##fileformat=VCFv4.1
##FILTER=<ID=GOF,Description="Variant fails goodness-of-fit test.">
##FILTER=<ID=HapScore,Description="Too many haplotypes are supported by the data in this region.">
##FILTER=<ID=MQ,Description="Root-mean-square mapping quality across calling region is low.">
##FILTER=<ID=Q20,Description="Variant quality is below 20.">
##FILTER=<ID=QD,Description="Variants fail quality/depth filter.">
##FILTER=<ID=QualDepth,Description="Variant quality/Read depth ratio is low.">
##FILTER=<ID=REFCALL,Description="This line represents a homozygous reference call">
##FILTER=<ID=SC,Description="Variants fail sequence-context filter. Surrounding sequence is low-complexity">
##FILTER=<ID=alleleBias,Description="Variant frequency is lower than expected for het">
##FILTER=<ID=badReads,Description="Variant supported only by reads with low quality bases close to variant position, and not present on both strands.">
##FILTER=<ID=hp10,Description="Flanking sequence contains homopolymer of length 10 or greater">
##FILTER=<ID=strandBias,Description="Variant fails strand-bias filter">
##FORMAT=<ID=AD,Number=.,Type=Integer,Description="Allelic depths for the ref and alt alleles in the order listed">
##FORMAT=<ID=AF,Number=A,Type=Float,Description="Allelic frequency for the alt alleles in the order listed">
##FORMAT=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Read depth">
##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype">
##GATKCommandLine.CombineVariants=<ID=CombineVariants,Version=3.4-0-g7e26428,Date="Wed Sep 05 01:26:37 EDT 2018",Epoch=1536125197583,CommandLineOptions="analysis_type=CombineVariants input_file=[] showFullBamList=false read_buffer_size=null phone_home=AWS gatk_key=null tag=NA read_filter=[] disable_read_filter=[] intervals=null excludeIntervals=null interval_set_rule=UNION interval_merging=ALL interval_padding=0 reference_sequence=/data/MoCha/patidarr/ref/ucsc.hg19.fasta nonDeterministicRandomSeed=false disableDithering=false maxRuntime=-1 maxRuntimeUnits=MINUTES downsampling_type=BY_SAMPLE downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=10000 baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 refactor_NDN_cigar_string=false fix_misencoded_quality_scores=false allow_potentially_misencoded_quality_scores=false useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 performanceLog=null BQSR=null quantize_quals=0 disable_indel_quals=false emit_original_quals=false preserve_qscores_less_than=6 globalQScorePrior=-1.0 validation_strictness=SILENT remove_program_records=false keep_program_records=false sample_rename_mapping_file=null unsafe=null disable_auto_index_creation_and_locking_when_reading_rods=false no_cmdline_in_header=false sites_only=false never_trim_vcf_format_field=false bcf=false bam_compression=null simplifyBAM=false disable_bam_indexing=false generate_md5=false num_threads=2 num_cpu_threads_per_data_thread=1 num_io_threads=0 monitorThreadEfficiency=false num_bam_file_handles=null read_group_black_list=null pedigree=[] pedigreeString=[] pedigreeValidationType=STRICT allow_intervals_with_unindexed_bam=false generateShadowBCF=false variant_index_type=DYNAMIC_SEEK variant_index_parameter=-1 logging_level=INFO log_to_file=null help=false version=false variant=[(RodBindingCollection [(RodBinding name=HC source=/lscratch/8928704//HC.vcf)]), (RodBindingCollection [(RodBinding name=Platypus source=/lscratch/8928704//PL.vcf)])] out=/gpfs/gsfs6/users/MoCha/processedDATA/296347/20170910/296347~364-R~U76V70QC7E19~WES/calls/296347~364-R~U76V70QC7E19~WES.merged.vcf genotypemergeoption=PRIORITIZE filteredrecordsmergetype=KEEP_IF_ANY_UNFILTERED multipleallelesmergetype=BY_TYPE rod_priority_list=HC,Platypus printComplexMerges=false filteredAreUncalled=false minimalVCF=false excludeNonVariants=false setKey=set assumeIdenticalSamples=false minimumN=1 suppressCommandLineHeader=false mergeInfoWithMaxAC=false filter_reads_with_N_cigar=false filter_mismatching_base_and_quals=false filter_bases_not_stored=false">
##INFO=<ID=AC,Number=A,Type=Integer,Description="Allele count in genotypes, for each ALT allele, in the same order as listed">
##INFO=<ID=AF,Number=A,Type=Float,Description="Allele Frequency, for each ALT allele, in the same order as listed">
##INFO=<ID=AF,Number=A,Type=Float,Description="Allele frequency, for each ALT allele, in the same order as listed">
##INFO=<ID=ALERT,Number=0,Type=Flag,Description="Variant is adjacent to other variants, but case was too complex for joinAdjacentSNPs to handle. Please review.">
##INFO=<ID=AN,Number=1,Type=Integer,Description="Total number of alleles in called genotypes">
##INFO=<ID=BRF,Number=1,Type=Float,Description="Fraction of reads around this variant that failed filters">
##INFO=<ID=BaseQRankSum,Number=1,Type=Float,Description="Z-score from Wilcoxon rank sum test of Alt Vs. Ref base qualities">
##INFO=<ID=ClippingRankSum,Number=1,Type=Float,Description="Z-score From Wilcoxon rank sum test of Alt vs. Ref number of hard clipped bases">
##INFO=<ID=DB,Number=0,Type=Flag,Description="dbSNP membership">
##INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Combined depth across samples">
##INFO=<ID=END,Number=1,Type=Integer,Description="Stop position of the interval">
##INFO=<ID=ExcessHet,Number=1,Type=Float,Description="Phred-scaled p-value for exact test of excess heterozygosity">
##INFO=<ID=FR,Number=.,Type=Float,Description="Estimated population frequency of variant">
##INFO=<ID=FS,Number=.,Type=Float,Description="Fisher's exact test for strand bias (Phred scale)">
##INFO=<ID=HP,Number=1,Type=Integer,Description="Homopolymer run length around variant locus">
##INFO=<ID=HapScore,Number=.,Type=Integer,Description="Haplotype score measuring the number of haplotypes the variant is segregating into in a window">
##INFO=<ID=InbreedingCoeff,Number=1,Type=Float,Description="Inbreeding coefficient as estimated from the genotype likelihoods per-sample when compared against the Hardy-Weinberg expectation">
##INFO=<ID=JOINED,Number=0,Type=Flag,Description="Variant is the result of joining adjacent SNPs/MNPs. Please use caution when interpreting sample-specific values.">
##INFO=<ID=MGOF,Number=.,Type=Integer,Description="Worst goodness-of-fit value reported across all samples">
##INFO=<ID=MLEAC,Number=A,Type=Integer,Description="Maximum likelihood expectation (MLE) for the allele counts, for each ALT allele, in the same order as listed">
##INFO=<ID=MLEAF,Number=A,Type=Float,Description="Maximum likelihood expectation (MLE) for the allele frequency, for each ALT allele, in the same order as listed">
##INFO=<ID=MMLQ,Number=1,Type=Float,Description="Median minimum base quality for bases around variant">
##INFO=<ID=MQ,Number=1,Type=Float,Description="RMS Mapping Quality">
##INFO=<ID=MQRankSum,Number=1,Type=Float,Description="Z-score From Wilcoxon rank sum test of Alt vs. Ref read mapping qualities">
##INFO=<ID=NF,Number=.,Type=Integer,Description="Total number of forward reads containing this variant">
##INFO=<ID=NR,Number=.,Type=Integer,Description="Total number of reverse reads containing this variant">
##INFO=<ID=PP,Number=.,Type=Float,Description="Posterior probability (phred scaled) that this variant segregates">
##INFO=<ID=QD,Number=1,Type=Float,Description="Variant-quality/read-depth for this variant">
##INFO=<ID=ReadPosRankSum,Number=.,Type=Float,Description="Mann-Whitney Rank sum test for difference between in positions of variants in reads from ref and alt">
##INFO=<ID=SC,Number=1,Type=String,Description="Genomic sequence 10 bases either side of variant position">
##INFO=<ID=SOR,Number=1,Type=Float,Description="Symmetric Odds Ratio of 2x2 contingency table to detect strand bias">
##INFO=<ID=START,Number=.,Type=Integer,Description="Start position of reference call block">
##INFO=<ID=SbPval,Number=.,Type=Float,Description="Binomial P-value for strand bias test">
##INFO=<ID=Size,Number=.,Type=Integer,Description="Size of reference call block">
##INFO=<ID=Source,Number=.,Type=String,Description="Was this variant suggested by Playtypus, Assembler, or from a VCF?">
##INFO=<ID=TC,Number=1,Type=Integer,Description="Total coverage at this locus">
##INFO=<ID=TCF,Number=1,Type=Integer,Description="Total forward strand coverage at this locus">
##INFO=<ID=TCR,Number=1,Type=Integer,Description="Total reverse strand coverage at this locus">
##INFO=<ID=TR,Number=.,Type=Integer,Description="Total number of reads containing this variant">
##INFO=<ID=WE,Number=1,Type=Integer,Description="End position of calling window">
##INFO=<ID=WS,Number=1,Type=Integer,Description="Starting position of calling window">
##INFO=<ID=set,Number=1,Type=String,Description="Source VCF for the merged record in CombineVariants">
##SentieonCommandLine.Haplotyper=<ID=Haplotyper,Version="sentieon-genomics-201711",Date="2018-09-05T04:33:00Z",CommandLine="/data/MoCha/patidarr/sentieon/sentieon-genomics-201711/libexec/driver --temp_dir /lscratch/8926841// -t 26 -r /data/MoCha/patidarr/ref/ucsc.hg19.fasta -i 296347/20170910/296347~364-R~U76V70QC7E19~WES/296347~364-R~U76V70QC7E19~WES.bwa.final.bam --interval /data/MoCha/patidarr/ref/design/Sureselect.v5.refseq.ensembl.noUTR.notfound.targetbp.hg19.bed --algo Haplotyper -d /data/MoCha/patidarr/ref/dbsnp_138.hg19.vcf --min_base_qual 20 --min_map_qual 30 /lscratch/8926841//296347~364-R~U76V70QC7E19~WES.HC_DNASeq.raw.vcf">
##contig=<ID=chrM,length=16571,assembly=hg19>
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##fileDate=2018-09-05
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chr1	69511	rs75062661	A	G	2282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=37;PP=1423;SC=TATGGCTGTCACATGGGGAAT;SOR=1.046;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=52;TCR=37;TR=89;WE=69519;WS=69501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
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chr1	762592	rs71507462	C	G	1100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.89;QD=45.87;SOR=2.124;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	762601	rs71507463	T	C	961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.64;QD=43.72;SOR=1.931;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	762632	rs61768173	T	A	307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=62;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=8;PP=199;SC=AGAACTAGGGTGGAAGGGCCG;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=762640;WS=762622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	792263	rs1044922	A	G	653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.28;QD=25.14;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	792480	rs2905036	C	T	4216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=76;NR=76;PP=2493;SC=TTGTGTTCAACATATTTCATT;SOR=0.756;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=76;TCR=76;TR=152;WE=792488;WS=792470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr1	861177	.	C	A	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.538;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=60;ReadPosRankSum=1.103;SC=GAAGTCGGGCCGAGGTGGGTG;SOR=0.321;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=7;WE=861185;WS=861167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr1	866319	rs9988021	G	A	1160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=12;PP=813;SC=GTGGCCCAGCGGGGCACTGAC;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=30;TCR=12;TR=42;WE=866327;WS=866309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	866511	.	C	CCCCT	602.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.822;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.552;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=349;ReadPosRankSum=-0.398;SC=GGCCGTGACTCCCCTCCCTCC;SOR=0.275;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=6;WE=866519;WS=866501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,21:0.66:32
chr1	876499	rs4372192	A	G	992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=22;NR=11;PP=565;SC=AGCCGGGGGGATCACTGCTGT;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=22;TCR=11;TR=33;WE=876507;WS=876489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	877715	rs6605066	C	G	296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=5;NR=6;PP=163;SC=CGAGACGGACCGGGTAGGGGA;SOR=1.022;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=11;TCF=5;TCR=6;TR=11;WE=877723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	877831	rs6672356	T	C	172.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=2;PP=103;SC=GATGTTCGCCTGGCAGCAGGA;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=877839;WS=877821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	879676	rs6605067	G	A	558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=14;PP=396;SC=TCAAAGGAAAGGAACAAATTT;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=879695;WS=879666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	879687	rs2839	T	C	589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=14;PP=417;SC=GAACAAATTTTCAAAGACTTG;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=879695;WS=879666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	880238	rs3748592	A	G	6587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=114;NR=110;PP=2965;SC=AGCCAGCCTTAGAGGTTACTC;SOR=0.778;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=224;TCF=114;TCR=110;TR=224;WE=880246;WS=880228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr1	880639	rs35916504	TC	T	518.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=13;PP=483;SC=TCCGCTGACTTCCAGCAGGTG;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=880647;WS=880629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	882033	rs2272756	G	A	1191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=34;PP=965;SC=TACCCCAGGAGGGGACATGGA;SOR=3.202;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=6;TCR=34;TR=40;WE=882041;WS=882023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	883625	rs4970378	A	G	4442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=87;NR=72;PP=2592;SC=GAAGAGCAGGAGAGAGGGCCG;SOR=0.728;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=159;TCF=87;TCR=72;TR=159;WE=883633;WS=883615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr1	884091	.	C	CACCCTGGTCCCCCTGGTCCCTTTGGCCCTGCACCTGGCTGG	2920.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.94;SOR=2.211;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr1	884101	.	A	C	1647	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.49;FR=0.5000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MMLQ=28;MQ=59.78;NF=5;NR=31;PP=1647;QD=46.7158670152;SC=CACCCTGGTCACCCTGGTCCT;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=53;TCF=9;TCR=44;TR=36;WE=884109;WS=884081;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:17,36:0.68:53
chr1	886788	rs10465242	G	A	2180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=47;PP=1386;SC=TGGGGCTGCAGGTACCTTACC;SOR=2.093;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=18;TCR=47;TR=65;WE=886796;WS=886778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr1	886817	rs10465241	C	T	1184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=31;PP=798;SC=AGCTTTATTTCAACACGGTGG;SOR=3.664;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=36;WE=886825;WS=886807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	887560	rs3748595	A	C	7355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=128;NR=128;PP=2965;SC=CCAGGCTGACAAGTCAGGCTG;SOR=0.791;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=256;TCF=128;TCR=128;TR=256;WE=887568;WS=887550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,275:1.00:275
chr1	887801	rs3828047	A	G	2609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=21;PP=1387;SC=CCTTCTTGCGAGTGGTCATGG;SOR=1.305;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=54;TCR=21;TR=75;WE=887809;WS=887791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr1	888639	rs3748596	T	C	9094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=156;NR=148;PP=2965;SC=GCAGAGACTCTTCCCCAGTGC;SOR=0.735;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=304;TCF=156;TCR=148;TR=304;WE=888647;WS=888629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,341:1.00:341
chr1	888659	rs3748597	T	C	8406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=141;NR=139;PP=2965;SC=CTCCATACGATCACCATTCTC;SOR=0.806;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=280;TCF=141;TCR=139;TR=280;WE=888667;WS=888649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,317:1.00:317
chr1	889158	rs13303056	GA	CC	1990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=31;NR=7;PP=752;SC=ACTGGGCCACGAACCTTGAGC;SOR=2.461;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=41;TCF=33;TCR=8;TR=38;WE=889167;WS=889148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	889638	rs13303206	G	C	767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=19;PP=581;SC=AGGGGCTTAGGAGGACCCTCT;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=889646;WS=889628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	892745	rs13303227	G	A	2178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=52;PP=1406;SC=CTTCACAAGGGTTACCAACTA;SOR=1.759;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=24;TCR=52;TR=76;WE=892753;WS=892735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr1	894573	rs13303010	G	A	7237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=139;PP=2965;SC=AGGCCAAATCGGCCCTCGGAC;SOR=1.152;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=243;TCF=104;TCR=139;TR=243;WE=894581;WS=894563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr1	897325	rs4970441	G	C	10135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=382;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=162;NR=186;PP=2965;SC=TTGCCGATGCGCACTCCTGCA;SOR=0.886;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=348;TCF=162;TCR=186;TR=348;WE=897333;WS=897307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,382:1.00:382
chr1	897564	rs13303229	T	C	9862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=370;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=179;NR=166;PP=2965;SC=CCGAGACCTTTCTGGATCTGG;SOR=0.699;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=347;TCF=181;TCR=166;TR=345;WE=897583;WS=897554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,369:1.00:369
chr1	898323	rs6605071	T	C	3845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=56;PP=2444;SC=CGTTTCCCTCTTGCCCTGTGC;SOR=0.752;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=125;TCF=69;TCR=56;TR=125;WE=898331;WS=898313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr1	899989	.	A	C	356	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=4;HapScore=4;MGOF=108;MMLQ=28;MQ=54.54;NF=0;NR=14;PP=356;QD=27.9122294677;SC=CGCAGTGGGGATGTGCTGCGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=900017;WS=899979;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	900000	.	G	GAA	373	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=3;HapScore=4;MGOF=108;MMLQ=24;MQ=52.75;NF=0;NR=5;PP=373;QD=81.4;SC=TGTGCTGCGGGGAGGGGGGCG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=900017;WS=899979;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,5:0.50:10
chr1	900009	.	CG	C	190	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=7;HapScore=4;MGOF=108;MMLQ=24;MQ=44.93;NF=0;NR=5;PP=190;QD=45.0;SC=GGGAGGGGGGCGCGGGTCCGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=900017;WS=899979;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
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chr1	909238	rs3829740	G	C	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.172;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=186;ReadPosRankSum=0.170;SC=CAGAGTGCACGTGGACCCACG;SOR=0.437;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=44;TCF=32;TCR=12;TR=18;WE=909246;WS=909228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,21:0.42:50
chr1	909419	rs28548431	C	T	971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=22;PP=534;ReadPosRankSum=0.324;SC=AGCCCCCAGACGCCCCTCAGC;SOR=0.714;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=41;TCR=38;TR=45;WE=909427;WS=909409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,48:0.54:89
chr1	909768	rs2340593	A	G	7419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=133;NR=121;PP=2965;SC=CTGCCTCCTGAGGTGAGTGCC;SOR=0.715;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=254;TCF=133;TCR=121;TR=254;WE=909776;WS=909758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,279:1.00:279
chr1	911595	rs7417106	A	G	3751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=56;PP=2112;SC=CCCTTGCCCCACCTGCCGGCG;SOR=0.866;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=131;TCF=75;TCR=56;TR=131;WE=911603;WS=911585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr1	912049	rs9803103	T	C	707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.281;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=25;PP=378;ReadPosRankSum=-1.178;SC=CACTCAGAGATGGCCCCGCAC;SOR=0.368;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=102;TCF=30;TCR=72;TR=38;WE=912057;WS=912039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,40:0.39:102
chr1	912103	.	G	A	405	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;FR=1.0000;HP=4;HapScore=2;MGOF=39;MMLQ=27;MQ=57.26;NF=1;NR=15;PP=405;QD=27.4857007842;SC=CACCAACCCCGGGAACCGCCT;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=16;WE=912111;WS=912093;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,16:0.94:17
chr1	912125	.	CG	C	311	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;FR=0.5000;HP=5;HapScore=4;MGOF=47;MMLQ=27;MQ=55.37;NF=0;NR=6;PP=311;QD=56.1666666667;SC=CCACTCCCCCCGCCAACCCCG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=6;WE=912135;WS=912115;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:5,6:0.55:11
chr1	912127	.	C	A	145	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;FR=0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=47;MMLQ=27;MQ=55.37;NF=0;NR=5;PP=145;QD=35.9542425094;SC=ACTCCCCCCGCCAACCCCGGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=5;WE=912135;WS=912115;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,5:0.45:11
chr1	914192	rs2340595	G	C	232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=3;PP=162;SC=GCGGCCCCCTGCTTGGCCAAG;SOR=1.085;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=10;WE=914200;WS=914182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	914333	rs13302979	C	G	853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=10;PP=456;ReadPosRankSum=-2.751;SC=CCCGCCCCCTCGGAGGCCGAC;SOR=0.678;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=65;TCF=44;TCR=21;TR=33;WE=914341;WS=914323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,38:0.54:71
chr1	914852	rs13303368	G	C	1647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.933;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=21;PP=1154;ReadPosRankSum=0.489;SC=GCTGAGGCCTGTCCTGAGCCT;SOR=1.643;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=130;TCF=81;TCR=49;TR=67;WE=914860;WS=914842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,72:0.50:143
chr1	914876	rs13302983	T	C	5144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=73;PP=2763;SC=TTATTGGGGCTGGGCCCAGCC;SOR=0.955;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=173;TCF=100;TCR=73;TR=173;WE=914884;WS=914866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr1	914940	rs13303033	T	C	3555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.448;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=67;PP=1752;ReadPosRankSum=1.550;SC=CCAGTGCGGGTGCCCCAGAGC;SOR=0.592;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=250;TCF=139;TCR=111;TR=146;WE=914948;WS=914930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,168:0.59:283
chr1	915227	rs13303355	A	G	5579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=95;NR=91;PP=2965;SC=TCCGTGTCCAATTGTGGCTTG;SOR=0.743;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=186;TCF=95;TCR=91;TR=186;WE=915235;WS=915217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr1	916549	rs6660139	A	G	2880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=342;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.396;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=60;PP=1810;ReadPosRankSum=0.278;SC=GGCTCCATCCATGCCCTGAAA;SOR=0.724;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=304;TCF=172;TCR=132;TR=137;WE=916557;WS=916539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:193,149:0.44:342
chr1	916590	rs28566954	G	A	4665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=443;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.729;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=105;NR=102;PP=2520;ReadPosRankSum=2.052;SC=GGGGAGGGCCGCGCTTCCTTC;SOR=0.578;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=403;TCF=211;TCR=192;TR=207;WE=916598;WS=916580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:211,232:0.52:443
chr1	917640	rs41285816	G	A	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=239;ReadPosRankSum=0.311;SC=AGTACATGAGGACGACTTCCT;SOR=0.641;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=33;TCF=10;TCR=23;TR=15;WE=917648;WS=917630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr1	935222	rs2298214	C	A	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.030;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=238;ReadPosRankSum=0.588;SC=CGGTCGCCCCCCTCACGCCCG;SOR=1.067;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=68;TCF=32;TCR=36;TR=22;WE=935230;WS=935212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,25:0.31:81
chr1	948846	rs3841266	T	TA	2066.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=9;PP=1498;SC=GCCTCAGGCTTATAATAGGGC;SOR=2.409;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=27;TCR=10;TR=33;WE=948854;WS=948836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	948870	rs4615788	C	G	2924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=21;PP=1276;SC=TGCTGCCTGCCGAAGCCGGCG;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=52;TCR=21;TR=73;WE=948878;WS=948860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr1	948921	rs15842	T	C	3762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=69;NR=53;PP=1875;SC=TACAGGAGCTTGTGCCGTGGC;SOR=0.811;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=122;TCF=69;TCR=53;TR=122;WE=948929;WS=948911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr1	949608	rs1921	G	A	3983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=376;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=89;PP=2351;ReadPosRankSum=1.381;SC=GAACCTCTGAGCATCCTGGTG;SOR=0.711;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=341;TCF=173;TCR=168;TR=179;WE=949616;WS=949598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:181,195:0.52:376
chr1	949654	rs8997	A	G	8870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=132;NR=154;PP=2965;SC=CCTACGAGGTACGGCTGACGC;SOR=0.924;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=287;TCF=133;TCR=154;TR=286;WE=949662;WS=949644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,315:1.00:315
chr1	949925	rs2799070	C	T	2128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=38;PP=1062;SC=GAGAAATGGCCGCCTCTGTGT;SOR=1.310;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=28;TCR=38;TR=66;WE=949933;WS=949915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
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chr1	957898	rs2799064	G	T	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=237;ReadPosRankSum=0.186;SC=GTGGCCAAGGGGGACAGGTTG;SOR=1.015;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=25;TCF=9;TCR=16;TR=15;WE=957906;WS=957888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr1	976481	.	CGGAGCGGGGCG	C	341	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;FR=0.9998;HP=8;HapScore=2;MGOF=15;MMLQ=15;MQ=60.98;NF=2;NR=0;PP=341;QD=177.0;SC=GCCTGGGGGGCGGAGCGGGGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=2;WE=976499;WS=976471;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,2:0.40:5
chr1	977330	rs2799066	T	C	1711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.75;SOR=1.214;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	977570	rs2710876	G	A	2297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=43;PP=1372;SC=GAGGCCAGGCGGGGTGGGCTG;SOR=1.581;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=25;TCR=43;TR=68;WE=977578;WS=977560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr1	978603	rs35881187	CCT	C	2248.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.523;NF=18;NR=19;PP=1454;ReadPosRankSum=-0.408;SC=CCACTGAGCCCCTGTGTCCTT;SOR=0.749;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=83;TCF=36;TCR=47;TR=37;WE=978612;WS=978593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,60:0.47:128
chr1	979397	rs143324306	G	A	2220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.482;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=50;PP=1404;ReadPosRankSum=0.493;SC=AGGGCCGTGCGAGCAGGGTAG;SOR=0.631;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=225;TCF=118;TCR=107;TR=107;WE=979405;WS=979387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,108:0.47:230
chr1	981087	rs3128098	A	G	8664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=144;NR=139;PP=2965;SC=TGCGGACATCACGTTCCTCCC;SOR=0.699;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=283;TCF=144;TCR=139;TR=283;WE=981095;WS=981077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,323:1.00:323
chr1	981931	rs2465128	A	G	4799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=84;PP=2965;SC=CGCCCTCATCACGACCTCGGA;SOR=0.737;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=186;TCF=102;TCR=84;TR=180;WE=981939;WS=981921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr1	982941	rs3128102	T	C	10477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=382;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=177;NR=162;PP=2965;SC=CCTTGCCTACTCCCTGCCACA;SOR=0.725;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=341;TCF=177;TCR=164;TR=339;WE=982949;WS=982931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,380:1.00:380
chr1	982994	rs10267	T	C	11321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=411;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=187;NR=196;PP=2965;SC=AGAAGGATTTTCGGAGTGTCC;SOR=0.784;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=383;TCF=187;TCR=196;TR=383;WE=983002;WS=982984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,410:1.00:410
chr1	984147	.	CAAAAAAAAAAAA	C,CA	411.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.56;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.245;HP=20;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=1287;ReadPosRankSum=1.645;SC=AACTCCGTCTCAAAAAAAAAA;SOR=0.051;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=9;WE=984180;WS=984137;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.65:17
chr1	984171	rs140904842	CAG	C	538.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.56;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=1223;ReadPosRankSum=2.096;SC=AAAAAAAAAGCAGGGGGCGGT;SOR=0.490;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=11;WE=984180;WS=984137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr1	984302	rs9442391	T	C	624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.166;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=13;PP=329;ReadPosRankSum=-0.659;SC=CCTTCCCCACTCTCCGCGCCT;SOR=0.468;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=22;TCR=19;TR=28;WE=984310;WS=984292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,31:0.65:48
chr1	985266	rs2275813	C	T	2864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.862;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=56;PP=1789;ReadPosRankSum=0.927;SC=GTCCCGGTCCCGTCTTCCTCC;SOR=0.802;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=291;TCF=164;TCR=127;TR=134;WE=985274;WS=985256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,144:0.46:314
chr1	985443	rs374942603	AG	A	215.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=1.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.635;SOR=0.280;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr1	985446	rs2275812	G	T	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.12;ReadPosRankSum=0.884;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr1	985449	rs2799067	G	A	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.69;ReadPosRankSum=0.761;SOR=1.508;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr1	985450	.	G	A	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.15;ReadPosRankSum=-0.900;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr1	986443	rs2710887	C	T	7419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.041;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=139;NR=125;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.068;SC=GCCTCTCATCCGCTCACCGTC;SOR=0.257;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=268;TCF=139;TCR=129;TR=264;WE=986451;WS=986433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,281:1.00:282
chr1	987200	rs9803031	C	T	4525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=76;NR=77;PP=2657;SC=CGAGAGGTAACGTGCCATCCT;SOR=0.766;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=153;TCF=76;TCR=77;TR=153;WE=987208;WS=987190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr1	988932	rs2710871	G	C	518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=15;PP=372;ReadPosRankSum=-1.784;SC=CCTCCCGCCCGTCTCTCTGAT;SOR=0.728;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=52;TCF=21;TCR=31;TR=24;WE=988940;WS=988922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,25:0.42:60
chr1	990280	rs4275402	C	T	1168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=19;PP=745;SC=GCTTGCGGGACGTGGTGGTGG;SOR=0.784;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=24;TCR=19;TR=43;WE=990288;WS=990270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	990517	rs2710872	C	T	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.210;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=82;ReadPosRankSum=0.105;SC=GACCTAGTGCCGAGGGATGGA;SOR=0.446;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=6;WE=990525;WS=990507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr1	1007203	rs4633229	A	G	1599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=5;PP=1221;SC=GGCCCTAATTATCAGTCAGAG;SOR=4.407;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=50;TCF=43;TCR=7;TR=48;WE=1007211;WS=1007193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	1007432	rs4333796	G	A	2070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.33;ReadPosRankSum=-0.840;SOR=0.736;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,92:0.55:168
chr1	1018144	rs9442395	T	C	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.918;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=12;PP=509;ReadPosRankSum=-0.991;SC=GCGGAGGGACTCAGAGCCGAG;SOR=0.903;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=65;TCF=37;TCR=28;TR=33;WE=1018152;WS=1018134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,36:0.46:78
chr1	1019175	rs2298215	C	G	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.67;ReadPosRankSum=0.144;SOR=0.719;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,6:0.24:25
chr1	1019180	rs9442396	T	C	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.61;ReadPosRankSum=-0.778;SOR=0.922;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,7:0.27:26
chr1	1021415	rs3737728	A	G	890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.904;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=29;PP=674;ReadPosRankSum=-0.341;SC=ACCGCTGAGCAGACGGGCAGG;SOR=0.572;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=89;TCF=23;TCR=66;TR=40;WE=1021423;WS=1021405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,40:0.45:88
chr1	1026707	rs4074137	C	A	2951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=65;NR=39;PP=1680;SC=CCCCTCTGACCCCAGCAGTGG;SOR=1.189;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=65;TCR=39;TR=104;WE=1026715;WS=1026697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr1	1026801	rs4562563	T	A	4236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=67;NR=65;PP=2164;SC=CCCACCGCCCTCCACAGAGGC;SOR=0.887;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=132;TCF=67;TCR=65;TR=132;WE=1026809;WS=1026791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr1	1026913	rs115662838	C	T	960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.647;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=23;PP=588;ReadPosRankSum=-0.380;SC=GGCGAGGTGCCGCAGCGCCAT;SOR=0.929;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=88;TCF=45;TCR=43;TR=42;WE=1026921;WS=1026903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,46:0.47:97
chr1	1115210	rs11260546	G	A	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.25;ReadPosRankSum=-0.188;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr1	1115213	rs11260547	G	T	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.878;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=25.98;ReadPosRankSum=-0.055;SOR=0.207;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr1	1117398	rs12097586	A	G	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.153;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=201;ReadPosRankSum=0.304;SC=GGCTCAGGCCACGCTCTCCGC;SOR=0.083;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=13;WE=1117406;WS=1117388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr1	1118212	rs10907171	T	C	876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.766;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=15;PP=513;ReadPosRankSum=-1.010;SC=GGGGCGTGGCTGGGTTGGGGG;SOR=0.594;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=93;TCF=60;TCR=33;TR=40;WE=1118220;WS=1118202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,44:0.43:102
chr1	1156131	rs2887286	T	C	2687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.668;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=60;PP=1630;ReadPosRankSum=-0.969;SC=AAGACCCAAATAAAGTGGCAC;SOR=0.855;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=238;TCF=111;TCR=127;TR=111;WE=1156139;WS=1156121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,128:0.48:267
chr1	1158631	rs6603781	A	G	3099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=72;NR=41;PP=1665;SC=CACTTTCCTCATCCACTTTGA;SOR=1.064;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=72;TCR=41;TR=113;WE=1158639;WS=1158621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr1	1196863	rs6659787	T	C	1599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=39;PP=1211;SC=GTTGGGGGAGTAGCTCATCTC;SOR=2.746;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=10;TCR=39;TR=49;WE=1196871;WS=1196853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	1222506	rs2229832	C	T	2674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.899;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=56;PP=1878;ReadPosRankSum=0.127;SC=GCACGGGCGGCGACTGCTTTT;SOR=0.772;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=265;TCF=146;TCR=119;TR=123;WE=1222527;WS=1222496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,128:0.44:291
chr1	1229680	rs2477781	G	T	5911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=93;PP=2965;SC=GGGACCGAACGTGGTCCCCAC;SOR=0.818;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=180;TCF=87;TCR=93;TR=180;WE=1229688;WS=1229670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr1	1239339	rs11260584	T	G	1489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=41;NR=9;PP=1048;SC=GACCAGGACCTGGAGCACCAC;SOR=2.876;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=41;TCR=9;TR=50;WE=1239347;WS=1239329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	1242707	rs2274262	A	G	6021.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=97;NR=112;PP=2965;SC=CACGTTTCCAAGCACCCTACC;SOR=0.939;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=210;TCF=98;TCR=112;TR=209;WE=1242715;WS=1242697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr1	1245368	rs11590283	G	A	1330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=31;PP=875;SC=ACAGCTGGAGGGGATTCGCCC;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=12;TCR=31;TR=43;WE=1245376;WS=1245358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	1246004	rs2296474	A	G	2733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=31;PP=1441;SC=ACAGGTACGTATTTTTCCAGG;SOR=1.094;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=58;TCR=31;TR=89;WE=1246012;WS=1245994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr1	1247494	rs12103	T	C	1638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=28;NR=26;PP=847;SC=CAGAGCCGTCTGGGAGGTGCT;SOR=0.957;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=54;TCF=28;TCR=26;TR=54;WE=1247502;WS=1247484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	1247589	.	C	G	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.700;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=13.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.31;ReadPosRankSum=-0.700;SOR=1.393;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr1	1249187	rs12142199	G	A	12900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=481;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=220;NR=216;PP=2965;SC=TCCTCTGCACGAAAGTCTTGC;SOR=0.753;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=436;TCF=220;TCR=216;TR=436;WE=1249195;WS=1249177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,480:1.00:480
chr1	1254136	rs4970432	G	A	2998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=72;NR=23;PP=2118;SC=ACCTAATATAGTTTCAAGAAA;SOR=2.397;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=72;TCR=23;TR=95;WE=1254144;WS=1254126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr1	1254436	rs1886773	A	G	11165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.84;SOR=0.838;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr1	1254443	rs1886772	G	A	11267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.36;SOR=0.844;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr1	1254841	rs10907179	C	G	3025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=65;PP=1983;SC=TGTAGATGGGCCCGTCGTAGC;SOR=1.462;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=37;TCR=65;TR=102;WE=1254849;WS=1254831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr1	1260168	rs61766199	C	A	155.85	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.025;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=3.010;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=17.32;ReadPosRankSum=2.200;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,7:0.78:9
chr1	1262591	rs2296472	C	T	5338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=116;NR=65;PP=2965;SC=CAGGCCTGGGCGAGGACTCGA;SOR=1.263;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=181;TCF=116;TCR=65;TR=181;WE=1262599;WS=1262581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr1	1262966	rs307349	C	T	5289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=70;PP=2965;SC=TCGTGCGCCGCGCCGTCACCG;SOR=0.887;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=169;TCF=99;TCR=70;TR=169;WE=1262974;WS=1262956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr1	1263144	rs307350	G	A	3063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=40;NR=62;PP=1823;SC=CCTGCCCTAGGGGCGGGAAGC;SOR=1.342;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=103;TCF=41;TCR=62;TR=102;WE=1263152;WS=1263134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr1	1268847	rs307378	T	G	12842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=485;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=224;NR=220;PP=2965;SC=GCCCACAGGGTACAAGACGAA;SOR=0.718;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=445;TCF=225;TCR=220;TR=444;WE=1268855;WS=1268833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,484:1.00:484
chr1	1269554	rs307377	T	C	4268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=85;NR=61;PP=2256;SC=CCAGCCGGGCTGCTACAACCG;SOR=0.879;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=146;TCF=85;TCR=61;TR=146;WE=1269562;WS=1269544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr1	1273116	rs307371	A	G	8301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=150;NR=148;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.439;SC=CCCCATTCACACTGGCTCCTG;SOR=0.260;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=301;TCF=152;TCR=149;TR=298;WE=1273124;WS=1273106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,326:1.00:327
chr1	1273278	rs307370	A	G	961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.29;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	1275264	.	A	ACAGCCGCATGTCCCCCAGCAGCCCCCACAGACCCACCCG	1124.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.84;SOR=4.461;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	1275291	.	G	A	734	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5006;HP=6;HapScore=1;MGOF=7;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=3;NR=34;PP=734;QD=20.7776003391;SC=AGCAGCCCCCGCAGACCCACC;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=43;TCF=6;TCR=37;TR=37;WE=1275299;WS=1275281;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,37:0.86:43
chr1	1275329	.	TA	CG	70	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=70;QD=41.1559582874;SC=CAGCAGCCCCTACAGACCCAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=3;WE=1275338;WS=1275319;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,3:0.33:9
chr1	1276973	rs145370195	G	GACAC	14059.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.55;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=72;PP=2975;SC=ACCTCATGCAGACACATGCAC;SOR=1.098;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=125;TCF=46;TCR=79;TR=113;WE=1276981;WS=1276963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,307:1.00:307
chr1	1277533	rs307362	T	C	2955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=60;PP=1660;SC=TGGCCACATTTGGGCTGTGCA;SOR=1.282;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=41;TCR=60;TR=101;WE=1277541;WS=1277523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr1	1278237	rs307361	T	C	1562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=43;PP=1030;SC=GCCCACACAATGTCACTCTGT;SOR=3.037;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=10;TCR=43;TR=53;WE=1278245;WS=1278227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	1284490	rs150789461	G	A	1851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=45;PP=1255;SC=GCCCGGCCCGGGGCTCGGACG;SOR=2.531;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=14;TCR=45;TR=59;WE=1284498;WS=1284480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	1288471	rs3766183	C	T	663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=14;NR=3;PP=311;SC=GGGGAGCTCTCGGTGGCAGGC;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=1288479;WS=1288465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	1288583	rs3845295	C	G	2576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=28;PP=1461;SC=TCCCAGCCCCCGACGAGCAGA;SOR=1.190;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=56;TCR=28;TR=84;WE=1288591;WS=1288573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr1	1288823	rs2296471	A	G	647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=13;PP=493;SC=AGCCCCTGGGAGAGGGGTGTG;SOR=1.085;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=22;TCF=9;TCR=13;TR=22;WE=1288831;WS=1288813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	1289367	rs140777846	CTG	C	8367.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=20;NR=80;PP=2957;SC=CAGCCCGGGACTGGGAGCCGC;SOR=0.725;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=106;TCF=23;TCR=83;TR=100;WE=1289376;WS=1289357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr1	1289911	rs4970365	G	A	1905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=38;PP=1138;SC=GCGGGGTCGGGGCGGCGTCAG;SOR=1.478;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=22;TCR=38;TR=60;WE=1289919;WS=1289901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	1291159	rs201260508	GA	G	293.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=0;NR=7;PP=389;SC=GTCGGTGGGGGAAGGGGTGGG;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=1291167;WS=1291149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	1293764	rs34841888	G	C	2557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=52;NR=28;PP=1310;SC=TCAGATGGGCGGTTTTGTCCG;SOR=1.378;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=52;TCR=28;TR=80;WE=1293772;WS=1293754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr1	1296691	rs2765025	C	G	3483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=66;PP=2176;SC=CGTTTGCTGACCACCTCCTGG;SOR=1.170;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=115;TCF=49;TCR=66;TR=115;WE=1296699;WS=1296681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr1	1310074	rs2765035	C	G	4026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=59;PP=2401;SC=CGCCCCCGCGCGGCTTCCTAC;SOR=0.707;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=71;TCR=59;TR=130;WE=1310082;WS=1310064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr1	1323078	rs12729599	A	G	939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=14;PP=609;SC=ACAAGAAACCACCTCAGGGTG;SOR=0.927;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=18;TCR=14;TR=32;WE=1323086;WS=1323068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	1323143	rs35654872	CCT	C	2838.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=16;PP=1909;SC=CTGGGTGCGCCCTGAGGCACA;SOR=1.793;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=44;TCF=28;TCR=16;TR=43;WE=1323152;WS=1323133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	1323945	rs111530797	GTC	G	220.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.46;MQRankSum=0.787;QD=12.98;ReadPosRankSum=1.505;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr1	1387667	rs1781144	C	G	8767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=157;NR=140;PP=2965;SC=CTGTGTCAAGCCCTCACCCTC;SOR=0.718;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=297;TCF=157;TCR=140;TR=297;WE=1387675;WS=1387657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,326:1.00:326
chr1	1395401	.	C	CTG	263.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.26;MQRankSum=-1.471;QD=20.29;ReadPosRankSum=0.277;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr1	1395402	.	CAG	TGC	326	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=19;MQ=48.94;NF=2;NR=5;PP=326;QD=55.6382678375;SC=GCTGAGCCTCCAGTGAACCCG;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=7;WE=1395412;WS=1395392;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr1	1395402	.	CAG	C	263.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.66;MQRankSum=-1.761;QD=21.98;ReadPosRankSum=0.729;SOR=2.066;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr1	1418531	rs819973	G	A	766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.96;SOR=0.957;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	1458073	rs3118507	A	G	788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=7;PP=538;SC=TCCTGCTCTAAGAGGGAGGGA;SOR=1.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=27;WE=1458081;WS=1458063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	1551927	rs7418389	T	C	3371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=73;NR=36;PP=2227;SC=GTCCCAAAGTTTCCAGGCATC;SOR=1.437;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=73;TCR=37;TR=109;WE=1551935;WS=1551917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr1	1558792	rs12755088	T	C	564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=13;NR=7;PP=297;SC=CGGCCCACCATGGACCCCTCT;SOR=1.329;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=13;TCR=7;TR=20;WE=1558800;WS=1558782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	1564712	rs61774907	G	T	755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.750;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=19;PP=394;ReadPosRankSum=-0.807;SC=GGACGGCGGGGATGGGGTCCG;SOR=1.104;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=75;TCF=37;TCR=38;TR=34;WE=1564720;WS=1564702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,38:0.47:81
chr1	1565972	rs137939848	G	C	1611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.827;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=40;PP=1081;ReadPosRankSum=-1.114;SC=TTTATAAAAAGAAAGATTCTC;SOR=0.569;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=169;TCF=79;TCR=90;TR=77;WE=1565980;WS=1565962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,81:0.45:182
chr1	1566068	rs28730454	A	G	418.81	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.8550;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=244;ReadPosRankSum=0.722;SC=GGGGGCGAGGAGGGGGGGCCC;SOR=1.893;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=20;WE=1566076;WS=1566057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,19:0.86:22
chr1	1571640	rs377058079	G	T	413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=31.83;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	1572968	rs151157623	C	T	601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.328;NF=9;NR=18;PP=388;ReadPosRankSum=0.163;SC=TAAGGACCTCCGGTGCCACCC;SOR=0.813;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=56;TCF=20;TCR=36;TR=27;WE=1572976;WS=1572958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,28:0.44:63
chr1	1573866	.	TTTC	T	85.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.795;ClippingRankSum=0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.79;MQRankSum=-0.428;QD=5.72;ReadPosRankSum=-0.068;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr1	1574019	rs9442412	A	G	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=3.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.70;MQRankSum=-1.907;QD=12.36;ReadPosRankSum=0.129;SOR=0.244;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr1	1575616	rs80012316	T	C	401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.48;QD=26.78;SOR=2.448;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	1575836	rs72468213	C	G	1605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FS=4.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.12;MQRankSum=-9.524;QD=5.28;ReadPosRankSum=0.594;SOR=0.578;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:202,102:0.34:304
chr1	1580738	rs149767621	T	A	2061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FS=2.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.46;MQRankSum=-8.810;QD=10.47;ReadPosRankSum=-1.054;SOR=0.529;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,103:0.52:197
chr1	1581558	rs117719933	C	T	70.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=23.43;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	1581586	rs61774914	T	C	104.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.37;QD=26.01;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	1581713	rs76922129	A	C,G	3804.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;NF=79,23;NR=47,0;PP=2028,344;SC=GTACTTTTTAAAACACTAAGA;SOR=1.579;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=149;TCF=102;TCR=47;TR=126,23;WE=1581721;WS=1581703;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.90,0.10:155
chr1	1581759	rs61774915	G	A	974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=399;ExcessHet=3.0103;FS=40.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.99;MQRankSum=-13.785;QD=2.44;ReadPosRankSum=-4.022;SOR=2.405;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:327,72:0.18:399
chr1	1581926	rs61774917	G	T	1354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.721;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-6.810;NF=21;NR=43;PP=926;ReadPosRankSum=0.357;SC=AGGAGAGATAGTTACAGGATA;SOR=0.359;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=141;TCF=42;TCR=99;TR=64;WE=1581934;WS=1581916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,65:0.46:141
chr1	1582106	rs79942991	T	C	7207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=178;NR=115;PP=2965;SC=CAGGGAATGTTGTTCGTTCCC;SOR=1.344;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=293;TCF=178;TCR=115;TR=293;WE=1582114;WS=1582096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr1	1582202	rs61774918	C	T	4437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=400;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.747;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.431;NF=108;NR=103;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.203;SC=TGCCTTCTGGCCTCCATTGTT;SOR=0.652;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=401;TCF=209;TCR=192;TR=211;WE=1582210;WS=1582192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:197,203:0.51:400
chr1	1582794	rs4648754	C	A	224.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=3;PP=209;SC=GTTCCTTCCCCCATGCCTATT;SOR=0.892;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=11;WE=1582802;WS=1582786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	1582841	rs61774920	A	G	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.52;MQRankSum=0.674;QD=14.69;ReadPosRankSum=-1.150;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr1	1582844	rs61774921	G	T	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.49;MQRankSum=-0.431;QD=22.59;ReadPosRankSum=-0.967;SOR=2.225;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr1	1582880	rs61774922	G	C	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.35;MQRankSum=0.758;QD=14.89;ReadPosRankSum=-0.955;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr1	1582961	rs61774949	G	C	1783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.57;MQRankSum=-2.871;QD=9.05;ReadPosRankSum=-1.554;SOR=1.155;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:107,90:0.46:197
chr1	1583003	rs72468214	C	T	1942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.043;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.342;NF=55;NR=86;PP=1987;ReadPosRankSum=-2.207;SC=TCTGCCAGGTCCTTTCACGCA;SOR=0.699;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=260;TCF=108;TCR=152;TR=141;WE=1583011;WS=1582993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,105:0.49:215
chr1	1583088	.	A	G	170	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=24;MQ=47.75;NF=0;NR=11;PP=170;QD=18.615564777;SC=GTCTTTGGCGAGATCACAGCT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=6;TCR=37;TR=11;WE=1583096;WS=1583078;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:32,11:0.26:43
chr1	1583276	.	TC	T	43	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=25;MQ=50.8;NF=4;NR=0;PP=43;QD=23.0077249675;SC=CCTCCGTGCTTCCCAAGTGCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=4;WE=1583284;WS=1583266;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:17,4:0.19:21
chr1	1585597	rs7531938	A	G	3945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=34;PP=2454;SC=CCATTATACCATAATTTCTGG;SOR=1.869;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=91;TCR=34;TR=124;WE=1585605;WS=1585587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr1	1585642	rs3936009	G	T	7477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=142;NR=115;PP=2965;SC=CCTGATGACGGATACGAGCTA;SOR=0.935;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=257;TCF=142;TCR=115;TR=257;WE=1585650;WS=1585632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,283:1.00:283
chr1	1586752	rs11486023	T	C	2390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=20;PP=1604;SC=GTTGTCACAGTGACCCTAGGA;SOR=2.140;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=59;TCR=20;TR=79;WE=1586760;WS=1586742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr1	1588670	rs61774958	G	A	654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.654;HP=6;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.882;NF=26;NR=5;PP=494;ReadPosRankSum=-0.852;SC=ATATTTGAATGTTTTTGTTAA;SOR=1.556;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=85;TCF=67;TCR=18;TR=31;WE=1588678;WS=1588660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,32:0.36:90
chr1	1588717	rs61774959	G	A	708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.02;MQRankSum=-3.261;QD=3.89;ReadPosRankSum=2.844;SOR=0.720;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:135,47:0.26:182
chr1	1588737	rs61776760	C	T	1463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FS=1.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.81;MQRankSum=-3.637;QD=6.51;ReadPosRankSum=3.123;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:176,49:0.22:225
chr1	1588743	rs61776761	A	T	1480.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FS=3.672;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.36;MQRankSum=-3.507;QD=5.90;ReadPosRankSum=2.746;SOR=0.451;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:200,51:0.20:251
chr1	1588744	rs79724854	AGCG	A	1444.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-2.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FS=3.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.37;MQRankSum=-3.525;QD=5.49;ReadPosRankSum=2.612;SOR=0.450;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:212,51:0.19:263
chr1	1599812	rs12729295	C	T	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=25.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.33;MQRankSum=-5.806;QD=9.27;ReadPosRankSum=0.475;SOR=5.053;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,16:0.40:40
chr1	1599888	rs2072923	A	G	2107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.55;BaseQRankSum=5.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.309;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.854;NF=65;NR=27;PP=1300;ReadPosRankSum=-2.831;SC=AGCTCTTCCCACTCCTCCCGA;SOR=1.635;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=159;TCF=97;TCR=62;TR=92;WE=1599896;WS=1599878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,92:0.69:134
chr1	1602787	rs4639697	G	T	396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=1;PP=288;SC=AAACTTACCTGCCGGGGATAC;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=1602795;WS=1602777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	1635004	rs874516	T	C	4776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=-0.650;NF=95;NR=77;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.409;SC=AGGTCATCTTTTTGACTACTG;SOR=0.347;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=173;TCF=96;TCR=77;TR=172;WE=1635012;WS=1634994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,181:0.99:182
chr1	1635619	rs2076329	T	C	1693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=37;NR=31;PP=1140;SC=TGGGTGGGCCTGGGCGGGTCA;SOR=0.723;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=37;TCR=31;TR=68;WE=1635627;WS=1635609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr1	1635749	rs55880629	C	A	1291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=28;PP=838;SC=GTTTCACCCCCCGCAGCAGCT;SOR=1.051;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=22;TCR=28;TR=50;WE=1635757;WS=1635739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	1636044	rs1059822	G	A	4196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=90;PP=2965;SC=CGTGCTCCACGTAGTTCATCA;SOR=1.097;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=176;TCF=85;TCR=91;TR=175;WE=1636052;WS=1636034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr1	1636274	rs2179381	C	T	2013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=23;PP=1219;SC=GCACCCGGCCCCAGGACAGCA;SOR=1.103;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=42;TCR=23;TR=65;WE=1636282;WS=1636264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr1	1639046	rs138369165	C	G	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=20.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	1644908	rs2179383	C	T	1190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.38;MQRankSum=-1.768;QD=29.04;ReadPosRankSum=1.017;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,40:0.98:41
chr1	1645050	rs77869096	C	T	780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.68;QD=28.92;SOR=3.690;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	1645838	rs33938712	CA	C	1185.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=34.79;QD=35.93;SOR=0.752;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
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chr1	1646789	rs760927	T	C	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=21.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	1647722	rs114460890	G	T	885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=6.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.45;ReadPosRankSum=-0.434;SOR=0.065;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,22:0.46:48
chr1	1647725	rs368680882	GT	AG	870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=2.465;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.28;ReadPosRankSum=0.633;SOR=0.195;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,24:0.42:57
chr1	1647729	.	CA	TG	861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.818;ClippingRankSum=0.000;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=2.566;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.90;ReadPosRankSum=1.592;SOR=0.151;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,24:0.39:62
chr1	1647745	rs72634830	G	A	1347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=2.367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.34;ReadPosRankSum=1.261;SOR=0.409;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,35:0.37:94
chr1	1647753	rs74045984	C	T	1383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=1.927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.03;ReadPosRankSum=1.502;SOR=0.471;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,41:0.36:115
chr1	1647778	rs72901773	C	G	1667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.176;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.218;NF=55;NR=23;PP=918;ReadPosRankSum=-1.638;SC=TGACCCAGCCCACTCACCTTT;SOR=0.603;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=199;TCF=142;TCR=57;TR=78;WE=1647786;WS=1647768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,85:0.41:209
chr1	1647814	rs72901775	T	C	3683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=418;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.767;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.120;NF=85;NR=61;PP=2040;ReadPosRankSum=-0.985;SC=CCCTTGCCATTTCCCTTCTCT;SOR=0.564;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=365;TCF=217;TCR=148;TR=146;WE=1647822;WS=1647804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:229,184:0.45:413
chr1	1647871	rs72909014	T	C	5952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-2.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=650;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.051;NF=97;NR=95;PP=2650;ReadPosRankSum=-1.177;SC=CTTCTCGATGTCGTTTCCGAC;SOR=0.647;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=518;TCF=256;TCR=262;TR=192;WE=1647879;WS=1647861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:338,308:0.48:646
chr1	1647893	rs144636354	C	CTTTCTT	9363.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-2.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=601;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.115;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=60.02;MQRankSum=1.111;NF=9;NR=75;PP=2970;ReadPosRankSum=0.834;SC=TTCGTGCTCTCTTTCTTTCAC;SOR=0.801;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=288;TCF=25;TCR=263;TR=84;WE=1647901;WS=1647883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:303,247:0.45:550
chr1	1647968	rs146207119	C	CAT	2111.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=5.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.945;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.806;NF=2;NR=46;PP=2954;ReadPosRankSum=-0.551;SC=AAAAATTTCACGAGGCCGGGC;SOR=1.471;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=121;TCF=3;TCR=118;TR=48;WE=1648010;WS=1647958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,58:0.38:153
chr1	1647971	rs77394327	G	A	2078.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=2.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.643;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.867;NF=4;NR=37;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.854;SC=AATTTCACGAGGCCGGGCACG;SOR=1.865;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=131;TCF=26;TCR=105;TR=41;WE=1648010;WS=1647958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,52:0.36:143
chr1	1647983	rs74429813	T	A	1064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=5.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQRankSum=-1.935;QD=10.86;ReadPosRankSum=-0.620;SOR=1.464;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,34:0.35:98
chr1	1647990	rs76519969	C	T	883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=8.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQRankSum=-2.079;QD=12.11;ReadPosRankSum=0.077;SOR=2.140;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,23:0.32:73
chr1	1648002	rs77107184	C	T	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-2.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.636;NF=1;NR=18;PP=1432;ReadPosRankSum=0.000;SC=CCTGTAATCCCAGCACTTTGG;SOR=0.902;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=54;TCF=5;TCR=49;TR=19;WE=1648010;WS=1647958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,15:0.31:49
chr1	1648018	rs79409185	C	T	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=5.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQRankSum=-2.671;QD=6.72;ReadPosRankSum=0.020;SOR=0.042;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,10:0.30:33
chr1	1648027	rs61776857	T	C	895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=44;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=27;PP=449;SC=CCGAGGCGGGTGGATCACCTG;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=1648035;WS=1648008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	1650657	.	C	G	262	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=31;MMLQ=27;MQ=59.29;NF=12;NR=1;PP=262;QD=22.8285548113;SC=CTTTCAGCTACAGTTTGCTTT;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=13;WE=1650665;WS=1650655;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr1	1650787	rs1137003	T	C	6269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=350;ExcessHet=3.0103;FS=1.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.91;ReadPosRankSum=0.987;SOR=0.779;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:187,163:0.47:350
chr1	1650797	rs1059830	A	G	6577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=365;ExcessHet=3.0103;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.02;ReadPosRankSum=1.939;SOR=0.787;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:197,168:0.46:365
chr1	1650801	rs1137004	T	C	6491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=370;ExcessHet=3.0103;FS=1.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.55;ReadPosRankSum=2.282;SOR=0.779;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:201,169:0.46:370
chr1	1650807	rs1137005	T	C	4439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=377;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.781;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=106;NR=85;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.231;SC=ATTTTTCTTTTCTCTTTTCAT;SOR=0.644;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=355;TCF=201;TCR=154;TR=191;WE=1650815;WS=1650777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,205:0.54:377
chr1	1650832	rs72909030	A	G	4390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=428;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.524;HP=1;HapScore=4;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=110;NR=88;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.289;SC=TCTGTGATGAACTTTTTCTTT;SOR=0.772;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=401;TCF=216;TCR=185;TR=198;WE=1650853;WS=1650822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:221,206:0.48:427
chr1	1650845	rs1059831	G	A	4792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=460;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.740;HP=2;HapScore=4;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=107;PP=2962;ReadPosRankSum=2.180;SC=TTTTCTTTCCGAGACATTTGC;SOR=0.628;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=431;TCF=220;TCR=211;TR=208;WE=1650853;WS=1650822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:233,226:0.49:459
chr1	1650920	rs36191908	G	A	7504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=433;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.756;HP=1;HapScore=2;MGOF=42;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=112;PP=2732;ReadPosRankSum=-0.978;SC=ACAGCACTGCGTCATGCTTGA;SOR=0.853;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=399;TCF=177;TCR=222;TR=197;WE=1650928;WS=1650910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:219,210:0.49:429
chr1	1650938	.	CGG	C	6992.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.034;ClippingRankSum=0.000;DP=392;ExcessHet=3.0103;FS=0.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.02;ReadPosRankSum=-0.691;SOR=0.730;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:206,182:0.47:388
chr1	1650942	.	A	AAG	6789.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=0.000;DP=374;ExcessHet=3.0103;FS=1.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.35;ReadPosRankSum=-0.536;SOR=0.800;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:195,175:0.47:370
chr1	1650960	rs72634834	G	A	4885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FS=4.945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.90;ReadPosRankSum=-0.287;SOR=0.983;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:150,123:0.45:273
chr1	1650967	rs75384210	T	C	4049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FS=2.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.09;ReadPosRankSum=-0.059;SOR=0.913;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:134,103:0.43:237
chr1	1650996	rs74223875	T	C	1984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=2.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.51;ReadPosRankSum=-1.559;SOR=0.940;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,56:0.44:128
chr1	1651003	rs76941027	G	A	1882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=0.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.43;ReadPosRankSum=-2.412;SOR=0.861;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,48:0.44:108
chr1	1651047	.	C	T	169	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=36;MMLQ=28;MQ=56.91;NF=0;NR=11;PP=169;QD=18.5246556861;SC=TCTCCAACTTCAGGCATCTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=11;WE=1651055;WS=1651037;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:25,11:0.31:36
chr1	1651076	.	ACGGAGT	A	168	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=45;MMLQ=25;MQ=51.99;NF=0;NR=3;PP=168;QD=70.3333333333;SC=TTTTTTTTAGACGGAGTCTCG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=1651089;WS=1651053;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr1	1653004	rs36039898	T	C	4366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=52;PP=2888;SC=CTGTGTACAGTTGGGTCTTGC;SOR=1.409;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=151;TCF=99;TCR=52;TR=151;WE=1653012;WS=1652994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr1	1653028	rs16825265	C	T	5832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=124;NR=79;PP=2965;SC=TCTGTACATCCGCTCACCTGT;SOR=1.111;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=203;TCF=124;TCR=79;TR=203;WE=1653036;WS=1653018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr1	1654038	rs61777494	G	A	1253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=53;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=5;PP=912;SC=TGCGACATTTGGAAGTACAAA;SOR=2.252;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=37;TCR=5;TR=42;WE=1654046;WS=1654028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	1654058	rs61777495	C	T	3886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.25;QD=49.20;SOR=2.455;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr1	1654064	rs200615789	A	T	4105.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.32;QD=44.63;SOR=2.461;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr1	1654065	rs35174499	AGCG	A	4097.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.49;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=34;NR=15;PP=2513;SC=TCACCGAAGAAGCGTTGTTCT;SOR=2.461;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=50;TCF=35;TCR=15;TR=49;WE=1654075;WS=1654048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr1	1657021	rs9439499	T	C	835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=44;PP=1080;SC=CTCGCTCTGTTGCCCAGGCTG;SOR=3.056;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=6;TCR=44;TR=50;WE=1657029;WS=1657011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	1663851	rs2294486	G	C	2360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=0.651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.30;ReadPosRankSum=-1.081;SOR=0.787;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,65:0.50:129
chr1	1663861	rs2294487	G	A	2253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=0.659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.75;ReadPosRankSum=-0.675;SOR=0.796;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,59:0.46:127
chr1	1664019	rs2294488	T	C	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.768;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=7;PP=147;ReadPosRankSum=0.565;SC=GCTGCGTGCGTGGTGCACAGC;SOR=0.283;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=21;TCF=8;TCR=13;TR=13;WE=1664027;WS=1664009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr1	1666175	rs61777509	C	T	581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=9.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.49;MQRankSum=-1.854;QD=8.31;ReadPosRankSum=-0.686;SOR=0.172;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,31:0.44:70
chr1	1666251	rs77655487	G	A	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FS=18.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.50;MQRankSum=-6.424;QD=0.74;ReadPosRankSum=-2.163;SOR=2.257;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:187,28:0.13:215
chr1	1666338	rs2072924	G	A	970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-1.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.492;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-6.922;NF=23;NR=31;PP=700;ReadPosRankSum=2.028;SC=CATCCACCACGAACACCCAGC;SOR=0.543;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=114;TCF=48;TCR=66;TR=54;WE=1666346;WS=1666328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,51:0.43:120
chr1	1669646	.	ACT	A	39	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=51.33;NF=2;NR=0;PP=39;QD=36.0;SC=TGTGGGCACCACTCTGAGTGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=2;WE=1669655;WS=1669636;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,2:0.29:7
chr1	1669748	rs115554296	A	G	1008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;BaseQRankSum=-2.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-7.349;NF=32;NR=14;PP=523;ReadPosRankSum=1.730;SC=GGTGGGGCCCAGGGGGCCTCA;SOR=0.619;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=99;TCF=70;TCR=29;TR=46;WE=1669756;WS=1669738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,53:0.46:115
chr1	1670537	rs199714077	C	T	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=2.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.82;MQRankSum=-1.018;QD=1.66;ReadPosRankSum=0.192;SOR=0.205;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,10:0.17:59
chr1	1670570	rs150051592	T	C	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.005;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.03;MQRankSum=-3.067;QD=8.16;ReadPosRankSum=-1.817;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr1	1684347	rs150880809	C	CCCT	1479.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.840;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-1.558;NF=13;NR=19;PP=1313;ReadPosRankSum=0.426;SC=CTTGACCTAGCCCTCCTCCTC;SOR=0.502;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=84;TCF=28;TCR=56;TR=32;WE=1684357;WS=1684336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,73:0.45:163
chr1	1684472	rs7407	C	T	2921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.404;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=72;PP=1574;ReadPosRankSum=0.985;SC=TGGAGGGGAGCGGGTAGCATG;SOR=0.792;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=262;TCF=119;TCR=143;TR=131;WE=1684480;WS=1684462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,147:0.50:293
chr1	1685213	rs2072928	C	G	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=231;ReadPosRankSum=1.225;SC=GCGGACGGTGCAGTGCACGTC;SOR=2.448;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=11;WE=1685221;WS=1685203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr1	1685921	rs139385870	TCCCTGGGACCGAAGTCGCCCCA	T	1058.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.861;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQ=60.14;MQRankSum=1.175;NF=9;NR=3;PP=2922;ReadPosRankSum=-0.406;SC=AAGGTCCTCATCCCTGGGACC;SOR=1.310;SbPval=0.09;Source=Platypus;TC=48;TCF=23;TCR=25;TR=12;WE=1685950;WS=1685911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,29:0.43:67
chr1	1688192	rs2281173	A	G	914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.683;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=10;PP=606;ReadPosRankSum=-2.385;SC=AAACTTCATCACCAACGCGCC;SOR=1.713;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=96;TCF=66;TCR=30;TR=43;WE=1688200;WS=1688182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,46:0.42:109
chr1	1688384	rs79052177	G	A	1377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.052;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=30;PP=758;ReadPosRankSum=0.038;SC=CGGACTTCCCGGCCTCCAGGG;SOR=1.089;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=75;TCF=28;TCR=47;TR=47;WE=1688392;WS=1688374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,57:0.63:90
chr1	1688469	rs4648623	C	G	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.714;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=99;ReadPosRankSum=-0.637;SC=CCCAGACACCCGGCAGATCCC;SOR=2.636;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=6;WE=1688477;WS=1688459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr1	1690126	rs79655042	A	AAC	160.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.34;MQRankSum=2.043;QD=5.54;ReadPosRankSum=-0.405;SOR=0.315;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,6:0.21:29
chr1	1690793	rs2235538	G	A	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=250;ReadPosRankSum=-0.794;SC=GGTACTGCACGGAGAGGGCAG;SOR=0.874;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=13;WE=1690801;WS=1690783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr1	1696659	rs5021859	A	G	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=178;ReadPosRankSum=0.953;SC=CATCCCTCCCAGTTGTACCTG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=12;WE=1696667;WS=1696649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr1	1823524	rs3806168	G	C	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=265;ReadPosRankSum=0.543;SC=GGCCTTCATCGCCTCCGAGCT;SOR=0.704;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=32;TCF=21;TCR=11;TR=16;WE=1823532;WS=1823514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr1	1823922	rs6688000	A	G	7570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=123;NR=140;PP=2965;SC=ACCTGTCCGCATCATTTCTGG;SOR=0.879;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=263;TCF=123;TCR=140;TR=263;WE=1823930;WS=1823912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,291:1.00:291
chr1	1846582	rs2748987	A	G	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=209;ReadPosRankSum=-1.095;SC=CCTGTACAAGATGGTCAAGCG;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=11;WE=1846590;WS=1846572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
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chr1	1847856	rs2748986	G	T	2143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.900;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=33;PP=1436;ReadPosRankSum=0.710;SC=CTCCTGGTCAGGCCGGTGCGG;SOR=1.027;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=197;TCF=122;TCR=75;TR=94;WE=1847864;WS=1847846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,100:0.48:209
chr1	1848109	rs2803296	G	C	1622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.838;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=25;PP=1033;ReadPosRankSum=0.537;SC=TGGGTCAGGTGTCAGTGCCTA;SOR=0.872;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=168;TCF=90;TCR=78;TR=62;WE=1848117;WS=1848099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,75:0.40:188
chr1	1849529	rs28640257	A	G	873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=22;PP=590;ReadPosRankSum=0.868;SC=AGGAGGAGCCATGGAGTCCAG;SOR=0.718;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=90;TCF=44;TCR=46;TR=42;WE=1849537;WS=1849519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,43:0.45:96
chr1	1850428	rs2295363	A	G	830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.039;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=14;PP=379;ReadPosRankSum=-0.279;SC=CGACCTCGCCACCCGTGCCTC;SOR=0.420;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=60;TCF=29;TCR=31;TR=32;WE=1850436;WS=1850418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,40:0.58:69
chr1	1850627	.	CAGCGGCAGG	C	362.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.394;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=3;PP=1005;ReadPosRankSum=-0.747;SC=CCACCTGCGGCAGCGGCAGGA;SOR=0.627;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=3;WE=1850643;WS=1850617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr1	1853615	rs113294876	T	TCTGA	862.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=2;PP=1019;SC=CCTATTGGAATCTGGCAGAGG;SOR=4.615;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=1853623;WS=1853605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	1854109	rs2803348	A	G	2566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=49;PP=1514;ReadPosRankSum=1.198;SC=AGGGCTCAATAGAGAAACCCT;SOR=0.689;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=235;TCF=129;TCR=106;TR=109;WE=1854117;WS=1854099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,126:0.48:263
chr1	1854321	rs2250833	A	G	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.856;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.808;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=40;ReadPosRankSum=0.210;SC=CCCGGCTGTCAGGACAAGCCC;SOR=1.981;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=4;WE=1854329;WS=1854311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr1	1855450	rs28423370	A	G	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.301;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=266;ReadPosRankSum=1.254;SC=ATAGAGCTCTACACCCTGCCC;SOR=2.833;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=12;WE=1855458;WS=1855440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,12:0.80:15
chr1	1858309	rs941530	T	C	3976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=379;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.679;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=99;NR=80;PP=2256;ReadPosRankSum=1.333;SC=GACCACACCCTGTTCTGGCCA;SOR=0.605;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=348;TCF=196;TCR=152;TR=179;WE=1858317;WS=1858299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:186,192:0.51:378
chr1	1859296	rs2748984	T	C	687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.790;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=22;PP=475;ReadPosRankSum=-1.573;SC=GCAGTTGGGATTGAATGTGGG;SOR=0.103;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=40;TCF=3;TCR=37;TR=25;WE=1859304;WS=1859286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,27:0.60:45
chr1	1860087	rs2748983	C	T	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=312;ReadPosRankSum=0.619;SC=CAGCTCGACACGTGCATTGCT;SOR=1.179;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=17;WE=1860095;WS=1860077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
chr1	1861582	rs2803295	C	T	1900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.498;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=35;PP=1161;ReadPosRankSum=0.581;SC=GACGTGGGCCCCATGGGAGAG;SOR=0.650;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=197;TCF=121;TCR=76;TR=89;WE=1861590;WS=1861572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,96:0.43:224
chr1	1870210	rs2803323	G	A	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.182;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=236;ReadPosRankSum=2.254;SC=GGTCAGGGGCGGGGATGTGGT;SOR=0.257;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=16;WE=1870218;WS=1870200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr1	1871979	rs2748982	G	A	784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=21;PP=413;ReadPosRankSum=-0.985;SC=GAGACGCATCGCGCCGCCCTC;SOR=0.818;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=19;TCR=38;TR=32;WE=1871987;WS=1871969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,37:0.57:65
chr1	1873453	rs2748981	G	A	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.124;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=173;ReadPosRankSum=-0.122;SC=CGGCCTTGGCGTCCTGGCACC;SOR=1.513;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=38;TCF=27;TCR=11;TR=13;WE=1873461;WS=1873443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,13:0.30:43
chr1	1873514	rs2803326	A	G	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.266;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=9;PP=1034;ReadPosRankSum=-1.651;SC=GTGCCTGGATATAGCCTGTCT;SOR=1.259;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=88;TCF=56;TCR=32;TR=33;WE=1873533;WS=1873504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,40:0.40:99
chr1	1873525	rs2803327	T	C	778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.993;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=9;PP=1034;ReadPosRankSum=-0.703;SC=TAGCCTGTCTTGGGCAGGAGC;SOR=1.155;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=89;TCF=54;TCR=35;TR=31;WE=1873533;WS=1873504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,38:0.39:97
chr1	1873697	rs2748980	G	A	981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=4.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.52;ReadPosRankSum=0.527;SOR=0.298;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,26:0.49:53
chr1	1873697	.	GAG	AAC	572	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;FR=0.5000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=7;NR=10;PP=572;QD=36.7922279331;SC=CCAAGCCCCCGAGAGGTGCTC;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=43;TCF=14;TCR=29;TR=17;WE=1873707;WS=1873687;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:26,17:0.40:43
chr1	1873699	rs2748979	G	C	981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=2.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.88;ReadPosRankSum=0.179;SOR=0.324;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,26:0.50:52
chr1	1875858	rs2803336	CA	GG	4846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.489;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=39;PP=2944;ReadPosRankSum=1.368;SC=CAGACCGGCACATCGATGGCC;SOR=0.632;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=211;TCF=134;TCR=77;TR=107;WE=1875867;WS=1875848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,124:0.52:237
chr1	1878628	rs2803341	C	T	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.609;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=150;ReadPosRankSum=1.482;SC=TGGAGCCATCCGTGTGGCCCC;SOR=1.371;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=9;WE=1878636;WS=1878618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr1	1886501	rs2748976	C	A	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.446;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.728;NF=6;NR=0;PP=47;ReadPosRankSum=0.837;SC=ACCGGAAGTGCGGCTCACACC;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=6;WE=1886509;WS=1886491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr1	1886519	rs2748975	C	A	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.723;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-1.076;NF=9;NR=1;PP=103;ReadPosRankSum=0.530;SC=ACCGGAAGTGCGGCTCACACA;SOR=1.112;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=10;WE=1886527;WS=1886509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr1	1887019	rs28548017	A	G	2288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.494;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=49;PP=1363;ReadPosRankSum=1.903;SC=TCGAAGGCCTAGGAAAATTCT;SOR=0.648;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=198;TCF=94;TCR=104;TR=94;WE=1887027;WS=1887009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,107:0.49:219
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chr1	1900186	rs35269416	T	C	1083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=1.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.34;ReadPosRankSum=0.650;SOR=0.857;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,54:0.47:116
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chr1	1903357	rs13303329	G	C	786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.225;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=8;PP=614;ReadPosRankSum=-1.123;SC=AGGAGCAGGGGCCCAGGGACG;SOR=0.473;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=66;TCF=53;TCR=13;TR=36;WE=1903365;WS=1903347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,34:0.52:65
chr1	1905790	rs16824603	A	G	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=184;ReadPosRankSum=0.794;SC=GCTCTGAGTCACCCAGACACT;SOR=1.061;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=10;WE=1905798;WS=1905780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr1	1956362	rs2376805	G	A	8418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=161;NR=125;PP=2965;SC=CTGTCTGACCGGTGGCTTTGC;SOR=0.900;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=286;TCF=161;TCR=125;TR=286;WE=1956370;WS=1956352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,316:1.00:316
chr1	1957037	rs2229110	T	C	11401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=429;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=194;NR=184;PP=2965;ReadPosRankSum=1.398;SC=AGACCCTGGGTCTGGACAGCC;SOR=0.707;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=379;TCF=194;TCR=185;TR=378;WE=1957045;WS=1957027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,427:1.00:429
chr1	1957219	rs3831907	CG	C	718.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.794;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.428;NF=0;NR=20;PP=652;ReadPosRankSum=1.193;SC=AGAGCCTGCCCGGGCCAAGCG;SOR=1.209;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=20;WE=1957227;WS=1957209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,27:0.51:53
chr1	1960926	rs28581504	T	C	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.392;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=3;PP=115;ReadPosRankSum=-0.216;SC=GTCACAGGCATCAAGGCTGGG;SOR=0.141;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=8;WE=1960934;WS=1960916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr1	1982013	rs57743955	C	T	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.86;ReadPosRankSum=0.589;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr1	1987803	rs2803309	G	A	617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=2;PP=433;SC=GAGGTGGCCAGTCTGAGCATC;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=1987811;WS=1987799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	1987993	rs12184	T	C	3338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=61;NR=58;PP=1763;SC=AGTGCAGGGATGAAGGCCTCA;SOR=0.822;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=61;TCR=58;TR=119;WE=1988001;WS=1987983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr1	1991014	rs1878745	A	G	9035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=353;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=172;NR=149;PP=2965;SC=CTGGCCTGCCATGTCCGGGAG;SOR=0.763;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=321;TCF=172;TCR=149;TR=321;WE=1991022;WS=1991004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,352:1.00:352
chr1	1991123	rs1878746	G	A	5275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=104;PP=2965;SC=TGCCGTTTTCGGAGGTTCACC;SOR=1.232;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=176;TCF=72;TCR=104;TR=176;WE=1991139;WS=1991113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr1	1991173	rs2247923	A	G	2174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=52;PP=1472;SC=TGGTGACCGCAGGTGGGGTTT;SOR=2.334;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=18;TCR=52;TR=70;WE=1991181;WS=1991163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr1	2005740	rs2459986	T	C	1074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=28;PP=662;SC=CTGGTGGATGTGTGGCGGTGG;SOR=2.247;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=9;TCR=28;TR=37;WE=2005748;WS=2005730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	2005805	rs28694018	C	G	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.008;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=30;ReadPosRankSum=-0.063;SC=GCTCGTCTGCCTGCCTGGCCC;SOR=0.941;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=4;WE=2005813;WS=2005795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr1	2075560	rs427811	T	G	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.370;SOR=0.479;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr1	2075570	rs377283	T	C	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.11;ReadPosRankSum=1.160;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,11:0.26:42
chr1	2077409	rs385039	A	G	2349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=43;PP=1357;ReadPosRankSum=0.474;SC=CAGAAGCTACATTGTAACACC;SOR=0.672;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=259;TCF=158;TCR=101;TR=111;WE=2077417;WS=2077399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,123:0.43:289
chr1	2082458	rs262670	C	T	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=3.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=303;ReadPosRankSum=-0.689;SC=CCCGGGAACGCGCTGCCCTGG;SOR=1.022;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=16;WE=2082466;WS=2082448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr1	2082489	rs262669	G	A	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=2.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.245;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=202;ReadPosRankSum=0.773;SC=GGGCTTTAGCGGAATTAATCC;SOR=1.942;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=10;WE=2082497;WS=2082479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr1	2106840	rs12135175	T	C	666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=2;NR=23;PP=635;SC=ACCCCAATATTCACCCAACCC;SOR=6.439;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=2106848;WS=2106830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	2113565	rs262688	T	G	3112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.426;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=54;PP=1892;ReadPosRankSum=-0.322;SC=GTTAGTAGAATGGATGTGGGC;SOR=0.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=251;TCF=143;TCR=108;TR=129;WE=2113573;WS=2113555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,144:0.51:282
chr1	2114271	rs74912021	C	T	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=310;ReadPosRankSum=0.406;SC=GGCTAGAGAACGAGCAAGGGA;SOR=1.358;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=16;WE=2114279;WS=2114261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr1	2118539	rs2503699	T	C	780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.421;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=11;PP=420;ReadPosRankSum=-1.060;SC=TGCGTGGGCGTGGTGCGGGGC;SOR=0.416;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=54;TCF=38;TCR=16;TR=33;WE=2118547;WS=2118529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,35:0.60:58
chr1	2118724	.	CTTTT	C	474.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.985;ClippingRankSum=0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=15;HapScore=3;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=1.510;NF=0;NR=15;PP=162;ReadPosRankSum=-0.315;SC=AAGCCATTTTCTTTTTTTTTT;SOR=0.948;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=15;WE=2118735;WS=2118714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr1	2121118	rs2503701	C	T	2311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.173;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=45;PP=1515;ReadPosRankSum=-0.501;SC=GTCCGGGCGCCGCACTCTGCG;SOR=0.827;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=177;TCF=104;TCR=73;TR=108;WE=2121126;WS=2121108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,111:0.60:185
chr1	2126139	rs6662296	C	G	90.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.51;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
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chr1	2337277	rs11586985	C	T	1566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=28;PP=909;SC=ACTCCGCCTGCGGAGAGGAGA;SOR=1.262;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=21;TCR=28;TR=49;WE=2337285;WS=2337267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
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chr1	2399149	rs2494631	A	G	1716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.751;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=22;PP=532;ReadPosRankSum=0.119;SC=TGGTCCCCGTAGGGAGCCCAG;SOR=0.848;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=85;TCF=43;TCR=42;TR=41;WE=2399157;WS=2399139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,47:0.47:101
chr1	2409892	rs12727342	A	G	1132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.666;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=21;PP=621;ReadPosRankSum=0.307;SC=CTCCGCTGACAGCCGTGTCTC;SOR=0.618;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=69;TCR=45;TR=52;WE=2409900;WS=2409882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,58:0.46:126
chr1	2411451	rs10797428	A	G	1704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=37;PP=925;ReadPosRankSum=-0.825;SC=ATGCAGACCCAGGGACCGGCC;SOR=0.711;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=146;TCF=74;TCR=72;TR=74;WE=2411459;WS=2411441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,85:0.51:167
chr1	2418625	rs7512269	C	T	2014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=31;PP=1074;ReadPosRankSum=0.977;SC=TCACCAACTACACCAGGAGCC;SOR=0.697;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=186;TCF=112;TCR=74;TR=83;WE=2418633;WS=2418615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,96:0.47:204
chr1	2418935	rs10910082	C	T	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=20;ReadPosRankSum=0.453;SC=TTCTGTGTCCCTCACTGAGCA;SOR=1.508;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=3;WE=2418943;WS=2418933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr1	2420590	rs10752744	T	C	1192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=4;PP=931;SC=GAGGTGGGGCTTACCCATCCT;SOR=3.855;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=34;WE=2420598;WS=2420580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	2420913	rs6668720	A	G	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=232;ReadPosRankSum=0.172;SC=CATGCCATCCATGGGCATATC;SOR=0.255;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=13;WE=2420921;WS=2420903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr1	2422614	rs2477699	G	A	3243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=34;PP=1804;SC=CAACAGGCCGGCCTCTGGCTC;SOR=1.397;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=67;TCR=34;TR=101;WE=2422622;WS=2422604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr1	2426248	rs41307848	G	C	2415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=48;PP=1287;ReadPosRankSum=2.573;SC=CTCCCTGCCTGGTTCAAGGCT;SOR=0.691;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=257;TCF=148;TCR=109;TR=111;WE=2426256;WS=2426238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,121:0.43:280
chr1	2426766	rs3001347	A	G	634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=4;PP=335;SC=TCGAGAGGGCACCGAGGAGGC;SOR=1.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=22;WE=2426774;WS=2426756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	2428874	rs2477706	T	C	1645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=38;NR=14;PP=903;SC=CGTGTGGTGGTGGGTGGGCGG;SOR=1.460;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=53;TCF=38;TCR=15;TR=52;WE=2428882;WS=2428864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	2430086	rs142848828	G	GGTGGGGGCC	264.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=1;PP=393;ReadPosRankSum=-0.855;SC=ACCGTGGGGAGGTGGGGGCCA;SOR=0.437;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=2;WE=2430094;WS=2430076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr1	2430617	rs2296442	C	T	7521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=138;NR=119;PP=2965;ReadPosRankSum=0.948;SC=ACGATCCCATCGGGCGTGACT;SOR=0.735;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=259;TCF=139;TCR=120;TR=257;WE=2430625;WS=2430607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,290:0.99:292
chr1	2433900	rs12736998	C	T	2930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=38;PP=1798;SC=GTGCGGCCCCCGCGTGTCCTG;SOR=0.941;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=61;TCR=38;TR=99;WE=2433908;WS=2433890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr1	2435738	rs114371513	G	A	1777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.099;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=29;PP=1062;ReadPosRankSum=0.716;SC=GCCCCTGGCCGCTCCCTTTCC;SOR=0.806;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=195;TCF=120;TCR=75;TR=77;WE=2435746;WS=2435728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,87:0.40:215
chr1	2436303	rs79405490	A	C	1677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.819;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=41;PP=862;ReadPosRankSum=0.405;SC=ACCCTGACAGAGCAGCTGCGC;SOR=0.484;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=145;TCF=66;TCR=79;TR=80;WE=2436311;WS=2436293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,85:0.52:162
chr1	2449924	rs116387284	G	A	1091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.565;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=12;PP=653;ReadPosRankSum=0.440;SC=GAGGCCCCACGCTGCTCAGGG;SOR=1.070;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=107;TCF=75;TCR=32;TR=47;WE=2449932;WS=2449914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,53:0.45:119
chr1	2452569	rs2985862	T	C	2177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=17;PP=1462;SC=CGATGAGGTCTTTGAACTTGT;SOR=1.966;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=54;TCR=17;TR=71;WE=2452577;WS=2452559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr1	2487663	rs2227312	C	A	2461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.766;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=50;PP=1384;ReadPosRankSum=-0.698;SC=AGTCAGCGCCCCGGGGAGCAG;SOR=0.524;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=234;TCF=131;TCR=103;TR=108;WE=2487671;WS=2487653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,122:0.48:255
chr1	2487766	rs2227313	T	C	2607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=65;PP=1396;ReadPosRankSum=0.069;SC=TGGACTGGAATGGTGCAGGGG;SOR=0.671;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=281;TCF=146;TCR=135;TR=130;WE=2487774;WS=2487756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,135:0.46:294
chr1	2488153	rs4870	A	G	816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.136;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=22;PP=525;ReadPosRankSum=-1.167;SC=TCCACCCCCAAAACCGACGTC;SOR=1.414;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=51;TCF=17;TCR=34;TR=30;WE=2488161;WS=2488143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,34:0.58:59
chr1	2490898	rs2257763	C	A	2386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.464;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=51;PP=1503;ReadPosRankSum=-0.906;SC=AACCCGTTTGCGGGGTGGGTG;SOR=0.699;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=231;TCF=121;TCR=110;TR=107;WE=2490906;WS=2490888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,116:0.47:248
chr1	2490942	rs2281852	C	A	2736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=56;PP=1785;ReadPosRankSum=-0.961;SC=GACCTGCCTGCGGGACCCTGC;SOR=0.672;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=227;TCF=119;TCR=108;TR=117;WE=2490950;WS=2490932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,127:0.52:243
chr1	2491205	rs2234161	C	T	1907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.467;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=32;PP=1193;ReadPosRankSum=0.382;SC=TGTCCTGGCCCGTGGATGGTG;SOR=0.887;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=178;TCF=104;TCR=74;TR=81;WE=2491213;WS=2491195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,89:0.45:197
chr1	2494330	rs2234167	G	A	2615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=363;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.079;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=66;PP=1328;ReadPosRankSum=1.066;SC=GATCGTCTCCGTCCAGGTATT;SOR=0.905;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=325;TCF=157;TCR=168;TR=126;WE=2494338;WS=2494320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:219,144:0.40:363
chr1	2494785	rs8725	G	A	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-0.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.316;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=238;ReadPosRankSum=-0.378;SC=CCACCTGGCGGAACCACCGGA;SOR=1.721;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=12;WE=2494793;WS=2494775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,12:0.41:29
chr1	2518186	rs10752746	A	G	108.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=4;NR=0;PP=40;SC=CGGCGGCAGCAAGAAAGGCGG;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=2518194;WS=2518176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	2527678	rs2260976	A	G	1173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=30;PP=875;SC=TGGGCCTCTCAGGTGAGGTGT;SOR=2.774;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=37;WE=2527686;WS=2527668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	2528133	rs2843401	T	C	7596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=119;NR=139;PP=2965;SC=CAGCGCCTGGTGGGGCCACCC;SOR=0.965;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=258;TCF=119;TCR=139;TR=258;WE=2528141;WS=2528123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,296:1.00:296
chr1	2530341	rs34705971	A	AG	783.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=521;SC=ATAAGAGAGAAGTGCAGGTAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=12;WE=2530349;WS=2530331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	2560735	rs4648657	A	G	1502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.36;SOR=1.140;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	2560882	rs4648658	G	A	3391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=35;NR=41;PP=1274;SC=CTGCACGGCCGGCGCTCTCCA;SOR=1.090;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=35;TCR=41;TR=76;WE=2560890;WS=2560872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr1	2560903	rs4648659	T	G	2862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=27;NR=34;PP=1141;SC=CCATCCCCACTGGGCCTTCGG;SOR=1.263;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=27;TCR=34;TR=61;WE=2560911;WS=2560893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr1	2573199	rs4648662	A	G	4313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=66;PP=2579;SC=AACTCCTGCAACTCGGCCAGG;SOR=0.744;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=74;TCR=66;TR=140;WE=2573207;WS=2573189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr1	2938265	rs4576609	C	T	650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.106;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=7;PP=460;ReadPosRankSum=1.695;SC=TTAATCCGCACGCTTTAGACT;SOR=1.050;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=67;TCF=47;TCR=20;TR=29;WE=2938273;WS=2938255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,31:0.43:72
chr1	2938407	rs4013154	CAGA	C	4107.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.312;NF=25;NR=43;PP=2860;ReadPosRankSum=1.523;SC=AGAGGCCAACCAGAAGAAGTA;SOR=0.719;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=148;TCF=52;TCR=96;TR=68;WE=2938417;WS=2938397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,109:0.49:223
chr1	2938697	rs3795262	T	G	2605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.583;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=58;PP=1663;ReadPosRankSum=-0.479;SC=TCTACGCCTCTGCCTGTGTCA;SOR=0.729;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=211;TCF=109;TCR=102;TR=113;WE=2938705;WS=2938687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,123:0.53:234
chr1	3301721	rs2282198	C	T	913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.306;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=7;PP=609;ReadPosRankSum=0.682;SC=AGCAGATCTCCGAAGACCTGG;SOR=1.486;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=105;TCF=77;TCR=28;TR=39;WE=3301729;WS=3301711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,41:0.38:109
chr1	3310928	rs145881072	C	CCG	344.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=2;PP=63;SC=TCCAGGAGGGCCGCCCAGCCC;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=3310936;WS=3310918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	3311212	rs2493253	C	G	427.10	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=307;ReadPosRankSum=1.778;SC=ACCTGCCCCACGGGCATCAGC;SOR=0.914;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=8;TCR=10;TR=18;WE=3311220;WS=3311202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,18:0.90:20
chr1	3311261	rs6702992	C	T	291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=8;PP=202;SC=TCCACTTGCGCCTGCTACAAT;SOR=1.802;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=3311269;WS=3311251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	3312914	rs871822	T	G	2373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.674;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=60;PP=1478;ReadPosRankSum=-0.833;SC=AGTTCCATAGTGGACCCTCTT;SOR=0.863;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=258;TCF=122;TCR=136;TR=111;WE=3312922;WS=3312904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,119:0.44:270
chr1	3319244	rs78946683	G	A	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-1.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.545;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=310;ReadPosRankSum=-0.776;SC=TGGCCAGCCTGGGTGCAGGCC;SOR=2.494;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=15;WE=3319252;WS=3319234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr1	3328358	rs870124	T	C	9482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=359;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=168;NR=153;PP=2965;SC=ACCTCCCACATCGCTGCTCAA;SOR=0.716;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=322;TCF=168;TCR=154;TR=321;WE=3328366;WS=3328348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,356:1.00:356
chr1	3342804	rs870171	G	T	2896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.001;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=64;PP=1662;ReadPosRankSum=0.351;SC=GAAAACTATCGCGGGCTGGGG;SOR=0.625;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=211;TCF=97;TCR=114;TR=121;WE=3342812;WS=3342794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,135:0.56:240
chr1	3348815	rs76162834	C	T	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=60;ReadPosRankSum=0.760;SC=GCTCTGGTCACGCAAACGCCC;SOR=0.368;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=6;WE=3348823;WS=3348805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr1	3350134	.	T	C	272	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=31;MMLQ=24;MQ=54.12;NF=11;NR=0;PP=272;QD=27.8882920497;SC=CCTGCCTGTCTGGGATGGCCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=3350142;WS=3350124;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	3350425	rs2493270	A	G	1043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.893;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=29;PP=653;ReadPosRankSum=-0.817;SC=ACCAGCCACGAAGGACGGAGG;SOR=0.484;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=93;TCF=25;TCR=68;TR=42;WE=3350433;WS=3350415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,46:0.47:97
chr1	3383593	rs3893316	G	T	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-3.623;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=111;ReadPosRankSum=0.393;SC=CCCAGCCTGGGGCAGTCCCCT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=7;WE=3383601;WS=3383590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr1	3383665	rs7550948	G	A	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.982;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=9;PP=548;ReadPosRankSum=0.127;SC=CTCAGCTGGCGGGTTGCAGGG;SOR=0.527;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=69;TCF=56;TCR=13;TR=37;WE=3383673;WS=3383655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,40:0.51:78
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chr1	3388406	rs72633372	A	G	1590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.759;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=37;PP=772;ReadPosRankSum=-0.137;SC=ACCTGCAGTCACCCATATGAG;SOR=0.843;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=173;TCF=76;TCR=97;TR=68;WE=3388414;WS=3388396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,83:0.40:209
chr1	3389543	rs2245539	T	C	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.111;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.802;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=39;ReadPosRankSum=0.473;SC=GCCACGTCCATGTATGTGTGA;SOR=0.093;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=5;WE=3389551;WS=3389535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr1	3389727	rs2185639	C	T	2663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.903;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=59;PP=1553;ReadPosRankSum=1.044;SC=CGCTGAGAAGCACTTCCACCC;SOR=0.684;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=254;TCF=134;TCR=120;TR=124;WE=3389735;WS=3389717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,136:0.48:283
chr1	3389885	rs2153709	C	T	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.648;HP=3;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;ReadPosRankSum=1.000;SC=AGCCCAGCTTCTGCAGGTCCT;SOR=0.116;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=14;WE=3389893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr1	3390238	rs2493323	T	A	3940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=63;NR=70;PP=2085;SC=GATGGCTTTATTAACCAGGAT;SOR=0.992;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=63;TCR=70;TR=133;WE=3390246;WS=3390228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr1	3394456	rs4638054	T	C	2114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=19;PP=1042;SC=CACTGATCTCTGCCTCCCGGT;SOR=1.409;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=47;TCR=19;TR=66;WE=3394464;WS=3394446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr1	3394640	rs4422946	A	G	4598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=88;PP=2904;SC=TGGACACTGGACCGCTGGCCC;SOR=1.099;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=155;TCF=67;TCR=88;TR=155;WE=3394648;WS=3394630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr1	3394674	rs4534324	T	C	2591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=69;PP=1753;SC=TACAGGGAGTTGGCCCTGAGC;SOR=2.486;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=20;TCR=69;TR=89;WE=3394682;WS=3394664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr1	3395039	rs10797395	G	A	4135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=397;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.361;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=90;PP=2596;ReadPosRankSum=-1.362;SC=ACATCCAGGTGGAGAAGATAG;SOR=0.663;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=365;TCF=191;TCR=174;TR=187;WE=3395047;WS=3395029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:195,202:0.51:397
chr1	3395174	rs61734742	C	A	597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=19;PP=392;ReadPosRankSum=-0.182;SC=CCTCGGACTCCGCGTAAGTGG;SOR=0.703;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=59;TCF=15;TCR=44;TR=26;WE=3395182;WS=3395164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,27:0.44:62
chr1	3395229	rs4553117	T	C	323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=13;PP=285;SC=ATTAGCTCCATGGGGACCGGG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=3395237;WS=3395219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	3395973	rs70938094	ACC	A	1989.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.496;NF=9;NR=16;PP=820;ReadPosRankSum=-0.982;SC=CACCCCCACCACCCCCATCTC;SOR=0.721;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=52;TCF=22;TCR=30;TR=25;WE=3395982;WS=3395963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,53:0.58:91
chr1	3396609	rs881978	C	T	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-3.183;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=93;ReadPosRankSum=-0.645;SC=CGAGGGCTTCCTCAAAGGGAG;SOR=0.175;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=7;WE=3396617;WS=3396599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr1	3397188	rs2487677	T	C	1464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=30;PP=941;SC=ACAGCCTGTCTCCAATCAGCA;SOR=2.078;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=13;TCR=30;TR=43;WE=3397196;WS=3397178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	3407007	rs2821039	G	A	767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=18;PP=529;ReadPosRankSum=-0.553;SC=CTCTGGGCCCGTGAAGTGTCC;SOR=0.651;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=126;TCF=68;TCR=58;TR=40;WE=3407015;WS=3406997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,42:0.32:130
chr1	3407043	rs2794321	G	T	730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.687;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=19;PP=477;ReadPosRankSum=-0.229;SC=AAAGGCCAGGGTCCCCTCTGG;SOR=0.764;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=124;TCF=65;TCR=59;TR=42;WE=3407051;WS=3407033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,44:0.34:131
chr1	3407367	rs2487667	G	A	1099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.124;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=16;PP=559;ReadPosRankSum=0.724;SC=CCAAGGCCCCGGGTGCAGCTG;SOR=0.341;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=91;TCF=62;TCR=29;TR=45;WE=3407375;WS=3407357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,54:0.52:104
chr1	3410223	rs74050550	A	G	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.141;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=7;PP=287;ReadPosRankSum=-0.098;SC=AGAGGCAACAAGAGGGGTTGG;SOR=0.513;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=45;TCF=30;TCR=15;TR=20;WE=3410231;WS=3410213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,21:0.44:48
chr1	3410581	rs61746168	G	A	1825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=47;PP=1182;ReadPosRankSum=0.049;SC=AAGTGGCCGTGGAAGCCGGCA;SOR=0.707;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=180;TCF=81;TCR=99;TR=85;WE=3410589;WS=3410571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,90:0.47:193
chr1	3410644	rs61742508	A	G	931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=27;PP=609;ReadPosRankSum=0.241;SC=TGTTGACACCAGCACAACCCC;SOR=0.769;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=89;TCF=33;TCR=56;TR=43;WE=3410652;WS=3410634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,45:0.45:99
chr1	3411038	rs61730954	G	A	1401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.307;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=36;PP=860;ReadPosRankSum=-1.324;SC=GATGGCAGGCGGCTCCGTAGC;SOR=0.858;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=138;TCF=67;TCR=71;TR=67;WE=3411046;WS=3411028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,70:0.48:147
chr1	3411184	rs78747258	G	A	636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.146;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=10;PP=248;ReadPosRankSum=3.269;SC=CACCCAGCTCGCAGTGCCGCC;SOR=0.518;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=39;TCF=18;TCR=21;TR=21;WE=3411192;WS=3411174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,30:0.64:47
chr1	3411367	rs7516439	T	C	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.587;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=155;ReadPosRankSum=0.460;SC=CCTCTGGGGATATGTCCCCAC;SOR=1.402;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=8;WE=3411375;WS=3411357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr1	3411396	rs77610498	T	C	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.812;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=126;ReadPosRankSum=1.803;SC=AGTCACTCGGTAAATGCTTCC;SOR=0.446;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=6;WE=3411404;WS=3411386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr1	3411413	rs2821038	C	T	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=89;ReadPosRankSum=0.967;SC=TTCCTGAGGCCCATCAGTGCC;SOR=0.527;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=5;WE=3411421;WS=3411403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr1	3412605	.	C	T	1024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=0.000;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.239;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=24;PP=586;ReadPosRankSum=0.533;SC=AAGTGGTGATCGTGGCTGGCT;SOR=0.900;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=117;TCF=61;TCR=56;TR=48;WE=3412613;WS=3412595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,54:0.42:129
chr1	3413153	rs2821033	G	A	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=11;PP=333;ReadPosRankSum=-1.308;SC=TCCTCCTGCAGGCTGGCTGGC;SOR=0.737;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=60;TCF=36;TCR=24;TR=26;WE=3413161;WS=3413143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,28:0.40:70
chr1	3413426	rs12405358	A	G	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.748;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=127;ReadPosRankSum=2.202;SC=GGCAGCTCTCATGAGACCCCC;SOR=0.387;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=12;WE=3413434;WS=3413416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr1	3417131	rs2821031	A	G	1119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.230;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=21;PP=518;ReadPosRankSum=-0.340;SC=GTGTGTGTGCACGTGTGCATA;SOR=0.840;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=160;TCF=90;TCR=70;TR=54;WE=3417139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,62:0.35:179
chr1	3418565	rs2821030	T	C	1769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=24;NR=48;PP=1099;SC=GGGCTCCTGGTGAGTGTGCCC;SOR=1.478;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=24;TCR=48;TR=72;WE=3418573;WS=3418555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	3418613	.	CCG	C	863	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.61;FR=0.5000;HP=6;HapScore=2;MGOF=39;MMLQ=17;MQ=49.2;NF=0;NR=17;PP=863;QD=52.0;SC=GTGTGCCCCCCCGGCGCCTCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=17;WE=3418626;WS=3418602;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,17:0.89:19
chr1	3418616	.	GCG	ACA	322	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.61;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=38;MMLQ=18;MQ=49.31;NF=2;NR=14;PP=322;QD=23.4667421789;SC=TGCCCCCCCGGCGCCTCCTCA;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=16;WE=3418626;WS=3418602;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,16:0.73:22
chr1	3421658	rs2821009	A	T	976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=9;PP=621;SC=GGGCTTAGGCAAAGGGGGCCG;SOR=1.675;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=33;WE=3421666;WS=3421648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	3421897	rs2821008	A	G	1251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FS=2.564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.26;ReadPosRankSum=1.559;SOR=0.806;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:131,69:0.34:200
chr1	3421959	.	G	C	1392	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=11;HapScore=1;MGOF=12;MMLQ=15;MQ=59.92;NF=22;NR=20;PP=1392;QD=33.9707431559;SC=GGCGCCCCCCGCCCCCAGACC;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=149;TCF=73;TCR=76;TR=42;WE=3421970;WS=3421949;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:107,42:0.28:149
chr1	3422144	rs2105305	G	C	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.721;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=66;ReadPosRankSum=0.158;SC=ACCGTTGAGGGGGGCTCCCGT;SOR=0.307;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=22;TCF=7;TCR=15;TR=10;WE=3422152;WS=3422134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr1	3422642	rs2247236	A	G	1360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=30;PP=844;ReadPosRankSum=0.647;SC=TGCCACCACCATGGACACTGG;SOR=0.820;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=140;TCF=77;TCR=63;TR=68;WE=3422650;WS=3422632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,71:0.46:154
chr1	3425867	rs2794359	C	A	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-3.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.521;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=134;ReadPosRankSum=0.778;SC=CTCCAGCGACCCCCCGGCGGG;SOR=0.164;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=11;WE=3425875;WS=3425857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr1	3426594	rs2821005	A	G	1574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=35;PP=961;ReadPosRankSum=-1.051;SC=CTGTGCTCCCAGGTGGGGAAC;SOR=0.707;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=62;TCR=63;TR=70;WE=3426602;WS=3426584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,77:0.55:139
chr1	3426693	rs2821004	A	G	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=282;ReadPosRankSum=0.517;SC=TCAACCAGCCAGTAAAACTCA;SOR=0.659;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=31;TCF=10;TCR=21;TR=21;WE=3426701;WS=3426683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,23:0.62:37
chr1	3426717	rs2821003	A	C	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=205;ReadPosRankSum=0.097;SC=TCAGCCACAGAGGCCACTCTG;SOR=1.078;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=15;WE=3426725;WS=3426707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr1	3427298	rs79653272	G	A	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.473;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=113;ReadPosRankSum=-0.800;SC=CCTTAGGGCAGCCCTGCTCCC;SOR=0.211;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=9;WE=3427306;WS=3427288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr1	3427351	rs2821000	A	G	611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=8;PP=321;ReadPosRankSum=-0.512;SC=GCTCACCCTCACAGCCGCAGC;SOR=0.809;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=59;TCF=42;TCR=17;TR=29;WE=3427359;WS=3427341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,32:0.48:67
chr1	3427485	rs2794360	G	A	2310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.398;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=56;PP=1547;ReadPosRankSum=0.452;SC=CACACGCCACGGGCCCCCTGG;SOR=0.609;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=271;TCF=142;TCR=129;TR=113;WE=3427493;WS=3427475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:180,120:0.40:300
chr1	3428160	rs2820999	T	G	3413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=68;NR=37;PP=2068;SC=CGCGGGGACATGTGCACAGGG;SOR=1.266;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=106;TCF=69;TCR=37;TR=105;WE=3428168;WS=3428142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr1	3428424	rs4648391	G	T	858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.95;ReadPosRankSum=-1.660;SOR=0.984;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,23:0.56:41
chr1	3428428	rs4648514	C	T	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=1.894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.51;ReadPosRankSum=-1.206;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,21:0.54:39
chr1	3428608	rs11585362	G	A	923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.753;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=14;PP=524;ReadPosRankSum=1.384;SC=CTCATAGCCCGCGTGACACAC;SOR=0.793;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=89;TCF=60;TCR=29;TR=42;WE=3428616;WS=3428598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,47:0.45:104
chr1	3428747	rs2820998	T	C	1748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.867;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=47;PP=901;ReadPosRankSum=1.535;SC=GGCCTTTGCATGGGACCAGTG;SOR=1.095;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=186;TCF=91;TCR=95;TR=85;WE=3428755;WS=3428737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,94:0.46:204
chr1	3440647	rs2794322	T	C	1619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=14;PP=1040;SC=TAGGGATGGCTGAAGCCAGGA;SOR=1.823;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=40;TCR=14;TR=54;WE=3440655;WS=3440637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	3440943	rs12049449	A	C	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=194;ReadPosRankSum=-0.267;SC=TGAGCCCCTCACCCACATCTG;SOR=0.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=12;WE=3440951;WS=3440933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr1	3496328	rs2821051	T	C	517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=5;PP=375;SC=CGACACATCCTCGCCCCTTGC;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=19;WE=3496336;WS=3496318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
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chr1	3518944	rs7521546	T	C	1106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=11;PP=622;SC=GACGGGGTCCTGGCCTCAGCT;SOR=1.501;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=26;TCR=11;TR=37;WE=3518952;WS=3518934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	3527944	rs10797402	C	G	2753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=49;PP=1804;SC=CCCGCGCCCGCTCCGCGGAGC;SOR=1.203;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=82;TCF=33;TCR=49;TR=82;WE=3527952;WS=3527934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr1	3528082	rs10797403	T	C	2479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.38;SOR=1.143;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr1	3545175	rs147637374	GTTCTGGGAGCTCCTCCCCC	G	222.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.61;ReadPosRankSum=-0.518;SOR=1.483;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr1	3548136	rs2760321	T	C	1562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.222;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=34;PP=736;ReadPosRankSum=1.465;SC=CCCACTGAAATGCGCGCACTG;SOR=0.563;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=154;TCF=84;TCR=70;TR=71;WE=3548144;WS=3548126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,80:0.49:164
chr1	3563428	rs76161888	C	T	1648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.588;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=46;PP=1045;ReadPosRankSum=0.172;SC=TTAAACGCAGCGGAGACCCGA;SOR=0.796;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=152;TCF=60;TCR=92;TR=75;WE=3563436;WS=3563418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,80:0.48:168
chr1	3563512	rs34514629	GC	G	529.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=13;PP=597;SC=CTTAAAACCAGCAGAGACCCG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=3563520;WS=3563502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	3566625	rs145464993	AGCAGGCTG	A	1693.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.960;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=22;PP=2966;ReadPosRankSum=1.733;SC=CTGGGCGCGCAGCAGGCTGCA;SOR=0.443;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=47;TCF=1;TCR=46;TR=23;WE=3566640;WS=3566615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,44:0.56:79
chr1	3566706	rs2251098	G	A	361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=11;PP=269;SC=AGCGCCGCCGGCTTCCGCGCG;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=3566714;WS=3566696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	3598900	rs2273953	G	A	3966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FS=0.502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.71;ReadPosRankSum=2.391;SOR=0.731;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,109:0.51:212
chr1	3598910	rs1801173	C	T	3819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FS=0.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.69;ReadPosRankSum=2.810;SOR=0.775;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,100:0.52:194
chr1	3638674	rs1801174	C	T	11931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=452;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=190;NR=233;PP=2965;SC=CCCCAGGCACCGCCATCCGGG;SOR=0.928;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=424;TCF=191;TCR=233;TR=423;WE=3638682;WS=3638664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,452:1.00:452
chr1	3640085	rs6424091	C	G	500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.36;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	3640134	rs35939665	TCTGC	T	187.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=67;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=6;PP=283;SC=AGTTGGCTGATCTGCCTGCCT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=6;WE=3640145;WS=3640124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	3644085	rs10910017	G	A	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=342;ReadPosRankSum=0.632;SC=TGTGGTGACCGAGGGCTCTCA;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=20;WE=3644093;WS=3644075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr1	3644349	rs2181486	A	G	1252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.564;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=36;PP=831;ReadPosRankSum=0.541;SC=GCGGCCGGCCAGGGGAACTGG;SOR=0.859;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=105;TCF=39;TCR=66;TR=55;WE=3644357;WS=3644339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,58:0.51:113
chr1	3644374	rs2146657	A	G	879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.540;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=29;PP=717;ReadPosRankSum=-0.628;SC=GTGTGGGAGGAGAAGGGGACA;SOR=1.112;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=60;TCF=14;TCR=46;TR=36;WE=3644382;WS=3644364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,36:0.57:63
chr1	3644715	rs12046074	C	T	1485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=29;PP=756;ReadPosRankSum=1.507;SC=GCCCCCCTGCCGTCCCCGCCC;SOR=0.654;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=138;TCF=80;TCR=58;TR=67;WE=3644723;WS=3644705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,76:0.48:158
chr1	3644754	rs12048341	T	C	1901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.057;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=41;PP=961;ReadPosRankSum=-0.008;SC=AGCGGCGGCATGGAGACGAGG;SOR=0.598;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=195;TCF=112;TCR=83;TR=92;WE=3644762;WS=3644744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,99:0.46:214
chr1	3644805	rs2236366	A	G	1419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FS=1.819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.63;ReadPosRankSum=0.264;SOR=0.556;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:106,80:0.43:186
chr1	3645804	rs77712545	C	A	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=2.602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.89;ReadPosRankSum=-2.033;SOR=0.138;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr1	3645835	rs2254530	C	A	620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=1.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.34;ReadPosRankSum=0.093;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,25:0.66:38
chr1	3645844	rs2096224	G	A	1838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.78;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	3646137	rs11589885	C	T	1521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.351;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=26;PP=732;ReadPosRankSum=-0.958;SC=GCAGCAGGGTCCAGAGCAGAG;SOR=0.559;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=126;TCF=62;TCR=64;TR=59;WE=3646145;WS=3646127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,69:0.50:137
chr1	3646192	rs1885867	G	A	1993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.457;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=26;PP=770;ReadPosRankSum=0.544;SC=AGCACTTGGGGCTGCCCTGGG;SOR=0.653;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=114;TCF=58;TCR=56;TR=55;WE=3646200;WS=3646182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,58:0.48:120
chr1	3646214	rs1885866	T	C	2085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.670;HP=2;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=27;PP=688;ReadPosRankSum=-0.068;SC=CCCTGGGTCATGGCCCTTGCT;SOR=0.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=110;TCF=54;TCR=56;TR=53;WE=3646222;WS=3646204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,59:0.48:123
chr1	3646291	rs1885865	G	A	1672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.609;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=32;PP=964;ReadPosRankSum=1.726;SC=GGTGGCCAGAGTGACCATGAC;SOR=0.690;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=130;TCF=69;TCR=61;TR=71;WE=3646299;WS=3646281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,80:0.54:148
chr1	3647419	rs41301973	G	A	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=83;ReadPosRankSum=0.150;SC=AGAGGTGTCTGGAGCCTGGGT;SOR=1.179;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=6;WE=3647427;WS=3647409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr1	3647877	rs7517037	T	C	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=46;ReadPosRankSum=0.366;SC=GTCCCCTCCCTGAGGGATGCC;SOR=0.039;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=4;WE=3647885;WS=3647867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
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chr1	3649562	rs9662633	G	A	4095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=460;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.748;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=103;PP=2682;ReadPosRankSum=-1.009;SC=ACGAGTGGGCGGACTTCGGCT;SOR=0.731;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=426;TCF=216;TCR=210;TR=195;WE=3649570;WS=3649552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:251,208:0.45:459
chr1	3649794	rs9659687	A	C	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=295;ReadPosRankSum=-0.146;SC=GGCACCTCACAGGCCCCAGGA;SOR=0.495;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=8;WE=3649813;WS=3649784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr1	3649805	rs9659688	A	G	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.783;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=295;ReadPosRankSum=1.327;SC=GGCCCCAGGAAAGGCCCAGCC;SOR=0.818;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=7;WE=3649813;WS=3649784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr1	3659657	rs2298222	G	A	1576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.578;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=25;PP=1001;ReadPosRankSum=0.048;SC=AGAGGCCGCCGGGAACAGGCA;SOR=0.788;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=161;TCF=104;TCR=57;TR=74;WE=3659665;WS=3659647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,79:0.45:174
chr1	3659742	rs2298223	C	T	3211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=72;PP=1920;ReadPosRankSum=0.998;SC=ACTGGAAAACCGGATCAAAGT;SOR=0.683;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=323;TCF=165;TCR=158;TR=149;WE=3659750;WS=3659732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,160:0.46:345
chr1	3662845	rs3737589	A	G	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=62;ReadPosRankSum=0.090;SC=GAGTTACCCTACAGACCAGTA;SOR=1.329;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=5;WE=3662853;WS=3662835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr1	3669201	rs10797410	A	G	7183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=381;ExcessHet=3.0103;FS=3.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.95;ReadPosRankSum=-0.692;SOR=0.630;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:187,192:0.51:379
chr1	3669205	rs10910021	C	G	7160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=365;ExcessHet=3.0103;FS=1.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.73;ReadPosRankSum=-0.312;SOR=0.621;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:180,183:0.50:363
chr1	3669500	rs10910022	A	G	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.410;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=298;ReadPosRankSum=0.362;SC=GGGGGATTCCAGGCAGGCAAC;SOR=0.048;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=18;WE=3669508;WS=3669490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr1	3670652	rs149705892	TTGTC	T	2780.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.344;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.426;NF=15;NR=24;PP=1812;ReadPosRankSum=-0.090;SC=GGGGCCTTCCTTGTCTGTCTT;SOR=1.102;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=108;TCF=32;TCR=76;TR=39;WE=3670663;WS=3670630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,77:0.41:188
chr1	3703337	rs2368537	G	C	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.751;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=89;ReadPosRankSum=-0.637;SC=CGGACACGCTGGCCTCAGGAT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=5;WE=3703345;WS=3703330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr1	3743433	rs5772126	T	TG	940.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.897;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=717;ReadPosRankSum=0.251;SC=TTCTACTGGCTGGCAAGGTGG;SOR=1.319;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=1;TCR=47;TR=19;WE=3743441;WS=3743423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,34:0.44:77
chr1	3746583	rs2275828	G	T	4820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.43;SOR=1.241;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr1	3746589	rs2275826	C	G	4648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.13;SOR=1.292;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr1	3747580	rs6424058	C	T	539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=3;PP=434;SC=TGCTGGGCCGCGTGGTGTGTC;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=3747588;WS=3747570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	3747603	rs6413779	T	C	845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=4;PP=578;SC=ACGCGAGGTCTGCTTACCTTC;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=26;WE=3747611;WS=3747593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	3753136	rs2275824	A	T	4557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=99;NR=66;PP=2794;SC=GGCTCCCCTAACATGCCTCCC;SOR=1.108;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=165;TCF=99;TCR=66;TR=165;WE=3753144;WS=3753126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr1	3755675	rs1891941	T	C	14222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=535;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=243;NR=250;PP=2965;SC=TCCCAAGGCGTTCACCAACCT;SOR=0.779;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=493;TCF=243;TCR=250;TR=493;WE=3755683;WS=3755665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,534:1.00:534
chr1	3756120	rs1539649	A	G	1896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=18;PP=1176;SC=CTAAGTATACATAAAACCTAT;SOR=1.643;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=45;TCR=18;TR=63;WE=3756128;WS=3756110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr1	3759784	rs10797347	A	G	1914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=47;PP=1375;SC=TGGCAAGGGAACCACTGTCCC;SOR=1.897;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=21;TCR=47;TR=68;WE=3759792;WS=3759774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	3761479	rs2275822	C	T	2722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=41;PP=1828;SC=ACCTGGCGTACGTTCCTTCTA;SOR=0.957;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=53;TCR=41;TR=94;WE=3761487;WS=3761469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr1	3761650	rs2275821	A	G	1200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=28;PP=800;SC=GCAAGGTTCAATGATCCTCAT;SOR=1.954;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=39;WE=3761658;WS=3761640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	3775454	rs4376673	C	G	2675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=61;PP=1825;SC=TGGCACTCTCCGAGGTCCTGG;SOR=1.493;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=33;TCR=61;TR=94;WE=3775462;WS=3775444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr1	3782608	rs10909809	C	T	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=175;ReadPosRankSum=1.441;SC=TTCTTTGGAGCCTGAGGTGCC;SOR=0.446;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=20;TCF=7;TCR=13;TR=13;WE=3782616;WS=3782598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr1	3788978	rs370474480	GA	G	45.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.12;ReadPosRankSum=1.886;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,10:0.24:41
chr1	3806643	rs4520357	T	A	2449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.522;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=59;PP=1476;ReadPosRankSum=-0.603;SC=AGGTCCTTAGTGGAGAAGAAA;SOR=0.775;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=190;TCF=78;TCR=112;TR=100;WE=3806651;WS=3806633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,111:0.54:207
chr1	3807122	rs7513321	G	A	1563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=19;PP=1045;ReadPosRankSum=1.896;SC=GGAGGAAGGCGCCGCTCTTAC;SOR=0.644;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=116;TCF=82;TCR=34;TR=64;WE=3807130;WS=3807112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,68:0.53:129
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chr1	3816683	rs113529609	A	G	1880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=33;PP=1099;ReadPosRankSum=0.648;SC=ACAGCAGGTGACCCAGAGTCC;SOR=0.682;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=190;TCF=113;TCR=77;TR=84;WE=3816691;WS=3816673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,97:0.45:216
chr1	3816908	.	CCC	ACA	121	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=17;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=121;QD=58.1559582874;SC=CCCCCCCCCCCCCGTGTTGGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=3;WE=3816918;WS=3816898;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,3:0.33:9
chr1	4772097	.	C	CGCCGCCCCG	2688.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.450;ClippingRankSum=0.000;DP=209;ExcessHet=3.0103;FS=1.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.26;MQRankSum=1.880;QD=21.01;ReadPosRankSum=-0.050;SOR=0.834;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,69:0.54:128
chr1	4772717	rs242056	G	A	4061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.708;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=78;PP=2450;ReadPosRankSum=-0.613;SC=CAGCAACAACGGGGAAGTCAC;SOR=0.746;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=142;TCF=64;TCR=78;TR=141;WE=4772725;WS=4772707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,154:0.99:155
chr1	4829795	rs3950181	C	T	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.139;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=105;ReadPosRankSum=1.425;SC=TTCCCCGCTGCGGATGGGACC;SOR=2.115;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=7;WE=4829803;WS=4829785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr1	4847594	rs11805709	C	T	565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=9;PP=361;ReadPosRankSum=-0.298;SC=GATAAGACATCGCAGTTGTTA;SOR=0.628;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=44;TCF=28;TCR=16;TR=24;WE=4847602;WS=4847584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,25:0.54:46
chr1	4847845	rs4654460	G	A	2715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.447;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=56;PP=1586;ReadPosRankSum=-0.620;SC=CTTGGCCCACGGGGCACGGGC;SOR=0.726;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=239;TCF=121;TCR=118;TR=115;WE=4847853;WS=4847835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,129:0.49:262
chr1	5623965	rs9439613	C	T	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=189;ReadPosRankSum=-1.118;SC=TATGTGGCTCCAGCCCCAGGT;SOR=0.622;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=12;WE=5623973;WS=5623955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr1	5922834	rs12133533	C	A	2355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=46;PP=1354;ReadPosRankSum=-0.731;SC=GCCTCTGACACTGCGCCAGCA;SOR=0.711;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=175;TCF=96;TCR=79;TR=101;WE=5922842;WS=5922824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,111:0.57:195
chr1	5925040	rs11121682	G	A	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=131;ReadPosRankSum=0.065;SC=CAGCGTCTGCGCGCTGGAGGC;SOR=0.892;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=9;WE=5925048;WS=5925030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr1	5925371	rs1287634	G	A	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=55;ReadPosRankSum=1.913;SC=TTGTCCCGGAGGACTCAGCAC;SOR=0.382;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=5;WE=5925379;WS=5925361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr1	5926507	rs555164	T	C	3055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.928;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=71;PP=1972;ReadPosRankSum=-0.225;SC=TGTCCCGTGGTTCCCCGGGGC;SOR=0.774;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=252;TCF=118;TCR=134;TR=133;WE=5926515;WS=5926497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,145:0.53:273
chr1	5927031	rs12122135	A	G	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.608;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=194;ReadPosRankSum=0.953;SC=GGGGAAGCCGACAGGGGCGCA;SOR=1.371;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=15;WE=5927039;WS=5927021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr1	5927738	rs2297791	G	A	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.793;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=140;ReadPosRankSum=1.834;SC=ACCCTCAAGAGGTATCTACTT;SOR=1.552;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=8;WE=5927746;WS=5927734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr1	5934490	rs868163	A	G	6062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=122;NR=93;PP=2965;SC=TCCCACCGTCATCAGCCAAAT;SOR=0.916;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=216;TCF=123;TCR=93;TR=215;WE=5934498;WS=5934480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr1	5934837	rs1287638	C	T	885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=2;PP=638;SC=CAAATCGCCCCGGCTCTCGGG;SOR=3.334;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=27;WE=5934845;WS=5934827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	5935162	rs1287637	A	T	3012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=52;PP=1701;SC=CTGCTGCGCCAGCAGACAAGA;SOR=0.995;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=44;TCR=52;TR=96;WE=5935170;WS=5935152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr1	5935222	rs963030	T	C	1298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=26;PP=868;SC=CAAGGGGCTATTGCTGGCTGC;SOR=1.559;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=14;TCR=26;TR=40;WE=5935230;WS=5935212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	5937327	rs3747990	C	T	2401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=57;PP=1450;ReadPosRankSum=1.257;SC=TGTCCACGTCCGCCAGCTTCT;SOR=0.707;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=260;TCF=127;TCR=133;TR=111;WE=5937335;WS=5937317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,121:0.43:279
chr1	5937391	rs3747989	C	T	5513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=106;PP=2965;SC=GTCAGGTAGACGTGCAGTGTC;SOR=1.036;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=190;TCF=84;TCR=106;TR=190;WE=5937399;WS=5937381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr1	5939544	rs11121915	T	G	7849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=149;NR=108;PP=2965;SC=CAACATAGGGTACTTCAACTT;SOR=0.962;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=257;TCF=149;TCR=108;TR=257;WE=5939552;WS=5939534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,291:1.00:291
chr1	5947308	rs41280814	G	A	1141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.448;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=10;PP=695;ReadPosRankSum=0.476;SC=GGGGTTGGGCGGCCGCTGGAG;SOR=0.281;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=76;TCF=61;TCR=15;TR=42;WE=5947316;WS=5947298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,48:0.59:82
chr1	5948677	rs2282281	G	A	8233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=152;NR=128;PP=2965;SC=TCTCCTTTAGGGAACAGCCAA;SOR=0.779;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=280;TCF=152;TCR=128;TR=280;WE=5948685;WS=5948667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,313:1.00:313
chr1	5964991	rs3737234	T	C	1312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=39;PP=944;SC=GAGGCTGCCGTGGTCACCAAT;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=9;TCR=39;TR=48;WE=5964999;WS=5964981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	5965381	rs12120967	C	T	3274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.052;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=56;PP=1840;ReadPosRankSum=-1.046;SC=GTAGCACCATCTCGTTGCTTT;SOR=0.866;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=280;TCF=162;TCR=118;TR=140;WE=5965389;WS=5965371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,158:0.51:311
chr1	5987696	rs7520105	T	C	2707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.390;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=63;PP=1430;ReadPosRankSum=0.576;SC=GTCAGCTCTCTGGAAACACTT;SOR=0.600;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=272;TCF=135;TCR=137;TR=129;WE=5987704;WS=5987686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,139:0.47:294
chr1	6027167	rs875574	C	A	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=1;PP=31;ReadPosRankSum=-0.385;SC=TCCCTCAGGGCTGGTGTGTTT;SOR=0.132;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=3;WE=6027175;WS=6027157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr1	6027252	rs875573	A	G	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.044;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=10;PP=239;ReadPosRankSum=-1.821;SC=TTAGCTAAGCAGATAGCAGTT;SOR=0.359;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=40;TCF=25;TCR=15;TR=22;WE=6027260;WS=6027242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,27:0.56:48
chr1	6038583	rs4908639	G	C	993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=24;PP=720;SC=ATATCAGCACGCTGGTTTCCT;SOR=3.477;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=28;WE=6038591;WS=6038573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	6145365	rs2294936	A	G	1088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=28;PP=871;SC=GAACTATCCCAGGGTCAGCCT;SOR=2.899;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=34;WE=6145373;WS=6145355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	6150637	rs12081978	C	T	815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=20;PP=586;SC=GCTGGGCACCCGGGTGAGCCG;SOR=2.468;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=26;WE=6150645;WS=6150627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	6155332	rs1555144	T	C	574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=16;NR=1;PP=450;SC=CCCGGCAGCCTCCCGCCTGCT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=6155340;WS=6155322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	6156306	rs116536189	G	A	303.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5565;FS=4.027;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=146;ReadPosRankSum=-1.118;SC=CCTCTGGGGGGGATGGCCAGG;SOR=2.670;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=9;WE=6156314;WS=6156296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,12:0.86:14
chr1	6157282	rs749434	C	T	1166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=5;PP=801;SC=CCATCAGGGGCCCCTGTGGTG;SOR=2.726;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=35;WE=6157290;WS=6157272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	6157434	rs2311802	C	T	7685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=149;NR=102;PP=2965;SC=GTGAGAGGCCCTGCTGGGCAG;SOR=1.016;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=251;TCF=149;TCR=102;TR=251;WE=6157442;WS=6157424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,282:1.00:282
chr1	6158562	rs2229002	A	G	9479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=364;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=174;NR=154;PP=2965;SC=CGAAACTGTCATCTTCCATTA;SOR=0.809;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=328;TCF=174;TCR=154;TR=328;WE=6158570;WS=6158552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,364:1.00:364
chr1	6162054	rs6696489	T	C	1647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=44;PP=1258;SC=CTGGCGCGCCTTGCACCCAGC;SOR=3.570;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=5;TCR=44;TR=49;WE=6162062;WS=6162044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	6186961	rs2746060	A	G	607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=15;PP=460;SC=TGATCACCCCAGCCCTAGCTA;SOR=1.828;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=21;WE=6186969;WS=6186951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	6195269	rs114398792	C	T	2269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.589;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=32;PP=1316;ReadPosRankSum=1.409;SC=CAGGCTGCTCCGGGGTCAGCC;SOR=0.798;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=154;TCF=99;TCR=55;TR=94;WE=6195277;WS=6195259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,102:0.60:171
chr1	6239937	rs70981314	C	CG	2638.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=10;PP=1355;SC=GCCCGCGCTCCGCCCTGGGCC;SOR=1.745;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=34;TCF=22;TCR=12;TR=32;WE=6239945;WS=6239927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr1	6257826	rs2294714	T	C	1249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.101;HP=5;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=19;PP=812;ReadPosRankSum=0.637;SC=TCTAAGAAAATACACAAATGA;SOR=0.916;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=137;TCF=86;TCR=51;TR=57;WE=6257834;WS=6257816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,64:0.43:150
chr1	6257856	rs2294713	G	A	4113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=57;PP=2324;SC=TGAAGTTTCAGTCAGTCGGAA;SOR=0.830;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=83;TCR=57;TR=140;WE=6257864;WS=6257846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr1	6305292	rs61760836	C	A	1836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=25;PP=1062;ReadPosRankSum=-0.715;SC=CCCCCTGGTGCCCGAGAGCGC;SOR=0.223;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=58;TCF=33;TCR=25;TR=57;WE=6305311;WS=6305282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,66:0.99:67
chr1	6305303	rs61760837	C	A	2055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=29;PP=1219;SC=CCGAGAGCGCCGCCGGCAGCA;SOR=0.720;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=65;TCF=36;TCR=29;TR=65;WE=6305311;WS=6305282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr1	6309319	rs1883608	C	G	656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.27;SOR=0.770;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	6313938	rs12735670	C	T	2996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=43;PP=1744;SC=GAAGGCGCGGCGGTCGGCCTG;SOR=0.730;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=48;TCR=43;TR=91;WE=6313946;WS=6313928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr1	6314349	rs6696630	A	G	340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=9;PP=253;SC=CCAGTGTGGCAGGGCCTTGTT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=6314357;WS=6314339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	6314479	rs12740426	C	T	1189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=5;PP=873;SC=ACAGCAGCCCCTCCTGAGCCT;SOR=3.202;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=33;TCR=5;TR=38;WE=6314487;WS=6314469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	6314822	rs11590458	T	C	5315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=94;NR=93;PP=2801;SC=TGGCCGCGAGTGTACACAGCA;SOR=0.817;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=187;TCF=94;TCR=93;TR=187;WE=6314830;WS=6314812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr1	6393445	rs2235693	A	G	1164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.731;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=15;PP=765;ReadPosRankSum=-1.267;SC=TGCTCCCTTGAGACCCTTAGC;SOR=0.587;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=116;TCF=84;TCR=32;TR=52;WE=6393453;WS=6393435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,55:0.45:121
chr1	6399711	rs2235692	A	G	709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=23;PP=490;ReadPosRankSum=0.768;SC=AGCCCCACCCAGGACATGCCC;SOR=0.678;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=70;TCF=22;TCR=48;TR=33;WE=6399719;WS=6399701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,34:0.45:75
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chr1	6479040	rs2235687	G	A	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.987;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=2;PP=83;ReadPosRankSum=0.239;SC=GGGGCAGACGGGCCACTGGAA;SOR=1.329;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=5;WE=6479048;WS=6479030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr1	6490016	rs12075883	G	A	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=2.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.15;MQRankSum=0.417;QD=6.15;ReadPosRankSum=-1.304;SOR=0.436;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,22:0.37:60
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chr1	6501044	rs2311045	C	G	1231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.41;ReadPosRankSum=3.366;SOR=0.658;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,63:0.58:108
chr1	6504823	rs6664393	G	A	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.393;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=181;ReadPosRankSum=1.152;SC=GCCTTGGGCCGCCCTGCCACA;SOR=0.446;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=27;TCF=11;TCR=16;TR=14;WE=6504831;WS=6504813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr1	6505671	rs11121879	G	A	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=3.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.35;ReadPosRankSum=1.159;SOR=0.339;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,28:0.52:54
chr1	6524862	rs77093528	G	A	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.886;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=22;ReadPosRankSum=0.481;SC=ATTATCCCAAGATAATGGAGA;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=3;WE=6524870;WS=6524852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr1	6527711	rs78137382	G	A	1344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.274;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=38;PP=918;ReadPosRankSum=-0.725;SC=TCTTCCCCACGGCACTCCTCA;SOR=1.100;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=122;TCF=50;TCR=72;TR=60;WE=6527719;WS=6527701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,63:0.48:132
chr1	6530965	rs111312565	C	CG	2148.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=31;PP=1671;SC=GGAGTGGGGGCGGGCTCAGGG;SOR=0.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=46;TCF=12;TCR=34;TR=41;WE=6530973;WS=6530955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	6579607	rs1556035	C	T	2084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=48;PP=1425;SC=CTGCCTGGACCTCCAGCCACA;SOR=2.147;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=18;TCR=48;TR=66;WE=6579615;WS=6579597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr1	6585804	rs13513	C	T	552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=0;PP=487;SC=AACACTGTTGCTAATAAGGGC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=6585812;WS=6585794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	6586070	rs7548042	C	T	5346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=98;PP=2965;SC=CACGCTGAAACGGAAACACAG;SOR=1.139;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=170;TCF=72;TCR=98;TR=170;WE=6586078;WS=6586060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr1	6591937	rs932112	T	C	786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=5;PP=620;SC=GAGCGAGGAGTTATGTAGTGG;SOR=2.670;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=26;WE=6591945;WS=6591927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	6601773	rs3761927	T	C	252.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=208;SC=GACCATGAGTTTGGTAGGCGC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=6601781;WS=6601772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	6609559	rs11122091	C	A	775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=1;PP=510;SC=AAGACAACATCCTACATAGTC;SOR=4.255;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=6609567;WS=6609549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	6609851	rs10864622	A	G	4606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=96;PP=2772;SC=AACTATAAACATTAGGAGAGT;SOR=1.489;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=56;TCR=96;TR=152;WE=6609859;WS=6609841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr1	6609896	rs11579888	G	A	2065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=52;PP=1394;SC=TCAGGGGGCCGTACTACATAC;SOR=3.258;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=11;TCR=52;TR=63;WE=6609904;WS=6609886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	6610366	rs2063805	T	C	401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=1;PP=280;SC=GCTGGGATTATAGGCGTGAGC;SOR=2.985;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=6610374;WS=6610364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	6610382	rs2063806	C	T	548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=3;PP=348;SC=TGAGCCACCGCGCCTGGCCCT;SOR=2.531;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=6610390;WS=6610372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	6614391	rs6693391	A	C	1478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=14;PP=790;SC=TCCACGCCGGACGCCTGGGCT;SOR=0.798;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=20;TCR=14;TR=34;WE=6614399;WS=6614381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	6614415	rs6693400	A	G	1369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=11;PP=695;SC=AGTAACCGCCACCGTAGGCGC;SOR=1.085;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=20;TCR=11;TR=31;WE=6614423;WS=6614405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	6614535	rs4908923	G	A	2454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.05;SOR=0.866;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr1	6614653	rs4908924	C	G	432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=10;PP=260;SC=GAGGGGCCTCCGAGCCGCCGG;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=15;WE=6614661;WS=6614643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	6615690	rs925745	A	G	1646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.34;SOR=2.073;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	6615695	rs925744	C	T	1646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.74;SOR=1.949;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	6635231	rs10864628	A	G	6591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=139;NR=76;PP=2965;SC=GGCAGACAAGAAGGCCCCTAG;SOR=1.274;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=216;TCF=140;TCR=76;TR=215;WE=6635239;WS=6635221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr1	6635306	rs34160967	G	A	4834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=478;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.004;NF=114;NR=104;PP=2865;ReadPosRankSum=1.486;SC=AGCTTTCATGGCACACACGAT;SOR=0.710;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=436;TCF=228;TCR=208;TR=218;WE=6635314;WS=6635296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:239,239:0.50:478
chr1	6636461	rs17492553	C	T	4666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=105;NR=52;PP=2909;SC=CTTCATGATACGCGTTTCTTT;SOR=1.375;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=157;TCF=105;TCR=52;TR=157;WE=6636469;WS=6636451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr1	6646959	rs3833475	GCCTGCCTTC	G	3017.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.731;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.932;NF=8;NR=33;PP=2983;ReadPosRankSum=-0.002;SC=CTGTCAGGGAGCCTGCCTTCC;SOR=0.762;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=112;TCF=19;TCR=93;TR=41;WE=6646975;WS=6646949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,81:0.45:180
chr1	6646992	.	GC	G	2066	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=5;HapScore=1;MGOF=57;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=9;NR=31;PP=2066;QD=52.425;SC=CCTTTCCAGTGCCCCCTTATC;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=125;TCF=36;TCR=89;TR=40;WE=6647000;WS=6646982;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:85,40:0.32:125
chr1	6649206	.	C	T	993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.017;ClippingRankSum=0.000;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.851;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=26;PP=569;ReadPosRankSum=-0.236;SC=AGAGCTTCACCGGCCCAGGTG;SOR=0.438;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=83;TCF=31;TCR=52;TR=44;WE=6649214;WS=6649196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,48:0.51:94
chr1	6655444	rs2232463	C	T	1916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=38;PP=1107;ReadPosRankSum=-1.051;SC=ATGAGACCCACCCATCATGGC;SOR=0.685;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=183;TCF=105;TCR=78;TR=89;WE=6655452;WS=6655434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,98:0.48:205
chr1	6679848	rs2072948	C	T	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.400;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=352;ReadPosRankSum=1.349;SC=GAATCTGCCACCTTTGTCTTT;SOR=1.495;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=16;WE=6679856;WS=6679838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
chr1	6681375	rs6695474	C	T	1043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.472;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=19;PP=624;ReadPosRankSum=-1.251;SC=TGGAAGTGTTCTCGTCAGTAG;SOR=0.842;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=112;TCF=65;TCR=47;TR=48;WE=6681383;WS=6681365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,52:0.43:121
chr1	6681744	rs3747994	C	T	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.163;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=414;ReadPosRankSum=0.470;SC=GAAGCGACCGCGGGCTTTTTT;SOR=0.189;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=43;TCF=4;TCR=39;TR=23;WE=6681752;WS=6681734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
chr1	6685442	rs12746591	A	G	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=5;PP=85;ReadPosRankSum=0.313;SC=CGGGAGGCCCAAAGGCGTGCG;SOR=0.653;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=15;TCF=7;TCR=8;TR=9;WE=6685450;WS=6685432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr1	6694513	rs1043703	GA	TT	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=170;ReadPosRankSum=-0.305;SC=GCTGGGGAGGGAGGCCTGACT;SOR=0.368;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=6;WE=6694522;WS=6694503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr1	6694927	rs2294532	C	T	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=58;ReadPosRankSum=0.489;SC=CTGGTCCTGTCCTCTTGAGCT;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=4;WE=6694935;WS=6694917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr1	6695802	rs6577583	A	G	2248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.129;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=64;PP=1433;ReadPosRankSum=-1.538;SC=GAAGGTGGCCATTCCCATGCA;SOR=0.801;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=190;TCF=69;TCR=121;TR=98;WE=6695810;WS=6695792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,107:0.52:207
chr1	6704635	rs200458	A	G	7556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=140;NR=123;PP=2965;SC=TGAGAGAAACACCCTGTGGAA;SOR=0.707;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=263;TCF=140;TCR=123;TR=263;WE=6704643;WS=6704625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,290:1.00:290
chr1	6705874	rs200454	G	C	2829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.463;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=52;PP=1832;ReadPosRankSum=0.915;SC=GAAGTGGCTGGTTTTAGTGTC;SOR=0.634;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=237;TCF=137;TCR=100;TR=123;WE=6705882;WS=6705864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,133:0.52:254
chr1	6713114	rs2235564	C	T	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=148;ReadPosRankSum=-1.986;SC=AAGGTGCAGACGATTCCTCTG;SOR=0.593;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=10;WE=6713122;WS=6713104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr1	6866978	rs660880	G	A	1330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=7;PP=1001;SC=GTGAACATTGGTTATTGTTAT;SOR=3.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=36;TCR=7;TR=43;WE=6866986;WS=6866968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	7151479	rs72640073	T	C	2548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.904;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=51;PP=1414;ReadPosRankSum=-0.600;SC=CATAAGTGGATTGATTTGCAT;SOR=0.772;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=244;TCF=126;TCR=118;TR=108;WE=7151487;WS=7151469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,129:0.45:285
chr1	7202190	rs970973	T	C	4432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=83;NR=62;PP=2560;SC=TGCCCAGATGTTCCTCTGCAG;SOR=0.819;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=145;TCF=83;TCR=62;TR=145;WE=7202198;WS=7202180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr1	7289777	rs4243824	G	A	695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.986;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=14;PP=345;ReadPosRankSum=-1.372;SC=CACAGAGGGCGGGGGTTGGGC;SOR=0.781;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=58;TCF=33;TCR=25;TR=30;WE=7289785;WS=7289767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,35:0.51:69
chr1	7527996	rs1201529	T	C	1475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=34;PP=843;SC=CTTCTGTCTCTGGTGCTCGGG;SOR=1.919;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=16;TCR=34;TR=50;WE=7528004;WS=7527986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	7595125	rs34371913	G	A	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=192;ReadPosRankSum=-1.250;SC=ACCACAGGCCGCCCGCCCCAC;SOR=0.430;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=13;WE=7595133;WS=7595115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr1	7624855	rs17031140	G	T	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=104;ReadPosRankSum=-0.478;SC=ACAAGCAAAAGGCTGTGAGGA;SOR=0.693;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=11;WE=7624863;WS=7624845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr1	7700352	rs4072987	GG	CA	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=521;ReadPosRankSum=-0.537;SC=CAAGAGAGCCGGGTGTCTGGG;SOR=0.257;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=12;WE=7700361;WS=7700342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr1	7700674	rs12743421	C	T	1006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.313;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=32;PP=698;ReadPosRankSum=1.079;SC=ATCAACCAGGCGGGGCCAGGA;SOR=0.293;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=71;TCF=14;TCR=57;TR=42;WE=7700682;WS=7700664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,43:0.57:76
chr1	7723588	rs3737906	C	T	3689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.057;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=76;PP=2168;ReadPosRankSum=-0.298;SC=AGAAGAGGAACGGCAAGGTGG;SOR=0.423;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=285;TCF=134;TCR=151;TR=156;WE=7723596;WS=7723578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,167:0.56:298
chr1	7723957	rs12128526	G	A	3515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=382;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.372;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=76;PP=2328;ReadPosRankSum=-1.214;SC=CGGGCAGCTCGGAGAGCCTGT;SOR=0.657;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=346;TCF=182;TCR=164;TR=156;WE=7723965;WS=7723947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:213,168:0.44:381
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chr1	7792411	rs2301488	C	T	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=132;ReadPosRankSum=0.451;SC=AAGTTACGGACGGCATTTGGA;SOR=0.527;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=26;TCF=18;TCR=8;TR=12;WE=7792419;WS=7792401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr1	7796641	rs2071985	A	G	993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=30;PP=805;SC=AGCCTCGCACATCCTCGCTCA;SOR=4.112;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=32;WE=7796649;WS=7796631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	7797734	rs1417986	T	A	1114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=31;PP=845;SC=TACATTTCAGTTTTTTTGTTA;SOR=3.500;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=36;WE=7797742;WS=7797724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	7807897	rs12133253	A	G	7036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=107;NR=140;PP=2965;SC=AGGCCACTGAAGATCCTGGTT;SOR=1.024;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=252;TCF=107;TCR=145;TR=247;WE=7807905;WS=7807887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,269:1.00:269
chr1	7807966	rs34083763	GT	G	431.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.59;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	7809728	rs60799863	C	CT	57.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.343;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.81;ReadPosRankSum=-1.616;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr1	7811014	rs1573753	G	A	2917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=23;PP=1995;SC=AGAAGGGCAAGATATTTTGAT;SOR=1.839;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=90;TCF=67;TCR=23;TR=89;WE=7811022;WS=7811004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr1	7811215	rs10779689	A	G	6523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=130;NR=102;PP=2965;SC=GAGCCCGTGCAGCCCCTGTTG;SOR=0.926;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=232;TCF=130;TCR=102;TR=232;WE=7811223;WS=7811205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr1	7812398	rs9919223	A	G	87.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=0;PP=61;SC=CATCTTTAACATATGCTGTTG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=7812406;WS=7812388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	7838113	rs697675	A	C	630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=8;PP=412;ReadPosRankSum=2.101;SC=ATATTATATAATACTCTTCAA;SOR=0.650;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=61;TCF=43;TCR=18;TR=28;WE=7838121;WS=7838103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,30:0.49:61
chr1	7845695	rs228729	T	C	608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.208;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=16;PP=414;ReadPosRankSum=-0.720;SC=CCAGGACTCATACAAGCAGCC;SOR=0.027;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=24;WE=7845703;WS=7845685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,25:0.69:36
chr1	7847362	rs35115980	C	CT	422.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=3;PP=344;SC=TTTAGTATATCTTTTTTAATC;SOR=1.911;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=11;WE=7847370;WS=7847352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	7847614	rs697685	G	A	43.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr1	7861153	rs34433622	C	CT	784.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.962;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=379;ReadPosRankSum=0.261;SC=TTAAATGGGTCTTTGTTTTTT;SOR=0.898;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=14;WE=7861161;WS=7861143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,31:0.49:63
chr1	7861304	rs707465	T	C	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.141;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=68;ReadPosRankSum=-0.630;SC=TAAATATAAATGTGAAGAAGA;SOR=0.205;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=9;WE=7861312;WS=7861294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr1	7861345	rs488728	G	A	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=28;ReadPosRankSum=-0.328;SC=TATACATTATGTAATTGAAAT;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=4;WE=7861353;WS=7861335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr1	7863293	rs228642	C	T	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.187;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=365;ReadPosRankSum=-1.392;SC=CTCATTAGAGCGCAACCTTTA;SOR=1.358;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=40;TCF=9;TCR=31;TR=20;WE=7863301;WS=7863283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr1	7869915	rs228668	G	C	2160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=25;PP=1193;SC=CATTTGAACAGCCAGCAATTC;SOR=1.112;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=47;TCR=25;TR=72;WE=7869923;WS=7869905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr1	7870048	rs228669	T	C	1574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=26;PP=752;SC=GTGAGGCCAGTGGGCACCGTG;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=22;TCR=26;TR=48;WE=7870056;WS=7870038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	7870144	rs228670	A	C	1907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=34;NR=28;PP=1029;SC=CTCGGTTCTGAATGTGGTGAC;SOR=0.721;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=34;TCR=28;TR=62;WE=7870152;WS=7870134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr1	7879627	rs10462018	C	T	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.738;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=121;ReadPosRankSum=1.691;SC=CTAACACATACGCTGAACATT;SOR=0.180;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=8;WE=7879635;WS=7879617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr1	7880469	rs228691	A	G	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.606;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=361;ReadPosRankSum=-0.955;SC=TGGGTCTTTTATGTAAATTTC;SOR=1.127;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=17;WE=7880477;WS=7880459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr1	7887248	rs2859387	G	A	1813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.485;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=39;PP=1299;ReadPosRankSum=0.442;SC=AGAAGCTGCCGGAGCCGCCAG;SOR=0.635;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=204;TCF=115;TCR=89;TR=86;WE=7887256;WS=7887238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,93:0.39:238
chr1	7887493	rs228696	T	C	9898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=373;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=180;NR=166;PP=2965;SC=CTGCATGGGCTGCCCTTGTCC;SOR=0.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=346;TCF=180;TCR=166;TR=346;WE=7887501;WS=7887483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,373:1.00:373
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chr1	7890064	rs12023156	A	G	4410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.491;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.626;NF=104;NR=88;PP=2709;ReadPosRankSum=0.230;SC=CTCTGTCCACAGGATCGCCTC;SOR=0.859;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=303;TCF=160;TCR=143;TR=192;WE=7890072;WS=7890054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,206:0.64:324
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chr1	7913430	rs228648	G	A	2283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.979;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=50;PP=1145;ReadPosRankSum=0.612;SC=GCAAAGAGACGTGGATTTATG;SOR=0.603;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=218;TCF=103;TCR=115;TR=97;WE=7913438;WS=7913420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,117:0.47:247
chr1	7913445	rs13306061	C	T	2535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.025;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=57;PP=1427;ReadPosRankSum=0.555;SC=TTTATGAGTCCGAGCAGAAGT;SOR=0.778;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=195;TCF=94;TCR=101;TR=109;WE=7913453;WS=7913435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,121:0.54:226
chr1	7998963	rs226476	T	G	3281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=69;PP=2154;SC=AAGTTTACAATAAAATAAGAT;SOR=1.309;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=110;TCF=41;TCR=69;TR=110;WE=7998971;WS=7998953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr1	8022772	rs144768319	CAG	C	53.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=7;NR=0;PP=271;SC=TGGGGTATCTCAGGGTTGCAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=7;WE=8022781;WS=8022762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	8029494	rs2641116	T	G	614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.087;HP=5;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=18;PP=337;ReadPosRankSum=-0.539;SC=TATACCTCAATAAAGCTGGGG;SOR=1.432;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=75;TCF=32;TCR=43;TR=29;WE=8029502;WS=8029484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,32:0.44:72
chr1	8029509	rs2640906	GG	AA	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.531;HP=9;HapScore=2;JOINED;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=518;ReadPosRankSum=-1.265;SC=CTGGGGGGGGGGAAAAACTAA;SOR=1.462;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=60;TCF=25;TCR=35;TR=18;WE=8029518;WS=8029499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,21:0.38:55
chr1	8384268	rs6702047	T	C	2345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=28;PP=1406;SC=TTTCGGGGGATGGTGTTTGAC;SOR=1.504;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=55;TCR=28;TR=83;WE=8384276;WS=8384258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr1	8390495	rs1058619	A	G	3698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=58;PP=2554;SC=CCCCGTCCCCACCCGTCCTGC;SOR=0.816;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=129;TCF=71;TCR=58;TR=128;WE=8390503;WS=8390485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr1	8397803	rs7520373	C	T	2314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=18;PP=1306;SC=AACCAGTAGACGCATGTTGGT;SOR=1.582;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=54;TCR=18;TR=72;WE=8397811;WS=8397793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr1	8418644	rs11121172	C	A	6313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.78;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr1	8418650	rs1058766	T	C	6585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.49;SOR=0.903;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr1	8421092	rs2784735	C	T	1153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=26;NR=10;PP=572;SC=GAGGCTGCAGCGGGGGATGTG;SOR=1.179;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=37;TCF=27;TCR=10;TR=36;WE=8421100;WS=8421082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	8421203	rs13596	T	C	1965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=33;PP=995;SC=TGGGAGCCTGTGGCTGGTTAG;SOR=0.892;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=35;TCR=33;TR=68;WE=8421211;WS=8421193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr1	8422676	rs2252865	T	C	3518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=43;PP=1989;SC=TGATCACGAATACCAGCAAAC;SOR=1.153;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=74;TCR=43;TR=117;WE=8422684;WS=8422666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr1	8424984	rs34269918	GA	G	131.86	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=21.98;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=1.872;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,5:0.83:6
chr1	8526142	rs4908760	G	A	1054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=23;PP=624;SC=GGACACAATCGATCCAAGGCA;SOR=2.073;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=9;TCR=23;TR=32;WE=8526150;WS=8526132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	8557320	rs7518608	C	G	402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=0;PP=370;SC=GAGCCAGGGTCCCGATTACAG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=8557328;WS=8557310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	8557691	rs7530745	A	C	1056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=25;PP=707;SC=TTTTACTGAGACTCTTTCCTT;SOR=2.242;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=33;WE=8557699;WS=8557681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	8926285	rs3831913	A	AG	1227.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.030;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=857;ReadPosRankSum=0.072;SC=CCCCCAACAGAGGGAGCTGGC;SOR=0.976;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=44;TCF=27;TCR=17;TR=23;WE=8926293;WS=8926275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,45:0.58:77
chr1	8926752	rs2781065	T	C	217.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=179;SC=GAGACAGGGTTTCACTATACT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=8926760;WS=8926742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	8928125	rs2071412	G	T	1737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.295;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=40;PP=1038;ReadPosRankSum=-0.105;SC=TTCTACGAGGGAGAGGGGAGA;SOR=0.828;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=132;TCF=61;TCR=71;TR=74;WE=8928133;WS=8928115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,83:0.55:151
chr1	8930369	rs2781060	T	C	1216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=9;PP=803;SC=ATGTCATGCATGGATTGTTCT;SOR=2.356;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=32;TCR=9;TR=41;WE=8930377;WS=8930359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	8930385	rs2765511	G	A	1739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=17;PP=1125;SC=GTTCTCGTGCGTGACAGGGAA;SOR=1.685;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=42;TCR=17;TR=59;WE=8930393;WS=8930375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
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chr1	9034421	rs3765964	G	A	2973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.481;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=57;PP=1898;ReadPosRankSum=0.134;SC=GGCCACGGGGGGCATCGTGGG;SOR=0.730;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=214;TCF=113;TCR=101;TR=119;WE=9034429;WS=9034411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,131:0.57:231
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chr1	9034815	rs35753212	C	CAGA	7408.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=55;PP=2924;SC=CTGACCTAGCCAGAAGTGCCT;SOR=1.186;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=76;TCF=8;TCR=68;TR=63;WE=9034823;WS=9034805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr1	9063602	rs4908804	G	C	998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=29;PP=640;ReadPosRankSum=0.203;SC=GAGAAAGACAGGAGGGGGCAG;SOR=0.759;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=19;TCR=51;TR=40;WE=9063610;WS=9063592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,45:0.56:81
chr1	9063646	rs4908805	T	C	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=274;ReadPosRankSum=0.677;SC=GCTGAGCACGTTGGCTCATGC;SOR=0.859;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=14;WE=9063654;WS=9063636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr1	9073801	rs7537425	C	T	717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.875;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=18;PP=375;ReadPosRankSum=-1.062;SC=GTTGGGGACCCTGGGACAGGA;SOR=0.342;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=53;TCF=19;TCR=34;TR=31;WE=9073809;WS=9073791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,35:0.60:58
chr1	9074932	rs1556757	G	A	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=199;ReadPosRankSum=-1.765;SC=TCAGAGCTGCGGAAAGCAGAA;SOR=0.773;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=25;TCF=10;TCR=15;TR=12;WE=9074940;WS=9074922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr1	9165868	rs1705303	A	G	239.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=195;SC=GGTGGAGCCCAGATCCTTCTC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=9165876;WS=9165858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	9305445	rs34603401	A	C	4373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=441;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.449;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=96;PP=2797;ReadPosRankSum=-1.486;SC=GCCTATGAAGACATTGCCCGC;SOR=0.566;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=397;TCF=211;TCR=186;TR=190;WE=9305453;WS=9305421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:233,208:0.47:441
chr1	9323463	rs141143158	C	CTGAGGCAG	441.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.986;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=417;ReadPosRankSum=1.362;SC=AGGGGCTTCCCTGAGGCAGGG;SOR=0.088;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=8;WE=9323471;WS=9323453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,11:0.33:33
chr1	9324213	rs17368528	C	T	2394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.899;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=45;PP=1304;ReadPosRankSum=-0.576;SC=CGAGAGAGCCCGCTGGTCTCC;SOR=0.618;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=206;TCF=114;TCR=92;TR=98;WE=9324221;WS=9324203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,113:0.48:234
chr1	9324571	rs9434742	T	C	2335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.440;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=60;PP=1371;ReadPosRankSum=-0.567;SC=CCCAGATCTATGCCAGGGAGA;SOR=0.903;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=241;TCF=113;TCR=128;TR=110;WE=9324579;WS=9324561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,118:0.46:255
chr1	9324670	rs9434743	A	G	1527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.083;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=36;PP=1053;ReadPosRankSum=0.348;SC=TCCCACAGTCACCCACTGGCC;SOR=0.804;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=196;TCF=108;TCR=88;TR=81;WE=9324678;WS=9324660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,83:0.39:215
chr1	9627521	rs6698575	A	G	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=153;ReadPosRankSum=-0.151;SC=GTCTTTTTCTATGTTGGATTT;SOR=0.392;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=10;WE=9627529;WS=9627511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr1	9639930	.	G	A	1604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.000;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.887;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=28;PP=829;ReadPosRankSum=1.759;SC=AGGAAGACCCGTACCTGTTCT;SOR=0.478;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=132;TCF=79;TCR=53;TR=65;WE=9639938;WS=9639920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,78:0.51:153
chr1	9642329	rs56026893	C	T	1731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.317;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=31;PP=940;ReadPosRankSum=1.223;SC=TAATATGTGGCGTAAAGTAGG;SOR=0.568;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=135;TCF=82;TCR=53;TR=76;WE=9642337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,84:0.57:148
chr1	9655795	rs4073710	G	A	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.298;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=144;ReadPosRankSum=-1.454;SC=TCCTCCTGCTGTTCTGGGGCC;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=10;WE=9655803;WS=9655785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr1	9658465	rs9430181	T	G	1227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.377;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=20;PP=644;ReadPosRankSum=-1.856;SC=AGGCAGCTCATCCACCCCTGC;SOR=0.542;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=80;TCR=46;TR=54;WE=9658473;WS=9658455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,61:0.43:142
chr1	9658707	rs9430182	G	A	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.186;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=276;ReadPosRankSum=0.229;SC=TCCACAGGGCGGGGGTGGGGG;SOR=0.293;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=42;TCF=10;TCR=32;TR=18;WE=9658715;WS=9658697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,18:0.39:46
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chr1	9670483	rs4244632	T	A	1331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=23;PP=852;ReadPosRankSum=1.311;SC=AATAGAAGAATGCCCCCAGAA;SOR=0.698;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=106;TCF=64;TCR=42;TR=59;WE=9670491;WS=9670473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,62:0.55:112
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chr1	9770690	rs112806445	CAG	CAGAG,C	404.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=2.236;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.738;NF=0,0;NR=18,18;PP=81,571;ReadPosRankSum=-1.489;SC=CCTTGGTGCTCAGAGAGAGAG;SOR=1.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=18,18;WE=9770699;WS=9770680;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.63:27
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chr1	9779871	rs9430220	T	C	785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=2;PP=568;SC=GGTTGGGAGATGTTAGCTGGG;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=23;WE=9779879;WS=9779861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
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chr1	10027540	rs2890358	G	A	854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.017;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=27;PP=612;ReadPosRankSum=0.335;SC=AAAGCAAAGCGAGAAATAAAT;SOR=0.534;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=66;TCF=18;TCR=48;TR=37;WE=10027548;WS=10027530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,38:0.54:70
chr1	10032291	rs79685493	G	A	1390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.622;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=34;PP=790;ReadPosRankSum=0.535;SC=AGAACCAGCCGGGTGCAGTGG;SOR=0.951;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=105;TCF=33;TCR=72;TR=49;WE=10032299;WS=10032281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,60:0.50:120
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chr1	10057422	rs112770895	G	C	1801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.199;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=36;PP=972;ReadPosRankSum=-0.544;SC=GCGGCGCGAGGCTCGCCGTGG;SOR=0.587;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=146;TCF=67;TCR=79;TR=69;WE=10057430;WS=10057412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,86:0.50:173
chr1	10161300	rs41280792	A	G	2511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.257;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=56;PP=1479;ReadPosRankSum=-0.723;SC=AAATAAACACATTTCATGTCT;SOR=0.918;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=177;TCF=88;TCR=89;TR=105;WE=10161308;WS=10161290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,117:0.58:200
chr1	10162951	rs72861447	C	T	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.611;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=260;ReadPosRankSum=-0.086;SC=CCTATTGAAACACCTAACTCA;SOR=1.316;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=58;TCF=36;TCR=22;TR=21;WE=10162959;WS=10162941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,25:0.38:65
chr1	10166603	.	C	A	1091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.526;ClippingRankSum=0.000;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=30;PP=720;ReadPosRankSum=0.094;SC=CACCCAGTGCCACGAGCAGAC;SOR=0.705;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=110;TCF=45;TCR=65;TR=51;WE=10166611;WS=10166593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,53:0.46:116
chr1	10167228	rs72861450	G	C	3412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=60;PP=1893;ReadPosRankSum=-0.600;SC=GCTTCTCCCCGTCTTGTTTTT;SOR=0.670;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=309;TCF=179;TCR=130;TR=143;WE=10167236;WS=10167218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:180,164:0.48:344
chr1	10190622	.	G	C	1228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.294;ClippingRankSum=0.000;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.652;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=24;PP=878;ReadPosRankSum=0.139;SC=GAGCTGCAGAGACTCTCTTAC;SOR=0.774;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=126;TCF=76;TCR=50;TR=59;WE=10190630;WS=10190612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,60:0.46:131
chr1	10207195	rs78038419	C	A	843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=20;PP=503;ReadPosRankSum=0.356;SC=TGGCTGGGCTCTGTTGTCTTT;SOR=0.635;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=96;TCF=49;TCR=47;TR=41;WE=10207203;WS=10207185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,45:0.42:107
chr1	10211351	rs41280806	G	A	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=7;PP=592;ReadPosRankSum=1.173;SC=GTTTCTCAGCGGTCTCTTTCT;SOR=0.798;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=75;TCF=56;TCR=19;TR=33;WE=10211359;WS=10211341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,33:0.42:78
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chr1	10218377	rs2273298	A	G	1073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.167;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=10;PP=632;ReadPosRankSum=-0.969;SC=AAGCAAGAAAATACATATCCC;SOR=0.461;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=65;TCF=48;TCR=17;TR=40;WE=10218385;WS=10218367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,46:0.61:75
chr1	10218439	rs2273299	T	C	2295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.128;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=33;PP=1208;ReadPosRankSum=1.827;SC=GAGCCACCAGTGAGTTTTATG;SOR=0.587;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=171;TCF=112;TCR=59;TR=94;WE=10218447;WS=10218429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,108:0.53:202
chr1	10218472	rs114291761	T	C	2983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.012;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=56;PP=1936;ReadPosRankSum=-0.699;SC=TTCGCTATCATATTAGCACCA;SOR=0.570;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=244;TCF=141;TCR=103;TR=126;WE=10218480;WS=10218462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,139:0.50:277
chr1	10221136	rs114631287	G	C	1582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.262;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=19;PP=1110;ReadPosRankSum=0.245;SC=TGTTCCCTGGGATTTGCTGTG;SOR=1.034;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=121;TCF=80;TCR=41;TR=62;WE=10221144;WS=10221126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,68:0.51:134
chr1	10228158	rs56019503	C	A	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.548;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=218;ReadPosRankSum=0.959;SC=ATGACCAGGACCGAGCCTTAC;SOR=0.399;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=52;TCF=37;TCR=15;TR=18;WE=10228166;WS=10228148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,20:0.38:53
chr1	10287866	.	C	CA	847.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.257;ClippingRankSum=0.000;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.761;HP=10;HapScore=3;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=1.152;NF=6;NR=19;PP=257;ReadPosRankSum=-1.031;SC=AACTTCATCTCAAAAAAAAAA;SOR=0.818;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=60;TCF=16;TCR=44;TR=25;WE=10287874;WS=10287856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,43:0.44:98
chr1	10287956	rs115871118	C	T	886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.039;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=22;PP=507;ReadPosRankSum=0.848;SC=AAAGAACTTACCCTCAGCCGG;SOR=1.048;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=61;TCF=25;TCR=36;TR=36;WE=10287964;WS=10287946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,42:0.58:72
chr1	10318543	rs138324955	CTT	C	3015.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=1.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.723;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=2.087;NF=21;NR=23;PP=1589;ReadPosRankSum=-0.651;SC=TCCTTTTACTCTTTACAGCCC;SOR=0.988;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=89;TCF=40;TCR=49;TR=44;WE=10318552;WS=10318533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,80:0.48:165
chr1	10322054	rs4846209	G	A	2607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.207;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=61;PP=1408;ReadPosRankSum=-0.596;SC=AGTTGACACCGTAAGCCCTTG;SOR=0.520;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=261;TCF=122;TCR=139;TR=118;WE=10322062;WS=10322044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,133:0.46:290
chr1	10327407	rs12141246	A	T	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.957;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=324;ReadPosRankSum=0.698;SC=TTTCTTTTTCACTCTAATTCA;SOR=1.270;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=45;TCF=36;TCR=9;TR=20;WE=10327415;WS=10327397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,23:0.47:49
chr1	10327623	rs139613776	T	TA	2020.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.266;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.031;NF=5;NR=27;PP=1187;ReadPosRankSum=0.749;SC=CCAGGTATGGTAGGAAATAGA;SOR=0.554;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=87;TCF=11;TCR=76;TR=32;WE=10327631;WS=10327613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,69:0.43:162
chr1	10334924	rs17396973	C	T	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.26;ReadPosRankSum=-1.238;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr1	10335315	rs6685773	G	A	911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=23;NR=8;PP=653;SC=AAATTACCTTGTTGCGTGAGT;SOR=1.911;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=31;WE=10335323;WS=10335305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	10337959	.	A	G	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=4.259;ClippingRankSum=-0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=165;ReadPosRankSum=-0.567;SC=CACTCAGGATATTTGATTTAG;SOR=2.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=8;WE=10337967;WS=10337949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr1	10342352	rs3748575	C	T	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=195;ReadPosRankSum=-1.312;SC=CCCTACTTTTCCTGCCTTCTC;SOR=0.614;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=37;TCF=27;TCR=10;TR=19;WE=10342360;WS=10342342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,27:0.54:50
chr1	10342629	rs3748576	G	A	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=2.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.62;ReadPosRankSum=1.366;SOR=0.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,17:0.35:48
chr1	10352228	rs76694630	T	C	1766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.832;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=38;PP=1045;ReadPosRankSum=-0.585;SC=CACTTTTTGTTTGTCTTTGTT;SOR=0.997;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=121;TCF=57;TCR=64;TR=67;WE=10352236;WS=10352218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,78:0.52:149
chr1	10354979	rs115417899	G	T	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.88;ReadPosRankSum=-0.180;SOR=0.117;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr1	10363664	rs41274458	G	T	2842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.719;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=53;PP=1808;ReadPosRankSum=1.221;SC=AAGACGTCATGGCCACTGGGA;SOR=0.894;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=279;TCF=155;TCR=124;TR=125;WE=10363672;WS=10363654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,137:0.44:311
chr1	10364057	rs41274462	A	G	2834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.042;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=54;PP=1697;ReadPosRankSum=1.012;SC=AGGAGATAACAAAGCAGCTTC;SOR=0.621;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=236;TCF=131;TCR=105;TR=114;WE=10364065;WS=10364047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,130:0.48:269
chr1	10397049	rs74722876	A	G	579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.791;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=349;ReadPosRankSum=0.783;SC=TATTTGTTGGACAGATAAACA;SOR=1.251;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=44;TCF=33;TCR=11;TR=20;WE=10397057;WS=10397039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,24:0.48:50
chr1	10403482	rs1556916	G	A	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=228;ReadPosRankSum=1.586;SC=CCTCTTGTATGTATCTAGTAG;SOR=0.892;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=14;WE=10403490;WS=10403472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr1	10407953	rs77386448	T	C	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.205;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=17;PP=357;ReadPosRankSum=0.222;SC=AGAGACGGAATTCTTTCTTAT;SOR=0.451;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=67;TCF=21;TCR=46;TR=28;WE=10407961;WS=10407943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,27:0.43:63
chr1	10408850	rs200317444	T	TC	454.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=2.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.67;ReadPosRankSum=2.099;SOR=0.197;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr1	10412648	rs80132035	C	T	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=11;PP=504;ReadPosRankSum=0.503;SC=GTTTTGTTTTCAAATGTGTCC;SOR=0.578;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=47;TCF=34;TCR=13;TR=32;WE=10412656;WS=10412638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,34:0.61:56
chr1	10425117	rs34161257	AT	A	504.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.156;NF=10;NR=11;PP=342;ReadPosRankSum=0.165;SC=TTGGAATTGAATTTTTTTTCT;SOR=0.582;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=42;TCF=22;TCR=20;TR=21;WE=10425125;WS=10425107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,26:0.48:54
chr1	10431407	rs140389867	A	C	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=297;ReadPosRankSum=-1.152;SC=TCTTGACTGAAGGCAGCACCT;SOR=0.801;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=40;TCF=13;TCR=27;TR=23;WE=10431415;WS=10431397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,25:0.56:45
chr1	10435170	rs11121551	T	C	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.075;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=87;ReadPosRankSum=1.131;SC=TTCTGCACTCTCTGTTACGTG;SOR=1.574;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=21;TCF=12;TCR=9;TR=6;WE=10435178;WS=10435167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,7:0.27:26
chr1	10460716	.	AT	A	113.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.523;ClippingRankSum=0.000;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=11.552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.38;MQRankSum=0.000;QD=2.84;ReadPosRankSum=-1.463;SOR=0.030;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,11:0.28:40
chr1	10479635	rs2298570	C	G	4273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=399;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.617;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=84;PP=2597;ReadPosRankSum=0.278;SC=GCTGGCCCCTCGGGGGCGTGC;SOR=0.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=370;TCF=195;TCR=175;TR=177;WE=10479643;WS=10479625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:202,197:0.49:399
chr1	10490285	rs649639	T	C	123.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.56;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=0;PP=53;SC=GTGCTCAGCGTTGTGCCAGGC;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=10490293;WS=10490275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	10490539	rs661256	G	C	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=4;PP=291;ReadPosRankSum=0.180;SC=GCCCCTTCTCGGCCCTCCTGC;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=16;TCR=12;TR=9;WE=10490558;WS=10490529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
chr1	10490550	rs661272	G	C	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=291;ReadPosRankSum=0.089;SC=GCCCTCCTGCGTTTGCCCAGG;SOR=0.719;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=19;TCR=13;TR=12;WE=10490558;WS=10490529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,12:0.36:33
chr1	10490759	rs143754643	TTGGCTTAAC	T	121.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=2;PP=1028;ReadPosRankSum=0.328;SC=TGCGCATGCGTTGGCTTAACT;SOR=0.061;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=2;WE=10490775;WS=10490749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr1	10502307	rs33919161	AT	A	612.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=288;ReadPosRankSum=-0.465;SC=ATAAATACAGATTTTTTTTTT;SOR=0.765;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=38;TCF=25;TCR=13;TR=21;WE=10502315;WS=10502297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,30:0.64:47
chr1	10511544	rs628462	C	T	972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.181;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=28;PP=681;ReadPosRankSum=-0.016;SC=GAGAGGAAGCCCGGGAGGTGG;SOR=1.283;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=100;TCF=46;TCR=54;TR=44;WE=10511552;WS=10511534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,47:0.44:107
chr1	10511589	rs666103	T	C	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=288;ReadPosRankSum=-0.861;SC=CCCAGCAATCTGCGCGCCGGG;SOR=0.608;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=57;TCF=19;TCR=38;TR=23;WE=10511597;WS=10511579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,26:0.39:67
chr1	10529194	rs2781233	T	C	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.433;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=193;ReadPosRankSum=-0.989;SC=ATGGATGCTGTACTGCATAGG;SOR=0.428;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=14;WE=10529202;WS=10529184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,15:0.35:43
chr1	10555257	rs622623	C	T	1851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.653;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=28;PP=1273;ReadPosRankSum=0.450;SC=CGTTTGAGAACGGAACATCTT;SOR=0.940;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=177;TCF=116;TCR=61;TR=85;WE=10555278;WS=10555247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,87:0.46:188
chr1	10596341	rs12375	C	T	1164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.455;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=31;PP=649;ReadPosRankSum=-1.073;SC=GGAGAGCATTCCTAAAGAAGA;SOR=1.098;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=114;TCF=46;TCR=68;TR=49;WE=10596349;WS=10596331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,57:0.46:124
chr1	10596388	rs2480779	A	G	1318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=32;PP=892;SC=AGCACGGCCTACAGGGGGACT;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=10;TCR=32;TR=42;WE=10596396;WS=10596378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	11026381	.	TA	T	109.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=0.000;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=4.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.23;MQRankSum=2.804;QD=1.34;ReadPosRankSum=0.055;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,17:0.21:82
chr1	11036050	rs79323519	T	C	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.123;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=105;ReadPosRankSum=0.483;SC=TGCCGCTTCCTTGTTGGGAGA;SOR=0.141;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=7;WE=11036058;WS=11036040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr1	11042201	rs56848003	C	CAG	688.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.507;NF=0;NR=12;PP=514;ReadPosRankSum=0.577;SC=GTGCAGGTCTCGGGTCACTCA;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=12;WE=11042209;WS=11042191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr1	11079077	rs2273348	A	G	740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=19;PP=488;SC=CCCTTAGTGCATGCTGAATAT;SOR=4.091;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=11079085;WS=11079067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	11080723	rs143130606	T	TG	1884.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=36;PP=1564;SC=CCCAGCACTTTGGAGGCCGAG;SOR=2.917;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=36;WE=11080731;WS=11080713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	11086097	rs3215616	A	AT	3550.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=42;PP=2174;SC=CTTATTTCTAATGCCACTTTT;SOR=1.298;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=50;TCF=6;TCR=44;TR=48;WE=11086105;WS=11086087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr1	11087524	rs1782455	G	A	8152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=130;NR=138;PP=2965;SC=TGTCCAGGGCGGATGCATCAT;SOR=0.821;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=268;TCF=130;TCR=138;TR=268;WE=11087532;WS=11087514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,296:1.00:296
chr1	11087835	rs1782454	T	C	1046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=29;PP=852;SC=GGTGGGTGACTACCTATACAG;SOR=3.611;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=32;WE=11087843;WS=11087825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	11090916	rs12711521	C	A	1739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=37;PP=1098;SC=CTGGGTAGATCATCAGGAGGG;SOR=1.467;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=21;TCR=37;TR=58;WE=11090924;WS=11090906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr1	11095039	rs6695096	C	T	228.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=7;PP=155;SC=GCTCTCACAGCAGTTCCTATT;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=11095047;WS=11095029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	11104845	rs9430347	T	C	961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=24;NR=14;PP=626;SC=CAGAGACACGTGGCAGCAGGT;SOR=1.371;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=24;TCR=14;TR=38;WE=11104853;WS=11104835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	11105106	rs2273345	C	T	2964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=35;PP=1457;SC=GCTGCCCACGCCCCAGAGCAC;SOR=0.720;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=72;TCF=36;TCR=36;TR=71;WE=11105114;WS=11105096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr1	11105122	rs2273344	C	T	3007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=34;PP=1572;SC=AGCACTGGCCCGTCCCACAGT;SOR=0.749;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=36;TCR=34;TR=70;WE=11105130;WS=11105112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	11119899	rs7545802	T	C	5699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=111;PP=2830;SC=CCACCTGCAGTGACAGGGCCT;SOR=1.063;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=199;TCF=88;TCR=111;TR=199;WE=11119907;WS=11119889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr1	11126569	rs2791659	C	A	668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=3;PP=448;SC=TCACCATAACCCCCGGAGCAC;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=11126577;WS=11126559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	11126941	rs6701726	C	T	1314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=10;NR=32;PP=869;SC=GAGAACTCGGCGGCCCACCAG;SOR=2.511;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=10;TCR=32;TR=42;WE=11126949;WS=11126931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	11128001	rs2791657	A	G	1157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=5;PP=811;SC=CCCACGGACCACACCACGCAG;SOR=3.109;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=33;TCR=5;TR=38;WE=11128009;WS=11127991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	11128329	rs2791656	A	G	398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=11;PP=290;SC=GAACAGGAGCACCCCAAAGCA;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=11128337;WS=11128319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	11128654	rs2791655	G	A	3656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=38;PP=2301;SC=GAGGAGGTCAGAAACAGGCGC;SOR=1.628;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=118;TCF=80;TCR=38;TR=118;WE=11128662;WS=11128644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr1	11129848	rs2791653	A	G	919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=25;PP=701;SC=AGGGAACTCCACCGGCCTCAG;SOR=3.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=29;WE=11129856;WS=11129838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	11132217	rs1130683	G	A	3045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=53;NR=51;PP=1695;SC=CCAGCTTCCAGCGGTTGCTGA;SOR=0.800;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=105;TCF=53;TCR=52;TR=104;WE=11132225;WS=11132207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr1	11134157	rs2748876	T	G	2344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=31;PP=1839;SC=TGCTGGTGCCTTGTCAGCGTC;SOR=1.220;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=82;TCF=51;TCR=31;TR=82;WE=11134165;WS=11134147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr1	11137778	rs2259886	C	T	518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=11;PP=310;SC=CAGTCTCCAGCGCTGACTGTA;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=6;TCR=11;TR=17;WE=11137786;WS=11137768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	11141187	rs2258621	C	G	5688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=108;NR=72;PP=2965;SC=GCAGCTGCACCGGCTGCCCGT;SOR=1.005;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=180;TCF=108;TCR=72;TR=180;WE=11141195;WS=11141165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr1	11150945	.	CTGGGCTCCCTTTGAACAAAGGAGGG	C	1395.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=0.881;ClippingRankSum=0.000;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.310;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.159;NF=9;NR=3;PP=2954;ReadPosRankSum=2.763;SC=AATAGCTGAACTGGGCTCCCT;SOR=1.883;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=47;TCF=27;TCR=20;TR=12;WE=11150977;WS=11150935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,38:0.44:87
chr1	11151779	rs1148482	A	G	231.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=7;PP=179;SC=GCAGTGGCGCAATCTTGCCTC;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=11151787;WS=11151769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	11181985	rs41274510	G	A	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.341;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=274;ReadPosRankSum=1.182;SC=CAGCGCTACGGAGATTCCCTG;SOR=1.508;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=14;WE=11181993;WS=11181975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr1	11187893	rs1770344	T	C	884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=22;PP=659;SC=GAGAGAAGCATCAAGAATCAG;SOR=2.546;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=27;WE=11187901;WS=11187883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	11205058	rs1057079	C	T	8649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=146;NR=143;PP=2965;SC=CTCCTGCCATCGCAGTTAATT;SOR=0.738;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=289;TCF=146;TCR=143;TR=289;WE=11205066;WS=11205048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,317:1.00:317
chr1	11288758	rs1064261	G	A	1575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=20;PP=920;ReadPosRankSum=-1.148;SC=CTCGAATGACGTTAAGGAACG;SOR=0.646;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=63;TCR=29;TR=63;WE=11288766;WS=11288748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,70:0.69:101
chr1	11292666	rs10864495	T	A	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.049;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=144;ReadPosRankSum=-0.128;SC=GCACGGTGGCTCATGCCTGTA;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=8;WE=11292674;WS=11292656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr1	11294474	rs718206	T	A	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=23;PP=487;ReadPosRankSum=1.358;SC=AGCAACAGACTTTTCTGCAAC;SOR=1.236;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=41;TCF=4;TCR=37;TR=25;WE=11294482;WS=11294464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,26:0.60:43
chr1	11298790	rs2024627	T	C	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.450;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=80;ReadPosRankSum=1.803;SC=TTCAACTAGATATTGATCAAT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=11298798;WS=11298780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr1	11301714	rs1135172	A	G	2542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=54;PP=1420;ReadPosRankSum=1.398;SC=AGACTGTGGCATCCACCTGCA;SOR=0.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=267;TCF=143;TCR=124;TR=118;WE=11301722;WS=11301704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,132:0.44:298
chr1	11317320	rs2092642	C	T	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.055;NF=6;NR=10;PP=160;ReadPosRankSum=-0.215;SC=CGGCCAGGCACGGTGGCTCAA;SOR=0.622;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=14;TCR=24;TR=16;WE=11317328;WS=11317310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr1	11318763	rs2076657	C	G	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=151;ReadPosRankSum=0.281;SC=TAGTTCAAACCAAAGAAGACA;SOR=0.512;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=8;WE=11318771;WS=11318753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr1	11319587	rs4845988	A	G	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=60;ReadPosRankSum=0.651;SC=CTTGTCAGGCAGGGGATTCTA;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=5;WE=11319595;WS=11319577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr1	11561593	rs2817580	G	A	2347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.284;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=47;PP=1600;ReadPosRankSum=0.821;SC=CTCACTCGGTGGCCCAGGCCC;SOR=0.884;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=202;TCF=105;TCR=97;TR=103;WE=11561601;WS=11561583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,112:0.50:222
chr1	11575375	rs2594318	T	A	1331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=17;PP=769;ReadPosRankSum=-1.046;SC=GTGGGGTTTGTGTCCCATGAG;SOR=0.693;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=78;TCF=53;TCR=25;TR=51;WE=11575383;WS=11575365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,58:0.63:92
chr1	11579470	rs2072994	G	A	2112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.620;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=49;PP=1133;ReadPosRankSum=0.480;SC=CGTGTTTGCCGCTCCCGAGCA;SOR=0.469;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=204;TCF=114;TCR=90;TR=102;WE=11579478;WS=11579460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,110:0.50:218
chr1	11585308	rs61750329	C	T	3719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.704;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=79;PP=2094;ReadPosRankSum=0.387;SC=TCCCTCAATGCCAGCCTGCCT;SOR=0.523;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=290;TCF=136;TCR=154;TR=157;WE=11585316;WS=11585298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,175:0.56:315
chr1	11593793	rs113116961	T	TGCACACACGCAC	2375.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.730;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.698;NF=21;NR=18;PP=1245;ReadPosRankSum=-1.433;SC=CAGACACGCATGCACACACAC;SOR=1.755;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=50;TCF=24;TCR=26;TR=39;WE=11593804;WS=11593783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,64:0.97:66
chr1	11708736	rs1055547	T	C	1606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.680;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=32;PP=884;ReadPosRankSum=-0.893;SC=TGGGGGAGAGTGGAGGCAGGG;SOR=0.908;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=150;TCF=82;TCR=68;TR=76;WE=11708744;WS=11708726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,80:0.48:168
chr1	11709052	rs4397658	C	G	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.99;ReadPosRankSum=1.321;SOR=0.287;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr1	11710561	rs9614	T	G	3408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=378;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.517;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=84;PP=2074;ReadPosRankSum=-0.302;SC=GCGGCGCCGCTTGCTCAGGAA;SOR=0.757;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=349;TCF=176;TCR=173;TR=162;WE=11710569;WS=11710551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:200,177:0.47:377
chr1	11710779	rs148874459	C	CGCG	840.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.415;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=2.177;NF=0;NR=10;PP=420;ReadPosRankSum=-1.374;SC=CGTCCAGGTACGCGGCGGCGG;SOR=1.078;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=4;TCR=31;TR=10;WE=11710787;WS=11710769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,23:0.48:48
chr1	11714368	rs2272983	T	G	2298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=31;NR=45;PP=1379;SC=GGTCCAGGCGTCGGCTACCTG;SOR=1.302;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=31;TCR=45;TR=76;WE=11714376;WS=11714358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr1	11718195	rs3125816	A	G	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.338;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=131;ReadPosRankSum=0.916;SC=TGTGATCTGCAGCGTCCCACA;SOR=1.609;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=9;WE=11718203;WS=11718189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr1	11728894	rs3125818	G	A	2932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.905;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.236;NF=67;NR=63;PP=1882;ReadPosRankSum=0.599;SC=AAGTGCCTGCGAGAGGGCTTC;SOR=0.507;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=264;TCF=143;TCR=121;TR=130;WE=11728902;WS=11728884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,142:0.50:285
chr1	11731927	rs3215521	AG	A	363.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.722;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=142;ReadPosRankSum=0.451;SC=GGCCTGGGTGAGGGGGGGGGC;SOR=1.171;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=13;WE=11731935;WS=11731917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr1	11734049	rs1063301	C	G	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.794;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=335;ReadPosRankSum=2.041;SC=TGTCACATAGCTCTGACGTTT;SOR=2.797;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=15;WE=11734057;WS=11734039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr1	11735262	rs2233027	C	T	863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.095;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=23;PP=480;ReadPosRankSum=1.170;SC=AGGGGGGTGACGGGGCTGGGC;SOR=0.434;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=71;TCF=21;TCR=50;TR=34;WE=11735270;WS=11735242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,38:0.49:78
chr1	11735652	rs2233025	G	A	1726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=28;PP=1019;ReadPosRankSum=1.167;SC=GCCCCTGCCCGCCTGGAACTG;SOR=0.752;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=118;TCF=72;TCR=46;TR=71;WE=11735660;WS=11735642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,79:0.61:130
chr1	11735841	rs2233024	C	A	1597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.919;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=27;PP=860;ReadPosRankSum=-1.600;SC=GTGCCAGCCACTGGGCCCAGC;SOR=0.906;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=131;TCF=74;TCR=57;TR=66;WE=11735849;WS=11735831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,74:0.50:147
chr1	11735877	rs2233022	A	G	1455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.692;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=34;PP=858;ReadPosRankSum=0.053;SC=TTGCTGGCTCAGCAGCACCCC;SOR=0.992;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=142;TCF=76;TCR=66;TR=68;WE=11735885;WS=11735867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,75:0.47:158
chr1	11737051	rs2294638	G	C	5059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=82;NR=95;PP=2965;SC=ACCCCACCCCGACTACACCAC;SOR=0.964;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=177;TCF=82;TCR=95;TR=177;WE=11737059;WS=11737041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr1	11740358	rs7417320	A	G	6440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=130;NR=82;PP=2965;SC=CGACCAAAGAATTTTTAAAAG;SOR=1.099;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=212;TCF=130;TCR=82;TR=212;WE=11740366;WS=11740348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr1	11766424	rs11121804	C	T	785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.906;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=23;PP=518;ReadPosRankSum=-1.397;SC=TGCCCGGAACCTCCCTGAGAA;SOR=0.846;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=73;TCF=26;TCR=47;TR=35;WE=11766432;WS=11766414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,37:0.49:76
chr1	11772303	rs1883574	A	G	1012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.828;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=9;PP=630;ReadPosRankSum=0.846;SC=CATGCTGTAGAGTGGTGGTAT;SOR=1.034;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=91;TCF=64;TCR=27;TR=40;WE=11772311;WS=11772293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,46:0.44:104
chr1	11772526	rs1883573	A	G	1090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.879;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=31;PP=739;ReadPosRankSum=-0.098;SC=CAGGCTGGGTACTGGGAGGGA;SOR=0.573;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=24;TCR=54;TR=45;WE=11772534;WS=11772516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,48:0.55:87
chr1	11779499	rs4846028	T	C	410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=3;PP=323;SC=TTTAAGCTCATTGGGGCTGCC;SOR=2.448;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=11779507;WS=11779494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	11779762	rs12117076	C	T	1981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.505;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=45;PP=1148;ReadPosRankSum=0.618;SC=AGCGGCCCCGCGGGACTGGGG;SOR=0.734;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=188;TCF=92;TCR=96;TR=89;WE=11779770;WS=11779752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,99:0.47:209
chr1	11782781	rs7533583	G	C	958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=15;PP=523;ReadPosRankSum=-0.692;SC=CAGCCACAGAGAGTGTGTAAA;SOR=0.699;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=89;TCF=52;TCR=37;TR=38;WE=11782789;WS=11782771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,47:0.46:102
chr1	11782814	rs7414943	G	A	936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=1.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.86;ReadPosRankSum=1.275;SOR=0.756;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,47:0.49:95
chr1	11782886	rs6540990	C	T	298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.98;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	11796168	rs146190997	CGGGCG	C	232.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=1;PP=195;SC=GTGGCCGCAACGGGCGGGGCG;SOR=2.303;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=3;WE=11796180;WS=11796158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	11804590	rs17875987	T	G	3537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.444;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=61;PP=2116;ReadPosRankSum=1.725;SC=CCCCCCACAGTGCGCCAGCTC;SOR=0.786;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=254;TCF=145;TCR=109;TR=148;WE=11804598;WS=11804580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,163:0.58:281
chr1	11807426	rs12752700	C	T	1711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.511;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=32;PP=1212;ReadPosRankSum=1.377;SC=GGCCCTGAGACGCCGGAGCAG;SOR=1.028;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=161;TCF=91;TCR=70;TR=81;WE=11807434;WS=11807416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,81:0.49:166
chr1	11824242	rs4845876	A	C	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.845;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=220;ReadPosRankSum=1.422;SC=GAGAGGAGCCACTGAGAGACC;SOR=0.239;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=15;WE=11824250;WS=11824232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr1	11824303	rs4845877	T	C	741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=13;PP=426;ReadPosRankSum=-0.545;SC=CAAGAGCAGCTAGGAGTACTG;SOR=0.617;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=69;TCF=43;TCR=26;TR=31;WE=11824311;WS=11824293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,37:0.46:81
chr1	11824346	rs4845878	G	A	1172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=21;PP=739;ReadPosRankSum=-1.693;SC=AGAATGGGGTGGGGTTGAATG;SOR=0.726;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=111;TCF=65;TCR=46;TR=49;WE=11824354;WS=11824336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,54:0.44:123
chr1	11824556	rs4845879	A	G	783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=17;PP=326;ReadPosRankSum=-1.744;SC=CTGGATGGGCAGTTACAGGAG;SOR=0.760;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=65;TCF=26;TCR=39;TR=28;WE=11824564;WS=11824546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,38:0.49:77
chr1	11824575	rs10864536	T	C	882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.05;ReadPosRankSum=-1.658;SOR=0.854;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,26:0.47:55
chr1	11824578	rs11121825	C	T	840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=2.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.82;ReadPosRankSum=-0.840;SOR=1.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,22:0.44:50
chr1	11825851	rs10218813	G	C	1353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.667;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=19;PP=862;ReadPosRankSum=-1.413;SC=GAGGCCTGGAGAGCTTCGCCT;SOR=0.799;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=118;TCF=77;TCR=41;TR=59;WE=11825859;WS=11825841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,65:0.50:131
chr1	11826630	rs6668699	C	T	776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=10;PP=610;ReadPosRankSum=0.468;SC=CCAGGAACCCCCCGGTGCTGT;SOR=0.907;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=30;TCR=15;TR=30;WE=11826638;WS=11826620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,30:0.65:46
chr1	11827180	rs6540995	A	G	3221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=64;NR=41;PP=2089;SC=GGTAGGGGGTAGGAGGTGTTG;SOR=1.129;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=106;TCF=64;TCR=42;TR=105;WE=11827188;WS=11827170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr1	11827304	rs6540996	A	G	6807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=119;NR=116;PP=2965;SC=TCACAGCCCCAGAGTCTGAGG;SOR=0.763;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=235;TCF=119;TCR=116;TR=235;WE=11827312;WS=11827294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,263:1.00:263
chr1	11827355	rs6540997	A	G	1426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=39;PP=977;ReadPosRankSum=-0.327;SC=CAGGGGTTGGAGTTGGGGGAC;SOR=0.690;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=128;TCF=49;TCR=79;TR=63;WE=11827363;WS=11827345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,66:0.47:140
chr1	11828238	rs4845880	G	A	927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=20;PP=557;ReadPosRankSum=0.449;SC=CAGCTGTTGCGAAAGTGCCTT;SOR=0.750;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=126;TCF=69;TCR=57;TR=43;WE=11828246;WS=11828228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,50:0.35:141
chr1	11828319	rs4845881	G	A	1264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.917;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=28;PP=877;ReadPosRankSum=2.279;SC=CTGCTGGTCCGGAGCTTCCGA;SOR=0.661;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=145;TCF=77;TCR=68;TR=61;WE=11828327;WS=11828309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,63:0.41:152
chr1	11831615	rs6667720	C	T	1996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.093;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=45;PP=1256;ReadPosRankSum=1.292;SC=GATTGCTCAGCGGCTTCTGTC;SOR=0.611;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=180;TCF=87;TCR=93;TR=89;WE=11831623;WS=11831605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,95:0.48:199
chr1	11831756	rs6680385	A	G	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=286;ReadPosRankSum=0.757;SC=CCTGAGCTCCACACTGGGCAG;SOR=0.765;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=18;WE=11831764;WS=11831746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr1	11832100	rs11121827	T	A	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.948;NF=16;NR=8;PP=315;ReadPosRankSum=0.718;SC=TCCCATCTGCTTACTCTCTCT;SOR=0.732;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=31;TCR=15;TR=24;WE=11832108;WS=11832090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,24:0.45:53
chr1	11832311	rs10779764	G	C	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=214;ReadPosRankSum=1.705;SC=GAGCTTGGCTGTGCAGGTAGG;SOR=0.990;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=26;TCF=10;TCR=16;TR=15;WE=11832319;WS=11832301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr1	11836441	rs6699669	T	C	4597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.49;SOR=1.430;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr1	11836441	.	TG	CA,CG	854	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=36,72;NR=19,38;PP=854,761;QD=16.4994159066;SC=AAGAGGGGCCTGAGGCAGCAG;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=110;TCF=72;TCR=38;TR=55,110;WE=11836450;WS=11836431;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.50:110
chr1	11836442	rs6659541	G	A	1461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=2.347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.42;ReadPosRankSum=0.658;SOR=0.945;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,66:0.52:128
chr1	11836628	rs6699881	T	C	1861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.723;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=45;PP=1004;ReadPosRankSum=0.614;SC=GGATGCCTGCTGGACACTGGC;SOR=0.623;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=114;TCF=50;TCR=64;TR=80;WE=11836636;WS=11836618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,89:0.70:127
chr1	11836682	rs7538516	C	T	1348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.091;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.531;NF=18;NR=33;PP=842;ReadPosRankSum=1.322;SC=GCTTTTCCAGCGCCAGTGGGC;SOR=0.990;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=68;TCF=25;TCR=43;TR=51;WE=11836690;WS=11836672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,57:0.76:75
chr1	11838848	rs6697244	G	T	1625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.08;ReadPosRankSum=1.977;SOR=0.717;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,83:0.46:179
chr1	11839033	rs55668272	G	T	1351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=30;PP=806;ReadPosRankSum=-0.231;SC=GCCTTCTGTGGGCAGCTGGGC;SOR=0.665;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=123;TCF=61;TCR=62;TR=60;WE=11839041;WS=11839023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,66:0.50:133
chr1	11839923	rs12561919	C	T	772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.175;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=14;PP=334;ReadPosRankSum=-0.793;SC=GGCTTCCCACCGGGCCTGGGA;SOR=0.931;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=52;TCF=29;TCR=23;TR=30;WE=11839931;WS=11839913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,37:0.60:62
chr1	11839966	rs4846043	G	A	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.59;ReadPosRankSum=-0.873;SOR=0.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,23:0.47:49
chr1	11839998	rs4846044	T	C	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.29;ReadPosRankSum=-0.685;SOR=0.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr1	11842144	rs10864542	C	G	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.287;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=319;ReadPosRankSum=0.056;SC=GTGGCCTCCTCTGTTCCCACC;SOR=1.609;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=16;WE=11842152;WS=11842134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
chr1	11844240	.	G	C	1104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=0.000;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.009;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=20;PP=575;ReadPosRankSum=-1.254;SC=GCTACTTCCAGGCCTGGTGTG;SOR=1.002;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=129;TCF=74;TCR=55;TR=51;WE=11844248;WS=11844230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,58:0.39:149
chr1	11844330	rs10864543	C	T	2043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.160;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=40;PP=1241;ReadPosRankSum=0.736;SC=CACTGGGGGCCGTGTTTGCCA;SOR=0.717;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=162;TCF=84;TCR=78;TR=82;WE=11844338;WS=11844320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,93:0.52:179
chr1	11845113	rs11587953	G	A	914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=10;PP=539;SC=GGCTGGGCCCGGAAGGCCCCC;SOR=1.542;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=30;WE=11845121;WS=11845103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	11845169	rs11586659	T	G	971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.23;ReadPosRankSum=-0.694;SOR=0.563;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,49:0.52:95
chr1	11847740	rs35562212	CCT	C	328.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.665;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=229;ReadPosRankSum=1.752;SC=CTGCCCCGCCCCTGTGATTTC;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=6;WE=11847749;WS=11847730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr1	11848139	rs11559040	G	A	1735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.540;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=41;PP=1044;ReadPosRankSum=-1.278;SC=TGGTGGGTCCGAGGGATGGGG;SOR=0.760;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=171;TCF=82;TCR=89;TR=78;WE=11848147;WS=11848129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,86:0.46:186
chr1	11848879	rs2077360	A	G	2154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=32;NR=39;PP=1175;SC=TGCCACAGCCACGCACCGTGG;SOR=1.124;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=32;TCR=39;TR=71;WE=11848887;WS=11848869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr1	11849447	rs868014	A	G	4061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=67;NR=72;PP=2442;SC=GGAAGCCGCCAGAGCACCGCG;SOR=0.923;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=68;TCR=72;TR=139;WE=11849455;WS=11849437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr1	11854457	rs4846051	G	A	12862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=146;NR=126;PP=2965;SC=GGTAAAGAACGAAGACTTCAA;SOR=0.783;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=272;TCF=146;TCR=126;TR=272;WE=11854465;WS=11854447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,299:1.00:299
chr1	11854476	rs1801131	T	G	12672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=138;NR=131;PP=2965;SC=AAAGACACTTTCTTCACTGGT;SOR=0.700;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=269;TCF=138;TCR=131;TR=269;WE=11854484;WS=11854466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,295:1.00:295
chr1	11854671	rs12121543	C	A	837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.423;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=11;PP=554;ReadPosRankSum=-0.084;SC=GGAGGCCATTCCTGTAAATTC;SOR=0.360;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=56;TCF=39;TCR=17;TR=33;WE=11854679;WS=11854661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,37:0.61:61
chr1	11860458	rs2066471	C	T	713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=18;PP=965;ReadPosRankSum=-0.857;SC=TACCTAGCCCCGACACCCAGG;SOR=0.766;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=15;TCR=30;TR=27;WE=11860473;WS=11860448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,31:0.61:51
chr1	11860465	rs13306567	C	G	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=494;ReadPosRankSum=1.105;SC=CCCCGACACCCAGGACTGCGA;SOR=0.542;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=41;TCF=12;TCR=29;TR=16;WE=11860473;WS=11860448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,18:0.39:46
chr1	11866183	rs13306560	C	T	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.189;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=315;ReadPosRankSum=-1.388;SC=CTCGCCCCACCCGTCTGCAGC;SOR=0.314;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=37;TCF=29;TCR=8;TR=21;WE=11866191;WS=11866173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,23:0.59:39
chr1	11866442	rs111334345	G	A	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.657;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=178;ReadPosRankSum=-1.989;SC=GGGAGGGGGCGGTTGCTAAGG;SOR=0.368;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=23;TCF=8;TCR=15;TR=13;WE=11866450;WS=11866432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr1	11867044	rs3737964	T	C	534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.523;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=245;ReadPosRankSum=1.724;SC=CCCTCACCCCTGAAAGGTTTT;SOR=0.402;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=38;TCF=33;TCR=5;TR=19;WE=11867052;WS=11867034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,23:0.53:43
chr1	11879468	rs78366115	C	T	860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.939;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.013;NF=24;NR=12;PP=573;ReadPosRankSum=-0.174;SC=GAGATGCCTTCAAGAGGAGCA;SOR=0.288;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=70;TCF=51;TCR=19;TR=36;WE=11879476;WS=11879458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,39:0.51:77
chr1	11879685	rs198393	C	T	3474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=71;PP=2301;SC=AGAAATGGGTCTAACAGTAAG;SOR=1.571;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=37;TCR=71;TR=108;WE=11879707;WS=11879675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr1	11879699	rs2050265	A	G	1051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.199;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=33;PP=717;ReadPosRankSum=-0.378;SC=CAGTAAGCATAGTATTAGAAG;SOR=1.185;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=90;TCF=27;TCR=63;TR=44;WE=11879707;WS=11879675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,48:0.49:98
chr1	11883731	rs12567136	C	T	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.570;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=8;PP=539;ReadPosRankSum=1.025;SC=CAATGGATTTCGAGTTATGGG;SOR=1.243;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=66;TCF=47;TCR=19;TR=33;WE=11883739;WS=11883721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,37:0.51:72
chr1	11884555	rs198400	A	G	5533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=90;PP=2965;SC=CTCTTCGTGGAGAAGGAAGGC;SOR=0.806;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=184;TCF=94;TCR=90;TR=183;WE=11884563;WS=11884545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr1	11884619	rs41275474	G	A	1155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.345;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=34;PP=754;ReadPosRankSum=-0.108;SC=AGGTAAGATGGGCTGAGAGGG;SOR=1.364;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=105;TCF=44;TCR=61;TR=51;WE=11884627;WS=11884609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,55:0.47:116
chr1	11886383	rs138460149	C	CTG	2073.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.930;NF=1;NR=33;PP=1337;ReadPosRankSum=0.853;SC=GGAAACCCGACTGGGAGAAGG;SOR=0.650;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=83;TCF=1;TCR=82;TR=34;WE=11886391;WS=11886373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,57:0.45:126
chr1	11887125	rs41275476	C	T	1255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.745;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=18;PP=726;ReadPosRankSum=2.553;SC=ATTGGATAACCCGTCTCTCTC;SOR=0.795;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=91;TCF=53;TCR=38;TR=49;WE=11887133;WS=11887115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,56:0.55:102
chr1	11887303	rs7537765	A	G	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.790;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=305;ReadPosRankSum=1.030;SC=CAGTGAAAGCATTAACCACAC;SOR=1.628;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=40;TCF=14;TCR=26;TR=20;WE=11887311;WS=11887293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,21:0.49:43
chr1	11888384	rs198401	A	G	2455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=33;PP=1856;SC=ACTTCCAGGGACACATCTCAC;SOR=0.770;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=74;TCF=41;TCR=33;TR=74;WE=11888392;WS=11888374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr1	11889213	rs41275482	T	G	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.052;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=414;ReadPosRankSum=-0.813;SC=GACCAGAGCTTCTTTCTGTGG;SOR=0.859;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=57;TCF=41;TCR=16;TR=26;WE=11889221;WS=11889203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,28:0.47:59
chr1	11889468	rs535107	A	G	1250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=29;PP=856;SC=ACTAATAGATATGTTGGGTTC;SOR=2.007;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=12;TCR=29;TR=41;WE=11889476;WS=11889458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	11893830	rs74771026	T	A	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.740;NF=8;NR=3;PP=210;ReadPosRankSum=-1.802;SC=TTCTGCCTCCTGTGTTGGAAG;SOR=0.836;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=11;WE=11893838;WS=11893820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr1	11893869	rs76337233	C	T	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.236;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=374;ReadPosRankSum=1.067;SC=TGGTCGGGCCCGGTAGGTCTA;SOR=2.161;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=19;WE=11893877;WS=11893859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr1	11895966	rs41275496	G	C	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=406;ReadPosRankSum=-0.701;SC=AGCACAGCTTGCTCCCAGGGG;SOR=0.749;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=20;WE=11895974;WS=11895956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,21:0.70:30
chr1	11896345	rs198402	T	C	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-2.795;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=50;ReadPosRankSum=0.072;SC=TCTCATCACATGCGACAGGGA;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=5;WE=11896353;WS=11896335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr1	11897271	rs198405	T	C	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.392;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=9;PP=331;ReadPosRankSum=-0.501;SC=GGGGTGAGCCTTTGGCTCAGA;SOR=0.407;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=49;TCF=28;TCR=21;TR=19;WE=11897279;WS=11897261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,21:0.40:52
chr1	11897592	rs198406	A	G	3784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=78;PP=2347;SC=GCCAGGCCAGACCTGACGAAG;SOR=1.478;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=44;TCR=78;TR=122;WE=11897600;WS=11897582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr1	11898849	rs198409	T	G	3587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.851;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.99;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=79;PP=2054;ReadPosRankSum=-0.358;SC=CAACACTAGCTTTGAACCCTG;SOR=0.821;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=281;TCF=136;TCR=145;TR=149;WE=11898857;WS=11898839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,170:0.53:319
chr1	11899033	rs1023252	G	T	2752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.882;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=71;PP=1742;ReadPosRankSum=-1.326;SC=CCTGCGTAGGGATTTGCGCAT;SOR=0.765;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=284;TCF=135;TCR=149;TR=135;WE=11899041;WS=11899023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,139:0.47:298
chr1	11900035	rs198410	G	A	1098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=5;PP=747;SC=TTGGCCTCCAGTGTGTGAGCC;SOR=3.086;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=34;WE=11900043;WS=11900025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	11900142	rs77785799	C	T	3073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.932;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=60;PP=1997;ReadPosRankSum=-1.457;SC=TCCTGTCACTCCTGTTCTCGC;SOR=0.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=275;TCF=155;TCR=120;TR=142;WE=11900150;WS=11900132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,150:0.50:298
chr1	11905981	rs5067	A	G	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.032;HP=2;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=8;PP=929;ReadPosRankSum=-1.752;SC=AAGATGACACAAATGCAGCAG;SOR=0.495;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=60;TCF=44;TCR=16;TR=24;WE=11906003;WS=11905971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,28:0.41:68
chr1	11905995	rs5066	C	A	658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.052;HP=3;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=9;PP=929;ReadPosRankSum=-1.660;SC=GCAGCAGAGACCCCAGGGGAC;SOR=0.419;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=65;TCF=46;TCR=19;TR=26;WE=11906003;WS=11905971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,31:0.41:76
chr1	11906068	rs5065	A	G	2033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.478;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=40;PP=1126;ReadPosRankSum=0.510;SC=TGTTATCTTCAGTACTGCAAA;SOR=0.751;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=204;TCF=110;TCR=94;TR=90;WE=11906076;WS=11906058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,105:0.44:236
chr1	11917620	rs35207557	T	TA	3893.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.254;NF=18;NR=46;PP=1134;ReadPosRankSum=0.911;SC=ATAAATACATTAAAAAAATGA;SOR=0.949;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=78;TCF=28;TCR=50;TR=64;WE=11917628;WS=11917610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,129:0.98:131
chr1	11971345	.	T	C	29	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=17;MQ=57.42;NF=0;NR=5;PP=29;QD=12.7542425094;SC=TTGCATCCTTTGATGCAATCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=5;WE=11971353;WS=11971335;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:10,5:0.33:15
chr1	11980449	rs17037529	T	C	2079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.344;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=41;PP=1262;ReadPosRankSum=0.089;SC=TGGCCAGCTATAGAAATAGGC;SOR=0.583;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=190;TCF=97;TCR=93;TR=88;WE=11980457;WS=11980439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,101:0.48:211
chr1	11982544	rs2639453	T	C	2124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.23;SOR=1.264;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr1	11983041	rs33910280	G	A	936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.295;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-2.565;NF=30;NR=25;PP=628;ReadPosRankSum=-0.014;SC=GCTGGCCACGGGACTCCACGG;SOR=0.492;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=138;TCF=74;TCR=64;TR=55;WE=11983049;WS=11983031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,52:0.40:131
chr1	11983206	rs3795408	A	G	1206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.642;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-10.751;NF=26;NR=30;PP=783;ReadPosRankSum=-0.459;SC=GCAGCCCCCCAAAGCTGAGCA;SOR=0.608;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=128;TCF=59;TCR=69;TR=56;WE=11983214;WS=11983196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,58:0.42:137
chr1	11986229	rs112019995	G	A	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.056;NF=4;NR=5;PP=82;ReadPosRankSum=0.407;SC=GCAGGCAGAGGAGGCGGCGGG;SOR=0.549;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=12;TCR=16;TR=9;WE=11986237;WS=11986219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,11:0.31:35
chr1	12004479	.	TAC	T	471.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.838;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=2.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.36;MQRankSum=0.744;QD=18.14;ReadPosRankSum=0.494;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,21:0.81:26
chr1	12056440	rs2236056	C	T	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.831;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=232;ReadPosRankSum=-0.546;SC=CGTTGTGACACGGCTGACCTC;SOR=0.169;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=13;WE=12056448;WS=12056430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr1	12062205	rs2236057	A	G	1268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.087;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=36;PP=846;ReadPosRankSum=0.447;SC=CTGCCGAGACAAGGGTGCTCC;SOR=1.292;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=112;TCF=40;TCR=72;TR=51;WE=12062213;WS=12062195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,56:0.46:122
chr1	12071680	rs1042842	A	G	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.792;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=167;ReadPosRankSum=0.324;SC=CCTAAGTGCCATGTGGGCTCC;SOR=1.204;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=11;WE=12071688;WS=12071670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr1	12082334	rs11553925	A	T	1952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.503;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=45;PP=1295;ReadPosRankSum=0.720;SC=CACCTGCCAAATGCCAGCACC;SOR=0.638;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=197;TCF=95;TCR=102;TR=87;WE=12082342;WS=12082324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,94:0.44:214
chr1	12082881	rs11588779	C	T	2251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.459;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=55;PP=1439;ReadPosRankSum=-1.289;SC=TCTGTGCTTCCTTCCTCAGCC;SOR=0.540;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=189;TCF=85;TCR=104;TR=103;WE=12082889;WS=12082871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,107:0.54:198
chr1	12082926	rs2295283	A	G	3393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=72;PP=2327;SC=TGCAGTTCCTAAGAGGAGCTG;SOR=1.672;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=36;TCR=72;TR=108;WE=12082934;WS=12082916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr1	12090001	rs4514248	T	C	2474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.686;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=59;PP=1331;ReadPosRankSum=-1.590;SC=CCTGAACCACTGGTTTTAAGA;SOR=0.865;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=236;TCF=119;TCR=117;TR=111;WE=12090009;WS=12089991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,124:0.47:264
chr1	12091210	rs946461	T	C	577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=0;PP=509;SC=AGGCCCTGCCTTGGTGGGGGC;SOR=4.514;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=12091218;WS=12091200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	12164437	rs2230622	C	T	1389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.024;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=16;PP=790;ReadPosRankSum=1.425;SC=GTCCCTTAGACGACCTCGTGG;SOR=0.428;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=86;TCF=62;TCR=24;TR=53;WE=12164445;WS=12164427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,62:0.63:98
chr1	12175729	rs1763642	C	T	6491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=113;NR=102;PP=2965;SC=CACCAACTCCCGTGCCCGCTG;SOR=0.701;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=216;TCF=113;TCR=103;TR=215;WE=12175737;WS=12175719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr1	12183174	rs4846096	A	C	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.130;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=99;ReadPosRankSum=-0.727;SC=GTGTGAGCCAATGTGCCTGGC;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=6;WE=12183182;WS=12183164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr1	12198635	rs6419481	T	C	467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=8;PP=326;SC=TTCACCCCAATTGAAGTTTCT;SOR=1.244;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=6;TCR=8;TR=14;WE=12198643;WS=12198625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	12248942	rs945439	A	G	1869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.905;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=47;PP=1164;ReadPosRankSum=2.250;SC=GCTGCAGCAAATGCTCGCCGG;SOR=0.554;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=158;TCF=67;TCR=91;TR=84;WE=12248950;WS=12248932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,89:0.51:176
chr1	12248965	rs945438	A	G	1495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=37;PP=925;ReadPosRankSum=-0.668;SC=GAGGGCAGCCACGGGGGCACT;SOR=0.660;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=99;TCF=39;TCR=60;TR=63;WE=12248973;WS=12248955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,68:0.62:110
chr1	12249020	rs1815530	C	T	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=3;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=817;ReadPosRankSum=0.424;SC=GGGGCTGGGGCGCAAGAGCAT;SOR=0.919;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=19;WE=12249039;WS=12249010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,20:0.62:32
chr1	12249031	rs1201157	A	G	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=818;ReadPosRankSum=-0.888;SC=GCAAGAGCATAGCCCTTGATT;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=17;WE=12249039;WS=12249010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,18:0.69:26
chr1	12251191	rs472093	T	A	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.301;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=336;ReadPosRankSum=0.489;SC=TGCCTCCAACTTCCCCCGGCA;SOR=1.463;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=18;WE=12251199;WS=12251181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr1	12251765	rs498906	T	G	738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.158;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=12;PP=428;ReadPosRankSum=-1.075;SC=TGCTGGGCTGTCTGGGAGGGC;SOR=0.411;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=67;TCF=44;TCR=23;TR=33;WE=12251773;WS=12251755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,36:0.48:75
chr1	12251808	rs653667	T	G	1319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.641;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=23;PP=745;ReadPosRankSum=-0.416;SC=GCGTGACCGTTTGCCGCCCTC;SOR=0.623;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=117;TCF=68;TCR=49;TR=58;WE=12251816;WS=12251798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,64:0.48:133
chr1	12252333	rs112033722	CTG	C	227.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=3;PP=214;ReadPosRankSum=0.107;SC=GTACAGGCATCTGTGTGTGTG;SOR=0.368;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=7;WE=12252344;WS=12252323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,10:0.83:12
chr1	12252892	rs1768642	C	T	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.637;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=229;ReadPosRankSum=1.151;SC=CCCCTGCTGCCTCCTGACCAA;SOR=1.179;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=13;WE=12252900;WS=12252882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr1	12252955	rs1061622	T	G	1357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.783;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=19;PP=885;ReadPosRankSum=-1.239;SC=AATGCAAGCATGGATGCAGTC;SOR=0.596;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=92;TCF=63;TCR=29;TR=57;WE=12252963;WS=12252945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,61:0.60:101
chr1	12254201	rs2275416	G	A	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=133;ReadPosRankSum=2.389;SC=AGCTGGATATGGGGGTCCTTG;SOR=0.250;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=8;WE=12254209;WS=12254191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr1	12261972	rs5746051	A	G	950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=12;PP=499;ReadPosRankSum=-0.809;SC=AGGGGAAGAAAGAGCTGGCTG;SOR=0.683;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=70;TCF=46;TCR=24;TR=38;WE=12261980;WS=12261962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,44:0.56:78
chr1	12339619	rs4845898	A	T	1498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=35;PP=772;ReadPosRankSum=-1.139;SC=ATAGAGAGAGAATCTGAATTG;SOR=0.702;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=168;TCF=84;TCR=84;TR=72;WE=12339627;WS=12339609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,83:0.43:191
chr1	12379756	.	T	G	2404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.169;ClippingRankSum=0.000;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.997;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=55;PP=1334;ReadPosRankSum=0.725;SC=GAAGAGAATTTTCCCTCTTAA;SOR=0.786;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=218;TCF=99;TCR=119;TR=101;WE=12379764;WS=12379746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,118:0.49:239
chr1	12401868	rs28551666	A	C	5143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=109;NR=75;PP=2965;SC=GCCGGCAGCCATTTGTCCCCT;SOR=0.992;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=184;TCF=109;TCR=75;TR=184;WE=12401876;WS=12401858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr1	12418700	rs10864552	T	C	1186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=30;PP=787;SC=AACCATTGGCTGATGACCTCA;SOR=2.200;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=12;TCR=30;TR=42;WE=12418708;WS=12418690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	12445490	rs149481587	TTGG	T	659.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.706;NF=0;NR=13;PP=450;ReadPosRankSum=0.713;SC=AGAATTTTACTTGGTGGTATT;SOR=0.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=13;WE=12445500;WS=12445480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,19:0.42:45
chr1	12567232	rs7554257	A	G	5962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=109;NR=82;PP=2965;SC=CTCAGCAGGAACTCATTTAGG;SOR=0.918;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=191;TCF=109;TCR=82;TR=191;WE=12567240;WS=12567222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr1	12569090	rs78839159	T	C	1094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.962;NF=14;NR=33;PP=609;ReadPosRankSum=-1.073;SC=GCCCCGCTGCTGAGATGGGCG;SOR=0.668;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=93;TCF=28;TCR=65;TR=47;WE=12569098;WS=12569080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,53:0.53:100
chr1	12638964	rs2275875	T	C	3114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=47;NR=57;PP=1507;SC=CCAGCATACGTGGCAGGAAGG;SOR=1.198;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=47;TCR=57;TR=104;WE=12638972;WS=12638954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr1	12639018	rs2275874	C	T	958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=28;PP=787;SC=GTGGAGCAGCCGCAGCTCTGA;SOR=3.545;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=4;TCR=28;TR=32;WE=12639026;WS=12639008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	12639168	rs3128461	A	G	1776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=38;NR=17;PP=995;SC=AGTCTGATGTATCCTAGAGCT;SOR=1.467;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=38;TCR=17;TR=55;WE=12639176;WS=12639158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr1	12776218	rs3000860	A	C	374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=1;PP=220;SC=CAGCAGCCTGAGTGTTCTCAC;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=12776226;WS=12776208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	12776344	rs3000859	A	T	4170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=50;PP=2533;SC=TGCTGTTGACATGGGTGAGTT;SOR=1.319;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=135;TCF=84;TCR=51;TR=134;WE=12776352;WS=12776334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr1	12779560	rs3010876	T	C	3184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.405;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=74;PP=2160;ReadPosRankSum=0.544;SC=TAAAGTATGATCCCGATGTTG;SOR=0.724;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=280;TCF=135;TCR=145;TR=140;WE=12779568;WS=12779550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,154:0.48:318
chr1	12779618	rs3010877	T	C	1600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.938;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=46;PP=1141;ReadPosRankSum=-2.149;SC=GCTGTACCAATCCAAGGCATC;SOR=0.852;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=158;TCF=63;TCR=95;TR=72;WE=12779626;WS=12779608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,77:0.45:172
chr1	12785093	rs4361998	T	G	699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=2;PP=522;ReadPosRankSum=1.072;SC=TTTCACAAAGTGAAGTGAATG;SOR=1.022;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=41;TCF=38;TCR=3;TR=23;WE=12785101;WS=12785083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,25:0.57:44
chr1	12785494	rs7513079	G	T	2162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.005;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=61;PP=1460;ReadPosRankSum=-0.097;SC=ATCTGCTACTGTTTTTTTCAA;SOR=0.816;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=265;TCF=122;TCR=143;TR=106;WE=12785502;WS=12785482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:179,112:0.38:291
chr1	12786070	rs3000930	A	G	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.812;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=111;ReadPosRankSum=0.812;SC=GCTAGGGAGGAGGTAGAGGTT;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=6;WE=12786078;WS=12786060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr1	12820870	rs1132185	T	C	1734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=44;PP=1140;ReadPosRankSum=0.250;SC=CCTGCATCCTTTCCCACACTT;SOR=0.748;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=104;TCF=36;TCR=68;TR=67;WE=12820878;WS=12820860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,74:0.62:120
chr1	12835868	rs1812242	T	C	5044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=100;PP=2775;SC=AAGAATGGGATGCTGGATGAA;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=170;TCF=70;TCR=100;TR=170;WE=12835876;WS=12835858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr1	12837634	rs848578	T	A	3885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=62;PP=2357;SC=AGCCCAAGATTATTGTGTTCA;SOR=0.707;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=132;TCF=70;TCR=62;TR=132;WE=12837642;WS=12837624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr1	12837840	rs848577	G	C	384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=14;PP=302;SC=CAATGTGAACGGGAAAGGAAA;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=12837848;WS=12837830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	12854428	rs1769774	C	T	1341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.079;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.310;NF=40;NR=18;PP=758;ReadPosRankSum=0.432;SC=CATGTCCTGGCCACGTCTGAT;SOR=1.122;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=135;TCF=89;TCR=46;TR=58;WE=12854436;WS=12854418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,66:0.42:156
chr1	12854530	rs1063776	C	G	8854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=144;NR=154;PP=2965;SC=TAATGAACTCCAAGGACGGTT;SOR=0.815;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=298;TCF=144;TCR=154;TR=298;WE=12854552;WS=12854520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,329:1.00:329
chr1	12854544	rs1063778	T	C	3228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-10.376;NF=65;NR=78;PP=1616;ReadPosRankSum=1.647;SC=GACGGTTAGTTGCCAAATTCA;SOR=0.674;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=274;TCF=121;TCR=153;TR=143;WE=12854552;WS=12854520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,157:0.52:302
chr1	12888601	rs113914674	G	GC	1069.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=18;PP=787;SC=AGCAGGCTCCGCCCGCAAGCT;SOR=1.751;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=19;WE=12888609;WS=12888591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	12907282	rs139731855	G	C	2879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FS=2.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.08;MQRankSum=-8.328;QD=18.95;ReadPosRankSum=1.859;SOR=0.525;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,73:0.48:152
chr1	12907284	rs149796618	TG	CC	1373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FS=2.885;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.96;MQRankSum=-8.377;QD=8.86;ReadPosRankSum=1.962;SOR=0.476;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:82,73:0.47:155
chr1	12907316	rs112607517	T	C	1570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.541;HP=3;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-10.566;NF=40;NR=42;ReadPosRankSum=0.270;SC=TTCCTCAGCCTCTTTTTCATC;SOR=0.603;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=167;TCF=88;TCR=79;TR=82;WE=12907324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,81:0.48:170
chr1	12907350	rs2359486	CA	TG	2134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=20.935;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-13.030;NF=21;NR=39;PP=1824;ReadPosRankSum=0.492;SC=TCCAGCTGGTCATCCCCCTGA;SOR=1.187;SbPval=0.06;Source=Platypus;TC=183;TCF=95;TCR=88;TR=60;WE=12907359;WS=12907340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,62:0.33:188
chr1	12907370	rs2076063	A	T	1115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FS=26.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.56;MQRankSum=-11.861;QD=6.23;ReadPosRankSum=-1.114;SOR=1.709;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:139,40:0.22:179
chr1	12907379	rs74055698	TC	CA	893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FS=30.314;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.82;MQRankSum=-10.349;QD=4.99;ReadPosRankSum=-1.921;SOR=1.904;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:146,33:0.18:179
chr1	12907385	rs150590256	G	A	770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FS=23.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.13;MQRankSum=-9.501;QD=4.21;ReadPosRankSum=-2.429;SOR=1.966;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:153,30:0.16:183
chr1	12907777	rs28391533	T	C	1285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FS=81.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.86;MQRankSum=-11.895;QD=4.29;ReadPosRankSum=-2.234;SOR=5.660;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:259,41:0.14:300
chr1	12907781	rs28441396	T	C	1723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FS=70.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.52;MQRankSum=-12.172;QD=5.44;ReadPosRankSum=-3.742;SOR=3.942;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:263,54:0.17:317
chr1	12907798	rs150096254	A	C	3854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=393;ExcessHet=3.0103;FS=38.811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.97;MQRankSum=-8.526;QD=9.83;ReadPosRankSum=-4.243;SOR=2.012;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:284,108:0.28:392
chr1	12907802	rs138087690	CC	TT	4196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=406;ExcessHet=3.0103;FS=23.956;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.06;MQRankSum=-7.435;QD=10.36;ReadPosRankSum=-3.490;SOR=2.106;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:285,120:0.30:405
chr1	12907837	rs1736811	C	T	4491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=517;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.710;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.001;NF=138;NR=69;PP=2962;ReadPosRankSum=1.971;SC=CGTACATCTCCGCTGCTGATC;SOR=1.482;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=489;TCF=282;TCR=207;TR=207;WE=12907845;WS=12907827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:297,217:0.42:514
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chr1	12908243	rs1736808	A	G	916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=8.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.15;MQRankSum=-4.366;QD=9.26;ReadPosRankSum=2.259;SOR=1.999;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,28:0.28:99
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chr1	13183511	rs72864546	T	C	6705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=460;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.182;HP=1;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-7.645;NF=98;NR=129;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.682;SC=GTACATCCCATCATAATAATC;SOR=0.985;SbPval=0.75;Source=Platypus;TCR=242;TR=227;WE=13183519;WS=13183501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:260,200:0.43:460
chr1	13183528	rs76937665	A	C	5743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=431;ExcessHet=3.0103;FS=15.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.47;MQRankSum=-10.546;QD=13.33;ReadPosRankSum=-1.152;SOR=1.391;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:277,154:0.36:431
chr1	13183532	rs77505369	CC	TT	5448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=431;ExcessHet=3.0103;FS=14.469;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.47;MQRankSum=-11.291;QD=12.64;ReadPosRankSum=-1.153;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:284,147:0.34:431
chr1	13183567	rs78160026	C	T	1568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=357;ExcessHet=3.0103;FS=70.679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.53;MQRankSum=-14.592;QD=4.39;ReadPosRankSum=-1.945;SOR=3.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:290,67:0.19:357
chr1	13183573	rs76669210	G	T	1308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FS=103.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.72;MQRankSum=-14.157;QD=4.00;ReadPosRankSum=-1.099;SOR=6.145;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:279,48:0.15:327
chr1	13183966	rs80025711	G	T	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=16.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.58;MQRankSum=0.918;QD=3.65;ReadPosRankSum=0.767;SOR=0.006;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr1	13183973	rs3929664	G	A	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=14.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.23;MQRankSum=-0.199;QD=15.61;ReadPosRankSum=1.674;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr1	13802325	rs3013105	T	C	527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=363;ReadPosRankSum=1.054;SC=CAGTCATCCTTGTCCTCGTCT;SOR=0.944;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=24;WE=13802333;WS=13802315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,24:0.59:41
chr1	13839382	rs2990682	C	G	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=6;PP=151;ReadPosRankSum=0.922;SC=ACGGCTCCTCCCACCCAGACT;SOR=0.542;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=34;TCF=20;TCR=14;TR=12;WE=13839390;WS=13839372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr1	13839462	.	G	A	1183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.078;ClippingRankSum=0.000;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.620;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=28;PP=899;ReadPosRankSum=-2.012;SC=GCTCACCTTTGGGCAGTTTGG;SOR=0.767;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=144;TCF=84;TCR=60;TR=64;WE=13839470;WS=13839452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,64:0.45:142
chr1	13922400	rs61777782	A	G	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=11;PP=232;ReadPosRankSum=-0.064;SC=ATAATTTTAAAGAAGTGTTCC;SOR=0.587;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=39;TCF=18;TCR=21;TR=19;WE=13922408;WS=13922390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,21:0.46:46
chr1	13936822	rs404658	G	T	664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.665;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=7;PP=357;ReadPosRankSum=0.383;SC=TAAGGCAGGGGATATATTTTA;SOR=0.336;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=46;TCF=37;TCR=9;TR=28;WE=13936830;WS=13936812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,31:0.57:54
chr1	13937089	rs2487643	G	T	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.350;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=18;PP=353;ReadPosRankSum=0.396;SC=TCAACAAATAGAATAATCAAT;SOR=1.179;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=72;TCF=31;TCR=41;TR=28;WE=13937097;WS=13937079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,33:0.39:85
chr1	13940864	rs2486188	C	G	7593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=141;NR=111;PP=2965;SC=TTCATTGGTGCAATCATCGTT;SOR=0.821;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=253;TCF=141;TCR=112;TR=252;WE=13940872;WS=13940854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,281:1.00:281
chr1	14106394	rs2308040	A	ACTC	4703.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.940;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.539;NF=9;NR=47;PP=2575;ReadPosRankSum=1.006;SC=AGATAAACTAACTCCTGCAGG;SOR=0.780;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=159;TCF=35;TCR=124;TR=56;WE=14106402;WS=14106384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,122:0.46:265
chr1	14107932	rs116517080	C	T	3065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.714;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=60;PP=2006;ReadPosRankSum=-1.503;SC=GAGATCTCCACCCAGATAAGG;SOR=0.545;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=235;TCF=131;TCR=104;TR=128;WE=14107940;WS=14107922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,141:0.54:261
chr1	14143003	rs1046331	A	G	7676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=142;NR=125;PP=2965;SC=TCAAAGCTCCAGCTGCAGCCC;SOR=0.735;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=267;TCF=142;TCR=125;TR=267;WE=14143011;WS=14142993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,294:1.00:294
chr1	14149505	rs2697970	C	A	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=149;ReadPosRankSum=0.396;SC=TCACTGTGAACATTCATCAAG;SOR=0.430;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=12;WE=14149513;WS=14149495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr1	14149601	rs2697969	C	T	1765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.502;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=29;PP=997;ReadPosRankSum=-1.367;SC=CCACCATGGTCGGCACTGAAT;SOR=0.906;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=172;TCF=104;TCR=68;TR=79;WE=14149609;WS=14149591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,88:0.45:195
chr1	14149622	rs2697968	T	C	2100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.493;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=43;PP=1110;ReadPosRankSum=-0.543;SC=GTGTGCTTACTGTTATTATTT;SOR=0.738;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=195;TCF=108;TCR=87;TR=96;WE=14149630;WS=14149612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,105:0.48:218
chr1	14220186	rs1358577	A	G	1494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.202;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=28;PP=870;ReadPosRankSum=-1.139;SC=GCGACATCCAATTCTGCCACA;SOR=0.591;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=139;TCF=83;TCR=56;TR=64;WE=14220194;WS=14220176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,75:0.44:170
chr1	14925343	.	A	G	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.841;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQRankSum=-3.666;QD=1.90;ReadPosRankSum=0.334;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,4:0.13:31
chr1	14925350	.	C	CT	77.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.845;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=-4.250;QD=2.29;ReadPosRankSum=0.223;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,5:0.15:34
chr1	14925361	.	T	C	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=0.000;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=-3.762;QD=2.30;ReadPosRankSum=-0.533;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,7:0.18:39
chr1	14925379	.	C	G	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.450;ClippingRankSum=0.000;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=4.781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-3.874;QD=4.72;ReadPosRankSum=0.578;SOR=1.837;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,11:0.17:65
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chr1	14925423	.	C	CA	905.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.017;ClippingRankSum=0.000;DP=203;ExcessHet=3.0103;FS=25.355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-4.016;QD=4.46;ReadPosRankSum=-0.087;SOR=2.621;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:171,32:0.16:203
chr1	14925429	.	G	GGCCA	1218.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.759;ClippingRankSum=0.000;DP=234;ExcessHet=3.0103;FS=6.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-3.464;QD=5.21;ReadPosRankSum=-2.428;SOR=1.184;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:187,47:0.20:234
chr1	14925441	.	C	CGT	2194.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=0.000;DP=283;ExcessHet=3.0103;FS=1.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.21;MQRankSum=1.824;QD=7.76;ReadPosRankSum=-3.286;SOR=0.845;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:216,67:0.24:283
chr1	15390200	rs41269413	A	G	1021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.616;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=30;PP=673;ReadPosRankSum=0.864;SC=CCCTGAGCCCACATCCATGCC;SOR=1.097;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=106;TCF=39;TCR=67;TR=44;WE=15390208;WS=15390190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,50:0.42:118
chr1	15427934	rs10927676	C	T	1027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=11;PP=620;SC=CCTCCCCCAACCCCATTGCTT;SOR=1.061;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=19;TCR=11;TR=30;WE=15427942;WS=15427924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	15427982	rs502918	G	A	2113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=27;PP=1155;SC=CTGCCCGTCCGTCTGTTTCTG;SOR=0.968;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=40;TCR=27;TR=67;WE=15427990;WS=15427972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr1	15428358	rs477953	T	C	526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=15;PP=436;SC=GTCCACCCACTACCCGTCTAT;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=15428366;WS=15428348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	15430016	rs141475354	TATATGCAAATCA	T	1687.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.746;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.911;NF=2;NR=27;PP=2964;ReadPosRankSum=1.171;SC=CATGCAAATCTATATGCAAAT;SOR=0.795;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=85;TCF=7;TCR=78;TR=29;WE=15430035;WS=15430006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,47:0.43:110
chr1	15439083	rs140963536	A	AAGGTCTTTTTTTTCTTCTCCCAGCGGC	5196.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.31;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,119:0.99:120
chr1	15441029	rs34135602	T	C	1445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.831;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=28;PP=667;ReadPosRankSum=1.966;SC=ATGATGACTATGGCTCTCTTC;SOR=0.797;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=164;TCF=89;TCR=75;TR=66;WE=15441037;WS=15441019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,77:0.41:187
chr1	15490962	rs11582684	A	G	2469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.115;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=57;PP=1485;ReadPosRankSum=-0.039;SC=AGAATCCTACAAAGGTGAAGT;SOR=0.857;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=237;TCF=112;TCR=125;TR=108;WE=15490970;WS=15490952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,120:0.47:256
chr1	15495110	rs78615461	A	G	2737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.454;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=56;PP=1722;ReadPosRankSum=-0.689;SC=CGAAGGCCATAGAGTTCTTCA;SOR=0.661;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=237;TCF=120;TCR=117;TR=117;WE=15495118;WS=15495100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,128:0.50:254
chr1	15497727	rs6429722	T	C	4489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=65;PP=2713;SC=GCCTGGAAGATCGCTGTTTGA;SOR=0.882;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=156;TCF=91;TCR=65;TR=156;WE=15497735;WS=15497717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr1	15497832	rs41307794	T	C	1370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.089;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=35;PP=897;ReadPosRankSum=-1.801;SC=AGGGGTTTGTTATAGGAATTA;SOR=1.201;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=90;TCF=39;TCR=51;TR=55;WE=15497852;WS=15497822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,59:0.58:102
chr1	15497844	rs10429935	T	A	2239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=47;PP=1593;SC=TAGGAATTAGTTCTTATGCAT;SOR=1.528;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=29;TCR=47;TR=76;WE=15497852;WS=15497822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr1	15541412	rs3753315	G	A	55.85	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5164;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=1;PP=32;ReadPosRankSum=-0.319;SC=GCAGCCATCCGCACGGGAGGC;SOR=0.446;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=3;WE=15541420;WS=15541407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr1	15541537	rs3753314	C	T	2463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=55;NR=24;PP=1334;SC=GCCTTGTATACATTTATTTTC;SOR=1.434;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=55;TCR=24;TR=79;WE=15541545;WS=15541527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr1	15541607	rs3820065	T	C	1807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.970;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.077;NF=48;NR=32;PP=1151;ReadPosRankSum=-1.280;SC=CCAAGGCCAATGGCTCGCACT;SOR=0.466;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=140;TCF=90;TCR=50;TR=80;WE=15541615;WS=15541597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,82:0.54:151
chr1	15546077	rs3753313	G	A	3824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=428;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=94;PP=2290;ReadPosRankSum=1.076;SC=GACTGAAACCGCTGAAAGTTC;SOR=0.728;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=393;TCF=182;TCR=211;TR=176;WE=15546085;WS=15546067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:237,191:0.45:428
chr1	15573775	rs1780598	A	G	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.036;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=109;ReadPosRankSum=0.282;SC=GCCGGGTGCGAGCTGGAGACT;SOR=1.122;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=18;TCF=10;TCR=8;TR=10;WE=15573783;WS=15573765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr1	15578513	rs41269433	A	G	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=135;ReadPosRankSum=0.073;SC=TTGGTGTGCTACCAATAGCCA;SOR=0.275;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=8;WE=15578521;WS=15578503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr1	15599025	rs75432354	G	A	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=141;ReadPosRankSum=0.886;SC=ATCCACCTCCGGTGAGTCCGG;SOR=0.693;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=8;WE=15599033;WS=15599015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr1	15623113	rs189421254	A	G	3329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=361;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=67;PP=2081;ReadPosRankSum=0.295;SC=GCTAACGTGAACATCTTCTTC;SOR=0.679;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=324;TCF=175;TCR=149;TR=145;WE=15623121;WS=15623103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:197,164:0.45:361
chr1	15654914	.	G	T	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.110;ClippingRankSum=0.000;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.09;ReadPosRankSum=1.613;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,11:0.21:52
chr1	15656200	rs111349324	TA	T	276.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.861;NF=1;NR=13;PP=157;ReadPosRankSum=-0.060;SC=AATTTTCCATTAAAAAAAAAA;SOR=0.420;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=14;WE=15656208;WS=15656190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr1	15668276	rs763821	G	A	876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.545;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=13;PP=466;ReadPosRankSum=-0.795;SC=CTTTACTGCAGGAAAAGCTGC;SOR=0.852;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=99;TCF=62;TCR=37;TR=38;WE=15668284;WS=15668266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,44:0.40:111
chr1	15668319	rs12126178	G	A	1296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.379;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=22;PP=788;ReadPosRankSum=0.108;SC=GAAGCTGAACGAGGAGAGGCT;SOR=0.843;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=120;TCF=68;TCR=52;TR=54;WE=15668327;WS=15668309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,60:0.45:132
chr1	15671483	rs486089	G	A	1439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=4;PP=1101;SC=AGGGGAGTGCGGTGAGGAGTG;SOR=3.958;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=41;TCR=4;TR=45;WE=15671491;WS=15671473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	15687059	rs4661330	A	G	1722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.906;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=31;PP=980;ReadPosRankSum=-0.436;SC=CACGGGTTTGAAGAAGAGATC;SOR=0.538;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=156;TCF=93;TCR=63;TR=74;WE=15687067;WS=15687049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,85:0.49:174
chr1	15693861	rs113990943	G	A	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.188;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=255;ReadPosRankSum=0.769;SC=TCGTGGTGGCGCATGCCCGTA;SOR=0.412;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=47;TCF=34;TCR=13;TR=19;WE=15693869;WS=15693851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,22:0.44:50
chr1	15696058	.	CTG	C	424.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.314;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=413;ReadPosRankSum=-0.909;SC=CCAGTGGTGGCTGTCTTTCCT;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=11;WE=15696067;WS=15696048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr1	15702297	rs2496342	T	G	1272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.734;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=34;PP=821;ReadPosRankSum=1.036;SC=GACACTAGCTTCGTTCCCTGG;SOR=0.776;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=103;TCF=37;TCR=66;TR=53;WE=15702305;WS=15702287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,57:0.51:111
chr1	15707775	rs113966492	A	G	1509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=32;PP=894;ReadPosRankSum=-0.125;SC=CATCAAGAATATGTCAGGCCA;SOR=0.650;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=141;TCF=79;TCR=62;TR=69;WE=15707783;WS=15707765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,73:0.49:150
chr1	15708540	rs1010294	A	G	2165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.669;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=41;PP=1192;ReadPosRankSum=-2.076;SC=CAAAGTGTCCATTGAGATGTA;SOR=1.000;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=235;TCF=135;TCR=100;TR=103;WE=15708548;WS=15708530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,117:0.43:271
chr1	15709516	rs79540080	A	G	611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.33;ReadPosRankSum=2.872;SOR=0.999;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,32:0.59:54
chr1	15709553	rs111605147	AC	A	2011.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.600;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.893;NF=6;NR=21;PP=1024;ReadPosRankSum=-0.827;SC=GTAGCATGGTACAGGAGTCAG;SOR=0.512;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=49;TCF=15;TCR=34;TR=27;WE=15709561;WS=15709543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,59:0.57:104
chr1	15709641	rs6685602	T	C	1304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.329;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=1.096;NF=30;NR=25;PP=773;ReadPosRankSum=-1.581;SC=GAGCCTTGCTTTCCTCATTAG;SOR=0.741;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=120;TCF=66;TCR=54;TR=55;WE=15709649;WS=15709631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,65:0.46:141
chr1	15710226	rs55823174	C	T	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.591;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=210;ReadPosRankSum=-0.960;SC=ACTGGGCTCACCTGAGCTTTG;SOR=0.368;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=18;WE=15710234;WS=15710216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr1	15710411	rs2496338	G	C	1176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.660;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=28;PP=711;ReadPosRankSum=-1.956;SC=TTCTCCTGCTGTCTGCAGGGT;SOR=0.502;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=38;TCR=53;TR=49;WE=15710419;WS=15710401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,53:0.53:100
chr1	15710493	rs3831918	CAT	C	271.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.583;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.150;HP=1;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=257;ReadPosRankSum=1.629;SC=TGTACATTCTCATGTGTGTGT;SOR=2.636;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=6;WE=15710502;WS=15710483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr1	15714774	rs3737694	T	A	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=49;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=65;ReadPosRankSum=0.619;SC=CCTCTGCCCCTCGTCCCTCCC;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=4;WE=15714782;WS=15714764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr1	15714831	.	C	CCATT,CCCTT	1781	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.41;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=3;MGOF=15;MMLQ=20;MQ=61.37;NF=19,19;NR=10,10;PP=1781,26;QD=62.2413793103;SC=CTCCCTCCCTCCCCTCCCCAG;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=47;TCF=30;TCR=17;TR=29,29;WE=15714850;WS=15714821;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.62:47
chr1	15714842	rs3002000	G	C	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.966;HP=3;HapScore=3;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=20;PP=1770;ReadPosRankSum=1.533;SC=CCCTCCCCAGGCCCTGCCCCA;SOR=0.518;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=97;TCF=65;TCR=32;TR=58;WE=15714850;WS=15714821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chr1	15717838	rs2473338	A	G	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.655;NF=1;NR=9;PP=152;ReadPosRankSum=-0.818;SC=TTGAGACGGAATCTCACTCTG;SOR=0.693;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=10;WE=15717846;WS=15717828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr1	15724033	rs2253372	A	G	771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.846;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=22;PP=453;ReadPosRankSum=0.735;SC=CTAGTGTTTCATTTCCTAGAC;SOR=0.879;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=83;TCF=31;TCR=52;TR=34;WE=15724041;WS=15724023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,38:0.42:91
chr1	15754484	rs2473356	T	C	2428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=29;PP=1424;SC=CGCCCTTGCTTTGCAGCAGCC;SOR=1.204;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=50;TCR=29;TR=79;WE=15754492;WS=15754474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr1	15755248	rs3765372	C	T	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.328;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr1	15769876	rs35149641	G	GC	2381.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=15;PP=1631;SC=TGGGGCCAGGGCCTCCTGCCC;SOR=1.716;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=40;TCF=25;TCR=15;TR=38;WE=15769884;WS=15769866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	15770101	rs10803384	C	A	1982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.434;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=55;PP=1338;ReadPosRankSum=-0.800;SC=GGAAGCAGGACGTCACCCACA;SOR=1.158;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=208;TCF=96;TCR=112;TR=91;WE=15770109;WS=15770091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,98:0.43:229
chr1	15772057	rs10927786	G	T	1286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=4;PP=969;SC=TCTGGGGGGGGGCCTGGTGGC;SOR=3.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=40;TCR=4;TR=44;WE=15772065;WS=15772047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	15772933	rs555015	A	G	437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=1;PP=356;SC=AGACCCCTTGAACAGGGACAA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=15772941;WS=15772923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	15783096	rs5772641	GA	G	5467.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FS=1.159;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.78;ReadPosRankSum=0.360;SOR=0.477;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:12,239:0.95:251
chr1	15783117	rs5772642	C	CA	13704.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-1.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=371;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.141;NF=60;NR=131;PP=2967;ReadPosRankSum=1.319;SC=TATTTGGACACAGCTCTTTTT;SOR=0.326;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=201;TCF=64;TCR=137;TR=191;WE=15783125;WS=15783107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,368:1.00:369
chr1	15783553	rs35457461	T	TG	5143.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.662;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.969;NF=27;NR=43;PP=2774;ReadPosRankSum=-1.013;SC=CGCTGCTTCCTGACTCAAGAC;SOR=0.905;SbPval=0.09;Source=Platypus;TC=164;TCF=45;TCR=119;TR=70;WE=15783561;WS=15783543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,164:0.52:316
chr1	15788269	rs3737696	A	C	2002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.505;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=45;PP=1247;ReadPosRankSum=-0.157;SC=TAACCACTATACTGGCTGAGA;SOR=0.624;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=197;TCF=102;TCR=95;TR=95;WE=15788277;WS=15788259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,100:0.48:210
chr1	15788491	rs3737697	C	T	1276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=25;PP=700;ReadPosRankSum=-2.703;SC=GCTTCAATACCATCACCTGCA;SOR=0.721;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=114;TCF=63;TCR=51;TR=58;WE=15788499;WS=15788481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,63:0.51:123
chr1	15788630	rs7512589	G	A	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.458;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=209;ReadPosRankSum=1.138;SC=ACAAGGTTCTGCAACGTTGTT;SOR=1.055;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=39;TCF=10;TCR=29;TR=15;WE=15788638;WS=15788620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,15:0.38:40
chr1	15788693	rs7536007	C	T	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.625;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=71;ReadPosRankSum=-0.360;SC=TGGAACTCACCGGAGTTTCTG;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=5;WE=15788701;WS=15788683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr1	15789176	rs3815786	C	T	1080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.013;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=18;PP=728;ReadPosRankSum=1.339;SC=CCAGCATTATCCAAAGCCAGG;SOR=0.353;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=109;TCF=74;TCR=35;TR=51;WE=15789184;WS=15789166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,52:0.45:115
chr1	15789297	rs3815787	A	C	4786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=483;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.516;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.272;NF=114;NR=100;PP=2480;ReadPosRankSum=-1.157;SC=GCTCGCTGGCAGTCAGTGTCT;SOR=0.746;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=436;TCF=227;TCR=209;TR=214;WE=15789305;WS=15789287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:244,238:0.49:482
chr1	15792426	rs2901964	C	G	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.838;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=21;ReadPosRankSum=0.875;SC=AAACCTAAGACGGGTCCATCA;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=3;WE=15792434;WS=15792423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr1	15793913	rs1042010	G	A	3602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.896;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=61;PP=1847;ReadPosRankSum=0.804;SC=ACTGTCAGGCGTCTGACGGCC;SOR=0.575;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=276;TCF=160;TCR=116;TR=146;WE=15793921;WS=15793903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,169:0.55:309
chr1	15802923	rs369630964	T	C	2805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.917;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.489;NF=59;NR=64;PP=1470;ReadPosRankSum=-1.052;SC=CGCTGCTTCCTGGACTCAAGA;SOR=0.837;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=239;TCF=121;TCR=118;TR=123;WE=15802931;WS=15802913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,137:0.52:262
chr1	15812432	rs6429745	A	G	2688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=31;PP=1682;SC=AAGCAGGGCCAGTTGCTGGTT;SOR=1.390;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=63;TCR=31;TR=94;WE=15812440;WS=15812422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr1	15812665	rs2861484	G	T	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=91;ReadPosRankSum=-0.444;SC=ACCCGGAAATGGTACCAGATA;SOR=0.446;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=7;WE=15812673;WS=15812655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,6:0.21:29
chr1	15813751	rs2011159	C	T	4592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=101;NR=44;PP=2694;SC=CCTCCCACTTCAACTCCCTAT;SOR=1.727;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=101;TCR=44;TR=145;WE=15813759;WS=15813741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr1	15813969	rs3737704	A	C	868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=25;PP=589;ReadPosRankSum=1.014;SC=CAAGGCACTGACCTGCTCACC;SOR=0.846;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=55;TCF=11;TCR=44;TR=30;WE=15813977;WS=15813959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,35:0.56:62
chr1	15820307	rs2234723	A	AC	443.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=501;ReadPosRankSum=0.066;SC=TGCCCTGCTCACCCCAAATCC;SOR=0.760;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=15;WE=15820315;WS=15820297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr1	15820576	rs2020900	T	A	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.395;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=167;ReadPosRankSum=-0.587;SC=CCATGCACGCTGGCTCGGGCG;SOR=0.233;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=11;WE=15820584;WS=15820566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr1	15820607	rs2020895	A	G	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=111;ReadPosRankSum=-0.073;SC=CTTGACTCATACATACATCCA;SOR=0.330;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=4;WE=15820626;WS=15820597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr1	15820618	rs2020898	A	G	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.049;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=111;ReadPosRankSum=-0.967;SC=CATACATCCAACAGGAGCAGC;SOR=0.412;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=4;WE=15820626;WS=15820597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr1	15822043	rs4646091	T	C	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=295;ReadPosRankSum=-2.304;SC=ACATTAACAGTGTGAAAGGAA;SOR=0.836;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=32;TCF=11;TCR=21;TR=22;WE=15822051;WS=15822033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,25:0.74:34
chr1	15832383	rs1800614	G	T	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.722;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=395;ReadPosRankSum=-1.336;SC=TTTCCACAAAGCCAAGGGTGT;SOR=0.269;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=21;WE=15832391;WS=15832373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,21:0.66:32
chr1	15832543	rs1052576	T	C	3558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.492;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=75;PP=1807;ReadPosRankSum=-0.773;SC=GTGGTCCTGCTGCGCCAGCTC;SOR=0.536;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=306;TCF=168;TCR=138;TR=158;WE=15832551;WS=15832533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,175:0.51:340
chr1	15834297	rs2020903	G	A	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=3;PP=455;ReadPosRankSum=0.040;SC=CACCTGCAGGGAAGGACCTGA;SOR=0.283;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=47;TCF=42;TCR=5;TR=25;WE=15834305;WS=15834287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,28:0.56:50
chr1	15834360	rs2020902	A	G	1793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.305;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=31;PP=1130;ReadPosRankSum=-0.450;SC=AATTTCATGGAGACTCACCAA;SOR=0.562;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=138;TCF=84;TCR=54;TR=76;WE=15834368;WS=15834350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,82:0.54:151
chr1	15834491	rs4646032	G	A	2053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.121;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=54;PP=1355;ReadPosRankSum=-2.630;SC=CCCCAAGAACGGAGCAGCGAG;SOR=0.793;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=178;TCF=79;TCR=99;TR=94;WE=15834499;WS=15834481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,98:0.51:193
chr1	15844615	rs1132312	A	G	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.067;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=12;PP=414;ReadPosRankSum=0.488;SC=CGACATCACCAAATCCTCCAG;SOR=0.502;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=51;TCF=34;TCR=17;TR=30;WE=15844623;WS=15844605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,32:0.56:57
chr1	15844926	rs1820205	C	T	786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=19;PP=416;ReadPosRankSum=-1.155;SC=TAATTATCCACGTACTTTTAT;SOR=0.725;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=92;TCF=44;TCR=48;TR=37;WE=15844934;WS=15844916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,41:0.41:100
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chr1	15850553	rs4645984	C	CGGGGGCG	297.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.683;HP=5;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=2.666;NF=3;NR=3;PP=189;ReadPosRankSum=-1.081;SC=GACAGGGGGCCGGGGGCGCAC;SOR=2.147;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=6;WE=15850561;WS=15850543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,7:0.23:30
chr1	15850603	rs4645983	G	A	1630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=3.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.07;MQRankSum=2.758;QD=20.38;ReadPosRankSum=-0.435;SOR=1.077;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,43:0.54:80
chr1	15850613	rs1052571	G	A	1829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.96;MQRankSum=2.527;QD=20.33;ReadPosRankSum=-0.049;SOR=0.854;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,52:0.58:90
chr1	15850792	rs142513755	GC	G	269.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.102;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=322;ReadPosRankSum=-1.178;SC=CCCAGGGCCTGCCCCCGCGTC;SOR=2.546;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=11;WE=15850800;WS=15850782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr1	15860803	rs11583306	C	T	4195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=388;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=84;PP=2318;ReadPosRankSum=1.927;SC=TACGAGGTATCGTGTCCAGCT;SOR=0.711;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=342;TCF=182;TCR=160;TR=181;WE=15860811;WS=15860793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:184,204:0.53:388
chr1	15892415	rs2236215	A	C	2039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.042;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=45;PP=1174;ReadPosRankSum=0.069;SC=TGGTTTTAGGAGGGAAATGAT;SOR=0.598;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=207;TCF=116;TCR=91;TR=96;WE=15892423;WS=15892405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,102:0.46:221
chr1	15901121	rs61213091	C	T	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=147;ReadPosRankSum=0.745;SC=GAGCTGCCCACCTTGGCCTCC;SOR=0.693;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=11;WE=15901129;WS=15901111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr1	15904318	rs11544523	C	T	1821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.157;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=47;PP=1115;ReadPosRankSum=-0.989;SC=GAGGAACCAGCGACTTCATCC;SOR=0.806;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=160;TCF=77;TCR=83;TR=85;WE=15904326;WS=15904308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,91:0.50:181
chr1	15905501	rs41270261	G	A	1791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.878;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=50;PP=1231;ReadPosRankSum=1.583;SC=GGGCCTTGTCGGTCGTGTCCG;SOR=1.094;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=143;TCF=55;TCR=88;TR=78;WE=15905509;WS=15905491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,81:0.51:158
chr1	15909624	rs111921608	TGAGTACAG	T	511.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.153;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=260;ReadPosRankSum=-1.101;SC=CTCAAGCCCCTGAGTACAGGA;SOR=0.877;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=28;TCF=12;TCR=16;TR=6;WE=15909639;WS=15909614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,16:0.28:57
chr1	15909744	rs11580170	C	T	993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.270;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=18;PP=651;ReadPosRankSum=-0.184;SC=CTCTTGAATTCGCCGGCAGCT;SOR=0.835;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=84;TCF=44;TCR=40;TR=44;WE=15909752;WS=15909734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,46:0.51:91
chr1	15909850	rs6429757	C	G	1153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=28;PP=712;ReadPosRankSum=-0.646;SC=TTGACTGTCCCAAGCATCACT;SOR=0.709;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=81;TCF=37;TCR=44;TR=51;WE=15909858;WS=15909840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,54:0.61:89
chr1	15909895	rs6429758	A	G	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=10;PP=223;ReadPosRankSum=-1.404;SC=CCGAATCTGCAGAAGGAAGAA;SOR=0.648;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=31;TCF=13;TCR=18;TR=17;WE=15909903;WS=15909885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr1	15911031	rs10927808	T	G	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=233;ReadPosRankSum=-0.125;SC=AGGGTCCAGGTAAATCAACCA;SOR=0.990;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=12;WE=15911039;WS=15911022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr1	15911131	rs59475085	G	A	2622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.352;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=44;PP=1552;ReadPosRankSum=-0.360;SC=TGCTTTCCATGCCCGACAGCC;SOR=0.879;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=203;TCF=123;TCR=80;TR=117;WE=15911139;WS=15911121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,125:0.57:220
chr1	15944384	rs75354298	G	A	2191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=59;PP=1332;ReadPosRankSum=0.229;SC=TTTGCTACTGGTGAAGAATTG;SOR=0.720;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=219;TCF=92;TCR=127;TR=100;WE=15944392;WS=15944374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,106:0.45:234
chr1	15953103	rs61782440	C	T	2342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.527;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=34;PP=1530;ReadPosRankSum=-0.295;SC=ACTGGTCCTTCTGCCTTGCGC;SOR=0.771;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=195;TCF=129;TCR=66;TR=102;WE=15953111;WS=15953093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,110:0.52:212
chr1	15956769	rs72647120	G	T	2626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.477;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=43;PP=1652;ReadPosRankSum=-0.367;SC=TCCTTCAAGTGCTTGTTTTTG;SOR=0.648;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=222;TCF=140;TCR=82;TR=115;WE=15956777;WS=15956759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,123:0.50:247
chr1	15959886	rs3795762	C	G	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=9;PP=458;ReadPosRankSum=0.067;SC=TACTGATAAACGTTGAAAATA;SOR=0.603;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=67;TCF=48;TCR=19;TR=29;WE=15959894;WS=15959876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,29:0.41:70
chr1	15959977	rs3795763	C	T	1181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.135;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=32;PP=766;ReadPosRankSum=-0.418;SC=AGGACCGAGCCCGGAGAGAGC;SOR=0.634;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=195;TCF=101;TCR=94;TR=64;WE=15959985;WS=15959967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,69:0.32:214
chr1	15986547	rs3766163	T	C	1989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.302;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=49;PP=1316;ReadPosRankSum=-0.242;SC=TTCAGCTGAATTCCAGCTAAA;SOR=0.554;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=207;TCF=90;TCR=117;TR=89;WE=15986555;WS=15986537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,96:0.43:225
chr1	16011005	.	G	GGGC	811.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.397;ClippingRankSum=0.000;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=1.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.01;MQRankSum=2.676;QD=15.32;ReadPosRankSum=-0.386;SOR=0.503;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,23:0.43:53
chr1	16011192	.	G	GGCGACCCTGCTGCCGCAGGGACTC	1062.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=0.000;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=3.564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.62;MQRankSum=2.347;QD=15.40;ReadPosRankSum=-1.024;SOR=1.302;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,30:0.43:69
chr1	16042724	rs66610224	TC	T	287.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.218;HP=8;HapScore=4;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=22;PP=1007;ReadPosRankSum=-0.308;SC=TGTTTTTTTTTCTTTCAGTTG;SOR=1.510;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=88;TCF=22;TCR=66;TR=30;WE=16042732;WS=16042704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,27:0.20:132
chr1	16042766	rs12091750	T	C	624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FS=9.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.14;ReadPosRankSum=-0.724;SOR=1.397;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:106,45:0.30:151
chr1	16043157	rs2280115	G	A	955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.328;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=20;PP=577;ReadPosRankSum=-2.513;SC=AGCTTCCCAGGGTGGCCCCAT;SOR=0.509;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=114;TCF=71;TCR=43;TR=47;WE=16043165;WS=16043147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,52:0.41:127
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chr1	16047726	rs12734937	T	C	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=173;ReadPosRankSum=0.779;SC=TCTCCTATTTTCTCCCCATGT;SOR=0.622;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=35;TCF=25;TCR=10;TR=15;WE=16047734;WS=16047716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr1	16048005	rs12091326	A	G	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=375;ReadPosRankSum=-0.305;SC=TAATAAAGCCAAGTTTGGTGT;SOR=0.506;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=9;TCR=30;TR=21;WE=16048013;WS=16047995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
chr1	16048038	rs12092485	T	C	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=149;ReadPosRankSum=0.387;SC=AATTCTGCAGTGGGAAAACTC;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=12;WE=16048046;WS=16048028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr1	16065303	.	ACACACT	A	101	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=101;QD=40.0;SC=ACACACTCTCACACACTCACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=16065316;WS=16065293;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,3:0.75:4
chr1	16095316	rs2271545	C	T	378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=285;SC=TACCTAAATTCTATTTAAAAT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=16095324;WS=16095306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	16096893	rs12146078	C	T	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=63;ReadPosRankSum=0.759;SC=CCTGTGTCTCCCCTACCCCAG;SOR=0.551;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=21;TCF=14;TCR=7;TR=9;WE=16096901;WS=16096883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr1	16096934	rs10927851	C	T	1231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=11;PP=758;SC=AAGACCGTGTCCCCCCGAGAG;SOR=1.364;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=26;TCR=11;TR=37;WE=16096942;WS=16096924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	16097237	rs10803398	G	A	589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=19;PP=526;SC=GAAGGCGATTGGTTTCCTAGG;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=16097245;WS=16097227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	16111014	rs144567113	C	T	3564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=377;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.211;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=67;PP=1980;ReadPosRankSum=0.949;SC=AGGCCCAGGGCGGGTCAGCAT;SOR=0.767;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=336;TCF=185;TCR=151;TR=153;WE=16111022;WS=16111004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:200,177:0.47:377
chr1	16256007	rs848209	T	C	3344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.422;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=65;PP=2159;ReadPosRankSum=0.351;SC=CTGGGAGAACTAGCAGGTGAA;SOR=0.660;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=263;TCF=141;TCR=122;TR=138;WE=16256015;WS=16255997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,154:0.52:294
chr1	16259813	rs848210	A	G	2580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.487;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=49;PP=1615;ReadPosRankSum=2.524;SC=CCCTGAATCCAACCAAGCTCA;SOR=0.743;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=208;TCF=115;TCR=93;TR=110;WE=16259821;WS=16259803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,123:0.54:226
chr1	16265422	rs848214	A	G	1160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.192;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=37;PP=821;ReadPosRankSum=0.131;SC=GGTGGGGCTGATCAGGGTAGG;SOR=0.527;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=139;TCF=52;TCR=87;TR=61;WE=16265430;WS=16265412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,60:0.41:145
chr1	16271260	rs9661939	G	A	1558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.550;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=29;PP=938;ReadPosRankSum=-1.428;SC=CCCGGCACGAGAAGGGCTTCT;SOR=0.772;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=166;TCF=90;TCR=76;TR=69;WE=16271268;WS=16271250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,77:0.42:183
chr1	16272250	rs848217	A	G	618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.769;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=12;PP=344;ReadPosRankSum=-0.988;SC=CAGCTTCTGCAGCAGCCATGC;SOR=1.025;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=85;TCF=51;TCR=34;TR=33;WE=16272258;WS=16272240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,35:0.36:98
chr1	16342237	rs1739840	A	G	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.101;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=16;PP=393;ReadPosRankSum=0.557;SC=TGTTCATGACAGTGCCGTCAG;SOR=0.409;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=66;TCF=30;TCR=36;TR=33;WE=16342245;WS=16342227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,36:0.48:75
chr1	16344360	rs732286	A	G	791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=16;PP=482;ReadPosRankSum=0.808;SC=GGGCCGGGAGAGCACGGGAGG;SOR=0.681;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=93;TCF=51;TCR=42;TR=37;WE=16344368;WS=16344350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,39:0.39:100
chr1	16344402	rs945416	G	A	955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=0.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.65;ReadPosRankSum=0.058;SOR=0.742;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,48:0.48:99
chr1	16344494	rs1572381	G	A	1005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=19;PP=578;ReadPosRankSum=-1.324;SC=AGGCGGGCGAGGGCTGGACAG;SOR=0.733;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=86;TCF=47;TCR=39;TR=43;WE=16344502;WS=16344484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,49:0.52:95
chr1	16344625	rs945417	C	G	949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.349;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=23;PP=488;ReadPosRankSum=-0.820;SC=ATTTAGGCCTCTCCATGGCCC;SOR=0.965;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=101;TCF=52;TCR=49;TR=44;WE=16344633;WS=16344615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,52:0.43:122
chr1	16344664	rs872222	G	A	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.964;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=16;PP=299;ReadPosRankSum=0.532;SC=TCTCCCGTGCGCCGGCCCTGC;SOR=0.957;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=68;TCF=28;TCR=40;TR=25;WE=16344672;WS=16344654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,28:0.36:78
chr1	16344730	rs945418	T	C	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.570;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=81;ReadPosRankSum=0.226;SC=CATTCCAGGCTGATCACAGCA;SOR=0.180;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=8;WE=16344738;WS=16344720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr1	16345619	rs945422	T	C	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.597;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=216;ReadPosRankSum=-0.403;SC=TCAGCAAAGCTGGGACTGACC;SOR=0.255;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=48;TCF=37;TCR=11;TR=18;WE=16345627;WS=16345609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,20:0.38:52
chr1	16346009	rs3841842	G	GC	676.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.536;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=597;ReadPosRankSum=-0.012;SC=TTTTGTCTGAGCCCCCTACAA;SOR=1.442;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=44;TCF=4;TCR=40;TR=19;WE=16346017;WS=16345999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,25:0.57:44
chr1	16351275	rs10927887	A	G	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.972;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=2;PP=342;ReadPosRankSum=0.340;SC=GTGGCTGTACAGGGAGATTGG;SOR=2.093;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=48;TCF=40;TCR=8;TR=22;WE=16351283;WS=16351265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,24:0.45:53
chr1	16352937	rs1010069	G	A	1642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.487;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=22;PP=913;ReadPosRankSum=-0.567;SC=TGGGGGTTGGGGAGATGGAGG;SOR=0.521;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=117;TCF=78;TCR=39;TR=66;WE=16352945;WS=16352927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,75:0.59:128
chr1	16353400	rs9442216	T	C	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=59;ReadPosRankSum=-0.637;SC=TCAGCCCCGCTTTGGGTATAG;SOR=1.179;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=5;WE=16353408;WS=16353390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr1	16356501	rs1805152	G	A	786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=16;PP=422;ReadPosRankSum=0.712;SC=TCTTGCCGTCGCCTTCCCTGA;SOR=0.690;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=67;TCF=36;TCR=31;TR=35;WE=16356509;WS=16356491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,39:0.54:72
chr1	16356583	rs3737218	C	T	521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.979;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=12;PP=331;ReadPosRankSum=-0.149;SC=GAGTGGGTCACGGCCCTGCTG;SOR=0.511;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=55;TCF=27;TCR=28;TR=25;WE=16356591;WS=16356573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,27:0.44:62
chr1	16358148	rs2015509	T	C	2860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.457;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=49;PP=1530;ReadPosRankSum=-1.619;SC=ATCCCCTTGCTGGCCTGGGTC;SOR=0.750;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=239;TCF=146;TCR=93;TR=127;WE=16358161;WS=16358138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,138:0.53:262
chr1	16358520	rs12131197	T	C	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.661;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-3.150;NF=11;NR=1;PP=119;ReadPosRankSum=0.537;SC=AAATCATGGCTACCCTCCCTT;SOR=0.148;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=12;WE=16358528;WS=16358510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr1	16358685	rs6669935	C	G	1840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=42;PP=1114;ReadPosRankSum=-0.063;SC=CCCTCTCCCTCTCTACTTGCC;SOR=0.716;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=164;TCF=82;TCR=82;TR=83;WE=16358693;WS=16358675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,91:0.50:183
chr1	16358932	rs10803407	T	C	3434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FS=0.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.41;ReadPosRankSum=1.526;SOR=0.748;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:158,172:0.52:330
chr1	16359051	rs10927892	C	A	2297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FS=1.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.17;ReadPosRankSum=0.605;SOR=0.832;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:116,110:0.49:226
chr1	16359051	.	CA	AG	1366	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=36;NR=55;PP=1366;QD=15.5985480754;SC=GTGACACACGCAGCCCCCGGG;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=201;TCF=83;TCR=118;TR=91;WE=16359060;WS=16359041;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:110,91:0.45:201
chr1	16359052	rs10927893	A	G	7899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.95;SOR=1.209;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr1	16359106	rs10803408	C	T	846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.831;HP=2;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=29;PP=619;ReadPosRankSum=0.085;SC=GCCTCCCGTCCCAACCCCGCC;SOR=2.618;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=72;TCF=15;TCR=57;TR=32;WE=16359114;WS=16359096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,36:0.46:78
chr1	16359123	rs9442217	A	G	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=277;ReadPosRankSum=-0.106;SC=CGCCCCGCCCATCTTATCCTG;SOR=0.885;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=37;TCF=5;TCR=32;TR=16;WE=16359131;WS=16359113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
chr1	16361719	rs186878371	A	G	68.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=2;PP=75;SC=GCCGCTGTCCATGGAGGGGAG;SOR=1.179;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=4;WE=16361727;WS=16361709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	16361875	rs11807054	A	G	214.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.85;QD=30.69;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	16361916	rs11811753	G	A	662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.106;NF=16;NR=9;PP=313;ReadPosRankSum=0.208;SC=GTGAGGGGCCGCTGGGAAGGC;SOR=0.892;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=40;TCF=25;TCR=15;TR=25;WE=16361933;WS=16361906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,28:0.64:44
chr1	16361989	rs12757385	C	T	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.97;MQRankSum=-5.086;QD=0.53;ReadPosRankSum=-2.839;SOR=0.663;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,8:0.11:71
chr1	16362561	rs55731534	C	G	627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=4.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.169;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-7.028;NF=23;NR=3;PP=438;ReadPosRankSum=0.297;SC=CCTGCTCCTGCCACTGCCGGG;SOR=2.556;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=82;TCF=64;TCR=18;TR=26;WE=16362569;WS=16362551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,28:0.31:91
chr1	16362621	rs2009044	G	A	9536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=354;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=191;NR=133;PP=2965;SC=GAAGAAACTCGGGCTGAGAAA;SOR=1.106;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=325;TCF=192;TCR=133;TR=324;WE=16362629;WS=16362611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,354:1.00:354
chr1	16362661	rs3978493	A	C	4471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=487;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.756;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.139;NF=119;NR=89;PP=2926;ReadPosRankSum=1.450;SC=GTCACACTGCATTTGGTGATG;SOR=0.862;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=454;TCF=250;TCR=204;TR=208;WE=16362669;WS=16362651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:264,221:0.46:485
chr1	16363158	rs74057560	G	A	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=1.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.21;MQRankSum=-4.478;QD=1.17;ReadPosRankSum=-2.287;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,7:0.17:41
chr1	16363237	rs143626665	C	T	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=3.281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.17;MQRankSum=-3.195;QD=1.18;ReadPosRankSum=0.759;SOR=0.643;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,9:0.18:49
chr1	16370899	rs945394	G	A	257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=177;SC=TTCATGGGTGGGGAGAGCACT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=16370907;WS=16370889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	16371067	rs2015352	G	T	3724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=71;NR=53;PP=1957;SC=CCCTGTCCCCGCATCCGCCGA;SOR=0.751;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=124;TCF=71;TCR=53;TR=124;WE=16371075;WS=16371045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr1	16371932	rs6604909	A	C	263.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=1;PP=176;SC=ACCCCAGAGTATACCACCAAG;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=16371940;WS=16371922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	16372003	rs6604910	G	C	1596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=11;PP=920;SC=GGATGGGACTGTCTGTGCCTC;SOR=1.823;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=37;TCR=11;TR=48;WE=16372011;WS=16371993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	16372283	rs6604911	T	G	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=266;ReadPosRankSum=0.391;SC=TTGGGGGGGGTGCTCTGGGTG;SOR=0.668;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=29;TCF=10;TCR=19;TR=25;WE=16372291;WS=16372272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,21:0.81:26
chr1	16373124	rs5257	A	G	5266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=117;NR=82;PP=2965;SC=CTTTCTCTTCAGGCTTCTCTC;SOR=1.072;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=201;TCF=118;TCR=83;TR=199;WE=16373132;WS=16373114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr1	16373199	rs35820664	CCTT	C	11223.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.269;NF=22;NR=121;PP=2948;ReadPosRankSum=1.232;SC=CTGGCCAAAACCTTCTCAGAT;SOR=0.757;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=149;TCF=22;TCR=127;TR=143;WE=16373213;WS=16373189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,256:0.99:258
chr1	16373282	rs2095540	A	G	1890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=12;NR=47;PP=1443;SC=TGGCTTGCCCAAAGGGACACA;SOR=2.760;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=12;TCR=47;TR=59;WE=16373290;WS=16373272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	16374533	rs2014562	G	C	3186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=64;NR=45;PP=1919;SC=TCTTCCTCGGGAAAGTGGTAT;SOR=0.816;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=64;TCR=45;TR=109;WE=16374541;WS=16374523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr1	16374622	rs2863440	C	G	1876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=38;PP=1153;SC=ACGAAAGCTGCGTCAGAGGGG;SOR=1.508;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=22;TCR=38;TR=60;WE=16374630;WS=16374612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	16374656	rs2902490	A	G	1180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=23;PP=817;SC=CCTGCCTTCCAGGAACTCAGT;SOR=1.347;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=14;TCR=23;TR=37;WE=16374664;WS=16374646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	16374994	rs1889788	C	T	1220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.94;QD=29.07;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	16375063	rs1889789	CA	GC	3297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=32;NR=30;PP=1910;SC=ACAGTCTTTGCAGCTCCCTTC;SOR=0.984;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=64;TCF=33;TCR=31;TR=62;WE=16375072;WS=16375053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr1	16376191	rs7367494	C	T	1189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.51;QD=29.74;SOR=4.021;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	16376230	rs59006537	A	AT	4100.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=18;PP=2175;SC=TGAGAGTCCAAAAGGCATTCC;SOR=2.147;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=53;TCF=35;TCR=18;TR=52;WE=16376246;WS=16376220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr1	16376232	rs59924562	A	T	4109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.56;QD=44.19;SOR=2.277;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr1	16376238	rs34589727	TC	T	3178.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=-1.936;NF=32;NR=24;PP=1751;ReadPosRankSum=1.635;SC=CAAAAGGCATTCCCCCCAAGG;SOR=0.917;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=80;TCF=49;TCR=31;TR=56;WE=16376246;WS=16376220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,105:0.99:106
chr1	16376278	rs7365182	G	A	6091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=114;NR=84;PP=2965;SC=TACTGGGGTCGGGCTCTGGGC;SOR=1.008;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=198;TCF=114;TCR=84;TR=198;WE=16376286;WS=16376268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr1	16376319	rs7368151	T	C	8216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.31;NF=149;NR=126;PP=2965;SC=GGGGTCTCTGTGGCATCCTGG;SOR=0.809;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=276;TCF=150;TCR=126;TR=275;WE=16376327;WS=16376309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,309:1.00:309
chr1	16376458	rs7368166	T	C	3095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=70;PP=2264;SC=AGCTCCCCCCTCACCGTACTC;SOR=2.147;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=96;TCF=25;TCR=71;TR=95;WE=16376466;WS=16376441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr1	16377108	rs35480349	G	C	4005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=376;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=92;PP=2659;ReadPosRankSum=-0.685;SC=AAGGGGCCTTGAGTGGGGTGG;SOR=0.703;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=342;TCF=172;TCR=170;TR=184;WE=16377116;WS=16377098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,192:0.51:375
chr1	16379008	rs2050522	C	T	941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=21;PP=595;SC=TAGCTGACCTCGGACATGGGG;SOR=2.985;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=25;WE=16379016;WS=16378998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	16380196	rs5253	T	C	5727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=116;PP=2965;SC=GCCAAGGACATGCCACTGGAG;SOR=1.158;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=196;TCF=80;TCR=116;TR=196;WE=16380204;WS=16380186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr1	16380243	rs2275166	A	G	1823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.92;MQRankSum=-6.006;QD=20.04;ReadPosRankSum=-2.391;SOR=0.646;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,52:0.57:91
chr1	16380252	rs2275167	C	T	1664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.08;MQRankSum=-6.442;QD=21.34;ReadPosRankSum=-1.922;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,42:0.54:78
chr1	16381718	rs1414498	T	C	651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.34;SOR=5.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	16381718	.	TCCTC	CCCTC,CCCTT	236	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=8;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=17,7;NR=0,0;PP=236,122;QD=15.9277183851;SC=CACTCAGCCATCCTCAGCTAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17,7;WE=16381730;WS=16381711;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:17
chr1	16381722	rs12691552	C	T	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.938;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr1	16381792	rs12047858	T	A	862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.717;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=11;PP=628;ReadPosRankSum=0.021;SC=AAGTTTCCTGTCCTTTATAAT;SOR=0.913;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=93;TCF=65;TCR=28;TR=40;WE=16381800;WS=16381782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,41:0.41:101
chr1	16381816	rs12029508	C	T	1225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.478;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=13;PP=778;ReadPosRankSum=-1.523;SC=TGACAATAGTCACAATAGCCC;SOR=1.153;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=121;TCF=83;TCR=38;TR=51;WE=16381824;WS=16381806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,56:0.42:133
chr1	16382086	rs2297727	C	T	1327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=20;PP=776;ReadPosRankSum=-1.764;SC=GAGAGGGGCCCGCTGATATCC;SOR=0.626;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=103;TCF=66;TCR=37;TR=58;WE=16382094;WS=16382076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,61:0.57:107
chr1	16382730	rs12030469	C	T	525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=268;ReadPosRankSum=0.362;SC=CCTGCGGCCCCGCCCAGACCC;SOR=0.760;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=13;WE=16382738;WS=16382726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr1	16382791	rs12023153	G	C	1542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-4.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.600;HP=2;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=17;PP=1152;ReadPosRankSum=-2.949;SC=TTGCAGGCCTGGGTCTCTTGT;SOR=0.229;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=116;TCF=92;TCR=24;TR=64;WE=16382799;WS=16382781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,66:0.52:127
chr1	16382827	rs77508204	CTCT	C	4149.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.486;HP=3;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.478;NF=25;NR=33;PP=2968;ReadPosRankSum=3.155;SC=GGCCCCGCCCCTCTTCCTGGC;SOR=0.746;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=159;TCF=68;TCR=91;TR=58;WE=16382842;WS=16382817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,107:0.42:256
chr1	16382831	rs61769890	T	A	4336.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FS=2.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQRankSum=1.469;QD=16.37;ReadPosRankSum=2.847;SOR=0.880;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:155,110:0.42:265
chr1	16382834	rs61769891	T	A	4411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FS=3.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=1.527;QD=15.70;ReadPosRankSum=1.602;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:159,122:0.43:281
chr1	16382877	rs7517792	A	G	17622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=496;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.87;QD=35.67;SOR=0.822;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,494:1.00:494
chr1	16382877	.	ACCT	GCCA,GCCT	2962	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.36;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MMLQ=24;MQ=59.86;NF=117,242;NR=105,219;PP=2944,2962;QD=20;SC=TGGGCTGGGCACCTTCTACCC;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=463;TCF=243;TCR=220;TR=222,461;WE=16382888;WS=16382867;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.48:463
chr1	16382880	rs7512547	T	A	5400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=506;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=-2.577;QD=10.72;ReadPosRankSum=2.818;SOR=0.718;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:244,260:0.52:504
chr1	16383267	rs12728542	A	G	596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.240;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.722;NF=16;NR=8;PP=386;ReadPosRankSum=-2.238;SC=TCTACTATTTACCCAGAAACC;SOR=1.101;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=44;TCF=29;TCR=15;TR=24;WE=16383275;WS=16383257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,27:0.63:43
chr1	16383329	rs138507185	T	TC	1362.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=3.351;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.70;MQRankSum=-1.220;QD=25.71;ReadPosRankSum=0.958;SOR=2.170;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,51:0.96:53
chr1	16383336	rs12746138	G	C	2580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=51.43;QD=41.63;SOR=1.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
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chr1	16383448	rs10803415	A	C	4088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=79;NR=84;PP=2755;SC=ACCCCAGCTGACCTGGTACTG;SOR=0.731;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=163;TCF=79;TCR=84;TR=163;WE=16383456;WS=16383438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr1	16383515	rs12402924	C	T	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.49;MQRankSum=0.335;QD=11.65;ReadPosRankSum=0.000;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr1	16383581	rs1057844	G	T	925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=2.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.53;MQRankSum=2.379;QD=34.29;ReadPosRankSum=0.451;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,24:0.89:27
chr1	16383605	rs1057845	A	G	1044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=5.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.41;MQRankSum=2.206;QD=29.85;ReadPosRankSum=0.807;SOR=0.156;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,28:0.80:35
chr1	16383668	rs6660218	T	G	5264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=105;NR=70;PP=2962;SC=TATCTGCCAGTTGCTCAGTGA;SOR=1.215;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=175;TCF=105;TCR=70;TR=175;WE=16383690;WS=16383658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr1	16383682	rs1057854	G	C	1101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.426;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.162;NF=41;NR=26;PP=824;ReadPosRankSum=-0.820;SC=TCAGTGACTGGCCATCACATT;SOR=1.141;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=220;TCF=124;TCR=96;TR=67;WE=16383690;WS=16383658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,65:0.31:210
chr1	16383742	rs1057857	C	G	4231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.334;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.711;NF=88;NR=106;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.699;SC=GGCACAGATGCCTTCTGGGGT;SOR=0.868;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=295;TCF=137;TCR=158;TR=194;WE=16383750;WS=16383732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,193:0.65:296
chr1	16383808	rs28690440	G	C	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.403;NF=8;NR=21;PP=395;ReadPosRankSum=0.004;SC=CCCAGAGCTGGTGTCCATCCC;SOR=0.642;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=29;TCR=78;TR=29;WE=16383816;WS=16383798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,28:0.26:109
chr1	16384868	rs12756288	G	A	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.241;NF=3;NR=1;PP=48;ReadPosRankSum=0.475;SC=GTCCAGATATGCCTGGGCTGC;SOR=0.105;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=4;WE=16384876;WS=16384858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr1	16384986	rs28496958	G	T	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.429;NF=2;NR=4;PP=305;ReadPosRankSum=0.066;SC=CCATGGAGGGGAGGGAGCCCG;SOR=0.527;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=16;TCF=7;TCR=9;TR=6;WE=16385007;WS=16384976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr1	16384998	rs1807285	GG	CA	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.128;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=4;JOINED;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.335;NF=2;NR=4;PP=286;ReadPosRankSum=1.698;SC=GGGAGCCCGGGGGGTGGGTCC;SOR=0.330;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=15;TCF=6;TCR=9;TR=6;WE=16385007;WS=16384976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr1	16385175	rs17853748	G	A	1057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.81;MQRankSum=-1.943;QD=32.05;ReadPosRankSum=2.209;SOR=0.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,32:0.97:33
chr1	16385184	rs75273615	G	A	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=6.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.76;MQRankSum=-1.177;QD=7.25;ReadPosRankSum=-0.824;SOR=0.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr1	16385248	rs74054903	C	T	389.89	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.67;MQRankSum=-0.404;QD=35.44;ReadPosRankSum=3.479;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,10:0.91:11
chr1	16385250	rs74054904	A	G	389.89	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.45;QD=38.99;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:0,10:1.00:10
chr1	16385797	rs3978478	C	G	1639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.052;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=2.689;NF=48;NR=10;PP=1316;ReadPosRankSum=1.376;SC=TGTGCTCACTCTCTCCTTCCT;SOR=2.097;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=66;TCF=53;TCR=13;TR=58;WE=16385805;WS=16385787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:6,58:0.91:64
chr1	16385815	rs2019456	G	A	974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.684;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.884;NF=30;NR=14;PP=621;ReadPosRankSum=-0.728;SC=CCTGCTCCTGGCACTGCCGGG;SOR=0.465;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=118;TCF=83;TCR=35;TR=44;WE=16385823;WS=16385805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,46:0.40:116
chr1	16385980	rs3884058	G	A	4537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=-0.113;NF=63;NR=106;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.671;SC=TGGACCCTCTGGGCTGTACCT;SOR=0.600;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=171;TCF=64;TCR=107;TR=169;WE=16385988;WS=16385970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,178:0.99:179
chr1	16386008	rs2863452	T	C	3144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=76;PP=2335;SC=GGACGATGCCTTGGGGGCTGT;SOR=2.036;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=28;TCR=76;TR=104;WE=16386016;WS=16385998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr1	16386247	rs2095543	T	C	73.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=24.43;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	16386305	rs372070031	G	GC	265.19	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.68;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5007;FS=3.802;HP=5;HapScore=2;MGOF=150;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=1.786;NF=3;NR=2;PP=138;ReadPosRankSum=-1.161;SC=AGTGATCTGGGCCCCCAAGGA;SOR=1.033;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=5;WE=16386313;WS=16386295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr1	16386416	rs9442230	G	A	1151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=22;NR=16;PP=574;SC=AGTAATGCTCGTCCTCAGCTG;SOR=0.737;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=22;TCR=16;TR=38;WE=16386424;WS=16386406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	16386447	rs11576236	G	C	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=16;NR=15;PP=425;SC=CCAGCCTGCCGGCTGGGCACT;SOR=0.756;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=16;TCR=15;TR=31;WE=16386455;WS=16386437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	16386495	rs71510977	C	T	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.00;MQRankSum=-0.393;QD=9.94;ReadPosRankSum=-0.994;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr1	16388534	rs2863454	C	T	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.03;MQRankSum=-0.272;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.697;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr1	16388556	rs2863455	C	T	556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=51.44;QD=42.83;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	16388556	.	CATTCTCCAC	TATTCTCCAC,TATTCTCCAG	41	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.58;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=20;MMLQ=24;MQ=43.49;NF=8,5;NR=1,1;PP=41,41;QD=8.41902361636;SC=TGGGACCGTGCATTCTCCACC;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9,6;WE=16388573;WS=16388546;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:9
chr1	16388565	rs7524413	C	G	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.003;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.20;MQRankSum=1.618;QD=20.48;ReadPosRankSum=1.218;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr1	16388580	rs3978467	C	T	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.20;MQRankSum=-1.618;QD=9.63;ReadPosRankSum=-1.071;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr1	16388646	rs2863456	T	C	820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.95;QD=25.65;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	16388709	rs28570004	G	T	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.221;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.719;NF=5;NR=6;PP=122;ReadPosRankSum=-1.403;SC=GGCAGGAGGAGTGAGCAGGGT;SOR=0.418;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=20;TCF=10;TCR=10;TR=11;WE=16388717;WS=16388699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr1	16388766	rs3978469	C	T	104.10	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.210;NF=2;NR=3;PP=59;ReadPosRankSum=0.210;SC=CACCCATCCCCGTCTCCCAGC;SOR=0.368;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=5;WE=16388774;WS=16388756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr1	16389026	rs2863458	T	C	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.108;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.67;MQRankSum=0.571;QD=9.98;ReadPosRankSum=0.063;SOR=0.754;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr1	16451767	rs3754334	G	A	1962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.183;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=49;PP=1188;ReadPosRankSum=-0.649;SC=GGCTGTAGGCGATGCGCTTCT;SOR=0.597;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=166;TCF=69;TCR=97;TR=86;WE=16451775;WS=16451757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,93:0.52:179
chr1	16460212	.	G	A	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=-0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=4;PP=142;ReadPosRankSum=0.210;SC=ACCAGGCTGTGGGGGACGGAC;SOR=0.368;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=16;TCF=7;TCR=9;TR=8;WE=16460220;WS=16460202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr1	16464673	rs2230597	G	A	4526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=58;PP=2525;SC=GTGGGGCGGAGGGGGGTCCTG;SOR=0.889;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=147;TCF=89;TCR=58;TR=146;WE=16464681;WS=16464663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr1	16474839	rs35127370	AC	A	2475.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=25;PP=2018;SC=GGAATGCAGAACCCCCTTCCC;SOR=1.550;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=59;TCF=33;TCR=26;TR=56;WE=16474847;WS=16474829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr1	16475123	rs6678616	C	T	5094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FS=4.647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.07;ReadPosRankSum=0.639;SOR=0.759;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:149,133:0.47:282
chr1	16475126	rs6678618	C	T	5094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FS=4.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.81;ReadPosRankSum=-0.146;SOR=0.681;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:151,135:0.47:286
chr1	16525056	rs451260	G	T	509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.448;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=391;ReadPosRankSum=-0.659;SC=AGGCATGGAGGTGGGGTCCTA;SOR=1.179;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=66;TCF=46;TCR=20;TR=27;WE=16525064;WS=16525046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,28:0.39:72
chr1	16525549	rs221032	C	T	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=117;ReadPosRankSum=-0.814;SC=GGCAGATCAACACTTGCAGAA;SOR=0.412;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=9;WE=16525557;WS=16525539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr1	16528233	rs221037	G	A	832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.034;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=8;PP=586;ReadPosRankSum=-0.935;SC=GAGAGCGGGCGAGGGTCCAGC;SOR=1.347;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=54;TCF=40;TCR=14;TR=34;WE=16528241;WS=16528223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,35:0.59:59
chr1	16528469	rs58225172	GCCTACCCTAGGGAC	GTACCCTAGGGAC,G	1248.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=2932;ReadPosRankSum=1.227;SC=TAGGACCCAGGCCTACCCTAG;SOR=0.841;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=14;WE=16528492;WS=16528459;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.55:60
chr1	16528472	rs200243292	TACCCTAGGGACC	T	1225.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=1.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.50;ReadPosRankSum=1.312;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,32:0.56:57
chr1	16528484	.	C	T	1267	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=7;NR=13;PP=1267;QD=65.0885606274;SC=CCCTAGGGACCCATGTCTGCC;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=37;TCF=11;TCR=26;TR=20;WE=16528492;WS=16528459;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:17,20:0.54:37
chr1	16528823	rs71574165	GCCATGGGGACGGGGTGCCCA	G	379.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.807;NF=6;NR=2;PP=697;ReadPosRankSum=-0.212;SC=AGGGGTGCCCGCCATGGGGAC;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=8;WE=16528850;WS=16528813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr1	16529117	rs221039	T	C	830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=21;PP=544;ReadPosRankSum=-0.246;SC=GCCCTGGCTCTAGGCACCCAC;SOR=0.735;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=68;TCF=25;TCR=43;TR=33;WE=16529125;WS=16529107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,36:0.51:71
chr1	16532803	rs221050	G	A	4177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=61;PP=2586;SC=TGTGGATGTAGGAGGCCTCGG;SOR=0.848;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=135;TCF=73;TCR=62;TR=134;WE=16532811;WS=16532793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr1	16532848	rs221051	A	G	4560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=61;PP=2942;ReadPosRankSum=0.710;SC=GAGGGAGGGCACACACGGGGT;SOR=0.426;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=156;TCF=95;TCR=61;TR=155;WE=16532856;WS=16532838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,170:0.99:171
chr1	16533022	rs221052	C	T	5760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=79;NR=107;PP=2965;SC=CAAGCCTTTCCTGTCCTCGAT;SOR=1.293;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=187;TCF=79;TCR=108;TR=186;WE=16533030;WS=16533012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr1	16533085	rs34933259	A	AC	515.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=3;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=253;SC=AGCCCCGCCCACCCCCCAGGT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=8;WE=16533113;WS=16533075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	16533096	rs221053	C	T	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.43;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	16533105	rs221054	G	C	241.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.31;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	16533817	rs170234	T	C	590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=14;PP=416;SC=GGTTCGGATATCTGGACACAG;SOR=2.419;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=16533825;WS=16533807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	16534002	rs221056	C	G	2924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=63;NR=36;PP=1612;SC=TCCCAGGGACCCCCCTCCCAC;SOR=1.270;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=99;TCF=63;TCR=36;TR=99;WE=16534010;WS=16533992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr1	16534255	rs221057	C	G	3782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=59;PP=2123;SC=CTTCGAGCCTCCATTCCAGAT;SOR=0.933;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=59;TCR=60;TR=118;WE=16534263;WS=16534245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr1	16534646	rs221058	C	G	3783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=65;NR=64;PP=2246;SC=ACTACCTGGCCAGGCTCTAGG;SOR=0.764;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=65;TCR=64;TR=129;WE=16534654;WS=16534636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr1	16534730	rs221059	G	A	1864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=35;PP=1090;SC=CCTAGGGTTGGGGGCAAGGAG;SOR=1.410;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=23;TCR=35;TR=58;WE=16534738;WS=16534720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	16543175	rs221024	A	C	3827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=82;PP=2091;SC=GCTTACCCTGAGCCAAACCCT;SOR=1.273;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=135;TCF=53;TCR=82;TR=135;WE=16543183;WS=16543165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr1	16731510	rs525409	C	G	3860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=48;PP=2402;SC=GCCAGCGTCACAGAGAAGCCC;SOR=1.098;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=76;TCR=48;TR=124;WE=16731518;WS=16731500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
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chr1	16778265	rs279782	G	T	2417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=20;PP=1572;SC=GGCCCTCCTTGTGGGGTTTTC;SOR=1.911;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=58;TCR=20;TR=78;WE=16778273;WS=16778255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr1	16802890	rs696095	G	A	278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQ=56.14;NF=8;NR=2;PP=124;SC=GGTGCACAGCGTACCTGGGTG;SOR=1.445;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=16802898;WS=16802880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
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chr1	16862340	rs200564364	G	A	840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=419;ExcessHet=3.0103;FS=1.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.10;MQRankSum=-8.477;QD=2.01;ReadPosRankSum=0.935;SOR=0.492;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:344,75:0.18:419
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chr1	16862461	rs145386412	T	A	32003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1382;ExcessHet=3.0103;FS=3.349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.29;MQRankSum=-22.386;QD=23.17;ReadPosRankSum=-1.729;SOR=0.855;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:516,865:0.63:1381
chr1	16862502	rs141629643	A	G	22347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=3.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1440;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.436;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-20.429;NF=541;NR=550;PP=2962;ReadPosRankSum=1.837;SC=ATCAATTCGTAATTTCCCATC;SOR=0.557;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=1662;TCF=793;TCR=869;TR=1091;WE=16862510;WS=16862492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:490,947:0.66:1437
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chr1	16862712	rs61769538	G	T	2450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=3.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.47;MQRankSum=-6.860;QD=26.35;ReadPosRankSum=-1.366;SOR=1.276;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,58:0.62:93
chr1	16862714	rs61769539	T	G	2301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=2.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.43;MQRankSum=-6.746;QD=26.16;ReadPosRankSum=-1.597;SOR=1.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,55:0.62:88
chr1	16862732	.	A	G	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.086;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.64;MQRankSum=-4.251;QD=8.88;ReadPosRankSum=-2.567;SOR=0.350;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr1	16863304	rs61769542	T	C	6625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=5.355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.59;MQRankSum=-12.411;QD=12.53;ReadPosRankSum=-6.878;SOR=1.064;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:351,178:0.34:529
chr1	16863308	rs112689425	G	T	7135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=550;ExcessHet=3.0103;FS=6.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.51;MQRankSum=-12.123;QD=12.97;ReadPosRankSum=-5.214;SOR=1.110;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:357,193:0.35:550
chr1	16863313	rs76539488	C	T	2617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=580;ExcessHet=3.0103;FS=2.917;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.45;MQRankSum=-6.170;QD=4.51;ReadPosRankSum=-2.160;SOR=0.973;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:439,141:0.24:580
chr1	16863314	rs74927161	A	G	7880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=587;ExcessHet=3.0103;FS=7.244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.42;MQRankSum=-11.861;QD=13.43;ReadPosRankSum=-3.199;SOR=1.161;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:365,222:0.38:587
chr1	16863328	rs61769543	T	G	6972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=3.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=700;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.986;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-10.369;NF=248;NR=161;PP=2962;ReadPosRankSum=0.094;SC=AAGAAAGGCGTCGAGTCCTGT;SOR=1.040;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=768;TCF=433;TCR=335;TR=409;WE=16863336;WS=16863294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:382,318:0.45:700
chr1	16863352	rs61769544	C	T	9980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-2.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=757;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.048;HP=4;HapScore=1;MGOF=42;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-9.650;NF=281;NR=234;PP=2962;ReadPosRankSum=3.278;SC=GTTGGGTAGGCGGAAGAGAGA;SOR=0.629;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=833;TCF=431;TCR=402;TR=515;WE=16863360;WS=16863342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:336,421:0.56:757
chr1	16863398	rs61769545	A	C	6854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-3.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=586;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.106;HP=2;HapScore=1;MGOF=40;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-7.920;NF=156;NR=201;PP=2962;ReadPosRankSum=2.112;SC=GGGAGGTTTCAGGATCTAAAG;SOR=0.467;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=614;TCF=255;TCR=359;TR=357;WE=16863406;WS=16863372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:270,316:0.54:586
chr1	16946535	rs437905	T	C	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=2.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQRankSum=0.267;QD=15.42;ReadPosRankSum=1.006;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr1	16948473	rs446948	C	T	1153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=1.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQRankSum=0.066;QD=10.78;ReadPosRankSum=1.350;SOR=0.890;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,54:0.50:107
chr1	16948473	.	CC	TG	666	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=27;MQ=59.8;NF=33;NR=17;PP=666;QD=14.3893574972;SC=AAGTCCTCCTCCTGGGCTGCC;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=98;TCF=63;TCR=35;TR=50;WE=16948482;WS=16948463;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:48,50:0.51:98
chr1	16948474	rs2781579	C	G	2923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=3.354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQRankSum=-0.985;QD=27.07;ReadPosRankSum=0.711;SOR=1.163;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,87:0.81:108
chr1	16950251	rs55674375	AG	A	47.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.122;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.17;MQRankSum=-0.431;QD=5.30;ReadPosRankSum=1.383;SOR=0.045;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr1	16950344	.	C	A	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.509;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.59;MQRankSum=0.759;QD=7.05;ReadPosRankSum=0.441;SOR=0.622;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,8:0.24:33
chr1	16950344	.	CAA	AAC	180	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;FR=0.5000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=16;MQ=55.73;NF=3;NR=4;PP=180;QD=33.3525535517;SC=GTGTTCCCCCCAAGTCCCCAG;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=25;TCF=16;TCR=9;TR=7;WE=16950354;WS=16950334;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:18,7:0.28:25
chr1	16950346	rs9663015	A	C	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.45;MQRankSum=0.828;QD=7.27;ReadPosRankSum=-0.022;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,8:0.25:32
chr1	16950470	rs12144467	C	T	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.87;MQRankSum=-0.320;QD=2.99;ReadPosRankSum=-2.091;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr1	16969246	rs11260857	G	A	1277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FS=3.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQRankSum=-6.053;QD=4.04;ReadPosRankSum=0.074;SOR=0.950;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:236,80:0.25:316
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chr1	16976032	rs2483047	A	C	2063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=360;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.854;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.038;NF=56;NR=59;PP=1479;ReadPosRankSum=-0.025;SC=TATGTGGACAACCTGGGAGGG;SOR=0.734;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=369;TCF=196;TCR=173;TR=115;WE=16976040;WS=16976022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:244,116:0.32:360
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chr1	16976649	rs1057333	C	T	1566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=630;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.22;MQRankSum=-6.826;QD=2.49;ReadPosRankSum=-1.029;SOR=0.692;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:549,81:0.13:630
chr1	16976679	rs1065528	G	A	10014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=545;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.626;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.876;NF=225;NR=258;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.044;SC=CCGTCTTCACGCGTGTCTCTG;SOR=0.612;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=651;TCF=298;TCR=353;TR=483;WE=16976689;WS=16976669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,421:0.77:545
chr1	16976681	rs3175284	G	T	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=531;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.00;MQRankSum=-6.698;QD=0.30;ReadPosRankSum=0.973;SOR=0.652;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:460,71:0.13:531
chr1	17017675	rs2743471	C	A	14632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=555;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=236;NR=290;PP=2965;SC=CAGTCAAGACCCGCTGCCAGG;SOR=0.929;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=527;TCF=237;TCR=290;TR=526;WE=17017683;WS=17017665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,553:1.00:553
chr1	17022840	.	G	A	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.579;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.660;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.818;NF=12;NR=2;PP=207;ReadPosRankSum=0.130;SC=AGGAGGTCCCGAGGTTGGTGT;SOR=0.123;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=36;TCF=34;TCR=2;TR=14;WE=17022848;WS=17022830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,14:0.37:38
chr1	17022921	rs200976124	C	T	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FS=1.575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-2.143;QD=1.63;ReadPosRankSum=0.959;SOR=0.522;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:149,32:0.18:181
chr1	17022952	rs557690	C	A	5766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=109;NR=103;PP=2965;SC=TCCTCCTCCTCCATCTTCAGC;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=213;TCF=109;TCR=104;TR=212;WE=17022960;WS=17022942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr1	17023110	rs11260887	G	A	1274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.889;NF=31;NR=26;PP=806;ReadPosRankSum=-0.577;SC=GTTGAGCAGCGGCTGAAACCC;SOR=0.683;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=133;TCF=74;TCR=59;TR=57;WE=17023118;WS=17023100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,62:0.43:143
chr1	17023126	rs2610633	C	G	1847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.949;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.51;MQRankSum=1.281;NF=42;NR=36;PP=1076;ReadPosRankSum=1.901;SC=AACCCCGCAGCTGGCGGTGTG;SOR=0.556;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=136;TCF=76;TCR=60;TR=78;WE=17023134;WS=17023116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,86:0.58:149
chr1	17023143	rs559507	C	T	1183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.608;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.439;NF=31;NR=22;PP=726;ReadPosRankSum=-1.337;SC=TGTGGGGCTCCGGACTGGTAA;SOR=0.761;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=138;TCF=80;TCR=58;TR=53;WE=17023151;WS=17023133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,60:0.39:153
chr1	17023182	rs614461	C	G	1269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-5.004;NF=33;NR=24;PP=733;ReadPosRankSum=-0.329;SC=CGGCAGCGGCCAATCGGGCTG;SOR=0.647;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=139;TCF=81;TCR=58;TR=57;WE=17023190;WS=17023172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,64:0.41:155
chr1	17023376	rs613579	C	T	4751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=534;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.767;NF=116;NR=113;PP=2962;ReadPosRankSum=1.102;SC=CCAGTAGCTCCGAGTTGTCGC;SOR=0.695;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=506;TCF=255;TCR=251;TR=229;WE=17023384;WS=17023366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:295,239:0.45:534
chr1	17023403	rs10907267	G	A	4208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=469;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.462;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.922;NF=87;NR=117;PP=2635;ReadPosRankSum=-0.710;SC=GGAACATCACGTTGAAAGACT;SOR=0.918;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=443;TCF=202;TCR=241;TR=204;WE=17023411;WS=17023393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:253,213:0.46:466
chr1	17023483	rs563062	C	T	1077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.676;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.127;NF=6;NR=40;PP=850;ReadPosRankSum=0.312;SC=ACCCCTCACCCGCCCCTCTGC;SOR=1.235;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=97;TCF=15;TCR=82;TR=46;WE=17023491;WS=17023473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,46:0.46:101
chr1	17023509	rs563142	T	C	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=3.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.109;QD=11.05;ReadPosRankSum=-2.281;SOR=1.956;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,22:0.43:51
chr1	17023509	.	TCC	CCA	402	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=22;MMLQ=27;MQ=59.95;NF=0;NR=16;PP=402;QD=28.4667421789;SC=CCTTCCCAACTCCAGATTGGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=1;TCR=44;TR=16;WE=17023519;WS=17023499;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:29,16:0.36:45
chr1	17023511	rs563144	C	A	1836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.94;NF=1;NR=40;PP=538;SC=TTCCCAACTCCAGATTGGATG;SOR=5.464;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=41;TCF=1;TCR=40;TR=41;WE=17023519;WS=17023499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	17025992	rs12026928	G	A	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=1.160;QD=8.16;ReadPosRankSum=1.146;SOR=0.763;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,29:0.44:66
chr1	17026043	.	G	GGCA	2172.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=0.000;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.610;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=6.077;NF=12;NR=21;PP=1119;ReadPosRankSum=-1.000;SC=CGGCGGCGGCGGCAGCTGCTG;SOR=0.612;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=29;TCR=52;TR=33;WE=17026051;WS=17026033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,66:0.43:152
chr1	17026087	rs678369	G	A	1517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=6.130;NF=36;NR=27;PP=744;ReadPosRankSum=0.004;SC=CGGCGCAGCCGTTAGGCACGT;SOR=0.660;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=161;TCF=94;TCR=67;TR=63;WE=17026095;WS=17026077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,83:0.43:192
chr1	17026551	rs665763	G	C	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=8;PP=201;ReadPosRankSum=-0.576;SC=GCTCGGGCAAGTGCCCGGTAG;SOR=0.586;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=40;TCF=23;TCR=17;TR=18;WE=17026559;WS=17026541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,23:0.44:52
chr1	17029257	rs12125112	T	C	1912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.052;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.943;NF=38;NR=52;PP=1232;ReadPosRankSum=-1.297;SC=CATGTAGATGTCAGCTGCCTG;SOR=0.907;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=210;TCF=91;TCR=119;TR=90;WE=17029265;WS=17029247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,95:0.43:222
chr1	17029462	rs11260891	A	G	2557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-0.078;NF=69;NR=55;PP=1578;ReadPosRankSum=0.112;SC=CTAGTGCTGGAAAGCCCTGGG;SOR=0.714;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=252;TCF=139;TCR=113;TR=124;WE=17029470;WS=17029452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,131:0.48:271
chr1	17029513	rs523936	C	G	1259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=35;PP=835;ReadPosRankSum=0.272;SC=ATGCAGACAGCCTTTCCCCCA;SOR=0.677;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=49;TCR=79;TR=57;WE=17029521;WS=17029503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,60:0.44:137
chr1	17030325	rs601893	A	G	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.394;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=500;ReadPosRankSum=0.659;SC=AGCAAGTGATAAGAGTAGTCT;SOR=0.039;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=11;WE=17030344;WS=17030315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr1	17030336	rs4661915	C	T	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.161;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=500;ReadPosRankSum=-0.254;SC=AGAGTAGTCTCCGATATTGGC;SOR=0.033;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=14;WE=17030344;WS=17030315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr1	17030716	rs4661917	G	A	1371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.947;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=43;PP=990;ReadPosRankSum=0.516;SC=GTCCTACTCAGCCATGCCTTT;SOR=1.122;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=113;TCF=31;TCR=82;TR=56;WE=17030724;WS=17030706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,59:0.50:117
chr1	17033758	rs1736691	A	G	1394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.630;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-10.267;NF=39;NR=22;PP=839;ReadPosRankSum=0.629;SC=GAGAGAATGCAACAGGAGCAG;SOR=0.620;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=134;TCF=89;TCR=45;TR=61;WE=17033766;WS=17033748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,69:0.47:147
chr1	17033805	rs59259153	C	T	2017.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.063;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-12.180;NF=52;NR=42;PP=1221;ReadPosRankSum=0.287;SC=CGTGCGCAGGCAGTGGGTGCA;SOR=0.619;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=197;TCF=114;TCR=83;TR=94;WE=17033813;WS=17033795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,102:0.48:211
chr1	17033854	rs2476568	C	T	2418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.771;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-9.574;NF=59;NR=51;PP=1419;ReadPosRankSum=-0.294;SC=TCAGCGGCCGCGTACCCGTCG;SOR=0.656;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=237;TCF=119;TCR=118;TR=110;WE=17033862;WS=17033844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,120:0.48:252
chr1	17034041	rs2743505	T	C	1461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=30;PP=1043;SC=CGCGCTGACCTCTAGCTCCCC;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=11;TCR=30;TR=41;WE=17034049;WS=17034031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	17034125	rs141324796	C	CAGCT	784.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.629;NF=2;NR=10;PP=553;ReadPosRankSum=-0.032;SC=CAGCAGCAGCCAGCTGAGCAC;SOR=0.848;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=12;WE=17034133;WS=17034115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr1	17034250	rs61773400	C	G	180.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.60;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	17034455	rs140689885	CGCGCGCGT	C	2135.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.663;NF=10;NR=17;PP=2973;ReadPosRankSum=-0.834;SC=CCGTCGTGGGCGCGCGCGTGC;SOR=0.730;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=83;TCF=31;TCR=52;TR=27;WE=17034470;WS=17034445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,60:0.40:149
chr1	17044511	rs2773185	T	C	2003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=19;PP=1154;SC=TCCCAGCTGCTCTTCCTGCAT;SOR=1.362;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=41;TCR=19;TR=60;WE=17044519;WS=17044501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
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chr1	17044695	rs2773186	A	G	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.346;NF=6;NR=13;PP=248;ReadPosRankSum=-0.549;SC=CCAGCGCCCAATCACACACAG;SOR=0.577;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=45;TCF=13;TCR=32;TR=19;WE=17044703;WS=17044685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,22:0.44:50
chr1	17046361	rs3856291	A	T	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.392;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=4;PP=539;ReadPosRankSum=0.256;SC=TGGAGGGATCATTGCCCTGGA;SOR=1.150;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=46;TCF=38;TCR=8;TR=29;WE=17046369;WS=17046351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,29:0.62:47
chr1	17046456	rs3856292	T	C	4512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.141;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=110;NR=63;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.709;SC=GGAGTGATCTTACTCAGGGTA;SOR=0.818;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=234;TCF=146;TCR=88;TR=173;WE=17046464;WS=17046446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,188:0.74:253
chr1	17046595	rs3856293	T	C	6105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.462;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.800;NF=118;NR=129;PP=2962;ReadPosRankSum=0.510;SC=TTCACCACCTTGGGGTGGCCA;SOR=0.652;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=325;TCF=153;TCR=172;TR=247;WE=17046603;WS=17046585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,265:0.77:346
chr1	17046613	rs3856294	C	T	5730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=343;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.99;MQRankSum=-0.585;NF=106;NR=127;PP=2962;ReadPosRankSum=0.531;SC=CCAAAGCGGGCAGTCAGATGC;SOR=0.702;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=314;TCF=141;TCR=173;TR=233;WE=17046621;WS=17046603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,254:0.74:343
chr1	17046698	rs3982089	C	G	2576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.197;NF=32;NR=59;PP=1554;ReadPosRankSum=-0.164;SC=GTTGCTGCCCCGCCCCTGGCT;SOR=0.669;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=123;TCF=42;TCR=81;TR=91;WE=17046706;WS=17046688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,107:0.74:145
chr1	17083652	rs113710576	C	T	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.29;MQRankSum=-1.616;QD=2.28;ReadPosRankSum=-0.170;SOR=0.425;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr1	17083778	rs28455793	C	T	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.638;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.93;MQRankSum=0.742;QD=4.18;ReadPosRankSum=0.052;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr1	17083807	rs9286084	T	C	208.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=37.83;QD=29.83;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	17083808	rs140260478	G	A	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.83;MQRankSum=-1.068;QD=5.82;ReadPosRankSum=-1.981;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,2:0.29:7
chr1	17083816	rs11260920	G	A	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.83;MQRankSum=-1.068;QD=5.82;ReadPosRankSum=-1.981;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,2:0.29:7
chr1	17083872	rs61635893	G	A	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.83;MQRankSum=1.282;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr1	17083919	rs143067724	G	A	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.63;MQRankSum=-0.913;QD=10.78;ReadPosRankSum=2.200;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
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chr1	17084021	rs2446543	C	G	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=6.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.93;MQRankSum=-4.041;QD=2.36;ReadPosRankSum=1.359;SOR=0.224;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:113,27:0.19:140
chr1	17084536	rs142741624	TGGAACA	T	285.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FS=3.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.42;MQRankSum=-2.031;QD=1.92;ReadPosRankSum=-2.222;SOR=1.210;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:131,18:0.12:149
chr1	17084948	rs199741699	A	C	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FS=3.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.45;MQRankSum=0.454;QD=0.53;ReadPosRankSum=-1.410;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:207,34:0.14:241
chr1	17084968	rs2761533	G	C	3504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.311;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.289;NF=104;NR=66;PP=2533;ReadPosRankSum=0.364;SC=CACCGATTCCGCAAGCTGACT;SOR=0.916;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=351;TCF=204;TCR=147;TR=170;WE=17084976;WS=17084958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,168:0.52:324
chr1	17085165	rs2490828	G	C	3279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.61;QD=30.37;SOR=2.437;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr1	17085412	rs872964	C	T	2556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-2.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=354;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.341;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.555;NF=92;NR=74;PP=2062;ReadPosRankSum=0.353;SC=GTTGTGCATGCGGTTCGGAGG;SOR=0.993;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=387;TCF=201;TCR=186;TR=166;WE=17085420;WS=17085402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:214,140:0.40:354
chr1	17085427	rs2002186	T	C	8247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=383;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-13.284;NF=140;NR=152;PP=2962;ReadPosRankSum=3.628;SC=CGGAGGTAAATGTGAACCGAG;SOR=0.675;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=407;TCF=195;TCR=212;TR=292;WE=17085435;WS=17085417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,262:0.68:383
chr1	17085502	rs2329006	T	C	2317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=6.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.48;MQRankSum=-2.402;QD=13.71;ReadPosRankSum=0.458;SOR=1.196;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,92:0.54:169
chr1	17085542	rs2261754	G	A	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=3.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.20;MQRankSum=0.740;QD=2.30;ReadPosRankSum=0.349;SOR=1.164;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,19:0.16:119
chr1	17085564	rs3851921	A	G	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.05;MQRankSum=-3.769;QD=4.34;ReadPosRankSum=-1.362;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,16:0.19:84
chr1	17085589	rs371449598	AGCGCTG	A	282.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=1.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.97;MQRankSum=-4.320;QD=3.21;ReadPosRankSum=-2.761;SOR=1.006;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,13:0.15:88
chr1	17085671	rs3863806	C	G	1226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.14;MQRankSum=-6.512;QD=13.19;ReadPosRankSum=-0.625;SOR=0.657;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,40:0.43:93
chr1	17085677	rs3863805	G	A	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.89;MQRankSum=-6.160;QD=4.78;ReadPosRankSum=0.699;SOR=0.737;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,27:0.29:92
chr1	17085712	rs3863803	C	T	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-5.941;NF=19;NR=12;PP=298;ReadPosRankSum=-0.253;SC=CCCCGGCCCTCCGGTTCCAGG;SOR=0.696;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=115;TCF=61;TCR=54;TR=31;WE=17085720;WS=17085702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,26:0.24:110
chr1	17085834	rs2005622	G	T	3358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=78;NR=60;PP=2525;SC=CGGGCCGCAGGGTGAAGCACC;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=138;TCF=78;TCR=60;TR=138;WE=17085842;WS=17085824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr1	17085995	.	G	GC	583.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-1.224;NF=0;NR=17;PP=438;ReadPosRankSum=1.438;SC=CCCAACGCCCGCCCCCCCGCC;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=17;WE=17086003;WS=17085985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,25:0.64:39
chr1	17086052	rs1057286	T	C	328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.19;QD=25.29;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	17086941	rs28462251	C	T	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FS=38.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.14;MQRankSum=-4.257;QD=0.37;ReadPosRankSum=-1.181;SOR=4.312;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:176,22:0.11:198
chr1	17087072	rs79486936	G	A	1890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=572;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.87;MQRankSum=-9.000;QD=3.31;ReadPosRankSum=2.848;SOR=0.758;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:437,135:0.24:572
chr1	17087262	rs2926375	C	T	1542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.917;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.977;NF=57;NR=32;PP=1196;ReadPosRankSum=-0.672;SC=TCGCCTTTCTCCTGGAAGAGG;SOR=1.091;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=293;TCF=171;TCR=122;TR=89;WE=17087270;WS=17087252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:215,89:0.29:304
chr1	17087365	rs2446556	C	G	7952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=394;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.080;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.983;NF=163;NR=153;PP=2962;ReadPosRankSum=0.733;SC=TGTAGTGGAACGCCCTGGAGA;SOR=0.629;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=382;TCF=194;TCR=188;TR=316;WE=17087373;WS=17087355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,331:0.84:394
chr1	17087432	rs2446554	G	T	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.15;MQRankSum=-10.697;QD=0.46;ReadPosRankSum=-0.564;SOR=0.669;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:271,38:0.12:309
chr1	17087459	rs11576695	A	G	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.59;MQRankSum=1.007;QD=1.12;ReadPosRankSum=-1.884;SOR=0.726;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:250,48:0.16:298
chr1	17087465	rs11260924	G	A	2307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.279;NF=58;NR=62;PP=1828;ReadPosRankSum=0.969;SC=GTCCATTAAGGGCCCACAGCG;SOR=0.698;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=305;TCF=146;TCR=159;TR=120;WE=17087473;WS=17087449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,116:0.39:298
chr1	17087521	rs11589598	G	A	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=352;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.79;MQRankSum=-3.702;QD=0.12;ReadPosRankSum=0.615;SOR=0.641;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:310,39:0.11:349
chr1	17087531	.	G	A	858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=371;ExcessHet=3.0103;FS=0.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.00;MQRankSum=4.721;QD=2.32;ReadPosRankSum=1.517;SOR=0.651;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:294,76:0.21:370
chr1	17087541	rs113982165	GGTGCT	G	3464.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=376;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.488;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-13.392;NF=11;NR=66;PP=2943;ReadPosRankSum=0.022;SC=GCATGTAGCAGGTGCTGTAGC;SOR=0.848;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=251;TCF=44;TCR=207;TR=77;WE=17087553;WS=17087511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:268,104:0.28:372
chr1	17087582	rs10907280	G	A	3051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.887;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-16.694;NF=64;NR=80;PP=2113;ReadPosRankSum=3.320;SC=GAAGTCATTCGATGGCGAGCG;SOR=0.768;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=329;TCF=152;TCR=177;TR=144;WE=17087603;WS=17087572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:194,119:0.38:313
chr1	17087593	rs12145944	C	T	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FS=1.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.66;MQRankSum=-9.470;QD=0.69;ReadPosRankSum=3.307;SOR=0.854;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:245,40:0.14:285
chr1	17087663	.	G	A	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.148;ClippingRankSum=0.000;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=3.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.09;MQRankSum=2.993;QD=4.02;ReadPosRankSum=1.584;SOR=0.315;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,22:0.28:80
chr1	17090902	.	A	AT	383.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.199;ClippingRankSum=0.000;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=1.827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.80;MQRankSum=-4.687;QD=2.72;ReadPosRankSum=0.513;SOR=0.945;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,24:0.17:141
chr1	17197563	rs7556482	G	T	1186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=12.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=375;ExcessHet=3.0103;FS=113.033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.82;MQRankSum=-13.926;QD=3.16;ReadPosRankSum=-2.828;SOR=7.427;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:328,47:0.13:375
chr1	17197571	rs76372883	G	A	2620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=424;ExcessHet=3.0103;FS=19.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.53;MQRankSum=-14.079;QD=6.18;ReadPosRankSum=-5.919;SOR=2.024;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:341,83:0.20:424
chr1	17197595	rs201521253	A	C	4536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=513;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.725;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-15.506;NF=140;NR=72;PP=2962;ReadPosRankSum=-3.130;SC=ACAGGACTCGACGCCTTTCTT;SOR=1.346;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=559;TCF=314;TCR=245;TR=212;WE=17197627;WS=17197585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:361,152:0.30:513
chr1	17197609	rs150993810	T	C	6422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=525;ExcessHet=3.0103;FS=11.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.72;MQRankSum=-15.180;QD=12.23;ReadPosRankSum=0.212;SOR=1.247;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:349,176:0.34:525
chr1	17197615	rs146936960	C	A	7183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=542;ExcessHet=3.0103;FS=15.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.44;MQRankSum=-15.776;QD=13.28;ReadPosRankSum=0.312;SOR=1.299;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:343,198:0.37:541
chr1	17197619	rs113661539	A	G	7250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=531;ExcessHet=3.0103;FS=17.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.32;MQRankSum=-15.650;QD=13.68;ReadPosRankSum=1.547;SOR=1.271;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:330,200:0.38:530
chr1	17197690	rs72642967	T	G	8438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=363;ExcessHet=3.0103;FS=2.904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.42;MQRankSum=-14.444;QD=23.25;ReadPosRankSum=0.916;SOR=0.559;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:148,215:0.59:363
chr1	17197694	rs72642969	G	A	8077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FS=3.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.09;MQRankSum=-13.987;QD=24.33;ReadPosRankSum=0.762;SOR=0.512;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:133,199:0.60:332
chr1	17197710	rs114564385	G	C	5958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FS=5.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.78;MQRankSum=-12.530;QD=23.65;ReadPosRankSum=2.328;SOR=0.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:105,147:0.58:252
chr1	17197715	rs202012907	G	A	5552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FS=3.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.32;MQRankSum=-12.183;QD=24.04;ReadPosRankSum=1.551;SOR=0.506;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,139:0.60:231
chr1	17197725	rs75030124	C	G	3141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FS=3.575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.64;MQRankSum=-9.149;QD=16.11;ReadPosRankSum=-0.153;SOR=0.463;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,106:0.54:195
chr1	17197736	.	G	C	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.412;ClippingRankSum=0.000;DP=163;ExcessHet=3.0103;FS=6.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.94;MQRankSum=-4.044;QD=0.86;ReadPosRankSum=-0.296;SOR=1.632;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:147,16:0.10:163
chr1	17197758	rs143100028	C	G	2542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.16;MQRankSum=-7.441;QD=23.33;ReadPosRankSum=-1.616;SOR=0.822;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,70:0.64:109
chr1	17197764	.	G	A	2281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.916;ClippingRankSum=0.000;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=8.330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.91;MQRankSum=-7.253;QD=25.35;ReadPosRankSum=-0.532;SOR=1.855;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,54:0.60:90
chr1	17197771	rs139655267	G	A	1926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=6.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.80;MQRankSum=-7.455;QD=25.69;ReadPosRankSum=0.022;SOR=1.680;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,44:0.59:75
chr1	17197777	rs149102001	T	G	1728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=2.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.39;MQRankSum=-7.169;QD=24.35;ReadPosRankSum=-0.638;SOR=1.316;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,43:0.61:71
chr1	17197779	rs138448635	G	A	1525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.23;MQRankSum=-6.410;QD=22.77;ReadPosRankSum=-0.562;SOR=0.824;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,38:0.57:67
chr1	17198209	rs61768108	A	C	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=9.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.47;MQRankSum=-3.675;QD=10.43;ReadPosRankSum=2.258;SOR=1.048;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr1	17198211	rs61768109	C	A	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=9.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.47;MQRankSum=-3.675;QD=10.43;ReadPosRankSum=1.672;SOR=1.048;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr1	17198215	rs61768117	A	C	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=13.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.44;MQRankSum=-3.781;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.821;SOR=1.044;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr1	17248500	rs6683035	A	G	2198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=53;NR=19;PP=1254;SC=AGGCATGCCCACAGCCTCCCC;SOR=1.730;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=53;TCR=19;TR=72;WE=17248508;WS=17248490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr1	17248532	rs6586566	A	G	3369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=40;PP=1968;SC=GGGGCTGGCGAGGGCACAGGA;SOR=1.115;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=69;TCR=40;TR=109;WE=17248540;WS=17248522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr1	17249395	rs6586567	A	G	4080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=87;PP=2636;SC=ACTGTAACTCACTGTGGGGCA;SOR=1.345;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=53;TCR=87;TR=140;WE=17249403;WS=17249385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr1	17251055	rs9435703	C	T	1472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=29;PP=897;SC=GGCCCACACACGGGGCAAAAG;SOR=1.220;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=20;TCR=29;TR=49;WE=17251063;WS=17251045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	17270751	rs12025984	G	A	752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.998;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=12;PP=348;ReadPosRankSum=1.022;SC=AGGATGGCGCGCGGGTGCGCC;SOR=0.593;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=52;TCF=30;TCR=22;TR=29;WE=17270759;WS=17270741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,35:0.53:66
chr1	17281003	rs2076606	T	C	759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=21;PP=506;SC=AGCCCCCATCTGAGGGAGGTG;SOR=1.942;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=29;WE=17281011;WS=17280993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	17287414	rs2273113	T	C	131.10	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=16.39;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr1	17295679	rs4920574	T	C	2961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=45;NR=55;PP=1813;SC=GGGCCCTGGCTAAGGTGGAGG;SOR=1.077;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=45;TCR=55;TR=100;WE=17295687;WS=17295669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr1	17297289	rs9435656	C	T	269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=8;PP=211;SC=TCCGGGACCCCAACTTCATCC;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=17297297;WS=17297279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	17299014	rs6661019	A	C	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.9876;FS=0.000;HP=10;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=39;ReadPosRankSum=-0.732;SC=CAGCCCCCCCACCCAGAGCCC;SOR=1.329;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=7;WE=17299022;WS=17299003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr1	17301672	rs761423	T	C	1587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.423;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=37;PP=860;ReadPosRankSum=-0.656;SC=GTGGATAATATGTGTTGAATA;SOR=0.696;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=129;TCF=67;TCR=62;TR=67;WE=17301680;WS=17301662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,74:0.54:138
chr1	17301780	rs761422	A	G	1699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.103;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=38;PP=855;ReadPosRankSum=-0.475;SC=GGAGCTCCTCATGGGCACACA;SOR=0.602;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=182;TCF=90;TCR=92;TR=79;WE=17301788;WS=17301770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,90:0.45:198
chr1	17301900	rs3830850	AGACAGAACCTGGCACGGGAGCCCG	A	196.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.830;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.928;NF=2;NR=5;PP=884;ReadPosRankSum=-0.734;SC=GGGATAGCCCAGACAGAACCT;SOR=1.179;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=7;WE=17301931;WS=17301890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr1	17303589	rs2235932	C	T	3183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.935;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=64;PP=1853;ReadPosRankSum=-0.593;SC=CTCGGTGACCCGGCAAGGCCC;SOR=0.830;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=269;TCF=143;TCR=126;TR=141;WE=17303597;WS=17303579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,154:0.52:294
chr1	17303792	rs4920588	C	T	478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=7;NR=8;PP=202;SC=AGGTCAGGCCCATAAGAGCCT;SOR=1.292;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=7;TCR=8;TR=15;WE=17303800;WS=17303782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	17312743	rs3170740	C	T	620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.856;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=15;PP=354;ReadPosRankSum=-1.928;SC=CGGGCAGCGGCGGCCAGGGCT;SOR=0.556;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=72;TCF=34;TCR=38;TR=30;WE=17312751;WS=17312733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,34:0.42:81
chr1	17313157	rs2076605	G	A	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=256;ReadPosRankSum=-0.667;SC=TCAGGCAGGAGCCACGCCCCC;SOR=0.473;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=29;TCF=10;TCR=19;TR=18;WE=17313165;WS=17313147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
chr1	17313343	rs9435659	G	A	763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.038;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=12;PP=574;ReadPosRankSum=-0.385;SC=CCTTGGACACGGCTGCAGCCA;SOR=0.972;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=65;TCF=42;TCR=23;TR=36;WE=17313351;WS=17313333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,36:0.52:69
chr1	17313454	rs7531163	G	A	1132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.11;ReadPosRankSum=0.913;SOR=0.604;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,57:0.56:102
chr1	17313654	rs761421	C	T	1312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.642;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=25;PP=770;ReadPosRankSum=-0.562;SC=CCGGTGGCCGCACCCGTCCCA;SOR=0.759;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=121;TCF=67;TCR=54;TR=58;WE=17313662;WS=17313644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,63:0.48:130
chr1	17314702	rs3738815	C	T	3788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=381;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.662;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=89;PP=2362;ReadPosRankSum=0.878;SC=AGACGCTGAACGAAGTGTCAA;SOR=0.794;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=352;TCF=175;TCR=177;TR=172;WE=17314710;WS=17314692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:195,186:0.49:381
chr1	17314942	rs9435662	G	A	1030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.752;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=30;PP=593;ReadPosRankSum=0.942;SC=AGTCATTGGCGCCGTCTCCGC;SOR=0.793;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=92;TCF=38;TCR=54;TR=50;WE=17314950;WS=17314932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,52:0.51:101
chr1	17319011	rs2076603	G	A	1947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.095;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=44;PP=1270;ReadPosRankSum=-0.711;SC=CCCAAAGTGGGGGTCTCATCA;SOR=0.761;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=175;TCF=92;TCR=83;TR=86;WE=17319019;WS=17319001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,96:0.48:199
chr1	17322848	.	T	A	1812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.091;ClippingRankSum=0.000;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.602;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=42;PP=1193;ReadPosRankSum=-0.117;SC=TGGGGGGGGCTATGGGCAGAG;SOR=0.765;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=150;TCF=78;TCR=72;TR=83;WE=17322856;WS=17322828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,85:0.56:151
chr1	17323449	rs9435736	T	C	123.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=54;SC=CCACCCTGCCTCACTCCACCT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=17323457;WS=17323448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	17331676	rs3738814	A	G	1018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.732;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=30;PP=669;ReadPosRankSum=-1.525;SC=AAGGCTATGGAGAGCCCTCCA;SOR=0.916;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=85;TCF=31;TCR=54;TR=44;WE=17331684;WS=17331666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,47:0.49:96
chr1	17354096	.	G	A	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.430;ClippingRankSum=0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5066;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=275;ReadPosRankSum=0.535;SC=CCGGCCCTAAGAGGATGAGTG;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=13;WE=17354104;WS=17354086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr1	17359676	rs1022580	C	A	1534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=29;PP=930;SC=ATTTATGTAACGTTCAACCTC;SOR=1.791;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=16;TCR=29;TR=45;WE=17359684;WS=17359666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	17371152	rs12073028	T	C	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=81;ReadPosRankSum=-0.492;SC=AACAGAGCCATCGGATGATCT;SOR=0.551;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=7;WE=17371160;WS=17371142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr1	17371494	rs9435745	C	T	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.56;BaseQRankSum=-2.412;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=25;ReadPosRankSum=0.637;SC=ACATTACTGACACATAATCTT;SOR=0.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=17371502;WS=17371484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr1	17380497	rs2746462	G	T	2320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=44;PP=1278;SC=TCAAGGAGAGGGCGACCACCG;SOR=1.402;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=30;TCR=44;TR=74;WE=17380505;WS=17380487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
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chr1	17395521	rs2076598	G	A	1344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.626;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=16;PP=834;ReadPosRankSum=0.697;SC=GGAGGCAAACGCCAGGGCCCC;SOR=0.430;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=114;TCF=85;TCR=29;TR=55;WE=17395529;WS=17395511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,62:0.50:124
chr1	17396498	rs2076596	T	C	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.153;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=251;ReadPosRankSum=-1.800;SC=GGCCTCCCCATTGGACAGCTT;SOR=0.093;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=15;WE=17396506;WS=17396488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr1	17396703	rs2076595	T	C	2829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=60;PP=1657;ReadPosRankSum=-2.237;SC=GGTTCCAGTCTAGGCAGCGCT;SOR=0.691;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=226;TCF=108;TCR=118;TR=118;WE=17396711;WS=17396693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,136:0.53:259
chr1	17398066	rs875219	G	C	1510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=3.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.61;ReadPosRankSum=-0.154;SOR=1.236;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,39:0.66:59
chr1	17398069	rs875218	T	C	1510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=2.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.05;ReadPosRankSum=-0.613;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,38:0.66:58
chr1	17401283	rs3818041	C	T	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.564;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=403;ReadPosRankSum=1.446;SC=TTATCTGCCCCACCCTCCCGA;SOR=1.551;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=46;TCF=38;TCR=8;TR=20;WE=17401291;WS=17401273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,20:0.42:48
chr1	17402116	rs3818035	G	T	1554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.374;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=19;PP=880;ReadPosRankSum=-0.460;SC=TGGCAGGGGCGGGTAATATAT;SOR=0.884;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=125;TCF=82;TCR=43;TR=61;WE=17402124;WS=17402106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,71:0.50:142
chr1	17402135	rs3818034	T	C	1816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.160;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=28;PP=1000;ReadPosRankSum=0.695;SC=ATTGGTTTGCTGCTACCCCAT;SOR=0.791;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=165;TCF=103;TCR=62;TR=79;WE=17402143;WS=17402125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,88:0.48:183
chr1	17402159	rs3818033	G	A	2478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.184;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=45;PP=1393;ReadPosRankSum=-0.408;SC=CTCCAGCCTCGGGAGGCTAGC;SOR=0.566;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=216;TCF=126;TCR=90;TR=107;WE=17402167;WS=17402149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,120:0.50:238
chr1	17402255	rs3818032	C	T	2828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=65;PP=1783;ReadPosRankSum=1.746;SC=GCTCCACGGGCGCCTGCACCT;SOR=0.681;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=259;TCF=127;TCR=132;TR=126;WE=17402263;WS=17402245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,136:0.49:279
chr1	17402347	rs2647205	C	T	6019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=114;PP=2965;SC=GGAGTTTCAGCAAATTACCCA;SOR=1.101;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=210;TCF=96;TCR=114;TR=209;WE=17402355;WS=17402337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr1	17402418	rs3818031	A	G	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=735;ReadPosRankSum=-0.311;SC=ACCCAGAGTGACATCAGCAGA;SOR=0.498;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=7;TCR=40;TR=19;WE=17402428;WS=17402408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,20:0.39:51
chr1	17402420	rs2647204	A	G	776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=24;PP=1229;ReadPosRankSum=0.311;SC=CCAGAGTGACATCAGCAGAGA;SOR=0.936;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=47;TCF=7;TCR=40;TR=28;WE=17402428;WS=17402408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,31:0.61:51
chr1	17405809	rs2057096	G	A	1914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.512;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=37;PP=1158;ReadPosRankSum=1.359;SC=ATGTCTTGCCGTTCACGGTCA;SOR=0.735;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=184;TCF=106;TCR=78;TR=86;WE=17405817;WS=17405799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,94:0.46:203
chr1	17405916	rs2057095	C	T	1017.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.414;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=32;PP=723;ReadPosRankSum=2.725;SC=GGGCCCTAGGCAGAGGGCACA;SOR=1.077;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=118;TCF=52;TCR=66;TR=54;WE=17405924;WS=17405906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,53:0.44:121
chr1	17405949	rs2057094	C	T	872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.895;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=27;PP=689;ReadPosRankSum=-2.413;SC=TCTTCTGCAGCCAGGGTCCTC;SOR=0.887;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=78;TCF=28;TCR=50;TR=41;WE=17405957;WS=17405939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,41:0.51:80
chr1	17406015	rs2057093	C	T	520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=16;PP=380;SC=TGTGGGCACCCAGTTTCCAGG;SOR=2.531;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=17406023;WS=17406005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	17406045	rs2057092	C	T	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.668;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=114;ReadPosRankSum=0.480;SC=CACGGTCTTCCTATGATTAAC;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=6;WE=17406053;WS=17406035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr1	17409017	rs2076617	G	A	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.518;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=314;ReadPosRankSum=0.261;SC=TGCTCCACCCGCAAGTGGCCC;SOR=0.405;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=47;TCF=35;TCR=12;TR=24;WE=17409025;WS=17409007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,29:0.56:52
chr1	17409241	rs2235925	G	A	927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=23;PP=534;ReadPosRankSum=1.300;SC=CACAAAGGAAGAAGAACGTCT;SOR=0.709;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=99;TCF=40;TCR=59;TR=40;WE=17409249;WS=17409231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,46:0.42:110
chr1	17410364	rs1883913	G	A	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.059;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=19;PP=454;ReadPosRankSum=1.112;SC=GAGAGGCCAGGAGAAAGGGTG;SOR=0.519;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=57;TCF=19;TCR=38;TR=30;WE=17410372;WS=17410354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,32:0.54:59
chr1	17418883	rs2647184	A	G	3366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=62;NR=29;PP=2058;SC=TCTAGGCTGGACTGGGCTGGG;SOR=1.514;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=62;TCR=29;TR=91;WE=17418902;WS=17418873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr1	17418894	rs2273111	A	G	802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.877;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=12;PP=524;ReadPosRankSum=-0.635;SC=CTGGGCTGGGATCACTCACTC;SOR=1.157;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=109;TCF=72;TCR=37;TR=40;WE=17418902;WS=17418873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,43:0.37:116
chr1	17419066	rs11203298	T	C	1853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.544;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=47;PP=1169;ReadPosRankSum=-1.223;SC=GATCTATCTGTTGCTGGAGCC;SOR=0.763;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=166;TCF=73;TCR=93;TR=83;WE=17419074;WS=17419056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,92:0.50:185
chr1	17422226	rs2076609	C	T	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.356;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=354;ReadPosRankSum=-0.964;SC=GCTCTGTTGCCGTCTCTAGGA;SOR=0.241;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=39;TCF=37;TCR=2;TR=19;WE=17422234;WS=17422216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,19:0.45:42
chr1	17422302	rs2076608	T	C	1769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.450;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=28;PP=1206;ReadPosRankSum=0.824;SC=TGTCTTGGGCTTTAGTCTCCT;SOR=1.045;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=164;TCF=103;TCR=61;TR=79;WE=17422310;WS=17422292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,82:0.46:180
chr1	17431618	rs11203300	A	G	1229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=23;PP=785;SC=GAGGGGCTTCAAGAGGAGACT;SOR=1.230;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=41;TCF=17;TCR=24;TR=40;WE=17431626;WS=17431608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	17431681	rs2647172	C	A	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.335;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.605;NF=1;NR=4;PP=55;ReadPosRankSum=-0.799;SC=TGAGCCCAGGCGTTTGAGACC;SOR=0.892;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=5;WE=17431689;WS=17431671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr1	17550225	rs3003481	T	C	3702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=61;PP=2132;SC=TCTATCCCTTTGCCCCTCCAG;SOR=0.751;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=71;TCR=61;TR=132;WE=17550233;WS=17550215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr1	17550303	rs2293913	T	C	960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.764;HP=1;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=27;PP=1350;ReadPosRankSum=2.226;SC=CCTCCATCACTGAGGGGCTTG;SOR=0.815;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=91;TCF=39;TCR=52;TR=45;WE=17550322;WS=17550293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,48:0.48:100
chr1	17550314	rs2293914	G	A	687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=20;PP=1146;ReadPosRankSum=-1.120;SC=GAGGGGCTTGGATTCCTCGGG;SOR=0.691;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=73;TCF=29;TCR=44;TR=33;WE=17550322;WS=17550293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,35:0.45:78
chr1	17586010	rs45438395	G	A	1496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=23;PP=734;ReadPosRankSum=-0.412;SC=TTGAGCCAAAGCTCAAACATC;SOR=0.701;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=131;TCF=79;TCR=52;TR=61;WE=17586018;WS=17586000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,73:0.49:148
chr1	17586134	rs3750300	A	G	2245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=52;PP=1305;ReadPosRankSum=0.652;SC=GGACATCTACATCTCTCCCAA;SOR=0.709;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=256;TCF=132;TCR=124;TR=106;WE=17586142;WS=17586124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:179,121:0.40:300
chr1	17609448	rs2293920	G	T	5629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=113;NR=79;PP=2965;SC=TGCTGGAGCCGCTGGGCCTCC;SOR=0.910;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=193;TCF=113;TCR=80;TR=192;WE=17609456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr1	17657534	rs11203366	G	A	2451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.462;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=49;PP=1495;ReadPosRankSum=-1.960;SC=TATTGCCCACGGCCCTCCAGC;SOR=0.640;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=234;TCF=133;TCR=101;TR=112;WE=17657542;WS=17657524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,121:0.48:250
chr1	17657616	rs11203367	T	C	1974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.519;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=46;PP=1019;ReadPosRankSum=0.212;SC=ACGATGAAAGTGGCCAGTGGT;SOR=0.637;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=185;TCF=92;TCR=93;TR=94;WE=17657624;WS=17657606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,99:0.50:199
chr1	17660499	rs874881	G	C	1162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.604;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=27;PP=572;ReadPosRankSum=0.760;SC=TACCTCACCGGGGTGGGTAAG;SOR=0.683;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=133;TCF=70;TCR=63;TR=56;WE=17660507;WS=17660487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,63:0.41:153
chr1	17660660	rs874882	G	A	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=392;ReadPosRankSum=-0.093;SC=CTGGGAGTTCGAAATATTCCA;SOR=0.749;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=23;WE=17660668;WS=17660650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,25:0.69:36
chr1	17660697	rs1548323	T	C	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=4;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=238;ReadPosRankSum=-0.612;SC=CACAAAGAAATACAATGTGGC;SOR=1.473;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=12;WE=17660705;WS=17660687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr1	17661128	rs1555658	A	C	936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.565;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=22;PP=560;ReadPosRankSum=0.087;SC=TCAAATATCTATAACAAAAAG;SOR=1.044;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=93;TCF=47;TCR=46;TR=41;WE=17661136;WS=17661118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,46:0.43:107
chr1	17661659	rs71575828	C	CAT	166.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.205;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.466;NF=2;NR=1;PP=52;ReadPosRankSum=1.163;SC=TATACACACACATATATATAT;SOR=0.255;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=3;WE=17661667;WS=17661649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr1	17661805	rs1635594	A	G	899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.769;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=19;PP=529;ReadPosRankSum=0.713;SC=AATCCTTACAACAATCCAGTG;SOR=0.425;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=80;TCF=39;TCR=41;TR=40;WE=17661813;WS=17661795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,44:0.48:92
chr1	17662541	rs1748034	A	C	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=239;ReadPosRankSum=0.145;SC=AGAGGGGCTCACACTATGGGT;SOR=0.776;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=12;WE=17662549;WS=17662531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr1	17662639	rs2240340	T	C	1539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.066;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=22;PP=1110;ReadPosRankSum=0.610;SC=CTCCTCTTACTTGATGGGATT;SOR=0.907;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=151;TCF=98;TCR=53;TR=66;WE=17662647;WS=17662629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,69:0.43:160
chr1	17662662	rs1748033	T	C	1809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=32;PP=1247;ReadPosRankSum=-0.116;SC=AGAAATCTCCTTGTGCGCAGA;SOR=0.722;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=187;TCF=111;TCR=76;TR=79;WE=17662670;WS=17662652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,85:0.42:201
chr1	17662751	rs1621005	C	G	2111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.122;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=56;PP=1395;ReadPosRankSum=1.671;SC=TCCTTTCCTACTTCTACTGGA;SOR=0.906;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=193;TCF=86;TCR=107;TR=97;WE=17662759;WS=17662741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,101:0.48:209
chr1	17662804	rs1748032	C	T	1201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=38;PP=844;ReadPosRankSum=0.614;SC=CAAATGCTGGCCTGTCCCACG;SOR=0.634;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=101;TCF=31;TCR=70;TR=54;WE=17662812;WS=17662794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,55:0.50:109
chr1	17662907	rs1748031	A	T	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=25;ReadPosRankSum=-0.439;SC=CAAAATCAGAATTTCACCAAT;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=3;WE=17662915;WS=17662897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr1	17664770	rs1635586	A	G	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=347;ReadPosRankSum=0.601;SC=CTTGTTGGCAAATCTGTTTTA;SOR=0.593;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=16;WE=17664778;WS=17664760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
chr1	17668270	rs1748021	A	G	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=90;ReadPosRankSum=-0.792;SC=TCCCAGCTAGAACTTCAGTCC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=5;WE=17668278;WS=17668264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr1	17674402	rs2240336	C	T	1439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=20;PP=905;ReadPosRankSum=-0.229;SC=CCAGGCAGCACGCGCAACAGC;SOR=0.642;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=100;TCF=70;TCR=30;TR=64;WE=17674410;WS=17674392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,66:0.58:113
chr1	17674537	rs2240335	C	A	3659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.349;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=90;PP=2497;ReadPosRankSum=-0.378;SC=CCATCAAACGCGTGATGGTAC;SOR=0.681;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=306;TCF=156;TCR=150;TR=171;WE=17674545;WS=17674527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,177:0.53:331
chr1	17681277	rs6683201	T	C	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.906;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=161;ReadPosRankSum=1.215;SC=CTGCTTCCGATTCTAGACAGC;SOR=0.260;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=12;WE=17681285;WS=17681267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr1	17683041	rs1635567	T	C	2409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.665;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=59;PP=1601;ReadPosRankSum=-0.216;SC=ATCCAGGCAATAGGGTAGCAT;SOR=0.503;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=212;TCF=93;TCR=119;TR=110;WE=17683049;WS=17683031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,114:0.49:233
chr1	17683157	rs1635566	A	G	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=219;ReadPosRankSum=-0.868;SC=GGGGGAAGTGAGTCAAAAGAA;SOR=0.399;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=12;WE=17683165;WS=17683147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr1	17685174	rs2428735	T	C	431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.114;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=308;ReadPosRankSum=0.479;SC=GTATTAAAGATATTTGACTTG;SOR=0.501;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=60;TCF=43;TCR=17;TR=22;WE=17685182;WS=17685164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,23:0.38:61
chr1	17707739	rs1204898	T	C	1044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.901;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=29;PP=733;ReadPosRankSum=-0.581;SC=TCCAGACTAATTTTCTCCACC;SOR=1.162;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=88;TCF=36;TCR=52;TR=44;WE=17707747;WS=17707729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,47:0.47:100
chr1	17707798	rs10788668	C	T	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.713;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=306;ReadPosRankSum=0.329;SC=GCTGATCAAACCTTTTGTCCT;SOR=1.329;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=17;WE=17707806;WS=17707788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr1	17708349	rs7556072	G	A	385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-2.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.087;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=204;ReadPosRankSum=-0.192;SC=GCAAAAGGCAGGGGGTCCTTG;SOR=1.345;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=12;WE=17708357;WS=17708339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr1	17718671	rs10709483	AG	A	4710.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=50;PP=2529;SC=AGCAACAGCCAGGGTGGCATC;SOR=0.754;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=66;TCF=13;TCR=53;TR=63;WE=17718679;WS=17718661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr1	17720391	rs6678552	G	A	1030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.778;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=18;PP=597;ReadPosRankSum=-0.550;SC=AAGGAAGGGGGTTCTTACCGT;SOR=0.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=90;TCF=53;TCR=37;TR=45;WE=17720399;WS=17720381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,49:0.51:97
chr1	17720439	rs6695849	T	C	1599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.686;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=35;PP=904;ReadPosRankSum=-1.627;SC=GATGTGTGACTGGCAAACAAT;SOR=0.451;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=141;TCF=74;TCR=67;TR=69;WE=17720447;WS=17720429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,76:0.47:160
chr1	17720615	rs10458537	A	C	1338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.217;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=29;PP=871;ReadPosRankSum=-1.414;SC=AGCTCAGTCCAATCTCTCAGG;SOR=0.899;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=107;TCF=54;TCR=53;TR=54;WE=17720623;WS=17720605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,62:0.48:128
chr1	17720686	rs34075690	AG	A	1326.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.266;HP=7;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.905;NF=22;NR=19;PP=1023;ReadPosRankSum=-0.725;SC=GTGGCCTCTGAGGGGGGAGGG;SOR=0.945;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=101;TCF=45;TCR=56;TR=41;WE=17720700;WS=17720676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,61:0.45:136
chr1	17721388	rs6691485	C	T	35.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.95;ReadPosRankSum=1.150;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr1	17721695	rs369334834	GTTT	G	76.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.35;ReadPosRankSum=0.524;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr1	17721721	.	TGA	T	146	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;FR=0.5000;HP=5;HapScore=2;MGOF=66;MMLQ=18;MQ=57.59;NF=1;NR=5;PP=146;QD=28.5;SC=GTTTGTTTTTTGAGAGTCTTG;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=6;WE=17721730;WS=17721711;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr1	17723476	rs61476146	C	CCA	667.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=583;ReadPosRankSum=1.952;SC=AGGAATGCACCCAGGTGGCTG;SOR=0.314;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=16;WE=17723484;WS=17723466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr1	17723739	rs12129196	G	A	769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.738;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=27;PP=619;ReadPosRankSum=1.554;SC=AGTGTTGGGCGGCGGGGGGCA;SOR=1.292;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=69;TCF=19;TCR=50;TR=34;WE=17723747;WS=17723729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,33:0.46:71
chr1	17725358	rs2244936	C	G	1459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.317;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=39;PP=1030;ReadPosRankSum=0.976;SC=GGGGCGACTGCGCATCCCTGG;SOR=0.974;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=118;TCF=44;TCR=74;TR=58;WE=17725366;WS=17725348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,65:0.49:133
chr1	17739586	rs942457	G	A	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=201;ReadPosRankSum=-0.574;SC=CCAGGCTCCGGATTCTCCAGC;SOR=0.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=11;WE=17739594;WS=17739576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr1	17739820	rs1075535	T	C	603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.660;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=17;PP=461;ReadPosRankSum=1.375;SC=GTGGCGTGCCTGTGCAGTCCT;SOR=0.304;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=60;TCF=24;TCR=36;TR=30;WE=17739828;WS=17739810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,28:0.46:61
chr1	17764627	rs113663016	G	A	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.078;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=147;ReadPosRankSum=0.769;SC=GAGGGAGCGTGACGCGAGGCG;SOR=1.312;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=11;WE=17764646;WS=17764617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr1	17914846	rs1193343	C	T	533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=6;PP=413;SC=CTGTCTGCGGCGCCCCTGGGG;SOR=2.419;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=23;TCF=16;TCR=7;TR=22;WE=17914854;WS=17914836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	17929972	rs75764220	G	T	1512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=16;PP=413;ReadPosRankSum=-0.920;SC=ACAGCCCACGGTGGTGCTCTC;SOR=0.630;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=66;TCR=43;TR=40;WE=17929980;WS=17929962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,44:0.38:116
chr1	17929990	rs111461054	A	C	1833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FS=1.299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.99;ReadPosRankSum=-1.833;SOR=0.564;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,61:0.40:153
chr1	17948305	rs139721173	G	GGGCCACAGCAGGTACT	336.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=1.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.35;ReadPosRankSum=-0.340;SOR=1.115;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,7:0.19:36
chr1	17964288	rs7521850	C	T	2408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.191;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=31;PP=1571;ReadPosRankSum=0.896;SC=CGTGAGCCACCGCGCCCAGCC;SOR=0.808;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=174;TCF=120;TCR=54;TR=98;WE=17964296;WS=17964278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,103:0.55:188
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chr1	17982559	rs867984	G	A	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.928;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=211;ReadPosRankSum=0.389;SC=CCTCGGCCACGGTGCATCCAA;SOR=0.846;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=60;TCF=30;TCR=30;TR=20;WE=17982567;WS=17982549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,25:0.33:75
chr1	17991052	rs6695710	T	C	4230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=68;PP=2638;ReadPosRankSum=0.559;SC=CTGTGGGCCCTGGGTCACTGT;SOR=0.889;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=165;TCF=96;TCR=69;TR=163;WE=17991060;WS=17991041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,165:0.99:167
chr1	17991196	rs11203432	A	G	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.943;NF=8;NR=19;PP=404;ReadPosRankSum=1.478;SC=TGGCATTCCAAGGATCGATTG;SOR=0.709;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=60;TCF=18;TCR=42;TR=27;WE=17991204;WS=17991186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,30:0.45:66
chr1	18016162	rs74061959	G	A	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.892;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=88;ReadPosRankSum=0.368;SC=CCATTATACAGGTTCAATCCA;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=6;WE=18016170;WS=18016152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr1	18016402	rs13376020	A	G	2243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=57;PP=1480;ReadPosRankSum=0.159;SC=TAGAACAGCCACTCCTGCCTG;SOR=0.682;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=158;TCF=62;TCR=96;TR=94;WE=18016410;WS=18016392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,100:0.56:177
chr1	18016441	rs13376112	T	C	1112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.946;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=36;PP=729;ReadPosRankSum=0.031;SC=GTGTTTCACATGCACCTTCAC;SOR=0.917;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=76;TCF=22;TCR=54;TR=48;WE=18016449;WS=18016431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,51:0.60:85
chr1	18016491	rs13375581	G	A	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.702;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=360;ReadPosRankSum=2.002;SC=ACCCTTTAAGGAAGGAAGGGC;SOR=1.136;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=18;WE=18016499;WS=18016481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr1	18017522	rs871087	T	C	2270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.512;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=34;PP=1283;ReadPosRankSum=0.693;SC=AACAATTTATTGCACTTCCTT;SOR=0.762;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=191;TCF=124;TCR=67;TR=94;WE=18017530;WS=18017512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,106:0.49:218
chr1	18017558	rs871088	A	G	3339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-1.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=359;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.249;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=63;PP=1923;ReadPosRankSum=-0.519;SC=TTCCACTCGCATACTCGACTG;SOR=0.774;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=319;TCF=184;TCR=135;TR=152;WE=18017566;WS=18017548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:188,171:0.48:359
chr1	18017704	rs871089	C	T	2138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=2.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=55;PP=1253;ReadPosRankSum=-0.583;SC=TGAACACTGCCGCATTAAGTC;SOR=0.646;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=161;TCF=51;TCR=110;TR=83;WE=18017712;WS=18017694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,93:0.50:186
chr1	18021406	rs905389	T	C	1257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=25;PP=847;ReadPosRankSum=0.196;SC=AATGCATCCGTATGGCAGCCC;SOR=0.719;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=137;TCF=78;TCR=59;TR=56;WE=18021414;WS=18021396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,61:0.41:149
chr1	18021444	rs41267491	G	T	1490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.937;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=25;PP=865;ReadPosRankSum=-1.632;SC=AACTGAGGCTGGTTAGGGGAG;SOR=0.879;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=154;TCF=88;TCR=66;TR=63;WE=18021452;WS=18021434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,72:0.43:169
chr1	18023290	rs2270979	C	T	1118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.748;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=13;PP=615;ReadPosRankSum=-0.469;SC=CAGGTGCTTCCCTTAATGCGC;SOR=0.966;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=82;TCF=56;TCR=26;TR=45;WE=18023298;WS=18023280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,52:0.55:94
chr1	18023365	rs2270978	C	T	2135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.124;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=44;PP=1180;ReadPosRankSum=1.362;SC=TCTCACTCAACGGGCACTGTG;SOR=0.669;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=170;TCF=90;TCR=80;TR=92;WE=18023373;WS=18023355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,104:0.54:191
chr1	18023509	rs2270977	T	C	1068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.450;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=23;PP=655;ReadPosRankSum=-0.732;SC=CCATGCCCGATAGCCACGTGG;SOR=0.730;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=108;TCF=59;TCR=49;TR=47;WE=18023517;WS=18023499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,55:0.45:122
chr1	18023690	rs2270976	A	G	1727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=32;PP=868;ReadPosRankSum=1.375;SC=CGACCCCGACATCTGGGTGCG;SOR=0.666;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=134;TCF=75;TCR=59;TR=71;WE=18023698;WS=18023680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,84:0.54:155
chr1	18023997	rs3835471	G	GC	296.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=324;ReadPosRankSum=1.304;SC=AACTACTTGGGCAGAGCAAAG;SOR=0.693;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=20;TCF=13;TCR=7;TR=10;WE=18024005;WS=18023987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr1	18149510	rs694214	G	T	1312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.057;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=20;PP=830;ReadPosRankSum=1.935;SC=CGCCATGGCTGCAAGAACCGT;SOR=0.884;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=157;TCF=101;TCR=56;TR=62;WE=18149518;WS=18149500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,66:0.40:167
chr1	18149566	rs2296035	C	A	2902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=348;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.817;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=61;PP=1840;ReadPosRankSum=-2.229;SC=GCACGGCCGGCTGGAATGAGC;SOR=0.741;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=307;TCF=170;TCR=137;TR=134;WE=18149574;WS=18149556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:198,148:0.43:346
chr1	18554345	rs61762155	T	C	1474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.002;HP=5;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=27;PP=2181;ReadPosRankSum=-0.070;SC=GCCCAGCCCCTCTGATCTGCT;SOR=0.516;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=145;TCF=91;TCR=54;TR=68;WE=18554364;WS=18554335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,77:0.47:164
chr1	18554356	rs3738087	C	T	1863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.246;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=35;PP=2181;ReadPosRankSum=-0.442;SC=CTGATCTGCTCGTGCCCTTAC;SOR=0.422;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=169;TCF=104;TCR=65;TR=83;WE=18554364;WS=18554335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,91:0.48:188
chr1	18702988	rs10796450	T	C	897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=4;NR=27;PP=666;SC=ACTCTTCCTTTGATCCCCAGC;SOR=3.545;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=31;WE=18702996;WS=18702978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	18703523	rs2271859	A	G	4745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.843;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=68;PP=1704;ReadPosRankSum=0.808;SC=GAGAACAACCACAGGGGCGGG;SOR=0.916;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=274;TCF=124;TCR=150;TR=122;WE=18703531;WS=18703513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,138:0.46:298
chr1	18703538	rs2271860	G	C	4257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.586;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=57;PP=1416;ReadPosRankSum=0.046;SC=GGCGGGTCCTGTCTGGGAGGT;SOR=0.806;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=224;TCF=91;TCR=133;TR=97;WE=18703546;WS=18703528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,111:0.45:245
chr1	18704862	rs1043459	A	G	986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.301;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=27;PP=638;ReadPosRankSum=0.558;SC=TGACATCTCCACGACCGGTTT;SOR=0.820;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=147;TCF=75;TCR=72;TR=51;WE=18704870;WS=18704852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,55:0.34:160
chr1	18807536	rs7512414	G	T	1340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.772;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=24;PP=899;ReadPosRankSum=1.951;SC=GACCGGCAAGGTGGTGCTGTC;SOR=0.795;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=88;TCF=51;TCR=37;TR=58;WE=18807544;WS=18807526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,62:0.63:99
chr1	18807620	rs34109355	G	C	883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=19;PP=482;ReadPosRankSum=-0.882;SC=CCAGCGGTGGGGTGGGAATGG;SOR=0.651;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=37;TCR=40;TR=37;WE=18807628;WS=18807610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,40:0.49:81
chr1	18807755	rs34976233	G	A	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=9;PP=362;ReadPosRankSum=-0.274;SC=AGCACCACAGGGCTGCAGCTG;SOR=0.644;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=54;TCF=34;TCR=20;TR=23;WE=18807763;WS=18807745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,27:0.42:64
chr1	18807781	rs35013594	C	T	671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.747;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=400;ReadPosRankSum=-0.020;SC=ATCCAAGAGGCCCCTATGTCC;SOR=1.319;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=61;TCF=42;TCR=19;TR=27;WE=18807789;WS=18807771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,32:0.44:73
chr1	18807897	rs2992755	C	G	7490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=155;NR=112;PP=2965;SC=CCTTGCTGCCCCAGCCAGGAA;SOR=0.947;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=267;TCF=155;TCR=112;TR=267;WE=18807905;WS=18807887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,289:1.00:289
chr1	18807938	rs2992754	C	A	3227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.345;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=68;PP=1963;ReadPosRankSum=0.639;SC=TAACCCTGACCCTCCCCATTT;SOR=0.574;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=308;TCF=170;TCR=138;TR=147;WE=18807956;WS=18807928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,156:0.47:332
chr1	18808056	rs7515150	G	C	3754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=78;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.111;SC=AGTAAACCCCGTGAGCATCCA;SOR=0.705;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=309;TCF=155;TCR=154;TR=156;WE=18808077;WS=18808046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,170:0.50:339
chr1	18808069	rs7528572	A	G	3628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.391;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=71;PP=2962;ReadPosRankSum=0.738;SC=AGCATCCAGGACTGGGGCAAC;SOR=0.661;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=304;TCF=155;TCR=149;TR=146;WE=18808077;WS=18808046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,167:0.49:341
chr1	18808292	rs2992753	C	A	9746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=165;NR=149;PP=2965;SC=AATGGAGGAGCATTTCATACA;SOR=0.722;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=315;TCF=165;TCR=150;TR=314;WE=18808300;WS=18808282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,355:1.00:355
chr1	18808465	rs3007718	T	A	4277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=74;PP=2850;SC=GAACAGGGGCTGCCTCGGGAG;SOR=1.148;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=54;TCR=74;TR=128;WE=18808473;WS=18808455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr1	18808526	rs2992752	A	C	4282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=59;PP=2345;SC=CTCCCCGCAGACAGGGCCGTG;SOR=0.719;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=74;TCR=59;TR=133;WE=18808534;WS=18808516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr1	18808711	rs2992751	G	C	1882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.587;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=36;PP=1286;ReadPosRankSum=1.529;SC=CGGTGGCCGGGACCAATTTCT;SOR=0.605;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=153;TCF=92;TCR=61;TR=85;WE=18808719;WS=18808701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,87:0.54:162
chr1	18809896	rs2992745	A	T	693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=21;PP=562;SC=TTCTAGGCAAACAGGCAACCC;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=18809904;WS=18809886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	18810344	rs2992740	G	T	2211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.49;SOR=3.296;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr1	18810344	.	GAGCCG	TAGCCC,TAGCCG	524	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=26,49;NR=4,7;PP=524,479;QD=19.2489291621;SC=GGCCAGGAAGGAGCCGAGGGA;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=56;TCF=49;TCR=7;TR=30,56;WE=18810357;WS=18810334;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.54:56
chr1	18810349	rs6667069	G	C	816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=7.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.19;ReadPosRankSum=1.300;SOR=1.571;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,35:0.48:73
chr1	18810484	rs1889861	G	A	4424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.70;ReadPosRankSum=1.894;SOR=0.718;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:150,115:0.43:265
chr1	18810484	.	GAA	AAC	2944	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;FR=0.5000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=48;NR=51;PP=2944;QD=20;SC=CTTATTGGAAGAAAGAGAAGC;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=232;TCF=117;TCR=115;TR=99;WE=18810494;WS=18810474;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:133,99:0.43:232
chr1	18810486	rs1889862	A	C	4424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FS=0.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.45;ReadPosRankSum=1.457;SOR=0.748;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:151,118:0.44:269
chr1	19027239	rs2743201	A	G	3707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=74;NR=55;PP=2187;SC=GAGGCTTCCCACCCACCGGCA;SOR=0.809;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=129;TCF=74;TCR=55;TR=129;WE=19027259;WS=19027229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr1	19029546	rs1416464	A	G	395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=2;PP=232;SC=AGCGTCCAGGATGAGGCCACT;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=19029554;WS=19029536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	19071153	rs142874250	C	CGGAT,CGGATGGAT	751.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=14,14;NR=1,1;PP=413,131;SC=GTAGACAGGACGGATGGATGG;SOR=5.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=15,15;WE=19071161;WS=19071143;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:16
chr1	19166294	rs12033832	G	A	2473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.457;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=51;PP=1497;ReadPosRankSum=2.710;SC=AGAGGGAGACGGATGAGGTGA;SOR=0.731;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=234;TCF=120;TCR=114;TR=106;WE=19166302;WS=19166284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,118:0.47:252
chr1	19175846	rs28374389	T	C	959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.943;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=16;PP=504;ReadPosRankSum=-0.770;SC=GTGTTGTTGATGGTGTGCCAG;SOR=0.443;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=75;TCF=49;TCR=26;TR=42;WE=19175854;WS=19175836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,47:0.57:82
chr1	19185956	rs76539818	C	A	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=202;ReadPosRankSum=2.749;SC=ACTTCCAGCCCCACACTGGAG;SOR=0.708;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=16;WE=19185964;WS=19185946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,20:0.43:46
chr1	19186129	rs9701796	G	C	5440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=86;PP=2965;SC=GAACAGGGAGGAGATGGTCTT;SOR=0.820;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=171;TCF=85;TCR=86;TR=171;WE=19186137;WS=19186119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr1	19186260	rs9700646	C	T	1454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=16;NR=29;PP=811;SC=GTCCTGCCACCGACTGTGGGG;SOR=1.791;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=16;TCR=29;TR=45;WE=19186268;WS=19186250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	19186320	rs9701803	G	C	229.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=7;PP=176;SC=GGAAAGGAGGGTGGAATTATG;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=19186328;WS=19186310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
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chr1	19202770	rs7550822	T	C	3358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=64;NR=56;PP=1984;SC=TCCGGTGGGATTGTCCTCCTC;SOR=0.724;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=120;TCF=64;TCR=56;TR=120;WE=19202778;WS=19202760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr1	19202896	rs2230707	G	A	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.802;HP=5;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=12;PP=368;ReadPosRankSum=-0.291;SC=ACTTGCCCCCGGCCAGGATGG;SOR=0.818;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=80;TCF=45;TCR=35;TR=28;WE=19202904;WS=19202886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,32:0.33:98
chr1	19202917	rs7550938	T	C	1017.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.71;ReadPosRankSum=-1.371;SOR=0.700;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,31:0.33:95
chr1	19202926	rs2230706	T	C	943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.897;SOR=0.785;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,28:0.30:92
chr1	19203997	rs2230705	C	G	3447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.73;SOR=0.886;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr1	19204154	rs6426813	G	A	306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=4;NR=5;PP=113;SC=TGGCTCCCCCGGTTGCCCAGG;SOR=1.445;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=9;TCF=4;TCR=5;TR=9;WE=19204162;WS=19204144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	19204173	rs6426814	A	G	272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=3;PP=84;SC=GGGGCCCAAAACACCACCTAC;SOR=0.859;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=8;WE=19204181;WS=19204163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	19205672	rs28497538	T	G	1095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.782;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=17;PP=586;ReadPosRankSum=-0.960;SC=GCAGTGCTGGTGCCTGAAATG;SOR=0.476;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=76;TCF=50;TCR=26;TR=45;WE=19205680;WS=19205662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,52:0.58:89
chr1	19208145	rs112548638	G	GGGTTGCCT	4094.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=18;PP=2713;SC=CAGGTGAGCAGGTGAACGTCC;SOR=1.473;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=39;TCF=20;TCR=19;TR=36;WE=19208153;WS=19208135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr1	19208944	rs28566028	A	G	1099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=7;PP=681;ReadPosRankSum=-0.765;SC=GCTGGGCTGCACCTCCCCCAC;SOR=1.358;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=37;WE=19208952;WS=19208934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,42:0.98:43
chr1	19209543	rs6426611	A	G	1072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=9;PP=833;SC=CAAGGGGCTCAGGGTGGCCTC;SOR=2.476;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=34;TCR=9;TR=43;WE=19209551;WS=19209533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	19210018	rs28508407	G	A	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=217;ReadPosRankSum=-0.811;SC=GCACTGAGCCGGGCCCCAGGA;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=13;WE=19210026;WS=19210008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr1	19215834	rs941495	T	C	8325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=155;NR=116;PP=2965;SC=GGGGCTGAGCTCTGCCCACCC;SOR=0.891;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=271;TCF=155;TCR=116;TR=271;WE=19215842;WS=19215824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,308:1.00:308
chr1	19243589	rs3748586	A	G	1469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.731;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=40;PP=1045;ReadPosRankSum=-0.011;SC=CTAGGATGGAAGGTAGGGGTG;SOR=0.593;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=112;TCF=37;TCR=75;TR=61;WE=19243597;WS=19243579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,64:0.53:120
chr1	19243651	rs78284463	G	A	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.105;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=228;ReadPosRankSum=-0.595;SC=ACTGGGGCCGGCCAGTGCCAG;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=12;WE=19243659;WS=19243641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr1	19282981	rs1886768	A	C	177.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=4;PP=63;SC=GCCTCCGCAGAGACGGCAGGA;SOR=1.179;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=7;WE=19282989;WS=19282971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	19401445	rs41273185	C	T	2702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.432;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=65;PP=1642;ReadPosRankSum=-0.051;SC=GCCCCCATTCCCCCTGAGTCA;SOR=0.739;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=262;TCF=125;TCR=137;TR=123;WE=19401453;WS=19401425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,134:0.47:284
chr1	19401542	rs16862503	A	T	608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.657;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=21;PP=424;ReadPosRankSum=-0.542;SC=CCGGGGAGGTAGTCATTGAGC;SOR=0.185;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=61;TCF=8;TCR=53;TR=26;WE=19401550;WS=19401532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,27:0.43:63
chr1	19408294	rs67232976	G	GC	2642.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.08;MQRankSum=1.438;NF=9;NR=54;PP=2098;ReadPosRankSum=1.235;SC=TTCTTCCCTGGCCCCATGTCT;SOR=0.683;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=142;TCF=17;TCR=125;TR=63;WE=19408303;WS=19408284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,132:0.49:267
chr1	19408380	rs12164540	T	C	968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.186;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=24;PP=588;ReadPosRankSum=-0.904;SC=ACGTTCACAATCTCCCCAACA;SOR=0.414;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=68;TCF=16;TCR=52;TR=32;WE=19408388;WS=19408370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,41:0.53:77
chr1	19411129	rs1043905	A	G	6991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=123;NR=119;PP=2965;SC=GTTTGATGTCATGGATGTTGA;SOR=0.755;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=242;TCF=123;TCR=119;TR=242;WE=19411137;WS=19411119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
chr1	19412464	rs2274009	C	T	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.882;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=94;ReadPosRankSum=-0.079;SC=TTGAGTAAGCCTCCATCCCCC;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=6;WE=19412472;WS=19412461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr1	19413261	rs12584	T	A	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.228;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=23;PP=445;ReadPosRankSum=0.013;SC=TTATTCTCCATCTCCTCCAAG;SOR=0.767;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=127;TCF=71;TCR=56;TR=44;WE=19413269;WS=19413251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,46:0.32:145
chr1	19413420	rs2274008	T	G	740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=21;PP=542;ReadPosRankSum=1.416;SC=ATGCCTTGGGTTTCAGGTTGC;SOR=1.839;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=25;WE=19413428;WS=19413410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,26:0.96:27
chr1	19415304	rs1043899	C	T	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.699;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=393;ReadPosRankSum=0.159;SC=TGGCCATGCGCTTCTTCTCTG;SOR=1.329;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=51;TCF=39;TCR=12;TR=24;WE=19415312;WS=19415294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,26:0.46:56
chr1	19419251	rs75794545	G	C	878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.446;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=16;PP=677;ReadPosRankSum=0.511;SC=ATGTCTCAAGGTAAACTAGGG;SOR=1.031;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=70;TCR=42;TR=42;WE=19419259;WS=19419241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,44:0.35:126
chr1	19420392	rs1106839	G	A	1811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=15;PP=1210;SC=GACCTAGTTCGGCGTTTTAGT;SOR=1.839;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=45;TCR=15;TR=60;WE=19420400;WS=19420382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	19426199	rs2236377	G	A	2394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=59;PP=1655;SC=TGAAGCTGTTGTTCCAAATAA;SOR=2.168;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=22;TCR=59;TR=81;WE=19426207;WS=19426189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr1	19431700	rs78576462	C	T	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=1.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.57;ReadPosRankSum=0.820;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,13:0.34:38
chr1	19433449	rs6426677	A	G	484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=10;PP=345;SC=TGAGGGCCTCAACGGGGACAT;SOR=2.584;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=19433457;WS=19433439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	19437185	rs10916957	G	T	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-1.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.654;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=7;PP=300;ReadPosRankSum=2.093;SC=GAAACACAAGGCATGTGAGGG;SOR=0.257;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=19;WE=19437193;WS=19437175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
chr1	19440107	rs9661719	A	G	264.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=220;SC=CTGGACTGCTAGATGAGAGAG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=19440115;WS=19440098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	19447843	rs1044010	C	G	1506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.594;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=35;PP=1016;ReadPosRankSum=3.330;SC=TGCTGCCGCACAGAGCACAGG;SOR=0.957;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=152;TCF=79;TCR=73;TR=66;WE=19447851;WS=19447833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,71:0.42:170
chr1	19448309	.	C	T	1549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.413;ClippingRankSum=0.000;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.13;ReadPosRankSum=-0.516;SOR=0.657;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,38:0.49:77
chr1	19448312	rs77437768	G	A	1540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.51;ReadPosRankSum=-0.050;SOR=0.720;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,43:0.49:88
chr1	19448326	rs6681662	C	T	2894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=32;PP=1742;SC=ATCTTGTTCACAGCTATATCT;SOR=1.423;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=62;TCR=32;TR=94;WE=19448334;WS=19448299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr1	19448608	rs7535738	C	G	328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=261;SC=TTGGACTACACCTGAACATGA;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=19448616;WS=19448598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	19455703	.	TA	T	87.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.601;ClippingRankSum=-0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=63;ReadPosRankSum=1.450;SC=TCTCCAGCATTAAAAAAAAAA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=6;WE=19455711;WS=19455693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr1	19470662	rs4912050	T	C	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=156;ReadPosRankSum=-0.407;SC=TTTCCTTTCTTGGTCACTCAC;SOR=0.460;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=12;WE=19470670;WS=19470652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
chr1	19476307	rs376797517	GA	G	41.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=22.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.70;ReadPosRankSum=-0.342;SOR=1.856;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,12:0.20:60
chr1	19481849	rs79789247	G	A	849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.951;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=10;PP=477;ReadPosRankSum=-1.033;SC=ACAGAAAAATGTTATAAAAGA;SOR=0.509;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=68;TCF=50;TCR=18;TR=34;WE=19481857;WS=19481839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,40:0.53:76
chr1	19483209	rs10799710	A	G	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=10;PP=477;ReadPosRankSum=1.045;SC=GGGGAGAGAAAATGACTAGAA;SOR=0.735;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=42;TCF=29;TCR=13;TR=28;WE=19483217;WS=19483199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,35:0.69:51
chr1	19486839	rs946419	T	C	890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=37;PP=918;SC=GGATAATACTTGTAAAAATCA;SOR=7.223;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=44;TCF=7;TCR=37;TR=43;WE=19486847;WS=19486829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	19487656	rs3748759	T	C	1415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.538;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=28;PP=616;ReadPosRankSum=0.529;SC=GGACAGAAAATGTCAGAGTCC;SOR=0.539;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=97;TCF=42;TCR=55;TR=53;WE=19487664;WS=19487646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,67:0.58:115
chr1	19491857	rs3748757	T	C	6321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=110;NR=110;PP=2965;SC=GGAGGCAAGATGGGAGAAAAA;SOR=0.813;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=220;TCF=110;TCR=110;TR=220;WE=19491865;WS=19491847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr1	19499560	rs16862578	T	C	1955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.087;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=42;PP=1239;ReadPosRankSum=0.613;SC=AAGATGGTGGTACAGTCGATA;SOR=0.610;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=182;TCF=92;TCR=90;TR=86;WE=19499568;WS=19499550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,94:0.47:201
chr1	19499835	rs951908	G	C	8176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=122;NR=135;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.668;SC=TTTAGGAGATGACTATAGGCA;SOR=0.292;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=257;TCF=122;TCR=135;TR=257;WE=19499843;WS=19499825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,286:1.00:287
chr1	19500729	rs6694521	G	A	2158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=15;PP=1356;SC=CAATAAACTGGTTACATTTCA;SOR=2.062;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=50;TCR=15;TR=65;WE=19500737;WS=19500719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr1	19503936	rs78463695	A	T	2252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.039;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=36;PP=1300;ReadPosRankSum=-1.465;SC=GAAGCAAAAAAGAACGTGTTG;SOR=0.802;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=196;TCF=119;TCR=77;TR=99;WE=19503944;WS=19503926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,110:0.49:225
chr1	19510394	rs3762396	A	G	7889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=155;NR=99;PP=2965;SC=GATGAACCTTAAAGACAAGTA;SOR=1.092;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=255;TCF=156;TCR=99;TR=254;WE=19510402;WS=19510384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,282:1.00:282
chr1	19513570	rs59833909	TTA	T,TTATA	382.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=201;ReadPosRankSum=-0.581;SC=CAAGAAAGTTTTATATATATA;SOR=2.584;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=16;TCF=10;TCR=6;TR=12;WE=19513579;WS=19513560;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.47,0.47:15
chr1	19513591	rs200315935	C	CAT	437.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=2.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.63;ReadPosRankSum=3.086;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr1	19526372	rs75749512	A	C	191.10	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5731;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=149;ReadPosRankSum=-0.489;SC=CAGAGCCAAAAACCCAAGGGG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=7;WE=19526380;WS=19526362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
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chr1	19557713	rs2275403	G	C	366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=9;NR=5;PP=297;SC=GCCCCAAACCGGACTCCGCTA;SOR=1.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=9;TCR=5;TR=14;WE=19557721;WS=19557703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	19559306	rs79432876	A	G	1323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.656;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=30;PP=752;ReadPosRankSum=1.542;SC=TACTAGAAAGAGAAACCAAAG;SOR=0.598;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=115;TCF=52;TCR=63;TR=57;WE=19559314;WS=19559296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,64:0.48:132
chr1	19559729	rs16862625	A	G	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=190;ReadPosRankSum=-0.750;SC=CCTCTGGAGCAATAAAGTCCA;SOR=0.871;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=11;WE=19559737;WS=19559719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr1	19561618	rs79970487	T	C	4332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=425;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.520;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=113;NR=80;PP=2673;ReadPosRankSum=-0.744;SC=CCTCTTAGGTTCATACCTGCC;SOR=0.746;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=383;TCF=218;TCR=165;TR=193;WE=19561626;WS=19561608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:207,213:0.51:420
chr1	19565338	rs709682	C	T	4449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.54;ReadPosRankSum=-0.204;SOR=0.700;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:125,115:0.48:240
chr1	19565344	rs709683	C	G	4517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FS=0.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.07;ReadPosRankSum=-0.080;SOR=0.635;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:129,121:0.48:250
chr1	19565587	rs75908290	G	T	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=9;PP=428;ReadPosRankSum=-2.280;SC=GTTGAGGCAAGACCTCACTTC;SOR=0.813;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=56;TCF=36;TCR=20;TR=26;WE=19565595;WS=19565577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,27:0.47:57
chr1	19566881	rs12084825	C	T	2757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=56;PP=1624;ReadPosRankSum=0.227;SC=CCAGGACAGCCTCATCCACCA;SOR=0.675;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=221;TCF=112;TCR=109;TR=113;WE=19566889;WS=19566871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,127:0.51:249
chr1	19566957	rs16862640	G	A	2042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=50;PP=1151;ReadPosRankSum=-2.309;SC=AAAAGTCATCGTTAACAGGAA;SOR=0.691;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=175;TCF=78;TCR=97;TR=91;WE=19566965;WS=19566947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,100:0.52:193
chr1	19568722	rs710866	G	C	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.933;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=143;ReadPosRankSum=-1.414;SC=ACACTCCATGGAACACCAACA;SOR=0.132;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=9;WE=19568730;WS=19568712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr1	19568972	rs710865	A	G	772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.076;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=16;PP=469;ReadPosRankSum=1.373;SC=TGGAAACTGAACACAAGTACA;SOR=0.408;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=69;TCF=28;TCR=41;TR=31;WE=19568980;WS=19568962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,36:0.44:81
chr1	19578027	rs2294943	C	T	1819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.635;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=54;PP=1173;ReadPosRankSum=-0.620;SC=GCACCACCCACCGCCGTCCCG;SOR=0.773;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=140;TCF=45;TCR=95;TR=78;WE=19578035;WS=19578012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,86:0.53:161
chr1	19578053	rs6680255	C	G	1113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.147;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=28;PP=653;ReadPosRankSum=-0.375;SC=CACCGCGCCGCGGGCTCCGCC;SOR=0.280;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=79;TCF=18;TCR=61;TR=40;WE=19578061;WS=19578043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,47:0.51:92
chr1	19578385	rs17522898	G	C	2743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.466;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=57;PP=1240;ReadPosRankSum=0.200;SC=CGGGACCCTGGGGGGAGCTCC;SOR=0.755;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=215;TCF=104;TCR=111;TR=110;WE=19578393;WS=19578375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,131:0.53:247
chr1	19578404	rs41264060	G	A	1812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=47;PP=1030;ReadPosRankSum=0.248;SC=CCGTGGGCTGGCTACCCAGCC;SOR=0.702;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=184;TCF=85;TCR=99;TR=86;WE=19578412;WS=19578394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,94:0.45:208
chr1	19581226	rs735026	G	A	3656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=51;PP=2187;SC=TAAGTCTCCAGTGCATTTAGA;SOR=0.886;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=122;TCF=71;TCR=51;TR=122;WE=19581234;WS=19581216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr1	19581442	.	G	GA	255.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.316;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.23;MQRankSum=0.471;QD=9.47;ReadPosRankSum=-1.585;SOR=0.743;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,24:0.89:27
chr1	19581467	rs1774081	C	T	947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=34;PP=931;SC=TCCAAGCTGCCAATCCAGGCC;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=35;WE=19581475;WS=19581457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	19582338	rs6694099	C	A	624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=2.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.57;ReadPosRankSum=-0.859;SOR=1.121;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,29:0.54:54
chr1	19582563	rs1557133	G	A	2940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=55;PP=1695;SC=GGCAGGGGGAGGAAGGCCCTT;SOR=1.015;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=47;TCR=55;TR=102;WE=19582571;WS=19582553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr1	19583400	rs1774075	A	G	632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=18;NR=5;PP=427;SC=AAGGGACCCCAACGTGGGGAC;SOR=2.124;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=23;WE=19583408;WS=19583390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	19583680	rs75881622	C	T	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=3.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.01;ReadPosRankSum=2.317;SOR=0.340;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,24:0.41:58
chr1	19583684	rs1774074	C	T	2047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.31;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	19583725	rs1738017	T	C	903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=16;PP=583;SC=CCCCAGCCATTGGCAGGCCGG;SOR=0.818;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=13;TCR=16;TR=29;WE=19583733;WS=19583715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	19583874	rs80329141	C	T	2229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=44;PP=1342;ReadPosRankSum=0.936;SC=CAAATGTACCCGGTGAGCAAA;SOR=0.707;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=238;TCF=136;TCR=102;TR=103;WE=19583882;WS=19583864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,114:0.43:267
chr1	19584004	rs1042380	G	A	2968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=55;PP=1764;SC=GCACAAAGGAGGAGGTGAATG;SOR=1.779;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=29;TCR=55;TR=84;WE=19584012;WS=19583994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr1	19584030	rs76779645	G	A	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=278;ReadPosRankSum=-1.359;SC=GTACTGCTGAGGAACGGAGGG;SOR=0.723;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=60;TCF=23;TCR=37;TR=22;WE=19584038;WS=19584020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,28:0.37:76
chr1	19584557	rs78298527	G	A	1458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.630;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=38;PP=898;ReadPosRankSum=0.245;SC=CTTTCTAGCTGAGCAAGTTAT;SOR=1.107;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=155;TCF=71;TCR=84;TR=62;WE=19584565;WS=19584547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,70:0.41:169
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chr1	19595159	rs116631486	C	T	2043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.493;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=37;PP=1073;ReadPosRankSum=1.478;SC=CCTTCTCCACCAGGGCAATGC;SOR=0.760;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=201;TCF=119;TCR=82;TR=92;WE=19595167;WS=19595149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,103:0.45:228
chr1	19595696	rs140814189	C	T	3467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.831;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.897;NF=90;NR=69;PP=2119;ReadPosRankSum=1.187;SC=ACCCCAGGAGCAGCCCAGGAC;SOR=0.746;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=302;TCF=169;TCR=133;TR=159;WE=19595704;WS=19595686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,169:0.51:331
chr1	19595760	rs76554243	A	G	5496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=446;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.115;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=116;NR=120;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.759;SC=AGCACCCCCAACTAACTGATT;SOR=0.581;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=401;TCF=194;TCR=207;TR=236;WE=19595768;WS=19595750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:191,254:0.57:445
chr1	19597156	rs115567428	T	A	917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.11;QD=31.65;SOR=3.334;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	19597274	rs140586925	TC	T	1031.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.250;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.530;NF=16;NR=6;PP=816;ReadPosRankSum=-0.496;SC=GCACGCAGTGTCTCTTCCACC;SOR=1.002;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=42;TCF=30;TCR=12;TR=22;WE=19597282;WS=19597264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,30:0.59:51
chr1	19597289	rs116080943	C	T	891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.310;NF=25;NR=12;PP=487;ReadPosRankSum=0.820;SC=TCCACCGGGGCGCTGTGGTCA;SOR=0.773;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=68;TCF=45;TCR=23;TR=37;WE=19597297;WS=19597279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,40:0.57:70
chr1	19597328	rs190747734	A	G	1486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.452;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=28;PP=848;ReadPosRankSum=0.148;SC=AGGTCCACTCAGGGACACTGC;SOR=0.542;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=117;TCF=71;TCR=46;TR=67;WE=19597336;WS=19597318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,73:0.58:126
chr1	19597477	rs115245335	C	T	828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=26;PP=552;ReadPosRankSum=0.627;SC=TGGTGGCTCACGCCTATAATC;SOR=0.631;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=78;TCF=19;TCR=59;TR=35;WE=19597485;WS=19597467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,37:0.46:80
chr1	19600323	rs115848326	C	G	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=4.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.34;ReadPosRankSum=1.071;SOR=0.142;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,7:0.27:26
chr1	19600370	rs184687027	T	C	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=1.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQRankSum=-4.310;QD=3.68;ReadPosRankSum=0.018;SOR=0.293;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,6:0.14:42
chr1	19600376	.	TT	GC	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.984;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=1.584;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQRankSum=-5.007;QD=4.37;ReadPosRankSum=-1.010;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,8:0.18:45
chr1	19600388	rs375898295	G	A	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=1.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQRankSum=-4.772;QD=7.36;ReadPosRankSum=-1.943;SOR=0.418;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,14:0.25:55
chr1	19600395	rs370005459	A	C	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.14;MQRankSum=-4.463;QD=8.35;ReadPosRankSum=-2.373;SOR=0.418;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,16:0.28:57
chr1	19600478	.	CTGCGGCGCTGGTGGGCGCGTCCA	C	562.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.000;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.420;NF=0;NR=5;PP=2004;ReadPosRankSum=-0.324;SC=GCGCGCGTGACTGCGGCGCTG;SOR=0.706;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=5;WE=19600508;WS=19600468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,17:0.34:50
chr1	19600590	rs189961258	T	C	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.72;MQRankSum=1.465;QD=15.97;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr1	19600591	rs181355263	G	A	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.72;MQRankSum=1.465;QD=15.97;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr1	19600614	rs148802056	C	G	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.83;MQRankSum=1.282;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.126;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr1	19609204	rs116787495	G	A	3169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.466;NF=78;NR=53;PP=1658;ReadPosRankSum=0.122;SC=AGAGCCTTGGGCAGCCTGAGA;SOR=0.721;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=259;TCF=152;TCR=107;TR=131;WE=19609212;WS=19609194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,150:0.52:291
chr1	19609254	rs1738025	T	C	9622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=364;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=-0.478;NF=165;NR=161;PP=2965;ReadPosRankSum=1.999;SC=CATTCGTGAGTAACCAAATGC;SOR=0.263;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=327;TCF=165;TCR=162;TR=326;WE=19609262;WS=19609244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,363:1.00:364
chr1	19609522	rs140599506	G	A	1136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.72;QD=27.07;SOR=1.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	19610598	rs116050237	A	G	1686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.658;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.411;NF=48;NR=36;PP=1064;ReadPosRankSum=0.586;SC=CAATGCCCTCAAAGTGGTGCT;SOR=0.815;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=201;TCF=113;TCR=88;TR=84;WE=19610606;WS=19610588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,91:0.41:222
chr1	19610999	rs116582396	C	A	969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.87;ReadPosRankSum=-1.337;SOR=0.377;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,23:0.59:39
chr1	19611006	rs114307705	C	A	1032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.25;ReadPosRankSum=-1.239;SOR=1.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,30:0.59:51
chr1	19611241	rs1738023	T	C	7045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=95;NR=136;PP=2965;SC=TGTTTCCCATTCTTGTCCTCA;SOR=1.253;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=232;TCF=96;TCR=136;TR=231;WE=19611249;WS=19611231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr1	19611759	rs79752186	AA	GG	1027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.053;NF=3;NR=19;PP=930;ReadPosRankSum=0.482;SC=CTGGTGAAAGAAGCTTATGCC;SOR=0.667;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=55;TCF=12;TCR=43;TR=22;WE=19611768;WS=19611749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,28:0.46:61
chr1	19612477	rs2231198	C	T	4777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=82;PP=2803;SC=CCAAGCTCCACGAACTTGCCC;SOR=0.762;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=166;TCF=84;TCR=82;TR=166;WE=19612485;WS=19612467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr1	19644216	rs148541674	C	T	2313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.761;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=43;PP=1224;ReadPosRankSum=0.938;SC=CCAGCTGCCCCAGTGGCTCCA;SOR=0.561;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=177;TCF=102;TCR=75;TR=96;WE=19644224;WS=19644206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,109:0.55:197
chr1	19650982	rs41264065	C	T	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.031;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=276;ReadPosRankSum=0.324;SC=GGATCCCGCCCGTGGGGAGGA;SOR=0.352;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=16;WE=19650990;WS=19650972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr1	19651102	rs41264067	A	G	3268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=62;PP=1770;ReadPosRankSum=-1.014;SC=CTGAGCATGCATCCCTTCCTC;SOR=0.709;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=294;TCF=168;TCR=126;TR=145;WE=19651110;WS=19651092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,166:0.51:326
chr1	19651277	rs41264069	G	A	725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=22;PP=507;ReadPosRankSum=0.603;SC=ACCCGGGCAAGGTGGCGCTAC;SOR=0.709;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=62;TCF=19;TCR=43;TR=31;WE=19651285;WS=19651267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,32:0.48:67
chr1	19651300	rs41264071	T	C	445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.501;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=347;ReadPosRankSum=-0.704;SC=CTAACCCTGCTTCACCCTGCA;SOR=0.169;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=19;WE=19651308;WS=19651290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr1	19651330	rs41264073	C	T	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=190;ReadPosRankSum=0.000;SC=GAGGAGATGCCAGGCTCTTTG;SOR=1.329;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=10;WE=19651338;WS=19651320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr1	19652063	rs11558390	G	A	1539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.42;ReadPosRankSum=1.659;SOR=0.752;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,74:0.60:124
chr1	19652127	rs199660210	AGTT	A	866.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=8.846;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=36.11;ReadPosRankSum=1.098;SOR=1.414;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,22:0.92:24
chr1	19652135	.	G	GGT	866.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.556;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=9.560;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=37.68;ReadPosRankSum=1.693;SOR=1.674;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,21:0.91:23
chr1	19652684	rs41264077	G	C	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.289;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.447;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=107;ReadPosRankSum=-0.623;SC=ACCCTCCCCCGACAACCGCTG;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=5;WE=19652692;WS=19652674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr1	19653256	rs7553611	A	G	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=241;ReadPosRankSum=-1.090;SC=TGGCTTGGGCAAGTTAATCCA;SOR=1.127;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=11;WE=19653264;WS=19653246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr1	19746332	rs41264091	A	T	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.550;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=145;ReadPosRankSum=-1.067;SC=TGCCCAAGGCATTCTAAAACC;SOR=1.215;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=27;TCF=10;TCR=17;TR=12;WE=19746340;WS=19746322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr1	19810810	rs11450129	G	GC	1780.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=3.057;NF=3;NR=45;PP=1213;ReadPosRankSum=0.859;SC=GGGCCTGGTGGCCCCCCAAGG;SOR=0.659;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=125;TCF=7;TCR=118;TR=48;WE=19810818;WS=19810786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,77:0.44:176
chr1	19948507	rs728611	A	G	1103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.956;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=13;PP=540;ReadPosRankSum=0.000;SC=AAATCTGTTTAATGATGTTCA;SOR=0.963;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=67;TCF=42;TCR=25;TR=42;WE=19948515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,50:0.65:77
chr1	19948573	rs144510765	GT	G	845.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.606;NF=6;NR=21;PP=645;ReadPosRankSum=-0.443;SC=GATTTAGCATGTTTTTTCTCC;SOR=0.619;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=56;TCF=16;TCR=40;TR=27;WE=19948581;WS=19948563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,40:0.44:90
chr1	19950062	rs1737428	T	C	490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=248;ReadPosRankSum=-1.555;SC=ATCTTCTACATGGAAAATATG;SOR=0.577;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=50;TCF=36;TCR=14;TR=19;WE=19950070;WS=19950052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,25:0.41:61
chr1	19972586	rs11810271	A	G	2348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=48;PP=1415;SC=GGGCTGGAAGATGCAGGCAGG;SOR=1.501;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=28;TCR=48;TR=76;WE=19972594;WS=19972576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr1	19981451	rs3828101	A	G	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=225;ReadPosRankSum=0.407;SC=TAACACCACTACCCGGCCCCC;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=11;WE=19981459;WS=19981441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,12:0.80:15
chr1	19981791	rs2294630	A	G	1648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.796;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=35;PP=1080;ReadPosRankSum=0.777;SC=ACAGTGACACAGGCATGGTGA;SOR=0.568;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=175;TCF=99;TCR=76;TR=79;WE=19981799;WS=19981781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,86:0.46:188
chr1	20020993	rs4370779	AC	GT	9922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=97;PP=2947;SC=GGCCGGCGACACGGAGCTGCA;SOR=0.807;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=197;TCF=97;TCR=100;TR=189;WE=20021002;WS=20020983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr1	20027404	rs10799834	G	A	2154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.151;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=37;PP=825;ReadPosRankSum=-0.225;SC=AGAAAAGGCCGTCAGTGTCCC;SOR=0.884;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=125;TCF=53;TCR=72;TR=61;WE=20027412;WS=20027394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,68:0.48:141
chr1	20027423	rs10737480	T	G	1726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.810;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=30;PP=631;ReadPosRankSum=-0.261;SC=CCTGGCCACATTGGGTGCTGG;SOR=1.085;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=86;TCF=32;TCR=54;TR=44;WE=20027431;WS=20027413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,46:0.48:95
chr1	20141528	rs1541185	C	T	4645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=66;NR=75;PP=2456;SC=GGGGCCACAGCGGTGGTGGTT;SOR=1.057;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=142;TCF=67;TCR=75;TR=141;WE=20141536;WS=20141518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr1	20216860	rs10799593	G	A	2465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.697;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=39;PP=1562;ReadPosRankSum=0.192;SC=GTCTTGACTCGTGTTGTTGTT;SOR=0.856;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=198;TCF=122;TCR=76;TR=104;WE=20216868;WS=20216850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,113:0.52:216
chr1	20221013	rs372964689	TCTAAGTCAG	T	1439.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.022;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=2938;ReadPosRankSum=0.122;SC=AGCTCTTATTTCTAAGTCAGC;SOR=0.914;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=1;TCR=53;TR=22;WE=20221037;WS=20221003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,38:0.49:78
chr1	20221029	rs199563201	G	GA	1494.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=2825;ReadPosRankSum=-0.610;SC=TCAGCTTTGGGAATATCCGAA;SOR=0.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=22;WE=20221037;WS=20221003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,37:0.54:68
chr1	20304962	rs2236771	C	G	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.793;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=11;PP=344;ReadPosRankSum=0.592;SC=CCTTTCCTGTCGTCAACTTGA;SOR=0.906;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=77;TCF=46;TCR=31;TR=27;WE=20304970;WS=20304952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,29:0.31:93
chr1	20305065	rs10732279	C	T	1310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=18;PP=913;SC=TGGGGTTCTGCGCCCTCCCTC;SOR=0.976;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=44;TCF=26;TCR=18;TR=44;WE=20305073;WS=20305055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	20395401	rs11573185	C	A	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=349;ReadPosRankSum=0.026;SC=CACACTCCCCCCTACGTCCTT;SOR=0.724;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=65;TCF=50;TCR=15;TR=26;WE=20395409;WS=20395391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,28:0.40:70
chr1	20395587	rs2148911	G	A	3149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=84;PP=1967;ReadPosRankSum=1.535;SC=ACAATGATACGCAATTTTATA;SOR=0.705;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=265;TCF=110;TCR=155;TR=140;WE=20395595;WS=20395577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,150:0.52:289
chr1	20411234	rs2020886	T	A	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.724;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=147;ReadPosRankSum=0.552;SC=TGGGGCCTGGTGGAGAGCCAG;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=9;WE=20411242;WS=20411224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr1	20411332	rs2020887	C	T	833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.685;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.711;NF=29;NR=17;PP=574;ReadPosRankSum=0.487;SC=AGATGAAAGGCCTCCTCCCAC;SOR=0.779;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=120;TCF=74;TCR=46;TR=46;WE=20411340;WS=20411322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,46:0.35:133
chr1	20440717	rs138535421	C	T	1688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=27;PP=869;ReadPosRankSum=-0.494;SC=TTGTCACAGGCACACAGCTGC;SOR=0.688;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=142;TCF=84;TCR=58;TR=71;WE=20440725;WS=20440707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,81:0.53:153
chr1	20442054	rs584367	T	C	1105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.094;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=32;PP=631;ReadPosRankSum=0.414;SC=TTGTAGATGCTGCACCCCTGG;SOR=0.960;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=128;TCF=54;TCR=74;TR=52;WE=20442062;WS=20442044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,56:0.40:141
chr1	20446170	rs11298078	GT	G	843.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.09;SOR=1.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	20446192	rs62543903	AT	A	84.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.147;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.65;ReadPosRankSum=-1.168;SOR=0.646;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr1	20474907	rs3738126	T	C	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=199;ReadPosRankSum=-0.234;SC=CCTCTGAGGTTTGAGAGAGAG;SOR=0.420;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=11;WE=20474915;WS=20474897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr1	20490518	rs6426616	T	C	7272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=126;NR=132;PP=2965;SC=ACACCTGGGCTGGCTGGAGAA;SOR=0.783;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=262;TCF=127;TCR=135;TR=258;WE=20490526;WS=20490508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,276:1.00:276
chr1	20499168	rs2301475	T	C	1916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=10;PP=1291;SC=CTCAGGAATATCTCCTTCCAA;SOR=2.566;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=49;TCR=10;TR=59;WE=20499176;WS=20499158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr1	20501362	rs6692902	C	T	427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=315;SC=CTCCAAATCCCGTTCAGTTCT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=20501370;WS=20501352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	20501582	rs12139100	G	A	4571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=70;PP=2500;SC=AAGGCACTTCGCCCCGTGATG;SOR=0.705;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=150;TCF=80;TCR=70;TR=150;WE=20501590;WS=20501572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr1	20503710	rs10753483	G	A	103.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.78;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	20637374	rs10916761	T	C	2369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=59;PP=1763;SC=AATGGTGAGATTCTTTCTGCT;SOR=2.804;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=14;TCR=59;TR=73;WE=20637382;WS=20637364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr1	20643944	rs4654851	G	C	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=157;ReadPosRankSum=-1.657;SC=GGAACTCATCGTCCTCTCCTT;SOR=0.914;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=12;WE=20643952;WS=20643934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr1	20649814	rs4655194	T	C	1863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.549;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=34;PP=1122;ReadPosRankSum=-0.435;SC=CTCTTGACCCTGATTGCCCAA;SOR=0.623;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=170;TCF=104;TCR=66;TR=83;WE=20649822;WS=20649804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,90:0.49:184
chr1	20657352	rs2072753	T	C	2646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.946;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=50;PP=1586;ReadPosRankSum=-0.465;SC=CTCTTCTCCCTTTCCGCCAGG;SOR=0.515;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=199;TCF=112;TCR=87;TR=108;WE=20657360;WS=20657342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,125:0.54:230
chr1	20664128	rs57312184	T	C	1931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FS=1.138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.96;ReadPosRankSum=0.823;SOR=0.809;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,94:0.48:194
chr1	20668864	rs368745611	TCTC	T	40.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.14;ReadPosRankSum=0.282;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,3:0.16:19
chr1	20671833	rs10799629	C	A	746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.053;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=10;PP=472;ReadPosRankSum=0.291;SC=TTAAAGGCTTCTTTAATCCCA;SOR=0.917;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=55;TCF=37;TCR=18;TR=33;WE=20671841;WS=20671823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,35:0.58:60
chr1	20676932	rs179471	T	A	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.337;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=212;ReadPosRankSum=1.124;SC=CACAGAGTACTCTGGTGACAG;SOR=2.694;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=11;WE=20676940;WS=20676922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr1	20680760	rs230180	A	G	1604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.623;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=36;PP=882;ReadPosRankSum=0.251;SC=TGTGTAGTTGAGTGACGGGGA;SOR=0.776;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=132;TCF=59;TCR=73;TR=65;WE=20680768;WS=20680750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,72:0.50:143
chr1	20940258	rs488991	T	A	1875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=40;NR=27;PP=1097;SC=ACAGACCGAGTCTCAGGGCCT;SOR=1.054;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=40;TCR=27;TR=67;WE=20940266;WS=20940248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	20940463	rs3738130	T	C	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=245;ReadPosRankSum=-0.848;SC=CCACGCCAAGTTGCAGGCATG;SOR=1.022;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=12;WE=20940471;WS=20940453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr1	20944889	rs77158575	G	A	1546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.687;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=23;PP=920;ReadPosRankSum=0.455;SC=GACCCAGTCCGTCTCAGCCCC;SOR=0.599;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=114;TCF=72;TCR=42;TR=64;WE=20944897;WS=20944879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,72:0.58:125
chr1	20944909	rs61781969	G	A	1920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=34;PP=2731;ReadPosRankSum=1.753;SC=CCTCAGCCACGCTGTGTCTCT;SOR=0.738;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=159;TCF=94;TCR=65;TR=84;WE=20944944;WS=20944899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,92:0.53:175
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chr1	20977221	rs686658	A	T	1083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=28;PP=810;SC=CTAAAAGAACATGGCATCCTC;SOR=4.112;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=30;WE=20977229;WS=20977211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	20978832	rs6893	T	C	1953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=15;PP=1286;SC=ACCCCCCTCCTTGCCCCGTCT;SOR=2.139;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=48;TCR=15;TR=63;WE=20978840;WS=20978822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	20979307	rs11428148	G	GT	2450.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.479;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=41;PP=2011;ReadPosRankSum=-1.264;SC=GCCTGGGGCCGTTTCTGGCAG;SOR=0.561;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=136;TCF=40;TCR=96;TR=57;WE=20979315;WS=20979297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,93:0.47:196
chr1	20979573	rs36110575	C	T	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.731;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=20.65;ReadPosRankSum=1.935;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr1	20979580	rs12410193	T	G	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=28.53;ReadPosRankSum=0.319;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr1	20980880	rs607254	G	A	2152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.934;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=45;PP=1269;ReadPosRankSum=2.170;SC=AACAAAACGAGGCTGTGACCC;SOR=0.574;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=172;TCF=88;TCR=84;TR=98;WE=20980888;WS=20980870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,110:0.55:201
chr1	20981806	rs592851	G	A	952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=5;PP=760;SC=ACTCGGCCTTGATATAACAAA;SOR=3.193;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=33;WE=20981814;WS=20981796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	20982151	rs3738140	G	A	1791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.514;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=36;PP=959;ReadPosRankSum=-0.329;SC=AAACCTGGAAGGTGACAGGCC;SOR=0.680;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=179;TCF=92;TCR=87;TR=77;WE=20982159;WS=20982141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,93:0.46:203
chr1	20982631	rs4704	G	A	6104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=122;NR=89;PP=2965;SC=CACTGCCTCCGCCGTCAATAA;SOR=0.934;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=211;TCF=122;TCR=89;TR=211;WE=20982639;WS=20982621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr1	20987873	rs537816	G	C	5069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=90;NR=87;PP=2965;SC=GACCCAGCACGTGCACACCGG;SOR=0.758;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=177;TCF=90;TCR=87;TR=177;WE=20987881;WS=20987863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr1	20992606	rs630484	G	T	1263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.451;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=17;PP=699;ReadPosRankSum=-1.764;SC=CTCCGAGAGGGAAAGGAGTTT;SOR=0.466;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=107;TCF=74;TCR=33;TR=52;WE=20992614;WS=20992596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,59:0.49:120
chr1	20992819	rs631357	G	C	4417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=89;PP=2775;SC=TGTAGCGGTCGTCCTCCTGCC;SOR=1.158;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=63;TCR=89;TR=152;WE=20992827;WS=20992809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr1	21012525	rs79488772	G	A	1309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.686;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=23;PP=672;ReadPosRankSum=0.827;SC=ATGGAGGCCCGGGGAGGTACT;SOR=0.459;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=87;TCF=44;TCR=43;TR=51;WE=21012533;WS=21012515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,61:0.62:99
chr1	21016906	rs493018	G	T	516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=9;NR=14;PP=365;SC=ATTCCTTTTTGGTTATTCAAA;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=9;TCR=14;TR=23;WE=21016914;WS=21016896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	21024901	rs522496	C	T	1566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.379;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=26;PP=900;ReadPosRankSum=2.098;SC=TCGGCCTCCACGTCATGCTGG;SOR=0.555;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=117;TCF=72;TCR=45;TR=63;WE=21024909;WS=21024891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,71:0.53:134
chr1	21040079	rs10799661	C	A	2030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.136;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=50;PP=1118;ReadPosRankSum=-1.833;SC=GAACCTAGACCTCAGAGCTCG;SOR=0.796;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=173;TCF=81;TCR=92;TR=92;WE=21040087;WS=21040069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,100:0.53:188
chr1	21042157	rs61778523	C	T	1744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=31;PP=750;ReadPosRankSum=-0.333;SC=GGCAGGACCCCGTGCTCAGTG;SOR=0.640;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=116;TCF=61;TCR=55;TR=68;WE=21042165;WS=21042143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,85:0.60:142
chr1	21043913	rs604659	T	C	1301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.518;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=19;PP=2325;ReadPosRankSum=0.378;SC=CCCTGGGGACTCTCGGGGCGG;SOR=0.524;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=113;TCF=79;TCR=34;TR=56;WE=21043934;WS=21043903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,61:0.49:124
chr1	21043926	rs604645	T	C	1827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.257;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=25;PP=2325;ReadPosRankSum=0.215;SC=CGGGGCGGCCTCATGCCCTGC;SOR=0.838;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=156;TCF=106;TCR=50;TR=80;WE=21043934;WS=21043903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,86:0.51:170
chr1	21044161	rs601329	A	G	2445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.475;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=57;PP=1326;ReadPosRankSum=0.237;SC=GGTTCATGGGACGGCAGCGCA;SOR=0.803;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=243;TCF=117;TCR=126;TR=108;WE=21044169;WS=21044151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,121:0.45:267
chr1	21044219	rs601392	A	C	1117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.713;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=30;PP=658;ReadPosRankSum=0.060;SC=CCCAGGACCAACGGGACCAGA;SOR=0.821;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=107;TCF=42;TCR=65;TR=49;WE=21044227;WS=21044209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,55:0.46:119
chr1	21050958	rs592060	C	T	1615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.570;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=36;PP=985;ReadPosRankSum=-3.395;SC=TCTGAGAGAGCTGATCACGGC;SOR=0.643;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=151;TCF=66;TCR=85;TR=68;WE=21050978;WS=21050948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,78:0.46:171
chr1	21052693	rs10916852	G	T	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.626;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=103;ReadPosRankSum=-0.660;SC=CTTCACATGGGCCCTGGGGCT;SOR=1.230;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=6;WE=21052701;WS=21052683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr1	21091861	rs1985278	G	T	3568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=38;PP=2171;SC=CCAGGCCAATGGCTCATACCT;SOR=1.467;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=75;TCR=38;TR=113;WE=21091869;WS=21091851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr1	21143770	rs376814165	TA	T	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.86;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	21143782	rs76848587	A	AAT	605.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.59;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	21167404	rs2230573	A	G	4142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=51;PP=2574;SC=TGATAGAGTAATTGGCCCATG;SOR=1.088;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=135;TCF=84;TCR=51;TR=135;WE=21167412;WS=21167394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr1	21175855	rs7525082	C	A	357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=268;SC=CCAAGTTATTCTATACTATCA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=21175863;WS=21175845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	21179969	rs7542882	G	A	3007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=39;PP=1794;SC=CATAAGGATTGCTATCAAAAC;SOR=1.258;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=68;TCR=39;TR=107;WE=21179977;WS=21179959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr1	21180181	rs2305463	C	T	2226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=41;PP=1282;SC=CTACACATGTCGAGGATTTAG;SOR=1.193;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=32;TCR=41;TR=73;WE=21180189;WS=21180171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr1	21180250	rs7543140	G	A	739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=9;NR=17;PP=491;SC=ATCCCTAGGTGAGGCCTGAGA;SOR=1.528;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=9;TCR=17;TR=26;WE=21180258;WS=21180240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	21188703	rs10916885	A	T	4927.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FS=3.781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.87;ReadPosRankSum=-1.050;SOR=1.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,219:0.88:248
chr1	21327637	rs1395508	C	T	4848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=51;PP=2903;SC=GTCAAAAATACTAAGTGCCAG;SOR=1.369;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=155;TCF=104;TCR=51;TR=155;WE=21327645;WS=21327627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr1	21377314	rs6426663	C	T	1445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=34;NR=12;PP=838;SC=AAAATGATGCCTTTACAGGGA;SOR=1.524;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=47;TCF=34;TCR=13;TR=46;WE=21377322;WS=21377304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	21554319	rs6426676	A	G	782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=3;PP=525;SC=CTGCAACCTGAAGCACTGGGG;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=22;WE=21554327;WS=21554309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	21571475	rs28368004	G	A	2079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.995;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=40;PP=1310;ReadPosRankSum=-1.367;SC=CGCAGTAGCAGGCTCACCTTC;SOR=0.778;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=215;TCF=123;TCR=92;TR=94;WE=21571483;WS=21571465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,105:0.44:241
chr1	21582719	rs28367989	C	T	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=109;ReadPosRankSum=0.671;SC=CAGCCAAGTCCGGCACAGGGA;SOR=0.425;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=7;WE=21582727;WS=21582709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr1	21671943	rs2072654	T	G	567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.47;ReadPosRankSum=-0.013;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,32:0.42:76
chr1	21751142	rs150916531	A	G	496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=2.573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.82;MQRankSum=-4.945;QD=9.20;ReadPosRankSum=0.107;SOR=0.151;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,21:0.39:54
chr1	21751214	rs72476501	G	A	1400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=461;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.75;MQRankSum=-9.295;QD=3.04;ReadPosRankSum=-0.182;SOR=0.683;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:352,109:0.24:461
chr1	21751325	rs140609058	G	C	2289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.252;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-4.659;NF=31;NR=72;PP=1737;ReadPosRankSum=0.873;SC=AAGACTTCAGGCTCTTCTGCT;SOR=0.845;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=202;TCF=63;TCR=139;TR=103;WE=21751333;WS=21751315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,98:0.54:181
chr1	21752682	rs71512992	G	A	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.52;MQRankSum=-3.253;QD=1.29;ReadPosRankSum=1.701;SOR=0.899;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,7:0.16:44
chr1	21752766	rs144829292	A	G	672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=3.343;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.24;MQRankSum=-5.839;QD=9.48;ReadPosRankSum=-0.577;SOR=1.193;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,29:0.41:71
chr1	21752782	rs140348908	T	G	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=5.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.21;MQRankSum=-2.846;QD=0.64;ReadPosRankSum=0.424;SOR=1.781;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,8:0.13:62
chr1	21753562	rs146549873	A	C	150.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.60;QD=30.18;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	21753632	.	G	A	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.316;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.08;MQRankSum=-0.140;QD=7.44;ReadPosRankSum=-0.664;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr1	21754996	rs12024079	C	T	882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.38;QD=26.75;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	21755055	rs12024104	C	A	75.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=25.09;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	21755288	.	A	ACCGCCGCGACT	1186.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=1.400;ClippingRankSum=0.000;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.227;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.356;NF=2;NR=5;PP=2637;ReadPosRankSum=-1.001;SC=GGCGTGCTGGACCGCCGCGAC;SOR=1.038;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=7;WE=21755296;WS=21755278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,26:0.44:59
chr1	21755347	rs41310392	C	T	1414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.774;NF=31;NR=34;PP=834;ReadPosRankSum=1.038;SC=CACCCTGCTACGAGACCCCGT;SOR=0.737;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=120;TCF=57;TCR=63;TR=65;WE=21755355;WS=21755337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,71:0.52:136
chr1	21755453	rs3856177	G	A	449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.84;QD=32.13;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	21755539	rs3855556	C	A	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=21.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	21755756	rs56343055	G	C	4889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=94;NR=86;PP=2965;SC=CAGTACAACAGCACGCGGGCG;SOR=0.748;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=181;TCF=95;TCR=86;TR=180;WE=21755764;WS=21755746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr1	21755867	rs7522332	A	G	2197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.78;QD=27.13;SOR=0.821;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr1	21755906	rs3738922	G	A	1220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.90;QD=27.74;SOR=0.990;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	21756008	rs3894725	G	T	1104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=18;PP=683;SC=GACTACATGAGCCACATCATT;SOR=0.843;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=20;TCR=18;TR=38;WE=21756016;WS=21755998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	21756069	rs7532750	G	A	442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=9;PP=290;SC=TGGGGTGTGTGGGGGATAAAA;SOR=1.371;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=7;TCR=9;TR=16;WE=21756077;WS=21756059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	21795288	rs61740199	C	T	1625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.013;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=33;PP=1062;ReadPosRankSum=-1.318;SC=CAAGAAATCGCGCCCCCAGCT;SOR=0.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=205;TCF=118;TCR=87;TR=81;WE=21795296;WS=21795278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,85:0.40:213
chr1	21795388	rs1827293	A	G	2070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.010;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=54;PP=1257;ReadPosRankSum=-1.367;SC=CAAAATAATTACGGTAAGTTC;SOR=1.030;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=176;TCF=73;TCR=103;TR=88;WE=21795396;WS=21795378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,99:0.50:200
chr1	21797204	rs72872292	G	C	602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.916;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=13;PP=300;ReadPosRankSum=1.195;SC=TTGCAGAGGAGCTCGGGCAAG;SOR=0.442;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=68;TCF=33;TCR=35;TR=28;WE=21797212;WS=21797194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,33:0.43:77
chr1	21798144	rs142355608	C	T	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.446;NF=8;NR=4;PP=102;ReadPosRankSum=-1.537;SC=AGATGCCTCCCGCTCATTGAA;SOR=0.883;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=31;TCF=19;TCR=12;TR=12;WE=21798152;WS=21798134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr1	21798249	rs72872297	C	G	521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.10;ReadPosRankSum=1.351;SOR=0.751;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,25:0.53:47
chr1	21799414	rs78430674	G	A	1174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=24;PP=552;ReadPosRankSum=-2.445;SC=CCCAGGTAACGCTGAATAATC;SOR=0.706;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=113;TCF=60;TCR=53;TR=52;WE=21799422;WS=21799404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,61:0.46:132
chr1	21799489	rs1971327	T	C	709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=19;PP=455;SC=CTGGCATCTATGATGGGCCGA;SOR=2.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=25;WE=21799497;WS=21799479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	21799823	rs1971328	A	G	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=158;ReadPosRankSum=-1.269;SC=CTGGTGTCCAATCCCTCTGTG;SOR=0.871;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=10;WE=21799831;WS=21799813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr1	21800185	rs7520015	T	G	672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=542;SC=TCTATTATGGTATTCTTAACA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=21800193;WS=21800175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	21801346	rs7531217	G	A	996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=26;NR=2;PP=716;SC=GTCATATGTGGAGTGTGAATT;SOR=4.680;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=28;WE=21801354;WS=21801336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	21804620	rs182761944	C	T	852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.565;NF=20;NR=9;PP=402;ReadPosRankSum=-1.752;SC=TCATCCCTGTCCTGCCTGGCT;SOR=0.653;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=48;TCF=32;TCR=16;TR=29;WE=21804628;WS=21804610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,37:0.63:59
chr1	21804815	rs7535654	T	G	849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=22;PP=622;SC=GTACTCCATTTTGAAGGTGAT;SOR=2.019;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=30;WE=21804823;WS=21804805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	21805730	rs2316504	A	G	1442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=12;PP=965;SC=AAAGTCTCCTATTCTCACACT;SOR=1.911;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=34;TCR=12;TR=46;WE=21805738;WS=21805720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	21806571	rs41265989	A	G	1384.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.9995;FS=1.933;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=5.085;NF=35;NR=23;PP=945;ReadPosRankSum=0.658;SC=TGGATGAGAAAGAGCCTGAAG;SOR=1.034;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=64;TCF=38;TCR=26;TR=58;WE=21806579;WS=21806561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:5,58:0.92:63
chr1	21807521	rs200206527	A	T	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=1.334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.78;MQRankSum=-2.337;QD=7.22;ReadPosRankSum=-1.773;SOR=0.458;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,15:0.42:36
chr1	21808159	rs71512991	G	A	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=1.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.54;MQRankSum=-6.684;QD=1.64;ReadPosRankSum=1.283;SOR=0.513;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:122,30:0.20:152
chr1	21808207	rs146564096	A	C	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.04;MQRankSum=-3.201;QD=3.45;ReadPosRankSum=-2.250;SOR=0.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,12:0.24:51
chr1	21808223	rs145079058	T	C	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.380;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.11;MQRankSum=-1.738;QD=10.16;ReadPosRankSum=1.390;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr1	21809667	rs139757131	C	G	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.16;MQRankSum=2.608;QD=6.95;ReadPosRankSum=1.265;SOR=0.963;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr1	21809750	rs202069483	T	C	432.31	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=9.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.71;MQRankSum=-2.823;QD=27.02;ReadPosRankSum=-0.730;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,14:0.88:16
chr1	21887290	rs1767430	C	A	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=140;ReadPosRankSum=0.210;SC=TAGCTAGGAGCCCCGGGAGCC;SOR=0.793;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=10;WE=21887298;WS=21887280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr1	21889635	rs1780316	T	C	4063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.40;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr1	21890464	rs1767428	A	G	1352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.18;SOR=1.562;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	21896767	rs1256328	C	T	1763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.544;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=37;PP=1180;ReadPosRankSum=1.280;SC=CCCTAGCCCCCGGCATGTGCT;SOR=0.772;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=165;TCF=91;TCR=74;TR=83;WE=21896775;WS=21896757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,87:0.48:183
chr1	21900420	rs2275370	A	G	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.070;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=293;ReadPosRankSum=-1.371;SC=TTAGGAGAATAGGTTGTGGAA;SOR=0.533;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=57;TCF=17;TCR=40;TR=20;WE=21900428;WS=21900410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,22:0.34:64
chr1	21904131	rs34605986	T	C	1222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=36;PP=870;ReadPosRankSum=-0.649;SC=CCCCTGAGCGTCCTGTTCTGA;SOR=0.608;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=84;TCF=15;TCR=69;TR=45;WE=21904139;WS=21904121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,48:0.54:89
chr1	21925108	rs2794278	T	C	283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=3;NR=6;PP=147;SC=ACCCGTACCCTCTGCGAGGAG;SOR=1.802;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=21925116;WS=21925098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	21928344	rs2275366	C	G	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=300;ReadPosRankSum=-0.840;SC=TGGCATCAGGCGTAGCGTGAG;SOR=0.565;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=18;WE=21928352;WS=21928334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,21:0.58:36
chr1	21929260	rs829368	A	G	3872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=46;PP=2199;SC=AGGGATGGGGATGCAGGGGAA;SOR=1.038;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=73;TCR=46;TR=119;WE=21929272;WS=21929250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr1	21929456	rs3215988	GC	G	1005.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=21;PP=512;SC=GAGCCCCAGTGCCCCCCCCAC;SOR=2.049;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=21929464;WS=21929446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	21930542	rs3767111	C	T	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=368;ReadPosRankSum=1.696;SC=AGGAAGAGAACGGTGCAGGAG;SOR=0.804;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=8;TCR=35;TR=21;WE=21930550;WS=21930532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,23:0.52:44
chr1	21932530	rs1767443	C	A	684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.293;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=7;PP=382;ReadPosRankSum=1.369;SC=AGGGAGGGGCCGGGGCCTGGG;SOR=0.416;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=58;TCF=45;TCR=13;TR=29;WE=21932538;WS=21932520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,33:0.52:64
chr1	21934667	rs829371	G	A	1640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=29;PP=933;ReadPosRankSum=-0.823;SC=CCCTAGCCACGTCCCTGCTCC;SOR=0.665;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=141;TCF=89;TCR=52;TR=76;WE=21934675;WS=21934657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,81:0.54:151
chr1	21934693	rs72660316	T	C	1797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.174;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=31;PP=1042;ReadPosRankSum=-1.027;SC=CAGTTAGACCTGGGGCCCTTC;SOR=0.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=167;TCF=101;TCR=66;TR=81;WE=21934701;WS=21934683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,86:0.48:180
chr1	21935358	rs74060020	C	T	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=16;PP=527;ReadPosRankSum=-1.213;SC=GTTTGGCAAACTTCTCTGCCT;SOR=0.679;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=48;TCR=34;TR=38;WE=21935366;WS=21935348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,42:0.46:91
chr1	21935467	rs12130950	G	A	898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.111;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=21;PP=466;ReadPosRankSum=-0.768;SC=AGGAAGGGAAGTTGAGATGAC;SOR=1.210;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=72;TCF=32;TCR=40;TR=35;WE=21935475;WS=21935457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,43:0.48:89
chr1	21935884	.	GAA	G	31.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=-0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=2.88;ReadPosRankSum=2.241;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr1	21939741	rs1256282	G	C	3751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=79;PP=2587;SC=GGAGATAAGGGAGGGGTGTGA;SOR=1.628;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=43;TCR=79;TR=122;WE=21939749;WS=21939731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr1	21945380	rs150275476	C	T	1153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=1.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.42;ReadPosRankSum=-0.159;SOR=1.004;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,53:0.66:80
chr1	21945389	rs12143471	C	T	3376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.31;SOR=1.119;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr1	21946396	rs12134357	T	C	1262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=5;PP=812;SC=CATCTTCTACTGGCGTGGCCT;SOR=3.716;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=35;WE=21946404;WS=21946386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	21946415	rs1681255	G	A	2066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=9;PP=1332;SC=CTGTCCTCAGGGAGGTGAAGG;SOR=3.226;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=59;TCF=50;TCR=9;TR=58;WE=21946423;WS=21946405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	21948936	rs829415	G	C	197.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=4;PP=64;SC=GGCCCCCGCCGGGGCGGCACT;SOR=0.892;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=8;WE=21948944;WS=21948926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	21953436	rs829412	A	G	9903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=374;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=162;NR=185;PP=2965;SC=CCCACTTTACAGACAGGACCC;SOR=0.918;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=347;TCF=162;TCR=185;TR=347;WE=21953444;WS=21953426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,372:1.00:372
chr1	21961339	rs10799706	A	T	5341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=87;NR=86;PP=2691;SC=CACCCCACCGAGGACTTCAGT;SOR=0.922;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=174;TCF=87;TCR=87;TR=173;WE=21961347;WS=21961320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr1	22005665	rs1059218	C	T	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=164;ReadPosRankSum=-1.139;SC=TTACTTGCCCCCTCCCACCCA;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=8;WE=22005673;WS=22005661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr1	22007443	rs72660363	C	T	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=130;ReadPosRankSum=-1.941;SC=ACCTTTGTCACCTGTAATAAT;SOR=1.022;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=9;WE=22007451;WS=22007433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr1	22013561	rs829420	C	A	790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=2;PP=499;SC=TCTACTGTAACAATATGTGGA;SOR=4.174;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=22013569;WS=22013551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	22013771	rs10493008	G	A	1656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.110;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=41;PP=1043;ReadPosRankSum=-0.061;SC=CCACAAGGGAGAGGGAGTCTG;SOR=0.601;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=181;TCF=87;TCR=94;TR=80;WE=22013779;WS=22013761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,85:0.43:200
chr1	22030120	rs370210128	GA	G	128.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=11.564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.17;MQRankSum=1.712;QD=2.43;ReadPosRankSum=0.363;SOR=0.055;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,14:0.26:53
chr1	22030189	rs829372	T	C	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.323;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=108;ReadPosRankSum=-0.125;SC=TAAAAACATATGTCAAAGTTA;SOR=0.976;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=9;WE=22030197;WS=22030179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr1	22032472	rs11426922	A	AT	724.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=4;PP=732;SC=TATTCATTTAATTAATAGAAA;SOR=1.828;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=18;WE=22032480;WS=22032462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	22032570	rs333173	T	G	1215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.109;NF=35;NR=13;PP=689;ReadPosRankSum=-1.845;SC=AATACCAGAGTCAACCAAATC;SOR=0.656;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=109;TCF=77;TCR=32;TR=48;WE=22032578;WS=22032560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,55:0.47:118
chr1	22033228	rs56167338	G	A	2952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.625;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=57;PP=1612;ReadPosRankSum=-0.293;SC=TGTCAGTAGCGTTCAGTACCT;SOR=0.568;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=208;TCF=115;TCR=93;TR=123;WE=22033236;WS=22033218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,140:0.60:233
chr1	22050649	rs2275668	C	A	3553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=82;PP=2557;SC=CTAAGTGATACATTCATTTTT;SOR=2.010;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=33;TCR=82;TR=115;WE=22050657;WS=22050639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr1	22063149	rs10753517	G	A	2707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=49;PP=1564;SC=TAAAAGAAACGTTGGATAACA;SOR=1.202;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=36;TCR=49;TR=85;WE=22063157;WS=22063139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr1	22079457	.	TA	T	47.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.800;ClippingRankSum=0.000;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=1.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.44;MQRankSum=2.788;QD=1.02;ReadPosRankSum=0.421;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,10:0.21:47
chr1	22141206	rs10917051	A	C	4871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=74;NR=84;PP=2830;SC=TGCGGCCTGAACATCCCGGTG;SOR=0.969;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=159;TCF=75;TCR=84;TR=158;WE=22141214;WS=22141196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr1	22149935	rs897467	T	C	2322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.728;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=40;PP=1111;ReadPosRankSum=0.470;SC=CTGTGATGCCTGAGGAGAATC;SOR=0.959;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=186;TCF=107;TCR=79;TR=101;WE=22149955;WS=22149925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,116:0.55:211
chr1	22150257	rs3736357	C	T	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.723;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=21;PP=438;ReadPosRankSum=0.909;SC=ACTTCCTGGTCCTCCCCGGCC;SOR=1.572;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=40;TCF=6;TCR=34;TR=24;WE=22150265;WS=22150247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,27:0.59:46
chr1	22155353	rs74859884	G	A	911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.810;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=13;PP=563;ReadPosRankSum=-0.177;SC=GCGGAAGTGAGCGCTCATGTT;SOR=0.842;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=69;TCF=45;TCR=24;TR=36;WE=22155361;WS=22155343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,43:0.49:87
chr1	22157689	rs3736355	G	A	2073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.484;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=51;PP=1326;ReadPosRankSum=-1.757;SC=GCCAGGTGGTGTGTGGGGTGT;SOR=0.835;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=207;TCF=103;TCR=104;TR=94;WE=22157697;WS=22157679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,101:0.46:221
chr1	22158363	rs4654771	G	A	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.264;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=190;ReadPosRankSum=2.616;SC=GCCCAGTTGGGTAGAGGGGTC;SOR=1.002;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=35;TCF=15;TCR=20;TR=18;WE=22158371;WS=22158353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr1	22160148	rs7547731	C	T	542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.218;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=375;ReadPosRankSum=-0.684;SC=CCTTGGCCCACGGCTCCAGGG;SOR=1.041;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=50;TCF=14;TCR=36;TR=23;WE=22160156;WS=22160138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,25:0.49:51
chr1	22161635	rs11338283	CT	C	47.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=7.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.08;ReadPosRankSum=-0.176;SOR=2.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr1	22165963	rs139500146	T	C	2168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=52;PP=1142;ReadPosRankSum=-0.689;SC=CGGGGTATGATGAGTGTGTCA;SOR=0.676;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=226;TCF=115;TCR=111;TR=104;WE=22165971;WS=22165953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,110:0.45:244
chr1	22168216	rs7556412	C	T	846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.559;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=21;PP=475;ReadPosRankSum=-1.439;SC=TGGTCCTTCTCGTGTCTTGGT;SOR=0.346;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=67;TCF=21;TCR=46;TR=34;WE=22168224;WS=22168206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,39:0.53:73
chr1	22168968	rs66533518	G	A	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.551;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=229;ReadPosRankSum=0.426;SC=GAGTTCTCTCGGAAGCTCAGG;SOR=2.179;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=26;TCF=8;TCR=18;TR=13;WE=22168976;WS=22168958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr1	22174600	rs3767138	A	G	1094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=29;PP=677;ReadPosRankSum=-0.723;SC=CAGGAAGCAGATGGCAGGAGG;SOR=0.619;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=39;TCR=56;TR=50;WE=22174608;WS=22174590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,52:0.50:104
chr1	22177119	rs61777200	A	G	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.820;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-1.179;NF=5;NR=10;PP=185;ReadPosRankSum=-0.666;SC=TGTCCTTCACATGGGGAAGGG;SOR=0.264;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=15;WE=22177127;WS=22177109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr1	22179673	rs12049614	T	C	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=25;PP=490;ReadPosRankSum=-0.524;SC=GGCCGACAGGTGGCCTTTCTG;SOR=0.937;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=50;TCF=13;TCR=37;TR=33;WE=22179681;WS=22179663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,35:0.67:52
chr1	22180548	rs12117402	T	C	1680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.170;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=31;PP=974;ReadPosRankSum=-2.486;SC=TCAACCTCCTTCTCTCTCTGA;SOR=0.711;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=160;TCF=88;TCR=72;TR=74;WE=22180556;WS=22180538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,83:0.47:178
chr1	22181360	rs116788687	G	C	2345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.399;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=42;PP=1230;ReadPosRankSum=0.275;SC=CAACCACTTGGATCCGGGCCT;SOR=0.489;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=165;TCF=79;TCR=86;TR=87;WE=22181368;WS=22181350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,105:0.57:184
chr1	22183471	rs12024579	A	C	1666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.570;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=28;PP=1079;ReadPosRankSum=2.504;SC=TGGGGGAGAGACAGGAGGGGA;SOR=0.789;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=161;TCF=101;TCR=60;TR=76;WE=22183479;WS=22183461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,82:0.47:174
chr1	22183739	rs2305562	A	G	2799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.417;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=62;PP=1828;ReadPosRankSum=1.184;SC=AGACCCCAGAAGACAGACTTC;SOR=0.673;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=279;TCF=146;TCR=133;TR=130;WE=22183747;WS=22183729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,139:0.46:304
chr1	22186234	rs10917056	A	G	2799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=51;PP=1833;SC=AGCCCCATGCACAAGGACAGC;SOR=0.905;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=44;TCR=51;TR=95;WE=22186242;WS=22186224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr1	22191454	rs897471	G	A	2297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=41;PP=1295;SC=GATGCTGGCCGCCAGCGGCAC;SOR=1.101;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=34;TCR=41;TR=75;WE=22191462;WS=22191444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr1	22199081	rs2501266	A	T	316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=9;NR=1;PP=233;SC=AGGTGGCAACACCGCCTGGGG;SOR=2.494;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=22199089;WS=22199071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	22199245	rs2229482	C	T	1519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.637;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=26;PP=800;ReadPosRankSum=-0.026;SC=TGAGGCCTTCCACCTGGGCCT;SOR=0.614;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=115;TCF=71;TCR=44;TR=64;WE=22199253;WS=22199235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,73:0.54:136
chr1	22199821	rs2454290	G	A	4627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=98;NR=56;PP=2945;SC=CTCCGCCCTAGGGACTCTGGG;SOR=1.371;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=154;TCF=98;TCR=56;TR=154;WE=22199829;WS=22199811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr1	22200082	rs2445136	T	C	1059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=30;PP=831;SC=AGCAGGGACGTGCCCTGGACC;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=9;TCR=30;TR=39;WE=22200090;WS=22200072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	22200835	rs2445135	C	G	149.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=88;SC=CTGGATGAAGCGGGTGTGGGA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=22200843;WS=22200829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	22201331	rs2290494	C	T	1103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.798;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=27;PP=864;ReadPosRankSum=0.140;SC=GGAGAAGGAGCGGGAAGCACC;SOR=0.859;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=89;TCF=43;TCR=46;TR=50;WE=22201339;WS=22201321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,50:0.56:90
chr1	22202109	rs2501265	C	T	1310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=32;NR=14;PP=772;SC=CCTCCTGCCCCGGCTCCAGAC;SOR=1.659;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=32;TCR=14;TR=46;WE=22202117;WS=22202099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	22204630	rs7513608	G	A	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-3.268;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=78;ReadPosRankSum=1.519;SC=CCTCCCAGCTGTGGTGCTGGG;SOR=0.169;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=7;WE=22204638;WS=22204620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr1	22205408	rs2454294	T	C	171.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=44;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=6;NR=1;PP=167;SC=CCAAGTCTCCTGCCTCCCTGC;SOR=2.303;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=22205416;WS=22205404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	22205466	rs2454293	T	C	1194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=5;PP=900;SC=AAACCCCCCCTGACCCGGAGC;SOR=3.145;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=34;TCR=5;TR=39;WE=22205474;WS=22205456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	22205755	rs55728940	C	A	445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.764;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=281;ReadPosRankSum=-0.571;SC=TCAACTGCAACCACTTATAGA;SOR=0.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=15;WE=22205763;WS=22205745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,18:0.69:26
chr1	22206649	rs989994	T	C	4847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=56;PP=2965;SC=GCCATTGCAATTGCAACCAGA;SOR=1.311;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=102;TCR=56;TR=158;WE=22206657;WS=22206639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr1	22206942	rs1874793	G	A	5984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=104;PP=2965;SC=GTCCCACGCTGGCCATCTTGG;SOR=0.914;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=199;TCF=95;TCR=104;TR=199;WE=22206950;WS=22206932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr1	22207235	rs1874792	T	C	2860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=54;PP=1452;SC=CCGGCACCCATGAGGACCACG;SOR=1.129;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=42;TCR=54;TR=96;WE=22207243;WS=22207225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr1	22207804	rs139046040	ACCCAGGGTGGCAG	A	7832.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=61;PP=2970;SC=TTCTTTCCCCACCCAGGGTGG;SOR=0.739;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=85;TCF=19;TCR=66;TR=78;WE=22207824;WS=22207794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr1	22208030	rs921847	C	T	251.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=8;PP=192;SC=AGGGCTGCAGCCTGGGCCTGC;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=22208038;WS=22208020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	22211217	rs2290493	G	A	3584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.01;ReadPosRankSum=-0.323;SOR=0.652;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:106,93:0.47:199
chr1	22211222	rs4654994	T	C	3785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FS=0.514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.77;ReadPosRankSum=-0.911;SOR=0.628;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,103:0.48:213
chr1	22214127	rs2229478	A	G	3546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=62;NR=56;PP=2038;SC=TCGTCTCCACAAGGAGAGAGA;SOR=0.787;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=62;TCR=56;TR=118;WE=22214135;WS=22214117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr1	22215088	rs2445140	T	C	2558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=30;PP=1490;SC=CGTGAGCCCCTGCACCCGGCC;SOR=1.434;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=56;TCR=30;TR=86;WE=22215096;WS=22215078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr1	22216279	rs3767141	C	T	2246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=57;NR=17;PP=1292;SC=TCGGGTCTAACGGGTATGTGC;SOR=1.759;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=57;TCR=17;TR=74;WE=22216287;WS=22216269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr1	22217108	rs2501260	G	A	6548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=115;NR=96;PP=2965;SC=ACACCTCTCGGAACTCTCTGG;SOR=0.718;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=212;TCF=116;TCR=96;TR=211;WE=22217116;WS=22217098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr1	22304463	rs12058649	A	G	182.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=37.46;QD=30.47;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	22307340	rs7528228	C	T	549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=0;PP=457;SC=ATGAGAAAAGCGGAAGCTTCT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=22307348;WS=22307330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	22307358	rs7528300	C	G	886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=4;PP=600;SC=TCTACCACACCTGTGGCGGTA;SOR=2.899;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=32;WE=22307366;WS=22307348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	22307538	rs7528405	C	T	2251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=42;PP=1287;SC=CAGGAGCTCCCGGACCTACCA;SOR=1.264;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=30;TCR=42;TR=72;WE=22307546;WS=22307528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr1	22310080	rs10799723	G	A	661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=3;PP=507;SC=TTTGGAGGGTGAAGGAGCTGG;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=22310088;WS=22310070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	22310139	rs10733031	T	G	4236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.68;QD=44.13;SOR=1.313;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr1	22310145	rs10733032	C	T	4205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.39;QD=44.27;SOR=1.227;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr1	22310262	rs10733033	G	C	4808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=102;PP=2965;SC=CACTCCCTCCGGCTGGTGACA;SOR=0.842;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=209;TCF=107;TCR=102;TR=208;WE=22310270;WS=22310252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr1	22310411	rs28468423	A	G	1026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.50;QD=41.07;SOR=3.014;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	22310413	rs7549398	A	G	1026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.96;QD=46.67;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	22310662	rs6426735	G	T	8504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=147;NR=158;PP=2965;SC=CCCCTGACTCGGTGCTTTTTA;SOR=0.750;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=305;TCF=147;TCR=158;TR=305;WE=22310682;WS=22310652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,325:1.00:325
chr1	22310674	rs7538207	C	T	7891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=127;NR=152;PP=2965;SC=TGCTTTTTATCGCTGCAGCCA;SOR=0.881;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=279;TCF=127;TCR=152;TR=279;WE=22310682;WS=22310652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,300:1.00:300
chr1	22310725	rs3820287	G	C	4175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=99;PP=2527;SC=CCCTGCTGCCGGTGGTGGACT;SOR=1.493;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=52;TCR=100;TR=151;WE=22310733;WS=22310715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr1	22310824	rs1803531	T	C	181.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=8;PP=177;SC=CCGGCTGCAATGTGAGTCAGC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=22310832;WS=22310814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	22313161	rs1803530	T	C	4298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=90;PP=2454;SC=CCGCCTTCATTGACTGGATTG;SOR=1.004;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=159;TCF=69;TCR=90;TR=159;WE=22313169;WS=22313151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr1	22313197	rs34963341	C	A	2656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=60;PP=1782;SC=CAGGGCGGCCCGGAGGGCTTT;SOR=1.298;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=37;TCR=60;TR=97;WE=22313205;WS=22313187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr1	22315738	rs4655006	C	T	1579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.84;QD=29.81;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	22329062	rs143337942	CC	GT	3989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.617;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-11.553;NF=75;NR=42;PP=2944;ReadPosRankSum=1.544;SC=TCTCAAACTCCCGGGCTCAAG;SOR=0.574;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=278;TCF=180;TCR=98;TR=117;WE=22329071;WS=22329052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,107:0.42:253
chr1	22329414	rs10917107	G	A	1313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=12;PP=865;SC=CCAGTTGAAGGCATGGCTTGG;SOR=1.659;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=31;TCR=12;TR=43;WE=22329422;WS=22329404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	22333595	rs3820290	G	A	1293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=2.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=8.755;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=-1.326;NF=1;NR=40;PP=1138;ReadPosRankSum=-1.296;SC=CACCAAGACCGGACCTTGTAC;SOR=5.235;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=42;TCF=2;TCR=40;TR=41;WE=22333603;WS=22333585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,42:0.95:44
chr1	22336277	rs3820285	C	G	6726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=124;NR=101;PP=2965;SC=TTTGTTTCTGCCTTTGGCTGC;SOR=0.861;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=225;TCF=124;TCR=101;TR=225;WE=22336285;WS=22336267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
chr1	22336371	rs3806297	C	A	3438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=76;PP=2266;SC=CAGGGCGGCCCGGAGGGCTTT;SOR=1.498;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=122;TCF=45;TCR=77;TR=121;WE=22336379;WS=22336361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr1	22408106	rs2501282	G	A	4881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=71;PP=2792;SC=GGATGGACTAGGGGACGATTA;SOR=0.842;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=163;TCF=92;TCR=71;TR=163;WE=22408114;WS=22408096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr1	22447148	rs12756110	G	C	299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;NF=2;NR=9;PP=215;SC=CCTCCTCTTAGGAATTACGCG;SOR=2.494;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=11;WE=22447156;WS=22447138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	22447645	rs41420150	C	CTG	424.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=337;ReadPosRankSum=0.740;SC=GTGGGAGAGTCTGGGGCCCTG;SOR=0.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=10;WE=22447653;WS=22447635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr1	22453842	rs6678992	T	C	2030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=28;PP=1043;ReadPosRankSum=-1.711;SC=CATGGGGTCCTGAGTACCCAC;SOR=0.705;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=141;TCF=89;TCR=52;TR=77;WE=22453850;WS=22453832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,93:0.56:166
chr1	22453975	rs2235527	C	G	2043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.527;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=54;PP=1212;ReadPosRankSum=1.188;SC=GCTTTGCCACCTGCCAAGAAA;SOR=0.888;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=174;TCF=76;TCR=98;TR=92;WE=22453983;WS=22453965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,100:0.53:190
chr1	22454001	rs2235526	T	C	1383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.654;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=41;PP=750;ReadPosRankSum=1.944;SC=CAATGAGCCATGAACCTTGCC;SOR=0.815;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=126;TCF=49;TCR=77;TR=66;WE=22454009;WS=22453991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,71:0.52:137
chr1	22832743	rs209732	A	T	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.685;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=256;ReadPosRankSum=0.000;SC=AGGTATTAGTAAATTGTTGAC;SOR=0.420;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=17;WE=22832751;WS=22832733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr1	22835677	rs209729	A	G	2594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.148;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=67;PP=1739;ReadPosRankSum=0.334;SC=AAGATTGAGTACAAGCTCTTT;SOR=0.596;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=186;TCF=68;TCR=118;TR=106;WE=22835685;WS=22835667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,113:0.55:204
chr1	22846709	rs209720	G	A	3244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=42;NR=68;PP=1932;SC=GGAGCGGCACGTGGTGACCCA;SOR=1.407;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=42;TCR=68;TR=110;WE=22846717;WS=22846699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr1	22849003	rs998978	A	C	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.494;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=255;ReadPosRankSum=-0.208;SC=CGGGGCCTGAATCTCCCCTCC;SOR=0.360;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=52;TCF=9;TCR=43;TR=18;WE=22849011;WS=22848993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,20:0.36:55
chr1	22852715	rs881646	G	C	2459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.479;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=48;PP=1311;ReadPosRankSum=1.896;SC=CCCCAGAGCCGGTGGCCCCGA;SOR=0.794;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=240;TCF=133;TCR=107;TR=108;WE=22852723;WS=22852705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,122:0.46:263
chr1	22895998	rs2273099	T	A	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.851;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=20;PP=378;ReadPosRankSum=0.721;SC=GTGCTGCTGATCTCTTAACAG;SOR=0.869;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=77;TCF=29;TCR=48;TR=32;WE=22896006;WS=22895988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,37:0.42:89
chr1	22902772	rs56218493	C	T	4962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=449;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.516;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=106;NR=105;PP=2962;ReadPosRankSum=0.595;SC=AGGTTTGCAACGTCATGAGCC;SOR=0.674;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=400;TCF=199;TCR=201;TR=211;WE=22902780;WS=22902762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:213,235:0.52:448
chr1	22913153	rs638058	T	C	2667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=64;PP=1686;ReadPosRankSum=0.442;SC=GAGATGCCAGTACCCTTGAGC;SOR=0.704;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=264;TCF=128;TCR=136;TR=124;WE=22913161;WS=22913143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,134:0.46:289
chr1	22913273	rs60727050	T	TGG	110.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=3;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=117;ReadPosRankSum=0.430;SC=CAGTCTGAGGTGGGGGGGGTG;SOR=0.260;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=8;WE=22913281;WS=22913263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr1	22915674	rs56044578	G	A	3033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.956;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=67;PP=1914;ReadPosRankSum=-0.301;SC=GGGCCGCTGTGGTCAACATCA;SOR=0.700;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=256;TCF=135;TCR=121;TR=136;WE=22915682;WS=22915664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,147:0.51:288
chr1	22915753	rs606002	T	C	1686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.255;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=36;PP=1210;ReadPosRankSum=1.771;SC=TTCCCCTGCCTCAGACCCATC;SOR=0.560;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=148;TCF=70;TCR=78;TR=71;WE=22915761;WS=22915743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,74:0.47:159
chr1	22915858	rs76452513	C	T	1417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=32;PP=862;ReadPosRankSum=0.246;SC=GCTGGAGGCTCTTCATTGCCT;SOR=0.744;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=123;TCF=61;TCR=62;TR=62;WE=22915866;WS=22915848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,71:0.51:140
chr1	22915891	rs200753371	ATAAG	A	1893.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.817;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=25;PP=1280;ReadPosRankSum=-1.057;SC=AACACATTCTATAAGTAAGAG;SOR=1.172;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=60;TCF=5;TCR=55;TR=27;WE=22915902;WS=22915881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,50:0.47:106
chr1	22915978	rs521570	A	T	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=115;ReadPosRankSum=-0.601;SC=TCTGTGCCTCAGTTTCCTCCC;SOR=0.892;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=8;WE=22915986;WS=22915968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr1	22919904	rs209696	C	T	7507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=143;NR=112;PP=2965;SC=AGCAGCCGAACGGCATCATCC;SOR=0.901;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=255;TCF=143;TCR=112;TR=255;WE=22919912;WS=22919894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,283:1.00:283
chr1	22922546	rs209692	G	A	647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=383;ReadPosRankSum=-0.833;SC=TTGGGGTCAGGTCCCGGGCTA;SOR=0.648;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=48;TCF=35;TCR=13;TR=26;WE=22922568;WS=22922536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,30:0.55:55
chr1	22922560	rs209691	G	A	1821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=18;PP=1179;SC=CGGGCTAGGGGTGGCCTGGCC;SOR=1.214;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=37;TCR=18;TR=55;WE=22922568;WS=22922536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	22924464	rs12404556	T	C	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.294;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;ReadPosRankSum=-1.598;SC=CCCTGTCCTCTTGGTTCAGGT;SOR=3.145;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=39;TCF=12;TCR=27;TR=17;WE=22924472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,19:0.45:42
chr1	22925292	rs664340	C	G	4743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=110;NR=65;PP=2965;SC=CAGGCGCCTCCCCGGGCTTTC;SOR=1.210;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=175;TCF=110;TCR=65;TR=175;WE=22925300;WS=22925282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr1	22927314	rs209702	A	G	7163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=123;NR=120;PP=2965;ReadPosRankSum=1.266;SC=GTGAGTGCCAAGCCCTGGCAG;SOR=0.226;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=244;TCF=123;TCR=121;TR=243;WE=22927334;WS=22927304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,263:1.00:264
chr1	22927326	rs209701	T	G	6534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=110;NR=106;PP=2965;SC=CCCTGGCAGGTCCGCGGGCGG;SOR=0.702;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=216;TCF=110;TCR=106;TR=216;WE=22927334;WS=22927304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr1	22927672	rs12126436	G	A	2651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=44;PP=1748;SC=CCTGACACTAGGACCAGGCCC;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=29;TCR=44;TR=73;WE=22927680;WS=22927662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr1	22928265	rs209700	A	G	1354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=36;PP=1070;SC=GGCAGCCACCAAGCCCACCCC;SOR=2.110;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=12;TCR=36;TR=48;WE=22928273;WS=22928255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	22928349	rs209699	A	G	41.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=43;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=3;PP=39;SC=CCCTCCTCTCAGGTGCTGGAG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=22928357;WS=22928339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	22965438	rs172378	A	G	8109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=150;NR=118;PP=2965;SC=GCCCCCTCGGAGCCCGTGGCA;SOR=0.868;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=268;TCF=150;TCR=118;TR=268;WE=22965446;WS=22965428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,296:1.00:296
chr1	22970642	rs15940	C	T	2847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=56;NR=36;PP=1419;SC=CCGGCCTGCCCGGGGCACCAG;SOR=0.876;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=56;TCR=36;TR=92;WE=22970650;WS=22970632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr1	22970828	rs666656	G	T	250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=6;PP=139;SC=CAGGGCAGAGGTGGACTCTCA;SOR=1.085;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=10;WE=22970836;WS=22970818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	22974297	rs9434	C	A	643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=19;PP=466;SC=TGCGCTCGAGCCCCACGGGCC;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=23;WE=22974305;WS=22974287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	22987958	rs10580	A	G	1483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=37;PP=1089;SC=CCCTTGCCCAACCAATGCACA;SOR=2.494;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=12;TCR=37;TR=49;WE=22987966;WS=22987948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	23045943	rs2869513	A	G	1228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.680;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=22;PP=652;ReadPosRankSum=-0.582;SC=ATCTGGTTTCACAGGGCCCAC;SOR=0.600;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=107;TCF=61;TCR=46;TR=51;WE=23045951;WS=23045933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,60:0.50:119
chr1	23101688	rs1561624	T	G	2637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=57;NR=36;PP=1700;SC=GTTGTGAAAATAGATGGATGT;SOR=1.037;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=57;TCR=36;TR=93;WE=23101696;WS=23101678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr1	23101708	rs138464253	T	A	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.766;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=15;PP=528;ReadPosRankSum=1.108;SC=TGGGTTCCAGTCCTAGCCCTG;SOR=0.812;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=58;TCR=40;TR=37;WE=23101716;WS=23101698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,37:0.36:104
chr1	23108089	rs2817904	A	G	472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=15;PP=396;SC=TTCAGGACCCAGAGCCAGGCC;SOR=2.712;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=23108097;WS=23108079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	23191746	rs45550439	G	T	1057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=31;PP=733;ReadPosRankSum=0.360;SC=GCCCCATCGCGCTGTGCCAGG;SOR=0.684;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=112;TCF=39;TCR=73;TR=47;WE=23191754;WS=23191736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,51:0.40:126
chr1	23216712	rs309474	T	C	948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.808;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=16;PP=431;ReadPosRankSum=-0.847;SC=GAGCCTCAGCTGGAAGTTGAG;SOR=0.543;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=82;TCF=49;TCR=33;TR=40;WE=23216720;WS=23216702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,47:0.53:89
chr1	23219187	rs116119	C	T	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.702;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=330;ReadPosRankSum=-0.549;SC=CTCTGCCTACCTTTGTGGGCA;SOR=1.189;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=19;WE=23219195;WS=23219177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
chr1	23219493	rs309472	T	C	9701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=352;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=170;NR=148;PP=2965;SC=CCGTGGCAGGTTACGGGCGCT;SOR=0.800;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=318;TCF=170;TCR=148;TR=318;WE=23219501;WS=23219483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,352:1.00:352
chr1	23223116	rs309466	C	T	1432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.711;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=45;PP=938;ReadPosRankSum=1.560;SC=AGCTCACTCTCACCTCTAGGC;SOR=1.179;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=115;TCF=33;TCR=82;TR=58;WE=23223124;WS=23223106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,66:0.50:133
chr1	23232400	rs309502	C	T	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.608;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=131;ReadPosRankSum=-1.008;SC=TTTCCCTCCACGGAGGGACTG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=9;WE=23232408;WS=23232390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr1	23236826	rs309497	C	T	1044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=10;PP=551;ReadPosRankSum=-2.107;SC=AGAGGGTAGACGCCCTCAGCC;SOR=0.657;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=99;TCF=74;TCR=25;TR=45;WE=23236834;WS=23236816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,50:0.46:108
chr1	23280424	rs12048993	G	T	2092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.544;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=38;PP=1286;ReadPosRankSum=0.464;SC=GCTCCAGCACGTTCTCCGAGA;SOR=0.941;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=222;TCF=125;TCR=97;TR=94;WE=23280432;WS=23280414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,106:0.42:250
chr1	23289568	rs10799777	T	C	920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.896;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=10;PP=490;ReadPosRankSum=-0.921;SC=GCCCAGCCCATATGCCCAGTT;SOR=0.846;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=65;TCF=45;TCR=20;TR=36;WE=23289576;WS=23289558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,43:0.57:75
chr1	23291582	rs4655138	G	A	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.492;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=357;ReadPosRankSum=1.639;SC=TTTTATACACGAGGACATCGA;SOR=0.442;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=40;TCF=34;TCR=6;TR=22;WE=23291590;WS=23291572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,23:0.55:42
chr1	23342193	rs10917344	C	G	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.20;ReadPosRankSum=0.372;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr1	23342362	rs681648	A	G	947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.745;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=23;PP=522;ReadPosRankSum=1.082;SC=TGTTTAATGTATACAGAATTT;SOR=0.565;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=86;TCF=39;TCR=47;TR=42;WE=23342370;WS=23342350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,49:0.48:102
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chr1	23405794	rs2072945	A	C	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=291;ReadPosRankSum=-0.180;SC=TTGTGACATCAGGGCTGAGGC;SOR=1.106;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=19;WE=23405802;WS=23405784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr1	23405872	rs2072944	T	C	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=3;PP=106;ReadPosRankSum=-1.383;SC=CTTAGTCTTATGGGGTCATTT;SOR=0.223;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=8;WE=23405880;WS=23405862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr1	23409538	rs2235546	G	A	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=4.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=372;ReadPosRankSum=-0.248;SC=GAGACTCTTCGATAGAATGAT;SOR=1.942;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=35;TCR=2;TR=19;WE=23409546;WS=23409528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,21:0.54:39
chr1	23418153	rs10799790	C	T	2116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.418;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=40;PP=1229;ReadPosRankSum=-0.240;SC=TCTGGCCTGTCCTTCAGGGGC;SOR=0.546;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=180;TCF=90;TCR=90;TR=85;WE=23418161;WS=23418143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,100:0.51:198
chr1	23419261	rs477717	G	A	2591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.466;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=55;PP=1536;ReadPosRankSum=-1.793;SC=CCTTCAGTCCGCTCTCGGTGC;SOR=0.709;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=197;TCF=107;TCR=90;TR=109;WE=23419269;WS=23419251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,122:0.55:223
chr1	23419374	rs3765407	G	T	4104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FS=4.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.67;ReadPosRankSum=-0.415;SOR=0.881;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:153,109:0.42:262
chr1	23419383	rs477830	C	T	4322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FS=2.575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.06;ReadPosRankSum=-0.457;SOR=0.710;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:162,125:0.44:287
chr1	23419855	rs1983965	T	C	1473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.997;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.931;NF=36;NR=27;PP=815;ReadPosRankSum=1.779;SC=GTTTGATTTGTGTCTTAAGTT;SOR=0.542;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=133;TCF=78;TCR=55;TR=63;WE=23419863;WS=23419845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,73:0.47:155
chr1	23519508	.	TA	T	49.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=0.000;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=1.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.68;MQRankSum=-0.931;QD=0.80;ReadPosRankSum=0.764;SOR=1.051;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,11:0.18:62
chr1	23519633	rs6300	A	G	3429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.832;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=74;PP=2249;ReadPosRankSum=-0.363;SC=GAAACTCTTCATTAAACACAG;SOR=0.645;SbPval=0.5;Source=Platypus;TCR=143;TR=151;WE=23519641;WS=23519623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,164:0.50:326
chr1	23720260	rs2486078	T	G	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.619;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.590;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=190;ReadPosRankSum=-0.002;SC=GAGGCTGGTTTGAAAAGCTCC;SOR=2.215;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=9;WE=23720268;WS=23720250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr1	23724183	rs2275355	C	T	779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=19;PP=527;ReadPosRankSum=-1.537;SC=TGTTCCTGTACCATCCCTTGG;SOR=0.646;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=59;TCF=24;TCR=35;TR=32;WE=23724191;WS=23724173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,35:0.53:66
chr1	23735241	rs1198423	G	T	1424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.593;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=33;PP=748;ReadPosRankSum=0.730;SC=AAATTGGCAAGGAGACTGCTT;SOR=0.762;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=141;TCF=70;TCR=71;TR=65;WE=23735249;WS=23735231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,73:0.47:154
chr1	23743581	rs2156087	C	G	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.636;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=49;ReadPosRankSum=1.352;SC=AGTCTAACATCTGGTTGAGCC;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=4;WE=23743589;WS=23743571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr1	23751140	rs71514235	G	T	3525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FS=1.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.71;ReadPosRankSum=-0.289;SOR=0.581;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:134,167:0.55:301
chr1	23755513	rs1198430	T	C	898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.581;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=21;PP=389;ReadPosRankSum=-0.226;SC=CCATCAACCCTGACTATTCCT;SOR=0.306;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=89;TCF=38;TCR=51;TR=42;WE=23755521;WS=23755503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,47:0.48:97
chr1	23758134	rs1198434	A	G	90.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=2;PP=53;SC=AAATCAATGGATGCTCAGAGA;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=4;WE=23758142;WS=23758130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	23765472	rs1767148	A	G	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.184;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=16;PP=366;ReadPosRankSum=-1.402;SC=CAAGGATGTGAAGTGTAGACT;SOR=0.526;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=15;TCR=27;TR=25;WE=23765480;WS=23765462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,26:0.59:44
chr1	23810658	rs71514236	G	A	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=1.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.87;ReadPosRankSum=2.524;SOR=0.954;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,17:0.35:48
chr1	23836364	rs2075993	A	G	1285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.414;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=24;PP=882;ReadPosRankSum=-0.171;SC=GGGGGCAGGCAGGGCCACTCA;SOR=0.867;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=127;TCF=80;TCR=47;TR=66;WE=23836372;WS=23836354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,66:0.50:133
chr1	23847464	rs2075995	C	A	1135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.378;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=23;PP=661;ReadPosRankSum=-0.645;SC=TCTGGATGAGCTGGTCCAAGG;SOR=0.824;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=118;TCF=58;TCR=60;TR=46;WE=23847472;WS=23847454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,55:0.41:134
chr1	23885498	rs11574	T	C	7633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=150;NR=109;PP=2965;SC=AGTTCCGGAGTGAGCTCGGCT;SOR=0.954;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=259;TCF=150;TCR=109;TR=259;WE=23885506;WS=23885488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,290:1.00:290
chr1	23885741	rs148870313	C	T	4264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=370;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.377;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=82;PP=2557;ReadPosRankSum=-0.657;SC=GAGTGCCTCTCGGGACTCCGG;SOR=0.658;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=322;TCF=171;TCR=151;TR=171;WE=23885749;WS=23885731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,197:0.53:369
chr1	23954126	rs34020220	T	TAC	240.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=329;ReadPosRankSum=-1.020;SC=CTTCCAATTGTACACACACAC;SOR=0.582;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=8;WE=23954134;WS=23954116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr1	23955186	rs139494227	T	TTTATTA,TTTATTATTATTATTATTATTATTATTA	1060.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;NF=1,1;NR=11,11;PP=1197,1588;SC=CATTTATTCATTTATTATTAT;SOR=2.494;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=41;TCF=2;TCR=39;TR=12,12;WE=23955194;WS=23955176;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.67,0.33:24
chr1	23965517	rs61777309	G	A	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=237;ReadPosRankSum=-1.570;SC=GTGGGCAGGTGCCAGGAATTT;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=12;WE=23965525;WS=23965507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
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chr1	23965829	rs10917404	C	T	656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=21;PP=428;ReadPosRankSum=-0.390;SC=AAGGAAAGAACGAATCGATGA;SOR=0.752;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=51;TCF=12;TCR=39;TR=27;WE=23965837;WS=23965819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,29:0.55:53
chr1	23966837	rs1317329	C	T	856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=10;PP=435;ReadPosRankSum=-1.252;SC=AAATGACAGACGCTACCATCA;SOR=0.703;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=59;TCF=38;TCR=21;TR=29;WE=23966845;WS=23966827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,41:0.53:77
chr1	23966894	rs3072132	T	TAAG	1895.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=18;PP=990;ReadPosRankSum=1.515;SC=GGTGGCTTTGTAAGAAGAAAA;SOR=0.665;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=52;TCF=10;TCR=42;TR=22;WE=23966902;WS=23966884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,50:0.48:105
chr1	24018224	rs3753270	C	T	4654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=64;PP=2658;SC=TCCTCGTCTTCATCTCTGTGG;SOR=0.907;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=155;TCF=91;TCR=64;TR=155;WE=24018232;WS=24018214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr1	24018277	rs10917413	C	G	6397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=108;NR=109;PP=2965;SC=ATAAGGCCCTCGGCCGGAAGC;SOR=0.808;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=217;TCF=108;TCR=109;TR=217;WE=24018285;WS=24018267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr1	24077451	rs2235541	C	T	1912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.131;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=45;PP=1220;ReadPosRankSum=-0.131;SC=TGGAAAGCCACGGGGAGCCGA;SOR=0.814;Source=Platypus;TCF=86;TR=86;WE=24077459;WS=24077441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,91:0.48:189
chr1	24083649	rs2076346	T	C	2832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=57;PP=1736;SC=CAAATATTATTTCAGCACTAG;SOR=1.352;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=36;TCR=57;TR=93;WE=24083657;WS=24083639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr1	24106510	rs3831910	A	AT	1426.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=33;PP=1360;SC=GAATAGTATCATTTTCTTCTT;SOR=2.252;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=41;TCF=3;TCR=38;TR=35;WE=24106518;WS=24106500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	24120668	rs373850330	G	A	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.280;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=3;PP=148;ReadPosRankSum=0.440;SC=AGGGGTGGCCGGTGAGTGAGC;SOR=0.283;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=9;WE=24120676;WS=24120658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr1	24122986	rs760941	C	T	1050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=34;NR=5;PP=606;SC=GTGGGTGGGGCGGGGGGGCCT;SOR=3.312;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=47;TCF=34;TCR=13;TR=39;WE=24122994;WS=24122976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	24133612	rs1018396	G	A	3364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=46;PP=1878;SC=TGTCCTGAGCGTGATCAGGAT;SOR=0.843;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=65;TCR=46;TR=111;WE=24133620;WS=24133602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr1	24134721	rs719400	T	C	6481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=114;NR=99;PP=2965;SC=TGACAGCAGATAGCATGTCTT;SOR=0.702;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=213;TCF=114;TCR=99;TR=213;WE=24134729;WS=24134711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr1	24143932	rs2076344	A	G	2993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=46;PP=1880;SC=TTTCATCCCTAGAGAAAGGCC;SOR=0.865;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=59;TCR=46;TR=105;WE=24143940;WS=24143922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr1	24180806	rs55699941	TA	T	118.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=4.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQRankSum=-1.158;QD=5.16;ReadPosRankSum=1.006;SOR=2.115;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr1	24200903	rs2229586	G	C	1283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=23;NR=5;PP=534;SC=TCAGCAAAAAGGGGTCCGTGT;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=28;WE=24200911;WS=24200893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	24200921	rs2229585	T	C	1724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=29;NR=14;PP=801;SC=TGTCTAGGTGTCTGGGACTGG;SOR=1.378;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=29;TCR=14;TR=43;WE=24200929;WS=24200911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	24200969	rs2229584	T	C	3822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=28;PP=1146;SC=CCTCTCTCTCTTCCAGGGAGT;SOR=0.892;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=44;TCR=28;TR=72;WE=24200991;WS=24200959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr1	24200983	rs2229583	C	T	4153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=35;PP=1419;SC=AGGGAGTGAACTGATTTCTGA;SOR=0.863;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=51;TCR=35;TR=86;WE=24200991;WS=24200959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr1	24201094	rs2229581	G	C	3585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=38;PP=1798;SC=CCTCTGTCTCGGTGACTGAGG;SOR=1.061;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=68;TCR=38;TR=106;WE=24201102;WS=24201084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr1	24201109	rs2229580	C	T	4031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=39;PP=2320;SC=CTGAGGATCTCGGGGCTTCTT;SOR=1.228;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=77;TCR=39;TR=116;WE=24201117;WS=24201099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr1	24201262	rs2502993	A	G	10697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=395;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=178;NR=170;PP=2965;SC=TGGAGCAGAAAGCAAAGGCCT;SOR=0.698;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=348;TCF=178;TCR=170;TR=348;WE=24201270;WS=24201252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,395:1.00:395
chr1	24201357	rs4649124	A	G	5775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=99;PP=2965;SC=AGCACAGCCAACACTAGCCCT;SOR=0.936;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=187;TCF=88;TCR=99;TR=187;WE=24201365;WS=24201347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr1	24201448	rs3003336	C	T	6763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=120;NR=101;PP=2965;SC=ACAAGCTGGCCACATGCTGAT;SOR=0.760;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=221;TCF=120;TCR=101;TR=221;WE=24201456;WS=24201438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr1	24201643	rs2501431	G	A	4966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=74;PP=2965;SC=CCCACATGATGCCCAGGGTCA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=162;TCF=88;TCR=74;TR=162;WE=24201651;WS=24201633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr1	24201919	rs2502992	TT	CC	11503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=112;NR=98;PP=2947;SC=TCCGGCGGAGTTGGTGGGAGG;SOR=0.749;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=216;TCF=116;TCR=100;TR=210;WE=24201928;WS=24201909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chr1	24255844	rs71575785	C	CTATTAT	172.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.77;QD=34.58;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	24383819	rs7540491	T	C	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.832;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=169;ReadPosRankSum=-1.727;SC=CTGGTCCATGTAGACTAGACT;SOR=0.078;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=12;WE=24383827;WS=24383809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr1	24387822	rs7553075	T	A	1878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.590;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=50;PP=1161;ReadPosRankSum=0.021;SC=CAGAGGAGAATGGGGGCCATC;SOR=0.752;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=150;TCF=56;TCR=94;TR=77;WE=24387830;WS=24387812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,87:0.52:168
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chr1	24388679	rs3795303	T	C	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=72;ReadPosRankSum=-1.370;SC=TCCTCTCCTCTGGTTTTGTTT;SOR=1.230;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=6;WE=24388687;WS=24388669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr1	24389509	rs67138023	GAA	G	115.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.86;ReadPosRankSum=0.842;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr1	24390717	rs41268127	G	A	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.036;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=13;PP=236;ReadPosRankSum=-0.918;SC=TACCAAATCCGGAGGCCTGGG;SOR=0.490;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=58;TCF=23;TCR=35;TR=23;WE=24390725;WS=24390707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,24:0.40:60
chr1	24398634	rs59491286	G	A	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.126;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=95;ReadPosRankSum=0.207;SC=CCCGACCTTGGGGTTCCTTGG;SOR=0.069;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=8;WE=24398642;WS=24398624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr1	24400584	rs6660949	G	C	3725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=51;PP=2363;SC=TTGCTGACCTGTGTGGGCATT;SOR=0.994;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=72;TCR=51;TR=123;WE=24400592;WS=24400574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr1	24400633	rs10903083	C	G	5322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=98;NR=84;PP=2965;SC=TGGCAGGGAGCGGGGTAGGTG;SOR=0.766;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=183;TCF=99;TCR=84;TR=182;WE=24400641;WS=24400623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr1	24416059	rs4393101	T	C	2363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=15;PP=1778;SC=TGGTGCTCTGTCCCGGGGGCT;SOR=2.162;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=56;TCR=15;TR=71;WE=24416078;WS=24416049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr1	24416070	rs7533060	G	C	1163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.737;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=14;PP=655;ReadPosRankSum=1.157;SC=CCCGGGGGCTGGGCTCCTCCC;SOR=0.436;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=95;TCF=71;TCR=24;TR=47;WE=24416078;WS=24416049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,53:0.49:108
chr1	24416628	rs72648548	T	C	1908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.235;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=47;PP=849;ReadPosRankSum=-0.170;SC=GAAGGGAGCATGGGAGGGTGG;SOR=0.809;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=150;TCF=67;TCR=83;TR=84;WE=24416636;WS=24416618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,98:0.59:166
chr1	24416689	rs150779661	C	T	746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=23;PP=494;ReadPosRankSum=0.280;SC=CCAGGGTCTGCGTCCTGCCCC;SOR=0.612;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=53;TCF=13;TCR=40;TR=30;WE=24416697;WS=24416679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,33:0.55:60
chr1	24434595	rs11249170	T	C	2418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.536;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=58;PP=1505;ReadPosRankSum=0.980;SC=TAAATGGCTCTTGCAGGATTG;SOR=0.769;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=176;TCF=80;TCR=96;TR=104;WE=24434603;WS=24434585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,114:0.58:196
chr1	24434717	rs11447181	T	TC	72.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=72;ReadPosRankSum=-0.554;SC=CAAGGCTGCATCCCCCCGACC;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=4;WE=24434725;WS=24434707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr1	24447214	rs3795300	G	A	888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=10;PP=510;ReadPosRankSum=1.088;SC=AGTGTGTGGCGTGGGCAGGCA;SOR=0.664;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=76;TCF=57;TCR=19;TR=36;WE=24447222;WS=24447204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,41:0.48:86
chr1	24447468	rs3795299	G	C	1185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.670;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=31;PP=716;ReadPosRankSum=-0.860;SC=GAACATGGACGGGAAGGAGGT;SOR=0.785;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=111;TCF=49;TCR=62;TR=53;WE=24447476;WS=24447458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,59:0.48:124
chr1	24448084	rs17852648	G	A	2363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.710;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=49;PP=1395;ReadPosRankSum=0.191;SC=GAGCTCCTGCGGGCTCCCTGG;SOR=0.701;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=193;TCF=103;TCR=90;TR=99;WE=24448092;WS=24448074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,111:0.52:213
chr1	24460797	rs17852649	T	G	1739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.211;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=32;PP=1044;ReadPosRankSum=-1.058;SC=CTGCACGGATTGGCGTGGGGG;SOR=0.507;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=117;TCF=64;TCR=53;TR=66;WE=24460805;WS=24460787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,78:0.58:135
chr1	24465113	rs10903022	C	T	3330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.811;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=78;PP=2092;ReadPosRankSum=-1.193;SC=GGGTGCCCTCCGGCCCGCTGT;SOR=0.685;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=318;TCF=165;TCR=153;TR=161;WE=24465121;WS=24465103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:179,166:0.48:345
chr1	24484441	rs946671	A	G	1987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=41;PP=1135;SC=CATAATTATCATCATCTGAAT;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=22;TCR=41;TR=63;WE=24484449;WS=24484431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr1	24485518	rs10751769	T	C	1234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=4;PP=907;SC=CCCCACCTGCTGCACACCCCC;SOR=3.312;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=36;TCR=4;TR=40;WE=24485526;WS=24485508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	24485813	rs4649194	T	C	993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=5;NR=25;PP=714;SC=AACCAAGGTTTGGGGCATTAT;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=30;WE=24485821;WS=24485803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	24485941	rs4649195	T	C	969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.842;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=20;PP=624;ReadPosRankSum=-1.520;SC=AAAGTTTCTCTTTCTGCACCA;SOR=0.360;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=100;TCF=63;TCR=37;TR=45;WE=24485949;WS=24485931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,48:0.44:110
chr1	24486107	.	G	A	1724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=0.000;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.892;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=48;PP=1194;ReadPosRankSum=0.212;SC=GCCATGGGGAGTGACTGGAAA;SOR=0.980;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=143;TCF=60;TCR=83;TR=77;WE=24486115;WS=24486097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,81:0.52:155
chr1	24486216	rs34545094	GT	G	173.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=67;SC=ATGGTAGGGTGTTTTTTTTTT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=6;WE=24486224;WS=24486206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	24513768	rs4090311	G	A	943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.20;SOR=0.850;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	24668842	rs4648974	T	C	1202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=24;PP=738;SC=TCCTCCTAGCTTCTCTGGGTT;SOR=1.556;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=13;TCR=24;TR=37;WE=24668850;WS=24668832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	24671464	.	ACCCTCCACACCTGTGCC	A	491.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=0;NR=10;PP=761;SC=ACACCTGTGCACCCTCCACAC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=10;WE=24671488;WS=24671454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	24673866	rs6691722	A	G	3834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=47;PP=2514;SC=AGCAGAAGTCAATCTTCAAGT;SOR=1.422;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=136;TCF=89;TCR=47;TR=136;WE=24673874;WS=24673856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr1	24680915	rs12030057	C	T	4717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=85;PP=2758;SC=GCAACCACGTCGCCTTCCTGC;SOR=0.932;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=159;TCF=74;TCR=85;TR=159;WE=24680923;WS=24680905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr1	24687653	rs532147	T	C	583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=17;PP=414;SC=GTCACGGCACTGGGGCAGAGC;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=24687661;WS=24687643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	24695749	rs35671964	C	G	4286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=75;NR=66;PP=2322;SC=TTTTATGTTACAAAAATAGAA;SOR=0.731;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=141;TCF=75;TCR=66;TR=141;WE=24695757;WS=24695739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr1	24706113	rs3765428	G	A	1345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=41;NR=6;PP=1085;SC=AATTCGATCTGTATTTAGCAA;SOR=3.564;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=41;TCR=6;TR=47;WE=24706121;WS=24706103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	24706269	rs1064842	A	G	6192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=105;NR=90;PP=2965;SC=TAGTGTATGCATTCGCTGCAG;SOR=0.764;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=195;TCF=105;TCR=90;TR=195;WE=24706277;WS=24706259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr1	24706292	rs1142057	T	C	5959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=99;PP=2965;SC=TATTTAGAAATGATGGTGTCC;SOR=0.851;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=198;TCF=99;TCR=99;TR=198;WE=24706300;WS=24706282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr1	24706410	rs3765431	T	C	944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=28;PP=639;SC=AAGGTCTAAATGCATTTTATA;SOR=2.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=35;WE=24706418;WS=24706400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	24706438	rs3835230	A	AG	485.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=46;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=14;PP=615;SC=AAACTCTGGCAGTAACAATGA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=14;WE=24706446;WS=24706428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	24718075	rs2294520	T	C	5772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=80;PP=2965;SC=ATCTCTTGGCTTGACTATTGA;SOR=0.742;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=174;TCF=93;TCR=81;TR=173;WE=24718097;WS=24718065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr1	24727678	rs2078445	C	T	1216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=3;PP=897;SC=CCTAAAGCCACCTATTTGGTA;SOR=3.664;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=36;TCR=3;TR=39;WE=24727686;WS=24727668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	24746205	rs12125143	C	T	6405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=104;NR=116;PP=2965;SC=CATTGGCTAACAGATATGTAT;SOR=0.961;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=221;TCF=104;TCR=117;TR=220;WE=24746213;WS=24746195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr1	24768778	rs4648863	G	C	314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=8;PP=238;SC=CAGAGTGCCAGCGCCAGGATC;SOR=1.802;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=24768786;WS=24768768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	24779855	rs2272934	T	C	928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=5;PP=705;SC=TCTCGCCTACTTCTGTGGTCC;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=31;WE=24779863;WS=24779845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	24780412	.	T	C	903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.322;ClippingRankSum=0.000;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=17;PP=479;ReadPosRankSum=0.081;SC=GATTCAAAGGTAAAACTAGAT;SOR=0.696;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=67;TCF=38;TCR=29;TR=40;WE=24780420;WS=24780402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,45:0.60:75
chr1	24784139	rs10903089	A	G	978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=3;PP=649;SC=AAGAGGCTAGAAAGTGGCGGA;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=29;WE=24784147;WS=24784129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	24784197	rs195718	T	C	2175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=26;PP=1086;SC=ATGCCCTCACTGCTCTGCTCT;SOR=1.085;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=47;TCR=26;TR=73;WE=24784205;WS=24784187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr1	24785393	rs2272935	C	T	6027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=112;PP=2962;SC=TGAGTCAAGCCTCACAGATGT;SOR=0.966;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=205;TCF=93;TCR=112;TR=205;WE=24785414;WS=24785383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr1	24785406	rs185614655	G	A	2120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.178;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=54;PP=1225;ReadPosRankSum=-0.471;SC=ACAGATGTACGACTCCTCTTT;SOR=0.924;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=188;TCF=84;TCR=104;TR=93;WE=24785414;WS=24785383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,103:0.51:203
chr1	24792617	rs195725	T	A	8466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=131;NR=141;PP=2965;SC=AAAAATGAGATCGAGAAACAG;SOR=0.828;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=272;TCF=131;TCR=141;TR=272;WE=24792625;WS=24792596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,314:1.00:314
chr1	24840768	rs196403	G	A	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=4.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.074;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=133;ReadPosRankSum=-0.060;SC=TTTGGTCTTCGGAGTTTTACC;SOR=2.007;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=8;WE=24840776;WS=24840758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr1	24859617	rs196429	G	A	695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.155;HP=6;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=419;ReadPosRankSum=0.206;SC=ATCTCCTGCCGCCCCAGCCTG;SOR=0.984;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=49;TCF=36;TCR=13;TR=27;WE=24859625;WS=24859607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,29:0.55:53
chr1	24859665	rs196430	G	A	1492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=26;PP=931;ReadPosRankSum=1.526;SC=CCTCTCCCCCGGTGGGGTGGA;SOR=0.725;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=130;TCF=78;TCR=52;TR=66;WE=24859673;WS=24859655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,70:0.50:141
chr1	24861704	rs196432	G	A	1171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=3.071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.43;ReadPosRankSum=1.958;SOR=0.459;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,62:0.45:139
chr1	24922056	rs12353957	T	C	996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=29;PP=523;ReadPosRankSum=0.422;SC=ACCAGTGTCATGGTCATAGTG;SOR=0.623;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=96;TCF=31;TCR=65;TR=45;WE=24922064;WS=24922046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,51:0.47:108
chr1	24922129	rs10903095	G	A	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.757;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=99;ReadPosRankSum=-1.353;SC=GTTCTGCCACGTGCCAACTGC;SOR=0.105;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=8;WE=24922137;WS=24922119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr1	24989762	rs4649011	G	T	3582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=73;PP=2316;SC=GTCAAAAATTGTAGTGACTTA;SOR=1.288;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=49;TCR=73;TR=122;WE=24989770;WS=24989752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr1	25098245	rs9332415	T	C	1641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=10;PP=1141;SC=ATTGGGGTTTTGTAACTAGCT;SOR=3.056;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=40;TCR=10;TR=50;WE=25098253;WS=25098235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	25098341	rs7548438	C	T	7002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=129;NR=106;PP=2965;SC=GGTTCAAGTCCTATGTGTATC;SOR=0.840;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=235;TCF=129;TCR=106;TR=235;WE=25098349;WS=25098331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr1	25153692	rs4649022	G	A	3985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=78;PP=2264;SC=TTATAAATGAGTACTTTAGAG;SOR=0.931;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=67;TCR=78;TR=145;WE=25153700;WS=25153682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr1	25234062	rs34878696	T	G	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.880;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=76;ReadPosRankSum=0.349;SC=CACAGAGGTTTTCAAAAGACT;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=5;WE=25234070;WS=25234052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr1	25254317	rs7517302	C	T	1453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=38;PP=1092;SC=GCAGCTCCCCCAGGTCCCAGG;SOR=2.494;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=11;TCR=38;TR=49;WE=25254325;WS=25254307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	25256444	rs71514255	G	A	1029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=28;PP=712;ReadPosRankSum=-1.286;SC=CTCGGCCGCCGCTGCCGCGAG;SOR=1.559;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=32;WE=25256452;WS=25256434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,37:0.97:38
chr1	25291010	rs6672420	A	T	2734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=25;PP=1489;ReadPosRankSum=0.545;SC=CTCACCGCGGATGAAGGTCGG;SOR=1.454;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=88;TCF=62;TCR=26;TR=87;WE=25291018;WS=25291000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,102:0.98:104
chr1	25570550	rs5773124	A	AT	297.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.43;MQRankSum=0.756;QD=12.94;ReadPosRankSum=1.003;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,16:0.70:23
chr1	25572984	rs34484514	T	G	3578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.699;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=78;PP=2511;ReadPosRankSum=-0.399;SC=TCGTCCTGGATCTGTCCCTCC;SOR=0.546;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=312;TCF=166;TCR=146;TR=155;WE=25572992;WS=25572974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,161:0.49:327
chr1	25611035	rs2301153	G	C	6662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=151;NR=84;PP=2965;SC=CTTCCCCCTCGTCCTTCTCGC;SOR=1.448;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=235;TCF=151;TCR=84;TR=235;WE=25611043;WS=25611025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr1	25629766	rs201798270	TTCTC	T	241.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.18;MQRankSum=-0.000;QD=20.14;ReadPosRankSum=1.489;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr1	25634143	rs2427766	T	C	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.467;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.023;NF=18;NR=4;PP=383;ReadPosRankSum=-2.641;SC=CCAAGGTCACTCGGCTGGAAC;SOR=1.959;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=61;TCF=46;TCR=15;TR=22;WE=25634151;WS=25634133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,20:0.30:66
chr1	25678238	rs3093616	T	A	2142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=45;PP=1393;SC=TTAAGATGAGTATTTCACATG;SOR=1.673;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=23;TCR=45;TR=68;WE=25678246;WS=25678228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr1	25687308	rs8876	C	G	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.998;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=239;ReadPosRankSum=-2.205;SC=TGAGTGTAGTCTCAGCTTAAA;SOR=0.172;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=18;WE=25687316;WS=25687298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr1	25780668	rs34006994	C	T	1926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=12;PP=1251;SC=AAGTTACTGTCGTCAAATTAG;SOR=2.412;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=46;TCR=12;TR=58;WE=25780676;WS=25780658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr1	25780889	rs141203814	A	ATG	1335.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.751;NF=0;NR=23;PP=721;ReadPosRankSum=-0.563;SC=TATTACATAAATGTATGTGTG;SOR=1.280;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=23;WE=25780901;WS=25780879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,36:0.97:37
chr1	25780893	rs61775167	A	G	1344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.696;NF=7;NR=26;PP=775;ReadPosRankSum=-0.645;SC=ACATAAATGTATGTGTGTGTG;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=33;WE=25780901;WS=25780879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,34:0.97:35
chr1	25785451	rs35530120	A	G	1466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=36;PP=996;SC=ACATACTCCCATATGGGCCTG;SOR=2.701;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=10;TCR=36;TR=46;WE=25785459;WS=25785441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	25889342	rs10687390	CAG	C	2334.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=6;NR=29;PP=1626;SC=CTTCACCGCTCAGAGTCTCGG;SOR=1.524;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=35;WE=25889351;WS=25889332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	25889422	rs12096438	C	T	1441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=16;PP=906;SC=AACTGACATCCGAAAGGTTTC;SOR=1.112;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=27;TCR=16;TR=43;WE=25889430;WS=25889412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	25889632	rs6687605	T	C	2335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=51;PP=1628;ReadPosRankSum=-0.231;SC=CTGCACCCCCTCCTTGAAGAG;SOR=1.265;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=41;TCR=53;TR=91;WE=25889640;WS=25889621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,94:0.98:96
chr1	25889672	rs6688931	G	A	1527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=39;PP=1066;SC=AGGGGGATTGGCCATGCGGTG;SOR=2.024;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=15;TCR=39;TR=54;WE=25889680;WS=25889662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	25890050	rs6661159	A	G	1858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=13;PP=1300;SC=GGCCTGGGCAAGGCCACATCA;SOR=2.157;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=43;TCR=13;TR=56;WE=25890058;WS=25890040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	25890189	rs28969504	A	G	7973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=151;NR=132;PP=2965;SC=TAGAGGAGACAGCTAAGGCCC;SOR=0.726;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=283;TCF=151;TCR=132;TR=283;WE=25890197;WS=25890179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,307:1.00:307
chr1	26073242	rs75075607	G	A	2850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FS=2.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.27;ReadPosRankSum=-0.525;SOR=0.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:114,139:0.55:253
chr1	26085048	rs11321223	AG	A	3050.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.393;NF=60;NR=13;PP=2275;ReadPosRankSum=1.245;SC=GCCTGGCCAAAGGGGGGATGA;SOR=2.147;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=84;TCF=65;TCR=19;TR=73;WE=26085056;WS=26085038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,102:0.99:103
chr1	26090072	rs807270	A	G	2993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=60;NR=43;PP=1826;SC=GTTGGGTGGGATAGGAGTCGG;SOR=0.802;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=103;TCF=60;TCR=43;TR=103;WE=26090080;WS=26090062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr1	26098107	rs2072747	G	A	1088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.900;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=14;PP=647;ReadPosRankSum=-1.310;SC=GAGAGCCGGCGGCAGATGGAG;SOR=0.439;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=91;TCF=65;TCR=26;TR=46;WE=26098115;WS=26098097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,52:0.53:98
chr1	26098333	rs807264	G	A	2022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=49;PP=1413;ReadPosRankSum=-0.820;SC=GCCGAGCGAGGGTGCTGCGGG;SOR=1.014;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=17;TCR=50;TR=66;WE=26098341;WS=26098323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,71:0.99:72
chr1	26098350	rs807263	G	A	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.373;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=362;ReadPosRankSum=1.382;SC=CGGGCAGCGGGGCCAGATGGG;SOR=0.450;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=8;TCR=33;TR=20;WE=26098358;WS=26098340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,24:0.53:45
chr1	26107688	rs807273	C	A	5866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=115;NR=79;PP=2965;SC=TGGCTTGGGCCTGGAGTGGAA;SOR=0.964;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=194;TCF=115;TCR=79;TR=194;WE=26107696;WS=26107678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr1	26109237	rs12567324	A	G	1219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=40;PP=875;ReadPosRankSum=0.267;SC=TGGGAGGTTGAGGGTAGGGGT;SOR=0.629;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=105;TCF=22;TCR=83;TR=51;WE=26109245;WS=26109227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,54:0.49:111
chr1	26110065	rs3820514	A	G	1155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.757;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=15;PP=805;ReadPosRankSum=1.301;SC=GCCTATCACAAAGGCCCTGAG;SOR=0.838;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=103;TCF=72;TCR=31;TR=50;WE=26110073;WS=26110055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,53:0.47:113
chr1	26110143	rs3767877	G	A	3357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=65;PP=2119;ReadPosRankSum=-0.178;SC=CCTGCCCTGCGTGGGGCACAG;SOR=0.710;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=293;TCF=167;TCR=126;TR=150;WE=26110151;WS=26110133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,158:0.50:319
chr1	26110298	rs116631146	G	A	1373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.076;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=44;PP=984;ReadPosRankSum=0.029;SC=TCCTGCCGCCGCCCTGGGGCC;SOR=0.413;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=103;TCF=25;TCR=78;TR=60;WE=26110306;WS=26110288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,60:0.57:105
chr1	26127020	rs13373825	G	A	538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.66;SOR=0.990;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	26127425	rs6659086	G	A	1085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=4;PP=778;SC=CACTGGGAGAGCTCAGGAAGA;SOR=3.321;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=32;WE=26127433;WS=26127415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	26131654	rs7349185	G	A	1496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=15;PP=989;SC=GCGGCCAGCTGCGAGGAGGAG;SOR=1.739;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=37;TCR=15;TR=52;WE=26131662;WS=26131644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	26135741	rs2280997	C	G	724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.984;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=18;PP=380;ReadPosRankSum=1.006;SC=TCCACCTCTCCTCCCACTGCC;SOR=0.507;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=60;TCF=21;TCR=39;TR=30;WE=26135749;WS=26135731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,35:0.51:69
chr1	26136282	rs147587542	C	T	4409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=400;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.362;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=100;PP=2545;ReadPosRankSum=1.599;SC=CCCACGTCCGCGACTTCCGGC;SOR=0.718;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=348;TCF=167;TCR=181;TR=191;WE=26136290;WS=26136272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,214:0.54:399
chr1	26138136	rs760598	C	A	7251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=152;NR=105;PP=2965;SC=CCTGAGGATTCTTGCCCATCT;SOR=1.137;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=257;TCF=152;TCR=105;TR=257;WE=26138144;WS=26138126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,273:1.00:273
chr1	26138262	rs760597	T	C	4874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=92;PP=2955;SC=GCCACCTGCCTTCAGGGGAGC;SOR=1.514;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=53;TCR=92;TR=145;WE=26138270;WS=26138252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr1	26139137	rs10902685	C	T	525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=3;PP=316;SC=GGACCCTGGCCGCTTTGATGA;SOR=1.981;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=26139145;WS=26139127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	26139392	rs3738451	A	G	1340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=25;PP=776;SC=TGAGGGCCTCAGGGACTGCCC;SOR=1.157;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=20;TCR=25;TR=45;WE=26139400;WS=26139382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	26139444	rs10751726	G	A	463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=347;SC=TTTCTGTGCTGAGCCCAGAGG;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=26139452;WS=26139434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	26139919	rs6676509	C	T	197.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=158;SC=AGTACAAGCACGGTGAGTGTT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=26139927;WS=26139909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	26140573	rs2294228	C	A	6354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=120;NR=97;PP=2965;SC=CACAGAACAACCAGGAGAACT;SOR=0.734;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=217;TCF=120;TCR=97;TR=217;WE=26140581;WS=26140563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr1	26146884	rs984412	C	G	1712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=36;PP=1266;SC=AGGCGGCGAGCACTTGGCCGA;SOR=1.569;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=19;TCR=36;TR=55;WE=26146892;WS=26146874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	26150023	rs11247758	C	T	2491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=25;PP=1718;SC=TAGAGAGTGCCCTGTCCCTAG;SOR=1.292;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=47;TCR=26;TR=71;WE=26150031;WS=26150013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr1	26152666	rs6598923	T	C	1559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=11;PP=1042;SC=AGGAACCTTCTTCTGCCCCCT;SOR=2.093;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=38;TCR=11;TR=49;WE=26152674;WS=26152656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	26152758	rs6598924	A	G	5095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=103;NR=76;PP=2959;SC=TCATCATGGCATCTGTAAATG;SOR=0.881;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=179;TCF=103;TCR=76;TR=179;WE=26152766;WS=26152748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr1	26310394	rs2275102	A	G	1156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.717;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=18;PP=686;ReadPosRankSum=-1.972;SC=GTAGGGAGAGAACAGGCTCAT;SOR=0.613;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=95;TCF=58;TCR=37;TR=47;WE=26310402;WS=26310384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,55:0.51:108
chr1	26314564	rs2245979	T	C	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.882;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=135;ReadPosRankSum=0.665;SC=AAAGGCCTTCTGGGGAAGGTG;SOR=0.264;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=11;WE=26314572;WS=26314554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr1	26314625	rs2257255	G	A	822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.802;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=11;PP=467;ReadPosRankSum=-0.856;SC=GCTAGCAGATGGAAATGTCTT;SOR=0.829;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=84;TCF=59;TCR=25;TR=40;WE=26314633;WS=26314615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,44:0.46:95
chr1	26349109	rs78022960	C	CT	2065.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.316;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.09;MQRankSum=0.910;NF=3;NR=27;PP=1066;ReadPosRankSum=-0.914;SC=GGCCTCCCAGCTTCCCTAGCC;SOR=0.404;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=64;TCF=14;TCR=50;TR=30;WE=26349117;WS=26349099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,70:0.56:126
chr1	26357656	rs2736831	C	A	3900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=487;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=92;PP=2962;ReadPosRankSum=0.008;SC=AACATCAGCTCACCCCTCACT;SOR=0.689;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=442;TCF=219;TCR=223;TR=187;WE=26357686;WS=26357640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:280,206:0.42:486
chr1	26357667	rs11247848	G	A	5838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=470;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=119;NR=135;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.981;SC=ACCCCTCACTGCTGTGGAACA;SOR=0.713;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=431;TCF=207;TCR=224;TR=254;WE=26357686;WS=26357640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:191,279:0.59:470
chr1	26357855	rs2802321	A	G	4149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=63;PP=2751;SC=TCCAAGCCCTAACATTTTTCC;SOR=0.866;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=140;TCF=77;TCR=63;TR=140;WE=26357863;WS=26357845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
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chr1	26365549	rs2997452	C	T	1643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.629;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=31;PP=876;ReadPosRankSum=-2.193;SC=ACCTGGTTTACAACACAGCTG;SOR=0.626;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=124;TCF=63;TCR=61;TR=67;WE=26365557;WS=26365539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,77:0.56:138
chr1	26372144	rs6686190	A	G	749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=3;PP=506;SC=CAGGGGTCAGAATCTGGGCTG;SOR=3.014;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=26372152;WS=26372134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	26392824	rs35123100	C	A	1844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.222;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=37;PP=1095;ReadPosRankSum=1.330;SC=GCAGGCCGTACACTCCGTGAC;SOR=0.570;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=149;TCF=75;TCR=74;TR=76;WE=26392832;WS=26392814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,86:0.52:165
chr1	26496370	rs2232646	C	T	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=410;ReadPosRankSum=0.044;SC=CCGAGCCTGCCTAGCCCCCCG;SOR=1.112;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=10;WE=26496391;WS=26496360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr1	26496383	rs2232647	G	T	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.737;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=369;ReadPosRankSum=-0.307;SC=GCCCCCCGGCGTGGCCTGACG;SOR=0.321;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=13;WE=26496391;WS=26496360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr1	26510336	rs115982258	C	T	882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=30;PP=628;ReadPosRankSum=-0.498;SC=CTTCCCCTGCCGCCCCCCGAC;SOR=0.728;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=80;TCF=27;TCR=53;TR=44;WE=26510344;WS=26510326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,49:0.54:91
chr1	26511139	rs2297711	G	A	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=19;PP=410;ReadPosRankSum=-1.066;SC=GGGTTCCCCTGTTTGAGGAGC;SOR=0.793;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=20;TCR=39;TR=29;WE=26511147;WS=26511129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,29:0.49:59
chr1	26511700	rs2783680	A	G	1781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.231;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=37;PP=1025;ReadPosRankSum=0.895;SC=ACACAAAAACAGGTAGGCAAG;SOR=0.843;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=145;TCF=75;TCR=70;TR=74;WE=26511708;WS=26511690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,84:0.52:162
chr1	26515956	rs1045105	C	A	2899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.267;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=62;PP=1652;ReadPosRankSum=0.878;SC=ACAGTCCCCCCACTCCCTGCC;SOR=0.473;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=261;TCF=123;TCR=138;TR=127;WE=26515964;WS=26515934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,141:0.49:285
chr1	26517667	rs11247864	T	C	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.301;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=88;ReadPosRankSum=1.556;SC=TCTCAGATGATTTCCCCCCTC;SOR=2.030;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=8;WE=26517675;WS=26517657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
chr1	26520292	rs12138368	G	T	2283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FS=3.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.28;ReadPosRankSum=-2.219;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:129,117:0.48:246
chr1	26524706	rs9970046	A	G	3840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=55;PP=2416;SC=GCGTTCATTTACATGACATTT;SOR=0.708;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=119;TCF=64;TCR=55;TR=119;WE=26524714;WS=26524696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr1	26527304	rs12121284	T	C	658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=2.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.34;ReadPosRankSum=0.120;SOR=0.250;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
chr1	26527310	rs12118976	C	G	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=2.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.84;ReadPosRankSum=0.086;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,21:0.66:32
chr1	26527809	rs1889755	AG	CA	1229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.351;HP=3;HapScore=2;JOINED;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=984;ReadPosRankSum=0.342;SC=CCCTCCCCTGAGGCCTTCTGA;SOR=1.547;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=24;WE=26527818;WS=26527799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,29:0.63:46
chr1	26527863	rs17163674	C	T	1375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.683;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=19;PP=781;ReadPosRankSum=-1.848;SC=AGGAGGTGCGCGCAATCCGCT;SOR=0.832;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=113;TCF=72;TCR=41;TR=57;WE=26527871;WS=26527853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,63:0.50:126
chr1	26527884	rs41310785	G	A	1717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.217;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=30;PP=978;ReadPosRankSum=0.556;SC=TCAACCAGGAGCAGGAGTCAG;SOR=0.578;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=151;TCF=91;TCR=60;TR=72;WE=26527892;WS=26527874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,81:0.48:168
chr1	26527951	rs6657616	G	A	2870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.423;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=60;PP=1740;ReadPosRankSum=0.348;SC=GTCATCCAAGGACATCCGCCA;SOR=0.590;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=259;TCF=140;TCR=119;TR=125;WE=26527959;WS=26527941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,138:0.49:282
chr1	26528922	rs10902720	C	G	3793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=76;NR=51;PP=2337;SC=AGGTGAGTAACGGAGGCTGCC;SOR=1.092;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=127;TCF=76;TCR=51;TR=127;WE=26528930;WS=26528912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr1	26529061	rs114100693	G	A	1589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=34;PP=804;ReadPosRankSum=-0.448;SC=CAAGGGGCCTGCACACACACA;SOR=0.726;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=108;TCF=43;TCR=65;TR=59;WE=26529069;WS=26529051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,68:0.54:127
chr1	26529121	rs6691747	G	C	1079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=23;PP=709;SC=GCAGAGCCTGGCCAGAGCCCA;SOR=2.432;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=31;WE=26529129;WS=26529111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	26566187	rs12134756	G	A	929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.582;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=5;PP=585;ReadPosRankSum=0.100;SC=TCAGTTGAATGGGAACTGAGT;SOR=1.692;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=83;TCF=63;TCR=20;TR=34;WE=26566195;WS=26566177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,40:0.43:92
chr1	26597435	rs4659419	G	A	5184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=103;NR=77;PP=2965;SC=TGTGCAATAAGTAGCAGAACC;SOR=0.938;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=181;TCF=104;TCR=77;TR=180;WE=26597443;WS=26597425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr1	26597673	rs11247894	G	A	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-3.224;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=56;ReadPosRankSum=-0.305;SC=GGAGGGATACGTGAATTCTTG;SOR=0.293;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=26597681;WS=26597663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr1	26601385	rs3795685	G	A	1406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=18;PP=772;ReadPosRankSum=0.070;SC=GTCCAAGCCAGCGGTGATATT;SOR=0.697;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=107;TCF=73;TCR=34;TR=59;WE=26601393;WS=26601375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,66:0.53:124
chr1	26608769	rs35567724	C	T	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.739;HP=4;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=17;PP=468;ReadPosRankSum=-0.566;SC=GGCGGAGCAGCGGGTTGAGGG;SOR=0.508;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=90;TCF=55;TCR=35;TR=40;WE=26608777;WS=26608759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,39:0.43:91
chr1	26608811	.	TCCAGGACAGGGACTGGGGCCGGGA	T	2226	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=3;HapScore=3;MGOF=12;MMLQ=24;MQ=62.47;NF=14;NR=14;PP=2226;QD=82.2773860461;SC=TGGGACTGGGTCCAGGACAGG;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=63;TCF=26;TCR=37;TR=28;WE=26608890;WS=26608801;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:35,28:0.44:63
chr1	26608814	rs6672357	A	G	3989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.66;QD=44.33;SOR=1.364;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr1	26608825	.	TGGGGCCG	T	981.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.293;ClippingRankSum=0.000;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.04;MQRankSum=-4.826;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.521;SOR=0.867;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,35:0.40:87
chr1	26608835	.	ACCGGGACCGGGACTGGG	A	951.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.704;ClippingRankSum=0.000;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=2.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.97;MQRankSum=-5.780;QD=10.02;ReadPosRankSum=0.037;SOR=1.108;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,35:0.37:95
chr1	26608853	.	GCCGGGACCGGGACCGGGACTGGGGCCGGGA	G	2295	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=3;HapScore=3;MGOF=12;MMLQ=23;MQ=62.65;NF=10;NR=23;PP=2295;QD=70.0909090909;SC=CGGGACTGGGGCCGGGACCGG;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=73;TCF=23;TCR=50;TR=33;WE=26608890;WS=26608801;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:40,33:0.45:73
chr1	26608865	.	ACC	A	2119.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-2.503;ClippingRankSum=0.000;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=64.30;MQRankSum=6.293;QD=23.55;ReadPosRankSum=1.458;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,55:0.61:90
chr1	26608868	.	GGGACTGGGGCCGGGACCGGGACCGGGAC	G	2044.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.492;ClippingRankSum=0.000;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=1.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.20;MQRankSum=7.882;QD=16.76;ReadPosRankSum=1.677;SOR=0.893;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,56:0.46:122
chr1	26608896	.	C	G	1222	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=49;MMLQ=22;MQ=63.04;NF=25;NR=20;PP=1222;QD=27.9282491677;SC=GGGACCGGGACAGGGACCAGG;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=102;TCF=58;TCR=44;TR=45;WE=26608904;WS=26608886;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:57,45:0.44:102
chr1	26609093	rs72872912	A	T	2368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=49;PP=1434;ReadPosRankSum=-0.554;SC=CAGGCTGGGCAGTGGGACCAG;SOR=0.671;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=256;TCF=132;TCR=124;TR=103;WE=26609101;WS=26609083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,114:0.40:288
chr1	26609259	rs7522905	C	T	3092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.426;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=62;PP=1754;ReadPosRankSum=-0.399;SC=GGGGTGCCGGCGTGTTGGGTG;SOR=0.749;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=262;TCF=134;TCR=128;TR=130;WE=26609267;WS=26609249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,145:0.50:290
chr1	26609307	rs6598952	G	T	5546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=94;PP=2965;SC=CCATCAGCACGCGGTGACCCA;SOR=0.843;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=184;TCF=89;TCR=95;TR=183;WE=26609315;WS=26609297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr1	26610891	rs4332350	A	C	4649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=82;PP=2526;SC=CTTGTGCATCAGCTGCCTGCC;SOR=0.824;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=161;TCF=79;TCR=82;TR=161;WE=26610899;WS=26610881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr1	26612042	rs11247898	A	G	2344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=38;NR=42;PP=1385;SC=GCTGCAAGGGAAGAGGAAAAG;SOR=0.997;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=38;TCR=42;TR=80;WE=26612050;WS=26612032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr1	26620846	rs3832184	C	CA	4968.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=75;PP=2966;SC=GGGGGAGATGCGGGGCACCGT;SOR=1.721;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=6;TCR=76;TR=81;WE=26620854;WS=26620836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr1	26627478	rs2276712	T	C	14333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=549;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=270;NR=241;PP=2965;SC=TCTTTTCTTCTGAGCCACACC;SOR=0.780;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=511;TCF=270;TCR=241;TR=511;WE=26627486;WS=26627468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,549:1.00:549
chr1	26629465	rs11803933	G	C	832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=21;PP=523;SC=CCAAGCCCAGGGGGTAGCCTG;SOR=2.165;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=28;WE=26629473;WS=26629455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	26646574	rs112252579	G	A	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=2.844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.36;MQRankSum=0.830;QD=12.26;ReadPosRankSum=-1.841;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr1	26646726	rs1071849	A	G	14589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.03;QD=44.21;SOR=0.808;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,330:1.00:330
chr1	26646730	rs17645	A	G	14501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.03;QD=45.04;SOR=0.811;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,322:1.00:322
chr1	26648551	rs11247913	G	C	9677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=366;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=170;NR=165;PP=2965;SC=CGGCCTCCTGGGGGTGGGATG;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=335;TCF=170;TCR=165;TR=335;WE=26648559;WS=26648541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,366:1.00:366
chr1	26648826	rs60799739	G	A	686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=21;PP=451;ReadPosRankSum=-0.061;SC=TGAGGCCCCAGGAGGTCATCA;SOR=0.801;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=65;TCF=20;TCR=45;TR=30;WE=26648834;WS=26648816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,32:0.47:68
chr1	26650550	rs11247915	C	A	894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.566;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=9;PP=678;ReadPosRankSum=-0.395;SC=CTGTGTGCATCCCTCTGTGTT;SOR=1.227;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=82;TCF=62;TCR=20;TR=40;WE=26650558;WS=26650540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,41:0.46:89
chr1	26654937	rs11589684	G	C	2063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.598;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=54;PP=1426;ReadPosRankSum=0.965;SC=TTCTCCCATGGAGGGATTCCT;SOR=0.606;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=153;TCF=61;TCR=92;TR=91;WE=26654945;WS=26654927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,95:0.58:164
chr1	26655208	rs11247916	C	T	565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.902;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=347;ReadPosRankSum=-0.528;SC=GCACCCATGCCTCCCCTCAGC;SOR=0.807;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=72;TCF=46;TCR=26;TR=25;WE=26655216;WS=26655198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,28:0.36:77
chr1	26655462	rs12057290	C	T	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.137;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=19;PP=407;ReadPosRankSum=-0.193;SC=ATCTGTATGTCAGGCCTTCTT;SOR=0.280;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=49;TCF=9;TCR=40;TR=25;WE=26655470;WS=26655452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,31:0.56:55
chr1	26662774	rs7517559	C	T	2760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=47;PP=1813;ReadPosRankSum=-0.121;SC=GGGAAAGGTCCGAAATGAGGG;SOR=0.719;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=248;TCF=155;TCR=93;TR=122;WE=26662782;WS=26662764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,130:0.48:273
chr1	26663362	rs10751735	C	T	1985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.542;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=33;PP=1147;ReadPosRankSum=0.540;SC=GGCCTGTGTGCTGGGGCCGTG;SOR=0.869;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=148;TCF=82;TCR=66;TR=82;WE=26663370;WS=26663352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,92:0.56:165
chr1	26670752	rs11247923	C	T	6448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=116;NR=110;PP=2965;SC=TGGCAGGCAGCGTGGCGTACA;SOR=0.761;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=226;TCF=116;TCR=110;TR=226;WE=26670760;WS=26670742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr1	26671084	rs12562454	G	T	6492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=117;NR=104;PP=2965;SC=GATGAGATGGGGCTCCCTTCA;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=223;TCF=117;TCR=106;TR=221;WE=26671092;WS=26671074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr1	26671248	rs57268417	A	G	2708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=46;PP=1730;SC=TGGGCCCTGGACAACCTCAGT;SOR=0.842;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=46;TCR=46;TR=92;WE=26671256;WS=26671238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr1	26673076	rs11247924	G	A	9416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=138;NR=188;PP=2965;SC=GTGGGGGGCCGCTGCCGCCAT;SOR=1.086;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=326;TCF=138;TCR=188;TR=326;WE=26673084;WS=26673066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,351:1.00:351
chr1	26673108	rs11247925	C	T	6097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=126;PP=2965;SC=ACTTACCACTCGGGCCTTGGC;SOR=1.284;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=208;TCF=82;TCR=126;TR=208;WE=26673116;WS=26673098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr1	26673220	rs11247926	A	G	624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=18;PP=496;SC=AGGAATAAGAAAGATGAGGGT;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=26673228;WS=26673210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	26691286	rs144078461	CCCACCGAGCGCTGGGGTGCCCCAG	C	2837.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.908;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.594;NF=5;NR=26;PP=2962;ReadPosRankSum=1.406;SC=AGCAGGGTCTCCCACCGAGCG;SOR=0.842;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=80;TCF=17;TCR=63;TR=31;WE=26691317;WS=26691276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,76:0.44:171
chr1	26694059	rs75541583	G	C	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=21;ReadPosRankSum=1.725;SC=CCAGGCGCAGGTGCAGCCCGG;SOR=0.765;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=16;TCF=11;TCR=5;TR=5;WE=26694067;WS=26694049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr1	26694245	rs10794531	T	C	1409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=33;PP=682;ReadPosRankSum=0.128;SC=GGATGGGCCATGAGCATCCAC;SOR=0.758;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=111;TCF=55;TCR=56;TR=63;WE=26694253;WS=26694235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,68:0.56:121
chr1	26698938	rs6703878	A	G	2063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.529;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=34;PP=1182;ReadPosRankSum=1.274;SC=CAAATACTTAATTCCAACCTC;SOR=0.631;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=183;TCF=112;TCR=71;TR=89;WE=26698946;WS=26698928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,99:0.50:197
chr1	26699051	rs6699091	C	A	2047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=52;PP=1106;ReadPosRankSum=2.045;SC=GCCAGCTCTGCCCTCTCCTGG;SOR=0.706;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=190;TCF=79;TCR=111;TR=93;WE=26699059;WS=26699041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,99:0.49:202
chr1	26699103	rs11584185	T	C	1055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.538;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=29;PP=701;ReadPosRankSum=-0.624;SC=CTTGCACAACTTCTCTGTTAG;SOR=0.377;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=75;TCF=18;TCR=57;TR=41;WE=26699111;WS=26699093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,44:0.55:80
chr1	26699157	rs11247937	T	C	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.521;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=148;ReadPosRankSum=-0.783;SC=CTTCCCAACCTACTCTGGTGA;SOR=0.193;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=9;WE=26699165;WS=26699147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr1	26700795	rs7520030	T	C	4191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=64;NR=77;PP=2489;SC=CCAGCTGTGCTCCCTCCTGGC;SOR=1.045;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=64;TCR=77;TR=141;WE=26700803;WS=26700785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr1	26856462	rs11800553	T	G	278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=7;NR=3;PP=105;SC=AGCTAGTGCCTCTGGACCCGG;SOR=1.022;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=10;WE=26856470;WS=26856452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	26869610	rs921893	G	A	7347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=156;NR=93;PP=2965;SC=AGCAGAAGTAGGAAGAGTAAC;SOR=1.154;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=250;TCF=157;TCR=93;TR=249;WE=26869618;WS=26869600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,275:1.00:275
chr1	26878390	rs11581016	G	A	1874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=50;PP=1357;SC=GAGGCCATACGCTGGCAAGGT;SOR=3.021;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=11;TCR=50;TR=61;WE=26878398;WS=26878380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr1	26879792	rs4970489	T	C	323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=231;SC=CCAGGGTGGCTCTTCAGGACC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=26879800;WS=26879791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	26879920	rs4970490	T	C	5130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=103;NR=71;PP=2685;SC=TTTACCTGGCTGAGCTGGCTC;SOR=0.966;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=177;TCF=105;TCR=72;TR=174;WE=26879928;WS=26879910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr1	26880583	rs41286645	C	A	682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=373;ReadPosRankSum=0.047;SC=CCCGCCCAGTCATCAGAGAGA;SOR=0.667;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=51;TCF=42;TCR=9;TR=25;WE=26880591;WS=26880573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,30:0.54:56
chr1	26881858	rs11247964	C	T	2175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=35;PP=1389;SC=CCTTCCAGAGCCCCTCTTTCA;SOR=0.719;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=37;TCR=35;TR=72;WE=26881866;WS=26881848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr1	26900708	rs2229714	G	A	3860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=73;PP=2304;SC=CAGGGCATTCGGGCCACAGGG;SOR=1.079;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=132;TCF=59;TCR=73;TR=132;WE=26900716;WS=26900698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr1	26900735	rs282179	C	G	2503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=45;PP=1651;SC=TAGCTTGACACAGTCAGCATG;SOR=1.192;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=33;TCR=45;TR=78;WE=26900743;WS=26900725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr1	26900805	rs12121702	G	A	1142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=14;PP=816;SC=CCGAGGGGCCGGGGAAGCTGC;SOR=1.236;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=22;TCR=14;TR=36;WE=26900813;WS=26900795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	26900920	rs12118436	A	T	6013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=120;NR=88;PP=2965;SC=TCACTGTATAAACTTTTTTTT;SOR=0.884;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=209;TCF=120;TCR=89;TR=208;WE=26900930;WS=26900910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr1	27210721	rs3170660	T	C	3298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=52;PP=1735;SC=TCTTGGGCTCTGAAACAGTAT;SOR=0.775;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=113;TCF=60;TCR=53;TR=112;WE=27210729;WS=27210711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr1	27237460	rs200723643	G	GT	220.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.798;HP=1;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=0;PP=144;ReadPosRankSum=-1.507;SC=CAAGTGTCATGGAAGGGTTTC;SOR=2.419;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=3;WE=27237472;WS=27237456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr1	27237461	rs377522661	G	T	226.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=5.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.94;ReadPosRankSum=-0.581;SOR=2.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr1	27237463	rs71824349	AGG	A	217.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.831;HP=3;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=0;PP=158;ReadPosRankSum=-0.246;SC=GTGTCATGGAAGGGTTTCAGA;SOR=2.247;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=3;WE=27237472;WS=27237456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr1	27278521	rs3010110	G	A	4322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=77;NR=65;PP=2275;SC=CCTCAGTGGAGTCCTCAGTAG;SOR=0.705;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=142;TCF=77;TCR=65;TR=142;WE=27278529;WS=27278511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr1	27278553	rs3010109	G	A	4256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=70;NR=73;PP=2298;SC=CTGCATCCCCGCACACAGGCT;SOR=0.881;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=144;TCF=70;TCR=74;TR=143;WE=27278561;WS=27278543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr1	27320356	rs6689941	T	C	2440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.42;SOR=0.778;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr1	27426796	rs4266911	T	C	2575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=35;PP=1305;ReadPosRankSum=-0.984;SC=CTGGCCCTGGTGTTACTGCCC;SOR=0.863;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=90;TCF=55;TCR=35;TR=89;WE=27426804;WS=27426786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,100:0.98:102
chr1	27427041	rs4418629	T	C	8971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=151;NR=143;PP=2965;SC=CCTTCAGCTCTTCATTCACCA;SOR=0.768;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=294;TCF=151;TCR=143;TR=294;WE=27427049;WS=27427031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,332:1.00:332
chr1	27428321	rs6598870	T	C	1212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=32;PP=562;ReadPosRankSum=2.199;SC=ACCGCAGCTGTGGGAGGGACA;SOR=0.747;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=104;TCF=45;TCR=59;TR=56;WE=27428329;WS=27428311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,63:0.51:124
chr1	27435976	rs3738689	C	G	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.156;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=336;ReadPosRankSum=-1.892;SC=CAGCCCCCGCCCCCACCCCGC;SOR=0.421;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=49;TCF=39;TCR=10;TR=27;WE=27435984;WS=27435966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,27:0.50:54
chr1	27480757	rs34306208	A	G	3092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.837;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=69;PP=1905;ReadPosRankSum=1.132;SC=CCACCAAAGCAACCACCACGA;SOR=0.579;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=300;TCF=164;TCR=136;TR=147;WE=27480765;WS=27480747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,160:0.50:322
chr1	27609980	rs6670124	T	G	5201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=94;PP=2965;SC=AAGCCACAGATCAAGCACAAG;SOR=1.240;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=160;TCF=66;TCR=94;TR=160;WE=27609988;WS=27609970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr1	27676125	rs12122380	C	T	1953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.793;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=34;PP=1306;ReadPosRankSum=-2.173;SC=GGCGCCCCGTCACTTGCCCCC;SOR=0.452;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=148;TCF=94;TCR=54;TR=85;WE=27676138;WS=27676115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,89:0.55:161
chr1	27677233	rs41291094	A	G	700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.767;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=13;PP=357;ReadPosRankSum=0.803;SC=CTCGCGCAGCATCTACGCGGG;SOR=0.434;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=77;TCF=49;TCR=28;TR=32;WE=27677241;WS=27677223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,38:0.40:96
chr1	27684396	rs4970520	G	A	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.384;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=95;ReadPosRankSum=1.580;SC=TGCTGATTGAGGACGGGCAGC;SOR=0.330;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=7;WE=27684404;WS=27684386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr1	27686063	rs7521552	G	C	1345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=12;NR=31;PP=962;SC=GCCAGCAGAAGTAGACCCTCT;SOR=1.931;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=12;TCR=31;TR=43;WE=27686071;WS=27686053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	27696011	rs10218730	C	T	2056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=51;PP=1446;SC=CCCAGCACCACGCCTGGCACC;SOR=2.584;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=13;TCR=51;TR=64;WE=27696019;WS=27696001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	27720178	rs2504786	T	C	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.032;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=155;ReadPosRankSum=0.442;SC=GCATTGGGACTCTATCAGGTA;SOR=1.329;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=10;WE=27720186;WS=27720168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
chr1	27875824	rs4908364	C	T	4501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=86;NR=60;PP=2302;SC=CAGTCTGAAGCGGCTGGAGTT;SOR=0.816;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=86;TCR=61;TR=146;WE=27875832;WS=27875814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr1	27876482	rs2076457	C	A	4873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.492;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=86;PP=2932;ReadPosRankSum=0.440;SC=CAGTAAGGCCCGGGCCCCCGA;SOR=0.590;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=166;TCF=80;TCR=86;TR=165;WE=27876493;WS=27876472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,180:0.99:181
chr1	27944000	rs1292089	T	A	480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=13;PP=374;SC=GTAGGTGCCCTGCAAAGGTTA;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=27944008;WS=27943990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	27995077	rs56015130	G	T	2734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=36;NR=52;PP=1539;SC=CGTAGTGGGGGTGTTGGGGTG;SOR=1.473;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=89;TCF=36;TCR=53;TR=88;WE=27995085;WS=27995067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr1	28086955	rs10902671	C	A	1778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.55;SOR=1.828;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	28159447	.	A	AT	301.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.604;ClippingRankSum=0.000;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.524;HP=10;HapScore=3;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=204;ReadPosRankSum=-1.908;SC=TTTCATCCTGATTTTTTTTTT;SOR=0.040;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=1;TCR=44;TR=18;WE=28159455;WS=28159437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,18:0.41:44
chr1	28199253	rs61787158	A	G	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.39;ReadPosRankSum=-0.632;SOR=0.746;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,26:0.45:58
chr1	28199369	rs61787159	C	T	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.522;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.07;ReadPosRankSum=0.541;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr1	28206588	rs12568383	T	C	1389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.685;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=34;PP=636;ReadPosRankSum=-0.845;SC=GGCAGATGGATGCGCGCTGCT;SOR=0.772;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=109;TCF=45;TCR=64;TR=60;WE=28206596;WS=28206578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,70:0.56:124
chr1	28209305	rs3766398	A	G	4597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=82;NR=63;PP=2838;SC=TGGTGAGCCTAGACTCTGAGC;SOR=0.823;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=147;TCF=82;TCR=65;TR=145;WE=28209313;WS=28209295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr1	28209362	rs3766399	T	C	7625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.60;SOR=0.753;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr1	28209366	rs3766400	A	G	7550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.42;SOR=0.741;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr1	28211650	rs1467464	T	C	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.858;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=209;ReadPosRankSum=0.448;SC=TTCACATGCATGTAGCAAAAA;SOR=3.209;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=12;WE=28211658;WS=28211640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr1	28212272	rs11247705	G	A	1367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.216;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=17;PP=875;ReadPosRankSum=0.120;SC=AAGACCGTAGGGCATCCAGGC;SOR=0.353;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=97;TCF=70;TCR=27;TR=56;WE=28212280;WS=28212262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,60:0.59:102
chr1	28224312	rs2295367	C	T	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=4;PP=65;ReadPosRankSum=0.899;SC=GAGAAAGTTACGAAGTAGAAG;SOR=0.608;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=17;TCF=6;TCR=11;TR=7;WE=28224320;WS=28224302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr1	28261593	rs3737809	T	C	2716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.54;SOR=1.392;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	28261600	rs3737808	A	C	2824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.46;SOR=1.341;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr1	28261658	rs3831926	T	TG	3862.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=27;PP=2921;SC=CAACAGTGCCTGAGAATCCCA;SOR=1.679;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=68;TCF=39;TCR=29;TR=65;WE=28261666;WS=28261648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr1	28261902	rs3737807	C	A	772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=22;PP=563;SC=AGCTAGTGGGCCTTAGCAAGT;SOR=4.255;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=24;WE=28261910;WS=28261892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	28268573	rs10902678	C	T	532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=1;PP=451;SC=CACCCTTCAGCAGTATGTGCC;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=28268581;WS=28268567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	28268706	rs4908341	G	A	2824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=55;NR=40;PP=1891;SC=ACGTCAAAGGGGCCAAACTGC;SOR=0.936;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=55;TCR=40;TR=95;WE=28268714;WS=28268696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr1	28268833	rs11386058	C	CG	5478.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=17;NR=46;PP=2684;SC=AGGGCCTCCCCCAACATCCAT;SOR=0.865;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=69;TCF=17;TCR=52;TR=63;WE=28268843;WS=28268823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr1	28268835	rs5018921	A	C	5487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=39;NR=46;PP=1923;SC=GGCCTCCCCCAACATCCATCC;SOR=0.816;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=39;TCR=46;TR=85;WE=28268843;WS=28268823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr1	28271781	rs141035438	G	A	2164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.529;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=46;PP=1268;ReadPosRankSum=-0.720;SC=CCTTGACCCTGACTACAAGGT;SOR=0.575;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=223;TCF=123;TCR=100;TR=100;WE=28271789;WS=28271771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,113:0.45:251
chr1	28282819	rs4908381	T	C	1358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=37;PP=1077;SC=CTGTCACAGCTTCATACCTGG;SOR=3.467;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=44;TCF=6;TCR=38;TR=43;WE=28282827;WS=28282809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	28290231	rs4373781	C	G	699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=15;PP=443;SC=GGCTGGCCCCCCTGTCGTGGC;SOR=1.697;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=8;TCR=15;TR=23;WE=28290239;WS=28290221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	28293712	rs6673064	G	A	891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.698;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=26;PP=539;ReadPosRankSum=-0.796;SC=GAAGGGATAGGTGAACGGCGT;SOR=0.510;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=99;TCF=31;TCR=68;TR=40;WE=28293720;WS=28293702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,44:0.41:108
chr1	28301217	rs12406483	C	T	720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=22;PP=450;ReadPosRankSum=-0.316;SC=TAATCATATGCATAAGGACCT;SOR=0.602;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=16;TCR=40;TR=31;WE=28301225;WS=28301207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,33:0.54:61
chr1	28303971	rs41284301	A	G	916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.855;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=25;PP=513;ReadPosRankSum=0.539;SC=GAGGATACTCAAAGAGGATAA;SOR=0.568;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=86;TCF=26;TCR=60;TR=37;WE=28303979;WS=28303961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,43:0.46:94
chr1	28304785	rs72656546	T	C	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=228;ReadPosRankSum=-0.220;SC=AGAGAAAATATTATAAATGCA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=12;WE=28304793;WS=28304775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr1	28319867	rs12140716	C	A	1272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=18;PP=669;ReadPosRankSum=1.398;SC=AAGGAGGAAACCAGGAAGAAA;SOR=0.683;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=63;TCR=36;TR=49;WE=28319875;WS=28319857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,59:0.53:111
chr1	28331013	rs12139076	G	A	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.039;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=179;ReadPosRankSum=-0.618;SC=AAAGAGAACTGGGAAATTCAT;SOR=0.160;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=10;WE=28331021;WS=28331003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr1	28339933	rs6683268	A	T	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.224;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=132;ReadPosRankSum=0.349;SC=CTTCTCATTTACCTACCTAAA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=7;WE=28339941;WS=28339923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr1	28354545	.	A	G	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.08;ReadPosRankSum=0.192;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr1	28369213	rs111559121	TA	T	2667.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.500;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.079;NF=3;NR=64;PP=2032;ReadPosRankSum=-0.854;SC=GCTGCATTGCTAAAAAGTGAT;SOR=0.638;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=149;TCF=7;TCR=142;TR=67;WE=28369221;WS=28369203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,112:0.48:231
chr1	28369279	rs2476547	G	A	2276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=58;PP=1539;ReadPosRankSum=0.021;SC=GTAAATCTTCGTGATATCCTT;SOR=1.426;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=76;TCF=17;TCR=59;TR=75;WE=28369287;WS=28369269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,80:0.99:81
chr1	28369294	rs72658322	T	C	780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.394;HP=1;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=25;PP=579;ReadPosRankSum=-0.660;SC=ATCCTTATTGTTGATTTTTAA;SOR=2.093;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=51;TCF=7;TCR=44;TR=27;WE=28369302;WS=28369284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,29:0.54:54
chr1	28374815	rs7541031	C	T	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.45;MQRankSum=-0.836;QD=7.66;ReadPosRankSum=0.234;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr1	28422847	rs2989472	C	T	3746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=41;PP=2757;SC=TACGGCCACTCCCTGTCCCGC;SOR=1.554;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=85;TCR=41;TR=126;WE=28422855;WS=28422837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr1	28422967	.	CT	C	213.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=0.000;DP=177;ExcessHet=3.0103;FS=8.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.000;QD=1.42;ReadPosRankSum=-0.629;SOR=0.641;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:121,29:0.19:150
chr1	28527011	rs1049504	A	G	2589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.445;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=54;PP=1564;ReadPosRankSum=3.169;SC=TTTGGGGTTCAGCCAAGCCAG;SOR=0.785;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=243;TCF=133;TCR=110;TR=122;WE=28527019;WS=28527001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,134:0.50:270
chr1	28555579	rs3753863	C	A	707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=16;PP=443;ReadPosRankSum=-2.332;SC=AATTCAATAACAAACTGAATT;SOR=0.616;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=42;TCR=35;TR=34;WE=28555587;WS=28555569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,36:0.43:84
chr1	28559574	rs510803	C	G	2029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.491;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=43;PP=1134;ReadPosRankSum=0.340;SC=TCTTACAGGTCCGCTCCTCTA;SOR=0.639;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=198;TCF=99;TCR=99;TR=90;WE=28559582;WS=28559564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,100:0.44:225
chr1	28559694	rs474597	A	G	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.645;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=349;ReadPosRankSum=-0.208;SC=CATATAATTAACCACTTTAAA;SOR=0.052;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=21;WE=28559702;WS=28559684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,22:0.65:34
chr1	28562676	rs12154	A	G	885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.277;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=11;PP=444;ReadPosRankSum=-0.672;SC=GAGACGCCAGAGGTGCAGCTC;SOR=0.373;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=67;TCF=49;TCR=18;TR=36;WE=28562684;WS=28562666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,42:0.55:77
chr1	28563084	rs2078348	C	T	745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.709;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=21;PP=445;ReadPosRankSum=0.489;SC=CCCAACAGAACTCCCGGGCCC;SOR=0.394;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=49;TCF=12;TCR=37;TR=30;WE=28563092;WS=28563074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,33:0.61:54
chr1	28564252	rs8559	A	G	1710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.881;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=25;PP=1102;ReadPosRankSum=0.469;SC=ATGGAATTGGAACTCCTATTC;SOR=0.961;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=143;TCF=91;TCR=52;TR=72;WE=28564260;WS=28564242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,79:0.50:159
chr1	28564279	rs9508	A	G	2495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.207;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.99;MQRankSum=-0.959;NF=66;NR=47;PP=1554;ReadPosRankSum=-1.096;SC=TAGACATTACAGGTTATGCTT;SOR=0.855;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=214;TCF=126;TCR=88;TR=113;WE=28564287;WS=28564269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,123:0.52:238
chr1	28696392	rs6703793	C	G	4387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=66;NR=78;PP=2570;SC=CAGGCTGCGGCCTCCTCTCAG;SOR=0.934;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=144;TCF=66;TCR=78;TR=144;WE=28696400;WS=28696382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr1	28733993	rs12091029	G	T	3155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=55;PP=1830;SC=CACCTACATTGTTCTTAGTAA;SOR=0.726;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=58;TCR=55;TR=113;WE=28734001;WS=28733983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr1	28800380	rs61785974	C	A	6573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=115;NR=99;PP=2965;SC=ATCCTTAGATCTACACCAGGA;SOR=0.709;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=214;TCF=115;TCR=99;TR=214;WE=28800388;WS=28800370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr1	28817597	rs10915235	A	G	1994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=51;PP=1469;SC=AAATGAATTCACAGCTGGGCA;SOR=2.636;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=14;TCR=51;TR=65;WE=28817605;WS=28817587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	28861636	rs2066726	G	A	6027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=109;NR=93;PP=2965;SC=AGCTGGATGTGCCTGTGGTAA;SOR=0.816;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=202;TCF=109;TCR=93;TR=202;WE=28861644;WS=28861626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr1	28863075	rs4654325	A	G	473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=10;PP=282;SC=TGTGAGTTCAATGGGGGCCCA;SOR=2.049;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=28863083;WS=28863065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	28887031	rs10915245	A	G	799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=26;NR=2;PP=645;SC=TCAGTGATCCACCTGCCTTGG;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=28;WE=28887039;WS=28887021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	28918992	rs12123931	C	G	275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.98;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	29018316	.	T	TTTTA	286.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.389;ClippingRankSum=-0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=26.07;ReadPosRankSum=-0.980;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr1	29063559	rs6697540	A	C	1628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=35;NR=17;PP=1093;SC=GCTCCCGCAGACGGGGCTCAT;SOR=1.278;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=35;TCR=17;TR=52;WE=29063581;WS=29063549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	29064036	rs61787567	C	T	1168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=21;PP=686;ReadPosRankSum=-1.047;SC=CAGCCTCTTCCTCACTACCAT;SOR=0.661;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=95;TCF=59;TCR=36;TR=52;WE=29064044;WS=29064026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,56:0.53:106
chr1	29138975	rs1042114	G	T	1564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.312;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=23;PP=881;ReadPosRankSum=0.314;SC=CCTAGCGCCTGCCCCAGCGCT;SOR=0.919;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=113;TCF=69;TCR=44;TR=62;WE=29138983;WS=29138965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,70:0.56:125
chr1	29139140	rs12133192	C	G	2072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.213;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=52;PP=1269;ReadPosRankSum=0.653;SC=CGCTGCGGGCCGGCGCCGCAG;SOR=0.862;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=210;TCF=102;TCR=108;TR=97;WE=29139148;WS=29139130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,107:0.45:236
chr1	29345009	rs5773229	C	CTT	712.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.861;NF=0;NR=13;PP=554;ReadPosRankSum=0.305;SC=AGTTTAAACACAACATGGTAT;SOR=0.852;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=13;WE=29345017;WS=29344999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr1	29442034	rs80349828	C	T	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=0;PP=20;ReadPosRankSum=0.000;SC=GTCCAGAAGCCTCCCTATGCA;SOR=1.426;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=3;WE=29442042;WS=29442024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,3:0.21:14
chr1	29475341	rs2230678	C	T	981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=17;PP=619;SC=CTCTTCCTGCCCTTCCTCTTG;SOR=1.002;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=13;TCR=17;TR=30;WE=29475349;WS=29475331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	29475394	rs2230677	C	G	1108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=9;PP=700;SC=CCTGCTGCCCCCTTTGCTCCT;SOR=1.788;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=36;WE=29475402;WS=29475384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	29475648	rs2230679	T	G	3182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=66;PP=1944;SC=TGCGGCTCTTTTCCTTGCTGG;SOR=1.362;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=39;TCR=66;TR=105;WE=29475656;WS=29475638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr1	29508350	rs571016	C	T	658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=19;PP=491;SC=GCAGCGGCGGCGGCGGCAACG;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=29508358;WS=29508340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	29529699	rs1062924	T	C	6913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=136;NR=99;PP=2965;SC=TCTGGATGACTGCTTGCCCCA;SOR=0.962;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=235;TCF=136;TCR=99;TR=235;WE=29529707;WS=29529689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chr1	29542435	rs2640469	C	G	2957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=23;PP=1866;SC=CAGGTACACTCGGCCAATCAG;SOR=1.993;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=91;TCF=67;TCR=24;TR=90;WE=29542443;WS=29542425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr1	29542637	rs1128400	A	G	4428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=80;PP=2604;SC=TCAGGAAGGAATCCGTAGTTT;SOR=1.068;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=147;TCF=66;TCR=81;TR=146;WE=29542652;WS=29542627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr1	29557224	rs2640466	C	T	7065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=125;NR=108;PP=2965;SC=CCTTCCCCGGCTTCGGCGCCG;SOR=0.806;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=233;TCF=125;TCR=108;TR=233;WE=29557232;WS=29557214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr1	29616318	rs2076620	C	A	1320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.501;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=41;PP=888;ReadPosRankSum=-0.031;SC=TCTCGCTGCACCCAGCCTGGC;SOR=1.163;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=129;TCF=46;TCR=83;TR=59;WE=29616326;WS=29616308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,63:0.47:134
chr1	29631236	rs3831903	C	CTA	19937.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.56;DB;DP=451;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=137;PP=2930;SC=GGAAGGGGCCCTCAGTGAGGG;SOR=0.698;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=187;TCF=45;TCR=142;TR=182;WE=29631244;WS=29631226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,439:1.00:439
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chr1	29842261	rs10915168	A	T	404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=10;NR=5;PP=187;SC=ATCCTCCTCCACTTCCTCCCC;SOR=0.941;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=16;TCF=10;TCR=6;TR=15;WE=29842269;WS=29842251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	29842303	rs140458694	T	C	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.71;ReadPosRankSum=1.481;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
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chr1	31188089	rs1065755	C	T	1950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=45;PP=1203;ReadPosRankSum=-1.725;SC=CTGCCACAGGCTCTGAGGCTA;SOR=0.666;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=182;TCF=90;TCR=92;TR=89;WE=31188097;WS=31188079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,95:0.47:200
chr1	31188901	rs20566	A	G	2636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.751;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=51;PP=1612;ReadPosRankSum=0.025;SC=GAGCAGCCCCAGTCATTGTGC;SOR=0.721;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=242;TCF=123;TCR=119;TR=113;WE=31188909;WS=31188891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,130:0.47:275
chr1	31191516	rs10914186	G	C	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=182;ReadPosRankSum=-0.973;SC=CTCCAGCCCTGGCCCCGCCCC;SOR=0.368;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=10;WE=31191524;WS=31191506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr1	31206637	rs3795438	C	T	1169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.972;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=13;PP=823;ReadPosRankSum=1.186;SC=TGAGGCAGCTCCACCCCTCCC;SOR=1.101;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=83;TCF=56;TCR=27;TR=44;WE=31206645;WS=31206627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,48:0.53:91
chr1	31206806	rs3795437	T	C	2747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=65;PP=1462;ReadPosRankSum=-1.247;SC=TGGTCAAGAATGACCTGCAAT;SOR=0.691;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=222;TCF=101;TCR=121;TR=120;WE=31206814;WS=31206796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,135:0.55:245
chr1	31206957	rs12404920	T	C	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.798;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=190;ReadPosRankSum=0.269;SC=AGTGGACATATTTGCCTTTGC;SOR=1.781;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=9;WE=31206965;WS=31206947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr1	31208042	rs35351292	C	T	1883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.212;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=39;PP=1201;ReadPosRankSum=1.599;SC=CTTGGAGTTTCTCTTCTCCTC;SOR=0.573;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=149;TCF=74;TCR=75;TR=78;WE=31208050;WS=31208032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,87:0.52:167
chr1	31215364	rs1050663	T	C	3943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=385;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.662;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=102;NR=76;PP=2000;ReadPosRankSum=-0.171;SC=CCACCTCTACTGAGTGCTCGA;SOR=0.798;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=351;TCF=195;TCR=156;TR=178;WE=31215372;WS=31215354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:190,194:0.51:384
chr1	31347399	rs4949184	C	T	1966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=44;PP=1148;ReadPosRankSum=0.717;SC=TCTGGCTCATCCCGGATTGTG;SOR=0.675;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=166;TCF=80;TCR=86;TR=84;WE=31347407;WS=31347389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,96:0.50:193
chr1	31349647	rs2491132	C	T	1159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=29;PP=784;ReadPosRankSum=-1.782;SC=AGCCTCCGTACGCCAGTGGTC;SOR=0.671;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=105;TCF=49;TCR=56;TR=53;WE=31349655;WS=31349637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,56:0.49:115
chr1	31351513	rs1891419	G	A	2167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.246;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=44;PP=1222;ReadPosRankSum=0.838;SC=GTTCATCATCGGGAAAGGAGT;SOR=0.659;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=209;TCF=108;TCR=101;TR=97;WE=31351521;WS=31351503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,109:0.48:227
chr1	31413972	rs3795433	T	C	1613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.295;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=29;PP=962;ReadPosRankSum=0.600;SC=TTCTGGGAAATAGTCCTTGTA;SOR=0.578;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=133;TCF=80;TCR=53;TR=71;WE=31413980;WS=31413962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,80:0.53:151
chr1	31415040	rs4949187	A	T	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=5.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.61;ReadPosRankSum=0.714;SOR=0.162;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,24:0.62:39
chr1	31426815	rs2275741	A	G	431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.348;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=12;PP=253;ReadPosRankSum=-0.510;SC=TTCCACTGCCATTCGTGAGTC;SOR=0.274;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=58;TCF=20;TCR=38;TR=21;WE=31426823;WS=31426805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,24:0.34:70
chr1	31440921	rs4317854	G	A	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=203;ReadPosRankSum=1.139;SC=ATCTATCCCTGATTCTGAAAC;SOR=1.739;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=11;WE=31440929;WS=31440911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,14:0.78:18
chr1	31445932	rs2491135	C	G	445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.633;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=233;ReadPosRankSum=0.453;SC=CGTCTCAAAACAAATTTATTT;SOR=0.141;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=18;WE=31445940;WS=31445922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr1	31478638	rs10580059	AAGAGAG	A	961.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=1.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.27;ReadPosRankSum=1.084;SOR=0.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,28:0.44:63
chr1	31654940	rs2297959	C	T	393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=9;PP=285;SC=AGGGTCAGACCCCGTGCAGGG;SOR=1.473;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=14;WE=31654948;WS=31654930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	31732390	rs6425725	G	A	190.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.765;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=17.34;ReadPosRankSum=1.593;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,10:0.91:11
chr1	31732602	rs59591825	CA	C	83.87	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.59;MQRankSum=2.200;QD=9.32;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr1	31732892	rs2292165	G	A	2936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.014;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=59;PP=1793;ReadPosRankSum=-0.394;SC=AAAGACAAGCGGCCTTGGAGT;SOR=0.609;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=208;TCF=112;TCR=96;TR=121;WE=31732900;WS=31732882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,131:0.58:224
chr1	31733721	rs140443791	A	AAAG	130.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=21.79;ReadPosRankSum=1.111;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr1	31733782	rs10914338	T	A	1045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.828;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=19;PP=587;ReadPosRankSum=-1.358;SC=GAAGTAAATTTAAAAAAAAAT;SOR=0.497;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=76;TCF=47;TCR=29;TR=45;WE=31733790;WS=31733772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,50:0.60:84
chr1	31733926	rs12121460	A	G	1301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=33;PP=993;SC=AGTGGCTCACACCTGTAATCC;SOR=2.252;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=12;TCR=33;TR=45;WE=31733934;WS=31733916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
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chr1	31744505	rs113021667	A	AT	664.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.92;ReadPosRankSum=-0.173;SOR=0.968;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,27:0.93:29
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chr1	31762374	rs1532858	C	T	377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=318;SC=CACTGACCTGCTGTGCTACGC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=31762382;WS=31762364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	31764693	rs12135540	G	A	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=273;ReadPosRankSum=-0.055;SC=CCTGAGAAAGGATGAAAGGTG;SOR=0.293;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=14;WE=31764701;WS=31764683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr1	31764713	rs142762586	C	CAAG	648.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.684;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=428;ReadPosRankSum=0.920;SC=GAAAGGACGCCAAGAATTAGT;SOR=1.101;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=12;WE=31764721;WS=31764703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,18:0.44:41
chr1	31764930	rs10733007	T	C	1397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=36;PP=1073;SC=AGTTCTCAGGTCAGGCACGGT;SOR=3.209;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=6;TCR=36;TR=42;WE=31764938;WS=31764920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	31792141	rs4949384	A	G	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.570;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=107;ReadPosRankSum=-0.631;SC=TTTTTAATGTATAGATATGAA;SOR=0.180;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=10;WE=31792149;WS=31792131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr1	31819407	rs34746219	A	C	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=2.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.95;ReadPosRankSum=0.341;SOR=1.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr1	31821932	rs34282779	TA	T	251.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.749;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.233;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=161;ReadPosRankSum=-1.197;SC=CTTGGGAGGATAAGGTGGGAG;SOR=0.105;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=6;WE=31821940;WS=31821922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr1	31840426	rs2271072	C	G	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.898;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=158;ReadPosRankSum=-1.534;SC=GGCCACAGAGCACACAGCCTT;SOR=0.089;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=11;WE=31840434;WS=31840416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr1	31882582	rs4012494	G	GGCCTCA	1806.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.697;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=977;ReadPosRankSum=0.089;SC=CATAAGGGATGGCCCTGCTCT;SOR=0.833;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=72;TCF=24;TCR=48;TR=20;WE=31882590;WS=31882572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,45:0.36:126
chr1	31883295	rs6701521	T	C	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.983;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=11;PP=245;ReadPosRankSum=0.904;SC=GAGTTATGCCTTCCATGCTGG;SOR=0.504;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=57;TCF=26;TCR=31;TR=24;WE=31883303;WS=31883285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,29:0.47:62
chr1	31886163	rs12042883	C	T	2403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.740;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=44;PP=1359;ReadPosRankSum=-0.352;SC=TGAGTCCCGACCCCGGCGCCC;SOR=0.869;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=238;TCF=134;TCR=104;TR=106;WE=31886171;WS=31886153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,120:0.47:257
chr1	31886750	rs142597528	G	GTCCC	1193.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.371;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=2.356;NF=4;NR=6;PP=448;ReadPosRankSum=0.019;SC=CCGCCCGTCCGTCCCTCAGTC;SOR=0.372;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=42;TCF=15;TCR=27;TR=10;WE=31886758;WS=31886740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,33:0.49:67
chr1	31886833	rs10914377	T	C	1395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.566;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=2.056;NF=38;NR=25;PP=797;ReadPosRankSum=-1.036;SC=TCGCCCCGGATCATCTGGGCC;SOR=0.761;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=157;TCF=92;TCR=65;TR=63;WE=31886841;WS=31886823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,73:0.42:174
chr1	31897493	rs1320585	A	G	884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=3;PP=628;SC=GTTCTGTGAGAGGTGGGGCTT;SOR=2.910;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=26;WE=31897501;WS=31897483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	31898132	rs4949400	T	C	2307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.448;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=50;PP=1143;ReadPosRankSum=-1.566;SC=CCAGTTTCCCTGCCTGCACTC;SOR=0.638;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=237;TCF=131;TCR=106;TR=109;WE=31898140;WS=31898122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,119:0.44:268
chr1	31898162	rs4949401	C	T	2873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=343;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.818;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=68;PP=1667;ReadPosRankSum=2.088;SC=GTCCATTCCCCGACCCCTTCT;SOR=0.690;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=301;TCF=156;TCR=145;TR=137;WE=31898170;WS=31898152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:191,152:0.44:343
chr1	31898234	rs4949402	T	C	2517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.357;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=63;PP=1596;ReadPosRankSum=-0.106;SC=CCTTCTACATTCCTGACGGCT;SOR=0.979;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=266;TCF=131;TCR=135;TR=113;WE=31898242;WS=31898224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,124:0.41:299
chr1	31898279	rs4949403	A	C	1270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.276;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=36;PP=838;ReadPosRankSum=-0.948;SC=GGCAGGAGGCATGGGGGGCTG;SOR=0.825;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=147;TCF=67;TCR=80;TR=65;WE=31898287;WS=31898269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,66:0.41:160
chr1	31898536	rs2275435	C	T	136.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5081;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=65;ReadPosRankSum=-0.566;SC=TCAGTGTCCCCGGTGCAGGGT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=5;WE=31898544;WS=31898526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr1	31899684	rs10454445	A	T	1271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=34;PP=1018;SC=AGCCTGCCTGACCCCCCCTGG;SOR=3.365;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=41;TCF=6;TCR=35;TR=40;WE=31899692;WS=31899674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	31899704	rs10454446	C	T	1029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=28;PP=789;SC=GCCTGAAGCCCGGCCCCTTAG;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=33;WE=31899712;WS=31899694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	31902418	rs10047085	A	G	1918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.512;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=42;PP=1055;ReadPosRankSum=1.694;SC=GGGAAGGATCATGATTGAGGG;SOR=0.536;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=115;TCF=46;TCR=69;TR=74;WE=31902426;WS=31902408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,85:0.65:130
chr1	31905865	.	G	A	1195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=0.000;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-1.449;NF=31;NR=19;PP=691;ReadPosRankSum=2.091;SC=AGACCGAGGAGTGCCCACCTA;SOR=0.707;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=84;TCF=54;TCR=30;TR=50;WE=31905873;WS=31905855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,54:0.51:105
chr1	31905889	rs3050461	A	ACAG	5612.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.687;NF=18;NR=40;PP=2810;ReadPosRankSum=0.021;SC=TAGACGCCACACAGCAGCAGC;SOR=0.656;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=81;TCF=28;TCR=53;TR=58;WE=31905897;WS=31905879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,135:0.92:147
chr1	31906882	rs11587589	A	G	3478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=47;PP=2238;SC=ACTGGGCACCAGGCTCATGGG;SOR=1.144;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=77;TCR=47;TR=123;WE=31906890;WS=31906872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr1	31907102	rs7417775	A	G	760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=20;PP=551;SC=CTCTCGGCTCAGTGACAGCCA;SOR=2.066;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=27;WE=31907110;WS=31907092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	31971684	rs1316427	C	G	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.195;NF=7;NR=1;PP=107;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TGTTTCCGCTCTTTGTTTCTG;SOR=0.368;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=8;WE=31971692;WS=31971674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr1	31971701	rs201612393	GC	G	286.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=2.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.64;MQRankSum=5.033;QD=11.03;ReadPosRankSum=1.242;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr1	31971705	.	C	A	495	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=3;HapScore=4;MGOF=10;MMLQ=27;MQ=63.11;NF=10;NR=1;PP=495;QD=48.1610193225;SC=CATTTGGCCCCAGTGGCTTCA;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=11;WE=31971714;WS=31971695;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:17,11:0.39:28
chr1	31971706	.	AG	A	487	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=4;HapScore=4;MGOF=10;MMLQ=27;MQ=62.89;NF=9;NR=1;PP=487;QD=53.0;SC=ATTTGGCCCCAGTGGCTTCAT;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=10;WE=31971714;WS=31971695;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:17,10:0.37:27
chr1	31971707	rs35567548	G	A	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.51;MQRankSum=5.031;QD=11.49;ReadPosRankSum=0.603;SOR=0.984;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr1	31973122	rs112889748	GTGGAGTCTGTC	G	770.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.897;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.683;NF=3;NR=7;PP=2962;ReadPosRankSum=0.327;SC=CTGCTTCTATGTGGAGTCTGT;SOR=0.859;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=45;TCF=11;TCR=34;TR=10;WE=31973146;WS=31973112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,24:0.27:90
chr1	31973138	rs56235358	T	C	788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.13;MQRankSum=1.633;QD=9.17;ReadPosRankSum=0.699;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,24:0.28:86
chr1	31973215	rs1320577	G	A	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.925;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.291;NF=15;NR=13;PP=378;ReadPosRankSum=1.473;SC=GGGTGGGGATGCCACTGTCCA;SOR=0.551;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=67;TCF=39;TCR=28;TR=28;WE=31973223;WS=31973205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,27:0.39:70
chr1	31973266	rs10753250	G	A	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=13;PP=486;ReadPosRankSum=0.454;SC=GCAGAGGGTTGGGCTCTGTCC;SOR=0.716;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=95;TCF=57;TCR=38;TR=33;WE=31973274;WS=31973256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,38:0.35:108
chr1	31973348	rs1574106	A	C	1446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.110;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=35;PP=765;ReadPosRankSum=-0.853;SC=ATTATCTCAAAGATGGCCACT;SOR=0.796;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=179;TCF=96;TCR=83;TR=74;WE=31973356;WS=31973338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,80:0.40:202
chr1	31973409	rs1574105	G	A	1394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.903;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=39;PP=834;ReadPosRankSum=0.729;SC=GGTTCCCATCGTGGTGAAGGT;SOR=0.867;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=158;TCF=75;TCR=83;TR=69;WE=31973417;WS=31973399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,73:0.41:177
chr1	31973440	rs1574104	G	A	1100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.073;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=31;PP=702;ReadPosRankSum=-1.188;SC=CTCCAGCCCCGAGTCTAGTCC;SOR=1.052;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=126;TCF=60;TCR=66;TR=53;WE=31973448;WS=31973430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,57:0.40:143
chr1	31973481	rs1573837	C	T	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.059;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=13;PP=239;ReadPosRankSum=-1.787;SC=GCCTCCCCTACTGGGAACAGT;SOR=1.003;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=71;TCF=28;TCR=43;TR=21;WE=31973489;WS=31973471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,25:0.31:81
chr1	32044641	.	G	A	352	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=83;MMLQ=24;MQ=55.91;NF=16;NR=7;PP=352;QD=16.816139676;SC=TTCAGTTATAGTTTAATTTCA;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=16;TCR=7;TR=23;WE=32044649;WS=32044631;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	32044641	.	G	GTTTAATTTCAGTGAGAGCTGGTGTGTCTGTGTGTGTGTGTGTGATGTCTTCAGTTATAA	257.27	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.61;MQRankSum=-0.674;QD=128.63;ReadPosRankSum=0.674;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,1:0.50:2
chr1	32052145	rs45611233	G	A	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.744;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.16;ReadPosRankSum=0.191;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr1	32084904	rs1056526	C	T	2471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=49;PP=1451;ReadPosRankSum=1.615;SC=ATCTGTGGCGCGATTATCTGT;SOR=0.674;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=244;TCF=134;TCR=110;TR=108;WE=32084912;WS=32084894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,123:0.46:270
chr1	32086912	rs2280386	A	C	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=46;ReadPosRankSum=-1.089;SC=AGGAGGGACAACCCAAGTTGG;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=32086920;WS=32086910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr1	32092525	rs2271933	A	G	1611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.329;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=38;PP=980;ReadPosRankSum=0.037;SC=CCGATGCTCCATCTCCAAAAT;SOR=0.851;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=132;TCF=66;TCR=66;TR=73;WE=32092533;WS=32092515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,76:0.54:142
chr1	32092735	rs2176807	T	G	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-3.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.478;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=303;ReadPosRankSum=0.014;SC=TTGTGTCCCCTAAGCAGGGTT;SOR=1.123;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=20;WE=32092743;WS=32092725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,21:0.52:40
chr1	32092918	rs141988488	T	TTCC	5070.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.972;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.675;NF=12;NR=46;PP=2611;ReadPosRankSum=-2.016;SC=TCCTACCCAATTACAGGCCTT;SOR=0.776;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=137;TCF=27;TCR=110;TR=58;WE=32092926;WS=32092908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,130:0.52:250
chr1	32096265	rs1061770	A	G	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=331;ReadPosRankSum=1.823;SC=AGCTGAGCCGAATGTTGCCTT;SOR=0.402;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=18;WE=32096273;WS=32096255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr1	32100551	rs3835520	GA	G	1762.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.892;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=35;PP=1192;ReadPosRankSum=-0.439;SC=ATCCCTGAATGAAAAAGACAC;SOR=0.470;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=101;TCF=11;TCR=90;TR=40;WE=32100559;WS=32100541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,74:0.48:155
chr1	32118160	rs1061392	C	A	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.61;ReadPosRankSum=0.240;SOR=0.846;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
chr1	32119347	rs67961612	AACAC	A,AACACAC	673.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=1.845;HP=2;HapScore=4;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8,8;NR=13,13;PP=659,648;ReadPosRankSum=0.797;SC=GATTACTTGAAACACACACAC;SOR=0.526;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=21,21;WE=32119360;WS=32119337;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.51,0.31:35
chr1	32119431	rs3817398	T	C	1270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.203;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=25;PP=815;ReadPosRankSum=-1.954;SC=CCCCAAAGAATTACATGTGTC;SOR=0.501;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=116;TCF=70;TCR=46;TR=57;WE=32119439;WS=32119421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,64:0.48:134
chr1	32126135	rs41263967	C	T	2944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.419;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=63;PP=1652;ReadPosRankSum=0.603;SC=CCAACCACCCCGCCAAAATGC;SOR=0.643;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=273;TCF=139;TCR=134;TR=132;WE=32126143;WS=32126125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,146:0.49:300
chr1	32127911	rs2271927	C	T	2673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.508;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=56;PP=1631;ReadPosRankSum=-0.156;SC=AAGGGGTGCCCGCCCTCCCAG;SOR=0.590;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=233;TCF=114;TCR=119;TR=114;WE=32127919;WS=32127901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,126:0.50:253
chr1	32127953	rs2271928	G	A	2004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.075;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=50;PP=1257;ReadPosRankSum=-0.334;SC=CAGGCTTGCCGTCCTTCCCAT;SOR=0.610;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=192;TCF=87;TCR=105;TR=91;WE=32127961;WS=32127943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,98:0.47:208
chr1	32128283	rs1568396	C	G	144.89	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=16.10;ReadPosRankSum=1.593;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,8:0.89:9
chr1	32131163	rs1356803	C	G	2520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.420;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=56;PP=1403;ReadPosRankSum=-1.428;SC=ACAGAGCTGGCTTTGTGTCTT;SOR=0.745;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=275;TCF=141;TCR=134;TR=118;WE=32131171;WS=32131153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,133:0.44:303
chr1	32133737	rs2292988	C	T	897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.005;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=10;PP=492;ReadPosRankSum=2.004;SC=ACCTGGCACCCACTCCCCAGC;SOR=0.560;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=58;TCF=42;TCR=16;TR=35;WE=32133745;WS=32133727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,39:0.61:64
chr1	32134491	rs2271929	C	G	1211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.579;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=29;PP=734;ReadPosRankSum=-1.479;SC=CTGCAGGAGCCGGCGGTCCCC;SOR=0.512;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=98;TCF=43;TCR=55;TR=53;WE=32134499;WS=32134481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,58:0.54:108
chr1	32136168	rs2292990	G	C,T	3557.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=24;NF=47,39;NR=26,24;PP=898,811;SC=TGGCTGACGGGGGGGAGGGGA;SOR=1.171;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=136;TCF=86;TCR=50;TR=73,63;WE=32136176;WS=32136158;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.51,0.49:150
chr1	32136398	rs1474182	G	A	729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.979;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=26;PP=484;ReadPosRankSum=-0.478;SC=GAAAGTCTTGGCTCAAAAGAC;SOR=1.588;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=83;TCF=24;TCR=59;TR=32;WE=32136406;WS=32136388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,36:0.39:92
chr1	32140733	rs2292993	C	T	811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=21;PP=507;ReadPosRankSum=0.694;SC=CGTCATGCACCTTCCAGCCTC;SOR=0.716;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=70;TCF=31;TCR=39;TR=37;WE=32140741;WS=32140723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,40:0.52:77
chr1	32145009	rs4949461	C	T	2844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=26;PP=1645;SC=TGACAGCTGACGCAACAGTGC;SOR=1.519;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=63;TCR=26;TR=89;WE=32145017;WS=32144999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr1	32146425	rs11590964	C	T	833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.382;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=7;PP=545;ReadPosRankSum=0.059;SC=CTGCTAATCCCCCAGAGTACG;SOR=1.477;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=65;TCF=45;TCR=20;TR=32;WE=32146433;WS=32146415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,35:0.51:68
chr1	32148571	rs10737358	A	G	4771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=65;PP=2868;SC=GAGGTCCCACAGGTCCGGTGG;SOR=1.005;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=165;TCF=100;TCR=65;TR=165;WE=32148579;WS=32148561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr1	32149982	rs10914466	A	T	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.153;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=24;ReadPosRankSum=0.373;SC=CTAGCAGAGGAGAAGCCCCGA;SOR=0.495;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=11;TCF=5;TCR=6;TR=4;WE=32149990;WS=32149972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr1	32155284	rs2297682	T	C	4439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=64;PP=2600;SC=TATGATCATGTCCCCAGGTTT;SOR=0.821;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=146;TCF=82;TCR=64;TR=146;WE=32155292;WS=32155274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr1	32155911	rs6425780	G	T	913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=25;NR=6;PP=682;SC=TCACTGTCATGTGCAGAAAGG;SOR=2.448;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=31;WE=32155919;WS=32155901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	32155929	rs2297681	G	A	1507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=38;NR=15;PP=946;SC=AGGGGGTCCCGTTCCCACCCC;SOR=1.692;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=38;TCR=15;TR=53;WE=32155937;WS=32155919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	32156722	rs10914467	G	A	2406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=19;PP=1587;SC=AAGCTGCCCCGGCCCCTTCTC;SOR=2.066;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=60;TCR=19;TR=79;WE=32156730;WS=32156712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr1	32156869	rs10798884	A	T	10171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=375;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=182;NR=145;PP=2965;SC=TCCAGGGACCACTCGCTACAG;SOR=0.787;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=327;TCF=182;TCR=145;TR=327;WE=32156877;WS=32156859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,375:1.00:375
chr1	32157531	rs2297676	T	C	5173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=109;NR=77;PP=2965;SC=GGGGGCTGGATTCCCGAAGGT;SOR=0.963;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=186;TCF=109;TCR=77;TR=186;WE=32157539;WS=32157521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr1	32158374	rs3818788	T	C	6672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=120;PP=2965;SC=TTACCTGAAGTGGGGCATCCG;SOR=0.872;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=229;TCF=109;TCR=120;TR=229;WE=32158382;WS=32158364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr1	32159588	rs2275097	A	C	2433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=52;NR=34;PP=1637;SC=ACACACACAAACCCCTGCTTT;SOR=1.191;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=52;TCR=34;TR=86;WE=32159596;WS=32159578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr1	32160918	rs6656079	A	G	4467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=73;NR=83;PP=2489;SC=CATCACACATATCTTGAGTGG;SOR=0.976;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=156;TCF=73;TCR=83;TR=156;WE=32160926;WS=32160908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr1	32162898	.	C	T	824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.409;ClippingRankSum=0.000;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=21;PP=434;ReadPosRankSum=-0.901;SC=TGCTGAAGGTCAAACTGCAGG;SOR=0.773;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=69;TCF=27;TCR=42;TR=35;WE=32162906;WS=32162888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,40:0.51:78
chr1	32163950	rs2297674	G	C	1075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=15;NR=18;PP=812;SC=GGTACTGGTGGGCTGGGGACA;SOR=0.804;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=15;TCR=18;TR=33;WE=32163958;WS=32163940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	32164206	rs2228550	T	G	3205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=48;NR=63;PP=1862;SC=GGGAATACTCTTCTGGAGATG;SOR=1.115;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=48;TCR=63;TR=111;WE=32164214;WS=32164196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr1	32165495	rs2228552	G	T	5533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.806;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=117;NR=67;PP=2965;ReadPosRankSum=1.709;SC=GATGGCAGACGTCTTCATGAG;SOR=0.810;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=185;TCF=117;TCR=68;TR=184;WE=32165503;WS=32165485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,208:1.00:209
chr1	32165771	rs375604132	C	T	1139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=27;PP=658;ReadPosRankSum=1.615;SC=GGTTGCTGCACGGCTGGACGC;SOR=0.729;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=67;TCF=26;TCR=41;TR=45;WE=32165779;WS=32165761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,52:0.69:75
chr1	32167526	rs1815465	G	C	832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=1;PP=616;SC=CGAAGACACAGGCACACACAC;SOR=4.332;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=32167534;WS=32167516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	32193647	rs1127100	T	C	3187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=61;NR=29;PP=1287;SC=TCCGCTCGGCTGCCCCACCCG;SOR=0.973;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=61;TCR=29;TR=90;WE=32193655;WS=32193637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr1	32196889	rs10914473	G	A	1461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.577;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=25;PP=799;ReadPosRankSum=-0.754;SC=TTCCCAGGCAGTGGTGAGAAG;SOR=0.752;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=145;TCF=87;TCR=58;TR=65;WE=32196897;WS=32196879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,74:0.45:163
chr1	32205274	.	G	A	2170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.799;ClippingRankSum=0.000;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.588;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=46;PP=1175;ReadPosRankSum=1.228;SC=CAGACAGAGGGGCAGAAACAA;SOR=0.793;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=145;TCF=67;TCR=78;TR=83;WE=32205282;WS=32205264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,99:0.60:166
chr1	32205458	.	TAGAGG	T	2483.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.140;ClippingRankSum=0.000;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.595;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=2.894;NF=17;NR=22;PP=1926;ReadPosRankSum=1.132;SC=CGGGGTTAGGTAGAGGAAAGA;SOR=0.763;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=97;TCF=41;TCR=56;TR=39;WE=32205470;WS=32205448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,69:0.43:162
chr1	32266026	rs552124	A	G	5455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=103;NR=77;PP=2965;SC=ATTAAATGACATCACTTGTTC;SOR=0.915;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=180;TCF=103;TCR=77;TR=180;WE=32266034;WS=32266016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr1	32381592	.	TA	T	61.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.389;ClippingRankSum=0.000;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=1.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=2.001;QD=1.16;ReadPosRankSum=0.154;SOR=0.908;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,11:0.21:53
chr1	32658062	rs79952364	G	GGT	1998.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=30;PP=1712;SC=TTGGGGTGGGGGTGGGAGGAG;SOR=2.352;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=40;TCF=7;TCR=33;TR=36;WE=32658070;WS=32658052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	32661349	.	T	C	2584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.443;ClippingRankSum=0.000;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.157;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=54;PP=1519;ReadPosRankSum=-0.850;SC=GAGCTGGGGATTTCCTGCCTG;SOR=0.716;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=223;TCF=118;TCR=105;TR=113;WE=32661357;WS=32661339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,125:0.51:243
chr1	32680606	rs72666786	T	C	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=153;ReadPosRankSum=-0.506;SC=CCTGCTGTTGTTGGGGATGTC;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=9;WE=32680614;WS=32680596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr1	32689857	rs589034	A	G	567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=9;PP=338;ReadPosRankSum=0.044;SC=CTCTTCACTGACTGAGGAAAC;SOR=0.963;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=29;TCF=15;TCR=14;TR=19;WE=32689865;WS=32689847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,23:0.70:33
chr1	32768065	rs76067435	T	C	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.75;ReadPosRankSum=0.030;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr1	32860161	rs547329	T	C	2386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=61;PP=1792;SC=CATCATTAGGTCCCGCCTCCC;SOR=3.884;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=9;TCR=61;TR=70;WE=32860169;WS=32860151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr1	32946720	rs61781220	T	C	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.393;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=248;ReadPosRankSum=0.753;SC=ATTCATGATATCATCTAATGG;SOR=0.231;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=14;WE=32946728;WS=32946710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr1	33065947	rs704886	G	C	11887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=445;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=202;NR=199;PP=2965;SC=GATGGGTCTGGTGATCTGGTC;SOR=0.702;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=403;TCF=203;TCR=200;TR=401;WE=33065955;WS=33065937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,442:1.00:442
chr1	33117071	rs583114	T	G	3157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=58;PP=1796;ReadPosRankSum=-0.797;SC=CCGCGGGGCGTGCTAACGGCT;SOR=0.353;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=107;TCF=47;TCR=60;TR=105;WE=33117079;WS=33117061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,120:0.99:121
chr1	33127730	rs1085416	T	C	55.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.43;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	33133968	rs2762904	T	C	8111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=145;NR=116;PP=2965;SC=ATGTTCTTGTTTTTGACTATA;SOR=0.851;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=261;TCF=145;TCR=116;TR=261;WE=33133976;WS=33133958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,298:1.00:298
chr1	33134774	rs359955	A	C	2206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=35;NR=40;PP=1006;SC=ATCTTGTCTAAGTTTTATGTT;SOR=0.911;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=35;TCR=40;TR=75;WE=33134782;WS=33134764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr1	33134989	rs359956	A	G	188.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=4;PP=106;SC=TAGAAAACATAATTTCTCTAG;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=8;WE=33134997;WS=33134979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	33146113	.	CT	C	92.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.196;ClippingRankSum=0.000;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=8.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=0.491;QD=0.97;ReadPosRankSum=1.186;SOR=0.177;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,17:0.18:96
chr1	33160878	rs360042	C	T	8947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=168;NR=143;PP=2965;SC=CAGCACTTCCCGGAAATCGGC;SOR=0.773;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=312;TCF=169;TCR=143;TR=311;WE=33160886;WS=33160868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,337:1.00:337
chr1	33161212	rs360041	T	C	11537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=431;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=218;NR=179;PP=2965;SC=TTCTCCTCCATGCTGGGGCTC;SOR=0.863;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=397;TCF=218;TCR=179;TR=397;WE=33161220;WS=33161202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,430:1.00:430
chr1	33231380	rs6694085	T	G	5205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=97;NR=84;PP=2965;SC=CATGGTGGTGTTCGTTGGCCG;SOR=0.723;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=181;TCF=97;TCR=84;TR=181;WE=33231388;WS=33231370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr1	33231403	rs6702519	G	T	5283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=93;NR=88;PP=2965;SC=GCCTCCCGGCGCTCCTAGGGC;SOR=0.754;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=181;TCF=93;TCR=88;TR=181;WE=33231411;WS=33231393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr1	33233323	rs360523	A	G	3248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=75;NR=32;PP=2251;SC=CCTTGCCGTGAGACCTGTGCC;SOR=1.695;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=75;TCR=32;TR=107;WE=33233331;WS=33233313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr1	33234128	rs3737992	G	A	1085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.24;SOR=2.124;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	33234136	rs360522	T	C	1217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.59;SOR=1.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	33246019	rs181563125	C	T	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=380;ReadPosRankSum=0.163;SC=TTTCTTTCCACGTCCCAGACA;SOR=0.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=20;WE=33246027;WS=33246009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr1	33246848	rs41265859	A	G	1044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=19;PP=463;ReadPosRankSum=-0.881;SC=GATTTAGTGTAGAATCCCCAG;SOR=0.641;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=84;TCF=38;TCR=46;TR=37;WE=33246856;WS=33246838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,49:0.48:102
chr1	33252099	rs149745059	TCACATGCATGACTATTCCTAGCC	T	3315.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.575;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.535;NF=1;NR=48;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.749;SC=CATTCCTAGCTCACATGCATG;SOR=2.303;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=88;TCF=2;TCR=86;TR=49;WE=33252129;WS=33252089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,118:0.98:120
chr1	33256884	rs1765223	C	A	2986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=53;PP=1857;SC=ACACAAAAGCCGATATTAGTC;SOR=0.888;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=50;TCR=53;TR=103;WE=33256892;WS=33256874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr1	33272307	rs145764358	T	TA	648.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=461;ReadPosRankSum=0.099;SC=TCCCTAACCTTAGTGTAACCA;SOR=0.665;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=12;WE=33272315;WS=33272297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,21:0.66:32
chr1	33276424	rs4951787	G	A	4664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=65;PP=2688;SC=CCTCCAACCTGTCTCCTCCAG;SOR=0.791;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=149;TCF=84;TCR=65;TR=148;WE=33276432;WS=33276414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr1	33293748	rs10753266	T	C	1013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=25;PP=726;SC=TCTTCCCCTCTCCAGTTTCCT;SOR=3.545;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=28;WE=33293756;WS=33293738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	33299816	rs4951773	A	T	224.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=8;PP=198;SC=TTGTTTATTGATAATTTATAT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=33299824;WS=33299806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	33318561	rs702836	T	C	1905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=14;PP=1136;SC=TTGTGATAATTGTAAGTATAT;SOR=2.231;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=43;TCR=14;TR=57;WE=33318569;WS=33318551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	33318634	rs785274	G	A	5863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=113;NR=81;PP=2965;SC=GTTGGCTGACGTAGTTCACTC;SOR=0.987;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=194;TCF=113;TCR=81;TR=194;WE=33318642;WS=33318624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr1	33330432	rs1284368	A	G	1916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=44;PP=1311;SC=CAGAGGCCAGAGCCTGGGTTC;SOR=2.231;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=15;TCR=44;TR=59;WE=33330440;WS=33330422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	33409551	rs194644	C	T	2870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=22;PP=1776;SC=CTGTAAAATGCGCTGAATTTT;SOR=2.124;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=69;TCR=22;TR=91;WE=33409559;WS=33409541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr1	33409693	rs194645	G	A	6018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=110;PP=2965;SC=CTCCACAGCCGCCTCCACGAC;SOR=1.005;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=194;TCF=84;TCR=110;TR=194;WE=33409701;WS=33409683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr1	33430102	rs113840389	T	G	293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=8;NR=3;PP=118;SC=GGGCGGCGGCTGCGCAGCCGG;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=11;WE=33430110;WS=33430092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	33476353	rs66599471	C	T	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=2.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQRankSum=-6.438;QD=2.10;ReadPosRankSum=1.589;SOR=0.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,17:0.21:80
chr1	33476385	rs76881767	C	G	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=1.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQRankSum=-8.524;QD=1.23;ReadPosRankSum=1.685;SOR=0.451;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:130,15:0.10:145
chr1	33476387	rs201842558	C	T	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FS=2.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQRankSum=-8.346;QD=1.12;ReadPosRankSum=1.841;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:134,14:0.09:148
chr1	33476396	rs79824855	G	A	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=2.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQRankSum=-9.293;QD=0.52;ReadPosRankSum=1.670;SOR=0.637;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:155,13:0.08:168
chr1	33485789	rs140580245	AACACACAC	A,AACACACACACACAC	992.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=0,0;NR=38,38;PP=1348,759;ReadPosRankSum=1.088;SC=AACATGTTAAAACACACACAC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=79;TCF=0;TCR=79;TR=38,38;WE=33485816;WS=33485779;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.78:45
chr1	33497070	rs1012884	G	A	1088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=3;PP=830;SC=GGTCTGTCACGTAACTGAGCA;SOR=3.797;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=34;WE=33497078;WS=33497060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	33502184	rs11591185	G	A	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=8;PP=256;ReadPosRankSum=-0.242;SC=GACCCTCTCCGAAATGCCCCA;SOR=0.612;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=31;TCR=17;TR=22;WE=33502192;WS=33502174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,25:0.46:54
chr1	33547768	rs1871322	T	C	664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.985;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=10;PP=452;ReadPosRankSum=-0.311;SC=TCATCTCCCCTCGCCCCGCAG;SOR=0.497;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=64;TCF=43;TCR=21;TR=28;WE=33547776;WS=33547758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,30:0.44:68
chr1	33549512	rs140567639	G	A	1202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.271;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=20;PP=737;ReadPosRankSum=-0.579;SC=CACAGGGTGCGAGCTGGATGG;SOR=0.931;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=110;TCF=71;TCR=39;TR=55;WE=33549520;WS=33549502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,61:0.48:128
chr1	33560338	rs804428	A	G	3957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=82;PP=2408;SC=TGGGAGTGTCATGCTGGGCTC;SOR=1.350;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=49;TCR=82;TR=131;WE=33560346;WS=33560328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr1	33631069	rs2306257	C	A	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.264;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=131;ReadPosRankSum=0.151;SC=CGGCCAGGCTCACCTTGGTCT;SOR=0.473;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=36;TCF=25;TCR=11;TR=15;WE=33631077;WS=33631059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,21:0.52:40
chr1	33641932	rs604941	A	G	5039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=73;PP=2963;SC=CCAGAGCCGAAATTTGAACCT;SOR=0.772;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=162;TCF=88;TCR=74;TR=161;WE=33641940;WS=33641922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr1	33642152	rs643402	C	T	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.814;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=278;ReadPosRankSum=0.203;SC=GAACCTGAGACGGCCAGAGAG;SOR=1.302;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=50;TCF=14;TCR=36;TR=19;WE=33642160;WS=33642142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,18:0.36:50
chr1	33646950	rs622407	A	G	1788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.281;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=40;PP=1007;ReadPosRankSum=-0.336;SC=GGCAGAAGTAATGCTCGCAGC;SOR=0.766;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=163;TCF=84;TCR=79;TR=77;WE=33646958;WS=33646940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,90:0.48:188
chr1	33741787	rs12743549	G	A	2016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.675;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=50;PP=1173;ReadPosRankSum=0.491;SC=TCGCCCCTCCGGCTGCCCTAC;SOR=0.848;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=200;TCF=91;TCR=109;TR=90;WE=33741795;WS=33741777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,101:0.47:216
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chr1	33742228	rs4475712	T	C	213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=5;PP=104;SC=GCGGGGCCGGTGAGGACTGGG;SOR=0.859;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=9;TCF=4;TCR=5;TR=9;WE=33742236;WS=33742218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
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chr1	33764421	.	C	T	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-3.477;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=252;ReadPosRankSum=-0.897;SC=CTGTCCTCCACCCTCTGAACC;SOR=0.425;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=14;WE=33764429;WS=33764411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr1	33777524	rs6679416	T	C	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=294;ReadPosRankSum=0.553;SC=GCAAGAAGTGTTGTCTTTGCT;SOR=0.593;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=38;TCR=7;TR=18;WE=33777532;WS=33777514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,21:0.43:49
chr1	33778591	rs6664593	T	C	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=9;PP=158;ReadPosRankSum=-0.179;SC=TCCAGCCAGCTGGTTCTTCTG;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=26;TCF=11;TCR=15;TR=16;WE=33778599;WS=33778581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr1	33790496	rs11554674	G	A	851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=12;PP=506;ReadPosRankSum=-2.356;SC=TGATGCGGGCGTAGATCTTCA;SOR=0.750;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=83;TCF=57;TCR=26;TR=39;WE=33790504;WS=33790486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,43:0.44:98
chr1	33795572	rs10914684	G	A	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.284;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=101;ReadPosRankSum=0.563;SC=AGCAGAGTGCGCTGAAGTCGG;SOR=0.250;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=8;WE=33795580;WS=33795564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr1	33795590	rs10914685	A	T	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.823;HP=6;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=163;ReadPosRankSum=-1.298;SC=CGGCAGCTGGAGGGGACCGTG;SOR=0.191;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=12;WE=33795598;WS=33795580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr1	33796834	rs34504596	GA	G	360.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.906;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.041;NF=5;NR=4;PP=286;ReadPosRankSum=0.953;SC=GTGGGTCGAGGAACTAGGAAA;SOR=0.260;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=17;TCF=11;TCR=6;TR=9;WE=33796842;WS=33796824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr1	33799548	rs12044118	C	T	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=84;ReadPosRankSum=-0.776;SC=AAAGAAATGGCTCTATATTCT;SOR=1.051;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=8;WE=33799556;WS=33799538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr1	33799900	rs12734630	G	A	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=219;ReadPosRankSum=0.425;SC=GTCTCTGCACGAGAGAGAGTA;SOR=0.784;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=11;WE=33799908;WS=33799890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr1	33820134	rs12026290	C	T	1767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.192;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=37;PP=1003;ReadPosRankSum=-0.090;SC=CCTGGTGCCACTTCTTTCCAG;SOR=0.583;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=121;TCF=65;TCR=56;TR=76;WE=33820142;WS=33820124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,83:0.61:135
chr1	33832865	rs6425816	A	G	1790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.557;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=43;PP=1117;ReadPosRankSum=1.049;SC=TGGCACCTGCAGGGGAAGCCT;SOR=0.519;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=165;TCF=76;TCR=89;TR=83;WE=33832873;WS=33832855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,89:0.48:186
chr1	33836796	rs7545416	C	G	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.104;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=297;ReadPosRankSum=2.617;SC=GTGTTAAGGACAACAGCCTCT;SOR=0.873;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=65;TCF=17;TCR=48;TR=21;WE=33836804;WS=33836786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,21:0.30:70
chr1	33957152	rs4403594	T	G	6922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=124;NR=104;PP=2965;SC=CAGGCTCGGGTATAGTGACGC;SOR=0.758;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=228;TCF=124;TCR=104;TR=228;WE=33957160;WS=33957142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr1	33960062	rs9943259	A	G	4344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=391;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.365;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=87;PP=2612;ReadPosRankSum=0.586;SC=TGTACCTTGCAGAGAAACCCT;SOR=0.662;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=349;TCF=182;TCR=167;TR=185;WE=33960070;WS=33960052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,206:0.53:391
chr1	33961147	rs3795420	T	G	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.786;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=291;ReadPosRankSum=-0.331;SC=ATGCTAGAGATAAACTTTCCA;SOR=0.352;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=16;WE=33961155;WS=33961137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr1	33985353	rs2641959	C	G	2662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.922;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=62;PP=1748;ReadPosRankSum=-1.321;SC=TGCGGGGGGCCCTGGAGGGAG;SOR=0.761;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=251;TCF=127;TCR=124;TR=121;WE=33985361;WS=33985343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,129:0.47:272
chr1	34033512	rs6703172	G	C	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.430;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=238;ReadPosRankSum=0.725;SC=CTCTCCCTGAGAGTAGCAATC;SOR=0.138;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=14;WE=34033520;WS=34033502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr1	34038214	rs2641962	T	C	1718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=32;PP=802;ReadPosRankSum=0.020;SC=CAGCTGTACATGGCCTTGGTT;SOR=0.704;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=161;TCF=95;TCR=66;TR=79;WE=34038222;WS=34038204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,88:0.48:182
chr1	34038413	rs2794602	A	C	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=273;ReadPosRankSum=-0.590;SC=AGGGTAAAGTATCATAATAAA;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=4;TCR=28;TR=15;WE=34038421;WS=34038403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr1	34043169	rs11291100	TC	T	1736.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=33;PP=1073;SC=CCCTTTCGTCTCCCCCCCATC;SOR=1.453;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=42;TCF=3;TCR=39;TR=36;WE=34043177;WS=34043159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	34052272	rs16835645	C	T	1720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=44;PP=1046;ReadPosRankSum=-0.124;SC=TCATTAGTACCTTGAACCCAC;SOR=0.665;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=164;TCF=68;TCR=96;TR=75;WE=34052280;WS=34052262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,82:0.45:181
chr1	34052305	rs12727575	C	T	2829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=65;PP=1855;SC=TAATCAGAGGCGGGTCATGTT;SOR=1.993;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=27;TCR=66;TR=92;WE=34052313;WS=34052295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr1	34052605	rs7526990	A	G	377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=13;NR=1;PP=294;SC=GATAAGGTCCACTGGCCCGAC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=34052613;WS=34052595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	34070826	rs12733436	G	A	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-2.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=175;ReadPosRankSum=-0.216;SC=GATTGCTCTGGACCAGTCTCC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=9;WE=34070834;WS=34070823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr1	34071434	rs1874044	C	T	760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.908;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=9;PP=414;ReadPosRankSum=-0.698;SC=ACCAGCCTAACTCCTTTCATG;SOR=1.289;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=49;TCF=31;TCR=18;TR=29;WE=34071442;WS=34071424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,34:0.62:55
chr1	34071525	rs1874045	C	T	1420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.670;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=22;PP=615;ReadPosRankSum=-0.777;SC=TGAGTTGGTTCTTTCCAACTC;SOR=0.781;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=95;TCF=53;TCR=42;TR=51;WE=34071533;WS=34071515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,69:0.56:123
chr1	34098959	rs604782	C	G	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=150;ReadPosRankSum=0.835;SC=GAGCCTCCTTCCTTTAGCCGG;SOR=1.179;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=9;WE=34098967;WS=34098949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr1	34189917	rs519370	C	T	3636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=69;PP=2081;SC=CAGAGAGCTACAGAAGGAGTG;SOR=1.138;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=51;TCR=69;TR=120;WE=34189925;WS=34189907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr1	34189957	rs11346874	AG	A	1786.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=36;PP=1448;SC=AGAGGGCCTCAGGGGAGCACC;SOR=2.259;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=2;TCR=39;TR=38;WE=34189965;WS=34189947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	34270498	rs10737374	G	A	2712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.884;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=66;PP=1413;ReadPosRankSum=-1.178;SC=GTCTCCTCCCGCCTGGATCAG;SOR=1.043;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=235;TCF=110;TCR=125;TR=120;WE=34270506;WS=34270488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,135:0.53:257
chr1	34285342	rs17342512	G	A	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=8;PP=350;ReadPosRankSum=-0.080;SC=GGTCGCTCCAGGCCGCAAACA;SOR=0.641;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=61;TCF=43;TCR=18;TR=29;WE=34285350;WS=34285332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,33:0.47:70
chr1	34285381	rs11578857	C	T	1495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.346;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=21;PP=769;ReadPosRankSum=0.374;SC=AGGTGATCCGCTTGGACCCTT;SOR=0.818;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=122;TCF=75;TCR=47;TR=62;WE=34285389;WS=34285371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,72:0.53:137
chr1	34285995	rs3795414	G	A	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.126;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=150;ReadPosRankSum=-0.498;SC=CCTGCAGGAAGGCCAGCCCCT;SOR=0.264;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=12;WE=34286003;WS=34285985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr1	34286189	rs3843294	A	C	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.98;MQRankSum=-1.457;QD=6.96;ReadPosRankSum=-1.596;SOR=1.292;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr1	34329897	rs911218	T	C	6296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=135;NR=71;PP=2965;SC=CAAATACCTATGTTGGCTTTA;SOR=1.367;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=207;TCF=135;TCR=72;TR=206;WE=34329905;WS=34329887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr1	34330067	rs10379	A	C	3735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.312;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=82;PP=2402;ReadPosRankSum=-0.688;SC=GATCCCCAGGAACCCAGACGG;SOR=0.785;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=305;TCF=145;TCR=160;TR=154;WE=34330075;WS=34330057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,169:0.52:326
chr1	34383662	rs12029535	T	C	1217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.30;ReadPosRankSum=0.208;SOR=0.729;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,63:0.48:131
chr1	34663180	rs3795412	G	A	2640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=52;PP=1781;ReadPosRankSum=0.846;SC=CAGAGGACAGGGGCCGCATCC;SOR=0.720;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=255;TCF=136;TCR=119;TR=112;WE=34663188;WS=34663170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,122:0.44:277
chr1	34663208	rs1382602	C	G	3142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=61;PP=1994;ReadPosRankSum=0.020;SC=CTCCAACTTGCAAGTCAGCAA;SOR=0.709;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=269;TCF=144;TCR=125;TR=131;WE=34663216;WS=34663198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,145:0.49:297
chr1	34663411	rs1414474	C	G	2577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.143;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=52;PP=1555;ReadPosRankSum=1.003;SC=CACGTCCTGACAAGCTCCCTG;SOR=0.600;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=169;TCF=78;TCR=91;TR=99;WE=34663419;WS=34663401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,112:0.58:192
chr1	34666235	rs375505691	TGAAA	T	446.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.723;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.211;NF=6;NR=1;PP=241;ReadPosRankSum=-0.414;SC=TGTATTTGGCTGAAAGAGAGT;SOR=1.112;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=7;WE=34666246;WS=34666233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr1	34667863	rs12746310	C	A	1726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.406;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=44;PP=1090;ReadPosRankSum=-0.709;SC=AGTATCAGGTCAGTGAGCTGG;SOR=0.447;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=166;TCF=67;TCR=99;TR=79;WE=34667871;WS=34667853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,85:0.46:184
chr1	34684463	rs705207	G	A	1669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=35;PP=1041;SC=GGAAAAGCAAGGTTCTGACCA;SOR=1.773;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=18;TCR=35;TR=53;WE=34684471;WS=34684453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr1	35183838	rs683589	A	C	1993.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=20;PP=1383;SC=CAGGAAAAAAAAAACAAACAA;SOR=1.812;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=50;TCR=20;TR=70;WE=35183846;WS=35183828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	35184033	rs693582	C	T	3714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=79;PP=2259;SC=AAAGGGAGCACGGAGGGACAA;SOR=1.381;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=46;TCR=79;TR=125;WE=35184041;WS=35184023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr1	35184084	rs693852	C	T	1663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=36;PP=981;SC=CCACTACTCACAACTTAACAC;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=16;TCR=36;TR=52;WE=35184092;WS=35184074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	35226813	rs75645913	C	G	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.190;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=252;ReadPosRankSum=1.087;SC=AGGTAGCACCCAGGTATAGAC;SOR=1.609;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=49;TCF=34;TCR=15;TR=20;WE=35226821;WS=35226803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,22:0.44:50
chr1	35227162	rs9426009	C	T	3866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=387;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.762;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=83;PP=2311;ReadPosRankSum=0.283;SC=GGAACGCGAGCGCAAGCACCA;SOR=0.644;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=349;TCF=182;TCR=167;TR=174;WE=35227170;WS=35227152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:197,190:0.49:387
chr1	35251229	rs476220	G	A	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=147;ReadPosRankSum=-1.138;SC=CATGCAGGGCGGTGTGGCAGG;SOR=0.904;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=10;WE=35251237;WS=35251219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr1	35259946	rs1764389	G	A	5006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.375;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=53;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.049;SC=GCGAGTCAGTGTGGGGTGACG;SOR=0.829;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=304;TCF=168;TCR=136;TR=121;WE=35259969;WS=35259936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:197,138:0.41:335
chr1	35259961	rs1764390	A	G	5266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=352;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.278;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=57;PP=2962;ReadPosRankSum=1.699;SC=GTGACGAGCAATCAGATTTCG;SOR=0.784;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=317;TCF=178;TCR=139;TR=130;WE=35259969;WS=35259936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:203,149:0.42:352
chr1	35260769	rs1764391	C	T	3112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.066;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=73;PP=1883;ReadPosRankSum=2.290;SC=TGGCCAAAAACCCCCAAGTCG;SOR=0.945;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=226;TCF=108;TCR=118;TR=136;WE=35260777;WS=35260759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,150:0.59:255
chr1	35260929	rs3543	G	A	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.526;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.85;MQRankSum=0.744;NF=4;NR=10;PP=139;ReadPosRankSum=-1.287;SC=GGGGAAGCAGGTGCTTGCTGG;SOR=0.345;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=14;WE=35260937;WS=35260919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,14:0.33:43
chr1	35561510	rs2101973	G	A	2840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.59;SOR=0.711;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr1	35562965	rs2971408	G	A	7297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.335;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=142;NR=103;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.821;SC=ATCATCTGGCGTGAATAAAAT;SOR=0.471;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=247;TCF=143;TCR=104;TR=245;WE=35562973;WS=35562955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,277:1.00:278
chr1	35563206	rs6658571	C	G	2632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=68;PP=1937;SC=TATTTCCCTACCTTGTTCTTG;SOR=2.277;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=22;TCR=68;TR=90;WE=35563214;WS=35563196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr1	35576145	rs2935955	C	T	231.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=7;PP=159;SC=CAAATTAAACCGACTTTTAAA;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=35576153;WS=35576135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	35879555	rs142314196	CT	C	282.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=141;ReadPosRankSum=-0.432;SC=TGTATATTTTCTTTTTTTTTT;SOR=0.551;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=17;TCR=11;TR=12;WE=35879563;WS=35879545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr1	35925861	rs2819002	C	A	4338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=95;NR=58;PP=2869;SC=CCACGAGAGGCAAAAAAATGG;SOR=1.151;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=153;TCF=95;TCR=58;TR=153;WE=35925869;WS=35925851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr1	36054149	.	C	T	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.419;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.424;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=333;ReadPosRankSum=0.132;SC=GGGTGTCCTCCGCAGGTAGGA;SOR=0.375;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=39;TCF=9;TCR=30;TR=22;WE=36054157;WS=36054139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,22:0.51:43
chr1	36205166	rs577483	A	G	1654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=43;PP=1239;SC=AAATGCAACAATGAATATACT;SOR=2.917;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=10;TCR=43;TR=53;WE=36205174;WS=36205156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	36213712	rs516992	G	T	1867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=30;NR=35;PP=1027;SC=ACAAATGTCAGTCATTGTCAT;SOR=0.934;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=30;TCR=35;TR=65;WE=36213720;WS=36213702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	36216835	rs535638	C	T	394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=4;PP=217;SC=AACAAAACAACGTAATTGCCA;SOR=1.473;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=12;WE=36216843;WS=36216825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	36216936	rs145184580	T	C	1033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.558;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=17;PP=699;ReadPosRankSum=-1.004;SC=CTCTACCTTCTCTTCTCCATC;SOR=0.510;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=100;TCF=69;TCR=31;TR=48;WE=36216944;WS=36216926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,52:0.46:114
chr1	36282417	rs2791960	A	G	990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=13.738;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.64;MQRankSum=-0.180;QD=22.52;ReadPosRankSum=0.538;SOR=1.471;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,41:0.93:44
chr1	36307412	rs147865378	CATAT	C	41.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.43;ReadPosRankSum=1.383;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,2:0.50:4
chr1	36316418	rs11403763	C	CA	1136.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=5.263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.04;ReadPosRankSum=-1.157;SOR=1.502;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,52:0.83:63
chr1	36316571	rs4652895	A	C	4241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=70;PP=2275;SC=GCACTCGCTCAGTCTCTATTC;SOR=0.853;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=70;TCR=70;TR=140;WE=36316579;WS=36316561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr1	36384028	rs61751004	G	T	2615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.168;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=50;PP=1478;ReadPosRankSum=-0.001;SC=CATCCAGGTAGCTGGGCTTTA;SOR=0.715;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=217;TCF=114;TCR=103;TR=112;WE=36384036;WS=36384018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,125:0.52:241
chr1	36384873	rs374752894	G	A	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=208;ReadPosRankSum=-0.504;SC=CTGGGATCAGGTTGGCCTCCT;SOR=0.941;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=22;TCF=7;TCR=15;TR=12;WE=36384881;WS=36384863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr1	36553673	rs399393	A	G	5563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=112;NR=76;PP=2965;SC=GCATGGACACACGGCGCAAGC;SOR=0.886;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=188;TCF=112;TCR=76;TR=188;WE=36553681;WS=36553663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr1	36556779	rs67749899	CA	C	4472.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.35;QD=29.04;SOR=1.309;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr1	36563158	rs3738360	C	A	726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=16;NR=8;PP=367;SC=GCAGCAGGACCCCCCCCGCGG;SOR=1.382;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=16;TCR=8;TR=24;WE=36563166;WS=36563148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	36565584	rs274753	C	G	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.675;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=218;ReadPosRankSum=-1.172;SC=TCTGATGGCTCTCAGGGAGGC;SOR=0.327;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=15;WE=36565592;WS=36565574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,17:0.46:37
chr1	36565617	rs274754	G	A	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.890;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=15;PP=435;ReadPosRankSum=1.008;SC=GGCTGGGAGCGATTTGAGGCA;SOR=0.539;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=71;TCF=42;TCR=29;TR=35;WE=36565625;WS=36565607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,38:0.51:75
chr1	36602943	rs2231318	C	T	1014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=24;PP=650;SC=AGTGGGAAAACGAAGGGGTAG;SOR=1.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=11;TCR=24;TR=35;WE=36602951;WS=36602933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	36752152	rs2242428	C	T	5028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=81;PP=2965;SC=ATGGAAACTACCGCTCAAATT;SOR=1.120;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=64;TCR=81;TR=145;WE=36752160;WS=36752142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr1	36752433	rs6425977	C	T	5351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=97;PP=2965;SC=GGAGATGAGGCCAAGGAGCAG;SOR=1.014;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=174;TCF=77;TCR=97;TR=174;WE=36752441;WS=36752423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr1	36762396	rs1566589	C	T	1276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=31;PP=866;SC=GTTACCCCTTCCAGACTCTTA;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=7;TCR=31;TR=38;WE=36762404;WS=36762386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	36767400	rs882799	C	T	1723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=37;PP=1079;SC=ATTAAATGTACGTGCAGGATT;SOR=2.080;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=16;TCR=37;TR=53;WE=36767408;WS=36767390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	36773819	rs11263871	C	G	3587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.81;SOR=0.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr1	36787888	rs58971913	G	A	889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=6;PP=559;SC=AGCGGGAGCCGGGGCCCATCA;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=30;WE=36787896;WS=36787878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	36788356	rs7536394	A	G	826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=11;PP=381;SC=GGTCACGGAGAGGCCCGGACG;SOR=0.892;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=13;TCR=11;TR=24;WE=36788364;WS=36788346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	36886364	rs2275478	C	G	771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=21;PP=584;SC=TAGAAAGCAGCCTTAACCAAA;SOR=3.528;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=36886372;WS=36886354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	36887702	rs2236565	C	T	2553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=55;NR=27;PP=1437;SC=TGTAGACTTCCGTATCTAGAG;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=55;TCR=27;TR=82;WE=36887710;WS=36887692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr1	36888302	rs35889349	C	CT	234.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.78;ReadPosRankSum=-0.615;SOR=1.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr1	36889197	rs11263892	T	C	377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=12;PP=256;SC=AGGGAGAGGCTGGGCGCAGTG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=36889205;WS=36889187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	36909385	rs10908303	G	A	335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=278;SC=TGGCTTTTTGGTCAGAGTTTG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=36909393;WS=36909375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	36923494	rs12023818	G	C	5006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=101;NR=67;PP=2965;SC=GGCTGCTGCTGTTTAACTGTG;SOR=1.080;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=168;TCF=101;TCR=67;TR=168;WE=36923502;WS=36923484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr1	36927733	rs7065	G	A	2825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=26;PP=1610;SC=GCAGCGTAGAGGGAGGTGGGT;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=62;TCR=26;TR=88;WE=36927741;WS=36927723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr1	36935128	rs3917989	G	A	1659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=9;PP=1029;SC=TGAGAACAACGAAGGATCAAG;SOR=2.753;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=39;TCR=9;TR=48;WE=36935136;WS=36935118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	36937059	rs3917981	A	G	8509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.86;SOR=0.894;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr1	36937065	rs3917980	A	G	8477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.62;SOR=0.826;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr1	36945307	rs3832027	AG	A	319.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=320;SC=ATGCAAGTCAAGGGCTTTTCA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=36945315;WS=36945297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	37307281	rs553882	T	G	775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=10;PP=548;ReadPosRankSum=1.150;SC=TGCAGACAGTTCTAGGCCAAG;SOR=0.612;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=56;TCF=42;TCR=14;TR=34;WE=37307289;WS=37307271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,33:0.57:58
chr1	37324683	rs3738081	A	C	1191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.706;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=12;PP=720;ReadPosRankSum=0.925;SC=GGGAGACAACACTGGTGGGGG;SOR=0.293;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=76;TCF=57;TCR=19;TR=45;WE=37324691;WS=37324673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,51:0.58:88
chr1	37324935	rs12067006	T	C	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.936;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=22;PP=517;ReadPosRankSum=0.560;SC=TTCTCCTCCCTTGCCACAGGT;SOR=1.574;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=46;TCF=11;TCR=35;TR=26;WE=37324943;WS=37324925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,25:0.51:49
chr1	37325477	rs6691840	A	C	746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=9;PP=428;ReadPosRankSum=1.213;SC=CCAGACTCGGACCGGGGAGCT;SOR=0.655;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=59;TCF=42;TCR=17;TR=31;WE=37325485;WS=37325467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,36:0.54:67
chr1	37335458	rs577094	A	G	692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.826;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=16;PP=356;ReadPosRankSum=0.314;SC=AGCCCTCCCCACATCCCCACC;SOR=0.336;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=53;TCF=20;TCR=33;TR=29;WE=37335466;WS=37335448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,33:0.57:58
chr1	37335485	rs509284	A	G	631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=3.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.38;ReadPosRankSum=1.104;SOR=0.195;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr1	37335494	rs577813	G	T	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=4.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.51;ReadPosRankSum=0.541;SOR=0.129;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr1	37626981	rs215756	T	C	537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=13;NR=2;PP=414;SC=TGGTTTAGTCTAGTGCCCCTG;SOR=2.712;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=37626989;WS=37626971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	37948212	rs215205	C	G	2687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.784;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=60;PP=1614;ReadPosRankSum=-0.279;SC=TGCCTGTGCCCTGTTTTCCTC;SOR=0.601;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=231;TCF=121;TCR=110;TR=122;WE=37948220;WS=37948202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,132:0.53:248
chr1	37959450	rs215210	T	C	2139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.347;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=64;PP=1134;ReadPosRankSum=-0.524;SC=AGCAACTTGCTGGGATTACAA;SOR=0.962;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=226;TCF=100;TCR=126;TR=108;WE=37959458;WS=37959440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,114:0.46:246
chr1	37959470	rs215211	C	G	1727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.561;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=49;PP=1136;ReadPosRankSum=1.592;SC=ACATTGTCTTCATCTTCCTGC;SOR=0.888;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=176;TCF=70;TCR=106;TR=78;WE=37959478;WS=37959460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,83:0.43:194
chr1	37961308	rs200110144	A	C	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.82;ReadPosRankSum=-1.981;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr1	37967649	rs41306601	C	T	638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.053;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=20;PP=432;ReadPosRankSum=1.031;SC=ACTCCTCAGGCAATCTGTCCA;SOR=1.009;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=57;TCF=20;TCR=37;TR=29;WE=37967657;WS=37967639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,30:0.50:60
chr1	37975279	rs215214	C	T	1242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=34;PP=934;SC=ATGCTGAACACAGAAAGCAAC;SOR=2.409;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=10;TCR=34;TR=44;WE=37975287;WS=37975269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	37975312	rs2036637	T	C	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=201;ReadPosRankSum=1.270;SC=ATGGTACATGTCCCACTGTGA;SOR=0.465;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=9;WE=37975320;WS=37975302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
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chr1	38030696	rs6619	T	C	612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.192;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=413;ReadPosRankSum=-1.313;SC=AACAAGACACTTGGGAGTTAT;SOR=0.976;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=53;TCF=15;TCR=38;TR=24;WE=38030704;WS=38030686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,26:0.48:54
chr1	38046920	rs2360010	G	T	1618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.118;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=30;PP=1013;ReadPosRankSum=0.007;SC=TAACTAAATAGACAAATTCAA;SOR=0.786;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=187;TCF=112;TCR=75;TR=79;WE=38046928;WS=38046910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,83:0.41:202
chr1	38049373	rs3753372	C	T	1364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.945;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=19;PP=798;ReadPosRankSum=-1.980;SC=CTGTACTCTGCGCAACAGAGC;SOR=1.057;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=131;TCF=86;TCR=45;TR=57;WE=38049381;WS=38049363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,67:0.43:156
chr1	38049552	rs6426024	C	G	1573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.047;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=42;PP=958;ReadPosRankSum=-0.132;SC=AGAAAGCACCCCAAATGAGCA;SOR=0.614;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=215;TCF=97;TCR=118;TR=74;WE=38049560;WS=38049542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,85:0.36:239
chr1	38061572	rs6697632	G	T	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-3.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=190;ReadPosRankSum=-1.574;SC=CGTCCCTCTCGGCCTCAGAGC;SOR=0.874;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=10;WE=38061580;WS=38061562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr1	38078300	rs4652964	A	G	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=304;ReadPosRankSum=-0.061;SC=TCTTGTGTCTATGTATGCATG;SOR=0.638;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=50;TCF=39;TCR=11;TR=20;WE=38078308;WS=38078290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,21:0.41:51
chr1	38148765	rs684260	A	G	824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=1.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=9;PP=446;ReadPosRankSum=-1.702;SC=CAACTGTGGTACCCGTGGTCT;SOR=0.741;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=96;TCF=65;TCR=31;TR=33;WE=38148773;WS=38148755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,42:0.36:118
chr1	38149076	rs34250208	G	A	2259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.994;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=45;PP=1357;ReadPosRankSum=-0.421;SC=CTCCCCACTGGATAGACGAAA;SOR=0.707;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=214;TCF=112;TCR=102;TR=94;WE=38149084;WS=38149066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,109:0.45:240
chr1	38149193	rs686083	C	T	759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.218;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=23;PP=482;ReadPosRankSum=-1.400;SC=CAGAGGGAGCCATAAAAGTGA;SOR=1.051;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=61;TCF=19;TCR=42;TR=32;WE=38149201;WS=38149183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,34:0.53:64
chr1	38155265	rs586252	G	C	1318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.677;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=19;PP=689;ReadPosRankSum=-1.837;SC=AACAGCACTAGGGAGCTGCTT;SOR=0.801;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=111;TCF=72;TCR=39;TR=57;WE=38155273;WS=38155255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,62:0.50:125
chr1	38161694	rs615530	A	G	1609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.360;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=45;PP=1050;ReadPosRankSum=-1.337;SC=CAACTAATAGATGCTTACTGT;SOR=0.560;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=142;TCF=45;TCR=97;TR=66;WE=38161702;WS=38161684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,73:0.46:157
chr1	38164724	rs557290	C	G	1317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.185;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=39;PP=871;ReadPosRankSum=-0.809;SC=GCTCAGGCAGCGCCTTGTTGG;SOR=0.925;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=146;TCF=51;TCR=95;TR=58;WE=38164732;WS=38164714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,63:0.40:157
chr1	38166022	rs513826	T	C	973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=18;PP=548;ReadPosRankSum=-2.630;SC=CTTAAGATTGTGTACATTTTA;SOR=0.693;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=87;TCF=54;TCR=33;TR=45;WE=38166030;WS=38166012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,48:0.50:96
chr1	38166327	rs661460	A	T	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.480;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=110;ReadPosRankSum=-1.085;SC=ATGACAAAAGAGATAATTGAC;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=6;WE=38166335;WS=38166317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr1	38167361	rs34342214	A	C	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=6.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=65.19;MQRankSum=4.087;QD=12.57;ReadPosRankSum=-1.771;SOR=1.108;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr1	38174185	rs557897	G	T	862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.978;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=27;PP=569;ReadPosRankSum=1.628;SC=AGACGTGCTAGTCCCACACCA;SOR=0.892;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=76;TCF=20;TCR=56;TR=36;WE=38174193;WS=38174175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,39:0.49:80
chr1	38184316	rs609437	T	C	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.353;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=19;PP=366;ReadPosRankSum=0.488;SC=GCCTTGACCTTGGTGCCTTGG;SOR=0.338;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=68;TCF=27;TCR=41;TR=34;WE=38184324;WS=38184306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,36:0.50:72
chr1	38184470	rs610213	C	G	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.194;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=11;PP=290;ReadPosRankSum=-1.300;SC=AGGCACGGTCCGCTAGTGGGG;SOR=1.005;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=38;TCF=18;TCR=20;TR=19;WE=38184478;WS=38184460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,21:0.49:43
chr1	38185337	rs518583	T	C	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.219;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=100;ReadPosRankSum=1.207;SC=GCATATGGTGTGTGCACACAC;SOR=0.495;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=8;WE=38185345;WS=38185327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr1	38186189	rs6671088	C	T	2177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.460;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=56;PP=1368;ReadPosRankSum=0.366;SC=AGGCAGCAACCCCATCAGTTG;SOR=0.643;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=240;TCF=115;TCR=125;TR=108;WE=38186197;WS=38186179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,112:0.44:256
chr1	38186294	rs1008879	C	T	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.898;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=282;ReadPosRankSum=-0.533;SC=GACACCAGGGCGGTCACCTAG;SOR=1.230;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=39;TCF=13;TCR=26;TR=17;WE=38186302;WS=38186284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,17:0.40:43
chr1	38187447	rs579908	A	G	1108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.173;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=18;PP=693;ReadPosRankSum=0.412;SC=CCCTCAGCATATGCACGGCTA;SOR=1.096;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=127;TCF=76;TCR=51;TR=51;WE=38187455;WS=38187437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,54:0.39:140
chr1	38187989	rs12123842	T	C	1048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=28;PP=599;ReadPosRankSum=2.117;SC=GGACAGGGCATATGCCAGCAC;SOR=0.627;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=109;TCF=34;TCR=75;TR=42;WE=38187997;WS=38187979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,49:0.40:122
chr1	38188841	rs12121777	G	A	3231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=373;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.375;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=72;PP=2019;ReadPosRankSum=0.284;SC=GACTTTGACTGGGAGAGAAAG;SOR=0.720;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=341;TCF=179;TCR=162;TR=152;WE=38188849;WS=38188831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:208,165:0.44:373
chr1	38192604	rs6699887	G	A	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.574;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=355;ReadPosRankSum=-1.632;SC=CACATGAACAGTGAGCTGGGG;SOR=2.683;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=18;WE=38192612;WS=38192594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr1	38262297	rs189643247	A	G	739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=9;PP=529;ReadPosRankSum=-1.003;SC=TGTGCCCACCACTGCCAGGCC;SOR=0.770;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=66;TCF=51;TCR=15;TR=35;WE=38262305;WS=38262287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,36:0.51:70
chr1	38272660	rs2291297	G	A	2499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=52;PP=1500;ReadPosRankSum=-0.644;SC=TGTAAGGCAAGGGGAAAGGGA;SOR=0.662;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=217;TCF=118;TCR=99;TR=111;WE=38272668;WS=38272650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,123:0.50:246
chr1	38274180	.	G	A	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.190;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=10;PP=325;ReadPosRankSum=-1.140;SC=CTGACCGTCTGTCTCTCGCTC;SOR=0.976;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=41;TCF=24;TCR=17;TR=26;WE=38274188;WS=38274170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,30:0.65:46
chr1	38289383	rs12751325	T	C	3161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=68;PP=1649;ReadPosRankSum=-1.776;SC=GTGACAAACCTGTCTGTTGAG;SOR=0.694;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=288;TCF=151;TCR=137;TR=141;WE=38289391;WS=38289373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,159:0.49:324
chr1	38293992	rs9329568	C	T	974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=26;PP=706;SC=TTCTTTTGTTCTGAGACAGAG;SOR=2.899;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=33;WE=38294000;WS=38293982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	38301250	rs3912368	A	G	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.582;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=269;ReadPosRankSum=-0.992;SC=TATATACAGGATCTATATCTC;SOR=1.426;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=14;WE=38301258;WS=38301240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,17:0.44:39
chr1	38301476	rs3762359	G	A	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=2.299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.95;ReadPosRankSum=-0.655;SOR=0.394;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,30:0.48:62
chr1	38304192	rs75240370	A	G	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=233;ReadPosRankSum=0.583;SC=TGCTAAATCAAGAGCTAGTAA;SOR=0.425;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=12;WE=38304200;WS=38304182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr1	38327982	rs3843	G	T	1909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=26;PP=1080;ReadPosRankSum=1.417;SC=GGAGGAGAGAGAGGCTCAGAG;SOR=0.725;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=132;TCF=86;TCR=46;TR=76;WE=38327990;WS=38327972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,86:0.58:148
chr1	38332074	rs149926262	TCTCTCACA	T	750.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.066;HP=2;HapScore=3;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.115;NF=26;NR=24;PP=2159;ReadPosRankSum=2.626;SC=TCTCTCTCTCTCTCTCACACA;SOR=1.088;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=75;TCF=41;TCR=34;TR=50;WE=38332091;WS=38332062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,37:0.42:89
chr1	38338795	rs11488569	A	G	3689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=391;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.657;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=90;PP=2233;ReadPosRankSum=0.413;SC=TGTAGCTGTCATCTTATTTAC;SOR=0.842;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=353;TCF=175;TCR=178;TR=172;WE=38338803;WS=38338785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:203,186:0.48:389
chr1	38345896	rs2306427	A	C	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.495;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=19;PP=421;ReadPosRankSum=-0.231;SC=AAAAAAAAATATCAGAATAAA;SOR=1.170;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=59;TCF=25;TCR=34;TR=31;WE=38345904;WS=38345886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,33:0.52:63
chr1	38352849	rs2279261	G	C	458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=368;ReadPosRankSum=0.110;SC=CCTACGAGTGGCGAGACCCTG;SOR=0.634;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=4;TCR=31;TR=16;WE=38352857;WS=38352839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chr1	38397341	rs34655914	G	A	1791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.168;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=30;PP=1211;ReadPosRankSum=1.776;SC=GCCGCCCGCCGAACCTGCAGT;SOR=0.791;Source=Platypus;TCR=65;TR=78;WE=38397349;WS=38397331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,83:0.47:177
chr1	38397369	rs35267671	C	T	2495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.481;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=44;PP=1523;ReadPosRankSum=-1.108;SC=TCCCGAGAGCCGGCGGCGGCA;SOR=0.645;SbPval=0.5;Source=Platypus;TCR=83;TR=107;WE=38397377;WS=38397359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,116:0.50:233
chr1	38411350	rs11485595	C	T	2085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.534;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=38;PP=1182;ReadPosRankSum=0.671;SC=CCTGGAGGGACAGTTGAAGTT;SOR=0.627;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=179;TCF=111;TCR=68;TR=93;WE=38411358;WS=38411340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,101:0.52:194
chr1	38423853	rs9293	G	C	808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=1;PP=547;SC=CTACATCCCTGAACACTAGAG;SOR=5.058;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=20;WE=38423861;WS=38423843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	38425724	rs17531342	T	C	2148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=24;PP=1326;SC=TTTCACCTCCTTTCTACATGG;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=47;TCR=24;TR=71;WE=38425732;WS=38425714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr1	38425895	rs28675056	T	C	3170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=54;PP=1548;SC=GAACATCTGTTGGGTATCCAG;SOR=0.950;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=106;TCF=52;TCR=54;TR=106;WE=38425903;WS=38425885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr1	38442547	rs10890216	G	A	6613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=118;PP=2965;SC=TCAGCAGTCAGTCACTTACCC;SOR=0.911;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=222;TCF=104;TCR=118;TR=222;WE=38442555;WS=38442537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr1	38444749	rs7555461	T	C	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.037;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=16;PP=411;ReadPosRankSum=0.883;SC=AGAGAAAAATTACAATATTAC;SOR=0.468;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=54;TCF=20;TCR=34;TR=27;WE=38444757;WS=38444739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,27:0.46:59
chr1	38447615	rs7533079	G	T	486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=13;PP=333;SC=GCTAATTTTGGTTTTTTTTGC;SOR=1.863;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=18;WE=38447623;WS=38447605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	38449910	rs11210870	T	C	2066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.065;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=27;PP=1267;ReadPosRankSum=-0.748;SC=CATATCCCTCTTCATCTGTGA;SOR=0.531;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=155;TCF=108;TCR=47;TR=84;WE=38449918;WS=38449900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,92:0.55:167
chr1	38450367	rs6680796	A	G	8127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=129;NR=134;PP=2965;SC=TGAAATTTTCACCCCTACTTA;SOR=0.825;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=263;TCF=129;TCR=134;TR=263;WE=38450375;WS=38450357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,305:1.00:305
chr1	38453576	rs10890285	A	C	1863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=44;PP=857;ReadPosRankSum=-0.978;SC=GCAAACAACAAGGGTTCTCCA;SOR=0.696;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=154;TCF=63;TCR=91;TR=75;WE=38453584;WS=38453566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,92:0.52:176
chr1	38455389	rs3935867	C	T	2432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=57;PP=1657;SC=CTCTGGGGCTCCGGACCCCGG;SOR=1.995;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=22;TCR=57;TR=79;WE=38455397;WS=38455379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr1	38462898	rs4274021	T	A	4807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.11;SOR=0.787;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr1	38462905	rs12724533	C	G	5105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.91;SOR=0.816;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr1	38463504	rs7366048	C	T	3120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.400;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=71;PP=1919;ReadPosRankSum=1.498;SC=CTCGATGCCACGGCTGATCAC;SOR=0.654;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=299;TCF=146;TCR=153;TR=143;WE=38463512;WS=38463494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:177,154:0.47:331
chr1	38464639	rs4570384	C	G	10350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=380;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=191;NR=159;PP=2965;SC=AGCCCCTGAACACATACCAGG;SOR=0.851;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=350;TCF=191;TCR=159;TR=350;WE=38464647;WS=38464629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,380:1.00:380
chr1	38488506	rs11362128	CT	C	71.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=1.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.11;MQRankSum=2.023;QD=1.28;ReadPosRankSum=1.838;SOR=0.347;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,13:0.23:56
chr1	38512308	.	GGCC	G	110.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.279;ClippingRankSum=0.000;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.56;ReadPosRankSum=1.482;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,8:0.11:71
chr1	39325063	rs1925678	T	C	899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=16;PP=438;ReadPosRankSum=-0.856;SC=GGCGGGGGACTGGGCGCAGCC;SOR=0.702;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=53;TCR=34;TR=41;WE=39325071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,47:0.48:98
chr1	39339449	rs12127091	C	T	1070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.411;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=17;PP=514;ReadPosRankSum=-0.106;SC=TTGCAGTAGCCGAGGAGGGTG;SOR=0.831;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=114;TCF=68;TCR=46;TR=45;WE=39339457;WS=39339439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,54:0.42:128
chr1	39340282	rs880303	C	T	3696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.617;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=64;PP=2177;ReadPosRankSum=2.042;SC=AGGGACACTACGTGATTTGGA;SOR=0.970;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=306;TCF=171;TCR=135;TR=159;WE=39340290;WS=39340272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,176:0.52:336
chr1	39340607	rs16825625	A	G	2648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.180;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=57;PP=1558;ReadPosRankSum=-1.026;SC=CTGGAATAGAACGGTGACCTC;SOR=0.745;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=217;TCF=112;TCR=105;TR=115;WE=39340615;WS=39340597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,126:0.53:239
chr1	39352271	rs2147914	G	T	3176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-3.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.835;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=62;PP=1709;ReadPosRankSum=-0.034;SC=GGATCTTTCAGCAGTGCTTTA;SOR=0.589;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=290;TCF=162;TCR=128;TR=142;WE=39352279;WS=39352261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,161:0.50:323
chr1	39352492	rs3790441	G	A	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.84;ReadPosRankSum=1.731;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr1	39361615	rs9438984	G	A	1023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.677;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=18;PP=664;ReadPosRankSum=1.022;SC=TAAGAGACTCGTGGACTCCAT;SOR=0.792;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=121;TCF=79;TCR=42;TR=51;WE=39361623;WS=39361605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,54:0.42:130
chr1	39384625	rs61750827	C	T	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.213;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=2;PP=415;ReadPosRankSum=-1.477;SC=GTGCCCACCCCGCTCCCCATT;SOR=1.353;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=39;TCF=34;TCR=5;TR=23;WE=39384633;WS=39384615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,27:0.56:48
chr1	39385086	rs7522863	A	C	1757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=37;PP=1112;SC=AAAGTTTTCTATGTAATTGTT;SOR=1.573;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=21;TCR=37;TR=58;WE=39385094;WS=39385076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr1	39457006	rs12043492	C	T	368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=6;PP=193;SC=GCCTCTTGGGCCGCACTTACC;SOR=0.976;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=8;TCR=6;TR=14;WE=39457014;WS=39456996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	39494666	.	CT	C	117.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.179;ClippingRankSum=0.000;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=13.493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.53;ReadPosRankSum=0.105;SOR=1.656;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr1	39550210	rs260972	C	T	604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=17;PP=467;SC=CTCACCAGGGCCTCTGACAAA;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=39550218;WS=39550200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	39568765	rs2282232	T	C	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.830;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=269;ReadPosRankSum=-2.258;SC=TTAGAGAAGCTCTCTAGCCAC;SOR=0.358;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=15;WE=39568773;WS=39568755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr1	39571211	rs13374459	T	C	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.201;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=127;ReadPosRankSum=0.127;SC=GCACAAAGGGTCGAGGCTGGG;SOR=1.179;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=8;WE=39571219;WS=39571201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr1	39717566	rs2490948	T	C	2549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=43;NR=46;PP=1218;SC=GCCCTCCTGGTGCCATACAAA;SOR=0.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=43;TCR=46;TR=89;WE=39717574;WS=39717556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr1	39719812	rs66880209	G	A	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=215;ReadPosRankSum=-0.611;SC=ACACGTACAGGCCTGGTCTTA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=31;TCR=4;TR=13;WE=39719820;WS=39719802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,16:0.41:39
chr1	39748921	rs2275188	G	A	771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.22;ReadPosRankSum=-0.754;SOR=0.728;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,46:0.37:124
chr1	39757799	rs16826036	G	C	960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=22;PP=391;ReadPosRankSum=1.323;SC=TATTGAAGGAGGAGGGTGCTC;SOR=0.729;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=83;TCF=40;TCR=43;TR=41;WE=39757807;WS=39757789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,50:0.51:99
chr1	39758634	rs16826038	G	A	1956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.077;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=53;PP=1172;ReadPosRankSum=0.116;SC=TGCTTATTAGGTTATATCATT;SOR=0.810;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=204;TCF=83;TCR=121;TR=88;WE=39758642;WS=39758624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,97:0.44:220
chr1	39758993	rs6688708	C	G	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.881;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=84;ReadPosRankSum=-1.025;SC=TTGTACAAAACTTGAATCCAT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=5;WE=39759001;WS=39758986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr1	39763242	rs2275187	G	A	2305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.011;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=35;PP=1416;ReadPosRankSum=-0.687;SC=TTAATATTCCGGTGTTCTAAT;SOR=1.160;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=228;TCF=138;TCR=90;TR=103;WE=39763250;WS=39763232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,115:0.46:252
chr1	39766041	rs41270803	A	G	922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.070;HP=4;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=24;PP=1235;ReadPosRankSum=0.343;SC=CGAGGTGAGGAGGTAGAAAGG;SOR=0.473;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=69;TCF=23;TCR=46;TR=38;WE=39766063;WS=39766031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,41:0.56:73
chr1	39766055	rs2275186	C	T	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.469;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=21;PP=1095;ReadPosRankSum=-0.587;SC=AGAAAGGGTACCTCTGGGCCA;SOR=1.128;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=58;TCF=16;TCR=42;TR=27;WE=39766063;WS=39766031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,28:0.45:62
chr1	39797055	rs16826069	A	G	1309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.291;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=24;PP=735;ReadPosRankSum=0.485;SC=GGAGGAGGGCATAGCCAGAAA;SOR=0.828;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=140;TCF=73;TCR=67;TR=58;WE=39797063;WS=39797045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,65:0.43:150
chr1	39801815	rs41270807	A	C	1191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=26;PP=895;ReadPosRankSum=0.455;SC=GAGGTCTTAAATTGGAAGAAA;SOR=0.636;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=115;TCF=60;TCR=55;TR=55;WE=39801823;WS=39801805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,56:0.46:122
chr1	39806610	rs3116396	C	T	5295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=101;PP=2902;SC=TGAACCTCTGCCTCCAACAGT;SOR=1.420;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=164;TCF=62;TCR=102;TR=163;WE=39806618;WS=39806600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr1	39812620	rs2490944	G	T	2532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=17;PP=1726;SC=GGTTTTTTGTGTTTTGTTTCC;SOR=2.049;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=63;TCR=17;TR=80;WE=39812628;WS=39812610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr1	39812822	rs2761764	C	A	4206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=79;PP=2632;SC=AACAGACTGCCGCTCAGGTGG;SOR=1.036;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=140;TCF=61;TCR=79;TR=140;WE=39812830;WS=39812812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr1	39815143	rs16826093	T	A	2651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=46;PP=1544;ReadPosRankSum=-0.892;SC=CTTTGCATTTTAATTAGACCC;SOR=0.706;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=240;TCF=138;TCR=102;TR=112;WE=39815151;WS=39815133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,127:0.48:264
chr1	39815344	rs41270811	G	A	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=306;ReadPosRankSum=0.336;SC=TCGCTCTATCGCTTAGGCTGG;SOR=0.941;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=16;WE=39815352;WS=39815334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr1	39823032	rs147223845	A	AT	1526.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.328;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=27;PP=610;ReadPosRankSum=-3.020;SC=GTTTGGGGGGATTTTTTTTTA;SOR=0.842;SbPval=0.05;Source=Platypus;TC=119;TCF=30;TCR=89;TR=45;WE=39823040;WS=39823022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,78:0.39:202
chr1	39824718	rs2256614	C	G	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=4.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=312;ReadPosRankSum=1.356;SC=GTTAAACTTACAATTATTCTG;SOR=0.199;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=14;WE=39824726;WS=39824708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr1	39826391	rs10632223	A	ATTAT	443.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.30;ReadPosRankSum=-0.360;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr1	39835817	rs2296172	A	G	2139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.495;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=43;PP=1347;ReadPosRankSum=-0.271;SC=GGAAACTTCTATGAGTGCTAA;SOR=0.761;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=204;TCF=109;TCR=95;TR=94;WE=39835825;WS=39835807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,103:0.47:219
chr1	39843958	rs663449	G	A	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.467;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.392;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=119;ReadPosRankSum=-0.402;SC=CTTGAGTGACGTTTTGTTGCC;SOR=1.552;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=8;WE=39843966;WS=39843948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr1	39879366	rs604316	T	C	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=2.033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.87;MQRankSum=-1.187;QD=7.43;ReadPosRankSum=3.363;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,28:0.40:70
chr1	39889677	rs663892	G	A	1559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.640;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=27;PP=846;ReadPosRankSum=0.355;SC=CTGTGTTACAGCTTTTCATTC;SOR=0.599;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=122;TCF=74;TCR=48;TR=65;WE=39889685;WS=39889667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,77:0.55:139
chr1	39893093	rs625384	C	T	716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.169;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=11;PP=409;ReadPosRankSum=1.696;SC=TGTGACTTTTCTTCCTGAGCA;SOR=0.258;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=68;TCF=50;TCR=18;TR=31;WE=39893101;WS=39893083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,35:0.45:77
chr1	39894839	rs645061	A	G	554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=0;PP=457;SC=TTTAAATTTGATCTCTTAAAG;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=39894847;WS=39894829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	39895460	rs683135	G	A	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=9;PP=365;ReadPosRankSum=-0.043;SC=TCATTCCTAGGTCTCTTAAAT;SOR=0.641;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=53;TCF=36;TCR=17;TR=27;WE=39895468;WS=39895450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,26:0.49:53
chr1	39908506	rs587404	G	A	1205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.577;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=13;PP=543;ReadPosRankSum=0.358;SC=CCGTTTGGAAGCCATGAACCA;SOR=0.976;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=87;TCF=56;TCR=31;TR=42;WE=39908514;WS=39908496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,56:0.54:104
chr1	39913351	rs2296173	A	G	2873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=54;PP=1808;ReadPosRankSum=1.946;SC=AAAGAGCACTATTGTTCCCTC;SOR=0.581;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=249;TCF=135;TCR=114;TR=115;WE=39913359;WS=39913341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,130:0.47:278
chr1	39914363	rs668556	G	C	2710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.373;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=61;PP=1582;ReadPosRankSum=1.182;SC=CCCGAAGATAGTCAGAAACTT;SOR=0.788;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=273;TCF=138;TCR=135;TR=120;WE=39914371;WS=39914353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,135:0.45:302
chr1	39927507	rs783820	G	A	2436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=28;PP=1767;SC=ACCGCCAACCGAACAAGTACC;SOR=1.531;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=58;TCR=28;TR=86;WE=39927515;WS=39927497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr1	39929240	rs7554206	T	C	2496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.626;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=40;PP=1628;ReadPosRankSum=0.077;SC=AATAGGAAGTTTTGCTCTACC;SOR=0.811;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=211;TCF=129;TCR=82;TR=102;WE=39929248;WS=39929230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,115:0.51:225
chr1	39957913	rs4660269	A	G	1401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=19;PP=741;SC=GTACCACGCCATGGCTGGCGA;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=31;TCR=19;TR=50;WE=39957921;WS=39957903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	39981522	rs200818147	G	A	2925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=9.202;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.02;MQRankSum=-4.593;QD=22.51;ReadPosRankSum=-0.321;SOR=2.033;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:14,116:0.89:130
chr1	39988145	rs6524	T	C	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=4.438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQRankSum=-10.675;QD=0.76;ReadPosRankSum=-0.233;SOR=1.246;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:138,22:0.14:160
chr1	39988193	rs139291071	C	T	948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.621;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=3.813;NF=22;NR=32;PP=599;ReadPosRankSum=-0.825;SC=ATGACAATCACCACCTGTAGA;SOR=0.766;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=160;TCF=70;TCR=90;TR=54;WE=39988201;WS=39988183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,55:0.34:160
chr1	39988219	.	C	T	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.713;ClippingRankSum=0.000;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=4.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.66;MQRankSum=-4.458;QD=2.09;ReadPosRankSum=2.472;SOR=0.249;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,14:0.13:110
chr1	39988238	.	T	TG	228.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.520;ClippingRankSum=0.000;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=4.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.06;MQRankSum=-3.442;QD=2.66;ReadPosRankSum=2.270;SOR=0.239;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,12:0.14:86
chr1	39991474	rs11583829	AG	CA	10563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=103;PP=2947;SC=CCACTGAGTCAGCCCGCCCAG;SOR=0.790;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=208;TCF=101;TCR=107;TR=202;WE=39991483;WS=39991464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr1	39991588	rs3738676	G	T	2265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=46;PP=1343;SC=CCTCACTCTCGGTGCCTACTT;SOR=1.525;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=25;TCR=46;TR=71;WE=39991596;WS=39991578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr1	40028180	rs4660293	A	G	3329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=55;PP=1821;SC=ACATCTGACTATGTGAAAGAG;SOR=1.150;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=41;TCR=55;TR=96;WE=40028188;WS=40028170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr1	40035686	rs17513135	C	T	6290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=113;PP=2965;SC=TAAAATGAAACCATGAAGAAC;SOR=1.083;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=201;TCF=88;TCR=113;TR=201;WE=40035694;WS=40035676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr1	40036847	rs2293476	G	C	640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=1;PP=453;SC=CCAGTTAATAGCGAGGTGGGG;SOR=3.912;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=40036855;WS=40036837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	40037354	rs41264487	C	G	1605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.32;SOR=0.725;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	40041371	rs79094524	G	GA	1764.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=25;NR=9;PP=1433;SC=GGCCCTGCCAGAAGACGACTC;SOR=2.400;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=27;TCR=10;TR=34;WE=40041379;WS=40041361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	40041699	rs201925786	T	TCGGAGC	231.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=4;PP=178;SC=AGGGGCGCCTTCGGAGCCCGG;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=40041707;WS=40041689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	40092089	rs2695320	T	C	1104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=12;PP=609;SC=AGCCAGTCCATGAAGCAAAGC;SOR=1.206;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=24;TCR=12;TR=36;WE=40092097;WS=40092079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	40098328	rs784625	T	C	3584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=71;NR=53;PP=1781;SC=CACCCCTCTGTGTTTCTTCCT;SOR=0.831;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=124;TCF=71;TCR=53;TR=124;WE=40098336;WS=40098318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr1	40149515	rs784633	A	G	1012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=8;PP=597;SC=GGGGAGCAGCAGGGAGGCCCC;SOR=1.788;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=36;WE=40149523;WS=40149513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	40149551	rs11206617	G	C	1617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=6;PP=1192;SC=CGCGGAGGCAGGGGCGGGGAT;SOR=3.098;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=45;TCR=6;TR=51;WE=40149559;WS=40149541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	40149642	rs784634	G	T	5521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=79;PP=2965;SC=GGCGCGTGATGCGCCCGTCGC;SOR=0.922;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=185;TCF=106;TCR=79;TR=185;WE=40149650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr1	40149870	rs113763288	C	G	833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=11.461;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=27;PP=757;ReadPosRankSum=1.239;SC=GCCCCGCCCACCCCGCCCCCA;SOR=5.207;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=28;WE=40149878;WS=40149860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,27:0.96:28
chr1	40150370	rs2746058	C	T	286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=8;PP=200;SC=ACACACAGGGCGGGGTTGCAG;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=40150378;WS=40150360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	40204424	rs7548120	A	T	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=43;ReadPosRankSum=-0.398;SC=GCACCTCACAAGGCGCCCAGT;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=40204432;WS=40204421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr1	40207169	rs497333	T	G	3369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=64;PP=1990;SC=TGGTTAGGTTTTTGGGCCTTA;SOR=1.292;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=47;TCR=64;TR=111;WE=40207177;WS=40207159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr1	40209650	.	CT	C	60.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=0.000;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=2.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.13;MQRankSum=2.292;QD=0.83;ReadPosRankSum=0.884;SOR=0.325;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,12:0.16:73
chr1	40214525	rs7520588	T	A	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=31;ReadPosRankSum=-0.241;SC=CGAGGTTTTTTATTTTGTCCT;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=4;WE=40214533;WS=40214524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr1	40219065	rs1046988	C	T	1140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.689;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=33;PP=737;ReadPosRankSum=0.469;SC=GCTCTTGACCCTGCATATCCA;SOR=0.514;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=99;TCF=29;TCR=70;TR=48;WE=40219073;WS=40219055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,54:0.51:106
chr1	40229297	rs71060328	A	AC	247.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=30.97;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	40229319	rs493473	G	A	258.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=28.75;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	40229368	rs2463260	A	G	799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.30;QD=30.76;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	40230336	rs76376226	C	G	915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.361;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-6.789;NF=35;NR=24;PP=631;ReadPosRankSum=0.083;SC=CAGCTCGTTGCTTTTCTTCGG;SOR=0.577;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=197;TCF=117;TCR=80;TR=59;WE=40230344;WS=40230326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,53:0.36:147
chr1	40230531	rs115705483	C	T	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=1.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.60;MQRankSum=-4.318;QD=4.55;ReadPosRankSum=1.640;SOR=0.349;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr1	40236074	rs230321	A	C	852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FS=6.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.95;MQRankSum=-5.623;QD=4.61;ReadPosRankSum=-1.759;SOR=1.218;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:136,49:0.26:185
chr1	40253726	rs230328	C	T	550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.36;QD=30.60;SOR=5.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	40253768	rs60164088	C	CA	2754.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=12;NR=14;PP=985;SC=CGGATGCGCGCCCCTCCCCTG;SOR=1.292;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=12;TCR=14;TR=26;WE=40253778;WS=40253758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	40253770	rs4068800	C	T	2788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=31;NR=14;PP=678;SC=GATGCGCGCCCCTCCCCTGCA;SOR=1.214;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=51;TCF=32;TCR=19;TR=45;WE=40253778;WS=40253758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	40253786	rs230329	C	T	2161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=44;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=40;NR=28;PP=1116;SC=CTGCAGCCAGCTTACTCCGAG;SOR=0.897;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=68;TCF=40;TCR=28;TR=68;WE=40253794;WS=40253776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
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chr1	40253812	rs57439527	G	A	1890.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.711;HP=1;HapScore=4;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.371;NF=22;NR=20;PP=1533;ReadPosRankSum=1.314;SC=CCGCGCGGGCGGCCGCACTCA;SOR=0.610;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=87;TCF=50;TCR=37;TR=42;WE=40253820;WS=40253800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,50:0.46:109
chr1	40313849	rs1333742	T	C	970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.818;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=24;PP=539;ReadPosRankSum=0.346;SC=GAACAGGTGGTCACAAAAAAA;SOR=1.272;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=70;TCF=20;TCR=50;TR=31;WE=40313857;WS=40313839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,41:0.48:86
chr1	40319587	rs2294814	A	C	6740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=142;NR=92;PP=2965;SC=CTGAAATTAGACAGCAAGAAA;SOR=1.048;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=234;TCF=142;TCR=92;TR=234;WE=40319595;WS=40319577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr1	40349131	rs3845570	G	A	1235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.407;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=31;PP=765;ReadPosRankSum=1.704;SC=CACTGCCCACGGGAACTGCTC;SOR=0.881;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=114;TCF=52;TCR=62;TR=54;WE=40349139;WS=40349121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,61:0.47:129
chr1	40363054	rs3134614	G	C	2500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=28;PP=1378;SC=TTAGTAGCCAGTGAGGTATGC;SOR=1.167;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=57;TCR=28;TR=84;WE=40363062;WS=40363044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr1	40367592	rs804719	A	G	2326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.29;SOR=0.878;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr1	40421617	rs140696582	TG	T	204.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.586;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.233;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=1.036;NF=0;NR=5;PP=122;ReadPosRankSum=-1.432;SC=TCCCCAGCCCTGGGGACTTAT;SOR=0.105;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=5;WE=40421625;WS=40421607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr1	40526003	rs3122419	T	C	734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=19;PP=597;SC=GAGTTCAGTCTAGCCACAGAA;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=40526011;WS=40525993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	40533266	rs11207440	T	G	3132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=46;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=-0.080;NF=42;NR=36;PP=1177;ReadPosRankSum=2.420;SC=TGCCGGATCATGTCCTCCTCC;SOR=1.040;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=43;TCR=37;TR=78;WE=40533274;WS=40533256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,78:0.98:80
chr1	40533287	rs6665926	T	G	3238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.30;QD=42.06;SOR=1.150;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr1	40533315	rs6665933	T	G	2573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.09;QD=43.62;SOR=1.649;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr1	40533320	rs6665936	T	G	2798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.13;QD=45.14;SOR=1.647;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	40533326	rs6665937	T	G	2928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.18;QD=44.38;SOR=1.376;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	40533347	rs6665944	T	G	2658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=56;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=28;PP=899;SC=TTCCCGCTCATCACTGTTCGC;SOR=1.010;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=29;TCR=28;TR=57;WE=40533355;WS=40533337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr1	40536074	rs58190778	C	CT	7686.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=73;PP=2965;SC=TAAAGTTACACGTTGACACAC;SOR=0.850;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=104;TCF=27;TCR=77;TR=99;WE=40536082;WS=40536064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr1	40545964	rs3122428	T	G	1326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.502;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=21;PP=818;ReadPosRankSum=-0.374;SC=TCTTTCCTAGTGTCTGCCCAG;SOR=0.523;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=112;TCF=72;TCR=40;TR=57;WE=40545972;WS=40545954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,64:0.52:122
chr1	40555321	rs3131651	C	T	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.087;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=154;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GAAAATAAAGCGCAGAGAACT;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=8;WE=40555329;WS=40555311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr1	40556922	rs3122439	T	C	3447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=84;NR=34;PP=2478;SC=TGTGCAAATATAGTTCCTAGA;SOR=1.907;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=120;TCF=84;TCR=36;TR=118;WE=40556950;WS=40556912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr1	40556942	rs56654546	A	T	1323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FS=1.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.07;ReadPosRankSum=3.748;SOR=0.809;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,75:0.46:164
chr1	40557656	rs6672053	G	A	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.590;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=6;PP=441;ReadPosRankSum=1.134;SC=GGATTTATCTGAATAAAAGAA;SOR=1.194;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=67;TCF=51;TCR=16;TR=28;WE=40557664;WS=40557646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,32:0.43:74
chr1	40558256	rs4481840	C	G	1330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=36;PP=1055;SC=AGGCCTCAAACAGCATTATCA;SOR=5.136;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=38;WE=40558264;WS=40558246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	40705427	rs34141181	C	G	2710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=58;PP=1671;ReadPosRankSum=1.560;SC=TTCCCTAGAACAGTGTAATAT;SOR=0.678;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=228;TCF=115;TCR=113;TR=116;WE=40705435;WS=40705417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,128:0.50:257
chr1	40737516	rs6677717	T	G	1117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=5;PP=765;SC=ATAAAGAATGTTTTTTCTTTA;SOR=2.774;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=31;TCR=5;TR=36;WE=40737524;WS=40737506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	40771973	rs2076696	C	G	1190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.586;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=32;PP=717;ReadPosRankSum=0.087;SC=AGCTGAACAACAGAAGGTCCA;SOR=0.615;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=153;TCF=64;TCR=89;TR=57;WE=40771981;WS=40771963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,65:0.37:176
chr1	40773149	rs2228564	T	C	2099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=33;PP=1072;ReadPosRankSum=0.690;SC=ACTTCCGGGCTGTCCCGCCTG;SOR=0.663;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=170;TCF=104;TCR=66;TR=86;WE=40773157;WS=40773139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,100:0.51:197
chr1	40776752	rs3737815	C	A	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=20;ReadPosRankSum=-0.867;SC=CAGCCCTCAGCCCTTGCACTC;SOR=1.565;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=4;WE=40776760;WS=40776742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr1	40777800	rs1979785	T	G	881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=0.734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.24;ReadPosRankSum=-2.119;SOR=0.558;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,45:0.42:107
chr1	40777842	rs209918	A	G	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.67;ReadPosRankSum=0.160;SOR=0.811;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,32:0.43:74
chr1	40778377	rs1983658	C	T	1625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.340;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=40;PP=977;ReadPosRankSum=0.580;SC=AGATTGCCCACGCTGAGGCCC;SOR=0.863;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=128;TCF=57;TCR=71;TR=68;WE=40778385;WS=40778367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,76:0.52:145
chr1	40781175	rs111700365	CG	C	2530.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=22;PP=2374;ReadPosRankSum=0.767;SC=CCGGGCACCCCGAAGTCCCCA;SOR=0.676;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=93;TCF=39;TCR=54;TR=37;WE=40781185;WS=40781165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,66:0.43:154
chr1	40781177	rs115504008	A	C	2539.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=23;PP=2373;ReadPosRankSum=0.573;SC=GGGCACCCCGAAGTCCCCACC;SOR=0.661;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=148;TCF=90;TCR=58;TR=62;WE=40781185;WS=40781165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,69:0.44:158
chr1	40840249	.	T	TTGCG	323	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=13;NR=9;PP=323;QD=15.2272727273;SC=ATGAACTGCATTGCGTGCGTG;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=31;TCF=18;TCR=13;TR=22;WE=40840257;WS=40840239;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:9,22:0.71:31
chr1	40840268	rs72258841	CGT	C	76.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.92;ReadPosRankSum=0.177;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,9:0.22:40
chr1	40840270	rs10645094	T	TGC	143.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.359;HP=2;HapScore=3;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=11;PP=594;ReadPosRankSum=1.770;SC=CGTGCGTGCGTGTGTGTGTGT;SOR=1.071;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=45;TCF=25;TCR=20;TR=28;WE=40840278;WS=40840258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr1	40840294	.	T	A	81.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=0.000;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=2.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.22;ReadPosRankSum=1.451;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,13:0.19:67
chr1	40840296	rs4561032	T	A	1613.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=2.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.21;ReadPosRankSum=0.456;SOR=1.302;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,57:0.68:84
chr1	40859235	.	T	C	78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;FR=0.5000;HP=20;HapScore=2;MGOF=17;MMLQ=17;MQ=52.25;NF=0;NR=8;PP=78;QD=14.0964015684;SC=TTTTTTTTTTTGTGACAGAGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=8;WE=40859243;WS=40859225;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,8:0.53:15
chr1	40879808	rs209605	G	C,T	6365.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=24;NF=70,80;NR=46,50;PP=1648,1688;SC=CTTATTTCTTGCTATAACATA;SOR=1.060;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=246;TCF=150;TCR=96;TR=116,130;WE=40879816;WS=40879798;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.45,0.55:271
chr1	40881041	rs209606	C	G	5332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=89;PP=2965;SC=CTTCTTCTTCCGGTTCCAGAA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=190;TCF=101;TCR=89;TR=190;WE=40881049;WS=40881031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr1	40923019	rs2272994	G	A	3667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=80;PP=2043;ReadPosRankSum=0.191;SC=TAAGCAGGATGTCAGCTTTCC;SOR=0.691;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=302;TCF=150;TCR=152;TR=158;WE=40923027;WS=40923009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,179:0.53:335
chr1	40929087	rs142494383	C	T	918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.688;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=15;PP=468;ReadPosRankSum=-0.852;SC=CTTATGAATGCAGTCATTGTG;SOR=0.767;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=100;TCF=59;TCR=41;TR=39;WE=40929095;WS=40929077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,47:0.39:120
chr1	40955156	rs10789144	A	T	1088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=11;PP=684;SC=TGGTTCTTAGACATCAGCATA;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=26;TCR=11;TR=37;WE=40955164;WS=40955146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	41094320	rs2076334	C	G	198.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=1;PP=148;SC=TATGAATCAACTGGGGACAGT;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=41094328;WS=41094310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	41095171	rs2076333	A	G	262.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=7;PP=202;SC=GATGGCACCAACCACATGGGC;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=41095179;WS=41095161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	41101572	rs2253835	A	G	1420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=15;PP=725;ReadPosRankSum=1.503;SC=GGACCACAGCACGGGGCTGCA;SOR=0.557;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=53;TCF=37;TCR=16;TR=51;WE=41101580;WS=41101562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,58:0.98:59
chr1	41107360	rs491619	T	C	6119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=112;NR=102;PP=2965;SC=CTCTACCCCGTGATGTCCCAT;SOR=0.745;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=215;TCF=113;TCR=102;TR=214;WE=41107379;WS=41107350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr1	41107612	rs2076332	C	G	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=125;ReadPosRankSum=-0.751;SC=CCCGGGGTGGCAGGGCCTCAG;SOR=0.582;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=9;WE=41107620;WS=41107602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr1	41204569	rs1057925	C	T	998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=18;PP=555;ReadPosRankSum=1.609;SC=CCCAGCAAAGCCTACAGTCGT;SOR=0.763;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=98;TCF=57;TCR=41;TR=44;WE=41204577;WS=41204559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,51:0.44:115
chr1	41219031	.	G	A	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.945;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=264;ReadPosRankSum=1.595;SC=TTTGCTTCTCGTTTCTAGACC;SOR=0.941;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=16;WE=41219039;WS=41219021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr1	41224008	rs16827552	C	T	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.040;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=277;ReadPosRankSum=-0.974;SC=AAGACAGTGCCCCTTAGGTTT;SOR=0.997;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=63;TCF=29;TCR=34;TR=22;WE=41224016;WS=41223998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,26:0.36:72
chr1	41228960	.	G	A	255	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=25;MQ=57.96;NF=12;NR=6;PP=255;QD=16.0984006971;SC=ATATATATCTGTAGCTATATA;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=18;WE=41228968;WS=41228950;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:12,18:0.60:30
chr1	41229122	rs35262530	G	T	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.403;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=317;ReadPosRankSum=-1.260;SC=AGGTTCAAGCGATTCTCCTGC;SOR=1.119;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=38;TCF=11;TCR=27;TR=20;WE=41229130;WS=41229112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,20:0.53:38
chr1	41229180	rs4660455	G	A	308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=8;PP=254;SC=CACTATGCCCGGCTGATTTTT;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=41229188;WS=41229170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	41232194	rs34212676	T	C	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.985;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=91;ReadPosRankSum=1.181;SC=TCAACATCTCTGGTCATGGAA;SOR=0.368;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=6;WE=41232202;WS=41232192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr1	41282919	rs13374844	C	T	5224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.66;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr1	41282919	.	CTC	TTT	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=18;MQ=60.0;NF=62;NR=36;PP=2947;QD=20;SC=AACCCTCTCCCTCATGTTGTA;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=100;TCF=62;TCR=38;TR=98;WE=41282929;WS=41282909;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,98:0.98:100
chr1	41282921	rs13374845	C	T	5224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.66;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr1	41284119	rs2296838	C	G	1148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=14;PP=735;SC=GAAGTCCCCGCCTCCGGGTCC;SOR=1.259;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=24;TCR=14;TR=38;WE=41284127;WS=41284109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	41284366	rs2361660	G	C	1659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=28;NR=29;PP=878;SC=AGGCCTGCAAGCCGCGCGCGG;SOR=1.044;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=28;TCR=29;TR=57;WE=41284374;WS=41284356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
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chr1	41285591	rs12143503	A	G	9405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.22;SOR=1.234;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
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chr1	41453286	rs5773721	GT	G	3844.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=79;PP=2973;SC=TAAGGGCACAGTTAACAGTCA;SOR=2.663;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=85;TCF=1;TCR=84;TR=80;WE=41453294;WS=41453276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr1	41454425	rs6675122	G	A	955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.46;ReadPosRankSum=-0.461;SOR=0.553;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,45:0.45:101
chr1	41456823	rs200861913	C	T	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=37.308;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.82;ReadPosRankSum=2.544;SOR=5.699;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,22:0.35:62
chr1	41466550	rs12735455	T	A	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.83;ReadPosRankSum=1.746;SOR=0.124;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,3:0.23:13
chr1	41466803	rs12718433	G	A	1379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.498;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=31;PP=764;ReadPosRankSum=-0.426;SC=AGTAGAGTTCGCTGCCTTGGG;SOR=0.893;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=100;TCF=49;TCR=51;TR=57;WE=41466811;WS=41466793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,65:0.56:117
chr1	41475085	rs12144160	A	G	1306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.748;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=14;PP=866;ReadPosRankSum=-1.584;SC=AACCTTCACAATGAAGCTGTT;SOR=0.992;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=86;TCF=61;TCR=25;TR=51;WE=41475093;WS=41475075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,56:0.56:100
chr1	41483805	.	GTCC	G	118.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.712;ClippingRankSum=0.000;DP=155;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.93;ReadPosRankSum=-0.226;SOR=0.660;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:116,12:0.09:128
chr1	41483951	rs11209361	G	C	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=86;ReadPosRankSum=0.325;SC=CGGACATCCTGATGCCCCTCA;SOR=0.458;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=7;WE=41483959;WS=41483941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr1	41485902	rs3738368	C	G	786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.778;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=14;PP=439;ReadPosRankSum=2.563;SC=ACTTACCTCTCTGTGGCTGAA;SOR=0.811;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=84;TCF=51;TCR=33;TR=34;WE=41485910;WS=41485892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,40:0.42:95
chr1	41486245	rs1138293	C	T	5479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=92;NR=97;PP=2965;SC=GACTGCTCTGCGGGTAGCTCC;SOR=0.882;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=189;TCF=92;TCR=97;TR=189;WE=41486253;WS=41486235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr1	41493749	rs11555079	G	A	929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=12;PP=669;ReadPosRankSum=-1.299;SC=ACAGCCTCTTGGAGTCCTGAG;SOR=0.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=78;TCF=55;TCR=23;TR=42;WE=41493757;WS=41493739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,43:0.52:82
chr1	41494222	rs11578697	G	T	2626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.489;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=42;PP=1702;ReadPosRankSum=-0.290;SC=TCTCCACACAGGTTCCTACTG;SOR=0.975;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=215;TCF=132;TCR=83;TR=116;WE=41494230;WS=41494212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,122:0.52:236
chr1	41540853	rs2011981	A	T	2560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.46;ReadPosRankSum=0.791;SOR=0.683;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,64:0.56:114
chr1	41540861	rs2011982	T	C	2765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.19;ReadPosRankSum=0.540;SOR=0.720;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,76:0.55:137
chr1	41618442	rs213768	A	T	1188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.558;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=36;PP=816;ReadPosRankSum=0.499;SC=CACTGAATGAAGAAATCTAAA;SOR=0.863;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=105;TCF=40;TCR=65;TR=56;WE=41618450;WS=41618432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,57:0.51:111
chr1	41848060	rs12092825	C	T	1543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=22;SC=CCTGGCACCGCCGGGCCACGC;SOR=0.800;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=31;TCR=22;TR=53;WE=41848068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	41848296	rs4359027	G	A	9562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=363;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=160;NR=175;PP=2965;SC=CCCTGCCTCCGCCGCCGCCGG;SOR=0.809;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=335;TCF=160;TCR=175;TR=335;WE=41848304;WS=41848286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,362:1.00:362
chr1	41848567	rs145530493	C	T	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.320;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=6;PP=120;ReadPosRankSum=-0.649;SC=CCACCCCCTTCTCCTGGGCAG;SOR=0.814;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=29;TCF=18;TCR=11;TR=13;WE=41848575;WS=41848557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr1	41949595	rs2759256	G	A	1588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=11;PP=1095;SC=ATATTAGCCAGTGCCTCCATC;SOR=2.480;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=40;TCR=11;TR=51;WE=41949603;WS=41949585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	41949628	rs2759257	A	C	2834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=26;PP=1822;SC=GAGAGATGGAATGTGTCAACG;SOR=1.802;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=68;TCR=26;TR=94;WE=41949636;WS=41949618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr1	41950312	rs2984691	T	C	2858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=61;PP=1518;SC=GAGCAGGGAGTGCCTGTTGCC;SOR=1.262;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=44;TCR=61;TR=105;WE=41950320;WS=41950302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr1	41976017	rs678110	C	T	2026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=50;NR=17;PP=1207;SC=AGCTCCTGGACGGAGGGACAG;SOR=2.062;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=68;TCF=50;TCR=18;TR=67;WE=41976025;WS=41976007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr1	41976328	rs9439043	T	C	1182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=15;PP=689;SC=TCGGGGTTGGTCGGTGCACGC;SOR=0.836;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=22;TCR=15;TR=37;WE=41976336;WS=41976318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	41978566	rs2991344	T	G	1801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=35;NR=20;PP=1106;SC=AACCCGTGGGTCCAGCCCCAA;SOR=1.160;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=35;TCR=20;TR=55;WE=41978574;WS=41978556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	41978825	rs2483689	C	G	4962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=65;PP=2965;SC=CAAGGGAGAGCGCCCATGCCC;SOR=0.861;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=160;TCF=95;TCR=65;TR=160;WE=41978833;WS=41978815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr1	41979156	rs615177	A	G	698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=16;PP=409;ReadPosRankSum=-1.058;SC=TGCCTCGTGTAGCCTCCGTGC;SOR=0.606;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=58;TCF=26;TCR=32;TR=30;WE=41979164;WS=41979146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,33:0.52:63
chr1	41983912	rs2810547	C	A	1984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=46;NR=14;PP=1114;SC=TTGTCTGATACTTGGGAGAAC;SOR=2.049;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=46;TCR=14;TR=60;WE=41983920;WS=41983902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	42041479	rs1815257	A	C	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.366;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=203;ReadPosRankSum=-1.457;SC=TGCAATCTTCACACTCCCCCA;SOR=1.552;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=31;TCF=10;TCR=21;TR=13;WE=42041487;WS=42041469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,14:0.40:35
chr1	42046812	rs2810565	C	T	2591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=40;NR=44;PP=1508;SC=AGGAAGGGGGCTGCCTGAAGG;SOR=1.022;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=40;TCR=45;TR=84;WE=42046820;WS=42046802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr1	42047300	rs41269473	A	T	2348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=52;PP=1494;ReadPosRankSum=1.478;SC=TCCAACTCAGATTCTGGAGGC;SOR=0.732;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=185;TCF=84;TCR=101;TR=96;WE=42047308;WS=42047290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,106:0.53:199
chr1	42048745	rs2810566	T	C	6420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=111;NR=112;PP=2965;SC=GTGACTGCTGTGGCTCAGGGC;SOR=0.904;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=225;TCF=112;TCR=113;TR=223;WE=42048753;WS=42048735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr1	42049032	rs2984694	G	A	3445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=68;PP=2296;SC=TGTCGATCTCGCTGGTGTCCA;SOR=1.207;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=46;TCR=68;TR=114;WE=42049040;WS=42049022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr1	42049140	rs2475842	C	G	5043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=70;PP=2965;SC=CTTCGGTGGACAGGGGCAGGA;SOR=1.205;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=174;TCF=104;TCR=70;TR=174;WE=42049148;WS=42049130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr1	42049250	rs41269477	G	T	3812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=378;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.371;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=72;PP=2259;ReadPosRankSum=-0.240;SC=TTGGTGTTTGGGGGGCTGACC;SOR=0.715;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=338;TCF=182;TCR=156;TR=161;WE=42049258;WS=42049240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:197,180:0.48:377
chr1	42050366	rs2146315	C	T	2164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.332;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=52;PP=1258;ReadPosRankSum=1.085;SC=GGGTATGGGACGCTGGAAGAA;SOR=1.026;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=208;TCF=106;TCR=102;TR=97;WE=42050374;WS=42050356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,109:0.48:229
chr1	42629040	rs2232224	A	G	1246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=10;PP=854;SC=GTATTCCCGAACCCCACCAAT;SOR=2.200;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=42;WE=42629048;WS=42629030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	42630364	rs2071499	G	A	2331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.91;SOR=0.832;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr1	42647536	.	T	TCA	69	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=4;NR=0;PP=69;QD=18.0;SC=CCTGGAGTGCTCACACACACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=6;TCR=5;TR=4;WE=42647544;WS=42647526;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,4:0.36:11
chr1	42657196	rs1139978	T	G	1512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.746;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=26;PP=1039;ReadPosRankSum=2.315;SC=GATGGCTGTGTGTGCATCTGG;SOR=0.485;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=170;TCF=113;TCR=57;TR=71;WE=42657204;WS=42657186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,73:0.40:184
chr1	42693597	rs343376	A	G	6775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=115;NR=115;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.072;SC=AGTAGGCAGCACATCTTCCTT;SOR=0.814;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=233;TCF=117;TCR=116;TR=230;WE=42693605;WS=42693587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,261:0.98:265
chr1	42846786	rs11210626	G	C	2584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=50;PP=1279;SC=AGGCGGGCCCGGGGAGGGCAG;SOR=1.225;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=87;TCF=36;TCR=51;TR=86;WE=42846794;WS=42846776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr1	42865468	rs56751964	G	A	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.750;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=62;ReadPosRankSum=0.911;SC=ATGCCTTGGCGTCTTCCCTTC;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=5;WE=42865476;WS=42865458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr1	42870338	rs1105670	C	T	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=74;ReadPosRankSum=0.795;SC=CTGGACAAGACACTCCTCAAG;SOR=0.693;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=6;WE=42870346;WS=42870328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr1	42880516	rs1055055	T	C	4889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=77;PP=2838;SC=CTACCTCTAGTGAAAGTGAGC;SOR=0.821;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=168;TCF=91;TCR=77;TR=168;WE=42880524;WS=42880506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr1	42896285	rs187901359	C	A	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=267;ReadPosRankSum=0.214;SC=TGTGTGCAATCCCAGGGGAAG;SOR=0.197;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=14;WE=42896293;WS=42896275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr1	42898843	rs1034268	A	G	2455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.121;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=39;PP=1387;ReadPosRankSum=0.081;SC=AGGTAGTAAAACATGACCAGG;SOR=0.463;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=176;TCF=112;TCR=64;TR=98;WE=42898851;WS=42898833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,113:0.55:204
chr1	42901082	rs3748845	A	C	1707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.962;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=39;PP=990;ReadPosRankSum=-0.643;SC=ATGGTAATACAACAAGCAGGC;SOR=0.438;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=132;TCF=57;TCR=75;TR=73;WE=42901090;WS=42901072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,81:0.55:148
chr1	42901173	rs4660634	C	T	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.222;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=230;ReadPosRankSum=1.523;SC=GGTTCTCTCTCTTACTGTGCC;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=11;WE=42901181;WS=42901163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr1	42915753	rs11210647	T	C	3520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.682;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=75;PP=2205;ReadPosRankSum=-0.879;SC=ACATAGACTTTATGATCTTTA;SOR=0.838;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=252;TCF=125;TCR=127;TR=146;WE=42915761;WS=42915743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,160:0.59:273
chr1	42948585	rs6656344	C	A	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.101;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.629;NF=0;NR=9;PP=173;ReadPosRankSum=-0.614;SC=CACTGAGAAACAAGTCTTTAA;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=9;WE=42948593;WS=42948575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr1	42956001	rs72659920	G	A	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.558;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=367;ReadPosRankSum=-1.251;SC=CCCAGGAGTTGGAGGTTGCAG;SOR=1.236;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=20;WE=42956009;WS=42955991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,26:0.70:37
chr1	42956034	rs72659921	A	G	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=155;ReadPosRankSum=0.530;SC=GTGCCACTGCACTCCAGCCTG;SOR=0.976;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=10;WE=42956042;WS=42956024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr1	42962800	rs3748841	A	T	1911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.609;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=41;PP=946;ReadPosRankSum=1.101;SC=CAAAGGAACAAAATCAGAGAC;SOR=0.587;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=195;TCF=95;TCR=100;TR=85;WE=42962808;WS=42962790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,101:0.44:228
chr1	42986956	rs72659942	T	C	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.30;ReadPosRankSum=0.115;SOR=0.773;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
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chr1	43011389	rs6661835	A	G	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=2;PP=105;ReadPosRankSum=1.383;SC=AGACTGAGGCAGGCAGATCGC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=2;WE=43011405;WS=43011379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,2:0.50:4
chr1	43011396	rs142311566	TCG	T	40.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=2;PP=97;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GGCAGGCAGATCGCTTGAGCT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=2;WE=43011405;WS=43011379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr1	43021810	rs12038786	C	T	1002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=12;PP=683;ReadPosRankSum=0.373;SC=AGATTTTATTCTTATATTTGC;SOR=0.683;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=88;TCF=61;TCR=27;TR=41;WE=43021818;WS=43021800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,46:0.47:98
chr1	43055243	rs10789417	C	G	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-1.428;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=47;ReadPosRankSum=1.510;SC=TTTACTAAACCTAATCCTTTA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=4;WE=43055251;WS=43055233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr1	43076555	.	CTTT	C	51.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=-0.000;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.62;ReadPosRankSum=1.111;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr1	43110276	rs7523056	G	A	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.235;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=265;ReadPosRankSum=-0.206;SC=TCTAAGATCCGGGGCCAGTGG;SOR=1.730;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=14;WE=43110284;WS=43110266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr1	43124701	rs6600419	A	G	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.200;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=18;PP=475;ReadPosRankSum=-0.585;SC=TGATTCCTCCATGCATTGCTC;SOR=0.205;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=52;TCF=15;TCR=37;TR=28;WE=43124709;WS=43124691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,31:0.54:57
chr1	43124859	rs3738494	C	T	1794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.071;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=34;PP=1054;ReadPosRankSum=1.292;SC=ACGACTGTGACATCATAGTGA;SOR=0.781;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=195;TCF=111;TCR=84;TR=81;WE=43124867;WS=43124849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,89:0.42:213
chr1	43132393	rs35844708	G	GA	664.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.786;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.184;NF=0;NR=14;PP=457;ReadPosRankSum=-0.220;SC=AAAGGGAAGAGAACCACCTAA;SOR=0.302;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=14;WE=43132401;WS=43132383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,25:0.43:58
chr1	43200855	rs74885359	G	A	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=353;ReadPosRankSum=-1.221;SC=CTGTGGGGTCGGGGGCAGGGG;SOR=0.704;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=60;TCF=19;TCR=41;TR=24;WE=43200863;WS=43200845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,28:0.41:69
chr1	43201534	rs4660658	G	A	752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.707;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=11;PP=402;ReadPosRankSum=-0.430;SC=CAGGGCAGGCGGAGCTCAGAC;SOR=0.891;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=47;TCF=26;TCR=21;TR=27;WE=43201542;WS=43201524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,35:0.61:57
chr1	43212431	rs4660662	A	G	3741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.238;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=51;PP=2140;ReadPosRankSum=1.494;SC=GTTCGGGGGGACCCTGCTGGG;SOR=0.413;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=117;TCF=64;TCR=53;TR=115;WE=43212439;WS=43212421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,136:0.99:137
chr1	43212869	rs3738496	A	T	3207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=376;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.221;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.132;NF=70;NR=77;PP=1894;ReadPosRankSum=-0.843;SC=GGGGAAGAGAAAGGCAAACCA;SOR=0.772;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=335;TCF=161;TCR=174;TR=147;WE=43212877;WS=43212859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:212,164:0.44:376
chr1	43213499	rs3738499	C	T	1240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.814;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=30;PP=686;ReadPosRankSum=-0.015;SC=CTCATCATGGCCCTTCCCTGC;SOR=1.026;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=86;TCF=37;TCR=49;TR=51;WE=43213507;WS=43213489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,57:0.60:95
chr1	43213797	rs3738500	A	G	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.501;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=280;ReadPosRankSum=0.063;SC=AGGGTGGGGTAGTAGAGTGCA;SOR=0.169;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=17;WE=43213805;WS=43213787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr1	43228189	rs2816593	T	A	2918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=62;PP=1710;SC=TCACATCCAATCTCTGAACGT;SOR=1.654;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=33;TCR=62;TR=95;WE=43228197;WS=43228179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr1	43239395	rs2760075	G	A	766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=25;PP=500;ReadPosRankSum=-0.055;SC=GTTTATAATCGTTGTGACTTT;SOR=0.767;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=60;TCF=10;TCR=50;TR=30;WE=43239403;WS=43239385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,33:0.52:64
chr1	43296354	rs12727498	G	T	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.186;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=232;ReadPosRankSum=-1.049;SC=GGCTCTGTCCGTCCCCGGGAT;SOR=1.041;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=44;TCF=15;TCR=29;TR=17;WE=43296362;WS=43296344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,20:0.41:49
chr1	43300663	rs4660672	T	C	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=243;ReadPosRankSum=0.579;SC=TGCCAGAAGCTCTTAGACATC;SOR=0.929;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=14;WE=43300671;WS=43300653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr1	43300921	rs4660673	C	G	1967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=43;PP=1311;SC=CCTGACACTTCTCCATAGGTT;SOR=1.512;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=22;TCR=43;TR=65;WE=43300929;WS=43300911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	43409179	rs12718444	G	T	724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.803;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=19;PP=459;ReadPosRankSum=0.564;SC=CTGACTTCAAGATACTGGGCT;SOR=0.572;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=82;TCF=41;TCR=41;TR=37;WE=43409187;WS=43409169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,38:0.42:91
chr1	43409364	rs34964576	T	C	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=201;ReadPosRankSum=-1.048;SC=AGCCCTCCTATGCGAGGGGGC;SOR=1.034;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=15;WE=43409372;WS=43409354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr1	43418026	rs2297972	C	T	3243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=59;NR=48;PP=1786;SC=CACTCAGGCCCACACTCAGCC;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=59;TCR=48;TR=107;WE=43418034;WS=43418016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr1	43418056	rs3216016	AT	A	2114.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.036;NF=11;NR=27;PP=1343;ReadPosRankSum=2.139;SC=GCTGGAGGAGATTCCCGTAGA;SOR=0.668;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=76;TCF=23;TCR=53;TR=38;WE=43418064;WS=43418046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,69:0.49:141
chr1	43610910	rs626842	T	G	2925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=58;NR=44;PP=1689;SC=TGCAGGGCCATTGACAGAGAA;SOR=0.827;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=58;TCR=44;TR=102;WE=43610918;WS=43610900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr1	43611005	rs627263	G	A	2134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=40;PP=1341;SC=TCAAGTGAGTGCAACCCCTGA;SOR=1.223;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=30;TCR=40;TR=70;WE=43611013;WS=43610995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr1	43613786	rs519666	G	T	4093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=58;NR=80;PP=2271;SC=GGGGAAGGGCGAGAGCGGGAG;SOR=1.135;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=59;TCR=80;TR=138;WE=43613794;WS=43613776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr1	43613850	rs34514362	C	CA	811.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=21;PP=788;SC=GCGGTCCCAGCAAAAACTCTT;SOR=2.753;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=21;WE=43613858;WS=43613840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	43618596	rs12074551	G	A	6514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=117;NR=102;PP=2965;SC=GGGACTTAGAGCCCTTGGTAA;SOR=0.718;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=220;TCF=118;TCR=102;TR=219;WE=43618604;WS=43618586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr1	43632536	rs7163	C	T	9019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=342;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=160;NR=146;PP=2965;SC=TGCCTTCTTGCGCTGTGCCAG;SOR=0.711;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=306;TCF=160;TCR=146;TR=306;WE=43632544;WS=43632526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,341:1.00:341
chr1	43632815	rs1749438	TT	GC	15227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=342;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=155;NR=125;PP=2947;SC=CGTTCCCCTATTAGAGATGTA;SOR=0.905;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=294;TCF=162;TCR=132;TR=280;WE=43632824;WS=43632805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,341:1.00:341
chr1	43632997	rs1691302	A	G	3241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=86;PP=2508;SC=GATTAATACCACTACCCTCTG;SOR=2.390;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=27;TCR=86;TR=113;WE=43633005;WS=43632987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr1	43634867	rs11210797	C	T	795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=24;PP=624;SC=AGCACTTTACCAAAAGTGCCA;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=43634875;WS=43634857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	43636484	rs1049276	C	G	5405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=95;PP=2965;SC=TGGGTCGCTTCGTAGGGACTT;SOR=0.917;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=182;TCF=87;TCR=95;TR=182;WE=43636492;WS=43636474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr1	43637549	rs1691289	A	G	1403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=12;PP=863;SC=CCCTGTGCCCACGCTCACCAC;SOR=1.697;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=38;TCR=12;TR=50;WE=43637557;WS=43637539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	43637932	rs9519	T	C	8566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=133;NR=157;PP=2965;SC=ACCGAATCGCTCCAGCGCCAG;SOR=0.945;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=291;TCF=133;TCR=158;TR=290;WE=43637940;WS=43637922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,309:1.00:309
chr1	43638185	rs1782383	A	G	406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=12;PP=368;SC=TACAAAGGAAAAGGCAGAAAA;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=43638193;WS=43638175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	43638334	rs2934883	A	T	166.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=1;PP=131;SC=GGGGAGGGCGAGTCCGGGCCG;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=43638342;WS=43638329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	43638410	rs1782386	G	C	1252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=9;PP=727;SC=CAGCAGAACTGTTTGGCGGGA;SOR=1.714;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=39;WE=43638418;WS=43638400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	43638457	rs1782387	T	A	3204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=69;NR=42;PP=1743;SC=CGCTGCATGTTTTTGGTCTTC;SOR=1.089;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=69;TCR=42;TR=111;WE=43638465;WS=43638447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr1	43642988	rs12094101	G	T	1383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=31;PP=871;SC=CACCATGTGGGGTGGAAGCAG;SOR=1.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=15;TCR=31;TR=46;WE=43642996;WS=43642978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	43649508	rs663824	A	G	2948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=53;PP=1705;SC=GGAACCTACCAATGGCTCAAA;SOR=0.976;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=43;TCR=53;TR=96;WE=43649516;WS=43649498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr1	43650741	rs598336	T	C	904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=5;PP=711;SC=CCAGTGACAGTCTTCTTTCTC;SOR=2.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=30;WE=43650749;WS=43650731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	43652369	rs6413971	T	C	4957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=78;PP=2965;SC=TGTTTTGCATTTTGGGCAGAT;SOR=0.715;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=173;TCF=95;TCR=78;TR=171;WE=43652377;WS=43652359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr1	43663376	rs513009	A	G	4144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=84;PP=2437;SC=AAGGAATGAAAGGCTTGCCTA;SOR=1.314;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=143;TCF=59;TCR=84;TR=143;WE=43663384;WS=43663366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr1	43664119	rs603560	A	G	2098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=16;PP=1485;SC=TAGTGAGCTAAGCTTACAATT;SOR=2.049;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=67;TCF=50;TCR=17;TR=65;WE=43664127;WS=43664109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	43664218	rs603123	C	T	7615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=145;NR=118;PP=2965;ReadPosRankSum=1.195;SC=CATCTGGACACTTCATTGTAG;SOR=0.249;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=265;TCF=147;TCR=118;TR=263;WE=43664226;WS=43664208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,291:1.00:292
chr1	43664319	rs10711519	TA	T	788.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=0.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.76;ReadPosRankSum=0.523;SOR=0.824;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,42:0.47:90
chr1	43665255	rs143705230	AAG	A	513.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=547;SC=AGGTGAACAAAAGAGAGATGG;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=11;WE=43665264;WS=43665245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	43675467	rs2453412	G	A	5450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=80;PP=2965;SC=TTGTCATCTCGCATTCTGGAC;SOR=0.877;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=183;TCF=102;TCR=81;TR=182;WE=43675475;WS=43675457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr1	43680839	rs34721748	T	TG	393.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=339;SC=CAGGATTGCATGGGGGGAAGC;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=11;WE=43680847;WS=43680829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	43680855	rs4233492	G	A	501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=2;PP=333;SC=GAAGCCTTGCGCAACAGCTGG;SOR=2.712;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=14;WE=43680863;WS=43680845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	43681184	rs612626	C	T	937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=23;PP=647;SC=CCTGGCTACACCCTATGCCCA;SOR=3.056;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=28;WE=43681192;WS=43681174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
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chr1	43699935	rs2477561	C	T	4790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=57;PP=2708;SC=CAGAAGGAAACGTCTCTGATT;SOR=1.160;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=157;TCF=100;TCR=57;TR=157;WE=43699943;WS=43699925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr1	43700140	rs2483688	A	G	2806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.965;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=62;PP=1773;ReadPosRankSum=0.030;SC=CCTCTCCCTCACTGAGAATCT;SOR=0.723;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=230;TCF=118;TCR=112;TR=123;WE=43700148;WS=43700130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,134:0.53:252
chr1	43738340	rs10890247	A	C	960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=14;PP=601;ReadPosRankSum=-0.405;SC=CTGTGATCTGAACCCTCTGAC;SOR=0.350;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=38;TCF=24;TCR=14;TR=37;WE=43738348;WS=43738327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,37:0.97:38
chr1	43771016	rs3831248	TA	T	3333.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.484;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.430;NF=10;NR=53;PP=2153;ReadPosRankSum=-0.167;SC=AGAGCAACGGTAAAGAGGGGC;SOR=0.749;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=128;TCF=17;TCR=111;TR=63;WE=43771024;WS=43771006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,114:0.50:229
chr1	43771090	rs3120044	G	A	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.602;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=21;PP=438;ReadPosRankSum=1.867;SC=TGACCCATGGGACCCTCAGCT;SOR=1.445;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=53;TCF=12;TCR=41;TR=26;WE=43771098;WS=43771080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,25:0.46:54
chr1	43773033	rs2275180	A	G	1410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.880;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=36;ReadPosRankSum=2.154;SC=CTTGGAGGGTAAGGGCGACAG;SOR=0.462;Source=Platypus;TCR=63;TR=55;WE=43773041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,57:0.61:94
chr1	43774437	rs1467809	G	A	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.501;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=138;ReadPosRankSum=1.013;SC=GCAGGTATTAGACGGTATCGG;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=8;WE=43774445;WS=43774427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr1	43774495	rs2282225	G	C	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.327;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=336;ReadPosRankSum=1.220;SC=GATGGGATGTGGGGCTGGGAC;SOR=1.405;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=20;WE=43774503;WS=43774485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,22:0.56:39
chr1	43774878	rs2282226	C	T	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=200;ReadPosRankSum=1.285;SC=ACCCCCTAGTCCCTCAGAACT;SOR=0.368;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=10;WE=43774886;WS=43774868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr1	43777852	rs1999595	C	T	2282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.42;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	43777852	.	CGTC	TGTC,TGTT	547	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=25,14;NR=28,12;PP=415,547;QD=8.48624929334;SC=GTTACTTTCCCGTCGACCCCA;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=25;TCR=28;TR=53,26;WE=43777863;WS=43777842;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:53
chr1	43777855	rs35909386	C	T	746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=6.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.49;ReadPosRankSum=0.367;SOR=0.370;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,31:0.48:65
chr1	43779564	rs3120276	T	C	1604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FS=0.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.54;ReadPosRankSum=-2.264;SOR=0.616;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,85:0.45:188
chr1	43779724	rs138876276	TTG	T	128.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FS=1.163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=3.503;QD=1.20;ReadPosRankSum=-0.493;SOR=0.931;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,14:0.13:107
chr1	43779869	rs2991990	T	G	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.638;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=30;ReadPosRankSum=-0.501;SC=AAATATTTAATATTCCCATTT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=3;WE=43779877;WS=43779859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr1	43782846	rs1198982	G	A	385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=243;ReadPosRankSum=-1.635;SC=TGGACCGTCTGCCCTCTTGTC;SOR=0.976;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=17;WE=43782854;WS=43782836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr1	43784956	rs1199039	A	G	1084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.419;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=22;PP=720;ReadPosRankSum=-0.066;SC=GAGAGAACCTAGCCTCCAAGA;SOR=0.530;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=127;TCF=78;TCR=49;TR=53;WE=43784964;WS=43784946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,55:0.41:134
chr1	43812075	rs1760670	G	A	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.646;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=7;PP=361;ReadPosRankSum=-0.413;SC=TTAGTCTCTGGGGCAGGCCTG;SOR=0.332;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=51;TCF=40;TCR=11;TR=29;WE=43812083;WS=43812065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,32:0.57:56
chr1	43814864	rs839995	T	C	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=9;PP=390;ReadPosRankSum=1.946;SC=GGGGCCAGAGTAGGGGCTGGC;SOR=0.716;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=74;TCF=49;TCR=25;TR=28;WE=43814872;WS=43814854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,29:0.38:77
chr1	43825644	rs839763	T	C	901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.762;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=13;PP=649;ReadPosRankSum=-1.515;SC=CCACAGGTTATCAGAACAGAC;SOR=1.063;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=88;TCF=55;TCR=33;TR=37;WE=43825652;WS=43825634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,40:0.41:98
chr1	43826312	rs710251	C	A	10639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=402;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=179;NR=179;PP=2965;SC=TGCCCACCCTCCCCTTGACTG;SOR=0.728;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=358;TCF=179;TCR=179;TR=358;WE=43826320;WS=43826302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,401:1.00:401
chr1	43855546	rs839752	A	G	2581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.941;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=65;PP=1620;ReadPosRankSum=-0.411;SC=CCCTCCCACCAACTTCCGGTT;SOR=1.097;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=227;TCF=102;TCR=125;TR=108;WE=43855554;WS=43855525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,121:0.48:252
chr1	43855578	rs839753	G	C	4848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=95;PP=2965;SC=CCGAGGTAGCGAGGTCAGGGG;SOR=1.289;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=157;TCF=62;TCR=95;TR=157;WE=43855586;WS=43855568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr1	43869235	rs710249	G	C	656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=10;PP=513;ReadPosRankSum=1.223;SC=GGGATACTTCGCTGATCCTTT;SOR=0.770;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=66;TCF=47;TCR=19;TR=32;WE=43869243;WS=43869225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,31:0.45:69
chr1	43886494	rs2782643	C	T	3072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.385;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=57;PP=1902;ReadPosRankSum=1.866;SC=GGCTATGGCACCCTGGCCCCT;SOR=0.878;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=287;TCF=153;TCR=134;TR=133;WE=43886502;WS=43886484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,148:0.48:310
chr1	43887146	rs2782644	G	A	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=290;ReadPosRankSum=0.820;SC=CCCCGGGGAAGAGGAGGATCT;SOR=1.493;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=13;WE=43887154;WS=43887136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr1	43888602	rs2782645	G	A	682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=20;PP=474;ReadPosRankSum=0.255;SC=TAGGGTGTAGGATAGCTCCCT;SOR=0.820;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=43;TCF=8;TCR=35;TR=25;WE=43888610;WS=43888592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,27:0.57:47
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chr1	43905286	rs72671125	C	T	3070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.878;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=64;PP=1869;ReadPosRankSum=-0.394;SC=GGGTTGCCTGCATCACTCTAG;SOR=0.774;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=286;TCF=158;TCR=128;TR=147;WE=43905294;WS=43905276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,151:0.50:300
chr1	43906896	rs2027130	A	G	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.788;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=392;ReadPosRankSum=-1.587;SC=GTAAAACAGAATGTGGGGATT;SOR=1.247;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=48;TCF=30;TCR=18;TR=25;WE=43906904;WS=43906886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,26:0.48:54
chr1	43907092	rs12407785	G	A	1785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=36;PP=991;ReadPosRankSum=-1.055;SC=GGGTATGGGTGTGAAGTCACA;SOR=0.661;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=177;TCF=93;TCR=84;TR=77;WE=43907113;WS=43907082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,89:0.45:196
chr1	43909265	rs2255632	T	C	2433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=53;PP=1547;ReadPosRankSum=1.410;SC=TTTACTCTCATAGCGGCGCCA;SOR=0.668;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=218;TCF=105;TCR=113;TR=103;WE=43909273;WS=43909255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,117:0.47:251
chr1	43912590	rs2782650	A	G	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.791;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=13;PP=508;ReadPosRankSum=0.376;SC=CAGTGCAGCCATACCTTAACC;SOR=0.865;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=85;TCF=54;TCR=31;TR=38;WE=43912598;WS=43912580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,44:0.46:96
chr1	43916642	rs6954	T	C	7717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=123;NR=136;PP=2965;SC=GAAGCACTTGTGGCCACCGTC;SOR=0.830;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=260;TCF=123;TCR=137;TR=259;WE=43916650;WS=43916632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,293:1.00:293
chr1	43917409	rs2251804	T	C	2021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.035;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=49;PP=1239;ReadPosRankSum=0.473;SC=GGATACTACATTCCGAGACCC;SOR=0.769;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=201;TCF=96;TCR=105;TR=93;WE=43917417;WS=43917399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,102:0.46:222
chr1	43917637	rs2251802	G	A	2679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.450;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=50;PP=1661;ReadPosRankSum=-0.199;SC=AGTACTGGGGGTCAGTGATGC;SOR=0.522;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=190;TCF=109;TCR=81;TR=110;WE=43917645;WS=43917627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,117:0.57:204
chr1	43919413	rs6692611	A	G	1690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.01;SOR=1.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr1	43998397	rs11350891	GT	G	1438.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=34;PP=959;SC=GAAAATCCCTGTTTTTTTACT;SOR=1.893;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=39;TCF=1;TCR=38;TR=35;WE=43998405;WS=43998387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	44035352	rs1065771	C	T	1872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=39;PP=1039;ReadPosRankSum=0.061;SC=TGCTATGTGCCGCAGGCGGAA;SOR=0.729;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=155;TCF=82;TCR=73;TR=82;WE=44035360;WS=44035342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,92:0.54:170
chr1	44035472	rs943513	G	A	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.158;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=352;ReadPosRankSum=-1.246;SC=CAGGGGTCAAGGGGCCATGCA;SOR=0.925;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=51;TCF=16;TCR=35;TR=23;WE=44035480;WS=44035462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,24:0.44:54
chr1	44035554	rs67630978	AG	A	100.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.253;NF=1;NR=3;PP=99;ReadPosRankSum=-1.282;SC=TCCAGGGCTGAGCGGAGGGTA;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=4;WE=44035562;WS=44035544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr1	44044468	rs11210874	C	T	602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=386;ReadPosRankSum=1.030;SC=CCTCTCGCTTCGTGTACCCAC;SOR=0.723;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=45;TCF=34;TCR=11;TR=25;WE=44044476;WS=44044458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,26:0.54:48
chr1	44057257	rs2304353	A	G	633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.962;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=15;PP=305;ReadPosRankSum=-0.099;SC=GGCAGCCAACAGCAGAGAAGG;SOR=0.883;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=59;TCF=27;TCR=32;TR=28;WE=44057265;WS=44057247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,32:0.51:63
chr1	44057668	rs7540068	G	T	1212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.298;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=30;PP=785;ReadPosRankSum=-1.352;SC=GTCCCTGAGGGTCTGTGATGG;SOR=0.510;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=117;TCF=53;TCR=64;TR=58;WE=44057676;WS=44057658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,59:0.48:123
chr1	44057696	rs7553297	A	G	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=22;PP=527;ReadPosRankSum=-0.290;SC=CCAGGAGGGTATTTTCTGGAT;SOR=0.606;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=66;TCF=18;TCR=48;TR=31;WE=44057704;WS=44057685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,30:0.45:66
chr1	44058034	rs2117316	G	A	983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=8;PP=566;ReadPosRankSum=-0.347;SC=GCCGTGGTGGGTCCAGAGGTG;SOR=0.588;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=82;TCF=65;TCR=17;TR=37;WE=44058042;WS=44058024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,42:0.48:88
chr1	44058265	rs3828151	C	A	1259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.737;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=39;PP=806;ReadPosRankSum=0.084;SC=CCCGCACAGCCCAGTCCAGTA;SOR=0.825;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=119;TCF=36;TCR=83;TR=55;WE=44058273;WS=44058255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,59:0.47:126
chr1	44064319	rs17849103	A	G	1424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.208;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=27;PP=932;ReadPosRankSum=2.641;SC=CAGGACCCTCAAGTTTGCTGT;SOR=0.439;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=125;TCF=81;TCR=44;TR=67;WE=44064327;WS=44064309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,71:0.53:134
chr1	44067859	rs12023161	A	G	3016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.719;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=75;PP=1821;ReadPosRankSum=0.695;SC=GCTAGCCTGCACTGCCAAGAT;SOR=0.899;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=277;TCF=129;TCR=148;TR=135;WE=44067867;WS=44067849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,151:0.49:308
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chr1	44070691	rs17371903	A	G	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.283;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=272;ReadPosRankSum=-1.657;SC=GGCCACGGCCAGCTGAGCCTG;SOR=0.995;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=20;WE=44070699;WS=44070681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,21:0.51:41
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chr1	44072018	rs1065772	C	T	3446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=350;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.389;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=71;PP=2095;ReadPosRankSum=-0.600;SC=TCCCGGAGACCTTTACCTTGG;SOR=0.656;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=323;TCF=180;TCR=143;TR=159;WE=44072026;WS=44072008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,170:0.49:348
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chr1	44072420	rs539096	A	G	2677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=55;NR=34;PP=1653;SC=CTCCAGGATTAATAGGCAGAG;SOR=1.122;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=56;TCR=34;TR=89;WE=44072428;WS=44072410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr1	44075227	rs517622	T	C	979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=23;PP=589;SC=CCTGTGGGTCTGTTCTGCAGG;SOR=2.115;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=9;TCR=23;TR=32;WE=44075235;WS=44075217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	44078359	rs3791149	T	A	737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.644;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=13;PP=504;ReadPosRankSum=1.922;SC=GTGATGGTGCTGTAAGCAGAA;SOR=0.240;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=71;TCF=49;TCR=22;TR=34;WE=44078367;WS=44078349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,35:0.47:75
chr1	44078384	rs499257	T	C	3892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=38;PP=2193;SC=TTAACGGGCTTTCTTTTCTTG;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=70;TCR=38;TR=108;WE=44078392;WS=44078374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr1	44078602	rs3791151	C	A	1558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.347;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=36;PP=784;ReadPosRankSum=-1.931;SC=TCTTCTCCCCCAATCCCACTG;SOR=0.512;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=119;TCF=42;TCR=77;TR=62;WE=44078610;WS=44078592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,73:0.57:129
chr1	44079411	rs603542	T	C	2907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=38;NR=65;PP=1605;SC=CCCCCTACCATGTGCCTGGCC;SOR=1.505;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=38;TCR=65;TR=103;WE=44079419;WS=44079401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr1	44083110	rs571862	C	T	2817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=31;PP=1797;SC=TCTCCATTCTCTGCAGTCCAT;SOR=1.454;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=66;TCR=31;TR=97;WE=44083118;WS=44083100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr1	44083507	rs641365	T	C	6151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=123;PP=2965;SC=AGACCATGGGTGATTTCTGGA;SOR=1.022;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=222;TCF=98;TCR=124;TR=221;WE=44083527;WS=44083497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr1	44083519	rs641351	G	A	5487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.99;NF=79;NR=108;PP=2965;SC=ATTTCTGGAGGATGGTGTGGG;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=189;TCF=80;TCR=109;TR=187;WE=44083527;WS=44083497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr1	44084739	rs1143701	C	T	6821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=120;NR=103;PP=2965;SC=GTGAGAAGCGCGAGCTGCGTC;SOR=0.724;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=224;TCF=120;TCR=104;TR=223;WE=44084747;WS=44084729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr1	44086080	rs568639	T	C	7242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=139;NR=105;PP=2965;ReadPosRankSum=1.026;SC=ACCCCTCCCCTATTCCTTCTC;SOR=0.917;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=247;TCF=141;TCR=106;TR=244;WE=44086088;WS=44086070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,265:0.99:267
chr1	44086831	rs1143702	C	T	9565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=358;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=161;NR=177;PP=2965;SC=GCATGCGCTACGAGGGCGTGG;SOR=0.811;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=338;TCF=161;TCR=177;TR=338;WE=44086839;WS=44086821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,358:1.00:358
chr1	44087496	rs673485	C	T	2660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=25;PP=1833;SC=GGGTCCAGCACCTGCTCTTGG;SOR=1.896;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=68;TCR=25;TR=93;WE=44087504;WS=44087486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr1	44119038	rs3215842	A	AT	143.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.136;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=156;ReadPosRankSum=0.431;SC=GAGCAGTAAGATTTTTTTCCT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=7;WE=44119046;WS=44119028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr1	44121557	rs2274465	C	G	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.010;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=57;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=104;ReadPosRankSum=-0.136;SC=TGGCTCTGTTCTAGCTGTCTC;SOR=1.270;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=7;WE=44121565;WS=44121547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr1	44125962	rs3215843	CA	C	1306.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=15;PP=906;ReadPosRankSum=0.067;SC=TTTTTACTTTCAAAAAGGTAC;SOR=0.706;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=92;TCF=51;TCR=41;TR=32;WE=44125970;WS=44125952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,57:0.43:134
chr1	44137257	rs586339	C	A	6503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.213;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=102;NR=108;PP=2965;ReadPosRankSum=0.302;SC=GAAGAACAAGCAGCAGCTGCC;SOR=0.385;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=211;TCF=103;TCR=108;TR=210;WE=44137265;WS=44137247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,240:1.00:241
chr1	44280381	rs37468	A	T	1899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=11;PP=1355;SC=AACTTGGTCCATCACAAAACA;SOR=2.658;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=46;TCR=11;TR=57;WE=44280389;WS=44280371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr1	44280425	rs3791064	T	G	1349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.382;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=21;PP=1022;ReadPosRankSum=-0.151;SC=TTTATGTATTTAGTTACGTTC;SOR=0.492;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=118;TCF=81;TCR=37;TR=60;WE=44280433;WS=44280415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,61:0.47:129
chr1	44290530	rs37458	A	G	2319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.588;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=47;PP=1312;ReadPosRankSum=-0.174;SC=GAGCGAGGACACAGCCTTTGC;SOR=0.733;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=251;TCF=134;TCR=117;TR=107;WE=44290538;WS=44290520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,122:0.42:288
chr1	44323736	rs2906465	T	C	2467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=25;PP=1413;SC=AACAGGTTTTTGAAGTGAATA;SOR=1.636;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=55;TCR=25;TR=80;WE=44323744;WS=44323726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr1	44386305	rs3120802	C	T	667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=15;PP=488;SC=GTGGGTGGGGCAGTGCTTCTG;SOR=1.708;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=7;TCR=15;TR=22;WE=44386313;WS=44386295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	44386615	rs3120803	A	G	1704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=31;PP=1137;SC=GGGGCTGGGTATGGGGGCAAT;SOR=0.941;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=58;TCF=27;TCR=31;TR=58;WE=44386623;WS=44386605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	44395786	rs2108202	C	T	4333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=72;PP=2708;SC=CAACTGATCACTTCATCTCTC;SOR=0.811;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=146;TCF=74;TCR=72;TR=146;WE=44395794;WS=44395776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr1	44401384	rs2242637	A	G	4967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=83;NR=79;PP=2634;SC=TGGCCTAGGCAGCAGGTGAGT;SOR=0.878;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=162;TCF=83;TCR=79;TR=162;WE=44401392;WS=44401369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr1	44415415	rs2240447	C	T	10315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=386;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=190;NR=165;PP=2965;SC=TGATGCCTGACGCTTGGCCAT;SOR=0.790;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=355;TCF=190;TCR=165;TR=355;WE=44415423;WS=44415405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,386:1.00:386
chr1	44426025	rs2301993	G	A	2188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.274;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=30;PP=1008;ReadPosRankSum=1.076;SC=CTTGCCCTCCGCTCCCATAGT;SOR=0.453;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=37;TCR=30;TR=66;WE=44426033;WS=44426015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,84:0.99:85
chr1	44426948	rs2906596	G	A	6211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=121;PP=2965;SC=GGTCCTGACCGGGGTCTCTGC;SOR=1.268;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=203;TCF=82;TCR=121;TR=203;WE=44426956;WS=44426938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr1	44432500	rs4660759	C	G	3475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=67;PP=2468;SC=CCAGTGCCCTCCCCTGCCCAG;SOR=0.986;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=51;TCR=67;TR=118;WE=44432508;WS=44432490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr1	44442521	rs12410334	A	C	1149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=24;PP=743;SC=GTATGAATGCAAAATGCTGGG;SOR=1.402;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=16;TCR=24;TR=40;WE=44442529;WS=44442511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	44443422	rs41270397	C	T	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=253;ReadPosRankSum=0.951;SC=TGAGTTGATTCTTAGTGACTA;SOR=1.828;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=12;WE=44443430;WS=44443412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr1	44451115	rs78433362	A	G	43.18	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.64;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,4:0.80:5
chr1	44451124	rs75761202	G	T	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=2.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.89;ReadPosRankSum=-1.356;SOR=1.262;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr1	44451234	rs1061781	C	T	4247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=386;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.668;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.921;NF=104;NR=79;PP=2341;ReadPosRankSum=-1.070;SC=ACATCCGAATCGGCCGCTACC;SOR=0.597;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=343;TCF=199;TCR=144;TR=183;WE=44451242;WS=44451224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,210:0.54:386
chr1	44457215	rs12403025	G	A	470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=2;PP=310;SC=ACCAAACACGGGAGGGGGCGG;SOR=2.712;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=44457223;WS=44457205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	44457305	rs12403036	G	A	3088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=68;NR=38;PP=1860;SC=CCCACTGCCTGGTTTCTGGGC;SOR=1.309;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=68;TCR=38;TR=106;WE=44457322;WS=44457295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr1	44457739	rs11376967	T	TC	809.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=16;PP=868;SC=ATTTCCCACCTCTGCGGGTCC;SOR=1.708;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=44457747;WS=44457729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	44460632	rs79401056	G	C	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=23.69;ReadPosRankSum=0.319;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr1	44460639	rs75862497	A	G	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=23.69;ReadPosRankSum=-1.150;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr1	44477431	rs111824744	T	G	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.249;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=321;ReadPosRankSum=-0.890;SC=GAGAGGCAGATGCGGGGATTT;SOR=0.444;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=48;TCF=12;TCR=36;TR=19;WE=44477439;WS=44477421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,22:0.41:54
chr1	44595047	rs11210969	T	A	2927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.511;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=56;PP=1720;ReadPosRankSum=1.419;SC=TCAGCGCCCATCTTGAACATG;SOR=0.555;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=266;TCF=150;TCR=116;TR=123;WE=44595055;WS=44595037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,140:0.47:299
chr1	44595113	rs2429051	G	C	3408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.829;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=68;PP=2053;ReadPosRankSum=1.123;SC=GGCCTACCAAGCATTCAGCAC;SOR=0.627;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=299;TCF=151;TCR=148;TR=143;WE=44595121;WS=44595103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,162:0.49:332
chr1	44596379	rs34057178	CCAA	C	7101.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=0.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=484;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.125;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.157;NF=7;NR=95;PP=2975;ReadPosRankSum=1.428;SC=GACCCACAGGCCAACAACAAC;SOR=0.813;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=263;TCF=20;TCR=243;TR=102;WE=44596389;WS=44596369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:251,189:0.43:440
chr1	44679556	rs803369	A	G	8299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=134;NR=146;PP=2965;SC=GAAAGCGTTGACTAGGGGAGG;SOR=0.866;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=280;TCF=134;TCR=146;TR=280;WE=44679564;WS=44679546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,311:1.00:311
chr1	44680719	rs4660780	G	C	2005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.490;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=37;PP=1209;ReadPosRankSum=0.781;SC=AATGCATGCAGAGTAGGACTC;SOR=0.739;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=200;TCF=111;TCR=89;TR=86;WE=44680727;WS=44680709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,97:0.43:226
chr1	44681113	rs1291169	T	C	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=106;ReadPosRankSum=0.889;SC=GGATCGTCCTTGACTTAGTCT;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=10;WE=44681121;WS=44681103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr1	44684995	rs2799480	T	C	1451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.823;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=27;PP=1106;ReadPosRankSum=1.299;SC=GTTCTGAGAGTACCCAGTGCT;SOR=0.769;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=91;TCF=48;TCR=43;TR=59;WE=44685003;WS=44684985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,60:0.60:100
chr1	44685664	rs41270415	C	T	1136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.666;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=28;PP=731;ReadPosRankSum=-1.361;SC=GGGCTCTGCCCGTGCTGCCTG;SOR=0.800;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=118;TCF=61;TCR=57;TR=55;WE=44685672;WS=44685654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,57:0.46:125
chr1	44686322	rs12419	T	C	1925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.306;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=54;PP=1072;ReadPosRankSum=-0.514;SC=GACGCTGTTATGTAAATAGAG;SOR=0.931;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=185;TCF=74;TCR=111;TR=87;WE=44686330;WS=44686312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,96:0.49:197
chr1	44750795	rs61771075	C	A	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.714;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.191;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr1	44788398	rs161721	A	T	1856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=37;NR=26;PP=1128;SC=ACTTCTTACCATCCCATATTG;SOR=0.990;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=64;TCF=37;TCR=27;TR=63;WE=44788406;WS=44788388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	45088629	rs28453885	G	A	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.909;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=57;ReadPosRankSum=-0.498;SC=CTAGGGCTGCGCCGTGTGTGT;SOR=0.569;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=6;WE=45088637;WS=45088619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr1	45097931	rs111993242	C	T	3121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.466;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=59;PP=1893;ReadPosRankSum=0.678;SC=GTCGGGGGTCCGGTGCTGGGG;SOR=0.807;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=246;TCF=133;TCR=113;TR=128;WE=45097939;WS=45097921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,142:0.53:268
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chr1	45223901	rs111920953	TATTAGCTG	T	523.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=4.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.91;ReadPosRankSum=-1.456;SOR=1.536;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,16:0.33:48
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chr1	45226084	rs1140279	G	A	3237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=363;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.736;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=68;PP=2281;ReadPosRankSum=2.164;SC=AGCGAGGCGCGGACACTTCCA;SOR=0.811;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=338;TCF=183;TCR=155;TR=151;WE=45226092;WS=45226074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:204,157:0.43:361
chr1	45227851	rs41269067	G	C	1557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.738;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=29;PP=1044;ReadPosRankSum=-1.858;SC=AGTCAGCTGGGTGAGGGGCTT;SOR=0.910;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=153;TCF=90;TCR=63;TR=73;WE=45227859;WS=45227841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,76:0.47:163
chr1	45241113	rs11211031	T	C	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.579;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=7;PP=255;ReadPosRankSum=-0.750;SC=GAGACCCTCCTAGGCTCGTGG;SOR=0.157;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=19;WE=45241121;WS=45241103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr1	45241285	rs12120833	C	G	2419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=53;PP=1476;ReadPosRankSum=1.624;SC=GAGTGTCGCTCTGCATTGAGG;SOR=0.702;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=238;TCF=123;TCR=115;TR=110;WE=45241293;WS=45241275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,120:0.46:260
chr1	45244051	rs3838955	T	TG	817.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.448;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=701;ReadPosRankSum=0.110;SC=CTGCCCAGGCTGAGGGGGCTG;SOR=1.135;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=18;WE=45244059;WS=45244041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,26:0.53:49
chr1	45266832	rs17881698	A	G	850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.814;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=23;PP=469;ReadPosRankSum=0.100;SC=AAGGTGAAAGATGGTGATTCC;SOR=0.239;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=90;TCF=27;TCR=63;TR=39;WE=45266840;WS=45266822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,42:0.45:93
chr1	45270024	rs11211036	G	C	3673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=358;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.812;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=68;PP=1701;ReadPosRankSum=0.818;SC=AACAGAACCCGGCCCCCCTGG;SOR=0.559;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=324;TCF=178;TCR=146;TR=151;WE=45270033;WS=45270014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,177:0.50:355
chr1	45271097	rs17883049	G	A	3336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.449;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=66;PP=1988;ReadPosRankSum=-1.204;SC=GAGGCCCAGGGTGCTGGGGAG;SOR=0.641;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=243;TCF=120;TCR=123;TR=131;WE=45271105;WS=45271087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,147:0.55:265
chr1	45271912	rs17886118	G	A	1296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=34;PP=820;ReadPosRankSum=0.354;SC=GCGCGGCCTCGTCGCTGGAGT;SOR=0.741;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=100;TCF=37;TCR=63;TR=53;WE=45271920;WS=45271902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,57:0.50:115
chr1	45291908	rs11211040	G	A	2771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=47;PP=1888;ReadPosRankSum=-0.121;SC=CCTCCCCGGGGTGCCCGTGCT;SOR=0.699;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=239;TCF=149;TCR=90;TR=124;WE=45291916;WS=45291898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,129:0.52:250
chr1	45293518	rs7525308	A	G	1679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.586;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=30;PP=903;ReadPosRankSum=-0.255;SC=GTCTTACCTTAGCATGTGACT;SOR=0.608;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=147;TCF=86;TCR=61;TR=71;WE=45293526;WS=45293508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,78:0.49:160
chr1	45293752	rs2295997	T	C	2322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.941;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=49;PP=1538;ReadPosRankSum=2.846;SC=GGCTGCTGGCTTCACAGTGGG;SOR=0.783;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=246;TCF=132;TCR=114;TR=111;WE=45293760;WS=45293742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,117:0.44:268
chr1	45294156	rs2273940	T	C	1821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.190;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=40;PP=1031;ReadPosRankSum=-0.109;SC=CACCCTGAGCTGCCCCGTGTG;SOR=0.836;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=158;TCF=83;TCR=75;TR=82;WE=45294164;WS=45294146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,88:0.51:172
chr1	45297753	rs2295999	A	G	2260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=51;PP=1514;ReadPosRankSum=1.109;SC=CAGCAGAAGAAGGGGATTCCC;SOR=0.679;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=192;TCF=83;TCR=109;TR=90;WE=45297761;WS=45297743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,99:0.47:211
chr1	45307506	rs3795720	G	A	2210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.078;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=43;PP=1151;ReadPosRankSum=-0.830;SC=TATGGCCAGTGTCCACAACTT;SOR=0.612;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=180;TCF=99;TCR=81;TR=95;WE=45307514;WS=45307496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,109:0.53:204
chr1	45308409	rs6696675	G	A	1928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.612;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=31;PP=1143;ReadPosRankSum=-1.093;SC=TTGCGGTGCTGGCTCTCACTT;SOR=0.611;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=90;TCR=54;TR=82;WE=45308417;WS=45308399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,91:0.58:156
chr1	45316741	.	CT	C	159.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.889;ClippingRankSum=0.000;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=2.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.29;MQRankSum=3.235;QD=2.16;ReadPosRankSum=0.630;SOR=1.018;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,17:0.23:74
chr1	45340282	rs9988451	C	T	791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=7;PP=527;ReadPosRankSum=-0.434;SC=TAAAATTAACCTTCCTTCAGA;SOR=0.627;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=63;TCF=51;TCR=12;TR=32;WE=45340290;WS=45340272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,34:0.49:70
chr1	45341360	rs138741202	T	C	3286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=78;PP=2183;ReadPosRankSum=-1.144;SC=AGACAGCAATTTGGGCACCTT;SOR=0.687;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=313;TCF=156;TCR=157;TR=156;WE=45341368;WS=45341350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,163:0.48:337
chr1	45362992	rs263978	T	C	1721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.584;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=29;PP=1278;ReadPosRankSum=-1.523;SC=GCTTGTTAAGTACTGTAGGTT;SOR=0.632;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=148;TCF=94;TCR=54;TR=79;WE=45363000;WS=45362982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,81:0.48:168
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chr1	45444038	rs11556200	G	A	3230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=352;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=71;PP=2022;ReadPosRankSum=-0.659;SC=CCATGTCAGCGTCATCAGGAA;SOR=0.714;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=324;TCF=175;TCR=149;TR=151;WE=45444046;WS=45444028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:191,161:0.46:352
chr1	45446651	rs188855420	T	C	1365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.431;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=22;PP=897;ReadPosRankSum=0.459;SC=TCAAATCTCCTAAAAGTTTTA;SOR=0.887;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=118;TCF=74;TCR=44;TR=59;WE=45446659;WS=45446641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,64:0.49:131
chr1	45469176	rs12749251	A	T	1513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.521;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=24;PP=908;ReadPosRankSum=-1.649;SC=ACTCCTCCCAAGGGCTCATGT;SOR=0.559;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=115;TCF=76;TCR=39;TR=66;WE=45469184;WS=45469166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,69:0.57:121
chr1	45470130	rs7528534	T	C	563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=16;PP=445;SC=TGTGGCCTTTTAGCAGCAGAA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=45470138;WS=45470120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	45472798	.	TTGTGTG	T,TTG	936.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.14;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=18;NF=9,9;NR=11,11;PP=237,700;SC=CCTCGAGCAGTTGTGTGTGTG;SOR=1.051;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=30;TCF=11;TCR=19;TR=20,20;WE=45472811;WS=45472788;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.79,0.21:24
chr1	45474008	rs7541207	T	C	2089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQ=59.99;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=40;PP=1305;ReadPosRankSum=-0.644;SC=CATGGGTAGATAGACTGCAGC;SOR=0.695;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=182;TCF=101;TCR=81;TR=87;WE=45474016;WS=45473998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,99:0.48:206
chr1	45474157	rs2298006	G	A	1040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.790;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=22;PP=709;ReadPosRankSum=-0.635;SC=AGACACACAAGGCTCAATGTT;SOR=0.833;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=79;TCF=40;TCR=39;TR=43;WE=45474165;WS=45474147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,46:0.55:83
chr1	45474750	rs2275599	A	T	802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=2.614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.24;ReadPosRankSum=-1.761;SOR=1.154;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,21:0.48:44
chr1	45474755	rs2275598	C	G	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=2.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.55;ReadPosRankSum=-1.741;SOR=1.189;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,24:0.49:49
chr1	45475566	rs6429552	A	G	1301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=4;PP=1046;SC=ACCCTGTTTTAGTCCTGGCCT;SOR=3.967;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=34;TCR=4;TR=38;WE=45475574;WS=45475556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	45476489	rs3806405	A	G	908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=17;PP=640;ReadPosRankSum=-0.309;SC=TACAGGGGAGAAAAGGCAAAC;SOR=0.670;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=89;TCF=53;TCR=36;TR=40;WE=45476497;WS=45476479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,43:0.44:98
chr1	45476663	rs2298005	G	A	1131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=2.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.51;ReadPosRankSum=0.277;SOR=0.471;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,52:0.44:119
chr1	45479772	rs11211066	G	T	2817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.038;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=63;PP=1656;ReadPosRankSum=0.979;SC=GAAATAGGCTGGGATTTGGTC;SOR=0.572;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=253;TCF=120;TCR=133;TR=124;WE=45479780;WS=45479762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,133:0.49:269
chr1	45479874	rs6698485	G	T	2224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=53;PP=1562;SC=GTGATCTAGCGGAGCAGCCAA;SOR=1.863;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=22;TCR=53;TR=75;WE=45479882;WS=45479864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr1	45504720	rs7551698	G	C	1599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.377;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=33;PP=768;ReadPosRankSum=0.871;SC=GGTTTGTGATGGTTGTGGTTC;SOR=0.504;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=157;TCF=88;TCR=69;TR=68;WE=45504728;WS=45504710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,82:0.47:176
chr1	45524213	rs3738246	C	T	885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=4;PP=695;SC=ATGGCAAGGGCTCATAAACAC;SOR=3.477;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=29;WE=45524221;WS=45524203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	45671966	rs4454584	A	G	1467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=31;PP=892;ReadPosRankSum=0.335;SC=ACTGCCGCTTAGCCGGAGAGA;SOR=0.745;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=138;TCF=71;TCR=67;TR=63;WE=45671974;WS=45671956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,69:0.45:155
chr1	45796269	rs3219493	G	C	4826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=82;PP=2804;SC=GGCACTTTTTGCAAAAGAGAT;SOR=1.060;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=153;TCF=71;TCR=82;TR=153;WE=45796277;WS=45796259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr1	45798555	rs3219487	T	C	9776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=368;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=170;NR=162;PP=2965;SC=GTCCCTCTATTGTTCCTATTT;SOR=0.704;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=332;TCF=170;TCR=162;TR=332;WE=45798563;WS=45798545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,368:1.00:368
chr1	45800156	rs3219484	C	T	1836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.718;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=40;PP=953;ReadPosRankSum=1.423;SC=CCACTTCCCACGGCTGCTCGT;SOR=0.938;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=140;TCF=75;TCR=65;TR=75;WE=45800164;WS=45800146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,89:0.54:166
chr1	45805566	rs3219468	G	C	7349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.73;SOR=0.730;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,275:1.00:275
chr1	45810865	rs17853159	G	A	3468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.141;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=74;PP=1980;ReadPosRankSum=-0.329;SC=GGCAAGGAACGCCACCGGCGA;SOR=0.482;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=284;TCF=135;TCR=149;TR=149;WE=45810873;WS=45810855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,166:0.53:311
chr1	46032311	rs2229540	A	G	802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.838;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=14;PP=429;ReadPosRankSum=-1.435;SC=ATCTACGGCAATGAGCCTGAG;SOR=0.740;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=64;TCF=36;TCR=28;TR=33;WE=46032319;WS=46032301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,39:0.49:80
chr1	46050004	rs57257530	TTCGG	T	2564.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=30;PP=1567;SC=GCTGTCGCTGTTCGGGAAGGC;SOR=2.187;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=30;WE=46050015;WS=46049994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr1	46057144	rs2991981	A	G	89.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.26;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	46065998	rs3014211	T	C	6234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=120;NR=87;PP=2965;SC=AGATAATGAGTATTTTCATCA;SOR=0.999;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=207;TCF=120;TCR=87;TR=207;WE=46066006;WS=46065975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr1	46078630	rs2050376	A	G	182.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=117;SC=TGAAGGTCTGACCCATAGACT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=46078638;WS=46078620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	46078854	rs2230658	A	G	1729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=30;NR=28;PP=969;SC=CTGAAGGCTCAGAAGAGGATG;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=30;TCR=28;TR=58;WE=46078862;WS=46078844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	46078884	rs2230659	C	T	1844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=27;PP=1021;SC=ATGATAAGACCGAAGAAATGC;SOR=0.722;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=60;TCF=32;TCR=28;TR=59;WE=46078892;WS=46078874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	46080947	rs1972410	A	C	7628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=134;NR=130;PP=2965;SC=TTCTTTTTTGAGCCATTACTA;SOR=0.707;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=265;TCF=135;TCR=130;TR=264;WE=46080955;WS=46080937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,286:1.00:286
chr1	46081940	rs2356581	T	A	2365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=18;PP=1616;SC=GGTGATGGGTTCCTGTTACAA;SOR=2.219;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=60;TCR=18;TR=78;WE=46081948;WS=46081930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr1	46081960	rs2253862	C	T	3585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=40;PP=2355;SC=AGGCTGTGGGCGGCCTGGGTT;SOR=1.452;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=119;TCF=79;TCR=40;TR=119;WE=46081968;WS=46081950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr1	46082431	rs2991988	C	A	5808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=120;PP=2965;SC=CATTTTTAATCCCTTTCCTAT;SOR=1.153;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=200;TCF=80;TCR=120;TR=200;WE=46082439;WS=46082421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr1	46083706	rs41310432	C	G	4100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=72;NR=67;PP=2315;SC=TAGGCTCACTCATGCCCAGGT;SOR=0.759;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=72;TCR=67;TR=139;WE=46083714;WS=46083696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr1	46085852	rs2275085	C	T	599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=1;PP=488;SC=TGCTTCTAGACCCAATGTCAG;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=46085860;WS=46085844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	46085879	rs2275086	C	G	1453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=6;PP=1088;SC=GAGTAGTAAACCTGTAGGTCT;SOR=3.306;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=46;TCF=40;TCR=6;TR=45;WE=46085887;WS=46085869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	46086077	rs3014246	C	T	3564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=53;PP=1981;SC=GGTGAGGAAGCTGGCTTCCAG;SOR=0.859;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=104;TCF=51;TCR=53;TR=104;WE=46086085;WS=46086067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr1	46086329	rs11590549	C	T	1795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=14;PP=1276;SC=AAAGGCTGGCCGTTAGCCATA;SOR=2.157;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=44;TCR=14;TR=58;WE=46086337;WS=46086319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	46086913	rs3014245	C	T	748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=6;PP=603;SC=TAAGCCTCAACTGTGGCAGAG;SOR=2.124;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=23;WE=46086921;WS=46086903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	46087577	rs3014242	G	A	7454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=129;NR=125;PP=2965;SC=TGGTGGCAGCGGTGGTGCCAC;SOR=0.738;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=255;TCF=129;TCR=126;TR=254;WE=46087585;WS=46087567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,274:1.00:274
chr1	46087879	rs3014241	A	G	5299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=111;NR=56;PP=2965;SC=GGGAGAGATAAGTGGGATGGG;SOR=1.371;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=167;TCF=111;TCR=56;TR=167;WE=46087887;WS=46087869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr1	46089225	rs3014240	C	G	7419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=138;NR=96;PP=2965;SC=GTAGGTAGCTCTACCTCCTCT;SOR=1.077;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=237;TCF=139;TCR=98;TR=234;WE=46089233;WS=46089215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr1	46095130	.	C	CG	229	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;FR=1.0000;HP=12;HapScore=2;MGOF=31;MMLQ=15;MQ=62.68;NF=13;NR=0;PP=229;QD=18.0;SC=AGGTAATCCCCCCCCCCCCCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=13;WE=46095138;WS=46095122;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,13:0.87:15
chr1	46124663	rs6671802	A	G	4852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=115;NR=52;PP=2919;SC=AAACCCTCTCATATTTGAGAA;SOR=1.437;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=167;TCF=115;TCR=52;TR=167;WE=46124671;WS=46124653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr1	46347879	rs10890362	T	A	457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.93;SOR=1.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	46424964	rs4460582	G	A	2540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=26;PP=1542;SC=GCGGCCCGTGGAATGGTGTCC;SOR=1.511;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=57;TCR=26;TR=83;WE=46424972;WS=46424954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr1	46485562	rs946528	C	T	229.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=219;SC=TGAGGGGATGCGGCAGGGAGA;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=46485570;WS=46485552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	46487560	rs946524	A	G	7181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=157;NR=96;PP=2965;SC=CTGTAAAACCAAAGATGCCAG;SOR=1.256;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=254;TCF=157;TCR=97;TR=253;WE=46487568;WS=46487550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,272:1.00:272
chr1	46491635	rs785478	C	T	933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=24;PP=674;SC=AGTTCTCTAGCCCCCCGACCA;SOR=3.126;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=29;WE=46491643;WS=46491625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	46495024	rs3795318	G	A	1969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=25;PP=1154;SC=GCTTTCAGGGGCTCCAGGCTG;SOR=1.209;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=43;TCR=25;TR=68;WE=46495032;WS=46495014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr1	46496709	rs925524	A	G	3934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=65;PP=2246;SC=TGTCTGAGTCATCCCACACAG;SOR=0.734;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=69;TCR=65;TR=134;WE=46496717;WS=46496699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr1	46498375	rs1622208	A	G	3396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=62;PP=2034;SC=CGGAGGTGGTAGAGCTGATCC;SOR=1.133;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=49;TCR=62;TR=111;WE=46498383;WS=46498365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr1	46500613	rs17855317	T	C	9272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=162;NR=143;PP=2965;SC=AGCTAGCCACTTCTCGCAAGC;SOR=0.754;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=306;TCF=162;TCR=144;TR=305;WE=46500621;WS=46500603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,338:1.00:338
chr1	46501359	rs34070850	A	G	3256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=342;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=74;PP=2174;ReadPosRankSum=-0.477;SC=CCAAGCAGAAAGGCAACCATG;SOR=0.713;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=314;TCF=158;TCR=156;TR=145;WE=46501367;WS=46501349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:187,154:0.45:341
chr1	46511487	rs2297883	G	C	972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=0;PP=805;SC=ATGGGTCCTCGTTACTGTACA;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=29;WE=46511495;WS=46511477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	46521517	rs785468	G	A	5395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=100;NR=77;PP=2755;SC=CAGGTTTGATGCTATTCATTT;SOR=0.734;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=178;TCF=100;TCR=78;TR=177;WE=46521532;WS=46521507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr1	46521559	rs785467	A	T	5349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=90;PP=2950;SC=CCAAAGCTTGATTCTTCAAAT;SOR=0.886;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=183;TCF=92;TCR=91;TR=182;WE=46521567;WS=46521549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr1	46597496	.	CT	C	430.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.931;ClippingRankSum=0.000;DP=314;ExcessHet=3.0103;FS=10.265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.70;ReadPosRankSum=1.868;SOR=0.705;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:203,51:0.20:254
chr1	46598273	rs1707303	A	C	3045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=62;NR=41;PP=1844;SC=AACCAACCCGACCGCACCAAC;SOR=0.990;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=62;TCR=41;TR=103;WE=46598281;WS=46598263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr1	46641741	rs11211261	A	G	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.172;NF=6;NR=1;PP=115;ReadPosRankSum=-0.289;SC=TAGAGATGGGATTTCACCGTG;SOR=0.169;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=7;WE=46641749;WS=46641738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr1	46650118	rs2234270	C	T	902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=21;PP=510;ReadPosRankSum=-1.154;SC=TCCCCTCGCCCTTGACACCAG;SOR=0.657;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=75;TCF=30;TCR=45;TR=36;WE=46650126;WS=46650108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,42:0.49:85
chr1	46655158	rs6659553	T	C	3735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=59;PP=2108;SC=ACCCCCACCATCAGGAAGTGG;SOR=0.722;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=65;TCR=59;TR=124;WE=46655166;WS=46655148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr1	46658328	rs2292484	A	G	885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.840;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=15;PP=336;ReadPosRankSum=-3.671;SC=CAGAGATGCTAGAATTGCTGG;SOR=0.479;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=80;TCF=35;TCR=45;TR=28;WE=46658336;WS=46658318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,32:0.37:86
chr1	46658343	rs2292485	G	A	684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=9;PP=182;ReadPosRankSum=0.734;SC=TGCTGGAGCTGGGTCTCAGGA;SOR=0.620;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=29;TCR=35;TR=17;WE=46658351;WS=46658333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,18:0.27:67
chr1	46659104	rs7527668	T	C	1319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.939;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=31;PP=773;ReadPosRankSum=0.841;SC=TCACTTTCCCTCTGCCCACCT;SOR=0.448;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=81;TCF=26;TCR=55;TR=48;WE=46659112;WS=46659094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,57:0.61:93
chr1	46659363	rs7527935	T	C	1842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.579;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=40;PP=1262;ReadPosRankSum=-1.498;SC=TCAACTCAGGTTCCCCTGTGT;SOR=0.669;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=154;TCF=79;TCR=75;TR=80;WE=46659371;WS=46659353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,83:0.52:161
chr1	46660295	rs2292487	T	C	2821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.472;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=62;PP=1665;ReadPosRankSum=1.523;SC=GGGCAGGTGATTTAGAATGTT;SOR=0.735;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=215;TCF=104;TCR=111;TR=120;WE=46660303;WS=46660285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,134:0.56:241
chr1	46739974	.	AT	A	109.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=0.000;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQRankSum=1.306;QD=3.33;ReadPosRankSum=1.861;SOR=0.673;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,10:0.30:33
chr1	46806393	rs41293273	T	C	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=35;ReadPosRankSum=0.110;SC=GTATTTCCTTTCCCTTTTTTC;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=4;WE=46806401;WS=46806383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr1	46806429	rs41293275	A	T	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=3.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.174;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=232;ReadPosRankSum=-0.923;SC=GGTGGCGCTCACCACCTCCCC;SOR=2.437;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=11;WE=46806437;WS=46806419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr1	46806480	rs17361749	C	T	863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=8;PP=499;ReadPosRankSum=0.157;SC=GTCGGAATTACCCCGTGGAGC;SOR=0.808;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=64;TCF=46;TCR=18;TR=33;WE=46806488;WS=46806470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,40:0.54:74
chr1	46806550	rs41293277	C	T	2279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FS=3.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.80;ReadPosRankSum=1.609;SOR=0.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,112:0.53:211
chr1	46806703	rs10489769	A	G	624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=17;PP=308;ReadPosRankSum=0.885;SC=ACTCCACGGAACGTCCTTAGG;SOR=0.644;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=24;TCR=46;TR=26;WE=46806711;WS=46806693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,32:0.41:78
chr1	46810405	rs79697925	TG	T	710.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.106;HP=7;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=490;ReadPosRankSum=0.381;SC=GGCTCTGAGGTGGGGGTCAGG;SOR=1.359;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=40;TCF=22;TCR=18;TR=17;WE=46810413;WS=46810395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,29:0.44:66
chr1	46810670	rs17361763	T	C	2336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.058;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=45;PP=1623;ReadPosRankSum=-0.380;SC=GTGCCAAGGATTTTGTGAATG;SOR=0.842;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=250;TCF=135;TCR=115;TR=102;WE=46810678;WS=46810660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,112:0.41:273
chr1	46810842	rs6684274	C	T	565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.153;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=18;PP=377;ReadPosRankSum=0.475;SC=ATGACTGGAGCGGTCCTGAGT;SOR=1.384;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=42;TCF=10;TCR=32;TR=22;WE=46810850;WS=46810832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,24:0.52:46
chr1	46812444	rs17357676	A	G	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=127;ReadPosRankSum=-0.580;SC=GTATAGATGAATGAATAAGTG;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=9;WE=46812452;WS=46812434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr1	46812519	rs17361791	A	G	853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.745;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=11;PP=507;ReadPosRankSum=1.421;SC=CAGAGGGCATAGACTTGGTGG;SOR=0.936;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=86;TCF=56;TCR=30;TR=37;WE=46812527;WS=46812509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,41:0.44:94
chr1	46818442	rs41294478	G	A	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.12;ReadPosRankSum=0.413;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr1	46818452	rs17413701	A	G	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.05;ReadPosRankSum=0.216;SOR=1.302;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr1	46818479	rs7515598	C	T	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=143;ReadPosRankSum=0.050;SC=ACTCCATCAGCGCCATTGCTG;SOR=0.972;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=11;WE=46818487;WS=46818469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr1	46818508	rs7529674	T	C	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.109;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=327;ReadPosRankSum=-0.950;SC=TTTCATTGGGTCATGGCCTCT;SOR=0.883;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=48;TCF=37;TCR=11;TR=22;WE=46818516;WS=46818498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,26:0.47:55
chr1	46826587	rs55887761	C	A	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=186;ReadPosRankSum=-1.472;SC=AGACCATAACCCACACAAGAA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=13;WE=46826595;WS=46826577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr1	46827214	rs324414	A	C	1117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=4;PP=796;SC=GCTCACTAGTAACTGCTTCTG;SOR=3.026;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=33;WE=46827222;WS=46827204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	46827485	rs1053624	C	T	1663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.163;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=31;PP=772;ReadPosRankSum=1.014;SC=ATTTTGGCCCCATGTACTTCT;SOR=0.791;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=151;TCF=82;TCR=69;TR=70;WE=46827493;WS=46827475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,84:0.48:176
chr1	46860237	rs72890727	G	A	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=12;PP=338;ReadPosRankSum=-0.072;SC=AGCGTAGTGGGATGGGCGCGG;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=54;TCF=29;TCR=25;TR=27;WE=46860245;WS=46860227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,32:0.52:62
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chr1	47013180	rs10890404	A	G	3435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.421;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.96;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=71;PP=2181;ReadPosRankSum=0.261;SC=GCGTCCGGCGACACCTTGCTC;SOR=0.723;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=274;TCF=144;TCR=130;TR=148;WE=47013188;WS=47013170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,159:0.54:295
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chr1	47016761	rs61997191	C	T	1299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.214;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=30;PP=730;ReadPosRankSum=2.179;SC=CCAATAAAGACACCGCCCATG;SOR=0.823;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=161;TCF=87;TCR=74;TR=66;WE=47016769;WS=47016751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,69:0.40:172
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chr1	47060078	rs7556307	G	A	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=65;ReadPosRankSum=-1.047;SC=TATACACGCAGCAATCACAGG;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=6;WE=47060086;WS=47060068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr1	47075932	rs3818323	C	T	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.398;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=126;ReadPosRankSum=1.502;SC=AAGCTCTGCTCAACTTTTCCC;SOR=1.927;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=9;WE=47075940;WS=47075922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr1	47078637	rs4660947	T	C	8643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=150;NR=145;PP=2965;SC=CCATGAGCAATGCCATATAGC;SOR=0.718;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=297;TCF=151;TCR=146;TR=295;WE=47078645;WS=47078627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,326:1.00:326
chr1	47080665	rs11211328	C	T	2705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.880;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=60;PP=2962;ReadPosRankSum=1.453;SC=TCATCTCATCCATCCCGACTC;SOR=0.770;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=268;TCF=138;TCR=130;TR=123;WE=47080687;WS=47080655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,133:0.44:301
chr1	47080679	rs6671527	G	A	2696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.610;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=55;PP=2962;ReadPosRankSum=0.018;SC=CCGACTCTTCGACTTCTCACC;SOR=0.861;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=249;TCF=133;TCR=116;TR=121;WE=47080687;WS=47080655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,130:0.47:278
chr1	47080741	rs12029680	C	T	1469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.408;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=41;PP=870;ReadPosRankSum=-0.374;SC=GAGATTTCTGCGCTTCATTTG;SOR=0.332;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=142;TCF=51;TCR=91;TR=70;WE=47080749;WS=47080731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,74:0.48:155
chr1	47099346	rs723333	C	A	2157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=21;PP=1239;SC=ACACATTTATCCATGGACACA;SOR=1.639;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=48;TCR=21;TR=69;WE=47099354;WS=47099336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr1	47108828	rs736188	T	C	2231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=27;PP=1343;SC=TTCAGTGCCATGAGGTAAATC;SOR=1.525;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=52;TCR=27;TR=79;WE=47108836;WS=47108818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr1	47109089	rs1745377	A	G	805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=22;PP=547;ReadPosRankSum=1.497;SC=TTGGGTGGCTAGTGAGTTGGA;SOR=0.704;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=86;TCF=35;TCR=51;TR=37;WE=47109097;WS=47109079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,39:0.42:93
chr1	47110712	rs1258053	C	T	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=55;ReadPosRankSum=0.480;SC=AATTCATCTGCGCCACAATAA;SOR=0.804;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=6;WE=47110720;WS=47110702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr1	47110766	rs3215990	G	GC	1297.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=9;PP=738;SC=TTGAGCCTCAGCAAGGGTTTC;SOR=1.244;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=8;TCR=9;TR=17;WE=47110774;WS=47110756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	47118067	rs620913	G	A	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=2.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=94;ReadPosRankSum=-1.372;SC=TACAATCAACGTGTGAGCATC;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=7;WE=47118075;WS=47118057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr1	47118096	rs2289446	C	A	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=305;ReadPosRankSum=-0.547;SC=GTAAACAGAGCACTATAACTT;SOR=0.892;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=47;TCF=42;TCR=5;TR=18;WE=47118104;WS=47118086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,19:0.36:53
chr1	47118168	rs2289447	C	T	4011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.007;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=35;PP=1220;ReadPosRankSum=-1.268;SC=ACATGTGAGACAGTATGGAAT;SOR=0.766;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=219;TCF=138;TCR=81;TR=96;WE=47118176;WS=47118158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,108:0.44:244
chr1	47118189	rs620431	G	T	4825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.627;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=52;PP=1843;ReadPosRankSum=-1.119;SC=ATGACGTGATGGGCTGGAAAA;SOR=0.903;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=297;TCF=176;TCR=121;TR=133;WE=47118197;WS=47118177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:181,148:0.45:329
chr1	47124204	rs34308534	C	CA	405.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=408;ReadPosRankSum=-1.489;SC=GTCAAGGACACAAAGTTCATA;SOR=0.906;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=13;WE=47124212;WS=47124194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
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chr1	47130873	rs594118	A	G	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.318;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=121;ReadPosRankSum=0.082;SC=GGGTGAGGGTAAGGAGGGTGA;SOR=1.302;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=41;TCF=30;TCR=11;TR=10;WE=47130881;WS=47130863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,10:0.24:42
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chr1	47138819	rs614486	T	G	5850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=530;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=126;NR=131;PP=2962;ReadPosRankSum=1.665;SC=TTCTGTGGGATTTGGACATCC;SOR=0.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=492;TCF=241;TCR=251;TR=257;WE=47138839;WS=47138809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:255,275:0.52:530
chr1	47139103	rs1025806	C	T	1973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=47;PP=1197;ReadPosRankSum=-0.120;SC=AGCTTCAATGCCAAGCCTTTT;SOR=0.687;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=201;TCF=90;TCR=111;TR=86;WE=47139111;WS=47139093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,98:0.43:229
chr1	47154272	rs2304745	C	T	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.623;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=115;ReadPosRankSum=-1.559;SC=ATTAGACAAGCAGGCCAGCAG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=7;WE=47154280;WS=47154262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr1	47155462	rs2241862	G	A	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.655;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=22;PP=477;ReadPosRankSum=-1.049;SC=CCCCCAGAATGCATCCACAGA;SOR=2.387;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=23;WE=47155470;WS=47155452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,22:0.76:29
chr1	47182206	rs3737731	C	T	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-1.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.129;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=41;ReadPosRankSum=1.946;SC=ATGCAATTATCTCCTTTAAAT;SOR=0.250;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=7;WE=47182214;WS=47182196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,9:0.29:31
chr1	47351052	rs5003005	A	T	241.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.86;QD=30.22;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	47395973	rs1126743	G	A	5327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=102;PP=2965;SC=ATTGTTTCCCGATGCAGTTCC;SOR=1.362;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=169;TCF=67;TCR=102;TR=169;WE=47395981;WS=47395963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr1	47398743	rs3890011	G	C	5722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=96;PP=2965;SC=TGGAAACAGAGAGAAGACCAA;SOR=0.815;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=188;TCF=91;TCR=97;TR=187;WE=47398751;WS=47398733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr1	47400059	rs71500102	A	G	2096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.89;QD=29.95;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	47401424	rs2269231	A	T	519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.73;QD=28.88;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	47402487	.	TTGTGTG	T,TTG	3946.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.29;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;NF=9,9;NR=45,45;PP=218,2006;SC=GAATGTGTGTTTGTGTGTGTG;SOR=0.733;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=89;TCF=9;TCR=80;TR=54,54;WE=47402502;WS=47402473;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.20,0.79:102
chr1	47571943	rs10534549	CT	C	286.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQRankSum=1.075;QD=5.03;ReadPosRankSum=0.269;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,26:0.46:57
chr1	47611598	rs2405599	T	C	1704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.240;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-10.358;NF=31;NR=42;PP=1246;ReadPosRankSum=0.463;SC=TGGCCCAACCTAGAGGTATGT;SOR=0.832;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=156;TCF=70;TCR=86;TR=73;WE=47611606;WS=47611588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,75:0.46:162
chr1	47652870	rs10549554	CCTTG	C	928.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.80;ReadPosRankSum=-1.532;SOR=1.418;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,23:0.64:36
chr1	47652875	rs10549555	AGC	A	950.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-2.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=2.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.38;ReadPosRankSum=-2.054;SOR=1.308;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,24:0.62:39
chr1	47652879	rs60327556	T	A	960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=1.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.43;ReadPosRankSum=-1.016;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,25:0.61:41
chr1	47655816	rs2248907	A	G	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.839;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=146;ReadPosRankSum=-0.103;SC=GAGCTGCCAGACCTGGCCTCC;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=8;WE=47655824;WS=47655806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr1	47685455	rs927462	T	C	3711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=68;PP=2210;SC=GGGCCGTGTGTTTGGGCGCGG;SOR=1.001;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=59;TCR=68;TR=127;WE=47685463;WS=47685445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr1	47717189	rs2758735	A	G	3827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=358;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.241;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=88;PP=2360;ReadPosRankSum=-0.872;SC=CAAGCTGTTCAGGTATGGACC;SOR=0.646;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=326;TCF=165;TCR=161;TR=178;WE=47717197;WS=47717179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,193:0.54:358
chr1	47735280	rs2742104	T	C	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=211;ReadPosRankSum=0.217;SC=GAAAGTAGGATGAAAGACTAA;SOR=0.927;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=14;WE=47735288;WS=47735270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
chr1	47753405	rs12125261	G	A	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.249;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=185;ReadPosRankSum=-1.304;SC=TAGATGAAAAGTAGCTCTGAA;SOR=1.489;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=14;WE=47753413;WS=47753395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,16:0.40:40
chr1	47765490	rs9436838	T	C	58.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=50;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GGCATATAAATTGACTGGACA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=47765498;WS=47765480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr1	47767141	rs6689687	C	A	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=98;ReadPosRankSum=-0.374;SC=TATTGTAAATCATTCTCAAAT;SOR=0.922;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=7;WE=47767149;WS=47767131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr1	47767914	rs3125630	G	A	1784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.541;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=29;PP=1065;ReadPosRankSum=-1.522;SC=ACCTTCGTCTGCTGTCAGAGA;SOR=0.773;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=169;TCF=105;TCR=64;TR=80;WE=47767922;WS=47767904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,88:0.45:194
chr1	47770441	rs3122615	A	C	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=64;ReadPosRankSum=-1.854;SC=CTGAGGGGAGATTCTAAAAGA;SOR=0.340;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=5;WE=47770449;WS=47770437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
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chr1	47799639	rs7543016	G	C	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=2.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.53;ReadPosRankSum=1.113;SOR=1.151;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,22:0.42:52
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chr1	47841109	rs2253511	T	C	216.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=6;PP=72;SC=TGGCTCATGCTTGTAATCCCA;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=47841117;WS=47841094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	47842431	rs3125648	G	A	2486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=34;PP=1575;SC=TAAACCTGAAGGCATCCTTGA;SOR=0.807;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=49;TCR=34;TR=83;WE=47842439;WS=47842421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr1	47883019	rs6666370	T	C	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.97;ReadPosRankSum=1.981;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr1	47883024	rs2820969	A	G	245.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.11;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	47904668	rs3046924	T	TCCGCAC	3704.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=20;PP=1449;SC=CGGCCCCGCATCCGCACCCGC;SOR=0.976;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=42;TCF=9;TCR=33;TR=28;WE=47904676;WS=47904658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr1	47904909	rs2405913	G	C	2166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=44;NR=23;PP=1028;SC=AGCCTTCTACGCGGCGTCCCT;SOR=0.961;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=44;TCR=23;TR=67;WE=47904917;WS=47904899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr1	48260116	rs3738314	C	T	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.486;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=221;ReadPosRankSum=1.717;SC=CCTTGGATCTCGGTGCTGCTG;SOR=2.985;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=11;WE=48260124;WS=48260106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr1	48459907	rs3814006	C	T	3506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=392;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.368;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=71;PP=2096;ReadPosRankSum=-0.207;SC=CCCAGTTGCCCGCGATGGCAT;SOR=0.731;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=365;TCF=202;TCR=163;TR=166;WE=48459915;WS=48459897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:217,175:0.45:392
chr1	48697733	rs212991	T	G	6359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=123;PP=2965;SC=CTTTCCACATTCTTCGGGACC;SOR=1.099;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=216;TCF=93;TCR=123;TR=216;WE=48697741;WS=48697723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr1	48697928	rs1004833	T	C	247.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=4;PP=189;SC=CATTCTGGGATTGTGACTGGA;SOR=0.892;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=9;TCF=5;TCR=4;TR=9;WE=48697936;WS=48697920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	48707838	rs705430	A	G	1695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=8;NR=47;PP=1371;SC=GTCCAGCCTCATTTGCCTCAG;SOR=3.383;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=8;TCR=47;TR=55;WE=48707846;WS=48707828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	48902977	rs2261674	G	C	1036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=27;PP=869;SC=GTACAAATACGAGAATTATAC;SOR=3.477;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=34;WE=48902985;WS=48902967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	49052933	rs2803277	T	C	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.969;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=157;ReadPosRankSum=1.726;SC=TCAGCTTCACTGTCTGAAGAG;SOR=0.180;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=12;WE=49052941;WS=49052923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr1	49056695	rs7543402	T	C	901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.826;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.855;NF=15;NR=26;PP=497;ReadPosRankSum=-1.120;SC=AAGTCTGGGCTGTAGAGCTTG;SOR=1.083;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=90;TCF=40;TCR=50;TR=41;WE=49056703;WS=49056685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,46:0.47:97
chr1	49056766	.	C	CCCG	174.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=8.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.17;MQRankSum=1.383;QD=17.47;ReadPosRankSum=0.316;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr1	49056772	rs71501782	A	C	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=17.75;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr1	49100332	rs319983	C	T	1344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=34;PP=846;ReadPosRankSum=-1.901;SC=AGCTTCTCACCTGTCAAAATA;SOR=0.778;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=92;TCF=36;TCR=56;TR=55;WE=49100340;WS=49100322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,60:0.61:99
chr1	49113319	rs319953	T	C	1803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.520;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=38;PP=821;ReadPosRankSum=-0.057;SC=TTCATATTGTTGTACGGAGAT;SOR=0.719;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=175;TCF=95;TCR=80;TR=81;WE=49113327;WS=49113309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,92:0.46:199
chr1	49128720	rs320007	C	T	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=172;ReadPosRankSum=0.860;SC=CATTAAATTTCCATTTAAGAT;SOR=0.662;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=76;TCF=54;TCR=22;TR=20;WE=49128728;WS=49128710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,26:0.31:84
chr1	49193394	rs1385152	G	T	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.838;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.23;ReadPosRankSum=0.518;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr1	49224584	rs1128934	G	T	3459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=38;PP=2149;SC=CTGCCAAGCCGCAGGAGCAGC;SOR=1.197;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=73;TCR=38;TR=111;WE=49224592;WS=49224574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr1	49332724	rs6703833	A	C	5004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=111;NR=57;PP=2959;ReadPosRankSum=1.913;SC=GGGGAGGAGAAGAATCATTCA;SOR=1.325;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=170;TCF=112;TCR=58;TR=168;WE=49332732;WS=49332714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,187:0.99:189
chr1	49332969	rs61785986	A	G	1147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=29;PP=818;SC=TTAGCAGGTCAGGGCGGACAA;SOR=2.554;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=8;TCR=29;TR=37;WE=49332977;WS=49332959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	49711281	rs7528510	C	T	310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=228;SC=TAAGTCTGATCCCCAGCTGTA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=49711289;WS=49711271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	50331725	rs10788920	T	C	1782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=43;PP=1262;SC=GGAGACAAGATTAGAGAAAGA;SOR=2.157;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=14;TCR=43;TR=57;WE=50331733;WS=50331715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	50575675	rs148666401	CTG	C	155.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=9.268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=2.175;QD=1.97;ReadPosRankSum=-0.864;SOR=0.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,15:0.19:79
chr1	50610037	.	TA	T	41.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=0.000;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.65;ReadPosRankSum=-0.789;SOR=0.538;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,11:0.17:64
chr1	50661411	rs2480683	C	T	6445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=113;NR=111;PP=2965;SC=ACCAGTCCCCCAACCGGCGCT;SOR=0.770;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=224;TCF=113;TCR=111;TR=224;WE=50661419;WS=50661401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr1	50666515	rs2494876	C	T	2718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=28;PP=1764;SC=TTCTGCTTGTCCCCCCAGGTT;SOR=1.538;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=61;TCR=28;TR=89;WE=50666523;WS=50666505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr1	50884778	rs2746610	G	A	716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.57;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	50956163	rs143167159	AAAGG	A	1095.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.12;ReadPosRankSum=-0.123;SOR=0.622;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,31:0.48:64
chr1	50956212	rs149582773	C	CAAATACAGTGG	8616.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=34;PP=2900;SC=GCTTCAGTATCAAATACAACC;SOR=1.732;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=98;TCF=52;TCR=46;TR=73;WE=50956220;WS=50956202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr1	50957509	rs1149790	A	T	2775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=25;NR=62;PP=1667;SC=TTTGACATATAACTTTTTTTT;SOR=2.165;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=25;TCR=62;TR=87;WE=50957517;WS=50957499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr1	51078223	rs74738164	G	A	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=390;ReadPosRankSum=-0.242;SC=ATAGTGAGATGCCATTTACCC;SOR=0.648;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=24;WE=51078231;WS=51078213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,25:0.68:37
chr1	51439506	rs66462949	T	A	583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=2;PP=467;ReadPosRankSum=-1.130;SC=GCAGATATTTTAAAATATCTC;SOR=1.040;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=40;TCF=36;TCR=4;TR=24;WE=51439514;WS=51439496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,24:0.57:42
chr1	51567930	rs72692268	A	G	2118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.521;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=51;PP=1267;ReadPosRankSum=2.624;SC=AGGTATGAGAAGCTGGGTCAT;SOR=0.758;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=186;TCF=81;TCR=105;TR=91;WE=51567938;WS=51567920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,101:0.50:203
chr1	51754726	rs12734773	C	T	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.985;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=18;PP=390;ReadPosRankSum=0.037;SC=GGGAGGTTCCCACTACCCAGC;SOR=0.497;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=23;TCR=40;TR=29;WE=51754734;WS=51754716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,30:0.44:68
chr1	51761602	rs2297182	G	T	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.265;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=102;ReadPosRankSum=-0.119;SC=GGGAGGACACGCAGGGGGGGC;SOR=0.223;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=7;WE=51761610;WS=51761592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr1	51767352	rs41287290	G	A	2592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=64;PP=1655;ReadPosRankSum=0.587;SC=ACATGTGGTGGAACTGCTTCC;SOR=0.690;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=216;TCF=94;TCR=122;TR=116;WE=51767360;WS=51767342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,122:0.52:235
chr1	51767432	rs41287292	C	T	496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=332;ReadPosRankSum=-0.019;SC=GTCAGCCTGACGGGTGCCCAC;SOR=0.588;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=11;TCR=36;TR=21;WE=51767440;WS=51767422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,23:0.44:52
chr1	51767912	rs375305601	GC	G	252.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=15.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.37;ReadPosRankSum=1.344;SOR=0.074;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,19:0.25:75
chr1	51777748	rs7521849	A	G	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=6;PP=188;ReadPosRankSum=-0.247;SC=GGAGCTGGCCACCTGGGCTTA;SOR=0.693;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=29;TCF=18;TCR=11;TR=14;WE=51777756;WS=51777738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr1	51808567	rs12072333	C	T	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.419;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.43;ReadPosRankSum=0.705;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr1	51826921	rs17567	T	C	3380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.415;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=80;PP=2156;ReadPosRankSum=0.194;SC=GATCACAAAATATTTCAGGAT;SOR=0.726;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=281;TCF=133;TCR=148;TR=149;WE=51826929;WS=51826911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,161:0.53:306
chr1	51831570	rs77742485	T	C	1658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=3.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.866;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=18;PP=1092;ReadPosRankSum=-1.489;SC=AGGAGGATTGTTCTTTTGGTG;SOR=1.019;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=144;TCF=98;TCR=46;TR=65;WE=51831578;WS=51831560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,75:0.45:167
chr1	51866405	rs76946509	A	G	72.85	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=66.83;MQRankSum=1.282;QD=14.57;ReadPosRankSum=1.282;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr1	51869004	rs74898383	T	C	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=1.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.63;ReadPosRankSum=0.053;SOR=0.467;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,20:0.38:52
chr1	51871438	rs10529789	G	GACTC	406.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=478;ReadPosRankSum=-0.964;SC=TTTGGATTAGGACTCTCTGCT;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=10;WE=51871446;WS=51871428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr1	51873951	rs1065754	G	A	1927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.985;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=44;PP=1031;ReadPosRankSum=-2.694;SC=ATTCTTCTTCGTAAGTGGAGA;SOR=0.548;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=147;TCF=61;TCR=86;TR=78;WE=51873959;WS=51873941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,90:0.54:167
chr1	51905949	.	CTG	C	368.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.661;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=2.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.69;ReadPosRankSum=1.078;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr1	51905956	.	T	C	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.965;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=4.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.88;ReadPosRankSum=1.627;SOR=1.472;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr1	51913564	rs79437178	T	C	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=256;ReadPosRankSum=0.142;SC=AAATGCCATGTACTTTGTTAA;SOR=0.113;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=8;WE=51913580;WS=51913554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr1	51913572	rs112593986	T	TA	194.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=277;ReadPosRankSum=0.543;SC=TGTACTTTGTTAAAAAAAAAT;SOR=0.793;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=9;WE=51913580;WS=51913554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr1	51924159	rs56167325	G	A	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.63;ReadPosRankSum=0.447;SOR=0.791;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr1	51924226	rs6672300	C	T	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=4;PP=77;ReadPosRankSum=1.373;SC=CTGGCAAACACGGCGAAACGC;SOR=0.802;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=8;WE=51924234;WS=51924216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr1	51926978	rs72696157	C	G	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.774;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=3;PP=20;ReadPosRankSum=0.310;SC=CACTTCAGCCCAGGAGTTTGA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=3;WE=51926986;WS=51926968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,3:0.23:13
chr1	51929504	rs5774101	TA	T	408.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.496;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=298;ReadPosRankSum=-0.418;SC=AGTTAAATAATAAGAGAAAAG;SOR=1.206;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=11;WE=51929512;WS=51929494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,15:0.39:38
chr1	51931089	rs56326822	C	T	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.356;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=289;ReadPosRankSum=1.213;SC=AATATGTTCACACAAAATGCT;SOR=0.257;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=41;TCF=7;TCR=34;TR=21;WE=51931097;WS=51931079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,23:0.52:44
chr1	51938639	rs41292535	G	A	2728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=62;PP=1587;ReadPosRankSum=-1.162;SC=ATACAAATCCGTAAGTTGACA;SOR=0.667;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=256;TCF=126;TCR=130;TR=122;WE=51938647;WS=51938629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,136:0.46:293
chr1	51955827	rs60698990	G	A	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=175;ReadPosRankSum=-0.499;SC=GTCATTTTTAGGGGAGGGTTA;SOR=0.914;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=9;WE=51955835;WS=51955817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr1	51956050	rs60294217	T	A	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.303;NF=2;NR=14;PP=274;ReadPosRankSum=0.428;SC=AGCCTGACCATCATGGTGAAA;SOR=0.804;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=16;WE=51956058;WS=51956040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr1	51956065	rs60723428	A	G	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-1.226;NF=0;NR=10;PP=202;ReadPosRankSum=0.600;SC=GTGAAACCCCATCTCTACTAA;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=10;WE=51956073;WS=51956055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr1	52205661	.	CT	C	28	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5338;HP=12;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=28;QD=12.3333333333;SC=TTGGCATAATCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=3;WE=52205669;WS=52205654;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:2,3:0.60:5
chr1	52213864	rs11802463	A	C	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.99;ReadPosRankSum=-1.236;SOR=0.425;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr1	52227456	rs41302778	A	G	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=186;ReadPosRankSum=-0.330;SC=GGCCTTTAGGATTTTGAATCC;SOR=0.527;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=43;TCF=31;TCR=12;TR=16;WE=52227464;WS=52227446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,20:0.41:49
chr1	52248017	rs6678977	A	G	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.057;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=85;ReadPosRankSum=0.674;SC=TCAGCCCTGAATGAGGCACAC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=5;WE=52248025;WS=52248010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr1	52264064	rs1770791	A	G	2179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.29;ReadPosRankSum=-0.436;SOR=0.701;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,109:0.56:193
chr1	52266120	rs2842581	C	T	852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=12;PP=492;ReadPosRankSum=0.461;SC=GATTCAAACACGGATGAAAAT;SOR=0.734;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=83;TCF=59;TCR=24;TR=39;WE=52266128;WS=52266110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,42:0.46:92
chr1	52266242	rs8375	G	A	1802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.480;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=44;PP=1225;ReadPosRankSum=-0.024;SC=CCAAAGTCTCGGGCTTGATGA;SOR=0.898;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=170;TCF=81;TCR=89;TR=76;WE=52266250;WS=52266232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,87:0.44:197
chr1	52279650	rs2982846	T	G	4815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=77;PP=2923;SC=GAACAATGTCTACACCAGCTT;SOR=0.831;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=170;TCF=93;TCR=77;TR=170;WE=52279658;WS=52279640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr1	52289220	rs67976949	TGTATTAAGGTCAA	T	295.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=1;PP=670;ReadPosRankSum=-0.839;SC=TCCTTTACTTTGTATTAAGGT;SOR=0.657;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=2;WE=52289240;WS=52289210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr1	52290984	rs11205896	T	G	782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=19;PP=487;ReadPosRankSum=1.480;SC=CCATAGGATGTCCAGGTCTAG;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=74;TCF=37;TCR=37;TR=37;WE=52290992;WS=52290974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,39:0.50:78
chr1	52293570	rs2077725	G	A	4477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=95;PP=2635;SC=TGGCATTTCCGTTTTTGTTCA;SOR=1.668;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=145;TCF=50;TCR=95;TR=145;WE=52293578;WS=52293560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr1	52293638	rs706495	G	A	886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=24;PP=621;SC=TGGAGATTTAGTTCACAATCC;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=52293646;WS=52293628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	52306063	rs35723519	ATCT	A	1261.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.363;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.152;NF=9;NR=12;PP=839;ReadPosRankSum=0.112;SC=CTTCATCATCATCTTCTTCTT;SOR=1.132;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=46;TCF=14;TCR=32;TR=21;WE=52306073;WS=52306053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,35:0.54:65
chr1	52344414	rs736756	A	C	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=108;ReadPosRankSum=0.520;SC=CCCTCCCCCAACCCAGTCTCC;SOR=0.160;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=6;WE=52344422;WS=52344404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr1	52402856	rs10888741	T	G	631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=1;PP=477;SC=CTGAGGCCAGTAACCATGTCT;SOR=4.514;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=17;WE=52402864;WS=52402846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	52402956	rs10888742	G	A	5365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=114;NR=67;PP=2965;SC=AATGAATATGGGTCTCATACC;SOR=1.208;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=181;TCF=114;TCR=67;TR=181;WE=52402964;WS=52402946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr1	52489322	rs2783178	G	A	6279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=115;PP=2965;SC=CTGGTACATCGGGCCCTCTGG;SOR=1.241;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=194;TCF=79;TCR=115;TR=194;WE=52489330;WS=52489312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr1	52490418	rs4926906	C	T	562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=16;PP=439;SC=TGTCCTACCCCTTGTTAAGTC;SOR=2.948;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=19;WE=52490426;WS=52490408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	52517412	rs7529324	A	G	6992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=139;NR=105;PP=2965;SC=TTCTTAATGAAAACAGTAGAG;SOR=0.977;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=244;TCF=139;TCR=105;TR=244;WE=52517420;WS=52517402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr1	52520858	rs142834436	CACA	C	180.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.891;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.792;NF=0;NR=3;PP=105;ReadPosRankSum=-1.541;SC=CGCCGCTCAGCACAACACCTC;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=3;WE=52520868;WS=52520848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr1	52530736	rs138064927	CTG	C	734.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.924;NF=1;NR=13;PP=556;ReadPosRankSum=0.650;SC=CTTTGAAGGACTGTGGCACTT;SOR=0.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=14;WE=52530745;WS=52530726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr1	52732183	rs45465801	C	G	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=60;ReadPosRankSum=-2.450;SC=AATCACCTATCTCTTTAATAC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=4;WE=52732191;WS=52732182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr1	52820226	rs2820334	G	A	7039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=125;NR=115;PP=2965;SC=CATTCAGTGCGTATTGGCTCT;SOR=0.724;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=240;TCF=125;TCR=115;TR=240;WE=52820234;WS=52820216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,262:1.00:262
chr1	52838992	rs34521609	A	G	1380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.628;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=32;PP=773;ReadPosRankSum=0.913;SC=GGTCTCTGACATGGTGGGGTA;SOR=0.787;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=124;TCF=60;TCR=64;TR=59;WE=52839000;WS=52838982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,68:0.49:139
chr1	52903766	rs140427487	C	G	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=45;ReadPosRankSum=-1.270;SC=CTCAAATGAACATTTACCTTA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=5;WE=52903774;WS=52903756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,5:0.22:23
chr1	52912122	.	TA	T	101.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.577;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.91;ReadPosRankSum=1.132;SOR=0.409;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr1	52929608	rs41294514	T	A	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=192;ReadPosRankSum=-1.358;SC=ATATTTCAGCTACATTATGGG;SOR=0.512;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=10;WE=52929616;WS=52929598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr1	53068093	rs11205977	G	T	2399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=52;NR=26;PP=1269;SC=TGGTGGCGGCGACGGTGGCAG;SOR=1.255;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=52;TCR=26;TR=78;WE=53068101;WS=53068083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr1	53072454	rs1970951	T	C	7098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=132;NR=103;PP=2965;SC=CCCACCACTTTAACGTGCTCG;SOR=0.870;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=235;TCF=132;TCR=103;TR=235;WE=53072462;WS=53072444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr1	53073838	rs11590859	G	T	1267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.36;SOR=1.051;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	53192187	rs269298	C	T	138.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=3;PP=83;SC=CTGCTACGCTCCTAGCTTGAG;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=6;WE=53192195;WS=53192177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	53237526	rs1571979	G	A	1401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=38;PP=1021;SC=ATGAATGTCTGTAATATATGG;SOR=4.362;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=4;TCR=38;TR=42;WE=53237534;WS=53237516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	53245472	rs9661082	A	T	4077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=41;PP=2669;SC=ACACATGATAATTAGATAGAG;SOR=1.577;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=90;TCR=41;TR=131;WE=53245480;WS=53245462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr1	53250650	rs6588443	G	A	5012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=94;PP=2965;SC=TTGCTGCAGGGATGCCTGTCC;SOR=1.002;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=171;TCF=77;TCR=94;TR=171;WE=53250658;WS=53250640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr1	53271225	rs487453	T	C	1754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=40;PP=1005;SC=ATTTGTGGGTTGGGTGCAGTG;SOR=1.828;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=20;TCR=40;TR=60;WE=53271233;WS=53271215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	53535478	rs1288386	G	A	895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.57;ReadPosRankSum=0.873;SOR=0.540;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,44:0.67:66
chr1	53537266	rs1769316	G	A	3950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=397;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=102;PP=2330;ReadPosRankSum=0.364;SC=GGCTGGAGACGCTGAACCTGC;SOR=0.702;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=364;TCF=157;TCR=207;TR=181;WE=53537274;WS=53537256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:201,195:0.49:396
chr1	53537396	rs34107528	G	A	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.991;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=95;ReadPosRankSum=-0.009;SC=TTGGCCCTGCGGATCTTGGGG;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=6;WE=53537404;WS=53537386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr1	53543112	rs946590	C	G	933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=26;PP=731;SC=GCCCACATGGCCACAGGTGCT;SOR=5.353;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=28;WE=53543120;WS=53543102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	53543312	rs12745973	C	T	1287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=16;PP=865;ReadPosRankSum=-0.748;SC=TGACCTTGCCCTCGGCCCTCC;SOR=0.629;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=99;TCF=70;TCR=29;TR=52;WE=53543320;WS=53543302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,56:0.52:108
chr1	53544439	rs1288388	G	A	3545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=395;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.148;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=93;PP=2135;ReadPosRankSum=-0.370;SC=TCACCAGCCCGCAGGTGCACC;SOR=0.813;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=365;TCF=159;TCR=206;TR=161;WE=53544457;WS=53544429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:220,175:0.44:395
chr1	53544578	rs11206088	T	C	1084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=2.679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.42;ReadPosRankSum=0.970;SOR=0.468;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,53:0.56:95
chr1	53544597	rs1288389	T	C	1993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.56;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr1	53553702	rs1288400	A	G	993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.84;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	53553754	rs1288401	T	C	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=224;ReadPosRankSum=0.168;SC=CTCCTCATCCTGCTCCACTTG;SOR=0.732;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=40;TCR=21;TR=23;WE=53553762;WS=53553744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,28:0.40:70
chr1	53554533	rs35707549	A	AT	2003.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.638;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=13;PP=1251;ReadPosRankSum=-1.616;SC=CAGCCTCTGGATCTCACTGCT;SOR=0.782;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=71;TCF=33;TCR=38;TR=30;WE=53554541;WS=53554523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,66:0.47:141
chr1	53555783	rs1288403	A	C	2035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=29;NR=39;PP=1229;SC=CACAGTCCTGAAGCCCCATGG;SOR=1.164;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=29;TCR=39;TR=68;WE=53555791;WS=53555773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr1	53558270	rs1288406	A	G	2382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.060;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=46;PP=1615;ReadPosRankSum=1.243;SC=GCAGGATGCCACGGATGAAGA;SOR=0.843;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=255;TCF=154;TCR=101;TR=118;WE=53558278;WS=53558260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,121:0.44:277
chr1	53559310	rs11206091	T	C	626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.053;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=21;PP=500;ReadPosRankSum=-1.141;SC=ATGGCTGGCTTCCCAGCAGCC;SOR=0.139;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=42;TCF=2;TCR=40;TR=23;WE=53559318;WS=53559300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,23:0.56:41
chr1	53568980	rs2242274	G	A	720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.230;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=7;PP=462;ReadPosRankSum=1.286;SC=CTGGGGGCCCGGCTCCACGGC;SOR=1.074;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=28;WE=53568988;WS=53568970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,30:0.64:47
chr1	53571288	rs1288422	C	G	386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=268;SC=CCACCTCCAGCAGACAGCGTG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=53571296;WS=53571278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	53574123	rs1769289	C	T	633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=1;PP=460;SC=CCTTCCTTAACAGAAGTCCTA;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=53574131;WS=53574113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
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chr1	53676448	rs1799821	G	A	3569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=54;PP=2241;SC=CTCTACTGCCGTCCACTTTGA;SOR=0.838;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=120;TCF=65;TCR=55;TR=119;WE=53676456;WS=53676438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr1	53679229	rs1799822	A	G	654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.044;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=18;PP=425;ReadPosRankSum=-1.185;SC=CTTAGAAGACATGTTTGATGC;SOR=0.524;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=56;TCF=19;TCR=37;TR=28;WE=53679237;WS=53679219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,30:0.49:61
chr1	53681699	rs1134688	T	G	1665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.609;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=44;PP=1106;ReadPosRankSum=-0.585;SC=AGGCTGTCCCTGACTCCACAC;SOR=0.760;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=140;TCF=57;TCR=83;TR=73;WE=53681707;WS=53681689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,77:0.51:151
chr1	53683921	rs12140585	C	G	699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.829;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=19;PP=410;ReadPosRankSum=-0.814;SC=TCCATACCCTCGCCCCAGCCA;SOR=0.993;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=74;TCF=33;TCR=41;TR=33;WE=53683929;WS=53683911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,37:0.44:84
chr1	53684324	rs3736118	A	G	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=4.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.691;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=441;ReadPosRankSum=1.323;SC=TGAGGAAAATAAAAAAAGGGC;SOR=1.355;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=20;WE=53684332;WS=53684314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr1	53684525	rs436887	C	G	2829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=42;PP=1990;ReadPosRankSum=-0.992;SC=GGGGGTTGGGCGGGGAACAGT;SOR=0.769;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=112;TCF=70;TCR=42;TR=110;WE=53684533;WS=53684514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,113:0.97:116
chr1	53686383	rs1679913	C	G	124.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=3;PP=54;SC=TTCTGCGCGCCGCTGCTCGCC;SOR=1.981;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=53686391;WS=53686373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	53694388	rs2275087	T	C	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.968;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=177;ReadPosRankSum=-1.146;SC=TCCTCAAAAATAATTTGGGGT;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=9;WE=53694396;WS=53694378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr1	53699129	rs17192655	G	C	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.003;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=350;ReadPosRankSum=-0.255;SC=AGTGAGATAGGCAACAAAAGC;SOR=1.349;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=61;TCF=40;TCR=21;TR=24;WE=53699137;WS=53699119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,26:0.38:69
chr1	53712727	rs5174	C	T	5475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=113;PP=2965;SC=TAATGCCACTCGCTGGGGAGA;SOR=1.333;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=184;TCF=71;TCR=113;TR=184;WE=53712735;WS=53712717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr1	53716416	rs3737983	G	A	9018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=149;NR=160;PP=2965;SC=GCTCATCTTCGTCTTCTTCTT;SOR=0.817;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=309;TCF=149;TCR=160;TR=309;WE=53716424;WS=53716406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,340:1.00:340
chr1	53723190	rs869987	G	T	1290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=28;PP=831;SC=GTTGCCTAAGGTATTGCCTCT;SOR=1.251;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=17;TCR=28;TR=45;WE=53723198;WS=53723180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	53732315	rs2297660	G	T	1762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=39;PP=1174;SC=ATGGGCTCTTGCCAGCTGTCA;SOR=1.685;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=20;TCR=40;TR=59;WE=53732323;WS=53732305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr1	53736613	rs7542607	A	G	346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=0;PP=213;SC=GTGTGCGCACATGTACACGCC;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=53736621;WS=53736610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	53738183	rs7546246	A	G	2272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=17;PP=1569;SC=GGCCATGCATATAGCTGGTCT;SOR=2.272;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=56;TCR=17;TR=73;WE=53738191;WS=53738173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr1	53742506	rs56300220	A	G	1338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=21;PP=847;SC=CGGGGCCCGGACGGCCGCAGA;SOR=0.733;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=24;TCR=21;TR=45;WE=53742514;WS=53742496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	53755151	rs12035577	T	C	1404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.642;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=25;PP=932;ReadPosRankSum=0.681;SC=TTCAACTGGTTACCTCTCCTG;SOR=0.592;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=132;TCF=85;TCR=47;TR=64;WE=53755159;WS=53755141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,66:0.46:142
chr1	53792651	rs3820198	A	C	1358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=32;PP=782;ReadPosRankSum=-0.749;SC=CCTTTTCGCAATCCTTGGCCG;SOR=0.664;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=41;TCR=61;TR=54;WE=53792659;WS=53792641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,63:0.54:117
chr1	53793511	rs4926972	T	C	107.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.010;HP=1;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=-0.770;NF=8;NR=9;PP=177;ReadPosRankSum=0.569;SC=ATGCTGGAGCTGCAGCAGCAG;SOR=0.207;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=38;TCF=15;TCR=23;TR=17;WE=53793521;WS=53793501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,9:0.28:32
chr1	53974987	rs10749691	G	T	2959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=55;PP=1707;SC=CAGGGGCCGCGTTCACAAAGG;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=45;TCR=55;TR=100;WE=53974995;WS=53974977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr1	53990321	rs541224	C	T	399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=13;NR=2;PP=323;SC=AACGGACGAACGGATGGACGA;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=53990329;WS=53990311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	54258880	rs2273139	C	T	1248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.119;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=28;PP=726;ReadPosRankSum=-0.723;SC=CCATTCCCAACGCTATAACCA;SOR=0.698;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=132;TCF=69;TCR=63;TR=61;WE=54258888;WS=54258870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,65:0.46:141
chr1	54284814	rs12089209	C	T	766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.000;NF=15;NR=25;PP=555;ReadPosRankSum=0.149;SC=CTCAACATCACCTTAAAGCAA;SOR=0.767;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=74;TCF=29;TCR=45;TR=40;WE=54284822;WS=54284804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,41:0.51:80
chr1	54298297	rs72662336	T	C	1228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=29;PP=791;ReadPosRankSum=2.405;SC=TAGTAAAGGTTATTCAGTCAT;SOR=0.679;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=92;TCF=39;TCR=53;TR=51;WE=54298305;WS=54298287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,55:0.56:98
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chr1	54370306	rs2294512	G	A	1140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=18;PP=806;ReadPosRankSum=-1.059;SC=CTGTGTGTAGGGTCTCAGTTT;SOR=0.671;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=92;TCF=63;TCR=29;TR=51;WE=54370314;WS=54370296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,53:0.51:104
chr1	54375570	rs2235544	C	A	8414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=136;NR=144;PP=2965;SC=GAAATCCTTACAAGTTGGGAA;SOR=0.795;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=280;TCF=136;TCR=144;TR=280;WE=54375578;WS=54375560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,307:1.00:307
chr1	54375701	rs11206244	C	T	1000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=28;PP=671;ReadPosRankSum=1.928;SC=TTCTAGGTGACCAACGGGAGG;SOR=0.745;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=89;TCF=32;TCR=57;TR=43;WE=54375709;WS=54375691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,47:0.48:98
chr1	54389774	rs61674130	TAG	T	187.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=157;SC=AATTTAAAAATAGAGGTATAT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=54389783;WS=54389764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	54483792	rs116802374	G	T	1709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.470;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=26;PP=961;ReadPosRankSum=0.003;SC=TCATGTCTTCGGTTTCCTGCT;SOR=0.979;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=137;TCF=80;TCR=57;TR=69;WE=54483800;WS=54483782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,81:0.48:168
chr1	54514223	rs41294772	T	C	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=186;ReadPosRankSum=-0.357;SC=CTGTAAAATATTAACTGCTTA;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=12;WE=54514231;WS=54514213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr1	54605242	rs41294792	G	A	2097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.553;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.069;NF=45;NR=40;PP=1128;ReadPosRankSum=-1.387;SC=AGCGGGAGCCGTACCGTCCAG;SOR=0.733;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=159;TCF=83;TCR=76;TR=85;WE=54605250;WS=54605232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,97:0.54:178
chr1	54605271	rs144631287	T	C	1990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.166;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.474;NF=39;NR=42;PP=1016;ReadPosRankSum=1.072;SC=GTCCCGAGAGTGGGCAAGGGT;SOR=0.800;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=150;TCF=75;TCR=75;TR=81;WE=54605279;WS=54605261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,94:0.53:177
chr1	54605319	rs36013100	G	GC	6400.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=26;NR=65;PP=2305;SC=GACCATTCATGGGGGGGGCAG;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=27;TCR=67;TR=91;WE=54605327;WS=54605309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr1	54606804	rs3766465	C	T	6346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=124;NR=83;PP=2965;SC=CCACGGCCTCCGATGTTGAAG;SOR=1.028;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=207;TCF=124;TCR=83;TR=207;WE=54606812;WS=54606794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr1	54607051	rs671103	A	G	6908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=106;NR=112;PP=2965;SC=AGTTGTTGGGATACTCAGGAC;SOR=0.850;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=218;TCF=106;TCR=112;TR=218;WE=54607059;WS=54607041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,259:1.00:259
chr1	54607157	rs671539	G	A	1858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=35;PP=1063;SC=GTGGCTCCCAGTTTCCTCCCT;SOR=1.716;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=23;TCR=35;TR=58;WE=54607165;WS=54607147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	54618435	rs7528345	A	T	5965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=126;NR=71;PP=2965;SC=CTGGCTTCCCATGTAGAAACT;SOR=1.103;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=197;TCF=126;TCR=71;TR=197;WE=54618443;WS=54618425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr1	54637167	rs625643	T	C	685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=17;PP=380;SC=GAAGTGACGTTGGTAAACATG;SOR=2.670;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=22;WE=54637175;WS=54637157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	54644859	rs61738851	C	T	1721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.104;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=39;PP=925;ReadPosRankSum=1.624;SC=ATTCCAGAAACGGGCCTGCTC;SOR=0.788;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=181;TCF=92;TCR=89;TR=76;WE=54644867;WS=54644849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,86:0.43:198
chr1	54653291	rs61775225	C	T	978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.272;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=15;PP=653;ReadPosRankSum=0.266;SC=AGCTTCTCCACGGCATCTTGG;SOR=0.269;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=72;TCF=53;TCR=19;TR=45;WE=54653299;WS=54653281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,46:0.62:74
chr1	54661150	rs946448	C	T	1388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.076;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=26;PP=859;ReadPosRankSum=0.090;SC=TGCCTCCCACCTTGCCAGATC;SOR=0.808;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=135;TCF=72;TCR=63;TR=59;WE=54661158;WS=54661133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,67:0.46:147
chr1	54681920	rs13571	G	C	3961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=64;NR=59;PP=2138;SC=GACCTGGACTGTAACGAGGGT;SOR=0.763;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=123;TCF=64;TCR=59;TR=123;WE=54681928;WS=54681910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr1	54686274	rs41309151	C	T	1193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=20;PP=659;ReadPosRankSum=0.084;SC=GACAGCTGCCCCCTCCACAGA;SOR=0.690;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=115;TCF=72;TCR=43;TR=54;WE=54686282;WS=54686264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,59:0.48:123
chr1	54686374	rs612711	T	C	1526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.175;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=28;PP=1044;ReadPosRankSum=0.253;SC=GCAGCGGAACTTGAGGGCCTC;SOR=0.822;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=166;TCF=94;TCR=72;TR=69;WE=54686382;WS=54686364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,74:0.40:183
chr1	54690954	rs3088379	T	C	3024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.96;MQRankSum=-1.063;NF=57;NR=70;PP=2039;ReadPosRankSum=0.831;SC=GAACACAGAATTTGCAGGCCC;SOR=1.004;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=273;TCF=132;TCR=141;TR=127;WE=54690973;WS=54690944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,138:0.47:296
chr1	54692854	rs372535521	AG	A	137.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=10.257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.72;ReadPosRankSum=-0.120;SOR=0.066;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,10:0.27:37
chr1	54694214	rs2297026	G	A	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.090;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=253;ReadPosRankSum=-0.152;SC=GTCTCCCCTCGTCCTGGGCTC;SOR=1.358;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=35;TCF=4;TCR=31;TR=15;WE=54694222;WS=54694204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,17:0.44:39
chr1	54871566	.	ACCGC	A	362.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.30;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	54871709	.	T	TCGCCGC	2060.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=15;PP=1031;SC=GCGCCGAGCCTCGCCGCCGCC;SOR=0.823;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=17;WE=54871717;WS=54871699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	55014099	rs299874	C	T	2423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=43;PP=1327;SC=TTAACTCAGACGCTCTGCATC;SOR=1.071;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=36;TCR=43;TR=79;WE=55014107;WS=55014089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr1	55014160	rs299872	C	T	898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=20;PP=593;SC=AAGGAGAAATCGCAGAACCCC;SOR=1.681;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=30;WE=55014168;WS=55014150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	55058160	rs17394626	G	T	2382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.135;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=44;PP=1480;ReadPosRankSum=-0.645;SC=AGTATCTGAGGCCCCTGTTCC;SOR=0.845;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=228;TCF=136;TCR=92;TR=111;WE=55058168;WS=55058150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,120:0.47:253
chr1	55066759	rs1655534	T	C	434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=43;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=2;PP=216;SC=AGTGTGTGTGTGCATACATGT;SOR=1.981;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=55066767;WS=55066753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	55066789	rs10533779	CAT	C	457.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=49;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=3;PP=368;SC=TGTGTGCATACATGTGTGTGT;SOR=1.802;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=8;WE=55066798;WS=55066779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	55066813	rs74310754	C	CAT	686.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=3;PP=496;SC=TGTGTGCATACGTGTGTGTGT;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=10;WE=55066821;WS=55066803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	55069986	rs746503	T	C	2203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=45;NR=20;PP=1049;SC=AGGAAGGGGGTGGGGTAGTGG;SOR=1.193;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=45;TCR=20;TR=65;WE=55069994;WS=55069976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr1	55072726	rs1616691	T	C	636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=1;PP=519;SC=GGCACTGCAGTGTGGCAGGGC;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=55072734;WS=55072716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	55074840	rs1617287	T	A	4228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=94;PP=2962;SC=CCCCAAGGACTCACATACAGT;SOR=1.924;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=135;TCF=41;TCR=94;TR=135;WE=55074848;WS=55074830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr1	55075452	rs1368883	G	A	3682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.96;NF=78;NR=48;PP=2210;SC=TGCGGGCTCCGCTATTTGCAA;SOR=1.098;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=78;TCR=48;TR=126;WE=55075460;WS=55075442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr1	55078046	rs1655528	T	C	616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=2;PP=453;SC=GCATGAGCACTGGCAGGGGTT;SOR=3.160;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=55078054;WS=55078036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	55080612	rs112970628	G	GGTGTGT,GGTGT	1103.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=2.410;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.658;NF=1,1;NR=32,32;PP=109,919;ReadPosRankSum=0.423;SC=AAGCAGAGCGGGTGTGTGTGT;SOR=0.223;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=56;TCF=1;TCR=55;TR=33,33;WE=55080620;WS=55080602;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.84:45
chr1	55080627	.	GCA	G	54.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.745;ClippingRankSum=0.000;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.17;MQRankSum=-0.586;QD=1.27;ReadPosRankSum=0.543;SOR=1.450;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,7:0.16:43
chr1	55080629	rs1702015	A	G	1065.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=2.466;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.10;MQRankSum=0.511;QD=25.38;ReadPosRankSum=-0.625;SOR=0.252;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,35:0.83:42
chr1	55080635	rs1655525	G	A	1853.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;QD=46.34;SOR=3.193;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	55085499	rs11206396	T	C	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5006;FS=4.027;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=181;ReadPosRankSum=0.181;SC=TCTCTATCCCTTGCCCTGGCC;SOR=2.670;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=10;WE=55085507;WS=55085489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr1	55100328	rs6588520	T	C	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.835;NF=10;NR=0;PP=152;ReadPosRankSum=-0.826;SC=AAAATAATAATTTGGGGTAGA;SOR=0.616;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=10;WE=55100336;WS=55100318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr1	55118566	rs1655520	C	G	4462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=87;NR=63;PP=2745;SC=TGGAGAGAAGCGGGCACTGGC;SOR=0.892;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=150;TCF=87;TCR=63;TR=150;WE=55118574;WS=55118556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr1	55119515	rs1655519	T	G	4300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=402;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.521;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=96;PP=2912;ReadPosRankSum=1.534;SC=TGGCTCCAGCTATGGTATCAG;SOR=0.753;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=371;TCF=187;TCR=184;TR=192;WE=55119523;WS=55119505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:196,206:0.51:402
chr1	55119546	rs1655518	A	G	11014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=409;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=186;NR=184;PP=2965;SC=AGCACCCATGAGCCCAACTCC;SOR=0.708;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=370;TCF=186;TCR=184;TR=370;WE=55119554;WS=55119536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,409:1.00:409
chr1	55130931	rs2078273	C	T	748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.971;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=20;PP=394;ReadPosRankSum=-0.258;SC=TCCTGCCCAACCCCTAGCTGA;SOR=0.481;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=66;TCF=21;TCR=45;TR=32;WE=55130939;WS=55130921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,37:0.50:74
chr1	55130946	rs6703113	G	C	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=13;PP=257;ReadPosRankSum=-0.072;SC=AGCTGACTGTGCTGGGATACT;SOR=0.693;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=47;TCF=16;TCR=31;TR=21;WE=55130954;WS=55130936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,25:0.47:53
chr1	55130972	rs471724	C	T	792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=14;PP=434;SC=CCTGCCAACCCCCTACCCCCC;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=9;TCR=14;TR=23;WE=55130980;WS=55130962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	55134379	rs627095	C	T	1555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=7;PP=1043;SC=CCACCCCAAGCTCCCCTTGTG;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=40;TCR=7;TR=47;WE=55134387;WS=55134369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	55134487	rs478513	G	A	3166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.820;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=67;PP=1997;ReadPosRankSum=-3.035;SC=GGGCTCAGTGGGTCTCTCACT;SOR=0.597;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=296;TCF=163;TCR=133;TR=143;WE=55134495;WS=55134477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,158:0.49:325
chr1	55136067	rs2251719	T	G	495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=1;PP=358;SC=CACTTGAGGGTATGCTGGCTG;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=55136075;WS=55136059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	55136529	rs480963	T	C	1464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.119;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=28;PP=646;ReadPosRankSum=-0.578;SC=AACGTGTGTGTGCACAGCGTG;SOR=0.568;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=126;TCF=74;TCR=52;TR=63;WE=55136537;WS=55136519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,73:0.52:141
chr1	55138673	rs564400	C	T	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.812;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.797;NF=13;NR=1;PP=167;ReadPosRankSum=1.013;SC=GTCTTAATTCCCCCTCCTCCC;SOR=1.739;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=14;WE=55138681;WS=55138663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
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chr1	55139741	rs570218	A	G	2832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=46;PP=1669;SC=CTCATCCTTCACATTGGGGAT;SOR=0.712;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=51;TCR=46;TR=97;WE=55139749;WS=55139731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
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chr1	55167773	rs646356	T	A	2956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=48;PP=1609;SC=GCACGAGAGGTCGTGCGCTCC;SOR=0.747;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=98;TCF=50;TCR=48;TR=97;WE=55167781;WS=55167763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr1	55174819	rs12028701	C	T	2184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=51;PP=1412;SC=CAGTGGGTAACAGGGAAAGGG;SOR=1.639;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=26;TCR=51;TR=77;WE=55174827;WS=55174809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr1	55174882	rs145713883	TTTTG	T	563.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=449;SC=TGTACTAGTTTTTTGTTTGTT;SOR=2.985;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=10;WE=55174893;WS=55174872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	55182300	rs1147990	T	A	3581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=58;PP=1839;SC=CCTATTTATGTCGAGAGCGCC;SOR=0.814;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=61;TCR=58;TR=119;WE=55182308;WS=55182290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr1	55188331	.	G	C	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.136;ClippingRankSum=0.000;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=365;ReadPosRankSum=1.598;SC=GAATCCTAAGGGTTCTGGGTT;SOR=0.818;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=50;TCF=39;TCR=11;TR=26;WE=55188339;WS=55188321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,27:0.49:55
chr1	55197149	rs3815226	T	C	7701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=137;NR=124;PP=2965;SC=TGTTTCTGTCTTTAACCCAGG;SOR=0.728;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=262;TCF=137;TCR=125;TR=261;WE=55197157;WS=55197139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,289:1.00:289
chr1	55247518	rs3815225	C	A	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=52;ReadPosRankSum=-0.110;SC=TCCCGCCCCACGCTTGCTTTA;SOR=0.527;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=6;WE=55247526;WS=55247508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr1	55250684	rs2286202	A	G	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.484;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=113;ReadPosRankSum=0.494;SC=TCTCTTATGAAATCTTACTGT;SOR=2.636;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=6;WE=55250692;WS=55250674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr1	55251689	rs586462	T	C	2189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=52;NR=22;PP=1443;SC=GCCAGTTGAGTTCTGGATCTC;SOR=1.734;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=75;TCF=53;TCR=22;TR=74;WE=55251697;WS=55251679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr1	55253346	rs2269999	G	A	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=7;PP=219;ReadPosRankSum=-0.125;SC=TTGGCAGGGGGCAGAGGCTGC;SOR=0.543;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=42;TCF=28;TCR=14;TR=19;WE=55253354;WS=55253336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,20:0.44:45
chr1	55253575	rs665118	T	C	1342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=26;PP=803;SC=TGCCCAGGCCTGTGGTGGTGG;SOR=0.952;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=22;TCR=26;TR=48;WE=55253583;WS=55253565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	55253594	rs2269998	G	A	567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=11;PP=381;ReadPosRankSum=2.437;SC=GGGGGGTGGCGGTTTGGGGAG;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=44;TCF=23;TCR=21;TR=24;WE=55253602;WS=55253584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,25:0.54:46
chr1	55266797	rs671108	G	C	8996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=347;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=133;NR=177;PP=2965;ReadPosRankSum=1.479;SC=TCGTCGATGAGGGCGTCTAGA;SOR=1.004;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=313;TCF=134;TCR=179;TR=310;WE=55266805;WS=55266787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,343:0.99:345
chr1	55273422	rs671022	A	T	1185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=20;PP=751;SC=TGTCCATTGCAGCTGCTCTGT;SOR=1.292;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=15;TCR=20;TR=35;WE=55273430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	55277599	rs600499	T	C	5625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=103;NR=82;PP=2965;SC=CCCCCGGCCTTATCAGGTACC;SOR=0.742;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=185;TCF=103;TCR=82;TR=185;WE=55277607;WS=55277589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr1	55279345	rs149536795	CCCGGCCT	C	441.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=4;NR=1;PP=280;SC=TTGAGGCTGGCCCGGCCTCCG;SOR=2.494;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=5;WE=55279359;WS=55279335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	55279688	rs602458	G	A	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.617;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=88;ReadPosRankSum=0.433;SC=CTCTCGGAGGGCAGCTCTCCT;SOR=0.350;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=10;WE=55279696;WS=55279678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr1	55307501	rs41297871	A	G	9548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=164;NR=159;PP=2965;SC=TTACTAAGGGAAAGTGCCCTC;SOR=0.716;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=324;TCF=165;TCR=159;TR=323;WE=55307509;WS=55307491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,354:1.00:354
chr1	55307640	rs59138759	C	T	1453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=39;PP=1109;SC=AGTGGGGTGTCTTAGAGAAAG;SOR=3.080;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=8;TCR=39;TR=47;WE=55307648;WS=55307630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	55318108	rs667222	C	T	1158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=31;PP=634;ReadPosRankSum=1.363;SC=ACACGGAACGCGAGGCGTGAG;SOR=0.654;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=99;TCF=31;TCR=68;TR=45;WE=55318116;WS=55318098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,55:0.45:122
chr1	55319008	rs631749	T	C	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.236;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=222;ReadPosRankSum=1.266;SC=GTTGATAGGCTTGGGGCTCCT;SOR=0.122;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=36;TCF=31;TCR=5;TR=16;WE=55319016;WS=55318998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,21:0.51:41
chr1	55319902	rs718265	A	G	2007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.511;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=49;PP=1363;ReadPosRankSum=0.627;SC=CAAAGGGGATAATGTCCTGGA;SOR=0.643;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=188;TCF=88;TCR=100;TR=92;WE=55319910;WS=55319892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,96:0.47:206
chr1	55330966	rs611057	T	C	1246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=7;PP=813;SC=TACAGAAACCTAAGCCTCACC;SOR=2.531;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=36;WE=55330974;WS=55330956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	55336950	rs608458	C	G	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;BaseQRankSum=2.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=123;ReadPosRankSum=-1.755;SC=GGTCAGGATACGGGAACCGGC;SOR=0.260;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=8;WE=55336958;WS=55336940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr1	55446664	rs2253467	G	C	956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=1.373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.26;ReadPosRankSum=-0.071;SOR=0.450;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,24:0.53:45
chr1	55446671	rs2253466	C	T	1052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=1.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.80;ReadPosRankSum=0.034;SOR=0.430;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,30:0.54:56
chr1	55446697	rs2253465	G	A	1095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.912;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=15;PP=629;ReadPosRankSum=-0.928;SC=ACCTGCGCCCGGCTCCCTGCG;SOR=0.423;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=88;TCF=60;TCR=28;TR=47;WE=55446705;WS=55446687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,53:0.57:93
chr1	55457710	rs2500326	G	A	1963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.732;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=50;PP=1311;ReadPosRankSum=-0.589;SC=CCGTTTCTGCGGAGACGACAC;SOR=0.913;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=155;TCF=68;TCR=87;TR=87;WE=55457718;WS=55457700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,89:0.54:166
chr1	55457815	rs2495513	C	T	720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.408;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=19;PP=419;ReadPosRankSum=1.349;SC=ACAAAAATGCCGTGCCTTCTC;SOR=0.260;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=39;TCF=11;TCR=28;TR=28;WE=55457823;WS=55457805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,31:0.72:43
chr1	55464743	rs2500340	T	C	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.976;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=289;ReadPosRankSum=1.295;SC=CTTGAAGCCTTGAGTTGCAGC;SOR=2.910;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=40;TCF=30;TCR=10;TR=15;WE=55464751;WS=55464733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,15:0.37:41
chr1	55464790	rs2500341	C	G	751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.766;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=12;PP=456;ReadPosRankSum=-1.246;SC=AAGCCTGTCTCGGTGTTTAGG;SOR=0.782;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=89;TCF=55;TCR=34;TR=35;WE=55464798;WS=55464780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,39:0.39:99
chr1	55473043	rs6687801	G	A	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.995;HP=4;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=279;ReadPosRankSum=1.289;SC=GGACACTGGGGGTAAGGAGAG;SOR=1.714;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=47;TCF=13;TCR=34;TR=18;WE=55473051;WS=55473033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,19:0.45:42
chr1	55474325	rs6682884	A	C	2169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.525;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=47;PP=1163;ReadPosRankSum=0.803;SC=CGTAGCTTCTAGTCTGGAACT;SOR=0.586;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=231;TCF=130;TCR=101;TR=102;WE=55474333;WS=55474315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,111:0.44:253
chr1	55474476	rs4339899	C	G	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-3.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.058;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=196;ReadPosRankSum=0.861;SC=TTAGTGGACTCTTGTTTTTCC;SOR=0.089;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=11;WE=55474484;WS=55474466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr1	55505732	rs2495482	A	G	1706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=25;NR=33;PP=892;SC=GGGTGTAGGGATGGGAGGCCG;SOR=1.376;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=25;TCR=33;TR=58;WE=55505740;WS=55505722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	55516781	rs599037	G	T	4659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=56;PP=2864;SC=GGGAATTTGTGACCGAAGCCA;SOR=1.289;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=102;TCR=56;TR=158;WE=55516789;WS=55516771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr1	55518166	rs625619	G	A	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.188;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=10;PP=302;ReadPosRankSum=-1.105;SC=ACCCCAGAGCGTTGCAGCTGT;SOR=1.008;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=33;TCF=18;TCR=15;TR=17;WE=55518174;WS=55518156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr1	55518190	rs45597632	AC	A	318.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=6;PP=418;ReadPosRankSum=-0.205;SC=CCTGGGTTGCACCCCCCCCAG;SOR=0.612;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=25;TCF=12;TCR=13;TR=11;WE=55518206;WS=55518180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr1	55518198	rs7552350	C	A	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=366;ReadPosRankSum=0.557;SC=GCACCCCCCCCAGCTGTCACT;SOR=0.782;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=28;TCF=16;TCR=12;TR=12;WE=55518206;WS=55518180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr1	55518316	rs2483205	C	T	2967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=45;PP=1797;SC=TTGTGTTCGTCGAGCAGGCCA;SOR=0.888;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=57;TCR=45;TR=102;WE=55518324;WS=55518306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr1	55518467	rs2495477	A	G	1027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=22;PP=669;ReadPosRankSum=-0.388;SC=CCTCATAGGTAAGTGATGGCC;SOR=0.674;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=71;TCF=37;TCR=34;TR=44;WE=55518475;WS=55518457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,47:0.60:78
chr1	55518528	rs494198	C	A	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=146;ReadPosRankSum=0.624;SC=GTGGCTTGGGCTGGGCCCAGG;SOR=0.627;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=32;TCF=10;TCR=22;TR=13;WE=55518536;WS=55518518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr1	55523033	rs509504	A	G	4648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=82;NR=74;PP=2780;SC=CCAATGCCCAAGACCAGCCGG;SOR=0.728;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=156;TCF=82;TCR=74;TR=156;WE=55523041;WS=55523012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr1	55524197	rs540796	A	G	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.11;ReadPosRankSum=-2.270;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr1	55524237	rs562556	G	A	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=3.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.71;ReadPosRankSum=0.559;SOR=0.598;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
chr1	55524339	.	CGTGTGTGTGTGTGT	C	300	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;FR=0.9990;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=0;NR=1;PP=300;QD=303.0;SC=ACCCCTCCTTCGTGTGTGTGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=1;WE=55524360;WS=55524329;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,1:0.33:3
chr1	55525400	rs483462	G	A	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=51;ReadPosRankSum=0.741;SC=CCCACTGCCCGCGAGGCTTGG;SOR=0.941;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=6;WE=55525408;WS=55525390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr1	55527323	rs630431	G	A	612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.739;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=372;ReadPosRankSum=0.784;SC=ATACCGCCATGCATCAGGGTG;SOR=1.633;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=48;TCF=13;TCR=35;TR=24;WE=55527331;WS=55527313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,27:0.53:51
chr1	55529187	rs505151	G	A	4557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=79;PP=2555;SC=ACCAGCGAAGGGGCCGTGACA;SOR=0.935;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=156;TCF=77;TCR=79;TR=156;WE=55529195;WS=55529177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr1	55537966	rs17410238	G	A	2864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.692;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=65;PP=1618;ReadPosRankSum=0.689;SC=TTTAGACCACGCAAAAACAAG;SOR=0.680;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=228;TCF=121;TCR=107;TR=130;WE=55537974;WS=55537956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,142:0.54:264
chr1	55538385	rs654674	T	C	788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.946;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=10;PP=467;ReadPosRankSum=-0.328;SC=TATTCAGTTCTAGAGATTTTT;SOR=0.489;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=68;TCF=49;TCR=19;TR=33;WE=55538393;WS=55538375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,37:0.50:74
chr1	55538462	rs17410294	C	T	2380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=41;PP=1382;ReadPosRankSum=-1.051;SC=CAGTTACCTTCTTCTGTAGCC;SOR=0.683;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=208;TCF=124;TCR=84;TR=104;WE=55538470;WS=55538452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,116:0.51:228
chr1	55541174	rs487230	A	G	1002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.581;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=26;PP=634;ReadPosRankSum=-0.286;SC=GACTCGCTCTACTTGTATAGG;SOR=1.017;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=93;TCF=41;TCR=52;TR=43;WE=55541182;WS=55541164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,47:0.44:107
chr1	55545466	.	T	TGAGTACTCTCACAGAGTACTCACACA	265.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.334;ClippingRankSum=-0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=17.72;ReadPosRankSum=-0.749;SOR=0.346;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr1	55545475	.	A	T	87	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=11;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=1;NR=2;PP=87;QD=40.5904041824;SC=CTGAGTACTCACACACTGAGT;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=3;WE=55545488;WS=55545465;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr1	55545479	.	ACT	A	93	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=11;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=93;QD=40.6666666667;SC=GTACTCACACACTGAGTACTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=3;WE=55545488;WS=55545465;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr1	55545484	rs74650614	G	A	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.86;ReadPosRankSum=-1.016;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr1	55546895	rs683880	T	C	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=332;ReadPosRankSum=1.374;SC=TAGCAAGTAGTCGAATGAGAA;SOR=1.220;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=15;WE=55546903;WS=55546886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr1	55555285	rs548852	G	A	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=399;ReadPosRankSum=-0.313;SC=TTAATTAAAAGACTCCAACAC;SOR=0.534;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=43;TCF=34;TCR=9;TR=24;WE=55555293;WS=55555275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,25:0.56:45
chr1	55557859	rs34673217	A	ATT	475.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.471;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=790;ReadPosRankSum=1.826;SC=ATTATTACACAGTTACGAACT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=12;WE=55557872;WS=55557849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr1	55557864	rs3736992	C	T	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.669;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=717;ReadPosRankSum=1.149;SC=TACACAGTTACGAACTAAATT;SOR=2.215;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=12;WE=55557872;WS=55557849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr1	55558661	rs585203	A	G	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=22;ReadPosRankSum=0.852;SC=ATTTCTAATGATATGTAAAAA;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=3;WE=55558669;WS=55558651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr1	55560796	rs503495	T	C	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=117;ReadPosRankSum=-1.783;SC=GGATTTATTTTCTTTTTGGAA;SOR=0.321;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=7;WE=55560804;WS=55560788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr1	55562125	rs580485	G	T	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=3.719;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=186;ReadPosRankSum=-0.139;SC=TATAGAAAACGATAAATAAAA;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=9;WE=55562133;WS=55562115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr1	55566411	rs67540253	TTAGTC	T	355.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=303;ReadPosRankSum=0.544;SC=TGGCAAGAGATTAGTCTAAAG;SOR=0.804;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=7;WE=55566423;WS=55566401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr1	55567143	rs1165282	T	C	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.274;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=127;ReadPosRankSum=0.649;SC=ACTAAAGAATTGCAAGTTATG;SOR=0.078;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=7;WE=55567151;WS=55567133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr1	55567410	rs615652	A	G	837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.921;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=12;PP=400;ReadPosRankSum=-1.317;SC=AGCAGAGGAGAAGAATGAGCA;SOR=0.495;SbPval=0.09;Source=Platypus;TC=96;TCF=46;TCR=50;TR=35;WE=55567418;WS=55567400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,43:0.38:112
chr1	55572867	rs594226	G	A	1488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.415;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=18;PP=893;ReadPosRankSum=-1.334;SC=GGCAATAACCGAGCACTGAAG;SOR=0.831;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=122;TCF=83;TCR=39;TR=62;WE=55572875;WS=55572857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,69:0.51:135
chr1	55575670	rs534741	A	C	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.224;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=138;ReadPosRankSum=-0.191;SC=ATGACTGGTTATGTAACAGAA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=7;WE=55575678;WS=55575661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr1	55609728	rs374324790	CT	C	41.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.32;ReadPosRankSum=-0.986;SOR=0.602;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr1	55614036	rs34030121	CAT	C	349.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-1.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=252;ReadPosRankSum=-0.307;SC=CATCAATAAACATAAAGATAG;SOR=0.610;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=7;WE=55614045;WS=55614026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr1	55619422	rs1165230	G	A	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=32;ReadPosRankSum=0.385;SC=TAGACATCAAGTTTAATATGA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=3;WE=55619430;WS=55619416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr1	55622563	.	C	T	1188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.604;ClippingRankSum=0.000;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=21;PP=738;ReadPosRankSum=0.278;SC=TCACCCTTTTCGCTCTCCTGT;SOR=0.739;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=145;TCF=89;TCR=56;TR=56;WE=55622571;WS=55622553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,59:0.39:151
chr1	55638075	rs1165222	G	A	2021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.207;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=31;PP=1108;ReadPosRankSum=-0.884;SC=CAGGAGACCAGTGGGAATTGG;SOR=0.585;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=156;TCF=102;TCR=54;TR=84;WE=55638083;WS=55638065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,95:0.53:178
chr1	55643837	rs11350615	TA	T	754.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.734;NF=1;NR=20;PP=737;ReadPosRankSum=0.294;SC=AAAAAGCAAATAAAACTAATT;SOR=0.516;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=21;WE=55643845;WS=55643827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,28:0.68:41
chr1	56977819	rs3738570	G	A	955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.116;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=26;PP=559;ReadPosRankSum=-1.204;SC=GGGCCTGCAGGTATAGCTGGA;SOR=0.361;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=88;TCF=32;TCR=56;TR=44;WE=56977827;WS=56977809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,47:0.51:93
chr1	57002613	rs11583161	G	A	1947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.510;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=39;PP=2665;ReadPosRankSum=1.761;SC=CCATAGCAGAGTCTGGACACT;SOR=0.646;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=183;TCF=104;TCR=79;TR=89;WE=57002635;WS=57002603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,97:0.47:205
chr1	57002627	rs1136164	C	T	2119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=42;PP=2665;ReadPosRankSum=0.351;SC=GGACACTTACCGCGAGGATGG;SOR=0.657;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=185;TCF=103;TCR=82;TR=93;WE=57002635;WS=57002603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,103:0.50:208
chr1	57185818	rs857141	A	G	2111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=30;PP=1490;SC=AGAATGAAATATTATGAAAGA;SOR=1.061;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=44;TCR=30;TR=74;WE=57185826;WS=57185808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr1	57209695	rs1156845	T	C	810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.700;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=12;PP=521;ReadPosRankSum=1.334;SC=CTTCCTATACTTACCACTACT;SOR=0.527;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=93;TCF=66;TCR=27;TR=38;WE=57209703;WS=57209685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,42:0.41:102
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chr1	57219631	rs11404547	G	GA	385.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=369;SC=GAGATACCAGGAAAAAAATGA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=13;WE=57219639;WS=57219621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
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chr1	57224460	rs857103	G	C	3969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=62;PP=2365;SC=CAAGGCAGCTGATCCACCCAT;SOR=0.734;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=67;TCR=62;TR=128;WE=57224468;WS=57224450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr1	57252615	rs2275733	A	T	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=48;ReadPosRankSum=-0.262;SC=GTGTAATAAAAAAAGGACCTC;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=4;WE=57252623;WS=57252614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr1	57258485	rs1935553	A	G	1289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=21;PP=783;ReadPosRankSum=-0.942;SC=TCCTAAGGCAAAGAATAATCA;SOR=0.646;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=48;TCR=41;TR=45;WE=57258493;WS=57258475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,52:0.53:99
chr1	57258598	rs4912416	C	T	2047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=43;PP=1251;ReadPosRankSum=-0.276;SC=ACTGATCTCACCATGTTAAGG;SOR=0.727;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=164;TCF=82;TCR=82;TR=86;WE=57258606;WS=57258588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,97:0.53:184
chr1	57395251	rs605648	T	C	4470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=61;PP=2593;SC=AGAAGGTCAATAAGCATCAAT;SOR=0.823;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=142;TCF=81;TCR=61;TR=142;WE=57395259;WS=57395241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr1	57406392	rs6669836	T	C	448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=2;PP=355;SC=TATTTTCTACTATCGTATATG;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=57406400;WS=57406382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	57411525	rs149848224	G	A	1257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.414;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=19;PP=739;ReadPosRankSum=-2.506;SC=TGTTCATAACGAGGGTGTATT;SOR=0.495;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=107;TCF=70;TCR=37;TR=53;WE=57411533;WS=57411515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,59:0.51:116
chr1	57415310	rs12085435	G	A	1711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.140;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=29;PP=919;ReadPosRankSum=-0.279;SC=AAATATTCCAGGTATTTTAAA;SOR=0.523;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=121;TCF=69;TCR=52;TR=68;WE=57415318;WS=57415300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,81:0.57:141
chr1	57420627	rs41452950	A	G	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.598;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=199;ReadPosRankSum=1.420;SC=TTAATTAGTCATCCTGTATCC;SOR=2.395;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=4;TCR=31;TR=12;WE=57420635;WS=57420617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,11:0.33:33
chr1	57422484	rs1013579	C	T	9496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=155;NR=154;PP=2965;SC=ACTTGACTTCCGCATGGTCTG;SOR=0.793;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=309;TCF=155;TCR=154;TR=309;WE=57422492;WS=57422474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,355:1.00:355
chr1	57422511	rs12067507	C	T	2774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=62;PP=1542;ReadPosRankSum=0.073;SC=ACACAGTCTTCGACTTCCTTG;SOR=0.670;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=254;TCF=118;TCR=136;TR=116;WE=57422519;WS=57422501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,137:0.47:294
chr1	57528772	rs1261611	A	G	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.289;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=423;ReadPosRankSum=1.672;SC=GAAAGTATCAAGCCAGGCTCC;SOR=0.474;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=11;TCR=34;TR=24;WE=57528780;WS=57528762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,25:0.49:51
chr1	58996203	rs2271004	T	C	1337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=14;PP=858;ReadPosRankSum=0.303;SC=CTGGATTTGCTGCTTTACAGT;SOR=0.791;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=79;TCF=57;TCR=22;TR=53;WE=58996211;WS=58996193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,55:0.66:83
chr1	59004979	rs902925	C	T	2453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=29;NR=56;PP=1619;SC=TTTCACTTGACTACCTGAAAC;SOR=1.880;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=87;TCF=30;TCR=57;TR=85;WE=59004997;WS=59004969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr1	59125683	rs232777	C	T	807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=6;PP=509;ReadPosRankSum=-0.108;SC=ATTAACAATTCCTTTGTACAG;SOR=0.818;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=63;TCF=50;TCR=13;TR=32;WE=59125691;WS=59125673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,35:0.52:67
chr1	59125894	rs12092264	A	G	597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=6.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.14;ReadPosRankSum=-0.271;SOR=0.082;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr1	59125899	rs12082192	G	A	601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=5.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.07;ReadPosRankSum=-1.063;SOR=0.100;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr1	59126676	rs232779	A	C	1026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=3;PP=768;SC=GGCAACAAAAAACGTTACTAA;SOR=3.675;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=31;WE=59126684;WS=59126666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	59127024	rs4912364	T	G	1810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.600;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=27;PP=1061;ReadPosRankSum=0.475;SC=CTCTGAAACATAATTTAATGA;SOR=0.791;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=126;TCF=71;TCR=55;TR=65;WE=59127032;WS=59127014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,81:0.53:152
chr1	59127207	rs232780	T	C	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=323;ReadPosRankSum=0.874;SC=AAGAAGCACATTGTCATCAAC;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=18;WE=59127215;WS=59127197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr1	59131088	rs516956	AA	GC	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.186;HP=4;HapScore=2;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=715;ReadPosRankSum=-2.105;SC=AAATAATTTTAAACAGTTGCA;SOR=1.424;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=37;TCF=28;TCR=9;TR=16;WE=59131097;WS=59131078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,17:0.40:43
chr1	59131311	rs232790	G	T	2767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=63;PP=1763;SC=ACTCTACAATGACAAGAAAAA;SOR=1.832;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=31;TCR=63;TR=94;WE=59131319;WS=59131301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr1	59134586	rs11207284	G	C	1919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.578;HP=6;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.488;NF=24;NR=34;PP=1003;ReadPosRankSum=2.884;SC=TACGGAAAAAGAGTAAGCATT;SOR=0.774;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=114;TCF=50;TCR=64;TR=58;WE=59134594;WS=59134576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,86:0.52:164
chr1	59134607	rs57822474	C	CAG	6684.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=59;PP=2974;SC=TCCTGTTTGACGGGGAAGCGG;SOR=0.923;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=74;TCF=15;TCR=59;TR=73;WE=59134615;WS=59134597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr1	59137783	rs539141	A	G	582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=15;PP=405;SC=ATGTAGAAAGACTGGACAGTA;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=59137791;WS=59137773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	59139223	rs2064370	C	G	6498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=130;NR=85;PP=2965;SC=CATGGATGAGCCATTTGAAAG;SOR=1.131;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=215;TCF=130;TCR=85;TR=215;WE=59139231;WS=59139213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr1	59142713	rs579110	T	C	3140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=63;PP=1694;SC=TTAAGTATTTTGGTTTGCATA;SOR=1.255;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=111;TCF=47;TCR=64;TR=110;WE=59142721;WS=59142703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr1	59147420	rs11207292	G	A	913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=3;PP=588;SC=AGAATATCACGTTTTAAAACA;SOR=3.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=26;WE=59147428;WS=59147410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	59147926	rs12139511	T	C	6472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=109;NR=87;PP=2965;SC=CTGTCAGAAGTAATGAATTCT;SOR=0.793;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=196;TCF=109;TCR=87;TR=196;WE=59147934;WS=59147916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr1	59148118	rs17118103	A	T	3212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=338;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=76;PP=2034;ReadPosRankSum=-1.311;SC=CCCCTTAAACATGATGGTGTC;SOR=0.852;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=313;TCF=157;TCR=156;TR=145;WE=59148126;WS=59148108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:180,157:0.47:337
chr1	59150941	rs2206764	G	A	844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=9;NR=18;PP=523;SC=ATTAAAATGGGAAAAAAAATT;SOR=1.460;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=9;TCR=18;TR=27;WE=59150949;WS=59150931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	59150997	.	TA	T	27	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;FR=0.9998;HP=13;HapScore=2;MGOF=23;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=27;QD=16.0;SC=ACTACCACATTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=2;WE=59151005;WS=59150987;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,2:0.40:5
chr1	59156155	rs12076049	C	T	1599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=35;PP=1056;SC=ATTACTTATACAAAACGTGTG;SOR=1.493;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=20;TCR=35;TR=55;WE=59156163;WS=59156145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	59158632	rs12097333	T	C	1591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=35;PP=1019;SC=TATTTGTCTTTTTATTTATTG;SOR=1.823;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=18;TCR=35;TR=53;WE=59158640;WS=59158622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	59165838	rs11207297	T	G	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.258;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=99;ReadPosRankSum=-1.113;SC=GCCCCTCCCGTGCCGGGAGGC;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=6;WE=59165846;WS=59165828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr1	59248813	rs2760499	G	C	2014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=44;PP=1285;SC=CAACAGGGCTGTGGCAAGCGG;SOR=3.258;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=9;TCR=44;TR=53;WE=59248821;WS=59248803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	59364615	rs11207326	G	C	1555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=14;PP=925;SC=TAGTCCATCAGAGGAGATAGG;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=33;TCR=14;TR=47;WE=59364623;WS=59364605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	59364918	rs6658104	G	A	3294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=58;NR=56;PP=1841;SC=TACAGCCCACGCAGAGGAAGG;SOR=0.774;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=114;TCF=58;TCR=56;TR=114;WE=59364934;WS=59364908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr1	59787205	rs17480358	T	C	1322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.074;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=28;PP=883;ReadPosRankSum=0.436;SC=TTGCTTACTATAGGTGGAGGA;SOR=0.375;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=140;TCF=86;TCR=54;TR=66;WE=59787213;WS=59787195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,69:0.47:148
chr1	60228310	rs10626387	T	TTC	7088.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.33;NF=8;NR=63;PP=2930;SC=CATTAAAGACTTGTCATTTGA;SOR=1.102;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=8;TCR=64;TR=71;WE=60228318;WS=60228300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr1	60280749	rs113730234	GT	G	6586.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=60;PP=2970;SC=GTAGGAGGGAGTGTGAAGGTG;SOR=0.768;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=83;TCF=21;TCR=62;TR=79;WE=60280757;WS=60280739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr1	60280962	rs41287714	A	G	187.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=4;PP=108;SC=GTCCCGGCGCACCCTGCCCTT;SOR=1.609;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=60280970;WS=60280952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	60299005	rs74649729	T	C	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=342;ReadPosRankSum=-0.151;SC=TTTATTTTCATTGTAATATTA;SOR=0.536;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=38;TCF=33;TCR=5;TR=19;WE=60299013;WS=60298995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
chr1	60299125	rs41312662	A	G	2670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.492;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=52;PP=1615;ReadPosRankSum=-0.165;SC=TTTAAACCAAATAACCGAATG;SOR=0.739;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=196;TCF=104;TCR=92;TR=110;WE=60299133;WS=60299115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,122:0.55:221
chr1	60299820	rs618716	C	A,G	5363.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=21;NF=53,48;NR=56,46;PP=1501,1176;SC=GGCTTTAATCCGTTTCGGTGG;SOR=0.821;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=204;TCF=101;TCR=103;TR=109,94;WE=60299828;WS=60299810;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.53,0.47:230
chr1	60305840	rs12405073	G	C	102.85	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5040;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=35;ReadPosRankSum=0.674;SC=TGTTGTAAGAGTCATTTCTTA;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=4;WE=60305848;WS=60305836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr1	60314648	rs2294947	A	C	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.458;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=44;ReadPosRankSum=-0.743;SC=ATATTTATTCATAATCAGTTT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=4;WE=60314656;WS=60314638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr1	60330883	rs17119807	C	G	876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.244;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=20;PP=514;ReadPosRankSum=-0.111;SC=AACAAGAACTCATTGAAGATC;SOR=0.356;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=72;TCF=27;TCR=45;TR=36;WE=60330891;WS=60330873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,40:0.52:77
chr1	60373500	rs2229191	G	T	1885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=32;PP=1042;ReadPosRankSum=-0.163;SC=AGAGCCCATCGCAGAGTTGTG;SOR=0.687;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=189;TCF=107;TCR=82;TR=79;WE=60373508;WS=60373490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,92:0.44:209
chr1	60373666	rs2271800	A	C	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.101;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=347;ReadPosRankSum=-0.079;SC=CCGTAACACAAAGGGGCTTCA;SOR=0.527;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=54;TCF=15;TCR=39;TR=22;WE=60373674;WS=60373656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,27:0.47:58
chr1	60466911	rs67112814	ACAG	A	759.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=20;PP=984;SC=GGCAACAACAACAGCAACAAC;SOR=2.833;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=21;WE=60466921;WS=60466901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	60475930	rs616949	C	G	3508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=26;PP=2421;SC=TTTTCCTTCACTGGGGAGCTA;SOR=2.224;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=83;TCR=26;TR=109;WE=60475938;WS=60475920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr1	60503762	rs17560663	T	C	689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.623;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=486;ReadPosRankSum=0.530;SC=AAAACCAGAGTAGCTTTTCAT;SOR=1.230;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=61;TCF=21;TCR=40;TR=29;WE=60503770;WS=60503752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,31:0.46:67
chr1	60505578	rs680390	A	G	1452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=12;PP=975;SC=CCAATAGTACAATTGCCATAC;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=38;TCR=12;TR=50;WE=60505586;WS=60505568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	61548344	rs113913435	TTC	T	191.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=1.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.52;ReadPosRankSum=2.082;SOR=0.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,16:0.21:76
chr1	61743160	rs332827	G	A	2055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.012;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=42;PP=1164;ReadPosRankSum=-1.956;SC=TGCAGACCCTGTAATTTTTGG;SOR=0.621;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=201;TCF=112;TCR=89;TR=91;WE=61743168;WS=61743150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,106:0.46:229
chr1	61818422	.	A	G	80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=7;MMLQ=27;MQ=59.6;NF=0;NR=6;PP=80;QD=19.1285354245;SC=ATGTGGCAAGATTAAATACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=6;WE=61818437;WS=61818412;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr1	61818428	.	TAC	T	312	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5003;HP=4;HapScore=4;MGOF=7;MMLQ=18;MQ=60.0;NF=0;NR=6;PP=312;QD=52.5;SC=CAAGATTAAATACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=6;WE=61818437;WS=61818412;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr1	61892301	rs5774558	T	TG	7642.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=76;PP=2966;SC=ACTTGTCTTTTGCACAAAAGG;SOR=0.772;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=31;TCR=79;TR=106;WE=61892309;WS=61892291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr1	61921185	rs11423561	A	AT	371.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=1.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.53;ReadPosRankSum=0.197;SOR=0.620;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,21:0.54:39
chr1	62160542	rs1151765	A	G	688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=20;PP=558;SC=TATATATCACACTCTTTATAT;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=62160550;WS=62160532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	62189541	rs17312971	T	C	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=77;ReadPosRankSum=1.040;SC=TATATACTCATGTTGATATTC;SOR=1.179;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=8;WE=62189549;WS=62189531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr1	62231924	rs141761262	T	TTGA	952.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=1;PP=1004;SC=TAGATTTCTGTTGATTCTTTT;SOR=4.804;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=20;WE=62231932;WS=62231914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	62232031	rs1286835	C	T	5459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=103;NR=80;PP=2965;SC=ATGGTTCCATCACTAATGGAA;SOR=0.815;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=185;TCF=105;TCR=80;TR=183;WE=62232039;WS=62232021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr1	62261168	rs7516332	A	G	2289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.113;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=48;PP=1264;ReadPosRankSum=-1.283;SC=TGTGAAAAGTATAATACCTGG;SOR=0.668;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=228;TCF=124;TCR=104;TR=102;WE=62261176;WS=62261158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,115:0.45:253
chr1	62329885	rs35853578	AT	A	1233.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=5;PP=791;SC=GTAACTTCACATTTTTTTGCA;SOR=2.935;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=29;WE=62329893;WS=62329875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	62330080	rs2799627	T	G	6377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=112;NR=91;PP=2965;SC=AAAGAGAAATTCTTGTTGATG;SOR=0.719;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=204;TCF=112;TCR=92;TR=203;WE=62330088;WS=62330070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr1	62330218	rs375640743	T	C	1940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=48;PP=1099;ReadPosRankSum=-0.489;SC=TGCATGATAATGAACCATCCG;SOR=0.699;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=228;TCF=117;TCR=111;TR=97;WE=62330226;WS=62330208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,101:0.41:244
chr1	62330353	rs2275859	G	A	1897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.575;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=47;PP=1128;ReadPosRankSum=-0.751;SC=TGCTCTCCTCGCCTGTCCCTG;SOR=0.780;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=154;TCF=68;TCR=86;TR=82;WE=62330361;WS=62330343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,89:0.53:169
chr1	62341157	rs4598521	T	C	162.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.6;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=4;PP=60;SC=TTTGAATTTATGTCTGCTTAA;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=62341165;WS=62341147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	62365217	rs1412622	C	T	2940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=65;NR=32;PP=1716;SC=TGAGTATGCCCTAAAATTGTG;SOR=1.423;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=65;TCR=32;TR=97;WE=62365225;WS=62365207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr1	62365428	rs5774578	G	GA	472.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=468;ReadPosRankSum=1.750;SC=TAATGATTGAGAATTGCGATA;SOR=0.716;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=13;WE=62365436;WS=62365418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
chr1	62365461	rs10889269	G	A	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.209;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=62;ReadPosRankSum=0.926;SC=GCTGGCCTACGTTTTGGTTTC;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=5;WE=62365469;WS=62365451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr1	62374267	rs2151122	T	C	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.025;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=86;ReadPosRankSum=-0.674;SC=CCAAACTATATTTAAAGTATG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=62374275;WS=62374257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr1	62380124	rs4915789	A	G	828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=2;PP=603;SC=GCGAATCTCCATCTCAGAAAA;SOR=3.912;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=28;WE=62380132;WS=62380114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	62393394	rs2251182	A	G	7792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=150;NR=114;PP=2965;SC=CAAATTTTGCATCTTCAGAGG;SOR=0.912;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=264;TCF=150;TCR=114;TR=264;WE=62393402;WS=62393384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,300:1.00:300
chr1	62417925	.	T	TGA,TGAGAGAGAGA	351	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MMLQ=27;MQ=61.34;NF=10,10;NR=0,0;PP=351,249;QD=35.5;SC=GAACAAAATCTGAGAGAGAGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=10,10;WE=62417933;WS=62417915;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.62:16
chr1	62417951	.	A	AG	232.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.221;ClippingRankSum=-0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.83;MQRankSum=0.493;QD=23.27;ReadPosRankSum=0.728;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr1	62417952	.	A	G	649	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;FR=1.0000;HP=4;HapScore=1;MGOF=36;MMLQ=27;MQ=60.6;NF=25;NR=4;PP=649;QD=23.578317674;SC=GAGAGAGAGAAAAATAGGCCC;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=29;WE=62417960;WS=62417942;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	62417952	.	A	AGAGAGAGAG	232.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.221;ClippingRankSum=-0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.83;MQRankSum=0.493;QD=23.27;ReadPosRankSum=0.967;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr1	62545085	rs17379217	C	T	1041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=10;PP=675;ReadPosRankSum=0.278;SC=TACCTTTCTCCTTTTTGATAT;SOR=0.638;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=71;TCF=56;TCR=15;TR=41;WE=62545093;WS=62545075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,44:0.54:82
chr1	62579672	rs1475564	A	C	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.245;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=201;ReadPosRankSum=-0.236;SC=GCAGACAGAGAAGGCAGAGAC;SOR=1.942;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=10;WE=62579680;WS=62579662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr1	62579823	rs1475563	G	A	2962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.917;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=57;PP=2040;ReadPosRankSum=1.745;SC=ATAGAGATGAGGCACACTACC;SOR=0.938;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=323;TCF=179;TCR=144;TR=135;WE=62579831;WS=62579813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:194,145:0.43:339
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chr1	62644118	rs2481703	A	G	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.659;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=371;ReadPosRankSum=-1.094;SC=TGCCCAATGGATTCACCTTGC;SOR=0.207;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=40;TCF=8;TCR=32;TR=23;WE=62644126;WS=62644108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,24:0.57:42
chr1	62672546	rs2457829	G	A	1362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.590;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=25;PP=788;ReadPosRankSum=1.824;SC=CAGTTTTAGGGGGAAAAGCTA;SOR=0.787;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=144;TCF=81;TCR=63;TR=60;WE=62672554;WS=62672536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,69:0.43:160
chr1	62673037	rs7542665	T	C	2510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.889;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=50;PP=1385;ReadPosRankSum=-1.619;SC=CTTACCCTGGTAGCCGACCTT;SOR=0.624;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=263;TCF=134;TCR=129;TR=105;WE=62673045;WS=62673027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,126:0.42:299
chr1	62673225	rs7533274	G	A	1207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=33;PP=761;ReadPosRankSum=-0.006;SC=AAAATCTTCTGTGAAAGAATT;SOR=0.732;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=115;TCF=50;TCR=65;TR=55;WE=62673233;WS=62673215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,60:0.47:128
chr1	62675619	rs4625314	C	T	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=1.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.15;ReadPosRankSum=1.985;SOR=0.669;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,23:0.43:53
chr1	62675892	rs2481694	A	G	2920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FS=3.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.522;QD=9.45;ReadPosRankSum=4.609;SOR=0.899;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:166,143:0.46:309
chr1	62676284	rs2886644	C	T	1460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=29;PP=908;ReadPosRankSum=0.058;SC=ACAGAGGAAACAGAAGAAAAC;SOR=0.653;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=154;TCF=82;TCR=72;TR=64;WE=62676292;WS=62676274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,72:0.43:168
chr1	62676714	rs75391297	T	G	2282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.264;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=42;PP=1455;ReadPosRankSum=-0.210;SC=AGAGACTGACTCCTAGACACA;SOR=1.119;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=219;TCF=125;TCR=94;TR=109;WE=62676722;WS=62676704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,116:0.50:233
chr1	62677048	rs1056517	G	T	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.869;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=17;PP=367;ReadPosRankSum=-1.227;SC=ACCTTAGCACGCCAGGGTGAC;SOR=0.858;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=69;TCF=32;TCR=37;TR=31;WE=62677056;WS=62677038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,36:0.46:78
chr1	62704134	rs41289438	A	G	1168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.773;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=29;PP=716;ReadPosRankSum=-0.346;SC=TTGGGAGTAGAGGGTATGCCT;SOR=0.593;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=89;TCF=32;TCR=57;TR=47;WE=62704142;WS=62704124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,54:0.52:103
chr1	62712999	.	TG	T	154	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=5;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=6;NR=0;PP=154;QD=30.8333333333;SC=TTTTAAGAGATGGGGGTCTCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=6;WE=62713007;WS=62712989;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr1	62713224	rs2941679	C	G	3264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=60;NR=47;PP=1861;SC=TGACAGGCCACCATGAGGGCC;SOR=0.710;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=60;TCR=47;TR=107;WE=62713232;WS=62713214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr1	62713246	rs10889315	G	A	1049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.480;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=19;PP=553;ReadPosRankSum=0.651;SC=AGGATCCATCGTGGTCCTGCA;SOR=0.532;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=61;TCR=44;TR=45;WE=62713254;WS=62713236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,52:0.44:118
chr1	62728784	rs2666472	A	G	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.395;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=6;PP=314;ReadPosRankSum=-0.006;SC=CAGCAGCTTCACGATGGAGAA;SOR=1.200;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=65;TCF=46;TCR=19;TR=27;WE=62728792;WS=62728774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,30:0.42:72
chr1	62728838	rs2258470	T	C	2639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.041;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=19;PP=748;ReadPosRankSum=-0.328;SC=GTTCCCGTTGTGATCGGCCAA;SOR=0.964;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=129;TCF=84;TCR=45;TR=60;WE=62728846;WS=62728828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,71:0.49:144
chr1	62728861	rs2260581	T	C	2951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.938;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=25;PP=1162;ReadPosRankSum=0.824;SC=TGACAAGCAGTTTCAGGAAGT;SOR=0.883;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=163;TCF=105;TCR=58;TR=76;WE=62728869;WS=62728851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,84:0.47:177
chr1	62728918	rs2262110	G	A	2814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.045;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=56;PP=1764;ReadPosRankSum=0.844;SC=CCACCACGGCGGGGCTAGACG;SOR=0.829;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=250;TCF=136;TCR=114;TR=125;WE=62728926;WS=62728908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,136:0.51:267
chr1	62729015	rs2262106	G	A	2274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.726;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=61;PP=1432;ReadPosRankSum=0.481;SC=ATTCCAAGAGGTTCCCCGGCC;SOR=0.836;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=199;TCF=82;TCR=117;TR=101;WE=62729023;WS=62729005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,107:0.51:208
chr1	62732421	rs11207949	T	C	1558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=0.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.17;ReadPosRankSum=1.298;SOR=0.608;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,83:0.49:170
chr1	62737125	rs77901899	T	C	3668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=349;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.267;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=74;PP=2304;ReadPosRankSum=2.045;SC=AGAAAGGCAGTCTGAGCTTCA;SOR=0.624;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=321;TCF=182;TCR=139;TR=164;WE=62737133;WS=62737115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,179:0.51:349
chr1	62738904	rs7516290	T	C	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.467;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=193;ReadPosRankSum=-0.583;SC=AGGAGGCCGGTGGCTCCTTGG;SOR=1.659;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=14;WE=62738912;WS=62738894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr1	62740446	rs2666506	T	C	2702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.44;ReadPosRankSum=-0.267;SOR=0.653;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,72:0.41:175
chr1	62740449	rs2666507	T	C	2702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.02;ReadPosRankSum=-0.634;SOR=0.730;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:105,75:0.42:180
chr1	62939634	rs1168007	C	T	2205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=25;PP=1293;SC=AAGATCTTTACGCAGAAAGCC;SOR=1.473;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=51;TCR=25;TR=76;WE=62939642;WS=62939624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr1	62943264	rs1168008	C	T	926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=4;PP=716;SC=GAGTAGTTTACTTGGCAAGAT;SOR=3.477;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=30;WE=62943272;WS=62943254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	62953183	rs1168025	C	T	1376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=29;PP=821;SC=TCTCCACAAACAGAAGACAGC;SOR=1.519;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=16;TCR=29;TR=45;WE=62953191;WS=62953173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	62954372	rs57650980	G	GA	94.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5567;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=106;ReadPosRankSum=-1.242;SC=ATTCAAAAATGAAAAAAAAAA;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=6;WE=62954380;WS=62954362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr1	62960101	rs10889335	A	G	3241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=60;PP=2000;SC=AACCAGGTCAATCGCAGATCT;SOR=1.159;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=47;TCR=60;TR=107;WE=62960109;WS=62960091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr1	62961928	rs1168038	T	C	104.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=78;SC=CCAGCAAAAATCAACTTTTGA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=62961936;WS=62961918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	62962240	rs200220657	T	TA	259.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=281;ReadPosRankSum=-0.571;SC=TTTTCCTTGCTAAAAGTATAT;SOR=0.437;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=9;WE=62962248;WS=62962230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr1	62976472	rs1168043	T	G	450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=378;SC=CAGTACAAGTTGAAAAACCTG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=62976480;WS=62976462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	63027411	rs5774610	AG	A	2871.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=45;PP=2066;SC=CAGATGCTTAAGTAGATTATG;SOR=1.739;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=48;TCF=2;TCR=46;TR=47;WE=63027419;WS=63027401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr1	63050598	rs3850634	T	G	2253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=48;PP=1446;SC=GTTTGTTAGGTAAACAATAAA;SOR=1.893;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=70;TCF=21;TCR=49;TR=69;WE=63050606;WS=63050588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr1	63070537	rs67461605	AGTTAATGTG	A	1095.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=18;PP=2941;SC=CCTCATTCCAAGTTAATGTGG;SOR=4.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=18;WE=63070553;WS=63070527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	63085483	rs34571440	T	TA	274.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=12;NR=0;PP=186;SC=GCCAGATAAATAAAAAAAAAA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=12;WE=63085491;WS=63085473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	63090858	rs6587980	C	T	1292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=5;PP=870;SC=ATAGTACAATCACTACCTTTC;SOR=3.365;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=37;WE=63090866;WS=63090848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	63099023	rs10889352	T	C	403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=279;SC=CAGAAAAAAATATAGTACTAG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=63099031;WS=63099015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	63113689	rs1168088	T	C	516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=1;PP=408;SC=TGCTTTATCCTCTACATTTTG;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=63113697;WS=63113682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	63153953	rs4344355	C	T	2390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=34;NR=53;PP=1475;SC=GCGGCGACGGCGACGGCGGCG;SOR=1.321;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=34;TCR=53;TR=87;WE=63153961;WS=63153943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr1	63788951	rs2274187	C	A	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=148;ReadPosRankSum=-0.270;SC=CTCAGCCGCCCCACCAGCAGC;SOR=0.608;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=34;TCF=12;TCR=22;TR=15;WE=63788959;WS=63788941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr1	63871881	rs1012872	A	G	428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=10;NR=4;PP=222;SC=TAGTAGGGCAAGAACCTTGTG;SOR=1.371;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=14;WE=63871889;WS=63871871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	63872871	rs6588028	A	G	1424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.283;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=32;PP=865;ReadPosRankSum=0.649;SC=CATTGCTGTCATCTAGTAATG;SOR=1.823;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=48;TCF=16;TCR=32;TR=47;WE=63872879;WS=63872861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,53:0.98:54
chr1	63881552	rs4630153	C	T	2489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=35;PP=1573;SC=AGCTTTTGTTCTACGTTTTTG;SOR=1.061;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=88;TCF=52;TCR=36;TR=87;WE=63881560;WS=63881542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr1	63912563	rs3838450	ACAATT	A	2078.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=0;NR=31;PP=1640;SC=TTTTCAGAAAACAATTCAAAG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=31;WE=63912575;WS=63912553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	63991140	rs9436686	T	C	359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=0;PP=213;SC=TTTTCTTCTATGTATAAAATC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=63991148;WS=63991130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	63991267	rs217478	T	C	4549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=93;NR=52;PP=2089;SC=CACGAAGCGATGCAACTTTCT;SOR=1.034;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=93;TCR=52;TR=145;WE=63991275;WS=63991257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr1	63997564	.	G	A	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.189;ClippingRankSum=0.000;DP=289;ExcessHet=3.0103;FS=6.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.13;ReadPosRankSum=1.681;SOR=1.218;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:246,43:0.15:289
chr1	63997594	.	G	C	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.469;ClippingRankSum=0.000;DP=240;ExcessHet=3.0103;FS=2.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.50;ReadPosRankSum=2.113;SOR=0.955;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:203,37:0.15:240
chr1	63997603	.	A	G	725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.071;ClippingRankSum=0.000;DP=225;ExcessHet=3.0103;FS=0.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.23;ReadPosRankSum=1.911;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:193,32:0.14:225
chr1	63997622	.	C	T	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.344;ClippingRankSum=0.000;DP=181;ExcessHet=3.0103;FS=0.816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.25;ReadPosRankSum=-1.704;SOR=0.806;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:155,26:0.14:181
chr1	63997624	.	A	G	593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.323;ClippingRankSum=0.000;DP=174;ExcessHet=3.0103;FS=0.849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.41;ReadPosRankSum=-1.818;SOR=0.795;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:150,24:0.14:174
chr1	63997639	.	GC	AA	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.637;ClippingRankSum=0.000;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=1.030;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.16;ReadPosRankSum=-2.767;SOR=0.887;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:133,17:0.11:150
chr1	63999087	rs217454	T	C	2012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=11;PP=1457;SC=CAGTGTATGATTGAATGTTTT;SOR=2.973;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=52;TCR=11;TR=63;WE=63999095;WS=63999077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	64015217	rs217485	G	A	4518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=86;NR=73;PP=2754;SC=GTTATTTCTCGTTGAATACTA;SOR=0.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=159;TCF=86;TCR=73;TR=159;WE=64015225;WS=64015207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr1	64017262	rs35587501	GA	G	75.14	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5020;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=53;ReadPosRankSum=0.210;SC=ACTCCGTCTTGAAAAAAAAAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=5;WE=64017270;WS=64017252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr1	64017377	rs370255098	CT	C	57.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=9.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.20;ReadPosRankSum=0.927;SOR=0.081;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,10:0.21:48
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chr1	64100478	rs6588052	A	T	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.669;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=73;ReadPosRankSum=1.343;SC=TTCTGCATACATTTATTCCAT;SOR=1.188;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=22;TCR=10;TR=10;WE=64100486;WS=64100468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,8:0.24:34
chr1	64102114	rs2269248	A	G	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=63;ReadPosRankSum=-0.440;SC=AGTCTTCACCATACCCTTCAC;SOR=0.293;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=7;WE=64102122;WS=64102104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr1	64125544	rs10909	C	T	172.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=108;SC=AGAGGACCTGCGGGCTTAGAT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=64125552;WS=64125534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	64515379	rs1772626	C	T	3837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=40;PP=2260;SC=ACCTGACCCTCGATGAACCAA;SOR=1.461;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=125;TCF=84;TCR=41;TR=124;WE=64515387;WS=64515369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr1	64608329	rs2762833	G	T	6760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=112;NR=105;PP=2965;SC=ACATCCCAGCGTGCGGTAAAT;SOR=0.751;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=217;TCF=112;TCR=105;TR=217;WE=64608337;WS=64608319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr1	64624612	rs4362024	G	A	714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=2;PP=517;SC=GTAATATTATGCATGTTACTT;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=64624620;WS=64624602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	64680654	rs7534166	G	A	733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.181;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=16;PP=311;ReadPosRankSum=0.871;SC=AGTGGCTCACGCCTGTAATCC;SOR=1.078;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=53;TCF=25;TCR=28;TR=29;WE=64680662;WS=64680644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,36:0.57:63
chr1	64680682	rs825174	C	G	1144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=23;PP=653;SC=TTGGGAGGCTCAGGTGGGTGG;SOR=1.312;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=16;TCR=23;TR=39;WE=64680690;WS=64680672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	64707243	rs825189	G	C	305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=251;SC=CACATATCAAGTTAATGAGAA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=64707251;WS=64707233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	64726414	rs705542	A	C	1708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=41;PP=1214;SC=GCTTTTATAAATAACATATTA;SOR=2.387;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=13;TCR=41;TR=54;WE=64726422;WS=64726404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	65016349	rs2164571	A	T	7247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=128;NR=127;PP=2965;SC=GGTAAGAGGCAATGAGTACTT;SOR=0.783;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=255;TCF=128;TCR=127;TR=255;WE=65016357;WS=65016339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,276:1.00:276
chr1	65016399	rs11808959	G	A	2090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.647;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=50;PP=1126;ReadPosRankSum=0.545;SC=ATGTGGCTTCGTCACTCTTTC;SOR=0.901;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=157;TCF=70;TCR=87;TR=87;WE=65016407;WS=65016389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,99:0.55:180
chr1	65045602	rs5774708	TA	T	416.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.9993;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=210;ReadPosRankSum=0.536;SC=AGCCAGATGTTAAAAAAAAAA;SOR=0.551;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=17;WE=65045610;WS=65045592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,22:0.73:30
chr1	65068638	rs6665437	T	C	2226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=31;NR=49;PP=1121;SC=TGTATTCTACTGCATTCAAGT;SOR=1.481;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=31;TCR=49;TR=80;WE=65068646;WS=65068628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr1	65099978	rs2118102	G	A	1673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=42;PP=1094;SC=TAGAGGCATAGTAGATAAAGA;SOR=2.226;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=13;TCR=42;TR=55;WE=65099986;WS=65099968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	65107372	rs6664905	C	T	2702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=17;PP=1466;SC=CAGCATCAAACAGGAGGGACT;SOR=2.006;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=65;TCR=17;TR=82;WE=65107380;WS=65107362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr1	65113351	rs7534210	T	C	245.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=202;SC=GTCCAGAGTCTATGTGGTCTC;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=65113359;WS=65113341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	65113568	rs6588100	T	C	4583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=74;PP=2472;SC=CCAGACCGGATGGCCTTGCCT;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=154;TCF=80;TCR=74;TR=154;WE=65113576;WS=65113558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr1	65141676	rs6143245	TTAATAATAATAATAA	T	403.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.696;NF=0;NR=5;PP=1082;ReadPosRankSum=0.594;SC=GGTAAAATAATTAATAATAAT;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=5;WE=65141698;WS=65141666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr1	65684425	rs11208611	C	T	5996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=117;NR=85;PP=2965;SC=TTGTTTTGTTCTTTGCATTTA;SOR=0.927;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=202;TCF=117;TCR=85;TR=202;WE=65684433;WS=65684415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr1	65690461	rs4915685	G	A	365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=57.38;NF=11;NR=2;PP=273;SC=CTGGTGAACCGTTAGTCCAGC;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=65690469;WS=65690451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	65775330	rs373500242	AT	A	37.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.55;ReadPosRankSum=1.036;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,2:0.40:5
chr1	65775339	.	T	C	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.036;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,2:0.40:5
chr1	65830608	rs1570868	T	C	931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=25;PP=731;SC=AGAAATGTCATTGAAGACATA;SOR=3.841;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=28;WE=65830616;WS=65830598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	65844963	rs3818449	A	G	824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.796;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=6;PP=624;ReadPosRankSum=0.015;SC=TGTTCCCACTATTCCTATCTA;SOR=1.751;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=59;TCF=46;TCR=13;TR=32;WE=65844971;WS=65844953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,33:0.51:65
chr1	65858088	rs6588144	T	C	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=1.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.92;ReadPosRankSum=0.069;SOR=0.437;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,14:0.22:64
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chr1	65886448	rs3790434	T	C	2684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.437;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=54;PP=1420;ReadPosRankSum=-2.634;SC=CCGGCTCGCTTGTCGTGTGGT;SOR=0.744;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=249;TCF=138;TCR=111;TR=123;WE=65886456;WS=65886438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,135:0.49:277
chr1	65887013	rs12145690	A	C	2646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.287;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=41;PP=1737;ReadPosRankSum=-1.799;SC=ATGGACAGAGAAGAAACCAGT;SOR=1.005;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=214;TCF=131;TCR=83;TR=115;WE=65887021;WS=65887003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,125:0.53:236
chr1	66036501	rs2186248	G	T	662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=15;PP=469;SC=CATTAGCTATGTTTTAAATGT;SOR=2.030;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=21;WE=66036509;WS=66036491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	66058513	rs1137101	A	G	1314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.230;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=36;PP=823;ReadPosRankSum=0.555;SC=GTAATTTTCCAGTCACCTCTA;SOR=0.844;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=157;TCF=65;TCR=92;TR=58;WE=66058521;WS=66058503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,68:0.38:178
chr1	66064293	rs3762273	A	C	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.447;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=123;ReadPosRankSum=0.736;SC=CTTTTAGTAAAGGTTCCACAT;SOR=1.609;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=8;WE=66064301;WS=66064283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr1	66067109	rs1805134	T	C	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=295;ReadPosRankSum=-0.095;SC=TTCTGACAAGTGTTGGGTCTA;SOR=0.760;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=20;WE=66067117;WS=66067099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,21:0.51:41
chr1	66081664	rs13306520	A	G	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.071;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=433;ReadPosRankSum=1.136;SC=CAGCCCTTAAACTAATCAATT;SOR=0.546;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=58;TCF=45;TCR=13;TR=25;WE=66081672;WS=66081654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,30:0.47:64
chr1	66085574	rs3790439	T	A	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.203;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=8;PP=252;ReadPosRankSum=-0.774;SC=ACTATTAATTTTGTATAAATG;SOR=0.444;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=53;TCF=35;TCR=18;TR=24;WE=66085582;WS=66085564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,28:0.47:59
chr1	66087301	rs4655743	G	C	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.108;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=65;ReadPosRankSum=-1.345;SC=GGCCTGTTGTGAGGAAATGGC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=66087309;WS=66087291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr1	66088701	rs12067936	C	A	760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.979;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=19;PP=504;ReadPosRankSum=2.412;SC=AGAATATATACGATTGCAATC;SOR=0.558;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=55;TCF=21;TCR=34;TR=32;WE=66088709;WS=66088691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,34:0.54:63
chr1	66102257	rs1805096	G	A	2758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.768;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.99;MQRankSum=1.012;NF=60;NR=56;PP=1601;ReadPosRankSum=-0.943;SC=AAAATTCTCCGTTGAAGGATT;SOR=0.475;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=227;TCF=130;TCR=97;TR=116;WE=66102265;WS=66102247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,131:0.50:261
chr1	66102755	rs70940806	A	ATTACT	559.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=498;ReadPosRankSum=1.116;SC=AGTGTAATAGATTATAGTTGT;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=10;WE=66102763;WS=66102745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr1	66618300	rs114287158	T	A	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=4.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.39;ReadPosRankSum=-0.833;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr1	66618303	rs115304639	T	A	562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.47;ReadPosRankSum=-1.199;SOR=1.292;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr1	66618316	rs202241040	TACACACACAC	T	103.06	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=1621;SC=TATATGTGTATACACACACAC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=6;WE=66618333;WS=66618290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	66731886	rs6588193	G	C	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.957;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=79;ReadPosRankSum=-0.052;SC=GCTCTCAAAAGTATGTCTCTT;SOR=1.002;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=5;WE=66731894;WS=66731876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr1	66732386	rs6588194	G	A	2220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FS=3.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.94;ReadPosRankSum=-0.014;SOR=0.528;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,109:0.54:203
chr1	66732529	rs6701329	A	T	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.072;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=364;ReadPosRankSum=-0.982;SC=TTCCCTACTAATGTAGCAGTA;SOR=0.225;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=50;TCF=10;TCR=40;TR=23;WE=66732537;WS=66732519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,24:0.44:54
chr1	66829262	rs783039	A	G	4544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=93;PP=2783;SC=GACGTGAGTAATTATGACCTG;SOR=1.292;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=154;TCF=61;TCR=93;TR=154;WE=66829284;WS=66829252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr1	66831322	rs7538869	T	G	2635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=42;PP=1480;ReadPosRankSum=0.411;SC=ATTGGATGTGTAGTTAAATGT;SOR=0.689;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=207;TCF=120;TCR=87;TR=102;WE=66831330;WS=66831312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,124:0.52:237
chr1	66831370	rs783036	G	A	6973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=119;NR=103;PP=2965;SC=CAGATTTGGAGATCCTGGCTG;SOR=0.717;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=222;TCF=119;TCR=103;TR=222;WE=66831378;WS=66831360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr1	67000103	rs1445578	A	G	2465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.106;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=55;PP=1427;ReadPosRankSum=-1.602;SC=TTTGGGCAGAACAGCATTAAA;SOR=0.836;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=226;TCF=107;TCR=119;TR=104;WE=67000111;WS=67000093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,118:0.46:255
chr1	67000162	rs1445579	T	G	1116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.785;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=33;PP=705;ReadPosRankSum=-0.647;SC=TGGTTGCCAATGTTTTGCAAG;SOR=0.853;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=102;TCF=28;TCR=74;TR=45;WE=67000170;WS=67000152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,51:0.44:117
chr1	67094171	rs12402181	G	A	1428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=29;PP=780;ReadPosRankSum=0.511;SC=AGGCATTATAGGACTCATATA;SOR=0.657;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=71;TCR=67;TR=59;WE=67094179;WS=67094161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,70:0.43:163
chr1	67101778	rs149719377	AAC	A	732.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.610;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=600;ReadPosRankSum=-1.327;SC=AAATTTGGAAAACACAGTAGT;SOR=0.035;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=15;WE=67101787;WS=67101768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,20:0.54:37
chr1	67101802	rs7546825	A	G	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=162;ReadPosRankSum=-0.067;SC=CATTTACTCCATTTAAGAAAA;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=9;WE=67101810;WS=67101792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr1	67109335	rs7526812	A	G	2749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.037;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=44;PP=1599;ReadPosRankSum=-0.389;SC=GACATTCTTAAGAATGCTGCA;SOR=0.605;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=199;TCF=120;TCR=79;TR=110;WE=67109343;WS=67109325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,127:0.55:229
chr1	67126114	rs12094526	A	G	6469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=118;NR=86;PP=2965;SC=GTTATCCTGAACCTTGACCTG;SOR=1.047;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=204;TCF=118;TCR=86;TR=204;WE=67126122;WS=67126104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr1	67126164	rs41305636	T	C	3884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.052;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=79;PP=2318;ReadPosRankSum=1.347;SC=TCATTTTCTCTTTATTCTTCC;SOR=0.505;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=292;TCF=156;TCR=136;TR=164;WE=67126172;WS=67126154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,183:0.57:323
chr1	67133111	rs11208941	T	C	950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=15;PP=633;ReadPosRankSum=-0.050;SC=GGAGTGTATGTTTGGTTAGCT;SOR=0.685;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=102;TCF=67;TCR=35;TR=42;WE=67133119;WS=67133101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,46:0.41:111
chr1	67136537	rs6686606	C	T	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.987;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=9;PP=243;ReadPosRankSum=-0.332;SC=CAATTTCCTACTTAAATGCGG;SOR=0.215;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=37;TCF=24;TCR=13;TR=21;WE=67136545;WS=67136527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,23:0.59:39
chr1	67138877	rs35377023	AG	A	1913.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.597;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.27;MQRankSum=1.713;NF=23;NR=18;PP=1438;ReadPosRankSum=0.436;SC=TGTTTCACTAAGAAAAATATG;SOR=0.544;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=84;TCF=50;TCR=34;TR=41;WE=67138885;WS=67138867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,61:0.51:119
chr1	67145322	rs10889644	C	A	7245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=139;NR=98;PP=2965;SC=ACTTAGGAAGCACATGACCAA;SOR=1.047;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=237;TCF=139;TCR=98;TR=237;WE=67145330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr1	67149706	rs10749764	G	C	391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=359;SC=AGCCCTAAATGCTTTTTGGCC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=67149714;WS=67149696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	67155862	rs71660869	TCTC	T	3048.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.198;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.874;NF=18;NR=30;PP=1889;ReadPosRankSum=-1.578;SC=TCTCTTTTCTTCTCCTTACAG;SOR=1.078;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=107;TCF=32;TCR=75;TR=48;WE=67155872;WS=67155852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,83:0.43:194
chr1	67160336	rs2146904	A	G	1739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=38;PP=1102;SC=ACTGTTCATCATGGAACTCGT;SOR=2.019;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=17;TCR=38;TR=55;WE=67160344;WS=67160326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	67160884	rs16844	A	G	78.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.51;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	67160981	rs1325268	C	T	963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.511;HP=5;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=25;PP=780;ReadPosRankSum=0.121;SC=TTCCCTTTTTCCTGCACGCTA;SOR=0.515;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=123;TCF=70;TCR=53;TR=53;WE=67160989;WS=67160971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,50:0.42:119
chr1	67194911	rs3078564	TTC	T	1994.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=19;PP=1120;ReadPosRankSum=-0.986;SC=GACATGGATTTTCTCTCTCTT;SOR=0.680;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=62;TCF=19;TCR=43;TR=27;WE=67194920;WS=67194901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,59:0.54:109
chr1	67242200	rs7541120	G	A	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=227;ReadPosRankSum=-0.260;SC=GTTAAAATGCGTATTTATAAT;SOR=0.721;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=56;TCF=16;TCR=40;TR=20;WE=67242208;WS=67242190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,22:0.39:57
chr1	67243024	rs2133173	C	A	2930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.433;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=57;PP=1636;ReadPosRankSum=0.631;SC=GCAGAGCATACTTATTGGAAG;SOR=0.664;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=243;TCF=129;TCR=114;TR=122;WE=67243032;WS=67243014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,141:0.51:278
chr1	67266756	rs549148	T	A	958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.402;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=22;PP=551;ReadPosRankSum=0.803;SC=GATCCCCTCCTGATGCCTTCT;SOR=0.526;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=117;TCF=67;TCR=50;TR=45;WE=67266764;WS=67266746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,52:0.39:133
chr1	67292473	rs34718535	A	AT	3206.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=14;PP=1498;SC=TGCTTCTACTAAAATTTATGC;SOR=2.082;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=38;TCF=23;TCR=15;TR=37;WE=67292486;WS=67292463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr1	67292478	rs36067642	T	A	3366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=16;PP=1088;SC=CTACTAAAATTTATGCAAGAA;SOR=2.073;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=59;TCF=43;TCR=16;TR=54;WE=67292486;WS=67292463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr1	67313793	rs79498460	G	A	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.343;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=322;ReadPosRankSum=2.304;SC=GTAGATTAGAGGCCTAACAGA;SOR=2.390;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=16;WE=67313801;WS=67313783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr1	67390416	rs3008858	G	C	7442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=120;NR=123;PP=2965;SC=GGGGAGTGGTGCACCACCCCT;SOR=0.841;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=244;TCF=120;TCR=124;TR=243;WE=67390424;WS=67390406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,273:1.00:273
chr1	67390468	rs1886686	C	G	5033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=102;PP=2965;SC=CCAAGCTCCTCCGTTAGCGGC;SOR=1.386;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=165;TCF=63;TCR=102;TR=164;WE=67390476;WS=67390458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr1	67396222	rs3008861	T	G	282.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=261;SC=AACAGGCCATTCTCTGGGCGG;SOR=3.056;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=67396230;WS=67396212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	67425311	rs2985794	T	G	994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=9;PP=627;SC=ATATGTAGATTTAGACAGGAT;SOR=1.675;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=23;TCR=9;TR=32;WE=67425319;WS=67425301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	67425494	rs35465377	A	AT	314.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5578;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=144;ReadPosRankSum=-0.047;SC=TCGTGTAATTATTTTTTTTTT;SOR=0.990;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=11;WE=67425502;WS=67425484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,16:0.80:20
chr1	67474977	rs2755271	C	T	87.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=2;PP=50;SC=ACAATGAAAACGCACCAACCC;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=4;WE=67474985;WS=67474967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	67487119	rs2065002	C	A	1977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=17;PP=1447;SC=TAGGCTGACACACTCAGGAGA;SOR=2.105;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=49;TCR=17;TR=66;WE=67487127;WS=67487109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr1	67487374	rs146592108	TCCAACACAGACACAGACACAGACA	T,TCAGACACAGACACAGACA	2123.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=1;NR=28;PP=250;SC=CGAGTCTGCCTCCAACACAGA;SOR=1.225;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=29;WE=67487415;WS=67487364;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:49
chr1	67508080	rs10546548	CCACT	C	2863.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.45;NF=1;NR=43;PP=2377;SC=GTACAAAATACCACTCAAACT;SOR=2.412;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=49;TCF=1;TCR=48;TR=44;WE=67508091;WS=67508070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr1	67512903	rs1024229	G	T	2104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=19;PP=1214;SC=GAATTGACATGCCAACATCAG;SOR=1.379;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=47;TCR=19;TR=66;WE=67512911;WS=67512893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr1	67512920	rs1024230	A	C	2266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=26;PP=1250;SC=TCAGTACACAACTGTTAAAGC;SOR=1.065;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=49;TCR=26;TR=74;WE=67512928;WS=67512910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr1	67516316	rs2815383	T	A	100.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=74;SC=TAATTTATGGTTAAACCCCTG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=67516324;WS=67516306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	67558739	rs6588237	C	T	910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.698;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=13;PP=600;ReadPosRankSum=0.000;SC=TATCCAGTGGCGTTACATTAT;SOR=0.346;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=54;TCF=38;TCR=16;TR=39;WE=67558747;WS=67558729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,40:0.70:57
chr1	67560897	rs10889653	A	G	631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.788;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=5;PP=473;ReadPosRankSum=-2.536;SC=TTTACTTAACAATAGATGATA;SOR=1.911;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=73;TCF=52;TCR=21;TR=30;WE=67560905;WS=67560887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,33:0.42:79
chr1	67560956	rs11208997	C	T	1859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.282;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=28;PP=1071;ReadPosRankSum=-0.027;SC=CTAACGTTGACTATCTTGGCA;SOR=1.174;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=174;TCF=103;TCR=71;TR=82;WE=67560964;WS=67560946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,92:0.48:190
chr1	67562106	rs6670381	G	T	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=166;ReadPosRankSum=1.717;SC=CATATGGAAAGTACCTAGTAT;SOR=0.804;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=10;WE=67562114;WS=67562096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr1	67577367	rs6588240	A	T	1568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=30;PP=792;ReadPosRankSum=0.643;SC=CTATTAAGTTACTTCTAATTA;SOR=0.690;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=118;TCF=60;TCR=58;TR=63;WE=67577375;WS=67577357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,75:0.56:133
chr1	67579245	rs2144655	G	A	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.224;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=98;ReadPosRankSum=0.663;SC=ACAGGGTTTCGCCATGTTGGT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=6;WE=67579253;WS=67579235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr1	67579386	rs2144656	A	G	1274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.720;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=22;PP=716;ReadPosRankSum=1.750;SC=ACTAAGTACAATGAGAATCCG;SOR=0.569;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=98;TCF=57;TCR=41;TR=52;WE=67579394;WS=67579376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,59:0.54:109
chr1	67591660	.	G	A	104	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=6;PP=104;QD=23.1285354245;SC=AAAATCTTAGGTGGAAAGAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=6;WE=67591668;WS=67591650;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:10,6:0.38:16
chr1	67633812	rs1884444	G	T	1768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.135;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=34;PP=928;ReadPosRankSum=-1.717;SC=ACATGAATCAGGTCACTATTC;SOR=0.808;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=170;TCF=94;TCR=76;TR=82;WE=67633820;WS=67633802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,92:0.49:187
chr1	67648460	rs6687620	T	C	926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.873;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=12;PP=509;ReadPosRankSum=0.417;SC=CATCTTGGCTTGGGACCAGAG;SOR=0.555;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=85;TCF=61;TCR=24;TR=39;WE=67648468;WS=67648450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,43:0.47:91
chr1	67672765	rs7539625	G	A	1054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=25;PP=549;ReadPosRankSum=-1.429;SC=TTATGCTTTAGCATGTGAATG;SOR=0.666;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=48;TCR=53;TR=48;WE=67672773;WS=67672755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,54:0.47:116
chr1	67672911	rs7539643	C	T	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=58;ReadPosRankSum=-0.524;SC=ATTTTAGATTCGGGGGCACAT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=67672919;WS=67672901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr1	67685387	rs7530511	T	C	1603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.996;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=43;PP=814;ReadPosRankSum=-2.501;SC=TGGAGTTCACTGTTTTTTCAT;SOR=1.047;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=130;TCF=54;TCR=76;TR=69;WE=67685395;WS=67685377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,78:0.54:145
chr1	67705726	rs10889671	A	G	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.720;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=192;ReadPosRankSum=-0.694;SC=TGTGGCCTAAAGTAAAGGTTA;SOR=1.877;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=13;WE=67705734;WS=67705716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,13:0.34:38
chr1	67795319	rs1495963	T	C	4671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=77;PP=2377;SC=AAAAGGCTTCTGTGAGCAGAT;SOR=0.786;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=162;TCF=83;TCR=79;TR=159;WE=67795327;WS=67795309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr1	67833643	rs2307153	G	A	2084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.177;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=40;PP=1152;ReadPosRankSum=0.442;SC=CATCCAGGGGGTGACACACAG;SOR=0.730;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=166;TCF=89;TCR=77;TR=92;WE=67833651;WS=67833633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,100:0.56:178
chr1	67852141	rs12138812	A	G	2046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=15;PP=1438;SC=AATTTACCTTATTCTTGAGCA;SOR=2.200;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=46;TCR=15;TR=61;WE=67852149;WS=67852131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	67852335	rs2228420	G	A	6959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=114;NR=123;PP=2965;SC=TTTTCTCAACGCATTACTTCC;SOR=0.876;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=238;TCF=115;TCR=123;TR=237;WE=67852343;WS=67852325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr1	67861520	rs2229546	C	A	8276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=156;NR=119;PP=2965;SC=ACCCAAAGCCCGAAAACCCAG;SOR=0.963;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=275;TCF=156;TCR=119;TR=275;WE=67861528;WS=67861510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,298:1.00:298
chr1	67890526	rs6702742	A	G	92.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=0;PP=26;SC=GTATGGATTAACCTCTAGTTA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=67890534;WS=67890516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	67892137	.	T	C	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.128;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.235;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=243;ReadPosRankSum=0.300;SC=AAAACTGCCATTTAAAGACAA;SOR=0.172;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=15;WE=67892145;WS=67892127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr1	68151980	rs2759219	T	G	2170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=15;PP=1608;SC=ACCCGGGCAGTGGTTGAGGGC;SOR=2.439;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=51;TCR=15;TR=65;WE=68151988;WS=68151970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	68152388	rs681673	T	C	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	68173264	rs2295942	C	T	2175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=47;PP=1362;ReadPosRankSum=-0.515;SC=GTTATCCAGTCGGGGCTTCTT;SOR=0.700;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=191;TCF=101;TCR=90;TR=94;WE=68173272;WS=68173254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,104:0.48:218
chr1	68603432	rs1430754	C	T	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=280;ReadPosRankSum=1.039;SC=TTTATCCTGACTTAAGCTGTT;SOR=0.941;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=35;TCF=24;TCR=11;TR=19;WE=68603440;WS=68603422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr1	68603586	rs983034	C	T	4847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=78;PP=2965;SC=TGGACTGTGACGCCGCCCCAT;SOR=0.738;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=168;TCF=90;TCR=78;TR=168;WE=68603594;WS=68603576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr1	68603731	rs1831297	A	G	1367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=31;PP=906;SC=TGTGGGAAACATGAAGGGCCA;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=13;TCR=31;TR=44;WE=68603739;WS=68603721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	68614013	rs2566789	A	G	2245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=52;PP=1649;SC=ACATTACAGAAATCCTAAAGA;SOR=2.012;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=21;TCR=52;TR=73;WE=68614021;WS=68614003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr1	68620762	rs3762371	G	A	9525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=177;NR=149;PP=2965;SC=CACATGTCAAGATCAATTACA;SOR=0.862;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=326;TCF=177;TCR=149;TR=326;WE=68620770;WS=68620752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,356:1.00:356
chr1	68652184	rs113664516	TA	T	277.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.97;ReadPosRankSum=1.089;SOR=0.662;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,21:0.30:70
chr1	68905358	rs1925955	G	C	1390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.083;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=41;PP=889;ReadPosRankSum=-1.701;SC=GGCTTTGGAAGAGCCTCTTAT;SOR=1.065;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=140;TCF=50;TCR=90;TR=61;WE=68905375;WS=68905348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,65:0.43:151
chr1	68943436	rs1924542	G	A	9436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.49;SOR=0.759;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr1	68943442	rs3790476	A	G	9375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.86;SOR=0.742;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr1	68943665	rs12119046	T	G	889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.847;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=18;PP=496;ReadPosRankSum=-0.721;SC=TCTGTAGTGATCAAAATGATA;SOR=0.582;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=70;TCF=36;TCR=34;TR=38;WE=68943673;WS=68943655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,43:0.55:78
chr1	68944633	rs12759438	A	T	1041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.179;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=16;PP=540;ReadPosRankSum=1.120;SC=ACACAGGATCAACACAGAAAT;SOR=0.893;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=126;TCF=75;TCR=51;TR=46;WE=68944641;WS=68944623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,54:0.38:142
chr1	68947318	rs3833522	C	CA	9379.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.52;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=119;PP=2979;SC=AATACCCCCCCAAAAATCATC;SOR=1.007;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=152;TCF=14;TCR=138;TR=133;WE=68947326;WS=68947308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,300:1.00:300
chr1	68955352	.	A	AT	100.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.864;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.223;HP=11;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.622;NF=0;NR=8;PP=69;ReadPosRankSum=0.213;SC=TTTAGAGCCTATTTTTTTTTT;SOR=2.655;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=8;WE=68955360;WS=68955342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr1	68960476	rs4926345	T	G	491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=12;PP=336;SC=TTAATTCACATCTGATTATAT;SOR=1.292;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=18;WE=68960484;WS=68960466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	70034370	rs11280966	C	CCAGCCGCGTG	6127.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=64.97;QD=40.31;SOR=1.716;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr1	70144056	rs72938954	T	C	1506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=21;PP=835;ReadPosRankSum=1.194;SC=TCTGATTCTCTCTTATAGGAT;SOR=0.648;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=125;TCF=85;TCR=40;TR=64;WE=70144064;WS=70144046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,73:0.51:143
chr1	70226125	rs12407496	T	C	976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.010;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=28;PP=693;ReadPosRankSum=-1.629;SC=TATTTCATAATTTTCAAATAC;SOR=0.431;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=86;TCF=22;TCR=64;TR=39;WE=70226133;WS=70226115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,42:0.46:91
chr1	70300399	rs11310186	AT	A	1922.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.972;NF=25;NR=25;PP=837;ReadPosRankSum=0.120;SC=AGAGATACATATTTTTTTTGT;SOR=0.661;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=57;TCR=59;TR=50;WE=70300408;WS=70300389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,91:0.53:173
chr1	70304664	rs78975854	A	G	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=174;ReadPosRankSum=0.123;SC=ACTCAATTAAATCAGTATAAC;SOR=0.430;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=12;WE=70304672;WS=70304654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr1	70397087	rs7530457	T	C	2300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=46;PP=1422;ReadPosRankSum=-0.104;SC=CAGTTTTGTGTACTACGCAAT;SOR=0.670;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=225;TCF=125;TCR=100;TR=103;WE=70397095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,116:0.47:249
chr1	70446182	rs12046022	G	A	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=21;PP=447;ReadPosRankSum=-0.327;SC=TTTGTTATACGTTTGTTGTAT;SOR=0.542;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=54;TCF=13;TCR=41;TR=28;WE=70446190;WS=70446172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,31:0.53:58
chr1	70460129	rs12024870	T	G	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.53;ReadPosRankSum=0.742;SOR=0.437;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr1	70460238	rs12035355	C	T	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.922;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=12;PP=336;ReadPosRankSum=-1.928;SC=TTCTTCTCTGCTTTAGGACTT;SOR=0.554;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=60;TCF=34;TCR=26;TR=27;WE=70460246;WS=70460228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,31:0.46:67
chr1	70486660	rs80149353	A	G	1172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=19;PP=782;ReadPosRankSum=0.149;SC=TTTTAAAAAAACAATAATACT;SOR=0.703;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=109;TCF=71;TCR=38;TR=53;WE=70486668;WS=70486650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,57:0.47:122
chr1	70587360	rs641909	C	T	1544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=20;PP=854;SC=TAAAAACTGACAACTTTTTGT;SOR=1.034;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=34;TCR=20;TR=54;WE=70587368;WS=70587350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
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chr1	70819912	rs112475035	C	T	2956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.342;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=65;PP=1708;ReadPosRankSum=1.629;SC=TCAGCTGTAGCCGGTGGTGAT;SOR=0.525;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=294;TCF=160;TCR=134;TR=131;WE=70819920;WS=70819902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,145:0.45:319
chr1	70904523	rs112004441	T	TTGTG,TTGTGTG	1757.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=16;NF=0,0;NR=32,32;PP=250,947;SC=AGTCTTATTATTGTGTGTGTG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=78;TCF=3;TCR=75;TR=32,32;WE=70904531;WS=70904513;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.29,0.71:38
chr1	71331498	rs1409986	A	G	896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.576;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=20;PP=511;ReadPosRankSum=1.667;SC=ATCACAGTAGAGGTGGGAAGA;SOR=0.518;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=97;TCF=55;TCR=42;TR=41;WE=71331506;WS=71331488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,46:0.43:106
chr1	71334870	rs1536537	C	T	1983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.579;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=36;PP=1069;ReadPosRankSum=0.238;SC=GTATGTGTGTCGGGGCAGGGG;SOR=0.371;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=125;TCF=75;TCR=50;TR=82;WE=71334878;WS=71334860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,91:0.68:134
chr1	71419499	rs571705	C	T	751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=19;PP=538;SC=ACAGTATAAGCTTGCTATAAT;SOR=2.066;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=25;WE=71419507;WS=71419489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	71440217	rs2072947	C	T	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=59;ReadPosRankSum=-0.108;SC=CTCATTTCTACTTCCATGCTT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=71440225;WS=71440207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr1	71477841	rs5673	A	T	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=116;ReadPosRankSum=-0.180;SC=AATTCACAGTAAGGTTTAGCG;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=6;WE=71477849;WS=71477831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr1	71512643	rs5671	C	A	3086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.409;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=70;PP=1877;ReadPosRankSum=0.182;SC=TGAAGCACCACGTCCCGGGCC;SOR=0.645;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=287;TCF=132;TCR=155;TR=133;WE=71512651;WS=71512633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,148:0.47:318
chr1	71537980	rs41287936	C	T	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=327;ReadPosRankSum=1.846;SC=GCTGATAATGCATTAAACTTA;SOR=0.614;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=42;TCF=11;TCR=31;TR=23;WE=71537991;WS=71537970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,26:0.52:50
chr1	71538191	rs11556475	A	G	1299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=3.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.62;ReadPosRankSum=0.053;SOR=0.409;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,60:0.58:103
chr1	71544069	rs74544306	G	A	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=301;ReadPosRankSum=0.036;SC=AATAAGAGCTGTAATATAAAC;SOR=1.002;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=43;TCF=36;TCR=7;TR=21;WE=71544077;WS=71544059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
chr1	72058367	rs1334004	C	T	786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=5;PP=583;SC=GTAAGGATTGCGTGATGTATA;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=27;WE=72058375;WS=72058357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	72058405	rs1334005	T	C	1907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=18;PP=1277;SC=GGTTGAGTTTTAAAATGAACG;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=45;TCR=18;TR=63;WE=72058413;WS=72058395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	72058552	rs1413368	G	A	4056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=62;PP=2494;SC=CAGCCACACAGGTATAATTGC;SOR=0.706;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=135;TCF=73;TCR=62;TR=135;WE=72058560;WS=72058542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr1	72242039	rs6424448	G	A	130.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=4;PP=74;SC=GTTGAAGTACGTATGATTAAT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=72242047;WS=72242029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	72747844	rs3101341	C	T	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.743;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=309;ReadPosRankSum=0.404;SC=CGGGCCGGGGCTCCGGGAAGA;SOR=2.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=17;WE=72747852;WS=72747834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr1	74550023	rs11210406	A	T	243.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=199;SC=TGAGCTCAAGATTTGCTTTTA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=74550031;WS=74550013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	74621574	rs148193468	T	C	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.749;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr1	74646514	rs6701961	C	T	1275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=27;PP=758;SC=AATAAATATTCTTCAAAAAGG;SOR=2.409;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=10;TCR=27;TR=37;WE=74646522;WS=74646504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	74701295	rs505508	T	A	226.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=156;SC=GCAGCATGTTTTGTGAAAGTC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=74701303;WS=74701285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	74819077	rs6424586	T	G	5878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=103;NR=91;PP=2965;SC=ACTAGTTCTATATGCTTATCA;SOR=0.711;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=195;TCF=103;TCR=92;TR=194;WE=74819085;WS=74819067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr1	74836217	rs7513825	G	A	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.098;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=192;ReadPosRankSum=-0.029;SC=AAGCTTAGGCGATAGAAAGTT;SOR=1.547;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=10;WE=74836225;WS=74836207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr1	74841173	rs2880795	A	C	680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=6;PP=505;SC=CTGAAAGATTAGAAACCTCCC;SOR=2.030;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=23;WE=74841181;WS=74841163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	75006027	rs3895907	A	G	5020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=98;PP=2965;SC=AGGTTTGTTAAGAAAACTACC;SOR=1.119;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=168;TCF=70;TCR=98;TR=168;WE=75006035;WS=75006017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr1	75006076	rs3845348	G	A	2334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=53;PP=1463;SC=AAGGGAGAAAGCATTGCATAT;SOR=1.939;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=23;TCR=53;TR=76;WE=75006084;WS=75006066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr1	75036783	rs9326115	T	C	3221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=38;PP=1713;SC=TTAAACTCACTGTCTGCCAGC;SOR=1.247;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=65;TCR=38;TR=103;WE=75036791;WS=75036773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr1	75036812	rs9326116	C	T	4342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=85;NR=50;PP=2268;SC=TAGACCTGCACGTTGTTGGGG;SOR=1.082;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=136;TCF=85;TCR=51;TR=135;WE=75036820;WS=75036802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr1	75037845	rs12723334	A	G	1621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.590;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=35;PP=1009;ReadPosRankSum=-0.524;SC=CTCTGGCTTCACTCAGTCTTT;SOR=0.810;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=223;TCF=125;TCR=98;TR=86;WE=75037853;WS=75037835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,92:0.37:246
chr1	75038228	rs11580409	A	C	3729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=393;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.760;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=87;PP=2495;ReadPosRankSum=0.415;SC=TCTCTTGCTAAATCTAATTCC;SOR=0.749;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=359;TCF=177;TCR=182;TR=167;WE=75038236;WS=75038218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:211,181:0.46:392
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chr1	75097426	rs11210490	G	C	1461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.026;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=27;PP=912;ReadPosRankSum=-0.397;SC=AAGCCATTTGGAGCAGTGGTT;SOR=0.543;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=132;TCF=74;TCR=58;TR=59;WE=75097434;WS=75097416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,69:0.46:151
chr1	75108863	rs623171	A	C	862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.209;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=19;PP=567;ReadPosRankSum=-2.210;SC=ATTCCAACAGATAACTATATT;SOR=1.011;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=53;TCF=21;TCR=32;TR=31;WE=75108871;WS=75108853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,36:0.59:61
chr1	75172001	rs7527057	T	A	1796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.585;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=29;PP=1022;ReadPosRankSum=1.371;SC=GAATCATTTTTCCAGTAGCCC;SOR=0.788;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=150;TCF=91;TCR=59;TR=78;WE=75172009;WS=75171991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,86:0.52:165
chr1	75172756	rs71695861	TAA	T	488.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.58;ReadPosRankSum=2.135;SOR=0.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr1	75175886	rs3819946	T	C	2134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.113;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=44;PP=1303;ReadPosRankSum=0.898;SC=GTGCCCAAAATCTTTAAGCCA;SOR=0.753;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=172;TCF=93;TCR=79;TR=92;WE=75175894;WS=75175876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,102:0.53:193
chr1	75190452	rs1051122	C	T	2436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.937;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=52;PP=1507;ReadPosRankSum=-0.288;SC=GGACTTCTGGCCCACCAAATT;SOR=0.634;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=231;TCF=126;TCR=105;TR=112;WE=75190460;WS=75190442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,125:0.48:263
chr1	75199152	rs277373	C	T	1734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=18;NR=45;PP=1166;SC=TGCGAAACTTCAGGAGCCCTG;SOR=2.035;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=64;TCF=18;TCR=46;TR=63;WE=75199160;WS=75199142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	75603055	rs1526503	A	G	1280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=29;PP=894;SC=GTTCTGGGTGAAGGTTGTAGG;SOR=2.007;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=10;TCR=29;TR=39;WE=75603063;WS=75603045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	75614380	rs35220110	CT	C	422.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=1.385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQRankSum=0.000;QD=11.12;ReadPosRankSum=1.636;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,25:0.66:38
chr1	75622616	rs941032	C	T	2997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=40;PP=1681;SC=ACAAGAAACACGTCAGTCCTA;SOR=1.028;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=63;TCR=40;TR=103;WE=75622624;WS=75622606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr1	75626420	rs2462955	A	T	2459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=10;PP=1590;SC=GATGAAAACAATGCCTTGGAT;SOR=3.285;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=60;TCR=10;TR=70;WE=75626428;WS=75626410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr1	75680433	rs687715	G	A	3562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=56;NR=67;PP=2115;SC=ACAATCCAATGACAGGAAGGT;SOR=0.957;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=123;TCF=56;TCR=67;TR=123;WE=75680441;WS=75680423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr1	75680545	rs688513	T	G	345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=258;SC=CAACTCTCAGTGTCATTGACA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=75680553;WS=75680535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	75681351	rs594470	A	T	358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=268;SC=AACTGCATGAAGTAAAAGTAC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=75681359;WS=75681341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	75681511	rs595009	T	C	5388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=98;NR=85;PP=2965;SC=TCAGGCAGCATTGTAGGAATT;SOR=0.764;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=183;TCF=98;TCR=85;TR=183;WE=75681519;WS=75681501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr1	75685403	rs600734	T	C	6974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=147;NR=82;PP=2965;SC=TTCCCAGGGATAGAAAACACT;SOR=1.243;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=229;TCF=147;TCR=82;TR=229;WE=75685411;WS=75685393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr1	75699646	rs10493564	T	C	1801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.243;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=24;PP=1360;ReadPosRankSum=0.989;SC=TGATATTTGATAATTTGAAGA;SOR=0.913;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=136;TCF=91;TCR=45;TR=76;WE=75699654;WS=75699636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,79:0.54:145
chr1	75699771	rs10493565	A	G	2531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.492;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=56;PP=1566;ReadPosRankSum=-0.251;SC=GGACCATGGCAATCGTCAGGC;SOR=0.936;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=215;TCF=104;TCR=111;TR=99;WE=75699779;WS=75699761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,119:0.47:254
chr1	75699831	rs10493566	G	A	1358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.217;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=36;PP=757;ReadPosRankSum=0.025;SC=GCTAAACACAGCATATTACAA;SOR=0.900;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=117;TCF=48;TCR=69;TR=57;WE=75699839;WS=75699821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,66:0.48:137
chr1	75702674	rs17096508	G	A	496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.993;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=309;ReadPosRankSum=1.848;SC=TCACTTACATGAGAATCCAAT;SOR=1.488;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=42;TCF=27;TCR=15;TR=22;WE=75702682;WS=75702664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,24:0.49:49
chr1	75704070	rs141512125	CATATATATATAT	C	227.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=4;NR=0;PP=1214;SC=ACGTATATTTCATATATATAT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=4;WE=75704089;WS=75704060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	75707652	rs7556057	C	T	1763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.449;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=31;PP=1106;ReadPosRankSum=1.911;SC=TTTGGTAGATCCTATGTTTCT;SOR=0.904;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=182;TCF=105;TCR=77;TR=81;WE=75707660;WS=75707642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,87:0.43:203
chr1	75708529	rs1856128	A	T	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.072;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=11;PP=508;ReadPosRankSum=0.791;SC=ATTGAAAAAAAAAGTTAAATT;SOR=0.504;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=57;TCF=41;TCR=16;TR=34;WE=75708537;WS=75708519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,36:0.59:61
chr1	75716925	rs588098	C	T	2438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-2.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.159;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=45;PP=1288;ReadPosRankSum=0.729;SC=GGTTTAGCAACACGGAGGGAC;SOR=0.713;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=210;TCF=110;TCR=100;TR=101;WE=75716933;WS=75716915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,117:0.48:244
chr1	75823084	rs1249833	C	T	104.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=78;SC=TCTCTGAGCACTGAGTAGAAT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=75823092;WS=75823074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	75868236	rs1249777	G	T	661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.494;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=15;PP=320;ReadPosRankSum=-0.469;SC=GCTGAAGTAGGGTGAGGCATC;SOR=1.149;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=40;TCF=17;TCR=23;TR=24;WE=75868244;WS=75868226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,30:0.59:51
chr1	76143505	rs1746748	T	C	1722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=49;PP=1163;SC=ACGCAGAAGATGGGTGATTTC;SOR=2.730;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=13;TCR=49;TR=62;WE=76143513;WS=76143495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr1	76194229	rs11316888	GT	G	2729.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=52;PP=2125;SC=AGCTTTATATGTTTTGTTTGG;SOR=1.781;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=57;TCF=5;TCR=52;TR=56;WE=76194237;WS=76194219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr1	76194306	rs1146572	A	G	587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=17;PP=451;SC=TCCACAGATAATTTACAATAA;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=76194314;WS=76194296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	76205530	.	T	C	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=53;ReadPosRankSum=-0.674;SC=TCTTTGATTTTGTAAGAACAT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=4;WE=76205538;WS=76205520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr1	76234886	rs1146593	A	G	986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=18;NR=15;PP=492;SC=TCACCTTCCAACATCATTGAA;SOR=0.798;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=18;TCR=15;TR=33;WE=76234894;WS=76234876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	76235001	rs1826978	A	G	141.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=111;SC=GTGAAAATGGACTAATACAGT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=76235009;WS=76234991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	76257074	rs35837562	A	AT	145.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.62;ReadPosRankSum=-0.331;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr1	76257892	rs12703	A	T	3525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=46;PP=2003;SC=GATTTCTGGCAATTACAAGTC;SOR=1.102;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=73;TCR=46;TR=119;WE=76257900;WS=76257882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr1	76272837	rs3737574	A	G	3124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=58;PP=1778;SC=GTAAGTATTAATAATTCTAGA;SOR=1.508;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=37;TCR=58;TR=95;WE=76272845;WS=76272827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr1	76280543	rs1144339	A	G	275.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=226;SC=ACTTAGCAAGAATAATCATTC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=76280551;WS=76280533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	76333352	rs5745437	G	A	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=126;ReadPosRankSum=0.778;SC=TTTCAAACTCGGAAAATTGCA;SOR=0.818;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=10;WE=76333360;WS=76333342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr1	76344011	rs1493367	C	A	1240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=29;PP=791;SC=CAGGTAATTTCTTTATTTGAT;SOR=2.200;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=12;TCR=29;TR=41;WE=76344019;WS=76344001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	76344705	rs5745448	T	C	5347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.10;SOR=0.960;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr1	76344711	rs5745449	A	T	5429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.44;SOR=0.920;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr1	76344920	rs5745453	G	A	198.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=132;SC=TGAATGTTCTGTATCTTCTCC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=76344928;WS=76344910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	76345640	rs2307077	G	T	924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=6;PP=556;SC=AGAGTAAAATGATTAACCTAA;SOR=2.165;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=28;WE=76345648;WS=76345630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	76345884	rs2307078	T	A	571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=11;PP=268;SC=ATTGGTTTAATTTGAGAAACT;SOR=2.200;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=15;WE=76345892;WS=76345874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	76346920	rs5745466	C	CAT	2756.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=13;PP=1895;SC=TCTTACCAAACGTGTTTTCAG;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=25;TCR=13;TR=38;WE=76346928;WS=76346910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	76365191	rs5745544	C	A	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=233;ReadPosRankSum=-0.470;SC=TTCAGAAGTGCCTCTAGAAGG;SOR=0.551;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=12;WE=76365199;WS=76365181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr1	76378345	.	G	GTA	1470	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=27;MQ=59.82;NF=9;NR=15;PP=1470;QD=61.6666666667;SC=TGGTATTTGTGTATATATATA;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=65;TCF=29;TCR=36;TR=24;WE=76378371;WS=76378335;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:41,24:0.37:65
chr1	76378359	rs71644658	ATT	A	254.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=2.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.07;ReadPosRankSum=-0.914;SOR=1.222;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,16:0.19:83
chr1	76378361	rs5020911	T	A	1420.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-3.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=1.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.12;ReadPosRankSum=1.067;SOR=0.471;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,58:0.70:83
chr1	76378363	rs28693610	T	A	3116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.13;ReadPosRankSum=1.024;SOR=1.168;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,105:0.98:107
chr1	76387748	rs12567390	T	A	2204.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=22;PP=1490;SC=CCATTTTTTTTAAAGTAGTTT;SOR=2.147;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=52;TCR=22;TR=74;WE=76387756;WS=76387738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr1	76397972	rs3795251	C	T	3771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=75;PP=2431;SC=AGTAGATTTACTCATTGTTAC;SOR=1.455;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=122;TCF=47;TCR=75;TR=122;WE=76397980;WS=76397962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr1	76608777	rs184095	C	T	790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=22;PP=564;SC=AAATTGAACTCACCCTGTTTA;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=27;WE=76608785;WS=76608767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	76771475	rs10782610	G	T	2353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=25;PP=1524;SC=ATCAGTTAGAGAATTATTTAT;SOR=1.583;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=55;TCR=25;TR=80;WE=76771483;WS=76771465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr1	76771495	rs11162118	G	C	1341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.455;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=20;PP=871;ReadPosRankSum=0.064;SC=TATAATCTCAGTTTTCCAGAC;SOR=0.851;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=114;TCF=75;TCR=39;TR=58;WE=76771503;WS=76771485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,62:0.49:126
chr1	76878156	rs17098942	C	T	1322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.682;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=34;PP=754;ReadPosRankSum=1.118;SC=TATGCTAAATCTTCGCCAATT;SOR=0.483;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=102;TCF=32;TCR=70;TR=52;WE=76878164;WS=76878146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,60:0.53:113
chr1	76878920	.	A	C	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.408;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=2.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.41;ReadPosRankSum=-0.325;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,10:0.34:29
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chr1	77627096	rs839825	G	A	1469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=24;PP=893;SC=TGATGCTATGGAAAGGGGGAA;SOR=0.767;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=24;TCR=24;TR=48;WE=77627104;WS=77627086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
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chr1	77629444	rs2293253	T	C	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=265;ReadPosRankSum=-1.948;SC=AAGTTAAAAATCTTAAAAAAT;SOR=0.811;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=48;TCF=34;TCR=14;TR=23;WE=77629452;WS=77629434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,27:0.52:52
chr1	77634948	rs1779199	G	A	4718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=103;NR=59;PP=2965;SC=AATTTACCTCGTAACTTCTAT;SOR=1.294;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=162;TCF=103;TCR=59;TR=162;WE=77634956;WS=77634938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr1	77635175	rs150380534	TCTC	T	190.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.483;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=172;ReadPosRankSum=-1.742;SC=TGTTCATTTTTCTCCTCCTTA;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=5;WE=77635185;WS=77635165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr1	77752921	.	TG	T	20	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=20;QD=31.5;SC=TATAAATGCCTGAAGTCATTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=2;WE=77752929;WS=77752911;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,2:0.22:9
chr1	77763542	rs1167206	G	A	2297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=34;NR=43;PP=1218;SC=CAGAGATAAAGCAAAAATTGA;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=34;TCR=43;TR=77;WE=77763550;WS=77763532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr1	77949123	rs7515509	G	A	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=1.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.21;ReadPosRankSum=-1.695;SOR=0.435;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr1	77949129	rs7528932	A	T	647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.34;ReadPosRankSum=-1.280;SOR=0.425;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr1	78001881	rs10873948	T	C	154.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.11;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	78024284	rs6675743	T	C	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.137;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=228;ReadPosRankSum=-1.092;SC=CTTTTAAATATAGATAAATGC;SOR=0.283;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=47;TCF=33;TCR=14;TR=17;WE=78024292;WS=78024274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,21:0.38:55
chr1	78024345	rs79671213	C	CTAT	1899.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-1.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.644;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=9;PP=701;ReadPosRankSum=-1.241;SC=GCTATTGACTCTATTTTCTGA;SOR=0.950;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=52;TCF=17;TCR=35;TR=18;WE=78024353;WS=78024335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,50:0.51:98
chr1	78031994	rs7552291	A	G	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=121;ReadPosRankSum=0.201;SC=GGACAGTAATATAACACACAA;SOR=0.275;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=8;WE=78032002;WS=78031984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr1	78033981	rs145860524	AAAATG	A	1232.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.278;NF=6;NR=8;PP=624;ReadPosRankSum=-0.276;SC=ATAAATAAATAAAATGAAATG;SOR=0.836;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=28;TCF=11;TCR=17;TR=14;WE=78033993;WS=78033971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,32:0.67:48
chr1	78045055	.	C	T	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-3.385;ClippingRankSum=0.000;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.488;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=309;ReadPosRankSum=0.768;SC=CTGAAATCAACGAAAATATAT;SOR=0.078;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=21;WE=78045063;WS=78045045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,22:0.56:39
chr1	78045369	rs1565852	G	A	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.533;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=329;ReadPosRankSum=-0.506;SC=TTAAATATTGGATTTCTAAAT;SOR=2.043;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=39;TCF=5;TCR=34;TR=17;WE=78045377;WS=78045359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,19:0.42:45
chr1	78166978	rs115007809	C	T	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=354;ReadPosRankSum=0.887;SC=CAAGTGCACACAGATATTCAA;SOR=1.251;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=34;TCR=2;TR=18;WE=78166986;WS=78166968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr1	78178976	rs6603958	T	A	562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.831;NF=9;NR=20;PP=460;ReadPosRankSum=1.680;SC=CCTAAAAAAATATATAAACAT;SOR=0.693;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=65;TCF=19;TCR=46;TR=29;WE=78178984;WS=78178965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,31:0.42:73
chr1	78179032	rs71075758	AT	A	139.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.955;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.349;NF=0;NR=9;PP=88;ReadPosRankSum=0.789;SC=CATTAAACTCATTTTTTTTTT;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=9;WE=78179040;WS=78179022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr1	78184325	rs12142671	A	G	1038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.763;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=24;PP=518;ReadPosRankSum=0.071;SC=CCATTTCTCAACCTAAGGGGA;SOR=0.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=42;TCR=47;TR=46;WE=78184333;WS=78184315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,52:0.53:98
chr1	78184433	rs1963170	G	A	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.457;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=103;ReadPosRankSum=-0.634;SC=TGGCAAACATGGTGAAATCCC;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=6;WE=78184441;WS=78184423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr1	78200005	rs3767037	T	C	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.202;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=331;ReadPosRankSum=-2.111;SC=ATTATACAAATAAAACAAAAT;SOR=1.329;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=51;TCF=41;TCR=10;TR=22;WE=78200013;WS=78199995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,24:0.44:55
chr1	78201745	rs2296227	G	T	1294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.808;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=20;PP=765;ReadPosRankSum=-1.002;SC=ATTTACCTCTGGCCCTAAGTT;SOR=1.051;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=144;TCF=83;TCR=61;TR=57;WE=78201753;WS=78201735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,65:0.40:161
chr1	78206682	rs2274123	A	C	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=126;ReadPosRankSum=1.016;SC=ATGTAAATTTATAACAGCATT;SOR=0.760;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=9;WE=78206690;WS=78206672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
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chr1	79355596	rs1061728	A	G	1428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=29;PP=814;SC=TGAGATCAAAATCACTGCTTA;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=18;TCR=29;TR=47;WE=79355604;WS=79355586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	79357360	rs2275902	G	C	3018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.478;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=69;PP=1902;ReadPosRankSum=0.651;SC=AAGAGCGAGGGCTCCTCTTGC;SOR=0.759;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=222;TCF=105;TCR=117;TR=130;WE=79357372;WS=79357350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,141:0.58:242
chr1	79383300	rs5775467	CA	C	186.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.707;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.077;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=1;PP=50;ReadPosRankSum=0.281;SC=ATTGTAATAACAATTTTATAT;SOR=0.275;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=3;WE=79383308;WS=79383290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
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chr1	79387242	rs3811440	C	T	796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.686;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=5;PP=520;ReadPosRankSum=0.125;SC=TCGAATGATGCGGAAAAAAAA;SOR=1.280;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=54;TCR=10;TR=32;WE=79387252;WS=79387232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,33:0.49:67
chr1	79392756	rs12754818	C	A	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.958;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=85;ReadPosRankSum=-0.400;SC=TTATAATATACAAATGCAACT;SOR=1.179;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=7;WE=79392764;WS=79392746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,7:0.28:25
chr1	79401927	rs61770681	A	G	695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.050;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=10;PP=428;ReadPosRankSum=-0.913;SC=TGCATGATAAATATTTATTGC;SOR=1.042;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=65;TCF=42;TCR=23;TR=29;WE=79401935;WS=79401917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,32:0.46:70
chr1	79403751	rs985277	T	G	1038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.639;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=21;PP=539;ReadPosRankSum=0.764;SC=AATTCAAAGCTCAATTATATT;SOR=0.722;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=115;TCF=61;TCR=54;TR=43;WE=79403759;WS=79403741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,56:0.40:140
chr1	79411888	rs723898	T	C	353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=269;ReadPosRankSum=-0.768;SC=TTGGTTTGAATATGTTTAACC;SOR=0.473;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=15;WE=79411896;WS=79411878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr1	79411918	rs6675156	A	G	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.374;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=5;PP=489;ReadPosRankSum=1.583;SC=AACAAACAATAAGAGATATAT;SOR=0.462;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=52;TCF=43;TCR=9;TR=26;WE=79411926;WS=79411908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,27:0.49:55
chr1	79472141	rs1571992	C	A	3042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=35;PP=2015;SC=TTGGAATATTCAACTTTAGAG;SOR=1.609;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=106;TCF=71;TCR=35;TR=105;WE=79472149;WS=79472131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr1	81967466	.	TCAG	T	52.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=8.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQRankSum=0.635;QD=1.76;ReadPosRankSum=-0.320;SOR=1.441;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,4:0.13:30
chr1	81970883	.	C	CCA	38.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.46;ReadPosRankSum=1.282;SOR=0.991;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr1	82402364	rs142993868	TAATC	T	1298.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=8;PP=778;SC=TAAGTGAAAATAATCAAATAA;SOR=1.536;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=9;TCR=9;TR=16;WE=82402375;WS=82402354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	82415814	rs9438715	T	C	1581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=10;PP=1105;SC=CATGTGTGCATGACTGTATGT;SOR=2.437;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=41;TCR=10;TR=51;WE=82415822;WS=82415804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	82421596	rs11163397	C	T	6469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=130;NR=83;PP=2965;SC=TTCTGAGACCCGAAGCTTTGG;SOR=1.108;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=214;TCF=131;TCR=83;TR=213;WE=82421604;WS=82421586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr1	82433819	rs145464208	G	A	2642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.450;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=57;PP=1505;ReadPosRankSum=-0.322;SC=AATAAAACTCGAACAACGTGT;SOR=0.649;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=232;TCF=118;TCR=114;TR=115;WE=82433827;WS=82433809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,130:0.50:261
chr1	84355734	rs71826512	AAGAACTTCAAGGAT	A	3119.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.17;MQRankSum=1.580;NF=6;NR=41;PP=2966;ReadPosRankSum=0.744;SC=GCGACTGCAGAAGAACTTCAA;SOR=0.696;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=101;TCF=9;TCR=92;TR=47;WE=84355755;WS=84355724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,83:0.45:185
chr1	84383079	rs17534614	G	A	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=294;ReadPosRankSum=1.234;SC=ACTGTCATCAGGAAAATAACC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=13;WE=84383087;WS=84383069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr1	84464900	rs151257524	G	A	92.81	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5165;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=88;ReadPosRankSum=-0.842;SC=CGTGCCGAGAGGCGCGGGCGC;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=5;WE=84464908;WS=84464890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr1	84640691	rs582201	T	G	1658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=36;NR=24;PP=957;SC=TTTAATCATTTTCTAATTTAT;SOR=1.010;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=36;TCR=24;TR=60;WE=84640699;WS=84640681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr1	84640834	rs12132002	T	G	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=60;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TTATATATTTTTAAGTATATC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=84640842;WS=84640824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr1	84765340	rs10658515	G	GTATA	471	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=0.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5020;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=1.203;NF=0;NR=10;PP=352;ReadPosRankSum=0.116;SC=GAGTACTAGTGTATATATATA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=10;WE=84765348;WS=84765330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,14:0.93:15
chr1	84791239	rs315555	T	C	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=115;ReadPosRankSum=1.354;SC=GAAAGGCCTGTCCCAGAAGAC;SOR=0.293;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=7;WE=84791247;WS=84791229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr1	84810396	rs315528	A	C	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=312;ReadPosRankSum=-0.172;SC=GTGTGCCTCAAAATGCTTCCT;SOR=1.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=15;WE=84810404;WS=84810386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr1	84810415	.	AT	A	629.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.544;ClippingRankSum=0.000;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=580;ReadPosRankSum=1.721;SC=CTCCCCTGATATTAAGAAGGC;SOR=0.811;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=17;WE=84810423;WS=84810405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,21:0.52:40
chr1	84810815	rs315527	A	G	12095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=464;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=214;NR=204;PP=2965;SC=TGTAAGCAGCAGACTGAGAAA;SOR=0.719;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=418;TCF=214;TCR=204;TR=418;WE=84810823;WS=84810805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,462:1.00:462
chr1	84853957	rs665074	A	T	2772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=29;PP=1773;SC=AAATTTTGCAATAAAGGATAA;SOR=1.477;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=64;TCR=29;TR=93;WE=84853965;WS=84853947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr1	84876711	rs3216015	C	CA	4509.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.09;NF=3;NR=61;PP=2957;SC=AGAAAAAAAACGATAACTATG;SOR=1.371;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=69;TCF=3;TCR=66;TR=64;WE=84876719;WS=84876701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr1	84876731	rs1506700	T	G	1963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=50;PP=1456;SC=GTTGAAGAAATGATTTGGAAA;SOR=2.235;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=15;TCR=50;TR=65;WE=84876739;WS=84876721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr1	84878228	rs7511984	C	T	1599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=34;PP=955;SC=CTTTTCTTGACGGTATGAAAG;SOR=1.688;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=19;TCR=34;TR=53;WE=84878236;WS=84878218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	84944989	rs2292191	A	G	1243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.568;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=15;PP=697;ReadPosRankSum=-0.459;SC=GGATAAGAGCAGCAGCAGCGG;SOR=0.974;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=92;TCF=61;TCR=31;TR=50;WE=84944997;WS=84944979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,59:0.55:107
chr1	84946745	rs7413066	C	T	1000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=19;PP=559;SC=TAGGGAATCCCTCCTGATATT;SOR=1.675;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=10;TCR=19;TR=29;WE=84946753;WS=84946735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	84956161	.	CT	C	189.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=0.000;DP=239;ExcessHet=3.0103;FS=5.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.96;ReadPosRankSum=0.837;SOR=0.456;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:162,35:0.18:197
chr1	84963000	rs1246159	A	G	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.871;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=388;ReadPosRankSum=-0.598;SC=GTTTTTCAGCACTAGTGTTAC;SOR=0.313;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=54;TCF=42;TCR=12;TR=30;WE=84963008;WS=84962990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,31:0.55:56
chr1	84986213	rs5775789	AT	A	331.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=2;PP=235;SC=ACATCAATTGATTTTTTTTTT;SOR=2.985;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=12;WE=84986221;WS=84986203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	84991488	rs2292808	T	G	1218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.701;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=20;PP=700;ReadPosRankSum=-0.580;SC=GCACTGCTTTTAATTGCAAAC;SOR=0.576;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=98;TCF=57;TCR=41;TR=46;WE=84991496;WS=84991478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,55:0.48:114
chr1	84998445	rs6690204	C	G	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=126;ReadPosRankSum=0.121;SC=CTGAAATCTACGATAAGATTA;SOR=1.136;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=8;WE=84998453;WS=84998435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr1	84999571	rs10874451	T	C	202.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.8362;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=161;ReadPosRankSum=0.887;SC=CTAATATCAATATAATCAATA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=7;WE=84999579;WS=84999561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr1	85009894	rs12143652	A	G	3499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.145;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=66;PP=2117;ReadPosRankSum=1.030;SC=GACAGCTGAAAAAGAGTACAT;SOR=0.770;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=302;TCF=159;TCR=143;TR=151;WE=85009902;WS=85009884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,170:0.50:339
chr1	85016177	rs1400777	A	G	1055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=23;PP=632;ReadPosRankSum=-1.175;SC=AGAGAAAACTAGATACTGACA;SOR=0.700;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=73;TCF=37;TCR=36;TR=44;WE=85016185;WS=85016167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,49:0.59:83
chr1	85029077	rs15911	C	T	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.892;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=13;PP=368;ReadPosRankSum=-0.071;SC=CGGAAAGGGACTTTTGCAATG;SOR=0.814;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=32;TCR=32;TR=26;WE=85029085;WS=85029067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,31:0.44:71
chr1	85031630	rs2994953	G	A	1891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.525;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=44;PP=1082;ReadPosRankSum=0.129;SC=AAGCATCTGCGATTCCAGTAT;SOR=0.765;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=170;TCF=80;TCR=90;TR=80;WE=85031638;WS=85031620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,93:0.47:198
chr1	85036239	rs2303306	C	G	1482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.400;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=32;PP=963;ReadPosRankSum=-2.043;SC=CCAATTGCTGCACACATAGAT;SOR=0.878;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=187;TCF=104;TCR=83;TR=75;WE=85036247;WS=85036229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,83:0.39:215
chr1	85039828	rs41299545	G	A	1990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=37;PP=1253;ReadPosRankSum=-1.141;SC=GCTGGTTTCGGCGCCCACGGC;SOR=0.708;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=185;TCF=109;TCR=76;TR=90;WE=85039836;WS=85039818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,99:0.46:215
chr1	85039955	rs2303307	G	A	1988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.944;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=46;PP=1262;ReadPosRankSum=0.477;SC=TCGGGCGGCAGAGCTCAGGCT;SOR=0.901;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=154;TCF=68;TCR=86;TR=82;WE=85039963;WS=85039945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,92:0.55:168
chr1	85039998	rs142534762	CGCAGCGCCA	C	1054.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.976;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.145;NF=1;NR=17;PP=2985;ReadPosRankSum=1.651;SC=GGCCGCGAGCCGCAGCGCCAG;SOR=0.878;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=64;TCF=5;TCR=59;TR=18;WE=85040014;WS=85039988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,29:0.45:65
chr1	85040069	rs2911592	GC	AA	765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=63;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.216;NF=6;NR=13;PP=622;ReadPosRankSum=1.819;SC=TAGAGACGAGGCGCCAGCGTC;SOR=0.781;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=45;TCF=15;TCR=30;TR=19;WE=85040078;WS=85040059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,21:0.42:50
chr1	85096592	rs11164027	C	T	1976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.690;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=43;PP=1279;ReadPosRankSum=2.615;SC=TAATGTGTTACTATAAGCCTC;SOR=0.938;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=150;TCF=73;TCR=77;TR=78;WE=85096600;WS=85096582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,88:0.52:170
chr1	85096920	rs6695249	A	G	1900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.550;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=27;PP=1190;ReadPosRankSum=0.920;SC=AACAAAAAAAATATTCCTATA;SOR=0.778;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=179;TCF=115;TCR=64;TR=79;WE=85096928;WS=85096910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,89:0.46:195
chr1	85097247	rs12031476	T	G	1176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.711;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=16;PP=727;ReadPosRankSum=0.269;SC=TTCCACCTGTTTAATTTTACC;SOR=0.834;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=112;TCF=72;TCR=40;TR=50;WE=85097255;WS=85097237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,54:0.45:119
chr1	85113203	rs2994949	T	C	6955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=122;NR=116;PP=2965;SC=CAGGTCTTGATGCCACACTCC;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=238;TCF=122;TCR=116;TR=238;WE=85113211;WS=85113193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr1	85113229	rs1057746	A	G	2310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.511;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=56;PP=1360;ReadPosRankSum=-0.392;SC=TGATTTGTACATTCTCCTCCA;SOR=0.803;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=232;TCF=110;TCR=122;TR=105;WE=85113237;WS=85113219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,116:0.45:255
chr1	85121255	rs4537578	A	G	2007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.090;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=53;PP=1260;ReadPosRankSum=0.637;SC=TAAAACACTTAGCAGGAGAAA;SOR=0.615;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=186;TCF=75;TCR=111;TR=89;WE=85121263;WS=85121245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,98:0.47:209
chr1	85128262	rs2911563	A	G	1745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.350;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=47;PP=1092;ReadPosRankSum=0.120;SC=ATGCTTAAGCATCTAAAACTC;SOR=0.559;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=141;TCF=49;TCR=92;TR=74;WE=85128270;WS=85128252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,81:0.53:152
chr1	85128280	rs2994437	T	C	3232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=72;PP=2212;SC=CTCTAATGCATTCTATACACG;SOR=1.715;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=34;TCR=72;TR=106;WE=85128288;WS=85128270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr1	85128305	rs11164033	G	C	1057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.300;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=28;PP=695;ReadPosRankSum=0.911;SC=TGGTGAAAGTGAACCTGGTAT;SOR=0.283;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=74;TCF=19;TCR=55;TR=41;WE=85128313;WS=85128295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,44:0.57:77
chr1	85131641	rs2911566	G	C	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=92;ReadPosRankSum=0.811;SC=GGGTTCCTGAGCTTCCAGTTA;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=6;WE=85131649;WS=85131631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr1	85131982	rs3096445	T	G	1246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=34;PP=987;SC=ATCCTTAAAATATCAGTAACA;SOR=3.967;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=38;WE=85131990;WS=85131972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	85331808	rs146269415	G	GAGA	6351.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=68;PP=2965;SC=ATTCATTGTGGAGAAGTGAAC;SOR=1.448;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=83;TCF=9;TCR=74;TR=76;WE=85331816;WS=85331798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr1	85488030	rs2028304	G	A	7646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=118;NR=138;PP=2965;SC=CAAGCCACACGAGCATGGTAG;SOR=0.976;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=256;TCF=118;TCR=138;TR=256;WE=85488038;WS=85488020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,286:1.00:286
chr1	85488154	rs2039814	G	C	649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=16;PP=477;SC=ATTGAGGTAAGTATGAGTAAG;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=85488162;WS=85488144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	85537502	rs4907131	T	A	246.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=233;SC=CCAGGGTAAATCTTAGAAAAC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=85537510;WS=85537492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	85537522	rs4907132	T	C	483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=2;PP=406;SC=CATATTCTTATGTTTATTAAA;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=85537530;WS=85537512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	85547945	rs7534574	T	C	1474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=14;PP=953;SC=TGAATGACCATTGAACATTAA;SOR=1.791;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=35;TCR=14;TR=49;WE=85547953;WS=85547935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	85550156	.	AAT	A,AATAT	77.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.000;ClippingRankSum=-0.000;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=3.090;HP=3;HapScore=3;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.473;NF=5,5;NR=3,3;PP=73,251;ReadPosRankSum=-0.179;SC=TTTGTTGCAAAATATATATAT;SOR=0.078;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=8,8;WE=85550165;WS=85550146;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.36:11
chr1	85551468	rs111823967	A	ATCAGTTTTTCT	656.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=2;PP=691;SC=TTGCCTACACATCAGGGACTT;SOR=2.303;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=11;WE=85551476;WS=85551458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	85555672	rs1417351	A	C	926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=7;PP=572;SC=AATTCAATGTATATAATTTAA;SOR=1.681;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=29;WE=85555680;WS=85555662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	85559118	rs11304107	CT	C	4157.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=38;PP=2373;SC=ATCTTAATTGCTTTTTTTATT;SOR=1.810;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=117;TCF=60;TCR=57;TR=85;WE=85559126;WS=85559108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr1	85559452	rs709762	A	G	7683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=124;NR=135;PP=2965;SC=CTCTGTACTCACTAGGTACCT;SOR=0.794;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=260;TCF=124;TCR=136;TR=259;WE=85559460;WS=85559442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,290:1.00:290
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chr1	85560313	rs709765	T	C	412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=12;PP=259;SC=CAGTTTTTATTGCAAAGTACT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=85560321;WS=85560303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	85561546	rs709766	T	C	2153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=23;PP=1415;SC=ACTGTCTTAATATTATTTTCT;SOR=1.522;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=49;TCR=23;TR=72;WE=85561554;WS=85561536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
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chr1	85564138	rs817489	A	G	1134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=12;PP=746;SC=ATTTTAATTGAGATGATGAGT;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=26;TCR=12;TR=38;WE=85564146;WS=85564128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	85573705	rs11427716	A	AC	4402.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.38;QD=38.62;SOR=1.919;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr1	85574021	rs709759	G	A	310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=287;SC=TCCTTGATTGGGAGGATTTTT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=85574029;WS=85574011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	85575838	rs376334573	TA	T	166.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.17;ReadPosRankSum=-0.752;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,15:0.38:40
chr1	85583323	rs817471	T	A	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.902;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=307;ReadPosRankSum=-0.239;SC=CAAATGCAGGTGGCAAGGGGC;SOR=0.142;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=41;TCF=37;TCR=4;TR=18;WE=85583331;WS=85583313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,20:0.47:43
chr1	85589939	rs11356964	GT	G	4948.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.928;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.352;NF=7;NR=84;PP=2948;ReadPosRankSum=-1.399;SC=GTTATGGTAAGTTGCCTGCAA;SOR=0.818;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=186;TCF=22;TCR=164;TR=91;WE=85589947;WS=85589929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,158:0.52:301
chr1	85590031	rs817473	G	A	870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.624;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=28;PP=649;ReadPosRankSum=-0.243;SC=GTGCCTTTGGGACACTTTTTA;SOR=0.368;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=68;TCF=13;TCR=55;TR=36;WE=85590039;WS=85590021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,37:0.52:71
chr1	85592126	rs817474	G	T	686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=5;PP=433;SC=TTAATGAACAGCATGGTGAAT;SOR=2.215;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=22;WE=85592134;WS=85592116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	85594466	rs709783	G	A	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.805;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=15;PP=322;ReadPosRankSum=0.270;SC=ACATTAAGTCGCCCTTCCACC;SOR=0.824;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=74;TCF=39;TCR=35;TR=30;WE=85594474;WS=85594456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,38:0.43:88
chr1	85595645	rs1020770	C	T	2671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=53;PP=1528;ReadPosRankSum=0.494;SC=CTGCCTGTCACCCTCTCATGG;SOR=0.689;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=197;TCF=102;TCR=95;TR=109;WE=85595653;WS=85595635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,123:0.56:220
chr1	85598527	rs36118758	TC	T	2225.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=14;PP=949;SC=TTGTTTTTCTTCCCCCCCCAG;SOR=2.334;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=52;TCF=31;TCR=21;TR=42;WE=85598535;WS=85598517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr1	85599563	rs817478	A	C	2201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.296;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=38;PP=1379;ReadPosRankSum=-0.185;SC=TGAAACTGAGACACAAAAGAG;SOR=0.860;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=200;TCF=115;TCR=85;TR=94;WE=85599571;WS=85599553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,107:0.49:220
chr1	85624549	rs709786	C	T	3478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=67;NR=50;PP=1967;SC=GTAGACTCAACTGTCTGCATT;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=117;TCF=67;TCR=50;TR=117;WE=85624557;WS=85624539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr1	85624864	rs817412	G	A	5360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=97;PP=2965;SC=TTCTGCCTCAGATAATTCAGA;SOR=1.099;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=173;TCF=76;TCR=97;TR=173;WE=85624872;WS=85624854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr1	85647713	rs817444	T	C	792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=7;PP=545;SC=ACCTTGAATTTCTTCCCCCAA;SOR=1.781;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=25;WE=85647721;WS=85647703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	85648620	rs817443	C	T	4001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=63;PP=2224;SC=GTATGATGAACTTCTCGGCAG;SOR=0.820;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=128;TCF=65;TCR=63;TR=128;WE=85648628;WS=85648610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr1	85648905	rs11161539	T	C	795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.896;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=25;PP=580;ReadPosRankSum=-1.382;SC=GAAAGAAAAATACGTTATAAA;SOR=0.854;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=76;TCF=27;TCR=49;TR=37;WE=85648913;WS=85648895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,37:0.45:82
chr1	85666327	rs817456	T	C	815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.894;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=19;PP=480;ReadPosRankSum=0.954;SC=TGGCGGGGGCTCGTCCCAGTC;SOR=0.906;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=64;TCF=30;TCR=34;TR=33;WE=85666335;WS=85666317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,38:0.51:74
chr1	85725353	rs112918702	GCCGGAAA	G	782.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.600;NF=1;NR=19;PP=1132;ReadPosRankSum=1.623;SC=TCCGCCGGAAGCCGGAAACCG;SOR=1.609;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=20;WE=85725367;WS=85725343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,31:0.94:33
chr1	85741921	rs2735594	G	C	2798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=58;NR=40;PP=1677;SC=TTCCGCTTTCGTCTCCCGCTG;SOR=0.987;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=58;TCR=40;TR=98;WE=85741929;WS=85741911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr1	85742012	rs11576939	G	C	1342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.242;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=25;PP=601;ReadPosRankSum=0.179;SC=CCTCCTCGGTGAGGGACGGTG;SOR=0.381;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=121;TCF=55;TCR=66;TR=54;WE=85742020;WS=85742002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,65:0.48:136
chr1	85787114	rs233116	A	T	1081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=8;PP=717;SC=TCTTGCCGGCAACCGGGGGGG;SOR=2.242;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=34;WE=85787122;WS=85787104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	85930272	rs4001153	GAC	G,GACAC	589.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=5.228;HP=1;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.500;NF=5,5;NR=18,18;PP=386,675;ReadPosRankSum=-0.412;SC=CTGACTCTCTGACACACACAC;SOR=2.215;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=8;TCR=30;TR=23,23;WE=85930283;WS=85930262;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.62,0.24:29
chr1	86046561	rs2297140	C	A	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=131;ReadPosRankSum=-2.323;SC=CCCACCGGGCCCACCGCGCCG;SOR=1.051;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=9;WE=86046569;WS=86046551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
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chr1	86047311	rs9658584	G	C	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.868;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=23;PP=540;ReadPosRankSum=-1.828;SC=AGTCCCCATAGTCCAGAAGTT;SOR=1.105;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=87;TCF=33;TCR=54;TR=33;WE=86047319;WS=86047301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,39:0.38:103
chr1	86119898	rs2274738	A	G	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=321;ReadPosRankSum=-0.167;SC=ACAGGGACACACAAACCGCGT;SOR=0.641;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=50;TCF=18;TCR=32;TR=24;WE=86119906;WS=86119888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,25:0.49:51
chr1	86167957	rs1764298	C	T	650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.33;ReadPosRankSum=0.582;SOR=0.719;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,33:0.52:63
chr1	86173298	rs1539444	C	T	5773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=131;NR=66;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.177;SC=TAAATGGAATCCCCCATGCCC;SOR=0.600;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=198;TCF=132;TCR=66;TR=197;WE=86173306;WS=86173288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,209:1.00:210
chr1	86173943	rs17399721	C	T	2762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.493;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=57;PP=1687;ReadPosRankSum=0.527;SC=CCAGACTTCCCTTCATTTTCA;SOR=0.587;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=229;TCF=118;TCR=111;TR=121;WE=86173951;WS=86173933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,135:0.52:259
chr1	86202016	rs1481200	C	T	6319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=120;NR=88;PP=2965;SC=GTCATGGAAACAACTAGAGTC;SOR=0.881;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=208;TCF=120;TCR=88;TR=208;WE=86202024;WS=86202006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr1	86202990	rs114069383	T	C	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.33;ReadPosRankSum=1.005;SOR=0.957;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,20:0.48:42
chr1	86210241	rs11387251	G	GT	949.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=1;PP=845;SC=TTCTGCCAGGGTTTTATCAAA;SOR=4.548;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=23;WE=86210249;WS=86210231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	86210546	rs7547023	G	A	2015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=47;PP=1297;SC=AATTATATAAGCAAAAAAATC;SOR=2.115;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=18;TCR=47;TR=65;WE=86210554;WS=86210536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	86211325	rs10747324	G	A	959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=22;PP=614;SC=TAACTCTTACGGTTAGACAGA;SOR=1.675;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=11;TCR=22;TR=33;WE=86211333;WS=86211315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	86246849	rs313722	A	C	609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=11;PP=399;ReadPosRankSum=0.906;SC=ATATTCTAGAAATAGAATTAA;SOR=0.606;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=59;TCF=38;TCR=21;TR=30;WE=86246857;WS=86246839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,32:0.48:66
chr1	86249063	rs313724	C	T	2694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=22;PP=1738;SC=TGAGTTTCTACCTTAAAAGTC;SOR=2.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=88;TCF=65;TCR=23;TR=87;WE=86249071;WS=86249053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr1	86249735	rs41371348	A	C	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=342;ReadPosRankSum=-1.481;SC=AGACTATATTATTTCAACAGC;SOR=0.826;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=43;TCF=34;TCR=9;TR=20;WE=86249743;WS=86249725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,20:0.43:46
chr1	86249903	rs41289767	T	C	1728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.71;ReadPosRankSum=1.913;SOR=0.653;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,82:0.46:178
chr1	86249911	rs313725	A	G	6157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.87;SOR=0.705;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr1	86252025	rs12746325	A	G	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.689;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=12;PP=448;ReadPosRankSum=1.541;SC=TTGGAACAAAATATTAAAGTA;SOR=0.583;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=74;TCF=42;TCR=32;TR=33;WE=86252033;WS=86252015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,41:0.44:94
chr1	86334070	rs313775	T	A	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.920;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=217;ReadPosRankSum=-2.544;SC=TCCTTCTCTCTAGCCACAGTT;SOR=0.238;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=18;WE=86334078;WS=86334060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,21:0.54:39
chr1	86334316	rs17411495	T	C	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.528;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=19;PP=329;ReadPosRankSum=-0.384;SC=CTCCCTGTAATGCAATAAAAA;SOR=1.204;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=50;TCF=18;TCR=32;TR=26;WE=86334324;WS=86334306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,26:0.49:53
chr1	86340193	rs11161696	G	T	248.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=131;SC=GCTTTTGAAAGTATGAAATGA;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=86340201;WS=86340183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	86340262	rs12136023	C	A	478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.939;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=288;ReadPosRankSum=-0.060;SC=TTGAGTGTTTCGAATAATAAG;SOR=1.329;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=55;TCF=40;TCR=15;TR=22;WE=86340270;WS=86340252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,25:0.41:61
chr1	86340523	rs1564518	T	C	152.03	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.01;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	86340523	.	TG	CA	127	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=1;NR=3;PP=127;QD=45.1169687156;SC=GGAAATGGGCTGCAAAACAGC;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=86340532;WS=86340513;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	86340524	rs1564517	G	A	152.03	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.01;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	86340794	rs1564516	T	C	734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=21;NR=1;PP=565;SC=CCAAATAGGTTGGGGACTGCT;SOR=4.003;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=86340802;WS=86340784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	86340880	rs1564515	A	G	1805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.601;HP=2;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=26;PP=2113;ReadPosRankSum=0.007;SC=GTTAGCAAATATAGGGGATTC;SOR=0.799;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=135;TCF=85;TCR=50;TR=73;WE=86340900;WS=86340870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,85:0.54:156
chr1	86340892	rs7536101	A	G	1592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.477;HP=1;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=30;PP=1774;ReadPosRankSum=-1.941;SC=AGGGGATTCAATGGTAGCAAA;SOR=0.489;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=148;TCF=91;TCR=57;TR=71;WE=86340900;WS=86340870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,82:0.47:173
chr1	86341153	rs12122234	G	A	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=367;ReadPosRankSum=0.337;SC=TAGCATAAGAGCAGATTCTTT;SOR=0.732;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=20;WE=86341161;WS=86341143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr1	86355414	.	CT	C	103.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.236;ClippingRankSum=0.000;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=3.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.24;ReadPosRankSum=0.408;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr1	86361802	rs7541806	C	G	1323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=14;NR=26;PP=739;SC=TATGGTCTTACTATGCTAGCA;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=14;TCR=26;TR=40;WE=86361810;WS=86361792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	86372839	rs5775877	T	TG	1258.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.393;HP=7;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.236;NF=8;NR=22;PP=605;ReadPosRankSum=0.110;SC=GAAGTAATTTTGGGGGGGTTA;SOR=0.545;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=82;TCF=29;TCR=53;TR=30;WE=86372847;WS=86372829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,60:0.42:142
chr1	86375654	rs1502657	C	G	8055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=148;NR=122;PP=2965;ReadPosRankSum=1.191;SC=TTTCTCCCTGCGGACCTAGTG;SOR=0.775;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=271;TCF=149;TCR=122;TR=270;WE=86375662;WS=86375631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,302:0.99:304
chr1	86377028	rs10493777	C	T	861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=1.586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.83;ReadPosRankSum=-0.130;SOR=0.516;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,49:0.45:110
chr1	86453237	rs11799965	T	G	831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=15;PP=491;ReadPosRankSum=-1.211;SC=AATCAGGAGCTCTAGATAACC;SOR=0.680;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=68;TCF=43;TCR=25;TR=37;WE=86453245;WS=86453227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,42:0.51:82
chr1	86482922	rs557928	A	T	2905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=60;PP=1847;SC=GTATAAACATAAACTTAATAA;SOR=1.158;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=103;TCF=43;TCR=60;TR=103;WE=86482930;WS=86482912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr1	86487981	rs516213	G	A	5455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=103;PP=2965;SC=AGCACCCTAAGAGAAGAGAAT;SOR=1.399;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=156;TCF=53;TCR=103;TR=156;WE=86488000;WS=86487971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr1	86487992	rs5775882	A	AACAG	6287.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=70;PP=2401;SC=AGAAGAGAATAACAGAAGAGA;SOR=1.609;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=98;TCF=7;TCR=91;TR=77;WE=86488000;WS=86487971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr1	86488232	rs641712	G	A	2912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=34;PP=1749;SC=TTGTCTCCAGGATACCCGGGT;SOR=1.265;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=64;TCR=34;TR=98;WE=86488240;WS=86488222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr1	86497769	rs582141	C	G	198.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=119;SC=TCCTGAGAAGCACAAACCTAT;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=86497777;WS=86497759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	86512433	rs41309161	C	T	783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.934;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=9;PP=419;ReadPosRankSum=0.917;SC=AGTATCTTCACATTTTAATAA;SOR=0.553;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=67;TCF=49;TCR=18;TR=32;WE=86512441;WS=86512423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,38:0.49:77
chr1	86524903	rs41309191	C	T	946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=26;PP=532;ReadPosRankSum=-1.220;SC=CCAAAGGAAACAAATTTGGTA;SOR=0.661;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=92;TCF=37;TCR=55;TR=45;WE=86524911;WS=86524893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,47:0.48:98
chr1	86554821	rs12405791	G	A	904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.61;SOR=1.244;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	86590915	rs2174767	G	A	5468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=98;NR=83;PP=2965;SC=TTAGGAGAGAGCTAAATTTCT;SOR=0.703;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=181;TCF=98;TCR=83;TR=181;WE=86590923;WS=86590905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr1	86591837	rs11161747	G	A	5351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=103;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.832;SC=TACAGCAGTCGCTGGTGATGA;SOR=0.946;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=190;TCF=86;TCR=104;TR=189;WE=86591845;WS=86591827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,201:0.99:203
chr1	86621992	rs1999747	C	A	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.425;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=227;ReadPosRankSum=1.018;SC=GTTGGTCTAACCCCTACCCTA;SOR=0.129;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=15;WE=86622000;WS=86621982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr1	86814688	rs272491	C	T	262.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=215;SC=AAATAATACTCACATCTGATG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=86814696;WS=86814678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	86818572	rs272496	T	C	3122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=40;PP=1735;SC=GTTGATTTTGTTCTTCATTTT;SOR=0.818;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=59;TCR=41;TR=97;WE=86818580;WS=86818562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr1	86820267	rs1182098	C	T	4319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=77;NR=60;PP=2415;SC=ATGCTGTATACTCTGCAGATT;SOR=0.866;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=137;TCF=77;TCR=60;TR=137;WE=86820275;WS=86820257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr1	86821194	rs10676142	A	ACT	502.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=450;SC=AGGAATTTAAACTAAAATTTT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=10;WE=86821202;WS=86821184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	86821910	.	CTAAAA	C	68	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=63.51;NF=0;NR=2;PP=68;QD=47.0;SC=CATGAATAAACTAAAATAAGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=2;WE=86821922;WS=86821900;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,2:0.67:3
chr1	86822231	rs385437	A	G	2051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FS=1.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.47;ReadPosRankSum=0.275;SOR=0.654;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,101:0.52:196
chr1	86838158	rs421105	C	T	1017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.82;SOR=0.741;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	86847955	rs272516	G	A	1576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=16;PP=1087;SC=TATCGTTCTCGGCTTCCCTTT;SOR=1.697;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=34;TCR=16;TR=50;WE=86847963;WS=86847945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	86896354	rs4292929	G	A	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-2.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=196;ReadPosRankSum=-0.927;SC=CTTTTTTATGGTGGTAGGTGG;SOR=1.022;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=11;WE=86896362;WS=86896348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr1	86897973	rs1334150	T	C	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.245;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=171;ReadPosRankSum=0.318;SC=ATCCTTGTAATAATTATATAA;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=9;WE=86897981;WS=86897965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr1	86906114	rs1981082	T	C	82.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5103;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=54;ReadPosRankSum=-0.000;SC=AATACAGAAATTGTTTTTAAA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=4;WE=86906122;WS=86906104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr1	86939130	rs2145412	C	T	2856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=34;PP=1529;SC=TCTGTATCTGCTTGAAGCTAC;SOR=0.936;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=55;TCR=34;TR=89;WE=86939138;WS=86939120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr1	86939390	rs2180762	G	A	2090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=18;PP=1325;SC=TGTGATGATAGAAACTTTTTC;SOR=1.778;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=44;TCR=18;TR=62;WE=86939398;WS=86939380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	86952324	rs2734705	A	G	3648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=59;PP=2273;SC=CATGTACAAAATGAACTCATA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=120;TCF=61;TCR=59;TR=120;WE=86952332;WS=86952314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr1	86954591	rs2075632	T	C	896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=11;PP=519;ReadPosRankSum=-0.205;SC=CCTCTAGAATTTCTTTTCTCC;SOR=0.608;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=98;TCF=73;TCR=25;TR=38;WE=86954599;WS=86954581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,44:0.39:112
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chr1	86959796	rs1321689	C	T	3028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=67;NR=32;PP=1771;SC=AGGGTTTTCCCGTACGTGACA;SOR=1.466;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=67;TCR=32;TR=99;WE=86959804;WS=86959786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr1	86965419	rs1882753	T	C	1352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-4.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.641;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=21;PP=774;ReadPosRankSum=0.877;SC=TGAATACTACTGCTCTCATCC;SOR=0.198;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=105;TCF=75;TCR=30;TR=60;WE=86965427;WS=86965409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,64:0.55:116
chr1	87036746	rs772599	C	A	3398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.436;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=56;PP=1952;ReadPosRankSum=-1.895;SC=CTGTGCTCTGCATTATGTTTG;SOR=0.644;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=260;TCF=152;TCR=108;TR=138;WE=87036754;WS=87036736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,157:0.55:284
chr1	87045896	rs4001061	TCCTACA	T	5284.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=380;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.218;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=5.976;NF=18;NR=55;PP=2970;ReadPosRankSum=1.146;SC=ATGACATTGATCCTACACCTA;SOR=0.812;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=199;TCF=44;TCR=155;TR=73;WE=87045909;WS=87045886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:222,152:0.41:374
chr1	87101245	rs2292831	A	G	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=347;ReadPosRankSum=-0.206;SC=TCATTTCACTATGAAATTATT;SOR=0.599;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=44;TCF=35;TCR=9;TR=23;WE=87101253;WS=87101235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,30:0.58:52
chr1	87101375	rs2292830	C	G	1371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=26;PP=768;ReadPosRankSum=-1.357;SC=CAATGACCTACAAATCAAAAT;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=132;TCF=71;TCR=61;TR=58;WE=87101383;WS=87101365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,68:0.44:154
chr1	87102593	rs41286592	T	C	2569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.022;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=61;PP=1679;ReadPosRankSum=-2.048;SC=AGCAACAAGGTATCATTGTAT;SOR=0.927;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=201;TCF=87;TCR=114;TR=103;WE=87102601;WS=87102583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,116:0.52:223
chr1	87458695	rs10873810	G	A	2200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=54;NR=20;PP=1291;SC=CTCCCAGTGTGGGGAGGGTAC;SOR=1.501;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=54;TCR=20;TR=74;WE=87458703;WS=87458685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr1	87538182	rs34124612	TTG	T	3685.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=34;PP=2095;SC=CATGCAATCTTTGTGTGTTTG;SOR=0.793;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=49;TCF=11;TCR=38;TR=44;WE=87538191;WS=87538172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr1	87538200	rs10782592	G	A	4006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=40;PP=1358;SC=TTGAGAATTAGTTCAGGCTGT;SOR=0.760;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=43;TCR=40;TR=83;WE=87538208;WS=87538190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr1	87549858	rs2798675	A	G	809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=6;PP=459;SC=TATATAATGAATGTGTTCTCC;SOR=1.942;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=24;WE=87549866;WS=87549848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	87558066	rs66709085	CCACATA	C	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=5;NR=1;PP=391;SC=TTCCCAATCGCCACATACACA;SOR=3.056;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=6;WE=87558079;WS=87558056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	87563668	rs1199677	G	A	1082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=26;PP=700;SC=TATTATCTCTGTAATCTGTGT;SOR=3.086;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=32;WE=87563676;WS=87563658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	87570398	rs1621247	G	A	3836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=78;PP=2378;SC=TGTGACTATTGGATTCTTGAA;SOR=1.699;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=119;TCF=41;TCR=78;TR=119;WE=87570406;WS=87570388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr1	87598117	rs6686259	T	G	1859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=42;NR=19;PP=1103;SC=CGCGGCGGCCTCGGGAGGCCC;SOR=1.163;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=42;TCR=19;TR=61;WE=87598125;WS=87598107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	87599697	rs6576865	G	A	4270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=90;PP=2713;SC=CTCTGGCCACGCTTGCACCCT;SOR=1.276;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=148;TCF=58;TCR=90;TR=148;WE=87599705;WS=87599687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr1	87633761	rs10782593	C	T	1219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=8;PP=731;SC=CAGTCCCAAACGCCAGCAGCT;SOR=2.200;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=30;TCR=8;TR=38;WE=87633769;WS=87633751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	89225976	rs430600	T	C	1834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=35;PP=1000;ReadPosRankSum=2.956;SC=ATTGAAGGCCTTACAAAAACA;SOR=0.679;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=119;TCF=60;TCR=59;TR=69;WE=89225984;WS=89225966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,84:0.59:142
chr1	89236029	rs7541301	T	A	2078.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.16;ReadPosRankSum=-0.544;SOR=0.680;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,99:0.58:171
chr1	89271574	rs786906	T	C	2429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.022;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=48;PP=1461;ReadPosRankSum=-1.351;SC=CTTCTATAAGTGATTCTACAG;SOR=0.800;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=206;TCF=113;TCR=93;TR=108;WE=89271582;WS=89271564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,115:0.50:228
chr1	89280965	rs786918	A	G	719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.044;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=398;ReadPosRankSum=1.809;SC=CAAGAATACAATGCTGCATTA;SOR=0.931;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=49;TCF=34;TCR=15;TR=27;WE=89280973;WS=89280955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,33:0.56:59
chr1	89322982	rs2794318	G	A	7150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=127;NR=107;PP=2965;ReadPosRankSum=1.623;SC=ACCAAGTCCAGTTCCACAGCT;SOR=0.261;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=236;TCF=128;TCR=108;TR=234;WE=89322990;WS=89322972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,268:1.00:269
chr1	89426902	rs3738055	G	A	6023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=123;NR=74;PP=2965;SC=AAACCTCATCGCTGATGCAGA;SOR=1.179;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=197;TCF=123;TCR=74;TR=197;WE=89426910;WS=89426892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr1	89430420	rs1536259	A	G	2368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.87;SOR=1.302;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr1	89449390	rs112636230	T	C	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.02;MQRankSum=-5.178;QD=2.29;ReadPosRankSum=-0.487;SOR=0.591;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,6:0.14:44
chr1	89449399	rs77567101	T	C	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.59;MQRankSum=-5.846;QD=1.38;ReadPosRankSum=1.069;SOR=0.394;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,6:0.11:55
chr1	89478854	rs4656076	C	G	644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=2;PP=328;SC=GGAAGTACTACGAAGGGGACT;SOR=3.160;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=89478862;WS=89478848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	89479063	rs4656077	G	A	4504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=64;NR=77;PP=2501;SC=AAGAACTTCCGGATACAGAGT;SOR=1.132;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=64;TCR=77;TR=141;WE=89479082;WS=89479053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr1	89479074	rs4656078	C	T	4137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=72;PP=2228;SC=GATACAGAGTCGGGGCAGATT;SOR=1.231;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=128;TCF=56;TCR=72;TR=128;WE=89479082;WS=89479053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr1	89479758	rs3795543	T	C	8369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=159;NR=117;PP=2965;SC=ATGGTACGTCTCTGTTACCTT;SOR=0.943;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=277;TCF=160;TCR=117;TR=276;WE=89479766;WS=89479748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,311:1.00:311
chr1	89486037	rs7555039	C	T	2477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=30;PP=1696;SC=ACTCACTACCCTCAGAACAGC;SOR=1.347;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=50;TCR=30;TR=80;WE=89486045;WS=89486027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr1	89520329	rs72054220	GAAAAAC	G	3589.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=34;PP=2781;SC=AGAGAAAACAGAAAAACAGAA;SOR=0.793;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=21;TCR=35;TR=54;WE=89520342;WS=89520319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr1	89520574	rs10922554	C	A	3613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.77;QD=27.59;SOR=1.470;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr1	89520636	rs10922555	G	A	1022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.85;QD=40.91;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	89520643	rs10922556	C	T	962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.01;QD=45.85;SOR=3.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	89522512	rs4376712	C	T	7268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=148;NR=95;PP=2965;SC=GACCCTAAACCGTATACATTT;SOR=1.149;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=243;TCF=148;TCR=95;TR=243;WE=89522520;WS=89522502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr1	89522646	rs1048425	G	C	4757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=89;PP=2965;SC=CTCCTGGAGGGTTTCTGTGGG;SOR=1.244;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=148;TCF=59;TCR=89;TR=148;WE=89522654;WS=89522636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr1	89574026	rs1329119	G	A	1699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=38;PP=1141;SC=ATTTCCACCAGATTAGTTCCC;SOR=1.903;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=17;TCR=38;TR=55;WE=89574034;WS=89574016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr1	89575677	rs2026043	T	C	201.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.6;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=1;PP=109;SC=AATTTTGCCTTGGGTAACCAG;SOR=1.609;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=89575685;WS=89575667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	89579941	rs2230338	T	C	7530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=147;NR=97;PP=2965;SC=TCCCCACTGCTGATGGCATTG;SOR=1.079;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=244;TCF=147;TCR=97;TR=244;WE=89579949;WS=89579931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,278:1.00:278
chr1	89582690	rs1803632	G	C	3974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=48;PP=2468;SC=CCATTGACTGGAATGCCACCT;SOR=1.171;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=131;TCF=82;TCR=49;TR=129;WE=89582698;WS=89582680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr1	89583544	rs2209956	T	C	324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=270;SC=ATTTGGTTTCTTTTTATTAGC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=89583552;WS=89583534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	89597755	rs942442	T	C	237.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=163;SC=ATTTTAAACTTTTCTTAAATG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=89597763;WS=89597745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	89607479	rs6666846	G	T	2792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.97;SOR=2.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr1	89607486	rs6658235	T	C	2596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.77;SOR=2.644;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	89615979	rs586609	C	T	1329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=7;PP=974;SC=TACAGTAGGCCTCAGTAAACA;SOR=2.885;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=37;TCR=7;TR=44;WE=89615987;WS=89615969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	89637578	rs676913	G	A	7712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=122;NR=133;PP=2965;SC=AGTGTTCTCAGTGAGGCACAC;SOR=0.915;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=255;TCF=122;TCR=133;TR=255;WE=89637586;WS=89637568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,287:1.00:287
chr1	89650850	rs623134	A	T	496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=1;PP=375;SC=GCTATAACACATATACTTACA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=89650858;WS=89650840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	89652071	rs561042	TC	CT	5420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.19;QD=44.43;SOR=0.726;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr1	89652078	rs608339	A	T	5370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.70;QD=46.70;SOR=0.746;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr1	89652087	rs1142890	CC	TG	5505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.45;QD=50.51;SOR=0.711;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr1	89652090	rs1142888	T	G	4921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.45;QD=45.15;SOR=0.711;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr1	89652094	rs1142887	G	A	4876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.18;QD=47.35;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr1	89652097	rs1142886	C	T	4719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.18;QD=45.82;SOR=0.752;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr1	89652102	rs655260	A	T	4489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.97;QD=45.35;SOR=0.842;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr1	89661228	rs650448	T	G	718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=18;PP=486;SC=GTTGTTTCCATCTCAGGCAGG;SOR=2.925;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=89661236;WS=89661218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	89726592	rs535351	G	A	977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=27;PP=710;SC=TACAGTAGCAGTAAACAGTTC;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=32;WE=89726600;WS=89726582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	89730723	rs9628688	C	T	3093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=70;PP=2031;SC=TTTCTGAGAACGTACATTTAA;SOR=2.014;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=27;TCR=70;TR=97;WE=89730731;WS=89730713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr1	89731959	rs12729209	G	A	1040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=2;PP=846;SC=ACAATGCAAGGATAATCTTAT;SOR=4.680;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=31;WE=89731967;WS=89731949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	89733273	rs6690597	T	C	2446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=52;PP=1736;SC=TATTTAAAAATAGGCTCTTGT;SOR=1.697;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=25;TCR=52;TR=77;WE=89733281;WS=89733263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr1	89845926	rs11361992	GT	G	4828.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=65;PP=2001;SC=TATATTCTCTGTTTTTTTTTA;SOR=1.141;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=115;TCF=43;TCR=72;TR=100;WE=89845934;WS=89845916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr1	89847372	rs4658359	G	T	5266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=78;PP=2965;SC=GCAGAGGGCAGCTGACTACTA;SOR=0.704;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=163;TCF=85;TCR=78;TR=163;WE=89847380;WS=89847362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr1	89847411	rs4658360	C	T	4737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=68;PP=2856;SC=GCGAGTGAAGCTCCCCACAGA;SOR=0.813;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=155;TCF=86;TCR=69;TR=154;WE=89847419;WS=89847401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr1	89847444	rs4658146	A	G	4951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=80;PP=2965;SC=GCTGCTGGACATGCATGCGGC;SOR=0.726;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=85;TCR=80;TR=165;WE=89847452;WS=89847434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr1	89849201	rs928652	C	G	2886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=36;PP=1786;SC=GCTTTTTCTTCCTTCCATAGG;SOR=1.115;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=62;TCR=36;TR=98;WE=89849209;WS=89849191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr1	89849350	rs928653	G	A	2271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=47;PP=1459;SC=GGAGGGGTACGTTTATACAAT;SOR=1.367;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=29;TCR=47;TR=76;WE=89849358;WS=89849340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr1	89849441	rs928654	T	G	620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=16;PP=454;SC=TGCTAAATCTTAAAATAACAA;SOR=1.931;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=22;WE=89849449;WS=89849431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	89849574	rs928655	G	A	952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=6;PP=663;SC=TTCAGATTTGGTTTAGTCTCA;SOR=2.448;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=30;WE=89849582;WS=89849564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	89849742	rs959460	A	T	4485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=75;NR=69;PP=2290;SC=GAGGCTCAAGATAAGAGTCGC;SOR=0.829;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=145;TCF=75;TCR=70;TR=144;WE=89849750;WS=89849732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr1	89885854	rs6673154	G	A	2096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=29;NR=40;PP=1206;SC=GCTGGACACCGAGGGTCTGGG;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=29;TCR=40;TR=69;WE=89885862;WS=89885844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr1	89888530	rs4261099	C	T	2650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=24;PP=1782;SC=ATCATCAGATCGTTGCTCAGC;SOR=1.796;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=61;TCR=24;TR=85;WE=89888538;WS=89888520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr1	89888552	rs4282800	T	A	3926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=42;PP=2489;SC=TTACTTCAGGTCATTTTCAGT;SOR=1.559;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=129;TCF=87;TCR=42;TR=128;WE=89888560;WS=89888542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr1	89888585	rs4415545	C	G	11321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.43;QD=45.11;SOR=1.277;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr1	89888588	rs4506445	G	T	11428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.63;QD=43.79;SOR=1.273;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr1	90048132	rs2279085	T	C	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=178;ReadPosRankSum=1.271;SC=TAGAGTAAAATGCTTATTTGA;SOR=0.368;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=12;WE=90048140;WS=90048122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr1	90049040	rs36084789	A	G	2872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.001;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=53;PP=1917;ReadPosRankSum=2.156;SC=CTTATGTTCCATATTTTTTAA;SOR=0.841;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=256;TCF=148;TCR=108;TR=129;WE=90049048;WS=90049030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,139:0.49:283
chr1	90171835	rs6657969	C	T	2318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=18;PP=1604;SC=AAGCTGCCTTCGTTTATATGT;SOR=2.026;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=58;TCR=18;TR=76;WE=90171843;WS=90171825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr1	90178743	rs474536	A	G	5887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=100;NR=94;PP=2965;SC=GGTCCAGAAGACAGCCTGGTC;SOR=0.731;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=194;TCF=100;TCR=94;TR=194;WE=90178751;WS=90178733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr1	90470915	rs11808927	T	A	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=3.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.736;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=300;ReadPosRankSum=-0.870;SC=TGTTTGCTATTGAATCATCAC;SOR=2.247;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=13;WE=90470923;WS=90470905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr1	90486412	rs2816881	T	G	1747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.467;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=41;PP=1024;ReadPosRankSum=0.343;SC=CTTGCAGTGTTTATATCCCTG;SOR=0.966;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=149;TCF=71;TCR=78;TR=74;WE=90486420;WS=90486402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,84:0.48:176
chr1	90493026	rs10922744	G	A	1960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=38;PP=1235;ReadPosRankSum=-1.419;SC=ATGAAGATGAGGAAGAAGAAG;SOR=0.565;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=168;TCF=87;TCR=81;TR=82;WE=90493034;WS=90493016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,93:0.50:187
chr1	91182860	.	TA	T	73.25	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.21;ReadPosRankSum=0.210;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr1	91447985	rs358691	C	T	942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.520;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=23;PP=493;ReadPosRankSum=0.997;SC=CATGAATAACCATAGCTACAA;SOR=0.512;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=105;TCF=45;TCR=60;TR=43;WE=91447993;WS=91447975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,50:0.42:120
chr1	91727781	rs580070	C	G	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.255;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=98;ReadPosRankSum=0.389;SC=CTTAAAGTGTCTTTAAAGAGT;SOR=0.169;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=7;WE=91727789;WS=91727771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr1	91728053	rs585898	G	A	3362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=56;PP=1994;SC=CTGCATTTCCGGCTTGTTGAG;SOR=0.808;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=114;TCF=58;TCR=56;TR=114;WE=91728061;WS=91728043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr1	91728202	rs555432	T	C	317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=9;PP=245;SC=AAAAACCATTTTAATTTGGAT;SOR=1.802;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=91728210;WS=91728192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	91739208	rs281964	C	T	750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=4;PP=439;SC=TAACACTACTCGTCAATTCAA;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=21;WE=91739216;WS=91739198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	91739414	rs281963	G	A	946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=23;PP=673;SC=AGAAAATATGGAAATTAATCT;SOR=1.308;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=13;TCR=23;TR=36;WE=91739422;WS=91739404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	91742055	rs281959	T	C	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=136;ReadPosRankSum=-0.043;SC=TTATGAATAATGGTAATATTC;SOR=1.179;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=10;WE=91742063;WS=91742045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr1	91781304	rs281991	T	C	417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=237;SC=TATTTTTTTTTCAGTAGAATT;SOR=2.985;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=91781312;WS=91781294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	91781413	rs281992	T	G	917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.829;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=17;PP=556;ReadPosRankSum=-0.865;SC=CTGCGTCACCTATGATTAAGG;SOR=0.536;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=80;TCF=49;TCR=31;TR=42;WE=91781421;WS=91781403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,45:0.53:85
chr1	91781644	rs11589490	C	G	1197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.741;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=23;PP=784;ReadPosRankSum=-0.171;SC=ATCTAAGAAACAGAAAATATT;SOR=0.580;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=85;TCF=46;TCR=39;TR=48;WE=91781652;WS=91781634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,52:0.56:93
chr1	91782031	rs11584478	T	C	1495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.688;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=34;PP=925;ReadPosRankSum=-0.813;SC=GACAATGTTATACCTGTGGAA;SOR=0.777;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=107;TCF=44;TCR=63;TR=56;WE=91782039;WS=91782021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,65:0.52:124
chr1	91784887	rs10493845	G	A	2438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.007;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=55;PP=1413;ReadPosRankSum=1.003;SC=AAATCTTTGCGGTATCTTGTG;SOR=0.772;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=205;TCF=102;TCR=103;TR=106;WE=91784895;WS=91784877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,120:0.52:231
chr1	91793877	rs281972	T	C	458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=3;PP=313;SC=CAACCCTGAATCAAGCTTTAG;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=91793885;WS=91793867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	91813184	rs281936	C	T	927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=25;PP=680;SC=TAAATATCCACAGAAACAATG;SOR=2.049;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=34;WE=91813192;WS=91813174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	91841301	rs282036	T	C	2140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=53;PP=1616;SC=AACACAAAAATATGTGCATTA;SOR=2.472;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=17;TCR=53;TR=70;WE=91841309;WS=91841291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr1	91846374	rs282033	C	A	471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=11;NR=4;PP=230;SC=TGTGGCAGTGCAGACATAAAG;SOR=1.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=15;WE=91846382;WS=91846364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	91846595	rs5776097	T	TA	569.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=467;SC=TAGTTACTTTTATTTTAAAAC;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=11;WE=91846603;WS=91846585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	91846654	rs282032	A	T	124.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=3;PP=54;SC=TGAGGTTTTAACATTTGCTAT;SOR=1.981;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=91846662;WS=91846644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	91851253	rs282026	T	C	1912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=22;PP=1143;SC=ACTGAAATTTTTGCTTACTAT;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=38;TCR=22;TR=60;WE=91851261;WS=91851243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr1	91859795	rs282009	T	C	5317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.99;SOR=0.803;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr1	91859795	.	TATGTGA	CATGTGA,CATGTGG	843	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.32;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=66,30;NR=64,31;PP=842,843;QD=6.74439394267;SC=TTGCCAGCAATATGTGATAAG;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=130;TCF=66;TCR=64;TR=130,61;WE=91859809;WS=91859785;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:130
chr1	91859801	rs11165778	A	G	1509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.50;ReadPosRankSum=1.037;SOR=0.731;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,75:0.47:159
chr1	91973557	rs553606	T	G	1538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=33;PP=924;SC=TTTTCCTTTTTTAGTCTTGGT;SOR=1.569;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=18;TCR=33;TR=51;WE=91973565;WS=91973547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	91978963	rs13447511	T	TAA	586.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=421;SC=ACTTATAATTTAAAAAACTTT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=12;WE=91978971;WS=91978953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	91980447	rs483532	A	G	7495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=150;NR=109;PP=2965;SC=CTATTTCTACAAAAGTTATGA;SOR=0.915;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=259;TCF=150;TCR=109;TR=259;WE=91980455;WS=91980437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,287:1.00:287
chr1	91989572	rs488126	T	G	2537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=16;PP=1681;SC=TTTTTCTGTTTTTGTTTTTTC;SOR=2.542;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=56;TCR=16;TR=72;WE=91989580;WS=91989562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr1	92149418	.	C	A	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.451;ClippingRankSum=0.000;DP=192;ExcessHet=3.0103;FS=4.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.21;ReadPosRankSum=0.386;SOR=0.957;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:161,31:0.16:192
chr1	92174260	rs284878	A	G	5236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=95;NR=83;PP=2965;SC=CAAGGGGCTTAGTGAACGTCT;SOR=0.724;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=178;TCF=95;TCR=83;TR=178;WE=92174268;WS=92174250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr1	92174415	rs2038931	G	A	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.674;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=222;ReadPosRankSum=-1.274;SC=CTGCACAGCTGTCCTGTGGCC;SOR=2.800;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=12;WE=92174423;WS=92174405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,13:0.81:16
chr1	92184814	rs7524066	G	T	2214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.496;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=40;PP=1284;ReadPosRankSum=0.472;SC=AACTTTAAGGGAGCACACAGC;SOR=0.623;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=205;TCF=124;TCR=81;TR=97;WE=92184822;WS=92184804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,106:0.47:224
chr1	92185657	rs1805112	C	T	1179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=27;PP=716;ReadPosRankSum=-0.646;SC=GGAAAGGAAACGGAAGGCCTC;SOR=0.616;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=87;TCF=38;TCR=49;TR=48;WE=92185665;WS=92185647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,54:0.55:98
chr1	92200593	rs11165376	A	G	1961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.565;HP=2;HapScore=3;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=49;PP=2588;ReadPosRankSum=1.586;SC=GTACTTCTCAAATCGAAGTGC;SOR=1.262;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=129;TCF=45;TCR=84;TR=71;WE=92200605;WS=92200583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,82:0.54:152
chr1	92200597	rs12124904	G	A	1303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.709;HP=2;HapScore=3;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=31;PP=1822;ReadPosRankSum=-0.620;SC=TTCTCAAATCGAAGTGCTTGT;SOR=0.359;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=116;TCF=40;TCR=76;TR=51;WE=92200605;WS=92200583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,62:0.45:138
chr1	92200627	rs10874913	T	C	1757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=47;PP=1128;SC=CTCTTCCCTTTGTTATACAAG;SOR=3.682;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=8;TCR=47;TR=55;WE=92200635;WS=92200617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr1	92262874	rs2810904	T	C	1014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.768;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=14;PP=581;ReadPosRankSum=-0.549;SC=GCCCCTGGCCTGCAGTGCGGA;SOR=0.901;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=85;TCF=57;TCR=28;TR=43;WE=92262882;WS=92262864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,47:0.52:91
chr1	92327045	rs1805110	G	A	2197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.318;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=38;PP=1410;ReadPosRankSum=-1.337;SC=GGCTAAACAGGAGCTCATCAG;SOR=0.870;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=207;TCF=128;TCR=79;TR=101;WE=92327053;WS=92327035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,104:0.46:224
chr1	92327126	rs1805109	C	T	3255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.584;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=71;PP=1990;ReadPosRankSum=-0.590;SC=CCAGTCACTTCAGCCTGCTCA;SOR=0.699;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=299;TCF=153;TCR=146;TR=150;WE=92327134;WS=92327116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,161:0.50:325
chr1	92428495	rs10783071	C	A	2788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=39;NR=48;PP=1472;SC=TGTGAAACTACAGTTGCCTGT;SOR=1.234;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=39;TCR=48;TR=87;WE=92428503;WS=92428485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
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chr1	92467730	rs74101071	A	G	1375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.777;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=41;PP=1880;ReadPosRankSum=-0.212;SC=TTTTTTTCTAACAAATCTTGA;SOR=1.074;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=150;TCF=61;TCR=89;TR=62;WE=92467749;WS=92467706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,68:0.41:166
chr1	92467741	rs72954738	A	C	1708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.479;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=44;PP=2380;ReadPosRankSum=0.256;SC=CAAATCTTGAAGGGATTTGAA;SOR=0.531;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=122;TCF=44;TCR=78;TR=73;WE=92467749;WS=92467706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,81:0.60:135
chr1	92568263	rs527412	A	G	947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=21;PP=588;SC=TTATAGCCGTAAAAATAATTA;SOR=2.376;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=28;WE=92568271;WS=92568253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	92573670	rs11166163	G	A	1079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=29;PP=724;ReadPosRankSum=0.774;SC=ACAGGCCACAGGGGTTCCATG;SOR=0.634;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=14;TCR=50;TR=37;WE=92573678;WS=92573660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,43:0.61:71
chr1	92612656	rs45458506	T	C	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.046;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=96;ReadPosRankSum=-0.102;SC=GGTATATAAATTGGATTATCT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=6;WE=92612664;WS=92612646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr1	92646021	rs1483022	G	A	4150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=77;PP=2702;SC=ATCAGTCAAAGAAAGGTGAAA;SOR=0.941;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=140;TCF=62;TCR=78;TR=139;WE=92646029;WS=92646011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr1	92647223	rs560389	A	G	4835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=72;PP=2965;SC=AAGCAAAGTAATAATGATCTT;SOR=0.815;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=160;TCF=88;TCR=72;TR=160;WE=92647231;WS=92647213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr1	92647532	rs565156	C	A	3917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=60;PP=2514;SC=TTTTCTGCAACTAAAAAGTTT;SOR=0.737;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=124;TCF=64;TCR=60;TR=124;WE=92647540;WS=92647522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr1	92649335	rs569593	A	G	188.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=1;PP=167;SC=TTTGACTATCACTGTTATATT;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=9;WE=92649343;WS=92649333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	92711067	rs3131827	A	T	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.018;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=73;ReadPosRankSum=0.886;SC=ATTTCTGTAAATAATGCTGCA;SOR=2.584;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=33;TCF=21;TCR=12;TR=8;WE=92711075;WS=92711057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,7:0.20:35
chr1	92712266	rs974924	C	T	1772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=28;NR=33;PP=922;SC=AAGCAAAACACAGAAAAGATT;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=28;TCR=33;TR=61;WE=92712274;WS=92712256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr1	92712598	rs35752451	GAA	G	3966.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FS=6.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.05;MQRankSum=1.010;QD=19.07;ReadPosRankSum=-0.646;SOR=0.459;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,104:0.50:208
chr1	92735359	rs1487540	T	C	660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.043;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=409;ReadPosRankSum=-0.478;SC=AACAAATATATATATTATACA;SOR=0.527;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=50;TCF=19;TCR=31;TR=26;WE=92735367;WS=92735349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,30:0.52:58
chr1	92755943	rs3103178	G	A	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=65;ReadPosRankSum=-0.812;SC=AAGAAGGCATGTATCGACAAA;SOR=0.859;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=6;WE=92755951;WS=92755933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr1	92764828	rs10875348	T	A	2031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=43;PP=1297;SC=CCAGGTAGAGTAGGCCGAAAG;SOR=1.457;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=25;TCR=43;TR=68;WE=92764836;WS=92764818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr1	92765848	rs1542685	A	T	909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.858;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=23;PP=502;ReadPosRankSum=-1.443;SC=ATCTTGTATTACTTGTACCAA;SOR=0.956;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=85;TCF=39;TCR=46;TR=40;WE=92765856;WS=92765838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,44:0.52:85
chr1	92799151	rs1487537	C	T	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.361;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=118;ReadPosRankSum=-1.655;SC=GTGAAAAGTTCACATGGATTT;SOR=0.368;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=8;WE=92799159;WS=92799141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr1	92852504	rs10747411	A	G	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.323;NF=8;NR=4;PP=128;ReadPosRankSum=0.977;SC=TCCTGACCTCATGATCTGCCT;SOR=0.818;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=23;TCF=15;TCR=8;TR=12;WE=92852512;WS=92852494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr1	92946479	rs11164605	G	A	657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=12;PP=345;ReadPosRankSum=1.975;SC=GGGCGGGTTCGCAGAAGAGGC;SOR=0.709;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=49;TCF=29;TCR=20;TR=28;WE=92946487;WS=92946469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,29:0.55:53
chr1	92979354	rs6603979	A	G	2496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.409;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=55;PP=1455;ReadPosRankSum=0.605;SC=AAGACATCGAACCAGATTTTC;SOR=0.791;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=262;TCF=136;TCR=126;TR=114;WE=92979362;WS=92979344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,126:0.43:290
chr1	93029453	rs6656432	A	G	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.204;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=27;ReadPosRankSum=1.579;SC=ACAATTCATAATGAACTATGC;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=3;WE=93029461;WS=93029443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr1	93071048	rs2050597	G	T	2904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=67;PP=2076;SC=TAAACCATACGTTAAGTATTA;SOR=1.802;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=31;TCR=67;TR=98;WE=93071056;WS=93071038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
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chr1	93089823	rs7514716	T	C	5435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=93;NR=92;PP=2965;SC=TCAGTTCATCTTGTAACTCAT;SOR=0.837;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=185;TCF=93;TCR=92;TR=185;WE=93089831;WS=93089813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr1	93128854	rs10747450	A	G	1888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=24;PP=1065;SC=ACCACCCAAAAAATTATTTCT;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=37;TCR=24;TR=61;WE=93128862;WS=93128844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	93160002	rs34202284	G	A	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=357;ReadPosRankSum=-0.353;SC=CAACAAAAACGAGTCATTTGA;SOR=0.495;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=18;WE=93160010;WS=93159992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr1	93160902	rs2391199	T	C	5240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=82;PP=2965;SC=CTTGTTGCAATTGGTAGTGGA;SOR=0.704;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=168;TCF=86;TCR=82;TR=168;WE=93160910;WS=93160892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr1	93163385	rs7418336	A	G	889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.779;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=17;PP=582;ReadPosRankSum=-1.096;SC=ATATAAAGGCAATATGCCTTT;SOR=0.542;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=81;TCF=48;TCR=33;TR=38;WE=93163393;WS=93163375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,43:0.45:95
chr1	93163633	rs1017008	C	T	295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=241;SC=CAGCCAACCACAAACATTGTT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=93163641;WS=93163623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	93167610	rs10218567	C	T	516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=1;PP=402;SC=TATCCACTTACATTTAATAAA;SOR=3.383;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=93167618;WS=93167600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	93167854	rs10218670	A	G	1571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=29;PP=806;SC=GGCAAGACAGACAGATTAAAA;SOR=1.255;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=50;TCF=21;TCR=29;TR=50;WE=93167862;WS=93167844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	93306281	rs115931438	A	G	1829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FS=1.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.17;ReadPosRankSum=0.688;SOR=0.829;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,92:0.51:180
chr1	93306317	rs10874744	G	A	1518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.246;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=37;PP=902;ReadPosRankSum=-0.455;SC=TGGCAGAAGCGAAGGGAACCA;SOR=0.836;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=146;TCF=72;TCR=74;TR=70;WE=93306325;WS=93306307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,77:0.48:159
chr1	93312142	rs12746956	A	G	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.768;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=114;ReadPosRankSum=-2.577;SC=TTTAGCTATCATAAATAATGT;SOR=0.582;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=8;WE=93312150;WS=93312132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr1	93312592	rs12062315	C	T	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=53;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TGAGCCACCACGCCCGGCCTC;SOR=2.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=4;WE=93312600;WS=93312582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr1	93426866	rs945629	T	C	1995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.96;SOR=1.567;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	93426866	.	TGCGCGGCG	CGCCCGGCT,CGCGCGGCG	1162	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=19,35;NR=8,15;PP=1162,544;QD=45.387699069;SC=GGGCGAGTCCTGCGCGGCGCG;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=51;TCF=35;TCR=16;TR=27,50;WE=93426882;WS=93426856;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.53:51
chr1	93426869	rs1415069	G	C	1283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=2.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.34;ReadPosRankSum=0.940;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,32:0.58:55
chr1	93426874	rs116489989	G	T	1326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=2.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.28;ReadPosRankSum=0.541;SOR=1.193;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,34:0.60:57
chr1	93545157	rs2815419	G	A	3416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=53;NR=67;PP=2287;SC=AGGAAGAAAGGAAGCAAGTAT;SOR=0.958;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=53;TCR=68;TR=120;WE=93545165;WS=93545147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr1	93580581	rs2815427	G	C	3646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=53;PP=2400;SC=CATATTGATTGCAGTGTGATT;SOR=0.788;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=65;TCR=54;TR=118;WE=93580589;WS=93580571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr1	93580992	rs566843	C	T	3746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=34;PP=2409;SC=AAATTTTAGCCTTCACTCTTT;SOR=1.816;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=89;TCR=34;TR=123;WE=93581014;WS=93580982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr1	93581024	rs2295423	T	C	6788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=142;NR=92;PP=2965;SC=CCCTCTAATGTAGAGGGGTGG;SOR=1.082;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=234;TCF=142;TCR=92;TR=234;WE=93581032;WS=93581014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr1	93602194	rs2281524	C	T	4606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=51;PP=2824;SC=TAAAAAAGCTCAGTAGACAAT;SOR=1.367;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=147;TCF=96;TCR=51;TR=147;WE=93602202;WS=93602184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr1	93620393	rs1060622	G	A	8625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=140;NR=153;PP=2965;SC=TCTAAGCAGAGTTTGTATGTG;SOR=0.855;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=294;TCF=141;TCR=153;TR=293;WE=93620401;WS=93620383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,331:1.00:331
chr1	93621483	rs1057257	A	G	676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=3;PP=416;SC=ACCACAAAATAGTTGTGAAAT;SOR=2.400;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=93621491;WS=93621473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	93646207	rs2297707	T	C	5208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=80;PP=2965;SC=CCCCGCGCCTTCGGCGGCGCC;SOR=0.792;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=170;TCF=90;TCR=80;TR=170;WE=93646215;WS=93646197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr1	93646418	rs10874763	C	T	3881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=369;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.202;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=86;PP=2495;ReadPosRankSum=-0.483;SC=GGGTGGGTCTCTCCCCAGCGA;SOR=0.586;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=334;TCF=162;TCR=172;TR=173;WE=93646426;WS=93646408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:181,187:0.51:368
chr1	93649732	rs6682670	A	G	1588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=37;PP=1082;SC=ATCTAGTTAAAAGAAGTTTTG;SOR=2.437;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=12;TCR=37;TR=49;WE=93649740;WS=93649722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	93659350	rs2815411	A	T	805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=12;NR=16;PP=435;SC=AATAAAAGGAAATATTACCTA;SOR=1.214;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=12;TCR=16;TR=28;WE=93659358;WS=93659340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	93672723	rs2815413	A	C	2640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=32;PP=1643;SC=GCAGTGAAAAATTCAGAAGTC;SOR=1.044;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=55;TCR=32;TR=87;WE=93672731;WS=93672713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr1	93676314	rs555161	A	G	349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=9;NR=0;PP=164;SC=AAGCAAATGCATCTCATTTAC;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=9;WE=93676322;WS=93676304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	93676578	rs797676	A	G	374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=271;SC=TCATGCCTGTAATCCCAACAC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=93676586;WS=93676568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	93697961	.	G	GAT	52.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.523;ClippingRankSum=0.000;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=4.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.01;ReadPosRankSum=0.818;SOR=0.169;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,7:0.13:52
chr1	93711782	rs3754186	T	A	1958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.071;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=44;PP=967;ReadPosRankSum=1.034;SC=CTTGATTATATTTTAATGGAG;SOR=0.601;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=187;TCF=86;TCR=101;TR=87;WE=93711790;WS=93711772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,101:0.48:210
chr1	93998640	rs34814765	AT	A	2122.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=41;PP=1691;SC=GTGCTAAATAATTATCTTTGA;SOR=2.468;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=44;TCF=1;TCR=43;TR=42;WE=93998648;WS=93998630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	94012287	rs237425	G	A	337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=201;SC=TTAAAAAGATGTGACTCTACT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=94012295;WS=94012277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	94041787	rs25569	G	GAC	2811.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=38;PP=2022;SC=CGATGGCGTGGACACTTTATG;SOR=2.303;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=47;TCF=2;TCR=45;TR=40;WE=94041795;WS=94041777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	94312482	rs5776191	T	TC	14592.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.68;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=431;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.248;NF=48;NR=79;PP=2969;ReadPosRankSum=-0.862;SC=ACCCCGTTTTTCGAACCCCGC;SOR=0.842;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=134;TCF=49;TCR=85;TR=127;WE=94312490;WS=94312472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,402:1.00:404
chr1	94312528	rs147446599	G	GC	10697.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.34;QD=43.14;SOR=1.649;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr1	94312533	rs202198870	G	GC	10529.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.68;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=33;PP=1854;SC=ACGTCGCGCGGCGGCGCTCGC;SOR=1.870;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=37;WE=94312592;WS=94312518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr1	94312542	.	G	GC	9682.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=194;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.49;QD=50.17;SOR=2.242;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr1	94312543	.	C	CCG	1263	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.68;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=36;MMLQ=25;MQ=59.82;NF=1;NR=29;PP=1263;QD=43.0666666667;SC=GCGGCGCTCGCGCGCAGGTCC;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=30;WE=94312592;WS=94312518;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	94312544	.	G	C	765	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.68;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=36;MMLQ=24;MQ=59.76;NF=12;NR=27;PP=765;QD=20.5069541679;SC=CGGCGCTCGCGCGCAGGTCCA;SbPval=0.04;Source=Platypus;TC=71;TCF=12;TCR=59;TR=39;WE=94312592;WS=94312518;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:32,39:0.55:71
chr1	94312544	.	G	GC	8872.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=182;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.52;QD=49.02;SOR=2.342;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr1	94312554	.	A	AG	7747.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.68;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=23;PP=1030;SC=GCGCAGGTCCAGCCGCGGCTG;SOR=2.434;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=24;WE=94312592;WS=94312518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr1	94312558	.	G	GC	2107.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.68;BaseQRankSum=1.684;ClippingRankSum=0.000;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.887;HP=3;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.719;NF=1;NR=20;PP=984;ReadPosRankSum=-0.303;SC=AGGTCCAGCCGCGGCTGGGTC;SOR=1.229;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=21;WE=94312592;WS=94312518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,60:0.40:150
chr1	94312559	.	CGGCTGGGTCGGGCG	C	3252.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.773;ClippingRankSum=0.000;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=6.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.60;MQRankSum=0.764;QD=21.26;ReadPosRankSum=0.700;SOR=0.313;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,90:0.59:153
chr1	94312566	rs2391318	G	T	2159.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=5.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FS=4.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.61;MQRankSum=-0.719;QD=14.40;ReadPosRankSum=-1.760;SOR=1.229;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,60:0.40:150
chr1	94312567	rs2391319	T	C	2129.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=5.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FS=4.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.61;MQRankSum=-0.719;QD=14.20;ReadPosRankSum=-1.946;SOR=1.229;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,60:0.40:150
chr1	94312571	.	G	GC	2083.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.153;ClippingRankSum=0.000;DP=151;ExcessHet=3.0103;FS=8.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.63;MQRankSum=-0.666;QD=14.27;ReadPosRankSum=-2.190;SOR=1.437;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,56:0.38:146
chr1	94312572	.	CGCGGCGGCCGGG	C	2971	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.68;FR=1.0000;HP=4;HapScore=1;MGOF=36;MMLQ=25;MQ=59.68;NF=1;NR=19;PP=2971;QD=20;SC=CTGGGTCGGGCGCGGCGGCCG;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=94312592;WS=94312518;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	94312573	.	G	GC	2002.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.639;ClippingRankSum=0.000;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=6.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.64;MQRankSum=-0.639;QD=13.91;ReadPosRankSum=-2.491;SOR=1.373;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,54:0.38:144
chr1	94312576	.	G	GC	6532.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.66;QD=45.68;SOR=2.456;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr1	94312579	.	G	GT,GC	5841.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.63;QD=43.92;SOR=2.506;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,86,47:0.65,0.35:133
chr1	94312584	rs200230769	G	GC	5452.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.71;QD=46.21;SOR=2.644;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr1	94335194	rs1051394	A	T	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.245;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=149;ReadPosRankSum=-0.911;SC=CTTTTTTCCCATAAAGAGTCT;SOR=0.072;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=9;WE=94335202;WS=94335184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr1	94336498	.	CAA	C	53.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.96;ReadPosRankSum=-0.598;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr1	94341137	rs2273166	C	T	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=192;ReadPosRankSum=0.808;SC=AGTCTTTTACCAAGGACTAAT;SOR=1.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=11;WE=94341145;WS=94341127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr1	94341267	rs2273165	A	G	2970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.493;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=49;PP=1705;ReadPosRankSum=0.414;SC=TATCTGCATTAAAATTAATAT;SOR=0.749;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=196;TCF=109;TCR=87;TR=116;WE=94341275;WS=94341257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,134:0.59:227
chr1	94342564	rs3747965	C	A	2028.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-2.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.443;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=52;PP=1246;ReadPosRankSum=1.393;SC=TTTCTTTCCCCTCATCTGTTA;SOR=0.894;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=183;TCF=80;TCR=103;TR=88;WE=94342572;WS=94342554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,98:0.47:210
chr1	94343023	rs2391322	A	G	2987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.408;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=69;PP=1840;ReadPosRankSum=1.573;SC=TTTTTTCTGTAGGAAGCACAA;SOR=0.657;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=290;TCF=132;TCR=158;TR=131;WE=94343031;WS=94343013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,145:0.45:319
chr1	94343233	rs3789457	T	C	2174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.860;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=38;PP=1326;ReadPosRankSum=1.890;SC=CCTCAGAGGTTTCTCCATCCG;SOR=0.632;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=180;TCF=91;TCR=89;TR=85;WE=94343241;WS=94343223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,99:0.49:204
chr1	94344716	rs2235971	C	T	5334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=553;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=120;NR=123;PP=2962;ReadPosRankSum=0.337;SC=TTTCCGGCTCCCTCGCGACCA;SOR=0.667;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=512;TCF=256;TCR=256;TR=243;WE=94344724;WS=94344706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:291,261:0.47:552
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chr1	94476203	rs112614086	CT	C	3542.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.469;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.362;NF=18;NR=43;PP=2301;ReadPosRankSum=-1.473;SC=ACCCGATCCTCTACTTGTATT;SOR=0.534;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=115;TCF=41;TCR=74;TR=61;WE=94476211;WS=94476193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,104:0.52:199
chr1	94476388	rs1801574	C	G	3953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.598;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=75;PP=2407;ReadPosRankSum=-2.393;SC=GCTGGACCAGCAGGGTCAGGA;SOR=0.597;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=258;TCF=131;TCR=127;TR=159;WE=94476396;WS=94476378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,176:0.62:285
chr1	94476467	rs1801466	T	A	2536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=63;PP=1514;ReadPosRankSum=-0.394;SC=GTGGAACGGATTTGCAGAGTG;SOR=0.669;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=185;TCF=78;TCR=107;TR=107;WE=94476475;WS=94476457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,119:0.58:204
chr1	94476555	rs537831	G	A	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=275;ReadPosRankSum=0.067;SC=CCACAGCACAGGGCCCACTAG;SOR=1.112;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=36;TCF=4;TCR=32;TR=15;WE=94476563;WS=94476545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,15:0.39:38
chr1	94476991	rs4147899	CT	C	1833.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.839;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=46;PP=1771;ReadPosRankSum=-0.748;SC=CCCACCCCCCCTCTCTTCAGC;SOR=0.533;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=122;TCF=10;TCR=112;TR=49;WE=94476999;WS=94476980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,80:0.40:198
chr1	94480037	rs2275033	C	T	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=3;PP=464;ReadPosRankSum=0.340;SC=TGGCTCTGCTCGACCAACACA;SOR=0.854;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=62;TCF=54;TCR=8;TR=27;WE=94480045;WS=94480027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,26:0.43:61
chr1	94487285	rs55860151	AAC	A	1227.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.063;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.159;NF=17;NR=9;PP=1023;ReadPosRankSum=0.243;SC=AAACCATGTAAACAAACAAAC;SOR=1.153;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=64;TCF=39;TCR=25;TR=26;WE=94487294;WS=94487275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,36:0.40:90
chr1	94487354	rs472908	G	A	2873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.767;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-1.095;NF=70;NR=54;PP=1522;ReadPosRankSum=0.435;SC=ATTCATGGTAGTTAAGCAAGT;SOR=0.528;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=228;TCF=132;TCR=96;TR=124;WE=94487362;WS=94487344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,141:0.55:257
chr1	94495930	rs547806	T	C	1711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=14;PP=944;SC=AACCCACCGTTGGGTCCTCCC;SOR=1.812;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=38;TCR=14;TR=52;WE=94495938;WS=94495920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	94512565	rs1801581	C	T	1560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.885;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=30;PP=942;ReadPosRankSum=-0.537;SC=CACAGCTGGCCGGCCACAGGG;SOR=0.855;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=153;TCF=81;TCR=72;TR=71;WE=94512573;WS=94512555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,78:0.45:172
chr1	94528363	rs4147833	C	T	951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=29;PP=597;ReadPosRankSum=0.229;SC=AGCTCACTCACACCTCCCGAC;SOR=0.580;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=61;TCF=14;TCR=47;TR=38;WE=94528371;WS=94528353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,42:0.61:69
chr1	94544135	rs4147887	A	AC	1262.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=22;NR=13;PP=1154;SC=CCATCCTCCAACCCCCCTTAC;SOR=1.127;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=41;TCF=27;TCR=14;TR=35;WE=94544143;WS=94544125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	94544234	rs3112831	T	C	3162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=55;PP=1566;ReadPosRankSum=-1.072;SC=CTTCCTAACGTGTTCCAGTTC;SOR=0.680;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=240;TCF=141;TCR=99;TR=132;WE=94544242;WS=94544224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,153:0.56:275
chr1	94544276	rs4147830	G	A	3040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.339;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=66;PP=1716;ReadPosRankSum=-1.526;SC=AAACCAGACAGAGATCAAGAC;SOR=0.652;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=296;TCF=155;TCR=141;TR=137;WE=94544284;WS=94544266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:180,153:0.46:333
chr1	94544326	rs3215952	GT	G	2653.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.273;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=51;PP=1844;ReadPosRankSum=1.409;SC=AGAACTTTTGGTTGTGTCTTT;SOR=1.238;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=129;TCF=12;TCR=117;TR=53;WE=94544334;WS=94544316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,90:0.43:211
chr1	94544805	rs139796930	TCA	TCACA,T	314.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.4997;FS=3.096;HP=2;HapScore=3;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.994;NF=10,10;NR=1,1;PP=297,28;ReadPosRankSum=-0.158;SC=CACATCTCTCTCACACACACA;SOR=2.049;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=11,11;WE=94544814;WS=94544795;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.59:22
chr1	94549029	rs526016	A	G	1317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=0.677;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.55;ReadPosRankSum=0.096;SOR=0.594;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,62:0.45:138
chr1	94549083	rs574741	T	C	1868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=40;PP=1197;SC=CTCCTATATGTTTGAAAACTC;SOR=2.872;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=51;TCF=10;TCR=41;TR=50;WE=94549091;WS=94549073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr1	94564483	rs6657239	C	T	3595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=71;PP=2087;ReadPosRankSum=-1.269;SC=GATGATGAAGCGCTCCAGGAG;SOR=0.569;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=117;TCF=45;TCR=72;TR=116;WE=94564491;WS=94564473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,130:0.99:131
chr1	94574053	rs11165073	C	A	801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=8;PP=475;SC=TTTTCACCAACTCTCCCTGTT;SOR=1.255;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=25;WE=94574061;WS=94574043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	94576968	rs2297634	T	C	1378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=14;PP=658;SC=CTTCCTCCCCTGCATGGTAGG;SOR=1.314;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=28;TCR=14;TR=42;WE=94576976;WS=94576958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	94578548	rs4847281	T	C	5005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=110;NR=66;PP=2902;SC=GGCTGTAGAGTGGGTTGGCAT;SOR=1.240;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=176;TCF=110;TCR=66;TR=176;WE=94578556;WS=94578538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr1	94639337	rs1330858	A	G	1147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=2;PP=806;SC=TATACAAAAGAGGCCCTGTCA;SOR=4.294;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=31;WE=94639345;WS=94639327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	94639447	rs1999272	C	T	8318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=166;NR=115;PP=2965;SC=TGGAATTTCACCTTCGAGGTC;SOR=1.015;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=281;TCF=166;TCR=115;TR=281;WE=94639455;WS=94639437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,312:1.00:312
chr1	94643752	.	G	A	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.700;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.167;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=21;PP=483;ReadPosRankSum=0.368;SC=AAAGTTGTATGAGATTTTCCT;SOR=2.147;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=41;TCF=9;TCR=32;TR=24;WE=94643760;WS=94643742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,24:0.56:43
chr1	94667430	rs5776210	G	GA	431.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=319;ReadPosRankSum=-1.281;SC=AAATATCACAGAAAAAAAAAT;SOR=4.514;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=15;WE=94667438;WS=94667420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,18:0.95:19
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chr1	94674723	.	GTTT	ATTC,ATTT	489	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.41;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=13,35;NR=4,13;PP=238,489;QD=17.1451691095;SC=TTAATACTTCGTTTCCCATGT;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=48;TCF=35;TCR=13;TR=17,48;WE=94674734;WS=94674713;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.35:48
chr1	94674726	rs2274788	T	C	664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.543;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,32:0.48:67
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chr1	94924046	rs2147794	A	G	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.247;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=238;ReadPosRankSum=0.902;SC=TCTCACTATGATGTGAAAAAG;SOR=1.773;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=36;TCF=31;TCR=5;TR=13;WE=94924054;WS=94924036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,14:0.38:37
chr1	94930345	rs16946	G	A	2882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.068;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=58;PP=1690;ReadPosRankSum=1.485;SC=AGGGGAAAAAGGAGCGAGCTG;SOR=0.548;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=268;TCF=150;TCR=118;TR=124;WE=94930353;WS=94930329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,143:0.47:305
chr1	94941376	rs681187	G	A	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.938;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=48;ReadPosRankSum=0.875;SC=AATTGATTTTGTGGACATAAC;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=4;WE=94941384;WS=94941366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr1	94948876	.	TAC	T	64.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.169;ClippingRankSum=0.000;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.51;ReadPosRankSum=0.123;SOR=0.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,6:0.14:43
chr1	94980671	rs3118109	C	G	2715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=41;PP=1719;SC=CTCTGTTACTCATTAAACCTA;SOR=0.754;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=48;TCR=41;TR=89;WE=94980679;WS=94980661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr1	94982785	rs662813	A	T	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.385;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.18;ReadPosRankSum=0.921;SOR=2.030;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr1	95001600	rs698946	A	C	3521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=61;NR=52;PP=1676;SC=CATTCCCTGCAGGGTAGGAGA;SOR=0.785;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=113;TCF=61;TCR=52;TR=113;WE=95001608;WS=95001590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr1	95211525	rs1333953	G	A	650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.256;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=22;PP=491;ReadPosRankSum=0.951;SC=CTGGAAGCCAGCAGGTTTTAC;SOR=1.164;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=77;TCF=28;TCR=49;TR=31;WE=95211533;WS=95211515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,31:0.39:80
chr1	95285897	.	C	CCCCAGA	125.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.559;NF=0;NR=3;PP=207;ReadPosRankSum=-1.242;SC=CCGGCTCCAGCCCCAGCCCCA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=3;WE=95285905;WS=95285877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr1	95286085	rs11165252	G	A	1208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=1.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.45;ReadPosRankSum=2.335;SOR=0.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,64:0.45:143
chr1	95286094	rs10782992	G	T	4648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.18;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr1	95286658	rs6676991	C	A	1011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.644;HP=1;HapScore=2;MGOF=45;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=26;PP=483;ReadPosRankSum=-1.430;SC=TGTGTGTGCACGTCTGGAAAT;SOR=1.135;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=96;TCF=42;TCR=54;TR=40;WE=95286666;WS=95286648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,50:0.43:117
chr1	95286675	rs11274910	GTCCCAAATGTAAA	G	1225.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.344;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=2954;ReadPosRankSum=-1.179;SC=AAATAACTCTGTCCCAAATGT;SOR=1.213;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=42;TCF=2;TCR=40;TR=15;WE=95286695;WS=95286665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,34:0.38:89
chr1	95290003	rs6687749	C	T	892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.002;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=13;PP=528;ReadPosRankSum=0.479;SC=GGGCACTGTGCGCTCAGCCCT;SOR=0.523;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=67;TCF=46;TCR=21;TR=40;WE=95290011;WS=95289993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,42:0.62:68
chr1	95290305	rs6541372	T	C	525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=13;PP=163;SC=CAGCCTATTTTATAAAAAGGA;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=17;WE=95290323;WS=95290295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	95290315	rs36094793	A	G	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.91;ReadPosRankSum=1.011;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,3:0.23:13
chr1	95291366	rs10874894	A	G	2964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=34;PP=1874;SC=CTAATTACGGAGCATTTTCTC;SOR=1.300;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=64;TCR=34;TR=98;WE=95291374;WS=95291356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr1	95291479	rs12057188	A	C	1773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=45;PP=1211;ReadPosRankSum=-0.303;SC=AGTGTCAACAAACAGTCATTC;SOR=0.727;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=201;TCF=95;TCR=106;TR=84;WE=95291487;WS=95291469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,90:0.41:218
chr1	95291509	.	A	G	2030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=0.000;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.587;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=49;PP=1229;ReadPosRankSum=0.440;SC=GTGAGTATACATTCCATTATT;SOR=0.609;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=153;TCF=66;TCR=87;TR=88;WE=95291517;WS=95291499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,97:0.58:167
chr1	95293005	rs17407097	A	G	1579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.554;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=28;PP=1032;ReadPosRankSum=0.371;SC=AAGGCCCACAATTAAGACCAG;SOR=0.741;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=164;TCF=101;TCR=63;TR=72;WE=95293013;WS=95292995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,78:0.43:183
chr1	95294089	rs2640065	T	C	1925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.688;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=42;PP=1260;ReadPosRankSum=2.683;SC=CCTTCAACTATACCCACAGTC;SOR=0.952;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=144;TCF=74;TCR=70;TR=80;WE=95294097;WS=95294079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,87:0.54:160
chr1	95305440	rs859120	A	G	9008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=154;NR=150;PP=2965;SC=TCATCGCAGTACTACCATCAT;SOR=0.735;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=304;TCF=154;TCR=150;TR=304;WE=95305448;WS=95305430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,337:1.00:337
chr1	95330372	rs859098	G	A	2784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.457;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=56;PP=1647;ReadPosRankSum=-0.665;SC=TCAAGGAACCGTTGTGAAAGG;SOR=0.636;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=228;TCF=131;TCR=97;TR=131;WE=95330380;WS=95330362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,138:0.53:258
chr1	95333068	rs859096	G	T	2090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=32;PP=1097;SC=TCTCTAAGGGGCTAAATTGTG;SOR=1.012;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=29;TCR=32;TR=61;WE=95333076;WS=95333058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr1	95358096	rs859063	A	G	2408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=40;PP=1160;SC=TTCATTTCCAATTGCAATCTC;SOR=1.071;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=36;TCR=40;TR=76;WE=95358104;WS=95358086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr1	95367108	rs10605235	ACC	A	242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=8;NR=0;PP=116;SC=TATAAACTACACCCCCCCCCC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=8;WE=95367117;WS=95367105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	95367136	rs859059	G	A	501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=16;NR=2;PP=388;SC=TAGTACTTCTGTCTATTCTTA;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=95367144;WS=95367126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	95367649	rs859058	T	C	4397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=88;NR=59;PP=2543;SC=GGGAATCTGTTAACCAGCCAT;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=88;TCR=60;TR=147;WE=95367657;WS=95367639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr1	95367894	rs859057	A	C	1262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=28;PP=788;SC=GTCTTCATAAACAGTTATAAG;SOR=2.059;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=40;WE=95367902;WS=95367884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	95369211	rs859054	T	G	1563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=41;PP=1206;SC=ACTCAATAGATCTCAATGGCA;SOR=3.215;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=8;TCR=41;TR=49;WE=95369219;WS=95369201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	95696612	rs6663164	C	T	1610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.323;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=37;PP=994;ReadPosRankSum=1.588;SC=TTAGACAGAACCAGTAGCACA;SOR=0.553;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=133;TCF=59;TCR=74;TR=69;WE=95696620;WS=95696602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,75:0.51:147
chr1	95705615	rs640527	G	A	2455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.244;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=51;PP=1558;ReadPosRankSum=1.882;SC=CCTCCTTATAGGGACCCTTGT;SOR=1.129;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=84;TCF=33;TCR=51;TR=83;WE=95705623;WS=95705605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,92:0.99:93
chr1	95709821	rs259358	T	C	6268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=122;NR=89;PP=2965;SC=TTTATGGATGTGGATATACCT;SOR=0.896;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=212;TCF=122;TCR=90;TR=211;WE=95709829;WS=95709811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr1	95709939	rs2296308	T	G	5670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=83;PP=2965;SC=TGAAAGAGAATTTACTTGAGC;SOR=0.703;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=172;TCF=89;TCR=83;TR=172;WE=95709947;WS=95709929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr1	97189091	rs3762411	G	A	2921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=35;PP=1591;SC=AATAACAGGAGGTTGAAACTA;SOR=0.912;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=57;TCR=35;TR=92;WE=97189099;WS=97189081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr1	97236130	rs3762409	G	A	132.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=75;SC=TTCTAATTCTGCTTATCAGAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=97236138;WS=97236129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	97272054	.	G	GT	1292.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.629;ClippingRankSum=0.000;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.734;HP=8;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=27;PP=991;ReadPosRankSum=-0.281;SC=TTTGATTTTTGTTTCACCTTA;SOR=1.039;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=4;TCR=60;TR=29;WE=97272062;WS=97272044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,49:0.48:102
chr1	97272456	rs6699932	A	G	5308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=89;PP=2965;SC=TGAAGATTTTATACAATAAGA;SOR=0.777;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=180;TCF=91;TCR=89;TR=180;WE=97272464;WS=97272446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr1	97278804	rs273886	G	A	1859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=26;PP=1332;SC=TGTATGAAGTGTCTAATTTTA;SOR=1.066;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=41;TCR=26;TR=67;WE=97278812;WS=97278794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	97547831	rs290854	G	A	2648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=18;PP=1771;SC=GCTTTCTGCCGTAAAAACAAG;SOR=2.226;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=64;TCR=18;TR=82;WE=97547839;WS=97547821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr1	97771947	rs7556439	C	A	768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.382;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=23;PP=523;ReadPosRankSum=0.785;SC=ACGTGCAAGACAAATCCAACT;SOR=0.240;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=47;TCF=10;TCR=37;TR=31;WE=97771955;WS=97771937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,32:0.65:49
chr1	97838972	rs1879374	A	G	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.342;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=8;PP=256;ReadPosRankSum=-0.260;SC=CTTTTTAAACACTAAATATTT;SOR=0.416;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=38;TCF=25;TCR=13;TR=21;WE=97838980;WS=97838962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr1	97839016	rs1890138	A	G	813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.001;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=13;PP=423;ReadPosRankSum=2.054;SC=CTAGCCAGTCATCTGATCCAT;SOR=0.987;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=64;TCF=39;TCR=25;TR=37;WE=97839024;WS=97839006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,40:0.57:70
chr1	97847874	rs72728438	T	C	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=205;ReadPosRankSum=0.605;SC=TTATTTCTCATGGCAGCTCTT;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=11;WE=97847882;WS=97847864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr1	97848140	rs56279424	G	T	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.315;HP=6;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=241;ReadPosRankSum=-0.071;SC=TTCAAACTGTGAAAAAATAAA;SOR=3.334;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=12;WE=97848148;WS=97848130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr1	97981242	rs2811178	T	C	402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=0;PP=306;SC=TTAAAATATATGATAGACATT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=97981250;WS=97981232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	98039541	rs56293913	A	G	1651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.724;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=42;PP=1018;ReadPosRankSum=-0.193;SC=AACAAAACAGAACAGAGAAGA;SOR=0.570;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=113;TCF=33;TCR=80;TR=62;WE=98039549;WS=98039531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,72:0.55:130
chr1	98144856	rs3790387	T	C	32.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=16.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	98165091	rs2297595	T	C	1950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.548;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=47;PP=1175;ReadPosRankSum=-0.642;SC=GGGATACTCATTGCTTTGAAT;SOR=0.645;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=165;TCF=65;TCR=100;TR=77;WE=98165099;WS=98165067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,89:0.48:186
chr1	98348885	rs1801265	G	A	6854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=119;NR=119;PP=2965;SC=GAAGTGGAACGCAGAGTTGCA;SOR=0.796;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=238;TCF=119;TCR=119;TR=238;WE=98348893;WS=98348875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,263:1.00:263
chr1	98349390	rs111231337	C	CA	664.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.7468;FS=3.442;HP=12;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=1.043;NF=4;NR=19;PP=302;ReadPosRankSum=-0.987;SC=TTAGGAATCACAAAAAAAAAA;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=23;WE=98349398;WS=98349380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,31:0.76:41
chr1	99127205	rs12723363	A	G	109.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=4;NR=0;PP=39;SC=GGGGAGGTGCAGGAGACGTGG;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=99127213;WS=99127195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	99127392	rs9728148	T	C	1321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=16;PP=691;SC=CGGGCAGCAGTGGCTCTTCCG;SOR=1.157;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=28;TCR=16;TR=44;WE=99127400;WS=99127382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	99150635	rs9433747	G	A	2257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=40;PP=1357;SC=TAAACATTTGGTGAATATTTT;SOR=0.928;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=35;TCR=40;TR=75;WE=99150643;WS=99150625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr1	99156904	rs183435886	T	A	99.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=16.66;ReadPosRankSum=-0.210;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr1	99225627	rs2019213	G	A	7130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=120;NR=114;PP=2965;SC=CTACGTGGGAGTCATTCCTTA;SOR=0.755;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=234;TCF=120;TCR=114;TR=234;WE=99225635;WS=99225617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr1	99387628	rs34854879	T	TA	2370.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;NF=4;NR=49;PP=785;SC=AAACATTCAATAAAAAAAATG;SOR=2.043;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=67;TCF=6;TCR=61;TR=53;WE=99387636;WS=99387618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr1	99418911	rs146451020	TTGTGTGTGTGTG	T	626.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=2669;ReadPosRankSum=0.757;SC=AACTTCTTGCTTGTGTGTGTG;SOR=0.990;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=16;WE=99418930;WS=99418901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,19:0.83:23
chr1	99418948	.	T	TGTGTGA	297	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=90;MMLQ=27;MQ=59.38;NF=0;NR=16;PP=297;QD=18.75;SC=TGTGTGTGTGTGTGAATTTCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=16;WE=99418956;WS=99418938;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr1	99730100	rs35285687	C	T	1078.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.079;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=12;PP=641;ReadPosRankSum=-1.023;SC=CTCAGCTGCGCTGTGCACACC;SOR=1.164;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=80;TCF=54;TCR=26;TR=42;WE=99730108;WS=99730090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,49:0.52:94
chr1	100111956	rs834997	A	G	1048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.934;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=27;PP=684;ReadPosRankSum=-0.507;SC=TAACGTTGTTACTTAGAGGAA;SOR=0.347;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=104;TCF=44;TCR=60;TR=52;WE=100111964;WS=100111946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,53:0.46:114
chr1	100182884	rs6696586	C	T	885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.124;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.013;NF=30;NR=6;PP=623;ReadPosRankSum=-0.837;SC=AACGCATACACATACACACAT;SOR=0.939;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=77;TCF=64;TCR=13;TR=36;WE=100182892;WS=100182874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,38:0.48:79
chr1	100185282	rs6679013	G	T	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=213;ReadPosRankSum=-0.162;SC=ATACGGGCAGGGCATGGCAAC;SOR=0.257;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=12;WE=100185290;WS=100185272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr1	100194305	rs7522921	C	G	1393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.800;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=36;PP=902;ReadPosRankSum=-1.075;SC=GATCGTATGTCCATGCTTTGT;SOR=0.599;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=98;TCF=28;TCR=70;TR=51;WE=100194313;WS=100194295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,59:0.53:111
chr1	100316589	rs2307130	A	G	658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=11;PP=355;ReadPosRankSum=2.426;SC=CAAATCCTCTAGAAGCCAAAA;SOR=0.614;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=78;TCF=52;TCR=26;TR=29;WE=100316597;WS=100316579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,34:0.36:95
chr1	100316765	rs663848	C	T	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=200;ReadPosRankSum=-2.111;SC=TTTTAAAGCTCTAAGATAAAT;SOR=0.804;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=21;TCF=7;TCR=14;TR=13;WE=100316773;WS=100316755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr1	100329889	rs535461	G	C	2023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=33;PP=1391;ReadPosRankSum=-0.351;SC=TTCATTTTAGGCTGGTTTTGT;SOR=0.693;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=171;TCF=111;TCR=60;TR=92;WE=100329897;WS=100329879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,97:0.53:183
chr1	100335883	rs903126	A	G	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-3.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.203;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=153;ReadPosRankSum=0.546;SC=ATTTTATTTCACCTCTAAACT;SOR=0.165;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=11;WE=100335891;WS=100335873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr1	100336361	rs2230306	C	T	882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.302;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=23;PP=574;ReadPosRankSum=2.293;SC=AGCTTAAACTCTGGGAATTTT;SOR=0.568;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=116;TCF=65;TCR=51;TR=46;WE=100336369;WS=100336351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,49:0.37:131
chr1	100340225	rs634880	G	A	1207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.338;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=23;PP=672;ReadPosRankSum=2.372;SC=TTAAGGTATCGTCTTTTCTTT;SOR=0.580;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=126;TCF=77;TCR=49;TR=56;WE=100340233;WS=100340215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,62:0.43:144
chr1	100342227	rs3736295	C	T	3489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=76;PP=2272;SC=ATCTGCTTTACTGATTTTCTT;SOR=1.942;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=35;TCR=76;TR=111;WE=100342235;WS=100342217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr1	100343153	rs2291638	A	G	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.448;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=420;ReadPosRankSum=-1.404;SC=AATTGTTTTCATTTTATTTCT;SOR=1.091;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=53;TCF=37;TCR=16;TR=30;WE=100343161;WS=100343143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,33:0.59:56
chr1	100345409	rs2392077	C	G	1544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=7;PP=1163;SC=TTGTCTCTTTCCTTCCTCCTA;SOR=3.306;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=37;TCR=7;TR=44;WE=100345417;WS=100345399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	100346741	rs3736296	T	C	4876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=74;PP=2965;SC=CAGGTTTGTTTATATGTTGTT;SOR=0.716;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=156;TCF=82;TCR=74;TR=156;WE=100346749;WS=100346731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr1	100350383	rs2234707	G	A	472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=14;PP=378;SC=AGGACCAGCAGTGTCAGCATC;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=100350391;WS=100350373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	100353675	rs555929	G	A	5797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=100;PP=2965;SC=GTAAGCAAATGGAAGGATAGC;SOR=0.861;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=199;TCF=99;TCR=100;TR=198;WE=100353683;WS=100353665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr1	100357141	rs2035961	T	A	2324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=21;PP=1547;SC=AAATTAACTTTCAAATTTATT;SOR=2.112;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=58;TCR=21;TR=79;WE=100357149;WS=100357131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr1	100358200	rs594249	G	A	2437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=61;PP=1753;SC=TATGTAAATCGATAGTATTCG;SOR=2.275;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=21;TCR=61;TR=82;WE=100358208;WS=100358190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr1	100361925	rs2230307	G	A	2856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.425;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=62;PP=1780;ReadPosRankSum=0.804;SC=GCTGATTACTGGACGCTATGT;SOR=0.736;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=269;TCF=143;TCR=126;TR=136;WE=100361933;WS=100361915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,142:0.49:291
chr1	100368382	rs834575	T	C	1630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=3.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.048;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=48;PP=1173;ReadPosRankSum=-0.848;SC=AGTACAAATTTATCAAGGTGA;SOR=1.136;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=147;TCF=52;TCR=95;TR=69;WE=100368390;WS=100368372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,72:0.44:163
chr1	100376448	rs2274570	G	A	3340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.74;SOR=1.697;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr1	100376456	rs1541041	T	A	2981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.18;SOR=2.165;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	100459021	rs74647865	C	T	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=166;ReadPosRankSum=0.380;SC=TTCTCCCTCTCGGTGTTTTTA;SOR=0.693;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=11;WE=100459029;WS=100459011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
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chr1	100481062	rs3835492	AG	A	229.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.006;NF=0;NR=9;PP=237;ReadPosRankSum=-1.690;SC=TACTGATGTGAGGGGGAAAAG;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=9;WE=100481070;WS=100481052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr1	100488177	rs482466	C	T	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=227;ReadPosRankSum=-1.205;SC=AAGGATAAGACATGTGTATAT;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=44;TCF=8;TCR=36;TR=17;WE=100488185;WS=100488167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,18:0.39:46
chr1	100503993	rs1395332	A	C	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=240;ReadPosRankSum=-0.658;SC=ACCCTGTCCGAGCTGCCGGTG;SOR=0.596;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=31;TCF=10;TCR=21;TR=16;WE=100504001;WS=100503983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr1	100515497	rs17121792	T	C	2119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.920;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=50;PP=1145;ReadPosRankSum=-1.885;SC=GTGTCTATCATGCAGTTATCG;SOR=0.519;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=210;TCF=116;TCR=94;TR=106;WE=100515505;WS=100515487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,111:0.48:232
chr1	100533960	rs6687189	G	A	886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.531;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=7;PP=590;ReadPosRankSum=0.027;SC=GAATCTCTGCGTATTCTTAAG;SOR=0.169;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=67;TCF=57;TCR=10;TR=35;WE=100533968;WS=100533950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,38:0.50:76
chr1	100543962	rs644835	A	G	1159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.220;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=16;PP=598;ReadPosRankSum=-1.646;SC=TTTCAGGTACAGTGGAGAAGA;SOR=0.909;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=119;TCF=79;TCR=40;TR=55;WE=100543970;WS=100543952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,62:0.47:133
chr1	100572459	rs17121889	C	T	771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.817;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=14;PP=435;ReadPosRankSum=0.713;SC=TAACACGTAACATACTTACAC;SOR=0.813;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=77;TCF=46;TCR=31;TR=36;WE=100572467;WS=100572449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,40:0.48:84
chr1	100575933	rs13375867	G	A	1275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.610;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=23;PP=606;ReadPosRankSum=0.841;SC=TTTATTAGCCGCTTCTAACTC;SOR=0.638;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=128;TCF=81;TCR=47;TR=59;WE=100575941;WS=100575923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,68:0.46:148
chr1	100584746	rs6662945	A	C	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.861;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=73;ReadPosRankSum=-0.000;SC=ATATGTAATAATTTTGATTAG;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=100584754;WS=100584736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr1	100587146	rs17418475	T	C	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.666;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=335;ReadPosRankSum=0.640;SC=ACTTAAGAGATAGTGAAAATC;SOR=0.402;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=29;TCF=9;TCR=20;TR=20;WE=100587154;WS=100587136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,21:0.70:30
chr1	100598744	rs141081618	C	T	3711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=342;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.315;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=67;PP=2116;ReadPosRankSum=-0.469;SC=TCCGCGACGTCGCCGCACGCG;SOR=0.578;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=297;TCF=174;TCR=123;TR=154;WE=100598752;WS=100598734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,177:0.52:341
chr1	100598866	rs472498	GC	AT	3059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.224;HP=3;HapScore=2;JOINED;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=44;PP=2311;ReadPosRankSum=-1.344;SC=CGCTGGAGCCGCGGAGGTGTG;SOR=0.590;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=158;TCF=56;TCR=102;TR=68;WE=100598875;WS=100598856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,81:0.45:180
chr1	100602506	rs144353071	G	GT	490.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=2.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.82;ReadPosRankSum=-0.123;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,26:0.36:72
chr1	100609639	rs6681721	C	T	1166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.373;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=21;PP=724;ReadPosRankSum=-1.261;SC=GATTCCTGTGCTAAGAGAAGA;SOR=0.970;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=108;TCF=65;TCR=43;TR=53;WE=100609647;WS=100609629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,58:0.49:119
chr1	100617887	rs2784177	C	T	2046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=11;PP=1395;SC=GTTAGTGATACACACATTACT;SOR=2.584;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=53;TCR=11;TR=64;WE=100617895;WS=100617877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	100672060	rs12021720	T	C	6116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=87;PP=2965;SC=CTGAGCTGACTCACAGAGCCC;SOR=0.776;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=195;TCF=108;TCR=87;TR=195;WE=100672068;WS=100672050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr1	100715454	rs3806235	G	A	3647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=77;PP=2147;SC=TGGGAAACGCGCCTCCCCCTG;SOR=1.721;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=41;TCR=77;TR=118;WE=100715462;WS=100715444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr1	100733552	rs4298755	T	C	798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=0;PP=590;SC=TCTAGGTGCATAAAAACCCAA;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=100733560;WS=100733545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	100750733	rs58046505	AGTTTT	A	3939.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=23;PP=2359;SC=CTTAGTAATTAGTTTTGTTTT;SOR=1.688;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=25;TCR=26;TR=46;WE=100750745;WS=100750723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr1	100817384	rs28361189	A	G	1638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.156;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=39;PP=914;ReadPosRankSum=-0.022;SC=GAGGAAACCAATACATGTACT;SOR=0.797;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=163;TCF=82;TCR=81;TR=76;WE=100817392;WS=100817374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,84:0.47:180
chr1	100817529	.	A	AGT	86	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5057;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=7;PP=212;SC=GGTTTTTACGAGTGTGTGTGT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=7;WE=100817537;WS=100817519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	100818464	rs594529	T	C	2544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=55;NR=30;PP=1416;SC=GGCGAGTGACTTCAGCTGGCC;SOR=1.109;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=55;TCR=30;TR=85;WE=100818472;WS=100818454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr1	100819273	rs2297170	T	C	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=121;ReadPosRankSum=-0.194;SC=CTTCCACTTCTCTACTTCTCA;SOR=0.663;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=9;WE=100819281;WS=100819263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr1	100856479	rs28361213	C	T	1704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.568;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=37;PP=1011;ReadPosRankSum=2.242;SC=GATTGAGAGACGGTGGAGATT;SOR=0.673;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=146;TCF=77;TCR=69;TR=76;WE=100856487;WS=100856469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,83:0.50:167
chr1	100908324	rs584350	A	G	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=27;ReadPosRankSum=-0.090;SC=TCTTAATGCAATATAACCAGT;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=3;WE=100908332;WS=100908318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
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chr1	101203827	rs3176879	G	A	3850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=69;PP=2258;SC=AAGCACAGAAGTCAAAAGTGT;SOR=0.922;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=132;TCF=63;TCR=69;TR=132;WE=101203835;WS=101203817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr1	101342497	rs2295280	T	C	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=343;ReadPosRankSum=-0.778;SC=ATAGTGTCTATATAGATCATT;SOR=0.593;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=18;WE=101342505;WS=101342487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr1	101372607	rs4908106	C	A	525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=16;PP=416;SC=GACTTGTTACCAATTGAACAC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=101372615;WS=101372597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	101377845	rs10493940	A	G	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.219;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=68;ReadPosRankSum=1.384;SC=GGTTTCTGTCATAATTATTTA;SOR=0.076;SbPval=0.1;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=10;WE=101377853;WS=101377835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr1	101476800	rs35409691	CA	C	129.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.497;HP=6;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=689;ReadPosRankSum=-0.480;SC=AAAAACTGTACAAAAATGAAT;SOR=1.751;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=27;TCF=16;TCR=11;TR=10;WE=101476822;WS=101476776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,10:0.22:46
chr1	101476814	rs17123612	C	T	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.946;HP=4;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=680;ReadPosRankSum=-1.141;SC=AATGAATCAACAATTACCTCT;SOR=1.214;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=47;TCF=35;TCR=12;TR=13;WE=101476822;WS=101476776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,12:0.23:52
chr1	101487373	.	AACACACAC	A	44.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=527;ReadPosRankSum=-0.967;SC=TGACCATTCTAACACACACAC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=6;WE=101487388;WS=101487363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr1	101491108	rs7521668	C	A	856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=23;PP=569;ReadPosRankSum=0.129;SC=ACCAAAGTAGCACAAGAGAAG;SOR=0.622;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=23;TCR=42;TR=36;WE=101491116;WS=101491098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,38:0.55:69
chr1	102271774	rs4907955	G	A	3201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.418;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=73;PP=1740;ReadPosRankSum=2.057;SC=TTAGGTGAACGCAGCCAATGA;SOR=0.743;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=273;TCF=122;TCR=151;TR=136;WE=102271782;WS=102271764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,155:0.50:308
chr1	102296144	rs10493974	T	G	2344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=26;PP=1569;SC=CCAATGCACATTCATTTCTAG;SOR=1.554;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=53;TCR=26;TR=79;WE=102296152;WS=102296134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr1	102296279	rs10493973	T	C	5518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=94;PP=2965;SC=TCTGCCGAAATTTTGCCTTCA;SOR=0.850;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=182;TCF=88;TCR=94;TR=182;WE=102296287;WS=102296269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr1	102462446	rs67744758	GTCAGT	G	1591.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.606;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.714;NF=2;NR=23;PP=1126;ReadPosRankSum=0.206;SC=CCTTTCCCTCGTCAGTTGCAC;SOR=0.944;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=65;TCF=9;TCR=56;TR=25;WE=102462458;WS=102462436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,44:0.41:107
chr1	103352451	rs2229783	A	G	2716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=59;PP=1686;ReadPosRankSum=1.069;SC=TCATATGCTCAATGTCTTGTT;SOR=0.689;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=209;TCF=108;TCR=101;TR=121;WE=103352459;WS=103352441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,131:0.56:232
chr1	103354115	rs17127203	T	C	1630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.623;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=30;PP=956;ReadPosRankSum=-1.621;SC=AACATCACTCTTGTTAACATA;SOR=0.601;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=133;TCF=76;TCR=57;TR=70;WE=103354123;WS=103354105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,79:0.55:144
chr1	103354138	rs1676486	A	G	1850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.568;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=37;PP=1263;ReadPosRankSum=-0.295;SC=CTTACTGGAGACCCAGGAGGC;SOR=0.755;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=156;TCF=85;TCR=71;TR=83;WE=103354146;WS=103354128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,87:0.52:167
chr1	103354428	rs1763347	A	G	748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.823;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=21;PP=515;ReadPosRankSum=0.628;SC=TTACTGGTAAACCTGGAGGAC;SOR=0.866;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=79;TCF=37;TCR=42;TR=36;WE=103354436;WS=103354418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,38:0.45:85
chr1	103354939	rs113226085	C	CTGTGTGTGTG,CTGTGTGTG	385.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.515;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=114;ReadPosRankSum=0.739;SC=ACTTAAAGGACTGTGTGTGTG;SOR=0.368;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=23;TCF=11;TCR=12;TR=10;WE=103354948;WS=103354929;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.32:37
chr1	103356107	rs11164634	A	G	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.242;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=20;PP=404;ReadPosRankSum=0.764;SC=CAGAGTAGGTATGAATTAGAG;SOR=1.434;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=76;TCF=25;TCR=51;TR=28;WE=103356115;WS=103356097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,25:0.37:68
chr1	103356168	rs1085	A	C	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.993;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=274;ReadPosRankSum=-0.189;SC=TACGGAGTTGAAAATAGTAAT;SOR=0.172;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=14;WE=103356176;WS=103356158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr1	103381129	rs4908273	C	T	3569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=37;PP=2100;SC=GTTTGTAATGCTGTAAAAGAA;SOR=1.537;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=113;TCF=76;TCR=37;TR=112;WE=103381137;WS=103381119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr1	103400491	rs11164641	GA	AT	2218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=7;PP=1687;SC=ATTTAAATTTGATTTAATGTC;SOR=2.701;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=44;TCF=36;TCR=8;TR=41;WE=103400500;WS=103400481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	103428389	rs1841834	G	A	847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.824;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=25;PP=563;ReadPosRankSum=-0.357;SC=CTCAAAAACAGTATTATTACA;SOR=1.289;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=59;TCF=18;TCR=41;TR=34;WE=103428397;WS=103428379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,36:0.56:64
chr1	103435626	rs2061710	G	A	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=51;ReadPosRankSum=1.368;SC=ATATATATATGTATATTTCAA;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=4;WE=103435634;WS=103435616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr1	103440497	rs41301263	A	G	956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.272;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=25;PP=523;ReadPosRankSum=1.013;SC=ATGCATCTTTATACTTTGAGG;SOR=0.266;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=79;TCF=24;TCR=55;TR=40;WE=103440505;WS=103440487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,45:0.53:85
chr1	103444679	rs11164649	T	G	2619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.611;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=54;PP=1675;ReadPosRankSum=2.268;SC=GACAGTTCAATTTCAATATGC;SOR=0.640;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=199;TCF=103;TCR=96;TR=114;WE=103444687;WS=103444669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,122:0.54:227
chr1	103449598	rs2615978	G	C	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.831;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=122;ReadPosRankSum=-0.374;SC=AAGTACTCATGATAATATAGA;SOR=2.247;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=7;WE=103449606;WS=103449588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr1	103455217	rs1463034	C	T	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=83;ReadPosRankSum=-0.407;SC=GTGCTGATAACGAGGGAAAAT;SOR=0.446;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=9;WE=103455225;WS=103455207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr1	103461508	rs2622867	T	A	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.512;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=13;PP=344;ReadPosRankSum=0.349;SC=AACATTTCACTTTGAAAGTAA;SOR=0.324;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=61;TCF=38;TCR=23;TR=27;WE=103461516;WS=103461498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,27:0.41:66
chr1	103461696	.	T	G	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.859;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=143;ReadPosRankSum=0.173;SC=GGATATGGTTTTTTTCTACTG;SOR=0.602;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=11;WE=103461704;WS=103461686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr1	103462473	rs2786125	A	G	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=1.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=246;ReadPosRankSum=-1.014;SC=ACATAGTCTAATTTCTAAAAT;SOR=1.721;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=11;WE=103462481;WS=103462463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr1	103463976	rs2622870	G	T	93.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5210;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=92;ReadPosRankSum=-0.253;SC=AAGCTTTAACGTGTACATATA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=5;WE=103463984;WS=103463966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr1	103467615	rs2929162	C	T	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=473;ReadPosRankSum=1.446;SC=CTATAGTACACAGTGAGTTAT;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=22;WE=103467623;WS=103467605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,23:0.64:36
chr1	103468609	rs2251895	A	G	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=2.985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.84;ReadPosRankSum=0.865;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,24:0.53:45
chr1	103471456	rs71752747	CCAT	C	1524.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.937;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.797;NF=9;NR=15;PP=1530;ReadPosRankSum=-2.151;SC=CCCTGTAAAACCATCATCATC;SOR=0.974;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=52;TCF=15;TCR=37;TR=24;WE=103471472;WS=103471446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,42:0.57:74
chr1	103471734	rs71592255	A	AAAATAAAT	2060.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=16.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.92;ReadPosRankSum=-0.964;SOR=1.884;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,52:0.45:115
chr1	103483514	rs945748	C	T	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=189;ReadPosRankSum=1.195;SC=CTAGTCCTATCGAAGAGTTCG;SOR=0.593;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=37;TCF=8;TCR=29;TR=14;WE=103483522;WS=103483504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,14:0.37:38
chr1	103487394	rs35291481	CT	C	346.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=3.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.40;MQRankSum=1.235;QD=10.84;ReadPosRankSum=0.730;SOR=2.348;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr1	103491239	rs41292533	A	C	738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.964;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=13;PP=439;ReadPosRankSum=-1.265;SC=ATCATGATTTAATTGGGTTAT;SOR=0.218;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=49;TCF=29;TCR=20;TR=27;WE=103491247;WS=103491229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,31:0.58:53
chr1	103496620	rs7523441	G	T	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.524;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=151;ReadPosRankSum=2.113;SC=ACTGCACTGCGATGTCCATAT;SOR=0.330;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=13;WE=103496628;WS=103496610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr1	103496805	rs36076089	GA	G	91.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQRankSum=0.792;QD=6.55;ReadPosRankSum=1.743;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr1	103548319	rs11164662	C	G	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.328;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=517;ReadPosRankSum=0.731;SC=AGTGTAATAACTTTTAGTAAT;SOR=1.003;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=45;TCF=34;TCR=11;TR=26;WE=103548327;WS=103548309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,28:0.60:47
chr1	103573547	rs6691654	G	A	876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=25;NR=11;PP=707;SC=AGAGCGGGGAGGAAGGGTAAA;SOR=1.911;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=25;TCR=11;TR=36;WE=103573555;WS=103573537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	104076495	rs6702220	A	G	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.420;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=191;ReadPosRankSum=-0.816;SC=TAGATCAGTAAATCATACATT;SOR=0.954;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=44;TCF=20;TCR=24;TR=16;WE=104076503;WS=104076485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,14:0.36:39
chr1	104076537	rs6702324	A	T	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.451;HP=7;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=8;PP=128;ReadPosRankSum=0.206;SC=GTGTTTTTTTAAATCAGTTAT;SOR=0.984;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=35;TCF=16;TCR=19;TR=15;WE=104076545;WS=104076527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,13:0.36:36
chr1	104080169	rs10736038	G	C	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=176;ReadPosRankSum=0.835;SC=AGAGACTCTTGCTCTCCCTAG;SOR=0.751;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=26;TCF=8;TCR=18;TR=12;WE=104080177;WS=104080159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr1	104084226	rs10881232	A	G	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.151;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=239;ReadPosRankSum=0.072;SC=CTTCCTAGTTACCAAATTTAC;SOR=2.049;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=14;WE=104084234;WS=104084216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr1	104086145	rs10785725	A	G	1651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=38;PP=1065;SC=ATAATGTTTCATATTTTAGTA;SOR=1.430;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=21;TCR=38;TR=59;WE=104086153;WS=104086135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	104116413	rs17851840	T	C	2156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.730;NF=41;NR=52;PP=1348;ReadPosRankSum=1.418;SC=AATATATGAATCATCTCATTG;SOR=0.676;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=177;TCF=79;TCR=98;TR=93;WE=104116421;WS=104116403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,103:0.52:198
chr1	104256478	rs167447	T	A	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.47;MQRankSum=-2.581;QD=2.20;ReadPosRankSum=2.028;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,3:0.21:14
chr1	104297300	.	G	GTGATATTCTA	1806.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.419;ClippingRankSum=0.000;DP=468;ExcessHet=3.0103;FS=3.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.27;MQRankSum=-1.526;QD=5.43;ReadPosRankSum=1.046;SOR=0.956;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:269,64:0.19:333
chr1	107946324	rs71897263	CA	C	327.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.28;MQRankSum=0.766;QD=9.10;ReadPosRankSum=3.138;SOR=0.716;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,24:0.67:36
chr1	107961159	rs12731224	A	G	1783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=23;PP=1000;ReadPosRankSum=-0.648;SC=AAATGACATTATAGCTGAAAA;SOR=0.649;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=138;TCF=92;TCR=46;TR=68;WE=107961167;WS=107961149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,79:0.52:152
chr1	107979396	rs480392	A	C	3765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=75;PP=2558;SC=GTCTGCCGGGAAATTCCTGGC;SOR=1.420;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=45;TCR=75;TR=120;WE=107979404;WS=107979386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr1	108139003	rs3748702	C	T	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.415;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=24;PP=556;ReadPosRankSum=0.570;SC=GATAAGGATACTTTTGTTCTC;SOR=1.093;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=53;TCF=9;TCR=44;TR=28;WE=108139011;WS=108138993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,30:0.53:57
chr1	108152332	rs1328208	T	A	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=215;ReadPosRankSum=0.380;SC=ATTATCAGTCTAGGGCACTGG;SOR=0.223;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=12;WE=108152340;WS=108152322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr1	108152630	rs2296877	G	T	612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.289;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=16;PP=304;ReadPosRankSum=0.456;SC=TTACATAAGGGAAGCTTTTAG;SOR=0.502;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=12;TCR=25;TR=24;WE=108152638;WS=108152620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,29:0.64:45
chr1	108160260	rs5776894	GA	G	1348.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=0.630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.14;MQRankSum=1.028;QD=9.05;ReadPosRankSum=0.930;SOR=0.595;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,77:0.52:149
chr1	108292260	rs6672483	A	G	732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.470;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=23;PP=511;ReadPosRankSum=-1.112;SC=TGGTTTAGAAACATGGGTTAT;SOR=1.505;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=68;TCF=24;TCR=44;TR=32;WE=108292268;WS=108292250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,34:0.45:75
chr1	108299807	.	G	GTA	293.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-1.659;ClippingRankSum=0.000;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=304;ReadPosRankSum=1.902;SC=GTGTGTGTGTGTGTATGCAAT;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=19;WE=108299821;WS=108299797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr1	108299809	rs12138353	G	A	1264.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=1.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=7;PP=596;ReadPosRankSum=0.528;SC=GTGTGTGTGTGTATGCAATTT;SOR=0.906;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=31;WE=108299821;WS=108299797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,34:0.97:35
chr1	108307642	rs7514025	C	T	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.153;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=288;ReadPosRankSum=-0.102;SC=TAAAGAGGAACACATTGCTTT;SOR=2.531;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=15;WE=108307650;WS=108307632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr1	108307727	rs7528153	T	A	1931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.587;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=32;PP=1156;ReadPosRankSum=-1.751;SC=TCTTCTTTTGTCTTAGAAATG;SOR=0.641;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=150;TCF=91;TCR=59;TR=82;WE=108307735;WS=108307717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,90:0.56:161
chr1	108313258	rs6583048	C	T	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.911;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=9;PP=284;ReadPosRankSum=0.468;SC=GATGACTTACCTTTTCTATTG;SOR=0.690;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=70;TCF=37;TCR=33;TR=23;WE=108313266;WS=108313248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,27:0.37:73
chr1	108315256	rs7416884	G	C	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.666;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=247;ReadPosRankSum=1.472;SC=AGCAAGCAAAGGTTAAAAAAA;SOR=2.642;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=12;WE=108315264;WS=108315246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,12:0.36:33
chr1	108315305	rs4611048	C	T	2894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=23;PP=1670;SC=TGTTAATTAGCCTTTCCTAAT;SOR=1.925;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=88;TCF=65;TCR=23;TR=87;WE=108315313;WS=108315295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr1	108507541	rs71796067	GGCC	G	438.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=10;PP=451;SC=GCAAGGATGCGGCCGCCGCCG;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=10;WE=108507551;WS=108507531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	108724518	rs490680	A	G	3889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=56;PP=2413;SC=TCTAATGCAGAATATTAAAGT;SOR=0.952;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=129;TCF=73;TCR=56;TR=129;WE=108724526;WS=108724508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr1	108724693	rs491785	G	A	1452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=35;PP=941;SC=CTCAGAACTGGTAAGAACCAC;SOR=2.049;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=12;TCR=35;TR=47;WE=108724701;WS=108724683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	108771721	rs79996376	T	C	1117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-14.611;NF=45;NR=44;PP=856;ReadPosRankSum=-0.712;SC=CACCTCTGACTGGTGGTGGCT;SOR=0.662;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=259;TCF=128;TCR=131;TR=89;WE=108771729;WS=108771711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,78:0.30:263
chr1	109143093	rs17024882	C	T	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.328;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=106;ReadPosRankSum=-0.617;SC=TAACACATTACTTTTGCATGT;SOR=0.105;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=10;WE=109143101;WS=109143083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr1	109170746	rs2133198	C	T	1437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=12;PP=923;SC=TGACCATTAACTTTTTGGCAA;SOR=1.848;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=33;TCR=12;TR=45;WE=109170754;WS=109170736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	109241669	rs2297563	G	A	558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=0;PP=445;SC=AATGATTCTTGACATGGCCTT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=109241677;WS=109241659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	109255513	rs3006864	G	T	4210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=45;PP=2703;SC=AAGAGGACCCGGATTGCTTTG;SOR=1.500;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=91;TCR=45;TR=136;WE=109255521;WS=109255503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr1	109268573	rs4494160	T	C	5615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=97;PP=2965;SC=AGTGTTTTTGTCTATAACAAG;SOR=0.846;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=183;TCF=85;TCR=98;TR=182;WE=109268581;WS=109268563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr1	109270402	rs10494096	G	A	801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.624;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=8;PP=624;ReadPosRankSum=0.631;SC=TGATGGGACCGCCATTTTCCC;SOR=1.162;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=54;TCF=39;TCR=15;TR=32;WE=109270410;WS=109270392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,32:0.60:53
chr1	109273456	rs4970809	A	G	2769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.421;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=60;PP=1754;ReadPosRankSum=0.390;SC=GCCTCCTAGGATGCATCACAT;SOR=0.660;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=263;TCF=135;TCR=128;TR=120;WE=109273464;WS=109273446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,135:0.45:297
chr1	109273610	rs4970810	G	A	852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.568;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=26;PP=596;ReadPosRankSum=0.042;SC=ATCCAGGCATGAGCCTTTCCT;SOR=0.340;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=60;TCF=15;TCR=45;TR=36;WE=109273618;WS=109273600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,37:0.57:65
chr1	109289236	rs1124426	C	A	292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=1;PP=169;SC=CCGGAGGGCGCGGTCTGCTAG;SOR=2.303;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=109289244;WS=109289226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	109289353	rs1124427	C	G	1362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=17;PP=759;SC=TCCGCAGTGTCGGGAAGATGG;SOR=0.952;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=25;TCR=17;TR=42;WE=109289361;WS=109289343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	109289487	rs6604120	C	T	963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=18;PP=506;SC=AGCCCCAACCCAGCGGTCTGT;SOR=1.547;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=12;TCR=18;TR=30;WE=109289495;WS=109289477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	109299453	rs1277044	C	G	747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=19;PP=546;SC=GGTTTACTAACAGAAAATTCA;SOR=2.584;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=24;WE=109299461;WS=109299443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	109301019	rs3841723	GC	G	236.25	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.765;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5026;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=257;ReadPosRankSum=-1.221;SC=TAAACTTTTAGCCAGTAAAGT;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=8;WE=109301027;WS=109301009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr1	109301250	rs1277042	G	C	3038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=53;PP=1844;SC=TGTTCAAAATGCCATTGGTTT;SOR=0.990;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=47;TCR=53;TR=100;WE=109301258;WS=109301240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr1	109315211	rs1623641	A	G	222.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=183;SC=TACATTATATATAACATAAAT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=109315219;WS=109315201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	109321824	rs1759481	G	T	1203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=7;PP=772;SC=TTAGGAAAAGGGTGCTTTGTA;SOR=2.780;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=38;WE=109321832;WS=109321814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	109325028	rs1277051	T	C	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.518;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=279;ReadPosRankSum=0.224;SC=GTTTTAGTGCTTCTGTCTACT;SOR=0.405;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=45;TCF=33;TCR=12;TR=23;WE=109325036;WS=109325018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,29:0.56:52
chr1	109338861	rs1127635	G	C	888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=15;PP=449;ReadPosRankSum=-1.212;SC=TTAAGGACCTGGCACTTGGAA;SOR=0.644;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=102;TCF=62;TCR=40;TR=38;WE=109338869;WS=109338851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,47:0.41:116
chr1	109349996	.	CT	C	93.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.337;ClippingRankSum=0.000;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=8.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.64;ReadPosRankSum=-0.382;SOR=0.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,12:0.21:57
chr1	109358755	rs11453763	A	AT	2587.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.110;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=29;PP=1111;ReadPosRankSum=-0.575;SC=TTTTCTTTGCATTTTTTTCTT;SOR=0.820;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=121;TCF=45;TCR=76;TR=47;WE=109358763;WS=109358745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,107:0.54:200
chr1	109358958	rs6696787	T	C	1191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=31;PP=725;ReadPosRankSum=0.051;SC=TTTAATTACATAAACTAACTG;SOR=0.668;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=98;TCF=31;TCR=67;TR=46;WE=109358966;WS=109358948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,53:0.50:107
chr1	109366286	rs7522157	C	T	2130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.949;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=45;PP=1105;ReadPosRankSum=-0.402;SC=AGAATCAGAACAGAAGCTGTG;SOR=0.627;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=235;TCF=116;TCR=119;TR=92;WE=109366294;WS=109366276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,110:0.42:265
chr1	109366370	rs7522260	C	T	2696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=60;PP=1731;SC=TCATAAAATACGGTGTGGAGA;SOR=1.384;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=35;TCR=60;TR=95;WE=109366378;WS=109366360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr1	109369791	rs11102505	G	A	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=1.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.14;ReadPosRankSum=0.464;SOR=0.905;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,18:0.33:54
chr1	109369797	rs11102506	T	G	2162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.81;SOR=1.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr1	109369915	rs7551421	G	T	3939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=68;NR=71;PP=2388;SC=TTTTCTCCACGTTTTGCTTCC;SOR=0.915;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=139;TCF=68;TCR=71;TR=139;WE=109369923;WS=109369905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr1	109372968	rs1277221	T	G	256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=9;NR=1;PP=167;SC=TTGTAAAATCTCCCATGGTGA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=109372976;WS=109372967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	109377070	rs12060255	C	A	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.96;ReadPosRankSum=1.215;SOR=0.746;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,25:0.44:57
chr1	109377157	rs112859436	T	TA	407.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.48;MQRankSum=1.979;QD=5.16;ReadPosRankSum=-0.278;SOR=0.844;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,29:0.37:79
chr1	109377283	rs12063387	A	G	1467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=36;PP=880;ReadPosRankSum=0.332;SC=AGAGAGTGCTATGGGCCTCAT;SOR=0.741;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=139;TCF=56;TCR=83;TR=58;WE=109377291;WS=109377273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,70:0.44:158
chr1	109377334	rs12061417	C	T	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.440;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=243;ReadPosRankSum=-0.399;SC=TCCCCCAGCCCCAGCTGTCCC;SOR=2.252;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=42;TCF=10;TCR=32;TR=13;WE=109377342;WS=109377324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,14:0.30:46
chr1	109377537	rs12057309	G	A	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=140;ReadPosRankSum=-0.769;SC=TGGGGCTCCAGGGCTAGGACT;SOR=0.693;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=23;TCF=16;TCR=7;TR=11;WE=109377545;WS=109377527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr1	109391486	rs1149142	G	A	2441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=34;PP=1561;SC=TTTCTCATGTGTGAATTTGGT;SOR=1.055;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=47;TCR=34;TR=81;WE=109391494;WS=109391476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr1	109395105	rs1277207	C	T	3988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.403;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=79;PP=2434;ReadPosRankSum=-0.191;SC=ACAAGTCTCACTATGCATAGC;SOR=0.689;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=294;TCF=154;TCR=140;TR=163;WE=109395113;WS=109395095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,180:0.55:326
chr1	109428249	rs10857987	G	A	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=278;ReadPosRankSum=-0.774;SC=TTATTTTAAAGTGTTTTTAAC;SOR=0.593;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=44;TCF=13;TCR=31;TR=21;WE=109428257;WS=109428239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,24:0.48:50
chr1	109440215	rs41279678	G	A	2981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.435;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=70;PP=1855;ReadPosRankSum=0.906;SC=TGTTGTCAGCGACACCTAGAT;SOR=0.503;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=273;TCF=129;TCR=144;TR=137;WE=109440223;WS=109440205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,148:0.49:305
chr1	109456850	rs1664419	G	A	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.255;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=218;ReadPosRankSum=-1.528;SC=AGGTTTTCTCGTTTCATATGG;SOR=1.426;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=38;TCF=30;TCR=8;TR=15;WE=109456858;WS=109456840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,18:0.43:42
chr1	109465165	rs35029887	ACTT	A	5873.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=352;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.293;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.162;NF=11;NR=63;PP=2971;ReadPosRankSum=1.858;SC=TTCAACAACAACTTCTTCCAC;SOR=0.778;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=179;TCF=25;TCR=154;TR=74;WE=109465175;WS=109465155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:179,155:0.46:334
chr1	109466562	rs151310940	TTTTTTTG	T	1746.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.956;NF=10;NR=9;PP=848;ReadPosRankSum=0.692;SC=TGTGCCTAGGTTTTTTTGTTT;SOR=0.793;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=52;TCF=21;TCR=31;TR=19;WE=109466576;WS=109466552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,46:0.53:86
chr1	109466858	rs705268	G	A	1211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.698;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=31;PP=675;ReadPosRankSum=1.489;SC=TATTTTTTTCGTTCTGCATAC;SOR=0.473;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=89;TCF=32;TCR=57;TR=50;WE=109466866;WS=109466848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,56:0.54:103
chr1	109474221	rs1769740	C	T	471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=282;ReadPosRankSum=-0.868;SC=AGAGTCATAACCTGGAATTAA;SOR=0.922;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=53;TCF=15;TCR=38;TR=22;WE=109474229;WS=109474211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,21:0.54:39
chr1	109477653	rs839850	G	A	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=181;ReadPosRankSum=1.352;SC=ACCCAAATCCGTTGTAGCAAG;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=11;WE=109477661;WS=109477643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr1	109479978	rs168107	G	T	3018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.434;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=64;PP=1955;ReadPosRankSum=0.408;SC=GGGGAGGTTCGCTCTCAGGAC;SOR=0.749;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=254;TCF=134;TCR=120;TR=134;WE=109479986;WS=109479968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,144:0.51:280
chr1	109482220	rs338480	C	T	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.281;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=404;ReadPosRankSum=0.461;SC=CGTGAGCCACCGCGCCTGGCC;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=41;TCR=15;TR=26;WE=109482228;WS=109482210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,28:0.47:59
chr1	109482826	rs338479	C	T	1489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.599;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=34;PP=827;ReadPosRankSum=1.446;SC=CATTCCCAAACAAGACATTAC;SOR=0.785;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=139;TCF=69;TCR=70;TR=67;WE=109482834;WS=109482816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,74:0.48:153
chr1	109483975	rs193139	T	C	1253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.687;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=21;PP=815;ReadPosRankSum=0.216;SC=TCTATGTTCTTTCATTCTCAG;SOR=0.823;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=110;TCF=69;TCR=41;TR=57;WE=109483983;WS=109483965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,61:0.51:120
chr1	109486016	rs17014489	A	G	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.969;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=170;ReadPosRankSum=-0.125;SC=ATCCAAGGCAAGATTGCTCTC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=8;WE=109486024;WS=109486011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr1	109486196	rs338466	A	G	10297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=391;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=187;NR=172;PP=2965;SC=TCCACAGCTCAGTAGCCACTA;SOR=0.772;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=359;TCF=187;TCR=172;TR=359;WE=109486204;WS=109486186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,391:1.00:391
chr1	109486240	rs3215062	TA	T	11608.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=370;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=174;PP=2966;SC=AGAAGTACCTTAAAACAGAGA;SOR=0.921;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=205;TCF=16;TCR=189;TR=190;WE=109486248;WS=109486230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,357:1.00:357
chr1	109490457	rs839543	T	C	1782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=33;PP=1043;SC=TTTGATCAAGTTTGCATTTAT;SOR=1.066;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=27;TCR=33;TR=60;WE=109490465;WS=109490447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	109493134	rs34131552	G	GTTA	276.19	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.9785;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.282;NF=0;NR=8;PP=325;ReadPosRankSum=1.593;SC=TGGGTTTTGGGTTATTATTAT;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=8;WE=109493142;WS=109493124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr1	109524584	rs487901	C	A	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-4.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=201;ReadPosRankSum=0.117;SC=GTGGCTCATGCCTATAATCCC;SOR=0.770;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=11;WE=109524592;WS=109524574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr1	109529322	rs61696019	T	TAA	2351.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=38;PP=1906;SC=GAATGAATATTAGTTATCCTA;SOR=3.098;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=38;WE=109529330;WS=109529312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	109545046	rs184606	C	T	609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=14;PP=380;SC=TAGAAAAAAACATATATATTT;SOR=1.931;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=20;WE=109545054;WS=109545036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	109618308	rs34069017	G	A	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.361;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=124;ReadPosRankSum=-1.294;SC=GATTCTGTACGTGTTTCAGTG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=7;WE=109618316;WS=109618298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr1	109704390	rs643197	C	G	1482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=8;PP=1060;SC=GCTCCCTGCCCGGGGTCCCAG;SOR=2.917;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=44;TCR=8;TR=52;WE=109704398;WS=109704380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	109704618	rs678238	A	G	2766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=59;PP=1752;ReadPosRankSum=1.733;SC=GCCTGACCCCATCAAGGGCAC;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=92;TCF=32;TCR=60;TR=91;WE=109704626;WS=109704608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,100:0.99:101
chr1	109714750	rs2297758	T	C	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.448;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=331;ReadPosRankSum=2.152;SC=TGTTGTTTTCTCTCTGGAGAG;SOR=0.334;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=38;TCF=10;TCR=28;TR=19;WE=109714758;WS=109714740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr1	109714919	rs2297757	A	G	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=64;ReadPosRankSum=1.068;SC=TTTGGTGTCAACGCTCATTTT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=4;WE=109714927;WS=109714909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr1	109727475	rs649531	T	C	398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=0;PP=375;SC=AAAGGGAAGCTTGAGCAGGGT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=109727483;WS=109727465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	109734157	rs606066	T	C	778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=582;ReadPosRankSum=0.042;SC=ATCTGCCCCATTGGTGTGTCC;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=44;TCF=11;TCR=33;TR=29;WE=109734165;WS=109734147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,30:0.68:44
chr1	109734225	rs643785	G	T	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.935;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=8;PP=230;ReadPosRankSum=-0.503;SC=AGACTGACCAGCAGGGACTTC;SOR=0.721;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=20;TCF=10;TCR=10;TR=15;WE=109734233;WS=109734222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,18:0.78:23
chr1	109734541	rs645128	C	T	1876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=46;PP=1349;SC=CCCAGGAGGACTCCTAGCATT;SOR=2.494;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=14;TCR=46;TR=60;WE=109734549;WS=109734531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr1	109735298	rs658779	T	C	1857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.455;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=36;PP=948;ReadPosRankSum=-0.333;SC=TTATGAATGGTGTGGCCTCCT;SOR=0.583;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=150;TCF=79;TCR=71;TR=78;WE=109735306;WS=109735288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,87:0.52:168
chr1	109735416	rs659543	A	C	1570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.152;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=36;PP=1028;ReadPosRankSum=-0.814;SC=CTCCTGCCCCACTAACACAAT;SOR=1.020;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=131;TCF=66;TCR=65;TR=66;WE=109735424;WS=109735406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,72:0.50:143
chr1	109735504	rs659659	T	C	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.280;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=16;PP=373;ReadPosRankSum=-2.442;SC=AAGGTACCTGTAGTCTGGCAT;SOR=0.446;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=41;TCF=12;TCR=29;TR=24;WE=109735512;WS=109735494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,25:0.56:45
chr1	109737063	rs2359246	C	T	813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.820;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=13;PP=487;ReadPosRankSum=1.325;SC=TGTGCTACAACGATTGCACCT;SOR=0.818;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=80;TCF=52;TCR=28;TR=35;WE=109737071;WS=109737053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,40:0.44:90
chr1	109737090	rs2359245	G	A	1420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.316;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=23;PP=723;ReadPosRankSum=-1.085;SC=GCAACACTCCGACCAGGACTT;SOR=0.556;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=80;TCR=50;TR=60;WE=109737098;WS=109737080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,71:0.49:146
chr1	109737132	rs2359244	T	C	1828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.209;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=35;PP=830;ReadPosRankSum=0.211;SC=TGGCAAACACTGTCACTCTTG;SOR=0.505;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=170;TCF=97;TCR=73;TR=78;WE=109737140;WS=109737122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,94:0.48:197
chr1	109737172	rs2359243	C	T	1642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.191;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=31;PP=839;ReadPosRankSum=0.807;SC=TTCCAAAGGGCTGAAATACTT;SOR=0.773;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=145;TCF=80;TCR=65;TR=69;WE=109737180;WS=109737162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,82:0.48:171
chr1	109737314	rs2359242	T	C	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.988;SOR=0.929;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr1	109737320	rs2359241	G	A	472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.51;ReadPosRankSum=1.091;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr1	109740548	rs2296696	G	T	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=14;PP=353;ReadPosRankSum=-1.258;SC=GAATTGAAGTGGTTGCCAGCT;SOR=0.691;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=85;TCF=49;TCR=36;TR=32;WE=109740556;WS=109740538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,35:0.37:94
chr1	109742452	rs913178	C	T	357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=3;PP=224;SC=AGTGAGAGCTCAGGTCTCTTT;SOR=1.981;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=10;WE=109742460;WS=109742442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	109742485	rs913179	G	A	637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=4;PP=455;SC=GAACGTGCTCGGATGGGACCT;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=20;WE=109742493;WS=109742475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	109743622	rs3736956	C	T	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=126;ReadPosRankSum=-0.573;SC=GGATGGGCACCCTGCTCCCCA;SOR=0.732;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=9;WE=109743630;WS=109743612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr1	109745618	rs1052878	T	C	3002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=34;NR=56;PP=1792;SC=TCAGGAGGCCTAGACATGGAC;SOR=1.343;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=90;TCF=34;TCR=56;TR=90;WE=109745626;WS=109745608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr1	109771881	rs657511	G	T	388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=321;SC=GTGTGTGAAGGAAATCTCAGT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=109771889;WS=109771871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	109779556	rs631927	T	A	3681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=69;PP=2324;SC=CCAAGTCAGGTGCTTGAAAGG;SOR=1.196;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=45;TCR=69;TR=114;WE=109779564;WS=109779546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr1	109792735	rs144034706	A	ACGC	940.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.932;NF=5;NR=8;PP=503;ReadPosRankSum=0.348;SC=CCCCCTCCCAACGCCGCCGCC;SOR=0.674;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=37;TCF=16;TCR=21;TR=13;WE=109792743;WS=109792725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,28:0.46:61
chr1	109794252	rs454107	T	C	11797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=450;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=192;NR=214;PP=2965;SC=TCCTGGAGAGTGTCCCCTTAG;SOR=0.830;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=406;TCF=192;TCR=214;TR=406;WE=109794260;WS=109794242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,449:1.00:449
chr1	109795026	rs413380	T	C	6216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=109;PP=2965;SC=AGCTGGACTATGAAGACCAAG;SOR=0.818;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=211;TCF=102;TCR=109;TR=210;WE=109795034;WS=109795016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr1	109795608	rs437444	T	C	8300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=142;NR=130;PP=2965;SC=CTGAGGTCTTTCAGCTGGACA;SOR=0.700;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=272;TCF=142;TCR=130;TR=272;WE=109795616;WS=109795598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,305:1.00:305
chr1	109796053	rs2359414	C	T	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.504;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=258;ReadPosRankSum=0.509;SC=GGGTAGCTCGCGGGGATGGTC;SOR=1.456;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=36;TCF=14;TCR=22;TR=17;WE=109796061;WS=109796043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,20:0.48:42
chr1	109804883	rs66795935	C	G	2014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.497;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=39;PP=1163;ReadPosRankSum=0.014;SC=TCAGTGTCCCCCTTCTCTGCT;SOR=0.638;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=192;TCF=112;TCR=80;TR=93;WE=109804891;WS=109804873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,104:0.48:218
chr1	109807283	rs6657811	A	T	1565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.371;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=39;PP=1068;ReadPosRankSum=0.502;SC=CGGGCAGGTTATCAGGTGCCT;SOR=0.391;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=129;TCF=49;TCR=80;TR=67;WE=109807291;WS=109807273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,69:0.52:132
chr1	109810200	rs72703203	GG	AA	4102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.634;HP=4;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=38;PP=2944;ReadPosRankSum=0.241;SC=GATGAGCACAGGGGGTGGCTC;SOR=0.952;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=219;TCF=125;TCR=94;TR=96;WE=109810209;WS=109810190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,109:0.46:238
chr1	109810544	rs2281894	C	A	2303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.553;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=51;PP=1379;ReadPosRankSum=0.617;SC=TGCTCCTGCGCAACGCCACGC;SOR=0.776;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=162;TCF=78;TCR=84;TR=95;WE=109810552;WS=109810534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,105:0.58:182
chr1	109813510	rs41279716	A	T	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=366;ReadPosRankSum=-0.370;SC=CAGGCCCCTCATCACCCCTCC;SOR=0.532;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=24;WE=109813518;WS=109813500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,25:0.54:46
chr1	109813719	rs17035665	C	T	946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.751;HP=1;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=25;PP=656;ReadPosRankSum=-0.181;SC=TGTCCTCCTGCTGCTGGGGCC;SOR=0.551;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=97;TCF=43;TCR=54;TR=44;WE=109813727;WS=109813709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,46:0.44:104
chr1	109814880	rs4970834	C	T	3054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.400;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=70;PP=1857;ReadPosRankSum=0.337;SC=CACTTACTGACCTCTCTGTTC;SOR=0.733;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=304;TCF=153;TCR=151;TR=140;WE=109814888;WS=109814870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,151:0.46:329
chr1	109815252	rs611917	A	G	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.801;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=13;PP=469;ReadPosRankSum=-0.167;SC=GCATGGTCTCATCTTCCTAGG;SOR=0.821;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=62;TCR=29;TR=40;WE=109815260;WS=109815242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,42:0.43:97
chr1	109816176	rs441853	A	C	4356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=90;PP=2567;SC=GCAGCCGGGGAGGCCCCCCTC;SOR=1.091;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=157;TCF=67;TCR=90;TR=157;WE=109816184;WS=109816166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr1	109824680	rs41302083	C	T	3040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.814;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=74;PP=1843;ReadPosRankSum=0.993;SC=TTCCTCCTCACGGCTGAGACA;SOR=0.798;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=294;TCF=143;TCR=151;TR=141;WE=109824688;WS=109824670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,153:0.47:327
chr1	109825360	rs643457	C	T	337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=279;SC=AGATCTGAGCCGGAGAGAAAC;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=109825368;WS=109825350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	109836842	rs646335	C	G	5852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=111;PP=2965;SC=GTCAGAGTACCATGCCTTCTT;SOR=0.983;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=194;TCF=83;TCR=111;TR=193;WE=109836850;WS=109836832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr1	109838833	rs616899	T	C	298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=8;NR=1;PP=199;SC=CTCAGCACAGTGCCCCCCAGA;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=109838841;WS=109838823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	109838918	rs629001	C	T	2617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.71;SOR=1.067;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr1	109839392	rs604349	A	G	1432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.654;HP=4;HapScore=4;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=22;PP=2211;ReadPosRankSum=-2.757;SC=CATGATCCCCATGCCTCCCTT;SOR=0.582;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=129;TCF=88;TCR=41;TR=66;WE=109839408;WS=109839382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,73:0.51:143
chr1	109839400	rs55660224	C	T	1765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=25;PP=2274;ReadPosRankSum=1.563;SC=CCATGCCTCCCTTACCTGCTT;SOR=0.687;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=152;TCF=100;TCR=52;TR=74;WE=109839408;WS=109839382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,83:0.49:169
chr1	109839433	rs1278285	A	G	7373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=147;NR=99;PP=2965;SC=CGAGGTCCGTAGTGATGGGGG;SOR=1.052;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=246;TCF=147;TCR=99;TR=246;WE=109839441;WS=109839423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,270:1.00:270
chr1	109839896	rs7515901	C	T	901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.875;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=20;PP=506;ReadPosRankSum=-2.006;SC=CCCTTTTTCTCCTCAGTTACC;SOR=1.157;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=83;TCF=38;TCR=45;TR=35;WE=109839904;WS=109839886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,42:0.42:99
chr1	109839954	rs603624	G	C	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=222;ReadPosRankSum=2.047;SC=GAGCCTTGCCGCAGCTTCCCC;SOR=0.773;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=38;TCF=16;TCR=22;TR=16;WE=109839962;WS=109839944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,16:0.39:41
chr1	109840753	rs114078488	C	T	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.488;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=188;ReadPosRankSum=-0.958;SC=CCTGCACTGGCCCCAGACATG;SOR=0.248;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=15;WE=109840761;WS=109840743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr1	109856842	rs372331171	TG	T	252.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=1.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=1.967;QD=2.30;ReadPosRankSum=1.174;SOR=0.644;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,23:0.21:110
chr1	109883576	rs3217347	C	CAT	3832.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=49;PP=2275;SC=TAACCACACACGATTACCTGC;SOR=1.836;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=53;TCF=2;TCR=51;TR=50;WE=109883584;WS=109883566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr1	109884775	rs2228604	T	G	2053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=36;PP=1197;SC=TCCTTCTTGTTGTATCCTAGA;SOR=1.288;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=28;TCR=36;TR=64;WE=109884783;WS=109884765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr1	109897103	rs11142	A	G	4659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=69;PP=2875;SC=CTGATGATCTAAAGATTCTTC;SOR=0.880;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=156;TCF=87;TCR=69;TR=156;WE=109897111;WS=109897093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr1	109898267	.	G	C	79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;FR=1.0000;HP=14;HapScore=2;MGOF=22;MMLQ=16;MQ=57.57;NF=0;NR=3;PP=79;QD=37.9237375157;SC=CATTCCACCCGCCCCCCCCCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=109898275;WS=109898257;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,3:0.60:5
chr1	109912051	rs17646665	A	G	891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.839;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=4;PP=596;ReadPosRankSum=-0.141;SC=TTGAGGCTAAAGACAGTTTCA;SOR=1.244;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=74;TCF=61;TCR=13;TR=34;WE=109912059;WS=109912041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,37:0.47:78
chr1	109958035	rs1465607	T	C	1954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=37;PP=1215;SC=ATAACTGTCTTACATACTCAC;SOR=1.478;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=59;TCF=22;TCR=37;TR=59;WE=109958043;WS=109958025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	110009434	rs2787015	A	C	1470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=8;PP=1071;SC=GAGCCAAGCCACCACGCCGCG;SOR=2.608;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=37;TCR=8;TR=45;WE=110009442;WS=110009424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	110009654	rs138525393	AC	A	3740.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=53;PP=2031;SC=CACCGCCCTGACCCCCCGGCC;SOR=0.973;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=65;TCF=11;TCR=54;TR=63;WE=110009662;WS=110009644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr1	110009802	rs2272272	G	A	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=2.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.55;ReadPosRankSum=-2.963;SOR=0.545;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,17:0.35:49
chr1	110018148	rs530565	C	T	1587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=8;PP=1158;SC=GGTTAGTTCTCGACTTTGGCC;SOR=3.014;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=42;TCR=8;TR=50;WE=110018156;WS=110018138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	110035280	rs187831153	G	A	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=5.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.20;ReadPosRankSum=-0.091;SOR=0.191;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr1	110091447	rs2230350	G	A	887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.732;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=24;PP=459;ReadPosRankSum=-0.867;SC=AAGAAGTGAAGCTGCTGCTAC;SOR=0.610;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=97;TCF=45;TCR=52;TR=46;WE=110091455;WS=110091437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,48:0.47:103
chr1	110146849	rs114388354	C	T	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.668;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=51;ReadPosRankSum=-0.210;SC=CAGAGAACAGCTTATCTCAAT;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=4;WE=110146857;WS=110146839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr1	110148974	rs1799875	C	T	9714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=185;NR=141;PP=2965;SC=CAATGATGCCCGTGGTTTTGA;SOR=0.950;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=326;TCF=185;TCR=141;TR=326;WE=110148986;WS=110148964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,355:1.00:355
chr1	110163076	rs6669802	A	G	555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=12;PP=362;SC=GGAAAAATCCAAAGAGGCTAG;SOR=2.419;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=16;WE=110163084;WS=110163066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	110168888	rs493972	C	G	7320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=123;NR=123;PP=2965;SC=TGCGGAGCTGCAGCCTGCCCT;SOR=0.755;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=247;TCF=123;TCR=124;TR=246;WE=110168896;WS=110168878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
chr1	110169957	rs524998	A	G	5674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=104;NR=91;PP=2965;SC=GGTGTGGTGCATGTTGGGGGG;SOR=0.843;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=196;TCF=105;TCR=91;TR=195;WE=110169965;WS=110169947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr1	110170866	rs114727970	C	T	1510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.793;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=32;PP=1093;ReadPosRankSum=0.037;SC=TCACGGCCTACGACCTGAGTG;SOR=0.702;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=147;TCF=77;TCR=70;TR=71;WE=110170874;WS=110170856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,72:0.46:158
chr1	110170896	rs863978	T	C	3974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=60;PP=2314;SC=TGGATGTGCATGCGGTCTGTG;SOR=0.790;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=138;TCF=78;TCR=60;TR=138;WE=110170904;WS=110170886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr1	110171705	rs523786	A	C	2558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=26;PP=1554;SC=TGACTTGCACATACCTGCATG;SOR=1.511;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=57;TCR=26;TR=83;WE=110171713;WS=110171695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr1	110172346	rs5776989	T	TG	690.82	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.815;HP=8;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=457;ReadPosRankSum=-1.979;SC=GCGTGCTGGGTGGGGGTCAGG;SOR=2.494;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=13;WE=110172354;WS=110172336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,24:0.92:26
chr1	110172362	rs2269341	C	T	1179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=5;PP=724;SC=TCAGGGGCTCCGGTGAGCCCA;SOR=2.247;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=32;WE=110172370;WS=110172352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	110200360	rs560018	T	C	2736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-4.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.354;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=57;PP=1580;ReadPosRankSum=-0.027;SC=TGGGGTGCTATGCTCAGAGTG;SOR=0.476;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=226;TCF=125;TCR=101;TR=120;WE=110200368;WS=110200350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,128:0.53:242
chr1	110201580	rs650985	C	T	8383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=142;NR=145;PP=2965;SC=ATACATCCTACGTTACAGAGA;SOR=0.779;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=288;TCF=142;TCR=146;TR=287;WE=110201600;WS=110201570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,313:1.00:313
chr1	110201699	rs506008	T	C	2774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NR=50;PP=2025;SC=TGGACGCCTTTCCAAATCTGA;SOR=1.154;Source=Platypus;TCR=50;WE=110201707;WS=110201689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr1	110201809	rs562996	G	T	7928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.25;QD=45.05;SOR=1.251;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr1	110201812	rs563003	A	G	8179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.48;QD=43.51;SOR=1.090;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr1	110207482	rs670439	C	T	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=196;ReadPosRankSum=1.534;SC=TGAATCTACCCGTCCTTGAAT;SOR=0.990;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=13;WE=110207490;WS=110207472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr1	110210671	rs625456	G	T	1621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.608;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=30;PP=914;ReadPosRankSum=2.339;SC=ACCCTCTCTGGGCCTCTCACA;SOR=0.613;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=134;TCF=79;TCR=55;TR=70;WE=110210679;WS=110210661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,80:0.53:150
chr1	110210780	rs530021	C	G	3615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.16;QD=26.98;SOR=0.957;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr1	110210818	rs2073483	C	T	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.090;HP=9;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=1.363;NF=15;NR=21;PP=448;ReadPosRankSum=-0.161;SC=TGCGTGGGGGCGGGGAAGTGT;SOR=0.446;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=70;TCF=28;TCR=42;TR=36;WE=110210826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,35:0.53:66
chr1	110211956	rs592792	C	T	2356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.415;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-6.021;NF=65;NR=47;PP=1447;ReadPosRankSum=1.333;SC=CCCAGAGCAACGCCATCCTGC;SOR=0.930;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=305;TCF=175;TCR=130;TR=112;WE=110211964;WS=110211946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:208,124:0.37:332
chr1	110230767	rs10857795	G	A	1574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=18;PP=887;SC=CATCTCTGACGCGACCTGCGG;SOR=1.342;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=32;TCR=18;TR=50;WE=110230775;WS=110230757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	110231592	rs737497	T	C	378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=60;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=0;PP=257;SC=CGGTCTCCTCTCTGCTCTTGC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=110231600;WS=110231591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	110231777	rs4147565	G	A	4802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;SC=TGCAATGTGTGGGGGGAAGGT;SOR=0.880;Source=Platypus;TCF=70;WE=110231785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr1	110233138	rs74837985	G	C	1410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=28;PP=920;SC=TTGAGCCCAAGTGCTTGGACG;SOR=2.110;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=41;WE=110233146;WS=110233128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	110252010	rs1292098	T	C	3876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=77;NR=68;PP=2478;SC=CTCTGTTCTGTTTTTTGCCCC;SOR=0.761;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=145;TCF=77;TCR=68;TR=145;WE=110252018;WS=110252000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr1	110252091	rs35677255	G	A	2253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=50;PP=1447;SC=CTTAATAAAAGCTTGCTGGTT;SOR=1.718;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=26;TCR=50;TR=76;WE=110252099;WS=110252081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr1	110255167	rs12736389	G	C	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.988;HP=1;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=9;PP=855;ReadPosRankSum=0.709;SC=ACTAGGGGCTGGCCTGGTGCA;SOR=0.917;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=56;TCF=37;TCR=19;TR=28;WE=110255195;WS=110255157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,31:0.49:63
chr1	110255174	rs929166	T	G	796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.970;HP=3;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=9;PP=1083;ReadPosRankSum=-0.653;SC=GCTGGCCTGGTGCAGAGAAAG;SOR=0.540;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=46;TCR=17;TR=33;WE=110255195;WS=110255157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,36:0.51:70
chr1	110256127	rs17854972	G	A	2687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.532;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-6.481;NF=73;NR=50;PP=1584;ReadPosRankSum=-1.323;SC=GATTGATGGGGCTCACAAGAT;SOR=0.807;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=227;TCF=133;TCR=94;TR=123;WE=110256135;WS=110256117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,130:0.52:250
chr1	110256220	rs7536162	A	C	3051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=71;PP=1643;ReadPosRankSum=1.632;SC=TGCGGGGGGAAGGTGACCTCC;SOR=0.688;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=259;TCF=129;TCR=130;TR=141;WE=110256228;WS=110256210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,151:0.53:284
chr1	110257590	rs2229059	T	C	857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.019;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.254;NF=25;NR=10;PP=450;ReadPosRankSum=0.452;SC=GCCAAAATACTTGGAGGAACT;SOR=0.207;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=68;TCF=52;TCR=16;TR=35;WE=110257598;WS=110257580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,40:0.53:76
chr1	110279602	rs2234696	T	G	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.361;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=200;ReadPosRankSum=0.609;SC=ACCAGTAACATAAGTGCTATT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=9;WE=110279610;WS=110279598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr1	110279701	rs7483	C	T	1143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.600;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=12;PP=630;ReadPosRankSum=1.251;SC=GCTCAGCATACAGGCTTGTTG;SOR=0.894;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=104;TCF=74;TCR=30;TR=48;WE=110279709;WS=110279691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,54:0.47:116
chr1	110279821	rs1537234	C	A	4504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=452;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=96;PP=2758;ReadPosRankSum=1.598;SC=AATCTTATAACGACCCCAACC;SOR=0.702;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=396;TCF=202;TCR=194;TR=194;WE=110279829;WS=110279811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:232,219:0.49:451
chr1	110279914	rs1571858	C	T	1763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.389;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=44;PP=1170;ReadPosRankSum=-0.940;SC=GACAGTGCCTCCAAGGTATAG;SOR=0.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=128;TCF=47;TCR=81;TR=69;WE=110279922;WS=110279904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,75:0.53:141
chr1	110280252	rs36120609	ATCC	A	6106.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.496;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=3.148;NF=7;NR=76;PP=2954;ReadPosRankSum=-0.316;SC=ATAGAGAAGTATCCTCTTCTT;SOR=0.862;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=168;TCF=22;TCR=146;TR=83;WE=110280262;WS=110280242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,161:0.53:301
chr1	110281941	rs10735234	G	A	1116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=10;PP=790;SC=TATTCTATCCGGGTTAAGATC;SOR=1.923;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=28;TCR=10;TR=38;WE=110281949;WS=110281931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	110282972	rs1332018	G	T	7310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=96;NR=150;PP=2965;SC=CTTTATACCCGACATAAGGGG;SOR=1.349;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=246;TCF=96;TCR=150;TR=246;WE=110282980;WS=110282962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,275:1.00:275
chr1	110292856	rs15864	G	C	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.103;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=122;ReadPosRankSum=0.571;SC=GTTTGCTTCAGCCTCTGGGCC;SOR=1.302;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=9;WE=110292864;WS=110292846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr1	110294577	rs2274536	A	G	781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.02;ReadPosRankSum=0.561;SOR=0.659;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,41:0.53:78
chr1	110295643	rs1887546	G	T	737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=6;PP=454;ReadPosRankSum=-0.741;SC=CCAGTGTTAGGTCACACTAGT;SOR=0.560;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=53;TCF=42;TCR=11;TR=30;WE=110295651;WS=110295633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,33:0.58:57
chr1	110295772	rs1887547	T	C	7015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=138;NR=113;PP=2965;SC=GCCAGTCATCTGAGAATGTGG;SOR=0.762;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=251;TCF=138;TCR=113;TR=251;WE=110295780;WS=110295762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,269:1.00:269
chr1	110295890	rs1887548	C	G	2535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=58;PP=1780;SC=GGGACGCGGACAGGGAGGGGA;SOR=2.168;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=22;TCR=58;TR=80;WE=110295898;WS=110295880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr1	110299550	rs2094469	A	G	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.395;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=225;ReadPosRankSum=0.164;SC=CTGGTTTGTGACAACATAGAG;SOR=1.002;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=34;TCR=8;TR=15;WE=110299558;WS=110299540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,16:0.34:47
chr1	110300441	rs3818562	G	A	1581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.284;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=29;PP=840;ReadPosRankSum=1.445;SC=TTGAAGCTGTGCTTGATCTTC;SOR=0.579;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=134;TCF=78;TCR=56;TR=69;WE=110300449;WS=110300431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,78:0.52:150
chr1	110300504	rs10776700	A	G	5483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=84;PP=2965;SC=AGGGGCCAAGACGGTGGGCCA;SOR=0.754;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=177;TCF=93;TCR=84;TR=177;WE=110300512;WS=110300494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr1	110301260	rs6693815	C	T	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.267;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=21;PP=455;ReadPosRankSum=-1.737;SC=CTGTCCTGGCCTGGCTGAAGG;SOR=1.127;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=59;TCF=22;TCR=37;TR=31;WE=110301268;WS=110301250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,31:0.52:60
chr1	110301766	rs146917181	AGTGTGTGT	A,AGTGT	736.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;QD=40.93;SOR=3.383;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,9,9:0.50,0.50:18
chr1	110304537	rs6676659	G	A	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.148;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=358;ReadPosRankSum=0.326;SC=GGCCCTTTCCGGAGCCATCTG;SOR=1.609;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=43;TCF=10;TCR=33;TR=19;WE=110304545;WS=110304527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,20:0.45:44
chr1	110456866	rs2297706	C	A	1866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.610;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=31;PP=1028;ReadPosRankSum=-1.880;SC=AGAAATGACACCCTCTCTGTC;SOR=0.935;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=160;TCF=91;TCR=69;TR=81;WE=110456874;WS=110456856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,90:0.51:178
chr1	110458234	rs2275123	G	A	3113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=55;PP=1755;ReadPosRankSum=0.355;SC=CCCTGCAATCGTTGGCCTGCT;SOR=0.716;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=233;TCF=131;TCR=102;TR=123;WE=110458242;WS=110458224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,143:0.53:271
chr1	110460145	rs12721515	G	A	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=131;ReadPosRankSum=0.634;SC=TGGAGGCGCCGCTCTATCCAC;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=8;WE=110460153;WS=110460135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr1	110466466	rs1058885	T	C	5251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=103;PP=2933;SC=ATCTCATCACTGCGCCCCCAG;SOR=1.122;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=182;TCF=79;TCR=103;TR=182;WE=110466474;WS=110466456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr1	110466709	rs333971	T	C	6716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=105;NR=119;PP=2965;SC=GAGGGATCCTTCAGCCCGCAG;SOR=0.959;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=224;TCF=105;TCR=119;TR=224;WE=110466717;WS=110466699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr1	110466810	rs2229166	C	A	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.887;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=362;ReadPosRankSum=-1.035;SC=GTGGAGGCGGCGGGTGAGTAG;SOR=0.116;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=40;TCF=6;TCR=34;TR=22;WE=110466818;WS=110466800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,24:0.56:43
chr1	110467745	rs333972	A	G	1451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=7;PP=893;SC=GATGTCTAATACCAGCCCTGT;SOR=2.208;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=35;TCR=7;TR=42;WE=110467753;WS=110467735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	110468009	rs3138072	C	A	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.17;ReadPosRankSum=0.074;SOR=0.260;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr1	110558276	rs11384766	A	AC	2742.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=46;PP=2233;SC=ATTAGATAAAATTTTGAGTTT;SOR=2.115;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=50;TCF=3;TCR=47;TR=49;WE=110558284;WS=110558266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	110560915	rs186724	C	T	809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.245;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=2;PP=585;ReadPosRankSum=0.570;SC=AGCCTCTGGTCTCCTATGTTC;SOR=2.390;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=71;TCF=58;TCR=13;TR=30;WE=110560923;WS=110560905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,33:0.43:76
chr1	110580702	rs2021518	A	G	152.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.01;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	110580704	rs4494133	A	G	152.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.01;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	110581780	rs1834	T	G	1514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.372;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=19;PP=674;ReadPosRankSum=-0.043;SC=TGTAACTGGTTTCTTGCCCTG;SOR=0.455;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=64;TCR=36;TR=52;WE=110581788;WS=110581770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,67:0.57:118
chr1	110582508	rs7521022	T	C	1034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=18;PP=435;ReadPosRankSum=-1.612;SC=GACTGACATATGGGCTCAACC;SOR=0.648;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=103;TCF=58;TCR=45;TR=43;WE=110582516;WS=110582498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,54:0.45:120
chr1	110603286	rs144523285	A	AGGTGCTTCCTCCGTGGTGTCCAGGCAGG	2975.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=3;PP=864;SC=TTGGAGGCAGAGGTGGGCTGG;SOR=3.981;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=27;TCF=18;TCR=9;TR=13;WE=110603294;WS=110603276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	110612925	rs2274568	G	A	388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=8;PP=261;SC=AGAGAGGGTCGGGCTGCGCGC;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=8;TCR=8;TR=16;WE=110612933;WS=110612915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	110717290	rs12752995	C	T	706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=4;PP=518;ReadPosRankSum=0.210;SC=CTCCCAGCTGCCCACCCTCAG;SOR=0.733;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=42;TCF=37;TCR=5;TR=28;WE=110717298;WS=110717280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,29:0.64:45
chr1	110765535	rs611587	C	G	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=247;ReadPosRankSum=1.133;SC=CCAGCTGGGCCCATCCATCCC;SOR=0.811;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=18;WE=110765543;WS=110765525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,19:0.46:41
chr1	110882444	rs814771	A	G	1359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.634;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=29;PP=956;ReadPosRankSum=-1.962;SC=GCGGGGGCGAATCGCGCAGCA;SOR=0.596;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=65;TCR=66;TR=58;WE=110882452;WS=110882434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,62:0.45:138
chr1	110921351	rs11102095	A	G	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=424;ReadPosRankSum=0.425;SC=CAAAAATTTTACTTTCTCTGG;SOR=1.044;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=18;WE=110921359;WS=110921341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,19:0.76:25
chr1	110944087	rs1161	A	G	1245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=12;PP=789;ReadPosRankSum=0.223;SC=TCTATAAGGTAATTAACATAG;SOR=0.658;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=90;TCF=66;TCR=24;TR=47;WE=110944095;WS=110944077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,54:0.52:103
chr1	110949720	rs6671673	C	T	1003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.662;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=24;PP=505;ReadPosRankSum=-0.491;SC=GTACCCTTTACACTTTTCCAG;SOR=0.620;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=56;TCR=61;TR=47;WE=110949728;WS=110949710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,53:0.41:129
chr1	110949810	rs35836705	A	C	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=142;ReadPosRankSum=0.384;SC=AGTAACTGATAGGTTACACAC;SOR=0.540;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=11;WE=110949818;WS=110949800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr1	110949857	rs6684395	A	T	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=32;ReadPosRankSum=0.619;SC=AGGGCTCGACACTGCACAACT;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=3;WE=110949865;WS=110949847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr1	110950277	rs6698159	G	A	1396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.238;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=30;PP=976;ReadPosRankSum=0.494;SC=AGAACCCAGCGGCACGGCACG;SOR=0.933;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=195;TCF=106;TCR=89;TR=72;WE=110950285;WS=110950267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,75:0.35:214
chr1	110950439	rs6674775	C	T	2879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=68;PP=1750;ReadPosRankSum=0.865;SC=CTGACGAAGGCTTGGGCTCCC;SOR=0.672;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=278;TCF=132;TCR=146;TR=133;WE=110950447;WS=110950429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,141:0.49:288
chr1	110993739	rs3806451	C	A	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.764;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=399;ReadPosRankSum=-1.227;SC=GCGGGGGATGCAGGAGAGCCT;SOR=0.284;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=44;TCF=38;TCR=6;TR=23;WE=110993747;WS=110993729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,24:0.51:47
chr1	111059812	rs3841846	C	CGA	451.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.37;MQRankSum=1.862;QD=8.07;ReadPosRankSum=1.736;SOR=0.544;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,20:0.36:56
chr1	111059825	rs3768457	G	A	1019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.26;MQRankSum=-1.569;QD=12.29;ReadPosRankSum=-0.972;SOR=0.728;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,46:0.55:83
chr1	111060669	rs1281175	T	C	4472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=72;PP=2916;SC=TGACCACCTTTAGCTCCCTAT;SOR=0.826;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=146;TCF=74;TCR=72;TR=146;WE=111060677;WS=111060659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr1	111061011	rs3748731	C	A	2467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=49;PP=1349;ReadPosRankSum=-0.352;SC=TGGGCCGGTTCCGATCAAAGA;SOR=0.708;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=201;TCF=106;TCR=95;TR=102;WE=111061019;WS=111061001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,119:0.52:231
chr1	111061062	rs1281174	T	C	5024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=72;PP=2739;SC=GCATCCTTTTTTCCCGGTCTC;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=154;TCF=82;TCR=72;TR=154;WE=111061070;WS=111061052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr1	111144526	rs4839071	T	G	219.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=180;SC=AAATTGCCCTTTGTCAAAAAT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=111144534;WS=111144516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	111436857	rs1578956	TC	GT	8893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=108;NR=62;PP=2947;ReadPosRankSum=1.690;SC=CACCCTGTACTCGTGCAAATG;SOR=0.532;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=179;TCF=114;TCR=65;TR=170;WE=111436866;WS=111436847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,196:0.99:197
chr1	111437129	rs1343817	A	C	1066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=28;PP=824;SC=TAGAGATAGAAATGAAGTGGA;SOR=3.611;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=31;WE=111437137;WS=111437119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	111437176	rs5777031	G	GA	348.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=407;SC=TAATTGGGGGGAAAATTTGTA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=11;WE=111437184;WS=111437166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	111441829	rs1803259	C	T	7678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=121;NR=139;PP=2965;SC=CTGCAGTAGTCCTGTGGTGAA;SOR=0.918;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=260;TCF=121;TCR=139;TR=260;WE=111441837;WS=111441819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,283:1.00:283
chr1	111661413	rs325916	T	C	5710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=83;PP=2965;SC=AAATCTAATATTGTGCCTTCT;SOR=0.824;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=187;TCF=104;TCR=83;TR=187;WE=111661421;WS=111661403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr1	111661528	rs325917	T	C	1083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.664;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=30;PP=482;ReadPosRankSum=-0.529;SC=CCCTGAGTGATGGGAAAAAAA;SOR=0.759;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=114;TCF=43;TCR=71;TR=47;WE=111661536;WS=111661518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,58:0.44:132
chr1	111662723	rs325918	G	A	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.074;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=181;ReadPosRankSum=1.537;SC=CACAGCAGTGGTACTGTAAAA;SOR=0.144;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=12;WE=111662731;WS=111662713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr1	111663040	rs647665	A	G	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.27;ReadPosRankSum=-1.495;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr1	111726026	rs2243393	G	A	2524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=59;NR=27;PP=1588;SC=ATGATTTACTGTGTAGTTCAC;SOR=1.739;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=59;TCR=27;TR=86;WE=111726034;WS=111726016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr1	111726213	rs694180	A	G	1902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=40;PP=1267;SC=TGCCCTGGTAAGTATTGTACT;SOR=1.926;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=18;TCR=40;TR=58;WE=111726221;WS=111726203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr1	111726288	rs2275122	T	G	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.920;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=132;ReadPosRankSum=0.448;SC=GACCCAGTCATGAAAGATCGT;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=7;WE=111726296;WS=111726278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr1	111730901	rs608881	C	T	1377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=34;PP=784;ReadPosRankSum=1.445;SC=GCCCATTTGCCTCCCGCTTGA;SOR=0.699;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=153;TCF=73;TCR=80;TR=64;WE=111730909;WS=111730891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,73:0.40:182
chr1	111737183	rs660173	C	T	1242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=28;NR=13;PP=809;SC=GGTGAGCCGTCCAGGGGCTGG;SOR=1.508;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=28;TCR=13;TR=41;WE=111737191;WS=111737173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	111739771	rs3833538	G	GCAGGACAAA	4234.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.493;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=19;PP=2897;ReadPosRankSum=0.537;SC=TGGAATATGGGCAGGCCCTGA;SOR=0.738;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=105;TCF=31;TCR=74;TR=31;WE=111739779;WS=111739761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,103:0.47:218
chr1	111741188	rs41312686	C	T	732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.049;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=7;PP=370;ReadPosRankSum=-1.182;SC=CTACAGGAGCCACAGAACTCA;SOR=0.990;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=57;TCF=42;TCR=15;TR=29;WE=111741196;WS=111741178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,34:0.52:65
chr1	111742838	rs639306	G	C	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=112;ReadPosRankSum=-1.282;SC=ACTAGCCCCAGAGAGGGCATG;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=8;WE=111742846;WS=111742828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr1	111770423	rs755467	T	G	3440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=53;PP=1887;SC=CAGCAGGAAATTTGGTGAGGA;SOR=0.862;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=54;TCR=53;TR=107;WE=111770431;WS=111770413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr1	111773568	rs2255089	G	C	2464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.499;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=59;PP=1601;ReadPosRankSum=-0.130;SC=AAAACCAAGTGAGTAAGATGG;SOR=1.057;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=214;TCF=81;TCR=133;TR=88;WE=111773576;WS=111773558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,108:0.45:241
chr1	111773830	rs2147789	A	T	1168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.375;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=20;PP=721;ReadPosRankSum=-1.104;SC=CAGCCAGAAAATAAATAATCA;SOR=0.836;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=124;TCF=78;TCR=46;TR=56;WE=111773838;WS=111773820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,60:0.44:136
chr1	111778187	rs2251715	A	G	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.284;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=90;ReadPosRankSum=-0.360;SC=GAAACCTCATAGATTCCAGGC;SOR=0.892;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=6;WE=111778195;WS=111778177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr1	111778241	rs2764544	C	T	1079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=6;PP=690;SC=TATTGCACCTCGTTTCTTTGT;SOR=2.242;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=34;WE=111778249;WS=111778231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	111778325	rs11556868	C	T	1679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=30;PP=986;ReadPosRankSum=1.950;SC=CTCTTGACTGCGGGCGTATCT;SOR=0.730;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=150;TCF=94;TCR=56;TR=77;WE=111778333;WS=111778315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,83:0.49:169
chr1	111778824	rs2251608	T	C	620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=19;PP=439;SC=GGGGTGGGGCTGGGGAGAGTC;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=111778832;WS=111778814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	111783982	rs13721	C	A	1874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=35;PP=1114;ReadPosRankSum=0.441;SC=CAAGATCACGCGGCTCCAGGA;SOR=0.725;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=153;TCF=89;TCR=64;TR=83;WE=111784004;WS=111783972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,91:0.54:167
chr1	111783996	rs2494007	A	G	5018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=77;PP=2962;SC=TCCAGGATCAACAGGTTCCCT;SOR=0.814;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=175;TCF=98;TCR=77;TR=173;WE=111784004;WS=111783972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr1	111784138	rs942694	T	C	472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.06;ReadPosRankSum=-0.351;SOR=0.579;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,28:0.36:78
chr1	111784148	rs2764551	T	G	2282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=36;PP=1281;SC=TGTTCAAAGATAGAAGCTTCT;SOR=1.467;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=21;TCR=36;TR=57;WE=111784166;WS=111784128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr1	111784158	rs942693	T	C	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.17;ReadPosRankSum=-0.657;SOR=0.733;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,22:0.38:58
chr1	111784227	rs2182114	C	T	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.091;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.472;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=38;ReadPosRankSum=0.771;SC=CTCTATGTCACACCCGCGAGC;SOR=0.061;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=5;WE=111784235;WS=111784217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr1	111784816	rs11102221	G	A	940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=17;PP=548;ReadPosRankSum=0.204;SC=GCCACCCTTCGAATCTCTGTG;SOR=0.731;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=117;TCF=70;TCR=47;TR=43;WE=111784824;WS=111784806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,49:0.37:131
chr1	111785930	rs1056825	T	C	1361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=30;PP=762;SC=CTTGCCAGGCTGGCCTTTGGA;SOR=1.848;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=13;TCR=30;TR=43;WE=111785938;WS=111785920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	111825883	rs4406629	T	C	2010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQ=59.98;MQRankSum=-1.000;NF=56;NR=30;PP=1208;ReadPosRankSum=0.175;SC=ATCAGAATGATTTTAAATCCT;SOR=0.701;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=175;TCF=110;TCR=65;TR=86;WE=111825891;WS=111825873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,97:0.49:196
chr1	111826055	rs12140873	A	G	496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.55;MQRankSum=-1.314;QD=11.83;ReadPosRankSum=1.298;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,20:0.48:42
chr1	111854207	rs4839122	T	C	3619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=41;PP=2375;SC=CTCACTGAGGTTGTAACAATT;SOR=1.573;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=118;TCF=77;TCR=41;TR=117;WE=111854215;WS=111854197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr1	111854223	rs6537695	C	T	4641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=101;NR=53;PP=2657;SC=CAATTTATGGCAAATTGGAAG;SOR=1.412;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=154;TCF=101;TCR=53;TR=154;WE=111854231;WS=111854213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr1	111854755	rs4423003	A	C	376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=0;PP=318;SC=CAAAACTCACAGCACACTTCA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=111854763;WS=111854750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	111857087	rs2786151	C	T	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=275;ReadPosRankSum=1.525;SC=CCAGATCCAACACTAAAGCAA;SOR=0.669;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=81;TCF=56;TCR=25;TR=25;WE=111857095;WS=111857077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,30:0.32:93
chr1	111857154	rs2786152	T	C	1384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.900;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=19;PP=877;ReadPosRankSum=-0.918;SC=CTATCCTTTGTTTTACAGGAA;SOR=1.056;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=140;TCF=87;TCR=53;TR=55;WE=111857162;WS=111857144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,64:0.40:159
chr1	111858291	rs2786155	T	C	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.447;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=174;ReadPosRankSum=-0.563;SC=GAACCATAACTCATTTCATCT;SOR=0.214;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=10;WE=111858299;WS=111858281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr1	111858444	rs2786156	C	T	2538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.942;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=49;PP=1148;ReadPosRankSum=-0.768;SC=GCAGTTTGGCCACAGAGTCCA;SOR=0.778;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=221;TCF=111;TCR=110;TR=97;WE=111858452;WS=111858434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,127:0.48:263
chr1	111858499	rs6661725	A	G	1647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=30;PP=826;ReadPosRankSum=-0.108;SC=TACTGAGTACATATTCTGTGG;SOR=0.660;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=136;TCF=59;TCR=77;TR=54;WE=111858507;WS=111858489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,82:0.47:173
chr1	111858525	rs371155945	TAAATATAAGAATAAGA	T	971.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=11.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.56;ReadPosRankSum=0.511;SOR=1.831;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,41:0.45:92
chr1	111858542	rs376128132	CACTATCCTTGGCTT	C	992.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=8.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.41;ReadPosRankSum=1.473;SOR=1.749;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,41:0.51:80
chr1	111858556	.	T	C	1060	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=6;NR=6;PP=1060;QD=91.2309343789;SC=ATCCTTGGCTTTGAAGAACTT;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=12;WE=111858564;WS=111858511;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:29,12:0.29:41
chr1	111858589	rs2786157	G	T	513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-4.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.339;HP=5;HapScore=4;MGOF=115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=671;ReadPosRankSum=-1.157;SC=AAGACTGAAAGAATATGAACA;SOR=0.037;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=20;WE=111858611;WS=111858579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,23:0.70:33
chr1	111858603	rs2786158	G	T	385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=5.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.43;ReadPosRankSum=-0.425;SOR=0.116;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr1	111861714	rs2786161	T	A	1654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=25;PP=911;ReadPosRankSum=0.098;SC=TAACATTTAATAGATTTGAAT;SOR=0.718;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=161;TCF=102;TCR=59;TR=73;WE=111861722;WS=111861704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,83:0.46:182
chr1	111861841	rs2275253	A	G	2646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.088;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=59;PP=1649;ReadPosRankSum=-0.124;SC=CTATGACAACATCAAGAGCTT;SOR=0.582;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=238;TCF=123;TCR=115;TR=121;WE=111861849;WS=111861831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,129:0.50:258
chr1	111861974	rs2275254	T	C	2147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.471;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=48;PP=1293;ReadPosRankSum=-0.627;SC=CACAACAAATTTGGAGGCGCC;SOR=1.044;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=155;TCF=74;TCR=81;TR=85;WE=111861982;WS=111861964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,94:0.54:173
chr1	111862952	rs2256721	T	G	2008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.643;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=35;PP=1245;ReadPosRankSum=1.019;SC=TTCTGTGCTGTCAGAGCCAAC;SOR=0.840;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=206;TCF=119;TCR=87;TR=87;WE=111862960;WS=111862942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,97:0.43:226
chr1	111863242	.	G	A	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.247;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=24;ReadPosRankSum=-0.101;SC=TATGAAAATAGGGGCTATGCA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=4;WE=111863250;WS=111863232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,4:0.20:20
chr1	111892905	rs3820443	T	C	738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.129;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=22;PP=546;ReadPosRankSum=1.467;SC=TCATAGGTATTAGGGACTCTT;SOR=0.919;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=57;TCF=14;TCR=43;TR=28;WE=111892913;WS=111892895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,30:0.51:59
chr1	111893708	rs10158004	G	A	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.75;ReadPosRankSum=1.645;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr1	111893958	rs1668	A	G	1015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.454;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=30;PP=728;ReadPosRankSum=-0.671;SC=GAGCGGCTGTAACTACCTTCA;SOR=1.133;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=119;TCF=48;TCR=71;TR=46;WE=111893966;WS=111893948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,49:0.36:135
chr1	111967961	rs373024216	T	A	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=240;ReadPosRankSum=-0.457;SC=CTAACCAGCCTGCTCCACCCT;SOR=0.990;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=32;TCF=23;TCR=9;TR=16;WE=111967969;WS=111967951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr1	112020222	rs3831358	GC	G	1317.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=5;PP=971;SC=CTTCCGCCCTGCCCCCCACCC;SOR=1.460;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=28;TCF=19;TCR=9;TR=20;WE=112020246;WS=112020212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	112020224	rs115634476	C	A	1350.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=5;PP=575;SC=TCCGCCCTGCCCCCCACCCAC;SOR=1.402;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=24;WE=112020246;WS=112020212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	112020238	rs2211494	A	C	1716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=32;NR=10;PP=958;SC=CACCCACCTGACAACACCTCC;SOR=1.828;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=44;TCF=34;TCR=10;TR=42;WE=112020246;WS=112020212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	112028515	rs72695203	T	C	2549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.065;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=56;PP=1491;ReadPosRankSum=-0.068;SC=TGCCTATTGATTCTCAGCTCT;SOR=0.521;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=194;TCF=83;TCR=111;TR=102;WE=112028523;WS=112028505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,118:0.53:221
chr1	112028577	rs2275796	A	T	1616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=35;PP=1023;SC=ACCCAGTTACAGTAGCTTCTG;SOR=2.522;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=11;TCR=35;TR=46;WE=112028585;WS=112028567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	112029193	rs2252739	A	G	1979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=46;NR=26;PP=1218;SC=TTCATCCGCCAAGACTATGAC;SOR=1.150;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=46;TCR=26;TR=72;WE=112029201;WS=112029183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr1	112029325	rs2800906	A	G	2835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=47;NR=48;PP=1565;SC=GCCAGGTCCTACCTCTGCCTC;SOR=0.961;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=47;TCR=48;TR=95;WE=112029333;WS=112029315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr1	112032347	rs2789539	G	A	6328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=122;PP=2965;SC=GAAAGAAAGTGATGTTTGGAG;SOR=0.982;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=226;TCF=104;TCR=122;TR=226;WE=112032355;WS=112032337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr1	112033456	rs3831359	G	GA	4137.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.16;NF=10;NR=55;PP=2804;SC=AGTGAAAAGGGAAACAACCAG;SOR=1.151;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=68;TCF=10;TCR=58;TR=65;WE=112033464;WS=112033446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr1	112033515	rs2252198	T	C	2027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.23;QD=43.14;SOR=1.659;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	112033519	rs2252197	A	G	1961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.25;QD=45.62;SOR=1.455;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	112042632	rs2229155	A	G	9312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=172;NR=142;PP=2965;SC=AGACCACACAAGCTTTGAGGA;SOR=0.867;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=314;TCF=172;TCR=142;TR=314;WE=112042640;WS=112042622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,335:1.00:335
chr1	112106342	rs1591711	C	T	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=10;PP=313;ReadPosRankSum=1.626;SC=CTATTTTACACGCTAGGACAA;SOR=0.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=72;TCF=48;TCR=24;TR=30;WE=112106350;WS=112106332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,34:0.43:80
chr1	112106444	rs1591712	G	A	6588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=129;NR=94;PP=2965;SC=CCTCCCAGCAGCTATATTTTC;SOR=0.911;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=223;TCF=129;TCR=94;TR=223;WE=112106452;WS=112106434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr1	112234084	rs10489469	G	T	1738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.846;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=50;PP=994;ReadPosRankSum=0.459;SC=AATACAAGAAGAATTTTGACA;SOR=0.857;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=168;TCF=70;TCR=98;TR=82;WE=112234092;WS=112234074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,89:0.48:187
chr1	112234215	rs10489470	C	T	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=2;PP=21;SC=AGTTTTATAACATTGGCTCAT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=112234223;WS=112234205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	112269872	rs197434	G	A	8613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=164;NR=118;PP=2965;SC=CTGTCAGGGCGAACCTGCGGC;SOR=1.036;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=282;TCF=164;TCR=118;TR=282;WE=112269880;WS=112269862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,308:1.00:308
chr1	112281899	rs3738299	G	T	2979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.892;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=75;PP=1821;ReadPosRankSum=-0.963;SC=AAACAGAGAGGGCCCGGGTGA;SOR=0.757;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=262;TCF=119;TCR=143;TR=132;WE=112281907;WS=112281889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,144:0.49:292
chr1	112298875	rs12741924	G	C	71.88	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.98;ReadPosRankSum=0.674;SOR=0.707;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr1	112303077	rs201858996	A	AT	459.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.54;ReadPosRankSum=2.005;SOR=0.618;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,27:0.44:61
chr1	112303237	rs3754025	T	A	1300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.313;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=33;PP=812;ReadPosRankSum=0.989;SC=ACTTGACTATTAAAACAGTGT;SOR=0.824;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=130;TCF=62;TCR=68;TR=58;WE=112303245;WS=112303227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,64:0.44:145
chr1	112303791	rs17569368	A	T	1496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.421;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=31;PP=822;ReadPosRankSum=0.231;SC=GTGAAATAAAAGGATAGTCAT;SOR=0.538;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=111;TCF=54;TCR=57;TR=62;WE=112303799;WS=112303781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,72:0.56:128
chr1	112305406	.	T	TA	1527	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;FR=0.5000;HP=16;HapScore=1;MGOF=56;MMLQ=15;MQ=59.22;NF=15;NR=67;PP=1527;QD=18.6585365854;SC=GCCGTTTTGGTAAAAAAAAAA;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=151;TCF=25;TCR=126;TR=82;WE=112305417;WS=112305395;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:69,82:0.54:151
chr1	112305437	rs200640014	T	TTTAAGGGGAGG	2440.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.427;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=59;PP=2967;ReadPosRankSum=0.372;SC=GAGTGCTTTCTTTAAGGGGAG;SOR=0.484;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=139;TCF=26;TCR=113;TR=72;WE=112305445;WS=112305427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,57:0.50:115
chr1	112308953	rs197412	T	C	1818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=41;PP=1268;ReadPosRankSum=-0.741;SC=AATAAAGTTATTGAACAGAGA;SOR=0.722;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=186;TCF=93;TCR=93;TR=82;WE=112308961;WS=112308943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,86:0.43:199
chr1	112308972	rs197413	G	A	1957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.096;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=41;PP=1317;ReadPosRankSum=-2.231;SC=GAGTCCCTGTGTTGGCAAGTA;SOR=0.796;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=192;TCF=103;TCR=89;TR=91;WE=112308980;WS=112308962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,92:0.46:200
chr1	112525085	rs17221819	G	A	3626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.419;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=79;PP=2403;ReadPosRankSum=0.247;SC=GGAACACCTCGGGGTCCCGGT;SOR=0.660;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=282;TCF=130;TCR=152;TR=148;WE=112525093;WS=112525075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,160:0.53:301
chr1	112533520	rs61742877	T	G	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.313;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=100;ReadPosRankSum=-2.542;SC=CTGAAGCCCATGGGTCCCCAC;SOR=0.465;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=11;WE=112533528;WS=112533510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,14:0.40:35
chr1	112533746	rs61746626	C	T	1179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.990;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=22;PP=736;ReadPosRankSum=-0.605;SC=AGCGAGGCAGCTCCGTGCCCC;SOR=0.861;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=147;TCF=83;TCR=64;TR=55;WE=112533754;WS=112533736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,62:0.38:165
chr1	112991698	rs2256883	T	C	1937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.991;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=48;PP=1369;ReadPosRankSum=-0.898;SC=TCTGCACAAATCCACTCTCTA;SOR=0.730;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=234;TCF=118;TCR=116;TR=91;WE=112991706;WS=112991688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,99:0.40:249
chr1	112991862	rs3818729	G	T	959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.866;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=26;PP=570;ReadPosRankSum=-1.043;SC=ATACTTTCTTGTCAGCTGCCA;SOR=1.019;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=78;TCF=34;TCR=44;TR=42;WE=112991870;WS=112991852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,45:0.53:85
chr1	112998539	rs201085546	C	CT	278.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=2.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.18;MQRankSum=1.453;QD=4.81;ReadPosRankSum=0.048;SOR=1.234;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,18:0.31:58
chr1	112999227	rs1175641	G	A	4716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=81;PP=2965;SC=TAGAAAACCAGGTGCCTCCAC;SOR=0.815;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=158;TCF=77;TCR=81;TR=157;WE=112999235;WS=112999217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr1	113052155	rs3790605	C	G	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=169;ReadPosRankSum=0.615;SC=CGGGACCAGGCTGTTGCTTCG;SOR=0.593;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=10;WE=113052163;WS=113052145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr1	113052186	rs3790606	G	C	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=136;ReadPosRankSum=0.239;SC=GACGATTCGGGCAGGACTGTC;SOR=0.657;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=10;WE=113052194;WS=113052176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr1	113063125	rs910697	A	G	2838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.277;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.872;NF=54;NR=67;PP=1808;ReadPosRankSum=-1.866;SC=GGCTGGACCAAACCTGAACAC;SOR=0.883;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=217;TCF=98;TCR=119;TR=121;WE=113063133;WS=113063115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,129:0.56:229
chr1	113068577	rs35147679	C	T	1480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.591;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=29;PP=858;ReadPosRankSum=-1.735;SC=TGTCACTTTACAGATGCTGTT;SOR=0.925;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=171;TCF=98;TCR=73;TR=74;WE=113068585;WS=113068567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,78:0.41:189
chr1	113083439	rs10745330	C	T	1081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=20;PP=626;ReadPosRankSum=-0.583;SC=TCAGTGTTTTCATTTTTGGGA;SOR=0.683;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=82;TCF=48;TCR=34;TR=47;WE=113083447;WS=113083429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,52:0.56:93
chr1	113140583	rs12049572	T	C	1216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.813;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=16;PP=779;ReadPosRankSum=-1.824;SC=TGAACAGATATGATACATACC;SOR=1.096;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=63;TCR=28;TR=52;WE=113140591;WS=113140573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,55:0.54:101
chr1	113202417	rs2932536	G	A	1050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.399;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=20;PP=512;ReadPosRankSum=-1.396;SC=ATTCCAACATGTTTATAGACT;SOR=0.877;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=112;TCF=65;TCR=47;TR=51;WE=113202425;WS=113202407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,57:0.44:131
chr1	113202571	rs12120956	G	A	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.044;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=98;ReadPosRankSum=-1.519;SC=GAGCTATTCTGAGTTGATAAA;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=6;WE=113202579;WS=113202561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr1	113234456	rs2932532	G	A	2197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.468;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=43;PP=1046;ReadPosRankSum=-0.667;SC=GCACTCTCCCGTCTTTTACCT;SOR=0.539;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=168;TCF=79;TCR=89;TR=88;WE=113234464;WS=113234446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,108:0.55:196
chr1	113236681	rs3748656	C	T	1915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.226;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=34;PP=1123;ReadPosRankSum=0.559;SC=TGCTACGGGGCGACCACCTGT;SOR=0.458;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=175;TCF=110;TCR=65;TR=84;WE=113236689;WS=113236671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,94:0.48:197
chr1	113237171	rs883593	A	G	1040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.438;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=17;PP=690;ReadPosRankSum=-0.757;SC=TGGAGCTGACAGGGCGCTGGC;SOR=1.014;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=102;TCF=61;TCR=41;TR=47;WE=113237179;WS=113237161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,52:0.45:115
chr1	113238665	rs71584764	T	TA	172.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.579;NF=8;NR=0;PP=135;ReadPosRankSum=1.099;SC=CCGTCTCAATTAAAAAAAATA;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=8;WE=113238673;WS=113238655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr1	113239382	rs17030651	G	A	1791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.683;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=41;PP=834;ReadPosRankSum=0.064;SC=CACTGCTGGAGCGGCTGCTCA;SOR=0.838;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=186;TCF=94;TCR=92;TR=80;WE=113239390;WS=113239372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,95:0.45:212
chr1	113239478	rs2999158	T	C	998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.816;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=30;PP=542;ReadPosRankSum=0.761;SC=GGTATTCCCATGCCCTTGCCT;SOR=0.873;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=87;TCF=32;TCR=55;TR=47;WE=113239486;WS=113239468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,51:0.54:94
chr1	113240790	rs12133583	G	T	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=462;ReadPosRankSum=-1.294;SC=CCCACTGAAGGTGCAGCCCCT;SOR=0.836;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=12;TCR=34;TR=23;WE=113240798;WS=113240780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,24:0.49:49
chr1	113241052	rs2306940	T	C	1608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.620;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=44;PP=1069;ReadPosRankSum=-2.518;SC=AGGGCAAAGCTCGCCTGAGCC;SOR=0.606;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=134;TCF=51;TCR=83;TR=72;WE=113241060;WS=113241042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,78:0.52:150
chr1	113242488	rs3013431	C	T	2757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.061;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=62;PP=1723;ReadPosRankSum=0.587;SC=CTCTTCCCTCCCATGACCACA;SOR=0.578;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=271;TCF=147;TCR=124;TR=122;WE=113242501;WS=113242478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,133:0.46:292
chr1	113243048	rs6679	C	T	2770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.606;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=56;PP=1744;ReadPosRankSum=-0.206;SC=GGCCCCACAGCCATGACTACC;SOR=0.770;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=211;TCF=112;TCR=99;TR=121;WE=113243056;WS=113243038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,130:0.57:229
chr1	113244433	rs2279500	T	C	3194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=66;PP=2103;SC=AATGCCTCCTTCTCCAGCCCT;SOR=1.258;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=45;TCR=66;TR=111;WE=113244441;WS=113244423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr1	113246229	rs937053	T	A	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.76;ReadPosRankSum=-0.171;SOR=0.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,15:0.35:43
chr1	113248365	rs954679	A	G	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.970;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=87;ReadPosRankSum=0.046;SC=CCTGTTTTGTAAAGATGGGCT;SOR=0.175;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=6;WE=113248373;WS=113248355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr1	113252614	rs41310100	C	A	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.523;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=207;ReadPosRankSum=0.563;SC=AATACAGACACACACCTTTAT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=10;WE=113252622;WS=113252612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr1	113254125	rs12040903	G	A	819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.172;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=21;PP=510;ReadPosRankSum=0.905;SC=TGTGCCACACGTTATTCTAAT;SOR=0.915;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=46;TCF=16;TCR=30;TR=31;WE=113254133;WS=113254115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,36:0.69:52
chr1	113254484	rs4839258	A	G	275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=8;NR=2;PP=204;SC=TTCCCAGTAAAGTGCTTTCTG;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=113254492;WS=113254474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	113255389	rs10857971	C	T	427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=4;PP=244;SC=GCATTCTCAACGGCCCCCACT;SOR=2.049;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=14;WE=113255397;WS=113255379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	113264930	rs35995150	C	G	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.900;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=18;PP=356;ReadPosRankSum=-1.251;SC=GGCTGTGGACCCACCTGACCT;SOR=0.848;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=79;TCF=30;TCR=49;TR=27;WE=113264938;WS=113264920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,29:0.33:89
chr1	113456546	rs1049434	A	T	1661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.650;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=24;PP=1022;ReadPosRankSum=0.559;SC=TGGGCCCTCCATCTGTGTCTT;SOR=0.922;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=167;TCF=106;TCR=61;TR=74;WE=113456554;WS=113456536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,80:0.43:184
chr1	113460683	.	T	G	25	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5000;HP=6;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=16;MQ=58.8;NF=2;NR=3;PP=25;QD=11.9542425094;SC=AGACAATAAATAAATAAATAA;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=5;WE=113460691;WS=113460673;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:2,5:0.71:7
chr1	113616382	rs56062000	G	GA	247.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.430;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=190;ReadPosRankSum=1.421;SC=CCTAAGCTCTGAAGGAAACTG;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=7;WE=113616390;WS=113616372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr1	113636924	rs1216802	T	C	398.89	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.803;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=292;ReadPosRankSum=1.633;SC=TTTATTTTACTAAATTTTTTC;SOR=3.126;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=113636932;WS=113636914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,15:0.88:17
chr1	113657092	rs1216793	A	C	4401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.17;SOR=0.999;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr1	113658887	rs1216791	G	A	1879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=45;NR=15;PP=1178;SC=ACCTTTGAGAGTTAAAAATGT;SOR=2.035;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=45;TCR=15;TR=60;WE=113658895;WS=113658877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	113659065	rs10541977	ACT	A	10241.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=116;PP=2965;SC=GACGGTAATGACTCTGTTGTT;SOR=1.022;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=138;TCF=16;TCR=122;TR=132;WE=113659074;WS=113659055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr1	113662249	rs12568813	G	C	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.923;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=87;ReadPosRankSum=0.010;SC=GCAAGCAGATGGGTATATAGG;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=7;WE=113662257;WS=113662239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr1	113666351	rs1728222	G	T	160.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.81;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	113933570	rs12568854	G	A	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=225;ReadPosRankSum=-0.697;SC=TGCGCGGGCCGCCCAGGGCCC;SOR=0.420;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=13;WE=113933578;WS=113933560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr1	114301335	rs61817589	C	T	6640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=122;NR=101;PP=2965;SC=TCTGTGTCTCCAGCCAGAGAA;SOR=0.725;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=225;TCF=123;TCR=102;TR=223;WE=114301343;WS=114301325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr1	114377568	rs2476601	A	G	6189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=114;NR=99;PP=2965;SC=TCAGGTGTCCATACAGGAAGT;SOR=0.710;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=213;TCF=114;TCR=99;TR=213;WE=114377576;WS=114377558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr1	114424601	rs1217381	C	T	2763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=53;PP=1744;SC=TCCACAGTGTCCTGGAGTATA;SOR=1.247;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=90;TCF=37;TCR=53;TR=90;WE=114424609;WS=114424591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr1	114472218	rs1217441	A	G	684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=18;PP=493;SC=GGGTTGAGGGACGGCCGCTCG;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=114472226;WS=114472208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	114512939	rs3811018	A	T	1800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=45;PP=1284;SC=TCTTAAAGAGACCTTAATTCA;SOR=3.076;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=55;TCF=9;TCR=46;TR=54;WE=114512947;WS=114512929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr1	114515717	rs2358996	G	A	5629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=108;NR=87;PP=2965;SC=GGCAGCAGGCGTTTGTGGCCC;SOR=0.781;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=195;TCF=108;TCR=87;TR=195;WE=114515725;WS=114515707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr1	114523465	rs3789614	A	G	962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=26;NR=4;PP=634;SC=GGAGGCAACCACTGGGCAAAT;SOR=3.321;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=30;WE=114523473;WS=114523455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	114634485	rs1053135	T	C	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.730;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=116;ReadPosRankSum=-0.207;SC=GTGTCTCAGCTTTGACCTACA;SOR=1.483;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=7;WE=114634493;WS=114634475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr1	114641685	rs2774285	A	G	2198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=16;PP=1373;SC=AGTGAGGGGTAGAATTACGTC;SOR=1.949;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=49;TCR=16;TR=65;WE=114641693;WS=114641675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr1	114940632	rs5777192	CA	C	217.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.51;ReadPosRankSum=1.333;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr1	114948281	rs6537825	A	G	7830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=141;NR=127;PP=2965;SC=TGCAGGTTCAATTTTCACATG;SOR=0.721;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=268;TCF=141;TCR=127;TR=268;WE=114948289;WS=114948271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,286:1.00:286
chr1	114951220	rs6672519	C	T	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.122;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=73;ReadPosRankSum=-0.000;SC=AAGGGGTTCACTGTAATATTC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=5;WE=114951228;WS=114951210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr1	114951390	rs71662879	T	A	353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=8;PP=160;ReadPosRankSum=-0.076;SC=AAAATGAATATCAATGCATAT;SOR=0.818;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=29;TCF=13;TCR=16;TR=15;WE=114951398;WS=114951380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr1	114969925	rs36115645	GA	G	2262.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.803;NF=6;NR=57;PP=1348;ReadPosRankSum=0.261;SC=ATCTTAAAGGGAAAAAAATCC;SOR=0.661;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=138;TCF=12;TCR=126;TR=63;WE=114969933;WS=114969911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,104:0.48:215
chr1	114973360	rs80326582	T	A	1143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.749;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=23;PP=693;ReadPosRankSum=0.649;SC=TCAATAAACATTAAAAACAGC;SOR=0.610;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=96;TCF=55;TCR=41;TR=54;WE=114973368;WS=114973350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,55:0.56:99
chr1	114973429	rs12083584	T	C	1131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.439;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=25;PP=726;ReadPosRankSum=1.597;SC=CCTCTAGCTGTTGTAAGAGAG;SOR=0.778;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=112;TCF=59;TCR=53;TR=51;WE=114973437;WS=114973419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,55:0.46:120
chr1	115112597	rs72698020	A	T	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.520;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=283;ReadPosRankSum=-0.097;SC=AAGATGATGGAATTATAGATA;SOR=0.256;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=21;WE=115112605;WS=115112587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,26:0.70:37
chr1	115128087	rs222493	A	G	298.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=218;SC=ATCCTCCTCTAACAGCCTGAC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=115128095;WS=115128077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	115144703	rs28398	A	G	10096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=369;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=178;NR=139;PP=2965;SC=TGACTCAATTATTCCTTGACC;SOR=0.920;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=318;TCF=178;TCR=140;TR=317;WE=115144711;WS=115144693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,368:1.00:368
chr1	115165472	rs222502	T	A	103.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=65;SC=AAACAAAAATTAAAAAAACTA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=115165480;WS=115165462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	115166350	rs148413143	ATTGT	A	232.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=2;PP=76;SC=TATTTGTTTGATTGTTTGTTT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=2;WE=115166361;WS=115166340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	115168097	rs12136548	T	C	1894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=42;PP=1279;ReadPosRankSum=1.089;SC=TTCTGAAGAGTCACAATGTTC;SOR=0.694;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=149;TCF=69;TCR=80;TR=77;WE=115168105;WS=115168087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,83:0.53:157
chr1	115219836	rs77720559	C	G	789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=6.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.49;ReadPosRankSum=0.749;SOR=1.734;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,21:0.41:51
chr1	115219844	rs78252530	G	A	835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=6.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.66;ReadPosRankSum=0.220;SOR=1.585;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,24:0.42:57
chr1	115220420	.	CTCCT	C	292.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.593;ClippingRankSum=-0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=29.27;ReadPosRankSum=0.140;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr1	115222434	rs761755	G	A	486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=15;PP=376;SC=GGAAATAATTGTTGGAACAAA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=115222442;WS=115222424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	115223156	rs148919817	A	T	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=416;ReadPosRankSum=0.673;SC=GACCACATAAAAATAACCAAA;SOR=0.914;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=8;TCR=31;TR=24;WE=115223164;WS=115223146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,26:0.65:40
chr1	115226990	.	CA	C	129.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.963;ClippingRankSum=0.000;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.49;ReadPosRankSum=1.091;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,14:0.27:52
chr1	115231298	rs61752480	T	C	2859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.878;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=64;PP=1923;ReadPosRankSum=-1.628;SC=CCTGACGACCTCCTTCATCTT;SOR=0.675;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=272;TCF=138;TCR=134;TR=137;WE=115231306;WS=115231288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,142:0.49:287
chr1	115256669	rs969273	G	A	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.089;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=95;ReadPosRankSum=0.448;SC=CACAGGGAATGCAATGCTATT;SOR=0.859;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=7;WE=115256677;WS=115256659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr1	115276978	rs57342611	GA	G	630.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=2.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.17;ReadPosRankSum=1.274;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,33:0.53:62
chr1	115280193	.	CA	C	261.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.542;ClippingRankSum=0.000;DP=235;ExcessHet=3.0103;FS=9.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.000;QD=1.36;ReadPosRankSum=-2.577;SOR=0.256;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:157,36:0.19:193
chr1	115284056	rs7537232	G	T	1859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.543;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=33;PP=1077;ReadPosRankSum=0.585;SC=AAGGTGAGTCGGCAAGATATT;SOR=0.764;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=176;TCF=107;TCR=69;TR=86;WE=115284064;WS=115284046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,92:0.48:190
chr1	115398044	rs60659641	GC	G	2892.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=25;PP=1594;SC=TTCCCCTCCCGCCCCCCCGGG;SOR=1.711;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=70;TCF=40;TCR=30;TR=59;WE=115398052;WS=115398034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr1	115399778	.	A	G	131.10	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.16;MQRankSum=1.465;QD=18.73;ReadPosRankSum=1.465;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr1	115399884	rs17544210	C	G	824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.85;ReadPosRankSum=1.355;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,44:0.58:76
chr1	115399940	rs360614	T	G	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.837;HP=2;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=7;PP=177;ReadPosRankSum=-0.341;SC=GTTTAGGTAATGAACTGCTTA;SOR=0.208;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=34;TCF=13;TCR=21;TR=14;WE=115399948;WS=115399930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
chr1	115401136	rs360615	G	A	506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=4;PP=379;SC=TAGAATTTTGGACAATTAATT;SOR=2.419;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=18;WE=115401144;WS=115401126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	115417093	rs7518392	A	C	928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.186;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=10;PP=581;ReadPosRankSum=-2.040;SC=TCTTATTTTAAAATTTAATCT;SOR=1.144;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=63;TCF=42;TCR=21;TR=36;WE=115417101;WS=115417083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,41:0.60:68
chr1	115420905	rs360636	T	C	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.156;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=204;ReadPosRankSum=-0.462;SC=ATTACAAGTTTGTTGTAATGC;SOR=1.006;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=64;TCF=27;TCR=37;TR=23;WE=115420913;WS=115420895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,23:0.34:68
chr1	115437986	rs6661511	G	A	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.891;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=12;PP=298;ReadPosRankSum=1.471;SC=TCCCTTTTGCGTAGTATTATG;SOR=0.544;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=70;TCF=42;TCR=28;TR=31;WE=115437994;WS=115437976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,34:0.46:74
chr1	115487468	.	CT	C	30.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.469;ClippingRankSum=0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.83;ReadPosRankSum=0.835;SOR=0.280;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,7:0.19:37
chr1	115524216	rs12026343	C	T	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=3.087;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=130;ReadPosRankSum=-0.682;SC=TCTGGCATCACGCACACATAT;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=7;WE=115524224;WS=115524206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr1	115576023	rs10776792	A	G	5872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=116;NR=72;PP=2965;SC=TTTTGGCCTTACATGTGGGCA;SOR=1.141;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=188;TCF=116;TCR=72;TR=188;WE=115576031;WS=115576013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr1	115576482	rs28566771	C	G	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-4.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.762;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=291;ReadPosRankSum=-1.191;SC=CAATTCTTTCCCAGTTGTATT;SOR=0.255;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=18;WE=115576490;WS=115576472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,22:0.65:34
chr1	115600081	rs3820630	G	C	1091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=19;PP=753;ReadPosRankSum=-1.676;SC=GATCCCATCCGAGATTCTACC;SOR=0.682;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=61;TCR=37;TR=49;WE=115600089;WS=115600071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,52:0.51:102
chr1	115600137	rs3738704	A	G	1710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.241;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=34;PP=989;ReadPosRankSum=0.564;SC=AGGTAGAGTAAGAACCTTGGT;SOR=0.574;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=137;TCF=78;TCR=59;TR=72;WE=115600145;WS=115600127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,82:0.52:159
chr1	115601528	rs3738702	C	G	4574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=353;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.387;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=90;PP=2818;ReadPosRankSum=1.327;SC=TGATGAGTGTCCCATTGCCTT;SOR=0.669;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=315;TCF=154;TCR=161;TR=179;WE=115601544;WS=115601518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,200:0.57:352
chr1	115601615	rs7523818	A	G	4536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=91;PP=2825;SC=GAAGAAATACAAGGAAAAATG;SOR=1.391;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=150;TCF=59;TCR=91;TR=150;WE=115601623;WS=115601605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr1	115604681	rs11102881	A	G	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=364;ReadPosRankSum=-0.590;SC=GCCAGGGGCCAGAGGCACTGA;SOR=0.751;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=59;TCF=43;TCR=16;TR=26;WE=115604689;WS=115604671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,28:0.45:62
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chr1	115615358	rs753189	T	C	143.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=0;PP=113;SC=AGCAGACAACTCGGAGGGCTA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=115615366;WS=115615354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	115631924	rs4240540	C	T	2993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=66;NR=30;PP=1853;SC=TCGGGGACCCCGGCCCCGCGC;SOR=1.609;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=96;TCF=66;TCR=30;TR=96;WE=115631932;WS=115631914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr1	115829313	rs6330	G	A	3693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=70;PP=2096;ReadPosRankSum=-0.701;SC=AGTCCAGTGGGCTTGGGGGAT;SOR=0.676;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=253;TCF=139;TCR=114;TR=155;WE=115829321;WS=115829303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,173:0.60:288
chr1	116224925	rs10923176	G	A	803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=7;PP=468;ReadPosRankSum=-0.903;SC=AGGATTTTTCGTTTAGGACCT;SOR=0.593;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=60;TCF=46;TCR=14;TR=30;WE=116224933;WS=116224915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,35:0.51:69
chr1	116224940	rs10754330	C	A	1343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-5.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.341;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=13;PP=794;ReadPosRankSum=-0.960;SC=GGACCTGCTTCTTCAGTGAAA;SOR=0.365;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=89;TCF=68;TCR=21;TR=51;WE=116224948;WS=116224930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,59:0.57:103
chr1	116225180	rs10923177	A	C	1028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.248;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=24;PP=554;ReadPosRankSum=-1.607;SC=ACTATTTAAGATTCATGGTAC;SOR=0.120;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=69;TCF=17;TCR=52;TR=37;WE=116225188;WS=116225170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,44:0.56:79
chr1	116228220	rs12145661	C	T	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=4.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=343;ReadPosRankSum=-0.060;SC=TGAATTATAGCGTGTTACTAG;SOR=2.004;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=17;WE=116228228;WS=116228210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr1	116243868	rs28730711	A	G	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.227;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=5;PP=423;ReadPosRankSum=0.724;SC=TGGGCTATTCATCATCATCGT;SOR=1.048;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=54;TCF=43;TCR=11;TR=29;WE=116243876;WS=116243858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,30:0.53:57
chr1	116260532	rs2997741	A	T	2180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.108;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=47;PP=1232;ReadPosRankSum=-0.402;SC=GAGAAAAGTAACAAAAGTTAC;SOR=0.594;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=173;TCF=80;TCR=93;TR=89;WE=116260540;WS=116260522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,104:0.53:198
chr1	116260604	rs2997742	G	A	1069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=28;PP=665;ReadPosRankSum=1.176;SC=GCTGGAATGGGAATAGGAGAG;SOR=0.852;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=65;TCF=16;TCR=49;TR=36;WE=116260612;WS=116260594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,43:0.58:74
chr1	116283343	rs9428083	A	G	5596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=113;NR=76;PP=2965;SC=GTGTATAAATACTTACATCCA;SOR=1.112;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=189;TCF=113;TCR=76;TR=189;WE=116283351;WS=116283333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr1	116283526	rs7538337	G	A	2489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=54;PP=1582;SC=AGGTCTGGCTGAGGGTTTCTG;SOR=1.954;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=23;TCR=54;TR=77;WE=116283534;WS=116283516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr1	116287634	rs10801969	A	G	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.009;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=21;PP=430;ReadPosRankSum=-0.618;SC=GGTTTCCTCTATACTTGCTGT;SOR=0.968;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=64;TCF=19;TCR=45;TR=28;WE=116287642;WS=116287624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,30:0.43:70
chr1	116287651	rs10801970	G	A	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.934;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=334;ReadPosRankSum=-0.180;SC=CTGTTACTATGTGACCAAGTT;SOR=1.755;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=51;TCF=10;TCR=41;TR=21;WE=116287659;WS=116287641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,23:0.42:55
chr1	116287682	rs9428211	T	C	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=4.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=245;ReadPosRankSum=-1.407;SC=AAAGGAAATGTATTCTTGTCC;SOR=0.874;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=11;WE=116287690;WS=116287672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr1	116310818	rs4484922	G	C	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-3.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=210;ReadPosRankSum=-2.817;SC=ATAAAGCAGAGTTCAGTATAT;SOR=0.223;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=12;WE=116310826;WS=116310808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr1	116310967	rs4074536	T	C	4418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=381;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.182;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=106;NR=82;PP=2166;ReadPosRankSum=1.978;SC=TGTTTTTGCGTGACCTTATCT;SOR=0.589;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=343;TCF=197;TCR=146;TR=188;WE=116310975;WS=116310957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,212:0.56:380
chr1	116311198	rs4074537	T	C	1174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=34;PP=813;SC=CCAAATATGCTGTGTGCAGAA;SOR=4.615;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=3;TCR=34;TR=37;WE=116311206;WS=116311188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	116534852	rs4046190	C	T	4072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=72;PP=2202;SC=GCTTCACCTCCATCGCCTCGG;SOR=0.934;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=67;TCR=72;TR=139;WE=116534860;WS=116534842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr1	116569530	rs2488429	G	C	1356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=9;PP=832;SC=TTGGCGGCCTGTTCTTTGCAG;SOR=2.160;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=42;WE=116569538;WS=116569520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	116577981	rs1935828	G	A	812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=21;PP=549;SC=GAAGTGCACCGTAGAGAATGC;SOR=2.753;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=26;WE=116577989;WS=116577971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	116607254	rs1281748	G	T	698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=23;PP=625;SC=GTGAACCTTGGCCCTTTTAGA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=116607262;WS=116607244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	116609126	rs3833541	TC	T	8220.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=31;NR=96;PP=2966;SC=TTCATTCCACTCCCCGCCTCT;SOR=0.727;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=134;TCF=36;TCR=98;TR=127;WE=116609134;WS=116609116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr1	116655272	rs61788520	C	T	2138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.063;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=43;PP=1474;ReadPosRankSum=0.676;SC=TAGAAGATTGCCTACTGAATA;SOR=0.776;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=189;TCF=106;TCR=83;TR=95;WE=116655280;WS=116655262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,102:0.49:208
chr1	117142531	rs631461	G	A	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=218;ReadPosRankSum=2.118;SC=CAGGCAGCATGGGCACATAGC;SOR=0.892;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=14;WE=117142539;WS=117142521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr1	117236970	rs614477	G	C	899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.899;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=28;PP=635;ReadPosRankSum=0.556;SC=GGACAGTGCTGCTGCCATGTG;SOR=1.415;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=66;TCF=10;TCR=56;TR=32;WE=117236978;WS=117236960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,35:0.50:70
chr1	117249070	rs138115464	CT	C	2476.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.639;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.944;NF=16;NR=26;PP=1602;ReadPosRankSum=-0.568;SC=CCTATCTCTTCTGTTACAGTT;SOR=0.776;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=82;TCF=28;TCR=54;TR=42;WE=117249078;WS=117249060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,73:0.54:136
chr1	117487710	rs10159095	AT	GA	8352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=87;PP=2947;SC=TGATCCAGCCATCAGGTGAGC;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=158;TCF=70;TCR=88;TR=155;WE=117487719;WS=117487700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr1	117527645	rs36119404	GTCT	G	2199.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.510;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.771;NF=1;NR=28;PP=1157;ReadPosRankSum=0.363;SC=GTTTGGGAATGTCTTCTTCTT;SOR=0.542;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=75;TCF=4;TCR=71;TR=29;WE=117527655;WS=117527635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,59:0.50:119
chr1	117552560	rs7554376	T	C	1214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.685;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=25;PP=675;ReadPosRankSum=0.452;SC=TTGGCTGCAATGTAACTGGCC;SOR=0.594;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=114;TCF=70;TCR=44;TR=60;WE=117552568;WS=117552550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,61:0.50:121
chr1	117555898	rs2764849	G	A	204.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=137;SC=TTTACCTACCGCTATAGAATT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=117555906;WS=117555894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	117559726	rs2249265	A	G	6774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=136;NR=101;PP=2965;SC=AAGTGTGGTCATGTCTACCAA;SOR=0.830;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=237;TCF=136;TCR=101;TR=237;WE=117559734;WS=117559716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,263:1.00:263
chr1	117560058	rs17235773	C	G	992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=31;PP=675;ReadPosRankSum=0.574;SC=GAGATCTGAGCTGGACTCAGA;SOR=0.769;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=84;TCF=31;TCR=53;TR=47;WE=117560066;WS=117560048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,47:0.53:89
chr1	117603156	rs2274253	G	T	1193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.748;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=32;PP=711;ReadPosRankSum=0.742;SC=GGGCAGACACGTGCAGCTTCG;SOR=0.289;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=93;TCF=27;TCR=66;TR=50;WE=117603164;WS=117603146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,55:0.54:102
chr1	117603188	rs2244406	G	T	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.387;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=19;PP=420;ReadPosRankSum=-0.045;SC=GAGTAGGTCTGGAGCTGGGCC;SOR=0.074;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=43;TCF=7;TCR=36;TR=26;WE=117603196;WS=117603178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,27:0.59:46
chr1	117617705	rs998532	A	G	2928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.685;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=66;PP=1931;ReadPosRankSum=0.710;SC=CGATCAAAAGAAAGAACAGAA;SOR=0.873;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=252;TCF=123;TCR=129;TR=120;WE=117617713;WS=117617695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,133:0.47:280
chr1	117618067	rs1289673	C	T	2440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.131;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=62;PP=1584;ReadPosRankSum=-1.046;SC=AGTACACGAACTGGGAGGCTA;SOR=0.854;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=241;TCF=112;TCR=129;TR=113;WE=117618075;WS=117618057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,119:0.47:252
chr1	117618722	rs1289672	T	C	604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=15;NR=2;PP=404;SC=AGAGTTTGGGTGTTTCAGGCT;SOR=3.056;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=117618730;WS=117618712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	117622286	rs2801939	A	G	7685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=155;PP=2965;SC=GTGTGGTATTATAAGAGTCAG;SOR=1.236;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=254;TCF=99;TCR=155;TR=254;WE=117622294;WS=117622276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,285:1.00:285
chr1	117631391	rs1555792	T	C	2242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.550;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=35;PP=1396;ReadPosRankSum=-0.387;SC=TTTTCCCATATTGTGGCTGGA;SOR=0.760;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=163;TCF=101;TCR=62;TR=94;WE=117631399;WS=117631381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,104:0.56:187
chr1	117656088	rs1289658	A	G	2159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.370;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=42;PP=1150;ReadPosRankSum=-0.813;SC=TCTCCTCACCATCACAGTGAA;SOR=0.869;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=185;TCF=102;TCR=83;TR=97;WE=117656096;WS=117656078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,109:0.53:207
chr1	117656276	rs1290530	A	G	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.140;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=128;ReadPosRankSum=-0.164;SC=AGCTGAGAGGAGGCAGACACA;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=7;WE=117656284;WS=117656266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr1	117659352	rs3738413	C	T	1048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.419;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=22;PP=605;ReadPosRankSum=1.624;SC=CTGTTTCTCCCGGGCTCTGTG;SOR=0.696;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=111;TCF=61;TCR=50;TR=47;WE=117659360;WS=117659342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,54:0.43:127
chr1	117660592	.	C	T	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.464;ClippingRankSum=-0.000;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=30;ReadPosRankSum=0.329;SC=AACAAGCCACCAATCTTCACA;SOR=0.283;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=4;WE=117660600;WS=117660582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr1	117660608	rs1289655	C	T	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=57;ReadPosRankSum=-0.320;SC=TCACACACCACCTCCCTGTCC;SOR=0.260;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=6;WE=117660616;WS=117660598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr1	117660754	rs749902	C	T	2031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.546;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=36;PP=1232;ReadPosRankSum=-0.795;SC=CTCCTGAGGACAGAAGCGTAT;SOR=0.783;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=159;TCF=92;TCR=67;TR=88;WE=117660762;WS=117660744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,97:0.53:183
chr1	117663913	rs3795655	C	T	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=185;ReadPosRankSum=0.828;SC=AAGAGAAAGTCTCCAGAACTT;SOR=0.591;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=34;TCF=12;TCR=22;TR=15;WE=117663921;WS=117663903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr1	117690272	rs10754339	G	A	1631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=15;PP=1056;SC=TTTTGTGGCCGAGGCACATTA;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=38;TCR=15;TR=53;WE=117690280;WS=117690262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	117699714	.	G	GAT	86	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=86;QD=45.5;SC=CAATCATTTTGATATATATAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=2;WE=117699722;WS=117699704;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:3,2:0.40:5
chr1	117715026	rs6657810	C	T	4241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=86;NR=54;PP=2474;SC=TCCTCTTTTCCCACACCTCAG;SOR=1.017;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=86;TCR=54;TR=140;WE=117715034;WS=117715016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr1	117715987	rs140251705	A	AAC	316.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=444;ReadPosRankSum=-0.722;SC=GACACAGATGAACACACACAC;SOR=0.610;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=11;WE=117715995;WS=117715977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,12:0.80:15
chr1	117957288	rs1289948	A	G	562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.302;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=389;ReadPosRankSum=0.322;SC=GAGAACAGGAACCTAAAGGGA;SOR=0.164;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=22;WE=117957296;WS=117957278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,23:0.61:38
chr1	117984776	rs2306444	A	T	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=175;ReadPosRankSum=-1.304;SC=TGTGCTATGTATACTATGAGA;SOR=1.460;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=9;WE=117984784;WS=117984766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr1	118053126	rs41506254	T	C	1060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.481;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=22;PP=597;ReadPosRankSum=0.656;SC=AGAACACAGATGAAAAGTCAA;SOR=0.541;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=109;TCF=65;TCR=44;TR=51;WE=118053134;WS=118053116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,55:0.47:118
chr1	118065841	rs1290558	A	G	2563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.096;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=51;PP=1705;ReadPosRankSum=1.535;SC=CACATGAGAAATGATACCTGT;SOR=0.838;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=237;TCF=128;TCR=109;TR=117;WE=118065849;WS=118065831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,122:0.48:256
chr1	118165691	rs1630312	C	T	1904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.007;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=45;PP=1088;ReadPosRankSum=-1.320;SC=TCAAAGTGCACGACGTCCGGC;SOR=1.030;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=180;TCF=81;TCR=99;TR=78;WE=118165699;WS=118165681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,91:0.46:198
chr1	118320644	rs1780028	A	G	51.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=17.09;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	118320859	rs1775749	T	A	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.01;QD=30.07;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	118321119	rs114485606	T	C	2578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.49;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=53;PP=1808;SC=TACCTCTCTCTACCACCCATC;SOR=1.085;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=35;TCR=53;TR=88;WE=118321127;WS=118321109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr1	118424269	rs10923444	C	T	261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=3;PP=186;SC=CCCACAAAGGCGCTGGAGTCA;SOR=1.609;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=10;WE=118424277;WS=118424259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	118429438	rs3054231	G	GACA	277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=345;SC=CTACTCTGCAGACAACACCTA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=7;WE=118429446;WS=118429428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	118483352	.	GACA	G	32	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=32;QD=14.0;SC=CTCTGTCTCCGACAACAACAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=3;WE=118483362;WS=118483342;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:17,3:0.15:20
chr1	118484265	rs10733098	G	A	180.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=1;PP=129;SC=CCAAGGTAATGCAACTACTAA;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=118484273;WS=118484255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	118491215	.	G	GT	30	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;FR=0.9998;HP=15;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=16;MQ=62.13;NF=0;NR=2;PP=30;QD=16.5;SC=AAAGCCTGAGGTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=2;WE=118491223;WS=118491205;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,2:0.50:4
chr1	118514723	.	TA	T	110.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=10.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.95;ReadPosRankSum=0.320;SOR=0.033;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
chr1	118526592	rs4347199	G	A	377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=8;PP=214;SC=TTCAACTGTCGCAAATATGTT;SOR=1.765;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=118526600;WS=118526582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	118565953	rs10923472	G	A	1280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.232;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=27;PP=880;ReadPosRankSum=0.217;SC=AATCTCAGATGGTATCGTTTC;SOR=0.499;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=129;TCF=78;TCR=51;TR=63;WE=118565961;WS=118565943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,65:0.49:134
chr1	118567809	.	T	C	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.460;ClippingRankSum=0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=228;ReadPosRankSum=-0.586;SC=ACCCATAAGTTGTCTTTTACT;SOR=0.582;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=51;TCF=36;TCR=15;TR=21;WE=118567817;WS=118567799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,23:0.43:54
chr1	118583408	rs10923477	G	A	1879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.385;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=44;PP=1093;ReadPosRankSum=0.473;SC=AAGGATACAGGTAGTAATTTG;SOR=0.780;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=153;TCF=83;TCR=70;TR=86;WE=118583416;WS=118583398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,93:0.51:181
chr1	118617274	rs1935993	C	T	8300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=112;NR=151;PP=2965;SC=TTGTTCTTGCCCTGCTGGTTA;SOR=1.130;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=263;TCF=112;TCR=151;TR=263;WE=118617282;WS=118617264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,299:1.00:299
chr1	118623681	.	TACACACAC	T,TAC	1700.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.15;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;NF=9,9;NR=7,7;PP=847,165;SC=AATAGTGTCTTACACACACAC;SOR=2.584;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=20;TCF=10;TCR=10;TR=16,16;WE=118623696;WS=118623671;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.21,0.79:43
chr1	118644430	rs10754367	A	G	2713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=31;PP=1536;SC=TCACTGGTGCATTTGCCTCAG;SOR=1.257;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=56;TCR=31;TR=87;WE=118644438;WS=118644420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr1	118644524	rs17185492	T	A	1928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.805;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=43;PP=990;ReadPosRankSum=-0.322;SC=TTTATCCTTTTCTAACTTAGG;SOR=0.839;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=165;TCF=82;TCR=83;TR=81;WE=118644532;WS=118644514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,96:0.52:185
chr1	119427454	rs12569041	G	A	1440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.547;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=31;PP=786;ReadPosRankSum=-1.576;SC=TGGGTGAAGGGCTAATCATGT;SOR=0.649;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=161;TCF=91;TCR=70;TR=68;WE=119427462;WS=119427444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,77:0.42:183
chr1	119466275	rs4659129	A	G	606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.074;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=325;ReadPosRankSum=-1.151;SC=AGGAACCTACATTTTGTTCTC;SOR=1.311;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=50;TCF=15;TCR=35;TR=22;WE=119466283;WS=119466265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,27:0.47:57
chr1	119469188	rs10494217	G	T	2081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.229;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=40;PP=1147;ReadPosRankSum=1.838;SC=TACTGCTGATGTGGATCTAGG;SOR=0.633;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=202;TCF=105;TCR=97;TR=89;WE=119469204;WS=119469178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,104:0.45:231
chr1	119530252	.	G	C	776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.223;ClippingRankSum=0.000;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=10;PP=430;ReadPosRankSum=-0.640;SC=CGCGTCCTCCGTGTCTCCGAG;SOR=0.760;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=59;TCF=39;TCR=20;TR=32;WE=119530260;WS=119530242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,37:0.57:65
chr1	119584949	rs33960696	G	A	1028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.448;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=23;PP=675;ReadPosRankSum=-0.189;SC=CCGTGCCATCGTGCTTCTGCT;SOR=0.521;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=118;TCF=57;TCR=61;TR=48;WE=119584957;WS=119584939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,52:0.40:131
chr1	119683063	rs3934789	G	A	602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.332;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=262;ReadPosRankSum=-0.239;SC=CCTTAGGCGAGGGAAGGCATG;SOR=0.285;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=47;TCF=35;TCR=12;TR=22;WE=119683071;WS=119683053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,29:0.56:52
chr1	119683390	rs12096448	G	A	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=191;ReadPosRankSum=0.562;SC=AGCCGCTATCGGGCGGACTGC;SOR=0.905;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=15;WE=119683398;WS=119683380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr1	119923531	rs2224995	A	C	645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.504;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=15;PP=359;ReadPosRankSum=0.447;SC=TTACTCTCTGACTTCTGGCTT;SOR=0.377;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=57;TCF=21;TCR=36;TR=26;WE=119923539;WS=119923521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,31:0.48:65
chr1	119923724	rs2275607	T	C	2199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.548;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=33;PP=1348;ReadPosRankSum=0.667;SC=CTTGGTGTGTTTGACAGACTT;SOR=0.781;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=161;TCF=99;TCR=62;TR=86;WE=119923732;WS=119923714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,96:0.52:185
chr1	119925403	rs1341007	C	T	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=75;ReadPosRankSum=0.199;SC=TCTCAGCCAACTGAACCCACC;SOR=0.340;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=7;WE=119925411;WS=119925394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr1	119925464	rs2298027	G	A	698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.149;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=6;PP=500;ReadPosRankSum=-0.889;SC=GAATCAGGGGGGTCCACCCCA;SOR=1.345;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=70;TCF=50;TCR=20;TR=31;WE=119925472;WS=119925454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,32:0.45:71
chr1	119927680	rs6667679	A	G	3115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.442;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=76;PP=1966;ReadPosRankSum=-1.228;SC=TAAAAAGGTAAGAAAGATACC;SOR=0.663;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=251;TCF=111;TCR=140;TR=136;WE=119927688;WS=119927660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,147:0.53:275
chr1	119935507	rs10802092	A	T	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=118;ReadPosRankSum=1.217;SC=AAGATCATTGACAGCTCTGGG;SOR=0.399;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=7;WE=119935515;WS=119935497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr1	119936263	rs3765949	G	A	827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=9;PP=580;ReadPosRankSum=-0.973;SC=ACAGAATTACGTTATTCATTC;SOR=0.639;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=65;TCF=47;TCR=18;TR=33;WE=119936271;WS=119936253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,35:0.51:68
chr1	120057158	rs6203	C	T	3013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.902;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.122;NF=51;NR=70;PP=1985;ReadPosRankSum=0.001;SC=TCAGCGAGATCTGGCGTATAA;SOR=0.527;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=224;TCF=89;TCR=135;TR=121;WE=120057166;WS=120057148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,131:0.54:243
chr1	120057246	rs1047303	C	A	863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.375;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.880;NF=7;NR=23;PP=496;ReadPosRankSum=0.317;SC=CACAAGGAGACCCTGAAGTCC;SOR=0.155;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=49;TCF=9;TCR=40;TR=30;WE=120057254;WS=120057236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,36:0.65:55
chr1	120165826	rs12076924	C	T	2728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=66;PP=1640;ReadPosRankSum=1.976;SC=CACAGCCGTGCGGCTTCTCGC;SOR=0.858;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=221;TCF=100;TCR=121;TR=116;WE=120165834;WS=120165816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,127:0.53:241
chr1	120166681	rs12067843	G	A	2299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.951;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=42;PP=1236;ReadPosRankSum=-0.922;SC=CAGCTACACCGGATTGGTCAT;SOR=0.631;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=224;TCF=126;TCR=98;TR=97;WE=120166689;WS=120166671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,117:0.45:258
chr1	120254913	rs138275645	G	C	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.47;ReadPosRankSum=1.611;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr1	120263643	rs550174	T	C	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.591;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=274;ReadPosRankSum=-0.460;SC=CTAGTGAGTATACCAAAGATA;SOR=1.022;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=40;TCF=36;TCR=4;TR=17;WE=120263651;WS=120263633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,17:0.38:45
chr1	120269507	rs148078511	C	T	954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=12;PP=597;ReadPosRankSum=-1.348;SC=CGATGAAGGACGGCAAATGGG;SOR=0.693;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=82;TCF=60;TCR=22;TR=42;WE=120269515;WS=120269497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,45:0.50:90
chr1	120285546	rs543703	G	A	2118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.430;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=36;PP=1163;ReadPosRankSum=2.225;SC=AAGGCACTACGCCTGTACTGC;SOR=0.532;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=78;TCR=54;TR=87;WE=120285554;WS=120285536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,98:0.68:144
chr1	120293352	rs667226	T	C	1159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=21;PP=652;ReadPosRankSum=-0.793;SC=CCACCTTCTCTCTCTGTGTTG;SOR=0.680;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=143;TCF=87;TCR=56;TR=56;WE=120293360;WS=120293342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,64:0.41:157
chr1	120293367	rs667246	T	C	1546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.740;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=33;PP=954;ReadPosRankSum=-0.803;SC=GTGTTGTTACTCAGAGGAAGA;SOR=0.568;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=189;TCF=112;TCR=77;TR=78;WE=120293375;WS=120293357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,86:0.42:205
chr1	120293568	rs668156	G	A	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.317;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=130;ReadPosRankSum=1.172;SC=CTCACAAAGAGTTATATGAGT;SOR=0.964;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=39;TCF=14;TCR=25;TR=13;WE=120293576;WS=120293558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,14:0.33:42
chr1	120336785	rs1052972	C	T	5647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=86;PP=2965;ReadPosRankSum=1.172;SC=TAAACCTTCCCATGGCCAAAG;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=191;TCF=104;TCR=87;TR=189;WE=120336793;WS=120336775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,216:0.99:218
chr1	120378678	rs3009182	C	T	5687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=117;NR=72;PP=2965;SC=TGGCTACATCCTGAGCAGAGC;SOR=1.089;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=189;TCF=117;TCR=72;TR=189;WE=120378686;WS=120378668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr1	120380008	rs3009184	T	A	1785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=45;PP=1250;SC=GAAGAGCAGGTCATATTATGC;SOR=2.231;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=15;TCR=45;TR=60;WE=120380016;WS=120379998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	120381686	rs5777416	G	GT,GTGTGAGTCA	1209.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=0;PP=2900;SC=GTGATTATATGGAGCACCTAG;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=120381695;WS=120381682;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:23
chr1	120381687	.	G	C	490	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=59.35;NF=18;NR=0;PP=490;QD=29.1539562526;SC=TGATTATATGGAGCACCTAGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=18;WE=120381695;WS=120381682;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:11,18:0.62:29
chr1	120381687	rs34302627	G	GTGAGTCAC	1209.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=50.41;SOR=6.439;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	120384205	rs2994820	A	G	578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=17;PP=478;SC=CCTGAGAGTGAACCAGGACTT;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=120384213;WS=120384195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	120387120	rs12405228	G	A	314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=259;SC=TGGCAGAAGAGGTGGAGCCAG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=120387128;WS=120387110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	120438827	rs41276636	T	C	1458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=36;PP=838;ReadPosRankSum=-0.771;SC=TTCTCAGGAATGGTGACTTCA;SOR=0.739;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=159;TCF=78;TCR=81;TR=70;WE=120438835;WS=120438817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,76:0.43:177
chr1	120459122	rs150516342	C	T	3798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=354;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.251;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=83;PP=2148;ReadPosRankSum=-0.303;SC=GAAGTCAACACGGTGCCTGGA;SOR=0.619;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=325;TCF=159;TCR=166;TR=169;WE=120459130;WS=120459112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,184:0.52:354
chr1	120467876	rs41302079	G	A	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.604;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.877;NF=11;NR=5;PP=213;ReadPosRankSum=-0.413;SC=ACGAGAAACTGAAGTGTGTTA;SOR=0.368;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=16;WE=120467884;WS=120467866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr1	120478285	rs5025718	T	C	2999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=69;PP=1774;SC=AAACAGACCATGAGAGCTAGT;SOR=1.589;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=34;TCR=69;TR=103;WE=120478293;WS=120478275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr1	120480394	rs2453057	T	C	324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=1;PP=208;SC=TCCCTCTTATTCCACAAAAAA;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=120480402;WS=120480391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	120512104	rs2493409	T	C	1097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=6;PP=736;SC=GCCCCTTCCCTGTTTCTAGAT;SOR=2.242;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=34;WE=120512112;WS=120512094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	120539331	rs2124109	C	T	6472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=642;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.092;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-6.776;NF=157;NR=138;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.231;SC=CTTGCCTGTCCCTTTCCCAGA;SOR=0.756;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=604;TCF=316;TCR=288;TR=295;WE=120539339;WS=120539321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:330,311:0.49:641
chr1	120611554	rs75248693	TT	CG	4659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.885;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=-11.573;NF=79;NR=47;PP=2944;ReadPosRankSum=0.197;SC=GAATCTGGCATTCCTTCGCTC;SOR=0.818;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=347;TCF=212;TCR=135;TR=126;WE=120611563;WS=120611544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:212,127:0.37:339
chr1	120611715	rs2794167	A	G	1056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.607;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.478;NF=30;NR=49;PP=1341;ReadPosRankSum=-2.304;SC=GGAGGCGTGTAAGGGGTCCCG;SOR=0.592;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=194;TCF=80;TCR=114;TR=79;WE=120611723;WS=120611705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,55:0.32:174
chr1	120611758	rs61790276	G	A	1234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.024;NF=20;NR=36;PP=969;ReadPosRankSum=1.089;SC=GGGGAACCCCGGCGGTTGGCG;SOR=0.721;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=119;TCF=44;TCR=75;TR=56;WE=120611766;WS=120611748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,55:0.45:123
chr1	120611830	rs61790277	G	A	1047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.893;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.022;NF=20;NR=28;PP=732;ReadPosRankSum=0.303;SC=GAGTGGCCTCGCTCCGCGCCG;SOR=0.314;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=83;TCF=35;TCR=48;TR=48;WE=120611838;WS=120611820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,45:0.62:72
chr1	120611876	rs11801062	C	T	873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=2.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.15;MQRankSum=-3.586;QD=15.60;ReadPosRankSum=-2.081;SOR=0.434;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,38:0.68:56
chr1	120611964	rs11810554	G	C	728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.801;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.009;NF=16;NR=16;PP=387;ReadPosRankSum=0.908;SC=CGGGGGCCGCGCAGCACAGCC;SOR=0.792;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=85;TCF=46;TCR=39;TR=32;WE=120611972;WS=120611950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,37:0.45:83
chr1	120612002	.	CGG	C	2963	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;FR=0.5000;HP=5;HapScore=1;MGOF=48;MMLQ=25;MQ=43.07;NF=10;NR=17;PP=2963;QD=20;SC=CACAGCAGAGCGGGGCGCAGG;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=65;TCF=19;TCR=46;TR=27;WE=120612014;WS=120611992;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:38,27:0.42:65
chr1	120612006	rs4021006	G	A	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.32;MQRankSum=0.029;QD=5.40;ReadPosRankSum=0.407;SOR=0.647;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,29:0.33:89
chr1	120612029	.	T	TCGC	2763	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=34;MMLQ=25;MQ=42.79;NF=8;NR=21;PP=2763;QD=20;SC=ATCTTCTCGGTCGCCTCCTCC;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=56;TCF=14;TCR=42;TR=29;WE=120612053;WS=120612019;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:27,29:0.52:56
chr1	120612037	.	TCCTCCGCCG	T	328.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=2.635;ClippingRankSum=0.000;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.053;HP=4;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-3.983;NF=9;NR=21;PP=2974;ReadPosRankSum=2.603;SC=GGTCGCCTCCTCCTCCGCCGC;SOR=1.593;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=57;TCF=18;TCR=39;TR=30;WE=120612053;WS=120612019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,14:0.16:88
chr1	120612040	.	T	TCCTCCGCCG	372.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.790;ClippingRankSum=0.000;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=4.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.89;MQRankSum=-2.438;QD=5.11;ReadPosRankSum=1.071;SOR=0.529;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,14:0.19:73
chr1	120612154	rs56375229	C	G	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.93;MQRankSum=-3.208;QD=3.86;ReadPosRankSum=0.134;SOR=0.532;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,11:0.17:64
chr1	120612163	rs55899574	C	A	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=1.305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.65;MQRankSum=-3.075;QD=3.74;ReadPosRankSum=1.567;SOR=0.430;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,11:0.17:66
chr1	120612168	rs11801102	C	T	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=3.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.18;MQRankSum=1.221;QD=4.09;ReadPosRankSum=1.117;SOR=0.296;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,19:0.30:63
chr1	120612194	rs79247096	C	G	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.104;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.996;NF=2;NR=11;PP=186;ReadPosRankSum=-1.442;SC=CCCCGCGCCCCGAGTCCGCCG;SOR=2.088;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=51;TCF=20;TCR=31;TR=13;WE=120612202;WS=120612184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,15:0.28:53
chr1	120612265	rs375584849	A	G	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.560;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.641;NF=0;NR=4;PP=54;ReadPosRankSum=-1.495;SC=CGGGTGTGCAACGAAGCAGCC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=6;TCR=7;TR=4;WE=120612273;WS=120612255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr1	121115786	rs199825051	C	A	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=3.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.09;MQRankSum=-5.061;QD=7.54;ReadPosRankSum=-0.054;SOR=1.344;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,27:0.40:68
chr1	121116079	.	G	C	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.305;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.34;MQRankSum=-2.731;QD=5.98;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.883;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr1	121116121	rs201302047	T	C	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.304;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.31;MQRankSum=-2.920;QD=7.98;ReadPosRankSum=-2.214;SOR=1.229;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr1	121116678	rs61806689	C	T	6451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.91;MQRankSum=1.926;QD=44.19;ReadPosRankSum=-1.472;SOR=0.826;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,145:0.99:146
chr1	121116688	rs61806690	A	G	7391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=52.86;MQRankSum=1.832;QD=39.53;ReadPosRankSum=-0.945;SOR=0.734;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,186:0.99:187
chr1	121116933	rs79097880	T	C	1324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=36;PP=1062;SC=ATTAGGAAGATAGCAGCCATG;SOR=5.943;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=38;WE=121116941;WS=121116923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	121116953	rs78187610	A	G	857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=25;PP=701;SC=GATCCATCAGAGTGCTTGCCA;SOR=6.593;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=121116961;WS=121116943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	121124501	rs201210511	C	A	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.01;MQRankSum=0.189;QD=5.96;ReadPosRankSum=0.189;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
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chr1	144854491	rs2798856	T	G	2255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=0.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.55;MQRankSum=4.364;QD=19.96;ReadPosRankSum=-0.538;SOR=0.571;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,59:0.52:113
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chr1	144854597	rs3851873	T	C	4192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FS=2.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.97;MQRankSum=-3.713;QD=24.24;ReadPosRankSum=-0.607;SOR=0.554;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,107:0.62:173
chr1	144854597	.	TC	CT	1897	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MMLQ=17;MQ=57.46;NF=34;NR=31;PP=1897;QD=30.0071980748;SC=TCTGAAGGAGTCGCTCCTGTT;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=154;TCF=81;TCR=73;TR=65;WE=144854606;WS=144854571;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:89,65:0.42:154
chr1	144854598	rs3863691	C	T	2907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.95;MQRankSum=4.288;QD=17.00;ReadPosRankSum=-1.823;SOR=0.728;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,77:0.45:171
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chr1	144860026	rs1699819	G	C	1201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.188;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.298;NF=24;NR=28;PP=721;ReadPosRankSum=-0.638;SC=TGGTAACATTGACCCAAGTAT;SOR=0.320;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=95;TCF=38;TCR=57;TR=52;WE=144860034;WS=144860016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,57:0.56:101
chr1	144865850	rs1613780	G	T	3201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=353;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.811;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=80;PP=2075;ReadPosRankSum=1.860;SC=GTCTTCGATTGTCTTCCCTGA;SOR=0.628;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=330;TCF=157;TCR=173;TR=154;WE=144865858;WS=144865840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:189,161:0.46:350
chr1	144866509	rs924667	G	A	1324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.845;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=10;PP=858;ReadPosRankSum=-1.125;SC=CATAAGGAGCGAGTGAAGTAA;SOR=0.820;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=108;TCF=83;TCR=25;TR=51;WE=144866517;WS=144866499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,56:0.50:111
chr1	144866643	rs1620560	G	A	4428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=529;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.239;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=114;PP=2869;ReadPosRankSum=0.403;SC=TCCCGTAGGCGGTCATTGATG;SOR=0.919;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=499;TCF=241;TCR=258;TR=207;WE=144866651;WS=144866633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:308,221:0.42:529
chr1	144866662	rs1064044	T	C	4049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=505;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.127;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=104;PP=2654;ReadPosRankSum=1.502;SC=TGCAGATGGATTCCTCCAGGC;SOR=0.808;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=472;TCF=223;TCR=249;TR=190;WE=144866670;WS=144866652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:301,204:0.40:505
chr1	144868170	rs1628310	C	T	1753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.555;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=61;PP=1306;ReadPosRankSum=1.437;SC=ACAGTGCTGGCACCTGGGCAG;SOR=0.877;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=164;TCF=33;TCR=131;TR=75;WE=144868178;WS=144868160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,77:0.46:167
chr1	144868204	rs1747951	A	C	893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=6.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.059;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=32;PP=718;ReadPosRankSum=-1.356;SC=TAAGAAGCAAATGGGGTGTCA;SOR=2.200;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=69;TCF=2;TCR=67;TR=32;WE=144868212;WS=144868194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,33:0.47:70
chr1	144871738	rs1698605	C	A	601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.637;NF=13;NR=3;PP=294;ReadPosRankSum=1.434;SC=TCCTGCTGAGCCTCAGCCAAG;SOR=0.502;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=16;WE=144871746;WS=144871728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr1	144871755	rs1778159	A	T	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.966;NF=15;NR=4;PP=330;ReadPosRankSum=1.519;SC=CAAGGAGACCACTGGTGTCTC;SOR=0.458;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=42;TCF=34;TCR=8;TR=19;WE=144871763;WS=144871745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,19:0.44:43
chr1	144871782	rs1778158	A	G	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.308;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.861;NF=21;NR=12;PP=375;ReadPosRankSum=-0.180;SC=GCCAAGGAGGAGAGGGCCAGT;SOR=0.359;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=70;TCF=47;TCR=23;TR=33;WE=144871790;WS=144871772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,35:0.47:75
chr1	144871889	rs1698606	A	C	1574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.536;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=42;PP=1030;ReadPosRankSum=0.886;SC=AGCCTAGGAAAAGAAAGTTAA;SOR=0.748;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=172;TCF=82;TCR=90;TR=78;WE=144871897;WS=144871879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,83:0.44:189
chr1	144873818	rs1610566	A	G	954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.566;HP=4;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=4;PP=680;ReadPosRankSum=0.126;SC=TTGAAGAAAAATCAAACAGGC;SOR=0.355;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=51;TCF=46;TCR=5;TR=32;WE=144873826;WS=144873808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,37:0.63:59
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chr1	144873887	rs1699787	C	T	2807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.159;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=3.023;NF=78;NR=30;PP=2009;ReadPosRankSum=2.290;SC=CTGAATGGGCCTGGTTGGCCT;SOR=1.148;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=198;TCF=137;TCR=61;TR=108;WE=144873909;WS=144873877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,116:0.54:216
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chr1	144874070	rs1610565	C	T	1462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-5.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.334;NF=13;NR=47;PP=1043;ReadPosRankSum=-3.005;SC=TGATGTTCTACAGAGAACTGG;SOR=0.652;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=105;TCF=22;TCR=83;TR=60;WE=144874078;WS=144874060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,63:0.58:109
chr1	144874088	rs1419158	G	C	880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.987;NF=3;NR=29;PP=672;ReadPosRankSum=-0.657;SC=TGGAATCCTGGCCTTATGTTT;SOR=0.608;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=6;TCR=62;TR=32;WE=144874096;WS=144874078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,34:0.48:71
chr1	144874641	rs1610771	G	C	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.837;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=199;ReadPosRankSum=-0.273;SC=TCTCCACTCAGCCTAGACAAA;SOR=0.269;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=44;TCF=39;TCR=5;TR=15;WE=144874649;WS=144874631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,17:0.37:46
chr1	144874760	rs1610774	T	C	1904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=43;PP=1152;ReadPosRankSum=1.369;SC=AGGCTTCCAGTTCATCAGACA;SOR=0.703;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=241;TCF=131;TCR=110;TR=92;WE=144874768;WS=144874750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,101:0.39:260
chr1	144874950	rs1747957	G	A	642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.532;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=15;PP=310;ReadPosRankSum=0.695;SC=GGTCACCGAAGCCAACCTGTC;SOR=0.348;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=66;TCF=29;TCR=37;TR=30;WE=144874958;WS=144874940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,34:0.47:73
chr1	144877176	rs2762875	C	T	1614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.362;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-10.049;NF=51;NR=17;PP=1018;ReadPosRankSum=-1.366;SC=TTTTGCATGCCGGGTGATAAG;SOR=0.496;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=145;TCF=110;TCR=35;TR=68;WE=144877184;WS=144877166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,72:0.47:153
chr1	144877366	rs1807092	A	G	2609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.507;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.583;NF=31;NR=77;PP=1723;ReadPosRankSum=0.387;SC=CTATGAGAACATCTCTAAGGA;SOR=0.749;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=226;TCF=69;TCR=157;TR=108;WE=144877374;WS=144877356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,119:0.49:243
chr1	144877390	rs1807093	G	A	1844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.236;NF=14;NR=56;PP=1280;ReadPosRankSum=0.481;SC=CCCCCAAGCTGAATTCTGGCA;SOR=0.634;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=148;TCF=29;TCR=119;TR=70;WE=144877398;WS=144877380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,73:0.47:155
chr1	144879264	rs2798901	A	G	3036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=352;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=72;PP=1860;ReadPosRankSum=0.326;SC=CTCAGCTTCCAGGGTCTTTCC;SOR=0.683;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=324;TCF=169;TCR=155;TR=148;WE=144879272;WS=144879254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:191,160:0.46:351
chr1	144879375	rs1747958	T	C	2341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.549;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=47;PP=1517;ReadPosRankSum=0.129;SC=TTCAGATCTTTGATGTCCTTT;SOR=0.709;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=169;TCF=87;TCR=82;TR=97;WE=144879383;WS=144879365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,102:0.56:181
chr1	144881711	rs937714	T	G	662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=23;PP=468;ReadPosRankSum=-0.902;SC=CCTGTGGACTTTACTCAAGTC;SOR=0.722;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=43;TCF=6;TCR=37;TR=27;WE=144881719;WS=144881701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,27:0.64:42
chr1	144882581	rs1699836	A	G	1073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.744;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.454;NF=23;NR=21;PP=848;ReadPosRankSum=0.076;SC=TTATTCTTTCAATGGTGCTGG;SOR=0.446;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=46;TCR=41;TR=44;WE=144882589;WS=144882571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,44:0.48:91
chr1	144882823	rs1698647	C	T	5839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=514;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=113;NR=145;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.585;SC=TCAGACATTGCTTCTCCCATC;SOR=0.730;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=481;TCF=212;TCR=269;TR=258;WE=144882831;WS=144882813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:238,276:0.54:514
chr1	144882912	rs1698646	G	T	1302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.869;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=41;PP=915;ReadPosRankSum=-0.525;SC=TGAGGGCTAGGTCTGGTCCTC;SOR=0.551;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=105;TCF=23;TCR=82;TR=54;WE=144882920;WS=144882902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,56:0.51:110
chr1	144886063	rs1625285	T	C	685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=5;PP=446;ReadPosRankSum=-0.399;SC=CCTCATGACCTGCAAGCTCCC;SOR=0.802;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=53;TCR=11;TR=29;WE=144886071;WS=144886053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,31:0.44:71
chr1	144886092	rs1343472	C	T	988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.707;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=11;PP=655;ReadPosRankSum=0.184;SC=GGAAGAATGTCCTACCTGATG;SOR=1.059;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=95;TCF=69;TCR=26;TR=44;WE=144886100;WS=144886082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,47:0.44:106
chr1	144886197	rs1698624	A	T	2277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=51;PP=1447;ReadPosRankSum=1.256;SC=TGCTGGTGGAACTCAGCCCTC;SOR=0.696;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=225;TCF=118;TCR=107;TR=108;WE=144886205;WS=144886187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,115:0.47:246
chr1	144886409	rs1620507	A	C	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.119;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=311;ReadPosRankSum=-0.756;SC=AGGCAGTTTTAAATGAGAACA;SOR=0.120;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=15;WE=144886417;WS=144886399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr1	144890833	rs11447	T	C	679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.955;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.112;NF=22;NR=4;PP=539;ReadPosRankSum=0.456;SC=CTTGTTAACTTATAATTACAC;SOR=1.332;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=50;TCF=41;TCR=9;TR=26;WE=144890841;WS=144890823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,27:0.48:56
chr1	144892089	rs1614098	G	T	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.319;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.654;NF=20;NR=4;PP=389;ReadPosRankSum=1.511;SC=TCCCAAGCAGGTCCTCCGCCC;SOR=1.038;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=47;TCF=38;TCR=9;TR=24;WE=144892097;WS=144892079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,26:0.52:50
chr1	144892149	rs1698709	G	A	1962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.511;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.277;NF=55;NR=31;PP=1189;ReadPosRankSum=-1.253;SC=TCTGTGGTGCGTTTCAGTTAC;SOR=0.894;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=177;TCF=110;TCR=67;TR=86;WE=144892157;WS=144892139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,96:0.49:196
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chr1	144912153	rs1628172	A	G	543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=7;PP=353;SC=TTTCCAAGACAGCCAGTGGGG;SOR=1.127;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=10;TCR=7;TR=17;WE=144912161;WS=144912143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	144912233	rs1629011	C	T	973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.552;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.96;MQRankSum=0.938;NF=28;NR=17;PP=616;ReadPosRankSum=-1.311;SC=TAAATATTGGCGCAGGGCCTG;SOR=0.861;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=89;TCF=57;TCR=32;TR=45;WE=144912241;WS=144912223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,49:0.46:107
chr1	144915561	rs1778111	G	A	2107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.666;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.641;NF=38;NR=60;PP=1343;ReadPosRankSum=-2.263;SC=CTTTCCTTTCGCTGTAGACGC;SOR=0.814;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=210;TCF=86;TCR=124;TR=98;WE=144915569;WS=144915551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,103:0.47:221
chr1	144915624	rs1778112	G	A	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.389;NF=3;NR=18;PP=331;ReadPosRankSum=1.587;SC=TTGCAGAGCAGTGTTGCACTA;SOR=0.941;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=44;TCF=7;TCR=37;TR=21;WE=144915632;WS=144915614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,22:0.49:45
chr1	144916676	rs1698683	C	T	3859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=428;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=85;PP=2545;ReadPosRankSum=1.710;SC=TTCTTTCAGCCACTGGAGGTT;SOR=0.724;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=401;TCF=216;TCR=185;TR=182;WE=144916684;WS=144916666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:236,191:0.45:427
chr1	144916748	rs1747930	C	G	2888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.418;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=83;PP=1869;ReadPosRankSum=0.602;SC=ACTCTCCATACTCTACAGCCA;SOR=0.731;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=295;TCF=118;TCR=177;TR=136;WE=144916756;WS=144916738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,145:0.46:317
chr1	144917546	rs1698682	A	G	1596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.579;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=39;PP=1171;ReadPosRankSum=-1.137;SC=AGTCTCTCTAAGTCATGATCT;SOR=0.791;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=151;TCF=72;TCR=79;TR=71;WE=144917554;WS=144917536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,73:0.44:166
chr1	144917827	rs11295415	CA	C	879.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.238;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.100;NF=15;NR=7;PP=1412;ReadPosRankSum=0.993;SC=ACCTCCAGAGCAACAGCTTTA;SOR=0.467;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=43;TCF=29;TCR=14;TR=22;WE=144917849;WS=144917817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,29:0.56:52
chr1	144917841	rs1698681	T	C	895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.946;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.994;NF=25;NR=12;PP=1426;ReadPosRankSum=0.961;SC=AGCTTTATCATGTATTCGCTG;SOR=0.508;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=70;TCF=51;TCR=19;TR=37;WE=144917849;WS=144917817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,41:0.53:78
chr1	144918034	rs2655804	A	G	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.001;NF=2;NR=17;PP=386;ReadPosRankSum=0.794;SC=AGATGTGATCACTCTCCTCAA;SOR=1.105;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=37;TCF=3;TCR=34;TR=19;WE=144918042;WS=144918024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr1	144918957	rs1061308	T	A	3859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=402;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.518;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-6.282;NF=95;NR=85;PP=2267;ReadPosRankSum=-1.435;SC=ATTCTGCAATTCTTCTTGTAG;SOR=0.750;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=382;TCF=202;TCR=180;TR=180;WE=144918965;WS=144918947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:208,193:0.48:401
chr1	144919008	rs11296953	AC	A	4118.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.198;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.518;NF=9;NR=71;PP=2735;ReadPosRankSum=0.127;SC=TAAACATATTACCTTTTTAAA;SOR=0.531;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=176;TCF=16;TCR=160;TR=80;WE=144919016;WS=144918998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,140:0.48:290
chr1	144919094	rs1698680	C	T	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-5.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=416;ReadPosRankSum=1.392;SC=GAAAGAGGAGCAGAGGGTGCC;SOR=0.613;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=0;TCR=46;TR=22;WE=144919102;WS=144919084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,22:0.48:46
chr1	144922109	rs1343469	A	G	6906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=669;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=159;NR=139;PP=2962;ReadPosRankSum=1.172;SC=CACAAAGACTAAAAATAAAAT;SOR=0.697;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=620;TCF=330;TCR=290;TR=298;WE=144922117;WS=144922099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:349,318:0.48:667
chr1	144922171	rs1343470	C	T	7106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=739;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.516;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=164;NR=162;PP=2962;ReadPosRankSum=0.341;SC=TCCTGTCCTACGTGACCCTCA;SOR=0.723;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=686;TCF=347;TCR=339;TR=326;WE=144922179;WS=144922161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:387,348:0.47:735
chr1	144922523	rs2455994	C	T	5613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=608;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.525;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=155;NR=116;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.505;SC=TGTTACCTCACGTTCCCTGCT;SOR=0.769;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=569;TCF=321;TCR=248;TR=271;WE=144922531;WS=144922513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:322,282:0.47:604
chr1	144922583	rs1359300	G	A	6583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=715;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=154;NR=159;PP=2962;ReadPosRankSum=1.086;SC=CTTTTGAGACGACTCCTGAGC;SOR=0.656;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=657;TCF=326;TCR=331;TR=313;WE=144922591;WS=144922573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:379,331:0.47:710
chr1	144923823	rs11268079	TAGGAAGAAACGGCA	T	11861.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=344;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=132;PP=2957;SC=AGTCATGGGCTAGGAAGAAAC;SOR=1.618;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=176;TCF=8;TCR=168;TR=138;WE=144923844;WS=144923813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr1	144923887	rs12140706	T	A	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.97;ReadPosRankSum=1.541;SOR=0.644;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,23:0.19:121
chr1	144930571	rs2762866	C	A	1408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.532;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=29;PP=846;ReadPosRankSum=0.033;SC=CACTATGTAGCCGTTTTGTAT;SOR=0.646;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=191;TCF=115;TCR=76;TR=73;WE=144930579;WS=144930561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,77:0.38:204
chr1	144930596	rs2762867	C	A	1967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.912;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=37;PP=1313;ReadPosRankSum=-1.186;SC=GGACCCGGAGCGGCAAATAAT;SOR=0.893;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=224;TCF=129;TCR=95;TR=92;WE=144930604;WS=144930586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,97:0.40:242
chr1	144930940	rs2147326	T	C	4732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=398;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.368;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=116;PP=2962;ReadPosRankSum=1.335;SC=TCCTCATCTTTCTGTTGTGGA;SOR=0.727;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=377;TCF=164;TCR=213;TR=204;WE=144930948;WS=144930930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,214:0.54:396
chr1	144931330	rs2762745	C	T	6566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=676;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.522;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=146;NR=153;PP=2962;ReadPosRankSum=1.860;SC=TGGAGCAGTGCAGAGTATCTC;SOR=0.758;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=639;TCF=316;TCR=323;TR=299;WE=144931338;WS=144931320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:357,319:0.47:676
chr1	144931392	rs2798893	G	A	4232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=466;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.112;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=105;PP=2902;ReadPosRankSum=-0.405;SC=CTTGATCTCCGCGCCAGAGTC;SOR=0.817;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=446;TCF=213;TCR=233;TR=196;WE=144931400;WS=144931382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:264,202:0.43:466
chr1	144931727	rs2985363	G	A	938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-4.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=34;PP=694;ReadPosRankSum=1.200;SC=CTAGCGGGTGGCAAGCTTCCC;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=9;TCR=64;TR=39;WE=144931735;WS=144931717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,40:0.54:74
chr1	144946510	rs2488977	C	T	2409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=9;PP=1756;SC=TTTAAACTGCCAAGTTTGTAG;SOR=3.316;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=67;TCR=9;TR=76;WE=144946518;WS=144946500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr1	144946768	rs2762733	G	A	1664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.723;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=46;PP=988;ReadPosRankSum=-0.362;SC=AGTAAGGACAGTAATTATGAT;SOR=0.517;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=165;TCF=62;TCR=103;TR=76;WE=144946776;WS=144946758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,82:0.47:175
chr1	144946876	rs2798887	C	T	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.94;ReadPosRankSum=-1.808;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr1	144951973	rs77471170	T	C	5967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=409;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.571;NF=164;NR=109;PP=2962;ReadPosRankSum=0.371;SC=TAAGTGAATCTATGTCTCTTG;SOR=0.755;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=419;TCF=256;TCR=163;TR=273;WE=144951981;WS=144951963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,261:0.64:409
chr1	144952078	rs71220421	C	A	3157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=570;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.492;NF=93;NR=94;PP=2322;ReadPosRankSum=-0.156;SC=CGGTTGTGGGCCCATAAAGTC;SOR=0.722;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=599;TCF=298;TCR=301;TR=187;WE=144952086;WS=144952068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:390,180:0.32:570
chr1	144952207	rs3121544	C	T	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.21;MQRankSum=-7.189;QD=0.97;ReadPosRankSum=1.579;SOR=0.728;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:192,33:0.15:225
chr1	144952220	rs139438772	C	T	1036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FS=0.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.13;MQRankSum=-8.789;QD=5.67;ReadPosRankSum=0.958;SOR=0.613;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:125,58:0.32:183
chr1	144994658	rs1664022	C	A	4506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=545;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.373;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=135;NR=74;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.569;SC=GAAGTAGATGCGCAGCTTGAG;SOR=0.968;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=523;TCF=318;TCR=205;TR=209;WE=144994666;WS=144994648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:322,223:0.41:545
chr1	144994861	rs2442640	C	T	7305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=415;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.261;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=153;NR=134;PP=2962;ReadPosRankSum=0.461;SC=GCTGGGGCTACGGCGACATGG;SOR=0.782;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=399;TCF=209;TCR=190;TR=287;WE=144994869;WS=144994851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,301:0.73:415
chr1	144994902	rs4649499	G	A	1901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=651;ExcessHet=3.0103;FS=1.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.93;ReadPosRankSum=0.481;SOR=0.526;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:506,143:0.22:649
chr1	145014103	rs1778711	G	C	683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=1.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.24;ReadPosRankSum=-0.606;SOR=0.935;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,36:0.49:74
chr1	145014186	rs67011214	GA	G	1184.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FS=6.535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.06;MQRankSum=1.807;QD=6.93;ReadPosRankSum=-0.345;SOR=0.292;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:109,62:0.36:171
chr1	145014210	rs1778710	G	A	2082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=364;ExcessHet=3.0103;FS=14.205;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.03;MQRankSum=-0.560;QD=5.75;ReadPosRankSum=1.327;SOR=1.212;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:274,88:0.24:362
chr1	145014218	rs1778709	G	A	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=438;ExcessHet=3.0103;FS=4.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.02;MQRankSum=-0.358;QD=0.14;ReadPosRankSum=0.106;SOR=1.193;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:383,51:0.12:434
chr1	145014263	rs1778708	C	T	7174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=746;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.180;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.01;MQRankSum=-0.950;NF=198;NR=166;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.645;SC=CACAGCTGTTCGGAGGTTTAG;SOR=0.764;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=756;TCF=394;TCR=362;TR=364;WE=145014271;WS=145014253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:390,354:0.48:744
chr1	145014394	rs1107089	C	T	3861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.541;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=84;PP=1897;ReadPosRankSum=-1.821;SC=CTTAGGCACACGTTATATGGT;SOR=0.758;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=227;TCF=60;TCR=167;TR=112;WE=145014402;WS=145014384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,117:0.50:236
chr1	145014411	rs1778707	T	C	2894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.586;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=63;PP=1457;ReadPosRankSum=2.252;SC=TGGTGCATATTCTTTGCCCAC;SOR=0.871;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=163;TCF=30;TCR=133;TR=75;WE=145014419;WS=145014401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,78:0.46:171
chr1	145015877	rs77741369	G	T	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=930;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.11;ReadPosRankSum=-1.112;SOR=0.571;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:821,109:0.12:930
chr1	145016020	rs657162	T	G	17362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=627;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=217;NR=366;PP=2965;SC=AGCTGTCAATTAAACAGAACA;SOR=1.295;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=595;TCF=218;TCR=377;TR=583;WE=145016043;WS=145016010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,621:1.00:621
chr1	145016032	rs112952246	C	CA	1114.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=497;ExcessHet=3.0103;FS=6.405;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQRankSum=3.163;QD=2.72;ReadPosRankSum=-0.072;SOR=1.099;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:317,93:0.23:410
chr1	145016035	rs80291027	A	C	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=487;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQRankSum=-0.672;QD=0.36;ReadPosRankSum=2.536;SOR=0.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:383,58:0.13:441
chr1	145017851	rs2596284	T	C	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=1.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQRankSum=0.798;QD=6.49;ReadPosRankSum=0.188;SOR=0.498;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,33:0.38:88
chr1	145018023	rs2799192	G	T	1958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.488;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.32;MQRankSum=3.177;NF=37;NR=49;PP=1179;ReadPosRankSum=1.013;SC=AGAAAAAATTGGAAGACAGGG;SOR=0.737;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=208;TCF=92;TCR=116;TR=86;WE=145018031;WS=145018013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,97:0.42:233
chr1	145018102	.	G	GAGAA	1020.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.195;ClippingRankSum=0.000;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=2.326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.86;MQRankSum=3.355;QD=13.79;ReadPosRankSum=-0.127;SOR=1.092;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,30:0.41:74
chr1	145021024	rs1778692	G	C	1062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FS=6.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.42;ReadPosRankSum=2.269;SOR=1.375;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:153,43:0.22:196
chr1	145021034	rs674066	C	A	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FS=0.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.22;ReadPosRankSum=-0.699;SOR=0.563;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:220,29:0.12:249
chr1	145021089	rs1613515	G	A	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=723;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.14;ReadPosRankSum=-0.736;SOR=0.632;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:640,83:0.11:723
chr1	145021265	rs673110	A	G	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=370;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.76;ReadPosRankSum=0.768;SOR=0.680;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:321,49:0.13:370
chr1	145038736	rs1663882	C	G	971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.842;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.229;NF=38;NR=5;PP=670;ReadPosRankSum=-0.219;SC=GTGTTTGTACCGTCTTCACTC;SOR=1.544;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=108;TCF=91;TCR=17;TR=43;WE=145038744;WS=145038726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,47:0.41:116
chr1	145038815	rs2442664	A	G	13861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=528;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=290;NR=212;PP=2965;SC=AGATGGAAGCATATCTGTTAT;SOR=1.013;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=502;TCF=290;TCR=212;TR=502;WE=145038823;WS=145038805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,528:1.00:528
chr1	145038952	rs1663881	C	T	5089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=588;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.115;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=112;NR=146;PP=2962;ReadPosRankSum=2.748;SC=TAAAGTGTGTCTGGGGGAAGG;SOR=0.807;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=566;TCF=256;TCR=310;TR=258;WE=145038960;WS=145038941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:317,256:0.45:573
chr1	145039026	rs1663880	T	C	1245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.013;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=49;PP=784;ReadPosRankSum=-0.634;SC=AACTGTTGCCTGGCCTCAATA;SOR=0.991;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=184;TCF=51;TCR=133;TR=66;WE=145039034;WS=145039016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,68:0.35:195
chr1	145039562	rs1663878	C	T	4623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=466;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.593;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=149;NR=69;PP=2962;ReadPosRankSum=0.477;SC=AAGTCTGGAGCGCGGCGAGAA;SOR=0.934;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=458;TCF=300;TCR=158;TR=218;WE=145039570;WS=145039552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:248,218:0.47:466
chr1	145039821	rs7554603	C	A	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=6.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.09;ReadPosRankSum=-0.828;SOR=0.164;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,25:0.24:103
chr1	145074882	rs3845334	G	T	868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FS=0.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.48;ReadPosRankSum=1.278;SOR=0.797;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:143,51:0.26:194
chr1	145074919	rs2289798	A	G	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=388;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.29;ReadPosRankSum=-0.287;SOR=0.598;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:325,62:0.16:387
chr1	145074939	rs1663854	T	C	5403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=499;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.750;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=136;NR=110;PP=2962;ReadPosRankSum=0.277;SC=TTTATGTTACTGCTGCTACAC;SOR=0.556;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=478;TCF=273;TCR=205;TR=246;WE=145074947;WS=145074929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:240,258:0.52:498
chr1	145075208	rs6424335	T	A	695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.098;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=33;PP=557;ReadPosRankSum=-1.628;SC=CGATCCTTCATCTTTCATGCC;SOR=1.237;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=147;TCF=46;TCR=101;TR=44;WE=145075216;WS=145075198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,42:0.28:148
chr1	145075519	rs2596337	G	C	518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=401;ReadPosRankSum=-0.085;SC=TCTTCAGTCCGGGGCCCCAGC;SOR=0.722;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=25;WE=145075527;WS=145075509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,23:0.55:42
chr1	145075683	rs2762779	C	T	3834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.389;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=74;PP=2308;ReadPosRankSum=-1.000;SC=CCGCTGCTGCCCAGCTCCCGG;SOR=0.669;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=314;TCF=174;TCR=140;TR=164;WE=145075691;WS=145075673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,182:0.53:345
chr1	145075854	rs1663853	G	C	5790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=561;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.521;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=126;NR=142;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.507;SC=CGCTGTCTGTGCCCTTCATGG;SOR=0.752;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=541;TCF=260;TCR=281;TR=268;WE=145075862;WS=145075844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:279,279:0.50:558
chr1	145075903	rs2596336	C	T	1049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=387;ExcessHet=3.0103;FS=1.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.72;ReadPosRankSum=2.319;SOR=0.792;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:306,80:0.21:386
chr1	145075923	rs6656135	C	T	2169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.440;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=67;PP=1518;ReadPosRankSum=-0.577;SC=TTCCTGGTGTCTTCCGGGACT;SOR=0.742;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=297;TCF=119;TCR=178;TR=108;WE=145075931;WS=145075913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:196,113:0.37:309
chr1	145103844	rs2590144	G	A	1536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.506;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=24;PP=979;ReadPosRankSum=2.421;SC=TCATAATATGGTGCTTCTCAC;SOR=0.642;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=265;TCF=185;TCR=80;TR=82;WE=145103852;WS=145103834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:193,86:0.31:279
chr1	145103928	rs2596251	G	A	4151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=702;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=120;NR=106;PP=2581;ReadPosRankSum=-1.913;SC=ACCTTCAACAGTATCAGAGTC;SOR=0.735;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=663;TCF=341;TCR=322;TR=226;WE=145103936;WS=145103918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:462,237:0.34:699
chr1	145103947	rs2794062	T	C	3951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=725;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.557;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.01;MQRankSum=1.486;NF=109;NR=111;PP=2962;ReadPosRankSum=1.538;SC=TCAGGCTAAGTAACTCTTTCG;SOR=0.726;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=688;TCF=342;TCR=346;TR=220;WE=145103955;WS=145103937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:497,226:0.31:723
chr1	145104052	.	AGT	A	2146.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.256;ClippingRankSum=0.000;DP=246;ExcessHet=3.0103;FS=0.589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.04;MQRankSum=1.600;QD=9.21;ReadPosRankSum=-0.190;SOR=0.607;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:167,66:0.28:233
chr1	145104075	rs4145928	G	A	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FS=2.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.69;ReadPosRankSum=-0.422;SOR=1.017;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:134,20:0.13:154
chr1	145109430	rs2442653	A	T	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=5.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.84;ReadPosRankSum=1.104;SOR=1.648;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,23:0.21:107
chr1	145109456	rs7553975	C	T	950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FS=7.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.42;ReadPosRankSum=-1.308;SOR=0.313;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:160,55:0.26:215
chr1	145109468	rs2442652	A	G	9633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;NF=187;NR=60;PP=2962;SC=GCTTTAAACTATTGTCAGTGC;SOR=2.293;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=278;TCF=208;TCR=70;TR=247;WE=145109476;WS=145109446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,290:1.00:290
chr1	145109493	rs2442651	C	T	1926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=458;ExcessHet=3.0103;FS=1.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.21;ReadPosRankSum=-0.109;SOR=0.849;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:359,99:0.22:458
chr1	145109549	rs2596331	G	T	3035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=881;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.45;ReadPosRankSum=-0.504;SOR=0.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:673,207:0.24:880
chr1	145109583	rs2794053	C	A	10487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1044;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.092;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=245;NR=227;PP=2962;ReadPosRankSum=1.315;SC=TTCCCTAAGACGTTGGCTTTT;SOR=0.622;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=1016;TCF=540;TCR=476;TR=472;WE=145109591;WS=145109573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:550,493:0.47:1043
chr1	145109661	rs2655551	G	A	3800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1221;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.12;ReadPosRankSum=2.077;SOR=0.690;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:939,278:0.23:1217
chr1	145109809	rs2596327	T	A	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.32;ReadPosRankSum=-0.507;SOR=0.531;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,8:0.15:53
chr1	145112284	.	CCG	C	971.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.903;ClippingRankSum=0.000;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=4.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.72;ReadPosRankSum=-1.746;SOR=0.200;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,28:0.28:100
chr1	145112287	rs2794042	T	C	357.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=4.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.51;ReadPosRankSum=0.584;SOR=0.660;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,21:0.21:102
chr1	145112288	.	G	GCA	1001.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.000;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.19;ReadPosRankSum=-0.798;SOR=0.463;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,30:0.28:109
chr1	145112313	rs2596302	T	C	614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.89;ReadPosRankSum=1.764;SOR=0.672;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:173,40:0.19:213
chr1	145112414	rs2590131	T	C	6043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1195;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.06;ReadPosRankSum=-2.922;SOR=0.737;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:977,217:0.18:1194
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chr1	145273473	rs202082259	T	C	2758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=865;ExcessHet=3.0103;FS=0.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.79;MQRankSum=-6.085;QD=3.19;ReadPosRankSum=-0.754;SOR=0.628;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:669,196:0.23:865
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chr1	145281247	rs74721027	T	A	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.64;MQRankSum=-1.625;QD=2.58;ReadPosRankSum=-0.274;SOR=0.082;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,6:0.21:29
chr1	145281361	rs147539840	TC	T	2610.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=697;ExcessHet=3.0103;FS=1.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.66;MQRankSum=-17.073;QD=3.75;ReadPosRankSum=-0.818;SOR=0.931;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:569,128:0.18:697
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chr1	145281543	rs8002	C	T	3774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1036;ExcessHet=3.0103;FS=1.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.74;MQRankSum=-5.044;QD=3.64;ReadPosRankSum=-1.030;SOR=0.561;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:781,255:0.25:1036
chr1	145281613	rs12120756	C	A	4839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=719;ExcessHet=3.0103;FS=0.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.95;MQRankSum=-3.578;QD=6.73;ReadPosRankSum=0.124;SOR=0.614;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:548,171:0.24:719
chr1	145281633	rs28576333	C	A	4969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=648;ExcessHet=3.0103;FS=0.613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.52;MQRankSum=-3.823;QD=7.67;ReadPosRankSum=0.634;SOR=0.742;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:492,156:0.24:648
chr1	145281656	rs4649852	A	T	4404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.25;MQRankSum=-3.166;QD=7.80;ReadPosRankSum=-0.303;SOR=0.689;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:425,140:0.25:565
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chr1	145282093	rs199946317	G	A	1173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.679;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-12.341;NF=7;NR=46;PP=921;ReadPosRankSum=0.849;SC=CATTAACAGTGGGTGATCAAC;SOR=1.387;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=163;TCF=29;TCR=134;TR=53;WE=145282101;WS=145282083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,53:0.31:170
chr1	145456732	rs375314716	GA	G	405.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.23;MQRankSum=1.792;QD=4.06;ReadPosRankSum=1.340;SOR=0.535;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,39:0.39:100
chr1	145510376	rs147038428	A	G	125.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.82;QD=25.18;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	145517561	rs4471211	C	T	799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=24;PP=654;SC=AGTAATTAGGCGGACTGGAGA;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=145517569;WS=145517551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	145530254	rs74119688	C	T	2468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.203;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=48;PP=1500;ReadPosRankSum=0.994;SC=CTCAGTGTTCCCCTTCCTTCT;SOR=0.872;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=217;TCF=118;TCR=99;TR=109;WE=145530262;WS=145530244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,119:0.50:236
chr1	145531980	rs4384171	T	C	589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=0;PP=447;SC=GGCAAGATGCTTGACCTCAGG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=145531988;WS=145531970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	145532549	rs1328584	T	C	5375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=97;NR=81;PP=2965;SC=AGCGATTCTTTTTCAATGTCA;SOR=0.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=178;TCF=97;TCR=81;TR=178;WE=145532557;WS=145532539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr1	145532994	rs34834904	GT	G	5253.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=26;NR=44;PP=2281;SC=CTCCTGGAACGTTTTTTTTCT;SOR=0.941;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=76;TCF=31;TCR=45;TR=70;WE=145533009;WS=145532984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr1	145533001	rs35103913	T	C	5459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=68;NR=46;PP=2388;SC=AACGTTTTTTTTCTCTTTATT;SOR=1.016;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=68;TCR=46;TR=114;WE=145533009;WS=145532984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr1	145533175	rs11590105	T	C	3655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=68;PP=2299;SC=CCCCCCTGCATTGCAGAACCA;SOR=0.898;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=128;TCF=60;TCR=68;TR=128;WE=145533183;WS=145533165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr1	145533314	rs2274619	T	C	4023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=85;NR=47;PP=2482;SC=TGACCTCTGGTTACTTCCCTT;SOR=1.242;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=132;TCF=85;TCR=47;TR=132;WE=145533322;WS=145533304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr1	145535921	rs2274617	T	C	10321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=377;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=190;NR=165;PP=2965;SC=TAAAATGCATTACAGGCAACT;SOR=0.787;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=356;TCF=191;TCR=165;TR=355;WE=145535929;WS=145535911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,377:1.00:377
chr1	145536012	rs35515885	G	A	2812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.830;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=71;PP=1749;ReadPosRankSum=0.497;SC=GAGGTTCACCGCATCACTGGA;SOR=0.644;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=310;TCF=154;TCR=156;TR=137;WE=145536020;WS=145536002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:190,145:0.43:335
chr1	145538664	rs1109216	A	G	1950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=22;PP=1159;SC=TGCTGATCATATGCCCCTGTG;SOR=1.042;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=65;TCF=43;TCR=22;TR=64;WE=145538672;WS=145538654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr1	145555653	rs6424379	C	T	8621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=163;NR=135;PP=2965;SC=CACACTACCCCCATGCCCTAT;SOR=0.850;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=299;TCF=163;TCR=136;TR=298;WE=145555661;WS=145555643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,326:1.00:326
chr1	145556986	rs56110740	C	T	1133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=10;PP=707;SC=GCCTTCCCTCCCTGTGAGTCA;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=36;WE=145556994;WS=145556976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	145557298	.	G	C	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.279;ClippingRankSum=0.000;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.618;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=289;ReadPosRankSum=0.468;SC=ATGTTTGATAGTGCCTTTGAG;SOR=0.374;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=40;TCF=7;TCR=33;TR=18;WE=145557306;WS=145557288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
chr1	145558565	rs11801520	C	G	1122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=29;PP=828;SC=GGCTGCTGCTCTCTCTCAGCT;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=8;TCR=29;TR=37;WE=145558573;WS=145558555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	145558824	rs17352281	A	C	1795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.912;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=27;PP=1117;ReadPosRankSum=-0.793;SC=CTCTTCCTACAATCTGTGCAG;SOR=0.556;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=163;TCF=101;TCR=62;TR=73;WE=145558832;WS=145558814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,83:0.48:174
chr1	145559010	rs374630197	CGT	C	176.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FS=0.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.04;MQRankSum=2.769;QD=0.96;ReadPosRankSum=0.357;SOR=0.524;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:164,21:0.11:185
chr1	145562087	rs41315701	G	A	2904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.473;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=61;PP=1647;ReadPosRankSum=-0.553;SC=CCTGGGGCTCGAGGAGAGCCT;SOR=0.744;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=218;TCF=98;TCR=120;TR=112;WE=145562095;WS=145562077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,129:0.54:241
chr1	145562293	rs11579366	G	C	6827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=114;NR=107;PP=2965;SC=GCCCAAGCCAGAGGCGCAGGT;SOR=0.726;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=222;TCF=115;TCR=107;TR=221;WE=145562301;WS=145562283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr1	145585317	rs4128488	A	G	4571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=64;PP=2769;SC=TGGGGAAGTCAGGATTGAGAT;SOR=1.078;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=163;TCF=99;TCR=64;TR=163;WE=145585325;WS=145585307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr1	145588536	rs9286836	C	T	3333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=61;PP=2070;ReadPosRankSum=0.261;SC=TTTGCTTGCCCCTCCCTCAGC;SOR=0.675;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=263;TCF=151;TCR=112;TR=143;WE=145588544;WS=145588526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,152:0.52:290
chr1	145597116	rs9728311	C	T	1963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=46;PP=1230;SC=TTCCCAGTCACAGATGGGGTG;SOR=2.082;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=19;TCR=46;TR=65;WE=145597124;WS=145597106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr1	145597417	rs9728345	C	A	823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.139;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=14;PP=453;ReadPosRankSum=1.199;SC=GAAAAGTATGCCAAGGTGTGG;SOR=0.406;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=74;TCF=48;TCR=26;TR=37;WE=145597425;WS=145597407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,40:0.51:78
chr1	145598459	rs9729715	T	C	3045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=46;PP=2401;SC=AGGAGGATGATACTAGGTATC;SOR=0.963;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=52;TCR=46;TR=98;WE=145598467;WS=145598449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr1	145601861	rs9286837	G	A	4024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=85;PP=2708;SC=GGCTGAGGAAGAGATTTAGAG;SOR=1.695;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=43;TCR=85;TR=128;WE=145601869;WS=145601851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr1	145696694	rs2231375	G	A	1299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.183;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=39;PP=791;ReadPosRankSum=-0.383;SC=AGATGCGTGCGTGATAGGCCC;SOR=0.791;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=169;TCF=74;TCR=95;TR=67;WE=145696702;WS=145696684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,70:0.38:184
chr1	145826770	rs34955113	G	A	792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=5;PP=611;SC=CAGAGTGACTGGCGCAGGACG;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=25;WE=145826778;WS=145826760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	146514442	rs3753431	A	G	728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.998;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.028;NF=28;NR=7;PP=584;ReadPosRankSum=0.226;SC=AAGGCATAAAAAGAATACAAT;SOR=0.903;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=82;TCF=63;TCR=19;TR=35;WE=146514450;WS=146514432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,33:0.39:84
chr1	146514576	rs34026136	T	C	3657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.722;NF=75;NR=79;PP=2417;ReadPosRankSum=-1.192;SC=TAAGGCCTCATTGAGCCGACT;SOR=0.680;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=305;TCF=151;TCR=154;TR=154;WE=146514584;WS=146514566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,167:0.52:323
chr1	146633933	rs1036852	G	A	989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.820;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=17;PP=629;ReadPosRankSum=-1.249;SC=CACCTCTGTAGTAATCCTAAC;SOR=0.582;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=83;TCF=54;TCR=29;TR=45;WE=146633941;WS=146633923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,46:0.51:90
chr1	146643555	rs1348316	A	G	1519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.132;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=37;PP=861;ReadPosRankSum=-0.767;SC=AACTGCGGGCATGGGACGCTT;SOR=0.629;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=172;TCF=89;TCR=83;TR=78;WE=146643563;WS=146643545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,85:0.45:190
chr1	146656292	rs4950385	A	G	1712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=34;PP=1030;SC=CATACTATCAATGTGACTTAT;SOR=1.127;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=24;TCR=34;TR=58;WE=146656300;WS=146656282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	146672906	rs894469	C	T	8001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=136;NR=123;PP=2965;SC=CTTCCAGAAACGGAAAGTCAA;SOR=0.748;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=259;TCF=136;TCR=123;TR=259;WE=146672914;WS=146672896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,296:1.00:296
chr1	146673178	rs6683215	A	G	493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=14;PP=387;SC=AGGTAAACAGAATGCCAATAA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=146673186;WS=146673168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	146680262	rs2354433	A	G	1240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=9;PP=1001;SC=CCGCCTCCCAAAGTGCTGGGA;SOR=2.476;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=42;WE=146680270;WS=146680252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	146685121	rs1530336	G	A	548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=14;PP=345;SC=GATATCACAGGCACTATCACA;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=146685129;WS=146685111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	146687250	rs1822312	A	T	717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=1;PP=608;SC=AAGTAAACATAGGTAACTGAA;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=146687258;WS=146687240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	146714281	rs1890041	C	G	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.96;ReadPosRankSum=0.842;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
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chr1	146724093	rs1890037	A	G	1375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=19;PP=989;SC=GAATAAGTCTACTCAAAAAGT;SOR=0.836;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=20;TCR=19;TR=39;WE=146724101;WS=146724083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	146727388	rs17160051	G	T	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.952;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=182;ReadPosRankSum=-0.185;SC=ATCCTCCCATGAAATGTAATT;SOR=0.195;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=16;WE=146727396;WS=146727378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr1	146728162	rs61409326	T	TA	2897.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=16;NR=30;PP=2094;SC=CCAGCCTTTATACGTGTCTTC;SOR=1.040;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=47;TCF=16;TCR=31;TR=46;WE=146728170;WS=146728152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr1	146736092	rs4950315	C	T	867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=2.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.33;ReadPosRankSum=2.078;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,42:0.45:93
chr1	146739277	rs4143738	T	C	1394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.697;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=39;PP=904;ReadPosRankSum=1.280;SC=CTTACTTTGTTTACTTTGTTT;SOR=0.976;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=109;TCF=28;TCR=81;TR=50;WE=146739285;WS=146739267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,59:0.48:122
chr1	146740502	rs17356233	C	G	1776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.153;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=30;PP=1033;ReadPosRankSum=-0.038;SC=GGAAGCTTCACCTGCTGGATA;SOR=0.585;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=173;TCF=105;TCR=68;TR=73;WE=146740510;WS=146740492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,83:0.44:189
chr1	146740576	rs11576360	G	A	6709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=114;NR=114;PP=2965;SC=TGAGCTAATGGCTGTTAAAAC;SOR=0.766;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=228;TCF=114;TCR=114;TR=228;WE=146740584;WS=146740566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr1	146747153	rs6680778	T	C	3759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=82;PP=2540;SC=TTTTCTGCTTTCTTGGCTTGC;SOR=1.458;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=129;TCF=47;TCR=82;TR=129;WE=146747161;WS=146747143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr1	146747232	rs6672850	C	T	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=212;ReadPosRankSum=1.110;SC=CACTGGGAGCCGAGAGACCAC;SOR=0.260;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=12;WE=146747240;WS=146747222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr1	146748008	rs3831929	CAGCCA	C	909.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.274;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.868;NF=1;NR=13;PP=715;ReadPosRankSum=1.948;SC=CAGCACTCACCAGCCACTCTC;SOR=0.190;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=14;WE=146748020;WS=146747998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,24:0.60:40
chr1	146748072	rs7534963	A	G	408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=12;PP=340;SC=AGTGCTGGCTATGTGCAGGGT;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=146748080;WS=146748062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	146751782	rs7547279	A	C	4064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=63;PP=2375;ReadPosRankSum=-0.089;SC=TGGAGTCCATACTGGGAGAAA;SOR=0.788;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=133;TCF=69;TCR=64;TR=131;WE=146751790;WS=146751772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,153:0.99:155
chr1	146756222	rs146052781	AAAAC	A	1155.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.712;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.13;MQRankSum=1.048;NF=0;NR=19;PP=766;ReadPosRankSum=1.028;SC=CTCTCATTCTAAAACAAACAA;SOR=0.119;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=1;TCR=54;TR=19;WE=146756233;WS=146756212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,31:0.49:63
chr1	146759306	rs6703892	T	C	943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.666;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=15;PP=568;ReadPosRankSum=-0.815;SC=TTCTCTTTCTTCAAACAGATG;SOR=0.479;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=95;TCF=60;TCR=35;TR=42;WE=146759314;WS=146759296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,47:0.46:102
chr1	146759528	rs12755465	A	G	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=161;ReadPosRankSum=-0.172;SC=ACCAGTTGGGAACTGAATTCT;SOR=1.038;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=9;WE=146759536;WS=146759518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr1	146763089	rs10900333	G	A	1519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.106;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=26;PP=930;ReadPosRankSum=0.530;SC=AATTTGAAGAGGGCGAGATAC;SOR=0.884;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=137;TCF=81;TCR=56;TR=67;WE=146763097;WS=146763079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,71:0.49:144
chr1	146763415	rs3737854	T	C	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-4.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.128;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=126;ReadPosRankSum=0.773;SC=TTCTGGAGGCTGAAAGTCCAA;SOR=0.123;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=11;WE=146763423;WS=146763405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr1	146766069	rs71083827	C	CAT	5583.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=30;PP=2965;SC=TGAGTGAAGACGTGTTCTTCT;SOR=1.407;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=36;TCR=31;TR=65;WE=146766077;WS=146766059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr1	146767149	rs4950394	G	T	2134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=24;PP=1093;SC=TGTCCTTCATGCACAGTCTTC;SOR=0.995;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=45;TCR=25;TR=68;WE=146767157;WS=146767139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr1	146767320	rs6537	A	G	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=10;PP=207;ReadPosRankSum=1.034;SC=CTGAGTTTCAATTTGGTTCTC;SOR=0.507;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=22;TCF=8;TCR=14;TR=17;WE=146767328;WS=146767310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,19:0.83:23
chr1	147083744	rs677977	C	T	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.941;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=18;PP=450;ReadPosRankSum=0.491;SC=CATAGGCACACCATGAACACT;SOR=0.456;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=32;TCR=37;TR=34;WE=147083752;WS=147083734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,34:0.46:74
chr1	147085066	rs35669952	G	A	880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.986;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=26;PP=598;ReadPosRankSum=0.442;SC=TCTGACATTCGACAGAGGCCA;SOR=0.527;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=69;TCF=20;TCR=49;TR=37;WE=147085074;WS=147085056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,39:0.51:76
chr1	147086504	rs7512513	A	C	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=146;ReadPosRankSum=-0.412;SC=TTTTATTATCACCTAAAGTTA;SOR=0.784;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=11;WE=147086512;WS=147086494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
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chr1	147096794	rs867270	A	G	1832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=35;PP=1181;SC=TCCTTGTCAAAATGAGATTCC;SOR=1.647;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=18;TCR=35;TR=53;WE=147096802;WS=147096784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
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chr1	147131465	rs6674938	T	C	906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.757;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=7;PP=538;ReadPosRankSum=1.932;SC=TATCCTCATGTTCAAGACCTT;SOR=1.251;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=59;TCF=46;TCR=13;TR=32;WE=147131473;WS=147131455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,38:0.54:71
chr1	147131945	rs2275552	T	C	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=60;ReadPosRankSum=-0.741;SC=TTGAAATGTATAGCATTAACA;SOR=0.223;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=5;WE=147131953;WS=147131935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr1	147142296	rs2883202	T	C	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-1.285;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.522;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=28;ReadPosRankSum=0.640;SC=CATCCAGCCCTTCAGCAAGCA;SOR=0.204;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=5;WE=147142304;WS=147142286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr1	147230217	rs1692141	T	C	2981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=61;NR=27;PP=1773;SC=CACGTCTTTCTTCTCTGAGCC;SOR=1.544;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=61;TCR=27;TR=88;WE=147230225;WS=147230207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr1	147381397	.	GAA	G	283.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.228;ClippingRankSum=0.000;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.191;SOR=0.602;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr1	147381444	rs1532399	A	C	814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=35;PP=1059;SC=ATGAAAGGAAAAGGTGCCAAC;SOR=6.518;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=36;WE=147381452;WS=147381434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	147806559	rs10752439	C	T	5083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=101;NR=66;PP=2952;SC=ACTTAGCTTGCGTTAAGCAAG;SOR=1.131;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=168;TCF=101;TCR=67;TR=167;WE=147806567;WS=147806549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr1	147806874	rs2999607	G	C	909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.56;SOR=3.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	147806880	rs537191	T	C	775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=48.49;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	149676264	rs199745503	T	C	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FS=9.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.18;MQRankSum=-10.780;QD=1.57;ReadPosRankSum=-2.613;SOR=1.305;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:274,53:0.16:327
chr1	149676293	rs200272225	C	A	1287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=482;ExcessHet=3.0103;FS=1.382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.88;MQRankSum=-0.770;QD=2.67;ReadPosRankSum=0.654;SOR=0.540;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:378,104:0.22:482
chr1	149676401	rs146138154	A	G	2843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-12.218;NF=49;NR=98;PP=2354;ReadPosRankSum=-4.008;SC=GCAGACAACCAGAGGGAGAGC;SOR=1.259;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=283;TCF=105;TCR=178;TR=147;WE=149676409;WS=149676391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,127:0.49:261
chr1	149880650	rs35002905	C	T	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=228;ReadPosRankSum=0.526;SC=CTTCCCTCATCGCTTGTCCCC;SOR=1.127;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=11;WE=149880658;WS=149880645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr1	149884667	.	G	A	1298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=0.000;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.527;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=22;PP=830;ReadPosRankSum=-0.354;SC=AACATCTTGGGTGCAGGGTCC;SOR=0.852;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=102;TCF=64;TCR=38;TR=57;WE=149884675;WS=149884657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,61:0.54:114
chr1	149908108	rs1868992	A	G	1453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=39;PP=866;ReadPosRankSum=-3.502;SC=CCGGCATCCTATTTTCCTGGA;SOR=0.736;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=121;TCF=43;TCR=78;TR=59;WE=149908116;WS=149908098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,68:0.49:140
chr1	149908174	rs61807549	A	G	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.730;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=175;ReadPosRankSum=0.690;SC=AGGCTCCCCAACTCCCCAGAG;SOR=0.200;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=12;WE=149908182;WS=149908164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr1	150122425	.	C	CCCCGCG	2070.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.302;ClippingRankSum=0.000;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=0.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQRankSum=1.099;QD=18.01;ReadPosRankSum=2.489;SOR=0.672;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,53:0.46:115
chr1	150122493	rs4553237	T	C	2715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=43;NR=43;PP=1087;SC=TGCGCTTGCCTGCCCTGCGGC;SOR=0.916;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=43;TCR=43;TR=86;WE=150122501;WS=150122483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr1	150128425	rs1545762	C	T	1545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=41;PP=1132;SC=CCACCTTGGCCGCTGGAACAT;SOR=3.014;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=9;TCR=41;TR=50;WE=150128433;WS=150128415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	150129267	rs10749675	G	A	1047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=27;PP=735;SC=AACAGCTGTGGCCCACTGAAG;SOR=2.432;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=35;WE=150129275;WS=150129257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	150193165	rs58395667	G	A	611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.621;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=21;PP=414;ReadPosRankSum=1.364;SC=GGCCTAGCACGGTGGCTCACA;SOR=1.096;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=67;TCF=13;TCR=54;TR=25;WE=150193173;WS=150193155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,27:0.39:69
chr1	150199123	rs7522034	G	T	1228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=28;PP=762;ReadPosRankSum=-0.824;SC=CATCTTCATCGCCATCTTTAA;SOR=0.699;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=123;TCF=67;TCR=56;TR=58;WE=150199131;WS=150199113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,63:0.45:140
chr1	150201305	rs148013046	A	AT	356.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=2.313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.17;ReadPosRankSum=1.604;SOR=1.095;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,22:0.32:69
chr1	150234657	rs34714364	G	T	1736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=36;PP=971;ReadPosRankSum=-1.359;SC=GATCCCCAGGGGGGTCAGAAC;SOR=0.674;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=166;TCF=88;TCR=78;TR=79;WE=150234665;WS=150234647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,86:0.46:185
chr1	150246363	rs142617444	GGA	G	69.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.960;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=119;ReadPosRankSum=-0.047;SC=GACTATTGGAGGAGAGAGAGA;SOR=1.473;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=27;TCF=16;TCR=11;TR=5;WE=150246372;WS=150246353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,6:0.18:33
chr1	150249101	rs11205354	C	A	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.407;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=22;PP=497;ReadPosRankSum=-0.141;SC=ACGTGGAATACATAGAGGGCT;SOR=0.296;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=47;TCF=9;TCR=38;TR=28;WE=150249109;WS=150249091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,31:0.61:51
chr1	150255587	rs2147324	T	C	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.712;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=63;ReadPosRankSum=-0.712;SC=CCTTAAACTCTGGTTTCAAAC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=5;WE=150255595;WS=150255577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr1	150256442	.	T	TATTATTATTATTATTA	139.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQRankSum=-1.348;QD=8.73;ReadPosRankSum=0.398;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr1	150258838	rs1122967	C	G	2202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.093;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=34;PP=1368;ReadPosRankSum=-1.666;SC=TCTCCCCTCTCTAGCATTTTC;SOR=0.782;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=187;TCF=115;TCR=72;TR=89;WE=150258846;WS=150258828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,99:0.48:205
chr1	150281202	rs580060	A	C	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.516;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=288;ReadPosRankSum=2.370;SC=ACTGGGGAGGAAGAGGTTGCA;SOR=1.635;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=16;WE=150281210;WS=150281192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,17:0.39:44
chr1	150281343	rs71622690	C	T	2332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.995;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=54;PP=1245;ReadPosRankSum=-1.993;SC=CTTAATGCCACTGAACTATAC;SOR=0.787;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=223;TCF=107;TCR=116;TR=104;WE=150281351;WS=150281333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,117:0.49:239
chr1	150284311	rs11580234	C	T	3373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.950;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=74;PP=2037;ReadPosRankSum=-0.429;SC=ATCTTCAGTCCTATTGCCCAT;SOR=0.853;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=293;TCF=145;TCR=148;TR=143;WE=150284319;WS=150284301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,160:0.49:324
chr1	150298192	rs11205362	G	A	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=298;ReadPosRankSum=-1.363;SC=CCCTACCACCGCCTTTCTTCC;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=22;WE=150298200;WS=150298182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,22:0.50:44
chr1	150300727	rs834225	T	C	1768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=37;NR=21;PP=952;SC=TAATTCTTCCTTTCTCCCCAC;SOR=1.098;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=37;TCR=21;TR=58;WE=150300735;WS=150300717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr1	150307270	rs1260408	T	G	330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=1;PP=285;SC=TAACTCCTGGTCTCAAGTGAT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=150307278;WS=150307260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	150319081	rs16836143	T	A	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=256;ReadPosRankSum=-0.537;SC=TAGATAGTGTTCAGGAATTTT;SOR=0.776;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=16;WE=150319089;WS=150319071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr1	150321486	rs1625468	G	A	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.776;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=131;ReadPosRankSum=1.320;SC=GTCTAATTTGGGGAAAATAAA;SOR=1.589;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=10;WE=150321494;WS=150321476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr1	150325231	rs41300865	A	G	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=94;ReadPosRankSum=-0.349;SC=CACAAATGTTACTAGGTCTTC;SOR=0.293;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=7;WE=150325239;WS=150325221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr1	150337289	rs72696841	G	T	1577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.11;ReadPosRankSum=1.551;SOR=0.685;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,79:0.51:156
chr1	150389964	.	GA	G	879.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.504;ClippingRankSum=0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.359;NF=32;NR=1;PP=571;ReadPosRankSum=-0.094;SC=ATCCATGTAAGAAAAAAAAAA;SOR=4.407;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=33;WE=150389972;WS=150389954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,36:0.97:37
chr1	150413588	rs115258200	G	A	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=131;ReadPosRankSum=-1.366;SC=TTGTATAATAGTGAAAAATTA;SOR=0.446;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=11;WE=150413596;WS=150413578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr1	150415631	rs3862206	T	G	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.830;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=210;ReadPosRankSum=2.350;SC=TATCTTTAACTATAGAGCTAA;SOR=1.201;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=15;WE=150415639;WS=150415621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr1	150416913	rs16836940	A	G	567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=429;ReadPosRankSum=-0.245;SC=TCATTTTTCCAGTAATCATAC;SOR=0.616;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=23;WE=150416921;WS=150416903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,23:0.62:37
chr1	150429944	rs41273537	A	G	2871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.434;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=68;PP=1773;ReadPosRankSum=-1.750;SC=GTCACCAACCATGGAGAGTGA;SOR=0.734;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=252;TCF=125;TCR=127;TR=130;WE=150429952;WS=150429934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,141:0.51:279
chr1	150437215	rs66513313	A	G	830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.726;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=20;PP=437;ReadPosRankSum=1.226;SC=TAACTGACATATGCCAGAGGG;SOR=0.822;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=98;TCF=49;TCR=49;TR=38;WE=150437223;WS=150437205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,43:0.38:114
chr1	150445819	rs7002	A	G	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=98;ReadPosRankSum=1.053;SC=GATGGAAACCAAGGGAAAGGC;SOR=0.784;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=7;WE=150445827;WS=150445809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr1	150468842	rs1343965	A	G	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.532;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=261;ReadPosRankSum=-0.378;SC=TACTGGTGGGATTGTTGTCAA;SOR=0.368;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=18;WE=150468850;WS=150468832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr1	150470296	rs11588874	G	A	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.338;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=386;ReadPosRankSum=-0.492;SC=GGCCGGGCACGGTGGCTCACG;SOR=0.148;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=46;TCF=11;TCR=35;TR=25;WE=150470304;WS=150470286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,27:0.56:48
chr1	150470322	rs11590324	C	A	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.127;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=236;ReadPosRankSum=0.210;SC=AATCCCAACACTTTGGGAGGC;SOR=1.402;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=14;WE=150470330;WS=150470312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
chr1	150471848	rs34802685	A	AT	364.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=1;NR=8;PP=163;SC=GATACAAAGAATTTTTTTTTT;SOR=1.244;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=9;WE=150471856;WS=150471838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	150477061	rs3738487	C	T	2362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.034;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=53;PP=1442;ReadPosRankSum=0.712;SC=GTACACAATTCGTGATACTTC;SOR=0.607;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=203;TCF=99;TCR=104;TR=105;WE=150477069;WS=150477051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,111:0.50:221
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chr1	150483236	rs9661040	A	C	567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=1;PP=406;SC=TCTCATTTCCACTATATCCTC;SOR=3.500;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=150483244;WS=150483233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	150483355	rs3737240	C	T	1447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=23;PP=738;ReadPosRankSum=0.205;SC=ATTCCAGGAACGCCAGCTCCA;SOR=0.733;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=127;TCF=76;TCR=51;TR=61;WE=150483363;WS=150483345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,72:0.48:149
chr1	150483840	rs4970979	C	T	1040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=12;PP=905;SC=CAACCACTGTCTCTTCTTTAT;SOR=1.352;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=22;TCR=12;TR=34;WE=150483848;WS=150483830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	150484395	rs149815479	ACC	A	582.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=11;PP=347;SC=CCATCCATGTACCCCCCCTGC;SOR=3.126;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=12;WE=150484404;WS=150484385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	150484844	rs151102225	A	T	2500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.502;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=40;PP=1608;ReadPosRankSum=0.210;SC=GATACCCTTGACAAATACTGT;SOR=0.797;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=251;TCF=157;TCR=94;TR=114;WE=150484852;WS=150484834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,121:0.45:270
chr1	150484987	rs13294	G	A	3092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.785;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=72;PP=2038;ReadPosRankSum=0.670;SC=CATTGACATCGGTCGAGTCAC;SOR=0.958;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=248;TCF=116;TCR=132;TR=128;WE=150484995;WS=150484977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,141:0.52:271
chr1	150485566	rs12031973	T	G	826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.51;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	150485571	rs12031974	T	C	934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.64;SOR=2.400;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	150522471	rs10668635	C	CTG	4538.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=33;PP=2311;SC=GTGGAGGGCTCTGAGGGCCCG;SOR=1.014;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=57;TCF=23;TCR=34;TR=52;WE=150522479;WS=150522461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr1	150526044	rs41317515	G	C	3836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=393;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.177;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=83;PP=2410;ReadPosRankSum=0.164;SC=AGGGGAAGAGGCTATTCCGTC;SOR=0.631;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=361;TCF=179;TCR=182;TR=170;WE=150526052;WS=150526034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:205,188:0.48:393
chr1	150526406	rs6681639	C	T	1744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.276;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=37;PP=1116;ReadPosRankSum=1.090;SC=GCCAGCAGGGCCAAGGGCCTT;SOR=0.739;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=138;TCF=75;TCR=63;TR=72;WE=150526414;WS=150526396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,78:0.53:147
chr1	150528090	rs146160043	G	GACAC	1126.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.962;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.199;NF=3;NR=18;PP=1003;ReadPosRankSum=-0.284;SC=TATGCACACAGACACATGCCC;SOR=0.980;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=7;TCR=46;TR=21;WE=150528098;WS=150528080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,32:0.42:76
chr1	150528118	rs149100901	T	TACAC	738.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.163;HP=1;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=642;ReadPosRankSum=-0.233;SC=CATACACATGTACACACATAT;SOR=0.995;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=3;TCR=38;TR=18;WE=150528126;WS=150528108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,21:0.40:52
chr1	150528175	rs35233292	GCA	G	187.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.541;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.796;HP=2;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=158;ReadPosRankSum=1.339;SC=ACGCATATGCGCACAGACACA;SOR=0.129;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=5;WE=150528184;WS=150528165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr1	150528207	rs28557455	A	G	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.309;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.31;ReadPosRankSum=1.710;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr1	150528208	rs9728540	C	T	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.703;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.85;ReadPosRankSum=-1.292;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr1	150529322	rs34379037	T	TAA	2651.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=15;PP=2122;SC=CTGTTCCCTCTGGGCAGAGCT;SOR=1.823;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=55;TCF=37;TCR=18;TR=51;WE=150529330;WS=150529312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	150531008	rs10888382	T	C	6901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=144;NR=102;PP=2965;ReadPosRankSum=1.030;SC=TTGGGAACAATGGTGATGAAG;SOR=0.339;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=247;TCF=144;TCR=103;TR=246;WE=150531016;WS=150530998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,266:1.00:267
chr1	150531050	rs10749657	G	A	8000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=152;NR=123;PP=2965;SC=CAGGCCCCCCGCAGCCCCCCA;SOR=0.835;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=276;TCF=152;TCR=124;TR=275;WE=150531058;WS=150531040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,300:1.00:300
chr1	150531170	rs10749658	C	T	8094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=129;NR=139;PP=2965;SC=TGGGTAACCACGCCCAGGACA;SOR=0.836;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=268;TCF=129;TCR=139;TR=268;WE=150531178;WS=150531150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,298:1.00:298
chr1	150531380	rs11204664	T	C	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.984;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=129;ReadPosRankSum=-0.521;SC=GCCCCCCTACTGTCCCTTGTG;SOR=0.223;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=17;TCF=6;TCR=11;TR=10;WE=150531388;WS=150531370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr1	150550019	rs11428742	T	TA	1736.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=25;PP=1219;SC=TCTGCTCTCTTACAACACTAC;SOR=1.251;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=27;WE=150550027;WS=150550009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	150551295	rs35661734	T	C	2114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.243;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=38;PP=1432;ReadPosRankSum=1.542;SC=GAGTGAGGCCTTGGCGATTAA;SOR=0.854;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=208;TCF=121;TCR=87;TR=95;WE=150551303;WS=150551285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,103:0.44:232
chr1	150552042	rs16837903	G	A	1873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.287;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=56;PP=1248;ReadPosRankSum=-0.140;SC=GAGAAAACTGGGGAAGACCCC;SOR=1.066;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=182;TCF=65;TCR=117;TR=81;WE=150552050;WS=150552032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,88:0.44:198
chr1	150599849	rs78646592	C	T	3072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=343;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.396;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=60;PP=1858;ReadPosRankSum=2.032;SC=AACAACAAAACCTCCAGAAAA;SOR=0.738;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=305;TCF=164;TCR=141;TR=132;WE=150599857;WS=150599839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:194,148:0.43:342
chr1	150666797	rs7412396	G	A	260.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=235;SC=GAAGACTTCAGTGTGTGGGCC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=150666805;WS=150666787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	150671243	rs139837908	AC	A	2348.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=30;PP=1381;SC=AAGAATAGATACTTTCCTGTT;SOR=0.986;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=32;WE=150671251;WS=150671233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	150678910	rs1336899	T	C	416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=260;SC=CCTTTCAACCTTGAGTTTATG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=150678918;WS=150678900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	150679033	rs1336900	G	A	5340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=109;NR=76;PP=2961;SC=ACTTACACTTGTATAATGCTC;SOR=0.930;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=185;TCF=109;TCR=76;TR=185;WE=150679041;WS=150679023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr1	150679358	rs11586422	C	T	2665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=59;PP=1645;SC=TAAAAACACACGCAGATTGCA;SOR=1.634;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=31;TCR=59;TR=90;WE=150679366;WS=150679348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr1	150705755	rs1415148	G	A	418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=13;PP=317;SC=ATGAAATAAGGTAATAATTTC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=150705763;WS=150705745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	150727539	rs2230061	G	A	7160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=132;NR=117;PP=2965;SC=GGCAATATCCGATTAGGGTTT;SOR=0.708;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=249;TCF=132;TCR=117;TR=249;WE=150727547;WS=150727529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr1	150730184	rs11204722	C	A	212.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=173;SC=TTTCTGTACACGTTCTTACGT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=150730192;WS=150730174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	150730279	rs2275235	A	G	2032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=22;PP=1350;SC=GGGGAGACAGAAAGGAAATGA;SOR=1.488;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=48;TCR=22;TR=70;WE=150730287;WS=150730269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr1	150771703	rs10788796	T	C	8502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=152;NR=142;PP=2965;SC=CTGCCAAAACTGCATGGTTCA;SOR=0.706;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=294;TCF=152;TCR=142;TR=294;WE=150771711;WS=150771693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,322:1.00:322
chr1	150779755	rs6587522	C	T	7253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=129;NR=109;PP=2965;SC=TAAGTTTTGCCTCCTGATCAT;SOR=0.785;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=238;TCF=129;TCR=109;TR=238;WE=150779763;WS=150779745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,270:1.00:270
chr1	150789961	rs3894771	A	T	1209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=36;PP=927;SC=AATTTTTTTTAAAAAAGAATC;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=16;TCR=36;TR=52;WE=150789969;WS=150789951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	150801466	rs3738483	T	C	2209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=20;PP=1536;ReadPosRankSum=1.547;SC=CTCTTTTTCTTAACTGAGGTT;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=71;TCF=51;TCR=20;TR=70;WE=150801474;WS=150801456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,76:0.99:77
chr1	150804429	rs10305704	A	C	1319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=12.218;HP=3;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.163;NF=6;NR=46;PP=1372;ReadPosRankSum=1.700;SC=CTACCCGTAAAACTCAAAGGG;SOR=5.546;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=57;TCF=11;TCR=46;TR=52;WE=150804437;WS=150804419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,49:0.98:50
chr1	150808889	rs2228099	C	G	3773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=66;PP=2346;SC=CGGAGTCAGACACATACACCA;SOR=1.112;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=120;TCF=54;TCR=66;TR=120;WE=150808897;WS=150808879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr1	150811794	rs2256355	T	C	509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=2;PP=411;SC=TAGCCAAGGATTGAAATTCGT;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=150811802;WS=150811784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	150815054	rs149242771	GA	G	329.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.28;MQRankSum=0.942;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.189;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr1	150825511	rs10305673	C	T	977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=30;PP=851;SC=AATCCCAGCACTTTGGAAGGC;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=31;WE=150825519;WS=150825501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	150849071	rs34415707	AC	A	425.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;QD=25.04;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	150923099	rs17661357	T	C	2136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.598;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=43;PP=1361;ReadPosRankSum=0.192;SC=GCTATACCTGTCTGTCTCGAG;SOR=0.741;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=228;TCF=121;TCR=107;TR=101;WE=150923107;WS=150923089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,109:0.45:240
chr1	150923774	rs2124952	T	A	1768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.80;SOR=1.376;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	150933350	.	G	A	4172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.440;ClippingRankSum=0.000;DP=406;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.521;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=93;PP=2522;ReadPosRankSum=-1.152;SC=GAAAGAGAACGGACTCTCTGA;SOR=0.661;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=373;TCF=189;TCR=184;TR=180;WE=150933358;WS=150933340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:207,199:0.49:406
chr1	150935872	rs2280627	A	G	661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=4;PP=478;SC=GCTACTTAGGATCTTTGAGTT;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=150935880;WS=150935862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	150938571	rs8444	G	A	1519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=15;PP=1030;SC=CGCAGGGAGCGGGGTAGTTCC;SOR=1.835;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=35;TCR=15;TR=50;WE=150938579;WS=150938561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	150938616	rs267739	G	A	3540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=38;PP=1884;SC=GGCAGCTGGAGTAATGGTTCA;SOR=1.224;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=71;TCR=38;TR=109;WE=150938624;WS=150938606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr1	150939744	rs11204750	C	A	3188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=47;PP=2013;SC=CCTTCTTACCCCTTGCCTTTG;SOR=0.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=103;TCF=56;TCR=47;TR=102;WE=150939752;WS=150939734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr1	150940357	rs6656535	GC	TT	1366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=23;PP=1304;SC=TCTCCAGCTGGCAGAGGAAGC;SOR=3.126;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=26;WE=150940366;WS=150940347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	150941381	rs752376	C	T	808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=4;PP=627;SC=TGAGGGTAGGCTGGCATGCTT;SOR=3.258;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=27;WE=150941389;WS=150941371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	150944541	rs267737	A	G	300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=5;PP=255;SC=TGCCTGCAAAACAGGGGGTGG;SOR=0.693;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=11;TCF=6;TCR=5;TR=11;WE=150944549;WS=150944531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	150958977	rs2305814	T	C	2447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=48;PP=1671;SC=TGTCCTGTAATGGACAAGAGA;SOR=1.014;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=85;TCF=37;TCR=48;TR=85;WE=150958985;WS=150958967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr1	150960350	rs7532008	A	C	2683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=28;PP=1791;SC=CCTCCTAGGCACTGCAGCGGG;SOR=1.585;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=90;TCF=62;TCR=28;TR=89;WE=150960358;WS=150960340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr1	150969992	rs2925740	T	C	7274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=126;NR=105;PP=2965;SC=GGGGAAGGACTCTGAGAGAAG;SOR=0.818;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=231;TCF=126;TCR=105;TR=231;WE=150970000;WS=150969982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,270:1.00:270
chr1	150970577	rs2925741	G	T	2543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=22;PP=1525;SC=CTGCAGCTGCGTTTCTGGGGA;SOR=1.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=57;TCR=22;TR=79;WE=150970585;WS=150970567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr1	150972538	rs708909	G	A	1170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=14;NR=29;PP=732;SC=CTACAACCCTGTGATGAATGG;SOR=1.609;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=48;TCF=14;TCR=34;TR=43;WE=150972546;WS=150972528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	150974162	rs771204	G	A	1477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.388;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=27;PP=903;ReadPosRankSum=-0.307;SC=TAGCTCTGGAGCCCCTTGGGT;SOR=0.572;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=120;TCF=74;TCR=46;TR=67;WE=150974170;WS=150974151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,70:0.53:131
chr1	150975108	rs771205	T	C	2599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=40;PP=1546;SC=AAAAGGGACTTGGCTGAGGGG;SOR=0.714;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=48;TCR=40;TR=88;WE=150975116;WS=150975098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr1	150990466	rs71090118	C	CAT	5453.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=52;PP=2566;SC=CACTTACCAGCATTTAGCATT;SOR=1.426;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=2;TCR=58;TR=54;WE=150990474;WS=150990456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr1	150990825	rs3738480	A	G	536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=14;NR=1;PP=368;SC=CTGGGTACTTATGGCTTTGAG;SOR=3.383;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=150990833;WS=150990815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	150991285	rs6664220	A	G	543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=15;PP=416;SC=TTGGGAGGCCAAGGCGGGCGG;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=150991293;WS=150991275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	150997940	rs3738478	T	C	1470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=2;PP=1100;SC=TTCTGGTGGTTGTGTGTGAAG;SOR=5.330;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=40;TCF=38;TCR=2;TR=40;WE=150997948;WS=150997930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	150998221	rs55774303	AT	A	818.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=2.538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.48;MQRankSum=0.672;QD=18.19;ReadPosRankSum=-0.515;SOR=0.288;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,41:0.91:45
chr1	150999863	rs55717234	A	G	1015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.557;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=24;PP=569;ReadPosRankSum=0.125;SC=CATGTTATGCATGTGGCCTTG;SOR=0.401;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=104;TCF=46;TCR=58;TR=48;WE=150999871;WS=150999853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,53:0.46:116
chr1	151001583	rs6691701	G	A	318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=10;PP=237;SC=TCCCCTTTCTGCTTTTTCCCA;SOR=4.977;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=11;WE=151001591;WS=151001573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	151006539	rs3738476	C	A	6339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=113;NR=96;PP=2965;SC=TGATTTCTGGCCTGAGTCAAG;SOR=0.762;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=209;TCF=113;TCR=96;TR=209;WE=151006547;WS=151006529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr1	151017254	.	G	GT	54.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.121;ClippingRankSum=0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.22;ReadPosRankSum=1.659;SOR=0.293;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr1	151019180	rs6587553	A	G	3618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=64;PP=2150;SC=ACTGGATAAAAGGCCTTAGAA;SOR=1.288;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=43;TCR=64;TR=107;WE=151019188;WS=151019170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr1	151026815	rs2902810	C	T	8257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=127;NR=150;PP=2965;SC=AAAACAGATGCGAGACACCTT;SOR=0.927;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=277;TCF=127;TCR=150;TR=277;WE=151026823;WS=151026805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,311:1.00:311
chr1	151028234	rs11204767	G	T	3594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=73;PP=2135;SC=GCTTCACTCCGCTGTCTGAGG;SOR=1.389;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=43;TCR=73;TR=116;WE=151028242;WS=151028224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr1	151039609	rs3738481	A	G	836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=28;NR=15;PP=758;SC=CCTTTTTACCAGTATGTGGAG;SOR=1.002;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=28;TCR=15;TR=43;WE=151039617;WS=151039599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	151104598	rs4971005	A	G	258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=2;PP=146;SC=CCAGACCCAGAAGGCCCGAGG;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=151104606;WS=151104590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	151104950	rs10788800	G	A	3503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=64;NR=56;PP=2183;SC=GAGGCCGTGGGCCGCTCCCTT;SOR=0.824;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=121;TCF=64;TCR=57;TR=120;WE=151104958;WS=151104940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr1	151105824	rs4971006	C	G	1381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=17;PP=782;SC=GCGGGAGCCCCGGAGTCTCGA;SOR=0.773;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=25;TCR=17;TR=42;WE=151105832;WS=151105814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	151108137	rs4971007	T	G	10260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=378;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=195;NR=154;PP=2965;SC=CCACCTGGGGTCAGCACCTTC;SOR=0.915;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=349;TCF=195;TCR=154;TR=349;WE=151108145;WS=151108127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,376:1.00:376
chr1	151110832	rs72708441	G	A	2364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.502;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=39;PP=1326;ReadPosRankSum=1.311;SC=CATCAAAGGGGCATCGAGCCT;SOR=0.760;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=200;TCF=119;TCR=81;TR=100;WE=151110840;WS=151110822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,110:0.51:216
chr1	151114882	rs11464219	C	CT	3158.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=20;PP=2279;SC=TGTTAGCTTCCTGAGGCTGGG;SOR=1.582;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=33;TCR=21;TR=51;WE=151114890;WS=151114872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr1	151143166	rs6689566	C	T	766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.293;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=26;PP=575;ReadPosRankSum=0.588;SC=CAAAAGCTGACAGTCACCCTC;SOR=1.981;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=64;TCF=22;TCR=42;TR=34;WE=151143174;WS=151143156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,34:0.52:65
chr1	151146186	rs7552226	C	G	982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=20;PP=615;SC=TAGAATGCTGCGTCACGAAGG;SOR=1.819;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=30;WE=151146194;WS=151146176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	151146276	rs7521416	T	C	177.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=4;PP=123;SC=AGTGCGGGGCTGGGCGCTGTG;SOR=0.941;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=7;WE=151146284;WS=151146266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	151149601	rs6656261	A	G	377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=12;PP=318;SC=AGTGGCTCACACCTGTAATTC;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=151149609;WS=151149591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	151205303	rs7544947	A	G	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=224;ReadPosRankSum=-2.518;SC=CAGGCCAGGCACGGTGGCTCA;SOR=1.292;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=12;WE=151205311;WS=151205293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr1	151209063	rs12407426	C	T	3619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=377;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.211;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.185;NF=90;NR=73;PP=2281;ReadPosRankSum=0.696;SC=TAATGGATTACAGCCTCTTGA;SOR=0.934;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=336;TCF=183;TCR=153;TR=163;WE=151209071;WS=151209053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:196,179:0.48:375
chr1	151210789	rs7532935	C	T	3863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=403;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=88;PP=2493;ReadPosRankSum=-1.874;SC=ATACAGATAACCAGTCACGTT;SOR=0.686;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=372;TCF=190;TCR=182;TR=180;WE=151210797;WS=151210779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:213,190:0.47:403
chr1	151212399	rs141190258	C	CCTT	2873.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=16;PP=2177;SC=TGCCGGGCCTCCTAACTCTAT;SOR=2.231;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=32;TCR=18;TR=44;WE=151212407;WS=151212389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	151227371	rs3811405	A	G	324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=10;PP=243;SC=GGTGGGGGCCAGGGGCTCATG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=151227379;WS=151227361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	151237589	rs3216063	TC	T	1437.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.874;NF=11;NR=20;PP=672;ReadPosRankSum=-1.257;SC=GCGGGTCCTTTCCCCCCCTCG;SOR=0.770;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=63;TCF=24;TCR=39;TR=31;WE=151237597;WS=151237579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,59:0.58:102
chr1	151238222	rs2275900	G	A	628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=21;PP=450;ReadPosRankSum=-1.032;SC=TCCTTTTGCCGCCTCTTCCCT;SOR=0.506;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=42;TCF=6;TCR=36;TR=25;WE=151238230;WS=151238212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,26:0.59:44
chr1	151239051	rs7489	T	C	1308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=37;PP=742;ReadPosRankSum=-0.014;SC=TGGACACATCTGAGCCAGCCA;SOR=0.753;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=119;TCF=52;TCR=67;TR=62;WE=151239059;WS=151239041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,68:0.50:136
chr1	151239570	rs10888408	C	T	1277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.823;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=24;PP=897;ReadPosRankSum=-1.284;SC=CCTCTGGCAGCGGCATGCTCC;SOR=0.287;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=89;TCF=41;TCR=48;TR=51;WE=151239578;WS=151239560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,54:0.58:93
chr1	151254041	rs3811406	T	C	1041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=16;PP=480;ReadPosRankSum=1.683;SC=ATTCCTTCCATGCTCCAAATC;SOR=0.638;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=71;TCR=36;TR=47;WE=151254049;WS=151254031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,54:0.45:120
chr1	151262200	rs41270700	C	T	782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=17;PP=378;ReadPosRankSum=-3.166;SC=GGGAAAGGGGCCGGGGGTGCC;SOR=0.732;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=83;TCF=39;TCR=44;TR=31;WE=151262208;WS=151262190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,41:0.42:98
chr1	151263677	rs145032688	G	GACA	1584.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.831;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.503;NF=1;NR=26;PP=1252;ReadPosRankSum=0.481;SC=GGCTGTTGGGGACAACTAGTC;SOR=0.494;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=64;TCF=2;TCR=62;TR=27;WE=151263685;WS=151263667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,43:0.48:90
chr1	151263782	rs10788803	A	G	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.160;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=44;ReadPosRankSum=-1.732;SC=ATTAACATTAATATTTTGTTA;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=4;WE=151263790;WS=151263772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr1	151280400	rs1536617	C	G	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.873;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=125;ReadPosRankSum=-0.160;SC=TCCAGGAAAGCAGCTGCTTTT;SOR=0.368;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=8;WE=151280408;WS=151280390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr1	151288172	rs1056847	G	A	891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.788;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=16;PP=578;ReadPosRankSum=0.191;SC=ACAGCCCTGTGTCAGGGGCCG;SOR=0.582;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=83;TCF=51;TCR=32;TR=40;WE=151288180;WS=151288162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,44:0.47:94
chr1	151288391	rs1752379	A	G	4168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=78;PP=2495;SC=CATCACCCACATCCTCATCCA;SOR=1.045;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=62;TCR=78;TR=140;WE=151288399;WS=151288381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr1	151314379	rs1752387	T	C	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.807;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=61;ReadPosRankSum=-0.217;SC=CTAACCTATATATTCATCATA;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=5;WE=151314387;WS=151314375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr1	151316161	rs1752386	G	A	3834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=51;PP=2353;SC=ACACACCAGCGAGCCCCATGG;SOR=1.108;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=76;TCR=51;TR=126;WE=151316169;WS=151316151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr1	151337788	rs10788804	A	G	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=2.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.182;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=261;ReadPosRankSum=-0.539;SC=TATAAGGAGGACCATAGTGGG;SOR=1.161;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=53;TCF=25;TCR=28;TR=22;WE=151337796;WS=151337778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,31:0.40:77
chr1	151342263	rs41285000	C	T	2914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.887;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=71;PP=1756;ReadPosRankSum=-1.576;SC=AGCAATGGGGCGCATTGGCTG;SOR=0.749;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=266;TCF=124;TCR=142;TR=130;WE=151342271;WS=151342253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,142:0.48:293
chr1	151372138	rs7172	G	A	3111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=49;NR=55;PP=1688;SC=ACCGCATTCCGTCCACTCCCG;SOR=0.997;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=49;TCR=55;TR=104;WE=151372146;WS=151372128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr1	151372770	rs2495390	A	G	1125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=26;PP=851;SC=GGGGGACTGGAAGAGTTGTTG;SOR=1.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=10;TCR=26;TR=36;WE=151372778;WS=151372760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	151373200	rs2495391	T	C	4947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=69;PP=2833;SC=CTAAGATGAATCTAAGGTGAA;SOR=0.727;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=83;TCR=69;TR=152;WE=151373208;WS=151373190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr1	151377248	rs6667714	T	C	1317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.45;SOR=1.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	151379250	rs2274535	G	A	828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=2;PP=646;SC=ACTTCAGGTCGGAAGGTTTCT;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=25;WE=151379258;WS=151379240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	151380505	.	AAAG	A	151.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=68.66;QD=25.30;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	151380725	rs112072925	GA	G	58.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.11;MQRankSum=2.281;QD=0.83;ReadPosRankSum=0.883;SOR=0.798;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,15:0.21:71
chr1	151381320	rs3831142	GA	G	3742.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.37;QD=28.35;SOR=1.646;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr1	151384711	rs1887545	A	G	3679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=39;PP=2374;SC=TTCATTAGTAAATTCTTTGTA;SOR=1.384;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=78;TCR=39;TR=117;WE=151384719;WS=151384701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr1	151384733	rs3748550	G	A	4341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=90;NR=53;PP=2641;SC=TCTTCCTGAGGGCAAAACTGC;SOR=1.116;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=143;TCF=90;TCR=53;TR=143;WE=151384741;WS=151384723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr1	151395782	rs2274533	T	C	677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=2;PP=486;SC=GTTACCCACATGTAAATAAAT;SOR=3.442;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=151395790;WS=151395772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	151396037	rs2274534	A	C	4067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=86;PP=2210;SC=TCTGTAATAAAGCACAAAGAG;SOR=1.421;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=135;TCF=49;TCR=86;TR=135;WE=151396045;WS=151396027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr1	151400942	rs11204811	A	C	2445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=31;NR=53;PP=1587;SC=CACCTATAACACATTCTCCCT;SOR=1.460;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=31;TCR=53;TR=84;WE=151400950;WS=151400932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr1	151402045	rs6587577	A	G	3032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.086;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=28;PP=1819;ReadPosRankSum=-0.210;SC=TCTGGATGCCAGTTTATTCCA;SOR=1.607;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=103;TCF=73;TCR=30;TR=99;WE=151402053;WS=151402035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,117:0.98:120
chr1	151499635	rs2298168	C	T	991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=13;NR=18;PP=512;SC=GAACACCTGCCTTACCTCTCC;SOR=1.371;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=13;TCR=18;TR=31;WE=151499643;WS=151499625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	151501698	rs2096232	A	G	372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=13;NR=1;PP=290;SC=AGAAACTGCCAAACTACTTTC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=151501706;WS=151501688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	151501737	rs6678068	T	C	948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=7;PP=698;SC=TTTTATTCCCTTGGCAGTGTA;SOR=2.235;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=32;WE=151501745;WS=151501727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	151512802	rs16833376	G	T	2251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=25;PP=1412;SC=GCCAGACAGCGGGGTGGACAA;SOR=1.581;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=49;TCR=25;TR=74;WE=151512810;WS=151512792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr1	151518479	.	CT	C	88	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.8087;HP=21;HapScore=4;MGOF=18;MMLQ=16;MQ=58.27;NF=0;NR=8;PP=88;QD=11.5;SC=GCATTTTTTTCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=8;WE=151518487;WS=151518469;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:10,8:0.44:18
chr1	151535020	.	A	ATC	72	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=2;MMLQ=27;MQ=58.21;NF=2;NR=0;PP=72;QD=38.0;SC=TGTCTGAGCCATCTCTCTCTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=2;WE=151535029;WS=151535010;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:10,2:0.17:12
chr1	151538507	rs11405272	T	TC	183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.25;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	151538784	rs201554325	TTC	T	2213.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.9894;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=28;PP=1344;SC=GTTTATTGCTTTCTCTCTCTC;SOR=1.107;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=40;TCF=3;TCR=37;TR=30;WE=151538795;WS=151538774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	151542099	rs3748610	G	T	2805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=38;PP=1775;SC=AGAAACTTGAGGGCTTCCCCT;SOR=1.257;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=59;TCR=38;TR=97;WE=151542107;WS=151542089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr1	151546931	rs6660238	A	G	859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=22;PP=599;SC=AGGGGCCTGCAGGTGGATCGA;SOR=2.621;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=28;WE=151546939;WS=151546921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	151551320	rs3748608	G	A	2611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=46;NR=42;PP=1273;SC=GGGCTGGTTTGTAACCTGCCC;SOR=0.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=46;TCR=42;TR=88;WE=151551328;WS=151551310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr1	151552301	rs3833527	TG	T	569.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=12;PP=559;SC=GTCTTTGTCATGTCTTGCTGT;SOR=2.448;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=13;WE=151552309;WS=151552291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	151553918	rs10494267	C	T	260.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=184;SC=ACCCTTGCTACAAGACACATG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=151553926;WS=151553911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	151554503	rs1891592	T	C	2533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=21;PP=1544;SC=ACTCTGGCTGTGCCATAAGCC;SOR=1.890;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=60;TCR=21;TR=81;WE=151554511;WS=151554493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr1	151634512	rs3831367	A	AT	1918.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=38;NR=8;PP=1354;SC=AAATGTATTGATTTTTTTCCC;SOR=3.511;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=60;TCF=49;TCR=11;TR=46;WE=151634520;WS=151634502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr1	151634803	rs11808761	G	A	2484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=68;PP=1908;SC=AAGGAAGATAGATTAAATAAG;SOR=3.781;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=10;TCR=68;TR=78;WE=151634811;WS=151634793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr1	151675618	rs1308150	T	C	3640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=48;PP=2110;SC=AAACGCTGGGTACAGAAGGCC;SOR=0.990;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=70;TCR=48;TR=118;WE=151675626;WS=151675608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr1	151700189	rs72506285	C	CCTG	2395.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=35;PP=1621;SC=CAGGATTCTCCCAGAGTCTGG;SOR=2.564;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=43;TCF=2;TCR=41;TR=36;WE=151700197;WS=151700179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	151740479	rs1196457	C	A	203.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=193;SC=GACACACCCCCATCTGCCTGA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=151740487;WS=151740476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	151740666	rs2495397	T	C	4997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=76;PP=2891;SC=TCGACTCTTCTTGGATATCCC;SOR=0.715;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=164;TCF=88;TCR=76;TR=164;WE=151740674;WS=151740656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr1	151742550	.	GGAGAGA	G	3841.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.60;QD=46.29;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr1	151742553	.	GAGAGAGGGAGAGGGAGACCATGGGGAGAC	G	2975	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MMLQ=25;MQ=61.0;NF=17;NR=9;PP=2975;QD=20;SC=AGACCGTGGAGAGAGAGGGAG;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=21;TCR=11;TR=26;WE=151742596;WS=151742543;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,26:0.81:32
chr1	151742565	rs140076465	GGGAGACCATGGGGAGACGGAGAC	G	4843.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.03;QD=40.03;SOR=1.730;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr1	151742588	.	C	G	2195	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MMLQ=25;MQ=60.63;NF=61;NR=32;PP=2195;QD=23.9760345435;SC=GAGACGGAGACGGAGAGGGAG;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=96;TCF=64;TCR=32;TR=93;WE=151742596;WS=151742543;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,93:0.97:96
chr1	151747043	rs1123855	C	T	4846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=80;PP=2921;SC=GCAATGCCAGCGAGGCTCAAA;SOR=0.822;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=159;TCF=79;TCR=80;TR=159;WE=151747051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr1	151747733	rs1781421	C	T	822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=19;PP=646;SC=ACTTTAAAGACATTCCTTTGG;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=9;TCR=19;TR=28;WE=151747741;WS=151747723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	151747799	rs1781419	G	A	1138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=13;PP=823;SC=GGTTTCTGAGGAAGAAAAAGT;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=23;TCR=13;TR=36;WE=151747807;WS=151747789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	151748425	rs3923394	C	A	2266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=50;PP=1459;SC=TTGCTGCTTTCAGAAAGAACC;SOR=1.996;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=22;TCR=50;TR=72;WE=151748433;WS=151748415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr1	151751081	rs1996729	G	A	1395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=14;PP=912;SC=AGACTGAGAAGGCATTCCTTC;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=33;TCR=14;TR=47;WE=151751089;WS=151751071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	151754112	rs35077383	T	C	5613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=82;NR=99;PP=2965;SC=CACCCAAAGCTAGTATAACTA;SOR=1.096;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=182;TCF=82;TCR=100;TR=181;WE=151754120;WS=151754102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr1	151780177	rs3828057	C	T	1692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=35;PP=1017;SC=GAAGTCCGCTCATTCTTCCTG;SOR=1.270;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=23;TCR=35;TR=58;WE=151780185;WS=151780167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr1	151783688	rs939595	A	C	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=52;ReadPosRankSum=-0.060;SC=TCTAACAGAGAGTGGTACTCC;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=4;WE=151783696;WS=151783678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr1	151789588	rs151171878	C	CTGTGTGTG,CTGTGTG	853.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;NF=7,7;NR=2,2;PP=34,104;SC=TAAGGAGACACTGTGTGTGTG;SOR=2.494;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=9,9;WE=151789596;WS=151789578;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:18
chr1	151789609	rs56273334	C	T	814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.88;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	151789611	rs55841824	C	T	813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.83;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	151789647	rs12144914	T	G	2684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=31;PP=1778;SC=CACACATGCATGCATACACAT;SOR=1.390;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=100;TCF=69;TCR=31;TR=99;WE=151789655;WS=151789637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr1	151811226	rs6673556	G	A	450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=6;PP=188;SC=GAGGCAGCGAGCAGGTCGCGG;SOR=0.804;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=7;TCR=6;TR=13;WE=151811234;WS=151811216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	151820298	rs6587624	G	C	5554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=100;NR=86;PP=2965;SC=ATCTTGTCCAGTTCTACGTCC;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=186;TCF=100;TCR=86;TR=186;WE=151820306;WS=151820288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr1	151820324	rs6587625	T	C	5041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=85;PP=2965;SC=AACCAGAGAGTCCACGGGGAT;SOR=0.878;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=168;TCF=83;TCR=85;TR=168;WE=151820332;WS=151820314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr1	151825991	rs7556386	G	T	2786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=48;PP=1498;SC=CCTCAAGAAGGCCTCTGTGGT;SOR=1.146;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=39;TCR=48;TR=87;WE=151825999;WS=151825981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr1	151862661	rs1060870	G	A	5108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=107;NR=67;PP=2965;SC=GATTATAGGCGTGAGCCACAG;SOR=1.097;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=175;TCF=108;TCR=67;TR=174;WE=151862669;WS=151862651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr1	151867560	rs3762427	G	A	2547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=26;PP=1695;SC=TCCAGGAGCCGTCTTCACATT;SOR=1.382;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=54;TCR=26;TR=80;WE=151867568;WS=151867550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr1	151881885	rs3748805	A	C	1064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=24;PP=559;SC=TACTGGCGGCAGGCACAGAGC;SOR=2.419;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=31;WE=151881893;WS=151881875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	152005327	rs35135981	TA	T	3300.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=2.019;NF=1;NR=60;PP=2256;ReadPosRankSum=0.777;SC=ATTACACCTTTATATCGCATC;SOR=0.693;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=128;TCF=6;TCR=122;TR=61;WE=152005335;WS=152005317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,107:0.50:214
chr1	152009530	rs3811422	T	C	338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=6;NR=6;PP=241;SC=CTCAGACAGCTTCCGCGCCTG;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=13;TCF=7;TCR=6;TR=12;WE=152009538;WS=152009520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	152083325	rs11803731	A	T	4895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=67;PP=2965;SC=TGCTCCCGCAATGGGGGCCTG;SOR=0.923;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=163;TCF=96;TCR=67;TR=163;WE=152083333;WS=152083315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr1	152085505	rs2515663	A	C	5562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=93;NR=91;PP=2507;SC=ATTACTGTCAAGATCCAGAAG;SOR=0.874;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=184;TCF=93;TCR=91;TR=184;WE=152085513;WS=152085495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr1	152185655	.	C	A	4710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-3.324;ClippingRankSum=0.000;DP=498;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=102;NR=103;PP=2590;ReadPosRankSum=-0.201;SC=ATCATGGTTACTTCCTCCTTT;SOR=0.660;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=430;TCF=215;TCR=215;TR=205;WE=152185663;WS=152185645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:261,236:0.47:497
chr1	152185762	rs41266112	C	G	6305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.72;QD=42.04;SOR=1.457;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr1	152185768	rs41266114	T	G	5810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.46;QD=46.49;SOR=1.411;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr1	152185774	rs61814932	A	G	4921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.11;QD=48.25;SOR=1.519;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr1	152185780	rs41266116	G	A	4291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.90;QD=46.65;SOR=1.968;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr1	152185790	rs76102381	T	C	2356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.62;QD=53.56;SOR=2.007;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	152185792	rs74493243	G	A	1951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.60;QD=54.22;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	152185796	rs41266118	A	G	1546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.22;QD=53.34;SOR=2.546;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	152191709	rs6662450	C	G	7152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=111;NR=114;PP=2965;SC=GGAAGAACAACTTGTGCCAGA;SOR=0.865;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=225;TCF=111;TCR=114;TR=225;WE=152191717;WS=152191699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,263:1.00:263
chr1	152191879	rs10788828	G	A	6472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=117;NR=90;PP=2965;SC=AGCTAGATCCGTGTTGTTCAC;SOR=0.817;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=208;TCF=117;TCR=91;TR=207;WE=152191887;WS=152191869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr1	152192114	rs7520249	C	T	3279.81	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-3.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=22.275;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=11.698;NF=50;NR=73;PP=1952;ReadPosRankSum=4.717;SC=GGACCCATGTCGGCCGCGACT;SOR=0.701;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=145;TCF=69;TCR=76;TR=123;WE=152192122;WS=152192104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,134:0.90:149
chr1	152192163	rs61814943	G	T	478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=2.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.50;MQRankSum=-10.426;QD=3.89;ReadPosRankSum=2.907;SOR=0.459;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,36:0.29:123
chr1	152192293	rs7520375	C	T	1704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=27;PP=1164;SC=AGGAATGACCCGAGCTAGATC;SOR=0.865;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=34;TCR=27;TR=61;WE=152192301;WS=152192283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	152192631	rs6587647	C	T	9846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=360;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=179;NR=150;PP=2965;SC=CCGTGTTGTCCGTGGCCGGAG;SOR=0.829;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=329;TCF=179;TCR=150;TR=329;WE=152192641;WS=152192621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,359:1.00:359
chr1	152192687	rs6587648	T	C	10258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=383;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=176;NR=166;PP=2965;SC=AGAGGAATGCTCTGAGCTAGA;SOR=0.714;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=342;TCF=176;TCR=166;TR=342;WE=152192695;WS=152192677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,382:1.00:382
chr1	152192825	rs6666097	C	T	3830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=58;PP=2549;SC=CCCACGCTGGCCGTGGCCTGG;SOR=0.826;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=115;TCF=57;TCR=58;TR=114;WE=152192833;WS=152192815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr1	152192978	rs6587649	T	C	10882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=409;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=187;NR=180;PP=2965;SC=AGATCCATGTTGTCCCTGGCT;SOR=0.698;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=368;TCF=187;TCR=181;TR=367;WE=152192986;WS=152192968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,409:1.00:409
chr1	152193052	rs6587650	A	G	8044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=138;NR=146;PP=2965;SC=AGCCAGACTCATGTTGCCCAA;SOR=0.824;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=285;TCF=138;TCR=147;TR=284;WE=152193060;WS=152193042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,307:1.00:307
chr1	152193121	rs6587651	G	T	4056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=79;PP=2754;SC=AGTAACTTGAGCCAGACCCGT;SOR=1.203;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=135;TCF=55;TCR=80;TR=134;WE=152193129;WS=152193111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr1	152193286	rs7545406	G	T	12298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.87;QD=45.05;SOR=0.927;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,273:1.00:273
chr1	152193291	rs6587652	G	T	12420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.88;QD=43.89;SOR=0.953;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,283:1.00:283
chr1	152193544	rs7535536	A	G	13410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.41;SOR=0.790;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,302:1.00:302
chr1	152193547	rs6587653	G	A	13361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.84;SOR=0.820;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,298:1.00:298
chr1	152193851	rs11204937	C	T	7136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=115;NR=119;PP=2965;SC=GATTTTATTACGAGCCTGAAC;SOR=0.778;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=234;TCF=115;TCR=119;TR=234;WE=152193859;WS=152193841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr1	152193990	rs11204938	A	G	1530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=37;PP=1105;SC=AGGTACAAAGAGTAGCTCTGT;SOR=2.093;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=14;TCR=37;TR=51;WE=152193998;WS=152193980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	152195728	rs34061715	AT	A	2703.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=9.705;HP=11;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.242;NF=3;NR=73;PP=1282;ReadPosRankSum=-0.150;SC=GAGTTTAGGCATTTTTTTTTT;SOR=1.552;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=100;TCF=3;TCR=97;TR=76;WE=152195737;WS=152195718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,117:0.97:121
chr1	152283742	rs142660239	G	T	1482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.874;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=45;PP=987;ReadPosRankSum=0.464;SC=CTGCCCATGGGAGGCATCAGA;SOR=1.313;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=139;TCF=43;TCR=96;TR=60;WE=152283750;WS=152283732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,65:0.43:151
chr1	152384498	rs3215709	G	GT	146.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=5;NR=0;PP=131;SC=AATTCCCCAGGCAAGGCCTCT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=152384506;WS=152384497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	152384833	rs1923492	T	C	2175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=50;PP=1611;ReadPosRankSum=-0.881;SC=TGTTTTTAGTTTTCCTTTGTC;SOR=1.429;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=14;TCR=50;TR=64;WE=152384841;WS=152384823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,71:0.99:72
chr1	152484129	rs2105117	G	A	7759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=116;NR=156;PP=2965;SC=CCTCCCCAGTGTTCAGCCCCA;SOR=1.032;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=272;TCF=116;TCR=156;TR=272;WE=152484137;WS=152484119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,291:1.00:291
chr1	152484260	rs56169785	A	T	1213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.679;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=23;PP=564;ReadPosRankSum=0.330;SC=CCGACCTCAGAGTTCCAGCTG;SOR=0.790;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=55;TCR=47;TR=49;WE=152484268;WS=152484250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,61:0.51:119
chr1	152487979	rs2282296	C	T	2303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=38;NR=33;PP=1141;SC=CCTCCTGCTGCGGCTCCGGCA;SOR=0.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=39;TCR=33;TR=71;WE=152487987;WS=152487969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr1	152488063	rs1053588	C	T	2742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=50;NR=41;PP=1447;SC=GGAGACGCCGCCGACAGCGGA;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=50;TCR=41;TR=91;WE=152488071;WS=152488053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr1	152552285	rs512208	C	A	1407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.403;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.163;NF=38;NR=24;PP=779;ReadPosRankSum=-1.081;SC=AGGGCCACAGCCCCCAGAGCT;SOR=0.437;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=115;TCF=72;TCR=43;TR=62;WE=152552293;WS=152552275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,65:0.55:119
chr1	152552461	rs4845313	C	A	679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.860;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=17;PP=324;ReadPosRankSum=2.245;SC=ATTTGTTAGTCCAAAATCTAC;SOR=0.216;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=55;TCF=18;TCR=37;TR=29;WE=152552469;WS=152552451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,32:0.53:60
chr1	152659266	rs57291980	G	T	654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.507;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.864;NF=21;NR=2;PP=434;ReadPosRankSum=-0.910;SC=TCCTTGGTTTGAAATATTTAA;SOR=1.773;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=46;TCF=39;TCR=7;TR=23;WE=152659274;WS=152659256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,26:0.52:50
chr1	152659471	rs3737859	T	G	1499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.395;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=35;PP=779;ReadPosRankSum=1.754;SC=TGTGGTCCCATCTCTGGGGGC;SOR=0.393;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=113;TCF=45;TCR=68;TR=63;WE=152659479;WS=152659461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,72:0.55:130
chr1	152681543	rs1332496	T	C	6588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=125;NR=83;PP=2965;SC=TTATCGAAATTCCACCAAGAT;SOR=1.074;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=208;TCF=125;TCR=83;TR=208;WE=152681551;WS=152681533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr1	152681680	rs6143428	C	CAGCTCTGGGGGCTGCTGT	7080.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=36;PP=2900;SC=GCTGTGGCTCCAGCTCTGGGG;SOR=2.288;Source=Platypus;TCF=10;TR=40;WE=152681688;WS=152681670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr1	152692512	rs41268474	G	A	3452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.401;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=78;PP=2145;ReadPosRankSum=-0.207;SC=AGCTACTGCTGTCTGGCTCCC;SOR=0.657;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=298;TCF=148;TCR=150;TR=153;WE=152692520;WS=152692502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,163:0.50:325
chr1	152732106	rs17612167	A	T	2072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.846;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=33;PP=1271;ReadPosRankSum=1.157;SC=TGCCGCTCCAACAGTGCTGCG;SOR=0.864;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=170;TCF=103;TCR=67;TR=87;WE=152732114;WS=152732096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,95:0.51:186
chr1	152732174	rs944683	T	C	2970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.323;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=63;PP=1935;ReadPosRankSum=0.251;SC=CAAGTGGTGGTTCAAGCCCCT;SOR=0.784;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=291;TCF=153;TCR=138;TR=136;WE=152732182;WS=152732164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,147:0.46:322
chr1	152732436	rs4845480	G	C	1828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.151;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=38;PP=1276;ReadPosRankSum=-0.903;SC=AGTGCGAAGCGTCACAACCTG;SOR=0.824;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=172;TCF=87;TCR=85;TR=75;WE=152732444;WS=152732426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,79:0.42:187
chr1	152732567	rs16834461	G	A	2961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.976;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=55;PP=1879;ReadPosRankSum=1.142;SC=TATAGAGGGCGTCCTGCAGTG;SOR=0.826;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=269;TCF=153;TCR=116;TR=130;WE=152732575;WS=152732557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,139:0.49:286
chr1	152733301	rs4329520	T	A	4571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=423;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.924;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=98;PP=2888;ReadPosRankSum=0.615;SC=CCCAGAACCATGCATAAGTCT;SOR=0.614;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=380;TCF=196;TCR=184;TR=191;WE=152733309;WS=152733291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:207,215:0.51:422
chr1	152733923	.	C	T	684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.483;ClippingRankSum=0.000;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=22;PP=468;ReadPosRankSum=1.484;SC=CTCCCTATTACGAAGGTGATG;SOR=0.743;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=53;TCF=12;TCR=41;TR=28;WE=152733931;WS=152733913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,30:0.55:55
chr1	152749008	.	C	CCAGCTCTGGGGGCTGCTG	1165.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=0.000;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.995;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.638;NF=1;NR=8;PP=2181;ReadPosRankSum=0.562;SC=TGCTGTGGCTCCAGCTCTGGG;SOR=0.544;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=9;WE=152749016;WS=152748998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,28:0.47:59
chr1	152749091	rs41268480	C	T	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=0.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.504;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.856;NF=8;NR=13;PP=330;ReadPosRankSum=0.974;SC=CCACCACAGACGGCGTAGGTC;SOR=0.948;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=31;TCF=16;TCR=15;TR=21;WE=152749099;WS=152749081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,21:0.64:33
chr1	152759950	rs11205106	A	G	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.035;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.650;NF=13;NR=10;PP=224;ReadPosRankSum=-1.418;SC=CTCTGGGGGCAGCTGTGGCTC;SOR=0.769;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=66;TCF=35;TCR=31;TR=23;WE=152759958;WS=152759948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,24:0.32:75
chr1	152760075	.	A	G	37	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;FR=0.5000;HP=5;HapScore=2;MGOF=15;MMLQ=16;MQ=56.02;NF=1;NR=4;PP=37;QD=14.3542425094;SC=GCCAGCCCTCAGGGGGCTCCA;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=22;TCF=11;TCR=11;TR=5;WE=152760083;WS=152760065;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:17,5:0.23:22
chr1	152760106	rs56313719	G	A	394.96	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=2.936;NF=6;NR=9;PP=237;ReadPosRankSum=2.392;SC=AGGGGGCAGCGGCCAGCACTC;SOR=1.609;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=22;TCF=11;TCR=11;TR=15;WE=152760114;WS=152760096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,16:0.89:18
chr1	152770521	rs41268492	G	A	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.271;HP=2;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.539;NF=10;NR=9;PP=473;ReadPosRankSum=-0.358;SC=TCCCACCGTCGCAGACCCCAG;SOR=0.465;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=35;TCF=18;TCR=17;TR=19;WE=152770541;WS=152770511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,17:0.46:37
chr1	152770533	rs41268494	G	A	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.494;NF=7;NR=7;PP=473;ReadPosRankSum=1.220;SC=AGACCCCAGAGCTCTGACTGC;SOR=0.657;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=37;TCF=20;TCR=17;TR=14;WE=152770541;WS=152770511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,15:0.38:39
chr1	152770589	rs11485496	A	G	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.192;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.205;NF=13;NR=13;PP=316;ReadPosRankSum=0.993;SC=TGGGGGCAGCAGCCAGCACTC;SOR=1.022;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=39;TCF=21;TCR=18;TR=26;WE=152770597;WS=152770579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,26:0.59:44
chr1	152777574	rs1048534	G	A	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=3.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.56;ReadPosRankSum=0.393;SOR=1.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,14:0.40:35
chr1	152777908	rs2006940	C	T	833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-0.870;QD=10.29;ReadPosRankSum=-2.223;SOR=0.695;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,45:0.56:81
chr1	152944594	rs3170863	C	T	5192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=98;PP=2965;SC=CCTCCAAGAGCAAACAGAAGT;SOR=1.037;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=174;TCF=76;TCR=98;TR=174;WE=152944602;WS=152944584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr1	152957573	rs1611760	T	C	744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=0;PP=593;SC=AATGGGGGAGTTAAGGGAGAT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=152957581;WS=152957563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	152957832	rs1611762	C	A	2847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=44;PP=1784;SC=AGCCCTGCCACCCCAAGGTGC;SOR=0.775;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=49;TCR=45;TR=92;WE=152957840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr1	152957887	rs1611764	G	A	3543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=43;PP=2424;SC=CCAGCCCAAGGTTCCAGAGCC;SOR=1.426;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=78;TCR=44;TR=120;WE=152957895;WS=152957877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr1	152975495	rs2075739	G	A	5246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.680;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=68;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.467;SC=ATCCTTTGAAGCATGAGTTCT;SOR=0.723;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=172;TCF=103;TCR=69;TR=171;WE=152975503;WS=152975485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,195:0.99:196
chr1	152975658	rs67156933	AGAGCCAGGCTGTACCAAGGTCCCT	A	895.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=17;PP=482;SC=CAAAGATTCCAGAGCCAGGCT;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=1;TCR=55;TR=17;WE=152975689;WS=152975648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	152975763	rs1977734	C	A	1830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=26;NR=18;PP=734;SC=CTGAGCCAGGCTGTACCAAGG;SOR=0.818;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=44;TCF=26;TCR=18;TR=44;WE=152975771;WS=152975753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	152975829	rs1970328	A	G	4119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=48;PP=2401;SC=AGGTCCCTGAACCAGGCAGCA;SOR=1.055;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=75;TCR=48;TR=123;WE=152975837;WS=152975819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr1	152975941	rs1055935	C	G	5735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=95;PP=2965;SC=CTACACAAAGCTACCAGAGCC;SOR=0.721;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=195;TCF=99;TCR=96;TR=194;WE=152975949;WS=152975931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr1	153004721	rs1334848	A	T	669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=3;PP=465;SC=GAAAGAACATAGCTTTTTAAG;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=153004729;WS=153004711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	153004778	rs3820141	C	T	2307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=30;PP=1302;SC=TTATTCTCTGCTTAAATCATC;SOR=1.116;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=45;TCR=30;TR=75;WE=153004786;WS=153004768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr1	153004809	rs3181787	T	C	3257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=44;PP=1944;SC=CCAGGACCAGTCACTGTTGCA;SOR=0.963;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=63;TCR=44;TR=107;WE=153004817;WS=153004799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr1	153004848	rs3795381	T	C	7279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.22;SOR=0.810;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr1	153004853	rs3795382	C	T	7260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.74;SOR=0.819;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr1	153004983	rs12195	C	T	2697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=34;PP=2119;SC=CCAAAGTGCCCGAGCCCTGCC;SOR=1.067;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=55;TCR=34;TR=89;WE=153004991;WS=153004973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr1	153005156	rs2711	C	T	4607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=96;PP=2965;SC=TCCCATTCTGCGTATGAGTCC;SOR=1.172;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=159;TCF=63;TCR=96;TR=159;WE=153005164;WS=153005146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr1	153122310	rs510277	G	A	1162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=9;PP=716;SC=AGTCCTGGGAGTAAGAAGAGC;SOR=1.845;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=28;TCR=9;TR=37;WE=153122318;WS=153122300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	153190590	rs35221508	G	GT	783.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.498;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.16;MQRankSum=1.015;NF=8;NR=7;PP=318;ReadPosRankSum=0.025;SC=CGAATCTTGTGTTTTTTTCAG;SOR=0.345;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=44;TCF=26;TCR=18;TR=15;WE=153190598;WS=153190580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,34:0.51:67
chr1	153233488	rs150026164	C	CGGCGGT	977.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=61.81;MQRankSum=2.733;NF=0;NR=26;PP=1470;ReadPosRankSum=0.675;SC=AGACCTCTGGCGGCGGTGGCG;SOR=0.704;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=57;TCF=2;TCR=55;TR=26;WE=153233496;WS=153233478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,45:0.63:71
chr1	153233510	rs6661601	A	G	431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.33;MQRankSum=-1.095;QD=6.85;ReadPosRankSum=-1.389;SOR=0.624;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,24:0.38:63
chr1	153233701	rs1143390	A	C	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=3.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.27;ReadPosRankSum=-0.400;SOR=1.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,11:0.31:36
chr1	153233991	rs11275959	A	ACTCTGGCGGCGG	848.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=5;PP=1759;SC=GTCTGCGGCTACTCTGGCGGC;SOR=1.022;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=11;TCF=5;TCR=6;TR=7;WE=153233999;WS=153233981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	153234295	rs12043009	G	A	1235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.642;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=17;PP=735;ReadPosRankSum=-2.102;SC=GTGGCTCCGGGAGTGGCAAGG;SOR=0.504;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=104;TCF=72;TCR=32;TR=52;WE=153234317;WS=153234285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,57:0.52:110
chr1	153279462	rs66966700	TAAG	T	4960.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=29;PP=2948;SC=GCGCAGAAAATAAGAGCCACA;SOR=1.991;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=45;TCR=30;TR=74;WE=153279472;WS=153279452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr1	153283004	rs821423	C	T	7018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=133;NR=96;PP=2965;SC=TGAAAGCACTCGGATGGGTTT;SOR=0.971;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=229;TCF=133;TCR=96;TR=229;WE=153283012;WS=153282994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr1	153283179	rs3006473	A	G	1919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=41;PP=1191;SC=TGTGGACGGCAGCCCTGGAAG;SOR=1.931;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=19;TCR=41;TR=60;WE=153283187;WS=153283169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	153314153	rs3006448	C	A	1118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=9;PP=743;SC=CTCGCCTTTCCCAAGAAGTGG;SOR=1.788;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=28;TCR=9;TR=37;WE=153314161;WS=153314143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	153314347	rs3006449	C	T	392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=11;PP=295;SC=AGCCCCTGCACAGCTGATGGA;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=153314355;WS=153314337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	153315467	rs5777858	T	TAAG	1482.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=4;PP=1172;SC=ATGAGAAGGATAAGACAGCAG;SOR=3.193;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=24;WE=153315475;WS=153315457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	153315579	rs3014863	A	G	3893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=52;PP=2462;SC=TCTTAGTGCCAAAGAAGGCAA;SOR=1.037;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=82;TCR=52;TR=134;WE=153315587;WS=153315569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr1	153315784	rs1865234	T	C	1707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.404;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=35;PP=1125;ReadPosRankSum=1.818;SC=GGACTGAAGCTATGTTCACTA;SOR=1.894;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=52;TCF=17;TCR=35;TR=51;WE=153315792;WS=153315774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,58:0.98:59
chr1	153320334	rs3006457	T	C	4697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=64;PP=2916;SC=CTCGGTTGCTTTTTGGCCCAG;SOR=0.996;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=94;TCR=64;TR=158;WE=153320342;WS=153320324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr1	153320372	rs3006458	T	G	5241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=86;PP=2965;SC=CAGGCCTGGATACCCAGAGCA;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=178;TCF=92;TCR=86;TR=178;WE=153320380;WS=153320362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr1	153320581	rs3006459	T	C	463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=15;PP=421;SC=CAGCACCTGCTTCAGTCTTCT;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=153320589;WS=153320571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	153346263	rs4772	A	G	1347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=12;PP=897;SC=AAAGACCCTCATTGAGGACAT;SOR=2.348;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=37;TCR=12;TR=49;WE=153346271;WS=153346253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	153362507	rs3006488	A	G	608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=21;NR=1;PP=485;SC=AGAGAGAGGCATGAGGTATTG;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=153362515;WS=153362497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	153362799	rs80122691	A	T	883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.920;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=21;PP=752;ReadPosRankSum=-0.033;SC=GAAGGGTGGCAGGGAGGACCG;SOR=0.558;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=65;TCF=30;TCR=35;TR=39;WE=153362807;WS=153362789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,36:0.53:68
chr1	153363105	rs3795391	T	C	1835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=47;PP=1441;SC=ACGCAGAGGATTCATGCCCCA;SOR=2.722;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=14;TCR=47;TR=61;WE=153363113;WS=153363095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	153391729	rs3006414	G	A	2456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.651;NF=61;NR=45;PP=1469;ReadPosRankSum=-1.020;SC=AGACATAGCCGCAGACTACCA;SOR=0.668;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=213;TCF=126;TCR=87;TR=106;WE=153391737;WS=153391719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,115:0.49:234
chr1	153391786	rs3014813	T	C	3199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.410;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.605;NF=73;NR=63;PP=2001;ReadPosRankSum=0.753;SC=AAGCCAGTGATCCAGCCCCAC;SOR=0.707;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=280;TCF=148;TCR=132;TR=136;WE=153391794;WS=153391776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,152:0.49:311
chr1	153410822	rs10888561	C	A	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.785;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=335;ReadPosRankSum=-1.143;SC=TTTCAAAAAGCCTTCAGGAAA;SOR=1.369;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=56;TCF=19;TCR=37;TR=23;WE=153410830;WS=153410812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,27:0.43:63
chr1	153412392	rs3006428	T	G	5171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=63;NR=105;PP=2965;SC=AAAAGGCAAATAGGCAGGTGA;SOR=1.399;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=168;TCF=63;TCR=105;TR=168;WE=153412400;WS=153412382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr1	153431406	rs3014837	C	G	3438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=51;PP=2264;SC=GGCTTGGCTTCTCAATCTTGT;SOR=1.039;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=69;TCR=51;TR=120;WE=153431414;WS=153431396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr1	153587256	rs11548102	A	T	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=137;ReadPosRankSum=0.450;SC=TGCAGAGATGAGGACAGGTGC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=7;WE=153587264;WS=153587246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr1	153587308	rs11548104	C	T	816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.973;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=6;PP=597;ReadPosRankSum=-0.283;SC=CAAGTTTTATCTCCAGGCCCA;SOR=1.388;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=60;TCF=46;TCR=14;TR=32;WE=153587316;WS=153587298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,35:0.52:67
chr1	153588208	rs9792963	G	A	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=258;ReadPosRankSum=0.190;SC=TGCAGGGCAAGGCCAAGGTGA;SOR=0.569;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=16;WE=153588216;WS=153588198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr1	153588279	rs9792967	G	A	1711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.026;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=20;PP=1122;ReadPosRankSum=-1.650;SC=TGTGGGAGCAGAAAGGCCAGG;SOR=0.870;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=146;TCF=101;TCR=45;TR=70;WE=153588287;WS=153588269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,78:0.48:164
chr1	153588340	rs11548103	C	T	2913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.809;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=62;PP=1691;ReadPosRankSum=-1.412;SC=CCCATGGTGCCCACTGTGTCT;SOR=0.572;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=274;TCF=148;TCR=126;TR=129;WE=153588348;WS=153588330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,142:0.48:295
chr1	153600778	rs3806233	G	A	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.779;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=284;ReadPosRankSum=0.248;SC=TTCCAGCCCAGGAGACAGAGG;SOR=3.500;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=14;WE=153600786;WS=153600768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr1	153604029	rs1046379	C	T	6314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=106;PP=2965;SC=CCCTCAAGACCTTTGAGGAGG;SOR=0.809;Source=Platypus;TCF=106;WE=153604037;WS=153604019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr1	153604112	rs1046381	G	A	1945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=42;PP=1230;ReadPosRankSum=1.299;SC=CCACCCCCTTGCCTCTGACTC;SOR=0.712;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=169;TCF=83;TCR=86;TR=84;WE=153604120;WS=153604102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,91:0.51:177
chr1	153609039	rs4845557	T	C	1760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.307;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=29;PP=1161;ReadPosRankSum=0.707;SC=TACGTATTGTTCTTTGTAGAT;SOR=0.576;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=141;TCF=90;TCR=51;TR=77;WE=153609047;WS=153609029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,82:0.54:152
chr1	153635425	rs3795396	G	A	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.476;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=208;ReadPosRankSum=-0.781;SC=ACCATATTCCGCTTTGCCTGC;SOR=2.617;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=18;TCF=11;TCR=7;TR=11;WE=153635433;WS=153635418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr1	153636468	rs369602600	CTA	C	174.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-2.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=1.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.64;ReadPosRankSum=0.845;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
chr1	153636471	rs372540759	CT	C	174.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.572;SOR=0.297;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,10:0.33:30
chr1	153636472	.	T	C	68	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=7;NR=3;PP=68;QD=10.2771212547;SC=CTACTACTACTAGTAAATAAG;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=10;WE=153636480;WS=153636462;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:20,10:0.33:30
chr1	153636860	rs4351684	A	G	2300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=47;PP=1388;ReadPosRankSum=1.244;SC=AAATGGTTAGAGAGGGACTCA;SOR=0.662;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=216;TCF=122;TCR=94;TR=106;WE=153636868;WS=153636850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,113:0.50:228
chr1	153637617	rs3862047	G	A	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.028;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=8;PP=270;ReadPosRankSum=-0.727;SC=ATAGCAACAAGCTAAGTAAAC;SOR=0.965;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=68;TCF=45;TCR=23;TR=24;WE=153637625;WS=153637607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,23:0.33:69
chr1	153642372	rs79913857	G	T	851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.832;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=17;PP=346;ReadPosRankSum=-1.981;SC=ATGAAAAACAGCCAAATTATT;SOR=0.555;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=72;TCF=33;TCR=39;TR=34;WE=153642380;WS=153642362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,43:0.51:85
chr1	153642835	rs6663046	G	C	1751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=45;PP=1327;SC=ACTTACACTTGTCCCCATTCC;SOR=3.651;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=6;TCR=45;TR=51;WE=153642843;WS=153642825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	153656352	rs9662664	T	G	565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.374;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=334;ReadPosRankSum=0.409;SC=GGAGAACCAATAGCAGAGGAG;SOR=0.098;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=19;WE=153656360;WS=153656342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,23:0.77:30
chr1	153660514	rs11295572	AC	A	112.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=2;PP=86;ReadPosRankSum=0.306;SC=CAGCTCCTCTACCCCCCCAAT;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=5;WE=153660522;WS=153660504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr1	153661374	rs34402066	CG	C	2360.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=26;PP=1570;ReadPosRankSum=1.734;SC=CGGGCGCTCACGGTAGGCTGT;SOR=0.646;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=94;TCF=46;TCR=48;TR=45;WE=153661382;WS=153661364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,76:0.51:149
chr1	153662617	.	T	A	104	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;FR=0.5001;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=27;MQ=57.98;NF=4;NR=2;PP=104;QD=23.1285354245;SC=TCTCTCTCTCTCACACACACA;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=9;TCF=5;TCR=4;TR=6;WE=153662625;WS=153662607;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:3,6:0.67:9
chr1	153665919	rs5777879	T	TC	66.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.501;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=112;ReadPosRankSum=1.036;SC=CCTCCACACCTCCCTACCCTG;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=4;WE=153665927;WS=153665909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr1	153701188	rs150819290	G	A	1420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.640;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=27;PP=870;ReadPosRankSum=0.740;SC=GAGGAGGAGCGGGAGCAGGAG;SOR=0.801;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=131;TCF=75;TCR=56;TR=66;WE=153701196;WS=153701178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,70:0.51:136
chr1	153701376	rs12074957	G	C	275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=6;PP=173;SC=CAAGTTTTTTGTGAAGTAACA;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=153701384;WS=153701366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	153736280	rs41265187	G	A	1115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.426;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=23;PP=572;ReadPosRankSum=-0.023;SC=TTATGTCCCTGGGATTTCCTC;SOR=0.667;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=106;TCF=58;TCR=48;TR=46;WE=153736288;WS=153736270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,56:0.44:126
chr1	153743234	rs6675978	T	C	2060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.164;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=42;PP=1282;ReadPosRankSum=0.732;SC=TGGGGCTCTTTAGCCCTCAAT;SOR=0.603;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=169;TCF=94;TCR=75;TR=92;WE=153743242;WS=153743224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,100:0.56:179
chr1	153790501	rs4363451	C	T	871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=10;PP=360;ReadPosRankSum=-2.536;SC=TAAGATCCCACTATGGGTCAC;SOR=0.598;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=55;TCF=37;TCR=18;TR=34;WE=153790509;WS=153790491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,42:0.63:67
chr1	153790790	.	CTT	C	75	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5434;HP=22;HapScore=4;MGOF=14;MMLQ=16;MQ=59.35;NF=0;NR=4;PP=75;QD=19.5;SC=TCAAGGTTTTCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=153790799;WS=153790778;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:4,4:0.50:8
chr1	153800931	.	TACACACAC	T	553	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=553;QD=185.333333333;SC=CTCTCACACATACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=3;WE=153800946;WS=153800921;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,3:0.27:11
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chr1	153906397	rs11264621	A	G	1678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=41;PP=998;ReadPosRankSum=-0.678;SC=CTCTGCACCAACTTCCCCTTT;SOR=0.658;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=144;TCF=64;TCR=80;TR=75;WE=153906405;WS=153906387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,82:0.51:161
chr1	153907278	rs3835302	CCTGCTGCTG	C	1449.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=3.124;NF=16;NR=15;PP=2990;ReadPosRankSum=0.073;SC=GACACCTGCTCCTGCTGCTGC;SOR=0.682;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=37;TCR=33;TR=31;WE=153907294;WS=153907268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,42:0.47:89
chr1	153909069	rs1043608	G	C	1027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=13;PP=520;ReadPosRankSum=1.941;SC=GCACATGGTAGGCTGTGTGCA;SOR=0.730;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=68;TCF=44;TCR=24;TR=40;WE=153909077;WS=153909059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,47:0.61:77
chr1	153913699	rs1110165	T	G	916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.957;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=14;PP=484;ReadPosRankSum=-0.179;SC=CACAATCTGATCACATACCTG;SOR=0.420;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=72;TCF=48;TCR=24;TR=37;WE=153913707;WS=153913689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,44:0.52:84
chr1	153913770	rs2252508	A	G	1649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.951;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=32;PP=852;ReadPosRankSum=0.572;SC=AGACATCTGGAAGGGAAGAAG;SOR=0.531;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=139;TCF=80;TCR=59;TR=70;WE=153913778;WS=153913760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,85:0.52:163
chr1	153917369	rs6680140	C	T	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.96;ReadPosRankSum=-1.960;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr1	153920564	rs10559	A	G	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=11;PP=602;ReadPosRankSum=0.970;SC=GGCCAAGAAGAGGGATGGTGA;SOR=0.651;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=63;TCF=44;TCR=19;TR=34;WE=153920572;WS=153920554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,33:0.54:61
chr1	153921483	rs111395902	AC	A	1165.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.13;MQRankSum=0.976;NF=15;NR=24;PP=1277;ReadPosRankSum=2.126;SC=CCCACCACCCACCCCACCTAG;SOR=0.684;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=71;TCF=28;TCR=43;TR=39;WE=153921491;WS=153921473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,42:0.52:80
chr1	153926078	rs11264680	T	C	521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=276;ReadPosRankSum=-2.769;SC=CCCCAGGCCATCGTCCTGGGG;SOR=0.595;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=15;TCR=22;TR=22;WE=153926086;WS=153926068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,26:0.60:43
chr1	153941514	rs11264743	C	T	1937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.614;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=35;PP=1229;ReadPosRankSum=1.222;SC=CTCTGAGGACCCCTGCCATCC;SOR=0.736;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=135;TCF=72;TCR=63;TR=77;WE=153941522;WS=153941504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,85:0.57:148
chr1	153949135	.	TA	T	31.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.862;ClippingRankSum=0.000;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=1.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.28;ReadPosRankSum=0.611;SOR=0.702;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,17:0.15:113
chr1	153954674	rs10908578	T	C	1894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FS=1.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.89;ReadPosRankSum=0.989;SOR=0.598;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,96:0.55:174
chr1	153954778	.	A	AAC	90	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=11;MMLQ=19;MQ=60.0;NF=2;NR=4;PP=90;QD=15.5;SC=TATCAACACCAACACACACAC;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=6;WE=153954787;WS=153954768;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:17,6:0.26:23
chr1	153954816	.	TAC	T	49	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=2;NR=4;PP=49;QD=10.0;SC=CACACATACATACACACACAC;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=6;WE=153954825;WS=153954806;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr1	153955601	rs370008084	CA	C	74.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=2.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.59;ReadPosRankSum=3.172;SOR=0.420;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:107,20:0.16:127
chr1	153964396	rs34521811	C	CAA	3350.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.534;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=18;PP=1960;ReadPosRankSum=-1.529;SC=AGGAAGTAACCAGTGATACAA;SOR=0.760;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=128;TCF=64;TCR=64;TR=45;WE=153964404;WS=153964386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,86:0.41:212
chr1	153974621	rs6701341	C	T	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=4.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.203;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=241;ReadPosRankSum=-0.102;SC=TTGGCCACTACGAGGAGGATG;SOR=1.885;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=12;WE=153974629;WS=153974611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr1	153994647	rs11264875	C	T	812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.882;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=15;PP=457;ReadPosRankSum=0.838;SC=ATATCTCCAACAAAGGTAAGC;SOR=0.293;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=75;TCF=52;TCR=23;TR=36;WE=153994655;WS=153994637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,40:0.48:84
chr1	154027381	rs3834774	AT	A	488.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.89;ReadPosRankSum=-0.189;SOR=0.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,31:0.56:55
chr1	154029450	rs11264964	G	C	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.317;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=19;PP=502;ReadPosRankSum=1.357;SC=ATTTTCAGGTGAGAAAGATTT;SOR=0.252;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=52;TCF=18;TCR=34;TR=32;WE=154029458;WS=154029440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,32:0.62:52
chr1	154061855	rs2066135	T	G	3113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=58;NR=47;PP=1831;SC=AAGCACGGAATATAAAAGTGC;SOR=0.728;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=58;TCR=47;TR=105;WE=154061863;WS=154061845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr1	154076366	rs7521047	T	C	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.235;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=84;ReadPosRankSum=-1.054;SC=TAGACTATAATTGGTAGTTTC;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=6;WE=154076374;WS=154076360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr1	154108387	rs3001361	G	A	5504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=106;PP=2965;SC=AATGAGACCCGTTAAGTGCAA;SOR=1.162;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=184;TCF=78;TCR=106;TR=184;WE=154108395;WS=154108377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr1	154112169	.	A	C	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.642;ClippingRankSum=0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.98;ReadPosRankSum=2.119;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,3:0.23:13
chr1	154178185	rs370938534	CT	C	102.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=6.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.05;ReadPosRankSum=2.807;SOR=1.811;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,12:0.24:50
chr1	154186918	rs12408458	G	C	1060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.294;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=20;PP=713;ReadPosRankSum=-0.293;SC=AGCATTCCAAGAGCTTGCCAC;SOR=0.837;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=138;TCF=81;TCR=57;TR=52;WE=154186926;WS=154186908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,58:0.36:161
chr1	154192143	rs9803862	G	A	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=275;ReadPosRankSum=-0.423;SC=GCACTGAGCAGGTAAGCCAAG;SOR=1.284;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=14;WE=154192151;WS=154192133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr1	154207834	.	AT	A	80.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.399;ClippingRankSum=0.000;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=8.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.97;ReadPosRankSum=1.793;SOR=2.194;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,10:0.24:41
chr1	154208877	rs3762339	A	G	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=149;ReadPosRankSum=1.575;SC=GTTTTGCTCTATTGCCTAGGC;SOR=1.426;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=9;WE=154208885;WS=154208867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr1	154218550	.	CT	C	65	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=65;QD=33.0;SC=CATTTCAAGGCTTTTGTGTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=3;WE=154218558;WS=154218545;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:2,3:0.60:5
chr1	154218639	rs4040743	TTCAG	T	924.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=2.185;NF=2;NR=10;PP=433;ReadPosRankSum=-0.873;SC=TGTTAGCGTGTTCAGTCATTC;SOR=0.650;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=12;WE=154218650;WS=154218629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,27:0.47:57
chr1	154227239	rs1194604	C	A	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.49;BaseQRankSum=-1.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=294;ReadPosRankSum=-0.613;SC=AATAAAGCTGCATCAGTGCTA;SOR=0.602;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=12;WE=154227247;WS=154227229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr1	154227292	.	G	GTT	71.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.59;ReadPosRankSum=-0.083;SOR=0.197;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr1	154228287	rs1194603	T	C	1614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=45;PP=847;ReadPosRankSum=-0.247;SC=ACTGTCCAACTGTAAGATTGT;SOR=0.652;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=150;TCF=56;TCR=94;TR=73;WE=154228295;WS=154228277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,81:0.49:167
chr1	154243115	rs1044013	C	T	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=132;ReadPosRankSum=1.742;SC=GACCCCCAAACATATATCAGC;SOR=0.818;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=9;WE=154243123;WS=154243105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr1	154285078	rs11581043	T	G	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-1.096;NF=18;NR=20;PP=408;ReadPosRankSum=-2.225;SC=AAGAAGGGGGTTGGGCAAAAG;SOR=0.689;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=83;TCF=37;TCR=46;TR=38;WE=154285086;WS=154285068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,40:0.44:90
chr1	154294560	rs41308403	C	T	1523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.298;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.208;NF=44;NR=27;PP=809;ReadPosRankSum=1.012;SC=GTCTGGTCATCAGAGCACGTG;SOR=1.037;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=168;TCF=97;TCR=71;TR=71;WE=154294568;WS=154294550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,78:0.42:187
chr1	154294656	rs1194607	T	C	1098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.039;NF=21;NR=31;PP=764;ReadPosRankSum=-0.086;SC=TTGAACAGTGTCCCAGACTGA;SOR=0.678;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=95;TCF=39;TCR=56;TR=52;WE=154294664;WS=154294646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,53:0.51:104
chr1	154296076	rs1194610	T	C	774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.812;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=10;PP=381;ReadPosRankSum=-1.092;SC=TTCTGGGCACTGGGATGCTGA;SOR=0.563;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=91;TCF=66;TCR=25;TR=33;WE=154296084;WS=154296066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,38:0.36:105
chr1	154303228	rs115165870	G	A	988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.897;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=13;PP=651;ReadPosRankSum=-1.680;SC=GGGGGAGGCAGCCTCAGTCTG;SOR=0.838;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=74;TCF=50;TCR=24;TR=41;WE=154303236;WS=154303218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,45:0.58:78
chr1	154305010	rs1209264	A	G	496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.172;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=292;ReadPosRankSum=-0.716;SC=CTCCAGCCTGAGCAGCAGAGC;SOR=0.211;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=16;WE=154305018;WS=154305000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
chr1	154310048	rs1760795	C	G	2769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=57;PP=1727;ReadPosRankSum=-0.436;SC=CCTGGGGTCTCTCCAGGGAGT;SOR=0.659;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=189;TCF=92;TCR=97;TR=111;WE=154310056;WS=154310038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,122:0.58:209
chr1	154313232	rs1194588	T	C	532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=1;PP=398;SC=TCTCCGTTCTTGTCTCTCCCC;SOR=3.500;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=154313240;WS=154313222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	154316434	rs2274988	C	T	1466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=21;PP=822;ReadPosRankSum=-0.717;SC=AAGAGTACTACGAGGAGTGGG;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=131;TCF=87;TCR=44;TR=66;WE=154316442;WS=154316424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,73:0.50:146
chr1	154317153	rs1194587	C	T	2686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.030;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=52;PP=1485;ReadPosRankSum=2.161;SC=CATCCCGCTCCGTAGGCAACG;SOR=0.603;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=199;TCF=100;TCR=99;TR=110;WE=154317161;WS=154317143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,126:0.56:226
chr1	154317418	rs1194586	T	C	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.422;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=342;ReadPosRankSum=0.707;SC=CTGGAAAGACTGGCTCTCTCA;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=19;WE=154317426;WS=154317408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr1	154320942	rs2297607	A	G	2081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.354;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=53;PP=1275;ReadPosRankSum=0.066;SC=TGCTCACCACAGTCGTCTGCA;SOR=1.157;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=168;TCF=73;TCR=95;TR=87;WE=154320950;WS=154320932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,96:0.52:185
chr1	154321072	rs1194591	A	G	1366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=22;PP=666;SC=GAAAGGCCTCATGTGAACACT;SOR=1.312;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=16;TCR=22;TR=38;WE=154321092;WS=154321062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	154321084	rs2297606	G	T	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=91;ReadPosRankSum=-0.727;SC=GTGAACACTGGGGGGCTCTGT;SOR=0.593;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=11;TCR=20;TR=11;WE=154321092;WS=154321062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr1	154409893	.	AT	A	67.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.769;ClippingRankSum=0.000;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=1.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.01;ReadPosRankSum=0.282;SOR=0.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,13:0.19:67
chr1	154437896	rs2229238	T	C	1483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=45;PP=1103;ReadPosRankSum=-0.294;SC=CTGTGGATGATAAAACACAAA;SOR=0.725;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=120;TCF=32;TCR=88;TR=60;WE=154437904;WS=154437886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,63:0.48:132
chr1	154442960	rs11265621	G	A	1384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.115;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=37;PP=829;ReadPosRankSum=1.116;SC=TACAGGGCAGGGGCAGGAAAC;SOR=0.340;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=107;TCF=32;TCR=75;TR=57;WE=154442968;WS=154442950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,62:0.53:116
chr1	154459197	rs4845633	C	G	2124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=41;PP=1290;SC=CAGGCCACTGCGGTGACCCAT;SOR=1.108;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=72;TCF=30;TCR=42;TR=71;WE=154459205;WS=154459187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr1	154474131	rs4845635	C	G	5584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=93;PP=2965;SC=CCTCCGTGGCCCGGGAGTTTT;SOR=0.946;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=178;TCF=85;TCR=93;TR=178;WE=154474139;WS=154474121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr1	154474557	rs6703672	T	C	409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=10;PP=242;SC=GGCTGCTCCGTGCGCCCCCGG;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=15;WE=154474565;WS=154474547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	154479657	rs10654618	C	CAT	2184.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=7;PP=1612;SC=ATGCCTGACACGTTTCCTTTT;SOR=2.448;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=33;WE=154479678;WS=154479647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	154479670	rs6664608	C	T	834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.211;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.287;NF=22;NR=8;PP=402;ReadPosRankSum=-1.707;SC=TTCCTTTTGTCGGAGTCTGAG;SOR=0.424;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=42;TCR=15;TR=30;WE=154479678;WS=154479647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,38:0.56:68
chr1	154492702	rs10908842	G	A	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.214;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=314;ReadPosRankSum=-0.753;SC=CAGACTAGCTGGCTGGGGATC;SOR=0.418;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=48;TCF=37;TCR=11;TR=23;WE=154492710;WS=154492692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,24:0.44:55
chr1	154493721	rs6684225	T	C	1392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=9;PP=804;SC=CCTTCCAGCTTGGGCTTGGTG;SOR=2.400;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=32;TCR=9;TR=41;WE=154493729;WS=154493711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	154514331	rs4845647	C	A	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.643;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=277;ReadPosRankSum=-1.034;SC=CTCAGGATGCCGTGAGGATGG;SOR=0.119;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=20;WE=154514339;WS=154514321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,23:0.70:33
chr1	154515193	rs58881140	C	T	1094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.686;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=13;PP=547;ReadPosRankSum=1.891;SC=AGGACTTAGTCTTCTGCTTTC;SOR=1.071;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=89;TCF=57;TCR=32;TR=43;WE=154515201;WS=154515183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,53:0.52:101
chr1	154516571	rs6678164	T	C	7348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.40;SOR=1.122;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr1	154516571	.	TATGCACG	CATGCACA,CATGCACG	1515	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.3;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=28,86;NR=46,111;PP=934,1515;QD=13.3441604711;SC=TTTTCTGGGCTATGCACGTCA;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=197;TCF=86;TCR=111;TR=74,197;WE=154516586;WS=154516561;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.38:197
chr1	154516578	rs3811448	G	A	1489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FS=4.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.20;ReadPosRankSum=0.950;SOR=1.004;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:128,79:0.38:207
chr1	154517217	rs6681207	T	C	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.241;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=311;ReadPosRankSum=-0.822;SC=AGGACTGCTGTGCATGGCACT;SOR=1.022;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=62;TCF=43;TCR=19;TR=23;WE=154517225;WS=154517207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,24:0.37:65
chr1	154517504	rs3811449	G	A	1368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.080;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=44;PP=983;ReadPosRankSum=1.264;SC=TGAACAGGAAGCAGCATAGTG;SOR=1.091;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=101;TCF=23;TCR=78;TR=54;WE=154517512;WS=154517494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,57:0.53:108
chr1	154519800	rs113168174	C	CA	229.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=182;ReadPosRankSum=-0.883;SC=ACTTTCCCTGCAGCCCCCGCC;SOR=0.732;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=7;WE=154519808;WS=154519790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr1	154523215	rs4520411	C	T	344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=2;PP=296;SC=ATCGGTGATACGATCATTTTG;SOR=2.670;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=154523223;WS=154523205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	154523588	rs10908849	T	G	286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=7;PP=155;SC=CTCCCAGCACTGTGGTCTAGT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=154523596;WS=154523578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	154528086	rs4078519	T	C	1234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=24;PP=635;SC=GCTCTTAGTTTGGGCCCCACA;SOR=1.298;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=43;TCF=18;TCR=25;TR=42;WE=154528094;WS=154528076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	154557685	rs9427094	C	T	1215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=21;PP=794;ReadPosRankSum=-0.083;SC=GCTCTCCTGTCTCCTTACCCA;SOR=0.773;Source=Platypus;TCF=41;TR=45;WE=154557693;WS=154557675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,50:0.61:82
chr1	154561261	rs9427095	G	C	605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=17;PP=513;SC=TGTTGCAGACGTTTCACAGTT;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=154561269;WS=154561251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	154561925	rs1127309	C	T	2254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.261;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=42;PP=1293;ReadPosRankSum=0.073;SC=AATCTCCTTTCACACAGCGAT;SOR=0.874;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=207;TCF=116;TCR=91;TR=102;WE=154561933;WS=154561915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,110:0.48:227
chr1	154562624	rs201932953	CG	C	299.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=1.257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.10;ReadPosRankSum=-0.599;SOR=0.498;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr1	154562625	rs7532276	G	C	388.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=1.257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.51;ReadPosRankSum=0.706;SOR=0.936;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
chr1	154562625	.	GCCCC	CCCCA,CCCCC	261	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000,0.5000;HP=11;HapScore=4;MGOF=14;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=12,25;NR=5,11;PP=261,128;QD=18.498110286;SC=GGACCCCCCCGCCCCAAAAAA;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=54;TCF=37;TCR=17;TR=17,36;WE=154562637;WS=154562614;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.31:54
chr1	154562629	rs60407842	C	A	623.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=1.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.56;ReadPosRankSum=1.089;SOR=1.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,34:0.74:46
chr1	154571174	rs143817514	T	TGGA	533.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=559;SC=TTTTCACTTGTGGAGATGAAG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=11;WE=154571182;WS=154571164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	154573967	rs2229857	T	C	2747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.583;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=63;PP=1741;ReadPosRankSum=0.228;SC=TGCGTTTCTTTTGGTCTCAGG;SOR=0.813;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=304;TCF=151;TCR=153;TR=122;WE=154573975;WS=154573957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:198,138:0.41:336
chr1	154574820	rs1466731	T	C	7191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=126;NR=114;PP=2965;SC=CCCTGACTTCTGAGATGCACG;SOR=0.716;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=241;TCF=127;TCR=114;TR=240;WE=154574828;WS=154574810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr1	154575040	rs1802645	C	T	3563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=53;PP=2062;SC=GCTGCTGGTACCTGAGCTGTC;SOR=0.709;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=116;TCF=63;TCR=53;TR=116;WE=154575048;WS=154575030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr1	154580348	rs71586026	G	GAC	3543.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=353;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.418;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.975;NF=24;NR=47;PP=2018;ReadPosRankSum=0.651;SC=TTGGCAAGACGACACACACAC;SOR=0.797;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=206;TCF=66;TCR=140;TR=71;WE=154580371;WS=154580338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:192,129:0.40:321
chr1	154600372	rs6426859	A	G	2670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=26;PP=1812;SC=ACACCCGGAGACTGCCAGTGC;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=52;TCR=26;TR=78;WE=154600380;WS=154600362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr1	154709682	rs35539682	TG	T	574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=3;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.521;NF=2;NR=14;PP=220;ReadPosRankSum=0.627;SC=ATAGAAAATTTGGGGGGGGGG;SOR=1.051;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=16;WE=154709691;WS=154709672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,24:0.92:26
chr1	154744807	rs1051614	C	G	5120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=97;PP=2965;SC=GGCTGATGTACAGGATGCGCT;SOR=1.221;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=164;TCF=67;TCR=97;TR=164;WE=154744815;WS=154744797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr1	154744852	rs1131820	A	G	2167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=46;PP=1325;SC=CATCCGCGCCATTGTCGATCA;SOR=1.670;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=24;TCR=46;TR=70;WE=154744860;WS=154744842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr1	154744937	rs11589471	C	T	56.10	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=3;PP=35;SC=CCAGGCAGGACAGGTGGGGCA;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=154744945;WS=154744927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	154832290	rs1061122	C	T	2993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=62;PP=1817;SC=TCAGTCCCTGCAAGGAGTGTC;SOR=1.480;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=36;TCR=62;TR=98;WE=154832298;WS=154832280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr1	154832322	rs1218586	A	C	1420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=37;PP=1149;SC=CTTTCCTGTTAATTTGACACT;SOR=3.767;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=5;TCR=37;TR=42;WE=154832330;WS=154832312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	154842199	.	G	GGCTGCTGCTGCTGCT	647.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=6;PP=2179;SC=GGGATGCGGTGGCTGCTGCTG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=6;WE=154842207;WS=154842189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	154917701	rs906594	A	G	3572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=72;PP=2170;SC=AGCAGGCACCACCAAGCATAT;SOR=1.416;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=117;TCF=45;TCR=72;TR=117;WE=154917709;WS=154917691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr1	154938214	rs61751623	C	G	1123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.503;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=20;PP=647;ReadPosRankSum=0.238;SC=CCATGGACACCGACTGGGGAG;SOR=0.550;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=102;TCF=62;TCR=40;TR=48;WE=154938226;WS=154938204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,56:0.49:115
chr1	154938603	rs114870819	C	T	2588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.793;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=61;PP=1533;ReadPosRankSum=-1.755;SC=GCCTCCAACACTCCCCAGCTC;SOR=1.016;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=225;TCF=110;TCR=115;TR=110;WE=154938611;WS=154938593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,126:0.49:258
chr1	154983423	.	T	C	727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.373;ClippingRankSum=0.000;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=17;PP=428;ReadPosRankSum=-0.635;SC=TCATCCTCCCTCACCCCAAGC;SOR=0.690;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=46;TCR=39;TR=36;WE=154983431;WS=154983413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,40:0.40:99
chr1	154983539	rs6686021	C	T	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=123;ReadPosRankSum=0.733;SC=TGCCTGTGTCCCAGGCCCATA;SOR=0.741;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=9;WE=154983547;WS=154983529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr1	154987526	rs11264295	C	T	3025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.870;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=66;PP=2051;ReadPosRankSum=-1.363;SC=TGCTGGAGATCCCGTGTGTCA;SOR=0.647;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=278;TCF=140;TCR=138;TR=137;WE=154987534;WS=154987516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,145:0.48:304
chr1	154988957	rs2242195	A	G	4506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=78;NR=74;PP=2717;SC=CCCACTACCCACCACCCTCTA;SOR=0.741;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=153;TCF=78;TCR=75;TR=152;WE=154988965;WS=154988947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr1	155001929	rs10908452	T	C	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=286;ReadPosRankSum=0.167;SC=GTCCACCAGATCCCAGTTCTT;SOR=0.567;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=47;TCF=17;TCR=30;TR=20;WE=155001937;WS=155001919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,22:0.42:52
chr1	155003954	rs11582128	G	A	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=7;PP=194;ReadPosRankSum=-0.230;SC=CCCTCTAATCGTCCTCCTGAG;SOR=1.426;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=10;WE=155003962;WS=155003944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr1	155006091	rs10908453	A	G	3039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.545;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=56;PP=1736;ReadPosRankSum=1.116;SC=CCAGGGTAAAACCTCCCACGC;SOR=0.716;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=225;TCF=119;TCR=106;TR=126;WE=155006099;WS=155006081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,141:0.57:248
chr1	155006999	rs6680600	C	T	2250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.078;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=43;PP=1441;ReadPosRankSum=1.410;SC=TCACTGCTCTCCTGCTGGGGG;SOR=0.612;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=189;TCF=109;TCR=80;TR=98;WE=155007007;WS=155006989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,105:0.51:204
chr1	155007293	rs4845404	C	T	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-0.684;QD=19.32;ReadPosRankSum=-0.091;SOR=1.244;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr1	155007302	rs4845405	C	A	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.618;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=-0.549;QD=19.65;ReadPosRankSum=2.183;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr1	155019710	rs11264300	A	C	1300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.401;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=23;PP=878;ReadPosRankSum=0.252;SC=GGGAGACTCCATGCTAGCCCG;SOR=0.842;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=121;TCF=72;TCR=49;TR=58;WE=155019718;WS=155019700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,61:0.47:131
chr1	155025361	rs2306125	T	C	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.46;ReadPosRankSum=0.842;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr1	155026114	rs6660884	C	T	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=185;ReadPosRankSum=0.432;SC=ATTGTCCTCACTTTATACATG;SOR=0.793;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=12;WE=155026122;WS=155026104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,11:0.33:33
chr1	155026259	rs75583932	A	G	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=97;ReadPosRankSum=0.079;SC=CCCCGGGGTCAGGAGTGGAAA;SOR=0.188;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=9;WE=155026267;WS=155026251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr1	155026871	rs11548311	G	T	1445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=35;PP=955;ReadPosRankSum=0.309;SC=CCATTATTTCGCGAATCCAAG;SOR=0.720;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=168;TCF=88;TCR=80;TR=70;WE=155026879;WS=155026861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,73:0.40:184
chr1	155026942	rs6427128	A	C	4557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=83;PP=2340;SC=CACACTCAGAAGCCACCAGAG;SOR=0.890;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=163;TCF=80;TCR=83;TR=163;WE=155026950;WS=155026932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr1	155028522	rs11264302	G	A	2806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.912;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=52;PP=1597;ReadPosRankSum=0.410;SC=CCTGACCATGGCAACCCCTCT;SOR=0.625;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=257;TCF=151;TCR=106;TR=124;WE=155028530;WS=155028512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,137:0.49:282
chr1	155030557	rs11264303	A	C	3391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=378;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.373;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=69;PP=1761;ReadPosRankSum=1.775;SC=GCCTCCAGACAGCTAATACTC;SOR=0.665;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=344;TCF=182;TCR=162;TR=146;WE=155030565;WS=155030547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:210,168:0.44:378
chr1	155031376	rs12023499	C	T	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.090;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=21;PP=390;ReadPosRankSum=-0.774;SC=TACTACTTCCCAGTTGTGTGA;SOR=1.057;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=67;TCF=23;TCR=44;TR=31;WE=155031384;WS=155031366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,37:0.49:75
chr1	155033317	rs11264304	T	C	2748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=61;PP=1494;SC=AGGTGAGTCCTGGATGCCAGA;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=96;TCF=35;TCR=61;TR=96;WE=155033325;WS=155033307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr1	155057499	rs3766918	A	G	999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.915;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=8;PP=682;ReadPosRankSum=2.082;SC=GGGGCTGCGGAGCGGTCAGAT;SOR=0.894;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=82;TCF=63;TCR=19;TR=38;WE=155057507;WS=155057489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,43:0.47:91
chr1	155106054	rs4390169	A	G	2421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.508;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=49;PP=1637;ReadPosRankSum=0.066;SC=AGTGAGTGTCAGAGCCCTGTG;SOR=0.545;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=177;TCF=90;TCR=87;TR=103;WE=155106062;WS=155106044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,109:0.56:193
chr1	155106227	rs4745	A	T	2132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.082;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=47;PP=1233;ReadPosRankSum=-0.502;SC=CAGGCCCATGACAATCCACAG;SOR=1.062;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=163;TCF=79;TCR=84;TR=83;WE=155106235;WS=155106217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,99:0.52:192
chr1	155106550	rs9297	A	G	1217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=29;PP=577;ReadPosRankSum=-0.143;SC=GTGAAGGTGTATGCCACACCT;SOR=0.672;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=127;TCF=53;TCR=74;TR=51;WE=155106558;WS=155106540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,62:0.43:143
chr1	155108038	.	G	A	2307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=0.000;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=35;PP=1157;ReadPosRankSum=-0.565;SC=GTGGGAACACGAGCGTTGAGA;SOR=0.692;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=176;TCF=107;TCR=69;TR=92;WE=155108046;WS=155108028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,112:0.54:209
chr1	155108287	rs11264333	G	A	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.550;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=250;ReadPosRankSum=-0.171;SC=GGAGCCGAGTGCGCGGGGCGG;SOR=1.123;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=26;TCF=18;TCR=8;TR=14;WE=155108295;WS=155108277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr1	155109218	.	CA	C	124.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.096;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=1.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.72;MQRankSum=1.844;QD=4.45;ReadPosRankSum=-0.377;SOR=1.123;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr1	155110390	.	AT	A	442.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.190;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.650;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=356;ReadPosRankSum=-0.575;SC=TCTTGAGGAAATTCTTAGGCA;SOR=0.250;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=37;TCF=29;TCR=8;TR=12;WE=155110398;WS=155110380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
chr1	155142210	rs4421576	A	G	1434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.629;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=29;PP=876;ReadPosRankSum=0.478;SC=CATCACAGTAAGATCCAATGC;SOR=0.598;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=146;TCF=73;TCR=73;TR=62;WE=155142218;WS=155142200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,69:0.42:164
chr1	155142229	rs4276914	G	A	1671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.564;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=33;PP=953;ReadPosRankSum=-1.413;SC=GCCAAAAAACGGAATGCTACA;SOR=0.694;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=152;TCF=77;TCR=75;TR=72;WE=155142237;WS=155142219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,81:0.48:168
chr1	155148779	rs12137850	G	T	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.785;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=135;ReadPosRankSum=-0.323;SC=GCCTGGCATTGTGGGTTTCCA;SOR=0.235;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=12;WE=155148787;WS=155148769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr1	155158605	rs1611772	G	A	929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.260;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=17;PP=590;ReadPosRankSum=0.054;SC=AGCGGGCGACGTGCCCCTACA;SOR=0.617;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=72;TCF=38;TCR=34;TR=39;WE=155158613;WS=155158595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,43:0.53:81
chr1	155171811	rs41264917	G	A	1979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.748;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=30;PP=1131;ReadPosRankSum=-1.768;SC=TGCATTCATCGATGTCATTGC;SOR=0.716;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=141;TCF=78;TCR=63;TR=79;WE=155171819;WS=155171801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,90:0.57:157
chr1	155205669	rs28559737	G	T	6628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=120;NR=126;PP=2965;SC=AGACAAAGGCGCAACACTGGG;SOR=0.961;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=246;TCF=120;TCR=126;TR=246;WE=155205677;WS=155205659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr1	155291253	rs72704152	C	T	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.076;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=68;ReadPosRankSum=-0.434;SC=AGAGCGCAGCCGCGTTCTCTG;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=5;WE=155291261;WS=155291243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr1	155294274	rs914616	A	G	3468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=74;PP=2248;SC=GCGCTGGGCTACACCTCCCTC;SOR=1.299;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=49;TCR=74;TR=123;WE=155294282;WS=155294264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr1	155294772	rs4971075	A	G	2215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=38;PP=1509;SC=GCTTCCGAATAAACTGCCCTT;SOR=1.134;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=28;TCR=38;TR=66;WE=155294780;WS=155294762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr1	155313047	rs4971051	T	C	1446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=36;NR=15;PP=962;SC=GCTGGGATTATCAGCGTGAGC;SOR=1.654;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=36;TCR=15;TR=51;WE=155313055;WS=155313037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	155327091	rs41264233	G	A	2341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.055;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=40;PP=1414;ReadPosRankSum=-0.481;SC=CATGGATAAGGATATTTCCTT;SOR=0.798;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=195;TCF=115;TCR=80;TR=98;WE=155327107;WS=155327081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,111:0.51:218
chr1	155330237	.	AT	A	46.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.390;ClippingRankSum=0.000;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.30;MQRankSum=1.687;QD=2.23;ReadPosRankSum=1.601;SOR=1.162;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr1	155408635	rs4971053	T	C	6381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=108;NR=109;PP=2965;SC=GAGTCACTTGTGACTGCAGGC;SOR=0.798;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=217;TCF=108;TCR=109;TR=217;WE=155408643;WS=155408625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr1	155532316	rs12403379	T	C	6436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.86;QD=43.49;SOR=0.807;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr1	155532325	rs12403380	T	C	7077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.86;QD=47.19;SOR=0.775;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr1	155532332	rs34869594	T	C	7188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.87;QD=46.08;SOR=0.828;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr1	155532341	rs61812107	T	C	7000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.87;QD=44.03;SOR=0.868;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr1	155618415	rs5777949	CT	C	6966.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=31;NR=83;PP=2966;SC=ACTCATGCGCCTTTTCAGATG;SOR=0.906;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=124;TCF=31;TCR=93;TR=114;WE=155618423;WS=155618405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr1	155631307	.	AAC	A	69	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MMLQ=26;MQ=57.18;NF=0;NR=2;PP=69;QD=36.0;SC=GATCAAGAGAAACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=2;WE=155631316;WS=155631297;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,2:0.20:10
chr1	155701055	.	CA	C	89.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.689;ClippingRankSum=0.000;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=6.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.45;ReadPosRankSum=1.676;SOR=1.744;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,14:0.23:62
chr1	155737425	.	AACAC	A	174	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=30;MMLQ=28;MQ=41.23;NF=0;NR=4;PP=174;QD=44.25;SC=GATCAAGAGAAACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=155737436;WS=155737415;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	155746340	rs60525991	CT	C	296.50	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=3.039;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.47;ReadPosRankSum=1.198;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,16:0.89:18
chr1	155755097	rs822021	G	A	5886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=104;PP=2965;SC=TTAAAATCCCGTGTTCTCACT;SOR=1.147;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=187;TCF=83;TCR=104;TR=187;WE=155755105;WS=155755087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr1	155785578	rs148569012	CAACT	C	5192.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=35;PP=2947;SC=CAAATATTACCAACTAACATT;SOR=1.382;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=73;TCF=35;TCR=38;TR=63;WE=155785589;WS=155785568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr1	155822971	rs822490	C	T	719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=1;PP=580;SC=AAATCAATATCCCCTTTCAGA;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=155822979;WS=155822961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	155823002	rs822491	T	C	1633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=8;PP=1202;SC=TGTAAAGGTATCCAGAAATAG;SOR=3.383;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=52;TCF=43;TCR=9;TR=51;WE=155823010;WS=155822992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	155829360	rs1749412	C	A	394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=1;PP=286;SC=CTTAGCTCAGCGCATCCCCGG;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=155829368;WS=155829353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	155837865	rs822522	G	C	8509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=158;NR=132;PP=2965;SC=AGAAGAAGCAGAAGAACCCAC;SOR=0.900;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=290;TCF=158;TCR=132;TR=290;WE=155837873;WS=155837855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,316:1.00:316
chr1	155838267	rs822521	T	C	7430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=149;NR=102;PP=2965;SC=AGGAGGCCCATGGGCTGCCAG;SOR=1.016;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=251;TCF=149;TCR=102;TR=251;WE=155838275;WS=155838257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,275:1.00:275
chr1	155850558	rs822508	T	C	1341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=39;PP=922;SC=CTCTTCCTGATGAGTATCTAC;SOR=3.398;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=7;TCR=39;TR=46;WE=155850566;WS=155850548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	155850811	rs822509	G	A	343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=1;PP=256;SC=CATCCAGGCAGGCAGACTCAC;SOR=3.442;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=155850819;WS=155850807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	155870416	rs1749409	G	A	7095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=112;NR=118;PP=2965;SC=TGACCTTTAAGGGCAAAATGT;SOR=0.831;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=230;TCF=112;TCR=118;TR=230;WE=155870424;WS=155870406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr1	155880573	rs493446	C	G	5436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=103;PP=2965;SC=GGGCCTTCCTCGGTTGCCCCG;SOR=1.297;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=169;TCF=66;TCR=103;TR=169;WE=155880594;WS=155880563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr1	155880760	rs5777961	C	CA	364.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=375;SC=AGAAACCCCCCCATCTTCACC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=155880768;WS=155880750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	155891045	rs625658	A	C	2328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=15;PP=1644;SC=AGGAACACAGAAGACAGCAGG;SOR=2.524;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=55;TCR=15;TR=70;WE=155891053;WS=155891035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr1	155891877	.	C	CAG	481	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=44;MMLQ=27;MQ=53.86;NF=1;NR=10;PP=481;QD=47.6363636364;SC=TTTTTTGAGACAGTCTTGCTC;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=155891885;WS=155891867;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	155899020	rs539602	A	T	6102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=124;NR=72;PP=2965;ReadPosRankSum=0.938;SC=ACCTAAGGATAAAAAACATGA;SOR=1.329;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=198;TCF=125;TCR=73;TR=196;WE=155899028;WS=155899010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,222:0.99:224
chr1	155903310	rs4661150	T	C	757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=1;PP=628;SC=CTCCTGACCTTGTGATCCACC;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=24;WE=155903318;WS=155903300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	155903408	rs4661151	C	T	4852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=99;NR=64;PP=2965;SC=AGTGGAGACCCTTCAACTTCA;SOR=1.103;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=163;TCF=99;TCR=64;TR=163;WE=155903416;WS=155903398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr1	155904177	rs2275079	T	C	11668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=444;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=215;NR=186;PP=2965;SC=CGACCGCTTCTACTCAACCAC;SOR=0.827;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=402;TCF=216;TCR=186;TR=401;WE=155904197;WS=155904167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,442:1.00:442
chr1	155904392	rs2275081	G	A	461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=15;PP=388;SC=GATGGCTGCTGTGCCTACTAT;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=155904400;WS=155904382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	155912486	rs2152051	T	C	6369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=131;PP=2965;SC=GATCTGCGGTTGAGGCTGTGG;SOR=1.251;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=223;TCF=92;TCR=131;TR=223;WE=155912494;WS=155912476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr1	155917880	rs1010033	T	A	7216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=108;NR=143;PP=2965;SC=GACTAATGCCTCCCCATCTGC;SOR=1.084;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=251;TCF=108;TCR=143;TR=251;WE=155917888;WS=155917870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,269:1.00:269
chr1	155928232	rs2364404	T	C	2338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.98;SOR=1.355;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	155928242	rs2886069	C	T	1962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.65;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	155931368	rs4661175	G	A	1693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=16;PP=1152;SC=ACCCGGCCAAGAGAGGTTGAT;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=40;TCR=16;TR=56;WE=155931376;WS=155931358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	155955076	rs4661216	A	G	3117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=38;PP=1853;SC=GCAACAAGATATATAGGGGAA;SOR=1.109;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=64;TCR=38;TR=102;WE=155955087;WS=155955066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr1	155981489	rs1475766	C	G	147.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=117;SC=CCAAAAAACACACAGGGCAAG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=155981497;WS=155981486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	156011444	rs2297792	T	C	5036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FS=3.213;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.90;MQRankSum=-0.278;QD=25.57;ReadPosRankSum=-1.150;SOR=0.388;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,196:0.99:197
chr1	156104292	rs12117552	G	A	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.428;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=312;ReadPosRankSum=2.041;SC=AGGAGGAACTGGACTTCCAGA;SOR=1.431;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=46;TCF=17;TCR=29;TR=19;WE=156104300;WS=156104282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,18:0.39:46
chr1	156131095	rs201004039	C	CGGGGCGG	1307.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=8;NR=1;PP=445;SC=GCTGGGGGGTCGGGGCGCCCG;SOR=3.716;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=22;TCF=14;TCR=8;TR=9;WE=156131103;WS=156131085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	156169610	rs2072499	A	G	817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=4.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.214;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.862;NF=23;NR=4;PP=543;ReadPosRankSum=0.739;SC=ATCCCTCCATACTGCTCAAAT;SOR=1.881;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=51;TCF=41;TCR=10;TR=27;WE=156169618;WS=156169600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,31:0.55:56
chr1	156182710	rs2241107	T	C	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=141;ReadPosRankSum=0.686;SC=GACGTTCTACTGCTTCCAATC;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=8;WE=156182718;WS=156182700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr1	156202173	rs1052053	A	G	2162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.516;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=44;PP=1320;ReadPosRankSum=0.333;SC=ATGACACAGCAAATCTATGAC;SOR=0.632;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=177;TCF=98;TCR=79;TR=94;WE=156202181;WS=156202163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,105:0.52:201
chr1	156202300	rs2251615	C	T	891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.906;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=23;PP=484;ReadPosRankSum=-1.251;SC=TGGCCCCACCCTCTACACCTC;SOR=0.581;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=73;TCF=23;TCR=50;TR=36;WE=156202308;WS=156202290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,41:0.52:79
chr1	156215562	rs2075166	G	A	2804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=54;PP=1490;ReadPosRankSum=1.474;SC=TCCCGCGCCTGTCCGGCTCAC;SOR=0.704;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=248;TCF=137;TCR=111;TR=123;WE=156215570;WS=156215552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,143:0.51:281
chr1	156215899	rs2075165	G	A	4725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=87;NR=69;PP=2860;SC=GGCCTGGGGCGGAGCCTCCCC;SOR=0.841;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=156;TCF=87;TCR=69;TR=156;WE=156215907;WS=156215889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr1	156220056	rs1043165	T	C	2719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=-0.243;NF=64;NR=16;PP=1650;ReadPosRankSum=-0.891;SC=CAAGAACCCATTCCAGTGAAA;SOR=1.508;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=81;TCF=65;TCR=16;TR=80;WE=156220064;WS=156220046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,93:0.99:94
chr1	156230141	rs2287025	T	A	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=188;ReadPosRankSum=-0.021;SC=CCTGTCTGAGTGGAAGAGGGC;SOR=0.813;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=12;WE=156230149;WS=156230131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr1	156230206	rs2287024	C	A	1158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.08;ReadPosRankSum=0.325;SOR=0.651;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,59:0.51:115
chr1	156230429	rs12139321	A	G	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=464;ReadPosRankSum=-0.228;SC=TGGGCAGAAGAAGGACACATA;SOR=0.758;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=55;TCF=16;TCR=39;TR=29;WE=156230437;WS=156230419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,30:0.48:62
chr1	156231266	rs759328	G	C	1960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.606;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=45;PP=1166;ReadPosRankSum=-0.629;SC=AGTGAGCAAGGAAAGCACCAC;SOR=0.522;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=163;TCF=64;TCR=99;TR=77;WE=156231274;WS=156231256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,91:0.48:188
chr1	156233143	rs2273832	A	G	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.331;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=394;ReadPosRankSum=-0.421;SC=CCCTCCTCCAAGACCCTGGGA;SOR=1.033;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=64;TCF=46;TCR=18;TR=25;WE=156233151;WS=156233133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,26:0.39:66
chr1	156233189	rs2273833	C	T	1379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.293;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=20;PP=815;ReadPosRankSum=-0.796;SC=GACACACCTGCGCACACACGA;SOR=0.826;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=148;TCF=96;TCR=52;TR=62;WE=156233197;WS=156233179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,69:0.44:158
chr1	156233479	rs4661036	T	C	890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.908;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=31;PP=681;ReadPosRankSum=-0.184;SC=TCCAAGGAATTTGGATATGAA;SOR=0.970;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=96;TCF=25;TCR=71;TR=40;WE=156233487;WS=156233469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,40:0.40:101
chr1	156236592	rs370875877	CT	C	171.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=17.17;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	156244559	rs12122180	G	A	1561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.973;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=39;PP=918;ReadPosRankSum=1.690;SC=CCGAGATGTAGAGACTAAGAA;SOR=0.867;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=150;TCF=64;TCR=86;TR=67;WE=156244567;WS=156244549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,75:0.46:164
chr1	156247665	rs114416960	C	T	3023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.217;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=60;PP=1787;ReadPosRankSum=-1.170;SC=ACTTTCCTAGCTGTCTCTTCC;SOR=0.534;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=253;TCF=146;TCR=107;TR=134;WE=156247673;WS=156247655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,149:0.52:287
chr1	156248609	rs10752615	T	C	1304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.676;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=14;PP=751;ReadPosRankSum=-0.317;SC=TCAGAGACCATTAAGGTACCA;SOR=0.780;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=122;TCF=85;TCR=37;TR=52;WE=156248617;WS=156248599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,62:0.46:135
chr1	156252291	rs3806409	A	G	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=248;ReadPosRankSum=1.071;SC=CTCCTTCCTCACCCGCACCTC;SOR=1.085;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=15;WE=156252299;WS=156252281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,17:0.71:24
chr1	156255456	rs6684514	G	A	3401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=81;PP=2050;ReadPosRankSum=-0.128;SC=AGACCTTATCGTGCGCTGTGA;SOR=0.684;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=311;TCF=149;TCR=162;TR=153;WE=156255464;WS=156255446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,167:0.50:337
chr1	156255833	rs2842883	G	C	1004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=27;PP=770;SC=GCAGGGCCTGGCTGGTGTGGG;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=29;WE=156255841;WS=156255823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	156261491	rs3795728	G	C	1288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=33;PP=867;ReadPosRankSum=-1.012;SC=GCCTAGGACCGCGGTGGGTGG;SOR=0.704;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=52;TCR=76;TR=56;WE=156261499;WS=156261481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,60:0.44:135
chr1	156263097	rs10908494	A	G	2428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.533;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=36;PP=1427;ReadPosRankSum=-0.795;SC=CCCGGCCCAAACCCTGGCTCT;SOR=0.770;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=177;TCF=105;TCR=72;TR=95;WE=156263105;WS=156263075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,107:0.55:194
chr1	156263940	rs10908495	T	C	960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.658;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=15;PP=660;ReadPosRankSum=0.150;SC=GAGGCTCCAATCAGGGCCACC;SOR=0.979;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=83;TCF=49;TCR=34;TR=39;WE=156263948;WS=156263930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,45:0.46:97
chr1	156264000	rs10908496	G	A	2311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.568;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=35;PP=1398;ReadPosRankSum=-1.218;SC=GGTTGGGCTGGTCGGCTGGAC;SOR=0.627;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=161;TCF=101;TCR=60;TR=95;WE=156264008;WS=156263990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,105:0.59:179
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chr1	156279210	rs3001784	T	C	2450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=56;PP=1750;SC=CTGAAATCTATCTTTTCAGTC;SOR=1.872;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=24;TCR=56;TR=80;WE=156279218;WS=156279200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr1	156280671	rs10908500	A	T	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.166;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=227;ReadPosRankSum=-0.301;SC=TAGCCAGATAAGAATCTTCCC;SOR=0.283;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=13;WE=156280679;WS=156280661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,17:0.44:39
chr1	156281020	rs12132794	G	C	1272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.574;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=35;PP=860;ReadPosRankSum=0.256;SC=TGAAGCCAAAGCTTGATGACT;SOR=0.754;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=165;TCF=73;TCR=92;TR=62;WE=156281028;WS=156281010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,66:0.37:179
chr1	156287403	rs2296374	T	C	1621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=37;PP=1138;SC=AAGGGTCATATTATACTCCTT;SOR=1.919;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=16;TCR=37;TR=53;WE=156287411;WS=156287393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	156290656	rs11548200	T	C	2564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.358;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=49;PP=1525;ReadPosRankSum=0.580;SC=TATTTTTTTATGTCAATCTCT;SOR=0.373;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=232;TCF=147;TCR=85;TR=117;WE=156290664;WS=156290646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,124:0.51:244
chr1	156304782	rs3762281	A	G	795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=20;PP=635;SC=AGTAATAGGGAAAAGGGGCAT;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=156304790;WS=156304772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	156308031	rs139949895	GGA	G	1607.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.880;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.519;NF=0;NR=28;PP=1084;ReadPosRankSum=0.433;SC=AGAACCTTCTGGAGAGAGAGA;SOR=0.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=78;TCF=2;TCR=76;TR=28;WE=156308040;WS=156308021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,49:0.47:104
chr1	156347131	rs2245623	G	A	3501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=73;PP=1901;ReadPosRankSum=-0.883;SC=GTGGGCTTTGGCTTCCTCATG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=304;TCF=159;TCR=145;TR=151;WE=156347139;WS=156347121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,171:0.50:340
chr1	156347834	rs11586833	T	A	2197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=43;PP=1212;ReadPosRankSum=-2.279;SC=TTTGGTGCCGTCCTGGGCAAG;SOR=0.696;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=169;TCF=88;TCR=81;TR=91;WE=156347842;WS=156347824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,104:0.56:185
chr1	156351066	rs942679	C	A	1281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.886;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=14;PP=679;ReadPosRankSum=-0.492;SC=GATTTGCCTGCAGTTATACAA;SOR=0.400;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=100;TCF=74;TCR=26;TR=51;WE=156351074;WS=156351056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,59:0.54:109
chr1	156351699	rs3748569	G	A	2811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.423;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=65;PP=1886;ReadPosRankSum=1.240;SC=CTTCTTGGCTGGGACTGTCTC;SOR=0.655;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=285;TCF=160;TCR=125;TR=141;WE=156351707;WS=156351688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,142:0.48:296
chr1	156351792	rs3748568	G	A	1724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.784;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=48;PP=1099;ReadPosRankSum=1.004;SC=CTTTCCTCCCGCCTCTCCAAC;SOR=1.069;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=197;TCF=93;TCR=104;TR=80;WE=156351800;WS=156351782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,87:0.41:213
chr1	156352447	rs954916	G	T	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.451;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=186;ReadPosRankSum=-1.572;SC=CTGTTCCCCAGTGTGAGTTCC;SOR=0.412;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=14;WE=156352455;WS=156352437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr1	156354367	rs6668857	A	G	1065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.558;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=30;PP=726;ReadPosRankSum=1.065;SC=GACTCCCAGCACTACGAGGAC;SOR=0.460;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=173;TCF=82;TCR=91;TR=61;WE=156354375;WS=156354357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,64:0.34:189
chr1	156376680	rs6662064	A	G	473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=1;PP=386;SC=GGGGCACAGAAGGGGAATTTC;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=156376688;WS=156376675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	156446242	rs2274316	C	A	1148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.422;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=14;PP=703;ReadPosRankSum=-1.273;SC=CAGAGCAATACCCAGAATTCA;SOR=1.067;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=110;TCF=72;TCR=38;TR=49;WE=156446250;WS=156446232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,55:0.44:124
chr1	156446450	rs12131289	C	T	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.641;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=219;ReadPosRankSum=-0.868;SC=AGCTCTCCACCGTCCTGACTC;SOR=0.317;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=14;WE=156446458;WS=156446440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,14:0.40:35
chr1	156446903	rs2274317	T	C	2182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=36;PP=1313;ReadPosRankSum=0.997;SC=TAGGTGGGGGTGGAGACTTGG;SOR=0.668;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=188;TCF=118;TCR=70;TR=96;WE=156446911;WS=156446893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,103:0.51:200
chr1	156450740	rs1925950	G	A	939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.729;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=21;PP=439;ReadPosRankSum=0.603;SC=TGTCGCAGCCGTTGAAGCCCT;SOR=0.846;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=91;TCF=46;TCR=45;TR=39;WE=156450748;WS=156450730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,48:0.45:107
chr1	156452870	rs2282286	G	A	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.042;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=7;PP=484;ReadPosRankSum=-0.275;SC=CAAGAGCTGCGAAGAGGTTGG;SOR=0.460;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=70;TCF=56;TCR=14;TR=33;WE=156452878;WS=156452860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,34:0.45:76
chr1	156496188	rs6427315	A	G	1475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=15;PP=1057;SC=CCTGAGCTCTAGGTGTCTGCA;SOR=1.702;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=35;TCR=15;TR=50;WE=156496196;WS=156496178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	156498673	rs1171564	T	A	1240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.019;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=16;PP=714;ReadPosRankSum=-0.303;SC=GAGAAGTCACTCGTAACCTTC;SOR=1.154;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=143;TCF=93;TCR=50;TR=58;WE=156498681;WS=156498663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,64:0.40:161
chr1	156499969	rs1171566	T	C	2423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.096;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=57;PP=1615;ReadPosRankSum=-0.725;SC=CAAGTCGGCGTAGGTTCCGCA;SOR=0.930;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=196;TCF=89;TCR=107;TR=99;WE=156499977;WS=156499959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,109:0.51:214
chr1	156500128	rs746505	T	C	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.771;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=4.771;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=64;ReadPosRankSum=0.792;SC=ACACAGACGCTGGAGGGGTCT;SOR=3.126;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=5;WE=156500136;WS=156500118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr1	156502991	rs1609666	A	G	959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=27;PP=774;SC=ATGGGGTCACATTAAATCAGC;SOR=3.545;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=32;WE=156502999;WS=156502981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
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chr1	156520173	rs1778819	T	A	3656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=61;NR=57;PP=2144;SC=AAAAAAGATGTGACCCCAAGC;SOR=0.787;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=118;TCF=61;TCR=57;TR=118;WE=156520181;WS=156520163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr1	156520320	rs1778818	C	T	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.838;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=153;ReadPosRankSum=0.271;SC=TTCCCTGGGACGCGGCCAGGC;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=8;WE=156520328;WS=156520310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr1	156524221	rs6694580	G	T	1475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=36;PP=1075;SC=CAAGTGGGCAGGTGAAGGGTC;SOR=2.448;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=11;TCR=36;TR=47;WE=156524229;WS=156524211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	156526234	rs2489139	C	T	1750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=14;PP=1047;SC=CATCTCATATCGCACTCACAA;SOR=1.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=41;TCR=14;TR=55;WE=156526242;WS=156526224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	156526430	rs35160849	G	A	1511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=32;PP=704;ReadPosRankSum=0.595;SC=CCTTCACAGTGTCAGCCGCCA;SOR=0.656;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=123;TCF=57;TCR=66;TR=59;WE=156526452;WS=156526420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,72:0.49:148
chr1	156526444	rs2488269	T	C	4578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=59;PP=2084;SC=GCCGCCACTCTCCTCCGGATG;SOR=1.133;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=45;TCR=59;TR=104;WE=156526452;WS=156526420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr1	156526564	rs2489138	C	A	298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=9;PP=200;SC=CTAGGCTCCGCCGGGGGATCT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=156526572;WS=156526554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	156531871	rs1171545	A	G	2841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=58;PP=1762;SC=CTAGGAATCTACCCTCTTCTT;SOR=1.681;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=31;TCR=58;TR=89;WE=156531879;WS=156531861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr1	156532977	rs1171547	T	C	4892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=80;PP=2965;SC=CCAGCATCTCTTGGTAGACGG;SOR=0.800;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=158;TCF=78;TCR=80;TR=158;WE=156532985;WS=156532967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr1	156536123	rs2066378	T	C	726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.42;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	156536133	rs4382715	A	G	982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.80;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	156536221	rs2066377	G	C	3378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=42;PP=1730;SC=TCTTCTTCAAGGGAACCACGG;SOR=1.075;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=69;TCR=42;TR=111;WE=156536229;WS=156536211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr1	156536251	rs947662	T	C	4463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=57;PP=2644;SC=AACAGTGGCCTAGCTTGGCCA;SOR=0.924;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=84;TCR=57;TR=141;WE=156536259;WS=156536241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr1	156536353	rs947663	A	G	5366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=93;NR=90;PP=2965;SC=GAACATGAGAACACCTTCTCA;SOR=0.828;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=183;TCF=93;TCR=90;TR=183;WE=156536361;WS=156536343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr1	156536480	rs947664	T	C	1057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=24;PP=748;SC=TCCAACTCCCTTCTCTGCCCA;SOR=2.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=33;WE=156536488;WS=156536470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	156539154	rs6427319	T	C	2971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=34;PP=1723;SC=TCCATCTTCCTGGACTCCGCT;SOR=1.380;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=64;TCR=34;TR=98;WE=156539167;WS=156539144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr1	156553102	rs34924172	AG	A	864.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.938;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.27;MQRankSum=1.725;NF=11;NR=13;PP=765;ReadPosRankSum=-0.205;SC=AAGTCATGAAAGGACCTTCCA;SOR=0.456;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=60;TCF=30;TCR=30;TR=24;WE=156553110;WS=156553092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,32:0.41:78
chr1	156553762	rs11264502	A	C	523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=15;PP=418;SC=GTAAGCAGAGACGCTGTTCCC;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=156553770;WS=156553752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	156556321	rs10796961	G	A	3686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=78;NR=46;PP=2074;SC=CCATGGAGTCGGGCATCTGCA;SOR=1.092;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=78;TCR=46;TR=124;WE=156556329;WS=156556311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr1	156561414	rs6698493	T	C	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=0;PP=25;SC=GAATCCCAAGTGGAAGGGAAG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=156561422;WS=156561404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	156561557	rs149629319	G	GGGGCCGGGCC,GGGGTCGGGCC	1596.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=23;NF=8,14;NR=3,3;PP=253,109;SC=CACATGCGCCGGGGCCGGGCC;SOR=2.235;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=21;TCF=10;TCR=11;TR=11,17;WE=156561565;WS=156561547;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.61,0.39:33
chr1	156561651	rs7516274	G	C	3672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=49;PP=2076;SC=GGGCTCGCGCGTGCCGCGGAT;SOR=0.818;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=65;TCR=49;TR=114;WE=156561659;WS=156561641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr1	156562008	rs1925949	G	A	1488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=32;PP=930;SC=CAAGGTCAGTGGCACAACTCT;SOR=1.791;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=15;TCR=32;TR=47;WE=156562016;WS=156561998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	156562143	rs942959	G	A	208.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=2;PP=92;SC=AACCACCCTTGACTCTGCCTT;SOR=1.402;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=156562151;WS=156562133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	156563375	rs6427321	G	A	5831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=92;PP=2965;SC=GTGGGGTGGGGGAGATTGGGG;SOR=0.770;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=186;TCF=94;TCR=92;TR=186;WE=156563389;WS=156563365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr1	156563726	rs6427322	A	C	3712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=54;PP=2271;SC=ACTTGCTCATATCCCTCACAG;SOR=0.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=120;TCF=66;TCR=54;TR=120;WE=156563734;WS=156563716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr1	156563813	rs6668178	G	A	3453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=67;PP=2062;SC=CTGCTCTGGAGAAGAAGTACC;SOR=0.978;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=119;TCF=52;TCR=67;TR=119;WE=156563821;WS=156563803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr1	156563852	rs942963	C	T	2079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=46;PP=1307;SC=ACCCTGACACCGAGTGTGTCT;SOR=1.519;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=24;TCR=46;TR=70;WE=156563860;WS=156563842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr1	156563898	rs1270	T	C	669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=14;PP=415;SC=TGGGTATTCTTCCCAATAAAG;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=156563906;WS=156563888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	156564640	rs3795732	G	A	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.637;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=397;ReadPosRankSum=-2.988;SC=AGCAGCTGACGTCCCAGAGAT;SOR=0.269;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=22;WE=156564648;WS=156564630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,22:0.73:30
chr1	156564922	rs3795733	C	T	1832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.338;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=40;PP=1261;ReadPosRankSum=-0.875;SC=CTAGCCCCGCCATCCTTCTCA;SOR=0.491;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=182;TCF=100;TCR=82;TR=81;WE=156564930;WS=156564912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,84:0.44:189
chr1	156565049	rs72559129	A	AAC	11513.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=99;PP=2966;SC=CACCACCTAAAAGTTTCCTCA;SOR=0.884;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=134;TCF=26;TCR=108;TR=123;WE=156565057;WS=156565039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr1	156565834	rs12024215	G	C	759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.635;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=369;ReadPosRankSum=-0.231;SC=GGTCAAAGGTGGGGAGAAAAG;SOR=0.255;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=58;TCF=45;TCR=13;TR=30;WE=156565842;WS=156565824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,35:0.55:64
chr1	156567496	rs879461	C	T	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=175;ReadPosRankSum=-1.427;SC=TCCAGATAATCTCTCAGGTCT;SOR=0.317;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=11;WE=156567504;WS=156567486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr1	156594364	rs12405992	T	C	974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=23;PP=724;ReadPosRankSum=0.974;SC=TGACGCCTCTTATCCCCGACC;SOR=0.664;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=62;TCR=60;TR=46;WE=156594372;WS=156594354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,49:0.37:134
chr1	156594656	rs12567958	C	A	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=270;ReadPosRankSum=0.523;SC=AGCTTGAGATCAGGGCAGGGT;SOR=0.604;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=11;TCR=24;TR=19;WE=156594664;WS=156594646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,23:0.56:41
chr1	156617968	rs2277873	G	A	953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.041;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=27;PP=658;ReadPosRankSum=-0.209;SC=AGGTCCTCCCGGGGCCTCTGC;SOR=0.971;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=63;TCF=18;TCR=45;TR=36;WE=156617976;WS=156617958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,40:0.57:70
chr1	156618768	rs4661209	T	G	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.756;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=332;ReadPosRankSum=0.195;SC=TTGCCTGAAGTGGTCGTGGGT;SOR=1.246;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=17;WE=156618776;WS=156618758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
chr1	156622252	rs1056695	G	A	1199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.220;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=21;PP=893;ReadPosRankSum=1.421;SC=AGCCCAGGAGGAGTCACTCTC;SOR=1.056;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=123;TCF=72;TCR=51;TR=57;WE=156622260;WS=156622242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,56:0.43:130
chr1	156626358	rs6700323	C	A	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.661;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=222;ReadPosRankSum=0.141;SC=AGTGAAACCACAATGCCTCTC;SOR=0.148;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=15;WE=156626366;WS=156626348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr1	156626920	rs7524611	T	C	8947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=349;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=148;NR=169;PP=2965;SC=GAGGGGCCCCTGCCATATGCT;SOR=0.928;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=318;TCF=149;TCR=169;TR=317;WE=156626928;WS=156626910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,347:1.00:347
chr1	156628717	rs951964	C	A	676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.790;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=12;PP=494;ReadPosRankSum=0.937;SC=ACATGCAGCCCCATTCTGGGC;SOR=1.183;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=63;TCF=36;TCR=27;TR=30;WE=156628725;WS=156628707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,31:0.47:66
chr1	156639753	rs11582300	G	A	3804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=391;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.758;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=83;PP=2252;ReadPosRankSum=-0.006;SC=CAAACCCATCGGACTCCCCAT;SOR=0.646;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=359;TCF=190;TCR=169;TR=176;WE=156639761;WS=156639743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:202,189:0.48:391
chr1	156640156	rs3748570	G	A	7336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=140;NR=94;PP=2965;SC=TTCCTCCTGGGGGCCCTCGGG;SOR=0.937;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=235;TCF=140;TCR=95;TR=234;WE=156640164;WS=156640146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,272:1.00:272
chr1	156640678	rs2886443	G	A	2090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=53;PP=1872;SC=CCCCTGCCCCGGGCCTGGCTC;SOR=1.638;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=95;TCF=42;TCR=53;TR=82;WE=156640686;WS=156640668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr1	156646668	rs4278369	A	G	4987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=70;PP=2633;SC=CAGCTCTGCCACCTGGCTACT;SOR=0.780;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=162;TCF=92;TCR=70;TR=162;WE=156646676;WS=156646658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr1	156670545	rs4661213	C	T	402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=5;PP=336;SC=CCCCCACCACCACCTAGGGAT;SOR=0.836;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=13;WE=156670553;WS=156670535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	156696603	rs35890195	G	A	758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.711;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=4;PP=571;ReadPosRankSum=-0.897;SC=CTCCACAAACGTTGGTGTCTT;SOR=1.341;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=62;TCF=51;TCR=11;TR=32;WE=156696611;WS=156696593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,32:0.50:64
chr1	156705593	rs4311877	G	C	5799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=109;NR=90;PP=2965;SC=TCAGGCCCACGTGGCCCAGGA;SOR=0.770;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=200;TCF=110;TCR=90;TR=199;WE=156705601;WS=156705583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr1	156706559	rs8658	A	C,G	722.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;NF=5,2;NR=12,5;PP=313,60;SC=AGCCTGAGGAAACATCTCAGA;SOR=2.066;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=17,7;WE=156706567;WS=156706549;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.74,0.26:27
chr1	156707775	rs6670122	T	G	1662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=16;PP=1084;SC=ACAGCACTTTTTGGACCCAGA;SOR=1.919;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=35;TCR=16;TR=51;WE=156707783;WS=156707765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	156708244	rs28697076	C	G	3882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=3.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=342;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=73;PP=2336;ReadPosRankSum=1.249;SC=TGGGAAGATACGAAGGTTAGG;SOR=0.677;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=314;TCF=168;TCR=146;TR=156;WE=156708252;WS=156708234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,174:0.51:341
chr1	156713512	rs4437869	C	T	2734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.81;ReadPosRankSum=-0.782;SOR=0.347;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,101:0.99:102
chr1	156752048	rs2274503	C	G	4046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=65;PP=2394;SC=AACAGTGAGGCCTTACTTCAT;SOR=0.818;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=132;TCF=67;TCR=65;TR=132;WE=156752056;WS=156752038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr1	156752231	rs367770256	AT	A	248.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=220;SC=AAACACAGATATTTGAGGACT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=6;WE=156752239;WS=156752221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	156760887	rs11264554	C	A	1518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=24;PP=835;ReadPosRankSum=0.885;SC=GGCCACTCGCCTCTAAGGGGA;SOR=0.730;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=143;TCF=89;TCR=54;TR=64;WE=156760895;WS=156760877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,76:0.45:170
chr1	156784186	rs34887185	C	A	2459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.569;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=56;PP=1392;ReadPosRankSum=-1.911;SC=CCCAAGCAAGCATGCTGGAGC;SOR=0.577;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=221;TCF=104;TCR=117;TR=110;WE=156784194;WS=156784176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,122:0.51:239
chr1	156784982	rs926103	T	C	1010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.671;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=19;PP=642;ReadPosRankSum=-0.075;SC=ATTCCCTGTGTTGGAGGCAGC;SOR=0.898;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=46;TCR=31;TR=47;WE=156784990;WS=156784972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,50:0.54:93
chr1	156785617	rs1800601	G	A	5866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=96;PP=2965;SC=TGGGCAACTCGGCGCATGAAG;SOR=0.751;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=203;TCF=107;TCR=96;TR=203;WE=156785625;WS=156785607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr1	156785762	rs11325907	AG	A	4297.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.866;HP=4;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.826;NF=13;NR=49;PP=2971;ReadPosRankSum=-2.094;SC=GAGATGAGGGAGCTGCACCAC;SOR=0.824;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=112;TCF=32;TCR=80;TR=62;WE=156785787;WS=156785752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,110:0.60:183
chr1	156785771	rs7546838	A	G	3955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FS=2.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.35;ReadPosRankSum=-1.585;SOR=0.795;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,101:0.57:177
chr1	156785779	rs1800600	G	A	6971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=81;PP=2962;SC=CCACGCTGCCGCCCCAGGTTT;SOR=0.725;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=172;TCF=91;TCR=81;TR=172;WE=156785787;WS=156785752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr1	156786574	rs12738727	TC	AA	6083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.394;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=69;PP=2944;ReadPosRankSum=0.175;SC=ACTCAGCAACTCATCATCTCT;SOR=0.666;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=303;TCF=142;TCR=161;TR=135;WE=156786583;WS=156786564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,160:0.47:338
chr1	156845492	rs144271100	A	AGT,AGTGT	965.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=2.207;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.07;MQRankSum=0.490;QD=22.46;ReadPosRankSum=-0.777;SOR=1.688;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:9,21,13:0.49,0.30:43
chr1	156846233	rs6334	G	A	1907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=44;PP=1044;ReadPosRankSum=1.055;SC=AGGACTTCCAGCGTGAGGCTG;SOR=0.699;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=225;TCF=122;TCR=103;TR=95;WE=156846241;WS=156846223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,104:0.42:245
chr1	156848918	rs6336	C	T	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.837;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=261;ReadPosRankSum=0.063;SC=TCACAGATCCCATGGACCTGA;SOR=2.124;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=55;TCF=36;TCR=19;TR=22;WE=156848926;WS=156848908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,25:0.40:62
chr1	156848946	rs6339	G	T	774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.586;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=9;PP=462;ReadPosRankSum=0.871;SC=CTGCTGGCTGGTGGGGAGGAT;SOR=1.308;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=79;TCF=50;TCR=29;TR=35;WE=156848954;WS=156848936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,39:0.45:87
chr1	156848995	rs6337	C	T	3296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=31;PP=2267;SC=AGCTGCTGGCCGTGGCTAGCC;SOR=1.898;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=107;TCF=76;TCR=31;TR=107;WE=156849003;WS=156848985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr1	156875092	rs4661074	G	A	3570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.20;SOR=1.522;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr1	156875097	rs4661075	G	A	3747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.70;SOR=1.292;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr1	156875107	rs2644590	C	A	4109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.51;SOR=1.321;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr1	156875377	rs2644591	G	C	340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=5;NR=7;PP=203;SC=CCCCAGGATGGGGATCAGCAC;SOR=1.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=12;TCF=5;TCR=7;TR=12;WE=156875385;WS=156875367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	156875985	rs2644593	G	A	2726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=37;PP=1643;SC=TGGTTTTGGAGGAAGGTGGGG;SOR=0.985;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=52;TCR=37;TR=89;WE=156875993;WS=156875975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr1	156877457	rs1952294	T	C	6302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=114;PP=2965;SC=CAGCACCCATTCTTGCCAAAA;SOR=1.079;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=206;TCF=92;TCR=114;TR=206;WE=156877465;WS=156877447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr1	156883546	rs12137505	A	G	4618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=67;PP=2927;SC=CCCATTCTACAATAAAGGTAT;SOR=0.997;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=166;TCF=99;TCR=67;TR=165;WE=156883554;WS=156883536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr1	156884365	rs749256	T	C	3266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=28;PP=2206;SC=AGGAGAGGAGTGCAGTGGGAG;SOR=2.045;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=79;TCR=28;TR=107;WE=156884373;WS=156884355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr1	156884584	rs56260937	C	T	1417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.562;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=40;PP=961;ReadPosRankSum=-2.329;SC=GACGCCAGGACCGTTGAGGAG;SOR=0.743;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=171;TCF=70;TCR=101;TR=67;WE=156884592;WS=156884574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,72:0.39:184
chr1	156890672	rs41273221	T	C	2024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.494;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=39;PP=962;ReadPosRankSum=-1.127;SC=TCTGGCGCGGTGACCAAAAAG;SOR=0.517;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=170;TCF=97;TCR=73;TR=86;WE=156890684;WS=156890662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,99:0.51:193
chr1	156890854	rs41273223	C	G	1269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.785;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=33;PP=823;ReadPosRankSum=-0.605;SC=TGAACTCATACATACCTACGT;SOR=0.857;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=95;TCF=36;TCR=59;TR=52;WE=156890862;WS=156890844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,57:0.58:99
chr1	156894006	rs822438	C	G	122.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=4;PP=80;SC=TGTGAGTCGGCGGTATTCGAC;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=156894014;WS=156893996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	156894613	rs12117221	G	T	753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=12;PP=561;ReadPosRankSum=1.364;SC=TGGCGACGGTGGGGAGGTCGG;SOR=0.662;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=73;TCF=45;TCR=28;TR=32;WE=156894621;WS=156894603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,32:0.46:70
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chr1	156899288	rs11264584	G	A	801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.035;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=17;PP=574;ReadPosRankSum=0.172;SC=ATCATGTACAGAGGTGGTGGA;SOR=0.951;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=55;TCF=24;TCR=31;TR=29;WE=156899296;WS=156899278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,31:0.55:56
chr1	156899592	rs822427	A	G	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=24;ReadPosRankSum=0.078;SC=GGGTGCAGGAAGCTGTTCTGG;SOR=1.075;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=4;WE=156899600;WS=156899582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,4:0.16:25
chr1	156901888	rs822429	T	C	496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=364;ReadPosRankSum=0.923;SC=CTGAGGGTGTTTACCCCGACT;SOR=0.446;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=18;WE=156901896;WS=156901878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,18:0.86:21
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chr1	156902259	rs822430	G	A	2042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=21;PP=1105;SC=TCCTCGCCACGGTGCAGTATC;SOR=1.371;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=41;TCR=21;TR=62;WE=156902267;WS=156902249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr1	156902281	rs822431	T	G	1106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.712;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=17;PP=576;ReadPosRankSum=-0.328;SC=GATGCAGTTCTCCAAGGCCAA;SOR=0.800;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=93;TCF=55;TCR=38;TR=46;WE=156902289;WS=156902271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,56:0.50:111
chr1	156902574	rs11415803	A	AT	95.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=12.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.66;ReadPosRankSum=-0.731;SOR=2.925;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,9:0.25:36
chr1	156906881	rs2275198	G	A	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=7;PP=206;ReadPosRankSum=1.952;SC=GGGCCTTGGGGAGGAGGGTGT;SOR=0.495;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=18;TCF=7;TCR=11;TR=12;WE=156906889;WS=156906871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr1	156907031	rs4570419	C	T	900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.833;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=16;PP=490;ReadPosRankSum=-0.481;SC=CCAAGCCCTGCTTCCCTCACC;SOR=0.598;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=75;TCF=46;TCR=29;TR=40;WE=156907039;WS=156907021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,44:0.54:81
chr1	156907081	rs945508	T	C	3557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=54;PP=1662;SC=CTCAATGGTATGGAAGATCAT;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=121;TCF=67;TCR=54;TR=121;WE=156907089;WS=156907071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr1	156907115	rs868188	T	C	852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.511;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=20;PP=595;ReadPosRankSum=0.398;SC=AGGGCCAGGCTTGGAGGAGAG;SOR=0.814;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=107;TCF=57;TCR=50;TR=40;WE=156907123;WS=156907105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,43:0.36:120
chr1	156909303	rs3818807	T	A	1143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.658;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=15;PP=641;ReadPosRankSum=0.868;SC=CTAGCAAGGGTGCTTGTCTCC;SOR=0.788;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=121;TCF=79;TCR=42;TR=50;WE=156909311;WS=156909293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,58:0.43:135
chr1	156909695	rs2275199	G	A	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.218;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=22;PP=469;ReadPosRankSum=0.132;SC=GATGTCGCAGGTTCTCCACTG;SOR=1.155;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=78;TCF=30;TCR=48;TR=32;WE=156909703;WS=156909685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,34:0.37:93
chr1	156911379	rs2275200	A	G	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=306;ReadPosRankSum=0.047;SC=GGGGGCTGCTAGCTGAGCTTC;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=19;WE=156911387;WS=156911369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr1	156913955	rs187987721	A	G	1289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.612;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=39;PP=915;ReadPosRankSum=1.436;SC=CATGAGCACAATGCAGGGCCA;SOR=1.060;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=114;TCF=36;TCR=78;TR=54;WE=156913963;WS=156913945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,57:0.46:123
chr1	156914070	rs16837807	C	A	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.094;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=229;ReadPosRankSum=-0.024;SC=GTCATGTTTCCATGCTTGGGA;SOR=0.869;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=45;TCF=29;TCR=16;TR=21;WE=156914078;WS=156914060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,22:0.45:49
chr1	156914240	rs112088642	CCATTCATT	C,CCATT	1218.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=0,0;NR=19,19;PP=132,897;SC=TAAGGAGACACCATTCATTCA;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=19,19;WE=156914255;WS=156914230;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.27,0.73:30
chr1	156915038	rs2275201	C	T	525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.169;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=303;ReadPosRankSum=-0.569;SC=CTGAGAAGTCCAACATGGCGC;SOR=0.495;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=54;TCF=14;TCR=40;TR=24;WE=156915046;WS=156915028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,26:0.46:57
chr1	156916640	rs111988963	G	GCCTATCCCTT	983.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.139;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.900;NF=3;NR=15;PP=2897;ReadPosRankSum=-0.978;SC=CCAGACCCCTGCCTTTGCCAA;SOR=1.807;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=42;TCF=7;TCR=35;TR=18;WE=156916648;WS=156916630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,26:0.58:45
chr1	156925435	rs2275204	T	C	1122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.815;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=19;PP=522;ReadPosRankSum=-1.013;SC=TACTGGTACATGAAAGGGCTG;SOR=0.405;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=90;TCF=59;TCR=31;TR=48;WE=156925443;WS=156925425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,52:0.51:102
chr1	156927751	rs12132684	T	C	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.959;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=198;ReadPosRankSum=0.361;SC=GATGCACAAGTATTTGGTACA;SOR=0.136;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=12;WE=156927759;WS=156927741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr1	156928776	rs1572409	A	T	2621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.728;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=58;PP=1615;ReadPosRankSum=-0.582;SC=AGAGGGAAGGAGCCAGGGCCA;SOR=0.664;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=233;TCF=120;TCR=113;TR=116;WE=156928784;WS=156928766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,126:0.49:257
chr1	156930053	rs56372341	C	T	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=239;ReadPosRankSum=0.093;SC=AGCTACTGTGCAGTGTTCTGG;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=12;WE=156930061;WS=156930048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
chr1	156939067	rs2275206	G	A	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.323;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=245;ReadPosRankSum=0.089;SC=GCCCTGCTGGGACTCACCTCA;SOR=1.022;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=17;WE=156939075;WS=156939057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr1	156939175	rs1336149	C	T	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=0.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.02;ReadPosRankSum=-0.040;SOR=0.779;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,39:0.39:99
chr1	156941412	rs12136088	T	G	1311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.307;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=25;PP=850;ReadPosRankSum=-0.403;SC=AGAAGCCTTCTGTCCTTGCTT;SOR=0.389;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=125;TCF=80;TCR=45;TR=61;WE=156941433;WS=156941402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,67:0.49:137
chr1	156946898	rs1006168	T	G	2452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.193;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=56;PP=1549;ReadPosRankSum=-0.523;SC=CTCAACAGCTTAGCTCTCTTC;SOR=0.546;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=216;TCF=94;TCR=122;TR=104;WE=156946906;WS=156946888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,117:0.48:243
chr1	156947928	rs16837897	T	C	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.645;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=78;ReadPosRankSum=2.127;SC=TTAACTTGCTTTCCTCCCCAA;SOR=0.223;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=27;TCF=18;TCR=9;TR=10;WE=156947936;WS=156947918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr1	156947953	rs12141806	A	T	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.916;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=10;PP=274;ReadPosRankSum=-2.017;SC=GAGCTTTTCAACAGGACATTA;SOR=0.132;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=46;TCF=32;TCR=14;TR=23;WE=156947961;WS=156947943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,25:0.51:49
chr1	156954267	rs6427339	C	T	1375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.283;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=31;PP=728;ReadPosRankSum=-0.401;SC=CGCAGTGTCACTGGGAGGTTA;SOR=0.567;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=139;TCF=61;TCR=78;TR=61;WE=156954275;WS=156954257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,70:0.45:156
chr1	156954384	rs6427340	T	C	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.087;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.881;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=59;ReadPosRankSum=0.094;SC=TAAACACTATTGCAATGACAC;SOR=0.197;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=7;WE=156954392;WS=156954374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr1	157062575	rs12126791	T	C	1631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.570;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=32;PP=1035;ReadPosRankSum=-0.436;SC=TTTGCCTCCATCATGGGAGCA;SOR=0.756;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=150;TCF=83;TCR=67;TR=72;WE=157062583;WS=157062565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,79:0.48:166
chr1	157062739	rs12136960	C	G	1460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.117;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=37;PP=913;ReadPosRankSum=0.843;SC=CTTAAAAGCCCCTGGGAGCTG;SOR=0.891;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=129;TCF=62;TCR=67;TR=68;WE=157062747;WS=157062729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,73:0.52:141
chr1	157485720	rs1002967	T	C	366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=11;PP=264;SC=TCTTCCCTTGTGCCTGCGCTG;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=157485728;WS=157485710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	157548669	rs1885561	T	A	621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=19;PP=496;SC=CACATAATAATCCCTGGAACA;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=157548677;WS=157548659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	157557957	rs11799853	T	C	3400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=70;PP=2174;SC=ATTCCTGCTATCTCCTTCTTC;SOR=1.590;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=39;TCR=70;TR=109;WE=157557965;WS=157557947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr1	157566019	rs10489674	G	A	619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=3;PP=468;SC=CTCAGGAAAAGGATGAAATGG;SOR=2.531;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=157566027;WS=157566009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	157566211	rs12744410	A	G	5583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=106;PP=2965;SC=GAGCCCATACACTCATATGCT;SOR=1.043;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=188;TCF=82;TCR=106;TR=188;WE=157566219;WS=157566201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr1	157566285	rs369546605	CAGTGGCCAG	C	1250.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.95;ReadPosRankSum=1.014;SOR=0.559;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,33:0.50:66
chr1	157566287	.	GT	CG	1698	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=3;NR=11;PP=1698;QD=125.104848204;SC=GGGAAACACAGTGGCCAGACG;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=47;TCF=11;TCR=36;TR=14;WE=157566312;WS=157566277;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:33,14:0.30:47
chr1	157566291	.	CCAGACGCTCAGGCT	C	2932	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=0;NR=11;PP=2932;QD=20;SC=AACACAGTGGCCAGACGCTCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=11;WE=157566312;WS=157566277;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:23,11:0.32:34
chr1	157566297	rs201614073	GCTCA	G	1261.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.75;ReadPosRankSum=0.259;SOR=0.746;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,33:0.57:58
chr1	157566304	rs199776951	CT	C	1281.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.74;ReadPosRankSum=-0.355;SOR=0.787;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,33:0.61:54
chr1	157567751	rs1361889	A	G	3066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=56;PP=1652;SC=CTGCTCCAGGATTGGAGAAGG;SOR=1.074;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=103;TCF=47;TCR=56;TR=103;WE=157567759;WS=157567741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr1	157648543	rs2282284	T	C	941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=10;PP=593;ReadPosRankSum=0.491;SC=ATTCTCATAGTTTTCTTCATC;SOR=0.667;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=64;TCF=46;TCR=18;TR=37;WE=157648551;WS=157648533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,42:0.58:72
chr1	157648838	rs115274198	C	A	689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.313;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=19;PP=420;ReadPosRankSum=0.482;SC=ACGCACACTGCATTCCAAACC;SOR=0.408;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=43;TCF=10;TCR=33;TR=26;WE=157648846;WS=157648828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,30:0.59:51
chr1	157650960	rs12563943	T	C	941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.880;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=27;PP=610;ReadPosRankSum=-1.457;SC=GAAATCAATATTCTGGAAGTC;SOR=0.956;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=76;TCF=26;TCR=50;TR=39;WE=157650968;WS=157650950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,43:0.51:85
chr1	157651017	rs1806798	T	C	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.817;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=267;ReadPosRankSum=1.859;SC=CTGCTTCTGCTTGGGTCTTTT;SOR=0.153;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=13;WE=157651025;WS=157651007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr1	157652929	rs141977401	TA	T	1374.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.884;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.561;NF=29;NR=13;PP=576;ReadPosRankSum=-2.275;SC=CATTGAAATTTAAAAAAAAAC;SOR=1.179;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=86;TCF=50;TCR=36;TR=42;WE=157652937;WS=157652919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,66:0.56:118
chr1	157668390	rs7522061	T	C	5935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=110;PP=2965;SC=CATGGAGGATTGAGGAGAAGT;SOR=1.091;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=200;TCF=90;TCR=110;TR=200;WE=157668398;WS=157668380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr1	157669580	rs58517866	T	A	1338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.211;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=26;PP=703;ReadPosRankSum=-3.128;SC=ACTTCTTTTGTTTTTCCTTAT;SOR=0.505;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=115;TCF=60;TCR=55;TR=58;WE=157669588;WS=157669570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,66:0.50:131
chr1	157670290	rs945635	C	G	5347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=104;NR=78;PP=2965;SC=GGGCACCGGCCGGGCAGAGGG;SOR=0.850;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=182;TCF=104;TCR=78;TR=182;WE=157670298;WS=157670280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr1	157718231	.	C	CAAAT	601.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=310;ReadPosRankSum=0.866;SC=GATAGATAGACAAATAAATAA;SOR=0.743;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=6;WE=157718239;WS=157718221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr1	157718283	rs6696643	A	T	4929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=34;PP=2064;SC=CTCTATTGCAAACAATGCATC;SOR=1.681;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=114;TCF=80;TCR=34;TR=114;WE=157718291;WS=157718273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr1	157718325	rs3818813	T	G	2091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.500;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=39;PP=1288;ReadPosRankSum=0.296;SC=TGACAAGAACTACTTTGCAGT;SOR=0.623;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=190;TCF=111;TCR=79;TR=93;WE=157718333;WS=157718315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,106:0.48:219
chr1	157718430	rs2275232	T	G	1469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.394;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=39;PP=963;ReadPosRankSum=0.519;SC=AGACAAGAGTTCACAGATGTT;SOR=0.853;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=122;TCF=47;TCR=75;TR=62;WE=157718438;WS=157718420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,66:0.49:136
chr1	157718645	rs2275233	T	C	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=223;ReadPosRankSum=-0.162;SC=CTCAGAGCCCTTCCCAGTGGA;SOR=0.622;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=15;WE=157718653;WS=157718635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chr1	157718780	rs3818814	A	G	932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.824;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=23;PP=571;ReadPosRankSum=1.621;SC=TTGTATGATAATCCCCAGGGC;SOR=0.805;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=76;TCF=35;TCR=41;TR=42;WE=157718788;WS=157718770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,44:0.53:83
chr1	157718835	rs6662117	G	A	685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.081;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=20;PP=455;ReadPosRankSum=-0.359;SC=GAGAGCAGGTGGAAGCCCTGC;SOR=1.582;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=49;TCF=18;TCR=31;TR=29;WE=157718843;WS=157718825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,30:0.59:51
chr1	157737504	rs2873413	G	A	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-3.361;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.150;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=35;ReadPosRankSum=-1.335;SC=GGTGCTGCCTGCAGACACGGT;SOR=0.074;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=5;WE=157737512;WS=157737494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr1	157740186	rs10540465	GTC	G	2793.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=25;PP=2954;ReadPosRankSum=0.593;SC=TCCCACAGAAGTCAGGGTTTT;SOR=0.716;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=79;TCF=32;TCR=47;TR=41;WE=157740197;WS=157740176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,72:0.50:143
chr1	157740189	rs57139984	A	G	2802.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=26;PP=2962;ReadPosRankSum=0.657;SC=CACAGAAGTCAGGGTTTTACC;SOR=0.670;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=128;TCF=80;TCR=48;TR=63;WE=157740197;WS=157740176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,73:0.51:142
chr1	157771880	rs4971154	C	T	2665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.433;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=64;PP=1764;ReadPosRankSum=0.607;SC=AGTACAGGATCGGAGGAGAGC;SOR=0.645;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=268;TCF=131;TCR=137;TR=127;WE=157771888;WS=157771870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,132:0.47:282
chr1	157802877	rs2765500	T	C	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=154;ReadPosRankSum=-1.404;SC=AGCAGCTTCATGGCGCTTGTG;SOR=0.430;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=10;WE=157802885;WS=157802874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr1	157802979	rs2261295	C	T	767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=14;PP=436;ReadPosRankSum=-0.466;SC=CTGTAGGACTCACCTGAGCAG;SOR=0.775;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=73;TCF=46;TCR=27;TR=37;WE=157802987;WS=157802969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,38:0.47:81
chr1	157806006	rs2765503	G	A	1535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.615;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=37;PP=798;ReadPosRankSum=-0.087;SC=CCTTAGGCATGTACTCAGTCA;SOR=0.788;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=136;TCF=59;TCR=77;TR=66;WE=157806014;WS=157805996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,76:0.51:148
chr1	157811392	rs2260040	G	A	1632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=29;PP=1079;ReadPosRankSum=-0.185;SC=CCAGGTTGGCGGGGAGAAAGT;SOR=0.663;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=146;TCF=90;TCR=56;TR=75;WE=157811400;WS=157811382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,78:0.50:155
chr1	157963362	rs148023130	GCGGGCTCC	G	3012.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.15;QD=44.30;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr1	157963410	.	G	C	2289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.418;ClippingRankSum=0.000;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.201;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-1.037;NF=66;NR=30;PP=1424;ReadPosRankSum=-0.114;SC=CCGCTCCTCTGGCTCGCTCGC;SOR=0.836;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=187;TCF=123;TCR=64;TR=96;WE=157963418;WS=157963400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,102:0.52:195
chr1	158054379	rs927662	A	G	660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=22;PP=484;ReadPosRankSum=-0.500;SC=GGTGAGCTCCAGCCAGCTCCC;SOR=0.556;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=58;TCF=17;TCR=41;TR=30;WE=158054387;WS=158054369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,31:0.50:62
chr1	158056299	rs7367384	C	G	1459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=9;PP=945;SC=CCCCTCCAGCCCAAGCCCATC;SOR=2.670;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=38;TCR=9;TR=47;WE=158056307;WS=158056289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	158057420	rs7514301	A	T	693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.433;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=13;PP=409;ReadPosRankSum=1.491;SC=ACTGGAGCCGATACACTGCAA;SOR=0.387;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=57;TCF=37;TCR=20;TR=31;WE=158057428;WS=158057410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,34:0.54:63
chr1	158057633	rs36008419	C	G	1108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.417;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=32;PP=739;ReadPosRankSum=-0.521;SC=CAGCCAACCCCGAGATCTTGG;SOR=1.162;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=115;TCF=54;TCR=61;TR=51;WE=158057641;WS=158057617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,56:0.43:129
chr1	158057691	rs3820676	A	C	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;ReadPosRankSum=0.238;SC=GGGAGTGATAAGGAAGAGTTC;SOR=0.732;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=46;TCF=21;TCR=25;TR=15;WE=158057699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,15:0.29:51
chr1	158058109	rs6427419	C	A	1581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.539;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=29;PP=847;ReadPosRankSum=-2.441;SC=CTTCTTTCTCCCTCACAGTTG;SOR=0.419;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=157;TCF=99;TCR=58;TR=72;WE=158058117;WS=158058099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,80:0.46:175
chr1	158066834	rs6427420	A	G	4270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=80;NR=62;PP=2284;SC=TTTTAACTTCACAGGAAGTCT;SOR=0.767;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=142;TCF=80;TCR=62;TR=142;WE=158066842;WS=158066824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr1	158067047	rs874844	A	C	342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=10;PP=282;SC=ATTTTCACAAAAACCAGAAAC;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=158067068;WS=158067037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	158067060	rs11339854	TG	T	191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=191;SC=CCAGAAACCATGGGGGAATCC;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=6;WE=158067068;WS=158067037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	158146946	rs3021477	T	C	889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.784;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.016;NF=22;NR=19;PP=579;ReadPosRankSum=1.709;SC=CCTGTATGGCTTCTGAGAGAC;SOR=0.747;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=80;TCF=44;TCR=36;TR=41;WE=158146954;WS=158146936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,44:0.48:91
chr1	158153996	rs426336	T	C	1735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=16;NR=36;PP=1134;SC=CTCAGGTTCCTAAGACTTCAG;SOR=2.001;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=16;TCR=36;TR=52;WE=158154004;WS=158153986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	158224575	.	CTGTGTG	C,CTG	258	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.31;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=12;MMLQ=26;MQ=59.55;NF=0,0;NR=22,22;PP=203,258;QD=9.36363636364;SC=CTCTCTCTCTCTGTGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=84;TCF=1;TCR=83;TR=22,22;WE=158224590;WS=158224559;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.26:84
chr1	158263405	rs183570192	A	G	1136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.958;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=36;PP=843;ReadPosRankSum=-0.396;SC=AATAAAAACCAAATTCTAATT;SOR=1.101;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=99;TCF=29;TCR=70;TR=49;WE=158263413;WS=158263395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,50:0.50:101
chr1	158298058	rs185915931	C	T	1722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.580;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=40;PP=888;ReadPosRankSum=-0.401;SC=CTGTTAAAAACAGAAGAACAA;SOR=0.602;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=141;TCF=63;TCR=78;TR=74;WE=158298066;WS=158298048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,86:0.52:165
chr1	158326447	rs376156858	CT	C	33.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=4.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.56;ReadPosRankSum=2.103;SOR=1.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,11:0.18:60
chr1	158532614	rs41273499	G	A	1863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.085;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=41;PP=1202;ReadPosRankSum=-2.844;SC=GCCCGGGGCCGTGCATAGGTG;SOR=0.610;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=184;TCF=98;TCR=86;TR=84;WE=158532622;WS=158532604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,90:0.44:203
chr1	158565115	rs1332688	G	T	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.744;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.89;ReadPosRankSum=-0.980;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr1	158577167	rs2427808	A	T	1674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.263;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=39;PP=950;ReadPosRankSum=-1.358;SC=TGGGTAAAGGATGAAGGTTAC;SOR=0.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=142;TCF=64;TCR=78;TR=70;WE=158577175;WS=158577157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,79:0.50:159
chr1	158580921	rs66981873	GCA	G	57.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.40;ReadPosRankSum=-0.450;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr1	158587784	rs857717	T	G	2768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=30;PP=1845;SC=AATTCTTCCATAATAATATAA;SOR=1.449;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=62;TCR=30;TR=92;WE=158587792;WS=158587770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr1	158607788	rs2518492	T	G	2136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=24;PP=1400;SC=TACTCGCTTGTATTATCCACA;SOR=1.223;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=45;TCR=24;TR=69;WE=158607796;WS=158607778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr1	158619728	rs2482965	A	C	5516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=87;PP=2965;SC=CCCCAGCGGGAATTCAATTCC;SOR=0.723;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=181;TCF=94;TCR=87;TR=181;WE=158619736;WS=158619718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr1	158639601	rs2298801	A	G	3857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=82;PP=2540;SC=ATAAAAATGAATGCTTTTCCT;SOR=1.244;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=137;TCF=55;TCR=82;TR=137;WE=158639609;WS=158639591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr1	158644105	rs703116	T	A	5735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=120;NR=64;PP=2965;SC=ACAAACTCTGTTAAACTAGAT;SOR=1.314;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=184;TCF=120;TCR=64;TR=184;WE=158644113;WS=158644095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr1	158647495	rs325996	A	T	8227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=138;NR=143;PP=2965;SC=CACTCATGACAGCAAGATTTC;SOR=0.767;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=281;TCF=138;TCR=143;TR=281;WE=158647503;WS=158647485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,307:1.00:307
chr1	158647631	rs325995	T	A	1453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=35;PP=989;SC=ATCCCTGCAGTCATTAACAAG;SOR=2.494;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=11;TCR=35;TR=46;WE=158647639;WS=158647621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	158654786	rs385096	C	T	260.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=182;SC=TGTTTCTAAACGGAATCTAAT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=158654794;WS=158654776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	158655036	rs435080	G	A	6358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=104;NR=106;PP=2965;SC=CCCTCTCAGCGACCCGCTCCT;SOR=0.746;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=210;TCF=104;TCR=106;TR=210;WE=158655044;WS=158655026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr1	158655162	rs2564859	C	A	2693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=58;PP=1661;SC=GATTCTGTTACTTGCTAGTTC;SOR=1.683;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=30;TCR=58;TR=88;WE=158655170;WS=158655152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr1	158656281	rs2564858	T	C	1281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=29;NR=13;PP=742;SC=AATATGTACTTACGGTTTCCT;SOR=1.225;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=29;TCR=13;TR=42;WE=158656289;WS=158656271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	158656347	rs111674514	C	CAGAG,CAG	1888.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.48;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;NF=3,3;NR=16,16;PP=124,526;SC=TAAAATGTGTCAGAGAGAGAG;SOR=0.902;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=19,19;WE=158656355;WS=158656337;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:43
chr1	158687896	rs857705	C	T	2599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.035;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=45;PP=1449;ReadPosRankSum=0.648;SC=GATTGGTTTCCGCTCTCCATA;SOR=0.609;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=190;TCF=107;TCR=83;TR=100;WE=158687904;WS=158687886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,120:0.54:222
chr1	158735595	rs857824	C	T	3432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=65;NR=48;PP=1917;SC=CTCCTTGTTGCGCAAGCTGTA;SOR=0.895;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=65;TCR=48;TR=113;WE=158735603;WS=158735585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr1	158735691	rs857825	T	C	4691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=83;NR=69;PP=2342;SC=CTTCTTCAGCTGCACATACAT;SOR=0.750;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=83;TCR=69;TR=152;WE=158735699;WS=158735681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr1	158735740	rs857826	A	G	4777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=72;PP=2702;SC=ACCACAGTGAAGTGGGAGGCA;SOR=0.777;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=72;TCR=72;TR=144;WE=158735748;WS=158735730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr1	158735892	rs857827	A	G	6641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=114;NR=109;PP=2965;SC=TAGGACATTTATAGACGTATC;SOR=0.718;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=224;TCF=115;TCR=109;TR=223;WE=158735900;WS=158735882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr1	158736215	rs6666753	G	A	4998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=74;PP=2965;SC=TTTTCTCACTGAGCAAGTTTG;SOR=0.749;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=158;TCF=84;TCR=74;TR=158;WE=158736223;WS=158736205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr1	158736445	rs1864346	C	T	978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=21;PP=440;ReadPosRankSum=-0.044;SC=ATGAATTCTGCTACCTGGCTC;SOR=0.684;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=94;TCF=38;TCR=56;TR=36;WE=158736453;WS=158736435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,50:0.43:116
chr1	158736517	rs1864347	A	T	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-3.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=149;ReadPosRankSum=-1.190;SC=GAAGGATAGGAAAGAAAGTTG;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=9;WE=158736525;WS=158736507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr1	158813819	rs857870	A	G	3213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.448;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=75;PP=2143;ReadPosRankSum=-0.319;SC=GTAAGCCCCCAGGTCCCTCAG;SOR=0.745;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=254;TCF=127;TCR=127;TR=149;WE=158813827;WS=158813803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,156:0.58:270
chr1	158817474	rs2261107	A	G	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.588;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=167;ReadPosRankSum=-0.150;SC=TCTATATGATACTAACAATCC;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=8;WE=158817482;WS=158817464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr1	158906555	rs1633280	A	C	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.605;NF=5;NR=0;PP=61;ReadPosRankSum=2.484;SC=AAACTGGAAGAATTCCCTTTG;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=5;WE=158906563;WS=158906545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr1	158909164	rs2325704	C	A	1329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=5;PP=927;SC=ACTGAGAATTCACTGCATTTT;SOR=3.516;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=35;TCR=5;TR=40;WE=158909172;WS=158909154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	158913525	rs856082	A	G	2259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.66;SOR=2.080;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	158913525	.	ATATGCAC	GTATGCAC,GTATGCAT	482	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=43,19;NR=11,4;PP=482,441;QD=9.56983726939;SC=AGACTTTCCTATATGCACGGT;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=43;TCR=11;TR=54,23;WE=158913540;WS=158913515;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:54
chr1	158913532	rs4656498	C	T	798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=2.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.58;ReadPosRankSum=-1.445;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,36:0.52:69
chr1	158943295	rs144676333	T	TCA	146.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=308;ReadPosRankSum=0.478;SC=AAAGGGATTTTCACACACACA;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=9;WE=158943303;WS=158943285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr1	158946629	.	A	AATATATGTAT	1838	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=7;PP=1838;QD=266.142857143;SC=CACAGAAAATAATATATGTAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=7;WE=158946637;WS=158946619;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:19,7:0.27:26
chr1	158986477	rs866484	G	C	7417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=132;NR=116;PP=2965;SC=CCACCCAACAGTTCTTCAACT;SOR=0.791;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=248;TCF=132;TCR=116;TR=248;WE=158986485;WS=158986467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,275:1.00:275
chr1	158987941	rs856046	A	G	1806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=9;PP=1340;SC=GCCCTGTGTTATACTGAGGTC;SOR=3.180;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=44;TCR=9;TR=53;WE=158987949;WS=158987931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	159002222	rs861318	A	G	986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=4;PP=660;SC=AGACCTATTAAAATCTAATAA;SOR=3.126;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=28;WE=159002230;WS=159002212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	159002301	rs2518553	T	C	6010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=132;NR=74;PP=2965;SC=AAACAGAAAATGAATACTTTC;SOR=1.278;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=206;TCF=132;TCR=74;TR=206;WE=159002323;WS=159002291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr1	159002377	rs1057027	C	A	9227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=161;NR=162;PP=2965;SC=CCAGGAACAGCGTCAGCTTCC;SOR=0.765;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=323;TCF=161;TCR=162;TR=323;WE=159002397;WS=159002367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,346:1.00:346
chr1	159002389	rs1057028	T	A	8309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=140;NR=156;PP=2965;SC=TCAGCTTCCATATCCTTCAGA;SOR=0.850;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=296;TCF=140;TCR=156;TR=296;WE=159002397;WS=159002367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,313:1.00:313
chr1	159169641	rs862999	T	C	889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.756;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=21;PP=506;ReadPosRankSum=0.257;SC=TCATCTTCCTTGGCCACTACT;SOR=0.602;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=43;TCR=42;TR=42;WE=159169649;WS=159169631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,45:0.46:97
chr1	159174824	rs863001	G	C	9428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=349;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=161;NR=154;PP=2965;SC=CTCATTTCCCGTGCTGTTTGC;SOR=0.728;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=315;TCF=161;TCR=154;TR=315;WE=159174832;WS=159174814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,348:1.00:348
chr1	159174920	rs863002	C	T	1873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=0.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.98;ReadPosRankSum=-1.655;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,81:0.60:134
chr1	159175004	rs17838198	CT	C	273.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=305;ReadPosRankSum=-0.114;SC=CTCTTGGTGCCTTTTCCTTCT;SOR=1.765;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=10;WE=159175012;WS=159174994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr1	159402584	rs11419544	G	GT	3016.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=52;PP=2679;SC=CTATCAAGGAGTTATTACTTT;SOR=1.954;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=68;TCF=10;TCR=58;TR=62;WE=159402592;WS=159402574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr1	159409196	rs6691297	T	C	4171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=45;PP=2330;SC=TGAGAACCTCTGAGTGTAATA;SOR=1.255;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=128;TCF=83;TCR=45;TR=128;WE=159409204;WS=159409186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr1	159409479	rs12145616	T	G	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.594;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=339;ReadPosRankSum=0.659;SC=GATTTGTAACTGAGAACTATT;SOR=0.297;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=18;WE=159409487;WS=159409469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr1	159409533	rs10908721	G	A	3899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=31;PP=2533;SC=TGCTTTACTGGGACTATGTGA;SOR=2.045;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=117;TCF=86;TCR=31;TR=117;WE=159409541;WS=159409523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr1	159409734	rs10908722	G	T	11996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=445;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=215;NR=187;PP=2965;SC=TCATCCGAATGGATCTTCATC;SOR=0.753;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=403;TCF=215;TCR=188;TR=402;WE=159409742;WS=159409724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,445:1.00:445
chr1	159409884	rs12118628	G	A	1765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.531;HP=3;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=43;PP=1137;ReadPosRankSum=0.702;SC=CCACACAGATGTTCTTTTTTG;SOR=0.632;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=187;TCF=84;TCR=103;TR=81;WE=159409892;WS=159409874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,86:0.43:200
chr1	159410340	rs12409540	T	A	2226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.675;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=42;PP=1356;ReadPosRankSum=-1.523;SC=ACTACAGCTGTGCCTCCATTG;SOR=0.559;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=194;TCF=110;TCR=84;TR=95;WE=159410348;WS=159410330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,106:0.50:214
chr1	159505101	rs35393723	G	A	2636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.529;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=57;PP=1561;ReadPosRankSum=0.630;SC=GTCTTCTTCCGGCCCTCAGCT;SOR=0.682;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=226;TCF=117;TCR=109;TR=113;WE=159505109;WS=159505091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,125:0.51:247
chr1	159505297	rs4656837	C	T	3323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.349;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=66;PP=2125;ReadPosRankSum=0.912;SC=TGCCACAGAACGGCAAATTGA;SOR=0.779;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=292;TCF=161;TCR=131;TR=149;WE=159505305;WS=159505287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,158:0.51:309
chr1	159558258	rs2808661	A	G	4660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=78;PP=2803;SC=GTTACTTTGTAGAAGCTCAGC;SOR=0.870;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=74;TCR=78;TR=152;WE=159558266;WS=159558248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr1	159684047	.	C	CCA	208	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=0;NR=6;PP=208;QD=35.1666666667;SC=CAGTTACACACCACACACACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=6;WE=159684055;WS=159684037;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:14,6:0.30:20
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chr1	159778699	rs12042065	G	A	1102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.848;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=12;PP=777;ReadPosRankSum=-0.939;SC=AGCCTCCTGGGGCTTCATCAT;SOR=0.827;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=91;TCF=67;TCR=24;TR=46;WE=159778707;WS=159778689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,48:0.51:95
chr1	159799599	rs11422063	C	CA	3651.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=29;PP=2968;SC=CAGATGCATGCAAAGAAGGAT;SOR=1.588;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=78;TCF=47;TCR=31;TR=70;WE=159799607;WS=159799589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr1	159799910	rs34687326	G	A	5884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=109;PP=2965;SC=TGGAGACAGCGGCAACTTCTC;SOR=0.957;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=200;TCF=91;TCR=109;TR=200;WE=159799918;WS=159799900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr1	159824967	rs2501340	G	C	2703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.51;SOR=0.732;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr1	159825061	rs2501339	G	C	3150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=59;NR=42;PP=1714;SC=CGTATCTGGAGAGCCCTGCAG;SOR=0.761;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=59;TCR=42;TR=101;WE=159825069;WS=159825051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr1	159828128	rs2494504	A	G	2361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=54;PP=1639;SC=CAGAGCCAAGAAGGGCCATGT;SOR=1.638;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=27;TCR=54;TR=81;WE=159828136;WS=159828118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr1	159850401	rs7550537	C	G	3957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=53;PP=2468;SC=CCTGAGCCAGCAGTTCTGCTT;SOR=1.052;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=78;TCR=53;TR=131;WE=159850409;WS=159850391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr1	159889686	rs2252815	G	A	1214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=33;PP=690;ReadPosRankSum=-0.557;SC=AGCTCAGCGTGCACCACCCTC;SOR=0.716;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=121;TCF=51;TCR=70;TR=57;WE=159889694;WS=159889676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,63:0.47:135
chr1	159890459	rs11265297	T	C	788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.079;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=25;PP=550;ReadPosRankSum=0.085;SC=ACCAGAACTGTTACCAAATGC;SOR=1.085;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=74;TCF=21;TCR=53;TR=33;WE=159890467;WS=159890449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,36:0.46:79
chr1	159897126	rs13052	C	T	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.213;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=71;ReadPosRankSum=0.495;SC=AGCCTCACATCAGGGATGTTC;SOR=0.473;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=6;WE=159897134;WS=159897116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr1	159897388	rs1934074	C	T	1374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.283;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=36;PP=851;ReadPosRankSum=0.715;SC=ATGTGAAGCTCGCTAGGCCCT;SOR=0.959;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=121;TCF=48;TCR=73;TR=58;WE=159897396;WS=159897378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,64:0.49:131
chr1	159898100	rs3747615	A	G	1160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.118;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=29;PP=877;ReadPosRankSum=1.642;SC=TGCCTCGCCCACTGCTCTGGC;SOR=1.140;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=75;TCF=33;TCR=42;TR=48;WE=159898108;WS=159898090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,49:0.61:80
chr1	159898913	rs7543462	A	G	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.225;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=144;ReadPosRankSum=-0.609;SC=CAGAGCTAGGAAGAACAAGCG;SOR=1.409;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=31;TCF=18;TCR=13;TR=10;WE=159898921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,12:0.34:35
chr1	159902526	rs3827531	T	C	739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.738;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=26;PP=447;ReadPosRankSum=0.874;SC=GGGGGCAGGATGAGAAACCCA;SOR=1.067;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=94;TCF=37;TCR=57;TR=39;WE=159902534;WS=159902516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,41:0.39:104
chr1	159906156	rs10908750	A	G	1329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.250;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=29;PP=834;ReadPosRankSum=1.161;SC=TGCATAGGTAACCCTGGACCC;SOR=0.765;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=135;TCF=73;TCR=62;TR=64;WE=159906164;WS=159906146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,67:0.42:158
chr1	159906849	rs10797055	A	G	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=58;ReadPosRankSum=-1.030;SC=CACCCTGTCTACTGCACCCAG;SOR=0.293;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=6;WE=159906857;WS=159906839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr1	159907362	rs7524321	A	G	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.79;ReadPosRankSum=-2.478;SOR=0.090;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr1	159907367	rs7526647	T	C	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.99;ReadPosRankSum=-1.010;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr1	159913053	rs41264841	C	T	1818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.567;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=31;PP=1077;ReadPosRankSum=-0.819;SC=CTGGAGAAACCCCCAGTTCAG;SOR=0.781;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=164;TCF=101;TCR=63;TR=83;WE=159913061;WS=159913043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,87:0.49:177
chr1	159922369	rs2840583	C	T	2634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=60;PP=1730;SC=AATCAGGGATCGGGTCTGTTT;SOR=2.154;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=23;TCR=60;TR=83;WE=159922377;WS=159922359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr1	159922458	rs1317520	A	G	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.804;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=82;ReadPosRankSum=-1.279;SC=GGCAAAAGCAAACAAACCCAA;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=5;WE=159922466;WS=159922448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr1	159923111	rs2789417	T	G	2977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=36;PP=1860;SC=TAGACACATATATTGTACTGC;SOR=1.200;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=65;TCR=36;TR=101;WE=159923119;WS=159923101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr1	160061934	rs12408242	T	C	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=193;ReadPosRankSum=-0.907;SC=GGGCTGGAAGTTGGATTTTTT;SOR=0.527;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=13;WE=160061942;WS=160061930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,14:0.78:18
chr1	160061959	rs12401728	C	T	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=241;ReadPosRankSum=0.421;SC=CTTCATGTGACATAATGTGGA;SOR=0.836;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=13;WE=160061967;WS=160061949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr1	160062472	rs2295622	C	T	2001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.71;ReadPosRankSum=0.840;SOR=0.701;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,97:0.57:171
chr1	160062727	rs2295621	A	G	1924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.515;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=39;PP=1053;ReadPosRankSum=0.726;SC=CCTCCCGCACATGTACAGGGA;SOR=0.639;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=177;TCF=95;TCR=82;TR=85;WE=160062735;WS=160062717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,97:0.48:201
chr1	160068068	rs12046504	A	C	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.596;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=64;ReadPosRankSum=-1.404;SC=GCGCAGCTGGACGCCGACCCC;SOR=1.115;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=25;TCF=16;TCR=9;TR=8;WE=160068076;WS=160068058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
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chr1	160090674	rs2854246	T	C	1886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=13;PP=838;SC=CCTGACTCTCTGGCTCTCCCT;SOR=1.574;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=34;TCR=13;TR=47;WE=160090692;WS=160090664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	160090681	rs67915591	CCCTT	C	2939.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.555;NF=13;NR=21;PP=1388;ReadPosRankSum=-0.781;SC=CTCTGGCTCTCCCTTCCTCCC;SOR=1.531;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=40;TCF=16;TCR=24;TR=34;WE=160090692;WS=160090664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,88:0.98:90
chr1	160093222	rs2820581	C	T	5850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=93;NR=99;PP=2965;SC=CCCACACGCCCGACCCGGGAA;SOR=0.836;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=192;TCF=93;TCR=99;TR=192;WE=160093230;WS=160093212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr1	160093648	rs41265763	G	A	1062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=23;PP=696;ReadPosRankSum=-3.261;SC=CATCTTGGATGGCACTGCCTG;SOR=0.700;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=91;TCF=47;TCR=44;TR=45;WE=160093656;WS=160093638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,49:0.47:104
chr1	160093911	rs2820582	T	C	1401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=23;PP=851;SC=AGCTCATCTTTTGTCAGCTCC;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=17;TCR=24;TR=39;WE=160093919;WS=160093901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	160093927	rs2854248	T	A	717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.289;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=16;PP=360;ReadPosRankSum=0.499;SC=GCTCCCAGGCTCTAAGATAGA;SOR=0.502;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=37;TCF=14;TCR=23;TR=27;WE=160093935;WS=160093917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,32:0.71:45
chr1	160095127	rs7548116	T	A	843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=28;PP=652;ReadPosRankSum=2.039;SC=AGTACTTACCTGGCAAAAGCT;SOR=0.767;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=51;TCF=8;TCR=43;TR=33;WE=160095135;WS=160095117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,33:0.62:53
chr1	160097315	rs2295623	C	A	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.342;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=351;ReadPosRankSum=2.620;SC=CACAAGGCACCCAACCTGATG;SOR=0.246;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=42;TCF=40;TCR=2;TR=19;WE=160097323;WS=160097305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,20:0.45:44
chr1	160097666	rs6695366	G	A	2737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=56;PP=1756;SC=TCTTTCCTCAGAGTGATAGAG;SOR=1.516;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=32;TCR=56;TR=88;WE=160097674;WS=160097656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr1	160098927	rs5778151	A	AG	404.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=8;PP=434;SC=GTGTCTCCAAAGCCTCTTGCT;SOR=1.445;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=160098935;WS=160098917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	160100201	rs17846713	C	G	3138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.904;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=66;PP=2024;ReadPosRankSum=0.240;SC=ATCCCTTCTGCCCCCCTTTAG;SOR=0.631;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=264;TCF=139;TCR=125;TR=135;WE=160100209;WS=160100191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,148:0.52:282
chr1	160121746	rs746362	C	T	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=2.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.874;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=122;ReadPosRankSum=0.050;SC=CCCCCTTGCCCGCGCGCCCTC;SOR=3.516;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=7;WE=160121754;WS=160121736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr1	160122826	rs11265335	G	A	525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=421;ReadPosRankSum=2.056;SC=CTCAAAAAAAGAATTGCAGGG;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=32;TCR=9;TR=22;WE=160122834;WS=160122816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,22:0.55:40
chr1	160124875	rs6427504	G	A	946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.968;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=13;PP=597;ReadPosRankSum=2.711;SC=CTGACTCGAGGTGGACCCAAT;SOR=0.889;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=67;TCF=45;TCR=22;TR=42;WE=160124883;WS=160124865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,44:0.61:72
chr1	160128671	rs4656888	G	A	930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=7;PP=657;SC=GAATGATGTGGTGGGTGACAG;SOR=2.448;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=31;WE=160128679;WS=160128661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	160128994	rs10908764	C	T	554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=12;PP=395;SC=ACACCTGGGCCGTTAGAGAAA;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=18;WE=160129002;WS=160128984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	160134205	rs11265338	C	T	1545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=41;PP=1072;SC=GGCTGTTGGCCACAGTCACTG;SOR=3.098;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=8;TCR=42;TR=49;WE=160134213;WS=160134195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	160136350	rs7529215	G	A	1003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.886;NF=32;NR=14;PP=652;ReadPosRankSum=-0.089;SC=AGCGCATGGCGCGGAAGAACT;SOR=0.638;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=67;TCR=29;TR=46;WE=160136358;WS=160136340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,46:0.47:97
chr1	160137300	rs4656889	A	C	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=288;ReadPosRankSum=0.499;SC=CACCTCGGAGAAGCAGAGGAG;SOR=0.741;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=54;TCF=16;TCR=38;TR=18;WE=160137308;WS=160137290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,20:0.35:57
chr1	160140998	rs1209804	G	A	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.990;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=130;ReadPosRankSum=-0.050;SC=CTGATCCTTGGTCTCTCCTCC;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=8;WE=160141006;WS=160140988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr1	160141196	rs625549	C	T	6133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=110;NR=93;PP=2965;SC=AAAATGCCTACTTAGAACTGG;SOR=0.775;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=203;TCF=110;TCR=93;TR=203;WE=160141204;WS=160141186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr1	160141285	rs669162	CC	TG	4020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.675;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=48;PP=2944;ReadPosRankSum=-0.129;SC=GGTTATTATCCCTGGGGTGAG;SOR=0.972;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=191;TCF=98;TCR=93;TR=91;WE=160141294;WS=160141275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,103:0.49:211
chr1	160141636	rs1891265	C	T	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.368;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=388;ReadPosRankSum=-0.129;SC=TGCTTAATACCCTTAGTTTAA;SOR=1.207;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=43;TCF=11;TCR=32;TR=22;WE=160141644;WS=160141626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,25:0.54:46
chr1	160145707	rs11805919	C	T	259.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=210;SC=GACGGCATGGCTCTGATTAAA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=160145715;WS=160145698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	160146173	rs881291	T	C	896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.743;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=21;PP=593;ReadPosRankSum=-0.192;SC=CAAGATGGATTGAGGCTGCGT;SOR=0.401;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=93;TCF=55;TCR=38;TR=41;WE=160146181;WS=160146163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,42:0.41:103
chr1	160147502	rs731852	T	G	4629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.61;SOR=1.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
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chr1	160147510	rs731853	G	A	1387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=0.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.17;ReadPosRankSum=0.947;SOR=0.620;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,64:0.56:114
chr1	160147517	rs11801984	A	G	1267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=2.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.21;ReadPosRankSum=-0.546;SOR=1.103;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,40:0.42:96
chr1	160147521	rs11806793	C	T	1230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=6.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.48;ReadPosRankSum=1.082;SOR=1.508;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,31:0.36:85
chr1	160151421	rs11265350	G	C	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.168;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=343;ReadPosRankSum=-0.111;SC=AGAAGCCTTAGGGTGTACAGA;SOR=1.061;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=72;TCF=55;TCR=17;TR=23;WE=160151429;WS=160151411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,28:0.36:77
chr1	160151450	rs7519748	T	C	960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.483;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=14;PP=641;ReadPosRankSum=-0.285;SC=CTGACACTGTTTCCTCTCTCC;SOR=1.094;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=116;TCF=73;TCR=43;TR=42;WE=160151458;WS=160151440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,47:0.38:125
chr1	160151624	rs36097870	G	GC	4120.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.265;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=46;PP=2433;ReadPosRankSum=0.341;SC=TCACAAAACAGCCCAGCACTC;SOR=0.778;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=193;TCF=53;TCR=140;TR=72;WE=160151632;WS=160151614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:195,156:0.44:351
chr1	160156027	rs12131640	C	G	857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.911;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=7;PP=575;ReadPosRankSum=-0.416;SC=TCTGGCATCTCTCTCTCCTGC;SOR=0.856;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=72;TCF=52;TCR=20;TR=34;WE=160156035;WS=160156017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,37:0.47:79
chr1	160163446	rs3747621	C	T	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.733;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=257;ReadPosRankSum=-1.312;SC=GATTATCAAACGGGCTGTGGC;SOR=0.124;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=17;WE=160163454;WS=160163436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr1	160163509	rs3747623	C	T	1049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.840;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=15;PP=625;ReadPosRankSum=-0.097;SC=GCTCACTACCCCACCCCTGCG;SOR=0.582;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=56;TCR=28;TR=44;WE=160163517;WS=160163499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,48:0.55:88
chr1	160164668	rs1186693	T	C	627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=3;PP=481;SC=GCACATGCAATCCCCCACACA;SOR=2.737;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=22;WE=160164676;WS=160164658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	160165095	rs2275703	A	C	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=8;PP=428;ReadPosRankSum=-0.025;SC=CCAGACAAGCACCTCCAGTAT;SOR=0.623;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=64;TCF=45;TCR=19;TR=28;WE=160165103;WS=160165085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,32:0.46:69
chr1	160165442	.	G	GC	234	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=11;HapScore=4;MGOF=24;MMLQ=15;MQ=60.83;NF=0;NR=4;PP=234;QD=60.75;SC=CTCCCTACCTGCCCCCCCCCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=4;WE=160165459;WS=160165432;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:12,4:0.25:16
chr1	160165451	rs10908769	C	T	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.852;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=10;HapScore=4;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=232;ReadPosRankSum=2.609;SC=TGCCCCCCCCCCCGGCTCCTC;SOR=0.148;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=7;WE=160165459;WS=160165432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr1	160168368	rs822450	G	A	1306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=21;PP=757;ReadPosRankSum=0.195;SC=ACAAAATTGAGGTTCAATGAA;SOR=0.741;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=125;TCF=79;TCR=46;TR=57;WE=160168376;WS=160168358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,64:0.45:141
chr1	160169473	rs959166	T	C	465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=1;PP=378;SC=TCCTCTTTTGTTGTTTAGTTC;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=160169481;WS=160169463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	160178356	rs667306	A	G	2438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=30;PP=1444;SC=TTTCTCCACGAGCCCTAAGGA;SOR=1.071;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=52;TCR=30;TR=82;WE=160178364;WS=160178346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr1	160247185	rs10594	G	C	1690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.483;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=42;PP=860;ReadPosRankSum=-1.089;SC=TACCTGTCATGGGCAATAGGA;SOR=0.976;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=163;TCF=76;TCR=87;TR=76;WE=160247193;WS=160247175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,83:0.47:176
chr1	160249857	rs141133579	T	C	891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.168;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=11;PP=659;ReadPosRankSum=-0.008;SC=CAAGAGGCCTTACCTGCTGCA;SOR=0.473;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=57;TCF=42;TCR=15;TR=37;WE=160249865;WS=160249847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,38:0.63:60
chr1	160251792	rs2795067	A	G	1373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=19;PP=734;ReadPosRankSum=-0.540;SC=ATGTGATGGAAAATGAAGAGA;SOR=0.659;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=125;TCF=79;TCR=46;TR=57;WE=160251800;WS=160251782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,67:0.47:143
chr1	160260233	rs2298104	T	C	713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.81;ReadPosRankSum=0.646;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,30:0.45:66
chr1	160263124	rs1317944	C	T	3140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.261;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=79;PP=1921;ReadPosRankSum=-0.135;SC=TGTTATATACCAATCAAGTAT;SOR=1.062;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=254;TCF=118;TCR=136;TR=134;WE=160263132;WS=160263114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,149:0.53:280
chr1	160265515	rs3789042	T	C	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=5;PP=432;ReadPosRankSum=-0.772;SC=ATGGGAGAAATAGGTACTTAC;SOR=0.673;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=39;TCR=9;TR=26;WE=160265523;WS=160265505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,29:0.54:54
chr1	160275434	rs2066320	A	G	5086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=97;PP=2965;SC=ATCGGGGTGGAAGGGAATGGT;SOR=1.147;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=166;TCF=69;TCR=97;TR=166;WE=160275442;WS=160275424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr1	160302444	rs4656897	G	A	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.555;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=88;ReadPosRankSum=-0.316;SC=TGCTTATCCAGTTTTACTTTT;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=6;WE=160302452;WS=160302434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr1	160303416	rs1802778	G	A	3319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.345;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=74;PP=1820;ReadPosRankSum=-2.383;SC=TAGATTGCCAGTTCCACACTC;SOR=0.571;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=292;TCF=142;TCR=150;TR=145;WE=160303424;WS=160303406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,165:0.50:331
chr1	160309664	rs1886419	T	G	2305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=32;PP=1182;ReadPosRankSum=-1.414;SC=CACATCCTCTTTCCTTTATTC;SOR=0.669;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=161;TCF=97;TCR=64;TR=84;WE=160309675;WS=160309654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,100:0.54:185
chr1	160313733	rs1886417	C	A	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=270;ReadPosRankSum=1.329;SC=TGTCCCCCTGCCTTGCCTCAG;SOR=0.795;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=54;TCF=12;TCR=42;TR=22;WE=160313741;WS=160313723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,23:0.56:41
chr1	160318940	rs6669689	A	G	2123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.565;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=54;PP=1412;ReadPosRankSum=-0.391;SC=CTGCTGGGAAAACATCCATAG;SOR=0.645;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=170;TCF=67;TCR=103;TR=92;WE=160318948;WS=160318930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,95:0.54:175
chr1	160393905	rs12086448	A	G	1853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.131;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=34;PP=1103;ReadPosRankSum=1.268;SC=AGGAGCAGAAAAACCCCAGGG;SOR=0.449;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=173;TCF=104;TCR=69;TR=79;WE=160393913;WS=160393895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,90:0.45:199
chr1	160394173	rs12087593	A	G	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.220;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=20;PP=458;ReadPosRankSum=0.246;SC=CTCACTGTCCACCTCATTTCT;SOR=1.077;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=67;TCF=20;TCR=47;TR=26;WE=160394181;WS=160394163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,29:0.40:73
chr1	160394937	rs17380127	A	C	1169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.509;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=23;PP=735;ReadPosRankSum=-1.686;SC=TGGCGGCTGGACCTACCATCC;SOR=0.368;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=120;TCF=71;TCR=49;TR=49;WE=160394945;WS=160394927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,55:0.43:127
chr1	160395003	rs17380141	G	A	1262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.767;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=23;PP=760;ReadPosRankSum=0.790;SC=GCGAGGAGCCGGTGACCAACG;SOR=0.856;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=145;TCF=78;TCR=67;TR=56;WE=160395011;WS=160394993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,63:0.40:158
chr1	160456712	rs3795329	G	C	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.759;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=213;ReadPosRankSum=-0.291;SC=ACTCAGTTATGCATGGTGATC;SOR=1.239;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=27;TCF=12;TCR=15;TR=13;WE=160456720;WS=160456702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,12:0.41:29
chr1	160458782	rs3795327	A	G	2002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.739;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=29;PP=1224;ReadPosRankSum=-0.100;SC=TCCTCCCCTCAGTGGTCATTT;SOR=0.833;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=177;TCF=115;TCR=62;TR=88;WE=160458790;WS=160458772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,100:0.48:207
chr1	160459909	rs12119876	C	A	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=2.334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.09;ReadPosRankSum=0.915;SOR=0.623;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,19:0.35:55
chr1	160460099	rs11265413	T	A	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=116;ReadPosRankSum=-0.178;SC=ACCCCGTGAGTGTTGGGATGT;SOR=1.022;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=7;WE=160460107;WS=160460089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr1	160466356	rs3795326	A	G	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.742;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=105;ReadPosRankSum=1.843;SC=TCACAGTCCCAGAGCTTCACC;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=6;WE=160466364;WS=160466346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr1	160580015	rs1061217	A	G	3425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=39;PP=1992;SC=TTCACCCTTCAGCCTCTATTC;SOR=1.249;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=78;TCR=39;TR=117;WE=160580023;WS=160580005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr1	160582213	rs2025515	C	A	1263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=23;PP=1039;ReadPosRankSum=-2.322;SC=AAAAAAAAAACTTCCTCATTT;SOR=1.061;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=67;TCF=44;TCR=23;TR=64;WE=160582221;WS=160582190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,55:0.96:57
chr1	160582248	rs11265449	C	G	3393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=69;NR=43;PP=2004;SC=TATTCCCTCTCTACGGAGAGT;SOR=0.810;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=70;TCR=43;TR=112;WE=160582256;WS=160582238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr1	160585554	rs149160	C	G	7491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=143;NR=111;PP=2965;SC=CTGATGATGACTGTCCTTATA;SOR=0.953;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=255;TCF=143;TCR=112;TR=254;WE=160585562;WS=160585544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,274:1.00:274
chr1	160585706	rs151607	C	T	2045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=48;PP=1414;SC=GGATTTTCTCCTAAAGCCTCC;SOR=2.406;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=14;TCR=48;TR=62;WE=160585714;WS=160585696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	160616768	rs12076998	G	A	1399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=41;PP=990;ReadPosRankSum=0.715;SC=GATCCTGGCCGGAGCCTGGCA;SOR=0.699;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=129;TCF=41;TCR=88;TR=60;WE=160616776;WS=160616758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,63:0.47:135
chr1	160650913	rs4656926	A	G	948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=11;PP=553;SC=AGGAGGCTGAATAGGACCCCC;SOR=1.148;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=21;TCR=11;TR=32;WE=160650921;WS=160650903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	160717872	rs527733	T	G	235.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=8;NR=0;PP=183;SC=TCCAGGAGGTTGTTGTGTTGG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=160717880;WS=160717862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	160720074	rs11581248	C	T	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.354;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=387;ReadPosRankSum=-0.630;SC=CTTCCCTGTGCCTCCACCCAT;SOR=1.124;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=40;TCF=32;TCR=8;TR=23;WE=160720082;WS=160720064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,25:0.53:47
chr1	160722064	rs527342	A	G	1016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=9;NR=26;PP=790;SC=GCTTAACTTCATCTTAATGGT;SOR=2.242;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=9;TCR=26;TR=35;WE=160722072;WS=160722054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	160766179	rs3831924	C	CT	80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=58;SC=CTGGGAGATTCTTTTTTTTGT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=3;WE=160766187;WS=160766169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	160789196	rs537540	A	C	3033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=65;PP=2054;SC=GCTATGGGGTATCTGGTCCAA;SOR=1.566;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=34;TCR=65;TR=99;WE=160789204;WS=160789186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr1	160803802	rs11265493	A	G	1237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=6;PP=763;SC=ACACATCTACATCAACAACAC;SOR=2.985;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=33;TCR=6;TR=39;WE=160803810;WS=160803792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	160809003	rs6682654	G	A	345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=287;SC=TTGCTCATTTGGTTAACCTCC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=160809011;WS=160808993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	160854876	rs150060331	C	T	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.245;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=146;ReadPosRankSum=1.934;SC=GCTGCACTTTCCTTGGGTACA;SOR=0.155;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=8;WE=160854884;WS=160854866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr1	160920813	rs790059	A	G	4523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=83;NR=71;PP=2628;SC=TCACCCAAGTAGGAGAGAAGT;SOR=0.753;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=155;TCF=84;TCR=71;TR=154;WE=160920821;WS=160920803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr1	160968609	rs41269993	G	A	1831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.263;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=30;PP=1238;ReadPosRankSum=1.428;SC=GCCAGAGTCCGGTAGCACCTG;SOR=0.829;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=147;TCF=88;TCR=59;TR=77;WE=160968617;WS=160968599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,82:0.52:158
chr1	160969008	rs3831190	T	TG	1051.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=22;PP=1094;SC=CAGGTATGGGTGGGGTAACAG;SOR=2.517;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=28;WE=160969016;WS=160968998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	160969110	rs2297222	T	C	1286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.587;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-1.099;NF=38;NR=19;PP=826;ReadPosRankSum=2.401;SC=CCCATTCCCCTAGGCCCACTT;SOR=1.006;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=96;TCF=63;TCR=33;TR=57;WE=160969118;WS=160969100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,60:0.56:108
chr1	160969585	rs790056	C	T	7075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=122;NR=103;PP=2965;SC=TCACTCACGGCACCTACAGTA;SOR=0.757;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=225;TCF=122;TCR=103;TR=225;WE=160969593;WS=160969575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
chr1	160969930	rs869985	A	C	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.232;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=7;PP=304;ReadPosRankSum=1.043;SC=ACCACCCCATACATACCAGCT;SOR=0.287;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=47;TCF=29;TCR=18;TR=16;WE=160969938;WS=160969920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,19:0.39:49
chr1	160970968	rs2297221	G	A	565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=16;ReadPosRankSum=-1.077;SC=GCAAATACACGAGATGGGGAA;SOR=0.710;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=40;TCF=14;TCR=26;TR=24;WE=160970976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,24:0.57:42
chr1	160971015	rs2297220	G	C	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.944;HP=2;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=233;ReadPosRankSum=-0.181;SC=GTGCTCTCTAGATCCCCAGGC;SOR=0.820;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=36;TCF=19;TCR=17;TR=14;WE=160971023;WS=160971005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,14:0.38:37
chr1	160971146	rs790055	A	G	4649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.21;SOR=0.722;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr1	160971146	.	AAGGAGAAAG	GAGGAGAAAC,GAGGAGAAAG	1059	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=25,66;NR=17,51;PP=505,1059;QD=13.2968541634;SC=CAGGGAGCCTAAGGAGAAAGA;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=117;TCF=66;TCR=51;TR=42,117;WE=160971163;WS=160971136;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.36:117
chr1	160971155	rs2297219	G	C	1020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=1.367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.24;ReadPosRankSum=-1.131;SOR=0.606;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,55:0.39:141
chr1	160990875	rs28365980	TC	CA	6513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FS=0.401;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.33;ReadPosRankSum=0.661;SOR=0.660;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:169,168:0.50:337
chr1	160990878	rs28365978	C	T	6434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FS=1.335;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.74;ReadPosRankSum=1.078;SOR=0.606;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:165,161:0.49:326
chr1	160990906	rs2481085	G	A	2539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=64;PP=1617;ReadPosRankSum=-0.440;SC=AGGACTCCTGGGAACAGACAC;SOR=0.663;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=206;TCF=79;TCR=127;TR=103;WE=160990914;WS=160990896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,114:0.49:233
chr1	161008849	rs6656547	C	A	907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=25;PP=572;ReadPosRankSum=0.845;SC=ACCAACCCACCGCAGAAGCCC;SOR=0.742;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=73;TCF=22;TCR=51;TR=35;WE=161008857;WS=161008839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,40:0.49:82
chr1	161010762	rs2073658	C	T	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.467;HP=2;HapScore=4;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=390;ReadPosRankSum=1.985;SC=ATTAGGACCACTTATGGTAGC;SOR=0.139;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=12;WE=161010782;WS=161010752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr1	161010774	rs2516841	A	G	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.197;HP=2;HapScore=4;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=390;ReadPosRankSum=-0.179;SC=TATGGTAGCTAGGTGTGGTGT;SOR=0.269;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=12;WE=161010782;WS=161010752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr1	161010791	rs2073657	C	T	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.582;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=109;ReadPosRankSum=-0.389;SC=GTGTCTCACACCTGTAATCCC;SOR=0.293;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=7;WE=161010799;WS=161010781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr1	161011209	rs17221763	G	A	710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=19;PP=406;ReadPosRankSum=0.569;SC=GACCTGTGAAGATGCAGGGTA;SOR=0.650;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=57;TCF=19;TCR=38;TR=28;WE=161011217;WS=161011199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,34:0.52:66
chr1	161011716	rs2774276	G	C	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.160;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=14;PP=393;ReadPosRankSum=-0.502;SC=GCTTCTATCCGTTGGGGTGGT;SOR=0.444;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=46;TCF=19;TCR=27;TR=26;WE=161011724;WS=161011706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,28:0.58:48
chr1	161011736	rs144100508	GGA	G	97.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=226;ReadPosRankSum=2.326;SC=TAGGTAGGGTGGAGAGAGAGA;SOR=0.941;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=6;WE=161011745;WS=161011726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,6:0.24:25
chr1	161012590	rs2073655	G	A	1422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.731;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=18;PP=939;ReadPosRankSum=-0.323;SC=GCCATGATGGGTTCTTAGTCT;SOR=0.844;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=107;TCF=71;TCR=36;TR=57;WE=161012598;WS=161012580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,61:0.54:114
chr1	161013121	rs2516839	C	T	1232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.531;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=31;PP=733;ReadPosRankSum=0.601;SC=GTCTTTGTATCTCCTGATTCA;SOR=0.512;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=105;TCF=41;TCR=64;TR=54;WE=161013129;WS=161013111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,60:0.51:117
chr1	161016801	rs17215366	T	G	2171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=46;PP=1126;ReadPosRankSum=-0.990;SC=GGCCCCAGCCTGGCTGGAGAA;SOR=0.726;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=162;TCF=75;TCR=87;TR=88;WE=161016809;WS=161016791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,106:0.55:192
chr1	161017761	rs112388093	C	T	3000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.427;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=68;PP=1993;ReadPosRankSum=-0.611;SC=GGTCTGGGTTCGCCGAACTCC;SOR=0.655;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=265;TCF=134;TCR=131;TR=133;WE=161017769;WS=161017751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,140:0.50:279
chr1	161018896	rs36089872	C	T	2137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=49;PP=1436;ReadPosRankSum=0.637;SC=CTTCCACATCCTGCTGCCTCT;SOR=0.702;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=197;TCF=97;TCR=100;TR=96;WE=161018904;WS=161018886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,101:0.48:212
chr1	161019040	rs3813609	G	C	3674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.830;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=74;PP=1997;ReadPosRankSum=-0.635;SC=GCGGAGTCCAGGGAACAGCAG;SOR=0.760;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=300;TCF=157;TCR=143;TR=162;WE=161019048;WS=161019030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,176:0.53:332
chr1	161022380	rs4396136	G	A	3839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=63;PP=2335;SC=CATGAAGGTCGGTGCAGGGGA;SOR=0.990;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=56;TCR=63;TR=119;WE=161022388;WS=161022370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr1	161022639	rs3813610	C	G	54.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.09;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	161023297	.	GA	TC	81	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;FR=0.9998;HP=2;HapScore=2;MGOF=120;MMLQ=28;MQ=62.13;NF=0;NR=2;PP=81;QD=67.2339374311;SC=TCTCTCTCTCGAATGACCTTA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=2;WE=161023306;WS=161023287;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,2:0.50:4
chr1	161043735	rs4656285	A	C	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.103;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=127;ReadPosRankSum=-0.805;SC=GGTGGCAGTGAGGCTGAAGAG;SOR=1.302;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=10;WE=161043743;WS=161043725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr1	161043764	rs4656978	G	A	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.484;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=48;ReadPosRankSum=-1.255;SC=TGCTGTGTGCGTGTGCATACT;SOR=0.307;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=9;TCF=4;TCR=5;TR=4;WE=161043772;WS=161043754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr1	161047125	rs60601836	CTATA	C	248.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.191;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.373;NF=6;NR=0;PP=263;ReadPosRankSum=-0.235;SC=CTGTCACATACTATATATAGC;SOR=0.078;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=6;WE=161047136;WS=161047118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr1	161049358	rs3820097	G	A	1026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=23;PP=567;ReadPosRankSum=1.662;SC=GGCTCAGACCGTACCCAGAGA;SOR=0.696;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=112;TCF=63;TCR=49;TR=51;WE=161049366;WS=161049348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,57:0.45:127
chr1	161184059	rs10629771	C	CTG	57.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=127;ReadPosRankSum=0.950;SC=AAATTGGCCTCTGTGTGTGTG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=9;WE=161184068;WS=161184049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr1	161191455	rs17244530	T	C	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQRankSum=0.833;QD=3.87;ReadPosRankSum=1.198;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr1	161192845	rs72374375	CCACACACACACA	C,CCACACACACA	1652.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.19;MQRankSum=0.600;QD=26.66;ReadPosRankSum=-0.599;SOR=0.684;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:8,41,13:0.66,0.21:62
chr1	161196166	rs3813628	A	C	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=7.908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.85;ReadPosRankSum=0.000;SOR=0.069;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr1	161200487	rs4073054	C	A	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=246;ReadPosRankSum=1.799;SC=CTAGACCCCACGATACCTGAA;SOR=0.693;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=13;WE=161200495;WS=161200484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,13:0.81:16
chr1	161200586	rs2307418	T	G	1501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.843;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=30;PP=895;ReadPosRankSum=-1.496;SC=CTCCAAGCCCTCAGTGTCCCA;SOR=0.434;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=142;TCF=89;TCR=53;TR=71;WE=161200594;WS=161200576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,76:0.49:154
chr1	161201350	rs11265567	G	T	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=16.52;ReadPosRankSum=1.049;SOR=0.238;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr1	161201350	.	GCG	TCA	248	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=2;NR=6;PP=248;QD=37.6834843578;SC=GAGTGCAGTGGCGTGATCTCT;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=8;WE=161201360;WS=161201340;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr1	161201352	rs11265568	G	A	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.342;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=16.52;ReadPosRankSum=1.131;SOR=0.238;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr1	161202605	rs2307424	G	A	1383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.049;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=29;PP=846;ReadPosRankSum=0.557;SC=ACCGGAAGACGGGCAGGTCCT;SOR=0.566;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=124;TCF=70;TCR=54;TR=62;WE=161202613;WS=161202595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,68:0.49:138
chr1	161206230	rs2307426	T	C	2051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.723;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=35;PP=1284;ReadPosRankSum=-1.817;SC=GCTATTTCCATTGGGGAGGAG;SOR=0.840;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=183;TCF=111;TCR=72;TR=91;WE=161206238;WS=161206220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,98:0.48:204
chr1	161208254	.	AAG	A	213.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.297;ClippingRankSum=0.000;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=4.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.12;ReadPosRankSum=2.052;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,20:0.20:101
chr1	161228800	rs4078110	C	T	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.187;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=189;ReadPosRankSum=-1.497;SC=CCGGCGCTGTCGGCAGGGCTG;SOR=0.260;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=13;WE=161228808;WS=161228790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr1	161253657	rs4255401	C	T	826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=22;PP=558;SC=TTTGGAACTACAGTACTATAT;SOR=2.621;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=28;WE=161253665;WS=161253647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	161254280	rs4477295	G	C	2193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=47;PP=1455;SC=GAATGGCCAGGCTTGCCCTTC;SOR=1.874;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=20;TCR=47;TR=67;WE=161254288;WS=161254270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr1	161276376	rs6685495	G	A	2101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=39;PP=1333;SC=TTCTGCCCACGCTCCCAGAGC;SOR=1.340;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=26;TCR=39;TR=65;WE=161276384;WS=161276366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr1	161276434	rs6674383	A	G	869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=10;PP=612;SC=CCCCCAACCTATCAGTCCTCC;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=16;TCR=10;TR=26;WE=161276442;WS=161276424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	161309239	rs115605940	C	T	1018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.508;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=17;PP=731;ReadPosRankSum=0.051;SC=TCCCAAAGTACTAGGATTACA;SOR=1.042;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=112;TCF=70;TCR=42;TR=50;WE=161309247;WS=161309229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,51:0.45:114
chr1	161332091	.	CTT	C	114.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.36;ReadPosRankSum=-0.992;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,6:0.75:8
chr1	161475750	rs10494360	G	A	4586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=61;PP=2495;SC=CCTGCTCGACGTTGATCCACT;SOR=0.894;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=150;TCF=89;TCR=61;TR=150;WE=161475758;WS=161475740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr1	161476204	rs9427397	CA	TG	8837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=97;NR=88;PP=2947;SC=TCTGACATGCCAGGGGGCTCG;SOR=0.734;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=186;TCF=97;TCR=89;TR=185;WE=161476213;WS=161476194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr1	161476533	rs9427399	T	C	1940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=21;NR=44;PP=1269;SC=TCACCCACCCTCTTTGCTTAG;SOR=1.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=65;TCF=21;TCR=44;TR=65;WE=161476541;WS=161476523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	161479599	rs7529425	G	A	2287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=21;PP=1558;SC=TATCATATTTGTGTCTTTCAG;SOR=1.981;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=78;TCF=57;TCR=21;TR=77;WE=161479607;WS=161479589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr1	161480649	rs11810143	A	G	8851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.023;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=158;NR=144;PP=2965;ReadPosRankSum=1.696;SC=GCTCTTCACCAATGGGGATCA;SOR=0.242;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=303;TCF=158;TCR=145;TR=302;WE=161480657;WS=161480639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,332:1.00:333
chr1	161483656	rs56157533	C	T	1923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-4.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.355;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-8.453;NF=68;NR=54;PP=1390;ReadPosRankSum=-1.284;SC=CAGCAGTGCCCTGGCTAATCT;SOR=0.441;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=314;TCF=188;TCR=126;TR=122;WE=161483664;WS=161483646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:201,112:0.36:313
chr1	161483750	rs395463	C	T	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=436;ExcessHet=3.0103;FS=6.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQRankSum=-20.599;QD=0.69;ReadPosRankSum=-6.199;SOR=1.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:377,59:0.14:436
chr1	161495477	rs72633678	A	T	6105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=103;PP=2965;SC=GGGGCTCCACACGCATCCCCA;SOR=0.766;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=204;TCF=101;TCR=103;TR=204;WE=161495485;WS=161495467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr1	161495885	rs404508	T	C	7109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=131;NR=106;PP=2965;SC=TAGAGGTGACTTTTGACATTG;SOR=0.772;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=237;TCF=131;TCR=106;TR=237;WE=161495893;WS=161495875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr1	161514542	rs396991	A	C	3441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=86;NR=56;PP=2805;SC=TTACTCCCAAAAAGCCCCCTG;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=142;TCF=86;TCR=56;TR=142;WE=161514550;WS=161514532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr1	161518333	rs10127939	A	C,T	7304.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=3.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=407;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=24;MQRankSum=10.327;NF=83,87;NR=83,85;PP=2007,2362;ReadPosRankSum=2.090;SC=GCTTGAGATGAGGCTCTCATT;SOR=0.700;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=403;TCF=204;TCR=199;TR=166,172;WE=161518341;WS=161518323;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.45,0.43:407
chr1	161561832	rs61801812	C	T	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.50;QD=20.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	161563281	rs149146947	A	AG	1742.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=18;PP=942;SC=AGGTGAGTACAGGTTGTCTCA;SOR=0.952;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=161563289;WS=161563271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	161565314	rs79316700	C	T	712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.88;QD=41.93;SOR=5.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	161565324	rs61801822	C	T	936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.70;QD=40.73;SOR=6.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	161565381	rs76277413	A	G	4812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.57;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=52;PP=2965;SC=CCAATTTGAGATGAGTAATCC;SOR=1.541;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=154;TCF=101;TCR=53;TR=152;WE=161565389;WS=161565371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr1	161569419	rs430178	C	G	382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=37.55;QD=29.44;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	161577657	rs61802306	G	A	4390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=80;PP=2965;SC=CGAGCAGTACGGGGCTGAGGA;SOR=0.912;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=149;TCF=69;TCR=80;TR=149;WE=161577677;WS=161577647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr1	161577669	rs61802307	G	A	4077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=71;PP=2965;SC=GGCTGAGGATGAGGCCCAGAG;SOR=0.814;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=140;TCF=69;TCR=71;TR=140;WE=161577677;WS=161577647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr1	161594226	rs61803008	C	T	2373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=59;NR=28;PP=1628;SC=CTCTTATTACCCCCATGGGAT;SOR=1.582;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=59;TCR=28;TR=87;WE=161594234;WS=161594216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr1	161594246	rs61803009	G	T	2933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=33;PP=2062;SC=TGGGGGTCATGTGTCTTGAGG;SOR=1.477;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=69;TCR=33;TR=102;WE=161594254;WS=161594236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr1	161594525	rs61803010	GT	CG	1308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.71;QD=43.63;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	161596283	rs418215	G	A	1193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=51;PP=1366;SC=AGATCCTGAGGCATAAGGGAA;SOR=4.021;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=4;TCR=51;TR=55;WE=161596291;WS=161596273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	161599693	rs76714703	T	C	3306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.72;QD=29.79;SOR=2.158;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr1	161600104	.	A	T	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.377;ClippingRankSum=0.000;DP=181;ExcessHet=3.0103;FS=12.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.67;MQRankSum=-8.339;QD=1.82;ReadPosRankSum=-2.837;SOR=1.851;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:149,31:0.17:180
chr1	161600189	rs115361564	A	C	1728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FS=4.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.54;MQRankSum=-1.271;QD=4.88;ReadPosRankSum=-1.760;SOR=0.957;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:249,105:0.30:354
chr1	161601133	rs61803027	T	C	738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=17;PP=474;SC=CCCTTTACTCTCCCAAAGGTC;SOR=2.215;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=23;WE=161601141;WS=161601123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	161643125	rs370506483	T	C	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=5.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.03;MQRankSum=-2.732;QD=3.55;ReadPosRankSum=0.516;SOR=0.295;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,25:0.25:101
chr1	161645259	rs1674759	T	G	184.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=3;NR=3;PP=87;SC=GGTCAGCTCTTAGTCTAACTC;SOR=0.941;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=6;WE=161645267;WS=161645249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	161676904	rs1340977	T	C	383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=1;PP=300;SC=CAAATCTGAATGATGAAAGCC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=161676912;WS=161676894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	161676970	rs1340978	A	G	1242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=12;PP=822;SC=GAGACAGTTAAATTTACTTCC;SOR=1.414;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=28;TCR=12;TR=40;WE=161676978;WS=161676960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	161680258	rs6427618	G	A	1619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.591;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=29;PP=868;ReadPosRankSum=-1.926;SC=CTGGTTTCCCGTACCAGCAGC;SOR=0.636;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=135;TCF=81;TCR=54;TR=70;WE=161680266;WS=161680248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,79:0.51:154
chr1	161680413	rs112039702	GA	G	862.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=3;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=172;ReadPosRankSum=1.141;SC=GGGTCTTTCCGAAAAAAAAAA;SOR=0.795;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=39;TCF=8;TCR=31;TR=18;WE=161680421;WS=161680403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,24:0.59:41
chr1	161680432	rs17405152	A	G	963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=396;ReadPosRankSum=0.739;SC=AAAGGTTTTGATGTCTTACTA;SOR=0.655;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=46;TCF=21;TCR=25;TR=24;WE=161680440;WS=161680422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,25:0.54:46
chr1	161680518	rs61801161	T	A	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.925;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=8;PP=183;ReadPosRankSum=1.402;SC=CATCATCATTTTCTGGTTCTC;SOR=0.846;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=65;TCF=37;TCR=28;TR=21;WE=161680526;WS=161680508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,26:0.37:70
chr1	161681848	rs4301614	C	T	2321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.083;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=43;PP=1319;ReadPosRankSum=-0.963;SC=TCCTCTTCTCCTTCTACAAGG;SOR=0.590;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=177;TCF=89;TCR=88;TR=91;WE=161681856;WS=161681838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,107:0.52:205
chr1	161682975	rs6688140	G	T	1559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=30;PP=919;ReadPosRankSum=-1.849;SC=CTCTGCCTCCGCCGCCAACCC;SOR=0.716;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=116;TCF=63;TCR=53;TR=64;WE=161682983;WS=161682965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,72:0.54:133
chr1	161695639	rs7520519	G	T	5601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.319;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=100;NR=78;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.597;SC=TGCCCTATGCGCCAGTGTTCG;SOR=0.464;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=179;TCF=100;TCR=79;TR=178;WE=161695647;WS=161695629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,203:1.00:204
chr1	161696088	rs1417582	T	C	7661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=123;NR=130;PP=2965;SC=CCGACGCACATCCTGGCTTCT;SOR=0.781;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=253;TCF=123;TCR=130;TR=253;WE=161696096;WS=161696078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,282:1.00:282
chr1	161697319	rs34868416	G	A	2431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.446;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=56;PP=1305;ReadPosRankSum=-0.299;SC=CTGCTCAAAGGCCTTCTGAGC;SOR=0.730;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=236;TCF=110;TCR=126;TR=107;WE=161697327;WS=161697309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,123:0.46:268
chr1	161697547	rs12044611	T	C	777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.833;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=23;PP=407;ReadPosRankSum=-0.184;SC=TTTGCATCCTTGTGTTTTGCT;SOR=1.013;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=77;TCF=34;TCR=43;TR=38;WE=161697555;WS=161697537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,40:0.46:87
chr1	161721351	rs7540096	A	G	455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=332;SC=TTGAGAAGCAAAAATGAAGTG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=13;WE=161721359;WS=161721341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	161721403	rs200382520	T	TG	398.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=2.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.64;MQRankSum=1.526;QD=15.95;ReadPosRankSum=-1.360;SOR=0.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr1	161721707	rs1063178	C	T	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.264;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=14;PP=304;ReadPosRankSum=1.225;SC=CAATGGGATACGAAGTGGATA;SOR=0.439;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=50;TCF=21;TCR=29;TR=25;WE=161721715;WS=161721697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,27:0.47:57
chr1	161722779	rs35439833	C	CAAA	518.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.157;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.57;MQRankSum=-0.000;QD=27.30;ReadPosRankSum=1.150;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr1	161722805	rs17415408	T	G	1145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.126;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.604;NF=32;NR=13;PP=793;ReadPosRankSum=-0.151;SC=ACCGCACATTTCATCCATGTT;SOR=0.469;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=71;TCF=51;TCR=20;TR=45;WE=161722813;WS=161722795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,47:0.70:67
chr1	161736035	rs2298019	A	G	1270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=16;PP=752;SC=TCGTGCGGCAAAAGTAGTTTG;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=28;TCR=16;TR=44;WE=161736043;WS=161736025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	161736052	rs111892839	C	A	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.979;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=9;PP=365;ReadPosRankSum=1.304;SC=TTTGTCTTTACTAGGCCACCG;SOR=0.850;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=38;TCR=19;TR=27;WE=161736060;WS=161736042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,29:0.46:63
chr1	161736209	rs35284289	T	C	1728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=39;PP=1130;ReadPosRankSum=-0.316;SC=CCGGGACTCTTTCACAGGCTG;SOR=0.675;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=175;TCF=92;TCR=83;TR=81;WE=161736217;WS=161736199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,88:0.45:197
chr1	161736272	rs113060703	C	T	1108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.892;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=30;PP=686;ReadPosRankSum=-0.907;SC=GGCTCGGGTTCGCGTCTAAAG;SOR=0.366;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=100;TCF=37;TCR=63;TR=52;WE=161736280;WS=161736262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,55:0.50:111
chr1	161751741	rs1058405	A	G	1188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.640;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=21;PP=626;ReadPosRankSum=1.844;SC=TTTGGATTTGATGCCTTGGGA;SOR=0.793;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=112;TCF=64;TCR=48;TR=51;WE=161751749;WS=161751731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,61:0.45:135
chr1	161754004	rs1503807	T	A	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.224;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=106;ReadPosRankSum=0.754;SC=GTCTCATTTATTGAGGGAACT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=7;WE=161754012;WS=161753994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr1	161761099	rs12045480	C	T	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=78;ReadPosRankSum=-0.847;SC=TGAAGTTACCCTGAAGTGTTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=5;WE=161761107;WS=161761093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr1	161771812	rs41271949	C	T	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=48;ReadPosRankSum=-0.637;SC=GTTGTGTACCCTTTGATTCCT;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=161771820;WS=161771809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr1	161772143	rs112792504	T	G	599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.282;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=21;PP=439;ReadPosRankSum=-0.580;SC=TGTTGCCTTGTTTTTGTTTTT;SOR=0.086;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=48;TCF=7;TCR=41;TR=27;WE=161772151;WS=161772133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,27:0.56:48
chr1	161789625	rs3817085	C	G	1192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=35;PP=753;ReadPosRankSum=1.241;SC=GTTAGTAATACGGCTGAGTCG;SOR=0.689;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=21;TCR=67;TR=46;WE=161789633;WS=161789615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,52:0.52:100
chr1	161822959	rs2340717	C	T	524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=2;PP=415;SC=GGTGAAACATCCATTTCTATG;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=161822967;WS=161822949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	161823011	rs2257107	T	A	620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.632;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=8;PP=389;ReadPosRankSum=-0.635;SC=CTATATTTTATAGGTTAAATC;SOR=0.340;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=45;TCF=32;TCR=13;TR=24;WE=161823019;WS=161823001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,27:0.54:50
chr1	161823197	rs3215134	G	GT	7010.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=82;PP=2936;SC=TCCCTAGAAGGTTGGTAAACT;SOR=1.059;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=94;TCF=9;TCR=85;TR=91;WE=161823205;WS=161823187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr1	161830214	rs144003510	GTA	G	167.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.884;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=18.64;ReadPosRankSum=1.210;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr1	161928327	rs9482	A	G	1823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.638;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=44;PP=1018;ReadPosRankSum=-0.910;SC=AAAGTTCGTCAGTTCCTCCTT;SOR=0.830;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=201;TCF=99;TCR=102;TR=86;WE=161928335;WS=161928317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,96:0.43:225
chr1	161954448	rs12726227	C	T	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=129;ReadPosRankSum=-0.608;SC=GAAGGGGGACCGCTCTCCAAG;SOR=0.098;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=9;WE=161954456;WS=161954438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr1	161967681	rs2499836	A	G	2975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=64;PP=1914;ReadPosRankSum=0.311;SC=GTTGTTCCCCACCCAGCAGGA;SOR=0.691;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=244;TCF=130;TCR=114;TR=135;WE=161967689;WS=161967671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,143:0.53:268
chr1	161976234	rs12022536	A	G	3729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.22;MQRankSum=-6.880;QD=25.37;ReadPosRankSum=-1.203;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,146:0.99:147
chr1	161976272	rs34863451	G	GA	3167.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.894;NF=16;NR=68;PP=932;ReadPosRankSum=1.218;SC=TCCTGAGAAGGAAAAAAAAAA;SOR=0.581;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=107;TCF=23;TCR=84;TR=84;WE=161976280;WS=161976262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:17,134:0.89:151
chr1	162257033	rs10800405	C	G	934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.61;ReadPosRankSum=-2.281;SOR=0.706;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,45:0.70:64
chr1	162302635	rs347306	T	C	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.270;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=257;ReadPosRankSum=0.644;SC=TTGTGGAATCTGTTGAAAGTG;SOR=0.274;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=15;WE=162302643;WS=162302625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr1	162302689	rs347307	C	T	1747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.169;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=23;PP=1067;ReadPosRankSum=-0.311;SC=AGAAGACTTTCTGTAATAACT;SOR=0.902;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=135;TCF=87;TCR=48;TR=71;WE=162302697;WS=162302679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,79:0.55:144
chr1	162313518	rs3751285	A	G	1711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=19;PP=1028;ReadPosRankSum=-1.295;SC=GCATATCTGAACAACTTTAGA;SOR=0.679;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=98;TCF=70;TCR=28;TR=63;WE=162313526;WS=162313508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,72:0.66:109
chr1	162313597	rs347278	T	C	6292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=110;NR=92;PP=2965;SC=TCCTCACCCATCCTGTTCTTC;SOR=0.774;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=202;TCF=110;TCR=92;TR=202;WE=162313605;WS=162313587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr1	162313735	rs3751284	C	T	2373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.723;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=52;PP=1359;ReadPosRankSum=0.909;SC=ATGGAGAGAGCGAGAGGAACA;SOR=1.088;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=156;TCF=76;TCR=80;TR=90;WE=162313743;WS=162313725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,106:0.59:179
chr1	162335052	rs905721	C	T	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.473;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=202;ReadPosRankSum=-0.083;SC=CCCAGATGCCCATGCTGCCCG;SOR=1.659;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=11;WE=162335060;WS=162335042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr1	162335424	rs1964052	T	C	265.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.54;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=7;PP=207;SC=GTCACTTTCCTTAAGTTTTTG;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=162335432;WS=162335414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	162343774	rs7512126	A	G	1601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.816;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=24;PP=904;ReadPosRankSum=-0.280;SC=TGGGAAGGACAGCAGGCTGTG;SOR=0.494;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=157;TCF=111;TCR=46;TR=72;WE=162343782;WS=162343764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,82:0.48:171
chr1	162344102	rs2282397	C	T	2222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.982;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=43;PP=1339;ReadPosRankSum=-1.546;SC=CTGGGTGCCACCTGGAAGCCA;SOR=0.864;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=183;TCF=99;TCR=84;TR=98;WE=162344110;WS=162344092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,109:0.53:204
chr1	162344390	rs164159	A	G	3248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=78;PP=2312;SC=CGTGCTGGGTATCCCCCAAGC;SOR=2.324;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=104;TCF=26;TCR=78;TR=104;WE=162344398;WS=162344380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr1	162345091	rs164181	G	A	1542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=9;PP=986;SC=TGGTGAGAGCGCTGTGTTCTG;SOR=2.437;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=38;TCR=9;TR=47;WE=162345099;WS=162345081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	162345294	rs3737312	G	T	947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.874;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=27;PP=644;ReadPosRankSum=-2.097;SC=GTACTTCAAGGCATCTCAACG;SOR=0.846;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=74;TCF=27;TCR=47;TR=41;WE=162345302;WS=162345284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,43:0.52:82
chr1	162346433	rs150155141	CA	C	2052.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.320;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.388;NF=19;NR=40;PP=997;ReadPosRankSum=0.005;SC=TTAAAAGCTTCAAAAAAAACC;SOR=0.943;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=128;TCF=38;TCR=90;TR=59;WE=162346441;WS=162346423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,96:0.51:187
chr1	162348637	rs164187	C	T	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=26;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GGGAGCCTGGCGGTTCCAGGG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=3;WE=162348645;WS=162348627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr1	162348662	rs164188	C	T	527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=1;PP=401;SC=CACCACTCCTCGTAGCAGGTC;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=162348670;WS=162348652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	162352819	rs1123005	A	G	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.782;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=144;ReadPosRankSum=0.474;SC=GCTAAGGCCTATGTGCCAAAC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=7;WE=162352827;WS=162352809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr1	162367235	rs164124	G	A	2283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=53;PP=1504;SC=CCTGAAAGTTGTATCTTTAAA;SOR=2.455;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=70;TCF=16;TCR=54;TR=69;WE=162367243;WS=162367211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr1	162467014	rs10919549	C	G	1174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=17;PP=786;ReadPosRankSum=1.120;SC=CCTCCAGGTACCAGGCTTCCA;SOR=0.700;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=63;TCR=32;TR=50;WE=162467022;WS=162467004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,53:0.53:100
chr1	162470961	rs5778280	A	AT	42.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.75;ReadPosRankSum=-0.120;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr1	162560360	.	TTC	T	49.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=0.000;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=2.629;QD=0.50;ReadPosRankSum=0.085;SOR=0.526;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,11:0.11:99
chr1	162562640	rs115126765	C	T	1063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.695;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=27;PP=619;ReadPosRankSum=1.463;SC=TAACTGGCATCGTAGTTTAGT;SOR=0.496;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=87;TCF=32;TCR=55;TR=44;WE=162562648;WS=162562630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,51:0.50:101
chr1	162722846	rs1632311	C	G	2031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=23;PP=1322;SC=AAAAATAAAACCATGTCCTCT;SOR=1.483;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=43;TCR=23;TR=66;WE=162722854;WS=162722836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	162725655	rs1115570	A	C	381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=9;PP=246;SC=TCAACCAATCAGTATTTATTT;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=162725663;WS=162725645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	162737116	rs2298258	C	G	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=16;PP=381;ReadPosRankSum=-0.309;SC=TCATCATCCTCTGGAGGCAGT;SOR=0.616;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=61;TCF=26;TCR=35;TR=27;WE=162737124;WS=162737106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,28:0.41:68
chr1	162740327	rs1780003	T	C	6866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=105;NR=138;PP=2965;SC=GTGGGCAGGGTGTCAAGGGAG;SOR=1.045;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=243;TCF=105;TCR=138;TR=243;WE=162740335;WS=162740317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr1	162741794	rs3738807	C	T	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.52;BaseQRankSum=1.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5021;FS=6.539;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=245;ReadPosRankSum=-0.274;SC=AATGAGGGCTCGTTGCCCTTG;SOR=2.786;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=12;WE=162741802;WS=162741784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr1	162742180	rs1704762	T	C	1030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=25;PP=737;SC=CCTCTGGATTTCAGTATTGGG;SOR=2.432;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=33;WE=162742188;WS=162742170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	162743418	rs1355287	G	T	2770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=60;PP=1795;SC=TTTTCCTTTAGGTATTTCATC;SOR=1.708;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=29;TCR=60;TR=89;WE=162743426;WS=162743408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr1	162748588	rs907074	C	A	1001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=30;PP=786;SC=GCAAGTCCTGCCTTAGCAGGA;SOR=3.675;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=34;WE=162748596;WS=162748578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	162754049	rs11338	G	A	687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.396;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.072;NF=22;NR=6;PP=408;ReadPosRankSum=-2.495;SC=TTCCAAGGAAGTATGCTGAAA;SOR=1.148;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=58;TCF=42;TCR=16;TR=28;WE=162754057;WS=162754039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,31:0.52:60
chr1	162754244	rs61812969	T	G	610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.72;QD=32.15;SOR=4.514;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	162760551	rs1704754	C	T	1155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=1.578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.79;MQRankSum=-0.792;QD=9.55;ReadPosRankSum=0.029;SOR=0.545;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,57:0.47:121
chr1	162760554	rs71519246	T	C	4608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.43;QD=34.91;SOR=1.758;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr1	162765475	rs2684884	G	C	2964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.66;QD=28.78;SOR=1.413;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr1	162766476	rs1780019	C	T	3034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.403;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.459;NF=56;NR=69;PP=1627;ReadPosRankSum=-1.115;SC=AGGTAATTTTCGTTTTATGGA;SOR=0.597;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=265;TCF=114;TCR=151;TR=125;WE=162766484;WS=162766466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,146:0.49:296
chr1	162774236	rs77482353	A	G	787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=22;PP=609;SC=TGAATAATTGAGGTCCCGTTT;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=162774244;WS=162774226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	162775267	rs12563263	C	T	6108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=97;NR=109;PP=2965;SC=GAAGAAATTACATTATGACCC;SOR=0.987;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=206;TCF=97;TCR=109;TR=206;WE=162775275;WS=162775257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr1	162787243	rs2803865	T	A	455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.89;QD=30.38;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	162822771	rs2684878	A	C	1569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=12;PP=1103;SC=ATGCCTATTCATGTTGGCCCA;SOR=2.024;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=39;TCR=12;TR=51;WE=162822779;WS=162822761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	162822807	rs56072121	G	A	1064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.743;HP=5;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=18;PP=555;ReadPosRankSum=1.064;SC=AATAAATTAAGTTTTTGTGAA;SOR=0.581;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=57;TCR=38;TR=45;WE=162822815;WS=162822797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,52:0.50:103
chr1	162824562	rs187742957	G	A	2051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.429;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=39;PP=1385;ReadPosRankSum=1.206;SC=CGGTTAGAGAGGAAGAAACTT;SOR=0.541;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=196;TCF=125;TCR=71;TR=99;WE=162824570;WS=162824552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,102:0.49:207
chr1	163038613	rs7515900	C	A	342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.845;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=216;ReadPosRankSum=0.595;SC=CCAGCTATTTCTCTCCACCTT;SOR=1.214;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=14;WE=163038621;WS=163038603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr1	163038853	rs10917671	G	A	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.298;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=19;PP=353;ReadPosRankSum=-0.163;SC=TTTTTTACAGGCATATGAATA;SOR=0.979;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=49;TCF=13;TCR=36;TR=25;WE=163038861;WS=163038843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,25:0.51:49
chr1	163117351	rs3768560	G	T	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.075;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=408;ReadPosRankSum=-1.123;SC=TTGATGAGGGGTGAAGAGGGA;SOR=0.957;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=51;TCF=18;TCR=33;TR=24;WE=163117359;WS=163117341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,27:0.49:55
chr1	163122528	rs1354939	G	C	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=148;ReadPosRankSum=-0.730;SC=AAAACAGTCAGCTGGAGAAAT;SOR=1.061;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=11;WE=163122536;WS=163122518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr1	163142537	rs10917691	G	A	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.404;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=92;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GGAGTTCATTGTTCAGGGAAT;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=6;WE=163142545;WS=163142527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr1	163142555	rs12035879	G	A	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.076;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=91;ReadPosRankSum=-0.786;SC=AATGACTAATGTTATTGCATT;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=6;WE=163142563;WS=163142545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr1	163187263	rs2814368	G	A	825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=3;PP=590;SC=AGTCTTTCCTGTAAATTATAA;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=25;WE=163187271;WS=163187253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	163307944	rs2175015	T	C	1094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=26;PP=748;ReadPosRankSum=-1.076;SC=GAATTGTAAGTAGTATTTTAC;SOR=1.329;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=33;WE=163307952;WS=163307934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,37:0.97:38
chr1	163309219	rs1509022	A	T	6109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=96;PP=2965;SC=TTTCAGATGGAATTCAGGAGC;SOR=0.702;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=204;TCF=108;TCR=96;TR=204;WE=163309227;WS=163309209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr1	163309302	rs2999852	C	T	2849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=62;PP=1773;SC=CTTTAAAAAACAAAATTTGTT;SOR=1.396;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=35;TCR=62;TR=97;WE=163309310;WS=163309292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr1	163315350	rs10753611	G	C	397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=0;PP=289;SC=TAATTGTTCCGTGCTCTTAAG;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=163315358;WS=163315340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	164559536	rs1780335	A	G	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=122;ReadPosRankSum=1.568;SC=AAAGGGGAACACTTTCTTGAT;SOR=0.876;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=12;WE=164559544;WS=164559526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,12:0.32:38
chr1	164789444	rs1538488	A	G	1770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=44;PP=1258;SC=CCAATATGTCACCAGGTGAAT;SOR=1.926;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=19;TCR=44;TR=63;WE=164789452;WS=164789434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr1	164853647	rs56025812	G	C	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=287;ReadPosRankSum=1.409;SC=TTGAGATCTTGCCAGAGGGTG;SOR=1.005;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=16;WE=164853655;WS=164853637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,16:0.42:38
chr1	165173216	rs1354509	A	G	3348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=65;PP=1996;SC=CTAGGAAACAATCACCCAGGT;SOR=1.016;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=117;TCF=52;TCR=65;TR=117;WE=165173224;WS=165173206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr1	165175374	rs4656435	G	A	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=68;ReadPosRankSum=-0.206;SC=GGGATGAGGTGACATCAGTGG;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=5;WE=165175382;WS=165175364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr1	165180089	rs1532815	T	A	1826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=44;PP=1245;SC=TATATAATACTTGAGGAGGCC;SOR=1.999;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=63;TCF=18;TCR=45;TR=62;WE=165180097;WS=165180079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr1	165370367	rs3215856	T	TA	246.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=156;ReadPosRankSum=-1.225;SC=TAGAAAGGTTTTCTTTATTAT;SOR=0.627;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=5;WE=165370375;WS=165370357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr1	165375895	rs283697	A	C	521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=4;PP=402;SC=CCGCTAGCCCAATGGAATTAA;SOR=2.419;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=19;WE=165375903;WS=165375885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	165376043	rs283696	T	C	2462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=38;PP=1585;SC=GCCAGCACTGTCTCACCTGCC;SOR=0.807;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=48;TCR=38;TR=86;WE=165376051;WS=165376033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr1	165376227	rs111545739	C	CCG	1226.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.30;SOR=1.688;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	165376231	.	CTG	C	1087.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.32;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	165377389	rs283692	T	C	943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=2;PP=667;SC=GGAGGACCAATAACATGGGAG;SOR=3.545;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=28;WE=165377397;WS=165377379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	165377552	rs2134095	G	A	3407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=72;PP=1935;ReadPosRankSum=0.910;SC=GCTCAGTTAGGACTCTGTTAA;SOR=0.705;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=298;TCF=153;TCR=145;TR=146;WE=165377560;WS=165377542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,167:0.50:335
chr1	165378729	rs66800417	TACAC	T,TAC	1797.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;ALERT;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;QD=35.95;SOR=2.247;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,29,21:0.58,0.42:50
chr1	165378733	rs12406497	C	T	623.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=4.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=10.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.73;ReadPosRankSum=0.986;SOR=2.441;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,18:0.37:49
chr1	165378735	rs138671935	C	T	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=10.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.71;ReadPosRankSum=0.965;SOR=2.441;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,18:0.37:49
chr1	165386567	rs2281986	C	T	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.361;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=58;ReadPosRankSum=-0.483;SC=ATCACTTGGGCATTGGGACAG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=5;WE=165386575;WS=165386557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr1	165389285	rs157870	C	G	2514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.005;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=56;PP=1538;ReadPosRankSum=1.433;SC=AAGCACAGAGCCAGAGTAAAT;SOR=0.821;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=243;TCF=121;TCR=122;TR=108;WE=165389293;WS=165389275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,124:0.45:277
chr1	165398115	rs113471	T	C	2158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=48;PP=1115;ReadPosRankSum=-0.278;SC=CTGGGGTATCTGTGTAGCTGG;SOR=0.685;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=211;TCF=107;TCR=104;TR=98;WE=165398123;WS=165398105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,112:0.47:237
chr1	165406187	rs79627842	T	C	65.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5103;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=68;ReadPosRankSum=0.319;SC=CATCTTTAATTCAAAAAGCAT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=3;WE=165406195;WS=165406177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr1	165406243	rs77182452	C	T	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=168;ReadPosRankSum=-0.070;SC=TAATGAATATCTTGGAGTGTT;SOR=0.655;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=11;WE=165406251;WS=165406233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr1	165406313	rs77875554	T	G	861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.780;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=15;PP=499;ReadPosRankSum=-0.066;SC=TTGCTCCTCCTTTTCATTTTA;SOR=0.542;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=92;TCF=62;TCR=30;TR=42;WE=165406321;WS=165406303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,46:0.46:100
chr1	165513439	rs285446	A	C	105.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=2;PP=74;SC=TTCTTTCCAGAGCCCCTCCCC;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=165513447;WS=165513429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	165513456	rs285445	A	T	206.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.47;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	165513463	rs285444	C	G	254.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.40;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	165514239	rs75784600	A	C	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=66;ReadPosRankSum=-1.102;SC=TCAGAATGGGAGAAAAAGTTG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=6;WE=165514247;WS=165514229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr1	165533005	rs453717	C	A	2656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.676;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=58;PP=1516;ReadPosRankSum=0.511;SC=GGAAGTCAGCCGGCGGATTTT;SOR=0.866;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=237;TCF=119;TCR=118;TR=111;WE=165533013;WS=165532995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,127:0.48:266
chr1	165533188	rs367199	A	C	192.28	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.6268;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=150;ReadPosRankSum=0.887;SC=AAAATCTCTGATGGCCATTTC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=7;WE=165533196;WS=165533178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr1	165601365	rs4147596	T	C	997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.815;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=20;PP=668;ReadPosRankSum=-0.547;SC=AGCTACATAATAGCGTCGGGG;SOR=0.545;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=81;TCF=47;TCR=34;TR=45;WE=165601373;WS=165601355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,46:0.53:87
chr1	165601466	rs9333378	G	A	917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=0.689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.71;ReadPosRankSum=1.095;SOR=0.747;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,50:0.42:119
chr1	165623411	rs4147605	C	G	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=298;ReadPosRankSum=-0.406;SC=GCCAAATCATCAAATTGTTAA;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=13;WE=165623419;WS=165623401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr1	165623451	rs4147606	C	T	705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.371;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=2;PP=455;ReadPosRankSum=3.105;SC=GTAATCAACCCTAGGTGTTAA;SOR=0.955;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=62;TCF=56;TCR=6;TR=25;WE=165623459;WS=165623441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,28:0.41:69
chr1	165623693	rs4147607	G	C	534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.673;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=376;ReadPosRankSum=-0.290;SC=TTTGGGAGGCGAAGGCAGGCA;SOR=2.340;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=43;TCF=7;TCR=36;TR=18;WE=165623701;WS=165623683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,21:0.42:50
chr1	165630475	rs7544840	C	T	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=45;ReadPosRankSum=-0.588;SC=TGAAAAGATACATAATTTTAT;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=5;WE=165630483;WS=165630465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
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chr1	165630698	rs6667681	A	G	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.155;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=88;ReadPosRankSum=-0.178;SC=CCTGGGCCACACTGGAAGAAG;SOR=0.157;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=10;WE=165630706;WS=165630688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,10:0.33:30
chr1	165651153	rs2882006	T	A	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.526;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=135;ReadPosRankSum=0.037;SC=TGTACAACCTTAACTATAAGC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=8;WE=165651161;WS=165651152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr1	165651502	rs1913844	G	C	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.633;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.447;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=4;PP=60;ReadPosRankSum=1.934;SC=AGGAGTAAAGGAGGATGCAGG;SOR=0.169;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=7;WE=165651510;WS=165651492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr1	165652273	rs1143659	A	G	2212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.071;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=35;PP=1394;ReadPosRankSum=1.402;SC=AGGAAATGTCAATGTCCAAGC;SOR=0.789;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=194;TCF=122;TCR=72;TR=99;WE=165652281;WS=165652263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,108:0.50:215
chr1	165652445	rs4233407	A	G	747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=23;PP=524;ReadPosRankSum=-1.090;SC=TTTAAAACTAAAAATAGCTTT;SOR=0.874;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=54;TCF=10;TCR=44;TR=28;WE=165652453;WS=165652435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,30:0.54:56
chr1	165721223	rs7512095	T	C	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=2.021;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=107;ReadPosRankSum=-0.925;SC=CTTGCAACTTTTCTTTAAGTT;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=6;WE=165721231;WS=165721213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr1	165721489	rs72699929	A	T	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.429;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=8.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.73;ReadPosRankSum=-0.538;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr1	165727274	rs71678704	CTCT	C	4025.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.498;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.175;NF=12;NR=45;PP=2300;ReadPosRankSum=0.729;SC=TGTCTGCATTCTCTTCTTCAT;SOR=0.642;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=135;TCF=23;TCR=112;TR=57;WE=165727284;WS=165727264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,108:0.42:255
chr1	165737704	rs2790053	C	G	9894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=382;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=184;NR=157;PP=2965;SC=CCACAAATACCCAAGTGAAAT;SOR=0.803;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=341;TCF=184;TCR=157;TR=341;WE=165737712;WS=165737694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,382:1.00:382
chr1	165859630	rs477033	C	G	4676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=65;NR=71;PP=2962;SC=GGGTATGTATCTGTATTGGTG;SOR=0.837;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=137;TCF=65;TCR=72;TR=136;WE=165859648;WS=165859620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr1	165859640	rs138035087	G	GTGT	2954.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.599;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.257;NF=4;NR=24;PP=973;ReadPosRankSum=2.015;SC=CTGTATTGGTGTGTTGGGGGG;SOR=0.616;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=84;TCF=12;TCR=72;TR=28;WE=165859648;WS=165859620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,77:0.50:153
chr1	166029970	rs4353067	T	C	1132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.584;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=30;PP=714;ReadPosRankSum=-1.418;SC=TGTCATTCCCTAAAAGCAGAT;SOR=1.083;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=100;TCF=43;TCR=57;TR=50;WE=166029978;WS=166029960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,54:0.50:109
chr1	166124134	rs896402	A	G	7400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=111;NR=136;PP=2965;SC=TGTAAGTTAAAAATGATTCTG;SOR=0.892;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=247;TCF=111;TCR=136;TR=247;WE=166124142;WS=166124124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,273:1.00:273
chr1	166591043	rs530513	T	C	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.768;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=213;ReadPosRankSum=-0.581;SC=TACTCAGACTTATGGGGTTTT;SOR=0.024;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=16;WE=166591051;WS=166591033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr1	166826773	rs6675153	C	T	912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=2;PP=650;SC=TCAATGAATTCGGTGAGGGTC;SOR=3.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=27;WE=166826781;WS=166826763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	166827674	rs6691431	T	C	506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=13;PP=359;SC=GTAATTTTAATTTTTAAAGGC;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=16;WE=166827682;WS=166827664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	166831404	rs2075947	A	C	314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=231;SC=TATCACATTCAACCTGTAAGA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=166831412;WS=166831394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	166831703	rs35181816	C	CA	962.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=16;PP=741;SC=AAACAAGACACAAAGTAAACT;SOR=1.765;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=18;WE=166831711;WS=166831693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	166833199	rs2272793	C	A	5055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=98;PP=2965;SC=AAAATAATGACAACTGATAAC;SOR=1.142;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=165;TCF=67;TCR=98;TR=165;WE=166833207;WS=166833189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr1	166838513	.	TA	T	41.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.613;ClippingRankSum=0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.78;ReadPosRankSum=-0.246;SOR=0.050;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr1	166944273	rs12116418	T	A	166.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.63;MQRankSum=-0.000;QD=12.83;ReadPosRankSum=0.967;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr1	166958601	rs2296837	T	C	2963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.411;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=61;PP=1966;ReadPosRankSum=-0.119;SC=TGCCGAACCGTAAGGCCAGCC;SOR=0.715;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=257;TCF=135;TCR=122;TR=128;WE=166958609;WS=166958591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,138:0.48:285
chr1	166958710	rs11578336	T	G	1884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.893;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=48;PP=1165;ReadPosRankSum=-2.049;SC=TTACTGCTCCTCAGACTGGGC;SOR=0.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=162;TCF=71;TCR=91;TR=83;WE=166958718;WS=166958700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,91:0.52:174
chr1	166958937	rs41269702	G	T	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.230;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=229;ReadPosRankSum=0.651;SC=GGATCCTCACGGCTGTTTCTC;SOR=0.490;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=36;TCF=24;TCR=12;TR=21;WE=166958945;WS=166958927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,24:0.59:41
chr1	166961857	rs7511933	G	A	977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=2;PP=774;SC=CAACTAAAGAGGCTTTTGTGG;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=30;WE=166961865;WS=166961847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	166963234	rs3736988	T	C	2657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=30;PP=1559;SC=TTTAAAATTTTTGCTTCTCAA;SOR=1.190;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=56;TCR=30;TR=86;WE=166963242;WS=166963224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr1	166974420	rs1041238	T	C	1693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=35;PP=1262;ReadPosRankSum=0.721;SC=ATATCTGTATTTGTTTCCACT;SOR=0.684;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=121;TCF=59;TCR=62;TR=67;WE=166974428;WS=166974410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,70:0.54:130
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chr1	167059575	rs28384507	G	T	1830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.218;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=42;PP=1035;ReadPosRankSum=-0.230;SC=GCAGCCTCCAGACAGGTCTGA;SOR=0.507;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=175;TCF=76;TCR=99;TR=78;WE=167059583;WS=167059565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,89:0.44:202
chr1	167082869	rs12122365	G	A	5606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=122;NR=51;PP=2965;SC=TAAAATCAAAGCCAGGTTTCT;SOR=1.732;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=174;TCF=123;TCR=51;TR=173;WE=167082877;WS=167082859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr1	167088473	rs1410244	C	A	690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.901;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=5;PP=455;ReadPosRankSum=0.301;SC=CAGGTCCCTGCCTCTTCCCGC;SOR=0.330;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=55;TCF=47;TCR=8;TR=29;WE=167088481;WS=167088463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,31:0.53:59
chr1	167094908	rs12118751	G	T	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=25;ReadPosRankSum=-0.328;SC=CAGAGGCAAAGTAAACACCTT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=3;WE=167094916;WS=167094898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr1	167095163	rs267745	G	C	1661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=35;PP=957;ReadPosRankSum=2.067;SC=ACCCCAATGAGGGCTTCCTGA;SOR=0.743;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=145;TCF=79;TCR=66;TR=78;WE=167095171;WS=167095153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,80:0.52:154
chr1	167095765	rs6668826	G	A	1278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.303;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=28;PP=800;ReadPosRankSum=2.401;SC=GGCAGGAGGCGCCGCGCAGAC;SOR=0.549;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=134;TCF=78;TCR=56;TR=64;WE=167095773;WS=167095755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,65:0.44:149
chr1	167095881	rs3795605	G	A	1960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=36;PP=1255;ReadPosRankSum=2.726;SC=AGAGGAGGCGGCAGACAGGAG;SOR=0.727;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=156;TCF=85;TCR=71;TR=81;WE=167095889;WS=167095871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,89:0.52:170
chr1	167096698	rs201313034	C	T	1773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.620;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=32;PP=1211;ReadPosRankSum=0.241;SC=CACAGCAGCTCCTCCTTGGGT;SOR=0.611;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=137;TCF=79;TCR=58;TR=73;WE=167096706;WS=167096688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,78:0.54:144
chr1	167097739	rs2281959	C	A	971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.647;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=23;PP=620;ReadPosRankSum=-2.092;SC=CGGAGAAGCACTGACAGGGAG;SOR=0.763;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=121;TCF=62;TCR=59;TR=45;WE=167097747;WS=167097729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,50:0.36:140
chr1	167345218	rs2273963	A	C	710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.346;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=7;PP=509;ReadPosRankSum=0.194;SC=AATTAAGCGAACTTTTATTTC;SOR=1.429;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=81;TCF=57;TCR=24;TR=31;WE=167345226;WS=167345208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,33:0.38:86
chr1	167353258	rs35617253	AT	A	2124.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.73;QD=25.91;SOR=1.788;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr1	167367193	rs7524019	C	T	1037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.721;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=15;PP=639;ReadPosRankSum=-1.268;SC=TCACTGTGCTCAGCTAATTTT;SOR=0.816;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=106;TCF=72;TCR=34;TR=47;WE=167367201;WS=167367183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,51:0.43:120
chr1	167382374	rs10753757	A	C	2430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=42;NR=40;PP=1346;SC=CTTTTTCTTAATTTGGTGGCA;SOR=0.929;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=42;TCR=40;TR=82;WE=167382382;WS=167382364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr1	167382399	rs67647055	AGTGT	A	682.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=2.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.19;MQRankSum=0.065;QD=32.51;ReadPosRankSum=1.211;SOR=0.172;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,17:0.81:21
chr1	167385178	rs199706857	G	A	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=12.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=1.99;ReadPosRankSum=-1.534;SOR=2.532;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr1	167403504	rs952962	A	G	535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=15;PP=391;SC=CACCCCCCTCATCCTCAGCCC;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=167403512;WS=167403494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	167404078	rs3108156	G	A	2023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=23;PP=1139;SC=GACATTACTCGATCCAAGAAG;SOR=1.194;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=44;TCR=23;TR=67;WE=167404086;WS=167404068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr1	167404179	rs61806155	G	A	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.311;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=1.525;NF=7;NR=16;PP=330;ReadPosRankSum=1.587;SC=CCTTCCTCCGGAGCCCTCCTC;SOR=1.455;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=39;TCF=16;TCR=23;TR=23;WE=167404187;WS=167404169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,24:0.52:46
chr1	167404196	.	TTCCTCCGGAGCCC	T	161.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=2.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQRankSum=-0.411;QD=8.51;ReadPosRankSum=-1.186;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr1	167407858	rs33937946	G	A	2618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.482;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=50;PP=1455;ReadPosRankSum=0.072;SC=CCAAAACATCGTACTCCTCTC;SOR=0.636;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=202;TCF=115;TCR=87;TR=115;WE=167407866;WS=167407848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,128:0.55:232
chr1	167515272	rs7513428	T	C	2318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=50;NR=26;PP=1257;SC=AAACCCCCCTTGCCTTAGAAG;SOR=1.259;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=50;TCR=26;TR=76;WE=167515280;WS=167515262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr1	167654598	rs74586478	C	T	931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.850;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=12;PP=626;ReadPosRankSum=1.655;SC=GCTCTTCCTCCCTGTTGCCTG;SOR=0.555;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=82;TCF=60;TCR=22;TR=40;WE=167654606;WS=167654588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,44:0.47:93
chr1	167778843	rs3213588	G	A	857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=2;PP=609;SC=GAGTGGGCCAGCCACGGAGAA;SOR=4.332;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=24;WE=167778851;WS=167778833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	167787265	rs12060498	C	T	1480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=5;PP=869;SC=GACAGAGATCCATTTAAGGCA;SOR=3.306;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=39;TCR=5;TR=43;WE=167787273;WS=167787255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	167793670	rs1476074	C	T	640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=5;PP=411;SC=CTCAATAATACGGCCTCCTCC;SOR=1.802;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=22;WE=167793678;WS=167793660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	167803896	rs2863273	T	A	720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=20;PP=553;SC=TTGAAGAATATAATAAGGTGA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=167803904;WS=167803886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	167805439	rs7550383	G	A	1986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=18;PP=1206;SC=GGGTGCTGTCGGGAATATACA;SOR=1.745;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=64;TCF=46;TCR=18;TR=62;WE=167805447;WS=167805429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr1	167806647	rs1034463	T	A	5844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=107;PP=2965;SC=TGTTCCCTTTTCGGAGTTGTT;SOR=1.028;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=194;TCF=87;TCR=107;TR=194;WE=167806655;WS=167806637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr1	167806696	rs1034464	T	C	3008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=58;PP=1917;SC=GTCCCCATTGTATCTTAGGTG;SOR=1.586;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=30;TCR=58;TR=88;WE=167806704;WS=167806686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr1	167806714	rs1034465	G	A	1925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=45;PP=1303;SC=GTGAAGCCACGTGATGAGTTC;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=15;TCR=45;TR=60;WE=167806722;WS=167806704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	167815374	rs115709018	C	T	3415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.829;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=68;PP=2194;ReadPosRankSum=0.719;SC=TGATCATCATCTTCATATTCC;SOR=0.810;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=299;TCF=161;TCR=138;TR=152;WE=167815395;WS=167815364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,161:0.50:323
chr1	167815514	rs35398078	G	A	4236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=90;PP=2677;SC=GCAGGTAGAAGGCCACACAGT;SOR=1.657;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=136;TCF=46;TCR=90;TR=136;WE=167815522;WS=167815504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr1	167817639	rs203795	A	G	5409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=103;NR=89;PP=2965;SC=TCAGTCTGACACCACTTGTGA;SOR=0.741;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=192;TCF=103;TCR=89;TR=192;WE=167817647;WS=167817629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr1	167844553	rs203826	C	A	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=502;ReadPosRankSum=-0.381;SC=CCCTGACTCACGGGTCGCAAA;SOR=1.308;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=22;WE=167844561;WS=167844543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,22:0.63:35
chr1	167844582	rs203827	C	G	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=214;ReadPosRankSum=-0.886;SC=GAAGGAGAAACGAGAAGGTCT;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=10;WE=167844590;WS=167844572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr1	167849318	rs203847	A	G	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=6.396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.21;ReadPosRankSum=0.161;SOR=2.129;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr1	167849327	rs203848	G	A	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=3.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.35;ReadPosRankSum=0.096;SOR=1.469;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr1	167849414	rs203849	A	G	1276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.151;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=31;PP=842;ReadPosRankSum=0.315;SC=CACTGGCAACACCGATGGATA;SOR=0.639;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=122;TCF=65;TCR=57;TR=61;WE=167849422;WS=167849404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,64:0.47:137
chr1	167849658	rs76779157	C	G	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.422;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=8;PP=307;ReadPosRankSum=-0.247;SC=TTTCCTGTTCCCTGCATGCCC;SOR=1.303;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=72;TCF=46;TCR=26;TR=28;WE=167849666;WS=167849648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,32:0.39:83
chr1	167865740	rs57419373	G	A	2121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.540;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=34;PP=1288;ReadPosRankSum=0.870;SC=GTGTTGAGGAGCCCACCCACC;SOR=0.773;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=175;TCF=107;TCR=68;TR=87;WE=167865748;WS=167865730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,97:0.51:192
chr1	167865871	rs16859886	G	A	1612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.552;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=43;PP=911;ReadPosRankSum=-1.620;SC=CATGAAGGTCGTACACTTTGT;SOR=0.747;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=173;TCF=71;TCR=102;TR=74;WE=167865879;WS=167865861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,81:0.43:187
chr1	167871297	rs71735758	GA	G	126.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.989;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.86;MQRankSum=0.605;QD=10.56;ReadPosRankSum=-1.740;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr1	167887416	rs1050037	C	T	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=179;ReadPosRankSum=2.660;SC=AAGTTTGCTGCATTTTTCTAT;SOR=0.536;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=32;TCF=20;TCR=12;TR=17;WE=167887424;WS=167887406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,20:0.54:37
chr1	167887436	rs1050036	A	C	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.783;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=10;PP=246;ReadPosRankSum=1.703;SC=TTGAATCAAGAACTAGCTACC;SOR=0.229;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=47;TCF=30;TCR=17;TR=22;WE=167887444;WS=167887426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,27:0.51:53
chr1	167887642	rs10918798	C	T	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=10.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.99;ReadPosRankSum=-0.823;SOR=0.020;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,5:0.21:24
chr1	167893759	rs9618	G	A	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.031;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=15;PP=329;ReadPosRankSum=0.449;SC=GAGCCCAGAAGAAAACTGTTC;SOR=0.983;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=67;TCF=33;TCR=34;TR=27;WE=167893767;WS=167893749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,27:0.39:69
chr1	167906239	rs203788	A	C	824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=17;NR=10;PP=448;SC=TGCGGAGTCGATACCTGGGTG;SOR=0.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=27;TCF=17;TCR=10;TR=27;WE=167906247;WS=167906229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	167921190	rs73024140	G	T	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.181;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=296;ReadPosRankSum=-0.049;SC=AGAAAGGATTGTGACTATAAT;SOR=0.458;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=43;TCF=12;TCR=31;TR=21;WE=167921198;WS=167921180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,25:0.48:52
chr1	167971979	rs436256	G	T	107.28	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	167971979	.	GC	TG	123	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=123;QD=58.8226249541;SC=GTGGAATGGCGCAGTCACTGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=167971988;WS=167971969;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	167971980	rs428694	C	G	107.28	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	167973648	rs60142550	T	C	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=227;ReadPosRankSum=0.616;SC=CCAGTAGTTATTATCACTGAA;SOR=0.784;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=11;WE=167973656;WS=167973638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr1	167984917	rs73026177	G	A	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=27;ReadPosRankSum=1.036;SC=TATGAGACATGTGTTTTGTTT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=3;WE=167984925;WS=167984907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr1	167985326	rs3831959	TG	T	137.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=245;ReadPosRankSum=-1.459;SC=TCCTTGCATATGGGTGGTATT;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=8;WE=167985334;WS=167985316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr1	167988590	rs73026184	A	T	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.20;ReadPosRankSum=1.253;SOR=0.033;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
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chr1	168013850	rs11558511	T	C	1138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.473;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=23;PP=498;ReadPosRankSum=-0.354;SC=TCAGAGGATGTGACAAAATAT;SOR=0.630;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=95;TCF=51;TCR=44;TR=50;WE=168013858;WS=168013840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,59:0.52:114
chr1	168033086	rs181446375	A	G	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.336;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=279;ReadPosRankSum=0.149;SC=TATATTGCCAATGGGATTTCA;SOR=0.948;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=55;TCF=10;TCR=45;TR=19;WE=168033094;WS=168033076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,21:0.34:62
chr1	168035104	rs380095	G	C	770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=20;PP=570;SC=TGACTAGGCAGCAGTAGAGTC;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=168035112;WS=168035094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	168056724	rs275143	A	G	1707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.784;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=20;PP=1106;ReadPosRankSum=0.293;SC=TGGAGCCCTGATATATTCCGG;SOR=0.399;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=122;TCF=90;TCR=32;TR=67;WE=168056732;WS=168056714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,73:0.58:126
chr1	168059866	rs275149	A	G	1785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.782;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=45;PP=1065;ReadPosRankSum=-0.831;SC=GGGGCTGTCCACCTGCCATGA;SOR=0.745;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=176;TCF=88;TCR=88;TR=87;WE=168059874;WS=168059856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,92:0.49:186
chr1	168073601	rs2294817	C	A	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-1.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=170;ReadPosRankSum=1.606;SC=TGGTCATCCTCCCCCAGCAAG;SOR=1.179;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=10;WE=168073609;WS=168073591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr1	168074145	rs6427119	G	A	760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=22;PP=512;ReadPosRankSum=0.497;SC=GGAAAGATAAGGCAGGACCAG;SOR=0.667;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=58;TCF=18;TCR=40;TR=33;WE=168074153;WS=168074135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,34:0.55:62
chr1	168105496	rs73030230	T	A	2500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.637;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=36;PP=1553;ReadPosRankSum=-0.802;SC=GCTGCTCACCTGGTCCTCACG;SOR=0.838;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=210;TCF=134;TCR=76;TR=104;WE=168105504;WS=168105486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,116:0.50:230
chr1	168106716	rs6664903	T	C	3254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=70;PP=2048;SC=AGTGAATTCGTCCCGAAGCCA;SOR=1.550;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=38;TCR=70;TR=108;WE=168106724;WS=168106706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr1	168160781	rs2023424	C	T	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.614;HP=4;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=196;ReadPosRankSum=-0.732;SC=TTCTTGCATTCTTAACATCAG;SOR=2.494;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=11;WE=168160801;WS=168160771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr1	168165888	rs16860183	T	G	923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=24;PP=494;ReadPosRankSum=-2.160;SC=GAGGTATTTATTGTTGTTTAA;SOR=0.714;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=37;TCR=46;TR=44;WE=168165896;WS=168165878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,48:0.54:89
chr1	168200733	rs11588504	T	C	3027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.759;HP=11;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=39;PP=1192;ReadPosRankSum=-0.525;SC=TATATGTATTTTTTTTTTTTC;SOR=1.452;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=129;TCF=86;TCR=43;TR=119;WE=168200741;WS=168200720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:6,130:0.96:136
chr1	168206118	rs55947108	GTTTAA	G	2279.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=30;PP=1512;SC=CACAGAAGCTGTTTAATTTAA;SOR=2.049;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=30;WE=168206130;WS=168206108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	168208308	rs12142742	T	C	3857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=56;PP=1918;SC=AAGCCCATTCTGCTGGATAAT;SOR=0.793;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=71;TCR=56;TR=127;WE=168208316;WS=168208298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr1	168262289	rs7543224	A	G	3466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.22;SOR=2.463;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr1	168262299	rs7520743	C	T	3951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.16;SOR=2.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr1	168266901	rs78189582	G	A	2212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.495;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=37;PP=1548;ReadPosRankSum=0.693;SC=GAAGACAAAGGGTTCTGTTTG;SOR=0.741;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=202;TCF=118;TCR=84;TR=92;WE=168266909;WS=168266891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,102:0.46:222
chr1	168274201	rs4656579	G	A	2779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=26;PP=1592;SC=TTTGGTGTGGGAGTTCACAGA;SOR=1.473;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=59;TCR=26;TR=85;WE=168274209;WS=168274191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr1	168278264	rs1883148	G	A	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.858;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=74;ReadPosRankSum=0.672;SC=TGGCAACAGGGTGGAGTTCTT;SOR=0.037;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=8;WE=168278272;WS=168278254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr1	168282261	rs3885717	T	A	1598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.118;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=32;PP=772;ReadPosRankSum=-0.277;SC=AGGAGCCTCTTTGCACAGCGA;SOR=0.920;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=120;TCF=56;TCR=64;TR=57;WE=168282269;WS=168282251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,74:0.51:144
chr1	168545949	rs34933908	G	A	6649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=113;NR=120;PP=2965;SC=AAGTGGAGAAGCTGTCTGTGA;SOR=0.818;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=233;TCF=113;TCR=120;TR=233;WE=168545957;WS=168545939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr1	168549422	rs6427130	C	T	4044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=67;PP=2415;SC=TAATGTGAGTCTGCCTCCTCA;SOR=0.866;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=129;TCF=62;TCR=67;TR=129;WE=168549430;WS=168549412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr1	168550535	rs79981832	A	G	1252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=39;PP=1091;SC=GTTTATACTCACCTTTTATGA;SOR=5.943;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=40;WE=168550543;WS=168550525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	168665747	rs78760104	C	CT	3528.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.264;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.828;NF=21;NR=28;PP=1751;ReadPosRankSum=-0.757;SC=CTCCTGTCCCCGGCCCCTTTC;SOR=0.944;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=128;TCF=44;TCR=84;TR=49;WE=168665755;WS=168665737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,109:0.43:251
chr1	168665974	rs524705	T	C	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=151;ReadPosRankSum=1.892;SC=GGACACTTAATCTCACTTTGC;SOR=0.732;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=9;WE=168665982;WS=168665964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr1	168670140	rs113747482	TGTGTGG	T	94.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.57;MQRankSum=1.793;QD=4.99;ReadPosRankSum=-0.046;SOR=0.287;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr1	168670213	rs116690380	T	C	959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.715;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=12;PP=641;ReadPosRankSum=-2.263;SC=TAGTCCCAACTCCTTTAACCC;SOR=0.907;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=81;TCF=56;TCR=25;TR=42;WE=168670221;WS=168670203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,46:0.49:94
chr1	168698173	rs1052591	C	T	1796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.245;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=33;PP=1156;ReadPosRankSum=-0.085;SC=GGCTCTGTGGCGTGGGCATGC;SOR=0.579;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=159;TCF=98;TCR=61;TR=80;WE=168698181;WS=168698163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,85:0.51:166
chr1	169076212	rs1200128	G	C	834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=18;PP=557;SC=GATCTTTCCCGGGCGGCGCAT;SOR=1.044;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=13;TCR=18;TR=31;WE=169076220;WS=169076202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	169080837	rs1200138	C	T	1066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=29;PP=631;ReadPosRankSum=-0.025;SC=ATAATGTAGTCTTAAAGCAAC;SOR=0.711;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=109;TCF=42;TCR=67;TR=47;WE=169080845;WS=169080827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,53:0.45:119
chr1	169094100	rs968304	T	A	3912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=51;PP=2280;SC=CCTACTAATGTTTTTCTCTCT;SOR=1.088;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=135;TCF=84;TCR=51;TR=134;WE=169094108;WS=169094090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr1	169094216	rs61742560	G	A	1814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.905;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=38;PP=986;ReadPosRankSum=0.278;SC=ACATAGTTAGGTTCCTGGAAA;SOR=0.867;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=149;TCF=76;TCR=73;TR=74;WE=169094224;WS=169094206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,85:0.50:169
chr1	169099061	rs1200157	G	A	227.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=1;PP=141;SC=TTTCATTTCAGCAAAATCACA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=169099069;WS=169099051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	169101269	rs199593766	T	TG	881.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=63.35;MQRankSum=0.781;QD=40.08;ReadPosRankSum=0.635;SOR=0.260;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,21:0.95:22
chr1	169101273	rs1779796	T	G	862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=3.074;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=63.08;MQRankSum=0.994;QD=35.95;ReadPosRankSum=2.310;SOR=0.144;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,22:0.92:24
chr1	169102223	rs61803315	G	C	767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=25;PP=594;ReadPosRankSum=-1.292;SC=GCTCCAGTTTGAAGTTCCATT;SOR=0.614;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=15;TCR=54;TR=32;WE=169102231;WS=169102213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,33:0.45:73
chr1	169138027	rs10919082	A	G	962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.690;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=21;PP=637;ReadPosRankSum=-0.476;SC=GTATCTATATATATGTTATGC;SOR=0.502;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=86;TCF=51;TCR=35;TR=46;WE=169138035;WS=169138017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,47:0.51:93
chr1	169138307	rs4656656	C	A	907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=15;PP=1122;ReadPosRankSum=0.948;SC=TGTATGCCAACCAGAAAAAAA;SOR=0.754;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=97;TCF=59;TCR=38;TR=41;WE=169138326;WS=169138297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,48:0.43:112
chr1	169138318	rs4656657	T	A	891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.693;HP=8;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=17;PP=1122;ReadPosRankSum=2.624;SC=CAGAAAAAAATATCTAAATTC;SOR=0.610;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=102;TCF=60;TCR=42;TR=41;WE=169138326;WS=169138297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,48:0.41:118
chr1	169138868	rs3737681	C	T	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.484;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=21;PP=427;ReadPosRankSum=-1.254;SC=CTATATGAAACGCTAACTTAT;SOR=0.427;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=47;TCF=8;TCR=39;TR=26;WE=169138876;WS=169138858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,27:0.54:50
chr1	169159866	rs7526721	G	T	1642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=33;NR=23;PP=996;SC=AAAAATGTTTGATTTTAATAC;SOR=1.092;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=33;TCR=23;TR=56;WE=169159874;WS=169159856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr1	169200111	rs10800420	C	T	445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=271;ReadPosRankSum=-0.495;SC=TTAACTCTCCCCTTTTAATTG;SOR=0.730;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=36;TCF=15;TCR=21;TR=17;WE=169200119;WS=169200101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,21:0.48:44
chr1	169216366	rs35977750	TCA	T	1742.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.086;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.669;NF=1;NR=33;PP=1301;ReadPosRankSum=0.593;SC=TGAAATAAGATCACAGTTTTA;SOR=1.801;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=74;TCF=6;TCR=68;TR=34;WE=169216375;WS=169216356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,49:0.42:116
chr1	169216412	rs2040445	C	G	1301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=30;PP=897;SC=AAATAAAGTACGGTACTGAGT;SOR=2.059;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=12;TCR=30;TR=42;WE=169216420;WS=169216402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	169256501	rs4589164	C	T	1435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=13;PP=853;ReadPosRankSum=0.663;SC=CATTGCTCTCCTATTAACAAA;SOR=0.749;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=120;TCF=92;TCR=28;TR=57;WE=169256509;WS=169256491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,66:0.46:142
chr1	169272299	rs10919130	A	T	2680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=55;NR=29;PP=1336;SC=ATTATTCTCAAGTAATAAATT;SOR=1.000;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=55;TCR=29;TR=84;WE=169272307;WS=169272289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr1	169272451	rs10800427	A	T	2191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.98;SOR=1.565;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	169272451	.	AGG	TGA	563	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;FR=1.0000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=18;MQ=60.0;NF=15;NR=23;PP=563;QD=16.2228388122;SC=ATAATCAAAAAGGCAATAGTT;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=41;TCF=17;TCR=24;TR=38;WE=169272461;WS=169272441;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,38:0.93:41
chr1	169272453	rs10800428	G	A	2191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.66;SOR=1.708;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	169279196	rs34054662	T	TA	1775.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=13;PP=994;SC=CTGAAAATGATAAAAAAATTA;SOR=1.942;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=42;TCF=28;TCR=14;TR=35;WE=169279204;WS=169279186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	169293721	rs1140523	G	A	4558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=89;PP=2827;SC=CAATGAAAACGAATCTTTCAC;SOR=1.468;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=143;TCF=54;TCR=89;TR=143;WE=169293729;WS=169293711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr1	169345704	rs12563090	G	A	1954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=17;PP=1319;SC=TTGAATATAGGGTATAGCATG;SOR=2.015;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=63;TCF=46;TCR=17;TR=62;WE=169345712;WS=169345694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	169349608	rs3830533	C	CTA	317.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=338;SC=AGTAACTATACTGTTAAATCT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=7;WE=169349616;WS=169349600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	169351596	rs3905328	A	G	839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=17;PP=482;SC=CATGGAAAGCATTTGGCATTA;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=27;TCF=10;TCR=17;TR=27;WE=169351604;WS=169351586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	169390957	rs35107735	A	T	513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=10;PP=308;ReadPosRankSum=-0.586;SC=GGAGGCAAAAACCCCTGACTG;SOR=0.602;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=42;TCF=21;TCR=21;TR=22;WE=169390965;WS=169390947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,22:0.54:41
chr1	169391154	rs3820059	A	G	3103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=43;PP=1883;SC=ATAATTTTTAAAAGTAGTAGT;SOR=0.841;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=56;TCR=43;TR=99;WE=169391162;WS=169391144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
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chr1	169484552	rs3820060	T	G	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=4.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=335;ReadPosRankSum=0.265;SC=CCAGGCACCTTAAGAACTAAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=15;WE=169484560;WS=169484542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr1	169492676	rs9332643	C	T	525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=368;ReadPosRankSum=-0.988;SC=CAGCTTTCTTCAGAACTAAAG;SOR=0.509;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=21;WE=169492684;WS=169492666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,22:0.59:37
chr1	169493953	rs12131397	A	C	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=2.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.135;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=394;ReadPosRankSum=-0.302;SC=ACTACATTGTAGTAGAGAAAA;SOR=1.106;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=64;TCF=45;TCR=19;TR=24;WE=169493961;WS=169493943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,31:0.41:75
chr1	169494196	rs2301515	C	T	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.219;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=22;PP=439;ReadPosRankSum=-1.775;SC=AAAATATATACAATAAAGTAA;SOR=1.015;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=53;TCF=11;TCR=42;TR=27;WE=169494204;WS=169494186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,27:0.45:60
chr1	169498834	rs6009	T	C	1871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=12;PP=1396;SC=GATCAAAGTCTGAGGAAAATA;SOR=2.457;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=46;TCR=12;TR=58;WE=169498842;WS=169498824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	169498975	rs6030	T	C	2757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.468;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=56;PP=1759;ReadPosRankSum=-0.219;SC=CTCATGTCCATAGGCATGTTG;SOR=0.656;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=218;TCF=112;TCR=106;TR=116;WE=169498983;WS=169498965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,126:0.52:240
chr1	169499190	rs2157581	A	G	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.164;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=66;ReadPosRankSum=-1.040;SC=AATGAATGGCATAATAAGCCT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=5;WE=169499198;WS=169499180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr1	169499951	rs9332620	C	T	885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=12;PP=498;ReadPosRankSum=1.486;SC=GAAATAACCCCGACTCTTCCA;SOR=0.635;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=66;TCF=45;TCR=21;TR=36;WE=169499959;WS=169499941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,42:0.54:78
chr1	169510233	rs9332607	G	A	2462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.469;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=46;PP=1457;ReadPosRankSum=-1.342;SC=CTAGAGAAAGGGTTGTATGGC;SOR=0.746;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=223;TCF=122;TCR=101;TR=105;WE=169510241;WS=169510223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,119:0.49:241
chr1	169510380	rs9287090	G	A	2750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.887;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.249;NF=65;NR=58;PP=1733;ReadPosRankSum=0.640;SC=GCATCTGACCGAGGGCTGGGG;SOR=0.727;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=278;TCF=146;TCR=132;TR=123;WE=169510394;WS=169510370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,133:0.46:292
chr1	169510524	rs1800594	A	G	2885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.250;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.248;NF=65;NR=61;PP=1837;ReadPosRankSum=-1.180;SC=CGAGGGCTGGAGAAAGGTTTG;SOR=0.529;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=252;TCF=123;TCR=129;TR=126;WE=169510532;WS=169510514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,137:0.49:279
chr1	169511555	rs6032	T	C	2962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.888;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=57;PP=1871;ReadPosRankSum=-0.933;SC=GGAGGGTCCTTCCAGGGCCTC;SOR=0.726;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=255;TCF=130;TCR=125;TR=119;WE=169511563;WS=169511545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,135:0.47:290
chr1	169511734	rs4525	T	C	3718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=394;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.758;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=93;PP=2037;ReadPosRankSum=-1.157;SC=GGGTCCCTTATGCTTAGCATG;SOR=0.749;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=370;TCF=176;TCR=194;TR=175;WE=169511742;WS=169511724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:208,186:0.47:394
chr1	169511755	rs4524	T	C	3315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=81;PP=2167;ReadPosRankSum=-0.389;SC=TTCTTGACTTTTGAATTCTCC;SOR=0.683;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=313;TCF=142;TCR=171;TR=148;WE=169511763;WS=169511745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:177,158:0.47:335
chr1	169512027	rs6021	T	C	3050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=64;PP=1675;ReadPosRankSum=-0.733;SC=TATCTGTGTTTGAAGAAACGA;SOR=0.673;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=312;TCF=165;TCR=147;TR=135;WE=169512035;WS=169512014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:189,150:0.44:339
chr1	169512093	rs6017	A	G	3395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=376;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.373;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=73;PP=2032;ReadPosRankSum=0.243;SC=CTTCTTCCTGATTCAATGATG;SOR=0.720;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=342;TCF=175;TCR=167;TR=151;WE=169512101;WS=169512083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:209,167:0.44:376
chr1	169512120	rs6016	G	A	3173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=365;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=66;PP=1902;ReadPosRankSum=1.494;SC=GGAATGACCTGATTCCTAATG;SOR=0.671;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=330;TCF=170;TCR=160;TR=137;WE=169512128;WS=169512110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:209,156:0.43:365
chr1	169513436	rs9287092	C	A	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=120;ReadPosRankSum=-0.269;SC=CAGGGAGATACATAGAGGAGC;SOR=0.963;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=7;WE=169513444;WS=169513426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr1	169515874	rs13306345	T	A	709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.944;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=23;PP=489;ReadPosRankSum=-0.494;SC=AACAGACGCATAGACCAATGG;SOR=0.289;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=57;TCF=10;TCR=47;TR=30;WE=169515882;WS=169515864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,31:0.51:61
chr1	169515916	rs13306344	G	A	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=102;ReadPosRankSum=-0.229;SC=ATAAGGCTGCGCACCTACAAC;SOR=0.425;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=7;WE=169515924;WS=169515906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr1	169519049	rs6025	T	C	3887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=44;PP=2327;SC=CTGTATTCCTTGCCTGTCCAG;SOR=1.263;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=79;TCR=44;TR=123;WE=169519057;WS=169519039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr1	169525766	rs2239853	T	C	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.890;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=69;ReadPosRankSum=0.308;SC=TGTTAGGAACTGAGGAAAGTT;SOR=1.096;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=7;WE=169525774;WS=169525756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,8:0.28:29
chr1	169525808	rs2239854	G	A	657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.917;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.33;ReadPosRankSum=-0.510;SOR=0.906;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,32:0.41:79
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chr1	169563951	rs6136	T	G	2731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.907;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=53;PP=1712;ReadPosRankSum=0.484;SC=GGCACGGTAGTTGACCAGTGG;SOR=0.764;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=255;TCF=140;TCR=115;TR=117;WE=169563959;WS=169563941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,129:0.46:282
chr1	169564167	rs742127	G	C	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=101;ReadPosRankSum=1.157;SC=GGAGGTGAAAGAGATTATAGT;SOR=0.200;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=7;WE=169564175;WS=169564157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr1	169566313	rs6127	C	T	1730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=38;PP=964;ReadPosRankSum=0.929;SC=AAGCCGTTGTCACAAGAGAAA;SOR=0.704;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=144;TCF=69;TCR=75;TR=73;WE=169566321;WS=169566303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,84:0.49:172
chr1	169572545	.	CTGTGTG	C	165.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;QD=10.36;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr1	169572553	.	G	C	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.17;ReadPosRankSum=3.177;SOR=0.188;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr1	169572555	rs201923719	G	C	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.17;ReadPosRankSum=3.061;SOR=0.188;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr1	169580885	rs6131	C	T	1721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.664;NF=35;NR=33;PP=1012;ReadPosRankSum=-1.376;SC=GGTTCCTTCACTGGGGGCTTC;SOR=0.688;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=130;TCF=68;TCR=62;TR=68;WE=169580893;WS=169580875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,82:0.53:156
chr1	169580972	rs3917730	C	CAT	1815.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.042;NF=1;NR=22;PP=983;ReadPosRankSum=-0.668;SC=AAAAGCCACACAGAGAGCAAT;SOR=0.612;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=52;TCF=3;TCR=49;TR=23;WE=169580980;WS=169580962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,49:0.50:98
chr1	169599254	rs732314	T	C	2669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.058;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=43;PP=1414;ReadPosRankSum=0.316;SC=CTGACTTTACTCCATACCACT;SOR=0.594;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=193;TCF=114;TCR=79;TR=107;WE=169599262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,127:0.58:219
chr1	169670940	rs4987327	TT	AA	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.188;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.472;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=130;ReadPosRankSum=-1.338;SC=TAGTAGCCCATTTGATGCCAT;SOR=0.061;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=5;WE=169670949;WS=169670930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr1	169672595	.	GAA	G	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.75;ReadPosRankSum=1.282;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr1	169677709	rs1051091	A	G	2573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.443;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=56;PP=1698;ReadPosRankSum=-1.588;SC=CTTCTTCAGTAAGAGATTTGT;SOR=0.760;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=249;TCF=130;TCR=119;TR=121;WE=169677717;WS=169677699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,129:0.47:272
chr1	169678024	rs4987285	T	C	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=367;ReadPosRankSum=-0.957;SC=CAGGCTGAGCTAGACACTTAG;SOR=0.504;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=20;WE=169678032;WS=169678014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
chr1	169679472	rs4987281	G	GCT	540.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=545;ReadPosRankSum=-0.160;SC=AGAATTAACAGCTCTGTGAAA;SOR=0.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=13;WE=169679480;WS=169679462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr1	169696033	rs3917427	A	G	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.861;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=19;PP=464;ReadPosRankSum=-1.700;SC=TTTTTTCTGTACATTCATTAC;SOR=1.781;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=36;TCF=13;TCR=23;TR=28;WE=169696041;WS=169696023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,31:0.77:40
chr1	169696754	rs3917425	A	T	1004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.821;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=29;PP=613;ReadPosRankSum=0.790;SC=ATGAATGTAAAGTGTAAGCGC;SOR=0.843;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=91;TCF=27;TCR=64;TR=39;WE=169696762;WS=169696744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,46:0.46:100
chr1	169697076	rs5367	A	G	2945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=65;PP=1764;ReadPosRankSum=-1.042;SC=CAGCTGGAACACACGAGAGAG;SOR=0.687;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=291;TCF=151;TCR=140;TR=134;WE=169697084;WS=169697066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,151:0.46:327
chr1	169697166	rs3917424	T	C	3169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.824;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=62;PP=2227;ReadPosRankSum=-2.806;SC=TAGTTCTTTTTATCTTAAAAT;SOR=0.518;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=264;TCF=127;TCR=137;TR=126;WE=169697174;WS=169697156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,140:0.48:293
chr1	169698789	rs5363	A	G	2202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.073;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=48;PP=1330;ReadPosRankSum=-0.510;SC=CATTGGCTGGATTTGTCACAG;SOR=0.596;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=230;TCF=113;TCR=117;TR=97;WE=169698797;WS=169698779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,111:0.41:269
chr1	169698825	rs1534904	T	G	2366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.485;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=52;PP=1364;ReadPosRankSum=-2.066;SC=CTGAGGATTTTAAAGAGCACC;SOR=0.605;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=226;TCF=104;TCR=122;TR=101;WE=169698833;WS=169698815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,117:0.44:263
chr1	169700853	rs3917454	G	A	353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=275;ReadPosRankSum=0.198;SC=CTCAGCTCACGATCACCATAT;SOR=0.765;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=16;WE=169700861;WS=169700843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr1	169700961	rs5362	A	G	2392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.984;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=47;PP=1451;ReadPosRankSum=-1.161;SC=AGAAAGAGGCAAGAACCAGAC;SOR=0.603;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=220;TCF=126;TCR=94;TR=105;WE=169700969;WS=169700951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,116:0.47:245
chr1	169701060	rs5361	T	G	1761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.521;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=45;PP=1126;ReadPosRankSum=0.562;SC=CCGTGGCCACTGCAGGATGTA;SOR=0.638;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=183;TCF=86;TCR=97;TR=84;WE=169701068;WS=169701050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,91:0.45:201
chr1	169701108	rs3917410	A	G	1057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.736;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=28;PP=676;ReadPosRankSum=0.704;SC=AAGCATGATGAGGAGGACTAT;SOR=0.580;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=107;TCF=36;TCR=71;TR=44;WE=169701116;WS=169701098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,50:0.42:120
chr1	169701901	rs1800016	T	C	3361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FS=1.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.32;ReadPosRankSum=-0.146;SOR=0.699;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,89:0.51:174
chr1	169701904	rs1800015	T	C	3348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FS=1.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.47;ReadPosRankSum=0.309;SOR=0.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,87:0.51:172
chr1	169702508	rs371244340	A	AT	106.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.021;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=1;PP=38;ReadPosRankSum=-1.776;SC=GAAATAGGTCATTATGATCCA;SOR=0.120;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=3;WE=169702516;WS=169702507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
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chr1	169702617	rs3917453	G	T	1475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.989;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=24;PP=957;ReadPosRankSum=-1.912;SC=GATGCTGCCAGATATCCTGTG;SOR=0.908;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=160;TCF=105;TCR=55;TR=71;WE=169702625;WS=169702607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,73:0.42:173
chr1	169702705	rs932307	G	A	2751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.819;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=60;PP=1749;ReadPosRankSum=-0.789;SC=TGGTCTAATGGCACTGACTTA;SOR=0.816;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=303;TCF=163;TCR=140;TR=131;WE=169702713;WS=169702695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:198,139:0.41:337
chr1	169702772	rs1805193	C	A	2454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.946;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=66;PP=1568;ReadPosRankSum=-1.914;SC=GAGTTCTTTTCACCCAAAGGT;SOR=0.811;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=266;TCF=128;TCR=138;TR=119;WE=169702780;WS=169702762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,126:0.43:296
chr1	169702899	rs3917400	G	A	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=75;ReadPosRankSum=-0.467;SC=CTAAGATTTTGGGCAAAGGAC;SOR=0.247;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=6;WE=169702907;WS=169702889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr1	169764420	rs41304562	C	T	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.029;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=16;PP=367;ReadPosRankSum=0.453;SC=CCTTTCTCTTCTGTCCCTTCA;SOR=0.526;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=66;TCF=20;TCR=46;TR=24;WE=169764428;WS=169764410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,26:0.37:70
chr1	169772285	rs76475485	G	T	2797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.092;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=46;PP=1683;ReadPosRankSum=1.918;SC=TATATTCTAAGTGAAATTTCC;SOR=0.912;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=205;TCF=119;TCR=86;TR=122;WE=169772293;WS=169772275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,131:0.60:219
chr1	169792642	rs12121443	A	T	1341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.234;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=26;PP=734;ReadPosRankSum=1.153;SC=GATTATTAAGATACAACAATG;SOR=0.461;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=113;TCF=56;TCR=57;TR=57;WE=169792650;WS=169792632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,65:0.52:124
chr1	169792692	rs3766141	T	C	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=22;PP=416;ReadPosRankSum=0.137;SC=TACCATTTTATGATAAAACAG;SOR=0.606;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=20;TCR=41;TR=33;WE=169792700;WS=169792682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,33:0.53:62
chr1	169795130	rs17601414	A	G	606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.051;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=11;PP=307;ReadPosRankSum=-0.580;SC=GTTAGTATACAGTTTATTTCT;SOR=0.892;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=49;TCF=28;TCR=21;TR=28;WE=169795138;WS=169795120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,31:0.58:53
chr1	169795276	rs6682137	A	C	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=67;ReadPosRankSum=-0.180;SC=TGCAATGGCGAAATCTCGGCT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=169795284;WS=169795266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr1	169799572	rs3215498	C	CTA	499.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.561;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=506;ReadPosRankSum=1.569;SC=TATAGAAAAACTGTTTCAATA;SOR=1.071;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=12;WE=169799580;WS=169799562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr1	169799880	rs2272920	G	T	2938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=338;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.290;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=61;PP=1696;ReadPosRankSum=1.289;SC=CACCATAGTGGCTCATCTGGT;SOR=0.619;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=307;TCF=162;TCR=145;TR=132;WE=169799888;WS=169799870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:190,148:0.44:338
chr1	169813011	.	CTTG	C	692.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=557;ReadPosRankSum=0.497;SC=TAAACCTCCTCTTGTTGTGTC;SOR=0.922;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=12;WE=169813021;WS=169813001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr1	169816662	rs41272481	T	A	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.846;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=418;ReadPosRankSum=-1.118;SC=CATAGGATTGTCTTATTTAAA;SOR=0.223;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=21;WE=169816670;WS=169816652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,22:0.63:35
chr1	169819670	rs12131444	G	A	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.512;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=105;ReadPosRankSum=-0.350;SC=CAGGCGCGGCGGCTCATGCCT;SOR=1.688;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=6;WE=169819678;WS=169819660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr1	169823790	rs12143301	C	G	2412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.499;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.064;NF=47;NR=65;PP=1605;ReadPosRankSum=1.310;SC=CTTCTGCTCCCCTGAGGTAAC;SOR=0.817;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=237;TCF=106;TCR=131;TR=112;WE=169823798;WS=169823780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,121:0.47:260
chr1	169824068	rs12132384	A	G	1696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.683;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=46;PP=1044;ReadPosRankSum=1.313;SC=CTGAGAGTCCATTTATGGGAA;SOR=0.792;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=43;TCR=87;TR=69;WE=169824076;WS=169824058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,76:0.55:138
chr1	169824104	rs12135726	G	A	940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.499;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=29;PP=634;ReadPosRankSum=-1.107;SC=AAAATGGATCGCCTGTAGGGA;SOR=0.349;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=68;TCF=16;TCR=52;TR=40;WE=169824112;WS=169824094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,41:0.59:69
chr1	169828098	rs17543370	A	G	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.757;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=206;ReadPosRankSum=1.144;SC=ATTTGACTGAATATGACCCTC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=11;WE=169828106;WS=169828088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr1	169828327	rs17602701	G	A	2138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.498;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=48;PP=1188;ReadPosRankSum=0.008;SC=CAATGGAATCGCTAGTATCAC;SOR=0.646;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=203;TCF=98;TCR=105;TR=97;WE=169828335;WS=169828317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,105:0.49:215
chr1	169831993	rs7525259	A	G	813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.509;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=20;PP=484;ReadPosRankSum=0.399;SC=TTTCAGTGAAAAGTATTAAGC;SOR=0.258;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=65;TCF=25;TCR=40;TR=36;WE=169832001;WS=169831983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,39:0.53:73
chr1	169835950	rs12133843	A	C	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=27;ReadPosRankSum=0.153;SC=AACCAAATATATGACTCATCT;SOR=0.120;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=169835958;WS=169835940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr1	169836175	rs17543611	T	C	1095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.776;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=27;PP=696;ReadPosRankSum=-0.254;SC=AATATTGAGGTCATAATCACA;SOR=0.822;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=87;TCF=35;TCR=52;TR=45;WE=169836183;WS=169836165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,51:0.53:96
chr1	169843017	rs12122419	C	T	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.828;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=19;PP=407;ReadPosRankSum=0.143;SC=AAATCAATGCCGCATATTAGA;SOR=0.922;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=77;TCF=36;TCR=41;TR=33;WE=169843025;WS=169843007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,33:0.41:81
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chr1	169951748	rs638486	A	G	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.481;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=120;ReadPosRankSum=2.139;SC=TTTTCCTAACATAATAATAGT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=8;WE=169951756;WS=169951738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr1	169951997	rs33943686	C	T	999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.565;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=26;PP=574;ReadPosRankSum=-1.532;SC=CTGCAAGGTCCCCAACATAAT;SOR=1.104;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=102;TCF=41;TCR=61;TR=38;WE=169952005;WS=169951987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,48:0.41:117
chr1	169952385	rs2057249	G	T	540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=359;ReadPosRankSum=-0.149;SC=CAGTCTATTTGAATAGAAAGC;SOR=0.523;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=41;TCF=36;TCR=5;TR=21;WE=169952393;WS=169952375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,23:0.53:43
chr1	169985796	rs16862933	A	G	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=246;ReadPosRankSum=1.843;SC=AATACAGTGAAGTTCTGTTGC;SOR=1.402;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=12;WE=169985804;WS=169985786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,14:0.82:17
chr1	169993762	rs16862956	A	T	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.311;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=215;ReadPosRankSum=-0.403;SC=TATATGAGAGATAAAGAATTA;SOR=0.406;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=17;WE=169993770;WS=169993752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,18:0.40:45
chr1	170004508	rs12750962	A	T	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.025;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=136;ReadPosRankSum=-1.590;SC=AACTGAGAGAACAAGTGATCT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=7;WE=170004516;WS=170004498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr1	170007355	rs12120229	T	C	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=52;ReadPosRankSum=1.559;SC=CTGGAAAATATATGAAGTCTT;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=4;WE=170007363;WS=170007347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr1	170016037	rs56147946	C	T	842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.274;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=26;PP=559;ReadPosRankSum=1.158;SC=TTTCAACTCACGTATTATAAA;SOR=0.399;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=59;TCF=12;TCR=47;TR=34;WE=170016045;WS=170016027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,36:0.58:62
chr1	170043389	rs12141428	T	C	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=111;ReadPosRankSum=0.867;SC=GTCAAAGGACTTTGAAACCCC;SOR=0.446;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=8;WE=170043397;WS=170043379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr1	170043609	rs202015317	G	GGCGGCA	2596.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.792;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=24;PP=1532;ReadPosRankSum=-0.619;SC=CCCCTTGCATGGCGGCAGCGG;SOR=1.100;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=94;TCF=10;TCR=84;TR=26;WE=170043617;WS=170043599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,69:0.44:156
chr1	170115156	rs550297	G	A	1763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.169;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=27;PP=996;ReadPosRankSum=-0.143;SC=TAAAATGACAGTCTCAAGTTC;SOR=0.365;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=139;TCF=94;TCR=45;TR=75;WE=170115164;WS=170115146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,83:0.53:156
chr1	170135669	rs6427234	C	T	2457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.743;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=17;PP=573;ReadPosRankSum=-1.468;SC=GAACAGACTGCGCCTTGGACT;SOR=0.789;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=91;TCF=58;TCR=33;TR=51;WE=170135677;WS=170135659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,63:0.59:106
chr1	170135693	rs41272485	A	G	2993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=28;PP=1050;ReadPosRankSum=1.804;SC=GCTCCGGGATAGGAAGGGTCA;SOR=0.680;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=139;TCF=86;TCR=53;TR=77;WE=170135701;WS=170135683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,89:0.57:157
chr1	170135760	rs6427235	T	C	2398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.235;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=44;PP=1508;ReadPosRankSum=0.015;SC=TATGATGGAATCCTTTCTCCT;SOR=0.749;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=179;TCF=94;TCR=85;TR=97;WE=170135768;WS=170135750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,111:0.56:197
chr1	170501385	rs7531125	A	C	2921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=40;PP=1685;SC=GTTGGGCAGGATTCTCTGAGG;SOR=0.827;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=54;TCR=40;TR=94;WE=170501393;WS=170501375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr1	170502517	rs1412892	A	G	161.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=2;PP=114;SC=AGGCTAAGCTATGTAGTTAAC;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=170502525;WS=170502507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	170508755	rs141412003	G	GT	663.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=16;PP=546;SC=CATTTAACCCGTTTTTTCCCA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=16;WE=170508763;WS=170508745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	170511604	rs7538037	T	C	3164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=28;PP=2077;ReadPosRankSum=1.073;SC=TTTCATAAACTCATTTTTATG;SOR=1.011;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=103;TCF=74;TCR=29;TR=101;WE=170511612;WS=170511594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,111:0.99:112
chr1	170521376	rs913257	G	A	6215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=98;NR=100;PP=2965;SC=ATTGCTACACGAACAAGAAGT;SOR=0.806;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=198;TCF=98;TCR=100;TR=198;WE=170521384;WS=170521366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr1	170633229	rs373077469	CCT	C	97.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.297;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.88;ReadPosRankSum=-0.269;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr1	170916646	rs4656817	G	T	2318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.998;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=48;PP=1360;ReadPosRankSum=0.447;SC=CCTTTTTAACGAATCTCCTTC;SOR=0.769;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=204;TCF=111;TCR=93;TR=103;WE=170916654;WS=170916636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,113:0.48:234
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chr1	171080080	rs1736557	G	A	1046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.989;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=28;PP=545;ReadPosRankSum=0.722;SC=CTGGTTGTACGTGAAGCAGAT;SOR=1.282;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=108;TCF=43;TCR=65;TR=42;WE=171080088;WS=171080070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,51:0.42:122
chr1	171112490	rs1736565	C	T	1365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.743;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=43;PP=915;ReadPosRankSum=-1.402;SC=AAGATACATACAGTTTGAGGT;SOR=0.843;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=111;TCF=36;TCR=75;TR=61;WE=171112498;WS=171112480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,64:0.54:119
chr1	171130598	rs145126383	CACACA	C	741.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=2.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.34;MQRankSum=1.664;QD=23.18;ReadPosRankSum=0.780;SOR=1.382;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,20:0.62:32
chr1	171300721	rs115576755	G	A	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=334;ReadPosRankSum=-1.646;SC=CTATCCCTGCGTAGTGAGAAA;SOR=0.586;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=42;TCR=14;TR=24;WE=171300729;WS=171300711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,26:0.42:62
chr1	171300959	rs2294482	T	C	983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=25;PP=558;ReadPosRankSum=0.617;SC=AATCCCATCATCAGTTATGAT;SOR=0.742;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=97;TCF=40;TCR=57;TR=42;WE=171300967;WS=171300949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,48:0.44:108
chr1	171301033	rs2294483	C	G	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=2.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.86;ReadPosRankSum=0.225;SOR=2.030;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,5:0.22:23
chr1	171303925	rs3820170	C	T	2398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.730;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=61;PP=1436;ReadPosRankSum=-0.035;SC=TACTGAAAGTCCTCTCTTTGG;SOR=0.882;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=234;TCF=105;TCR=129;TR=107;WE=171303933;WS=171303915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,118:0.45:264
chr1	171311003	rs1042772	A	C	2353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=55;PP=1480;ReadPosRankSum=-0.552;SC=AGGGTTACACAAAGTCATGCT;SOR=0.721;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=182;TCF=82;TCR=100;TR=98;WE=171311011;WS=171310993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,111:0.54:204
chr1	171491264	rs3736679	T	A	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.480;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.56;ReadPosRankSum=1.169;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr1	171496895	rs10753126	A	G	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=214;ReadPosRankSum=0.146;SC=ACTGTCTCCAAAATAATAAGA;SOR=0.743;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=12;WE=171496903;WS=171496885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,12:0.41:29
chr1	171509327	rs760644	G	A	3428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.340;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=77;PP=1909;ReadPosRankSum=-1.003;SC=GACCTTATCCGCTCCTCAAGA;SOR=0.614;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=284;TCF=136;TCR=148;TR=146;WE=171509335;WS=171509317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,163:0.52:312
chr1	171511039	rs1687064	C	G	2807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.615;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=61;PP=1746;ReadPosRankSum=-0.203;SC=GGGATATTTCCGGGAATAAGA;SOR=0.752;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=292;TCF=148;TCR=144;TR=133;WE=171511047;WS=171511029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,144:0.45:322
chr1	171511442	rs2272810	A	G	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.374;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=174;ReadPosRankSum=-1.678;SC=TGGTTGAATTATGCAAAGAGC;SOR=0.017;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=14;WE=171511450;WS=171511432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr1	171514731	rs235468	C	G	2562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.008;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=51;PP=1456;ReadPosRankSum=1.893;SC=TCCAAAGATTCTACTGGGAAA;SOR=0.777;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=203;TCF=101;TCR=102;TR=101;WE=171514739;WS=171514721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,120:0.52:231
chr1	171514875	rs144856960	T	TATTC	289.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.33;MQRankSum=2.662;QD=16.10;ReadPosRankSum=-0.535;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr1	171519487	rs235470	A	C	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.471;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=136;ReadPosRankSum=-0.329;SC=TCATTATTCAAGTGTTAAAAG;SOR=2.494;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=9;WE=171519495;WS=171519477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr1	171526570	rs1687057	G	A	3193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=76;PP=2002;ReadPosRankSum=-1.247;SC=CTCCACTTCCGGCAACCTTAA;SOR=0.710;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=325;TCF=157;TCR=168;TR=143;WE=171526578;WS=171526560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:202,154:0.43:356
chr1	171527322	rs235482	A	G	969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=30;PP=738;ReadPosRankSum=2.645;SC=GGAATGGCATAGGAATACTGA;SOR=0.631;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=56;TCF=14;TCR=42;TR=41;WE=171527335;WS=171527312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,38:0.67:57
chr1	171546833	rs6685179	C	A	1115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-2.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.789;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.744;NF=14;NR=35;PP=742;ReadPosRankSum=-1.245;SC=TACTAAAATGCTTATTTTTGT;SOR=0.476;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=96;TCF=26;TCR=70;TR=49;WE=171546841;WS=171546823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,52:0.50:103
chr1	171548617	rs3817772	G	A	2453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.162;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=73;PP=1675;ReadPosRankSum=-0.291;SC=TAATATCAAAGACTTCTTCCA;SOR=1.012;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=240;TCF=97;TCR=143;TR=114;WE=171548625;WS=171548607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,119:0.47:254
chr1	171548868	rs235489	T	C	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.849;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=166;ReadPosRankSum=0.397;SC=TAGTATTAATTTTACTCTTTT;SOR=2.760;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=8;WE=171548876;WS=171548858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr1	171556165	rs235501	G	C	2401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.466;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=40;PP=1308;ReadPosRankSum=1.310;SC=TACCAGCATCGCAGCTTTCCT;SOR=0.656;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=208;TCF=118;TCR=90;TR=96;WE=171556173;WS=171556155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,116:0.48:243
chr1	171558516	rs235503	C	T	1034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.912;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=16;PP=743;ReadPosRankSum=1.496;SC=AGATTCTCTCCCAGCCTAACC;SOR=1.206;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=94;TCF=62;TCR=32;TR=49;WE=171558524;WS=171558506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,50:0.46:109
chr1	171605725	rs146606638	C	A	3170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.420;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=59;PP=2032;ReadPosRankSum=1.715;SC=CGATTCTCCACGTGGTCTCCT;SOR=0.739;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=271;TCF=150;TCR=121;TR=135;WE=171605733;WS=171605715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,147:0.49:299
chr1	171607702	rs2032555	C	T	932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.635;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=22;PP=658;ReadPosRankSum=1.386;SC=ATAAAGACCACGTGGGCACAA;SOR=0.694;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=71;TCR=57;TR=48;WE=171607710;WS=171607692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,51:0.34:149
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chr1	171751051	rs2294719	A	G	2409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.152;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=54;PP=1651;ReadPosRankSum=-1.043;SC=AAGCTCCTCAAATGGTATCTC;SOR=0.582;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=175;TCF=82;TCR=93;TR=103;WE=171751059;WS=171751041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,106:0.57:187
chr1	171751236	rs2294720	T	C	1245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.591;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=29;PP=765;ReadPosRankSum=0.460;SC=GGGTGCTACATAAATATATCA;SOR=1.083;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=95;TCF=45;TCR=50;TR=50;WE=171751244;WS=171751226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,57:0.53:108
chr1	171755071	rs17650204	A	G	1319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.456;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=22;PP=946;ReadPosRankSum=-1.031;SC=AGGGCCGGAAACAGCTGGCGG;SOR=0.864;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=69;TCR=43;TR=57;WE=171755079;WS=171755061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,61:0.50:121
chr1	171755182	rs2232819	G	A	2281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.199;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=54;PP=1363;ReadPosRankSum=1.017;SC=CTAGAGTCATGGAGCTGGCCC;SOR=0.805;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=161;TCF=76;TCR=85;TR=99;WE=171755190;WS=171755172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,106:0.60:177
chr1	171761458	rs2232824	T	C	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=277;ReadPosRankSum=0.350;SC=CTACAGTTTATCTCTAAGAGA;SOR=0.502;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=37;TCF=12;TCR=25;TR=20;WE=171761466;WS=171761448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,20:0.54:37
chr1	171763549	rs2232825	C	T	2220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=40;PP=1207;ReadPosRankSum=0.722;SC=GGCCTTGCTACGATGTCATAA;SOR=0.349;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=178;TCF=111;TCR=67;TR=95;WE=171763557;WS=171763539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,108:0.56:193
chr1	171765964	rs1801898	A	G	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=161;ReadPosRankSum=1.078;SC=AGAATGAAGAAATACAACGCA;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=10;WE=171765972;WS=171765954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr1	172038079	rs12760234	T	C	1292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.601;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=34;PP=768;ReadPosRankSum=0.517;SC=GGCAGGGAGATTGTGGGAGGT;SOR=1.157;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=103;TCF=43;TCR=60;TR=53;WE=172038087;WS=172038069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,60:0.52:116
chr1	172222629	rs145316116	TCTCTCCTCTCCTCTC	T,TCTCTCCTCTC	591.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.27;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6,6;NR=0,0;PP=1285,148;SC=CAATTTTCTGTCTCTCCTCTC;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=6,6;WE=172222651;WS=172222628;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.94:16
chr1	172292355	rs79240969	C	CTCA	544.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.176;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=504;ReadPosRankSum=-0.966;SC=CAAGAAAAACCTCATTTTATT;SOR=1.493;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=13;WE=172292363;WS=172292345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr1	172308238	rs6697844	C	T	1062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.695;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=21;PP=708;ReadPosRankSum=0.323;SC=GAACATCTCACTGTGAAATAT;SOR=0.808;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=101;TCF=59;TCR=42;TR=49;WE=172308246;WS=172308228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,53:0.46:115
chr1	172356437	rs6688654	A	G	2651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=61;PP=1816;SC=ACATCAGCACAGCCACCGTGT;SOR=1.634;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=31;TCR=61;TR=92;WE=172356445;WS=172356427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr1	172410967	rs1063412	G	A	2729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=49;PP=1669;ReadPosRankSum=-1.195;SC=AGGTAGAATGGACACAGACAT;SOR=0.663;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=214;TCF=128;TCR=86;TR=122;WE=172410975;WS=172410957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,130:0.57:227
chr1	172411496	rs2230471	A	G	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.630;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=123;ReadPosRankSum=1.648;SC=AAGAAGCCAGACCAGTCCCTA;SOR=0.343;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=28;TCF=10;TCR=18;TR=9;WE=172411504;WS=172411486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,9:0.30:30
chr1	172417781	rs2157451	A	G	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=49;ReadPosRankSum=-0.241;SC=TACACCATCAATGTTCAATAA;SOR=0.105;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=4;WE=172417789;WS=172417771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr1	172425529	rs2285170	C	G	2389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=56;PP=1467;ReadPosRankSum=-0.904;SC=ATTTCCTCACCTCTCTCTGTC;SOR=0.710;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=229;TCF=118;TCR=111;TR=116;WE=172425537;WS=172425519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,124:0.48:259
chr1	172431210	rs4916261	G	A	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.143;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=88;ReadPosRankSum=-0.239;SC=AAGGATGTATGAAGGACTTTG;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=7;WE=172431218;WS=172431200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr1	172434309	rs9425328	G	A	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.13;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr1	172434375	rs2901655	G	A	1254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=16;PP=745;ReadPosRankSum=2.406;SC=ATGTATAAAGGCACATTTCTT;SOR=0.723;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=102;TCF=70;TCR=32;TR=49;WE=172434383;WS=172434365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,56:0.49:114
chr1	172434812	rs2901656	C	T	2269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=48;PP=1224;ReadPosRankSum=0.296;SC=ATAAAAGTTCCCCTATTGGCA;SOR=0.697;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=170;TCF=85;TCR=85;TR=95;WE=172434820;WS=172434802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,111:0.55:203
chr1	172437592	rs1129942	G	A	1731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.309;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=27;PP=920;ReadPosRankSum=0.216;SC=CATCCAGAAAGCATTCACTAC;SOR=0.829;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=130;TCF=75;TCR=55;TR=68;WE=172437600;WS=172437582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,79:0.54:146
chr1	172501643	rs2239816	T	C	2594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.588;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=40;PP=1652;ReadPosRankSum=-0.936;SC=CCCCTTTCTATCTACCAATCA;SOR=0.590;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=218;TCF=138;TCR=80;TR=108;WE=172501651;WS=172501633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,119:0.49:241
chr1	172502340	rs2285143	T	C	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.906;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=197;ReadPosRankSum=-1.013;SC=AGCCGGTGGCTGCAGCGGCGG;SOR=1.270;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=12;WE=172502348;WS=172502330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr1	172502479	rs2285144	T	C	1790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=28;PP=1198;SC=TCGGTCACATTCTCGCGCTCC;SOR=0.790;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=31;TCR=28;TR=59;WE=172502487;WS=172502469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr1	172502727	rs55696309	TA	T	1270.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.140;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.489;NF=1;NR=24;PP=880;ReadPosRankSum=0.804;SC=TTTTGGCTTTTAGGGTCCGGG;SOR=0.299;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=48;TCF=3;TCR=45;TR=25;WE=172502735;WS=172502717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,40:0.59:68
chr1	172520731	.	G	A	1449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=0.000;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.635;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=39;PP=924;ReadPosRankSum=0.423;SC=TGACAACTGCGCACTAGAAAA;SOR=0.628;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=54;TCR=79;TR=66;WE=172520739;WS=172520721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,69:0.49:141
chr1	172522602	rs1159378	G	A	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=28;ReadPosRankSum=0.489;SC=TGTGTGTATTGTTAGTTTTTT;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=172522610;WS=172522592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr1	172547465	rs2285664	A	G	3040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.972;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=58;PP=1778;ReadPosRankSum=-0.122;SC=TGGTGGAAGAATATGAAGAAA;SOR=0.573;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=262;TCF=146;TCR=116;TR=129;WE=172547473;WS=172547455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,144:0.51:285
chr1	172554867	rs10752995	T	A	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5958;FS=5.229;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=130;ReadPosRankSum=0.319;SC=CTTTGATTTTTTAAGAAAAAG;SOR=3.383;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=7;WE=172554875;WS=172554860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr1	172633350	rs5030772	A	G	149.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=0;PP=87;SC=TGATTAGTATATGTTAGACTG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=172633358;WS=172633341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	172634734	rs2639653	T	C	1966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=12;PP=1222;SC=CTATTCCTTGTTGAAAGCTCC;SOR=2.448;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=44;TCR=12;TR=56;WE=172634742;WS=172634724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	173012997	rs77521540	A	T	1128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=15;PP=692;ReadPosRankSum=0.928;SC=AAGAAAATACAGGTTTTCTTG;SOR=0.653;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=57;TCR=29;TR=44;WE=173013005;WS=173012987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,50:0.52:96
chr1	173490616	.	CTA	C	58.75	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.69;ReadPosRankSum=0.319;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr1	173556699	rs301698	G	T	404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=0;PP=318;SC=AAAGCACAGAGTCTTATTCTT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=173556707;WS=173556689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	173636845	rs200555170	TA	T	201.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.65;ReadPosRankSum=0.246;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,18:0.24:76
chr1	173638537	rs58611776	CA	C	194.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=1.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.49;ReadPosRankSum=0.736;SOR=0.344;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr1	173794587	rs55949406	C	CATTATT	39.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=2;PP=121;ReadPosRankSum=1.383;SC=TTTTTTCCCCCATTATTATTA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=2;WE=173794595;WS=173794577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,2:0.50:4
chr1	174417231	rs7516240	G	A	2749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=31;PP=1802;SC=GTCTGCAGGTGTCTTTAAATT;SOR=1.454;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=66;TCR=31;TR=97;WE=174417239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr1	174927388	rs10798329	G	C	620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=16;PP=439;SC=TGATATTTGAGTTAAAGTATG;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=174927396;WS=174927378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	174945171	rs142125254	CTGTATGACTGTGA	C	14364.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=347;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=134;PP=2965;SC=TCTTTACCCTCTGTATGACTG;SOR=0.803;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=187;TCF=36;TCR=151;TR=160;WE=174945191;WS=174945161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,323:1.00:323
chr1	174969271	rs1046439	C	T	4573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=95;NR=58;PP=2578;SC=TCCTGTTCCTCCTTCTGCGCG;SOR=1.126;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=153;TCF=95;TCR=58;TR=153;WE=174969279;WS=174969261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr1	174984071	rs201839540	TTTC	T	515.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=5.229;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.79;ReadPosRankSum=-1.391;SOR=1.872;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,19:0.95:20
chr1	175046488	rs2072033	G	A	746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=6;PP=488;ReadPosRankSum=-0.887;SC=GCACATCTCCGTGGCTTTCTT;SOR=0.807;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=58;TCF=45;TCR=13;TR=31;WE=175046496;WS=175046478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,34:0.55:62
chr1	175046789	rs2072032	A	G	2844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.093;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=60;PP=1822;ReadPosRankSum=2.146;SC=GGGGGAGGCCAGGGAGGAACA;SOR=0.559;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=236;TCF=118;TCR=118;TR=125;WE=175046797;WS=175046768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,134:0.52:257
chr1	175046835	rs41266080	C	T	1578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.088;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=36;PP=876;ReadPosRankSum=1.718;SC=CGCCTTCAGACGCCACAGAAG;SOR=0.886;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=195;TCF=100;TCR=95;TR=71;WE=175046843;WS=175046825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,84:0.38:223
chr1	175048734	rs61744341	G	A	3869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=366;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.378;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=79;PP=2339;ReadPosRankSum=-0.490;SC=ACTTCATGTCGGAGGACTGCA;SOR=0.660;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=328;TCF=172;TCR=156;TR=168;WE=175048742;WS=175048724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:180,185:0.51:365
chr1	175053098	rs11577778	T	C	2757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.41;ReadPosRankSum=-1.020;SOR=0.727;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:102,77:0.43:179
chr1	175053101	rs2072030	A	T	2632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=1.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.86;ReadPosRankSum=0.420;SOR=0.846;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,70:0.42:166
chr1	175054548	rs1573758	C	T	819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.279;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=7;PP=387;ReadPosRankSum=1.278;SC=CAGGTCTGCACCCGGGGACTG;SOR=1.504;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=62;TCF=41;TCR=21;TR=28;WE=175054556;WS=175054538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,36:0.48:75
chr1	175086461	rs6690229	A	G	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=117;ReadPosRankSum=-0.178;SC=GTGGGATGGCATCCCTTCATA;SOR=0.184;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=8;WE=175086469;WS=175086451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr1	175087606	rs10912888	T	C	949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.355;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.079;NF=32;NR=12;PP=698;ReadPosRankSum=0.652;SC=CCACACAACATGAAAGGGTTT;SOR=1.222;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=87;TCF=61;TCR=26;TR=44;WE=175087614;WS=175087596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,43:0.47:91
chr1	175087677	rs6656284	G	A	2437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQRankSum=0.865;QD=9.16;ReadPosRankSum=-0.014;SOR=0.695;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:139,127:0.48:266
chr1	175087683	rs149150350	A	AT	2210.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQRankSum=0.924;QD=8.50;ReadPosRankSum=-1.052;SOR=0.674;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:147,113:0.43:260
chr1	175087729	rs6696455	T	C	3290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.411;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.430;NF=80;NR=77;PP=1980;ReadPosRankSum=-0.616;SC=GGTCACTGACTGGGTGACAGA;SOR=0.737;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=294;TCF=152;TCR=142;TR=157;WE=175087737;WS=175087719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,164:0.53:312
chr1	175092674	rs2285215	C	T	4384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.99;NF=74;NR=60;PP=2876;SC=AGGGAGGTTCCGGTGGGGAAG;SOR=0.836;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=134;TCF=74;TCR=60;TR=134;WE=175092682;WS=175092664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr1	175092707	rs10798333	C	T	5185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.99;NF=103;NR=74;PP=2965;SC=ACTGTCCTGACGGGCCTGAGA;SOR=1.026;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=177;TCF=103;TCR=74;TR=177;WE=175092715;WS=175092697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr1	175092840	rs2072041	T	C	4145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=52;NR=77;PP=2401;SC=CTCACACTTATCAGGAGAGAA;SOR=1.345;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=129;TCF=52;TCR=77;TR=129;WE=175092848;WS=175092830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr1	175095936	rs7515770	C	T	470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=3;PP=351;SC=GTCAGAAAGGCCCTGTGGCAG;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=175095944;WS=175095934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	175097331	rs10912891	G	A	2420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=46;PP=1360;SC=CTGAACGACCGTGCAATGAGA;SOR=1.191;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=33;TCR=46;TR=79;WE=175097339;WS=175097321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr1	175097349	rs7547567	C	T	2145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=41;PP=1241;SC=AGAACCAGCACCGGAAAGCCT;SOR=1.236;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=71;TCF=30;TCR=41;TR=70;WE=175097357;WS=175097339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr1	175104796	rs4651324	G	T	228.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=6;NR=1;PP=143;SC=GGCATACTACGGTACATATAA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=175104804;WS=175104786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	175105880	rs2072037	G	A	1406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=6;PP=1014;SC=GGTTCTGAAAGCCTCAGACAC;SOR=3.516;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=34;TCR=6;TR=40;WE=175105888;WS=175105870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	175105942	rs4650703	G	A	4020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=89;NR=51;PP=2412;SC=TTGGAATTCCGTTTTTTATTT;SOR=1.279;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=89;TCR=51;TR=140;WE=175105950;WS=175105932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr1	175113578	rs10912897	T	C	3667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=53;PP=2038;SC=ACAGAGACAATGATATCGCAC;SOR=0.898;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=124;TCF=71;TCR=53;TR=124;WE=175113586;WS=175113568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr1	175116252	rs4651335	C	G	1205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=26;PP=758;SC=CCAGCTGTGGCAGCTTGGGGC;SOR=2.247;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=9;TCR=26;TR=35;WE=175116260;WS=175116242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	175129942	.	TC	T	92.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.864;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=2.241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.23;MQRankSum=-1.016;QD=3.71;ReadPosRankSum=-0.307;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,5:0.20:25
chr1	175129944	.	TTCTTCTTCTTG	T	92.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.864;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=2.241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.23;MQRankSum=-1.016;QD=3.71;ReadPosRankSum=-0.512;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,5:0.20:25
chr1	175129945	rs60195884	TC	T	766.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=2.241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.23;MQRankSum=1.122;QD=30.67;ReadPosRankSum=0.647;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,20:0.80:25
chr1	175129947	.	TTCTTCTTG	T	766.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.269;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=2.241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.23;MQRankSum=1.122;QD=30.67;ReadPosRankSum=0.784;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,20:0.80:25
chr1	175129955	.	G	T	464	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;FR=1.0000;HP=4;HapScore=2;MGOF=42;MMLQ=17;MQ=60.9;NF=18;NR=11;PP=464;QD=17.1990073292;SC=TCTTCTTCTTGTTCTTCTCTG;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=18;TCR=11;TR=29;WE=175129963;WS=175129945;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	175130204	rs1057239	G	A	395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=10;PP=264;SC=GCAGGTCCTGGGCTCAAAAGG;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=175130212;WS=175130194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	175293424	rs2213635	T	C	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.149;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=108;ReadPosRankSum=-0.473;SC=GCTTTTAAAATATAAAGCTAA;SOR=0.368;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=7;WE=175293432;WS=175293421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr1	175299301	rs2027867	T	C	2066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.347;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=37;PP=1310;ReadPosRankSum=0.083;SC=AGGCGGCCTCTTGGCCATCCC;SOR=0.412;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=167;TCF=103;TCR=64;TR=88;WE=175299309;WS=175299291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,97:0.53:183
chr1	175324518	rs55715761	GCA	G	1104.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=1013;ReadPosRankSum=-0.781;SC=AAGCTGATGAGCAATCCTTGT;SOR=0.673;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=28;TCR=9;TR=16;WE=175324529;WS=175324508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,29:0.54:54
chr1	175324521	rs55973835	A	T	1114.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=1021;ReadPosRankSum=-1.128;SC=CTGATGAGCAATCCTTGTGGA;SOR=0.673;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=39;TCR=9;TR=21;WE=175324529;WS=175324508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,29:0.54:54
chr1	175324651	rs2228359	A	G	1627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.714;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=40;PP=950;ReadPosRankSum=-1.700;SC=TGCGGCTTCCATCGGTGGATT;SOR=0.831;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=186;TCF=92;TCR=94;TR=76;WE=175324659;WS=175324641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,85:0.40:211
chr1	175335412	rs1385540	A	C	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.559;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=84;ReadPosRankSum=0.375;SC=ACACTTATCTAATATTTTGCT;SOR=0.061;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=7;WE=175335420;WS=175335402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr1	175336530	rs6697701	T	C	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.012;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=24;PP=513;ReadPosRankSum=1.335;SC=CCTATTCATATCTTGTGTTTA;SOR=0.406;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=87;TCF=27;TCR=60;TR=38;WE=175336538;WS=175336520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,42:0.44:96
chr1	175336619	rs6697801	T	C	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.224;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=54;ReadPosRankSum=-0.576;SC=GTCAATAGGATGAACCAGCCC;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=175336627;WS=175336609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr1	175348723	rs859427	C	T	2222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=17;PP=1398;SC=ACCAATGCCCCTGGGGACCAG;SOR=2.012;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=49;TCR=17;TR=66;WE=175348731;WS=175348713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr1	175355128	rs859436	C	G	3466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.38;SOR=1.550;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr1	175355152	rs72723450	C	T	1650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.552;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=31;PP=1077;ReadPosRankSum=0.202;SC=GCGTCTCTCCCCCACCGCAGC;SOR=0.743;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=163;TCF=95;TCR=68;TR=76;WE=175355160;WS=175355142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,81:0.45:181
chr1	175355391	rs859437	A	G	4935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=90;PP=2965;SC=CAAAAGCCACAGTGTCCGAGA;SOR=1.009;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=163;TCF=73;TCR=90;TR=163;WE=175355399;WS=175355381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr1	175360690	rs859444	C	T	1105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=26;PP=734;SC=AAAATGGGGGCGATGTCTCTT;SOR=1.788;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=12;TCR=26;TR=38;WE=175360698;WS=175360680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	175362736	rs3752517	G	A	582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=1;PP=417;SC=TCAGCAGGTCGTTACCACATA;SOR=4.514;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=175362744;WS=175362734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	175365663	rs859446	G	A	1766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=32;PP=1026;ReadPosRankSum=0.027;SC=GAAGCAGGACGGGGAAATGGT;SOR=0.671;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=153;TCF=86;TCR=67;TR=73;WE=175365671;WS=175365653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,83:0.50:167
chr1	175375334	rs859400	C	T	1032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=10;PP=741;SC=GACCACGCTGCGAGCTCCCGG;SOR=1.949;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=36;WE=175375342;WS=175375324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	175375469	rs2239819	C	A	7965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=147;NR=121;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.674;SC=GCTGAACTGGCACATGGACAG;SOR=0.289;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=269;TCF=148;TCR=121;TR=268;WE=175375477;WS=175375459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,298:1.00:299
chr1	175375683	rs859399	T	C	6995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=131;NR=109;PP=2965;SC=CTTTGCTGGATGTGTTGTAGT;SOR=0.788;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=241;TCF=131;TCR=110;TR=240;WE=175375691;WS=175375673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
chr1	175375802	rs859398	T	C	8125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=146;NR=135;PP=2965;SC=ATCAGGTTGATGCCAATGAGC;SOR=0.732;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=281;TCF=146;TCR=135;TR=281;WE=175375810;WS=175375792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,310:1.00:310
chr1	175916267	rs6674353	T	C	2004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=16;PP=1324;SC=GGTGTATTTCTATAATCCTGT;SOR=1.931;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=46;TCR=16;TR=62;WE=175916275;WS=175916257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	175937540	rs4534339	C	T	3981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=53;PP=2464;SC=AAAGGCTGTACGGAGGGGAAC;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=132;TCF=79;TCR=53;TR=132;WE=175937548;WS=175937530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr1	175951347	rs10798430	T	A	1192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=1;PP=861;SC=TAAAATTAGGTTACAGAAAAA;SOR=5.838;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=32;WE=175951355;WS=175951337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	176012807	rs4233165	G	A	706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=6;PP=492;SC=CAAACCAAATGTATGATTCAT;SOR=2.215;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=24;WE=176012815;WS=176012797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	176103053	rs34010407	TAC	T	2763.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=32;PP=1825;SC=GATAACAATATACACAGACCA;SOR=1.044;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=43;TCF=9;TCR=34;TR=40;WE=176103062;WS=176103043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	176118219	rs3748618	G	A	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.912;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=17;PP=335;ReadPosRankSum=0.130;SC=TCCTACAATAGAAAATTATAA;SOR=0.850;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=65;TCF=28;TCR=37;TR=29;WE=176118227;WS=176118209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,30:0.42:71
chr1	176153658	rs791744	T	C	1443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=30;NR=13;PP=593;SC=AAAAAAAATATGACTGTAACA;SOR=1.287;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=30;TCR=13;TR=43;WE=176153666;WS=176153648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	176659237	rs190611676	T	C	1980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.560;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=34;PP=1042;ReadPosRankSum=0.715;SC=CTATTCATTCTGTGCTCTGAA;SOR=0.529;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=168;TCF=101;TCR=67;TR=81;WE=176659245;WS=176659227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,94:0.51:186
chr1	176665102	.	ATGTG	A	90	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=90;QD=46.5;SC=ATGTATGTGTATGTGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=2;WE=176665113;WS=176665092;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:10,2:0.17:12
chr1	176671912	rs371785478	TGA	T	38.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=2;HapScore=3;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=270;ReadPosRankSum=2.055;SC=TGTGTGTGTGTGAGAGAGAGA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=7;WE=176671922;WS=176671902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr1	176681165	rs66731142	ATG	A	273.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=420;ReadPosRankSum=0.663;SC=GTGTAAGCATATGTGTGTGTG;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=0;TCR=42;TR=10;WE=176681174;WS=176681155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr1	176734756	rs3737759	C	T	776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.202;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=7;PP=494;ReadPosRankSum=-0.650;SC=CTCCTCCTTACTGGTTCTCAA;SOR=1.022;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=65;TCF=49;TCR=16;TR=31;WE=176734764;WS=176734746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,35:0.48:73
chr1	176769358	rs10913256	T	C	1025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=28;PP=650;ReadPosRankSum=0.758;SC=TAGGACCTGGTCCCTCTCCTA;SOR=0.711;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=94;TCF=40;TCR=54;TR=48;WE=176769366;WS=176769348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,52:0.51:101
chr1	176809368	rs12118034	C	T	2676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.214;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=62;PP=1610;ReadPosRankSum=-0.845;SC=GCCACTATGACGGGGGAGACT;SOR=0.538;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=260;TCF=126;TCR=134;TR=126;WE=176809376;WS=176809358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,133:0.47:283
chr1	176845528	rs2076341	C	T	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=84;ReadPosRankSum=-1.377;SC=GGAAAGGCAACGCTCCTGTAC;SOR=0.495;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=6;WE=176845536;WS=176845518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr1	176857347	rs2072935	A	G	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.234;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=102;ReadPosRankSum=1.166;SC=AGAGCTGCATAAGAGAACAGG;SOR=0.973;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=39;TCF=17;TCR=22;TR=11;WE=176857355;WS=176857337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,15:0.32:47
chr1	176863836	rs2281180	G	C	1593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.991;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=33;PP=1068;ReadPosRankSum=1.137;SC=GTCCCTTGCTGTGGCACTCCA;SOR=0.523;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=140;TCF=77;TCR=63;TR=70;WE=176863844;WS=176863826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,76:0.48:158
chr1	176863867	rs2228956	T	C	1618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.531;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=36;PP=869;ReadPosRankSum=-0.232;SC=AGCCGCCATGTGCTTGGTGCC;SOR=0.683;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=168;TCF=89;TCR=79;TR=74;WE=176863875;WS=176863857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,83:0.43:193
chr1	176905200	rs2076071	A	G	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.054;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=10;PP=448;ReadPosRankSum=-1.441;SC=AAGATAACACATGCAATGTAA;SOR=0.320;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=58;TCF=43;TCR=15;TR=34;WE=176905208;WS=176905190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,37:0.59:63
chr1	176913215	rs35968661	AT	A	93.27	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.36;ReadPosRankSum=0.431;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,8:0.89:9
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chr1	176998930	rs56297461	C	T	1907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.184;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=43;PP=1010;ReadPosRankSum=-1.536;SC=GGTTTCATGACACCAAACCTT;SOR=0.827;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=217;TCF=113;TCR=104;TR=85;WE=176998938;WS=176998920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,101:0.41:246
chr1	176999917	rs12568439	G	A	1928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.750;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=36;PP=939;ReadPosRankSum=1.064;SC=ATCCACCCACGAGCCCTAATG;SOR=0.608;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=169;TCF=93;TCR=76;TR=76;WE=176999925;WS=176999907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,93:0.48:195
chr1	177001896	rs2076069	C	G	4000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=383;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.771;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=90;PP=2660;ReadPosRankSum=-0.977;SC=TCTGGGGCTGCGGGACCCGGC;SOR=0.636;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=356;TCF=167;TCR=189;TR=173;WE=177001904;WS=177001886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:193,189:0.49:382
chr1	177199323	rs3176442	C	T	1206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.268;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=33;PP=774;ReadPosRankSum=1.201;SC=TCCCTAAGAACCCAACCTGCA;SOR=0.502;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=118;TCF=53;TCR=65;TR=62;WE=177199331;WS=177199313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,63:0.50:127
chr1	177244253	.	G	T	935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.898;ClippingRankSum=0.000;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.891;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=19;PP=577;ReadPosRankSum=0.377;SC=GCCTCCTGCAGATCTGACCTC;SOR=0.353;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=105;TCF=70;TCR=35;TR=47;WE=177244261;WS=177244243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,48:0.43:111
chr1	177898799	rs623479	C	T	310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=1;PP=242;SC=CATTGTGAAGCTAATCTTAAG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=177898807;WS=177898789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	177899121	rs545608	G	C	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.085;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=232;ReadPosRankSum=-0.763;SC=ACTCTGCCCGGGGTTGATTGG;SOR=0.512;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=50;TCF=18;TCR=32;TR=24;WE=177899129;WS=177899111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,29:0.52:56
chr1	177901619	rs7531399	G	A	808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=8;PP=506;ReadPosRankSum=0.683;SC=CAGGGGGGCCGCTTACCTCTG;SOR=0.737;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=78;TCF=59;TCR=19;TR=36;WE=177901627;WS=177901609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,39:0.45:86
chr1	177901655	rs3748792	G	A	3021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=0.604;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.88;ReadPosRankSum=-1.733;SOR=0.633;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,77:0.51:152
chr1	177901658	rs7554597	C	T	3108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.43;ReadPosRankSum=-2.533;SOR=0.650;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,84:0.52:160
chr1	177901713	rs522367	T	C	5860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=111;NR=87;PP=2965;SC=ACCTGGAAAGTAATGAGGCAG;SOR=0.720;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=198;TCF=111;TCR=87;TR=198;WE=177901721;WS=177901703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr1	177901741	rs684227	A	G	5109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=88;NR=90;PP=2965;SC=TCCTCTGCTCAGGACTGGGGG;SOR=0.848;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=179;TCF=88;TCR=91;TR=178;WE=177901749;WS=177901731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr1	177902387	rs61745560	C	A	2233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.006;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=39;PP=1519;ReadPosRankSum=-0.412;SC=TCGTCTCCAGCGGGGGATGCG;SOR=0.903;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=209;TCF=123;TCR=86;TR=100;WE=177902395;WS=177902377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,105:0.47:223
chr1	177902482	rs3813648	G	A	2336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.919;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=60;PP=1479;ReadPosRankSum=-0.806;SC=TGACCTGCAGGTTGGCTTCTT;SOR=0.690;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=263;TCF=135;TCR=128;TR=116;WE=177902490;WS=177902472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,122:0.44:277
chr1	177902725	rs3813649	C	T	1230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.597;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=23;PP=679;ReadPosRankSum=-3.365;SC=CTTGGCTGAACTGGCGGAACT;SOR=0.783;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=136;TCF=79;TCR=57;TR=57;WE=177902733;WS=177902715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,65:0.41:158
chr1	177902753	rs591120	G	C	4912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=68;PP=2674;SC=ATACTTCGTGGTCTAGCAGCC;SOR=0.761;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=157;TCF=89;TCR=68;TR=157;WE=177902761;WS=177902743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr1	177905469	rs7522194	C	A	1667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.733;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=25;PP=946;ReadPosRankSum=-1.092;SC=CATCAGGAGGCTGGGAAGTTT;SOR=0.934;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=145;TCF=93;TCR=52;TR=71;WE=177905477;WS=177905459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,82:0.48:170
chr1	177906292	rs61816275	C	T	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=201;ReadPosRankSum=-0.464;SC=CCCTTTCCTGCTTCCTCCCCA;SOR=0.610;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=14;WE=177906300;WS=177906282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr1	177913980	rs532842	T	C	528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=15;PP=416;SC=AGTGTTTCACTTCCTCTCCCT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=177913988;WS=177913970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	177915474	rs842192	A	C	4412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=76;NR=68;PP=2653;SC=AAAATGAAAAATGGATCCATA;SOR=0.718;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=144;TCF=76;TCR=68;TR=144;WE=177915482;WS=177915464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr1	177916889	.	AA	GG	177	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=47;MMLQ=27;MQ=58.09;NF=6;NR=0;PP=177;QD=38.411312477;SC=GGAGGTGAGGAAAGGGACAGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=6;WE=177916898;WS=177916879;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr1	177916890	.	A	AAGGGACAGGGAGGGGAGGTGAGGGG	276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=92.26;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	177917479	rs6695715	G	A	1400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-3.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.121;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=16;PP=834;ReadPosRankSum=0.191;SC=AGAGGCCACAGCCTGTCACAG;SOR=0.346;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=106;TCF=81;TCR=25;TR=55;WE=177917487;WS=177917469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,63:0.51:124
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chr1	177930642	rs945640	G	A	458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.726;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=307;ReadPosRankSum=-0.663;SC=ATGATCCATCGTAAGGCTGAC;SOR=0.215;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=21;WE=177930650;WS=177930632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,21:0.58:36
chr1	177930894	rs945641	C	T	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=16;PP=325;ReadPosRankSum=0.770;SC=CAAAAACACACAGGAAGAAGT;SOR=0.679;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=60;TCF=27;TCR=33;TR=30;WE=177930902;WS=177930884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,37:0.51:72
chr1	177933443	rs3813651	G	A	1859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.146;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=45;PP=1155;ReadPosRankSum=-0.671;SC=AGCAGTGAGCGGGGTCCTGGG;SOR=0.825;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=169;TCF=79;TCR=90;TR=82;WE=177933451;WS=177933433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,90:0.48:187
chr1	177933505	rs3813652	C	T	704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.137;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=21;PP=448;ReadPosRankSum=-0.622;SC=TGCTCCAAAGCGTGGGCAGGT;SOR=0.420;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=66;TCF=23;TCR=43;TR=34;WE=177933513;WS=177933495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,35:0.51:69
chr1	177934351	rs72703030	G	T	1564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=43;PP=925;ReadPosRankSum=-2.100;SC=TCCTGTTTCTGAAAGTTCTTA;SOR=0.687;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=130;TCF=48;TCR=82;TR=68;WE=177934359;WS=177934341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,75:0.53:142
chr1	177935050	rs1889981	T	A	1243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.437;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=23;PP=754;ReadPosRankSum=1.702;SC=GCAGCCACTGTGGGTGTCCAT;SOR=0.526;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=106;TCF=65;TCR=41;TR=54;WE=177935058;WS=177935040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,61:0.49:124
chr1	177935203	rs954502	A	G	974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.667;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=22;PP=675;ReadPosRankSum=0.503;SC=GAAACCAATGAAGAACTTGAC;SOR=0.501;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=88;TCF=41;TCR=47;TR=43;WE=177935211;WS=177935193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,45:0.47:96
chr1	177935275	rs1415085	A	G	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.452;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=328;ReadPosRankSum=0.448;SC=TGAAAGCCACAGTTAATTCTA;SOR=2.419;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=16;WE=177935283;WS=177935265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr1	178062359	rs964993	G	A	3697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=349;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.766;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=86;PP=2087;ReadPosRankSum=0.422;SC=AGGCCCGTCCGTCCATCCACA;SOR=0.933;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=316;TCF=153;TCR=163;TR=159;WE=178062367;WS=178062335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,175:0.50:349
chr1	178408795	rs10913550	A	G	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;BaseQRankSum=4.259;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=97;ReadPosRankSum=-0.207;SC=TCATTGCTGTACAGTTGATGA;SOR=1.781;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=6;WE=178408803;WS=178408785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr1	178421901	rs12691482	T	G	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.256;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=351;ReadPosRankSum=0.069;SC=TTTCACTGTGTTATTAATAAA;SOR=1.530;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=52;TCF=16;TCR=36;TR=24;WE=178421909;WS=178421891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,28:0.50:56
chr1	178433368	rs12039605	C	T	1180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=20;PP=546;ReadPosRankSum=-0.559;SC=ACATAGCACACGGGTGAGCTG;SOR=0.675;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=54;TCR=38;TR=48;WE=178433376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,59:0.53:112
chr1	178442190	rs10913557	C	T	2573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.425;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQ=59.98;MQRankSum=0.879;NF=72;NR=42;PP=1485;ReadPosRankSum=1.187;SC=CTGAATAAAGCCATGATTGGT;SOR=0.735;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=270;TCF=164;TCR=106;TR=114;WE=178442198;WS=178442180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,131:0.43:303
chr1	178483231	rs10913563	G	A	3755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.389;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=83;PP=2132;ReadPosRankSum=-0.398;SC=CCCTTTTGAGGCCATGCAGGC;SOR=0.715;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=295;TCF=152;TCR=143;TR=163;WE=178483239;WS=178483221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,177:0.55:324
chr1	178484834	rs10798611	A	G	785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=2;PP=541;SC=GAGCCAGTGCACCTGGTCTAT;SOR=3.334;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=26;WE=178484842;WS=178484824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	178489978	rs3813636	T	G	869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.788;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=17;PP=388;ReadPosRankSum=0.123;SC=CAGGGCTCACTGGATCCCCTT;SOR=0.359;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=99;TCF=45;TCR=54;TR=38;WE=178489986;WS=178489968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,47:0.42:113
chr1	178491680	rs3813637	C	G	1209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.866;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=28;PP=695;ReadPosRankSum=0.861;SC=ATTTGAAGGACGAGGAATGAT;SOR=0.561;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=78;TCF=31;TCR=47;TR=48;WE=178491688;WS=178491670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,55:0.63:87
chr1	178492447	rs7527160	T	A	672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=9;PP=328;SC=GTATATACGCTGCAGTGGGAC;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=12;TCR=9;TR=21;WE=178492455;WS=178492437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	178514203	rs12044868	C	A	1026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.839;HP=2;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=22;PP=602;ReadPosRankSum=-0.327;SC=AACTGAGCTCCCAATGCATTT;SOR=0.574;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=74;TCF=30;TCR=44;TR=39;WE=178514211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,46:0.54:85
chr1	178514560	rs34632529	A	AT	4037.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.562;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.850;NF=28;NR=55;PP=2681;ReadPosRankSum=-1.612;SC=TTGAAGGTTGATTTTGACTAC;SOR=0.531;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=203;TCF=51;TCR=152;TR=83;WE=178514568;WS=178514550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,155:0.47:330
chr1	178514622	rs12568310	C	T	2712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.263;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=-1.685;NF=60;NR=65;PP=1605;ReadPosRankSum=-2.437;SC=CCCATGATCCCTGTGAGGGGT;SOR=0.890;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=243;TCF=119;TCR=124;TR=125;WE=178514630;WS=178514612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,135:0.49:278
chr1	178515135	rs4650992	A	T	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.674;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=113;ReadPosRankSum=-1.152;SC=GAAAACTAAGACCTTCCCACT;SOR=1.390;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=8;WE=178515143;WS=178515125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,10:0.33:30
chr1	178646752	rs2773075	A	C	73.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.43;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	178745798	rs11323887	CT	C	370.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.779;SOR=0.608;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,21:0.81:26
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chr1	178820159	rs1544124	C	A	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-5.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=287;ReadPosRankSum=-1.182;SC=TAAAAACTTTCTGTGTAGAAA;SOR=0.203;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=17;WE=178820167;WS=178820149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr1	178854162	rs6425503	C	T	780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.959;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=13;PP=490;ReadPosRankSum=1.115;SC=TTTCAAGGGACTGAAAAATAA;SOR=0.503;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=64;TCF=44;TCR=20;TR=39;WE=178854170;WS=178854152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,40:0.58:69
chr1	178858624	rs34280213	A	T	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.41;ReadPosRankSum=1.508;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr1	178858711	rs10798635	C	A	798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=8;PP=476;ReadPosRankSum=-0.504;SC=TTTATTTTTACATTGTGAAAT;SOR=0.823;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=62;TCF=44;TCR=18;TR=31;WE=178858719;WS=178858701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,35:0.52:67
chr1	178858759	rs3753534	G	A	1371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=23;PP=733;ReadPosRankSum=1.439;SC=TAAAAAATAGGATAACTTTTC;SOR=0.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=70;TCR=46;TR=58;WE=178858767;WS=178858749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,67:0.52:130
chr1	178866674	rs17674780	A	G	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=149;ReadPosRankSum=1.031;SC=GAAGTGATACAGCTCAACTCT;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=10;WE=178866682;WS=178866664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr1	179023879	rs12735672	T	G	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=298;ReadPosRankSum=-0.509;SC=AAGAACTCAGTGGAATACAAA;SOR=0.330;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=15;WE=179023887;WS=179023869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr1	179040930	rs10913689	T	C	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.091;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=263;ReadPosRankSum=-0.105;SC=AAAGCAAAAATTATTTAGTTA;SOR=0.527;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=53;TCF=40;TCR=13;TR=22;WE=179040938;WS=179040920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,25:0.44:57
chr1	179041011	rs3820163	A	G	5607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=109;NR=76;PP=2965;SC=GATAATGAGAAGTTTTATGTA;SOR=0.846;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=187;TCF=110;TCR=77;TR=185;WE=179041019;WS=179040999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr1	179051300	rs2296377	T	C	1447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=11;PP=794;SC=TTGGCTCTTTTTCCTGCTGCT;SOR=1.480;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=33;TCR=11;TR=44;WE=179051308;WS=179051290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	179051733	rs78417185	C	T	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=98;ReadPosRankSum=1.645;SC=TGCGCACCCCCCTGGCGCCCG;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=10;WE=179051741;WS=179051723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr1	179052002	rs2274228	T	G	1408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=28;PP=2170;ReadPosRankSum=-0.962;SC=TGACAAGTTGTGTGGCAAGGT;SOR=0.665;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=58;TCR=55;TR=57;WE=179052014;WS=179051992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,63:0.50:127
chr1	179052006	rs2274227	G	T	1352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=27;PP=1819;ReadPosRankSum=-0.258;SC=AAGTTGTGTGGCAAGGTTGCC;SOR=0.718;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=112;TCF=55;TCR=57;TR=55;WE=179052014;WS=179051992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,63:0.51:123
chr1	179054692	rs912758	T	G	6467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=127;NR=84;PP=2965;SC=CTTGGTTTCTTGGCTGTTGGC;SOR=1.012;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=211;TCF=127;TCR=84;TR=211;WE=179054700;WS=179054682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr1	179066907	rs79003648	T	G	963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.242;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=14;PP=470;ReadPosRankSum=0.000;SC=CAATTACTCCTGAAGGTTAAC;SOR=1.297;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=66;TCF=38;TCR=28;TR=40;WE=179066915;WS=179066897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,46:0.61:75
chr1	179067071	rs10913690	C	A	1066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.441;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=27;PP=582;ReadPosRankSum=0.669;SC=ATTCCCCATGCTTTTACTCAC;SOR=0.534;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=114;TCF=52;TCR=62;TR=51;WE=179067079;WS=179067061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,56:0.45:125
chr1	179084080	rs2274230	T	G	1678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.545;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=31;PP=925;ReadPosRankSum=-1.903;SC=ATCCTTTTTCTAGTAGGTCAT;SOR=0.625;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=168;TCF=98;TCR=70;TR=75;WE=179084088;WS=179084070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,86:0.46:185
chr1	179086419	rs56346584	T	TA	755.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.478;HP=12;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.089;NF=18;NR=13;PP=315;ReadPosRankSum=-1.845;SC=AAGGCATTTATAAAAAAAAAA;SOR=0.163;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=84;TCF=44;TCR=40;TR=31;WE=179086427;WS=179086409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,43:0.44:97
chr1	179087934	rs2171959	T	C	1020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-3.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.849;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=31;PP=554;ReadPosRankSum=0.626;SC=TTTTTATTAGTGTACATTCAA;SOR=0.534;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=91;TCF=25;TCR=66;TR=45;WE=179087942;WS=179087924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,49:0.49:101
chr1	179089213	rs1858551	C	T	602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=2.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.39;ReadPosRankSum=-0.398;SOR=1.215;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,30:0.67:45
chr1	179089239	rs67836984	GA	G	88.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=1.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.11;ReadPosRankSum=-0.056;SOR=0.929;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,15:0.19:80
chr1	179089475	rs9726961	C	G	1129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.852;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=27;PP=678;ReadPosRankSum=0.258;SC=AAAATCATTTCATTCATCTCA;SOR=0.864;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=80;TCF=28;TCR=52;TR=41;WE=179089483;WS=179089465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,49:0.54:90
chr1	179089491	rs9728480	A	C	817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=21;PP=531;ReadPosRankSum=0.807;SC=TCTCACAATCATAAAGCTTCA;SOR=0.655;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=58;TCF=20;TCR=38;TR=32;WE=179089499;WS=179089481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,36:0.56:64
chr1	179089518	rs9727252	C	G	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-3.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.013;HP=5;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=382;ReadPosRankSum=1.524;SC=AAAGTAAAAACTATCTTTTGA;SOR=0.228;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=19;WE=179089526;WS=179089508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,22:0.59:37
chr1	179100710	rs17277358	C	T	763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.117;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=24;PP=549;ReadPosRankSum=-1.578;SC=CAGCTGCTGGCTCCAGAGTAG;SOR=1.605;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=82;TCF=29;TCR=53;TR=32;WE=179100718;WS=179100700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,35:0.36:97
chr1	179102268	rs28914510	A	T	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=64;ReadPosRankSum=-1.534;SC=CTGGGATTACAAACGTGAGCC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=5;WE=179102276;WS=179102258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr1	179112145	rs1318056	C	G	2747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.642;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=58;PP=1557;ReadPosRankSum=0.316;SC=TCTGCCATAACTATTAGGTGG;SOR=0.453;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=207;TCF=96;TCR=111;TR=116;WE=179112153;WS=179112135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,130:0.57:227
chr1	179292442	rs2902277	G	A	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.775;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=158;ReadPosRankSum=0.964;SC=CCATGCTGTCGTGTTTTATGG;SOR=1.352;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=11;WE=179292450;WS=179292432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,12:0.41:29
chr1	179304892	rs1034269	T	C	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=132;ReadPosRankSum=0.030;SC=CACCCTGGTGTCACTTTCTAT;SOR=1.022;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=8;WE=179304900;WS=179304882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr1	179310262	rs11576517	C	T	3694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.862;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=64;PP=2317;ReadPosRankSum=-0.159;SC=TTTCAGTTCCCTATTTTCTGT;SOR=0.767;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=282;TCF=161;TCR=121;TR=147;WE=179310270;WS=179310252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,163:0.52:313
chr1	179310514	.	C	T	935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-3.241;ClippingRankSum=0.000;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.919;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=30;PP=649;ReadPosRankSum=-0.207;SC=TGATGACATACTGATACTATT;SOR=0.295;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=86;TCF=20;TCR=66;TR=42;WE=179310522;WS=179310504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,43:0.46:93
chr1	179312102	rs4651024	T	C	7771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=123;NR=138;PP=2965;SC=GAACCAGAAATGTGGTAAACA;SOR=0.881;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=261;TCF=123;TCR=138;TR=261;WE=179312110;WS=179312092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,300:1.00:300
chr1	179312249	rs11350945	AT	A	749.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=16;PP=665;SC=GTCTAATTTGATTATAGTAAT;SOR=3.816;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=179312257;WS=179312239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	179316687	rs13306729	A	G	1011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.855;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=7;PP=518;ReadPosRankSum=0.126;SC=GTTGCTTGGTATGTGAGCTAT;SOR=0.869;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=73;TCF=54;TCR=19;TR=35;WE=179316695;WS=179316677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,45:0.51:88
chr1	179317895	rs200924427	ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	A	697.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.04;SOR=4.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	179319580	rs3753527	T	C	2991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.967;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=83;PP=2224;ReadPosRankSum=0.214;SC=AGTATCTTGGTATGCTGTGAG;SOR=0.763;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=254;TCF=97;TCR=157;TR=132;WE=179319588;WS=179319570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,133:0.51:263
chr1	179320665	rs13306732	A	G	1556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=42;PP=1023;ReadPosRankSum=0.978;SC=GTTGGTGGGCAATGTTGAGGA;SOR=0.633;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=44;TCR=80;TR=65;WE=179320673;WS=179320655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,71:0.51:139
chr1	179339334	rs6666358	G	A	340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=10;PP=236;SC=AAAATTTACAGTATCTTTGAA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=179339342;WS=179339324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	179347832	rs10798674	T	C	2119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=40;PP=1118;ReadPosRankSum=-0.811;SC=AGAAGGCAGTTTGTCCCCCAC;SOR=0.664;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=218;TCF=120;TCR=98;TR=88;WE=179347840;WS=179347822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,109:0.42:258
chr1	179348646	rs141815555	T	TG	1072.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.895;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.671;NF=1;NR=21;PP=739;ReadPosRankSum=-1.200;SC=AAAAAATACCTGCCCCAGCTC;SOR=0.976;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=48;TCF=5;TCR=43;TR=22;WE=179348654;WS=179348625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,38:0.47:80
chr1	179351606	rs4625243	G	C	169.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=100;SC=GCCATGTCCCGATGATTATTT;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=179351614;WS=179351602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	179354304	rs7541905	A	G	746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=2;PP=485;SC=CATTCAAGGTATTAACCTCCT;SOR=3.352;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=179354312;WS=179354294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	179364391	rs61173288	A	G	597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.743;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=15;PP=315;ReadPosRankSum=0.615;SC=AGAAGCTTATATAGCTTCTGA;SOR=0.223;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=45;TCF=13;TCR=32;TR=24;WE=179364399;WS=179364381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,28:0.55:51
chr1	179380472	rs5779024	GT	G	769.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=16;PP=397;SC=TTTAAAATTTGTTTTTTTTGT;SOR=1.460;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=18;WE=179380480;WS=179380462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	179398563	rs4652382	C	G	233.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=0;PP=184;SC=TTAATGATTCCATGAAAAATC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=179398571;WS=179398553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	179398875	rs4652383	T	A	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.734;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=8;PP=178;ReadPosRankSum=0.898;SC=TAGTGCTTATTGTACAGAATG;SOR=0.301;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=10;WE=179398883;WS=179398865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr1	179401379	rs11314780	CT	C	293.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.94;ReadPosRankSum=1.064;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr1	179401526	rs7550638	C	G	1791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.73;MQRankSum=-0.977;QD=7.62;ReadPosRankSum=0.141;SOR=0.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:134,101:0.43:235
chr1	179401559	rs7550656	C	T	1231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FS=0.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.09;MQRankSum=-0.894;QD=7.80;ReadPosRankSum=-0.176;SOR=0.754;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,66:0.42:158
chr1	179401564	rs10706073	CT	C	1954.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.20;MQRankSum=1.212;QD=19.35;ReadPosRankSum=1.526;SOR=0.563;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:9,92:0.91:101
chr1	179401599	rs7550736	C	T	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.457;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=31;PP=617;ReadPosRankSum=0.233;SC=CACTCACTGTCGCCCAGGCTG;SOR=0.378;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=89;TCF=29;TCR=60;TR=45;WE=179401607;WS=179401589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,20:0.37:54
chr1	179402037	rs199738366	C	CA	100.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=3.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.05;ReadPosRankSum=0.608;SOR=0.275;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,10:0.30:33
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chr1	179418132	rs10913770	C	T	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.328;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
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chr1	179452522	rs12407885	G	C	781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.853;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=21;PP=515;ReadPosRankSum=-1.141;SC=TTTTAAAGCAGAATGTTTCTG;SOR=0.264;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=40;TCF=7;TCR=33;TR=27;WE=179452530;WS=179452512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,30:0.70:43
chr1	179462149	rs7549194	A	G	1160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=28;PP=828;SC=AGATTTTTGAAGTTCAATTGA;SOR=2.362;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=9;TCR=28;TR=37;WE=179462157;WS=179462139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	179494612	rs35486954	CTACA	C	446.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.935;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=377;ReadPosRankSum=0.849;SC=GTTTTTCCTCCTACATACATA;SOR=0.191;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=8;WE=179494623;WS=179494602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr1	179494665	rs4620484	C	T	309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=256;SC=AGGGTCCTGCCCTGTCACCCA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=179494673;WS=179494655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	179497359	rs6698201	T	C	1368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=7;PP=723;SC=AAATGGAAAATGTAAGCTTCC;SOR=2.400;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=38;WE=179497367;WS=179497349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	179503806	rs6425572	G	A	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=209;ReadPosRankSum=-0.334;SC=AATGAGTTTCGAAATCAAAAA;SOR=0.527;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=16;WE=179503814;WS=179503796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
chr1	179504025	rs141228272	AAAG	A	2506.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=2.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.43;MQRankSum=2.343;QD=18.16;ReadPosRankSum=-1.075;SOR=0.501;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,67:0.49:138
chr1	179504043	rs6658180	C	G	2578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.299;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.140;NF=31;NR=24;PP=2417;ReadPosRankSum=0.161;SC=AGAAGAACAACAAGAAGAAGA;SOR=0.563;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=128;TCF=75;TCR=53;TR=55;WE=179504051;WS=179504015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,70:0.47:148
chr1	179504130	rs6425574	G	A	1486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.929;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.068;NF=29;NR=36;PP=797;ReadPosRankSum=-0.238;SC=CTTTATTCAGGTTGTATTTAT;SOR=0.413;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=131;TCF=53;TCR=78;TR=65;WE=179504138;WS=179504120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,74:0.49:151
chr1	179520254	rs1410591	C	G	1148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.650;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=20;PP=802;ReadPosRankSum=-0.146;SC=CTCCCTCAGGCATGTGACTTT;SOR=0.502;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=92;TCF=63;TCR=29;TR=52;WE=179520262;WS=179520244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,54:0.53:102
chr1	179520506	rs1410592	G	A	1599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=43;PP=1030;ReadPosRankSum=-1.254;SC=GAAGCTGAACGGCAGCAGGGG;SOR=0.719;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=42;TCR=76;TR=67;WE=179520514;WS=179520496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,72:0.57:126
chr1	179528917	rs12401708	G	A	986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.650;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=26;PP=624;ReadPosRankSum=1.632;SC=GGAGGAGGAAGTGACAGATAA;SOR=0.796;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=131;TCF=57;TCR=74;TR=44;WE=179528925;WS=179528907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,51:0.34:149
chr1	179528942	rs12401711	G	A	1021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=21;PP=539;ReadPosRankSum=-1.567;SC=CTAGCATGAAGGCTGTTTGGG;SOR=0.637;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=110;TCF=51;TCR=59;TR=41;WE=179528950;WS=179528932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,51:0.39:130
chr1	179544898	rs1079292	T	C	4328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=72;NR=73;PP=2616;SC=GCCCGCGGCCTCCGCCGCTCC;SOR=0.881;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=72;TCR=73;TR=145;WE=179544906;WS=179544888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr1	179545050	rs12406197	C	A	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.643;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=280;ReadPosRankSum=0.397;SC=GCTAGGGGCACGGGAGCGCAG;SOR=0.100;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=15;WE=179545058;WS=179545040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,16:0.70:23
chr1	179561645	rs4652418	A	C	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.519;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=64;ReadPosRankSum=-0.514;SC=TTAAAACTGGAGTCTCAGTTA;SOR=0.086;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=7;WE=179561653;WS=179561635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr1	179561683	rs4652419	A	T	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.88;ReadPosRankSum=1.052;SOR=0.909;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,10:0.22:45
chr1	179590352	rs61826406	C	T	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.457;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=228;ReadPosRankSum=-1.341;SC=TTTTGTTTTGCATTTTAGTAT;SOR=0.180;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=39;TCF=12;TCR=27;TR=22;WE=179590360;WS=179590342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
chr1	179604864	rs4628468	C	T	3286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=338;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.780;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=67;PP=2024;ReadPosRankSum=0.815;SC=TCCCGCCAGACGCTGTGCCGA;SOR=0.800;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=307;TCF=165;TCR=142;TR=150;WE=179604872;WS=179604854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,163:0.48:338
chr1	179609589	rs16854429	G	T	3080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.404;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=63;PP=1764;ReadPosRankSum=1.106;SC=AGGTATGTTTGCTTGTCTCCC;SOR=0.647;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=294;TCF=152;TCR=142;TR=135;WE=179609597;WS=179609579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,154:0.48:322
chr1	179631242	rs35448215	G	A	1167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.705;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=23;PP=795;ReadPosRankSum=0.312;SC=ATTTTAGGATGAGATCCCCAC;SOR=0.576;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=109;TCF=69;TCR=40;TR=57;WE=179631250;WS=179631232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,57:0.49:116
chr1	179816816	rs7531195	T	A	458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=4.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.590;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=376;ReadPosRankSum=0.602;SC=AGTACACTAATGACAGTATGT;SOR=2.161;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=45;TCF=7;TCR=38;TR=19;WE=179816824;WS=179816806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,19:0.40:48
chr1	179852074	rs1281378	T	C	2654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.107;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=75;PP=1622;ReadPosRankSum=1.347;SC=TCTCCTGTTATGACCAGGAGA;SOR=0.836;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=247;TCF=99;TCR=148;TR=123;WE=179852082;WS=179852064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,129:0.49:265
chr1	179852552	rs605807	T	G	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=264;ReadPosRankSum=-0.552;SC=GATCTAACCTTTCAGTCTTTT;SOR=1.402;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=13;WE=179852560;WS=179852542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
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chr1	179887125	rs627897	G	A	10452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=382;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=174;NR=155;PP=2965;SC=ATGAAAACGCGGCCTTCAAAG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=329;TCF=174;TCR=155;TR=329;WE=179887133;WS=179887115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,382:1.00:382
chr1	179956497	rs16855052	G	T	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.547;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=221;ReadPosRankSum=0.487;SC=AGATTAAAATGTTTTCCATAC;SOR=0.361;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=16;WE=179956505;WS=179956487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr1	179972337	rs17371159	A	C	3492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.394;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=70;PP=2258;ReadPosRankSum=1.056;SC=CCAAGATTCGAACACCTGATG;SOR=0.740;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=310;TCF=171;TCR=139;TR=158;WE=179972345;WS=179972327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,170:0.50:338
chr1	179983665	rs2501607	G	A	1463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-2.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.756;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=37;PP=791;ReadPosRankSum=-0.360;SC=ATATACAAAGGAGAGTCATTC;SOR=0.601;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=106;TCF=27;TCR=79;TR=52;WE=179983673;WS=179983655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,65:0.51:127
chr1	179985156	rs16855107	C	T	912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.464;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=26;PP=572;ReadPosRankSum=-0.065;SC=TGAAATTTAGCGGAGTGGTCT;SOR=0.366;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=71;TCF=21;TCR=50;TR=39;WE=179985164;WS=179985146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,43:0.54:80
chr1	179989742	rs2477120	G	C	2327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=50;PP=1619;ReadPosRankSum=-3.242;SC=TCCCAAACCAGAAGGGCTACT;SOR=0.635;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=197;TCF=105;TCR=92;TR=102;WE=179989750;WS=179989732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,109:0.50:216
chr1	179992076	rs2477117	A	G	431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=14;PP=359;SC=AGTTTTGCTCATTTAAAAATA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=179992084;WS=179992066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	179993793	rs4622030	T	C	199.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.64;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=5;PP=90;SC=ATGATTTGATTGCATAAGAAG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=179993801;WS=179993783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	180000542	rs12125245	G	T	2541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.679;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=54;PP=1435;ReadPosRankSum=-2.417;SC=AAGAAATCTGGGACCAGCAGC;SOR=0.665;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=245;TCF=122;TCR=123;TR=113;WE=180000550;WS=180000532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,125:0.47:268
chr1	180003277	rs74487535	C	A	847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.906;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=25;PP=506;ReadPosRankSum=1.193;SC=TTTCTCTCAACATTCCTTTTC;SOR=0.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=76;TCF=21;TCR=55;TR=34;WE=180003285;WS=180003267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,39:0.46:85
chr1	180010702	rs4652461	T	C	435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=1;PP=243;SC=TTTTTTACTATGAATAAGACA;SOR=3.126;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=180010710;WS=180010692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	180022343	rs9425854	T	G	802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=4.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.329;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=26;PP=648;ReadPosRankSum=0.666;SC=GTTGTGGATATGTTCTCTCAA;SOR=1.484;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=78;TCF=25;TCR=53;TR=34;WE=180022351;WS=180022333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,35:0.42:84
chr1	180022813	rs17371308	A	G	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.683;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=201;ReadPosRankSum=0.967;SC=TTGTAAATGCATACCTCTTTT;SOR=0.132;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=17;WE=180022821;WS=180022803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr1	180034431	rs139704987	CTT	C	532.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.643;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.097;NF=1;NR=10;PP=377;ReadPosRankSum=-0.495;SC=ATAAATATCTCTTGTTTAGTT;SOR=0.385;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=11;WE=180034440;WS=180034421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr1	180049840	rs12126967	C	T	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.718;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=113;ReadPosRankSum=-1.162;SC=TGTATTTGAACAGCCTTTACT;SOR=2.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=8;WE=180049848;WS=180049830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,10:0.34:29
chr1	180059736	rs67852047	GACATACCT	G	166.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=829;ReadPosRankSum=0.704;SC=GACATAGATTGACATACCTAC;SOR=0.157;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=8;WE=180059751;WS=180059726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr1	180059811	rs10798729	A	C	1166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.654;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=19;PP=1479;ReadPosRankSum=-0.381;SC=TTATTATAGTAATATGTTTAT;SOR=0.594;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=137;TCF=94;TCR=43;TR=59;WE=180059819;WS=180059801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,59:0.40:149
chr1	180067914	rs12121834	G	A	342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.224;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=250;ReadPosRankSum=0.787;SC=TATTCTTATCGTGAATCTGTT;SOR=1.855;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=15;WE=180067922;WS=180067904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr1	180067988	rs12121845	G	A	1125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=16;PP=555;ReadPosRankSum=2.644;SC=TATTTGTCTTGTTTCCACAGA;SOR=0.713;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=69;TCF=43;TCR=26;TR=43;WE=180067996;WS=180067978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,53:0.62:85
chr1	180080115	rs3767202	T	G	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.304;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=335;ReadPosRankSum=0.738;SC=CTAACCTTATTGTCTTCTAAA;SOR=1.092;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=54;TCF=37;TCR=17;TR=25;WE=180080123;WS=180080105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,26:0.44:59
chr1	180080290	rs12126496	T	A	2411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.185;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=62;PP=1577;ReadPosRankSum=-0.566;SC=GAATGCTACTTGTGTGACATC;SOR=0.842;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=218;TCF=100;TCR=118;TR=109;WE=180080298;WS=180080280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,117:0.49:238
chr1	180124061	rs10913933	G	C	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.89;ReadPosRankSum=0.629;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr1	180124379	rs35481032	T	C	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.21;ReadPosRankSum=-0.888;SOR=0.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
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chr1	180155376	rs2298207	C	G	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.728;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=104;ReadPosRankSum=0.930;SC=AGTGTGCGTTCCTGTAAGGCT;SOR=1.179;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=6;WE=180155390;WS=180155366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr1	180155382	rs3216058	AG	A	371.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=8;PP=412;SC=CGTTCCTGTAAGGCTGGGCAC;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=10;WE=180155390;WS=180155366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	180158668	rs3894210	C	T	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.646;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=207;ReadPosRankSum=-0.028;SC=CTCCAGCTTCCGCTTGTTCCT;SOR=1.569;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=14;WE=180158676;WS=180158658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr1	180159654	rs7521513	C	T	2325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.45;ReadPosRankSum=-0.279;SOR=0.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,66:0.41:161
chr1	180159657	rs1050154	C	T	2218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FS=0.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.69;ReadPosRankSum=0.504;SOR=0.762;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,60:0.40:151
chr1	180159728	rs12091378	C	G	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.295;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=333;ReadPosRankSum=0.544;SC=ACGTCCAGGACCCGTTCACCC;SOR=0.473;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=42;TCF=12;TCR=30;TR=20;WE=180159736;WS=180159718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,19:0.45:42
chr1	180163578	rs67343209	G	T	1268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.345;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=29;PP=717;ReadPosRankSum=1.522;SC=GGACGAGGGGGTGAGGATACT;SOR=0.499;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=111;TCF=50;TCR=61;TR=55;WE=180163586;WS=180163568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,62:0.52:120
chr1	180167440	rs3843273	A	G	1413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.069;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=28;PP=806;ReadPosRankSum=-1.275;SC=GGTGAGGGAGAAGCCTGTCTG;SOR=0.770;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=66;TCR=58;TR=59;WE=180167448;WS=180167430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,68:0.47:144
chr1	180180669	rs164980	A	G	3107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=51;NR=52;PP=1607;SC=TAACTCGTGCATAGTGGCAGG;SOR=0.910;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=103;TCF=51;TCR=52;TR=103;WE=180180677;WS=180180659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr1	180217656	rs35619850	G	A	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.702;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=266;ReadPosRankSum=-0.044;SC=CAGTGAGGGGGAAGTTTGCAG;SOR=0.255;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=18;WE=180217664;WS=180217646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr1	180240752	rs3845397	C	T	757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=16;PP=523;SC=CATCAGCTCACGGGTGGTTGG;SOR=1.528;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=9;TCR=16;TR=25;WE=180240760;WS=180240742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	180243524	rs7536561	A	G	7054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=117;NR=114;PP=2965;SC=CCTTTGCTCAATGGGCTGGAT;SOR=0.750;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=231;TCF=117;TCR=114;TR=231;WE=180243532;WS=180243514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr1	180257692	rs2254465	A	C	1176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=23;PP=590;SC=AAGTTTACCAAGAGACAGAGA;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=18;TCR=23;TR=41;WE=180257700;WS=180257682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	180283659	rs2764433	T	C	290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=3;PP=186;SC=GGATTACAGGTGTGAGCCCTC;SOR=1.802;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=11;WE=180283667;WS=180283649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	180471054	rs12723183	C	A	165.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.69;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	180757007	.	C	CT	393.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=0.000;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.35;ReadPosRankSum=0.968;SOR=0.876;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,25:0.40:62
chr1	180757117	rs34984251	G	GT	245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=1;NR=7;PP=333;SC=CACTTAAGAGGATTTTCTTGA;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=180757125;WS=180757107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	180772414	.	G	A	20	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=18;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=20;QD=18.2570708491;SC=TACATGTAACGGTTTTCTTCT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=3;WE=180772422;WS=180772404;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,3:0.33:9
chr1	180849494	rs10914123	T	C	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-3.588;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=68;ReadPosRankSum=-1.051;SC=TTGGGTAGCATGTAAGCTAAA;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=6;WE=180849502;WS=180849484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr1	180885430	rs10732273	T	C	6971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=122;NR=110;PP=2965;SC=ACATCCAGCCTGATGGCCCCC;SOR=0.709;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=232;TCF=122;TCR=110;TR=232;WE=180885438;WS=180885420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr1	180886810	rs3761905	C	G	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.813;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=222;ReadPosRankSum=1.368;SC=CAGCATATGGCTGTGCCCACA;SOR=2.303;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=11;WE=180886818;WS=180886800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr1	180897521	rs7544551	C	T	6475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=123;NR=100;PP=2965;SC=CGTTATTTTCCTCTAATCCCT;SOR=0.832;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=224;TCF=123;TCR=101;TR=223;WE=180897529;WS=180897511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr1	180897569	rs3747958	C	T	2355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=51;PP=1294;ReadPosRankSum=-0.173;SC=GCTGCAGGACCGTTGGTCCCA;SOR=0.684;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=196;TCF=98;TCR=98;TR=105;WE=180897577;WS=180897559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,115:0.54:212
chr1	180897792	rs35197779	ATGC	A	362.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=4;PP=183;SC=ATCTAGCCAAATGCTGCTGCT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=4;WE=180897802;WS=180897782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	180904951	rs188274594	G	A	723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=18;PP=516;ReadPosRankSum=-0.153;SC=GGCTGGCTGGGCGTGTGGGCG;SOR=0.665;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=66;TCF=31;TCR=35;TR=32;WE=180904959;WS=180904941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,33:0.46:71
chr1	180905352	rs3795505	C	T	3599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=375;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.374;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=78;PP=2362;ReadPosRankSum=0.842;SC=TTACAGAAAGCCACGAGTCCC;SOR=0.652;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=342;TCF=184;TCR=158;TR=167;WE=180905360;WS=180905342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:196,179:0.48:375
chr1	180905448	rs3795504	G	T	4602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=392;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.646;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=93;PP=2865;ReadPosRankSum=-0.305;SC=CAGCTTCCTTGTGTCCTGAAG;SOR=0.574;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=351;TCF=173;TCR=178;TR=188;WE=180905456;WS=180905438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,208:0.53:391
chr1	180905694	rs3795503	C	T	2120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.485;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=55;PP=1336;ReadPosRankSum=0.084;SC=ACTGCAACAACAGCGCACCTC;SOR=0.759;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=213;TCF=97;TCR=116;TR=101;WE=180905702;WS=180905684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,106:0.46:230
chr1	180913597	rs2331995	A	G	8520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=156;NR=135;PP=2965;ReadPosRankSum=2.462;SC=CAGCAAGGGGAACCGGTCCAG;SOR=0.772;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=293;TCF=157;TCR=136;TR=291;WE=180913605;WS=180913587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,314:0.99:316
chr1	180933498	rs4652543	C	T	1023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=2;PP=816;SC=GTCCAGGCCCCGGTTCCTGGG;SOR=4.680;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=30;WE=180933506;WS=180933488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	180953853	rs3747957	A	G	6503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=122;NR=98;PP=2965;SC=TCTTCATCACATTGTCCAGCC;SOR=0.759;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=220;TCF=122;TCR=98;TR=220;WE=180953861;WS=180953843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr1	180962282	rs1411478	A	G	279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=3;PP=206;SC=GAGCCCAGAGAAGAAGACCAG;SOR=1.609;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=10;WE=180962290;WS=180962272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	180991665	rs12565758	C	G	4478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=108;NR=53;PP=2844;SC=ACTGTTCCCCCTCCCCAGCTC;SOR=1.542;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=162;TCF=108;TCR=54;TR=161;WE=180991673;WS=180991655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr1	181018308	rs3897433	G	A	1438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.662;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-7.474;NF=36;NR=26;PP=1051;ReadPosRankSum=0.417;SC=AGTGTCACTCGGCAGAAGGAG;SOR=0.824;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=120;TCF=68;TCR=52;TR=62;WE=181018316;WS=181018298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,64:0.50:128
chr1	181024404	rs3747956	G	A	3470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=365;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.707;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=73;PP=2077;ReadPosRankSum=-0.543;SC=ATCGATGATTGCAGATCCCTC;SOR=0.738;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=340;TCF=175;TCR=165;TR=156;WE=181024412;WS=181024394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:195,170:0.47:365
chr1	181058313	rs3747955	G	A	310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=10;PP=240;SC=CCCGCCGCTCGTGCCTCTTGG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=181058321;WS=181058303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	181058618	rs1416829	C	G	839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=11;PP=363;SC=CGCGACCCCCCGCGCTGCCTG;SOR=0.874;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=10;TCR=11;TR=21;WE=181058626;WS=181058608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	181058643	rs1361365	A	G	699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=9;PP=340;SC=TGCGCGCCGCAACCAGCGGAG;SOR=0.804;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=9;TCR=9;TR=18;WE=181058651;WS=181058633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	181684605	rs12407563	A	G	1959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=42;PP=1296;SC=ATTCAAAAGGAGAGAAAGAAA;SOR=1.418;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=24;TCR=42;TR=66;WE=181684613;WS=181684595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	181686216	rs7540850	T	C	3622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.08;SOR=1.110;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr1	181714466	rs375841404	AT	A	260.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=2.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=-0.722;QD=2.56;ReadPosRankSum=1.373;SOR=0.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,32:0.31:102
chr1	181719679	rs704332	C	T	4373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=74;PP=2472;SC=GTTGGAGGAGCGAGAAAGTAT;SOR=1.017;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=140;TCF=65;TCR=75;TR=139;WE=181719687;WS=181719669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr1	181726413	rs704330	G	A	131.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.38;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	181727273	rs704329	G	A	1377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=28;PP=818;SC=CACAAGAGCCGACTGAGCCCC;SOR=1.755;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=14;TCR=28;TR=42;WE=181727281;WS=181727263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	181731940	rs116198720	A	G	941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=29;PP=639;ReadPosRankSum=0.018;SC=GCTGCTTGGCATCAGCCAGGG;SOR=0.725;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=81;TCF=23;TCR=58;TR=41;WE=181731948;WS=181731930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,43:0.51:85
chr1	181750469	rs704328	G	T	384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=3;PP=292;SC=TCTCCTATCTGTCTGCATCCT;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=11;WE=181750477;WS=181750465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	181752923	rs36163765	AAGCTT	A	3980.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=44;PP=2566;SC=TGCCAAAGGTAAGCTTAGCTT;SOR=1.255;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=55;TCF=3;TCR=52;TR=47;WE=181752935;WS=181752913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr1	181759497	rs144520471	C	A	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=336;ReadPosRankSum=-1.069;SC=CCAGCCAAGGCTAAAGGGTGT;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=33;TCR=14;TR=23;WE=181759505;WS=181759487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,25:0.50:50
chr1	181759657	rs704326	G	A	5706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=94;PP=2965;SC=TATGGACCCCGCCGATGACGG;SOR=0.712;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=194;TCF=100;TCR=94;TR=194;WE=181759665;WS=181759647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr1	182355046	rs2296519	A	G	5321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=100;NR=81;PP=2867;SC=AGGACAAAACACTAAGAGTCA;SOR=0.752;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=181;TCF=100;TCR=81;TR=181;WE=182355054;WS=182355036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr1	182356399	rs1058111	A	G	7388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=145;NR=115;PP=2965;SC=GTAAAGTACTAGAGCCATCGA;SOR=0.873;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=260;TCF=145;TCR=115;TR=260;WE=182356407;WS=182356389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,275:1.00:275
chr1	182369078	rs6698722	G	A	3490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=49;PP=1909;SC=AGCCAGAGACGGGTCTGTATA;SOR=0.775;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=105;TCF=56;TCR=49;TR=105;WE=182369086;WS=182369068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr1	182369233	rs6674281	A	G	8882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=155;NR=137;PP=2965;SC=AGCAGAGAATAAACGTGCAGC;SOR=0.823;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=294;TCF=156;TCR=138;TR=292;WE=182369241;WS=182369223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,326:1.00:326
chr1	182423146	rs41299607	G	A	1157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.620;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=29;PP=680;ReadPosRankSum=0.560;SC=AGTCTTTGCCGATTTTTTCAA;SOR=0.678;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=125;TCF=67;TCR=58;TR=59;WE=182423154;WS=182423136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,63:0.44:143
chr1	182429295	rs10572829	CTG	C	258.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.162;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=338;ReadPosRankSum=-1.069;SC=ATGCGTGTGTCTGTGTGTGTG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=9;WE=182429304;WS=182429285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr1	182429728	rs266508	T	C	1345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.598;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=21;PP=882;ReadPosRankSum=-0.129;SC=AATTTGTCTCTTTGCTTTTGC;SOR=0.907;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=64;TCR=34;TR=60;WE=182429736;WS=182429717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,64:0.59:109
chr1	182443462	rs649437	T	C	2473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=56;PP=1587;ReadPosRankSum=2.673;SC=CTGGCAGGACTTGCAGCATTT;SOR=0.709;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=248;TCF=128;TCR=120;TR=114;WE=182443470;WS=182443452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,123:0.45:275
chr1	182491107	rs607269	A	C	756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.40;SOR=2.737;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	182491107	.	AGTGT	CGTGC,CGTGT	306	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.1;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=7,20;NR=0,4;PP=79,306;QD=18.9239821232;SC=CTTATAATATAGTGTTCTCCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=7,24;WE=182491119;WS=182491097;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.28:25
chr1	182491111	rs12142736	T	C	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=2.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.70;ReadPosRankSum=-1.015;SOR=1.508;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr1	182496829	rs7535533	A	G	2621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.679;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=57;PP=1371;ReadPosRankSum=1.956;SC=GAAGATCAGTATAGAGACCAA;SOR=0.838;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=186;TCF=87;TCR=99;TR=105;WE=182496837;WS=182496819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,123:0.57:216
chr1	182499295	.	TA	T	46.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.26;MQRankSum=1.984;QD=2.92;ReadPosRankSum=-0.272;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr1	182501933	rs266534	C	A	3134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.909;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=72;PP=2026;ReadPosRankSum=2.835;SC=GAAAGTAAGTCATTTCTGTAT;SOR=0.760;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=259;TCF=131;TCR=128;TR=142;WE=182501941;WS=182501923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,148:0.53:279
chr1	182502033	rs266535	G	T	3728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=79;PP=2448;SC=GCAGCCTGGAGTCTAGCAAAA;SOR=1.318;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=128;TCF=48;TCR=80;TR=127;WE=182502041;WS=182502023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr1	182509269	rs266531	G	A	1336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=6;PP=1051;ReadPosRankSum=0.240;SC=GACTATTTCAGTAGGCCAAAA;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=45;TCF=39;TCR=6;TR=44;WE=182509277;WS=182509259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,46:0.98:47
chr1	182509292	rs3856115	A	G	977.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=13;PP=644;ReadPosRankSum=0.084;SC=ATGGATCCACAGTCTCCTTTC;SOR=0.741;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=100;TCF=72;TCR=28;TR=48;WE=182509300;WS=182509282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,50:0.48:105
chr1	182509617	rs3911280	C	A	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.552;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=107;ReadPosRankSum=-1.262;SC=TAGGACTGCCCAGCAGAAACT;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=7;WE=182509625;WS=182509607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr1	182517357	rs6657620	G	C	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=4.101;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=176;ReadPosRankSum=-0.255;SC=CTGGCCTTGCGTTTTTTGGGC;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=9;WE=182517365;WS=182517356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr1	182517642	rs10911094	C	A	1763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-2.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.223;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=45;PP=1051;ReadPosRankSum=0.821;SC=GCATTTCCCCCACAAGGACAA;SOR=0.521;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=132;TCF=44;TCR=88;TR=71;WE=182517650;WS=182517632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,80:0.54:148
chr1	182522552	rs266544	C	T	1881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=27;PP=1101;ReadPosRankSum=-1.089;SC=TAGGAGTTGTCGCAGGTGTTT;SOR=0.745;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=132;TCF=87;TCR=45;TR=80;WE=182522560;WS=182522542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,87:0.58:151
chr1	182544815	rs11807829	T	C	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-2.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.463;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=140;ReadPosRankSum=-0.980;SC=TGATTTCTATTGCAGAATGAA;SOR=0.255;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=35;TCF=9;TCR=26;TR=15;WE=182544823;WS=182544805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr1	182549019	rs533259	A	G	3446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=44;PP=1916;SC=TCACAGCTTCATGTAGTGGTG;SOR=1.049;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=119;TCF=75;TCR=44;TR=119;WE=182549027;WS=182549009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr1	182551337	rs627928	A	C	2363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.481;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=45;PP=1502;ReadPosRankSum=-0.338;SC=GAGCTTTCAGATCCTCAAATG;SOR=0.797;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=234;TCF=129;TCR=105;TR=106;WE=182551345;WS=182551327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,116:0.44:266
chr1	182554557	rs486907	C	T	2510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.841;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=57;PP=1399;ReadPosRankSum=-2.283;SC=CAGGACATTTCGGGCAAATTC;SOR=0.928;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=266;TCF=134;TCR=132;TR=107;WE=182554565;WS=182554547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:179,124:0.41:303
chr1	182569626	rs1144566	T	C	6824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=108;NR=122;PP=2965;SC=CGTCAGCTCGTGGGTCTCATG;SOR=0.979;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=230;TCF=108;TCR=122;TR=230;WE=182569634;WS=182569616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,259:1.00:259
chr1	182571003	rs610367	C	T	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.904;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=107;ReadPosRankSum=0.470;SC=GGCCCTTCTACCTCTACACCT;SOR=0.122;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=11;WE=182571011;WS=182570993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr1	182571277	rs569790	C	T	1576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.594;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=35;PP=878;ReadPosRankSum=1.075;SC=TCTGGGGTTGCGGGAAAGAAG;SOR=0.622;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=136;TCF=65;TCR=71;TR=67;WE=182571285;WS=182571267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,77:0.50:155
chr1	182573227	rs509476	T	C	4098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=80;NR=65;PP=2708;SC=TCAAGTGCGCTTCTACCTCTC;SOR=0.889;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=145;TCF=80;TCR=65;TR=145;WE=182573235;WS=182573217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr1	182635936	rs2482810	A	T	579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.903;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=12;PP=399;ReadPosRankSum=-1.484;SC=TCTGGTCAGCATCTCACTAAA;SOR=0.581;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=71;TCF=45;TCR=26;TR=31;WE=182635944;WS=182635926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,30:0.41:73
chr1	182640638	rs567397	A	G	654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=440;ReadPosRankSum=-0.287;SC=AAAGCAAAGAACAAAGATTTA;SOR=0.892;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=41;TCR=10;TR=25;WE=182640646;WS=182640628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,26:0.49:53
chr1	182640851	rs569956	T	G	2291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.206;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=27;PP=1767;ReadPosRankSum=0.005;SC=CAGAGAGGCTTCGGGTTAAGG;SOR=0.468;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=110;TCF=53;TCR=57;TR=55;WE=182640872;WS=182640841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,64:0.51:126
chr1	182640864	rs680277	T	C	2133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.473;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=25;PP=1767;ReadPosRankSum=0.014;SC=GGTTAAGGTGTTCTGGGGAAA;SOR=0.460;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=99;TCF=44;TCR=55;TR=48;WE=182640872;WS=182640841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,56:0.49:114
chr1	182640994	rs681081	T	C	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.148;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=89;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CTCCCACCACTTGAGCCAGGC;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=182641002;WS=182640984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr1	182778367	rs971040	G	A	6110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=110;PP=2965;SC=CAAAGTAGACGGAGTAGCTTT;SOR=0.966;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=207;TCF=96;TCR=111;TR=206;WE=182778375;WS=182778357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr1	182850399	rs116290610	C	T	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.465;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=272;ReadPosRankSum=0.643;SC=TGTATTTCAGCGTGGGAGATG;SOR=1.863;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=16;WE=182850407;WS=182850389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr1	182850727	rs6677840	T	C	2408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=43;PP=1562;SC=TAAGAATGACTTGGGAAGCCA;SOR=1.275;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=32;TCR=43;TR=75;WE=182850735;WS=182850717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr1	182854017	rs3130492	G	A	1093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=24;PP=670;SC=TAGAATTCCTGAAGTTAGTGA;SOR=1.666;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=12;TCR=24;TR=36;WE=182854025;WS=182854007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	182993025	rs10911194	C	T	11427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=419;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=197;NR=176;PP=2965;SC=TCAACGCCGCCTTCAACGTGA;SOR=0.803;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=373;TCF=197;TCR=176;TR=373;WE=182993033;WS=182993015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,418:1.00:418
chr1	182993358	rs12030652	G	T	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=190;ReadPosRankSum=-1.695;SC=CCTCACGGGCGCAGACGGCCG;SOR=0.392;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=13;WE=182993366;WS=182993348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr1	183072590	rs2296288	T	C	5044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=82;PP=2610;SC=GTGGTTCCTGTGAGAACACCT;SOR=0.935;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=162;TCF=80;TCR=82;TR=161;WE=183072598;WS=183072580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr1	183072701	rs2296289	C	T	1513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=37;PP=918;ReadPosRankSum=0.263;SC=CTGGGGGCAACGTGGCCTTTT;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=65;TCR=73;TR=71;WE=183072709;WS=183072691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,75:0.50:150
chr1	183077296	rs3835273	A	AG	1699.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=0;PP=1514;SC=ATTTAGTGCTAAAGAGGGCGT;SOR=7.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=37;WE=183077304;WS=183077286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	183077615	rs3765521	C	T	983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.72;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	183077618	rs3765522	C	T	951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.26;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	183079509	rs2296291	C	T	1051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=4;PP=730;SC=GCTCAGTTCCCCAGTTTACAC;SOR=2.964;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=32;WE=183079517;WS=183079499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	183079853	rs6672093	T	C	633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=21;PP=478;SC=GAAGAAGGAATGGGTGACTTT;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=183079861;WS=183079843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	183084607	rs3736888	AC	GA	4915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=31;PP=2947;SC=GATTTTACTTACGTATCTGGC;SOR=1.386;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=101;TCF=66;TCR=35;TR=94;WE=183084616;WS=183084597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr1	183085696	rs6424888	A	G	3450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=42;PP=2388;SC=TGTTTTATCCATTTTTCATTG;SOR=1.437;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=129;TCF=87;TCR=42;TR=128;WE=183085704;WS=183085686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr1	183085755	rs20563	A	G	7899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=150;NR=115;PP=2965;SC=TGAATGTAATATTGAAACAGG;SOR=0.880;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=265;TCF=150;TCR=115;TR=265;WE=183085763;WS=183085745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,289:1.00:289
chr1	183086757	rs2296292	A	C	2838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=46;PP=1484;SC=GCCTCTCTGCAGAAGACCTTG;SOR=0.808;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=96;TCF=50;TCR=46;TR=96;WE=183086765;WS=183086747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr1	183093875	rs20557	T	C	4576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=81;NR=71;PP=2386;SC=TCGATCCCAATGCAGTTGGAA;SOR=0.716;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=152;TCF=81;TCR=71;TR=152;WE=183093883;WS=183093865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr1	183094547	rs20558	T	C	4235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=91;NR=52;PP=2239;SC=AATTGCAATCTGTATGGGACC;SOR=1.179;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=143;TCF=91;TCR=52;TR=143;WE=183094555;WS=183094537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr1	183094802	rs10797850	G	A	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.006;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=285;ReadPosRankSum=1.221;SC=GCCTAATGTAGGCAAGGCATC;SOR=3.126;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=13;WE=183094810;WS=183094792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr1	183095185	rs55856623	TAA	T	1936.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=2.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.91;ReadPosRankSum=-1.040;SOR=0.734;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,64:0.96:67
chr1	183095234	rs1886501	A	G	4039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=57;PP=2658;SC=TGCCTGAGAAATGTCCTGTGT;SOR=0.776;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=145;TCF=88;TCR=57;TR=142;WE=183095242;WS=183095224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr1	183095477	rs2296293	G	A	2180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=43;PP=1262;SC=GACTTTGACAGCCTCAGTCTA;SOR=1.387;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=71;TCF=28;TCR=43;TR=71;WE=183095485;WS=183095467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr1	183096253	rs3066017	T	TATA	429.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=61.07;NF=9;NR=0;PP=407;SC=TCAAAAAAATTATGACAGTAT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=9;WE=183096261;WS=183096243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	183096634	rs1413390	G	A	746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=21;PP=539;SC=GGTGAACAAGGTAGATGTGGT;SOR=3.098;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=25;WE=183096642;WS=183096624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	183096668	rs1413389	C	T	223.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=6;PP=171;SC=GACTTATGTTCCAGTTGGGAG;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=183096676;WS=183096658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	183097956	rs34133998	G	GTTA	2859.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=34;PP=2084;SC=CTAAAGCAAGGTTAGTATAGT;SOR=1.376;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=43;TCF=5;TCR=38;TR=39;WE=183097964;WS=183097946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	183098001	rs10797851	A	G	879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=22;PP=647;SC=TAAACTACTCATAGATTATAA;SOR=1.911;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=31;WE=183098009;WS=183097991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	183099701	rs2296300	G	A	1690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=39;PP=1034;SC=GATTGCAAACGTCTGAGGTGG;SOR=2.381;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=13;TCR=39;TR=52;WE=183099709;WS=183099691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	183100555	rs2333620	T	C	2394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=3.695;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.32;ReadPosRankSum=0.230;SOR=2.383;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,89:0.98:91
chr1	183100562	.	G	GT	1815.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=0.000;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=3.561;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.37;ReadPosRankSum=1.526;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,62:0.97:64
chr1	183100563	rs55951405	G	GTGTGTGT	2755.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.51;SOR=2.644;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	183100596	rs2333619	A	G	286.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.97;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	183100596	.	ATT	GTG	300	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=55;MMLQ=29;MQ=56.98;NF=0;NR=12;PP=300;QD=29.4556562385;SC=GTGTGTGTGTATTGTCTTATC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=12;WE=183100606;WS=183100586;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr1	183100598	rs4047797	T	G	286.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.80;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	183101427	rs148796825	AAAT	A	772.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=56;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=455;SC=ACTCCATTTCAAATAATAATA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=10;WE=183101437;WS=183101423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	183101444	rs12071514	A	C	1096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.45;QD=45.70;SOR=4.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	183101451	rs12066735	T	G	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.39;MQRankSum=0.878;QD=16.63;ReadPosRankSum=2.047;SOR=1.220;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr1	183101471	rs12061219	G	A	1910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=7;PP=1089;SC=AGCATTACCTGAATTTTACTT;SOR=3.098;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=40;TCR=7;TR=47;WE=183101479;WS=183101461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	183101686	rs12095664	G	A	5248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=102;PP=2965;SC=AGTATAATTTGAAAGTGGTTT;SOR=1.121;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=177;TCF=75;TCR=102;TR=177;WE=183101694;WS=183101676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr1	183102719	rs73036945	C	T	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=104;ReadPosRankSum=0.507;SC=AGCCCCACCCCGTCTCTCCCC;SOR=0.593;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=6;WE=183102727;WS=183102709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr1	183104003	rs3831074	GGTCTGT	G	2311.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.144;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=34;PP=2942;ReadPosRankSum=0.742;SC=AGTCCAAATGGGTCTGTGATG;SOR=0.885;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=96;TCF=3;TCR=93;TR=37;WE=183104021;WS=183103993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,63:0.39:162
chr1	183104013	rs2296299	G	A	1899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.663;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=47;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.918;SC=GGTCTGTGATGATGCCGTACT;SOR=0.582;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=43;TCR=81;TR=72;WE=183104021;WS=183103993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,85:0.57:148
chr1	183104079	rs2296298	C	G	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=322;ReadPosRankSum=-0.020;SC=TTTATGCTGGCAAGTCTCAGG;SOR=0.622;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=16;WE=183104087;WS=183104069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr1	183104340	rs35182436	AT	A	3427.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.596;NF=5;NR=75;PP=1274;ReadPosRankSum=-0.558;SC=CACTAGAGTGATTTTTTTTTT;SOR=0.950;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=99;TCF=5;TCR=94;TR=80;WE=183104349;WS=183104330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:5,144:0.97:149
chr1	183105399	rs2296296	C	G	587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=4;PP=441;SC=AGCCCATGCTCTCTTCCATTT;SOR=2.531;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=183105407;WS=183105389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	183105534	rs20560	T	C	6621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=134;NR=86;PP=2965;SC=TTGATAGGCGTGTGAACGATA;SOR=1.064;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=220;TCF=134;TCR=86;TR=220;WE=183105542;WS=183105524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr1	183105705	rs20561	G	A	985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=33;PP=725;ReadPosRankSum=0.078;SC=AGAGGATCGCGAGCGCTGTCC;SOR=0.859;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=75;TCF=14;TCR=61;TR=40;WE=183105713;WS=183105695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,41:0.53:77
chr1	183106739	rs10797854	G	A	1479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=12;PP=1084;SC=TATAAAAGGAGCGGGAGCATA;SOR=2.348;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=38;TCR=12;TR=50;WE=183106747;WS=183106729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	183155399	rs2276542	A	G	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.481;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=96;ReadPosRankSum=-1.198;SC=AAAGGAAGGCACAGCGGAGCG;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=8;WE=183155407;WS=183155389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr1	183155482	rs684527	C	A	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.041;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=326;ReadPosRankSum=-0.793;SC=GCGGCCCGGCCCCGCCATGCC;SOR=0.880;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=60;TCF=45;TCR=15;TR=23;WE=183155490;WS=183155472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,25:0.38:65
chr1	183155700	rs6678888	C	A	1261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=28;PP=594;ReadPosRankSum=-0.682;SC=CCTTCTCCTCCCCTATCTGGG;SOR=0.706;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=28;TCR=52;TR=43;WE=183155708;WS=183155690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,59:0.58:101
chr1	183155715	rs60707856	CT	C	2903.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=33;PP=1640;SC=TCTGGGGCTCCTCCAGAGACG;SOR=2.200;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=1;TCR=37;TR=34;WE=183155725;WS=183155705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	183155717	rs61418038	C	A	2912.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=33;PP=990;SC=TGGGGCTCCTCCAGAGACGGA;SOR=2.200;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=13;TCR=36;TR=45;WE=183155725;WS=183155705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	183155778	rs6703054	A	C	407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=58;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=11;PP=300;SC=AAATAGTAAGACAATAAGCTG;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=183155786;WS=183155768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	183177218	rs647347	A	G	812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=18;PP=578;SC=GCTGAAAAGGACGGAAAGAGG;SOR=3.098;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=183177226;WS=183177208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	183184524	rs2274981	C	T	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.614;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=373;ReadPosRankSum=-0.089;SC=TAGTTGCTTCCAATGCCGCAT;SOR=1.255;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=21;WE=183184532;WS=183184514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,22:0.59:37
chr1	183184616	rs2274980	C	T	1709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=28;PP=971;ReadPosRankSum=-1.090;SC=GTGACAACTCCGGACGGTGCA;SOR=0.719;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=126;TCF=72;TCR=54;TR=68;WE=183184624;WS=183184606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,78:0.56:140
chr1	183184848	rs875794	T	G	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=200;ReadPosRankSum=-0.912;SC=AGTACATCATTTGGGCTATCT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=10;WE=183184856;WS=183184838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr1	183187494	rs10911285	T	C	1599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.810;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=24;PP=875;ReadPosRankSum=0.592;SC=TTTGGAAGCATGTCCCTAATT;SOR=0.925;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=140;TCF=89;TCR=51;TR=70;WE=183187502;WS=183187484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,78:0.49:158
chr1	183187603	rs1129723	C	T	2294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=50;PP=1474;ReadPosRankSum=1.095;SC=AGCCAGCTGTCACTGGAGAAC;SOR=0.729;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=190;TCF=99;TCR=91;TR=103;WE=183187611;WS=183187593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,107:0.52:204
chr1	183191144	rs2296307	C	T	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.186;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=369;ReadPosRankSum=-0.291;SC=TAGGACTTGTCGGCAAGCAAA;SOR=1.061;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=21;WE=183191152;WS=183191134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,28:0.53:53
chr1	183191324	rs2296306	C	A	1935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.542;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=37;PP=1112;ReadPosRankSum=1.083;SC=AACGACTAGACCCTGTCTATT;SOR=0.613;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=168;TCF=96;TCR=72;TR=84;WE=183191334;WS=183191314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,91:0.49:184
chr1	183191367	rs2296305	C	T	1620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.964;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=34;PP=901;ReadPosRankSum=-1.130;SC=AATAATGTCTCCTATAGAGGC;SOR=0.538;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=148;TCF=73;TCR=75;TR=72;WE=183191375;WS=183191357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,80:0.50:161
chr1	183192304	rs1047980	T	G	1519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.692;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=23;PP=940;ReadPosRankSum=-0.110;SC=TGAGCTATGGTCAAAGCCTGT;SOR=0.612;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=106;TCF=67;TCR=39;TR=63;WE=183192312;WS=183192294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,70:0.58:121
chr1	183194619	rs2021956	A	G	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=1.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=119;ReadPosRankSum=-0.650;SC=TCTCAGTCCTATGCCCCCTTC;SOR=1.061;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=7;WE=183194627;WS=183194615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr1	183206573	rs1047981	G	A	4085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=419;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=90;PP=2457;ReadPosRankSum=1.256;SC=AGCGTACACAGAAGAATCTGG;SOR=0.687;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=381;TCF=194;TCR=187;TR=184;WE=183206581;WS=183206563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:217,202:0.48:419
chr1	183207603	rs1925043	T	C	843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.103;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=23;PP=506;ReadPosRankSum=0.602;SC=AAGTGTATAGTCATGACCAAT;SOR=0.994;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=56;TCF=15;TCR=41;TR=32;WE=183207611;WS=183207593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,37:0.58:64
chr1	183209086	rs2477436	C	A	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=245;ReadPosRankSum=-0.271;SC=GCCCGGCTGCCGCTGTATTTT;SOR=0.368;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=13;WE=183209094;WS=183209076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr1	183212171	rs3768594	C	A	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=106;ReadPosRankSum=-1.541;SC=ATACTATTTGCTCTAGGCAAG;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=6;WE=183212179;WS=183212161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr1	183212548	rs3768593	T	G	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=4.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.360;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=371;ReadPosRankSum=0.694;SC=CTGCCATAAATATTTCTCAAC;SOR=2.179;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=78;TCF=27;TCR=51;TR=23;WE=183212556;WS=183212538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,23:0.26:89
chr1	183253959	rs603850	T	G	1275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.841;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=31;PP=778;ReadPosRankSum=-0.024;SC=AGGGACAGAGTGGGAGAGAAC;SOR=0.506;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=86;TCF=27;TCR=59;TR=47;WE=183253967;WS=183253949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,53:0.58:91
chr1	183471295	rs789193	G	T	478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=3;PP=339;SC=CCTTTCACATGAAGTCATTTC;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=183471303;WS=183471285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	183486859	rs789169	G	A	7764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=142;NR=115;PP=2965;SC=TCACAACACTGCAAGGCCAGG;SOR=0.756;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=257;TCF=142;TCR=115;TR=257;WE=183486867;WS=183486849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,293:1.00:293
chr1	183516100	rs699246	G	C	617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=1;PP=550;SC=ATTTCAGAGCGTTTTTTCTCT;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=183516108;WS=183516090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	183516440	rs2702182	G	A	862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=19;PP=546;SC=CTGCTTCTCTGAGATACTGTA;SOR=2.019;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=27;WE=183516448;WS=183516430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	183525452	rs699244	T	G	4073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.155;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=79;PP=2466;ReadPosRankSum=-1.010;SC=ATTTGTTATCTGTCACCCTTC;SOR=1.057;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=130;TCF=51;TCR=79;TR=129;WE=183525460;WS=183525442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,150:0.99:151
chr1	183532580	rs17849502	G	T	1809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.588;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=45;PP=1233;ReadPosRankSum=-0.024;SC=TCAGCTTAGTGTGTTCCAGCC;SOR=0.788;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=148;TCF=65;TCR=83;TR=77;WE=183532588;WS=183532570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,82:0.51:162
chr1	183534935	rs2296164	C	T	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.63;ReadPosRankSum=0.601;SOR=0.728;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,38:0.30:127
chr1	183542323	rs17849501	C	T	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=337;ReadPosRankSum=0.397;SC=CACCTACCGTCGCCTTGCCTA;SOR=0.811;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=39;TCF=32;TCR=7;TR=21;WE=183542331;WS=183542313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,22:0.52:42
chr1	183542387	rs2274064	T	C	1374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.153;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=24;PP=859;ReadPosRankSum=0.476;SC=TCGAAACAGCTTGCCCACAGG;SOR=0.499;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=130;TCF=88;TCR=42;TR=65;WE=183542395;WS=183542377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,68:0.47:146
chr1	183592353	rs75330230	G	T	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.054;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=37;ReadPosRankSum=1.191;SC=GTTTCATGTGGTGTGGATTCT;SOR=0.368;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=5;WE=183592361;WS=183592344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr1	183592416	rs2761573	G	T	699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=366;ReadPosRankSum=0.205;SC=TATTTATGTTGATTACTCTTA;SOR=0.843;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=53;TCF=39;TCR=14;TR=24;WE=183592424;WS=183592406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,31:0.53:59
chr1	183592594	rs16861256	A	G	1361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.637;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=31;PP=697;ReadPosRankSum=-0.272;SC=ATCTGGAATCATACAAGAGGC;SOR=0.594;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=124;TCF=58;TCR=66;TR=62;WE=183592602;WS=183592584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,69:0.49:140
chr1	183596703	rs2231241	G	A	2889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.408;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=68;PP=1763;ReadPosRankSum=0.529;SC=CACGAACAATGGACCCTACTC;SOR=0.662;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=288;TCF=142;TCR=146;TR=134;WE=183596711;WS=183596693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,145:0.46:316
chr1	183599638	rs2231240	C	T	2300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.783;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=42;PP=1288;ReadPosRankSum=0.620;SC=TATTGTCAGACGGGCTCTCAA;SOR=0.866;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=219;TCF=121;TCR=98;TR=100;WE=183599646;WS=183599628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,116:0.46:250
chr1	183602075	rs2231239	T	C	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=95;ReadPosRankSum=0.858;SC=ACGTGAAATTTTTACCTATCA;SOR=0.502;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=6;WE=183602083;WS=183602065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr1	183602138	rs138442122	A	ATT	1317.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=11;PP=448;ReadPosRankSum=0.147;SC=TAAAATATTGATTTTTTTTTG;SOR=0.796;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=60;TCF=36;TCR=24;TR=26;WE=183602146;WS=183602128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,47:0.52:90
chr1	183602308	rs12032504	G	T	2240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.495;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=54;PP=1390;ReadPosRankSum=0.526;SC=AGTTAAGGGTGTAACAGCAAA;SOR=0.653;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=191;TCF=88;TCR=103;TR=101;WE=183602316;WS=183602298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,110:0.50:218
chr1	183604596	rs114167613	GG	AA	858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.731;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=633;ReadPosRankSum=-1.222;SC=CCGGGTCCCAGGAGAAGGGCG;SOR=1.267;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=46;TCF=40;TCR=6;TR=17;WE=183604605;WS=183604586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,24:0.47:51
chr1	183604637	rs111394690	T	A	1270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=3.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.439;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=15;PP=808;ReadPosRankSum=1.070;SC=GGGAGGGCGGTGAATGCAAGG;SOR=0.946;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=125;TCF=89;TCR=36;TR=53;WE=183604645;WS=183604627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,59:0.43:138
chr1	183604905	rs2767305	A	G	742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.739;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=25;PP=581;ReadPosRankSum=0.895;SC=TTCCGCTCTGAGGCGTCGCCG;SOR=1.734;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=53;TCF=6;TCR=47;TR=27;WE=183604913;WS=183604895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,28:0.49:57
chr1	183616781	rs10911388	G	T	1353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-3.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.602;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=10;PP=401;ReadPosRankSum=1.079;SC=AAGTCCCTTGGTAATTGGTTT;SOR=0.348;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=63;TCF=46;TCR=17;TR=32;WE=183616789;WS=183616771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,34:0.47:73
chr1	183616805	rs10911389	T	C	1784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.699;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=15;PP=686;ReadPosRankSum=0.563;SC=GCTGTAGGAATGTAGATTTTA;SOR=0.798;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=107;TCF=73;TCR=34;TR=52;WE=183616813;WS=183616795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,58:0.47:123
chr1	183616884	rs10911390	C	T	3087.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.425;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=59;PP=1690;ReadPosRankSum=1.190;SC=GTGATTTCCACTATCTCCACT;SOR=0.747;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=260;TCF=141;TCR=119;TR=131;WE=183616892;WS=183616874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,149:0.51:292
chr1	183616926	rs1174657	T	C	3080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.698;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=59;PP=1577;ReadPosRankSum=0.694;SC=CCAAGGTCCTTGGTTTCCTGG;SOR=0.646;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=242;TCF=124;TCR=118;TR=128;WE=183616934;WS=183616916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,146:0.55:265
chr1	183617094	rs10911391	G	A	1917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.297;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=38;PP=2919;ReadPosRankSum=-0.198;SC=TGTCCACTCGGCATTTGAAAA;SOR=0.437;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=156;TCF=88;TCR=68;TR=78;WE=183617113;WS=183617084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,89:0.49:181
chr1	183617105	rs1174658	A	G	2158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.056;HP=5;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=43;PP=2919;ReadPosRankSum=0.740;SC=CATTTGAAAAAACTGTCCAGG;SOR=0.644;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=175;TCF=94;TCR=81;TR=84;WE=183617113;WS=183617084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,95:0.47:200
chr1	183617266	rs17436878	C	G	3707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=77;PP=2523;ReadPosRankSum=0.236;SC=CCAGTGCTCTCCCAGTTAAAA;SOR=0.695;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=280;TCF=139;TCR=141;TR=153;WE=183617274;WS=183617256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,164:0.54:303
chr1	183617311	rs10911392	T	A	3024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=62;PP=2030;ReadPosRankSum=0.047;SC=AGACACCACTTATAAAGCTGT;SOR=0.699;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=282;TCF=151;TCR=131;TR=131;WE=183617319;WS=183617301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,143:0.46:310
chr1	183617413	rs12045762	T	C	2592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=58;PP=1405;ReadPosRankSum=1.017;SC=CGCGGTTCCATGCTGAGGCAG;SOR=0.661;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=214;TCF=104;TCR=110;TR=116;WE=183617421;WS=183617403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,125:0.54:231
chr1	183617693	rs16861394	G	A	2954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.005;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=59;PP=2089;ReadPosRankSum=1.573;SC=CAGGCTACCAGAAGAAGTTTT;SOR=0.775;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=274;TCF=141;TCR=133;TR=127;WE=183617701;WS=183617683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,139:0.46:302
chr1	183711483	rs3820689	C	T	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=241;ReadPosRankSum=-0.739;SC=TACCTGAGACCATAATTCTTC;SOR=0.772;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=45;TCF=12;TCR=33;TR=19;WE=183711491;WS=183711473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,21:0.44:48
chr1	183775704	rs368701909	CT	C	51.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.37;MQRankSum=2.109;QD=1.10;ReadPosRankSum=0.853;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,9:0.19:47
chr1	183852914	rs10797919	G	C	1014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=15;PP=633;ReadPosRankSum=1.756;SC=TTCCATATGTGAACAGATGGG;SOR=0.722;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=61;TCR=33;TR=42;WE=183852922;WS=183852904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,48:0.46:105
chr1	183867085	rs3814330	C	T	628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=353;ReadPosRankSum=-0.398;SC=GGGCCGTGTGCGTCTGGGCTC;SOR=0.613;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=52;TCF=15;TCR=37;TR=25;WE=183867093;WS=183867075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,30:0.48:62
chr1	183871637	rs4604659	G	A	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=4.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.33;ReadPosRankSum=0.606;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,18:0.25:71
chr1	183873898	rs10797920	A	G	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=186;ReadPosRankSum=0.625;SC=CTAATGTGGTATATTTTCATG;SOR=1.751;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=11;WE=183873906;WS=183873888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr1	183876182	rs11591089	C	T	2453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.021;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=61;PP=1514;ReadPosRankSum=0.427;SC=CAGCTGCTGACGCCAGCACCA;SOR=0.797;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=215;TCF=94;TCR=121;TR=107;WE=183876190;WS=183876172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,117:0.50:232
chr1	183876287	rs16861715	T	C	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.627;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=360;ReadPosRankSum=-1.570;SC=ATCAGAGTCGTGAGAGGAGAT;SOR=0.047;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=38;TCF=5;TCR=33;TR=24;WE=183876295;WS=183876277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,25:0.62:40
chr1	183891159	rs11803613	C	G	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.590;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=313;ReadPosRankSum=-1.087;SC=GGTGACTCGCCCATCATCTGT;SOR=2.124;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=18;WE=183891167;WS=183891153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
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chr1	183944444	rs2378795	C	T	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.71;ReadPosRankSum=1.248;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr1	183947757	rs3833521	G	GA	80.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.589;NF=0;NR=4;PP=56;ReadPosRankSum=-0.464;SC=GCTACTCCTGGAAAAAAAATT;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=4;WE=183947765;WS=183947747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr1	184020945	rs2274432	G	A	2165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=28;PP=1345;SC=CTGGGTCCGGGCGGTGTTCGC;SOR=1.281;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=45;TCR=28;TR=73;WE=184020953;WS=184020935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr1	184023529	rs1046934	A	C	5925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=118;NR=83;PP=2965;SC=ATGCCACCCAAGTTTATGTAG;SOR=0.958;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=201;TCF=118;TCR=83;TR=201;WE=184023537;WS=184023519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr1	184662181	rs1061508	C	T	1259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.433;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=16;PP=729;ReadPosRankSum=-0.082;SC=AACCACAGTTCTATCATGGCT;SOR=0.471;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=103;TCF=74;TCR=29;TR=48;WE=184662189;WS=184662171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,58:0.46:127
chr1	184663537	rs9425343	A	C	977.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.253;NF=20;NR=26;PP=656;ReadPosRankSum=-2.812;SC=ACTTGATGAAATCTGTTCACC;SOR=0.735;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=113;TCF=50;TCR=63;TR=46;WE=184663545;WS=184663527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,51:0.40:129
chr1	184663581	rs9425634	T	C	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.032;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.150;NF=8;NR=17;PP=392;ReadPosRankSum=1.675;SC=CAGAGGATGGTTGTTCTTCAT;SOR=0.540;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=51;TCF=15;TCR=36;TR=25;WE=184663589;WS=184663571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,28:0.44:63
chr1	184663643	rs34236444	TA	T	173.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.388;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.396;NF=0;NR=6;PP=142;ReadPosRankSum=0.750;SC=GCTACTTCTCTAAAAAAATGT;SOR=0.250;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=6;WE=184663651;WS=184663633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr1	184675814	rs1062994	G	A	3362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=75;PP=2032;ReadPosRankSum=0.406;SC=CATTCTGGATGTTGCGTGCCT;SOR=0.691;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=287;TCF=143;TCR=144;TR=148;WE=184675822;WS=184675804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,164:0.52:316
chr1	184677464	rs3736757	G	A	1630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FS=6.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQRankSum=-0.994;QD=10.00;ReadPosRankSum=-0.509;SOR=0.360;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,82:0.50:163
chr1	184681081	rs7525074	A	G	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.144;NF=0;NR=13;PP=247;ReadPosRankSum=0.424;SC=TTTTTTTTGAAATGGAGTCTC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=13;WE=184681089;WS=184681071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr1	184688237	rs111917956	CGT	C	36.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=68;ReadPosRankSum=1.802;SC=TATATGTGTACGTGTGTGTGT;SOR=0.392;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=5;WE=184688246;WS=184688227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,5:0.16:32
chr1	184695571	rs10752941	C	T	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.432;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=23;PP=482;ReadPosRankSum=-0.811;SC=AGACAATGACCTTCTGATAAG;SOR=2.049;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=64;TCF=13;TCR=51;TR=25;WE=184695579;WS=184695561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,28:0.37:75
chr1	184702064	rs201115464	C	A	2762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.632;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=56;PP=1559;ReadPosRankSum=1.205;SC=CATTGTACCACTGCATATATT;SOR=0.889;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=279;TCF=149;TCR=130;TR=127;WE=184702072;WS=184702054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,143:0.45:321
chr1	184702154	rs41264584	T	C	1997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=51;PP=1327;ReadPosRankSum=-0.520;SC=ACATTATCCATATCTTATAGA;SOR=0.679;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=183;TCF=70;TCR=113;TR=83;WE=184702162;WS=184702144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,92:0.46:198
chr1	184706212	rs10711907	GT	G	1789.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.780;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.191;NF=3;NR=26;PP=1013;ReadPosRankSum=0.813;SC=AGAAACAAGCGTTAACAAGAT;SOR=0.592;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=5;TCR=46;TR=29;WE=184706220;WS=184706202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,57:0.59:96
chr1	184723731	rs200912232	G	C	3087.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.172;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=80;PP=2056;ReadPosRankSum=-0.760;SC=TCTCCATCGCGCTCGCTGGGG;SOR=0.848;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=226;TCF=91;TCR=135;TR=128;WE=184723739;WS=184723721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,139:0.55:254
chr1	184760001	rs570441	T	C	1553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=8;PP=1001;SC=CATTAAGTGGTTTCCCTGCAG;SOR=2.259;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=37;TCR=8;TR=45;WE=184760009;WS=184759991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	184764067	rs581100	C	G	10159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=392;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=188;NR=160;PP=2965;SC=CCCCTATAACCCTTTGGCTTT;SOR=0.811;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=348;TCF=188;TCR=160;TR=348;WE=184764082;WS=184764057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,392:1.00:392
chr1	184777079	rs338564	G	A	868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=4.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=363;ReadPosRankSum=-1.679;SC=GTGTCCTCCCGCAACATGATG;SOR=0.793;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=37;TCF=35;TCR=2;TR=19;WE=184777087;WS=184777069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,22:0.52:42
chr1	184777101	rs338565	G	A	1147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.527;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=6;PP=605;ReadPosRankSum=1.921;SC=CTAAAGAGACGCGACGTATTT;SOR=1.213;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=92;TCF=72;TCR=20;TR=36;WE=184777109;WS=184777091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,38:0.39:97
chr1	184777177	rs543912	C	A	3329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=347;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.774;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=63;PP=2055;ReadPosRankSum=-1.256;SC=TCTTTACCCTCATCCACCACG;SOR=0.802;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=322;TCF=182;TCR=140;TR=154;WE=184777185;WS=184777167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:180,165:0.48:345
chr1	184777467	rs338566	A	T	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-1.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=132;ReadPosRankSum=-0.119;SC=ATCAAATGCAAGTTGTTAAAG;SOR=0.540;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=9;WE=184777475;WS=184777457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr1	184801065	rs487675	T	C	2626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.437;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=62;PP=1673;ReadPosRankSum=0.561;SC=CTAAAAAGGCTTGGGCTTCAA;SOR=0.660;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=252;TCF=108;TCR=144;TR=110;WE=184801073;WS=184801055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,126:0.45:283
chr1	184868251	rs3753575	G	A	1382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=13;PP=930;ReadPosRankSum=1.547;SC=TCAGAAATACGGCTGTGCTAT;SOR=0.683;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=80;TCF=62;TCR=18;TR=53;WE=184868259;WS=184868241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,58:0.64:90
chr1	185119794	rs1544051	C	T	478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=5;NR=10;PP=241;SC=GTAATTGTTGCAGCACATGAT;SOR=1.863;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=15;WE=185119802;WS=185119784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	185143721	rs10489579	A	G	2723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=59;PP=1691;ReadPosRankSum=1.486;SC=TGACCATGGAATTAAAAGCCT;SOR=0.709;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=246;TCF=132;TCR=114;TR=126;WE=185143729;WS=185143711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,135:0.50:271
chr1	185144347	rs6696591	T	G	100.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.01;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	185153545	rs76544683	G	GT	715.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.267;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=408;ReadPosRankSum=0.799;SC=TAACAATGATGGGCTTTTTTT;SOR=0.386;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=12;WE=185153553;WS=185153535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,22:0.50:44
chr1	185171869	rs6698109	A	G	1923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=42;PP=1123;ReadPosRankSum=-0.342;SC=GAGTTATTACACTTATCTCTG;SOR=0.736;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=76;TCR=71;TR=87;WE=185171877;WS=185171859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,94:0.59:158
chr1	185240474	rs12041704	A	G	2109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.569;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=49;PP=1358;ReadPosRankSum=0.136;SC=CCCAAACAGTAATTATCAAGA;SOR=0.778;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=158;TCF=73;TCR=85;TR=87;WE=185240482;WS=185240464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,96:0.56:172
chr1	185259731	rs2378909	A	G	610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.887;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=373;ReadPosRankSum=-1.146;SC=ATTAAAATGTAAAATAAAATG;SOR=0.360;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=21;WE=185259739;WS=185259721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,26:0.54:48
chr1	185267114	rs10174	A	G	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=64;ReadPosRankSum=0.209;SC=GTGTACCTCTACTAACCATAA;SOR=0.582;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=8;WE=185267122;WS=185267104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,9:0.26:35
chr1	185269100	.	TA	T	168.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.944;ClippingRankSum=0.000;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=3.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.14;MQRankSum=2.423;QD=1.87;ReadPosRankSum=0.372;SOR=0.511;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,21:0.23:90
chr1	185833565	rs7556537	A	C	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.471;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=419;ReadPosRankSum=1.302;SC=ATTGTTTTTGATGATGACGTA;SOR=1.528;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=21;WE=185833573;WS=185833555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr1	185833880	rs41458549	A	G	800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.343;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=25;PP=549;ReadPosRankSum=0.609;SC=ATCCACATGTATGTTCTCCAA;SOR=1.108;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=67;TCF=17;TCR=50;TR=32;WE=185833888;WS=185833870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,35:0.49:72
chr1	185984517	rs6665753	T	C	1601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.024;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=42;PP=765;ReadPosRankSum=0.546;SC=ATACGTGTCATGTAGCCAATG;SOR=1.058;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=173;TCF=83;TCR=90;TR=73;WE=185984525;WS=185984507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,86:0.43:199
chr1	185988567	.	CT	C	49	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;FR=0.5000;HP=11;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=5;NR=0;PP=49;QD=11.6;SC=TAGGGATTTGCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=185988575;WS=185988559;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:4,5:0.56:9
chr1	186022032	rs10911808	T	G	660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.620;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=443;ReadPosRankSum=2.285;SC=TAAACTGTTATGAGAATTCTA;SOR=0.392;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=38;TCF=30;TCR=8;TR=24;WE=186022040;WS=186022022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,26:0.65:40
chr1	186026474	rs12129650	T	C	2707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.432;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=60;PP=1699;ReadPosRankSum=1.213;SC=CTGCCTTCCATAACCTGGTTC;SOR=0.663;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=255;TCF=127;TCR=128;TR=121;WE=186026482;WS=186026464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,131:0.47:281
chr1	186030902	rs10737266	G	T	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=275;ReadPosRankSum=-1.151;SC=AATTTTTACCGAAATTGAGCA;SOR=0.368;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=15;WE=186030910;WS=186030892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr1	186031041	rs7522627	C	T	2027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.592;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=51;PP=1370;ReadPosRankSum=-1.167;SC=AATATACTTGCGTTGTAAGGA;SOR=0.777;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=207;TCF=107;TCR=100;TR=101;WE=186031049;WS=186031031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,105:0.46:230
chr1	186039006	rs761905	C	T	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-1.820;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=90;ReadPosRankSum=-0.366;SC=TTTATACTCACCATTAAAGAC;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=6;WE=186039014;WS=186038996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr1	186050417	rs10798035	A	G	1516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.715;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=22;PP=856;ReadPosRankSum=0.540;SC=GCACTGATAGAGTGTTTATCC;SOR=0.927;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=147;TCF=86;TCR=61;TR=64;WE=186050425;WS=186050407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,74:0.44:168
chr1	186055371	rs6425017	A	G	1360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=22;PP=818;ReadPosRankSum=-1.225;SC=TATATTTACTATTATAGTTCC;SOR=0.646;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=108;TCF=69;TCR=39;TR=58;WE=186055379;WS=186055361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,62:0.54:115
chr1	186057181	rs10911816	T	C	2345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.525;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=53;PP=1434;ReadPosRankSum=-1.167;SC=CTTTTTCCCCTAGATATGCAA;SOR=0.502;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=230;TCF=100;TCR=130;TR=100;WE=186057189;WS=186057171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,113:0.45:253
chr1	186064760	rs1022671	A	T	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.72;ReadPosRankSum=1.319;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr1	186077463	rs1555495	A	G	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=217;ReadPosRankSum=-0.415;SC=GTTTGTAATTATCTAGGCTAT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=11;WE=186077471;WS=186077455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr1	186081918	rs7555520	C	T	2602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.707;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=51;PP=1537;ReadPosRankSum=0.985;SC=ATTTTAACGGCAAATTTCTTT;SOR=0.485;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=216;TCF=129;TCR=87;TR=116;WE=186081926;WS=186081908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,125:0.53:235
chr1	186086578	rs10157742	G	A	1884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FS=3.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.47;ReadPosRankSum=-0.233;SOR=0.510;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,96:0.48:199
chr1	186113852	rs17531405	G	C	2495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.483;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=61;PP=1588;ReadPosRankSum=-0.491;SC=GTTGGAAATAGTGAGTCAACA;SOR=0.467;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=223;TCF=97;TCR=126;TR=114;WE=186113860;WS=186113842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,121:0.52:234
chr1	186120982	rs80159306	G	A	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.388;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=249;ReadPosRankSum=0.091;SC=AACTTTTTACGCAATCTTATA;SOR=2.012;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=13;WE=186120990;WS=186120972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr1	186135231	rs78002252	A	C	812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=1.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.252;SOR=1.130;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,22:0.45:49
chr1	186135236	rs6425021	G	A	920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=2.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.37;ReadPosRankSum=-1.259;SOR=1.314;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,26:0.49:53
chr1	186141301	rs4651302	G	A	1858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.092;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=51;PP=1111;ReadPosRankSum=-1.886;SC=AGATCAGTTTGCCGTCAACAA;SOR=0.793;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=191;TCF=81;TCR=110;TR=87;WE=186141309;WS=186141291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,92:0.44:210
chr1	186151493	rs16825040	C	G	1289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.664;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=34;PP=857;ReadPosRankSum=-0.543;SC=AGTTTTTTTTCAATAATCATT;SOR=0.439;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=100;TCF=34;TCR=66;TR=54;WE=186151501;WS=186151483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,58:0.52:112
chr1	186265948	rs1293987	T	A	908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.983;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=11;PP=648;ReadPosRankSum=0.358;SC=ATGAAAGAGCTGTTTTCTGAT;SOR=1.192;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=95;TCF=65;TCR=30;TR=41;WE=186265956;WS=186265938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,43:0.41:104
chr1	186270894	rs1547084	A	G	921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.461;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=25;PP=546;ReadPosRankSum=-0.615;SC=AGATCTGTGCACCTACCTTAG;SOR=0.934;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=98;TCF=46;TCR=52;TR=44;WE=186270902;WS=186270884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,48:0.44:110
chr1	186273994	rs2273779	C	T	1228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.644;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=25;PP=688;ReadPosRankSum=-0.261;SC=TTCAACAATTCGGAAAATCAA;SOR=0.773;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=122;TCF=67;TCR=55;TR=57;WE=186274002;WS=186273984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,62:0.47:132
chr1	186276661	rs61831150	A	G	961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.45;ReadPosRankSum=1.660;SOR=0.748;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,52:0.57:92
chr1	186277088	rs68069719	G	C	8146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=120;NR=155;PP=2965;SC=TCCACCACCTGTGACAAGCCC;SOR=0.984;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=276;TCF=120;TCR=156;TR=275;WE=186277096;WS=186277078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,294:1.00:294
chr1	186277989	rs3737940	A	G	4333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=411;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.101;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=89;PP=2647;ReadPosRankSum=-0.935;SC=TGAGAAAACCAAAGACGACAC;SOR=0.578;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=364;TCF=176;TCR=188;TR=180;WE=186277997;WS=186277979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:210,201:0.49:411
chr1	186300535	.	TA	T	107.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.505;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=1.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.26;ReadPosRankSum=0.916;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,10:0.30:33
chr1	186305914	rs12085497	A	C	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=2;PP=28;ReadPosRankSum=-0.090;SC=TAACTTATTAATTTGCTTTTT;SOR=0.045;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=2;WE=186305922;WS=186305904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr1	186313249	rs2950829	A	G	3795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=82;PP=2446;SC=TATCAGAATAACAGATTTTCC;SOR=1.793;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=36;TCR=82;TR=118;WE=186313257;WS=186313239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr1	186316656	rs3753564	G	C	1070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=31;PP=772;ReadPosRankSum=1.022;SC=CTGTTATAAAGAGCTTATGAA;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=60;TCF=10;TCR=50;TR=37;WE=186316664;WS=186316646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,40:0.59:68
chr1	186329869	rs2026187	C	G	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.128;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=12;PP=478;ReadPosRankSum=-1.044;SC=AGTATTTCAACTCACTAACAA;SOR=1.154;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=84;TCF=51;TCR=33;TR=36;WE=186329877;WS=186329859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,38:0.43:88
chr1	186330643	rs10494586	T	C	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.346;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=100;ReadPosRankSum=-2.166;SC=TACCTAATTCTGTCCCAAATA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=6;WE=186330651;WS=186330633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr1	186352347	rs4651309	A	T	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=204;ReadPosRankSum=-1.189;SC=GCTAGAATCAAGAAGATTTAG;SOR=1.179;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=11;WE=186352355;WS=186352337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr1	186357523	rs1290390	T	C	669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=2;PP=513;SC=TCAACACTCATCTTTTTTTTT;SOR=3.352;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=21;WE=186357531;WS=186357513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	186358588	rs1003127	A	G	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.47;ReadPosRankSum=-1.029;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr1	186359750	rs3115752	G	A	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.023;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=317;ReadPosRankSum=-0.163;SC=GTTTGTATGCGTTATTTAGGT;SOR=0.160;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=17;WE=186359758;WS=186359740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr1	186363119	rs12084264	C	G	1339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=26;PP=737;ReadPosRankSum=-0.030;SC=ACTAGTCATTCTTTTGATGTC;SOR=0.689;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=88;TCF=46;TCR=42;TR=52;WE=186363127;WS=186363109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,60:0.58:103
chr1	186418600	rs12407957	C	T	1046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=27;PP=623;ReadPosRankSum=0.205;SC=ATTTTAGGGACTGGATTTGAT;SOR=0.650;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=99;TCF=41;TCR=58;TR=47;WE=186418608;WS=186418590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,52:0.46:113
chr1	186645488	rs4648276	A	G	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.251;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=225;ReadPosRankSum=2.497;SC=TGTATATAGAATGTGTGAGTT;SOR=1.739;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=12;WE=186645496;WS=186645478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr1	186645927	rs2066826	C	T	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=15;PP=356;ReadPosRankSum=-0.132;SC=TGGGTATAAGCGGTAATAACT;SOR=0.696;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=66;TCF=35;TCR=31;TR=32;WE=186645935;WS=186645917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,33:0.49:68
chr1	186649221	rs2745557	A	G	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=2.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.004;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=289;ReadPosRankSum=-1.193;SC=AGTTCTTTCGAACTCTAGCGG;SOR=0.869;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=43;TCF=28;TCR=15;TR=22;WE=186649229;WS=186649211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,31:0.54:57
chr1	186839861	rs7547993	G	A	1747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.728;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=39;PP=978;ReadPosRankSum=1.344;SC=GACAAAGGGGGCCTTTGGTGA;SOR=0.862;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=211;TCF=110;TCR=101;TR=88;WE=186839869;WS=186839851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,95:0.41:232
chr1	186862419	rs7519192	A	G	349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=10;PP=269;SC=AGCTTGGTAGACTAGAATCTA;SOR=3.611;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=186862427;WS=186862409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
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chr1	186919732	rs4650709	A	T	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.69;ReadPosRankSum=1.498;SOR=0.476;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,27:0.52:52
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chr1	186925168	rs5007825	A	G	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=150;ReadPosRankSum=1.342;SC=CACCGTGCCCAGCCCAAAGAT;SOR=0.368;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=11;WE=186925176;WS=186925166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr1	186925194	rs5007824	T	C	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.444;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=318;ReadPosRankSum=-0.404;SC=TTTAAACATGTATTTTGGAGT;SOR=0.119;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=18;WE=186925202;WS=186925184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,19:0.70:27
chr1	186925552	rs2307199	T	C	774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.332;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=24;PP=536;ReadPosRankSum=-0.713;SC=GCATTTTAATTATTATTAACA;SOR=0.181;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=73;TCF=14;TCR=59;TR=33;WE=186925560;WS=186925542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,34:0.47:73
chr1	186946638	rs2891262	C	T	717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.40;ReadPosRankSum=1.930;SOR=0.885;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
chr1	186946641	rs2891263	C	G	748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.83;ReadPosRankSum=0.911;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,21:0.50:42
chr1	186946912	rs2307198	G	A	1869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.885;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=47;PP=1174;ReadPosRankSum=0.831;SC=AGAAAGTACAGGGCTCCAGGT;SOR=1.008;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=145;TCF=54;TCR=91;TR=72;WE=186946920;WS=186946902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,82:0.52:158
chr1	187610537	rs10159161	AC	GG	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;JOINED;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=327;ReadPosRankSum=1.548;SC=GGGACAAAGAACCCCGTCTTT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=8;WE=187610546;WS=187610527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr1	187610698	rs10157987	C	A	1909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.119;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=31;PP=1061;ReadPosRankSum=1.120;SC=GAAACCATGCCCCCACCCCTA;SOR=0.799;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=171;TCF=103;TCR=68;TR=79;WE=187610706;WS=187610688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,90:0.46:195
chr1	187610852	rs10159182	A	C	3319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.937;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=75;PP=2187;ReadPosRankSum=-0.716;SC=CCATGTGCCCATGGAATCTCC;SOR=0.822;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=262;TCF=127;TCR=135;TR=140;WE=187610860;WS=187610842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,154:0.52:294
chr1	192128183	rs4454527	G	A	833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=3;PP=589;SC=AAACATTTTCGTATGTTACCC;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=26;WE=192128191;WS=192128173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	192129370	rs4329489	G	A	87.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=0;PP=21;SC=TAATGTAAATGCAATTTTCAT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=192129378;WS=192129360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	192544795	rs2984920	A	G	315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=2;PP=237;SC=CACCAAGAAAAGGGGAACTTC;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=192544803;WS=192544785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	192545099	rs7535818	G	A	2668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=62;PP=1759;SC=ATTTTAACAAGTTATCTTTAA;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=22;TCR=62;TR=84;WE=192545107;WS=192545089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr1	192779227	rs2746073	T	A	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=4.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.136;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=336;ReadPosRankSum=-0.215;SC=TTGGTAAAAATGCGTTCAGCT;SOR=2.406;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=16;WE=192779235;WS=192779217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chr1	192780088	rs5779653	GCT	G	4813.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.943;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=56;PP=2847;ReadPosRankSum=-0.940;SC=CATTCTGCATGCTCTCTTTTC;SOR=0.584;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=160;TCF=39;TCR=121;TR=69;WE=192780097;WS=192780078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,135:0.46:292
chr1	192780337	rs10607546	CAA	C	193.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.872;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=196;ReadPosRankSum=0.138;SC=AAAAGTGAAACAAAGTAATCA;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=6;WE=192780346;WS=192780327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr1	193039658	.	CTTT	C	99.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.070;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=2.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.36;MQRankSum=0.000;QD=3.69;ReadPosRankSum=1.494;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,6:0.22:27
chr1	193051685	rs2275444	G	A	2044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=18;PP=1230;SC=CTTTTGTTCCGAATTAGATCC;SOR=1.739;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=47;TCR=18;TR=65;WE=193051693;WS=193051675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr1	193053996	.	GA	G	84.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.830;ClippingRankSum=0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.57;MQRankSum=1.418;QD=4.46;ReadPosRankSum=1.451;SOR=0.394;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr1	193054154	rs10921309	G	A	1105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.695;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=22;PP=503;ReadPosRankSum=1.702;SC=TGAATAATACGTGTGTACCTA;SOR=0.769;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=85;TCF=45;TCR=40;TR=47;WE=193054162;WS=193054144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,54:0.57:94
chr1	193074371	rs10801175	A	G	400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=2;PP=273;SC=ACGCCGCGGCACTCCTGCCCG;SOR=2.448;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=193074379;WS=193074361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	193074651	rs10921310	T	A	3158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=44;PP=2052;SC=GGTCACCTCCTCGCAGCTGAG;SOR=0.874;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=110;TCF=66;TCR=44;TR=108;WE=193074659;WS=193074641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr1	193090865	rs10737621	C	A	6824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=126;NR=109;PP=2965;SC=GGTACGCGCGCACCTGACGCC;SOR=0.799;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=235;TCF=126;TCR=109;TR=235;WE=193090873;WS=193090855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chr1	193094375	rs4466634	T	C	3473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=69;PP=2193;SC=TACTTATCTATCTATTTATCA;SOR=1.411;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=43;TCR=69;TR=112;WE=193094383;WS=193094365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr1	193104827	rs10921318	G	A	39.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	193202001	rs10921328	C	G	197.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=1;PP=199;SC=CCACTGCACTCTAGCCTGGGC;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=193202009;WS=193201991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	193205272	rs3738244	T	A	3075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=36;PP=1692;SC=ATAAGACTCTTTCACATGAAT;SOR=1.188;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=69;TCR=36;TR=105;WE=193205280;WS=193205262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr1	196227526	rs977157	A	G	3624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=53;NR=58;PP=2206;SC=GGTCCGACTGATCACTGGATG;SOR=0.937;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=112;TCF=53;TCR=59;TR=111;WE=196227534;WS=196227516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr1	196227832	rs17696477	A	C	888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.261;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=20;PP=535;ReadPosRankSum=-0.344;SC=AATCAGGCAAAATAAATACCT;SOR=1.206;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=66;TCF=34;TCR=32;TR=36;WE=196227840;WS=196227822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,41:0.51:81
chr1	196242764	rs558895	T	G	1375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=33;PP=964;SC=ATTTCTCGTATGGCTTTTGAA;SOR=2.400;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=9;TCR=33;TR=42;WE=196242772;WS=196242754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	196251522	rs2477357	T	C	1722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.71;SOR=1.688;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	196254970	rs2477360	C	T	1977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=43;PP=1191;SC=TGTTGACATACGTAAAAAGTT;SOR=2.799;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=12;TCR=43;TR=55;WE=196254978;WS=196254960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	196311513	rs6658788	G	A	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=140;ReadPosRankSum=0.674;SC=GTCTGAAGATGACATTATATG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=7;WE=196311521;WS=196311503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr1	196461513	rs4607811	C	T	390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=13;PP=335;SC=ATGCAAGCAACCATATCTTTA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=196461521;WS=196461503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	196642072	rs551397	C	T	1113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.975;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=5;PP=610;ReadPosRankSum=-0.451;SC=TTTAAATAGACACTTTATGCA;SOR=1.421;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=73;TCF=58;TCR=15;TR=40;WE=196642080;WS=196642062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,48:0.56:85
chr1	196642233	rs800292	G	A	1405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.655;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=41;PP=974;ReadPosRankSum=0.867;SC=TCTTGGAAATGTAATAATGGT;SOR=0.788;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=131;TCF=52;TCR=79;TR=65;WE=196642241;WS=196642223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,66:0.49:136
chr1	196642969	rs35507625	C	CTT	1033.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=1.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.24;MQRankSum=0.000;QD=11.88;ReadPosRankSum=0.248;SOR=1.000;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,41:0.47:87
chr1	196654324	rs1061147	A	C	9807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=362;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=169;NR=156;PP=2965;SC=GAAATACAGCAAAATGCACAA;SOR=0.738;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=326;TCF=170;TCR=156;TR=325;WE=196654332;WS=196654314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,360:1.00:360
chr1	196658497	rs482934	G	T	2065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=46;NR=25;PP=1149;SC=TCTAATATGAGTGTTTATTAC;SOR=1.165;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=72;TCF=46;TCR=26;TR=71;WE=196658505;WS=196658487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr1	196658905	rs12029785	G	A	604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=18;PP=491;SC=TATTATGAGGGTTTCTTCTTG;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=196658913;WS=196658895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	196659237	rs1061170	C	T	5781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=84;PP=2965;SC=TAATCAAAATCATGGAAGAAA;SOR=0.771;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=179;TCF=95;TCR=84;TR=179;WE=196659245;WS=196659227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr1	196682947	rs2274700	G	A	7070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=131;NR=101;PP=2965;SC=AAGAAAAAGCGAAATATCAAT;SOR=0.927;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=232;TCF=131;TCR=101;TR=232;WE=196682955;WS=196682937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
chr1	196684574	rs6664877	C	T	155.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=25.96;ReadPosRankSum=-1.834;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr1	196684575	rs6677460	A	G	155.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.712;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=22.25;ReadPosRankSum=-1.981;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr1	196684625	rs203674	G	T	481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=1;PP=419;SC=TTTATTAGTAGATCTAATCAA;SOR=4.294;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=196684633;WS=196684615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	196705926	rs375046	C	A	605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.34;SOR=2.030;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	196710916	rs16840522	T	C	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=1.800;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=64;ReadPosRankSum=-1.934;SC=ATTGATTCTATATATCGCTAT;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=5;WE=196710924;WS=196710912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr1	196712577	rs513699	T	C	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FS=13.797;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQRankSum=-17.756;QD=0.86;ReadPosRankSum=-4.941;SOR=1.877;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:290,27:0.09:317
chr1	196712586	rs61822181	C	T	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=377;ExcessHet=3.0103;FS=21.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQRankSum=-15.319;QD=1.70;ReadPosRankSum=-5.231;SOR=1.923;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:328,47:0.13:375
chr1	196757258	rs400642	C	T	276.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=202;SC=TTCATTGTTTCGCCATATTGC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=196757266;WS=196757248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	196757392	rs400344	C	T	718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.68;QD=27.64;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	196794519	rs442759	C	T	375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=1;PP=292;SC=GAAAGAAAAACACTATAAGTG;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=196794527;WS=196794509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	196794909	rs409549	G	C	1092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=10;NR=26;PP=734;SC=GACCAAAGAAGCTGGAAAGAT;SOR=1.923;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=10;TCR=26;TR=36;WE=196794917;WS=196794899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	196796184	rs399507	G	A	2572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=48;PP=1490;SC=TATAAAGTTTGAGAGAAATAA;SOR=1.227;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=34;TCR=48;TR=82;WE=196796192;WS=196796174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr1	196796240	rs438781	T	A	796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=20;PP=545;SC=TACTTTTATCTTTATTCATTT;SOR=3.690;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=22;WE=196796248;WS=196796230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	196797123	rs677961	C	T	1320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=10;PP=900;SC=CGTCTTGAAACATATTTGTAA;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=34;TCR=10;TR=44;WE=196797131;WS=196797113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	196797238	rs425757	C	T	2156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.54;QD=41.48;SOR=1.893;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	196797244	rs113811987	C	G	2058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.18;QD=46.79;SOR=2.636;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	196797292	rs388862	G	C	73.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=24.43;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	196801042	rs4230	G	T	5510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=81;PP=2965;SC=TGTGTAAACGGGGATATCGTC;SOR=0.776;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=174;TCF=93;TCR=81;TR=174;WE=196801050;WS=196801032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr1	196801078	rs414628	A	T	5036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=81;PP=2867;SC=ACACATTGCGAACAACATGTT;SOR=0.736;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=173;TCF=92;TCR=81;TR=173;WE=196801086;WS=196801068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr1	196801190	rs390679	C	A	1507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=37;PP=1053;SC=TTCTTAATTTCATTTTTAAGT;SOR=2.925;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=8;TCR=37;TR=45;WE=196801198;WS=196801180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	196874356	rs10801578	G	T	7219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=-0.319;NF=127;NR=111;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.276;SC=CAACAGCAGAGGGAAATTCTT;SOR=0.746;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=240;TCF=128;TCR=112;TR=238;WE=196874364;WS=196874345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,269:0.99:271
chr1	196920148	rs4085749	C	T	1495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.082;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.078;NF=40;NR=35;PP=919;ReadPosRankSum=-3.277;SC=CTCCCAAATGCAGGTCCACTA;SOR=0.610;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=192;TCF=99;TCR=93;TR=75;WE=196920156;WS=196920138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,80:0.37:216
chr1	196920178	rs3828032	C	T	2421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.643;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=52;PP=1404;ReadPosRankSum=-0.969;SC=ATGTTGTTCTCTCAGATGCTG;SOR=0.794;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=138;TCF=62;TCR=76;TR=92;WE=196920186;WS=196920168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,108:0.69:157
chr1	196920299	rs3790414	T	A	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.101;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=133;ReadPosRankSum=0.202;SC=TCAGTTCCAATTGTGTCTAAG;SOR=0.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=8;WE=196920307;WS=196920289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr1	196926956	rs3748556	C	T	783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=9;PP=484;ReadPosRankSum=-1.722;SC=GCCTTGTTTGCATTTGCCTTA;SOR=0.798;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=59;TCF=42;TCR=17;TR=34;WE=196926964;WS=196926946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,36:0.57:63
chr1	196926973	rs3748555	C	A	1020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.856;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=15;PP=581;ReadPosRankSum=-0.116;SC=CTTATTTGAACTTGTATTTTT;SOR=0.562;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=53;TCR=26;TR=46;WE=196926981;WS=196926963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,50:0.57:87
chr1	196946775	rs9427662	T	C	1352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.636;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=25;PP=780;ReadPosRankSum=-0.063;SC=TTTAGTTATATACGATTGAGA;SOR=0.904;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=154;TCF=88;TCR=66;TR=61;WE=196946783;WS=196946765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,71:0.39:181
chr1	196967458	rs1332664	G	T	780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.965;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=18;PP=487;ReadPosRankSum=-1.674;SC=AAAACATTTTGTTGATCTTGT;SOR=0.426;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=67;TCF=32;TCR=35;TR=35;WE=196967466;WS=196967448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,39:0.48:81
chr1	197008597	rs5990	A	C	813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.758;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=19;PP=468;ReadPosRankSum=0.339;SC=TCAGGTGTTAATTACAATCTC;SOR=0.607;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=87;TCF=38;TCR=49;TR=35;WE=197008605;WS=197008587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,41:0.40:102
chr1	197009798	rs5998	A	G	1231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=24;PP=597;ReadPosRankSum=0.719;SC=TGTGTGGTCTATTGTCAAAAT;SOR=0.648;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=84;TCF=46;TCR=38;TR=52;WE=197009806;WS=197009788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,60:0.59:101
chr1	197026672	rs1759009	A	G	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=54;ReadPosRankSum=1.423;SC=AATATTCATCATGTCAAGCAT;SOR=1.609;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=5;WE=197026680;WS=197026662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr1	197029345	rs1332661	G	A	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5064;FS=4.771;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=34;ReadPosRankSum=0.842;SC=AAAGATTGCTGAAAATAGCAC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=3;WE=197029353;WS=197029335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr1	197030201	rs5997	T	C	938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-4.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.676;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=33;PP=603;ReadPosRankSum=-0.564;SC=GAGCCAAACATGTTTCTAAAA;SOR=0.341;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=68;TCF=12;TCR=56;TR=42;WE=197030209;WS=197030191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,45:0.58:77
chr1	197030237	rs17549277	CT	C	209.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.11;ReadPosRankSum=0.814;SOR=1.244;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr1	197030829	rs5993	A	T	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=125;ReadPosRankSum=0.000;SC=ATTCTATTAAATAATAGATAT;SOR=0.512;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=8;WE=197030837;WS=197030819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr1	197031021	rs6003	C	T	2520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.481;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=55;PP=1498;ReadPosRankSum=2.020;SC=GCAACCATAACGCATGTTCTC;SOR=0.600;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=232;TCF=118;TCR=114;TR=113;WE=197031029;WS=197031011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,125:0.48:261
chr1	197053373	rs12677	G	A	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.342;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=8;PP=290;ReadPosRankSum=-0.477;SC=AGTTGTACACGGAGAGCAAAA;SOR=0.368;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=39;TCF=27;TCR=12;TR=22;WE=197053381;WS=197053363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,21:0.54:39
chr1	197055925	rs10754213	T	C	707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=12;PP=380;ReadPosRankSum=3.464;SC=CTATATTTAATTGCTTACCTT;SOR=0.601;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=56;TCF=33;TCR=23;TR=30;WE=197055933;WS=197055915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,34:0.56:61
chr1	197059878	rs4915315	G	A	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=405;ReadPosRankSum=-0.316;SC=CGGCTAATGCGTTAGCTTTTT;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=6;WE=197059900;WS=197059868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr1	197059892	rs10754214	A	G	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=405;ReadPosRankSum=-1.781;SC=GCTTTTTAAAATGGTAACTAT;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=11;WE=197059900;WS=197059868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr1	197059928	rs4915316	A	G	663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.469;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=412;ReadPosRankSum=1.222;SC=GATATCATGTAGATGAATTGC;SOR=0.397;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=43;TCF=35;TCR=8;TR=24;WE=197059936;WS=197059918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,27:0.57:47
chr1	197070521	rs12138336	C	G	1168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.696;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=25;PP=658;ReadPosRankSum=-0.476;SC=GTTCCTGAATCTGTTTTTTTA;SOR=0.863;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=89;TCF=44;TCR=45;TR=48;WE=197070529;WS=197070511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,54:0.56:96
chr1	197070776	rs10922162	C	T	1523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.660;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=28;PP=1071;ReadPosRankSum=1.348;SC=CCTGAATAACCACAGCAGAAT;SOR=0.967;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=148;TCF=82;TCR=66;TR=66;WE=197070784;WS=197070766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,70:0.43:163
chr1	197070815	rs1412640	T	C	1848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.576;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=35;PP=1136;ReadPosRankSum=-1.055;SC=TTTCTCTTTGTAATTTTGCAG;SOR=0.784;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=147;TCF=81;TCR=66;TR=78;WE=197070823;WS=197070805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,87:0.53:164
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chr1	197101621	rs3737111	T	C	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.287;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5008;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=180;ReadPosRankSum=0.282;SC=AATACACTTATAGTCTTAAAT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=8;WE=197101629;WS=197101611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr1	197102745	rs4915344	A	G	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.289;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=158;ReadPosRankSum=1.388;SC=AACAAAAGAAAGAATGTTTCT;SOR=1.292;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=38;TCF=10;TCR=28;TR=12;WE=197102753;WS=197102735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,14:0.31:45
chr1	197104149	rs35659894	TA	T	108.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.248;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=123;ReadPosRankSum=-1.362;SC=TATGTATAATTAAAGAATGAC;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=5;WE=197104157;WS=197104139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr1	197109042	rs1332663	C	T	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=93;ReadPosRankSum=0.839;SC=CATTAAAATACAAATTCCCTA;SOR=0.527;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=9;WE=197109050;WS=197109032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
chr1	197112533	rs6677082	G	A	2722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.602;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=46;PP=1616;ReadPosRankSum=-1.253;SC=TAACATTTACGGAATTAAAGG;SOR=0.805;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=200;TCF=109;TCR=91;TR=105;WE=197112541;WS=197112523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,123:0.54:227
chr1	197113073	rs1571964	G	A	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.025;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=356;ReadPosRankSum=1.362;SC=ATCACAGAATGGTTAAAACAT;SOR=0.492;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=59;TCF=40;TCR=19;TR=26;WE=197113081;WS=197113063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,28:0.44:64
chr1	197128726	rs12128631	G	A	2597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.454;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=58;PP=1588;ReadPosRankSum=-0.455;SC=AAGATGGTGGGAGTGTGGTAG;SOR=0.932;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=209;TCF=104;TCR=105;TR=111;WE=197128734;WS=197128716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,122:0.53:231
chr1	197141243	rs6428389	A	C	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=1.191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.78;ReadPosRankSum=0.286;SOR=0.956;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,24:0.51:47
chr1	197141253	rs10429910	A	C	1012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.75;ReadPosRankSum=-0.467;SOR=0.735;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,30:0.56:54
chr1	197141261	rs45512792	A	G	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=9;PP=1149;ReadPosRankSum=0.937;SC=CTATATATATATATCTATGAA;SOR=0.772;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=53;TCF=34;TCR=19;TR=24;WE=197141269;WS=197141233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,26:0.42:62
chr1	197297540	rs12042179	A	T	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=345;ReadPosRankSum=0.541;SC=GTTACTTTTTATTTCCTTGTA;SOR=0.892;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=40;TCF=32;TCR=8;TR=19;WE=197297548;WS=197297530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr1	197316435	rs1337167	T	C	1067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.509;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=6;PP=778;ReadPosRankSum=-0.139;SC=TCAATATGACTAAGAGTTGAC;SOR=1.722;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=107;TCF=82;TCR=25;TR=46;WE=197316443;WS=197316425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,49:0.43:114
chr1	197325908	rs2786098	T	G	1553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.263;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=26;PP=974;ReadPosRankSum=0.334;SC=AGGCAAATGCTCTATAATTCA;SOR=0.589;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=152;TCF=98;TCR=54;TR=73;WE=197325916;WS=197325898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,79:0.49:161
chr1	197390368	rs3902057	A	G	6055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=97;NR=93;PP=2965;SC=TCAGCTGCCTATGTCCATCTG;SOR=0.837;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=190;TCF=97;TCR=93;TR=190;WE=197390376;WS=197390358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr1	197398086	rs7534863	A	G	1293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.501;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=17;PP=817;ReadPosRankSum=0.407;SC=AAATAATAATACTATGTCTCT;SOR=0.852;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=103;TCF=68;TCR=35;TR=52;WE=197398094;WS=197398076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,57:0.48:119
chr1	197407886	rs5779871	A	AT	442.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.547;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=336;ReadPosRankSum=1.723;SC=TTCTCCTCTAATTTTTTATCT;SOR=0.412;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=13;WE=197407894;WS=197407876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr1	197407942	rs980371	A	G	243.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=177;SC=TTCAGACAGAATGAAACAATA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=197407950;WS=197407932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	197446702	rs1135810	G	T	1595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.588;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=26;PP=925;ReadPosRankSum=0.120;SC=AGCTTGCTCTGGTTGGTCTTC;SOR=0.780;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=146;TCF=89;TCR=57;TR=72;WE=197446710;WS=197446692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,77:0.48:162
chr1	197482167	rs2013617	C	G	752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=18;PP=542;SC=AATGTGATTTCATAAGAAACA;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=197482175;WS=197482157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	197510025	rs3902061	G	T	425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=2;PP=324;SC=TTCTAATTTGGAAGTATAAAC;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=197510033;WS=197510015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	197510299	rs3850628	G	A	355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=292;SC=TCAGGGATACGCATATCACTT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=197510307;WS=197510289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	197515777	rs4316386	A	T	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.458;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=317;ReadPosRankSum=-1.892;SC=TCAAATAAACAGCATAAGTAT;SOR=0.428;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=23;WE=197515785;WS=197515767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,25:0.62:40
chr1	197576307	rs11411505	A	AT	612.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=13;PP=574;SC=TTCACTCTCTATAAAAAAAAC;SOR=1.981;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=14;WE=197576315;WS=197576297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	197741951	rs2477067	C	A	2578.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.126;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=34;PP=1350;ReadPosRankSum=0.303;SC=GATCTTGTCCCAAAAAAAAGA;SOR=1.485;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=103;TCF=67;TCR=36;TR=99;WE=197741959;WS=197741938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,104:0.96:108
chr1	197742171	rs2488396	C	T	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.611;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.590;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=71;ReadPosRankSum=-0.369;SC=ATACATTTCACGTGACTGTAT;SOR=0.116;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=6;WE=197742179;WS=197742161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr1	197874949	rs2270763	T	C	1925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.705;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=33;PP=1094;ReadPosRankSum=-0.761;SC=ACTATGTGGATCCAGCTACTG;SOR=0.519;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=148;TCF=91;TCR=57;TR=80;WE=197874957;WS=197874939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,92:0.55:168
chr1	197876533	rs1546244	C	A	393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=12;PP=315;SC=GCACATTGATCGTTATTTTCC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=197876541;WS=197876523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	197890422	rs12122995	C	G	1932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=44;NR=13;PP=1162;SC=TGACTCAACTCTTTCCTTCCA;SOR=1.946;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=44;TCR=13;TR=57;WE=197890430;WS=197890412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	198247229	rs116369607	C	A	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.751;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=209;ReadPosRankSum=0.461;SC=TACTTTTAATCTTGTTTTAAA;SOR=1.206;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=42;TCF=16;TCR=26;TR=16;WE=198247237;WS=198247219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,17:0.39:44
chr1	198677420	rs2274368	T	A	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.394;HP=8;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=156;ReadPosRankSum=-0.646;SC=CAGAGAATTTTTTTTTGTGGC;SOR=0.039;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=13;WE=198677428;WS=198677410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr1	198711170	rs370217220	CA	C	155.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQRankSum=0.000;QD=4.58;ReadPosRankSum=0.487;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr1	200143442	rs1060061	T	C	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=2.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.291;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=215;ReadPosRankSum=1.810;SC=CTGCTCCAAGTAACGCTAATT;SOR=1.445;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=11;WE=200143450;WS=200143432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr1	200182654	rs6427805	T	C	1726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.13;QD=38.37;SOR=1.154;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	200182654	.	TCGGAACGACC	CCGGAACGACC,CCGGAACGACT	458	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=52;MMLQ=24;MQ=62.04;NF=26,14;NR=14,8;PP=228,458;QD=6.56928031368;SC=TCTCCTTCCGTCGGAACGACC;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=42;TCF=28;TCR=14;TR=40,22;WE=200182672;WS=200182644;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.95:42
chr1	200182664	rs6427806	C	T	662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.81;MQRankSum=2.761;QD=12.51;ReadPosRankSum=-0.018;SOR=0.792;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,31:0.58:53
chr1	200182703	rs141962771	GGAGGACGCCGGAGAGGAGGCCGGA	G	715.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.847;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.386;NF=2;NR=7;PP=2971;ReadPosRankSum=0.795;SC=TGGAAGGCATGGAGGACGCCG;SOR=0.818;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=9;WE=200182734;WS=200182693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,37:0.47:78
chr1	200182834	rs12028402	A	G	1392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.825;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.409;NF=37;NR=27;ReadPosRankSum=0.921;SC=CTAGGGATGCAGTCCATTCCC;SOR=0.385;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=105;TCF=65;TCR=40;TR=64;WE=200182842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,66:0.61:109
chr1	200183398	rs10919847	C	A	1036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.213;NF=23;NR=24;PP=625;ReadPosRankSum=0.232;SC=ATCATTGATACTATTGTGTCT;SOR=0.680;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=55;TCR=58;TR=47;WE=200183406;WS=200183388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,51:0.40:128
chr1	200183460	rs10919848	C	T	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.087;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.110;NF=7;NR=18;PP=363;ReadPosRankSum=1.630;SC=AGGCCCTGGCCCAGGCCTGCC;SOR=0.941;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=56;TCF=18;TCR=38;TR=25;WE=200183468;WS=200183450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,26:0.43:60
chr1	200183487	rs150389208	A	G	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.968;NF=0;NR=14;PP=265;ReadPosRankSum=1.179;SC=GAAGCCCAGGATGGTCAGCTG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=14;WE=200183495;WS=200183477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr1	200311868	rs2790109	C	G	1241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=22;PP=669;ReadPosRankSum=-0.666;SC=CTTCTCTTCTCCTGTCTCAAA;SOR=0.641;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=93;TCF=54;TCR=39;TR=53;WE=200311876;WS=200311858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,60:0.55:109
chr1	200311910	rs2225986	T	A	890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.887;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=16;PP=412;ReadPosRankSum=0.061;SC=TGTCATTGGATTTAGGGCCCA;SOR=0.578;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=61;TCF=30;TCR=31;TR=35;WE=200311918;WS=200311900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,42:0.58:73
chr1	200376695	rs35342093	C	T	3925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=397;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.210;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=91;PP=2548;ReadPosRankSum=0.920;SC=CCAAAGGAGACGTAGTGTATA;SOR=0.692;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=365;TCF=186;TCR=179;TR=171;WE=200376703;WS=200376685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:213,183:0.46:396
chr1	200538885	rs10800711	C	T	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=90;ReadPosRankSum=0.129;SC=ATTTTTGAAGCGGAAGGGGTC;SOR=0.892;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=7;WE=200538893;WS=200538875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr1	200538962	rs73070685	G	A	906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=15;PP=542;ReadPosRankSum=-0.590;SC=ATTTGCACACGGATAAGAAAA;SOR=0.744;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=43;TCR=25;TR=40;WE=200538970;WS=200538952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,42:0.54:78
chr1	200544650	rs142403729	TACAC	T,TAC	1540.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.69;QD=35.02;SOR=3.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,19,25:0.43,0.57:44
chr1	200555203	rs58696327	G	T	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.758;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=75;ReadPosRankSum=-1.177;SC=TTTAGAAAATGTTTGCTAAAA;SOR=0.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=6;WE=200555211;WS=200555193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr1	200558363	rs6665951	T	C	1175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=27;PP=677;ReadPosRankSum=0.510;SC=TAGCCAATGTTTCCATTTCTA;SOR=0.674;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=127;TCF=65;TCR=62;TR=58;WE=200558371;WS=200558353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,62:0.47:133
chr1	200561456	rs16846948	T	C	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=314;ReadPosRankSum=-0.225;SC=CAATTCAATATAGTCTAGTAT;SOR=1.022;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=16;WE=200561464;WS=200561446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr1	200567596	rs2809358	T	G	231.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=7;PP=151;SC=CAGTATGAAATTGTTAAATTC;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=200567604;WS=200567586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	200569392	rs2809357	C	A	4874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=98;NR=57;PP=2962;SC=TAAGGAAGGTCGGAAAAATAC;SOR=1.218;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=155;TCF=98;TCR=57;TR=155;WE=200569400;WS=200569382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr1	200574959	rs2808238	T	C	1908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=23;PP=1249;SC=ATGCTCTTTCTATCTAGTGAA;SOR=1.362;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=45;TCR=23;TR=68;WE=200574967;WS=200574949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr1	200575744	rs10577607	CTAAA	C	1357.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=0;PP=1223;SC=GGGTAGAAGGCTAAATAAATA;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=25;WE=200575755;WS=200575734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	200575794	rs2794410	A	G	2458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=20;PP=1601;SC=CAATGAGAATACAATAAAGAT;SOR=1.754;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=52;TCR=20;TR=72;WE=200575802;WS=200575784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr1	200578093	rs2794409	G	A	2448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=40;NR=45;PP=1492;SC=AATTTATTTTGATGTTTTGCA;SOR=0.982;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=40;TCR=45;TR=85;WE=200578101;WS=200578083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr1	200583380	rs2808241	T	G	1097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=23;NR=13;PP=654;SC=TGGCCATGACTGATTTGAACT;SOR=1.347;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=23;TCR=13;TR=36;WE=200583388;WS=200583370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	200594240	rs2809350	G	A	1721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=41;PP=1090;SC=GAGGTATTAGGTGATCTCAAT;SOR=2.722;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=10;TCR=41;TR=51;WE=200594248;WS=200594230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	200618238	rs6665604	T	C	3137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=41;PP=1676;SC=GCGACTTCTCTGAATGTATAG;SOR=0.914;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=64;TCR=41;TR=105;WE=200618246;WS=200618228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr1	200619530	rs2809365	T	C	1248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=10;PP=822;SC=CCATAAAACATAGTTAACTGC;SOR=2.200;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=30;TCR=10;TR=40;WE=200619538;WS=200619520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	200816519	.	TTG	T	840	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;FR=1.0000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MMLQ=28;MQ=60.83;NF=0;NR=14;PP=840;QD=60.5;SC=CAGGGTTTTTTTGTGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=14;WE=200816531;WS=200816509;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:7,14:0.67:21
chr1	200816520	.	TG	T	804.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.98;QD=38.32;SOR=4.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	200816522	rs35428855	TG	T	804.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.02;QD=38.32;SOR=4.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	200816658	rs2131834	T	C	406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=0;PP=354;SC=TATGTACCTATTTAATTTGTA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=200816666;WS=200816648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	200821924	rs2275194	C	T	992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=29;PP=799;SC=TAACAGATTTCTTTCAGAGAA;SOR=4.680;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=31;WE=200821932;WS=200821914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	200824108	rs2275193	C	T	1229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=33;PP=849;SC=AGTGTTTTTACATTTTATAAT;SOR=4.125;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=4;TCR=33;TR=37;WE=200824116;WS=200824098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	200824169	.	T	TCTTATCTTTGTATTACCATCCTTTGTGTTATTTGCCAGTTTTC	141.06	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.27;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	200826395	rs2292095	A	T	722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=7;PP=447;SC=CTGACTTAGGAATGTTATTTT;SOR=1.781;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=26;WE=200826403;WS=200826385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	200868493	rs72225687	GTGTGTGTGCA	G	577.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.767;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.980;NF=9;NR=1;PP=1624;ReadPosRankSum=-1.112;SC=AGATGTGTGTGTGTGTGTGCA;SOR=1.236;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=10;WE=200868510;WS=200868483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr1	200877786	rs2279837	T	C	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=151;ReadPosRankSum=-0.696;SC=GCATGGGCTGTGGTTTGTGGA;SOR=0.770;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=12;WE=200877794;WS=200877776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr1	200877850	rs41299637	T	G	774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.952;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=16;PP=387;ReadPosRankSum=0.675;SC=TTTCTTTTACTCCTGCAGAGG;SOR=0.418;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=68;TCF=40;TCR=28;TR=34;WE=200877858;WS=200877840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,40:0.49:81
chr1	200881172	rs296521	C	A	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-1.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-0.565;NF=12;NR=8;PP=174;ReadPosRankSum=0.595;SC=GGAGCACCCGCCCCCACTCAC;SOR=0.884;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=47;TCF=26;TCR=21;TR=20;WE=200881180;WS=200881162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,17:0.40:43
chr1	200881392	rs10800746	C	T	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.262;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=44;ReadPosRankSum=1.086;SC=GGGTAATCCCCGTCTAGGAAG;SOR=0.446;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=5;WE=200881400;WS=200881382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr1	200943793	rs71991687	CAGGA	C	5405.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=39;PP=2970;SC=CTGCCCACACCAGGAAGGAGA;SOR=1.426;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=83;TCF=41;TCR=42;TR=74;WE=200943804;WS=200943783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr1	200944840	rs296563	T	G	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.969;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=142;ReadPosRankSum=-0.086;SC=AGTGGGAGGATGGAAGGCAGG;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=8;WE=200944848;WS=200944830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr1	200957697	rs12142704	A	G	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.23;ReadPosRankSum=-0.439;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr1	200960307	rs2297909	G	A	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=248;ReadPosRankSum=0.289;SC=AGAGGGAGCCGGTGAGCAGGG;SOR=0.502;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=14;WE=200960315;WS=200960297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr1	200965601	rs10920088	G	A	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.581;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=168;ReadPosRankSum=1.454;SC=AAGGGGGAACGCAGGAACCCT;SOR=0.215;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=15;WE=200965609;WS=200965591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr1	200967490	rs10920089	A	G	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=119;ReadPosRankSum=-0.559;SC=GATGGGGTGGAGGGGCATGGC;SOR=1.022;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=8;WE=200967498;WS=200967480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr1	200978379	rs35918012	G	C	785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.384;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=10;PP=507;ReadPosRankSum=0.235;SC=ATAGGTGGGCGTGAAGATGGC;SOR=0.187;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=59;TCF=45;TCR=14;TR=33;WE=200978387;WS=200978369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,35:0.57:61
chr1	201009556	rs1546416	A	G	5658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=102;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.849;SC=GAGCCCACCAATGAGCAAAAT;SOR=0.732;Source=Platypus;TCF=103;WE=201009564;WS=201009546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,206:0.99:208
chr1	201009897	rs6427875	T	C	694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=15;PP=383;SC=CCAGGAGCCCTGAGTCAACAG;SOR=1.528;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=9;TCR=15;TR=24;WE=201009905;WS=201009887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	201010862	rs6675915	T	C	431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=12;PP=329;SC=GGCTGACGTTTCCACCACTGT;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=201010870;WS=201010852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	201038687	rs7415038	A	G	1810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.040;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=36;PP=1016;ReadPosRankSum=-0.249;SC=TGAAGTTGGTAAACCAGGTGG;SOR=0.505;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=197;TCF=96;TCR=101;TR=78;WE=201038695;WS=201038677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,92:0.41:224
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chr1	201044748	rs1998721	A	G	4927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=84;NR=89;PP=2770;SC=CAGTACCTGTATGGAGGGAGG;SOR=0.887;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=173;TCF=84;TCR=89;TR=173;WE=201044756;WS=201044738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr1	201047075	rs4915477	A	G	1734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.458;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=35;PP=970;ReadPosRankSum=-1.072;SC=GTGTCATGGCACCCGACTCCA;SOR=0.539;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=183;TCF=111;TCR=72;TR=82;WE=201047083;WS=201047065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,91:0.45:202
chr1	201047111	rs9427714	A	G	2298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.070;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=41;PP=1360;ReadPosRankSum=-0.543;SC=GGATACCGCTACACACCACGA;SOR=0.824;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=234;TCF=134;TCR=100;TR=98;WE=201047119;WS=201047101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,113:0.43:265
chr1	201052310	rs12742169	A	T	2716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=1.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.98;ReadPosRankSum=-0.899;SOR=0.814;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,70:0.44:160
chr1	201052310	.	AGA	TGC	1713	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=36;NR=20;PP=1713;QD=31.544069194;SC=GGTCAGCCAGAGAGGCTGGTT;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=141;TCF=87;TCR=54;TR=56;WE=201052320;WS=201052300;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:85,56:0.40:141
chr1	201052312	rs12742170	A	C	2716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.27;ReadPosRankSum=-1.268;SOR=0.661;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,74:0.44:167
chr1	201052474	rs12724643	T	C	1168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.533;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=34;PP=782;ReadPosRankSum=0.422;SC=CAGAGGATGGTCTACAGTGCT;SOR=0.883;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=109;TCF=41;TCR=68;TR=51;WE=201052482;WS=201052464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,55:0.46:120
chr1	201052562	rs12743065	G	T	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.459;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=103;ReadPosRankSum=-0.736;SC=CCCCACTTCCGCCAGCCACAT;SOR=0.836;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=7;WE=201052570;WS=201052552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr1	201060865	rs2296383	G	A	2996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=49;PP=1565;ReadPosRankSum=-0.925;SC=CCAGCAGGGCGATGTGAAAGA;SOR=0.877;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=101;TCF=51;TCR=50;TR=99;WE=201060873;WS=201060855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,116:0.98:118
chr1	201112981	rs8158	A	G	3854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=75;NR=61;PP=2279;SC=GTTGCTCAGTATATGCATCCG;SOR=0.778;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=137;TCF=76;TCR=61;TR=136;WE=201112989;WS=201112971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr1	201113118	rs3738266	A	G	3375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=48;NR=59;PP=1934;SC=CCATTATCTGAGGCCAGGGCT;SOR=1.071;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=48;TCR=59;TR=107;WE=201113126;WS=201113108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr1	201116018	rs3752979	C	G	1504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=25;NR=29;PP=858;SC=AGGGCCACCACGTCTTAGAGC;SOR=0.997;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=25;TCR=29;TR=54;WE=201116026;WS=201116008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	201120730	rs2068152	C	A	193.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=1;PP=144;SC=AGACAGTTGACAACTATGAAA;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=201120738;WS=201120721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	201122784	rs6684980	C	T	2786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=31;PP=1574;SC=CTCTGTGCCCCACCCTTCCTC;SOR=1.431;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=54;TCR=31;TR=85;WE=201122792;WS=201122774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr1	201122947	rs1925361	T	G	5449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=96;PP=2965;SC=GGCCGTGCACTGTGGTCGTGA;SOR=0.815;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=186;TCF=90;TCR=96;TR=186;WE=201122955;WS=201122937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr1	201163191	rs1107128	G	T	1949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=46;NR=16;PP=1194;SC=TCTTGCTCCTGGGGTGAGTGG;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=46;TCR=16;TR=62;WE=201163199;WS=201163181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	201166281	rs7533096	C	T	5389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=74;PP=2965;SC=AACACATAGCCGTGTCTAGTA;SOR=0.903;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=174;TCF=100;TCR=74;TR=174;WE=201166289;WS=201166271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr1	201166383	rs4915221	G	A	6176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=97;PP=2965;SC=GATCTGTACCGCTGCACAGCA;SOR=0.702;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=205;TCF=108;TCR=97;TR=205;WE=201166391;WS=201166373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr1	201166435	rs11589317	T	C	5292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=97;PP=2944;SC=TGAGACTCACTGTCATCGAAG;SOR=0.933;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=182;TCF=85;TCR=97;TR=182;WE=201166443;WS=201166425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr1	201168803	rs45555632	G	T	1183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.649;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=27;PP=582;ReadPosRankSum=-0.609;SC=GCCTGTCCATGAGGGATTTTG;SOR=0.606;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=116;TCF=55;TCR=61;TR=54;WE=201168811;WS=201168793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,62:0.47:132
chr1	201170772	rs10157730	A	G	1628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=13;PP=1132;SC=ATGGTACCAGAGCCTATGAGG;SOR=2.147;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=43;TCR=13;TR=56;WE=201170780;WS=201170762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	201170824	rs10158976	C	G	3815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=79;NR=49;PP=2158;SC=AGCTCTCCTGCTGGGTGTTTG;SOR=1.108;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=129;TCF=80;TCR=49;TR=128;WE=201170832;WS=201170814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr1	201171007	rs10800762	T	G	1255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=31;PP=924;SC=CAGGGATGCTTCAGGTCTAGT;SOR=2.147;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=11;TCR=31;TR=42;WE=201171015;WS=201170997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	201175227	rs832156	C	A	4168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=87;NR=62;PP=2470;SC=AGGATAAAGACCTTCAGTCCA;SOR=1.008;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=149;TCF=87;TCR=62;TR=149;WE=201175235;WS=201175217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr1	201175715	rs1341631	G	T	5047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;PP=2965;SC=GGGTCCAGTCGGCTTCAGGCT;SOR=0.834;Source=Platypus;TCF=86;WE=201175723;WS=201175705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr1	201176018	rs10753895	A	G	1213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=19;PP=842;SC=GAAGCTGGAGACAGCAATGGG;SOR=0.836;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=20;TCR=19;TR=39;WE=201176026;WS=201176008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	201176108	rs12094334	G	A	2416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=28;PP=1443;SC=GAATCCTGGGGTTCTCAGGGA;SOR=1.218;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=51;TCR=28;TR=79;WE=201176116;WS=201176098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr1	201176968	rs12063867	A	G	4148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=67;PP=2531;SC=TCCAGGAGAAATGGGGTCCGG;SOR=0.850;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=63;TCR=67;TR=130;WE=201176976;WS=201176958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr1	201177246	rs72751165	T	C	6688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=123;NR=112;PP=2965;SC=ATTCAGATGGTGGCCTAGGGA;SOR=0.701;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=235;TCF=123;TCR=112;TR=235;WE=201177254;WS=201177236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr1	201177278	rs7551098	C	T	6667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=119;NR=109;PP=2965;SC=ACAGGGTCTGCGGGTAGAGGT;SOR=0.743;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=229;TCF=119;TCR=110;TR=228;WE=201177286;WS=201177268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr1	201177538	rs7551538	G	T	5924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=116;NR=81;PP=2965;SC=ATGCCCTGGTGCTAAGGCCTC;SOR=1.011;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=197;TCF=116;TCR=81;TR=197;WE=201177546;WS=201177528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr1	201178470	rs12757706	G	A	4215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=71;PP=2630;SC=GTGGTTTAAGGGGTTCTGGGG;SOR=0.864;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=136;TCF=65;TCR=71;TR=136;WE=201178478;WS=201178460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr1	201178788	.	A	G	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=26;MMLQ=17;MQ=53.69;NF=126;NR=114;PP=2962;QD=20;SC=ATGGTTTAGGAGGTTCTGGAG;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=467;TCF=235;TCR=232;TR=240;WE=201178796;WS=201178778;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:227,240:0.51:467
chr1	201178819	.	G	A	2834	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=29;MMLQ=26;MQ=54.35;NF=94;NR=125;PP=2834;QD=20;SC=AGTGAATGAAGCAGGTTATAG;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=438;TCF=200;TCR=238;TR=219;WE=201178827;WS=201178809;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:219,219:0.50:438
chr1	201178866	.	A	G	1965	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=29;MMLQ=26;MQ=55.18;NF=54;NR=76;PP=1965;QD=15.3828554811;SC=TAGGTTCAGGAAGTAAGGCAG;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=264;TCF=119;TCR=145;TR=130;WE=201178877;WS=201178856;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:134,130:0.49:264
chr1	201178904	.	A	G	2132	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=34;MMLQ=27;MQ=47.07;NF=58;NR=49;PP=2132;QD=20.2501982481;SC=GGGGGTTCTGAAGAAATGGGG;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=185;TCF=90;TCR=95;TR=107;WE=201178912;WS=201178894;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:78,107:0.58:185
chr1	201178924	.	AAG	GAA	2944	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MMLQ=27;MQ=42.5;NF=58;NR=48;PP=2944;QD=20;SC=GTCAGTGAATAAGGCAGGTTA;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=179;TCF=91;TCR=88;TR=106;WE=201178934;WS=201178914;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:73,106:0.59:179
chr1	201181217	rs12070918	A	G	13596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.44;SOR=0.895;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,313:1.00:313
chr1	201181223	rs12070919	A	G	13134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.83;SOR=0.926;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,293:1.00:293
chr1	201181920	rs12060924	G	T	6283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=111;NR=113;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.223;SC=AAAACCAGGGGTTTAGCCAAG;SOR=0.805;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=226;TCF=112;TCR=114;TR=224;WE=201181928;WS=201181906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,243:0.99:245
chr1	201182779	rs2282413	A	G	4087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=89;PP=2732;SC=GCTGGCTCCCATGGGCTAGAG;SOR=1.761;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=45;TCR=89;TR=134;WE=201182787;WS=201182769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr1	201183363	rs2282415	C	T	3915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=39;PP=2196;SC=CGGGGGAGGCCGCCACACTCT;SOR=1.253;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=122;TCF=83;TCR=39;TR=121;WE=201183371;WS=201183353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr1	201183402	rs1568810	T	C	4988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=95;NR=78;PP=2519;SC=ACCTGGGACCTGGCACCTGGT;SOR=0.778;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=173;TCF=95;TCR=78;TR=173;WE=201183410;WS=201183392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr1	201184275	rs2275673	C	T	1854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=28;PP=889;SC=CCACCCTGACCGTCCAGGGTA;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=41;WE=201184283;WS=201184265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	201184294	rs34052252	C	T	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-0.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=240;ReadPosRankSum=0.829;SC=TAAGGCCCAGCCCTGCCCTGC;SOR=0.756;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=17;WE=201184302;WS=201184284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,22:0.51:43
chr1	201187764	rs10920144	T	C	4904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.127;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=77;PP=2529;ReadPosRankSum=-0.730;SC=CATCGGATGCTGTCTTTGCTC;SOR=0.325;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=171;TCF=92;TCR=79;TR=168;WE=201187772;WS=201187754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,188:0.99:189
chr1	201187828	rs3738268	T	C	3532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=50;NR=66;PP=1642;SC=GAGGTGAGCATGGGATAGCCC;SOR=1.237;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=50;TCR=67;TR=116;WE=201187836;WS=201187818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr1	201187954	rs6667020	C	T	241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=5;PP=101;SC=TGAGCCACATCTTAGGGGCCC;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=8;WE=201187962;WS=201187944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	201193668	rs6687494	G	T	179.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=6;NR=0;PP=144;SC=TTTTCTTGTCGACGTTGTGTT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=201193676;WS=201193665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	201195119	rs3738270	C	T	7096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=140;NR=100;PP=2965;SC=CGACCGCATCCACACCAACCG;SOR=0.915;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=241;TCF=140;TCR=101;TR=240;WE=201195127;WS=201195109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr1	201197331	rs3753971	G	A	633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=0;PP=532;SC=ATGGTTCCCCGAGGGGCCAGC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=201197339;WS=201197321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	201282167	rs1772860	C	G	1794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=3;PP=1425;SC=GTTCCTTCCACGCCAAACATT;SOR=4.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=53;TCF=50;TCR=3;TR=53;WE=201282175;WS=201282157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	201285759	rs1779297	A	G	2968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=44;PP=1536;SC=AGGATGAGAAATACCAGGCCA;SOR=0.825;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=49;TCR=44;TR=93;WE=201285767;WS=201285749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr1	201285909	rs1534051	A	G	417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=10;PP=317;SC=GAGATGGGTGAGGGCATCTGC;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=201285917;WS=201285899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	201286614	rs11336457	GA	G	2145.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.778;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.395;NF=24;NR=30;PP=936;ReadPosRankSum=-0.195;SC=TTTTTGGTCTGAAAAAAAAAA;SOR=1.460;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=33;TCR=42;TR=54;WE=201286636;WS=201286604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:6,91:0.94:97
chr1	201286628	rs1772823	C	G	5127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=44;PP=2213;SC=AAAAAAATCACCTTTGAGTAG;SOR=1.205;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=119;TCF=75;TCR=44;TR=119;WE=201286636;WS=201286604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr1	201288007	rs1794868	G	A	104.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.98;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	201288898	rs1722759	A	C	3874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=53;PP=2498;SC=CCACCCCCAGATCCACTTCTG;SOR=1.032;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=77;TCR=53;TR=130;WE=201288906;WS=201288888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr1	201290968	rs1779292	T	G	1322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=7;PP=872;SC=CCCAGGCTGATAGTGTGGTGG;SOR=2.409;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=38;WE=201290976;WS=201290958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	201291066	rs2071960	C	T	6962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.048;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=146;NR=85;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.191;SC=CCTGTCGGGCCGGGCAGAGGC;SOR=0.976;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=231;TCF=146;TCR=85;TR=231;WE=201291074;WS=201291056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,253:1.00:254
chr1	201292110	rs1779288	T	C	2140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=50;NR=20;PP=1345;SC=AGGCTCCCCATTGACCCCCCT;SOR=1.550;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=50;TCR=20;TR=70;WE=201292121;WS=201292100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr1	201293512	rs36076398	TG	T	1850.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=14;PP=1127;SC=CCATGGTGCCTGGGAAGCCAC;SOR=1.402;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=19;TCR=18;TR=29;WE=201293520;WS=201293502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	201293970	rs1620046	C	T	279.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=172;SC=GCTCAGAGCCCGGCAGAAGGC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=201293978;WS=201293960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	201293985	rs854505	G	A	299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=187;SC=GAAGGCTATCGAAGAGTGTGG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=201293993;WS=201293975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	201331554	rs1104859	T	G	5076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=98;NR=76;PP=2965;SC=GAGAGGCCCATAGAAAAAGAC;SOR=0.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=175;TCF=98;TCR=77;TR=174;WE=201331562;WS=201331544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr1	201331664	rs2365652	C	A	1946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=45;PP=1353;SC=GCCGGGTTTACTAGGACGTGG;SOR=1.981;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=18;TCR=45;TR=63;WE=201331672;WS=201331654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr1	201334382	rs3729547	G	A	5125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=91;PP=2945;SC=AGTGAGCCTCGATCAGCGCCT;SOR=1.041;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=167;TCF=76;TCR=91;TR=167;WE=201334390;WS=201334372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr1	201335899	rs1573230	C	T	841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=1;PP=729;SC=TACTGCACCCCGTTCCATCAT;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=27;WE=201335907;WS=201335889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	201336984	rs3729843	C	T	3635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=69;PP=2294;SC=GAGCTCAAGTCCCCCCCTCCG;SOR=1.033;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=125;TCF=56;TCR=69;TR=125;WE=201336992;WS=201336974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr1	201337170	rs3729842	A	G	539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=4;PP=433;SC=AATCTTAGTCAATAGGAGAGT;SOR=2.419;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=19;WE=201337178;WS=201337169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	201338553	rs10800776	T	C	1338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=30;PP=775;SC=CCCTGCTTGGTGCTGTCCAGC;SOR=1.755;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=14;TCR=30;TR=44;WE=201338561;WS=201338543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	201338586	rs10920183	A	G	886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=19;PP=629;SC=CCCAGCATGGAACACTGGGGT;SOR=2.468;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=24;WE=201338594;WS=201338576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	201338896	rs10920184	T	C	3973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=83;NR=54;PP=2232;SC=AGGCTGCACTTGGGACAGCAG;SOR=1.067;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=137;TCF=83;TCR=54;TR=137;WE=201338904;WS=201338886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr1	201339043	rs12049476	C	T	1956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=46;PP=1341;SC=AGAGAGCCCGCGGCAGGAGCA;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=23;TCR=46;TR=69;WE=201339051;WS=201339033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	201341175	rs45533739	CAGAAG	C	6931.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=48;PP=2971;SC=TGCTTCTGCTCAGAAGAGAAG;SOR=1.223;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=86;TCF=30;TCR=56;TR=76;WE=201341187;WS=201341165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr1	201341341	rs868407	C	T	2843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=57;PP=1664;SC=CAAACACACACGCCTGCACAC;SOR=1.609;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=91;TCF=33;TCR=58;TR=90;WE=201341349;WS=201341331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr1	201353827	rs10920189	G	C	1692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=37;NR=22;PP=1159;SC=GTGCCCTACCGCACAGCCTGG;SOR=1.234;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=59;TCF=37;TCR=22;TR=59;WE=201353835;WS=201353817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	201356393	rs74662114	C	T	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=140;ReadPosRankSum=-0.721;SC=GCTGCCAGGGCCACCAAGGAG;SOR=0.836;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=28;TCF=10;TCR=18;TR=10;WE=201356401;WS=201356383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,10:0.33:30
chr1	201356428	rs4915230	C	A	638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=16;PP=433;SC=AGGCCCTGGCCTCCCCGGCTC;SOR=2.030;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=22;WE=201356436;WS=201356418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	201368463	rs28364652	G	GT	2046.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=1.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQRankSum=0.907;QD=18.44;ReadPosRankSum=-2.392;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,62:0.56:111
chr1	201383616	rs2026593	A	G	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.78;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr1	201383643	rs2026594	A	C	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=149;ReadPosRankSum=-1.011;SC=CTGCCAGGCTAACCTGCAGGG;SOR=0.693;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=10;WE=201383651;WS=201383633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,10:0.34:29
chr1	201434740	rs1053592	G	A	2221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.507;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=45;PP=1327;ReadPosRankSum=1.339;SC=GGGAAGATGCGTAGAGGTGGG;SOR=0.632;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=192;TCF=109;TCR=83;TR=101;WE=201434748;WS=201434730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,108:0.52:209
chr1	201437477	rs1256930	A	T	1185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.398;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=18;PP=680;ReadPosRankSum=-1.071;SC=ACCTGCCTTGACCTCAGCACT;SOR=0.495;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=113;TCF=77;TCR=36;TR=51;WE=201437485;WS=201437467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,57:0.46:123
chr1	201437832	rs35383942	C	T	1187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.658;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=29;PP=730;ReadPosRankSum=0.735;SC=GCAGCGCTTCCGCTTCCACAG;SOR=0.521;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=89;TCF=32;TCR=57;TR=47;WE=201437840;WS=201437822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,54:0.51:106
chr1	201453289	rs576697	T	C	530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=12;PP=278;SC=CCTAGGACCCTGCCTGCATGC;SOR=2.200;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=17;WE=201453297;WS=201453279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	201687451	rs11576721	A	G	854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.133;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=11;PP=545;ReadPosRankSum=-1.127;SC=GCTGGGGTGCATGTGAGGGGA;SOR=1.157;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=86;TCF=57;TCR=29;TR=40;WE=201687459;WS=201687441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,43:0.47:91
chr1	201688733	rs138079376	G	A	1209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.907;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=20;PP=626;ReadPosRankSum=-1.130;SC=AGTGCTGGGCGCTTAGGGGGA;SOR=0.949;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=129;TCF=77;TCR=52;TR=55;WE=201688741;WS=201688723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,62:0.41:153
chr1	201763184	rs564440	T	C	2299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=26;PP=1514;SC=TCCCAATTCCTTGCCCTTCTC;SOR=1.528;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=53;TCR=26;TR=79;WE=201763192;WS=201763174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr1	201763499	rs567185	C	T	217.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=2;PP=135;SC=GAACTCCTGACCTCAGGTGAT;SOR=1.863;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=201763507;WS=201763489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	201772863	rs34105833	T	TG	2925.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=60;PP=2676;SC=GTTTGGGGGGTGGGAAGTAGG;SOR=1.890;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=71;TCF=4;TCR=67;TR=64;WE=201772871;WS=201772852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr1	201773566	.	CT	C	332.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.458;ClippingRankSum=0.000;DP=224;ExcessHet=3.0103;FS=3.409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.76;ReadPosRankSum=2.306;SOR=0.646;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:153,36:0.19:189
chr1	201788804	rs11803449	G	A	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.824;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=138;ReadPosRankSum=-0.518;SC=GTAGAGTCAGGGTCTCTCTTT;SOR=0.818;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=8;WE=201788812;WS=201788794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr1	201816639	rs146207613	ATCTTTT	A	1565.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.820;HP=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.608;NF=17;NR=12;ReadPosRankSum=0.838;SC=TGTGAAAAAAATCTTTTTCTT;SOR=0.830;Source=Platypus;TR=29;WE=201816652;WS=201816629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,43:0.44:97
chr1	201821443	rs1400875	T	C	972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.766;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=25;PP=577;ReadPosRankSum=-0.390;SC=CTGACAAAGATCTGGATCTGA;SOR=0.461;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=84;TCF=32;TCR=52;TR=43;WE=201821451;WS=201821433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,47:0.50:94
chr1	201824390	rs11576508	G	A	2030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.433;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=51;PP=1155;ReadPosRankSum=0.640;SC=GCGGGAAACAGTAACTTGAGA;SOR=0.903;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=180;TCF=78;TCR=102;TR=86;WE=201824398;WS=201824380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,98:0.48:206
chr1	201826340	rs2172935	C	T	2312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.031;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=50;PP=1292;ReadPosRankSum=0.138;SC=TACCTTGATACTTCAGCCACA;SOR=0.771;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=197;TCF=92;TCR=105;TR=94;WE=201826348;WS=201826330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,110:0.50:222
chr1	201826482	rs2132363	C	T	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=50;ReadPosRankSum=1.540;SC=AAATTCGAGACTCAGAAATTC;SOR=0.193;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=6;WE=201826490;WS=201826472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr1	201832864	rs2494115	G	C	650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=408;ReadPosRankSum=-0.694;SC=GTGAATGTTGGAAGGACAGGG;SOR=0.793;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=47;TCF=13;TCR=34;TR=24;WE=201832872;WS=201832854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,28:0.52:54
chr1	201837934	.	CGTGT	C,CGT	3718.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.324;ClippingRankSum=0.000;DP=212;ExcessHet=3.0103;FS=6.986;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.41;MQRankSum=0.368;QD=21.50;ReadPosRankSum=0.951;SOR=0.315;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:5,27,141:0.16,0.82:173
chr1	201837956	.	TGA	T	998	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MMLQ=27;MQ=60.33;NF=7;NR=77;PP=998;QD=11.9404761905;SC=TGTGTGTGTGTGAGAGAGATC;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=110;TCF=14;TCR=96;TR=84;WE=201837965;WS=201837946;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:26,84:0.76:110
chr1	201838107	rs2820310	G	A	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.876;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=97;ReadPosRankSum=0.748;SC=TTGGCTTGGCGCGGTGGCTCA;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=201838115;WS=201838097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr1	201840059	rs150361248	GTTATT	G	1887.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=28;PP=1483;SC=TTGGTCCTGAGTTATTTTATT;SOR=3.109;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=30;WE=201840071;WS=201840049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	201840464	rs2644124	T	C	2579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=36;NR=40;PP=1273;SC=AGGTAGAACCTCATCTTTCTT;SOR=1.216;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=82;TCF=36;TCR=46;TR=76;WE=201840472;WS=201840454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr1	201844128	rs2678203	G	A	3909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=57;NR=72;PP=2196;SC=GATCCCAACAGTGGGGTACCC;SOR=1.063;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=57;TCR=73;TR=129;WE=201844136;WS=201844118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr1	201860626	rs2250377	A	G	1594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=36;PP=886;ReadPosRankSum=-0.896;SC=CTGGCTTCATATACCCACCTA;SOR=0.717;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=127;TCF=61;TCR=66;TR=69;WE=201860634;WS=201860616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,76:0.54:140
chr1	201861016	rs2279681	C	G	1399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.970;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=39;PP=919;ReadPosRankSum=-0.204;SC=TGATGCCAACCTTGGGAGATG;SOR=0.504;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=80;TCF=21;TCR=59;TR=54;WE=201861024;WS=201861006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,58:0.65:89
chr1	201865763	rs8028	A	G	2379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.303;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=63;PP=1524;ReadPosRankSum=2.633;SC=GTGCAGTGGGACTGACAGTGA;SOR=0.876;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=209;TCF=82;TCR=127;TR=100;WE=201865771;WS=201865753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,109:0.46:235
chr1	201869257	rs2820312	G	A	2177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=44;PP=1339;ReadPosRankSum=-0.235;SC=GCCACTGGGCGTCTGTTTCTC;SOR=0.730;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=159;TCF=82;TCR=77;TR=89;WE=201869265;WS=201869247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,97:0.55:176
chr1	201924749	rs3820438	G	C	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.079;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=254;ReadPosRankSum=-0.158;SC=CCCTTGTCCAGGCTCCCAAGG;SOR=1.038;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=64;TCF=24;TCR=40;TR=25;WE=201924757;WS=201924739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,29:0.40:73
chr1	201926386	rs57833794	C	CT	3276.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=-1.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.427;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=29;PP=924;ReadPosRankSum=-1.893;SC=GAAATATGGTCTTTTTTTTCC;SOR=0.795;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=150;TCF=59;TCR=91;TR=53;WE=201926394;WS=201926376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,148:0.51:290
chr1	201938482	rs58623305	C	T	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-3.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=46;ReadPosRankSum=-0.289;SC=AGGGTTATAGCTTTAATTTAG;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=5;WE=201938490;WS=201938477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr1	201952294	rs73074403	C	G	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=174;ReadPosRankSum=-0.751;SC=TTCCGGCCCCCAGCCGCCCTG;SOR=0.446;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=12;WE=201952302;WS=201952284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr1	201952310	rs112370844	T	G	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.702;HP=4;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=75;ReadPosRankSum=0.983;SC=CCCTGCACCCTCACCTACCCC;SOR=0.148;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=7;WE=201952318;WS=201952300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr1	201952574	rs4950806	T	C	1519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FS=0.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.80;ReadPosRankSum=2.117;SOR=0.748;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,75:0.48:155
chr1	201952755	rs4950807	T	A	965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=27;PP=555;ReadPosRankSum=-1.810;SC=GTTAAAGCTCTTATCTTTGTT;SOR=0.761;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=107;TCF=44;TCR=63;TR=45;WE=201952763;WS=201952745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,49:0.43:114
chr1	201958312	rs35164608	C	G	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.643;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=248;ReadPosRankSum=-1.277;SC=TTAAATTCTTCCACCTACTGA;SOR=1.938;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=13;WE=201958320;WS=201958302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr1	201966774	rs10920300	T	C	569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.459;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=19;PP=338;ReadPosRankSum=-0.602;SC=AGAATACAAGTGGGTGTGAAG;SOR=0.111;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=39;TCF=9;TCR=30;TR=27;WE=201966782;WS=201966764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,27:0.68:40
chr1	201969082	rs1130790	G	A	1818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.966;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=28;PP=1120;ReadPosRankSum=0.161;SC=TGCTGCGTCAGCACATGGACA;SOR=0.881;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=147;TCF=93;TCR=54;TR=77;WE=201969090;WS=201969072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,85:0.52:164
chr1	201970562	rs4332408	T	C	8942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=147;NR=145;PP=2965;SC=TCTGCTTTGTTTCATACCTGG;SOR=0.774;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=292;TCF=147;TCR=145;TR=292;WE=201970570;WS=201970552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,333:1.00:333
chr1	201970748	rs4131469	G	A	829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.453;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=18;PP=493;ReadPosRankSum=-1.074;SC=CACTCCCCACGGGGCCAGAGA;SOR=0.473;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=109;TCF=63;TCR=46;TR=37;WE=201970756;WS=201970738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,44:0.36:123
chr1	201980119	rs2819361	C	G	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.980;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.392;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=134;ReadPosRankSum=2.327;SC=CTTGAAGAGACGGTGTCCGCA;SOR=0.238;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=8;WE=201980127;WS=201980109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr1	201983242	rs2819365	C	T	1007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=2.140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.00;ReadPosRankSum=0.512;SOR=0.195;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,28:0.50:56
chr1	201983249	.	C	A	994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.682;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=3.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.72;ReadPosRankSum=-0.485;SOR=0.123;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,26:0.54:48
chr1	202092046	rs3795593	C	T	616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=5;PP=375;SC=GGGCCCCCTGCACTCACCTGC;SOR=1.931;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=20;WE=202092054;WS=202092036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	202092360	rs3795595	G	A	3899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=81;NR=54;PP=2385;SC=CCTAACCCCGGCAAGGATGGG;SOR=1.022;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=135;TCF=81;TCR=54;TR=135;WE=202092368;WS=202092350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr1	202092415	rs3795596	A	G	6082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=115;NR=86;PP=2965;SC=ATCTGACAGGAGCACCAGGGC;SOR=0.929;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=202;TCF=116;TCR=86;TR=201;WE=202092423;WS=202092405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr1	202092580	rs7516762	T	C	5393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=103;PP=2965;ReadPosRankSum=2.233;SC=ACCTGAAGAGTGCCTGGAACT;SOR=0.954;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=191;TCF=86;TCR=105;TR=188;WE=202092588;WS=202092570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,204:0.99:206
chr1	202096815	rs3820380	G	A	3049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=41;PP=1917;SC=GTCCTTCCTTGTCCCCATAGA;SOR=1.238;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=71;TCR=41;TR=112;WE=202096823;WS=202096805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr1	202103802	rs4342901	G	A	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.160;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=326;ReadPosRankSum=-0.543;SC=GGAAGCTCAGGTGAGAGGATT;SOR=2.833;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=16;WE=202103810;WS=202103792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr1	202107422	.	AACACACAC	A,AAC	1047.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.29;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=23;NF=9,9;NR=5,5;PP=90,495;SC=TGCCCTCCCCAACACACACAC;SOR=3.098;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=19;TCF=10;TCR=9;TR=14,14;WE=202107437;WS=202107412;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.35,0.65:26
chr1	202113835	rs4989100	T	G	1107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=27;PP=758;SC=CGAGCGCGGCTGCCGACGACT;SOR=3.383;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=32;WE=202113843;WS=202113825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	202121643	rs10920337	G	A	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.258;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=90;ReadPosRankSum=0.309;SC=ACAGTCCACAGGCTGCAGTGA;SOR=0.072;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=10;WE=202121651;WS=202121633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,10:0.30:33
chr1	202122783	rs11590076	C	A	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.492;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=70;ReadPosRankSum=-0.896;SC=TAGTGAAGAGCCAGCCTGAGT;SOR=0.157;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=8;WE=202122791;WS=202122773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr1	202130728	.	C	T	916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.135;ClippingRankSum=0.000;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=20;PP=459;ReadPosRankSum=-0.512;SC=ACATTTCAAACGCCCTTCCCT;SOR=0.647;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=85;TCF=36;TCR=49;TR=36;WE=202130736;WS=202130718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,45:0.45:99
chr1	202130754	rs3934648	T	C	1553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=36;PP=865;SC=GCCCCCAACATGCACAATCCA;SOR=2.147;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=13;TCR=36;TR=49;WE=202130762;WS=202130744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	202152859	rs2993441	A	C	871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.967;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=25;PP=544;ReadPosRankSum=-1.882;SC=TGCAGGCCACACTGGCCTTTG;SOR=0.429;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=75;TCF=26;TCR=49;TR=41;WE=202152867;WS=202152849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,43:0.54:80
chr1	202155331	.	CTGCCCCCT	C	542	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=28;MQ=58.58;NF=2;NR=4;PP=542;QD=92.0;SC=CAGGGCCCCTCTGCCCCCTTG;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=14;TCF=6;TCR=8;TR=6;WE=202155346;WS=202155321;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,6:0.43:14
chr1	202155543	rs2993432	A	C	1515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=32;PP=1020;ReadPosRankSum=0.392;SC=ATCCTGGTGCACTGCAGGAGG;SOR=0.706;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=58;TCR=58;TR=64;WE=202155551;WS=202155533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,68:0.54:125
chr1	202156135	rs139095833	C	CCCTCGCT	456.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=3;PP=209;ReadPosRankSum=0.000;SC=CTGCAGGCCCCCCTCGCTCCT;SOR=0.527;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=4;WE=202156143;WS=202156125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr1	202156482	rs3010088	G	A	743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.664;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=9;PP=516;ReadPosRankSum=-1.196;SC=GAAGGAGTACGAGGTACACTT;SOR=1.278;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=60;TCF=43;TCR=17;TR=34;WE=202156490;WS=202156472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,34:0.52:66
chr1	202156628	rs3010089	A	C	1713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.626;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=35;PP=853;ReadPosRankSum=-0.009;SC=GCTGGCTCTTACGCACCCCTG;SOR=0.889;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=44;TCR=56;TR=63;WE=202156636;WS=202156618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,77:0.68:114
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chr1	202163364	rs2077598	C	G	103.10	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5164;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=35;ReadPosRankSum=-0.431;SC=CCTGGTCCTGCGGGCTGCTGG;SOR=0.941;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=4;WE=202163372;WS=202163354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
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chr1	202163621	rs3120747	G	A	1867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=39;PP=975;ReadPosRankSum=-1.372;SC=TGGACCCTGAGCGGGAGGGCG;SOR=0.657;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=147;TCF=71;TCR=76;TR=77;WE=202163629;WS=202163611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,92:0.53:175
chr1	202183308	rs10920362	C	T	768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.052;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=24;PP=530;ReadPosRankSum=-0.932;SC=GAGGGCCGCTCAGCGAGGGCG;SOR=1.183;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=83;TCF=39;TCR=44;TR=38;WE=202183316;WS=202183298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,39:0.43:90
chr1	202183327	rs79821910	C	T	1041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.860;SOR=0.623;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,50:0.59:85
chr1	202196931	rs1452070	G	A	985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.846;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=13;PP=569;ReadPosRankSum=-1.971;SC=AGTATTAAACGCATCGTAGAT;SOR=0.572;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=83;TCF=58;TCR=25;TR=44;WE=202196939;WS=202196921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,47:0.53:89
chr1	202197161	rs3795598	C	T	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.393;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=306;ReadPosRankSum=2.492;SC=CCTCATTTTACATAGAGCTGC;SOR=1.138;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=65;TCF=25;TCR=40;TR=25;WE=202197169;WS=202197151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,27:0.37:73
chr1	202266547	rs788827	C	T	1083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.061;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=14;PP=723;ReadPosRankSum=-1.628;SC=TCTCCCTGGCCAAGCCCAGAG;SOR=1.219;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=97;TCF=64;TCR=33;TR=47;WE=202266555;WS=202266537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,49:0.47:105
chr1	202266607	rs788826	C	T	1885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=34;PP=1000;ReadPosRankSum=1.539;SC=AAGCCTTTGCCCTAATGACTG;SOR=0.697;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=168;TCF=91;TCR=77;TR=77;WE=202266615;WS=202266597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,92:0.47:194
chr1	202274936	rs705762	T	C	1549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=0.662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.01;ReadPosRankSum=-1.181;SOR=0.824;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,74:0.57:129
chr1	202276494	rs896551	C	T	2153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=46;PP=1149;ReadPosRankSum=1.014;SC=CCATCCACCCCGAGGCCTTCT;SOR=0.725;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=178;TCF=92;TCR=86;TR=93;WE=202276502;WS=202276484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,104:0.52:200
chr1	202278054	rs749249	C	T	808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.266;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=1;PP=581;ReadPosRankSum=-0.672;SC=TTCTAAGCTTCTCTCCTGTCC;SOR=2.291;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=61;TCF=57;TCR=4;TR=29;WE=202278062;WS=202278044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,31:0.52:60
chr1	202287206	rs788795	T	C	2257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.788;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=43;PP=1336;ReadPosRankSum=-0.706;SC=GGCGGGCCTGTCCCCCTGCCC;SOR=0.559;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=172;TCF=87;TCR=85;TR=93;WE=202287214;WS=202287196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,104:0.55:190
chr1	202287537	rs788794	G	A	1494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.559;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=18;PP=917;ReadPosRankSum=-1.697;SC=TGGCCGCCGCGCTGCCCCTGG;SOR=1.168;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=111;TCF=71;TCR=40;TR=59;WE=202287545;WS=202287527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,67:0.53:126
chr1	202287813	rs788793	T	C	1693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.668;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=45;PP=984;ReadPosRankSum=0.090;SC=TCCTCAGCTTTGCCTCCATGC;SOR=0.844;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=200;TCF=104;TCR=96;TR=83;WE=202287821;WS=202287803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,88:0.40:219
chr1	202304868	rs14451	T	C	1476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.194;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=30;PP=774;ReadPosRankSum=-0.370;SC=TCTTCAGACGTGAAGCTCTCT;SOR=0.727;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=125;TCF=67;TCR=58;TR=68;WE=202304876;WS=202304858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,72:0.54:133
chr1	202318316	rs930734	A	C	1191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.623;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=33;PP=689;ReadPosRankSum=0.207;SC=CCTACAGATGAGCCTTTGACC;SOR=0.515;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=100;TCF=39;TCR=61;TR=55;WE=202318324;WS=202318306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,57:0.54:105
chr1	202386075	rs2843413	T	C	3640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=72;PP=2301;SC=TGTGGCTTTGTAGTATTTGTA;SOR=1.554;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=42;TCR=72;TR=114;WE=202386083;WS=202386065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr1	202457784	rs3820374	T	A	1057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.044;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=29;PP=649;ReadPosRankSum=-0.223;SC=TGTCATTTTGTGTATCTACCC;SOR=0.291;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=78;TCF=24;TCR=54;TR=45;WE=202457792;WS=202457774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,49:0.57:86
chr1	202531741	rs2249811	C	T	741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.070;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=9;PP=512;ReadPosRankSum=-1.955;SC=GCCCTGAGGTCTGGGAACGCT;SOR=0.479;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=60;TCF=44;TCR=16;TR=31;WE=202531749;WS=202531731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,32:0.51:63
chr1	202536848	rs2292489	C	T	767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=10;PP=471;ReadPosRankSum=-0.184;SC=CTAGACTGGGCGTTCTACTGG;SOR=0.622;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=59;TCF=42;TCR=17;TR=33;WE=202536856;WS=202536838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,36:0.56:64
chr1	202572105	rs55968420	GCC	G	7736.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=79;PP=2804;SC=CCCCCACTCTGCCCCCCCACA;SOR=0.758;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=112;TCF=27;TCR=85;TR=100;WE=202572120;WS=202572095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr1	202574784	rs1968583	G	A	4142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=73;PP=2454;SC=TGTCCTCCTGGCTCTCCCCAG;SOR=0.843;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=142;TCF=69;TCR=73;TR=141;WE=202574792;WS=202574774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr1	202703053	rs4310498	G	A	1225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.851;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=30;PP=766;ReadPosRankSum=-1.631;SC=TGTCCGAGATGGCTTGGCCTT;SOR=0.495;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=83;TCF=31;TCR=52;TR=50;WE=202703061;WS=202703043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,54:0.61:89
chr1	202705455	rs1141109	G	C	1110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.736;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=19;PP=456;ReadPosRankSum=-0.500;SC=TCAGATGTACGGGGATAGATC;SOR=0.655;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=86;TCF=52;TCR=34;TR=46;WE=202705463;WS=202705445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,55:0.53:103
chr1	202711743	rs55798081	G	A	1953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.161;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=34;PP=1136;ReadPosRankSum=0.094;SC=CCAAACATAGGTGCCAAAGAA;SOR=0.747;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=169;TCF=90;TCR=79;TR=81;WE=202711765;WS=202711733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,91:0.48:190
chr1	202715244	rs3216061	G	GA	1407.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.689;HP=8;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=16;PP=535;ReadPosRankSum=-0.425;SC=TTTTCCATAGGAAAAAAAATC;SOR=0.834;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=84;TCF=37;TCR=47;TR=31;WE=202715252;WS=202715234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,63:0.50:126
chr1	202715284	rs1141108	G	A	2351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-2.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.106;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=41;PP=1294;ReadPosRankSum=0.548;SC=ATTTATATTTGTAAGGAGGAC;SOR=0.553;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=228;TCF=138;TCR=90;TR=102;WE=202715292;WS=202715274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,122:0.46:263
chr1	202718028	rs1892163	A	G	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=187;ReadPosRankSum=-0.492;SC=ATTTTACTAAATAATACCCAA;SOR=0.507;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=10;WE=202718036;WS=202718019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr1	202718202	rs1892164	G	A	3583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=367;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.376;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=74;PP=1838;ReadPosRankSum=1.782;SC=TCATCTCATCGTGGGAAAACA;SOR=0.662;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=324;TCF=173;TCR=151;TR=160;WE=202718210;WS=202718192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:186,181:0.49:367
chr1	202722277	rs4950742	G	A	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=118;ReadPosRankSum=-0.683;SC=TTTCAGACTCGGCTTTGTAAG;SOR=0.124;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=8;WE=202722285;WS=202722267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr1	202731986	rs140328663	C	CCTCAA	412.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.188;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.931;NF=0;NR=10;PP=468;ReadPosRankSum=0.163;SC=TTCTCCACTTCCTCATCATCT;SOR=2.448;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=10;WE=202731994;WS=202731976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr1	202733238	rs3196669	C	T	1018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.96;ReadPosRankSum=0.327;SOR=0.652;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,53:0.41:128
chr1	202735751	rs12140729	T	C	697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.494;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=17;PP=441;ReadPosRankSum=-1.491;SC=CAACGCCAATTTTGTGAGGGT;SOR=1.149;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=44;TCF=17;TCR=27;TR=27;WE=202735759;WS=202735741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,30:0.59:51
chr1	202743892	rs17497253	T	C	823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=20;PP=476;ReadPosRankSum=-0.319;SC=AGTTTTCATCTCATTTAGCTT;SOR=0.648;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=66;TCF=18;TCR=48;TR=28;WE=202743900;WS=202743882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,37:0.47:79
chr1	202827191	rs6663182	G	A	730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.048;NF=24;NR=5;PP=510;ReadPosRankSum=-0.731;SC=TCAGCCTCCCGACCAGAGACC;SOR=0.776;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=57;TCF=48;TCR=9;TR=29;WE=202827199;WS=202827181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,31:0.52:60
chr1	202827398	rs6687459	A	G	1097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=7.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.04;ReadPosRankSum=1.028;SOR=0.191;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,46:0.63:73
chr1	202887295	rs2275734	G	A	3627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=371;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=82;PP=2016;ReadPosRankSum=0.272;SC=AGACAAATCCGTACCTGAATT;SOR=0.673;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=337;TCF=164;TCR=173;TR=162;WE=202887303;WS=202887285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:189,181:0.49:370
chr1	202889207	rs7520522	T	C	347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=9;PP=281;SC=TTTGAGAGGCTAAGGCAGGCA;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=202889215;WS=202889197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	202897431	rs10800882	A	G	414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.91;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	202910687	rs61822676	G	A	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=5.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.926;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.95;MQRankSum=-1.143;NF=20;NR=1;PP=372;ReadPosRankSum=1.400;SC=CCTCCACCCCGCAGGTGGGAA;SOR=2.898;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=53;TCF=44;TCR=9;TR=21;WE=202910695;WS=202910677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,23:0.42:55
chr1	202976622	rs199910238	G	T	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.756;NF=7;NR=7;PP=157;ReadPosRankSum=0.172;SC=CCGCTAGGCAGGCCTCGCCCC;SOR=0.569;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=26;TCF=14;TCR=12;TR=14;WE=202976630;WS=202976612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr1	202976678	.	G	T	527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.322;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQRankSum=-0.299;QD=11.00;ReadPosRankSum=-0.688;SOR=0.646;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,28:0.58:48
chr1	202978032	rs1418444	C	G	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=66;ReadPosRankSum=-0.170;SC=AGATATAAGACGTGATACCAG;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=6;WE=202978040;WS=202978022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,9:0.30:30
chr1	202987770	rs782788	T	C	881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.593;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=24;PP=522;ReadPosRankSum=1.530;SC=TCTGTTTGTGTTGCTATAACA;SOR=1.025;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=95;TCF=42;TCR=53;TR=39;WE=202987778;WS=202987760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,44:0.41:108
chr1	202987796	rs782787	G	A	710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.856;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=20;PP=410;ReadPosRankSum=-2.266;SC=ACAGATTCTGGGTAACTTAAA;SOR=0.858;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=74;TCF=28;TCR=46;TR=31;WE=202987804;WS=202987786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,36:0.41:87
chr1	203003870	rs782800	G	A	1481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.562;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=34;PP=871;ReadPosRankSum=0.333;SC=AGGGAAGGCCGAGGGGAGCTG;SOR=0.774;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=164;TCF=80;TCR=84;TR=67;WE=203003878;WS=203003860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,74:0.42:177
chr1	203004367	rs10920551	C	T	1764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.197;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=37;PP=1087;ReadPosRankSum=0.540;SC=ACGCTCCTAGCGGCCCTGCCC;SOR=0.809;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=148;TCF=82;TCR=66;TR=81;WE=203004375;WS=203004357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,88:0.52:169
chr1	203004627	rs5780134	A	AC	1075.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.28;QD=30.74;SOR=1.002;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	203004930	.	T	TAGC	122	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=14;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=1;NR=5;PP=122;QD=25.8333333333;SC=TGTTTCTGTGTAGCAGAGAGG;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=6;WE=203004938;WS=203004920;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr1	203006098	.	A	G	33	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=3;NR=1;PP=33;QD=16.9428031368;SC=ATGTGGCCACATGTGTATCTG;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=4;WE=203006106;WS=203006093;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr1	203006179	rs782804	G	A	1033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=3.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.069;HP=5;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=9;PP=752;ReadPosRankSum=0.453;SC=GCACTACTGCGCCCCTCTGGG;SOR=1.147;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=92;TCF=70;TCR=22;TR=43;WE=203006187;WS=203006169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,46:0.46:100
chr1	203006243	rs782805	A	G	6966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=140;NR=101;PP=2965;SC=AACTTTCCTCAGATCTAGACC;SOR=0.909;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=242;TCF=140;TCR=102;TR=241;WE=203006251;WS=203006233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,273:1.00:273
chr1	203008174	rs61821060	G	C	8161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=148;NR=135;PP=2965;SC=GAGGGGGACCGCCTGGGTCCC;SOR=0.746;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=284;TCF=148;TCR=136;TR=283;WE=203008182;WS=203008164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,306:1.00:306
chr1	203008286	rs10920553	C	G	1722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.532;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=42;PP=893;ReadPosRankSum=1.451;SC=GTCAGGAGACCTTGGCGGCCA;SOR=0.514;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=177;TCF=76;TCR=101;TR=79;WE=203008294;WS=203008276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,88:0.45:195
chr1	203012906	rs4950908	G	A	1531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=14;PP=1035;SC=CAGTTGGGGCGGGAGCTCTGT;SOR=1.835;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=36;TCR=14;TR=50;WE=203012914;WS=203012896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	203013663	rs4950909	A	G	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=258;ReadPosRankSum=0.585;SC=GTTTCTTGTCAGATTTCTCCC;SOR=0.892;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=18;WE=203013671;WS=203013653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,22:0.65:34
chr1	203018190	rs6696772	G	C	720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=4.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.79;ReadPosRankSum=1.801;SOR=0.524;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,40:0.49:82
chr1	203023122	rs2291691	A	C	1844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.863;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=45;PP=1236;ReadPosRankSum=-0.615;SC=TGGGAAGTGCATTGAAGGGCA;SOR=0.548;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=168;TCF=77;TCR=91;TR=85;WE=203023130;WS=203023112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,85:0.48:178
chr1	203023240	rs10635298	G	GGC	840.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=412;ReadPosRankSum=0.267;SC=CAGGCCCGCTGCCAGTGCCGG;SOR=0.705;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=11;WE=203023248;WS=203023230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,23:0.44:52
chr1	203025209	rs11590950	G	C	1946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=35;PP=1308;ReadPosRankSum=-0.850;SC=AGGGCACCCAGAGGGTGAGTC;SOR=0.688;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=210;TCF=132;TCR=78;TR=93;WE=203025217;WS=203025199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,98:0.44:222
chr1	203028711	rs4590732	C	G	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.505;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=137;ReadPosRankSum=-1.102;SC=TTGGGGTGGTCAGGTGTTCCT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=6;WE=203028719;WS=203028701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr1	203030261	rs17508518	C	T	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.639;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=357;ReadPosRankSum=-1.930;SC=GGGCTGCCATCGATCTCACGT;SOR=2.383;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=44;TCF=10;TCR=34;TR=21;WE=203030269;WS=203030251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,21:0.48:44
chr1	203030685	rs2270543	T	C	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.218;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=1;PP=39;ReadPosRankSum=1.094;SC=GATACTGGGATGTCTTTTTCC;SOR=1.508;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=4;WE=203030693;WS=203030675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr1	203032922	rs1416262	C	T	1216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=21;PP=763;ReadPosRankSum=0.226;SC=TACCTTCCTCCCCCATAATAG;SOR=0.759;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=70;TCR=44;TR=54;WE=203032930;WS=203032912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,58:0.48:121
chr1	203036757	rs2275354	T	C	1446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.724;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=19;PP=910;ReadPosRankSum=0.543;SC=TGATGCTGGATGTGAGACAGG;SOR=0.812;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=113;TCF=80;TCR=33;TR=63;WE=203036765;WS=203036747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,65:0.52:125
chr1	203040673	rs9803710	A	G	398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=4;PP=300;SC=AGCAGCTTCAAAAAGGTGTGT;SOR=1.765;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=14;WE=203040681;WS=203040663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	203040740	rs11583155	T	C	628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.884;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=10;PP=417;ReadPosRankSum=0.125;SC=CTTGGACCCTTGGAAAATGGT;SOR=0.949;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=81;TCF=50;TCR=31;TR=30;WE=203040748;WS=203040730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,31:0.37:84
chr1	203040816	rs2270540	G	C	1493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.103;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=31;PP=902;ReadPosRankSum=-0.855;SC=TCTATGGACTGCAGGCACGCC;SOR=0.808;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=193;TCF=109;TCR=84;TR=75;WE=203040824;WS=203040806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,81:0.39:208
chr1	203044777	rs12130501	G	A	1589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=28;PP=862;ReadPosRankSum=-0.473;SC=CCACGGTCGCGGCGGCATGCT;SOR=0.650;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=141;TCF=80;TCR=61;TR=66;WE=203044785;WS=203044767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,76:0.49:156
chr1	203045413	rs11578206	G	T	3252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.609;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=54;PP=1865;ReadPosRankSum=-1.925;SC=AACCTCTCTCGCAGATGCCCT;SOR=0.889;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=299;TCF=179;TCR=120;TR=141;WE=203045421;WS=203045403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,157:0.48:330
chr1	203045583	rs6682652	T	C	1740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.188;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=49;PP=1181;ReadPosRankSum=0.678;SC=CTGACCCCTCTTGCTCGTTCC;SOR=0.460;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=139;TCF=41;TCR=98;TR=72;WE=203045591;WS=203045573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,77:0.51:152
chr1	203053768	rs903356	T	C	4171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=75;PP=2534;SC=AGTCAGGCCTTACTTACCCCC;SOR=0.875;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=142;TCF=67;TCR=75;TR=142;WE=203053776;WS=203053758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr1	203055101	rs4950877	A	G	4056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=75;PP=2369;SC=GGGTCGGAAAAGGCTTGTTCC;SOR=1.394;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=54;TCR=76;TR=128;WE=203055109;WS=203055091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr1	203119928	rs67418568	CTCTGTCCTCCCCCTA	C	508.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.035;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=2735;ReadPosRankSum=-0.508;SC=TTCCTGTCTTCTCTGTCCTCC;SOR=1.651;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=7;WE=203119950;WS=203119918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,15:0.34:44
chr1	203137784	rs35823777	A	ACT	4793.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=35;PP=2446;ReadPosRankSum=1.221;SC=TCCTCCCGTGACTTCAGTGTG;SOR=0.699;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=137;TCF=55;TCR=82;TR=60;WE=203137792;WS=203137774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,123:0.50:248
chr1	203140671	rs3737875	G	A	706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.161;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=18;PP=419;ReadPosRankSum=0.926;SC=GGGCATGGCCGTTGTGGGTCC;SOR=0.269;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=72;TCF=28;TCR=44;TR=34;WE=203140679;WS=203140661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,36:0.47:76
chr1	203141240	rs12737716	G	T	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.676;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=202;ReadPosRankSum=-2.170;SC=GATGGGGCAGGGGACAGCTGG;SOR=0.243;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=26;TCF=8;TCR=18;TR=16;WE=203141248;WS=203141230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
chr1	203143395	rs3737872	T	C	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.500;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=136;ReadPosRankSum=0.440;SC=CTGAGGAACCTGGAACTTTCT;SOR=0.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=8;WE=203143403;WS=203143385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr1	203143823	rs35635529	C	T	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.450;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=31;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GGAAATCAGCCTCCCTCTCTG;SOR=0.148;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=4;WE=203143831;WS=203143813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr1	203148633	rs4950927	A	G	3668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=60;PP=2250;SC=GATCCTGGCCACAGAAGGAGC;SOR=0.722;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=125;TCF=65;TCR=60;TR=125;WE=203148641;WS=203148623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr1	203152801	rs880633	T	C	2614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=34;PP=1678;SC=TGTTTGTCTCTCCGTCCAGGG;SOR=1.109;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=52;TCR=34;TR=86;WE=203152809;WS=203152791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr1	203153555	rs12128727	C	T	472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=1;PP=416;SC=CTTTGCTACACATCAGGCAGG;SOR=4.174;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=203153563;WS=203153545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	203153634	rs2071579	C	G	4508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=98;NR=52;PP=2760;SC=ACAGTGGATGCGGGAGACCCA;SOR=1.287;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=151;TCF=99;TCR=52;TR=150;WE=203153642;WS=203153624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr1	203154532	rs1538372	A	G	901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=22;PP=610;SC=GAAGTCTGGGATGGGGCCCGG;SOR=2.376;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=28;WE=203154540;WS=203154522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	203155882	rs4950928	G	C	934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=28;PP=822;SC=TCCACTCCCCGACGCGGCAAA;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=29;WE=203155890;WS=203155872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	203174864	rs4950932	T	C	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=68;ReadPosRankSum=1.616;SC=CAGGGTTGGGTGAAGTAGCTC;SOR=0.495;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=10;WE=203174872;WS=203174854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr1	203174921	rs2486951	A	G	791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.581;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=13;PP=427;ReadPosRankSum=-0.067;SC=GTGGGCACAGATAAGCCACAT;SOR=1.017;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=91;TCF=57;TCR=34;TR=37;WE=203174929;WS=203174911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,43:0.40:107
chr1	203175107	rs2494296	A	C	865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=23;PP=643;SC=GTTTGGGTGGACTGGCTCCCC;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=31;WE=203175115;WS=203175097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	203186950	rs150192398	C	CAGACCATGGCCCCGCCCAGTCCCT	1076.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=20.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.17;ReadPosRankSum=0.933;SOR=3.013;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,27:0.38:71
chr1	203187341	rs142759151	T	TGGTCAA	3109.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.301;NF=2;NR=35;PP=2457;ReadPosRankSum=1.235;SC=TATTGTATGCTGGTCAAGGTC;SOR=0.616;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=63;TCF=4;TCR=59;TR=37;WE=203187349;WS=203187331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,72:0.99:73
chr1	203188692	rs2486958	A	C	2144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=21;PP=1157;SC=ATTCTCTGCAATTGGCATCCT;SOR=1.281;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=69;TCF=47;TCR=22;TR=68;WE=203188700;WS=203188682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr1	203192137	rs3820145	T	C	4487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=48;PP=2517;SC=TTTGTTCTGGTGTAAGGATGG;SOR=1.427;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=145;TCF=97;TCR=48;TR=145;WE=203192145;WS=203192127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr1	203192567	rs2297949	G	T	579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=2;PP=428;SC=GTGCTGTGGGGGCTCCAGCTC;SOR=3.056;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=203192575;WS=203192557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	203192820	rs10920586	C	T	3345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=65;PP=1977;SC=TAAGGGCCGGCCTTGGACCAG;SOR=1.274;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=44;TCR=65;TR=109;WE=203192828;WS=203192810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr1	203194186	rs2297950	C	T	3553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=45;PP=1888;ReadPosRankSum=1.237;SC=TTCTGAGTGCCGAAATTCCAG;SOR=0.355;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=69;TCR=45;TR=114;WE=203194194;WS=203194176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,134:0.99:135
chr1	203276437	rs61749326	C	T	2220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.516;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=49;PP=1279;ReadPosRankSum=1.123;SC=TTGGGGAGGACGGCTCCATCT;SOR=0.746;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=173;TCF=88;TCR=85;TR=96;WE=203276445;WS=203276427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,108:0.54:201
chr1	203317162	rs7543148	C	T	3741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=51;PP=2324;SC=GGCAGTCGCACTCCTGGGGGC;SOR=0.953;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=124;TCF=72;TCR=52;TR=123;WE=203317170;WS=203317152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr1	203465396	rs2242199	T	C	988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=27;PP=546;ReadPosRankSum=-0.093;SC=CTACATTCCCTGCATGACACT;SOR=0.653;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=33;TCR=51;TR=45;WE=203465404;WS=203465386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,48:0.55:87
chr1	203465470	rs75011045	T	C	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=1.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.093;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=230;ReadPosRankSum=-0.211;SC=CCTCCACCTCTTTCTCTGTGA;SOR=1.609;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=13;WE=203465478;WS=203465460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr1	203652444	rs1419114	A	G	5372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=108;NR=75;PP=2965;SC=AGCTGCGTTCAAGGGATGCAC;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=183;TCF=108;TCR=75;TR=183;WE=203652452;WS=203652434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr1	203667409	rs2228445	T	C	4869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.310;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=81;PP=2936;ReadPosRankSum=1.481;SC=ATGTCACGCTTATCATCCTGG;SOR=0.460;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=161;TCF=80;TCR=81;TR=160;WE=203667417;WS=203667399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,179:0.99:180
chr1	203677323	.	G	A	974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.426;ClippingRankSum=0.000;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.852;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=27;PP=567;ReadPosRankSum=1.440;SC=TGTTTACACTGCCTAAATTGC;SOR=0.569;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=81;TCF=26;TCR=55;TR=41;WE=203677331;WS=203677313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,46:0.51:90
chr1	203740615	rs3737976	T	C	4435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=81;PP=2628;SC=GGTAGGTTTTTCCTTCTAATC;SOR=1.040;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=66;TCR=81;TR=147;WE=203740623;WS=203740605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr1	203741110	rs16852291	C	T	644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=289;ReadPosRankSum=0.397;SC=ACCACGCAAACCCGCTTCATC;SOR=0.688;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=70;TCF=48;TCR=22;TR=27;WE=203741118;WS=203741100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,34:0.42:81
chr1	203741368	rs3737973	C	A	1096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=27;PP=811;SC=TCACTGCAAACAAACAGCATG;SOR=2.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=34;WE=203741376;WS=203741358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	203766827	rs872032	T	C	10142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=384;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=174;NR=167;PP=2965;SC=CAAAACAGCCTGCTAAAAAGA;SOR=0.698;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=342;TCF=174;TCR=168;TR=341;WE=203766838;WS=203766817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,383:1.00:383
chr1	203787700	rs4951260	T	C	2443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=28;PP=1443;SC=GTTTACAGGGTGACAGCTGCC;SOR=1.481;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=51;TCR=28;TR=79;WE=203787708;WS=203787690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr1	203803016	rs6694647	A	G	2288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=50;PP=1454;SC=TTTCTTTTCTACTTGTTTGTG;SOR=1.554;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=26;TCR=50;TR=76;WE=203803024;WS=203803006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr1	203821200	rs7512877	G	A	1754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=7;PP=1159;SC=CTTTGTGTCCGTGAGACTAGG;SOR=2.872;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=46;TCR=7;TR=53;WE=203821208;WS=203821190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr1	203830931	rs41300861	G	A	1002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.085;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=27;PP=583;ReadPosRankSum=-0.918;SC=GGATAGTGGAGTACGGATCCA;SOR=1.358;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=62;TCF=22;TCR=40;TR=38;WE=203830939;WS=203830921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,44:0.59:74
chr1	204006538	rs4951291	T	C	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.48;BaseQRankSum=-1.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=81;ReadPosRankSum=-0.998;SC=ATCACCTTCCTCTCATGCTGC;SOR=0.223;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=6;WE=204006546;WS=204006528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr1	204006597	rs4951039	G	A	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.480;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=145;ReadPosRankSum=2.188;SC=ACAAGCCCGCGCGATGGGAGT;SOR=0.324;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=13;WE=204006605;WS=204006587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr1	204010389	rs10437107	G	T	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=25;PP=488;ReadPosRankSum=0.805;SC=GGAATCGGGCGGAGTGATTAG;SOR=0.806;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=82;TCF=20;TCR=62;TR=33;WE=204010397;WS=204010379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,39:0.43:90
chr1	204081655	rs940653	A	T	451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=70.00;QD=28.24;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	204081655	.	A	ACACACT	436	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=27;MQ=68.71;NF=15;NR=3;PP=436;QD=24.3888888889;SC=ACACACACACACTTTCTCTCT;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=204081663;WS=204081645;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	204081892	rs2250538	C	T	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.775;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=129;ReadPosRankSum=-0.500;SC=TGTGGGTTCACAAGTAAGCTT;SOR=2.303;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=9;WE=204081900;WS=204081882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr1	204082002	rs2293336	C	T	1016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.944;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=11;PP=640;ReadPosRankSum=-1.419;SC=CAGAAGTTTACGACTGGGGAC;SOR=0.311;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=71;TCF=55;TCR=16;TR=42;WE=204082010;WS=204081992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,45:0.60:75
chr1	204085609	rs7551756	A	G	3398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.412;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=71;PP=2053;ReadPosRankSum=-0.410;SC=AAAAGTCTCAATGGGGTCTGT;SOR=0.730;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=285;TCF=139;TCR=146;TR=141;WE=204085617;WS=204085599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,156:0.50:309
chr1	204091245	rs2692018	G	A	1224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.170;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=10;PP=869;ReadPosRankSum=0.346;SC=CTCCTTCTGCGTCCACTTTTC;SOR=1.483;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=71;TCF=53;TCR=18;TR=46;WE=204091253;WS=204091235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,49:0.63:78
chr1	204103618	rs2293335	G	A	983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.220;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=9;PP=635;ReadPosRankSum=-1.641;SC=TTTTCTCCACGTCCCACCATC;SOR=1.032;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=72;TCF=54;TCR=18;TR=40;WE=204103626;WS=204103608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,43:0.58:74
chr1	204108961	rs11799485	A	G	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=152;ReadPosRankSum=-2.106;SC=GCATGTTACTATACTGAATAC;SOR=0.512;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=7;WE=204108969;WS=204108959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr1	204110334	rs10793755	A	G	6489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=128;NR=90;PP=2965;SC=GACCTAAATCAAGGTCTAACT;SOR=0.986;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=218;TCF=128;TCR=90;TR=218;WE=204110342;WS=204110324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr1	204120952	rs3737655	G	T	3481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.933;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=78;PP=1935;ReadPosRankSum=0.534;SC=GGACGCGCGCGGCTGAGGGGC;SOR=0.619;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=254;TCF=117;TCR=137;TR=147;WE=204120963;WS=204120942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,162:0.58:279
chr1	204124370	rs11571092	AC	A	1922.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=30;PP=1264;SC=ACCTTGCCTGACCCCCAGCAA;SOR=1.571;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=35;WE=204124378;WS=204124360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	204124865	rs2368564	C	T	2401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=20;PP=1502;ReadPosRankSum=1.519;SC=TCTAACATGACCTGTGCATTG;SOR=0.922;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=80;TCF=60;TCR=20;TR=79;WE=204124873;WS=204124855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,88:0.99:89
chr1	204125089	rs3795575	G	A	703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=25;PP=507;ReadPosRankSum=0.375;SC=TATGGAAGACGTCTCAGCAGA;SOR=0.793;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=64;TCF=19;TCR=45;TR=34;WE=204125097;WS=204125079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,33:0.49:67
chr1	204125272	rs3795574	C	A	983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=13;PP=572;ReadPosRankSum=0.288;SC=GGCGCTCCCCCCACCCACAGC;SOR=0.644;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=66;TCR=30;TR=41;WE=204125280;WS=204125262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,48:0.43:112
chr1	204125464	.	T	TCAGACAGA,TCAGACAGACAGA	2507.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.535;ClippingRankSum=0.000;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5,5;NR=27,27;PP=1453,183;ReadPosRankSum=1.491;SC=GAGGCCACAGTCAGACAGACA;SOR=0.898;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=60;TCF=5;TCR=55;TR=32,32;WE=204125472;WS=204125454;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.63,0.32:60
chr1	204125485	.	C	CAGACAGAT	2593	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MMLQ=27;MQ=60.5;NF=5;NR=27;PP=2593;QD=20;SC=GACAGACAGACAGACAGAAGG;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=45;TCF=5;TCR=40;TR=32;WE=204125493;WS=204125475;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:13,32:0.71:45
chr1	204125509	rs11571088	T	G	793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.872;HP=4;HapScore=1;MGOF=81;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.589;NF=7;NR=22;PP=542;ReadPosRankSum=-1.592;SC=ATGGGGCACCTCCAGGCTGCA;SOR=0.250;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=38;TCF=7;TCR=31;TR=29;WE=204125517;WS=204125499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,32:0.78:41
chr1	204126378	rs3730102	G	A	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.254;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=8;PP=286;ReadPosRankSum=0.626;SC=GGCATCTAGCGGAGGCTGGGC;SOR=0.399;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=41;TCF=28;TCR=13;TR=22;WE=204126386;WS=204126368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,23:0.53:43
chr1	204131186	rs5705	T	G	3160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.438;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=57;PP=1989;ReadPosRankSum=0.232;SC=TGTTGCCAAGTGTCAGCCTCT;SOR=0.727;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=249;TCF=138;TCR=111;TR=128;WE=204131194;WS=204131176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,147:0.53:276
chr1	204161947	rs12998	C	T	1283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.634;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=28;PP=758;ReadPosRankSum=0.865;SC=TCTAATGGCTCCCCAAAGTGG;SOR=0.351;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=110;TCF=52;TCR=58;TR=58;WE=204161955;WS=204161937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,62:0.51:121
chr1	204167672	rs3795573	T	C	1718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.557;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=45;PP=865;ReadPosRankSum=-0.562;SC=AGAGAGCAGATGCAATATCTA;SOR=0.749;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=166;TCF=70;TCR=96;TR=79;WE=204167680;WS=204167662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,88:0.49:178
chr1	204171016	rs75815971	C	A	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=315;ReadPosRankSum=0.553;SC=TGGAGCCAGGCGGTGGGCTGG;SOR=0.547;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=19;WE=204171024;WS=204171006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr1	204198209	rs3795571	A	G	640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=21;PP=453;ReadPosRankSum=1.872;SC=TGTCTACCTCATGGATGCTGC;SOR=0.968;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=43;TCF=9;TCR=34;TR=26;WE=204198217;WS=204198199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,27:0.60:45
chr1	204199614	rs10900562	C	T	2114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=26;PP=1285;ReadPosRankSum=-1.284;SC=CCGCTTCTCCCTCATGGAGCC;SOR=0.678;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=162;TCF=113;TCR=49;TR=88;WE=204199622;WS=204199604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,96:0.55:175
chr1	204210750	rs4412655	C	A	1109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=24;PP=710;ReadPosRankSum=0.575;SC=TGTGAATGAGCACCCAGGGCT;SOR=0.703;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=86;TCF=37;TCR=49;TR=41;WE=204210758;WS=204210740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,48:0.49:98
chr1	204210791	rs4951325	G	A	825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=15;PP=505;ReadPosRankSum=-0.400;SC=TTACTTCTAGGGGAAGATGGG;SOR=0.746;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=35;TCR=31;TR=31;WE=204210799;WS=204210781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,37:0.48:77
chr1	204214975	.	TACACAC	T	189	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=8;MMLQ=15;MQ=60.21;NF=0;NR=11;PP=189;QD=17.4545454545;SC=GCACCCTGTGTACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=11;WE=204214990;WS=204214965;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:27,11:0.29:38
chr1	204216410	rs4951329	C	T	1217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.597;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=24;PP=759;ReadPosRankSum=-1.594;SC=TATCAATGGCCGGAACCTTTG;SOR=0.764;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=149;TCF=88;TCR=61;TR=60;WE=204216424;WS=204216400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,64:0.39:163
chr1	204216468	rs4512713	C	T	1671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.933;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=41;PP=1104;ReadPosRankSum=1.691;SC=TCCCAATCCCCGCCAGCTCAG;SOR=0.697;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=203;TCF=100;TCR=103;TR=85;WE=204216476;WS=204216458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,87:0.41:214
chr1	204216601	rs4288652	G	A	1246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.662;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=31;PP=702;ReadPosRankSum=0.133;SC=ACGGGGGAAAGAGGCGTTCAC;SOR=0.780;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=109;TCF=49;TCR=60;TR=54;WE=204216609;WS=204216591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,62:0.48:128
chr1	204219850	rs4951331	G	A	1247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.668;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=32;PP=698;ReadPosRankSum=-0.277;SC=ACCATGGTCCGTCACCTCTGG;SOR=0.620;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=46;TCR=64;TR=55;WE=204219858;WS=204219840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,62:0.49:127
chr1	204230581	rs3795569	G	A	827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.917;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=17;PP=454;ReadPosRankSum=0.242;SC=CTCAGCCTGTGGGGAGAGGCA;SOR=0.568;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=59;TCF=26;TCR=33;TR=33;WE=204230589;WS=204230571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,39:0.57:69
chr1	204234196	.	G	GGT	990.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.972;ClippingRankSum=0.000;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.120;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=22;PP=946;ReadPosRankSum=-2.020;SC=GCACAAGAAGGGTGTGTGTGT;SOR=1.065;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=56;TCF=6;TCR=50;TR=24;WE=204234204;WS=204234186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,35:0.49:71
chr1	204234222	rs4076020	T	C	1248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=3.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.34;ReadPosRankSum=1.597;SOR=1.234;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,34:0.47:72
chr1	204234225	rs4073136	G	A	1281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=3.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.13;ReadPosRankSum=0.859;SOR=1.262;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,33:0.49:67
chr1	204237416	rs10900571	C	T	2096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.500;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=46;PP=1068;ReadPosRankSum=-0.410;SC=CCAAAGGCGACGGCTTTGCGG;SOR=0.732;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=193;TCF=91;TCR=102;TR=87;WE=204237424;WS=204237406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,101:0.47:213
chr1	204378775	rs17855962	T	C	3323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=360;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.246;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=70;PP=1975;ReadPosRankSum=0.166;SC=GATGGGGTCTTTGAGTCACGA;SOR=0.766;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=325;TCF=163;TCR=162;TR=142;WE=204378783;WS=204378765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:201,158:0.44:359
chr1	204379617	rs3014626	T	C	5253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=79;PP=2965;SC=TTGCCCCTTGTTAGCCTGTTG;SOR=0.757;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=165;TCF=86;TCR=79;TR=165;WE=204379625;WS=204379607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr1	204409281	rs3014631	C	G	2736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=19;PP=2068;SC=ATAAGCAAAGCGGTCCCCTCC;SOR=2.435;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=89;TCF=70;TCR=19;TR=88;WE=204409289;WS=204409271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr1	204413297	rs2292459	C	T	7637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.01;SOR=0.717;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr1	204413297	.	CGG	TGA	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=72;NR=65;PP=2947;QD=20;SC=GGGCCTGTTTCGGAGAAAGGG;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=149;TCF=79;TCR=70;TR=137;WE=204413307;WS=204413287;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:12,137:0.92:149
chr1	204413299	rs2292460	G	A	7637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.15;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr1	204418889	rs2999492	C	T	227.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=1;PP=183;SC=TCTCCCAAGGCGCACTGGCCA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=204418897;WS=204418879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	204418939	rs3014637	C	T	932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=8;PP=635;SC=CCCTCCTCCCCTTCCAAGGCC;SOR=2.165;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=30;WE=204418947;WS=204418929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	204423811	rs61762608	G	A	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.434;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=134;ReadPosRankSum=-0.501;SC=GGTCCCAGACGATGAGGTGGA;SOR=1.802;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=9;WE=204423819;WS=204423801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr1	204426052	rs2999490	A	C	398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.89;QD=39.88;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	204429212	rs5013460	AT	TG	1726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.44;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	204429215	rs5013458	TA	AG	1726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.44;SOR=1.493;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	204429285	rs2999485	A	G	232.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=4;PP=180;SC=AGAGGGAAGAAATGAAACATG;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=8;WE=204429293;WS=204429275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	204429838	rs2271414	C	G	2987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=60;NR=40;PP=1691;SC=GACTCAGTGGCAAGGGAGATA;SOR=0.844;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=60;TCR=40;TR=100;WE=204429846;WS=204429828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr1	204433093	rs2271415	A	C	1161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=8;PP=856;SC=CCCCCTCACAATCTTACTACC;SOR=2.362;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=39;TCF=31;TCR=8;TR=38;WE=204433101;WS=204433083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	204433326	.	C	T	671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.430;ClippingRankSum=0.000;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.092;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=15;PP=370;ReadPosRankSum=0.648;SC=TCAGTTTCCCCACCCTGATCC;SOR=0.439;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=61;TCF=25;TCR=36;TR=28;WE=204433334;WS=204433316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,32:0.47:68
chr1	204433511	rs11455991	T	TC	825.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=17;NR=2;PP=867;SC=GGAAATCGAGTCAAAACACAG;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=204433519;WS=204433501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	204434277	rs2942149	T	C	1368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=9;PP=857;SC=AAAGAAAGTTTGGAAATGGAT;SOR=2.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=35;TCR=9;TR=44;WE=204434285;WS=204434267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	204438113	rs61740701	G	T	3073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.115;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=62;PP=1901;ReadPosRankSum=-1.924;SC=CCTGGCCACGGGTTTTCCAGA;SOR=0.552;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=235;TCF=115;TCR=120;TR=126;WE=204438121;WS=204438103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,141:0.55:256
chr1	204438334	rs1124777	C	T	5488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=87;NR=94;PP=2965;SC=GCAGTTTGCCCGGCAATTGTT;SOR=0.866;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=182;TCF=88;TCR=94;TR=181;WE=204438342;WS=204438324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr1	204438643	rs1553921	G	T	7337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=130;NR=125;PP=2965;SC=CCTGTGGGGAGAGTGAGTTGT;SOR=0.715;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=255;TCF=130;TCR=125;TR=255;WE=204438651;WS=204438633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,277:1.00:277
chr1	204494576	rs4252675	T	C	857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=2.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.576;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=4;PP=484;ReadPosRankSum=-0.594;SC=ATTTTCTGCATTAGAATAGAT;SOR=1.209;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=59;TCF=48;TCR=11;TR=29;WE=204494584;WS=204494566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,36:0.52:69
chr1	204915393	rs2595960	A	G	3468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=70;NR=42;PP=2118;SC=ATGCACCAGGAAGTGAGCTAA;SOR=1.143;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=70;TCR=42;TR=112;WE=204915401;WS=204915383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr1	204921258	rs12141283	A	G	7466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=131;NR=143;PP=2965;ReadPosRankSum=1.403;SC=AGTGAAGGGGAAAAAGAGTGC;SOR=0.916;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=276;TCF=132;TCR=144;TR=274;WE=204921266;WS=204921247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,285:0.99:287
chr1	204931137	rs16854813	A	G	860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.833;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=12;PP=506;ReadPosRankSum=-1.173;SC=TGCCCTCCTCAGTTGTTTTTC;SOR=0.476;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=83;TCF=59;TCR=24;TR=39;WE=204931145;WS=204931127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,44:0.47:93
chr1	204943285	rs2595945	A	T	4754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=63;PP=2860;SC=GGCACTCGAGATTGCTTCTCT;SOR=1.051;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=163;TCF=100;TCR=63;TR=161;WE=204943293;WS=204943275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr1	204943947	rs2246662	C	A	1616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=34;PP=821;ReadPosRankSum=-2.382;SC=GCCTGGAGGTCAAAGGTAAAG;SOR=0.677;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=119;TCF=52;TCR=67;TR=63;WE=204943955;WS=204943937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,76:0.55:138
chr1	204943991	rs2246661	C	T	1144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=1.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.33;ReadPosRankSum=1.068;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,54:0.53:101
chr1	204943991	.	CA	TG	568	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=21;NR=24;PP=568;QD=13.8103972192;SC=TGGAGAGGGACAAGGAGGCCA;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=88;TCF=37;TCR=51;TR=45;WE=204944000;WS=204943981;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:43,45:0.51:88
chr1	204943992	rs2794861	A	G	3646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.84;SOR=1.202;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr1	204945618	rs12124296	G	A	2364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.021;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=45;PP=1275;ReadPosRankSum=-0.346;SC=CAAGTATGATGAGTGCTCCAG;SOR=0.606;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=201;TCF=114;TCR=87;TR=101;WE=204945626;WS=204945608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,116:0.51:227
chr1	204951209	rs2278796	C	T	669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.168;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=489;ReadPosRankSum=2.338;SC=CACGAGGCCACGCTCACAGGC;SOR=0.509;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=14;TCR=37;TR=29;WE=204951217;WS=204951199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,29:0.53:55
chr1	204954993	rs2278795	A	G	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.448;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.447;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=59;ReadPosRankSum=0.489;SC=CAACTAACCCAGCCCTGCCTG;SOR=0.223;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=7;WE=204955001;WS=204954983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr1	204955319	rs11240324	G	A	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.65;ReadPosRankSum=-1.342;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr1	204955329	rs11240325	A	G	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.93;ReadPosRankSum=0.249;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr1	204966170	rs16854920	T	C	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=131;ReadPosRankSum=0.286;SC=TCCGTTATGCTTGGGGAGGCT;SOR=1.426;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=8;WE=204966178;WS=204966160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr1	204966690	rs2794858	G	A	3622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=66;PP=2247;SC=ACCCGTGACTGGATGCTCAGT;SOR=1.170;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=117;TCF=51;TCR=66;TR=117;WE=204966698;WS=204966680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr1	204966749	rs2595944	A	G	2037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=47;PP=1457;SC=TGACACACACACACTCCTTGG;SOR=1.931;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=20;TCR=47;TR=67;WE=204966757;WS=204966739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	204970148	rs10716288	TC	T	49.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=66;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TTTCTGACTCTCCCCTTTCCT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=3;WE=204970156;WS=204970138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr1	204970243	rs4950976	A	G	901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=10;PP=545;ReadPosRankSum=0.671;SC=GTGTCTCCATATCTCTGGTGC;SOR=0.697;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=61;TCF=43;TCR=18;TR=35;WE=204970251;WS=204970233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,39:0.58:67
chr1	204970302	rs4951151	T	C	1284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=23;PP=649;ReadPosRankSum=1.109;SC=CACCAGCCCCTGATGAGCAGT;SOR=0.669;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=115;TCF=67;TCR=48;TR=55;WE=204970310;WS=204970292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,62:0.49:127
chr1	204970495	rs4951152	C	A	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.350;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=105;ReadPosRankSum=-0.619;SC=CATTAAAGAGCTCCTGTGAAC;SOR=0.250;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=9;WE=204970503;WS=204970485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
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chr1	205031116	rs2229866	C	T	1934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.079;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=41;PP=1140;ReadPosRankSum=-0.156;SC=AACGGGGAGCCTCTGGCCTCC;SOR=0.596;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=180;TCF=100;TCR=80;TR=85;WE=205031124;WS=205031106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,96:0.47:206
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chr1	205031769	rs2242000	G	A	1963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=49;PP=1175;ReadPosRankSum=-0.270;SC=CTGAGTTTAGGTGTTTCCAAA;SOR=0.724;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=184;TCF=89;TCR=95;TR=92;WE=205031777;WS=205031759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,99:0.48:205
chr1	205033374	rs2305277	T	C	961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.325;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=13;PP=597;ReadPosRankSum=-1.160;SC=ATGGCGTGGCTTCAAAGGGCA;SOR=1.277;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=86;TCF=58;TCR=28;TR=41;WE=205033382;WS=205033364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,47:0.48:98
chr1	205034488	rs4460698	A	G	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.594;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=352;ReadPosRankSum=1.596;SC=AGAAACCCATAGCCTAAGCGC;SOR=1.358;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=19;WE=205034496;WS=205034478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr1	205038731	rs2305275	C	T	1407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=34;PP=1005;SC=CCTCCCTGACCCCTCTCCCGC;SOR=1.958;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=14;TCR=34;TR=48;WE=205038739;WS=205038721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	205039295	rs56283998	A	C	1280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=25;PP=650;ReadPosRankSum=0.677;SC=CCATAGGAGGAGGTTGAGAGG;SOR=0.395;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=47;TCF=21;TCR=26;TR=46;WE=205039303;WS=205039285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,53:0.98:54
chr1	205041542	rs3903399	T	C	329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=1;PP=231;SC=GAAGGGCTGGTTAAAGGTGAG;SOR=2.494;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=205041550;WS=205041532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	205042115	rs56338794	C	T	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=509;ReadPosRankSum=1.034;SC=ATCGGGTCTCCTCCCAGTACC;SOR=0.892;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=52;TCF=42;TCR=10;TR=27;WE=205042123;WS=205042105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,28:0.54:52
chr1	205042939	rs17416088	C	T	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.450;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=343;ReadPosRankSum=-0.471;SC=CCACCTCCGACGGACACAGCC;SOR=0.358;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=23;WE=205042947;WS=205042929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,27:0.60:45
chr1	205052939	rs4950979	G	A	4357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=77;NR=68;PP=2611;SC=GCCTCTTGACGAGTCTCAAGT;SOR=0.718;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=147;TCF=78;TCR=69;TR=145;WE=205052947;WS=205052929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr1	205053219	rs4951168	C	T	5019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=78;PP=2965;SC=TTCTAAGCGCCGAGTCTGACA;SOR=0.704;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=167;TCF=89;TCR=78;TR=167;WE=205053227;WS=205053209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr1	205085358	rs12025836	T	C	354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=4;PP=266;SC=ACTAAATACTTTGTTTTTGAA;SOR=0.859;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=8;WE=205085366;WS=205085348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	205129319	rs1062715	G	A	3169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=55;PP=1761;SC=GGGCACAAGGGAAGTGTCCTC;SOR=0.978;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=47;TCR=55;TR=102;WE=205129327;WS=205129309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr1	205130413	rs3851294	A	G	3033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=45;PP=1621;SC=TGTAAAGAACAGCTTTCCAGA;SOR=0.710;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=99;TCF=54;TCR=45;TR=99;WE=205130421;WS=205130403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr1	205133169	rs61822658	T	C	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-3.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.445;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=158;ReadPosRankSum=-0.963;SC=ATCAGAACCATGGAACTACCG;SOR=0.412;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=32;TCF=9;TCR=23;TR=16;WE=205133177;WS=205133159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr1	205138321	rs35845538	G	C	3419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=363;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.381;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=75;PP=2361;ReadPosRankSum=0.696;SC=GCATCATCCAGAAGTTCCTCC;SOR=0.734;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=325;TCF=169;TCR=156;TR=152;WE=205138329;WS=205138311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:198,165:0.45:363
chr1	205240913	rs9659978	A	G	479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=4;PP=382;SC=TCCTGAGCGCACACATGCCAG;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=19;WE=205240921;WS=205240903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	205272926	rs1106201	C	T	1410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=23;PP=787;ReadPosRankSum=1.591;SC=CCGCGAGCTCCAAGGCTGTCT;SOR=0.698;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=149;TCF=93;TCR=56;TR=61;WE=205272934;WS=205272916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,67:0.40:167
chr1	205272983	rs1106202	C	G	2559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=52;PP=1532;ReadPosRankSum=-1.292;SC=GATGGAGGAGCAGCCCTGAAG;SOR=0.697;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=254;TCF=139;TCR=115;TR=114;WE=205272991;WS=205272970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,126:0.45:279
chr1	205273142	rs41264881	G	C	1560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.652;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=38;PP=869;ReadPosRankSum=-1.021;SC=TGGGGAGCAGGGGGGCAGCCT;SOR=0.829;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=146;TCF=73;TCR=73;TR=72;WE=205273150;WS=205273132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,77:0.49:158
chr1	205274174	rs10793728	A	G	287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=1;PP=189;SC=CAGAGGTCTCAACATTGGACA;SOR=2.670;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=205274182;WS=205274166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	205275206	rs4951195	AG	TT	3563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=19;PP=2592;SC=GAGGCTTGAGAGTTGTGCTCT;SOR=1.700;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=74;TCF=53;TCR=21;TR=71;WE=205275215;WS=205275196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr1	205275421	rs4951197	A	G	3076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=54;PP=1873;SC=GGTTGGAGAGACCGAAGTCAG;SOR=0.841;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=51;TCR=55;TR=105;WE=205275429;WS=205275411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr1	205312280	rs7549293	C	G	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=230;ReadPosRankSum=-0.303;SC=CAGCAAATGCCTGTTGGTTTC;SOR=0.997;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=15;WE=205312288;WS=205312270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr1	205312767	rs7526603	G	T	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.618;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=283;ReadPosRankSum=-0.555;SC=GCCGGGAGAGGTGCGAGCGCG;SOR=0.045;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=19;WE=205312775;WS=205312757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,20:0.69:29
chr1	205325609	rs2298250	C	A	5388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=104;NR=84;PP=2965;SC=ACCAGCAGGCCCTCAGAATGC;SOR=0.859;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=189;TCF=105;TCR=84;TR=188;WE=205325617;WS=205325599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr1	205385498	rs6688045	C	T	7575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=115;NR=131;PP=2965;SC=ACATCAATCACCAGGGTGAAT;SOR=0.918;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=246;TCF=115;TCR=131;TR=246;WE=205385506;WS=205385488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,283:1.00:283
chr1	205492756	rs7529442	A	G	4570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=84;PP=2965;SC=CCATGGAGGTAAGGGCCTCTG;SOR=1.008;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=151;TCF=67;TCR=84;TR=151;WE=205492764;WS=205492746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr1	205493545	rs41264889	C	T	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=288;ReadPosRankSum=0.238;SC=CCAGCATGGGCATATCAGTCC;SOR=0.765;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=15;WE=205493553;WS=205493535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr1	205494397	rs12126241	G	A	699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.133;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=22;PP=488;ReadPosRankSum=-0.493;SC=CTCCCTAGTCGGCCCTCTCTG;SOR=0.966;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=62;TCF=14;TCR=48;TR=28;WE=205494405;WS=205494387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,30:0.45:66
chr1	205495392	rs2297837	A	G	5715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=103;NR=79;PP=2965;SC=AGCTGGGGGTAGAGGATCATT;SOR=0.840;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=182;TCF=103;TCR=79;TR=182;WE=205495400;WS=205495382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr1	205495976	rs1544154	A	G	6590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=111;PP=2965;SC=GTGAGGCCTCAGGGGCAGGGT;SOR=0.883;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=214;TCF=102;TCR=112;TR=213;WE=205495984;WS=205495966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr1	205498021	rs7531230	T	C	186.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=1;PP=193;SC=AGAGCCACGATCCCTGCAGCC;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=205498029;WS=205498011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	205498343	rs4951235	C	G	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.363;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=50;ReadPosRankSum=-0.583;SC=GCGGGGACCCCCTGTGGCCTC;SOR=1.981;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=15;TCF=9;TCR=6;TR=5;WE=205498351;WS=205498333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr1	205498843	rs45479796	G	T	3590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=348;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.390;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=86;PP=2272;ReadPosRankSum=-0.493;SC=AGGCCAAGGGGTGGCCTCCAT;SOR=0.727;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=311;TCF=147;TCR=164;TR=156;WE=205498851;WS=205498833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,173:0.50:345
chr1	205499355	rs12042887	C	A	1166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.774;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=13;PP=694;ReadPosRankSum=1.368;SC=GCCCCCCAGCCGGGCCCAATA;SOR=0.840;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=96;TCF=67;TCR=29;TR=48;WE=205499363;WS=205499345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,54:0.50:109
chr1	205499495	rs12035825	G	A	2178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=55;PP=1473;ReadPosRankSum=1.687;SC=CTGGGGGTCCGGGAGCAGGGC;SOR=0.660;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=196;TCF=87;TCR=109;TR=98;WE=205499503;WS=205499485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,103:0.50:208
chr1	205499577	rs6668356	C	G	2363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=55;SC=GAGGCCCCAGCCCCAGCAGAG;SOR=2.055;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=22;TCR=55;TR=77;WE=205499585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr1	205499595	rs41264891	G	A	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.024;HP=4;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=458;ReadPosRankSum=-0.873;SC=GAGCAGCCCCGGGCACCTTGC;SOR=0.859;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=59;TCF=21;TCR=38;TR=25;WE=205499603;WS=205499585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,25:0.41:61
chr1	205499611	rs41264893	C	T	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.116;HP=3;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=356;ReadPosRankSum=0.629;SC=CTTGCCTCCCCTGCTGGGGTT;SOR=0.965;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=48;TCF=22;TCR=26;TR=20;WE=205499619;WS=205499601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,20:0.40:50
chr1	205499701	rs12748821	T	C	1404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.613;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=24;PP=885;ReadPosRankSum=0.414;SC=GGCCAGTCCTTACTGGAGGCC;SOR=0.769;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=143;TCF=86;TCR=57;TR=62;WE=205499709;WS=205499691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,67:0.45:150
chr1	205499921	rs11240505	C	G	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=24;PP=556;ReadPosRankSum=-0.513;SC=CCCATGGTCCCCCCACCACTG;SOR=0.735;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=60;TCF=19;TCR=41;TR=35;WE=205499929;WS=205499911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,35:0.56:63
chr1	205548777	rs79314271	G	A	1349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.636;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=22;PP=717;ReadPosRankSum=1.330;SC=TCTACCAGAGGGGGAGAAATG;SOR=0.440;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=57;TCR=37;TR=55;WE=205548785;WS=205548767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,65:0.62:105
chr1	205555145	rs7531623	G	A	353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=3;PP=192;SC=GCTCAACAGCGCCCGGTCTCT;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=12;WE=205555153;WS=205555135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	205568213	rs2282449	C	T	967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.182;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=15;PP=579;ReadPosRankSum=0.742;SC=ACACCTTCCACGTGAAGTTTT;SOR=1.270;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=96;TCF=62;TCR=34;TR=45;WE=205568221;WS=205568203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,47:0.46:103
chr1	205568390	rs2282450	T	A	1184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=27;PP=613;ReadPosRankSum=0.669;SC=GTAAGGAAAGTATCTGTTTCT;SOR=0.665;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=128;TCF=58;TCR=70;TR=51;WE=205568398;WS=205568380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,61:0.43:142
chr1	205568438	rs2282451	G	T	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.245;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=19;PP=364;ReadPosRankSum=0.947;SC=GTCGGGGAGCGGGGGAGCAGG;SOR=1.085;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=66;TCF=19;TCR=47;TR=26;WE=205568446;WS=205568428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,30:0.42:72
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chr1	205615947	rs4951250	C	A	906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=5.669;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.25;MQRankSum=0.375;QD=22.12;ReadPosRankSum=-1.153;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,38:0.93:41
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chr1	205696671	rs1772147	G	A	482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=1;PP=362;SC=TTGTATACTCGAGCACAGCCT;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=205696679;WS=205696661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	205739396	rs823139	T	G	4394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=49;PP=2875;SC=TTAATAAAATTGTCAGGTGGG;SOR=1.255;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=92;TCR=49;TR=141;WE=205739404;WS=205739386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr1	205744138	rs708725	G	T	1031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.433;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=31;PP=663;ReadPosRankSum=-0.911;SC=GGGATCGGGGGTCGCTCGTTT;SOR=0.852;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=119;TCF=53;TCR=66;TR=52;WE=205744146;WS=205744128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,53:0.41:129
chr1	205764640	rs823156	G	A	3188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=54;PP=1814;SC=GACACAGACAGAGGTCAGAGG;SOR=0.973;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=48;TCR=54;TR=102;WE=205764648;WS=205764630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr1	205766159	rs5780304	CA	C	6416.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=17;NR=81;PP=2951;SC=CAAAATGACGCAAAGACCACT;SOR=0.784;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=19;TCR=89;TR=98;WE=205766167;WS=205766149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr1	205767885	rs708727	G	A	3003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.951;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=68;PP=1819;ReadPosRankSum=1.204;SC=GTGTGGCCACGTTGTCTGGGT;SOR=0.826;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=265;TCF=133;TCR=132;TR=131;WE=205767893;WS=205767875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,143:0.49:289
chr1	205779231	rs11240569	G	A	1294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=18;PP=732;ReadPosRankSum=-0.092;SC=CAGCAGCCACGGTCCCAAAGC;SOR=0.767;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=103;TCF=66;TCR=37;TR=52;WE=205779239;WS=205779221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,58:0.50:116
chr1	205801872	rs1361754	A	G	3281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=76;PP=1942;ReadPosRankSum=0.720;SC=ATCAGCCACAATGTTCTTCGT;SOR=0.687;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=264;TCF=118;TCR=146;TR=140;WE=205801880;WS=205801862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,154:0.52:297
chr1	205809642	rs10900525	G	C	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.795;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.34;ReadPosRankSum=-0.321;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr1	205814497	rs1891460	T	C	8133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=144;NR=131;PP=2965;SC=CCATAGATGATGCCATCACGC;SOR=0.774;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=275;TCF=144;TCR=131;TR=275;WE=205814505;WS=205814487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,308:1.00:308
chr1	205884062	rs9438438	T	C	3676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.583;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=77;PP=2030;ReadPosRankSum=0.075;SC=CCGAGCCGTGTGGGCTCTGGG;SOR=0.599;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=300;TCF=156;TCR=144;TR=160;WE=205884070;WS=205884052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,175:0.54:326
chr1	205884274	rs6669481	T	C	1571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=26;PP=753;ReadPosRankSum=2.177;SC=CTCTCACTCCTGTAAGGGTAG;SOR=0.653;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=119;TCF=62;TCR=57;TR=58;WE=205884282;WS=205884264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,73:0.53:137
chr1	205886376	rs35694044	T	A	1382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=28;PP=867;ReadPosRankSum=-0.102;SC=CTCTTCGCCCTGCTCCCACCC;SOR=0.660;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=77;TCR=57;TR=66;WE=205886384;WS=205886366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,72:0.47:152
chr1	205887981	rs16856462	T	C	661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.451;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=8;PP=301;ReadPosRankSum=1.910;SC=TTGGAAGTTGTGTCCTGGGGT;SOR=0.206;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=58;TCF=46;TCR=12;TR=29;WE=205887989;WS=205887971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,32:0.49:65
chr1	205889329	rs16856470	C	T	1425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.657;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=25;PP=797;ReadPosRankSum=1.497;SC=AGAAGACCTTCACGCCGATCT;SOR=0.632;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=71;TCR=46;TR=63;WE=205889337;WS=205889319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,67:0.53:127
chr1	205889532	rs16856473	G	A	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.735;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=140;ReadPosRankSum=0.025;SC=CTGGAGTGTTGGCTGACGGTT;SOR=0.495;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=8;WE=205889540;WS=205889522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr1	205890679	rs12759719	T	C	4046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=75;NR=58;PP=2469;SC=TGCTTGCTGTTCCCGAGGGCC;SOR=0.834;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=133;TCF=75;TCR=58;TR=133;WE=205890687;WS=205890669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr1	205893753	rs34907090	AT	A	709.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.116;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.17;MQRankSum=0.917;NF=3;NR=20;PP=572;ReadPosRankSum=2.242;SC=TTTAAATAGCATTTTTTGCAA;SOR=0.161;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=49;TCF=4;TCR=45;TR=23;WE=205893761;WS=205893743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,31:0.56:55
chr1	205896235	rs11240594	G	A	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.410;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=199;ReadPosRankSum=0.156;SC=GAGACTAAGTGTGACAACAGT;SOR=1.609;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=15;WE=205896243;WS=205896225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
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chr1	205896647	rs34803033	A	G	1853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.534;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=37;PP=956;ReadPosRankSum=-0.186;SC=CTCCATCCACAGCCAGAGTGA;SOR=0.650;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=166;TCF=89;TCR=77;TR=82;WE=205896655;WS=205896637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,94:0.51:186
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chr1	205901788	rs3811423	G	T	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=71;ReadPosRankSum=-1.085;SC=CCCATCCTTGGGGTCTGGGTC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=5;WE=205901796;WS=205901778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
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chr1	206317568	rs73074812	G	A	1888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.532;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=36;PP=1034;ReadPosRankSum=1.288;SC=GCTGCTGGTCGGACTCACAAT;SOR=0.779;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=169;TCF=95;TCR=74;TR=84;WE=206317576;WS=206317558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,95:0.50:190
chr1	206319119	rs57621203	A	G	4202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=382;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.370;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=86;PP=2404;ReadPosRankSum=0.725;SC=CTTCGGCACTATCTCCATTGG;SOR=0.713;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=347;TCF=181;TCR=166;TR=183;WE=206319127;WS=206319109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:181,201:0.53:382
chr1	206327510	rs61742539	T	C	1692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.312;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=26;PP=1051;ReadPosRankSum=-0.827;SC=AGCTGATTTTTGGAGGCTACG;SOR=0.815;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=147;TCF=94;TCR=53;TR=74;WE=206327518;WS=206327500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,78:0.51:153
chr1	206328647	rs28694519	G	C	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.473;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=213;ReadPosRankSum=1.599;SC=CATTTGAGAGGCCAAAAAAGA;SOR=1.659;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=11;WE=206328655;WS=206328637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr1	206328803	rs41302235	T	C	2291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.887;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=41;PP=1414;ReadPosRankSum=-0.482;SC=TCACTGGCCCTTCCGACAAGA;SOR=0.913;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=210;TCF=117;TCR=93;TR=98;WE=206328811;WS=206328793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,111:0.47:237
chr1	206516261	rs201036189	C	T	1018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=6.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.56;MQRankSum=1.375;QD=12.90;ReadPosRankSum=-0.664;SOR=2.440;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,40:0.51:79
chr1	206566195	rs200978831	C	T	1079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FS=7.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.69;MQRankSum=-11.929;QD=3.45;ReadPosRankSum=-1.820;SOR=0.392;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:232,81:0.26:313
chr1	206566860	rs11361942	TA	T	460.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=2.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.02;MQRankSum=-5.982;QD=6.78;ReadPosRankSum=-0.452;SOR=1.154;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,28:0.41:68
chr1	206566904	rs2919105	T	C	2892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.862;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-14.548;NF=94;NR=40;PP=2201;ReadPosRankSum=-0.372;SC=CTTTTCAGCGTCAAGCCAAGT;SOR=0.891;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=282;TCF=198;TCR=84;TR=134;WE=206566912;WS=206566894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,132:0.48:275
chr1	206567100	rs2480377	C	T	2834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.503;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-9.914;NF=46;NR=77;PP=1785;ReadPosRankSum=0.523;SC=AGACATTCCCCGATACTATTG;SOR=0.601;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=242;TCF=88;TCR=154;TR=123;WE=206567108;WS=206567090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,134:0.49:271
chr1	206567165	rs2480376	T	A	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-4.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.662;NF=1;NR=15;PP=199;ReadPosRankSum=0.391;SC=CCATGATCCATCAGGGTGCTT;SOR=0.290;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=55;TCF=3;TCR=52;TR=16;WE=206567173;WS=206567155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,17:0.27:62
chr1	206579936	rs201644221	A	G	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.84;MQRankSum=-1.814;QD=5.74;ReadPosRankSum=-0.558;SOR=0.883;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr1	206603384	.	C	G	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=9.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.40;ReadPosRankSum=0.634;SOR=0.023;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr1	206603535	rs2297539	G	A	4820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=66;PP=2718;SC=CAATTCCTCTGGTGGTGGAAA;SOR=0.846;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=157;TCF=91;TCR=66;TR=156;WE=206603543;WS=206603525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr1	206623685	rs12725078	G	T	2182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.044;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=39;PP=1426;ReadPosRankSum=0.489;SC=GACAAGAATTGTATGAGCACA;SOR=0.799;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=200;TCF=120;TCR=80;TR=99;WE=206623693;WS=206623675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,105:0.47:222
chr1	206623866	rs11809494	C	T	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.633;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=20;PP=399;ReadPosRankSum=-0.369;SC=CAGAAGGAAGCGATTATATAT;SOR=1.118;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=54;TCF=13;TCR=41;TR=25;WE=206623874;WS=206623856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,26:0.46:56
chr1	206626607	rs11120575	G	A	1757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.465;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=32;PP=1046;ReadPosRankSum=-0.873;SC=CCCGAGAGCTGTCCTTTAAGA;SOR=0.978;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=161;TCF=92;TCR=69;TR=81;WE=206626615;WS=206626597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,87:0.49:177
chr1	206626779	rs2483059	A	G	1996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=49;PP=1400;SC=CTCTATGGGAATGAGACTTCA;SOR=1.778;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=22;TCR=49;TR=71;WE=206626787;WS=206626769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	206626828	rs2483058	C	G	671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=21;PP=564;SC=GCCAACCCCTCGGGGGTCCAG;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=206626836;WS=206626818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	206631518	rs10864212	G	T	514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=0;PP=532;SC=GTTACAGTCTGTTTGGAAAAA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=206631540;WS=206631509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	206631532	rs12565311	T	A	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=223;ReadPosRankSum=-0.290;SC=GGAAAAAGAGTCATGCTAAAA;SOR=0.387;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=11;WE=206631540;WS=206631509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr1	206646427	rs1930437	C	A	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=198;ReadPosRankSum=-1.116;SC=TGTGGAATGGCCACATGGAGC;SOR=1.022;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=14;WE=206646435;WS=206646417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,14:0.38:37
chr1	206647742	rs1539242	A	G	7101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=130;NR=108;PP=2965;SC=GCGAGGTGCAAGTGAGGGAGT;SOR=0.756;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=239;TCF=131;TCR=108;TR=238;WE=206647750;WS=206647732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,262:1.00:262
chr1	206647787	rs1539243	T	C	2604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=54;PP=1135;ReadPosRankSum=-0.421;SC=ACCAGAACATTGTCAAGCTCT;SOR=0.675;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=228;TCF=115;TCR=113;TR=110;WE=206647795;WS=206647777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,131:0.51:257
chr1	206648378	rs1059704	G	A	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=119;ReadPosRankSum=-0.523;SC=TCAGACCAGCGGCAGGCCTGG;SOR=0.368;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=8;WE=206648386;WS=206648368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr1	206665896	rs2336940	C	G	1137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.521;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=22;PP=789;ReadPosRankSum=-0.318;SC=CGAGGGCTGACCTCCAACCCC;SOR=0.751;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=98;TCF=51;TCR=47;TR=48;WE=206665904;WS=206665886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,50:0.47:106
chr1	206667441	rs2184030	G	A	1153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.599;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=28;PP=632;ReadPosRankSum=-0.181;SC=GTCCATTTTCGAAGAAGCCCT;SOR=0.509;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=95;TCF=39;TCR=56;TR=50;WE=206667449;WS=206667431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,57:0.53:108
chr1	206670827	rs12754274	G	T	1412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.649;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=25;PP=803;ReadPosRankSum=1.409;SC=TGTGTGCTTCGAAGCGTGAAG;SOR=0.763;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=68;TCR=47;TR=60;WE=206670835;WS=206670817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,68:0.52:131
chr1	206680983	rs2095124	A	C	1777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FS=0.498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.04;ReadPosRankSum=-0.686;SOR=0.756;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:126,95:0.43:221
chr1	206758077	rs4418597	T	A	4355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=102;PP=2829;SC=AAGCCCACCCTCTAAAACTCC;SOR=1.565;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=155;TCF=53;TCR=102;TR=155;WE=206758085;WS=206758067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr1	206766799	.	GGAGA	G	277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.68;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	206766817	.	AGAGAGC	A	328	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=2;HapScore=4;MGOF=23;MMLQ=21;MQ=62.65;NF=6;NR=2;PP=328;QD=41.625;SC=AGAGAGAGAGAGAGAGCGCGA;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=206766835;WS=206766807;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	206766825	rs144194477	CGA	C	130.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.17;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	206766827	.	A	C	152	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=2;HapScore=4;MGOF=23;MMLQ=19;MQ=62.13;NF=4;NR=2;PP=152;QD=31.1285354245;SC=AGAGAGCGCGAGAGAGAGAGA;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=6;WE=206766835;WS=206766807;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,6:0.60:10
chr1	206766857	.	C	CGTGTGTGT	141.76	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.65;MQRankSum=0.524;QD=28.35;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=1.447;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr1	206769047	rs11584983	T	C	2123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=50;NR=17;PP=1193;SC=TCCTTGAACATTGTGTCTTTC;SOR=1.795;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=50;TCR=17;TR=67;WE=206769055;WS=206769037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr1	206772753	rs4845116	A	G	863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=4;PP=614;SC=CACTACTCAGATTGAGAGGAA;SOR=2.546;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=25;WE=206772761;WS=206772743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	206773659	rs6662929	A	G	5149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=89;PP=2940;SC=GTCGTCCTTCAGGGCTGATGG;SOR=0.877;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=168;TCF=79;TCR=89;TR=168;WE=206773667;WS=206773649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr1	206776200	rs6668054	C	T	1037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.12;SOR=4.003;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	206776203	rs6675741	T	C	1037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.24;SOR=4.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	206778642	rs4077413	A	C	109.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=83;SC=TGGGCTTAGCAACTTGCTTAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=206778650;WS=206778632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	206904464	rs10863805	C	T	816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.753;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=17;PP=524;ReadPosRankSum=1.314;SC=CTCCCACTTCCTTCCTCCTGT;SOR=0.664;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=94;TCF=51;TCR=43;TR=35;WE=206904472;WS=206904452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,39:0.37:106
chr1	206943351	rs3024494	T	C	859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=21;PP=486;SC=CCAAATGCCTTGCCTCACAGC;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=30;WE=206943359;WS=206943341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	206944233	rs1554286	A	G	4696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=61;PP=2747;SC=GCAAGGGAAAAAACTGATCTG;SOR=1.005;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=156;TCF=95;TCR=61;TR=156;WE=206944241;WS=206944223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr1	206944645	rs1518111	T	C	508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=1;PP=365;SC=GGAAGCAGAGTCTCCCTTCCC;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=206944653;WS=206944635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	206944845	.	AT	A	58.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=0.000;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=1.349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.13;MQRankSum=2.216;QD=0.93;ReadPosRankSum=0.408;SOR=1.012;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,11:0.17:63
chr1	206944861	rs1518110	A	C	1801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=19;NR=38;PP=1123;SC=TTTTTTAAATAAAATTGGCTC;SOR=1.649;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=58;TCF=20;TCR=38;TR=57;WE=206944869;WS=206944851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr1	207009910	rs2243170	T	C	276.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=8;NR=1;PP=228;SC=TCCTCCCGGCTTGCCTTCGAG;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=207009918;WS=207009905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	207014472	rs2243188	A	C	1872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=38;PP=993;SC=GAGGTAGATCAGGAGGGTGCC;SOR=1.394;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=26;TCR=38;TR=64;WE=207014480;WS=207014462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	207015957	rs2243191	T	C	5456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=98;NR=82;PP=2965;SC=GAAGTAATGTTCTCAGCTTGA;SOR=0.733;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=180;TCF=98;TCR=82;TR=180;WE=207015965;WS=207015947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr1	207040659	rs2232360	G	A	1781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=11;PP=1107;SC=TAGAGTTTCTGCCTGCTTCAT;SOR=2.531;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=46;TCR=11;TR=57;WE=207040667;WS=207040649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	207106093	rs116784853	C	T	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=114;ReadPosRankSum=-0.726;SC=GGCAAAGGCACGCACTGGGCC;SOR=0.593;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=9;WE=207106101;WS=207106083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr1	207195779	rs2842726	A	G	5036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=73;PP=2965;SC=TTAGGGATAGAAATTGGCATA;SOR=0.762;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=157;TCF=84;TCR=73;TR=157;WE=207195787;WS=207195769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr1	207222471	rs139358134	T	C	2912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.486;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.985;NF=71;NR=49;PP=2003;ReadPosRankSum=-0.619;SC=GGTGAAGCGGTTGACATCAGT;SOR=0.793;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=234;TCF=139;TCR=95;TR=120;WE=207222479;WS=207222461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,130:0.50:262
chr1	207235954	rs2075863	G	A	2752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.135;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=60;PP=1589;ReadPosRankSum=-0.926;SC=GGATTTGGGTGTCTTCTACAG;SOR=0.643;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=267;TCF=142;TCR=125;TR=124;WE=207235962;WS=207235944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,138:0.46:298
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chr1	207245080	rs35425352	A	AT	163.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=2.514;NF=1;NR=11;PP=136;ReadPosRankSum=-0.855;SC=TGTTGGAATTATTTTTTTTTT;SOR=0.678;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=12;WE=207245088;WS=207245070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,11:0.34:32
chr1	207262980	rs12711513	T	G	1553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.570;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=37;PP=914;ReadPosRankSum=0.537;SC=TTTGGTGTCCTTTTGCGGTGT;SOR=0.633;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=145;TCF=68;TCR=77;TR=69;WE=207262988;WS=207262970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,78:0.46:168
chr1	207263829	rs6690037	A	G	1683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.509;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=41;PP=974;ReadPosRankSum=-0.198;SC=GTGCCGCTGTAAGTTAGATCT;SOR=0.968;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=152;TCF=70;TCR=82;TR=73;WE=207263837;WS=207263819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,82:0.47:175
chr1	207268779	rs7542292	A	G	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=338;ReadPosRankSum=1.214;SC=AGGTTCAAGCAGTTCTCATGC;SOR=0.504;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=16;WE=207268787;WS=207268769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr1	207269919	rs8942	C	T	2044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=46;PP=1156;ReadPosRankSum=2.724;SC=AAGGAAATAACTTCACCTTAG;SOR=0.676;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=186;TCF=96;TCR=90;TR=94;WE=207269927;WS=207269909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,105:0.49:213
chr1	207271387	rs55926923	G	T	1118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.935;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=11;PP=690;ReadPosRankSum=1.217;SC=GGGCAGGGAGGTGGATTCCAT;SOR=1.084;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=91;TCF=68;TCR=23;TR=48;WE=207271395;WS=207271377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,50:0.51:98
chr1	207286409	rs74867186	A	G	1943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.180;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=37;PP=1249;ReadPosRankSum=0.290;SC=CTCTTCATAGAAAAAGGAAAA;SOR=0.594;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=156;TCF=91;TCR=65;TR=84;WE=207286417;WS=207286399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,91:0.52:174
chr1	207288897	rs12031629	T	C	919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=2.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.825;SOR=1.041;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,38:0.51:75
chr1	207297484	rs2842707	G	C	741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.262;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=22;PP=551;ReadPosRankSum=1.609;SC=TGATGCCTTCGCTGAGTATTT;SOR=1.092;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=71;TCF=24;TCR=47;TR=31;WE=207297492;WS=207297474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,32:0.42:76
chr1	207297680	rs1126618	T	C	1621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.096;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=35;PP=843;ReadPosRankSum=0.064;SC=AAACAATAGGTGTTTGGAGAC;SOR=0.678;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=182;TCF=97;TCR=85;TR=78;WE=207297688;WS=207297670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,86:0.42:204
chr1	207314388	rs12043615	C	T	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=242;ReadPosRankSum=-0.870;SC=ATGTATTCTGCAATGTGCTAC;SOR=0.677;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=55;TCF=36;TCR=19;TR=22;WE=207314396;WS=207314378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,26:0.43:60
chr1	207500293	rs4844591	C	T	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=349;ReadPosRankSum=2.341;SC=GCAAACCCACCTTTCAATATA;SOR=0.892;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=19;WE=207500301;WS=207500283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,21:0.45:47
chr1	207504669	rs2184476	G	A	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=293;ReadPosRankSum=-1.162;SC=TTATATTTTTGCTTTATTCTT;SOR=0.854;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=55;TCF=13;TCR=42;TR=21;WE=207504677;WS=207504659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,21:0.35:60
chr1	207510289	rs2490257	T	C	4976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=104;PP=2965;SC=ACCAACACCTTAGAAACCCAC;SOR=1.770;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=154;TCF=50;TCR=104;TR=154;WE=207510297;WS=207510279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr1	207510548	rs10746462	A	G	657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.576;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=3;PP=459;ReadPosRankSum=1.421;SC=ACAGCCCAAAAATTCACCACA;SOR=0.381;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=46;TCR=6;TR=25;WE=207510556;WS=207510538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,26:0.47:55
chr1	207510596	rs10746463	G	A	1890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=3.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.024;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=20;PP=1199;ReadPosRankSum=-2.296;SC=TCAGCAGCACGTAAGTCCACT;SOR=0.989;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=151;TCF=109;TCR=42;TR=78;WE=207510604;WS=207510586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,84:0.50:169
chr1	207512577	rs10641442	T	TTAA	399.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=384;SC=CTTGATTAAGTTAATGTGTAA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=9;WE=207512585;WS=207512567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	207520376	rs2404781	T	C	831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.845;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=12;PP=560;ReadPosRankSum=-0.153;SC=CTTGCTTCTGTCTCCTTCCTT;SOR=0.590;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=50;TCR=24;TR=36;WE=207520384;WS=207520366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,40:0.48:83
chr1	207520610	rs368894631	AT	A	39.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.95;ReadPosRankSum=0.839;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,8:0.19:42
chr1	207520788	rs1257729	G	A	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=35;ReadPosRankSum=-1.111;SC=GTATTTTTCAGTAGAGACGGT;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=3;WE=207520796;WS=207520778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
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chr1	207643949	rs10863322	G	A	416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=0;PP=319;SC=CCCAAAGCTGGTCTGCAACAT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=207643957;WS=207643939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
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chr1	207679229	rs4844599	T	G	4057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=373;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.747;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=83;PP=2638;ReadPosRankSum=-1.328;SC=CTTTGATGCTTCTATGGTCTT;SOR=0.564;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=354;TCF=194;TCR=160;TR=179;WE=207679237;WS=207679219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:181,189:0.51:370
chr1	207679307	rs4844600	A	G	3546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=353;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.385;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.325;NF=80;NR=82;PP=2367;ReadPosRankSum=-0.748;SC=TAACTGATGAATTTGAGTTTC;SOR=0.723;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=332;TCF=164;TCR=168;TR=162;WE=207679315;WS=207679297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,167:0.47:352
chr1	207753621	rs2274567	A	G	2588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.997;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.506;NF=45;NR=55;PP=1521;ReadPosRankSum=-0.206;SC=CATGGTGAGCATACCCCAAGC;SOR=0.444;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=184;TCF=76;TCR=108;TR=100;WE=207753629;WS=207753611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,116:0.57:203
chr1	207757936	rs646817	A	G	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-5.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.955;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=2;PP=381;ReadPosRankSum=0.000;SC=CTGTAGAATCACCTTGGATTA;SOR=0.180;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=37;TCF=35;TCR=2;TR=22;WE=207757944;WS=207757926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,25:0.60:42
chr1	207758232	rs1752688	A	G	1648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.564;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.353;NF=30;NR=42;PP=988;ReadPosRankSum=-0.153;SC=GTCAGTATCCACTTCCACATA;SOR=0.510;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=176;TCF=69;TCR=107;TR=72;WE=207758240;WS=207758222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,84:0.42:199
chr1	207782916	rs4844609	A	T	4962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=74;NR=83;PP=2965;SC=GAGTTTCTTTACCCTCACTGA;SOR=1.038;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=158;TCF=74;TCR=84;TR=157;WE=207782924;WS=207782906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr1	207782931	rs6691117	A	G	1420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=31;PP=780;ReadPosRankSum=-0.069;SC=CACTGAGATCATCAGATTTAG;SOR=0.649;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=138;TCF=67;TCR=71;TR=62;WE=207782939;WS=207782921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,70:0.44:158
chr1	207784968	rs3818361	A	G	4702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=482;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.742;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=105;NR=100;PP=2794;ReadPosRankSum=0.609;SC=ATAAGATATAACAAAGGAAAT;SOR=0.573;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=432;TCF=229;TCR=203;TR=205;WE=207784976;WS=207784958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:249,230:0.48:479
chr1	207790088	rs3811381	C	G	2966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.276;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=69;PP=1749;ReadPosRankSum=-0.837;SC=ACAAGTGACCCTCAAGGGAAT;SOR=0.511;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=281;TCF=135;TCR=146;TR=137;WE=207790096;WS=207790078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,151:0.47:324
chr1	207795320	rs2296160	A	G	1040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.566;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=18;PP=609;ReadPosRankSum=-0.158;SC=CCTTTTAGGTACACATGATGC;SOR=0.399;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=98;TCF=63;TCR=35;TR=44;WE=207795328;WS=207795310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,50:0.45:112
chr1	207812791	rs41274776	A	G	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.712;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.148;NF=0;NR=9;PP=174;ReadPosRankSum=1.755;SC=CTCGAATACAATTTTGGTGGG;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=9;WE=207812799;WS=207812781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr1	207850879	rs34509370	C	T	4841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=449;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.148;NF=108;NR=105;PP=2932;ReadPosRankSum=0.581;SC=GCCTAAAAAACTCAGTCTGGA;SOR=0.683;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=404;TCF=205;TCR=199;TR=213;WE=207850887;WS=207850869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:216,233:0.52:449
chr1	207851611	rs2296158	A	G	3799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=362;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.970;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.366;NF=85;NR=84;PP=2284;ReadPosRankSum=0.349;SC=CATCCAGTTCAGATCCCAAAT;SOR=0.528;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=323;TCF=157;TCR=166;TR=169;WE=207851619;WS=207851601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,187:0.52:362
chr1	207857158	rs12411037	T	C	1534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=2.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.615;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.649;NF=40;NR=20;PP=954;ReadPosRankSum=0.554;SC=AAGTAGTAATTTAATTGGGTA;SOR=0.606;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=97;TCR=48;TR=60;WE=207857166;WS=207857148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,70:0.43:162
chr1	207872595	rs12729569	A	G	2890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.294;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.214;NF=77;NR=57;PP=1918;ReadPosRankSum=0.114;SC=AAGCCTTTGGAATAGCAGTGT;SOR=0.614;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=311;TCF=182;TCR=129;TR=134;WE=207872603;WS=207872585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:200,146:0.42:346
chr1	207872657	rs12748243	C	T	3403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=407;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=84;PP=2210;ReadPosRankSum=-0.483;SC=CAATCTCTCCCCTTCATCTGT;SOR=0.763;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=369;TCF=178;TCR=191;TR=160;WE=207872665;WS=207872647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:233,172:0.42:405
chr1	207888739	rs7553211	G	T	3028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=69;PP=2112;SC=TCCAGTGTGTGAACGTGAGTA;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=42;TCR=69;TR=111;WE=207888747;WS=207888729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr1	207941191	rs2724374	G	T	1927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=46;PP=1357;SC=CCTGCTTATAGTTTTTCAAAA;SOR=2.200;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=17;TCR=46;TR=63;WE=207941199;WS=207941181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	207959122	.	CTTT	C	554.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.62;SOR=2.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	207959136	rs373519619	T	TAA	554.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.62;SOR=2.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	207975315	rs150749580	C	T	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.378;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=278;ReadPosRankSum=-0.494;SC=GTCTGCACCTCGACAGTCCAG;SOR=1.721;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=15;WE=207975323;WS=207975305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
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chr1	208062260	rs2745952	T	C	2653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=59;PP=1787;ReadPosRankSum=-0.599;SC=GCTCCAGCCCTCTGTGTGTGA;SOR=0.569;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=94;TCF=34;TCR=60;TR=93;WE=208062268;WS=208062250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,97:0.99:98
chr1	208062973	rs2745953	A	T	6416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=121;NR=100;PP=2965;SC=CCGCCTGGGAAGACAGAGAAA;SOR=0.726;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=221;TCF=121;TCR=100;TR=221;WE=208062981;WS=208062963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr1	208063067	rs2179634	G	A	4240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.34;SOR=1.296;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr1	208200737	rs659192	C	G	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.980;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=291;ReadPosRankSum=2.077;SC=TAGAAGACACCATTTTCTGGA;SOR=0.957;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=59;TCF=28;TCR=31;TR=24;WE=208200745;WS=208200727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,29:0.40:72
chr1	208204794	rs76190764	CTGTT	C	269.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.455;NF=5;NR=1;PP=260;ReadPosRankSum=0.000;SC=CATATGTGCACTGTTTGTTCC;SOR=0.247;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=23;TCF=15;TCR=8;TR=6;WE=208204805;WS=208204784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr1	208207839	rs3736963	G	A	1226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.703;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=20;PP=621;ReadPosRankSum=0.132;SC=GGTTCTCACCGTATCTGCTGA;SOR=0.423;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=91;TCF=57;TCR=34;TR=51;WE=208207847;WS=208207829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,57:0.56:101
chr1	208208034	rs12128144	G	C	843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.292;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=25;PP=475;ReadPosRankSum=-0.769;SC=AGATAGCTGTGGGGTAGAGAG;SOR=0.345;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=78;TCF=30;TCR=48;TR=43;WE=208208046;WS=208208024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,44:0.51:87
chr1	208208124	rs6540448	C	A	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=57;ReadPosRankSum=0.108;SC=ATAACCCAATCAAATAGCTAC;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=208208132;WS=208208114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr1	208211887	rs905100	T	C	724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=16;PP=452;SC=TGTCTCCCGATTGCACCTTCT;SOR=2.215;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=22;WE=208211895;WS=208211877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	208212397	rs2767566	A	G	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.958;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=320;ReadPosRankSum=-0.438;SC=GAGGGTCAGGACCTCAGAATC;SOR=0.148;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=37;TCF=9;TCR=28;TR=21;WE=208212405;WS=208212387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr1	208213125	rs1751580	A	G	5918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=98;NR=93;PP=2965;SC=GTGGGCACAGACAGGGCAGGA;SOR=0.788;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=191;TCF=98;TCR=93;TR=191;WE=208213133;WS=208213115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr1	208219164	rs1536471	A	C	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=205;ReadPosRankSum=-1.551;SC=GCCAGGAGCGAGGGGCGCCCT;SOR=0.776;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=14;WE=208219172;WS=208219154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr1	208225909	rs841865	G	A	815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.376;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=26;PP=543;ReadPosRankSum=-1.888;SC=CATTCTGGGCGTGGTGGTACT;SOR=1.321;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=93;TCF=36;TCR=57;TR=37;WE=208225917;WS=208225899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,40:0.40:99
chr1	208252489	rs2274445	T	C	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.470;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=3;PP=143;ReadPosRankSum=-1.074;SC=CCCCCCACATTAAACTCACTG;SOR=0.086;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=8;WE=208252497;WS=208252481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr1	208252504	rs2274444	C	A	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.799;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=47;ReadPosRankSum=1.807;SC=TCACTGTACGCCAATAATTTG;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=4;WE=208252512;WS=208252494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr1	208255877	rs6540453	T	C	699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.977;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=25;PP=427;ReadPosRankSum=-0.429;SC=GGCAGAGGCATGGGGCTCATG;SOR=0.967;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=68;TCF=22;TCR=46;TR=36;WE=208255885;WS=208255867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,36:0.50:72
chr1	208270244	rs3818517	A	C	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=22;PP=366;ReadPosRankSum=-1.260;SC=GGAGGAGCAAAGAGATGATGC;SOR=0.815;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=70;TCF=24;TCR=46;TR=33;WE=208270252;WS=208270234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,35:0.48:73
chr1	208276399	rs10654695	C	CCTCT	6930.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=31;PP=2973;SC=GAGGACAATTCCTCTCTCTGC;SOR=1.282;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=75;TCF=35;TCR=40;TR=57;WE=208276407;WS=208276389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr1	208390469	rs3748735	C	T	4800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=438;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.750;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=110;NR=106;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.679;SC=GAGTTGATGGCCACACCCTCA;SOR=0.549;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=410;TCF=217;TCR=193;TR=216;WE=208390477;WS=208390459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:205,233:0.53:438
chr1	209605636	rs3842530	TAGCAGCAGCAGC	T	1595.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=15;PP=2997;SC=GCCACCACCGTAGCAGCAGCA;SOR=1.121;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=17;WE=209605655;WS=209605626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	209778737	rs2235455	G	A	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.581;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=257;ReadPosRankSum=1.122;SC=GACTGGAGTAGTCTGCTGGCA;SOR=0.238;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=48;TCF=37;TCR=11;TR=20;WE=209778745;WS=209778727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,23:0.44:52
chr1	209778771	rs35508847	G	C	720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=11;PP=400;ReadPosRankSum=0.220;SC=AGTTCATGGGGGCCTGCCTGT;SOR=0.634;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=78;TCF=54;TCR=24;TR=32;WE=209778779;WS=209778761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,37:0.42:89
chr1	209779126	rs11119313	C	A	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.944;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5341;FS=4.771;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=103;ReadPosRankSum=-0.060;SC=GGACTAGTGACTCCCAAGGCC;SOR=3.126;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=6;WE=209779134;WS=209779116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr1	209779652	rs35498535	T	G	3718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.882;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=68;PP=2231;ReadPosRankSum=-2.057;SC=ACTACATATTTTTTCTCCTAC;SOR=0.690;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=275;TCF=147;TCR=128;TR=153;WE=209779669;WS=209779642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,169:0.55:310
chr1	209781125	rs760833	T	C	1567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.232;SOR=0.649;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:82,80:0.49:162
chr1	209781417	.	TACACAC	T	65.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.30;ReadPosRankSum=-0.652;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr1	209782343	rs11119314	A	G	1189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.107;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=21;PP=738;ReadPosRankSum=-2.512;SC=GATACCCCCCATTCTATGAAG;SOR=0.967;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=121;TCF=73;TCR=48;TR=57;WE=209782351;WS=209782333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,61:0.46:133
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chr1	209784663	rs10746421	A	C	743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=3;PP=550;SC=CACAGAGGAGACCTGCTTGCA;SOR=3.180;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=25;WE=209784671;WS=209784653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	209784927	rs2076230	G	T	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=253;ReadPosRankSum=-0.246;SC=GGGTGGGAAAGCTGTTCTGGG;SOR=0.742;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=77;TCF=22;TCR=55;TR=22;WE=209784935;WS=209784917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,24:0.29:83
chr1	209785206	rs11119315	G	A	2429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.749;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=41;PP=1285;ReadPosRankSum=1.472;SC=CAGCCCGGGCGTCCGCCCAGA;SOR=0.456;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=199;TCF=126;TCR=73;TR=101;WE=209785214;WS=209785196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,116:0.53:220
chr1	209785957	rs2272879	T	G	296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=254;SC=CAGAAGGAAGTGTAGGGGGGC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=209785965;WS=209785947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	209786078	rs2272880	G	A	2933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=46;PP=1712;ReadPosRankSum=-0.889;SC=CTGCCCCATCGACTCTTCTTC;SOR=0.822;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=58;TCR=47;TR=103;WE=209786086;WS=209786068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,113:0.98:115
chr1	209788514	rs2566	G	A	855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.058;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=7;PP=561;ReadPosRankSum=-1.398;SC=ACTTTAGGCTGCATGAAAGTC;SOR=1.368;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=78;TCF=57;TCR=21;TR=37;WE=209788522;WS=209788504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,40:0.48:83
chr1	209788703	rs1049607	T	C	1991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.075;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=54;PP=1057;ReadPosRankSum=0.155;SC=TCAGGTCCGCTGAGCGCAGCA;SOR=0.600;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=193;TCF=90;TCR=103;TR=102;WE=209788711;WS=209788693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,105:0.50:209
chr1	209792015	rs5780528	A	AC	5312.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=61;PP=2967;SC=CTGGAAGACAACACGCATTTG;SOR=1.276;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=71;TCF=6;TCR=65;TR=67;WE=209792023;WS=209792005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr1	209799253	rs2179402	A	G	1607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.819;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=30;PP=888;ReadPosRankSum=-1.226;SC=GGTAGCGATTACAGTAGCCTC;SOR=0.569;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=159;TCF=80;TCR=79;TR=67;WE=209799261;WS=209799243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,80:0.44:183
chr1	209800976	rs2072938	C	T	1209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.377;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=39;PP=860;ReadPosRankSum=-0.637;SC=AAAAACTCACCCCCAGAGGAC;SOR=1.347;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=162;TCF=66;TCR=96;TR=56;WE=209800984;WS=209800966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,63:0.32:194
chr1	209804095	rs4844863	G	A	1765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=41;PP=1125;SC=GAGGGGGACCGTCAGCCATCA;SOR=2.056;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=17;TCR=41;TR=58;WE=209804103;WS=209804085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr1	209805895	rs2072940	C	G	431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-4.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.042;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=170;ReadPosRankSum=-1.103;SC=GGTCCTGCCCCCTTCCTCTCC;SOR=0.152;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=15;WE=209805903;WS=209805885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,22:0.54:41
chr1	209807972	rs1130667	G	A	2822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FS=0.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.51;ReadPosRankSum=0.779;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,133:0.64:209
chr1	209811886	rs2076356	T	G	3460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=54;PP=2031;SC=CACCATTCTGTGACTGCCACC;SOR=0.771;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=65;TCR=54;TR=119;WE=209811894;WS=209811876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr1	209812063	rs2076357	T	C	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.208;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=135;ReadPosRankSum=0.670;SC=CGTCCTGAGATCCCAGCATAT;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=7;WE=209812071;WS=209812053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr1	209849002	rs3817870	T	C	1105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.698;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=14;PP=693;ReadPosRankSum=0.117;SC=CTGCAGGTCATTCCCGCCTCC;SOR=0.770;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=117;TCF=80;TCR=37;TR=49;WE=209849011;WS=209848992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,54:0.43:125
chr1	209849399	rs3830766	AG	A	1585.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.764;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.051;NF=1;NR=23;PP=903;ReadPosRankSum=1.478;SC=ACAGACCGAGAGAGGAATGGA;SOR=0.602;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=50;TCF=3;TCR=47;TR=24;WE=209849414;WS=209849389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,48:0.48:99
chr1	209849406	rs1473683	T	G	3431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=37;NR=44;PP=1480;SC=GAGAGAGGAATGGAGAGACAG;SOR=1.227;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=81;TCF=37;TCR=44;TR=81;WE=209849414;WS=209849389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr1	209880508	rs58182526	GA	G	73.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.19;MQRankSum=-0.481;QD=1.64;ReadPosRankSum=-2.007;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,10:0.22:45
chr1	209933379	rs76991497	G	T	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=10;PP=346;ReadPosRankSum=1.160;SC=GTGCTTGGAGGTCATCATGAT;SOR=0.598;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=58;TCF=38;TCR=20;TR=29;WE=209933387;WS=209933369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,30:0.48:62
chr1	209948711	rs17015183	A	C	2116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.559;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=29;PP=1310;ReadPosRankSum=2.038;SC=CCCCTTGGGGAATGAAAAAAG;SOR=0.918;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=176;TCF=111;TCR=65;TR=89;WE=209948719;WS=209948701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,98:0.51:194
chr1	209950681	rs649275	T	C	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.941;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=228;ReadPosRankSum=-0.327;SC=ATATTGGCCCTTCCTCCTCCT;SOR=0.931;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=62;TCF=39;TCR=23;TR=22;WE=209950689;WS=209950671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,27:0.39:70
chr1	209950760	rs669694	C	G	2092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=35;PP=1314;SC=TGAGCACCAGCAACTGCAGGC;SOR=0.887;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=36;TCR=35;TR=70;WE=209950768;WS=209950750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr1	209950848	rs41305104	G	A	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.908;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=12;PP=265;ReadPosRankSum=2.295;SC=CTTCTCCTTGGAGGCCTTGAG;SOR=0.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=57;TCF=30;TCR=27;TR=26;WE=209950856;WS=209950838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,31:0.46:68
chr1	209951400	rs41303303	C	G	2454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.644;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=30;PP=1702;ReadPosRankSum=-0.522;SC=ATCCTAAGTACTGAGTTCATT;SOR=1.275;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=182;TCF=118;TCR=64;TR=99;WE=209951408;WS=209951390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,107:0.54:200
chr1	209952865	rs623360	C	G	565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.111;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=406;ReadPosRankSum=-0.059;SC=TTTTTAAGGACTGATCATTGG;SOR=1.402;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=39;TCF=11;TCR=28;TR=24;WE=209952873;WS=209952855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,25:0.57:44
chr1	209956542	rs7550857	C	A	1812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.183;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=28;PP=1030;ReadPosRankSum=-0.375;SC=GCAGCCCCTGCAAATGTGTGA;SOR=0.791;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=152;TCF=88;TCR=64;TR=71;WE=209956550;WS=209956532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,82:0.47:173
chr1	209963803	rs2235373	G	A	1699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=24;PP=931;ReadPosRankSum=0.353;SC=CTTCCAGAGAGTGATTCCCAC;SOR=0.717;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=77;TCR=42;TR=68;WE=209963811;WS=209963793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,81:0.57:141
chr1	209965587	rs2235375	G	C	2636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=45;PP=1779;ReadPosRankSum=-1.814;SC=GCAGAAGACCGAGCAAGAAAG;SOR=0.664;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=208;TCF=125;TCR=83;TR=113;WE=209965595;WS=209965577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,124:0.54:228
chr1	209968684	rs2013162	C	A	1883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.598;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=45;PP=1068;ReadPosRankSum=1.489;SC=CATGGTGCTGCGACTGATCCA;SOR=0.776;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=150;TCF=67;TCR=83;TR=81;WE=209968692;WS=209968674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,88:0.56:158
chr1	209969902	rs7552506	G	C	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=70;ReadPosRankSum=0.267;SC=CCAGGCCTGAGAACAAGAAAC;SOR=0.502;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=6;WE=209969910;WS=209969892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr1	210001586	rs616227	A	G	2036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=50;PP=1406;SC=CTGGTCTCCCAGATAGTGCTG;SOR=2.704;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=14;TCR=50;TR=64;WE=210001594;WS=210001576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	210003388	rs599663	A	C	609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=425;ReadPosRankSum=0.689;SC=TTAACATCTCATTTGACCTTT;SOR=0.558;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=53;TCF=40;TCR=13;TR=26;WE=210003410;WS=210003378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,28:0.44:63
chr1	210003402	rs599649	T	C	2132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=18;PP=1435;SC=GACCTTTTCCTAATTTCTACA;SOR=1.704;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=45;TCR=18;TR=63;WE=210003410;WS=210003378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr1	210004199	rs585627	C	G	3287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=34;PP=1796;SC=GAGTGAACCACAACAAGTTTC;SOR=1.112;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=101;TCF=66;TCR=35;TR=100;WE=210004207;WS=210004189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr1	210004332	rs61747285	G	A	2820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.130;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=66;PP=1671;ReadPosRankSum=0.017;SC=GAAGATGGTGGTAGCGATGTC;SOR=0.531;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=272;TCF=147;TCR=125;TR=133;WE=210004340;WS=210004322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,142:0.48:298
chr1	210006437	rs655712	GC	AT	916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=0;PP=789;SC=ATCAATGAACGCTATTGTTGG;SOR=3.816;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=16;WE=210006446;WS=210006427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	210006603	rs656566	C	T	6287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=124;NR=85;PP=2965;SC=AAACATCCCCCGAAGAGTTCA;SOR=0.927;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=209;TCF=124;TCR=85;TR=209;WE=210006611;WS=210006593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr1	210008367	rs685248	C	G	1744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=5;PP=1320;SC=GGGAAGACCACAAAACCCCTC;SOR=3.651;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=44;TCR=5;TR=49;WE=210008375;WS=210008357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	210008673	rs686582	T	G	1180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=34;PP=917;SC=TGGGGCACAGTTGTAGCTAGA;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=6;TCR=34;TR=40;WE=210008681;WS=210008663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	210012102	rs1962735	A	G	967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=3;PP=768;SC=TGTTGAGCCAAGCCCTGCGCA;SOR=3.912;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=29;WE=210012110;WS=210012092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	210015568	rs10570454	GCT	G	5060.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=36;PP=2760;SC=ACATGTAAATGCTCTCAGTCA;SOR=1.238;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=24;TCR=40;TR=58;WE=210015577;WS=210015558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr1	210016709	rs1415543	A	T	676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-5.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.605;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=4;PP=449;ReadPosRankSum=0.283;SC=TTAACACGAGATTGTAATTTG;SOR=0.298;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=65;TCF=58;TCR=7;TR=29;WE=210016717;WS=210016699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,31:0.44:71
chr1	210017083	rs1073150	G	A	618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=20;PP=475;ReadPosRankSum=1.364;SC=CTGAAGGGGAGGTGCAGGACA;SOR=0.730;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=48;TCF=14;TCR=34;TR=28;WE=210017091;WS=210017073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,27:0.57:47
chr1	210111733	rs12025114	G	A	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=307;ReadPosRankSum=0.639;SC=CTGTGGTCTGGAGCCGGCTGA;SOR=1.030;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=16;WE=210111741;WS=210111723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,17:0.46:37
chr1	210406940	rs624270	T	C	610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=4;PP=444;SC=GCAGCAGAGCTGCGCTGCGGG;SOR=2.200;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=210406948;WS=210406930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	210407031	rs624706	G	T	3054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=41;PP=2006;SC=TCCGCCTCTCGCTTCCCTTCC;SOR=1.159;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=63;TCR=41;TR=104;WE=210407039;WS=210407021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr1	210407329	.	GTT	G	246.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;QD=35.25;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	210407339	.	T	TAA	54.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.464;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.08;ReadPosRankSum=1.200;SOR=0.027;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr1	210414871	.	G	GT	67	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;FR=1.0000;HP=10;HapScore=2;MGOF=22;MMLQ=23;MQ=57.9;NF=3;NR=0;PP=67;QD=30.0;SC=TTTTCTGTTTGTTTTTTTCTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=210414879;WS=210414861;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	210502580	rs10863819	A	G	856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.518;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=28;PP=636;ReadPosRankSum=1.082;SC=TGCGCGCCCGAGGGCGGGACA;SOR=1.777;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=65;TCF=19;TCR=46;TR=35;WE=210502588;WS=210502570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,36:0.52:69
chr1	210536078	rs2294848	C	G	3352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=38;PP=2249;SC=CGTGCCTGCACCTTAGTCCAC;SOR=1.368;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=112;TCF=73;TCR=39;TR=111;WE=210536086;WS=210536068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr1	210536178	.	CT	C	108.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.157;ClippingRankSum=0.000;DP=211;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.05;MQRankSum=2.522;QD=0.58;ReadPosRankSum=1.002;SOR=0.676;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:157,31:0.16:188
chr1	210536278	rs11119469	C	A	1294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.388;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=33;PP=773;ReadPosRankSum=0.854;SC=AAAGTGGATGCATAATAAATC;SOR=0.488;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=107;TCF=45;TCR=62;TR=58;WE=210536286;WS=210536268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,62:0.52:120
chr1	210577831	rs34772809	C	T	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=170;ReadPosRankSum=-2.012;SC=AGACAGAAAACGAGTACTACC;SOR=0.610;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=10;WE=210577839;WS=210577821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr1	210577873	rs2066721	G	C	1835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=10;PP=1142;SC=TTCGCTGCCTGTACTACACCA;SOR=2.540;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=36;TCR=10;TR=46;WE=210577892;WS=210577863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	210577884	rs2294851	G	A	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=291;ReadPosRankSum=-0.663;SC=TACTACACCAGCTTCAGCCTG;SOR=0.599;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=56;TCF=41;TCR=15;TR=23;WE=210577892;WS=210577863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,27:0.43:63
chr1	210577901	rs34228541	T	C	904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.909;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=10;PP=503;ReadPosRankSum=1.005;SC=CCTGGAGCTCTGCTGGCAGCA;SOR=0.835;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=64;TCF=44;TCR=20;TR=36;WE=210577909;WS=210577891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,42:0.56:75
chr1	210591742	rs3215542	TG	T	1297.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=34;PP=1059;SC=GGAGCTGGAGTGGGGGGTGAG;SOR=5.235;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=34;WE=210591750;WS=210591732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	210686570	rs4545340	A	G	2354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=40;PP=1459;SC=ACATTGAATAACATGTCTATT;SOR=0.917;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=36;TCR=40;TR=76;WE=210686578;WS=210686560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr1	210686614	rs12142231	A	G	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.676;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=20;PP=490;ReadPosRankSum=-1.162;SC=TTTGTTAAGTATCTTGATAAA;SOR=1.473;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=44;TCF=10;TCR=34;TR=24;WE=210686622;WS=210686604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,26:0.54:48
chr1	210761462	rs4297293	G	C	1053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=23;PP=659;SC=GATCCTTGCTGCTGTGTTAGG;SOR=2.012;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=10;TCR=23;TR=33;WE=210761470;WS=210761452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	210847514	rs1934615	A	T	315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=1;PP=202;SC=CAGACTTTCCAGGAGGCCTTT;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=210847522;WS=210847504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	210856585	rs3135473	G	T	1303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=32;NR=14;PP=722;SC=GGCAGGGTTGGAGGTATCTGT;SOR=1.473;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=32;TCR=14;TR=46;WE=210856593;WS=210856575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	210856982	.	C	T	3491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=0.000;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.537;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=77;PP=2056;ReadPosRankSum=-0.274;SC=AGTGTGGCCTCGCCTGACGCT;SOR=0.621;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=305;TCF=158;TCR=147;TR=149;WE=210856990;WS=210856972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,168:0.49:341
chr1	210857457	rs1135317	A	G	2236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=29;NR=48;PP=1434;SC=CACGTTTCACATCGCTGATCT;SOR=1.367;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=29;TCR=48;TR=77;WE=210857465;WS=210857447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr1	211263836	rs17188860	T	A	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.957;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=30;ReadPosRankSum=-1.188;SC=CCTTAAATGCTCTGTAACAAG;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=4;WE=211263844;WS=211263826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr1	211264140	rs79802694	A	G	1469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=32;PP=939;SC=CATTTTTTAAATGGTCTTATT;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=11;TCR=32;TR=43;WE=211264148;WS=211264130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	211280737	rs56223346	A	AC	1063.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=6.606;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=30.39;ReadPosRankSum=1.351;SOR=4.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,33:0.94:35
chr1	211447625	rs11580084	G	A	3409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=50;PP=1869;SC=AAACACTTCAGTAGTAAGGCT;SOR=0.757;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=61;TCR=50;TR=111;WE=211447633;WS=211447615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr1	211452529	.	TA	T	59	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;FR=0.5029;HP=15;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=16;MQ=59.48;NF=6;NR=0;PP=59;QD=10.3333333333;SC=AACGCTGTCTTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=6;WE=211452537;WS=211452519;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr1	211452678	rs3767377	G	A	2297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=40;PP=1233;SC=ATCACTAGAAGTACTTGTGAT;SOR=1.065;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=34;TCR=40;TR=74;WE=211452686;WS=211452668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr1	211452728	rs3767378	G	A	1146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=29;PP=762;SC=ACAGTACTTCGTATTAAGAAA;SOR=2.613;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=8;TCR=29;TR=37;WE=211452736;WS=211452718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	211527609	rs7530570	C	A	775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=4;PP=582;SC=TACAGGAGGCCCCTTCTGGGT;SOR=3.098;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=25;WE=211527617;WS=211527599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	211840278	rs1542140	T	C	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.876;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=23;ReadPosRankSum=-0.238;SC=AAATAAATCATTGCTATAACA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=3;WE=211840286;WS=211840268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr1	211846876	rs701929	A	G	2833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=63;PP=1752;ReadPosRankSum=0.158;SC=AACTCGTGTCATGGTTTAATA;SOR=0.712;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=265;TCF=147;TCR=118;TR=140;WE=211846884;WS=211846866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,145:0.52:280
chr1	211847646	rs45623136	G	C	2326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.996;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=40;PP=1322;ReadPosRankSum=-0.134;SC=ACCTTTCCTTGGTTCCCTTTG;SOR=0.611;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=231;TCF=144;TCR=87;TR=104;WE=211847654;WS=211847636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,112:0.45:251
chr1	212142054	rs11322485	GA	G	99.27	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.456;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=7.404;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.02;ReadPosRankSum=2.362;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,9:0.82:11
chr1	212209367	rs3215984	T	TC	914.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=24;PP=959;SC=CAGGGCCGACTCCAATTCTGA;SOR=5.211;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=24;WE=212209375;WS=212209357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	212217971	rs35704923	C	CTT	1890.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=8;PP=1639;SC=TTGTGTTACTCTATATATTTT;SOR=2.093;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=34;TCF=24;TCR=10;TR=32;WE=212217979;WS=212217961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	212220847	rs2970592	G	A	991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=29;PP=796;SC=CCTTTCCCCTGTCAAAGTTAC;SOR=5.549;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=30;WE=212220855;WS=212220837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	212236157	rs4951436	G	T	2091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=15;PP=1404;SC=TCTACAAAATGTAAACTGAAA;SOR=2.336;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=49;TCR=15;TR=64;WE=212236165;WS=212236147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr1	212241714	rs201294353	TA	T	417.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.36;MQRankSum=0.521;QD=16.07;ReadPosRankSum=-2.070;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,24:0.92:26
chr1	212250820	rs17656453	T	C	138.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=108;SC=AACTGAAATATAGTTTTAGAG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=212250828;WS=212250810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	212251103	rs6658972	A	G	1244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=31;PP=871;SC=ATCTGAAGATATATATGCTGT;SOR=2.200;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=11;TCR=31;TR=42;WE=212251111;WS=212251093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	212251367	rs5780675	GT	G	1243.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.286;NF=26;NR=10;PP=647;ReadPosRankSum=-0.381;SC=GAAATCTGTTGTTTTTTTTTT;SOR=1.460;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=39;TCF=27;TCR=12;TR=36;WE=212251375;WS=212251357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,49:0.98:50
chr1	212273639	rs3135474	C	T	5525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=100;PP=2965;SC=GCCCCCAGGGCAAAGTGCAAT;SOR=0.837;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=191;TCF=91;TCR=100;TR=191;WE=212273647;WS=212273629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr1	212274413	rs6540718	A	C	2034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=42;PP=1341;SC=AGCGGAAAGAAATTGCCAAGC;SOR=1.483;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=68;TCF=25;TCR=43;TR=67;WE=212274421;WS=212274403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	212475634	rs12743785	C	T	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=23;ReadPosRankSum=-0.442;SC=CTGTGGCCATCTTAATAAGCT;SOR=0.297;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=5;WE=212475642;WS=212475624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,5:0.21:24
chr1	212502630	.	G	T	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.583;ClippingRankSum=0.000;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=2.819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.75;ReadPosRankSum=0.189;SOR=0.410;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,28:0.20:139
chr1	212502642	.	T	A	685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.343;ClippingRankSum=0.000;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=4.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.96;ReadPosRankSum=-1.887;SOR=0.362;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,24:0.21:115
chr1	212502646	.	A	G	697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.659;ClippingRankSum=0.000;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=3.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.52;ReadPosRankSum=-2.720;SOR=0.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,23:0.21:107
chr1	212515613	rs1774249	C	T	1351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.049;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=38;PP=901;ReadPosRankSum=0.100;SC=ATCAGAAATTCGTACAACAGG;SOR=0.895;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=146;TCF=68;TCR=78;TR=66;WE=212515621;WS=212515603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,67:0.44:153
chr1	212521639	rs701908	T	G	5125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=97;NR=65;PP=2965;SC=GATTGAAGCATAGCACTGTTC;SOR=1.071;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=162;TCF=97;TCR=65;TR=162;WE=212521647;WS=212521629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr1	212526288	rs792442	C	T	7553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=117;NR=138;PP=2965;SC=TGGGAAAATACCATTCCATTG;SOR=0.949;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=255;TCF=117;TCR=138;TR=255;WE=212526296;WS=212526278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,278:1.00:278
chr1	212530192	rs792439	T	C	991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=23;PP=800;SC=ATTTTTTTGCTTATTGTATAC;SOR=2.694;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=29;WE=212530200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	212551139	rs71573837	G	GCA	366.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.042;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.618;NF=0;NR=11;PP=405;ReadPosRankSum=-0.501;SC=TTCTTTGCTGGCACAACCAGG;SOR=1.868;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=11;WE=212551147;WS=212551129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,13:0.29:45
chr1	212553111	rs701905	G	C	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=116;ReadPosRankSum=1.573;SC=TCCTGGGCCAGTGGGTCATCT;SOR=0.512;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=8;WE=212553119;WS=212553101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr1	212560327	rs792449	A	G	8115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=122;NR=140;PP=2965;SC=GGTAGACCAGAAAGACGGCCA;SOR=0.883;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=263;TCF=122;TCR=141;TR=262;WE=212560335;WS=212560317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,296:1.00:296
chr1	212588206	rs518793	C	G	699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=4.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.491;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=21;PP=478;ReadPosRankSum=-0.397;SC=GAGGCGAAACCGGTCCGGAGG;SOR=1.127;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=51;TCF=7;TCR=44;TR=23;WE=212588214;WS=212588196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,28:0.47:59
chr1	212615875	rs521469	T	C	1282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.150;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=21;PP=745;ReadPosRankSum=-1.282;SC=GGCTCTTCCCTTCCTCTTCAC;SOR=0.955;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=119;TCF=69;TCR=50;TR=57;WE=212615883;WS=212615865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,62:0.47:131
chr1	212616080	rs150643811	C	CATTTT	186.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=200;SC=CTTTTCATTCCATTTTATTTT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=4;WE=212616088;WS=212616070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	212617829	rs2275712	C	G	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=1.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.17;ReadPosRankSum=-0.082;SOR=0.414;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
chr1	212619339	rs4804	T	C	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=21;PP=326;ReadPosRankSum=-0.244;SC=ACATCAAGGATGAGTTCTGAT;SOR=0.675;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=90;TCF=31;TCR=59;TR=32;WE=212619347;WS=212619329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,33:0.35:93
chr1	212788206	rs11119988	G	A	151.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=124;ReadPosRankSum=0.514;SC=TTAAGATGAGGATGGCATGAA;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=5;WE=212788214;WS=212788203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr1	212791288	rs3839030	CGT	C	341.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.98;QD=31.07;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	212798977	rs3122712	A	G	2318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=44;PP=1239;ReadPosRankSum=2.387;SC=AAACCCACTAATGTGCTCAAT;SOR=0.682;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=230;TCF=118;TCR=112;TR=96;WE=212798985;WS=212798967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,112:0.43:258
chr1	212799870	rs3122713	A	G	6785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=119;NR=98;PP=2965;SC=CAGAGATGTGAACGTCATGGC;SOR=0.842;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=217;TCF=119;TCR=98;TR=217;WE=212799878;WS=212799860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr1	212799949	rs3795842	C	T	3378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=68;PP=2007;ReadPosRankSum=-0.374;SC=GGGCTGGAGACGGTTGGTTCT;SOR=0.669;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=295;TCF=158;TCR=137;TR=146;WE=212799957;WS=212799939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,165:0.50:330
chr1	212900487	rs2244935	A	G	2315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=26;PP=1540;SC=TTCTCTCCTAAACTGCCCCTA;SOR=1.473;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=51;TCR=26;TR=77;WE=212900495;WS=212900477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr1	212960866	rs3738800	C	T	2607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=27;PP=1498;SC=CAAAAATAACCCAGAAATTAA;SOR=1.190;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=54;TCR=27;TR=81;WE=212960874;WS=212960856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr1	212970375	rs1284800	A	G	1615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=12;PP=1115;SC=ACCATGCCCGACCTCTACTTA;SOR=2.147;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=41;TCR=12;TR=53;WE=212970383;WS=212970365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	213003428	rs12038225	T	G	283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=2;PP=208;SC=TAGAATGGAATGAATAAAGAT;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=213003436;WS=213003418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
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chr1	213031709	rs2201603	C	T	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.903;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.48;ReadPosRankSum=2.128;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr1	213031948	rs11120047	G	C	1402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.545;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=27;PP=792;ReadPosRankSum=-0.933;SC=GGTGAATGGGGCCCCCCGGGA;SOR=0.534;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=100;TCF=52;TCR=48;TR=60;WE=213031956;WS=213031938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,68:0.61:112
chr1	213032568	rs12023052	T	A	1583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.195;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=39;PP=959;ReadPosRankSum=-0.241;SC=GTCAGATCCTTAAAAGACCGG;SOR=0.818;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=158;TCF=78;TCR=80;TR=74;WE=213032576;WS=213032558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,79:0.46:172
chr1	213046236	rs1890932	G	A	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=211;ReadPosRankSum=-1.635;SC=ATTTAACCTAGTGGTTTGAAC;SOR=0.430;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=12;WE=213046244;WS=213046226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr1	213056819	rs2644547	A	G	3531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=62;NR=55;PP=2060;SC=GCCTGGCCAAAAATTTTTCTT;SOR=0.708;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=62;TCR=55;TR=117;WE=213056827;WS=213056809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr1	213056892	rs12125982	A	G	948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.889;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=24;PP=516;ReadPosRankSum=2.699;SC=TTGCTATCAAATATTTACATT;SOR=0.859;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=68;TCF=28;TCR=40;TR=40;WE=213056900;WS=213056882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,46:0.59:78
chr1	213058852	rs7536716	T	A	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=187;ReadPosRankSum=-0.365;SC=AAGATACGGATTCTAAACACT;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=10;WE=213058860;WS=213058842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr1	213061362	rs2291772	T	A	864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.532;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=18;PP=500;ReadPosRankSum=-0.190;SC=CAGATGTGTTTAGGAGGAATG;SOR=0.529;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=102;TCF=51;TCR=51;TR=38;WE=213061370;WS=213061352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,45:0.39:115
chr1	213061460	rs2291771	T	C	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.066;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=201;ReadPosRankSum=0.270;SC=TTTTAAACTTTAAAGGATTCA;SOR=0.307;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=13;WE=213061468;WS=213061450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr1	213062017	rs112024320	T	TTTG	869.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.9830;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.463;NF=0;NR=15;PP=656;ReadPosRankSum=1.208;SC=CATGGTTTTATTTGTTGTTGT;SOR=4.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=15;WE=213062025;WS=213062007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,22:0.96:23
chr1	213068192	rs2792558	T	C	1155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=7;PP=851;SC=TATTATTTTTTAGGCTGTTGG;SOR=2.554;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=35;WE=213068200;WS=213068182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	213068233	rs12408694	C	T	2210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=30;PP=1350;SC=CACTACAGTGCATTAAATTTG;SOR=1.248;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=49;TCR=30;TR=79;WE=213068241;WS=213068223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr1	213068404	rs17019870	T	C	843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.903;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=23;PP=614;ReadPosRankSum=0.385;SC=CTGTAAGTAATATTTTTATGA;SOR=0.883;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=72;TCF=28;TCR=44;TR=36;WE=213068412;WS=213068394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,37:0.49:75
chr1	213068436	rs17019873	A	G	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.192;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.119;NF=8;NR=11;PP=354;ReadPosRankSum=-0.324;SC=AGAAGTATGTATAGAATAAAT;SOR=1.022;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=42;TCF=19;TCR=23;TR=19;WE=213068444;WS=213068426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,20:0.47:43
chr1	213068542	rs146462077	C	CTGAT	2103.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.613;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.152;NF=16;NR=9;PP=1131;ReadPosRankSum=-1.289;SC=TTTTAATCTTCTGATTGTTTT;SOR=1.145;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=79;TCF=42;TCR=37;TR=25;WE=213068550;WS=213068532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,55:0.44:126
chr1	213068595	rs3207090	C	T	2893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.434;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-1.011;NF=68;NR=56;PP=1658;ReadPosRankSum=0.976;SC=GAACCAAAAACGGTTATGTTG;SOR=0.647;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=236;TCF=130;TCR=106;TR=124;WE=213068603;WS=213068585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,143:0.51:281
chr1	213124871	rs3123305	G	A	284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.73;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	213139748	rs3738805	T	G	2261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=47;PP=1381;SC=CAATGGGGCTTGTTGTGCCTT;SOR=1.923;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=69;TCF=22;TCR=47;TR=68;WE=213139756;WS=213139738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr1	213140362	rs10779597	G	A	1233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=7;PP=712;SC=GTTGAGATTAGAGGCAGGAGC;SOR=2.147;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=34;WE=213140370;WS=213140352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	213140398	rs10779598	A	C	2822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=58;NR=38;PP=1611;SC=GCCAGGGAAAATTCTAAGAGT;SOR=1.028;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=96;TCF=58;TCR=38;TR=96;WE=213140406;WS=213140388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr1	213146944	rs7511930	A	G	1016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=28;PP=767;SC=CTGGTTTCTGAGGCAATAGAG;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=31;WE=213146952;WS=213146934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	213173457	rs3738806	C	T	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=76;ReadPosRankSum=-0.083;SC=GAAACTGAACCTCAGAGATGT;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=5;WE=213173465;WS=213173447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr1	213178340	rs11120076	G	A	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.019;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=175;ReadPosRankSum=-0.597;SC=GAGCAACTATGTCCACTCCCT;SOR=1.480;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=12;WE=213178348;WS=213178330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,14:0.39:36
chr1	213224719	rs4951476	T	C	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=2.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.43;ReadPosRankSum=-1.309;SOR=1.209;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,30:0.50:60
chr1	213341122	rs78772049	G	A	875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-1.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=9;PP=492;ReadPosRankSum=0.295;SC=AACAAGCAGTGTATTGGGTAG;SOR=0.760;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=81;TCF=59;TCR=22;TR=34;WE=213341130;WS=213341112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,40:0.47:86
chr1	213405414	rs11271079	GGCAACTGAGGAT	G	1436.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.085;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.678;NF=8;NR=10;PP=2934;ReadPosRankSum=0.726;SC=AGGCTCCAAAGGCAACTGAGG;SOR=1.008;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=43;TCF=21;TCR=22;TR=18;WE=213405433;WS=213405404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,38:0.53:72
chr1	214491536	rs55760458	G	C	2804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=54;PP=1483;SC=ATTTCACATGGGTTGGGCAGG;SOR=1.322;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=35;TCR=54;TR=89;WE=214491544;WS=214491526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr1	214492286	rs1134647	G	A	6606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=109;NR=106;PP=2965;SC=AAGCATCTCGGATTCCCTGAC;SOR=0.823;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=215;TCF=109;TCR=106;TR=215;WE=214492303;WS=214492276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr1	214497861	rs6695148	G	T	843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=5;PP=633;SC=AAAAGAAAGGGTTTAAAACCA;SOR=2.910;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=28;WE=214497869;WS=214497851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	214500907	rs17022608	A	C	4007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=93;NR=39;PP=2686;SC=GTAGTGAAGGAAGCTAAACAG;SOR=1.643;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=93;TCR=39;TR=132;WE=214500915;WS=214500897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr1	214504604	rs2270704	T	C	2435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=54;PP=1733;SC=GTTGTATGATTTTATTTCCCC;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=21;TCR=54;TR=75;WE=214504612;WS=214504594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr1	214542668	rs3002311	T	C	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=81;ReadPosRankSum=0.593;SC=AAGGAATATATATTTCAATAT;SOR=0.693;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=7;WE=214542676;WS=214542658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr1	214542819	rs1135352	T	C	3643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=75;PP=2482;ReadPosRankSum=-0.583;SC=CTTGGACATCTTCTGGACAGC;SOR=0.714;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=297;TCF=164;TCR=133;TR=164;WE=214542827;WS=214542809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,173:0.54:323
chr1	214551276	rs3013451	G	A	848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.088;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=4;PP=626;ReadPosRankSum=0.329;SC=CAGAGAATGAGTCACATTGAC;SOR=2.206;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=59;TCF=46;TCR=13;TR=32;WE=214551284;WS=214551266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,35:0.55:64
chr1	214558228	rs3013446	A	G	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.148;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=50;ReadPosRankSum=1.000;SC=ATTTAAACAAATCATAAAAAG;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=4;WE=214558236;WS=214558218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr1	214564340	rs7550799	T	C	1771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.542;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=43;PP=1168;ReadPosRankSum=2.350;SC=CCAGAGAGGATCGGCTCCAGG;SOR=0.780;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=167;TCF=74;TCR=93;TR=76;WE=214564348;WS=214564330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,84:0.44:192
chr1	214566845	rs7355212	A	G	725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=2;PP=549;SC=TTCTCTCTCTAGGCATATGCA;SOR=3.352;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=214566853;WS=214566835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	214566952	rs4655342	A	G	1124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=16;PP=700;ReadPosRankSum=-0.290;SC=AAGAGTGAATAGGAAAAGAGA;SOR=0.850;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=99;TCF=65;TCR=34;TR=49;WE=214566960;WS=214566942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,54:0.48:113
chr1	214567013	rs11322819	CG	C	1697.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.107;NF=8;NR=32;PP=853;ReadPosRankSum=1.605;SC=GCCATCAAGTCGGGGGGGATT;SOR=0.698;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=98;TCF=19;TCR=79;TR=40;WE=214567021;WS=214567003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,71:0.46:156
chr1	214576454	rs72757974	C	A	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=140;ReadPosRankSum=-0.397;SC=ATTTTTAGAACTGAGTTATGA;SOR=0.883;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=11;WE=214576462;WS=214576444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr1	214625431	rs7355177	A	G	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.699;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.881;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=77;ReadPosRankSum=-1.807;SC=CAGCCCATATATAAGATCCAG;SOR=0.197;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=7;WE=214625439;WS=214625421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr1	214638172	rs10864100	C	T	1667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=40;PP=933;ReadPosRankSum=-1.643;SC=GGACGCCGCCCGCCTATCCTG;SOR=0.737;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=114;TCF=46;TCR=68;TR=66;WE=214638180;WS=214638162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,77:0.57:136
chr1	214825289	rs71679696	CT	C	282.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=2.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.18;MQRankSum=2.284;QD=3.77;ReadPosRankSum=2.503;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,22:0.29:75
chr1	214826196	rs335524	G	A	1853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=40;NR=24;PP=1048;SC=CAGACATACCGAGAGAAATTG;SOR=0.934;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=40;TCR=24;TR=64;WE=214826204;WS=214826186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	214826364	rs335523	G	A	1559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=32;PP=998;SC=TCATGATTTCGAATGGTTTAT;SOR=1.140;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=22;TCR=32;TR=54;WE=214826372;WS=214826354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	214826810	rs11303309	CT	C	1263.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=2.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.17;MQRankSum=0.762;QD=13.89;ReadPosRankSum=-0.720;SOR=0.338;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,76:0.84:91
chr1	214828812	rs435043	A	G	3838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=81;PP=2395;SC=AACATATGGTATGCGTGCATA;SOR=1.559;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=46;TCR=81;TR=127;WE=214828820;WS=214828802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr1	214830617	rs438034	A	G	9247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=161;NR=140;PP=2965;SC=GGAGAATGGTAGAGGACCAAC;SOR=0.786;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=302;TCF=161;TCR=141;TR=301;WE=214830625;WS=214830607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,335:1.00:335
chr1	214837110	rs7289	C	G	2365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=51;PP=1506;SC=TGGAGTCCAACGGCAGTGAGA;SOR=2.162;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=71;TCF=20;TCR=51;TR=71;WE=214837118;WS=214837100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr1	215256544	.	C	CT	376.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=12;NR=1;PP=417;SC=CGCTCCCCCCCCCGCCCCCTC;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=13;WE=215256552;WS=215256534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	215345263	rs3834061	GTCTCTC	G	801.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.60;QD=40.09;SOR=6.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	215368514	rs1556907	A	G	847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=24;PP=646;SC=TTATGTTTACATTTAAAATAT;SOR=3.767;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=27;WE=215368522;WS=215368504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	215741053	rs2275768	T	G	1956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=39;NR=31;PP=1099;SC=CTGCGGCAGCTTCCCCGCGGC;SOR=0.832;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=39;TCR=31;TR=70;WE=215741061;WS=215741043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr1	215753355	rs11803705	T	G	3959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=81;PP=2609;SC=AGTGTATAATTAATAATGCTT;SOR=1.493;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=46;TCR=82;TR=127;WE=215753363;WS=215753345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr1	215781574	rs3767255	A	G	1010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=28;PP=753;SC=GAAGAAGCATATCAACTAATA;SOR=2.964;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=33;WE=215781582;WS=215781564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
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chr1	215848641	rs2797235	T	C	9936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=371;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=167;NR=170;PP=2965;SC=CGGCCTGGATTGTCTGATTTC;SOR=0.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=337;TCF=167;TCR=170;TR=337;WE=215848649;WS=215848631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,371:1.00:371
chr1	215853748	rs5780842	GT	G	897.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=30;PP=415;ReadPosRankSum=0.060;SC=TTAAGTTGTTGTTTTTTTTTT;SOR=0.954;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=47;TCF=2;TCR=45;TR=31;WE=215853756;WS=215853737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,41:0.91:45
chr1	215914826	rs35309576	T	C	1487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.910;NF=30;NR=32;PP=803;ReadPosRankSum=-1.169;SC=TTAAGATCCATTGGGGCTGCT;SOR=0.664;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=141;TCF=68;TCR=73;TR=62;WE=215914834;WS=215914816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,74:0.46:161
chr1	215916563	rs11120616	G	A	3011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.429;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=66;PP=1787;ReadPosRankSum=-0.419;SC=TGTGAATGGAGTCAAATTTTC;SOR=0.561;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=290;TCF=162;TCR=128;TR=143;WE=215916571;WS=215916553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,152:0.48:314
chr1	215916728	.	ATG	A	102.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.77;QD=17.16;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr1	215916732	rs4053764	G	A	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.77;MQRankSum=0.674;QD=9.96;ReadPosRankSum=1.440;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr1	215916734	rs372668836	G	A	145.98	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.77;QD=36.49;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	216073289	rs56074952	G	T	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-4.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.695;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=317;ReadPosRankSum=-1.469;SC=TCTTGCCCTAGAAAAGGTTAT;SOR=0.156;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=20;WE=216073297;WS=216073279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,25:0.66:38
chr1	216172380	rs10864219	A	G	385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=191;ReadPosRankSum=-2.218;SC=AATCCCACTTATTTTTCTTGG;SOR=0.743;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=41;TCF=16;TCR=25;TR=15;WE=216172388;WS=216172370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,20:0.40:50
chr1	216219781	rs6657250	A	G	4033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=48;PP=2166;SC=ACCTGTGACTATGTAGTTCTC;SOR=1.052;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=79;TCR=48;TR=126;WE=216219789;WS=216219771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr1	216246675	rs35944387	AG	A	1328.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=23;PP=880;SC=TATCGCATAAAGGGCTTGAGT;SOR=1.730;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=23;WE=216246683;WS=216246665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	216348764	rs1805049	C	T	3473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=65;PP=2174;SC=TGGAAACCACCTAAGATGGAT;SOR=1.099;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=115;TCF=50;TCR=65;TR=115;WE=216348772;WS=216348754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr1	216370130	rs386851	T	G	690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=18;PP=528;SC=TTTTTAAATTTAATTCACACA;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=216370138;WS=216370120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	216390694	rs1324330	C	T	2919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=32;PP=1716;SC=TATGATGCTGCTTCACACACC;SOR=1.402;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=67;TCR=32;TR=99;WE=216390702;WS=216390684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr1	216424303	rs45555435	A	G	2767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.385;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=59;PP=1650;ReadPosRankSum=0.718;SC=TAATATCTCCATCCACTGTCC;SOR=0.602;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=269;TCF=134;TCR=135;TR=122;WE=216424311;WS=216424293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,139:0.47:296
chr1	216592003	rs4253963	T	C	2945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.432;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=63;PP=1578;ReadPosRankSum=0.011;SC=GCCCATCTACTGTCTTTTCTA;SOR=0.593;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=250;TCF=133;TCR=117;TR=130;WE=216592011;WS=216591993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,143:0.51:279
chr1	216595306	rs10779261	C	T	2510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=342;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.308;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=60;PP=1507;ReadPosRankSum=2.388;SC=ATAAAACTTGCAGAATTGCTA;SOR=0.645;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=314;TCF=156;TCR=158;TR=123;WE=216595314;WS=216595296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:209,133:0.39:342
chr1	216737861	rs11117622	G	T	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=178;ReadPosRankSum=1.167;SC=GGCTCAATAGGTATATATTAA;SOR=0.804;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=10;WE=216737869;WS=216737851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr1	216824505	rs10863261	C	G	788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=20;PP=463;ReadPosRankSum=-0.506;SC=AAGGCAATGTCAACTCTATTA;SOR=0.735;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=17;TCR=35;TR=30;WE=216824513;WS=216824495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,35:0.58:60
chr1	216880662	rs11572672	G	A	2136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-0.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.341;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=40;PP=1359;ReadPosRankSum=-0.238;SC=TGGCAACTTTGGTGATCAAGT;SOR=0.914;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=255;TCF=153;TCR=102;TR=105;WE=216880670;WS=216880652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,115:0.40:285
chr1	217671771	rs724803	C	G	1570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.578;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=33;PP=1039;ReadPosRankSum=0.374;SC=TTAGAGGGAACCTAACTAAAA;SOR=0.727;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=151;TCF=78;TCR=73;TR=69;WE=217671779;WS=217671761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,74:0.45:163
chr1	217793938	rs111668135	T	TTAA	166.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=119;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TCGACAAAAATTAATGATTAC;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=217793946;WS=217793928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr1	217804325	rs944730	G	A	5048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=474;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.088;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=111;NR=113;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.049;SC=AACGACACCCGGGAGCCTGGC;SOR=0.636;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=440;TCF=223;TCR=217;TR=224;WE=217804333;WS=217804315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:232,241:0.51:473
chr1	217822135	rs12140261	G	A	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=161;ReadPosRankSum=-0.431;SC=TATCATCTTGGAAGAAATTAA;SOR=0.693;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=10;WE=217822143;WS=217822125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr1	217856626	rs12068167	G	A	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.010;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=9;PP=448;ReadPosRankSum=0.697;SC=GAGGCTATAGGGTTCGGAAGT;SOR=0.923;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=49;TCF=34;TCR=15;TR=27;WE=217856634;WS=217856616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,29:0.49:59
chr1	217856803	rs12073566	T	C	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=69;ReadPosRankSum=-0.830;SC=TTGTTTTAGATGGAGTCTTGC;SOR=0.527;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=8;WE=217856811;WS=217856793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
chr1	217915324	rs34347452	C	T	3111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.414;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=55;PP=1853;ReadPosRankSum=-1.852;SC=CAGGAAGGCACTGGAGGAGTT;SOR=0.598;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=271;TCF=165;TCR=106;TR=134;WE=217915332;WS=217915314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,151:0.51:296
chr1	217947738	rs6604561	G	A	6717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=132;NR=96;PP=2965;SC=TGCAATTACAGAAGGCAAAGC;SOR=0.904;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=230;TCF=134;TCR=96;TR=228;WE=217947746;WS=217947728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr1	217975289	rs55773207	C	T	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=50;ReadPosRankSum=0.852;SC=ACAATTAAGACCTTTATGGTA;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=4;WE=217975297;WS=217975279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr1	218475533	rs2251169	C	T	759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.885;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=4;PP=535;ReadPosRankSum=-0.781;SC=ACCCCCCTTGCAAAAATGGGG;SOR=2.058;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=47;TCF=38;TCR=9;TR=29;WE=218475541;WS=218475523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,31:0.61:51
chr1	218519928	rs113711540	A	AAAAC	67.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=0;PP=51;ReadPosRankSum=-1.440;SC=TTTCGCATCAAAAACAACAAC;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=2;WE=218519936;WS=218519918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr1	219366400	rs35359058	T	TG	854.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=3;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=13;PP=431;ReadPosRankSum=-0.860;SC=TCTTTTTTTTTGGGGGGGGGC;SOR=0.472;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=40;TCF=19;TCR=21;TR=24;WE=219366409;WS=219366390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:6,37:0.86:43
chr1	219383848	rs5781096	A	ACTTTTT	1716.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=9;PP=1226;SC=TATGTATTCTACTTTTAAGTA;SOR=1.802;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=24;TCF=15;TCR=9;TR=20;WE=219383856;WS=219383838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	219383867	rs940571	T	C	1448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=14;PP=887;SC=TATGTTTTTGTTTTTAGGAGG;SOR=1.567;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=33;TCR=14;TR=47;WE=219383875;WS=219383857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	219383905	rs940570	A	G	1924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=38;NR=27;PP=1058;SC=GCATGGCAATACATTTAGCAT;SOR=0.804;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=38;TCR=27;TR=65;WE=219383913;WS=219383895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr1	219706428	rs10746385	T	C	9486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=360;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=173;NR=152;PP=2965;SC=TGGGTTTTTATGCATAGAAGG;SOR=0.804;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=325;TCF=173;TCR=152;TR=325;WE=219706436;WS=219706418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,359:1.00:359
chr1	219783279	rs79789352	T	A	4286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.34;QD=26.96;SOR=1.595;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr1	220089352	rs2231734	A	C	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=62;ReadPosRankSum=0.647;SC=ATGGAACTACAGGAGGGATAT;SOR=0.716;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=8;WE=220089360;WS=220089342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,9:0.26:34
chr1	220142023	rs1061248	C	T	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.633;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=132;ReadPosRankSum=0.351;SC=AATAATTGTCCTGTGTGACTT;SOR=0.693;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=8;WE=220142031;WS=220142013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr1	220142070	rs1061242	C	T	624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.072;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=10;PP=392;ReadPosRankSum=-0.650;SC=AATCATAAAACGGTCTGTATC;SOR=0.527;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=35;TCR=18;TR=29;WE=220142078;WS=220142060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,30:0.55:55
chr1	220145371	rs2795315	T	G	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=179;ReadPosRankSum=-0.615;SC=ACAATTTACTTAAATATTCTT;SOR=0.752;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=10;WE=220145379;WS=220145361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,10:0.29:34
chr1	220145584	rs1982986	C	T	342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=11;PP=183;ReadPosRankSum=0.164;SC=AAAAGACAACCTGGGAGTGAG;SOR=0.650;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=53;TCF=23;TCR=30;TR=19;WE=220145592;WS=220145574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,21:0.34:61
chr1	220145655	rs1982984	C	T	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.796;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=4;PP=36;ReadPosRankSum=-0.241;SC=ATCAGAGTTACCTTATCATTG;SOR=0.330;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=24;TCF=9;TCR=15;TR=7;WE=220145663;WS=220145645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,7:0.27:26
chr1	220151808	rs3215088	C	CAA	181.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=220;ReadPosRankSum=0.731;SC=TGAGAAACCTCGTTTTATAAA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=7;WE=220151816;WS=220151798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,6:0.22:27
chr1	220153332	rs34917248	T	TAA	1223.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=7;PP=658;ReadPosRankSum=0.613;SC=ACTTATTTTTTAAGAGTCTAC;SOR=0.680;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=60;TCF=34;TCR=26;TR=19;WE=220153340;WS=220153322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,35:0.39:89
chr1	220154246	rs35193743	AT	A	322.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.67;MQRankSum=1.352;QD=9.49;ReadPosRankSum=0.139;SOR=0.458;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr1	220156090	rs2647462	T	C	2992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.315;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=56;PP=1861;ReadPosRankSum=0.757;SC=GAGCATTCTCTTGCACTCCAA;SOR=0.904;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=243;TCF=134;TCR=109;TR=129;WE=220156098;WS=220156080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,143:0.53:272
chr1	220156427	rs1391566	T	C	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.628;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.34;ReadPosRankSum=0.998;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr1	220160360	rs2647435	A	G	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-3.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=155;ReadPosRankSum=-0.557;SC=ATCTGCTGACATTGTAGCTTT;SOR=1.127;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=11;WE=220160368;WS=220160350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr1	220160433	rs2647434	A	G	1568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.470;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=15;PP=982;ReadPosRankSum=-1.765;SC=ACTATTAAGAATTGAATTAAT;SOR=1.070;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=108;TCF=76;TCR=32;TR=59;WE=220160441;WS=220160423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,67:0.53:126
chr1	220162195	rs2254494	T	C	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.897;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=415;ReadPosRankSum=0.286;SC=GAGATATTTATAAAACTTTGG;SOR=1.676;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=46;TCF=10;TCR=36;TR=20;WE=220162203;WS=220162185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,25:0.49:51
chr1	220178717	rs5781162	T	TA	1046.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=665;ReadPosRankSum=0.266;SC=AAAGATGATATAAACCAAAGT;SOR=0.690;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=19;WE=220178725;WS=220178707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,39:0.54:72
chr1	220184150	rs34170326	CA	C	98.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5043;FS=0.000;HP=17;HapScore=4;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=4;NR=0;PP=110;SC=GACTACGTCTCAAAAAAAAAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=4;WE=220184172;WS=220184140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	220184164	rs28570471	A	G	115.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.47;ReadPosRankSum=1.960;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr1	220192495	rs2245457	C	G	940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.369;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=26;PP=618;ReadPosRankSum=1.377;SC=GATACTTAATCAATAATAAAT;SOR=0.431;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=69;TCF=17;TCR=52;TR=37;WE=220192503;WS=220192485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,39:0.56:70
chr1	220197545	rs2577159	C	T	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.510;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=260;ReadPosRankSum=-1.044;SC=AAAGAAATCACGTTCTACTAA;SOR=2.636;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=38;TCR=4;TR=15;WE=220197553;WS=220197535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,17:0.38:45
chr1	220197625	rs2230301	G	T	2353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-2.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=47;PP=1420;ReadPosRankSum=-0.106;SC=TATGTTTAGAGTCTATCCTCT;SOR=0.671;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=229;TCF=132;TCR=97;TR=110;WE=220197633;WS=220197615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,122:0.47:257
chr1	220205704	.	T	TA	490.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.212;ClippingRankSum=0.000;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=1.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.26;ReadPosRankSum=-1.372;SOR=0.460;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,26:0.49:53
chr1	220205943	rs2789816	G	A	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.195;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=330;ReadPosRankSum=-1.092;SC=GTGACTAATTGAAGTAATTGA;SOR=1.969;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=50;TCF=8;TCR=42;TR=18;WE=220205951;WS=220205933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,18:0.34:53
chr1	220205980	rs2577138	A	C	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=73;ReadPosRankSum=0.069;SC=GCTTCTAAAGAAAATGAAATG;SOR=0.260;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=5;WE=220205988;WS=220205970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr1	220207017	rs2647456	C	T	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.085;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=308;ReadPosRankSum=1.232;SC=ACATAAAAGACAGAAAAGAAA;SOR=0.957;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=51;TCF=18;TCR=33;TR=25;WE=220207025;WS=220207007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,26:0.46:56
chr1	220208154	rs2789817	C	A	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=306;ReadPosRankSum=-1.619;SC=CTGTTAATATCCTTAAGTAGA;SOR=0.544;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=18;WE=220208162;WS=220208144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
chr1	220231180	rs34887640	CT	C	1808.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.862;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.785;NF=2;NR=24;PP=992;ReadPosRankSum=2.529;SC=TTTAAAATTACTGTGAAAAAC;SOR=0.941;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=41;TCF=6;TCR=35;TR=26;WE=220231188;WS=220231170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,52:0.63:82
chr1	220239448	rs1146773	T	C	1445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=40;PP=1009;ReadPosRankSum=1.349;SC=TTAACTGCTGTTTTTCATTGT;SOR=0.655;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=124;TCF=48;TCR=76;TR=65;WE=220239456;WS=220239438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,67:0.50:133
chr1	220269439	rs78836180	A	T	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.52;ReadPosRankSum=-0.551;SOR=0.720;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr1	220291713	rs78379784	C	T	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=72;ReadPosRankSum=1.080;SC=AGATTTGAAACGCTGATGTTT;SOR=0.169;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=6;WE=220291721;WS=220291703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr1	220300035	rs2289191	T	C	1925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.126;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=31;PP=1260;ReadPosRankSum=1.236;SC=GGTACAGTATTTGTTGTCTAT;SOR=0.592;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=179;TCF=113;TCR=66;TR=81;WE=220300043;WS=220300025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,90:0.45:199
chr1	220310347	rs74902866	A	C	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=262;ReadPosRankSum=0.377;SC=TGTAAAAATAAAAACTATCTT;SOR=0.730;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=13;WE=220310355;WS=220310337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr1	220319007	rs75519000	A	G	669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.816;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=23;PP=427;ReadPosRankSum=0.159;SC=TAAGAAGGAGATGAAAGTAAC;SOR=0.901;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=92;TCF=30;TCR=62;TR=33;WE=220319015;WS=220318997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,35:0.36:98
chr1	220330672	rs11547779	C	T	1523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.566;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=33;PP=784;ReadPosRankSum=-0.852;SC=TGACTGCATACAAGATGGAGC;SOR=0.614;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=159;TCF=87;TCR=72;TR=71;WE=220330680;WS=220330662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,79:0.46:170
chr1	220331205	rs2289189	C	G	1957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=40;PP=1135;ReadPosRankSum=0.132;SC=TGCTGTGTCACTCATTCCCAC;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=208;TCF=115;TCR=93;TR=92;WE=220331213;WS=220331195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,103:0.43:241
chr1	220331298	rs3767655	C	G	1311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.065;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=33;PP=859;ReadPosRankSum=-0.643;SC=AACCAGGATACAATACACTGG;SOR=0.477;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=136;TCF=54;TCR=82;TR=58;WE=220331306;WS=220331288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,63:0.43:145
chr1	220332552	rs2789792	C	T	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=75;ReadPosRankSum=1.981;SC=TAAATTAAAACTGGCCATAGT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=5;WE=220332560;WS=220332542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr1	220332876	rs2808026	G	A	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.992;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.60;ReadPosRankSum=-0.703;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr1	220345878	rs41303055	A	G	720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.539;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=7;PP=477;ReadPosRankSum=0.250;SC=TGTTTTGTACACTACAGACTC;SOR=0.195;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=59;TCF=49;TCR=10;TR=32;WE=220345886;WS=220345868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,34:0.52:65
chr1	220359237	rs17622257	G	T	31.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr1	220366497	rs78010602	T	A	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=43;ReadPosRankSum=1.065;SC=AGAGTTATCATCCAGAAGCTG;SOR=0.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=4;WE=220366505;WS=220366487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr1	220373857	rs74948809	C	A	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.16;ReadPosRankSum=-0.456;SOR=0.882;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,7:0.23:30
chr1	220406291	rs10863538	A	G	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.870;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=261;ReadPosRankSum=-0.184;SC=TCATAGAACCAACCCCTGTAT;SOR=0.052;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=15;WE=220406299;WS=220406281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr1	220427839	rs146145094	G	A	2059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.868;NF=34;NR=48;PP=1291;ReadPosRankSum=1.405;SC=TAGTGCCAGCGATTATGAAGT;SOR=0.669;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=177;TCF=72;TCR=105;TR=82;WE=220427847;WS=220427829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,94:0.49:192
chr1	220445488	rs2292418	C	T	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.144;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=134;ReadPosRankSum=-1.366;SC=AGGCGCAGAGCGAGTAGGAGA;SOR=2.387;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=9;WE=220445496;WS=220445478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr1	220603310	rs10553491	TGTGA	T	713.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=955;ReadPosRankSum=-0.091;SC=TGTGTGTGTGTGTGAGAGAGA;SOR=0.804;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=42;TCF=23;TCR=19;TR=25;WE=220603323;WS=220603298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,37:0.77:48
chr1	220607685	rs1361256	G	A	6221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=108;NR=99;PP=2965;SC=GGTACTACCCGAAGAAGAAAA;SOR=0.702;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=207;TCF=108;TCR=99;TR=207;WE=220607706;WS=220607675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr1	220607891	rs1338767	A	G	2070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=21;PP=1384;SC=TTAGCCCTTTAAGAAAAAAGT;SOR=1.244;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=40;TCR=21;TR=61;WE=220607899;WS=220607881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	220789236	rs2786599	C	T	1946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.96;SOR=0.774;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr1	220789355	rs369680057	AT	A	238.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=1.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.95;ReadPosRankSum=0.099;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr1	220789362	rs12137627	T	A	490.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.31;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	220808921	rs10746403	T	C	1960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.193;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=43;PP=1136;ReadPosRankSum=-1.477;SC=TCTTCCCAAATTTGTGTTTTT;SOR=0.808;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=149;TCF=74;TCR=75;TR=82;WE=220808929;WS=220808911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,93:0.54:172
chr1	220825523	rs3737296	A	G	674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=18;PP=370;ReadPosRankSum=0.098;SC=CATTTTGTTCATTAAGAGTTT;SOR=0.650;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=65;TCF=30;TCR=35;TR=33;WE=220825531;WS=220825513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,36:0.49:73
chr1	220978645	rs17596144	C	T	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=68;ReadPosRankSum=0.566;SC=GGCTCATCCTCGGGTTTAGGT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=5;WE=220978653;WS=220978635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr1	220982320	rs34579579	CA	C	198.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=2.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.85;ReadPosRankSum=0.965;SOR=1.493;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr1	220986516	rs12144830	C	G	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.315;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=218;ReadPosRankSum=-0.847;SC=TGAGCTTTGACGGGATGGTGC;SOR=1.609;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=12;WE=220986524;WS=220986506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr1	221055463	rs2247213	G	A	2622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.430;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=59;PP=1696;ReadPosRankSum=0.335;SC=GACACTGAACGGCCCTCTTGT;SOR=0.655;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=266;TCF=122;TCR=144;TR=112;WE=221055471;WS=221055453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,125:0.43:293
chr1	221057646	rs2738755	C	T	3056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.955;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=36;PP=1037;ReadPosRankSum=1.825;SC=GGTGGAGCCCCGGCTGCGGAT;SOR=0.709;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=145;TCF=78;TCR=67;TR=73;WE=221057654;WS=221057636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,82:0.51:162
chr1	221057662	rs3738182	G	A	3123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.758;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=39;PP=1139;ReadPosRankSum=-0.616;SC=CGGATGGCGAGCAGGACGAGA;SOR=0.504;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=151;TCF=82;TCR=69;TR=82;WE=221057670;WS=221057652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,88:0.54:162
chr1	221507141	rs7555947	C	T	2176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=16;PP=1627;SC=TGTGAACATACTTTCATAGGC;SOR=2.425;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=59;TCR=16;TR=75;WE=221507149;WS=221507119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr1	222721288	rs4846382	C	T	3731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=67;NR=56;PP=2101;SC=CCACCTGGCCCAACAAGAATA;SOR=0.722;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=123;TCF=67;TCR=56;TR=123;WE=222721296;WS=222721278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr1	222734803	rs1134898	G	C	6841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=109;NR=110;PP=2965;SC=TGAAATGAAAGCCTGGCCACC;SOR=0.810;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=219;TCF=109;TCR=110;TR=219;WE=222734811;WS=222734793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr1	222737265	rs35877231	G	T	622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=4;PP=351;SC=AGACAATACAGAAACAGATGG;SOR=2.030;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=21;WE=222737273;WS=222737255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	222737568	rs3008640	C	T	404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=334;SC=TAATATGCTCCCTTTAAATTT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=222737576;WS=222737558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	222742676	rs4846766	T	C	1138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=28;NR=13;PP=675;SC=CAGGGGATAGTGTGGATGATA;SOR=1.364;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=28;TCR=13;TR=41;WE=222742684;WS=222742666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	222751034	rs2936033	T	C	2362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=56;PP=1728;SC=TAGATAACCATTAGTCAAAAA;SOR=2.554;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=17;TCR=56;TR=73;WE=222751042;WS=222751024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr1	222798106	rs3008617	G	A	3178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=51;PP=1804;SC=ATTCTTTTGTGTAGGTTGGAC;SOR=0.918;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=51;TCR=51;TR=102;WE=222798114;WS=222798096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr1	222802006	rs2936053	A	G	6236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=112;NR=88;PP=2965;SC=GGTACAAGATAAGACAGAATT;SOR=0.856;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=200;TCF=112;TCR=88;TR=200;WE=222802014;WS=222801996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr1	222802803	rs3748626	T	G	5996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=88;PP=2965;SC=AAAAAAACCCTGGGAATCAGG;SOR=0.838;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=194;TCF=106;TCR=88;TR=194;WE=222802811;WS=222802793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr1	222802926	rs3008620	C	T	9676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=358;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=164;NR=158;PP=2965;SC=TTTTGGATAGCGAAAAAACAA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=322;TCF=164;TCR=158;TR=322;WE=222802934;WS=222802916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,358:1.00:358
chr1	222803189	.	C	A	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.563;ClippingRankSum=0.000;DP=217;ExcessHet=3.0103;FS=0.613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.45;ReadPosRankSum=-1.676;SOR=0.783;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:171,46:0.21:217
chr1	222821211	rs61824282	C	T	1444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=24;PP=825;SC=ATTCCTATAACAATGGTATTA;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=49;TCF=25;TCR=24;TR=49;WE=222821219;WS=222821201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	222823529	rs17465637	A	C	1202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=9;PP=784;SC=CTGAGAAGTTATTTTTTGTCA;SOR=2.093;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=40;TCF=31;TCR=9;TR=39;WE=222823537;WS=222823519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	222823743	rs67180937	T	G	1396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.35;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	222825403	rs3002150	G	A	1738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=27;NR=29;PP=818;SC=AAAGCTGACTGTAATTCCTGC;SOR=1.033;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=27;TCR=29;TR=56;WE=222825411;WS=222825393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	222825717	rs10495198	T	C	6917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=107;NR=126;PP=2965;SC=AATAGAGAACTCAGTATCATA;SOR=0.960;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=233;TCF=107;TCR=126;TR=233;WE=222825725;WS=222825707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,259:1.00:259
chr1	222825761	rs2936019	G	A	2919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=68;PP=2006;SC=TCTATTTTTAGGGTAATATAT;SOR=1.925;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=27;TCR=68;TR=95;WE=222825769;WS=222825751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr1	222826481	rs2291832	G	A	2212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=29;PP=1208;SC=ATGTAAGTGCGTTCATGAATA;SOR=0.718;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=37;TCR=29;TR=66;WE=222826489;WS=222826471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr1	222832010	rs35822937	A	G	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-3.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.469;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=8;PP=362;ReadPosRankSum=-0.223;SC=GTATTCAGACAGAATGCCAGG;SOR=0.149;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=44;TCF=34;TCR=10;TR=28;WE=222832018;WS=222832000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,34:0.65:52
chr1	222832295	rs2291834	T	C	804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=19;PP=576;SC=AAAAACTAAATTTTAAGTTAA;SOR=2.670;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=24;WE=222832303;WS=222832285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	222833601	rs3002153	T	C	3906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=86;PP=2192;SC=TGGAGCCACCTGTGAGACCTC;SOR=1.345;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=55;TCR=86;TR=141;WE=222833609;WS=222833591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr1	222837594	rs2270707	G	A	1285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=35;PP=921;SC=CAATGCAGCAGTGAAGCTGAT;SOR=3.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=6;TCR=35;TR=41;WE=222837602;WS=222837584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	222838216	rs2936026	C	T	2610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=47;PP=1480;SC=ATCTATCTCTCTTTTTCAGAT;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=30;TCR=47;TR=77;WE=222838224;WS=222838206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr1	222846882	rs12138316	G	A	1243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=34;PP=914;SC=ACTTTGGGAGGCCGAGGCGGG;SOR=3.611;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=38;WE=222846890;WS=222846872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	222860734	rs3008638	C	T	101.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=0;PP=48;SC=GATAGCGCCACTGCATGCCAG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=222860742;WS=222860724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	222886119	rs3811465	A	G	8853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=136;NR=166;PP=2965;SC=CTCGGTAGCTATCATGGCCGC;SOR=0.919;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=302;TCF=136;TCR=166;TR=302;WE=222886127;WS=222886109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,321:1.00:321
chr1	222919895	rs2378607	T	G	2037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=42;NR=23;PP=1269;SC=ATTATGGAGATTGACGGTTTC;SOR=1.308;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=42;TCR=23;TR=65;WE=222919903;WS=222919885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	222923001	rs2068814	A	G	2333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=51;PP=1522;SC=CCACCTGGTCATATGTACTAT;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=17;TCR=51;TR=68;WE=222923009;WS=222922991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr1	222923351	rs6683071	A	G	2173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=44;PP=1381;SC=GCTGGGGTCCAAGAGTATGGA;SOR=1.493;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=26;TCR=44;TR=70;WE=222923359;WS=222923341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr1	223152868	rs1815607	G	A	1077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=3;PP=829;SC=GGTGAATTATGTGGTATATGA;SOR=3.855;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=34;WE=223152876;WS=223152858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	223156382	rs2926159	C	T	599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.26;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	223168213	rs2609359	T	C	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.290;HP=9;HapScore=3;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=229;ReadPosRankSum=0.059;SC=TCCTTTTTTTTTTCATATCAC;SOR=1.580;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=34;TCF=21;TCR=13;TR=15;WE=223168221;WS=223168195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,15:0.45:33
chr1	223177574	rs2609355	A	G	2034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.199;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=47;PP=1417;ReadPosRankSum=-0.081;SC=AGTTTTATAAAGAGGTGGACT;SOR=0.794;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=159;TCF=69;TCR=90;TR=83;WE=223177582;WS=223177564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,88:0.52:169
chr1	223178561	rs9441941	A	C	3441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.837;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=67;PP=1922;ReadPosRankSum=-0.453;SC=GTAGCTGCCCAGATGCCTACA;SOR=0.696;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=292;TCF=154;TCR=138;TR=141;WE=223178569;WS=223178551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,163:0.50:326
chr1	223283910	rs7512943	A	G	8369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=155;NR=132;PP=2965;SC=ACATCCTGGAAATCCTCAGGC;SOR=0.851;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=287;TCF=155;TCR=132;TR=287;WE=223283918;WS=223283900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,311:1.00:311
chr1	223284528	rs5744174	A	G	5996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=95;PP=2965;SC=ACCCCAGAGAACGAGTCAGGG;SOR=0.712;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=196;TCF=100;TCR=96;TR=195;WE=223284536;WS=223284518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr1	223397037	rs851149	T	C	1405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.379;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=35;PP=897;ReadPosRankSum=0.258;SC=AGGCCACCCATACTCCCTCCT;SOR=0.961;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=120;TCF=44;TCR=76;TR=54;WE=223397045;WS=223397027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,61:0.47:129
chr1	223715248	rs36108579	GT	G	2936.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-6.602;NF=11;NR=47;PP=2361;ReadPosRankSum=-0.162;SC=ACAAGATTGAGTTCTTGGCTT;SOR=0.884;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=59;TCF=11;TCR=48;TR=58;WE=223715256;WS=223715238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,112:0.98:114
chr1	223716349	rs4072246	G	A	4567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=41;PP=2743;SC=GCCACAGAACGTGCATGGTAT;SOR=1.744;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=145;TCF=104;TCR=41;TR=145;WE=223716357;WS=223716339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr1	223717379	rs61823524	A	C	2159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=27;PP=1326;SC=CCCTGCCCCAACTTGCACCTT;SOR=1.193;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=47;TCR=27;TR=74;WE=223717387;WS=223717369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr1	223717484	rs34158997	G	A	4455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=61;PP=2560;SC=AGTTGATGCCGAGCTTGCTGC;SOR=0.767;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=84;TCR=61;TR=145;WE=223717492;WS=223717474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr1	223717961	.	A	G	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=-0.000;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=4.260;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=70;ReadPosRankSum=0.090;SC=GGAATCGAGCAATATTCTCCC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=5;WE=223717969;WS=223717951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr1	223718462	rs61823525	G	A	1488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=18;PP=983;SC=TTGTTCCTTCGTGACCAATGT;SOR=1.487;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=35;TCR=18;TR=53;WE=223718470;WS=223718452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	223718518	rs61823552	C	A	3793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=51;PP=2389;SC=TGTGGTCAGACTACAATGGAC;SOR=1.098;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=128;TCF=77;TCR=51;TR=127;WE=223718526;WS=223718508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
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chr1	223718670	rs61823554	G	A	5411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=85;PP=2965;SC=CTCTAGGCACGTTAAAGACCA;SOR=0.776;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=176;TCF=91;TCR=85;TR=176;WE=223718678;WS=223718660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr1	223718793	rs72747903	G	C	562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=21;PP=391;ReadPosRankSum=0.368;SC=CAGAGCAGTGGGGGTGACGGT;SOR=0.843;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=40;TCF=4;TCR=36;TR=23;WE=223718801;WS=223718783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,25:0.61:41
chr1	223722646	rs34630115	T	TA	470.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.425;HP=12;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=213;ReadPosRankSum=-0.610;SC=CGGACGAAAGTAAAAAAAAAA;SOR=0.105;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=17;WE=223722654;WS=223722636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,22:0.73:30
chr1	223722780	rs34606532	G	A	6948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=114;NR=108;PP=2965;SC=AGTGGGAATCGGATCATTTGA;SOR=0.725;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=222;TCF=114;TCR=108;TR=222;WE=223722788;WS=223722770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr1	223799857	rs34786756	C	T	1848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.539;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=35;PP=2737;ReadPosRankSum=1.233;SC=CCAGCTTCTACCACAGGAAAC;SOR=0.915;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=167;TCF=98;TCR=69;TR=86;WE=223799879;WS=223799847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,90:0.48:187
chr1	223799871	rs35116708	C	T	1800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.252;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=41;PP=2737;ReadPosRankSum=1.785;SC=AGGAAACAGACGCTGCTGGCT;SOR=0.664;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=171;TCF=97;TCR=74;TR=83;WE=223799879;WS=223799847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,88:0.45:196
chr1	223813586	rs35539373	G	T	3209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=69;PP=1917;SC=GGCTGCACTGGAGACCTGCGT;SOR=1.870;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=33;TCR=69;TR=102;WE=223813594;WS=223813576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr1	223814671	rs61825208	A	T	1486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=14;PP=865;SC=GTGGGGCAGTAGAGAAGCCAT;SOR=1.739;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=35;TCR=14;TR=49;WE=223814679;WS=223814661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	223815575	rs34187970	G	A	493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=0;PP=355;SC=CTCTCTCTCCGGCTCATGGGG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=223815583;WS=223815565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	223816322	rs66602040	A	G	3718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=48;PP=2178;SC=AGCCCTAAGAATACGGAAAAC;SOR=1.082;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=71;TCR=48;TR=119;WE=223816330;WS=223816312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr1	223816347	rs61825210	A	G	4632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=67;PP=2616;SC=ACAAAGGGCCAGAGCAGAGCA;SOR=0.899;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=155;TCF=88;TCR=67;TR=155;WE=223816355;WS=223816337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr1	223841836	rs2105405	C	T	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.944;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.136;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=101;ReadPosRankSum=0.991;SC=GAGGTAGTTCCAGCATTTGGA;SOR=2.066;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=6;WE=223841844;WS=223841826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr1	223841877	rs2105406	C	G	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.821;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=332;ReadPosRankSum=0.865;SC=TTTGGACTCACAGTGAAGAAT;SOR=1.179;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=18;WE=223841885;WS=223841867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,18:0.39:46
chr1	223842126	rs187522196	C	T	1218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.763;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=33;PP=756;ReadPosRankSum=0.309;SC=GAACAAAACACAAGTCACAAG;SOR=0.821;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=98;TCF=38;TCR=60;TR=52;WE=223842134;WS=223842116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,56:0.53:105
chr1	223900408	rs25655	C	G	7929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=149;NR=114;PP=2965;SC=GCTCCCACGACAGGGCCATCA;SOR=0.876;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=263;TCF=149;TCR=114;TR=263;WE=223900416;WS=223900398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,295:1.00:295
chr1	223905532	rs17596	G	A	1787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.824;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=44;PP=1084;ReadPosRankSum=-0.593;SC=AAGGAGCCCTGGGTAAGTGAT;SOR=0.870;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=167;TCF=78;TCR=89;TR=78;WE=223905540;WS=223905522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,86:0.46:186
chr1	223931648	rs1222137	T	C	394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=0;PP=285;SC=CCAAACCCTCTGACCCAACCC;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=223931656;WS=223931638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	223934720	rs17600	G	A	5101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=98;NR=74;PP=2892;SC=GCTATGAAGCGCTATCAGGGG;SOR=0.815;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=172;TCF=98;TCR=74;TR=172;WE=223934728;WS=223934710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr1	223938565	rs1153968	A	C	1650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.535;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=32;PP=1147;ReadPosRankSum=0.724;SC=TCAACCTCTTACTCCTCCCTT;SOR=0.774;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=187;TCF=107;TCR=80;TR=78;WE=223938573;WS=223938555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,81:0.41:196
chr1	223949158	rs6687003	G	A	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=84;ReadPosRankSum=2.489;SC=TCCCCCCACCGCAGCCCTGCC;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=7;WE=223949166;WS=223949148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr1	223951985	rs737066	C	A	4453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=86;PP=2621;SC=AATCTTTCCCCCTCCATGTCT;SOR=1.264;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=149;TCF=62;TCR=87;TR=148;WE=223951993;WS=223951975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr1	223954338	rs28370152	C	T	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=64;ReadPosRankSum=-1.241;SC=ATGCTACACCCCCCCTCCCAC;SOR=0.223;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=5;WE=223954346;WS=223954328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr1	223959796	rs1153950	G	A	1744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.584;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=35;PP=1089;ReadPosRankSum=0.861;SC=ATGGTGGTCAGTGAAGTCAGT;SOR=0.600;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=145;TCF=73;TCR=72;TR=72;WE=223959804;WS=223959786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,80:0.50:160
chr1	223959959	rs1153949	G	A	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.109;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=22;PP=497;ReadPosRankSum=-1.101;SC=AGCAGGCCCCGCCTTGCTTCT;SOR=1.148;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=77;TCF=33;TCR=44;TR=34;WE=223959967;WS=223959949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,40:0.46:87
chr1	223980207	rs1153936	G	C	1529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.734;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=43;PP=1213;ReadPosRankSum=-2.252;SC=CATCATTGGGGAGGCTTGGGT;SOR=1.055;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=143;TCF=61;TCR=82;TR=68;WE=223980215;WS=223980197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,70:0.43:162
chr1	223984306	rs28364803	G	GA	90.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.48;ReadPosRankSum=0.079;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr1	223989966	rs1153933	C	T	2314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.842;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=60;PP=1496;ReadPosRankSum=-0.891;SC=GCATAGTAGACGACTGGATAT;SOR=0.886;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=215;TCF=97;TCR=118;TR=101;WE=223989974;WS=223989956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,112:0.46:246
chr1	223998054	.	A	G	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-0.074;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=159;ReadPosRankSum=0.658;SC=TGAATAACAAAGTAATAATGA;SOR=0.446;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=13;WE=223998062;WS=223998044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr1	224008913	rs3738370	G	A	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.031;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=111;ReadPosRankSum=2.149;SC=GGCTGTCAGCGTCTCTCACCA;SOR=1.214;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=9;WE=224008921;WS=224008903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr1	224301749	rs6690695	C	T	203.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=0;PP=79;SC=TACCCCTTCCCCGGCGGCTGC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=224301757;WS=224301746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	224301951	.	C	A	963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.358;ClippingRankSum=0.000;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=5.349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.14;ReadPosRankSum=0.439;SOR=0.323;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,48:0.51:95
chr1	224302154	rs3066024	T	TGAG	2832.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=31;PP=1952;SC=GTCTGGGAGATGAGAAGGGAG;SOR=1.539;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=42;TCF=4;TCR=38;TR=35;WE=224302162;WS=224302144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr1	224318151	rs3065998	T	TTTG	3599.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=13;PP=2420;SC=GTTATTGATTTTTGTTCTTTT;SOR=2.215;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=55;TCF=41;TCR=14;TR=46;WE=224318159;WS=224318141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr1	224321984	rs1472167	C	T	1066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=24;PP=674;SC=TTATGAATTTCTGATTTTAGA;SOR=1.552;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=12;TCR=24;TR=36;WE=224321992;WS=224321974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	224345012	rs7543762	G	A	1222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=4;PP=903;SC=CTGGTAGAGAGACATTTTAAG;SOR=3.556;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=36;WE=224345020;WS=224345002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	224377996	rs61732863	A	G	1127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=27;PP=609;ReadPosRankSum=0.271;SC=GATTTCCCCAACATTCCTGGA;SOR=0.696;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=31;TCR=61;TR=41;WE=224378004;WS=224377986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,50:0.47:106
chr1	224444628	rs10799556	C	T	5422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=112;NR=62;PP=2965;SC=ATTCAGATTCCTTCTACATCC;SOR=1.345;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=174;TCF=112;TCR=62;TR=174;WE=224444636;WS=224444618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr1	224444901	rs2897055	G	C	441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=12;PP=328;SC=AAGAGAAAGTGCATTCACTCA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=224444909;WS=224444891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	224468986	rs34156240	C	CGT	97.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=4;PP=131;SC=ACTCTGTGTGCGTGTGTGTGT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=4;WE=224468994;WS=224468976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	224469014	.	T	TGA	131	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=131;QD=33.5;SC=TGTGTGTGTGTGAGATTTAGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=224469022;WS=224469004;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:2,4:0.67:6
chr1	224482216	rs2404783	T	C	561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=4;NR=15;PP=386;SC=TTACAGATTTTGACAGCAACA;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=19;WE=224482224;WS=224482206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	224492381	rs7522125	C	T	1724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=38;NR=10;PP=889;SC=TAGGCTTTTTCCTCATAACTG;SOR=1.888;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=38;TCR=10;TR=48;WE=224492389;WS=224492371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	224492746	rs3754090	C	T	10271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=389;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=176;NR=162;PP=2965;SC=CTTTCTTTTGCAGGACAGCTT;SOR=0.698;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=339;TCF=177;TCR=162;TR=338;WE=224492754;WS=224492730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,389:1.00:389
chr1	224495852	rs7534447	C	T	9055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=153;NR=134;PP=2965;SC=TGGAACTTATCCGTGGTGTTG;SOR=0.724;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=287;TCF=153;TCR=134;TR=287;WE=224495860;WS=224495842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,329:1.00:329
chr1	224500881	.	A	G	43	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;FR=0.5559;HP=21;HapScore=2;MGOF=16;MMLQ=26;MQ=56.77;NF=0;NR=3;PP=43;QD=25.9237375157;SC=AAAAAAAAAAAACAAGCAAAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=3;WE=224500889;WS=224500871;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr1	224505570	rs3066969	T	TAA	4975.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=49;PP=2653;SC=GCTCTAACAATAAGACTCACC;SOR=0.990;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=63;TCF=8;TCR=55;TR=57;WE=224505578;WS=224505560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr1	224505719	rs4436353	T	G	312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=230;SC=AAATAAATTTTCATGAATATT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=224505727;WS=224505709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	224514275	rs4653578	G	A	507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=16;PP=407;SC=TAAACTCTTCGTTAATAAAGT;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=224514283;WS=224514265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	224517842	rs2896990	C	T	4971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=83;PP=2767;SC=CGTCGGTCTTCCAAGCCACAG;SOR=0.839;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=167;TCF=84;TCR=83;TR=166;WE=224517850;WS=224517832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr1	224517907	rs4146965	A	T	2307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=51;PP=1416;SC=GCCCGCCGCGATCGCCGGGCC;SOR=1.939;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=24;TCR=51;TR=75;WE=224517915;WS=224517897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr1	224544529	rs7517754	A	G	886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=9.700;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=2;PP=768;ReadPosRankSum=-0.650;SC=GGATTCGAGGACCACACGCCT;SOR=4.322;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=27;WE=224544537;WS=224544519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,27:0.96:28
chr1	224577397	rs16847945	A	G	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.509;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=78;ReadPosRankSum=0.335;SC=TTTGGCCCCAATCGGGCTTCA;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=4;WE=224577405;WS=224577387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr1	224577595	.	C	G	1859	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000;HP=9;HapScore=1;MGOF=9;MMLQ=15;MQ=59.08;NF=0;NR=67;PP=1859;QD=28.2652419783;SC=GTATGGGGGGCGGGCGGGGGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=175;TCF=86;TCR=89;TR=67;WE=224577607;WS=224577585;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:108,67:0.38:175
chr1	224600910	rs10916612	C	A	2343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.40;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	224600920	rs10916613	C	A	2529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.47;SOR=1.107;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	224621368	rs2405033	G	C	1871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=20;PP=1137;SC=TCACCAGCTGGCGGTAAGGGA;SOR=1.244;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=41;TCR=20;TR=61;WE=224621376;WS=224621358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	224805112	rs1532557	C	T	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=172;ReadPosRankSum=1.412;SC=TTCGCTGCATCCCGCCGGGCG;SOR=0.490;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=12;WE=224805120;WS=224805102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,16:0.39:41
chr1	224872443	rs3738364	A	G	1253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.985;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=28;PP=840;ReadPosRankSum=-0.892;SC=TTCTCATGCTATTTTAGCAGA;SOR=0.488;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=136;TCF=79;TCR=57;TR=62;WE=224872451;WS=224872433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,62:0.43:145
chr1	225230608	rs2501107	C	T	3496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=52;PP=2089;SC=TAAATCTATGCTTGAGAATTC;SOR=0.873;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=68;TCR=52;TR=120;WE=225230616;WS=225230598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr1	225237850	rs2501086	A	C	253.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=136;SC=GTCATGGATAATTTTGAAGTG;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=225237858;WS=225237840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	225266966	rs3105559	C	G	1295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=12;PP=789;SC=AGAAGAATTTCTGGAGCATTT;SOR=1.714;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=28;TCR=12;TR=40;WE=225266974;WS=225266956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	225268343	rs3128651	A	G	8614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.18;SOR=0.745;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr1	225268346	rs3128652	G	A	8608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.38;SOR=0.778;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr1	225270409	rs3128655	A	T	2741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=40;NR=50;PP=1476;SC=GCTTGATAAAAACTGTAAAGT;SOR=1.072;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=40;TCR=51;TR=90;WE=225270417;WS=225270399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr1	225273248	rs3128658	G	T	1197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=10;PP=790;SC=CATTTTAGATGTTTCAGTATG;SOR=1.845;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=27;TCR=10;TR=37;WE=225273256;WS=225273238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	225273633	rs3105565	T	A	123.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=93;SC=TATTTACTAGTTTGAATACCA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=225273641;WS=225273623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	225477491	rs12024361	C	T	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.025;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.60;ReadPosRankSum=-1.068;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr1	225477546	rs12042076	A	C	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=153;ReadPosRankSum=0.525;SC=AAAGATTCCCAGAAAATGTAT;SOR=0.846;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=13;WE=225477554;WS=225477536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr1	225477793	rs12042900	T	G	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=116;ReadPosRankSum=0.705;SC=AAGTAAGTACTTTTTGTCTTT;SOR=1.136;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=9;WE=225477801;WS=225477783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr1	225492545	rs1995482	A	G	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.977;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=213;ReadPosRankSum=0.545;SC=CTAAGTGTTCAACTTTCTCTT;SOR=0.257;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=15;WE=225492553;WS=225492535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr1	225492845	rs12034925	C	T	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.622;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=16;PP=365;ReadPosRankSum=0.813;SC=TTTTTGTTTGCGAAAAGAGAC;SOR=0.337;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=35;TCF=11;TCR=24;TR=25;WE=225492853;WS=225492835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,26:0.70:37
chr1	225506294	rs10495237	A	G	3009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.968;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=57;PP=1839;ReadPosRankSum=-0.263;SC=GAAAACTGCCAATGAACTAAA;SOR=0.831;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=264;TCF=147;TCR=117;TR=136;WE=225506302;WS=225506281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,149:0.52:286
chr1	225510564	rs67676118	C	T	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=280;ReadPosRankSum=1.351;SC=CTCATATTTACAGTCTGTGGG;SOR=0.587;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=19;WE=225510572;WS=225510554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,22:0.54:41
chr1	225525698	rs34298762	C	CT	60.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.603;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.880;HP=10;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=24;ReadPosRankSum=-1.451;SC=TTTATTGCTGCTTTTTTTTTT;SOR=2.546;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=3;WE=225525706;WS=225525688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr1	225528486	rs16844711	G	A	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=172;ReadPosRankSum=0.873;SC=TTGAATTTGAGCCAAAAATAC;SOR=0.193;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=11;WE=225528494;WS=225528476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr1	225533731	rs12742757	T	A	2743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=53;PP=1601;ReadPosRankSum=0.364;SC=CAAACGAAATTTCAAAGCGCA;SOR=0.705;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=284;TCF=162;TCR=122;TR=122;WE=225533739;WS=225533721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:187,139:0.43:326
chr1	225539665	rs3856150	T	A	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.699;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=113;ReadPosRankSum=0.037;SC=ATGTCGTACATTATCTTACAT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=7;WE=225539673;WS=225539655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr1	225541649	rs3915578	A	G	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=355;ReadPosRankSum=-0.949;SC=TTTATTAGTAACTTAAACCCT;SOR=0.643;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=23;WE=225541657;WS=225541639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,27:0.79:34
chr1	225541899	rs3915579	C	T	1639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.230;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=30;PP=999;ReadPosRankSum=-0.254;SC=CCTGCTTCTCCGTGCCATAAA;SOR=0.589;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=153;TCF=95;TCR=58;TR=72;WE=225541907;WS=225541889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,79:0.48:166
chr1	225545301	rs142111235	A	AATATGTGATAT	178.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.51;ReadPosRankSum=-1.421;SOR=0.193;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr1	225545580	rs12745950	A	C	1006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=27;PP=773;ReadPosRankSum=-1.648;SC=CATGTAAGTGATTTGTATAAA;SOR=0.820;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=60;TCF=16;TCR=44;TR=36;WE=225545588;WS=225545570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,40:0.61:66
chr1	225546172	rs9659299	C	G	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=140;ReadPosRankSum=-1.481;SC=TTAATTTTACCTTATCTTCCA;SOR=0.430;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=11;WE=225546180;WS=225546162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr1	225552624	rs10495239	G	A	850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.318;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=21;PP=513;ReadPosRankSum=1.537;SC=CAGATTTAATGTTGACTGAGG;SOR=0.368;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=60;TCF=25;TCR=35;TR=38;WE=225552632;WS=225552614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,40:0.65:62
chr1	225552650	rs12563830	C	T	611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.736;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=15;PP=334;ReadPosRankSum=-1.468;SC=TGTTTGAATGCAAGTCATCTT;SOR=0.346;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=43;TCF=18;TCR=25;TR=28;WE=225552658;WS=225552640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,30:0.65:46
chr1	225555512	rs11578981	C	T	869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.704;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=15;PP=422;ReadPosRankSum=-0.339;SC=TCAAGATTGCCGTGGAATCTC;SOR=0.755;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=101;TCF=55;TCR=46;TR=37;WE=225555520;WS=225555502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,46:0.39:117
chr1	225555602	rs12737248	T	G	871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.581;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=18;PP=476;ReadPosRankSum=0.107;SC=TATTTGAAAATCCTGACTGTG;SOR=0.523;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=92;TCF=45;TCR=47;TR=38;WE=225555610;WS=225555592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,45:0.42:107
chr1	225562385	rs10915816	C	T	4019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=73;NR=51;PP=2082;SC=ATGGGTTTTCCAAAGGTTGCC;SOR=0.963;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=73;TCR=51;TR=124;WE=225562393;WS=225562375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr1	225562620	.	G	A	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.709;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=294;ReadPosRankSum=1.158;SC=TGCATTTCTCGATAATTTTAA;SOR=2.101;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=15;WE=225562628;WS=225562610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr1	225565015	rs3856154	T	C	1432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=24;PP=787;ReadPosRankSum=-1.864;SC=GATGATGACCTTCCCGAGGTC;SOR=0.702;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=71;TCR=55;TR=54;WE=225565023;WS=225565005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,69:0.47:146
chr1	225565073	rs3856155	C	T	1333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.376;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=26;PP=819;ReadPosRankSum=-0.319;SC=AGACCCAGGGCGAAAAGTTTA;SOR=0.573;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=117;TCF=57;TCR=60;TR=52;WE=225565081;WS=225565063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,61:0.47:131
chr1	225569241	rs950210	T	G	939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.824;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=22;PP=571;ReadPosRankSum=-1.426;SC=GAGGAAATATTTAACTCTTTT;SOR=0.805;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=73;TCF=32;TCR=41;TR=38;WE=225569249;WS=225569231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,44:0.53:83
chr1	225576058	rs6679430	T	C	973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.682;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=10;PP=582;ReadPosRankSum=1.346;SC=AAAAATGATGTGACTGTCTTT;SOR=0.892;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=92;TCF=64;TCR=28;TR=42;WE=225576066;WS=225576048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,46:0.46:100
chr1	225576311	rs10753405	A	G	770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.264;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=22;PP=499;ReadPosRankSum=-1.690;SC=TGAATTAAGCAAGGGAGGGAT;SOR=1.073;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=61;TCF=17;TCR=44;TR=30;WE=225576319;WS=225576301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,33:0.49:68
chr1	225577648	rs12134158	C	T	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.386;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=433;ReadPosRankSum=0.055;SC=TGTCACTCACCCTTTCCTCCT;SOR=2.746;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=45;TCF=8;TCR=37;TR=21;WE=225577656;WS=225577638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,21:0.43:49
chr1	225586737	.	AT	A	187.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.808;ClippingRankSum=0.000;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=12.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.14;MQRankSum=1.764;QD=2.61;ReadPosRankSum=-1.204;SOR=3.327;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,18:0.25:72
chr1	225601647	rs3766928	C	T	6034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=122;NR=77;PP=2965;SC=TAACACAAGACTACTTAGAAA;SOR=1.134;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=199;TCF=122;TCR=77;TR=199;WE=225601655;WS=225601637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr1	225603103	rs6702433	C	T	458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=11;PP=269;SC=TACACACACACATATATATAT;SOR=2.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=15;WE=225603111;WS=225603093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	225607144	rs2230419	C	T	1052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=25;PP=705;SC=TTGTGACAAACTGAATTTTTC;SOR=2.432;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=32;WE=225607152;WS=225607134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	225609884	rs1056608	A	G	3506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=62;PP=2081;SC=GTGGTCGACCAGGGGATCGGG;SOR=0.925;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=119;TCF=57;TCR=62;TR=119;WE=225609892;WS=225609874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr1	225611661	rs1056607	C	T	4660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=56;PP=2891;SC=CTTTATACTTCACAGTGTAAA;SOR=1.419;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=159;TCF=102;TCR=57;TR=158;WE=225611669;WS=225611651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr1	225611845	rs1340867	C	T	1982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=50;PP=1389;SC=TTTATGTATTCGTCTTTTTCC;SOR=2.173;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=18;TCR=50;TR=68;WE=225611853;WS=225611835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	225685621	rs145776060	TAAG	T	781.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=581;ReadPosRankSum=-1.495;SC=CTCACAGTAATAAGAAGATTA;SOR=1.022;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=14;WE=225685631;WS=225685611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,20:0.74:27
chr1	225685928	rs1629896	A	G	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5005;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=144;ReadPosRankSum=-0.838;SC=CTAAAAGGGCAGGACTATGGA;SOR=0.330;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=11;WE=225685936;WS=225685918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,12:0.80:15
chr1	226019633	rs1051740	T	C	2244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.028;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=38;PP=1220;ReadPosRankSum=0.177;SC=TCTCAACAGATACCCTCACTT;SOR=0.701;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=199;TCF=107;TCR=92;TR=94;WE=226019641;WS=226019623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,109:0.49:224
chr1	226019653	rs1131873	G	A	2262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=53;PP=1476;ReadPosRankSum=0.051;SC=TCAAGACTAAGATTGAAGGTA;SOR=0.666;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=200;TCF=104;TCR=96;TR=101;WE=226019661;WS=226019643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,111:0.48:230
chr1	226019774	rs2260863	G	C	635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=432;ReadPosRankSum=0.352;SC=AATTATAGGTGACTGAGATGT;SOR=0.576;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=41;TCF=9;TCR=32;TR=24;WE=226019782;WS=226019764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,26:0.57:46
chr1	226026406	rs2234922	A	G	2099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.509;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=39;PP=1368;ReadPosRankSum=0.485;SC=CCCGCAGGCCATACCCCGAAG;SOR=0.629;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=199;TCF=125;TCR=74;TR=98;WE=226026414;WS=226026396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,105:0.48:217
chr1	226027067	.	G	GGTGTGTGTGTGT	36.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.24;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr1	226027659	rs2292568	C	T	1479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FS=1.065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.61;ReadPosRankSum=-0.676;SOR=0.651;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:141,83:0.37:224
chr1	226032018	rs56301120	G	A	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.965;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=232;ReadPosRankSum=0.537;SC=AAATCCATGCGCTCCAGTCTA;SOR=0.368;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=15;WE=226032026;WS=226032015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
chr1	226032229	rs1051741	C	T	3911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=423;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.523;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=87;PP=2243;ReadPosRankSum=-0.325;SC=TGCTGACCAACGTCATGCTCT;SOR=0.767;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=392;TCF=196;TCR=196;TR=174;WE=226032237;WS=226032219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:226,195:0.46:421
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chr1	226036309	rs360063	A	G	7815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=138;NR=126;PP=2965;SC=CTCTGTGAACAAACACCCTCC;SOR=0.700;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=264;TCF=138;TCR=126;TR=264;WE=226036317;WS=226036299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,293:1.00:293
chr1	226041438	rs2292556	C	T	2314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.458;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=49;PP=1324;ReadPosRankSum=-1.344;SC=CGATGAAGGCCGAGGCGATGA;SOR=0.728;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=235;TCF=125;TCR=110;TR=105;WE=226041446;WS=226041428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,114:0.45:252
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chr1	226043855	rs3766936	A	G	658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=24;PP=549;ReadPosRankSum=0.374;SC=GGCCTTCCCTAAGTGGAAGGT;SOR=0.458;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=46;TCF=3;TCR=43;TR=26;WE=226043863;WS=226043845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,25:0.54:46
chr1	226044489	rs60955535	G	GC	1034.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=13;PP=837;SC=TGCTCTATGTGCCCCAGTGAG;SOR=0.957;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=29;TCF=15;TCR=14;TR=24;WE=226044508;WS=226044479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	226044500	rs3215220	GC	G	535.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.816;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=13;PP=491;ReadPosRankSum=0.920;SC=CCCCAGTGAGGCCCCTGCCAT;SOR=0.323;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=38;TCF=22;TCR=16;TR=26;WE=226044508;WS=226044479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,21:0.50:42
chr1	226044591	rs2292560	C	T	1210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=23;PP=695;ReadPosRankSum=1.222;SC=GGCAGGGCCTCGGGGCTCCCG;SOR=0.638;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=129;TCF=77;TCR=52;TR=57;WE=226044599;WS=226044568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,61:0.43:141
chr1	226044766	rs9919303	G	A	1185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.678;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=32;PP=688;ReadPosRankSum=1.231;SC=CGTGGGCCACGCGGCTCTGAG;SOR=0.931;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=94;TCF=39;TCR=55;TR=52;WE=226044774;WS=226044756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,56:0.56:100
chr1	226046974	rs2292561	T	C	981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=26;PP=679;ReadPosRankSum=1.397;SC=TCAGGAAAAATAGCCCCAGGA;SOR=0.665;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=122;TCF=57;TCR=65;TR=47;WE=226046982;WS=226046964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,51:0.39:132
chr1	226048746	rs74150534	A	C	927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=1.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.79;ReadPosRankSum=-0.174;SOR=0.465;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,47:0.55:86
chr1	226049909	rs74150536	T	C	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.811;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=409;ReadPosRankSum=-1.247;SC=TGGATGTGCCTACACTCACTA;SOR=0.188;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=45;TCF=38;TCR=7;TR=24;WE=226049917;WS=226049899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,24:0.51:47
chr1	226050678	rs74229306	G	A	1408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.704;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=40;PP=905;ReadPosRankSum=2.121;SC=CTGTGCCAGCGGAGACCTCTC;SOR=0.791;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=116;TCF=39;TCR=77;TR=60;WE=226050686;WS=226050668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,63:0.50:125
chr1	226053805	rs7515156	G	A	733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=21;PP=512;ReadPosRankSum=1.492;SC=TTCTGTGGCCGGGGGAGCCCC;SOR=0.671;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=70;TCF=23;TCR=47;TR=32;WE=226053813;WS=226053795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,33:0.45:73
chr1	226054681	rs360085	T	A	470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=393;SC=GCTCAACAACTCACTAGCTGC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=226054689;WS=226054671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	226054714	rs2292563	G	A	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=322;ReadPosRankSum=0.039;SC=GATACCAGCCGGCCCCCTTTG;SOR=0.795;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=19;WE=226054722;WS=226054704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,23:0.56:41
chr1	226055595	rs2292564	G	A	1182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.707;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=19;PP=759;ReadPosRankSum=0.158;SC=TACCCAGCAAGTCCCCTGAGA;SOR=0.823;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=107;TCF=67;TCR=40;TR=52;WE=226055603;WS=226055585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,56:0.49:115
chr1	226061956	rs2271544	G	A	1559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.563;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=14;PP=900;ReadPosRankSum=-1.120;SC=GTACGCACACGCATGCTCACA;SOR=0.883;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=109;TCF=80;TCR=29;TR=58;WE=226061964;WS=226061946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,69:0.56:124
chr1	226074373	rs3766941	C	A	870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=13;PP=560;ReadPosRankSum=0.452;SC=CTGGTACCCTCGAACACTTCA;SOR=0.782;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=73;TCF=48;TCR=25;TR=39;WE=226074381;WS=226074363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,41:0.53:77
chr1	226074985	rs2236143	T	C	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=4;PP=430;ReadPosRankSum=-0.794;SC=AGAGGAAGAATTGTATACATT;SOR=0.815;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=57;TCF=47;TCR=10;TR=26;WE=226074993;WS=226074975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,29:0.48:60
chr1	226075473	rs77296604	C	G	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.948;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.792;NF=7;NR=16;PP=408;ReadPosRankSum=1.185;SC=CTGCGCGCCCCCGCGACCCCC;SOR=1.255;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=40;TCF=14;TCR=26;TR=23;WE=226075481;WS=226075463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,24:0.59:41
chr1	226075558	rs191758097	C	T	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.043;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-2.388;NF=1;NR=5;PP=67;ReadPosRankSum=0.000;SC=CACCCGGGCCCGGGCGCTGCG;SOR=2.833;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=21;TCF=8;TCR=13;TR=6;WE=226075566;WS=226075548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,4:0.20:20
chr1	226076669	rs41310561	C	T	1109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.855;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=27;PP=681;ReadPosRankSum=1.019;SC=CTGCAGCTGCCGCAGCAGGCT;SOR=0.459;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=78;TCF=32;TCR=46;TR=48;WE=226076677;WS=226076659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,51:0.59:86
chr1	226111945	rs77157663	T	C	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=31;ReadPosRankSum=1.201;SC=CAGCAGCTTCTGGGATGGTGC;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=4;WE=226111953;WS=226111935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr1	226125385	rs2295418	G	A	1206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.133;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.397;NF=27;NR=25;PP=618;ReadPosRankSum=-0.632;SC=CAGGAAGCCCGGGGGCTCCAG;SOR=0.745;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=130;TCF=70;TCR=60;TR=52;WE=226125393;WS=226125375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,62:0.44:142
chr1	226125543	rs60825997	G	GA	672.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=17;PP=782;SC=GGTCATCTGGGAGGCTGAAGT;SOR=3.611;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=18;WE=226125551;WS=226125533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	226127746	rs428237	C	G	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-5.963;NF=8;NR=7;PP=143;ReadPosRankSum=-0.802;SC=CGGACTCCAGCGGAGCTCTGA;SOR=0.560;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=36;TCF=19;TCR=17;TR=15;WE=226127754;WS=226127736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,12:0.32:38
chr1	226180816	rs67548369	C	T	129.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.98;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	226252232	rs2036870	C	T	2177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=32;NR=42;PP=1314;SC=TATGTATCCACATAATTTAAC;SOR=1.193;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=32;TCR=42;TR=74;WE=226252240;WS=226252222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr1	226253316	rs1849032	G	T	3473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=51;PP=1893;SC=TTTTGTGCTAGTTATGTTTTT;SOR=0.756;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=62;TCR=51;TR=113;WE=226253324;WS=226253306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr1	226334578	rs1219666	G	A	3347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=69;PP=2076;SC=ACTTGCATCAGGCAATTAAAA;SOR=2.242;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=99;TCF=29;TCR=70;TR=98;WE=226334586;WS=226334568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr1	226352498	rs2306120	T	G	7368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=134;NR=102;PP=2965;SC=ACCTTTTTTTTTCTTGCTCTT;SOR=0.851;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=236;TCF=134;TCR=102;TR=236;WE=226352506;WS=226352488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,270:1.00:270
chr1	226353521	rs2306121	T	A	7188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=158;NR=102;PP=2965;SC=TTGCCAACATTATCCTCATTA;SOR=1.191;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=261;TCF=158;TCR=103;TR=260;WE=226353529;WS=226353511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,272:1.00:272
chr1	226411317	rs10915962	C	T	1621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.95;ReadPosRankSum=-0.841;SOR=0.420;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,64:0.98:65
chr1	226420722	rs2306119	A	G	298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=11;NR=1;PP=232;SC=ACAAATATGCATAATTCTTAA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=226420730;WS=226420712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	226438449	rs6678137	T	C	473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=15;NR=4;PP=355;SC=AAGGTTTCCTTCCATAGATAT;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=19;WE=226438457;WS=226438439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	226474132	rs10799347	G	A	2059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=44;PP=1318;SC=GACATACACAGAAGTCATTAT;SOR=1.349;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=26;TCR=44;TR=70;WE=226474140;WS=226474122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr1	226485327	rs11390947	A	AT	1611.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.270;NF=17;NR=13;PP=994;ReadPosRankSum=-0.248;SC=AAACTTGTAAATTTTTTACTG;SOR=0.618;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=36;TCF=19;TCR=17;TR=30;WE=226485335;WS=226485317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,55:0.98:56
chr1	226497256	rs150096442	G	A	9298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=343;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=171;NR=132;PP=2965;SC=GGAGGCCCCGGCGGGGGGAAA;SOR=0.960;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=304;TCF=172;TCR=132;TR=303;WE=226497264;WS=226497246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,343:1.00:343
chr1	226549885	rs368063214	CT	C	52.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.49;MQRankSum=0.748;QD=4.79;ReadPosRankSum=1.434;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr1	226550741	rs747659	C	T	4598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=64;PP=2683;SC=AGCAAGCCCCCGGCTTCTGTG;SOR=1.052;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=160;TCF=96;TCR=64;TR=160;WE=226550749;WS=226550731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr1	226556094	rs1805400	T	C	2982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=61;PP=1995;SC=GCTTTCTCTTTTAGCAGGTGG;SOR=1.436;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=96;TCF=35;TCR=61;TR=96;WE=226556102;WS=226556084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr1	226564884	rs148181159	G	A	2551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.141;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=41;PP=1579;ReadPosRankSum=1.455;SC=AAGCGTTCCCGGTTTTTTCTT;SOR=0.810;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=180;TCF=113;TCR=67;TR=108;WE=226564892;WS=226564874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,117:0.59:198
chr1	226566726	rs907190	A	C	399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=11;NR=2;PP=316;SC=CTCTGTGATTAGATTTCATTC;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=226566734;WS=226566716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	226567008	rs732284	C	G	4226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=73;NR=70;PP=2184;SC=ACAGTTTTCTCTCCCCTTGAG;SOR=0.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=143;TCF=73;TCR=70;TR=143;WE=226567016;WS=226566998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr1	226567563	rs2271343	C	G	283.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=1;PP=262;SC=CCGTGGACAACAACCTGGCCA;SOR=3.056;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=226567571;WS=226567553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	226570840	rs1805415	T	C	1570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=28;NR=16;PP=674;SC=TACGGTCCTGTTTTTTAACCT;SOR=0.841;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=28;TCR=16;TR=44;WE=226570848;WS=226570830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	226573364	rs1805414	A	G	7125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=124;NR=114;PP=2965;SC=CCATGCCATCAGCTACTCGGT;SOR=0.738;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=239;TCF=124;TCR=115;TR=238;WE=226573372;WS=226573354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,270:1.00:270
chr1	226573402	rs1805408	T	C	5958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=99;NR=100;PP=2935;SC=TGGAGAAACATGTCAGAGGGC;SOR=0.842;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=200;TCF=99;TCR=101;TR=199;WE=226573410;WS=226573392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr1	226576296	rs2293464	G	A	6629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=130;NR=95;PP=2965;SC=TGTCTTCCCAGAATGAGAAAG;SOR=0.937;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=225;TCF=130;TCR=95;TR=225;WE=226576304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr1	226580021	rs1805405	G	T	3217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=66;PP=1917;SC=TTTGCCTGGAGAATCAAACAG;SOR=1.382;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=41;TCR=66;TR=107;WE=226580029;WS=226580011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr1	226580093	rs2280712	C	T	1407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=30;PP=885;SC=CCTCTTCTACCTCCCCAGGAT;SOR=1.656;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=13;TCR=30;TR=43;WE=226580101;WS=226580083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	226589709	rs2666428	C	T	2230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=27;PP=1365;SC=ATTCCAAGCACCTGGAAAAAC;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=53;TCR=27;TR=80;WE=226589717;WS=226589699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr1	226589833	rs1805407	T	C	3933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=62;PP=2380;SC=TGGGGGAGGTTTGCTTTGCTC;SOR=0.735;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=130;TCF=68;TCR=62;TR=130;WE=226589841;WS=226589823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
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chr1	226923264	rs708775	G	A	717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=15;PP=476;ReadPosRankSum=-0.629;SC=TATGCAGGAAGGCTGAGTTGG;SOR=0.731;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=76;TCF=38;TCR=38;TR=30;WE=226923272;WS=226923254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,34:0.40:86
chr1	226923505	rs708776	G	T	2459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.435;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=48;PP=1585;ReadPosRankSum=1.485;SC=AGGCTTGTCCGGATCTTGGGG;SOR=0.579;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=208;TCF=104;TCR=104;TR=101;WE=226923513;WS=226923495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,113:0.48:233
chr1	226923938	rs6667260	A	C	1223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=27;PP=884;ReadPosRankSum=-0.417;SC=CAGCTCAGGGAATCAGAGGAC;SOR=0.659;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=159;TCF=86;TCR=73;TR=57;WE=226923946;WS=226923928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,62:0.36:174
chr1	226924875	rs147889095	ACTGCCGCTG	A	1787.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.116;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.593;NF=5;NR=13;PP=2976;ReadPosRankSum=-0.977;SC=TGCTCACGCTACTGCCGCTGC;SOR=0.378;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=46;TCF=8;TCR=38;TR=18;WE=226924891;WS=226924865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,48:0.55:87
chr1	227069677	rs11405	T	C	3678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.403;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=80;PP=1673;ReadPosRankSum=0.797;SC=TAATGTCGGCTGAGAGCCCCA;SOR=0.658;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=288;TCF=137;TCR=151;TR=157;WE=227069685;WS=227069667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,184:0.56:328
chr1	227069737	rs6759	C	T	1590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.627;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=43;PP=981;ReadPosRankSum=-1.488;SC=ATGGAGAGAACACTGCCCAGT;SOR=1.172;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=118;TCF=39;TCR=79;TR=62;WE=227069745;WS=227069727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,72:0.55:132
chr1	227071364	rs1295643	G	A	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.419;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=378;ReadPosRankSum=1.103;SC=ATAGGCTGCCGTGGGGGACAT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=8;WE=227071385;WS=227071354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr1	227071377	rs1295644	T	C	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.031;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=378;ReadPosRankSum=0.677;SC=GGGGACATTCTGCGGCCCTCA;SOR=1.214;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=10;WE=227071385;WS=227071354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr1	227071525	rs1046240	C	T	1756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.641;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=45;PP=1017;ReadPosRankSum=0.162;SC=GAGCGAAGCACGTGATCATGC;SOR=0.947;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=222;TCF=114;TCR=108;TR=84;WE=227071533;WS=227071515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,95:0.38:247
chr1	227073410	rs2236910	G	C	1475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.334;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=36;PP=860;ReadPosRankSum=-1.778;SC=CTCCAGCCACGCTTCTCTCCG;SOR=0.941;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=108;TCF=42;TCR=66;TR=55;WE=227073418;WS=227073400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,67:0.52:130
chr1	227078955	rs2802267	T	C	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.331;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=204;ReadPosRankSum=0.934;SC=CCGCCTGAGATGTGAACCTTT;SOR=1.040;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=53;TCF=33;TCR=20;TR=18;WE=227078963;WS=227078945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,20:0.35:57
chr1	227079222	rs2236915	C	G	581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.755;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=10;PP=333;ReadPosRankSum=1.001;SC=CTTGAAGATTCAGCAAGTGTT;SOR=0.790;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=36;TCF=19;TCR=17;TR=19;WE=227079230;WS=227079212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,25:0.61:41
chr1	227081622	rs10753428	A	G	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.243;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=10;PP=382;ReadPosRankSum=1.624;SC=GGGCAAGAGCAGCTGGGCCTT;SOR=0.292;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=58;TCF=43;TCR=15;TR=33;WE=227081630;WS=227081612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,37:0.57:65
chr1	227081850	rs2855562	G	A	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.958;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=287;ReadPosRankSum=-1.382;SC=GATGCGTCCAGCTGCCTCGTG;SOR=1.549;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=45;TCF=18;TCR=27;TR=22;WE=227081858;WS=227081840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,27:0.53:51
chr1	227085155	rs11802358	G	A	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=305;ReadPosRankSum=1.029;SC=TTAGGGTGAAGTGTTAAGACT;SOR=0.941;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=17;WE=227085163;WS=227085145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,17:0.44:39
chr1	227149203	rs11549708	G	A	1437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.810;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=36;PP=873;ReadPosRankSum=-0.892;SC=TGATCATGGCGGCCAGGGCCC;SOR=0.940;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=145;TCF=68;TCR=77;TR=65;WE=227149211;WS=227149193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,71:0.44:162
chr1	227165097	rs3806263	G	A	811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.915;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=11;PP=441;ReadPosRankSum=1.441;SC=GTGGGCGAGCGGGTGGCCCCA;SOR=0.883;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=64;TCF=42;TCR=22;TR=34;WE=227165105;WS=227165087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,38:0.53:72
chr1	227170298	rs2297412	A	G	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.817;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=81;ReadPosRankSum=-1.797;SC=TGGCCAGGGCATCCCAGGAGT;SOR=1.954;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=7;WE=227170306;WS=227170288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr1	227170768	rs2256060	T	C	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=73;ReadPosRankSum=-0.042;SC=CCTGTCCCTATGGGGGCTGCA;SOR=1.091;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=8;WE=227170776;WS=227170758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr1	227171584	rs3215919	GT	G	150.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.867;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=1.418;NF=2;NR=3;PP=109;ReadPosRankSum=0.043;SC=CCCCTTGCGTGTTTGCACCAG;SOR=0.544;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=5;WE=227171592;WS=227171574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr1	227171736	rs149374145	G	GT	698.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.83;MQRankSum=2.324;QD=14.87;ReadPosRankSum=-1.789;SOR=0.478;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,21:0.45:47
chr1	227171738	rs377335668	G	T	706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=2.406;NF=20;NR=6;PP=462;ReadPosRankSum=-0.880;SC=GTGTGTGTGGGGGGGGGGACG;SOR=0.593;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=74;TCF=50;TCR=24;TR=26;WE=227171746;WS=227171725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,21:0.43:49
chr1	227171958	rs7530213	G	C	1858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=16;NR=47;PP=1238;SC=CCAGCAGACAGGTGGGGCCAG;SOR=2.372;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=16;TCR=47;TR=63;WE=227171966;WS=227171948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr1	227172290	rs12593	C	T	3647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=383;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.370;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=72;PP=2095;ReadPosRankSum=-0.482;SC=GGGAGCTGTTCGAGTTCCACT;SOR=0.655;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=343;TCF=177;TCR=166;TR=155;WE=227172298;WS=227172280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:206,176:0.46:382
chr1	227172518	rs1317490	C	T	1047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.251;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=4;PP=605;ReadPosRankSum=1.723;SC=CTTCCCGGCCCCACACACCCG;SOR=0.505;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=55;TCR=7;TR=35;WE=227172526;WS=227172508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,41:0.58:71
chr1	227172903	rs2297415	G	A	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=7;PP=434;ReadPosRankSum=-0.388;SC=CTGGGATGTCGGGAGCTGAGC;SOR=0.771;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=58;TCF=43;TCR=15;TR=28;WE=227172911;WS=227172893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,29:0.48:60
chr1	227172935	rs2297416	C	G	1277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.603;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=18;PP=747;ReadPosRankSum=-0.584;SC=CCCACGGTCCCCTCCTGTGCC;SOR=0.466;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=106;TCF=74;TCR=32;TR=57;WE=227172943;WS=227172925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,62:0.55:113
chr1	227174122	rs41303131	C	G	1520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.844;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=12;PP=1030;ReadPosRankSum=1.341;SC=TCTGGTGTCTCGCCGCCATTT;SOR=1.015;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=91;TCF=69;TCR=22;TR=55;WE=227174130;WS=227174112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,61:0.59:104
chr1	227174145	rs7552783	T	C	2279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.627;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=28;PP=1555;ReadPosRankSum=-0.099;SC=CCTTCCTCTCTTGCCCCAGGT;SOR=0.637;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=151;TCF=108;TCR=43;TR=93;WE=227174153;WS=227174135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,99:0.60:166
chr1	227174210	rs3738725	T	C	3762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=382;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.867;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=77;PP=2146;ReadPosRankSum=1.533;SC=CCTTCGCCTCTGATGAGCCTT;SOR=0.534;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=351;TCF=202;TCR=149;TR=173;WE=227174218;WS=227174200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:197,185:0.48:382
chr1	227181923	rs3795451	C	T	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.087;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=121;ReadPosRankSum=-0.282;SC=TGAGAGGAGGCGAGTGGCAGG;SOR=0.495;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=8;WE=227181931;WS=227181913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr1	227182033	rs2802269	G	A	3157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=48;PP=1919;SC=TCGGGGTGAAGCTGGGCTTGG;SOR=0.892;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=64;TCR=48;TR=112;WE=227182049;WS=227182023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr1	227182179	rs61833999	C	T	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.253;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=351;ReadPosRankSum=0.200;SC=ACCACCGCCCCCTCCAGCCAC;SOR=0.246;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=43;TCF=10;TCR=33;TR=24;WE=227182187;WS=227182169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,25:0.56:45
chr1	227182575	rs1045247	A	G	4102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=52;PP=2232;SC=CCATGCCTCCAGAGGACAAAG;SOR=1.136;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=87;TCR=52;TR=139;WE=227182583;WS=227182565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr1	227192579	rs2297418	A	C	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=173;ReadPosRankSum=-0.283;SC=CACTGCAGCCACTTGAGAATG;SOR=0.223;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=10;WE=227192587;WS=227192569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr1	227198775	rs12403978	C	G	927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.059;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=28;PP=647;ReadPosRankSum=0.215;SC=CTATCAAAAACAAAAGAAAGA;SOR=0.282;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=78;TCF=15;TCR=63;TR=37;WE=227198783;WS=227198765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,39:0.48:82
chr1	227210820	rs11580229	G	A	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.845;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=185;ReadPosRankSum=2.861;SC=GAATGTGATAGTGGCCAACAT;SOR=0.352;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=14;WE=227210828;WS=227210810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr1	227210888	rs11578479	A	T	794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=16;PP=444;ReadPosRankSum=-0.488;SC=ACTTATTATTAATGTGACCTT;SOR=0.635;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=48;TCR=34;TR=38;WE=227210896;WS=227210878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,40:0.47:86
chr1	227213968	rs7535826	G	T	597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.163;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=19;PP=388;ReadPosRankSum=0.089;SC=AAATCCTATGGGGCTATCATA;SOR=0.921;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=53;TCF=14;TCR=39;TR=25;WE=227213976;WS=227213958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,27:0.47:57
chr1	227216662	rs1929861	T	C	2725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.923;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;ReadPosRankSum=0.494;SC=CTTGAATTTCTTTAAATTTTC;SOR=0.762;Source=Platypus;TCF=129;WE=227216670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,126:0.46:272
chr1	227218069	rs5781458	C	CAT	2156.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=16;PP=1263;SC=TTTTTTAACACGATTTAAAAT;SOR=1.329;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=29;TCF=13;TCR=16;TR=28;WE=227218077;WS=227218059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	227218085	rs34370338	CA	C	763.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.31;MQRankSum=-1.682;QD=11.23;ReadPosRankSum=1.087;SOR=0.674;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,40:0.59:68
chr1	227219314	rs1319103	A	G	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=35;ReadPosRankSum=-0.697;SC=CCAATAAAATAAGCATTCATT;SOR=0.223;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=4;WE=227219322;WS=227219304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr1	227221251	rs12031609	T	C	458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.795;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=298;ReadPosRankSum=-0.494;SC=AAAAATTAATTTTCCCCCATT;SOR=1.241;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=42;TCF=14;TCR=28;TR=18;WE=227221259;WS=227221241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,20:0.44:45
chr1	227222515	rs113874316	G	GACAA	7160.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=66;PP=2972;SC=GTTTTAGACAGACAAACAGCC;SOR=1.281;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=89;TCF=6;TCR=83;TR=70;WE=227222523;WS=227222495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr1	227227740	rs12026688	A	C	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.057;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=242;ReadPosRankSum=0.750;SC=TGATTAAGTAAAACAAACATT;SOR=1.863;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=43;TCF=36;TCR=7;TR=15;WE=227227748;WS=227227730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,16:0.36:45
chr1	227228037	rs10495270	A	C	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=196;ReadPosRankSum=-1.479;SC=TTTTCTAAATAGGAATAGAAT;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=11;WE=227228045;WS=227228027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr1	227239739	rs55865118	T	A	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=4.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.03;ReadPosRankSum=-0.595;SOR=1.449;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,27:0.52:52
chr1	227239746	rs10799381	G	T	1627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.39;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	227246890	rs59693176	C	CA	148.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=169;ReadPosRankSum=0.851;SC=CGGCCAAAGCCAAAAAAAAAA;SOR=0.818;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=14;WE=227246898;WS=227246880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr1	227247016	rs10495266	G	C	1641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=28;PP=933;ReadPosRankSum=0.932;SC=ACAGGCAAAAGGATGAGAGAG;SOR=0.648;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=142;TCF=86;TCR=56;TR=69;WE=227247024;WS=227247001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,78:0.48:163
chr1	227259884	rs10495263	G	A	2446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.875;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=36;PP=1317;ReadPosRankSum=-2.131;SC=TAAGTCCTGAGTGAGGCAAAC;SOR=0.884;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=214;TCF=128;TCR=86;TR=96;WE=227259892;WS=227259874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,116:0.48:241
chr1	227268488	rs1929853	T	G	1504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.757;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=14;PP=889;ReadPosRankSum=-0.694;SC=ATTTATCACATCTGACAAATG;SOR=0.449;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=72;TCR=25;TR=54;WE=227268496;WS=227268478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,64:0.57:112
chr1	227288655	rs2104863	G	A	312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=3;PP=227;SC=CAGGTACTCAGTAAGTATTTA;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=12;WE=227288663;WS=227288645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	227299978	rs2458521	C	T	2119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.840;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=34;PP=1241;ReadPosRankSum=1.334;SC=AGAAGAAAATCAATTAAGCTT;SOR=0.331;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=127;TCF=82;TCR=45;TR=82;WE=227299986;WS=227299968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,91:0.64:142
chr1	227300277	rs488104	G	A	687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=3;PP=556;SC=AATAACTTTAGAAATATTTTA;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=227300285;WS=227300267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	227330759	rs12139502	A	G	1582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=39;PP=847;ReadPosRankSum=-1.478;SC=TAAGAAATAGATAGCTATATG;SOR=0.721;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=155;TCF=75;TCR=80;TR=73;WE=227330767;WS=227330749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,83:0.47:176
chr1	227333141	rs60079575	T	C	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=144;ReadPosRankSum=0.398;SC=TATATAACCATAGTAGAAAGA;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=9;WE=227333149;WS=227333131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr1	227335329	rs6685954	T	C	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=128;ReadPosRankSum=1.200;SC=TTACTTAAGATACACAATAGA;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=7;WE=227335337;WS=227335319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr1	227348126	rs11800062	T	C	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.971;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=97;ReadPosRankSum=1.372;SC=GGCGCATAGATAGACAAATGG;SOR=0.307;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=10;WE=227348134;WS=227348116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr1	227348349	rs3754419	A	C	825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=22;PP=505;ReadPosRankSum=-1.663;SC=TGAAAAAATAAATAAATTCAA;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=71;TCF=26;TCR=45;TR=34;WE=227348357;WS=227348339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,39:0.50:78
chr1	227381326	rs6696485	C	T	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.761;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=59;ReadPosRankSum=1.094;SC=CAAATAATAACAACAACAAAG;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=5;WE=227381334;WS=227381324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr1	227381373	rs3768436	G	T	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.957;HP=8;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=406;ReadPosRankSum=-1.745;SC=AATTTTTTTTGGTTGACGATA;SOR=0.330;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=47;TCF=37;TCR=10;TR=25;WE=227381381;WS=227381363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,26:0.53:49
chr1	227381674	rs35780410	TA	T	389.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=333;ReadPosRankSum=-1.031;SC=AGTAAACTAATAAGGGTGAAA;SOR=1.061;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=10;WE=227381682;WS=227381664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr1	227387143	rs3768435	A	G	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=82;ReadPosRankSum=-1.085;SC=CTTACCCTGTATGAAATGCAC;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=5;WE=227387151;WS=227387133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr1	227387361	rs3768434	A	G	2455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=36;NR=47;PP=1383;SC=TGTCTGAAACACAAAAAGAAA;SOR=1.061;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=36;TCR=47;TR=83;WE=227387369;WS=227387351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr1	227400792	rs1513612	A	T	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=234;ReadPosRankSum=0.621;SC=ATTCCTGAAAAATATTTCTAA;SOR=0.787;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=19;WE=227400800;WS=227400782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr1	227401081	.	A	G	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.31;ReadPosRankSum=-0.105;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr1	227834228	rs79145640	AT	A	1898.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.010;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=49;PP=2007;ReadPosRankSum=1.617;SC=ATACGTGTGTATTTTTCCCCC;SOR=0.608;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=159;TCF=55;TCR=104;TR=72;WE=227834241;WS=227834218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,104:0.44:236
chr1	227841981	rs72748099	A	G	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=219;ReadPosRankSum=0.190;SC=AGATTTGTAAAGTATATTTAC;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=10;WE=227841989;WS=227841971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr1	227920061	rs1060295	T	G	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.147;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=153;ReadPosRankSum=-0.473;SC=GCTGCCTCTCTTCCACCCGTC;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=9;WE=227920069;WS=227920051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr1	227920103	rs3087908	G	A	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.142;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=430;ReadPosRankSum=0.630;SC=CTATGGGGCCGCAGCAGCATC;SOR=1.473;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=43;TCF=32;TCR=11;TR=25;WE=227920111;WS=227920093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,26:0.58:45
chr1	227920447	rs751748	C	T	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.212;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=325;ReadPosRankSum=0.212;SC=ACCCGACATGCGCCCAGTCCC;SOR=1.042;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=51;TCF=15;TCR=36;TR=21;WE=227920455;WS=227920437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,21:0.40:53
chr1	227922918	rs2295994	A	C	3449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.623;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=52;PP=2192;ReadPosRankSum=0.150;SC=CGCCGGGGACATCGACCCCCA;SOR=0.850;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=256;TCF=155;TCR=101;TR=141;WE=227922926;WS=227922908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,159:0.56:284
chr1	227923081	rs7419238	G	A	11118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=413;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=182;NR=200;PP=2965;SC=TTTCTGCCCCGCCAGCGCCTG;SOR=0.843;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=382;TCF=182;TCR=200;TR=382;WE=227923089;WS=227923071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,413:1.00:413
chr1	227935280	rs2236361	C	T	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.217;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=5;PP=393;ReadPosRankSum=0.499;SC=GAGTCAGCCACGTGCTGCAGC;SOR=0.461;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=52;TCF=43;TCR=9;TR=26;WE=227935288;WS=227935270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,27:0.48:56
chr1	227935355	rs2236360	T	C	2170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.527;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=43;PP=1168;ReadPosRankSum=-0.833;SC=CTCCAGTCCATGGGTGACGGC;SOR=0.648;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=182;TCF=108;TCR=74;TR=102;WE=227935363;WS=227935345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,106:0.54:196
chr1	227935444	rs2236359	A	G	2724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.183;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=56;PP=1537;ReadPosRankSum=-0.087;SC=ACAGATGAGCAGGGATGTCTG;SOR=0.858;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=212;TCF=106;TCR=106;TR=111;WE=227935452;WS=227935434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,127:0.53:240
chr1	227963491	rs754224	G	T	1068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.830;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=17;PP=523;ReadPosRankSum=-1.425;SC=GCTCTGCAGGGCTTCCGGCCT;SOR=0.818;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=70;TCF=40;TCR=30;TR=42;WE=227963499;WS=227963481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,49:0.59:83
chr1	227968107	rs10799448	G	A	534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.129;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=8;PP=338;ReadPosRankSum=-1.619;SC=CTGCTGGCTCGCAGATGGCAT;SOR=0.467;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=48;TCF=36;TCR=12;TR=24;WE=227968115;WS=227968097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,26:0.48:54
chr1	228003657	.	C	T	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.540;ClippingRankSum=0.000;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=328;ReadPosRankSum=-2.290;SC=GTCGCCTGCCCATCCCTTCCC;SOR=0.582;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=42;TCF=16;TCR=26;TR=22;WE=228003665;WS=228003647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,21:0.45:47
chr1	228003839	rs79840641	C	T	1143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=0.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.86;ReadPosRankSum=1.271;SOR=0.770;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,57:0.49:116
chr1	228033197	rs9426581	A	G	2763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=26;PP=1733;SC=GCTGCAGGAGATGCAGCTCCC;SOR=1.708;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=63;TCR=26;TR=89;WE=228033205;WS=228033187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr1	228033333	rs16848162	T	A	2201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=49;PP=1222;ReadPosRankSum=0.138;SC=TCCTGGTCCATGAGACAGAGG;SOR=0.699;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=187;TCF=82;TCR=105;TR=88;WE=228033341;WS=228033323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,101:0.50:204
chr1	228112121	rs4653889	A	G	687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.981;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=19;PP=416;ReadPosRankSum=-0.615;SC=GCAAGGGCCGATCAGTGAGCC;SOR=0.843;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=59;TCF=22;TCR=37;TR=30;WE=228112129;WS=228112111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,33:0.52:63
chr1	228113163	rs3795768	A	G	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=21;PP=457;ReadPosRankSum=0.152;SC=GCGCCTGGGCAGCCGCCTCTG;SOR=0.720;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=65;TCF=24;TCR=41;TR=31;WE=228113171;WS=228113153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,33:0.45:74
chr1	228129197	rs631768	T	C	1977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=33;NR=30;PP=1007;SC=GGAGACTCCATGGGGACCCTC;SOR=0.832;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=33;TCR=30;TR=63;WE=228129205;WS=228129187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr1	228294300	rs12564763	T	C	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=141;ReadPosRankSum=1.394;SC=CACTGAGCTCTCTCTGTGCTT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=8;WE=228294308;WS=228294291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr1	228334418	rs3216021	GAT	G	538.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=475;ReadPosRankSum=1.010;SC=GCCCAGCAAGGATCTGACTAA;SOR=1.085;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=12;WE=228334427;WS=228334408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,14:0.78:18
chr1	228334436	rs55873533	G	A	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=327;ReadPosRankSum=0.933;SC=TAAAGCAGTCGTGGGTGTGGG;SOR=0.638;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=17;WE=228334444;WS=228334426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,18:0.78:23
chr1	228335116	rs144608344	G	A	565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=297;ReadPosRankSum=1.301;SC=GCAAGGTGGCGGTGCAGGCCG;SOR=0.613;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=42;TCR=19;TR=25;WE=228335124;WS=228335106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,30:0.42:72
chr1	228352160	rs4348717	T	C	2290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=53;PP=1332;SC=TAGCAGTGTGTGGTTCCTGCC;SOR=1.455;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=30;TCR=53;TR=83;WE=228352168;WS=228352150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr1	228353651	rs55873785	G	C	604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.392;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=393;ReadPosRankSum=-1.259;SC=CCAACGGCCGGAGCGGCCTGG;SOR=1.154;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=49;TCF=35;TCR=14;TR=25;WE=228353659;WS=228353641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,28:0.49:57
chr1	228362682	rs2298014	G	A	1263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.035;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=27;PP=756;ReadPosRankSum=1.552;SC=GGTGCCCGGGGGCCGGCTCGG;SOR=0.473;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=129;TCF=75;TCR=54;TR=58;WE=228362690;WS=228362672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,62:0.44:140
chr1	228391591	rs12022917	G	C	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.087;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=404;ReadPosRankSum=-0.333;SC=ATGGTAGAGTGACTGTAGGTA;SOR=0.941;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=57;TCF=40;TCR=17;TR=24;WE=228391599;WS=228391581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,26:0.43:60
chr1	228399482	rs11804508	C	G	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=89;ReadPosRankSum=1.088;SC=CGCCGCCACCCTCATGGATCA;SOR=0.582;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=8;WE=228399490;WS=228399472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr1	228399766	rs55971985	T	C	1043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.289;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=26;PP=582;ReadPosRankSum=0.023;SC=CCTTCGCTGCTGTGGGCCTGC;SOR=0.911;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=108;TCF=57;TCR=51;TR=49;WE=228399774;WS=228399756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,54:0.43:127
chr1	228400646	rs3121192	T	C	2277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=3.514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.81;ReadPosRankSum=2.451;SOR=1.066;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,62:0.54:115
chr1	228400653	rs3121191	A	T	2114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=1.679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.36;ReadPosRankSum=2.707;SOR=0.913;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,54:0.55:99
chr1	228402047	rs1620111	A	G	2285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.428;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=52;PP=1534;ReadPosRankSum=0.966;SC=GCCACACACTAACCATCTCCC;SOR=0.735;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=284;TCF=148;TCR=136;TR=108;WE=228402055;WS=228402037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:191,115:0.38:306
chr1	228402121	rs1771487	A	G	1666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.012;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=44;PP=990;ReadPosRankSum=-0.858;SC=ACGTCCACCCAGTTCTGCGTG;SOR=0.770;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=230;TCF=104;TCR=126;TR=80;WE=228402129;WS=228402111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,90:0.35:255
chr1	228402508	rs2776853	C	T	1466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=18;PP=874;ReadPosRankSum=1.091;SC=GAAGCCTCCCCTGCAACCCCC;SOR=0.724;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=113;TCF=77;TCR=36;TR=60;WE=228402516;WS=228402498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,67:0.53:127
chr1	228404668	rs3795777	T	C	1108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=6;PP=814;SC=TGGCCAAGTTTGTGCTCAGGG;SOR=2.964;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=33;WE=228404676;WS=228404658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	228412106	rs1771482	T	C	1404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=32;NR=18;PP=915;SC=TCTGAAACTTTAGTTTCTGTG;SOR=1.036;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=32;TCR=18;TR=50;WE=228412114;WS=228412096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	228412227	rs1771480	TG	CA	5731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=45;PP=2947;SC=CAGGAGCCAGTGCCACACTGA;SOR=0.895;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=62;TCR=47;TR=105;WE=228412236;WS=228412217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr1	228412308	rs1757152	G	A	4784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=67;PP=2809;SC=GCTCCAGCTCGAAAGTGTGCA;SOR=0.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=157;TCF=90;TCR=67;TR=156;WE=228412316;WS=228412298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr1	228431095	rs1771455	A	G	2685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=44;PP=1390;SC=CAGGCAAGACAGATGCCGGGG;SOR=1.469;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=75;TCF=31;TCR=44;TR=74;WE=228431103;WS=228431085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr1	228431235	rs11584385	G	A	472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=5;NR=9;PP=209;SC=CCACCTAATTGCCTCTTTTCT;SOR=1.863;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=14;WE=228431243;WS=228431225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	228431930	rs10916293	C	T	6249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=120;NR=90;PP=2965;SC=GAATCTTCAGCGCCTGTGAAA;SOR=0.950;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=210;TCF=120;TCR=90;TR=210;WE=228431938;WS=228431920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr1	228432987	rs1757129	G	C	1400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=9;PP=958;SC=AGAGCATCTTGAGTCTGTGGA;SOR=2.560;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=43;TCF=34;TCR=9;TR=42;WE=228432995;WS=228432977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	228433217	rs2487384	A	G	4212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=65;PP=2716;ReadPosRankSum=-0.711;SC=AGCCCCAGACAGAGGTGACGT;SOR=0.278;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=148;TCF=83;TCR=65;TR=147;WE=228433225;WS=228433207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,158:0.99:159
chr1	228434395	rs7517088	T	C	5092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=78;PP=2763;SC=GCATAGAGGCTGCGGGCTGCA;SOR=0.793;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=164;TCF=86;TCR=78;TR=163;WE=228434403;WS=228434385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr1	228434467	rs7517108	T	C	4930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=82;PP=2622;SC=CCTGTGAGGCTGGGGGCCAGC;SOR=0.852;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=166;TCF=84;TCR=82;TR=166;WE=228434475;WS=228434457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr1	228437603	rs6426494	T	C	1052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.546;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=15;PP=686;ReadPosRankSum=-1.190;SC=GGCCTTGTCTTCCCAGTGCTG;SOR=0.862;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=72;TCR=33;TR=48;WE=228437611;WS=228437593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,50:0.43:116
chr1	228444297	rs7532141	T	G	1258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.993;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=20;PP=738;ReadPosRankSum=-0.359;SC=TCTCCCCAGTTCTGCCTTCCT;SOR=0.378;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=86;TCF=56;TCR=30;TR=52;WE=228444305;WS=228444287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,58:0.60:97
chr1	228444318	rs7532144	T	G	1669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.225;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=29;PP=976;ReadPosRankSum=1.313;SC=GACCTAGATGTTGGTGGTCAC;SOR=0.516;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=118;TCF=72;TCR=46;TR=70;WE=228444326;WS=228444308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,78:0.58:135
chr1	228444565	rs7532342	T	A	6620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.063;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=116;NR=107;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.707;SC=GGCCAGGCGGTCGCCGGGGAG;SOR=0.275;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=223;TCF=116;TCR=107;TR=223;WE=228444573;WS=228444555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,246:1.00:247
chr1	228444741	rs3795780	C	T	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.481;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=140;ReadPosRankSum=-0.669;SC=TCCACTTCTCCATGCCCTCAC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=9;WE=228444749;WS=228444731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr1	228447513	rs7525075	T	G	2435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FS=0.608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.82;ReadPosRankSum=0.403;SOR=0.785;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,66:0.43:154
chr1	228447519	rs7525078	T	A	2388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.94;ReadPosRankSum=-2.272;SOR=0.733;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,65:0.46:141
chr1	228456147	rs878388	T	C	6701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=124;NR=111;PP=2965;SC=CCTACTTTCTTGTCTAGGCCC;SOR=0.741;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=236;TCF=124;TCR=112;TR=235;WE=228456155;WS=228456137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr1	228461129	rs1188724	A	G	1188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=1.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.82;ReadPosRankSum=-2.009;SOR=0.566;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,66:0.43:152
chr1	228461408	rs11398292	A	AG	2460.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=21;NR=24;PP=1845;SC=GTGGCCCTGAAGGGAGCGGGG;SOR=1.164;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=50;TCF=25;TCR=25;TR=45;WE=228461416;WS=228461398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr1	228461757	rs474735	G	A	1692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.247;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.817;NF=41;NR=25;PP=855;ReadPosRankSum=-1.183;SC=AAGGTGAGCCGGGCATGGGGC;SOR=0.796;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=116;TCF=66;TCR=50;TR=66;WE=228461765;WS=228461747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,78:0.59:132
chr1	228464100	rs936884	G	A	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.420;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=91;ReadPosRankSum=-0.253;SC=GGTTCTAAAGGCGGTGGTCTC;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=6;WE=228464108;WS=228464090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr1	228464248	rs1188721	T	G	3867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=42;PP=2235;SC=CGGACGTGGATGGCAGCTGGA;SOR=1.187;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=124;TCF=82;TCR=42;TR=124;WE=228464256;WS=228464238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr1	228464276	rs1188722	T	C	4994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=98;NR=71;PP=2965;SC=CGGTCTGCGGTTCCAGCAGGG;SOR=0.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=169;TCF=98;TCR=71;TR=169;WE=228464284;WS=228464266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr1	228464842	rs936885	C	G	5436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=105;NR=75;PP=2965;SC=GTGCCTGACTCGGCCTCTGCC;SOR=0.857;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=180;TCF=105;TCR=75;TR=180;WE=228464850;WS=228464832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr1	228465346	rs493945	A	G	4977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=89;PP=2965;SC=GCCCACTGACAACGTGCGCAT;SOR=0.818;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=170;TCF=81;TCR=89;TR=170;WE=228465354;WS=228465336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr1	228465370	rs867599	T	G	4214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=69;PP=2761;SC=CCAGGAAGGTTCGAGGACAGG;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=69;TCR=69;TR=138;WE=228465378;WS=228465360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr1	228466750	rs3795782	T	C	1330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=25;PP=929;SC=ACGCTGGGTCTGGGCAGCTCA;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=19;TCR=25;TR=44;WE=228466758;WS=228466740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	228469801	rs150312546	G	C	2081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=49;PP=1111;ReadPosRankSum=0.300;SC=CACACGTCAGGGCCGAAAATA;SOR=0.715;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=181;TCF=86;TCR=95;TR=94;WE=228469809;WS=228469791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,101:0.52:194
chr1	228471046	rs41303079	C	T	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=2.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.269;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=4;PP=146;ReadPosRankSum=0.569;SC=TAGCGGGGCACGGGGCCACCC;SOR=0.175;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=16;TCF=7;TCR=9;TR=9;WE=228471054;WS=228471036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
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chr1	228480282	rs1150908	A	G	8399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=158;NR=133;PP=2965;SC=AAGGGGCCACAGCTGTGCTGC;SOR=0.812;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=291;TCF=158;TCR=133;TR=291;WE=228480290;WS=228480272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,318:1.00:318
chr1	228480964	rs10158357	A	G	1814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=45;NR=11;PP=1223;SC=GTCCAGTTGGATTCTGTGTCT;SOR=2.457;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=45;TCR=11;TR=56;WE=228480972;WS=228480954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	228482028	rs4653547	G	C	8356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=132;NR=124;PP=2965;SC=GGTGTGAGCTGCAGATCCGTG;SOR=0.707;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=256;TCF=132;TCR=124;TR=256;WE=228482036;WS=228482018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,292:1.00:292
chr1	228482285	rs1150909	T	C	1269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=23;PP=886;SC=CAGGAGGTGTTCTCATGCTCA;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=13;TCR=23;TR=36;WE=228482293;WS=228482275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	228484744	rs72759967	T	C	251.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=238;SC=TTGGTTCCTTTTTTATTTACA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=228484752;WS=228484739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	228486404	rs56021350	C	T	2244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.251;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=46;PP=1168;ReadPosRankSum=-2.058;SC=ACCTCGGCCACGCTCACTGTC;SOR=0.414;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=208;TCF=94;TCR=114;TR=92;WE=228486412;WS=228486394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,108:0.45:239
chr1	228494357	rs3795795	C	T	8503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=127;PP=2965;SC=CCCAGGCTAGCGTGGCCCAGG;SOR=1.284;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=207;TCF=80;TCR=127;TR=206;WE=228494365;WS=228494347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr1	228494382	rs1150911	T	C	6573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=94;PP=2938;SC=AGCGCAGTTCTTGTGCTTTGG;SOR=1.908;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=135;TCF=41;TCR=94;TR=135;WE=228494390;WS=228494372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr1	228494438	rs3795797	C	T	1207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=33;PP=926;SC=CCAACTGAGACGGCTCCACAG;SOR=3.967;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=4;TCR=33;TR=37;WE=228494446;WS=228494428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	228494696	rs4653939	G	A	4634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=60;PP=2724;SC=GGGCGGGTGCGAGCGTGGAGT;SOR=1.057;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=155;TCF=95;TCR=60;TR=155;WE=228494704;WS=228494686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr1	228495696	rs419173	T	C	1053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=6;PP=741;SC=ACAGATGGGCTATGGCAAAAG;SOR=2.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=33;WE=228495704;WS=228495686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	228496014	rs876180	G	A	3296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=52;NR=59;PP=1812;SC=AGGGCGTGACGCCCGAGGACG;SOR=1.064;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=111;TCF=52;TCR=59;TR=111;WE=228496022;WS=228496004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr1	228497053	rs379620	A	G	5005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=75;PP=2965;SC=CTCCATTCAGAAAGGCCTTCC;SOR=0.785;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=166;TCF=91;TCR=75;TR=166;WE=228497061;WS=228497043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr1	228503677	rs1150912	A	G	6377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=135;NR=88;PP=2965;SC=GAACCCGTGCACACCTCGGAG;SOR=1.019;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=223;TCF=135;TCR=88;TR=223;WE=228503685;WS=228503667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr1	228504472	rs1188732	T	C	4756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=89;PP=2679;SC=CGCACAGGCATGCTTCACCTG;SOR=0.783;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=177;TCF=88;TCR=89;TR=177;WE=228504480;WS=228504462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr1	228504507	rs114932694	G	T	1400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.299;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=34;PP=925;ReadPosRankSum=0.869;SC=CGGTGCCCGTGGGAGAGGCGT;SOR=0.844;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=141;TCF=73;TCR=68;TR=67;WE=228504515;WS=228504497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,69:0.47:147
chr1	228504591	rs61825301	C	A	3523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=58;NR=63;PP=1907;SC=GCAGTCACCACGCCCTACTGC;SOR=0.994;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=121;TCF=58;TCR=63;TR=121;WE=228504599;WS=228504581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr1	228504669	rs61825302	G	A	1192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=12;NR=26;PP=673;SC=TGGCCTCTGCGCGGCTCACCG;SOR=1.828;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=12;TCR=26;TR=38;WE=228504677;WS=228504659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	228504701	rs111792077	G	GCTCC	546.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=7;PP=349;SC=TGGTGGGCGAGCTTTTCCCTC;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=7;WE=228504709;WS=228504691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	228505204	rs4653942	G	A	3941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=78;NR=59;PP=2121;SC=GTGGTGGCTCGCAGCAGCCAC;SOR=0.848;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=137;TCF=78;TCR=59;TR=137;WE=228505212;WS=228505194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr1	228505668	rs1188729	C	G	7014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=140;NR=100;PP=2965;ReadPosRankSum=2.347;SC=GAAGATGTCTCTCTGGAGCTT;SOR=0.931;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=243;TCF=141;TCR=102;TR=240;WE=228505676;WS=228505658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,260:0.99:262
chr1	228505699	rs1188728	T	C	8084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=163;NR=124;PP=2965;SC=CTGAGGCTGGTGAGGTCATCT;SOR=0.923;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=288;TCF=163;TCR=125;TR=287;WE=228505707;WS=228505689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,306:1.00:306
chr1	228505739	rs3795801	G	A	9010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=156;NR=160;PP=2965;SC=CATCCAGCCCGGTGGGCGGTT;SOR=0.754;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=317;TCF=157;TCR=160;TR=316;WE=228505747;WS=228505729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,336:1.00:336
chr1	228509427	rs373610	A	G	6177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=95;PP=2965;SC=ACTGGCCTGGACCGTGCTGAT;SOR=0.702;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=202;TCF=107;TCR=95;TR=202;WE=228509435;WS=228509417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr1	228523447	rs10799473	T	C	2894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=41;PP=1580;SC=TCAGATGTGCTGGGGTTGGGA;SOR=1.028;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=57;TCR=41;TR=98;WE=228523455;WS=228523437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr1	228525008	rs3795809	G	A	6386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=115;PP=2965;SC=GCATCCCCCCGCCATGGCCGA;SOR=0.892;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=219;TCF=104;TCR=115;TR=219;WE=228525016;WS=228524991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr1	228526011	rs11577699	C	T	7362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=126;NR=115;PP=2965;SC=AGTGGGGGGCCGCTGAGGCCC;SOR=0.700;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=241;TCF=126;TCR=115;TR=241;WE=228526019;WS=228526001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,273:1.00:273
chr1	228527880	.	G	A	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=-0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.34;ReadPosRankSum=0.239;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr1	228539300	rs3795812	G	A	184.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=5;PP=103;SC=CACCATACCCGCTGCTACACC;SOR=1.179;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=8;WE=228539308;WS=228539290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	228547530	.	C	T	1104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.687;ClippingRankSum=0.000;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.125;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=23;PP=593;ReadPosRankSum=-1.917;SC=GGCCCACTCTCCAGCTCTGCC;SOR=0.752;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=113;TCF=63;TCR=50;TR=47;WE=228547542;WS=228547520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,54:0.39:137
chr1	228560139	rs498382	A	G	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=13;PP=431;ReadPosRankSum=0.351;SC=TGTCCCAGTCAGAGGAGGAGG;SOR=0.588;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=31;TCR=27;TR=27;WE=228560147;WS=228560129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,28:0.45:62
chr1	228560700	rs512253	T	C	1722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.552;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=36;PP=943;ReadPosRankSum=0.316;SC=TGCCGCTGGATGAGCCTGCAG;SOR=0.741;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=156;TCF=87;TCR=69;TR=80;WE=228560708;WS=228560690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,85:0.49:174
chr1	228565329	rs61730829	G	A	1957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.096;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=40;PP=1091;ReadPosRankSum=-0.518;SC=CCTGCTCAAGGTCGTGGACCT;SOR=0.626;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=195;TCF=107;TCR=88;TR=84;WE=228565337;WS=228565319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,95:0.45:212
chr1	228601638	rs472594	T	C	2634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.992;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=55;PP=1620;ReadPosRankSum=1.373;SC=GCGATCCCCCTACCTCCTGCC;SOR=0.790;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=207;TCF=107;TCR=100;TR=111;WE=228601646;WS=228601628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,123:0.51:240
chr1	228612838	rs2230656	G	T	3414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=47;PP=2234;SC=GCAACTTGCGGATTAGCAGCT;SOR=0.888;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=64;TCR=47;TR=111;WE=228612846;WS=228612828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr1	228613052	rs1188474	T	C	3227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=67;PP=1822;SC=GGCCCCGCGGTGTCCTCTGCC;SOR=1.292;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=46;TCR=67;TR=113;WE=228613060;WS=228613042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr1	228645063	rs10916317	A	G	2044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=16;PP=1300;SC=TTCTCGAGATAGTAGGTGGCT;SOR=1.965;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=49;TCR=16;TR=65;WE=228645071;WS=228645053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr1	228681749	rs3795817	C	T	370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=295;SC=TCCTTCACCCCGAGGCGTGTT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=228681757;WS=228681739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	228699477	rs6665115	T	C	10713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=391;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=193;NR=157;PP=2965;SC=CCTGGCCACGTGGTCACTCAT;SOR=0.894;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=350;TCF=193;TCR=157;TR=350;WE=228699485;WS=228699467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,390:1.00:390
chr1	229407233	.	G	C	51	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=1;NR=3;PP=51;QD=21.4428031368;SC=GCCGGAGCCGGGGGACGGATC;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=4;WE=229407241;WS=229407223;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:4,4:0.50:8
chr1	229422193	rs237764	T	C	1141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=16;PP=628;ReadPosRankSum=0.119;SC=TTCACAGCACTATTTTGAAGT;SOR=0.714;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=38;TCR=26;TR=39;WE=229422201;WS=229422183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,50:0.64:78
chr1	229438828	rs237787	G	A	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.802;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=160;ReadPosRankSum=-0.209;SC=TGAAAAAGAGGGGATCCCAGC;SOR=0.105;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=9;WE=229438836;WS=229438818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr1	229461024	rs2282083	C	T	2350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.079;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=54;PP=1611;ReadPosRankSum=0.578;SC=CTGTCATCCACGGGTTCTCTG;SOR=0.602;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=243;TCF=129;TCR=114;TR=109;WE=229461032;WS=229461014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,113:0.43:264
chr1	229477725	.	GA	G	64.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.798;ClippingRankSum=0.000;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.18;ReadPosRankSum=1.494;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,13:0.24:55
chr1	229477767	rs12756927	A	G	2161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.519;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=46;PP=1527;ReadPosRankSum=-0.182;SC=GGCGCAAGAAATAAGAGATCA;SOR=0.632;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=199;TCF=106;TCR=93;TR=97;WE=229477775;WS=229477757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,102:0.51:199
chr1	229568231	.	T	G	202	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=3;NR=9;SC=GAGGCTAGGCTCTCAGCGCTA;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=12;WE=229568239;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr1	229606225	rs113446739	G	T	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.740;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=42;ReadPosRankSum=0.084;SC=ATTTCAGTGAGATCTTTTGTG;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=229606233;WS=229606215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr1	229623292	rs34971259	G	A	2983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.054;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=63;PP=1772;ReadPosRankSum=0.637;SC=CAGCACTTTCGTTATACAGAT;SOR=0.615;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=286;TCF=149;TCR=137;TR=135;WE=229623300;WS=229623282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,147:0.47:310
chr1	229631378	rs12730426	C	A	956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.18;ReadPosRankSum=0.802;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,48:0.51:94
chr1	229663064	rs113712941	GAGGAA	G	10987.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=102;PP=2981;SC=TCCTTGTTGAGAGGAAAGGAA;SOR=0.892;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=148;TCF=38;TCR=110;TR=136;WE=229663076;WS=229663054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr1	229730452	rs2295625	G	A	4183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=77;PP=2327;ReadPosRankSum=-0.774;SC=CCTGCTGAGCGCTCCACAGCC;SOR=0.689;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=295;TCF=162;TCR=133;TR=168;WE=229730460;WS=229730442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,191:0.58:332
chr1	229738170	rs3753886	T	G	1631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.330;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=28;PP=855;ReadPosRankSum=0.066;SC=CATCCTTGACTCGCTTAATGC;SOR=0.908;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=165;TCF=91;TCR=74;TR=74;WE=229738178;WS=229738160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,84:0.47:179
chr1	229738236	rs4925500	G	A	1241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=30;PP=754;ReadPosRankSum=1.270;SC=TGGGCATGTCGGGGGGCTCCA;SOR=0.724;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=73;TCR=72;TR=60;WE=229738244;WS=229738226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,63:0.42:151
chr1	229745771	rs12735468	T	C	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.328;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=28;ReadPosRankSum=-0.566;SC=GGAGCAGGGCTAACTCACAAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=3;WE=229745779;WS=229745762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr1	229746019	rs2273573	C	T	1260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.600;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=31;PP=673;ReadPosRankSum=0.589;SC=TAACCCAGTACGTGGCAGGAT;SOR=0.778;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=131;TCF=61;TCR=70;TR=55;WE=229746027;WS=229746009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,66:0.42:159
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chr1	229781744	rs2274994	T	C	2372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.509;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=49;PP=1409;ReadPosRankSum=-0.352;SC=ATGTGTCCTCTAGCTCCTCCC;SOR=0.639;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=194;TCF=95;TCR=99;TR=102;WE=229781752;WS=229781734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,114:0.55:208
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chr1	229783236	.	TTATT	CTATC,CTATT	935	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.32;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=19;MQ=60.0;NF=27,63;NR=14,37;PP=492,935;QD=13.3040945088;SC=CATTTTTCCTTTATTTTATTT;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=100;TCF=63;TCR=37;TR=41,100;WE=229783248;WS=229783226;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.41:100
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chr1	229795070	rs1048306	T	G	789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.867;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=20;PP=461;ReadPosRankSum=-1.843;SC=GTGCCGCCAGTGACACTGTCC;SOR=0.960;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=74;TCF=31;TCR=43;TR=33;WE=229795078;WS=229795060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,36:0.44:81
chr1	230313911	rs678050	T	C	1263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=23;PP=721;ReadPosRankSum=-0.796;SC=AACTGATGAATGAAGGTGTGC;SOR=0.636;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=119;TCF=71;TCR=48;TR=57;WE=230313919;WS=230313901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,61:0.47:129
chr1	230371883	rs3811488	G	A	648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.117;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=18;PP=428;ReadPosRankSum=0.883;SC=TGCATTACCTGTCAGGGGTGT;SOR=1.101;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=63;TCF=27;TCR=36;TR=28;WE=230371891;WS=230371873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,30:0.46:65
chr1	230384970	rs1923950	G	A	1021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=25;PP=592;ReadPosRankSum=0.943;SC=ATTACATGACGCCTGAGCAGA;SOR=0.732;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=98;TCF=47;TCR=51;TR=47;WE=230384978;WS=230384960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,50:0.45:110
chr1	230386341	rs2273966	T	A	2005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=46;PP=1237;ReadPosRankSum=1.200;SC=GACAGAGAAGTGCCTCAGCTC;SOR=0.670;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=179;TCF=88;TCR=91;TR=90;WE=230386349;WS=230386331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,99:0.51:195
chr1	230451935	rs144363709	C	CAT	1672.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=10;PP=890;SC=TACACATGTGCATGTGTATAC;SOR=1.483;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=24;TCF=12;TCR=12;TR=21;WE=230451943;WS=230451925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	230451978	rs11122492	G	A	2221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=26;PP=1052;SC=ATGTGTATACGTACATATGTG;SOR=0.922;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=43;TCR=26;TR=69;WE=230451986;WS=230451968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr1	230459433	rs35048134	GC	G	889.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=24;PP=651;SC=CATCCCAAAGGCCCCCCCTCA;SOR=4.548;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=24;WE=230459441;WS=230459423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	230473103	rs10864744	A	C	925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=27;PP=637;ReadPosRankSum=-2.222;SC=AGTATTCAGCAAGCACAGATC;SOR=0.728;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=78;TCF=23;TCR=55;TR=38;WE=230473111;WS=230473093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,40:0.51:79
chr1	230497940	rs828479	G	T	2974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=20;PP=1936;SC=GCACGAGAGGGTGGGGGAGGA;SOR=2.371;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=74;TCR=20;TR=94;WE=230497948;WS=230497930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr1	230498232	rs2820384	C	T	1125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=33;PP=959;SC=GGAAGCCCTCCTGGGGCTCCA;SOR=5.670;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=34;WE=230498240;WS=230498222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	230503684	rs2632571	C	T	979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=6;PP=717;SC=CTCAAGGTCACGCAAGCTGGC;SOR=2.584;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=34;WE=230503692;WS=230503674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	230513128	rs828463	G	A	272.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=194;SC=ACATCAACACGTGATAAATCC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=230513136;WS=230513124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	230778243	rs11361885	AC	A	627.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.896;NF=14;NR=1;PP=368;ReadPosRankSum=-0.925;SC=GCGGAAGCGGACCCCCCTGTG;SOR=0.472;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=15;WE=230778251;WS=230778233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,25:0.58:43
chr1	230778491	rs4846864	G	C	2974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=79;PP=1927;SC=CCTCTGTGGCGGTCTCTTCGG;SOR=2.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=28;TCR=79;TR=107;WE=230778499;WS=230778481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr1	230795177	rs1359866	T	C	3280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=63;NR=38;PP=2061;SC=ATATCATTGCTATAATTTTTT;SOR=1.368;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=63;TCR=38;TR=101;WE=230795185;WS=230795167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr1	230796326	rs3736983	A	G	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=23;ReadPosRankSum=0.414;SC=TTCACATTCTATCAGCAATAT;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=3;WE=230796334;WS=230796325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr1	230796375	rs3736982	A	C	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=188;ReadPosRankSum=0.242;SC=TTACTTAACAATATATGGTTG;SOR=0.507;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=32;TCR=8;TR=14;WE=230796383;WS=230796365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,15:0.35:43
chr1	230819295	rs5781596	ATTC	A	3510.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.457;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.882;NF=12;NR=35;PP=1944;ReadPosRankSum=1.856;SC=ATAAACATTAATTCTTCTTCT;SOR=0.539;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=109;TCF=40;TCR=69;TR=47;WE=230819305;WS=230819285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,93:0.46:201
chr1	230820763	rs150768186	C	CACATT	753.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=509;ReadPosRankSum=-1.055;SC=TCGGAAGTCTCACATTAGACT;SOR=0.616;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=41;TCF=28;TCR=13;TR=10;WE=230820771;WS=230820753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,18:0.38:48
chr1	230822607	rs1536591	G	A	914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=7;PP=590;ReadPosRankSum=0.861;SC=TTATTGACGCGCACATATGTA;SOR=0.633;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=68;TCF=56;TCR=12;TR=34;WE=230822615;WS=230822597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,37:0.49:76
chr1	230825942	rs3000064	A	G	945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.982;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=21;PP=464;ReadPosRankSum=-0.250;SC=TGCTTAGAAGAGTCTGCGGCA;SOR=0.399;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=76;TCF=30;TCR=46;TR=38;WE=230825950;WS=230825932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,46:0.53:86
chr1	230828987	rs2478534	C	A	1562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.629;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=21;PP=907;ReadPosRankSum=-1.836;SC=TTTCCCCCCCCATATTCAGCT;SOR=0.602;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=127;TCF=86;TCR=41;TR=62;WE=230828995;WS=230828977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,75:0.49:152
chr1	230829139	rs1051038	A	G	1699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.628;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=41;PP=1099;ReadPosRankSum=-0.803;SC=AGCAGCCTTAAGCATCTTGGA;SOR=0.784;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=134;TCF=54;TCR=80;TR=67;WE=230829147;WS=230829129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,75:0.51:146
chr1	230839821	rs11568044	C	T	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=5;PP=459;ReadPosRankSum=0.906;SC=CCCTACTCTCCGCTCCCTCTT;SOR=0.698;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=63;TCF=52;TCR=11;TR=30;WE=230839829;WS=230839811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,30:0.43:69
chr1	230841559	rs3827749	G	A	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.802;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=252;ReadPosRankSum=1.160;SC=CCGTGCCACCGCGGCCCTGCC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=13;WE=230841567;WS=230841549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr1	230841687	rs7080	T	C	7156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=138;NR=105;PP=2965;SC=ACCGGGGAGATAGTTTCTTCA;SOR=0.873;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=243;TCF=138;TCR=105;TR=243;WE=230841695;WS=230841677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
chr1	230845794	rs699	A	G	3284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=364;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.802;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=65;PP=2037;ReadPosRankSum=0.435;SC=ACTGGCTCCCATCAGGGAGCA;SOR=0.630;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=329;TCF=191;TCR=138;TR=152;WE=230845802;WS=230845784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:192,169:0.47:361
chr1	230883466	rs12143120	C	T	4971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=98;PP=2913;SC=GTGAGTGGGGCGAGCAGGGGA;SOR=1.191;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=167;TCF=69;TCR=98;TR=167;WE=230883474;WS=230883456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr1	230883484	rs6690251	T	C	4263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=87;PP=2766;SC=GGAAGGAGCATAGATGAGGCC;SOR=1.691;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=44;TCR=87;TR=131;WE=230883492;WS=230883474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr1	230883499	rs6690254	T	C	3231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=69;PP=2072;SC=GAGGCCGAGGTTCAGCAGCCC;SOR=2.058;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=28;TCR=69;TR=97;WE=230883507;WS=230883489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr1	230891248	rs2493145	C	T	348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=9;PP=246;SC=CCAAGAGGCACGGGGCTGGGG;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=230891256;WS=230891238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	230898231	rs2282318	T	A	1042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=2;PP=709;SC=TGTAACTTGGTGGACAAAGCC;SOR=3.611;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=29;WE=230898239;WS=230898221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	230898494	rs2282319	C	T	7629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=126;NR=127;PP=2965;SC=CCGACCACAACGAGTTCTGGA;SOR=0.811;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=254;TCF=126;TCR=128;TR=253;WE=230898502;WS=230898484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,286:1.00:286
chr1	230898615	rs3215985	G	GA	1099.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=30;PP=995;SC=TAAGGGCTGGGAAAAAATCAG;SOR=4.351;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=30;WE=230898623;WS=230898605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	230903234	rs11122590	A	G	481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=4;PP=330;SC=AGGGTGCCCCAGTGGCCTCCC;SOR=1.863;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=17;WE=230903242;WS=230903224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	230903350	rs3828126	T	C	2668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=35;PP=1342;SC=AAGACTTCACTGGGGGTGTGG;SOR=0.957;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=51;TCR=35;TR=86;WE=230903358;WS=230903340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr1	230904911	rs11122593	C	T	2331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=20;PP=1424;SC=TGACTCTGCTCTTTCCATGTT;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=52;TCR=20;TR=72;WE=230904919;WS=230904901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr1	230914612	rs12130847	A	G	1227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=27;NR=15;PP=595;SC=CCTTGCGGACAGGAACAAGAT;SOR=1.007;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=27;TCR=15;TR=42;WE=230914620;WS=230914602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	230928351	rs2282321	C	T	890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=19;PP=584;SC=GAATTGTATTCGGACAGGGGA;SOR=1.112;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=13;TCR=19;TR=32;WE=230928359;WS=230928341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	230933898	rs2297831	C	T	1537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.696;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=32;PP=936;ReadPosRankSum=0.097;SC=TCCCCCTTCTCTCCTATCAGG;SOR=0.466;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=142;TCF=79;TCR=63;TR=64;WE=230933906;WS=230933888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,74:0.47:157
chr1	230975454	rs1202550	A	G	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.600;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=75;ReadPosRankSum=-1.426;SC=AAATCTGGCAATATTGACCAG;SOR=1.426;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=5;WE=230975462;WS=230975444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr1	231042732	rs3811502	T	A	4370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=63;NR=83;PP=2659;SC=ACGTTTCTGATACTGATGGAA;SOR=1.068;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=146;TCF=63;TCR=83;TR=146;WE=231042740;WS=231042722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr1	231047310	rs10580953	TAC	T	1858.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=24;PP=1244;SC=AAAAAAAAGATACAGACTCAT;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=28;WE=231047319;WS=231047300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	231047392	rs2153049	G	A	293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=229;SC=ACATCAAGAAGAGGATTGTTT;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=231047400;WS=231047382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	231057310	rs2275334	C	T	717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=18;PP=500;SC=CTCAAGCCAACATCTAATTTC;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=25;WE=231057318;WS=231057300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	231059784	rs3748774	C	T	644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=22;PP=564;SC=GCTAGTCCATCATATCTAAAA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=231059792;WS=231059774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	231060736	rs3748775	T	C	3856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=62;PP=2323;SC=GAAAGGAATATCGAGAAGAGT;SOR=0.780;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=129;TCF=67;TCR=62;TR=129;WE=231060744;WS=231060726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr1	231064578	rs5781609	T	TCTC	547.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=437;SC=CCCAGGCAATTCTACCTCACC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=9;WE=231064586;WS=231064568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	231064611	rs950029	G	A	883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=3;PP=703;SC=AGGGAGTAGCGTGCCACCATG;SOR=3.841;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=29;WE=231064619;WS=231064601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	231067236	rs11122624	C	T	4925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=97;PP=2872;SC=CAAAATGCTGCATTAGTATCA;SOR=1.262;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=162;TCF=65;TCR=97;TR=162;WE=231067244;WS=231067226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr1	231067318	rs11122625	G	T	1298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=30;PP=887;SC=GGTTAAACCAGACCTGTAAAC;SOR=1.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=15;TCR=30;TR=45;WE=231067326;WS=231067308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	231069652	rs1890351	A	C	812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=19;PP=555;SC=ATAATTGTTAAAATTGAGATT;SOR=3.098;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=23;WE=231069660;WS=231069642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	231081304	rs6673085	T	G	769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=23;PP=629;SC=CAGCTCTACTTCTTTATGCTA;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=231081312;WS=231081294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	231093785	rs59207624	CT	C	473.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.129;HP=10;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=1.206;NF=20;NR=0;PP=247;ReadPosRankSum=0.718;SC=CCATCCAAACCTTTTTTTTTT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=36;TCR=5;TR=20;WE=231093793;WS=231093775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,24:0.60:40
chr1	231298699	rs112692510	T	G	1369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.238;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=23;PP=850;ReadPosRankSum=-0.441;SC=AGAGCAGCGCTGGCAGCCGGC;SOR=0.807;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=154;TCF=95;TCR=59;TR=66;WE=231298707;WS=231298689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,72:0.43:169
chr1	231337031	rs11122252	C	A	1649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.341;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=28;PP=926;ReadPosRankSum=-0.771;SC=AAAGTCCCTACCTCTTCCTCA;SOR=0.576;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=126;TCF=74;TCR=52;TR=68;WE=231337039;WS=231337021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,77:0.55:139
chr1	231359931	rs16854007	C	T	832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.949;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=9;PP=607;ReadPosRankSum=-2.026;SC=CTGTGAAATGCGTGTTAAGAA;SOR=0.927;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=79;TCF=58;TCR=21;TR=37;WE=231359939;WS=231359921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,38:0.45:84
chr1	231361110	rs11590715	C	T	2143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.484;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.98;MQRankSum=-1.101;NF=63;NR=39;PP=1356;ReadPosRankSum=-0.528;SC=GACAGTGAAGCGCTCTAATGG;SOR=0.740;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=224;TCF=142;TCR=82;TR=102;WE=231361118;WS=231361100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,108:0.45:241
chr1	231362923	rs491182	G	A	1186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=38;PP=744;ReadPosRankSum=-0.750;SC=TAATGACAGCGTACAGGAATA;SOR=0.760;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=123;TCF=38;TCR=85;TR=54;WE=231362931;WS=231362913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,56:0.43:129
chr1	231363000	rs16854012	A	G	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=210;ReadPosRankSum=-2.010;SC=CATCTCTCACAACATCTTTCT;SOR=0.892;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=11;WE=231363008;WS=231362990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr1	231377081	rs518686	C	T	1281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.018;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=20;PP=856;ReadPosRankSum=0.589;SC=ACCACCACGGCTTAGCAAAGA;SOR=0.864;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=158;TCF=105;TCR=53;TR=64;WE=231377089;WS=231377071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,67:0.40:169
chr1	231401596	rs532226	T	C	1644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.731;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=49;PP=1212;ReadPosRankSum=-0.149;SC=TACATAAAACTTGACGCTTTA;SOR=0.788;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=120;TCF=32;TCR=88;TR=65;WE=231401604;WS=231401586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,69:0.53:130
chr1	231401902	rs574553	G	A	1432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.580;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=29;PP=796;ReadPosRankSum=1.749;SC=AACCAAAAGAGTCTACAACTG;SOR=0.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=156;TCF=90;TCR=66;TR=68;WE=231401910;WS=231401892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,73:0.44:166
chr1	231408091	rs11558492	A	G	1296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=27;PP=684;ReadPosRankSum=2.433;SC=TTCCTACGTGATGTTTTTGCA;SOR=0.723;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=131;TCF=68;TCR=63;TR=56;WE=231408099;WS=231408081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,67:0.46:147
chr1	231480507	rs1009227	A	G	1120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.91;SOR=0.829;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	231486989	rs2474633	A	C	495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=12;NR=6;PP=363;SC=TGCTTATGTAAATTGTTTTCT;SOR=1.127;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=18;WE=231486997;WS=231486979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	231487017	rs2474634	T	C	1148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=9;PP=658;SC=GTTAACTTGCTTATTGAATAC;SOR=1.347;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=34;WE=231487025;WS=231487007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	231488524	rs2437150	C	T	5656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=98;NR=77;PP=2965;SC=GCTGTAAGACCTAATTCTAAA;SOR=0.890;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=175;TCF=98;TCR=77;TR=175;WE=231488532;WS=231488514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr1	231502244	rs371204614	AT	A	144.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.78;ReadPosRankSum=-1.043;SOR=0.745;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,14:0.27:52
chr1	231502245	rs1435167	T	A	494.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=2.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.16;ReadPosRankSum=-0.538;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,29:0.54:54
chr1	231502310	rs1435166	T	C	1406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=25;NR=26;PP=783;SC=CCTAAGAGTATGGACAATATT;SOR=1.262;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=51;TCF=25;TCR=26;TR=51;WE=231502318;WS=231502300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	231506557	rs2256908	G	A	617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=18;PP=459;SC=TCACAAATACGTCTCAATAAA;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=231506565;WS=231506547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	231509943	.	A	G	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.384;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.039;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=185;ReadPosRankSum=0.618;SC=ACTGATTTACACTTAGATTCT;SOR=0.160;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=11;WE=231509951;WS=231509933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr1	231936016	rs2759354	A	G	5401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=118;PP=2965;SC=AGCTACCAGCACATCGTGTTT;SOR=1.830;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=170;TCF=52;TCR=118;TR=170;WE=231936024;WS=231936006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr1	231954872	rs11588937	C	T	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=47;ReadPosRankSum=0.573;SC=TCTCAGAAGACGCTGGTTCAG;SOR=0.905;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=15;TCF=8;TCR=7;TR=5;WE=231954880;WS=231954862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr1	231956086	rs11122343	A	T	942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=21;PP=643;ReadPosRankSum=0.792;SC=TTGTGTTTTGAGGGTTAAAAA;SOR=0.693;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=84;TCF=47;TCR=37;TR=46;WE=231956094;WS=231956076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,47:0.50:94
chr1	232172374	rs17773715	G	A	2751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=63;NR=28;PP=1726;SC=CACGCTCTTCGATCCCTCGGA;SOR=1.681;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=91;TCF=63;TCR=28;TR=91;WE=232172382;WS=232172364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr1	232535030	rs629939	C	T	4489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=71;PP=2510;SC=CTGGTCAGAGCAGAAATAAAC;SOR=0.766;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=149;TCF=78;TCR=71;TR=149;WE=232535038;WS=232535020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr1	232568293	rs1547741	A	G	478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.234;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=340;ReadPosRankSum=-0.111;SC=ATTCAGAGCCACAAGGCTTTA;SOR=0.425;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=45;TCF=14;TCR=31;TR=21;WE=232568301;WS=232568283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,22:0.44:50
chr1	232577281	rs573140	T	G	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.813;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=224;ReadPosRankSum=2.260;SC=CCAATGGATATGTCACAAAAG;SOR=2.303;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=11;WE=232577289;WS=232577271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr1	232596653	rs1766574	A	G	1765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.658;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=34;PP=1131;ReadPosRankSum=-0.327;SC=AGCCGTCATCATGGGGCTGGA;SOR=0.508;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=164;TCF=103;TCR=61;TR=82;WE=232596661;WS=232596643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,89:0.49:182
chr1	232601263	.	TAC	T	67	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=67;QD=25.3333333333;SC=CACATATACATACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=3;WE=232601272;WS=232601253;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr1	232650750	rs3795366	A	G	8067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=147;NR=132;PP=2965;SC=TCTGCAGGACAGAAGTGATGC;SOR=0.790;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=279;TCF=147;TCR=132;TR=279;WE=232650758;WS=232650740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,302:1.00:302
chr1	232650867	rs4649383	C	T	10984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=411;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=187;NR=187;PP=2965;SC=TCACACCCATCTTGGGCACAG;SOR=0.718;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=374;TCF=187;TCR=187;TR=374;WE=232650875;WS=232650857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,411:1.00:411
chr1	232941153	rs12409898	C	T	971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.760;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=21;PP=518;ReadPosRankSum=-0.374;SC=GCTTCAGCTTCTCGTTTGCGG;SOR=0.795;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=86;TCF=43;TCR=43;TR=41;WE=232941161;WS=232941143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,46:0.48:96
chr1	233086456	rs13381	T	C	1140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=20;PP=680;ReadPosRankSum=-0.916;SC=CGCCCACCAGTATGGCCCGGC;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=58;TCR=39;TR=49;WE=233086472;WS=233086446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,54:0.50:108
chr1	233113827	rs1045158	G	T	1228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=4.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.563;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=11;PP=889;ReadPosRankSum=1.301;SC=CCTTCCAGGCGTTTCTTTTAG;SOR=1.315;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=103;TCF=76;TCR=27;TR=51;WE=233113835;WS=233113817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,51:0.46:112
chr1	233121791	rs12038915	G	A	1022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=17;PP=568;ReadPosRankSum=0.223;SC=CCAGGAGCCCGTGCCACCATC;SOR=0.711;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=51;TCR=36;TR=41;WE=233121799;WS=233121781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,48:0.48:100
chr1	233122127	rs41309639	C	T	1002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.803;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=14;PP=579;ReadPosRankSum=-1.841;SC=CAAGGAGAGCCGGCTGCCCGA;SOR=0.882;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=84;TCF=50;TCR=34;TR=40;WE=233122135;WS=233122117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,45:0.50:90
chr1	233134086	rs56231757	C	T	1835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.654;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=33;PP=1063;ReadPosRankSum=0.420;SC=GCTGCCACCACTCGGGGCATT;SOR=0.900;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=150;TCF=87;TCR=63;TR=80;WE=233134094;WS=233134076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,91:0.53:171
chr1	233137225	rs140788891	CATAA	C	683.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=2;PP=297;SC=AACTCCATCTCATAAATAAAT;SOR=3.258;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=6;WE=233137236;WS=233137215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	233150270	rs6424263	T	C	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.155;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.881;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=28;ReadPosRankSum=-0.473;SC=GTAGGCCCAATATAATTTATT;SOR=0.197;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=233150278;WS=233150260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr1	233152910	rs11271054	A	AAAAGCAAGATTTTGAGTCCTCACAGCTATTCT	780.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.173;NF=0;NR=3;PP=2934;ReadPosRankSum=-0.089;SC=TCTGCAGAGAAAAAGCCAGGA;SOR=0.723;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=3;WE=233152918;WS=233152900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,21:0.62:34
chr1	233296891	rs2296515	T	C	1290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=7;PP=881;SC=TCCCTAAGCCTCTCAGCGGGC;SOR=2.200;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=32;TCR=7;TR=39;WE=233296899;WS=233296881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	233296908	rs2296516	T	G	1784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=16;PP=1150;ReadPosRankSum=0.561;SC=GGGCATTTTGTTTTCTTTCTC;SOR=0.765;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=59;TCF=43;TCR=16;TR=58;WE=233296916;WS=233296898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,64:0.98:65
chr1	233395214	rs2139998	T	A	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=245;ReadPosRankSum=-0.543;SC=GATACTTTTTTAATTTTACTT;SOR=0.776;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=11;WE=233395222;WS=233395204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr1	233397267	rs10489808	G	A	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-3.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.181;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=200;ReadPosRankSum=-0.448;SC=ACATTCAACCGAGACAACTGT;SOR=0.116;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=14;WE=233397275;WS=233397257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr1	233397752	rs6701073	T	C	1106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.600;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=25;PP=773;ReadPosRankSum=0.789;SC=AACATCGAAATCACATGAAGA;SOR=0.376;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=111;TCF=66;TCR=45;TR=53;WE=233397760;WS=233397742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,54:0.46:117
chr1	233398670	rs12132556	C	A	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.763;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=287;ReadPosRankSum=1.131;SC=AAAACATTTACATTTTGAAGT;SOR=0.307;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=37;TCF=33;TCR=4;TR=19;WE=233398678;WS=233398660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,23:0.52:44
chr1	233398713	rs1033325	C	T	1343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=14;PP=715;ReadPosRankSum=-0.127;SC=CCTTGGATTTCTGTGATTAGT;SOR=0.753;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=94;TCF=65;TCR=29;TR=49;WE=233398721;WS=233398703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,60:0.54:112
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chr1	233398993	rs1033323	C	A	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=50;ReadPosRankSum=0.566;SC=TTTAGACTATCTATTGAATAT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=233399001;WS=233398983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr1	233489499	rs7539016	A	G	804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.15;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
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chr1	233489707	rs7551511	G	T	2250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.660;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=39;PP=1479;ReadPosRankSum=0.389;SC=GAAAGGTATTGTGTGTGTGTG;SOR=0.471;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=50;TCR=41;TR=86;WE=233489715;WS=233489694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,91:0.96:95
chr1	233490536	rs137943316	A	AATGTCTTGGGGATAATCTG	4376.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=10;PP=2900;SC=TAGCAACTCTAAACTGCGTTG;SOR=2.303;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=32;TCF=21;TCR=11;TR=26;WE=233490551;WS=233490526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	233490543	rs2049182	G	A	4778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=28;PP=1948;SC=TCTAAACTGCGTTGAGAGATG;SOR=1.629;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=66;TCR=28;TR=94;WE=233490551;WS=233490526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr1	233490764	rs4649219	G	T	893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-4.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=29;PP=1057;ReadPosRankSum=-0.665;SC=AAAGGTGAGAGAAATTTTTAA;SOR=0.540;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=60;TCF=8;TCR=52;TR=34;WE=233490784;WS=233490754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,37:0.57:65
chr1	233490776	rs4649220	C	T	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=1057;ReadPosRankSum=1.248;SC=AATTTTTAAACAGCATAATGT;SOR=0.643;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=18;WE=233490784;WS=233490754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr1	233498026	rs56052041	C	T	1591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.272;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=48;PP=1057;ReadPosRankSum=-1.494;SC=GACATCGAATCAGTTTACCTT;SOR=0.820;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=154;TCF=55;TCR=99;TR=72;WE=233498034;WS=233498016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,76:0.46:165
chr1	233749855	rs2795294	A	G	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.522;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.123;HP=1;HapScore=2;MGOF=67;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=86;ReadPosRankSum=-1.600;SC=CGGGGCCAGAAGAGGCGGCGG;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=233749863;WS=233749847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr1	233749896	rs140745317	C	CTTGGCTTTGGCT	534.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.887;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=657;ReadPosRankSum=2.004;SC=CGGCGTTGGCCTTGGCGGCGG;SOR=0.026;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=7;WE=233749904;WS=233749886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr1	233759864	rs12092901	C	T	1046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=23;PP=679;ReadPosRankSum=0.621;SC=TTACTCAAGTCGATGCCCCAG;SOR=0.629;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=97;TCF=55;TCR=42;TR=50;WE=233759872;WS=233759854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,53:0.49:108
chr1	233759918	rs701213	T	C	968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.690;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=24;PP=630;ReadPosRankSum=-1.181;SC=GGGGCTTATTTAGACAATGGT;SOR=0.780;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=102;TCF=52;TCR=50;TR=47;WE=233759926;WS=233759908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,51:0.44:116
chr1	234040742	rs12136133	A	C	986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.723;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=14;PP=520;ReadPosRankSum=-2.205;SC=CAGTCTTCCCAGGCTAGCGGC;SOR=0.818;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=105;TCF=68;TCR=37;TR=43;WE=234040750;WS=234040732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,49:0.42:118
chr1	234041422	rs57010808	G	C	5180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=465;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.746;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=130;NR=94;PP=2887;ReadPosRankSum=1.148;SC=CCAGCGGGCCGGTGGGGCTCA;SOR=0.870;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=428;TCF=231;TCR=197;TR=224;WE=234041430;WS=234041412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:220,245:0.53:465
chr1	234367549	rs2236220	T	C	1717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=44;PP=1049;SC=GCGCTGACTCTGCAGAGCTGC;SOR=1.911;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=19;TCR=44;TR=63;WE=234367557;WS=234367539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	234442376	rs674385	G	A	186.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=5;PP=134;SC=TGGCCATGAGGCCTTAAAGGG;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=234442384;WS=234442366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	234458668	rs35870005	G	A	262.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=1;PP=292;SC=GCCAGACAGAGGAGGGTGCCC;SOR=3.056;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=234458676;WS=234458658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	234527575	rs3862040	C	T	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=115;ReadPosRankSum=2.250;SC=TTTGTTTATTCACTTATTTTT;SOR=1.329;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=8;WE=234527583;WS=234527565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr1	234528006	rs3754317	A	G	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=112;ReadPosRankSum=-0.687;SC=TGCTTGAGCCAATGAGGCAGA;SOR=0.512;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=8;WE=234528014;WS=234528003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr1	234529519	rs1802871	C	T	2496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=28;PP=728;ReadPosRankSum=0.085;SC=GACTGTTCCACGGGATAATCT;SOR=0.687;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=142;TCF=80;TCR=62;TR=63;WE=234529527;WS=234529509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,70:0.42:165
chr1	234529540	rs1134756	G	A	2581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.891;HP=1;HapScore=4;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=29;PP=1820;ReadPosRankSum=0.893;SC=TCTTCTGAACGTCGGTCCACT;SOR=0.754;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=152;TCF=83;TCR=69;TR=67;WE=234529560;WS=234529530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,74:0.42:175
chr1	234529552	rs2175594	C	T	2832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.963;HP=1;HapScore=4;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=31;PP=1820;ReadPosRankSum=-0.209;SC=CGGTCCACTCCGCTTGGTTAT;SOR=0.531;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=140;TCF=72;TCR=68;TR=67;WE=234529560;WS=234529530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,74:0.46:162
chr1	234529570	rs2175593	G	A	2412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=30;PP=796;ReadPosRankSum=0.165;SC=TATCTGCTTCGACCAAATTAG;SOR=0.657;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=63;TCR=67;TR=59;WE=234529578;WS=234529560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,65:0.44:149
chr1	234541801	rs12073170	A	G	1546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.789;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=40;PP=917;ReadPosRankSum=-0.722;SC=TGTGATTGAAACACCACTGCA;SOR=0.855;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=179;TCF=79;TCR=100;TR=67;WE=234541809;WS=234541791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,80:0.40:201
chr1	234546384	rs12072682	T	C	942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.811;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=23;PP=553;ReadPosRankSum=-2.817;SC=GGAGGCAGCCTCTTCCCTGGA;SOR=0.542;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=82;TCF=30;TCR=52;TR=37;WE=234546392;WS=234546374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,44:0.47:93
chr1	234563060	rs443685	T	C	1185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.709;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=18;PP=733;ReadPosRankSum=1.592;SC=CTACCATACTTACTTTTCCAT;SOR=0.790;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=60;TCR=34;TR=50;WE=234563068;WS=234563050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,57:0.51:111
chr1	234565078	.	GA	G	108.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.905;ClippingRankSum=0.000;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQRankSum=2.283;QD=0.84;ReadPosRankSum=0.134;SOR=0.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:106,23:0.18:129
chr1	234582457	rs270527	C	T	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=4.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.97;ReadPosRankSum=-0.174;SOR=0.239;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,18:0.38:48
chr1	234582461	rs2203167	G	A	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=1.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.10;ReadPosRankSum=0.134;SOR=0.461;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,20:0.36:56
chr1	234582651	rs4920246	T	C	2304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=53;PP=1371;ReadPosRankSum=-0.763;SC=GCATTGGTACTAAACTTCATA;SOR=0.679;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=190;TCF=84;TCR=106;TR=95;WE=234582659;WS=234582641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,109:0.53:207
chr1	234584231	rs2102596	C	T	3820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.772;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=100;NR=74;PP=2554;ReadPosRankSum=0.167;SC=ATTACCTATACTGAGTCTTCA;SOR=0.794;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=325;TCF=183;TCR=142;TR=174;WE=234584239;WS=234584221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,179:0.52:344
chr1	234584445	rs7527374	C	T	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=4.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=214;ReadPosRankSum=-2.554;SC=GAAATACAACCGAGATGAACT;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=11;WE=234584453;WS=234584435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr1	234593403	rs6693478	T	C	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.992;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=9;PP=416;ReadPosRankSum=-0.254;SC=TAAATTATCTTTAATCTCACC;SOR=0.907;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=62;TCF=40;TCR=22;TR=29;WE=234593411;WS=234593393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,30:0.47:64
chr1	234596202	rs270511	T	A	595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.703;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=336;ReadPosRankSum=-0.011;SC=AGAAGCTCAATACCATTAGGT;SOR=0.184;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=40;TCF=8;TCR=32;TR=22;WE=234596210;WS=234596192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,26:0.55:47
chr1	234601586	rs270504	G	A	1130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=24;PP=697;SC=GATCTCTTACGCTGCAGGCTA;SOR=0.990;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=44;TCF=20;TCR=24;TR=43;WE=234601594;WS=234601576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	234603386	rs270502	G	T	1358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=31;PP=891;SC=ATGGGTGAAAGAGCCAACATC;SOR=2.208;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=12;TCR=31;TR=43;WE=234603394;WS=234603376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	234608725	rs34245359	A	AT	49.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=16.42;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	234614921	.	G	T	20	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=20;QD=27.3856062736;SC=GTGCGCACAGGACCGGCCGGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=234614929;WS=234614911;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	234744250	rs8722	G	A	2839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=58;PP=1786;ReadPosRankSum=1.270;SC=CCTGCAGTCAGGGCCGGCTCC;SOR=0.685;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=238;TCF=126;TCR=112;TR=126;WE=234744258;WS=234744240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,137:0.53:260
chr1	234744413	rs4636	C	A	2069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=36;PP=1172;SC=CGGCCCCGGCCGCGGTGGACA;SOR=1.121;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=31;TCR=36;TR=67;WE=234744421;WS=234744403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr1	234745009	rs7545855	A	G	2301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.07;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr1	235299492	rs61837172	C	T	2274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.451;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=57;PP=1414;ReadPosRankSum=0.157;SC=GACAGGTCACCCATCTTCTAA;SOR=0.654;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=242;TCF=107;TCR=135;TR=102;WE=235299500;WS=235299482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,114:0.42:271
chr1	235316088	.	TA	T	74.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.814;ClippingRankSum=0.000;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=3.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.53;ReadPosRankSum=-0.844;SOR=0.186;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,10:0.20:49
chr1	235384838	rs12117563	G	A	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=6;PP=475;ReadPosRankSum=1.052;SC=TGCTTTCTAGGTAAAAATACT;SOR=0.516;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=39;TCF=32;TCR=7;TR=27;WE=235384846;WS=235384828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,28:0.68:41
chr1	235409714	rs186060595	C	T	1129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.871;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=16;PP=716;ReadPosRankSum=-0.405;SC=GTTCAACTAACAGTCATGAAA;SOR=0.558;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=80;TCF=56;TCR=24;TR=49;WE=235409728;WS=235409704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,51:0.58:88
chr1	235420493	rs61740940	G	A	1472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.277;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=33;PP=888;ReadPosRankSum=-0.553;SC=GGCCCTTTATGTGGTCATCCT;SOR=0.806;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=136;TCF=69;TCR=67;TR=67;WE=235420501;WS=235420483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,73:0.49:148
chr1	235543476	rs10524346	TTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	T,TTGTGTGTG	1412.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=13.646;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=1.376;NF=0,0;NR=38,38;PP=172,522;ReadPosRankSum=2.301;SC=TAAGCAATTATTGTGTGTGTG;SOR=2.774;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=89;TCF=8;TCR=81;TR=38,38;WE=235543507;WS=235543466;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.70:53
chr1	235564924	rs17543709	G	T	1030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.729;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=26;PP=624;ReadPosRankSum=-0.309;SC=TTATGAATCAGCACGGTCATT;SOR=0.611;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=41;TCR=57;TR=45;WE=235564932;WS=235564914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,50:0.46:108
chr1	235590559	rs12757197	G	A	2374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.951;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=58;PP=1372;ReadPosRankSum=0.619;SC=TGTCAGGTATGAACTCTTGGT;SOR=0.898;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=207;TCF=99;TCR=108;TR=105;WE=235590567;WS=235590549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,115:0.51:227
chr1	235594182	rs2291687	A	G	1533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=34;PP=1035;SC=GGTTTAATAGAGAATTGTTAG;SOR=2.259;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=13;TCR=34;TR=47;WE=235594190;WS=235594172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	235594250	rs2291688	A	G	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.812;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=95;ReadPosRankSum=-0.728;SC=CTATTAATAGATAACAAGATT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=6;WE=235594258;WS=235594240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
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chr1	235601958	rs3819974	G	T	1384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=13;PP=798;SC=GTGAAAACTAGATCTTGTCCC;SOR=2.004;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=32;TCR=13;TR=45;WE=235601966;WS=235601948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	235612219	rs7537	T	A	1191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.512;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=31;PP=717;ReadPosRankSum=0.073;SC=ATGTATTTTTTGTTGGGAAGT;SOR=0.302;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=90;TCF=29;TCR=61;TR=50;WE=235612227;WS=235612209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,57:0.56:101
chr1	235616309	rs6702967	T	C	1127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.058;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=16;PP=763;ReadPosRankSum=0.814;SC=ATACTTCTGGTCCCAGGCATT;SOR=0.967;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=144;TCF=98;TCR=46;TR=55;WE=235616317;WS=235616299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,59:0.38:156
chr1	235628908	rs1305556	G	A	801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.743;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=14;PP=500;ReadPosRankSum=1.647;SC=AAGATTAAGTGTAAGACATTC;SOR=0.600;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=97;TCF=63;TCR=34;TR=39;WE=235628916;WS=235628898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,42:0.38:110
chr1	235647631	rs291387	G	T	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.700;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=333;ReadPosRankSum=-0.494;SC=TACAGAGCAGGGCATACCTCT;SOR=0.356;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=21;WE=235647639;WS=235647621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,21:0.60:35
chr1	235652513	rs291396	T	C	2675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.560;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=46;PP=1597;ReadPosRankSum=-0.967;SC=AATAAGGATCTTCCCTGTCTT;SOR=0.560;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=270;TCF=161;TCR=109;TR=111;WE=235652521;WS=235652503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,128:0.43:297
chr1	235667398	rs149884283	AC	A	315.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=286;ReadPosRankSum=1.432;SC=CGGGCCTCCCACCCCCCCGGC;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=13;WE=235667406;WS=235667388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr1	235667690	rs291348	A	G	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=210;ReadPosRankSum=0.000;SC=CGACGTCTGGAGGGCTCCTCG;SOR=1.179;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=12;WE=235667698;WS=235667680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr1	235826382	rs36014994	TA	T	915.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.390;NF=1;NR=30;PP=370;ReadPosRankSum=0.420;SC=TGTAAGGCTGTAAAAAAAAAA;SOR=0.627;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=31;WE=235826391;WS=235826372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,45:0.92:49
chr1	235827443	rs3819013	T	C	510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=14;PP=310;SC=TTAAAAATCATGTGGAAGGAA;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=235827451;WS=235827433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	235827641	rs12092604	C	T	553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=1;PP=353;SC=AGAACCTACACCCCAAGGTGA;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=235827649;WS=235827640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	235856901	rs3754232	G	A	229.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=158;SC=ATCATTTGGTGCAAGACCATC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=235856909;WS=235856891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	235860340	rs7541057	C	T	1655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=18;PP=1091;SC=TCAAATCTCACGAAAGATATA;SOR=1.688;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=39;TCR=18;TR=57;WE=235860348;WS=235860330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	235887276	rs6667717	G	T	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.951;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=138;ReadPosRankSum=1.299;SC=TATAGTTACAGTGGCCCATGA;SOR=0.180;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=9;WE=235887284;WS=235887266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr1	235896726	rs6429275	C	T	855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=10;PP=489;ReadPosRankSum=-0.161;SC=GTCTGAATTCCGGAATACAAA;SOR=0.624;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=71;TCF=49;TCR=22;TR=33;WE=235896734;WS=235896716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,39:0.49:80
chr1	235910392	rs6676149	A	G	662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.316;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=8;PP=419;ReadPosRankSum=0.669;SC=TTGGAATTCAATGCTACAAAA;SOR=0.399;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=46;TCF=34;TCR=12;TR=28;WE=235910400;WS=235910382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,29:0.62:47
chr1	235910542	rs3754234	C	T	1638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=39;PP=949;ReadPosRankSum=0.074;SC=TTTAATGGACCGAAGGAGAAG;SOR=0.655;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=155;TCF=76;TCR=79;TR=77;WE=235910550;WS=235910532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,83:0.48:172
chr1	235918688	rs149138177	CAAAAG	C,CAAAAGAAAAG	1327.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.25;QD=37.94;SOR=2.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,17,18:0.49,0.51:35
chr1	235922228	rs3738519	T	C	1186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=14;PP=825;ReadPosRankSum=0.074;SC=CTTTAAAGAATAGTAAAATAA;SOR=0.668;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=97;TCF=71;TCR=26;TR=50;WE=235922236;WS=235922218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,54:0.50:109
chr1	235940450	rs2273584	C	T	1229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.392;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=20;PP=665;ReadPosRankSum=0.447;SC=GTTGGAGATTCTTTAGATGAT;SOR=0.561;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=114;TCF=69;TCR=45;TR=49;WE=235940458;WS=235940440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,59:0.44:133
chr1	235945294	rs6696123	T	C	1311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.592;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=24;PP=783;ReadPosRankSum=1.105;SC=CTTGGGATGATAAACAATGGC;SOR=0.754;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=139;TCF=78;TCR=61;TR=56;WE=235945302;WS=235945284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,66:0.42:156
chr1	235972435	rs3820553	T	C	4241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.393;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=84;PP=2744;ReadPosRankSum=0.407;SC=AAGCCTGCTGTAGTAAGCGCA;SOR=0.723;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=295;TCF=146;TCR=149;TR=162;WE=235972443;WS=235972425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,186:0.55:340
chr1	235972867	rs1063128	T	C	3465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.98;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=72;PP=2197;ReadPosRankSum=0.146;SC=AAGCTGCACTTTGAAGACAAC;SOR=0.671;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=304;TCF=150;TCR=154;TR=145;WE=235972875;WS=235972857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,161:0.49:326
chr1	236142565	rs1536132	T	C	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=400;ReadPosRankSum=-1.108;SC=CTGGGGTGGGTCAAGCCTGCA;SOR=0.898;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=40;TCF=5;TCR=35;TR=20;WE=236142573;WS=236142555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,20:0.47:43
chr1	236175327	rs3738531	C	A	1401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.858;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=26;PP=2290;ReadPosRankSum=-0.643;SC=ATCGGCTTGGCTGGCATTCAT;SOR=0.957;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=141;TCF=85;TCR=56;TR=64;WE=236175347;WS=236175317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,70:0.45:157
chr1	236175339	rs2031487	T	C	1596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.726;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=31;PP=2290;ReadPosRankSum=-0.902;SC=GGCATTCATCTACATCTGTAA;SOR=0.943;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=149;TCF=87;TCR=62;TR=71;WE=236175347;WS=236175317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,77:0.46:168
chr1	236180580	rs3768081	C	G	1072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=26;PP=631;ReadPosRankSum=-0.206;SC=ATATCTGCAGCAAAAATTTTT;SOR=0.641;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=27;TCR=48;TR=41;WE=236180588;WS=236180570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,46:0.56:82
chr1	236187365	rs3738533	T	C	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=331;ReadPosRankSum=-1.066;SC=AATCAAAGGCTGTACCATAGC;SOR=0.784;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=20;WE=236187373;WS=236187355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,26:0.67:39
chr1	236393654	rs2812471	A	G	819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=26;PP=706;SC=GCTCATGCCTATAATCCTAGC;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=27;WE=236393662;WS=236393644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	236413230	rs2477599	T	A	3208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=55;NR=44;PP=1681;SC=TTGCTCACAATCTTCTAATTC;SOR=0.761;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=55;TCR=44;TR=99;WE=236413238;WS=236413220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr1	236433135	rs3834089	AT	A	2924.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=28;PP=1841;SC=GTCACATATAATACCTTTGAT;SOR=0.747;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=41;WE=236433143;WS=236433125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr1	236557771	rs966365	G	A	5169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=89;NR=78;PP=2782;SC=CTAAACAGATGGGGAGAGGCA;SOR=0.724;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=167;TCF=89;TCR=78;TR=167;WE=236557779;WS=236557761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr1	236557928	rs966364	G	A	598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=18;PP=522;SC=TTTTCGACCCGACTTTTATCT;SOR=2.531;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=236557936;WS=236557918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	236572389	rs659901	G	A	369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=19;NR=2;PP=495;SC=AAAAAAAAAGGAGTAAGGTTT;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=21;WE=236572397;WS=236572379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	236572475	rs669710	A	G	2815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=43;PP=1929;SC=TTTAAATTAAAGCAAACCCGC;SOR=0.872;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=103;TCF=60;TCR=43;TR=103;WE=236572483;WS=236572465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr1	236577761	rs625444	TC	CT	142.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.81;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	236590497	rs1759388	C	G	449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=5;PP=302;SC=TCTTGATAAGCAGCATTGTTT;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=15;WE=236590505;WS=236590487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	236590563	rs1778861	C	T	1003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=14;PP=532;SC=GTAGTCCAGCCCTTCTGATTT;SOR=0.850;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=19;TCR=14;TR=33;WE=236590571;WS=236590553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	236590629	rs636378	C	T	1042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=12;PP=663;SC=TCTTACACCACGGAGTGTGTG;SOR=1.329;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=38;TCF=23;TCR=15;TR=35;WE=236590637;WS=236590619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	236590659	rs636048	G	C	962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=24;NR=13;PP=719;SC=ATCACACTTTGTTTCTTTCTT;SOR=1.885;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=40;TCF=24;TCR=16;TR=37;WE=236590667;WS=236590649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	236590816	rs635487	T	G	939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=23;PP=636;SC=TTTTTTGAGATTTATAGAGTT;SOR=1.675;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=11;TCR=23;TR=34;WE=236590824;WS=236590806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	236645670	rs604070	C	T	2903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.551;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=54;PP=1683;ReadPosRankSum=-0.540;SC=ACTTACTAGACGTGATCAGGA;SOR=0.760;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=249;TCF=130;TCR=119;TR=123;WE=236645678;WS=236645660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,139:0.50:276
chr1	236719135	rs1885532	T	C	1348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.148;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=21;PP=909;ReadPosRankSum=-0.080;SC=AGTCCAGGGCTTCCAGGAAAA;SOR=0.459;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=131;TCF=88;TCR=43;TR=57;WE=236719143;WS=236719125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,64:0.44:147
chr1	236721731	rs819431	T	C	8314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=145;NR=123;PP=2965;ReadPosRankSum=0.753;SC=AGGTATACAATGCTGTCTGTC;SOR=0.462;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=271;TCF=147;TCR=124;TR=268;WE=236721739;WS=236721716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,314:0.99:317
chr1	236722182	rs819432	A	T	954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=2;PP=679;SC=TATATTCAGAAAATAATATAC;SOR=4.047;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=30;WE=236722190;WS=236722172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	236729956	rs653737	T	C	2578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.494;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=47;PP=1632;ReadPosRankSum=-0.603;SC=CTTTTCGCCATAGGCAGCCGC;SOR=0.641;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=199;TCF=109;TCR=90;TR=102;WE=236729964;WS=236729946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,119:0.54:220
chr1	236737830	rs150953030	C	T	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.290;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=69;ReadPosRankSum=1.550;SC=TCCTTTAAAACGTCTAGTCCA;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=5;WE=236737838;WS=236737820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr1	236748570	rs657629	T	C	1650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=3.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.144;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=47;PP=1194;ReadPosRankSum=0.168;SC=CATAAAACAATTTTTTCAACT;SOR=0.936;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=150;TCF=48;TCR=102;TR=68;WE=236748578;WS=236748560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,73:0.45:162
chr1	236755937	rs67239913	TA	T	48.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=8.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.80;ReadPosRankSum=0.138;SOR=0.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
chr1	236758851	rs149968331	T	C	3109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.404;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=66;PP=1701;ReadPosRankSum=1.526;SC=TGTAACATGATGAATGATGGA;SOR=0.740;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=292;TCF=156;TCR=136;TR=142;WE=236758859;WS=236758841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,156:0.48:323
chr1	236881403	rs2275399	C	T	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=90;ReadPosRankSum=-0.361;SC=CCAAAGAAAACCTTTCCAAAG;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=6;WE=236881411;WS=236881393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr1	236882110	rs1341865	G	A	2626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=34;PP=1784;SC=TTAAGGAAAAGATGGATGCTT;SOR=1.251;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=58;TCR=34;TR=92;WE=236882118;WS=236882100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr1	236882303	rs1341864	T	C	2073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=43;PP=1126;SC=TGGTGTCCATTGGCGCTGAAG;SOR=1.358;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=71;TCF=28;TCR=43;TR=71;WE=236882311;WS=236882293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr1	236883240	rs1768053	T	C	215.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=0;PP=180;SC=TTATGAATACTGTATTTATAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=236883248;WS=236883230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	236883421	rs1341863	C	T	3763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=56;PP=2378;SC=TTGATGGCAACGTGAAAATGA;SOR=0.949;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=132;TCF=76;TCR=56;TR=132;WE=236883429;WS=236883411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr1	236883564	rs1341862	G	A	1242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=29;PP=794;SC=TGAGCAAGATGTTTTAAAGTC;SOR=2.584;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=9;TCR=29;TR=38;WE=236883572;WS=236883554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	236890781	rs1768056	A	G	309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=9;NR=2;PP=198;SC=CAAGGAAGTCAAAAGGAGAGG;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=236890789;WS=236890775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	236894647	rs819640	G	A	2838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.534;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=74;PP=1835;ReadPosRankSum=1.056;SC=TGAGTTACAGGAAATTTGAAG;SOR=0.936;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=230;TCF=96;TCR=134;TR=120;WE=236894655;WS=236894637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,131:0.51:255
chr1	236897633	rs707203	A	G	3165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=21;PP=2110;SC=ATGGGGGCGAAGGGGGAGGAT;SOR=2.237;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=76;TCR=21;TR=97;WE=236897641;WS=236897623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr1	236900598	.	CAT	C	206.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.792;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=189;ReadPosRankSum=0.033;SC=TCCGTGGGGGCATATATATAT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=8;WE=236900609;WS=236900588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr1	236902532	.	AT	A	123.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=0.000;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.61;ReadPosRankSum=-0.440;SOR=0.654;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,16:0.21:77
chr1	236958532	rs28372871	G	T	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=274;ReadPosRankSum=0.444;SC=GAGGAGCTCGGGCAGACCAAT;SOR=0.563;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=43;TCF=37;TCR=6;TR=18;WE=236958540;WS=236958522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,18:0.41:44
chr1	236978992	rs5781924	T	TTCTG	4548.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=55;PP=2918;SC=GCACAATACATTCTTTTATTA;SOR=1.848;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=70;TCF=5;TCR=65;TR=60;WE=236979000;WS=236978982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr1	236988593	rs5781926	A	AT	1963.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=1.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.943;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=17;PP=1250;ReadPosRankSum=-0.156;SC=TACAGTGTATATTTTTAAGGC;SOR=1.033;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=86;TCF=36;TCR=50;TR=39;WE=236988601;WS=236988583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,77:0.52:148
chr1	237001926	rs3820568	A	G	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=80;ReadPosRankSum=-0.691;SC=GGCCTAATCCATTGTGTTTCC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=6;WE=237001934;WS=237001916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr1	237013550	rs146375090	AT	A	774.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=65.04;MQRankSum=4.446;QD=23.48;ReadPosRankSum=-0.185;SOR=0.392;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr1	237013553	rs200399202	T	A	783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=1.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=65.05;MQRankSum=4.646;QD=22.39;ReadPosRankSum=-0.169;SOR=0.379;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,21:0.60:35
chr1	237023333	rs10925254	T	C	412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=12;PP=311;SC=CCACTGATTCTCAACCTGGGG;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=237023341;WS=237023323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	237038008	rs10925256	T	A	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.20;ReadPosRankSum=1.590;SOR=0.420;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr1	237048500	rs1805087	A	G	1031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=29;PP=691;ReadPosRankSum=-2.020;SC=ATTAGACAGGACCATTATGAG;SOR=0.780;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=90;TCF=36;TCR=54;TR=47;WE=237048508;WS=237048490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,49:0.50:98
chr1	237048562	rs2275566	G	A	881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=24;PP=626;SC=TAATGTGACTGTTTTTTATGA;SOR=2.694;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=30;WE=237048570;WS=237048552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	237049879	rs12065382	C	T	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.857;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=74;ReadPosRankSum=0.519;SC=CTGAGATGGACTCATAGCAGC;SOR=0.836;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=7;WE=237049887;WS=237049869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr1	237054569	rs2229276	A	G	795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.829;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=22;PP=455;ReadPosRankSum=-2.254;SC=ACCTGTACGCAGAGGCTGCTG;SOR=0.854;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=80;TCF=31;TCR=49;TR=35;WE=237054577;WS=237054559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,40:0.45:89
chr1	237057608	rs2297965	G	A	2454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=24;PP=1656;SC=CTGGCGCCACGTTCTTGCTAA;SOR=1.836;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=57;TCR=24;TR=81;WE=237057616;WS=237057598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr1	237058744	rs12070777	C	A	2232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=42;PP=1398;ReadPosRankSum=-0.970;SC=CAGACCTGCGCAGGCTGCGGT;SOR=0.674;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=183;TCF=97;TCR=86;TR=92;WE=237058752;WS=237058734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,103:0.50:205
chr1	237058828	rs1131449	C	T	3136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=51;PP=1582;ReadPosRankSum=1.865;SC=TGTGGAGACTCGCAGACATCG;SOR=0.422;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=99;TCF=47;TCR=52;TR=98;WE=237058836;WS=237058818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,118:0.99:119
chr1	237058996	rs75739277	C	CTATT	98.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=3;PP=134;SC=TCACTCGTAGCTATTCTGCAT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=237059004;WS=237058986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	237060433	rs3820571	G	T	4960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=91;PP=2798;SC=GCTAGCTGTTGCATTATATGT;SOR=1.148;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=157;TCF=66;TCR=91;TR=157;WE=237060441;WS=237060423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr1	237061056	rs2853522	A	C	229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=1;NR=10;PP=224;SC=GCTGACACTTACCTGCTTCTG;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=237061064;WS=237061046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	237063335	rs1050996	G	C	5615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=115;NR=73;PP=2965;SC=ATTTGCAGACGTTATGATCTT;SOR=1.129;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=188;TCF=115;TCR=73;TR=188;WE=237063343;WS=237063325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr1	237063504	rs9779	A	G	1149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.718;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=26;PP=765;ReadPosRankSum=-0.925;SC=TTAGATATATATATTCATTCT;SOR=0.811;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=99;TCF=47;TCR=52;TR=49;WE=237063512;WS=237063494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,54:0.50:109
chr1	237433524	rs2275288	C	T	1492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.312;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=25;PP=911;ReadPosRankSum=-0.132;SC=CAGGTTGCCTCTGGGGATCAG;SOR=0.831;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=130;TCF=78;TCR=52;TR=64;WE=237433532;WS=237433514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,72:0.49:148
chr1	237433625	rs2275287	C	T	1488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.552;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=32;PP=810;ReadPosRankSum=-1.519;SC=ATAAAAAGTACGTGAGGGATT;SOR=0.774;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=158;TCF=85;TCR=73;TR=66;WE=237433633;WS=237433615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,75:0.41:183
chr1	237504759	rs10925374	T	C	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.490;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=367;ReadPosRankSum=-1.567;SC=TTAACACTCCTTCCTGCATTT;SOR=1.247;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=42;TCF=35;TCR=7;TR=22;WE=237504767;WS=237504749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,24:0.55:44
chr1	237516073	rs10802607	T	C	907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.908;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=17;PP=630;ReadPosRankSum=0.480;SC=AGTAGATCTGTACATTTGTGT;SOR=0.434;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=82;TCF=52;TCR=30;TR=43;WE=237516081;WS=237516063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,45:0.51:88
chr1	237519137	rs10802608	T	A	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=36;ReadPosRankSum=0.921;SC=CAATTTTTTATGCTTTAGAAT;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=3;WE=237519145;WS=237519129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr1	237519165	rs10925382	G	T	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.761;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=37;ReadPosRankSum=1.345;SC=AGATTGTGGTGCAAGGACCAA;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=3;WE=237519173;WS=237519155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr1	237527569	.	G	A	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.544;ClippingRankSum=0.000;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.59;ReadPosRankSum=-0.548;SOR=0.663;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,31:0.40:77
chr1	237532763	rs17681893	T	G	487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.036;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=8;PP=288;ReadPosRankSum=-0.374;SC=AAGAGAGTATTTTATCAACTT;SOR=0.541;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=60;TCF=40;TCR=20;TR=21;WE=237532771;WS=237532753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,24:0.38:64
chr1	237540615	rs10925391	A	C	1859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=28;PP=1098;ReadPosRankSum=1.658;SC=ATATCCGTATATCTGCAGGGG;SOR=0.714;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=152;TCF=92;TCR=60;TR=74;WE=237540623;WS=237540605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,86:0.48:178
chr1	237551376	rs10754602	T	A	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=7;PP=235;ReadPosRankSum=1.422;SC=AATGATTTTTTATCCTTACAG;SOR=0.648;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=49;TCF=31;TCR=18;TR=19;WE=237551384;WS=237551366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,24:0.43:56
chr1	237580606	rs6673182	G	T	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.95;ReadPosRankSum=-0.919;SOR=0.195;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr1	237580612	rs6673187	G	C	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.35;ReadPosRankSum=-1.694;SOR=0.260;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr1	237617757	rs3765097	C	T	2364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.981;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=44;PP=1435;ReadPosRankSum=-1.311;SC=AGTCCGTAAGCCTAAGTCTGC;SOR=0.774;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=225;TCF=127;TCR=98;TR=105;WE=237617765;WS=237617747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,115:0.47:244
chr1	237619875	rs5781961	A	AT	69.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=4.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.48;ReadPosRankSum=-1.506;SOR=0.184;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,11:0.23:47
chr1	237620049	rs2045955	T	C	1724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.327;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=41;PP=1070;ReadPosRankSum=1.196;SC=AGAAGCATGATTGGGTTCATA;SOR=0.849;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=126;TCF=57;TCR=69;TR=69;WE=237620057;WS=237620039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,78:0.53:147
chr1	237620139	.	G	A	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.570;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=248;ReadPosRankSum=-0.127;SC=CAATTTGGGAGGCTGAGGTGG;SOR=1.802;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=13;WE=237620147;WS=237620129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr1	237632285	rs35662567	A	AT	294.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=360;ReadPosRankSum=0.632;SC=TAGATGTAACAGAGGATATTT;SOR=0.430;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=10;WE=237632293;WS=237632275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr1	237632595	rs71561877	T	TGTG	76.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.368;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.96;ReadPosRankSum=1.465;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr1	237670140	rs2618702	A	G	1736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.146;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=43;PP=1016;ReadPosRankSum=1.793;SC=ATTTATTTTCAGATTCTGTGA;SOR=0.446;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=132;TCF=52;TCR=80;TR=76;WE=237670148;WS=237670130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,83:0.58:144
chr1	237693921	rs2779365	A	G	211.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=6;PP=142;SC=TTTAAAATTCAGATTCAAGGC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=237693929;WS=237693911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	237711644	rs2618661	T	C	551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=2;PP=442;SC=GGAAGAACAGTAATGAGGTAG;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=237711652;WS=237711634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	237711797	rs2253273	A	G	4358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=66;PP=2594;SC=TCACCCCATCACAAGAAGCAA;SOR=0.768;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=145;TCF=79;TCR=66;TR=145;WE=237711805;WS=237711787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr1	237714103	rs2306238	G	A	41.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.45;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr1	237730124	rs2805390	A	G	998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=26;PP=717;SC=CTGGAGGCTCATCTCCTCTGC;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=31;WE=237730132;WS=237730114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	237730169	rs2779401	C	T	238.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=195;SC=ACCAGTGTTTCCCACAGCACA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=237730177;WS=237730159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	237732395	rs2805396	G	A	645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=3;PP=511;SC=GGGTGGGTGCGATTTTCCTGG;SOR=3.816;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=21;WE=237732403;WS=237732388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	237753074	rs11331089	AT	A	1469.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.698;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.617;NF=25;NR=22;PP=605;ReadPosRankSum=-0.241;SC=CTAAAACTTGATTTTTTTTTT;SOR=0.591;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=98;TCF=55;TCR=43;TR=47;WE=237753082;WS=237753064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,73:0.54:135
chr1	237754340	rs1332777	A	G	487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.175;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=367;ReadPosRankSum=1.262;SC=TATGTGAGGAAGGTTACAGTC;SOR=0.310;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=42;TCF=3;TCR=39;TR=20;WE=237754348;WS=237754330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr1	237755188	rs2618713	C	T	1948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=51;PP=1201;ReadPosRankSum=0.769;SC=TTATTTCTATCTGTCACTCAT;SOR=0.698;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=162;TCF=62;TCR=100;TR=82;WE=237755196;WS=237755178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,91:0.51:179
chr1	237755203	rs2779430	T	C	1606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=42;PP=1040;ReadPosRankSum=0.294;SC=ACTCATTATGTTTTACATCTC;SOR=0.649;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=41;TCR=83;TR=63;WE=237755211;WS=237755193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,71:0.51:138
chr1	237757027	rs1478915	G	A	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=194;ReadPosRankSum=-0.340;SC=TGTGACCAAGGTATTTCTATT;SOR=1.501;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=11;WE=237757035;WS=237757017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr1	237765200	rs2805418	G	A	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=31;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CACATCAATCGATATGCAAGA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=3;WE=237765208;WS=237765190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr1	237765470	rs791541	A	T	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.444;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=256;ReadPosRankSum=-1.011;SC=TATAGCATTGATTTATTCTGA;SOR=0.119;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=15;WE=237765478;WS=237765460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,19:0.70:27
chr1	237794603	rs1759123	A	G	476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.898;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=330;ReadPosRankSum=0.879;SC=GTGGCTTATTAAATACTGTGA;SOR=0.296;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=41;TCF=37;TCR=4;TR=19;WE=237794611;WS=237794593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,20:0.45:44
chr1	237798414	rs75658478	G	A	943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=27;PP=696;SC=TGACATTATGGCCAAAACCGC;SOR=4.047;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=29;WE=237798422;WS=237798404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	237801770	rs707189	T	C	4870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=92;PP=2965;SC=TTGACTTTCTTAGATTTGCTG;SOR=1.233;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=158;TCF=66;TCR=92;TR=158;WE=237801778;WS=237801760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr1	237802559	rs530109	T	C	2962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.43;SOR=1.077;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr1	237824332	rs471647	G	A	869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=8;NR=21;PP=582;SC=TTTTTCTAAAGAATAATCTGA;SOR=2.376;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=29;WE=237824340;WS=237824322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	237831103	rs477245	C	A	456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=4;PP=316;SC=TATTCCTTTACGGTATCTAAT;SOR=2.049;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=15;WE=237831111;WS=237831093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	237862164	rs1521745	G	C	1656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=8;PP=1042;SC=AAATATTACTGTTGTGTCATT;SOR=2.345;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=39;TCR=8;TR=47;WE=237862172;WS=237862154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	237862436	rs1521744	T	C	183.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=149;SC=GGATTTGTAATAAAGTCTTTA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=237862444;WS=237862426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	237863439	rs12754190	G	A	1901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=14;PP=1136;SC=TAGAGTAATGGAGAAATAAAC;SOR=2.035;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=41;TCR=14;TR=55;WE=237863447;WS=237863429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	237863718	rs2797436	T	G	3457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=63;NR=62;PP=1992;SC=CAATGCTGTCTTCATTATTTG;SOR=0.723;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=133;TCF=63;TCR=70;TR=125;WE=237863726;WS=237863708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr1	237865203	rs939699	C	T	1191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=9;PP=824;SC=CTGAATAGTACATAGCTTAAG;SOR=2.531;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=31;TCR=9;TR=40;WE=237865211;WS=237865193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	237872714	rs35261418	GT	G	1227.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.33;MQRankSum=0.454;QD=19.80;ReadPosRankSum=-0.231;SOR=0.649;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,58:0.94:62
chr1	237881770	rs2797441	C	T	3217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.081;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=53;PP=1812;ReadPosRankSum=0.587;SC=AGAAAGATACCGAGGATGAAG;SOR=0.301;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=62;TCR=53;TR=114;WE=237881778;WS=237881760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,123:0.99:124
chr1	237890437	rs2685301	C	T	9342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=168;NR=150;PP=2965;SC=AACTACTGTCCAAGCAGAGGA;SOR=0.699;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=319;TCF=168;TCR=151;TR=318;WE=237890445;WS=237890427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,355:1.00:355
chr1	237893674	rs2797445	C	T	5238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=84;PP=2965;SC=TTTAGTGGGGCTCTAAGATGA;SOR=0.804;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=168;TCF=84;TCR=84;TR=168;WE=237893682;WS=237893664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr1	237923053	rs2253831	C	T	2299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=42;PP=1405;ReadPosRankSum=-0.815;SC=TCAGTGGCCACGTGGTTTCTA;SOR=0.667;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=194;TCF=119;TCR=75;TR=108;WE=237923061;WS=237923043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,108:0.54:200
chr1	237946964	rs790889	T	C	662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.129;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=9;PP=418;ReadPosRankSum=1.393;SC=ATGCAACTGCTTTACCACCAG;SOR=0.293;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=53;TCF=38;TCR=15;TR=28;WE=237946972;WS=237946954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,30:0.55:55
chr1	237951451	rs2256242	A	G	2577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=61;PP=1761;ReadPosRankSum=1.099;SC=ATGTTTTAGAATGAATATTGT;SOR=1.220;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=82;TCF=20;TCR=62;TR=81;WE=237951459;WS=237951441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,88:0.99:89
chr1	237951482	rs16835818	G	A	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.803;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=395;ReadPosRankSum=2.091;SC=GTGCAATACCGTAATAATTTA;SOR=0.358;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=45;TCF=5;TCR=40;TR=23;WE=237951490;WS=237951472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,23:0.48:48
chr1	237955649	rs68129840	CTGTG	C	359.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=0;NR=8;PP=301;SC=ACCAAGGTACCTGTGTGTGTG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=8;WE=237955660;WS=237955639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	237955678	rs144369382	T	C	411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.43;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	237955680	rs146659498	T	C	411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.75;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	237955698	rs71162418	CGT	C	31.71	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=15.85;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	237957146	rs790902	G	A	1951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=17;PP=1261;SC=TAATTTTAACGTATTTATTTT;SOR=1.897;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=44;TCR=17;TR=61;WE=237957154;WS=237957136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	237957161	rs790901	A	G	3013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=32;PP=1903;SC=TATTTTTCCTATGTAGGTCCC;SOR=1.632;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=95;TCF=63;TCR=32;TR=94;WE=237957169;WS=237957151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr1	237957309	rs790900	A	C	4165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=71;PP=2527;SC=TGAGTAAATAATTATATGAGA;SOR=1.103;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=59;TCR=71;TR=130;WE=237957317;WS=237957299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
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chr1	237965133	rs35563566	A	AT	913.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.11;MQRankSum=0.902;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.177;SOR=0.531;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,48:0.51:94
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chr1	238046253	rs2794814	T	C	179.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=7;PP=140;SC=CTTGGTTCTATGCCTTACAAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=238046261;WS=238046243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	238048325	rs2298100	A	G	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.081;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=80;ReadPosRankSum=0.545;SC=TCATGTAATTAGTAACAAGGG;SOR=0.627;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=7;WE=238048333;WS=238048315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr1	238051933	rs2236595	C	T	633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=17;PP=467;SC=TAGGTGTCTACTCCATATTGT;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=238051941;WS=238051923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	238053524	rs538499	T	C	640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=23;PP=527;SC=CAGTCTCCAGTGCCAGAAAGG;SOR=4.091;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=238053532;WS=238053514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	240070603	rs3738435	T	C	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.337;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=210;ReadPosRankSum=-0.537;SC=AGAATGAACTTGATGTTTGGC;SOR=2.694;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=10;WE=240070611;WS=240070599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr1	240254874	rs7521945	T	C	31.29	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=10.43;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	240255203	rs12727981	G	T	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.706;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=88;ReadPosRankSum=0.847;SC=CCGCAGCGACGGCAGCCACGG;SOR=0.658;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=9;WE=240255211;WS=240255193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr1	240255568	rs140531536	GGGC	G	4103.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.04;QD=42.31;SOR=1.337;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr1	240256822	rs10926124	C	A	967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=24;PP=650;ReadPosRankSum=0.649;SC=AGCACCGGGCCGACGGCGGCC;SOR=0.703;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=33;TCR=51;TR=40;WE=240256830;WS=240256812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,43:0.47:91
chr1	240286716	rs3738433	G	A	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.104;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=310;ReadPosRankSum=-1.443;SC=ATGTGTATCTGCCCAGTCACC;SOR=0.990;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=61;TCF=16;TCR=45;TR=23;WE=240286724;WS=240286706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,27:0.41:66
chr1	240351628	rs4659948	T	C	2044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.158;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=50;PP=1265;ReadPosRankSum=0.444;SC=TGTGACAGACTCTGCGATTTA;SOR=0.370;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=185;TCF=76;TCR=109;TR=92;WE=240351636;WS=240351618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,100:0.50:202
chr1	240370629	rs10926166	C	G	3193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=447;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.130;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=78;PP=2167;ReadPosRankSum=1.237;SC=AGTTTCAAACCAGCCACGAAC;SOR=0.592;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=411;TCF=195;TCR=216;TR=154;WE=240370637;WS=240370619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:280,167:0.37:447
chr1	240421383	rs10926181	G	A	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=279;ReadPosRankSum=-0.593;SC=TTTGGGCTGAGGGATATGATG;SOR=0.743;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=16;WE=240421391;WS=240421373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr1	240421437	rs10926182	C	T	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=79;ReadPosRankSum=2.189;SC=CTGTGTAAACCGAGGTTAGTA;SOR=0.307;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=6;WE=240421445;WS=240421427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr1	240457973	rs7526497	G	T	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.197;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=125;ReadPosRankSum=1.093;SC=AATTCCTGGTGCAGGCTTTGC;SOR=1.402;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=8;WE=240457981;WS=240457963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr1	240492543	rs6686353	G	A	979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=22;PP=747;ReadPosRankSum=0.584;SC=ATGCAAATGCGGTGTCTTCAG;SOR=0.807;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=23;TCR=37;TR=36;WE=240492551;WS=240492533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,38:0.57:67
chr1	240492896	rs75147245	C	T	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-4.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=178;ReadPosRankSum=-1.256;SC=CGCAGTCCCACAGAAGGGAAC;SOR=0.191;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=11;WE=240492904;WS=240492886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr1	240497265	rs10157874	A	C	1195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.707;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=25;PP=780;ReadPosRankSum=-1.619;SC=ATTTTTACATATAGTCATATT;SOR=0.590;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=103;TCF=59;TCR=44;TR=55;WE=240497273;WS=240497255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,57:0.51:111
chr1	240601222	rs2356385	T	C	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=270;ReadPosRankSum=1.288;SC=AGAGAGCTACTGTTGGTGCTT;SOR=0.859;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=14;WE=240601230;WS=240601212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
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chr1	240635491	rs2210861	G	C	174.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=140;SC=ATAAATTAGCGTCTGTAGCTG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=240635499;WS=240635483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
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chr1	240975213	rs2275742	T	C	1769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=2.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.864;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=18;PP=994;ReadPosRankSum=-1.755;SC=AGCAATGTGTTTTACCTTAAA;SOR=1.073;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=144;TCF=100;TCR=44;TR=66;WE=240975221;WS=240975203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,79:0.46:170
chr1	240975435	rs2275744	C	T	903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.125;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=27;PP=632;ReadPosRankSum=1.332;SC=ATGTGTGCCTCGAAGTTCCCA;SOR=0.473;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=65;TCF=16;TCR=49;TR=37;WE=240975443;WS=240975425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,38:0.54:70
chr1	240977964	rs12744536	G	T	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.667;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=163;ReadPosRankSum=0.459;SC=TTAAACACATGTAATTGTCAT;SOR=0.264;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=11;WE=240977972;WS=240977954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr1	240978276	rs199649548	AT	A	106.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=121;ReadPosRankSum=-1.282;SC=CACAATTGATATCACTTTAGA;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=240978284;WS=240978266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr1	240979803	rs3738068	G	A	341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=10;PP=255;SC=CATAAATTCAGTAAGGTCTCT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=240979811;WS=240979793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	241093952	rs3912110	C	T	1256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.691;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=16;PP=786;ReadPosRankSum=0.202;SC=AGCAATAAAACGCAAGTACAC;SOR=0.824;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=119;TCF=81;TCR=38;TR=52;WE=241093960;WS=241093942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,60:0.44:136
chr1	241093972	rs3912109	C	G	1655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.648;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=21;PP=1136;ReadPosRankSum=-0.468;SC=CATCCATCTACACATACAGGC;SOR=0.976;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=154;TCF=98;TCR=56;TR=66;WE=241093980;WS=241093962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,75:0.43:174
chr1	241519098	rs4659599	T	A	3267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=53;PP=1824;SC=CTTGGTCCACTCTCAAGATAC;SOR=0.888;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=54;TCR=53;TR=107;WE=241519106;WS=241519088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr1	241667233	rs4660099	C	T	496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.897;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=821;ReadPosRankSum=0.826;SC=GTGCGCCTTGCGCATCCAGCT;SOR=1.302;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=49;TCF=38;TCR=11;TR=20;WE=241667252;WS=241667223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,23:0.44:52
chr1	241667244	rs4659607	G	T	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.298;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=3;PP=821;ReadPosRankSum=1.986;SC=GCATCCAGCTGCGGGATAACT;SOR=1.428;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=62;TCF=49;TCR=13;TR=23;WE=241667252;WS=241667223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,26:0.39:67
chr1	241675119	rs6673988	G	C	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=263;ReadPosRankSum=0.564;SC=ATAAAACCAAGATTCCTTCAA;SOR=0.963;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=13;WE=241675127;WS=241675109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr1	241676758	rs10926500	C	T	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.303;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=255;ReadPosRankSum=-0.353;SC=ATTAATATCACCACTAAAAAT;SOR=0.280;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=43;TCF=34;TCR=9;TR=19;WE=241676766;WS=241676748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,19:0.43:44
chr1	241712134	rs11556464	C	T	2919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.449;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=52;PP=1793;ReadPosRankSum=-0.659;SC=TCTAGGTTGGCTCATTACAAG;SOR=0.986;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=252;TCF=142;TCR=110;TR=124;WE=241712142;WS=241712124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,141:0.49:286
chr1	241712230	rs61825636	G	A	2021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.992;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=53;PP=1178;ReadPosRankSum=0.952;SC=CAGGATGAACGCTGGGCACGG;SOR=0.782;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=225;TCF=101;TCR=124;TR=93;WE=241712238;WS=241712220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,103:0.41:251
chr1	241728198	rs12139441	A	G	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.589;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=328;ReadPosRankSum=-1.009;SC=ACTGGTTTTAATTACTGTGGA;SOR=1.118;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=51;TCF=39;TCR=12;TR=21;WE=241728206;WS=241728188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,22:0.41:54
chr1	241729687	rs140702304	AAGCTCCCTGGTCAC	A	1684.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=8;PP=2963;ReadPosRankSum=0.153;SC=TTCCTTCCAAAAGCTCCCTGG;SOR=0.638;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=52;TCF=34;TCR=18;TR=20;WE=241729708;WS=241729677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,44:0.51:86
chr1	241755348	rs1053230	C	T	2179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.426;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=40;PP=1214;ReadPosRankSum=-0.105;SC=ATCTTTCCTCCGCTTGAGAAG;SOR=0.538;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=179;TCF=102;TCR=77;TR=94;WE=241755356;WS=241755338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,103:0.51:200
chr1	241755567	rs1053221	T	C	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=246;ReadPosRankSum=1.719;SC=GTGTTCTGCTTATAATTAAAC;SOR=0.495;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=48;TCF=11;TCR=37;TR=16;WE=241755575;WS=241755557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,16:0.33:48
chr1	241761349	rs45572340	T	C	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=211;ReadPosRankSum=-2.004;SC=AAAGAAGGGTTTCTTTTGTTG;SOR=0.648;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=54;TCF=22;TCR=32;TR=20;WE=241761357;WS=241761339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,27:0.43:63
chr1	241767930	rs632966	G	A	1570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=34;PP=1025;SC=GGGGGAAACCGGGCATAAGAG;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=15;TCR=34;TR=49;WE=241767938;WS=241767920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	241838057	rs67170285	C	T	3910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.74;SOR=1.190;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr1	241838065	rs66585415	T	C	3570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.78;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr1	241846710	rs41310587	A	T	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.318;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=196;ReadPosRankSum=-0.152;SC=GGAAAGTGAAATTTTTGTCAA;SOR=1.473;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=11;WE=241846718;WS=241846700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr1	241847018	rs10802979	C	T	878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=6;NR=24;PP=625;SC=GAGTATCATACAGTTAATTTA;SOR=2.694;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=30;WE=241847026;WS=241847008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	241886430	rs12748037	C	G	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.731;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=50;ReadPosRankSum=1.531;SC=GCAGCAGATCCAAACCAAGGC;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=5;WE=241886438;WS=241886420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr1	241913062	rs11432682	C	CT	865.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.108;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.647;NF=2;NR=20;PP=686;ReadPosRankSum=-0.290;SC=TGCAGGTGCCCTTTTTGGGAA;SOR=0.464;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=48;TCF=3;TCR=45;TR=22;WE=241913070;WS=241913052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,35:0.54:65
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chr1	241935987	rs35632793	AC	A	407.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.882;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.560;NF=13;NR=0;PP=444;ReadPosRankSum=-0.934;SC=CTGATCTGGAACTCCTGACCT;SOR=2.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=13;WE=241935995;WS=241935977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
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chr1	241951034	rs6429312	C	T	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.501;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=141;ReadPosRankSum=1.569;SC=GGTCTTGAACCCAAGTAAAAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=7;WE=241951042;WS=241951024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr1	241951106	rs6429313	A	G	685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.882;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=11;PP=390;ReadPosRankSum=-1.911;SC=AACTTTGACCAAATTTTCCAG;SOR=0.886;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=70;TCF=47;TCR=23;TR=32;WE=241951114;WS=241951096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,36:0.44:81
chr1	241958401	rs146518112	C	CTTGT	370.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=423;ReadPosRankSum=0.000;SC=AGGGAAGTCCCTTAAGATCAC;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=6;WE=241958417;WS=241958391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr1	241958409	rs55865277	C	T	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-2.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=439;ReadPosRankSum=1.741;SC=CCCTTAAGATCACACATCTAA;SOR=0.446;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=9;WE=241958417;WS=241958391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr1	241964559	rs4658661	C	T	3552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=76;PP=2135;ReadPosRankSum=-0.889;SC=AAAATGGCAACGTTTGGATGA;SOR=0.704;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=306;TCF=156;TCR=150;TR=154;WE=241964567;WS=241964549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,170:0.50:337
chr1	242042690	rs1418760	A	G	1010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.080;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=30;PP=751;ReadPosRankSum=-0.087;SC=TATATGTAAGAAAAAATAGAT;SOR=1.022;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=66;TCF=19;TCR=47;TR=41;WE=242042698;WS=242042680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,42:0.63:67
chr1	242045275	rs1635498	C	T	4887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=87;NR=79;PP=2595;SC=CTCCAAGCTACGTTTATCTCA;SOR=0.782;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=167;TCF=87;TCR=80;TR=166;WE=242045283;WS=242045265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr1	242048514	rs71570909	G	GTAAA	844.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=430;SC=ATCTCAAAAAGTAAATAAATA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=9;WE=242048522;WS=242048504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	242053042	rs851797	A	G	948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=24;PP=660;SC=TTTGTATATTAACTTTATAAT;SOR=3.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=27;WE=242053050;WS=242053032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	242253024	rs7523793	T	C	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=289;ReadPosRankSum=1.002;SC=TATTATGTGTTGTTCAGAGAA;SOR=1.179;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=14;WE=242253032;WS=242253014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr1	242264102	rs12124966	A	G	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.778;HP=10;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=24;PP=654;ReadPosRankSum=2.215;SC=AAAAAAAAAAAGGGGGCAGGT;SOR=0.312;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=78;TCF=36;TCR=42;TR=42;WE=242264110;WS=242264081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,37:0.60:62
chr1	242383170	rs5782230	T	TAC	860.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=448;ReadPosRankSum=0.602;SC=CTCTTAAAACTACAGTTAAGA;SOR=0.752;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=33;TCF=22;TCR=11;TR=11;WE=242383178;WS=242383160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,23:0.51:45
chr1	242383201	rs1973498	T	G	810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=12;PP=481;ReadPosRankSum=0.160;SC=CTGTAGGTTTTAGGATCCTTA;SOR=0.597;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=65;TCF=43;TCR=22;TR=31;WE=242383209;WS=242383191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,39:0.50:78
chr1	242383510	rs7547029	T	C	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=134;ReadPosRankSum=1.167;SC=TGGTTCACCATTTGTCCCAAT;SOR=1.012;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=9;WE=242383518;WS=242383500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
chr1	242511556	rs112478548	AACAAAG	A	1960.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.238;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.887;NF=2;NR=50;PP=2617;ReadPosRankSum=0.231;SC=TGAAAGAGGAAACAAAGACAA;SOR=0.387;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=107;TCF=6;TCR=101;TR=52;WE=242511569;WS=242511546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,90:0.58:154
chr1	242612420	rs2654871	G	A	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=2.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=132;ReadPosRankSum=-1.455;SC=AGAGCCCAGCGAAGTCCTTAT;SOR=0.793;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=8;WE=242612428;WS=242612418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr1	242687390	rs2810008	G	A	1133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.684;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=17;PP=605;ReadPosRankSum=0.978;SC=TCGCCCTTACGTGCTCCAGCT;SOR=0.589;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=105;TCF=68;TCR=37;TR=46;WE=242687398;WS=242687380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,57:0.46:123
chr1	243328887	rs199575184	G	T	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=362;ExcessHet=3.0103;FS=80.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.42;MQRankSum=-11.724;QD=0.69;ReadPosRankSum=-0.444;SOR=6.602;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:322,40:0.11:362
chr1	243329049	rs3766664	G	A	4157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-2.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=593;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.226;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-6.693;NF=96;NR=130;PP=2822;ReadPosRankSum=-0.459;SC=TACCAAAGAAGTTTCCTTATC;SOR=1.049;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=580;TCF=276;TCR=304;TR=226;WE=243329057;WS=243329039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:367,225:0.38:592
chr1	243329075	rs61833876	T	C	2036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=482;ExcessHet=3.0103;FS=7.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.29;MQRankSum=-4.466;QD=4.24;ReadPosRankSum=-0.571;SOR=1.199;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:355,125:0.26:480
chr1	243335940	rs74889777	GA	G	1447.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=17;PP=672;SC=TCTCAGACAAGAAAAAAAAAA;SOR=1.781;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=44;TCF=25;TCR=19;TR=36;WE=243335948;WS=243335930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	243362331	rs2789172	C	T	1330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.01;QD=29.57;SOR=3.516;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	243419429	rs3904682	T	A	4923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=105;NR=65;PP=2965;SC=GGGAGAAAGCTGGACATTTCC;SOR=1.100;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=170;TCF=105;TCR=65;TR=170;WE=243419445;WS=243419419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr1	243471462	rs976529	C	T	2797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.407;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=62;PP=1658;ReadPosRankSum=-2.083;SC=ATATGCAGACCATCGAAAGAC;SOR=0.735;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=284;TCF=146;TCR=138;TR=125;WE=243471470;WS=243471452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,140:0.43:322
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chr1	243579112	rs10927011	G	A	886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.016;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=23;PP=540;ReadPosRankSum=0.269;SC=AGCAAATGGAGGCCCAGCATG;SOR=0.484;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=59;TCF=17;TCR=42;TR=33;WE=243579120;WS=243579102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,39:0.57:68
chr1	244527857	rs10927214	T	C	1120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=6;PP=754;SC=ATAGCCTATATGCATAGTCCT;SOR=2.891;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=36;WE=244527865;WS=244527847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	244528127	rs9782996	T	C	2272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=57;PP=1658;SC=GGAGTTAGAATTGCACATCCT;SOR=2.774;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=15;TCR=57;TR=72;WE=244528135;WS=244528117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr1	244579519	rs3123696	T	C	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=3.782;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=147;ReadPosRankSum=0.417;SC=GTTAGGATTATATTTTAAAGC;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=7;WE=244579527;WS=244579509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr1	244601152	rs3127465	C	T	1131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.751;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=22;PP=533;ReadPosRankSum=-0.117;SC=AATTAATGACCTCCTGCCAAA;SOR=0.576;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=80;TCF=38;TCR=42;TR=43;WE=244601160;WS=244601142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,55:0.54:102
chr1	244723920	rs7522899	C	G	535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.938;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=289;ReadPosRankSum=0.909;SC=AATTGTTAGGCCCGTCTCTAA;SOR=1.247;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=19;WE=244723928;WS=244723910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,24:0.62:39
chr1	244724092	rs7544794	G	A	4231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=379;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.220;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=105;NR=76;PP=2423;ReadPosRankSum=0.350;SC=TAAGTCTATCGGTGACTGCTA;SOR=0.613;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=340;TCF=200;TCR=140;TR=181;WE=244724100;WS=244724082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,204:0.54:378
chr1	244735858	rs10927267	A	G	1443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.902;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=31;PP=949;ReadPosRankSum=-0.440;SC=TAGCTTTCACAACAAAAGACA;SOR=0.868;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=156;TCF=86;TCR=70;TR=69;WE=244735866;WS=244735848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,75:0.44:172
chr1	244747051	rs6429486	G	C	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=64;ReadPosRankSum=0.440;SC=TCTAGAAATTGGCGTGGGAGG;SOR=0.321;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=5;WE=244747059;WS=244747041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr1	244747150	rs6429487	G	A	1365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.580;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=25;PP=931;ReadPosRankSum=-0.016;SC=TAACCTGTACGAATTGTTTCT;SOR=0.609;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=163;TCF=102;TCR=61;TR=63;WE=244747158;WS=244747140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,69:0.39:178
chr1	244747293	rs6429488	CG	TA	1539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;JOINED;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=28;PP=1482;ReadPosRankSum=0.506;SC=AATGTATAGGCGGTCAACCAA;SOR=0.627;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=86;TCF=26;TCR=60;TR=39;WE=244747302;WS=244747283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,42:0.44:96
chr1	244747339	rs6429490	G	A	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.643;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=228;ReadPosRankSum=0.839;SC=ATACCTCCATGCAATACCTCC;SOR=1.402;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=15;WE=244747347;WS=244747329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr1	244754961	rs41269387	C	A	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.139;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=177;ReadPosRankSum=-1.072;SC=ATTTCAACTTCATTATGTTTT;SOR=0.473;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=44;TCF=31;TCR=13;TR=18;WE=244754969;WS=244754951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,21:0.40:52
chr1	244773784	rs6698173	T	C	764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=16;PP=357;SC=ATTTTTAAAATGCTTCATCTT;SOR=2.400;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=21;WE=244773792;WS=244773774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	244773803	rs6698180	T	C	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.260;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=144;ReadPosRankSum=1.135;SC=TTAATTTCTGTGTGATCTTTT;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=9;WE=244773811;WS=244773793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr1	244803205	rs60280231	CTT	C	433.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.65;ReadPosRankSum=0.083;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,16:0.76:21
chr1	245021291	rs11299108	TA	T	97.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=5.627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.18;ReadPosRankSum=0.971;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,16:0.19:83
chr1	245133489	rs7545078	T	G	525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.878;HP=5;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=13;PP=290;ReadPosRankSum=2.808;SC=GGGGGCCGGGTGGCAGACGGG;SOR=0.573;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=69;TCF=37;TCR=32;TR=27;WE=245133497;WS=245133479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,30:0.40:75
chr1	245133539	rs7542813	A	G	2863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=43;NR=32;PP=1690;SC=GTGGCGCGAAACGGGGACAGG;SOR=0.768;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=43;TCR=32;TR=75;WE=245133558;WS=245133529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr1	245133549	rs10536649	GGC	G	1193.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.926;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=12;PP=770;ReadPosRankSum=-0.724;SC=ACGGGGACAGGGCGCGCGCTC;SOR=0.790;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=53;TCF=20;TCR=33;TR=19;WE=245133558;WS=245133529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,35:0.48:73
chr1	245133623	rs145835471	T	TCCTCC	1652.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=13;PP=1098;ReadPosRankSum=-1.153;SC=GAGCGGCCCCTCCTCCAGGCC;SOR=0.703;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=76;TCF=29;TCR=47;TR=24;WE=245133634;WS=245133613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,43:0.44:98
chr1	245133662	rs61844237	G	C	1547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.445;NF=34;NR=33;PP=728;ReadPosRankSum=1.345;SC=TGAGCAGGCCGGGACACCGCG;SOR=0.648;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=149;TCF=75;TCR=74;TR=67;WE=245133670;WS=245133652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,79:0.49:160
chr1	245179011	.	CAA	C	169.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=1.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=1.542;QD=6.06;ReadPosRankSum=0.356;SOR=0.694;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
chr1	245179171	rs1196365	C	T	2214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.566;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=48;PP=1016;ReadPosRankSum=-0.526;SC=CCAAAGTGATCAGCAGACCGC;SOR=1.224;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=143;TCF=45;TCR=98;TR=66;WE=245179179;WS=245179161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,69:0.46:150
chr1	245179188	rs1196366	G	T	1733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=35;PP=764;ReadPosRankSum=0.564;SC=CCGCATCACTGTGCTGCCTGG;SOR=0.773;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=93;TCF=18;TCR=75;TR=43;WE=245179196;WS=245179178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,45:0.46:97
chr1	245180639	rs34180210	AT	A	131.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.31;ReadPosRankSum=-0.634;SOR=0.741;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,13:0.23:57
chr1	245222634	rs694793	C	G	1686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=9;PP=1088;SC=TTGGAGAAACCTGGCCTTTTC;SOR=2.985;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=56;TCF=46;TCR=10;TR=55;WE=245222642;WS=245222624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	245222839	rs579269	G	T	4478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=62;NR=90;PP=2821;SC=AATCCTTACCGGAAACTAAAA;SOR=1.172;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=153;TCF=62;TCR=91;TR=152;WE=245222847;WS=245222829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr1	245245378	rs10927386	T	C	2478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=33;PP=762;ReadPosRankSum=-0.456;SC=ACTTATTGAATGTTTAGGTAG;SOR=0.689;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=63;TCR=65;TR=66;WE=245245386;WS=245245368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,73:0.51:142
chr1	245245402	rs10927387	C	T	2257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.681;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=25;PP=752;ReadPosRankSum=2.704;SC=AAGAAGAACCCACTGGATACA;SOR=0.597;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=106;TCF=53;TCR=53;TR=53;WE=245245410;WS=245245392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,62:0.52:119
chr1	245318688	rs12409851	C	T	3692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.819;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=72;PP=2298;ReadPosRankSum=-0.097;SC=GATGTAGCGTCGGTGGAACCT;SOR=0.758;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=305;TCF=169;TCR=136;TR=165;WE=245318696;WS=245318678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,176:0.52:340
chr1	245704130	rs61754898	G	C	2233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.010;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=53;PP=1325;ReadPosRankSum=1.270;SC=CACTTCTTCCGCTGCCGAACC;SOR=0.624;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=206;TCF=93;TCR=113;TR=100;WE=245704138;WS=245704120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,111:0.47:234
chr1	245765800	rs7541927	T	A	1706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=12;PP=961;SC=TGCATGTATATCGCAGAGTAT;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=41;TCR=12;TR=53;WE=245765808;WS=245765790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	245851304	rs6701084	A	G	6884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=114;NR=127;PP=2965;SC=GCAGGGCGACAGTCAGCCACT;SOR=0.848;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=241;TCF=114;TCR=127;TR=241;WE=245851312;WS=245851294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr1	245861571	rs3205034	C	T	4092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=54;NR=83;PP=2487;SC=AAATCGATGACGTGGAGCGCC;SOR=1.248;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=137;TCF=54;TCR=83;TR=137;WE=245861579;WS=245861561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr1	246021941	rs2362587	T	C	6165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=111;NR=96;PP=2965;SC=TGCTTATGATTGCCTGGCACA;SOR=0.702;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=207;TCF=111;TCR=96;TR=207;WE=246021949;WS=246021931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr1	246022071	rs2185370	C	T	894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=23;PP=645;SC=AGCACAGGAGCGAGGGAAGCA;SOR=3.334;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=26;WE=246022079;WS=246022061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	246027024	rs12123124	A	G	3075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.60;SOR=2.035;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	246027029	rs61830203	A	T	3458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.12;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr1	246027034	rs2153404	G	C	3613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.54;SOR=2.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr1	246091457	rs6669768	T	C	1606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=34;PP=821;SC=GTTGACAGGATGCCAGGGGTT;SOR=1.812;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=17;TCR=34;TR=51;WE=246091465;WS=246091447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	246091515	rs2275318	C	T	595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=15;PP=393;SC=ACACCTCCCACGAAGTGCAAT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=246091523;WS=246091505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	246091531	rs6669866	T	C	464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=11;PP=281;SC=GCAATTCTCCTCAAGATGCAG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=246091539;WS=246091521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	246093465	rs11295264	GA	G	682.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=9.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.88;ReadPosRankSum=1.375;SOR=2.356;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,38:0.72:53
chr1	246110573	rs10802300	A	G	5501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=116;NR=61;PP=2965;SC=AAGAGCAAGTAGCTAAAGGAA;SOR=1.384;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=178;TCF=117;TCR=61;TR=177;WE=246110581;WS=246110563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr1	246489706	rs57404221	GA	G	3022.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=81;PP=1298;ReadPosRankSum=-0.073;SC=GGCTAGTGAAGAAAAAAAAAA;SOR=0.700;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=10;TCR=89;TR=90;WE=246489725;WS=246489695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,124:0.98:127
chr1	246489769	rs367922653	TA	T	163.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.44;ReadPosRankSum=1.024;SOR=2.049;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr1	246490438	rs3737245	T	C	5409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.04;SOR=1.490;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr1	246490442	rs3737246	A	G	5728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.83;SOR=1.360;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr1	246490452	rs3737247	G	A	6301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.73;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr1	246498866	rs10159376	A	C	1035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=24;PP=745;SC=ATAAACATTAAATTTTAATAG;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=32;WE=246498874;WS=246498856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	246670281	rs6671418	G	C	318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=46;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=24;NR=4;PP=590;SC=GCGGCTGCCGGCCGCCCGACG;SOR=0.836;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=28;WE=246670289;WS=246670271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	246670297	rs201911211	CCCT	C	75.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.99;ReadPosRankSum=1.494;SOR=1.265;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr1	246670298	rs150603688	CCT	C	233.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5333;FS=2.017;HP=7;HapScore=4;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=184;ReadPosRankSum=-1.406;SC=GACGCCCCCCCCTCCCCAGCA;SOR=0.510;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=30;TCF=16;TCR=14;TR=18;WE=246670308;WS=246670287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr1	246670333	rs6426303	A	G	2116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.49;SOR=0.948;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr1	246670481	rs7520453	C	G	5533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=97;PP=2965;SC=CGTTTCCCCTCTTGGCGGTTG;SOR=0.944;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=185;TCF=88;TCR=97;TR=185;WE=246670489;WS=246670471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr1	246711789	rs3124131	T	A	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.123;HP=11;HapScore=3;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.653;NF=16;NR=7;PP=399;ReadPosRankSum=0.030;SC=CCTAAAAAAATAAAATAAAAA;SOR=0.349;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=23;WE=246711797;WS=246711778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,13:0.33:39
chr1	246711816	rs5782396	GA	G	1114.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.946;HP=6;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.12;MQRankSum=0.946;NF=17;NR=10;PP=722;ReadPosRankSum=0.599;SC=CACGTAGGGAGAAAAAGGAAA;SOR=1.096;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=64;TCF=33;TCR=31;TR=27;WE=246711824;WS=246711806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,47:0.54:87
chr1	246712033	rs1890160	A	G	1386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=34;PP=1021;SC=TTGGATTTAAAAGAAACATGT;SOR=3.767;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=3;TCR=34;TR=37;WE=246712041;WS=246712023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	246714426	rs12140400	A	G	155.41	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5164;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=70;ReadPosRankSum=0.887;SC=GCAGCAAGCTATGATTGTGCC;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=6;WE=246714434;WS=246714421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr1	246714587	rs10754526	G	A	925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.540;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=20;PP=512;ReadPosRankSum=0.633;SC=CTGGATTTCCGGGATCTGCCA;SOR=0.693;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=98;TCF=53;TCR=45;TR=41;WE=246714595;WS=246714577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,48:0.44:109
chr1	246714631	rs80342781	TG	AA	789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=5.407;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.61;ReadPosRankSum=0.097;SOR=1.532;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,23:0.34:68
chr1	246714636	rs34850511	T	A	768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=5.797;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.60;ReadPosRankSum=0.802;SOR=1.545;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,20:0.33:61
chr1	246720174	rs3120710	A	G	247.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=204;SC=CCTTGGCATGAAACTTGGCTT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=246720182;WS=246720164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	246720798	rs3124071	G	A	5462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=94;PP=2965;SC=AGTCACAGTGGATCACTCGTA;SOR=0.936;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=177;TCF=83;TCR=94;TR=177;WE=246720806;WS=246720788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr1	246727558	rs3120713	G	T	1378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=14;PP=869;SC=GATATTCTATGTAAAACACTG;SOR=1.519;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=32;TCR=14;TR=46;WE=246727566;WS=246727548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	246754778	rs35302997	G	GA	87.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=132;ReadPosRankSum=0.911;SC=GCAAAGGTTAGAAAATGAAGT;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=5;WE=246754786;WS=246754773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr1	246755124	rs6702823	T	C	4714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=88;NR=75;PP=2834;SC=GGTGAGAACTTGCAAAACACC;SOR=0.764;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=163;TCF=88;TCR=75;TR=163;WE=246755132;WS=246755114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr1	246797710	rs35650980	G	T	695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.808;HP=6;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=519;ReadPosRankSum=0.288;SC=TTAACTGTTTGTTTGTTTTTT;SOR=0.235;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=13;WE=246797722;WS=246797700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr1	246797714	rs11396823	G	GT	682.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.905;HP=10;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=533;ReadPosRankSum=0.562;SC=CTGTTTGTTTGTTTTTTTGCT;SOR=0.201;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=9;WE=246797722;WS=246797700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr1	246797974	rs6680646	T	A	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.997;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=100;ReadPosRankSum=0.273;SC=TTCTTTGTTTTATGTTTTCAA;SOR=0.582;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=7;WE=246797982;WS=246797964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr1	246804824	rs12401692	T	C	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=82;ReadPosRankSum=-0.520;SC=GTTGCTTCTTTGGGGGTTTCC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=5;WE=246804832;WS=246804814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr1	246805435	rs12748305	G	T	54.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.71;ReadPosRankSum=-1.150;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr1	246887594	rs12754750	G	A	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.563;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=80;ReadPosRankSum=0.404;SC=GCGCGCGCGGGGTGAAGGGAG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=5;WE=246887602;WS=246887584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,4:0.22:18
chr1	246890158	rs34677128	T	C	1386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.353;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=13;PP=887;ReadPosRankSum=0.461;SC=AATCCTCTACTGGGATTTACT;SOR=0.328;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=98;TCF=81;TCR=17;TR=57;WE=246890166;WS=246890148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,62:0.56:111
chr1	246899123	rs61852479	T	C	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=129;ReadPosRankSum=-0.296;SC=TGTGAGCCACTGTGCCTGGCC;SOR=0.859;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=7;WE=246899131;WS=246899113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr1	246903654	rs3007322	G	C	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.936;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=11;PP=290;ReadPosRankSum=-0.434;SC=CCGTGCAAAGGCTTCATGTTT;SOR=0.188;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=42;TCF=12;TCR=30;TR=19;WE=246903662;WS=246903644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,25:0.50:50
chr1	246929483	rs12144408	A	G	1693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=42;PP=1128;SC=TTTTTTATCTATGTTATATTT;SOR=2.019;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=58;TCF=15;TCR=43;TR=57;WE=246929491;WS=246929473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	246930377	rs10924821	C	T	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=266;ReadPosRankSum=-0.211;SC=CAAAGGTAGCCGTGATTACCA;SOR=1.230;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=14;WE=246930385;WS=246930367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr1	246939443	rs6665017	G	A	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.774;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=152;ReadPosRankSum=-0.978;SC=TCAGAGCCTTGGCAAGCTCTC;SOR=0.223;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=10;WE=246939451;WS=246939433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr1	246939610	rs3838991	A	ATATT	9301.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=54;PP=2972;SC=GGGCATCTCTATATTTATTTT;SOR=0.836;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=96;TCF=29;TCR=67;TR=79;WE=246939618;WS=246939600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr1	246939856	rs3795465	G	A	1576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.237;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=32;PP=902;ReadPosRankSum=-0.407;SC=ACCAGAAGCAGTTTTCGCAAG;SOR=0.590;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=143;TCF=79;TCR=64;TR=66;WE=246939864;WS=246939846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,74:0.47:159
chr1	246939943	rs6685364	T	C	1487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.309;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=29;PP=906;ReadPosRankSum=-0.134;SC=CTGCTCTAGCTTGAGCAGCTT;SOR=0.566;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=126;TCF=60;TCR=66;TR=57;WE=246939951;WS=246939933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,68:0.47:146
chr1	246940179	rs3795464	G	A	1447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=0.572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.62;ReadPosRankSum=0.883;SOR=0.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,73:0.43:168
chr1	246940182	rs3795463	C	A	5772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.57;SOR=0.832;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr1	246940442	rs3795462	T	C	1039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=7;PP=791;SC=CCCTGCTGGATGAGAACCCAG;SOR=2.049;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=31;WE=246940450;WS=246940432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	246940757	rs4325176	A	G	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.189;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=354;ReadPosRankSum=1.034;SC=GAAAAACATAAAACATAATTT;SOR=0.223;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=18;WE=246940765;WS=246940747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr1	247004392	rs12031687	C	T	461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=14;PP=345;SC=ACCTTAGGGACTGCTTAGTGC;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=247004400;WS=247004382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	247006051	rs12410563	G	C	2110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=29;PP=1281;SC=GGCTTTCCCAGAGTTTCTACT;SOR=0.941;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=70;TCF=41;TCR=29;TR=69;WE=247006059;WS=247006041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr1	247006160	rs5021094	G	T	880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=19;PP=487;SC=AGGAATACTAGAGCCAAACAC;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=26;WE=247006177;WS=247006150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	247006169	rs34402133	A	ACTG	1222.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=18;PP=993;SC=AGAGCCAAACACTGATGAATT;SOR=2.147;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=18;WE=247006177;WS=247006150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	247021138	rs41310593	A	T	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=14;PP=254;ReadPosRankSum=1.484;SC=ACAAATAAGAATATTATTTAT;SOR=0.625;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=82;TCF=34;TCR=48;TR=25;WE=247021146;WS=247021128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,27:0.31:88
chr1	247031237	rs2800222	C	G	159.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=51;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=13;PP=330;SC=CGTGGTAATACTAGCTAAAAA;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=247031245;WS=247031227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	247048834	rs2642990	T	C	274.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=0;PP=225;SC=GATAACATCGTTACCACTGGA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=247048842;WS=247048824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	247054530	rs1472275	T	C	320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=205;SC=ATCTTTGTATTTAGTTTACTT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=247054538;WS=247054520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	247067119	.	G	A	73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=28;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=73;QD=35.9237375157;SC=CAGCCTGGGCGACAGAGCGAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=247067127;WS=247067109;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	247109014	rs2642982	G	C	922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=6;PP=640;SC=TCGGGCTGACGCAGCTGGACC;SOR=2.448;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=30;WE=247109022;WS=247109004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	247109168	rs6426191	G	A	5885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=116;NR=80;PP=2965;SC=TTAAGGTTCCGAGTAGCTCCT;SOR=0.974;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=196;TCF=116;TCR=80;TR=196;WE=247109176;WS=247109158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr1	247109267	rs2642983	A	C	5293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=98;PP=2965;SC=TGCCATTTCAAATTCACGCAG;SOR=1.114;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=175;TCF=77;TCR=98;TR=175;WE=247109275;WS=247109247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr1	247129945	rs1779985	A	G	377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=274;SC=CTAATCAGCTAGGTATGGGGG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=247129953;WS=247129941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	247130577	rs4971282	C	A	490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=1;PP=363;SC=TATTAAAAAGCCACTGGATTG;SOR=3.383;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=247130585;WS=247130572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	247150740	rs3749427	T	C	3168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=48;PP=1958;SC=GGTTAAAGGCTTTTCCACATT;SOR=0.710;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=103;TCF=55;TCR=48;TR=103;WE=247150748;WS=247150730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr1	247151557	rs2642992	A	G	3146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=76;PP=2207;SC=AGAAGACAAAACTGGAAAAAA;SOR=2.368;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=27;TCR=76;TR=103;WE=247151565;WS=247151547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr1	247162658	rs2642973	C	T	10027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=377;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=156;NR=183;PP=2965;SC=ACCTGAGTGTCTGGCTGTCTT;SOR=0.921;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=339;TCF=156;TCR=183;TR=339;WE=247162666;WS=247162648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,377:1.00:377
chr1	247241850	rs41305955	G	C	5759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=122;NR=68;PP=2965;SC=CCGCTTCCTGGCGGTTCCCTT;SOR=1.268;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=190;TCF=122;TCR=68;TR=190;WE=247241858;WS=247241840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr1	247242032	rs3806269	C	T	3283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=75;PP=2224;SC=ACGCACCGAGCTCGCCACATT;SOR=1.777;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=109;TCF=34;TCR=75;TR=109;WE=247242040;WS=247242022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr1	247267274	rs4925692	C	A	1954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=25;PP=1103;SC=CCCGACAGGGCTCCGGCCGGC;SOR=0.971;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=40;TCR=25;TR=65;WE=247267282;WS=247267264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr1	247274899	rs73135916	A	G	310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=2;PP=87;SC=CAGGTGGCCGAAGTCGGAGGG;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=247274907;WS=247274889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	247287256	rs12058911	T	A	932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FS=4.300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.62;MQRankSum=2.347;QD=3.87;ReadPosRankSum=0.652;SOR=1.036;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:177,64:0.27:241
chr1	247287260	rs3901383	A	G	1793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FS=2.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.83;MQRankSum=-3.346;QD=7.51;ReadPosRankSum=1.368;SOR=0.531;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:146,93:0.39:239
chr1	247287269	rs78802037	T	C	5059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQRankSum=-1.994;QD=22.29;ReadPosRankSum=0.490;SOR=0.661;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,150:0.66:227
chr1	247320105	rs33998996	G	T	3031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=348;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.481;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=65;PP=1889;ReadPosRankSum=0.129;SC=GGGAACTGGCGTATCTGAAGG;SOR=0.559;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=311;TCF=150;TCR=161;TR=133;WE=247320113;WS=247320095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:196,151:0.44:347
chr1	247322298	rs6675536	G	T	1412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.423;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=20;PP=699;ReadPosRankSum=0.512;SC=CTCTTGTGAGGGCAAATTACC;SOR=0.859;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=110;TCF=67;TCR=43;TR=58;WE=247322306;WS=247322288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,68:0.54:126
chr1	247323260	rs9793102	C	A	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=143;ReadPosRankSum=-0.052;SC=GTCTACACTTCCTTTCTCCCA;SOR=0.412;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=32;TCF=4;TCR=28;TR=13;WE=247323268;WS=247323250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr1	247337159	rs10924931	A	G	4275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;BaseQRankSum=1.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.594;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.064;NF=83;NR=90;PP=2866;ReadPosRankSum=-0.618;SC=GATGAGGTTTATATAACTTTC;SOR=0.549;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=206;TCF=102;TCR=104;TR=173;WE=247337167;WS=247337149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,177:0.84:210
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chr1	247485932	rs10924984	A	G	1026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=9;PP=685;SC=TCCTCAGAGCACCCGAGTAAG;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=38;WE=247485940;WS=247485922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	247486213	rs41268345	G	A	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=15;PP=332;ReadPosRankSum=1.949;SC=TCCTGCTATCGTCTGCACAAA;SOR=0.598;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=56;TCF=25;TCR=31;TR=27;WE=247486221;WS=247486203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,31:0.48:64
chr1	247486421	rs6692645	G	C	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=174;ReadPosRankSum=1.131;SC=GAGGCAAACAGGGGATTTTCA;SOR=0.614;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=28;TCR=9;TR=16;WE=247486429;WS=247486411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,19:0.44:43
chr1	247486647	rs185110959	A	T	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.990;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=291;ReadPosRankSum=-0.078;SC=GAAAATCACAAGAGAGGCACC;SOR=0.892;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=55;TCF=22;TCR=33;TR=23;WE=247486655;WS=247486637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,28:0.42:66
chr1	247486678	rs7540329	T	C	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.960;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=168;ReadPosRankSum=-0.607;SC=TGTTTCATGGTGCTTTTCATA;SOR=0.218;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=14;WE=247486686;WS=247486668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chr1	247582461	rs368835809	TATA	T	379.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=34.52;ReadPosRankSum=0.158;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,10:0.91:11
chr1	247582466	rs4998423	A	T	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=35.34;ReadPosRankSum=0.475;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,10:0.91:11
chr1	247587477	rs3806268	G	A	3194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.495;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=71;PP=1903;ReadPosRankSum=1.789;SC=TGGACTGGGCGTCGGGGACAC;SOR=0.564;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=268;TCF=128;TCR=140;TR=138;WE=247587485;WS=247587467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,152:0.51:298
chr1	247587531	rs4925543	A	G	9364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=165;NR=146;PP=2965;SC=TCCACTGTCGAGAGGTGAGCC;SOR=0.792;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=311;TCF=165;TCR=146;TR=311;WE=247587539;WS=247587521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,336:1.00:336
chr1	247597329	rs12124866	C	T	72.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.18;QD=24.09;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	247597364	.	G	GAT	1197.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.99;QD=171.10;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	247597365	.	G	A	699	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MMLQ=27;MQ=58.87;NF=29;NR=0;PP=699;QD=25.3024556051;SC=CTCTGGTCAGGTGTGTTCTGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=29;WE=247597373;WS=247597355;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	247597365	.	G	GTGTTCTGAGGCCTTCTCTATTCCAGAGCTCTCTGGTCAGA	1194.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.24;QD=149.34;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	247597656	rs3835304	TG	T	1243.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.170;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.734;NF=0;NR=33;PP=1071;ReadPosRankSum=0.269;SC=CCCGGTGGGCTGGGGTTTGAG;SOR=0.955;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=0;TCR=59;TR=33;WE=247597664;WS=247597646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,45:0.58:77
chr1	247599232	rs10754557	G	A	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=185;ReadPosRankSum=-0.997;SC=GTGGAGCGTGGGTGAGAGACA;SOR=0.412;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=11;WE=247599240;WS=247599222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr1	247614617	rs4925663	C	T	2858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.377;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=63;PP=1856;ReadPosRankSum=1.049;SC=GGCAATAAAGCCATAGGAGAG;SOR=0.597;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=287;TCF=159;TCR=128;TR=137;WE=247614625;WS=247614602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,142:0.47:301
chr1	247614693	rs6695302	C	T	9016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=165;NR=155;PP=2965;SC=GTGTCATTCACAGCGGTGTCA;SOR=0.729;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=322;TCF=165;TCR=157;TR=320;WE=247614701;WS=247614683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,340:1.00:340
chr1	247614896	rs11583410	A	C	1361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.633;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=28;PP=924;ReadPosRankSum=0.321;SC=GGGCTTGCAGATGGCCACGTA;SOR=0.624;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=131;TCF=62;TCR=69;TR=56;WE=247614904;WS=247614886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,60:0.43:138
chr1	247615261	rs35305980	GA	G	4304.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.04;MQRankSum=1.000;NF=19;NR=64;PP=2964;ReadPosRankSum=-0.019;SC=AGTCCCCTAAGAAGCTATGGT;SOR=0.583;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=153;TCF=30;TCR=123;TR=83;WE=247615269;WS=247615251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,138:0.50:274
chr1	247615340	rs55889481	C	T	1511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.479;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.918;NF=24;NR=40;PP=977;ReadPosRankSum=0.221;SC=TGAATAATACCTGAGAAGAGG;SOR=0.548;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=117;TCF=42;TCR=75;TR=64;WE=247615348;WS=247615330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,70:0.55:127
chr1	247615358	rs10925030	C	G	1156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.895;NF=16;NR=30;PP=774;ReadPosRankSum=0.426;SC=AGGAATTGATCACTTTCCTCC;SOR=0.603;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=80;TCF=26;TCR=54;TR=46;WE=247615366;WS=247615348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,50:0.57:88
chr1	247654993	rs10925061	T	C	2170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=51;PP=1461;ReadPosRankSum=0.023;SC=TTGCCATGTCTTGTGAGGAAA;SOR=0.723;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=235;TCF=115;TCR=120;TR=98;WE=247655001;WS=247654983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,106:0.42:255
chr1	247655275	rs12141850	T	C	1582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.140;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=32;PP=916;ReadPosRankSum=-0.386;SC=ACCATCGTCATTCCCAGCATC;SOR=0.601;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=171;TCF=89;TCR=82;TR=71;WE=247655283;WS=247655265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,80:0.43:188
chr1	247690320	rs2141543	C	T	1254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.977;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=27;PP=848;ReadPosRankSum=-0.243;SC=GTGTGGAATGCCTGGTGTTTC;SOR=0.471;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=144;TCF=89;TCR=55;TR=61;WE=247690328;WS=247690310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,63:0.41:152
chr1	247695612	rs6657127	G	A	6953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=114;NR=119;PP=2965;SC=TCCAGGAAGGGGAGGTTGGCA;SOR=0.751;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=234;TCF=115;TCR=119;TR=233;WE=247695620;WS=247695602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr1	247695756	rs6697472	T	C	6456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=122;PP=2965;SC=GAGGGTCGTGTGGAGAAGCCC;SOR=1.080;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=217;TCF=95;TCR=122;TR=217;WE=247695764;WS=247695746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr1	247702118	rs2103336	C	T	1507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=27;PP=854;ReadPosRankSum=-0.352;SC=TTCTGTTGCCCGCCACCACCC;SOR=0.667;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=176;TCF=107;TCR=69;TR=71;WE=247702126;WS=247702108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,79:0.40:198
chr1	247726822	rs142922665	CTTTT	C	3983.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.594;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=39;PP=1531;ReadPosRankSum=0.436;SC=CAACCAAATGCTTTTTTTGAA;SOR=0.814;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=135;TCF=34;TCR=101;TR=49;WE=247726833;WS=247726812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,105:0.45:234
chr1	247752109	rs61732336	A	G	1385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.959;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=29;PP=777;ReadPosRankSum=1.954;SC=CTTGGCATCTATGGCATGGCT;SOR=0.588;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=147;TCF=84;TCR=63;TR=63;WE=247752117;WS=247752099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,71:0.43:164
chr1	247752367	rs869111	A	G	1559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.372;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=29;PP=1064;ReadPosRankSum=-0.243;SC=GTCAGCTACCAGGAGACAGAA;SOR=0.980;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=183;TCF=109;TCR=74;TR=76;WE=247752375;WS=247752357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,80:0.41:193
chr1	247769217	rs61750030	T	G	3405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.322;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=85;PP=2112;ReadPosRankSum=0.172;SC=TGGGCTCCACTGAATGTATCC;SOR=0.830;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=307;TCF=140;TCR=167;TR=151;WE=247769225;WS=247769207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,166:0.49:340
chr1	247769752	rs61730407	A	G	1298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=33;PP=721;ReadPosRankSum=-0.395;SC=AAATCCTATCATCTATACTTT;SOR=0.691;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=125;TCF=51;TCR=74;TR=57;WE=247769760;WS=247769742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,64:0.47:136
chr1	247835352	rs1151641	C	T	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-2.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=113;ReadPosRankSum=-1.151;SC=GTATGAAAAACCAGTAAAATC;SOR=0.317;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=7;WE=247835360;WS=247835342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr1	247835674	rs28446289	G	A	3540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=75;PP=2228;ReadPosRankSum=-0.876;SC=GTGCGGATACGGAGAATAGCA;SOR=0.703;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=290;TCF=144;TCR=146;TR=149;WE=247835682;WS=247835664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,165:0.52:319
chr1	247835908	rs28556931	T	A	2061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.130;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=42;PP=1234;ReadPosRankSum=0.579;SC=GCAATAGCCATGACCATGCTG;SOR=0.531;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=61;TCR=70;TR=80;WE=247835916;WS=247835898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,92:0.62:148
chr1	247836008	rs28555391	G	A	1561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=31;PP=1019;ReadPosRankSum=-0.032;SC=CCATGGTGGTGAAGAGAACCA;SOR=0.687;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=126;TCF=68;TCR=58;TR=68;WE=247836016;WS=247835998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,72:0.53:136
chr1	247836207	rs28711149	T	A	2693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.432;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=59;PP=1550;ReadPosRankSum=-1.717;SC=GTTATAGATTTTGGCAATGAT;SOR=0.725;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=253;TCF=129;TCR=124;TR=121;WE=247836215;WS=247836197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,134:0.48:280
chr1	247921100	rs1552812	T	G	5375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=84;PP=2965;SC=CCAATAGACCTCCTACTGCAA;SOR=0.863;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=190;TCF=106;TCR=84;TR=190;WE=247921108;WS=247921090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr1	247921352	rs1552813	C	T	6684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=125;NR=102;PP=2965;SC=ATCTATCATACGCCATCACAC;SOR=0.866;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=227;TCF=125;TCR=102;TR=227;WE=247921360;WS=247921342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr1	247921717	rs10888359	C	A	2636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=57;PP=1759;SC=ATATTCCCAACAAATCTAGAA;SOR=1.440;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=32;TCR=57;TR=89;WE=247921725;WS=247921707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr1	247921789	rs147960387	A	AGT	120.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=237;SC=AGAGAGAGACAGTGTGTGTGT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=6;WE=247921797;WS=247921779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	247978079	rs72777548	T	A	900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=9;PP=1296;ReadPosRankSum=-0.345;SC=TATCTATTATTGAAAGAAGAA;SOR=0.750;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=58;TCF=43;TCR=15;TR=32;WE=247978095;WS=247978069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,40:0.61:66
chr1	247978087	rs10888248	G	A	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=6;PP=863;ReadPosRankSum=0.269;SC=ATTGAAAGAAGAAAAGCAACA;SOR=0.608;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=71;TCF=53;TCR=18;TR=29;WE=247978095;WS=247978069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,31:0.39:80
chr1	247978135	rs12734733	C	A	1219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.293;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=21;PP=620;ReadPosRankSum=-0.700;SC=TTATCAACATCCCCAGAGCCA;SOR=0.567;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=138;TCF=90;TCR=48;TR=57;WE=247978143;WS=247978125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,65:0.41:159
chr1	247978319	rs6695283	A	G	5937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=91;PP=2965;SC=TGGAAGGCAAATAGAGTAGGC;SOR=0.779;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=183;TCF=91;TCR=92;TR=182;WE=247978327;WS=247978309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr1	247978541	rs35979231	AAGG	A	5055.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.427;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=3.049;NF=13;NR=57;PP=2828;ReadPosRankSum=-1.040;SC=ACAGTAGGATAAGGAGAAGGT;SOR=0.653;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=155;TCF=24;TCR=131;TR=70;WE=247978551;WS=247978531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,136:0.47:290
chr1	247978996	rs10888249	A	G	1418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=34;PP=905;ReadPosRankSum=-0.027;SC=AAAACCCCATAAGGATAAATT;SOR=0.728;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=116;TCF=51;TCR=65;TR=60;WE=247979004;WS=247978986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,65:0.52:124
chr1	248004614	rs6667389	G	A	7011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=131;NR=105;PP=2965;ReadPosRankSum=1.066;SC=TGGTCACCTCGGTGATATAAA;SOR=0.879;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=238;TCF=132;TCR=106;TR=236;WE=248004622;WS=248004604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,256:0.99:258
chr1	248004687	rs10888255	C	G	10229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=377;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=189;NR=153;PP=2965;SC=AATCTGATTGCGCCCACAGAA;SOR=0.840;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=342;TCF=189;TCR=153;TR=342;WE=248004695;WS=248004677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,376:1.00:376
chr1	248004775	rs10888256	C	T	9296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=349;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=161;NR=160;PP=2965;SC=ACCAACCTGGCACAGAGCCCA;SOR=0.764;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=321;TCF=161;TCR=160;TR=321;WE=248004783;WS=248004765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,348:1.00:348
chr1	248004848	rs4607924	G	C	6977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=117;PP=2965;SC=CATAGGCCATGAAGGCCAGGA;SOR=0.880;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=222;TCF=104;TCR=118;TR=221;WE=248004856;WS=248004838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr1	248004877	rs10888257	C	T	9888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.15;SOR=0.865;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr1	248004884	rs1339845	T	C	9660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.11;SOR=0.838;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr1	248005213	rs7522811	G	C	3295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=52;PP=1925;SC=TGTGGGGGATGAAAAACATTC;SOR=0.871;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=103;TCF=51;TCR=52;TR=103;WE=248005221;WS=248005203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr1	248020448	rs10749636	G	A	286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=2;PP=163;SC=GACACCACCCGTCGGCGCCTG;SOR=1.802;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=248020456;WS=248020438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	248020556	rs11204523	G	C	2616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=27;PP=1518;SC=GTCATGGCCTGGGCGCCGCCC;SOR=1.481;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=58;TCR=27;TR=85;WE=248020564;WS=248020546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr1	248028219	rs946696	G	A	617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=13;PP=347;SC=GCCAGCGCCCGGCCCTGGGTC;SOR=1.136;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=10;TCR=13;TR=23;WE=248028227;WS=248028209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	248039451	rs3811444	C	T	2519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.938;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=57;PP=1592;ReadPosRankSum=-0.313;SC=GGGGAAACCACGCCATCTCCT;SOR=0.616;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=244;TCF=122;TCR=122;TR=118;WE=248039459;WS=248039441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,123:0.46:266
chr1	248039713	rs3811445	A	G	2251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.434;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=46;PP=1291;ReadPosRankSum=-0.637;SC=TGCCACCCACAACAATAGCAG;SOR=0.534;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=174;TCF=82;TCR=92;TR=93;WE=248039721;WS=248039703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,104:0.52:200
chr1	248058755	rs1337876	A	G	771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.59;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	248058755	.	ATAACTG	GTAACTC,GTAACTG	284	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=35;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=9,19;NR=0,1;PP=205,284;QD=28.7186527625;SC=GCAACTCCATATAACTGTTGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=9,20;WE=248058769;WS=248058745;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.45:20
chr1	248058761	rs11204543	G	C	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.91;ReadPosRankSum=-0.932;SOR=1.483;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr1	248058797	rs1856248	T	G	1796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=5;PP=1301;SC=ATAAAAAGCATAGAAGAATGC;SOR=3.651;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=43;TCR=5;TR=48;WE=248058805;WS=248058787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	248058845	rs4500353	A	C	3992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=38;PP=2658;SC=ATCAGCTGTTATTATTATTAT;SOR=1.772;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=88;TCR=38;TR=126;WE=248058853;WS=248058835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr1	248058879	rs6587387	A	T	6490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=129;NR=80;PP=2965;SC=TCTGTTCAGCAGCAGTAGAGA;SOR=1.174;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=209;TCF=129;TCR=80;TR=209;WE=248058887;WS=248058869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr1	248059423	rs10888267	C	T	2100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.545;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=41;PP=1273;ReadPosRankSum=-1.454;SC=CCACTTCCTGCGTGAGATGCC;SOR=0.644;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=163;TCF=89;TCR=74;TR=89;WE=248059431;WS=248059413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,97:0.54:180
chr1	248059456	rs12135078	G	A	4461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=65;PP=2732;SC=GATGGCCTGCGTCAGCACTGT;SOR=0.744;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=145;TCF=80;TCR=65;TR=145;WE=248059464;WS=248059446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr1	248059476	rs12139390	A	C	4184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=60;PP=2455;SC=TGGCCATCGAAGGCACCGTCT;SOR=0.914;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=143;TCF=83;TCR=60;TR=143;WE=248059484;WS=248059466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr1	248059703	rs11204545	T	A	4854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.14;MQRankSum=-1.916;QD=20.84;ReadPosRankSum=-0.077;SOR=0.717;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:105,128:0.55:233
chr1	248059712	rs11204546	T	C	4700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.14;MQRankSum=-1.917;QD=21.17;ReadPosRankSum=-0.245;SOR=0.724;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,122:0.55:222
chr1	248059779	rs112696640	G	GA	1829.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.265;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.741;NF=7;NR=27;PP=1182;ReadPosRankSum=-2.797;SC=ACAGAGAGGTGAAGGGGGCAC;SOR=0.496;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=74;TCF=11;TCR=63;TR=34;WE=248059787;WS=248059769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,65:0.50:129
chr1	248059856	rs10888268	T	C	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=190;ReadPosRankSum=0.337;SC=CTGACTTCACTTCCATCCAGG;SOR=0.895;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=12;WE=248059864;WS=248059846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr1	248084222	rs12048237	T	C	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=230;ReadPosRankSum=1.748;SC=CACAAGTACTTTTCTATTTTT;SOR=0.631;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=13;WE=248084230;WS=248084212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,15:0.38:40
chr1	248084434	rs11204563	G	A	1419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=1.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.748;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.072;NF=32;NR=35;PP=1111;ReadPosRankSum=0.543;SC=CTCCCTGTTTGGCAATTCCCT;SOR=0.368;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=126;TCF=54;TCR=72;TR=67;WE=248084442;WS=248084424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,62:0.54:115
chr1	248084464	rs11204564	T	C	1775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=12.258;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.93;MQRankSum=0.524;QD=23.06;ReadPosRankSum=-1.246;SOR=2.190;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,73:0.95:77
chr1	248085108	rs4625315	C	T	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.394;NF=14;NR=1;PP=274;ReadPosRankSum=-0.693;SC=CCAAATCCCACAGGTCCACTA;SOR=1.051;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=15;WE=248085116;WS=248085098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr1	248085124	rs4590708	G	A	471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.786;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=3.106;NF=16;NR=4;PP=314;ReadPosRankSum=-1.074;SC=CACTAACCACGACAAGGTTGT;SOR=0.256;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=41;TCF=35;TCR=6;TR=20;WE=248085132;WS=248085114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,21:0.50:42
chr1	248085341	rs4925773	T	A	676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.938;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=25;PP=511;ReadPosRankSum=-2.118;SC=ACACTTTTATTTCTACATCTG;SOR=2.015;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=53;TCF=13;TCR=40;TR=30;WE=248085349;WS=248085331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,30:0.55:55
chr1	248112627	rs4925787	T	C	3593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=425;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.251;NF=83;NR=93;PP=1985;ReadPosRankSum=-1.204;SC=TCAATGCTTGTGCTCACACTG;SOR=0.664;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=407;TCF=193;TCR=214;TR=176;WE=248112635;WS=248112617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:234,189:0.45:423
chr1	248112745	rs4925788	G	T	3805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.28;QD=29.28;SOR=0.822;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr1	248112762	rs4925789	TG	CA	6670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.94;QD=46.32;SOR=1.079;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr1	248112771	rs4925791	C	T	7003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.31;QD=42.71;SOR=1.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr1	248112809	rs4925583	A	G	6524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=51;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=125;NR=89;PP=2965;SC=TCATGTTCCTATGGCCAGGTT;SOR=0.987;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=215;TCF=126;TCR=89;TR=214;WE=248112817;WS=248112799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr1	248112836	rs4925792	A	G	7249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=129;NR=119;PP=2965;SC=GCTGTCTACCACATGAAATCT;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=249;TCF=130;TCR=119;TR=248;WE=248112844;WS=248112826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,270:1.00:270
chr1	248112915	rs10888280	A	G	2111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.734;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.083;NF=40;NR=51;PP=1405;ReadPosRankSum=1.604;SC=TCTACTATGCACCTTTTGTCT;SOR=0.826;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=178;TCF=81;TCR=97;TR=91;WE=248112923;WS=248112905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,99:0.50:200
chr1	248128929	rs6664332	G	A	2387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.988;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=43;PP=1564;ReadPosRankSum=-0.356;SC=ATGGCAGTCAGCTTCCTCTCA;SOR=0.849;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=207;TCF=111;TCR=96;TR=97;WE=248128937;WS=248128919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,105:0.47:223
chr1	248129240	rs4478844	G	A	2234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.733;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=44;PP=1280;ReadPosRankSum=-0.018;SC=ACTATCATTGGTGTGTCAGGA;SOR=0.696;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=181;TCF=93;TCR=88;TR=97;WE=248129248;WS=248129230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,106:0.53:200
chr1	248129689	rs78182622	G	T	827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.795;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=23;PP=428;ReadPosRankSum=0.249;SC=TATCTGGAAAGATATAAATAT;SOR=0.988;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=82;TCF=31;TCR=51;TR=36;WE=248129697;WS=248129679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,42:0.45:93
chr1	248224569	rs75239130	G	T	1173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=528;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.28;MQRankSum=-13.092;QD=2.23;ReadPosRankSum=3.303;SOR=0.655;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:414,112:0.21:526
chr1	248224595	rs76336532	C	T	935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=522;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQRankSum=-17.194;QD=1.80;ReadPosRankSum=-4.675;SOR=0.728;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:421,100:0.19:521
chr1	248262644	rs78385124	A	G	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=328;ReadPosRankSum=-0.024;SC=TTTTGTTTCTATTTCTCTTTC;SOR=0.544;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=17;WE=248262652;WS=248262634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
chr1	248343543	rs9435919	C	T	818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.170;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.795;NF=25;NR=8;PP=536;ReadPosRankSum=0.691;SC=CTTCAACTACCTGTCTGGCAG;SOR=1.622;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=68;TCF=48;TCR=20;TR=33;WE=248343551;WS=248343533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,36:0.47:77
chr1	248344442	rs4916105	C	T	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.368;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=59;ReadPosRankSum=0.566;SC=AATAAGGACACTAAAGTATTT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=248344450;WS=248344432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr1	248366702	rs4916112	G	A	4860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=451;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=122;NR=94;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.418;SC=TTGGCTCTGAGTGCTTTCTTT;SOR=0.694;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=413;TCF=236;TCR=177;TR=216;WE=248366710;WS=248366692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:220,229:0.51:449
chr1	248366792	rs12562957	T	C	3516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=398;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.198;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=93;PP=1999;ReadPosRankSum=1.166;SC=CTAAAATTTGTGGACTTATGA;SOR=0.855;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=374;TCF=173;TCR=201;TR=166;WE=248366800;WS=248366782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:218,179:0.45:397
chr1	248367415	rs4916082	C	T	877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=24;PP=624;SC=CATAAATCTGCAATGACATAT;SOR=2.694;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=30;WE=248367423;WS=248367405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	248402758	rs6666148	C	T	6817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=113;NR=112;PP=2965;SC=AAATTCATCACTTTTTCTGTG;SOR=0.783;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=225;TCF=113;TCR=112;TR=225;WE=248402766;WS=248402748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr1	248457979	rs6667171	C	A	8913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=107;NR=117;PP=2962;SC=CCCCAGCCACCGTTTCAGGGC;SOR=0.874;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=224;TCF=107;TCR=117;TR=224;WE=248458001;WS=248457969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,262:1.00:262
chr1	248457993	rs11204625	C	G	2249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.240;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.055;NF=44;NR=55;PP=1332;ReadPosRankSum=-0.771;SC=TCAGGGCTTCCTTGACCTCAC;SOR=0.876;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=198;TCF=92;TCR=106;TR=99;WE=248458001;WS=248457969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,111:0.48:231
chr1	248458676	rs6678138	T	C	1430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.78;QD=47.69;SOR=4.548;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	248458689	rs6674940	A	G	1837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=9;PP=1216;SC=CCATGAGGGAAAGTTGGCTCA;SOR=2.608;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=38;TCR=9;TR=47;WE=248458697;WS=248458666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	248458717	rs12745228	C	G	2612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=26;PP=1432;SC=GTACATGGGCCTGTGGAGCCG;SOR=1.468;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=52;TCR=26;TR=77;WE=248458725;WS=248458707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr1	248458736	rs28409263	A	G	1468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.544;HP=3;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.774;NF=28;NR=13;PP=513;ReadPosRankSum=-2.543;SC=CGGTGGTCCCAGTGAATCAGG;SOR=0.859;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=115;TCF=75;TCR=40;TR=41;WE=248458744;WS=248458726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,42:0.34:125
chr1	248458760	rs12135684	C	A	1899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.238;HP=3;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.064;NF=37;NR=24;PP=799;ReadPosRankSum=-1.092;SC=ATCATGAGGGCATTGCTAAAC;SOR=0.837;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=157;TCF=92;TCR=65;TR=61;WE=248458768;WS=248458750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,64:0.37:172
chr1	248458875	rs11339452	CT	C	873.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.555;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.300;NF=4;NR=18;PP=749;ReadPosRankSum=-1.197;SC=TATTTCTCATCTCCATAATTT;SOR=0.329;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=51;TCF=5;TCR=46;TR=22;WE=248458883;WS=248458865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,29:0.40:73
chr1	248486895	rs4244184	G	T	3956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=52;PP=2290;SC=AAAAGAAGACGTTAGCAGACA;SOR=1.125;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=79;TCR=52;TR=131;WE=248486903;WS=248486885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr1	248486913	rs4244185	A	G	4468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=67;PP=2367;SC=ACAGCAAAACATGAAATTTAT;SOR=0.867;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=151;TCF=84;TCR=67;TR=151;WE=248486921;WS=248486903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr1	248487016	rs4451579	C	T	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-2.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=19;PP=327;ReadPosRankSum=1.569;SC=TGAGAGGATTCAGCATGGGAG;SOR=0.636;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=76;TCF=28;TCR=48;TR=32;WE=248487024;WS=248487006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,37:0.41:90
chr1	248487638	rs7555310	A	G	2662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=56;PP=1941;SC=CATCTTGGGTACAGTGGTGCA;SOR=1.636;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=84;TCF=27;TCR=57;TR=83;WE=248487646;WS=248487628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr1	248487768	rs7555424	A	G	5105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=65;PP=2965;SC=GCCACTGAAAAGATGGCCAGG;SOR=1.210;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=169;TCF=104;TCR=65;TR=169;WE=248487776;WS=248487758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr1	248512064	rs28372410	T	G	1780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.850;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=29;PP=1140;ReadPosRankSum=-1.304;SC=GGTCCAAGCTTCATCATCCAC;SOR=0.550;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=174;TCF=114;TCR=60;TR=76;WE=248512072;WS=248512054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,85:0.44:193
chr1	248512094	rs28728105	C	T	2359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.662;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=53;PP=1489;ReadPosRankSum=0.234;SC=ATTCAACCACCGTGATGGAAT;SOR=0.545;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=255;TCF=143;TCR=112;TR=112;WE=248512102;WS=248512084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,119:0.43:274
chr1	248512498	rs28448343	A	G	1700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.830;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=43;PP=1152;ReadPosRankSum=-0.505;SC=ATCTGCATCCAGATGACACTG;SOR=0.874;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=168;TCF=84;TCR=84;TR=81;WE=248512506;WS=248512488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,84:0.46:183
chr1	248512637	rs2039824	C	T	1438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.197;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=32;PP=868;ReadPosRankSum=-2.065;SC=AGCTCTCTTGCTCTGACACCT;SOR=1.028;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=118;TCF=60;TCR=58;TR=59;WE=248512645;WS=248512627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,67:0.50:135
chr1	248512749	rs28377739	G	A	1256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.766;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=20;PP=703;ReadPosRankSum=1.011;SC=GACCGTGCTCGGGTTTCCAAG;SOR=0.944;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=100;TCF=55;TCR=45;TR=52;WE=248512757;WS=248512739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,59:0.51:115
chr1	248512767	rs28545014	G	T	1213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.504;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=16;PP=669;ReadPosRankSum=0.673;SC=AAGAGGAGCAGACAGAACAAA;SOR=1.066;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=96;TCF=58;TCR=38;TR=47;WE=248512775;WS=248512757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,55:0.50:111
chr1	248513023	rs28607995	G	A	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.393;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=324;ReadPosRankSum=-0.901;SC=TAAGAAACCCGAGAGGCTCAC;SOR=0.136;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=20;WE=248513031;WS=248513013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr1	248513088	rs28481429	G	C	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=90;ReadPosRankSum=-0.135;SC=ATAATTGATTGTGGTTATTAG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=5;WE=248513096;WS=248513078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr1	248525053	rs28415565	A	T	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FS=3.572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQRankSum=-7.228;QD=1.32;ReadPosRankSum=-5.809;SOR=1.032;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:190,30:0.14:220
chr1	248525060	rs28491677	T	A	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FS=1.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQRankSum=-11.197;QD=2.14;ReadPosRankSum=-4.233;SOR=0.989;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:185,22:0.11:207
chr1	248525071	rs28499298	T	C	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FS=3.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQRankSum=-13.314;QD=0.84;ReadPosRankSum=-3.467;SOR=0.975;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:174,17:0.09:191
chr1	248525146	rs28482938	C	T	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-3.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.212;HP=2;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.190;NF=18;NR=15;PP=331;ReadPosRankSum=0.945;SC=CCCACCTCCACACCCCCATGT;SOR=0.361;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=110;TCF=49;TCR=61;TR=33;WE=248525154;WS=248525136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,24:0.24:100
chr1	248525193	rs28655275	C	T	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.910;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.693;NF=15;NR=23;PP=463;ReadPosRankSum=0.663;SC=ATGGACATGGCGTACATTTCT;SOR=1.038;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=121;TCF=60;TCR=61;TR=38;WE=248525201;WS=248525183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,30:0.26:114
chr1	248525285	rs28637620	T	C	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FS=40.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.90;MQRankSum=-14.217;QD=1.96;ReadPosRankSum=-0.314;SOR=3.923;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:212,26:0.11:238
chr1	248525290	rs202028348	CG	TC	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FS=35.439;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.95;MQRankSum=-15.014;QD=2.46;ReadPosRankSum=-0.449;SOR=3.285;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:221,30:0.12:251
chr1	248525328	rs61248663	C	CTA	2246.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FS=23.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.02;MQRankSum=-9.155;QD=8.38;ReadPosRankSum=-0.632;SOR=1.475;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:200,68:0.25:268
chr1	248525330	rs56721857	A	G	2254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FS=25.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.00;MQRankSum=-8.890;QD=8.51;ReadPosRankSum=0.228;SOR=1.471;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:197,68:0.26:265
chr1	248525638	rs34079073	CA	C	4044.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.532;HP=1;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=5.866;NF=17;NR=55;PP=2954;ReadPosRankSum=-1.667;SC=CCTATTTACTCATCCTCCTCA;SOR=0.816;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=148;TCF=39;TCR=109;TR=72;WE=248525665;WS=248525628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,120:0.49:247
chr1	248525647	rs28405645	C	A	4674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FS=1.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.12;MQRankSum=-6.307;QD=19.32;ReadPosRankSum=2.949;SOR=0.669;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:121,121:0.50:242
chr1	248525650	rs28602650	C	T	4737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FS=0.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQRankSum=-6.261;QD=19.74;ReadPosRankSum=2.872;SOR=0.697;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:119,121:0.50:240
chr1	248525657	rs28718027	G	A	4726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FS=1.573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.63;MQRankSum=-6.610;QD=20.11;ReadPosRankSum=2.761;SOR=0.649;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,118:0.50:235
chr1	248525780	rs28698997	C	T	2003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.955;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.043;NF=49;NR=48;PP=1344;ReadPosRankSum=-0.272;SC=CTACCACACCCCTGAGAAGGA;SOR=0.666;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=242;TCF=125;TCR=117;TR=97;WE=248525788;WS=248525770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,103:0.39:267
chr1	248550894	rs7418152	T	G	1733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=26;PP=1079;ReadPosRankSum=-0.792;SC=TATGCCTCCATTTCAAACTCA;SOR=0.730;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=161;TCF=108;TCR=53;TR=78;WE=248550902;WS=248550884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,82:0.47:173
chr1	248550970	rs7417616	A	G	3227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FS=0.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.02;ReadPosRankSum=-1.474;SOR=0.720;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:162,160:0.50:322
chr1	248550976	rs6587467	T	G	11540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.95;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,321:1.00:321
chr1	248551203	rs6700947	T	C	748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.988;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=19;PP=509;ReadPosRankSum=-1.352;SC=TCGCCTGCACTGCTCAGTGCT;SOR=0.549;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=50;TCF=21;TCR=29;TR=32;WE=248551211;WS=248551193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,34:0.56:61
chr1	248551560	rs954474	C	T	2312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.049;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=49;PP=1554;ReadPosRankSum=0.795;SC=TGACTGCATCCTACACCAGGA;SOR=0.702;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=191;TCF=95;TCR=96;TR=97;WE=248551568;WS=248551550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,105:0.49:216
chr1	248551636	rs954475	T	G	2882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.116;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=55;PP=1793;ReadPosRankSum=0.568;SC=CACCTGCTCTTCACACATGAT;SOR=0.565;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=220;TCF=123;TCR=97;TR=119;WE=248551644;WS=248551626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,132:0.52:252
chr1	248551955	rs28437787	C	A	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.920;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=147;ReadPosRankSum=0.649;SC=ACTTTCAATACCAGCTGTGCT;SOR=0.223;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=8;WE=248551963;WS=248551945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr1	248569282	rs28667896	A	G	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.098;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=319;ReadPosRankSum=-0.270;SC=AGTAAATGCTAGATATCAGTC;SOR=0.994;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=53;TCF=40;TCR=13;TR=23;WE=248569290;WS=248569272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,26:0.44:59
chr1	248569369	rs28599722	A	G	1564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.153;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=26;PP=956;ReadPosRankSum=-0.490;SC=ATTAATTCACATGTTGTTATT;SOR=0.813;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=171;TCF=111;TCR=60;TR=75;WE=248569377;WS=248569359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,83:0.43:195
chr1	248570440	rs6695780	G	A	1224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=30;PP=884;SC=GGTAAATGGGGGACTCTGTGG;SOR=2.476;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=9;TCR=30;TR=39;WE=248570448;WS=248570430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	248604559	rs150497047	T	TTC	537.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.58;QD=67.22;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	248604614	rs201226597	A	T	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.32;MQRankSum=-0.785;QD=9.28;ReadPosRankSum=1.633;SOR=0.704;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,25:0.50:50
chr1	248604765	rs144165631	T	A	2277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=3.882;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.69;MQRankSum=1.789;QD=25.88;ReadPosRankSum=0.257;SOR=0.883;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,87:0.99:88
chr1	248605395	rs28631666	T	G	2923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.217;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-1.218;NF=63;NR=55;PP=1718;ReadPosRankSum=-1.014;SC=AGAAGGTTGTTGGGAGGTGTG;SOR=0.404;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=184;TCF=90;TCR=94;TR=118;WE=248605403;WS=248605385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,131:0.65:201
chr1	248605436	rs71642447	C	G	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=14.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.73;MQRankSum=-6.974;QD=5.85;ReadPosRankSum=-3.267;SOR=2.267;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,27:0.22:125
chr1	248605442	rs71642448	G	T	612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=13.712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.71;MQRankSum=-8.474;QD=5.33;ReadPosRankSum=-2.920;SOR=2.333;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,22:0.19:115
chr1	248617173	rs78428672	A	G	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=1.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.52;MQRankSum=-6.119;QD=4.82;ReadPosRankSum=-2.066;SOR=0.984;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,11:0.22:51
chr1	248617181	.	C	T	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.741;ClippingRankSum=0.000;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=2.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.61;MQRankSum=-5.262;QD=3.64;ReadPosRankSum=-1.622;SOR=1.349;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,6:0.15:40
chr1	248637046	rs148025314	G	A	1050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=2.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.96;MQRankSum=-4.344;QD=9.38;ReadPosRankSum=-0.153;SOR=0.954;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,52:0.46:112
chr1	248637362	rs77686526	C	T	1359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=20.073;HP=2;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-5.338;NF=55;NR=30;PP=918;ReadPosRankSum=0.428;SC=ATTCTGCCGCCGGCCACAGGA;SOR=1.351;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=235;TCF=131;TCR=104;TR=85;WE=248637370;WS=248637352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,73:0.33:218
chr1	248637416	rs75924848	GC	CT	4705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-3.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=433;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.171;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.661;NF=87;NR=64;PP=2944;ReadPosRankSum=3.358;SC=TAGTGCTGCTGCTCTTCGGTG;SOR=0.822;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=464;TCF=266;TCR=198;TR=151;WE=248637425;WS=248637406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:269,136:0.34:405
chr1	248637543	rs139993642	C	T	1619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=378;ExcessHet=3.0103;FS=0.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.80;MQRankSum=-8.618;QD=4.29;ReadPosRankSum=0.938;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:278,100:0.26:378
chr1	248637685	rs201431222	T	C	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=1.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.19;MQRankSum=-4.897;QD=3.69;ReadPosRankSum=-0.401;SOR=0.317;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,12:0.23:52
chr1	248651927	rs201060805	A	G	73.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.75;QD=24.43;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	248685253	rs9727474	T	C	5815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=109;NR=91;PP=2965;SC=CCCAGCTCTATGTGGCCATGG;SOR=0.757;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=201;TCF=109;TCR=92;TR=200;WE=248685275;WS=248685243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr1	248722611	rs200169450	C	G	241.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.48;QD=40.31;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	248722613	rs199532952	G	A	241.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.48;QD=40.31;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	248722671	rs140437806	T	A	1200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.87;QD=25.55;SOR=0.823;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	248722739	rs200935922	G	C	1294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=9.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.72;MQRankSum=-2.396;QD=21.95;ReadPosRankSum=0.918;SOR=0.540;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,40:0.68:59
chr1	248722752	.	A	G	1002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.384;ClippingRankSum=0.000;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=7.797;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.50;MQRankSum=-3.594;QD=18.92;ReadPosRankSum=-0.946;SOR=1.561;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,25:0.47:53
chr1	248722756	.	T	A	727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.229;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=15.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.05;MQRankSum=-4.047;QD=16.17;ReadPosRankSum=-0.855;SOR=2.697;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,17:0.38:45
chr1	248722767	.	T	C	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.212;ClippingRankSum=0.000;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=11.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.97;MQRankSum=-3.680;QD=9.48;ReadPosRankSum=-3.136;SOR=2.662;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,12:0.29:41
chr1	248722777	rs77589892	T	A	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=9.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.36;MQRankSum=-3.659;QD=4.97;ReadPosRankSum=-3.848;SOR=2.575;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,7:0.19:36
chr1	248722788	.	G	T	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.124;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=4.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.07;MQRankSum=-3.247;QD=2.62;ReadPosRankSum=-4.050;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,5:0.14:35
chr1	248737259	rs189248971	C	G	883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.82;QD=27.62;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	248737343	rs61833441	C	T	793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FS=12.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.27;MQRankSum=-3.484;QD=2.90;ReadPosRankSum=-2.047;SOR=1.764;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:239,35:0.13:274
chr1	248737348	rs61833442	G	A	926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FS=8.704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.87;MQRankSum=-3.280;QD=3.06;ReadPosRankSum=-3.154;SOR=1.377;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:257,46:0.15:303
chr1	248737595	rs150601708	A	G	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.84;MQRankSum=-0.023;QD=6.79;ReadPosRankSum=0.140;SOR=0.202;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,17:0.31:54
chr1	248738133	rs373986839	A	G	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.95;MQRankSum=-10.745;QD=3.95;ReadPosRankSum=0.859;SOR=0.625;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,29:0.24:121
chr1	248756502	rs41269353	A	C	1500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.626;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=30;PP=837;ReadPosRankSum=-0.307;SC=GAGGTGTCTGAGCAAGAGAGC;SOR=0.780;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=128;TCF=69;TCR=59;TR=64;WE=248756510;WS=248756492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,70:0.50:139
chr1	248789454	rs1892441	G	C	4159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=53;PP=2617;SC=TCCTTAGGAAGCCTTATCCTC;SOR=1.156;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=137;TCF=84;TCR=53;TR=137;WE=248789462;WS=248789444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr1	248789504	rs1892442	T	C	6118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=118;NR=94;PP=2965;SC=TGCTACTTTCTGAGCAGATGA;SOR=0.841;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=212;TCF=118;TCR=94;TR=212;WE=248789512;WS=248789494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr1	248790075	rs1892443	A	G	8375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=142;NR=143;PP=2965;SC=GCCACGTAGCAGTCATAGGCC;SOR=0.752;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=287;TCF=143;TCR=144;TR=285;WE=248790083;WS=248790065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,311:1.00:311
chr1	248801480	.	A	G	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.043;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=13.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.60;MQRankSum=-2.655;QD=22.59;ReadPosRankSum=-1.982;SOR=4.332;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr1	248801488	.	C	T	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.221;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=13.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.67;MQRankSum=-2.548;QD=29.51;ReadPosRankSum=-2.078;SOR=4.479;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr1	248801505	.	T	TCA	1114.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.193;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.013;HP=1;HapScore=4;MGOF=69;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.021;NF=16;NR=5;PP=2954;ReadPosRankSum=-2.723;SC=TCCTTCCTGATCAGTCACCAC;SOR=2.342;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=21;WE=248801574;WS=248801495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,26:0.76:34
chr1	248801511	.	A	G	1375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=4.855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.50;MQRankSum=0.055;QD=36.20;ReadPosRankSum=-2.311;SOR=2.235;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,30:0.79:38
chr1	248801514	.	AC	A	1492.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.382;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.731;HP=6;HapScore=4;MGOF=69;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.082;NF=16;NR=7;PP=2273;ReadPosRankSum=-2.228;SC=ATCAGTCACCACCCCTGATGC;SOR=2.155;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=31;TCF=20;TCR=11;TR=23;WE=248801574;WS=248801495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,34:0.81:42
chr1	248801528	.	G	A	2133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.488;ClippingRankSum=0.000;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=4.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.97;MQRankSum=0.246;QD=36.79;ReadPosRankSum=-1.815;SOR=2.137;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,51:0.88:58
chr1	248801538	.	G	A	2721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.159;ClippingRankSum=0.000;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=4.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.56;MQRankSum=0.244;QD=38.88;ReadPosRankSum=-1.018;SOR=1.946;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,63:0.90:70
chr1	248801542	rs372631772	A	G	2973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=4.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.80;MQRankSum=0.367;QD=39.65;ReadPosRankSum=-0.437;SOR=1.847;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,68:0.91:75
chr1	248801550	rs374446105	C	T	3435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=3.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.00;MQRankSum=0.485;QD=40.42;ReadPosRankSum=0.968;SOR=1.595;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,78:0.92:85
chr1	248801556	rs79649486	C	T	3841.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=4.197;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.53;MQRankSum=1.180;QD=39.61;ReadPosRankSum=0.996;SOR=1.770;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:6,91:0.94:97
chr1	248801566	rs74154510	T	G	4291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=13.796;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.84;MQRankSum=2.614;QD=43.35;ReadPosRankSum=0.470;SOR=1.372;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,96:0.97:99
chr1	248801592	rs78622116	C	T	4921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.6;BaseQRankSum=-3.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.003;HP=2;HapScore=1;MGOF=102;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=2.523;NF=57;NR=43;PP=2382;ReadPosRankSum=2.502;SC=TCCCTGCTAGCCCTTCCTGAT;SOR=0.669;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=104;TCF=57;TCR=47;TR=100;WE=248801619;WS=248801582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,112:0.97:115
chr1	248801602	.	T	TCA	4777.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.680;ClippingRankSum=0.000;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=6.552;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.64;MQRankSum=2.083;QD=43.43;ReadPosRankSum=1.914;SOR=0.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,108:0.98:110
chr1	248801610	rs150878651	G	A	4696.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-2.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=6.225;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.65;MQRankSum=2.030;QD=43.49;ReadPosRankSum=1.471;SOR=0.240;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,106:0.98:108
chr1	248801611	rs143981271	C	T	4651.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-2.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=6.225;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.65;MQRankSum=2.030;QD=43.07;ReadPosRankSum=1.448;SOR=0.240;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,106:0.98:108
chr1	248801633	rs74901534	A	G	4259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=3.018;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=52.09;MQRankSum=1.818;QD=43.03;ReadPosRankSum=-0.821;SOR=0.138;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,97:0.98:99
chr1	248801778	rs201643849	A	T	237.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=29.72;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	248801897	rs79303917	G	A	1573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=3.732;NF=83;NR=63;PP=1887;ReadPosRankSum=-2.131;SC=CAGTCAGGAGGATGTGCGTGT;SOR=0.715;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=450;TCF=254;TCR=196;TR=146;WE=248801905;WS=248801887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:238,103:0.30:341
chr1	248801944	rs143010547	TCAGCACG	T	4215.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FS=2.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.53;MQRankSum=-8.276;QD=15.22;ReadPosRankSum=0.049;SOR=0.848;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,185:0.67:277
chr1	248813135	rs4916153	G	A	639.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=10.969;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=4.171;NF=22;NR=0;PP=495;ReadPosRankSum=2.043;SC=GGTGGCATGTGGGTCACTTGT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=22;WE=248813143;WS=248813125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,23:0.92:25
chr1	248813547	rs201161767	G	C	198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.92;QD=33.13;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	248814052	rs28533004	T	A	1670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FS=4.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.54;MQRankSum=-3.313;QD=10.85;ReadPosRankSum=-1.213;SOR=1.044;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,79:0.51:154
chr1	248814080	rs1782242	A	C	6667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=141;NR=128;PP=2965;SC=ATGGAGGTCAAAAAGACCAGG;SOR=1.087;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=269;TCF=141;TCR=128;TR=269;WE=248814088;WS=248814070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr1	248814126	rs28418327	G	A	5529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.908;NF=119;NR=138;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.296;SC=GGAAACGGGCGTTGCTGAACA;SOR=0.674;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=330;TCF=153;TCR=177;TR=257;WE=248814134;WS=248814116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,255:0.78:326
chr1	248814265	rs3033476	GAAC	G	213.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.63;QD=35.63;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	248845097	rs2000390	C	T	10221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=381;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=182;NR=163;PP=2965;SC=GTGGATCACACTGGATCTGCA;SOR=0.698;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=345;TCF=182;TCR=163;TR=345;WE=248845105;WS=248845087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,381:1.00:381
chr1	248845411	rs11485825	G	A	6064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=112;PP=2965;SC=GATCCAAAACGGAGAGGTTCT;SOR=1.039;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=197;TCF=85;TCR=112;TR=197;WE=248845419;WS=248845401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr1	248845458	rs4509608	C	T	5296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=84;PP=2965;SC=AGATGCTGATCGAGAGTGATG;SOR=0.782;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=165;TCF=81;TCR=84;TR=165;WE=248845479;WS=248845448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr1	248845471	rs4575113	T	C	5076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=84;PP=2965;SC=GAGTGATGACTGCAATGATGA;SOR=0.748;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=165;TCF=81;TCR=84;TR=165;WE=248845479;WS=248845448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr1	248845499	rs4462184	A	G	5117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=89;PP=2965;SC=CCCCACCAGCACTGCCAGATA;SOR=0.779;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=176;TCF=87;TCR=89;TR=176;WE=248845507;WS=248845489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr1	249110906	rs4926508	G	C	2634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;NF=37;SC=TTGGGTCCCAGCCCCTCTTGT;SOR=0.929;SbPval=0.56;Source=Platypus;TCF=37;WE=249110914;WS=249110896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr1	249145072	rs11434456	C	CA	1881.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=21;PP=1136;ReadPosRankSum=-0.117;SC=CAGAGTGCACCGTATTGGAGG;SOR=0.698;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=71;TCF=23;TCR=48;TR=32;WE=249145080;WS=249145062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,54:0.48:112
chr1	249148399	rs12022223	C	T	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.066;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=118;ReadPosRankSum=-0.418;SC=ATGGCCTGCTCGTTTCCTTGA;SOR=1.329;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=9;WE=249148407;WS=249148389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
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chr2	45895	rs4241318	A	G	2498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=33;PP=1828;SC=GGTCTCGGGGATTGCGGGGTC;SOR=1.075;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=47;TCR=33;TR=80;WE=45903;WS=45885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr2	224970	rs2290912	C	T	1896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.769;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=43;PP=1048;ReadPosRankSum=-0.377;SC=TAGTATATATCATACAAAATA;SOR=0.848;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=109;TCF=49;TCR=60;TR=78;WE=224978;WS=224960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,86:0.72:120
chr2	234130	rs3748872	T	G	3927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.464;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=59;PP=2473;ReadPosRankSum=1.733;SC=GTTAAACCTTTACTGTCTAAC;SOR=0.649;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=245;TCF=152;TCR=93;TR=151;WE=234138;WS=234120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,170:0.62:273
chr2	242732	rs113405432	T	TAAC	1315.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=4.244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.16;MQRankSum=2.667;QD=20.88;ReadPosRankSum=-1.301;SOR=1.460;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,33:0.52:63
chr2	242800	rs10181051	T	C	2737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.943;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.36;MQRankSum=3.094;NF=73;NR=51;PP=1662;ReadPosRankSum=0.158;SC=AAAGTTACCATTAGATTGACA;SOR=0.615;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=249;TCF=147;TCR=102;TR=124;WE=242808;WS=242790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,132:0.49:268
chr2	243504	rs7556816	C	T	1815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FS=8.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.05;MQRankSum=-0.961;QD=8.99;ReadPosRankSum=2.045;SOR=0.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,98:0.49:202
chr2	243567	rs11383620	T	TA	2143.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.739;HP=10;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=2.455;NF=20;NR=67;PP=1036;ReadPosRankSum=-1.356;SC=ATGTGTCTATTAAAAAAAAAA;SOR=1.272;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=229;TCF=55;TCR=174;TR=87;WE=243575;WS=243557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:180,115:0.39:295
chr2	253291	rs34931255	A	G	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.13;ReadPosRankSum=-0.385;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr2	262553	rs7596678	T	C	2129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.514;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=43;PP=1450;ReadPosRankSum=-0.570;SC=TGGGATCTTCTCAGAGAAAAT;SOR=0.330;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=139;TCF=84;TCR=55;TR=94;WE=262561;WS=262543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,97:0.65:149
chr2	264895	rs4854300	G	C	3509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=35;PP=2233;SC=GGGCAAGAGGGTGGCAGTGCG;SOR=1.727;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=74;TCR=35;TR=109;WE=264903;WS=264885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr2	269352	rs6755722	G	A	1709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.561;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=33;PP=868;ReadPosRankSum=-0.767;SC=AAAAAAGTACGTAATATGCTT;SOR=0.718;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=149;TCF=81;TCR=68;TR=73;WE=269360;WS=269342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,86:0.50:171
chr2	271998	rs112400131	CA	C	424.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=1.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.27;MQRankSum=1.495;QD=7.58;ReadPosRankSum=2.105;SOR=0.982;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,33:0.59:56
chr2	272840	rs12714401	G	A	695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.238;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=5;PP=508;ReadPosRankSum=-0.401;SC=TTTATATTATGAATTAGAAGC;SOR=1.112;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=51;TCF=42;TCR=9;TR=29;WE=272848;WS=272830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,30:0.54:56
chr2	272926	rs12714402	A	G	3408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.448;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=58;PP=1978;ReadPosRankSum=-0.532;SC=TGGAATCTTCATTGGTCAGGT;SOR=0.746;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=251;TCF=147;TCR=104;TR=146;WE=272934;WS=272916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,161:0.58:276
chr2	273070	rs12714403	A	G	4643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=94;PP=2950;SC=GGGGCTGTGAAGTCCTTCTTG;SOR=1.315;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=154;TCF=60;TCR=94;TR=154;WE=273078;WS=273060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr2	275055	rs144670341	G	GT	433.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.72;ReadPosRankSum=0.619;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,22:0.59:37
chr2	283231	rs368562757	A	AT	2320.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=49;PP=1535;SC=AATAAATCGCATTTTTTTGCA;SOR=1.996;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=63;TCF=3;TCR=60;TR=52;WE=283239;WS=283221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr2	672976	rs58078949	A	G	674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=22;PP=464;ReadPosRankSum=-0.898;SC=AATTTTAAACATAACATCAGG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=19;TCR=43;TR=32;WE=672984;WS=672966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,33:0.50:66
chr2	675831	rs2293084	G	T	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=304;ReadPosRankSum=-0.369;SC=CAGGAGGATGGAAACAGGATT;SOR=0.557;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=50;TCF=12;TCR=38;TR=23;WE=675839;WS=675821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,24:0.47:51
chr2	676177	rs2293083	C	G	1927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.412;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=47;PP=1047;ReadPosRankSum=-1.815;SC=CTGCAATACACTGAACTCTCC;SOR=0.515;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=258;TCF=117;TCR=141;TR=94;WE=676185;WS=676167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:181,104:0.36:285
chr2	676457	rs2293082	G	C	5474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=27;PP=1962;SC=GCTGCAGCCCGGCACAGCCCT;SOR=1.788;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=68;TCR=27;TR=95;WE=676465;WS=676447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr2	676478	rs3215297	T	TGTAA	9617.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.49;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=48;PP=2967;SC=CCAGAACTCCTGTGTCACTAC;SOR=1.428;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=106;TCF=45;TCR=61;TR=87;WE=676486;WS=676468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr2	677213	rs3749138	G	A	536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=2;PP=313;SC=GCCACAGGCCGGGTGCTCTGT;SOR=2.419;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=677221;WS=677203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	677295	rs3210390	C	T	1746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.431;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=30;PP=958;ReadPosRankSum=-2.617;SC=TTACCGTGAGCACGGCTGGGA;SOR=0.541;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=128;TCF=79;TCR=49;TR=76;WE=677303;WS=677285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,80:0.60:134
chr2	1079143	rs4971431	A	G	2581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.296;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=29;PP=1698;ReadPosRankSum=1.975;SC=TGCGTCACCTATCCCCACCCC;SOR=0.867;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=163;TCF=112;TCR=51;TR=96;WE=1079151;WS=1079133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,107:0.61:175
chr2	1093965	rs11127460	G	A	2271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.668;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=54;PP=1334;ReadPosRankSum=1.673;SC=CTCTATTCCTGCTTTTTATTT;SOR=0.671;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=247;TCF=130;TCR=117;TR=109;WE=1093973;WS=1093955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,118:0.43:272
chr2	1133188	rs5828807	G	GCACA	88.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=129;ReadPosRankSum=1.225;SC=GTGGACACATGCACACACACA;SOR=0.069;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=4;WE=1133196;WS=1133178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,3:0.18:17
chr2	1168756	rs4597564	G	A	1547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.271;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=21;PP=811;ReadPosRankSum=-0.825;SC=AATTGGAAGGGACTTCTCTTG;SOR=0.780;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=114;TCF=65;TCR=49;TR=59;WE=1168764;WS=1168746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,71:0.55:128
chr2	1168982	rs7560649	T	A	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=102;ReadPosRankSum=-1.559;SC=GATAATTGTGTTAGTTTCAGA;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=6;WE=1168990;WS=1168972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr2	1241592	rs146197111	C	T	862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=5;PP=596;SC=GCATCAGCCTCGAAACTCACG;SOR=2.226;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=26;WE=1241600;WS=1241582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	1437410	rs4927578	C	T	1861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=46;PP=1309;SC=CACTGAGGAGCGGCAACTCCC;SOR=2.985;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=11;TCR=46;TR=57;WE=1437418;WS=1437400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr2	1442551	rs33990262	ATT	A	302.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=4.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.30;MQRankSum=-0.892;QD=5.22;ReadPosRankSum=1.126;SOR=1.453;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,17:0.29:58
chr2	1457364	rs2070881	A	G	5770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=126;NR=61;PP=2965;SC=CTCCGGAGAGACCCCACTTAT;SOR=1.598;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=188;TCF=127;TCR=61;TR=187;WE=1457372;WS=1457354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr2	1459806	rs4927610	A	G	717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=4;PP=506;SC=CTGCTACCACAGGGTCCTCCT;SOR=2.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=1459814;WS=1459796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	1460004	rs4927611	G	T	1038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.936;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=23;PP=556;ReadPosRankSum=-0.609;SC=CGGGGGAGGGGCTGACTGCCA;SOR=0.484;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=136;TCF=68;TCR=68;TR=49;WE=1460012;WS=1459994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,57:0.36:159
chr2	1460140	rs4927612	A	G	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.315;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=93;ReadPosRankSum=0.246;SC=ACAAAATGTGAAAGTCTGTTT;SOR=0.223;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=7;WE=1460148;WS=1460130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr2	1481155	rs2280132	G	T	1354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.521;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=25;PP=827;ReadPosRankSum=-2.005;SC=ACGCGCGCCTGCGGCCTGTGC;SOR=0.346;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=72;TCF=34;TCR=38;TR=51;WE=1481163;WS=1481145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,56:0.73:77
chr2	1481231	rs2175977	G	C	1424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.986;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=23;PP=787;ReadPosRankSum=-0.372;SC=GGCCGCGCCAGCGAGGTCCCC;SOR=0.452;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=75;TCF=45;TCR=30;TR=54;WE=1481239;WS=1481221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,63:0.72:87
chr2	1481383	.	G	A	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.801;ClippingRankSum=-0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.392;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=5;PP=71;ReadPosRankSum=-0.652;SC=CCAGGTGCGCGGGGTGGTCCT;SOR=0.141;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=8;WE=1481391;WS=1481373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr2	1488668	rs6715129	T	C	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=2.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=131;ReadPosRankSum=1.652;SC=CATGAACTCTTCCTTCTTTTT;SOR=0.340;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=8;WE=1488676;WS=1488658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr2	1491497	rs6727192	T	C	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=3.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.61;ReadPosRankSum=-0.442;SOR=1.414;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,12:0.31:39
chr2	1491510	.	C	CA	267.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=0.000;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=2.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.54;ReadPosRankSum=1.177;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,16:0.27:59
chr2	1497442	rs9679267	A	G	635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.949;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=9;PP=415;ReadPosRankSum=-0.298;SC=GCAAACTGCCAGGCAGTGTCA;SOR=0.490;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=62;TCR=22;TR=34;WE=1497450;WS=1497432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,34:0.40:86
chr2	1497803	rs1126797	C	T	1297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.617;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=39;PP=746;ReadPosRankSum=1.232;SC=CTCTGCGGGACGGTGACTGGT;SOR=0.591;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=152;TCF=51;TCR=101;TR=61;WE=1497811;WS=1497793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,67:0.39:170
chr2	1499728	rs2276704	C	T	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.64;ReadPosRankSum=0.812;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr2	1499899	rs732608	C	T	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.88;ReadPosRankSum=-0.589;SOR=0.724;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:226,66:0.23:292
chr2	1499927	rs732609	A	C	1252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FS=0.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.31;ReadPosRankSum=0.880;SOR=0.699;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:210,81:0.28:291
chr2	1500112	.	TGGGGC	T	75	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=75;QD=43.5;SC=GGGCAGCTCCTGGGGCGGGGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=2;WE=1500124;WS=1500102;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:9,2:0.18:11
chr2	1500665	rs867983	C	T	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.35;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr2	1520676	rs1126799	T	C	4039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=41;PP=2338;SC=CTCCCTCGGGTGACTTGGATC;SOR=1.546;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=135;TCF=94;TCR=41;TR=135;WE=1520684;WS=1520666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr2	1544617	rs12615819	G	A	2120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.456;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=48;PP=1244;ReadPosRankSum=0.202;SC=TTCCTAGTCCGTTCTGCACCT;SOR=0.846;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=302;TCF=165;TCR=137;TR=109;WE=1544625;WS=1544607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:216,119:0.36:335
chr2	1642537	rs6729142	T	C	826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.93;SOR=3.500;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	1642537	.	TGCTATACC	CGTTATACG,CGTTATATG	84	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000,0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=7,6;NR=1,0;PP=84,75;QD=18.4334843578;SC=GGGAATAAAATGCTATACCCA;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=8,6;WE=1642553;WS=1642527;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.53:15
chr2	1642539	rs6742040	C	T	916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=48.25;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	1642544	rs116214231	C	T	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=6.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.51;ReadPosRankSum=-1.318;SOR=2.786;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr2	1642545	rs6742039	C	G	1023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.66;SOR=4.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	1642803	.	CGGGTCTCATTTCAAGGTTTCCTGGGTGTGCACCGCCCCTGATGCTCTGAGCT	C	247.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=8.26;SOR=1.536;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	1647171	rs6730800	T	C	5436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=108;NR=69;PP=2965;SC=CCCGGAGGTCTACCCTGGGGA;SOR=1.070;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=179;TCF=109;TCR=70;TR=177;WE=1647179;WS=1647161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr2	1651842	rs11685976	C	A	942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.786;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=11;PP=553;ReadPosRankSum=-0.404;SC=CTGCACGACACGAACAAAACT;SOR=0.321;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=60;TCF=47;TCR=13;TR=37;WE=1651850;WS=1651832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,42:0.61:69
chr2	1652660	rs3811613	G	A	1936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.270;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=41;PP=1133;ReadPosRankSum=-0.977;SC=TGGGGCTCTCGTTCTCGTCCC;SOR=1.024;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=117;TCF=55;TCR=62;TR=74;WE=1652668;WS=1652650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,85:0.63:135
chr2	1652822	rs1863135	T	G	7028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=139;NR=113;PP=2965;SC=TGGATGCGTCTATGTAGGAGG;SOR=0.793;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=254;TCF=139;TCR=115;TR=252;WE=1652830;WS=1652812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,271:1.00:271
chr2	1664654	rs17841813	A	G	968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.338;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=10;PP=620;ReadPosRankSum=0.114;SC=GCATCTTACCATTCACACTGA;SOR=1.105;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=67;TCF=50;TCR=17;TR=44;WE=1664662;WS=1664644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,46:0.64:72
chr2	1667310	rs12475392	G	A	2055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.265;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=32;PP=1316;ReadPosRankSum=1.100;SC=TGTCAGCTGCGGAATTCTGTG;SOR=0.851;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=154;TCF=96;TCR=58;TR=89;WE=1667318;WS=1667300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,95:0.58:165
chr2	1683923	rs72763569	G	T	377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=1;PP=165;SC=GTGTGTAGATGGTGTGAGTGT;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=1683931;WS=1683913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	1696510	rs138859568	AAC	A	1528.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=1.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.49;ReadPosRankSum=0.850;SOR=0.499;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,46:0.35:133
chr2	1813057	rs12988270	G	T	4001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=83;PP=2574;SC=GCAAAAGGCTGTCTGAAAATG;SOR=1.334;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=51;TCR=83;TR=134;WE=1813065;WS=1813047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr2	1926437	rs1529667	G	T	8005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=145;NR=115;PP=2965;SC=GCGTCCTTCCGGGGAAGTCCT;SOR=0.852;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=261;TCF=145;TCR=116;TR=260;WE=1926445;WS=1926427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,283:1.00:283
chr2	3193040	rs17682	G	A	3482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.501;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=52;PP=2119;ReadPosRankSum=-0.106;SC=AAAGAGCTGCGACTGTTTGAG;SOR=0.754;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=222;TCF=137;TCR=85;TR=140;WE=3193048;WS=3193030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,155:0.64:241
chr2	3200948	rs1037467	C	A	347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=260;SC=CCTTAAATGGCAAAAATGAAC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=3200956;WS=3200938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	3212247	rs7584823	G	T	674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.013;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=6;PP=461;ReadPosRankSum=0.524;SC=TCATCTGTCAGTTGGGAGGGG;SOR=0.823;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=86;TCF=70;TCR=16;TR=32;WE=3212255;WS=3212237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,33:0.37:90
chr2	3212704	rs7595702	C	A	1041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.024;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=31;PP=639;ReadPosRankSum=-0.106;SC=GTGCACGCTCCTTCAGAATGT;SOR=1.120;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=90;TCF=30;TCR=60;TR=43;WE=3212712;WS=3212694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,48:0.48:99
chr2	3212817	rs12467123	C	T	213.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5010;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=95;ReadPosRankSum=0.112;SC=CCATCTTTTCCGGGACGCCTG;SOR=0.368;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=9;WE=3212825;WS=3212807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,10:0.83:12
chr2	3217777	rs11127386	A	C	272.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=223;SC=CCGCTCCCCCAACCCCACGAC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=3217785;WS=3217767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	3217794	rs10865535	T	C	497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=1;PP=431;SC=CGACAGGCCCTGGTGTGTGAT;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=3217802;WS=3217784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	3217908	rs11682452	G	C	6756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=140;NR=83;PP=2965;SC=CTGTGTTGTTGCTTTTACTTA;SOR=1.231;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=223;TCF=140;TCR=83;TR=223;WE=3217916;WS=3217898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr2	3277947	rs2694081	T	A	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=59;ReadPosRankSum=0.166;SC=TACCCTTAAGTGGGGTGCACA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=5;WE=3277955;WS=3277937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr2	3322555	rs62121538	T	C	525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.103;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=394;ReadPosRankSum=1.452;SC=GGTGACGTGCTACTCCTCGAT;SOR=0.117;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=19;WE=3322563;WS=3322545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,20:0.54:37
chr2	3322797	rs12618407	C	A	2390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=63;PP=1583;ReadPosRankSum=0.020;SC=GGGTCCATAACATCTAATTTT;SOR=0.677;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=169;TCF=59;TCR=110;TR=99;WE=3322805;WS=3322787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,105:0.59:179
chr2	3342009	rs3811617	T	C	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=4.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.52;ReadPosRankSum=-0.836;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr2	3356849	rs4854122	A	G	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-4.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=492;ReadPosRankSum=-0.133;SC=TATAACTTTCATAACTAATAA;SOR=0.776;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=11;WE=3356858;WS=3356839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr2	3356850	rs12479261	T	C	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=454;ReadPosRankSum=0.527;SC=ATAACTTTCATAACTAATAAT;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=10;WE=3356858;WS=3356839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr2	3356953	rs2875394	A	T	7229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=158;NR=86;PP=2965;SC=AAAAAGCATGATATGTTTAGG;SOR=1.306;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=245;TCF=159;TCR=86;TR=244;WE=3356961;WS=3356943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,270:1.00:270
chr2	3356995	rs62119517	G	A	5228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=387;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.382;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=123;NR=94;PP=2833;ReadPosRankSum=-0.559;SC=CCTGGCATCCGCTGGGTGGTC;SOR=0.653;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=346;TCF=197;TCR=149;TR=217;WE=3357003;WS=3356985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,243:0.63:386
chr2	3358458	rs146001084	ATTATGAAGTTAGAT	A	6262.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=76;PP=2974;SC=TTTAATAGAGATTATGAAGTT;SOR=1.973;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=2;TCR=82;TR=78;WE=3358479;WS=3358448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr2	3381189	rs13022433	G	A	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=382;ReadPosRankSum=0.591;SC=TCATGTTCGGGACAGGATGTG;SOR=0.468;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=18;WE=3381197;WS=3381179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr2	3392075	rs10865541	T	C	7727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=554;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=168;NR=154;PP=2962;ReadPosRankSum=1.184;SC=TCGACTCCTTTACTACCTCCG;SOR=0.729;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=513;TCF=267;TCR=246;TR=322;WE=3392083;WS=3392065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:209,345:0.62:554
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chr2	3502709	rs10208494	A	G	471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.676;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=275;ReadPosRankSum=-1.842;SC=TTTACGAGGCACGTGTTAGTT;SOR=1.329;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=18;WE=3502717;WS=3502699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,22:0.55:40
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chr2	3502910	rs58219575	G	T	5999.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.329;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.04;MQRankSum=0.879;NF=34;NR=66;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.256;SC=CTTCTACTTAGTATTTATTAA;SOR=0.977;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=211;TCF=79;TCR=132;TR=100;WE=3502918;WS=3502890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,149:0.57:262
chr2	3502932	rs10194787	G	A	2302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.991;HP=4;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=63;PP=1391;ReadPosRankSum=-1.774;SC=ATATCAACTTGTTAACATTAA;SOR=1.053;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=150;TCF=42;TCR=108;TR=83;WE=3502940;WS=3502922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,101:0.58:173
chr2	3504290	rs6146601	GTGTACCTGCCGCCGCA	G	1004.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.769;NF=6;NR=8;PP=2966;ReadPosRankSum=-1.249;SC=GCTCGTGGGTGTGTACCTGCC;SOR=0.627;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=28;TCF=15;TCR=13;TR=14;WE=3504313;WS=3504280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,28:0.58:48
chr2	3504687	rs9950	A	G	4071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=348;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.298;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=86;PP=2461;ReadPosRankSum=1.483;SC=TGTCCCTCACATCGAAGTACC;SOR=0.718;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=322;TCF=166;TCR=156;TR=181;WE=3504695;WS=3504677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,197:0.57:347
chr2	3504819	rs34240449	A	G	3617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=47;NR=70;PP=2055;SC=ACGCAAGCTCACACCCACCCA;SOR=1.312;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=47;TCR=70;TR=117;WE=3504827;WS=3504809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr2	3504893	rs35008570	G	GA	453.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.772;NF=0;NR=11;PP=398;ReadPosRankSum=0.467;SC=CCATAAAAATGAAACTACACT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=11;WE=3504901;WS=3504883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr2	3517840	rs116205064	C	G	1222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.528;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=26;PP=626;ReadPosRankSum=-0.157;SC=ATTTTATACTCCAAATTTATC;SOR=0.265;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=58;TCF=20;TCR=38;TR=43;WE=3517848;WS=3517830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,51:0.77:66
chr2	3523324	rs10179340	A	G	811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.746;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=21;PP=493;ReadPosRankSum=0.147;SC=GCCGCGCTTTATCTTATAGGG;SOR=0.833;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=93;TCF=45;TCR=48;TR=38;WE=3523332;WS=3523314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,42:0.39:108
chr2	3595834	rs13002108	C	A	981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=26;PP=701;SC=CTTCCCTTTCCCCTAACTTGT;SOR=4.680;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=28;WE=3595842;WS=3595824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr2	3627648	rs7576238	G	C	2895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.049;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=47;PP=1659;ReadPosRankSum=0.590;SC=CTCTGGAGTTGCCCAGAGGGC;SOR=0.717;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=194;TCF=104;TCR=90;TR=108;WE=3627656;WS=3627638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,130:0.59:222
chr2	3652616	rs3769507	G	C	1678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.181;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-0.745;NF=44;NR=48;PP=1248;ReadPosRankSum=-1.861;SC=TTCTGCAGGTGAGGCATGGGT;SOR=0.839;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=251;TCF=127;TCR=124;TR=92;WE=3652624;WS=3652606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,93:0.36:257
chr2	3653576	rs7604806	A	G	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=3;PP=570;ReadPosRankSum=1.344;SC=TGATAAATGTACCTGCTTTAG;SOR=0.836;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=48;TCF=42;TCR=6;TR=27;WE=3653584;WS=3653566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,26:0.53:49
chr2	3653844	rs3739147	T	C	800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.336;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=31;PP=479;ReadPosRankSum=-0.454;SC=GTCAGTAGCCTGCACTGGTGG;SOR=1.294;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=119;TCF=38;TCR=81;TR=41;WE=3653852;WS=3653834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,45:0.36:124
chr2	3660752	rs3811531	T	C	471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.293;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=333;ReadPosRankSum=0.025;SC=GCGGCTGGGCTGCAGGCGGGG;SOR=1.697;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=43;TCF=34;TCR=9;TR=20;WE=3660760;WS=3660742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,21:0.47:45
chr2	3660856	rs7567724	G	A	1747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.475;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=39;PP=1095;ReadPosRankSum=0.001;SC=CTGAGACGCTGTGCTGGCCAG;SOR=0.644;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=223;TCF=128;TCR=95;TR=85;WE=3660864;WS=3660846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,94:0.37:252
chr2	3673648	rs10170348	G	A	4511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=101;PP=2635;ReadPosRankSum=0.341;SC=CCAAAAGGAAGTGCACCTCGT;SOR=0.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=310;TCF=148;TCR=162;TR=191;WE=3673656;WS=3673638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,205:0.61:336
chr2	3685046	rs3811528	T	C	1921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=8;PP=1459;SC=GGTCGGGTTATCCGTGCACGT;SOR=3.258;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=53;TCR=8;TR=61;WE=3685054;WS=3685036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr2	3685074	rs3811527	A	G	3505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=86;NR=31;PP=2055;SC=GGAGGAGGCCACGGTGTCACC;SOR=1.816;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=117;TCF=86;TCR=31;TR=117;WE=3685082;WS=3685064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr2	3691606	.	CGAG	C	5956.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.304;ClippingRankSum=0.000;DP=483;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.118;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=5.057;NF=12;NR=81;PP=2968;ReadPosRankSum=-0.248;SC=ATGCCTACGACGAGGAGGACT;SOR=1.015;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=274;TCF=59;TCR=215;TR=93;WE=3691616;WS=3691596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:279,169:0.38:448
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chr2	3800383	rs357969	C	T	2239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.912;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=57;PP=1469;ReadPosRankSum=-0.695;SC=ATCTTTTGGGCGACTCAAAGG;SOR=0.769;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=274;TCF=133;TCR=141;TR=106;WE=3800391;WS=3800373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,113:0.38:296
chr2	3800496	rs357968	C	T	1314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.63;ReadPosRankSum=-1.221;SOR=0.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:200,84:0.30:284
chr2	3815532	rs11404437	A	AT	461.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.632;HP=12;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=307;ReadPosRankSum=-2.039;SC=AGAACATGGGATTTTTTTTTT;SOR=0.097;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=44;TCF=2;TCR=42;TR=22;WE=3815540;WS=3815522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,24:0.86:28
chr2	4135981	rs1024026	C	T	2807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.052;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=53;PP=1645;ReadPosRankSum=1.974;SC=CCTAGCATGTCAAGGCCAGAC;SOR=0.771;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=202;TCF=110;TCR=92;TR=119;WE=4135989;WS=4135971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,131:0.60:219
chr2	4136145	rs1024027	A	G	753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=20;PP=435;ReadPosRankSum=-2.117;SC=CTAGAAGTTTATGGACCAATG;SOR=0.784;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=45;TCF=17;TCR=28;TR=32;WE=4136153;WS=4136135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,34:0.69:49
chr2	4672834	.	CTG	C	57	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=26;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=57;QD=21.3333333333;SC=TTTCCTCTCTCTGTGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=3;WE=4672843;WS=4672824;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:11,3:0.21:14
chr2	7001233	rs3085147	ACG	A	2922.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.36;SOR=2.139;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr2	7001249	rs202012587	ACACACACACC	A	568.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=2.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.16;ReadPosRankSum=1.110;SOR=1.265;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,24:0.43:56
chr2	7001251	.	ACACACACC	A	523.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.169;ClippingRankSum=0.000;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=1.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.88;ReadPosRankSum=-0.602;SOR=0.930;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,23:0.43:53
chr2	7001259	.	C	A	1594	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=62;MMLQ=20;MQ=60.0;NF=67;NR=32;PP=1594;QD=16.4522344702;SC=ACACACACACCCACACACTTA;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=67;TCR=32;TR=99;WE=7001267;WS=7001249;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
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chr2	7003879	rs2712039	G	A	134.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=104;SC=GGACTGGAGTGTTTTATTTTA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=7003887;WS=7003869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr2	7005069	rs2595172	C	T	4711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=55;PP=2933;SC=AGAACCGGCTCTACAGACCAG;SOR=1.307;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=158;TCF=102;TCR=56;TR=157;WE=7005077;WS=7005059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr2	7005369	rs11678810	A	G	4297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=74;NR=67;PP=2461;SC=GTGCCTCCTGACAGGCGCCCA;SOR=0.731;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=74;TCR=67;TR=141;WE=7005377;WS=7005359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr2	7005992	rs4669108	C	T	801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=19;NR=4;PP=489;SC=GGCAGGAGCCCTGGGGCTGGG;SOR=2.670;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=23;WE=7006000;WS=7005982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	7017903	rs10182815	A	G	2207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=20;PP=1562;SC=TGGCATACAGAGACTGCTCTG;SOR=1.936;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=71;TCF=51;TCR=20;TR=71;WE=7017911;WS=7017893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr2	7019079	rs6704746	A	G	5043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=76;PP=2955;SC=GATGAATTTCACAAAGCAATC;SOR=0.870;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=179;TCF=103;TCR=76;TR=178;WE=7019087;WS=7019069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr2	7026958	rs10197837	T	A	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.112;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=455;ReadPosRankSum=-0.245;SC=TAAGGAAAAGTGTCTTTTTAA;SOR=2.468;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=42;TCR=1;TR=22;WE=7026966;WS=7026948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,22:0.50:44
chr2	7027323	rs9917321	T	A	1322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.567;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=39;PP=788;ReadPosRankSum=-0.442;SC=CTTTTGCTGATTTCCTTCAAG;SOR=0.610;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=177;TCF=71;TCR=106;TR=67;WE=7027331;WS=7027313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,72:0.39:187
chr2	7030541	rs2305258	C	T	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.117;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=71;ReadPosRankSum=-0.664;SC=AAGGACCCCACACATTGTTAT;SOR=1.911;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=5;WE=7030549;WS=7030531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr2	7046272	.	TACACACACACACACACAC	T	915.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;ClippingRankSum=0.000;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=10.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.10;SOR=3.383;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,30:0.79:38
chr2	7046309	rs13395107	A	T	1342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=2.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.38;ReadPosRankSum=1.703;SOR=0.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,50:0.61:82
chr2	7050426	rs6725201	G	C	3457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.932;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=91;PP=1890;ReadPosRankSum=1.311;SC=AGGCCGTCAAGGTGTGGGGAT;SOR=0.810;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=293;TCF=136;TCR=157;TR=163;WE=7050434;WS=7050416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,167:0.56:297
chr2	7050483	rs145080587	ATGTGTGTG	A,ATGTGTGTGTGTGTGTG	1488.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=16;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=15;NF=0,0;NR=33,33;PP=2088,444;SC=GGTGGTGGCGATGTGTGTGTG;SOR=2.133;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=74;TCF=2;TCR=72;TR=33,33;WE=7050502;WS=7050473;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.67,0.29:45
chr2	7050520	.	AAG	A	1307	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=56;MMLQ=27;MQ=59.88;NF=3;NR=33;PP=1307;QD=36.6111111111;SC=TGTGTGTAGAAAGAGAGAGAG;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=51;TCF=3;TCR=48;TR=36;WE=7050529;WS=7050510;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:15,36:0.71:51
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chr2	7130552	.	CACACACACACACACAG	C	357.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.974;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=14.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.04;ReadPosRankSum=2.399;SOR=3.229;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
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chr2	7243449	rs10617957	AGTGTGT	A	9048.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.526;NF=51;NR=69;PP=2997;ReadPosRankSum=1.890;SC=TGCATGAGTGAGTGTGTGTGT;SOR=1.598;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=141;TCF=57;TCR=84;TR=120;WE=7243464;WS=7243439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,224:0.99:226
chr2	7403641	rs111726098	T	TAC	2640.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.050;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=26;PP=1936;ReadPosRankSum=-0.052;SC=CAGGTATAGATACACACACAC;SOR=0.509;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=72;TCF=26;TCR=46;TR=47;WE=7403650;WS=7403631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,96:0.79:121
chr2	7409989	rs10548278	TTG	T	189.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FS=2.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.05;MQRankSum=2.540;QD=1.15;ReadPosRankSum=-1.961;SOR=1.067;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:145,20:0.12:165
chr2	7421569	rs142314951	C	CTG	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=377;ReadPosRankSum=0.398;SC=AGATGCACGTCTGTGTGTGTG;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=8;WE=7421577;WS=7421559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,14:0.88:16
chr2	7471732	rs6732990	G	A	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.623;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=114;ReadPosRankSum=-2.000;SC=TCTGGAATGAGCTGTTCACAT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=6;WE=7471740;WS=7471722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr2	7540646	rs5829105	C	CA	2809.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.161;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=34;PP=1641;ReadPosRankSum=1.872;SC=GAAGGTCAAGCAAGCATTCGA;SOR=0.757;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=95;TCF=21;TCR=74;TR=44;WE=7540654;WS=7540636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,96:0.54:179
chr2	7540695	rs2163257	C	G	1974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.250;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=41;PP=1117;ReadPosRankSum=0.473;SC=ACAAACACTTCATGGACAGAT;SOR=0.582;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=131;TCF=53;TCR=78;TR=66;WE=7540703;WS=7540685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,89:0.55:162
chr2	7540784	rs4669196	T	C	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.527;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=180;ReadPosRankSum=0.861;SC=AAAGAATATATAAAGTTTATT;SOR=1.034;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=28;TCF=9;TCR=19;TR=12;WE=7540792;WS=7540774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr2	8866844	rs13024421	C	G	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=2.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=95;ReadPosRankSum=-1.679;SC=GTACTGAATACTGCAGGCAAC;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=6;WE=8866852;WS=8866834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr2	8870814	rs6431959	A	G	5516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=117;NR=63;PP=2965;SC=TCTGTCATAAAGGTACAGTAA;SOR=1.291;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=180;TCF=117;TCR=63;TR=180;WE=8870822;WS=8870804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr2	8871342	rs1044280	C	A	2339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.478;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.935;NF=46;NR=46;PP=1392;ReadPosRankSum=-0.452;SC=CCTTTTCAAGCTGGGAGTCAT;SOR=0.757;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=173;TCF=90;TCR=83;TR=92;WE=8871350;WS=8871332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,104:0.54:193
chr2	8887910	rs1978841	A	T	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=4.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=107;ReadPosRankSum=0.347;SC=AAAACTATGTATAAAATCAGT;SOR=0.173;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=8;WE=8887918;WS=8887900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,9:0.29:31
chr2	8898036	rs6750682	A	G	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=162;ReadPosRankSum=-0.171;SC=CTTGTTGCCCAGGCTGGAGTG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=9;WE=8898044;WS=8898026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr2	8910717	rs10929557	T	C	145.10	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5729;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=107;ReadPosRankSum=0.366;SC=TATTATTTTGTATTGTCTGCT;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=6;WE=8910725;WS=8910709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr2	8910987	rs12476359	A	T	3763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=47;NR=83;PP=2371;SC=AAAAGCATTTAAAAATTAATA;SOR=1.495;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=47;TCR=83;TR=130;WE=8910995;WS=8910977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr2	8911010	rs17630893	T	C	1037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.133;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=31;PP=743;ReadPosRankSum=1.282;SC=TGTGTGATAGTATGTTAAGTA;SOR=1.089;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=83;TCF=19;TCR=64;TR=38;WE=8911018;WS=8911000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,42:0.47:89
chr2	8916847	rs4669338	A	T	1048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=8;PP=812;SC=AAGCTTATTAACTATCATAGA;SOR=2.432;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=36;WE=8916855;WS=8916837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr2	8943291	rs2356658	G	A	812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=22;PP=558;SC=AAAACAAAACGCAAGCCCAAG;SOR=5.211;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=8943299;WS=8943281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	8998624	rs10929559	A	G	803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=27;NR=0;PP=740;SC=TGGCCCACGGAGACATGGCAT;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=27;WE=8998632;WS=8998619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	8998775	rs71657308	C	CA	71.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQRankSum=1.866;QD=0.74;ReadPosRankSum=-0.998;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:82,15:0.15:97
chr2	9419411	rs10193043	G	A	6412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=138;NR=84;PP=2965;SC=TCTCAGCACAGACACGGTTTA;SOR=1.224;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=222;TCF=138;TCR=84;TR=222;WE=9419419;WS=9419401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr2	9458460	rs3811599	A	G	209.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=3;PP=126;SC=TAGACTTTTCATTAGCCCTCT;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=9;WE=9458468;WS=9458450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
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chr2	9467815	rs7569295	C	T	1183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=8;PP=851;SC=GGAATCCAGGCGATACTAAGT;SOR=2.531;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=41;WE=9467823;WS=9467805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
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chr2	9576553	rs6432003	T	C	972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.874;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=26;PP=469;ReadPosRankSum=-0.156;SC=AAGATAATAATGTGGTCTTGG;SOR=0.336;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=59;TCF=17;TCR=42;TR=38;WE=9576561;WS=9576543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,46:0.67:69
chr2	9580540	rs111411247	G	GT	178.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=129;ReadPosRankSum=-0.168;SC=ATCATTTCTTGTTCTGTGTGT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=5;WE=9580548;WS=9580530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
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chr2	9613289	rs2001658	T	C	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.291;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=122;ReadPosRankSum=-0.647;SC=ACTGCTAAATTGCTAATTAAT;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=8;WE=9613297;WS=9613279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
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chr2	9616301	rs3831465	TAGG	T	490.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=401;ReadPosRankSum=1.096;SC=AATCAGTATATAGGAGAAGGA;SOR=0.610;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=10;WE=9616311;WS=9616291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr2	9630231	rs6705408	C	T	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.473;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=720;ReadPosRankSum=-0.342;SC=TCACAAAATACAAGCTGTGAT;SOR=1.659;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=11;WE=9630252;WS=9630221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr2	9630244	rs3833563	AT	A	380.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.374;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.42;MQRankSum=1.003;NF=11;NR=2;PP=727;ReadPosRankSum=-0.335;SC=GCTGTGATTGATTTGTAGGTC;SOR=1.916;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=13;WE=9630252;WS=9630221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
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chr2	9633137	rs4622692	T	G	2291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.570;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=53;PP=1536;ReadPosRankSum=-1.911;SC=TCCAAACAGTTAATGTCTTGA;SOR=0.900;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=163;TCF=83;TCR=80;TR=98;WE=9633145;WS=9633127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,104:0.57:184
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chr2	9695906	rs12692386	A	G	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=91;ReadPosRankSum=-0.497;SC=CGACGCCCCCAGAAGTGCAGG;SOR=1.179;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=7;WE=9695914;WS=9695896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr2	9727657	rs41308184	C	T	943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=2.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.74;ReadPosRankSum=-0.509;SOR=0.460;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,50:0.46:108
chr2	9770589	rs200302461	G	GCGGGGC	1536.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=2.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.08;MQRankSum=1.230;QD=14.50;ReadPosRankSum=-0.396;SOR=1.016;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,43:0.41:106
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chr2	9983686	rs2303914	G	T	1144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-2.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.966;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=28;PP=634;ReadPosRankSum=0.104;SC=CCTCGAGGAGGCGGTAAGGAG;SOR=0.849;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=64;TCF=25;TCR=39;TR=44;WE=9983694;WS=9983676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,53:0.71:75
chr2	9983716	rs385513	A	C	1609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=36;PP=1159;SC=CTGGCGGGCCACGATCGCCGG;SOR=1.569;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=19;TCR=36;TR=55;WE=9983724;WS=9983706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr2	9986162	rs287987	C	T	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=345;ReadPosRankSum=0.776;SC=AATTATTCTTCGTTATCCTTT;SOR=0.665;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=46;TCF=38;TCR=8;TR=20;WE=9986170;WS=9986152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,20:0.44:45
chr2	9989442	rs16867195	A	G	1851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=1.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.06;ReadPosRankSum=0.351;SOR=0.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,84:0.68:123
chr2	9991556	rs287991	G	A	131.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=153;SC=TGGGTTAATTGAAAAAAAAAG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=9991564;WS=9991546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr2	9991867	rs287992	G	A	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-3.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.141;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=280;ReadPosRankSum=-0.286;SC=TAACACTAGGGCTACTGGAAG;SOR=0.213;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=19;WE=9991875;WS=9991857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,23:0.64:36
chr2	9994288	rs4669471	C	G	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=324;ReadPosRankSum=-1.033;SC=ATGCTACATACAGACCCCAGA;SOR=2.419;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=14;WE=9994296;WS=9994279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr2	10008872	rs12623017	A	G	2507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.718;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=61;PP=1557;ReadPosRankSum=0.425;SC=GTCTTCAAAGAAAAGTTGTAG;SOR=0.584;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=132;TCF=45;TCR=87;TR=95;WE=10008880;WS=10008862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,108:0.72:151
chr2	10023016	rs447465	T	C	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=247;ReadPosRankSum=-1.161;SC=GCTTGACTTATTATTTGGTGT;SOR=0.671;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=12;TCR=32;TR=18;WE=10023024;WS=10023006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,19:0.39:49
chr2	10044941	rs450192	G	T	2256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.00;SOR=2.265;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr2	10044941	.	GTTTTG	TTTTTG,TTTTTT	776	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000,0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=23;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=46,19;NR=12,6;PP=776,370;QD=13.9788140094;SC=TTAAAAATAAGTTTTGTTGCA;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=46;TCR=12;TR=58,25;WE=10044954;WS=10044931;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:58
chr2	10044946	rs450194	G	T	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=2.382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.19;ReadPosRankSum=0.037;SOR=0.397;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,29:0.40:72
chr2	10045014	rs400917	C	T	10157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.95;SOR=1.038;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr2	10045024	rs396190	G	A	11051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.02;SOR=0.956;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,263:1.00:263
chr2	10045147	rs448327	A	G	6665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=126;PP=2965;SC=TAAGTGTGTGACATATATTGT;SOR=1.016;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=226;TCF=100;TCR=126;TR=226;WE=10045155;WS=10045137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr2	10050947	rs1054561	T	C	3599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=57;PP=2039;SC=ATCCTATAGCTAAAATGGCAA;SOR=0.983;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=109;TCF=52;TCR=57;TR=109;WE=10050968;WS=10050937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr2	10050960	rs1054565	A	G	3257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=54;PP=1724;SC=AATGGCAAAAACTGTTAAGTA;SOR=1.123;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=98;TCF=44;TCR=54;TR=98;WE=10050968;WS=10050937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr2	10051053	rs10495576	G	C	713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=15;PP=410;SC=GTAAGTGTACGTCAATTTTAT;SOR=2.215;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=21;WE=10051061;WS=10051043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	10053412	rs12467598	C	T	9126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=156;NR=167;PP=2965;SC=ATGCACCTGCCTTACTTCTGT;SOR=0.797;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=323;TCF=156;TCR=167;TR=323;WE=10053420;WS=10053402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,341:1.00:341
chr2	10059770	rs1820965	G	T	7219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=151;NR=94;PP=2965;SC=CACTGGTCGAGTCAACAGCAA;SOR=1.141;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=245;TCF=151;TCR=94;TR=245;WE=10059778;WS=10059760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,271:1.00:271
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chr2	10095374	rs13401891	C	T	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.180;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=29;ReadPosRankSum=0.043;SC=CTTTGACTTACTGTGATTCGA;SOR=0.116;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=6;WE=10095382;WS=10095364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr2	10105584	rs111854908	AT	A	42.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.11;MQRankSum=2.111;QD=0.66;ReadPosRankSum=0.775;SOR=0.622;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,11:0.17:65
chr2	10126416	rs16867274	A	G	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.278;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=207;ReadPosRankSum=-0.066;SC=ACAAGGTAAGATCGGCAGGGA;SOR=0.378;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=48;TCF=12;TCR=36;TR=17;WE=10126424;WS=10126406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,21:0.39:54
chr2	10133728	rs6711126	T	C	1660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.925;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=48;PP=973;ReadPosRankSum=1.800;SC=CAAATATTTTTGAAGATTACA;SOR=0.729;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=289;TCF=153;TCR=136;TR=95;WE=10133736;WS=10133718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:215,99:0.32:314
chr2	10133820	rs6750565	C	T	988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.753;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=32;PP=560;ReadPosRankSum=0.340;SC=GCAGGGATGTCATAGAGGCCA;SOR=0.419;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=124;TCF=33;TCR=91;TR=47;WE=10133828;WS=10133810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,50:0.38:132
chr2	10135855	rs11674576	T	C	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=382;ReadPosRankSum=1.004;SC=GATCTTCCTTTAGCCTGATTT;SOR=0.619;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=63;TCF=50;TCR=13;TR=24;WE=10135863;WS=10135845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,24:0.35:68
chr2	10135956	rs41264205	G	A	3093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=392;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.226;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=60;PP=2125;ReadPosRankSum=0.780;SC=CCTTAATGTTGATGCAGCTGG;SOR=0.782;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=369;TCF=214;TCR=155;TR=151;WE=10135964;WS=10135946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:232,157:0.40:389
chr2	10138960	.	A	G	156	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.7500;HP=2;HapScore=4;MGOF=106;MMLQ=27;MQ=51.44;NF=3;NR=0;PP=156;QD=63.5904041824;SC=ACACATATATATATACGTATA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=3;WE=10138974;WS=10138950;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr2	10138965	.	CGT	C	91	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=106;MMLQ=27;MQ=49.07;NF=3;NR=0;PP=91;QD=44.6666666667;SC=TATATATATACGTATATATAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=3;WE=10138974;WS=10138950;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr2	10139018	rs189326991	A	G	363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.98;SOR=2.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	10140651	rs2163338	A	G	922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.973;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=15;PP=496;ReadPosRankSum=-0.336;SC=GAGAGCTAACAGGTCAATCTA;SOR=0.975;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=152;TCF=99;TCR=53;TR=47;WE=10140659;WS=10140641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,56:0.32:173
chr2	10188649	rs11687357	A	T	1953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.471;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=49;PP=1204;ReadPosRankSum=1.234;SC=GGAACTATGTATGCAGCTTCC;SOR=0.649;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=229;TCF=101;TCR=128;TR=89;WE=10188657;WS=10188639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,100:0.39:255
chr2	10220247	rs192172817	C	A	99.28	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.18;ReadPosRankSum=1.465;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr2	10225241	rs6432058	C	T	1517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=11;PP=996;SC=CTGAGTAAGACGATGTTTGTG;SOR=2.437;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=39;TCR=11;TR=50;WE=10225249;WS=10225231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr2	10226306	rs34098251	G	GC	2164.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.263;NF=1;NR=32;PP=1220;ReadPosRankSum=0.963;SC=GAATAGACCAGCGAGCTCTGA;SOR=0.708;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=105;TCF=10;TCR=95;TR=33;WE=10226314;WS=10226296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,74:0.39:190
chr2	10262920	rs1130609	T	G	1608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.859;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=37;PP=1039;ReadPosRankSum=-0.480;SC=TCGCTGCGCCTCCACTATGCT;SOR=0.451;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=193;TCF=88;TCR=105;TR=74;WE=10262928;WS=10262910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,83:0.38:218
chr2	10264057	rs6432065	T	C	8007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=126;NR=160;PP=2965;SC=TCGTCTTGTATGTTTTTCCAT;SOR=1.017;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=286;TCF=126;TCR=160;TR=286;WE=10264065;WS=10264047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,310:1.00:310
chr2	10267211	rs61754180	T	C	3355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.053;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=73;ReadPosRankSum=-0.433;SC=AACTCCTAAATAGGTGAACGT;SOR=0.501;SbPval=0.39;Source=Platypus;TCF=89;TR=131;WE=10267219;WS=10267201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,141:0.60:234
chr2	10281903	rs5829249	G	GC	813.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=4;PP=941;SC=GGTGGCCATGGCCTGGGGCTG;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=21;WE=10281911;WS=10281898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	10282147	rs11896140	T	C	2368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=395;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.458;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=71;PP=1580;ReadPosRankSum=2.280;SC=GCTATGCCCCTTGCTCTTTCA;SOR=0.875;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=359;TCF=157;TCR=202;TR=120;WE=10282155;WS=10282137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:262,131:0.33:393
chr2	10332876	rs56228505	AC	A	1274.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=23;PP=589;SC=CTGCCACTCCACCCCCCCCTG;SOR=1.508;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=24;WE=10332885;WS=10332866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr2	10563233	rs2270304	G	A	3190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.628;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=77;PP=2051;ReadPosRankSum=0.148;SC=GGGTGGGGGCGGGGCTGCATG;SOR=0.584;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=225;TCF=95;TCR=130;TR=138;WE=10563241;WS=10563223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,146:0.61:238
chr2	10563297	rs2270305	G	A	866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.512;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=26;PP=630;ReadPosRankSum=-0.756;SC=CCTCCCCTCTGCAGCTTCTTG;SOR=1.312;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=47;TCF=12;TCR=35;TR=33;WE=10563305;WS=10563287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,35:0.71:49
chr2	10564528	rs11674615	C	T	1526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=19;PP=967;ReadPosRankSum=0.210;SC=TGAGGCTGTCCGCTCCTCGTG;SOR=0.622;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=99;TCF=69;TCR=30;TR=60;WE=10564536;WS=10564518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,64:0.62:103
chr2	10585302	rs2302613	T	C	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=35;ReadPosRankSum=0.241;SC=AGAGATGGAATTGAAAGAAAT;SOR=0.527;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=4;WE=10585310;WS=10585292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr2	10586780	rs28362380	T	C	353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.62;ReadPosRankSum=0.472;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr2	10586790	rs7608353	A	G	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.08;ReadPosRankSum=-0.514;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr2	10587169	rs7558559	T	A	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=63;ReadPosRankSum=1.368;SC=TCATGCAGTCTCGGACTGGGT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=5;WE=10587177;WS=10587159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
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chr2	10741141	rs10181806	A	G	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.97;ReadPosRankSum=-1.699;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
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chr2	10743191	rs2287062	G	A	2470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.526;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=43;PP=1509;ReadPosRankSum=0.008;SC=AATAACTGTAGTTTTCTGTTT;SOR=0.487;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=164;TCF=97;TCR=67;TR=101;WE=10743199;WS=10743181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,111:0.62:180
chr2	10747246	rs6744854	C	G	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=1.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=326;ReadPosRankSum=-1.543;SC=TTCTCATGTTCAAAACTCAAA;SOR=1.508;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=14;WE=10747261;WS=10747236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr2	10747271	rs6759740	A	G	767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=4.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.284;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=370;ReadPosRankSum=0.411;SC=AAGTAGAAATAAAGTAATTAC;SOR=3.654;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=33;TCR=3;TR=20;WE=10747279;WS=10747261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,22:0.56:39
chr2	10762302	rs70953325	TA	T	12954.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=371;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=176;PP=2951;SC=GGTAAACAGTTAACACAGGAA;SOR=0.998;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=209;TCF=22;TCR=187;TR=197;WE=10762310;WS=10762292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,349:1.00:349
chr2	10774531	rs77767350	C	T	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=139;ReadPosRankSum=0.323;SC=AACAAGGCTTCAGCTGAAATG;SOR=1.051;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=9;WE=10774539;WS=10774521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr2	10799467	rs147521601	TGGG	T	213.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.241;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=21.37;ReadPosRankSum=2.638;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr2	10808776	rs55925118	C	CAA	3235.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=32;PP=1920;SC=ATTACTAAAACTACTCACGCA;SOR=0.934;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=39;TCF=6;TCR=33;TR=38;WE=10808784;WS=10808766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr2	10813782	rs6748766	T	C	2184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=27;NR=42;PP=1336;SC=AGAAATTATATACATACCAGT;SOR=1.409;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=27;TCR=42;TR=69;WE=10813790;WS=10813772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr2	10815833	rs9287721	A	G	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.140;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=2.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.29;ReadPosRankSum=0.405;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr2	10908893	rs1198849	A	G	7198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=111;NR=137;PP=2965;SC=GGCCGCCTACAACACTCTGAA;SOR=0.986;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=248;TCF=111;TCR=137;TR=248;WE=10908901;WS=10908883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,269:1.00:269
chr2	10911891	rs1198850	T	C	2249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=49;NR=16;PP=1270;SC=AGTGCCCGGGTGTGGGTGTGT;SOR=1.936;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=66;TCF=50;TCR=16;TR=65;WE=10911899;WS=10911874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr2	10915020	rs2969881	A	G	7117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.669;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.96;MQRankSum=0.000;NF=148;NR=99;PP=2965;ReadPosRankSum=1.589;SC=AGGGTCCTCCAGGTTTGGTTC;SOR=0.711;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=247;TCF=148;TCR=99;TR=247;WE=10915028;WS=10915010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,269:1.00:270
chr2	10915037	rs13020917	C	T	3644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.879;NF=91;NR=59;PP=2304;ReadPosRankSum=0.402;SC=GTTCATCTCCCGCTGCGGGGG;SOR=0.720;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=266;TCF=160;TCR=106;TR=150;WE=10915045;WS=10915027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,163:0.56:291
chr2	10960921	rs149553803	T	G	973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.038;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=18;PP=571;ReadPosRankSum=-0.137;SC=GAGCTGATGTTGGCTGGGACC;SOR=0.991;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=144;TCF=81;TCR=63;TR=47;WE=10960945;WS=10960911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,52:0.33:158
chr2	10961184	rs1686497	A	G	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=162;ReadPosRankSum=-2.453;SC=CAGAATTTTCAGGTCGTGTTT;SOR=0.593;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=9;WE=10961192;WS=10961174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr2	10994418	rs1198852	T	C	661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=18;NR=0;PP=455;SC=TGAGCCACTGTGTCCGGCCTC;SOR=4.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=10994426;WS=10994410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	10994937	rs1198851	C	T	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.412;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=155;ReadPosRankSum=-0.972;SC=GGTGGCCTCCCTTTCCATAAG;SOR=0.446;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=36;TCF=20;TCR=16;TR=10;WE=10994945;WS=10994927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,10:0.28:36
chr2	11053020	rs3732104	A	G	7436.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.856;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=102;NR=134;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.793;SC=GCGTGGACGCAGCCGAGGGCC;SOR=0.842;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=237;TCF=103;TCR=134;TR=236;WE=11053028;WS=11053010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,264:1.00:265
chr2	11053740	rs3732105	C	T	10242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=370;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=168;NR=174;PP=2965;SC=GTGGTGTCATCGCCATCGCCC;SOR=0.748;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=342;TCF=168;TCR=174;TR=342;WE=11053748;WS=11053730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,370:1.00:370
chr2	11264830	rs7560331	G	A	9579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=359;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=186;NR=138;PP=2965;SC=CGTGGACCTGGCAACCTGCTC;SOR=0.977;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=325;TCF=187;TCR=138;TR=324;WE=11264838;WS=11264820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,357:1.00:357
chr2	11273407	.	GTC	G	322.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=0.000;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=21;PP=365;ReadPosRankSum=-0.845;SC=TCAGGCACAGGTCTCTCTCTC;SOR=0.663;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=76;TCF=26;TCR=50;TR=30;WE=11273420;WS=11273397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,22:0.23:96
chr2	11273436	.	GCA	G	103.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.095;ClippingRankSum=0.000;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.70;ReadPosRankSum=0.865;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:131,17:0.11:148
chr2	11295226	rs148805827	C	CG	255.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=2;PP=259;SC=GACTGTCGCCCGGGGCGGGGC;SOR=2.093;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=11295234;WS=11295216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	11295867	rs7598570	G	C	2126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=47;PP=1227;SC=AGCTGCTGCCGGCTGGGAGCC;SOR=1.264;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=30;TCR=47;TR=77;WE=11295875;WS=11295857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr2	11300732	rs2271622	C	T	9827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=165;NR=149;PP=2965;SC=CCCCCTCACTCGGAGCCTCTC;SOR=0.765;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=314;TCF=165;TCR=149;TR=314;WE=11300740;WS=11300710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,346:1.00:346
chr2	11300854	rs137965414	C	T	3007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.012;HP=4;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=90;PP=2050;ReadPosRankSum=1.883;SC=GAAGTGGGAACGGGGATGTTA;SOR=0.620;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=273;TCF=113;TCR=160;TR=156;WE=11300862;WS=11300843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,141:0.58:243
chr2	11300869	rs6432182	T	C	8120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.42;SOR=1.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr2	11300927	.	TAAAAA	T	44.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.98;ReadPosRankSum=0.967;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr2	11312181	rs12987956	G	A	2686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=60;PP=1843;SC=AGTAAGAACCGGACTCACATG;SOR=2.033;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=25;TCR=61;TR=85;WE=11312189;WS=11312171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr2	11312224	rs3732103	C	T	1469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=40;PP=1095;SC=CAAGTGTCTACGTAGTAGGGT;SOR=4.003;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=5;TCR=40;TR=45;WE=11312232;WS=11312214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr2	11333994	rs2271621	T	G	3357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=76;PP=2257;SC=CTATAAAAAATTTTGAATAAA;SOR=1.649;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=115;TCF=39;TCR=76;TR=115;WE=11334002;WS=11333984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr2	11359031	rs9808228	G	T	935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=21;NR=12;PP=517;SC=AAAACATGGGGATTACTAAAA;SOR=1.061;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=21;TCR=12;TR=33;WE=11359039;WS=11359021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr2	11680896	rs34137466	CAA	C	406.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=214;ReadPosRankSum=1.119;SC=GGAGGACCGTCAAAGAGTTTA;SOR=0.465;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=8;WE=11680905;WS=11680886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,13:0.28:47
chr2	11702661	rs10929757	A	C	1544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=40;PP=960;ReadPosRankSum=1.549;SC=GGCCCCCCAAACCCTTTCCAG;SOR=0.677;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=187;TCF=89;TCR=98;TR=75;WE=11702669;WS=11702642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,82:0.40:206
chr2	11718591	rs1529868	C	T	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.780;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=20;PP=397;ReadPosRankSum=-0.178;SC=AGCTGCTAAACCCACAGAGCT;SOR=0.330;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=58;TCF=11;TCR=47;TR=26;WE=11718599;WS=11718581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,31:0.48:65
chr2	11725179	.	G	GA	397	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=12;HapScore=4;MGOF=15;MMLQ=15;MQ=59.97;NF=22;NR=15;PP=397;QD=10.972972973;SC=TCTGTGATTAGAAAAAAAAAA;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=50;TCR=33;TR=37;WE=11725187;WS=11725169;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:46,37:0.45:83
chr2	11725241	rs12470971	G	A	3655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.072;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.601;NF=88;NR=80;PP=2431;ReadPosRankSum=-0.133;SC=TTTTATTGGAGCCCTGTCCTG;SOR=0.615;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=262;TCF=140;TCR=122;TR=168;WE=11725249;WS=11725231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,168:0.61:274
chr2	11727507	rs13394619	G	A	5597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=491;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.524;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=121;NR=128;PP=2962;ReadPosRankSum=1.073;SC=GCCCACTGCAGTATTTGTAAA;SOR=0.619;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=458;TCF=220;TCR=238;TR=249;WE=11727515;WS=11727497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:219,272:0.55:491
chr2	11731774	rs2358040	T	G	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=114;ReadPosRankSum=-0.319;SC=TGGGAAGCAATCTGATGATAT;SOR=1.022;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=8;WE=11731782;WS=11731764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr2	11738091	rs1435547	T	C	9265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=357;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=151;NR=171;PP=2965;SC=CTCTGCTCCATGTGTGGCATT;SOR=0.862;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=322;TCF=151;TCR=171;TR=322;WE=11738099;WS=11738081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,356:1.00:356
chr2	11738765	rs1865575	C	T	885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=6;PP=582;SC=AAACCCAGTGCGCATGTTTGC;SOR=2.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=29;WE=11738773;WS=11738755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr2	11741193	rs11681838	C	A	978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=26;PP=721;SC=CATTTAGTAACAGCCTTGACC;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=28;WE=11741201;WS=11741183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	11742458	rs72772088	A	G	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.793;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=231;ReadPosRankSum=-1.709;SC=GGTCATCCGCAGGCCTGGCAC;SOR=0.123;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=16;WE=11742466;WS=11742448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr2	11752635	rs2304399	T	C	2623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=37;PP=1442;SC=GGCAGAAAATTGAGGATGTGG;SOR=0.776;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=49;TCR=37;TR=86;WE=11752643;WS=11752625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr2	11755443	rs2252958	T	G	800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=22;PP=619;SC=CTCAGCCTACTTGTCCCTGTC;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=11755451;WS=11755433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	11757009	rs6735957	A	G	1020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=25;PP=671;SC=GAGAGTAAATATTGTGGTCAA;SOR=3.675;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=28;WE=11757017;WS=11756999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr2	11810095	rs6432225	G	A	3366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=67;PP=2040;SC=CACCACGTGCGCGGACAGCGC;SOR=1.304;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=46;TCR=67;TR=113;WE=11810103;WS=11810085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr2	11817812	rs4669769	G	C	3940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=78;NR=59;PP=2345;SC=CCAGCTGGGAGACCTCGCAGG;SOR=0.923;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=138;TCF=79;TCR=59;TR=137;WE=11817820;WS=11817802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr2	11853774	rs12465629	T	C	73.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=0;PP=23;SC=ATGTTCAAAATGTAGAGTTCA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=11853782;WS=11853764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr2	11853988	rs12465630	A	T	4791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=77;PP=2629;SC=ACATTTTAAGATTAGAGAAAA;SOR=0.737;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=160;TCF=82;TCR=78;TR=159;WE=11853996;WS=11853978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr2	11854099	rs4668739	T	C	824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=21;PP=517;SC=CCGCAGCACTTGCTGGATGCT;SOR=2.985;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=26;WE=11854107;WS=11854089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	11905636	rs3214670	GT	G	3756.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.23;QD=26.64;SOR=1.543;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr2	11905876	rs10209969	C	T	599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.443;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=343;ReadPosRankSum=-0.700;SC=TCTCAGGGCACGGGGACCTGG;SOR=0.102;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=46;TCF=8;TCR=38;TR=23;WE=11905884;WS=11905866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,27:0.52:52
chr2	11907842	rs45509591	C	T	2389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.703;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=36;PP=1353;ReadPosRankSum=1.032;SC=GGTCTCCTGTCCTGGTGAAGG;SOR=0.504;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=151;TCF=93;TCR=58;TR=86;WE=11907850;WS=11907832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,103:0.59:175
chr2	11911761	rs11538448	C	T	2395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.919;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=58;PP=1542;ReadPosRankSum=-0.248;SC=TGTTCCCCATCGAGATGAGCT;SOR=0.495;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=154;TCF=65;TCR=89;TR=102;WE=11911769;WS=11911751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,106:0.64:166
chr2	11924950	rs3795974	T	C	5462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=83;PP=2814;SC=CACTGGATGGTGATGTAGGAC;SOR=0.866;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=189;TCF=106;TCR=83;TR=189;WE=11924958;WS=11924940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr2	11931931	rs78343196	A	AT	263.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=86;ReadPosRankSum=-0.298;SC=GTTTTCTCTGATTTTTTTTTA;SOR=0.698;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=44;TCF=25;TCR=19;TR=10;WE=11931939;WS=11931921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,17:0.28:61
chr2	11932173	rs7561070	G	T	2257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=49;PP=1535;SC=CTTAGCAAGTGTTGGTTTTGT;SOR=1.395;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=29;TCR=49;TR=78;WE=11932181;WS=11932163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr2	11936798	rs2577264	A	G	1438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=4;PP=990;SC=AAGAAAGAATAGGAAGGCACC;SOR=3.209;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=35;TCR=4;TR=39;WE=11936806;WS=11936788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr2	11944746	rs111652164	TG	T	588.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.886;NF=1;NR=19;PP=638;ReadPosRankSum=0.143;SC=TGCTTCACCGTGGGGGTCTCT;SOR=0.358;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=37;TCF=1;TCR=36;TR=20;WE=11944754;WS=11944736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,23:0.59:39
chr2	11959905	rs2716609	T	C	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=389;ReadPosRankSum=1.356;SC=ATCTTATGGCTTCCAGGGTTC;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=17;WE=11959913;WS=11959895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr2	12864613	rs6432324	T	A	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.579;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=28;ReadPosRankSum=-1.465;SC=AGTTCCTGAATGAGGCCCCAC;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=3;WE=12864621;WS=12864607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr2	12877501	rs5829384	G	GA	9667.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=72;PP=2974;SC=GTGAGAATGGGTAGAGGAAGC;SOR=0.930;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=121;TCF=49;TCR=72;TR=120;WE=12877509;WS=12877491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr2	12877609	rs7604252	C	T	1645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.996;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.197;NF=39;NR=44;PP=841;ReadPosRankSum=1.255;SC=CGTCACATCTCGACAGCTAGT;SOR=0.615;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=231;TCF=104;TCR=127;TR=83;WE=12877617;WS=12877599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,94:0.36:262
chr2	12877695	rs7564991	A	C	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.565;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=146;ReadPosRankSum=1.598;SC=GTTTTTAATCAGCTCCATTCC;SOR=0.368;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=15;WE=12877703;WS=12877685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,17:0.41:41
chr2	12880744	.	C	T	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.901;ClippingRankSum=0.000;DP=391;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.55;ReadPosRankSum=1.419;SOR=0.707;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:326,65:0.17:391
chr2	15319070	rs5829492	TA	T	927.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=6.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.24;MQRankSum=1.129;QD=11.04;ReadPosRankSum=1.623;SOR=0.338;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,58:0.69:84
chr2	15378822	rs140225141	G	GAATT	277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=331;SC=TTAAAAAAAAGAATAGTGAGA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=7;WE=15378830;WS=15378812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	15449484	.	C	A	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-4.181;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.210;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=226;ReadPosRankSum=-1.252;SC=GTGGCAGAGACCTTTTAGGAA;SOR=0.178;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=16;WE=15449492;WS=15449474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr2	15491994	.	GCACACACACACA	G,GCA	7415.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.31;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=19;NF=26,26;NR=52,52;PP=159,2997;SC=TGGTCTGCATGCACACACACA;SOR=1.596;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=104;TCF=37;TCR=67;TR=78,78;WE=15492015;WS=15491980;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.19,0.81:190
chr2	15493881	rs2277915	A	G	4191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=86;PP=2539;SC=GAAGAAGAATATTCAATCTAA;SOR=1.429;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=135;TCF=49;TCR=86;TR=135;WE=15493889;WS=15493871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr2	15519992	rs2058866	G	T	3030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=61;PP=1763;SC=GTTATAGAGAGGGAAGATTCA;SOR=1.445;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=37;TCR=61;TR=98;WE=15520000;WS=15519982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr2	15523266	rs6756934	A	T	927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=3;PP=688;SC=ATGGTCATCAATCTTGTATCC;SOR=3.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=29;WE=15523274;WS=15523256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	15523307	rs3834149	TA	T	1858.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.45;QD=26.55;SOR=2.439;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr2	15523549	rs3755129	T	C	1481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=34;PP=1040;SC=CACCACTCTATATCCACATCA;SOR=2.608;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=8;TCR=34;TR=42;WE=15523557;WS=15523539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr2	15533689	rs2380650	T	C	612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=60;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=1;PP=582;SC=AACTATTCACTTACCAAATGA;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=15533697;WS=15533679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	15533734	rs139494535	G	GAAATGAAAGCGTATGTCTACAC	3236.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=5;PP=2969;SC=TTGTCTGAGAGAAATGAAAGC;SOR=1.863;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=19;TCF=8;TCR=11;TR=8;WE=15533742;WS=15533724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr2	15533779	rs9710889	G	A	4313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=55;PP=2216;SC=ATGAAAAGTCGTAGCAACTTT;SOR=0.895;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=132;TCF=76;TCR=56;TR=131;WE=15533787;WS=15533769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr2	15533884	rs9710962	C	A	3138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=46;PP=1399;SC=AATACCATTCCGCAAACAAAA;SOR=1.996;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=20;TCR=46;TR=66;WE=15533907;WS=15533874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr2	15533895	rs13417550	A	G	2660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.88;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr2	15533899	rs11689153	A	G	2520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.83;SOR=2.522;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr2	15564718	rs10929367	T	C	1194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=32;PP=914;SC=ATGTATGTGGTTTGTGTATCT;SOR=4.977;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=34;WE=15564726;WS=15564708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr2	15567649	rs3796002	T	C	773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=1;PP=586;SC=TCCTTTGTAGTATTTAATTTT;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=15567657;WS=15567639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	15601287	rs11411624	A	AT	4521.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=26;PP=2383;SC=TTATCAATATAAAAAAGAAGG;SOR=2.107;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=75;TCF=47;TCR=28;TR=72;WE=15601295;WS=15601277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr2	15601441	rs7590340	C	T	8525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=134;NR=155;PP=2965;SC=ACAGAATTTCCAGGGCTTGTA;SOR=0.915;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=289;TCF=134;TCR=155;TR=289;WE=15601450;WS=15601431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,316:1.00:316
chr2	15601574	rs7590458	C	T	790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=22;PP=654;SC=TATGAAACACCTTGAAATGAC;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=15601582;WS=15601564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	15607842	rs4668909	T	C	3925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.45;SOR=0.889;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr2	15608013	rs4668910	C	A	497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=14;PP=376;SC=TGACTGATTTCATTATTGATT;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=15608021;WS=15608003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	15614404	rs13014906	T	C	5634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=102;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.702;SC=CTTCTCCAGCTCTAGTCTCCA;SOR=0.470;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=176;TCF=73;TCR=103;TR=175;WE=15614412;WS=15614394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,202:1.00:203
chr2	15615910	rs1990754	A	G	7190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=129;NR=117;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.524;SC=AAGTTTTCACAGATGAAACAG;SOR=0.226;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=247;TCF=129;TCR=118;TR=246;WE=15615918;WS=15615900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,275:1.00:276
chr2	15616013	rs1990755	C	G	2816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=68;PP=2006;SC=ATCTAAGAAGCGAAAAACAAA;SOR=1.609;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=103;TCF=34;TCR=69;TR=102;WE=15616021;WS=15616003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr2	15616030	rs1990756	C	T	2213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=54;PP=1467;SC=CAAATCAATACAAATGCATCT;SOR=1.824;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=24;TCR=54;TR=78;WE=15616038;WS=15616020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr2	15618339	rs1125534	G	A	2652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=28;PP=1691;SC=ATCACATTTCGTAGAACTCAC;SOR=1.378;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=59;TCR=28;TR=87;WE=15618347;WS=15618329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr2	15623608	rs10201564	C	G	278.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=8;PP=201;SC=AAAATTAAGGCCGAAAATGAG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=15623616;WS=15623598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	15644107	rs3732002	C	A	1910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.43;SOR=4.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr2	15644111	rs3732003	C	T	2007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.62;SOR=4.758;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr2	15644401	rs2287265	C	T	2461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=62;PP=1792;SC=TAAAATGTCCCTTTATAATGA;SOR=3.070;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=14;TCR=62;TR=76;WE=15644409;WS=15644391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr2	15674686	rs13029846	T	C	7888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=156;NR=116;PP=2965;SC=GGGTGGTAAATAGCTGTGTTG;SOR=0.934;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=272;TCF=156;TCR=116;TR=272;WE=15674694;WS=15674676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,294:1.00:294
chr2	15676456	.	C	CA	73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=11;HapScore=3;MGOF=16;MMLQ=17;MQ=60.35;NF=7;NR=1;PP=73;QD=10.25;SC=AGACAGAAAGCAAAAAAAAAA;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=8;WE=15676464;WS=15676446;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:14,8:0.36:22
chr2	15676686	rs10208972	G	A	2295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=33;NR=63;PP=1855;SC=CTACAGAAGAGGGGGAAATTA;SOR=1.609;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=101;TCF=33;TCR=68;TR=96;WE=15676694;WS=15676676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr2	15678368	rs7595512	C	T	716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=2;PP=545;SC=CATTTGAGCACACATACAGCT;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=23;WE=15678376;WS=15678358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	15678482	rs2380657	T	C	4684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=63;PP=2784;SC=CGTTTTTAGTTTCTCCACTCA;SOR=0.954;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=150;TCF=87;TCR=63;TR=149;WE=15678490;WS=15678463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr2	15678501	rs66736557	GA	G	3844.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.750;HP=9;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.220;NF=20;NR=60;PP=1531;ReadPosRankSum=-0.974;SC=CATTATTTCTGAAAAAAAAAT;SOR=0.605;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=95;TCF=22;TCR=73;TR=80;WE=15678509;WS=15678491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:5,149:0.97:154
chr2	15679609	rs2058868	A	T	436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=335;SC=TCTCTAATAAAGCTTCCCTCA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=15679617;WS=15679599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	15691886	rs7572131	G	A	381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=289;SC=CATATATATGGAATATAGTGA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=15691894;WS=15691876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	15694164	rs34789730	T	TA	8446.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=56;PP=2936;SC=CAGAAAAACATTGAATTTCAC;SOR=1.072;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=40;TCR=56;TR=96;WE=15694172;WS=15694154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr2	15731998	rs10221770	A	G	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=263;ReadPosRankSum=1.231;SC=CGCCACTGCCACGCCGTGTCA;SOR=0.814;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=53;TCF=38;TCR=15;TR=20;WE=15732006;WS=15731988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,22:0.38:58
chr2	15735419	rs2302928	G	A	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=162;ReadPosRankSum=-1.433;SC=AGTTGGGTAAGTGAAAATCAG;SOR=0.404;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=11;WE=15735427;WS=15735409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
chr2	15737698	rs2302932	G	A	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=127;ReadPosRankSum=1.869;SC=AATCTTGTCAGTATCTGGGGG;SOR=1.981;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=8;WE=15737706;WS=15737688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr2	15744484	rs35195784	CT	C	576.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.881;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=584;ReadPosRankSum=0.649;SC=GAAACACATACTTTTGATGCA;SOR=1.460;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=18;WE=15744492;WS=15744474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,22:0.63:35
chr2	15747393	rs10929378	C	T	3370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.546;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=83;PP=2090;ReadPosRankSum=0.363;SC=AAACTTTGAACAACATCAAGC;SOR=0.786;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=200;TCF=80;TCR=120;TR=135;WE=15747401;WS=15747383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,150:0.68:220
chr2	15768876	rs11900266	G	A	1948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=50;PP=1227;ReadPosRankSum=0.568;SC=AAGCTTGTATGCTTTAGGAAT;SOR=0.734;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=156;TCF=72;TCR=84;TR=90;WE=15768884;WS=15768866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,93:0.57:164
chr2	15768981	rs62122280	C	G	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-1.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.630;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=76;ReadPosRankSum=1.970;SC=TTGTAGGGCTCTATTATATTC;SOR=1.059;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=7;WE=15768989;WS=15768971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,11:0.33:33
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chr2	17692243	rs141516716	A	AAG	2109.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.292;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.019;NF=0;NR=25;PP=972;ReadPosRankSum=-0.258;SC=AAGACAATAAAAGTAAAAATT;SOR=0.916;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=75;TCF=4;TCR=71;TR=25;WE=17692251;WS=17692233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,58:0.43:135
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chr2	17696756	rs17314548	C	T	919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.142;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=16;PP=444;ReadPosRankSum=0.927;SC=ATGAAACATACGAAGTTCTTC;SOR=0.749;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=137;TCF=73;TCR=64;TR=41;WE=17696764;WS=17696746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,51:0.33:155
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chr2	17697404	rs76177128	C	A	795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.238;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=25;PP=504;ReadPosRankSum=-2.388;SC=TAAATCTTGGCTGTGCATATT;SOR=1.000;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=135;TCF=58;TCR=77;TR=40;WE=17697412;WS=17697394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,45:0.30:150
chr2	17698085	rs62130402	C	T	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.19;ReadPosRankSum=0.053;SOR=0.741;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,15:0.22:69
chr2	17698091	rs62130403	G	A	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.26;ReadPosRankSum=-0.205;SOR=0.748;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,16:0.22:73
chr2	17698213	rs62130404	C	G	2512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FS=0.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.37;ReadPosRankSum=-0.814;SOR=0.775;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,70:0.37:188
chr2	17698220	rs62130405	G	A	2512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.23;ReadPosRankSum=-0.048;SOR=0.686;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:120,70:0.37:190
chr2	17698678	rs665312	A	G	843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=21;PP=475;ReadPosRankSum=0.778;SC=TATTTTGGCTACTGAGTGATG;SOR=0.634;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=111;TCF=50;TCR=61;TR=38;WE=17698686;WS=17698668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,43:0.35:122
chr2	17699275	rs114644105	G	T	2023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.598;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=55;PP=1324;ReadPosRankSum=2.091;SC=TGTCATGCAGGCCTGCCTCAG;SOR=0.782;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=305;TCF=154;TCR=151;TR=98;WE=17699283;WS=17699265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:215,108:0.33:323
chr2	17699720	rs77886839	G	C	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=2.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.76;ReadPosRankSum=-1.200;SOR=0.124;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr2	17773524	rs2680827	G	A	783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.081;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=21;PP=471;ReadPosRankSum=0.426;SC=TTTCAACCTTGTTTTTATTCC;SOR=0.489;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=59;TCF=18;TCR=41;TR=32;WE=17773532;WS=17773514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,35:0.56:62
chr2	17830599	rs79992476	T	G	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.062;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=110;ReadPosRankSum=0.646;SC=GCACCTGTGATGCCGTCATTA;SOR=0.274;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=9;WE=17830607;WS=17830589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,9:0.30:30
chr2	17836450	rs144020266	C	CT	1573.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.272;NF=29;NR=6;PP=1129;ReadPosRankSum=1.513;SC=ACCTACAATGCTTTTTTCCCC;SOR=1.473;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=41;TCF=32;TCR=9;TR=35;WE=17836458;WS=17836440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,54:0.98:55
chr2	17888457	rs6734462	G	A	2065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=17;PP=1327;SC=CAGTGGGAATGATACAGTAAA;SOR=1.810;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=50;TCR=17;TR=67;WE=17888465;WS=17888447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr2	17890091	rs113290670	G	GTA,GTATA	803.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0,0;NR=19,19;PP=645,119;ReadPosRankSum=-0.632;SC=TGAAAATTGTGTATATATATA;SOR=1.893;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=19,19;WE=17890099;WS=17890077;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:0.96:26
chr2	17898326	rs12469221	C	T	4047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=78;NR=52;PP=2229;SC=AATGGGATAGCCATGAAAATT;SOR=1.036;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=131;TCF=79;TCR=52;TR=130;WE=17898334;WS=17898316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr2	17902381	rs11897477	C	G	5872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=114;NR=69;PP=2965;SC=CACATAGATACGTGAACAAGT;SOR=1.228;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=184;TCF=115;TCR=69;TR=183;WE=17902389;WS=17902371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr2	17913266	rs2052746	A	C	982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=25;PP=754;SC=TGCAAATTAGATTTACATCAA;SOR=3.912;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=28;WE=17913274;WS=17913256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	17927275	rs12474069	C	T	453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=15;PP=377;SC=ATATTAAACTCAACAAAATAA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=17927283;WS=17927265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	17941423	rs2555072	T	G	2378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=54;PP=1652;SC=ACAGTCTTGGTATCTTGATTT;SOR=1.882;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=24;TCR=55;TR=78;WE=17941431;WS=17941413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr2	17942775	rs1812152	T	A	10225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=390;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=184;NR=177;PP=2965;ReadPosRankSum=0.812;SC=GAGGAATCAGTCTCGGTATGG;SOR=0.227;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=362;TCF=184;TCR=178;TR=361;WE=17942783;WS=17942765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,388:1.00:389
chr2	17946243	rs16981869	A	G	6410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=107;NR=104;PP=2965;SC=GCTTATCTCAATGCTGGTGGT;SOR=0.826;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=212;TCF=108;TCR=104;TR=211;WE=17946251;WS=17946233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr2	17948034	rs16983838	A	G	1705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=41;PP=1221;SC=ATATGAATATAATATGGCTAT;SOR=2.917;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=9;TCR=41;TR=50;WE=17948042;WS=17948024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr2	17949939	rs72407975	TTAA	T	2559.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=12;PP=1300;SC=TTCCGTTCAATTAATATACTT;SOR=1.863;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=32;TCF=19;TCR=13;TR=28;WE=17949949;WS=17949929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr2	17954027	rs300175	G	A	5218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=108;PP=2965;SC=AGGCAACTCAGTGAAGTAGAG;SOR=1.487;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=173;TCF=65;TCR=108;TR=173;WE=17954035;WS=17954017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
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chr2	17954647	rs300178	T	G	231.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=147;SC=TGATTGGTCTTAGAGGAGGTT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=17954655;WS=17954637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
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chr2	17962518	rs300169	C	T	5305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=78;PP=2965;SC=CGAATATTTACAAAATTATCA;SOR=0.826;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=172;TCF=94;TCR=78;TR=172;WE=17962526;WS=17962508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr2	17997752	rs115417570	A	G	954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=10;PP=608;ReadPosRankSum=-2.107;SC=CTCACTTGCCAGGGAGCCATT;SOR=0.665;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=59;TCF=45;TCR=14;TR=44;WE=17997760;WS=17997742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,46:0.71:65
chr2	18112473	rs4240213	G	A	9317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=161;NR=141;PP=2965;SC=CCGATAAGGAGTACTACTTTG;SOR=0.766;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=302;TCF=161;TCR=141;TR=302;WE=18112481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,340:1.00:340
chr2	18113623	rs4832524	A	G	2270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.579;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=62;PP=1432;ReadPosRankSum=-1.076;SC=GCGGATGCACACCTTCATTAC;SOR=0.949;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=287;TCF=137;TCR=150;TR=111;WE=18113631;WS=18113613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:191,118:0.38:309
chr2	18767384	rs11096544	G	T	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.087;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=160;ReadPosRankSum=1.311;SC=ACGGGCAGAAGGGAGTTCTCC;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=9;WE=18767392;WS=18767378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr2	19552340	.	T	C	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.669;ClippingRankSum=0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=252;ReadPosRankSum=0.506;SC=AGTGGGGAGGTAAAGGAGATG;SOR=0.941;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=10;WE=19552348;WS=19552330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr2	20096936	rs7563410	C	A	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.210;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=323;ReadPosRankSum=-0.709;SC=CCGAGTATTTCTATATATTAT;SOR=1.528;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=37;TCF=12;TCR=25;TR=22;WE=20096944;WS=20096926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,24:0.62:39
chr2	20097874	rs12328613	T	C	1870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.038;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=51;PP=1300;ReadPosRankSum=-1.023;SC=CTTTTGGGTATTGTCAAACTT;SOR=1.279;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=122;TCF=40;TCR=82;TR=70;WE=20097882;WS=20097854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,77:0.57:135
chr2	20101487	rs2304589	G	A	1710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.926;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=26;PP=989;ReadPosRankSum=0.957;SC=TCTCGTCGCTGGAGGCCGCGC;SOR=0.444;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=103;TCF=68;TCR=35;TR=73;WE=20101495;WS=20101477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,80:0.73:110
chr2	20101717	rs2304588	A	G	1343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.152;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=40;PP=954;ReadPosRankSum=0.661;SC=CTACCTTGACAGCCAACCTTG;SOR=1.049;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=73;TCF=17;TCR=56;TR=51;WE=20101725;WS=20101707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,54:0.71:76
chr2	20130145	rs28502265	T	G	1520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.569;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=30;PP=906;ReadPosRankSum=0.423;SC=ACACATTAGGTGACATGCCCA;SOR=0.331;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=128;TCF=80;TCR=48;TR=70;WE=20130153;WS=20130135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,75:0.52:143
chr2	20131079	rs1191778	T	C	1564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.479;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=36;PP=911;ReadPosRankSum=-0.452;SC=CTTCATCTGTTCATGGTATTG;SOR=0.636;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=231;TCF=129;TCR=102;TR=79;WE=20131087;WS=20131069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,91:0.36:251
chr2	20131184	rs1191779	C	A	3259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=69;PP=2048;SC=AAACATTTTTCAAAATTGAGG;SOR=1.368;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=42;TCR=69;TR=111;WE=20131192;WS=20131174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr2	20135283	rs6741091	T	C	4780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=348;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.402;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=90;PP=2820;ReadPosRankSum=2.708;SC=TCTCTAACCCTTCATAATCCT;SOR=0.682;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=304;TCF=160;TCR=144;TR=191;WE=20135291;WS=20135273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,220:0.63:348
chr2	20137864	rs2293671	T	C	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=279;ReadPosRankSum=-0.368;SC=TTTCTGCTTATTTTGAGGACT;SOR=0.631;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=14;WE=20137872;WS=20137854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr2	20160209	rs10169398	G	A	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=210;ReadPosRankSum=1.008;SC=GGTCATCCTCGTTTTAGAAAA;SOR=0.733;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=15;WE=20160217;WS=20160199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr2	20173255	rs10153717	A	C	1330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=11;PP=795;ReadPosRankSum=1.850;SC=TTCCTTTGTTATTTTTTCCTC;SOR=0.811;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=72;TCF=56;TCR=16;TR=47;WE=20173263;WS=20173245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,54:0.65:83
chr2	20189015	rs1060742	T	C	5734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=498;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.099;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=127;NR=125;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.062;SC=GGATACACACTGCAGCTTCAC;SOR=0.623;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=455;TCF=234;TCR=221;TR=252;WE=20189023;WS=20189005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:219,279:0.56:498
chr2	20189089	rs3731663	C	T	3685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.868;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=90;PP=2197;ReadPosRankSum=1.223;SC=CACGAAGGAGCTGGGAAGTAA;SOR=0.640;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=288;TCF=118;TCR=170;TR=155;WE=20189097;WS=20189079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,174:0.55:318
chr2	20192696	rs7569975	G	A	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=178;ReadPosRankSum=1.436;SC=TTCCTTGGAAGAATCATGCTG;SOR=1.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=9;WE=20192704;WS=20192686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr2	20194036	rs3820949	G	C	2402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=38;PP=1404;ReadPosRankSum=-1.213;SC=CAGGCAGAAGGAGAAAACCTT;SOR=0.717;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=150;TCF=87;TCR=63;TR=89;WE=20194044;WS=20194026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,106:0.60:178
chr2	20201920	.	T	TAC	234	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=8;MMLQ=15;MQ=59.85;NF=0;NR=3;PP=234;QD=89.6666666667;SC=CACTTACAGTTATACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=3;WE=20201930;WS=20201910;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,3:0.33:9
chr2	20201922	rs55977150	T	C	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=234;ReadPosRankSum=1.368;SC=CTTACAGTTATACACACACAC;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=5;WE=20201930;WS=20201910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr2	20205423	rs5829721	A	AAAAG	1146.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.052;HP=5;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.450;NF=12;NR=8;PP=812;ReadPosRankSum=-0.190;SC=TCCACCAAAAAAGAATAATAC;SOR=0.551;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=27;TCR=18;TR=20;WE=20205431;WS=20205413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,31:0.53:59
chr2	20205680	rs28401180	C	T	4868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=379;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=105;NR=98;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.144;SC=GAGCCGCCACCTCATTCACCT;SOR=0.695;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=350;TCF=185;TCR=165;TR=203;WE=20205688;WS=20205670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,221:0.58:379
chr2	20205848	rs28598872	G	A	4118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.887;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=86;PP=2654;ReadPosRankSum=1.583;SC=TTCGACCCACGGCCTGCTTCA;SOR=0.772;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=287;TCF=145;TCR=142;TR=173;WE=20205856;WS=20205838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,183:0.60:305
chr2	20233135	rs1191824	T	C	662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=16;PP=491;SC=TAAATAGGGTTATACAAAACC;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=20233143;WS=20233125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	20302490	.	G	GAGA,GAGAAGAAGAAGAAGAAGA	2249.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.763;ClippingRankSum=0.000;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.12;MQRankSum=-0.810;QD=45.91;ReadPosRankSum=-0.457;SOR=1.154;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:4,36,9:0.73,0.18:49
chr2	20302527	rs12612373	C	A	1675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.654;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.524;NF=40;NR=24;PP=889;ReadPosRankSum=-2.243;SC=AAGAAGAAGACGACGACAACG;SOR=0.585;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=124;TCF=75;TCR=49;TR=64;WE=20302535;WS=20302517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,64:0.49:130
chr2	20317815	.	G	A	163	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;FR=0.5026;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=28;MQ=57.25;NF=8;NR=1;PP=163;QD=21.9745791719;SC=GGAGGAGCCCGGAGGTGGAGG;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=9;WE=20317823;WS=20317805;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:3,9:0.75:12
chr2	20403794	rs10205485	A	T	4243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=84;NR=67;PP=2689;SC=CGTTGAGGCCAGATGAGTGGT;SOR=0.839;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=151;TCF=84;TCR=67;TR=151;WE=20403802;WS=20403784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr2	20403949	rs2230924	C	T	3510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.182;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=65;PP=2141;ReadPosRankSum=-0.916;SC=CAGCTGTAGCCTCCAGGCCGG;SOR=0.511;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=202;TCF=113;TCR=89;TR=141;WE=20403957;WS=20403939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,155:0.68:228
chr2	20405004	rs3732166	C	T	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=54;ReadPosRankSum=-0.431;SC=GCAGGGTGCACTCAGTACATG;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=20405012;WS=20404998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr2	20405050	rs6531225	A	C	817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=3;PP=624;SC=ACCACTGCCCACAGGCATGAC;SOR=3.690;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=27;WE=20405058;WS=20405040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	20423154	rs4666375	A	G	3301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=78;PP=2437;SC=AGCAGTGGAGAACCCGAGTGC;SOR=1.843;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=116;TCF=38;TCR=78;TR=116;WE=20423162;WS=20423144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr2	20699625	rs13010768	G	A	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=90;ReadPosRankSum=1.462;SC=GGCTGAGCAAGGTCCTTCACC;SOR=0.963;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=8;WE=20699633;WS=20699615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr2	20699667	rs342089	C	G	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.053;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=8;PP=236;ReadPosRankSum=-0.818;SC=CAGCAGTCACCCCACATCTAG;SOR=0.494;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=50;TCF=32;TCR=18;TR=22;WE=20699675;WS=20699657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,28:0.51:55
chr2	20700900	rs342088	A	G	3374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=49;PP=2049;SC=CTTCTTTGCTAGCCTTGGGCA;SOR=0.882;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=65;TCR=49;TR=114;WE=20700908;WS=20700890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr2	20798006	rs34750020	CT	C	1081.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.718;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=2.351;NF=13;NR=17;PP=929;ReadPosRankSum=0.600;SC=GCTTGTTTGCCTGCAACTAGA;SOR=0.558;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=92;TCF=41;TCR=51;TR=30;WE=20798014;WS=20797996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,39:0.27:145
chr2	20818454	rs3732152	T	A	2238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=39;PP=1254;ReadPosRankSum=2.014;SC=GGGGCTGGGCTTCTGGTTGGC;SOR=0.648;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=160;TCF=97;TCR=63;TR=97;WE=20818462;WS=20818444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,104:0.60:173
chr2	20818517	rs3732150	T	C	3082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.523;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=63;PP=1973;ReadPosRankSum=0.521;SC=ATAAGACACATTGGGCTCTGG;SOR=0.747;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=237;TCF=124;TCR=113;TR=137;WE=20818525;WS=20818507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,144:0.57:254
chr2	20818551	rs11680700	G	C	1867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.574;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=46;PP=1305;ReadPosRankSum=2.220;SC=AGCCGCTCCCGCAGCCCGCAG;SOR=0.616;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=234;TCF=123;TCR=111;TR=91;WE=20818559;WS=20818541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,97:0.39:247
chr2	20818764	rs3732149	C	T	2227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.909;HP=7;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=55;PP=1551;ReadPosRankSum=0.795;SC=AGGCTGGGGGCGGCCTGGGCT;SOR=0.794;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=303;TCF=153;TCR=150;TR=109;WE=20818772;WS=20818754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:215,114:0.35:329
chr2	20818840	rs34708707	C	T	3127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=393;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.767;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=80;PP=1989;ReadPosRankSum=-0.379;SC=TCTGCTCCTGCGGCTTCTGCT;SOR=0.749;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=365;TCF=184;TCR=181;TR=158;WE=20818848;WS=20818830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:226,166:0.42:392
chr2	20822218	rs4666444	T	C	1255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=30;PP=764;SC=CACCACAGAGTGGGGGGCCCA;SOR=1.708;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=15;TCR=30;TR=45;WE=20822226;WS=20822208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr2	20823612	rs13030108	A	G	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.15;ReadPosRankSum=0.815;SOR=0.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,28:0.74:38
chr2	20823724	rs6531248	T	C	2255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=40;NR=32;PP=1020;SC=CACAGGCGGCTGGCAGCAGGA;SOR=0.716;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=40;TCR=32;TR=72;WE=20823732;WS=20823714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr2	20823850	rs6733419	T	C	1182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.96;SOR=1.284;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr2	20823858	rs2305459	C	T	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.03;ReadPosRankSum=-0.742;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,22:0.76:29
chr2	20824498	rs2305458	C	T	3933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=82;NR=58;PP=2262;SC=TTACGGTCCACGGATGACACG;SOR=0.906;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=82;TCR=58;TR=140;WE=20824506;WS=20824488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
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chr2	20838222	rs3796065	C	T	2372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=357;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.402;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=56;PP=1542;ReadPosRankSum=-1.476;SC=GGTCCAGCGCCTCCTCCTCCT;SOR=0.665;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=331;TCF=163;TCR=168;TR=112;WE=20838230;WS=20838212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:233,123:0.35:356
chr2	20841059	rs4666449	C	T	957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=26;PP=756;SC=GGTACGCCCGCCTGCTGCCCC;SOR=3.912;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=29;WE=20841067;WS=20841049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	20845273	rs2304423	G	A	3367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=69;PP=2170;SC=CGCCTGCCAGGGGAAAAGAAG;SOR=1.285;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=45;TCR=69;TR=114;WE=20845281;WS=20845263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr2	20870579	rs13013489	G	A	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=13;PP=324;ReadPosRankSum=-1.263;SC=CACTGCGGCGGCTGGGCTTCG;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=40;TCR=36;TR=27;WE=20870587;WS=20870569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,30:0.37:82
chr2	20871190	rs4666457	A	C	3159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=75;PP=1917;SC=AGGTAGCGCGAGGGCCGGGGA;SOR=1.931;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=35;TCR=75;TR=110;WE=20871198;WS=20871180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr2	20884550	rs11693849	C	A	1042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=22;PP=733;ReadPosRankSum=-0.901;SC=TCACAAAGACCATCCATGTGG;SOR=0.688;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=194;TCF=118;TCR=76;TR=59;WE=20884558;WS=20884540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,61:0.31:200
chr2	20885321	rs17663874	C	A	3546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.612;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=64;PP=2420;ReadPosRankSum=-0.258;SC=AAGTTGGCAGCAAATCAGAGC;SOR=0.867;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=264;TCF=151;TCR=113;TR=154;WE=20885329;WS=20885311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,161:0.56:286
chr2	20939708	rs653347	C	T	1271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.377;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=17;PP=674;ReadPosRankSum=1.375;SC=AATAAACATACACATTTTAAA;SOR=0.547;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=151;TCF=109;TCR=42;TR=55;WE=20939716;WS=20939698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,65:0.38:170
chr2	21225281	rs1042034	C	T	2028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.367;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=38;PP=1288;ReadPosRankSum=0.651;SC=GATATAATCACTGAAGATTGT;SOR=0.575;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=132;TCF=68;TCR=64;TR=83;WE=21225289;WS=21225271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,89:0.63:141
chr2	21231524	rs676210	G	A	3640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=471;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=82;PP=2320;ReadPosRankSum=-0.575;SC=CTGGAATTCTGGTATGTGAAG;SOR=0.739;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=433;TCF=213;TCR=220;TR=165;WE=21231532;WS=21231514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:285,184:0.39:469
chr2	21232195	rs693	G	A	4594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=370;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.325;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=106;NR=87;PP=2962;ReadPosRankSum=0.285;SC=TATCTTCTAGGGTCTCTCGGA;SOR=0.798;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=346;TCF=183;TCR=163;TR=193;WE=21232203;WS=21232185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,203:0.55:370
chr2	21232803	rs584542	T	C	8763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.78;SOR=0.948;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr2	21232803	.	TG	CA,CG	1893	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=59.89;NF=55,89;NR=66,102;PP=1893,812;QD=16.0865113625;SC=TGCTCAAGAATGTCATTTATT;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=194;TCF=91;TCR=103;TR=121,191;WE=21232812;WS=21232793;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.62:194
chr2	21232804	rs1041968	G	A	3437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FS=1.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.35;ReadPosRankSum=-1.958;SOR=0.824;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,149:0.67:224
chr2	21235475	rs568413	T	C	3204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=61;PP=2140;SC=AGACCCATCATATGATAGTGT;SOR=1.282;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=41;TCR=61;TR=102;WE=21235483;WS=21235465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr2	21236482	rs488329	A	G	578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=15;PP=402;SC=GACCTTCACAACAATATTGTA;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=21236490;WS=21236472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	21237544	rs673548	G	A	692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.104;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=24;PP=537;ReadPosRankSum=0.246;SC=CAAAAATACCGATTTGACAAG;SOR=0.958;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=69;TCF=16;TCR=53;TR=30;WE=21237552;WS=21237534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,30:0.43:70
chr2	21250914	rs679899	G	A	4629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=95;PP=2827;SC=TTCTTTCAGAGCTTCTTTCAC;SOR=1.409;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=151;TCF=56;TCR=95;TR=151;WE=21250922;WS=21250904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr2	21252365	rs67556837	GAGGA	G	828.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=63.35;QD=39.46;SOR=6.184;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	21255573	rs10701091	C	CCATCT	1516.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=25;PP=1721;SC=TCAAATCTAACTTCAAAACCC;SOR=4.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=25;WE=21255581;WS=21255563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	21266751	.	CCAG	C	88.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.123;ClippingRankSum=0.000;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=1.816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.85;ReadPosRankSum=0.608;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,6:0.12:48
chr2	21360583	rs312966	A	G	4223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=66;PP=2660;SC=AGGAAGAGTCATGGAAAAGAA;SOR=0.772;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=142;TCF=76;TCR=66;TR=142;WE=21360591;WS=21360573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr2	23860176	rs7422570	G	A	1387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=39;PP=908;ReadPosRankSum=0.999;SC=CAGGGCACTCGTTAAAAGCTG;SOR=0.695;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=231;TCF=118;TCR=113;TR=75;WE=23860184;WS=23860166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,79:0.31:251
chr2	23862187	rs540290	C	G	3501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=85;PP=2217;ReadPosRankSum=0.518;SC=CGACTGAGCCCAGGGCTTGGC;SOR=0.718;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=247;TCF=107;TCR=140;TR=149;WE=23862195;WS=23862177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,159:0.60:266
chr2	23865260	rs642931	T	C	7291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=131;NR=128;PP=2965;SC=CCACCCTGATTGCACACTCCT;SOR=0.730;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=259;TCF=131;TCR=128;TR=259;WE=23865268;WS=23865250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,275:1.00:275
chr2	23865908	rs527176	G	C	3278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.494;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=63;PP=1996;ReadPosRankSum=1.654;SC=GAGGGGGAAGGTGTGGAGGGC;SOR=0.652;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=212;TCF=112;TCR=100;TR=135;WE=23865916;WS=23865898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,148:0.64:233
chr2	23914776	rs78748802	G	A	2294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.711;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=60;PP=1561;ReadPosRankSum=0.222;SC=ATGTCGCTTGGGGGGAAGAGT;SOR=0.937;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=166;TCF=66;TCR=100;TR=95;WE=23914784;WS=23914766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,102:0.57:179
chr2	23919169	rs72796125	C	T	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.962;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=328;ReadPosRankSum=0.548;SC=CTCCTCACCCCGCCCGCTCTC;SOR=0.824;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=83;TCF=59;TCR=24;TR=25;WE=23919177;WS=23919159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,26:0.31:85
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chr2	24042550	rs2879639	C	T	1209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=29;NR=12;PP=707;SC=AAAAATATACCATAATTCTAA;SOR=1.508;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=29;TCR=12;TR=41;WE=24042558;WS=24042540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr2	24046426	rs75866363	G	A	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.078;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=20;PP=486;ReadPosRankSum=0.298;SC=CCTTGATATCGGCTCCACAGT;SOR=1.402;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=40;TCF=10;TCR=30;TR=25;WE=24046434;WS=24046416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,26:0.60:43
chr2	24055058	rs10432637	G	C	12553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=461;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=201;NR=213;PP=2965;SC=ACACCCCACTGTCTTTAGTTT;SOR=0.742;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=414;TCF=201;TCR=213;TR=414;WE=24055066;WS=24055048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,459:1.00:459
chr2	24087621	rs72788214	A	C	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=108;ReadPosRankSum=0.888;SC=AATTTACTCAAATAACATTTG;SOR=0.090;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=8;WE=24087629;WS=24087611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr2	24087857	rs12623316	A	G	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.68;ReadPosRankSum=1.001;SOR=0.552;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,24:0.44:54
chr2	24108557	rs72790304	G	A	755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.731;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=9;PP=447;ReadPosRankSum=-1.084;SC=CAATTAAAATGAAAAATATTT;SOR=0.990;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=106;TCF=74;TCR=32;TR=35;WE=24108565;WS=24108547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,40:0.35:114
chr2	24108652	rs7579201	T	C	7145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=132;NR=110;PP=2965;SC=TCGACGATTCTGTCGGATGTT;SOR=0.777;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=242;TCF=132;TCR=110;TR=242;WE=24108660;WS=24108642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,271:1.00:271
chr2	24111311	rs72790306	T	G	1240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.288;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=35;PP=791;ReadPosRankSum=2.338;SC=CATCAACATTTGCTTATATAA;SOR=0.949;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=120;TCF=52;TCR=68;TR=57;WE=24111319;WS=24111301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,60:0.47:128
chr2	24149439	rs61739076	G	A	1402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.104;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=25;PP=789;ReadPosRankSum=0.434;SC=GCCTCATCCAGAGTGACGCCG;SOR=0.358;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=141;TCF=94;TCR=47;TR=65;WE=24149447;WS=24149429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,72:0.45:160
chr2	24181159	rs12616678	G	T	719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.925;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=8;PP=460;ReadPosRankSum=-0.806;SC=TACTTTCTTTGTACTTTTACA;SOR=0.846;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=63;TCF=45;TCR=18;TR=31;WE=24181167;WS=24181149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,34:0.47:73
chr2	24239189	rs113601626	T	TCCTGGC	3432.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.477;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.942;NF=11;NR=36;PP=2657;ReadPosRankSum=2.973;SC=AGGCACCTGGTCCTGGCCCTG;SOR=0.633;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=131;TCF=21;TCR=110;TR=47;WE=24239197;WS=24239179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,93:0.37:251
chr2	24245659	rs17712391	C	T	1196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=19;PP=771;ReadPosRankSum=0.856;SC=GCTGGCAGCACGGCCCTGGCG;SOR=0.695;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=142;TCF=96;TCR=46;TR=57;WE=24245667;WS=24245649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,63:0.40:157
chr2	24246175	rs12989842	C	T	1056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.388;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=35;PP=693;ReadPosRankSum=3.536;SC=GTAAACCTGCCGTCCCAGGCC;SOR=1.047;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=128;TCF=44;TCR=84;TR=49;WE=24246183;WS=24246165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,54:0.39:140
chr2	24246679	rs925228	A	G	774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.666;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=25;PP=523;ReadPosRankSum=0.527;SC=TACCAAGCTCAGGGCATCCAT;SOR=1.169;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=83;TCF=18;TCR=65;TR=30;WE=24246687;WS=24246669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,34:0.37:93
chr2	24255862	rs10179142	C	G	3404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;SC=CAGAAGTAATCGAGTTAACAT;SOR=2.002;Source=Platypus;TCF=29;WE=24255870;WS=24255852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr2	24255991	rs17763442	C	T	914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.354;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=15;PP=565;ReadPosRankSum=-0.326;SC=CTAAAAAATCCGAACAAAACA;SOR=1.236;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=154;TCF=91;TCR=63;TR=47;WE=24255999;WS=24255981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,52:0.31:169
chr2	24272645	rs116520786	C	T	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.323;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=178;ReadPosRankSum=-1.865;SC=GGAGCGACGGCGGGGCTGGGG;SOR=1.417;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=13;WE=24272653;WS=24272635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr2	24276736	rs11125393	T	C	2878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.488;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=59;PP=1747;ReadPosRankSum=2.468;SC=TTTTCCAATATCCTACTCCTT;SOR=0.633;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=206;TCF=107;TCR=99;TR=119;WE=24276752;WS=24276726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,136:0.59:231
chr2	24290671	rs61742149	G	A	1746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=38;PP=1085;ReadPosRankSum=2.041;SC=ATTTCTCCTTGAGAAGCTTCA;SOR=0.672;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=127;TCF=62;TCR=65;TR=73;WE=24290679;WS=24290661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,82:0.58:141
chr2	24291445	rs72783611	C	T	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.549;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=118;ReadPosRankSum=0.700;SC=AATTGAAATACGTTTTTAGTT;SOR=0.301;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=43;TCF=10;TCR=33;TR=13;WE=24291453;WS=24291435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,14:0.31:45
chr2	24302246	rs2303287	C	T	863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=9;PP=591;ReadPosRankSum=0.981;SC=CTTCCTTTCTCGGGGTAATGT;SOR=0.793;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=87;TCF=66;TCR=21;TR=38;WE=24302254;WS=24302236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,40:0.42:95
chr2	24342505	rs1056122	T	C	1531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.501;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=35;PP=1072;ReadPosRankSum=0.700;SC=TGTAAGTTGCTACCAGAAGAT;SOR=0.640;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=214;TCF=118;TCR=96;TR=75;WE=24342513;WS=24342495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,84:0.36:232
chr2	24344060	rs33913065	T	G	3473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=440;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.528;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=91;PP=2313;ReadPosRankSum=-1.850;SC=AATATTCATCTGCCCGGACAC;SOR=0.760;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=401;TCF=190;TCR=211;TR=169;WE=24344068;WS=24344050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:257,182:0.41:439
chr2	24369674	rs11693860	C	T	8993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=148;NR=159;PP=2965;SC=ACAAGGATAACGAAAAAAGAA;SOR=0.804;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=307;TCF=148;TCR=159;TR=307;WE=24369682;WS=24369664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,340:1.00:340
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chr2	24387178	rs113322110	G	GC	2786.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=44;PP=2223;SC=TTGAGCCTCAGCAGGAACGGG;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=51;TCF=4;TCR=47;TR=48;WE=24387186;WS=24387168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr2	24388096	rs4665668	G	A	377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=4;PP=264;SC=AGCTGGCACCGATGTCTCCAG;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=15;WE=24388104;WS=24388086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	24390517	rs2288072	G	A	3468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.994;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=80;PP=2143;ReadPosRankSum=-0.044;SC=CGCGTTTGGGGCTGCTGAAGC;SOR=0.610;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=238;TCF=111;TCR=127;TR=152;WE=24390525;WS=24390493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,160:0.63:255
chr2	24395269	rs918802	T	C	840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=1;PP=684;SC=AGCCTTTCCTTCGTTCAAGTA;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=24;WE=24395277;WS=24395259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	24395294	rs918803	T	C	1869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=15;PP=1247;SC=TAGAAATTTCTTAAGTTTTCT;SOR=2.231;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=47;TCR=15;TR=62;WE=24395302;WS=24395284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr2	24395506	rs889830	T	C	1838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=52;PP=1274;SC=CGGACTCAAGTGATCCTCCCA;SOR=2.269;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=17;TCR=52;TR=69;WE=24395514;WS=24395496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr2	24398281	rs2042467	T	G	1987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=17;PP=1248;SC=CCCAAAGGCCTGGCTCTCAAC;SOR=2.062;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=48;TCR=17;TR=65;WE=24398289;WS=24398271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr2	24398446	rs2042468	A	T	1706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=42;PP=1096;ReadPosRankSum=-0.618;SC=AATGGAGGTGAGATAACGTGG;SOR=0.745;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=141;TCF=67;TCR=74;TR=79;WE=24398454;WS=24398436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,81:0.54:151
chr2	24400744	rs115212978	G	A	2311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.701;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=51;PP=1551;ReadPosRankSum=-1.433;SC=GTGAAGGTAAGAGTTGGCTCC;SOR=0.893;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=309;TCF=169;TCR=140;TR=120;WE=24400752;WS=24400734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:206,123:0.37:329
chr2	24400769	rs55661701	A	C	2635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.279;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=62;PP=1701;ReadPosRankSum=-0.238;SC=TGCATTCTACATATGTTCTAG;SOR=0.725;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=332;TCF=172;TCR=160;TR=132;WE=24400777;WS=24400759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:215,140:0.39:355
chr2	24402127	rs61193015	C	CAA	4014.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=45;PP=2288;SC=TAAAATGAAACGAGAATGTTG;SOR=1.154;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=6;TCR=46;TR=51;WE=24402135;WS=24402117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr2	24413298	rs2288073	A	G	2049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=42;PP=1154;ReadPosRankSum=2.726;SC=AAGCTCATCTATGCAGACAAG;SOR=0.701;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=236;TCF=133;TCR=103;TR=97;WE=24413306;WS=24413288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,105:0.42:253
chr2	24429234	rs138070209	CCCGGCGGGAAGGAAGGTGGAGATGCAGGGGG	C	922.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.520;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=4.961;NF=0;NR=13;PP=2505;ReadPosRankSum=0.036;SC=CATGGGGGGGCCCGGCGGGAA;SOR=0.381;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=13;WE=24429272;WS=24429224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,31:0.57:54
chr2	24431184	rs2303291	C	T	1390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.564;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=26;PP=847;ReadPosRankSum=1.420;SC=TGCACCCAGGCGGTCCTACGG;SOR=0.764;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=165;TCF=96;TCR=69;TR=63;WE=24431192;WS=24431174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,71:0.39:180
chr2	24432138	rs2303292	C	T	2218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.598;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=55;PP=1431;ReadPosRankSum=1.295;SC=GGCTAGAACACTCCACCCGCC;SOR=0.494;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=277;TCF=133;TCR=144;TR=113;WE=24432146;WS=24432128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,119:0.40:301
chr2	24432211	rs2303293	C	T	3236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=81;PP=2307;SC=AGGGGTCTAGCGTCTAAGGTC;SOR=1.940;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=32;TCR=81;TR=113;WE=24432219;WS=24432201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr2	24432620	rs2303294	A	G	936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.245;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=8;PP=630;ReadPosRankSum=0.126;SC=GTCTGCCAGGAAGGCCTTAAG;SOR=0.484;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=55;TCF=45;TCR=10;TR=35;WE=24432628;WS=24432610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,38:0.63:60
chr2	24432667	rs2303295	C	G	4882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=116;NR=52;PP=2965;SC=TGATGCTACCCCCAGACGCGT;SOR=1.533;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=168;TCF=116;TCR=52;TR=168;WE=24432675;WS=24432657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr2	24432839	rs2303296	A	G	1780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.194;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=53;PP=1158;ReadPosRankSum=-0.097;SC=GTCTTGTATAATTTCCCACTG;SOR=0.574;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=188;TCF=64;TCR=124;TR=82;WE=24432847;WS=24432829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,86:0.43:199
chr2	24432937	rs2303297	C	T	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=63;ReadPosRankSum=1.216;SC=TTTTAAATCCCGGCACAAACC;SOR=0.340;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=5;WE=24432945;WS=24432927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr2	24440997	rs2551183	A	T	1691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=44;PP=1220;ReadPosRankSum=1.319;SC=AATAATGTCAACATAAACTGA;SOR=1.609;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=55;TCF=10;TCR=45;TR=54;WE=24441005;WS=24440987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,58:0.98:59
chr2	24475205	rs4450560	T	C	6165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=128;NR=70;PP=2965;SC=GATTTTAATATCAAAATACCT;SOR=1.436;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=198;TCF=128;TCR=70;TR=198;WE=24475213;WS=24475195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr2	24484150	rs4665680	T	C	1384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=35;PP=1017;SC=TATAAGTATATTTATTTGTTT;SOR=2.935;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=8;TCR=35;TR=43;WE=24484158;WS=24484140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr2	24498839	rs4411652	T	G	106.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.51;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr2	24509370	rs17733015	T	C	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=6.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.04;ReadPosRankSum=-3.016;SOR=0.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
chr2	24521493	rs7559133	C	T	3588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=32;PP=2167;SC=CAGGTAGCTCCATCATCATTC;SOR=1.537;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=81;TCR=32;TR=113;WE=24521501;WS=24521483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr2	24521766	rs6707600	C	T	929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=28;PP=754;SC=CAATAAAAGTCAGGCAGAGTT;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=29;WE=24521774;WS=24521756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	24524725	rs72793213	A	G	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.481;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=364;ReadPosRankSum=-1.507;SC=CTTTTCAAGTATAACTTGTTG;SOR=1.075;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=21;WE=24524733;WS=24524715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,24:0.62:39
chr2	24524958	rs7603997	C	T	1642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.982;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.271;NF=34;NR=49;PP=995;ReadPosRankSum=0.598;SC=TCACCATCAACGTCAGCCAGA;SOR=0.910;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=223;TCF=100;TCR=123;TR=83;WE=24524966;WS=24524948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,91:0.38:240
chr2	24550867	.	CAA	C,CA	2261.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.908;ClippingRankSum=0.000;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=2.015;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.16;ReadPosRankSum=1.040;SOR=0.490;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:20,46,74:0.33,0.53:140
chr2	24888854	rs142101398	TTTA	T	226.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.235;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.385;NF=0;NR=6;PP=213;ReadPosRankSum=1.213;SC=GTGATTTTACTTTATTATTAT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=6;WE=24888864;WS=24888844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr2	24896389	rs4665712	T	G	753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.812;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=28;PP=560;ReadPosRankSum=-0.407;SC=GCCAGTTTGGTTTTTTCTTTT;SOR=0.959;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=94;TCF=30;TCR=64;TR=38;WE=24896397;WS=24896379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,39:0.40:98
chr2	24905927	rs11125744	G	C	8576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=145;NR=141;PP=2965;SC=TAATGAATACGAGCGTCTACA;SOR=0.712;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=286;TCF=145;TCR=141;TR=286;WE=24905935;WS=24905917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,323:1.00:323
chr2	24933689	rs7593430	A	C	648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=1;PP=507;SC=TTTCTTCATTATCTCAAAGTC;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=24933697;WS=24933679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	24952740	rs11439247	C	CT	921.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=31;PP=1498;SC=CGAAGTCTCACCTGTCACCAG;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=34;WE=24952748;WS=24952730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	24974945	rs11125763	T	G	4071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=55;NR=44;PP=2084;SC=AGAGTTCTCTTCTCCAGCAAA;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=55;TCR=44;TR=99;WE=24974966;WS=24974935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr2	24974958	rs1804645	C	T	1522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.728;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=29;PP=906;ReadPosRankSum=1.086;SC=CCAGCAAACTCCACCTGCCTC;SOR=0.614;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=98;TCF=51;TCR=47;TR=62;WE=24974966;WS=24974935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,68:0.62:109
chr2	25022442	rs34475213	TA	T	261.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.70;ReadPosRankSum=-1.243;SOR=0.916;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
chr2	25022598	rs1550116	A	G	1384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.520;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=32;PP=861;ReadPosRankSum=0.482;SC=TCCCGTAAACAGTCTGAAGAG;SOR=0.540;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=105;TCF=57;TCR=48;TR=65;WE=25022606;WS=25022588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,68:0.60:114
chr2	25037042	rs1003064	G	A	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=89;ReadPosRankSum=1.935;SC=GACCTGTACAGTCTCCACTTC;SOR=0.963;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=6;WE=25037050;WS=25037041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr2	25039804	rs2099505	G	A	325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=12;PP=320;SC=TTTATATACTGTACATTACTC;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=25039812;WS=25039794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	25040423	rs10178420	G	A	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.913;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=370;ReadPosRankSum=0.412;SC=GAGATTGAATGTCAGTGATCC;SOR=0.847;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=67;TCF=48;TCR=19;TR=30;WE=25040431;WS=25040413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,32:0.43:74
chr2	25046090	rs1127568	T	C	2670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=29;PP=1610;SC=AGTCAAAATCTGAGATGATTT;SOR=1.562;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=65;TCR=29;TR=94;WE=25046098;WS=25046080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr2	25046355	rs4665273	T	C	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.48;ReadPosRankSum=-1.171;SOR=0.169;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr2	25047408	rs7604576	A	G	2048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.074;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=53;PP=1280;ReadPosRankSum=-1.120;SC=TTTTCTACCTACAGACACAGA;SOR=0.835;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=251;TCF=120;TCR=131;TR=97;WE=25047416;WS=25047398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,107:0.39:274
chr2	25048847	rs2289090	A	G	2608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=23;PP=1745;SC=CTTAGGTCCCAGGGCTGCTTC;SOR=2.208;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=88;TCF=65;TCR=23;TR=87;WE=25048855;WS=25048837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr2	25050977	rs7566416	T	C	3432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=69;PP=2367;SC=TGCCCTCCGTTTCCATCCCTG;SOR=1.188;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=50;TCR=70;TR=118;WE=25050985;WS=25050967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr2	25053828	rs1056074	T	C	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=261;ReadPosRankSum=-0.703;SC=GGGAGTCACCTGACAGCTGAC;SOR=0.582;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=16;WE=25053836;WS=25053818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
chr2	25057420	.	G	A	1157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.540;ClippingRankSum=0.000;DP=172;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.73;ReadPosRankSum=-0.784;SOR=0.645;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:108,64:0.37:172
chr2	25061810	.	ATTTT	A	53.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=11.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.58;ReadPosRankSum=1.738;SOR=2.792;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,3:0.20:15
chr2	25064079	rs2241757	G	A	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.933;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=48;ReadPosRankSum=0.826;SC=TGGGTCCAGGGCCGGGGCCCT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=5;WE=25064087;WS=25064069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr2	25064193	rs2241759	G	A	2324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=27;PP=1487;SC=CCCGGTAGTCGGGCAAGCCGC;SOR=1.275;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=49;TCR=27;TR=76;WE=25064201;WS=25064183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr2	25100738	rs10865315	C	A	1349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=20;PP=794;ReadPosRankSum=0.292;SC=AGGGCAACAGCTGTACCTGGG;SOR=0.680;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=115;TCF=75;TCR=40;TR=59;WE=25100746;WS=25100728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,67:0.51:132
chr2	25100902	rs2033656	C	G	1145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.697;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=31;PP=714;ReadPosRankSum=0.750;SC=TGACAGAGGTCCACAGCCCCT;SOR=0.892;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=87;TCF=31;TCR=56;TR=47;WE=25100910;WS=25100892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,52:0.53:98
chr2	25141538	rs11676272	A	G	9112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=676;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=200;NR=183;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.263;SC=ACGGCGAGGGAAGCCAGCTTG;SOR=0.716;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=629;TCF=330;TCR=299;TR=383;WE=25141546;WS=25141528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:266,409:0.61:675
chr2	25141768	.	C	T	1054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.449;ClippingRankSum=0.000;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.218;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=24;PP=675;ReadPosRankSum=-0.956;SC=GCCCACCCCGCGGTCAGGGTC;SOR=0.917;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=122;TCF=62;TCR=60;TR=45;WE=25141776;WS=25141758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,50:0.37:134
chr2	25194741	rs7593864	G	A	1843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.349;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=49;PP=1166;ReadPosRankSum=-0.022;SC=GAGACCTGCCGGGCTCCTTCC;SOR=0.521;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=264;TCF=119;TCR=145;TR=95;WE=25194749;WS=25194731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:193,104:0.35:297
chr2	25314186	rs2918630	T	C	1293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.603;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=35;PP=874;ReadPosRankSum=-1.836;SC=TTCCCATTCTTATTCCAGGTG;SOR=0.797;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=138;TCF=64;TCR=74;TR=60;WE=25314194;WS=25314176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,65:0.41:158
chr2	25344464	rs2276597	G	A	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.938;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=176;ReadPosRankSum=0.847;SC=GACCATGGCAGGGGGTCTGGG;SOR=1.151;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=9;WE=25344472;WS=25344454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,10:0.33:30
chr2	25362194	rs6718083	G	A	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=303;ReadPosRankSum=0.561;SC=ACCACTAATGGTGAGAAGTTA;SOR=0.551;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=17;TCR=33;TR=23;WE=25362202;WS=25362184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,25:0.47:53
chr2	25368005	rs10188516	G	A	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=230;ReadPosRankSum=-1.173;SC=CTGCATAGTGGGCTTAAGGCT;SOR=0.404;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=14;WE=25368013;WS=25367995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr2	25368030	rs10180231	T	C	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=72;ReadPosRankSum=0.312;SC=GGAAAGCAAGTTTCTCGAGTA;SOR=0.307;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=5;WE=25368038;WS=25368020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr2	25377176	rs2164808	T	C	2424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=62;PP=1252;ReadPosRankSum=0.760;SC=TCCCCGTCTATGAAATGAAGT;SOR=0.690;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=271;TCF=127;TCR=144;TR=119;WE=25377184;WS=25377160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,127:0.43:293
chr2	25377329	rs2118404	C	T	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.798;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=117;ReadPosRankSum=0.420;SC=TAGATGGCAGCGCCTCCCAGG;SOR=0.976;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=8;WE=25377337;WS=25377319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr2	25458546	rs2304429	C	T	1527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.816;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=24;PP=989;ReadPosRankSum=-0.321;SC=ACAGCCACACCGCAGCCAGAT;SOR=0.928;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=146;TCF=84;TCR=62;TR=64;WE=25458554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,71:0.45:157
chr2	25463126	.	T	C	1058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=0.000;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=19;PP=653;ReadPosRankSum=-1.977;SC=CAGTCCAAGGTAGAAGCCATT;SOR=0.688;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=157;TCF=97;TCR=60;TR=53;WE=25463134;WS=25463116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,60:0.33:180
chr2	25466888	rs2289093	G	T	1309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.923;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=27;PP=784;ReadPosRankSum=0.923;SC=TGCAGGCCCAGCGGTGTCCCA;SOR=0.561;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=75;TCF=37;TCR=38;TR=52;WE=25466896;WS=25466878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,59:0.72:82
chr2	25469913	rs2276599	C	T	2332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=24;PP=1399;ReadPosRankSum=0.350;SC=CCAGCAGGGACACTCACCTGC;SOR=0.714;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=149;TCF=111;TCR=38;TR=91;WE=25469921;WS=25469903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,103:0.61:170
chr2	25472784	rs11681447	C	T	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=360;ReadPosRankSum=-1.486;SC=GCTGCGAATGCAAACCCATCC;SOR=1.609;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=19;WE=25472792;WS=25472774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,19:0.76:25
chr2	25551692	rs12995245	C	T	288.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.55;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=1;NR=4;PP=76;SC=TGTGGGTCTGCAGGCTCACCT;SOR=3.056;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=25551700;WS=25551682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	25602142	rs2304426	G	A	6897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=147;NR=78;PP=2965;SC=GGGAGGCAGAGGACTCTTTGT;SOR=1.524;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=225;TCF=147;TCR=78;TR=225;WE=25602150;WS=25602132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr2	25602310	rs2304427	C	T	7198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=146;PP=2965;SC=TTGCTTCTCCCGTTACTCGTT;SOR=1.375;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=231;TCF=85;TCR=146;TR=231;WE=25602318;WS=25602296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,259:1.00:259
chr2	25610287	rs66917623	G	T	1913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=35;NR=35;PP=1163;SC=CAGGGTGGGTGAGCGTGGAGA;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=35;TCR=35;TR=70;WE=25610295;WS=25610277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr2	25650631	rs34648410	A	G	3806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=89;PP=2604;SC=TTAGCATCCAATACCTCATAA;SOR=2.494;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=117;TCF=28;TCR=89;TR=117;WE=25650639;WS=25650621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr2	25650668	rs3832082	C	CT	1752.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=41;PP=1725;SC=GTTTTGCCTACTTCCTGGACT;SOR=3.486;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=0;TCR=48;TR=41;WE=25650676;WS=25650658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr2	25655772	rs7583475	T	C	2076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=39;PP=1169;ReadPosRankSum=-0.721;SC=GCCGCAGCTCTGCCAGCAGCG;SOR=0.724;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=73;TCR=61;TR=84;WE=25655780;WS=25655762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,93:0.61:152
chr2	25656880	rs1395949	C	G	3712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.78;SOR=1.027;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr2	25656889	rs11451153	G	GT	55.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=1.259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.78;ReadPosRankSum=-0.814;SOR=0.448;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,12:0.17:71
chr2	26082057	rs13422450	T	C	185.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=2;PP=86;SC=TTGATTCTCCTAACCTAGCCT;SOR=1.179;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=26082065;WS=26082047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	26161226	rs11388254	C	CA	629.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=2.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.46;MQRankSum=1.075;QD=10.32;ReadPosRankSum=-0.190;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,37:0.61:61
chr2	26203678	rs1465878	T	C	9182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=176;NR=137;PP=2965;SC=CTCGTTCACCTGGGGCTTGTT;SOR=0.930;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=313;TCF=176;TCR=137;TR=313;WE=26203686;WS=26203668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,345:1.00:345
chr2	26321526	rs11678157	T	C	1670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=37;NR=19;PP=888;SC=TTTTCTGCATTGTAGGAATAG;SOR=1.092;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=37;TCR=19;TR=56;WE=26321534;WS=26321516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr2	26350136	rs2289022	G	T	2704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=51;PP=1493;SC=ACTCTGCTCTGTCTTTGTAAA;SOR=1.473;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=29;TCR=51;TR=80;WE=26350144;WS=26350126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr2	26357748	rs2243834	G	T	4717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=109;NR=50;PP=2965;SC=CTGTTGAATCGTGATTTTATC;SOR=1.638;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=160;TCF=110;TCR=50;TR=159;WE=26357756;WS=26357738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr2	26399214	rs4665830	G	A	8732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=145;NR=149;PP=2965;SC=CCTTCCCAGGGGAGTACGCCG;SOR=0.775;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=294;TCF=145;TCR=149;TR=294;WE=26399222;WS=26399204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,329:1.00:329
chr2	26405985	rs10779956	A	G	2177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=35;NR=40;PP=1214;SC=CTCCCTCACCAGGTGTGGTGT;SOR=0.961;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=35;TCR=40;TR=75;WE=26405993;WS=26405975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr2	26408064	rs4665833	T	C	789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=17;PP=480;SC=CAGGGCTCGATCTCATCTCCT;SOR=1.329;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=11;TCR=17;TR=28;WE=26408072;WS=26408054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	26415429	rs5001914	A	G	753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=22;PP=599;SC=GCCGAGGCGGAGGATCATTTG;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=24;WE=26415437;WS=26415419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	26416301	rs7582341	A	G	2699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=19;PP=2029;SC=CCTGACTCATAAAATCATTTT;SOR=2.468;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=67;TCR=19;TR=86;WE=26416309;WS=26416291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr2	26417533	rs1865324	C	A	633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=19;PP=497;SC=ACATGAGCTCCCTGGCCCTGC;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=22;WE=26417541;WS=26417523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	26420708	rs13387855	T	G	4159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=74;PP=2359;SC=AGAGGCCACATCAAAGCTAAT;SOR=1.127;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=59;TCR=74;TR=133;WE=26420716;WS=26420698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr2	26420809	rs2289019	G	C	622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=17;PP=482;SC=CACCTAGGGGGTTTTGTGTCG;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=26420817;WS=26420799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	26454996	rs7593175	A	G	982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=8;PP=563;SC=TAAAGAGGGCATATAGCTTCA;SOR=2.133;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=34;WE=26455004;WS=26454986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr2	26477125	rs147970487	G	GACT	1151.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=5;PP=855;SC=ATTCCAGAATGACTATCTTGA;SOR=2.494;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=19;WE=26477133;WS=26477115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	26512957	rs1056471	G	C	987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=24;PP=700;SC=CTATTAAATAGTTTGCACTTA;SOR=3.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=28;WE=26512965;WS=26512947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	26532491	rs2007556	G	T	2954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=54;NR=51;PP=1624;SC=GCAGTTATTAGTATTGTCAAC;SOR=0.802;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=54;TCR=51;TR=105;WE=26532499;WS=26532481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr2	26532735	rs3856397	G	A	2451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=26;PP=1558;SC=TGACTGCTCTGACCAGGCTGC;SOR=1.770;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=59;TCR=26;TR=85;WE=26532743;WS=26532725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr2	26533023	rs3851967	C	T	9378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=352;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=172;NR=142;PP=2965;SC=CCCCGGCCTGCGGGCTGCAAG;SOR=0.788;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=315;TCF=172;TCR=143;TR=314;WE=26533031;WS=26533013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,352:1.00:352
chr2	26534801	rs7568529	G	A	3156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=51;NR=48;PP=1780;SC=GCGAAGGGGTGGTCCTGTGGG;SOR=0.800;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=51;TCR=48;TR=99;WE=26534809;WS=26534791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr2	26536694	rs2052937	C	T	5353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=116;NR=71;PP=2965;SC=AGGTCACAAGCGTACGTGGTG;SOR=1.249;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=187;TCF=116;TCR=71;TR=187;WE=26536702;WS=26536684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr2	26537499	rs10187359	A	C	7373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=152;PP=2965;SC=CACCTGCAGAAACGTGTGTGC;SOR=1.289;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=251;TCF=99;TCR=152;TR=251;WE=26537507;WS=26537489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,268:1.00:268
chr2	26606347	rs13030294	T	A	1189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=28;PP=732;SC=TTTTAAATCTTTAATGGGGTA;SOR=1.828;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=40;WE=26606355;WS=26606337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr2	26607992	rs934280	T	C	4775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=63;NR=92;PP=2892;SC=TTGGAACAGCTTTTGCCAACA;SOR=1.225;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=156;TCF=64;TCR=92;TR=155;WE=26608000;WS=26607982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr2	26625042	rs13003230	C	A	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.654;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=300;ReadPosRankSum=-0.509;SC=GGGCGGGATCCGCGCCGCAGG;SOR=0.322;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=49;TCF=17;TCR=32;TR=22;WE=26625050;WS=26625032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,21:0.45:47
chr2	26647277	rs7423300	T	G	2959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=66;PP=1960;SC=TGCACTGTGCTGGACTCTTAG;SOR=1.546;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=103;TCF=37;TCR=66;TR=103;WE=26647285;WS=26647267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr2	26652671	rs4356622	A	G	2136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=47;PP=1370;SC=CTGCTCTTGGAGGGCCCCTGG;SOR=1.734;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=25;TCR=47;TR=72;WE=26652679;WS=26652661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr2	26653457	rs4450561	G	A	9675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=360;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=194;NR=137;PP=2965;SC=TTGGAGTATCGTCTTCATAAT;SOR=0.995;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=332;TCF=194;TCR=138;TR=331;WE=26653465;WS=26653447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,360:1.00:360
chr2	26663187	rs138497746	T	TTG,TTGTG	1160.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.54;MQRankSum=0.408;QD=33.16;ReadPosRankSum=-0.442;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:3,10,22:0.29,0.63:35
chr2	26663215	rs56218945	A	G	1143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.509;NF=59;NR=19;PP=1396;ReadPosRankSum=2.342;SC=GTGTGTGTGTATATATATATA;SOR=0.826;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=82;TCF=63;TCR=19;TR=78;WE=26663223;WS=26663205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,42:0.95:44
chr2	26667615	rs939820	T	C	4255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=60;PP=2188;SC=TGAGAAGTTTTGGGAGATTTG;SOR=0.927;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=143;TCF=83;TCR=60;TR=143;WE=26667623;WS=26667605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr2	26671544	rs4072407	A	G	4488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=83;NR=72;PP=2458;SC=TCTCCTCCCCATGACCCAACT;SOR=0.705;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=155;TCF=83;TCR=72;TR=155;WE=26671552;WS=26671534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr2	26676322	rs1402962	A	G	6872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.06;SOR=0.709;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr2	26677810	rs2280516	A	G	643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=18;NR=5;PP=510;SC=CATGTGGGGCAGTTGGCTCTT;SOR=2.400;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=23;WE=26677818;WS=26677800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
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chr2	26726752	rs884390	G	A	3409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=429;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.529;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=78;PP=2179;ReadPosRankSum=-0.099;SC=CAGGGAGAGGGACGCATGGAG;SOR=0.629;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=395;TCF=200;TCR=195;TR=163;WE=26726760;WS=26726742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:254,175:0.41:429
chr2	26733500	rs939817	C	T	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.457;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=298;ReadPosRankSum=1.684;SC=ATCCCGCCCTCCACAGCCTGT;SOR=1.697;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=46;TCF=39;TCR=7;TR=18;WE=26733508;WS=26733490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,20:0.40:50
chr2	26739247	rs7575020	T	A	1278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.551;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=20;PP=788;ReadPosRankSum=-0.233;SC=TCCCCGTGTCTTGGGAGCAGT;SOR=0.541;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=70;TCR=35;TR=59;WE=26739255;WS=26739237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,62:0.54:114
chr2	26739423	rs11687696	T	C	1288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.567;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=28;PP=589;ReadPosRankSum=-0.915;SC=AGGAGCCCACTGTGCCGTCAG;SOR=0.621;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=155;TCF=77;TCR=78;TR=59;WE=26739431;WS=26739413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,70:0.40:176
chr2	26741961	rs13031859	G	A	4295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.864;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=105;PP=2697;ReadPosRankSum=0.563;SC=AGCACCATGCGGAAGGTCCCG;SOR=0.992;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=305;TCF=136;TCR=169;TR=178;WE=26741969;WS=26741951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,196:0.59:333
chr2	26750557	rs10865425	T	C	962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=4;PP=738;SC=CAGCCCAAGATTTCTTCGGTC;SOR=3.545;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=30;WE=26750565;WS=26750547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr2	26750645	rs1879760	G	A	2086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=38;PP=1396;ReadPosRankSum=0.194;SC=CCAAGGAGAAGAGCAGGCTCC;SOR=0.710;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=185;TCF=113;TCR=72;TR=97;WE=26750653;WS=26750635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,101:0.50:201
chr2	26781247	rs4665880	G	C	3035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=44;PP=2067;ReadPosRankSum=-0.733;SC=CCCAGCCCCTGCTAGAACTTT;SOR=0.660;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=230;TCF=147;TCR=83;TR=125;WE=26781255;WS=26781237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,135:0.55:246
chr2	26795235	.	C	T	110	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MMLQ=28;MQ=58.01;NF=0;NR=7;PP=110;QD=20.6816017925;SC=TTTTTTTTCTCTTGAATCATC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=7;WE=26795243;WS=26795225;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr2	26798893	rs13002673	A	T	5015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=635;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.524;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=121;NR=128;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.870;SC=CCTTCAGCCAAGGCGGCCATT;SOR=0.737;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=585;TCF=284;TCR=301;TR=249;WE=26798901;WS=26798883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:373,262:0.41:635
chr2	26799031	rs2272464	G	A	998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.740;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=31;PP=660;ReadPosRankSum=-1.210;SC=CAGAGCTTACGAATTTCTACC;SOR=0.770;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=111;TCF=34;TCR=77;TR=44;WE=26799039;WS=26799021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,48:0.39:122
chr2	26800422	rs1053807	G	A	4874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=363;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.393;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=103;PP=2916;ReadPosRankSum=0.530;SC=AAGACAAGACGGGCACAGTGC;SOR=0.648;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=337;TCF=167;TCR=170;TR=206;WE=26800430;WS=26800412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,226:0.62:362
chr2	26801586	rs1148956	G	A	1734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.926;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=17;PP=1049;ReadPosRankSum=2.032;SC=GCCAGGATCTGCCCCCCATCC;SOR=0.588;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=92;TCF=69;TCR=23;TR=66;WE=26801594;WS=26801576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,75:0.74:102
chr2	26802392	rs2272467	A	T	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=0.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.18;ReadPosRankSum=0.836;SOR=0.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,29:0.28:104
chr2	26804008	rs744538	A	G	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.335;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=103;ReadPosRankSum=-0.366;SC=AGCCCTGGAAAGGGCAGTTCT;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=6;WE=26804016;WS=26803998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr2	26804122	rs744539	T	G	1323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.453;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=17;PP=889;ReadPosRankSum=-0.170;SC=TAGAGGTGAGTGTGGGCCCAG;SOR=0.479;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=135;TCF=100;TCR=35;TR=56;WE=26804130;WS=26804112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,61:0.43:142
chr2	26804143	rs744540	T	C	1710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.881;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=30;PP=1204;ReadPosRankSum=0.046;SC=TACAAAGTCATACTTCAAACC;SOR=0.533;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=187;TCF=121;TCR=66;TR=79;WE=26804151;WS=26804133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,83:0.43:194
chr2	26804218	rs935171	G	A	11879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=453;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=213;NR=216;PP=2965;SC=CATGTCAGGTGTTTGCCGCTA;SOR=0.720;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=429;TCF=213;TCR=216;TR=429;WE=26804226;WS=26804208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,452:1.00:452
chr2	26804331	rs367739525	A	G	1808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.720;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=50;PP=1242;ReadPosRankSum=0.304;SC=CTGGGTTCACAGTAGTCCTGG;SOR=0.625;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=120;TCF=40;TCR=80;TR=75;WE=26804339;WS=26804321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,77:0.61:126
chr2	26818006	rs1148962	T	C	3606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=49;PP=2147;SC=CTCTATGGCCTTTCCACCCCT;SOR=1.055;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=121;TCF=71;TCR=50;TR=120;WE=26818014;WS=26817996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr2	26818021	rs1148963	C	T	3712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=57;PP=2243;SC=ACCCCTCACCCCTCAGTCCCC;SOR=0.864;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=126;TCF=68;TCR=58;TR=125;WE=26818029;WS=26818011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr2	26846282	rs1615551	T	C	6497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=135;NR=82;PP=2965;SC=CCCCACCTACTTTTAGGATTT;SOR=1.169;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=217;TCF=135;TCR=82;TR=217;WE=26846290;WS=26846272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr2	26951449	rs1663002	G	A	1623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=27;NR=27;PP=778;SC=GCCCCGAGGGGCCTGGAGCAC;SOR=0.826;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=27;TCR=27;TR=54;WE=26951457;WS=26951439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr2	26997031	rs13007156	G	A	2707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=41;PP=1632;ReadPosRankSum=0.736;SC=CCCAGGTCTGGGCCTCTTGAC;SOR=0.690;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=209;TCF=132;TCR=77;TR=110;WE=26997039;WS=26997021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,126:0.54:235
chr2	27157396	rs920437	G	A	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.08;ReadPosRankSum=0.859;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr2	27157400	rs920436	A	G	443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.98;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	27163044	rs3739085	T	C	700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.749;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=24;PP=362;ReadPosRankSum=-1.405;SC=AGGAGTGGTATGTTTCCTAGA;SOR=0.942;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=97;TCF=34;TCR=63;TR=36;WE=27163052;WS=27163034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,40:0.39:102
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chr2	27167784	rs3739088	C	T	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.075;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=332;ReadPosRankSum=1.617;SC=TCTTTTGTGTCCTCTCCTCCC;SOR=4.119;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=15;WE=27167792;WS=27167774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr2	27169637	rs3835821	TC	T	488.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.909;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.047;NF=4;NR=3;PP=186;ReadPosRankSum=-2.387;SC=TGAGCCTCTGTCTCCTCATCT;SOR=0.287;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=33;TCF=22;TCR=11;TR=7;WE=27169645;WS=27169627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,18:0.33:54
chr2	27169842	rs11126784	C	A	1897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.450;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=50;PP=1084;ReadPosRankSum=2.204;SC=CTCCCGGAGGCAGGTCGAGTG;SOR=0.739;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=261;TCF=117;TCR=144;TR=91;WE=27169850;WS=27169832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:184,104:0.36:288
chr2	27246285	rs10865456	C	T	7478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=141;NR=115;PP=2965;SC=AACTAGAGCACGAATACATCC;SOR=0.823;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=256;TCF=141;TCR=115;TR=256;WE=27246293;WS=27246275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,277:1.00:277
chr2	27249245	rs3754733	A	G	1833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=52;PP=1079;ReadPosRankSum=0.406;SC=CTGACTGCACAGCTTCCCCGT;SOR=0.685;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=242;TCF=96;TCR=146;TR=86;WE=27249253;WS=27249235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,97:0.37:260
chr2	27259794	rs13021112	G	A	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=314;ReadPosRankSum=-1.446;SC=AGAATGTGATGGTGAGGAAGG;SOR=0.531;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=20;WE=27259802;WS=27259784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
chr2	27260469	rs1124649	G	A	2892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=57;PP=1660;ReadPosRankSum=0.101;SC=CCGACTGAAAGTGCTGGCATT;SOR=0.704;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=219;TCF=115;TCR=104;TR=122;WE=27260477;WS=27260459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,136:0.56:245
chr2	27261315	rs144175132	C	T	821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=7;PP=497;ReadPosRankSum=-0.081;SC=TGAGGCTGCGCGAGCCACCTG;SOR=0.706;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=46;TCF=34;TCR=12;TR=30;WE=27261337;WS=27261305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,35:0.66:53
chr2	27261329	rs11690454	A	G	2734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=19;PP=1437;SC=CCACCTGACTAGGGGGTTGTG;SOR=1.704;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=48;TCR=19;TR=67;WE=27261337;WS=27261305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr2	27262763	rs146244277	GGGA	G	5885.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=7;NR=83;PP=2971;SC=CTGGGTGTCAGGGAGGAGGCG;SOR=1.828;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=108;TCF=8;TCR=100;TR=90;WE=27262773;WS=27262753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr2	27263122	rs1866654	T	C	1902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.336;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=32;PP=1131;ReadPosRankSum=0.355;SC=AGCAGAATTCTGGGAAAGGAG;SOR=0.965;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=248;TCF=150;TCR=98;TR=90;WE=27263130;WS=27263112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,98:0.37:267
chr2	27263439	rs41288793	A	G	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.329;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=340;ReadPosRankSum=1.024;SC=AGCCATCTCTATCCAGTCTCC;SOR=1.638;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=32;TCF=23;TCR=9;TR=16;WE=27263447;WS=27263429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr2	27276202	rs3806520	G	A	794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.687;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=10;PP=480;ReadPosRankSum=2.533;SC=GGCTGGCTCCGGCTCTCCCAC;SOR=0.923;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=90;TCF=61;TCR=29;TR=35;WE=27276210;WS=27276192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,40:0.39:102
chr2	27279416	rs2384570	A	G	4106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=50;PP=2613;SC=TCACATGGTCACATACTTGCT;SOR=1.451;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=148;TCF=98;TCR=50;TR=148;WE=27279424;WS=27279406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr2	27280092	rs6711384	T	A	1068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.844;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=10;PP=754;ReadPosRankSum=1.106;SC=TTGCCTCCTTTGACCACCTAA;SOR=0.900;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=89;TCF=68;TCR=21;TR=46;WE=27280100;WS=27280082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,49:0.50:98
chr2	27280127	rs6721395	G	A	1850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.600;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=23;PP=1099;ReadPosRankSum=0.085;SC=TTCTGTCCTGGTATCTGTTCA;SOR=0.760;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=139;TCF=95;TCR=44;TR=74;WE=27280135;WS=27280117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,83:0.52:160
chr2	27290525	rs11681145	A	G	2107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.890;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.99;MQRankSum=-1.259;NF=56;NR=46;PP=1218;ReadPosRankSum=0.015;SC=GTCTGTACCCACTGCCACTGA;SOR=0.710;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=274;TCF=139;TCR=135;TR=102;WE=27290533;WS=27290515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:186,116:0.38:302
chr2	27292651	rs10865461	T	C	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.021;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=103;ReadPosRankSum=-1.706;SC=TTCAGAATAATTTTCTGCTTC;SOR=1.276;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=8;WE=27292659;WS=27292641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr2	27293150	rs1053609	G	T	1467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.664;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=46;PP=997;ReadPosRankSum=-0.768;SC=TTATGTTCAAGCCCAGGATAT;SOR=0.837;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=231;TCF=102;TCR=129;TR=77;WE=27293158;WS=27293140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,81:0.32:251
chr2	27302165	rs2289360	T	C	903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.663;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=33;PP=535;ReadPosRankSum=-0.527;SC=ATGCCACCTCTGCCTGGCTCT;SOR=1.003;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=114;TCF=35;TCR=79;TR=45;WE=27302173;WS=27302155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,48:0.39:122
chr2	27303755	rs2736976	A	G	2639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=70;PP=2065;SC=CCCCTGGCCCAGCCTGCCCGC;SOR=2.557;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=19;TCR=70;TR=89;WE=27303763;WS=27303745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr2	27306601	.	C	A	1038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.239;ClippingRankSum=0.000;DP=372;ExcessHet=3.0103;FS=1.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.81;ReadPosRankSum=1.259;SOR=0.815;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:288,82:0.22:370
chr2	27307769	rs2304682	G	C	2000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=365;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.856;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=52;PP=1401;ReadPosRankSum=0.798;SC=ACGTAGCACCGAGCACAACAG;SOR=0.624;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=331;TCF=170;TCR=161;TR=108;WE=27307777;WS=27307759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:249,114:0.31:363
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chr2	27319826	rs9677784	A	G	471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=12;PP=361;SC=TTCAGGTGAGAAAACTAAGGC;SOR=2.049;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=16;WE=27319834;WS=27319816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
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chr2	27351279	rs1866561	G	A	1890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=15;PP=1377;SC=AAAAGTCAGGGAAGTGGGGCA;SOR=2.200;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=52;TCR=15;TR=67;WE=27351287;WS=27351269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
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chr2	27354173	rs11126874	C	A	989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=0;PP=805;SC=ATCTTGTCAGCGGCAACCTCA;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=30;WE=27354181;WS=27354163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
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chr2	27424496	rs1006898	G	A	933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.758;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=14;PP=561;ReadPosRankSum=-2.922;SC=TCAAAGGAGGGCTTTGAGAAA;SOR=0.546;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=92;TCF=61;TCR=31;TR=38;WE=27424504;WS=27424486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,44:0.42:106
chr2	27424636	rs1395	G	A	2583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.434;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=46;PP=1284;ReadPosRankSum=-0.734;SC=TGGCATGCTGGAGCCCATGCT;SOR=0.683;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=247;TCF=131;TCR=116;TR=105;WE=27424644;WS=27424626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,129:0.46:281
chr2	27426475	rs181024443	T	C	1576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.992;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=9;PP=1061;ReadPosRankSum=1.194;SC=GGTATCTCTGTTGTGCTGTGG;SOR=0.969;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=100;TCF=83;TCR=17;TR=56;WE=27426483;WS=27426465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,63:0.57:110
chr2	27426514	rs1275521	G	C	6655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=145;NR=74;PP=2965;ReadPosRankSum=0.179;SC=CCCTTGTCATGCACACAGATG;SOR=1.464;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=221;TCF=146;TCR=75;TR=219;WE=27426522;WS=27426503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,238:0.99:240
chr2	27428147	rs1298361	A	G	2788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=25;PP=2004;SC=TACTATAGCCAAGACCAGCCT;SOR=2.147;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=100;TCF=74;TCR=26;TR=99;WE=27428155;WS=27428137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr2	27428173	rs41288807	C	T	2072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.838;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=26;PP=1412;ReadPosRankSum=0.763;SC=ATGGGCTCAGCGCCCAGGCAC;SOR=1.003;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=162;TCF=110;TCR=52;TR=89;WE=27428181;WS=27428163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,93:0.55:170
chr2	27428295	rs1275524	A	G	14090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=526;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=246;NR=239;PP=2965;SC=CTGACCCCACAATGATAACTG;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=485;TCF=246;TCR=239;TR=485;WE=27428303;WS=27428285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,526:1.00:526
chr2	27428702	rs1275525	A	C	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.468;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=102;ReadPosRankSum=-1.741;SC=CCCTGTTGACATCATTCCCAT;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=6;WE=27428710;WS=27428692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
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chr2	27428877	rs1275527	C	G	2002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.472;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=45;PP=1196;ReadPosRankSum=-1.114;SC=CCCCACACCACGGCTTACTGC;SOR=0.685;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=216;TCF=110;TCR=106;TR=94;WE=27428885;WS=27428867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,103:0.42:243
chr2	27430237	rs56970590	T	C	5316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=432;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.109;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=121;NR=96;PP=2962;ReadPosRankSum=1.661;SC=GGGTCCCAAATCGGTAGATCT;SOR=0.811;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=387;TCF=211;TCR=176;TR=217;WE=27430245;WS=27430227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:186,245:0.57:431
chr2	27435250	rs1275533	A	G	4592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=66;PP=2837;SC=GCGCCTCACGACCCGGGTAGT;SOR=0.742;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=81;TCR=66;TR=147;WE=27435258;WS=27435240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr2	27435374	rs11608	G	A	1042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.664;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=28;PP=584;ReadPosRankSum=-1.214;SC=AAGCAGGGTCGCTGGCCAGCC;SOR=0.603;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=124;TCF=54;TCR=70;TR=52;WE=27435382;WS=27435364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,55:0.42:130
chr2	27439518	rs41288811	A	G	3910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.538;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=84;PP=2663;ReadPosRankSum=0.160;SC=AACTAGGGATACAAGGAATGC;SOR=0.707;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=281;TCF=144;TCR=137;TR=164;WE=27439526;WS=27439508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,173:0.58:298
chr2	27439751	rs7437	G	T	2812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.506;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=61;PP=1722;ReadPosRankSum=-0.831;SC=GATTCTGGGAGCCACCACTCT;SOR=0.754;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=198;TCF=92;TCR=106;TR=113;WE=27439759;WS=27439741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,127:0.59:217
chr2	27439884	rs4617	T	C	640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=18;PP=433;ReadPosRankSum=1.279;SC=GGAGCTCTGCTTCCTAGAAAG;SOR=0.813;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=44;TCF=16;TCR=28;TR=27;WE=27439892;WS=27439874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,29:0.58:50
chr2	27440722	rs41288813	C	T	2103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.284;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=23;PP=1375;ReadPosRankSum=0.017;SC=CTACCGGAGCCCAGCCCTGCT;SOR=0.924;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=129;TCF=86;TCR=43;TR=73;WE=27440730;WS=27440712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,84:0.59:143
chr2	27440785	rs1275536	C	T	9992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=371;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=197;NR=133;PP=2965;SC=AGGCCCTCACCGATCCCTCCT;SOR=1.048;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=330;TCF=197;TCR=133;TR=330;WE=27440793;WS=27440775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,371:1.00:371
chr2	27441018	rs73921471	C	G	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=303;ReadPosRankSum=0.832;SC=AAGTCAAGGACTAAGATCACT;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=15;WE=27441026;WS=27441008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr2	27444024	rs73921475	G	A	1777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.799;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=31;PP=1334;ReadPosRankSum=-1.680;SC=CCACACAATCGGGAAAATGCT;SOR=0.843;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=183;TCF=111;TCR=72;TR=81;WE=27444032;WS=27444014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,84:0.43:197
chr2	27445518	rs60463044	A	G	1269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.359;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=34;PP=954;ReadPosRankSum=0.659;SC=ACCATGCACTAGACAGCCAAG;SOR=0.345;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=90;TCF=29;TCR=61;TR=54;WE=27445526;WS=27445508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,53:0.58:92
chr2	27448175	.	T	C	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.671;ClippingRankSum=0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.67;ReadPosRankSum=0.596;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr2	27449293	rs7593448	C	G	1667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=27;PP=1248;ReadPosRankSum=-0.498;SC=CCCTGGAGTACAAGCTGGAAT;SOR=1.004;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=108;TCF=59;TCR=49;TR=63;WE=27449301;WS=27449283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,66:0.58:113
chr2	27455281	rs6747264	C	T	878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=8;PP=574;ReadPosRankSum=1.789;SC=ACCCTACTCTCTGGGCCTGTG;SOR=0.716;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=50;TCF=39;TCR=11;TR=35;WE=27455289;WS=27455271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,36:0.71:51
chr2	27458606	rs75314245	A	G	1683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.665;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=47;PP=1124;ReadPosRankSum=-0.183;SC=GGTGGCATATACCTGTAGTCC;SOR=1.179;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=120;TCF=39;TCR=81;TR=65;WE=27458614;WS=27458596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,72:0.56:129
chr2	27460787	rs9679426	G	C	2674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.178;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=52;PP=1894;ReadPosRankSum=0.324;SC=CCACCACCCAGTGTCTCCTGG;SOR=0.419;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=183;TCF=86;TCR=97;TR=105;WE=27460795;WS=27460777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,111:0.58:191
chr2	27460968	rs1141313	A	G	5459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=434;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=124;NR=127;PP=2962;ReadPosRankSum=0.298;SC=TGGCTCACGCAGAGCAGCAAA;SOR=0.725;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=408;TCF=208;TCR=200;TR=251;WE=27460976;WS=27460958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,259:0.60:433
chr2	27462405	rs2014252	T	A	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.067;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=18;PP=478;ReadPosRankSum=0.261;SC=TTTCTTCCCTTCCCAGCACAT;SOR=0.337;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=41;TCF=12;TCR=29;TR=27;WE=27462413;WS=27462395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,27:0.66:41
chr2	27462651	rs61741874	T	C	3325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=67;PP=2093;ReadPosRankSum=-0.140;SC=CCCCTGCCACTAGTGAGATGA;SOR=0.706;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=243;TCF=127;TCR=116;TR=141;WE=27462659;WS=27462641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,153:0.57:269
chr2	27463351	rs7573037	C	T	4055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=82;PP=2617;ReadPosRankSum=-1.486;SC=TCTGATCTGCCGTGCCATCCT;SOR=0.711;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=289;TCF=151;TCR=138;TR=172;WE=27463359;WS=27463341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,183:0.58:316
chr2	27465881	rs56252443	G	T	1546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.523;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=34;PP=1070;ReadPosRankSum=-1.192;SC=GGCTGCTGCCGTAGGGCATCA;SOR=0.777;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=107;TCF=52;TCR=55;TR=63;WE=27465889;WS=27465871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,68:0.60:113
chr2	27522543	rs141577308	C	CCTAT,CCTATCTAT	2530.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0,0;NR=26,26;PP=1160,36;ReadPosRankSum=1.041;SC=CGCACTCAGCCCTATCTATCT;SOR=1.220;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=0;TCR=59;TR=26,26;WE=27522551;WS=27522533;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:0.97:62
chr2	27528692	rs4665963	T	C	707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=16;PP=392;ReadPosRankSum=-1.490;SC=CCAGGTGGGCTCTAGGGGAGG;SOR=0.846;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=49;TCF=21;TCR=28;TR=28;WE=27528700;WS=27528682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,32:0.59:54
chr2	27535311	rs5830041	T	TG	10585.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=80;PP=2936;SC=CTTCTTCCCCTGGCTGTCAGC;SOR=0.866;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=51;TCR=85;TR=128;WE=27535319;WS=27535300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,298:1.00:298
chr2	27547247	rs76164683	G	C	2417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=434;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=62;PP=1913;ReadPosRankSum=-0.455;SC=ACCTTTTACAGACAGCTTACC;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=408;TCF=217;TCR=191;TR=131;WE=27547255;WS=27547237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:299,135:0.31:434
chr2	27556721	rs3739095	G	A	3570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.007;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=78;PP=2135;ReadPosRankSum=2.263;SC=GCTCAAATCAGTGCTTAATCC;SOR=0.613;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=240;TCF=114;TCR=126;TR=151;WE=27556729;WS=27556711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,161:0.64:252
chr2	27564740	rs76845159	T	C	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.896;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=420;ReadPosRankSum=1.621;SC=AAAGCTGTCCTTCCTTTCTCA;SOR=1.014;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=100;TCF=71;TCR=29;TR=30;WE=27564748;WS=27564730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,30:0.27:110
chr2	27591708	rs56402945	G	A	1619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.868;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=37;PP=1191;ReadPosRankSum=0.776;SC=GGAGAAAACGGGAGAATAGGG;SOR=0.836;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=83;TCF=29;TCR=54;TR=55;WE=27591716;WS=27591698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,61:0.66:92
chr2	27597190	.	ATT	A	83.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.234;ClippingRankSum=0.000;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.58;ReadPosRankSum=-0.026;SOR=0.544;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,8:0.15:53
chr2	27597338	rs73921518	C	A	1400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.837;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=42;PP=952;ReadPosRankSum=-0.692;SC=GTGGGAGGTGCTGTGCTGGAT;SOR=1.014;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=97;TCF=29;TCR=68;TR=58;WE=27597346;WS=27597328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,62:0.61:101
chr2	27598097	rs4665972	T	C	737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.070;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=25;PP=579;ReadPosRankSum=-0.442;SC=GCTCTGCCTCTCAGATTCATG;SOR=0.299;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=50;TCF=4;TCR=46;TR=28;WE=27598105;WS=27598087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,28:0.56:50
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chr2	27717151	rs141504043	C	G	2418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.618;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=48;PP=1614;ReadPosRankSum=0.171;SC=AGATCCCCCCCACTTAAGTGA;SOR=0.811;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=210;TCF=123;TCR=87;TR=116;WE=27717159;WS=27717141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,120:0.53:226
chr2	27720385	rs8179205	C	T	1354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.880;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=22;PP=836;ReadPosRankSum=1.508;SC=CCCCATTCATCGTCCTCCTTT;SOR=0.528;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=78;TCF=47;TCR=31;TR=53;WE=27720393;WS=27720375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,56:0.66:85
chr2	27730817	rs8179219	G	A	925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=16;PP=592;ReadPosRankSum=-2.659;SC=CCAGCCTTTCGACTCTGATGC;SOR=0.784;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=41;TCR=29;TR=38;WE=27730825;WS=27730807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,42:0.51:82
chr2	27730940	rs1260326	T	C	2310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.599;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=35;PP=1081;ReadPosRankSum=0.885;SC=CAGACCTTGCTGGTGAGAGTC;SOR=0.598;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=137;TCF=81;TCR=56;TR=86;WE=27730948;WS=27730930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,105:0.64:165
chr2	27789861	rs965813	T	A	5901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=466;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=126;NR=114;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.402;SC=ATCCTCTGTGTTCAGGAACCA;SOR=0.674;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=426;TCF=225;TCR=201;TR=240;WE=27789869;WS=27789851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:202,263:0.57:465
chr2	27801403	rs1919125	C	G	17952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=409;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=189;NR=178;PP=2965;SC=AGTCCATGTACTCAAGTGAAG;SOR=0.698;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=368;TCF=189;TCR=179;TR=367;WE=27801411;WS=27801393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,409:1.00:409
chr2	27801418	rs1919126	C	A	17706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=437;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=203;NR=190;PP=2965;SC=GTGAAGTCTGCAGAATTAACC;SOR=0.707;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=394;TCF=203;TCR=191;TR=393;WE=27801426;WS=27801408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,437:1.00:437
chr2	27801493	rs1919127	T	C	2821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=383;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=68;PP=1503;ReadPosRankSum=-0.428;SC=CTTCAGGCTGTGAAATCTACA;SOR=0.689;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=356;TCF=180;TCR=176;TR=138;WE=27801501;WS=27801483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:234,149:0.39:383
chr2	27801759	rs1919128	A	G	2934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=420;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.539;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=68;PP=1713;ReadPosRankSum=1.488;SC=TGGGACAGATATTTTGCAGCC;SOR=0.617;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=379;TCF=201;TCR=178;TR=139;WE=27801767;WS=27801749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:266,154:0.37:420
chr2	27802805	rs3811644	A	G	3948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.476;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=92;PP=2531;ReadPosRankSum=-1.410;SC=CTATCTGCCTACAGTGTGGCC;SOR=0.798;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=258;TCF=116;TCR=142;TR=165;WE=27802813;WS=27802795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,176:0.62:282
chr2	27804432	rs28381983	T	C	8375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=141;NR=137;PP=2965;SC=CCATCGCAGTTCCTCTGAGAG;SOR=0.734;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=278;TCF=141;TCR=137;TR=278;WE=27804440;WS=27804422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,296:1.00:296
chr2	27824168	rs56725354	G	C	5322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=410;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.120;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=118;NR=99;PP=2962;ReadPosRankSum=2.289;SC=CGGACTTCATGACATTCTGTT;SOR=0.600;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=370;TCF=203;TCR=167;TR=217;WE=27824176;WS=27824158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,242:0.59:410
chr2	27830990	rs6547734	G	T	2565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=64;PP=1764;SC=TGCACTTGAGGAAGTACGTGA;SOR=2.354;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=20;TCR=64;TR=84;WE=27830998;WS=27830980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr2	27838058	rs11127071	C	A	6503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=103;NR=108;PP=2965;SC=GTCCAGGGCTCCCTACCTTCA;SOR=0.806;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=211;TCF=103;TCR=108;TR=211;WE=27838066;WS=27838048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr2	27839107	rs6737921	T	C	5378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=92;NR=90;PP=2965;SC=ATAGTCTTCATACTATTTCTT;SOR=0.798;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=182;TCF=92;TCR=90;TR=182;WE=27839115;WS=27839097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr2	27851120	rs12615690	T	C	424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=0;PP=387;SC=GAACACTGTTTGCAGCTACAA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=27851128;WS=27851110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	27851918	rs3749147	G	A	1302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.333;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=25;PP=864;ReadPosRankSum=0.587;SC=GGTGGGGCCAGGAGGAAGATG;SOR=0.551;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=147;TCF=95;TCR=52;TR=67;WE=27851926;WS=27851908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,69:0.45:154
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chr2	27852118	rs58737572	A	C	4625.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=36;PP=1099;SC=AAGGGAGGGAAGAGGATTTGG;SOR=1.190;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=58;TCF=21;TCR=37;TR=49;WE=27852126;WS=27852107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
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chr2	27852637	rs6547738	A	G	1123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=4;PP=850;SC=TCTAAGTGCAATATTCTTAAG;SOR=3.797;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=34;WE=27852645;WS=27852628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
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chr2	27857992	rs4666009	T	A	10582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=403;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=202;NR=170;PP=2965;SC=GGCTTTGATTTTTTTGTGGCT;SOR=0.854;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=372;TCF=202;TCR=170;TR=372;WE=27858000;WS=27857982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,400:1.00:400
chr2	27884878	rs1569152	C	T	520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=0;PP=351;SC=TGCCTTCTAACTGGTATCCCT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=27884886;WS=27884868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	27892023	rs2272406	A	T	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.682;HP=9;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=210;ReadPosRankSum=-0.922;SC=AAGGCCATCTAAAAAAAAAAT;SOR=0.354;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=39;TCF=32;TCR=7;TR=15;WE=27892031;WS=27892012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,14:0.35:40
chr2	27910706	rs13023094	A	C	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.026;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=346;ReadPosRankSum=1.378;SC=ATGATTATGTACTTAGCTTCT;SOR=0.859;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=67;TCF=49;TCR=18;TR=25;WE=27910714;WS=27910696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,26:0.38:68
chr2	27930837	rs4665385	C	T	3160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-4.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.836;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=75;PP=1979;ReadPosRankSum=-0.289;SC=ACCTGTCTCCCACCCTGGCTG;SOR=0.449;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=212;TCF=80;TCR=132;TR=128;WE=27930845;WS=27930827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,138:0.61:227
chr2	27995781	rs3736594	A	C	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=83;ReadPosRankSum=-0.908;SC=GAAATACTTGAAGGAACCTTT;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=27995789;WS=27995771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr2	28005709	rs77370238	C	T	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=440;ReadPosRankSum=-0.950;SC=GGGAATTATTCCCTGAAGTTA;SOR=1.708;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=19;WE=28005717;WS=28005699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,16:0.70:23
chr2	28065875	rs34139736	C	G	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=7.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.29;ReadPosRankSum=1.568;SOR=0.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,28:0.48:58
chr2	28069713	rs11901133	T	G	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5731;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=148;ReadPosRankSum=-1.078;SC=TCCAAAAATTTATCTGAACGA;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=9;WE=28069721;WS=28069703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,10:0.83:12
chr2	28084530	rs141374929	T	TGG	49.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=14.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.34;MQRankSum=1.650;QD=2.07;ReadPosRankSum=0.542;SOR=0.469;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr2	28084536	rs188598574	G	T	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=19.816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.37;MQRankSum=-1.170;QD=14.60;ReadPosRankSum=0.590;SOR=3.362;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr2	28236120	rs11127132	C	T	2944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=53;PP=1863;ReadPosRankSum=1.517;SC=ATTCTGACACCCTGGCACAAA;SOR=0.690;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=227;TCF=137;TCR=90;TR=128;WE=28236128;WS=28236110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,137:0.54:256
chr2	28268467	rs6738887	C	T	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=49;ReadPosRankSum=0.431;SC=TCTTGCCTAACGTTAGGAAAA;SOR=0.307;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=5;WE=28268475;WS=28268457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr2	28464369	rs376402633	CT	C	44.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=3.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.93;ReadPosRankSum=0.267;SOR=1.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,10:0.21:48
chr2	28464435	rs6737817	T	C	262.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=262;SC=GATCTTGGCTTACTGCAACCT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=28464443;WS=28464425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	28615812	rs72195155	GGA	G	116.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=12.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.34;ReadPosRankSum=0.413;SOR=3.082;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,12:0.14:87
chr2	28718897	rs4665423	A	G	1290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.564;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=30;PP=826;ReadPosRankSum=-3.669;SC=ACACAGAGGAACATAAAAGCA;SOR=0.615;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=166;TCF=93;TCR=73;TR=64;WE=28718905;WS=28718887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,68:0.37:182
chr2	28748857	rs4666085	T	C	4917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.386;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=88;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.547;SC=GCCCCTCTCCTTCCCAACACA;SOR=0.514;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=170;TCF=82;TCR=88;TR=169;WE=28748865;WS=28748847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,180:0.99:181
chr2	28748916	rs10181687	A	C	3370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=75;PP=2327;SC=CCACTTTATCACTGGAGCCCA;SOR=1.355;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=42;TCR=75;TR=117;WE=28748924;WS=28748906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr2	28752498	rs6728486	T	C	5262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=106;NR=63;PP=2965;SC=GGATAAAGCTTAGAGACTGAC;SOR=1.260;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=170;TCF=106;TCR=64;TR=169;WE=28752506;WS=28752488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr2	28752555	rs4473343	T	C	8968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=170;NR=141;PP=2965;SC=AACAAAATAATATTTAGCCAA;SOR=0.832;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=311;TCF=170;TCR=141;TR=311;WE=28752563;WS=28752545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,336:1.00:336
chr2	28752727	rs6710800	C	G	2216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=38;PP=1071;SC=TGATGACCCTCGTACCATTTT;SOR=2.041;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=15;TCR=38;TR=53;WE=28752749;WS=28752717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr2	28752741	rs6725577	A	G	1653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=6;NR=26;PP=722;SC=CCATTTTACCATGAACTCGGC;SOR=2.712;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=32;WE=28752749;WS=28752717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr2	28761257	rs7589169	A	G	1489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.14;SOR=1.047;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr2	28761282	rs7589254	A	G	892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=9;NR=22;PP=641;SC=CCCCAAGGGCAGTGGGGCCCA;SOR=1.681;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=31;WE=28761290;WS=28761272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr2	28761981	rs6753929	G	C	2039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.076;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=46;PP=1425;ReadPosRankSum=-0.508;SC=CAGAGCATTTGTAAACCTGGT;SOR=0.720;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=252;TCF=128;TCR=124;TR=98;WE=28761989;WS=28761971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,104:0.38:275
chr2	28763374	rs11127162	G	T	2340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=48;PP=1304;ReadPosRankSum=1.138;SC=AGGAGAACAGGAGTGATAGGG;SOR=0.721;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=144;TCF=67;TCR=77;TR=90;WE=28763382;WS=28763364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,104:0.63:166
chr2	28771452	rs56019402	CTA	C	3036.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5187;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.514;NF=18;NR=29;PP=1993;ReadPosRankSum=2.660;SC=GAAGTCCCTTCTATATATATA;SOR=0.801;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=61;TCF=23;TCR=38;TR=47;WE=28771463;WS=28771442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,92:0.89:103
chr2	28771579	rs72789777	C	T	1089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.409;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=26;PP=598;ReadPosRankSum=0.834;SC=GTCTCAGACTCAGTAGTTTGG;SOR=0.798;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=108;TCF=56;TCR=52;TR=52;WE=28771587;WS=28771569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,57:0.50:114
chr2	28771624	rs11680168	T	G	4394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=58;PP=2960;SC=TCTAATGCGTTCCCTGGTACT;SOR=0.959;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=139;TCF=81;TCR=58;TR=139;WE=28771632;WS=28771614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr2	28771897	rs11680304	T	C	542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=17;PP=381;SC=ACCTGAGATGTGAATCCTGTT;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=28771905;WS=28771887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	28785754	rs7560628	G	C	715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=0;PP=514;SC=CATTGACAAGGATGGGTTTTT;SOR=4.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=28785762;WS=28785744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	28788428	rs34237604	AG	A	524.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=604;SC=GCCTTGAGCCAGGAATCCAGG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=28788436;WS=28788418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	28789643	rs10186460	T	C	5055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=663;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.124;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=133;NR=115;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.187;SC=TTCATTTTCTTTCTTGGACCC;SOR=0.801;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=628;TCF=322;TCR=306;TR=248;WE=28789651;WS=28789633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:401,262:0.40:663
chr2	28795893	rs13005799	G	A	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.84;ReadPosRankSum=0.000;SOR=0.188;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
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chr2	28795962	rs13005854	G	A	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=264;ReadPosRankSum=-0.454;SC=TAGGGGCTGCGGAGTGGGGAC;SOR=0.712;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=59;TCF=45;TCR=14;TR=20;WE=28795970;WS=28795952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,22:0.34:64
chr2	28800894	rs877832	C	T	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.02;ReadPosRankSum=-1.022;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,9:0.21:43
chr2	28802355	rs12466173	G	C	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=2.022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.57;ReadPosRankSum=0.542;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,26:0.28:93
chr2	28804835	rs5830085	GA	G	485.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=3.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.47;ReadPosRankSum=2.271;SOR=0.317;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,29:0.45:65
chr2	28805410	rs4666102	C	A	760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.416;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=25;PP=431;ReadPosRankSum=-1.785;SC=ACTAAGAATCCTCACTGCTAA;SOR=0.831;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=135;TCF=59;TCR=76;TR=43;WE=28805418;WS=28805400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,46:0.31:147
chr2	28808539	rs13393932	G	A	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.916;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=63;ReadPosRankSum=-0.757;SC=TAAAAGAAATGTATTGAGTCT;SOR=0.551;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=6;WE=28808547;WS=28808529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr2	28812285	rs12468715	T	C	1244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.175;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=7;PP=903;ReadPosRankSum=-0.440;SC=CAGAGAGGACTGCCTGACATC;SOR=1.119;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=102;TCF=85;TCR=17;TR=49;WE=28812293;WS=28812275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,51:0.47:108
chr2	28812982	rs4666105	C	T	1075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.115;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=31;PP=606;ReadPosRankSum=-1.123;SC=TCCGGCTGCACTGGGCTTCTT;SOR=0.880;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=140;TCF=56;TCR=84;TR=48;WE=28812990;WS=28812972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,57:0.35:161
chr2	28814033	rs11681826	A	G	2900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=433;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.506;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=71;PP=1677;ReadPosRankSum=-0.092;SC=CAAGAACAGCATGCAGGTACC;SOR=0.603;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=401;TCF=198;TCR=203;TR=149;WE=28814041;WS=28814023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:267,165:0.38:432
chr2	28814548	rs12464271	A	T	1569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=35;PP=1050;ReadPosRankSum=-1.420;SC=AGATTCTGGGATTTGTTCTAT;SOR=0.676;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=204;TCF=116;TCR=88;TR=79;WE=28814556;WS=28814538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,84:0.38:220
chr2	28814683	rs11127176	T	C	749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.819;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=23;PP=351;ReadPosRankSum=1.856;SC=GCTGCTATGCTGGTGAGTCCT;SOR=0.416;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=96;TCF=33;TCR=63;TR=38;WE=28814691;WS=28814673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,42:0.42:101
chr2	28816425	rs10176136	T	C	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=92;ReadPosRankSum=-0.325;SC=GGCTCCTGGTTCCATGTCTGC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=6;WE=28816433;WS=28816415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr2	28816948	rs4665429	C	T	2665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=432;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=67;PP=1425;ReadPosRankSum=0.055;SC=TGCATGTATACGTGTACACGT;SOR=0.692;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=405;TCF=204;TCR=201;TR=135;WE=28816956;WS=28816938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:282,149:0.35:431
chr2	28821662	rs7557359	C	T	1405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=37;PP=808;ReadPosRankSum=-1.106;SC=GCCTGCAGAGCAGGGAGTGGA;SOR=0.628;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=90;TCF=31;TCR=59;TR=58;WE=28821670;WS=28821652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,64:0.65:98
chr2	28824303	rs1106882	C	G	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=256;ReadPosRankSum=-0.680;SC=CTAGGATTATCCACCTACACC;SOR=0.420;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=14;WE=28824311;WS=28824293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr2	28824793	rs7601771	C	G	3714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.461;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=73;PP=2406;ReadPosRankSum=-1.700;SC=CAACTTTGTTCACCATCTCCG;SOR=0.652;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=239;TCF=120;TCR=119;TR=147;WE=28824801;WS=28824783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,163:0.62:263
chr2	28824940	rs67381370	G	A	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=505;ReadPosRankSum=-0.146;SC=GAGACAGCCAGGGGCATGGAC;SOR=1.244;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=22;WE=28824948;WS=28824930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,22:0.79:28
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chr2	28841021	rs1881256	G	A	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.049;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=278;ReadPosRankSum=0.587;SC=GATAGCCATGGAACCCATTCC;SOR=0.340;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=15;WE=28841029;WS=28841011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr2	28841049	rs1881255	G	A	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=411;ReadPosRankSum=1.131;SC=GCCTTGGTTGGTCTGAATGAA;SOR=0.859;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=43;TCF=35;TCR=8;TR=22;WE=28841057;WS=28841039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,24:0.49:49
chr2	28847806	rs11127181	C	G	3183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.156;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=43;PP=2107;ReadPosRankSum=1.487;SC=AATGGAATGACCTTTGTACTG;SOR=0.597;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=188;TCF=126;TCR=62;TR=124;WE=28847814;WS=28847796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,135:0.64:212
chr2	28849435	rs10186023	T	C	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=96;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=257;ReadPosRankSum=-1.209;SC=TCTGGCAACATCCTTGCCCAT;SOR=0.701;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=47;TCF=12;TCR=35;TR=17;WE=28849443;WS=28849425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,17:0.35:49
chr2	28849461	rs149607211	CCCCGAGCTCCTTGCT	C	904.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=2963;ReadPosRankSum=1.509;SC=CCTGGCCCTGCCCCGAGCTCC;SOR=0.693;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=15;WE=28849483;WS=28849451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,23:0.74:31
chr2	28849473	rs899149	T	C	75.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=397;ReadPosRankSum=-2.411;SC=CCGAGCTCCTTGCTCATGGGA;SOR=0.569;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=7;WE=28849483;WS=28849451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,7:0.23:30
chr2	28853352	rs6713038	C	T	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=296;ReadPosRankSum=-1.361;SC=GGCTGCAGGCCCCTGGGGTAG;SOR=0.997;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=17;WE=28853360;WS=28853342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr2	28853377	rs6731155	T	C	657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.041;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=9;PP=443;ReadPosRankSum=0.177;SC=CTGCTCTGTGTGTCAGAGCCA;SOR=0.864;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=41;TCR=18;TR=29;WE=28853385;WS=28853367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,30:0.48:63
chr2	28854816	rs2272388	G	A	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.688;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=271;ReadPosRankSum=0.528;SC=GTTGACTCCCGTCAACAACCA;SOR=2.093;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=14;WE=28854824;WS=28854807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr2	28854958	rs2199619	C	T	2826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.048;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=56;PP=1640;ReadPosRankSum=0.374;SC=GAGGACTTTGCGGTTGTGGTG;SOR=0.596;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=197;TCF=108;TCR=89;TR=116;WE=28854966;WS=28854948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,129:0.58:222
chr2	28855918	rs34314459	A	AG	7225.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=97;PP=2974;SC=TGAGCAGCCAAGGCCTGGTGG;SOR=0.944;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=123;TCF=20;TCR=103;TR=117;WE=28855926;WS=28855908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr2	28856047	rs3752901	T	C	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.897;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=423;ReadPosRankSum=0.417;SC=TTGGTCCTGATAGATTAATTC;SOR=2.093;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=39;TCF=9;TCR=30;TR=21;WE=28856055;WS=28856037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,22:0.51:43
chr2	28863738	rs56350389	A	G	1903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.344;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=30;PP=1259;ReadPosRankSum=1.143;SC=CCCCTCAGAGAGGAAAGTGTC;SOR=0.567;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=137;TCF=87;TCR=50;TR=79;WE=28863746;WS=28863728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,84:0.57:148
chr2	28865760	rs2272387	T	C	4419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=338;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=100;PP=2872;ReadPosRankSum=-0.848;SC=GAACAGCCGATTGCTCCCAGA;SOR=0.689;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=319;TCF=145;TCR=174;TR=187;WE=28865768;WS=28865750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,199:0.59:338
chr2	28865968	rs57817040	T	C	116.10	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5040;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=3;PP=41;ReadPosRankSum=-0.489;SC=CTATAGCCACTCTCTTCACCG;SOR=0.330;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=6;WE=28865976;WS=28865958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr2	28974897	.	C	T	1759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.157;ClippingRankSum=0.000;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.061;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=39;PP=1145;ReadPosRankSum=-0.326;SC=CGCCGCGTGACTTGTAGGTGA;SOR=0.619;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=212;TCF=125;TCR=87;TR=92;WE=28974905;WS=28974887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,96:0.44:216
chr2	28975107	rs2276547	G	C	869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.671;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=28;PP=687;ReadPosRankSum=0.043;SC=CTGCGTCCCCGTCTGCCGCCG;SOR=2.554;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=48;TCF=6;TCR=42;TR=30;WE=28975115;WS=28975097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,32:0.64:50
chr2	29001691	rs1128416	A	G	949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.496;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=13;PP=464;ReadPosRankSum=1.073;SC=TTCATGGACAATATACAGATT;SOR=0.257;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=55;TCF=38;TCR=17;TR=35;WE=29001699;WS=29001681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,42:0.66:64
chr2	29045323	rs4436918	C	T	3331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=58;PP=1800;SC=CTATTATATACATTACACCTT;SOR=0.937;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=50;TCR=58;TR=108;WE=29045331;WS=29045313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr2	29052256	rs12998251	T	C	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=2.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.29;ReadPosRankSum=0.780;SOR=0.188;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr2	29087814	rs55785599	C	A	1022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.923;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=10;PP=692;ReadPosRankSum=1.570;SC=ATCTTTATACCTTTCTGTTAT;SOR=0.874;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=89;TCF=68;TCR=21;TR=44;WE=29087822;WS=29087804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,45:0.49:92
chr2	29092679	rs4233729	T	C	2753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.949;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=59;PP=1747;ReadPosRankSum=-1.150;SC=CTAAAATCAGTTCCCCAGCCT;SOR=0.659;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=273;TCF=140;TCR=133;TR=123;WE=29092687;WS=29092669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,133:0.46:292
chr2	29092850	rs4666122	G	T	2466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=392;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.798;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=56;PP=1513;ReadPosRankSum=-0.146;SC=GCTCTCGAGGGGATGACTCTT;SOR=0.639;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=353;TCF=197;TCR=156;TR=129;WE=29092858;WS=29092840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:252,140:0.36:392
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chr2	29129418	rs11688605	A	G	1839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.936;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.422;NF=47;NR=49;PP=1129;ReadPosRankSum=0.091;SC=ATATTGTGGAATGGAACGTAC;SOR=0.765;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=267;TCF=129;TCR=138;TR=96;WE=29129426;WS=29129408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:184,103:0.36:287
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chr2	29136623	rs4666133	T	C	1106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.029;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=34;PP=594;ReadPosRankSum=0.263;SC=ACCCAAAGTATGCCTTTTAAA;SOR=0.893;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=157;TCF=66;TCR=91;TR=57;WE=29136631;WS=29136613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,63:0.37:170
chr2	29136653	rs4666134	T	C	899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.739;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=24;PP=593;ReadPosRankSum=-2.652;SC=ATTAAGTGAATCTTTAATTCA;SOR=0.842;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=107;TCF=44;TCR=63;TR=40;WE=29136661;WS=29136643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,43:0.38:114
chr2	29136685	rs12472068	C	T	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.347;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=328;ReadPosRankSum=-0.942;SC=AACAAAGGTGCGGAGTGGTAG;SOR=1.184;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=82;TCF=32;TCR=50;TR=24;WE=29136693;WS=29136675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,25:0.28:90
chr2	29140711	rs4389288	G	A	1899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.455;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=45;PP=1221;ReadPosRankSum=-0.425;SC=TTTTTAGGAAGAAAATTAAAT;SOR=0.732;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=245;TCF=129;TCR=116;TR=98;WE=29140719;WS=29140701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,104:0.39:266
chr2	29145725	rs9653591	G	T	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.49;ReadPosRankSum=0.032;SOR=0.638;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,18:0.33:55
chr2	29161010	rs4233731	G	A	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=124;ReadPosRankSum=-0.817;SC=GTTTTACCCCGGGTGCAATGA;SOR=0.641;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=8;WE=29161018;WS=29161000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr2	29169612	rs3087649	T	C	2677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=61;PP=1827;ReadPosRankSum=0.719;SC=GAGATTCTGATTTAGATCCTG;SOR=0.699;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=259;TCF=128;TCR=131;TR=118;WE=29169620;WS=29169602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,129:0.45:285
chr2	29221994	rs72786175	G	T	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=106;ReadPosRankSum=-0.287;SC=GCTGGTGCCTGGTGCCACCCT;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=8;WE=29222002;WS=29221984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr2	29222070	rs13009279	G	A	1913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=31;PP=1111;ReadPosRankSum=0.672;SC=TGAGCCAAGAGCCCTGCTGAA;SOR=0.715;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=130;TCF=80;TCR=50;TR=82;WE=29222078;WS=29222060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,90:0.63:143
chr2	29222388	rs57018089	G	C	2145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=48;PP=1564;SC=GTCAAGGGCCGCAGGCCTCCA;SOR=1.739;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=22;TCR=48;TR=70;WE=29222396;WS=29222378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr2	29225502	rs72786178	T	G	3259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.22;ReadPosRankSum=0.880;SOR=0.753;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:114,87:0.43:201
chr2	29225502	.	TCT	GCC	2430	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=41;NR=35;PP=2430;QD=32.6772088798;SC=GGCCGATGCCTCTCATCCAGA;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=180;TCF=102;TCR=78;TR=76;WE=29225512;WS=29225492;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:104,76:0.42:180
chr2	29225504	rs72786179	T	C	3308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FS=0.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.98;ReadPosRankSum=0.553;SOR=0.751;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,90:0.43:207
chr2	29225710	rs72786181	C	T	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=4.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.18;ReadPosRankSum=1.227;SOR=1.688;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,6:0.16:38
chr2	29226498	rs12613325	G	A	2665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.569;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=70;PP=1582;ReadPosRankSum=1.315;SC=TTCCCAGCCCGTTACCTCCAG;SOR=0.640;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=177;TCF=65;TCR=112;TR=111;WE=29226520;WS=29226488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,120:0.63:191
chr2	29226512	rs12623297	A	G	4067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=93;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.042;SC=CCTCCAGGCCAGGGAGTCCTC;SOR=0.703;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=46;TCR=94;TR=139;WE=29226520;WS=29226488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,149:0.99:150
chr2	29226559	rs12619829	C	T	1405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=34;PP=917;SC=GTAAGAGCTCCAAGTCAAACC;SOR=2.655;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=10;TCR=34;TR=44;WE=29226567;WS=29226549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	29239942	rs11685375	T	G	3292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.138;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=53;PP=2253;ReadPosRankSum=1.292;SC=TGGCACACAGTAGAAACATTT;SOR=0.800;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=203;TCF=125;TCR=78;TR=136;WE=29239950;WS=29239932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,142:0.66:215
chr2	29240060	rs11127202	A	G	2825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.743;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=74;PP=1851;ReadPosRankSum=-0.494;SC=GAGAAGATGCAGCTGAAGCAG;SOR=0.853;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=199;TCF=84;TCR=115;TR=122;WE=29240068;WS=29240050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,129:0.60:214
chr2	29240582	rs66482868	T	C	896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.246;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=8;PP=617;ReadPosRankSum=-0.369;SC=CAGCCATGGGTCCATTTTCAA;SOR=1.448;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=65;TCF=46;TCR=19;TR=36;WE=29240590;WS=29240572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,38:0.56:68
chr2	29240673	rs35166194	G	A	2469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FS=0.609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.61;ReadPosRankSum=-0.538;SOR=0.643;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,115:0.68:169
chr2	29240686	rs34261417	A	C	2545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.567;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=50;PP=2962;ReadPosRankSum=0.899;SC=GCAGCGGGACACTGTCTGTGC;SOR=0.673;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=168;TCF=90;TCR=78;TR=105;WE=29240694;WS=29240663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,116:0.64:182
chr2	29240783	rs1109758	A	G	3312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=63;NR=59;PP=1905;SC=CAGCATCCCCATCAGCCGGCA;SOR=0.709;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=63;TCR=59;TR=122;WE=29240791;WS=29240773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr2	29245933	rs13420380	G	A	1846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=39;PP=830;ReadPosRankSum=-0.054;SC=CTGCAACAGGGCCTGGCCTTG;SOR=0.681;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=202;TCF=101;TCR=101;TR=82;WE=29245941;WS=29245923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,98:0.43:226
chr2	29246044	rs6721861	T	C	809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=0.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.92;ReadPosRankSum=-0.003;SOR=0.590;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,46:0.39:117
chr2	29249670	rs72788152	C	G	2516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.849;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=53;PP=1586;ReadPosRankSum=2.794;SC=CCTGGGGACTCCCACACCACT;SOR=0.595;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=305;TCF=181;TCR=124;TR=127;WE=29249678;WS=29249660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:200,134:0.40:334
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chr2	29356567	rs17749904	G	C	1827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=43;PP=1043;ReadPosRankSum=0.406;SC=TTATTGACCTGGGAGCAGACA;SOR=0.707;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=261;TCF=148;TCR=113;TR=96;WE=29356575;WS=29356557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,101:0.36:279
chr2	29366830	rs3213947	A	G	1735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.339;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.809;NF=24;NR=41;PP=924;ReadPosRankSum=0.942;SC=AGTAACTGCAATCTCTGAAGC;SOR=0.514;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=111;TCF=40;TCR=71;TR=65;WE=29366838;WS=29366820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,81:0.61:132
chr2	29366875	rs3217572	C	CACAG	1584.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.036;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.827;NF=0;NR=20;PP=1037;ReadPosRankSum=-1.796;SC=TGTTCAAGGACACAGTATGGT;SOR=0.972;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=20;WE=29366883;WS=29366865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,41:0.61:67
chr2	29375775	rs113615666	C	CT	580.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.223;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.549;NF=0;NR=18;PP=304;ReadPosRankSum=0.208;SC=GATTGCTTCACTTTTTTTTGT;SOR=0.411;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=0;TCR=56;TR=18;WE=29375783;WS=29375765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,28:0.47:60
chr2	29383256	rs3100246	G	T	1592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=4.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.451;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=48;PP=1175;ReadPosRankSum=-1.262;SC=GGGGAACTCCGCCTCGGAGAG;SOR=1.037;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=237;TCF=114;TCR=123;TR=82;WE=29383264;WS=29383246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,83:0.32:256
chr2	29383374	rs2305450	G	A	1924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=46;PP=1286;SC=ATTCTTTAGAGTACAAAAGGT;SOR=1.545;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=24;TCR=46;TR=70;WE=29383382;WS=29383364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr2	29386646	rs10200936	G	C	990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=8;PP=647;ReadPosRankSum=1.016;SC=AGTAGCATAAGAGTTTTGGAT;SOR=0.648;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=52;TCR=13;TR=39;WE=29386654;WS=29386636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,42:0.61:69
chr2	29390301	rs72790253	A	G	1373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.596;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=26;PP=843;ReadPosRankSum=1.887;SC=AAACCTGAAGACCAGCTACTT;SOR=0.753;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=141;TCF=79;TCR=62;TR=63;WE=29390309;WS=29390291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,69:0.45:153
chr2	29416366	rs1881421	G	C	2672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=60;PP=1794;ReadPosRankSum=1.400;SC=GGTTACCCCTGTCGTGTGGCT;SOR=0.699;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=226;TCF=108;TCR=118;TR=112;WE=29416374;WS=29416350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,119:0.49:244
chr2	29416572	rs1670283	T	C	9668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=362;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=171;NR=164;PP=2965;SC=CGAACAGAGATCTCTGCAGCT;SOR=0.699;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=335;TCF=171;TCR=164;TR=335;WE=29416580;WS=29416562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,361:1.00:361
chr2	29416794	rs17007646	G	A	2862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.955;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=69;PP=1587;ReadPosRankSum=1.436;SC=GGGTCCTGCCGTAGGGGAAAT;SOR=0.630;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=242;TCF=102;TCR=140;TR=121;WE=29416802;WS=29416784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,137:0.52:262
chr2	29419591	rs1670284	G	T	1745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=21;PP=1114;ReadPosRankSum=0.206;SC=CTTTAAGACTGTTTCATATAG;SOR=0.742;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=169;TCF=121;TCR=48;TR=75;WE=29419599;WS=29419581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,81:0.44:185
chr2	29432776	rs3738867	T	C	2616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.630;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=54;PP=1547;ReadPosRankSum=0.598;SC=TTCCTAATTTTATCCCTAGGA;SOR=0.624;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=147;TCF=68;TCR=79;TR=103;WE=29432784;WS=29432766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,116:0.70:165
chr2	29444095	rs1569156	C	T	2163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=46;PP=1347;SC=CAACTGCTTCCAAGAGAGACT;SOR=1.468;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=27;TCR=46;TR=73;WE=29444103;WS=29444085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr2	29445113	rs72852030	C	T	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=371;ReadPosRankSum=0.365;SC=CTAGGGACAACACGATTTCCC;SOR=0.646;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=50;TCF=38;TCR=12;TR=26;WE=29445121;WS=29445103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,26:0.49:53
chr2	29449819	rs2293563	C	T	1588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.254;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=24;PP=1051;ReadPosRankSum=-0.486;SC=CAGCCAGCACCGTCCCGTGGT;SOR=1.097;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=115;TCF=71;TCR=44;TR=64;WE=29449827;WS=29449809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,71:0.54:131
chr2	29450383	rs114991822	G	A	1202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.658;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=15;PP=660;ReadPosRankSum=0.450;SC=TGAGGTTTTAGCTTGGTGGGA;SOR=0.949;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=88;TCF=58;TCR=30;TR=48;WE=29450391;WS=29450373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,56:0.55:102
chr2	29450605	rs80250630	G	A	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.951;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=302;ReadPosRankSum=0.299;SC=ACACACACACGTCAGTGGGGC;SOR=1.508;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=16;WE=29450613;WS=29450595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr2	29455267	rs2256740	A	G	7819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=153;NR=127;PP=2965;SC=AGGCCCTGCCACCACCTCCGG;SOR=0.886;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=280;TCF=153;TCR=127;TR=280;WE=29455275;WS=29455257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,303:1.00:303
chr2	29456384	rs77684724	TG	CA	1285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=5;PP=1206;SC=GCTCTGACATTGCAGATGCAC;SOR=2.387;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=24;WE=29456393;WS=29456374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	29462520	rs77855517	G	A	1113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=6;PP=839;SC=GAGTGCAGACGAGAAACCCCT;SOR=3.145;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=36;WE=29462528;WS=29462510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr2	29498210	rs4589708	A	G	1794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=25;PP=1382;SC=GGAGGGGACAATGAGGCCATG;SOR=0.836;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=30;TCR=25;TR=55;WE=29498218;WS=29498200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
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chr2	29525341	.	ATCAT	GTCAC,GTCAT	696	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=32,47;NR=2,2;PP=696,240;QD=22.0431727901;SC=CCGAGATTGCATCATTGCACT;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=49;TCF=47;TCR=2;TR=34,49;WE=29525353;WS=29525331;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.69:49
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chr2	29543663	rs2293564	T	C	3238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=39;PP=2059;SC=TGACCTGCCATTGAGGAGTGT;SOR=1.309;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=70;TCR=39;TR=109;WE=29543674;WS=29543653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr2	29551161	rs62130643	G	A	1408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=18;PP=984;ReadPosRankSum=-0.151;SC=TGGGGACAACGGGGTTATGAG;SOR=0.661;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=139;TCF=100;TCR=39;TR=65;WE=29551169;WS=29551151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,66:0.44:151
chr2	29754721	rs11689790	T	C	1078.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=14;PP=545;ReadPosRankSum=-0.817;SC=TCTGGAAATGTGTAACCAAAA;SOR=0.635;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=109;TCF=75;TCR=34;TR=47;WE=29754729;WS=29754711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,54:0.44:124
chr2	29917940	rs2256376	C	G	1536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=33;PP=985;SC=CTTTTCAGCCCCCTCCACTCC;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=18;TCR=33;TR=51;WE=29917948;WS=29917930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr2	29940529	rs2246745	A	T	9757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=365;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=163;NR=149;PP=2965;SC=GAGAAGGAGAAGGCATGTTTG;SOR=0.699;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=312;TCF=163;TCR=149;TR=312;WE=29940537;WS=29940519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,365:1.00:365
chr2	30143499	rs4358080	G	C	1097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=26;PP=821;SC=GCAGCGGCAGGAGCCACAGGA;SOR=2.649;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=33;WE=30143507;WS=30143489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	30381505	rs1137288	T	C	342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=241;ReadPosRankSum=0.829;SC=TGCAGTACAGTGAAGTTCAAG;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=12;WE=30381513;WS=30381495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr2	30480196	rs6548005	C	G	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.614;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=292;ReadPosRankSum=0.395;SC=AGTCCCTGGCCTATGGCATGC;SOR=1.304;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=83;TCF=62;TCR=21;TR=24;WE=30480204;WS=30480186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,26:0.28:92
chr2	30682360	rs829574	G	A	1995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=14;PP=1100;SC=TGATGAGCCCGGTGCACTGTT;SOR=1.675;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=45;TCR=14;TR=59;WE=30682368;WS=30682350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr2	30682630	rs829573	T	A	875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.058;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=20;PP=472;ReadPosRankSum=1.676;SC=GTTTTTGTCTTGCTTCATATA;SOR=0.510;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=54;TCF=18;TCR=36;TR=32;WE=30682638;WS=30682620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,39:0.63:62
chr2	30756196	rs829624	A	G	2740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=69;PP=1658;ReadPosRankSum=0.093;SC=TTATTCACACATTATTTTAAG;SOR=0.713;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=222;TCF=86;TCR=136;TR=112;WE=30756204;WS=30756186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,124:0.51:241
chr2	30756265	rs829625	G	A	821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-3.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=26;PP=573;ReadPosRankSum=-2.030;SC=GCATTAAAGCGATTCCATTTT;SOR=0.498;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=56;TCF=5;TCR=51;TR=29;WE=30756273;WS=30756255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,32:0.52:61
chr2	30775299	rs12053428	G	A	1311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=10;PP=857;SC=GTTTGTTAGAGTATTATGTAA;SOR=2.110;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=32;TCR=10;TR=42;WE=30775307;WS=30775289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr2	30791152	rs6749074	A	G	1089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=25;PP=779;SC=TTGTCTCAAGAAATGAGATAT;SOR=2.964;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=31;WE=30791160;WS=30791142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	30828792	rs2248777	G	A	2832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=23;PP=1920;SC=TAAGGAGCGCGCAACCTAGAT;SOR=2.141;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=93;TCF=70;TCR=23;TR=92;WE=30828800;WS=30828782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr2	30955528	rs2276567	C	A	680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=16;PP=431;SC=AGGGCCCGGCCACCTCCCACC;SOR=1.893;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=23;WE=30955536;WS=30955518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	30959262	rs509380	G	T	4094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=89;NR=51;PP=2478;SC=AGGGGTGAGAGTTCCTCTTCT;SOR=1.208;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=89;TCR=51;TR=140;WE=30959270;WS=30959252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr2	30959562	rs72867120	G	T	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=241;ReadPosRankSum=-0.622;SC=TCACCTGGATGTGGCCCCATG;SOR=0.793;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=11;WE=30959570;WS=30959552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr2	30961393	rs78810531	G	A	1257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.967;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=29;PP=779;ReadPosRankSum=-2.206;SC=TCTGCCTGCCGTGTAAAAGCA;SOR=0.512;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=72;TCF=28;TCR=44;TR=50;WE=30961401;WS=30961383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,54:0.69:78
chr2	30973825	rs1879283	C	A	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.565;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=308;ReadPosRankSum=-0.603;SC=TAGACTTGGACTGCATGAATG;SOR=2.133;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=14;WE=30973833;WS=30973815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr2	30976058	rs2926304	C	T	2119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.173;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=53;PP=1198;ReadPosRankSum=-0.849;SC=AATCTTGACACGACATCCTGT;SOR=0.811;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=278;TCF=144;TCR=134;TR=107;WE=30976066;WS=30976048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:189,116:0.38:305
chr2	30977073	rs485100	G	A	8723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=166;NR=137;PP=2965;SC=TTCCACCTTCGTAAATGTTCA;SOR=0.895;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=304;TCF=166;TCR=138;TR=303;WE=30977081;WS=30977063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,324:1.00:324
chr2	30980940	rs508405	C	T	2967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=23;PP=1925;SC=CTCCATTCGGCCTCGCCCCAG;SOR=2.027;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=70;TCR=23;TR=93;WE=30980948;WS=30980930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr2	30986853	rs17396613	A	G	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5042;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=479;ReadPosRankSum=0.151;SC=GCAGGGTTCAATGGGGTGACC;SOR=1.255;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=21;WE=30986861;WS=30986843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,20:0.87:23
chr2	30986989	rs579016	G	T	2652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=50;PP=1722;ReadPosRankSum=0.467;SC=GGGCTCCCCAGTGACTTACCC;SOR=0.702;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=209;TCF=116;TCR=93;TR=111;WE=30986997;WS=30986979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,122:0.54:228
chr2	31009977	rs1915125	G	C	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=184;ReadPosRankSum=-1.501;SC=GGGTATGCTCGTGTGGGGCTC;SOR=1.022;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=11;WE=31009985;WS=31009967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr2	31188957	rs889896	C	T	779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=0;PP=654;SC=GTGCCTGGCACGTAGTTAGAT;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=31188965;WS=31188947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	31397696	rs10168043	G	C	1977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=39;PP=1167;SC=GCCAGAGGGAGCATATCATCC;SOR=1.745;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=22;TCR=39;TR=61;WE=31397704;WS=31397686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr2	31397727	rs10180369	T	C	1114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=25;PP=763;SC=ATAAATCAACTTGAAATATAA;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=34;WE=31397735;WS=31397717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr2	31399358	rs7570373	T	G	894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=1;PP=712;SC=CAGAATAAAGTGTCCCCAGAG;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=31399366;WS=31399348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	31399414	rs7556787	G	C	3587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=27;PP=2359;SC=CCACCTCTACGTAAGATGACA;SOR=2.207;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=81;TCR=27;TR=108;WE=31399422;WS=31399404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr2	31399659	rs6720151	T	C	4585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=96;PP=2959;SC=CGCAGCCACATCTATGATAAG;SOR=1.669;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=146;TCF=50;TCR=96;TR=146;WE=31399667;WS=31399649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr2	31399751	rs6720254	T	G	1560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=16;PP=1280;SC=CACAGGCACTTGGCTGGAGGT;SOR=1.755;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=35;TCR=16;TR=51;WE=31399759;WS=31399741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	31399988	rs4592896	C	T	2692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=60;PP=1770;SC=AGCTGACAGACGTCATCACTG;SOR=1.634;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=90;TCF=29;TCR=61;TR=89;WE=31399996;WS=31399978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr2	31400039	rs4516476	A	G	1082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=29;PP=816;SC=TGCTGTGGGTATTGGGGGCTT;SOR=3.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=32;WE=31400047;WS=31400029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	31400502	rs13421721	A	C	286.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.97;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	31400510	rs1443707	G	A	320.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.10;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	31400722	rs1443706	G	A	4570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=78;PP=2740;SC=CAGGAAGCCAGGCATTTCCAA;SOR=0.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=153;TCF=75;TCR=78;TR=153;WE=31400730;WS=31400712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr2	31400867	rs1373216	T	C	344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=8;PP=161;SC=TACCGCCTCATGTTTCCTACA;SOR=3.767;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=31400875;WS=31400857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	31401188	rs4951967	A	C	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=51;ReadPosRankSum=-0.842;SC=GAACTTCAGGAGACTACTGCA;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=4;WE=31401196;WS=31401178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr2	31401290	rs4952052	A	C	3525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=40;PP=2396;SC=TAAAGGGCTGAAGGGGACAGA;SOR=1.482;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=120;TCF=80;TCR=40;TR=119;WE=31401298;WS=31401280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr2	31401499	rs28684727	G	A	2342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=54;PP=1675;SC=CCATGCTTTGGAGGCAGTGAT;SOR=2.215;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=19;TCR=54;TR=73;WE=31401507;WS=31401489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr2	31403947	rs2028678	G	A	2179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=49;PP=1396;SC=AGGCAGTGCTGCATGGGCCAG;SOR=2.494;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=16;TCR=49;TR=65;WE=31403955;WS=31403937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr2	31409115	rs10445909	T	C	495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=424;SC=ATTTTCAAAGTTGTATAAATT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=31409123;WS=31409105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	31410653	rs7422120	C	T	8069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=140;NR=128;PP=2965;SC=AAGAATTCATCCTGCCTTTCA;SOR=0.764;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=269;TCF=140;TCR=129;TR=268;WE=31410661;WS=31410643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,290:1.00:290
chr2	31410708	rs1822496	C	T	7777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=124;NR=134;PP=2965;SC=CAGAAAGACACAATTATTCAC;SOR=0.818;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=258;TCF=124;TCR=134;TR=258;WE=31410716;WS=31410698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,287:1.00:287
chr2	31410728	rs764072	C	A	7755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=117;NR=137;PP=2965;SC=CCTGTATAAACGGACTTTCGT;SOR=0.945;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=254;TCF=117;TCR=137;TR=254;WE=31410736;WS=31410718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,282:1.00:282
chr2	31411184	rs1465972	C	A	12089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=453;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=226;NR=200;PP=2965;SC=GACTACTCACCTTTGAGAAGA;SOR=0.799;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=426;TCF=226;TCR=200;TR=426;WE=31411192;WS=31411174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,453:1.00:453
chr2	31411242	rs1465973	C	A	12761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=472;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=203;NR=229;PP=2965;SC=CAAACAAGAACAAACTCAGAG;SOR=0.829;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=434;TCF=204;TCR=230;TR=432;WE=31411250;WS=31411232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,470:1.00:470
chr2	31411310	rs1465974	C	T	6414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=136;PP=2965;SC=TCGTCTTCCACGTTCCTTCAC;SOR=1.389;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=217;TCF=81;TCR=136;TR=217;WE=31411318;WS=31411300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr2	31411365	rs1465975	G	A	2410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=59;PP=1608;SC=CTCACCTCCTGCTTCCCCTTG;SOR=2.698;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=17;TCR=59;TR=76;WE=31411373;WS=31411355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr2	31412096	rs55741080	T	C	464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=1;PP=293;SC=CCTGTCCTCGTCCAAGTGGTC;SOR=2.584;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=31412104;WS=31412094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	31412443	rs13382984	T	C	2615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=21;PP=1824;SC=TAAGGTGGCCTCTGCTCTGCC;SOR=1.809;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=79;TCF=58;TCR=21;TR=78;WE=31412451;WS=31412433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr2	31412646	rs1562021	T	C	7355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=111;NR=149;PP=2965;SC=TTCCATTTTATGGCTGAGGGC;SOR=1.111;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=260;TCF=111;TCR=149;TR=260;WE=31412654;WS=31412636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,282:1.00:282
chr2	31412670	rs1465976	C	T	5408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=119;PP=2965;SC=GAGGCTTAGACGGGTTAGGTC;SOR=1.585;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=181;TCF=62;TCR=119;TR=181;WE=31412678;WS=31412660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr2	31414223	rs13408524	G	A	1345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.39;SOR=1.201;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr2	31414807	rs1562022	C	G	1418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.484;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=28;PP=883;ReadPosRankSum=0.386;SC=CTACCCTATACAGGTAGAAGC;SOR=0.527;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=107;TCF=59;TCR=48;TR=59;WE=31414815;WS=31414797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,64:0.55:117
chr2	31414851	rs7587515	T	C	1113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.631;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=24;PP=555;ReadPosRankSum=-0.762;SC=TTGCGGCACCTGTGCCTGGGC;SOR=0.632;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=128;TCF=72;TCR=56;TR=53;WE=31414859;WS=31414841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,57:0.41:140
chr2	31415054	rs17010928	G	A	1831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.504;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=52;PP=1057;ReadPosRankSum=-0.027;SC=GTCTGAGGACGCCTCTGCCAG;SOR=0.629;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=210;TCF=90;TCR=120;TR=93;WE=31415062;WS=31415044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,97:0.44:220
chr2	31415077	rs10192210	G	A	1693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.145;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=47;PP=1118;ReadPosRankSum=1.317;SC=TTGACACCCTGAGGCCCACTG;SOR=0.893;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=138;TCF=54;TCR=84;TR=74;WE=31415085;WS=31415067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,78:0.54:145
chr2	31420245	rs7568661	A	G	5729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=93;NR=96;PP=2965;SC=CTGAGTGCAAACATTCCAGAG;SOR=0.843;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=189;TCF=93;TCR=96;TR=189;WE=31420253;WS=31420235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr2	31422452	rs7563977	T	A	5254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=91;PP=2965;SC=AGCTTATTCTTTGAGTCGTGG;SOR=0.846;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=178;TCF=87;TCR=91;TR=178;WE=31422460;WS=31422442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr2	31422514	rs7564077	T	A	3347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=67;PP=1922;SC=TGGGAGATAATCATGGTATGG;SOR=1.262;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=46;TCR=67;TR=113;WE=31422522;WS=31422504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr2	31422601	rs7576637	A	T	709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=19;PP=512;SC=TTCTGCAGTGATCATGCCATA;SOR=3.442;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=31422609;WS=31422591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	31423443	rs17011001	G	A	3733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=71;NR=55;PP=2099;SC=AGTCTACAAGGGCTTCAGACA;SOR=0.737;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=126;TCF=71;TCR=55;TR=126;WE=31423451;WS=31423433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr2	31424693	rs749251	C	A	567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.069;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=10;PP=369;ReadPosRankSum=-0.424;SC=GAAAAAGAAGCGATGGGAAGG;SOR=0.971;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=62;TCF=36;TCR=26;TR=25;WE=31424701;WS=31424683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,27:0.41:66
chr2	31426096	rs1470334	T	G	1501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.73;ReadPosRankSum=1.606;SOR=0.642;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,45:0.32:140
chr2	31426096	.	TAC	GAT	1281	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=15;NR=23;PP=1281;QD=35.1175756543;SC=CCCAAAACTGTACTTATGGGG;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=121;TCF=50;TCR=71;TR=38;WE=31426106;WS=31426086;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:83,38:0.31:121
chr2	31426098	rs1470335	C	T	1501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.21;ReadPosRankSum=0.844;SOR=0.658;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,45:0.34:134
chr2	31457817	rs2236170	T	C	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.107;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=188;ReadPosRankSum=-1.251;SC=ATGGGAAGCCTTCAGTTGAGG;SOR=2.636;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=10;WE=31457825;WS=31457807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr2	31467351	rs2295473	T	A	2190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.163;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=55;PP=1193;ReadPosRankSum=-1.069;SC=TTTCAGGTGCTCTCTTTTCTT;SOR=0.573;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=169;TCF=67;TCR=102;TR=94;WE=31467359;WS=31467341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,104:0.55:190
chr2	31483890	rs13028669	T	C	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-4.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.114;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=273;ReadPosRankSum=0.235;SC=CAGTGCATCATGTGTGTGACA;SOR=0.119;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=18;WE=31483898;WS=31483880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr2	31484334	rs654650	G	A	2392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.511;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=29;PP=1572;ReadPosRankSum=0.219;SC=GTAGGGGAAGGAATGATGCAA;SOR=0.377;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=141;TCF=101;TCR=40;TR=90;WE=31484342;WS=31484324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,98:0.64:154
chr2	31488965	rs619002	C	T	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.376;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=370;ReadPosRankSum=1.788;SC=CATTCTGGTGCTCATAGGAGG;SOR=1.093;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=21;WE=31488973;WS=31488955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,28:0.61:46
chr2	31489627	rs67643147	TAC	T	101.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=9.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.09;ReadPosRankSum=-0.398;SOR=0.036;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr2	31567743	rs566224	T	C	1606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=21;NR=28;PP=900;SC=TACCTTACCTTACATTGTCAC;SOR=1.278;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=21;TCR=28;TR=49;WE=31567751;WS=31567733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr2	31569471	rs7599175	A	G	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.313;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=321;ReadPosRankSum=-1.030;SC=ACCCAGCCAGAATGAGCATTT;SOR=1.688;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=56;TCF=47;TCR=9;TR=20;WE=31569479;WS=31569461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,22:0.37:59
chr2	31570376	rs1366813	T	C	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.100;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=208;ReadPosRankSum=1.450;SC=CGGGATCCCATGGGCTCCTTA;SOR=0.511;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=49;TCF=33;TCR=16;TR=17;WE=31570384;WS=31570366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,20:0.37:54
chr2	31570626	rs4952083	C	T	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.984;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=17.74;ReadPosRankSum=-0.135;SOR=0.293;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr2	31570631	rs4952084	A	G	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.799;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=16.52;ReadPosRankSum=0.403;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr2	31571241	rs13415401	G	C	1372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.604;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=34;PP=933;ReadPosRankSum=1.365;SC=TAGGGAAAGAGAAGGATGCCA;SOR=0.798;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=142;TCF=67;TCR=75;TR=62;WE=31571249;WS=31571231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,65:0.42:154
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chr2	31572482	rs11408029	T	TG	1775.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.07;MQRankSum=1.151;NF=15;NR=20;PP=1077;ReadPosRankSum=0.663;SC=GCTTCCTATATGGGGTCAGCA;SOR=0.710;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=91;TCF=37;TCR=54;TR=35;WE=31572490;WS=31572472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,71:0.44:163
chr2	31587235	rs1018505	G	A	742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.805;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=22;PP=434;ReadPosRankSum=-0.559;SC=ACATCATCCCGTGAAAAAAAG;SOR=1.090;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=100;TCF=39;TCR=61;TR=33;WE=31587243;WS=31587225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,39:0.35:113
chr2	31588288	rs2365842	T	A	1940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=45;PP=1183;ReadPosRankSum=-0.972;SC=ACAAAATGGCTCATCCCGCCC;SOR=0.709;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=238;TCF=129;TCR=109;TR=100;WE=31588296;WS=31588278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,103:0.41:251
chr2	31590759	rs2281550	C	T	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.145;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=268;ReadPosRankSum=1.147;SC=GGGTTCAATGCATATCTCTTG;SOR=0.448;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=69;TCF=56;TCR=13;TR=21;WE=31590767;WS=31590749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,22:0.29:75
chr2	31596955	rs4952086	G	A	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.93;ReadPosRankSum=0.000;SOR=0.616;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr2	31596963	rs4952087	T	C	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.30;ReadPosRankSum=-0.670;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr2	31600146	rs10187719	T	C	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=104;ReadPosRankSum=-0.857;SC=CCTTGCTCTGTAGGGGCTGCA;SOR=0.307;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=7;WE=31600154;WS=31600136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr2	31609448	rs477626	A	C	4381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=76;NR=69;PP=2533;SC=TCTTACTACAATGTCTCCCTC;SOR=0.755;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=146;TCF=76;TCR=70;TR=145;WE=31609456;WS=31609438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr2	31611029	rs2073316	G	A	1016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=5;PP=825;SC=CATGGAGCTCGTGCACTGACT;SOR=2.964;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=35;WE=31611037;WS=31611019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	31611367	rs206847	T	C	457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=15;PP=331;SC=AAACAACTCATGGATAAACAA;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=31611375;WS=31611357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	31805619	rs619857	T	C	987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=4;PP=628;SC=GTGCGCGCTCTACGCTGCGCT;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=29;WE=31805627;WS=31805609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr2	31805675	rs522638	A	G	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.881;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=7;PP=315;ReadPosRankSum=0.133;SC=GGCGCCCGCAAGGGAAAAACG;SOR=0.867;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=83;TCF=54;TCR=29;TR=24;WE=31805683;WS=31805665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,27:0.29:92
chr2	31805706	rs523349	G	C	769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=17;PP=436;ReadPosRankSum=-1.562;SC=AAGTAATGTAGGCAGAAGAGG;SOR=0.718;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=111;TCF=65;TCR=46;TR=41;WE=31805714;WS=31805696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,44:0.36:122
chr2	31805880	rs142200057	A	AG	7125.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=18;NR=63;PP=2936;SC=CCGTAGCCGGAGGCTTCGCGA;SOR=0.723;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=83;TCF=18;TCR=65;TR=81;WE=31805888;WS=31805870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr2	31806031	rs632148	C	G	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.913;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.447;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=5;PP=96;ReadPosRankSum=0.738;SC=CCCCGCAACCCCTTTATGGAG;SOR=0.132;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=8;WE=31806039;WS=31806021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr2	32117217	.	GA	G	112.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.216;ClippingRankSum=0.000;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=1.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.24;ReadPosRankSum=1.162;SOR=0.934;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,18:0.20:91
chr2	32312700	rs7561519	T	C	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=235;ReadPosRankSum=0.521;SC=TTCACATGATTGTCCAGATTT;SOR=0.602;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=18;WE=32312708;WS=32312690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr2	32314473	rs469305	A	T	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.10;ReadPosRankSum=0.414;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr2	32324072	rs7566162	T	C	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.809;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=119;ReadPosRankSum=0.878;SC=ATTGTTCATGTTTTCACAGGG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=7;WE=32324080;WS=32324062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr2	32361482	rs11392886	T	TC	140.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.930;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.332;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=91;ReadPosRankSum=0.439;SC=AAGGGACGGTTAGTAGTACTC;SOR=0.105;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=3;WE=32361490;WS=32361472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr2	32361907	.	TG	T	1717.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.845;ClippingRankSum=0.000;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.641;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.857;NF=18;NR=19;PP=1121;ReadPosRankSum=-0.686;SC=TCACATAGCTTGGTCTTTAAT;SOR=0.980;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=111;TCF=43;TCR=68;TR=37;WE=32361915;WS=32361897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,63:0.33:189
chr2	32362079	rs10627985	G	GTATA	2396.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.737;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.862;NF=14;NR=22;PP=1697;ReadPosRankSum=1.228;SC=CAGCATTTTAGTATATTTTCC;SOR=0.680;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=80;TCF=34;TCR=46;TR=36;WE=32362087;WS=32362069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,62:0.58:106
chr2	32369901	rs2365556	T	C	580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=17;NR=1;PP=447;SC=CACAGTGAGCTGAGATCATGC;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=32369909;WS=32369891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	32379663	rs56272862	A	G	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.723;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=281;ReadPosRankSum=-0.937;SC=CTAAGTTTACAGGACTTTTTA;SOR=0.299;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=57;TCF=7;TCR=50;TR=19;WE=32379671;WS=32379653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,19:0.33:58
chr2	32390834	rs6733481	A	C	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.043;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=268;ReadPosRankSum=0.985;SC=AAGGGGACGGAAGCCGGAGGC;SOR=2.584;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=13;WE=32390842;WS=32390824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
chr2	32402636	rs4258846	C	T	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.861;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=11;PP=254;ReadPosRankSum=-1.249;SC=GCTGGGATAACAGGCGTGAGC;SOR=0.816;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=49;TCR=34;TR=26;WE=32402644;WS=32402626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,26:0.28:94
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chr2	32449879	rs199998217	T	TAAA	321.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=5.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQRankSum=2.576;QD=3.50;ReadPosRankSum=-0.953;SOR=1.669;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,19:0.21:92
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chr2	32475109	rs455060	G	A	2759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=369;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.839;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=58;PP=1702;ReadPosRankSum=0.361;SC=TGAAGTCCAGGGCACTTGCAC;SOR=0.782;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=334;TCF=175;TCR=159;TR=124;WE=32475117;WS=32475099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:228,140:0.38:368
chr2	32476390	rs408813	T	G	1836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.586;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=45;PP=1150;ReadPosRankSum=-1.703;SC=GCATGGCAATTCGCTGCAGCA;SOR=0.830;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=222;TCF=110;TCR=112;TR=86;WE=32476398;WS=32476380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,94:0.38:247
chr2	32481793	rs11295492	AT	A	2307.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.482;HP=4;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=21;PP=1985;ReadPosRankSum=0.878;SC=AATCACCAGTATTTGGTAGCA;SOR=0.903;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=63;TCF=19;TCR=44;TR=32;WE=32481803;WS=32481783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,60:0.51:118
chr2	32481795	rs59966205	T	A	2316.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.368;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=21;PP=2000;ReadPosRankSum=0.960;SC=TCACCAGTATTTGGTAGCAGA;SOR=0.942;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=106;TCF=60;TCR=46;TR=53;WE=32481803;WS=32481783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,60:0.51:117
chr2	32667058	rs55734616	C	A	1070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.56;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	32667061	rs60955793	T	A	1095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.14;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	32667182	rs60197615	G	C	10052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=365;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=196;NR=123;PP=2965;SC=TGAGAAGCTTGTTAATACTCT;SOR=1.132;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=319;TCF=196;TCR=123;TR=319;WE=32667190;WS=32667172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,363:1.00:363
chr2	32667562	rs2276592	A	G	2357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=56;PP=1677;ReadPosRankSum=0.110;SC=CTTTCTAGGTACACCTGCAAT;SOR=1.036;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=78;TCF=21;TCR=57;TR=77;WE=32667570;WS=32667552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,83:0.99:84
chr2	32688601	rs762019	A	C	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=35;ReadPosRankSum=0.108;SC=AGTCTTTGTGATATTTAAATT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=32688609;WS=32688591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr2	32690109	.	AT	A	64.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.131;ClippingRankSum=0.000;DP=200;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.34;ReadPosRankSum=1.536;SOR=0.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:165,28:0.15:193
chr2	32706579	rs9646977	T	A	1299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=34;PP=967;SC=TCATGCCTGTTATCCCAGCAC;SOR=3.109;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=7;TCR=34;TR=41;WE=32706587;WS=32706569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr2	32712875	rs2366891	A	C	3449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=70;PP=2149;SC=TCAGGTATGAATTCAGGAGAA;SOR=2.001;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=32;TCR=70;TR=102;WE=32712883;WS=32712865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr2	32740138	rs34757266	T	C	3225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=428;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.783;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=75;PP=2123;ReadPosRankSum=1.460;SC=GCTCAATGTGTCACGTACACC;SOR=0.598;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=394;TCF=211;TCR=183;TR=153;WE=32740146;WS=32740128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:259,167:0.39:426
chr2	32749880	rs2710609	C	T	646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.12;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	32749890	rs2710610	C	T	871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.59;SOR=6.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	32749893	rs2710611	A	T	905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.29;SOR=6.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	32749903	rs2710612	T	C	905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.13;SOR=6.184;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	32855615	rs2710623	A	G	1562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=19;PP=937;ReadPosRankSum=-0.543;SC=TACAATTGCTACTGGAAGGGA;SOR=0.478;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=55;TCF=36;TCR=19;TR=54;WE=32855623;WS=32855605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,57:0.98:58
chr2	32860415	rs11124286	C	T	4600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=74;NR=82;PP=2487;SC=ATCCAGAACTCGTGCAGCAAA;SOR=0.944;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=156;TCF=74;TCR=82;TR=156;WE=32860423;WS=32860405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr2	32865521	rs1031261	G	C	3457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=77;PP=2187;ReadPosRankSum=1.734;SC=TATGACTTTTGTGCTTATTAA;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=269;TCF=133;TCR=136;TR=153;WE=32865529;WS=32865511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,163:0.55:296
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chr2	32958838	rs3830967	CTT	C	982.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.153;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.077;NF=13;NR=6;PP=630;ReadPosRankSum=-0.391;SC=ACAATAAGGACTTATTTATAT;SOR=1.085;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=64;TCF=34;TCR=30;TR=19;WE=32958847;WS=32958828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,30:0.32:93
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chr2	33392911	rs6728094	G	A	3789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=76;PP=2172;ReadPosRankSum=-0.357;SC=ATCAAGGAGAGCCCTTCTGCC;SOR=0.669;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=277;TCF=141;TCR=136;TR=156;WE=33392919;WS=33392901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,175:0.57:309
chr2	33407186	rs6759943	T	C	748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=0;PP=564;ReadPosRankSum=1.203;SC=TACTGGACTTTTATTGGTTGA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=41;TCR=0;TR=24;WE=33407194;WS=33407176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,26:0.60:43
chr2	33407285	rs2367619	G	A	4877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=387;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.789;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=121;NR=88;PP=2962;ReadPosRankSum=0.260;SC=CACGTATGCTGGTATAGTCCT;SOR=0.634;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=353;TCF=207;TCR=146;TR=209;WE=33407293;WS=33407275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,228:0.59:384
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chr2	33413640	rs6712473	G	T	1516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-2.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.269;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=10;PP=901;ReadPosRankSum=0.222;SC=CCAATCTGTTGTAGTGAAATT;SOR=1.168;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=89;TCF=70;TCR=19;TR=53;WE=33413648;WS=33413630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,61:0.60:102
chr2	33413949	rs4542826	G	A	1090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=25;PP=630;ReadPosRankSum=0.475;SC=TGCTTTAGCAGTGTCTTACAG;SOR=0.779;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=66;TCF=26;TCR=40;TR=41;WE=33413957;WS=33413939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,48:0.64:75
chr2	33414009	rs3922572	T	A	635.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=19;PP=639;SC=AATGCTTTTTTAAAAAAAAGG;SOR=2.215;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=10;TCR=19;TR=29;WE=33414017;WS=33413999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	33442549	rs2290449	G	A	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.959;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=7;PP=551;ReadPosRankSum=1.565;SC=GGCTGTGAGGGACAGCAGTGC;SOR=1.308;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=28;WE=33442557;WS=33442539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,28:0.60:47
chr2	33447202	rs2290448	C	T	4515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=390;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.766;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=109;NR=89;PP=2625;ReadPosRankSum=-2.264;SC=AGCGGGTTAACAACACCTTTT;SOR=0.757;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=354;TCF=189;TCR=165;TR=198;WE=33447210;WS=33447192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,217:0.56:390
chr2	33477964	rs3731575	C	T	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=166;ReadPosRankSum=0.209;SC=CATGAGTACACGGGACAACTT;SOR=0.793;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=9;WE=33477972;WS=33477954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr2	33488419	rs12468099	G	A	3097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.956;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=59;PP=1754;ReadPosRankSum=-0.238;SC=AAGCTTCTACGTCTAGTGCCA;SOR=0.763;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=233;TCF=127;TCR=106;TR=135;WE=33488427;WS=33488409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,147:0.57:258
chr2	33500848	rs3816479	A	G	4460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=350;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.399;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=114;NR=75;PP=2713;ReadPosRankSum=1.489;SC=AAACTCAACAATGCTATCTGC;SOR=0.729;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=316;TCF=189;TCR=127;TR=189;WE=33500856;WS=33500838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,206:0.60:346
chr2	33525407	rs2123769	A	G	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.706;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=2;PP=441;ReadPosRankSum=1.183;SC=AGTGCCAGACATAAGAAGTAC;SOR=1.828;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=25;WE=33525415;WS=33525397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,25:0.78:32
chr2	33540138	rs2276591	G	A	681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.45;NF=20;NR=3;PP=483;SC=AGATTTATTTGCCATCTGTTT;SOR=2.925;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=33540146;WS=33540128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	33540172	rs3216704	A	AT	449.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.276;HP=7;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.297;NF=9;NR=3;PP=235;ReadPosRankSum=1.189;SC=AATGAAACCGATTTTTTTCAA;SOR=1.656;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=44;TCF=24;TCR=20;TR=12;WE=33540180;WS=33540162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,22:0.39:57
chr2	33540248	rs1058840	G	A	5280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=108;NR=75;PP=2965;SC=TCTGTGGTCCGCAAGGGGAGT;SOR=0.938;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=183;TCF=108;TCR=75;TR=183;WE=33540256;WS=33540238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr2	33585796	rs4422143	T	C	8813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=143;NR=162;PP=2965;SC=ACATCAGGCGTGGGATGGGGA;SOR=0.886;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=305;TCF=143;TCR=162;TR=305;WE=33585804;WS=33585786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,338:1.00:338
chr2	33614187	rs642472	C	T	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=279;ReadPosRankSum=-0.985;SC=CTCTGAGCTGCGAGGGGGTGG;SOR=0.892;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=50;TCF=38;TCR=12;TR=20;WE=33614195;WS=33614177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,21:0.41:51
chr2	33622448	rs2367734	T	C	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=404;ReadPosRankSum=-0.405;SC=GAGTTTCAGTTTGAGAAGATG;SOR=0.793;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=37;TCF=10;TCR=27;TR=25;WE=33622456;WS=33622438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,28:0.70:40
chr2	33622475	rs12053346	T	C	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=201;ReadPosRankSum=-1.216;SC=GTTCTGGAGATGTACATTAAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=12;WE=33622483;WS=33622465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr2	33623306	rs2034693	C	T	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.707;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=1;PP=450;ReadPosRankSum=-0.281;SC=TTGTCTGTGACTGAAGCAATG;SOR=1.751;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=22;WE=33623314;WS=33623298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,24:0.69:35
chr2	33623387	rs624060	AT	GC	6086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.145;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.700;NF=81;NR=42;PP=2944;ReadPosRankSum=0.253;SC=TCCTCACAGAATAATATCCAA;SOR=0.810;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=194;TCF=128;TCR=66;TR=123;WE=33623396;WS=33623377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,149:0.67:224
chr2	33623720	rs8970	A	G	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.051;HP=1;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=377;ReadPosRankSum=0.640;SC=CTGGAAATACAGAAACAGCAT;SOR=3.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=10;WE=33623742;WS=33623710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr2	33623734	rs622716	A	G	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.712;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=2;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=379;ReadPosRankSum=0.094;SC=ACAGCATGGAATTGCAAGTCC;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=7;WE=33623742;WS=33623710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr2	33643740	rs6724875	T	G	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQRankSum=0.934;QD=6.51;ReadPosRankSum=2.542;SOR=1.053;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,18:0.44:41
chr2	33744958	rs7597095	C	T	1704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=24;PP=1028;SC=ATTGAGGGCACAGCTGCAGGG;SOR=1.162;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=39;TCR=24;TR=62;WE=33744966;WS=33744948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr2	33745208	rs2305576	T	C	6376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=95;NR=133;PP=2965;SC=CCACCAACTTTGTTAAAATTG;SOR=1.165;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=229;TCF=95;TCR=134;TR=228;WE=33745216;WS=33745198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr2	33764286	rs7592762	T	C	3890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=70;PP=2368;SC=AGGTAAGTGGTTGAGGGAGAA;SOR=1.085;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=126;TCF=56;TCR=70;TR=126;WE=33764305;WS=33764276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr2	33784161	rs2278955	G	A	2253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=46;PP=1367;SC=TGAGATGAGCGTTACAGAGGG;SOR=1.139;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=33;TCR=46;TR=79;WE=33784169;WS=33784151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr2	33784500	rs2278956	G	A	831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=1;PP=629;SC=TTAGATAAAGGAGAATTGGAA;SOR=4.332;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=33784508;WS=33784490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	33787976	rs10572554	CCTAA	C	1427.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=0;NR=25;PP=1185;SC=GAGAATTGACCCTAACTAACT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=0;TCR=44;TR=25;WE=33787987;WS=33787966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr2	33813031	rs62150471	G	A	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.008;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.363;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=104;ReadPosRankSum=-0.647;SC=CAGTCAATGGGGAGGAGGGTG;SOR=1.609;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=7;WE=33813039;WS=33813021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr2	33952022	rs4670913	C	A	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.918;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=108;ReadPosRankSum=1.817;SC=AGAGGAAAACCCAGGAAATGA;SOR=0.293;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=9;WE=33952030;WS=33952013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr2	33952055	rs2290101	C	G	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.058;HP=6;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=301;ReadPosRankSum=-1.461;SC=GAAAACTCAGCGGGGGCAGGA;SOR=0.223;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=18;WE=33952063;WS=33952045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,19:0.40:47
chr2	33952413	rs4477896	T	C	3451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=66;PP=2098;ReadPosRankSum=0.856;SC=CTCAGCAGGATAGTGAGGGCC;SOR=0.687;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=230;TCF=120;TCR=110;TR=138;WE=33952421;WS=33952401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,153:0.60:256
chr2	33952456	rs2367810	C	G	6786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=121;NR=109;PP=2965;SC=ACACCGCCACCCACCACTCCA;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=230;TCF=121;TCR=109;TR=230;WE=33952464;WS=33952446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr2	33952621	rs11684598	G	A	4864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=361;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.300;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=117;NR=85;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.013;SC=CTTCGGTGGCGTAAGCCACAC;SOR=0.914;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=330;TCF=180;TCR=150;TR=202;WE=33952630;WS=33952611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,219:0.61:360
chr2	35696612	rs4670472	C	T	319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=5;NR=8;PP=198;SC=GTTTTAGTGTCTATGTGCATG;SOR=1.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=5;TCR=8;TR=13;WE=35696620;WS=35696602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	36668395	rs2276673	T	A	1900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=25;PP=1032;ReadPosRankSum=-2.214;SC=TTTCTCTCCCTTTTAGAAGAG;SOR=0.690;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=157;TCF=103;TCR=54;TR=77;WE=36668403;WS=36668385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,88:0.51:171
chr2	36669645	rs17018798	T	C	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.945;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=326;ReadPosRankSum=-0.419;SC=TAGGACTGGGTTTGTGGAAGC;SOR=1.675;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=38;TCF=25;TCR=13;TR=19;WE=36669653;WS=36669635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr2	36669670	rs3821157	C	A	887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.724;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=9;PP=527;ReadPosRankSum=-3.059;SC=AGACTTTGGACATTTGTCAAG;SOR=1.531;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=54;TCF=36;TCR=18;TR=34;WE=36669678;WS=36669660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,38:0.64:59
chr2	36704144	rs848547	C	T	2573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=42;PP=1461;ReadPosRankSum=0.011;SC=TCTGCTTCACCGCCCAGTGTG;SOR=0.671;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=160;TCF=92;TCR=68;TR=101;WE=36704152;WS=36704134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,115:0.64:181
chr2	36739553	rs848526	T	C	1336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=43;PP=1040;SC=TGTGTACACATGGCCCTTCCC;SOR=3.657;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=6;TCR=43;TR=49;WE=36739561;WS=36739543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr2	36756288	rs711247	T	C	8705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=147;NR=147;PP=2965;SC=TCTCTTATTTTGGTCCAGGAG;SOR=0.762;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=296;TCF=148;TCR=148;TR=294;WE=36756296;WS=36756278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,327:1.00:327
chr2	36771701	rs2276671	C	A	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.062;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=16;PP=335;ReadPosRankSum=-1.993;SC=TAGGTGTTTTCTAATTTTTAA;SOR=0.426;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=72;TCF=24;TCR=48;TR=27;WE=36771709;WS=36771691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,31:0.39:80
chr2	36775315	rs2270333	C	G	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.473;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQRankSum=-0.000;QD=7.43;ReadPosRankSum=1.498;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
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chr2	36785667	.	TA	T	75.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.404;ClippingRankSum=0.000;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=7.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.10;ReadPosRankSum=1.881;SOR=0.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,13:0.19:69
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chr2	36824956	rs5830430	G	GC	485.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=5;NR=2;PP=265;SC=CGGCCGTAGGGCTGCCGGTCG;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=7;WE=36824964;WS=36824946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	36825137	rs1544655	G	A	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=1.635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.76;ReadPosRankSum=-0.344;SOR=0.848;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,35:0.31:112
chr2	36825170	rs2287104	T	C	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=8.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.53;ReadPosRankSum=-3.283;SOR=1.756;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,14:0.16:85
chr2	36825330	rs11441122	C	CG,CGGCCCAGCCCG	1104.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=24;NF=1,1;NR=15,15;PP=325,1011;SC=CGGCCCAGCCCGCCCAGCCCG;SOR=1.329;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16,16;WE=36825338;WS=36825320;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.77,0.23:22
chr2	36943338	rs4670597	C	G	594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=2;PP=478;SC=AGGCCAGCCACTGACATCTCT;SOR=2.948;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=36943346;WS=36943328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	36943419	rs4670598	T	C	3463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=42;PP=2130;SC=TGATGCAGTCTATCCCCACAC;SOR=1.143;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=72;TCR=42;TR=114;WE=36943427;WS=36943409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr2	36965582	rs35608380	TC	T	251.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=62.36;NF=1;NR=7;PP=261;SC=TATATTAGGGTCCTTTGTAAA;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=8;WE=36965590;WS=36965572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	36994439	rs11124542	A	C	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=319;ReadPosRankSum=0.518;SC=GTCAGTAGGTAGACCATGTGT;SOR=0.655;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=11;TCR=29;TR=25;WE=36994447;WS=36994429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,26:0.62:42
chr2	37001386	rs201437662	CTATGCCA	C	2157.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.807;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=2954;ReadPosRankSum=-0.893;SC=CTGAGTAATTCTATGCCACGG;SOR=1.203;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=62;TCF=38;TCR=24;TR=26;WE=37001412;WS=37001376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,56:0.46:122
chr2	37001399	.	G	T	2394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.062;ClippingRankSum=0.000;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=8.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.71;ReadPosRankSum=0.093;SOR=1.393;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,61:0.48:128
chr2	37001401	rs202045170	C	CT	2416.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=5.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.463;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=8;PP=2954;ReadPosRankSum=0.987;SC=CCACGGGGGACAGAAACACAT;SOR=1.396;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=65;TCF=36;TCR=29;TR=24;WE=37001412;WS=37001376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,62:0.46:135
chr2	37001402	.	A	C	2474.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=5.359;ClippingRankSum=0.000;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=8.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.61;ReadPosRankSum=0.943;SOR=1.376;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,62:0.47:133
chr2	37001402	.	AGA	CGG	2944	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=26;NR=7;PP=2944;QD=20;SC=CACGGGGGACAGAAACACATT;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=114;TCF=79;TCR=35;TR=33;WE=37001412;WS=37001376;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:81,33:0.29:114
chr2	37001404	.	A	G	2439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.542;ClippingRankSum=0.000;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=8.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.81;ReadPosRankSum=0.770;SOR=1.406;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,65:0.47:137
chr2	37001570	rs974964	C	T	5113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=104;PP=2965;SC=CAGGGTTTGACGGTTTCCACA;SOR=1.300;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=171;TCF=67;TCR=104;TR=171;WE=37001578;WS=37001560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr2	37077015	rs723674	C	A	1108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=31;PP=827;SC=CTACCATGTCCTGCTGGTTTC;SOR=4.351;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=34;WE=37077023;WS=37077005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr2	37078095	rs10668550	A	AT	329.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.68;ReadPosRankSum=0.579;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,19:0.73:26
chr2	37094945	rs2540923	A	G	3164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=45;PP=1942;SC=TAAAGAAAAAACATATACTTA;SOR=0.896;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=62;TCR=45;TR=107;WE=37094953;WS=37094935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr2	37095139	rs6752845	G	C	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.582;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=100;ReadPosRankSum=-0.654;SC=ACGTAAGAAAGCTTACTTAAC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=37095147;WS=37095129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr2	37096970	rs2160379	C	T	438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=365;SC=TGTCAATAAACGATCACTTTG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=37096978;WS=37096960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	37111045	rs2691106	T	A	862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.749;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=13;PP=568;ReadPosRankSum=0.116;SC=CCAAGTGCATTTTGTGCTCCA;SOR=0.802;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=111;TCF=75;TCR=36;TR=42;WE=37111053;WS=37111035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,45:0.38:119
chr2	37129618	rs148671880	A	ATAAT	996.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.31;SOR=6.273;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	37241050	rs17020125	G	A	2966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.065;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=67;PP=1769;ReadPosRankSum=0.343;SC=ACAGCTGGCTGGAAGATCCTT;SOR=0.912;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=200;TCF=92;TCR=108;TR=118;WE=37241058;WS=37241040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,135:0.60:224
chr2	37248015	rs17020136	T	C	1290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.831;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=33;PP=840;ReadPosRankSum=1.776;SC=ATGAAAACTTTTCCAAAAATA;SOR=0.876;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=88;TCF=32;TCR=56;TR=51;WE=37248023;WS=37248005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,56:0.59:95
chr2	37255015	rs2540998	G	A	1053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.697;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=13;PP=673;ReadPosRankSum=-0.095;SC=GCAGCAAAATGTCTCAAGGTG;SOR=0.352;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=76;TCF=57;TCR=19;TR=44;WE=37255023;WS=37255005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,46:0.57:80
chr2	37267428	rs79461666	C	G	1691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=3.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=12;PP=1096;ReadPosRankSum=0.736;SC=TTTAAAGATACTGATTATCTA;SOR=0.685;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=112;TCF=88;TCR=24;TR=61;WE=37267436;WS=37267418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,68:0.55:124
chr2	37282421	rs138815251	GTTAT	G	132	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=3;PP=126;SC=GAATATTTATGTTATTTATTA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=37282432;WS=37282411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
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chr2	37297285	rs143933017	T	C	992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=7;PP=661;ReadPosRankSum=1.358;SC=TCAGGCAATCTGCCCGCCTTG;SOR=0.544;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=62;TCF=53;TCR=9;TR=37;WE=37297293;WS=37297275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,40:0.59:68
chr2	37297306	rs144268682	A	G	1574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=16;PP=985;ReadPosRankSum=-0.078;SC=GCCTCCAAAAATGCTGGGATT;SOR=0.643;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=103;TCF=76;TCR=27;TR=56;WE=37297314;WS=37297296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,66:0.57:116
chr2	37299145	rs12621276	G	A	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=354;ReadPosRankSum=-0.737;SC=TCATTTTATGGAAAAGTAGAC;SOR=0.593;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=18;WE=37299153;WS=37299135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
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chr2	37306340	rs6758981	T	C	1184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=1.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.02;ReadPosRankSum=-0.773;SOR=0.881;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,56:0.62:91
chr2	37306343	rs6743906	G	A	3447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.48;SOR=0.782;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
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chr2	37317869	rs4670654	C	T	2275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=32;PP=1316;SC=AAAACAGGTACGTAATTATTT;SOR=0.742;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=39;TCR=32;TR=71;WE=37317877;WS=37317859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr2	37319156	rs62621388	A	C	2110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.483;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=38;PP=1017;ReadPosRankSum=-1.473;SC=ACCAAGCTGAAGAAAAAGCTG;SOR=0.556;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=153;TCF=80;TCR=73;TR=84;WE=37319164;WS=37319146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,100:0.57:176
chr2	37319223	rs74474978	T	C	2430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.779;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=38;PP=1285;ReadPosRankSum=0.921;SC=TTCCTCTTTATTGTGGTATGT;SOR=0.446;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=139;TCF=72;TCR=67;TR=87;WE=37319231;WS=37319213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,106:0.64:166
chr2	37319495	rs202239979	TTATA	T	274.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.80;MQRankSum=1.679;QD=13.74;ReadPosRankSum=-1.028;SOR=0.877;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr2	37319541	.	AT	A	51	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5001;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=51;QD=39.0;SC=TGTATTACATATATTTATATG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=2;WE=37319549;WS=37319531;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:1,2:0.67:3
chr2	37365798	rs2307483	A	G	808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=22;PP=471;ReadPosRankSum=-0.243;SC=CTCAGTTTCTATGTACTATCA;SOR=0.773;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=64;TCF=23;TCR=41;TR=33;WE=37365806;WS=37365788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,38:0.51:74
chr2	37366688	rs2307474	T	C	1109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=13;PP=536;ReadPosRankSum=1.046;SC=CTGGCTGTCTTGGCATAATGT;SOR=0.750;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=52;TCR=22;TR=43;WE=37366696;WS=37366678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,50:0.59:85
chr2	37368567	rs4648175	C	A	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.617;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=255;ReadPosRankSum=0.247;SC=AATTACTTATCAATCATGTAA;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=13;WE=37368575;WS=37368557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr2	37373897	rs4648169	G	C	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.488;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.342;NF=19;NR=4;PP=431;ReadPosRankSum=0.861;SC=AAGGGAACGTGTGAATGGCTT;SOR=0.434;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=43;TCF=37;TCR=6;TR=23;WE=37373905;WS=37373887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,25:0.54:46
chr2	37373982	rs2307475	A	AT	6857.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=60;PP=2975;SC=TTAGGAAAAAAGGCAATCACT;SOR=0.899;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=89;TCF=28;TCR=61;TR=88;WE=37373990;WS=37373972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr2	37374772	rs4648160	C	T	1551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-3.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.305;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.573;NF=48;NR=10;PP=1042;ReadPosRankSum=-0.121;SC=CATGTCCCTACAAAGGACATG;SOR=0.453;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=95;TCF=80;TCR=15;TR=58;WE=37374780;WS=37374762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,63:0.62:102
chr2	37402270	rs11569755	C	G	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.799;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=6;PP=105;ReadPosRankSum=2.919;SC=CAATAATAATCTCACCTCTTT;SOR=0.568;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=36;TCF=22;TCR=14;TR=13;WE=37402278;WS=37402260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,15:0.36:42
chr2	37402373	rs11569758	A	G	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=6;PP=106;ReadPosRankSum=0.680;SC=CAAGAAACTAAAAACACAGGG;SOR=0.629;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=43;TCF=23;TCR=20;TR=14;WE=37402381;WS=37402363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,17:0.34:50
chr2	37406644	rs10182091	A	G	4016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.329;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=96;PP=2467;ReadPosRankSum=0.807;SC=CCCAAGAGCCATAGCTTGGAA;SOR=0.987;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=311;TCF=148;TCR=163;TR=174;WE=37406652;WS=37406634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,191:0.56:343
chr2	37406680	rs10205833	C	G	3579.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.959;HP=6;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=84;PP=2365;ReadPosRankSum=-2.728;SC=TGTGGAAATGCAAAAAAGATA;SOR=0.623;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=258;TCF=113;TCR=145;TR=149;WE=37406688;WS=37406670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,162:0.57:283
chr2	37406761	rs4459710	T	C	819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=25;PP=623;ReadPosRankSum=-0.841;SC=TTTATTTGGGTCTATGTTTTG;SOR=0.564;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=58;TCF=16;TCR=42;TR=35;WE=37406769;WS=37406751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,35:0.59:59
chr2	37406807	rs2111630	A	G	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.974;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=267;ReadPosRankSum=0.283;SC=CAATATCATCATGTCCACTCG;SOR=1.387;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=14;WE=37406815;WS=37406797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr2	37410537	rs6544061	C	T	925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=12;PP=454;ReadPosRankSum=0.899;SC=ATAGAAATTTCAAAGAATTAT;SOR=0.714;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=109;TCF=70;TCR=39;TR=37;WE=37410545;WS=37410527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,48:0.37:131
chr2	37414431	rs6724820	A	C	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.58;ReadPosRankSum=0.024;SOR=0.650;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,21:0.26:82
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chr2	37428743	rs2540973	C	T	481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=2;PP=318;SC=TTTAACAATGCTTCCACATGA;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=37428751;WS=37428733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	37428926	rs148813970	GTTT	G	2793.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.365;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.899;NF=23;NR=19;PP=1363;ReadPosRankSum=1.837;SC=TTGTTTTTTAGTTTTTTGAGT;SOR=0.968;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=88;TCF=46;TCR=42;TR=42;WE=37428936;WS=37428916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,73:0.56:130
chr2	37438993	rs1137437	G	A	2173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.021;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=42;PP=1197;ReadPosRankSum=-0.944;SC=TACCTGGAACGCTCTCACTTT;SOR=0.845;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=273;TCF=158;TCR=115;TR=106;WE=37439001;WS=37438983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,117:0.40:292
chr2	37447471	.	AATAT	A	401.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.17;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	37456032	rs2098386	C	T	4890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=60;PP=2965;SC=TCTTCTTCAACTAAGGAAGCT;SOR=1.307;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=164;TCF=104;TCR=60;TR=164;WE=37456040;WS=37456022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr2	37458711	rs3213745	G	A	3120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=461;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=81;PP=2122;ReadPosRankSum=-0.001;SC=CTGCGGCCATGGCGGGCAAAG;SOR=0.709;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=430;TCF=218;TCR=212;TR=162;WE=37458719;WS=37458701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:287,172:0.37:459
chr2	37459208	rs17020344	C	T	1886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.205;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=34;PP=1266;ReadPosRankSum=0.325;SC=CGTGAATGGTCAGATTTATCA;SOR=0.842;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=162;TCF=96;TCR=66;TR=83;WE=37459216;WS=37459198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,86:0.50:172
chr2	37465137	rs75490807	T	C	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=59;ReadPosRankSum=0.217;SC=AAATATAATGTCAGAATAATG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=37465145;WS=37465127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr2	37474386	rs78879417	G	A	1951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.407;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=24;PP=1155;ReadPosRankSum=0.901;SC=TGGCTGTGTAGTAGTTTGTAG;SOR=0.883;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=129;TCF=84;TCR=45;TR=78;WE=37474394;WS=37474376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,88:0.61:144
chr2	37480249	rs1056021	A	G	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.163;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=243;ReadPosRankSum=0.865;SC=GACAATCTACAAAGAACAAGT;SOR=1.828;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=15;WE=37480257;WS=37480239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr2	37480319	rs140587747	A	AT	2435.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.721;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=16;PP=1391;ReadPosRankSum=0.773;SC=TAGCTCAGTGATTAAGGATCT;SOR=0.839;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=85;TCF=48;TCR=37;TR=38;WE=37480327;WS=37480309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,80:0.62:128
chr2	37487341	rs199676568	TA	T	164.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=2.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.54;ReadPosRankSum=0.422;SOR=0.438;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,20:0.19:107
chr2	37505105	rs10460527	T	G	2531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.242;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=63;PP=1653;ReadPosRankSum=-1.755;SC=CAACCCTCATTAGCGGAATAT;SOR=0.863;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=211;TCF=93;TCR=118;TR=108;WE=37505113;WS=37505095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,116:0.50:233
chr2	37506939	rs3770761	A	G	3896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=74;PP=2232;ReadPosRankSum=-0.029;SC=GATCAGATGGATCCAAGAAGA;SOR=0.686;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=274;TCF=146;TCR=128;TR=158;WE=37506947;WS=37506929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,179:0.59:305
chr2	37513586	rs2287091	A	G	685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.199;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=24;PP=548;ReadPosRankSum=0.023;SC=CTTAACCACAAGAATCATTTA;SOR=1.947;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=47;TCF=6;TCR=41;TR=26;WE=37513594;WS=37513576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,26:0.57:46
chr2	37516481	rs2302649	T	C	1442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=15;PP=1058;ReadPosRankSum=-1.269;SC=AAAATGTCTATTACCTTAGAA;SOR=0.728;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=101;TCF=74;TCR=27;TR=58;WE=37516489;WS=37516471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,61:0.58:106
chr2	37518045	rs10177176	G	C	2038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.347;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=47;PP=1426;ReadPosRankSum=-0.284;SC=CCAATCCCCAGAGCATCTCAC;SOR=0.784;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=305;TCF=165;TCR=140;TR=106;WE=37518053;WS=37518035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:236,115:0.33:351
chr2	37543371	rs6544066	A	G	1755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.119;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=29;PP=1206;ReadPosRankSum=-1.478;SC=ATAATAGCACACACAGTACCT;SOR=0.984;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=132;TCF=83;TCR=49;TR=80;WE=37543379;WS=37543361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,83:0.58:142
chr2	37543544	rs11896614	T	C	3196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.067;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=73;PP=2383;ReadPosRankSum=-0.510;SC=AAGCTTCCATTAGAGAGTCGG;SOR=0.788;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=202;TCF=92;TCR=110;TR=127;WE=37543552;WS=37543534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,133:0.60:221
chr2	37543758	rs78363830	C	T	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=179;ReadPosRankSum=2.643;SC=AGAAAATGACCGCACTTTTGG;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=13;WE=37543766;WS=37543748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr2	37586681	rs2302651	A	G	1121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=12;PP=622;ReadPosRankSum=-0.374;SC=AATGAAAGCCATTTCTTTAGA;SOR=0.735;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=93;TCF=68;TCR=25;TR=47;WE=37586689;WS=37586671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,54:0.52:103
chr2	37599619	rs112031803	ATG	A	33.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=0.000;QD=0.26;ReadPosRankSum=0.823;SOR=0.490;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:114,14:0.11:128
chr2	38177525	rs11687301	A	C	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.739;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=8;PP=555;ReadPosRankSum=-0.176;SC=GGTGAGCTACAGAACAGTTCT;SOR=0.884;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=98;TCF=73;TCR=25;TR=38;WE=38177533;WS=38177515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,42:0.39:108
chr2	38178406	rs4670799	A	G	949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.046;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=19;PP=557;ReadPosRankSum=-0.288;SC=GCTTCCAACGATGTTCTCCAG;SOR=0.913;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=160;TCF=94;TCR=66;TR=50;WE=38178414;WS=38178396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,55:0.31:179
chr2	38179134	rs4670800	G	A	13311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=491;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.98;NF=222;NR=212;PP=2965;SC=TACAGCACAGGTCATTCTCCA;SOR=0.714;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=434;TCF=222;TCR=212;TR=434;WE=38179142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,491:1.00:491
chr2	38179414	rs72332368	CTG	C	2852.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.447;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.06;MQRankSum=1.206;NF=5;NR=39;PP=1714;ReadPosRankSum=-1.189;SC=CTTTCATAGCCTGTAGAATTC;SOR=0.441;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=111;TCF=7;TCR=104;TR=44;WE=38179423;WS=38179404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,77:0.41:187
chr2	38216766	rs112425530	CT	C	130.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.13;MQRankSum=1.890;QD=2.11;ReadPosRankSum=1.518;SOR=0.624;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,14:0.23:62
chr2	38298593	rs34468862	G	GA	61.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.484;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=51;ReadPosRankSum=-0.652;SC=ATATTTCTGGGAAAAAAATCT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=38298601;WS=38298583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr2	38537579	rs34873284	T	C	995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.642;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=28;PP=618;ReadPosRankSum=-0.384;SC=TTCATGTTGATTTTGTTTTAC;SOR=0.625;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=138;TCF=57;TCR=81;TR=49;WE=38537601;WS=38537569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,54:0.37:146
chr2	38827161	rs115373059	A	G	2824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.507;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=64;PP=1915;ReadPosRankSum=0.193;SC=GAAGAAGCACAAGACAGTAAA;SOR=0.637;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=191;TCF=79;TCR=112;TR=109;WE=38827169;WS=38827151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,125:0.57:221
chr2	38956947	rs2272445	A	G	2943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=69;PP=2129;SC=CTATGCTACAAGTGACCCAAT;SOR=2.016;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=28;TCR=69;TR=97;WE=38956955;WS=38956937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr2	38977371	rs3112183	C	T	7249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=157;PP=2965;SC=ATGCACGTTACGCAAAATCTG;SOR=1.386;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=247;TCF=90;TCR=157;TR=247;WE=38977379;WS=38977361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,263:1.00:263
chr2	38977402	rs3134630	T	C	4200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=97;PP=2933;SC=CAATTACTTATTTGCCTTAAA;SOR=2.006;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=136;TCF=38;TCR=98;TR=135;WE=38977410;WS=38977392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr2	38978342	rs141709559	A	G	3570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=599;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-0.706;NF=91;NR=94;PP=2283;ReadPosRankSum=-1.609;SC=ACCCACACCAACGTCCCTCAC;SOR=0.699;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=554;TCF=277;TCR=277;TR=185;WE=38978350;WS=38978332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:397,200:0.34:597
chr2	39006603	rs3112201	T	G	3489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=48;PP=1951;SC=AAACTCCTGATCTCCAAGGAT;SOR=0.912;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=66;TCR=48;TR=114;WE=39006611;WS=39006593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr2	39025555	rs1530853	G	A	9937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=380;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=161;NR=181;PP=2965;SC=GATCAAGTTCGCAACGAAGCT;SOR=0.869;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=342;TCF=161;TCR=181;TR=342;WE=39025563;WS=39025545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,379:1.00:379
chr2	39025632	rs1530852	A	G	3584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=81;PP=2428;SC=AACAGGCAGGATAGGTTATTG;SOR=2.000;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=114;TCF=33;TCR=81;TR=114;WE=39025640;WS=39025622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr2	39030074	rs13029406	C	T	3986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=80;PP=2412;SC=CAAAAAACCTCAGATGATGAC;SOR=1.225;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=138;TCF=58;TCR=80;TR=137;WE=39030082;WS=39030054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr2	39042639	rs3112138	G	A	7736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=158;NR=106;PP=2965;SC=AAAGAGAAATGAGAACCAACT;SOR=1.082;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=264;TCF=158;TCR=106;TR=264;WE=39042647;WS=39042629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,288:1.00:288
chr2	39043360	rs368002198	AT	A	188.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=2.679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.11;MQRankSum=1.613;QD=3.50;ReadPosRankSum=0.186;SOR=0.559;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,17:0.31:54
chr2	39045885	rs10176932	C	T	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.643;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=218;ReadPosRankSum=0.969;SC=CCATTTTACACGGCTGGTAAG;SOR=1.938;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=12;WE=39045893;WS=39045884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr2	39046321	.	C	CT	35	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;FR=0.6253;HP=11;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=16;MQ=61.34;NF=0;NR=3;PP=35;QD=14.6666666667;SC=TTAAAGAACACTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=3;WE=39046329;WS=39046311;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr2	39050019	rs3112146	G	T	965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=5;PP=680;SC=AAAATTCACAGCTAACATACA;SOR=3.193;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=30;WE=39050027;WS=39050009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr2	39050061	rs34582261	AT	A	3000.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=17;PP=2480;SC=CATGCCCTTGATTTCCCCCAT;SOR=2.557;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=66;TCF=46;TCR=20;TR=62;WE=39050069;WS=39050051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr2	39050141	rs3770681	A	C	7843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=157;NR=115;PP=2965;SC=TTACAAACGGAGACTTAAAAG;SOR=0.937;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=273;TCF=158;TCR=115;TR=272;WE=39050149;WS=39050131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,290:1.00:290
chr2	39065729	rs17494315	C	A	1569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=8;PP=1220;SC=CAAAATTCAACGTCAAATACA;SOR=3.300;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=43;TCR=8;TR=51;WE=39065737;WS=39065719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr2	39075356	rs11124651	A	C	578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=1;PP=419;SC=CAAACTTTAAAATAATTATAT;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=39075364;WS=39075346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	39082344	rs7598922	T	C	7687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=117;NR=143;PP=2965;SC=AGGTGGTCCATTCAGAGAATC;SOR=1.001;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=260;TCF=117;TCR=143;TR=260;WE=39082352;WS=39082334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr2	39090696	rs3099999	T	C	4399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=101;PP=2965;SC=TACACACATATCTTCAATCAG;SOR=2.072;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=37;TCR=101;TR=138;WE=39090704;WS=39090686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr2	39117117	rs7565111	G	A	5916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=112;NR=90;PP=2965;SC=AACCACCGCAGGCAACATGGG;SOR=0.840;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=202;TCF=112;TCR=90;TR=202;WE=39117125;WS=39117107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr2	39185048	rs422854	C	T	2203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=60;NR=8;PP=1727;SC=TGCAAAGGCCCCTGGAGATAG;SOR=3.912;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=60;TCR=8;TR=68;WE=39185056;WS=39185038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr2	39187190	rs6755527	T	C	5127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=65;PP=2965;SC=GGACTTCGAGTCCTCTCCGGC;SOR=1.147;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=165;TCF=100;TCR=65;TR=165;WE=39187198;WS=39187180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr2	39187519	rs958412	A	G	1558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.42;SOR=0.950;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr2	39198966	rs2305516	A	G	3444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=35;PP=2423;SC=AGCTGAGTTTATGGACTTTGA;SOR=1.569;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=114;TCF=79;TCR=35;TR=114;WE=39198974;WS=39198956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr2	39201073	rs141703594	CTA	C	63.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.25;ReadPosRankSum=0.458;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr2	39214821	rs2290445	A	C	351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=262;SC=AATTGCTTATAATTAAAAGTA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=39214829;WS=39214811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	39224351	rs1454223	G	T	1532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=9;PP=1200;SC=AAGTAGTTTAGAAACTTAATC;SOR=3.014;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=43;TCR=9;TR=52;WE=39224359;WS=39224341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr2	39224615	rs5830551	G	GT	1720.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=37;PP=1178;SC=GAAAATGCAAGTTTTTTTCTG;SOR=2.507;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=46;TCF=2;TCR=44;TR=39;WE=39224623;WS=39224605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr2	39233500	rs7577088	G	A	616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=3;PP=389;SC=TTAATGAAATGAGTGTTTTGT;SOR=2.200;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=39233508;WS=39233490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	39251375	rs10634554	T	TCAC	816.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=707;SC=TATTCAACTGTCACAATAAAA;SOR=2.531;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=39251383;WS=39251365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	39262068	rs10153761	C	T	3293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=35;NR=86;PP=2226;SC=AGGTACAAGACAAAAATATCT;SOR=1.807;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=125;TCF=35;TCR=90;TR=121;WE=39262076;WS=39262058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr2	39281730	rs997344	G	C	170.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=135;SC=CATTCAATGAGAGGCATATAT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=39281738;WS=39281720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	39283784	rs180918477	G	C	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=417;ReadPosRankSum=0.113;SC=TAGTACGTTAGCATCTAATAA;SOR=0.683;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=29;TCR=11;TR=25;WE=39283792;WS=39283774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,25:0.62:40
chr2	39406572	rs7566123	C	A	2433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=60;PP=1713;SC=GAAAATCTTCCAGTTTGTGTA;SOR=2.093;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=22;TCR=60;TR=82;WE=39406580;WS=39406562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr2	39440727	rs10196407	G	C	1605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=35;PP=974;SC=AACACCATGCGGAAGGGTCCT;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=24;TCR=35;TR=59;WE=39440735;WS=39440717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr2	39452861	rs11124663	C	T	1791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=18;PP=1122;SC=ATGGGGTAGCCAGATGCATTG;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=39;TCR=18;TR=57;WE=39452869;WS=39452851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr2	39479122	rs3770678	G	C	309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=225;SC=AAACATGATCGCTAAAAATGA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=39479130;WS=39479112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	39494197	rs2302749	C	T	1307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=10;PP=903;SC=AGAGATGAAACAGCCAAGAAA;SOR=2.160;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=45;WE=39494205;WS=39494187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr2	39494469	rs10865149	C	G	650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=18;PP=509;SC=GATCAGTGCACAAAGGATGAG;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=39494477;WS=39494459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	39507417	rs3755176	T	A	4024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=56;PP=2247;SC=TACTACCTCTTGTATCTGGGT;SOR=0.864;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=134;TCF=78;TCR=56;TR=134;WE=39507425;WS=39507407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr2	39514136	rs3755172	T	C	1040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=24;PP=798;SC=TGAAAATGATTAATCTTCATG;SOR=1.885;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=34;WE=39514144;WS=39514126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	39514204	rs3755171	G	C	279.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=230;SC=CTCTGACATAGTGTCATTATT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=39514212;WS=39514194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	39526842	rs2111382	A	C	2163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=20;PP=1518;SC=GCAACTTAATAATTCTTGAAT;SOR=1.739;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=50;TCR=20;TR=70;WE=39526850;WS=39526832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr2	39542658	rs5830562	AT	A	114.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=0;NR=8;PP=123;SC=CACTTTGCAAATTTTTTTTTT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=8;WE=39542666;WS=39542648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	39553271	rs3815594	A	G	7032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=145;NR=88;PP=2965;SC=AGATTCTTCAATGATGATGCA;SOR=1.170;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=233;TCF=145;TCR=88;TR=233;WE=39553279;WS=39553261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chr2	39558928	rs6760382	G	A	36.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr2	39564620	rs1125839	C	A	1388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=16;PP=765;SC=GTAAGTAAAGCCTTAGTTTAA;SOR=1.244;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=28;TCR=16;TR=44;WE=39564628;WS=39564610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr2	39570427	rs3732053	T	C	1260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=5;PP=973;SC=CAATAAAACATAGCTTGCTTT;SOR=3.365;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=35;TCR=5;TR=40;WE=39570435;WS=39570417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr2	39583446	rs8545	A	G	4840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=87;NR=79;PP=2858;SC=CTTTCATCATAATAATTTCTT;SOR=0.704;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=166;TCF=87;TCR=79;TR=166;WE=39583454;WS=39583436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr2	39944055	rs2540229	G	A	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=55;ReadPosRankSum=-0.744;SC=GACTGCCTCAGTGGTTGATCT;SOR=0.096;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=6;WE=39944063;WS=39944045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,6:0.22:27
chr2	40392313	rs434725	G	C	1631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=41;PP=1224;SC=ATCACTGTGAGAGCAAGTGAT;SOR=4.091;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=5;TCR=41;TR=46;WE=40392321;WS=40392303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr2	40402064	rs6760003	A	T	808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.764;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=21;PP=439;ReadPosRankSum=-1.110;SC=CTGCCTGACAACCCACCCAAG;SOR=0.796;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=94;TCF=41;TCR=53;TR=37;WE=40402072;WS=40402054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,42:0.42:101
chr2	40402275	rs6734847	G	A	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=105;ReadPosRankSum=0.074;SC=TGAGGTCAATGGCCCTAAACA;SOR=0.498;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=10;WE=40402283;WS=40402265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr2	40402602	rs10199306	C	T	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=206;ReadPosRankSum=-2.352;SC=TAAACAATCCCAACTGAAATT;SOR=1.061;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=12;WE=40402610;WS=40402592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
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chr2	40564647	rs11893826	G	A	2442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.71;SOR=2.226;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
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chr2	40655563	rs3838567	CCACA	C,CCA	772.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=4.806;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.76;ReadPosRankSum=0.134;SOR=3.098;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:2,9,19:0.30,0.63:30
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chr2	42275819	rs11897440	T	C	1390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.173;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=29;PP=754;ReadPosRankSum=-1.267;SC=TGCCCGGCGGTGCCGCGGTGG;SOR=0.592;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=168;TCF=99;TCR=69;TR=64;WE=42275827;WS=42275809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,74:0.40:186
chr2	42280300	rs34482969	G	A	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=258;ReadPosRankSum=-0.784;SC=AGGAGAGAGAGGGGGAACCTG;SOR=0.801;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=37;TCF=29;TCR=8;TR=16;WE=42280308;WS=42280290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr2	42280358	rs35771566	C	T	816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=6.875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.18;ReadPosRankSum=2.187;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,43:0.48:89
chr2	42282632	rs13401037	A	T	1035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.556;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=30;PP=646;ReadPosRankSum=-1.048;SC=TTCTCTGGGGACCCTTGTCTC;SOR=0.889;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=37;TCR=71;TR=46;WE=42282640;WS=42282622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,51:0.42:121
chr2	42491751	rs35132936	C	T	618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=2;PP=438;SC=AGATTATAGCCTAAGCATTAA;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=42491759;WS=42491741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	42492191	rs13016514	A	C	1972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=27;NR=38;PP=1212;SC=TTCTTCCTTAAAAAGGAAATA;SOR=1.195;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=67;TCF=27;TCR=40;TR=65;WE=42492199;WS=42492181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr2	42510018	rs6736913	A	G	7096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=136;NR=104;PP=2965;SC=TCCGACCGGGAAAATAGTTTA;SOR=0.879;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=240;TCF=136;TCR=104;TR=240;WE=42510026;WS=42510008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr2	42511903	rs6744779	A	G	6578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=132;PP=2965;ReadPosRankSum=1.194;SC=AGTGGAATCTATTGTAATTTT;SOR=0.378;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=231;TCF=98;TCR=133;TR=230;WE=42511911;WS=42511893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,243:1.00:244
chr2	42515388	rs10202624	A	G	2770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=53;NR=40;PP=1528;SC=TCATTTATGTATTATTGATGA;SOR=0.751;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=94;TCF=53;TCR=41;TR=93;WE=42515396;WS=42515378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr2	42515437	rs28651764	A	G	2750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=48;NR=44;PP=1614;SC=GACTGGCAGAAGAAAGCAAAA;SOR=0.795;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=93;TCF=48;TCR=45;TR=92;WE=42515445;WS=42515427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr2	42522756	rs10490555	A	G	485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=14;PP=363;SC=CAGTGTAACAATATGAGCAAG;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=42522764;WS=42522746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	42531871	rs12464702	G	T	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=321;ReadPosRankSum=-0.669;SC=TGCCTTTTGCGACATGCTACA;SOR=1.519;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=16;WE=42531879;WS=42531861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr2	42544821	rs7558501	C	T	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=228;ReadPosRankSum=1.305;SC=AGCAGAACATCAGAGTTCCCT;SOR=0.418;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=15;WE=42544829;WS=42544811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr2	42553210	rs2286703	C	A	1341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=10;PP=925;ReadPosRankSum=-0.098;SC=TACAAGTAAACGTGGCTAGTT;SOR=0.696;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=82;TCF=64;TCR=18;TR=49;WE=42553218;WS=42553200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,53:0.60:89
chr2	42556022	rs2286700	A	T	2186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.306;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=32;PP=1151;ReadPosRankSum=0.552;SC=TTTCCATATCAAAGGTGTCTG;SOR=0.846;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=137;TCF=86;TCR=51;TR=87;WE=42556030;WS=42556012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,100:0.63:158
chr2	42560975	rs7572231	A	G	2853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=64;NR=39;PP=1675;SC=AGTCTCCAGCAGCCACAGAAA;SOR=1.089;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=103;TCF=64;TCR=39;TR=103;WE=42560983;WS=42560965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr2	42588195	rs3764906	T	C	5197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=107;NR=65;PP=2965;SC=GGGCCGCCACTTCTCATGTCC;SOR=1.220;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=172;TCF=107;TCR=65;TR=172;WE=42588203;WS=42588185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr2	42719847	rs113015907	T	TG	5387.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=37;NR=31;PP=2714;SC=TGGCCGCGCCTGGGCCTCGCT;SOR=1.490;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=69;TCF=38;TCR=31;TR=68;WE=42719868;WS=42719837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr2	42719860	rs112592817	G	GC	6595.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=35;PP=2975;SC=GCCTCGCTGGGCGCGCACCCC;SOR=1.421;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=87;TCF=49;TCR=38;TR=81;WE=42719868;WS=42719837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr2	42795954	rs78106475	T	C	1979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.71;SOR=0.828;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr2	42996709	.	A	ATGTGTGTG,ATGTGTG	114.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.108;ClippingRankSum=-0.000;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.000;NF=4,4;NR=1,1;PP=53,45;ReadPosRankSum=0.328;SC=AACCTCTGAAATGTGTGTGTG;SOR=0.223;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=5,5;WE=42996717;WS=42996699;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.57:7
chr2	42996759	.	AAG	A	57.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.691;ClippingRankSum=0.000;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=1.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.03;ReadPosRankSum=0.228;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,7:0.12:56
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chr2	43798792	rs11884742	G	A	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FS=2.349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.40;ReadPosRankSum=2.135;SOR=0.506;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:120,41:0.25:161
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chr2	43804229	rs13021894	T	C	2906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=382;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.373;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=71;PP=2039;ReadPosRankSum=-0.851;SC=GACCCATGCTTCCGTTCTGCC;SOR=0.790;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=340;TCF=172;TCR=168;TR=134;WE=43804237;WS=43804219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:239,143:0.37:382
chr2	43805608	rs6759861	C	G	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=1.333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.045;SOR=0.467;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,15:0.38:40
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chr2	43819139	rs17031095	A	G	1514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.911;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=36;PP=861;ReadPosRankSum=0.783;SC=GTTGCACACAATGTAACAGCA;SOR=0.555;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=159;TCF=85;TCR=74;TR=74;WE=43819147;WS=43819129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,77:0.46:167
chr2	43871983	rs12105773	T	C	1233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.392;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=39;PP=871;ReadPosRankSum=-1.973;SC=CTATTTAGGGTCTGCTTCATT;SOR=0.453;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=123;TCF=39;TCR=84;TR=58;WE=43871991;WS=43871973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,60:0.43:141
chr2	43902511	rs755862	G	C	745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.799;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.274;NF=25;NR=9;PP=443;ReadPosRankSum=-0.160;SC=TATTCTCCAGGCCTCAGTCAT;SOR=0.903;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=88;TCF=62;TCR=26;TR=34;WE=43902519;WS=43902501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,37:0.39:95
chr2	43903066	rs3828297	A	G	2664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=420;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.540;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=68;PP=1809;ReadPosRankSum=0.798;SC=TGTAGTTGTCACCATACTTTT;SOR=0.650;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=388;TCF=198;TCR=190;TR=136;WE=43903074;WS=43903056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:272,148:0.35:420
chr2	43903354	rs4952675	T	C	3309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=457;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.534;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=80;PP=2247;ReadPosRankSum=1.099;SC=GGTCTTGAGTTTGACCTCTGT;SOR=0.646;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=432;TCF=218;TCR=214;TR=156;WE=43903362;WS=43903344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:287,170:0.37:457
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chr2	43905898	rs142175341	G	GAGGTGGAGGTGC	223.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=3.044;NF=2;NR=1;PP=72;ReadPosRankSum=0.557;SC=GGTGGAGGTGGAGGTGGAGGT;SOR=0.693;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=3;WE=43905906;WS=43905888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
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chr2	44066174	rs3806471	T	G	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.084;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=6;PP=585;ReadPosRankSum=-2.168;SC=CAGCCCAGGGTCACAGACCTG;SOR=0.963;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=71;TCF=54;TCR=17;TR=30;WE=44066182;WS=44066164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,34:0.43:79
chr2	44071625	rs4148209	C	A	4002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.571;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=73;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.487;SC=AGGAGCCCCTCATCTCTCCTG;SOR=0.595;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=243;TCF=134;TCR=109;TR=160;WE=44071647;WS=44071615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,179:0.67:266
chr2	44071639	rs4148210	C	T	4435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.017;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=82;PP=2962;ReadPosRankSum=0.646;SC=TCTCCTGTCTCCCACAGGGCC;SOR=0.571;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=270;TCF=144;TCR=126;TR=172;WE=44071647;WS=44071615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,198:0.66:302
chr2	44071743	rs4148211	A	G	3329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.946;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=75;PP=1921;ReadPosRankSum=-0.326;SC=GACCTCAACTACCAGGTAGAG;SOR=0.780;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=235;TCF=106;TCR=129;TR=135;WE=44071751;WS=44071733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,154:0.57:271
chr2	44071833	rs4148212	A	C	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.080;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=323;ReadPosRankSum=-1.106;SC=GGTGGGCCCAACTTGCAGGCC;SOR=0.130;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=16;WE=44071841;WS=44071823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr2	44079004	rs4148214	T	C	1757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.543;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=45;PP=1225;ReadPosRankSum=0.280;SC=TCCAAGAAGCTACAGTGTCCA;SOR=0.560;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=39;TCR=78;TR=68;WE=44079012;WS=44078994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,74:0.58:128
chr2	44101214	rs10709506	CA	C	687.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=14;PP=694;SC=GGTTTGATTTCATTGTGATTG;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=44101222;WS=44101204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	44101394	rs4953027	A	G	647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=2;PP=552;SC=CATCTAAATTAGGATGGCTTT;SOR=4.615;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=44101402;WS=44101384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	44101430	rs4952689	T	G	1564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=9;PP=1184;SC=AAAAAAAAATTAGAGACTTGG;SOR=3.126;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=40;TCR=9;TR=49;WE=44101438;WS=44101407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	44101537	rs138296512	A	AT	3434.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.649;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=33;PP=2679;ReadPosRankSum=0.795;SC=CCTTTCCCTTACTTTTTAGGT;SOR=0.855;SbPval=0.08;Source=Platypus;TC=164;TCF=40;TCR=124;TR=52;WE=44101546;WS=44101527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:218,97:0.31:315
chr2	44101538	rs28517482	C	T	3443.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=3.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FS=2.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.86;ReadPosRankSum=0.667;SOR=0.850;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:218,99:0.31:317
chr2	44101649	rs10667526	G	GC,GCC	3721.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=2.770;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.30;ReadPosRankSum=-0.600;SOR=1.769;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:2,74,51:0.58,0.40:127
chr2	44102235	rs4148220	T	C	925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=15;PP=570;ReadPosRankSum=0.252;SC=TTTATAATAATGGCAGTGAAG;SOR=0.722;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=95;TCF=65;TCR=30;TR=45;WE=44102255;WS=44102225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,46:0.44:105
chr2	44104925	rs6544718	T	C	7264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=123;NR=123;PP=2965;SC=ATCCTCAGTGTCATGGAGCTG;SOR=0.716;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=247;TCF=123;TCR=124;TR=246;WE=44104933;WS=44104915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr2	44172636	rs13022151	T	C	596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=443;ReadPosRankSum=-0.143;SC=TTAATCACTTTTCAAAAGCTC;SOR=0.701;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=51;TCF=9;TCR=42;TR=23;WE=44172644;WS=44172626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,24:0.45:53
chr2	44174968	rs35768060	T	A	1220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.641;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=31;PP=691;ReadPosRankSum=0.295;SC=TAAAAATACATCAGCAAACAT;SOR=0.632;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=122;TCF=52;TCR=70;TR=55;WE=44174976;WS=44174958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,61:0.45:137
chr2	44187829	rs10190161	A	C	1623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=39;PP=999;SC=TATTTTGATAAGCCAAAGATC;SOR=1.467;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=24;TCR=39;TR=63;WE=44187837;WS=44187819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr2	44209477	rs6741066	C	T	6372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=122;NR=99;PP=2965;SC=CCCAATCAAACTGATTGGAAA;SOR=0.842;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=221;TCF=122;TCR=99;TR=221;WE=44209485;WS=44209467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr2	44471313	rs372100783	GA	G	482.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.31;ReadPosRankSum=1.604;SOR=1.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,23:0.92:25
chr2	44471324	.	A	C	218	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;FR=1.0000;HP=10;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=16;MQ=59.91;NF=17;NR=5;PP=218;QD=11.4896005703;SC=AAAAAAAAAAACCATATATAT;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=33;TCF=23;TCR=10;TR=22;WE=44471335;WS=44471314;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:11,22:0.67:33
chr2	44471325	.	CCAT	C	201	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;FR=1.0000;HP=11;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=27;MQ=60.54;NF=12;NR=11;PP=201;QD=10.9795510697;SC=AAAAAAAAAACCATATATATA;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=12;TCR=11;TR=23;WE=44471335;WS=44471314;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	44471326	rs143311578	CAT	C	1018.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.07;QD=35.13;SOR=1.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	44471409	rs12613956	T	G	3742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=51;PP=2304;SC=TGCTGAGAGCTCTGGTGACAA;SOR=1.123;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=132;TCF=81;TCR=51;TR=132;WE=44471417;WS=44471399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr2	44502788	rs3738985	A	C	10911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=410;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=175;NR=195;PP=2965;ReadPosRankSum=1.445;SC=CGGATCCAGGAAGCTCAACAG;SOR=0.440;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=373;TCF=177;TCR=196;TR=370;WE=44502796;WS=44502778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,407:1.00:408
chr2	44502905	rs146630359	T	A	1594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.083;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=32;PP=1017;ReadPosRankSum=-0.929;SC=TCCAGTTCTCTGGCCAGGCCC;SOR=0.587;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=202;TCF=115;TCR=87;TR=74;WE=44502913;WS=44502895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,81:0.37:220
chr2	44508835	rs11124986	G	A	764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=21;PP=544;SC=GTTTCCAGTTGTTATTTACTC;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=44508843;WS=44508825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	44512971	rs3768919	G	A	1546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=32;PP=973;SC=GTAAAAATACGTTGCAACCAT;SOR=1.487;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=19;TCR=32;TR=51;WE=44512979;WS=44512961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr2	44531484	rs3738984	C	T	3045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=66;PP=1948;SC=GATGGTAAGTCCTCATGACAG;SOR=2.193;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=90;TCF=24;TCR=66;TR=90;WE=44531492;WS=44531474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr2	44539792	rs121912691	T	C	2815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=454;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=75;PP=1522;ReadPosRankSum=0.077;SC=GTGATGAACATGCTTCTTTTC;SOR=0.630;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=418;TCF=205;TCR=213;TR=151;WE=44539800;WS=44539782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:293,161:0.35:454
chr2	44547574	rs698761	G	A	7109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=137;NR=101;PP=2965;SC=CCGCTAAAATGAGAATAAGGT;SOR=1.045;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=238;TCF=137;TCR=101;TR=238;WE=44547582;WS=44547564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr2	44547909	rs8886	T	C	869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=26;PP=628;SC=TGAATGTAACTGCTTTAAGAA;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=28;WE=44547917;WS=44547899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	44548613	rs2241871	T	C	2867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=58;PP=1849;SC=AAAAATTAAATAGAAGGCCTT;SOR=1.540;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=31;TCR=58;TR=89;WE=44548621;WS=44548603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr2	44556298	rs2033951	T	C	1478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=41;PP=1245;SC=TCTTTTATAATAACTGTTTTA;SOR=3.033;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=8;TCR=41;TR=49;WE=44556306;WS=44556288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr2	44565447	rs2289463	A	T	552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=15;NR=4;PP=337;SC=AAACTGCATAAATATTTTGAT;SOR=2.200;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=19;WE=44565455;WS=44565437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	44569474	rs2304769	G	A	489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=16;NR=3;PP=384;SC=CAAAATAAACGTTTTAAGTCA;SOR=2.833;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=44569482;WS=44569464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	44569700	rs61004197	AAAT	A	2382.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=37;PP=1021;SC=TTCTGAAAGAAAATAATGAGA;SOR=1.528;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=37;WE=44569714;WS=44569685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr2	44570776	rs17580226	C	T	1369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=8;PP=1045;SC=CATAGGGATACATGAATCAGG;SOR=2.985;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=37;TCR=8;TR=45;WE=44570784;WS=44570766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr2	44570804	rs12053381	C	A	2063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=15;PP=1463;SC=CTTCTCCCTCCCTCACATGCG;SOR=2.439;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=55;TCR=15;TR=70;WE=44570812;WS=44570794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr2	44573624	rs698763	G	A	469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=13;PP=319;SC=TAGACTTAACGTTGTACAAAA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=44573632;WS=44573614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	44573658	rs698764	T	C	187.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=125;SC=AAATAGTAGGTATTTCACAGA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=44573679;WS=44573648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	44573671	rs698765	G	T	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=2;PP=23;SC=TTCACAGATTGTAAATGTTCT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=44573679;WS=44573648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr2	44617324	rs1085486	T	A	2467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=28;PP=1541;SC=CTTTTTTGAATACTAAAAATG;SOR=1.338;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=55;TCR=28;TR=83;WE=44617332;WS=44617314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr2	44622256	rs1067342	A	C	163.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=119;SC=TATGGTCTAAATTTTTAGTTT;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=44622264;WS=44622246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	44858687	rs10191477	T	C	996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.489;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=21;PP=649;ReadPosRankSum=0.099;SC=AAGCAATCCTTCTGCCTCAGC;SOR=0.529;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=109;TCF=67;TCR=42;TR=47;WE=44858695;WS=44858677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,53:0.43:123
chr2	44931520	rs343989	C	T	1128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.868;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=36;PP=777;ReadPosRankSum=-0.220;SC=TAGCCCATCACGGATATTGAA;SOR=0.950;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=159;TCF=64;TCR=95;TR=56;WE=44931528;WS=44931510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,60:0.35:173
chr2	44942384	rs343957	C	G	2129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=57;NR=25;PP=1674;SC=TTTTTGGTCACTTCACAATCA;SOR=1.522;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=83;TCF=58;TCR=25;TR=82;WE=44942392;WS=44942374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr2	44981119	rs3738980	T	G	1855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.592;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=12;PP=1178;ReadPosRankSum=-0.808;SC=TAATTAGCCTTGTACTTATCT;SOR=0.940;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=124;TCF=97;TCR=27;TR=67;WE=44981127;WS=44981109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,75:0.56:135
chr2	44993542	rs343937	A	G	933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=18;PP=581;ReadPosRankSum=0.052;SC=GTTTTAAAATATGTGAATTTC;SOR=0.700;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=136;TCF=82;TCR=54;TR=48;WE=44993550;WS=44993532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,51:0.35:145
chr2	45171842	rs338074	A	G	11039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=424;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=205;NR=180;PP=2965;SC=CGGAGCGCGCAGACACCGGCA;SOR=0.792;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=386;TCF=205;TCR=181;TR=385;WE=45171850;WS=45171832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,424:1.00:424
chr2	45647043	rs3213788	C	G	5391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=106;PP=2965;SC=GCTGAAAAGACAAAGATCAAA;SOR=1.251;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=179;TCF=73;TCR=106;TR=179;WE=45647051;WS=45647033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr2	45773816	rs2276657	C	G	1664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=13;PP=1272;SC=ATCACAAAAGCAACTTTAAAG;SOR=2.387;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=41;TCR=13;TR=54;WE=45773824;WS=45773806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr2	45774050	rs6708810	G	A	4245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=75;PP=2507;SC=AAAATGTACAGAATGCACAAA;SOR=1.108;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=136;TCF=61;TCR=75;TR=136;WE=45774058;WS=45774040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr2	45774548	rs1865685	A	C	4104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=55;PP=2857;SC=TATATGGTTTATTGTCTCTCA;SOR=1.282;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=147;TCF=91;TCR=56;TR=146;WE=45774556;WS=45774538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr2	45780962	rs3816107	C	G	3080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=70;PP=2040;SC=AATACAGAAGCGGGGAAAACC;SOR=2.193;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=26;TCR=70;TR=96;WE=45780970;WS=45780952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr2	45826526	rs35501868	CT	C	6785.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=52;PP=2966;SC=AGTACAACCCCTATGCTAGTC;SOR=1.556;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=108;TCF=55;TCR=53;TR=106;WE=45826534;WS=45826516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr2	45879610	rs637909	A	G	631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=19;PP=497;SC=CCTCCCCGTCATTCCGGGAAC;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=22;WE=45879618;WS=45879600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	46070269	rs3214783	T	TC	806.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.318;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.841;NF=1;NR=26;PP=646;ReadPosRankSum=0.420;SC=GTCTCTTCTTTCCCCCCCTTG;SOR=1.662;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=27;WE=46070277;WS=46070259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,34:0.61:56
chr2	46203796	rs2278786	G	C	2709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=57;PP=1884;SC=TGGGGTAGGGGAGACTATGCA;SOR=1.916;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=25;TCR=57;TR=82;WE=46203804;WS=46203786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr2	46211658	rs4953294	G	A	1698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=31;PP=1094;ReadPosRankSum=0.743;SC=TGAGGAGCTCGGTGGTGAACC;SOR=0.700;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=192;TCF=115;TCR=77;TR=80;WE=46211666;WS=46211648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,86:0.40:213
chr2	46228391	rs61190862	C	CAT	370.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.701;HP=2;HapScore=3;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=378;ReadPosRankSum=-0.284;SC=TGATGGAAGACATATATATAT;SOR=2.448;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=12;WE=46228399;WS=46228381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr2	46231525	rs4953297	T	A	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=392;ReadPosRankSum=-0.617;SC=TCATTTTGGCTACTTTGGCGA;SOR=0.590;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=60;TCF=45;TCR=15;TR=27;WE=46231533;WS=46231515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,30:0.45:66
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chr2	46583281	rs75984373	C	T	1128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=26.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=31.35;ReadPosRankSum=0.476;SOR=3.226;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,28:0.78:36
chr2	46583593	rs2278753	G	A	545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.377;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=387;ReadPosRankSum=-1.043;SC=CTCAGGCCACGCTCCCACCCC;SOR=2.675;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=37;TCF=9;TCR=28;TR=22;WE=46583601;WS=46583583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,23:0.61:38
chr2	46602722	rs7567582	T	C	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=243;ReadPosRankSum=-0.623;SC=CGCCCTGTTCTGTCTGTTCCC;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=11;WE=46602730;WS=46602712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr2	46603671	rs7557402	C	G	1135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.132;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=26;PP=721;ReadPosRankSum=-0.204;SC=TCTTTCCCCCCCATTAGTGAG;SOR=0.802;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=204;TCF=117;TCR=87;TR=61;WE=46603679;WS=46603661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,69:0.31:221
chr2	46605659	rs7571218	A	G	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=22;ReadPosRankSum=-0.368;SC=GTTAATTAGCAGCCCCTCTAC;SOR=0.602;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=4;WE=46605667;WS=46605649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr2	46605954	rs7598371	G	C	749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.919;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=23;PP=409;ReadPosRankSum=-1.201;SC=GCTGTCTGGTGGACAGCAAAG;SOR=0.937;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=73;TCF=26;TCR=47;TR=35;WE=46605962;WS=46605944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,38:0.50:76
chr2	46608542	rs13006131	C	G	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.793;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=112;ReadPosRankSum=-1.281;SC=CCTTCAGCATCTTATAGCTGA;SOR=1.552;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=7;WE=46608550;WS=46608537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr2	46711631	rs111701016	G	A	734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=24;PP=443;ReadPosRankSum=-0.358;SC=AGTGTTATCCGTGCATGATCC;SOR=0.718;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=19;TCR=66;TR=31;WE=46711639;WS=46711621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,35:0.38:92
chr2	46739489	rs147855126	A	G	2952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=50;PP=1753;ReadPosRankSum=-0.883;SC=CAGACCCTGGAGCACCAGTTT;SOR=0.655;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=176;TCF=92;TCR=84;TR=106;WE=46739497;WS=46739479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,124:0.62:200
chr2	46771134	rs6714484	G	C	1447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=40;PP=1170;SC=AACAAACAGAGCCGGATAAGC;SOR=3.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=5;TCR=40;TR=45;WE=46771142;WS=46771124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr2	46799852	rs1451153	G	T	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=305;ReadPosRankSum=0.774;SC=AAAATATAATGGGTTTGTTAA;SOR=0.711;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=45;TCR=17;TR=25;WE=46799860;WS=46799842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,27:0.40:68
chr2	46819815	rs2305350	A	G	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.348;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=331;ReadPosRankSum=-0.155;SC=GTATACATATATTTCCTGCTA;SOR=1.410;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=75;TCF=23;TCR=52;TR=23;WE=46819823;WS=46819805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,23:0.30:77
chr2	46840735	rs3213985	T	C	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=3.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.63;ReadPosRankSum=-0.326;SOR=0.257;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr2	46842410	rs2242033	A	G	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.661;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=332;ReadPosRankSum=-0.324;SC=AATAGGTCATAAAGTCAATTT;SOR=0.300;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=43;TCF=6;TCR=37;TR=19;WE=46842418;WS=46842400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,20:0.44:45
chr2	46844247	rs113423551	G	T	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.881;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=25;ReadPosRankSum=-0.355;SC=AGAAAGGGAGGGGCGGGCAAA;SOR=0.250;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=4;WE=46844255;WS=46844237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr2	46986416	rs6738426	A	G	5032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-2.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=365;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.163;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.624;NF=111;NR=93;PP=2940;ReadPosRankSum=-0.761;SC=TTTTTGATACATTTGATCCAT;SOR=0.876;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=321;TCF=170;TCR=151;TR=204;WE=46986424;WS=46986406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,233:0.64:364
chr2	46987300	rs3768720	T	G	4042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=79;PP=2465;SC=TCCCCAAAGGTTGTTAACTAG;SOR=1.248;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=134;TCF=55;TCR=79;TR=134;WE=46987308;WS=46987290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr2	47045267	rs2289931	G	A	1550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=9;PP=1015;SC=GCAGCAACCCGGGCCAGCCCA;SOR=2.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=36;TCR=9;TR=45;WE=47045275;WS=47045257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr2	47045309	rs2289933	C	T	6741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=92;NR=49;PP=2747;SC=TCTTGCCTCTCCTCCTCCAGG;SOR=1.563;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=92;TCR=49;TR=141;WE=47045329;WS=47045299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr2	47045321	rs17773492	A	G	7420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=67;PP=2965;SC=TCCTCCAGGGAACTCTTTGAA;SOR=1.198;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=167;TCF=100;TCR=67;TR=167;WE=47045329;WS=47045299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr2	47049409	rs2278715	C	T	1722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=38;PP=1081;SC=GCCAGTCCCCCACTTCGGTCT;SOR=2.119;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=15;TCR=38;TR=53;WE=47049417;WS=47049399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
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chr2	47081092	rs11687883	C	T	662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=14;NR=10;PP=364;SC=AAGGATGATACGGTTTGGCTG;SOR=0.846;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=14;TCR=10;TR=24;WE=47081100;WS=47081082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
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chr2	47134904	rs2289928	G	A	826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=14;PP=483;ReadPosRankSum=-2.111;SC=TTAACAAAGGGAAGCCTTTCT;SOR=0.691;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=112;TCF=72;TCR=40;TR=41;WE=47134912;WS=47134894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,45:0.37:123
chr2	47144394	rs76192704	C	G	1177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.880;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=18;PP=802;ReadPosRankSum=0.416;SC=ACCTCCGCCTCCCAAAGTGCT;SOR=0.929;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=155;TCF=98;TCR=57;TR=56;WE=47144402;WS=47144384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,60:0.36:167
chr2	47168533	.	CGCCGCCCGGGCCCCCGCT	C	228.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.830;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.632;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=2;PP=369;ReadPosRankSum=-0.967;SC=GCCCACCCTCCGCCGCCCGGG;SOR=0.148;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=3;WE=47168558;WS=47168530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr2	47168892	rs6755386	G	C	1087.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=32;PP=587;ReadPosRankSum=1.125;SC=CTGGCTCGCCGGCAGCGAGCG;SOR=0.673;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=151;TCF=64;TCR=87;TR=57;WE=47168900;WS=47168882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,61:0.38:162
chr2	47201797	rs6745836	A	T	2417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=52;NR=34;PP=1393;SC=AAATTTTTTTAAAAAACCTCA;SOR=0.947;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=52;TCR=34;TR=86;WE=47201805;WS=47201787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr2	47201988	rs72888545	C	T	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.687;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.276;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=247;ReadPosRankSum=-1.430;SC=CGCAGACCTCCGCCTCCTCCT;SOR=1.609;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=6;WE=47201999;WS=47201978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr2	47201991	rs67758600	CT	C	156.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.852;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=229;ReadPosRankSum=1.843;SC=AGACCTCCGCCTCCTCCTGGC;SOR=0.368;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=9;TCF=5;TCR=4;TR=4;WE=47201999;WS=47201978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr2	47314052	rs1474394	T	C	617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=1;PP=482;SC=CAATCATGTTTTGTGGCCAGA;SOR=3.611;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=47314060;WS=47314045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	47317250	rs28679288	T	C	600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=1;PP=391;SC=TCACTCCTGATTGCCTTGACA;SOR=3.716;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=47317258;WS=47317240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	47348347	rs1880583	C	T	3114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=56;NR=48;PP=1760;SC=CTCCCCTCACCCCTAGCTGTC;SOR=0.710;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=105;TCF=56;TCR=49;TR=104;WE=47348355;WS=47348337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr2	47357458	rs58184321	A	G	7775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=163;PP=2965;SC=TCACTTCGTTATCTGTCATTC;SOR=1.434;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=260;TCF=97;TCR=163;TR=259;WE=47357466;WS=47357448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,274:1.00:274
chr2	47380203	rs815809	T	C	3013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=51;PP=1416;SC=GGTGATCCCTTGAAATTAAAT;SOR=0.978;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=98;TCF=47;TCR=51;TR=98;WE=47380211;WS=47380193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr2	47382214	rs815806	C	G	2433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=56;NR=24;PP=1699;SC=GGAACGAGAGCGGCACGAAGG;SOR=1.554;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=81;TCF=57;TCR=24;TR=80;WE=47382222;WS=47382204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr2	47382342	rs815804	G	T	7676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=136;NR=130;PP=2965;SC=CCACCCACCAGGTCTTCCCTT;SOR=0.778;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=267;TCF=136;TCR=131;TR=266;WE=47382350;WS=47382332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,292:1.00:292
chr2	47601106	rs1126497	T	C	7757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=146;NR=124;PP=2965;SC=GGCACCTCCATGTGCTGGTGT;SOR=0.854;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=270;TCF=146;TCR=124;TR=270;WE=47601114;WS=47601096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,292:1.00:292
chr2	47605097	rs28609437	C	T	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=23;ReadPosRankSum=-0.566;SC=GATGGCCGGGCACGGTGGCTC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=3;WE=47605105;WS=47605087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr2	47607186	rs11687953	T	C	593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.624;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=344;ReadPosRankSum=-0.202;SC=GCGCGGTGGCTCACCACACCT;SOR=0.307;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=33;TCF=10;TCR=23;TR=22;WE=47607194;WS=47607176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,25:0.69:36
chr2	47612224	rs7584256	C	T	884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.662;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=11;PP=559;ReadPosRankSum=-0.503;SC=AAATTATGTCCATTAAAAGCA;SOR=0.872;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=93;TCF=66;TCR=27;TR=40;WE=47612232;WS=47612214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,43:0.42:103
chr2	47613699	rs62139669	T	C	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=10;PP=370;ReadPosRankSum=-0.191;SC=TCTGTGCTTTTTCCTGTTTCA;SOR=0.678;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=31;TCR=21;TR=24;WE=47613707;WS=47613689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,24:0.45:53
chr2	47630550	rs2303426	C	G	2173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=31;NR=42;PP=1299;SC=AGGTGAGGGCCGGGACGGCGC;SOR=1.292;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=31;TCR=42;TR=73;WE=47630558;WS=47630540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
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chr2	47672569	rs1981929	G	A	355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=1;PP=286;SC=TTGGAGACCTGCTGTACTATT;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=47672577;WS=47672559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
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chr2	47693706	rs3732182	G	T	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=167;ReadPosRankSum=-0.453;SC=ATAACAGTATGTTTTTCACTA;SOR=0.522;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=41;TCR=3;TR=12;WE=47693714;WS=47693696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,12:0.28:43
chr2	47703500	rs2303428	T	C	1429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.033;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=19;PP=952;ReadPosRankSum=1.080;SC=ATAATTTGTTTTGTAGGCCCC;SOR=0.950;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=129;TCF=81;TCR=48;TR=61;WE=47703508;WS=47703490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,68:0.48:141
chr2	47739551	rs2303424	A	G	1059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.606;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=30;PP=692;ReadPosRankSum=-2.053;SC=AGACAGAACCAGGGCAGTGGT;SOR=0.624;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=152;TCF=72;TCR=80;TR=57;WE=47739559;WS=47739541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,59:0.37:159
chr2	47748292	rs2278139	A	G	5506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=83;PP=2965;SC=CGGGGTCGGCACCGAGCGCGG;SOR=0.809;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=185;TCF=102;TCR=83;TR=185;WE=47748300;WS=47748282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr2	48010558	rs1042820	C	A	1403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=35;PP=691;ReadPosRankSum=1.682;SC=CCTTGGCGCGCTCCGCGTCAC;SOR=0.675;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=139;TCF=57;TCR=82;TR=61;WE=48010566;WS=48010548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,71:0.46:156
chr2	48010654	rs55927047	C	G	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=151;ReadPosRankSum=-1.169;SC=GGGGTGGGGTCGAAGGCGGGG;SOR=0.603;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=58;TCF=24;TCR=34;TR=18;WE=48010662;WS=48010644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,20:0.32:62
chr2	48018081	rs1800932	A	G	1929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.659;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=40;PP=1267;ReadPosRankSum=0.333;SC=ACTTCTCACCAGGAGATTTGG;SOR=1.025;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=263;TCF=154;TCR=109;TR=100;WE=48018089;WS=48018071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:187,107:0.36:294
chr2	48018314	rs3136282	T	A	321.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=313;ReadPosRankSum=0.252;SC=TGTGTGTGTGTGAGAGAAACA;SOR=0.994;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=47;TCF=4;TCR=43;TR=17;WE=48018322;WS=48018304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,15:0.33:45
chr2	48022900	rs3136316	A	G	222.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=1;PP=188;SC=GTGAGCCACCACACCTGGCAT;SOR=3.056;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=48022908;WS=48022890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	48023115	rs1800935	T	C	1999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.657;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=54;PP=1153;ReadPosRankSum=-1.751;SC=AACGTGCAGATGAAGCCTTAA;SOR=0.807;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=260;TCF=131;TCR=129;TR=104;WE=48023123;WS=48023105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,109:0.39:279
chr2	48030458	rs2072447	G	C	1414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=3;PP=1016;SC=TGAAAGTTATGTCTTATAATG;SOR=4.712;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=36;TCR=3;TR=39;WE=48030466;WS=48030448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr2	48030838	rs2020911	A	T	4800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=96;PP=2724;SC=ACTGATTCTTAAAGTTTTGTT;SOR=1.431;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=155;TCF=59;TCR=96;TR=155;WE=48030846;WS=48030828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr2	48032874	rs2234731	ACTAT	A	2223.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=27;PP=1569;SC=TCATTTGAAGACTATCTATCT;SOR=1.314;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=30;WE=48032885;WS=48032864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr2	48032937	rs3136359	T	C	420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=14;PP=375;SC=TGAAGTACATTTAAACAATAT;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=48032945;WS=48032927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	48033551	rs3136367	C	G	10249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=376;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=172;NR=155;PP=2965;SC=GGGCACTTCTCTTGCTAGCAC;SOR=0.753;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=328;TCF=173;TCR=155;TR=327;WE=48033559;WS=48033541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,375:1.00:375
chr2	48033890	rs267608137	CT	C	83.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=2.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQRankSum=1.144;QD=3.99;ReadPosRankSum=0.388;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr2	48040904	rs373765859	G	GA	4150.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=43;PP=2169;ReadPosRankSum=-0.611;SC=TATTAACACAGAAAAAAGATG;SOR=1.116;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=90;TCF=37;TCR=53;TR=69;WE=48040918;WS=48040894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,161:0.99:163
chr2	48046012	.	TAA	T	54.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.255;ClippingRankSum=0.000;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.61;MQRankSum=0.000;QD=1.66;ReadPosRankSum=0.200;SOR=0.507;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,6:0.18:33
chr2	48066232	rs368463059	CT	C	130.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=79;ReadPosRankSum=-0.207;SC=TAATGAATAGCTTTTTTTTTT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=8;WE=48066240;WS=48066222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr2	48586409	rs137947879	ATTTAGTT	A	989.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.404;NF=0;NR=21;PP=918;ReadPosRankSum=-0.793;SC=TTTATGTTTTATTTAGTTTTT;SOR=0.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=0;TCR=51;TR=21;WE=48586423;WS=48586399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,27:0.63:43
chr2	48602252	rs17855177	C	T	3856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.435;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=80;PP=2714;ReadPosRankSum=-0.444;SC=GCGTGTCTTCCCTGTCTTCTG;SOR=0.643;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=266;TCF=124;TCR=142;TR=154;WE=48602260;WS=48602242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,166:0.58:287
chr2	48688258	rs376347710	AT	A	129.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.42;MQRankSum=1.100;QD=6.49;ReadPosRankSum=0.455;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr2	48689053	rs11125171	A	G	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.72;ReadPosRankSum=0.135;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
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chr2	48738388	rs62135170	C	T	886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.217;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=8;PP=534;ReadPosRankSum=-0.734;SC=TATAATTTCCCTACTCCACAT;SOR=0.386;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=107;TCF=90;TCR=17;TR=38;WE=48738396;WS=48738378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,41:0.35:117
chr2	48738687	rs4528813	G	C	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.818;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=24;PP=537;ReadPosRankSum=0.356;SC=ATTTCAGGAGGAAGAGGACAT;SOR=0.352;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=63;TCF=10;TCR=53;TR=30;WE=48738695;WS=48738677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,30:0.45:67
chr2	48756682	rs34461314	C	G	932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.96;ReadPosRankSum=1.254;SOR=0.699;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,45:0.62:72
chr2	48807796	rs17039250	A	C	2566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.461;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=43;PP=1584;ReadPosRankSum=0.051;SC=ATCCAGGCAAATGGGTCACCT;SOR=0.751;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=233;TCF=137;TCR=96;TR=107;WE=48807804;WS=48807786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,123:0.48:256
chr2	48807976	rs3828340	T	C	5466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=368;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.291;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=120;NR=98;PP=2962;ReadPosRankSum=1.588;SC=CCATTGTAGATTTTTATTTCA;SOR=0.785;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=328;TCF=179;TCR=149;TR=218;WE=48807984;WS=48807966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,238:0.65:367
chr2	48808152	rs940389	G	C	4771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.333;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=106;NR=85;PP=2962;ReadPosRankSum=0.548;SC=CTGCCTACCAGACCAACATGT;SOR=0.601;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=305;TCF=170;TCR=135;TR=191;WE=48808160;WS=48808128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,204:0.61:334
chr2	48808594	rs3749142	C	T	5105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=414;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.523;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=111;NR=93;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.482;SC=AGCCAAAATCCGGATGGTCTT;SOR=0.744;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=381;TCF=205;TCR=176;TR=204;WE=48808602;WS=48808584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:186,227:0.55:413
chr2	48808882	rs3749144	T	A	2221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.209;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=45;PP=1651;ReadPosRankSum=1.118;SC=TTCATGAACCTGACATAGAGC;SOR=1.005;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=127;TCF=60;TCR=67;TR=82;WE=48808890;WS=48808872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,86:0.63:136
chr2	48808898	rs3749145	C	T	2379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.366;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=46;PP=1605;ReadPosRankSum=-0.699;SC=AGAGCAGATGCTGAAGTTGGG;SOR=0.788;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=69;TCR=67;TR=92;WE=48808906;WS=48808888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,98:0.66:149
chr2	48809593	rs3792234	G	T	2870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.613;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=54;PP=1899;ReadPosRankSum=0.774;SC=GGAGTTTACAGGAACTTGAAT;SOR=0.574;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=220;TCF=128;TCR=92;TR=124;WE=48809601;WS=48809583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,129:0.56:232
chr2	48809756	rs3792235	T	C	1068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.534;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=32;PP=828;ReadPosRankSum=2.499;SC=TAAATATTCTTACCTTCCTCC;SOR=1.796;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=54;TCF=10;TCR=44;TR=37;WE=48809764;WS=48809746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,39:0.70:56
chr2	48822381	rs2140551	G	A	1279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.584;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=21;PP=860;ReadPosRankSum=-0.998;SC=AAATAGAAAAGAAGTGGATTA;SOR=0.754;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=157;TCF=95;TCR=62;TR=59;WE=48822389;WS=48822371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,64:0.37:173
chr2	48822540	rs7574549	T	C	1350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.636;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=31;PP=775;ReadPosRankSum=-1.815;SC=GACTTCTGAATAGCGGTTTTA;SOR=0.540;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=99;TCF=35;TCR=64;TR=50;WE=48822548;WS=48822530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,59:0.54:109
chr2	48844968	rs2293269	C	G	3667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=41;PP=1968;SC=TCCGAGGGCACTGCGTGCCGC;SOR=1.027;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=114;TCF=73;TCR=41;TR=114;WE=48844976;WS=48844958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr2	48847918	.	G	GAATAAATA,GAATA	343.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.23;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;NF=2,2;NR=1,1;PP=35,97;SC=TCCATCTCAAGAATAAATAAA;SOR=1.981;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=3,3;WE=48847926;WS=48847908;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:5
chr2	48848515	rs17037472	G	C	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.017;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=228;ReadPosRankSum=0.837;SC=ACAGGGTAATGTTCTTAGGGT;SOR=3.690;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=11;WE=48848523;WS=48848505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr2	48873978	rs10432667	A	G	3025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.487;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=58;PP=1951;ReadPosRankSum=1.420;SC=AACAAATTCTAATGTGGAGTC;SOR=0.778;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=269;TCF=140;TCR=129;TR=127;WE=48873986;WS=48873968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,142:0.47:301
chr2	48898798	rs3920390	T	A	4692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=73;PP=2626;SC=CGGATAATGTTATTGTCTGTC;SOR=0.839;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=146;TCF=73;TCR=73;TR=146;WE=48898806;WS=48898788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr2	48906625	rs1965508	T	C	3198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=53;NR=52;PP=1708;SC=ATCAGTTGGATTATATTGCAT;SOR=0.848;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=53;TCR=52;TR=105;WE=48906633;WS=48906615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr2	48915871	rs11125179	A	G	8571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=123;NR=163;PP=2965;SC=AGCCCATAATATCTTCACAGG;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=287;TCF=124;TCR=163;TR=286;WE=48915879;WS=48915861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,313:1.00:313
chr2	48921375	rs2293275	T	C	2926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=63;NR=36;PP=1654;SC=TGTTTTGTTATTCACTTTCCT;SOR=1.042;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=99;TCF=63;TCR=36;TR=99;WE=48921383;WS=48921365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr2	48925746	rs6755901	C	T	933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.501;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=13;PP=624;ReadPosRankSum=-0.739;SC=CTTTTGGTTTCTACTTACTCT;SOR=0.946;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=111;TCF=75;TCR=36;TR=44;WE=48925754;WS=48925736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,47:0.39:119
chr2	48925986	rs70946824	AT	A	809.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.82;SOR=2.899;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr2	48952701	rs6545063	C	G	505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=2;PP=329;SC=GAGGAACATGCAAATAGTGCC;SOR=2.712;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=48952709;WS=48952691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	48956233	rs192797514	G	C	1123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.748;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=16;PP=697;ReadPosRankSum=-0.698;SC=TACCAAGTGGGCTCCAGCCAG;SOR=0.252;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=70;TCF=49;TCR=21;TR=46;WE=48956241;WS=48956223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,49:0.64:76
chr2	48956431	rs11892719	T	A	3387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.362;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=73;PP=2009;ReadPosRankSum=-0.033;SC=TCTGCATGATTATGAGCTATG;SOR=0.886;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=205;TCF=97;TCR=108;TR=135;WE=48956439;WS=48956421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,151:0.65:232
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chr2	48956512	rs11897846	A	G	879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.052;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=26;PP=639;ReadPosRankSum=-0.383;SC=GTTGTCCCCAAATCATACAGT;SOR=2.055;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=60;TCF=13;TCR=47;TR=30;WE=48956520;WS=48956502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,33:0.52:64
chr2	49003566	rs10194838	C	T	512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=15;PP=362;SC=AAATGCCTGACATTGAAATTC;SOR=2.419;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=49003574;WS=49003556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	49189921	rs6166	C	T	1442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.178;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=27;PP=928;ReadPosRankSum=-0.081;SC=AGTGGAACCACTGGTGACTCT;SOR=1.109;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=251;TCF=144;TCR=107;TR=76;WE=49189929;WS=49189911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:197,84:0.30:281
chr2	49191041	rs6165	C	T	900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.697;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=20;PP=490;ReadPosRankSum=-0.933;SC=TGACCCCTAGCCTGAGTCATA;SOR=0.608;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=110;TCF=52;TCR=58;TR=40;WE=49191049;WS=49191031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,45:0.37:123
chr2	49215977	rs2072488	G	A	857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=21;NR=6;PP=583;SC=AGATGAGAGAGGAACGCAGAA;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=27;WE=49215985;WS=49215967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	49216284	rs2072487	C	T	293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=240;SC=ATGCGGTCTTCAGCTGAGGTA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=49216292;WS=49216274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	49217916	rs2072486	T	G	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=4.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.783;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=197;ReadPosRankSum=0.412;SC=ATACGTGAATTAGGCTCATGT;SOR=2.964;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=10;WE=49217924;WS=49217906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr2	49244559	rs2091787	A	G	933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.533;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=13;PP=511;ReadPosRankSum=0.036;SC=AGTATCAAGTAGGCCTTTTAG;SOR=0.869;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=115;TCF=76;TCR=39;TR=41;WE=49244567;WS=49244549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,47:0.38:123
chr2	49381585	rs1394205	C	T	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=24;ReadPosRankSum=-2.100;SC=CTGATTTCTTCCTGCATTTGC;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=3;WE=49381593;WS=49381575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr2	49510173	rs7578654	A	C	2288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=61;PP=1435;ReadPosRankSum=1.479;SC=CTGCTATATAACTTGATCTCT;SOR=0.664;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=238;TCF=108;TCR=130;TR=112;WE=49510181;WS=49510163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,120:0.45:265
chr2	50201110	rs9636391	A	G	3498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=44;PP=2109;SC=AGCTACCTGCAAGTTTTCACA;SOR=1.136;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=120;TCF=76;TCR=44;TR=120;WE=50201118;WS=50201100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr2	50246224	rs7571903	C	G	1021.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=0;PP=664;SC=CCCTGTTTTGCAAATCCTTCC;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=23;WE=50246257;WS=50246217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	50246232	rs146211469	TCCAAAACATTA	T	1527.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=0;PP=2938;SC=TGCAAATCCTTCCAAAACATT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=22;WE=50246257;WS=50246217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr2	50246249	rs7586095	T	G	1692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=5;PP=1051;SC=CATTACCTCATCTGTGCTTTC;SOR=4.021;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=33;TCR=5;TR=38;WE=50246257;WS=50246217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr2	50280283	rs1363050	T	C	639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=2;PP=526;SC=TTAAGCTAGTTTCAAAGGAAG;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=50280291;WS=50280273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	50280338	rs1363049	G	A	1955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=18;PP=1262;SC=TAGAAAAGACGCATATGCAGA;SOR=1.819;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=48;TCR=18;TR=66;WE=50280346;WS=50280328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr2	50434741	rs17040210	C	T	1900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=22;PP=1110;SC=TACTATGTGACGGAACTTGAC;SOR=1.226;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=43;TCR=22;TR=65;WE=50434749;WS=50434731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr2	50434759	rs1715984	C	G	2428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=50;NR=26;PP=1410;SC=GACTTTGAATCAAATATTATA;SOR=1.153;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=50;TCR=26;TR=76;WE=50434767;WS=50434749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr2	50574485	rs13422484	A	G	2910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.111;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=75;PP=1910;ReadPosRankSum=1.533;SC=TCCTCCTGGAAGGTCCTCACT;SOR=0.616;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=198;TCF=77;TCR=121;TR=125;WE=50574493;WS=50574475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,134:0.63:214
chr2	50692459	rs12713101	T	A	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.222;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=200;ReadPosRankSum=1.083;SC=ACTGCTTCTATGGGTTATGAC;SOR=2.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=10;WE=50692467;WS=50692449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr2	50692819	rs10168838	T	G	487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=349;SC=AACTAGTTTTTAAAGTTCTAG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=50692827;WS=50692809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	50693504	rs75315267	AAC	A	3522.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=28;PP=1894;SC=GAACCCAAATAACAGTTACTG;SOR=0.908;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=40;TCF=10;TCR=30;TR=38;WE=50693513;WS=50693494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr2	50699305	rs2075234	T	A	1001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=2;PP=707;SC=AATTAAAAACTTGAATAAGGA;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=27;WE=50699313;WS=50699304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	50733545	rs13008919	G	T	1015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.700;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=15;PP=554;ReadPosRankSum=-1.384;SC=TTCAAGTTGTGTACCAGCCTT;SOR=0.614;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=115;TCF=78;TCR=37;TR=47;WE=50733553;WS=50733535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,52:0.41:128
chr2	50733860	rs7584062	A	G	2306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.48;SOR=2.162;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr2	50758657	rs2066948	T	C	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.595;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=110;ReadPosRankSum=-0.386;SC=TTATCATTTATTTAAGACTTC;SOR=0.385;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=10;WE=50758665;WS=50758647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,11:0.28:39
chr2	50858107	rs961405	T	A	981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.729;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=18;PP=712;ReadPosRankSum=-1.942;SC=AGAAAAGGAATGTCTGCTTAT;SOR=0.562;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=117;TCF=79;TCR=38;TR=51;WE=50858115;WS=50858097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,50:0.42:120
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chr2	54023247	rs72502136	GT	G	449.94	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5007;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=212;ReadPosRankSum=-0.273;SC=GTTGTGTCAGGTTTTTTTTTT;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=18;WE=54023255;WS=54023237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,21:0.91:23
chr2	54024626	rs2692514	C	T	1624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=19;PP=965;SC=GGCTTTTGTGCATTGAAATAT;SOR=1.392;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=37;TCR=19;TR=56;WE=54024634;WS=54024616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr2	54035374	rs2692519	A	G	1079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=1;PP=828;SC=AACTTAAGCCATAACTGAAAA;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=35;TCR=1;TR=36;WE=54035382;WS=54035364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr2	54035447	rs1127362	A	G	1673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.547;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=30;PP=1071;ReadPosRankSum=-0.864;SC=AAGATTTGCAATCAACTAAAG;SOR=0.647;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=172;TCF=107;TCR=65;TR=78;WE=54035455;WS=54035437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,81:0.43:187
chr2	54041983	rs2542571	G	T	3582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=72;NR=48;PP=1942;SC=ACCTTAAAGTGCTCTCTGTTT;SOR=0.973;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=120;TCF=72;TCR=48;TR=120;WE=54041991;WS=54041973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr2	54114967	rs805399	G	A	1429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.341;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=12;PP=895;ReadPosRankSum=0.196;SC=GAACTCGAGAGGTACACCACA;SOR=1.130;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=131;TCF=97;TCR=34;TR=55;WE=54114975;WS=54114957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,65:0.41:157
chr2	54115904	rs805400	A	G	2068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.408;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=52;PP=1289;ReadPosRankSum=-1.515;SC=GGTGATTCCAACAGCAGTTCA;SOR=0.665;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=323;TCF=170;TCR=153;TR=111;WE=54115912;WS=54115894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:225,120:0.35:345
chr2	54116003	rs805401	C	T	897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=30;PP=574;ReadPosRankSum=0.180;SC=ATTCTGTAAACAAATCATACT;SOR=0.728;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=107;TCF=29;TCR=78;TR=41;WE=54116011;WS=54115993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,44:0.39:113
chr2	54120025	rs805408	A	T	1487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.949;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=44;PP=965;ReadPosRankSum=-0.055;SC=CTTTCATGTGAATCTGCAACC;SOR=0.897;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=243;TCF=119;TCR=124;TR=81;WE=54120033;WS=54120015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,84:0.33:256
chr2	54120204	rs805409	A	G	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.881;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=51;ReadPosRankSum=1.264;SC=AGCTCCAAGCACACTCCCCTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=4;WE=54120212;WS=54120194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr2	54120820	rs805412	G	A	705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=16;PP=342;ReadPosRankSum=-0.368;SC=CCTTAAAGAGGCAAAAACGTC;SOR=0.755;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=93;TCF=47;TCR=46;TR=34;WE=54120828;WS=54120810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,39:0.37:106
chr2	54122956	rs698856	A	G	1809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=50;PP=1383;SC=CAGTACCAGCATAACTTTGTC;SOR=5.247;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=52;TCF=2;TCR=50;TR=52;WE=54122964;WS=54122946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr2	54122984	rs698857	C	T	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=26;ReadPosRankSum=0.064;SC=AACAACACTACAAAAATAACA;SOR=0.536;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=5;WE=54122992;WS=54122974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,7:0.27:26
chr2	54125258	rs805416	T	C	623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=8;PP=467;SC=TAGTGAAGAATACTGCTCCTA;SOR=0.793;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=9;TCR=8;TR=17;WE=54125266;WS=54125248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	54125495	rs805417	T	C	567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.991;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=22;PP=489;ReadPosRankSum=-1.856;SC=ATAGTTCCTTTAAAAAAAAGG;SOR=1.039;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=87;TCF=34;TCR=53;TR=32;WE=54125503;WS=54125485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,31:0.34:91
chr2	54127041	rs805423	C	T	5181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=97;NR=73;PP=2751;SC=CATTCTTTTCCTGTTGGCGTT;SOR=0.822;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=171;TCF=98;TCR=73;TR=170;WE=54127049;WS=54127031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr2	54133744	rs805316	T	C	1978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.106;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=37;PP=1060;ReadPosRankSum=1.465;SC=CCTGACTGTATGAACTTGTAG;SOR=0.914;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=187;TCF=105;TCR=82;TR=88;WE=54133752;WS=54133734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,99:0.48:208
chr2	54135429	rs805319	G	C	679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.956;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=10;PP=386;ReadPosRankSum=0.703;SC=AAAACAATTAGTGCAGACTTT;SOR=0.481;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=69;TCF=49;TCR=20;TR=31;WE=54135437;WS=54135419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,34:0.44:77
chr2	54144448	rs805325	T	C	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=3.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.969;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=172;ReadPosRankSum=1.524;SC=TAATAGTCTGTATCATATGGT;SOR=2.120;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=11;WE=54144456;WS=54144438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,14:0.37:38
chr2	54152927	rs2302879	T	C	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=6;ReadPosRankSum=0.421;SC=ATTCAAGTGATAGCTACTTAA;SOR=0.518;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=19;TCR=21;TR=12;WE=54152935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,12:0.29:41
chr2	54155240	rs805349	A	G	915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=17;PP=609;ReadPosRankSum=0.291;SC=GTGTATAATCACCAATATACT;SOR=0.737;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=83;TCR=44;TR=48;WE=54155248;WS=54155230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,53:0.37:142
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chr2	54159311	rs76043348	T	A	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.391;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=27;PP=558;ReadPosRankSum=1.100;SC=GCTCTCTAGCTTCTTGAGAAA;SOR=1.038;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=56;TCF=8;TCR=48;TR=31;WE=54159319;WS=54159301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,30:0.52:58
chr2	54161885	rs805357	G	T	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.954;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=18;PP=377;ReadPosRankSum=0.615;SC=AAAAAAATAAGTAAGGATATT;SOR=0.556;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=70;TCF=22;TCR=48;TR=26;WE=54161893;WS=54161875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,30:0.41:73
chr2	54343012	rs7573491	C	A	1120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=24;PP=679;SC=ACTTCCGCTCCGCCATGACAC;SOR=1.666;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=14;TCR=24;TR=38;WE=54343020;WS=54343002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr2	54362437	rs2357954	T	C	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.384;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=216;ReadPosRankSum=-1.472;SC=AAATTTAATATTGTAGGACCA;SOR=0.180;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=16;WE=54362445;WS=54362427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr2	54369120	.	T	TTGTGTGTG	152.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.000;ClippingRankSum=-0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.88;ReadPosRankSum=1.097;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr2	54494370	rs865816	A	G	1234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=8;PP=968;SC=GGCACAAAGAAGCTCCCAATA;SOR=2.780;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=33;TCR=8;TR=41;WE=54494378;WS=54494360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr2	54562012	rs55714450	C	A	3320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=41;PP=2204;SC=AGAAATTAAACACGAAGAAAA;SOR=1.131;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=68;TCR=41;TR=109;WE=54562020;WS=54562002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr2	54587319	rs13028962	C	T	1313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.594;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=23;PP=839;ReadPosRankSum=1.528;SC=TGGTTAATGTCGACTTTGTTT;SOR=0.794;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=162;TCF=103;TCR=59;TR=63;WE=54587327;WS=54587309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,68:0.39:174
chr2	54587596	rs2280718	C	T	6614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=109;NR=115;PP=2965;SC=CCCAGCACTCCTGAGAGCAGA;SOR=0.808;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=224;TCF=109;TCR=115;TR=224;WE=54587604;WS=54587586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr2	54839276	rs3796014	A	G	8035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=147;NR=118;PP=2965;SC=ATGTGTCTCTACCTCTGCTCT;SOR=0.882;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=265;TCF=147;TCR=118;TR=265;WE=54839284;WS=54839266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,287:1.00:287
chr2	54844911	rs72618664	G	A	931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.658;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=26;PP=561;ReadPosRankSum=-0.763;SC=TTCCATATCCGTTGGCTTAAC;SOR=0.344;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=56;TCF=15;TCR=41;TR=37;WE=54844919;WS=54844901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,41:0.66:62
chr2	54844926	rs7569127	T	G	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.560;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=155;ReadPosRankSum=-0.028;SC=CTTAACTGTCTCACCGTGGTG;SOR=0.307;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=43;TCF=9;TCR=34;TR=14;WE=54844934;WS=54844916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,16:0.35:46
chr2	54848728	rs12713274	A	G	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.322;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=333;ReadPosRankSum=0.996;SC=CACTCATAAAATTTGCCAATA;SOR=0.132;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=21;WE=54848736;WS=54848718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr2	54855137	rs2971887	T	C	3413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=37;PP=2272;SC=AGGGAAGGCATAGCTTCATTG;SOR=1.517;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=115;TCF=78;TCR=37;TR=115;WE=54855145;WS=54855127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr2	54855454	rs17046036	G	A	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=158;ReadPosRankSum=0.668;SC=GAAACACAGTGGGGCTTTTGA;SOR=0.350;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=10;WE=54855462;WS=54855444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr2	54858511	rs1052788	C	T	6423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=520;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=135;NR=135;PP=2962;ReadPosRankSum=2.179;SC=ACATCAAGAACGAGATCGACA;SOR=0.718;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=474;TCF=238;TCR=236;TR=270;WE=54858519;WS=54858501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:221,299:0.57:520
chr2	54858664	rs2229503	C	T	2102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.937;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=58;PP=1196;ReadPosRankSum=-1.130;SC=TGTGGGAGAACAGACAAAATC;SOR=0.936;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=276;TCF=131;TCR=145;TR=102;WE=54858672;WS=54858654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:191,113:0.37:304
chr2	54877146	rs3739109	A	G	683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=22;PP=454;ReadPosRankSum=-1.598;SC=GCAGCCACCCAGGGGTGCTGG;SOR=0.709;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=55;TCF=15;TCR=40;TR=30;WE=54877154;WS=54877136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,31:0.53:58
chr2	54882381	rs2271329	G	A	1391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.539;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=42;PP=884;ReadPosRankSum=1.258;SC=TGCAGCTGGCGTCAAGATGTA;SOR=0.745;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=188;TCF=72;TCR=116;TR=68;WE=54882389;WS=54882371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,75:0.35:212
chr2	54884870	rs966003	C	T	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.722;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=43;ReadPosRankSum=-0.464;SC=TTAGAGTAGACGATAGACTGG;SOR=0.055;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=6;WE=54884878;WS=54884860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr2	54886347	rs1052820	G	A	3882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.868;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=80;PP=2021;ReadPosRankSum=1.007;SC=AGAGGCGGCCGCCTTCTCCCG;SOR=0.754;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=279;TCF=132;TCR=147;TR=153;WE=54886355;WS=54886337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,181:0.58:313
chr2	54893237	rs3817163	C	T	1094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.224;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=35;PP=787;ReadPosRankSum=-0.256;SC=TGAGAGTCGCCGTGCTTCATG;SOR=0.437;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=70;TCF=12;TCR=58;TR=43;WE=54893245;WS=54893227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,45:0.62:73
chr2	55040426	rs2631840	A	G	7604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=125;NR=136;PP=2965;SC=GGAAGGAGCCATATATATGCA;SOR=0.870;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=262;TCF=125;TCR=137;TR=261;WE=55040434;WS=55040416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,292:1.00:292
chr2	55071101	.	TTG	T,TTGTGTGTGTG	276	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=4;MGOF=9;MMLQ=17;MQ=58.11;NF=7,7;NR=2,2;PP=194,276;QD=21.8888888889;SC=CTTTAGGGTTTTGTGTGTGTG;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=16;TCF=11;TCR=5;TR=9,9;WE=55071112;WS=55071091;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.56:16
chr2	55077061	rs12713278	A	G	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=245;ReadPosRankSum=0.547;SC=TTCTATTTGTAGAATTGCTGC;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=12;WE=55077069;WS=55077051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr2	55093842	rs1961245	G	A	2016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.365;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=28;PP=1296;ReadPosRankSum=-0.887;SC=ATGTCAAGATGCTGATATTTT;SOR=0.555;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=146;TCF=99;TCR=47;TR=87;WE=55093850;WS=55093832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,92:0.60:154
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chr2	55138272	rs2304688	G	A	320.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=207;ReadPosRankSum=-0.272;SC=ACTAATATGGGTTATATTTAC;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=10;WE=55138280;WS=55138262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr2	55144103	rs2304685	C	G	868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.356;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=26;PP=593;ReadPosRankSum=-1.115;SC=TCTTTACTTGCTCAGTCTCCT;SOR=0.432;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=62;TCF=16;TCR=46;TR=36;WE=55144111;WS=55144093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,39:0.58:67
chr2	55155672	rs10164886	A	G	2258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.452;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=50;PP=1324;ReadPosRankSum=-0.669;SC=CACCTGCCACATGCCTCCTGC;SOR=0.560;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=303;TCF=167;TCR=136;TR=107;WE=55155680;WS=55155662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:210,122:0.37:332
chr2	55155957	rs17418194	C	T	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.947;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=22;PP=419;ReadPosRankSum=1.196;SC=AGCCAGAGTGCGTTTTCTTTG;SOR=1.836;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=87;TCF=28;TCR=59;TR=26;WE=55155965;WS=55155947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,32:0.33:97
chr2	55176112	rs13394146	C	T	1987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.518;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=38;PP=902;ReadPosRankSum=-0.385;SC=GTTAAACAATCACTTGTAGTC;SOR=0.724;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=230;TCF=122;TCR=108;TR=86;WE=55176120;WS=55176102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,106:0.41:260
chr2	55180965	rs4671998	G	A	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=170;ReadPosRankSum=0.522;SC=TGGAGGTTGCGGTGAGCTGAG;SOR=0.269;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=9;WE=55180973;WS=55180955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr2	55186229	rs12623902	T	C	1091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.208;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=11;PP=503;ReadPosRankSum=-1.373;SC=GAAGATGTTGTTTTGTTTACA;SOR=1.057;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=114;TCF=73;TCR=41;TR=45;WE=55186237;WS=55186219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,56:0.42:133
chr2	55186394	rs17346629	A	C	1181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.202;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=32;PP=602;ReadPosRankSum=-0.791;SC=CGGAAAAGAGAGGCCGTAAGC;SOR=0.825;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=169;TCF=82;TCR=87;TR=61;WE=55186402;WS=55186384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,68:0.38:180
chr2	55187297	rs58866010	A	AG	5691.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=41;NR=52;PP=2966;SC=AGAGGGCCGGAGGGGTAGTGG;SOR=1.172;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=98;TCF=42;TCR=56;TR=93;WE=55187305;WS=55187287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr2	55189869	rs34564860	C	T	818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.147;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=24;PP=553;ReadPosRankSum=-0.032;SC=TCTGCCCAAACTCAGATGCCC;SOR=0.141;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=39;TCF=5;TCR=34;TR=29;WE=55189877;WS=55189859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,32:0.74:43
chr2	55201038	rs2255026	C	T	671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=18;PP=299;ReadPosRankSum=-0.087;SC=TCAAAAAGAACGGAATGATTT;SOR=0.635;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=94;TCF=37;TCR=57;TR=32;WE=55201046;WS=55201028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,38:0.35:108
chr2	55214618	rs2580769	A	C	697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.060;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=11;PP=450;ReadPosRankSum=0.694;SC=TGTTTTCCAGACATCTCACCT;SOR=0.439;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=70;TCF=50;TCR=20;TR=33;WE=55214626;WS=55214608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,34:0.45:76
chr2	55214912	rs2580770	C	G	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=202;ReadPosRankSum=-0.345;SC=AAAACAAAAACGCTACTACAT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=10;WE=55214920;WS=55214902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr2	55254721	rs13002841	T	C	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-3.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=193;ReadPosRankSum=0.061;SC=AAAGACTTACTGTTTACTAAA;SOR=0.193;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=12;WE=55254729;WS=55254711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr2	55258704	rs10173203	C	G	2789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.464;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=47;PP=1827;ReadPosRankSum=-1.712;SC=TGGATTATATCGAAGGTCAGA;SOR=0.741;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=231;TCF=137;TCR=94;TR=115;WE=55258712;WS=55258694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,123:0.49:252
chr2	55276898	.	C	T	1001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.017;ClippingRankSum=0.000;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=4.056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.05;ReadPosRankSum=-2.528;SOR=0.433;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,59:0.42:142
chr2	55404794	rs14026	G	A	783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.101;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=11;PP=513;ReadPosRankSum=0.788;SC=TTTCATGTCTGCAGAGAACAG;SOR=1.447;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=61;TCF=36;TCR=25;TR=32;WE=55404802;WS=55404784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,36:0.55:65
chr2	55404925	rs6545477	C	T	695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=2.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.91;ReadPosRankSum=0.340;SOR=0.396;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,39:0.44:88
chr2	55407754	rs6716066	C	T	10092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=377;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=176;NR=171;PP=2965;SC=TCACTGTAGACAATCTGAGCT;SOR=0.698;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=347;TCF=176;TCR=171;TR=347;WE=55407772;WS=55407744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,377:1.00:377
chr2	55407935	rs10183953	G	A	971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=27;PP=762;SC=AGCACAGTAGGACTGGATTTT;SOR=4.047;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=30;WE=55407943;WS=55407925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr2	55436934	rs9677948	G	A	1519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=37;PP=904;ReadPosRankSum=0.218;SC=TTTAGTGAGAGCATCTAGATT;SOR=0.696;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=256;TCF=133;TCR=123;TR=79;WE=55436942;WS=55436924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:198,87:0.31:285
chr2	55439963	rs2118283	C	A	2034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=42;PP=1155;SC=GAAAGGCTTTCTTATGTCTTT;SOR=1.432;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=27;TCR=42;TR=69;WE=55439971;WS=55439953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr2	55470115	rs11357	C	T	1839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.97;NF=48;NR=13;PP=1210;SC=TTTGCACTTACATCACCCACT;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=62;TCF=48;TCR=14;TR=61;WE=55470123;WS=55470105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr2	55471407	rs2589083	T	C	1537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=44;PP=1082;SC=AATGTCATAATGTACTTTAAG;SOR=2.753;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=11;TCR=44;TR=55;WE=55471415;WS=55471397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr2	55473371	rs2576724	A	G	1657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.039;HP=1;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.968;NF=53;NR=14;PP=1027;ReadPosRankSum=0.313;SC=AATATTGTTCATGAACTAACA;SOR=1.316;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=131;TCF=96;TCR=35;TR=67;WE=55473379;WS=55473361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,79:0.52:151
chr2	55473386	rs3833559	CAT	C	8357.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=55;NR=49;PP=2973;SC=CTAACAATAACATGTAACAAA;SOR=1.752;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=57;TCR=51;TR=104;WE=55473395;WS=55473376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr2	55473681	rs2589081	A	C	1478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=36;PP=1099;SC=GTCACATAATACTTGCAAGTT;SOR=3.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=4;TCR=36;TR=40;WE=55473689;WS=55473671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr2	55489629	rs2589093	T	C	1410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=35;PP=1026;SC=TTTAGATTTATTCTCAAATAT;SOR=3.816;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=41;TCF=5;TCR=36;TR=40;WE=55489637;WS=55489619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr2	55490819	rs1056445	G	T	4591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=103;NR=64;PP=2965;SC=AGCAGCCCCAGTGAGCACATC;SOR=1.039;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=168;TCF=103;TCR=65;TR=167;WE=55490827;WS=55490809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr2	55518742	rs2249856	T	C	2070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=18;PP=1319;SC=TGTGCACTTGTTTCACACTTA;SOR=1.810;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=49;TCR=18;TR=67;WE=55518750;WS=55518732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr2	55522422	rs2589110	A	G	6911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=113;NR=113;PP=2965;SC=TTATTCTGATAACTGGCCTAG;SOR=0.777;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=226;TCF=113;TCR=113;TR=226;WE=55522430;WS=55522412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr2	55527108	rs1545121	G	A	8338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=118;NR=156;PP=2965;SC=TGATGATGCTGATGAGCTTTT;SOR=1.085;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=274;TCF=118;TCR=156;TR=274;WE=55527116;WS=55527098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,310:1.00:310
chr2	55528257	rs2576699	A	C	2009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=29;PP=1254;SC=GCTGGCAATGACGCATTCACC;SOR=0.855;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=70;TCF=41;TCR=29;TR=69;WE=55528265;WS=55528247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr2	55528514	rs2589117	A	G	246.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=149;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=181;SC=TCAATCATGTATAATACAGAT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=55528522;WS=55528504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	55566531	.	A	C	127	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=127;QD=53.9237375157;SC=AGTGGAAAATAAATGGGCTAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=3;WE=55566549;WS=55566521;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:13,3:0.19:16
chr2	55566538	rs71821845	CTATT	C	119.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.793;NF=3;NR=0;PP=135;ReadPosRankSum=-1.251;SC=AATAAATGGGCTATTTATTTA;SOR=0.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=3;WE=55566549;WS=55566521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr2	55576634	rs2589090	C	T	2187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=347;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.410;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=49;PP=1437;ReadPosRankSum=1.812;SC=TCCTAAATAACAGATATTCCA;SOR=0.744;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=318;TCF=180;TCR=138;TR=116;WE=55576642;WS=55576617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:224,122:0.35:346
chr2	55582601	rs5831355	T	TTTGACACA	388.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=393;ReadPosRankSum=-0.330;SC=TTTTTCTCATTTACTTGTGAA;SOR=0.540;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=7;WE=55582609;WS=55582591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr2	55582684	rs1437394	A	T	1349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.804;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=29;PP=775;ReadPosRankSum=-0.866;SC=GACCATATAAATTCAATGAAC;SOR=0.541;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=190;TCF=119;TCR=71;TR=72;WE=55582692;WS=55582674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,79:0.38:206
chr2	55589364	rs13019339	G	A	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=151;ReadPosRankSum=-1.055;SC=AAATAGTATCGTTTCTGAAAA;SOR=0.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=9;WE=55589372;WS=55589354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr2	55589434	rs3111412	T	A	1232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.373;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=23;PP=785;ReadPosRankSum=-1.076;SC=ACTGAAAGAATTTTACAAACC;SOR=0.569;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=141;TCF=91;TCR=50;TR=62;WE=55589442;WS=55589424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,63:0.44:143
chr2	55591017	rs114386931	T	C	1138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.627;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=19;PP=674;ReadPosRankSum=-1.366;SC=TGAAGTATTTTAGGAGATAGA;SOR=0.756;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=129;TCF=77;TCR=52;TR=49;WE=55591025;WS=55591007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,58:0.41:143
chr2	55599655	rs3111411	G	A	2018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=43;PP=1050;ReadPosRankSum=3.665;SC=TTCTAAAATAGAAACAATTAT;SOR=0.690;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=138;TCF=64;TCR=74;TR=81;WE=55599663;WS=55599645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,94:0.61:153
chr2	55760940	rs4671248	G	T	1787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.583;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=15;PP=1039;ReadPosRankSum=-0.788;SC=CTTAAGGAACGAGAACAGTGA;SOR=0.934;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=117;TCF=89;TCR=28;TR=65;WE=55760948;WS=55760930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,76:0.57:134
chr2	55762957	rs3762513	C	T	766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.199;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=22;PP=512;ReadPosRankSum=-2.015;SC=ATTAAGTTTACACCTAGATCT;SOR=0.930;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=49;TCF=18;TCR=31;TR=34;WE=55762965;WS=55762947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,34:0.69:49
chr2	55764754	rs11280083	AATATGAATAC	A	1706.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.279;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.238;NF=0;NR=26;PP=2968;ReadPosRankSum=1.673;SC=TTTCTCTAATAATATGAATAC;SOR=1.346;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=69;TCF=6;TCR=63;TR=26;WE=55764771;WS=55764744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,47:0.40:117
chr2	55771050	rs3816489	C	G	1222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=9;PP=694;ReadPosRankSum=-0.215;SC=ATTCTAATTGCTCTTATTGTC;SOR=0.622;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=64;TCF=49;TCR=15;TR=41;WE=55771058;WS=55771040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,51:0.66:77
chr2	55771161	rs1045910	A	G	10695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.12;SOR=0.774;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,333:1.00:333
chr2	55771161	.	ACCTGAAGA	GCCTGAAGA,GCCTGAAGT	2962	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=167,49;NR=139,43;PP=2962,1076;QD=20;SC=CCACAAAAAGACCTGAAGATT;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=306;TCF=167;TCR=139;TR=306,92;WE=55771177;WS=55771151;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:306
chr2	55771169	rs1045920	A	T	1732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.14;ReadPosRankSum=-0.434;SOR=0.714;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:230,107:0.32:337
chr2	55805440	rs2903704	T	C	3455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=52;NR=82;PP=2055;SC=GGGGTACATATGAAACTCCAA;SOR=1.237;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=52;TCR=82;TR=134;WE=55805448;WS=55805430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr2	55808969	rs1975486	C	T	567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=18;PP=486;SC=TTATTTAAACCTCTATTCCTA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=55808977;WS=55808959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	55812061	rs4312532	A	G	650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.068;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=6;PP=1258;ReadPosRankSum=-0.338;SC=AAGTCACAACAAGTCAGAAAT;SOR=0.987;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=72;TCF=56;TCR=16;TR=30;WE=55812081;WS=55812051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,33:0.41:80
chr2	55812073	rs7594279	T	G	1309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-4.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.893;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=14;PP=1786;ReadPosRankSum=0.094;SC=GTCAGAAATCTATTATTTTGC;SOR=0.510;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=94;TCF=71;TCR=23;TR=54;WE=55812081;WS=55812051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,61:0.58:105
chr2	55815892	rs6545507	C	T	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.267;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=257;ReadPosRankSum=-0.562;SC=AATTTAAATACATACTTTTCA;SOR=0.204;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=44;TCF=35;TCR=9;TR=20;WE=55815900;WS=55815882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,21:0.44:48
chr2	55815997	rs6545508	T	C	1224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=24;PP=712;ReadPosRankSum=0.379;SC=CTTTAAGAGTTTGAATTTCAT;SOR=0.686;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=181;TCF=106;TCR=75;TR=59;WE=55816005;WS=55815985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,67:0.32:210
chr2	55844445	rs782594	T	C	781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.717;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=24;PP=600;ReadPosRankSum=1.191;SC=TCCACCGCTCTAGCCGCCGCC;SOR=0.275;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=26;WE=55844453;WS=55844435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,28:0.65:43
chr2	55863360	rs35916020	T	TA	397.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.048;NF=12;NR=6;PP=233;ReadPosRankSum=-0.063;SC=GAATTCTCTTTAAAAAAAAAA;SOR=0.501;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=39;TCF=28;TCR=11;TR=18;WE=55863368;WS=55863350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,21:0.50:42
chr2	55871932	rs71393504	AT	A	146.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.24;ReadPosRankSum=0.449;SOR=0.542;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr2	55872538	rs7594497	T	C	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=0.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.35;ReadPosRankSum=-0.528;SOR=0.608;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,34:0.30:112
chr2	55873301	rs2627776	T	A	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=193;ReadPosRankSum=-0.460;SC=TTCCACTTTTTAAAGCAATAT;SOR=1.781;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=11;WE=55873309;WS=55873291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr2	55873385	rs7584120	C	G	723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.188;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=5;PP=536;ReadPosRankSum=-2.627;SC=ATCAAGCACACTAGCTCACCT;SOR=1.431;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=78;TCF=57;TCR=21;TR=30;WE=55873393;WS=55873375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,33:0.38:86
chr2	55874657	.	AT	A	58.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.037;ClippingRankSum=0.000;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.96;ReadPosRankSum=1.256;SOR=0.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,10:0.33:30
chr2	55881954	rs148083902	TCCTGCCTTGGCCTCCCAAGGCTCATG	T	1247.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=0.734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.79;ReadPosRankSum=1.488;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,38:0.27:142
chr2	55883317	rs2627765	G	T	983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.092;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=18;PP=658;ReadPosRankSum=-2.316;SC=GGAAAATCTCGGGGAATAACA;SOR=0.886;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=35;TCR=28;TR=40;WE=55883325;WS=55883307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,43:0.63:68
chr2	55889062	rs782604	G	A	1710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=14;PP=1099;SC=ATCATAAAACGTAACAAACAT;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=42;TCR=14;TR=56;WE=55889070;WS=55889052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr2	55894247	rs782637	T	C	2021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.539;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=43;PP=1203;ReadPosRankSum=-1.152;SC=ATATAGGAAATAAGTACATTA;SOR=0.776;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=164;TCF=84;TCR=80;TR=86;WE=55894255;WS=55894237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,98:0.53:186
chr2	55898290	rs782632	C	G	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=60;ReadPosRankSum=-0.126;SC=CATTCTAGGTCTAGGGAACAG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=55898298;WS=55898280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr2	55898929	rs2627771	A	G	299.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=4;NR=0;PP=65;SC=GCCACTGCACACCAGCCTGGG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=55898937;WS=55898919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	55898930	rs2627772	C	T	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.09;ReadPosRankSum=-1.495;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr2	55899228	rs782631	A	T	2149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=46;PP=1290;SC=TCTGGAAACAAGAGGCAGTTT;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=24;TCR=46;TR=70;WE=55899236;WS=55899218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr2	55900283	rs782629	A	G	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=89;ReadPosRankSum=-0.619;SC=ATTTTCAAATACCATGACATG;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=6;WE=55900291;WS=55900273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr2	55912120	rs782572	T	C	769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.942;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=20;PP=485;ReadPosRankSum=-0.396;SC=GAAGTACCAATCTCTCTTCTC;SOR=0.950;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=59;TCF=25;TCR=34;TR=31;WE=55912128;WS=55912110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,35:0.50:70
chr2	55914573	.	C	CA	35	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.6253;HP=11;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=18;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=35;QD=14.6666666667;SC=GAGTCCACCTCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=3;WE=55914581;WS=55914567;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:4,3:0.43:7
chr2	55914621	rs809732	T	C	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=152;ReadPosRankSum=-0.136;SC=TGGACTCTGGTTGTCTGGAAT;SOR=0.610;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=11;WE=55914629;WS=55914611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr2	56097778	rs202135588	CACA	C	111.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=165;ReadPosRankSum=1.116;SC=GTGGATACCACACAACAACAA;SOR=0.078;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=7;WE=56097788;WS=56097768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,5:0.20:25
chr2	56216052	rs10865292	G	A	8241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=163;NR=137;PP=2965;SC=GAAATTTGGTGTTTAATTTTG;SOR=0.812;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=300;TCF=163;TCR=137;TR=300;WE=56216060;WS=56216042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,318:1.00:318
chr2	56411817	rs35587531	C	T	1279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.676;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=20;PP=869;ReadPosRankSum=0.474;SC=AAGTTGTTCCCCAGCCCCGGC;SOR=0.953;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=95;TCF=61;TCR=34;TR=57;WE=56411825;WS=56411807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,58:0.57:101
chr2	56603118	rs72803075	C	G	1354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.068;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=35;PP=879;ReadPosRankSum=1.183;SC=GTTGTGTCGTCGCTTGTTCGC;SOR=0.317;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=160;TCF=69;TCR=91;TR=70;WE=56603126;WS=56603108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,73:0.40:182
chr2	56611386	.	CT	C	215.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.418;ClippingRankSum=0.000;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=8.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.02;ReadPosRankSum=0.235;SOR=0.183;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,24:0.22:107
chr2	56611543	rs34920355	C	CAAG	3600.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.101;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.647;NF=2;NR=43;PP=1839;ReadPosRankSum=1.524;SC=TGATAGAAGACAAGAAGAAAA;SOR=0.517;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=145;TCF=5;TCR=140;TR=45;WE=56611551;WS=56611533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,97:0.43:227
chr2	58275666	rs986512	G	A	2483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=39;PP=1526;SC=CTTAAGGTGTGTCCTGCACTG;SOR=0.999;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=53;TCR=39;TR=92;WE=58275674;WS=58275656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
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chr2	58362161	rs11678320	G	A	813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=11;PP=935;SC=AAAAAAAAAAGCATTGAAAGT;SOR=1.765;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=40;WE=58362169;WS=58362151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	58478843	.	T	TC	214.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=-1.120;ClippingRankSum=-0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.718;NF=4;NR=4;PP=250;ReadPosRankSum=1.550;SC=CCAGGGCCCTTCCCCGGCGGC;SOR=0.086;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=8;WE=58478851;WS=58478833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr2	60614572	rs243080	G	A	1548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.728;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=33;PP=906;ReadPosRankSum=1.323;SC=GAACGGCTCTGCAAGATGCCT;SOR=0.499;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=157;TCF=89;TCR=68;TR=72;WE=60614580;WS=60614562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,77:0.46:166
chr2	60687959	rs7569946	A	G	7662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=125;NR=110;PP=2965;SC=AGAAGCGCAAACTCCCGTTCT;SOR=0.715;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=235;TCF=125;TCR=110;TR=235;WE=60687967;WS=60687949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,279:1.00:279
chr2	60768978	rs2665668	G	A	747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.255;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=6;PP=506;ReadPosRankSum=-1.660;SC=AAAATAAGTAGTCATAATAGC;SOR=1.387;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=50;TCF=37;TCR=13;TR=31;WE=60768986;WS=60768968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,33:0.60:55
chr2	60780421	.	GGGC	G	55.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.822;ClippingRankSum=0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.92;ReadPosRankSum=1.019;SOR=0.622;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,4:0.14:29
chr2	60996116	rs62149379	A	T	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.54;ReadPosRankSum=-1.068;SOR=0.086;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr2	60997770	.	T	A	65	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;FR=1.0000;HP=12;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=1;NR=4;PP=65;QD=19.9542425094;SC=TTTTTTTTTTTAATGAAGAGA;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=60997778;WS=60997760;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr2	61007782	rs10496089	A	G	5002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=114;NR=42;PP=2965;SC=ATAATTATAAAGTTTCATGTA;SOR=2.075;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=157;TCF=115;TCR=42;TR=156;WE=61007790;WS=61007772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr2	61007913	.	G	A	4393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.119;ClippingRankSum=0.000;DP=358;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.762;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=106;PP=2890;ReadPosRankSum=-0.432;SC=TGGGATCCTCGGGTATGTGAT;SOR=0.601;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=328;TCF=140;TCR=188;TR=190;WE=61007921;WS=61007903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,201:0.56:357
chr2	61007986	rs17538295	T	C	1516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=43;PP=1081;ReadPosRankSum=0.773;SC=ACAGTCTAGTTAAAGATAGTT;SOR=0.745;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=102;TCF=27;TCR=75;TR=58;WE=61007994;WS=61007976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,61:0.56:109
chr2	61008036	rs3845814	C	T	953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=26;PP=786;SC=ACTATAGTCCCCTTCCTCCTT;SOR=4.548;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=28;WE=61008044;WS=61008026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	61009813	rs74492547	T	A	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=4.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.78;MQRankSum=4.103;QD=8.13;ReadPosRankSum=-0.288;SOR=2.030;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr2	61009813	.	T	TA	177	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000;HP=20;HapScore=2;MGOF=50;MMLQ=19;MQ=61.79;NF=6;NR=3;PP=177;QD=20.0;SC=TTTTTTTTTTTAATTTAGGTC;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=17;TCF=10;TCR=7;TR=9;WE=61009821;WS=61009803;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,9:0.53:17
chr2	61009909	rs10197672	C	T	1367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.13;QD=24.42;SOR=1.101;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr2	61009938	rs139543059	AT	A	198.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.11;MQRankSum=1.317;QD=10.46;ReadPosRankSum=0.308;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr2	61014952	rs4672404	A	G	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.198;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=49;ReadPosRankSum=-0.315;SC=TTTGGGAGGCAGAGGCGGGCA;SOR=0.022;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=6;WE=61014960;WS=61014942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,6:0.24:25
chr2	61021349	rs11125855	A	G	1911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=49;PP=1459;SC=CTTTAGTGGTAATTCAGTAGT;SOR=3.804;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=7;TCR=49;TR=56;WE=61021357;WS=61021339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr2	61118739	rs10185028	A	G	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=62;ReadPosRankSum=1.084;SC=CTGCTGTTATAAAAAAAACAG;SOR=0.283;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=6;WE=61118747;WS=61118729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr2	61121492	rs842644	G	A	644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=1;PP=509;SC=TTATAATGCAGTCTATTTGGA;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=61121500;WS=61121482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	61128268	rs6707682	G	A	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.218;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=62;ReadPosRankSum=-0.423;SC=GTTGATTTCTGTTTCTTTTTT;SOR=1.508;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=6;WE=61128276;WS=61128258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr2	61128284	rs2115592	T	C	219.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.47;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	61145498	rs149570046	AT	A	261.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=6.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.03;ReadPosRankSum=-0.994;SOR=1.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,23:0.44:52
chr2	61175312	rs12479056	T	C	10889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=399;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=181;NR=180;PP=2965;SC=TCTGGTCGATTTTTAAGTCCT;SOR=0.760;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=362;TCF=182;TCR=180;TR=361;WE=61175320;WS=61175302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,399:1.00:399
chr2	61245551	rs12996059	G	C	984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.994;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=28;PP=658;ReadPosRankSum=-1.474;SC=TTCTAGATCTGAGGCCTATGG;SOR=0.551;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=74;TCF=20;TCR=54;TR=40;WE=61245559;WS=61245541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,42:0.55:77
chr2	61245604	rs70959887	AT	A	92.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=51;ReadPosRankSum=-1.455;SC=TGAGGCCTGTATTTTTTTTTT;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=6;WE=61245612;WS=61245594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr2	61300556	rs368466121	CT	C	77.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=2.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.05;ReadPosRankSum=1.182;SOR=0.385;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,13:0.18:74
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chr2	61304377	rs10172306	A	T	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=71;ReadPosRankSum=-0.877;SC=AAATGTGGAAAATTGTTTGGA;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=6;WE=61304385;WS=61304367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
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chr2	61389609	rs17006627	G	C	3526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=64;PP=2052;ReadPosRankSum=-0.030;SC=TATTTGGACAGTCTGTGATTG;SOR=0.701;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=243;TCF=138;TCR=105;TR=147;WE=61389617;WS=61389599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,165:0.62:268
chr2	61389737	rs1729674	T	G	1004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.718;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=25;PP=584;ReadPosRankSum=1.173;SC=GGTTTTTTTATATAAATGGTA;SOR=0.819;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=111;TCF=41;TCR=70;TR=39;WE=61389745;WS=61389718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,48:0.38:125
chr2	61389799	rs1729673	G	A	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.142;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=210;ReadPosRankSum=0.548;SC=TAGCAAATGTGTATAGAAATA;SOR=0.148;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=15;WE=61389807;WS=61389789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,16:0.42:38
chr2	61404514	rs112583316	G	A	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQ=61.78;MQRankSum=0.431;NF=3;NR=1;PP=80;ReadPosRankSum=-0.431;SC=TGGGGCTCCCGGGCGCGCCGC;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=4;WE=61404522;WS=61404507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr2	61412559	rs777585	C	T	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.757;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=208;ReadPosRankSum=0.651;SC=TGATGTTTTACTGAGAAGACT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=11;WE=61412567;WS=61412549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr2	61413092	rs67060712	AATAAC	A	1249.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.922;NF=9;NR=10;PP=864;ReadPosRankSum=0.440;SC=TGTGTACTGGAATAACATGTT;SOR=0.818;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=35;TCF=15;TCR=20;TR=19;WE=61413104;WS=61413082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,33:0.56:59
chr2	61413723	rs1809028	A	G	4619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=64;PP=2530;SC=TTCATAATGCAGTAATAAGGT;SOR=0.801;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=149;TCF=85;TCR=64;TR=149;WE=61413731;WS=61413713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr2	61415492	rs14170	A	G	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.209;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=249;ReadPosRankSum=-1.929;SC=ATTCTTCCTCAGCTAGGGTAG;SOR=0.914;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=50;TCF=34;TCR=16;TR=19;WE=61415500;WS=61415482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,18:0.38:48
chr2	61417617	rs777591	A	G	796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FS=1.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.06;MQRankSum=1.684;QD=4.28;ReadPosRankSum=-0.201;SOR=0.781;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:137,49:0.26:186
chr2	61441611	.	A	G	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.877;ClippingRankSum=0.000;DP=334;ExcessHet=3.0103;FS=0.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.67;ReadPosRankSum=2.422;SOR=0.636;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:284,49:0.15:333
chr2	61450454	rs2123111	A	G	567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.479;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=16;PP=378;ReadPosRankSum=1.274;SC=ATTAGTGGAAATAAGTTTTTC;SOR=0.133;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=25;WE=61450462;WS=61450444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,25:0.74:34
chr2	61468991	rs77445405	A	C	680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=18;PP=444;ReadPosRankSum=-1.705;SC=TCTTTGAAAAAATGGGTATAC;SOR=0.349;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=41;TCF=12;TCR=29;TR=27;WE=61468999;WS=61468981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,29:0.66:44
chr2	61475577	rs34823499	A	G	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=35;ReadPosRankSum=1.579;SC=TGACAACTTTATAATTATGCC;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=3;WE=61475585;WS=61475567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr2	61483715	rs68101593	A	T	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.361;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.67;ReadPosRankSum=1.611;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr2	61483725	rs72811484	T	A	94.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.84;ReadPosRankSum=-0.732;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr2	61484556	rs2060824	T	C	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.638;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5006;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=157;ReadPosRankSum=0.903;SC=TCAATGAACATATAACAAAAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=7;WE=61484564;WS=61484546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr2	61507401	.	A	C	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.339;ClippingRankSum=0.000;DP=148;ExcessHet=3.0103;FS=0.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.56;ReadPosRankSum=1.340;SOR=0.845;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:120,27:0.18:147
chr2	61522047	rs35292974	T	C	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=247;ReadPosRankSum=-0.230;SC=AGATAAATTATTTTTATCAAT;SOR=2.235;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=12;WE=61522055;WS=61522037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr2	61522123	rs13014347	T	C	2785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=33;PP=1901;SC=CCACTTGATCTTCACTTGAAT;SOR=1.261;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=59;TCR=33;TR=92;WE=61522131;WS=61522113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr2	61528299	rs11428092	T	TA	2131.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.880;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=39;PP=1183;ReadPosRankSum=0.468;SC=ATACCATCTATAAAAAACAGG;SOR=0.556;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=106;TCF=9;TCR=97;TR=44;WE=61528307;WS=61528289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,87:0.49:177
chr2	61538602	rs141750762	G	GAAAAGAGAAAGAAAAAGAAAA	1205.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.26;QD=70.93;SOR=4.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	61552484	rs2593624	T	A	943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.801;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=17;PP=651;ReadPosRankSum=1.067;SC=AACAGATTTTTAAAAAGTACT;SOR=0.501;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=72;TCF=42;TCR=30;TR=39;WE=61552492;WS=61552474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,44:0.54:82
chr2	61570886	rs72381726	AAAGT	A	1654.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=4;PP=1285;ReadPosRankSum=-1.570;SC=TCCTTTCAACAAAGTAAGATA;SOR=0.844;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=55;TCF=46;TCR=9;TR=29;WE=61570897;WS=61570876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,42:0.64:66
chr2	61575308	rs6722430	A	G	7781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=124;NR=135;PP=2965;SC=TCTTTCTGACATGCCTTGGGA;SOR=0.811;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=259;TCF=124;TCR=135;TR=259;WE=61575316;WS=61575298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,284:1.00:284
chr2	61576517	rs811378	G	A	3660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=76;PP=2229;SC=TCAACAAGATGTAAGTGGAGA;SOR=1.424;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=48;TCR=76;TR=124;WE=61576525;WS=61576507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr2	61605614	rs10208769	T	A	1220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.673;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=35;PP=780;ReadPosRankSum=-0.076;SC=ATTCTTGCATTTGTCAGCAAA;SOR=0.828;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=118;TCF=52;TCR=66;TR=61;WE=61605622;WS=61605604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,62:0.50:124
chr2	61622251	rs3213951	C	T	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=5.163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.64;ReadPosRankSum=0.543;SOR=1.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,25:0.42:59
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chr2	61648932	rs778156	A	G	239.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=157;ReadPosRankSum=2.231;SC=ACACACACACACGCGCGCGCG;SOR=0.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=11;WE=61648940;WS=61648922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr2	61713209	rs35844473	GGAAAATC	G	148.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.420;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=397;ReadPosRankSum=-1.015;SC=ACTGAAAACAGGAAAATCTTG;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=4;WE=61713228;WS=61713199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr2	61713218	rs60155512	T	A	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.209;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.14;ReadPosRankSum=0.291;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr2	61713218	.	TGT	AGG	370	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;FR=0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=370;QD=105.866968716;SC=AGGAAAATCTTGTGTTTGTAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=4;WE=61713228;WS=61713199;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr2	61713220	rs61235340	T	G	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.012;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.15;ReadPosRankSum=-0.079;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr2	61722519	rs74392163	G	GA	170.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.275;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=3;PP=172;ReadPosRankSum=0.583;SC=ATACATTTTAGAAAAAGGCAC;SOR=0.098;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=7;WE=61722527;WS=61722509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr2	61729258	rs2305155	A	G	2109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.16;ReadPosRankSum=-0.687;SOR=0.726;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,59:0.40:149
chr2	61729268	rs2305156	T	C	2116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.40;ReadPosRankSum=-1.064;SOR=0.671;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,58:0.39:147
chr2	61749690	rs3732171	C	T	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.733;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=8;PP=247;ReadPosRankSum=-0.092;SC=CAGTCAACTACAATAAAAATG;SOR=0.966;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=94;TCF=59;TCR=35;TR=28;WE=61749698;WS=61749680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,34:0.32:106
chr2	61749716	rs3732170	C	T	836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=15;PP=406;ReadPosRankSum=1.191;SC=AAAAACAAAACTCTGAATTTA;SOR=0.743;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=117;TCF=71;TCR=46;TR=40;WE=61749724;WS=61749706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,48:0.36:134
chr2	61761169	rs1446532	G	A	201.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=164;SC=TTTAATTACAGAAAACTGAGA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=61761177;WS=61761159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	62053878	rs11392751	G	GA	100	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=3;PP=86;SC=TCAAAAAAAAGAAGAAAACGC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=62053886;WS=62053868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr2	62065851	rs17513666	C	T	1710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.673;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=45;PP=1001;ReadPosRankSum=0.713;SC=CTGAGGGTAACAAACTAAGGC;SOR=0.800;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=127;TCF=47;TCR=80;TR=71;WE=62065859;WS=62065841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,78:0.57:137
chr2	62066927	rs4672457	A	G	5286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.166;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=84;PP=2965;ReadPosRankSum=0.470;SC=TCCTGCATCCACAAGCTGACC;SOR=0.353;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=181;TCF=96;TCR=85;TR=179;WE=62066935;WS=62066917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,198:0.99:199
chr2	62067433	rs17513722	T	C	5354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=429;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=115;NR=101;PP=2962;ReadPosRankSum=1.064;SC=GGTACTGTAATTGTGGGCACC;SOR=0.684;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=381;TCF=202;TCR=179;TR=216;WE=62067441;WS=62067423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,247:0.58:429
chr2	62069358	rs11125895	T	C	1922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.484;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=43;PP=1269;ReadPosRankSum=3.042;SC=CCATAGTTTCTATGTGGGCAG;SOR=0.646;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=211;TCF=115;TCR=96;TR=91;WE=62069366;WS=62069348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,98:0.42:232
chr2	62069528	rs11125896	C	T	1314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.508;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.975;NF=20;NR=37;PP=860;ReadPosRankSum=-1.854;SC=TATATAGTGACTGGAGCTGAA;SOR=1.010;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=109;TCF=41;TCR=68;TR=57;WE=62069536;WS=62069518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,60:0.52:115
chr2	62073918	rs58256183	C	T	572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=2;PP=413;SC=CCTCTGACTGCTTCCTGTCGG;SOR=3.056;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=62073926;WS=62073908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	62074140	rs113296637	A	AAC	751.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=17;PP=743;SC=CTCTACTAAAAACAAAACTTA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=62074162;WS=62074130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	62074154	rs62149863	G	A	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=108;ReadPosRankSum=-0.705;SC=AAACTTAGTCGGGTGTGGTGG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=6;WE=62074162;WS=62074130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr2	62081012	rs4270331	A	C	8431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=168;NR=137;PP=2965;SC=CAGCGGGCTGAGCCACTTTCT;SOR=0.861;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=305;TCF=168;TCR=137;TR=305;WE=62081020;WS=62081002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,319:1.00:319
chr2	62081217	rs1881616	A	G	1442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=41;PP=1158;SC=CTGGCCCGGGACGGGAAAGCT;SOR=4.317;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=4;TCR=41;TR=45;WE=62081225;WS=62081207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr2	62095994	rs4672463	A	G	1168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=29;PP=822;SC=AAACTTGGCCAGGCACGGTGG;SOR=2.191;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=9;TCR=29;TR=38;WE=62096002;WS=62095984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr2	62096790	rs149499966	TTCTG	T	2439.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.569;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.953;NF=4;NR=33;PP=1703;ReadPosRankSum=0.986;SC=CTAGTTTTCTTTCTGTCTAAG;SOR=1.160;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=77;TCF=6;TCR=71;TR=37;WE=62096801;WS=62096780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,65:0.52:125
chr2	62104343	rs7571143	C	T	922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=26;PP=721;SC=TCCACTGCTGCCTTACTATCA;SOR=3.841;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=28;WE=62104351;WS=62104333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	62105986	rs78442748	C	T	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.821;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=234;ReadPosRankSum=2.205;SC=GACAAGTATCCGTTAGTGTTT;SOR=1.179;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=41;TCF=32;TCR=9;TR=15;WE=62105994;WS=62105976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,18:0.39:46
chr2	62107376	rs5831625	T	TC	1765.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=6;PP=1070;SC=TAAAGTTTGTTTTTTAAACTT;SOR=2.461;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=29;WE=62107384;WS=62107366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr2	62107632	rs2272429	G	A	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.362;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=296;ReadPosRankSum=1.262;SC=ATTTGAAGATGCAACATGATT;SOR=1.131;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=62;TCF=18;TCR=44;TR=23;WE=62107640;WS=62107622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,26:0.39:67
chr2	62112221	rs11429418	G	GA	2527.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=9.893;HP=6;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=64;PP=1239;ReadPosRankSum=1.472;SC=CAGATGGGGGGGAAAAAAAAG;SOR=1.227;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=105;TCF=11;TCR=94;TR=72;WE=62112230;WS=62112210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:7,98:0.93:105
chr2	62112222	rs67059162	G	A	5478.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.05;SOR=1.006;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr2	62112246	rs57035931	C	CT	195.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=5.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.89;ReadPosRankSum=0.877;SOR=0.163;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,15:0.38:40
chr2	62228180	rs55785307	C	G	583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.430;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=415;ReadPosRankSum=0.729;SC=GTTAGCTTGTCTATTCAGCTT;SOR=1.075;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=45;TCF=8;TCR=37;TR=23;WE=62228188;WS=62228170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,25:0.52:48
chr2	62729674	rs4672527	T	C	6037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=99;PP=2965;SC=AGTAGTCAGGTAAGATTGAAT;SOR=0.967;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=182;TCF=82;TCR=100;TR=181;WE=62729682;WS=62729664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr2	62729747	rs11443505	G	GA	4189.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.352;NF=24;NR=49;PP=2383;ReadPosRankSum=-0.356;SC=ATTTAAGATAGAAAAAATTAT;SOR=0.753;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=96;TCF=29;TCR=67;TR=73;WE=62729755;WS=62729737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,136:0.99:138
chr2	62738883	rs6757222	C	T	3727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=38;PP=2032;SC=TTTTTTGGTTCGGTGGCATTT;SOR=1.346;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=75;TCR=38;TR=113;WE=62738891;WS=62738873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr2	62738931	rs6757448	G	C	6036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=75;PP=2965;SC=CCTGCTATATGAAGCAGCTGC;SOR=1.001;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=183;TCF=108;TCR=75;TR=183;WE=62738939;WS=62738921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr2	62739135	rs4405748	A	C	741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=21;PP=605;SC=AAAATATTTTATATATTACAC;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=62739143;WS=62739125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	63182611	rs148454752	G	GT	184.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.173;HP=10;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=168;ReadPosRankSum=1.557;SC=TAGATTACCCGTTTTTTTTTT;SOR=2.953;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=45;TCF=32;TCR=13;TR=14;WE=63182619;WS=63182601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,13:0.32:41
chr2	63380809	rs7595595	G	A	229.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=213;SC=ATATTTTAAAGTTTCTGGGTT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=63380817;WS=63380799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	63486429	rs992214	C	T	3598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=36;PP=2102;SC=TTAAAAATAGCGTTAATTCTT;SOR=1.470;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=82;TCR=36;TR=118;WE=63486437;WS=63486419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr2	63540523	rs1517402	A	T	1835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=48;PP=1408;SC=TTTAACATATATCTGTGATAC;SOR=3.767;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=7;TCR=48;TR=55;WE=63540531;WS=63540513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr2	63605772	rs2292794	A	G	782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=22;PP=625;SC=CAGGAAAGATAAAATTAAAAT;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=25;WE=63605780;WS=63605762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	63609017	rs2138796	A	T	1835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=20;PP=1133;SC=AAAACTCATCAATGAAAAATA;SOR=1.376;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=41;TCR=20;TR=61;WE=63609025;WS=63609007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr2	63720210	rs7563623	A	G	510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=15;PP=393;SC=GAATAAACATACTCTAGTGTA;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=63720218;WS=63720200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	63798333	rs4671068	C	T	1497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=11;PP=949;SC=GCATAAGCCACCGCGCCTGGT;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=35;TCR=11;TR=46;WE=63798341;WS=63798323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr2	63816672	rs10469944	C	G	727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=20;PP=562;SC=GCGTTTGCAGCAGACGTGTTT;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=63816680;WS=63816662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	63822785	rs2305157	T	C	671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=16;PP=510;SC=ACTACCACTGTTTATTAACTA;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=63822793;WS=63822775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	63826528	rs7606045	T	G	344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=263;SC=TTTCTTGTTTTTGTTTAGTAG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=63826536;WS=63826518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	63849491	rs262496	T	C	7884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=148;NR=116;PP=2965;SC=AAACCCTTCATAGTCTTGGTC;SOR=0.846;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=265;TCF=149;TCR=116;TR=264;WE=63849499;WS=63849481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,293:1.00:293
chr2	64069732	rs6546029	G	A	2264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=56;PP=1677;SC=GAGAAAAGCCGGGTGGGTTTT;SOR=2.494;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=15;TCR=56;TR=71;WE=64069740;WS=64069722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr2	64085114	rs10183479	G	A	6840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=130;PP=2965;SC=GTAATCTTGGGCACTGGTTTT;SOR=1.057;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=234;TCF=104;TCR=130;TR=234;WE=64085122;WS=64085104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr2	64118158	rs368306965	TA	T	36.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.04;ReadPosRankSum=-1.183;SOR=0.169;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr2	64174664	rs41291181	G	A	741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=19;PP=529;SC=TTTTAAATATGAAGTAATTTT;SOR=2.584;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=24;WE=64174672;WS=64174654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	64210979	.	CA	C	61.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.761;ClippingRankSum=0.000;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=1.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.56;ReadPosRankSum=0.286;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,19:0.17:111
chr2	64323751	rs368871090	GA	G	136.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FS=3.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.04;MQRankSum=0.000;QD=0.57;ReadPosRankSum=-0.096;SOR=0.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:205,36:0.15:241
chr2	64327544	rs329498	G	T	6359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=128;NR=80;PP=2965;SC=GAAACATATCGGTGTTGCTGT;SOR=1.159;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=208;TCF=128;TCR=80;TR=208;WE=64327552;WS=64327534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr2	64327592	rs329497	T	C	8019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=135;NR=129;PP=2965;SC=GGGCCCGAGATAAAGTATATG;SOR=0.700;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=265;TCF=135;TCR=130;TR=264;WE=64327600;WS=64327582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,297:1.00:297
chr2	64335394	rs17753351	A	G	6406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=130;NR=99;PP=2965;SC=TGAGTTCACCATATTTTACTG;SOR=0.904;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=229;TCF=130;TCR=99;TR=229;WE=64335402;WS=64335384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr2	64567680	rs12477412	T	G	394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=0;PP=331;SC=GTCACTTTGATTGTAGGAAAA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=64567688;WS=64567672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	64567916	rs12473206	C	G	2215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=48;PP=1507;SC=TCCCACCCCCCACTCCTGTTT;SOR=1.522;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=25;TCR=48;TR=73;WE=64567924;WS=64567906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr2	64682364	rs3770741	A	C	3214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=23;PP=2113;SC=CATCATCTGCAGACACTGTGT;SOR=2.437;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=99;TCF=76;TCR=23;TR=98;WE=64682372;WS=64682354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr2	64794945	rs7598893	G	A	1120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=32;PP=873;SC=CAGGCCAGGCGCAGTGGATCA;SOR=3.855;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=4;TCR=32;TR=36;WE=64794953;WS=64794935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr2	64796479	rs6546087	C	T	553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=15;PP=408;SC=TAAATGTTCACTTATATTGAA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=64796487;WS=64796469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	64796847	rs2287532	A	G	3874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=74;PP=2291;SC=TGTATTTATCATTACTGCATC;SOR=1.203;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=50;TCR=74;TR=124;WE=64796855;WS=64796837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr2	64796932	rs2287533	G	A	792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=23;PP=645;SC=GAATCTGAAGGGTATAAATAG;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=64796940;WS=64796922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	64799937	rs147232569	TAA	T	441.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.45;ReadPosRankSum=-0.116;SOR=1.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,14:0.93:15
chr2	65200618	rs4671636	C	A	1090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.632;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=24;PP=676;ReadPosRankSum=1.912;SC=AAAATGAAACCATGAACAGCA;SOR=0.610;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=88;TCF=49;TCR=39;TR=51;WE=65200626;WS=65200608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,53:0.55:96
chr2	65231063	rs35470885	GT	G	2756.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.312;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.032;NF=27;NR=56;PP=978;ReadPosRankSum=0.314;SC=CTAACAGTGGGTTTTTTTTTC;SOR=0.782;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=211;TCF=56;TCR=155;TR=83;WE=65231071;WS=65231053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:202,143:0.41:345
chr2	65245365	rs759458	G	A	2673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=353;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.395;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=63;PP=1618;ReadPosRankSum=-0.604;SC=ACTCAACAACGTAGAGCTCAA;SOR=0.456;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=326;TCF=177;TCR=149;TR=129;WE=65245373;WS=65245355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:211,140:0.40:351
chr2	65248271	rs7563131	G	A	1671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.276;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=54;PP=1128;ReadPosRankSum=0.887;SC=CCAAGGAGTCGGTTCTGTGAT;SOR=1.103;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=250;TCF=98;TCR=152;TR=79;WE=65248279;WS=65248261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:191,89:0.32:280
chr2	65315880	rs1420184	G	C	2625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=61;PP=1867;SC=CTAATTCTTAGTGCATTTCTA;SOR=2.250;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=22;TCR=61;TR=83;WE=65315888;WS=65315870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr2	65315903	rs1420185	G	A	1631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=42;PP=1208;SC=ATCCATAATGGAGCGTGAGGA;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=7;TCR=42;TR=49;WE=65315911;WS=65315893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr2	65481008	rs268871	A	C	5225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=92;PP=2786;SC=GGTAAGTGAAAGGAAAATATC;SOR=0.819;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=184;TCF=92;TCR=92;TR=184;WE=65481016;WS=65480998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr2	65488538	rs268862	G	A	4868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=65;NR=91;PP=2649;SC=TACATTAGAAGTGGTGATTTC;SOR=1.237;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=156;TCF=65;TCR=91;TR=156;WE=65488546;WS=65488528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr2	65495570	rs55843720	A	C	3166.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.60;SOR=2.336;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr2	65495570	.	AT	CC	2852	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=45;NR=14;PP=2852;QD=20;SC=GGTACCAAATATTACGTTCTA;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=68;TCF=50;TCR=18;TR=59;WE=65495581;WS=65495560;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:9,59:0.87:68
chr2	65495571	rs60931828	T	C	3260.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.93;SOR=2.336;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr2	65495573	rs72536103	A	AC	3332.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=33;NR=14;PP=2129;SC=ACCAAATATTACGTTCTACTT;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=52;TCF=36;TCR=16;TR=47;WE=65495581;WS=65495560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr2	65495887	rs268875	G	A	10929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=405;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=176;NR=205;PP=2965;SC=GCTTGTTCCCGTCATACCCGT;SOR=0.846;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=381;TCF=176;TCR=205;TR=381;WE=65495895;WS=65495877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,405:1.00:405
chr2	65540639	.	G	A	716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.294;ClippingRankSum=0.000;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.541;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=6;PP=569;ReadPosRankSum=-0.915;SC=ACTGAGTCACGCGGCCGCTTT;SOR=1.291;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=46;TCF=36;TCR=10;TR=32;WE=65540647;WS=65540629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,30:0.68:44
chr2	65559027	rs2271198	A	G	2829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=57;PP=1688;ReadPosRankSum=0.288;SC=AACAGCAAACACTGCATTGCA;SOR=0.692;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=213;TCF=115;TCR=98;TR=122;WE=65559035;WS=65559017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,135:0.56:241
chr2	65561543	rs17533992	T	G	923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.593;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=31;PP=736;ReadPosRankSum=-2.460;SC=CTCCTTACTCTGAAACCCATC;SOR=1.516;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=71;TCF=17;TCR=54;TR=37;WE=65561551;WS=65561533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,38:0.49:78
chr2	65604911	rs34928603	G	C	928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=32;PP=1547;ReadPosRankSum=-0.948;SC=CTGTCAAAGCGGCAGTCCTCA;SOR=0.752;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=57;TCF=10;TCR=47;TR=39;WE=65604922;WS=65604901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,42:0.69:61
chr2	65604914	rs268120	A	G	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=697;ReadPosRankSum=0.518;SC=TCAAAGCGGCAGTCCTCAGCA;SOR=0.504;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=53;TCF=6;TCR=47;TR=17;WE=65604922;WS=65604901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,18:0.32:56
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chr2	66667186	rs2271856	C	T	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=6.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.07;ReadPosRankSum=-1.065;SOR=0.114;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,11:0.30:37
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chr2	66670211	rs368068335	GA	G	234.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.85;ReadPosRankSum=-1.298;SOR=0.644;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:102,25:0.20:127
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chr2	66798282	rs2861108	G	T	375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=1;PP=297;SC=TTAATCACAGGGTTCTCTGGC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=66798290;WS=66798272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	67624522	.	T	A	768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=0.000;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=16;PP=547;ReadPosRankSum=0.555;SC=GCTGTTGCCCTACTCATCCCT;SOR=0.662;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=120;TCF=80;TCR=40;TR=43;WE=67624530;WS=67624512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,43:0.33:130
chr2	67630980	rs3770657	G	A	5537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=90;PP=2965;SC=TTACTAGGTAGTGAACCTTTT;SOR=0.703;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=186;TCF=95;TCR=91;TR=185;WE=67630988;WS=67630970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr2	67631831	rs61740794	G	A	4314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=57;PP=2536;SC=TAATAATTCCGAACATGGAGC;SOR=0.914;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=82;TCR=57;TR=139;WE=67631839;WS=67631821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr2	67632125	rs3770655	C	T	3783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=51;PP=2230;SC=ATTGGTTCTTCCAGGAAGTTC;SOR=0.846;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=69;TCR=51;TR=120;WE=67632133;WS=67632115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr2	67637196	rs1569	G	A	5479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=111;PP=2965;SC=AAGACTTCACGAAGACTGCTG;SOR=1.272;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=184;TCF=73;TCR=111;TR=184;WE=67637204;WS=67637173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr2	68272883	rs72821819	G	A	168.03	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5130;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=90;ReadPosRankSum=-0.319;SC=TAATATGTAAGTTATAAATAA;SOR=1.402;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=6;WE=68272891;WS=68272879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr2	68352515	rs6742154	A	C	1875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.621;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=46;PP=1321;ReadPosRankSum=-2.503;SC=TGCTCTGAGCACTGGAGAGAA;SOR=0.789;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=133;TCF=52;TCR=81;TR=72;WE=68352523;WS=68352505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,79:0.52:151
chr2	68358341	rs62145930	T	C	2390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=19;PP=1479;SC=TGAGCCACCGTGCCCAGCCTC;SOR=2.010;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=53;TCR=19;TR=72;WE=68358349;WS=68358331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr2	68358653	rs17035004	T	C	1136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=25;PP=609;SC=TACACTTCAATGACTCTATTT;SOR=1.954;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=35;WE=68358661;WS=68358643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr2	68361859	rs138784630	C	T	1706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=41;PP=1032;ReadPosRankSum=0.399;SC=AGGCCGCCGGCGCCTCCAGCT;SOR=0.718;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=173;TCF=83;TCR=90;TR=78;WE=68361867;WS=68361849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,84:0.44:193
chr2	68385097	rs2044693	A	G	7092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=122;NR=107;PP=2965;SC=GCAGAGCGCCAGGGCAGAGGA;SOR=0.716;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=229;TCF=122;TCR=107;TR=229;WE=68385105;WS=68385087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,263:1.00:263
chr2	68388823	rs1137930	A	G	3333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.410;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=57;PP=1991;ReadPosRankSum=-0.955;SC=AGACTTGTAAAGAAACCAAGG;SOR=0.723;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=283;TCF=165;TCR=118;TR=141;WE=68388831;WS=68388813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,157:0.50:316
chr2	68388972	rs113134222	TA	T	177.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.73;ReadPosRankSum=0.634;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr2	68389276	rs11402583	G	GA	425.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.347;NF=10;NR=2;PP=163;ReadPosRankSum=-0.560;SC=GTCTCCAAGGGAAAAAAAAAA;SOR=0.906;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=12;WE=68389284;WS=68389266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,21:0.66:32
chr2	68389481	rs3217588	CTT	C	6251.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.442;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=64;PP=2947;ReadPosRankSum=-1.528;SC=GGTCTGCGCTCTTGTGTCGCT;SOR=0.644;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=155;TCF=25;TCR=130;TR=79;WE=68389490;WS=68389471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,164:0.58:282
chr2	68415767	rs687	G	A	7870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=128;NR=145;PP=2965;ReadPosRankSum=0.081;SC=AACCAGAATTGTCCAAATCAA;SOR=0.945;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=277;TCF=130;TCR=147;TR=273;WE=68415775;WS=68415757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,300:0.99:302
chr2	68444171	rs374427852	C	CGCAG,CACGCAG	4018.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=5.681;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=31,33;NR=35,35;PP=429,783;ReadPosRankSum=2.503;SC=CACACACACACAGAGAGAGAT;SOR=1.492;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=76;TCF=34;TCR=42;TR=66,68;WE=68444179;WS=68444158;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.56,0.40:68
chr2	68483396	rs7593613	A	T	275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=208;SC=CCTTCCTGCTAAGCAGCAGAG;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=68483404;WS=68483386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	68511506	rs5831925	GA	G	1218.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.027;HP=12;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=20;PP=390;ReadPosRankSum=0.318;SC=AAATAATTTGGAAAAAAAAAA;SOR=0.726;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=36;TCF=10;TCR=26;TR=30;WE=68511515;WS=68511496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,56:0.93:60
chr2	68511584	rs735815	A	G	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=18;PP=432;ReadPosRankSum=0.364;SC=CATATGTAAGAGAGATCTCTT;SOR=0.646;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=37;TCR=37;TR=36;WE=68511592;WS=68511574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,42:0.47:90
chr2	68546304	rs4671897	T	C	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.842;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=41;ReadPosRankSum=0.190;SC=CTCAGTCCTCTGCCTGTACCC;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=4;WE=68546312;WS=68546294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr2	68546374	rs4671898	T	C	593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.42;ReadPosRankSum=-1.686;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,31:0.49:63
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chr2	68613710	rs2070171	G	A	2531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.918;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=46;PP=1425;ReadPosRankSum=0.493;SC=TTGCTTCATCGCTGCTCAATG;SOR=0.484;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=150;TCF=87;TCR=63;TR=104;WE=68613718;WS=68613700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,115:0.68:170
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chr2	68620410	rs17602092	T	A	4017.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.994;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=91;PP=2374;ReadPosRankSum=-0.713;SC=TCCATTCAAATAAATAAATCC;SOR=0.829;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=275;TCF=125;TCR=150;TR=166;WE=68620418;WS=68620400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,183:0.61:298
chr2	68621338	rs17530191	G	T	2870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.200;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=66;PP=1967;ReadPosRankSum=-0.079;SC=GAGAGAGGTGGGTCTGCTCAG;SOR=0.569;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=177;TCF=79;TCR=98;TR=121;WE=68621346;WS=68621328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,124:0.65:190
chr2	68621427	rs34196827	G	A	1228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.172;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=34;PP=837;ReadPosRankSum=0.143;SC=GAATGGGGCAGGCATGGTGGC;SOR=1.037;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=63;TCF=20;TCR=43;TR=48;WE=68621435;WS=68621417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,51:0.75:68
chr2	68622658	rs1373200	C	T	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-2.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=183;ReadPosRankSum=-1.547;SC=AATGAATTATCCTATAATCAT;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=8;WE=68622666;WS=68622656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr2	68622914	rs1063479	G	A	3381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.060;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=85;PP=2215;ReadPosRankSum=-1.088;SC=GAGTGGATCAGAGCCATCCAG;SOR=0.518;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=227;TCF=96;TCR=131;TR=151;WE=68622922;WS=68622904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,156:0.65:240
chr2	68622952	rs1050181	G	C	1717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.633;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=48;PP=1264;ReadPosRankSum=-0.743;SC=GAAGTAAAGAGACTCCTGCAT;SOR=0.533;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=114;TCF=34;TCR=80;TR=70;WE=68622960;WS=68622942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,72:0.60:121
chr2	68753240	rs35002937	T	A	3084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.266;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=42;PP=1918;ReadPosRankSum=-1.244;SC=CAAAGATAAATCCCAGCTAAA;SOR=0.870;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=217;TCF=141;TCR=76;TR=126;WE=68753248;WS=68753230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,137:0.56:243
chr2	68762501	rs13413327	G	A	2851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.493;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=55;PP=1501;ReadPosRankSum=0.803;SC=ACCTCATTGCGTTACTAATTT;SOR=0.748;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=196;TCF=101;TCR=95;TR=113;WE=68762509;WS=68762491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,133:0.59:226
chr2	68765205	rs13404469	C	T	4332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.967;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=69;PP=2737;ReadPosRankSum=-1.031;SC=GGGCGACTCACTTCAGGATGA;SOR=0.814;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=283;TCF=166;TCR=117;TR=173;WE=68765213;WS=68765195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,188:0.62:304
chr2	68772281	rs11337234	AT	A	360.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=2.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.30;MQRankSum=2.015;QD=5.08;ReadPosRankSum=-0.541;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,24:0.34:71
chr2	68794528	rs6751531	G	T	934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=27;PP=653;ReadPosRankSum=-0.096;SC=AGGTAAGTAAGTTTACTTCAG;SOR=0.767;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=63;TCF=24;TCR=39;TR=41;WE=68794536;WS=68794518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,42:0.62:68
chr2	68805142	rs149897324	GA	G	2460.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.624;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.634;NF=9;NR=48;PP=1827;ReadPosRankSum=-2.234;SC=AAAGGTTTATGAAAAGAAAAT;SOR=0.793;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=103;TCF=19;TCR=84;TR=57;WE=68805150;WS=68805132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,91:0.61:150
chr2	69002281	rs11685672	C	G	960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.549;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=15;PP=656;ReadPosRankSum=-0.145;SC=GGGTTCCTCTCTCCTCTCCGC;SOR=1.180;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=129;TCF=78;TCR=51;TR=45;WE=69002289;WS=69002271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,48:0.34:140
chr2	69002760	rs10445945	C	T	2568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=48;PP=1568;ReadPosRankSum=-0.128;SC=AGCACCAGGACGGGCACTGTG;SOR=0.728;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=181;TCF=98;TCR=83;TR=106;WE=69002768;WS=69002750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,119:0.60:199
chr2	69009304	rs2271834	C	T	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.027;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=334;ReadPosRankSum=0.420;SC=TGTTGTCCAACCCAATTTTAG;SOR=0.836;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=75;TCF=55;TCR=20;TR=24;WE=69009312;WS=69009294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,24:0.32:76
chr2	69043264	rs67399232	CT	C	5100.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.558;HP=11;HapScore=3;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=50;PP=2570;ReadPosRankSum=1.531;SC=AGTTATTTCCCTTTTTTTTTT;SOR=0.377;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=165;TCF=67;TCR=98;TR=79;WE=69043274;WS=69043254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,145:0.58:251
chr2	69043266	rs78107572	T	A	2334.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.557;HP=10;HapScore=3;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=44;PP=2544;ReadPosRankSum=1.328;SC=TTATTTCCCTTTTTTTTTTTA;SOR=0.337;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=263;TCF=167;TCR=96;TR=114;WE=69043274;WS=69043254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,124:0.50:249
chr2	69043539	rs2271832	G	C	1387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=29;PP=909;SC=AACCCCATCAGAAAGAAGCTC;SOR=1.708;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=15;TCR=29;TR=44;WE=69043547;WS=69043529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr2	69045158	rs10197806	C	A	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.340;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=218;ReadPosRankSum=0.492;SC=AAGCAGGTACCCAGGAAATAA;SOR=1.646;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=42;TCF=10;TCR=32;TR=14;WE=69045166;WS=69045148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,16:0.36:45
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chr2	69049941	rs10177248	T	C	2935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=378;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.376;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=67;PP=1504;ReadPosRankSum=-0.127;SC=TTGCAGAGGATGGTCCAAGAG;SOR=0.722;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=339;TCF=174;TCR=165;TR=143;WE=69049949;WS=69049931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:221,157:0.42:378
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chr2	69204629	rs35624281	T	C	888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=13;PP=463;ReadPosRankSum=0.699;SC=GATTTCAGATTGTCTTTGCTG;SOR=0.582;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=64;TCF=42;TCR=22;TR=38;WE=69204637;WS=69204619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,41:0.60:68
chr2	69204671	rs9808077	A	T	1548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=22;PP=914;ReadPosRankSum=0.491;SC=CTCCTGCCCTAGCTAACTATG;SOR=0.736;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=96;TCF=61;TCR=35;TR=61;WE=69204679;WS=69204661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,69:0.64:108
chr2	69205023	rs146210841	TAC	T	136.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.422;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.869;NF=0;NR=4;PP=91;ReadPosRankSum=-1.659;SC=ACACATAGCATACAGTTATAA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=4;WE=69205032;WS=69205013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr2	69205942	rs13424275	C	T	2493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.416;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=35;PP=1467;ReadPosRankSum=1.079;SC=TGGAACTGACCTCTGATAAGA;SOR=0.900;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=192;TCF=123;TCR=69;TR=102;WE=69205950;WS=69205932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,114:0.54:213
chr2	69272116	rs11126214	C	T	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=134;ReadPosRankSum=-0.683;SC=GCTGCTAGTTCACTCTTCAGT;SOR=0.188;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=9;WE=69272124;WS=69272106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr2	69297622	rs4591376	C	T	311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=2;PP=214;SC=TGACCCTGAACGGATAATATA;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=69297630;WS=69297616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	69298817	rs13030844	T	C	1544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.088;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=28;PP=1017;ReadPosRankSum=0.342;SC=CAGAGCCCATTATCCACTATG;SOR=0.791;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=202;TCF=121;TCR=81;TR=73;WE=69298825;WS=69298807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,80:0.36:222
chr2	69300087	rs57008189	G	C	1325.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=1.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.55;ReadPosRankSum=0.124;SOR=0.437;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,33:0.61:54
chr2	69300088	rs67110959	GGAC	G	1330.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=2.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.35;ReadPosRankSum=-0.156;SOR=0.436;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,34:0.60:57
chr2	69300093	.	G	A	1342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.710;ClippingRankSum=0.000;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.38;ReadPosRankSum=0.165;SOR=0.660;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,35:0.58:60
chr2	69300243	rs10202939	G	A	1777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=33;PP=834;ReadPosRankSum=-0.517;SC=GGTAAGCAACGGCCTGGCTGT;SOR=0.709;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=132;TCF=68;TCR=64;TR=70;WE=69300251;WS=69300233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,83:0.56:148
chr2	69304719	rs7424907	T	C	2284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.145;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=54;PP=1470;ReadPosRankSum=0.547;SC=CTGGTGTTTTTCTGCTTAAGA;SOR=0.320;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=165;TCF=64;TCR=101;TR=96;WE=69304727;WS=69304709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,105:0.57:183
chr2	69304779	rs13419465	C	T	924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=29;PP=690;ReadPosRankSum=0.651;SC=CCATCTCTCCCTTCTGCCTTT;SOR=1.050;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=48;TCF=9;TCR=39;TR=35;WE=69304787;WS=69304769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,36:0.71:51
chr2	69317925	rs4854546	G	A	12088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=446;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=218;NR=179;PP=2965;SC=GCTAAAAGCAGAACCCTGATT;SOR=0.817;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=399;TCF=219;TCR=180;TR=397;WE=69317933;WS=69317915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,444:1.00:444
chr2	69318129	rs4241348	T	G	1102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=33;PP=905;SC=TACTTCATTGTTGGTGGGGTG;SOR=4.863;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=2;TCR=33;TR=35;WE=69318137;WS=69318119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	69318161	rs13412636	T	G	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=50;ReadPosRankSum=-0.659;SC=CAGGAAGGGGTAGGGTGAAAA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=5;WE=69318169;WS=69318151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr2	69330118	rs6710260	A	G	876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.245;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=17;PP=515;ReadPosRankSum=-1.248;SC=AGTGGCTTCAAGGAAGGGAAT;SOR=0.763;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=122;TCF=67;TCR=55;TR=43;WE=69330126;WS=69330108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,48:0.35:136
chr2	69330284	rs4241349	G	A	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.195;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=80;ReadPosRankSum=-0.812;SC=TGGGTGTCCAGCTTGGTAAGC;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=6;WE=69330292;WS=69330274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr2	69409029	rs6749826	C	A	4751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=70;NR=90;PP=2903;SC=AGGACAGCTTCATATACACTT;SOR=1.127;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=160;TCF=70;TCR=90;TR=160;WE=69409037;WS=69409019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr2	69420591	.	T	TCTCA	946.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.905;ClippingRankSum=0.000;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=6.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.10;MQRankSum=4.094;QD=16.91;ReadPosRankSum=-0.025;SOR=0.156;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,27:0.48:56
chr2	69420596	rs7584057	T	C	857.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.69;MQRankSum=2.267;QD=17.50;ReadPosRankSum=-1.314;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,23:0.47:49
chr2	69565563	rs113734896	TA	T	2215.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.152;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=3.175;NF=35;NR=22;PP=1683;ReadPosRankSum=1.008;SC=TTTAAGTCTTTAAAATTAACA;SOR=0.788;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=156;TCF=91;TCR=65;TR=57;WE=69565571;WS=69565553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,93:0.42:223
chr2	69565842	rs11296709	TA	T	401.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=4.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.47;ReadPosRankSum=-1.990;SOR=0.963;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr2	69565844	rs116730412	A	T	410.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-4.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.86;ReadPosRankSum=-1.542;SOR=0.963;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
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chr2	69657349	rs113587680	CT	C	30.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.12;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr2	69709919	rs6721259	A	G	1181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.714;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=40;PP=897;ReadPosRankSum=-0.833;SC=AAGTGTCAGGAGATTTGAGTC;SOR=1.117;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=186;TCF=71;TCR=115;TR=59;WE=69709927;WS=69709909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,61:0.31:199
chr2	69741609	rs2276689	C	T	1015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.409;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=16;PP=674;ReadPosRankSum=-1.601;SC=TTACCGCTGGCTCCTGGGCAG;SOR=1.085;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=58;TCF=35;TCR=23;TR=43;WE=69741617;WS=69741599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,44:0.72:61
chr2	69741753	rs3832159	CTGT	C	1311.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=12;PP=1260;ReadPosRankSum=0.120;SC=GTTGCTGTTGCTGTTGTTGTT;SOR=0.677;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=52;TCF=23;TCR=29;TR=23;WE=69741763;WS=69741743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,37:0.55:67
chr2	69741801	rs6757825	C	T	833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.837;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=19;PP=554;ReadPosRankSum=-0.493;SC=TCTGCATTAGCTGCTGTTGAG;SOR=0.373;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=103;TCF=60;TCR=43;TR=42;WE=69741809;WS=69741791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,43:0.39:110
chr2	69741854	rs6715776	T	G	6456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=127;NR=89;PP=2965;SC=ATTGCTGGTTTCTGGGTTGCT;SOR=0.932;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=216;TCF=127;TCR=89;TR=216;WE=69741862;WS=69741844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr2	70315448	rs12319	A	T	990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.025;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=33;PP=643;ReadPosRankSum=0.002;SC=CCAGCTCCCCAGTCATCTGCG;SOR=1.528;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=151;TCF=65;TCR=86;TR=49;WE=70315456;WS=70315438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,53:0.33:162
chr2	70456510	.	G	T	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.295;ClippingRankSum=-0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=148;ReadPosRankSum=-1.088;SC=AATCACATTTGTATCTATAAA;SOR=0.818;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=9;WE=70456518;WS=70456500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr2	70457784	rs200532251	C	CA	32.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.82;ReadPosRankSum=0.050;SOR=0.616;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr2	70485446	rs370775019	C	G	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.259;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=242;ReadPosRankSum=-1.358;SC=GGTGCTGGAGCGCGCCCCGCG;SOR=1.123;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=34;TCF=15;TCR=19;TR=20;WE=70485454;WS=70485436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,24:0.59:41
chr2	70508823	rs372729562	A	G	1860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.779;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=24;PP=1106;ReadPosRankSum=0.654;SC=TTACCTAAGAAAGAGAAAAAT;SOR=0.448;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=100;TCF=66;TCR=34;TR=67;WE=70508831;WS=70508813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,75:0.68:110
chr2	70676639	rs538118	A	G	873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.710;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=17;PP=469;ReadPosRankSum=0.060;SC=GGCAGGCCCCATGGGTCAGAT;SOR=0.303;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=97;TCF=66;TCR=31;TR=45;WE=70676647;WS=70676629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,47:0.47:100
chr2	70676769	rs71710818	GA	G	2183.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.583;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.918;NF=5;NR=55;PP=867;ReadPosRankSum=-1.299;SC=TGGAAATGAGGAAAAAAAAAT;SOR=0.916;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=115;TCF=7;TCR=108;TR=60;WE=70676778;WS=70676759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,104:0.55:188
chr2	70677994	rs2166975	G	A	2570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.569;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=47;PP=1489;ReadPosRankSum=1.269;SC=GGGCTCTTCAGACCACTGGCA;SOR=0.606;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=168;TCF=92;TCR=76;TR=105;WE=70678002;WS=70677973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,115:0.64:181
chr2	70678173	rs3732249	C	A	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=2.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.22;ReadPosRankSum=0.756;SOR=0.155;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr2	70678176	rs3732248	G	A	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=6.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.19;ReadPosRankSum=0.266;SOR=0.049;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr2	70679067	rs3771522	G	A	1773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.657;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=51;PP=1082;ReadPosRankSum=1.127;SC=ATCCTCAAGAGCTGTGGCTCC;SOR=0.808;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=136;TCF=43;TCR=93;TR=74;WE=70679075;WS=70679057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,82:0.55:149
chr2	70680211	rs112692567	CT	C	1906.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.927;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.244;NF=18;NR=13;PP=1146;ReadPosRankSum=0.540;SC=TAAACTAAACCTGACTTGGTA;SOR=0.241;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=55;TCF=37;TCR=18;TR=31;WE=70680219;WS=70680201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,55:0.67:82
chr2	70683753	rs2278791	T	C	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=2.547;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=114;ReadPosRankSum=0.037;SC=GCTTTTGCAATTGGAGGGAAA;SOR=2.546;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=6;WE=70683761;WS=70683743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr2	70905099	rs2902577	T	G	1031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=26;PP=775;SC=GGGCCCAACATCCTGCATGGA;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=31;WE=70905107;WS=70905089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
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chr2	70915134	rs2074820	C	G	733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.158;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=8;PP=524;ReadPosRankSum=0.232;SC=CCTGGGCCCACTTTCCAGGAG;SOR=0.459;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=55;TCF=43;TCR=12;TR=31;WE=70915142;WS=70915124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,32:0.54:59
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chr2	71159918	.	C	T	1155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.638;ClippingRankSum=0.000;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.663;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=20;PP=686;ReadPosRankSum=0.332;SC=GTTCCAGAACCGCCGCACCAA;SOR=1.098;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=156;TCF=96;TCR=60;TR=57;WE=71159926;WS=71159908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,63:0.36:174
chr2	71162930	rs55655347	A	G	1086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=27;NR=8;PP=608;SC=TTTACTGTCAACCTAGAGGAG;SOR=2.133;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=37;TCF=27;TCR=10;TR=35;WE=71162938;WS=71162920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr2	71162996	rs11685700	A	G	3530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=38;PP=2337;SC=AAGGCTGAGCAGCTCTCTCCA;SOR=1.793;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=91;TCR=38;TR=129;WE=71163004;WS=71162986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr2	71163086	rs11681642	T	C	7183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=121;NR=128;PP=2965;SC=GACTGCTCCATGGCCATGGAG;SOR=0.784;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=249;TCF=121;TCR=128;TR=249;WE=71163094;WS=71163076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,274:1.00:274
chr2	71163225	rs759219	C	T	2335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=32;NR=45;PP=1246;SC=TCCACCGTGACGGGTGAGGTC;SOR=1.166;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=32;TCR=45;TR=77;WE=71163233;WS=71163215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr2	71205976	rs1115049	A	G	2022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=38;PP=1175;SC=TCCCGGCTGCAGGGAGCGAGA;SOR=1.209;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=28;TCR=38;TR=66;WE=71205984;WS=71205966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr2	71206058	rs1115050	A	C	670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=15;PP=365;SC=CCGAGAAGCCAGCAGAGACAG;SOR=1.445;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=9;TCR=15;TR=24;WE=71206066;WS=71206048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	71211989	rs3796099	A	G	9903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=371;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=169;NR=174;PP=2965;SC=AGCGGCCCACAATGTGGAATG;SOR=0.824;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=343;TCF=169;TCR=174;TR=343;WE=71211997;WS=71211979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,371:1.00:371
chr2	71297695	rs2287328	T	C	3179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.435;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=68;PP=1680;ReadPosRankSum=-1.698;SC=CAGAAGCAGATGGACTGAGCA;SOR=0.648;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=267;TCF=140;TCR=127;TR=142;WE=71297703;WS=71297685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,154:0.55:281
chr2	71297982	rs2287327	C	T	7097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=523;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=157;NR=143;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.981;SC=GAGTCTGGGGCGGAGCCTGGG;SOR=0.726;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=478;TCF=246;TCR=232;TR=300;WE=71297990;WS=71297972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:195,325:0.62:520
chr2	71305359	rs2302794	G	A	2408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=36;PP=1459;ReadPosRankSum=2.133;SC=AGTACCTCAGGGTCTGGGCGT;SOR=0.727;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=160;TCF=103;TCR=57;TR=97;WE=71305367;WS=71305349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,110:0.60:182
chr2	71305456	rs6713	C	T	4305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.971;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=96;PP=2571;ReadPosRankSum=0.014;SC=AGGTTTTCTTCTGGCGCTGAC;SOR=0.862;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=305;TCF=149;TCR=156;TR=181;WE=71305464;WS=71305446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,203:0.60:337
chr2	71351403	rs6748672	C	A	3865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.013;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=70;PP=2197;ReadPosRankSum=-0.172;SC=TGGACTGTCACGTCCCAATGG;SOR=0.646;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=251;TCF=131;TCR=120;TR=150;WE=71351411;WS=71351393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,175:0.61:286
chr2	71351487	rs11541017	G	A	1979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.536;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=45;PP=957;ReadPosRankSum=-1.250;SC=AAGAGGGACCGCTTCACTTAC;SOR=0.809;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=225;TCF=108;TCR=117;TR=86;WE=71351495;WS=71351477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,104:0.41:256
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chr2	71357634	rs1813348	C	T	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=237;ReadPosRankSum=0.438;SC=TGCGAAAGCGCTCGCGCTGCC;SOR=0.614;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=38;TCF=30;TCR=8;TR=16;WE=71357642;WS=71357624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,16:0.42:38
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chr2	71360735	rs138856662	T	TTCC	4776.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.09;NF=1;NR=46;PP=2462;SC=AGAGAGCACTTTCCTCCTCAA;SOR=1.919;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=67;TCF=1;TCR=66;TR=47;WE=71360743;WS=71360713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
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chr2	71415479	rs357780	T	C	619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=16;NR=0;PP=378;SC=GTCACAGTATTGTGAGACCAC;SOR=3.716;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=71415487;WS=71415469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	71417065	rs357777	G	T	8523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=122;NR=168;PP=2965;SC=GGTCTCGTGAGGGAATAAACC;SOR=1.139;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=291;TCF=123;TCR=168;TR=290;WE=71417073;WS=71417055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,315:1.00:315
chr2	71417134	rs357776	C	T	981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.211;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=32;PP=709;ReadPosRankSum=0.538;SC=AGTCTTGCTCCTGCAGTTCCT;SOR=1.371;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=86;TCF=19;TCR=67;TR=39;WE=71417142;WS=71417124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,41:0.45:91
chr2	71607539	rs17693408	G	A	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=209;ReadPosRankSum=0.060;SC=TATCACTCCAGTTGAATTATT;SOR=0.693;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=23;TCF=8;TCR=15;TR=12;WE=71607547;WS=71607529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr2	71615534	rs2542528	C	T	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5010;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=218;ReadPosRankSum=-1.015;SC=TTTGATCATCCGCGTGCAGGA;SOR=1.473;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=11;WE=71615542;WS=71615524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,11:0.85:13
chr2	71615571	rs2542529	C	T	1650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=3;PP=1085;SC=GGGGCAACAACTACCCACAGA;SOR=4.450;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=42;TCR=3;TR=45;WE=71615579;WS=71615561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	71620563	rs12713748	A	G	4951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=382;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.225;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=117;NR=88;PP=2747;ReadPosRankSum=-0.970;SC=AGACCATACCATGGCGTGGCT;SOR=0.818;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=343;TCF=187;TCR=156;TR=205;WE=71620571;WS=71620553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,232:0.61:380
chr2	71620818	rs6741436	C	T	3523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=69;PP=2216;SC=GCTCTCGCTTCCCCTGCAACC;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=47;TCR=69;TR=116;WE=71620826;WS=71620808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr2	71625767	rs13424541	G	A	1329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.823;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=14;PP=865;ReadPosRankSum=0.807;SC=TCTCTGTGAGGTTCTTTGGAG;SOR=1.003;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=66;TCR=23;TR=54;WE=71625775;WS=71625757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,57:0.59:96
chr2	71627539	rs3771371	C	T	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=200;ReadPosRankSum=-1.344;SC=TACTGTTTAACCTATTGTGGA;SOR=0.672;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=57;TCF=40;TCR=17;TR=17;WE=71627547;WS=71627529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,17:0.28:60
chr2	71631109	rs3732235	A	G	1938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=38;PP=1097;ReadPosRankSum=-1.449;SC=GCTCCTGAAAACATGAATATA;SOR=0.690;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=168;TCF=89;TCR=79;TR=82;WE=71631117;WS=71631099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,93:0.51:182
chr2	71633275	rs3732233	T	C	1118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.055;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=25;PP=700;ReadPosRankSum=-0.284;SC=TAGATACAATTTATGATCGAT;SOR=0.882;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=138;TCF=76;TCR=62;TR=55;WE=71633283;WS=71633265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,60:0.39:155
chr2	71633389	rs6714975	C	T	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=12;PP=230;ReadPosRankSum=1.089;SC=GTAATAGAAACAAGGTAACAA;SOR=0.653;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=54;TCF=18;TCR=36;TR=19;WE=71633397;WS=71633379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,23:0.35:66
chr2	71635462	rs3755334	T	G	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=139;ReadPosRankSum=-1.485;SC=TCAAACTGTTTCTGTGTTTAG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=8;WE=71635470;WS=71635452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr2	71635931	rs12466025	G	T	2910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=56;PP=1886;SC=GACCTTATATGTGGTGTCCTT;SOR=1.292;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=95;TCF=39;TCR=56;TR=95;WE=71635939;WS=71635921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr2	71636036	rs12474072	A	G	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=194;ReadPosRankSum=-0.342;SC=TAAATGTATTATGATAGGTAC;SOR=0.446;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=11;WE=71636044;WS=71636026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr2	71645828	rs4852783	G	A	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.251;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=19;PP=324;ReadPosRankSum=0.116;SC=GAATTTTATTGCTGTATTTTA;SOR=1.705;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=84;TCF=33;TCR=51;TR=25;WE=71645836;WS=71645818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,26:0.28:94
chr2	71645890	rs4852784	G	C	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=113;ReadPosRankSum=1.302;SC=TTTATTTTGTGTACATATGGG;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=7;WE=71645898;WS=71645880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,7:0.28:25
chr2	71651691	rs150899421	G	GT	55.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=50;ReadPosRankSum=-0.484;SC=AATGTTTACTGTTTTTTTTTG;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=4;WE=71651699;WS=71651681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr2	71651939	rs12613800	T	A	1718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=38;PP=1085;ReadPosRankSum=-0.058;SC=ACAATGTTAGTGACTAAGAGT;SOR=0.667;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=51;TCR=67;TR=67;WE=71651947;WS=71651929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,76:0.57:134
chr2	71654175	rs1804020	G	A	4698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=371;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.795;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=99;NR=99;PP=2953;ReadPosRankSum=0.410;SC=TTCTTCTCAGGTGCCCGAAGA;SOR=0.631;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=338;TCF=168;TCR=170;TR=198;WE=71654183;WS=71654165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,216:0.59:369
chr2	71654450	rs60163900	A	G	1435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.608;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=29;PP=821;ReadPosRankSum=-1.844;SC=TGGACACAAAAAAGACAAAAC;SOR=1.015;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=96;TCF=49;TCR=47;TR=56;WE=71654458;WS=71654440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,64:0.59:109
chr2	71655586	rs28613330	T	A	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=230;ReadPosRankSum=0.377;SC=TGCAAAAATGTATAATGTTGA;SOR=0.148;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=12;WE=71655594;WS=71655576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr2	71658364	rs13383758	C	T	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=147;ReadPosRankSum=-0.094;SC=GGAGGTTTTCCCTGAGAAAGA;SOR=0.430;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=9;WE=71658372;WS=71658354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr2	71658541	rs11542286	C	T	3308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.471;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=77;PP=1923;ReadPosRankSum=-0.373;SC=AAATCAGTGGCGTCTGATGTC;SOR=0.939;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=272;TCF=128;TCR=144;TR=141;WE=71658549;WS=71658531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,158:0.52:304
chr2	71660495	rs34126477	T	TC	128.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=131;ReadPosRankSum=1.122;SC=AACGTACATTTCCCCCCGCTT;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=6;WE=71660503;WS=71660485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr2	71708810	rs34707417	T	G	304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.9785;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=90;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=63.17;NF=9;NR=1;PP=182;SC=AATTTCTGGATCTGTGGTCTT;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=71708818;WS=71708800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	71708852	.	C	CCATCCATCCATCCATT	922.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=3;PP=1287;SC=ATCCATCCATCCATCCATGCT;SOR=2.531;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=20;TCF=12;TCR=8;TR=13;WE=71708860;WS=71708842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	71708918	rs35628632	C	T	2929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=28;PP=1679;SC=TGAATGCCTACTCAGTGCCCT;SOR=1.458;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=61;TCR=28;TR=89;WE=71708939;WS=71708908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr2	71709120	rs12470028	G	A	1596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=39;PP=1062;ReadPosRankSum=2.696;SC=CCAGAGGGGGGTGCTCCATGG;SOR=1.052;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=21;TCR=40;TR=59;WE=71709128;WS=71709110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,62:0.95:65
chr2	71755380	rs4852800	A	G	2812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.626;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=36;PP=1844;ReadPosRankSum=1.418;SC=TCAGGGTTTTAGAGGAGAGAC;SOR=0.598;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=164;TCF=108;TCR=56;TR=104;WE=71755388;WS=71755370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,115:0.66:174
chr2	71762232	rs4852801	C	T	8058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=120;NR=147;PP=2965;SC=GAGCCTCCTGCCCCCAGCAAA;SOR=0.963;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=267;TCF=120;TCR=147;TR=267;WE=71762240;WS=71762222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,298:1.00:298
chr2	71762310	rs4852802	A	G	2841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=56;PP=2124;SC=GCATCCTGCCAGTATCCCAGA;SOR=1.714;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=29;TCR=56;TR=85;WE=71762318;WS=71762300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr2	71766487	rs7609409	G	A	1464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=30;PP=816;SC=TAAGGCCTCTGTTGCCCATTT;SOR=1.791;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=15;TCR=30;TR=45;WE=71766495;WS=71766477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr2	71776345	rs736096	CA	TG	5260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=19;PP=2947;SC=GGCCTCGGGCCACATCTGTTT;SOR=2.107;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=101;TCF=80;TCR=21;TR=88;WE=71776354;WS=71776335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr2	71780215	rs2303596	T	C	12052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=465;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=212;NR=217;PP=2965;SC=ATGTGGATGATGCCATCCAGT;SOR=0.746;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=429;TCF=212;TCR=217;TR=429;WE=71780223;WS=71780205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,464:1.00:464
chr2	71780821	rs2303597	T	C	192.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=1;PP=144;SC=GTGTGGTCCCTTTCCCAGCTC;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=71780829;WS=71780814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	71795152	rs2288355	A	T	12854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=481;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=242;NR=198;PP=2965;SC=TTGGGCTCTCAGTGGATGAGA;SOR=0.844;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=440;TCF=242;TCR=198;TR=440;WE=71795160;WS=71795142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,480:1.00:480
chr2	71796865	rs10205023	C	G	638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=3;PP=472;SC=GGCTGACATACGCAGGGGTGC;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=71796873;WS=71796855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	71797176	rs10183967	A	C	2848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=57;SC=ACCTCCGGAGACTTCATGCTT;SOR=1.533;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=28;TCR=57;TR=85;WE=71797184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr2	71817003	rs1473228	A	G	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=257;ReadPosRankSum=0.450;SC=GTCCGTGCCTATCTGTGTGGT;SOR=2.476;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=11;WE=71817011;WS=71816993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr2	71825677	rs13421969	C	T	2247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.687;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=28;PP=1470;ReadPosRankSum=-0.168;SC=TCCCCTCCCCCTCTCCGGCCC;SOR=0.801;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=135;TCF=92;TCR=43;TR=89;WE=71825685;WS=71825667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,97:0.66:147
chr2	71828423	rs2303604	A	T	703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=2;PP=518;SC=AACCCGAATAAGTAGACTGAA;SOR=3.442;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=23;WE=71828431;WS=71828413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	71829821	rs1529408	G	T	3100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=63;NR=41;PP=1789;SC=CGCCTAGTGCGCCTTGATACT;SOR=1.121;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=63;TCR=41;TR=104;WE=71829829;WS=71829811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr2	71838597	rs2303606	C	A	1851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.012;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=42;PP=1159;ReadPosRankSum=0.843;SC=GTGCTTAGATCCTGGCATGGG;SOR=0.793;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=226;TCF=120;TCR=106;TR=90;WE=71838605;WS=71838587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,96:0.40:240
chr2	71847943	rs12995778	C	A	216.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=4;NR=6;PP=159;SC=AAATGGACACCCCTAGGTTAC;SOR=0.892;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=10;WE=71847951;WS=71847933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	71871039	rs84181	A	G	2878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=31;PP=1747;SC=AACTCTGAAGAATGCTGCTTG;SOR=1.222;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=61;TCR=31;TR=92;WE=71871047;WS=71871029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr2	71871236	rs84182	A	G	1445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=30;PP=915;SC=GTGTGTGCGTACTGGGCAGTG;SOR=2.200;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=10;TCR=30;TR=40;WE=71871244;WS=71871226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr2	71891361	rs2303599	C	T	2007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=15;PP=1107;SC=TTGGGTGCCCCGTGTTGGCTG;SOR=1.675;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=46;TCR=15;TR=61;WE=71891369;WS=71891351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr2	71901286	rs2559081	C	T	1178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=5;PP=775;SC=TCTCTCTAACCTTGCTTCCTT;SOR=2.948;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=35;WE=71901294;WS=71901276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr2	71906171	rs1863812	T	C	1407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=9;PP=942;SC=GGCCAAAAACTACCTCTCTGT;SOR=2.124;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=37;TCR=9;TR=46;WE=71906179;WS=71906161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr2	71907930	rs7558412	G	T	228.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=157;SC=AGTGGAAGTAGGGGTGGCAGT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=71907938;WS=71907925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	72692272	rs5832083	A	AAG	9172.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=45;PP=2930;SC=AGGACAAAGTAAGCAACTGCC;SOR=1.356;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=101;TCF=52;TCR=49;TR=93;WE=72692280;WS=72692262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr2	72742083	.	GACAC	G,GAC	1885.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.573;ClippingRankSum=0.000;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=2.080;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.94;ReadPosRankSum=0.901;SOR=1.524;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:5,12,53:0.17,0.76:70
chr2	73151231	rs1561247	C	T	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=4;PP=365;ReadPosRankSum=-0.514;SC=CTCTCGAGTGCGGGGAGGTGT;SOR=0.732;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=61;TCF=51;TCR=10;TR=26;WE=73151239;WS=73151221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,29:0.41:70
chr2	73151279	rs192579903	G	T	1596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.765;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=24;PP=944;ReadPosRankSum=-0.458;SC=GGCGGCAAAAGGGCAAAGGGA;SOR=0.492;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=159;TCF=109;TCR=50;TR=70;WE=73151287;WS=73151269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,77:0.43:178
chr2	73280303	rs13030434	G	A	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.950;QD=9.44;ReadPosRankSum=-0.739;SOR=0.965;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr2	73339430	rs4143146	T	G	2339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.523;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=41;PP=1474;ReadPosRankSum=-2.264;SC=AGCCCCGCCCTGTTAGGCCTT;SOR=0.754;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=198;TCF=122;TCR=76;TR=110;WE=73339438;WS=73339420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,117:0.57:206
chr2	73339708	rs1864488	G	A	5594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=448;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=124;NR=117;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.346;SC=GCCACTCGGGGCAGCCGTGCG;SOR=0.668;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=415;TCF=216;TCR=199;TR=241;WE=73339716;WS=73339698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:186,259:0.58:445
chr2	73491683	rs4852916	G	A	997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=25;PP=711;SC=TGAGCGTGGAGGGTCAAGGCT;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=31;WE=73491691;WS=73491673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr2	73493303	rs13021769	T	C	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=108;ReadPosRankSum=0.204;SC=CACAATACCCTGGACCCCAGC;SOR=0.446;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=10;WE=73493311;WS=73493293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,11:0.85:13
chr2	73613031	rs61156725	TGGAGGA	T,TGGAGGAGGA	591.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=4.501;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=1.745;NF=4,4;NR=6,6;PP=633,392;ReadPosRankSum=-0.818;SC=CCGGGCGAGCTGGAGGAGGAG;SOR=0.144;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=16;TCF=10;TCR=6;TR=10,10;WE=73613044;WS=73613021;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.61:28
chr2	73613341	rs11126399	G	A	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.197;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=232;ReadPosRankSum=0.161;SC=CCGGGGAGGGGTGTGGAGCCG;SOR=1.061;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=66;TCF=27;TCR=39;TR=21;WE=73613349;WS=73613331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,22:0.30:74
chr2	73649928	rs1881245	G	A	1597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=18;PP=1031;ReadPosRankSum=0.023;SC=TATTATATACGTAAGTAAATA;SOR=0.643;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=131;TCF=96;TCR=35;TR=65;WE=73649936;WS=73649918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,71:0.50:141
chr2	73650122	rs1881246	T	A	2809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.573;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=76;PP=1885;ReadPosRankSum=0.288;SC=TTTATTTGCATGTAACCTTTC;SOR=0.791;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=186;TCF=66;TCR=120;TR=116;WE=73650130;WS=73650112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,122:0.63:195
chr2	73651967	rs3813227	C	T	1164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.626;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=29;PP=663;ReadPosRankSum=0.530;SC=TGATGCTGCTCGTTCATATGG;SOR=0.791;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=135;TCF=63;TCR=72;TR=51;WE=73651975;WS=73651957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,58:0.39:148
chr2	73675019	rs66492706	CT	C	414.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.721;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=299;ReadPosRankSum=0.582;SC=TCAAAGCTGGCTTTTTTTCCA;SOR=0.069;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=14;WE=73675027;WS=73675009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr2	73675227	rs34628045	T	TCTC	7287.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.247;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.383;NF=44;NR=52;PP=2964;ReadPosRankSum=-0.447;SC=GGCTGTAAGTTCTCTAGAAAC;SOR=1.138;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=180;TCF=69;TCR=111;TR=96;WE=73675235;WS=73675217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,181:0.61:295
chr2	73675669	rs2037814	T	G	6610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=119;NR=86;PP=2965;SC=CACTCACATGTAGAGGACCTC;SOR=0.972;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=205;TCF=119;TCR=86;TR=205;WE=73675677;WS=73675659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr2	73675844	rs7598901	C	T	5252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=392;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.664;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=107;NR=114;PP=2962;ReadPosRankSum=1.127;SC=AACAAGAGTTCGCAGACAGTC;SOR=0.761;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=371;TCF=183;TCR=188;TR=221;WE=73675852;WS=73675834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,233:0.59:392
chr2	73676050	.	A	G	5204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.509;ClippingRankSum=0.000;DP=419;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.750;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=125;NR=103;PP=2962;ReadPosRankSum=1.702;SC=CCAGCTGACCAGAAGACTGGC;SOR=0.805;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=389;TCF=214;TCR=175;TR=228;WE=73676058;WS=73676040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,241:0.58:419
chr2	73677833	rs6546836	A	G	3371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=532;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.414;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=73;PP=2152;ReadPosRankSum=-1.031;SC=TTTTCTACCAACAGTCGTTGC;SOR=0.778;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=490;TCF=249;TCR=241;TR=163;WE=73677841;WS=73677823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:353,179:0.34:532
chr2	73677898	rs6546837	G	C	3692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=469;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.773;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=80;PP=2346;ReadPosRankSum=0.291;SC=CCTGGACCAGGTGACCGGAAG;SOR=0.581;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=431;TCF=211;TCR=220;TR=168;WE=73677906;WS=73677888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:283,185:0.40:468
chr2	73679280	rs6546838	A	G	2155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.174;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=46;PP=1324;ReadPosRankSum=1.191;SC=TTTGAAAGCAATAGGGGTTCC;SOR=0.730;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=221;TCF=116;TCR=105;TR=92;WE=73679299;WS=73679270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,105:0.43:246
chr2	73679866	rs10496192	T	C	2488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=3.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.783;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=59;PP=1531;ReadPosRankSum=-1.211;SC=AGTAAAGGTATTCTAAAGATT;SOR=0.920;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=310;TCF=135;TCR=175;TR=100;WE=73679877;WS=73679856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:222,118:0.35:340
chr2	73679990	rs6724782	T	A	2146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.024;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=51;PP=1367;ReadPosRankSum=-1.431;SC=TGCCAGGTAGTCATGTAACTG;SOR=0.736;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=274;TCF=141;TCR=133;TR=108;WE=73679998;WS=73679980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,111:0.39:286
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chr2	73828538	rs1052161	G	A	3631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.993;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=85;PP=2326;ReadPosRankSum=0.253;SC=GACCTACTGAGGCCATTTGTG;SOR=0.926;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=261;TCF=113;TCR=148;TR=146;WE=73828546;WS=73828514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,161:0.56:287
chr2	73829372	rs1052162	C	T	1509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.745;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=33;PP=891;ReadPosRankSum=0.796;SC=GATAAAGCGCCTGAAGTTAAT;SOR=0.499;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=237;TCF=143;TCR=94;TR=76;WE=73829380;WS=73829362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,86:0.34:251
chr2	73830581	rs113408397	G	GA	183.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.40;MQRankSum=1.916;QD=4.48;ReadPosRankSum=1.030;SOR=0.293;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,14:0.34:41
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chr2	73898118	rs7570683	C	T	1297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.036;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.884;NF=39;NR=7;PP=793;ReadPosRankSum=0.370;SC=GTGACATTGACTGCAGGTAAT;SOR=0.968;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=87;TCF=72;TCR=15;TR=46;WE=73898126;WS=73898108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,55:0.55:100
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chr2	73899613	rs2421585	T	G	3014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=66;PP=2010;SC=CAAGAAGAATTCCCATGAAGG;SOR=1.655;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=34;TCR=66;TR=100;WE=73899621;WS=73899603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr2	73899955	rs6725284	G	T	7724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=167;NR=94;PP=2965;SC=GTTTGTTCCTGTGGAAAATGT;SOR=1.324;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=261;TCF=167;TCR=94;TR=261;WE=73899963;WS=73899945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr2	73900210	rs4637150	A	G	1963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=45;PP=1260;SC=TTAGCCCTACATGTAGGGAGA;SOR=1.885;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=19;TCR=45;TR=64;WE=73900218;WS=73900200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr2	73900900	rs10206899	T	C	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.29;MQRankSum=-0.214;QD=8.11;ReadPosRankSum=1.101;SOR=0.340;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr2	73927931	rs4852974	A	G	2828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.166;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.97;MQRankSum=0.312;NF=69;NR=36;PP=1887;ReadPosRankSum=-0.368;SC=CTGTAGCCCTAGTCCCGGGCA;SOR=1.466;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=173;TCF=103;TCR=70;TR=105;WE=73927939;WS=73927921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,113:0.61:186
chr2	73928098	rs2001490	C	G	8414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=652;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.778;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=175;NR=185;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.412;SC=TTCAGATTCACCCACCCAGAA;SOR=0.700;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=610;TCF=301;TCR=309;TR=360;WE=73928106;WS=73928088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:262,388:0.60:650
chr2	73928366	rs2012574	G	C	5722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=503;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.198;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=122;NR=138;PP=2962;ReadPosRankSum=0.281;SC=GCCATCCCCCGGGAGAGCAAG;SOR=0.832;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=459;TCF=228;TCR=231;TR=260;WE=73928374;WS=73928356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:222,280:0.56:502
chr2	73957124	rs7210	A	G	1785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.665;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=37;PP=1009;ReadPosRankSum=-0.073;SC=ATAATGTCCCAATACTTTCTT;SOR=0.809;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=60;TCR=58;TR=74;WE=73957132;WS=73957114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,84:0.63:134
chr2	73957227	rs13003035	T	A	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.283;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=270;ReadPosRankSum=-0.704;SC=TATACAAACATGTGTAAGTGA;SOR=0.995;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=38;TCF=12;TCR=26;TR=18;WE=73957235;WS=73957217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,21:0.51:41
chr2	73994074	rs2567599	G	A	2666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=56;PP=1768;SC=ACAAAAAGCAGATCTTTCCAG;SOR=1.796;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=27;TCR=56;TR=83;WE=73994082;WS=73994064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr2	74000701	rs2116367	C	T	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=291;ReadPosRankSum=0.321;SC=AAAGATGAGCCAGTTCAGTTC;SOR=0.420;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=14;WE=74000709;WS=74000691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
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chr2	74007345	rs3813228	A	G	990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.103;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=27;PP=641;ReadPosRankSum=-0.329;SC=GCCAGAGGCCAGTAGCACAGG;SOR=0.470;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=71;TCF=21;TCR=50;TR=40;WE=74007353;WS=74007335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,44:0.59:75
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chr2	74128433	rs1050146	C	T	4821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=420;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=110;NR=101;PP=2833;ReadPosRankSum=-0.256;SC=CTCAGCCACACACACCATGTG;SOR=0.719;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=377;TCF=194;TCR=183;TR=211;WE=74128441;WS=74128423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:184,233:0.56:417
chr2	74128660	.	TG	T	620	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=21;MMLQ=26;MQ=59.25;NF=1;NR=18;PP=620;QD=32.7894736842;SC=GGGAAGGAAATGTGTGTGTGT;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=19;WE=74128668;WS=74128650;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr2	74135797	rs702461	T	C	569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.165;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=445;ReadPosRankSum=0.552;SC=TTGTCTCCACTAGATCTGGCA;SOR=0.994;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=54;TCF=41;TCR=13;TR=26;WE=74135805;WS=74135787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,26:0.46:57
chr2	74135898	rs756128	A	G	3285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.464;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=52;PP=2299;ReadPosRankSum=1.727;SC=CCAACAGGGAAAAGATGACCC;SOR=1.048;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=210;TCF=122;TCR=88;TR=133;WE=74135906;WS=74135888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,140:0.60:235
chr2	74140581	rs891699	A	T	1086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.535;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=7;PP=708;ReadPosRankSum=0.602;SC=AAGAATGAGAATTTTATAAGC;SOR=1.174;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=69;TCF=55;TCR=14;TR=41;WE=74140589;WS=74140571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,44:0.61:72
chr2	74140789	rs891698	T	C	3732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.145;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=89;PP=2574;ReadPosRankSum=-1.239;SC=CAGCCCCTTTTCTGATTCTGA;SOR=0.953;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=251;TCF=117;TCR=134;TR=156;WE=74140797;WS=74140779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,164:0.60:274
chr2	74142142	rs58329068	A	C	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.111;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=52;ReadPosRankSum=1.367;SC=AGGGCCAAAAATGTATTTTAA;SOR=0.941;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=5;WE=74142150;WS=74142132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr2	74142164	rs35892339	GA	G	63.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.579;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.136;HP=5;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=93;ReadPosRankSum=-2.189;SC=AAAAATTAGGGAAAAATCTCA;SOR=1.492;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=4;WE=74142172;WS=74142154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr2	74146869	rs1721238	G	A	326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=241;SC=CCATGCAATAGTGCTGTAAGG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=74146877;WS=74146859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	74153905	rs831526	C	T	1096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=5;PP=775;SC=GCGCACCCCGCCGCATGTTCA;SOR=3.442;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=34;WE=74153913;WS=74153895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr2	74159734	rs6737156	T	C	3304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=429;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.535;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=69;PP=2177;ReadPosRankSum=0.260;SC=GGTAACATCCTCAAGCAAATC;SOR=0.780;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=396;TCF=224;TCR=172;TR=162;WE=74159742;WS=74159724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:256,172:0.40:428
chr2	74159925	rs6722482	G	A	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=245;ReadPosRankSum=-0.754;SC=GCAACTAATGGCATCTAGCAT;SOR=0.551;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=4;TCR=32;TR=16;WE=74159933;WS=74159915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,19:0.46:41
chr2	74185876	rs4777	A	T	8752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=152;NR=146;PP=2965;SC=AATACCATGAAGTTCAGGCTG;SOR=0.724;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=298;TCF=152;TCR=146;TR=298;WE=74185884;WS=74185866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,331:1.00:331
chr2	74273383	rs11426743	T	TC	2497.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.87;ReadPosRankSum=1.895;SOR=0.687;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,96:0.57:168
chr2	74300717	rs7560668	T	C	3349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.435;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=64;PP=2056;ReadPosRankSum=1.343;SC=TTATACTCACTTGGGATCTGG;SOR=0.649;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=248;TCF=135;TCR=113;TR=135;WE=74300725;WS=74300707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,155:0.55:282
chr2	74320262	rs12713810	C	G	847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.897;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=21;PP=502;ReadPosRankSum=0.289;SC=TGATGTGGTTCTTTGATAAAA;SOR=0.293;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=60;TCF=20;TCR=40;TR=35;WE=74320270;WS=74320252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,38:0.60:63
chr2	74362090	rs828879	A	G	651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=20;PP=510;SC=AGTCTGGAATATCTGCCTGTG;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=74362098;WS=74362080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	74374884	rs1667605	G	A	602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.951;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=12;PP=319;ReadPosRankSum=0.355;SC=GACAGCCGCCGGCCCCGCGGT;SOR=0.478;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=62;TCF=37;TCR=25;TR=28;WE=74374892;WS=74374874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,32:0.45:71
chr2	74383630	rs11540640	G	A	2722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.800;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=36;PP=1695;ReadPosRankSum=-0.052;SC=GTCTATAACAGATAGCAATGA;SOR=0.848;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=184;TCF=119;TCR=65;TR=111;WE=74383638;WS=74383620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,121:0.59:204
chr2	74383911	rs828852	G	A	607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.52;SOR=2.448;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	74383912	rs56259334	T	C	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.25;ReadPosRankSum=0.898;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,12:0.80:15
chr2	74394034	rs56873314	G	C	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=173;ReadPosRankSum=-0.112;SC=CAATAAAACTGAATCACCTTC;SOR=0.622;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=11;WE=74394042;WS=74394024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr2	74394388	.	C	CT	36.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.195;ClippingRankSum=-0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=18.543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=2.83;ReadPosRankSum=-0.075;SOR=1.389;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
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chr2	74405952	rs2272240	T	C	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.839;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=19;PP=438;ReadPosRankSum=-0.059;SC=GCTGCGAGCCTTTGCAAACCT;SOR=1.981;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=20;WE=74405960;WS=74405942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,20:0.53:38
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chr2	74448672	rs1020485	C	A	1676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=43;PP=985;ReadPosRankSum=-1.589;SC=CAGGTTTGAGCACCATATTTC;SOR=0.744;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=45;TCR=85;TR=66;WE=74448680;WS=74448662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,77:0.54:143
chr2	74450125	rs6745054	T	C	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=1.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.26;ReadPosRankSum=-1.792;SOR=1.145;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,26:0.49:53
chr2	74450134	.	CT	C	386.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.72;ReadPosRankSum=0.488;SOR=0.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,12:0.36:33
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chr2	74725144	rs6546908	T	C	1280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.500;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=23;PP=866;ReadPosRankSum=-0.064;SC=CTGGAGCGCCTTCGGGCAGTG;SOR=1.061;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=171;TCF=101;TCR=70;TR=63;WE=74725152;WS=74725134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,66:0.35:188
chr2	74734983	.	TG	T	30.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.05;ReadPosRankSum=0.197;SOR=0.602;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr2	74900588	rs34617503	G	T	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.797;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=9;PP=428;ReadPosRankSum=-0.491;SC=CTGCAGGGGGGGTCCTCTATG;SOR=0.960;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=85;TCF=57;TCR=28;TR=33;WE=74900596;WS=74900578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,38:0.40:94
chr2	75061873	rs663504	C	G	3766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=40;NR=87;PP=2576;SC=CTCCCTACTCCGGGCCTGGGA;SOR=1.828;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=40;TCR=87;TR=127;WE=75061881;WS=75061863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr2	75099694	rs28363003	G	A	822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.525;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=30;PP=686;ReadPosRankSum=-0.316;SC=TGTGTATGTCGATGGGGGGGC;SOR=0.226;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=61;TCF=8;TCR=53;TR=36;WE=75099702;WS=75099684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,32:0.57:56
chr2	75105798	rs604112	A	G	9450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=348;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=161;NR=157;PP=2965;SC=CCCACATGCTATCTTTCTGTT;SOR=0.752;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=318;TCF=161;TCR=157;TR=318;WE=75105806;WS=75105788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,348:1.00:348
chr2	75185856	rs12366	G	T	1925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-4.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=19;PP=1046;ReadPosRankSum=0.632;SC=GAGGAGGAGGGACCTGCTGGG;SOR=0.633;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=117;TCF=88;TCR=29;TR=75;WE=75185864;WS=75185846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,84:0.66:127
chr2	75187573	rs3771799	G	A	779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.891;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=14;PP=450;ReadPosRankSum=-1.160;SC=ATCCCTAAATGTCAGGCTTGC;SOR=0.317;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=61;TCF=38;TCR=23;TR=33;WE=75187581;WS=75187563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,36:0.55:65
chr2	75187793	rs3821312	A	T	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=239;ReadPosRankSum=-0.643;SC=AATTTTAGCTACCTAGCCTCA;SOR=0.859;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=14;WE=75187801;WS=75187783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,16:0.73:22
chr2	75187869	rs3771800	T	C	46.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.70;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr2	75425623	rs2024512	G	A	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=214;ReadPosRankSum=-0.892;SC=CAGCAATGCCGTGGTCCTCTA;SOR=0.553;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=14;WE=75425631;WS=75425613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr2	75425728	rs6715729	A	G	1401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.550;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=29;PP=891;ReadPosRankSum=-2.371;SC=CGGCGATGGGAAAGAAGTTGT;SOR=0.744;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=173;TCF=99;TCR=74;TR=67;WE=75425736;WS=75425718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,73:0.39:186
chr2	75873733	rs2286238	T	C	906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=0;PP=685;ReadPosRankSum=-0.935;SC=CTTTCTAGGCTGGGAGAACAC;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=28;WE=75873741;WS=75873723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,31:0.74:42
chr2	75881828	rs6759555	T	C	961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.127;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=10;PP=661;ReadPosRankSum=3.022;SC=AACGTGGACTTAGATTGTAAG;SOR=1.235;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=110;TCF=75;TCR=35;TR=40;WE=75881836;WS=75881818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,44:0.37:118
chr2	75897176	rs13429072	C	G	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.728;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=218;ReadPosRankSum=-2.141;SC=GAGTACCACACATTTAATTAT;SOR=0.311;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=45;TCF=39;TCR=6;TR=15;WE=75897184;WS=75897166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,16:0.33:48
chr2	75907351	rs6722682	T	C	708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=0.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.21;ReadPosRankSum=-1.026;SOR=0.575;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,44:0.32:136
chr2	75915035	rs1803196	C	T	1178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.551;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=29;PP=679;ReadPosRankSum=0.774;SC=TTGAATCTTCCACACTGCTAT;SOR=0.740;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=171;TCF=92;TCR=79;TR=59;WE=75915043;WS=75915025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,66:0.33:201
chr2	75919272	.	AATAT	A	611	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=5;PP=611;QD=123.0;SC=TCGATAATGAAATATATATAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=5;WE=75919283;WS=75919262;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:12,5:0.29:17
chr2	75919294	rs116783069	T	C	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.299;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=27.16;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
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chr2	75923413	rs7560262	T	C	966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.547;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=19;PP=606;ReadPosRankSum=-0.091;SC=TGAAGATCCATTGCCACAGGA;SOR=0.599;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=101;TCF=52;TCR=49;TR=42;WE=75923421;WS=75923403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,47:0.43:110
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chr2	75933858	rs34446032	A	G	353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.746;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=201;ReadPosRankSum=-0.680;SC=AACACATGGCATATGTATAAT;SOR=0.116;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=15;WE=75933866;WS=75933848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr2	75937801	rs10177030	C	T	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=204;ReadPosRankSum=3.341;SC=GGGCCCCGAACCCGGTGGGGC;SOR=0.595;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=53;TCF=37;TCR=16;TR=22;WE=75937809;WS=75937791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,27:0.44:61
chr2	77748604	rs113233659	TA	T	833.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=4.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.33;MQRankSum=1.546;QD=8.78;ReadPosRankSum=0.904;SOR=1.290;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,44:0.46:95
chr2	79253028	rs3816371	G	T	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.590;HP=1;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=711;ReadPosRankSum=-1.191;SC=GTACTGGGAGGTCTCAGGGAT;SOR=2.124;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=16;WE=79253037;WS=79253018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr2	79253029	rs385742	T	G	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.698;HP=2;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=627;ReadPosRankSum=0.162;SC=TACTGGGAGGTCTCAGGGATG;SOR=0.067;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=16;WE=79253037;WS=79253018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr2	79253150	rs369967	A	G	3040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.991;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=52;PP=1865;ReadPosRankSum=0.103;SC=AGGCAGTAGGATATCTGTGTG;SOR=0.769;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=223;TCF=132;TCR=91;TR=127;WE=79253158;WS=79253140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,138:0.57:244
chr2	79253375	rs425846	C	T	1248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.645;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=40;PP=884;ReadPosRankSum=0.548;SC=CTGTGTGTCACGTGAGGTAAT;SOR=1.000;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=108;TCF=32;TCR=76;TR=55;WE=79253383;WS=79253365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,57:0.49:116
chr2	79253818	rs412912	C	G	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=424;ReadPosRankSum=-0.100;SC=ATTTTACTCTCTCCCTTTTCT;SOR=0.784;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=34;TCF=24;TCR=10;TR=22;WE=79253826;WS=79253808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,28:0.65:43
chr2	79253987	.	ATAGGGGAAAGTCCATG	ACCATG,A	672.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.47;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=3;PP=741;SC=GTTGGAGGTGATAGGGGAAAG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=79254013;WS=79253977;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:16
chr2	79254000	.	CATGCA	C	915.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.69;QD=61.05;SOR=4.047;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	79254029	rs34088535	C	CA	1799.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=3;PP=1461;SC=GGAGGGTCTCCTTCAGGAGAG;SOR=3.716;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=35;TCR=3;TR=36;WE=79254037;WS=79254019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr2	79254065	rs431912	C	T	5121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=119;NR=35;PP=2965;SC=GATGAACACGCTTATCTTTCA;SOR=2.250;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=154;TCF=119;TCR=35;TR=154;WE=79254073;WS=79254055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr2	79254101	rs396461	T	G	11287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=399;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=219;NR=122;PP=2965;SC=ACCTACCTTTTCCCTGCCCTC;SOR=1.228;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=341;TCF=219;TCR=122;TR=341;WE=79254109;WS=79254091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,399:1.00:399
chr2	79254261	rs452267	T	C	8657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=179;PP=2965;SC=GTAACAGCTATTCATACATCT;SOR=1.649;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=270;TCF=91;TCR=179;TR=270;WE=79254269;WS=79254251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,306:1.00:306
chr2	79254771	rs77260235	G	C	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=197;ReadPosRankSum=-0.312;SC=GCAATGAGGAGTTAAGGAAAA;SOR=0.793;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=11;WE=79254779;WS=79254761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr2	79255426	rs383969	G	C	3632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=69;PP=2293;SC=TCAGCAGCCTGAGCTTGGCGT;SOR=1.187;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=47;TCR=69;TR=116;WE=79255434;WS=79255416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr2	79312414	rs3739144	G	A	2187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.416;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=51;PP=1418;ReadPosRankSum=-0.068;SC=TGAATCCTATGGTACAATGAG;SOR=0.650;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=294;TCF=161;TCR=133;TR=106;WE=79312422;WS=79312404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:209,120:0.36:329
chr2	79313815	rs2073445	G	T	703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.847;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=11;PP=480;ReadPosRankSum=2.593;SC=TGGGAAGTTTGGGACCAGTGG;SOR=0.824;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=77;TCF=52;TCR=25;TR=34;WE=79313823;WS=79313805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,36:0.41:88
chr2	79313990	rs62640882	C	T	1311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.37;ReadPosRankSum=-0.312;SOR=0.695;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,67:0.48:140
chr2	79314081	rs6738657	T	C	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=21;PP=1070;ReadPosRankSum=0.972;SC=AAGGAGATAATTAAGAAAGAA;SOR=0.708;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=60;TCF=17;TCR=43;TR=30;WE=79314102;WS=79314071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,28:0.47:59
chr2	79314094	rs6723688	G	T	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.331;HP=2;HapScore=4;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=1070;ReadPosRankSum=0.294;SC=AGAAAGAATCGCAGGGCAAGG;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=11;TCR=33;TR=24;WE=79314102;WS=79314071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,22:0.50:44
chr2	79348129	.	GAA	G	444.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.693;ClippingRankSum=0.000;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=6.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQRankSum=1.146;QD=14.82;ReadPosRankSum=0.675;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr2	79349372	rs283891	C	G	588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=19;PP=526;SC=GTTTACAGATCCTCTAATGTC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=79349380;WS=79349362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	79350347	rs12228	A	G	10863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=397;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=197;NR=161;PP=2965;SC=ACTAGAGGCAACTGGAAAATA;SOR=0.874;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=359;TCF=198;TCR=161;TR=358;WE=79350355;WS=79350337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,395:1.00:395
chr2	79385758	rs80188986	A	C	2008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.027;HP=3;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-5.324;NF=32;NR=38;PP=1488;ReadPosRankSum=1.511;SC=CACCTCCAACACCACATCTAA;SOR=0.916;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=187;TCF=87;TCR=100;TR=70;WE=79385766;WS=79385756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,99:0.43:228
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chr2	79386058	rs2272109	G	A	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=73;ReadPosRankSum=-1.368;SC=CAAAATAGCCGTAGTAAATGG;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=5;WE=79386066;WS=79386048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
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chr2	79750543	rs10205858	C	T	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=110;ReadPosRankSum=0.015;SC=TCCACACTGGCTCAAAAACAT;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=6;WE=79750551;WS=79750533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr2	79914570	.	CT	C	62.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.14;ReadPosRankSum=2.073;SOR=0.963;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr2	80801346	rs2228460	T	C	3237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=68;NR=41;PP=2104;SC=GTGCCAACGTTCCTCAACCGT;SOR=1.085;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=68;TCR=41;TR=109;WE=80801354;WS=80801336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr2	80809027	rs17019401	C	G	662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=20;PP=545;SC=AAACTCCAGACACGTGGTACC;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=80809035;WS=80809017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	80831481	rs2302875	G	A	617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=20;PP=516;SC=AGTGGCAAACGTAGATTTAGC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=80831489;WS=80831471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	84518438	rs1968722	T	C	3315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=64;PP=2013;SC=TTTTTTCCAGTCAGCAGCCTC;SOR=1.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=110;TCF=46;TCR=64;TR=110;WE=84518446;WS=84518428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr2	84650707	rs2832	A	G	1375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=40;NR=7;PP=976;SC=TGGTGAAAACATCTTAATTCA;SOR=3.171;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=40;TCR=7;TR=47;WE=84650715;WS=84650697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr2	84676163	rs10202632	C	A	1844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=39;PP=1149;SC=TTTACACTTACACAAAATCTA;SOR=1.508;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=23;TCR=39;TR=62;WE=84676171;WS=84676153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr2	84755996	rs35980296	A	AT,ATTT	993.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.86;ReadPosRankSum=1.978;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:2,19,16:0.51,0.43:37
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chr2	84756341	rs4832090	T	G	257.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=257;SC=AAATAAGATTTCACATATTAT;SOR=3.056;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=84756349;WS=84756331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	84771480	rs1037863	G	A	5677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=96;NR=92;PP=2965;SC=AGGAATATCTGTATCACAGAG;SOR=0.760;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=188;TCF=96;TCR=92;TR=188;WE=84771488;WS=84771470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr2	84771567	rs1542477	C	T	4127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=63;NR=69;PP=2015;SC=ATGTCCGCTCCAAGAAAATCA;SOR=1.008;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=132;TCF=63;TCR=69;TR=132;WE=84771575;WS=84771557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr2	84775673	rs60315854	A	T	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.750;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=133;ReadPosRankSum=1.026;SC=ATATCAAAGCATCATGTTGTA;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=8;WE=84775681;WS=84775663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr2	84800605	rs11891970	C	A	4398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.561;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=64;PP=2689;ReadPosRankSum=-0.625;SC=CCATTCAGGCCGCATTTGAAT;SOR=0.641;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=156;TCF=92;TCR=64;TR=156;WE=84800613;WS=84800595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,167:0.99:168
chr2	84806553	rs6547569	G	A	652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=1;PP=405;SC=TGCTTCCAATGCCTGCTGATT;SOR=3.912;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=84806561;WS=84806543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	84822715	rs6761632	C	T	1347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=6;PP=957;SC=TATTTCAAACCTGACTTTTAC;SOR=2.935;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=43;TCF=37;TCR=6;TR=42;WE=84822723;WS=84822705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr2	84834063	rs4276039	T	C	7539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=156;NR=105;PP=2965;SC=GCACAAATACTGGGTGCTGCA;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=264;TCF=158;TCR=106;TR=261;WE=84834071;WS=84834053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,283:1.00:283
chr2	84834237	rs4441485	T	C	4601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=110;PP=2784;SC=AGAATAATTTTGATTCATACA;SOR=1.886;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=158;TCF=48;TCR=110;TR=158;WE=84834245;WS=84834227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr2	84896628	rs17708884	G	A	1426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.554;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=44;PP=968;ReadPosRankSum=0.264;SC=TAACTGGAGTGGGCAAGGTAG;SOR=0.752;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=177;TCF=67;TCR=110;TR=67;WE=84896636;WS=84896618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,74:0.36:205
chr2	84897361	rs12470102	T	A	390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=1;PP=314;SC=TCTCTTTTTATCCTGTTTCTT;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=84897369;WS=84897351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	84897517	rs1881095	A	G	3112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=56;NR=44;PP=1614;SC=CTGTTTATCTAAATTTTTCTG;SOR=0.710;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=56;TCR=44;TR=100;WE=84897525;WS=84897507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr2	84899360	rs4832106	G	A	762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=5;PP=509;SC=CCTGTAGGATGTCATTGAGTC;SOR=2.753;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=25;WE=84899368;WS=84899350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	85108252	rs34667238	G	GC	408.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.06;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	85360828	.	GGGC	G	450.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.303;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=1.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.43;MQRankSum=1.041;QD=18.03;ReadPosRankSum=0.844;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
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chr2	85553784	rs1044973	C	T	1517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=38;PP=1012;ReadPosRankSum=-1.934;SC=CCGAAAGTGTCCCTTCACGGT;SOR=0.667;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=200;TCF=94;TCR=106;TR=74;WE=85553792;WS=85553774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,79:0.35:224
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chr2	85570942	rs9309620	G	C	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.826;NF=4;NR=14;PP=282;ReadPosRankSum=0.185;SC=AAAGGGTGGGGCAGGCATGTG;SOR=0.711;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=42;TCF=10;TCR=32;TR=18;WE=85570950;WS=85570932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,19:0.41:46
chr2	85571710	rs4832171	A	G	802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.145;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.339;NF=33;NR=5;PP=577;ReadPosRankSum=1.118;SC=ACACACGTGCACCTTACGCCT;SOR=1.055;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=75;TCF=62;TCR=13;TR=38;WE=85571718;WS=85571700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,38:0.50:76
chr2	85573033	rs908302	G	A	2725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.422;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=63;PP=1666;ReadPosRankSum=1.403;SC=ACACGGAGCAGGTTGGCTCCA;SOR=0.647;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=268;TCF=126;TCR=142;TR=118;WE=85573041;WS=85573023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,132:0.44:303
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chr2	85589223	rs368398168	TA	T	145.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=1.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.20;MQRankSum=1.613;QD=2.80;ReadPosRankSum=1.143;SOR=0.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,15:0.29:52
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chr2	85662650	rs6547618	A	G	1236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.840;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=31;PP=849;ReadPosRankSum=-1.495;SC=GGTCTTCTCCAAAACCCCTTT;SOR=0.966;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=85;TCF=38;TCR=47;TR=53;WE=85662658;WS=85662640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,54:0.63:86
chr2	85766545	rs2289972	C	T	755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.735;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=25;PP=486;ReadPosRankSum=1.727;SC=GGGCAGAAGGCAGCGCCAAGG;SOR=0.972;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=102;TCF=37;TCR=65;TR=37;WE=85766553;WS=85766535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,39:0.38:104
chr2	85769246	rs1078005	G	A	1732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=12;PP=1271;SC=ATTGTTTGGTGTGATGTTCTG;SOR=2.262;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=41;TCR=12;TR=53;WE=85769254;WS=85769236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr2	85769711	rs1078004	C	G	1210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=26;PP=769;ReadPosRankSum=0.259;SC=TGACTGGACGCAAAATCATTG;SOR=0.704;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=201;TCF=113;TCR=88;TR=61;WE=85769719;WS=85769701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,69:0.31:221
chr2	85769975	rs2043675	A	G	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.064;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=9;PP=401;ReadPosRankSum=-0.249;SC=TTATACAAGTATATGGGTCTT;SOR=0.874;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=51;TCF=30;TCR=21;TR=24;WE=85769983;WS=85769965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,24:0.48:50
chr2	85777270	rs2028898	G	A	776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=23;PP=519;ReadPosRankSum=-1.792;SC=GGAAAAAGCCGACCAAGTTCA;SOR=0.598;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=31;TCR=56;TR=36;WE=85777278;WS=85777260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,38:0.40:94
chr2	85777633	rs11676382	C	G	1354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.854;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=17;PP=823;ReadPosRankSum=1.017;SC=AGTTACCAAGCTTGCCAACAT;SOR=0.511;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=83;TCF=57;TCR=26;TR=53;WE=85777641;WS=85777623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,58:0.63:92
chr2	85780131	rs2592551	G	A	3655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=426;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=84;PP=2109;ReadPosRankSum=-0.286;SC=GCTGGTGGGAGCGGGAGTGCA;SOR=0.687;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=395;TCF=205;TCR=190;TR=174;WE=85780139;WS=85780121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:236,189:0.44:425
chr2	85780536	rs699664	C	T	1730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=45;PP=1068;ReadPosRankSum=1.256;SC=TTGCAACCTTCGGGGGCAGTA;SOR=0.721;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=217;TCF=102;TCR=115;TR=83;WE=85780544;WS=85780526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,92:0.38:239
chr2	85781318	rs1254896	T	G	6124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.98;NF=112;NR=97;PP=2965;SC=CAAAGAACAGTCCAATGGATC;SOR=0.782;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=209;TCF=112;TCR=97;TR=209;WE=85781326;WS=85781308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr2	85788140	rs1254898	C	T	2126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.315;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=50;PP=1218;ReadPosRankSum=0.908;SC=AATATGTGTGCGGGGGTGGGC;SOR=0.575;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=140;TCF=53;TCR=87;TR=82;WE=85788148;WS=85788130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,96:0.60:160
chr2	85788175	rs7568458	T	A	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=449;ReadPosRankSum=-2.054;SC=AAGAAATCACTGCACCAACAG;SOR=0.791;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=81;TCF=23;TCR=58;TR=29;WE=85788183;WS=85788165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,32:0.36:90
chr2	85788402	rs55829881	AC	A	285.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.81;ReadPosRankSum=-0.126;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,14:0.82:17
chr2	85788738	rs115669754	C	A	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=1.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.18;ReadPosRankSum=-0.300;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,7:0.19:37
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chr2	85806266	rs3731828	C	T	1130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.25;ReadPosRankSum=-0.877;SOR=0.723;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,63:0.40:156
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chr2	85820301	rs1049363	A	T	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.511;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=14;PP=253;ReadPosRankSum=0.289;SC=CCTGAAGGAGAAGCCAAATGG;SOR=0.343;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=60;TCF=26;TCR=34;TR=27;WE=85820309;WS=85820291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,28:0.43:65
chr2	85823167	rs35880310	TG	T	152.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.197;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=158;ReadPosRankSum=-0.098;SC=TGGGCCGGCCTGGGGCAAGGG;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=6;WE=85823175;WS=85823157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr2	85824039	rs1127974	G	A	2579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.432;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=64;PP=1684;ReadPosRankSum=0.635;SC=GCTGCATTCTGCCCTGGCTAA;SOR=0.842;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=286;TCF=148;TCR=138;TR=125;WE=85824047;WS=85824029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:189,132:0.41:321
chr2	85824084	rs2232748	G	C	2270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.244;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=55;PP=1682;ReadPosRankSum=-0.119;SC=AGCTCTCACCGTGCCCTGGGC;SOR=0.808;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=272;TCF=141;TCR=131;TR=108;WE=85824092;WS=85824074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:186,112:0.38:298
chr2	85826132	rs1044158	G	A	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.241;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=22;ReadPosRankSum=0.052;SC=TTTTTGGTACGAAATAAATGG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=3;WE=85826140;WS=85826122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr2	85826721	rs11891495	G	A	2880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=359;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.807;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=64;PP=1749;ReadPosRankSum=0.457;SC=CCAGCGGGGCGGTGGCCCCTT;SOR=0.637;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=329;TCF=173;TCR=156;TR=130;WE=85826729;WS=85826711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:211,148:0.41:359
chr2	85828014	rs6733550	T	G	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.035;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=219;ReadPosRankSum=2.300;SC=ACAGTAACTGTCAAGTAGTGT;SOR=0.498;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=57;TCF=42;TCR=15;TR=20;WE=85828022;WS=85828004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,23:0.36:64
chr2	85890758	rs2304566	T	C	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.505;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=19;PP=497;ReadPosRankSum=1.149;SC=AGAGCAGGCATTGGGCTAAGG;SOR=0.957;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=120;TCF=61;TCR=59;TR=36;WE=85890779;WS=85890748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,37:0.29:126
chr2	85890771	rs893159	T	G	4433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=62;PP=2962;SC=GGCTAAGGAGTGGGCAGTGGG;SOR=0.722;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=133;TCF=71;TCR=62;TR=133;WE=85890779;WS=85890748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr2	85893741	rs1130866	G	A	7538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=154;NR=117;PP=2965;ReadPosRankSum=1.781;SC=AGCCCTCACAGTCTGGTTCTG;SOR=0.960;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=273;TCF=155;TCR=118;TR=271;WE=85893749;WS=85893731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,284:0.99:286
chr2	85894308	rs3024798	G	T	826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FS=4.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.99;ReadPosRankSum=-1.068;SOR=0.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:153,54:0.26:207
chr2	85895338	rs2077079	T	G	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=10;PP=223;ReadPosRankSum=0.274;SC=CCCTGCTTGGTGCATGGCCCC;SOR=0.776;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=39;TCF=20;TCR=19;TR=19;WE=85895346;WS=85895328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,23:0.44:52
chr2	85981761	rs17851881	T	C	1367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.669;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=26;PP=791;ReadPosRankSum=-0.385;SC=GAGCCGGGTCTGCGTCCTCGC;SOR=0.395;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=103;TCF=64;TCR=39;TR=59;WE=85981769;WS=85981751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,64:0.57:113
chr2	86107840	rs11127008	G	A	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=50;ReadPosRankSum=1.803;SC=CCAGCTACTCGGGAGGCTGAG;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=4;WE=86107848;WS=86107830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr2	86107951	rs34410645	GA	G	558.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.73;ReadPosRankSum=1.264;SOR=0.826;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,31:0.48:64
chr2	86107987	rs11127009	T	C	789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.762;HP=7;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=17;PP=510;ReadPosRankSum=2.915;SC=TTTTAAAAAATAGACAAGTAG;SOR=0.676;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=76;TCF=41;TCR=35;TR=37;WE=86107995;WS=86107977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,42:0.49:85
chr2	86259443	rs2276626	C	T	4237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=347;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.196;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=82;PP=2410;ReadPosRankSum=0.588;SC=CATCGGCGTCCCCCTCCTCAG;SOR=0.688;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=306;TCF=158;TCR=148;TR=178;WE=86259451;WS=86259433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,203:0.59:343
chr2	86272758	rs1561328	G	A	1724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.261;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=36;PP=1208;ReadPosRankSum=-0.063;SC=TGATGCCGGTGAGGAACCTGC;SOR=0.581;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=146;TCF=84;TCR=62;TR=81;WE=86272766;WS=86272748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,85:0.54:157
chr2	86292656	rs311563	C	T	1986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.228;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=59;PP=1293;ReadPosRankSum=0.809;SC=AATCCCTAATCGCCTGCCTGG;SOR=0.491;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=206;TCF=70;TCR=136;TR=95;WE=86292664;WS=86292646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,98:0.45:218
chr2	86302103	rs3815840	A	G	44.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.20;ReadPosRankSum=0.319;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr2	86304926	rs73947323	G	A	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.385;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=24.68;ReadPosRankSum=1.893;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr2	86304936	rs373790562	A	G	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=24.68;ReadPosRankSum=1.383;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr2	86305123	rs2288117	T	C	4292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=61;PP=2824;SC=AGAAAAAAGGTCATAAAAAAC;SOR=0.920;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=146;TCF=85;TCR=61;TR=144;WE=86305131;WS=86305113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr2	86305534	rs74607112	T	C	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=331;ReadPosRankSum=-0.427;SC=CCTCTGAACCTGACAGATCAG;SOR=0.631;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=5;TCR=34;TR=22;WE=86305542;WS=86305524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,22:0.56:39
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chr2	86315741	rs2288120	C	T	897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.693;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=16;PP=591;ReadPosRankSum=-0.155;SC=TGGCTGGAAACGTGATAGTCA;SOR=0.812;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=124;TCF=82;TCR=42;TR=48;WE=86315749;WS=86315731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,50:0.37:134
chr2	86317037	rs4832242	G	C	1811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.268;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=39;PP=1201;ReadPosRankSum=-0.329;SC=GAGGGATCGGGATTTTCTTCC;SOR=0.554;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=211;TCF=116;TCR=95;TR=81;WE=86317045;WS=86317027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,90:0.38:235
chr2	86332809	rs4832245	G	A	2504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.865;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=43;PP=1509;ReadPosRankSum=-0.482;SC=CACGCTACCCGACCAACTCCT;SOR=0.748;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=309;TCF=187;TCR=122;TR=115;WE=86332817;WS=86332785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:202,130:0.39:332
chr2	86334199	rs2367201	G	A	1688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=22;PP=1046;ReadPosRankSum=1.126;SC=TATAAGTGGGGTATGTAATTT;SOR=0.656;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=157;TCF=110;TCR=47;TR=70;WE=86334207;WS=86334189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,77:0.45:173
chr2	86334386	rs3810827	A	G	3510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.003;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=86;PP=2094;ReadPosRankSum=0.134;SC=CTTCCTCAGCATCCGTTCTCA;SOR=0.602;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=233;TCF=89;TCR=144;TR=141;WE=86334394;WS=86334376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,157:0.60:262
chr2	86343476	rs4832022	C	A	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=71;ReadPosRankSum=-0.450;SC=TTGGGTGACACAGCAAGACAC;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=5;WE=86343484;WS=86343466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr2	86343494	rs4832248	G	A	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.825;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=95;ReadPosRankSum=0.265;SC=CACCCTCTCTGCAAAAAATTT;SOR=0.016;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=10;WE=86343502;WS=86343484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr2	86344095	rs3764949	G	T	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=72;ReadPosRankSum=0.842;SC=TTTTTGTGAGGGGGGAGAAAT;SOR=0.307;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=6;WE=86344103;WS=86344087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr2	86344367	rs2059353	T	C	785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=20;PP=562;SC=TTTCAGTAGCTATTTGAATAC;SOR=2.753;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=25;WE=86344375;WS=86344357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	86346180	rs2303339	G	A	3022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.003;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=70;PP=1954;ReadPosRankSum=-0.588;SC=GACTGAGTTCGATTAAAGCCC;SOR=0.914;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=212;TCF=104;TCR=108;TR=130;WE=86346188;WS=86346170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,138:0.60:230
chr2	86346308	rs6715623	G	A	632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=19;PP=485;SC=TATATTTTTAGTAGTTTATTT;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=86346316;WS=86346298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	86352010	rs4832250	G	T	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=271;ReadPosRankSum=0.012;SC=ATAATGTATAGAAAGTACTTG;SOR=0.716;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=31;TCR=10;TR=20;WE=86352018;WS=86352000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,22:0.47:47
chr2	86352037	rs75544197	A	G	927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.099;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=9;PP=516;ReadPosRankSum=-0.886;SC=TGCCTAGAACATAATAAACCG;SOR=1.077;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=71;TCF=49;TCR=22;TR=38;WE=86352045;WS=86352027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,45:0.56:81
chr2	86352522	.	G	A	2173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.350;ClippingRankSum=0.000;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.981;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=33;PP=1168;ReadPosRankSum=-0.466;SC=GGACAGAAATGTGCAAGGACT;SOR=0.907;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=150;TCF=89;TCR=61;TR=90;WE=86352530;WS=86352512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,101:0.60:167
chr2	86352785	rs4618054	G	A	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.785;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=14;PP=390;ReadPosRankSum=0.099;SC=GAGATCCAGAGAGGAGAGTAG;SOR=0.476;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=94;TCF=45;TCR=49;TR=29;WE=86352793;WS=86352775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,30:0.30:101
chr2	86352825	rs6740228	C	T	785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.652;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=15;ReadPosRankSum=-0.337;SC=TGTGATTAGTCAAGGGACACA;SOR=1.043;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=110;TCF=63;TCR=47;TR=39;WE=86352833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,41:0.33:123
chr2	86357960	.	ATT	A	46.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.718;ClippingRankSum=-0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.40;MQRankSum=-0.566;QD=6.68;ReadPosRankSum=1.718;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr2	86359405	rs1559515	G	T	1771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.664;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=28;PP=966;ReadPosRankSum=0.910;SC=GGCTGACAGGGTATCAGAGTG;SOR=0.818;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=202;TCF=125;TCR=77;TR=80;WE=86359413;WS=86359395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,94:0.42:224
chr2	86360573	rs2241437	T	G	4503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.372;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=113;PP=2877;ReadPosRankSum=-2.057;SC=AGTTTTACTTTTTATGTGTCC;SOR=0.617;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=306;TCF=128;TCR=178;TR=193;WE=86360581;WS=86360563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,203:0.62:328
chr2	86362204	rs7606421	C	T	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.698;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=290;ReadPosRankSum=-0.156;SC=CATTTGGCCACATAACACGTA;SOR=2.055;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=47;TCF=10;TCR=37;TR=18;WE=86362212;WS=86362194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,19:0.38:50
chr2	86363074	rs3770069	A	G	1643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.391;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=30;PP=875;ReadPosRankSum=-1.385;SC=TTTGTCCTGCATGTGGCAGGC;SOR=0.882;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=197;TCF=116;TCR=81;TR=82;WE=86363082;WS=86363064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,89:0.42:213
chr2	86363855	rs7558040	G	C	618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=13;PP=416;SC=TATCTGTGTTGACGGATCATC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=86363863;WS=86363845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	86364706	rs56274257	TG	T	1280.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=34;PP=1333;SC=GGAGCAGCAATGGGTCTCACC;SOR=5.838;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=34;WE=86364714;WS=86364696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
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chr2	86400824	rs1050301	G	A	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=14;PP=392;ReadPosRankSum=0.153;SC=TGTGAGGCAGGCTGTTTAGAT;SOR=0.719;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=91;TCF=57;TCR=34;TR=36;WE=86400832;WS=86400814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,38:0.38:100
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chr2	86479035	rs12988844	A	G	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.468;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=1;PP=38;ReadPosRankSum=0.319;SC=AGGGCACACTAGAGGGACTGA;SOR=0.105;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=4;WE=86479043;WS=86479025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
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chr2	86481835	rs2276625	C	T	927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.356;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=13;PP=640;ReadPosRankSum=0.190;SC=TTGAAGATAGCGTGGGATGTA;SOR=0.942;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=140;TCF=98;TCR=42;TR=47;WE=86481843;WS=86481825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,50:0.32:155
chr2	86491245	rs1863056	C	T	1631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=45;PP=929;ReadPosRankSum=-0.876;SC=CAGGCCCCGGCGGCAGATACG;SOR=0.713;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=193;TCF=80;TCR=113;TR=74;WE=86491253;WS=86491231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,86:0.40:217
chr2	86509267	rs1863058	G	A	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=1.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.74;ReadPosRankSum=0.895;SOR=0.926;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:102,33:0.24:135
chr2	86509388	rs1863059	T	G	713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.727;HP=8;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=19;PP=411;ReadPosRankSum=1.153;SC=GAGACAAAAATAAATACGATT;SOR=0.814;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=111;TCF=53;TCR=58;TR=36;WE=86509396;WS=86509378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,40:0.34:119
chr2	86683642	rs2030259	A	G	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.018;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=11;PP=283;ReadPosRankSum=-1.494;SC=AGCAACCGTTATAAATGGAAA;SOR=0.465;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=58;TCF=33;TCR=25;TR=24;WE=86683650;WS=86683632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,25:0.42:59
chr2	86691250	rs12714187	G	A	1854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.479;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.04;MQRankSum=-0.822;NF=49;NR=37;PP=1046;ReadPosRankSum=1.357;SC=GCTGTACTGCGGCAACTCCAC;SOR=0.647;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=217;TCF=122;TCR=95;TR=86;WE=86691258;WS=86691240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,98:0.41:240
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chr2	86737649	rs966477	G	A	1376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=33;PP=771;ReadPosRankSum=1.365;SC=GGATGGAATAGAGAGAGACAG;SOR=0.705;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=179;TCF=80;TCR=99;TR=63;WE=86737657;WS=86737639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,72:0.36:198
chr2	86756209	rs1036940	C	G	36.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr2	86756280	rs9284788	G	A	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.043;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=310;ReadPosRankSum=2.434;SC=CAAGGAACCCGTGTTGATAAT;SOR=2.419;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=17;WE=86756288;WS=86756270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr2	86850022	rs396354	T	C	989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.296;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=29;PP=682;ReadPosRankSum=0.952;SC=TCCCTGGAGTTTCCTCTCTTT;SOR=0.497;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=124;TCF=48;TCR=76;TR=49;WE=86850030;WS=86850012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,52:0.37:140
chr2	86947783	rs76239019	C	T	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-5.046;NF=11;NR=6;PP=196;ReadPosRankSum=0.573;SC=AGCGCCGCCGCCTCCGGCATG;SOR=0.741;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=44;TCF=30;TCR=14;TR=17;WE=86947791;WS=86947773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,16:0.35:46
chr2	86979093	rs10186663	G	A	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.924;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=8;PP=278;ReadPosRankSum=0.245;SC=TTCTCAATGAGGTGATGGTGG;SOR=0.821;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=66;TCF=39;TCR=27;TR=21;WE=86979101;WS=86979083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,24:0.32:75
chr2	86992337	rs3840984	T	TAA	891.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=1.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.26;MQRankSum=2.970;QD=7.69;ReadPosRankSum=1.050;SOR=0.889;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,30:0.26:116
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chr2	87015633	rs71378806	T	TGA	1309.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.812;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=737;ReadPosRankSum=-0.526;SC=GTGAGCAGGCTGAGTTCAAAA;SOR=0.857;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=70;TCF=44;TCR=26;TR=20;WE=87015641;WS=87015623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,37:0.31:121
chr2	87042825	rs35555413	T	C	1689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.800;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=36;PP=1138;ReadPosRankSum=-1.628;SC=GTTCCTGATATACCTTCCCCT;SOR=0.644;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=171;TCF=87;TCR=84;TR=75;WE=87042833;WS=87042815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,82:0.43:190
chr2	87048702	rs13001400	T	G	1809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=11;PP=1400;SC=CCGAGTTCGGTTGTTGCTGTA;SOR=2.722;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=49;TCR=11;TR=60;WE=87048710;WS=87048692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr2	87069379	rs4322832	G	A	844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.29;QD=30.17;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	87069431	rs4514875	C	T	1786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.31;QD=28.82;SOR=1.057;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr2	87073743	rs4971887	A	G	1183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.92;QD=30.35;SOR=2.362;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr2	87085598	rs28727404	T	C	208.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.68;QD=26.10;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
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chr2	88387557	rs1542087	A	C	2345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=390;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.385;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=52;PP=1257;ReadPosRankSum=-0.007;SC=CAGAGCCAGCAGTTCAGCATG;SOR=0.717;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=356;TCF=193;TCR=163;TR=118;WE=88387565;WS=88387547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:256,133:0.34:389
chr2	88395989	rs2197077	G	C	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.007;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.44;ReadPosRankSum=1.352;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
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chr2	88396120	rs2919882	G	A	1509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=1.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.62;ReadPosRankSum=-0.637;SOR=0.844;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:112,45:0.29:157
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chr2	88396174	rs2919881	T	C	1448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FS=0.994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.39;ReadPosRankSum=-0.307;SOR=0.766;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:182,87:0.32:269
chr2	88402511	rs1866946	C	A	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.265;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=178;ReadPosRankSum=1.318;SC=AAGATGGCAACTATTCAAAGG;SOR=4.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=27;TCR=10;TR=10;WE=88402519;WS=88402501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,10:0.25:40
chr2	88402560	rs894197	G	A	562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.098;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=11;PP=414;ReadPosRankSum=0.442;SC=CTAGCTCAATGTGTCTCTCTT;SOR=1.190;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=95;TCF=57;TCR=38;TR=32;WE=88402568;WS=88402550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,32:0.31:103
chr2	88406108	rs2919862	C	T	609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.83;ReadPosRankSum=-1.113;SOR=0.749;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,29:0.47:62
chr2	88407959	rs2970918	T	C	2528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=360;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.279;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=68;PP=1337;ReadPosRankSum=-0.658;SC=CCAACTGGCATGCTGGTAACA;SOR=0.787;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=343;TCF=165;TCR=178;TR=128;WE=88407967;WS=88407949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:222,138:0.38:360
chr2	88409719	.	A	AGTGTGTGTGT,AGAGTGTGTGTGT	53.25	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.17;DP=1;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=4;NR=1;PP=137;SC=TTGATGAATGAGTGTGTGTGT;SOR=1.609;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=88409727;WS=88409709;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:1
chr2	88410102	rs2289497	C	G	2250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=60;PP=1710;SC=GTGGGTCTCTCGGGAGACCCC;SOR=3.228;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=12;TCR=60;TR=72;WE=88410110;WS=88410092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr2	88411605	rs2919865	A	T	2861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.446;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=52;PP=1744;ReadPosRankSum=-1.412;SC=TGTTTGAAGAATTTCCTTTCT;SOR=0.552;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=306;TCF=191;TCR=115;TR=132;WE=88411613;WS=88411595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,145:0.44:328
chr2	88411793	rs2970888	C	A	3759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=89;PP=2541;SC=CTGCTAAGCCCCTGGTCATTT;SOR=2.321;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=30;TCR=89;TR=119;WE=88411801;WS=88411783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr2	88422758	rs2197076	G	A	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.178;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=30;ReadPosRankSum=0.832;SC=TCAAAAATTCGTCTGGTTTCC;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=4;WE=88422766;WS=88422748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr2	88424066	rs2241883	T	C	3856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.729;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=68;PP=2450;ReadPosRankSum=0.295;SC=TTTTTGAAAGTTGTCACCAGT;SOR=0.879;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=254;TCF=142;TCR=112;TR=160;WE=88424074;WS=88424056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,174:0.63:277
chr2	88472791	rs4129190	G	A	882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=20;PP=553;ReadPosRankSum=-1.402;SC=TTGGACAGAGGGACCCTGTGC;SOR=0.750;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=106;TCF=58;TCR=48;TR=43;WE=88472799;WS=88472781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,46:0.40:115
chr2	88474370	rs2139100	A	G	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=15;PP=363;ReadPosRankSum=-0.487;SC=TTTGGGGCACAAACGCAGAAT;SOR=0.746;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=90;TCF=41;TCR=49;TR=26;WE=88474378;WS=88474360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,28:0.28:100
chr2	88484808	rs2292869	C	A	945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=1.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.11;ReadPosRankSum=-0.152;SOR=0.521;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,53:0.40:133
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chr2	88747840	.	G	A	1188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.169;ClippingRankSum=0.000;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.737;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=28;PP=678;ReadPosRankSum=0.297;SC=GGAAAGGGCTGTAATAGGAAG;SOR=0.840;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=209;TCF=113;TCR=96;TR=66;WE=88747848;WS=88747830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,71:0.30:233
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chr2	88826219	rs56783496	G	A	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=121;ReadPosRankSum=0.831;SC=GTCTTACTCTGTCACCCAGGC;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=7;WE=88826227;WS=88826209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr2	88870632	rs4972221	A	T	985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=24;PP=720;SC=ATTATTTAAAAGACTACAAAG;SOR=2.049;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=33;WE=88870640;WS=88870622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr2	88874891	rs1805165	C	A	6942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=116;PP=2965;SC=TCTTTTGTAGCGAAAGGATCC;SOR=0.845;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=224;TCF=108;TCR=116;TR=224;WE=88874899;WS=88874881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr2	88879131	rs1805164	T	C	6691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=140;PP=2965;SC=GTCCCAGGCATTGAATTGGCT;SOR=1.183;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=236;TCF=95;TCR=141;TR=235;WE=88879139;WS=88879121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr2	88895123	rs13045	T	C	9327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=350;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=174;NR=153;PP=2965;SC=TTCACGGTCTTGGTCCCACTG;SOR=0.740;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=328;TCF=175;TCR=153;TR=327;WE=88895131;WS=88895113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,350:1.00:350
chr2	88895351	rs7571971	T	C	5910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=105;PP=2965;SC=CATGAAGCAGTGCAGTCCATC;SOR=0.854;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=204;TCF=99;TCR=105;TR=204;WE=88895359;WS=88895341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr2	88926729	rs72416210	CCAGCAG	CCAG,C	1039.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;NF=3,3;NR=10,10;PP=660,44;SC=GCCGCGAGCCCCAGCAGCAGC;SOR=1.136;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=13,13;WE=88926742;WS=88926719;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:25
chr2	88997878	rs908277	C	T	1136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=0;PP=852;SC=GGCACAGTACCTGTCTTGTAC;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=30;WE=88997886;WS=88997868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr2	88999476	rs1158603	G	A	8054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=139;NR=131;PP=2965;SC=ATGACAAGAAGAATAAAGTAA;SOR=0.728;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=270;TCF=139;TCR=131;TR=270;WE=88999484;WS=88999466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,293:1.00:293
chr2	89160889	rs232224	G	T	2789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.046;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=60;PP=1676;ReadPosRankSum=-0.895;SC=ACAAGCTAGCGTCCTGTGGAA;SOR=0.778;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=275;TCF=139;TCR=136;TR=116;WE=89160897;WS=89160879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,136:0.43:314
chr2	89161322	rs232223	C	G	2516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=361;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.933;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=50;PP=1683;ReadPosRankSum=-1.755;SC=TGCAGAGTCACCTTATAGATC;SOR=0.857;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=329;TCF=186;TCR=143;TR=120;WE=89161330;WS=89161312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:228,132:0.37:360
chr2	89161547	rs232222	A	G	533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.190;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=429;ReadPosRankSum=1.176;SC=AGGTGTGGAAACCCTGAGGCT;SOR=1.961;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=42;TCF=7;TCR=35;TR=22;WE=89161555;WS=89161537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,22:0.51:43
chr2	89512775	rs145409842	T	G	459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=0;PP=507;SC=AACTTCCCAGTGAGCTTCAAA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=89512783;WS=89512769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	89512854	rs77255451	A	C	786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-1.196;NF=26;NR=11;PP=411;ReadPosRankSum=0.971;SC=GGCAGCCCAGACTCACACATC;SOR=0.630;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=120;TCF=83;TCR=37;TR=37;WE=89512862;WS=89512844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,43:0.33:132
chr2	90007670	rs2847917	G	A	2170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=13;PP=1569;SC=CTCTCAGTCCGGACACAGCAT;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=56;TCR=13;TR=69;WE=90007678;WS=90007660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr2	90008208	rs138920656	T	G	4293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=91;PP=2752;SC=GATGTGTGAGTCTGGGCTGCC;SOR=1.144;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=156;TCF=65;TCR=91;TR=155;WE=90008216;WS=90008198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr2	90008287	rs147071425	A	C	850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=25;PP=713;SC=TTTGAAGCTCACTGGGAAGTT;SOR=4.332;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=28;WE=90008295;WS=90008277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	90043509	rs201839533	C	T	213.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.38;QD=26.72;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	90108416	rs859744	G	A	1770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=12;PP=1085;SC=GGACATTCCCGTAATTTGCAT;SOR=1.963;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=58;TCF=46;TCR=12;TR=57;WE=90108424;WS=90108406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr2	90108778	rs859745	G	T	3040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=27;PP=1969;SC=TTGCTGTATGGTTTCAGCCTC;SOR=1.813;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=72;TCR=27;TR=99;WE=90108786;WS=90108768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr2	91766609	rs56138505	G	A	686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1029;ExcessHet=3.0103;FS=1.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.33;MQRankSum=-6.708;QD=0.68;ReadPosRankSum=1.948;SOR=0.929;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:870,143:0.14:1013
chr2	91766685	rs2258279	GA	TG	2037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FS=6.061;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.34;MQRankSum=-12.971;QD=7.49;ReadPosRankSum=-1.468;SOR=1.197;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:205,67:0.25:272
chr2	91767199	rs2558010	A	C	819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=5.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.113;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.084;NF=31;NR=0;PP=699;ReadPosRankSum=0.207;SC=AATTTGTGTCAGCTTATATTC;SOR=2.665;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=69;TCF=66;TCR=3;TR=31;WE=91767207;WS=91767189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,31:0.46:68
chr2	91767507	rs2580541	T	A	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FS=1.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=0.730;QD=1.05;ReadPosRankSum=-0.734;SOR=0.477;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:191,33:0.15:224
chr2	91809227	rs2536993	A	G	611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FS=11.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQRankSum=-8.087;QD=2.28;ReadPosRankSum=1.538;SOR=0.244;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:213,55:0.21:268
chr2	91809324	rs2536994	C	T	1099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1051;ExcessHet=3.0103;FS=5.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.80;MQRankSum=-27.375;QD=1.05;ReadPosRankSum=0.262;SOR=0.929;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:898,153:0.15:1051
chr2	91809385	rs55812636	C	G	2007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1067;ExcessHet=3.0103;FS=0.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.82;MQRankSum=-21.323;QD=1.88;ReadPosRankSum=2.589;SOR=0.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:946,120:0.11:1066
chr2	91809404	rs55918232	G	C	2401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=968;ExcessHet=3.0103;FS=0.809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.58;MQRankSum=-20.791;QD=2.48;ReadPosRankSum=-2.499;SOR=0.546;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:842,125:0.13:967
chr2	91809456	rs2191971	T	G	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=560;ExcessHet=3.0103;FS=5.698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQRankSum=-18.430;QD=0.84;ReadPosRankSum=2.294;SOR=0.301;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:484,75:0.13:559
chr2	91809468	.	C	CTAA	1816.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=0.000;DP=460;ExcessHet=3.0103;FS=10.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQRankSum=-19.017;QD=4.01;ReadPosRankSum=5.901;SOR=0.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:383,70:0.15:453
chr2	91809470	rs2386154	G	A	1832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=444;ExcessHet=3.0103;FS=7.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQRankSum=-18.741;QD=4.15;ReadPosRankSum=6.346;SOR=0.299;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:371,71:0.16:442
chr2	91809472	.	G	GTGACTAACAA	1806.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.000;DP=427;ExcessHet=3.0103;FS=6.579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQRankSum=-18.204;QD=4.25;ReadPosRankSum=6.759;SOR=0.319;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:355,70:0.16:425
chr2	91925022	rs28577290	C	A	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=1.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.03;MQRankSum=-1.690;QD=9.46;ReadPosRankSum=-1.344;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,24:0.46:52
chr2	91960776	rs372330500	AG	A	111.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.309;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5006;FS=2.398;HP=12;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=43;ReadPosRankSum=1.104;SC=GCCACTCTGGAGGGGGGGGGG;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=4;WE=91960784;WS=91960766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr2	95537871	rs377160464	GC	G	120.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=2.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.04;ReadPosRankSum=2.206;SOR=0.211;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr2	95539487	rs77715120	C	T	1015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=29;PP=596;ReadPosRankSum=-0.971;SC=GAGGTTCCGGCGCAGCCTGAG;SOR=0.725;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=29;TCR=60;TR=43;WE=95539495;WS=95539477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,48:0.49:98
chr2	95783701	.	GA	G	57.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.192;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.32;MQRankSum=-0.483;QD=1.99;ReadPosRankSum=-1.328;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,7:0.24:29
chr2	95818809	rs79435252	C	A	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=58;ReadPosRankSum=0.742;SC=AGCCCAGACACCACTAGCTCT;SOR=1.302;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=5;WE=95818817;WS=95818799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr2	95830737	rs11395151	C	CA	4506.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=37;PP=2329;SC=TGTGTACCCACAAAAACTTAA;SOR=0.952;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=25;TCR=39;TR=61;WE=95830745;WS=95830727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr2	95846158	rs3112230	T	C	581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=15;PP=418;SC=CAATAGCTTTTATTTTTTTCC;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=95846166;WS=95846148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	95847040	rs10578519	TGCG	T	9688.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=46;NR=85;PP=2973;SC=GACAAAGGCTTGCGGCGGCGA;SOR=0.934;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=164;TCF=57;TCR=107;TR=131;WE=95847050;WS=95847030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr2	95944902	rs61086044	A	AC	1184.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=20;PP=784;SC=GGTGCTGGGCACCGCAGGGTG;SOR=1.885;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=21;WE=95944910;WS=95944892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	95945568	rs7585914	G	A	2347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.09;SOR=0.935;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr2	95945830	rs7586229	G	T	822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=16;PP=464;SC=TCCCGGTGTGGCTGCCAGTGT;SOR=1.329;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=9;TCR=16;TR=25;WE=95945838;WS=95945820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	95947085	rs12992066	A	G	7302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=124;NR=131;PP=2965;ReadPosRankSum=0.844;SC=CTGGTGTGCCAGAGCTGGGAG;SOR=0.829;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=258;TCF=125;TCR=133;TR=255;WE=95947093;WS=95947075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,280:0.99:282
chr2	95952177	rs7602232	C	G	1937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=38;NR=25;PP=1141;SC=GGCTGGGTGACGGGTAGATGG;SOR=0.971;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=38;TCR=25;TR=63;WE=95952185;WS=95952167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr2	95952641	rs1006021	A	G	5457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=111;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.095;SC=GGTGGAGCACAGGGGCTGCAG;SOR=1.114;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=193;TCF=80;TCR=113;TR=190;WE=95952649;WS=95952631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,207:0.99:209
chr2	95963242	rs2248415	C	G	1756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.62;SOR=4.680;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr2	96012907	rs7602807	C	G	6551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=125;PP=2965;SC=CCGCCTCCGCCGCAGACCAGT;SOR=1.132;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=219;TCF=93;TCR=126;TR=218;WE=96012915;WS=96012897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr2	96048859	rs200310184	GCCCACCCGCCCATCCA	G	2046.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=14;NR=4;PP=2973;SC=AGTGGAGGGAGCCCACCCGCC;SOR=3.958;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=18;WE=96048882;WS=96048849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr2	96076409	rs6577014	C	T	1648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=39;PP=1277;SC=AGTTCTGACCCCACTCACCAA;SOR=1.493;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=21;TCR=39;TR=60;WE=96076417;WS=96076399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr2	96195504	rs75098566	A	G	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=69;ReadPosRankSum=2.099;SC=GCTAAAATCTATTTTACTAGT;SOR=0.954;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=6;WE=96195512;WS=96195494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
chr2	96601240	rs199988716	G	A	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=14.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.96;MQRankSum=-6.340;QD=4.79;ReadPosRankSum=-5.274;SOR=1.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,41:0.29:141
chr2	96601296	rs145876416	A	ATGATTAAT	1184.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FS=2.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.95;MQRankSum=-10.030;QD=5.15;ReadPosRankSum=3.043;SOR=0.918;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:160,70:0.30:230
chr2	96601312	rs201144574	G	A	1692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FS=1.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.12;MQRankSum=-10.376;QD=6.09;ReadPosRankSum=1.437;SOR=0.585;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:172,106:0.38:278
chr2	96601345	rs149389865	T	C	1435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.27;MQRankSum=-7.953;QD=8.16;ReadPosRankSum=-0.279;SOR=0.843;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,80:0.45:176
chr2	96601364	rs148485539	C	T	1454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FS=6.592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.13;MQRankSum=-6.694;QD=8.27;ReadPosRankSum=3.025;SOR=1.150;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:102,74:0.42:176
chr2	96604473	rs75003856	T	A	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.79;MQRankSum=-1.155;QD=2.95;ReadPosRankSum=-1.546;SOR=0.197;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,20:0.18:110
chr2	96604516	rs62154560	C	T	5942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=360;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.376;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-8.982;NF=181;NR=70;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.469;SC=CAAAAAACTACGAGCATTTTC;SOR=0.488;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=352;TCF=259;TCR=93;TR=251;WE=96604524;WS=96604506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,251:0.70:359
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chr2	96604632	rs62154562	A	T	10261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=763;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.810;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-15.484;NF=212;NR=302;PP=2962;ReadPosRankSum=-3.708;SC=AAATGTGATCACTGTCTTTCA;SOR=0.875;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=803;TCF=341;TCR=462;TR=514;WE=96604640;WS=96604622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:300,461:0.61:761
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chr2	96610921	rs62154594	T	G	34867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-3.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.234;HP=1;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-13.476;NF=410;NR=458;PP=2962;ReadPosRankSum=2.218;SC=TTCTGAAATATTCTAGAAGAA;SOR=0.584;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=1215;TCF=567;TCR=648;TR=868;WE=96610931;WS=96610911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:349,874:0.71:1223
chr2	96610923	rs75080810	C	G	1814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1209;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.12;MQRankSum=-4.714;QD=1.51;ReadPosRankSum=0.154;SOR=0.679;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:999,206:0.17:1205
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chr2	96611013	rs202100353	A	T	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.14;MQRankSum=-0.792;QD=2.69;ReadPosRankSum=0.812;SOR=0.597;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:161,35:0.18:196
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chr2	96616313	.	A	ATT	495.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.430;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.217;HP=1;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.167;NF=14;NR=2;PP=539;ReadPosRankSum=-0.058;SC=AGAGTTGCCTAATTAGTAAAA;SOR=0.081;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=40;TCF=36;TCR=4;TR=16;WE=96616321;WS=96616304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,11:0.32:34
chr2	96616348	rs62154609	C	G	1731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=5.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.292;HP=4;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-9.651;NF=34;NR=5;PP=2011;ReadPosRankSum=-0.255;SC=CAAATAGTTTCTAAAGTTGTG;SOR=1.876;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=98;TCF=80;TCR=18;TR=39;WE=96616363;WS=96616338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,39:0.38:102
chr2	96616353	rs150793442	GT	G	835.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=2.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.00;MQRankSum=-5.739;QD=7.02;ReadPosRankSum=0.921;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,31:0.26:119
chr2	96616354	rs78161475	T	C	363.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=3.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=1.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.00;MQRankSum=-6.178;QD=3.06;ReadPosRankSum=-2.348;SOR=0.960;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:102,17:0.14:119
chr2	96616355	rs62154610	T	C	835.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=2.321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.93;MQRankSum=-5.676;QD=6.96;ReadPosRankSum=0.885;SOR=1.067;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,31:0.26:120
chr2	96616378	rs62154611	C	T	3159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-12.236;NF=81;NR=33;PP=1830;ReadPosRankSum=-1.353;SC=CATGACATGACAAATGTTAAG;SOR=0.726;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=223;TCF=157;TCR=66;TR=114;WE=96616386;WS=96616368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,111:0.49:226
chr2	96616442	rs74960926	C	A	9715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.31;MQRankSum=-17.533;QD=19.09;ReadPosRankSum=4.302;SOR=0.612;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:256,253:0.50:509
chr2	96616448	rs76503749	G	T	9632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=506;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.17;MQRankSum=-16.556;QD=19.07;ReadPosRankSum=3.532;SOR=0.688;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:256,249:0.49:505
chr2	96616485	rs78218362	C	G	6453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=410;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.751;HP=2;HapScore=2;MGOF=44;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-13.043;NF=84;NR=125;PP=2937;ReadPosRankSum=-2.963;SC=TAAAAAATCTCTGAAATCATA;SOR=0.829;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=419;TCF=177;TCR=242;TR=209;WE=96616493;WS=96616475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:213,197:0.48:410
chr2	96616501	.	C	CAA	5714.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.507;ClippingRankSum=0.000;DP=339;ExcessHet=3.0103;FS=6.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.75;MQRankSum=-10.497;QD=16.86;ReadPosRankSum=-2.925;SOR=1.026;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:189,150:0.44:339
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chr2	96616532	rs112676430	T	G	2051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=10.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=67.584;HP=3;HapScore=2;MGOF=51;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-9.068;NF=4;NR=73;PP=1687;ReadPosRankSum=-0.816;SC=GAAGCACTATTAAAGAAAAAG;SOR=5.387;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=205;TCF=50;TCR=155;TR=77;WE=96616540;WS=96616522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,57:0.31:184
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chr2	96617194	rs75924615	A	G	2513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.161;HP=3;HapScore=1;MGOF=52;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-9.251;NF=18;NR=62;PP=1297;ReadPosRankSum=1.103;SC=AATAACATGGAGCAAGTTAAA;SOR=1.306;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=228;TCF=69;TCR=159;TR=80;WE=96617202;WS=96617184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,74:0.32:234
chr2	96617209	rs74343816	G	T	2312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.973;HP=2;HapScore=1;MGOF=50;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-8.844;NF=15;NR=48;PP=901;ReadPosRankSum=-0.068;SC=GTTAAAATAAGGATAATACCC;SOR=1.053;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=189;TCF=56;TCR=133;TR=63;WE=96617217;WS=96617199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,65:0.32:203
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chr2	96617256	rs2438948	A	G	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=7.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.77;MQRankSum=-6.541;QD=6.31;ReadPosRankSum=-1.295;SOR=2.215;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,11:0.18:61
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chr2	96619642	rs201891130	A	T	746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=27.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.69;MQRankSum=-8.871;QD=4.42;ReadPosRankSum=-2.583;SOR=3.705;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:140,29:0.17:169
chr2	96619688	rs74946480	T	G	2988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=4.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=466;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=22.768;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-15.615;NF=165;NR=68;PP=2962;ReadPosRankSum=-3.400;SC=GTACTCTACCTCAGATTCCAA;SOR=1.920;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=537;TCF=339;TCR=198;TR=233;WE=96619696;WS=96619678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:300,164:0.35:464
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chr2	96619735	rs200095242	A	G	2030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=638;ExcessHet=3.0103;FS=5.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.56;MQRankSum=-7.786;QD=3.18;ReadPosRankSum=-1.547;SOR=1.086;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:490,148:0.23:638
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chr2	96619873	rs111807008	C	A	1533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-7.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.067;HP=3;HapScore=2;MGOF=101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.887;NF=2;NR=39;PP=842;ReadPosRankSum=-0.161;SC=TCTGAGGAAACTCAGTTATCT;SOR=0.100;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=80;TCF=2;TCR=78;TR=41;WE=96619881;WS=96619863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,39:0.51:77
chr2	96646293	rs12613703	T	C	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.985;NF=28;NR=0;PP=605;ReadPosRankSum=1.483;SC=TGAAAACTACTTGAATCAAAC;SOR=1.157;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=46;TCR=0;TR=28;WE=96646301;WS=96646283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,31:0.60:52
chr2	96685307	rs59878168	G	A	4195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.352;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.348;NF=101;NR=72;PP=2521;ReadPosRankSum=2.235;SC=CATGGCCCACGTGGCCGGCTT;SOR=0.619;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=297;TCF=173;TCR=124;TR=173;WE=96685315;WS=96685297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,188:0.59:320
chr2	96688990	rs2278564	C	T	5266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.639;NF=122;NR=43;PP=2965;ReadPosRankSum=1.028;SC=GGGGACAGGCCGGGGTGAGTG;SOR=1.044;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=167;TCF=124;TCR=43;TR=165;WE=96688998;WS=96688980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,180:0.99:181
chr2	96689817	rs77642907	C	T	579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.206;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.206;NF=13;NR=11;PP=393;ReadPosRankSum=-1.004;SC=AGCCAAAGACCGGGCAAGGCC;SOR=0.478;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=38;TCF=22;TCR=16;TR=24;WE=96689825;WS=96689807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,25:0.60:42
chr2	96690478	rs142519133	A	AC	1605.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.657;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.840;NF=18;NR=22;PP=735;ReadPosRankSum=-0.310;SC=ACACATCGCCACCCCCCCCAC;SOR=0.711;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=89;TCF=33;TCR=56;TR=40;WE=96690486;WS=96690468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,78:0.60:131
chr2	96697823	rs76666665	G	A	877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.308;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-4.469;NF=34;NR=17;PP=601;ReadPosRankSum=-2.307;SC=GACCCACAAAGGGGCGATACT;SOR=0.944;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=147;TCF=86;TCR=61;TR=51;WE=96697831;WS=96697813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,49:0.36:135
chr2	96698185	rs375306245	G	A	919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=24;PP=656;SC=GGGGAAAGGTGCAAGGATGGA;SOR=1.819;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=15;TCR=24;TR=39;WE=96698193;WS=96698175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr2	96780716	rs2229169	T	G	13119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=492;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=229;NR=222;PP=2965;SC=GGCAGATGGCTCCCAGGCTGT;SOR=0.710;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=452;TCF=230;TCR=222;TR=451;WE=96780724;WS=96780706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,490:1.00:490
chr2	96780986	rs29000568	C	CTCCTCCTCT	7645.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.08;MQRankSum=0.418;QD=28.96;ReadPosRankSum=1.798;SOR=0.730;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,262:0.99:264
chr2	96781853	rs9333567	T	C	2837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.591;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=76;PP=1567;ReadPosRankSum=-0.820;SC=CTATGGCCGCTGTGGCCTGCA;SOR=0.826;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=223;TCF=97;TCR=126;TR=128;WE=96781861;WS=96781843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,137:0.56:243
chr2	96781986	rs3111873	G	C	402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=9;PP=245;SC=GTCGCCCCTCGGGCGGCGCCG;SOR=1.911;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=96781994;WS=96781976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	96789787	rs893173	T	C	2573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.542;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=55;PP=1681;ReadPosRankSum=-0.327;SC=GGGAGGAAGCTAGGGTCTGAG;SOR=0.764;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=180;TCF=89;TCR=91;TR=109;WE=96789795;WS=96789777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,115:0.60:191
chr2	96795608	rs1657502	T	G	1050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.074;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=12;PP=499;ReadPosRankSum=0.696;SC=CCGTAGAGTTTGAGGACCCGG;SOR=1.067;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=62;TCF=40;TCR=22;TR=38;WE=96795616;WS=96795598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,48:0.62:78
chr2	96795714	rs749459	G	A	1541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.712;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=28;PP=842;ReadPosRankSum=1.050;SC=GGCTGAAGGCGAGCCTGGAAC;SOR=0.570;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=102;TCF=56;TCR=46;TR=60;WE=96795722;WS=96795704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,71:0.61:116
chr2	96795857	rs749458	T	C	5835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=115;NR=87;PP=2965;SC=GTTGCTGCTCTGAGACTTGAT;SOR=0.900;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=202;TCF=115;TCR=87;TR=202;WE=96795865;WS=96795847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr2	96795944	rs749457	A	G	1703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.827;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=47;PP=1121;ReadPosRankSum=-0.250;SC=AAGAAAGGGCAGGCAATGGCT;SOR=1.038;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=143;TCF=58;TCR=85;TR=73;WE=96795952;WS=96795934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,80:0.51:158
chr2	96798305	rs41320144	C	T	1670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=20;PP=857;ReadPosRankSum=1.398;SC=CCAGTTGACACGGATATAGCG;SOR=0.715;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=116;TCF=77;TCR=39;TR=65;WE=96798313;WS=96798295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,79:0.56:140
chr2	96798510	rs1168966	G	A	1326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=30;PP=792;ReadPosRankSum=0.581;SC=AGATCCCTCCGGACATACAGA;SOR=0.684;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=79;TCF=29;TCR=50;TR=48;WE=96798518;WS=96798500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,56:0.63:89
chr2	96804107	rs72825845	G	A	2560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.177;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=37;PP=1622;ReadPosRankSum=-0.246;SC=AGGAGGGACAGGCAGCCAGCT;SOR=0.838;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=177;TCF=112;TCR=65;TR=106;WE=96804115;WS=96804097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,116:0.60:193
chr2	96858914	rs997548	A	G	2909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=455;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.165;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=74;PP=1971;ReadPosRankSum=0.371;SC=GAAATGGAGGAGCAGGATTAG;SOR=0.591;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=418;TCF=220;TCR=198;TR=149;WE=96858922;WS=96858904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:296,157:0.35:453
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chr2	96861041	rs17119362	C	T	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.047;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.830;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=145;ReadPosRankSum=0.441;SC=TGCACCTGTGCAACTATGGAA;SOR=3.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=8;WE=96861049;WS=96861032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr2	96861159	rs2276650	C	G	938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.697;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=19;PP=562;ReadPosRankSum=0.704;SC=CATTTCCCAACGTTGCTCTTT;SOR=0.586;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=113;TCF=70;TCR=43;TR=45;WE=96861167;WS=96861149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,49:0.39:125
chr2	96874590	rs6725867	TT	CC	21894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=492;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;JOINED;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=200;NR=224;PP=2947;SC=CGCACCCTACTTTTTCTCCGC;SOR=0.850;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=436;TCF=203;TCR=233;TR=424;WE=96874599;WS=96874580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,490:1.00:490
chr2	96874626	rs80229301	C	A	4306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=347;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.302;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=111;PP=2679;ReadPosRankSum=-0.847;SC=TGGGCGCGACCTGGGCTCCTG;SOR=0.777;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=319;TCF=133;TCR=186;TR=188;WE=96874634;WS=96874616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,202:0.58:346
chr2	96919642	rs3852673	C	T	1443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.042;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=34;PP=840;ReadPosRankSum=-0.345;SC=GCAGCTCCAGCGCCTGCTCCT;SOR=0.591;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=225;TCF=125;TCR=100;TR=74;WE=96919650;WS=96919632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,82:0.33:247
chr2	96934504	rs62153033	T	C	1021.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=24;PP=702;SC=TAAGATGTGCTACAAGAGGGC;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=28;WE=96934512;WS=96934494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr2	96943473	rs3214063	T	C	9174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=338;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=151;NR=153;PP=2965;SC=AAAAGGAGTATAAAAGTGGGC;SOR=0.766;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=304;TCF=151;TCR=153;TR=304;WE=96943481;WS=96943463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,338:1.00:338
chr2	96944480	rs78519182	C	G	4841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=369;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.024;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=112;NR=86;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.346;SC=TGGGGAGCCTCAAGAAGATGC;SOR=0.893;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=342;TCF=185;TCR=157;TR=198;WE=96944488;WS=96944470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,213:0.59:364
chr2	96948273	rs76047826	C	T	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.775;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=325;ReadPosRankSum=-1.456;SC=ATCTCGTCGACCTGTAGTCTC;SOR=0.102;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=18;WE=96948281;WS=96948263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr2	96950487	.	C	CT	107	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=17;HapScore=2;MGOF=24;MMLQ=16;MQ=57.08;NF=0;NR=7;PP=107;QD=16.1428571429;SC=GCAGCTTTTTCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=7;WE=96950495;WS=96950477;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,7:0.88:8
chr2	96952833	rs3171927	A	G	1473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=37;PP=874;ReadPosRankSum=-2.095;SC=GACAACTCCAACTTGGGAAAC;SOR=0.706;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=214;TCF=105;TCR=109;TR=75;WE=96952841;WS=96952823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,82:0.35:234
chr2	96955480	rs3214058	T	C	755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=1;PP=568;SC=GAAAAATTTTTTCCTGGGCCA;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=96955488;WS=96955470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	96956315	rs772176	T	G	3325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=63;PP=2123;ReadPosRankSum=1.938;SC=TTGATGCAGGTATCTACATTA;SOR=1.142;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=49;TCR=64;TR=111;WE=96956323;WS=96956305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,121:0.98:123
chr2	96962859	rs17479466	A	G	1934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=38;PP=1153;SC=TCCTTGAGCAAAACGTTATTG;SOR=1.576;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=22;TCR=38;TR=60;WE=96962867;WS=96962849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr2	96966661	rs3731930	G	C	4250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=38;PP=2734;SC=TAGAGAGCTTGTTTACACTAG;SOR=1.778;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=96;TCR=38;TR=134;WE=96966669;WS=96966651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr2	96991492	rs772174	A	G	9163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=184;NR=116;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.954;SC=CAGGGCTCCTAGAGAGGGCGG;SOR=1.116;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=303;TCF=186;TCR=117;TR=300;WE=96991500;WS=96991482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,324:0.99:326
chr2	96993757	rs2279105	C	T	12529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=472;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=223;NR=212;PP=2965;SC=CTGCCCCTCACGGACTGGGCC;SOR=0.715;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=435;TCF=223;TCR=212;TR=435;WE=96993770;WS=96993747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,471:1.00:471
chr2	96993884	rs1048675	A	G	7438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=120;NR=134;PP=2965;SC=TGACCATCCCAATCCCTAAGA;SOR=0.830;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=255;TCF=120;TCR=135;TR=254;WE=96993892;WS=96993874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,278:1.00:278
chr2	97020049	rs3731935	T	C	1773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=41;PP=744;ReadPosRankSum=2.208;SC=ATGCCAACGATGAACCTGACC;SOR=0.666;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=194;TCF=90;TCR=104;TR=77;WE=97020057;WS=97020039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,94:0.44:216
chr2	97026576	rs62153915	C	T	2049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=50;PP=1297;SC=AGCGTGTTGCCAGGAAATCAA;SOR=2.649;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=15;TCR=51;TR=65;WE=97026584;WS=97026566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr2	97030247	rs2305935	T	C	6569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=133;NR=95;PP=2965;SC=GGCCATAGGGTAGAGACTGAG;SOR=0.991;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=228;TCF=133;TCR=95;TR=228;WE=97030255;WS=97030237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr2	97166204	rs3731938	A	G	8296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.200;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=149;NR=142;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.536;SC=TAGTGGTCCCATACACGTCCA;SOR=0.196;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=293;TCF=151;TCR=142;TR=291;WE=97166212;WS=97166194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,316:0.99:318
chr2	97213289	rs113045278	T	G	1528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.307;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=35;PP=811;ReadPosRankSum=-0.826;SC=CCCTGGGCACTCTTCCCTGCC;SOR=0.396;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=120;TCF=50;TCR=70;TR=65;WE=97213297;WS=97213279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,76:0.58:132
chr2	97218367	rs6576973	A	G	2232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=58;PP=1463;ReadPosRankSum=-0.172;SC=ACCAGTGTGAATCCACGTAGC;SOR=0.733;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=162;TCF=67;TCR=95;TR=97;WE=97218375;WS=97218357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,102:0.58:175
chr2	97267260	rs6759099	G	C	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=196;ReadPosRankSum=-0.630;SC=ATACAGATTTGAATTTGAATC;SOR=0.540;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=14;WE=97267268;WS=97267250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr2	97267293	rs6749159	T	C	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=273;ReadPosRankSum=0.107;SC=GTCCAGTGCATGGGCAGCCCC;SOR=0.678;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=36;TCR=19;TR=23;WE=97267301;WS=97267283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,22:0.40:55
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chr2	97351840	rs7599598	A	G	2891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.032;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=66;PP=1768;ReadPosRankSum=0.820;SC=CCGCCTCAACACCGTGCTCCC;SOR=0.779;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=212;TCF=102;TCR=110;TR=125;WE=97351848;WS=97351830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,137:0.60:230
chr2	97353725	rs868168	G	A	1502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.997;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=45;PP=1088;ReadPosRankSum=0.602;SC=GCAGGCACGCGGGGGTGGGGG;SOR=1.730;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=88;TCF=23;TCR=65;TR=56;WE=97353733;WS=97353715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,61:0.62:98
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chr2	97400324	rs6727384	A	G	2881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=67;PP=1642;ReadPosRankSum=-0.562;SC=CCTCAAGCCCACATCAGCAAT;SOR=0.710;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=232;TCF=109;TCR=123;TR=125;WE=97400332;WS=97400314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,142:0.55:260
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chr2	97463095	rs1318597	T	C	840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=6;PP=632;ReadPosRankSum=0.610;SC=CCCTCGGCCTTTGTGCCTCGG;SOR=0.556;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=38;TCF=30;TCR=8;TR=27;WE=97463103;WS=97463091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,29:0.73:40
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chr2	97559759	rs11677797	G	A	1624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.076;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=42;PP=1046;ReadPosRankSum=0.497;SC=ATGGCCTCATGAGGCCCAGGA;SOR=0.869;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=207;TCF=108;TCR=99;TR=80;WE=97559767;WS=97559749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,86:0.38:224
chr2	97560629	rs13421275	C	T	114.90	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=78;ReadPosRankSum=-0.210;SC=ATCCCCCCCACAGACCCTCAC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=5;WE=97560637;WS=97560619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr2	97560913	rs4907206	C	T	1411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.045;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=36;PP=901;ReadPosRankSum=-0.902;SC=TACATCGTATCGTTTTACCCA;SOR=0.917;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=139;TCF=62;TCR=77;TR=62;WE=97560921;WS=97560903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,68:0.43:158
chr2	97587049	rs34895357	T	C	927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=23;PP=616;ReadPosRankSum=2.065;SC=CGCCTTCCCCTTGCTCTCGCC;SOR=0.682;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=79;TCF=32;TCR=47;TR=38;WE=97587057;WS=97587039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,41:0.48:85
chr2	97589274	rs143763449	C	T	5211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=408;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.258;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=125;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.462;SC=TCTTGGGGAGCGTCCTGCTCC;SOR=0.943;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=381;TCF=174;TCR=207;TR=219;WE=97589282;WS=97589264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,237:0.58:408
chr2	97595109	rs6725927	T	C	1417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.506;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=41;PP=857;ReadPosRankSum=2.596;SC=GAGGGCAGGGTGCACCACTCC;SOR=0.948;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=110;TCF=44;TCR=66;TR=67;WE=97595117;WS=97595099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,67:0.59:113
chr2	97613616	rs1624844	T	C	1696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=0.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.62;ReadPosRankSum=1.711;SOR=0.631;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,86:0.59:146
chr2	97613748	rs1623881	C	A	1105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.906;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=28;PP=633;ReadPosRankSum=0.682;SC=CCATTTAATTCTCATAAGTCT;SOR=0.311;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=74;TCF=24;TCR=50;TR=44;WE=97613756;WS=97613738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,50:0.63:79
chr2	97617140	rs1257019	T	C	3418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.015;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=71;PP=2219;ReadPosRankSum=-0.662;SC=GGAGCAGGGATACCGGGCAGT;SOR=0.545;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=250;TCF=136;TCR=114;TR=144;WE=97617148;WS=97617130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,158:0.57:278
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chr2	97637516	rs6714860	T	C	834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=11;PP=577;ReadPosRankSum=0.445;SC=ATGGTCAAGGTGAAGTGTCCG;SOR=0.606;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=69;TCF=52;TCR=17;TR=39;WE=97637524;WS=97637506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,38:0.56:68
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chr2	97814956	rs4386368	G	A	561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.076;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.183;NF=19;NR=7;PP=340;ReadPosRankSum=-1.311;SC=GTGGACATACGTGTATAGACT;SOR=0.960;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=51;TCF=36;TCR=15;TR=26;WE=97814964;WS=97814946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,27:0.47:58
chr2	97817469	.	T	A	89	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MMLQ=27;MQ=40.44;NF=7;NR=1;PP=89;QD=15.4714015684;SC=ATCTGTAGATTAGTAAATGGC;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=8;WE=97817477;WS=97817460;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:12,8:0.40:20
chr2	97817511	rs62153867	T	C	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=23.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.39;MQRankSum=-4.503;QD=5.66;ReadPosRankSum=-1.236;SOR=0.281;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,13:0.36:36
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chr2	97817563	rs112026456	C	CA	426.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-2.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=36.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.28;MQRankSum=-4.538;QD=6.77;ReadPosRankSum=1.793;SOR=0.722;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,15:0.24:63
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chr2	97817578	rs113800206	T	C	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=18.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.90;MQRankSum=-5.016;QD=3.73;ReadPosRankSum=0.561;SOR=0.775;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,15:0.16:96
chr2	97817802	.	TCACTG	T	574	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=48;MMLQ=15;MQ=48.28;NF=0;NR=12;PP=574;QD=51.4166666667;SC=CGATCTTGGCTCACTGCAGTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=12;WE=97817814;WS=97817792;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr2	97818101	.	T	G	621	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=59;MMLQ=28;MQ=40.55;NF=10;NR=0;PP=621;QD=65.5771212547;SC=TCAAACTCCTTGGCTTCTCAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=10;WE=97818122;WS=97818091;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,10:0.62:16
chr2	97818114	.	G	T	623	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=59;MMLQ=27;MQ=40.07;NF=14;NR=0;PP=623;QD=46.9836580391;SC=CTTCTCAAGTGATACTTCTGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=14;WE=97818122;WS=97818091;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,14:0.70:20
chr2	97818146	rs145799985	G	A	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.738;HP=2;HapScore=2;MGOF=50;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.373;NF=22;NR=1;PP=477;ReadPosRankSum=-2.286;SC=GAGTAGCTGGGATTATAGGAA;SOR=0.132;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=23;WE=97818154;WS=97818136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr2	97818161	rs74715701	C	A	1402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=9.438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.93;MQRankSum=-5.803;QD=29.85;ReadPosRankSum=-1.310;SOR=0.124;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,34:0.72:47
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chr2	97818192	rs202154783	A	G	1377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=8.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.31;MQRankSum=-2.824;QD=26.00;ReadPosRankSum=3.357;SOR=0.261;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,35:0.66:53
chr2	97818197	rs200340181	G	T	1383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=10.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.20;MQRankSum=-2.370;QD=25.63;ReadPosRankSum=3.436;SOR=0.242;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,35:0.65:54
chr2	97818236	rs112647905	A	C	1928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=8.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.09;MQRankSum=-5.088;QD=20.52;ReadPosRankSum=0.280;SOR=0.872;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,55:0.59:94
chr2	97818260	.	GGC	G	1691.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.820;ClippingRankSum=0.000;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=6.321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.99;MQRankSum=-5.880;QD=16.42;ReadPosRankSum=-0.173;SOR=1.146;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,46:0.45:103
chr2	97818264	.	G	GTT	1593.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=0.000;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=8.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.21;MQRankSum=-5.782;QD=15.94;ReadPosRankSum=-0.031;SOR=1.440;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,43:0.43:100
chr2	97818283	rs112336445	G	C	885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.947;HP=2;HapScore=2;MGOF=45;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.872;NF=13;NR=26;PP=581;ReadPosRankSum=2.214;SC=TATGATTTCAGAGATTTTTTA;SOR=1.426;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=103;TCF=44;TCR=59;TR=39;WE=97818300;WS=97818273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,23:0.29:79
chr2	97818326	rs72493416	G	T	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.47;MQRankSum=-6.838;QD=4.03;ReadPosRankSum=-5.371;SOR=0.625;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,17:0.25:67
chr2	97820321	.	T	TG	74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=7;HapScore=3;MGOF=8;MMLQ=29;MQ=49.53;NF=1;NR=1;PP=74;QD=45.5;SC=ACCATTTTTTTTGGAGGGGAC;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=2;WE=97820340;WS=97820311;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:9,2:0.18:11
chr2	97820332	.	C	A	56	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=8;MMLQ=28;MQ=51.19;NF=2;NR=1;PP=56;QD=30.2570708491;SC=TGGAGGGGACCTGCATGTATA;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=3;WE=97820340;WS=97820311;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:14,3:0.18:17
chr2	97823971	rs13011421	T	C	1323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=1.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.499;NF=14;NR=40;PP=942;ReadPosRankSum=1.624;SC=TTTTTCTTTCTTATTTTTTGT;SOR=0.656;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=98;TCF=24;TCR=74;TR=54;WE=97823979;WS=97823961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,58:0.53:110
chr2	97827737	rs76168297	C	T	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.76;MQRankSum=-1.461;QD=5.12;ReadPosRankSum=-2.064;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,8:0.21:39
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chr2	97877440	rs35711845	T	C	3697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=597;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=100;NR=100;PP=2162;ReadPosRankSum=-1.814;SC=GTTCCGAATATGGCCACGGAA;SOR=0.689;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=565;TCF=280;TCR=285;TR=200;WE=97877456;WS=97877422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:388,209:0.35:597
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chr2	98273661	rs2290124	A	G	1324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.722;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=28;PP=858;ReadPosRankSum=1.708;SC=GAGATCTAGAAGGAGGAAGTG;SOR=0.385;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=97;TCF=46;TCR=51;TR=57;WE=98273669;WS=98273651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,60:0.58:104
chr2	98274527	rs1042705	G	C	4540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=354;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.760;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=89;PP=2944;ReadPosRankSum=0.639;SC=TCTCATCCCCGACAAGGTCCG;SOR=0.671;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=324;TCF=167;TCR=157;TR=183;WE=98274535;WS=98274517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,204:0.58:353
chr2	98276014	rs150112418	CCCTCACCTGCCCTGACCAGAA	C	523.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.510;NF=0;NR=13;PP=2923;ReadPosRankSum=-3.170;SC=TGGAAGCTGACCCTCACCTGC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=13;WE=98276042;WS=98276004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr2	98351654	rs34532595	TG	T	796.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.576;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=3;PP=767;ReadPosRankSum=-0.970;SC=GGTGGGGGTGTGGGGCCGAGC;SOR=1.148;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=46;TCF=39;TCR=7;TR=24;WE=98351662;WS=98351644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,29:0.53:55
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chr2	98382886	rs895438	G	A	2208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=4.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.663;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=26;PP=1551;ReadPosRankSum=-0.014;SC=TTGTTAATACGGTGCACTATG;SOR=0.827;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=96;TCR=44;TR=83;WE=98382894;WS=98382876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,91:0.59:153
chr2	98409046	rs12995673	G	A	2101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.587;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=36;PP=1350;ReadPosRankSum=-0.642;SC=TTCAGGCTGCGGCTCCTGGGG;SOR=0.793;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=151;TCF=82;TCR=69;TR=84;WE=98409054;WS=98409036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,91:0.57:161
chr2	98409565	rs13032265	T	C	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=410;ReadPosRankSum=0.338;SC=AGGGAAAAAATAGCAAGAAAT;SOR=0.760;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=17;WE=98409573;WS=98409555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,19:0.76:25
chr2	98449796	rs6721250	C	T	591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=16;NR=4;PP=353;SC=AAAGAATATACAAATTAGGGG;SOR=1.931;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=98449804;WS=98449786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	98451503	.	TA	T	302.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.695;ClippingRankSum=0.000;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.351;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=202;ReadPosRankSum=-0.265;SC=TACCTATTAATAAAAAAAATG;SOR=0.245;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=14;WE=98451511;WS=98451493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr2	98525107	rs1317178	T	C	2799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.545;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=65;PP=1786;ReadPosRankSum=0.058;SC=AATTATCTTATTAAATATACT;SOR=0.751;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=179;TCF=81;TCR=98;TR=117;WE=98525115;WS=98525097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,127:0.64:199
chr2	98611833	rs2279825	T	C	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=150;ReadPosRankSum=0.133;SC=CGCCCAACTTTGCGCCGGAGC;SOR=1.179;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=10;WE=98611841;WS=98611823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr2	98611994	rs2279824	G	T	1028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.016;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=21;PP=463;ReadPosRankSum=0.050;SC=GGTGCAGCGCGCCTAGGAGGC;SOR=0.951;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=69;TCF=34;TCR=35;TR=40;WE=98612002;WS=98611984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,51:0.62:82
chr2	98709684	rs298917	T	C	3242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=472;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.539;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=84;PP=1872;ReadPosRankSum=-1.162;SC=TTCAACTGCATGGGCTTAAGA;SOR=0.718;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=425;TCF=216;TCR=209;TR=165;WE=98709703;WS=98709674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:293,179:0.38:472
chr2	98795873	rs11419620	T	TG	11324.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=145;PP=2965;SC=ATTGGCATTGTGGTTATTCTT;SOR=1.129;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=171;TCF=18;TCR=153;TR=162;WE=98795881;WS=98795863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,321:1.00:321
chr2	98797744	rs4851890	C	T	782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=19;PP=552;SC=AGGCCTCCATCGGGTCAGAAG;SOR=3.611;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=22;WE=98797752;WS=98797734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	98804314	rs1466156	G	A	763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=10;PP=542;SC=ACTAACAAAGGAATGATTGAC;SOR=1.460;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=30;WE=98804322;WS=98804304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	98809432	rs74735968	T	C	2747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.911;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=52;PP=1771;ReadPosRankSum=-0.568;SC=TACATTCTCATTGACACGTCT;SOR=0.811;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=279;TCF=162;TCR=117;TR=127;WE=98809440;WS=98809422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,136:0.44:306
chr2	98811075	rs7579916	A	G	1019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=27;PP=786;SC=AAGTGGCTTAACATGTAGACT;SOR=3.193;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=32;WE=98811083;WS=98811065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr2	98833446	rs67163987	C	CCA	440.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5005;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=0;NR=8;PP=128;SC=ATTGTAAGCACCCGCCCCGCA;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=8;WE=98833457;WS=98833436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	98833449	rs62156666	G	C	449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=8;PP=224;SC=GTAAGCACCCGCCCCGCACCC;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=98833457;WS=98833436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	98844575	rs7606220	A	G	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=141;ReadPosRankSum=-0.087;SC=AACATAGTGAACCTCTTGTCT;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=8;WE=98844583;WS=98844565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
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chr2	98853173	rs11889349	G	A	2472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=373;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.811;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=61;PP=1539;ReadPosRankSum=0.466;SC=CAAGCATGTCGTGTCTAAGGT;SOR=0.690;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=358;TCF=181;TCR=177;TR=128;WE=98853181;WS=98853163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:236,136:0.37:372
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chr2	98950659	.	T	C	20	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MMLQ=18;MQ=60.0;NF=1;NR=4;PP=20;QD=10.9542425094;SC=GGAAGGTAGATGCTGTGGCAG;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=5;WE=98950667;WS=98950649;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:5,5:0.50:10
chr2	98986510	rs6727412	T	C	3833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.546;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=84;PP=2399;ReadPosRankSum=0.713;SC=CAGACCGAGATCTCAATCGCG;SOR=0.599;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=247;TCF=114;TCR=133;TR=160;WE=98986518;WS=98986500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,176:0.66:268
chr2	98994414	rs937725	T	C	1110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=8;PP=658;ReadPosRankSum=-0.637;SC=AAACTATCAGTGAGTAATTTC;SOR=0.590;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=76;TCF=61;TCR=15;TR=39;WE=98994422;WS=98994404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,46:0.56:82
chr2	99160508	rs3217304	GCA	G	39.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=7.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.97;ReadPosRankSum=-0.160;SOR=0.048;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,6:0.15:41
chr2	99168953	rs1181562	T	C	204.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=8;NR=0;PP=194;SC=TGGGTGATTATGGGATATGAT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=99168961;WS=99168943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	99170727	rs61748141	C	T	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.691;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=319;ReadPosRankSum=2.119;SC=TTTGTGTGCACCTGCAGACAC;SOR=1.355;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=20;WE=99170735;WS=99170717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr2	99232873	rs6711099	T	C	5352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=411;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.116;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=110;NR=111;PP=2896;ReadPosRankSum=-1.626;SC=AAGGGACTCATGGTCTGCGTC;SOR=0.697;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=378;TCF=190;TCR=188;TR=221;WE=99232881;WS=99232863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,245:0.60:410
chr2	99271712	rs7557647	T	C	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=90;ReadPosRankSum=0.469;SC=AGTGGAGGGCTGGCTTCCCTA;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=6;WE=99271720;WS=99271702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr2	99272057	rs3754870	T	C	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.345;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=75;ReadPosRankSum=0.921;SC=AATGTATAAATGTCAAATGTC;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=6;WE=99272065;WS=99272047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
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chr2	99274849	rs114008231	G	C	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5081;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=72;ReadPosRankSum=1.282;SC=TAAATTTTTAGACAATTTATT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=4;WE=99274857;WS=99274839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr2	99295003	rs17021875	C	A	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=158;ReadPosRankSum=0.000;SC=CTCAATGGAACTGTAAAATTA;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=9;WE=99295011;WS=99294993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr2	99614595	.	CA	C	46.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.334;ClippingRankSum=0.000;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.63;ReadPosRankSum=-0.205;SOR=0.718;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,14:0.19:74
chr2	99725223	rs6542864	A	G	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=435;ReadPosRankSum=-0.729;SC=CAGTCTCATAAAACTCAAAGA;SOR=0.598;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=20;WE=99725231;WS=99725213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,20:0.77:26
chr2	99725479	rs11396964	A	AT	1332.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.086;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=24;PP=1009;ReadPosRankSum=0.200;SC=GGAATTTGAAATCTTCTTTGA;SOR=0.484;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=46;TCF=3;TCR=43;TR=25;WE=99725487;WS=99725469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,42:0.64:66
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chr2	99743419	rs13008171	G	A	301.89	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=284;ReadPosRankSum=-0.726;SC=AATGAGCTCTGAATTAGTAGT;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=99743427;WS=99743417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr2	99771533	rs2516834	C	T	2549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=59;PP=1608;ReadPosRankSum=1.672;SC=AGCGGAAACGCTTCAAACCGG;SOR=0.677;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=139;TCF=54;TCR=85;TR=98;WE=99771541;WS=99771523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,110:0.70:158
chr2	99771590	rs2632260	G	T	974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=28;PP=646;ReadPosRankSum=0.346;SC=TCTTGGGCGCGCGCGGTGTTT;SOR=0.671;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=51;TCF=9;TCR=42;TR=35;WE=99771598;WS=99771580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,40:0.70:57
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chr2	99779131	rs2516835	T	C	7330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=510;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.567;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=152;NR=135;PP=2962;ReadPosRankSum=0.054;SC=AGTATGCTGCTTATCATCAAA;SOR=0.505;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=461;TCF=250;TCR=211;TR=287;WE=99779139;WS=99779121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:186,323:0.63:509
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chr2	99870872	rs138844118	AAGATAGTATTCTCACAGGCTC	A	55.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=3;PP=812;ReadPosRankSum=-2.127;SC=TCCCTGTTTCAAGATAGTATT;SOR=0.105;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=3;WE=99870900;WS=99870862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,3:0.21:14
chr2	99923088	rs13003899	T	C	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.594;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.120;NF=9;NR=0;PP=159;ReadPosRankSum=1.936;SC=AAGTACTTATTGATGTAGACA;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=9;WE=99923096;WS=99923082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr2	99938942	rs12464785	A	G	1015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.855;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=7;PP=765;ReadPosRankSum=-0.606;SC=GCTTTAAGTCATAAAGGAAGT;SOR=1.875;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=75;TCF=60;TCR=15;TR=46;WE=99938950;WS=99938932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,47:0.59:80
chr2	99939031	rs17022564	A	G	4120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.645;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=105;NR=78;PP=2671;ReadPosRankSum=-0.166;SC=TACAAGAATCAGAAGTGCACA;SOR=0.888;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=300;TCF=168;TCR=132;TR=183;WE=99939039;WS=99939021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,194:0.59:328
chr2	99944233	.	G	GT	74.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.542;ClippingRankSum=0.000;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.21;MQRankSum=-0.460;QD=2.02;ReadPosRankSum=-0.742;SOR=0.519;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,8:0.22:37
chr2	99954636	rs11326784	GT	G	419.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.275;HP=10;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.927;NF=13;NR=5;PP=229;ReadPosRankSum=-0.169;SC=CTTCCGGCCTGTTTTTTTTTG;SOR=0.044;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=18;WE=99954644;WS=99954626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
chr2	99992822	rs7558074	A	C	1127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=8;PP=816;SC=GAAGGAAACAAAGTTCATATA;SOR=2.613;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=31;TCR=8;TR=39;WE=99992830;WS=99992812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr2	99993176	rs10179343	G	A	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=184;ReadPosRankSum=-0.054;SC=ACAACTAAAGGCTTTGAACAG;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=10;WE=99993184;WS=99993166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr2	99995458	rs200706463	AT	A	201.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=6.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.11;ReadPosRankSum=0.627;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr2	99995517	rs11896520	C	T	2846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.04;MQRankSum=0.903;QD=11.21;ReadPosRankSum=-1.811;SOR=0.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:113,141:0.56:254
chr2	99995804	rs1376443	T	C	8612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=150;NR=149;PP=2965;SC=ATGTACAAGATGGTGAAGCAG;SOR=0.711;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=301;TCF=151;TCR=150;TR=299;WE=99995812;WS=99995794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,331:1.00:331
chr2	99998561	rs2290256	C	T	927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=7;PP=605;SC=AAGGATTGTTCTGTAAAGAAG;SOR=1.839;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=28;WE=99998569;WS=99998551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	99999483	.	TTATTGTGCTTCACTA	T	440	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=440;QD=237.0;SC=ATAGCTCATTTTATTGTGCTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=2;WE=99999505;WS=99999473;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:5,2:0.29:7
chr2	100006620	rs10187843	G	T	2623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=24;PP=1640;SC=TTCTAGTGAGGCACACCTATT;SOR=1.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=61;TCR=24;TR=85;WE=100006628;WS=100006610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr2	100019496	rs2305354	A	G	5676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=106;PP=2965;ReadPosRankSum=1.934;SC=TTGGTGAACCAATGGTTTTTT;SOR=0.505;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=182;TCF=75;TCR=107;TR=181;WE=100019504;WS=100019486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,205:1.00:206
chr2	100019612	rs3087397	TG	T	359.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.607;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=331;ReadPosRankSum=1.235;SC=AATGATAGTATGGATAGTCTG;SOR=1.274;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=10;WE=100019620;WS=100019602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr2	100021184	rs2290261	A	G	2107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=52;PP=1239;ReadPosRankSum=0.844;SC=AAGCATGCTCAGAGATGAGGT;SOR=0.733;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=159;TCF=64;TCR=95;TR=86;WE=100021192;WS=100021174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,99:0.54:183
chr2	100022617	rs13394927	G	A	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.738;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=281;ReadPosRankSum=0.690;SC=ATCGGGCAGGGCCTTTAATCC;SOR=1.210;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=59;TCF=24;TCR=35;TR=22;WE=100022625;WS=100022607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,24:0.41:59
chr2	100022772	rs717454	T	C	3565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=65;PP=2405;ReadPosRankSum=2.096;SC=AAGAACCACATTGATGACCAC;SOR=0.690;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=271;TCF=154;TCR=117;TR=150;WE=100022780;WS=100022762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,160:0.56:286
chr2	100050740	rs13409359	A	C	2081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.490;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=36;PP=1352;ReadPosRankSum=0.484;SC=CAAATAGCAAAATCCAGAAGC;SOR=0.732;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=217;TCF=136;TCR=81;TR=98;WE=100050748;WS=100050730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,105:0.46:230
chr2	100055033	rs10175852	C	A	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.568;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=181;ReadPosRankSum=-0.318;SC=ATGACTGTTTCTTAAGAAGAC;SOR=2.303;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=12;WE=100055041;WS=100055023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,12:0.32:37
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chr2	100055506	rs3087386	A	G	3595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=62;NR=55;PP=2624;SC=CTCCTGGGAAAAGGCTGGAGA;SOR=0.743;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=62;TCR=55;TR=117;WE=100055514;WS=100055496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
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chr2	100081323	rs28369943	C	T	4857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=120;NR=41;PP=2965;SC=CACATTATAACAGAAGAATGA;SOR=2.030;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=161;TCF=120;TCR=41;TR=161;WE=100081331;WS=100081313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr2	100081561	rs28369942	A	AAAGTC	1131.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=21;PP=1290;SC=CCAACTGATGAAAGTATACAA;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=21;WE=100081569;WS=100081551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	100218080	rs4851214	G	A	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.38;ReadPosRankSum=-2.500;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,5:0.22:23
chr2	100288931	rs4851222	G	A	1426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=23;PP=781;ReadPosRankSum=-0.364;SC=GTTAACACCCGGCACAGTCCA;SOR=0.723;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=202;TCF=124;TCR=78;TR=67;WE=100288939;WS=100288921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,79:0.34:229
chr2	100343557	rs4851223	C	T	6843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=124;NR=117;PP=2965;SC=CGATGTGCCACTGTCTGGACT;SOR=0.708;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=242;TCF=124;TCR=118;TR=241;WE=100343565;WS=100343547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,262:1.00:262
chr2	100454072	rs5832886	C	CT	3210.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.573;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.04;MQRankSum=1.241;NF=4;NR=42;PP=2716;ReadPosRankSum=0.899;SC=TTAGTCCCCCCCAACAAAAAA;SOR=0.593;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=135;TCF=10;TCR=125;TR=46;WE=100454093;WS=100454062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,100:0.40:252
chr2	100454085	rs1864273	T	A	2826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.113;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.234;NF=48;NR=77;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.357;SC=ACAAAAAAATTCAGCGAGTTA;SOR=0.783;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=187;TCF=71;TCR=116;TR=125;WE=100454093;WS=100454062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,130:0.61:214
chr2	100915629	rs4851286	T	C	7825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=153;NR=112;PP=2965;ReadPosRankSum=1.479;SC=TACACTTTGGTATACATTTCA;SOR=0.351;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=266;TCF=154;TCR=112;TR=265;WE=100915637;WS=100915619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,285:1.00:286
chr2	100915772	rs4851287	A	G	6151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=120;PP=2965;SC=GCTCCTTTGAAGTGAGAGATC;SOR=1.231;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=204;TCF=84;TCR=120;TR=204;WE=100915780;WS=100915762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr2	100916051	rs2033749	T	C	513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=1;PP=342;SC=CTCTATAATCTTAGAGCTGAT;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=100916059;WS=100916041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	100916306	rs2033748	A	G	6929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.78;SOR=0.908;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr2	100916315	rs11123823	A	G	3833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.90;ReadPosRankSum=0.189;SOR=0.934;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,146:0.99:148
chr2	100917109	rs13006224	C	T	9532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=180;NR=142;PP=2965;SC=GTCATACCTCCGAGCTCCCTG;SOR=0.865;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=322;TCF=180;TCR=142;TR=322;WE=100917117;WS=100917099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,350:1.00:350
chr2	100925803	rs10195793	A	G	469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=14;PP=364;SC=TATAAATACAATACAATACAA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=100925811;WS=100925793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	100938226	rs74177694	G	C	416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.15;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	100938241	rs192225848	G	A	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.43;ReadPosRankSum=-0.795;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr2	100938328	rs74177695	T	C	70.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=17.51;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr2	100938481	rs74177696	C	G	275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=4;PP=139;SC=CCTCTAAGCGCTGGGCGATCG;SOR=1.085;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=6;TCR=4;TR=10;WE=100938489;WS=100938471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	100938520	.	GGGC	G	94.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.047;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.92;ReadPosRankSum=1.275;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr2	100986964	rs1437971	A	C	1703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=36;PP=1176;SC=GCACTGGGCAAACTTCTGAAC;SOR=1.919;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=16;TCR=36;TR=52;WE=100986972;WS=100986954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr2	101009600	rs1530030	G	A	1044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=29;NR=0;PP=781;SC=GACCCCGGGCGTCCTCAAAGG;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=29;WE=101009608;WS=101009590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr2	101010082	rs3748930	G	C	8993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=344;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=160;NR=158;PP=2965;SC=GGATCCCCCGGGTCTCTGTCC;SOR=0.699;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=319;TCF=160;TCR=159;TR=318;WE=101010090;WS=101010072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,343:1.00:343
chr2	101011877	rs2241810	T	C	4408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=54;PP=2801;SC=CTCCGATCAATCTGCCAAGTA;SOR=1.207;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=154;TCF=100;TCR=54;TR=154;WE=101011885;WS=101011867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr2	101014247	rs4149517	C	A	471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=0;PP=362;SC=CCTGTCTGGACGGCCACCAGT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=101014255;WS=101014241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	101014363	rs2241809	C	T	5089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=105;NR=63;PP=2924;SC=AGTAGACCCACACACACCATT;SOR=1.143;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=169;TCF=106;TCR=63;TR=168;WE=101014371;WS=101014353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr2	101022886	rs4149512	C	T	1112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=4;PP=839;SC=ACCTCTGTAACATGAAGGAAC;SOR=3.797;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=33;WE=101022894;WS=101022876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr2	101031561	rs3828193	G	T	2395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=36;NR=57;PP=1715;SC=GAGGTTCTTGGTTCCTCTTGT;SOR=1.255;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=94;TCF=37;TCR=57;TR=93;WE=101031569;WS=101031551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr2	101096960	rs1519654	C	T	1670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.238;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=36;PP=887;ReadPosRankSum=-0.004;SC=CCTTGCAGGGCTCGGGGACTG;SOR=0.348;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=92;TCF=36;TCR=56;TR=63;WE=101096968;WS=101096950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,75:0.71:106
chr2	101126124	rs1829479	T	A	4532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=105;PP=2871;SC=TTTCTCCTTATTATGTTACTT;SOR=1.917;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=150;TCF=44;TCR=106;TR=149;WE=101126132;WS=101126114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr2	101179341	rs2970988	A	G	542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.18;SOR=3.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	101179341	.	AG	GA,GG	126	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.05;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=8,13;NR=1,2;PP=126,74;QD=19.9408749847;SC=CTTCTGTGCCAGTTCCTTGAA;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=9,15;WE=101179350;WS=101179331;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.60:15
chr2	101179342	rs2309848	G	A	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.256;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.58;ReadPosRankSum=-1.087;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr2	101186088	rs1052117	C	T	1031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.449;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.110;NF=31;NR=4;PP=657;ReadPosRankSum=0.510;SC=AGAATAAATTCGGAGAAGTTT;SOR=1.088;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=72;TCF=62;TCR=10;TR=35;WE=101186096;WS=101186078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,41:0.51:81
chr2	101188373	rs138885839	C	CCTGTGTATGAGTGA	2098.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-2.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.354;NF=0;NR=19;PP=2897;ReadPosRankSum=0.983;SC=TTCACTTCTGCCTGTGTATGA;SOR=0.756;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=73;TCF=2;TCR=71;TR=19;WE=101188381;WS=101188363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,54:0.53:102
chr2	101192883	rs4618078	G	A	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FS=10.338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQRankSum=-8.273;QD=0.12;ReadPosRankSum=4.354;SOR=1.045;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:244,33:0.12:277
chr2	101437561	rs6542989	G	A	4164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=342;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.401;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=109;NR=79;PP=2742;ReadPosRankSum=1.630;SC=TGACCTTTCTGAAGAGCTGGG;SOR=0.654;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=319;TCF=189;TCR=130;TR=188;WE=101437569;WS=101437551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,196:0.58:340
chr2	101437601	rs6542990	C	G	4911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=370;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.804;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=107;NR=105;PP=2962;ReadPosRankSum=1.309;SC=GGGACAGGCACCACCCGGCTA;SOR=0.589;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=349;TCF=182;TCR=167;TR=212;WE=101437609;WS=101437591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,222:0.60:370
chr2	101437762	rs13390078	A	G	934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.387;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=29;PP=677;ReadPosRankSum=-1.155;SC=GCACTTCCACAAAGTCTAAAC;SOR=1.077;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=66;TCF=17;TCR=49;TR=37;WE=101437770;WS=101437752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,39:0.57:69
chr2	101520972	rs5832941	A	AT	632.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=445;SC=GCCCAATGAAAGAGTGCCTGT;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=101520993;WS=101520962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	101520985	rs10168430	A	T	550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=1;PP=351;SC=GTGCCTGTGCATTTAAACATT;SOR=3.500;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=101520993;WS=101520962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	101521173	rs57350721	ATT	A	179.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.248;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQRankSum=-0.000;QD=16.34;ReadPosRankSum=2.128;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr2	101564628	rs10207725	A	G	663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.777;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=9;PP=412;ReadPosRankSum=0.994;SC=TGAATGTTCAATTTTTGTTTT;SOR=0.942;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=96;TCF=66;TCR=30;TR=32;WE=101564636;WS=101564618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,35:0.32:111
chr2	101566070	rs3739005	C	T	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=179;ReadPosRankSum=-0.207;SC=TTTGAATTTTCGAGTTCCCAG;SOR=0.675;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=13;WE=101566078;WS=101566060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr2	101580575	rs41280595	G	A	3291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.372;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=51;PP=1942;ReadPosRankSum=1.011;SC=CTTGCCGGGTGCCACTAGGAA;SOR=0.973;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=239;TCF=145;TCR=94;TR=140;WE=101580583;WS=101580565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,152:0.59:256
chr2	101581246	rs7581886	C	T	2513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.32;SOR=2.571;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr2	101581294	.	CT	C	185.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.046;ClippingRankSum=0.000;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.04;ReadPosRankSum=0.167;SOR=0.725;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,24:0.26:91
chr2	101581976	rs4851392	A	G	296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=224;SC=AGCCTCTCTGATTTTGACCAT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=101581984;WS=101581972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	101587455	rs1562313	C	T	1236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.677;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=32;PP=777;ReadPosRankSum=2.167;SC=TGTACAGTTACGCAGATGTCC;SOR=0.578;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=219;TCF=124;TCR=95;TR=71;WE=101587463;WS=101587445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,75:0.30:248
chr2	101591304	rs2305160	A	G	6845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=119;NR=118;PP=2965;SC=GCACTTTAACACACTCGACGT;SOR=0.740;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=239;TCF=120;TCR=119;TR=237;WE=101591312;WS=101591294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr2	101591443	rs2305159	A	C	1152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=31;PP=712;ReadPosRankSum=0.524;SC=TGGGATGTCCACATCAGACCA;SOR=0.647;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=118;TCF=39;TCR=79;TR=47;WE=101591451;WS=101591433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,54:0.43:125
chr2	101594191	rs11541353	C	T	3828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.082;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=76;PP=2195;ReadPosRankSum=1.227;SC=CCTTCCCCATCGTCCTGCGAC;SOR=0.560;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=249;TCF=125;TCR=124;TR=156;WE=101594199;WS=101594181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,177:0.63:279
chr2	101594454	rs9679638	T	C	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=67;ReadPosRankSum=0.511;SC=AGTTCTTTTTTCCAGTGTCTG;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=5;WE=101594462;WS=101594444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr2	101598677	rs2278727	C	T	3458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=447;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.534;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=71;PP=2242;ReadPosRankSum=0.592;SC=TTATGTTTTTCGGCTCCACCT;SOR=0.769;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=398;TCF=225;TCR=173;TR=163;WE=101598685;WS=101598667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:268,177:0.40:445
chr2	101609827	rs9223	C	T	2301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.404;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=51;PP=1321;ReadPosRankSum=-0.486;SC=AGAGCCAGACCGTGTTTCAAA;SOR=0.624;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=257;TCF=132;TCR=125;TR=109;WE=101609835;WS=101609817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,123:0.41:297
chr2	101619283	rs2278724	C	G	10321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=381;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=189;NR=163;PP=2965;SC=GAGTATCCCTCTAGCCGCCCT;SOR=0.797;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=352;TCF=189;TCR=163;TR=352;WE=101619296;WS=101619273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,381:1.00:381
chr2	101619321	rs2278723	T	C	11977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=439;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=198;NR=204;PP=2965;SC=GTCTGGTTGTTACCGAGAGAT;SOR=0.773;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=402;TCF=198;TCR=204;TR=402;WE=101619329;WS=101619311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,439:1.00:439
chr2	101619377	rs72821045	C	T	4142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.957;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=97;PP=2469;ReadPosRankSum=1.356;SC=GTGGCCTTCCCTGTTTCATTC;SOR=0.774;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=255;TCF=106;TCR=149;TR=166;WE=101619385;WS=101619367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,184:0.64:288
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chr2	101627925	rs1062062	C	T	2319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.747;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=27;PP=1239;ReadPosRankSum=-2.411;SC=TTGGGTTTCCCGAAAACCAGG;SOR=0.928;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=151;TCF=98;TCR=53;TR=87;WE=101627933;WS=101627915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,105:0.60:176
chr2	101635369	rs56291532	G	A	4590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.361;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=108;NR=81;PP=2767;ReadPosRankSum=-0.344;SC=AATCTGCAGTGAAAACTGTTG;SOR=0.838;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=309;TCF=170;TCR=139;TR=189;WE=101635377;WS=101635359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,210:0.61:345
chr2	101635538	rs13007048	C	T	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.057;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=16;PP=277;ReadPosRankSum=0.559;SC=CCTTGGGTCTCGGCTCTTCAT;SOR=0.419;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=79;TCF=25;TCR=54;TR=25;WE=101635546;WS=101635528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,30:0.33:90
chr2	101638828	rs34685616	C	T	3377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.413;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=67;PP=1983;ReadPosRankSum=0.239;SC=CGAGGATCTCCGTGTGGGCCC;SOR=0.676;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=243;TCF=126;TCR=117;TR=144;WE=101638836;WS=101638818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,159:0.59:268
chr2	101638888	rs3739014	A	G	5507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=93;PP=2965;SC=ACTGCCGGGCATCTATGCGGT;SOR=0.703;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=190;TCF=97;TCR=93;TR=190;WE=101638896;WS=101638878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr2	101644855	rs11683877	G	A	2947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.882;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=43;PP=1645;ReadPosRankSum=-1.081;SC=TGCCAACTGGGGGCCCTGGGC;SOR=0.805;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=276;TCF=169;TCR=107;TR=123;WE=101644863;WS=101644845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,146:0.46:316
chr2	101646359	rs12472882	G	C	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=174;ReadPosRankSum=0.581;SC=CCAGAAAAGCGTCCATGCTTA;SOR=0.960;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=10;WE=101646367;WS=101646349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr2	101652732	rs4850957	C	T	638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.342;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=21;PP=421;ReadPosRankSum=1.365;SC=CCCTGCTCTCCGAGGGGCCAA;SOR=0.211;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=74;TCF=22;TCR=52;TR=33;WE=101652740;WS=101652722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,32:0.44:73
chr2	101656726	rs2289953	T	C	5859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=95;PP=2965;SC=ATCCGCCCCGTGGTGTGACAG;SOR=0.711;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=204;TCF=109;TCR=95;TR=204;WE=101656734;WS=101656716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr2	101675808	rs7572457	A	G	1517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=3.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.359;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=13;PP=952;ReadPosRankSum=-1.136;SC=AACTGTTAGTATGCTACAGTG;SOR=0.977;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=125;TCF=91;TCR=34;TR=55;WE=101675816;WS=101675798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,65:0.45:144
chr2	101883046	rs1660694	A	G	1369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.753;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=4;PP=1073;ReadPosRankSum=1.503;SC=AGCTTTTTGTATAAAATGCTT;SOR=1.574;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=62;TCF=55;TCR=7;TR=46;WE=101883054;WS=101883036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,48:0.74:65
chr2	101898412	rs13151	G	C	1869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.324;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=29;PP=1062;ReadPosRankSum=0.063;SC=GTGGACTGCTGTCATCACTTC;SOR=0.823;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=128;TCF=74;TCR=54;TR=73;WE=101898420;WS=101898402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,84:0.58:144
chr2	101925026	rs11123868	T	C	1743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.502;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=55;PP=947;ReadPosRankSum=-0.576;SC=GCCCCGACGCTGGCTTCGCGC;SOR=0.639;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=246;TCF=82;TCR=164;TR=84;WE=101925034;WS=101925016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,95:0.36:263
chr2	101967346	rs6543032	C	T	3394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.482;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=53;PP=2165;ReadPosRankSum=-0.327;SC=AAAAGGTTTTCATTTAAGTGC;SOR=0.746;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=240;TCF=151;TCR=89;TR=141;WE=101967354;WS=101967336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,151:0.60:253
chr2	102000210	rs11694978	G	A	1007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.063;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=27;PP=635;ReadPosRankSum=-0.973;SC=GCTGTGGCTCGACTTGATCTG;SOR=1.080;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=67;TCF=29;TCR=38;TR=44;WE=102000218;WS=102000200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,46:0.62:74
chr2	102003633	rs11554173	G	T	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=1.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.25;ReadPosRankSum=1.419;SOR=0.930;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,19:0.32:60
chr2	102018878	rs11123876	G	A	1308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=20;PP=718;ReadPosRankSum=-0.443;SC=CTGTGTGGAAGGGGGTCCTGG;SOR=0.764;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=89;TCF=54;TCR=35;TR=51;WE=102018886;WS=102018868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,60:0.60:100
chr2	102019129	rs201832728	C	T	6513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=487;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=129;NR=127;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.232;SC=TCCCCATGTCCTCCTCCTCCT;SOR=0.711;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=437;TCF=221;TCR=216;TR=256;WE=102019137;WS=102019116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:191,286:0.60:477
chr2	102027050	rs35603034	CT	C	149.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.39;ReadPosRankSum=0.439;SOR=0.546;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,24:0.22:108
chr2	102029273	rs11689348	T	C	535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=344;ReadPosRankSum=1.707;SC=ATCGGAGTTATAAAGTTCTAC;SOR=0.833;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=19;WE=102029281;WS=102029263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,22:0.67:33
chr2	102029548	rs1554070	G	A	2057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=52;PP=1249;ReadPosRankSum=-0.086;SC=AGATAACAGGGAGGCATAATA;SOR=0.742;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=147;TCF=61;TCR=86;TR=86;WE=102029556;WS=102029538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,94:0.59:159
chr2	102031176	rs4851434	A	G	1246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=4;PP=867;SC=TCCTCTGCCAATGGCCAGGCA;SOR=3.258;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=36;WE=102031184;WS=102031166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr2	102031489	rs4851435	C	G	1819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.380;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=51;PP=1180;ReadPosRankSum=0.258;SC=TAAACTGCAACTTCCCCCACC;SOR=1.079;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=126;TCF=43;TCR=83;TR=75;WE=102031497;WS=102031479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,80:0.59:136
chr2	102035192	rs6709913	C	T	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.925;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=235;ReadPosRankSum=0.728;SC=TCCATACACCCCACTATTCAC;SOR=2.049;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=13;WE=102035200;WS=102035182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr2	102038849	rs4851436	T	A	10873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=395;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=152;NR=197;PP=2965;SC=TTTCTTTGCCTGTTCTTGCTC;SOR=1.037;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=349;TCF=152;TCR=197;TR=349;WE=102038857;WS=102038839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,395:1.00:395
chr2	102045328	rs6543047	C	T	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.497;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=243;ReadPosRankSum=1.896;SC=CAGAAGAGTACGCACAGAAAA;SOR=1.463;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=16;WE=102045336;WS=102045318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr2	102066878	rs4851448	A	T	464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=2;PP=347;SC=AGAGATGGAGATTTGCCATGT;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=102066886;WS=102066871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	102067083	rs7585228	T	C	4866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=81;PP=2965;SC=ACCTATCAGGTAGCAATACTG;SOR=0.875;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=77;TCR=81;TR=158;WE=102067091;WS=102067073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr2	102068715	rs11123884	C	G	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=112;ReadPosRankSum=0.814;SC=GGAATTAATGCGAATTGTGGA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=7;WE=102068723;WS=102068705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr2	102068872	rs4851449	T	A	3905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.442;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=73;PP=2131;ReadPosRankSum=-0.647;SC=GTGCCCAGCCTCCGGGTGCCA;SOR=0.737;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=258;TCF=142;TCR=116;TR=161;WE=102068880;WS=102068862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,182:0.63:290
chr2	102069002	rs4851450	T	C	885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.351;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=26;PP=545;ReadPosRankSum=2.009;SC=ATATTCCTTTTCCTCTTTTCT;SOR=0.211;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=59;TCF=10;TCR=49;TR=34;WE=102069010;WS=102068992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,37:0.60:62
chr2	102083183	rs4851455	T	C	1415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=12;PP=994;SC=CTCCAATAACTTGCTTCCCTT;SOR=1.911;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=34;TCR=12;TR=46;WE=102083191;WS=102083173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	102314437	rs13430711	T	C	1537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.837;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=14;PP=1048;ReadPosRankSum=1.422;SC=CCGGGCCGGCTCGGCTGCCGC;SOR=0.830;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=104;TCF=78;TCR=26;TR=59;WE=102314445;WS=102314427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,63:0.58:109
chr2	102314633	.	G	GGGCAGCC	1142.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.108;ClippingRankSum=0.000;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.196;NF=1;NR=19;PP=1310;ReadPosRankSum=0.843;SC=CGCGGGGAGCGGGCAGCCGGC;SOR=0.965;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=75;TCF=1;TCR=74;TR=20;WE=102314641;WS=102314623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,30:0.60:50
chr2	102315057	rs1567385	A	G	597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=436;ReadPosRankSum=1.523;SC=TTATTGGGGGACGAGGAGAGG;SOR=0.569;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=22;WE=102315065;WS=102315047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,23:0.66:35
chr2	102459268	rs17801985	A	G	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=175;ReadPosRankSum=-1.463;SC=GCATCTTACTATCTCCATTCT;SOR=0.741;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=10;WE=102459276;WS=102459258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr2	102483883	rs17745869	T	G	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.395;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=460;ReadPosRankSum=0.137;SC=CCCTCACAGATTTGAGGAATT;SOR=2.232;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=20;WE=102483891;WS=102483873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,25:0.64:39
chr2	102501891	rs57584884	A	G	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.551;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=259;ReadPosRankSum=0.119;SC=TTTATCATAAACCATTTCTAA;SOR=1.802;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=12;WE=102501899;WS=102501881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr2	102632582	rs3819369	T	A	1517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=40;PP=1054;SC=AAAGAAAGACTTAAAATATCG;SOR=2.480;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=12;TCR=40;TR=52;WE=102632590;WS=102632572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr2	102788409	rs2041747	G	A	4251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=91;PP=2708;SC=TCACATTTTGGTGTTAAATCC;SOR=1.463;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=148;TCF=53;TCR=95;TR=144;WE=102788417;WS=102788399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr2	102804538	rs144678772	A	AACC	1202.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=25;PP=1267;SC=GGAAACAGAGAACCAGCTCCA;SOR=5.353;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=25;WE=102804546;WS=102804528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	102817954	rs2302623	A	T	2113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=16;PP=1323;SC=TTACCTAAATACTAGGGATCA;SOR=1.997;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=49;TCR=16;TR=65;WE=102817962;WS=102817944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr2	102828378	rs138145179	A	ATT	387.92	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.71;ReadPosRankSum=-0.623;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
chr2	102828768	rs1922290	G	C	254.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=210;SC=TTGGATATACGTGAGCTCATG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=102828776;WS=102828758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	102955370	rs190188722	C	T	1709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.496;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=31;PP=1072;ReadPosRankSum=-0.437;SC=CTAGTTACACCGTGGATTGGT;SOR=0.753;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=213;TCF=132;TCR=81;TR=81;WE=102955378;WS=102955360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,90:0.37:241
chr2	102955468	rs1041973	C	A	3950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=94;PP=2553;ReadPosRankSum=-0.266;SC=CTACCAGCTGCAGTTGCTGAT;SOR=0.674;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=307;TCF=143;TCR=164;TR=174;WE=102955476;WS=102955458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,184:0.55:336
chr2	102957262	rs201973706	C	T	4424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=92;PP=2742;ReadPosRankSum=-2.034;SC=TATAGTGTGACGGCGACCAGG;SOR=0.675;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=296;TCF=149;TCR=147;TR=185;WE=102957270;WS=102957252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,203:0.62:326
chr2	102957716	rs1420101	C	T	2204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.89;SOR=1.151;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr2	102979028	rs2287037	C	T	3828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=33;PP=2308;SC=ATTTTTAAACCTTCATAAGAT;SOR=1.699;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=84;TCR=33;TR=117;WE=102979036;WS=102979018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr2	102984279	rs1420098	T	C	2915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=21;PP=2022;SC=TACTAATCTTTTGAAGAATCT;SOR=2.502;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=71;TCR=21;TR=92;WE=102984287;WS=102984269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr2	102998279	rs3213732	A	G	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=156;ReadPosRankSum=0.993;SC=AAAACTAAGAAAAGAGTGCCA;SOR=0.818;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=10;WE=102998287;WS=102998269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr2	103001402	rs1035130	C	T	2891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.818;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=72;PP=1686;ReadPosRankSum=-1.419;SC=ATTGGATGTTCGGGGAAGAAA;SOR=0.644;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=319;TCF=145;TCR=174;TR=133;WE=103001417;WS=103001392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:203,148:0.42:351
chr2	103003265	rs2241116	C	A	561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.229;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=9;PP=345;ReadPosRankSum=0.133;SC=CATGTGAATTCCCCTCTCAAG;SOR=0.402;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=67;TCF=48;TCR=19;TR=28;WE=103003273;WS=103003255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,29:0.41:70
chr2	103006387	rs4851570	A	G	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.885;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=159;ReadPosRankSum=-0.114;SC=ACTCAGTGGAATGTGTCAGCA;SOR=0.241;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=41;TCF=30;TCR=11;TR=16;WE=103006395;WS=103006377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,17:0.38:45
chr2	103006448	rs6749014	C	T	1870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.703;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=25;PP=1219;ReadPosRankSum=0.020;SC=TGGACAAGCACGTGATGATGG;SOR=0.620;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=118;TCF=80;TCR=38;TR=75;WE=103006456;WS=103006438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,82:0.63:130
chr2	103010912	rs1420096	C	T	3344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.632;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=47;PP=1999;ReadPosRankSum=-0.125;SC=ATTAAAAGAGCCAATCTTACC;SOR=0.575;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=222;TCF=146;TCR=76;TR=138;WE=103010920;WS=103010902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,151:0.61:249
chr2	103039584	rs3817465	A	T	1617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=4;PP=1210;SC=CCTGTGTGAGATGCACTTTGT;SOR=4.615;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=44;TCR=4;TR=48;WE=103039592;WS=103039574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr2	103040247	rs11377261	T	TG	2981.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=4;PP=2079;SC=TGTTTCCATGTGCTTTGTTTA;SOR=4.479;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=45;TCR=4;TR=48;WE=103040257;WS=103040237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr2	103040249	rs2272129	C	T	2989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=4;PP=1201;SC=TTTCCATGTGCTTTGTTTATT;SOR=4.143;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=68;TCF=60;TCR=8;TR=57;WE=103040257;WS=103040237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr2	103040702	rs11695455	A	G	2511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=425;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=63;PP=1734;ReadPosRankSum=-1.865;SC=AGCCCCTATGATGTAGCCTGT;SOR=0.708;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=395;TCF=211;TCR=184;TR=136;WE=103040710;WS=103040692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:284,140:0.33:424
chr2	103040945	rs887972	G	A	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.234;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=281;ReadPosRankSum=0.302;SC=GGCTTTTCATGGAAAAGCGTG;SOR=3.777;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=14;WE=103040953;WS=103040935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr2	103048738	rs62154972	G	A	754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.988;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=0;PP=565;ReadPosRankSum=-0.134;SC=TTGAGTCGCTGGCTGAGCTCT;SOR=3.040;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=26;WE=103048746;WS=103048728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,28:0.68:41
chr2	103057668	rs11465700	G	A	1266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.166;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=22;PP=807;ReadPosRankSum=1.318;SC=TGAAGACAGAGCTCCAAGACA;SOR=0.492;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=126;TCF=81;TCR=45;TR=56;WE=103057676;WS=103057658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,62:0.42:147
chr2	103059613	rs1558651	A	G	5643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=114;NR=73;PP=2965;SC=AGGACAAAGTATTCTCACCAG;SOR=1.151;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=189;TCF=115;TCR=74;TR=187;WE=103059621;WS=103059603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr2	103090127	rs17027255	C	T	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=94;ReadPosRankSum=0.293;SC=ACTTTTGACCCAGGTGGATGC;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=6;WE=103090135;WS=103090119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr2	103095404	rs11692304	G	A	2460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.034;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=57;PP=1375;ReadPosRankSum=1.791;SC=ACCACAAATCGCCTCCGGTCA;SOR=0.542;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=290;TCF=157;TCR=133;TR=118;WE=103095412;WS=103095394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:190,133:0.41:323
chr2	103095531	rs61731286	T	C	2970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.302;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=63;PP=1815;ReadPosRankSum=1.018;SC=GTGGGCAGTATTGGGGGCCCT;SOR=0.855;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=201;TCF=91;TCR=110;TR=112;WE=103095539;WS=103095521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,128:0.57:225
chr2	103120232	rs2075188	G	A	5587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=111;PP=2965;SC=CATCACATGAGCCAGGCATCT;SOR=1.057;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=198;TCF=87;TCR=111;TR=197;WE=103120240;WS=103120222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr2	103120311	rs2075187	G	A	1144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=31;PP=908;SC=AAACTTTTATGAAACCTGATT;SOR=4.294;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=34;WE=103120319;WS=103120301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr2	103125182	rs6724322	C	T	196.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=157;SC=GCAGCATTTACTCTGTAATAG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=103125190;WS=103125172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	103125457	rs6739301	A	G	13493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.11;SOR=0.779;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,313:1.00:313
chr2	103125466	rs6742381	T	C	13199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.29;SOR=0.898;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,298:1.00:298
chr2	103128866	rs4851609	T	C	1185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=28;PP=640;SC=CTACAGGAAGTGGTTGAAATT;SOR=2.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=40;WE=103128874;WS=103128856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr2	103136309	rs1403550	T	C	6297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=123;NR=101;PP=2965;SC=TCTCCAATAATGATTCCAGGG;SOR=0.779;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=224;TCF=123;TCR=101;TR=224;WE=103136317;WS=103136299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr2	103136446	rs1403551	T	G	1711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=42;PP=1177;SC=TGTCCCCATTTTCTGTCCTTG;SOR=2.381;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=14;TCR=42;TR=56;WE=103136454;WS=103136436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr2	103141447	rs2015478	A	G	5015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=67;PP=2873;SC=TGTATGGAGGAGTCCTTACGT;SOR=0.842;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=161;TCF=94;TCR=67;TR=161;WE=103141455;WS=103141437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr2	103141651	rs1024798	G	C	1552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=35;PP=1053;SC=TTCCTTCAGTGTGCAAGTGTT;SOR=2.925;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=9;TCR=35;TR=44;WE=103141659;WS=103141641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr2	103149100	rs1014286	G	A	2911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=51;PP=1766;SC=CCATGGACACGGCAGGGACCA;SOR=1.125;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=39;TCR=52;TR=90;WE=103149108;WS=103149090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr2	103149162	rs2008159	A	G	1538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=34;PP=1016;SC=ATTGTCCACAAGATTGTTTTG;SOR=1.528;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=18;TCR=34;TR=52;WE=103149170;WS=103149152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr2	103149182	rs2008157	A	G	1169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=26;PP=768;SC=GGTGTTTCTCAAGAGTCTGTC;SOR=1.455;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=15;TCR=26;TR=41;WE=103149190;WS=103149172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr2	103300070	rs41280599	G	A	751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=20;PP=496;ReadPosRankSum=1.326;SC=TCTTACCTACGTCTTCCTCCT;SOR=0.628;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=68;TCF=29;TCR=39;TR=35;WE=103300078;WS=103300060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,36:0.47:76
chr2	103300506	rs6757258	A	G	2874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=29;PP=1825;SC=CTTTGTCCCCATCGCAGAAGC;SOR=1.743;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=75;TCR=29;TR=104;WE=103300514;WS=103300496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr2	103334969	rs1052431	G	A	2054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=372;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.824;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.689;NF=50;NR=51;PP=1039;ReadPosRankSum=0.357;SC=CTAACACAGCGCCCAGGCTGG;SOR=0.583;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=331;TCF=157;TCR=174;TR=101;WE=103334985;WS=103334959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:251,121:0.33:372
chr2	103335754	rs72828057	T	C	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=21;PP=493;ReadPosRankSum=0.569;SC=TTATTTGTGTTAGATTACTAA;SOR=0.556;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=42;TCF=4;TCR=38;TR=24;WE=103335762;WS=103335744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,25:0.54:46
chr2	103375056	rs2732838	T	G	1817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.588;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=39;PP=1088;ReadPosRankSum=-0.681;SC=GCTTAACAAGTACCAAGCTGG;SOR=0.624;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=143;TCF=70;TCR=73;TR=77;WE=103375064;WS=103375046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,85:0.54:158
chr2	103378857	rs2540298	C	G	1889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-3.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.613;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=56;PP=1342;ReadPosRankSum=-0.876;SC=TATGAAGATACCCTTATGTAT;SOR=0.622;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=159;TCF=51;TCR=108;TR=83;WE=103378865;WS=103378847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,85:0.52:165
chr2	103414593	rs140870577	CACTA	C	493.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.481;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.652;NF=0;NR=7;PP=263;ReadPosRankSum=-2.194;SC=ACTTCTTGAACACTAACTAAT;SOR=1.688;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=7;WE=103414604;WS=103414583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr2	103431404	rs887987	T	C	2610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=59;PP=1454;SC=GGTTGTTGGATGGCATATTCA;SOR=1.454;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=36;TCR=59;TR=95;WE=103431412;WS=103431394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr2	104995800	rs4851692	C	T	4674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=370;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=102;NR=89;PP=2825;ReadPosRankSum=-2.271;SC=GTGACCCATACCTGATGTCTC;SOR=0.701;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=340;TCF=180;TCR=160;TR=191;WE=104995808;WS=104995790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,215:0.58:370
chr2	105472556	.	AGCC	A	20	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.4999;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=0;NR=1;PP=20;QD=30.0;SC=CCGCAGCCGCAGCCGCCGCCG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=1;WE=105472566;WS=105472546;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:8,1:0.11:9
chr2	105654716	rs3739160	C	T	1820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=45;PP=1041;ReadPosRankSum=-1.262;SC=AAGCGGCTTACCTCTGCCGCG;SOR=0.675;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=209;TCF=94;TCR=115;TR=83;WE=105654724;WS=105654706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,95:0.41:233
chr2	105654830	rs3739159	G	T	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=122;ReadPosRankSum=-0.327;SC=AGGTTGGGGGGGAGGAGGTGG;SOR=0.197;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=10;WE=105654838;WS=105654820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr2	105696591	rs68154520	C	T	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=3.361;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=67;ReadPosRankSum=1.027;SC=GGATACTGTTCGCAGCTTCAG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=5;WE=105696599;WS=105696581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr2	105708941	rs116793449	G	A	3846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.156;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=76;PP=2340;ReadPosRankSum=-0.382;SC=CAGAGGTTTCGAAGAAGTGTA;SOR=0.709;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=236;TCF=120;TCR=116;TR=151;WE=105708949;WS=105708931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,170:0.65:263
chr2	105709023	rs6543282	T	C	4217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.978;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=90;PP=2411;ReadPosRankSum=2.310;SC=TTAGCAAAAGTGAAGGTAATG;SOR=1.315;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=149;TCF=59;TCR=90;TR=148;WE=105709031;WS=105709013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,165:0.98:169
chr2	105885961	rs2241797	T	C	1002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.752;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=17;PP=588;ReadPosRankSum=-1.102;SC=GGGGCCAGCATGCAGGTAGAT;SOR=0.843;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=97;TCF=56;TCR=41;TR=45;WE=105885969;WS=105885951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,48:0.48:101
chr2	105886219	rs2241798	C	A	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.05;ReadPosRankSum=0.408;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,3:0.20:15
chr2	105897003	rs2241799	G	A	2782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.161;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=56;PP=1571;ReadPosRankSum=1.450;SC=TGCGGACCTCGTTCAGGTAGC;SOR=0.791;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=179;TCF=92;TCR=87;TR=112;WE=105897011;WS=105896993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,126:0.65:194
chr2	105897261	rs2679833	C	T	2517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=54;PP=1558;SC=TGGAGGGGAGCGCACGGTGGC;SOR=1.440;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=87;TCF=32;TCR=55;TR=86;WE=105897269;WS=105897251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr2	105915128	rs12476720	G	A	1112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.482;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=32;PP=637;ReadPosRankSum=-0.380;SC=GCACGGGGGCGCGCTGGGATA;SOR=0.986;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=111;TCF=38;TCR=73;TR=46;WE=105915136;WS=105915118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,54:0.44:124
chr2	105924510	rs2241801	A	G	5438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=85;PP=2965;SC=CTGAGGCCGCACGCAGCTCGT;SOR=0.831;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=187;TCF=102;TCR=85;TR=186;WE=105924518;WS=105924500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr2	105953909	rs2033727	G	C	942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.304;NF=21;NR=13;PP=547;ReadPosRankSum=0.064;SC=ACCCGAACCAGCAGCGAGAGA;SOR=0.641;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=55;TCF=36;TCR=19;TR=34;WE=105953917;WS=105953899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,44:0.61:72
chr2	105953938	rs3217439	G	GC	4397.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=24;NR=30;PP=2446;SC=GGCATGCGGCGACTCAGAGTG;SOR=1.211;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=56;TCF=25;TCR=31;TR=54;WE=105953946;WS=105953928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr2	105961703	rs2679842	G	A	1740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=9;PP=1226;SC=TTGGTTGTTTGAAATGTTCAT;SOR=3.296;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=46;TCR=9;TR=55;WE=105961711;WS=105961693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr2	105977903	rs2244182	G	C	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=13;PP=287;ReadPosRankSum=0.362;SC=TGTTAACAGAGAGAAAATAAT;SOR=0.588;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=27;TCR=45;TR=21;WE=105977911;WS=105977893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,22:0.27:83
chr2	105979710	rs371939143	G	A	3469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=426;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.125;HP=5;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=69;PP=1884;ReadPosRankSum=1.811;SC=GCTTCCAATCGCCCCTGGAAA;SOR=0.591;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=392;TCF=230;TCR=162;TR=163;WE=105979718;WS=105979700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:241,183:0.43:424
chr2	105979730	rs2278502	C	A	6073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=513;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.762;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=150;NR=116;PP=2962;ReadPosRankSum=0.073;SC=ATGGGAACCCCGGGACACTCA;SOR=0.851;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=471;TCF=259;TCR=212;TR=266;WE=105979738;WS=105979720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:226,285:0.56:511
chr2	106013216	rs11891016	T	C	2079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-2.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.531;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=62;PP=1117;ReadPosRankSum=2.157;SC=CTCAGTATAATGCAACTTGAG;SOR=0.617;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=205;TCF=63;TCR=142;TR=92;WE=106013224;WS=106013206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,105:0.46:226
chr2	106013248	rs11884297	C	T	1166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-2.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.051;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=35;PP=762;ReadPosRankSum=-2.143;SC=ATAAATGTGGCTTTGATCAAA;SOR=0.874;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=86;TCF=15;TCR=71;TR=42;WE=106013256;WS=106013238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,48:0.51:95
chr2	106471393	rs6543345	T	C	1969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=13;PP=1235;SC=AGGAGAAAACTGGTTGCAGAG;SOR=2.235;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=47;TCR=13;TR=60;WE=106471401;WS=106471383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr2	106471825	.	C	CA	194	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;FR=0.9998;HP=12;HapScore=2;MGOF=18;MMLQ=16;MQ=61.25;NF=0;NR=16;PP=194;QD=12.5;SC=TTTGCTGTTTCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=16;WE=106471833;WS=106471815;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:9,16:0.64:25
chr2	106690557	rs41280611	G	A	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.903;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=140;ReadPosRankSum=1.036;SC=GCAGGGAGGAGGCCTGGCTCG;SOR=0.569;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=6;WE=106690565;WS=106690547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr2	106710668	rs11268588	C	CGCAGGAAGGAAGTGCCACCTT	1197.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.24;QD=46.07;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	106713480	rs17032319	C	G	4171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.652;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=75;PP=2765;ReadPosRankSum=-0.642;SC=ACTGCTGTGGCCAAGCTGACT;SOR=0.738;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=264;TCF=134;TCR=130;TR=158;WE=106713488;WS=106713470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,175:0.61:285
chr2	106715342	rs3820891	G	A	3792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=93;PP=2521;SC=ACCTCCCTGCGCTGCTTCAGC;SOR=2.025;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=33;TCR=93;TR=126;WE=106715350;WS=106715332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr2	106717274	rs3739136	A	G	332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=2;PP=245;SC=TCTTAGACCCAGGCCCTTCAG;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=106717282;WS=106717264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	106717656	rs10177888	G	A	1040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=30;PP=850;SC=CCTCCCAGAAGAAAAATTACC;SOR=4.112;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=33;WE=106717664;WS=106717646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr2	106739327	.	A	G	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.034;ClippingRankSum=-0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=102;ReadPosRankSum=-0.072;SC=CTATCCCCAGACAAAATCAGT;SOR=1.230;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=6;WE=106739335;WS=106739317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr2	106742139	rs4851925	C	T	5520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=99;NR=83;PP=2872;SC=GCCAGCCCTACAGAAAGCAAT;SOR=0.722;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=183;TCF=99;TCR=84;TR=182;WE=106742147;WS=106742129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr2	106742177	rs3739137	T	A	5378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=86;NR=88;PP=2965;SC=TGAATTTACATGTGCAGGCAC;SOR=0.879;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=174;TCF=86;TCR=88;TR=174;WE=106742185;WS=106742167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr2	106780015	rs3910716	C	T	1549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=17;PP=923;SC=AATGCGTATACAGACATTTAT;SOR=1.382;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=33;TCR=17;TR=50;WE=106780023;WS=106780005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr2	106780055	rs10631203	C	CTG	3857.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=29;PP=2447;SC=AGCAAACAAACAGAATTAATT;SOR=0.972;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=18;TCR=29;TR=47;WE=106780063;WS=106780045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr2	106782398	rs4851115	C	G	2030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=20;PP=1364;SC=CAAGAACCCACTTTTGTTTTA;SOR=1.852;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=48;TCR=20;TR=68;WE=106782406;WS=106782388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr2	106810727	rs7604916	A	G	6572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=129;PP=2965;SC=CCAGGGCCCTACCGCGCGGGG;SOR=1.232;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=219;TCF=89;TCR=130;TR=218;WE=106810735;WS=106810717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr2	106810767	rs78870678	G	T	827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=0.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.33;ReadPosRankSum=0.060;SOR=0.856;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,40:0.35:113
chr2	106992845	rs56959583	A	G	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.37;MQRankSum=-0.679;QD=18.88;ReadPosRankSum=1.716;SOR=1.493;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr2	106992952	rs4641931	A	G	1167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.49;BaseQRankSum=1.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.613;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.260;NF=35;NR=22;PP=731;ReadPosRankSum=-0.212;SC=CATCTGACCTATGTGGGCAAA;SOR=0.772;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=144;TCF=91;TCR=53;TR=57;WE=106992980;WS=106992942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,60:0.36:166
chr2	106992963	rs11464214	A	AG	7515.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.49;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=64;PP=2963;SC=TGTGGGCAAAATTCCTGTGCT;SOR=0.993;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=39;TCR=65;TR=102;WE=106992980;WS=106992942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr2	107007467	rs7575679	G	A	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FS=9.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.39;MQRankSum=-12.071;QD=1.48;ReadPosRankSum=-0.718;SOR=1.452;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:194,35:0.15:229
chr2	107007576	rs60043380	A	T	963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=2.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.499;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.960;NF=4;NR=32;PP=733;ReadPosRankSum=-1.431;SC=ACCAAAATCCATGCTTCTCAA;SOR=0.307;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=53;TCF=5;TCR=48;TR=36;WE=107007584;WS=107007566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,36:0.78:46
chr2	107107511	rs11124115	C	T	7259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=121;NR=117;PP=2965;SC=TCTGGGATTCCGCAAAAGGGA;SOR=0.732;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=238;TCF=121;TCR=117;TR=238;WE=107107519;WS=107107501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,259:1.00:259
chr2	107107567	rs2228021	G	C	6684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=124;NR=120;PP=2965;SC=GCTGTGTTTCGGGATGCAAGC;SOR=0.943;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=244;TCF=124;TCR=120;TR=244;WE=107107575;WS=107107557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chr2	107107694	rs6543414	A	G	1596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.12;QD=29.57;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr2	107107765	rs6543415	C	A	905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=25;PP=685;SC=GACCACCAGGCTTCAGTGTGC;SOR=1.751;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=34;WE=107107773;WS=107107755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr2	107118896	rs4340514	T	C	2364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=24;PP=1438;SC=AAAAATGTTCTGTGTTGAACA;SOR=1.788;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=61;TCR=24;TR=85;WE=107118904;WS=107118886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
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chr2	107120812	rs62154001	T	A	777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=0.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.09;MQRankSum=-4.549;QD=7.01;ReadPosRankSum=2.652;SOR=0.840;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,46:0.41:111
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chr2	107423395	rs1470590	T	G	3508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.219;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=64;PP=2047;ReadPosRankSum=-0.586;SC=TGGACATCATTATGAGGATTC;SOR=0.568;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=220;TCF=119;TCR=101;TR=137;WE=107423403;WS=107423385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,161:0.64:252
chr2	107429801	rs6739022	C	T	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.53;ReadPosRankSum=0.921;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr2	107446396	rs877693	T	C	736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=1;PP=622;SC=AAATCAGAAATACTTCTGGTT;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=24;WE=107446404;WS=107446386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	107446430	rs935565	T	C	1841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=9;PP=1197;SC=ATAAGGTATTTTCAACCTGTA;SOR=2.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=44;TCR=9;TR=53;WE=107446438;WS=107446420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr2	107450390	rs7608410	C	T	1035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.423;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=5;PP=687;ReadPosRankSum=0.285;SC=ACAAGTACCACGGTCATAATT;SOR=1.087;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=62;TCF=53;TCR=9;TR=37;WE=107450398;WS=107450380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,41:0.62:66
chr2	107450589	rs3796111	C	T	3507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=80;PP=1982;ReadPosRankSum=0.254;SC=ATCTCAAAACCGCATCATGAG;SOR=0.722;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=257;TCF=114;TCR=143;TR=144;WE=107450597;WS=107450579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,161:0.57:284
chr2	107459974	rs3796110	C	T	4061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.865;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=77;PP=2493;ReadPosRankSum=2.346;SC=CCTGGCTCCCCGGGGGAAGGG;SOR=0.634;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=294;TCF=163;TCR=131;TR=170;WE=107459982;WS=107459964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,183:0.58:316
chr2	108608648	rs1013940	A	G	1752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.993;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=43;PP=1170;ReadPosRankSum=1.112;SC=TCAGGCACCAATTGGATATTC;SOR=0.795;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=248;TCF=122;TCR=126;TR=83;WE=108608656;WS=108608638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:177,90:0.34:267
chr2	108863650	rs9646947	A	C	8525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=171;NR=118;PP=2965;SC=CCAGATTCCCAATGGCGAAGA;SOR=1.142;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=289;TCF=171;TCR=118;TR=289;WE=108863658;WS=108863640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,308:1.00:308
chr2	108863767	rs9308806	A	C	7878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=112;NR=140;PP=2965;SC=GGGAAAAAGTATGTAATTTCC;SOR=1.054;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=252;TCF=112;TCR=140;TR=252;WE=108863775;WS=108863757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,282:1.00:282
chr2	108868736	rs13030422	G	A	430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=2;PP=360;SC=GTGCTCTCATGTTGCTGTCTT;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=108868744;WS=108868726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	108875464	.	AAAACTTGGTCAGGTGATGTTAT	A	11452.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=88;PP=2974;SC=ATTCTTGGAGAAAACTTGGTC;SOR=0.914;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=117;TCF=22;TCR=95;TR=109;WE=108875493;WS=108875454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr2	108876948	rs4141931	C	T	810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=4;PP=644;SC=GTGGGTAGGCCTAGGAACCAT;SOR=3.014;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=108876956;WS=108876938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	108877062	rs4141932	T	A	7014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=143;NR=93;PP=2965;SC=TACTGTGGCTTTGAATGAGAA;SOR=1.122;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=236;TCF=143;TCR=93;TR=236;WE=108877070;WS=108877052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,259:1.00:259
chr2	108915136	rs7590599	T	C	3869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=84;NR=50;PP=2415;SC=CTGCCCCTGGTCTTCTTTGCA;SOR=1.117;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=135;TCF=84;TCR=51;TR=134;WE=108915144;WS=108915126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr2	108915263	rs4149422	C	T	3602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=48;NR=76;PP=2270;SC=TTTTCCCTCACTTGTTTTGTA;SOR=1.312;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=48;TCR=76;TR=124;WE=108915271;WS=108915253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr2	108994808	rs1402467	C	G	11603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=428;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=214;NR=165;PP=2965;SC=CCTTACACGACATGGAGGATT;SOR=0.926;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=379;TCF=214;TCR=165;TR=379;WE=108994816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,427:1.00:427
chr2	108998797	rs145051924	A	AG	2283.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.454;HP=1;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=35;PP=2426;ReadPosRankSum=0.397;SC=AAGCAAATAGATAAAAAAAAA;SOR=0.659;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=169;TCF=85;TCR=84;TR=81;WE=108998806;WS=108998784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,127:0.47:273
chr2	108998798	rs4149434	T	A	5157.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=3.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.954;HP=11;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=36;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.242;SC=AGCAAATAGATAAAAAAAAAA;SOR=0.769;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=271;TCF=177;TCR=94;TR=120;WE=108998806;WS=108998784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,150:0.54:280
chr2	108999786	rs4149436	T	C	4091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=66;PP=2885;SC=TAATGGAACATTCTCACTTCT;SOR=0.749;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=139;TCF=73;TCR=66;TR=139;WE=108999794;WS=108999776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr2	109003761	rs3731686	A	G	2039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.333;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=42;PP=1209;ReadPosRankSum=-0.154;SC=CCTCTCCCACATAACTGTATT;SOR=0.623;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=195;TCF=107;TCR=88;TR=91;WE=109003769;WS=109003751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,100:0.47:213
chr2	109065858	rs2460947	T	C	627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=13;PP=336;ReadPosRankSum=-0.466;SC=CCCGCGCTGCTGTCGCCTCCC;SOR=0.647;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=48;TCF=23;TCR=25;TR=26;WE=109065866;WS=109065848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,29:0.56:52
chr2	109066234	rs377365761	AT	A	56.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.016;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.30;ReadPosRankSum=-0.241;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr2	109069008	rs2683797	T	C	3730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.093;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=75;PP=2144;ReadPosRankSum=1.097;SC=GGCTTTCTGTTTCTGTTCTAC;SOR=0.552;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=254;TCF=123;TCR=131;TR=155;WE=109069016;WS=109068998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,175:0.63:277
chr2	109089404	rs2243888	C	G	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.698;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=209;ReadPosRankSum=-0.121;SC=ACAGATTCTTCTTAGTGTTAG;SOR=0.257;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=15;WE=109089412;WS=109089394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr2	109098998	rs2577615	A	G	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=103;ReadPosRankSum=0.210;SC=TAAGAGTAGCATTTATGAATA;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=8;WE=109099006;WS=109098988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr2	109099385	rs2577614	C	T	861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.065;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=10;PP=526;ReadPosRankSum=0.495;SC=ATCCACCCGCCTCGGCCTCCC;SOR=1.345;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=61;TCF=41;TCR=20;TR=35;WE=109099393;WS=109099375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,38:0.57:67
chr2	109099477	rs2577613	A	G	2039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.858;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=34;PP=1330;ReadPosRankSum=1.271;SC=CCTTTTTAATATTGGTTGGGT;SOR=0.908;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=135;TCF=75;TCR=60;TR=80;WE=109099485;WS=109099467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,87:0.57:152
chr2	109099572	rs2718698	C	G	2437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=48;PP=1606;SC=ACTTCAAAAGCAAAAGAAACA;SOR=1.423;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=26;TCR=48;TR=74;WE=109099580;WS=109099562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr2	109109325	rs143344405	TAAGA	T	1015.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.305;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=803;ReadPosRankSum=0.828;SC=CACAAATTCATAAGAAAGAAA;SOR=0.225;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=45;TCF=1;TCR=44;TR=19;WE=109109336;WS=109109315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,27:0.50:54
chr2	109123996	rs2577596	T	G	971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.865;HP=10;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=2;PP=695;ReadPosRankSum=0.349;SC=TTCTTTTTTTTTTTGTTTTAC;SOR=2.247;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=45;TCF=40;TCR=5;TR=31;WE=109124004;WS=109123986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,34:0.72:47
chr2	109124242	rs62148108	T	A	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.963;NF=0;NR=7;PP=98;ReadPosRankSum=1.082;SC=AAAAGTTTCATCTTGAAGTAA;SOR=1.460;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=7;WE=109124250;WS=109124232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr2	109292280	rs7584953	T	C	2424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.024;NF=66;NR=36;PP=1280;ReadPosRankSum=-0.724;SC=CTAGCCCCATTGGTTGGCCAC;SOR=0.692;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=219;TCF=140;TCR=79;TR=102;WE=109292288;WS=109292270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,115:0.48:241
chr2	109381438	rs61748149	A	G	1201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.542;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=22;PP=722;ReadPosRankSum=-0.752;SC=CAAAGGAAGGACAGTGGGATT;SOR=0.909;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=196;TCF=109;TCR=87;TR=56;WE=109381446;WS=109381428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,67:0.31:218
chr2	109388846	rs700876	G	A	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.82;ReadPosRankSum=-0.243;SOR=0.834;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,16:0.28:58
chr2	109389124	rs700875	A	T	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.197;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=145;ReadPosRankSum=-0.042;SC=TTCTATAATTATCGATTTTAC;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=8;WE=109389132;WS=109389114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr2	109389463	rs826580	G	A	4951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=87;PP=2926;SC=GAAATGGGGAGGACTTTCAAT;SOR=0.990;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=163;TCF=76;TCR=87;TR=163;WE=109389471;WS=109389453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr2	109393522	rs58272304	TG	T	2030.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=8;PP=1643;SC=CTCTAGGTCCTGGGGTAAAGC;SOR=3.113;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=50;TCF=39;TCR=11;TR=43;WE=109393530;WS=109393512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr2	109393766	rs56132830	A	T	1333.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=7.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=2.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.51;ReadPosRankSum=0.635;SOR=0.996;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,36:0.42:86
chr2	109393767	rs367802106	TATAAC	T	1324.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=7.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=2.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.40;ReadPosRankSum=0.766;SOR=0.996;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,36:0.42:86
chr2	109393774	rs371189636	A	T	1388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=2.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.52;ReadPosRankSum=1.586;SOR=1.100;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,33:0.44:75
chr2	109393779	rs375449172	A	T	1278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=4.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.53;ReadPosRankSum=1.421;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,32:0.46:69
chr2	109393780	rs367803624	G	T	1281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=6.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.13;ReadPosRankSum=1.981;SOR=1.705;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,30:0.45:67
chr2	109393781	rs371705935	A	T	1203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=6.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.24;ReadPosRankSum=1.940;SOR=1.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,30:0.45:66
chr2	109393786	rs371246549	TC	T	1119.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=4.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.06;ReadPosRankSum=1.776;SOR=1.564;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,30:0.48:62
chr2	109393789	.	TCCCTTACCCCCC	T	1179.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.981;ClippingRankSum=0.000;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=1.546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.07;ReadPosRankSum=1.435;SOR=1.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,29:0.52:56
chr2	109393803	.	GT	G	1200.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.488;ClippingRankSum=0.000;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=1.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.50;ReadPosRankSum=1.694;SOR=1.312;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,30:0.61:49
chr2	109393807	rs199740075	G	GTTTAGT	1171.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.63;ReadPosRankSum=0.731;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,30:0.68:44
chr2	109408159	rs35794776	G	T	1043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.650;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=24;PP=522;ReadPosRankSum=0.449;SC=TTCTTTCCATGATTTGAAGAA;SOR=0.741;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=115;TCF=60;TCR=55;TR=48;WE=109408167;WS=109408144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,56:0.42:133
chr2	109408208	rs6740879	G	A	1233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.596;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=29;PP=749;ReadPosRankSum=-0.109;SC=AATGATTATAGAGTTAGTACC;SOR=0.764;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=71;TCR=68;TR=58;WE=109408216;WS=109408198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,65:0.42:156
chr2	109411248	rs111234702	GAATAT	G	122.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.579;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=164;ReadPosRankSum=0.792;SC=TACGAAATTTGAATATAATAT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=4;WE=109411260;WS=109411238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr2	109421334	rs147074070	TCTC	T	735.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.606;HP=9;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=19;PP=1055;ReadPosRankSum=2.613;SC=GTTTTTTTTTTCTCCTCCTAG;SOR=0.878;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=77;TCF=25;TCR=52;TR=28;WE=109421344;WS=109421324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,40:0.35:115
chr2	109429146	rs975597	T	A	1263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=14;PP=556;ReadPosRankSum=-0.270;SC=GAGTTCAAGCTCGTTTAGATA;SOR=0.680;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=90;TCF=59;TCR=31;TR=46;WE=109429154;WS=109429136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,59:0.54:109
chr2	109490104	rs6737810	A	G	838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=23;PP=653;SC=TGATCATTTAAACCAGGGGTT;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=23;WE=109490112;WS=109490094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	109513321	rs7607563	C	A	1834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=44;NR=18;PP=1289;SC=CCCTCGTTGGCTCCTTGGCTT;SOR=1.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=44;TCR=18;TR=62;WE=109513329;WS=109513311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
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chr2	109513785	rs189753082	AA	TT	1946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=1.995;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.16;ReadPosRankSum=-0.713;SOR=0.463;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,51:0.55:92
chr2	109522720	rs260639	G	A	1265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.749;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-1.500;NF=38;NR=17;PP=746;ReadPosRankSum=-0.198;SC=CCTTCATGTCGGTGGGGTGGG;SOR=0.806;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=103;TCF=71;TCR=32;TR=55;WE=109522728;WS=109522710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,59:0.53:111
chr2	109522747	rs3833574	CT	C	1543.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.228;HP=8;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.172;NF=16;NR=26;PP=666;ReadPosRankSum=1.402;SC=CTCTCCCAGGCTTTTTTTTCA;SOR=0.561;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=110;TCF=43;TCR=67;TR=42;WE=109522755;WS=109522737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,75:0.43:176
chr2	109526969	rs260632	G	A	4856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=95;NR=66;PP=2902;SC=CATCCTTCTCGGAGAACATCA;SOR=0.909;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=161;TCF=95;TCR=66;TR=161;WE=109526977;WS=109526959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr2	109527087	rs260631	G	A	1002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.136;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=27;PP=627;ReadPosRankSum=-1.591;SC=AGAGCTGCCCGGTGTCTGTGT;SOR=0.321;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=60;TCF=17;TCR=43;TR=40;WE=109527095;WS=109527077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,43:0.67:64
chr2	109527373	rs260630	A	G	4321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=57;PP=2708;SC=GAGTCCAGGAAGCAGGGCACC;SOR=0.948;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=84;TCR=57;TR=141;WE=109527381;WS=109527363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr2	109539653	rs260643	A	G	351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=10;NR=0;PP=191;SC=TGTGGCAAACATCCCTCCCTT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=10;WE=109539661;WS=109539643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	109539774	rs3749107	G	A	1596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.536;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=25;PP=839;ReadPosRankSum=-0.292;SC=GTAGTGAAAGGGATCCGTGCT;SOR=0.910;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=159;TCF=96;TCR=63;TR=71;WE=109539782;WS=109539764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,82:0.43:191
chr2	109539913	rs748225	C	T	1069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.608;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=30;PP=751;ReadPosRankSum=-0.645;SC=GTAGTAGCTACGGGGGAGAGA;SOR=0.791;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=139;TCF=71;TCR=68;TR=56;WE=109539921;WS=109539903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,60:0.38:157
chr2	109745782	rs200435574	TGGCCGGTCCCCGCCACGCA	T	2723.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=18;PP=2928;SC=CGGGCTCGGCTGGCCGGTCCC;SOR=0.793;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=39;TCF=8;TCR=31;TR=22;WE=109745808;WS=109745772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr2	109988215	rs11680644	C	G	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.366;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=325;ReadPosRankSum=-1.061;SC=ACCTGACCTTCAAGCCCCTTT;SOR=1.802;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=17;WE=109988223;WS=109988205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,20:0.74:27
chr2	110053248	rs7369523	C	T	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.385;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=65;ReadPosRankSum=-0.156;SC=TGGCCTTCATCTCTTAAAGCC;SOR=0.116;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=7;WE=110053256;WS=110053238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
chr2	110325590	.	A	AT	213.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=5.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.94;ReadPosRankSum=-2.594;SOR=1.245;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,14:0.39:36
chr2	110371493	rs3829700	A	T	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.287;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=3;PP=32;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GCCGGAGGGCAGAAGCAACGG;SOR=0.223;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=6;WE=110371501;WS=110371483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr2	110372192	rs6594048	A	G	2611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=57;NR=28;PP=1494;SC=GGGGCGCCCTAGGCGGCGAAC;SOR=1.143;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=57;TCR=28;TR=85;WE=110372200;WS=110372182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr2	110373197	rs1560884	G	A	3540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.862;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=84;PP=2382;ReadPosRankSum=0.615;SC=GTGGGAAAAAGGCCTCCCAGT;SOR=0.756;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=296;TCF=137;TCR=159;TR=156;WE=110373205;WS=110373187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,166:0.54:310
chr2	110552183	.	G	C	270.80	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.47;QD=38.69;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	110552184	rs368194978	GC	G	261.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.47;QD=37.40;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	110855123	rs2004273	G	T	9179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=343;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.98;NF=170;NR=136;PP=2965;SC=AGGGGCTGCTGCAGGGGCCGG;SOR=0.876;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=306;TCF=170;TCR=136;TR=306;WE=110855131;WS=110855113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,343:1.00:343
chr2	110855270	rs5833366	TG	T	1800.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=0.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.93;ReadPosRankSum=2.142;SOR=0.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,67:0.44:151
chr2	110882699	rs2048243	A	G	2248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.284;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=41;PP=1479;ReadPosRankSum=-1.331;SC=AAAGCCAAGAAGATTTTCCAT;SOR=0.403;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=235;TCF=153;TCR=82;TR=106;WE=110882707;WS=110882689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,112:0.44:253
chr2	110886671	.	C	CA	1097	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;FR=0.5000;HP=11;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=26;MQ=60.0;NF=9;NR=18;PP=1097;QD=41.1481481481;SC=ATCCTAGTAACAAAAAAAAAG;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=83;TCF=29;TCR=54;TR=27;WE=110886679;WS=110886661;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:56,27:0.33:83
chr2	110886686	rs3838315	A	AGACCAGAT	2550.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FS=1.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.71;ReadPosRankSum=-1.623;SOR=0.847;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:120,66:0.35:186
chr2	110889108	rs11240790	C	T	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=171;ReadPosRankSum=-1.098;SC=TGAAGATGTCCCATAAGTAAT;SOR=1.460;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=9;WE=110889116;WS=110889098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr2	110905664	rs1509417	G	A	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=251;ReadPosRankSum=0.224;SC=GGGGTTTGATGTGGTTTGAAT;SOR=0.693;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=48;TCF=9;TCR=39;TR=17;WE=110905672;WS=110905654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,18:0.35:51
chr2	110919041	rs3817140	A	G	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.831;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=211;ReadPosRankSum=-0.661;SC=AGTTATAAAAATATCGCTATT;SOR=0.169;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=13;WE=110919049;WS=110919031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr2	110919321	rs2271244	C	T	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.193;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=19;PP=334;ReadPosRankSum=0.526;SC=AAAGAAACTCCAAATCAAAAA;SOR=0.216;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=70;TCF=15;TCR=55;TR=27;WE=110919329;WS=110919311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,28:0.39:72
chr2	110922703	rs11675767	C	T	4212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=545;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.532;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=104;PP=2485;ReadPosRankSum=-0.987;SC=CTTCACTTGACTCTTGGCCTT;SOR=0.764;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=494;TCF=241;TCR=253;TR=199;WE=110922720;WS=110922693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:325,219:0.40:544
chr2	110959898	rs11240794	C	G	1506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=20;PP=961;ReadPosRankSum=0.624;SC=AGTTTCTTCTCTACTCTTGCA;SOR=0.663;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=136;TCF=94;TCR=42;TR=66;WE=110959906;WS=110959888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,69:0.46:151
chr2	111058854	rs190352639	G	A	846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.39;QD=23.52;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr2	111397237	.	CTT	C	143.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.266;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=2.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.96;ReadPosRankSum=-1.170;SOR=0.141;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,8:0.28:29
chr2	111406724	rs34802999	T	TCA	600.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.973;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=371;ReadPosRankSum=-0.391;SC=AATAGGAGAATCACACACACA;SOR=0.283;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=10;WE=111406732;WS=111406714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,21:0.72:29
chr2	111526090	.	TGA	T	234.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.206;ClippingRankSum=0.000;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=5.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.18;ReadPosRankSum=-1.710;SOR=0.108;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,13:0.34:38
chr2	111644475	rs10188079	C	T	686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=4.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.015;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=26;PP=556;ReadPosRankSum=1.928;SC=TACGCTTGCTCGTGAAATCAG;SOR=1.012;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=91;TCF=23;TCR=68;TR=32;WE=111644483;WS=111644465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,33:0.32:102
chr2	111644491	rs66815319	TA	T	829.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.144;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=24;PP=790;ReadPosRankSum=0.620;SC=ATCAGCCACTTAACTGTTCTG;SOR=0.999;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=58;TCF=0;TCR=58;TR=24;WE=111644499;WS=111644481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,29:0.40:73
chr2	111721142	.	ATG	A	368.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.987;ClippingRankSum=0.000;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.21;MQRankSum=2.362;QD=4.19;ReadPosRankSum=-1.181;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,27:0.31:88
chr2	111753449	rs3761707	G	C	7294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=154;NR=97;PP=2965;SC=AATAATGATGGTCACCGTGAT;SOR=1.174;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=251;TCF=154;TCR=97;TR=251;WE=111753457;WS=111753439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr2	111789092	rs3789090	G	A	1843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=6;PP=1344;SC=TCTGCACTGTGTCCATGCTTA;SOR=4.174;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=52;TCR=6;TR=57;WE=111789100;WS=111789082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr2	111886332	rs13429049	C	T	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.401;HP=5;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=12;PP=268;ReadPosRankSum=0.045;SC=CTCATGATACCTTTTTATAGC;SOR=0.382;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=52;TCF=19;TCR=33;TR=21;WE=111886340;WS=111886322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,24:0.44:55
chr2	111907691	rs724710	T	C	1871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.847;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=28;PP=1026;ReadPosRankSum=-0.810;SC=TGCGGCGTATTGGAGACGAGT;SOR=0.850;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=166;TCF=103;TCR=63;TR=81;WE=111907699;WS=111907681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,87:0.48:183
chr2	111909247	rs3789068	A	G	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=119;ReadPosRankSum=1.207;SC=GTTCTTCAGTATGGAATTTCT;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=7;WE=111909255;WS=111909246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr2	111909610	rs79493742	A	G	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.195;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=129;ReadPosRankSum=0.056;SC=ATTGACTAGGAAGAACTGGTG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=7;WE=111909618;WS=111909600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr2	112526866	rs137999262	G	A	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.05;MQRankSum=-3.912;QD=6.06;ReadPosRankSum=0.175;SOR=0.775;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr2	112536264	rs76115652	G	T	728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.53;QD=30.37;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	112540142	.	T	C	258	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;FR=0.5000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=46.22;NF=2;NR=16;PP=258;QD=16.2650673637;SC=TGGCTGGAAATAGTGTTTTCC;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=72;TCF=8;TCR=64;TR=18;WE=112540150;WS=112540132;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:54,18:0.25:72
chr2	112545981	.	T	G	67	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=46.44;NF=0;NR=7;PP=67;QD=14.5387446496;SC=AGGAAACTGGTGTATAATAGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=7;WE=112545989;WS=112545971;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:27,7:0.21:34
chr2	112552427	rs190739040	C	T	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.00;MQRankSum=0.000;QD=9.36;ReadPosRankSum=-0.521;SOR=1.140;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr2	112582766	rs60136848	CTT	C	5012.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.692;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.762;NF=3;NR=74;PP=2947;ReadPosRankSum=1.484;SC=CAAAATGAAACTTAATTTTGA;SOR=0.841;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=136;TCF=6;TCR=130;TR=77;WE=112582775;WS=112582756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,128:0.56:227
chr2	112583476	rs12614297	C	T	1973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.803;NF=24;NR=58;PP=1301;ReadPosRankSum=-0.174;SC=TTTTCAGAGACAGCATCTCAC;SOR=0.670;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=123;TCF=35;TCR=88;TR=82;WE=112583484;WS=112583466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,85:0.66:129
chr2	112590989	rs3761697	A	T	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.014;NF=0;NR=14;PP=262;ReadPosRankSum=-0.019;SC=AAAAACTTACATATGAGAAAG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=14;WE=112590997;WS=112590979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr2	112605302	rs4848197	C	T	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=6.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=57.768;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-8.841;NF=33;NR=6;PP=800;ReadPosRankSum=-1.526;SC=TTATACTTACCAGGGTGACTC;SOR=6.269;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=124;TCF=81;TCR=43;TR=39;WE=112605322;WS=112605292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,27:0.23:116
chr2	112605465	rs4848800	T	C	3123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=63;PP=2088;SC=GTAAATACGATACAAATGAAT;SOR=1.445;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=103;TCF=40;TCR=63;TR=102;WE=112605473;WS=112605455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr2	112625575	rs6742515	T	C	3097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.104;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=78;PP=2130;ReadPosRankSum=1.307;SC=AGAGCTTATCTAAAAGAATAT;SOR=0.906;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=228;TCF=107;TCR=121;TR=144;WE=112625583;WS=112625565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,152:0.66:232
chr2	112630412	rs141064868	A	C	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.503;NF=0;NR=16;PP=398;ReadPosRankSum=0.080;SC=AAAGTAACATAATCATTAAAT;SOR=2.049;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=16;WE=112630420;WS=112630402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr2	112641149	rs17835589	G	C	1178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.431;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=73;PP=2323;ReadPosRankSum=-1.433;SC=ACACTAACGGGAGCTTAAGTC;SOR=0.556;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=200;TCF=71;TCR=129;TR=109;WE=112641170;WS=112641139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,65:0.52:126
chr2	112641256	rs2037198	G	A	3338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.38;SOR=2.441;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr2	112641256	.	GAAAGCTGAGG	AAAAGCTGAGG,AGAAGCTGAGC	1990	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=17,9;NR=57,31;PP=876,1990;QD=12.3077190885;SC=AGGCCAGTCTGAAAGCTGAGG;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=76;TCF=17;TCR=59;TR=74,40;WE=112641274;WS=112641246;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.97:76
chr2	112641257	rs7575582	A	G	2024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=3.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.54;ReadPosRankSum=0.965;SOR=1.204;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,54:0.63:86
chr2	112641266	rs71414610	G	C	1843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.61;ReadPosRankSum=0.774;SOR=0.870;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,45:0.62:72
chr2	112641283	rs12233011	A	G	1401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.121;HP=1;HapScore=1;MGOF=55;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=29;PP=694;ReadPosRankSum=-0.184;SC=ATGGGATGCTACGCACAGCTC;SOR=1.714;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=47;TCF=6;TCR=41;TR=32;WE=112641291;WS=112641273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,34:0.67:51
chr2	112686988	rs13027171	G	A	4193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.838;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=92;PP=2588;ReadPosRankSum=-0.594;SC=TGCTCAATCAGTGTACCTAAT;SOR=0.637;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=305;TCF=142;TCR=163;TR=175;WE=112686996;WS=112686978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,192:0.57:334
chr2	112687157	rs138909702	A	ATATTTATTTATT,ATATTTATTTATTTATTTATTTATTTATT	1297.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=66.26;QD=61.80;SOR=6.184;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,9,12:0.43,0.57:21
chr2	112702647	rs11683694	C	T	4794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=457;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=107;NR=106;PP=2949;ReadPosRankSum=-2.499;SC=GGTAAGTCCACAGACCAGAGT;SOR=0.728;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=418;TCF=213;TCR=205;TR=213;WE=112702655;WS=112702637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:222,232:0.51:454
chr2	112704862	rs7601798	A	G	455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=23;NR=4;PP=459;SC=CCCGCCCCCCACAAAAAAAGA;SOR=2.531;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=27;WE=112704870;WS=112704852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	112705157	rs3761701	T	C	1756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=47;PP=1140;SC=AAGTCCGAGCTGTGGGCTTAT;SOR=2.730;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=61;TCF=13;TCR=48;TR=60;WE=112705165;WS=112705147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr2	112705185	rs3761700	G	T	1085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=29;PP=782;SC=TTCTCTAATAGCGGACAGGAT;SOR=3.086;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=35;WE=112705193;WS=112705175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr2	112725684	rs113538397	A	ATGTGTG	3810.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.65;QD=43.80;SOR=1.493;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr2	112740373	rs1996323	G	A	850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=5;PP=548;SC=ATACATCTGTGTGTGCTTTGT;SOR=2.621;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=28;WE=112740381;WS=112740363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	112740596	rs57740008	GA	G	5218.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.494;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=69;PP=2954;ReadPosRankSum=2.370;SC=AGAAGAGCACGATTAGTCATC;SOR=0.856;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=176;TCF=24;TCR=152;TR=74;WE=112740606;WS=112740586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,141:0.45:315
chr2	112740598	rs57297275	T	G	5218.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.494;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=69;PP=2962;ReadPosRankSum=2.151;SC=AAGAGCACGATTAGTCATCTC;SOR=0.856;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=287;TCF=136;TCR=151;TR=128;WE=112740606;WS=112740586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,137:0.44:309
chr2	112751928	rs7604639	G	A	4644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=62;PP=2678;SC=GCCGTCACCAGAGGGGGAGTT;SOR=0.904;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=153;TCF=91;TCR=62;TR=153;WE=112751936;WS=112751918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr2	112752142	rs7592909	A	C	990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=26;PP=786;SC=GAGTTTGAGAACAACCTGGGC;SOR=2.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=32;WE=112752150;WS=112752132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr2	112752361	.	AG	A	39	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;FR=0.9998;HP=6;HapScore=2;MGOF=19;MMLQ=20;MQ=56.57;NF=0;NR=3;PP=39;QD=20.6666666667;SC=TCTCAAAAAAAGAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=112752369;WS=112752351;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr2	112752880	rs6739294	G	A	6240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=116;NR=94;PP=2965;SC=AGTGAACCAAGTGCTGTGCTC;SOR=0.948;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=210;TCF=116;TCR=94;TR=210;WE=112752888;WS=112752870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr2	112753020	rs77702371	A	G	2954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=415;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.529;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=63;PP=1745;ReadPosRankSum=-0.600;SC=GTTTTTGCCAAACATGACCTT;SOR=0.660;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=380;TCF=194;TCR=186;TR=139;WE=112753028;WS=112753010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:259,156:0.38:415
chr2	112753097	rs6726639	A	C	7829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=114;NR=147;PP=2965;SC=TCCCAGTGACACTGAAACTTG;SOR=1.082;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=264;TCF=115;TCR=149;TR=261;WE=112753105;WS=112753087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,288:1.00:288
chr2	112753781	rs34346510	TA	T	9817.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=130;PP=2951;SC=TTACCACAGTTAAATAACACC;SOR=0.898;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=159;TCF=27;TCR=132;TR=157;WE=112753789;WS=112753771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,276:1.00:276
chr2	112753883	rs10173553	C	T	1770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=49;PP=1419;SC=GCTCTTCAGGCCACCAACCAT;SOR=3.990;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=6;TCR=49;TR=55;WE=112753891;WS=112753873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr2	112753950	rs13003919	G	A	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.952;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=79;ReadPosRankSum=0.279;SC=TCTTTCAAAGGCTGTTGTGAT;SOR=1.329;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=18;TCF=8;TCR=10;TR=6;WE=112753958;WS=112753940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr2	112754720	rs4848238	A	C	63.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5064;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=1;PP=40;ReadPosRankSum=-0.674;SC=CTAGTTTCCCATCAGTTATTA;SOR=0.446;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=3;WE=112754728;WS=112754714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr2	112754828	rs3811632	G	T	746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.976;HP=5;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=8;PP=484;ReadPosRankSum=-0.233;SC=TTGACTATTTGTTCTTCCCTG;SOR=1.057;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=101;TCF=72;TCR=29;TR=34;WE=112754836;WS=112754818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,36:0.35:104
chr2	112754880	rs3811633	G	A	2808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.121;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=47;PP=1913;ReadPosRankSum=-0.455;SC=CCCATGACTGGTCTATTGGTA;SOR=0.602;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=196;TCF=121;TCR=75;TR=120;WE=112754888;WS=112754870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,124:0.60:205
chr2	112754943	rs3811634	C	T	4067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.381;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=79;PP=2562;ReadPosRankSum=-0.722;SC=CGCCTGGCAACGCAGATCCTG;SOR=0.802;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=290;TCF=153;TCR=137;TR=173;WE=112754951;WS=112754933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,183:0.59:308
chr2	112755001	rs2230515	A	G	7546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=116;NR=140;PP=2965;SC=GATTGGGTTGATTTTATACAT;SOR=0.961;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=256;TCF=116;TCR=140;TR=256;WE=112755009;WS=112754991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,275:1.00:275
chr2	112761653	rs4848933	C	G	1453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=35;PP=976;SC=AATCTCAGTTCCCAGTGGGCC;SOR=1.848;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=14;TCR=35;TR=49;WE=112761661;WS=112761643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr2	112765973	rs1131244	A	G	4333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=69;PP=2730;SC=ACAACTCTTCACAGCGGGAGA;SOR=0.912;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=162;TCF=93;TCR=69;TR=162;WE=112765981;WS=112765963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr2	112766262	rs10210692	A	G	6580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=127;NR=100;PP=2965;SC=GGACGCTGATAGGCTCAGGAA;SOR=0.868;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=227;TCF=127;TCR=100;TR=227;WE=112766270;WS=112766252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr2	112766304	rs55766181	G	C	2134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.739;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=56;PP=1323;ReadPosRankSum=0.573;SC=TTCTAGGAGAGTGTGAATTAA;SOR=0.785;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=264;TCF=137;TCR=127;TR=107;WE=112766312;WS=112766294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,115:0.40:287
chr2	112766319	rs55799805	T	C	1987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.689;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=55;PP=1195;ReadPosRankSum=-0.196;SC=AATTAAATTGTCCTCAGTTAC;SOR=0.913;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=258;TCF=129;TCR=129;TR=101;WE=112766327;WS=112766309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,109:0.39:280
chr2	112767406	rs11884641	A	G	719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.064;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=8;PP=510;ReadPosRankSum=-0.466;SC=GGCGCTCTTGATTTTTTCAAA;SOR=0.476;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=76;TCF=60;TCR=16;TR=32;WE=112767414;WS=112767396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,33:0.42:78
chr2	112767483	rs11884693	A	G	2451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.997;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=52;PP=1549;ReadPosRankSum=-2.301;SC=TGGTCACAGTAACAAGGACTC;SOR=0.573;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=271;TCF=154;TCR=117;TR=113;WE=112767491;WS=112767473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,122:0.42:289
chr2	112767739	rs75313362	A	G	1965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.671;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=54;PP=1435;ReadPosRankSum=-0.712;SC=TGAAGCCAGGAAGGAGAGGAC;SOR=0.990;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=213;TCF=94;TCR=119;TR=88;WE=112767747;WS=112767729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,91:0.40:230
chr2	112767824	rs77781750	A	G	661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.814;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=17;PP=343;ReadPosRankSum=1.714;SC=GGCCTGCTCCAGGTATTATTA;SOR=0.570;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=93;TCF=35;TCR=58;TR=30;WE=112767832;WS=112767814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,35:0.34:102
chr2	112767941	rs77306155	A	G	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.823;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=63;ReadPosRankSum=0.000;SC=CACAACCCTCATGGCCGCATA;SOR=1.751;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=5;WE=112767949;WS=112767931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr2	112770770	rs4374383	A	G	4514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=88;NR=68;PP=2841;SC=CAACATGAGTACTAACCGTAG;SOR=0.897;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=156;TCF=88;TCR=68;TR=156;WE=112770778;WS=112770760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr2	112770798	rs4500955	T	C	7041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.85;SOR=0.857;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr2	112770798	.	TG	CA,CG	1600	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MMLQ=21;MQ=60.0;NF=41,103;NR=32,84;PP=851,1600;QD=12.3899708885;SC=AGGCTGCAGCTGCATCACACA;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=188;TCF=104;TCR=84;TR=73,187;WE=112770807;WS=112770788;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.39:188
chr2	112770799	rs57116599	G	A	1688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FS=0.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.04;ReadPosRankSum=1.021;SOR=0.743;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:122,88:0.42:210
chr2	112773366	rs6710591	A	G	1740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=19;PP=1231;SC=TCTAAAGATTATGTTCTTTTA;SOR=1.532;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=41;TCR=19;TR=60;WE=112773374;WS=112773356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr2	112773500	rs6710733	A	G	740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.511;HP=3;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=24;PP=523;ReadPosRankSum=0.640;SC=TAATCCATGAAAAGACTGTCC;SOR=1.024;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=115;TCF=57;TCR=58;TR=42;WE=112773508;WS=112773490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,43:0.33:129
chr2	112773528	rs111619827	TCTTGTAC	T	3850.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=40;PP=2905;SC=ATTGAGTTGCTCTTGTACCTT;SOR=1.030;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=52;TCF=9;TCR=43;TR=49;WE=112773542;WS=112773518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr2	112776913	rs3841094	T	TC	1755.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.486;HP=8;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.924;NF=13;NR=28;PP=565;ReadPosRankSum=-0.872;SC=AAGCATCCTTTCCCCCCCCGG;SOR=0.633;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=46;TCR=101;TR=41;WE=112776921;WS=112776903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,89:0.35:256
chr2	112776979	rs3811640	C	A	1919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.417;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.885;NF=47;NR=47;PP=1127;ReadPosRankSum=-1.222;SC=CTTGTTTCCTCTATCATCTAG;SOR=0.656;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=292;TCF=150;TCR=142;TR=94;WE=112776987;WS=112776969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:208,118:0.36:326
chr2	112779286	rs10667527	A	ATC	2234.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=46;PP=2053;SC=GCTTGCTCAGATCTCTTTTAT;SOR=3.990;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=0;TCR=54;TR=46;WE=112779294;WS=112779276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr2	112782675	rs77209182	G	A	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=366;ReadPosRankSum=0.747;SC=TGGCACTGCCGCCGACTGTTG;SOR=0.928;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=21;WE=112782683;WS=112782665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr2	112785770	rs6738237	A	G	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.788;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=259;ReadPosRankSum=-0.223;SC=CAAAAGTTGTATAAATATTAG;SOR=1.730;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=6;WE=112785783;WS=112785760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr2	112785775	rs4848958	T	C	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.737;HP=4;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=608;ReadPosRankSum=0.207;SC=GTTGTATAAATATTAGGCCAC;SOR=0.223;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=16;WE=112785783;WS=112785760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,16:0.73:22
chr2	112786523	rs147500027	A	AT	848.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.885;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=597;ReadPosRankSum=-0.296;SC=TGTTTTTGGTATTTGTCTTCC;SOR=0.880;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=57;TCF=2;TCR=55;TR=19;WE=112786531;WS=112786513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,34:0.41:83
chr2	112813163	rs10176769	G	A	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.132;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=110;ReadPosRankSum=-2.034;SC=CAGCTTCCTGGTCAAGATGGT;SOR=0.582;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=8;WE=112813171;WS=112813153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr2	112813391	rs9308665	C	G	1851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.363;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=36;PP=1009;ReadPosRankSum=0.672;SC=GGCCGTCGTGCGGCTTCGCTT;SOR=0.570;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=124;TCF=58;TCR=66;TR=73;WE=112813399;WS=112813381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,85:0.61:140
chr2	112832535	rs71385858	CAAT	C	3645.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.695;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=41;PP=2455;ReadPosRankSum=0.340;SC=CAGGAAAGATCAATGGTAAGC;SOR=0.521;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=109;TCF=31;TCR=78;TR=59;WE=112832545;WS=112832525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,93:0.56:167
chr2	112832684	rs6542026	G	A	819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=23;PP=616;SC=ATTTAAAACCGTATGTTTTCA;SOR=3.258;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=27;WE=112832692;WS=112832674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	112847164	rs11123128	C	T	3461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.082;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=61;PP=2184;ReadPosRankSum=-2.044;SC=CTCACCCATGCTTTTTCTTCT;SOR=0.889;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=279;TCF=157;TCR=122;TR=147;WE=112847172;WS=112847154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,162:0.53:307
chr2	112856165	rs4849007	C	A	1979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.231;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=31;PP=1111;ReadPosRankSum=0.622;SC=AATTGTCCTTCTTTTAGGATT;SOR=0.569;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=154;TCF=100;TCR=54;TR=86;WE=112856173;WS=112856155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,94:0.55:170
chr2	112858122	rs4848272	C	T	912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.706;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=12;PP=460;ReadPosRankSum=-1.423;SC=ATTTTTTATACAATGGCTTTT;SOR=0.093;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=43;TCF=31;TCR=12;TR=34;WE=112858130;WS=112858112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,39:0.80:49
chr2	112865517	rs7562848	G	C	2297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=39;NR=34;PP=1200;SC=CCTCGTACTTGCATGTACTTG;SOR=0.839;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=73;TCF=39;TCR=34;TR=73;WE=112865525;WS=112865507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr2	112917102	rs1320360	G	C	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=2;PP=479;ReadPosRankSum=0.329;SC=TGTACTTGGGGCTGTCCAGCG;SOR=0.869;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=45;TCF=40;TCR=5;TR=27;WE=112917110;WS=112917092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,34:0.64:53
chr2	112945188	rs4848281	T	A	1908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=57;PP=1503;SC=GTTCCCGCCCTCTCACCAGTG;SOR=4.277;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=64;TCF=7;TCR=57;TR=63;WE=112945196;WS=112945178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr2	113079576	rs4507112	C	A	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=59;ReadPosRankSum=-1.282;SC=TCTATTTGAGCAATATTCTTT;SOR=0.368;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=4;WE=113079584;WS=113079566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr2	113082250	rs59100751	CT	C	1063.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.720;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=29;PP=685;ReadPosRankSum=1.893;SC=GGTAAGTTTACTTTTTTGAAA;SOR=0.474;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=91;TCF=1;TCR=90;TR=30;WE=113082258;WS=113082240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,50:0.41:123
chr2	113089267	rs7601200	T	C	2930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.316;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=67;PP=2048;ReadPosRankSum=-0.076;SC=TTCATCAAAATACAGTGTCCA;SOR=0.615;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=299;TCF=153;TCR=146;TR=129;WE=113089275;WS=113089257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:187,141:0.43:328
chr2	113090047	rs4578863	T	C	1552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.483;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=45;PP=820;ReadPosRankSum=2.267;SC=TTGATCCAACTGCTTCACCAT;SOR=0.739;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=227;TCF=106;TCR=121;TR=81;WE=113090064;WS=113090037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,89:0.36:249
chr2	113258671	rs62157516	G	A	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=4.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.043;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.062;NF=14;NR=0;PP=257;ReadPosRankSum=0.042;SC=AAAGGTGAGCGGGACATTGAA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=14;WE=113258679;WS=113258661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr2	113258916	rs17846193	C	T	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.124;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-6.313;NF=6;NR=24;PP=503;ReadPosRankSum=-1.471;SC=AGTTTGACATCCGGTAATGCA;SOR=1.358;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=71;TCF=13;TCR=58;TR=30;WE=113258924;WS=113258906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,20:0.29:70
chr2	113277949	rs62157538	T	C	573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.970;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=22;PP=365;ReadPosRankSum=0.772;SC=TCATGGTCGATGAGGAGCTGA;SOR=0.869;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=71;TCF=23;TCR=48;TR=30;WE=113277957;WS=113277939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,31:0.40:78
chr2	113300330	rs4849071	G	A	784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=24;PP=572;ReadPosRankSum=2.613;SC=TATGACCCCAGATGCATGTGC;SOR=2.012;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=24;WE=113300338;WS=113300320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,27:0.73:37
chr2	113305150	rs11123139	G	C	2212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.287;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=55;PP=1430;ReadPosRankSum=0.309;SC=CAGAGGTAATGACGGGCGTCC;SOR=0.588;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=154;TCF=53;TCR=101;TR=85;WE=113305158;WS=113305140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,95:0.56:169
chr2	113308516	rs2304555	T	A	5105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=412;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=107;NR=109;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.543;SC=AAAATGGCACTGTTATGTTGA;SOR=0.677;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=372;TCF=184;TCR=188;TR=216;WE=113308524;WS=113308506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,240:0.59:409
chr2	113308622	rs3816140	C	T	1189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.461;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=33;PP=805;ReadPosRankSum=-1.183;SC=AAGAAATTCACTGGGGGTAGT;SOR=0.246;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=66;TCF=15;TCR=51;TR=46;WE=113308630;WS=113308612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,49:0.69:71
chr2	113309473	rs1545133	C	T	4379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=359;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.847;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=100;NR=93;PP=2715;ReadPosRankSum=-1.544;SC=GAGGGTTGTTCGACACAAAAA;SOR=0.550;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=326;TCF=178;TCR=148;TR=193;WE=113309481;WS=113309463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,205:0.58:356
chr2	113310197	rs11351307	CT	C	614.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=3.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.66;ReadPosRankSum=2.350;SOR=0.321;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,35:0.78:45
chr2	113315735	rs57858974	CT	C	194.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.660;NF=0;NR=7;PP=181;ReadPosRankSum=-0.875;SC=CCTGAGAGTTCTTTTTAAAAG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=7;WE=113315743;WS=113315725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr2	113321900	rs41280572	T	C	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.946;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=171;ReadPosRankSum=0.945;SC=GAATGTTGGATGAAGCATTCT;SOR=0.298;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=13;WE=113321908;WS=113321890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr2	113326281	rs6746874	C	G	669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=456;ReadPosRankSum=2.944;SC=AAATGTGTAACCAGTTGCAGT;SOR=0.542;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=40;TCF=30;TCR=10;TR=27;WE=113326289;WS=113326271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,28:0.68:41
chr2	113326502	rs13010814	C	T	3768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.486;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=85;PP=2110;ReadPosRankSum=-0.449;SC=GATGATGTTACAGTCACAATC;SOR=0.654;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=234;TCF=106;TCR=128;TR=156;WE=113326510;WS=113326492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,173:0.67:257
chr2	113344047	rs752992	T	C	4365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=377;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.186;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=94;PP=2710;ReadPosRankSum=-0.801;SC=CCCCACCCCATCACCACACAG;SOR=0.581;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=340;TCF=166;TCR=174;TR=186;WE=113344055;WS=113344037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,208:0.55:377
chr2	113346413	rs3748024	C	G	1635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.317;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=33;PP=956;ReadPosRankSum=0.402;SC=AGAGGAGGTGCTACTAGATGT;SOR=0.606;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=128;TCF=67;TCR=61;TR=71;WE=113346421;WS=113346403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,81:0.56:145
chr2	113346512	rs1047652	A	C	1622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.984;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=28;PP=917;ReadPosRankSum=-1.765;SC=GACTGCCCCCACGCCCCTCCC;SOR=0.587;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=139;TCF=79;TCR=60;TR=64;WE=113346520;WS=113346502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,77:0.49:157
chr2	113404708	rs4849091	G	A	5595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=106;PP=2965;SC=CTCAAGGGCTGCTGATGGCCG;SOR=1.151;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=188;TCF=82;TCR=106;TR=188;WE=113404716;WS=113404698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr2	113479614	rs13386452	G	A	3078.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=370;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.323;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=60;PP=1785;ReadPosRankSum=1.358;SC=CTGCTGGAGCGCCTGGTGTGC;SOR=0.849;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=336;TCF=179;TCR=157;TR=141;WE=113479622;WS=113479604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:213,156:0.42:369
chr2	113479745	rs34781106	AC	A	5406.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=23;NR=75;PP=2976;SC=GTGCCCCCCGACCCCCCGTCT;SOR=0.922;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=112;TCF=27;TCR=85;TR=98;WE=113479753;WS=113479735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr2	113480556	rs34912983	GC	G	977.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.347;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.011;NF=26;NR=4;PP=967;ReadPosRankSum=-1.498;SC=CCCAGTGAAGGCCCCAGTGTG;SOR=0.125;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=57;TCF=51;TCR=6;TR=30;WE=113480564;WS=113480546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,34:0.68:50
chr2	113480938	.	G	GCACACA,GCACACACA	1283.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.22;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=16;NF=1,1;NR=10,10;PP=179,297;SC=GGGTACACATGCACACACACA;SOR=0.922;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=11,11;WE=113480946;WS=113480928;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.41,0.59:29
chr2	113481439	rs13384583	T	A	1772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.676;HP=3;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=55;PP=1084;ReadPosRankSum=0.527;SC=GGGGACACAGTGGCACTGCAA;SOR=0.571;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=227;TCF=84;TCR=143;TR=90;WE=113481447;WS=113481429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,92:0.39:236
chr2	113481547	rs2063919	A	G	2968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=40;PP=1987;SC=AGGCCTCAGAAGAATGAGCAA;SOR=0.900;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=56;TCR=40;TR=96;WE=113481555;WS=113481537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr2	113482779	rs4849116	A	C	8266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=152;NR=134;PP=2965;SC=GTGGGCACCTACACAGGGCCC;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=286;TCF=152;TCR=134;TR=286;WE=113482791;WS=113482769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,306:1.00:306
chr2	113484319	rs2138604	G	A	10864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=402;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=157;NR=214;PP=2965;SC=GATCCAGGTGGGAGCTGGGTG;SOR=1.125;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=372;TCF=157;TCR=215;TR=371;WE=113484327;WS=113484309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,401:1.00:401
chr2	113484353	rs2138605	A	G	6262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=135;PP=2965;SC=CAGGCCCAGCAGGGGCGGAGC;SOR=1.547;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=209;TCF=74;TCR=135;TR=209;WE=113484361;WS=113484343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr2	113484441	rs2138606	T	G	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=115;ReadPosRankSum=-0.615;SC=CTCCTCAGCCTCGCCTGGGCT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=7;WE=113484449;WS=113484431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr2	113513825	rs6731822	T	C	10805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=403;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=191;NR=186;PP=2965;SC=CTCTGGCTTATGGCTTTTGAC;SOR=0.708;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=377;TCF=191;TCR=186;TR=377;WE=113513833;WS=113513815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,403:1.00:403
chr2	113514883	rs11311327	AT	A	498.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=15;PP=231;SC=GCTAAAAAAAATAATCATTTT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=113514891;WS=113514872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	113532885	rs3783550	G	T	4169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=85;PP=2609;SC=GAACAAGATGGTAGAAAAAGG;SOR=1.108;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=150;TCF=65;TCR=85;TR=150;WE=113532893;WS=113532875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr2	113535395	rs2071376	G	T	296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=214;SC=TTCTCATAGAGCCTGCCTAGG;SOR=2.494;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=113535403;WS=113535385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	113535438	rs2071375	C	T	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.953;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=178;ReadPosRankSum=2.881;SC=GTGGGGTGGGCAGGTGGGGGC;SOR=1.222;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=12;WE=113535446;WS=113535428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,13:0.35:37
chr2	113537223	rs17561	C	A	779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.066;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=24;PP=480;ReadPosRankSum=-0.081;SC=CTAAAAGGTGCTGACCTAGGC;SOR=0.349;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=100;TCF=34;TCR=66;TR=40;WE=113537231;WS=113537213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,41:0.40:103
chr2	113540177	rs1894399	C	T	867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=8;PP=484;ReadPosRankSum=-0.557;SC=GGTCTCTGGACCTCTAGTGAG;SOR=0.724;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=66;TCR=19;TR=35;WE=113540185;WS=113540167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,40:0.43:94
chr2	113540205	rs1609682	G	T	5232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=114;NR=53;PP=2965;SC=CAAAAGTATTGAAGATTCAAG;SOR=1.509;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=167;TCF=114;TCR=53;TR=167;WE=113540213;WS=113540195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr2	113588302	rs1143643	C	T	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=281;ReadPosRankSum=-0.415;SC=CCCAACTTTCCGTGTGATTAT;SOR=0.307;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=15;WE=113588310;WS=113588292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr2	113588755	rs1143640	CAA	C	259.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.056;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.722;NF=6;NR=0;PP=109;ReadPosRankSum=0.370;SC=GCAAAATTGTCAAATAGACCT;SOR=0.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=6;WE=113588764;WS=113588747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr2	113588793	rs1143639	C	T	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.171;NF=14;NR=2;PP=200;ReadPosRankSum=0.821;SC=GGGATGGGGGCGGGGAGAAGG;SOR=0.468;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=39;TCF=35;TCR=4;TR=16;WE=113588801;WS=113588783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,19:0.44:43
chr2	113590390	rs1143634	G	A	1886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.064;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=46;PP=1211;ReadPosRankSum=-1.410;SC=CCCATGTGTCGAAGAAGATAG;SOR=0.609;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=201;TCF=91;TCR=110;TR=87;WE=113590398;WS=113590380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,94:0.43:217
chr2	113590467	rs1143633	C	T	759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.534;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=20;PP=446;ReadPosRankSum=-0.770;SC=TGAGGCGAGGCGGCAAAATTT;SOR=0.339;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=65;TCF=21;TCR=44;TR=32;WE=113590475;WS=113590457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,36:0.51:71
chr2	113763463	rs2305152	A	C	10343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=391;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=199;NR=156;PP=2965;SC=AAAAAGGTAAAGATCCTCGTG;SOR=0.900;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=356;TCF=200;TCR=156;TR=355;WE=113763471;WS=113763453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,391:1.00:391
chr2	113763575	rs895497	A	G	7490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=111;NR=137;PP=2965;SC=ACACCTCAGCAGGGGAGCATT;SOR=1.068;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=249;TCF=112;TCR=137;TR=248;WE=113763583;WS=113763565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,279:1.00:279
chr2	113783570	rs13030063	C	T	677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=2;PP=514;SC=CTTAGACCTGCCATGGGTGAT;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=113783578;WS=113783560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	113783909	rs6744874	A	T	1120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=30;PP=877;SC=AAAGGCCTGCATACAGCATGT;SOR=3.086;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=36;WE=113783917;WS=113783899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr2	113785020	rs12711747	A	G	1280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=1;PP=1025;SC=TTAGGATTAGAAAGACATGCA;SOR=5.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=35;TCR=1;TR=36;WE=113785028;WS=113785010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
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chr2	113785727	rs1562304	A	G	1487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.55;SOR=1.567;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr2	113786833	rs3948121	C	G	428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=13;PP=360;SC=CCCCAGTTGTCACCAGGACAT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=113786841;WS=113786823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	113789316	rs2305150	C	T	2665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=49;NR=33;PP=1229;SC=GTGAAGAGAACAAGATAGATC;SOR=0.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=82;TCF=49;TCR=33;TR=82;WE=113789324;WS=113789306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr2	113830201	rs3811051	T	G	982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=6;PP=738;SC=CGTGCAGCCCTTGGCTGAGTG;SOR=3.026;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=35;WE=113830209;WS=113830191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr2	113890304	rs315952	T	C	9026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=338;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=167;NR=141;PP=2965;SC=GCTCAGACAGTGGCCCCACCA;SOR=0.786;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=308;TCF=167;TCR=141;TR=308;WE=113890312;WS=113890294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,337:1.00:337
chr2	113940681	rs3748914	T	C	1609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.094;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=26;PP=882;ReadPosRankSum=0.670;SC=AAGACAGCAGTGAGCCTGAGG;SOR=0.518;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=126;TCF=75;TCR=51;TR=62;WE=113940689;WS=113940671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,74:0.50:147
chr2	113940839	rs4849167	G	C	5407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=442;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.530;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=125;NR=118;PP=2962;ReadPosRankSum=1.608;SC=TTTTCCTGGGGGGCTTCAGAC;SOR=0.612;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=416;TCF=219;TCR=197;TR=243;WE=113940847;WS=113940829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,260:0.59:442
chr2	113942903	rs1975535	A	C	1029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=12;PP=657;ReadPosRankSum=-0.743;SC=CTCTCTGTGTATCCAGGGCTC;SOR=0.656;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=53;TCR=22;TR=41;WE=113942911;WS=113942893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,43:0.53:81
chr2	113943470	rs2241976	A	G	2765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=54;PP=1597;ReadPosRankSum=-1.316;SC=GGGAGGGTGGACACCCCCAGG;SOR=0.688;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=247;TCF=138;TCR=109;TR=124;WE=113943478;WS=113943460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,134:0.51:262
chr2	113953401	rs923693	A	G	6600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=119;NR=117;PP=2965;SC=CTGTCTTTGGACTGTCCTCCC;SOR=0.709;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=236;TCF=119;TCR=117;TR=236;WE=113953409;WS=113953391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr2	113953657	rs4849169	A	C	6842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=139;NR=100;PP=2965;SC=AGGCTCTGGGAGGCAATGGAT;SOR=1.087;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=239;TCF=139;TCR=100;TR=239;WE=113953665;WS=113953647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr2	113953952	rs4848318	T	C	2064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=51;PP=1369;SC=CCTGTGCCGATGCATGCACAG;SOR=1.905;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=71;TCF=20;TCR=51;TR=71;WE=113953960;WS=113953942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr2	113953973	rs71385890	A	AT	1823.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=23;PP=1162;SC=GTGTGCAGAGAGACAGCCCGC;SOR=3.056;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=24;WE=113953984;WS=113953963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr2	113953974	rs10579377	GACA	G	1823.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=23;PP=1196;SC=TGTGCAGAGAGACAGCCCGCG;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=24;WE=113953984;WS=113953963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr2	113955074	rs902695	G	A	5182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=103;NR=74;PP=2965;SC=GCACACTTGCGTGTGTCTGAG;SOR=0.976;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=177;TCF=103;TCR=74;TR=177;WE=113955082;WS=113955064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr2	113956371	rs2276561	G	C	6630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=122;NR=106;PP=2965;SC=CTGCGGCCACGCACTCCGCGC;SOR=0.701;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=229;TCF=122;TCR=107;TR=228;WE=113956379;WS=113956361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr2	113956821	rs2305133	C	G	2240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=50;PP=1468;SC=GCCGAGCCCACCTCCCCGCCG;SOR=1.966;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=22;TCR=50;TR=72;WE=113956829;WS=113956811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr2	113977862	rs4849175	T	G	307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=6;PP=173;SC=CAGGAATGGTTGGGGAGACAG;SOR=1.802;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=113977870;WS=113977852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	113994417	rs1110839	G	T	3725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=81;PP=2390;SC=GGTCCTCATCGCCCCCTTCTT;SOR=1.473;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=124;TCF=43;TCR=81;TR=124;WE=113994425;WS=113994407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr2	114000458	rs902691	C	A	642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=17;PP=509;SC=TGGGTATCTCCAAGGCACTTG;SOR=1.931;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=23;WE=114000466;WS=114000448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	114220055	rs1210133	T	C	1739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.513;NF=27;NR=43;PP=1097;ReadPosRankSum=1.881;SC=TGTAAAGAAATTAAGAGCGAC;SOR=0.651;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=43;TCR=70;TR=70;WE=114220063;WS=114220045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,76:0.63:121
chr2	114386338	rs149500718	G	A	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.72;MQRankSum=-0.431;QD=20.64;ReadPosRankSum=2.200;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr2	114387907	rs1964835	C	T	885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.767;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-8.548;NF=11;NR=34;PP=664;ReadPosRankSum=0.428;SC=GACTCAAGAACTACTGCCAAT;SOR=0.579;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=131;TCF=31;TCR=100;TR=45;WE=114387915;WS=114387897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,46:0.32:145
chr2	114387950	rs1040646	G	A	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.074;NF=0;NR=10;PP=154;ReadPosRankSum=-0.750;SC=ATCTAAACTCGGTTGGGCTAA;SOR=0.387;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=10;WE=114387958;WS=114387940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,10:0.24:42
chr2	114392716	rs146907164	C	T	974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.144;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-7.701;NF=23;NR=40;PP=985;ReadPosRankSum=1.348;SC=TGGTACGAGACGGTGGGGAGG;SOR=1.258;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=143;TCF=57;TCR=86;TR=63;WE=114392724;WS=114392706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,48:0.38:127
chr2	114425425	rs145764632	C	A	782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.12;MQRankSum=-3.779;QD=12.23;ReadPosRankSum=1.351;SOR=0.865;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,36:0.56:64
chr2	114426115	rs80314553	T	C	2810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.183;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-11.283;NF=90;NR=61;PP=1821;ReadPosRankSum=-1.405;SC=TGGCTGAACGTGCTCATTGTA;SOR=1.025;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=301;TCF=168;TCR=133;TR=151;WE=114426123;WS=114426105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,140:0.47:297
chr2	114429542	rs13003858	G	A	1244.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.042;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.090;NF=38;NR=37;PP=867;ReadPosRankSum=0.508;SC=GGGAGCCAGGGGAGAGAGAGA;SOR=0.654;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=259;TCF=142;TCR=117;TR=75;WE=114429550;WS=114429532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:208,79:0.28:287
chr2	114429576	rs12986781	T	C	1008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.78;MQRankSum=-1.348;QD=3.88;ReadPosRankSum=0.872;SOR=0.684;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:192,68:0.26:260
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chr2	114480812	rs3835109	A	AAAC	1165.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=19;PP=1000;SC=TTAAAAAATTAAACCAAAGAA;SOR=3.180;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=20;WE=114480820;WS=114480802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	114480881	rs73955056	A	G	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=2.722;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=50;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.605;NF=0;NR=6;PP=107;ReadPosRankSum=0.528;SC=AGGAGCAAAGATAAGAGGCTA;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=6;WE=114480889;WS=114480871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr2	114486907	rs4849269	T	C	176.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=0;PP=141;SC=CTATTCCCTCTGAAAAACAAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=114486915;WS=114486897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	114492135	rs2305254	C	T	2787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=39;PP=1455;SC=TTAAGCAGAGCAAACTAGCTA;SOR=0.916;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=57;TCR=39;TR=96;WE=114492143;WS=114492125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr2	114493315	rs10199515	C	A	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=170;ReadPosRankSum=-0.814;SC=AATACATACACTGATTTATAA;SOR=0.580;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=12;WE=114493323;WS=114493305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr2	114493524	rs10199704	C	T	2525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=46;PP=1374;SC=TTGTTCTCCTCCTAAATACCG;SOR=1.227;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=35;TCR=46;TR=81;WE=114493532;WS=114493514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr2	114501242	rs3748907	T	C	2379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=45;PP=1263;ReadPosRankSum=0.062;SC=AGTTCTGAAGTGGCTTGAATA;SOR=0.705;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=77;TCR=64;TR=99;WE=114501250;WS=114501232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,107:0.69:155
chr2	114513386	rs7578249	C	T	4142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=87;NR=54;PP=2371;SC=AGTTAACTACCAGAAAATAGC;SOR=1.051;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=87;TCR=54;TR=141;WE=114513394;WS=114513376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr2	114513787	rs4538208	C	G	2484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=31;PP=1664;SC=CGCAGGGCTCCGGCGCCCCTG;SOR=1.420;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=61;TCR=31;TR=92;WE=114513795;WS=114513777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr2	114514098	rs7592689	A	C	635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=16;PP=447;SC=GCTCCTGAAGACGCGGTGCCC;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=21;WE=114514106;WS=114514088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	115822349	rs114821649	G	T	3037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.470;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=61;PP=1776;ReadPosRankSum=2.997;SC=TCATCACAGAGGTGGCTGAGG;SOR=0.591;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=240;TCF=130;TCR=110;TR=131;WE=115822357;WS=115822339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,145:0.54:268
chr2	115919677	rs7557011	CT	GC	601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=9;PP=295;SC=CCGCCTCCCGCTTCCCAGGCT;SOR=1.329;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=6;TCR=9;TR=15;WE=115919686;WS=115919667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	116066984	rs975453	G	A	796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=23;PP=476;ReadPosRankSum=-1.803;SC=TGATAATTTCGCATTCAAATG;SOR=0.560;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=53;TCF=16;TCR=37;TR=34;WE=116066992;WS=116066974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,36:0.63:57
chr2	116099725	rs843403	A	T	1626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.393;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.893;NF=25;NR=46;PP=1058;ReadPosRankSum=1.261;SC=CAAACTCATTAAGCACTCTCT;SOR=0.492;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=120;TCF=41;TCR=79;TR=71;WE=116099733;WS=116099715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,74:0.56:131
chr2	116283668	rs984066	G	A	657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=18;PP=441;ReadPosRankSum=-0.169;SC=AACTACCGGAGGACAGTAATG;SOR=0.793;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=67;TCF=24;TCR=43;TR=27;WE=116283676;WS=116283658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,30:0.39:76
chr2	116497479	rs1550854	A	G	4743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=97;PP=2756;SC=GGTAAGTAACATGGAAGTACT;SOR=1.442;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=159;TCF=62;TCR=97;TR=159;WE=116497487;WS=116497469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr2	116497528	rs1550853	A	G	1219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=27;PP=762;SC=GTGACTTGACAGATGGTATTC;SOR=2.726;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=35;WE=116497536;WS=116497518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr2	116510817	rs2053724	G	C	4685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=95;NR=70;PP=2708;SC=GTTAAACCGAGCTCAGAACAT;SOR=0.785;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=165;TCF=95;TCR=70;TR=165;WE=116510825;WS=116510807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr2	116525960	rs1446495	G	A	6157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=101;NR=100;PP=2965;SC=ATTTCACCACGTAGCTATGTT;SOR=0.792;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=201;TCF=101;TCR=100;TR=201;WE=116525968;WS=116525950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr2	116526023	rs369808228	A	G	901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.237;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=29;PP=603;ReadPosRankSum=-0.292;SC=CATTGTCCTCATGTCCCCGAA;SOR=0.917;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=131;TCF=58;TCR=73;TR=48;WE=116526031;WS=116526013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,51:0.36:141
chr2	116548526	rs6735355	A	G	438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=4;PP=322;SC=TAGTAATTCAAAAGAGAAATG;SOR=2.448;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=16;WE=116548534;WS=116548516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	116548820	rs3738879	C	T	3682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=52;PP=2027;SC=GTTTTACCTGCAAATGACTCT;SOR=0.862;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=122;TCF=70;TCR=52;TR=122;WE=116548828;WS=116548810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr2	116593675	rs10549769	ATG	A	1972.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.44;SOR=1.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr2	116593695	rs34212292	GAT	G	1099.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.174;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=22;PP=804;ReadPosRankSum=-1.043;SC=GTGTGTGTGAGATATATATAT;SOR=1.338;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=50;TCF=17;TCR=33;TR=36;WE=116593707;WS=116593665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,54:0.65:83
chr2	116594221	rs736335	G	C	1423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.908;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=36;PP=1037;ReadPosRankSum=1.312;SC=TAGATCTATAGATACAGATAT;SOR=0.923;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=81;TCF=29;TCR=52;TR=54;WE=116594229;WS=116594211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,56:0.65:86
chr2	116598546	rs272011	G	A	652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=19;PP=525;SC=CTCTGTTCCTGATTACACCGA;SOR=3.816;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=116598554;WS=116598536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	116599659	rs272010	A	T	1240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=9;PP=822;SC=AACTTAGAGTAGAATTAGGTT;SOR=2.007;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=31;TCR=9;TR=40;WE=116599667;WS=116599649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr2	116599927	rs272009	T	C	3411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=80;PP=2127;SC=AATAATGGACTGTATTTATAC;SOR=1.802;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=118;TCF=38;TCR=80;TR=118;WE=116599935;WS=116599917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr2	118575215	rs1052637	C	G	2229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=39;NR=34;PP=1515;SC=ACTGTATTAACCAATGGAGAA;SOR=0.770;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=40;TCR=34;TR=73;WE=118575223;WS=118575205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr2	118575468	rs6737733	C	T	437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=12;PP=308;SC=TTGGCAGAAGCGGGGAGTCCA;SOR=3.126;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=118575476;WS=118575458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	118582741	rs116239647	A	C	3156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.900;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=68;PP=1956;ReadPosRankSum=0.968;SC=AGATTGTAGGATTGGAGGTAT;SOR=0.483;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=209;TCF=91;TCR=118;TR=127;WE=118582764;WS=118582731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,139:0.62:226
chr2	118688754	rs971754	T	C	5744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=113;PP=2965;SC=GAAATGGTGATGAAAAGACAT;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=204;TCF=91;TCR=113;TR=204;WE=118688762;WS=118688744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr2	118692929	rs12151445	G	A	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=2;PP=422;ReadPosRankSum=-1.058;SC=TAAGACGCATGGTGGGAATAC;SOR=1.022;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=22;WE=118692937;WS=118692919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,25:0.83:30
chr2	118694393	rs2303333	C	G	3387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.806;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=84;PP=2130;ReadPosRankSum=1.434;SC=TGCAAGCTTGCCTGTCTCCAC;SOR=0.960;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=255;TCF=114;TCR=141;TR=143;WE=118694401;WS=118694383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,159:0.57:277
chr2	118694477	rs55918624	T	C	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.988;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=24;PP=439;ReadPosRankSum=2.104;SC=ATTAGCCACATGTTCTGTCTC;SOR=0.560;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=65;TCF=19;TCR=46;TR=35;WE=118694485;WS=118694467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,36:0.52:69
chr2	118698699	rs2303330	A	G	733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.144;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=9;PP=547;ReadPosRankSum=0.666;SC=CCCATGCTAAAGTGGAACAGA;SOR=0.518;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=39;TCR=15;TR=32;WE=118698707;WS=118698689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,31:0.58:53
chr2	118701764	rs3732320	C	T	908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.742;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=27;PP=622;ReadPosRankSum=0.158;SC=CTCCCCCATCCTAAGGCCTTA;SOR=0.601;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=101;TCF=41;TCR=60;TR=45;WE=118701772;WS=118701754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,46:0.44:105
chr2	118704478	rs7580124	T	G	3861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=86;PP=2555;SC=TGACATGAACTTTTACAAAAT;SOR=1.697;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=127;TCF=41;TCR=86;TR=127;WE=118704486;WS=118704468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr2	118704503	rs2303329	A	G	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.115;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=25;PP=492;ReadPosRankSum=0.295;SC=ACAAGGAGTAATTAGACGCAA;SOR=0.973;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=78;TCF=20;TCR=58;TR=32;WE=118704521;WS=118704493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,32:0.39:83
chr2	118705570	rs10186396	A	G	3338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=35;PP=2087;SC=GCGCCTGGCCAAATCTGCTTT;SOR=1.666;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=81;TCR=35;TR=116;WE=118705578;WS=118705560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr2	118706879	rs1035598	A	G	6595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=126;NR=94;PP=2965;SC=AAAAATAAGCACATGCTGAAA;SOR=0.827;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=220;TCF=126;TCR=94;TR=220;WE=118706887;WS=118706869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr2	118716166	rs1991102	C	T	1038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.917;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=30;PP=694;ReadPosRankSum=0.695;SC=GCCAGTCACACCAAGCCAGGG;SOR=0.540;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=78;TCF=24;TCR=54;TR=44;WE=118716174;WS=118716156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,46:0.57:81
chr2	118732975	rs6722547	T	C	913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=22;PP=665;SC=AGCAGCAGCATCCTGAGAGAG;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=27;WE=118732983;WS=118732965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	118735395	rs889899	G	A	388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=3;PP=279;SC=TTGCTCCCCAGTCTGTAGAGG;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=14;WE=118735403;WS=118735385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	118753148	rs10633675	A	ATC	3459.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.13;NF=1;NR=47;PP=2437;SC=CCACTCAGATATGTCTTATAA;SOR=2.185;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=50;TCF=1;TCR=49;TR=48;WE=118753156;WS=118753138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr2	118766024	rs10864966	A	G	1851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=12;PP=1384;SC=CAGACATGGAAGAAGTTAAAA;SOR=2.457;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=46;TCR=12;TR=58;WE=118766032;WS=118766014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr2	118771566	rs11545372	C	A	2260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.460;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=43;PP=1310;ReadPosRankSum=0.720;SC=CCCTGGGCAACCCCATGATCC;SOR=0.625;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=167;TCF=86;TCR=81;TR=95;WE=118771574;WS=118771556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,102:0.57:179
chr2	118771663	rs12477588	A	G	3234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=53;NR=55;PP=1780;SC=GGGGTGGAGTACAAAGCGGAA;SOR=1.010;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=108;TCF=53;TCR=55;TR=108;WE=118771671;WS=118771653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr2	118771682	rs58181584	TGCC	T	1670.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.764;NF=0;NR=24;PP=1024;ReadPosRankSum=-0.834;SC=AAACTCCCTCTGCCGCCGCCG;SOR=0.900;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=1;TCR=46;TR=24;WE=118771692;WS=118771672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,42:0.79:53
chr2	118854094	.	AT	A	295.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.169;ClippingRankSum=0.000;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=4.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.52;ReadPosRankSum=-0.640;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,24:0.29:84
chr2	119700096	rs2077344	T	C	581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.131;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=483;ReadPosRankSum=0.805;SC=TTGCACGTAATCATCACTAAT;SOR=2.387;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=45;TCF=6;TCR=39;TR=22;WE=119700104;WS=119700086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,22:0.47:47
chr2	119732042	rs11693199	T	C	2274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.247;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=51;PP=1468;ReadPosRankSum=0.227;SC=TTCTGACCCTTAATCATTTTC;SOR=1.002;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=170;TCF=77;TCR=93;TR=87;WE=119732050;WS=119732032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,98:0.53:186
chr2	119739269	rs56216274	C	T	2124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.337;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=48;PP=1203;ReadPosRankSum=0.410;SC=ATCCCAGCTACGACTGTCCCT;SOR=0.495;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=169;TCF=81;TCR=88;TR=95;WE=119739277;WS=119739259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,104:0.56:187
chr2	119748135	rs3835093	TC	T	4046.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=5.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.215;HP=12;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=2.542;NF=27;NR=43;PP=2298;ReadPosRankSum=-0.552;SC=TATTATCTCCTCCCCCCCCCC;SOR=1.107;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=203;TCF=59;TCR=144;TR=70;WE=119748153;WS=119748125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,116:0.39:301
chr2	119748143	rs116412702	C	G	1834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FS=7.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.14;MQRankSum=2.812;QD=5.75;ReadPosRankSum=0.209;SOR=1.009;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:211,108:0.34:319
chr2	119749477	rs2304708	T	G	9168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=157;NR=156;PP=2965;ReadPosRankSum=1.301;SC=CTGATTCCTTTGTTCTTAGGA;SOR=0.228;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=315;TCF=158;TCR=157;TR=313;WE=119749485;WS=119749467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,338:1.00:339
chr2	119749611	rs4848530	C	T	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.911;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=21;PP=459;ReadPosRankSum=-0.951;SC=TGTGCTGGGGCTTGCCCTAGG;SOR=0.330;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=51;TCF=11;TCR=40;TR=28;WE=119749619;WS=119749601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,30:0.53:57
chr2	119749858	rs3765035	A	G	202.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=0;PP=183;SC=CCCGCAGGACATCCCATCCCC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=119749866;WS=119749851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	119751867	rs11678719	C	T	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.497;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=5;PP=404;ReadPosRankSum=2.115;SC=GTCGGCAGTCCACCTCAGATG;SOR=1.090;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=59;TCF=46;TCR=13;TR=26;WE=119751875;WS=119751857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,27:0.41:66
chr2	119915132	rs11308896	CG	C	1628.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=10;PP=1227;SC=CGAGGGTTTACGGGGGCCGGT;SOR=2.348;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=40;TCF=28;TCR=12;TR=34;WE=119915140;WS=119915122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr2	119915249	rs7556873	T	C	8359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=167;NR=126;PP=2965;SC=AGATGCCGCGTACCTGGCAGC;SOR=0.943;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=294;TCF=167;TCR=127;TR=293;WE=119915257;WS=119915239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,311:1.00:311
chr2	120003642	rs838083	C	T	1277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.84;NF=13;NR=29;PP=864;SC=CCAGCATGCTCTTTTTGATAT;SOR=1.880;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=13;TCR=29;TR=42;WE=120003650;WS=120003632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr2	120012171	rs12711924	G	A	1252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=8;PP=886;SC=AGCGCCCGCCGTCTTGTCTTT;SOR=2.636;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=34;TCR=8;TR=42;WE=120012179;WS=120012161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr2	120014985	rs838072	A	G	1057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=1;PP=788;SC=GGCTCTGGCAATCTATTTTTG;SOR=4.680;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=29;WE=120014993;WS=120014984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr2	120059895	rs16744	G	GGAAA	950.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=730;SC=AAAGAGAGAAGGAAAGACCTG;SOR=4.514;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=16;WE=120059903;WS=120059885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	120059988	rs1890	T	C	3227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=43;PP=1976;SC=ATTTCAAAAATTCAGCAGTGG;SOR=0.991;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=65;TCR=43;TR=108;WE=120059996;WS=120059978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr2	120060082	rs1052500	T	C	3587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=55;NR=60;PP=2104;SC=TTTGTAGTTCTTATAATCTTC;SOR=0.851;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=115;TCF=55;TCR=60;TR=115;WE=120060090;WS=120060072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr2	120069281	.	TA	T	149.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.768;ClippingRankSum=0.000;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.02;ReadPosRankSum=-0.588;SOR=0.631;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,16:0.22:74
chr2	120078778	rs1132267	T	C	2147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.19;SOR=0.824;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr2	120125029	rs2084202	A	G	3700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=39;PP=2584;SC=TCCGTGGCCGAGAGCTTGGAG;SOR=1.628;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=120;TCF=81;TCR=39;TR=120;WE=120125037;WS=120125019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr2	120125363	rs3091405	C	A	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.781;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=81;ReadPosRankSum=-1.440;SC=GGCTTCGCTGCAGCCCCGGCC;SOR=0.486;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=20;TCF=13;TCR=7;TR=6;WE=120125371;WS=120125353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,7:0.28:25
chr2	120125936	rs2244135	T	C	1927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=29;NR=38;PP=1162;SC=GCTCAGCAGCTCAGACTGGAA;SOR=1.073;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=68;TCF=30;TCR=38;TR=67;WE=120125944;WS=120125916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr2	120128459	rs3091408	G	A	789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=6.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.37;ReadPosRankSum=-1.151;SOR=1.305;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,41:0.33:124
chr2	120187344	rs11123523	A	G	1128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=6;PP=856;SC=CCTCCTTATTATTCTTAAGTC;SOR=2.712;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=35;WE=120187352;WS=120187334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr2	120187755	rs143841178	G	T	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.913;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=37;ReadPosRankSum=1.486;SC=CGGAGGGAAGGCCCCAGAGCA;SOR=0.330;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=11;TCR=5;TR=6;WE=120187763;WS=120187750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr2	120189404	rs4340531	A	G	138.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=4;NR=2;PP=86;SC=CCTGCGGAGAAGTCCCGGGCT;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=120189412;WS=120189394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	120189433	rs4599130	G	C	227.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=5;NR=3;PP=98;SC=CGGCCACAGCGGAGCAGCTGG;SOR=1.179;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=8;WE=120189441;WS=120189423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	120194651	rs3217464	A	AGTGTGC	7960.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=56;PP=2957;SC=CACCAACCAGACGATCTGCTT;SOR=1.146;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=83;TCF=16;TCR=67;TR=72;WE=120194659;WS=120194641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr2	120197670	rs1042656	G	A	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=12;PP=312;ReadPosRankSum=0.100;SC=GTCTCTGTCCGTGGGTGACCC;SOR=0.801;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=56;TCF=32;TCR=24;TR=27;WE=120197678;WS=120197660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,27:0.43:63
chr2	120199140	rs1126839	A	G	9459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=366;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=159;NR=171;PP=2965;SC=TCACCTCCCCATTGAGGAAGC;SOR=0.814;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=330;TCF=159;TCR=171;TR=330;WE=120199148;WS=120199130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,365:1.00:365
chr2	120209689	rs2587692	A	G	6574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=124;PP=2965;SC=GGTTATGAGCAGGAGCTGTGG;SOR=1.013;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=224;TCF=100;TCR=124;TR=224;WE=120209697;WS=120209679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr2	120221585	rs2253870	G	A	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=89;ReadPosRankSum=-0.045;SC=TTGGTATTAAGTGCAGCCTCA;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=7;WE=120221593;WS=120221575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr2	120221861	rs57757577	G	A	2932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.569;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=71;PP=1732;ReadPosRankSum=1.808;SC=GGACATAGAGGCCAGAGCCTG;SOR=0.647;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=181;TCF=71;TCR=110;TR=118;WE=120221869;WS=120221851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,130:0.66:196
chr2	120221984	rs2579647	A	C	628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.09;SOR=2.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	120221984	.	ACTGGGTCT	CCTGGGTCC,CCTGGGTCT	132	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.07;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=16;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=1,4;NR=8,14;PP=132,32;QD=20.6075416514;SC=TGAATGAGGAACTGGGTCTCC;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=9,18;WE=120222000;WS=120221974;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.47:19
chr2	120221992	rs6729195	T	C	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.352;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=2.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.52;ReadPosRankSum=0.116;SOR=2.115;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr2	120230998	rs2579641	G	A	1825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=38;NR=22;PP=1087;SC=TCCTGTCCCCGGGTTCGTGGG;SOR=1.263;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=38;TCR=22;TR=60;WE=120231006;WS=120230988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr2	120231165	rs2587701	T	C	3690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=77;PP=2096;SC=AGGTGAGCCATGGGCCCAGGC;SOR=1.302;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=51;TCR=77;TR=128;WE=120231173;WS=120231155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr2	120231303	rs2587702	T	C	657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=17;PP=382;SC=AGGGGGAAAGTGATTTGAACC;SOR=1.697;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=25;WE=120231311;WS=120231293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	120236332	rs41279776	A	C	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.805;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=317;ReadPosRankSum=2.066;SC=CTGAGGCCCCACCCAGAGGGA;SOR=0.368;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=19;WE=120236340;WS=120236322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr2	120303820	rs2579624	A	T	4717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=106;PP=2965;SC=AAAAGAAAAGAAGTACCTAAT;SOR=1.596;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=164;TCF=57;TCR=107;TR=163;WE=120303828;WS=120303810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr2	120306862	rs12469321	G	A	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=208;ReadPosRankSum=-0.189;SC=ATAATCAGCCGTAGTGCAAGA;SOR=0.990;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=11;WE=120306870;WS=120306852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr2	120362407	rs1568540	C	T	7662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=125;NR=132;PP=2965;SC=GAAAGGGTGACAGAGGGGCAG;SOR=0.833;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=257;TCF=125;TCR=132;TR=257;WE=120362415;WS=120362397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,287:1.00:287
chr2	120362897	rs1521914	T	A	2661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=63;PP=1757;SC=GTATCAAGTGTCAGTACAGTT;SOR=2.277;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=20;TCR=63;TR=83;WE=120362905;WS=120362887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr2	120369300	rs10864986	T	C	8147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.96;NF=134;NR=145;PP=2965;SC=ATAAACGGGTTGTTCGCAATC;SOR=0.873;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=282;TCF=136;TCR=146;TR=279;WE=120369308;WS=120369290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,312:1.00:312
chr2	120383138	rs77292092	CATT	C	2655.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.163;NF=33;NR=15;PP=1919;ReadPosRankSum=1.132;SC=AATTTGAAATCATTATCCACT;SOR=0.636;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=89;TCF=58;TCR=31;TR=48;WE=120383148;WS=120383128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,70:0.61:114
chr2	120385094	rs200629080	GATATATAT	G,GAT	1564.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=25,25;NR=4,4;PP=260,1087;ReadPosRankSum=-0.608;SC=AGTAAAAGTGGATATATATAT;SOR=2.252;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=29,29;WE=120385111;WS=120385084;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.36,0.62:45
chr2	120387637	rs12711931	G	C	916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.20;SOR=6.439;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	120387637	.	GACT	CACC,CACT	166	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=0,0;NR=9,21;PP=101,166;QD=17.1630972069;SC=TGGTAGATTAGACTGTGTGGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=9,21;WE=120387648;WS=120387627;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.43:21
chr2	120387640	rs2272056	T	C	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.24;ReadPosRankSum=-1.331;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr2	120388412	rs2272058	G	A	8685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=135;NR=162;PP=2965;SC=CAAAACATCAGTCTTGAGCAT;SOR=0.965;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=297;TCF=135;TCR=162;TR=297;WE=120388420;WS=120388402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,321:1.00:321
chr2	120404629	.	ATT	A,AT	2674.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=0.000;DP=183;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.12;MQRankSum=0.468;QD=18.84;ReadPosRankSum=1.120;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:13,29,100:0.20,0.70:142
chr2	120409430	rs1521912	A	G	847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=0;PP=692;SC=ACAAAAGTAGATGGAACTAAA;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=120409438;WS=120409420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	120414083	rs6761357	C	T	2168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=52;PP=1523;SC=ATTTGCTTTCCGTGGGCCACT;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=21;TCR=52;TR=73;WE=120414091;WS=120414073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr2	120438523	rs13011768	A	G	9724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=357;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=178;NR=161;PP=2965;SC=TGGAGTTCCAATCTCGTACCA;SOR=0.739;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=339;TCF=178;TCR=161;TR=339;WE=120438531;WS=120438513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,356:1.00:356
chr2	120438696	rs939777	A	G	12433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=456;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=215;NR=218;PP=2965;SC=TCACCTTCCAACCTGTGAGTG;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=435;TCF=216;TCR=219;TR=433;WE=120438704;WS=120438686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,454:1.00:454
chr2	120439230	rs1983406	C	G	10314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=376;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=167;NR=182;PP=2965;SC=TGGGCAAAGACGGGGAGAAGC;SOR=0.805;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=350;TCF=167;TCR=183;TR=349;WE=120439238;WS=120439220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,376:1.00:376
chr2	120443443	rs939778	A	G	2406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=58;PP=1713;SC=GTTAGAAGTAACTTTTTCAGG;SOR=1.664;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=27;TCR=58;TR=85;WE=120443451;WS=120443433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr2	120567392	.	AT	A	85.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.425;ClippingRankSum=0.000;DP=165;ExcessHet=3.0103;FS=0.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.53;ReadPosRankSum=1.011;SOR=0.512;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:133,28:0.17:161
chr2	120620092	.	AT	A	369.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.203;ClippingRankSum=0.000;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=1.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.40;MQRankSum=2.274;QD=4.80;ReadPosRankSum=-2.041;SOR=0.924;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,29:0.38:77
chr2	120635205	rs3768914	G	A	148.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=3;PP=48;SC=AGAAATTACTGTGGTGTAATT;SOR=2.303;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=120635213;WS=120635195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	120643280	rs74866537	G	GT	126.52	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5564;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=155;ReadPosRankSum=-0.566;SC=AGACTGCTCAGTTTTTTCAGA;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=6;WE=120643288;WS=120643270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
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chr2	121708663	rs10864866	A	G	609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=21;NR=0;PP=459;SC=TGTAATTCACAGATGACCAGG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=121708671;WS=121708660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
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chr2	121713041	rs12617878	T	C	1408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=33;PP=982;SC=AGGATGGGGCTAGCAGATCTC;SOR=5.235;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=34;WE=121713049;WS=121713012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr2	121726447	rs2592595	G	A	11378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=423;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=177;NR=210;PP=2965;SC=GAAGCAGCTCGGCGGCCAGCG;SOR=0.936;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=389;TCF=178;TCR=211;TR=387;WE=121726455;WS=121726437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,420:1.00:420
chr2	121729323	rs2677507	A	G	399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=13;NR=0;PP=247;SC=TGGCATGCCCAGGTCTGGGTG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=121729331;WS=121729316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	121729360	rs2592592	T	C	1060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=8;PP=630;SC=CATGTGCCCCTGGCAGGACTG;SOR=1.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=33;WE=121729368;WS=121729350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr2	121729490	rs2592591	C	T	6078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=120;NR=94;PP=2965;SC=CCCTGAGTAACAGACTGTCCT;SOR=0.888;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=214;TCF=120;TCR=94;TR=214;WE=121729498;WS=121729480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr2	121729686	rs2592590	T	C	924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=24;PP=672;SC=AGGACCAGGCTTGTGGGCTGC;SOR=2.165;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=32;WE=121729694;WS=121729676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr2	121730138	rs3106962	C	G	1049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=5;PP=716;SC=GGGGTCACTTCAGGGCATGTG;SOR=2.899;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=32;WE=121730146;WS=121730128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr2	121740190	rs1968619	C	T	1951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.36;SOR=3.467;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr2	121740194	rs1530580	T	G	1975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.91;SOR=3.209;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr2	121740505	rs280196	C	T	1834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=21;NR=44;PP=1182;SC=GCCCCACTGACGCCCCATGGC;SOR=1.751;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=65;TCF=21;TCR=44;TR=65;WE=121740513;WS=121740495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr2	121744225	rs2276553	A	G	1239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.253;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=32;PP=806;ReadPosRankSum=1.053;SC=GATGGGGCAGAAGAGAGTCTG;SOR=0.385;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=74;TCF=21;TCR=53;TR=47;WE=121744233;WS=121744215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,50:0.64:78
chr2	121746956	rs3738880	G	T	4175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.401;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=87;PP=2567;ReadPosRankSum=0.195;SC=CACCGTAGACGCCCTGGCCAG;SOR=0.784;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=279;TCF=140;TCR=139;TR=173;WE=121746964;WS=121746946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,190:0.62:305
chr2	121747406	rs12711538	G	A	3102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=64;PP=1934;ReadPosRankSum=-0.821;SC=TGGGGTCCCCGATTCAGCCCT;SOR=0.675;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=208;TCF=104;TCR=104;TR=124;WE=121747414;WS=121747396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,141:0.60:236
chr2	121747429	rs10167980	A	G	2733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=56;PP=1738;ReadPosRankSum=1.402;SC=CTGGAGTGCCACCACCTCACC;SOR=0.663;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=205;TCF=112;TCR=93;TR=119;WE=121747437;WS=121747419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,128:0.57:223
chr2	121982011	rs4384798	T	A	1800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.642;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=38;PP=1032;ReadPosRankSum=-1.543;SC=AAAGGTGCAGTGCCACAGTAT;SOR=0.634;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=119;TCF=52;TCR=67;TR=70;WE=121982019;WS=121982001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,80:0.58:138
chr2	121983299	rs72828950	A	G	669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=28;PP=555;ReadPosRankSum=0.534;SC=CTGCCAAGCCACTGCCACGGT;SOR=0.654;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=114;TCF=29;TCR=85;TR=37;WE=121983307;WS=121983289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,35:0.31:113
chr2	121989489	rs2304667	G	A	3892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.537;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQ=59.96;MQRankSum=-0.814;NF=95;NR=76;PP=2367;ReadPosRankSum=1.273;SC=ACAGGTTGGCGATCTTCTCAA;SOR=0.564;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=280;TCF=159;TCR=121;TR=171;WE=121989497;WS=121989479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,181:0.60:303
chr2	121992921	rs2250092	T	C	3149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=406;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.134;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=97;PP=1731;ReadPosRankSum=0.149;SC=GCCTGTTACATGGAACCCAGA;SOR=0.812;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=363;TCF=152;TCR=211;TR=163;WE=121992929;WS=121992911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:236,170:0.42:406
chr2	121995151	rs2260394	T	C	1882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.480;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=34;PP=1156;ReadPosRankSum=0.560;SC=AGCCTTGAAGTGTCTCCAAGA;SOR=0.761;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=244;TCF=153;TCR=91;TR=91;WE=121995159;WS=121995141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,97:0.37:262
chr2	122004596	rs2252862	C	G	800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.782;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=28;PP=600;ReadPosRankSum=-0.459;SC=AAGCAGGGTGCCCCTGGATCC;SOR=0.592;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=111;TCF=34;TCR=77;TR=41;WE=122004604;WS=122004586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,41:0.36:115
chr2	122006700	rs7562700	G	C	1149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FS=1.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.01;ReadPosRankSum=-1.696;SOR=0.837;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,65:0.40:164
chr2	122007378	rs2119021	A	C	660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=19;PP=447;ReadPosRankSum=1.413;SC=AGCTCAGCTCACTCTCTGGAC;SOR=0.582;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=39;TCF=12;TCR=27;TR=28;WE=122007386;WS=122007368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,28:0.72:39
chr2	122042750	rs13415738	A	T	2344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=52;PP=1545;SC=CGCGCCGAGGACCCAGCGGCG;SOR=1.697;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=25;TCR=52;TR=77;WE=122042758;WS=122042740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr2	125192068	rs1425745	T	C	5619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=109;NR=91;PP=2925;SC=CAGAATCAGATGTTGCTGACT;SOR=0.759;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=200;TCF=109;TCR=91;TR=200;WE=125192076;WS=125192058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr2	125232609	rs4411700	G	T	1046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=30;PP=762;SC=GAGAGAAAGAGAATGGCAGAT;SOR=3.797;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=33;WE=125232617;WS=125232599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr2	125405302	rs924802	C	T	2433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.177;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=36;PP=1510;ReadPosRankSum=-1.337;SC=TTGCTTCTAACGTCTCTTGCT;SOR=0.801;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=171;TCF=108;TCR=63;TR=102;WE=125405310;WS=125405292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,111:0.59:188
chr2	125660609	rs34165507	C	T	4075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.422;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=89;PP=2431;ReadPosRankSum=-1.365;SC=GGGACCTTGACGGAATCCAGC;SOR=0.739;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=282;TCF=136;TCR=146;TR=170;WE=125660617;WS=125660599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,185:0.60:309
chr2	125669260	rs2602655	A	G	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=215;ReadPosRankSum=0.345;SC=TTTCATGAGTAGTCCTGTGTG;SOR=3.014;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=10;WE=125669268;WS=125669250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr2	127447763	rs6709803	G	A	1752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=14;PP=1272;SC=GATGCAGCTTGGGCCAAGGTG;SOR=2.194;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=48;TCR=14;TR=62;WE=127447771;WS=127447753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr2	127453479	rs4538146	G	A	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.508;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=258;ReadPosRankSum=-0.421;SC=AGGCCCCAGAGCCCCTGCCTC;SOR=2.165;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=15;WE=127453487;WS=127453469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr2	127453664	rs1050967	A	C	6219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=108;NR=108;PP=2965;SC=CCCTGCAGGGAGACCCTGCCC;SOR=0.702;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=217;TCF=109;TCR=108;TR=216;WE=127453672;WS=127453654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr2	127657221	rs3795873	C	T	1348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=25;PP=829;SC=GCACACGGCCCAGCCCTCCAC;SOR=1.426;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=17;TCR=25;TR=42;WE=127657229;WS=127657211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr2	127659104	rs115618463	A	T	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.977;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=71;ReadPosRankSum=0.980;SC=TGCAGAACAGAGTGGGATCGA;SOR=0.175;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=6;WE=127659112;WS=127659094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr2	127807941	rs7568161	C	T	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.435;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=157;ReadPosRankSum=1.436;SC=CGGTGCCAGCCGCAGCCAGGA;SOR=1.179;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=43;TCF=29;TCR=14;TR=12;WE=127807949;WS=127807931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,12:0.29:42
chr2	127808161	rs7558000	G	A	2728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FS=0.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.14;ReadPosRankSum=1.074;SOR=0.618;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:116,77:0.40:193
chr2	127808170	rs7558001	G	A	2535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=1.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.00;ReadPosRankSum=0.515;SOR=0.547;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,69:0.41:169
chr2	127816743	rs6720741	G	T	1854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FS=1.568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.66;ReadPosRankSum=-2.337;SOR=0.720;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:138,104:0.43:242
chr2	127816846	rs140171337	CTG	C	758.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.015;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.682;NF=0;NR=20;PP=744;ReadPosRankSum=-0.530;SC=AGGTGTGAAACTGTGTGTGTG;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=0;TCR=42;TR=20;WE=127816857;WS=127816836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,26:0.65:40
chr2	127818406	rs1108031	G	A	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.260;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=110;ReadPosRankSum=0.213;SC=GGCCCCTGCTGTGGCCAGGTG;SOR=0.076;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=9;WE=127818414;WS=127818396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr2	127821085	rs2071268	C	T	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.647;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=335;ReadPosRankSum=-0.560;SC=CCTCCCACGACTCTGACTCTG;SOR=1.201;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=66;TCF=48;TCR=18;TR=25;WE=127821093;WS=127821075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,27:0.36:74
chr2	127821207	rs1137845	G	A	3375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=438;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.531;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=75;PP=1929;ReadPosRankSum=-0.851;SC=ACGTGTTGACGTAGAAACCTA;SOR=0.625;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=402;TCF=224;TCR=178;TR=166;WE=127821215;WS=127821197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:259,179:0.41:438
chr2	127821499	rs72481904	T	C	1318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.521;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=29;PP=654;ReadPosRankSum=-1.353;SC=GGCACCGTGCTGGGCCTCACC;SOR=0.642;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=209;TCF=120;TCR=89;TR=66;WE=127821522;WS=127821489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,72:0.31:229
chr2	127825968	rs934826	G	A	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=289;ReadPosRankSum=-1.337;SC=GGGCCCTTGAGGCCGAGAGAA;SOR=0.588;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=45;TCF=10;TCR=35;TR=19;WE=127825976;WS=127825958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,21:0.48:44
chr2	127826533	rs1060743	A	G	1654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.459;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=41;PP=948;ReadPosRankSum=0.121;SC=TCTTTTTGGCAGTTTGAAGGG;SOR=0.656;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=247;TCF=126;TCR=121;TR=87;WE=127826541;WS=127826523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:177,96:0.35:273
chr2	127834136	rs2276575	T	C	1578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.084;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=29;PP=854;ReadPosRankSum=0.624;SC=ATTCAGCTCGTGCCATTTTTC;SOR=0.812;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=189;TCF=111;TCR=78;TR=73;WE=127834144;WS=127834126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,83:0.38:217
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chr2	128076022	rs9636237	T	C	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=64;ReadPosRankSum=0.361;SC=AAAATTATGATTATCCAAATT;SOR=0.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=5;WE=128076030;WS=128076012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr2	128079806	rs3732209	A	G	1331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.532;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=35;PP=912;ReadPosRankSum=1.200;SC=GGGTCCTTCTAGCTCTTGGAA;SOR=0.125;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=81;TCF=25;TCR=56;TR=56;WE=128079814;WS=128079796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,57:0.69:83
chr2	128081682	rs12622436	C	A	1256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.783;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=28;PP=762;ReadPosRankSum=2.839;SC=AATCCCCCCTCTCCCTCCCAG;SOR=0.495;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=156;TCF=88;TCR=68;TR=61;WE=128081690;WS=128081672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,64:0.38:170
chr2	128087651	rs61422716	C	T	1897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.197;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=38;PP=1106;ReadPosRankSum=0.072;SC=ATCCTCTCCCCTACCAAGTAC;SOR=0.250;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=106;TCF=41;TCR=65;TR=68;WE=128087659;WS=128087641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,82:0.66:124
chr2	128175862	rs1799808	C	T	769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.525;HP=2;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=9;PP=1255;ReadPosRankSum=0.010;SC=CCCTGCTGGACGGCATCCTTG;SOR=0.366;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=81;TCF=66;TCR=15;TR=36;WE=128175883;WS=128175852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,39:0.44:88
chr2	128175875	rs1799809	G	A	942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.311;HP=2;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=13;PP=1255;ReadPosRankSum=0.522;SC=CATCCTTGGTGGGCAGAGGTG;SOR=0.327;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=102;TCF=79;TCR=23;TR=44;WE=128175883;WS=128175852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,47:0.43:110
chr2	128176040	rs1799810	A	T	5060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=378;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.389;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=120;PP=2962;ReadPosRankSum=1.921;SC=CAGGACGGCGAACTTGCAGTA;SOR=0.650;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=344;TCF=151;TCR=193;TR=214;WE=128176048;WS=128176030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,235:0.62:376
chr2	128176195	rs2854700	G	A	618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=18;PP=495;SC=AGCTTGGGGTGAAAGGACACA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=128176203;WS=128176185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	128177377	rs1158867	C	T	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.71;ReadPosRankSum=-0.590;SOR=0.634;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,24:0.49:49
chr2	128180872	rs5936	G	T	3617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=73;NR=42;PP=2106;SC=TCAATTGCTCGCTGGACAACG;SOR=1.119;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=115;TCF=73;TCR=42;TR=115;WE=128180880;WS=128180862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr2	128181028	rs1878844	A	G	4632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=78;PP=2965;SC=CGCTGGGTGCAGGGTGGGCAG;SOR=0.716;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=163;TCF=85;TCR=78;TR=163;WE=128181036;WS=128181018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr2	128181234	rs2069922	GC	G	1213.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=26;PP=950;SC=TCCTCCGGGCGCCCCCTGCGC;SOR=2.362;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=27;WE=128181242;WS=128181224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr2	128184770	rs5937	T	C	1340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.156;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=35;PP=657;ReadPosRankSum=-2.656;SC=ACTGCATGGATGAGTCCAAGA;SOR=0.973;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=118;TCF=53;TCR=65;TR=60;WE=128184778;WS=128184760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,68:0.52:131
chr2	128253571	rs334151	C	T	2398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=47;PP=1344;ReadPosRankSum=0.317;SC=CGACCCAGCTCACCTCAGCAG;SOR=0.669;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=183;TCF=103;TCR=80;TR=105;WE=128253579;WS=128253561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,112:0.57:195
chr2	128271958	rs10432384	C	T	1656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.362;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=47;PP=994;ReadPosRankSum=-1.315;SC=CCCTCCCTCCCGCTTACCCAG;SOR=0.885;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=209;TCF=98;TCR=111;TR=84;WE=128271966;WS=128271948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,87:0.39:221
chr2	128281469	rs2303947	C	T	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-3.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.769;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=293;ReadPosRankSum=0.723;SC=GCAAAAGTTACCACTGAGGAA;SOR=1.489;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=2;TCR=48;TR=17;WE=128281477;WS=128281459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,20:0.36:55
chr2	128321770	rs2404991	G	A	1603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.531;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=42;PP=1115;ReadPosRankSum=-0.268;SC=CCACAAGACCGGCGTGGCCAT;SOR=0.766;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=177;TCF=79;TCR=98;TR=72;WE=128321778;WS=128321760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,81:0.40:202
chr2	128341662	rs143819345	C	A	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.249;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=239;ReadPosRankSum=1.140;SC=CAGCTGGCCCCACTCCACCCC;SOR=0.284;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=68;TCF=62;TCR=6;TR=19;WE=128341670;WS=128341652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,21:0.30:70
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chr2	128351346	.	T	C	41	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=0;NR=7;PP=41;QD=10.8244589353;SC=CAGCTCAAAGTGTGGTCCCCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=7;WE=128351354;WS=128351336;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:26,7:0.21:33
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chr2	128366272	rs17261971	G	A	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=347;ReadPosRankSum=-0.935;SC=CTTCCTCCACGGGGTATGCAG;SOR=0.769;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=75;TCF=55;TCR=20;TR=27;WE=128366280;WS=128366262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,30:0.37:82
chr2	128367092	rs777432	G	A	3938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=442;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.110;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=80;PP=2351;ReadPosRankSum=0.765;SC=ATCTGGAATCGAAGACCCAGA;SOR=0.836;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=401;TCF=215;TCR=186;TR=181;WE=128367100;WS=128367082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:241,200:0.45:441
chr2	128367359	rs58719465	G	A	3149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=403;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.787;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=70;PP=2081;ReadPosRankSum=1.410;SC=TATGGCTCGGGGAAAGAAGGA;SOR=0.733;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=383;TCF=196;TCR=187;TR=153;WE=128367367;WS=128367349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:243,160:0.40:403
chr2	128369896	rs777435	A	G	1786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.151;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=46;PP=1200;ReadPosRankSum=0.737;SC=CCCGGATCACAGGCCAGGTGA;SOR=0.557;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=240;TCF=132;TCR=108;TR=95;WE=128369904;WS=128369886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,97:0.37:263
chr2	128377833	rs2248519	C	G	1244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=1.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.00;ReadPosRankSum=0.301;SOR=0.889;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,34:0.41:83
chr2	128377842	rs77159371	T	C	1335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.21;ReadPosRankSum=0.405;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,38:0.40:94
chr2	128379563	rs61744148	C	G	2045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=53;PP=1267;ReadPosRankSum=0.475;SC=CCAGTATCTACTGAACTTCAT;SOR=0.718;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=284;TCF=146;TCR=138;TR=109;WE=128379571;WS=128379553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:197,114:0.37:311
chr2	128381808	rs13422424	C	T	2005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=376;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=52;PP=1240;ReadPosRankSum=-1.433;SC=CCCCCTGGCACGACTCCCGGG;SOR=0.682;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=335;TCF=184;TCR=151;TR=115;WE=128381816;WS=128381798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:254,122:0.32:376
chr2	128382859	rs2245297	C	T	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=60;ReadPosRankSum=0.210;SC=GGGCAAGAGCCCGGCCACGGG;SOR=0.527;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=6;WE=128382867;WS=128382849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr2	128383174	rs76503952	T	C	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=7;PP=132;ReadPosRankSum=0.422;SC=GGGGGGCTCATGGTATACAGA;SOR=0.511;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=15;TCR=17;TR=13;WE=128383182;WS=128383164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,13:0.37:35
chr2	128385224	rs10164978	C	G	2243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.866;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=55;PP=1677;ReadPosRankSum=-0.113;SC=GAACTGGTGGCCTGGAGGGTA;SOR=0.676;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=315;TCF=162;TCR=153;TR=113;WE=128385232;WS=128385214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:220,115:0.34:335
chr2	128385244	rs58961411	T	C	2059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.997;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=57;PP=1448;ReadPosRankSum=0.231;SC=ACAGGTTGTCTGGGAAGGCGA;SOR=0.822;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=285;TCF=140;TCR=145;TR=105;WE=128385252;WS=128385234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:196,107:0.35:303
chr2	128389343	rs10208043	C	T	1175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.688;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=37;PP=762;ReadPosRankSum=-0.461;SC=GCTGGGGCGGCGGCCAGCCCA;SOR=0.604;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=121;TCF=40;TCR=81;TR=56;WE=128389351;WS=128389333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,58:0.44:132
chr2	128389422	rs10183797	G	C	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-3.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=107;ReadPosRankSum=0.358;SC=CACCGCAGCTGGTGGCGGCAG;SOR=0.430;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=11;WE=128389430;WS=128389412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr2	128392688	rs13391954	C	T	1655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=33;PP=1044;ReadPosRankSum=0.313;SC=TGCTGGCCCTCGCCCAGGGGC;SOR=0.713;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=251;TCF=151;TCR=100;TR=85;WE=128392696;WS=128392678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,92:0.35:266
chr2	128393261	rs2255178	T	C	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.133;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=207;ReadPosRankSum=1.242;SC=GGGCCGCAGCTGGAGACCCAG;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=59;TCF=44;TCR=15;TR=19;WE=128393269;WS=128393251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,19:0.29:65
chr2	128394758	rs2255039	T	C	1027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FS=5.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.27;ReadPosRankSum=-0.044;SOR=0.586;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:134,61:0.31:195
chr2	128394877	rs3217355	C	CT	3310.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.704;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=3.656;NF=26;NR=33;PP=2017;ReadPosRankSum=0.395;SC=CTGACCCCCCCGTCCCCTGTC;SOR=0.885;SbPval=0.06;Source=Platypus;TC=175;TCF=52;TCR=123;TR=59;WE=128394885;WS=128394860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:200,107:0.35:307
chr2	128396807	rs891515	A	G	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.118;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=352;ReadPosRankSum=-0.136;SC=CATGGACAGCAGGAGGGGAGA;SOR=2.872;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=39;TCR=6;TR=22;WE=128396815;WS=128396797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,21:0.48:44
chr2	128400608	rs4662751	C	T	4056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=69;PP=2320;ReadPosRankSum=-0.124;SC=TGCCCAGGCCCTTGGCCTTCT;SOR=0.745;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=145;TCF=75;TCR=70;TR=143;WE=128400616;WS=128400598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,156:0.99:158
chr2	128400992	rs2244513	A	G	1754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.520;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=35;PP=1114;ReadPosRankSum=1.215;SC=TTCCCAATGTATTTAACACAC;SOR=0.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=265;TCF=159;TCR=106;TR=91;WE=128401000;WS=128400982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:192,95:0.33:287
chr2	128401091	rs2244507	A	G	2089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=347;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.865;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=56;PP=1339;ReadPosRankSum=0.246;SC=GGGGTTTGCCAGATGAAGAAG;SOR=0.771;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=318;TCF=154;TCR=164;TR=107;WE=128401099;WS=128401081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:231,116:0.33:347
chr2	128401553	rs2288658	A	G	2379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.658;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=48;PP=1547;ReadPosRankSum=0.109;SC=AAGAGATCCAATCGCAGACCC;SOR=0.897;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=313;TCF=175;TCR=138;TR=119;WE=128401561;WS=128401543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:215,125:0.37:340
chr2	128407499	rs2243805	G	A	1301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.787;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=19;PP=818;ReadPosRankSum=0.901;SC=CCCTGGTGGTGGATCTACTCT;SOR=0.564;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=90;TCF=63;TCR=27;TR=57;WE=128407507;WS=128407489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,61:0.60:102
chr2	128407771	rs1820971	C	T	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=47;ReadPosRankSum=-1.016;SC=GGTGACACCCCGGCCACTGCA;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=4;WE=128407779;WS=128407761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr2	128411934	rs6707277	A	G	1705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=6;PP=1279;SC=CACACAGGAGAGGTGGCAGGT;SOR=3.383;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=45;TCR=6;TR=51;WE=128411942;WS=128411924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr2	128411950	rs6707282	A	G	2053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=18;PP=1400;SC=CAGGTGTGCCAGGAAGGGCTG;SOR=2.073;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=76;TCF=57;TCR=19;TR=75;WE=128411958;WS=128411940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr2	128421829	rs79110686	G	A	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.949;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=149;ReadPosRankSum=0.206;SC=CCCTGCCGCCGCAGCTTTCCG;SOR=1.400;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=19;TCF=12;TCR=7;TR=12;WE=128421837;WS=128421819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr2	128431188	rs6430942	A	G	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=276;ReadPosRankSum=-1.138;SC=CCAGCCCCGCACCCTTCACGG;SOR=0.671;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=67;TCF=50;TCR=17;TR=24;WE=128431196;WS=128431178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,25:0.35:71
chr2	128432511	rs140650322	C	T	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.254;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.214;NF=9;NR=8;PP=190;ReadPosRankSum=0.643;SC=CGGGGCTGTACGAGGGCGAGC;SOR=0.437;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=36;TCF=22;TCR=14;TR=17;WE=128432519;WS=128432501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
chr2	128432620	.	TGGGTTGCCG	T	751.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.462;ClippingRankSum=0.000;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=2.276;NF=1;NR=6;PP=1883;ReadPosRankSum=0.336;SC=CGCCGAGCCCTGGGTTGCCGG;SOR=0.757;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=7;WE=128432636;WS=128432610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,22:0.38:58
chr2	128459039	rs1048211	A	G	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=5.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.69;ReadPosRankSum=0.275;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,14:0.39:36
chr2	128459214	rs10206957	C	G	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.467;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=4;PP=111;ReadPosRankSum=0.058;SC=GCCCGGGGACCGGCCGGCGGA;SOR=1.221;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=30;TCF=13;TCR=17;TR=10;WE=128459222;WS=128459204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
chr2	128464116	rs34550770	G	A	2693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=357;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.776;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=68;PP=1768;ReadPosRankSum=-1.505;SC=CAGGTCCTGGGCCCCCTCGGC;SOR=0.795;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=316;TCF=155;TCR=161;TR=126;WE=128464124;WS=128464106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:217,138:0.39:355
chr2	128467473	rs72846240	T	C	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.163;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=308;ReadPosRankSum=-1.089;SC=AGAGAACACCTTGCCACTCTA;SOR=1.828;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=14;WE=128467481;WS=128467463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr2	128474887	rs3771293	C	T	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=17;PP=284;ReadPosRankSum=0.417;SC=GCTTGAGCTACATAAATAGTG;SOR=0.749;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=82;TCF=35;TCR=47;TR=28;WE=128474895;WS=128474877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,30:0.33:90
chr2	128495645	rs6754215	G	A	2563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.884;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=63;PP=1571;ReadPosRankSum=0.126;SC=AAACAAGAAGGGTGCATGAAC;SOR=0.639;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=268;TCF=119;TCR=149;TR=114;WE=128495653;WS=128495635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,129:0.42:305
chr2	128520547	rs6731093	G	A	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.030;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=285;ReadPosRankSum=0.766;SC=TTGAATGGAGGTGTAAGCCAG;SOR=0.094;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=16;WE=128520555;WS=128520537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,17:0.40:43
chr2	128522189	rs62621432	T	C	3681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=525;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.130;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=82;PP=2308;ReadPosRankSum=-2.104;SC=ATCTCTAACATATTGCAAAGG;SOR=0.805;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=484;TCF=253;TCR=231;TR=183;WE=128522197;WS=128522179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:328,197:0.38:525
chr2	128526579	rs143186338	T	TTAAA,TTAAATAAA	689.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;NF=0,0;NR=13,13;PP=212,352;SC=TTCTGTTCTGTTAAATAAATA;SOR=4.294;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=13,13;WE=128526587;WS=128526569;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.59,0.41:17
chr2	128608184	rs11556864	C	T	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=2.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.76;ReadPosRankSum=0.488;SOR=1.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,16:0.22:72
chr2	128608271	rs34858843	GA	G	192.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=3.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.21;ReadPosRankSum=0.292;SOR=0.312;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,14:0.38:37
chr2	128608290	.	T	C	258	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=6;HapScore=2;MGOF=25;MMLQ=24;MQ=59.42;NF=7;NR=14;PP=258;QD=13.9414863118;SC=AAAATCAAAATAATCAAAAAC;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=70;TCF=26;TCR=44;TR=21;WE=128608298;WS=128608280;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:49,21:0.30:70
chr2	128615577	rs74857120	G	A	2465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=384;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.263;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=53;PP=1512;ReadPosRankSum=1.523;SC=GTGGCGCGGGGGAGTCTGGCA;SOR=0.607;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=339;TCF=193;TCR=146;TR=123;WE=128615585;WS=128615567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:248,135:0.35:383
chr2	128699750	rs2304519	G	C	2327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.872;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=65;PP=1703;ReadPosRankSum=-0.533;SC=TGAAACAGAAGACATTGCATC;SOR=0.861;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=178;TCF=70;TCR=108;TR=103;WE=128699758;WS=128699740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,104:0.56:186
chr2	128708063	rs2461463	T	C	1868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=47;PP=1151;SC=CCAACAAAGATGATTAAGAAG;SOR=1.965;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=21;TCR=47;TR=68;WE=128708071;WS=128708053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr2	128744580	rs2948068	A	G	5804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=86;NR=96;PP=2965;SC=AGAGAGGGAAACAAAATGCCA;SOR=0.957;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=182;TCF=86;TCR=96;TR=182;WE=128744588;WS=128744570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr2	128751012	rs142670061	A	G	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=104;ReadPosRankSum=-0.879;SC=TGTGTCCCAAACAAACTCTTA;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=6;WE=128751020;WS=128751002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr2	128753854	rs1550174	T	C	3684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=39;PP=2029;SC=TGGGACACTTTGTTTTATGCT;SOR=1.406;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=78;TCR=39;TR=117;WE=128753862;WS=128753844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr2	128757804	rs10928793	C	T	1810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=34;PP=1134;ReadPosRankSum=0.795;SC=TCGGTATCACCAGGCCCTCAG;SOR=0.643;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=72;TCR=62;TR=73;WE=128757812;WS=128757794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,80:0.55:145
chr2	128772310	rs35312230	C	T	1260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.725;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=14;PP=687;ReadPosRankSum=-0.039;SC=TTCTGTGTTACGTATTTTACC;SOR=0.784;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=118;TCF=84;TCR=34;TR=53;WE=128772318;WS=128772300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,59:0.48:124
chr2	128849114	rs4476299	T	C	5431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=95;PP=2965;ReadPosRankSum=1.555;SC=TCTGGTGTCCTATCCCTTCCC;SOR=0.315;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=179;TCF=83;TCR=96;TR=178;WE=128849122;WS=128849104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,202:1.00:203
chr2	128854948	.	CA	C	131.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.081;ClippingRankSum=0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=1.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.58;MQRankSum=2.071;QD=3.66;ReadPosRankSum=-0.418;SOR=1.038;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,12:0.33:36
chr2	128860835	rs7355336	A	G	1591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=45;PP=1245;SC=CAATTACTACATGCATTTCCT;SOR=3.300;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=8;TCR=45;TR=53;WE=128860843;WS=128860825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr2	128870808	rs4662775	T	C	4156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=91;PP=2918;SC=GCAAAATCAATTATGTATTCA;SOR=1.677;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=45;TCR=91;TR=136;WE=128870816;WS=128870798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr2	128872595	rs56397917	C	T	3336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=38;PP=2232;SC=GGGCATAATCCGAGGTAATGG;SOR=1.570;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=118;TCF=80;TCR=38;TR=118;WE=128872603;WS=128872585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr2	128874061	rs10210598	G	A	764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=17;PP=464;SC=CCTACGTGGAGAGTCAACCAC;SOR=2.670;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=128874069;WS=128874051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	128877837	rs4662593	G	C	1425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=5;PP=1096;SC=AGGGTTGGGAGAGGAAAACCA;SOR=3.958;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=39;TCR=5;TR=44;WE=128877845;WS=128877827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr2	128878014	rs4662594	G	A	12323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=461;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=206;NR=216;PP=2965;SC=CACCTTTAAAGGTTTGGCAGT;SOR=0.822;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=422;TCF=206;TCR=216;TR=422;WE=128878022;WS=128878004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,460:1.00:460
chr2	128878667	rs6430990	T	C	534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=17;NR=0;PP=447;SC=CATTCGAAGATATTCTTAATT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=128878675;WS=128878657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	128879022	rs6430991	G	C	242.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.06;QD=26.98;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	128880899	rs4480941	T	A	980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=24;PP=629;SC=ATCAGCAGCATTTAACAGTGT;SOR=1.949;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=34;WE=128880907;WS=128880889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr2	128880993	rs4633871	A	G	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=2;PP=21;SC=CAGTATGCACATAACTGAAAG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=128881001;WS=128880983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr2	128913757	rs3738923	G	A	2483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=22;PP=1771;SC=TTTCTCAGCTGTATGTAAAGT;SOR=2.250;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=64;TCR=22;TR=86;WE=128913765;WS=128913747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr2	128915057	rs13392666	T	A	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=203;ReadPosRankSum=1.083;SC=GAGAATTGTATCTCTAGAGAT;SOR=0.540;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=14;WE=128915065;WS=128915047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr2	128934400	rs2290111	T	C	6162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=120;NR=101;PP=2965;SC=ACGATGGCACTGATTCTCCCC;SOR=0.727;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=222;TCF=120;TCR=102;TR=221;WE=128934408;WS=128934390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr2	128936000	rs2290110	T	C	1645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=18;PP=792;SC=TGTGTCTGTATGAGTGTTTCA;SOR=0.933;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=34;TCR=18;TR=52;WE=128936008;WS=128935990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr2	128936171	rs3217587	TATG	T	592.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=8;PP=479;SC=TTTCATTATATATGATGAATG;SOR=1.329;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=10;WE=128936181;WS=128936161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	128939606	rs62160075	C	T	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.170;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.14;ReadPosRankSum=0.433;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr2	128939695	rs17793615	A	G	1956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.711;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=24;PP=1178;ReadPosRankSum=-0.080;SC=GACTTTTTATATTCTCCAGAT;SOR=0.627;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=118;TCF=81;TCR=37;TR=77;WE=128939703;WS=128939685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,84:0.65:130
chr2	128939799	rs17178720	C	T	1603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.988;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=39;PP=976;ReadPosRankSum=-0.306;SC=GAGAAATGGACGGCTACAGGT;SOR=0.708;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=254;TCF=129;TCR=125;TR=79;WE=128939807;WS=128939789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,88:0.32:273
chr2	128939817	rs1699	G	A	7296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=124;NR=118;PP=2965;SC=GGTTCTGGAAGTCAGGGTACT;SOR=0.731;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=242;TCF=124;TCR=118;TR=242;WE=128939825;WS=128939807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr2	128941513	.	A	T	154	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=41;MMLQ=27;MQ=58.02;NF=0;NR=8;PP=154;QD=23.5964015684;SC=TGTGTGTGTGAGAGAGAGAGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=8;WE=128941521;WS=128941503;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr2	128944424	rs744265	T	C	4166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=92;PP=2330;SC=GATGTGTGAGTGAATCACGAT;SOR=1.670;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=138;TCF=46;TCR=92;TR=138;WE=128944432;WS=128944414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr2	128947505	rs11542865	G	A	901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=27;PP=692;SC=TTAAAGCTCTGTTGGATTTGT;SOR=3.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=30;WE=128947513;WS=128947495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	130750446	rs199529770	C	A	604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.80;MQRankSum=-5.030;QD=8.40;ReadPosRankSum=-0.312;SOR=0.844;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,32:0.44:72
chr2	130915892	rs71785866	CT	C	120.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=2.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-2.155;QD=1.34;ReadPosRankSum=0.897;SOR=0.653;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,17:0.19:90
chr2	130932371	rs111636541	C	A	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.909;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.204;NF=17;NR=1;PP=339;ReadPosRankSum=0.857;SC=AATGGCCAGGCCTCTGTGCCA;SOR=1.349;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=18;WE=130932379;WS=130932361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,20:0.54:37
chr2	130941065	rs6737226	T	C	1716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.041;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-10.493;NF=48;NR=34;PP=1180;ReadPosRankSum=-0.452;SC=GTGGAGCCTCTGTCCCTGCTC;SOR=0.547;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=146;TCF=91;TCR=55;TR=82;WE=130941073;WS=130941055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,79:0.52:153
chr2	130949411	rs10208844	G	T	1555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.777;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-5.464;NF=49;NR=19;PP=1263;ReadPosRankSum=1.811;SC=CCCTCAGTATGCTTCGCCTTC;SOR=0.816;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=114;TCF=83;TCR=31;TR=68;WE=130949419;WS=130949401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,64:0.55:116
chr2	130951548	rs1052319	G	A	1369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.108;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-1.349;NF=32;NR=23;PP=670;ReadPosRankSum=1.542;SC=TGGTGATCTCGGCCACAGACA;SOR=0.881;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=112;TCF=62;TCR=50;TR=55;WE=130951556;WS=130951538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,65:0.49:133
chr2	130951566	rs7340193	G	A	1390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.070;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.657;NF=32;NR=23;PP=611;ReadPosRankSum=1.151;SC=ACAGCTGCTCGTGGTAGGCCT;SOR=0.874;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=114;TCF=64;TCR=50;TR=55;WE=130951574;WS=130951556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,70:0.49:144
chr2	130988166	rs201275727	A	G	719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=402;ExcessHet=3.0103;FS=9.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.12;MQRankSum=-13.805;QD=1.79;ReadPosRankSum=-0.852;SOR=1.462;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:327,74:0.18:401
chr2	130988203	rs79048658	C	T	1826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=418;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.660;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-11.059;NF=73;NR=60;PP=2962;ReadPosRankSum=1.076;SC=GTCCTGAGCACTGTGGGCCCC;SOR=0.744;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=420;TCF=209;TCR=211;TR=133;WE=130988224;WS=130988193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:299,119:0.28:418
chr2	130988216	rs76582648	C	G	2139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=404;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.503;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-11.471;NF=70;NR=66;PP=2962;ReadPosRankSum=0.314;SC=TGGGCCCCAGCGAAGCCCTCC;SOR=0.626;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=402;TCF=194;TCR=208;TR=136;WE=130988224;WS=130988193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:274,129:0.32:403
chr2	130988276	rs3894178	C	T	1366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.903;NF=34;NR=48;PP=982;ReadPosRankSum=1.888;SC=GTATCAAGCTCATCCCCACTG;SOR=0.685;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=270;TCF=113;TCR=157;TR=82;WE=130988284;WS=130988266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:204,78:0.28:282
chr2	130988410	rs202147725	G	A	614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=2.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.91;MQRankSum=-5.071;QD=4.42;ReadPosRankSum=1.121;SOR=0.920;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,39:0.28:139
chr2	130988421	rs200539608	C	T	830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FS=2.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.41;MQRankSum=-6.343;QD=5.03;ReadPosRankSum=0.529;SOR=0.943;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,50:0.30:165
chr2	131119567	.	C	CT	158	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000;HP=11;HapScore=3;MGOF=19;MMLQ=15;MQ=60.45;NF=8;NR=6;PP=158;QD=11.9285714286;SC=ATTGTAGGGACTTTTTTTTTT;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=31;TCF=17;TCR=14;TR=14;WE=131119575;WS=131119557;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr2	131487673	rs272128	A	C	4675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.412;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=106;PP=2962;ReadPosRankSum=0.738;SC=TGCCATGCTCACATACCTGTA;SOR=0.649;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=311;TCF=141;TCR=170;TR=194;WE=131487681;WS=131487663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,209:0.62:335
chr2	131520663	rs1905235	T	C	3818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.423;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=68;PP=2478;ReadPosRankSum=0.467;SC=CAGGGACCAATCCCGGCTGGA;SOR=0.660;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=270;TCF=147;TCR=123;TR=148;WE=131520671;WS=131520653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,166:0.56:297
chr2	131595205	.	A	G	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.716;ClippingRankSum=0.000;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=0.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.13;ReadPosRankSum=-0.778;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,31:0.26:119
chr2	131672950	rs12464119	A	G	11732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=421;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=186;NR=189;PP=2965;SC=AAGGCACCCAACTCGCACCAA;SOR=0.742;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=375;TCF=186;TCR=189;TR=375;WE=131672958;WS=131672940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,420:1.00:420
chr2	131673316	rs3739129	C	T	9882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=364;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=147;NR=186;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.014;SC=ACTGCGGCCCCGGGGCTGAGG;SOR=1.036;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=335;TCF=148;TCR=187;TR=333;WE=131673324;WS=131673306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,362:0.99:364
chr2	131674285	rs3739127	A	G	10341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=393;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=198;NR=163;PP=2965;SC=TTATTGAGTCAATAGTTCTAG;SOR=0.828;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=362;TCF=198;TCR=164;TR=361;WE=131674293;WS=131674275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,393:1.00:393
chr2	131769237	rs13023338	G	A	2029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=18;PP=1452;SC=AGAGCCCATCGGAGCTGATGG;SOR=2.049;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=48;TCR=18;TR=66;WE=131769245;WS=131769227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr2	131888361	.	AT	A	155.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.273;ClippingRankSum=0.000;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.43;ReadPosRankSum=0.239;SOR=0.758;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,17:0.27:64
chr2	132111166	.	G	GCC	236.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=51.34;QD=33.82;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	132111167	.	G	GCCGCCGCCGC	236.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=51.34;QD=33.82;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	132120501	rs146351322	C	CT	7287.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-0.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=2.822;NF=56;NR=67;PP=2354;ReadPosRankSum=0.022;SC=AAGACGCTGACTTTTTTTGTG;SOR=0.628;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=147;TCF=67;TCR=80;TR=123;WE=132120509;WS=132120491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,244:1.00:245
chr2	132121350	rs371054387	G	C	88.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.61;QD=22.01;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr2	132200256	rs71345553	T	C	648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-6.085;NF=19;NR=7;PP=389;ReadPosRankSum=-1.357;SC=GCTCATCCTCTGGCCCCTGGG;SOR=0.627;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=44;TCF=33;TCR=11;TR=26;WE=132200264;WS=132200246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,28:0.60:47
chr2	132200307	rs71345554	G	A	1085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.808;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-2.967;NF=27;NR=20;PP=537;ReadPosRankSum=-0.283;SC=CCGCCTCTGCGTCTGGGTCTC;SOR=0.556;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=85;TCF=48;TCR=37;TR=47;WE=132200315;WS=132200297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,53:0.59:90
chr2	132200345	rs71428578	C	T	1830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-2.216;NF=44;NR=31;PP=918;ReadPosRankSum=1.220;SC=CTGTCCTCCTCGCCCTCCTCC;SOR=0.674;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=133;TCF=76;TCR=57;TR=75;WE=132200353;WS=132200335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,84:0.58:145
chr2	132200529	rs71345555	A	G	1155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.255;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.292;NF=44;NR=32;PP=1165;ReadPosRankSum=-1.060;SC=TGATCTCAGGAAAGTTCAGGT;SOR=1.052;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=143;TCF=82;TCR=61;TR=76;WE=132200537;WS=132200519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,57:0.45:128
chr2	132200935	rs71345556	C	T	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=27.287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.42;MQRankSum=-5.471;QD=2.70;ReadPosRankSum=-0.746;SOR=5.058;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,12:0.20:61
chr2	132201288	rs4337511	A	G	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=18.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.06;MQRankSum=-9.161;QD=0.70;ReadPosRankSum=-0.572;SOR=2.501;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:121,20:0.14:141
chr2	132201468	rs4522649	G	A	4943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=365;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.785;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.358;NF=115;NR=103;PP=2962;ReadPosRankSum=0.158;SC=TGAGGACGGGGCCAAGGAAAG;SOR=0.589;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=345;TCF=187;TCR=158;TR=218;WE=132201476;WS=132201458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,228:0.63:363
chr2	132201582	rs1806886	A	G	4502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.876;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=99;PP=2923;ReadPosRankSum=0.385;SC=TAAGCAGCATACGGCACTGCT;SOR=0.591;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=302;TCF=135;TCR=167;TR=183;WE=132201590;WS=132201572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,197:0.61:325
chr2	132201663	rs1317139	T	C	3405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.455;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.431;NF=76;NR=70;PP=1771;ReadPosRankSum=0.983;SC=CCATCGTCTCTGCCACACAGG;SOR=0.650;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=239;TCF=124;TCR=115;TR=146;WE=132201671;WS=132201653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,161:0.61:266
chr2	132201718	rs2001215	T	C	3304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.825;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-5.744;NF=75;NR=69;PP=1905;ReadPosRankSum=-0.553;SC=GATGTCCACATGGAGCTTCCC;SOR=0.481;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=248;TCF=137;TCR=111;TR=144;WE=132201726;WS=132201708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,155:0.57:272
chr2	132201736	rs2076798	C	G	3300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.919;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-5.874;NF=70;NR=69;PP=2230;ReadPosRankSum=0.412;SC=CCCCCAGAGCCGGCTGCTGGA;SOR=0.690;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=250;TCF=129;TCR=121;TR=139;WE=132201744;WS=132201726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,149:0.54:276
chr2	132201862	rs1806887	C	G	4264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=354;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.756;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.310;NF=99;NR=109;PP=2821;ReadPosRankSum=0.502;SC=AGCACTGTCCCTGACCTGGAA;SOR=0.791;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=349;TCF=169;TCR=180;TR=208;WE=132201870;WS=132201852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,206:0.58:354
chr2	132201889	rs2007096	C	A	3356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.455;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-6.524;NF=71;NR=87;PP=2211;ReadPosRankSum=-3.877;SC=GGCCTCAGCACTTTCCTGGTC;SOR=0.733;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=264;TCF=118;TCR=146;TR=158;WE=132201897;WS=132201879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,156:0.58:267
chr2	132201930	rs13411254	T	C	2332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.538;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-10.326;NF=45;NR=62;PP=1459;ReadPosRankSum=0.067;SC=CTGCTCCGAATGCCTGTACCA;SOR=0.777;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=189;TCF=80;TCR=109;TR=107;WE=132201938;WS=132201920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,109:0.56:196
chr2	132202050	rs13413908	T	C	1230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.249;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.670;NF=23;NR=25;PP=830;ReadPosRankSum=-1.261;SC=CTCTGGGGACTCTGTCCCCAT;SOR=0.440;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=67;TCF=31;TCR=36;TR=48;WE=132202058;WS=132202040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,51:0.73:70
chr2	132229720	rs3101998	T	C	725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.510;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-8.777;NF=7;NR=35;PP=681;ReadPosRankSum=-1.252;SC=GAAATCTTGTTGAGGCGCCGC;SOR=2.253;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=110;TCF=34;TCR=76;TR=42;WE=132229728;WS=132229710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,37:0.33:112
chr2	132237983	rs71347110	A	G	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.951;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-4.875;NF=12;NR=1;PP=184;ReadPosRankSum=-1.209;SC=CCTCCATCACAGCCTCCCTGC;SOR=2.322;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=13;WE=132237991;WS=132237973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr2	132238410	rs11884621	T	C	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=0.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQRankSum=-3.501;QD=4.57;ReadPosRankSum=0.087;SOR=0.822;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,28:0.25:112
chr2	132248379	rs12469517	T	G	2204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.665;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.174;NF=45;NR=35;PP=1407;ReadPosRankSum=0.882;SC=CTGTGGAGCATAACCAGAGAG;SOR=0.809;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=122;TCF=69;TCR=53;TR=80;WE=132248387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,89:0.65:137
chr2	132248584	rs10182785	T	C	4809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=63;PP=2965;SC=CCCTGGCACTTCCCCCATGAA;SOR=0.954;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=153;TCF=90;TCR=63;TR=153;WE=132248592;WS=132248574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr2	132248876	rs6709245	A	G	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.886;NF=2;NR=8;PP=171;ReadPosRankSum=1.433;SC=TTCCGCGTCTAACTCTCTTCC;SOR=1.022;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=10;WE=132248884;WS=132248866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr2	132249372	rs6706952	C	T	173.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.53;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=2;PP=111;SC=AGGGCCACGCCGCCGCTGTGC;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=132249380;WS=132249362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	132249600	rs2272357	G	A	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=4.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.03;MQRankSum=0.258;QD=27.74;ReadPosRankSum=-1.297;SOR=1.069;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr2	132249605	rs2272358	G	A	687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=3.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.52;MQRankSum=0.809;QD=26.45;ReadPosRankSum=-1.156;SOR=0.991;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,18:0.69:26
chr2	132249760	rs187876897	C	T	432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.844;NF=12;NR=11;PP=240;ReadPosRankSum=0.869;SC=GAGCATGCGGCCCCCACCCGC;SOR=0.575;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=55;TCF=32;TCR=23;TR=23;WE=132249768;WS=132249750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,25:0.40:63
chr2	132254681	rs6711982	A	G	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.120;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=363;ReadPosRankSum=0.830;SC=GTGCTGCCGCATGCCAGCCTG;SOR=1.268;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=52;TCF=43;TCR=9;TR=25;WE=132254689;WS=132254671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,23:0.45:51
chr2	132257830	rs13035779	C	T	2472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.762;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.450;NF=56;NR=43;PP=1342;ReadPosRankSum=-0.239;SC=GCAGCCTAGACGGTGTCCTCG;SOR=0.455;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=152;TCF=90;TCR=62;TR=99;WE=132257838;WS=132257820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,111:0.65:170
chr2	132258031	rs3108473	A	G	2801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.678;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-9.994;NF=79;NR=63;PP=2087;ReadPosRankSum=0.122;SC=AAGATAATTCACAGTTCATTT;SOR=0.828;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=226;TCF=122;TCR=104;TR=142;WE=132258039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,132:0.60:219
chr2	132258484	rs139623617	G	A	431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.647;NF=15;NR=1;PP=296;ReadPosRankSum=-0.419;SC=ACTGCGTATCGGGCACTACGC;SOR=1.714;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=16;WE=132258492;WS=132258474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,17:0.77:22
chr2	132258593	rs13415770	A	G	1885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.925;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.938;NF=48;NR=35;PP=1287;ReadPosRankSum=0.818;SC=CTGTACCACAACAAGGTCCAG;SOR=0.490;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=150;TCF=91;TCR=59;TR=83;WE=132258601;WS=132258583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,86:0.56:153
chr2	132258815	rs12691986	G	A	1971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.706;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.096;NF=41;NR=45;PP=1300;ReadPosRankSum=-0.610;SC=AGGTAAGGAAGGGATGCCTTT;SOR=0.892;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=159;TCF=81;TCR=78;TR=86;WE=132258823;WS=132258805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,89:0.53:168
chr2	132266015	rs12477848	T	A	2419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.548;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.092;NF=69;NR=28;PP=1521;ReadPosRankSum=0.620;SC=TGGAATGAGTTCCCAGCTCTG;SOR=0.460;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=143;TCF=105;TCR=38;TR=97;WE=132266023;WS=132266005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,104:0.68:152
chr2	132266142	rs12691988	G	C	3890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=4.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=349;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.264;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-7.045;NF=80;NR=89;PP=2846;ReadPosRankSum=0.242;SC=ATCACTATTCGTTGGAGATGT;SOR=0.788;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=332;TCF=162;TCR=170;TR=169;WE=132266150;WS=132266132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,174:0.50:348
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chr2	132272158	rs13031436	T	A	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.006;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.93;MQRankSum=-0.566;QD=22.82;ReadPosRankSum=-0.652;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
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chr2	132272235	rs36013871	GA	G	1008.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=6.647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQRankSum=-2.096;QD=10.19;ReadPosRankSum=1.153;SOR=0.305;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,54:0.55:99
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chr2	132273092	rs2950565	T	G	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.496;NF=8;NR=4;PP=177;ReadPosRankSum=-0.552;SC=ACTGGCTCGGTGCGGGATGTG;SOR=0.495;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=12;WE=132273100;WS=132273082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr2	132273797	.	C	CA	487.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.297;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.26;ReadPosRankSum=-2.395;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
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chr2	132273801	.	C	T	690.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=0.000;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=3.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.71;ReadPosRankSum=-2.640;SOR=1.762;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,17:0.44:39
chr2	132273802	rs201262646	C	CATTAG	681.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=3.704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.94;ReadPosRankSum=-2.413;SOR=1.656;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,16:0.42:38
chr2	132274077	rs4309618	A	G	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.699;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.58;MQRankSum=-0.238;QD=16.80;ReadPosRankSum=-0.481;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr2	132274113	rs4493309	A	G	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-1.803;NF=0;NR=6;PP=85;ReadPosRankSum=1.068;SC=GGAGGGCCACATTGTTCTTTC;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=6;WE=132274121;WS=132274103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr2	132274474	rs13010688	G	A	776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.501;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=12;PP=353;ReadPosRankSum=-2.847;SC=GGCGGTACGCGCCTGACAAGC;SOR=0.948;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=59;TCF=34;TCR=25;TR=34;WE=132274482;WS=132274464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,38:0.59:64
chr2	132275343	rs12691998	G	T	5808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=447;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.134;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-2.570;NF=137;NR=116;PP=2962;ReadPosRankSum=0.097;SC=CACCAAGTTGGTTGTGGGCTT;SOR=0.591;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=414;TCF=230;TCR=184;TR=253;WE=132275351;WS=132275333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,270:0.61:445
chr2	132275396	rs2277878	T	C	5956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=521;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.522;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.986;NF=133;NR=143;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.609;SC=GCCCCAAGCATGCGCTCCTGG;SOR=0.747;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=489;TCF=241;TCR=248;TR=276;WE=132275404;WS=132275386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:229,292:0.56:521
chr2	132276039	rs28681469	C	T	1201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.755;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.588;NF=33;NR=17;PP=635;ReadPosRankSum=0.836;SC=TACTCTGCCCCGGGGAAGTGG;SOR=0.856;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=92;TCF=57;TCR=35;TR=50;WE=132276047;WS=132276029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,55:0.54:101
chr2	132276254	rs28621583	A	G	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.79;MQRankSum=-3.812;QD=8.89;ReadPosRankSum=-0.281;SOR=0.519;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr2	132276650	rs28712373	G	C	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.405;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.336;NF=23;NR=3;PP=480;ReadPosRankSum=0.872;SC=GCTCATCACAGAGGCCAAACA;SOR=1.398;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=52;TCF=41;TCR=11;TR=26;WE=132276658;WS=132276640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,11:0.27:41
chr2	132277686	rs9287520	C	T	2318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.157;NF=59;NR=39;PP=1232;ReadPosRankSum=0.013;SC=GGACAGATGGCGGCTCTGTGT;SOR=0.687;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=177;TCF=102;TCR=75;TR=98;WE=132277694;WS=132277676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,112:0.57:198
chr2	132277962	rs7560296	T	C	1463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-9.048;NF=39;NR=35;PP=1042;ReadPosRankSum=1.507;SC=TCTGCCATGATACTGCTGACC;SOR=0.720;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=147;TCF=80;TCR=67;TR=74;WE=132277970;WS=132277952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,73:0.48:153
chr2	132277984	rs10209980	G	A	1120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.662;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-7.691;NF=31;NR=30;PP=756;ReadPosRankSum=1.757;SC=AGCGGGGGAAGCTGCACCAGC;SOR=0.771;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=121;TCF=63;TCR=58;TR=61;WE=132277992;WS=132277974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,59:0.48:124
chr2	132286046	rs3101992	A	G	922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.381;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-9.520;NF=31;NR=25;PP=923;ReadPosRankSum=-1.585;SC=GACTCCGCCAATCCTCTCCTC;SOR=0.919;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=130;TCF=72;TCR=58;TR=56;WE=132286054;WS=132286036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,44:0.35:124
chr2	132286061	rs60469601	A	G	978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.378;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-8.790;NF=32;NR=27;PP=904;ReadPosRankSum=-2.850;SC=CTCCTCTCCAAGCAGGGTCAG;SOR=0.957;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=129;TCF=69;TCR=60;TR=59;WE=132286069;WS=132286051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,47:0.38:123
chr2	132286155	rs10174409	G	C	627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.082;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.884;NF=11;NR=19;PP=344;ReadPosRankSum=0.565;SC=AGGCCGAGACGGGCGGATCAC;SOR=0.277;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=53;TCF=15;TCR=38;TR=30;WE=132286163;WS=132286145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,32:0.56:57
chr2	132287824	rs10187823	C	T	3937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.482;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-4.101;NF=91;NR=92;PP=2487;ReadPosRankSum=1.616;SC=GGATCCTGGGCTGTGGTCTCA;SOR=0.549;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=305;TCF=146;TCR=159;TR=183;WE=132287832;WS=132287814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,188:0.60:314
chr2	132290399	rs57007130	G	A	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.067;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.133;NF=16;NR=20;PP=538;ReadPosRankSum=-0.545;SC=GTCTGGCACCGCCACAGGCCC;SOR=0.684;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=67;TCF=30;TCR=37;TR=36;WE=132290407;WS=132290389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,32:0.59:54
chr2	132491544	rs7599401	C	G	4259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=86;PP=2538;SC=TTATTTTTCTCTCTGTGTTTT;SOR=1.151;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=146;TCF=60;TCR=86;TR=146;WE=132491552;WS=132491534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr2	132494171	rs4850247	G	A	3347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-3.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.032;NF=82;NR=69;PP=2052;ReadPosRankSum=0.049;SC=AGGGTATTCTGTGGTCAACTT;SOR=0.663;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=236;TCF=128;TCR=108;TR=151;WE=132494179;WS=132494161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,153:0.65:235
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chr2	132586854	rs4558626	C	T	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.320;NF=4;NR=5;PP=208;ReadPosRankSum=-1.280;SC=AAGGTTGGACCGGGACTGGCC;SOR=0.760;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=23;TCF=11;TCR=12;TR=9;WE=132586874;WS=132586844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr2	132586866	rs186960073	C	A	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.643;HP=3;HapScore=4;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-0.228;NF=4;NR=3;PP=208;ReadPosRankSum=-0.388;SC=GGACTGGCCGCAAAGCTGCCC;SOR=0.399;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=20;TCF=10;TCR=10;TR=7;WE=132586874;WS=132586844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr2	132587035	rs191789863	G	A	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.214;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=0.549;QD=5.48;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
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chr2	132591808	rs55998054	T	G	2218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.396;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-2.735;NF=56;NR=43;PP=1258;ReadPosRankSum=-2.490;SC=GATGCCTCGCTCTCAAAGTCG;SOR=0.809;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=186;TCF=100;TCR=86;TR=99;WE=132591816;WS=132591798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,112:0.54:206
chr2	132592178	rs9751367	T	C	1196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-7.237;NF=31;NR=27;PP=855;ReadPosRankSum=0.416;SC=TGCTGGGGAGTTGGGGCAGGG;SOR=0.619;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=54;TCR=46;TR=58;WE=132592186;WS=132592168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,55:0.57:97
chr2	132592361	rs142486391	G	T	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.517;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.161;NF=6;NR=11;PP=199;ReadPosRankSum=1.100;SC=CCATCACTGCGAAGCAGGGGG;SOR=1.219;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=45;TCF=21;TCR=24;TR=17;WE=132592369;WS=132592351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,20:0.40:50
chr2	132593636	rs59199382	C	T	1055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=1.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQRankSum=-2.501;QD=12.00;ReadPosRankSum=-0.041;SOR=0.860;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,51:0.58:88
chr2	133014497	.	G	C	1771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.874;ClippingRankSum=0.000;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.36;MQRankSum=-3.412;QD=15.54;ReadPosRankSum=1.008;SOR=0.759;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,45:0.39:114
chr2	133014504	rs79813268	G	T	1973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=0.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.38;MQRankSum=-3.128;QD=15.07;ReadPosRankSum=-0.853;SOR=0.813;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,57:0.44:131
chr2	133014510	rs9287404	T	C	2932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=5.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.57;MQRankSum=-4.666;QD=21.10;ReadPosRankSum=-0.217;SOR=0.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,77:0.55:139
chr2	133014511	rs76230250	G	A	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FS=8.734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.66;MQRankSum=-2.102;QD=1.12;ReadPosRankSum=2.139;SOR=0.162;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:138,15:0.10:153
chr2	133014518	rs78879023	C	G	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FS=4.071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.57;MQRankSum=-2.017;QD=0.77;ReadPosRankSum=3.713;SOR=0.266;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:156,15:0.09:171
chr2	133014602	rs75245503	G	C	11808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=583;ExcessHet=3.0103;FS=4.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQRankSum=-10.091;QD=20.26;ReadPosRankSum=-0.536;SOR=0.978;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:280,303:0.52:583
chr2	133014612	rs74853538	A	C	13342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=638;ExcessHet=3.0103;FS=3.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQRankSum=-9.540;QD=20.91;ReadPosRankSum=-0.776;SOR=0.956;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:289,349:0.55:638
chr2	133014619	rs78327226	C	T	1880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=703;ExcessHet=3.0103;FS=4.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQRankSum=-16.666;QD=2.68;ReadPosRankSum=-3.213;SOR=1.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:618,85:0.12:703
chr2	133014640	rs78867621	C	T	3552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=790;ExcessHet=3.0103;FS=1.538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQRankSum=-16.371;QD=4.50;ReadPosRankSum=-2.346;SOR=0.905;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:659,131:0.17:790
chr2	133014651	rs111708138	A	AC	18862.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-2.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=821;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.192;HP=3;HapScore=1;MGOF=41;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-7.232;NF=74;NR=164;PP=2966;ReadPosRankSum=-4.238;SC=GGCCCTCGGCACCACCGAGAC;SOR=0.843;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=435;TCF=124;TCR=311;TR=238;WE=133014665;WS=133014630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:263,553:0.68:816
chr2	133014657	rs113237573	G	A	4173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=866;ExcessHet=3.0103;FS=0.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQRankSum=-13.723;QD=4.82;ReadPosRankSum=0.174;SOR=0.837;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:697,169:0.20:866
chr2	133014678	rs72869462	A	G	24873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=922;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.202;HP=4;HapScore=1;MGOF=49;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-6.042;NF=249;NR=216;PP=2962;ReadPosRankSum=1.748;SC=CATGAGCCCCAGGTCCCGCCA;SOR=0.779;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=744;TCF=387;TCR=357;TR=465;WE=133014686;WS=133014668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:283,638:0.69:921
chr2	133014703	rs72869464	T	C	26483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-3.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=877;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.004;HP=3;HapScore=1;MGOF=54;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.441;NF=253;NR=246;PP=2962;ReadPosRankSum=2.396;SC=GACCCCGAGGTGACCTCAGCC;SOR=0.545;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=733;TCF=361;TCR=372;TR=499;WE=133014711;WS=133014693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:239,637:0.73:876
chr2	133014721	rs72869465	T	C	24231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=798;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.288;HP=2;HapScore=1;MGOF=54;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-3.570;NF=230;NR=250;PP=2962;ReadPosRankSum=0.253;SC=GCCACAAACCTAACGCCAGGG;SOR=0.536;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=682;TCF=320;TCR=362;TR=480;WE=133014729;WS=133014711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:203,594:0.75:797
chr2	133014751	rs75204936	T	C	8498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=598;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.764;HP=2;HapScore=1;MGOF=61;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.030;NF=107;NR=132;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.908;SC=TCGTTTCTCATCCATCCTCCA;SOR=0.567;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=552;TCF=240;TCR=312;TR=239;WE=133014759;WS=133014741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:329,268:0.45:597
chr2	133014776	rs72869466	CA	TG	7313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=434;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=57;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=101;PP=2944;ReadPosRankSum=0.577;SC=GGTCAAGCTCCAGGAGACCGG;SOR=0.662;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=402;TCF=152;TCR=250;TR=157;WE=133014796;WS=133014761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:242,191:0.44:433
chr2	133014786	rs72869468	G	A	2468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=376;ExcessHet=3.0103;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-2.479;QD=6.58;ReadPosRankSum=-1.681;SOR=0.823;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:283,92:0.25:375
chr2	133075726	rs2598810	A	G	2417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.498;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.392;NF=65;NR=63;PP=2164;ReadPosRankSum=-1.594;SC=CACACTGGAGAGAAGCCCTAC;SOR=0.761;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=231;TCF=113;TCR=118;TR=128;WE=133075734;WS=133075716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,107:0.49:219
chr2	133075809	rs55902546	G	A	1079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=349;ExcessHet=3.0103;FS=5.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.47;MQRankSum=1.140;QD=3.09;ReadPosRankSum=-0.577;SOR=0.467;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:269,80:0.23:349
chr2	133075904	rs113311843	C	CA	8201.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=468;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.119;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-8.898;NF=48;NR=99;PP=2968;ReadPosRankSum=0.957;SC=AGAAACAATACAATGCAATGT;SOR=0.621;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=274;TCF=88;TCR=186;TR=147;WE=133075912;WS=133075894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,272:0.60:455
chr2	133174764	rs2241764	C	T	3643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=69;PP=2463;ReadPosRankSum=1.642;SC=GGGAACAGCGCCACCATTCGG;SOR=0.694;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=250;TCF=142;TCR=108;TR=159;WE=133174772;WS=133174754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,164:0.63:262
chr2	133174999	rs2241763	A	G	5058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=344;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.862;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=102;NR=99;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.271;SC=ACGTGCTGACACTCAGCTTTG;SOR=0.636;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=312;TCF=155;TCR=157;TR=201;WE=133175007;WS=133174989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,227:0.66:343
chr2	133402607	rs1131671	C	T	610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=11;PP=436;ReadPosRankSum=-2.132;SC=TGGTTTTATTCATTTACTGTG;SOR=0.593;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=76;TCF=50;TCR=26;TR=31;WE=133402615;WS=133402597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,31:0.38:82
chr2	133425912	rs2709533	C	T	3924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=43;PP=2792;SC=TTTAATGGCCCCCTCACTCCC;SOR=1.714;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=91;TCR=43;TR=134;WE=133425920;WS=133425902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr2	133426183	rs2709532	G	C	516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=17;PP=479;SC=ACCATCCCACGCCTCAGAGCC;SOR=4.294;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=133426191;WS=133426173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	133472385	rs11329925	CA	C	135.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.66;ReadPosRankSum=0.299;SOR=0.346;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr2	133489601	rs56284623	A	G	1414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.158;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=33;PP=838;ReadPosRankSum=0.911;SC=CCACTGTCCAATGTTCTCATC;SOR=0.501;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=139;TCF=60;TCR=79;TR=60;WE=133489609;WS=133489591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,66:0.46:144
chr2	133539460	rs6717116	A	T	880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=3;PP=703;ReadPosRankSum=1.508;SC=CAACTCTTTTAAAGGTGGTGG;SOR=1.329;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=38;TCF=34;TCR=4;TR=30;WE=133539468;WS=133539450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,32:0.78:41
chr2	133539566	rs6730282	G	A	3500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.423;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=68;PP=2127;ReadPosRankSum=-0.102;SC=CAACAGGGCTGTGTCTATTCC;SOR=0.610;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=263;TCF=147;TCR=116;TR=150;WE=133539574;WS=133539556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,162:0.57:285
chr2	133541427	.	G	A	5237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.592;ClippingRankSum=0.000;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=70;PP=2239;ReadPosRankSum=0.161;SC=TGTCGTGGCCGGATTAGAAGA;SOR=0.721;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=238;TCF=120;TCR=118;TR=138;WE=133541435;WS=133541417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,142:0.58:246
chr2	133541444	rs12691829	T	C	5327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FS=2.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.06;ReadPosRankSum=0.654;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:102,129:0.56:231
chr2	133541454	rs12691830	A	G	4887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FS=2.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.98;ReadPosRankSum=1.257;SOR=0.563;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:107,126:0.54:233
chr2	133541575	rs12611515	C	T	1927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.693;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=34;PP=1234;ReadPosRankSum=0.261;SC=AGCAGGGAGACGGACCTGCCT;SOR=0.610;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=116;TCF=60;TCR=56;TR=72;WE=133541583;WS=133541556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,80:0.65:124
chr2	133542014	rs12616282	T	C	4057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.871;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=78;PP=2287;ReadPosRankSum=-1.319;SC=TGCCCATGGGTGCCGAAGACC;SOR=0.578;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=292;TCF=161;TCR=131;TR=165;WE=133542022;WS=133542004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,185:0.58:321
chr2	133542545	rs10191147	G	A	4385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=88;PP=2687;ReadPosRankSum=-2.498;SC=GGTTCTCCACGGACTTATCGG;SOR=0.686;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=294;TCF=151;TCR=143;TR=176;WE=133542553;WS=133542535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,197:0.59:335
chr2	133554288	rs1868076	A	G	4754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.386;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=103;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.415;SC=GATCCAAGAGACGTGAGTGAA;SOR=0.603;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=294;TCF=129;TCR=165;TR=186;WE=133554296;WS=133554278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,206:0.63:325
chr2	133636209	.	ACACACACACACACACACACG	A	55.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.789;ClippingRankSum=0.000;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=2.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.89;MQRankSum=1.928;QD=1.30;ReadPosRankSum=0.965;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,7:0.16:43
chr2	133636211	rs140434127	ACACACACACACACACACG	A	232.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=5.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.89;MQRankSum=1.049;QD=5.41;ReadPosRankSum=2.825;SOR=2.235;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,12:0.28:43
chr2	133683658	rs2577634	G	T	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=0.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.32;ReadPosRankSum=-1.237;SOR=0.587;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,33:0.31:106
chr2	133881219	rs2278456	G	A	1679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.128;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=13;PP=986;ReadPosRankSum=1.101;SC=ATCAGGAGGAGCAAGGCACTC;SOR=1.112;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=86;TCF=63;TCR=23;TR=57;WE=133881227;WS=133881209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,69:0.68:102
chr2	133887421	rs13004057	G	T	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.255;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=5;PP=415;ReadPosRankSum=-2.086;SC=AGAACAGAAGGTCTAAATGGT;SOR=0.968;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=49;TCF=38;TCR=11;TR=26;WE=133887429;WS=133887411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,28:0.55:51
chr2	134884700	rs6430498	G	A	2714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.548;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=49;PP=1538;ReadPosRankSum=0.216;SC=GCCCCACGTGGTGAGGATATG;SOR=0.399;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=166;TCF=95;TCR=71;TR=107;WE=134884708;WS=134884690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,120:0.65:185
chr2	135076111	rs4954134	C	G	86.94	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=4;NR=1;PP=57;SC=GTTCTTTAGGCCACAGCTTGA;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=135076119;WS=135076101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr2	135096097	rs7598410	T	C	901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=21;PP=598;SC=AATGATATTCTCTCAGGGTGA;SOR=3.334;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=24;WE=135096105;WS=135096087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	135102453	rs3214771	TA	T	2492.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=11;PP=1742;SC=ACCTTTTAAGTAAATGATTTT;SOR=2.472;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=35;TCR=12;TR=44;WE=135102461;WS=135102443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr2	135102742	rs2290048	A	G	3724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=82;PP=2407;SC=TTTCAGCTGTATGGAGTGTTG;SOR=1.663;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=40;TCR=82;TR=122;WE=135102750;WS=135102732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr2	135186057	rs62170036	T	G	3746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.474;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=95;PP=2304;ReadPosRankSum=1.243;SC=TACTGCTTCCTGTGACGCCAT;SOR=0.801;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=265;TCF=111;TCR=154;TR=161;WE=135186065;WS=135186047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,168:0.59:283
chr2	135206340	rs2230908	C	A	3785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.066;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=89;PP=2036;ReadPosRankSum=1.472;SC=GTGCAGGCGCCCACCCCAGGC;SOR=0.592;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=234;TCF=97;TCR=137;TR=156;WE=135206348;WS=135206330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,174:0.69:254
chr2	135260419	rs78739338	C	T	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.900;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=394;ReadPosRankSum=-1.698;SC=AAGAGGCAGCCCAGGGGGCCA;SOR=1.244;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=56;TCF=43;TCR=13;TR=25;WE=135260427;WS=135260409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,31:0.47:66
chr2	135602601	rs6430545	T	A	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.692;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=230;ReadPosRankSum=-2.438;SC=GAGATAACAGTATTTTCTTCT;SOR=0.384;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=15;WE=135602609;WS=135602591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,15:0.42:36
chr2	135629927	rs12469941	C	T	545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=352;ReadPosRankSum=-1.927;SC=AATAGGTCCTCTGTAATTACT;SOR=0.567;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=46;TCR=17;TR=25;WE=135629935;WS=135629917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,27:0.42:64
chr2	135694379	rs1374289	C	T	690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.867;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=9;PP=428;ReadPosRankSum=0.440;SC=TGTATTTGTTCTTAAATGACC;SOR=1.010;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=93;TCF=66;TCR=27;TR=32;WE=135694387;WS=135694369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,35:0.34:103
chr2	135705558	rs1979033	G	A	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=279;ReadPosRankSum=-0.425;SC=TACACTATCAGATGAACAGAA;SOR=0.663;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=52;TCF=19;TCR=33;TR=22;WE=135705566;WS=135705548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,23:0.42:55
chr2	135710322	rs10166142	A	G	854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.338;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=24;PP=520;ReadPosRankSum=0.944;SC=TCAGTCTTTTATGTAACATTT;SOR=0.858;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=143;TCF=72;TCR=71;TR=47;WE=135710330;WS=135710312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,51:0.32:161
chr2	135710958	.	G	A	3715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=0.000;DP=437;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.762;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=86;PP=2247;ReadPosRankSum=1.087;SC=CATTCCCTGCGCCAGTACCTC;SOR=0.643;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=408;TCF=213;TCR=195;TR=173;WE=135710966;WS=135710948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:251,186:0.43:437
chr2	135711516	rs3814355	C	T	2858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.368;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=61;PP=1769;ReadPosRankSum=0.296;SC=ACATGGCAGACAAAAAGGAAA;SOR=0.701;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=305;TCF=153;TCR=152;TR=128;WE=135711524;WS=135711506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:193,141:0.42:334
chr2	135711657	rs3814354	G	A	4233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=449;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.197;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=94;PP=2540;ReadPosRankSum=0.693;SC=GCAGTGGGAAGAGCAAACATT;SOR=0.624;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=412;TCF=215;TCR=197;TR=185;WE=135711665;WS=135711647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:242,206:0.46:448
chr2	135745129	rs16831235	G	A	1362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.701;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=39;PP=826;ReadPosRankSum=0.011;SC=TTTAAGTACAGTACACTCTTC;SOR=1.460;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=181;TCF=80;TCR=101;TR=59;WE=135745137;WS=135745119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,71:0.34:207
chr2	136467164	rs2304367	C	A	2721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=65;PP=1849;SC=AGTTCGATTACTTTCCTTAGG;SOR=2.597;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=18;TCR=65;TR=83;WE=136467172;WS=136467154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr2	136527318	rs372143998	GT	G	56.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.49;MQRankSum=1.515;QD=2.70;ReadPosRankSum=-0.187;SOR=0.053;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr2	136527443	rs113881162	G	GTGAT	7913.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=48;PP=2972;SC=AACTGAGGTTGTGATTGATTA;SOR=0.941;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=86;TCF=24;TCR=62;TR=70;WE=136527451;WS=136527433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr2	136545844	rs1042712	C	G	1685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=18;PP=1104;SC=GGCCGGTAAACATAGATGAAG;SOR=1.498;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=40;TCR=18;TR=58;WE=136545852;WS=136545834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr2	136546110	rs2278544	A	G	531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=17;PP=466;SC=TGGTGGGTCCAGCATCTAGGA;SOR=4.294;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=136546118;WS=136546100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	136548169	rs892716	A	G	330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=2;PP=209;SC=CACTCCTGCAAATAGCAGATG;SOR=1.981;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=136548177;WS=136548159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	136548192	rs1808756	G	A	511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=3;PP=350;SC=TCCAACAGGGGAAGGTGCACG;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=136548200;WS=136548182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	136555659	rs2322659	T	C	7001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=125;NR=105;PP=2965;SC=CATCACCTCATTGTAATCTCC;SOR=0.757;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=230;TCF=125;TCR=105;TR=230;WE=136555667;WS=136555649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
chr2	136558157	rs748841	C	T	262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=2;PP=186;SC=TAAGAACAAGCGCCCAGAGGA;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=136558165;WS=136558147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	136561557	rs2304371	G	A	4797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=77;PP=2886;SC=GGCTCATTCAGCGTGATCCAA;SOR=0.740;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=157;TCF=80;TCR=77;TR=157;WE=136561565;WS=136561547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr2	136565028	rs10928549	C	G	1541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=40;PP=1153;SC=CCTCCATGCACCCAACCCACT;SOR=2.970;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=8;TCR=40;TR=48;WE=136565036;WS=136565018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr2	136569848	rs12988076	C	A	1326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=2;PP=1024;SC=GTACCACCCACCTTCCAATCA;SOR=4.073;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=39;TCF=37;TCR=2;TR=39;WE=136569856;WS=136569838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr2	136575199	rs6719488	G	T	12708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=456;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=201;NR=213;PP=2965;SC=AGTAGGCAACGCCTGGGAGGC;SOR=0.756;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=414;TCF=201;TCR=213;TR=414;WE=136575207;WS=136575189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,456:1.00:456
chr2	136575534	rs4954449	T	C	6558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=110;NR=107;PP=2965;SC=GCTTCCCAGATTCTCTGATAG;SOR=0.735;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=218;TCF=110;TCR=108;TR=217;WE=136575542;WS=136575524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr2	136594158	rs2236783	G	A	6924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=144;NR=84;PP=2965;SC=CATCACTGAGGGTCTGGAGTT;SOR=1.262;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=228;TCF=144;TCR=84;TR=228;WE=136594166;WS=136594148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr2	136610598	rs4988226	A	G	837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=22;PP=608;SC=TACCACTTAAAGAAGTATTAA;SOR=2.226;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=29;WE=136610606;WS=136610588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	136614255	rs309180	G	A	4686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=101;NR=58;PP=2955;SC=TGTCTCACTCGATTACTCCAA;SOR=1.172;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=160;TCF=101;TCR=59;TR=159;WE=136614263;WS=136614245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr2	136622825	rs309177	A	G	2678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=62;PP=1729;SC=ACAACATAGCATGGGAAGTCA;SOR=3.284;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=14;TCR=62;TR=76;WE=136622833;WS=136622815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr2	136873549	rs2680880	A	T	3591.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=94;PP=2810;SC=GTTAAAAAAAATTTTTAAAGC;SOR=2.093;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=137;TCF=43;TCR=94;TR=137;WE=136873557;WS=136873539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr2	136956640	.	G	GA	28	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;FR=0.4999;HP=12;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=22;MQ=57.91;NF=3;NR=0;PP=28;QD=11.3333333333;SC=GAAGCAGATTGAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=3;WE=136956648;WS=136956639;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:12,3:0.20:15
chr2	137639616	rs1465612	C	T	860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=1;PP=601;SC=TAATGAAAAACTTGCAATACC;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=137639624;WS=137639609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	137640006	rs11298935	CT	C	222.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.754;NF=0;NR=10;PP=168;ReadPosRankSum=-1.198;SC=AAAATAGACTCTTTTTTTTAA;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=10;WE=137640014;WS=137639996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr2	137814477	rs17727482	C	G	3590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=77;PP=2293;ReadPosRankSum=1.139;SC=TCATAGCTCCCCCTCTCTTTG;SOR=0.676;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=275;TCF=135;TCR=140;TR=154;WE=137814499;WS=137814467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,166:0.55:300
chr2	137852550	rs61741426	G	A	2316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.348;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=58;PP=1447;ReadPosRankSum=0.774;SC=AAGACATGCCGTTCAGGGAGT;SOR=0.607;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=316;TCF=155;TCR=161;TR=116;WE=137852558;WS=137852540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:211,122:0.37:333
chr2	137917922	rs4954474	T	A	2620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=392;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.706;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=73;PP=1566;ReadPosRankSum=-0.017;SC=ACTGTCATGATCCTCAGGGGA;SOR=0.798;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=366;TCF=173;TCR=193;TR=135;WE=137917930;WS=137917912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:247,145:0.37:392
chr2	137999979	rs10490735	G	C	1527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.572;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=14;PP=997;ReadPosRankSum=0.290;SC=TGCGTTCAACGGCTTAGTCTC;SOR=1.296;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=92;TCF=67;TCR=25;TR=60;WE=137999987;WS=137999969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,64:0.65:98
chr2	138000226	rs7605259	T	C	2489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.66;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr2	138000233	.	CT	C	70.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=0.000;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=10.486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.26;ReadPosRankSum=-1.036;SOR=1.485;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,12:0.21:56
chr2	138030271	rs10182152	G	A	1108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.263;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=34;PP=755;ReadPosRankSum=-0.392;SC=TAGACCTACTGTAAATTATAA;SOR=1.055;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=64;TCF=13;TCR=51;TR=42;WE=138030279;WS=138030261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,46:0.67:69
chr2	138033349	rs111639929	A	T	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.224;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=60;ReadPosRankSum=-0.032;SC=GTGCTTGCCAAGGCTTGGTTT;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=5;WE=138033357;WS=138033339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr2	138163391	rs1551281	T	C	1500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=38;PP=1112;SC=TAGTGTGCATTTTACTCTTTA;SOR=3.352;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=7;TCR=38;TR=45;WE=138163399;WS=138163381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr2	138169158	rs1463285	T	C	3031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=23;PP=2126;SC=TTTAATATCTTAATGTCTCTT;SOR=2.063;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=72;TCR=23;TR=95;WE=138169166;WS=138169148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr2	138208631	rs1453302	G	T	970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=28;PP=686;ReadPosRankSum=-2.237;SC=AGCTAAAAAAGCTATCCTCAT;SOR=0.631;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=59;TCF=11;TCR=48;TR=35;WE=138208639;WS=138208621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,39:0.61:64
chr2	138237038	rs1584435	C	T	1047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.11;ReadPosRankSum=-0.116;SOR=0.687;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,53:0.46:115
chr2	138375815	rs17692768	T	C	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=2.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=212;ReadPosRankSum=0.081;SC=ATAAGGGCATTGCATGATGAT;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=10;WE=138375823;WS=138375805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr2	138375896	rs7574994	G	A	3471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=1.499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.10;ReadPosRankSum=-0.840;SOR=0.538;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,86:0.65:133
chr2	138375896	.	GTC	ATA	2437	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=49;NR=29;PP=2437;QD=31.9290753187;SC=ATAATCAAAGGTCTGTTGTAT;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=120;TCF=81;TCR=39;TR=78;WE=138375906;WS=138375886;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:42,78:0.65:120
chr2	138375898	rs73961010	C	A	3471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=2.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.16;ReadPosRankSum=-0.957;SOR=0.496;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,90:0.65:138
chr2	138375972	rs17692792	A	T	3027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=62;PP=1790;ReadPosRankSum=-0.238;SC=AGTGGAGCACATGCCAGCTGA;SOR=0.714;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=213;TCF=110;TCR=103;TR=128;WE=138375980;WS=138375962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,139:0.60:230
chr2	138376209	rs17743744	C	T	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=192;ReadPosRankSum=1.969;SC=TTAGAGTAAGCGGTGCCAGTA;SOR=2.147;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=10;WE=138376217;WS=138376199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr2	138378351	rs58339575	AG	A	1077.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.201;NF=1;NR=19;PP=664;ReadPosRankSum=0.483;SC=AATATCATTCAGTATGCCATA;SOR=0.720;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=48;TCF=3;TCR=45;TR=20;WE=138378359;WS=138378341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,34:0.42:81
chr2	138378388	rs1448922	A	G	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=267;ReadPosRankSum=0.592;SC=AAGGTATGGGACCCAGCTGAA;SOR=0.837;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=37;TCF=12;TCR=25;TR=19;WE=138378396;WS=138378378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,23:0.56:41
chr2	138399937	rs3828170	A	G	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.136;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=180;ReadPosRankSum=0.288;SC=ACTAAAAGTGAGATAGGACAG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=9;WE=138399945;WS=138399927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr2	138420996	rs10206850	A	G	5134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=94;NR=75;PP=2965;SC=GAGATAATGAAATCAAATGGT;SOR=0.814;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=169;TCF=94;TCR=75;TR=169;WE=138421004;WS=138420986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr2	138421227	rs72844590	G	T	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=36;ReadPosRankSum=0.736;SC=TGGAAAGAATGGAGGGAAGGA;SOR=1.179;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=5;WE=138421235;WS=138421217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr2	138727607	rs3100702	G	A	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.239;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=70;ReadPosRankSum=0.044;SC=ATATAATTGGGACATTTCATG;SOR=0.086;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=6;WE=138727615;WS=138727597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr2	139045972	rs6733578	T	C	4594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=90;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.403;SC=TTCTGCCAGATACCTGTGGTA;SOR=0.680;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=325;TCF=164;TCR=161;TR=184;WE=139045980;WS=139045962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,200:0.57:351
chr2	139046301	rs12691943	A	G	5206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=435;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.98;MQRankSum=-1.540;NF=107;NR=115;PP=2962;ReadPosRankSum=0.088;SC=CCACCATTTCATCGTATCACT;SOR=0.709;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=392;TCF=189;TCR=203;TR=222;WE=139046309;WS=139046291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:192,243:0.56:435
chr2	139046385	rs13382964	G	A	2280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.286;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=62;PP=1460;ReadPosRankSum=0.958;SC=CTCCAGCAGGGTCTGCGTGAC;SOR=0.854;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=158;TCF=52;TCR=106;TR=91;WE=139046393;WS=139046375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,97:0.56:173
chr2	139308127	rs35257103	G	A	1912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=40;PP=1140;ReadPosRankSum=-0.661;SC=TGGGTGAAGTGTTAAAAAGTT;SOR=0.705;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=154;TCF=85;TCR=69;TR=88;WE=139308135;WS=139308117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,91:0.55:165
chr2	139308397	rs148464901	T	TTCTCTC	233.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.00;MQRankSum=0.431;QD=25.97;ReadPosRankSum=-0.210;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr2	139429068	rs10803570	G	A	9475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=168;NR=161;PP=2965;SC=TGCTGTCTGCGTACGCCATGG;SOR=0.704;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=329;TCF=168;TCR=161;TR=329;WE=139429076;WS=139429058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,354:1.00:354
chr2	140992337	rs13387241	C	A	9124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=169;NR=136;PP=2965;SC=CATGAAATAACGAATATTCTT;SOR=0.905;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=306;TCF=170;TCR=136;TR=305;WE=140992345;WS=140992327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,330:1.00:330
chr2	140997197	rs3748864	T	G	564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=16;PP=432;SC=ACTTGACCATTGATATAATAA;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=140997205;WS=140997187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	141004513	rs11895946	C	T	280.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=7;NR=0;PP=172;SC=AGTGCTTCCTCTTTCAAAAAC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=141004521;WS=141004510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	141004529	rs2129483	A	G	383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=0;PP=237;SC=AAAACACCTCAATTGCAGTGG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=141004537;WS=141004519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	141027926	rs3748865	A	G	5432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=109;PP=2965;SC=CTGCAACAACAAAGAAAAAAA;SOR=1.381;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=176;TCF=67;TCR=109;TR=176;WE=141027934;WS=141027916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr2	141032088	rs1386356	C	T	7386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=131;NR=116;PP=2965;SC=CTTCATAGCGCGTTGGACAGA;SOR=0.700;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=247;TCF=131;TCR=116;TR=247;WE=141032096;WS=141032078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,275:1.00:275
chr2	141032220	rs76176617	C	T	978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.628;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=27;PP=618;ReadPosRankSum=-0.333;SC=GGACATTTTTCTTCAGTCATA;SOR=0.430;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=109;TCF=38;TCR=71;TR=45;WE=141032228;WS=141032210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,48:0.41:117
chr2	141250009	.	G	A	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.532;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=158;ReadPosRankSum=2.480;SC=TTGAGGCAAAGATAAATTTGG;SOR=0.776;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=11;WE=141250017;WS=141249999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
chr2	141260668	rs4444457	A	G	4163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=110;PP=2724;ReadPosRankSum=0.003;SC=CACACTGTCGATATCCTAGAG;SOR=0.671;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=325;TCF=124;TCR=201;TR=178;WE=141260676;WS=141260658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,190:0.56:340
chr2	141267744	rs1948051	T	C	210.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=5;PP=117;SC=AGGAGGCGATTGTAGTTATTG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=141267752;WS=141267734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	141274576	rs4954672	T	C	1053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.531;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=32;PP=722;ReadPosRankSum=-0.809;SC=TGTGTTTGTTTTGAACTGTGA;SOR=0.902;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=113;TCF=42;TCR=71;TR=48;WE=141274584;WS=141274566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,51:0.42:122
chr2	141283603	rs1352047	T	G	2494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=59;PP=1897;SC=TACCTCATTTTCAAAGATTAT;SOR=2.274;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=20;TCR=59;TR=79;WE=141283611;WS=141283593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr2	141284041	rs7562323	A	G	825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=20;PP=570;SC=AACTCTGGGAAGCCAAACTTG;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=25;WE=141284049;WS=141284031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	141298467	rs6729619	A	C	1194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.224;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=4;PP=823;ReadPosRankSum=0.306;SC=TCATGAATACACTAACACAAT;SOR=1.054;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=73;TCF=64;TCR=9;TR=41;WE=141298475;WS=141298457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,46:0.57:81
chr2	141298674	rs13013854	T	C	5699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FS=0.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.92;ReadPosRankSum=0.428;SOR=0.742;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:107,153:0.59:260
chr2	141298682	rs11694934	G	C	5443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FS=1.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.16;ReadPosRankSum=0.244;SOR=0.812;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,136:0.58:235
chr2	141298749	rs11694970	G	C	908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=28;PP=672;ReadPosRankSum=-0.477;SC=TAAACTATTAGACTGCCTCAA;SOR=0.647;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=7;TCR=51;TR=32;WE=141298757;WS=141298739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,34:0.55:62
chr2	141299317	rs9287535	A	G	1160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.698;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=13;PP=605;ReadPosRankSum=1.707;SC=TATACAATGAAAAAACACATT;SOR=0.479;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=85;TCF=60;TCR=25;TR=43;WE=141299325;WS=141299307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,54:0.53:102
chr2	141359287	rs1441465	C	T	148.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=74;SC=GCATTTAAGACATACATGTAT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=141359295;WS=141359277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	141473409	rs10716305	CA	C	475.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=0;PP=482;SC=TGAATATAAACATTTTTTTCT;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=141473417;WS=141473399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	141473505	rs4954852	A	T	2584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=23;PP=1720;SC=GAAAACTCACATAAAACTTGG;SOR=1.635;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=61;TCR=23;TR=84;WE=141473513;WS=141473495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr2	141474402	rs5834770	G	GA	2412.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=53;PP=1356;SC=ATAAGACACAGAAAAAAAATA;SOR=2.503;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=78;TCF=0;TCR=78;TR=53;WE=141474410;WS=141474392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr2	141474456	rs1372255	C	T	796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=23;PP=599;SC=GTGTTAGGATCATATTGCAAC;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=141474464;WS=141474446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	141527013	rs13002947	A	G	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.741;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=148;ReadPosRankSum=1.621;SC=ATCTTAATTTATGTTAACAAA;SOR=3.014;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=10;WE=141527021;WS=141527003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,10:0.34:29
chr2	141528592	rs7599219	T	C	1183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.387;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=38;PP=608;ReadPosRankSum=1.420;SC=AGAATGAAAATGAAACAAATT;SOR=0.553;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=139;TCF=48;TCR=91;TR=60;WE=141528600;WS=141528582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,64:0.44:147
chr2	141533662	rs996361	T	C	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.266;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=7;PP=228;ReadPosRankSum=0.859;SC=ATTAGTGTGATTTACCTTGCT;SOR=0.208;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=56;TCF=42;TCR=14;TR=19;WE=141533670;WS=141533652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,20:0.32:62
chr2	141571329	rs3749010	T	C	1019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FS=2.679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.02;ReadPosRankSum=1.531;SOR=0.555;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:142,61:0.30:203
chr2	141571440	rs17575847	C	G	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.403;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.226;NF=3;NR=11;PP=198;ReadPosRankSum=0.766;SC=CCACCTAGCACCACTGGATTT;SOR=0.095;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=14;WE=141571448;WS=141571430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr2	141571456	rs60071104	G	GA	126.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.728;NF=0;NR=7;PP=141;ReadPosRankSum=-0.282;SC=GATTTGAGGGGAAAAAAATAA;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=7;WE=141571464;WS=141571446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr2	141598473	rs35745624	A	AT	6715.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=39;PP=2988;SC=TTTAAAAAAAAAATCATACTT;SOR=1.557;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=103;TCF=62;TCR=41;TR=96;WE=141598481;WS=141598463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr2	141707694	rs1980343	C	T	209.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=1;PP=172;SC=CATGTATATTCTTGCCTAATA;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=141707702;WS=141707685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	141709419	rs1429348	T	G	3199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.704;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=54;PP=1963;ReadPosRankSum=0.652;SC=AGTGAGCATTTGGTACTTGCC;SOR=0.821;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=203;TCF=114;TCR=89;TR=128;WE=141709427;WS=141709409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,142:0.64:221
chr2	141747249	rs1429365	A	T	4224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=83;PP=2691;SC=GGGAAGCAAGATTAATTATTT;SOR=1.410;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=50;TCR=83;TR=133;WE=141747257;WS=141747239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr2	141747293	rs1429366	T	C	2358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=53;PP=1651;SC=TTTTGAATGATAGTTACAGAA;SOR=1.854;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=24;TCR=55;TR=76;WE=141747301;WS=141747283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr2	141751461	rs11678316	C	T	1931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=7;PP=1276;SC=TAGGTTCAATCTGCATCAAAG;SOR=3.442;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=48;TCR=7;TR=55;WE=141751469;WS=141751451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr2	141751592	rs13007735	G	A	12817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=486;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=231;NR=213;PP=2965;SC=CATCGCTTCCGTCTAGGCAGT;SOR=0.744;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=444;TCF=231;TCR=213;TR=444;WE=141751600;WS=141751582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,486:1.00:486
chr2	141816621	rs1525579	A	G	951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=21;PP=667;SC=AAAGATGTCTAACCTATAAAG;SOR=1.911;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=29;WE=141816629;WS=141816611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr2	141945949	rs1249434	C	T	1773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=14;PP=1319;SC=TCTTTTTAAACGCAAACTTTT;SOR=2.494;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=48;TCR=14;TR=62;WE=141945957;WS=141945939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr2	141987087	rs79330716	G	A	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.579;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=29;ReadPosRankSum=-0.566;SC=GTTATTGAAAGCTATTTTCTA;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=141987095;WS=141987077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr2	142012027	rs431809	G	T	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=239;ReadPosRankSum=-0.775;SC=AAAGATGTCTGCTTACATTTC;SOR=0.634;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=65;TCF=45;TCR=20;TR=21;WE=142012035;WS=142012017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,25:0.32:79
chr2	142012301	.	T	C	42	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=0;NR=5;PP=42;QD=15.3542425094;SC=ACTATAGTCTTGATTGTTCTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=142012309;WS=142012291;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:5,5:0.50:10
chr2	142237868	rs4264514	G	A	802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-5.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.991;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=6;PP=584;ReadPosRankSum=-0.820;SC=TGATATGCTTGTAGTTGAAAG;SOR=0.069;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=46;TCF=40;TCR=6;TR=33;WE=142237876;WS=142237858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,33:0.70:47
chr2	142356616	.	CCCCCCG	C	1144.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.091;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=24.554;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=35.77;ReadPosRankSum=0.627;SOR=2.775;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,28:0.88:32
chr2	142356630	rs147283574	C	T	1990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=20.900;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=37.56;ReadPosRankSum=0.996;SOR=1.949;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,49:0.92:53
chr2	142356635	rs144533069	C	G	2282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=20.151;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=32.61;ReadPosRankSum=2.256;SOR=1.758;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,66:0.94:70
chr2	142567738	rs28529494	G	T	1677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.63;SOR=2.194;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr2	142888376	rs1375610	G	C	1235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-3.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.055;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=35;PP=681;ReadPosRankSum=-1.545;SC=GCGGCGGCAGGGGCCGCTTGG;SOR=0.398;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=90;TCF=24;TCR=66;TR=49;WE=142888384;WS=142888366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,55:0.54:101
chr2	143746494	rs10496935	C	G	1227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=28;PP=841;ReadPosRankSum=-2.035;SC=GTCATCACTTCATTGTCCCTG;SOR=0.732;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=103;TCF=49;TCR=54;TR=52;WE=143746502;WS=143746484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,56:0.50:113
chr2	143787161	rs6429999	C	A	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=3.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQRankSum=0.000;QD=2.64;ReadPosRankSum=2.234;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,19:0.23:83
chr2	143787274	rs6430000	C	T	2214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=46;PP=1332;SC=TTACCTAATGCCATTTTTATT;SOR=1.275;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=30;TCR=46;TR=76;WE=143787282;WS=143787264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr2	143791014	rs2304700	G	T	1700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.255;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=50;PP=1091;ReadPosRankSum=0.342;SC=ATGAACAAGGGACAGAAGGCA;SOR=1.213;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=104;TCF=28;TCR=76;TR=66;WE=143791022;WS=143791004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,71:0.63:113
chr2	143798189	rs9013	A	G	2880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.195;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=72;PP=1891;ReadPosRankSum=0.111;SC=TGTTCCAAACAAAGATGTTTT;SOR=0.842;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=223;TCF=95;TCR=128;TR=123;WE=143798197;WS=143798179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,133:0.55:242
chr2	143913004	rs2580857	T	G	2125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=14;PP=1468;SC=TCATGGAAAATTGTATGTTTA;SOR=2.472;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=54;TCR=14;TR=68;WE=143913012;WS=143912994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr2	143973860	rs1451805	G	A	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.07;ReadPosRankSum=-0.194;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr2	144710295	rs56385884	A	G	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.005;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=245;ReadPosRankSum=-0.439;SC=AGCATGAATCATATATTAAAT;SOR=0.877;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=60;TCF=42;TCR=18;TR=23;WE=144710303;WS=144710285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,25:0.38:66
chr2	144728478	rs72852918	T	C	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=215;ReadPosRankSum=-0.116;SC=TTCCTATAACTTCACACTATA;SOR=0.582;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=12;WE=144728486;WS=144728468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr2	144934655	rs5834992	A	AG	564.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=1;PP=510;SC=ACAGCACCAAAGGGGAAATCC;SOR=3.383;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=14;WE=144934663;WS=144934645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	145121339	rs10206546	G	A	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.461;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=369;ReadPosRankSum=-0.065;SC=TTGACTGCACGCAGTCTAAGT;SOR=1.522;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=69;TCF=17;TCR=52;TR=23;WE=145121347;WS=145121329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,22:0.31:71
chr2	145146457	.	GA	G	153.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.145;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.96;ReadPosRankSum=1.380;SOR=0.515;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr2	145255210	rs12691693	T	C	5286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=66;PP=2965;SC=CTTGTAATAATAGCAGAATGA;SOR=1.197;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=168;TCF=102;TCR=66;TR=168;WE=145255218;WS=145255200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr2	145255399	.	TATATATATATATGTCATTCTCAACATATATATATATATGTCATTCTCAAC	T	218	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=-0.000;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.20;MQRankSum=-2.200;QD=24.22;ReadPosRankSum=2.200;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr2	145255431	.	TA	T	163	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=25;MQ=58.25;NF=1;NR=2;PP=163;QD=58.0;SC=AACATATATATATATATGTCA;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=3;WE=145255443;WS=145255374;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,3:0.43:7
chr2	147596973	rs4411641	A	G	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.691;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=9;PP=217;ReadPosRankSum=-2.737;SC=CTAAATTTGAATGATAAAATA;SOR=0.223;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=51;TCF=34;TCR=17;TR=20;WE=147596981;WS=147596963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,22:0.37:59
chr2	148657117	rs1128919	G	A	2044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.378;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=47;PP=1459;ReadPosRankSum=-1.575;SC=CTTATTTTCCGGAGATGGAAG;SOR=0.782;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=309;TCF=177;TCR=132;TR=109;WE=148657125;WS=148657107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:217,114:0.34:331
chr2	148674797	rs3764955	G	C	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.038;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=153;ReadPosRankSum=-0.333;SC=TCTTATGCATGGTTTATTAAA;SOR=0.307;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=11;WE=148674805;WS=148674787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr2	148680427	rs2303392	G	C	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.93;ReadPosRankSum=-0.250;SOR=0.052;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr2	148716428	rs2307394	T	C	1017.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=24;PP=557;ReadPosRankSum=-0.152;SC=CAAAGCATGATTTATTAACTA;SOR=0.715;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=86;TCF=31;TCR=55;TR=39;WE=148716436;WS=148716418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,47:0.47:99
chr2	148733548	rs2307399	T	TA	817.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.717;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=316;ReadPosRankSum=2.960;SC=TCAAATCCTTTAAAAAAATTG;SOR=0.915;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=66;TCF=3;TCR=63;TR=19;WE=148733556;WS=148733535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,39:0.36:108
chr2	149240657	rs5835195	GT	G	1000.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=4.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.72;ReadPosRankSum=-1.231;SOR=0.188;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,59:0.87:68
chr2	149246906	rs111476224	C	CT	1038.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.863;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=7;PP=614;ReadPosRankSum=-1.100;SC=TCTTTGAGGCCTCAAAATTAT;SOR=0.836;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=62;TCF=31;TCR=31;TR=18;WE=149246914;WS=149246896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,36:0.40:89
chr2	149259949	rs73003524	G	A	1661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.891;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=31;PP=949;ReadPosRankSum=1.007;SC=AGTAAAAACCGTGTTTAACAA;SOR=0.487;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=201;TCF=126;TCR=75;TR=75;WE=149259957;WS=149259939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,87:0.38:229
chr2	149449185	rs6724787	G	A	5713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=449;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=133;NR=113;PP=2962;ReadPosRankSum=1.161;SC=ATTTGTTTCTGCCAGGCATTT;SOR=0.672;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=406;TCF=219;TCR=187;TR=246;WE=149449193;WS=149449175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:180,268:0.60:448
chr2	149520186	rs12622667	T	C	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=119;ReadPosRankSum=1.611;SC=TTATTTTCCTTCTTTATTGTC;SOR=0.321;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=8;WE=149520194;WS=149520176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr2	149520214	rs10193313	C	A	1044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=7;PP=737;SC=GCAATGTTTTCTTATATTTTT;SOR=2.494;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=36;WE=149520222;WS=149520204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr2	149798213	rs73970609	G	A	962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.378;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=23;PP=520;ReadPosRankSum=-0.345;SC=GTTCTGTAACGAAAGTCCGGG;SOR=0.559;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=127;TCF=61;TCR=66;TR=47;WE=149798221;WS=149798203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,52:0.37:142
chr2	149799216	rs61734995	T	C	2225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.507;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=59;PP=1292;ReadPosRankSum=-0.519;SC=TGTCGAGCCCTGAGGAAGTCA;SOR=0.845;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=296;TCF=143;TCR=153;TR=110;WE=149799224;WS=149799206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:194,119:0.38:313
chr2	149803357	rs73962006	A	T	787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.745;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=14;PP=451;ReadPosRankSum=-1.818;SC=AAATGAGAGGATTGCTACCTA;SOR=0.553;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=99;TCF=65;TCR=34;TR=38;WE=149803365;WS=149803347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,43:0.39:111
chr2	149804599	rs111543209	C	T	1673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.330;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=48;PP=1118;ReadPosRankSum=-1.316;SC=CAGTGGCTCACGCCTGTAATC;SOR=1.259;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=99;TCF=26;TCR=73;TR=62;WE=149804607;WS=149804589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,69:0.63:109
chr2	149806388	rs60169973	C	T	1405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=30;PP=782;ReadPosRankSum=-1.055;SC=CTGTTCTTGACGAAGCTAAAA;SOR=0.685;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=190;TCF=104;TCR=86;TR=66;WE=149806396;WS=149806378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,74:0.36:204
chr2	149835264	rs60693991	G	A	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=99;ReadPosRankSum=-0.197;SC=AGGTGGGTGAGGAGGTATTTT;SOR=0.984;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=7;WE=149835272;WS=149835254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr2	149853960	rs6738277	A	G	961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.368;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=26;PP=621;ReadPosRankSum=2.466;SC=GTATATGGCAAGGGACAGGGG;SOR=1.142;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=65;TCF=21;TCR=44;TR=36;WE=149853968;WS=149853950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,41:0.55:75
chr2	149987310	rs140893476	T	C	717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.044;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=7;PP=526;ReadPosRankSum=0.740;SC=GTCCCCAGCCTAAAACCCCCT;SOR=0.487;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=90;TCF=75;TCR=15;TR=32;WE=149987318;WS=149987300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,34:0.35:97
chr2	150305703	rs11681264	G	A	2552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.431;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=64;PP=1695;ReadPosRankSum=0.722;SC=TGGGCTGTCCGTGAGTGAACA;SOR=0.536;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=193;TCF=81;TCR=112;TR=114;WE=150305711;WS=150305693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,117:0.56:208
chr2	150320627	rs34341723	TA	T	665.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=5.883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.16;ReadPosRankSum=0.219;SOR=1.060;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,39:0.83:47
chr2	150427516	rs4500908	C	T	720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=6;PP=471;SC=AAGTCTTAATCTATTACCAAA;SOR=2.124;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=21;WE=150427524;WS=150427506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	150432377	rs12232959	C	G	1517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=26;PP=806;SC=AATAAACATTCCAGGTAGAAA;SOR=1.140;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=23;TCR=26;TR=49;WE=150432385;WS=150432367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr2	150432469	rs10932467	G	T	227.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=8;PP=185;SC=TAAAATTACTGTGGTATTAGT;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=150432477;WS=150432459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	150432976	rs11545261	C	T	3884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=51;PP=2152;SC=CTGGACATGTCTGTATTGCAC;SOR=0.779;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=73;TCR=51;TR=124;WE=150432984;WS=150432966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr2	150433128	rs11680630	C	G	1937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=34;PP=941;SC=TGTTATAAACCTGTCTTCCTT;SOR=1.195;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=28;TCR=34;TR=62;WE=150433136;WS=150433118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr2	150443689	rs4667420	C	G	11329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=420;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=188;NR=195;PP=2965;SC=ACAAAACAGACGAGTGATCGA;SOR=0.752;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=383;TCF=188;TCR=195;TR=383;WE=150443697;WS=150443679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,420:1.00:420
chr2	150443813	rs4667419	C	T	3563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=73;PP=2189;SC=CCAGAACTCGCCCCCATGCCA;SOR=1.519;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=43;TCR=73;TR=116;WE=150443821;WS=150443803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr2	151328284	rs11338446	GA	G	1917.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.167;HP=15;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=81;PP=978;ReadPosRankSum=0.071;SC=CACTATGAAAGAAAAAAAAAA;SOR=2.472;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=106;TCF=7;TCR=99;TR=87;WE=151328294;WS=151328273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,86:0.96:90
chr2	151857799	rs6709096	A	T	1857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.040;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=36;PP=1066;ReadPosRankSum=1.171;SC=CTCTGTATCTACAGCTGTTTA;SOR=0.602;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=202;TCF=119;TCR=83;TR=84;WE=151857807;WS=151857789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,96:0.42:228
chr2	151900223	rs7589036	T	C	15098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=567;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=283;NR=234;PP=2965;SC=GGAACTAGATTGGTTACCACA;SOR=0.881;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=517;TCF=283;TCR=234;TR=517;WE=151900231;WS=151900213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,567:1.00:567
chr2	151900390	rs150701043	TAAAAACAAAAAC	T	1776.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=20;PP=2990;SC=ATTGTGAGCTTAAAAACAAAA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=0;TCR=59;TR=20;WE=151900409;WS=151900380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr2	152109159	rs289885	C	T	1166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=3;PP=824;SC=TTGCATTTTCCTTCCTAGAAG;SOR=3.855;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=30;TCR=3;TR=33;WE=152109167;WS=152109149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr2	152118338	rs35240993	G	GT	6122.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=10;NR=71;PP=2719;SC=TTTTGGTTTCGTTTTTTGTTC;SOR=0.946;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=92;TCF=10;TCR=82;TR=81;WE=152118346;WS=152118328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr2	152132130	rs289834	A	G	4708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=88;NR=73;PP=2533;SC=TCTTCACGCAATGTGTCAGGA;SOR=0.749;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=161;TCF=88;TCR=73;TR=161;WE=152132138;WS=152132120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr2	152135335	rs72856970	G	A	1558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.779;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=22;PP=1068;ReadPosRankSum=0.786;SC=TTTAACATTAGTCATACCTTC;SOR=0.588;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=107;TCF=72;TCR=35;TR=65;WE=152135343;WS=152135325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,68:0.62:110
chr2	152135514	rs289831	A	G	1798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=40;PP=1140;SC=TCTAATCCAAATGAAAATGTT;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=13;TCR=40;TR=53;WE=152135522;WS=152135504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr2	152138522	rs3771886	T	C	2669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=45;NR=45;PP=1511;SC=CCTTCTTTAGTTGAATATTTT;SOR=0.859;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=45;TCR=45;TR=90;WE=152138530;WS=152138512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr2	152139271	rs10169816	C	T	396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=3;PP=328;SC=TAAAGCCTAACGGCCTCCCAA;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=152139279;WS=152139261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	152139493	rs10182245	A	G	986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=16;PP=581;SC=AATAAATATTATAAGCATAGC;SOR=0.746;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=18;TCR=16;TR=34;WE=152139501;WS=152139483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr2	152266473	rs2290368	T	C	2437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.001;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=40;PP=1290;ReadPosRankSum=-0.064;SC=CAGCCGGAGCTGGGAAAGTCG;SOR=0.433;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=150;TCF=94;TCR=56;TR=101;WE=152266481;WS=152266463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,111:0.66:167
chr2	152266731	rs2290367	T	A	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.456;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=188;ReadPosRankSum=-0.807;SC=GAATGTGGCGTGGGCTCAGGT;SOR=0.593;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=9;WE=152266739;WS=152266721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr2	152267072	rs4664045	T	G	2501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.065;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=59;PP=1507;ReadPosRankSum=-2.610;SC=TAGCGGAGAGTGGGGCGCTCT;SOR=0.598;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=194;TCF=88;TCR=106;TR=112;WE=152267080;WS=152267062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,121:0.56:216
chr2	152267672	rs7585604	G	A	454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=1;PP=376;SC=TTCATTTGCAGGAGTTAGAAA;SOR=4.047;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=16;WE=152267680;WS=152267662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	152267721	rs66862523	AT	A	549.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=3.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.24;MQRankSum=0.000;QD=12.78;ReadPosRankSum=0.905;SOR=0.249;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,28:0.65:43
chr2	152267897	rs147405197	G	GT	93.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.605;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.45;MQRankSum=0.615;QD=7.21;ReadPosRankSum=-0.416;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr2	152271188	rs144193655	GTTTATT	G	161.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.441;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=139;ReadPosRankSum=-1.465;SC=TTTATTCCTTGTTTATTTTTA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=152271201;WS=152271181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr2	152273503	rs6735771	G	A	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.330;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=234;ReadPosRankSum=0.840;SC=ATGAGAGACAGACATTAAAAG;SOR=0.236;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=36;TCF=10;TCR=26;TR=18;WE=152273511;WS=152273493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
chr2	152289767	rs72860233	G	A	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.240;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=29;PP=589;ReadPosRankSum=-0.541;SC=GTTGACTATAGCACTTTATGT;SOR=1.022;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=62;TCF=12;TCR=50;TR=35;WE=152289775;WS=152289757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,37:0.56:66
chr2	152292169	rs34105266	GA	G	1277.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.978;NF=0;NR=42;PP=624;ReadPosRankSum=-0.844;SC=TTTGAAGTAGGAAAAAAAAAG;SOR=0.708;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=74;TCF=0;TCR=74;TR=42;WE=152292177;WS=152292159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,60:0.66:91
chr2	152298562	.	T	TTTTTATTTTATTTTA	171.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.93;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr2	152303171	rs2432941	G	A	1047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.221;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=32;PP=772;ReadPosRankSum=0.425;SC=TTTGTGAACTGTCACCTATTA;SOR=0.468;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=63;TCF=12;TCR=51;TR=41;WE=152303179;WS=152303161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,43:0.65:66
chr2	152311570	rs2444263	G	A	5687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=443;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.120;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=124;NR=116;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.833;SC=CTCAATCACCGGCATTATTTC;SOR=0.606;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=400;TCF=206;TCR=194;TR=240;WE=152311578;WS=152311560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:177,265:0.60:442
chr2	152314547	rs35044903	C	CA	214.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.639;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=235;ReadPosRankSum=-2.153;SC=TACTTTGATTCAAATAATCTT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=8;WE=152314555;WS=152314537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr2	152315549	.	G	T	76	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=5;PP=76;QD=22.1542425094;SC=CATTGTCAGTGGTGTGGCCTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=152315557;WS=152315539;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr2	152320118	rs2123465	G	A	2481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=50;ReadPosRankSum=0.166;SC=AGCAGCAACAGTGGAAAATGC;SOR=0.689;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=181;TCF=94;TCR=87;TR=104;WE=152320126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,111:0.57:196
chr2	152322095	rs2444257	A	T	3380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.412;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=63;PP=2074;ReadPosRankSum=-2.777;SC=AATGAAAAATAATGAAGAAAT;SOR=0.651;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=274;TCF=154;TCR=120;TR=143;WE=152322103;WS=152322085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,158:0.51:311
chr2	152331418	rs1065177	C	G	929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=1.898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.48;ReadPosRankSum=0.643;SOR=0.448;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,48:0.59:81
chr2	152346979	rs1061305	T	C	2790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=54;PP=1491;ReadPosRankSum=0.276;SC=CCCCCACTGATGCTTAGTGCA;SOR=0.708;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=202;TCF=109;TCR=93;TR=118;WE=152346987;WS=152346969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,131:0.59:221
chr2	152348631	rs184319249	T	C	886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=14;PP=660;ReadPosRankSum=-0.715;SC=TCTCCTGATCTTGGTCATTCC;SOR=0.666;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=92;TCF=62;TCR=30;TR=44;WE=152348639;WS=152348621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,43:0.45:96
chr2	152348842	rs2288193	T	A	3507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.447;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=73;PP=2226;ReadPosRankSum=2.400;SC=GGTGTGACTATATCCCTTTTT;SOR=0.726;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=242;TCF=126;TCR=116;TR=145;WE=152348855;WS=152348832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,159:0.57:277
chr2	152349026	rs2288195	G	A	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.358;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=426;ReadPosRankSum=0.602;SC=AGGAGAGACCGTGAATGAGTG;SOR=1.839;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=23;WE=152349034;WS=152349016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,25:0.68:37
chr2	152350462	rs4664455	T	C	1476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.535;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=40;PP=972;ReadPosRankSum=0.095;SC=GGGGGAAATGTTATGTTTAAT;SOR=0.892;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=107;TCF=40;TCR=67;TR=60;WE=152350470;WS=152350452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,67:0.55:121
chr2	152350903	rs112383145	G	GTA	719.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.197;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.45;MQRankSum=0.616;NF=0;NR=17;PP=812;ReadPosRankSum=0.677;SC=ATGGAAAGTAGTATGTTTCCT;SOR=2.737;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=17;WE=152350911;WS=152350893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,19:0.79:24
chr2	152352843	rs7575451	C	G	7009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=482;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.553;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.766;NF=148;NR=148;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.508;SC=GGAGTGACAGCTAAAGGAGTT;SOR=0.601;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=443;TCF=220;TCR=223;TR=296;WE=152352851;WS=152352833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,318:0.66:482
chr2	152360136	rs3835058	AT	A	93.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.345;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=132;ReadPosRankSum=-1.930;SC=AATAGTAAAAATTTTTACTAC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=152360144;WS=152360126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr2	152369117	rs13023600	T	C	2275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=8;PP=1541;SC=CGTGAGCCACTGCACCTGGTG;SOR=3.551;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=54;TCR=8;TR=62;WE=152369125;WS=152369107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr2	152371514	.	G	GA	44.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=-0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=39;ReadPosRankSum=0.204;SC=ATCTCAGGAAGAAAAAAAAAA;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=5;WE=152371522;WS=152371504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr2	152374800	rs16830136	G	A	1602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.902;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=27;PP=897;ReadPosRankSum=0.933;SC=ATGAATGTGCGCCAGAGGAAA;SOR=0.872;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=161;TCF=96;TCR=65;TR=75;WE=152374808;WS=152374790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,81:0.47:172
chr2	152382454	rs6721666	C	G	758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=3;PP=496;ReadPosRankSum=0.755;SC=GCCAAGAGACCGGTGGTTGAT;SOR=0.781;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=46;TCF=41;TCR=5;TR=30;WE=152382462;WS=152382444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,32:0.65:49
chr2	152383913	rs2288198	T	C	936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.175;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=8;PP=618;ReadPosRankSum=-0.321;SC=ACACTCATGATAGTGGTTATT;SOR=0.210;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=50;TCF=41;TCR=9;TR=35;WE=152383921;WS=152383903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,39:0.71:55
chr2	152387553	rs4664475	T	C	3501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.382;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=87;PP=1876;ReadPosRankSum=0.197;SC=GCAACATGGGTGTGTCGTGGA;SOR=0.850;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=301;TCF=147;TCR=154;TR=164;WE=152387561;WS=152387543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,174:0.54:325
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chr2	152388415	rs56026241	AT	A	1453.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.594;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=27;PP=980;ReadPosRankSum=0.599;SC=TTTGATCTAAATTGTGGAAGA;SOR=0.112;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=55;TCF=2;TCR=53;TR=29;WE=152388423;WS=152388405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,47:0.64:73
chr2	152394534	rs3732310	T	G	1932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.95;ReadPosRankSum=1.446;SOR=0.857;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,51:0.50:102
chr2	152394539	rs374484102	G	A	1962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.43;ReadPosRankSum=1.483;SOR=0.900;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,51:0.50:101
chr2	152396726	rs66541369	T	TA	949.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.449;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=2.305;NF=17;NR=9;PP=627;ReadPosRankSum=-0.524;SC=TTTTTCTCTTTAAAAAAATGT;SOR=0.345;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=79;TCF=57;TCR=22;TR=26;WE=152396734;WS=152396716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,41:0.50:82
chr2	152403014	rs4664486	C	T	2434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.640;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=67;PP=1535;ReadPosRankSum=-1.757;SC=TCAGGAAACACAAAAGATGGA;SOR=0.919;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=181;TCF=71;TCR=110;TR=107;WE=152403022;WS=152403004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,115:0.61:189
chr2	152404294	rs2288201	C	T	929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.568;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=25;PP=555;ReadPosRankSum=0.355;SC=TAGTAGGGGACGACGAGGGCA;SOR=0.247;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=74;TCF=23;TCR=51;TR=40;WE=152404302;WS=152404284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,43:0.55:78
chr2	152409416	rs2288203	C	T	1532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.973;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=43;PP=1084;ReadPosRankSum=2.142;SC=CTCAACAGACCGAGATGCATT;SOR=0.982;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=86;TCF=27;TCR=59;TR=60;WE=152409424;WS=152409406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,65:0.69:94
chr2	152409809	rs4575719	C	A	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.850;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=397;ReadPosRankSum=1.628;SC=AGCCACCCCCCAGAGCTGGCC;SOR=1.565;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=39;TCF=34;TCR=5;TR=20;WE=152409817;WS=152409799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,22:0.51:43
chr2	152417064	rs2288206	G	A	848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=8;PP=585;ReadPosRankSum=0.053;SC=GCAGGGGAGGGGAGGGAGGGT;SOR=0.706;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=31;TCR=10;TR=33;WE=152417072;WS=152417054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,35:0.81:43
chr2	152422076	rs2288210	C	G	4632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.840;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=81;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.527;SC=CACCACACTTCTAAAGTTAGG;SOR=0.745;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=309;TCF=168;TCR=141;TR=184;WE=152422095;WS=152422066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,200:0.60:334
chr2	152422087	rs2288211	A	G	4400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=344;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.286;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=99;NR=82;PP=2962;ReadPosRankSum=1.166;SC=TAAAGTTAGGATAGTTTTCAA;SOR=0.778;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=318;TCF=169;TCR=149;TR=181;WE=152422095;WS=152422066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,196:0.57:343
chr2	152425692	rs3732312	T	C	973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=5;PP=635;ReadPosRankSum=0.440;SC=ATGGTTAAGATTGCTGATATT;SOR=0.929;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=54;TCF=46;TCR=8;TR=36;WE=152425700;WS=152425682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,41:0.67:61
chr2	152427249	rs7568873	A	G	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=238;ReadPosRankSum=0.000;SC=AAGAGCATAGATGAGAATCAT;SOR=1.230;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=13;WE=152427257;WS=152427239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr2	152432311	rs33988153	T	C	710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.585;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=27;PP=410;ReadPosRankSum=-0.646;SC=CTCTGTACTTTGGCTGTGGAA;SOR=1.056;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=114;TCF=46;TCR=68;TR=41;WE=152432319;WS=152432301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,42:0.34:122
chr2	152432886	rs61254943	G	A	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=305;ReadPosRankSum=1.021;SC=AGAAAACACAGGTAGAAGCAG;SOR=0.693;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=15;WE=152432894;WS=152432876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,18:0.69:26
chr2	152472417	rs62174707	C	T	793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.322;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=4;PP=613;ReadPosRankSum=0.300;SC=GGAATTGAGACTTATAGGGGT;SOR=0.130;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=45;TCF=41;TCR=4;TR=31;WE=152472425;WS=152472407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,31:0.69:45
chr2	152483662	rs199847072	A	T	4915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=423;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.519;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=2.739;NF=116;NR=102;PP=2962;ReadPosRankSum=0.952;SC=ACATCCATAGACCCAATGGGG;SOR=0.742;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=389;TCF=204;TCR=185;TR=218;WE=152483670;WS=152483652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:188,232:0.55:420
chr2	152490219	rs6709886	A	G	3632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.028;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=74;PP=2207;ReadPosRankSum=0.036;SC=CGCTCTGGTCAGGCAGGCATG;SOR=0.577;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=249;TCF=127;TCR=122;TR=153;WE=152490227;WS=152490209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,170:0.60:281
chr2	152490458	rs6710212	A	G	6184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=111;NR=105;PP=2965;SC=AGTTGCTTGCAGTAACCATCT;SOR=0.736;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=219;TCF=113;TCR=106;TR=216;WE=152490466;WS=152490448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr2	152496910	rs200729207	C	T	4619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=358;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.811;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=105;PP=2922;ReadPosRankSum=0.718;SC=TGGATGACGTCGCTCTGGTCG;SOR=0.743;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=325;TCF=156;TCR=169;TR=195;WE=152496918;WS=152496900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,212:0.60:356
chr2	152500449	rs13013209	C	G	2506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.489;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.241;NF=44;NR=56;PP=1621;ReadPosRankSum=0.890;SC=TCTGGCACTTCTTGGCCAACA;SOR=1.036;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=167;TCF=80;TCR=87;TR=100;WE=152500470;WS=152500439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,106:0.60:176
chr2	152527572	rs7426114	C	T	10896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=411;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=195;NR=179;PP=2965;SC=TGAGCCAACACCATGCCCATG;SOR=0.733;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=375;TCF=195;TCR=180;TR=374;WE=152527580;WS=152527562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,410:1.00:410
chr2	152531077	rs6711382	A	G	8474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=132;NR=141;PP=2965;SC=ATTAAGTCATACCAATCCCGT;SOR=0.840;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=275;TCF=132;TCR=143;TR=273;WE=152531085;WS=152531067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,305:1.00:305
chr2	152536498	rs6735208	T	A	5655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=84;NR=107;PP=2965;SC=GCAGGTTGTATTTGTGAATAA;SOR=1.089;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=191;TCF=84;TCR=107;TR=191;WE=152536506;WS=152536488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr2	152552062	rs6433569	A	C	12566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=472;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=233;NR=189;PP=2965;SC=TTGTCAGTACATCACATGGTA;SOR=0.892;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=422;TCF=233;TCR=189;TR=422;WE=152552070;WS=152552052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,471:1.00:471
chr2	152566433	rs12464543	A	G	889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=23;PP=659;SC=TACCATTACAAAAATGATTAG;SOR=3.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=26;WE=152566441;WS=152566423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	152573902	rs34733773	A	AGGC	10392.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=52;NR=59;PP=2889;SC=TCTTCAAGGGAGGCAATGTCC;SOR=1.305;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=133;TCF=67;TCR=66;TR=111;WE=152573910;WS=152573892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr2	152573981	rs4611637	A	G	10700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=406;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=166;NR=178;PP=2965;SC=CTGGAGGATCAGCCAGAGGCG;SOR=0.780;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=345;TCF=166;TCR=179;TR=344;WE=152573989;WS=152573971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,405:1.00:405
chr2	152581866	rs4300824	T	C	8134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=163;NR=111;PP=2965;SC=CTCATAGTAATTCAACTGCTC;SOR=1.119;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=274;TCF=163;TCR=111;TR=274;WE=152581874;WS=152581856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,300:1.00:300
chr2	152584153	rs4664499	A	C	1159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=9;PP=823;SC=GAGTTGAGATAAGTAATTTCT;SOR=2.093;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=31;TCR=9;TR=40;WE=152584161;WS=152584143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr2	152684704	rs150910136	A	AC	3287.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FS=1.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.37;ReadPosRankSum=0.664;SOR=0.864;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,140:0.78:179
chr2	152729138	rs770609	T	C	1048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=29;PP=874;SC=CTATAAAGAATTTCAAGAATC;SOR=4.680;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=31;WE=152729146;WS=152729128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr2	152827973	rs7567588	A	G	2433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=21;PP=1535;SC=GACTGCAGCTAGCCATCTGAG;SOR=1.845;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=56;TCR=21;TR=77;WE=152827981;WS=152827963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr2	152828281	rs7607341	C	G	1912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=48;PP=1377;SC=GAACATCTCTCTCTTCCCCTG;SOR=2.694;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=11;TCR=48;TR=59;WE=152828289;WS=152828271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr2	153000337	rs12617139	T	A	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.550;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=15;PP=506;ReadPosRankSum=2.623;SC=GATTTAAAACTTACCTGTCAT;SOR=0.526;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=114;TCF=71;TCR=43;TR=38;WE=153000345;WS=153000327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,43:0.35:123
chr2	153004736	rs72864741	C	T	1111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=2.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.99;ReadPosRankSum=-0.757;SOR=0.542;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,65:0.41:159
chr2	153192324	rs2003332	C	T	673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=4.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.965;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=22;PP=479;ReadPosRankSum=0.518;SC=CACCCCGTGCCGGGAGCGAGC;SOR=2.448;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=36;TCF=4;TCR=32;TR=23;WE=153192332;WS=153192314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,26:0.67:39
chr2	153378459	rs4664114	T	C	2727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=382;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=70;PP=1455;ReadPosRankSum=-0.184;SC=TTAAACAGAATGCTATGAACC;SOR=0.682;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=344;TCF=171;TCR=173;TR=137;WE=153378467;WS=153378449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:231,149:0.39:380
chr2	153378574	rs4664592	A	G	1064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.521;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=30;PP=669;ReadPosRankSum=-0.721;SC=TTATGAAAAAAGTAATGAAAG;SOR=0.451;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=102;TCF=37;TCR=65;TR=50;WE=153378582;WS=153378564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,54:0.47:116
chr2	153378652	rs4664593	G	A	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.915;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=34;ReadPosRankSum=0.983;SC=TTGCTTCTGCGACAGAGATAG;SOR=0.160;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=5;WE=153378660;WS=153378642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr2	153405594	rs1155779	G	A	2031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.497;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=53;PP=1296;ReadPosRankSum=-0.937;SC=AAATTTCTTTGAGAACTAACC;SOR=0.731;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=209;TCF=94;TCR=115;TR=96;WE=153405602;WS=153405584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,102:0.47:218
chr2	153415170	rs6705427	A	C	1361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=3;PP=1026;SC=CTGGTGGAAAAAACAAAACTT;SOR=4.223;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=42;TCF=39;TCR=3;TR=42;WE=153415178;WS=153415160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr2	153415234	rs200953857	T	TG	9296.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=53;PP=2062;SC=CAATGATTTTTTTTTTTTTTT;SOR=1.575;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=68;TCR=53;TR=120;WE=153415252;WS=153415222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr2	153415244	rs72868279	T	C	6201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.677;NF=134;NR=66;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.415;SC=TTTTTTTTTTTCCCCAACAGA;SOR=0.587;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=206;TCF=138;TCR=68;TR=200;WE=153415252;WS=153415222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,246:0.98:250
chr2	153415376	rs6434098	T	G	12999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=480;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=212;NR=238;PP=2965;SC=GAATTTTATGTGGTCACAGCA;SOR=0.826;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=450;TCF=212;TCR=238;TR=450;WE=153415384;WS=153415366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,480:1.00:480
chr2	153417325	rs6713836	A	G	4229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=29;PP=2965;SC=AGGAACAGCAAGTTATACATG;SOR=2.387;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=131;TCF=102;TCR=29;TR=131;WE=153417333;WS=153417315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr2	153435288	rs12693407	G	A	499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=1;PP=411;SC=ATTTATAATGGTGTAAGTTTC;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=153435296;WS=153435278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	153463984	rs72210499	TACAC	T	184.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=0;NR=4;PP=174;SC=TTTTTCTAAATACACACACAC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=4;WE=153463995;WS=153463974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr2	153476066	rs5835439	G	GCCA	1807.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=22;PP=1203;SC=CGCCGCCGCCGCCCCCTCCTC;SOR=2.093;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=29;WE=153476074;WS=153476056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr2	153478931	rs7609122	T	C	1499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=1;PP=1180;SC=TGTGCCGCCTTGTGAAATGTG;SOR=6.184;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=41;TCF=40;TCR=1;TR=41;WE=153478939;WS=153478921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr2	153481943	rs2346532	T	C	3838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=43;PP=2562;SC=TTCTCTTTGATGTCTTTAGCT;SOR=1.661;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=135;TCF=92;TCR=43;TR=135;WE=153481951;WS=153481933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr2	153482128	rs12478681	G	A	4333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.426;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=100;PP=2842;ReadPosRankSum=0.364;SC=CAGCAAAGCCGGCATGGGTGT;SOR=0.559;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=316;TCF=139;TCR=177;TR=183;WE=153482136;WS=153482118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,192:0.59:328
chr2	153483257	rs7604573	T	C	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=3.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=289;ReadPosRankSum=-0.423;SC=TTCAGGAAAATTATATTCTAG;SOR=0.774;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=52;TCF=3;TCR=49;TR=17;WE=153483265;WS=153483247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,20:0.34:59
chr2	153484685	rs3811570	G	A	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.605;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=101;ReadPosRankSum=-0.887;SC=TCTTAGACTCGTTGATTTGGT;SOR=1.085;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=7;WE=153484693;WS=153484675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr2	153492910	rs1561267	G	T	3202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=41;PP=1993;SC=TCCCCATTGAGTTTCACTGGG;SOR=1.336;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=72;TCR=41;TR=113;WE=153492918;WS=153492900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr2	153497168	rs1465818	C	T	486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=1;PP=404;SC=TTCTCTGCAACTGAGCAGAAT;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=153497176;WS=153497163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	153502243	rs71394494	G	GTATT	76.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.96;ReadPosRankSum=1.579;SOR=0.086;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr2	153504552	rs12693429	G	A	1501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.894;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=46;PP=1096;ReadPosRankSum=-0.930;SC=TAGCAAACACGGAAGAATTTT;SOR=1.162;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=112;TCF=34;TCR=78;TR=63;WE=153504560;WS=153504542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,64:0.54:118
chr2	153514583	rs6713779	G	C	1588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=32;PP=1086;SC=AGATACCATTGTTATATAGGT;SOR=1.371;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=20;TCR=32;TR=52;WE=153514591;WS=153514573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr2	153514610	rs12999331	T	C	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.491;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=321;ReadPosRankSum=-0.177;SC=TAAGAACATCTATGTGTAACA;SOR=0.425;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=20;WE=153514618;WS=153514600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,22:0.63:35
chr2	153519524	rs1036526	A	G	2916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=34;PP=1846;SC=GAATTCCATTAGAAAAAAATA;SOR=1.103;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=60;TCR=34;TR=94;WE=153519532;WS=153519514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr2	153520782	rs3762507	A	G	791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=19;PP=600;SC=GAGAAAAATTATATTTGGAAA;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=25;WE=153520790;WS=153520772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	153520819	rs3762506	C	A	415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=117;SC=GAGAAATAAGCGTCTAACATG;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=153520827;WS=153520800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	153529361	rs2304559	T	C	491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=380;SC=TTATTAGACATAAAACAACTC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=153529369;WS=153529351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	153535670	rs10166987	C	T	2412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=50;NR=42;PP=1491;SC=TTAAAATCTACAGAACTGAGA;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=93;TCF=51;TCR=42;TR=92;WE=153535678;WS=153535660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr2	153549814	rs10172024	G	C	11946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.04;SOR=1.259;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,306:1.00:306
chr2	153549814	.	GTGTAC	CTGTAC,CTGTAT	2703	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.3;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=176,103;NR=107,68;PP=1643,2703;QD=5.92852018568;SC=TGGTCACCAAGTGTACACAAG;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=283;TCF=176;TCR=107;TR=283,171;WE=153549827;WS=153549804;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:283
chr2	153549819	rs13003670	C	T	4420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FS=1.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.32;ReadPosRankSum=0.278;SOR=0.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:130,202:0.61:332
chr2	153572438	rs2346548	C	T	3534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=28;PP=2197;SC=GACCTAGATTCTGAAATCTTG;SOR=2.100;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=79;TCR=28;TR=107;WE=153572446;WS=153572428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr2	153576548	.	G	GTCAGTCTTAAATGATTGGCTGCCAATGTTTCATTTCTTTATCATTCCCCTCCCCCCTTTTTTACCCTTTTTTGAATGTGCATGGAATGTAAATTA	246.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=171;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.19;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:0,0:0:0
chr2	153576580	.	A	ATTTC	2666	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.49;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MMLQ=27;MQ=58.96;NF=0;NR=51;PP=2666;QD=20;SC=CCAATGTTTCATTTATCATTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=73;TCF=1;TCR=72;TR=51;WE=153576588;WS=153576570;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:22,51:0.70:73
chr2	153577013	rs9646744	G	A	6527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=115;PP=2965;ReadPosRankSum=0.176;SC=TTATAGTATTGCTTTCCTACC;SOR=0.917;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=221;TCF=105;TCR=116;TR=219;WE=153577021;WS=153577003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,245:0.99:247
chr2	154801143	.	G	T	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.472;ClippingRankSum=0.000;DP=179;ExcessHet=3.0103;FS=1.494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.96;ReadPosRankSum=1.629;SOR=0.519;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:139,39:0.22:178
chr2	155099146	rs9288324	G	A	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.727;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=40;ReadPosRankSum=-0.009;SC=CATCTTGGTAGTATCTCTGCT;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=4;WE=155099154;WS=155099143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr2	155099537	rs12477393	T	G	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=271;ReadPosRankSum=1.814;SC=TTTATAGCTTTTCTTAAAAGC;SOR=1.085;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=14;WE=155099545;WS=155099527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,14:0.78:18
chr2	155252653	rs13026208	T	C	1515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.258;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=39;PP=971;ReadPosRankSum=-1.888;SC=GTATGAATTATTTATTTTGGT;SOR=0.937;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=126;TCF=46;TCR=80;TR=60;WE=155252661;WS=155252643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,67:0.48:141
chr2	155265623	rs1405936	G	A	2538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.928;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=67;PP=1551;ReadPosRankSum=1.953;SC=TCAGCTTCATGTTTTAGAGGG;SOR=0.556;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=178;TCF=62;TCR=116;TR=106;WE=155265631;WS=155265613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,114:0.60:190
chr2	155306885	rs697648	C	T	2422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=24;PP=1444;SC=AAGCTAAAGACGAAATAAGCT;SOR=1.636;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=57;TCR=24;TR=81;WE=155306893;WS=155306875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr2	155711357	rs17642086	T	C	2821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=380;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.710;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=62;PP=1488;ReadPosRankSum=0.355;SC=CCCAGTTCCATGCAACATTTG;SOR=0.799;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=343;TCF=182;TCR=161;TR=134;WE=155711365;WS=155711347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:228,151:0.40:379
chr2	157183211	rs35479735	TC	T	3426.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.203;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.943;NF=22;NR=40;PP=2230;ReadPosRankSum=-1.433;SC=CTGGATTGTCTCCCTCCCTCC;SOR=0.524;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=90;TCF=31;TCR=59;TR=62;WE=157183219;WS=157183201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,111:0.70:159
chr2	157189011	rs834836	G	C	6421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=123;PP=2965;SC=CTCCGCGTCTGTCTTCATTCA;SOR=0.894;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=230;TCF=107;TCR=123;TR=230;WE=157189019;WS=157189001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr2	157352734	rs55843224	CT	C	216.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=1.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.29;ReadPosRankSum=0.583;SOR=0.929;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,15:0.37:41
chr2	157406249	rs2116665	G	A	7372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=109;NR=128;PP=2965;SC=GGGAAAGTGCGTGTGAGCGGC;SOR=0.971;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=237;TCF=109;TCR=128;TR=237;WE=157406257;WS=157406239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,274:1.00:274
chr2	157406296	rs2116664	A	C	5233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=92;PP=2965;SC=TATGCCAGGTATCTGGGAGGG;SOR=1.085;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=167;TCF=75;TCR=92;TR=167;WE=157406304;WS=157406286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr2	157425801	rs67602053	A	G	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.891;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=387;ReadPosRankSum=1.082;SC=TGTTATTGGTAAGTTGATAAA;SOR=1.609;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=44;TCF=33;TCR=11;TR=22;WE=157425809;WS=157425791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,23:0.48:48
chr2	157426114	rs147508905	ACTGGCAGCAAT	A	655.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.333;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=2935;ReadPosRankSum=1.829;SC=CAGTGACAGAACTGGCAGCAA;SOR=1.402;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=15;WE=157426132;WS=157426104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
chr2	157427593	rs1469652	T	C	1775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=18;PP=1219;SC=GCTTTATTTCTCATTTTCTAA;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=60;TCF=42;TCR=18;TR=59;WE=157427601;WS=157427583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr2	157427837	rs1469651	C	A	1848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=27;NR=35;PP=935;SC=ACCACAATTCCTATTGTAAAC;SOR=1.163;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=27;TCR=35;TR=62;WE=157427858;WS=157427827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr2	157427850	rs1469650	G	A	1613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=33;PP=922;SC=TTGTAAACGCGGAATGGCTTA;SOR=1.649;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=19;TCR=33;TR=52;WE=157427858;WS=157427827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr2	157435821	rs9711295	A	T	57.81	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.45;ReadPosRankSum=-1.150;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr2	158157361	rs3214040	C	T	6111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=103;NR=98;PP=2965;SC=TCTATGGCCACGGAGACCACC;SOR=0.758;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=201;TCF=103;TCR=98;TR=201;WE=158157369;WS=158157351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr2	158162475	rs3214039	C	T	1407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=35;PP=1017;SC=AGAGAGTCCACCACTAAACAC;SOR=2.608;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=10;TCR=35;TR=45;WE=158162483;WS=158162465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr2	158162521	rs3816595	T	G	419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=13;PP=351;SC=GTGTGGGTCCTGCAGTCAACT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=158162529;WS=158162511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	158165004	rs6728956	C	T	520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=1;PP=381;SC=TTAACTGTTGCTAACAAAAAT;SOR=3.500;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=158165012;WS=158164994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	158283710	rs155614	A	G	183.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=117;SC=TATTCCTCCAAAGGTAATTGT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=158283718;WS=158283707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	158284056	rs155613	C	T	423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=13;PP=350;SC=AAACGAAATACAAATGTTACA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=158284064;WS=158284046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	158291107	rs70987792	T	TAG	454.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=473;ReadPosRankSum=0.827;SC=TGTGTGTGCGTAGAGAGAGAG;SOR=1.609;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=11;WE=158291115;WS=158291097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,15:0.88:17
chr2	158291188	rs11904180	A	C	2442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=30;PP=1540;SC=GGGAGAGACAAAAAATAATTC;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=51;TCR=30;TR=81;WE=158291196;WS=158291178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr2	158395079	rs7576514	C	G	8727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=182;NR=109;PP=2965;SC=AAAAACATGGCCTTACTTCAC;SOR=1.218;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=291;TCF=182;TCR=109;TR=291;WE=158395087;WS=158395069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,321:1.00:321
chr2	158400908	rs6728987	C	T	4471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=103;NR=31;PP=2965;SC=AACTAAGTACCTCTATCCTCA;SOR=2.382;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=103;TCR=31;TR=134;WE=158400916;WS=158400898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr2	158401137	rs10432556	T	C	2691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=69;PP=1841;SC=AACAAGAAAATGTAATTTTGT;SOR=2.303;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=92;TCF=23;TCR=69;TR=92;WE=158401145;WS=158401127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr2	158626980	rs1146031	C	T	5621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=106;NR=82;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.638;SC=CGGCAACATTCTCCCCTTGCC;SOR=0.871;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=190;TCF=107;TCR=83;TR=188;WE=158626988;WS=158626969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,205:0.99:207
chr2	158636789	.	C	T	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.728;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.929;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=104;ReadPosRankSum=-1.396;SC=TTAACCCACACGGACCCAGGA;SOR=0.049;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=8;WE=158636797;WS=158636779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
chr2	158978178	rs10804389	C	G	800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.349;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=27;PP=599;ReadPosRankSum=0.552;SC=ATGCCAGCAACTCTTTGTTAT;SOR=1.179;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=61;TCF=9;TCR=52;TR=31;WE=158978186;WS=158978168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,33:0.50:66
chr2	159028800	rs2222390	A	G	809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=19;PP=618;SC=AATTTAAATAACAATTCATTG;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=24;WE=159028808;WS=159028790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	159035344	.	A	ATT	3394.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.479;ClippingRankSum=0.000;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.570;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=27;PP=1093;ReadPosRankSum=0.395;SC=ACTTAGAAACATTTTTTTTAA;SOR=0.768;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=109;TCF=42;TCR=67;TR=50;WE=159035352;WS=159035334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,107:0.59:182
chr2	159077019	rs958671	A	C	3540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=46;PP=2063;SC=TATAGAAAAAAGTTCCCTCTG;SOR=1.335;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=129;TCF=83;TCR=46;TR=129;WE=159077027;WS=159077009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr2	159166069	rs7559772	T	C	4623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=95;PP=2908;SC=AAAGTCTTTCTTATTTTTATT;SOR=1.470;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=151;TCF=56;TCR=95;TR=151;WE=159166077;WS=159166059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr2	159195225	rs11686762	T	G	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.287;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=60;ReadPosRankSum=0.222;SC=AGGACTCAGTTTTATCTTATC;SOR=0.223;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=7;WE=159195233;WS=159195215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr2	159312733	rs1111212	C	T	934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.276;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=8;PP=645;ReadPosRankSum=1.667;SC=ACCTCGTTCCCTTACCAAAAT;SOR=0.260;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=50;TCF=40;TCR=10;TR=35;WE=159312741;WS=159312723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,37:0.71:52
chr2	159312776	rs3796107	GA	TT	1569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.616;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=11;PP=877;ReadPosRankSum=-0.597;SC=GAGTCTTTCAGAAGAGTTATG;SOR=0.446;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=72;TCR=35;TR=33;WE=159312785;WS=159312766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,43:0.37:116
chr2	159434492	rs2356188	G	A	642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.85;SOR=3.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	159434492	.	GAATAGTTA	AAATAGTTA,AAATAGTTG	337	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=13,11;NR=2,1;PP=17,337;QD=3.45141416981;SC=TACATGTTCCGAATAGTTAAA;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15,12;WE=159434508;WS=159434482;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:15
chr2	159434500	rs2356189	A	G	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.03;ReadPosRankSum=0.562;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,18:0.75:24
chr2	159434727	rs10933494	T	G	980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.697;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=25;PP=600;ReadPosRankSum=-1.222;SC=TGAATAGAATTCTGTCTGTTG;SOR=0.803;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=109;TCF=52;TCR=57;TR=45;WE=159434735;WS=159434717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,48:0.40:119
chr2	159434802	rs72184107	ATC	A	506.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.425;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=490;ReadPosRankSum=0.681;SC=TGAATTTTTCATCTCTCTTAA;SOR=0.425;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=12;WE=159434811;WS=159434792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,16:0.35:46
chr2	159520085	rs3771679	G	C	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=171;ReadPosRankSum=0.589;SC=CTTAGCTTGTGTGTGAAGGGG;SOR=0.307;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=10;WE=159520093;WS=159520075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr2	159522879	rs2248854	C	G	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.732;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=146;ReadPosRankSum=-1.383;SC=ACATATGAGACTGGAACTCTG;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=7;WE=159522887;WS=159522869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr2	159530651	rs2711034	A	T	1249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.575;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=34;PP=855;ReadPosRankSum=-1.922;SC=TTCTGTAGGAATCACACACCA;SOR=0.368;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=69;TCF=13;TCR=56;TR=43;WE=159530659;WS=159530641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,50:0.64:78
chr2	159534863	rs2356505	A	G	412.94	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=289;ReadPosRankSum=-0.886;SC=GGAAACACACACAGCCTGTTT;SOR=2.200;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=16;WE=159534882;WS=159534856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,17:0.89:19
chr2	159534874	rs2356506	C	T	750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=2;PP=582;SC=CAGCCTGTTTCTGCCATAGTT;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=23;WE=159534882;WS=159534856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	159534889	rs2711040	C	T	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=2;PP=522;ReadPosRankSum=0.621;SC=ATAGTTTTGCCATTAGCCCCC;SOR=1.022;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=24;WE=159534897;WS=159534879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,25:0.83:30
chr2	159651973	rs1356173	G	A	3870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.902;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=62;PP=2246;ReadPosRankSum=0.624;SC=AGTCCTGCAGGCTGTTGCTGC;SOR=0.775;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=268;TCF=160;TCR=108;TR=157;WE=159651992;WS=159651963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,177:0.59:298
chr2	159661077	rs2271663	C	T	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.096;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=38;ReadPosRankSum=-0.617;SC=CTGGAGGGATCCCTCTGAGAG;SOR=0.138;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=5;WE=159661085;WS=159661067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr2	159663599	rs9869	T	C	2435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.356;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=61;PP=1375;ReadPosRankSum=-1.755;SC=ATACAGACACTGGATGCCCTG;SOR=0.664;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=289;TCF=144;TCR=145;TR=123;WE=159663607;WS=159663589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:186,130:0.41:316
chr2	159663616	rs12535	G	A	3529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=77;PP=1947;ReadPosRankSum=0.382;SC=CCTGAATGACGCACTGGAGAA;SOR=0.703;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=261;TCF=126;TCR=135;TR=150;WE=159663624;WS=159663606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,168:0.59:285
chr2	159672168	rs1515922	G	A	1223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.978;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=16;PP=744;ReadPosRankSum=1.286;SC=AATATTTCATGACCAAGAAGA;SOR=0.861;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=180;TCF=127;TCR=53;TR=59;WE=159672176;WS=159672158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,66:0.33:201
chr2	159672252	rs61740878	G	A	2651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=387;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=64;PP=1582;ReadPosRankSum=1.415;SC=TGCACATGGCGCATCAAAAAC;SOR=0.693;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=352;TCF=184;TCR=168;TR=127;WE=159672260;WS=159672242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:248,138:0.36:386
chr2	159672322	rs138143887	C	T	2385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=354;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.324;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=61;PP=1545;ReadPosRankSum=0.520;SC=TCAGCAGCCTCGAAAATGTTA;SOR=0.620;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=323;TCF=145;TCR=178;TR=110;WE=159672330;WS=159672312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:231,123:0.35:354
chr2	159672442	rs10016	G	A	609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.989;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=23;PP=398;ReadPosRankSum=0.755;SC=GGTAAATTAAGCAGCTTTTGT;SOR=1.248;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=64;TCF=10;TCR=54;TR=26;WE=159672450;WS=159672432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,28:0.42:67
chr2	159683021	rs12185615	A	T	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.385;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.48;ReadPosRankSum=0.086;SOR=1.139;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr2	159954420	rs13414916	C	T	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=165;ReadPosRankSum=0.865;SC=AACTAGTGCCCATGAGAAATC;SOR=1.148;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=11;WE=159954428;WS=159954410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr2	159992572	rs35935932	C	T	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=8.451;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.654;NF=13;NR=1;PP=360;ReadPosRankSum=-2.116;SC=CGCGCGCGCGCGTTTAAGGGA;SOR=5.136;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=159992580;WS=159992562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,12:0.86:14
chr2	160005600	rs72951453	G	A	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.245;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=88;ReadPosRankSum=0.957;SC=ATCCAGATGCGATACTGAAAT;SOR=0.155;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=7;WE=160005608;WS=160005590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr2	160019863	rs12466551	A	G	6470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=113;NR=94;PP=2965;SC=AAAGATGGAAACCTAAGATTA;SOR=0.719;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=207;TCF=113;TCR=94;TR=207;WE=160019871;WS=160019853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr2	160033174	rs759034	A	G	426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=11;PP=313;SC=CCAGAGAGCCAGACTTGGGTG;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=160033182;WS=160033164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	160034919	rs4665031	A	G	581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=0;PP=431;SC=ACCTTATCCTATTACACGTTT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=160034927;WS=160034916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	160035207	rs6748288	T	C	8492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=133;NR=151;PP=2965;SC=TCTCCCTGAATGGCAAGGCCG;SOR=0.847;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=284;TCF=133;TCR=151;TR=284;WE=160035215;WS=160035197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,319:1.00:319
chr2	160042430	rs13389867	G	A	3875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=509;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.517;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=92;PP=2473;ReadPosRankSum=0.646;SC=ACACCAACTTGGGGAAGGGTT;SOR=0.543;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=474;TCF=232;TCR=242;TR=185;WE=160042438;WS=160042420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:311,197:0.39:508
chr2	160055448	rs13430891	T	A	5058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=110;NR=56;PP=2965;SC=CACCTCTTGCTAAGAGAACTC;SOR=1.308;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=166;TCF=110;TCR=56;TR=166;WE=160055456;WS=160055438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr2	160073895	rs4665042	G	C	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.160;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=10;PP=345;ReadPosRankSum=-0.267;SC=GGTTCAAAGGGGGAGGACATA;SOR=0.450;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=43;TCF=29;TCR=14;TR=27;WE=160073903;WS=160073885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,32:0.62:52
chr2	160082354	rs12692544	C	T	5381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=74;NR=112;PP=2965;SC=TAATTGGGTACATAATGGCTA;SOR=1.272;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=186;TCF=74;TCR=112;TR=186;WE=160082362;WS=160082344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr2	160084224	rs2042494	G	A	2441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=27;PP=1570;SC=ATGTTCTGTCGTGGGTTTGCA;SOR=1.531;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=55;TCR=27;TR=82;WE=160084232;WS=160084214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr2	160084263	rs2042495	A	G	4364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=65;PP=2617;SC=ACGGTGTTCCAGGTGTGGGAG;SOR=0.957;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=154;TCF=89;TCR=65;TR=153;WE=160084271;WS=160084253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr2	160084473	rs2288110	A	C	1047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=26;PP=775;SC=GAAGAAAAACAAATGTAAGCT;SOR=3.126;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=31;WE=160084481;WS=160084463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr2	160084534	rs2288111	A	G	141.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=5;PP=111;SC=CTTCTCCAGCAGTGAAGGCCA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=160084542;WS=160084524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr2	160086653	rs4664276	CA	TG	18652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=415;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=192;NR=162;PP=2947;SC=GAATCGCTGCCACTCCTGCTG;SOR=0.837;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=375;TCF=201;TCR=174;TR=354;WE=160086662;WS=160086643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,414:1.00:414
chr2	160086692	rs3821296	A	G	11691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=435;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=203;NR=197;PP=2965;SC=TAGAGGGAACAGGTACTTTCA;SOR=0.716;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=400;TCF=203;TCR=197;TR=400;WE=160086700;WS=160086682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,435:1.00:435
chr2	160087535	rs3821301	T	G	5676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=120;PP=2965;SC=CCTTAAGAAATCCCCATTTGT;SOR=1.781;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=179;TCF=59;TCR=120;TR=179;WE=160087543;WS=160087525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr2	160132196	rs35620648	A	AC	2465.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.274;NF=5;NR=46;PP=934;ReadPosRankSum=-0.645;SC=AAACACTGAAACCCCCCCAAA;SOR=1.347;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=57;TCF=7;TCR=50;TR=51;WE=160132204;WS=160132186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,86:0.98:88
chr2	160136337	rs174264	G	A	3675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=72;NR=54;PP=2085;SC=TTCACTATGCGGACACCTCAT;SOR=0.842;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=72;TCR=54;TR=126;WE=160136345;WS=160136327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr2	160176943	rs174229	A	C	1478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=33;PP=1021;SC=AAAGAAAACAAATAATTAGAG;SOR=2.256;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=12;TCR=33;TR=45;WE=160176951;WS=160176933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	160181549	.	ATAT	A	210.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=63.51;QD=35.13;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	160182074	rs440241	T	A	392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=2;PP=227;SC=ACATAAATTATCAGAAAGAAA;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=160182082;WS=160182064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	160182302	rs415793	C	T	3371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.822;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=49;PP=1928;ReadPosRankSum=3.805;SC=TTTTAGTGAACTACTTGTAGA;SOR=0.592;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=115;TCF=65;TCR=50;TR=114;WE=160182310;WS=160182292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:6,128:0.96:134
chr2	160203934	rs965163	A	C,T	1068.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=25;NF=18,14;NR=2,1;PP=391,297;SC=ATATTAGGCAAGTAATAAACA;SOR=4.407;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=20,15;WE=160203942;WS=160203924;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.55,0.45:38
chr2	160231108	rs6742788	A	G	1110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=10;PP=783;SC=CCAAAAGCCTATTTTTGCTTA;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=27;TCR=10;TR=37;WE=160231116;WS=160231098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr2	160239378	rs2302927	A	G	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.828;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=293;ReadPosRankSum=1.630;SC=TTAAAAGAGCAAAACATGAGT;SOR=0.231;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=48;TCF=12;TCR=36;TR=20;WE=160239386;WS=160239368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,23:0.44:52
chr2	160241936	rs1469015	A	G	255.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=7;PP=186;SC=TACCATAAAAACAATAAGATT;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=160241944;WS=160241926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	160243183	rs918351	TA	AT	2201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=40;PP=2203;SC=CATGATTTCGTATCTTCTAAA;SOR=4.977;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=43;TCF=3;TCR=40;TR=43;WE=160243192;WS=160243173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr2	160261721	rs35567166	T	C	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=52;ReadPosRankSum=-0.414;SC=ATAAAGGATATAATTATTACT;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=4;WE=160261737;WS=160261711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr2	160261729	rs74694096	AC	A	135.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.17;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr2	160285060	rs57144725	C	T	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=252;ReadPosRankSum=0.206;SC=ACTCCTCAAACAACCCAAATA;SOR=0.963;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=13;WE=160285068;WS=160285050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr2	160285575	rs12473781	C	T	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.987;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=95;ReadPosRankSum=0.719;SC=CCCTTTGCTCCGGCTCTTCTG;SOR=0.301;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=9;WE=160285583;WS=160285565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
chr2	160285660	rs10754963	T	A	1055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.037;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=18;PP=497;ReadPosRankSum=-0.382;SC=TACATCAAACTTGCATAAATA;SOR=0.882;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=151;TCF=86;TCR=65;TR=48;WE=160285668;WS=160285650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,58:0.35:167
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chr2	160304741	rs12470533	A	T	1027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.747;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=12;PP=552;ReadPosRankSum=-1.064;SC=TCACTTATGTAAATGTGGATA;SOR=0.235;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=86;TCF=64;TCR=22;TR=41;WE=160304774;WS=160304731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,46:0.49:94
chr2	160585740	rs3821299	C	A	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=4.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.66;ReadPosRankSum=-1.501;SOR=0.124;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
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chr2	160604936	rs13024801	G	A	4022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.639;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=71;PP=2485;ReadPosRankSum=-0.723;SC=AGAATCTGAAGGTAGAAATAC;SOR=0.809;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=256;TCF=136;TCR=120;TR=155;WE=160604944;WS=160604926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,174:0.61:286
chr2	160605268	rs1365803	T	C	4850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=80;PP=2914;SC=TTGCAGTCCCTCCAGCACTTG;SOR=0.875;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=155;TCF=75;TCR=80;TR=155;WE=160605276;WS=160605258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr2	160605489	rs10929950	C	T	282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.71;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	160609162	rs1365802	T	C	792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.019;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=25;PP=641;ReadPosRankSum=-0.105;SC=AATTTATAGATTGTTGAATTT;SOR=4.320;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=3;TCR=36;TR=25;WE=160609170;WS=160609152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,27:0.64:42
chr2	160634564	rs5835761	ACC	A	129.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.445;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=3;PP=203;ReadPosRankSum=0.643;SC=TTAAAAATAAACCCTTTTATT;SOR=0.180;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=4;WE=160634573;WS=160634554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr2	160634582	rs148276105	TAATATC	T	64.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.586;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=176;ReadPosRankSum=-1.501;SC=ATTAGTAGCTTAATATCAATA;SOR=0.132;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=3;WE=160634595;WS=160634572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr2	160637324	rs2303551	A	G	5975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=127;NR=69;PP=2965;SC=GAGAATTGAAAAGCCATCAGT;SOR=1.347;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=196;TCF=127;TCR=69;TR=196;WE=160637332;WS=160637314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr2	160639970	rs2114626	T	C	689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=2.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.85;ReadPosRankSum=-0.156;SOR=1.026;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,41:0.35:118
chr2	160654524	rs2556106	G	T	575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=14;NR=7;PP=281;SC=GGGCGGGATGGCCGGCCGGGT;SOR=1.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=14;TCR=7;TR=21;WE=160654532;WS=160654514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	160663678	rs7566887	T	C	669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.060;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=18;PP=356;ReadPosRankSum=0.488;SC=AATACAACTATGTCTACTGCC;SOR=0.427;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=65;TCF=24;TCR=41;TR=30;WE=160663686;WS=160663668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,34:0.47:73
chr2	160667004	rs35590513	G	A	2437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-1.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.653;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=25;PP=1689;ReadPosRankSum=0.838;SC=AAAAATTATTGAGTCATAAGA;SOR=0.807;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=155;TCF=116;TCR=39;TR=97;WE=160667012;WS=160666994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,104:0.60:172
chr2	160671832	rs80076779	T	C	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=387;ReadPosRankSum=-1.053;SC=AATCTTTAAATAAAAATTCCA;SOR=0.527;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=20;WE=160671840;WS=160671822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,21:0.75:28
chr2	160676350	rs17827158	T	C	2999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.354;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQ=60.05;MQRankSum=0.712;NF=62;NR=53;PP=1674;ReadPosRankSum=-0.534;SC=AGCCAAAAACTTCTCATTTTT;SOR=0.440;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=176;TCF=99;TCR=77;TR=115;WE=160676358;WS=160676340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,134:0.67:200
chr2	160676427	rs12692566	C	A	1772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.694;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.362;NF=24;NR=41;PP=959;ReadPosRankSum=-0.261;SC=ACATAAGAGACTTATCTAGAG;SOR=0.790;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=112;TCF=43;TCR=69;TR=65;WE=160676435;WS=160676417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,80:0.62:128
chr2	160676445	rs60586916	A	ATT	1754.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.039;HP=6;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.491;NF=0;NR=32;PP=1039;ReadPosRankSum=-0.891;SC=GAGAAGAAACATTTTTTCCTA;SOR=0.475;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=64;TCF=0;TCR=64;TR=32;WE=160676453;WS=160676435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,52:0.58:89
chr2	160710216	rs41264211	A	G	3159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=485;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=82;PP=2006;ReadPosRankSum=-0.749;SC=TATCTGAAAAACAAGCCAAAC;SOR=0.735;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=448;TCF=221;TCR=227;TR=161;WE=160710224;WS=160710206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:310,175:0.36:485
chr2	160711045	rs3951216	G	C	3217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=57;PP=1949;SC=TTCCAGCACGGTCTAAAGAAG;SOR=1.250;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=40;TCR=57;TR=97;WE=160711059;WS=160711035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr2	160711556	rs975490	T	G	3639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=79;PP=2537;SC=TATTGTTGAGTCTTGTCCATT;SOR=1.323;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=50;TCR=79;TR=129;WE=160711564;WS=160711546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr2	160729134	rs1397705	A	C	3375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=75;PP=2288;SC=AATTTGTTTTATGGTATTATC;SOR=2.033;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=32;TCR=75;TR=107;WE=160729142;WS=160729124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr2	160729186	rs10168271	T	C	943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=29;PP=673;SC=CTGTCACATGTGTGGGCCCCT;SOR=5.728;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=30;WE=160729194;WS=160729176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	160737495	rs2729712	A	C	543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=0;PP=451;SC=CTTACCTTTTATTTTCCAGCT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=160737503;WS=160737485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	160737560	rs2729711	G	T	4052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=40;PP=2417;SC=GGTAAAACAGGAAGAATATAA;SOR=1.547;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=135;TCF=95;TCR=40;TR=135;WE=160737568;WS=160737550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr2	160742771	rs2666986	A	G	478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=2;PP=360;SC=CAATAACAGTACCACAATTAA;SOR=3.126;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=160742779;WS=160742761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	160743040	rs2271381	T	A	3781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=84;PP=2378;SC=TGCCTTCTTTTTCTGTAAGAA;SOR=1.754;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=122;TCF=38;TCR=84;TR=122;WE=160743048;WS=160743030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
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chr2	160813249	rs3749113	G	A	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=22;PP=534;ReadPosRankSum=0.782;SC=AATTTTCTTGGGCAGAAAGAA;SOR=0.394;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=35;TCF=2;TCR=33;TR=24;WE=160813257;WS=160813239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,26:0.70:37
chr2	160833188	rs2715918	A	G	3445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=45;PP=2127;SC=TGCCAGAGTCATTCTTACCGT;SOR=1.249;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=80;TCR=45;TR=125;WE=160833196;WS=160833178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr2	160840370	rs5835784	AC	A	337.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=384;SC=TGGGATACTCACCCCTCAGAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=11;WE=160840378;WS=160840360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	160843623	rs6757188	T	C	1411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=27;PP=1049;ReadPosRankSum=0.080;SC=CAAATTAAAATAGTGTTGGTC;SOR=0.661;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=103;TCF=59;TCR=44;TR=61;WE=160843631;WS=160843613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,64:0.57:113
chr2	160872990	rs71422290	GT	G	753.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.649;HP=7;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=744;ReadPosRankSum=0.352;SC=GAAGGGGGGGGTGCGAGGAGA;SOR=0.238;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=56;TCF=49;TCR=7;TR=21;WE=160873005;WS=160872980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,27:0.41:66
chr2	160873021	rs2715939	G	A	1119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FS=2.305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.57;ReadPosRankSum=0.306;SOR=0.902;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,59:0.40:148
chr2	160873270	rs2667040	A	G	705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=23;PP=421;ReadPosRankSum=-0.877;SC=CTGTGCTGATACCGATGGGCA;SOR=0.813;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=71;TCF=15;TCR=56;TR=29;WE=160873278;WS=160873260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,34:0.43:79
chr2	160873294	rs3833577	T	TA	156.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.075;HP=9;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=95;ReadPosRankSum=0.663;SC=GCAATTCTTATAAAAAAAATA;SOR=0.086;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=7;WE=160873302;WS=160873284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr2	160876827	rs1511213	A	G	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.936;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=97;ReadPosRankSum=0.128;SC=TGCAAAGGAGATAACACCCTG;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=6;WE=160876835;WS=160876817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr2	160885418	rs35771982	G	C	2028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FS=2.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.02;ReadPosRankSum=0.383;SOR=0.553;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:225,112:0.33:337
chr2	160885442	rs3749117	T	C	2344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=382;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.387;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=59;PP=1538;ReadPosRankSum=-0.038;SC=TTGAGGCCCATCCACACCTCC;SOR=0.666;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=357;TCF=190;TCR=167;TR=124;WE=160885450;WS=160885432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:249,133:0.35:382
chr2	160889673	rs2203053	G	A	1421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.346;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=41;PP=880;ReadPosRankSum=-1.144;SC=AAAACAACCAGGTCTTATTTT;SOR=0.861;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=145;TCF=51;TCR=94;TR=62;WE=160889681;WS=160889663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,69:0.43:160
chr2	160901517	rs4665143	A	G	1507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.734;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=33;PP=1025;ReadPosRankSum=-0.522;SC=CCAGGCAACCACTGCCTCCTA;SOR=0.829;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=195;TCF=102;TCR=93;TR=72;WE=160901525;WS=160901507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,79:0.38:210
chr2	160919020	rs3749119	C	T	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.760;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=231;ReadPosRankSum=0.945;SC=GAAGCGGATCCGTAGCCTCCT;SOR=1.885;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=31;TCF=10;TCR=21;TR=15;WE=160919028;WS=160919010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr2	160919040	rs11285500	AC	A	473.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=10;PP=339;SC=TCCGCGCCCCACCCCCTCCGG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=10;WE=160919048;WS=160919030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	160958349	rs34330288	GA	G	1126.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=3.968;HP=12;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.706;NF=7;NR=32;PP=388;ReadPosRankSum=-0.227;SC=TGGTTCCCTGGAAAAAAAAAA;SOR=0.197;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=55;TCF=11;TCR=44;TR=39;WE=160958358;WS=160958339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:7,57:0.89:64
chr2	160964057	rs13009231	G	T	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.02;ReadPosRankSum=-0.386;SOR=0.242;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,11:0.34:32
chr2	160964057	.	GGA	TGG	340	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=22;MQ=60.0;NF=9;NR=0;PP=340;QD=43.7186527625;SC=CAAAGCTGTTGGAGTCATGGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=9;WE=160964067;WS=160964047;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:22,9:0.29:31
chr2	160964059	rs13008664	A	G	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=2.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.32;ReadPosRankSum=-0.528;SOR=0.242;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr2	160968743	rs66470452	CA	C	591.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.795;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=530;ReadPosRankSum=-1.354;SC=TTAGGTTAAACAAGATTCCAA;SOR=1.497;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=15;WE=160968751;WS=160968733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr2	160983060	rs2305819	G	C	614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.924;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=19;PP=405;ReadPosRankSum=1.594;SC=TGCAGTACTCGCCAGTCCAGC;SOR=0.569;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=69;TCF=23;TCR=46;TR=30;WE=160983068;WS=160983050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,31:0.42:74
chr2	161028992	rs1037694	T	C	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=117;ReadPosRankSum=1.846;SC=TTTCACCAAGTGTATGTTATT;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=7;WE=161029000;WS=161028982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr2	161029218	rs2305818	G	A	2599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=372;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.385;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=65;PP=1366;ReadPosRankSum=0.538;SC=GGTGGAGGGAGTCATTCCGCC;SOR=0.727;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=342;TCF=164;TCR=178;TR=126;WE=161029238;WS=161029208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:227,144:0.39:371
chr2	161132293	rs57047289	T	C	1989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.456;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=54;PP=1004;ReadPosRankSum=1.017;SC=TACTTAGGCCTGACTGAATCC;SOR=0.736;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=242;TCF=104;TCR=138;TR=93;WE=161132301;WS=161132283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,108:0.40:273
chr2	161169524	rs189726510	C	T	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.202;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=8;PP=358;ReadPosRankSum=-0.521;SC=GTGGAGGCTGCGGAGGCACAG;SOR=0.307;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=51;TCF=38;TCR=13;TR=28;WE=161169532;WS=161169514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,31:0.56:55
chr2	161797329	rs1524626	C	T	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=206;ReadPosRankSum=-0.826;SC=AAACCCTGCCCAGGGACTCTC;SOR=0.404;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=13;WE=161797337;WS=161797319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr2	161797513	rs1524625	A	G	1899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.496;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=46;PP=1094;ReadPosRankSum=-1.318;SC=TCATGTTTCAAAACACCAGAG;SOR=0.515;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=238;TCF=110;TCR=128;TR=92;WE=161797521;WS=161797503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,103:0.40:259
chr2	162175290	rs1116165	T	C	4178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=53;PP=2833;SC=TGAATAAACATTTTTGTGCTT;SOR=1.390;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=147;TCF=94;TCR=53;TR=146;WE=162175298;WS=162175280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr2	162175546	rs4027148	CAT	C	547.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=562;ReadPosRankSum=0.685;SC=CACTAGATAACATGTGGAAAA;SOR=0.199;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=14;WE=162175555;WS=162175536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr2	162224193	rs58162668	G	GT	2227.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.875;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.535;NF=23;NR=28;PP=1646;ReadPosRankSum=-0.257;SC=TATAAAAGGAGTTTTTATTTT;SOR=0.932;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=110;TCF=45;TCR=65;TR=51;WE=162224201;WS=162224183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,86:0.57:152
chr2	162224495	rs2303318	A	C	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=4.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=428;ReadPosRankSum=-1.012;SC=AACTCTCATCATATTACATTT;SOR=1.528;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=17;WE=162224503;WS=162224485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
chr2	162241846	rs62188123	T	C	792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=1.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.02;ReadPosRankSum=1.663;SOR=0.454;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,32:0.73:44
chr2	162247772	rs1921674	C	T	739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=17;PP=391;ReadPosRankSum=0.062;SC=GATTTAAATTCGAATTTTTGA;SOR=0.717;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=55;TCF=22;TCR=33;TR=29;WE=162247780;WS=162247762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,34:0.55:62
chr2	162265270	rs16845844	A	G	847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.240;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=5;PP=462;ReadPosRankSum=-1.164;SC=TCTGGTCATCATTATTTTTGG;SOR=1.022;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=60;TCF=48;TCR=12;TR=33;WE=162265278;WS=162265260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,40:0.56:72
chr2	162280748	rs890076	G	A	4084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.02;SOR=1.201;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr2	162730312	rs35292746	T	C	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.738;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=3.090;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=133;ReadPosRankSum=0.481;SC=AGAATCCCTCTGACAATGCCT;SOR=2.093;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=8;WE=162730320;WS=162730302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr2	162757676	rs6754546	A	G	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.046;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=72;ReadPosRankSum=0.009;SC=CTCTGAAGTTACTAATGATTG;SOR=0.446;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=6;WE=162757684;WS=162757666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr2	162873188	rs2970931	T	C	226.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=182;SC=TTATATATAATATGAAATACA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=162873196;WS=162873178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	162877041	rs373538683	CA	C	63.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.08;ReadPosRankSum=0.956;SOR=0.598;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr2	162890175	rs1558957	T	C	1739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=26;NR=41;PP=1117;SC=TAGGAAAAAATAATCACAGAA;SOR=1.376;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=73;TCF=26;TCR=47;TR=67;WE=162890183;WS=162890165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr2	162891848	rs6432708	C	T	4806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=99;PP=2839;SC=AAAAAAGACACAAATTGTTCT;SOR=1.442;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=155;TCF=56;TCR=99;TR=155;WE=162891856;WS=162891838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr2	162930286	rs3216773	CGCCAGGGTCCTAGCAGAA	C	3359.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.801;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.495;NF=31;NR=23;PP=2957;ReadPosRankSum=-0.672;SC=CAAAGCTCGACGCCAGGGTCC;SOR=2.448;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=78;TCF=42;TCR=36;TR=54;WE=162930311;WS=162930276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,117:0.98:119
chr2	163051415	rs1468916	C	T	375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=12;PP=309;SC=AACATCACTTCTAAGTCACAT;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=163051423;WS=163051405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	163078310	rs185392835	T	C	1661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=43;PP=1025;ReadPosRankSum=1.163;SC=CCTACCTAGCTTGAAACCAGT;SOR=0.707;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=174;TCF=72;TCR=102;TR=74;WE=163078318;WS=163078300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,82:0.44:186
chr2	163124026	rs116508532	T	C	2032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=47;PP=1323;ReadPosRankSum=-1.432;SC=ATTTATTTGATAGTCGGCACA;SOR=0.789;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=219;TCF=108;TCR=111;TR=90;WE=163124034;WS=163124016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,101:0.42:243
chr2	163124051	rs1990760	C	T	4847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=94;PP=2940;SC=TTTTGCAGTGCTTTGTTTTCT;SOR=1.153;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=161;TCF=67;TCR=94;TR=161;WE=163124059;WS=163124034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr2	163128824	rs3747517	T	C	5798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=118;NR=88;PP=2965;SC=AACTGTCTCATGTTCGATAAC;SOR=0.900;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=206;TCF=118;TCR=88;TR=206;WE=163128832;WS=163128814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr2	163163191	rs72650665	T	A	940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.646;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=5;PP=684;ReadPosRankSum=1.130;SC=GTAATTACTGTATTAAAGTAC;SOR=1.480;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=73;TCF=60;TCR=13;TR=37;WE=163163199;WS=163163181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,39:0.51:77
chr2	163694878	rs4667768	C	G	838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=6.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.47;ReadPosRankSum=-1.526;SOR=0.181;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,23:0.48:48
chr2	163694886	rs4667769	G	A	856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=2.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.58;ReadPosRankSum=0.108;SOR=0.382;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,24:0.44:55
chr2	164466039	rs3833554	AT	A	1004.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.503;HP=10;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=1.655;NF=17;NR=19;PP=361;ReadPosRankSum=1.165;SC=CATTCATTACATTTTTTTTTT;SOR=1.077;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=84;TCF=30;TCR=54;TR=36;WE=164466048;WS=164466029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,55:0.44:126
chr2	164466638	rs188936612	A	G	3538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.579;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=63;PP=2109;ReadPosRankSum=-0.299;SC=GAAAAGAGGCATGGATAATTT;SOR=0.834;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=232;TCF=135;TCR=97;TR=152;WE=164466646;WS=164466628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,167:0.64:260
chr2	165349459	rs1051160	G	A	1352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=2;PP=1065;SC=TTTTCACATGGTAATGTTTTC;SOR=5.235;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=40;TCF=38;TCR=2;TR=40;WE=165349467;WS=165349449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
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chr2	165358672	rs4667463	A	G	850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=4;PP=544;SC=AGAAAATAACATAAATTATTA;SOR=2.765;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=29;WE=165358680;WS=165358662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr2	165383661	rs34831964	C	T	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.57;ReadPosRankSum=-0.331;SOR=0.954;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,6:0.19:31
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chr2	165424994	rs16849597	T	C	1538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.338;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=38;PP=873;ReadPosRankSum=-0.929;SC=ATGAAACAACTAGGAAAGTAA;SOR=0.814;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=138;TCF=48;TCR=90;TR=57;WE=165425002;WS=165424984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,70:0.45:155
chr2	165476253	rs61748245	A	T	3729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=477;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.768;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=100;NR=78;PP=2209;ReadPosRankSum=0.014;SC=ACAGATGTAAATGGAGAACAG;SOR=0.814;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=442;TCF=240;TCR=202;TR=178;WE=165476261;WS=165476243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:279,198:0.42:477
chr2	165477903	rs62173895	G	C	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.048;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=118;ReadPosRankSum=-1.224;SC=CGAGGTGCCGGCTAGGCAGCC;SOR=0.260;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=9;WE=165477911;WS=165477893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr2	165698715	rs71028447	A	AG	1057.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=19;PP=784;SC=TCCCACCGCTAGGCTGCGCTT;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=20;WE=165698723;WS=165698705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	165809138	rs10544528	ATG	A	968.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.67;QD=33.40;SOR=4.332;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	165987772	rs62174900	T	G	1535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.285;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=28;PP=935;ReadPosRankSum=0.016;SC=ATGATCGCAGTACAGACAATC;SOR=0.862;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=230;TCF=138;TCR=92;TR=76;WE=165987780;WS=165987762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,85:0.34:251
chr2	165988022	rs78280506	C	A	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.82;ReadPosRankSum=0.037;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr2	165996107	rs1946892	T	A	2013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.585;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=52;PP=1232;ReadPosRankSum=-0.128;SC=CTTCCGTTTCTGTGGTGGTGC;SOR=0.845;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=267;TCF=137;TCR=130;TR=98;WE=165996115;WS=165996097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:192,109:0.36:301
chr2	166003479	rs16850131	G	A	2934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=411;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.536;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=74;PP=1863;ReadPosRankSum=-0.730;SC=CTTTCCAACAGCTCTCCTAAC;SOR=0.747;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=368;TCF=180;TCR=188;TR=142;WE=166003487;WS=166003469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:255,156:0.38:411
chr2	166003573	rs58539679	C	T	1000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.594;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=34;PP=687;ReadPosRankSum=-1.822;SC=CTATTTAGAACACAGAGCTTT;SOR=0.856;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=119;TCF=34;TCR=85;TR=46;WE=166003581;WS=166003563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,50:0.39:128
chr2	166012203	rs3731760	C	T	1022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.635;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=11;PP=627;ReadPosRankSum=0.133;SC=GCCACCACACCCAGCCTATGC;SOR=0.354;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=58;TCF=43;TCR=15;TR=39;WE=166012211;WS=166012193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,43:0.68:63
chr2	166018703	rs6756990	T	C	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.560;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.282;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=81;ReadPosRankSum=-0.003;SC=GGAGCAGCACTGCTCTTTATT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=5;WE=166018711;WS=166018693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr2	166018901	rs11887309	C	A	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.801;HP=9;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=21;PP=564;ReadPosRankSum=0.950;SC=CAAAAAAAAACCCATTTTATT;SOR=1.598;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=60;TCF=22;TCR=38;TR=31;WE=166018909;WS=166018881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,28:0.49:57
chr2	166018990	rs11887343	C	A	638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.130;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=540;ReadPosRankSum=0.684;SC=GGTGGCTGTACACCCACAGTC;SOR=1.622;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=40;TCF=29;TCR=11;TR=24;WE=166018998;WS=166018980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,23:0.59:39
chr2	166019384	rs9333576	T	C	4096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.063;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=81;PP=2255;ReadPosRankSum=0.566;SC=GTGCCAGAAATCATGATTTCT;SOR=0.570;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=254;TCF=113;TCR=141;TR=154;WE=166019392;WS=166019374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,184:0.63:290
chr2	166020295	rs2304710	C	T	5789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-3.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=404;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.552;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=99;NR=135;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.222;SC=TACTACCTTACACCAGTTTCT;SOR=0.656;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=356;TCF=147;TCR=209;TR=234;WE=166020303;WS=166020285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,260:0.65:403
chr2	166020893	rs7579000	G	A	3649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.808;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=56;PP=2083;ReadPosRankSum=-1.837;SC=AATTTTCAAAGTTACTCACGC;SOR=0.967;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=255;TCF=152;TCR=103;TR=148;WE=166020901;WS=166020883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,167:0.59:285
chr2	166025174	rs4667795	G	A	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.368;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=225;ReadPosRankSum=-0.380;SC=CATAAGTCAGGCTATACCCAC;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=11;WE=166025182;WS=166025164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr2	166025417	rs4667796	G	A	822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.406;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=20;PP=449;ReadPosRankSum=1.905;SC=AAAGTTTATCGATGCAAAAAC;SOR=1.078;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=51;TCF=19;TCR=32;TR=31;WE=166025425;WS=166025407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,36:0.63:57
chr2	166027176	rs3754961	A	G	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.468;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=310;ReadPosRankSum=0.114;SC=GTTTGTTTAAACCAGTTGATA;SOR=0.283;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=8;WE=166027195;WS=166027166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr2	166027187	rs3754960	T	A	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.268;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=310;ReadPosRankSum=1.092;SC=CCAGTTGATATATCATAACTA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=166027195;WS=166027166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr2	166032775	rs72471101	CATT	C	6115.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.538;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.755;NF=25;NR=69;PP=2971;ReadPosRankSum=1.329;SC=TTCTCATCATCATTATCTTGT;SOR=0.562;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=169;TCF=48;TCR=121;TR=94;WE=166032785;WS=166032765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,160:0.55:291
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chr2	166164215	rs3214603	CA	C	443.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=2;PP=257;SC=ATAGAAATGGCAAAAAAAAGG;SOR=3.500;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=13;WE=166164223;WS=166164205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
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chr2	166170127	rs2121371	T	C	1733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.540;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=25;PP=1182;ReadPosRankSum=-0.552;SC=AACCTAATTATAGCCAGTGTC;SOR=0.926;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=112;TCF=71;TCR=41;TR=74;WE=166170135;WS=166170117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,78:0.63:123
chr2	166172317	rs1838846	A	G	1962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.750;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=54;PP=1315;ReadPosRankSum=0.799;SC=TTTTTTAAAAAAATATGCCAG;SOR=0.846;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=121;TCF=28;TCR=93;TR=70;WE=166172325;WS=166172307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,80:0.58:137
chr2	166179650	rs1867864	C	T	3453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=50;PP=2289;ReadPosRankSum=1.100;SC=TTTGTTTCTTCTCTTGTTATT;SOR=0.704;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=222;TCF=143;TCR=79;TR=142;WE=166179658;WS=166179640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,151:0.64:237
chr2	166221569	rs3835933	TG	T	472.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.154;HP=10;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=893;ReadPosRankSum=-0.500;SC=ATACAGAAGATGGGGGGGGGG;SOR=1.833;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=17;WE=166221590;WS=166221559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,23:0.55:42
chr2	166221582	rs3769951	C	T	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.280;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=686;ReadPosRankSum=0.872;SC=GGGGGGGGCACACCTAATTAA;SOR=0.473;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=56;TCF=45;TCR=11;TR=24;WE=166221590;WS=166221559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,24:0.41:59
chr2	166221883	.	G	GTATC	363.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.233;ClippingRankSum=0.000;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.246;NF=0;NR=9;PP=445;ReadPosRankSum=1.792;SC=CTATCTATCTGTATCTATCTA;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=9;WE=166221891;WS=166221873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr2	166229922	rs6432821	T	C	783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=21;PP=482;SC=CTTTGTACCATGGAAATGTCA;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=29;WE=166229930;WS=166229912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	166245230	rs2060198	T	A	2302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.120;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.424;NF=60;NR=47;PP=1535;ReadPosRankSum=1.089;SC=GAATCCTACGTCTGATCAAAG;SOR=0.843;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=243;TCF=127;TCR=116;TR=107;WE=166245238;WS=166245220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,111:0.44:255
chr2	166514594	rs10803800	A	G	418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=12;PP=307;SC=TGAGTTAACCATTTTCATATT;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=166514602;WS=166514584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	166535918	rs777346	C	T	7398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=130;NR=114;PP=2965;SC=TGCCTTACACCATGACCCCGG;SOR=0.701;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=244;TCF=130;TCR=114;TR=244;WE=166535926;WS=166535908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr2	166605266	.	T	C	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=0.000;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.649;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=11;PP=319;ReadPosRankSum=2.262;SC=AATATTTCCTTTTTCAACTTA;SOR=0.356;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=56;TCF=35;TCR=21;TR=26;WE=166605274;WS=166605256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,28:0.47:59
chr2	166610972	rs67722214	CA	C	229.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=6;NR=0;PP=106;SC=GAGTAAAAACCAAAAAAAAAT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=6;WE=166610980;WS=166610962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	166611006	rs62174818	C	T	972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=5;PP=601;SC=AATTGCCAAACTCAGTCTGAA;SOR=2.368;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=30;WE=166611014;WS=166610996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	166611086	rs41268661	C	T	4580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=98;NR=59;PP=2738;SC=CAACATCTCACTTGTGCTTGT;SOR=1.246;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=157;TCF=98;TCR=59;TR=157;WE=166611094;WS=166611076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr2	166618262	rs1968294	C	T	1338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=13;PP=987;SC=AGAGCTGTTACCTGCTTGGGC;SOR=1.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=35;TCR=13;TR=48;WE=166618270;WS=166618252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr2	166621354	rs2113840	T	C	1313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=10;PP=956;SC=TACCACAATATGGATTTGGGA;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=37;TCR=10;TR=47;WE=166621362;WS=166621344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr2	166740578	rs34701755	C	T	998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.024;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=25;PP=546;ReadPosRankSum=0.618;SC=CATAAATGCCCCAAAAACATA;SOR=0.234;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=80;TCF=23;TCR=57;TR=40;WE=166740586;WS=166740554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,46:0.54:85
chr2	166770120	rs10176588	A	G	1662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.847;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=34;PP=1013;ReadPosRankSum=0.609;SC=CAAGGAGAAGAAAAGACCGAG;SOR=0.550;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=160;TCF=87;TCR=73;TR=71;WE=166770128;WS=166770110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,81:0.45:180
chr2	166771663	rs7590559	C	T	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=100;ReadPosRankSum=1.376;SC=GGAATTAATACTAGTGGCTAA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=7;WE=166771671;WS=166771653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr2	166773971	rs6750044	G	A	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=194;ReadPosRankSum=0.441;SC=TTATCAAATGGTATAAAGGAT;SOR=0.713;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=14;WE=166773979;WS=166773961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr2	166781242	rs58208220	T	TA	717.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.081;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.14;MQRankSum=1.198;NF=0;NR=19;PP=576;ReadPosRankSum=1.334;SC=AATATTTACCTAAAATAAACA;SOR=0.470;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=0;TCR=55;TR=19;WE=166781250;WS=166781232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,30:0.42:71
chr2	166788336	rs7592429	T	C	6997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=112;NR=126;PP=2965;SC=GCATCCAATGTATTTCCCAAG;SOR=0.926;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=238;TCF=112;TCR=126;TR=238;WE=166788344;WS=166788326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr2	166797646	rs1432273	C	T	3411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.056;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=63;PP=1826;ReadPosRankSum=1.262;SC=ATCTGGTTCACAGTCTCCAGG;SOR=0.850;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=273;TCF=146;TCR=127;TR=144;WE=166797654;WS=166797636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,165:0.53:310
chr2	166799596	rs13000534	T	C	598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=1;PP=540;SC=AATGCCAGTCTACCTTACAGC;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=166799604;WS=166799587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	166799893	rs10930190	G	A	2722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=66;PP=1935;SC=TTAGAAATGAGAGAAATAAAT;SOR=2.758;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=17;TCR=66;TR=83;WE=166799901;WS=166799883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr2	166802306	rs5836067	ACTGT	A	329.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.268;NF=0;NR=7;PP=247;ReadPosRankSum=-0.823;SC=CTATAGTGGTACTGTCTAATA;SOR=0.430;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=7;WE=166802317;WS=166802296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr2	166810161	.	G	GCCCGCTCA	2784.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=10;PP=1204;SC=CCGCCCGCCCGCCCGCTCACC;SOR=1.981;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=37;TCF=21;TCR=16;TR=21;WE=166810169;WS=166810151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr2	166810373	rs1347041	A	G	2135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=47;PP=1488;SC=TCGGAGGGAGAGGCGGGCCTG;SOR=1.578;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=25;TCR=47;TR=72;WE=166810381;WS=166810363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr2	166810433	rs5836068	GT	G	731.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=16;PP=716;SC=GGACCCGGAGGTGAGGGCTGC;SOR=2.419;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=166810441;WS=166810423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	166892788	rs2298771	C	T	1579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.109;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=31;PP=863;ReadPosRankSum=-0.339;SC=CCAATTTCTGCTGTATGATTG;SOR=0.614;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=180;TCF=94;TCR=86;TR=69;WE=166892796;WS=166892778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,80:0.40:199
chr2	166893081	rs7601520	G	A	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.594;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=236;ReadPosRankSum=1.845;SC=TTACACCAATGTAGGGAAGAG;SOR=0.404;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=17;WE=166893089;WS=166893071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr2	166894230	rs2020318	T	C	1404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=25;PP=1069;ReadPosRankSum=1.209;SC=GTTACATATGTATACATGTGC;SOR=0.691;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=190;TCF=125;TCR=65;TR=74;WE=166894238;WS=166894220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,72:0.36:199
chr2	166896143	rs2126152	T	G	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.055;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=19;PP=463;ReadPosRankSum=-0.606;SC=TTCCACCAGATAATAACATAC;SOR=0.869;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=52;TCF=19;TCR=33;TR=29;WE=166896151;WS=166896133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,31:0.55:56
chr2	166896178	rs490317	C	T	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=169;ReadPosRankSum=2.126;SC=GCTCTTAGAACATAATGCTTA;SOR=0.507;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=14;WE=166896186;WS=166896168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr2	166897864	rs6432860	A	G	785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.403;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=24;PP=531;ReadPosRankSum=-0.819;SC=GGTCCATCACAACCAGGTTGA;SOR=0.964;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=129;TCF=61;TCR=68;TR=43;WE=166897872;WS=166897854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,43:0.32:135
chr2	166898017	rs10198801	G	T	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.369;NF=2;NR=6;PP=85;ReadPosRankSum=-1.383;SC=CCACCAAAAGGTATACTTTAT;SOR=0.446;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=8;WE=166898025;WS=166898007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr2	166900606	rs6753355	A	C	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.05;ReadPosRankSum=-0.577;SOR=1.034;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,6:0.17:35
chr2	166903188	rs538921	A	C	5576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=118;NR=59;PP=2965;SC=TTCCTCATACAACCACCTGCT;SOR=1.447;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=177;TCF=118;TCR=59;TR=177;WE=166903196;WS=166903178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr2	166903228	rs6432861	C	T	2337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.861;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=49;PP=1359;ReadPosRankSum=1.557;SC=TTCAATATTACGTAACAATCA;SOR=0.755;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=295;TCF=162;TCR=133;TR=112;WE=166903236;WS=166903218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:197,127:0.39:324
chr2	166903445	rs7580482	T	C	2511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.989;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=59;PP=1637;ReadPosRankSum=0.781;SC=AAATGACCAATACAAAAAATA;SOR=0.831;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=259;TCF=124;TCR=135;TR=111;WE=166903453;WS=166903435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,124:0.44:285
chr2	166904346	rs1461193	G	A	1239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.569;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=33;PP=740;ReadPosRankSum=1.096;SC=ACTATGCTATGATATTGCCTA;SOR=0.411;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=110;TCF=37;TCR=73;TR=53;WE=166904354;WS=166904336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,59:0.49:120
chr2	166905375	rs1542484	A	G	946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.103;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=24;PP=578;ReadPosRankSum=-1.693;SC=ATACACAGATACACACAAATT;SOR=0.500;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=148;TCF=83;TCR=65;TR=51;WE=166905383;WS=166905365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,54:0.33:164
chr2	166905480	rs994399	G	A	818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.563;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=21;PP=463;ReadPosRankSum=-0.452;SC=AAAGAAAGTCGTATGATGAAC;SOR=0.514;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=101;TCF=43;TCR=58;TR=39;WE=166905488;WS=166905470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,44:0.38:117
chr2	166905572	rs1542483	T	A	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=162;ReadPosRankSum=1.438;SC=TTAAATATATTATTCATTCAA;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=9;WE=166905580;WS=166905562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr2	166909544	rs3812718	C	T	2483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.032;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=66;PP=1579;ReadPosRankSum=-0.431;SC=CTAATCACTTCTTACCTGGAA;SOR=0.596;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=227;TCF=80;TCR=147;TR=104;WE=166909552;WS=166909534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,115:0.47:247
chr2	166909559	rs3812719	C	A	1933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.594;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=53;PP=1192;ReadPosRankSum=-0.568;SC=CTGGAATTACCGAAATAGTTT;SOR=0.763;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=171;TCF=53;TCR=118;TR=76;WE=166909567;WS=166909549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,86:0.46:188
chr2	166915335	rs10930201	C	A	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=26;ReadPosRankSum=-0.328;SC=TCTAAAGTGCCCCATGAAAAC;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=166915343;WS=166915325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr2	166930214	rs566839	T	A	816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=22;PP=609;SC=TTTTAAAGAGTGGACTAAGAG;SOR=3.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=26;WE=166930222;WS=166930204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	167056220	.	C	T	2773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=0.000;DP=366;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.683;NF=62;NR=76;ReadPosRankSum=-0.342;SC=TGTTAAACAACGCAGGAAGGG;SOR=0.675;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=339;TCF=150;TCR=189;TR=138;WE=167056228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:220,146:0.40:366
chr2	167060449	rs10180721	A	T	1465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=10;PP=967;SC=AAAATCTGAAAAATAAATATT;SOR=2.393;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=39;TCR=10;TR=49;WE=167060457;WS=167060439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr2	167060980	rs77944059	GAAAC	G	322.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=227;SC=CCAAGGTAAAGAAACAAACAA;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=167060991;WS=167060970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
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chr2	167085141	rs58519838	CTT	C	4972.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.09;MQRankSum=0.188;NF=53;NR=21;PP=2950;ReadPosRankSum=0.091;SC=TAAAGAATAACTTATATCCTT;SOR=1.296;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=75;TCF=54;TCR=21;TR=74;WE=167085150;WS=167085131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,113:0.99:114
chr2	167090042	rs722204	G	A	678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=17;PP=497;SC=AGTCAATTCTGAAACTCACTA;SOR=1.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=24;WE=167090050;WS=167090032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	167099158	rs6746030	A	G	8391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=117;NR=171;PP=2965;SC=GAGAACCTCCATACACAACCT;SOR=1.201;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=289;TCF=117;TCR=172;TR=288;WE=167099166;WS=167099148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,311:1.00:311
chr2	167137119	rs6432893	G	A	1253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=32;PP=726;ReadPosRankSum=-1.033;SC=GGAGAAAAAAGCAGAGAACAT;SOR=0.746;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=125;TCF=58;TCR=67;TR=58;WE=167137127;WS=167137109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,64:0.47:135
chr2	167144974	rs6747673	A	T	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.232;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=145;ReadPosRankSum=0.584;SC=CTTTTTTAAGACGGTCTAACA;SOR=0.970;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=51;TCF=38;TCR=13;TR=15;WE=167144982;WS=167144964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,19:0.32:59
chr2	167144995	rs13402180	T	C	796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.925;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=6;PP=435;ReadPosRankSum=-0.925;SC=TCTGTTGAAATTCTAATTCTT;SOR=0.935;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=81;TCF=60;TCR=21;TR=31;WE=167145003;WS=167144985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,38:0.40:94
chr2	167145142	rs13414203	A	G	1212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.653;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=40;PP=756;ReadPosRankSum=-0.255;SC=TTTTGCCAGCAGCACGCAGCG;SOR=0.987;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=234;TCF=110;TCR=124;TR=68;WE=167145150;WS=167145132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:191,76:0.28:267
chr2	167149693	rs7588632	G	A	1027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.682;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=12;PP=712;ReadPosRankSum=-1.735;SC=CATACACCAGGTACATATGCC;SOR=0.938;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=97;TCF=66;TCR=31;TR=45;WE=167149701;WS=167149683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,47:0.44:107
chr2	167162277	rs4429487	G	A	4525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=417;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.746;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=113;NR=81;PP=2598;ReadPosRankSum=1.664;SC=TAAATTTGCCGTTTCAAAAAG;SOR=0.863;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=376;TCF=212;TCR=164;TR=194;WE=167162285;WS=167162267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:198,218:0.52:416
chr2	167163043	rs9646771	T	C	2521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.087;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=44;PP=1258;ReadPosRankSum=-0.251;SC=TCCAGTCCGGTGGGTTATTCA;SOR=0.610;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=184;TCF=109;TCR=75;TR=106;WE=167163051;WS=167163033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,118:0.57:207
chr2	167163199	rs9646772	A	T	718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=21;PP=418;ReadPosRankSum=-1.073;SC=AACTTTTCCTAAGAAAAAAAT;SOR=0.582;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=55;TCF=14;TCR=41;TR=28;WE=167163207;WS=167163189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,33:0.51:65
chr2	167163372	rs4583483	TC	CA	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=260;ReadPosRankSum=0.431;SC=CCAGAGTCTTTCAAGGTGCAA;SOR=1.179;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=5;WE=167163381;WS=167163362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr2	167163663	rs4447616	C	T	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.715;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=262;ReadPosRankSum=-0.599;SC=GTTTACCTTTCTACATGGCAG;SOR=0.197;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=16;WE=167163671;WS=167163653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,17:0.77:22
chr2	167168093	rs6432901	C	T	2153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.783;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=26;PP=1322;ReadPosRankSum=0.019;SC=TGAAGGGCAGCTGTTTGCCAG;SOR=0.803;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=81;TCR=36;TR=86;WE=167168101;WS=167168083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,93:0.74:126
chr2	167268972	rs142496225	C	G	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=239;ReadPosRankSum=1.168;SC=TGAAGCAGGGCATTTATATAT;SOR=0.446;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=13;WE=167268980;WS=167268962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr2	167313337	rs7593207	T	G	93.84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=18.77;ReadPosRankSum=-0.842;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr2	167759948	rs7599152	C	T	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=12;PP=417;ReadPosRankSum=-0.433;SC=GAGTGTATCACTGATAAAAGG;SOR=0.725;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=62;TCR=31;TR=35;WE=167759956;WS=167759938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,38:0.37:104
chr2	167760451	rs5836125	AG	A	672.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.607;NF=0;NR=17;PP=578;ReadPosRankSum=0.149;SC=TTCCTTGCCTAGCCTACCATT;SOR=0.665;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=60;TCF=0;TCR=60;TR=17;WE=167760459;WS=167760441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,24:0.29:84
chr2	168986154	rs925846	A	G	6631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=128;PP=2965;SC=AACATCAAATATGATACACAT;SOR=0.983;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=230;TCF=102;TCR=128;TR=230;WE=168986162;WS=168986144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr2	168996775	rs2278785	T	C	1490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.961;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=12;PP=1061;ReadPosRankSum=0.819;SC=TCAACCCCGATGTAGTATTTC;SOR=1.338;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=85;TCF=67;TCR=18;TR=59;WE=168996783;WS=168996765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,61:0.67:91
chr2	168997097	rs2278784	A	G	1888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.421;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=30;PP=1267;ReadPosRankSum=1.740;SC=AAATGTTAGCATATTAATGAT;SOR=0.868;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=82;TCR=48;TR=81;WE=168997105;WS=168997087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,85:0.62:138
chr2	169487610	rs11347055	GT	G	398.52	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;MQRankSum=0.487;NF=1;NR=18;PP=294;ReadPosRankSum=0.602;SC=CTATATCCTGGTTTTTTTTTT;SOR=1.609;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=19;WE=169487618;WS=169487600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,19:0.90:21
chr2	169487668	rs4667585	A	C	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=134;ReadPosRankSum=0.524;SC=CAGGCTTCCTAAGAATTATTT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=7;WE=169487676;WS=169487658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr2	169674655	rs830026	T	C	601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.98;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	169674663	rs830025	A	T	632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.18;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	169674764	rs830024	C	G	972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.60;SOR=0.798;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr2	169681278	rs11374385	T	TTTTGTTTGTTTG	2541.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=9.183;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.90;MQRankSum=0.382;QD=43.82;ReadPosRankSum=0.658;SOR=4.015;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,57:0.98:58
chr2	169690729	rs522893	T	C	5194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=106;NR=74;PP=2965;SC=GTATGTTTTTTACTCTAGGCC;SOR=1.010;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=181;TCF=106;TCR=75;TR=180;WE=169690737;WS=169690719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr2	169707428	rs540652	C	T	11033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=418;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=186;NR=195;PP=2965;SC=TACCAAGACACATTCCTTCCT;SOR=0.752;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=381;TCF=186;TCR=195;TR=381;WE=169707436;WS=169707418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,418:1.00:418
chr2	169707552	rs488621	A	G	6531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=111;NR=111;PP=2965;SC=TCCATTTTGCATAACAACTGG;SOR=0.769;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=222;TCF=111;TCR=111;TR=222;WE=169707560;WS=169707542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr2	169712115	.	C	CA	92	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.9986;HP=15;HapScore=2;MGOF=32;MMLQ=16;MQ=59.68;NF=2;NR=7;PP=92;QD=10.7777777778;SC=GTTGTGTGAACAAAAAAAAAA;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=9;WE=169712123;WS=169712105;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:13,9:0.41:22
chr2	169713084	rs11385898	T	TA	2266.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.9997;FS=1.024;HP=11;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.619;NF=27;NR=32;PP=795;ReadPosRankSum=-0.608;SC=GACTCCGTCTTAAAAAAAAAA;SOR=0.492;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=46;TCR=56;TR=59;WE=169713103;WS=169713074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,103:0.86:120
chr2	169717541	rs2632372	T	C	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.821;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=20;PP=289;ReadPosRankSum=-0.770;SC=ATATTTCCATTGGGACCGATT;SOR=0.578;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=96;TCF=32;TCR=64;TR=32;WE=169717549;WS=169717531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,35:0.34:104
chr2	169721377	rs479661	G	A	6563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=136;NR=87;PP=2965;SC=AAAAAAGAAGGAGGATGGTGG;SOR=1.113;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=223;TCF=136;TCR=87;TR=223;WE=169721385;WS=169721367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr2	169727879	rs61598834	G	GA	918.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=0;PP=483;SC=ATAAAAACAAGAAAAAAAGAG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=16;WE=169727887;WS=169727869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	169728069	.	GAAA	G	3666.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.542;ClippingRankSum=0.000;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.20;MQRankSum=0.216;QD=40.29;ReadPosRankSum=1.574;SOR=0.822;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,90:0.99:91
chr2	169763148	rs560887	T	C	4610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=358;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=100;NR=98;PP=2284;ReadPosRankSum=0.150;SC=TTGCTTTTTATGCTTGTATCT;SOR=0.699;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=319;TCF=161;TCR=158;TR=198;WE=169763156;WS=169763138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,219:0.61:357
chr2	169764141	rs2232323	A	C	1925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.700;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=45;PP=1296;ReadPosRankSum=0.380;SC=CTGGGCACATACCTGAAGACC;SOR=0.550;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=263;TCF=144;TCR=119;TR=91;WE=169764149;WS=169764131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,101:0.36:283
chr2	169764176	rs492594	G	C	4281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.473;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=100;NR=88;PP=2689;ReadPosRankSum=0.579;SC=CCTGTTTGCAGTTGGCTTTTA;SOR=0.681;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=302;TCF=154;TCR=148;TR=188;WE=169764184;WS=169764166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,200:0.62:321
chr2	169764546	rs2232328	C	G	5348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=451;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.746;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=100;NR=133;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.153;SC=ATTCCCTACTCTGTTCATATG;SOR=0.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=419;TCF=187;TCR=232;TR=233;WE=169764554;WS=169764536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:199,251:0.56:450
chr2	169780366	rs579275	T	C	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=222;ReadPosRankSum=-0.407;SC=GATGCAAAGATGCATGATTGC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=14;WE=169780374;WS=169780356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr2	169789016	rs497692	T	C	2411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.570;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=64;PP=1301;ReadPosRankSum=-0.461;SC=CAAGAGCTGTTGCACTCAGTA;SOR=0.626;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=162;TCF=62;TCR=100;TR=102;WE=169789024;WS=169789006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,115:0.61:188
chr2	169801488	rs853789	A	G	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.947;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=13;PP=281;ReadPosRankSum=-1.025;SC=AAGATAGTAAACAAGAAAGTA;SOR=0.091;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=32;TCF=11;TCR=21;TR=23;WE=169801496;WS=169801478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,26:0.72:36
chr2	169814347	rs853773	A	G	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=232;ReadPosRankSum=0.477;SC=GAAATTTTTCATTCTTTAGAG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=14;WE=169814355;WS=169814337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr2	169814655	rs853772	G	T	686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.003;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=18;PP=440;ReadPosRankSum=1.966;SC=CAGAGAGAGGGTTATATTAAT;SOR=0.481;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=58;TCF=23;TCR=35;TR=31;WE=169814663;WS=169814645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,33:0.52:63
chr2	169820618	rs4148796	AT	GC	718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.445;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=6;PP=481;ReadPosRankSum=0.627;SC=ACTGCTAGATATATACCTAGA;SOR=0.412;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=15;WE=169820627;WS=169820608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr2	169824739	rs4148789	T	TA	139.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=0;PP=234;ReadPosRankSum=-0.227;SC=GATGAGAAGCTAACCAAAAAC;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=3;WE=169824757;WS=169824729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr2	169824743	rs2389613	C	A	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.11;ReadPosRankSum=-0.057;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr2	169824749	rs28405534	C	A	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.87;ReadPosRankSum=-0.403;SOR=2.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr2	169826877	rs2193831	C	T	3229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.436;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=84;PP=2006;ReadPosRankSum=-0.063;SC=CTTCCCCAGACGGGTTATTGT;SOR=0.921;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=249;TCF=108;TCR=141;TR=140;WE=169826885;WS=169826867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,151:0.57:267
chr2	169828325	rs2241340	A	G	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=302;ReadPosRankSum=0.458;SC=ATGACCTCTTAGTTTCTCCCA;SOR=0.582;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=14;WE=169828333;WS=169828315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr2	169830051	rs2389605	C	T	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.973;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=291;ReadPosRankSum=0.630;SC=TGGTTATTCACTGAACACTGT;SOR=3.086;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=14;WE=169830059;WS=169830048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr2	169830155	rs2287623	G	A	2376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.659;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=31;PP=1492;ReadPosRankSum=0.672;SC=ACACCTTTCTGTTTGATCAAT;SOR=0.920;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=169;TCF=109;TCR=60;TR=98;WE=169830163;WS=169830145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,108:0.58:186
chr2	169830328	rs2287622	A	G	2278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=52;PP=1462;ReadPosRankSum=1.651;SC=TGGTTTAATGACCATGTTGAG;SOR=0.650;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=151;TCF=66;TCR=85;TR=92;WE=169830336;WS=169830318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,102:0.59:172
chr2	169842809	rs2287618	T	C	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.859;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=240;ReadPosRankSum=-1.095;SC=GAAGACAAAATGCTTGAGTCA;SOR=2.531;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=13;WE=169842817;WS=169842799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,17:0.77:22
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chr2	169985418	rs41268683	T	C	1807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.095;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;ReadPosRankSum=-0.752;SC=AAGAAGACTATTTGTGGCCAC;SOR=0.589;Source=Platypus;TCF=85;WE=169985426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,87:0.40:216
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chr2	170002500	rs41265945	C	T	1890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.780;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=51;PP=1254;ReadPosRankSum=-1.001;SC=TACACCCTACCGCCACTTCTA;SOR=1.126;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=153;TCF=57;TCR=96;TR=76;WE=170002508;WS=170002490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,84:0.49:170
chr2	170003432	rs4667591	T	G	7306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=115;NR=125;PP=2965;SC=GCAGACTCGATTTTAGGTTCC;SOR=0.879;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=240;TCF=115;TCR=125;TR=240;WE=170003440;WS=170003422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr2	170010985	rs2075252	T	C	2754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=44;PP=1502;ReadPosRankSum=-1.489;SC=CCTATGTCCTTGGGATCCCAA;SOR=0.701;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=215;TCF=132;TCR=83;TR=117;WE=170010998;WS=170010975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,127:0.54:234
chr2	170025083	rs2229268	A	G	3926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=72;PP=2249;ReadPosRankSum=1.045;SC=AACCATCGCCACAGTCATCAT;SOR=0.715;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=300;TCF=169;TCR=131;TR=167;WE=170025091;WS=170025073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,189:0.56:335
chr2	170028426	rs141500552	C	T	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.527;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=90;ReadPosRankSum=-0.618;SC=TATCATCCTACCCATTGAGGA;SOR=0.197;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=8;WE=170028434;WS=170028416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr2	170029800	rs17848190	T	C	2109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.075;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=48;PP=1241;ReadPosRankSum=1.414;SC=CATTGTCACATTGAGGTTGTG;SOR=0.886;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=138;TCF=60;TCR=78;TR=82;WE=170029808;WS=170029790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,96:0.62:156
chr2	170030821	rs2075250	T	C	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=58;ReadPosRankSum=1.180;SC=TACTACTACATGGAGCACTTC;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=170030829;WS=170030811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr2	170063783	rs13417389	T	C	888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.090;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=26;PP=506;ReadPosRankSum=-1.637;SC=TGAAAGTGCATGCTGATCAAT;SOR=0.465;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=63;TCF=16;TCR=47;TR=37;WE=170063791;WS=170063773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,41:0.61:67
chr2	170077165	rs3815572	C	T	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;BaseQRankSum=-3.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=192;ReadPosRankSum=0.182;SC=AAACAAATTCCAAAGCACGAT;SOR=0.387;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=11;WE=170077173;WS=170077155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr2	170082013	rs2075246	A	G	2080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=50;PP=1299;ReadPosRankSum=-0.069;SC=CATGGCTCCTACAAAAGAACC;SOR=0.653;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=49;TCR=79;TR=81;WE=170082021;WS=170082003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,88:0.62:142
chr2	170088477	rs2302693	T	C	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.831;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=305;ReadPosRankSum=1.326;SC=CGTTGTTACCTCTGTTGTTTT;SOR=1.863;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=14;WE=170088485;WS=170088467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr2	170088506	rs2302692	T	C	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=70;ReadPosRankSum=0.210;SC=TTGTTTTCACTGAACTACTCA;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=6;WE=170088514;WS=170088496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr2	170089824	rs2239596	T	C	973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=10;PP=636;ReadPosRankSum=0.065;SC=AAATGTATTGTCCAAACAAAT;SOR=0.735;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=73;TCF=54;TCR=19;TR=40;WE=170089832;WS=170089814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,43:0.55:78
chr2	170089851	rs2239595	G	A	1546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.421;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=24;PP=817;ReadPosRankSum=-0.149;SC=GTAACAGTGTGCATTTAGCAT;SOR=0.535;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=123;TCF=81;TCR=42;TR=67;WE=170089870;WS=170089841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,75:0.55:136
chr2	170092395	rs2229267	A	G	4096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.804;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=86;PP=2438;ReadPosRankSum=0.364;SC=CATTATAATCACAAAAGTCCA;SOR=0.629;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=319;TCF=163;TCR=156;TR=178;WE=170092403;WS=170092385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,196:0.55:355
chr2	170096018	rs830973	G	A	1792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=22;PP=1188;ReadPosRankSum=1.129;SC=AAACTGGCTCGGGTTAGTTCA;SOR=0.657;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=127;TCF=89;TCR=38;TR=75;WE=170096026;WS=170096008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,80:0.58:138
chr2	170099446	rs831041	T	G	5000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=381;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.706;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=113;NR=87;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.069;SC=TCTGAAACATTCTGGGTATGT;SOR=0.602;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=337;TCF=189;TCR=148;TR=200;WE=170099454;WS=170099436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,221:0.58:379
chr2	170099473	rs831042	T	C	5571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=443;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.118;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=119;NR=111;PP=2880;ReadPosRankSum=0.241;SC=TACGACAGCCTGCTTCATCCG;SOR=0.604;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=389;TCF=201;TCR=188;TR=230;WE=170099481;WS=170099463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:177,261:0.60:438
chr2	170099895	rs2075255	A	C	4467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FS=4.201;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.09;ReadPosRankSum=-0.172;SOR=0.954;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:114,182:0.61:296
chr2	170099899	rs2075254	G	A	4511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FS=1.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.10;ReadPosRankSum=-0.228;SOR=0.817;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:124,196:0.61:320
chr2	170103336	rs831043	T	C	4493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=365;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.376;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=100;PP=2477;ReadPosRankSum=-0.971;SC=CACACTGCTCTGTGGGTGGTT;SOR=0.847;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=333;TCF=167;TCR=166;TR=189;WE=170103344;WS=170103326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,211:0.58:365
chr2	170103351	rs2075249	G	T	3976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.830;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=83;PP=2355;ReadPosRankSum=0.432;SC=GTGGTTCATTGGTTGGGTCCC;SOR=0.746;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=299;TCF=147;TCR=152;TR=160;WE=170103359;WS=170103341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,182:0.55:332
chr2	170115588	rs2241190	T	C	6341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=522;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.105;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=142;NR=135;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.079;SC=ACTGAACTACTGTGCGTCTCG;SOR=0.606;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=476;TCF=253;TCR=223;TR=277;WE=170115596;WS=170115578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:220,302:0.58:522
chr2	170127380	rs145964808	TAC	T	39.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.17;ReadPosRankSum=1.055;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,5:0.15:34
chr2	170129528	rs830994	G	A	8262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=141;NR=132;PP=2965;SC=TGTGGCTGAGGACACAGACCT;SOR=0.713;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=273;TCF=141;TCR=132;TR=273;WE=170129536;WS=170129518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,303:1.00:303
chr2	170129636	rs830995	A	G	4770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=92;PP=2742;SC=TATCCAAGACATGAAGCCACT;SOR=1.153;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=158;TCF=66;TCR=92;TR=158;WE=170129644;WS=170129626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr2	170134191	rs831003	G	C	1111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=0;PP=899;SC=ATATTTCTCTGCAGCCATTTT;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=31;WE=170134199;WS=170134181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr2	170139346	rs831010	C	T	6624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=134;NR=87;PP=2965;SC=AGAATCTGTTCACTGTTCAGA;SOR=1.052;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=221;TCF=134;TCR=87;TR=221;WE=170139354;WS=170139336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr2	170139639	rs831011	A	G	889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=22;PP=597;SC=ACCCTCTGGAATTAGGCACAG;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=170139647;WS=170139629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	170147266	rs61219833	T	C	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=32;ReadPosRankSum=-0.107;SC=GTTATGCAAATGCCAACAGAT;SOR=0.127;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=5;WE=170147274;WS=170147261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,6:0.25:24
chr2	170147502	rs34693334	C	G	1187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.561;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=30;PP=572;ReadPosRankSum=0.843;SC=TCATGAGGACCGCTTTCTGTG;SOR=0.640;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=184;TCF=73;TCR=111;TR=53;WE=170147510;WS=170147492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,66:0.33:202
chr2	170148745	rs62171262	A	G	2439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.925;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=41;PP=1476;ReadPosRankSum=-1.802;SC=TTCAGTAGGAATCTCTTCCCC;SOR=0.634;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=264;TCF=166;TCR=98;TR=111;WE=170148753;WS=170148735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,123:0.43:287
chr2	170150671	rs2229266	G	A	4033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=663;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.550;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=106;PP=2384;ReadPosRankSum=1.340;SC=AAGCATGTTCGTCACTGCCGT;SOR=0.614;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=599;TCF=307;TCR=292;TR=209;WE=170150679;WS=170150661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:432,230:0.35:662
chr2	170163768	rs2247506	T	C	8544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=158;NR=125;PP=2965;SC=CCAAATACAGTGCAAGGACTA;SOR=0.869;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=284;TCF=159;TCR=125;TR=283;WE=170163776;WS=170163758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,318:1.00:318
chr2	170175334	rs2229263	T	C	7406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=151;NR=98;PP=2965;SC=CACCCAGGAGTTGGGGATGCA;SOR=1.060;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=251;TCF=152;TCR=99;TR=249;WE=170175342;WS=170175324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,271:1.00:271
chr2	170218816	rs1559013	T	C	2228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=21;PP=1246;SC=CGAGAGGCTCTGGCTGGGCTC;SOR=1.358;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=46;TCR=21;TR=67;WE=170218824;WS=170218806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr2	170218847	rs1559014	C	G	3268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=37;PP=1965;SC=CACTGGCCGGCGCTAGGCAGG;SOR=1.217;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=68;TCR=37;TR=105;WE=170218855;WS=170218837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr2	170336024	rs1879466	G	C	8242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=160;NR=116;PP=2965;SC=AGCTAGGCCTGCACGGCTGTG;SOR=0.992;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=276;TCF=160;TCR=116;TR=276;WE=170336032;WS=170336014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,302:1.00:302
chr2	170339003	rs2353187	C	A	881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=23;PP=636;SC=AAACAGAAGACAGGATAGGTA;SOR=2.376;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=30;WE=170339011;WS=170338993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	170350279	rs137853921	A	G	3126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=52;PP=1649;ReadPosRankSum=0.555;SC=TTTATTACCAATGTGAGAATT;SOR=0.707;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=191;TCF=103;TCR=88;TR=113;WE=170350287;WS=170350269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,139:0.61:227
chr2	170355944	rs12692909	A	T	756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=24;NR=5;PP=588;SC=TATACTATAAATACTGTTCTT;SOR=3.180;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=29;WE=170355952;WS=170355934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	170393925	rs2683423	G	A	497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=4;NR=22;PP=463;SC=CGGAGTTTTCGCTCTTGTTGC;SOR=2.200;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=26;WE=170393933;WS=170393915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	170394487	rs2290005	T	A	4052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=49;PP=2393;SC=TACTTTAGAATCAAACTTTGC;SOR=1.202;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=135;TCF=86;TCR=49;TR=134;WE=170394495;WS=170394477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr2	170403030	rs2253680	T	C	4276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=78;PP=2559;SC=TCCAAATACATGTGATCATGC;SOR=0.881;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=149;TCF=71;TCR=78;TR=149;WE=170403038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr2	170411485	rs2592823	C	A	535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=15;NR=0;PP=378;SC=GGCAGAATGGCCACGGAGGGA;SOR=4.294;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=170411493;WS=170411475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	170411693	rs2683455	T	C	3407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=55;PP=2205;SC=GCAGAAAAGTTAATTCTTGAG;SOR=0.955;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=49;TCR=55;TR=104;WE=170411701;WS=170411683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr2	170413601	rs2592824	A	T	2742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=19;PP=1763;SC=CTTCAAAACAACTGGTAGATT;SOR=2.376;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=68;TCR=19;TR=87;WE=170413609;WS=170413591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr2	170413815	.	CA	C	171.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.771;ClippingRankSum=0.000;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.08;MQRankSum=1.950;QD=1.83;ReadPosRankSum=-1.548;SOR=0.826;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,20:0.21:94
chr2	170413897	rs56157235	G	GA	196.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=13;PP=258;SC=TAACAAATAGGAAAAAAAATA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=13;WE=170413905;WS=170413887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	170425523	rs2683446	A	C	181.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.97;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	170463551	rs2592813	T	G	997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=12;PP=631;SC=AAGAAGTATTTTGTTTAGGTA;SOR=1.209;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=22;TCR=12;TR=34;WE=170463559;WS=170463541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr2	170605981	rs4667607	C	T	4877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=104;NR=56;PP=2621;SC=ATCTAGTCGGCGGACAAACTA;SOR=1.210;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=160;TCF=104;TCR=56;TR=160;WE=170605989;WS=170605971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr2	170606476	.	CAT	C	353	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=113;MMLQ=26;MQ=56.39;NF=2;NR=14;PP=353;QD=23.75;SC=TATATGTATACATATATATGT;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=170606485;WS=170606466;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:0,16:1.00:16
chr2	170606496	.	C	CGCAT	340	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=110;MMLQ=26;MQ=55.15;NF=2;NR=7;PP=340;QD=41.1111111111;SC=TGTATATATACGTATGTATAC;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=170606504;WS=170606486;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:0,9:1.00:9
chr2	170606570	.	G	A	130	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=151;MMLQ=25;MQ=48.71;NF=5;NR=0;PP=130;QD=32.9542425094;SC=ATGTATACATGTATGTGTATA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=5;WE=170606578;WS=170606560;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,5:0.71:7
chr2	170606588	.	A	G	169	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.9785;HP=2;HapScore=2;MGOF=126;MMLQ=24;MQ=55.08;NF=8;NR=0;PP=169;QD=25.4714015684;SC=ATATATACGTATGTATGTATA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=8;WE=170606596;WS=170606578;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr2	170606609	.	TATAC	T	478	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=40;MMLQ=24;MQ=58.95;NF=9;NR=0;PP=478;QD=57.0;SC=CATATATGTGTATACATATAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=9;WE=170606629;WS=170606599;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,9:0.82:11
chr2	170606621	rs10200721	T	C	96.85	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=2;PP=270;SC=TACATATATATGTGTGTATAT;SOR=1.329;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=170606629;WS=170606599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	170606658	rs1469355	G	A	436.41	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.18;ReadPosRankSum=-0.994;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,22:0.92:24
chr2	170606724	rs10164599	A	G	2110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=36;NR=36;PP=1171;SC=AAGGTAATATAGAATATTTGA;SOR=0.920;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=36;TCR=36;TR=72;WE=170606732;WS=170606714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr2	170632807	rs10930375	C	T	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=47;ReadPosRankSum=-0.096;SC=ATCTTTAGGGCGAAGCACATG;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=4;WE=170632815;WS=170632797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr2	170632896	rs10930376	T	C	1344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=16;PP=741;ReadPosRankSum=-0.859;SC=TTCTACACCATGTGGTGATAA;SOR=0.780;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=100;TCF=70;TCR=30;TR=54;WE=170632904;WS=170632886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,61:0.63:97
chr2	170632960	rs150673586	C	CA	964.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FS=12.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.56;ReadPosRankSum=-1.583;SOR=1.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,53:0.36:147
chr2	170632969	rs55969365	C	A	1233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=12.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.34;ReadPosRankSum=-0.159;SOR=1.186;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:105,63:0.38:168
chr2	170633023	rs11422611	T	TA	3423.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.512;HP=5;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=68;PP=2850;ReadPosRankSum=0.046;SC=CCACAGAAAATAGGAACCTGC;SOR=0.737;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=131;TCF=36;TCR=95;TR=99;WE=170633031;WS=170633013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,109:0.54:203
chr2	170633067	rs6745191	G	T	2826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.343;HP=1;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=62;PP=1628;ReadPosRankSum=1.610;SC=TTCAAGGCCTGGAACCTGGAT;SOR=0.548;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=199;TCF=88;TCR=111;TR=114;WE=170633075;WS=170633057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,128:0.58:221
chr2	170633103	rs11325477	GA	G	6266.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=93;PP=2970;SC=GTCTAAGAATGAATCACCTTA;SOR=1.343;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=6;TCR=94;TR=99;WE=170633111;WS=170633093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr2	170668106	rs2246149	G	A	1989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=18;PP=1413;SC=ATCATTATTAGTAATTGTGCT;SOR=1.897;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=49;TCR=18;TR=67;WE=170668114;WS=170668096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr2	170668813	rs3731674	C	T	957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=1;PP=732;SC=TTCAGTGGGGCAATCTCAGCT;SOR=5.549;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=31;WE=170668821;WS=170668803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr2	170676227	rs1541776	T	C	1047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=24;PP=688;SC=GATTTAGAAATATTTTCTTCC;SOR=1.670;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=12;TCR=24;TR=36;WE=170676235;WS=170676217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr2	170677855	rs34089373	G	GT	494.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.36;QD=26.04;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	170680879	rs3769767	G	A	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.276;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=182;ReadPosRankSum=-0.340;SC=TAACGCGACAGGTGATCTTAG;SOR=0.420;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=17;WE=170680887;WS=170680869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,19:0.44:43
chr2	170684224	rs2303555	C	T	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=169;ReadPosRankSum=0.534;SC=CCGCGGCTGCCGGCGGCGAGG;SOR=0.773;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=11;WE=170684232;WS=170684214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr2	170762487	rs10171268	C	T	3739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=37;PP=2328;SC=TGATATTTAACATGAATGTGT;SOR=1.811;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=88;TCR=37;TR=125;WE=170762495;WS=170762477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr2	170782037	rs1461958	C	T	551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=0;PP=464;SC=ATACTATGATCACATCATTAA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=170782045;WS=170782027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	170782338	rs13016918	C	T	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.859;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=406;ReadPosRankSum=1.651;SC=GAGGTGACTGCGTGATGACAT;SOR=1.981;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=38;TCF=7;TCR=31;TR=21;WE=170782346;WS=170782328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,22:0.54:41
chr2	170783769	rs72891954	G	C	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.523;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=367;ReadPosRankSum=-0.329;SC=AGTGTGGTAAGTTTTTTTCTT;SOR=1.108;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=72;TCF=57;TCR=15;TR=25;WE=170783777;WS=170783759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,26:0.33:79
chr2	170784049	rs898851	G	A	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=127;ReadPosRankSum=0.812;SC=AAGAACACCAGTTGTGTGCTC;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=7;WE=170784057;WS=170784039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr2	170804033	.	AT	A	111.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=0.000;DP=181;ExcessHet=3.0103;FS=2.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.66;ReadPosRankSum=-0.188;SOR=0.453;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:144,26:0.15:170
chr2	170850738	rs1461959	T	C	1049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=1;PP=808;SC=TGAAATAATTTGAGTTGCTTG;SOR=4.680;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=30;WE=170850746;WS=170850728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr2	170870595	rs10497357	T	C	924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=21;PP=526;ReadPosRankSum=0.985;SC=AGCTGGAACGTTATCGGTGTT;SOR=0.859;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=48;TCF=15;TCR=33;TR=30;WE=170870603;WS=170870585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,38:0.60:63
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chr2	170873361	rs10497356	T	C	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.21;ReadPosRankSum=1.168;SOR=0.709;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,31:0.42:74
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chr2	170917983	rs79097626	CTT	C,CT	2075.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=6.439;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.84;MQRankSum=-0.406;QD=22.56;ReadPosRankSum=0.881;SOR=2.038;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:8,45,39:0.49,0.42:92
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chr2	171071369	rs4667626	C	T	4724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=98;PP=2965;SC=GTTTTCTTGACGTGTGCAGTT;SOR=1.409;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=157;TCF=59;TCR=98;TR=157;WE=171071377;WS=171071359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr2	171074008	rs6713360	G	C	3486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=44;NR=63;PP=2115;SC=TTAGGGAGAAGAAAGTCCATT;SOR=1.323;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=44;TCR=63;TR=107;WE=171074016;WS=171073998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr2	171092445	rs1035625	A	G	255.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=209;SC=GGGCCTTTTTAGGACATCTGA;SOR=4.407;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=171092453;WS=171092435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	171225841	rs4668246	A	G	4658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=365;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.819;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=107;NR=95;PP=2908;ReadPosRankSum=1.422;SC=ACAGCTGGCCAAGGTTCTCCA;SOR=0.677;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=342;TCF=176;TCR=166;TR=202;WE=171225849;WS=171225831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,215:0.59:364
chr2	171242761	rs17497636	G	A	3513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.022;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=76;PP=2147;ReadPosRankSum=-0.421;SC=TGATTGTTCAGCATTTGACTT;SOR=0.582;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=253;TCF=126;TCR=127;TR=151;WE=171242769;WS=171242751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,161:0.58:277
chr2	171256597	rs7561268	A	C	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=291;ReadPosRankSum=0.661;SC=AAGAGGGAGAATGGACTTTGG;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=15;WE=171256605;WS=171256591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr2	171260708	rs10930425	C	A	2341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=27;PP=1488;SC=TCCTGGTGGTCCCAAGGCTAG;SOR=1.450;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=53;TCR=27;TR=80;WE=171260716;WS=171260698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr2	171260787	rs6736609	G	A	6464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=127;NR=99;PP=2965;SC=CATTGATGCTGTACCCGTGGA;SOR=0.869;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=226;TCF=127;TCR=99;TR=226;WE=171260795;WS=171260777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr2	171260820	rs6751520	T	C	7216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=126;NR=120;PP=2965;SC=CCGCCCGCTCTTGGACATGTT;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=246;TCF=126;TCR=120;TR=246;WE=171260828;WS=171260810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr2	171261021	rs6751781	T	G	936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=23;PP=637;SC=TATATGGTGGTTTGTAAGAAT;SOR=3.477;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=27;WE=171261029;WS=171261011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	171264091	rs138990294	T	TGCTCTGGATATGAAA	1950.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5276;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.354;NF=16;NR=3;PP=2970;ReadPosRankSum=1.534;SC=CTTTATCTGGTGCTCTGGATA;SOR=2.712;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=19;WE=171264099;WS=171264081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,32:0.97:33
chr2	171300575	rs17426211	C	A	1737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.066;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.193;NF=39;NR=42;PP=947;ReadPosRankSum=-1.380;SC=CAGATTTGCACCAAATATAGT;SOR=0.791;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=194;TCF=94;TCR=100;TR=81;WE=171300583;WS=171300565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,90:0.42:216
chr2	171300648	rs4667639	T	A	858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=25;PP=542;ReadPosRankSum=-0.953;SC=AGTTCCCTTCTAGCAGCCCTC;SOR=0.749;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=98;TCF=40;TCR=58;TR=41;WE=171300656;WS=171300638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,44:0.40:110
chr2	171319997	rs12477518	A	C	3562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.422;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=65;PP=1838;ReadPosRankSum=2.508;SC=GCTTCCAAAAAGGACTGTCTA;SOR=0.795;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=261;TCF=146;TCR=115;TR=152;WE=171320005;WS=171319987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,170:0.59:290
chr2	171323280	rs67549561	CTGTGTCCTAAGAT	C	1875.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.330;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.144;NF=4;NR=23;PP=2964;ReadPosRankSum=-0.072;SC=CTGGCCATCCCTGTGTCCTAA;SOR=0.395;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=53;TCF=5;TCR=48;TR=27;WE=171323300;WS=171323270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,48:0.62:78
chr2	171323328	rs4359605	T	C	1106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=210;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=29;PP=572;SC=AAACATGTAATTGGCTAGTTG;SOR=2.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=8;TCR=29;TR=37;WE=171323336;WS=171323318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr2	171355198	rs6761297	A	G	9151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=148;NR=146;PP=2965;SC=ATCACTGGGTACTGGGAAAAA;SOR=0.743;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=294;TCF=148;TCR=146;TR=294;WE=171355206;WS=171355188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,326:1.00:326
chr2	171355329	rs6733198	G	C	3100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=62;PP=2087;SC=AGACTCCAACGTAACAATGGT;SOR=1.725;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=33;TCR=62;TR=95;WE=171355337;WS=171355319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr2	171356274	rs10185178	G	A	4835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=87;PP=2965;SC=AGATACAAAAGGGTCAGAGAG;SOR=0.969;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=160;TCF=73;TCR=87;TR=160;WE=171356282;WS=171356264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr2	171356423	rs9752383	T	C	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.95;ReadPosRankSum=-2.135;SOR=0.671;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr2	171358211	rs7593940	G	A	5297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=110;NR=63;PP=2965;SC=CGGGCAATAGGCTGGAGGGGA;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=173;TCF=110;TCR=63;TR=173;WE=171358219;WS=171358201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
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chr2	171508262	rs6724627	G	A	3081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.018;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=70;PP=1626;ReadPosRankSum=0.279;SC=CAAAGTGGCCGTAAAGCTGTT;SOR=0.777;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=204;TCF=82;TCR=122;TR=117;WE=171508270;WS=171508252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,141:0.58:243
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chr2	171572940	rs3749036	G	A	2459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.923;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=45;PP=1268;ReadPosRankSum=-0.005;SC=CCCGTGGACCGCCGACATGCC;SOR=0.779;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=247;TCF=146;TCR=101;TR=114;WE=171572948;WS=171572930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,128:0.46:276
chr2	171573185	rs1134626	G	T	2122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=59;PP=1317;ReadPosRankSum=0.627;SC=CCGCGCTGCCGCCAGGCTACT;SOR=0.713;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=183;TCF=69;TCR=114;TR=93;WE=171573193;WS=171573175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,100:0.52:191
chr2	171627676	rs1861462	T	G	7693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.31;SOR=0.733;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,304:1.00:304
chr2	171632225	rs17694506	C	T	441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=5;PP=259;SC=AGACTTTAGTCCTCTGTGAGC;SOR=1.244;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=15;WE=171632233;WS=171632215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	171632385	rs10626619	C	CTT	3022.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=20;PP=1619;SC=AAAATAAAAACAATACGAAAT;SOR=0.917;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=35;TCF=12;TCR=23;TR=32;WE=171632393;WS=171632375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr2	171632401	rs13028382	C	T	838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=11;PP=430;ReadPosRankSum=-0.366;SC=GAAATAATGACGCTTTGCTTT;SOR=0.713;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=73;TCF=46;TCR=27;TR=32;WE=171632409;WS=171632391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,42:0.43:98
chr2	171633554	rs17694562	A	G	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.390;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=253;ReadPosRankSum=-0.070;SC=AACAAAATACATACTTAATAC;SOR=0.255;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=19;WE=171633562;WS=171633544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr2	171634104	rs55923006	C	T	1024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-3.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.996;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=15;PP=668;ReadPosRankSum=-1.135;SC=AAGTGTATGTCAGGGACATCA;SOR=0.527;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=56;TCF=33;TCR=23;TR=34;WE=171634112;WS=171634094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,40:0.62:64
chr2	171634347	rs11334749	TA	T	7736.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=122;PP=2972;SC=CAATTGTTACTATAGATAGAA;SOR=1.760;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=124;TCF=0;TCR=124;TR=122;WE=171634355;WS=171634337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr2	171634395	rs1065651	C	T	986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-6.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.758;HP=1;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=31;PP=657;ReadPosRankSum=-0.370;SC=GATAAAAATGCAGAAGTATAG;SOR=0.100;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=62;TCF=8;TCR=54;TR=38;WE=171634403;WS=171634385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,41:0.60:68
chr2	171636496	rs55693618	C	T	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.732;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=145;ReadPosRankSum=0.185;SC=AGAATTATTTCAGTAGAAGTT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=8;WE=171636504;WS=171636486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr2	171649402	rs3764916	C	T	841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.42;ReadPosRankSum=-0.812;SOR=0.632;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,45:0.45:100
chr2	171654663	rs2287111	A	C	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.774;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=249;ReadPosRankSum=1.599;SC=TCATAGAACTATAAGCAGTCA;SOR=0.098;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=14;WE=171654671;WS=171654653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,14:0.34:41
chr2	171678379	rs2241165	C	T	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=430;ReadPosRankSum=0.674;SC=GACACCGTTCCATATTTGAAG;SOR=0.693;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=21;WE=171678387;WS=171678369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,26:0.68:38
chr2	171693455	rs769390	A	C	1233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.994;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=34;PP=920;ReadPosRankSum=0.326;SC=GTTGCTTTAAAAGTTCAGTCC;SOR=0.551;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=76;TCF=23;TCR=53;TR=50;WE=171693463;WS=171693445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,50:0.65:77
chr2	171702480	rs701492	C	T	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=11;PP=448;ReadPosRankSum=0.991;SC=ATCTCATTGACTCTTCATTTT;SOR=0.584;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=57;TCF=37;TCR=20;TR=30;WE=171702488;WS=171702470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,31:0.53:59
chr2	171705157	rs35403424	AT	A	73.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=3.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.10;ReadPosRankSum=-0.973;SOR=0.199;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,12:0.18:67
chr2	171709430	rs769391	A	G	291.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=282;ReadPosRankSum=0.981;SC=CTGAGAGACTACTGCTGCTGT;SOR=0.495;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=15;WE=171709438;WS=171709420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr2	171786169	rs2676158	A	G	257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=1;PP=164;SC=CGACTCGGCCAGGGGGCGGCC;SOR=2.303;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=171786177;WS=171786159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	171818289	rs2557804	G	A	9714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=353;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=135;NR=193;PP=2965;SC=AGATGTGGCTGATAATAACAG;SOR=1.124;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=330;TCF=135;TCR=195;TR=328;WE=171818297;WS=171818279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,352:1.00:352
chr2	171822466	rs4668356	C	T	11964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=444;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=193;NR=218;PP=2965;SC=ACGCACCCTCCGACCCTGCCA;SOR=0.868;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=411;TCF=193;TCR=218;TR=411;WE=171822474;WS=171822456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,444:1.00:444
chr2	171851048	rs11397597	C	CA	92.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.57;MQRankSum=1.230;QD=5.15;ReadPosRankSum=0.270;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr2	171854416	rs80037512	G	A	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=409;ReadPosRankSum=-1.365;SC=CTTAGAACACGAATTTTATTC;SOR=0.495;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=21;WE=171854424;WS=171854406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,23:0.70:33
chr2	171913207	rs200719254	CAA	C	342.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.9816;FS=0.000;HP=14;HapScore=3;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;MQRankSum=0.671;NF=1;NR=13;PP=157;ReadPosRankSum=0.000;SC=GGGTCCAGAACAAAAAAAAAA;SOR=2.147;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=14;WE=171913216;WS=171913197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
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chr2	172216969	rs3731986	T	C	1691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.880;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=36;PP=930;ReadPosRankSum=0.299;SC=CTGAGTTTTCTTTTACTTTTT;SOR=0.937;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=97;TCF=47;TCR=50;TR=66;WE=172216977;WS=172216959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,77:0.69:111
chr2	172378818	rs868106	A	G	4311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.411;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=106;PP=2534;ReadPosRankSum=-0.207;SC=CCACCAGGCAATGAGCGCCCT;SOR=0.801;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=292;TCF=113;TCR=179;TR=173;WE=172378826;WS=172378808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,191:0.61:314
chr2	172378889	rs2356782	C	G	1377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=1.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.41;ReadPosRankSum=0.173;SOR=0.428;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,38:0.54:71
chr2	172378893	rs3731976	G	A	1263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=1.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.79;ReadPosRankSum=-0.224;SOR=0.395;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,32:0.55:58
chr2	172379649	rs115283512	C	T	525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.950;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=312;ReadPosRankSum=0.956;SC=GCAGCCCACGCGCCCCGGAAA;SOR=1.925;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=53;TCF=40;TCR=13;TR=21;WE=172379657;WS=172379639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,24:0.41:58
chr2	172379686	rs960750	G	A	1742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.436;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=24;PP=1234;ReadPosRankSum=0.655;SC=GAGCCTGCGCGATCGGGGGCG;SOR=0.875;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=131;TCF=89;TCR=42;TR=74;WE=172379694;WS=172379676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,77:0.55:140
chr2	172379781	rs960749	G	A	4080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=343;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.392;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=73;PP=2442;ReadPosRankSum=0.081;SC=AAAGATTGCCGGAGCGAGAAT;SOR=0.727;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=309;TCF=170;TCR=139;TR=167;WE=172379789;WS=172379771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,188:0.55:342
chr2	172379936	rs960748	G	A	1038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=32;PP=647;ReadPosRankSum=1.540;SC=AGTGTGTTTCGCCGCCCTGCC;SOR=0.661;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=19;TCR=62;TR=42;WE=172379944;WS=172379926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,46:0.54:85
chr2	172398311	rs7586144	T	C	1850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=43;PP=1182;SC=CAGGTCAGTATTTCAGTGTAT;SOR=2.303;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=58;TCF=13;TCR=45;TR=56;WE=172398319;WS=172398301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr2	172411056	.	T	C	977.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.590;ClippingRankSum=0.000;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=17;PP=654;ReadPosRankSum=1.978;SC=ATACAGTACATTCCCGCCAGA;SOR=0.960;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=136;TCF=79;TCR=57;TR=45;WE=172411064;WS=172411046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,51:0.34:148
chr2	172411273	rs10455	G	A	4136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=56;NR=85;PP=2318;SC=GAGTTAAACAGTGAAGTAGCA;SOR=1.421;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=56;TCR=85;TR=141;WE=172411281;WS=172411263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr2	172582281	rs139032813	A	ATTAC	3505.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=31;PP=2020;SC=GATTCCTTTTATTATGTATTA;SOR=0.948;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=40;TCF=4;TCR=36;TR=35;WE=172582289;WS=172582271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr2	172582344	rs139881666	AAC	A	762.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.073;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=661;ReadPosRankSum=1.567;SC=GAAAAATAATAACATACATTG;SOR=1.048;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=26;TCF=10;TCR=16;TR=20;WE=172582353;WS=172582334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr2	172644229	rs2292813	T	C	3150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=59;PP=2160;ReadPosRankSum=-0.815;SC=GTGGTAAAGATAGCCACTGAG;SOR=0.669;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=217;TCF=115;TCR=102;TR=124;WE=172644237;WS=172644219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,135:0.57:235
chr2	172709215	rs3770444	G	C	1744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=37;PP=1094;ReadPosRankSum=0.366;SC=AAATAAACTCGAAGTTAATTA;SOR=0.745;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=107;TCF=51;TCR=56;TR=71;WE=172709223;WS=172709205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,78:0.67:116
chr2	172712480	rs2056202	T	C	2725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.636;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=70;PP=1793;ReadPosRankSum=-0.396;SC=ATATAAAACGTCATTGGCTGG;SOR=0.818;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=164;TCF=46;TCR=118;TR=97;WE=172712488;WS=172712470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,110:0.61:180
chr2	172725301	rs1878583	A	G	4661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=357;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.975;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=116;PP=2865;ReadPosRankSum=-1.477;SC=CTGGGGTCATATAACGCTCTC;SOR=0.871;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=325;TCF=138;TCR=187;TR=197;WE=172725309;WS=172725288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,212:0.61:348
chr2	172778859	.	C	T	723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.573;ClippingRankSum=0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.442;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=3;PP=568;ReadPosRankSum=0.069;SC=GAGGCGCTTCCGCCGCCGGGC;SOR=1.493;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=50;TCF=43;TCR=7;TR=28;WE=172778867;WS=172778849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,28:0.53:53
chr2	172779122	rs28372952	C	T	934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.068;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=29;PP=649;ReadPosRankSum=-0.359;SC=GGGCTGTAGCCTGGGTTCCAG;SOR=0.459;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=78;TCF=22;TCR=56;TR=42;WE=172779130;WS=172779112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,43:0.54:80
chr2	172822963	rs370978033	C	T	928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=477;ExcessHet=3.0103;FS=3.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.95;ReadPosRankSum=1.570;SOR=0.852;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:384,93:0.19:477
chr2	172864845	rs6730085	C	A	1164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.133;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=14;PP=607;ReadPosRankSum=0.330;SC=GGGCGGCGAGCGAGTGCTCGC;SOR=0.504;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=58;TCF=41;TCR=17;TR=45;WE=172864853;WS=172864835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,53:0.77:69
chr2	172865009	rs62183782	T	A	2519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=46;PP=1236;ReadPosRankSum=-0.561;SC=GCGCTCAGACTTCTCGGCGCA;SOR=0.707;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=203;TCF=110;TCR=93;TR=102;WE=172865017;WS=172864999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,123:0.51:239
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chr2	173609173	rs13005651	T	A	2446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=401;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=62;PP=1454;ReadPosRankSum=-0.940;SC=AATGCAAACGTTGCGTGGTCA;SOR=0.706;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=357;TCF=179;TCR=178;TR=123;WE=173609181;WS=173609163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:262,137:0.34:399
chr2	173659913	rs7585729	T	C	581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=4;NR=16;PP=392;SC=ATGCAACTCTTGTAGTATATT;SOR=1.931;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=173659921;WS=173659903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	173793096	rs3835838	GA	G	758.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=18;PP=683;SC=GCATTTTTAGGAATGACGTGT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=18;WE=173793104;WS=173793086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	173831934	rs16861098	C	T	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.928;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=197;ReadPosRankSum=0.289;SC=TTCTAGTAAACGGAGCTGTGA;SOR=1.244;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=27;TCF=18;TCR=9;TR=14;WE=173831942;WS=173831924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr2	173861340	rs2290374	G	A	1893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.434;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=46;PP=1041;ReadPosRankSum=-0.052;SC=TTGTTTAAAAGTCCTGAATTC;SOR=0.749;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=269;TCF=141;TCR=128;TR=94;WE=173861348;WS=173861330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:196,109:0.36:305
chr2	173861450	rs2290375	A	T	569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=3.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.30;ReadPosRankSum=-0.974;SOR=0.337;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,29:0.37:78
chr2	173861456	rs5010643	G	C	2326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=40;PP=680;SC=TCTGACTGTCGTCTTCCCTCC;SOR=1.508;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=23;TCR=40;TR=63;WE=173861464;WS=173861440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr2	173866203	rs2028934	C	T	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.243;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=24;PP=495;ReadPosRankSum=1.413;SC=CCTCATCACACTGAAATGTGT;SOR=2.808;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=61;TCF=5;TCR=56;TR=24;WE=173866211;WS=173866193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,24:0.36:66
chr2	174055731	rs2289399	A	G	6516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=134;NR=85;PP=2965;SC=TAATTAGCCAATAAGTAGAAA;SOR=1.169;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=219;TCF=134;TCR=85;TR=219;WE=174055739;WS=174055721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr2	174068513	rs11899707	G	C	7218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=144;NR=99;PP=2965;SC=GTTTCCCTCTGTCTATTGTAG;SOR=1.087;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=244;TCF=145;TCR=99;TR=243;WE=174068521;WS=174068503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr2	174074353	rs2289398	T	G	625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=2;PP=459;SC=TTTATTTTGTTATGGTGGGTT;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=174074361;WS=174074351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	174074375	rs2289397	T	C	835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=608;ReadPosRankSum=1.692;SC=AGTTTATTACTATGCTTGTAG;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=25;WE=174074383;WS=174074365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,28:0.97:29
chr2	174074407	rs2289396	A	G	1566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=17;PP=1004;SC=TCTCTTAAATATCTCCTTTCT;SOR=1.487;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=33;TCR=17;TR=50;WE=174074415;WS=174074397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr2	174123399	rs820008	A	G	749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=18;NR=6;PP=445;SC=CACTTTCTCAAATTCTGTAAT;SOR=1.528;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=24;WE=174123407;WS=174123389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	174128513	rs3769148	C	T	2599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.060;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=38;PP=1614;ReadPosRankSum=0.423;SC=CATGTCCATTCGATTCAGTGG;SOR=0.802;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=198;TCF=120;TCR=78;TR=102;WE=174128521;WS=174128503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,114:0.52:221
chr2	174128595	rs16861466	T	C	3355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=72;PP=1587;ReadPosRankSum=1.028;SC=CCAATTCAGATGGCAACCCTG;SOR=0.701;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=319;TCF=162;TCR=157;TR=146;WE=174128603;WS=174128585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:188,168:0.47:356
chr2	174227876	rs767074	A	G	2496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=21;PP=1601;SC=CAAGTGTCTCATTGAAAAGGG;SOR=1.821;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=63;TCR=21;TR=84;WE=174227884;WS=174227866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr2	174228418	rs4972555	C	T	1100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=0;PP=847;SC=ATCAGAAACTCTGAATGTGTC;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=29;WE=174228426;WS=174228408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr2	174229731	rs13382180	A	G	1002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.570;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=25;PP=579;ReadPosRankSum=0.184;SC=AGTTCTCCGCATTGGTACTTG;SOR=0.610;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=173;TCF=81;TCR=92;TR=52;WE=174229739;WS=174229721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,61:0.31:198
chr2	174230153	rs2288993	C	G	4291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=80;NR=57;PP=2449;SC=TTTTGAAGTTCTGTGTTTTGT;SOR=0.972;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=139;TCF=82;TCR=57;TR=137;WE=174230161;WS=174230143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr2	174230983	rs35959156	G	GT	1841.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.33;SOR=2.730;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr2	174232076	rs3816061	G	A	934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=10;NR=21;PP=632;SC=GTCTTAATGAGAAGATGATAG;SOR=1.751;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=10;TCR=21;TR=31;WE=174232084;WS=174232066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
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chr2	175199869	rs56000618	G	T	3580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=401;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.106;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=82;PP=2426;ReadPosRankSum=0.511;SC=CAACGCATTTGCTTGTTTTAA;SOR=0.701;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=365;TCF=187;TCR=178;TR=172;WE=175199877;WS=175199859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:222,179:0.45:401
chr2	175199895	rs3856434	G	A	4129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=364;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.773;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=84;PP=2429;ReadPosRankSum=-0.778;SC=GTAATTTTTCGTTATGGCTTC;SOR=0.681;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=330;TCF=171;TCR=159;TR=169;WE=175199903;WS=175199885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,196:0.54:363
chr2	175200014	rs34372833	G	A	984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.782;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=33;PP=727;ReadPosRankSum=0.981;SC=TTGGAACCCAGAAAGATGCCT;SOR=0.923;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=95;TCF=28;TCR=67;TR=44;WE=175200022;WS=175200004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,45:0.42:107
chr2	175200903	rs35548534	G	C	3992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=556;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=96;PP=2531;ReadPosRankSum=-0.334;SC=TCGGCAACACGAGCCCGCTGA;SOR=0.676;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=515;TCF=253;TCR=262;TR=191;WE=175200911;WS=175200893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:344,212:0.38:556
chr2	175215287	rs67384376	G	A	785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.047;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=12;PP=386;ReadPosRankSum=-0.671;SC=GTGATGCATGGTATAAGGACC;SOR=0.467;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=59;TCF=39;TCR=20;TR=34;WE=175215295;WS=175215277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,38:0.57:67
chr2	175223296	rs4972650	T	A	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=2.90;ReadPosRankSum=-1.691;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr2	175244756	rs2358666	T	C	306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=2;PP=118;SC=CAGCCTGATTTCTGTCTTTTA;SOR=1.022;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=175244764;WS=175244746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	175262970	rs41270193	C	T	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=197;ReadPosRankSum=0.601;SC=TAAAAGTGTTCTTTTTATTTT;SOR=0.818;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=13;WE=175262978;WS=175262960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr2	175263063	rs10497410	G	A	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.817;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=11;PP=367;ReadPosRankSum=-1.329;SC=AGCAACAGTCGATAACAGGAT;SOR=0.846;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=97;TCF=61;TCR=36;TR=31;WE=175263071;WS=175263039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,32:0.31:102
chr2	175265666	rs13016842	A	G	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=1.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.17;ReadPosRankSum=-0.589;SOR=0.332;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr2	175268763	rs2358672	A	G	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=290;ReadPosRankSum=-0.572;SC=GAATCATGATATACAGATACA;SOR=0.846;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=13;WE=175268771;WS=175268753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr2	175287778	rs2290158	G	A	2521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.325;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=59;PP=1462;ReadPosRankSum=1.700;SC=CCTGAGAGGTGAAGCCACAAA;SOR=0.963;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=176;TCF=74;TCR=102;TR=98;WE=175287786;WS=175287768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,113:0.57:199
chr2	175289144	rs3739150	C	A	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5033;FS=2.869;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=213;ReadPosRankSum=0.734;SC=AAGACTTAGACTAACACTGAA;SOR=0.184;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=11;WE=175289152;WS=175289134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,12:0.80:15
chr2	175292580	rs145699077	TTCAAATTTATCAG	T	1663.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.947;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.616;NF=3;NR=23;PP=2970;ReadPosRankSum=0.119;SC=AAAGATGAAATTCAAATTTAT;SOR=0.839;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=50;TCF=5;TCR=45;TR=26;WE=175292600;WS=175292570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,44:0.62:71
chr2	175300997	rs6757461	G	A	5248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=399;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=112;NR=104;PP=2791;ReadPosRankSum=-0.270;SC=ATTCATACTCGTTGGTAATAT;SOR=0.697;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=355;TCF=183;TCR=172;TR=216;WE=175301005;WS=175300987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,244:0.61:399
chr2	175306691	rs35594437	G	A	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.788;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=119;ReadPosRankSum=2.458;SC=GCCCAGGCTGGTCTTGAACTC;SOR=1.270;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=8;WE=175306699;WS=175306681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr2	175309624	rs12993286	C	T	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=229;ReadPosRankSum=-0.133;SC=TATAATAATTCGTCTCTACTA;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=11;WE=175309632;WS=175309614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr2	175309792	rs34291465	T	C	2738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=54;PP=1566;ReadPosRankSum=-1.082;SC=CCCTCAAAGTTCTCCATAAAT;SOR=0.705;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=187;TCF=94;TCR=93;TR=110;WE=175309800;WS=175309782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,127:0.59:216
chr2	175318396	.	G	A	583	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.49;FR=1.0000;HP=22;HapScore=1;MGOF=47;MMLQ=27;MQ=49.48;NF=9;NR=4;PP=583;QD=47.5208625036;SC=TCAAAAAAAAGAAAAAAAAAA;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=13;WE=175318404;WS=175318386;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
chr2	175326258	rs72910819	G	T	2536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=412;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.830;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=64;PP=1576;ReadPosRankSum=0.587;SC=AAAAAGAAAGGATGAATAGTA;SOR=0.597;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=379;TCF=190;TCR=189;TR=135;WE=175326266;WS=175326248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:268,143:0.35:411
chr2	175335076	rs2358637	G	T	939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=25;NR=0;PP=684;SC=AATTTTTTTCGACTAAACACA;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=175335084;WS=175335066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	175335365	rs56101059	A	G	561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=24;PP=463;ReadPosRankSum=1.369;SC=TGAATTTGGCATCAGGTTCTC;SOR=0.892;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=66;TCF=6;TCR=60;TR=26;WE=175335373;WS=175335355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,25:0.36:69
chr2	175431707	rs2163236	C	G	937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.370;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=9;PP=648;ReadPosRankSum=1.811;SC=CTACCCCACTCCAGGCAAGAA;SOR=1.132;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=60;TCF=42;TCR=18;TR=35;WE=175431715;WS=175431697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,37:0.57:65
chr2	175431990	rs143689509	AAGAG	A	967.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.422;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=879;ReadPosRankSum=0.563;SC=CACAGAATGAAAGAGAGAGAG;SOR=0.259;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=47;TCF=1;TCR=46;TR=19;WE=175432001;WS=175431980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,26:0.47:55
chr2	175436940	rs4972450	G	A	5370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=86;PP=2965;SC=CCGGTTGTGCGGACTTGATTG;SOR=0.734;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=186;TCF=100;TCR=86;TR=186;WE=175436948;WS=175436930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr2	175439512	rs1367218	T	C	6613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=146;NR=87;PP=2965;ReadPosRankSum=1.016;SC=TTCCACAAGATGTGCTCCATC;SOR=0.458;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=234;TCF=147;TCR=87;TR=233;WE=175439520;WS=175439502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,248:1.00:249
chr2	175439536	rs12624277	G	A	3999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=77;PP=2686;ReadPosRankSum=0.236;SC=TTTGAAAAGCGGCTCACAAGT;SOR=0.690;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=308;TCF=178;TCR=130;TR=181;WE=175439544;WS=175439526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,190:0.58:326
chr2	175613169	rs2305414	A	C	2650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=19;PP=1796;SC=AAGGTGGTCTAGAGGCGGTCA;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=58;TCR=19;TR=77;WE=175613177;WS=175613159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr2	175613600	rs2646159	T	C	233.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=7;PP=181;SC=GAGGCAAGCATAAAACTCTGT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=175613608;WS=175613590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	175614908	.	CAAA	C,CA	1221.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.252;ClippingRankSum=0.000;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.80;ReadPosRankSum=2.211;SOR=1.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:2,17,22:0.41,0.54:41
chr2	175622178	rs11327107	TG	T	212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=1;PP=115;SC=GCCACCATCCTGGGTGATTTA;SOR=1.609;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=4;WE=175622186;WS=175622168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	175622788	rs2646164	G	A	4069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=80;PP=2379;SC=TAGTGTGAACGTTTTTCTCAA;SOR=1.225;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=135;TCF=55;TCR=80;TR=135;WE=175622796;WS=175622778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr2	175622907	rs2600687	T	C	207.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=7;PP=138;SC=GAGGCTGAGGTGGGTGGATCA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=175622915;WS=175622897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	175624107	rs34695580	GA	G	6325.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=104;PP=2966;SC=CTTCATCCTGGAAAAAAAAAT;SOR=0.710;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=141;TCF=33;TCR=108;TR=133;WE=175624116;WS=175624097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr2	175629021	rs7560774	C	A	5341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=105;NR=77;PP=2926;SC=GATTTGGGGGCCTCCAGCACT;SOR=0.873;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=182;TCF=105;TCR=77;TR=182;WE=175629029;WS=175629011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr2	175677022	rs12613075	C	T	3478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=32;PP=2404;SC=GCAACCCGCACTGCAAATGGC;SOR=1.915;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=84;TCR=32;TR=116;WE=175677030;WS=175677012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr2	175711942	rs14228	C	T	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=26;PP=517;ReadPosRankSum=-1.264;SC=AGCATTCTGCCAGGCAGCACA;SOR=0.748;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=96;TCF=27;TCR=69;TR=35;WE=175711950;WS=175711932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,38:0.36:106
chr2	176867131	rs747051	G	A	517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=16;PP=402;SC=CGGCCGGGAGGTTAGGATCTT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=176867139;WS=176867121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	176944778	rs73029921	G	A	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=4.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.89;ReadPosRankSum=1.061;SOR=0.279;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,18:0.32:57
chr2	176946829	rs73029924	A	G	1144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=13;PP=761;ReadPosRankSum=2.170;SC=CCACCCAGAAAGGGGAAAGGG;SOR=0.697;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=122;TCF=87;TCR=35;TR=46;WE=176946837;WS=176946819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,52:0.40:129
chr2	176947237	rs6758117	C	T	770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.714;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=18;PP=394;ReadPosRankSum=-0.843;SC=CCGGCGCTGGCGCTGCGCGCG;SOR=0.462;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=87;TCF=38;TCR=49;TR=37;WE=176947245;WS=176947227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,41:0.44:94
chr2	176948445	rs61731351	C	G	1122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.166;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=26;PP=657;ReadPosRankSum=-0.946;SC=TCTTGCCCGCCGTAGGGCTGT;SOR=0.810;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=182;TCF=98;TCR=84;TR=59;WE=176948453;WS=176948435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,68:0.35:196
chr2	176957580	rs144577020	G	C	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.758;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=170;ReadPosRankSum=-0.928;SC=TGTCCTGCGCGGGGCCAGGGC;SOR=0.293;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=14;WE=176957588;WS=176957570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr2	176957822	rs2518053	G	A	1645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.474;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=31;PP=928;ReadPosRankSum=-1.336;SC=CGGCGGCGGCGGCGGCAGCCT;SOR=0.655;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=245;TCF=144;TCR=101;TR=75;WE=176957830;WS=176957812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,88:0.33:270
chr2	176964904	rs847151	G	A	1802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.157;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=44;PP=1164;ReadPosRankSum=-0.843;SC=AGTCTAGCCTGGCTCCTGCAG;SOR=0.860;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=245;TCF=121;TCR=124;TR=83;WE=176964912;WS=176964894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:179,93:0.34:272
chr2	176996023	rs4972804	C	T	811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=2.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=1.000;QD=10.68;ReadPosRankSum=3.278;SOR=1.066;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,37:0.49:76
chr2	177016728	rs34727427	T	C	1954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FS=1.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.556;SOR=0.603;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:204,115:0.36:319
chr2	177033779	rs72927183	C	T	835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.697;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=4;PP=563;ReadPosRankSum=1.240;SC=GCCTGGGGGCCGGCCCAGCTC;SOR=1.954;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=84;TCF=68;TCR=16;TR=32;WE=177033787;WS=177033769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,35:0.40:87
chr2	177034121	rs34729309	G	T	868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.359;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=18;PP=527;ReadPosRankSum=0.288;SC=GCATGCGGCCGGGCACTGGGA;SOR=0.668;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=114;TCF=66;TCR=48;TR=38;WE=177034129;WS=177034111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,44:0.34:130
chr2	177036754	rs1051929	T	C	3867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=511;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=94;PP=2436;ReadPosRankSum=-0.164;SC=CAGCGCCAACTTGCAGGGCAG;SOR=0.703;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=479;TCF=238;TCR=241;TR=186;WE=177036762;WS=177036744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:307,201:0.40:508
chr2	177054411	rs13390932	T	C	2597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.352;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=56;PP=1814;ReadPosRankSum=1.142;SC=CTTCTCCTGGTACAAATTCTG;SOR=0.601;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=311;TCF=173;TCR=138;TR=124;WE=177054419;WS=177054401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:195,129:0.40:324
chr2	177054769	rs6710142	G	A	1736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=40;PP=935;ReadPosRankSum=-1.646;SC=TCTGGCCACGGCCATTCCTGT;SOR=0.662;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=238;TCF=122;TCR=116;TR=85;WE=177054777;WS=177054759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,93:0.36:259
chr2	177194125	.	A	G	3404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=0.000;DP=405;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=77;PP=2082;ReadPosRankSum=0.038;SC=GATGAAAGCTATTGGATGGGG;SOR=0.668;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=354;TCF=183;TCR=171;TR=156;WE=177194133;WS=177194115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:231,174:0.43:405
chr2	178085137	rs9068	G	A	2940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=55;NR=37;PP=1475;SC=GAGCAAATTAGTGGGTACCTT;SOR=0.830;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=55;TCR=37;TR=92;WE=178085145;WS=178085127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr2	178098087	rs139080704	CA	C	3365.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=397;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.459;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.395;NF=2;NR=75;PP=2478;ReadPosRankSum=-0.745;SC=GGGAATGACACAAAGGAAAAC;SOR=1.087;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=231;TCF=15;TCR=216;TR=77;WE=178098095;WS=178098077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:239,126:0.35:365
chr2	178301428	rs3754989	C	T	142.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=112;SC=GTCATTCTCTCTAACTGAAGT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=178301436;WS=178301418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr2	178326838	rs1979059	C	G	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.94;SOR=3.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	178326838	.	CCTGGGCGCG	GCTGGGCGCA,GCTGGGCGCG	151	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=3;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0,3;NR=5,16;PP=52,151;QD=21.0935749724;SC=AAGAGTTGGGCCTGGGCGCGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=5,19;WE=178326855;WS=178326828;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.26:19
chr2	178326847	rs1979058	G	A	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.46;ReadPosRankSum=-0.945;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr2	178346654	rs140823121	GCCATTATTCC	G	358.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=1165;ReadPosRankSum=-0.447;SC=GACTTGAGTAGCCATTATTCC;SOR=0.914;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=4;WE=178346671;WS=178346644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr2	178358072	rs1348849	C	T	445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=16;PP=284;ReadPosRankSum=0.509;SC=TAGACAATTACATAAATGAGT;SOR=0.675;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=54;TCF=20;TCR=34;TR=24;WE=178358080;WS=178358062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,24:0.40:60
chr2	178362572	rs12468046	G	A	1488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=28;PP=803;SC=TGCACCTATTGTAAGGGTGTT;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=20;TCR=28;TR=48;WE=178362580;WS=178362562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr2	178364328	rs371154486	AT	A	55.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=4.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.47;ReadPosRankSum=0.928;SOR=0.162;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,9:0.24:38
chr2	178378452	rs2364854	T	A	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.361;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=70;ReadPosRankSum=0.136;SC=TAAGAAAATGTCAGACTTGAA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=5;WE=178378460;WS=178378442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr2	178402786	rs3213945	G	T	2953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.154;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=58;PP=1813;ReadPosRankSum=-2.142;SC=AAGCATTTTTGATTTTGTTTT;SOR=0.571;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=228;TCF=136;TCR=92;TR=133;WE=178402794;WS=178402776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,141:0.56:251
chr2	178417142	rs11694988	C	T	3179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=70;PP=2102;SC=AGCTTGCAGGCGGAGGACCCG;SOR=2.058;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=98;TCF=28;TCR=70;TR=98;WE=178417150;WS=178417132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr2	178417225	rs11695035	C	T	1901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=14;PP=1565;SC=AGGCCTTGTACAGGGCCTGGG;SOR=2.265;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=47;TCR=14;TR=61;WE=178417233;WS=178417223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr2	178481818	rs10497497	G	T	5949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-2.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=487;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.272;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-12.982;NF=158;NR=132;PP=2962;ReadPosRankSum=1.453;SC=TACATTTTCCGATTTGGGTCA;SOR=0.664;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=479;TCF=263;TCR=216;TR=290;WE=178481826;WS=178481808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:202,284:0.58:486
chr2	178482560	rs61164370	C	T	2687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.565;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.140;NF=86;NR=62;PP=2048;ReadPosRankSum=-1.740;SC=CCTGGTTGTGCAGGGTCACAG;SOR=0.961;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=312;TCF=173;TCR=139;TR=148;WE=178482568;WS=178482550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,132:0.43:304
chr2	178482698	rs3813256	A	G	4147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.400;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.568;NF=77;NR=96;PP=2793;ReadPosRankSum=-1.714;SC=TCTGATGGAGAACTAAGGTGT;SOR=0.648;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=311;TCF=137;TCR=174;TR=173;WE=178482706;WS=178482688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,186:0.55:337
chr2	178528703	rs13025391	C	T	3394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.630;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=81;PP=2201;ReadPosRankSum=-0.329;SC=GGAAGAACCTCGCTTTATTAC;SOR=0.825;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=222;TCF=93;TCR=129;TR=137;WE=178528711;WS=178528693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,149:0.62:240
chr2	178528789	rs13025904	G	A	1581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.952;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=46;PP=1057;ReadPosRankSum=0.530;SC=TGAACCCTTCGCAAATCACAA;SOR=0.546;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=93;TCF=26;TCR=67;TR=65;WE=178528797;WS=178528779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,66:0.71:93
chr2	178534324	rs6433687	A	G	2730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.123;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=68;PP=1746;ReadPosRankSum=0.755;SC=TTAATCTGTGATTATGTGTAG;SOR=0.795;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=186;TCF=74;TCR=112;TR=111;WE=178534332;WS=178534314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,123:0.59:208
chr2	178540293	rs3770016	A	G	2269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.317;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=42;PP=1300;ReadPosRankSum=2.010;SC=CTTTTGTTGCATTCCTAAACA;SOR=0.886;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=188;TCF=109;TCR=79;TR=102;WE=178540301;WS=178540283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,116:0.53:219
chr2	178545713	rs4538242	C	T	1904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=34;PP=1024;SC=ATAAACACATCTATGGGAAAA;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=49;TCF=15;TCR=34;TR=48;WE=178545721;WS=178545703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr2	178545736	rs9677333	T	C	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=1.001;NF=8;NR=14;PP=318;ReadPosRankSum=-0.621;SC=ATAAGACCACTTGAACCAAGT;SOR=0.620;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=40;TCF=14;TCR=26;TR=22;WE=178545744;WS=178545726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,24:0.52:46
chr2	178561947	rs2886424	G	C	719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.378;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=7;PP=440;ReadPosRankSum=-0.358;SC=AAGTTTAGCTGGTTTACACAT;SOR=0.250;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=56;TCF=47;TCR=9;TR=28;WE=178561955;WS=178561937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,32:0.51:63
chr2	178565775	rs62182973	A	G	642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.408;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=6;PP=357;ReadPosRankSum=-0.451;SC=GTGGCACCACAAAGGAAGAGA;SOR=1.170;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=69;TCF=51;TCR=18;TR=28;WE=178565783;WS=178565765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,33:0.42:78
chr2	178565815	rs10201180	T	C	1189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.592;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=20;PP=629;ReadPosRankSum=0.741;SC=TTTTGGTTTCTGTTAAGGGGA;SOR=0.746;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=148;TCF=89;TCR=59;TR=54;WE=178565823;WS=178565805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,64:0.39:164
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chr2	178592332	rs62183008	C	T	1705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.501;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=28;PP=1174;ReadPosRankSum=-0.153;SC=AGGAGAAGGCCTGCCAGTTCC;SOR=0.764;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=239;TCF=157;TCR=82;TR=84;WE=178592340;WS=178592322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,88:0.34:261
chr2	178633945	rs34543540	A	C	1717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=29;PP=857;ReadPosRankSum=1.016;SC=CTAGTCCTCCAGCTCCCAATG;SOR=0.676;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=131;TCF=83;TCR=48;TR=76;WE=178633953;WS=178633935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,84:0.55:152
chr2	178681447	rs6433697	C	A	882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.043;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=13;PP=642;ReadPosRankSum=0.153;SC=TGATTAAGGCCCAATGAATAA;SOR=0.379;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=106;TCF=79;TCR=27;TR=41;WE=178681455;WS=178681437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,43:0.37:116
chr2	178681534	rs6433698	C	T	2726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=338;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.573;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=55;PP=1706;ReadPosRankSum=-0.432;SC=GCATACAAACCTGACATAAAC;SOR=0.883;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=306;TCF=164;TCR=142;TR=126;WE=178681542;WS=178681524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:202,136:0.40:338
chr2	178681716	rs1438059	G	C	974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=32;PP=590;ReadPosRankSum=0.618;SC=TATGAAAGCAGGCAGCCACCA;SOR=0.617;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=24;TCR=55;TR=46;WE=178681724;WS=178681706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,47:0.57:83
chr2	178682558	rs3841879	A	ATATAAAC	1451.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=1.588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.08;ReadPosRankSum=0.677;SOR=0.899;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,40:0.31:131
chr2	178682603	rs6720891	T	C	1556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=29;PP=747;ReadPosRankSum=-3.211;SC=GTCGTTGATCTGCATCATCAA;SOR=0.723;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=212;TCF=127;TCR=85;TR=72;WE=178682611;WS=178682593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,86:0.35:243
chr2	178682655	rs3821010	A	G	1536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.688;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=37;PP=919;ReadPosRankSum=1.399;SC=AGCCACTCCTATGGGGAAAGA;SOR=0.587;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=221;TCF=112;TCR=109;TR=76;WE=178682663;WS=178682645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,86:0.34:255
chr2	178684799	rs7581861	T	C	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=34;ReadPosRankSum=0.309;SC=TAGGAGCCTGTGCTTATGAAA;SOR=0.340;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=6;WE=178684807;WS=178684789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr2	178684820	rs41440047	G	A	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=159;ReadPosRankSum=-0.243;SC=TTATACGAGAGTGTGAGACAT;SOR=0.990;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=11;WE=178684828;WS=178684810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr2	178684878	rs144786387	A	AAG	1310.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.038;HP=2;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=896;ReadPosRankSum=0.078;SC=TAAAAAAGATATGGGAATATT;SOR=0.475;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=36;TCF=18;TCR=18;TR=14;WE=178684887;WS=178684868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,33:0.48:69
chr2	178684879	rs58796031	T	G	1319.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.029;HP=3;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=9;PP=896;ReadPosRankSum=-0.132;SC=AAAAAAGATATGGGAATATTT;SOR=0.458;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=56;TCF=38;TCR=18;TR=21;WE=178684887;WS=178684868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,35:0.49:71
chr2	178684921	rs13386827	G	A	954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=16;PP=405;ReadPosRankSum=0.144;SC=TATTCAAGAAGTTTAACTATT;SOR=0.735;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=82;TCF=45;TCR=37;TR=37;WE=178684929;WS=178684911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,49:0.49:99
chr2	178685129	rs13386870	C	T	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=58;ReadPosRankSum=0.674;SC=CTTTTTAAAGCTATTTTATAC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=178685137;WS=178685119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr2	178764364	.	AAT	A,AATAT	636.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.22;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;NF=0,0;NR=13,13;PP=302,380;SC=CAGATTCTTAAATATATATAT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=13,13;WE=178764373;WS=178764354;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.60,0.40:20
chr2	178769992	rs2695096	T	C	2302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=49;PP=1495;SC=TGCACACTTCTTCTATATGCC;SOR=1.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=22;TCR=49;TR=71;WE=178770000;WS=178769982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr2	178936373	rs1435573	T	G	7402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=120;NR=114;PP=2965;SC=GCAGCAGAGGTGTTCCTGCAT;SOR=0.701;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=234;TCF=120;TCR=114;TR=234;WE=178936381;WS=178936363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr2	178936614	rs6433711	C	T	10104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=372;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=167;NR=178;PP=2965;SC=AGGGGGATACCGAGGCAGATT;SOR=0.760;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=346;TCF=168;TCR=178;TR=345;WE=178936622;WS=178936604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,370:1.00:370
chr2	178986130	.	TAC	T	481.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=32.12;ReadPosRankSum=-1.044;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,14:0.93:15
chr2	178986134	.	C	T	489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=32.65;ReadPosRankSum=-0.580;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,14:0.93:15
chr2	179203797	rs1434087	G	A	5132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=377;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=125;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.601;SC=GAACTCAGTCGGCACCTAACT;SOR=0.890;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=340;TCF=150;TCR=190;TR=218;WE=179203805;WS=179203787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,233:0.62:377
chr2	179226290	rs1560871	T	C	826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=0;PP=644;SC=TTAATTAGACTATTACATAGC;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=179226298;WS=179226283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	179236831	rs6433724	A	G	1731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=20;PP=1092;ReadPosRankSum=-1.364;SC=TAAATTACATATGTGGTTTTT;SOR=0.735;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=114;TCF=79;TCR=35;TR=66;WE=179236839;WS=179236821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,73:0.56:130
chr2	179238507	rs7595571	T	C	1735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=16;PP=1184;SC=TGCTTGTGGCTGCCACTTTTT;SOR=2.157;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=46;TCR=16;TR=62;WE=179238515;WS=179238497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr2	179238841	rs10190530	A	G	325.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=233;ReadPosRankSum=1.660;SC=CTTTTTGGTGATTACTTTCAT;SOR=1.022;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=13;WE=179238849;WS=179238831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,13:0.87:15
chr2	179247468	rs77450626	C	T	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.741;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=388;ReadPosRankSum=-0.151;SC=AAACCAACAGCTTGAGTCCTT;SOR=0.260;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=18;WE=179247476;WS=179247458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
chr2	179253796	rs116608280	G	C	4003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=354;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.737;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=89;PP=2775;ReadPosRankSum=-0.534;SC=TCCTCAGTGGGAGAAGATGGA;SOR=0.805;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=324;TCF=158;TCR=166;TR=170;WE=179253804;WS=179253786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,184:0.52:354
chr2	179260382	rs2304340	A	G	922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=28;PP=653;ReadPosRankSum=-0.595;SC=TTTCTGGGTCAACTGAAAACC;SOR=0.800;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=12;TCR=48;TR=35;WE=179260390;WS=179260372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,37:0.60:62
chr2	179325735	rs17304212	C	G	3188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.099;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=47;PP=2280;ReadPosRankSum=0.835;SC=TGTCATTTCTCGTTCACAGCT;SOR=1.042;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=230;TCF=142;TCR=88;TR=132;WE=179325743;WS=179325725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,140:0.56:250
chr2	179363807	rs3214536	A	AT	52.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.006;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.674;NF=3;NR=1;PP=28;ReadPosRankSum=0.816;SC=GAAAGATTAAATTTTTTTTTG;SOR=0.148;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=4;WE=179363815;WS=179363797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr2	179366093	rs2303537	C	T	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=214;ReadPosRankSum=-1.498;SC=AGGTTTGTTACTAACTAAGGA;SOR=0.610;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=11;WE=179366101;WS=179366083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr2	179396782	rs55866005	C	G	2746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.555;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=51;PP=1480;ReadPosRankSum=-0.632;SC=AGCTCAGACACTGGCCTCATT;SOR=0.675;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=218;TCF=113;TCR=105;TR=110;WE=179396790;WS=179396772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,129:0.54:241
chr2	179410282	rs62621206	A	G	2980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=476;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=73;PP=1907;ReadPosRankSum=-1.260;SC=TGTCCAGCGCAGGCTCTTCTT;SOR=0.662;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=443;TCF=245;TCR=198;TR=160;WE=179410290;WS=179410272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:305,169:0.36:474
chr2	179442292	rs148238009	TA	T	2681.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.259;HP=10;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.539;NF=34;NR=49;PP=1180;ReadPosRankSum=1.143;SC=TAATTTGCTTTAAAAAAAAAA;SOR=0.850;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=140;TCF=55;TCR=85;TR=83;WE=179442300;WS=179442282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,126:0.66:190
chr2	179444768	rs4145333	C	G	11572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=417;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=174;NR=198;PP=2965;SC=TCCAAATTAGCTACTCTGAAG;SOR=0.910;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=373;TCF=174;TCR=199;TR=372;WE=179444776;WS=179444758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,415:1.00:415
chr2	179459396	rs74977311	T	G	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=2.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.854;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=243;ReadPosRankSum=-0.057;SC=GTATAGGAATTGTGGTAGAAA;SOR=1.329;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=14;WE=179459404;WS=179459386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr2	179482347	rs72677235	CTAAG	C	806.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.776;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.727;NF=11;NR=5;PP=701;ReadPosRankSum=-0.476;SC=ATCAAATTCACTAAGTAAAGT;SOR=2.123;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=23;TCF=13;TCR=10;TR=16;WE=179482358;WS=179482337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,21:0.70:30
chr2	179482937	rs72677232	C	T	1696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=38;PP=1081;ReadPosRankSum=-1.296;SC=CTTGCTTCTACAGGATTGTCA;SOR=0.685;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=202;TCF=114;TCR=88;TR=87;WE=179482945;WS=179482927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,90:0.41:222
chr2	179486037	rs72677225	C	A	3136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-3.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=71;PP=1842;ReadPosRankSum=0.704;SC=CAAATTCAGCCTTTTCTCCTT;SOR=0.723;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=235;TCF=110;TCR=125;TR=133;WE=179486045;WS=179486027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,146:0.57:256
chr2	179498042	rs6723526	T	C	3843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.693;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=73;PP=2466;ReadPosRankSum=-0.750;SC=TTTTCCACTTTTATTAGTCGA;SOR=0.688;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=252;TCF=128;TCR=124;TR=147;WE=179498050;WS=179498032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,164:0.60:273
chr2	179502305	rs72650074	G	A	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=106;ReadPosRankSum=-0.497;SC=ACATTTCCAGGAAGGCATATT;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=6;WE=179502313;WS=179502295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr2	179511767	rs375648400	GTATA	G	100.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.20;ReadPosRankSum=0.974;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr2	179518911	rs139167585	TAGC	T	4516.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.523;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.672;NF=13;NR=49;PP=2768;ReadPosRankSum=-0.754;SC=AAGTTATTCTTAGCAGAGGAG;SOR=0.758;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=110;TCF=22;TCR=88;TR=62;WE=179518921;WS=179518901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,115:0.57:200
chr2	179566146	rs2251987	T	G	3308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=83;NR=35;PP=2110;SC=ACATGGAAGGTTTTGTTCTGA;SOR=1.360;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=119;TCF=84;TCR=35;TR=118;WE=179566154;WS=179566136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr2	179582853	rs72648982	T	C	2718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=338;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.334;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=68;PP=1938;ReadPosRankSum=0.176;SC=CAAGAAATTCTAATTTCTGGA;SOR=0.772;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=309;TCF=157;TCR=152;TR=123;WE=179582861;WS=179582843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:204,132:0.39:336
chr2	179583317	rs72648978	G	A	4008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.419;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=64;PP=2648;ReadPosRankSum=-0.441;SC=TTTTCACAAAGGTGGCTGGTT;SOR=0.908;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=249;TCF=138;TCR=111;TR=154;WE=179583325;WS=179583307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,170:0.62:274
chr2	179585266	rs2562831	C	T	3304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=54;PP=2246;SC=TGTTTCTAACCTGCTTTCGAT;SOR=0.903;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=51;TCR=54;TR=105;WE=179585274;WS=179585256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr2	179590329	rs17355460	C	T	2523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=384;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.801;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=61;PP=1581;ReadPosRankSum=-0.097;SC=GCAGGCTCTCCGGCTACAACA;SOR=0.631;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=351;TCF=173;TCR=178;TR=123;WE=179590337;WS=179590319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:246,138:0.36:384
chr2	179591708	rs114742263	C	T	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.484;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=92;ReadPosRankSum=-1.251;SC=GAAAAATATTCTATGATCTCA;SOR=0.250;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=11;WE=179591716;WS=179591698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,11:0.24:45
chr2	179600563	rs2742348	G	A	10260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=379;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=165;NR=168;PP=2965;SC=CAAACTTGTTGGAAGCCTTAC;SOR=0.792;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=333;TCF=165;TCR=168;TR=333;WE=179600571;WS=179600553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,378:1.00:378
chr2	179612883	rs139669372	A	G	3115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.925;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=76;PP=2080;ReadPosRankSum=-2.725;SC=TTTTCTCAGAAAGATCAGTTT;SOR=0.631;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=256;TCF=105;TCR=151;TR=128;WE=179612891;WS=179612873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,139:0.49:281
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chr2	179614952	rs10803917	A	G	8736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=139;NR=151;PP=2965;SC=ACCAATGCTAACTCTTCTTCC;SOR=0.850;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=290;TCF=139;TCR=151;TR=290;WE=179614960;WS=179614942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,313:1.00:313
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chr2	179615931	rs922985	C	G	3433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=44;PP=2299;SC=CTTCACTTCTCAAAGTTCTTG;SOR=0.877;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=62;TCR=44;TR=106;WE=179615939;WS=179615921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr2	179615994	rs922986	T	C	5623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=85;PP=2965;SC=TCTCCATTAATGTTTTTCTAG;SOR=0.822;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=194;TCF=109;TCR=85;TR=194;WE=179616002;WS=179615984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr2	179616770	.	GAA	G	771.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;QD=30.87;SOR=2.636;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	179618019	rs3754953	T	A	446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=10;PP=289;SC=AACAGAAAACTACATTCCCCA;SOR=3.126;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=179618027;WS=179618009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	179620951	rs7585334	C	T	6164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=132;NR=82;PP=2965;SC=CAATTAACCACCTTCTACACT;SOR=1.144;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=214;TCF=132;TCR=82;TR=214;WE=179620959;WS=179620941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr2	179621477	rs6433728	C	T	5918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=118;PP=2965;SC=TGGGACTTGGCGGACTCTCTT;SOR=1.221;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=201;TCF=83;TCR=118;TR=201;WE=179621485;WS=179621467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr2	179623758	rs2291310	C	T	8252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=158;NR=113;PP=2965;SC=TACAGCATTACTAGCAACAAA;SOR=1.007;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=271;TCF=158;TCR=113;TR=271;WE=179623780;WS=179623748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,297:1.00:297
chr2	179623772	rs45447891	G	A	3718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.967;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=67;PP=2392;ReadPosRankSum=0.089;SC=CAACAAACGTGTAAGTTCCTT;SOR=0.859;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=296;TCF=167;TCR=129;TR=160;WE=179623780;WS=179623748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,170:0.52:326
chr2	179623939	rs6705594	T	C	3796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=89;PP=2331;SC=ACCACAAAAATGAGTGGATTT;SOR=1.609;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=140;TCF=50;TCR=90;TR=139;WE=179623947;WS=179623929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr2	179629363	rs4894043	T	C	5563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=98;NR=100;PP=2965;SC=AAAGCGTGTATTCTTGCCCAT;SOR=0.762;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=198;TCF=98;TCR=100;TR=198;WE=179629371;WS=179629353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr2	179629461	rs2291311	C	T	2818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=41;NR=53;PP=1621;SC=CCGGATATCACGGCACAGAAG;SOR=1.043;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=41;TCR=53;TR=94;WE=179629469;WS=179629451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr2	179632710	rs2291313	T	C	10996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=394;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=206;NR=164;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.675;SC=AACTGGGAATTACTGGAATGT;SOR=0.310;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=371;TCF=207;TCR=164;TR=370;WE=179632718;WS=179632700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,393:1.00:394
chr2	179633298	rs4471922	G	T	588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=18;NR=0;PP=467;SC=CCCATCGTATGGCTATCCCAC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=179633306;WS=179633288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	179634376	rs72125115	GTA	G	2193.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.98;QD=34.28;SOR=1.942;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr2	179635882	rs4894047	C	T	827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=3;PP=627;SC=TCTTTTAAAACGATAACGATC;SOR=3.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=27;WE=179635890;WS=179635872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	179638238	rs2291306	G	A	2971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=53;PP=1758;ReadPosRankSum=-0.079;SC=CTATCAGCTTGTAAGGTCCTT;SOR=0.667;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=235;TCF=136;TCR=99;TR=126;WE=179638246;WS=179638228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,136:0.55:248
chr2	179639297	rs3816781	C	T	367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=13;PP=310;SC=TTATCTCCCCCATACTATCAG;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=179639305;WS=179639287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	179642425	rs719201	G	A	7450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=147;NR=102;PP=2965;SC=AACTTATCACGCTTACCATCA;SOR=1.060;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=250;TCF=148;TCR=102;TR=249;WE=179642433;WS=179642415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,271:1.00:271
chr2	179643886	rs2291302	A	G	3321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=58;PP=2275;SC=AATTTACATCAAATAGTTATA;SOR=0.978;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=107;TCF=49;TCR=58;TR=107;WE=179643894;WS=179643876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr2	179643934	rs2291301	A	G	4099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=52;PP=2421;SC=GCAAGGAGCTATGATAAATGT;SOR=0.956;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=78;TCR=52;TR=130;WE=179643942;WS=179643924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr2	179644035	rs1552280	G	A	4806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=78;PP=2812;SC=CTTGATTCTTGAATCAAATCC;SOR=0.715;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=87;TCR=78;TR=165;WE=179644043;WS=179644025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr2	179644855	rs10497520	T	C	3828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=50;PP=2297;SC=TCTCCAACTTTAGGTTCTTGA;SOR=0.914;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=122;TCF=72;TCR=50;TR=122;WE=179644863;WS=179644845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr2	179650408	rs35813871	G	A	743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=11;PP=357;ReadPosRankSum=1.082;SC=AGGGCTAGCTGTGCGGGGGCG;SOR=0.655;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=106;TCF=71;TCR=35;TR=35;WE=179650416;WS=179650398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,40:0.34:116
chr2	179698844	rs78585114	G	A	552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=403;ReadPosRankSum=-0.786;SC=GAAGATAAACGGCGGCACTTT;SOR=0.646;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=20;WE=179698852;WS=179698834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,21:0.78:27
chr2	179698945	rs16866554	G	A	895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.412;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=18;PP=543;ReadPosRankSum=-0.579;SC=TAACATAGACGACACACAGGG;SOR=0.876;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=131;TCF=73;TCR=58;TR=44;WE=179698953;WS=179698935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,49:0.35:140
chr2	179702268	rs1032283	A	G	8091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=143;NR=124;PP=2965;SC=ATGGTGCAAGAGGGGACTCAG;SOR=0.787;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=268;TCF=143;TCR=125;TR=267;WE=179702276;WS=179702258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,289:1.00:289
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chr2	179718133	rs13033688	T	A	739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.753;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=13;PP=462;ReadPosRankSum=0.065;SC=ATTTGTTCAATGGCCAATCAC;SOR=0.454;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=88;TCF=59;TCR=29;TR=36;WE=179718141;WS=179718123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,39:0.39:100
chr2	179719966	rs1872203	A	T	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.979;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=110;ReadPosRankSum=-0.975;SC=AAGGAGCATGATACATGAATA;SOR=1.845;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=8;WE=179719974;WS=179719956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,9:0.23:39
chr2	179721032	rs12464157	C	T	1487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.340;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=35;PP=884;ReadPosRankSum=-1.339;SC=GATATTTAAGCGCCTTCAGAT;SOR=0.971;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=111;TCF=56;TCR=55;TR=64;WE=179721040;WS=179721022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,71:0.58:123
chr2	179732636	rs35755711	T	C	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.691;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=2.90;ReadPosRankSum=0.703;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
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chr2	179732980	rs10165177	A	G	1277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=29;PP=889;SC=TATGAAGACAAATTTTTTTTT;SOR=2.007;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=12;TCR=29;TR=41;WE=179732988;WS=179732970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr2	179733011	rs76209803	A	T	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.822;HP=4;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=176;ReadPosRankSum=1.209;SC=TCTATAGCACATTTTGCTAGC;SOR=0.048;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=12;WE=179733019;WS=179733001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr2	179737144	rs12693170	C	A	460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=15;PP=389;SC=CAACCAAAGCCGAAGATGGTT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=179737152;WS=179737134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	179753245	rs7573293	C	T	1284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.955;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=9;PP=677;ReadPosRankSum=-1.153;SC=TTTTAGTTTACGAAACTACCT;SOR=0.869;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=71;TCF=53;TCR=18;TR=45;WE=179753253;WS=179753235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,53:0.66:80
chr2	179753549	rs1873164	G	A	462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=12;PP=316;SC=GGCATAGCAGGAAGCAAAAAT;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=179753557;WS=179753539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	179770175	rs34883828	C	A	1186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FS=1.658;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.24;ReadPosRankSum=-0.536;SOR=0.834;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:205,75:0.27:280
chr2	179809500	rs9677932	C	T	715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=15;PP=430;SC=TTATATAAACCATCTCATGTA;SOR=1.220;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=10;TCR=15;TR=25;WE=179809508;WS=179809490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	179809563	rs4146958	C	T	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.200;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=126;ReadPosRankSum=-0.812;SC=CCTCTACATGCATAAAAGAGA;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=7;WE=179809571;WS=179809553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr2	179825838	rs11303440	TG	T	328.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.614;NF=8;NR=5;PP=325;ReadPosRankSum=0.193;SC=GAAAGCTTTTTGGACCAAAGA;SOR=0.558;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=38;TCF=26;TCR=12;TR=13;WE=179825858;WS=179825828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,15:0.32:47
chr2	179826241	rs6725028	A	G	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=89;ReadPosRankSum=0.787;SC=AAAAAGAATAATGATATTAGC;SOR=0.693;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=7;WE=179826249;WS=179826231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr2	179839555	rs13019119	C	A	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.006;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=120;ReadPosRankSum=-0.844;SC=TCTAGCACACCAAATAACAGA;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=7;WE=179839563;WS=179839545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr2	179914640	rs61397643	G	A	2034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.910;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=57;PP=1421;ReadPosRankSum=-1.208;SC=CGTAGAAAGCGCAACACTAGG;SOR=0.891;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=171;TCF=67;TCR=104;TR=88;WE=179914648;WS=179914630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,92:0.51:179
chr2	179974761	rs2305170	A	C	869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.793;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=28;PP=616;ReadPosRankSum=-1.571;SC=CGGTTCTAAAAATCAAAACAC;SOR=0.597;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=98;TCF=31;TCR=67;TR=41;WE=179974769;WS=179974751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,43:0.39:110
chr2	179977723	rs17454087	C	G	980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.266;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=32;PP=722;ReadPosRankSum=1.417;SC=AAGGCATTTTCTTGTTCTTAG;SOR=1.372;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=55;TCF=8;TCR=47;TR=37;WE=179977731;WS=179977713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,39:0.66:59
chr2	179980070	rs2044479	G	A	1169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=30;PP=788;SC=TGTCGTTACAGTTAAGTGACA;SOR=4.514;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=33;WE=179980078;WS=179980060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr2	179982125	rs3217565	AAGAT	A	817.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=0;PP=728;SC=ATTCTTCAACAAGATAGATAA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=14;WE=179982136;WS=179982115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	179989039	rs2289992	G	A	1680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=6;PP=1169;SC=TTACGTGTAGGTAAGTGTTCA;SOR=3.912;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=42;TCR=6;TR=48;WE=179989047;WS=179989029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr2	179996977	rs17363323	T	C	700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=13;PP=395;ReadPosRankSum=1.318;SC=CATATGCTACTAATTACCCAC;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=101;TCF=64;TCR=37;TR=36;WE=179996985;WS=179996967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,40:0.35:115
chr2	179997177	rs3214766	AT	A	1829.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=33;PP=1110;SC=TTGAGATAACATTTTTTAAAG;SOR=1.214;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=41;TCF=3;TCR=38;TR=36;WE=179997185;WS=179997167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr2	180015941	rs148589684	TA	T	590.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.559;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=432;ReadPosRankSum=-1.044;SC=ACTAAAATGATAAAGTTATCA;SOR=0.368;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=33;TCF=23;TCR=10;TR=14;WE=180015949;WS=180015931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,21:0.52:40
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chr2	180047746	rs1446673	G	C	1715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.705;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=24;PP=1170;ReadPosRankSum=-1.388;SC=ACAATAGAAAGAATCATTAGT;SOR=0.586;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=115;TCF=77;TCR=38;TR=68;WE=180047754;WS=180047736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,76:0.59:128
chr2	180047908	rs6757681	T	C	5403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=107;PP=2965;SC=TCCGTCTGTCTTTTCCTCCTA;SOR=1.333;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=172;TCF=65;TCR=107;TR=172;WE=180047916;WS=180047898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr2	180308028	rs2367796	C	T	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=217;ReadPosRankSum=0.587;SC=TGGGCCCATGCCCAGGCCTCA;SOR=0.807;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=17;WE=180308036;WS=180308018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr2	180308335	rs10171283	C	G	65.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5025;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=42;ReadPosRankSum=-0.319;SC=GTCAAGAAATCATTATTTTCA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=180308343;WS=180308325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr2	180311207	rs2271760	G	A	717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.599;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=11;PP=481;ReadPosRankSum=0.013;SC=GGAAAAGTTGGGTTTTGTTAT;SOR=0.336;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=64;TCF=45;TCR=19;TR=33;WE=180311215;WS=180311197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,34:0.49:70
chr2	180383498	rs4567894	C	A	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=74;ReadPosRankSum=0.060;SC=AAAGAGTCTCCTTCAACAGTA;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=6;WE=180383506;WS=180383488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr2	180387784	rs72954339	G	A	573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.910;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=16;PP=339;ReadPosRankSum=0.209;SC=GGCAGCAAAAGTTAACACTTG;SOR=0.297;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=64;TCF=26;TCR=38;TR=30;WE=180387792;WS=180387774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,30:0.43:69
chr2	180448523	rs11695089	A	G	776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.926;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=3;PP=594;ReadPosRankSum=0.019;SC=TCTTCCTACTATCCCCATGAT;SOR=1.335;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=75;TCF=65;TCR=10;TR=30;WE=180448531;WS=180448513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,31:0.40:77
chr2	180610312	rs79002982	C	T	1646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=32;PP=1058;ReadPosRankSum=-0.758;SC=AGCTTTGCTCCTTCAGATGTG;SOR=0.692;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=207;TCF=125;TCR=82;TR=80;WE=180610320;WS=180610302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,86:0.39:221
chr2	180610350	rs1533383	GG	AC	6871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.894;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=72;PP=2944;ReadPosRankSum=0.747;SC=ACACAATTGAGGACTCCACAG;SOR=0.633;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=275;TCF=150;TCR=125;TR=155;WE=180610359;WS=180610340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,175:0.59:298
chr2	180725481	rs259816	T	C	2784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.27;SOR=1.244;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr2	180810180	rs6433817	C	T	7499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=148;NR=97;PP=2965;SC=CTCTGTCATTCGCAACTCTAC;SOR=1.089;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=245;TCF=148;TCR=97;TR=245;WE=180810188;WS=180810170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,272:1.00:272
chr2	180810264	rs6433818	A	T	10875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=394;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.307;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=194;NR=162;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.322;SC=AATTTGAACCACTTGAATTTT;SOR=0.448;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=357;TCF=194;TCR=163;TR=356;WE=180810272;WS=180810254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,393:1.00:394
chr2	180815528	rs2304858	A	T	2808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=45;PP=1771;SC=TAATCTGAACATAAATTCTGA;SOR=0.733;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=92;TCF=47;TCR=45;TR=92;WE=180815536;WS=180815518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr2	180823590	rs10497553	C	T	153.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=1;PP=108;SC=CTGAAACACCCTAAGCTTTGT;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=180823598;WS=180823580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	180835589	rs4894140	A	G	5691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=81;PP=2965;SC=TATAGCTAAAAGTTAACAGAA;SOR=0.919;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=180;TCF=99;TCR=81;TR=180;WE=180835597;WS=180835579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr2	180835607	.	A	C	1633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.909;ClippingRankSum=0.000;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.499;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=36;PP=1026;ReadPosRankSum=-0.546;SC=GAAAGAAAAGACAATAAAATA;SOR=0.516;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=183;TCF=102;TCR=81;TR=72;WE=180835615;WS=180835597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,81:0.41:199
chr2	180835792	rs3768837	T	A	5321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=111;PP=2965;SC=CTAAGCATAATACTTCGTGTG;SOR=1.523;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=172;TCF=61;TCR=111;TR=172;WE=180835800;WS=180835782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr2	180837722	rs6433820	T	C	259.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=1;PP=210;SC=GGCGACAGAGTGAGACTCCAT;SOR=3.056;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=180837730;WS=180837712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	180837806	rs6433821	T	A	3914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=89;NR=46;PP=2410;SC=CATCCAACATTTTTATCCCAA;SOR=1.355;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=135;TCF=89;TCR=46;TR=135;WE=180837814;WS=180837796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr2	180843126	rs2367990	C	T	529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=13;PP=350;SC=CTACATAGTGCTCCTTAATTT;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=16;WE=180843134;WS=180843116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	180846743	rs3738943	G	T	1318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=30;PP=869;SC=TAAATTTTTTGAAGAGCAGAA;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=16;TCR=30;TR=46;WE=180846751;WS=180846733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	182344846	rs11412304	G	GT	463.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=1.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.88;ReadPosRankSum=-0.115;SOR=0.420;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,23:0.64:36
chr2	182346232	.	T	C	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.786;ClippingRankSum=0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=6.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.632;SOR=0.226;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,22:0.41:54
chr2	182350447	rs155102	A	G	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=131;ReadPosRankSum=0.509;SC=CTCAATAAATATTTATTGAAT;SOR=1.302;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=8;WE=182350455;WS=182350443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
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chr2	182359613	rs165419	G	A	613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=18;PP=475;SC=AGTGAAGTACGTAAAACTGGT;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=182359621;WS=182359603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	182374328	rs3816521	T	A	1808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.459;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=24;PP=1097;ReadPosRankSum=1.801;SC=GGAGTTTTATTTTTTTTTAAT;SOR=0.899;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=125;TCF=88;TCR=37;TR=78;WE=182374336;WS=182374318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,84:0.60:141
chr2	182374534	rs1143674	A	G	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=25;PP=493;ReadPosRankSum=1.293;SC=TGAAAAAAACAGTAGGAATAT;SOR=0.737;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=96;TCF=28;TCR=68;TR=35;WE=182374542;WS=182374524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,38:0.37:103
chr2	182374553	rs2305584	A	T	1398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=27;PP=1186;ReadPosRankSum=0.788;SC=ATTTTCCTTTATTCAAATTAT;SOR=0.588;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=68;TCF=20;TCR=48;TR=39;WE=182374575;WS=182374543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,42:0.58:73
chr2	182374567	rs2305583	A	G	1107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.482;HP=2;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=20;PP=1186;ReadPosRankSum=-0.012;SC=AAATTATTGTATGGCATTTAA;SOR=1.112;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=42;TCF=9;TCR=33;TR=25;WE=182374575;WS=182374543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,28:0.62:45
chr2	182376546	rs1466109	T	G	4248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=76;PP=2642;SC=ATCGAGAGGGTGTAATGAGTG;SOR=0.884;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=71;TCR=76;TR=147;WE=182376554;WS=182376536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr2	182387133	rs7602504	A	G	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=385;ReadPosRankSum=-1.333;SC=TTAAAAGTAAATGGTAGAATT;SOR=0.726;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=46;TCF=7;TCR=39;TR=21;WE=182387141;WS=182387123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,21:0.45:47
chr2	182392143	rs56095368	G	C	2621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.209;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=42;PP=1612;ReadPosRankSum=-1.893;SC=GTTAATATTTGTAACAACCTA;SOR=0.825;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=165;TCF=93;TCR=72;TR=99;WE=182392151;WS=182392133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,112:0.63:179
chr2	182395345	rs1143676	G	A	2657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=466;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=64;PP=1739;ReadPosRankSum=-0.244;SC=GGCATAGTCCGGTTCTTGTCC;SOR=0.730;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=425;TCF=218;TCR=207;TR=137;WE=182395353;WS=182395335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:313,148:0.32:461
chr2	182399097	rs7562325	T	C	1119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.605;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=29;PP=514;ReadPosRankSum=0.237;SC=ATGTTGCGCATGTAAGATTAC;SOR=0.759;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=138;TCF=64;TCR=74;TR=54;WE=182399105;WS=182399087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,62:0.40:156
chr2	182399497	rs11418738	A	ATT	312.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=1.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.74;ReadPosRankSum=-1.734;SOR=0.935;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,15:0.23:66
chr2	182399638	rs2124443	A	G	1294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=15;NR=31;PP=807;SC=TTGTACTTCTATTGATCTCAT;SOR=1.755;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=15;TCR=31;TR=46;WE=182399646;WS=182399628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	182399685	rs41265949	C	T	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-3.481;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=146;ReadPosRankSum=0.478;SC=CAATTACCAACATTAGTCTAC;SOR=0.446;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=9;WE=182399693;WS=182399675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr2	182402790	rs6747500	G	A	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.43;ReadPosRankSum=-2.253;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr2	182403792	rs57234957	A	AT	8783.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=55;PP=2936;SC=ACTGGTTGACAATAAGCGGTG;SOR=1.383;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=125;TCF=67;TCR=58;TR=116;WE=182403800;WS=182403782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr2	182403851	rs10180793	G	A	11650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=432;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=207;NR=154;PP=2965;SC=CTTCCATTAAGTCACCATCTA;SOR=0.951;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=361;TCF=207;TCR=154;TR=361;WE=182403859;WS=182403841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,432:1.00:432
chr2	182412633	rs139036113	G	GACACACACACACAC	1565.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FS=14.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.04;MQRankSum=2.020;QD=7.68;ReadPosRankSum=2.429;SOR=1.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:153,51:0.25:204
chr2	182412723	rs34890422	C	CGT	141.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=179;ReadPosRankSum=0.494;SC=TAAGTAAAAACGTACAATTTT;SOR=0.075;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=6;WE=182412731;WS=182412713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,6:0.20:30
chr2	182413259	rs12997453	A	G	704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.873;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=10;PP=460;ReadPosRankSum=-2.729;SC=TATTACATTGAGTTTTTACCT;SOR=0.862;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=73;TCF=50;TCR=23;TR=33;WE=182413267;WS=182413249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,35:0.43:82
chr2	182413602	rs13003064	A	T	1664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=48;PP=1069;ReadPosRankSum=-0.785;SC=ATTACATTAAATATTAATCAG;SOR=0.685;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=193;TCF=83;TCR=110;TR=82;WE=182413610;WS=182413592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,85:0.42:202
chr2	182430261	.	T	C	2534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=0.000;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=62;PP=1552;ReadPosRankSum=-1.760;SC=ACCTAAATTGTAGTCACTACA;SOR=0.688;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=266;TCF=117;TCR=149;TR=111;WE=182430269;WS=182430251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,127:0.43:296
chr2	182521578	rs1473295	G	A	4206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=437;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.518;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=101;PP=2677;ReadPosRankSum=-0.756;SC=TCCCGATCTCGAAGATGCCCC;SOR=0.756;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=411;TCF=204;TCR=207;TR=197;WE=182521592;WS=182521568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:227,209:0.48:436
chr2	182543455	rs1801262	T	C	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=0.711;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.70;ReadPosRankSum=-1.826;SOR=0.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:113,36:0.24:149
chr2	182794534	rs1051085	G	A	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=28;ReadPosRankSum=-0.189;SC=TTGTATGTCAGTATTTTTCAT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=182794542;WS=182794524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr2	182928555	rs1196161	G	C	8690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=145;NR=145;PP=2965;SC=GTCATGAGTGGTGAATCATGG;SOR=0.784;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=292;TCF=145;TCR=147;TR=290;WE=182928563;WS=182928545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,320:1.00:320
chr2	182981846	rs1882211	G	C	919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=2;PP=624;SC=TGAAAACTTTGCACTCTTTTC;SOR=3.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=25;WE=182981854;WS=182981836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	182981968	rs1882212	A	G	2372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.616;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=54;PP=1409;ReadPosRankSum=1.239;SC=ATGAATCAGCATTCCCTGAAG;SOR=0.480;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=270;TCF=155;TCR=115;TR=115;WE=182981976;WS=182981958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,125:0.42:299
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chr2	183088584	rs3754929	G	A	569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=13;PP=480;ReadPosRankSum=-1.490;SC=TACTTTTTCAGACTTACCTTG;SOR=0.610;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=104;TCF=65;TCR=39;TR=31;WE=183088592;WS=183088574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,33:0.28:118
chr2	183106758	rs2568667	T	G	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.990;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=17;PP=375;ReadPosRankSum=-0.338;SC=TCAGATACAGTGTAGGTAGAA;SOR=0.501;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=64;TCF=22;TCR=42;TR=27;WE=183106766;WS=183106748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,28:0.40:70
chr2	183593394	rs193261690	T	C	2199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.526;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=33;PP=1027;ReadPosRankSum=-0.664;SC=CAGTATGTATTTTTCACATCC;SOR=0.529;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=111;TCF=60;TCR=51;TR=79;WE=183593402;WS=183593384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,99:0.72:137
chr2	183593697	rs288280	C	T	4104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.424;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=97;PP=2580;ReadPosRankSum=1.217;SC=GCTATCCCAGCCTCTTCATTT;SOR=0.792;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=270;TCF=119;TCR=151;TR=171;WE=183593705;WS=183593687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,184:0.61:301
chr2	183594699	rs185305206	T	C	1070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=28;PP=637;ReadPosRankSum=1.033;SC=TGCTTGATTTTCAGGGTATTT;SOR=0.687;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=85;TCF=27;TCR=58;TR=42;WE=183594707;WS=183594689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,49:0.52:95
chr2	183597318	rs825660	A	G	2086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.460;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=56;PP=1282;ReadPosRankSum=-1.555;SC=AAAGAAACACATTTAGAAATT;SOR=0.978;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=131;TCF=38;TCR=93;TR=78;WE=183597326;WS=183597308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,89:0.62:144
chr2	183616592	rs3098359	C	T	3318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=72;PP=2567;SC=CTAGATAACTCTGAATCATTA;SOR=1.841;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=104;TCF=32;TCR=72;TR=104;WE=183616600;WS=183616582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr2	183622547	rs288334	T	G	826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.009;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=24;PP=568;ReadPosRankSum=-0.379;SC=AAGCTTATCATTATCAGTAAG;SOR=0.976;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=67;TCF=26;TCR=41;TR=37;WE=183622555;WS=183622537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,39:0.54:72
chr2	183627619	rs190830	C	G	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.729;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=390;ReadPosRankSum=-0.854;SC=TCTGTTTTCTCATCCTTGTCA;SOR=1.270;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=21;WE=183627627;WS=183627609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,25:0.66:38
chr2	183793383	rs9333279	T	C	1096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=1;PP=599;SC=AACTGCAGTTTAGGAAAAGGG;SOR=4.174;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=183793391;WS=183793373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	183793398	rs9333280	A	G	1450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=33;NR=1;PP=761;SC=AAAGGGAAACAGACTACCCCA;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=34;WE=183793406;WS=183793388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr2	183799558	rs9288088	G	C	2458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=41;PP=1545;SC=GGTAGGATAAGACCTAGGCAG;SOR=0.859;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=40;TCR=41;TR=81;WE=183799566;WS=183799548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr2	183827018	rs2271671	G	A	4566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=86;PP=2782;SC=TGTGAAGGCAGAATAATAATA;SOR=1.348;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=142;TCF=55;TCR=87;TR=141;WE=183827026;WS=183827008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr2	183851058	rs10185562	C	T	207.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=145;SC=ATTATCAATTCAGAAACTGGC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=183851066;WS=183851048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	183960143	.	GT	G	93.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.87;ReadPosRankSum=-0.745;SOR=0.758;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,12:0.24:50
chr2	183960522	rs13399265	T	C	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=90;ReadPosRankSum=0.947;SC=GGAGGTCAATTTGATTGTCCT;SOR=0.141;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=6;WE=183960530;WS=183960512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr2	183988984	rs2705719	C	G	672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=5;PP=512;SC=CTTCCCGGTGCAAAAACCCTT;SOR=2.400;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=23;WE=183988992;WS=183988974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	183995742	rs925803	A	C	1162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=25;PP=674;ReadPosRankSum=-0.224;SC=CAGGGTCCTGATCAGTTGCCC;SOR=0.736;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=43;TCR=49;TR=48;WE=183995750;WS=183995732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,55:0.54:102
chr2	183998237	rs1980160	C	T	1538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.293;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=38;PP=863;ReadPosRankSum=1.559;SC=AGCCTTTTAACACTTACTGTA;SOR=0.823;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=140;TCF=70;TCR=70;TR=74;WE=183998245;WS=183998227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,78:0.53:147
chr2	184022015	rs3791249	G	C	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.960;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=116;ReadPosRankSum=-0.460;SC=GTCACTGACAGAATTAGCCCA;SOR=1.204;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=9;WE=184022023;WS=184022005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,11:0.34:32
chr2	185243700	rs12693375	C	T	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.208;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=265;ReadPosRankSum=-1.086;SC=GCAAAAGTAACGGCAGTTTTT;SOR=1.325;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=43;TCF=34;TCR=9;TR=18;WE=185243708;WS=185243690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,21:0.46:46
chr2	185798504	rs4667000	A	C	2913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.952;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=73;PP=2053;ReadPosRankSum=0.012;SC=AACATGACCAAAAAAGGGGTA;SOR=0.994;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=197;TCF=78;TCR=119;TR=113;WE=185798512;WS=185798494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,125:0.57:218
chr2	185800905	rs12476147	A	T	4016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.823;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=93;PP=2536;ReadPosRankSum=-0.804;SC=CATCTTCAACAATCTTCACCA;SOR=0.745;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=307;TCF=144;TCR=163;TR=172;WE=185800913;WS=185800895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,187:0.55:339
chr2	185801559	rs35676856	A	G	1862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.496;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=31;PP=1289;ReadPosRankSum=-0.648;SC=AATAAGCCAGACTTAAAAGAT;SOR=0.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TCF=135;TR=83;WE=185801567;WS=185801549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,90:0.37:241
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chr2	185801917	rs728534	A	G	1291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=1.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.96;ReadPosRankSum=1.841;SOR=0.535;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,57:0.53:108
chr2	185802211	rs5836928	C	CACA	3068.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.159;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.221;NF=16;NR=29;PP=2045;ReadPosRankSum=-0.588;SC=GTAAAAAGAACACAATACTTT;SOR=0.782;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=84;TCF=26;TCR=58;TR=45;WE=185802219;WS=185802192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,77:0.58:133
chr2	185802243	rs1366842	C	A	2197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.334;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.342;NF=44;NR=36;PP=1415;ReadPosRankSum=-0.142;SC=TCAAATGCAACAATGATACAT;SOR=0.834;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=69;TCR=57;TR=80;WE=185802251;WS=185802233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,94:0.63:149
chr2	185802363	rs12477430	A	G	5418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=86;PP=2965;SC=GATATGAAACACATGAGTCAG;SOR=0.733;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=184;TCF=97;TCR=87;TR=183;WE=185802371;WS=185802353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr2	185803364	rs3731834	C	G	3913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.561;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=85;PP=2555;ReadPosRankSum=1.734;SC=TAGCACACCTCTGCAGCCTTT;SOR=0.788;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=265;TCF=134;TCR=131;TR=160;WE=185803372;WS=185803354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,170:0.60:284
chr2	186603605	rs35617283	A	AG	1262.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.555;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=20;PP=806;ReadPosRankSum=1.878;SC=GAAGGGGCTGAGGGGGCTGTG;SOR=0.446;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=62;TCF=11;TCR=51;TR=27;WE=186603613;WS=186603595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,50:0.48:104
chr2	186610344	rs11884004	T	G	3071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.594;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=74;PP=1964;ReadPosRankSum=0.316;SC=TGGACCCAAATAAGCTGGAAA;SOR=0.617;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=168;TCF=59;TCR=109;TR=115;WE=186610352;WS=186610334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,128:0.66:193
chr2	186610388	rs17813736	G	A	1101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.528;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=30;PP=760;ReadPosRankSum=-0.130;SC=TTTAAGTACTGGACACCATTC;SOR=0.265;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=61;TCF=16;TCR=45;TR=43;WE=186610396;WS=186610378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,45:0.68:66
chr2	186611566	rs6758484	C	A	4595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=105;PP=2965;SC=AAAATATTAACAGAAAAATTG;SOR=2.303;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=141;TCF=36;TCR=105;TR=141;WE=186611574;WS=186611556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr2	186611938	rs12618129	G	A	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=228;ReadPosRankSum=2.179;SC=CCTGATTTCTGTTAGGCCCTG;SOR=0.963;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=14;WE=186611946;WS=186611928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr2	186625670	.	TAA	T	390.06	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.685;ClippingRankSum=0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.24;MQRankSum=0.722;QD=24.38;ReadPosRankSum=-0.219;SOR=0.416;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,15:0.94:16
chr2	186625770	rs7562137	A	G	1153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.853;NF=28;NR=26;PP=758;ReadPosRankSum=-0.182;SC=ATTTTACGAAAAAAAACTCAG;SOR=0.689;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=94;TCF=50;TCR=44;TR=54;WE=186625778;WS=186625760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,57:0.55:104
chr2	186627943	rs17228441	T	C	3010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=58;PP=1896;ReadPosRankSum=0.938;SC=GGTTCAATTATTTCAGCGCAG;SOR=0.666;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=209;TCF=114;TCR=95;TR=129;WE=186627951;WS=186627933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,137:0.61:224
chr2	186629191	rs12998112	T	G	958.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.857;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.99;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=10;PP=603;ReadPosRankSum=0.818;SC=AAATTTTTTTTTGTGGATCTA;SOR=1.212;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=121;TCF=78;TCR=43;TR=40;WE=186629199;WS=186629173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,46:0.35:131
chr2	186629349	rs1986166	G	A	1137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.059;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.785;NF=16;NR=33;PP=792;ReadPosRankSum=0.876;SC=TCTTTCAACTGACATTTACTG;SOR=1.089;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=82;TCF=30;TCR=52;TR=49;WE=186629357;WS=186629339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,50:0.59:85
chr2	186647270	rs140906899	T	TA	444.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=387;ReadPosRankSum=-0.078;SC=GATCTTACAGTACAGGTCCTT;SOR=1.127;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=10;WE=186647278;WS=186647260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr2	186654592	rs992822	A	G	1925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.872;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=34;PP=1253;ReadPosRankSum=-1.970;SC=GAAGCAATCAATGCTATACTA;SOR=0.486;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=137;TCF=79;TCR=58;TR=76;WE=186654600;WS=186654582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,86:0.55:155
chr2	186655726	rs10931199	G	A	3161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=47;PP=1871;SC=TCTTCATTACGATCTCAACTT;SOR=0.729;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=50;TCR=47;TR=97;WE=186655734;WS=186655716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr2	186656657	rs10173807	C	T	2457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.797;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=43;PP=1443;ReadPosRankSum=0.378;SC=GGTTTGCCAACGGACATTTAG;SOR=0.757;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=149;TCF=80;TCR=69;TR=90;WE=186656665;WS=186656647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,105:0.62:168
chr2	186656840	rs17815052	T	C	2884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=52;ReadPosRankSum=-0.916;SC=CAGAATTAAATGTGACCTCAT;SOR=0.695;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=208;TCF=116;TCR=92;TR=119;WE=186656848;WS=186656830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,132:0.59:225
chr2	186656956	rs17229201	T	C	2639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.504;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=51;PP=1481;ReadPosRankSum=-0.162;SC=TTTAATGAAATGGAATCTGAA;SOR=0.734;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=193;TCF=98;TCR=95;TR=107;WE=186656964;WS=186656946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,119:0.56:211
chr2	186657089	rs17229222	C	A	2271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=55;PP=1426;ReadPosRankSum=-1.220;SC=ATGAGAGATCCCCACAAAGAG;SOR=0.726;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=174;TCF=77;TCR=97;TR=97;WE=186657097;WS=186657079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,105:0.54:194
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chr2	186659359	rs2161036	G	T	1562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=32;PP=907;ReadPosRankSum=1.061;SC=CAAAGAGTAAGGGAAGTCACA;SOR=0.715;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=139;TCF=71;TCR=68;TR=63;WE=186659367;WS=186659349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,74:0.46:160
chr2	186661673	rs55938253	A	G	4052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.417;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=88;PP=2550;ReadPosRankSum=-1.928;SC=GCAGTTTCTTACAAAAGCTGC;SOR=0.733;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=282;TCF=130;TCR=152;TR=163;WE=186661681;WS=186661663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,179:0.58:311
chr2	186664473	rs11686997	T	C	1200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.779;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=18;PP=681;ReadPosRankSum=-0.428;SC=GGAAAAAATATGAATCAAAAC;SOR=1.140;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=102;TCF=64;TCR=38;TR=53;WE=186664481;WS=186664463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,56:0.52:107
chr2	186664963	rs10931200	C	A	2757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.620;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=56;PP=1662;ReadPosRankSum=-0.976;SC=TAGTGTACCCCTTTGCAACAA;SOR=0.574;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=181;TCF=96;TCR=85;TR=117;WE=186664971;WS=186664953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,124:0.65:192
chr2	186665432	rs36004074	G	A	2017.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.241;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=38;PP=1433;ReadPosRankSum=-1.202;SC=GTAGAAGATGGAAAATCTGAT;SOR=0.838;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=157;TCF=84;TCR=73;TR=84;WE=186665440;WS=186665422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,85:0.53:160
chr2	186665824	rs11695215	A	G	3742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.419;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=69;PP=2482;ReadPosRankSum=-1.047;SC=AGCACCATTTAACAAGCATTG;SOR=0.740;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=276;TCF=150;TCR=126;TR=150;WE=186665832;WS=186665814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,165:0.55:302
chr2	186667121	rs7605884	T	C	2064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.601;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=40;PP=1230;ReadPosRankSum=1.532;SC=CAGGCTTTCTTTTCTTTCAAT;SOR=0.621;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=141;TCF=68;TCR=73;TR=81;WE=186667129;WS=186667111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,91:0.59:155
chr2	186668935	rs13003744	A	G	1032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=18;PP=417;ReadPosRankSum=-0.252;SC=TTCACATAACATGTTGGTTAC;SOR=0.645;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=130;TCF=75;TCR=55;TR=44;WE=186668943;WS=186668925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,57:0.38:151
chr2	186670104	rs7576532	A	C	5832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=109;NR=80;PP=2965;SC=TTGTATATGAACAGTTCATAG;SOR=0.841;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=191;TCF=110;TCR=81;TR=189;WE=186670112;WS=186670094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr2	186670780	rs16827154	T	A	2557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.548;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=44;PP=1720;ReadPosRankSum=-1.262;SC=TGATGAGATATACACACATTT;SOR=0.625;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=175;TCF=107;TCR=68;TR=107;WE=186670788;WS=186670770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,112:0.59:190
chr2	186670979	rs4666689	T	C	8804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=163;NR=146;PP=2965;SC=GAAATAAGAATTCGAACATCA;SOR=0.736;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=310;TCF=163;TCR=147;TR=309;WE=186670987;WS=186670969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,329:1.00:329
chr2	186671357	rs17826534	G	A	2413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=42;PP=1427;ReadPosRankSum=-0.613;SC=CAAAACCAACGAGAAAGTAAA;SOR=0.698;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=170;TCF=96;TCR=74;TR=94;WE=186671365;WS=186671347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,106:0.56:188
chr2	186671912	rs1862066	G	A	2311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.474;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=42;PP=1276;ReadPosRankSum=-0.055;SC=ATTTTCCAACGTCAGGTTAAC;SOR=0.642;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=212;TCF=114;TCR=98;TR=93;WE=186671920;WS=186671902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,109:0.46:238
chr2	186672527	rs72900086	T	A	2656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.098;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=52;PP=1750;ReadPosRankSum=-0.378;SC=GATGTGCCCCTACCTAAACCT;SOR=0.611;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=190;TCF=100;TCR=90;TR=112;WE=186672535;WS=186672517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,121:0.57:212
chr2	186672897	rs4666690	A	G	912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.693;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=21;PP=574;ReadPosRankSum=0.780;SC=TAGGCTTTTTAATGGTGAATG;SOR=0.569;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=64;TCR=52;TR=46;WE=186672905;WS=186672887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,48:0.40:121
chr2	186678241	rs34138386	A	AT	162.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.812;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5016;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=101;ReadPosRankSum=-0.282;SC=TAGGCATTTGATTTTAATATT;SOR=0.859;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=4;WE=186678249;WS=186678231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr2	186678633	rs17826666	C	T	2776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=55;PP=1728;ReadPosRankSum=0.532;SC=ATTGAAAGTACTGAAGCAATC;SOR=0.681;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=277;TCF=156;TCR=121;TR=124;WE=186678641;WS=186678623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,137:0.45:306
chr2	186678887	rs2161035	T	C	894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.478;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=29;PP=590;ReadPosRankSum=0.598;SC=ATCTCAAGCCTGGTGATATTT;SOR=0.377;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=64;TCF=18;TCR=46;TR=42;WE=186678895;WS=186678877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,42:0.65:65
chr2	186680041	rs2287606	G	T	843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=10;PP=446;ReadPosRankSum=-1.248;SC=ATGCCATAAGGTAAGAAAATA;SOR=0.586;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=35;TCR=15;TR=33;WE=186680049;WS=186680031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,39:0.66:59
chr2	186696759	rs2302913	C	T	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.200;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=123;ReadPosRankSum=0.319;SC=TTACTGTTTGCATAAATACCA;SOR=0.859;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=7;WE=186696767;WS=186696749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr2	186697876	rs1468999	A	G	8224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=133;NR=144;PP=2965;SC=AATGTCTTCAACTTTGTCAAA;SOR=0.875;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=279;TCF=134;TCR=145;TR=277;WE=186697884;WS=186697866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,308:1.00:308
chr2	187364811	rs4144786	G	A	324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=238;SC=GGTAAGGACTGTAAATATGCA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=187364819;WS=187364801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
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chr2	187368733	rs10164423	G	A	1804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=34;PP=1076;ReadPosRankSum=-1.072;SC=CTGAGCCACCGCTTGTGAATA;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=195;TCF=120;TCR=75;TR=88;WE=187368741;WS=187368723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,95:0.43:220
chr2	187370673	rs11690758	G	C	3165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.652;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=70;PP=1698;ReadPosRankSum=1.028;SC=ACAGTGCCTGGGTTCAAATCC;SOR=0.864;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=248;TCF=124;TCR=124;TR=137;WE=187370681;WS=187370663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,150:0.55:272
chr2	187371606	.	T	TA	1471.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.375;ClippingRankSum=0.000;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.376;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=22;PP=981;ReadPosRankSum=1.705;SC=ACTAGGAAGTTATCTAAAGGG;SOR=0.944;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=60;TCF=12;TCR=48;TR=27;WE=187371614;WS=187371596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,50:0.42:119
chr2	187455278	rs9333287	C	T	933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=21;PP=563;ReadPosRankSum=-2.060;SC=GAACTGGAGCCGGCCCCCTCC;SOR=0.674;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=23;TCR=31;TR=37;WE=187455288;WS=187455268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,40:0.69:58
chr2	187487160	rs9333288	G	A	3018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.856;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=74;PP=1776;ReadPosRankSum=-1.618;SC=AAATTTTGGTGAGTCTTCTGG;SOR=0.993;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=240;TCF=107;TCR=133;TR=125;WE=187487168;WS=187487150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,144:0.53:272
chr2	187487269	rs6741369	G	T	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=260;ReadPosRankSum=2.148;SC=AAGGGCACAGGGTATAACAAC;SOR=0.255;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=14;WE=187487277;WS=187487259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr2	187490371	rs2197787	T	G	1354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.932;HP=5;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.785;NF=4;NR=35;PP=827;ReadPosRankSum=-0.090;SC=CCTAGTTTGTTAAAAATATGT;SOR=0.248;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=59;TCF=5;TCR=54;TR=39;WE=187490379;WS=187490361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,39:0.64:61
chr2	187490389	rs28633327	G	T	1030.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.25;MQRankSum=0.000;QD=23.97;ReadPosRankSum=4.632;SOR=1.206;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,26:0.60:43
chr2	187498107	rs9333289	T	C	1776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.503;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=40;PP=1037;ReadPosRankSum=-0.634;SC=GCAAGGTAGGTTAATATTTTT;SOR=0.769;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=182;TCF=91;TCR=91;TR=78;WE=187498115;WS=187498097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,91:0.42:218
chr2	187501682	rs56136540	G	A	1260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-5.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.731;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=10;PP=780;ReadPosRankSum=-1.561;SC=ACAAAATATTGCATAAGTAAA;SOR=0.229;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=81;TCF=68;TCR=13;TR=49;WE=187501690;WS=187501672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,56:0.62:90
chr2	187519338	rs9333290	G	T	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=336;ReadPosRankSum=-0.025;SC=TGTCTAAACTGAATTATAGAA;SOR=0.776;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=59;TCF=40;TCR=19;TR=27;WE=187519346;WS=187519328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,28:0.44:63
chr2	187521260	rs3738919	C	A	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=213;ReadPosRankSum=0.891;SC=GGAAATTTAGCTTTGTAAAGT;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=11;WE=187521268;WS=187521250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr2	187528635	rs3816386	A	G	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.598;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=224;ReadPosRankSum=-0.354;SC=TCAAAGGACTAACATATTTTA;SOR=0.352;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=56;TCF=18;TCR=38;TR=16;WE=187528643;WS=187528625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,18:0.31:59
chr2	187528695	rs55767908	A	G	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.137;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=130;ReadPosRankSum=-0.084;SC=TATAACACTAAAACTATCAAT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=7;WE=187528703;WS=187528685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr2	187532010	rs41265951	G	T	1563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=36;PP=982;ReadPosRankSum=-1.046;SC=CTTTTTAAAGGTAACTGTCAG;SOR=0.716;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=141;TCF=69;TCR=72;TR=69;WE=187532018;WS=187532000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,75:0.47:158
chr2	187532417	rs2230616	G	A	9167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=185;NR=130;PP=2965;SC=TCCTGATCATGTCTTTCTTCC;SOR=0.988;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=315;TCF=185;TCR=130;TR=315;WE=187532425;WS=187532407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,345:1.00:345
chr2	187533368	rs11685758	C	T	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.417;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=329;ReadPosRankSum=0.287;SC=TAGAGGTTAACTGTGGAAATT;SOR=0.365;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=65;TCF=50;TCR=15;TR=25;WE=187533376;WS=187533358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,26:0.37:70
chr2	187541377	rs35251833	G	A	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=74;ReadPosRankSum=0.516;SC=TTTCATGTGTGTATGTGCATG;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=5;WE=187541385;WS=187541375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr2	187543374	rs1839123	C	T	1160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.315;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=14;PP=596;ReadPosRankSum=-2.375;SC=TTATATGGCTCTGTAGAGTGG;SOR=0.829;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=133;TCF=84;TCR=49;TR=46;WE=187543382;WS=187543364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,59:0.38:156
chr2	187559029	.	A	ACAG,ACAGCAG	3440.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=1.808;ClippingRankSum=0.000;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.912;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.018;NF=22,22;NR=63,63;PP=1736,1721;ReadPosRankSum=0.088;SC=GCCTCATCCAACAGCAGCAGC;SOR=0.692;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=147;TCF=30;TCR=117;TR=85,85;WE=187559037;WS=187559019;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.42,0.48:194
chr2	187559047	.	G	GCAGCAA	1751	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=29;MQ=60.68;NF=22;NR=61;PP=1751;QD=21.2409638554;SC=AGCAGCAGCAGCAACAACAAC;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=165;TCF=51;TCR=114;TR=83;WE=187559055;WS=187559037;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:82,83:0.50:165
chr2	187559222	rs6705757	T	G	1477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=35;PP=1061;SC=CCCTTCCCTATCCATTCCTAT;SOR=1.791;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=17;TCR=35;TR=52;WE=187559230;WS=187559212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr2	187611748	rs2247924	G	A	2714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=29;PP=1534;SC=TTTAAAGTAAGACATCCTGAC;SOR=1.167;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=54;TCR=29;TR=83;WE=187611756;WS=187611738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr2	187626338	rs13026081	C	T	4384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=64;PP=2508;SC=AAGCTGAGGACAAGTCGCAGT;SOR=0.769;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=140;TCF=75;TCR=65;TR=139;WE=187626346;WS=187626328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr2	187698037	rs7609183	G	A	1178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=31;PP=816;SC=AGTTGGTTGCGTATCAATAAT;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=41;WE=187698045;WS=187698027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr2	188216783	rs858744	C	T	1968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.402;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=34;PP=1294;ReadPosRankSum=-0.218;SC=TAAACCAAAGCTATATGTATA;SOR=0.557;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=127;TCF=74;TCR=53;TR=81;WE=188216791;WS=188216773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,86:0.62:138
chr2	188216807	rs858745	T	C	4235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=51;PP=2875;SC=AATTCCAAACTTCTCAAGCTG;SOR=1.244;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=130;TCF=79;TCR=51;TR=130;WE=188216815;WS=188216797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr2	188227921	rs698582	A	G	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=259;ReadPosRankSum=-2.330;SC=CTATATTCCAATGTAGAAAGG;SOR=0.963;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=12;WE=188227929;WS=188227915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr2	188243633	rs3771084	A	G	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=105;ReadPosRankSum=-1.459;SC=CAAGACATCTAGTAATTTTCT;SOR=0.546;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=11;WE=188243641;WS=188243623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,12:0.32:38
chr2	188245640	rs1511877	G	A	566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=17;PP=465;SC=GACATTATATGAAAATCTATA;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=188245648;WS=188245630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	188250301	rs698577	T	A	4701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=79;NR=80;PP=2503;SC=ACCAGAAAATTCAGGGTACAC;SOR=0.798;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=159;TCF=79;TCR=80;TR=159;WE=188250309;WS=188250291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr2	188331890	rs111681715	C	A	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.339;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.119;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=158;ReadPosRankSum=-0.736;SC=GATTTAAAAGCCTTTAATTTG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=9;WE=188331898;WS=188331880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr2	188332692	rs8176592	A	G	2777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.226;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=73;PP=1824;ReadPosRankSum=0.509;SC=GGTAAGCCATATGTGATAGTG;SOR=0.850;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=224;TCF=87;TCR=137;TR=116;WE=188332700;WS=188332682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,125:0.51:244
chr2	188343497	rs7586970	T	C	856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.001;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=20;PP=496;ReadPosRankSum=-0.480;SC=ATGAGCCGCATTCTTCCAACC;SOR=0.894;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=52;TCF=22;TCR=30;TR=32;WE=188343505;WS=188343487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,38:0.59:64
chr2	188348696	rs144825443	TAAAC	T	37.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.55;ReadPosRankSum=-0.842;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,2:0.40:5
chr2	189448896	rs2048138	A	T	1462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=82;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=4;PP=961;SC=TGCAACTGAAATTGTTGTTTA;SOR=4.047;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=39;TCR=4;TR=43;WE=189448904;WS=189448886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	189448931	rs72270766	TATTTAGCATTACA	T	3374.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.485;HP=4;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.720;NF=22;NR=15;PP=2962;ReadPosRankSum=1.584;SC=GCATATGAAATATTTAGCATT;SOR=0.310;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=73;TCF=41;TCR=32;TR=37;WE=189448951;WS=189448921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,85:0.67:127
chr2	189449248	rs13019484	A	G	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.10;ReadPosRankSum=0.059;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr2	189855166	rs13306275	A	G	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.954;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=13;PP=228;ReadPosRankSum=-1.033;SC=CTGGACAATTATGTGCCAAAA;SOR=0.484;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=70;TCF=27;TCR=43;TR=23;WE=189855174;WS=189855156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,30:0.36:84
chr2	189859434	rs371354802	CT	C	249.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=1.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.32;ReadPosRankSum=0.125;SOR=1.244;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr2	189861031	rs141685938	T	TAC	201.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.494;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=4;PP=529;ReadPosRankSum=-0.547;SC=TCTATATATATACACACACAC;SOR=0.760;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=23;TCF=13;TCR=10;TR=9;WE=189861041;WS=189861021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr2	189861033	rs192889832	C	T	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.162;HP=2;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.522;NF=4;NR=4;PP=418;ReadPosRankSum=2.761;SC=TATATATATACACACACACAC;SOR=0.799;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=22;TCF=13;TCR=9;TR=8;WE=189861041;WS=189861021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr2	189862048	rs7579815	G	C	829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.617;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=21;PP=595;ReadPosRankSum=-0.625;SC=TTCCCTAACTGTTCTTGTTTT;SOR=0.927;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=94;TCF=49;TCR=45;TR=40;WE=189862056;WS=189862038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,42:0.40:104
chr2	189862097	rs7579903	G	A	946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.218;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=28;PP=671;ReadPosRankSum=-0.331;SC=CTGGACCTCAGGGACCCCCAG;SOR=1.261;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=82;TCF=33;TCR=49;TR=42;WE=189862105;WS=189862087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,44:0.50:88
chr2	189862203	rs3134654	C	T	418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=7;PP=305;SC=TCTCTGACACCATGTTGTTAC;SOR=0.976;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=6;TCR=7;TR=13;WE=189862211;WS=189862193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	189864582	rs1801184	T	C	6822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=125;PP=2965;SC=AACCAGGCGGTCCAGGTGCTG;SOR=0.978;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=232;TCF=107;TCR=125;TR=232;WE=189864590;WS=189864572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr2	189870246	rs7583195	A	C	2145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.601;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=40;PP=1381;ReadPosRankSum=0.071;SC=AGCAAAGGTGAAATTGAGCTT;SOR=0.612;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=142;TCF=80;TCR=62;TR=89;WE=189870254;WS=189870236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,96:0.61:158
chr2	189874873	rs10204508	C	A	1772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=20;PP=993;ReadPosRankSum=-1.392;SC=GATTTTATAACCAATTCCCAT;SOR=0.716;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=118;TCF=81;TCR=37;TR=66;WE=189874881;WS=189874863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,77:0.59:131
chr2	189875421	rs1516446	T	G	9565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=350;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=164;NR=155;PP=2965;SC=TTGATGTGCATCTGGCATTCC;SOR=0.722;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=319;TCF=164;TCR=155;TR=319;WE=189875437;WS=189875411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,347:1.00:347
chr2	189899541	rs4666770	T	C	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=108;ReadPosRankSum=0.256;SC=TATGCTCATATACAAGGTAAA;SOR=0.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=8;WE=189899549;WS=189899539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
chr2	189899572	rs7420715	T	C	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.931;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=323;ReadPosRankSum=-0.988;SC=GTTCTAGTGCTGTAATAGTAT;SOR=0.304;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=52;TCR=5;TR=20;WE=189899580;WS=189899562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,18:0.31:58
chr2	189901295	rs12693526	G	A	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=178;ReadPosRankSum=0.199;SC=TATGTAATAAGTAGTAAAAAG;SOR=0.560;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=23;TCR=11;TR=15;WE=189901303;WS=189901285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr2	189907937	rs6434312	A	G	3144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=50;PP=1799;SC=GACCTCTGTCACCTCGGTCTC;SOR=0.820;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=102;TCF=52;TCR=50;TR=102;WE=189907945;WS=189907927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr2	189910066	.	ATG	A	61	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=61;QD=32.5;SC=ATATATATATATGTGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=2;WE=189910075;WS=189910056;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:14,2:0.12:16
chr2	189918337	rs6750027	T	C	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=231;ReadPosRankSum=-0.125;SC=TTAAGGAAGGTCCTTAAGGAT;SOR=1.051;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=13;WE=189918345;WS=189918327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,14:0.39:36
chr2	189918787	rs6738371	C	T	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=11;PP=340;ReadPosRankSum=0.393;SC=AATGATCTTGCTCAGATACCA;SOR=0.641;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=29;TCR=31;TR=22;WE=189918795;WS=189918777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,23:0.35:66
chr2	189923104	rs7556733	A	G	5618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=120;NR=55;PP=2965;SC=TGCGTTTATTAAGCAGTAATT;SOR=1.573;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=175;TCF=120;TCR=55;TR=175;WE=189923112;WS=189923094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr2	189923434	rs12989558	A	C	471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=243;ReadPosRankSum=0.240;SC=TCATAGCACAAAATATTTCTC;SOR=0.910;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=44;TCF=37;TCR=7;TR=15;WE=189923442;WS=189923424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,20:0.41:49
chr2	189923630	rs5837121	AT	A	2395.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=371;ExcessHet=3.0103;FS=7.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.35;MQRankSum=3.939;QD=7.51;ReadPosRankSum=-2.026;SOR=0.523;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:173,146:0.46:319
chr2	189925313	rs6414121	G	C	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.611;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=98;ReadPosRankSum=0.230;SC=TGGAGATAATGATAGTACCTA;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=6;WE=189925321;WS=189925303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr2	189925548	rs6414122	T	A	5386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=105;PP=2965;SC=TGAATCTGTGTAAGTTTAACA;SOR=1.167;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=182;TCF=77;TCR=105;TR=182;WE=189925556;WS=189925538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr2	189926228	rs369656754	TA	T	99.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=0.894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.23;MQRankSum=3.689;QD=0.73;ReadPosRankSum=1.887;SOR=0.850;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:113,23:0.17:136
chr2	189927506	rs7424947	C	G	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-4.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=190;ReadPosRankSum=1.364;SC=TGAAACTTACCCATAAGTCTT;SOR=0.874;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=13;WE=189927514;WS=189927496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr2	189932831	rs2229495	T	C	4973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=91;PP=2830;SC=CAGAGGTACCTGGAGAGCCCT;SOR=0.825;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=178;TCF=87;TCR=91;TR=178;WE=189932839;WS=189932821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr2	189936687	rs6434317	T	G	753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.841;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=14;PP=455;ReadPosRankSum=-0.128;SC=ACTTTTCAATTAATTAAATGT;SOR=0.446;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=82;TCF=52;TCR=30;TR=37;WE=189936695;WS=189936677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,39:0.45:86
chr2	189943121	rs5837122	GA	G	191.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.43;ReadPosRankSum=-1.426;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,10:0.91:11
chr2	189962098	rs73051214	T	C	1777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.641;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=43;PP=1139;ReadPosRankSum=0.615;SC=AAATGTATACTTTCTTATTGA;SOR=0.368;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=123;TCF=48;TCR=75;TR=76;WE=189962106;WS=189962088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,80:0.61:131
chr2	189974958	rs4128539	G	T	1228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=6;PP=839;SC=TACCAAAATTGGTATTGCCAC;SOR=2.531;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=33;TCR=6;TR=39;WE=189974966;WS=189974948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr2	189997838	rs62182417	G	A	165.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=6;PP=131;SC=GCCCAAGTACGACTTTTTTTT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=6;WE=189997846;WS=189997828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	190313268	rs77312241	C	T	3686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.655;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=93;PP=2336;ReadPosRankSum=0.167;SC=TACTTTAAGACTGGCTTTGTT;SOR=0.838;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=230;TCF=91;TCR=139;TR=150;WE=190313276;WS=190313258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,163:0.65:252
chr2	190313396	rs6738193	A	G	907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=12;PP=627;SC=TGCCTATAGCATATTCTGTGA;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=19;TCR=12;TR=31;WE=190313404;WS=190313386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr2	190313441	rs79567107	C	T	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=9;PP=353;ReadPosRankSum=1.602;SC=GAGGTATTACCTGAGAAGGAT;SOR=0.784;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=53;TCF=34;TCR=19;TR=25;WE=190313449;WS=190313431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,28:0.49:57
chr2	190313570	rs28760459	T	A	1451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.487;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=26;PP=773;ReadPosRankSum=-2.042;SC=GGTATGTAGTTTTTGGTGTTT;SOR=0.484;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=96;TCF=49;TCR=47;TR=56;WE=190313578;WS=190313558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,67:0.59:114
chr2	190313613	rs28509172	G	T	1199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=23;PP=616;ReadPosRankSum=1.890;SC=ACCATTTGGTGTCTGGAACAC;SOR=0.624;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=41;TCR=36;TR=48;WE=190313621;WS=190313603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,57:0.61:93
chr2	190314052	rs10196323	C	T	1480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=29;PP=991;ReadPosRankSum=0.457;SC=AAAGTAGCACCGATCTTTTCT;SOR=0.756;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=100;TCF=52;TCR=48;TR=61;WE=190314060;WS=190314042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,64:0.62:104
chr2	190314085	rs28627748	T	C	1404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.608;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=35;PP=933;ReadPosRankSum=-1.803;SC=ATGAGCTACTTCTAAAAATCA;SOR=1.015;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=105;TCF=49;TCR=56;TR=61;WE=190314093;WS=190314075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,64:0.59:109
chr2	190314186	rs10196675	G	A	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=20;PP=397;ReadPosRankSum=-1.295;SC=TGTGTGTAGTGTTTGAATGTT;SOR=0.741;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=56;TCF=18;TCR=38;TR=28;WE=190314194;WS=190314176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,30:0.51:59
chr2	190315720	rs10202780	G	C	2767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=4.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.14;ReadPosRankSum=-0.849;SOR=1.157;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,71:0.57:125
chr2	190315723	rs10178969	A	C	2737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=3.385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.26;ReadPosRankSum=-0.746;SOR=1.075;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,70:0.57:123
chr2	190316625	rs13389403	T	C	1551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.266;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=41;PP=812;ReadPosRankSum=1.406;SC=AAACCAGGTATGGTATAATTA;SOR=0.909;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=118;TCF=42;TCR=76;TR=61;WE=190316633;WS=190316615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,75:0.54:138
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chr2	190320083	rs6737615	C	A	4921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=401;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.443;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=120;NR=87;PP=2962;ReadPosRankSum=0.351;SC=TGCCAAAATCCTCAAGCCAGG;SOR=0.908;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=362;TCF=205;TCR=157;TR=207;WE=190320091;WS=190320055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,225:0.57:397
chr2	190321930	rs112846132	A	G	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.86;ReadPosRankSum=1.803;SOR=3.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
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chr2	190323530	rs1157910	A	G	2386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.409;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=54;PP=1530;ReadPosRankSum=-0.317;SC=ACAATTTTACATGTGTAGCAT;SOR=0.722;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=319;TCF=185;TCR=134;TR=130;WE=190323538;WS=190323520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:195,133:0.41:328
chr2	190323964	rs78478456	G	T	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=298;ReadPosRankSum=-0.584;SC=TTATGATTTAGTATGTTTGGT;SOR=0.560;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=14;WE=190323972;WS=190323954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,14:0.78:18
chr2	190324006	rs115176763	T	C	890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.190;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=4;PP=631;ReadPosRankSum=-0.524;SC=TGGCATGCCATTGTTTTCCTA;SOR=0.120;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=45;TCF=41;TCR=4;TR=32;WE=190324014;WS=190323996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,34:0.72:47
chr2	190324047	rs111249433	A	G	1377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=20;PP=931;ReadPosRankSum=1.829;SC=TAAGAGTTTTATCTTTCTCCA;SOR=0.719;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=62;TCR=34;TR=56;WE=190324055;WS=190324037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,59:0.57:104
chr2	190324195	rs74699810	T	C	1437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=38;PP=936;ReadPosRankSum=0.095;SC=GAAGATATGATTCAAGTGTTT;SOR=0.754;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=104;TCF=37;TCR=67;TR=57;WE=190324203;WS=190324185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,64:0.56:115
chr2	190324215	rs75875035	G	A	921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.392;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=31;PP=646;ReadPosRankSum=-1.881;SC=TTAATTCACTGTATTTTTAGT;SOR=1.061;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=68;TCF=14;TCR=54;TR=37;WE=190324223;WS=190324205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,39:0.53:73
chr2	190324275	rs77151836	G	A	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=49;ReadPosRankSum=-0.304;SC=ACACTTGTGTGTTACCCCTGT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=5;WE=190324283;WS=190324265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr2	190327076	rs2304703	C	T	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-2.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=181;ReadPosRankSum=1.074;SC=TTAAAAGATACGAAGACACTT;SOR=0.874;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=10;WE=190327084;WS=190327066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr2	190327126	rs2304702	C	G	2512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=18;PP=1605;SC=AGTACGGTAGCAAAAACAAAA;SOR=2.093;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=57;TCR=18;TR=75;WE=190327134;WS=190327116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr2	190327179	rs77698215	A	G	2303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.435;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=34;PP=1306;ReadPosRankSum=0.406;SC=TCAAAACACCATCCTTTTAAT;SOR=0.870;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=190;TCF=121;TCR=69;TR=102;WE=190327187;WS=190327169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,115:0.55:209
chr2	190327389	rs112863490	A	G	850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.799;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=25;PP=572;ReadPosRankSum=-0.761;SC=ATTTTTTATTATGAGGAAATA;SOR=1.923;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=46;TCF=13;TCR=33;TR=33;WE=190327397;WS=190327379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,35:0.73:48
chr2	190328382	rs113875420	C	T	644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.739;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=3;PP=423;ReadPosRankSum=-1.403;SC=TTTCTCTAACCTATTGATATT;SOR=1.633;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=46;TCF=37;TCR=9;TR=24;WE=190328390;WS=190328372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,27:0.53:51
chr2	190328561	rs77997560	C	T	3455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.489;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=67;PP=2182;ReadPosRankSum=-1.315;SC=TATTTGTCACCACTTCTGCAG;SOR=0.646;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=217;TCF=115;TCR=102;TR=141;WE=190328569;WS=190328551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,153:0.64:240
chr2	190328699	rs142586889	A	AT	1883.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.052;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=38;PP=1550;ReadPosRankSum=-1.575;SC=TAAGATTTTGATCATTAGCCT;SOR=1.070;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=65;TCF=2;TCR=63;TR=38;WE=190328707;WS=190328689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,60:0.61:98
chr2	190329873	rs13429203	A	G	4850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-3.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=390;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.775;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=121;NR=98;PP=2900;ReadPosRankSum=-0.419;SC=CAAAGGCTGCATTTGGCTGCT;SOR=0.459;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=357;TCF=206;TCR=151;TR=219;WE=190329881;WS=190329863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,236:0.61:389
chr2	190331081	rs76407376	A	G	747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.602;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=4;PP=536;ReadPosRankSum=1.796;SC=AATGTACAGCATGTCAGAAAT;SOR=1.559;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=52;TCF=45;TCR=7;TR=33;WE=190331089;WS=190331071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,34:0.64:53
chr2	190332108	rs7606348	T	A	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=95;ReadPosRankSum=-0.385;SC=AAGTGAACCCTCAGATAATGG;SOR=0.569;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=7;WE=190332116;WS=190332098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr2	190430177	rs2304704	A	G	6989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=132;NR=110;PP=2965;SC=TCCAGAGCAGAACGTACTCCA;SOR=0.797;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=243;TCF=133;TCR=110;TR=242;WE=190430185;WS=190430167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr2	190443304	rs1439815	C	T	2516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=66;PP=1911;SC=AGATACTATTCCCATCACATG;SOR=2.753;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=17;TCR=66;TR=83;WE=190443312;WS=190443294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr2	190444630	rs1439816	C	G	6910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=107;NR=124;PP=2965;SC=GGCGGGGTGACAAAAAGCGAT;SOR=0.937;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=231;TCF=107;TCR=124;TR=231;WE=190444638;WS=190444620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr2	190445076	rs4287798	T	G	302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=1;PP=208;SC=CCAGAACTCGTGTAGAGTTGC;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=190445084;WS=190445066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	190448047	rs987028	T	C	6832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=142;NR=91;PP=2965;SC=TTTTAAGTTGTCTTTTCACTT;SOR=1.067;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=233;TCF=142;TCR=91;TR=233;WE=190448055;WS=190448037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr2	190448548	rs142563615	CAT	C	819.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.03;SOR=1.828;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	190448552	rs11887969	T	C	828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.47;SOR=1.828;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	190531426	rs1437880	G	A	5767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=93;PP=2965;SC=TGTCATTTCCGGATGCATTAT;SOR=0.713;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=188;TCF=95;TCR=93;TR=188;WE=190531434;WS=190531416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr2	190541861	.	G	T	151	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=18;HapScore=2;MGOF=41;MMLQ=19;MQ=57.29;NF=2;NR=7;PP=151;QD=20.6412458386;SC=TTTTTTTTTTGGAACAGAGTC;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=9;WE=190541869;WS=190541851;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
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chr2	190570001	rs11319823	TA	T	448.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=19;PP=351;SC=TAGGCAATAATAAAAAAAAAA;SOR=4.514;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=20;WE=190570009;WS=190569991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	190593168	rs3067424	ATTTTT	A	102.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=3.842;NF=1;NR=6;PP=137;ReadPosRankSum=-0.327;SC=TCCTTATTTTATTTTTATTTT;SOR=0.648;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=7;WE=190593180;WS=190593158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,6:0.18:33
chr2	190593311	rs1225087	C	G	1841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=19;PP=1138;SC=TTACAAGTGTCAGCCACCGTG;SOR=1.366;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=36;TCR=19;TR=55;WE=190593319;WS=190593301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr2	190595258	rs1225090	G	T	8499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=155;NR=148;PP=2965;SC=GTCAACAATTGGTTGTAGATG;SOR=0.699;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=304;TCF=155;TCR=149;TR=303;WE=190595266;WS=190595248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,321:1.00:321
chr2	190602513	rs1225099	T	C	1684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=29;NR=33;PP=859;SC=TATCTATTTTTGAACGTTTTC;SOR=0.917;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=29;TCR=33;TR=62;WE=190602521;WS=190602503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr2	190603201	rs56352098	T	TA	137.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.60;MQRankSum=0.674;QD=8.61;ReadPosRankSum=0.358;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr2	190611084	rs13002216	T	C	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=282;ReadPosRankSum=-0.175;SC=AGGAGAGACATTTAATTGTGG;SOR=0.631;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=20;WE=190611092;WS=190611074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr2	190611414	rs2254166	T	C	4083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=95;PP=2905;SC=TTATTTTTAATAATGGTAATA;SOR=1.998;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=132;TCF=37;TCR=95;TR=132;WE=190611422;WS=190611404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr2	190611459	rs2254167	A	G	1299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=37;PP=1042;SC=TTTTTGAATGAAAGTTCTTGA;SOR=5.136;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=39;WE=190611467;WS=190611449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr2	190617643	rs2243876	A	G	5681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=89;PP=2965;ReadPosRankSum=2.237;SC=ACTGTGTTGCATTTGTTAAAA;SOR=0.702;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=194;TCF=104;TCR=90;TR=192;WE=190617651;WS=190617633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,221:0.99:223
chr2	190636411	rs6942	C	G	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=38;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=306;ReadPosRankSum=0.202;SC=CACATTATCACAGAAACAGTG;SOR=1.085;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=14;WE=190636419;WS=190636401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,14:0.78:18
chr2	190640475	rs3816196	A	G	1159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.111;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=29;PP=679;ReadPosRankSum=1.192;SC=TAAATGATCAATATTAAATAC;SOR=1.022;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=60;TCF=20;TCR=40;TR=42;WE=190640487;WS=190640465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,48:0.71:68
chr2	190643257	rs7591929	G	A	2162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.284;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=47;PP=1205;ReadPosRankSum=0.510;SC=TGGGAGTTGTGTAGATTCCTG;SOR=0.567;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=145;TCF=73;TCR=72;TR=95;WE=190643265;WS=190643247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,103:0.64:162
chr2	190647108	rs10168387	T	C	2316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=11;PP=1525;SC=ACCACTAAACTTAAAACTTTT;SOR=2.804;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=58;TCR=11;TR=69;WE=190647116;WS=190647098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr2	190670539	rs3214425	T	TA	187.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=2.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.84;ReadPosRankSum=-0.946;SOR=1.194;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,17:0.26:66
chr2	190682632	rs3791773	G	C	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=168;ReadPosRankSum=0.754;SC=TCTAGAATTGGAGGAGGAGAC;SOR=0.793;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=10;WE=190682640;WS=190682622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr2	190926859	rs11333758	GT	G	219.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=230;ReadPosRankSum=1.872;SC=CCAACAGCTTGTTTAAAAGAG;SOR=0.412;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=9;WE=190926867;WS=190926849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,10:0.31:32
chr2	191159232	rs188339	A	G	1609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=33;NR=18;PP=851;SC=CAGTTCTAGTAGGGGGAAAGA;SOR=0.906;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=33;TCR=18;TR=51;WE=191159240;WS=191159222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr2	191161622	rs1058180	T	C	9640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=374;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=152;NR=189;PP=2965;SC=ATGACTCCCGTGCAACCTTTT;SOR=0.942;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=341;TCF=152;TCR=189;TR=341;WE=191161636;WS=191161612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,374:1.00:374
chr2	191175639	rs36074132	GT	G	2387.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=29;PP=1797;SC=AGAACAAAAAGTTTTAAAAGG;SOR=0.832;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=54;TCF=20;TCR=34;TR=47;WE=191175647;WS=191175629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr2	191184475	rs291466	A	G	7776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=133;NR=138;PP=2965;SC=GCGCTGCCCCATCGCCAAACA;SOR=0.790;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=272;TCF=133;TCR=139;TR=271;WE=191184483;WS=191184460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,300:1.00:300
chr2	191184524	rs3749022	C	T	4777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=91;PP=2849;SC=TCTCCCGGACCGTTCCAGCGC;SOR=1.166;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=157;TCF=66;TCR=91;TR=157;WE=191184532;WS=191184514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr2	191224981	rs4656	G	T	3785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=70;PP=2375;ReadPosRankSum=1.369;SC=ACTTCAAGACGCTGGCTGATG;SOR=0.694;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=264;TCF=149;TCR=115;TR=160;WE=191224989;WS=191224971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,171:0.60:285
chr2	191227197	rs2067420	G	A	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.235;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=145;ReadPosRankSum=-0.458;SC=AGTTGACTTCGTTTTTTTATA;SOR=0.184;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=9;WE=191227205;WS=191227187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr2	191227235	rs2067421	T	G	708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.061;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=470;ReadPosRankSum=-0.341;SC=AATTGGAAATTTTGGAATTTC;SOR=0.283;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=44;TCF=33;TCR=11;TR=30;WE=191227243;WS=191227225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,31:0.66:47
chr2	191227492	rs972689	A	G	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=194;ReadPosRankSum=0.413;SC=ACCATGAACTAAATGTTTGGA;SOR=1.473;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=11;WE=191227500;WS=191227482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr2	191231458	rs11544940	G	A	2807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.512;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=53;PP=1664;ReadPosRankSum=-1.601;SC=CAACAGAGGAGGAAACAGCAG;SOR=0.795;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=226;TCF=121;TCR=105;TR=121;WE=191231466;WS=191231448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,134:0.53:251
chr2	191235901	rs1882891	A	C	5837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=96;PP=2965;SC=TGCCATACTGAGGGCCATGGG;SOR=0.845;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=191;TCF=95;TCR=96;TR=191;WE=191235909;WS=191235891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr2	191301461	rs202152253	C	T	6467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=506;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.526;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=136;NR=135;PP=2962;ReadPosRankSum=1.091;SC=AATTACTAACCGTATGATGGA;SOR=0.631;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=467;TCF=230;TCR=237;TR=271;WE=191301469;WS=191301451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:216,290:0.57:506
chr2	191334459	rs145257711	A	ATTTTTAT	492.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=49.27;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	191354658	rs59123011	C	CCT	4555.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=53;PP=2966;SC=ACAAATGCCCCGAGAAGCCTA;SOR=1.477;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=65;TCF=7;TCR=58;TR=60;WE=191354666;WS=191354648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr2	191364708	rs72907168	G	A	4477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=67;PP=2772;SC=TGCTATCACTGATCATGGGGC;SOR=0.718;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=144;TCF=77;TCR=67;TR=144;WE=191364716;WS=191364698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr2	191373775	rs6707244	C	T	1170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=2;PP=933;SC=GGGTTGGTTTCCCTTTCCAGA;SOR=4.351;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=36;TCF=34;TCR=2;TR=36;WE=191373783;WS=191373765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr2	191375375	rs6712426	G	A	1339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=40;PP=1144;SC=TGGGAGGCCTGGGGAGGCGGA;SOR=5.994;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=41;TCF=1;TCR=40;TR=41;WE=191375383;WS=191375365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr2	191379268	rs4586658	G	A	7099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=128;NR=95;PP=2965;SC=ACTGAGGCACGGCCACACCAG;SOR=0.837;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=223;TCF=128;TCR=95;TR=223;WE=191379276;WS=191379258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr2	191390126	rs10931458	G	A	1854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=39;PP=1142;SC=AAAAGGGAATGCATTTTCTAA;SOR=1.716;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=21;TCR=39;TR=60;WE=191390134;WS=191390116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr2	191399433	rs12693579	T	C	2567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=48;PP=1319;SC=CCGGCTCCGCTGCGAGGAGCG;SOR=1.067;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=38;TCR=48;TR=86;WE=191399441;WS=191399423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr2	191552148	rs6716415	C	T	1050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=38;PP=1048;SC=AAAAAAAAGTCATTACTGACA;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=38;WE=191552156;WS=191552138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	191765206	.	T	C	24	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=2;NR=1;PP=24;QD=19.5904041824;SC=ATTATTTAAATAGTGTCCTAA;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=3;WE=191765214;WS=191765196;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:5,3:0.38:8
chr2	191777768	rs11363248	AT	A	67.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.699;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5010;FS=4.260;HP=11;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=39;ReadPosRankSum=2.369;SC=GCTATTTGTGATTTTTTTTTT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=4;WE=191777776;WS=191777758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr2	191839976	rs1914408	C	T	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=9;PP=312;ReadPosRankSum=0.307;SC=GACAATGCCTCGTGGCTTACC;SOR=0.627;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=104;TCF=74;TCR=30;TR=28;WE=191839984;WS=191839966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,27:0.24:113
chr2	191841759	rs2066804	G	A	1561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=49;PP=1066;ReadPosRankSum=-1.106;SC=GTTCTAAAAAGGAGAAAAGCT;SOR=0.710;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=158;TCF=46;TCR=112;TR=69;WE=191841767;WS=191841749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,72:0.44:164
chr2	191843830	rs2280235	A	G	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.155;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=26;PP=607;ReadPosRankSum=-0.029;SC=TGAGAAAAAAAACCTACGGTA;SOR=0.406;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=79;TCF=20;TCR=59;TR=36;WE=191843838;WS=191843820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,38:0.43:88
chr2	191848312	rs12477076	T	C	1309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=11;PP=872;SC=GATGCAGCAGTGAGAGCGTGG;SOR=2.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=34;TCR=11;TR=45;WE=191848320;WS=191848302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr2	191922841	rs3024866	G	A	2024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.638;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=52;PP=1352;ReadPosRankSum=0.397;SC=TCGGTTGCTGGAGAGGAAATC;SOR=0.507;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=225;TCF=98;TCR=127;TR=96;WE=191922849;WS=191922831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,101:0.42:242
chr2	191996518	rs1551443	T	C	1708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.387;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=29;PP=966;ReadPosRankSum=1.008;SC=TAGTATCATCTGAATGTCCCA;SOR=0.882;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=195;TCF=116;TCR=79;TR=79;WE=191996526;WS=191996508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,88:0.41:216
chr2	192161058	rs11397643	G	GT	1249.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=27;PP=433;SC=GTTTTTGTCAGTTTTTTTTAA;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=27;WE=192161066;WS=192161048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	192214833	rs67146186	A	T	2400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=24;PP=1445;SC=TAAGAAGTACACTGAGTTAAC;SOR=1.477;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=77;TCF=53;TCR=24;TR=76;WE=192214841;WS=192214823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr2	192214966	rs59642822	T	C	2165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=44;PP=1397;SC=GTATTTTTCTTCAGTCCTTGT;SOR=1.640;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=24;TCR=44;TR=68;WE=192214974;WS=192214956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr2	192225294	rs2138913	A	G	1180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=4;PP=836;SC=TGAGAAGGAAAAAAAGCATGG;SOR=3.145;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=31;TCR=4;TR=35;WE=192225302;WS=192225284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr2	192225477	rs71403288	G	GTGTTGTTGT,GTGTTGTTGTTGT	976.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=4.512;HP=1;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1,1;NR=21,21;PP=336,460;ReadPosRankSum=-0.193;SC=TTTCTATGTGGTGTTGTTGTT;SOR=2.925;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=65;TCF=2;TCR=63;TR=22,22;WE=192225485;WS=192225467;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.39,0.46:28
chr2	192226908	rs2271769	G	C	829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=0;PP=710;SC=CCATGTTACCGATGTGAACAA;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=192226916;WS=192226901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	192227230	rs12988758	T	C	1349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=35;PP=1053;SC=ACAAGAATTCTATTTTTGTTA;SOR=4.073;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=4;TCR=35;TR=39;WE=192227238;WS=192227220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr2	192247808	rs34460997	A	G	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.256;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=84;ReadPosRankSum=-0.783;SC=GTTTGCTTCAATCAGATTATG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=6;WE=192247816;WS=192247804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr2	192247836	rs4641883	C	T	450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.365;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=259;ReadPosRankSum=-0.631;SC=TAGGCAGCTGCATTGAGAAAG;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=15;WE=192247844;WS=192247826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr2	192250543	rs13000398	A	G	1708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.665;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=22;PP=1016;ReadPosRankSum=-2.066;SC=TGATGGTGTAATTAGGAATAA;SOR=0.626;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=123;TCF=82;TCR=41;TR=68;WE=192250551;WS=192250533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,77:0.56:137
chr2	192250568	rs13026888	T	C	2651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.092;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=35;PP=1601;ReadPosRankSum=-0.199;SC=TAAAACAATATAGTGAGGAAG;SOR=0.804;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=192;TCF=123;TCR=69;TR=105;WE=192250576;WS=192250558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,122:0.56:216
chr2	192250726	rs13018796	G	A	3402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.561;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=73;PP=2141;ReadPosRankSum=0.302;SC=AGCATTTTGAGAGCAGGATGA;SOR=0.550;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=258;TCF=119;TCR=139;TR=139;WE=192250734;WS=192250716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,155:0.53:291
chr2	192261313	rs140669206	GGCTCCTCT	G	4147.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.474;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=3.764;NF=7;NR=53;PP=2939;ReadPosRankSum=-1.215;SC=GCAGAGGAGGGGCTCCTCTGT;SOR=0.647;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=138;TCF=13;TCR=125;TR=60;WE=192261328;WS=192261303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,111:0.45:248
chr2	192265712	rs115149685	T	C	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=182;ReadPosRankSum=-0.212;SC=CTGGAAACATTAGTTCAGTAG;SOR=0.336;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=11;WE=192265720;WS=192265702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr2	192272933	rs2271768	A	G	758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=21;PP=462;ReadPosRankSum=-0.490;SC=GACACTTTATATCTGTGGATA;SOR=0.761;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=96;TCF=45;TCR=51;TR=38;WE=192272941;WS=192272923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,41:0.38:108
chr2	192274001	rs34296473	T	C	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.197;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=54;ReadPosRankSum=-0.050;SC=ATTCTTCCTTTGCCTCAAAGA;SOR=0.283;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=8;WE=192274009;WS=192273991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr2	192279327	rs2271767	T	C	4257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=348;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.392;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=83;PP=2628;ReadPosRankSum=-2.203;SC=AGAGGTTCCATTGGTGGATGT;SOR=0.719;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=317;TCF=171;TCR=146;TR=181;WE=192279335;WS=192279317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,200:0.58:346
chr2	192288497	rs7607560	G	A	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.691;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=232;ReadPosRankSum=0.212;SC=AAATACAAAAGCAAGTGTTAT;SOR=1.795;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=13;WE=192288505;WS=192288487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,13:0.32:40
chr2	192701393	rs10167187	A	G	2228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.103;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=50;PP=1398;ReadPosRankSum=0.793;SC=CTTCCACGGCACCGGAAACGG;SOR=0.435;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=138;TCF=61;TCR=77;TR=93;WE=192701401;WS=192701383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,100:0.66:151
chr2	192711162	rs4471838	A	C	7709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=142;NR=115;PP=2965;SC=GCATAGGGGGAACTGACCTGG;SOR=0.757;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=258;TCF=142;TCR=116;TR=257;WE=192711170;WS=192711152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,289:1.00:289
chr2	192820898	rs7606017	T	G	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-5.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.078;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=305;ReadPosRankSum=0.540;SC=GAAGAATGTCTACCAATTTTC;SOR=0.130;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=43;TCF=37;TCR=6;TR=23;WE=192820906;WS=192820888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,25:0.51:49
chr2	193056737	rs3768702	C	A	1598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=44;PP=955;ReadPosRankSum=1.155;SC=AGAGAACACTCCAGTCATTAA;SOR=0.706;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=38;TCR=80;TR=65;WE=193056745;WS=193056727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,72:0.55:130
chr2	196545817	rs16838394	C	T	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.669;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=18;PP=390;ReadPosRankSum=-1.320;SC=GTAATTCTCACATAATTGTGG;SOR=0.834;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=86;TCF=45;TCR=41;TR=38;WE=196545825;WS=196545807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,42:0.45:94
chr2	196578313	.	CT	C	160.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=0.000;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=6.205;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.18;ReadPosRankSum=0.791;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr2	196582816	rs842736	T	C	643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=1;PP=482;SC=CTTATTATACTCCACTATATG;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=196582824;WS=196582806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	196602582	rs75708451	A	AAAT	986.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=2;PP=1029;ReadPosRankSum=1.197;SC=TTAAGTAGTAAAATATGCTTT;SOR=0.527;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=49;TCF=43;TCR=6;TR=24;WE=196602590;WS=196602572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,26:0.57:46
chr2	196605447	rs147122074	TATAAA	T	397.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=2.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.89;ReadPosRankSum=0.591;SOR=1.659;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr2	196636662	rs1145939	C	G	3693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=82;PP=2506;SC=AAAGGTCTAACAATAGCTGAA;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=30;TCR=82;TR=112;WE=196636670;WS=196636652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr2	196663997	rs7567285	T	C	4308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=51;PP=2765;SC=TAATATCCGATAACTTCATCT;SOR=1.242;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=146;TCF=95;TCR=51;TR=146;WE=196664005;WS=196663987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr2	196673533	rs13411834	A	G	9231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=152;NR=153;PP=2965;SC=CCATGTACAAAGGTTGGCATA;SOR=0.773;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=305;TCF=152;TCR=153;TR=305;WE=196673541;WS=196673523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,337:1.00:337
chr2	196681284	rs2280452	A	T	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.224;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=67;ReadPosRankSum=-0.372;SC=ACAACAATAGAGGTCACAAAT;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=5;WE=196681292;WS=196681274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr2	196682630	rs975417	C	A	1152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=34;PP=869;SC=TCAAGTTCTGCCCTTAAAATA;SOR=5.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=35;WE=196682638;WS=196682620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr2	196709683	rs16840768	G	A	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-4.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.710;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=303;ReadPosRankSum=1.005;SC=TAAATCTACTGTTATTTAATA;SOR=0.341;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=70;TCF=59;TCR=11;TR=25;WE=196709691;WS=196709673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,29:0.37:78
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chr2	196749544	rs341947	C	A	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.924;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=123;ReadPosRankSum=-0.806;SC=CTGCATTGGACAGATGAGAAG;SOR=0.223;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=8;WE=196749552;WS=196749534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr2	196756535	rs79407338	GAA	G,GA	2384.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=3.006;HP=11;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.243;NF=3,3;NR=65,65;PP=259,710;ReadPosRankSum=0.990;SC=GCCCCTTAATGAAAAAAAAAA;SOR=2.023;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=84;TCF=3;TCR=81;TR=68,68;WE=196756545;WS=196756524;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.44,0.53:95
chr2	196771780	rs6710775	G	A	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.572;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=266;ReadPosRankSum=-0.022;SC=CTGATTCAATGTTGCAATGAA;SOR=0.087;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=47;TCF=12;TCR=35;TR=22;WE=196771788;WS=196771770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,24:0.47:51
chr2	196791276	rs1489802	T	G	2621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.303;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=63;PP=1584;ReadPosRankSum=1.658;SC=AGGCAAAAGTTGCATCTCCAG;SOR=0.569;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=161;TCF=56;TCR=105;TR=99;WE=196791284;WS=196791266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,113:0.64:177
chr2	196825402	rs6719500	T	C	3555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=366;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.234;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=83;PP=2361;ReadPosRankSum=-1.396;SC=CTTACTTTTTTTGTCATTGCC;SOR=0.782;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=335;TCF=160;TCR=175;TR=156;WE=196825410;WS=196825392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:198,168:0.46:366
chr2	196836945	rs57117613	T	C	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=364;ReadPosRankSum=-1.963;SC=AAAATGAAAATAAAATATCTA;SOR=0.760;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=21;WE=196836953;WS=196836935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,23:0.57:40
chr2	196837129	rs73042525	G	C	3773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.408;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=74;PP=2278;ReadPosRankSum=-0.471;SC=GCAGTTTTTGGAATCCACTAA;SOR=0.729;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=284;TCF=144;TCR=140;TR=150;WE=196837137;WS=196837119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,170:0.54:316
chr2	196866420	rs6434811	C	T	2069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.277;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=39;PP=1422;ReadPosRankSum=0.330;SC=CAATTAAGTCCGTGAAATCTT;SOR=1.035;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=307;TCF=179;TCR=128;TR=107;WE=196866428;WS=196866410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:210,111:0.35:321
chr2	196912067	rs4850381	A	G	974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=10;PP=631;ReadPosRankSum=-1.348;SC=GTTAGCCTATACAACTTACAT;SOR=0.732;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=59;TCF=44;TCR=15;TR=35;WE=196912075;WS=196912057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,41:0.60:68
chr2	196915991	rs10174065	A	G	1287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.832;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=32;PP=819;ReadPosRankSum=1.238;SC=AAAAATATGAAGGGGAAAAAA;SOR=0.960;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=82;TCF=36;TCR=46;TR=54;WE=196915999;WS=196915981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,58:0.64:90
chr2	196933462	rs61384618	G	A	2033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.356;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=34;PP=1085;ReadPosRankSum=-1.106;SC=TGGCCTCACCGGTGCTTCTGG;SOR=0.772;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=126;TCF=71;TCR=55;TR=80;WE=196933470;WS=196933452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,93:0.64:146
chr2	196933558	rs6741762	G	C	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=19;PP=449;ReadPosRankSum=-0.309;SC=CACCAGAGCCGTCTAGCGTCC;SOR=0.616;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=50;TCF=20;TCR=30;TR=32;WE=196933566;WS=196933548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,38:0.67:57
chr2	197010782	rs16845711	A	G	1078.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=25;PP=701;ReadPosRankSum=0.991;SC=CTGCAGCACTAAAATAAAATT;SOR=0.632;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=55;TCR=62;TR=48;WE=197010790;WS=197010772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,54:0.42:130
chr2	197106759	rs2045277	T	C	6862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=132;NR=102;PP=2965;SC=AACTGTGCCCTCTCCTTTCAC;SOR=0.807;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=235;TCF=132;TCR=103;TR=234;WE=197106767;WS=197106749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr2	197118729	rs4850690	C	T	7264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=139;NR=109;PP=2965;SC=GAGGCACATACGACATTATCT;SOR=0.900;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=249;TCF=139;TCR=110;TR=248;WE=197118737;WS=197118719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,274:1.00:274
chr2	197122493	rs6731238	T	G	7551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=148;NR=92;PP=2965;SC=CAATGTTCCATGATATCTGAT;SOR=1.217;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=241;TCF=149;TCR=92;TR=240;WE=197122501;WS=197122483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,270:1.00:270
chr2	197135806	rs4850693	T	C	440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=11;NR=5;PP=304;SC=CAAGATGTTTTGCAAAGGATG;SOR=1.244;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=11;TCR=5;TR=16;WE=197135814;WS=197135796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	197171104	rs6729640	G	A	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=191;ReadPosRankSum=0.623;SC=AACACACTAAGTGCTCTGGAA;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=10;WE=197171112;WS=197171094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr2	197171175	rs4241189	C	T	2468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.94;ReadPosRankSum=-1.222;SOR=0.646;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,62:0.63:99
chr2	197171183	rs12468199	C	T	2589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=0.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.54;ReadPosRankSum=-1.461;SOR=0.565;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,68:0.62:110
chr2	197172742	rs61752161	C	T	872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.764;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=25;PP=535;ReadPosRankSum=1.505;SC=GTCGCTGCCACGTCGTGGTTC;SOR=0.848;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=99;TCF=38;TCR=61;TR=38;WE=197172750;WS=197172732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,43:0.38:112
chr2	197172816	rs2305567	G	A	527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.378;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=344;ReadPosRankSum=-0.015;SC=CAGTCTAAATGGCAGTGAGGC;SOR=0.437;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=35;TCF=11;TCR=24;TR=21;WE=197172824;WS=197172806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,23:0.61:38
chr2	197172856	rs41510048	A	T	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.187;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=72;ReadPosRankSum=1.573;SC=AGGAGCTGAGATGATTAATAG;SOR=0.269;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=6;WE=197172864;WS=197172846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr2	197184321	rs1531111	C	T	3075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.482;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=63;PP=1840;ReadPosRankSum=2.074;SC=TCGCTGTCCCCGGCCTGGAGT;SOR=0.737;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=217;TCF=111;TCR=106;TR=128;WE=197184329;WS=197184311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,139:0.59:235
chr2	197208531	rs6716054	T	G	990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.760;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=36;PP=673;ReadPosRankSum=0.024;SC=ATTATAACCTTTCTCTCCGTA;SOR=1.060;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=169;TCF=69;TCR=100;TR=55;WE=197208539;WS=197208521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,58:0.32:183
chr2	197504545	rs1879128	C	G	4326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=79;NR=71;PP=2611;SC=TGGTCGGAGGCTCGCGAGGCT;SOR=0.729;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=79;TCR=71;TR=150;WE=197504553;WS=197504535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr2	197531518	rs376590781	CA	C	359.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FS=3.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.22;ReadPosRankSum=0.216;SOR=0.394;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:123,39:0.24:162
chr2	197534692	rs7590083	C	T	4874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=68;NR=97;PP=2965;SC=GTGCTTCTTACTCTCATCAAA;SOR=1.128;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=68;TCR=97;TR=165;WE=197534700;WS=197534682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr2	197584504	rs2680970	C	T	1115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=37;PP=983;SC=AAAAAAATTGCAAAATGATAT;SOR=3.086;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=9;TCR=37;TR=46;WE=197584512;WS=197584494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr2	197593787	rs2460436	C	T	714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=0;PP=625;SC=CTTAATCAGACATTATTATTG;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=197593795;WS=197593777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	197594203	rs2577580	G	C	4087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=89;PP=2787;SC=TAGAACCCTAGCAGCCCCATG;SOR=1.660;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=132;TCF=43;TCR=89;TR=132;WE=197594211;WS=197594193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr2	197595762	rs2680967	G	A	5375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=101;PP=2965;SC=CTTCATTAACGTAGTTGTCAG;SOR=1.249;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=174;TCF=73;TCR=101;TR=174;WE=197595770;WS=197595752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr2	197654578	rs367760289	GA	G	72.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=3.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.40;ReadPosRankSum=1.867;SOR=1.508;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,12:0.23:52
chr2	197744755	rs77319831	T	C	4655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=99;NR=65;PP=2647;SC=AAATTTAGCATGTGTCTCCAA;SOR=1.030;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=164;TCF=99;TCR=65;TR=164;WE=197744763;WS=197744745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr2	197758148	rs332299	C	T	193.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=6;PP=144;SC=AATGATTTCGCCTGCATTTGA;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=197758156;WS=197758138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	197777589	rs12693800	C	T	3708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=44;PP=2644;ReadPosRankSum=-1.266;SC=GGTTAATGTTCATGTAACAGT;SOR=1.393;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=128;TCF=83;TCR=45;TR=126;WE=197777597;WS=197777578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,135:0.99:137
chr2	197854233	rs144034091	T	TAC	838.76	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5013;FS=8.751;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.490;NF=18;NR=0;PP=767;ReadPosRankSum=1.469;SC=GCTGATGAACTACACACACAC;SOR=5.211;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=18;WE=197854241;WS=197854223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,26:0.87:30
chr2	197863214	rs1966703	C	T	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.857;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=26;PP=504;ReadPosRankSum=0.750;SC=GAAGTTACTACAAACACAATA;SOR=0.809;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=89;TCF=24;TCR=65;TR=36;WE=197863222;WS=197863204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,39:0.39:99
chr2	197863851	rs4850742	C	T	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-3.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.437;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=112;ReadPosRankSum=-0.274;SC=AAGAAACATGCACAAGGTGTT;SOR=0.173;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=11;WE=197863859;WS=197863841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr2	197864996	rs6434897	A	C	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=167;ReadPosRankSum=-0.879;SC=AGGGAAATTTATTTTAATTAT;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=9;WE=197865004;WS=197864986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr2	197866470	rs12478175	T	A	1293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=27;PP=641;ReadPosRankSum=-0.826;SC=TCAGCGTTTCTACTTACATTG;SOR=0.732;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=187;TCF=100;TCR=87;TR=60;WE=197866478;WS=197866460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,74:0.35:211
chr2	197872727	rs57048274	T	TTCTC	1229.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.064;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=970;ReadPosRankSum=-0.362;SC=GACATTCTCTTTCTCCCATTC;SOR=1.266;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=69;TCF=1;TCR=68;TR=21;WE=197872735;WS=197872717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,33:0.46:72
chr2	197946392	rs35272229	C	T	5106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=373;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.266;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=119;PP=2962;ReadPosRankSum=0.275;SC=TTTCCTTCAGCTCCCTGGCTC;SOR=0.612;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=347;TCF=152;TCR=195;TR=215;WE=197946400;WS=197946382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,229:0.62:372
chr2	197953372	rs146161383	TAAGTC	T	4774.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.78;NF=38;NR=28;PP=2974;SC=ACAGACAACTTAAGTCAAGTC;SOR=1.981;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=82;TCF=48;TCR=34;TR=66;WE=197953384;WS=197953362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr2	197954780	rs4300850	A	G	6751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=97;NR=136;PP=2965;SC=AAACAGAGCAACTCACGGCAA;SOR=1.169;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=233;TCF=97;TCR=136;TR=233;WE=197954788;WS=197954770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr2	197986048	rs2697270	T	C	5047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=61;PP=2840;SC=AGACTAAGAGTGTCATACCTG;SOR=1.367;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=168;TCF=107;TCR=61;TR=168;WE=197986056;WS=197986038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr2	197989945	rs2579395	T	C	1044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=6;PP=856;SC=CCGACTGGAGTGCACTATGCA;SOR=2.964;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=36;WE=197989953;WS=197989935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	197990741	rs35338671	A	C	2823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.981;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=63;PP=1860;ReadPosRankSum=1.187;SC=CTGAGTGCTTAATCAAAACCT;SOR=0.736;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=225;TCF=116;TCR=109;TR=127;WE=197990749;WS=197990731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,136:0.56:245
chr2	197990899	rs77359771	G	C	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.199;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.60;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr2	197990909	rs2918628	G	A	537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=13;PP=167;SC=GTAATATTTGGTAAAGATCAA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=197990917;WS=197990889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	198001319	rs3731569	A	G	4440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=406;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=99;NR=95;PP=2770;ReadPosRankSum=1.576;SC=CACTCACTTCACTTCTGGAAG;SOR=0.709;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=369;TCF=187;TCR=182;TR=194;WE=198001327;WS=198001309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:190,214:0.53:404
chr2	198001443	rs2579387	C	T	2617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=61;PP=1744;SC=GCCCTGCCGACGTTAAATCAA;SOR=2.409;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=22;TCR=61;TR=83;WE=198001451;WS=198001433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr2	198011904	rs2249470	G	A	7362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=103;NR=154;PP=2965;SC=ATAGTAAGACGTGTCACTCAC;SOR=1.142;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=258;TCF=103;TCR=155;TR=257;WE=198011912;WS=198011894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,276:1.00:276
chr2	198257652	rs11380582	T	TA	93.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.41;ReadPosRankSum=1.803;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr2	198257795	rs4685	T	C	8187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=150;NR=115;PP=2965;SC=ATGTCTCAAATACATTGGGCC;SOR=0.997;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=265;TCF=150;TCR=115;TR=265;WE=198257803;WS=198257785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,298:1.00:298
chr2	198263146	rs16865262	T	C	2863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=23;PP=1939;SC=AATTTGAAAATTGATACTGCT;SOR=1.879;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=91;TCF=68;TCR=23;TR=90;WE=198263154;WS=198263136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr2	198264903	rs140740106	AAAT	A	8916.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=90;PP=2974;SC=ATAATAAAACAAATAATGTTA;SOR=1.101;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=124;TCF=24;TCR=100;TR=111;WE=198264913;WS=198264893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr2	198265173	rs788017	T	A	1250.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.01;ReadPosRankSum=1.589;SOR=2.628;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,49:0.98:50
chr2	198265526	rs788018	A	G	9163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=183;NR=118;PP=2965;SC=CTCCCAAATTACCCATAATTT;SOR=1.135;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=301;TCF=183;TCR=118;TR=301;WE=198265534;WS=198265516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,334:1.00:334
chr2	198266943	rs788019	C	T	1337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=33;PP=986;SC=ATCAACTATTCAGCCAAACTG;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=13;TCR=33;TR=46;WE=198266951;WS=198266933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr2	198267770	rs3217350	G	GAA	4166.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=46;PP=2208;SC=CTGAAAAAGAGAAAAGAGAAG;SOR=1.157;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=3;TCR=49;TR=49;WE=198267778;WS=198267760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr2	198273347	rs77132083	T	C	40.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=3;PP=30;SC=TTTTAATCACTGTTAAAATAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=198273355;WS=198273337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr2	198281743	rs699318	T	C	335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=9;PP=239;SC=GCTCATTCTCTTTTCTATGTA;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=198281751;WS=198281733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	198283305	rs788023	T	C	5435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=89;NR=87;PP=2965;SC=GATCAGGGGTTTTCCCTCCTG;SOR=0.877;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=176;TCF=89;TCR=87;TR=176;WE=198283313;WS=198283295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr2	198299530	rs181833955	G	A	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=3;PP=379;ReadPosRankSum=1.030;SC=ACGCCATTACGCGGGGCAGTG;SOR=0.788;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=48;TCF=41;TCR=7;TR=23;WE=198299538;WS=198299520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,26:0.52:50
chr2	198327314	rs3754822	G	A	3608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=65;NR=54;PP=1784;SC=AGGATTACAAGCATTTTGTTC;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=65;TCR=54;TR=119;WE=198327322;WS=198327304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr2	198355135	rs148517124	T	TTG	2878.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.65;QD=39.98;SOR=1.675;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr2	198355153	rs11682567	T	G	1527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=38;PP=1070;SC=TTTTGTTTTTTTTTTGCTTCC;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=12;TCR=38;TR=50;WE=198355161;WS=198355143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr2	198359027	rs7585486	G	C	4043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=74;NR=63;PP=2427;SC=ACAAAACATGGAATTACAGGC;SOR=0.706;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=137;TCF=74;TCR=63;TR=137;WE=198359035;WS=198359017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr2	198362018	rs8539	T	C	3379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=27;PP=2428;SC=CTCCAATGTTTTTGTATTTAT;SOR=1.959;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=100;TCF=73;TCR=27;TR=100;WE=198362026;WS=198362008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr2	198363504	rs1050347	A	G	5211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.072;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-0.052;NF=106;NR=66;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.078;SC=CATAAGCCCGAGTGAGATGAG;SOR=0.996;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=173;TCF=106;TCR=67;TR=172;WE=198363512;WS=198363494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,188:0.99:189
chr2	198365043	rs1116734	C	G	997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=65;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=9;PP=632;SC=TAGCGGCGACCGCTGGGGCGA;SOR=2.073;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=35;WE=198365051;WS=198365033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr2	198365788	rs2305560	C	T	2640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=21;PP=1681;SC=AAACATTTCTCTTCCTACAGG;SOR=2.033;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=83;TCF=62;TCR=21;TR=80;WE=198365796;WS=198365787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr2	198508951	rs10497806	G	A	6306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=115;NR=92;PP=2965;SC=CCTCAATCACGAGCCTTGGGC;SOR=0.850;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=207;TCF=115;TCR=92;TR=207;WE=198508959;WS=198508941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr2	198509058	rs16866940	C	T	5025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=93;PP=2791;SC=CTAATATGCTCATGTGAAAAT;SOR=1.107;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=162;TCF=69;TCR=93;TR=162;WE=198509066;WS=198509048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr2	198563642	rs6743671	T	C	367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.63;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	198563742	rs6760078	A	T	68.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr2	198623751	rs73054817	A	G	6304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=117;NR=106;PP=2965;SC=AAAGAGAGGCATGATGTCAGC;SOR=0.710;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=223;TCF=117;TCR=106;TR=223;WE=198623759;WS=198623741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr2	198643529	.	TAC	T	381.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.671;ClippingRankSum=0.000;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=2.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.18;MQRankSum=1.469;QD=6.58;ReadPosRankSum=-0.780;SOR=0.313;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,19:0.33:58
chr2	198669754	rs770659	G	C	299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=4;PP=210;SC=GGAGCGCACCGGTGCCTAGCG;SOR=1.270;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=11;WE=198669762;WS=198669744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	198950029	rs2228135	A	G	4805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=91;PP=2965;SC=AATCTGTTCAATACAGGGATT;SOR=1.112;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=159;TCF=68;TCR=91;TR=159;WE=198950037;WS=198950019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr2	198950968	rs75433604	A	AT	4182.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=69;PP=2972;SC=TAGGAGAAACACTCACACTCT;SOR=2.768;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=76;TCF=2;TCR=74;TR=71;WE=198950976;WS=198950958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr2	198953816	rs3213867	G	A	3956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=62;NR=82;PP=2361;SC=ATTTTTTTACGTGTGTGTGTG;SOR=1.164;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=144;TCF=62;TCR=82;TR=144;WE=198953824;WS=198953806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr2	200173684	rs10153730	T	G	8886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=127;NR=160;PP=2965;SC=GCCAGCCCTGTAGAGAGAGGA;SOR=1.047;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=289;TCF=128;TCR=161;TR=287;WE=200173692;WS=200173674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,319:1.00:319
chr2	200245245	rs1348813	C	G	1282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.686;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=27;PP=710;ReadPosRankSum=0.338;SC=AATACACAAACCTCAACCAGG;SOR=0.833;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=107;TCF=48;TCR=59;TR=50;WE=200245253;WS=200245235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,60:0.50:120
chr2	200246318	rs2305262	C	T	1109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=15;PP=741;ReadPosRankSum=-1.100;SC=GTCCAATGTCCAGAAATTAAT;SOR=0.671;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=100;TCF=69;TCR=31;TR=49;WE=200246326;WS=200246308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,51:0.48:106
chr2	200298313	rs7596597	A	G	3944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=87;PP=2615;SC=GAAGGGAAGCAACAGTTATAA;SOR=1.435;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=138;TCF=51;TCR=87;TR=138;WE=200298321;WS=200298303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr2	200625581	rs2346586	T	C	3930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.946;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=86;PP=2362;ReadPosRankSum=1.241;SC=GAAGGAGAGATTAGTATTTGG;SOR=0.775;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=254;TCF=112;TCR=142;TR=155;WE=200625589;WS=200625571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,173:0.62:281
chr2	200677625	rs2030653	C	T	491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=16;PP=425;SC=GGCCTGATGTCTTCCTGACAA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=200677633;WS=200677615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	200710706	rs769960	T	G	1006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=28;NR=4;PP=702;SC=GGAGTATTCATATTTACAGAG;SOR=2.899;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=32;WE=200710714;WS=200710696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr2	200800493	.	A	G	102	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=77;MMLQ=24;MQ=61.34;NF=6;NR=1;PP=102;QD=19.5387446496;SC=ACACACATACACACACACGCA;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=200800501;WS=200800491;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	200800572	rs371263004	TA	T	51.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=1.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.40;ReadPosRankSum=0.933;SOR=1.219;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,9:0.24:37
chr2	200820505	rs281766	T	G	3100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=35;PP=2022;SC=CAGGCACCGGTGTGAAGGGTC;SOR=1.432;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=73;TCR=35;TR=108;WE=200820513;WS=200820495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr2	200873144	rs113489455	AATACAAAAAAAACTTG	A	4950.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.157;NF=13;NR=71;PP=2932;ReadPosRankSum=-0.319;SC=AGAATGATGCAATACAAAAAA;SOR=1.088;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=88;TCF=13;TCR=75;TR=84;WE=200873167;WS=200873134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,183:0.99:185
chr2	201171014	rs3739121	G	C	3787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.542;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=61;PP=1988;ReadPosRankSum=0.959;SC=TCATTTTCTCGGGTAGGAGAA;SOR=0.865;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=266;TCF=157;TCR=109;TR=156;WE=201171022;WS=201171004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,175:0.58:301
chr2	201171191	rs10931898	C	G	4758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=366;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.386;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=101;PP=2797;ReadPosRankSum=-1.952;SC=GGGAAAGGAGCTAGGGAGGGC;SOR=0.736;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=334;TCF=164;TCR=170;TR=199;WE=201171199;WS=201171181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,219:0.60:366
chr2	201171207	rs12614621	G	C	4618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=358;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=95;PP=2894;ReadPosRankSum=-0.335;SC=AGGGCGTGTGGAGGGACGAGA;SOR=0.703;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=324;TCF=163;TCR=161;TR=191;WE=201171215;WS=201171197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,211:0.59:358
chr2	201194279	rs3739119	C	A	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.523;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=339;ReadPosRankSum=-0.175;SC=CCTGCAGCTGCCTCCTGGGAG;SOR=0.350;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=38;TCF=9;TCR=29;TR=23;WE=201194287;WS=201194269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,22:0.56:39
chr2	201253956	rs842823	A	G	1880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.954;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=42;PP=1249;ReadPosRankSum=1.870;SC=GGCCTATTCCACTAGAAGCAA;SOR=0.622;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=256;TCF=155;TCR=101;TR=101;WE=201253964;WS=201253946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,106:0.38:278
chr2	201254049	rs3820881	G	C	2148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=392;ExcessHet=3.0103;FS=1.259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.48;ReadPosRankSum=0.447;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:263,129:0.33:392
chr2	201254171	rs4674015	A	G	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.330;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=19;PP=317;ReadPosRankSum=2.019;SC=CATAAGTAACATTTACTGAAA;SOR=0.360;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=98;TCF=30;TCR=68;TR=29;WE=201254179;WS=201254161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,32:0.30:106
chr2	201277181	rs6706953	T	C	1112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.181;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=26;PP=553;ReadPosRankSum=-3.081;SC=GATGTTAGACTTAAATATTCC;SOR=0.411;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=127;TCF=51;TCR=76;TR=50;WE=201277189;WS=201277171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,59:0.42:140
chr2	201334852	rs17532294	A	G	757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=24;PP=538;ReadPosRankSum=0.752;SC=CGTGAGGTCTAAAGAGATTTA;SOR=0.763;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=69;TCF=18;TCR=51;TR=32;WE=201334860;WS=201334842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,33:0.49:68
chr2	201355106	rs13018579	G	A	2573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.047;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=54;PP=1639;ReadPosRankSum=1.290;SC=GCCCACCAGGGCCGTGGCTCT;SOR=0.612;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=197;TCF=96;TCR=101;TR=109;WE=201355114;WS=201355096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,115:0.53:216
chr2	201371768	rs3739116	G	T	5460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=92;NR=101;PP=2965;SC=AATTTTTGCCGCCCAACACTT;SOR=0.915;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=194;TCF=93;TCR=101;TR=193;WE=201371776;WS=201371758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr2	201397569	rs842940	G	A	98.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=0;PP=47;SC=CAGATTTTATGTAAAGTTTAG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=201397577;WS=201397559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr2	201397647	rs842939	A	C	909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=20;NR=9;PP=490;SC=TATCAGTTATACTTTTTCTTT;SOR=1.308;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=29;WE=201397655;WS=201397637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	201399917	rs10497848	G	T	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=195;ReadPosRankSum=2.204;SC=TATTGTTTTTGAATTCTAATT;SOR=0.704;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=37;TCF=10;TCR=27;TR=16;WE=201399925;WS=201399907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,16:0.41:39
chr2	201400685	rs10497849	A	G	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.299;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=89;ReadPosRankSum=-1.431;SC=GATATCAACTATTTTTTAAGT;SOR=0.223;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=8;WE=201400693;WS=201400675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
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chr2	201437048	rs17532665	A	G	1490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.322;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=25;PP=1067;ReadPosRankSum=-0.560;SC=ATCTCTGAAAACATAGAAGTT;SOR=1.125;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=181;TCF=109;TCR=72;TR=67;WE=201437056;WS=201437038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,72:0.36:198
chr2	201437214	rs17532679	A	G	4199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=91;PP=2682;ReadPosRankSum=-2.104;SC=TTAGGCAGAAAGTAAATCGGA;SOR=0.678;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=252;TCF=120;TCR=132;TR=172;WE=201437222;WS=201437204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,183:0.68:271
chr2	201437334	rs12052989	T	C	8777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=163;NR=128;PP=2965;SC=AAATCATCCCTGGAAACCTAG;SOR=0.921;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=291;TCF=163;TCR=128;TR=291;WE=201437342;WS=201437324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,328:1.00:328
chr2	201445152	rs4674194	C	T	532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.37;SOR=0.990;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
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chr2	201462357	rs1405984	C	T	545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=337;ReadPosRankSum=1.478;SC=TACAACCTAGCTGGGAACAAG;SOR=0.722;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=20;WE=201462365;WS=201462347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,23:0.82:28
chr2	201464295	rs10179964	T	C	994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=4.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.43;ReadPosRankSum=0.759;SOR=0.406;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,53:0.45:118
chr2	201466954	rs2248130	C	G	1393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.992;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=29;PP=899;ReadPosRankSum=-0.703;SC=TCTTGGTAGACTGTGCCTCTA;SOR=0.911;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=244;TCF=134;TCR=110;TR=72;WE=201466962;WS=201466944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:190,79:0.29:269
chr2	201470233	rs35086177	ATTTT	A,ATTTTT	587.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=15;HapScore=3;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=7,7;NR=3,3;PP=151,89;SC=AGTCTTATTGATTTTTTTTTT;SOR=2.985;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=10,10;WE=201470244;WS=201470223;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:14
chr2	201473674	rs2470902	G	A	1243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=10;PP=868;SC=AGCAGTGATCGCACTGTGTTA;SOR=2.356;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=31;TCR=10;TR=41;WE=201473682;WS=201473664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr2	201474179	rs17593811	C	T	1573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.578;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=38;PP=1000;ReadPosRankSum=1.337;SC=AGCTGTTTCTCTACCCCTTTT;SOR=0.412;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=210;TCF=95;TCR=115;TR=75;WE=201474187;WS=201474169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,84:0.36:235
chr2	201474234	rs10497865	C	T	1554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.575;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=37;PP=964;ReadPosRankSum=0.356;SC=ATGACTTTTCCCTATAATATC;SOR=0.510;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=107;TCF=41;TCR=66;TR=63;WE=201474242;WS=201474224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,69:0.59:116
chr2	201485747	rs6761252	G	T	729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.986;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=9;PP=440;ReadPosRankSum=0.274;SC=AGAGACTGTTGGACAGTTCTT;SOR=0.205;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=45;TCF=33;TCR=12;TR=27;WE=201485755;WS=201485737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,30:0.62:48
chr2	201488758	rs2348021	A	G	2530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.544;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=58;PP=1551;ReadPosRankSum=0.408;SC=AACAAATATCAGTTAAAATGC;SOR=0.645;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=175;TCF=79;TCR=96;TR=107;WE=201488766;WS=201488748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,116:0.61:191
chr2	201501568	rs4622702	A	G	1524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=18;PP=996;ReadPosRankSum=1.372;SC=AGATGTGACAATGACAGTCAC;SOR=0.708;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=96;TCF=65;TCR=31;TR=57;WE=201501576;WS=201501558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,63:0.61:103
chr2	201503176	rs2465663	A	G	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.335;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=111;ReadPosRankSum=-1.691;SC=GGTTGCACTGACTTTTAATTA;SOR=1.402;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=7;WE=201503184;WS=201503166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr2	201505953	rs11887334	C	T	1244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.774;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=32;PP=720;ReadPosRankSum=2.046;SC=AAGAGTGTTACATAAAATAAT;SOR=0.506;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=89;TCF=31;TCR=58;TR=52;WE=201505961;WS=201505943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,57:0.59:97
chr2	201515939	rs868810	T	C	1441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=41;PP=963;SC=GTTCTCCAAATGCACATGAGG;SOR=2.221;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=14;TCR=41;TR=55;WE=201515947;WS=201515929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr2	201534136	rs2715907	C	T	244.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=343;SC=CACTACACTCCAGTGTCATGC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=201534144;WS=201534129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	201534173	rs202142577	CA	C	35.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=2.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.43;MQRankSum=1.650;QD=1.49;ReadPosRankSum=1.271;SOR=0.250;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr2	201677454	rs2270281	C	T	690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.008;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=6;PP=573;ReadPosRankSum=0.164;SC=CAGGCATGACCTAGGGTAGGA;SOR=1.995;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=78;TCF=55;TCR=23;TR=32;WE=201677462;WS=201677444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,31:0.41:76
chr2	201677791	rs2270280	T	C	976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.849;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=19;PP=684;ReadPosRankSum=-0.574;SC=TTTGTGCCTGTATCGGGTATA;SOR=0.679;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=85;TCF=48;TCR=37;TR=38;WE=201677799;WS=201677781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,41:0.43:95
chr2	201683695	rs2881880	T	C	1325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.106;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=40;PP=944;ReadPosRankSum=-1.784;SC=TGTGACTATATTTTTCTAAGA;SOR=0.916;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=150;TCF=58;TCR=92;TR=61;WE=201683703;WS=201683685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,64:0.41:158
chr2	201686122	rs3815501	T	C	3029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=44;NR=62;PP=1985;SC=TCTGATGCCATTTTGTACCTG;SOR=1.209;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=107;TCF=45;TCR=62;TR=106;WE=201686130;WS=201686112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr2	201686666	rs6705053	C	T	1524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=3;PP=1181;SC=GTGGTGGGCGCCTGTAGTTCC;SOR=4.493;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=43;TCR=3;TR=46;WE=201686674;WS=201686656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr2	201719916	rs72927093	A	G	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=265;ReadPosRankSum=-0.949;SC=CATGTAATGTAGGCTGGGCAC;SOR=0.340;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=13;WE=201719924;WS=201719906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
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chr2	202025621	rs1594	A	G	2650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.060;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=67;PP=1527;ReadPosRankSum=-0.133;SC=ACAGCTCACCATCCCTGTACC;SOR=0.809;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=202;TCF=83;TCR=119;TR=114;WE=202025629;WS=202025611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,127:0.56:226
chr2	202050677	rs3900115	A	G	2285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=44;PP=1288;ReadPosRankSum=-0.759;SC=GCTCAGCCTCAGATGTTTTTG;SOR=0.678;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=164;TCF=85;TCR=79;TR=93;WE=202050685;WS=202050667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,106:0.58:183
chr2	202070735	rs6712872	A	T	390.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.592;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=418;ReadPosRankSum=-0.445;SC=TAATAAAAAAATTTTTTTTCC;SOR=1.467;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=40;TCF=10;TCR=30;TR=22;WE=202070743;WS=202070725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,21:0.48:44
chr2	202082459	rs13006529	T	A	4288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=88;PP=2479;ReadPosRankSum=-0.484;SC=TGCACTTTCATTATAGCAGAG;SOR=0.684;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=266;TCF=129;TCR=137;TR=172;WE=202082467;WS=202082449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,194:0.66:296
chr2	202122956	rs3769824	T	C	2416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.152;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=48;PP=1263;ReadPosRankSum=0.338;SC=AGTGAGGCCATGGAGGGAGGC;SOR=0.606;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=172;TCF=97;TCR=75;TR=105;WE=202122964;WS=202122946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,115:0.61:189
chr2	202122995	rs3769823	A	G	2473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.132;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=53;PP=1635;ReadPosRankSum=0.723;SC=ATTGAAAGTAAAAGAAACTTC;SOR=0.677;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=188;TCF=99;TCR=89;TR=103;WE=202123003;WS=202122985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,113:0.55:207
chr2	202146658	.	T	TATCTATCAATGTTATGCCCACTGTGCTCTCCAGCTGTGGTCTGTGAA	1223.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.049;ClippingRankSum=0.000;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.85;ReadPosRankSum=-0.109;SOR=0.663;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,31:0.76:41
chr2	202151163	rs3769818	A	G	3099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.980;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=50;PP=1809;ReadPosRankSum=-1.313;SC=CAGTCACAATATTATGTGATG;SOR=0.794;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=234;TCF=141;TCR=93;TR=129;WE=202151171;WS=202151153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,142:0.56:255
chr2	202151377	rs13425113	C	T	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=134;ReadPosRankSum=1.669;SC=CTCGCTCTGTCGCCCAGGCTG;SOR=0.191;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=8;WE=202151385;WS=202151367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr2	202152162	rs13113	T	A	1593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.352;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=22;PP=826;ReadPosRankSum=-2.836;SC=TTGTTTGAAATCTTTTAAAAA;SOR=1.054;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=114;TCF=70;TCR=44;TR=62;WE=202152170;WS=202152152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,73:0.58:125
chr2	202153225	rs700635	C	A	569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=437;ReadPosRankSum=0.433;SC=AATTCAGATGCGAATTCAAAC;SOR=0.648;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=46;TCF=39;TCR=7;TR=24;WE=202153233;WS=202153215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,24:0.49:49
chr2	202153252	rs700636	A	C	1006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=13;PP=664;ReadPosRankSum=-0.905;SC=AGACATTCAGAGAGTCAGAGC;SOR=0.750;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=84;TCF=59;TCR=25;TR=45;WE=202153260;WS=202153242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,45:0.53:85
chr2	202211443	rs1406122	C	T	3532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=95;PP=2406;ReadPosRankSum=-1.190;SC=ACTTGGAGTGCTGAGATTTTT;SOR=0.712;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=266;TCF=100;TCR=166;TR=151;WE=202211451;WS=202211433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,159:0.57:279
chr2	202215409	rs71022364	C	CAAAACAAAACAAAACAA	689.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.570;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=1490;ReadPosRankSum=1.226;SC=ATCTCAAAAACAAAACAAAAC;SOR=1.702;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=32;TCF=21;TCR=11;TR=7;WE=202215417;WS=202215399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,13:0.35:37
chr2	202215492	rs13014235	C	G	1297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=2.522;NF=31;NR=24;PP=667;ReadPosRankSum=-1.078;SC=GGAGCTGGTACAAGAGGAGTT;SOR=0.665;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=113;TCF=61;TCR=52;TR=55;WE=202215500;WS=202215482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,66:0.50:133
chr2	202245244	rs3795966	A	G	1262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.800;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=15;PP=845;ReadPosRankSum=0.210;SC=ACTTGTATAAAAGGTCAGTTA;SOR=0.916;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=82;TCF=56;TCR=26;TR=51;WE=202245252;WS=202245234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,55:0.62:89
chr2	202245944	rs3832088	TAA	T	2655.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.890;HP=17;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=33;PP=1619;ReadPosRankSum=1.562;SC=ACCCAGAGCTTAAAAAAAAAA;SOR=0.204;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=53;TCF=4;TCR=49;TR=36;WE=202245963;WS=202245934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,66:0.97:68
chr2	202245955	rs72937131	A	G	2688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=2.868;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=38.97;ReadPosRankSum=0.340;SOR=0.214;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,67:0.97:69
chr2	202246034	rs3731709	G	C	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=220;ReadPosRankSum=0.876;SC=AGTTATCCTTGGTAAATATAA;SOR=1.292;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=14;WE=202246042;WS=202246024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,13:0.81:16
chr2	202248788	rs7579617	T	C	1099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.789;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=16;PP=895;ReadPosRankSum=-0.320;SC=CATGAAAATATAGCTGAGGAA;SOR=1.148;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=114;TCF=76;TCR=38;TR=53;WE=202248796;WS=202248778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,51:0.44:116
chr2	202248979	rs7579853	T	A	1715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.740;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=49;PP=1100;ReadPosRankSum=0.405;SC=AGATTGAAAGTCTAGATTAAT;SOR=0.593;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=118;TCF=36;TCR=82;TR=71;WE=202248987;WS=202248969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,77:0.61:126
chr2	202252539	rs2244438	G	A	1052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.593;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=26;PP=663;ReadPosRankSum=0.525;SC=AAGGCTCTCTGTCGGGGTGAC;SOR=0.621;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=158;TCF=85;TCR=73;TR=56;WE=202252547;WS=202252529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,59:0.35:169
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chr2	202264156	rs13022344	C	T	4093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=372;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.218;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=94;PP=2480;ReadPosRankSum=-1.058;SC=TCAGATAAGACATGGTTCCGC;SOR=0.773;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=338;TCF=169;TCR=169;TR=182;WE=202264164;WS=202264146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,197:0.53:372
chr2	202264316	rs6732993	C	T	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-4.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=24;PP=536;ReadPosRankSum=-1.639;SC=AAAGCAACGTCCTAGAAAGCA;SOR=0.527;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=38;TCF=1;TCR=37;TR=25;WE=202264324;WS=202264306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,25:0.64:39
chr2	202272032	rs11691865	T	A	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.923;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=450;ReadPosRankSum=1.113;SC=CACTGAACAATGGCTACTAAA;SOR=0.275;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=9;WE=202272051;WS=202272022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr2	202272043	rs113185307	C	T	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=450;ReadPosRankSum=1.138;SC=GGCTACTAAACATCAGTGCTT;SOR=0.223;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=10;WE=202272051;WS=202272022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr2	202284236	rs113582398	C	CTTAAT	3388.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=41;PP=2909;ReadPosRankSum=-0.951;SC=AACAAGCAAACTTAAAGTGGC;SOR=0.705;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=112;TCF=38;TCR=74;TR=66;WE=202284246;WS=202284226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,148:0.69:216
chr2	202285100	rs4507084	A	G	987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.165;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=9;PP=696;ReadPosRankSum=-0.115;SC=ATTTTCTCCTATAAGCGATAG;SOR=0.503;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=61;TCF=47;TCR=14;TR=37;WE=202285108;WS=202285090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,39:0.59:66
chr2	202337730	rs1019299	A	G	1337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.404;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.366;NF=35;NR=27;PP=852;ReadPosRankSum=-2.732;SC=ATACTCCCACAGGAACACTGG;SOR=0.854;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=121;TCF=66;TCR=55;TR=62;WE=202337738;WS=202337720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,65:0.51:127
chr2	202342402	rs12990557	G	T	812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-2.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.748;NF=23;NR=3;PP=525;ReadPosRankSum=0.283;SC=TCTCTGGCCTGTCCCATCTGC;SOR=0.495;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=40;TCF=36;TCR=4;TR=26;WE=202342410;WS=202342392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,31:0.69:45
chr2	202342802	rs2243791	T	C	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=3.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=196;ReadPosRankSum=-1.096;SC=ATTAATTGTGTCCTACAGGAT;SOR=0.627;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=39;TCF=35;TCR=4;TR=13;WE=202342810;WS=202342792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,14:0.30:46
chr2	202344179	rs34469362	GT	G	1343.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.392;NF=16;NR=17;PP=593;ReadPosRankSum=1.259;SC=TAATATAAAGGTTTTTTTTTT;SOR=1.371;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=40;TCF=16;TCR=24;TR=33;WE=202344187;WS=202344169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,55:0.96:57
chr2	202352649	rs2714481	A	G	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=225;ReadPosRankSum=-0.556;SC=TAAAAGATCCAATTGGTAAAT;SOR=0.730;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=13;WE=202352657;WS=202352639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,13:0.32:40
chr2	202357949	rs2714482	A	C	5472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=90;PP=2965;SC=TTGTCTTTACAAAGCCTCTGA;SOR=0.806;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=194;TCF=104;TCR=90;TR=194;WE=202357957;WS=202357925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr2	202402250	rs3083390	AAC	A	1009.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.323;NF=0;NR=18;PP=713;ReadPosRankSum=0.473;SC=AAAAACAATAAACACATATGT;SOR=0.791;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=18;WE=202402259;WS=202402240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,28:0.55:51
chr2	202410147	rs10931955	C	A	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=235;ReadPosRankSum=0.181;SC=AGTGAAATGCCTATTTATTTC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=11;WE=202410155;WS=202410137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr2	202410300	rs10804117	A	T	1026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.694;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=26;PP=590;ReadPosRankSum=0.114;SC=CCTCTTCAGGATGATTACTTT;SOR=1.001;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=90;TCF=45;TCR=45;TR=46;WE=202410308;WS=202410290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,49:0.52:95
chr2	202410395	.	G	C	39	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.5;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MMLQ=25;MQ=51.94;NF=0;NR=3;PP=39;QD=24.5904041824;SC=AATATATATGGGAAAATATTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=202410403;WS=202410385;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:3,3:0.50:6
chr2	202447009	rs13425990	C	T	385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=303;ReadPosRankSum=-1.634;SC=CACATACATCCAATATACTAT;SOR=1.179;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=18;WE=202447017;WS=202446999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,17:0.77:22
chr2	202468136	rs10205247	T	A	1437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=36;PP=1050;SC=TTGTTTCTCATGAAAAATATC;SOR=2.608;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=10;TCR=36;TR=46;WE=202468144;WS=202468126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr2	202469361	rs12474206	C	T	6601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=109;NR=106;PP=2965;SC=CCAAATTTGGCGTCTCCTGTG;SOR=0.768;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=215;TCF=109;TCR=106;TR=215;WE=202469369;WS=202469351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr2	202469472	rs7572583	A	G	1347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=36;PP=988;SC=ACATAACTAGATGAAACATCA;SOR=4.664;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=3;TCR=36;TR=39;WE=202469480;WS=202469462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr2	202491995	rs2540450	G	A	1258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.683;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=13;PP=783;ReadPosRankSum=-2.460;SC=GATAAGAAAAGTTGCTGTTAT;SOR=1.089;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=98;TCF=70;TCR=28;TR=51;WE=202492003;WS=202491985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,57:0.52:110
chr2	202501448	rs1208081	T	C	813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.649;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=14;PP=499;ReadPosRankSum=1.102;SC=CTATCACAACTTAACCTTGGT;SOR=0.518;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=97;TCF=67;TCR=30;TR=40;WE=202501456;WS=202501438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,43:0.39:110
chr2	202507982	rs6723016	T	C	1559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.420;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=26;PP=902;ReadPosRankSum=-0.815;SC=CCTTAGTGATTCCCAGCTCGT;SOR=0.713;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=158;TCF=89;TCR=69;TR=68;WE=202507990;WS=202507972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,78:0.45:173
chr2	202509814	rs3754932	T	C	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.875;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.881;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=75;ReadPosRankSum=0.682;SC=AATTAATAAATTGCTGCACTT;SOR=1.721;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=3;WE=202509822;WS=202509804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr2	202523347	rs2597900	C	T	2215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.181;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=57;PP=1479;ReadPosRankSum=1.571;SC=CCTTAGTAGACGGCAGCAGAG;SOR=0.836;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=169;TCF=71;TCR=98;TR=95;WE=202523355;WS=202523337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,102:0.55:184
chr2	202534303	rs145833090	TATAGGAAGAGCTTAA	T	132	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.00;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr2	202546113	rs1208073	T	C	2226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=25;PP=1559;SC=CAGTCTTGAATCCAGGTCCAA;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=50;TCR=25;TR=75;WE=202546121;WS=202546103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr2	202547528	rs16838004	A	T	3348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.464;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=63;PP=2022;ReadPosRankSum=-1.463;SC=CCAAGTCATTAACAAAAAGGC;SOR=0.653;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=242;TCF=145;TCR=97;TR=151;WE=202547536;WS=202547518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,158:0.60:262
chr2	202555132	rs2287050	T	C	1764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.148;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=43;PP=938;ReadPosRankSum=-1.445;SC=GTGTGGTTGGTGTTTAGTAAG;SOR=0.896;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=130;TCF=58;TCR=72;TR=75;WE=202555140;WS=202555122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,84:0.58:145
chr2	202557702	rs6725443	C	T	4609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=93;PP=2965;SC=ACATCTCTGCCGTAGAACAGA;SOR=1.609;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=143;TCF=50;TCR=93;TR=143;WE=202557710;WS=202557692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr2	202566741	rs7603563	T	C	401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=7;PP=240;SC=ACAGATTTAATTGATTTCACT;SOR=1.765;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=11;WE=202566749;WS=202566731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	202566764	rs3731707	C	T	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.699;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=87;ReadPosRankSum=1.534;SC=TCCCTGTTCCCTTCTAGTTCC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=202566772;WS=202566754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr2	202569992	rs3219171	A	T	6956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.114;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=131;PP=2965;ReadPosRankSum=1.071;SC=AATGATACTGATGTCAGAGTG;SOR=1.021;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=218;TCF=87;TCR=131;TR=217;WE=202570000;WS=202569982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,244:1.00:245
chr2	202570232	rs3219170	A	G	1536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=33;PP=975;SC=ACTTATGGTAAACAAAATCCC;SOR=1.528;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=18;TCR=33;TR=51;WE=202570240;WS=202570222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr2	202574825	rs1210940	C	T	343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=242;SC=AATCCATCAACAAGAAACAAC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=202574833;WS=202574815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	202575821	rs3219168	G	A	6308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=113;NR=97;PP=2965;SC=GAACGACTCAGTATTTCTGGA;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=211;TCF=113;TCR=98;TR=210;WE=202575829;WS=202575811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr2	202575907	rs2882231	A	G	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=343;ReadPosRankSum=0.599;SC=CACATGAAACACAATCACTAG;SOR=0.578;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=71;TCF=21;TCR=50;TR=25;WE=202575915;WS=202575897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,29:0.36:81
chr2	202575965	rs16838095	C	A	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=279;ReadPosRankSum=-1.428;SC=CCAACGAACTCAGAAATCATC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=13;WE=202575973;WS=202575955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr2	202580370	rs3219167	G	A	795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-3.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.189;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=4;PP=588;ReadPosRankSum=-0.124;SC=ATGCTCTGCTGTATGTTGAGC;SOR=1.047;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=90;TCF=78;TCR=12;TR=36;WE=202580378;WS=202580360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,37:0.39:95
chr2	202587653	rs7572898	C	T	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=25;ReadPosRankSum=1.465;SC=ATCACTGAAACGTGCACTTGA;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=3;WE=202587661;WS=202587643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr2	202587706	rs144704088	T	TA	405.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=1.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.59;ReadPosRankSum=-1.027;SOR=0.465;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr2	202593280	rs3219161	G	A	2085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.573;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=44;PP=1276;ReadPosRankSum=3.486;SC=ACCAATTCACGGAAAACCTCC;SOR=0.548;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=170;TCF=86;TCR=84;TR=93;WE=202593288;WS=202593270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,99:0.54:183
chr2	202593929	rs113406595	GA	G	161.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.99;ReadPosRankSum=0.463;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr2	202598113	rs2276615	C	T	948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=28;PP=650;ReadPosRankSum=-1.009;SC=TTTCGTCATTCACTTCTGACA;SOR=0.638;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=117;TCF=49;TCR=68;TR=48;WE=202598121;WS=202598103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,50:0.38:130
chr2	202606639	rs3731703	G	A	679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.839;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=20;PP=374;ReadPosRankSum=0.470;SC=TTATTATGATGTGATTATGAT;SOR=1.061;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=95;TCF=34;TCR=61;TR=29;WE=202606647;WS=202606629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,36:0.32:112
chr2	202608877	rs4673207	C	A	1033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=3;PP=815;SC=CAGTGCATAGCAAGAAGTAAA;SOR=4.174;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=33;WE=202608885;WS=202608867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr2	202614632	rs41308828	T	G	581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.590;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.064;NF=4;NR=17;PP=363;ReadPosRankSum=-0.595;SC=ATTAAGTACTTATATTAGTCT;SOR=0.125;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=42;TCF=6;TCR=36;TR=21;WE=202614640;WS=202614622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,24:0.51:47
chr2	202625615	rs3219156	C	T	8491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=156;NR=131;PP=2965;SC=TGAGATGGCACTGGCTTTTCA;SOR=0.821;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=287;TCF=156;TCR=131;TR=287;WE=202625623;WS=202625605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,313:1.00:313
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chr2	202688293	rs4675229	A	G	1566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=8;PP=1177;SC=TGTACTTCGTAATACCTTCTG;SOR=2.925;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=39;TCR=8;TR=47;WE=202688301;WS=202688283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr2	202712095	rs917958	A	C	4428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=88;NR=65;PP=2668;SC=CTCTTATTTCATTTGCTAGGG;SOR=0.884;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=153;TCF=88;TCR=65;TR=153;WE=202712103;WS=202712085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr2	202741064	rs2072504	G	A	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.361;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=10;NR=0;PP=201;ReadPosRankSum=0.056;SC=TTGTTTTCCCGGGACTCTTTC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=10;WE=202741072;WS=202741054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr2	202741256	rs4675235	A	T	7969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=83;PP=2965;SC=GGAGGAAGAGACTTCACTTGC;SOR=0.759;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=170;TCF=87;TCR=83;TR=170;WE=202741277;WS=202741246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr2	202741269	rs4675236	G	A	7618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=75;PP=2721;SC=TCACTTGCCCGCTTTGCCCTG;SOR=0.753;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=156;TCF=81;TCR=75;TR=156;WE=202741277;WS=202741246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr2	202899957	rs34908164	G	A	1618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.506;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=33;PP=894;ReadPosRankSum=-0.004;SC=CTGCCCCCGGGGGCCTCAGAT;SOR=0.689;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=200;TCF=105;TCR=95;TR=72;WE=202899965;WS=202899947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,83:0.38:221
chr2	202939654	rs10221698	T	C	1526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.497;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=34;PP=1000;ReadPosRankSum=-1.133;SC=TATGTTCCTGTCAGCAAACCT;SOR=0.705;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=182;TCF=94;TCR=88;TR=76;WE=202939662;WS=202939644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,82:0.42:196
chr2	202955454	rs1568535	G	C	6625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=137;NR=86;PP=2965;SC=TGGCTCAGGGGTCAGCAGCTG;SOR=1.146;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=223;TCF=137;TCR=86;TR=223;WE=202955462;WS=202955444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr2	202964517	rs10197514	G	C	1381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.541;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=36;PP=867;ReadPosRankSum=-1.026;SC=GCAGATCTCAGCGGTAAGAAC;SOR=0.895;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=176;TCF=85;TCR=91;TR=67;WE=202964525;WS=202964507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,74:0.38:197
chr2	202974360	rs12615065	T	G	3385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.355;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=62;PP=2076;ReadPosRankSum=1.666;SC=CCTCACGATGTGGCCCCACCA;SOR=0.903;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=248;TCF=131;TCR=117;TR=137;WE=202974368;WS=202974350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,155:0.57:271
chr2	203000717	rs7578906	A	T	778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.11;ReadPosRankSum=-0.640;SOR=0.706;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,44:0.46:96
chr2	203000729	rs56806886	AA	TT	899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.82;ReadPosRankSum=-0.925;SOR=0.696;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,49:0.48:102
chr2	203003066	rs3043926	G	GGTGT	2014.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.975;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=3;PP=1548;ReadPosRankSum=1.408;SC=ATATGAACTAGGTGTGTGTGT;SOR=1.890;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=65;TCF=46;TCR=19;TR=33;WE=203003074;WS=203003056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,52:0.61:85
chr2	203003085	rs16838883	T	C	2584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.390;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.901;NF=58;NR=24;PP=1485;ReadPosRankSum=1.613;SC=GTGTGTATGGTATATATAAAA;SOR=0.991;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=138;TCF=97;TCR=41;TR=82;WE=203003093;WS=203003075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,80:0.56:143
chr2	203029951	rs7582695	T	A	669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=10;PP=494;ReadPosRankSum=1.181;SC=AGAAGTGTTTTAAGTGTTTGC;SOR=0.649;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=93;TCF=67;TCR=26;TR=34;WE=203029959;WS=203029941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,35:0.35:99
chr2	203051886	rs6722588	C	T	1572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=40;PP=1079;SC=GGATACCATGCACAGTTGTAT;SOR=2.107;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=14;TCR=40;TR=54;WE=203051894;WS=203051876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr2	203079307	rs3769817	T	C	488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=14;PP=417;SC=TTTAGCATTCTTAACAGGTTT;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=203079315;WS=203079297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	203139738	rs11397579	A	AC	662.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=1;PP=748;SC=AATAGCTTCTACACCTTCATT;SOR=4.514;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=17;WE=203139746;WS=203139728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	203139844	rs80282360	T	C	1149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.639;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=20;PP=574;ReadPosRankSum=-0.817;SC=AGGTTCTAAATGAGAAGAAAC;SOR=0.778;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=122;TCF=73;TCR=49;TR=52;WE=203139852;WS=203139834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,60:0.44:137
chr2	203152355	rs7572505	G	A	1819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.065;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=32;PP=1264;ReadPosRankSum=-1.351;SC=ATGCTATCTTGCTAATTTATT;SOR=0.803;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=225;TCF=141;TCR=84;TR=90;WE=203152363;WS=203152345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,92:0.39:235
chr2	203155015	rs11310035	GT	G	484.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.415;NF=6;NR=9;PP=411;ReadPosRankSum=-0.515;SC=ATCCCTTTAAGTTTTGTTTGT;SOR=0.575;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=45;TCF=21;TCR=24;TR=15;WE=203155023;WS=203155005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,22:0.34:64
chr2	203155936	rs3731700	A	C	2848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=65;PP=1910;ReadPosRankSum=0.524;SC=CAGAGATATCAATGGGAACAG;SOR=0.690;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=268;TCF=135;TCR=133;TR=130;WE=203155944;WS=203155926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,136:0.47:289
chr2	203421199	rs1061157	G	A	2460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.404;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=62;PP=1563;ReadPosRankSum=-1.649;SC=GAGCACAGAGGCCTAATTCTC;SOR=0.780;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=272;TCF=129;TCR=143;TR=115;WE=203421207;WS=203421189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,123:0.42:293
chr2	203621800	rs16839308	A	C	211.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=0;PP=142;SC=AACGTGCAACATGAAATCCTA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=203621808;WS=203621794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	203650558	rs145836386	TA	T	529.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=0;PP=642;SC=GTGAAAACAATATAAAGTGAT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=203650566;WS=203650548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	203651278	rs55689177	CA	C	2274.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-0.751;NF=36;NR=26;PP=1122;ReadPosRankSum=-0.267;SC=GACTCCGTCTCAAAAAAAAAA;SOR=0.960;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=75;TCF=43;TCR=32;TR=62;WE=203651286;WS=203651267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,90:0.99:91
chr2	203651475	rs57934594	A	AT	525.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=4.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=0.803;QD=11.95;ReadPosRankSum=-0.195;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,28:0.64:44
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chr2	203690387	rs1344959	G	A	1921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=18;PP=1196;SC=TTTAAATGGGGATTATCAGAT;SOR=1.478;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=43;TCR=18;TR=61;WE=203690395;WS=203690377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr2	203693559	rs4675296	C	G	8619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=156;NR=128;PP=2965;SC=TACATAGAATCCTCAAATTTA;SOR=0.838;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=284;TCF=156;TCR=128;TR=284;WE=203693567;WS=203693549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,309:1.00:309
chr2	203748544	rs34788166	A	AT	2021.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=-0.164;NF=3;NR=52;PP=746;ReadPosRankSum=-0.651;SC=ATTTGTAGAAATTTTTTTTTT;SOR=1.056;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=89;TCF=4;TCR=85;TR=55;WE=203748552;WS=203748531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,90:0.96:94
chr2	203748594	rs10196719	A	G	946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=25;PP=668;SC=GGAGTGCAGTAGTGCAATCTT;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=30;WE=203748602;WS=203748584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr2	203749392	rs3050865	C	CTTT	637.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=615;SC=CTTATTTCTTCCTTTACAATG;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=12;WE=203749400;WS=203749382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	203820275	rs3731695	T	C	304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=250;SC=TCTGTAGTTATTGTTAAAATT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=203820283;WS=203820265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	203880992	rs2351524	T	C	1047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=10;PP=692;SC=TTTTGCTTTCTTTACTGCTAT;SOR=1.670;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=36;WE=203881000;WS=203880982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr2	203921270	rs4673241	A	G	2540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=55;PP=1736;SC=TTTACTGAGAACAACTAGGTT;SOR=1.434;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=32;TCR=55;TR=87;WE=203921278;WS=203921260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr2	203964456	.	CT	C	85.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=0.000;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.38;ReadPosRankSum=1.768;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,12:0.19:62
chr2	203996870	rs6748898	A	G	3224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=77;PP=2338;SC=GAATAAGGCTAATAAAGCTAA;SOR=2.746;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=19;TCR=77;TR=96;WE=203996878;WS=203996860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr2	204002809	rs10180815	A	C	788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=5;PP=533;SC=CTCTCAAGCTATTTTGTTTTG;SOR=2.670;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=24;WE=204002817;WS=204002799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	204054834	.	G	A	116	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=18;MQ=49.55;NF=6;NR=0;PP=116;QD=25.1285354245;SC=ACTCCAGCCTGGGCAACAGAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=6;WE=204054842;WS=204054824;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,6:0.75:8
chr2	204062061	rs4675323	A	G	11070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=426;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=197;NR=188;PP=2965;SC=AAAGGCCACCATCCCCAAAAA;SOR=0.703;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=385;TCF=197;TCR=188;TR=385;WE=204062069;WS=204062051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,426:1.00:426
chr2	204073435	rs182855092	G	A	4564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=342;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.562;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=98;PP=2908;ReadPosRankSum=0.128;SC=ACTGAGTGTCGGCATCAGCAC;SOR=0.837;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=309;TCF=152;TCR=157;TR=184;WE=204073443;WS=204073425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,204:0.60:342
chr2	204090887	rs2351773	C	G	5214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=101;NR=70;PP=2965;SC=TGAACCTTTACCTACTAGCAC;SOR=0.913;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=171;TCF=101;TCR=70;TR=171;WE=204090895;WS=204090877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr2	204110748	rs56317341	G	A	219.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=7;PP=181;SC=AAGATCGCTTGAGGCCAGGAG;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=204110756;WS=204110738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	204111394	rs13015873	T	C	1591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=4;PP=678;SC=CATTTATTGATACAGTTAATT;SOR=2.899;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=31;WE=204111409;WS=204111384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr2	204111398	rs10586509	GTTAA	G	1711.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=5;PP=1157;SC=TATTGATACAGTTAATTCAGA;SOR=2.948;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=25;WE=204111409;WS=204111384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr2	204111443	rs6435176	A	G	3593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=36;PP=2243;SC=TCCAAATTAAATTGATTATTT;SOR=1.628;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=80;TCR=36;TR=116;WE=204111451;WS=204111433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr2	204111705	rs6751894	T	C	1696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=43;PP=1018;SC=ATGTTTAGGCTGGGCACGGTG;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=15;TCR=43;TR=58;WE=204111713;WS=204111695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr2	204116660	rs3731694	A	T	3414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=81;NR=32;PP=2064;SC=GATTATTTTGATACAGAAATA;SOR=1.705;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=81;TCR=32;TR=113;WE=204116668;WS=204116650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr2	204116690	rs2043449	C	T	5985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=130;NR=58;PP=2965;SC=TCTGTTTCAGCGGACCCTTTT;SOR=1.502;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=188;TCF=130;TCR=58;TR=188;WE=204116698;WS=204116680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr2	204116887	rs2351771	T	G	2639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=60;PP=1732;SC=ATAGTATTTATTTTTTGAGTA;SOR=2.461;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=18;TCR=60;TR=78;WE=204116895;WS=204116877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr2	204154552	rs1048013	C	T	5281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.05;NF=91;NR=90;PP=2965;SC=TTCTGCCCAGCTTCAAGATAT;SOR=0.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=181;TCF=91;TCR=90;TR=181;WE=204154560;WS=204154542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr2	204154686	rs10170454	A	G	486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=15;PP=409;SC=TATTTTAGACAGAGGTTTGCT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=204154694;WS=204154676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	204206977	rs4675333	C	T	3316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=57;PP=1774;SC=GGACCAAGTCCAGTTCTGTTA;SOR=0.899;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=112;TCF=55;TCR=57;TR=112;WE=204206985;WS=204206967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr2	204261723	rs3731652	G	C	6568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=97;NR=126;PP=2965;SC=GCAGGCAGATGCAGTCATCTG;SOR=1.071;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=224;TCF=97;TCR=127;TR=223;WE=204261731;WS=204261713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr2	204305093	rs3814365	T	C	4780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.03;SOR=0.814;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr2	204322298	rs2469953	T	C	6410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=133;NR=111;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.262;SC=CAGCTGTTTCTTTTTTCCCCA;SOR=0.717;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=246;TCF=134;TCR=112;TR=244;WE=204322306;WS=204322287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,251:0.99:253
chr2	204355822	rs2469962	G	A	1247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=8;PP=963;SC=GAACTTGGTCGAGTTATGCAT;SOR=2.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=32;TCR=8;TR=40;WE=204355830;WS=204355812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr2	204732850	rs231776	A	G	5221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=96;PP=2965;SC=CAGCAGTCAAAGGCAGTGATT;SOR=0.977;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=175;TCF=79;TCR=96;TR=175;WE=204732858;WS=204732840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr2	204822670	rs5837889	A	AT	503.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=3.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.21;MQRankSum=1.515;QD=7.00;ReadPosRankSum=-1.098;SOR=0.377;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,31:0.43:72
chr2	204824178	rs146016344	AGT	A	1143.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=2.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.30;ReadPosRankSum=1.465;SOR=1.438;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,45:0.52:86
chr2	204824283	rs10172036	T	G	4794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.418;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=89;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.284;SC=AGCATTTAGATAATTTATGCT;SOR=0.653;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=291;TCF=153;TCR=138;TR=187;WE=204824291;WS=204824273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,209:0.64:326
chr2	205829991	rs236843	C	T	1405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=37;PP=843;ReadPosRankSum=-2.235;SC=CCCAACTGGCCGCATTTAAGC;SOR=0.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=198;TCF=93;TCR=105;TR=68;WE=205829999;WS=205829981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,79:0.34:230
chr2	205912210	rs7563474	C	A	261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=8;NR=2;PP=162;SC=ACATAAAAGCCTGTTGTAAAC;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=205912218;WS=205912200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	205912403	rs1510765	T	C	2957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=42;PP=1666;SC=AGTCTGAAACTGGTTGTTCCA;SOR=0.865;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=61;TCR=42;TR=103;WE=205912411;WS=205912393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr2	205969023	rs2289024	A	C	1268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=5;PP=907;SC=TCCAGTTTTCAAAGAAATTAG;SOR=3.056;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=40;TCF=34;TCR=6;TR=39;WE=205969031;WS=205969013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr2	205969220	rs2289025	G	A	7183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=104;NR=137;PP=2965;SC=ACTTCGCCAAGAACTAAGGAC;SOR=1.095;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=241;TCF=104;TCR=137;TR=241;WE=205969228;WS=205969210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,268:1.00:268
chr2	205978113	rs368750104	CA	C	926.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=48.78;SOR=5.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	205978114	.	A	G	408	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;FR=1.0000;HP=4;HapScore=4;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=16;NR=0;PP=408;QD=27.6732007842;SC=AATCCTGAGCAGGGGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=16;WE=205978130;WS=205978104;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,16:0.94:17
chr2	205978117	.	GGTGT	G	551	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;FR=0.6748;HP=3;HapScore=4;MGOF=3;MMLQ=15;MQ=61.78;NF=12;NR=0;PP=551;QD=46.1666666667;SC=CCTGAGCAGGGGTGTGTGTGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=12;WE=205978130;WS=205978104;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr2	205978118	.	GTGT	G	919.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.90;QD=38.32;SOR=4.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	205986321	rs2289023	A	G	5308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=115;NR=52;PP=2965;SC=CCAGGGCTCAAGATGTCTTCC;SOR=1.635;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=167;TCF=115;TCR=52;TR=167;WE=205986329;WS=205986311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr2	206023437	rs141931478	C	A	785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.769;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=15;PP=490;ReadPosRankSum=-0.518;SC=ATGTGTATTCCCCTAACAGAA;SOR=0.562;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=95;TCF=62;TCR=33;TR=38;WE=206023445;WS=206023427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,41:0.39:104
chr2	206041366	.	TAA	T	114.84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=-0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.47;MQRankSum=0.210;QD=19.14;ReadPosRankSum=0.674;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr2	206050355	rs62172732	A	G	2492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=13;PP=1898;SC=TCAGTTCTGTATGAGAACTTA;SOR=2.862;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=64;TCR=13;TR=77;WE=206050363;WS=206050345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr2	206166580	rs11686273	G	A	4391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=54;NR=84;PP=2666;SC=TTTCTGCAGAGGCAGAGGAGC;SOR=1.354;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=138;TCF=54;TCR=84;TR=138;WE=206166588;WS=206166570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr2	206364737	rs10197347	T	C	3400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=61;PP=1704;SC=CAAGGCCATCTGAGTATGACC;SOR=0.988;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=53;TCR=61;TR=114;WE=206364745;WS=206364727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr2	206418032	rs6730102	G	A	6409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=124;NR=97;PP=2965;SC=ATCTCTAATTGCTTTTCTCTC;SOR=0.842;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=221;TCF=124;TCR=97;TR=221;WE=206418040;WS=206418022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr2	206481612	rs35710107	TGA	T	1307.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.53;SOR=5.838;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr2	206481631	.	GAGTA	G	425	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MMLQ=26;MQ=60.0;NF=27;NR=1;PP=425;QD=15.3928571429;SC=GAGAGAGAGAGAGTATGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=72;TCF=57;TCR=15;TR=28;WE=206481643;WS=206481621;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:44,28:0.39:72
chr2	206481635	.	A	ATG	420	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MMLQ=26;MQ=60.0;NF=19;NR=1;PP=420;QD=21.5;SC=GAGAGAGAGTATGTGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=69;TCF=42;TCR=27;TR=20;WE=206481643;WS=206481621;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:49,20:0.29:69
chr2	206562250	rs849558	C	T	2849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=55;NR=39;PP=1499;SC=TTCTTTGGGTCGTTGATTTCT;SOR=1.056;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=95;TCF=55;TCR=40;TR=94;WE=206562258;WS=206562240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr2	206581033	rs849541	G	A	3065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=54;PP=1856;SC=CTCTACATCAGGTTCACCTCC;SOR=1.009;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=48;TCR=54;TR=102;WE=206581041;WS=206581023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr2	206592695	rs849526	T	C	7545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=143;NR=132;PP=2965;SC=ATGGCTACTATGTCAAATCCT;SOR=0.756;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=275;TCF=143;TCR=132;TR=275;WE=206592703;WS=206592685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,295:1.00:295
chr2	206605180	rs849575	T	G	1491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.058;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=28;PP=843;ReadPosRankSum=-1.198;SC=CTTCAAAGACTGCTCAAGTGG;SOR=0.801;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=213;TCF=127;TCR=86;TR=75;WE=206605188;WS=206605170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,83:0.35:239
chr2	206608039	rs849568	T	C	3902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=66;PP=2520;SC=CCCGCCTGGTTAGCAGCCGCT;SOR=0.917;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=57;TCR=67;TR=123;WE=206608047;WS=206608029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr2	206610502	rs849563	T	G	3853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=567;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.540;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=100;PP=2352;ReadPosRankSum=0.506;SC=ATGACACCCCTGACATCCGAA;SOR=0.616;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=517;TCF=240;TCR=277;TR=196;WE=206610510;WS=206610492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:351,214:0.38:565
chr2	206630073	rs35659576	A	AAC	2867.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.250;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.902;NF=33;NR=18;PP=2131;ReadPosRankSum=-0.202;SC=CAGGTGCAATAACACACACAC;SOR=1.014;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=77;TCF=45;TCR=32;TR=51;WE=206630082;WS=206630063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,92:0.85:108
chr2	206882530	rs41272653	G	C	1437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.532;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=37;PP=910;ReadPosRankSum=1.718;SC=AGTGGTTCAAGAGGATATCTG;SOR=0.613;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=183;TCF=86;TCR=97;TR=71;WE=206882538;WS=206882520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,77:0.37:206
chr2	206884726	rs76373237	G	A	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=84;ReadPosRankSum=0.770;SC=AAAGAAAGACGGTATTACAAT;SOR=0.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=6;WE=206884734;WS=206884716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr2	206911191	rs34828561	C	CA	777.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.94;ReadPosRankSum=-1.100;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,33:0.85:39
chr2	206921451	rs818009	G	A	7368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=133;NR=110;PP=2965;SC=CTTCCAATTCGGTTTCCAGGT;SOR=0.762;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=244;TCF=134;TCR=110;TR=243;WE=206921459;WS=206921441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,269:1.00:269
chr2	206988751	rs3770989	A	G	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.332;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=168;ReadPosRankSum=0.150;SC=CAAAGTTGATAACTAATATCA;SOR=0.153;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=10;WE=206988759;WS=206988741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr2	207008675	rs35409448	C	CT	5762.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.368;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=3.073;NF=46;NR=44;PP=2976;ReadPosRankSum=-1.276;SC=TACATCCCCCCCTTCATGGCA;SOR=0.910;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=163;TCF=73;TCR=90;TR=90;WE=207008683;WS=207008665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,167:0.59:283
chr2	207008763	rs1127566	C	A	6635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=468;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.134;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.873;NF=136;NR=120;PP=2962;ReadPosRankSum=1.967;SC=CGCGAGAGAGCGCATCCTCCC;SOR=0.759;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=419;TCF=218;TCR=201;TR=256;WE=207008771;WS=207008753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,288:0.62:466
chr2	207011836	rs77655991	C	T	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.720;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=148;ReadPosRankSum=0.505;SC=AATGTGTCATCAATGGTCAAG;SOR=0.284;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=51;TCF=8;TCR=43;TR=14;WE=207011844;WS=207011826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,15:0.28:53
chr2	207012483	rs11548670	A	G	1763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.909;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=50;PP=1162;ReadPosRankSum=0.537;SC=ATACCTGCAGATCACATTCAC;SOR=0.555;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=166;TCF=61;TCR=105;TR=81;WE=207012491;WS=207012473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,87:0.48:180
chr2	207023595	rs4147709	C	A	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=279;ReadPosRankSum=1.896;SC=GTCAATGGACCAAACAAACAA;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=15;WE=207023603;WS=207023585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,17:0.77:22
chr2	207023620	rs4147708	A	G	1023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.835;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=2;PP=459;ReadPosRankSum=-0.357;SC=AACAAACAGAAGCGTGAGCCA;SOR=0.394;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=26;WE=207023628;WS=207023610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,31:0.77:40
chr2	207024886	rs113729178	G	GC	839.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.30;QD=29.99;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	207025444	rs11689362	T	C	7141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=1.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=545;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=161;NR=131;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.190;SC=GGTAAAATCATCTTTGTATAG;SOR=0.716;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=485;TCF=269;TCR=216;TR=292;WE=207025452;WS=207025434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:224,321:0.59:545
chr2	207026131	rs11546386	G	A	1858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.637;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.470;NF=52;NR=39;PP=1192;ReadPosRankSum=0.929;SC=AGACACTACAGGAAGTGGAGC;SOR=0.577;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=220;TCF=128;TCR=92;TR=91;WE=207026139;WS=207026121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,95:0.41:231
chr2	207027407	rs35430253	C	CT	1916.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.648;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.887;NF=10;NR=33;PP=1488;ReadPosRankSum=0.628;SC=TTCAACCTTTCCTACAAGACT;SOR=0.983;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=71;TCF=15;TCR=56;TR=43;WE=207027415;WS=207027397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,56:0.57:98
chr2	207041053	rs3732083	T	C	3605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.434;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=71;PP=2274;ReadPosRankSum=-0.942;SC=TTCTTACTAATTAGGACATAA;SOR=0.642;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=258;TCF=134;TCR=124;TR=145;WE=207041061;WS=207041043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,162:0.57:283
chr2	207041441	rs3732082	G	A	4057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.678;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=80;PP=2558;ReadPosRankSum=0.645;SC=ACTCCACAGTGTCCCGGAAGT;SOR=0.640;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=306;TCF=155;TCR=151;TR=170;WE=207041449;WS=207041431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,184:0.55:333
chr2	207169731	rs10932150	G	A	3126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=398;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.663;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=75;PP=2230;ReadPosRankSum=1.096;SC=GCCAGTGTGAGAAAATGTAAC;SOR=0.778;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=377;TCF=189;TCR=188;TR=144;WE=207169739;WS=207169721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:241,157:0.39:398
chr2	207172627	rs7582864	A	G	1095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.262;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=22;PP=731;ReadPosRankSum=-0.828;SC=TTTCTGTCCAATCTGTGGCTG;SOR=0.661;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=113;TCF=56;TCR=57;TR=47;WE=207172635;WS=207172617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,52:0.40:129
chr2	207174316	rs3732084	T	C	2122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=360;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.432;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=50;PP=1528;ReadPosRankSum=-2.129;SC=AAGAAGCCAGTCTTCGGAAGG;SOR=0.741;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=330;TCF=170;TCR=160;TR=107;WE=207174324;WS=207174306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:246,113:0.31:359
chr2	207413170	rs34288550	T	G	1111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.475;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=35;PP=724;ReadPosRankSum=-1.470;SC=CCTAAAACAGTTCAGATTTTG;SOR=1.135;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=125;TCF=40;TCR=85;TR=46;WE=207413178;WS=207413160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,56:0.40:141
chr2	207427101	rs75880224	A	T	899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.682;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=27;PP=485;ReadPosRankSum=0.437;SC=AATATTTTTCATTCCAGTCAT;SOR=0.407;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=132;TCF=37;TCR=95;TR=40;WE=207427109;WS=207427091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,48:0.33:146
chr2	207452151	rs3832131	GT	G	1382.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=31;PP=606;SC=TCATTGGAAAGTTTTTTTTTC;SOR=1.524;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=31;WE=207452159;WS=207452141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr2	207472606	rs5838036	G	GT	239.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.15;ReadPosRankSum=1.128;SOR=1.345;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,14:0.36:39
chr2	207472683	rs78458117	C	CTA	6172.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=48;PP=2421;SC=TAATCCTAGCCTGTTTTCTGA;SOR=0.708;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=8;TCR=48;TR=56;WE=207472691;WS=207472673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr2	207516721	rs35581991	A	G	922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=26;PP=567;ReadPosRankSum=0.117;SC=TAAAGCTCTCACATGGAGAAG;SOR=0.759;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=115;TCF=47;TCR=68;TR=43;WE=207516729;WS=207516711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,48:0.38:127
chr2	207527608	rs2359680	T	C	2311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.401;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=44;PP=1287;ReadPosRankSum=0.011;SC=ACGATGTCTATGGATTGTGAA;SOR=0.609;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=294;TCF=184;TCR=110;TR=109;WE=207527616;WS=207527598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:202,121:0.37:323
chr2	207527840	rs2115591	G	T	2095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.031;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=44;PP=1438;ReadPosRankSum=0.540;SC=ATGACTTTCTGTGGCATCTTT;SOR=0.834;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=257;TCF=144;TCR=113;TR=103;WE=207527848;WS=207527830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,110:0.38:288
chr2	207530855	rs13022891	G	C	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.455;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=402;ReadPosRankSum=-0.010;SC=GGGAAAAGATGCTGGAAAACC;SOR=1.002;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=6;TCR=40;TR=22;WE=207530863;WS=207530845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,23:0.45:51
chr2	207569715	rs16838626	T	C	1968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.215;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=61;PP=1438;ReadPosRankSum=0.298;SC=TTGCAATGTATCTTTGAAGAG;SOR=1.204;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=200;TCF=74;TCR=126;TR=88;WE=207569723;WS=207569705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,93:0.44:213
chr2	207569803	rs16838630	A	C	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=140;ReadPosRankSum=0.296;SC=ATTATTGGCTAGCTATTATGA;SOR=0.368;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=10;WE=207569811;WS=207569793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr2	207570529	rs56067462	G	C	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.759;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=13;PP=443;ReadPosRankSum=0.980;SC=TTTTGAAAGAGGGCTGTCTCC;SOR=0.922;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=93;TCF=61;TCR=32;TR=37;WE=207570537;WS=207570519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,37:0.38:98
chr2	207570705	rs16838632	A	G	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.487;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=233;ReadPosRankSum=-1.232;SC=ATATGGTGCTATAAGTTCCAA;SOR=0.170;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=48;TCF=14;TCR=34;TR=20;WE=207570713;WS=207570695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,22:0.41:54
chr2	207572341	rs16838641	T	G	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=226;ReadPosRankSum=-0.847;SC=GTCGCTATTTTCTTTTAAGGG;SOR=0.473;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=14;WE=207572349;WS=207572331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr2	207575074	rs74345488	C	T	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.135;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=269;ReadPosRankSum=-0.786;SC=TTTGCCTGCACGTGATGTTTT;SOR=0.105;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=16;WE=207575082;WS=207575064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr2	207613980	rs13427620	G	A	573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=15;PP=382;SC=CCCTGGCTCAGTGGAACTAAG;SOR=3.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=207613988;WS=207613970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	207621759	rs1990849	A	G	4946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=97;PP=2965;SC=TGACATCATAATAAAGCTAAA;SOR=1.392;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=60;TCR=98;TR=157;WE=207621767;WS=207621749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr2	207636518	rs12620432	C	T	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=321;ReadPosRankSum=-0.438;SC=GTTGAGGCTCCAACCTGGGTG;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=15;WE=207636526;WS=207636516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,18:0.75:24
chr2	207814273	rs75295922	C	A	1880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=18;PP=1235;ReadPosRankSum=0.699;SC=CCTTTTTCAACAACCCGCCAA;SOR=0.626;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=112;TCF=84;TCR=28;TR=74;WE=207814281;WS=207814263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,80:0.65:123
chr2	207820276	rs13420911	G	A	2474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.481;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=61;PP=1565;ReadPosRankSum=1.324;SC=CCCACCCCATGTATTATCTGA;SOR=0.732;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=217;TCF=106;TCR=111;TR=118;WE=207820284;WS=207820266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,123:0.54:229
chr2	207824384	rs11903403	T	G	2403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.388;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=36;PP=1636;ReadPosRankSum=-1.047;SC=ACAACTCAAGTATACGCAAGC;SOR=1.022;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=210;TCF=129;TCR=81;TR=100;WE=207824392;WS=207824374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,110:0.47:234
chr2	207824548	rs1453168	G	A	1541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=41;PP=1009;ReadPosRankSum=-1.774;SC=TATCCATTCCGGCTCTAAAAA;SOR=0.739;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=97;TCF=33;TCR=64;TR=60;WE=207824556;WS=207824538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,66:0.61:109
chr2	207824650	rs1453169	A	G	144.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.54;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=3;PP=56;SC=GTTTAGGCCTAAGGAAGCCTA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=207824658;WS=207824640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr2	207825656	rs13397039	A	T	3187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.543;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=77;PP=1967;ReadPosRankSum=-1.371;SC=ATTTCAATGCATCTTGGTGTA;SOR=0.991;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=220;TCF=89;TCR=131;TR=124;WE=207825664;WS=207825646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,141:0.58:244
chr2	207833848	rs7582092	A	G	1546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.700;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=19;PP=992;ReadPosRankSum=-1.801;SC=ATAGAAATCCATTCTTCCAAA;SOR=1.364;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=146;TCF=95;TCR=51;TR=70;WE=207833856;WS=207833838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,77:0.49:157
chr2	207833983	rs7582305	A	G	2357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.051;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=52;PP=1566;ReadPosRankSum=-1.340;SC=ACAGTGGAACATATGGGTTTG;SOR=0.528;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=70;TCR=82;TR=97;WE=207833991;WS=207833973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,102:0.63:161
chr2	207946141	rs2287507	A	G	2270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.178;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=51;PP=1255;ReadPosRankSum=-0.919;SC=AGTTTAAGGGACAAAATGTTT;SOR=0.374;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=141;TCF=50;TCR=91;TR=85;WE=207946149;WS=207946131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,100:0.61:165
chr2	207946164	rs2287506	T	C	1698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.345;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=37;PP=998;ReadPosRankSum=-0.316;SC=GTTTAAATCCTATCTCTTCCA;SOR=0.257;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=94;TCF=27;TCR=67;TR=56;WE=207946172;WS=207946154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,67:0.60:112
chr2	207974818	rs2244923	C	T	6561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=105;NR=123;PP=2965;SC=TTTCTATGCACGTGAATGTAG;SOR=0.954;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=228;TCF=105;TCR=123;TR=228;WE=207974826;WS=207974808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr2	207988613	rs2700166	C	T	1415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=29;PP=1057;SC=CTTCAGCCCCCAGCCCTCCTT;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=15;TCR=29;TR=44;WE=207988621;WS=207988603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr2	207998800	rs2284934	C	T	5444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.80;SOR=0.741;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr2	207999021	rs2284933	G	C	765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=12;NR=21;PP=597;SC=ATTACTTCTTGTACTCCAAAG;SOR=1.071;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=12;TCR=21;TR=33;WE=207999029;WS=207999011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	208031796	rs2037893	C	G	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.103;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=7;PP=333;ReadPosRankSum=0.216;SC=TAGAGGGAGCCTAGGTAGACG;SOR=0.435;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=75;TCF=59;TCR=16;TR=28;WE=208031804;WS=208031786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,28:0.36:78
chr2	208031992	rs1269424	T	A	5981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=119;PP=2965;SC=CCTGCACAATTCACGTTAGGG;SOR=1.209;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=204;TCF=85;TCR=119;TR=204;WE=208032000;WS=208031982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr2	208442095	rs2709387	G	A	795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=4.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=2;PP=546;ReadPosRankSum=-0.271;SC=TTCTTTCAACGCTTTAGCCAG;SOR=0.563;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=49;TCF=46;TCR=3;TR=28;WE=208442103;WS=208442085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,31:0.57:54
chr2	208447632	.	AAC	A	417.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=0.000;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=4.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.17;MQRankSum=4.536;QD=8.53;ReadPosRankSum=-0.412;SOR=0.219;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,15:0.31:49
chr2	208447642	rs35896795	A	ATAT,AT	1810.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=63.12;MQRankSum=0.685;QD=31.22;ReadPosRankSum=0.661;SOR=0.460;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:3,24,31:0.41,0.53:58
chr2	208477852	rs2551949	G	A	2911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=471;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.598;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=60;PP=1699;ReadPosRankSum=-0.230;SC=CTTTCTCACAGTAAATTGCCT;SOR=0.904;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=425;TCF=234;TCR=191;TR=144;WE=208477860;WS=208477842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:311,159:0.34:470
chr2	208477956	rs2709416	C	T	2582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.400;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=60;PP=1589;ReadPosRankSum=0.716;SC=GTTCCAGTGTCTGAAGAAGAT;SOR=0.849;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=306;TCF=147;TCR=159;TR=111;WE=208477964;WS=208477946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:211,129:0.38:340
chr2	208591523	rs77591925	G	A	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=4.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.00;ReadPosRankSum=-1.368;SOR=1.182;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,28:0.22:127
chr2	208633413	rs4675711	T	C	5967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=112;PP=2965;SC=CCAGCTGCGCTAGGAGCAGCA;SOR=1.211;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=194;TCF=81;TCR=113;TR=193;WE=208633421;WS=208633403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr2	208693261	rs720632	C	G	2169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.459;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=55;PP=1477;ReadPosRankSum=-0.169;SC=AAGACTGAAGCCAGCAAGACA;SOR=0.641;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=232;TCF=110;TCR=122;TR=106;WE=208693269;WS=208693251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,110:0.43:258
chr2	208693307	rs720631	T	C	1269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.440;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=34;PP=686;ReadPosRankSum=1.636;SC=GTGCAGCTGGTGGCACAATCT;SOR=0.376;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=122;TCF=45;TCR=77;TR=59;WE=208693315;WS=208693297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,63:0.47:135
chr2	208717440	rs10932211	A	G	980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.151;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=15;PP=557;ReadPosRankSum=-2.809;SC=AGGCAGGGAAAGGCTGAAAAA;SOR=0.990;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=128;TCF=80;TCR=48;TR=48;WE=208717448;WS=208717430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,54:0.38:141
chr2	208811097	rs10932215	C	T	1338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.338;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=26;PP=891;ReadPosRankSum=0.368;SC=CTACCTTATACTTTGAAGTAT;SOR=0.871;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=233;TCF=136;TCR=97;TR=72;WE=208811105;WS=208811087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,79:0.32:249
chr2	208841964	rs4441448	A	G	7035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=130;NR=115;PP=2965;SC=TTGTCAGCTCATTCTGCCGCC;SOR=0.755;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=245;TCF=130;TCR=115;TR=245;WE=208841972;WS=208841954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
chr2	208986385	rs2305429	A	G	3405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=40;PP=2281;SC=AAACAACAAAAGAGGACATAT;SOR=1.460;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=76;TCR=40;TR=116;WE=208986393;WS=208986375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr2	208986637	rs2305430	T	C	7648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=121;NR=141;PP=2965;SC=TGTAGTCCTCTCTCTCATAGA;SOR=0.931;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=264;TCF=123;TCR=141;TR=262;WE=208986645;WS=208986627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,278:1.00:278
chr2	208989037	rs2242074	A	G	723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-8.297;NF=21;NR=20;PP=419;ReadPosRankSum=1.396;SC=TGCTGCATTCATAGTGGCGGC;SOR=0.651;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=126;TCF=64;TCR=62;TR=41;WE=208989045;WS=208989027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,44:0.32:136
chr2	209007559	rs796287	T	G	954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.493;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=24;PP=548;ReadPosRankSum=0.487;SC=TGAACAGAGATACAGTCGTCT;SOR=0.970;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=97;TCF=45;TCR=52;TR=42;WE=209007567;WS=209007549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,47:0.42:112
chr2	209010558	rs2854723	A	G	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.816;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=11;PP=359;ReadPosRankSum=-0.157;SC=GCTGGTAGTCAGGGTACTCCC;SOR=0.861;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=95;TCF=61;TCR=34;TR=31;WE=209010572;WS=209010548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,33:0.32:102
chr2	209010823	rs184047772	ACC	TTT	4033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.425;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=49;PP=2934;ReadPosRankSum=-0.401;SC=AGCATCCGGTACCCAGGACTT;SOR=0.724;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=287;TCF=133;TCR=154;TR=93;WE=209010833;WS=209010813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:211,112:0.35:323
chr2	209010891	rs2289917	G	A	1119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.349;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=33;PP=729;ReadPosRankSum=0.167;SC=GTGGGACTGCGGGAACGTCAC;SOR=1.127;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=138;TCF=46;TCR=92;TR=46;WE=209010899;WS=209010881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,54:0.34:159
chr2	209028191	rs796280	C	T	4849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=394;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=109;NR=98;PP=2819;ReadPosRankSum=-0.655;SC=AATAAGGTGACAGTAGACAGT;SOR=0.711;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=360;TCF=186;TCR=174;TR=207;WE=209028199;WS=209028181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,226:0.58:392
chr2	209030330	.	G	GT	47	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=11;HapScore=2;MGOF=22;MMLQ=20;MQ=59.77;NF=4;NR=1;PP=47;QD=11.2;SC=TAAGGTCACAGTTTTTTTTTT;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=5;WE=209030338;WS=209030320;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr2	209030572	rs6721025	A	G	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.595;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=437;ReadPosRankSum=0.447;SC=GGTATCAAGCACATCAATTTA;SOR=1.314;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=33;TCF=10;TCR=23;TR=11;WE=209030586;WS=209030562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,12:0.31:39
chr2	209030578	rs796281	A	G	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=648;ReadPosRankSum=-0.741;SC=AAGCACATCAATTTAACATGG;SOR=0.504;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=19;WE=209030586;WS=209030562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,22:0.69:32
chr2	209033138	rs7589065	C	T	2591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=47;PP=1443;SC=TGGCTCAAGCCTGTAATCCCA;SOR=1.132;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=37;TCR=47;TR=84;WE=209033146;WS=209033128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr2	209033173	rs7562540	A	G	1510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=34;PP=944;SC=CAAGGCGGGCAGATCGCGAGG;SOR=1.781;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=17;TCR=34;TR=51;WE=209033181;WS=209033163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr2	209035485	rs6435420	T	G	985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=2;PP=816;SC=ATTTTGCAGATGAGGAAACTA;SOR=4.548;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=30;WE=209035493;WS=209035475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	209035658	rs6748431	C	T	9067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=166;NR=139;PP=2965;SC=AATTTACAATCTCACACCTAC;SOR=0.793;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=305;TCF=166;TCR=139;TR=305;WE=209035666;WS=209035648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,334:1.00:334
chr2	209035849	rs4292037	A	C	1056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=26;PP=817;SC=TGTCCATCCAAAGTTTCATTT;SOR=2.584;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=33;WE=209035857;WS=209035839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr2	209036605	rs10932244	T	C	4157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=89;NR=54;PP=2751;SC=CAACCAGACATAGAAATCTAA;SOR=1.270;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=143;TCF=89;TCR=54;TR=143;WE=209036613;WS=209036595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr2	209036712	rs10804166	T	C	6770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=113;NR=115;PP=2965;SC=CCAGGCTTACTCTGTTTGCGG;SOR=0.819;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=228;TCF=113;TCR=115;TR=228;WE=209036720;WS=209036702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr2	209036778	rs6435421	A	G	4945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=85;PP=2774;SC=AAGGAGAGGCAGAGAGATGAA;SOR=1.093;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=154;TCF=69;TCR=85;TR=154;WE=209036786;WS=209036768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr2	209036799	rs368879068	C	G	1129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.262;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=32;PP=764;ReadPosRankSum=-0.558;SC=ACTCGGGGAACCTGAAAGGAA;SOR=1.031;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=119;TCF=48;TCR=71;TR=49;WE=209036807;WS=209036789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,54:0.38:142
chr2	209046162	rs6435425	G	A	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.18;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	209046162	.	GTA	ATG	505	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=10;PP=505;QD=55.8467874862;SC=AATAAAATTGGTATGATTGTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=209046172;WS=209046152;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	209046164	rs6435426	A	G	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.18;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	209049840	rs10804167	C	T	4876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=69;NR=114;PP=2965;SC=TCCCATCCCTCCCTCCCCCAC;SOR=1.249;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=183;TCF=69;TCR=114;TR=183;WE=209049848;WS=209049830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr2	209101905	rs57383668	GA	G	2801.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=41;PP=976;SC=TAACGGGAAGGAAAAAAAAAA;SOR=0.730;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=57;TCF=10;TCR=47;TR=51;WE=209101913;WS=209101895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr2	209108301	rs34599179	T	C	4837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=348;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.805;NF=89;NR=106;PP=2962;ReadPosRankSum=1.405;SC=ATCTTGATTATACATCCCCAT;SOR=0.690;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=314;TCF=146;TCR=168;TR=195;WE=209108309;WS=209108291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,215:0.62:348
chr2	209138946	rs6705163	C	T	859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=19;PP=600;SC=GCTGAATAAGCTGAGCTCCTC;SOR=2.468;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=25;WE=209138954;WS=209138936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	209163556	rs7569723	C	T	6425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=142;PP=2965;SC=AGAGAATGTTCATGTGACTGA;SOR=1.569;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=217;TCF=75;TCR=142;TR=217;WE=209163577;WS=209163546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr2	209168853	rs893256	C	T	6031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=121;NR=93;PP=2965;SC=ACATTGTTGCCATTGAAGGCC;SOR=0.841;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=214;TCF=121;TCR=93;TR=214;WE=209168861;WS=209168843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr2	209176807	rs12624141	T	G	616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=0;PP=527;SC=GAGGCATTTTTACCCAAAGCT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=209176815;WS=209176797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	209184844	rs934712	A	G	477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=2;PP=374;SC=CTAAATGAGAATATATTAATA;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=209184852;WS=209184834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	209184980	rs10932258	G	A	2259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=33;PP=1191;SC=TTGTAGATGAGTTCTTGTATT;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=39;TCR=33;TR=72;WE=209184988;WS=209184970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr2	209184999	rs10932259	C	T	2495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=38;PP=1340;SC=TTAAAAACCCCAAAATTCTTC;SOR=0.758;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=41;TCR=38;TR=79;WE=209185007;WS=209184989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr2	209189912	rs893255	A	G	966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=10;PP=845;SC=TTTTACAGATATTAAGAGAGT;SOR=1.688;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=30;WE=209189920;WS=209189902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	209190330	rs2363468	T	C	7651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=140;NR=110;PP=2965;SC=TTGCTGGAATTGAGGATTGTG;SOR=0.860;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=251;TCF=140;TCR=111;TR=250;WE=209190338;WS=209190320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,282:1.00:282
chr2	209190519	rs893254	A	T	14952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.17;SOR=0.814;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,331:1.00:331
chr2	209190528	rs893253	C	G	15574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=366;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.55;SOR=0.772;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,366:1.00:366
chr2	209191082	rs1529979	C	A	6094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.188;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=100;NR=101;PP=2965;ReadPosRankSum=1.790;SC=TTCAAGTGGCCAATCAGGAAG;SOR=0.367;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=202;TCF=101;TCR=101;TR=201;WE=209191090;WS=209191072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,224:1.00:225
chr2	209191099	rs1529978	T	C	5765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=112;PP=2965;SC=GAAGCAAAAATGAGGGTGATG;SOR=1.049;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=200;TCF=88;TCR=112;TR=200;WE=209191107;WS=209191089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr2	209194696	rs1437414	G	C	2662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=46;PP=1526;SC=AAAATTTCAAGCTAAAACGTA;SOR=1.067;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=39;TCR=46;TR=85;WE=209194704;WS=209194686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr2	209195099	rs1866045	G	A	502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=1;PP=391;SC=AACTATCACCGTGCTGTAGCT;SOR=4.174;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=15;WE=209195107;WS=209195089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	209195133	rs12694109	T	C	1151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=6;PP=844;SC=AGCTGCAGGCTCAGAGCAGCA;SOR=2.891;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=31;TCR=6;TR=37;WE=209195141;WS=209195123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr2	209199945	rs2363469	A	G	1693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=3;PP=1328;SC=TGCCTCATAGAATATAGTTGA;SOR=5.018;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=45;TCR=3;TR=48;WE=209199953;WS=209199935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr2	209201054	rs6744236	T	C	633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=21;PP=479;SC=TTTTGTTTCCTGTCACTCTCC;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=209201062;WS=209201044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	209201739	rs7596571	T	C	696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=21;PP=481;SC=TAGTTTAATATGTACTTTAGT;SOR=3.611;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=24;WE=209201747;WS=209201729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	209203122	rs4675756	C	G	437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=0;PP=295;SC=AATTTTTTAACGGTATAAATG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=209203130;WS=209203112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	209204714	rs2289171	G	A	4715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=58;PP=2886;SC=TAATATATAAGTAGACTATTT;SOR=1.436;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=100;TCR=58;TR=158;WE=209204722;WS=209204704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr2	209209827	rs2304544	G	A	7218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=146;NR=103;PP=2965;SC=ACCTATTTCTGCCCTAAGTTG;SOR=1.049;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=249;TCF=146;TCR=103;TR=249;WE=209209835;WS=209209804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,272:1.00:272
chr2	209209997	rs2043718	C	T	1538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=42;PP=1120;SC=AGTTTTATTACAGCATTTATC;SOR=4.977;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=3;TCR=42;TR=45;WE=209210005;WS=209209987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr2	209212707	rs2304545	G	A	5392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=90;NR=87;PP=2965;SC=TTGGGCAGACGGGCAAGGAGG;SOR=0.723;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=177;TCF=90;TCR=87;TR=177;WE=209212715;WS=209212697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr2	209214770	rs2118297	A	G	5511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=108;NR=88;PP=2965;SC=GAGGAGATACACAAAAGAAGC;SOR=0.740;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=196;TCF=108;TCR=88;TR=196;WE=209214778;WS=209214760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr2	209215448	rs994696	A	G	1111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=9;PP=711;SC=GAGGAAAGATATTTTCTGAGT;SOR=1.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=34;WE=209215456;WS=209215438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr2	209215586	rs994697	A	G	3814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=56;PP=2316;SC=ACAGCAGTGAAGAAGATTTCA;SOR=0.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=63;TCR=56;TR=119;WE=209215594;WS=209215576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr2	209219190	rs6435453	A	G	1917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=10;PP=1428;SC=AGCACTCAATAAAAGTTAACT;SOR=2.683;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=45;TCR=10;TR=55;WE=209219198;WS=209219180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr2	209220157	rs10208191	G	T	783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=20;PP=538;SC=CAGTTCTGTGGCTGTTTAGAC;SOR=4.174;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=209220165;WS=209220147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	209224874	rs11357589	CA	C	3642.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=29;PP=2475;SC=AGCAGTTTGTCAACCAGCATA;SOR=1.384;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=61;TCF=31;TCR=30;TR=59;WE=209224882;WS=209224864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr2	209293168	rs962595	C	T	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=23;PP=599;SC=TGCAGCAGAACAACAACACTC;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=209293176;WS=209293158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	209315573	rs1370371	G	A	4562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=73;PP=2498;SC=AACCTCAGATGTTCTCAAGAC;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=143;TCF=70;TCR=73;TR=143;WE=209315581;WS=209315563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr2	209353607	rs6726003	A	G	144.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=114;SC=CCCTGTCTCAAGAAAAGATAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=209353615;WS=209353603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr2	209353656	rs11335842	GT	G	819.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.530;NF=15;NR=8;PP=359;ReadPosRankSum=-0.286;SC=GCTCTGCTAAGTTTTTTTTTT;SOR=1.329;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=32;TCF=18;TCR=14;TR=23;WE=209353664;WS=209353646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,37:0.90:41
chr2	209355471	rs375999596	G	A	1194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.007;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=29;PP=670;ReadPosRankSum=0.078;SC=AATGTATCCTGAATCTCTTTA;SOR=0.522;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=151;TCF=69;TCR=82;TR=56;WE=209355479;WS=209355461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,63:0.37:171
chr2	209358027	rs3820900	C	T	7268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=116;NR=131;PP=2965;SC=GTCGGTGGAACCTCTCCGTGG;SOR=0.895;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=247;TCF=116;TCR=131;TR=247;WE=209358035;WS=209358017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,269:1.00:269
chr2	210517785	rs2254169	C	T	1790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.97;NF=48;NR=7;PP=1284;SC=CGGTTTGCTACAAATTTTTCC;SOR=3.538;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=48;TCR=7;TR=55;WE=210517793;WS=210517775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr2	210559865	rs35927101	G	A	2129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=384;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=56;PP=1569;ReadPosRankSum=-1.307;SC=AGAAACATTCGGATTAGGAGT;SOR=0.684;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=353;TCF=175;TCR=178;TR=111;WE=210559873;WS=210559855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:266,117:0.31:383
chr2	210594540	rs4673486	A	G	8321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=156;NR=120;PP=2965;SC=CGAATGCAAGATATAGTTAAA;SOR=0.859;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=276;TCF=156;TCR=120;TR=276;WE=210594548;WS=210594530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,310:1.00:310
chr2	210594717	rs11389149	C	CT	1507.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.435;HP=6;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=54;PP=984;ReadPosRankSum=-1.541;SC=CCAATCTTGTCTTTTTAAAAA;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=61;TCF=1;TCR=60;TR=54;WE=210594730;WS=210594707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,63:0.97:65
chr2	210594768	rs7594601	T	C	640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=14;PP=530;SC=AGGTCCCAGATTGTAGACCTG;SOR=1.721;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=20;WE=210594776;WS=210594758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	210659434	rs7603924	A	G	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=336;ReadPosRankSum=0.295;SC=CTCGATAGTGAGTAAATCTCA;SOR=0.552;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=35;TCF=25;TCR=10;TR=23;WE=210659442;WS=210659424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,24:0.63:38
chr2	210678272	rs193198971	A	G	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=79;ReadPosRankSum=-0.624;SC=CTTGATTGTCAGTATAATTAT;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=7;WE=210678280;WS=210678262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr2	210678691	rs2159745	T	G	2741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=69;PP=2051;SC=TTACACTGTTTCTATTATCTT;SOR=2.662;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=20;TCR=69;TR=89;WE=210678699;WS=210678681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr2	210704200	rs9288414	C	A	2139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=42;PP=1243;SC=TATTACCAACCATGTCCTCAG;SOR=1.310;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=29;TCR=42;TR=71;WE=210704208;WS=210704190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr2	210705348	rs10178675	C	G	6625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=120;NR=101;PP=2965;SC=TGGACCGACTCTCTTTCATCA;SOR=0.785;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=221;TCF=120;TCR=101;TR=221;WE=210705356;WS=210705338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr2	210714162	rs2191906	A	G	7926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=160;NR=114;PP=2965;SC=CCACCATGGCACCACCTTTAC;SOR=0.966;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=274;TCF=160;TCR=114;TR=274;WE=210714170;WS=210714152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,303:1.00:303
chr2	210737363	rs16843880	T	A	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=187;ReadPosRankSum=-1.216;SC=ATATGGCCAATATAAATCAAA;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=10;WE=210737371;WS=210737353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr2	210745681	rs2370838	C	A	7835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=162;NR=113;PP=2965;SC=CTTTCATTTCCTAGGTACTGT;SOR=1.019;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=277;TCF=163;TCR=114;TR=275;WE=210745689;WS=210745671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,294:1.00:294
chr2	210745855	rs17748818	C	T	593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.037;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=23;PP=431;ReadPosRankSum=1.087;SC=TCAGGTTACTCGGAGAGGCCA;SOR=0.911;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=78;TCF=19;TCR=59;TR=29;WE=210745863;WS=210745845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,30:0.36:83
chr2	210760913	.	C	T	125.88	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5210;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=92;ReadPosRankSum=0.210;SC=AATGCTATGCCCTGTAACCCA;SOR=0.941;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=5;WE=210760921;WS=210760904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr2	210786137	rs9288415	G	A	1870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=20;PP=1295;SC=AAACTACTACGTTTGTGTCAT;SOR=1.716;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=46;TCR=20;TR=66;WE=210786145;WS=210786127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr2	210819095	rs74465551	A	G	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=95;ReadPosRankSum=-0.269;SC=CTAAAACCCAATCTTTATTTA;SOR=0.693;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=8;WE=210819103;WS=210819085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr2	210838004	rs141804658	TTC	T	75.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=2.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.63;ReadPosRankSum=-0.287;SOR=1.137;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:106,14:0.12:120
chr2	210874246	rs3738934	T	C	1907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=45;NR=19;PP=1222;SC=TTTAGTATTATTTAATACTGA;SOR=1.678;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=45;TCR=19;TR=64;WE=210874254;WS=210874236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr2	210880893	rs7570090	C	T	6176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=120;PP=2965;SC=GGAAGATTTGCGGGAAACAGG;SOR=1.091;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=208;TCF=88;TCR=120;TR=208;WE=210880901;WS=210880883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr2	210882456	rs2243769	G	T	374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=340;SC=AAGTGGATATGCTTTTTTTTT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=12;WE=210882464;WS=210882446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	210882677	rs2723213	C	T	279.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=231;SC=CTATGTTGGCCAGGCTGGTCT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=210882685;WS=210882667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	210889759	rs6435550	A	G	1940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=8;PP=1409;SC=GTCTCACCCAAAATTCATGCA;SOR=2.985;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=50;TCR=8;TR=58;WE=210889767;WS=210889749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr2	211060050	rs2286963	T	G	2456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=43;PP=1423;SC=TCTGCTAATTTATGTTGCACT;SOR=1.312;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=32;TCR=43;TR=75;WE=211060058;WS=211060040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr2	211069438	rs263677	G	A	6428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=125;PP=2965;SC=GTAGAGAATGGTCTCATTTAA;SOR=1.290;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=209;TCF=84;TCR=125;TR=209;WE=211069446;WS=211069428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr2	211074909	rs3764913	T	C	4829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=73;PP=2798;ReadPosRankSum=1.349;SC=TAGAAGTCCTTTTTTACACAC;SOR=0.715;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=160;TCF=87;TCR=73;TR=160;WE=211074917;WS=211074899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,180:0.99:182
chr2	211162998	rs7592060	G	A	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.938;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=77;ReadPosRankSum=-0.473;SC=GCCCTATTATGTGAAACATTT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=5;WE=211163006;WS=211162993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr2	211163063	.	TACACAC	T,TACACACACACACAC	1080.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.22;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;NF=7,7;NR=12,12;PP=314,1188;SC=ACACACATACTACACACACAC;SOR=1.112;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=29;TCF=11;TCR=18;TR=19,19;WE=211163076;WS=211163044;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.60:25
chr2	211167132	rs2292300	A	T	3623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.455;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=66;PP=2060;ReadPosRankSum=-1.211;SC=GAAGAGCTAAACTCATCCCAA;SOR=0.790;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=280;TCF=148;TCR=132;TR=147;WE=211167140;WS=211167122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,172:0.55:310
chr2	211168181	rs35179660	T	TC	338.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.005;NF=7;NR=0;PP=199;ReadPosRankSum=-0.762;SC=TCAGTTCCATTTTTGCCTATC;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=7;WE=211168189;WS=211168171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr2	211168277	rs181132123	G	A	980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQ=60.08;MQRankSum=-0.788;NF=31;NR=13;PP=523;ReadPosRankSum=-0.711;SC=ATGATGGAGCGGCTGGGCTGC;SOR=0.638;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=110;TCF=76;TCR=34;TR=44;WE=211168285;WS=211168267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,51:0.39:130
chr2	211168346	rs12469767	A	C	2092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.602;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=45;PP=1293;ReadPosRankSum=-2.100;SC=GAGTGGGGTCATCCCTGGCTG;SOR=0.764;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=141;TCF=68;TCR=73;TR=85;WE=211168354;WS=211168336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,96:0.61:157
chr2	211302685	rs13420747	T	C	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.264;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=419;ReadPosRankSum=-0.587;SC=AAAGCATGGCTAAGGGGAAAT;SOR=0.151;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=38;TCF=8;TCR=30;TR=25;WE=211302693;WS=211302675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,27:0.68:40
chr2	211319824	rs2287432	T	C	3801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=81;NR=54;PP=2066;SC=TATAGAAACATGATTACCGTG;SOR=1.052;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=135;TCF=81;TCR=54;TR=135;WE=211319832;WS=211319814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr2	211340937	rs3214410	A	AT	1577.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.928;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=14;PP=895;ReadPosRankSum=2.443;SC=CGAATCATGTATTTTTTTAAA;SOR=0.982;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=62;TCF=31;TCR=31;TR=36;WE=211340945;WS=211340927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,62:0.66:94
chr2	211341156	rs2287418	C	G	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.413;HP=6;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=-0.604;NF=9;NR=10;PP=182;ReadPosRankSum=1.069;SC=AGGGGAAAAACAGAAACTAGG;SOR=0.086;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=39;TCF=12;TCR=27;TR=19;WE=211341164;WS=211341146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,23:0.51:45
chr2	211341204	rs56033100	G	GC	538.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=10;PP=389;SC=GAGGGCGGCGGCGGCGCCCAG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=10;WE=211341212;WS=211341194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	211342502	rs17552879	G	A	1783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=47;PP=1097;ReadPosRankSum=-0.911;SC=TGAGTCTTAAGCTGGATATCT;SOR=0.713;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=217;TCF=102;TCR=115;TR=87;WE=211342510;WS=211342492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,95:0.40:238
chr2	211442212	rs114819130	G	A	1804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.421;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.679;NF=53;NR=43;PP=1036;ReadPosRankSum=-1.365;SC=AAGAGTTTAGGGCAATGGCTA;SOR=0.665;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=304;TCF=166;TCR=138;TR=96;WE=211442220;WS=211442202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:230,108:0.32:338
chr2	211444533	rs35833900	G	GGT	566.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=22;PP=448;ReadPosRankSum=-0.128;SC=TGTTTCTTCGGGTGTGTGTGT;SOR=0.578;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=58;TCF=3;TCR=55;TR=23;WE=211444542;WS=211444523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,32:0.46:70
chr2	211456637	rs1047883	A	G	3190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.50;ReadPosRankSum=-1.942;SOR=0.692;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:148,156:0.51:304
chr2	211456637	.	ACC	GCT	2944	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=73;NR=66;PP=2944;QD=20;SC=CTTGGACAACACCCTCCCTGC;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=278;TCF=144;TCR=134;TR=139;WE=211456647;WS=211456627;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:139,139:0.50:278
chr2	211456639	rs2229589	C	T	6125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.08;ReadPosRankSum=-2.210;SOR=0.704;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:145,160:0.52:305
chr2	211470086	rs2277909	T	C	542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=20;PP=359;ReadPosRankSum=1.461;SC=GACAGACTAGTGATAACATTT;SOR=0.567;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=49;TCF=9;TCR=40;TR=25;WE=211470094;WS=211470076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,26:0.52:50
chr2	211473070	rs2287600	G	T	2515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.128;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.261;NF=63;NR=42;PP=1441;ReadPosRankSum=-0.524;SC=AAATAAATTTGTCTTCTTTTT;SOR=0.601;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=175;TCF=107;TCR=68;TR=105;WE=211473078;WS=211473060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,118:0.59:199
chr2	211481257	rs2287599	C	G	3934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=353;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.251;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=82;PP=2533;ReadPosRankSum=-1.163;SC=CACTGAAAGGCCTCAACAGGT;SOR=0.749;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=318;TCF=166;TCR=152;TR=174;WE=211481265;WS=211481247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,184:0.52:353
chr2	211513118	rs4673540	C	T	1073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=2;PP=840;SC=GGCTACCACTCGAGCTAATGA;SOR=4.743;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=32;WE=211513126;WS=211513108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr2	211514995	rs34449727	G	T	880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.653;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=15;PP=565;ReadPosRankSum=-0.271;SC=AGCCCCGACTGGAACTATAGG;SOR=0.807;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=149;TCF=94;TCR=55;TR=45;WE=211515003;WS=211514985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,49:0.31:160
chr2	211521227	rs200838660	CTT	C	216.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=1.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.04;ReadPosRankSum=0.000;SOR=0.293;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr2	211523457	rs6435580	C	T	2047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.907;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=53;PP=1158;ReadPosRankSum=-0.065;SC=CACTGTGTTACGTCATGTTGG;SOR=0.754;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=278;TCF=125;TCR=153;TR=98;WE=211523465;WS=211523447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:196,111:0.36:307
chr2	211527716	rs3214427	A	AT	151.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=131;ReadPosRankSum=-0.041;SC=GACCCAAGAGATTTTTTACAT;SOR=1.302;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=7;WE=211527724;WS=211527706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr2	211527827	rs5838215	GT	G	713.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.26;MQRankSum=1.405;QD=9.03;ReadPosRankSum=0.741;SOR=0.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,46:0.58:79
chr2	211532800	rs3217217	A	ATG	95.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.519;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=177;ReadPosRankSum=-1.646;SC=TTGTGCGTGCATGTGTGTGTG;SOR=0.086;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=6;WE=211532808;WS=211532796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr2	211533070	rs10932347	A	G	3737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=72;PP=2144;SC=GAGGGGCAGGATAGAATGTTA;SOR=1.364;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=47;TCR=72;TR=119;WE=211533078;WS=211533060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr2	211540507	rs1047891	C	A	2550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.896;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=61;PP=1654;ReadPosRankSum=1.777;SC=GTCCCTGCCACCCCAGTGGCA;SOR=0.822;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=184;TCF=91;TCR=93;TR=106;WE=211540515;WS=211540497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,116:0.55:212
chr2	212251864	rs3748962	T	C	1046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.164;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=30;PP=765;ReadPosRankSum=0.375;SC=CATCTCGGTATACAAACTGGT;SOR=1.009;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=126;TCF=59;TCR=67;TR=49;WE=212251872;WS=212251854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,52:0.37:142
chr2	212252809	rs934607	G	A	2806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=-0.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.330;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=73;PP=1725;ReadPosRankSum=-0.021;SC=AAGCCACATGGGTCGTATGAA;SOR=0.478;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=254;TCF=84;TCR=170;TR=114;WE=212252817;WS=212252799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,128:0.45:283
chr2	212295590	rs141267844	G	GT	595.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.618;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=615;ReadPosRankSum=0.388;SC=AGGCTTATTGGTTTCTTGTAT;SOR=1.981;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=18;WE=212295598;WS=212295580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr2	212295875	rs6710946	C	T	909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=22;PP=538;ReadPosRankSum=0.332;SC=CCCAGGTTTTCCCATTTTTCT;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=49;TCF=16;TCR=33;TR=33;WE=212295883;WS=212295865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,38:0.68:56
chr2	212426588	rs139728050	C	T	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=247;ReadPosRankSum=-0.260;SC=GAAATATTAACCTAAAAATGT;SOR=0.631;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=18;WE=212426596;WS=212426578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr2	212488828	rs146953835	GTC	G	36.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=1.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.62;ReadPosRankSum=-0.313;SOR=0.338;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,7:0.12:59
chr2	212488870	rs3215298	G	GC	1277.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=25;PP=1216;SC=TTCTTACAAAGAAAAACACAC;SOR=3.737;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=25;WE=212488878;WS=212488860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	212544026	rs67647157	CT	C	414.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.045;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.24;MQRankSum=1.226;NF=0;NR=15;PP=448;ReadPosRankSum=0.918;SC=TGGCAAATGACTTTGGTGGCC;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=15;WE=212544034;WS=212544016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,16:0.42:38
chr2	212569879	rs10221746	T	C	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=105;ReadPosRankSum=-1.519;SC=ACAGGGTTTCTCCATGTTGGC;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=6;WE=212569887;WS=212569869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr2	212569924	rs10221615	G	A	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=188;ReadPosRankSum=0.580;SC=TGATCCACCCGCCTCAACCTC;SOR=0.527;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=11;WE=212569932;WS=212569914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr2	212569983	rs6723705	G	A	1536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.785;HP=3;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=13;PP=1154;ReadPosRankSum=1.846;SC=AGTCAATCTTGTGTAATTTTT;SOR=0.590;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=90;TCF=61;TCR=29;TR=37;WE=212570002;WS=212569973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,42:0.41:102
chr2	212569994	rs74395874	A	T	1572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=2.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.00;ReadPosRankSum=1.066;SOR=0.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,47:0.39:121
chr2	212578379	.	TAA	T,TA	481.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.104;ClippingRankSum=0.000;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=2.764;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.20;ReadPosRankSum=-0.501;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:3,9,16:0.32,0.57:28
chr2	212587321	rs13002712	G	A	1312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.974;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=40;PP=873;ReadPosRankSum=0.385;SC=TTAATGAAACGCTGCCAAAAC;SOR=0.328;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=80;TCF=18;TCR=62;TR=54;WE=212587329;WS=212587311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,56:0.68:82
chr2	212589986	rs35778743	T	C	1537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.848;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=38;PP=846;ReadPosRankSum=2.813;SC=AGCTGAGTTCTGGAGTGACAA;SOR=1.012;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=90;TCF=36;TCR=54;TR=61;WE=212589994;WS=212589976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,71:0.71:100
chr2	212615516	rs6757068	T	C	1417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.166;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=35;PP=689;ReadPosRankSum=1.007;SC=GAAATACTCCTGCTCCTTTAT;SOR=0.369;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=91;TCF=35;TCR=56;TR=60;WE=212615524;WS=212615506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,66:0.66:100
chr2	212989410	rs6723461	G	C	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.140;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=308;ReadPosRankSum=1.091;SC=CAGCACACAGGTCTGCCTGTA;SOR=0.184;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=20;WE=212989418;WS=212989400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,24:0.71:34
chr2	213790978	rs62186510	C	T	1799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.986;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=48;PP=1149;ReadPosRankSum=0.880;SC=AGTGGGAGCTCGGCTATATGC;SOR=0.430;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=185;TCF=77;TCR=108;TR=87;WE=213790986;WS=213790968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,93:0.46:202
chr2	213886454	rs2291241	A	T	4779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=88;PP=2736;SC=TCTGGTTAGAAAAATGAAAAA;SOR=0.997;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=70;TCR=88;TR=158;WE=213886462;WS=213886444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr2	213886647	rs141472671	A	ATTTTATCT	1895.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=9;PP=1550;SC=ACAGCATAAGATTTTATCTTC;SOR=1.788;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=29;TCF=15;TCR=14;TR=21;WE=213886655;WS=213886637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr2	213914343	rs2165444	C	T	825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=5;PP=490;SC=TGGTCATTACCGACTACATAA;SOR=2.226;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=25;WE=213914351;WS=213914333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	214012405	rs6738070	A	C	5700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.73;ReadPosRankSum=-0.135;SOR=0.646;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,250:0.91:275
chr2	214012508	rs6709554	C	T	1662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.496;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=42;PP=928;ReadPosRankSum=0.572;SC=TATTGGAGTGCTCCCTTTCGG;SOR=0.627;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=217;TCF=96;TCR=121;TR=79;WE=214012516;WS=214012498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,89:0.38:236
chr2	214142631	rs13000409	G	C	3941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=67;PP=2500;SC=CAGGGCATGTGAGAGGTCTTC;SOR=0.778;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=137;TCF=70;TCR=67;TR=137;WE=214142639;WS=214142621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr2	214161773	rs975956	C	T	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=10;PP=322;ReadPosRankSum=0.313;SC=CAAACTAATCCTGAATTTATT;SOR=0.681;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=102;TCF=69;TCR=33;TR=31;WE=214161781;WS=214161763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,35:0.30:115
chr2	214161849	rs1488988	C	T	908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.345;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=19;PP=574;ReadPosRankSum=-1.378;SC=TTTCATGGATCTTCAGAATGA;SOR=0.847;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=151;TCF=86;TCR=65;TR=46;WE=214161857;WS=214161839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,50:0.31:161
chr2	214174659	rs72935193	A	G	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=41;ReadPosRankSum=0.758;SC=TTCCTGGCATATAACAGTCAA;SOR=0.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=4;WE=214174667;WS=214174649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr2	214174767	rs10498003	C	T	816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.741;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=14;PP=434;ReadPosRankSum=1.436;SC=TAAATAAATGCACGTTTAAAT;SOR=0.846;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=103;TCF=64;TCR=39;TR=39;WE=214174775;WS=214174757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,43:0.39:110
chr2	214182100	rs10183630	A	T	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.659;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=166;ReadPosRankSum=-2.280;SC=TTTTTAAATGACATTTTCTTC;SOR=0.333;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=48;TCF=8;TCR=40;TR=14;WE=214182108;WS=214182090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,15:0.30:50
chr2	214228792	rs12469417	C	T	1354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=11;PP=732;SC=TTGAATTTTACTTTTTAGATT;SOR=1.426;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=42;WE=214228800;WS=214228782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr2	214228959	rs4146048	G	A	1272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=15;PP=871;SC=GATATTTAAAGGTGAGTAAGT;SOR=1.127;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=22;TCR=15;TR=37;WE=214228967;WS=214228949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr2	214233812	rs6752347	C	A	2952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=40;NR=59;PP=1685;SC=AGTGTGGAAACAATTTTAATT;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=40;TCR=59;TR=99;WE=214233820;WS=214233802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr2	214261534	rs339815	T	C	363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=14;PP=300;SC=ACCCTTTATCTGTGTTCTTTA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=214261542;WS=214261524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	214727150	rs2042790	T	C	909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.636;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=18;PP=531;ReadPosRankSum=-0.543;SC=CATTTATTCATATTCTGAAAA;SOR=0.585;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=145;TCF=89;TCR=56;TR=46;WE=214727158;WS=214727140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,54:0.34:159
chr2	214727221	rs2042791	A	C	1405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.505;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=33;PP=732;ReadPosRankSum=-1.466;SC=TCTCCATGCAACCCCACAAAG;SOR=0.719;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=213;TCF=109;TCR=104;TR=68;WE=214727229;WS=214727211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,80:0.34:232
chr2	214727367	rs2042792	C	G	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=9.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.91;ReadPosRankSum=-0.866;SOR=2.285;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,13:0.18:72
chr2	215013777	rs5838412	GTA	G	158.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=19.84;ReadPosRankSum=1.242;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr2	215013801	.	G	GTATA	339.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.99;ReadPosRankSum=0.566;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr2	215102929	rs1912207	T	A	6920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=130;NR=92;PP=2965;SC=TGTTACCTCATATTGAAGTTG;SOR=0.990;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=222;TCF=130;TCR=92;TR=222;WE=215102937;WS=215102919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr2	215595512	rs12614960	C	T	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=44;ReadPosRankSum=1.180;SC=TTCTGAAAAACCTAAGCCAGG;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=4;WE=215595520;WS=215595502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr2	215595645	rs16852600	C	T	724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=14;PP=418;ReadPosRankSum=-0.622;SC=CTATACTGCTCATTTTGACAG;SOR=0.725;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=127;TCF=78;TCR=49;TR=36;WE=215595653;WS=215595635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,42:0.31:136
chr2	215595765	rs6435849	C	G	4765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=89;PP=2877;SC=AACAGCGCTTCCTAAAATAAA;SOR=0.997;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=76;TCR=89;TR=165;WE=215595773;WS=215595755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr2	215595861	rs34664471	G	GA	266.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.040;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.82;ReadPosRankSum=1.140;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr2	215595872	rs28685662	G	A	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.36;ReadPosRankSum=1.034;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr2	215609693	rs6435856	G	A	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=118;ReadPosRankSum=-0.367;SC=CCAGAGGTAAGAAAATTAACA;SOR=0.512;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=8;WE=215609701;WS=215609683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr2	215617178	rs28997576	C	G	2033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.547;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=37;PP=1331;ReadPosRankSum=0.672;SC=TACTACTGAGCAGTGGCTAGC;SOR=0.644;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=158;TCF=91;TCR=67;TR=82;WE=215617186;WS=215617168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,91:0.51:178
chr2	215632124	rs5031008	ATT	A	1157.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=2;PP=764;SC=CAACTTGACTATTTTAAAGTC;SOR=3.180;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=20;WE=215632133;WS=215632114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	215632155	rs5031009	T	C	1932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=18;PP=1099;SC=CACACCTTGATTCAAGAATAT;SOR=1.308;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=41;TCR=18;TR=59;WE=215632163;WS=215632145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr2	215632192	rs5031011	G	A	1415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.581;HP=2;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.179;NF=40;NR=23;PP=764;ReadPosRankSum=-0.166;SC=TAATTTTTACGTTGAACTACT;SOR=0.743;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=150;TCF=97;TCR=53;TR=63;WE=215632200;WS=215632182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,72:0.42:170
chr2	215632255	rs2070094	CA	TG	13340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=149;NR=106;PP=2947;SC=ACTATATCCACATGCCCATTC;SOR=0.984;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=264;TCF=153;TCR=111;TR=255;WE=215632266;WS=215632245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,294:1.00:294
chr2	215634055	rs6704780	C	T	2307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=51;PP=1471;SC=ATGAACAAAACGGAAATTAAA;SOR=1.423;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=27;TCR=51;TR=78;WE=215634063;WS=215634045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr2	215645255	rs71579845	G	C	1847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.699;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=20;PP=1281;ReadPosRankSum=1.037;SC=GCCTCATTCTGAGATGGTATT;SOR=0.963;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=111;TCF=78;TCR=33;TR=69;WE=215645263;WS=215645245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,76:0.63:121
chr2	215645464	rs2229571	C	G	8616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=137;NR=141;PP=2965;SC=TACTGTTTTTCCTCCCTGATG;SOR=0.700;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=278;TCF=137;TCR=141;TR=278;WE=215645472;WS=215645454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,305:1.00:305
chr2	215661724	rs67240037	CAT	C	703.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.235;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.948;NF=6;NR=5;PP=402;ReadPosRankSum=-0.803;SC=AACAAGATTACATGATTGTTA;SOR=1.402;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=27;TCF=14;TCR=13;TR=11;WE=215661733;WS=215661714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr2	215674090	rs35933323	T	G	9130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=348;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=167;NR=151;PP=2965;ReadPosRankSum=0.687;SC=CCAGAAACTGTGCGACCCGTG;SOR=0.265;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=319;TCF=168;TCR=151;TR=318;WE=215674098;WS=215674080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,347:1.00:348
chr2	215674224	rs1048108	G	A	1860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.625;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=45;PP=1081;ReadPosRankSum=-0.706;SC=TCCATGGCGGGCGCGGAACGA;SOR=0.591;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=142;TCF=54;TCR=88;TR=76;WE=215674232;WS=215674214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,84:0.55:154
chr2	215674323	rs1129804	C	G	1304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=19;PP=528;SC=AGGCTCCTCGCAGAGCGGGAA;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=10;TCR=19;TR=29;WE=215674331;WS=215674313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr2	215674341	rs17489363	A	G	1098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=13;PP=330;SC=GAAGCAAGGAAGCCTCGGGAA;SOR=2.030;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=19;WE=215674349;WS=215674331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	215674371	rs34732883	C	T	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.332;HP=2;HapScore=4;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=2;PP=62;ReadPosRankSum=-0.637;SC=AAGCTGCAGGCCAGCGACTCG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=2;WE=215674384;WS=215674361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr2	215674376	rs71579840	G	A	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.579;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=176;ReadPosRankSum=2.189;SC=GCAGGCCAGCGACTCGAAACC;SOR=0.223;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=4;WE=215674384;WS=215674361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr2	215797332	rs17426207	C	T	1340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.306;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=22;PP=719;ReadPosRankSum=0.623;SC=ATTGGTCACACGCTGAGATTG;SOR=0.574;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=133;TCF=85;TCR=48;TR=58;WE=215797340;WS=215797322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,68:0.45:152
chr2	215797527	rs10532785	AATTC	A	590.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=19.015;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=3.013;NF=0;NR=8;PP=269;ReadPosRankSum=-0.624;SC=AAATAAAGTTAATTCATTCTC;SOR=0.016;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=8;WE=215797538;WS=215797517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,17:0.44:39
chr2	215812297	rs2274412	G	A	1636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.348;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=47;PP=1012;ReadPosRankSum=2.109;SC=GCAATAAAAGGGGAGTTAGGT;SOR=0.538;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=226;TCF=103;TCR=123;TR=92;WE=215812305;WS=215812287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,90:0.40:223
chr2	215820013	rs10498027	G	A	2670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=417;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.819;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=73;PP=1513;ReadPosRankSum=-0.244;SC=TGACACAGACGTAAGTGATGA;SOR=0.565;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=381;TCF=186;TCR=195;TR=148;WE=215820021;WS=215820003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:264,153:0.37:417
chr2	215821580	rs17492577	T	C	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.377;NF=0;NR=9;PP=152;ReadPosRankSum=-0.111;SC=CCCATCTAGTTTAAAACTGCA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=9;WE=215821588;WS=215821570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr2	215833415	rs4673925	A	G	825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=10;PP=532;ReadPosRankSum=-2.864;SC=TCATTTGTATAACATTCCAGA;SOR=0.716;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=98;TCF=69;TCR=29;TR=37;WE=215833423;WS=215833405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,40:0.39:103
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chr2	215848034	rs7608150	T	C	372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=9;PP=300;SC=ATCACCCTGGTTGCTCTTTGA;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=215848042;WS=215848024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	215851246	rs7559069	A	G	2156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=10;PP=1608;SC=ATGGCAATAAATGTCAAAAAG;SOR=3.258;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=55;TCR=10;TR=65;WE=215851254;WS=215851236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr2	215855780	rs4533467	G	A	1593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.758;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=44;PP=909;ReadPosRankSum=0.800;SC=AATGTGAGGCGCTTGTTATGC;SOR=0.950;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=169;TCF=62;TCR=107;TR=67;WE=215855788;WS=215855770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,76:0.41:184
chr2	215862383	rs1980844	G	A	2701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=26;PP=1861;SC=TCTATGAACAGGACTTATTCA;SOR=1.872;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=64;TCR=26;TR=90;WE=215862391;WS=215862373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr2	215862633	rs1326748	C	G	2137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=54;PP=1534;SC=TTACATTGAACTTATGATCGT;SOR=2.932;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=13;TCR=54;TR=67;WE=215862641;WS=215862623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr2	215865575	rs10498030	T	C	4752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=406;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=102;NR=105;PP=2834;ReadPosRankSum=-1.882;SC=GGTTGTGTGATGGAGAATTGT;SOR=0.703;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=372;TCF=181;TCR=191;TR=207;WE=215865583;WS=215865565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,221:0.54:406
chr2	215872334	rs940279	G	A	4297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=94;NR=39;PP=2705;SC=CTGGAAGAGAGGCAATTTAAT;SOR=1.755;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=134;TCF=95;TCR=39;TR=133;WE=215872342;WS=215872324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr2	215874965	rs6733264	G	T	1149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=3;PP=815;SC=AAGATAGAAAGAAATCAGTCA;SOR=3.912;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=34;WE=215874973;WS=215874955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr2	215875251	rs1409607	A	T	2052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=44;PP=1265;SC=ATCCATTTCCACATGGCAAAT;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=13;TCR=44;TR=57;WE=215875259;WS=215875241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr2	215876166	rs7560008	A	T	1677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=10;PP=1262;SC=TACTCACTGGAATTTATGGGA;SOR=2.998;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=47;TCR=10;TR=57;WE=215876174;WS=215876156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr2	215876589	rs11388414	G	GT	87.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.62;ReadPosRankSum=0.635;SOR=0.321;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr2	215878240	rs7594353	G	A	4333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.11;SOR=1.414;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr2	215878246	rs10192100	C	T	4529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.73;SOR=1.544;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr2	215880108	rs6753310	C	T	356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=272;SC=TTCCAAAAGCCGAATAAATGG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=215880116;WS=215880098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	215890312	rs2177423	A	G	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr2	215890324	rs5838479	G	GT	98.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=4;MGOF=47;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=0;PP=77;SC=AAGTGTTAAGGTTTTTTTTTT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=215890332;WS=215890305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr2	215890352	rs5838480	GTT	G	35.71	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=17.85;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr2	215928677	rs12694351	G	C	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.704;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=363;ReadPosRankSum=-0.227;SC=CACATTTATAGACAGAGAAAA;SOR=0.307;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=21;WE=215928685;WS=215928667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr2	215928972	rs1523721	G	C	775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.966;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=24;PP=596;ReadPosRankSum=0.849;SC=CATTACATCAGTATGGCACAT;SOR=0.231;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=44;TCF=7;TCR=37;TR=30;WE=215928980;WS=215928962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,30:0.68:44
chr2	215940242	rs6711179	T	C	6892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.62;SOR=0.701;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,269:1.00:269
chr2	215940283	.	GA	G	165.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=0.000;DP=265;ExcessHet=3.0103;FS=1.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.69;ReadPosRankSum=2.908;SOR=0.544;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:199,41:0.17:240
chr2	215976231	rs2948978	A	T	262.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=161;SC=ACAAAAAAAAATTTTTGAAAT;SOR=4.615;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=215976239;WS=215976221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	216176807	rs4535042	T	G	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.97;ReadPosRankSum=1.190;SOR=0.713;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,19:0.40:47
chr2	216182769	rs4672766	A	T	1630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=9;PP=1060;SC=CAGAATTTTCACGTTGAATTC;SOR=2.876;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=38;TCR=9;TR=47;WE=216182777;WS=216182759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr2	216190020	rs2372536	C	G	3421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.302;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=68;PP=1934;ReadPosRankSum=-0.607;SC=CCAGGTGTAACTGTTGAGGAG;SOR=0.723;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=220;TCF=115;TCR=105;TR=142;WE=216190028;WS=216190010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,157:0.65:240
chr2	216190654	rs7563206	C	T	755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.417;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=10;PP=428;ReadPosRankSum=-0.684;SC=TATTTAAAAGCGGTTCATAAG;SOR=0.338;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=70;TCF=51;TCR=19;TR=32;WE=216190662;WS=216190644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,37:0.48:77
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chr2	216191515	rs6751557	C	T	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.343;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=7;PP=293;ReadPosRankSum=0.722;SC=AAGTGCTGCTCGTGTCTCACA;SOR=0.420;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=41;TCF=29;TCR=12;TR=20;WE=216191523;WS=216191505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,18:0.44:41
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chr2	216212339	rs4673993	T	C	4656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.076;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=100;PP=2937;ReadPosRankSum=2.535;SC=CAGTTTTTTATTCAGGAGCAG;SOR=0.542;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=310;TCF=144;TCR=166;TR=194;WE=216212347;WS=216212329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,209:0.64:329
chr2	216214124	rs4672768	G	A	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-3.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=313;ReadPosRankSum=-0.184;SC=GGTGGATGGAGAACCCAAATC;SOR=1.708;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=15;WE=216214132;WS=216214114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr2	216214492	rs10498036	T	G	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=131;ReadPosRankSum=-0.669;SC=ACTGGATCCATAGTTTTTGGT;SOR=0.354;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=10;WE=216214500;WS=216214482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,10:0.29:34
chr2	216226642	rs13394662	A	C	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.614;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=197;ReadPosRankSum=0.799;SC=TACCTGTAGAAAGAGACTGTC;SOR=0.336;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=37;TCF=31;TCR=6;TR=15;WE=216226650;WS=216226632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr2	216229692	rs11651	A	G	3689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=374;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.688;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=102;NR=70;PP=2227;ReadPosRankSum=0.795;SC=TCCCATCATCATAACACGTTG;SOR=0.786;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=345;TCF=202;TCR=143;TR=172;WE=216229700;WS=216229682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:188,186:0.50:374
chr2	216229850	rs7579867	C	T	889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.671;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=32;PP=639;ReadPosRankSum=1.707;SC=TCCCTAAGAGCAGTACTGCTA;SOR=1.045;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=121;TCF=36;TCR=85;TR=44;WE=216229858;WS=216229840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,45:0.35:128
chr2	216232556	rs7568287	C	T	1144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.714;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=14;PP=774;ReadPosRankSum=0.032;SC=GAGACAAACACGGAAGTGGAT;SOR=1.452;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=121;TCF=81;TCR=40;TR=51;WE=216232578;WS=216232546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,55:0.42:132
chr2	216235089	rs1250209	C	T	8703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=153;NR=148;PP=2965;SC=TCCACTATGACGTTGTAGGTG;SOR=0.749;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=301;TCF=153;TCR=148;TR=301;WE=216235097;WS=216235079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,329:1.00:329
chr2	216236532	rs10804241	G	A	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.744;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=23;ReadPosRankSum=-1.030;SC=CATCACACCCGGCCATGAAGC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=3;WE=216236540;WS=216236522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr2	216237929	rs2289199	A	T	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=146;ReadPosRankSum=0.601;SC=GCTGTTAGATAAAAAAAATCA;SOR=0.245;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=9;WE=216237937;WS=216237920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr2	216240126	rs3214672	AAC	A	1513.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.288;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=23;PP=1098;ReadPosRankSum=0.395;SC=GCTGAAAGAAAACAAAATTAA;SOR=0.514;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=14;TCR=68;TR=28;WE=216240135;WS=216240116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,46:0.34:135
chr2	216242917	rs1132741	T	A	1308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.152;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=21;PP=591;ReadPosRankSum=0.524;SC=TGGTGACAACTCCCTGAGCTG;SOR=0.573;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=185;TCF=119;TCR=66;TR=60;WE=216242925;WS=216242907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,75:0.36:210
chr2	216243832	rs1250204	T	C	8774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=175;NR=133;PP=2965;SC=TTTATTCCAATGAACAACGGT;SOR=0.984;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=308;TCF=175;TCR=133;TR=308;WE=216243840;WS=216243822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,333:1.00:333
chr2	216248305	rs1250203	G	T	1183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=34;PP=953;SC=TCGAATGATCGCTTACATGAG;SOR=4.977;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=36;WE=216248313;WS=216248295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr2	216248707	rs35639338	TAA	T	771.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=494;ReadPosRankSum=1.994;SC=TCTGAATAAGTAAAAGCTGGT;SOR=0.737;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=39;TCF=26;TCR=13;TR=15;WE=216248716;WS=216248697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,21:0.47:45
chr2	216249587	rs13652	C	T	2970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=34;PP=1890;SC=CTGTACCTGTCTCTCCGTAAG;SOR=1.244;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=63;TCR=34;TR=97;WE=216249595;WS=216249577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr2	216249819	rs1250201	C	T	361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=11;PP=266;SC=GTAAATACTACGTGTAATTAG;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=216249827;WS=216249809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	216251697	rs35343655	G	A	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.670;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=78;ReadPosRankSum=-0.871;SC=TTTCCCACCCGGGGGAGGAAG;SOR=0.368;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=9;TCR=23;TR=10;WE=216251705;WS=216251687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,10:0.31:32
chr2	216253039	rs1250215	G	C	2244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.831;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=56;PP=1227;ReadPosRankSum=-1.684;SC=AGGGGCAAATGGGGCTTATTT;SOR=0.873;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=164;TCF=74;TCR=90;TR=95;WE=216253047;WS=216253029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,108:0.57:190
chr2	216256344	rs10498038	C	G	2214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.834;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=40;PP=1490;ReadPosRankSum=0.696;SC=CAGATACATTCAACTGCTTAC;SOR=0.456;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=189;TCF=117;TCR=72;TR=92;WE=216256352;WS=216256334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,102:0.49:209
chr2	216256615	rs6709607	T	C	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.343;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=108;ReadPosRankSum=1.169;SC=AAAGGTAAAATCAATATTTCA;SOR=0.096;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=11;WE=216256623;WS=216256605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr2	216259479	rs71428382	G	A	693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=19;PP=444;ReadPosRankSum=-0.283;SC=TTGCACAGAGGATCTGTGAGC;SOR=0.641;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=52;TCF=17;TCR=35;TR=28;WE=216259487;WS=216259469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,31:0.54:57
chr2	216262621	rs6725958	A	C	1178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.628;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=29;PP=655;ReadPosRankSum=-0.920;SC=TTTCCAGAGGACTGTTACTGC;SOR=0.596;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=132;TCF=59;TCR=73;TR=55;WE=216262629;WS=216262611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,59:0.40:148
chr2	216263926	rs2692224	C	A	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.245;NF=19;NR=7;PP=1376;ReadPosRankSum=-2.890;SC=TACATGGGAACCACAAGGACA;SOR=0.693;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=70;TCF=48;TCR=22;TR=26;WE=216263946;WS=216263916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,31:0.40:77
chr2	216263938	rs3832178	C	CT	1092.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.807;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.346;NF=16;NR=8;PP=1368;ReadPosRankSum=-0.822;SC=ACAAGGACAGCTCAGGGCTGT;SOR=0.809;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=68;TCF=40;TCR=28;TR=24;WE=216263946;WS=216263916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,37:0.36:102
chr2	216269031	rs7575551	G	T	1134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.39;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	216269033	rs72943909	T	G	717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.58;SOR=2.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	216269095	rs13306359	C	T	1343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=3.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.84;ReadPosRankSum=-1.407;SOR=1.052;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,67:0.44:152
chr2	216269209	rs1053238	T	G	2719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=58;PP=1706;ReadPosRankSum=1.158;SC=GATTCCTCAGTGGGTACTTGG;SOR=0.724;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=183;TCF=93;TCR=90;TR=114;WE=216269217;WS=216269199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,125:0.61:205
chr2	216269254	rs7589580	T	G	2150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.572;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=51;PP=1423;ReadPosRankSum=-1.366;SC=GCCTGGGCTGTCCTCTTCGGG;SOR=0.619;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=157;TCF=73;TCR=84;TR=93;WE=216269262;WS=216269244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,99:0.58:172
chr2	216271812	rs7592898	A	T	705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-2.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.006;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=1;PP=484;ReadPosRankSum=-1.058;SC=AACAATCCTGATAAGATAACA;SOR=2.093;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=42;TCF=39;TCR=3;TR=24;WE=216271820;WS=216271802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,28:0.55:51
chr2	216272819	rs7570208	C	G	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.533;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=288;ReadPosRankSum=-1.154;SC=AAGAGGGGGACGCTTAGCTGA;SOR=1.223;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=47;TCF=40;TCR=7;TR=17;WE=216272827;WS=216272809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,19:0.34:56
chr2	216272900	rs2577301	T	G	7622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.18;SOR=0.816;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr2	216272900	.	TGTCAGGA	GGTCAGGA,GGTCAGGT	1618	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=111,52;NR=88,35;PP=1618,1217;QD=8.30538297762;SC=TCCACAGTCGTGTCAGGAGGG;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=199;TCF=111;TCR=88;TR=199,87;WE=216272915;WS=216272890;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:199
chr2	216272907	rs7596677	A	T	2010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FS=6.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.31;ReadPosRankSum=1.392;SOR=1.043;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:138,104:0.43:242
chr2	216274853	rs5838511	AAC	A,AACAC	815.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3,3;NR=18,18;PP=696,346;ReadPosRankSum=-0.270;SC=AATTTAAATTAACACACACAC;SOR=0.723;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=21,21;WE=216274864;WS=216274843;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.41,0.41:49
chr2	216283958	rs3796123	T	A	2695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=57;PP=1657;ReadPosRankSum=-0.204;SC=GTAATAGAGCTACTTACTTGG;SOR=0.676;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=307;TCF=177;TCR=130;TR=129;WE=216283966;WS=216283934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:199,138:0.41:337
chr2	216295312	rs1250241	T	A	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=156;ReadPosRankSum=0.218;SC=TTTTCTTGACTTCCAGAAGTT;SOR=0.392;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=9;WE=216295320;WS=216295302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr2	216296730	.	AT	A	513.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.756;ClippingRankSum=0.000;DP=263;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.16;ReadPosRankSum=0.896;SOR=0.684;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:187,51:0.21:238
chr2	216299281	rs1250246	A	C	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=2.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=40;ReadPosRankSum=1.309;SC=AAATATAAGCAGTTTTTAAAC;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=5;WE=216299289;WS=216299280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,4:0.17:24
chr2	216299550	rs2577290	GC	AA	2563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FS=1.756;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.05;MQRankSum=1.461;QD=11.00;ReadPosRankSum=-0.489;SOR=0.560;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:158,75:0.32:233
chr2	216299571	rs10648691	T	TTAC	1722.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.294;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.456;NF=1;NR=27;PP=1162;ReadPosRankSum=-0.892;SC=AAGGAAAACGTTACATTTGCA;SOR=0.898;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=100;TCF=3;TCR=97;TR=28;WE=216299579;WS=216299561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,50:0.32:154
chr2	216299629	rs1250247	C	G	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=3.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.657;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=125;ReadPosRankSum=1.390;SC=TGAATATTGACGTACATATTT;SOR=1.545;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=10;WE=216299637;WS=216299619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,11:0.29:38
chr2	216300482	rs1250259	T	A	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.113;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=15;PP=250;ReadPosRankSum=-0.434;SC=CCCCAGGCACTGGACGGCCAG;SOR=1.097;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=85;TCF=36;TCR=49;TR=24;WE=216300490;WS=216300472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,27:0.29:93
chr2	216861273	rs2303845	T	C	398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=10;PP=289;SC=ACAATATCAATTAAAACTTAT;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=216861281;WS=216861263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	217012901	rs207906	A	G	2409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=60;PP=1544;ReadPosRankSum=1.256;SC=AGGTGACAACAAAAAGTCAGA;SOR=0.669;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=248;TCF=111;TCR=137;TR=110;WE=217012909;WS=217012891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,119:0.44:268
chr2	217055171	rs12470053	A	G	916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=3.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.466;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=28;PP=575;ReadPosRankSum=1.694;SC=CATTCTCAATATGAATAGCAG;SOR=1.136;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=76;TCF=15;TCR=61;TR=34;WE=217055179;WS=217055161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,40:0.45:89
chr2	217069151	rs1438162	A	G	1232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.606;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=38;PP=742;ReadPosRankSum=0.119;SC=CTGGTGTTCTATGATTGAAGT;SOR=0.760;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=164;TCF=58;TCR=106;TR=58;WE=217069159;WS=217069141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,64:0.36:177
chr2	217123958	rs169616	T	C	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.564;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=144;ReadPosRankSum=0.052;SC=CTGTTGGCTCTGGGGGTGCCA;SOR=0.412;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=13;WE=217123966;WS=217123948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
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chr2	217364452	rs284573	C	G	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.449;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=410;ReadPosRankSum=-0.600;SC=GTCTGTGCATCTAATACCATT;SOR=0.140;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=23;WE=217364460;WS=217364442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,24:0.63:38
chr2	217364539	rs284572	C	T	5051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=97;NR=73;PP=2965;SC=ACAGCAATCCCTGTTTTGTTT;SOR=0.956;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=170;TCF=97;TCR=73;TR=170;WE=217364547;WS=217364529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr2	217498290	rs5838590	C	CGCCGCTGCT	458.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.53;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=3;PP=530;SC=CTGCCGCCGCCGCCGCTGCTG;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=217498298;WS=217498280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	217525243	rs9341201	T	C	1116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.240;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=14;PP=675;ReadPosRankSum=1.892;SC=TCTGGGAAACTGGACCTGGAG;SOR=0.922;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=141;TCF=95;TCR=46;TR=49;WE=217525251;WS=217525233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,56:0.36:155
chr2	217526521	rs9341206	C	T	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.168;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=241;ReadPosRankSum=0.091;SC=TTGCGTCTGGCGCGTGCTTCG;SOR=0.955;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=56;TCF=45;TCR=11;TR=21;WE=217526529;WS=217526511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,24:0.39:62
chr2	217528609	rs9341218	A	G	868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FS=1.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.30;ReadPosRankSum=0.698;SOR=0.524;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:143,59:0.29:202
chr2	217541426	rs11575205	C	T	819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.960;HP=4;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=0;PP=1099;ReadPosRankSum=0.953;SC=TGGCTGGAGTCGGGGCTGGGG;SOR=3.014;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=45;TCR=9;TR=31;WE=217541445;WS=217541416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,32:0.68:47
chr2	217541437	rs11575204	G	A	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=3;PP=1069;ReadPosRankSum=2.661;SC=GGGGCTGGGGGTGGGAGGGGG;SOR=1.136;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=61;TCF=51;TCR=10;TR=33;WE=217541445;WS=217541416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,31:0.60:52
chr2	217541582	rs2160549	T	C	8640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=149;NR=142;PP=2965;SC=AGATGCCACGTTTGCGGCCAC;SOR=0.718;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=291;TCF=149;TCR=142;TR=291;WE=217541590;WS=217541572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,324:1.00:324
chr2	217543541	rs6746360	T	C	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.125;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=274;ReadPosRankSum=0.500;SC=GGTCAAAAGCTGGGAGGGAAT;SOR=1.436;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=33;TCR=3;TR=15;WE=217543549;WS=217543531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr2	217543633	rs11575195	G	A	2133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.461;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=41;PP=1353;ReadPosRankSum=0.052;SC=CAGTGTTCTCGGCTCCCCCGA;SOR=0.650;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=234;TCF=136;TCR=98;TR=101;WE=217543641;WS=217543623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,111:0.43:258
chr2	217543728	rs11575194	G	A	4951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=390;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=104;PP=2962;ReadPosRankSum=0.576;SC=TGTTTGGGCCGGAAGATCTTG;SOR=0.701;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=353;TCF=173;TCR=180;TR=207;WE=217543736;WS=217543718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,230:0.59:387
chr2	217736131	rs2241191	G	A	824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=8;PP=509;ReadPosRankSum=-2.071;SC=TGAAAAACACGTGGGTTCTTG;SOR=0.770;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=80;TCF=59;TCR=21;TR=32;WE=217736139;WS=217736121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,39:0.43:90
chr2	218577575	rs1835333	T	A	554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=0;PP=422;SC=AGTTTGCATCTGTCACCCACC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=218577583;WS=218577565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	218577813	rs148961389	AC	A	2995.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.192;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=56;PP=1398;ReadPosRankSum=0.904;SC=AGGCATCTTCACCCCCCCTCA;SOR=0.512;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=123;TCF=9;TCR=114;TR=63;WE=218577821;WS=218577803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,118:0.57:207
chr2	218604247	rs4672848	A	C	1968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=66;NR=28;PP=1792;SC=GCATAAGTAGAACTGGGGCAG;SOR=1.340;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=66;TCR=28;TR=94;WE=218604255;WS=218604237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr2	218604356	rs4294980	G	A	1632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.547;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.110;NF=37;NR=48;PP=1123;ReadPosRankSum=0.162;SC=GCCAGGGAGAGGCAACTTGCA;SOR=0.744;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=197;TCF=89;TCR=108;TR=85;WE=218604364;WS=218604346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,86:0.45:190
chr2	218694510	rs55877504	CT	C	2851.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=28;PP=1288;ReadPosRankSum=-0.148;SC=TCAAGCCCTGCTTTGAAAAGC;SOR=1.300;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=56;TCF=25;TCR=31;TR=50;WE=218694520;WS=218694499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,106:0.98:108
chr2	218694512	rs55694913	T	G	4836.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=29;PP=1383;SC=AAGCCCTGCTTTGAAAAGCCA;SOR=1.253;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=93;TCF=60;TCR=33;TR=84;WE=218694520;WS=218694499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr2	218694691	rs10188605	A	G	6155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.36;SOR=0.795;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr2	218695102	rs3796028	G	A	4150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=65;PP=2370;SC=GGCTGGATCCGTCTTCTGGTA;SOR=0.784;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=146;TCF=81;TCR=65;TR=145;WE=218695110;WS=218695092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr2	218712102	rs55763335	A	G	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.142;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=304;ReadPosRankSum=-1.356;SC=TGGCTAGCATATAGGCTCCTG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=14;WE=218712110;WS=218712101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr2	218745685	rs10199795	G	A	2504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=350;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.848;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=69;PP=1731;ReadPosRankSum=0.360;SC=TGAGGGGGTCGGAGGTGTTAT;SOR=0.820;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=328;TCF=141;TCR=187;TR=116;WE=218745693;WS=218745675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:223,127:0.36:350
chr2	218750453	rs35040165	A	AG	2521.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.565;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=34;PP=1563;ReadPosRankSum=-0.441;SC=CTTGACACAGAGGACAGCACT;SOR=0.605;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=91;TCF=24;TCR=67;TR=45;WE=218750461;WS=218750443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,85:0.50:170
chr2	218758070	rs56217129	C	A	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.836;NF=9;NR=2;PP=189;ReadPosRankSum=0.493;SC=CAGGTACACACAATCATCCAA;SOR=0.527;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=11;WE=218758078;WS=218758060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr2	218758123	rs141673800	G	GCA	1734.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-2.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.457;NF=11;NR=25;PP=1261;ReadPosRankSum=0.374;SC=GTGCGCGCGCGCACACACACA;SOR=0.784;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=51;TCF=13;TCR=38;TR=36;WE=218758134;WS=218758113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,74:0.76:97
chr2	218768422	rs3791936	T	G	3491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=73;PP=2138;SC=CTGTCAGGAATTTCCTCCTGG;SOR=1.667;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=38;TCR=73;TR=111;WE=218768430;WS=218768412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr2	218770003	rs7600493	G	A	9545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=170;NR=149;PP=2965;SC=CCACGCCCAGGGGAACTCATG;SOR=0.751;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=320;TCF=171;TCR=149;TR=319;WE=218770011;WS=218769993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,356:1.00:356
chr2	218801767	rs4674232	C	T	3520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=63;PP=2029;SC=TTTTCCTCCCCGCAAAACTCC;SOR=1.005;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=56;TCR=63;TR=119;WE=218801775;WS=218801757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr2	218937860	rs10211510	G	T	1286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=34;NR=7;PP=974;SC=ATGACGGTGTGTAGTGGAGGC;SOR=3.056;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=41;WE=218937868;WS=218937850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr2	218940259	rs7423696	C	T	6260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=97;NR=114;PP=2965;SC=TGCTGATGCCCAGCCCCAGAG;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=211;TCF=97;TCR=114;TR=211;WE=218940267;WS=218940249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr2	218940418	rs4674246	C	T	1537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=36;PP=867;ReadPosRankSum=-0.359;SC=CCCTTGTGGCCAGAAGGGAGG;SOR=0.667;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=61;TCR=65;TR=70;WE=218940426;WS=218940408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,78:0.54:144
chr2	219082119	rs2271541	G	T	3265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=32;PP=2231;SC=CAGCAGGGCCGCTCCCTCCGT;SOR=1.733;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=116;TCF=84;TCR=32;TR=115;WE=219082127;WS=219082109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr2	219082330	rs12694432	A	G	6304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=111;PP=2965;SC=CTAATCCCCAATGTTGTCCAG;SOR=0.943;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=206;TCF=95;TCR=111;TR=206;WE=219082338;WS=219082320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr2	219093278	rs60528331	A	G	464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=0;PP=377;SC=GCAAAGAAACAAGTGCTCAGC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=219093286;WS=219093274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	219099260	rs1018288	G	C	1798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=50;PP=1501;SC=TTTCAACTCCGTCCATAAAAA;SOR=5.136;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=54;TCF=4;TCR=50;TR=54;WE=219099268;WS=219099250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr2	219099484	rs10932765	T	C	1840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=13;PP=1269;SC=TAATTCTGCATACTACATATT;SOR=2.494;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=44;TCR=13;TR=57;WE=219099492;WS=219099474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr2	219103580	rs10169718	A	G	2917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=62;PP=1752;SC=CCATGTGAGTATAGAATTTGG;SOR=2.063;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=27;TCR=62;TR=89;WE=219103588;WS=219103570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr2	219104316	.	ATT	A,AT	768.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.624;ClippingRankSum=0.000;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=3.672;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.62;MQRankSum=0.994;QD=16.02;ReadPosRankSum=-1.229;SOR=1.092;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:7,16,25:0.33,0.52:48
chr2	219117482	rs35271699	G	A	73.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=0;PP=52;SC=GCTGCTGCCCGATTCCACAGC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=219117490;WS=219117472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr2	219128506	rs2292549	C	T	2391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=54;PP=1590;SC=CTGTCTCTACCGGGCCCCACT;SOR=1.845;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=24;TCR=54;TR=78;WE=219128514;WS=219128496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr2	219138940	rs4791	C	T	3887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=66;PP=2524;SC=TAGACATAAACTTTATTACAT;SOR=0.766;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=65;TCR=66;TR=131;WE=219138948;WS=219138930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr2	219139573	rs6734242	G	A	357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=294;SC=TGCTCGTTCTGTTATCTGTCC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=219139581;WS=219139563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	219142023	rs2168703	G	A	1079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=6;PP=832;SC=TCCCTAGTGTGCCGGGGTCCG;SOR=3.442;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=36;WE=219142031;WS=219142013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr2	219142492	rs2168704	G	A	3386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=51;PP=2244;SC=GCTGGGGAACGCCACCAAGTT;SOR=0.796;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=59;TCR=51;TR=110;WE=219142500;WS=219142482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr2	219142773	rs6707559	C	T	1870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=39;PP=1067;SC=CAGAAGGAAGCGCTTGGCTCC;SOR=1.512;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=20;TCR=39;TR=59;WE=219142781;WS=219142763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr2	219144815	rs2045435	T	C	10210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=394;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=176;NR=182;PP=2965;SC=TATCACTCACTGCTCTCTCCT;SOR=0.799;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=358;TCF=176;TCR=182;TR=358;WE=219144823;WS=219144805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,394:1.00:394
chr2	219146803	rs2292553	G	A	1056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=15;NR=23;PP=600;SC=CCCAGGGGGCGGAGGGCCTGG;SOR=1.206;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=15;TCR=23;TR=38;WE=219146811;WS=219146793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr2	219153983	rs10707182	GA	G	985.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=14;PP=581;SC=GTGGGGACCTGAAGTTCTTGT;SOR=1.609;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=15;WE=219153991;WS=219153973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	219187901	rs1870125	C	T	650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=0;PP=433;SC=ACGTCCAGAGCCGGCAGGCAG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=219187909;WS=219187891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	219205471	rs34014804	G	A	3303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.410;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=72;PP=2086;ReadPosRankSum=0.302;SC=AAAAGGAAGGGGTCACCTTGG;SOR=0.664;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=279;TCF=142;TCR=137;TR=147;WE=219205479;WS=219205461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,160:0.52:310
chr2	219206919	rs3816562	C	T	631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=18;PP=410;ReadPosRankSum=-0.903;SC=GAGACAGAAGCCAGGGCAGCC;SOR=0.606;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=53;TCF=17;TCR=36;TR=27;WE=219206927;WS=219206909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,29:0.48:60
chr2	219209393	rs1350336	A	G	1478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=13;PP=1107;SC=CCTCCCCAAAACTCTGACCTC;SOR=1.280;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=28;TCR=13;TR=41;WE=219209401;WS=219209383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr2	219221982	rs144807145	G	GTCTCTCTCTC	309.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.463;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=22.12;ReadPosRankSum=1.476;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr2	219222974	rs142143856	C	T	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.222;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=283;ReadPosRankSum=-1.308;SC=TCAAAAGCAACGCACTTCAGA;SOR=1.371;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=15;WE=219222982;WS=219222964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr2	219227756	rs6723716	T	C	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.350;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=242;ReadPosRankSum=-0.526;SC=CAGGTGGGAATGGGGCTTTCA;SOR=0.227;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=58;TCF=9;TCR=49;TR=22;WE=219227764;WS=219227746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,24:0.40:60
chr2	219231807	rs3845833	C	T	4327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=68;NR=80;PP=2358;SC=CCAAGATGCCCATCTTGAGGG;SOR=1.008;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=68;TCR=80;TR=148;WE=219231815;WS=219231797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr2	219232354	rs7608923	C	A	2531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=45;PP=1753;SC=AAGGCTCCAGCGCCCCTTAGC;SOR=1.206;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=31;TCR=45;TR=76;WE=219232362;WS=219232344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr2	219254622	rs2695342	A	G	9620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=373;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=181;NR=155;PP=2965;SC=CCCGCCGAGCAGACATCAGAG;SOR=0.800;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=336;TCF=181;TCR=155;TR=336;WE=219254630;WS=219254612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,371:1.00:371
chr2	219257688	rs2045433	T	C	4151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=78;NR=61;PP=2401;SC=CACCAAGGAGTTCACCCCCAC;SOR=0.789;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=78;TCR=61;TR=139;WE=219257696;WS=219257678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr2	219263277	rs2695344	A	G	737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=17;PP=497;SC=CTTCTGGCAGACGCCGCTCCC;SOR=1.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=25;WE=219263285;WS=219263267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	219265094	rs2579958	T	C	8510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=123;NR=118;PP=2965;SC=GCGCTCCTGTTCGCTCGAGGT;SOR=0.725;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=241;TCF=123;TCR=118;TR=241;WE=219265102;WS=219265084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,313:1.00:313
chr2	219265136	rs11463820	T	TC	11588.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=11;NR=125;PP=2965;SC=GAGAGGGAACTCTTCGGGGGT;SOR=0.950;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=143;TCF=12;TCR=131;TR=136;WE=219265144;WS=219265126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,312:1.00:312
chr2	219266204	rs2252235	T	C	3794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=89;NR=41;PP=2672;SC=TCCTCCTGGCTCAGGGGTTCA;SOR=1.662;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=89;TCR=41;TR=130;WE=219266212;WS=219266194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr2	219267781	rs2227255	C	T	7069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=151;NR=102;PP=2965;SC=AGCGTCCTCACGTGGATGAGT;SOR=1.008;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=254;TCF=152;TCR=102;TR=253;WE=219267789;WS=219267771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr2	219267913	rs2227258	A	G	9690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=361;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=172;NR=174;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.623;SC=ATGCAGCCCAATGAACCTGCG;SOR=0.744;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=346;TCF=172;TCR=174;TR=346;WE=219267921;WS=219267903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,359:0.99:361
chr2	219288382	rs4672893	A	G	1714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=4;PP=1102;SC=TGCTCCCCCAAGCCCCTGAGC;SOR=3.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=40;TCR=4;TR=44;WE=219288390;WS=219288372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr2	219288899	rs3731866	C	T	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=237;ReadPosRankSum=0.316;SC=TTCCTGGGCCCGGCTCTTTGT;SOR=0.608;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=15;WE=219288907;WS=219288889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,15:0.36:42
chr2	219294258	rs6720403	A	C	2167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=47;PP=1705;ReadPosRankSum=2.746;SC=TCCCTGGGAGAAGGTGCCCTG;SOR=0.666;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=226;TCF=117;TCR=109;TR=96;WE=219294266;WS=219294248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,98:0.40:242
chr2	219295835	rs4674307	G	A	1009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=32;PP=677;ReadPosRankSum=0.756;SC=ACTTTGGGAGGCTGAGGCGGG;SOR=0.919;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=65;TCF=12;TCR=53;TR=39;WE=219295843;WS=219295825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,42:0.62:68
chr2	219296545	rs17572485	G	A	2100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.199;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=39;PP=1434;ReadPosRankSum=-0.345;SC=GACCTCAGCTGGTGACAGTTG;SOR=0.966;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=264;TCF=156;TCR=108;TR=105;WE=219296553;WS=219296535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,109:0.40:274
chr2	219305404	rs2305833	G	C	2386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.579;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=38;PP=1519;ReadPosRankSum=1.747;SC=AGGTAGCTGTGCACCAGCTAA;SOR=0.769;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=165;TCF=100;TCR=65;TR=97;WE=219305412;WS=219305394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,107:0.60:177
chr2	219319657	rs6436058	A	G	3809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=54;PP=2415;SC=TGTTCCTCACAAGGCCTGACG;SOR=1.027;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=129;TCF=75;TCR=54;TR=129;WE=219319665;WS=219319647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr2	219320233	rs143712588	GAA	G	156.06	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=4.393;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.83;MQRankSum=0.632;QD=14.19;SOR=1.447;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,10:0.91:11
chr2	219321692	rs5838699	CA	C	219.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=11;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.825;NF=11;NR=0;PP=108;ReadPosRankSum=-1.453;SC=GACTGGATCTCAAAAAAAAAA;SOR=2.985;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=11;WE=219321700;WS=219321682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr2	219327898	.	AACACACACACACACACACAC	A	199.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.34;QD=33.29;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	219339283	rs549026	T	C	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.429;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=6;PP=512;ReadPosRankSum=-0.573;SC=ATTTGGAGGTTATTTGTCACT;SOR=0.439;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=49;TCF=40;TCR=9;TR=28;WE=219339291;WS=219339273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,31:0.58:53
chr2	219353195	rs10932782	C	T	977.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.052;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=31;PP=645;ReadPosRankSum=0.299;SC=ACACAAGAAACACAAATATAC;SOR=1.051;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=74;TCF=21;TCR=53;TR=40;WE=219353203;WS=219353185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,44:0.54:82
chr2	219433597	rs526897	G	A	795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.472;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=2;PP=611;ReadPosRankSum=-1.074;SC=GCGGCTCATTGTTTTCCGCTG;SOR=1.609;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=60;TCF=53;TCR=7;TR=34;WE=219433605;WS=219433587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,34:0.55:62
chr2	219433888	rs689116	C	A	1298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.039;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=41;PP=1015;ReadPosRankSum=0.662;SC=CCTTGCCGGACGCCTCTCGCG;SOR=0.939;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=85;TCF=17;TCR=68;TR=50;WE=219433896;WS=219433878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,51:0.57:89
chr2	219445860	rs34214861	GAA	G	1060.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.659;HP=7;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=852;ReadPosRankSum=-1.903;SC=CTATGGAAAAGAAATGGGTTT;SOR=1.209;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=23;WE=219445869;WS=219445850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,27:0.69:39
chr2	219447912	rs2952825	A	G	1643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.18;QD=27.40;SOR=0.986;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
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chr2	219447954	.	GTGTCTCTCTCTCTCTCTC	G	648	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=76;MMLQ=27;MQ=55.89;NF=0;NR=31;PP=648;QD=21.0;SC=GTGTGTGTGTGTGTCTCTCTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=31;WE=219447985;WS=219447942;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,31:0.84:37
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chr2	219508372	rs3770213	A	T	2064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=352;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.922;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=57;PP=1198;ReadPosRankSum=-0.945;SC=GACTGTGGCAAGAGGCTCTTC;SOR=0.834;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=325;TCF=165;TCR=160;TR=104;WE=219508380;WS=219508362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:236,115:0.33:351
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chr2	219541056	rs2556388	T	C	727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.100;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=19;PP=407;ReadPosRankSum=-1.621;SC=TCTCCCTCTATCTCTGTTCCT;SOR=0.455;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=55;TCF=15;TCR=40;TR=28;WE=219541064;WS=219541046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,33:0.53:62
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chr2	219562675	rs1863704	G	A	1908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=55;PP=1198;ReadPosRankSum=-0.728;SC=CTCCTTATAGGTGTCTTGGCC;SOR=0.702;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=252;TCF=106;TCR=146;TR=95;WE=219562683;WS=219562665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,100:0.37:272
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chr2	219602819	rs3731876	G	A	3718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=488;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=85;PP=2230;ReadPosRankSum=0.175;SC=GTTCGAGCCCGTCAGAAAAAA;SOR=0.711;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=439;TCF=221;TCR=218;TR=169;WE=219602827;WS=219602799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:296,191:0.39:487
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chr2	219609776	rs2272191	G	A	3063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.365;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=52;PP=1848;ReadPosRankSum=-1.003;SC=TAGTAACGACGCTTCAGGGCT;SOR=0.596;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=304;TCF=194;TCR=110;TR=134;WE=219609784;WS=219609766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,147:0.45:329
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chr2	219612282	rs2272188	A	G	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=11;PP=312;ReadPosRankSum=1.547;SC=GAGCCCCATCATCTGGCTGTA;SOR=0.639;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=79;TCF=53;TCR=26;TR=29;WE=219612290;WS=219612272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,30:0.35:86
chr2	219618237	rs6436073	A	C	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.202;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=298;ReadPosRankSum=-0.193;SC=GCTGGAGGGTACCAAGACCCC;SOR=0.988;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=52;TCF=39;TCR=13;TR=20;WE=219618245;WS=219618227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,21:0.39:54
chr2	219618497	rs6757772	T	G	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=227;ReadPosRankSum=-2.138;SC=ATTCTCCAGCTGGGGGTTGGT;SOR=1.127;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=32;TCF=4;TCR=28;TR=13;WE=219618505;WS=219618487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr2	219618708	rs55900247	T	C	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.755;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=143;ReadPosRankSum=2.620;SC=GTAAATAGAATTTTTTTTATG;SOR=1.877;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=9;WE=219618716;WS=219618698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
chr2	219691566	rs1467320	A	G	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=101;ReadPosRankSum=-2.629;SC=GGATGGCATGAGAAACCCTGC;SOR=0.446;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=8;WE=219691574;WS=219691556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr2	219692527	rs11385903	G	GC	2221.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=24;PP=1623;SC=ATCACCAACAGCCCTTTCCGG;SOR=1.146;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=45;TCF=20;TCR=25;TR=41;WE=219692535;WS=219692517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr2	219692696	rs1722196	G	C	1873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.139;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-0.292;NF=47;NR=34;PP=1163;ReadPosRankSum=-0.719;SC=GCCCCTCTGGGTGCCCATAAG;SOR=0.835;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=128;TCF=71;TCR=57;TR=81;WE=219692704;WS=219692686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,87:0.60:144
chr2	219692790	rs5838710	A	AG	4092.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=53;PP=2627;SC=GCATCCCTGCAGGGAGGGGCG;SOR=1.004;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=63;TCF=8;TCR=55;TR=61;WE=219692798;WS=219692780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr2	219695487	rs692243	G	C	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=299;ReadPosRankSum=0.935;SC=TGACCTGGTGGCTCCCCTTCC;SOR=0.558;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=19;WE=219695495;WS=219695477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,21:0.64:33
chr2	219696014	rs650898	G	A	2656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=35;PP=1696;SC=GGGACAAGGAGGTGGGGGAAG;SOR=0.969;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=54;TCR=35;TR=89;WE=219696022;WS=219696004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr2	219903258	rs6736922	T	G	7370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=118;NR=131;PP=2965;SC=GTGAGCATCATGTCCTTGGGA;SOR=0.881;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=249;TCF=118;TCR=131;TR=249;WE=219903266;WS=219903248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,276:1.00:276
chr2	219903723	rs4674354	C	T	2940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=46;PP=1535;SC=ATGGATTCTCCACCTTCTGGG;SOR=0.892;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=94;TCF=48;TCR=46;TR=94;WE=219903731;WS=219903713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr2	219903787	rs4672910	T	C	1386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=17;NR=29;PP=877;SC=AATAAATCAATCAAAGCATAA;SOR=1.565;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=17;TCR=29;TR=46;WE=219903795;WS=219903777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr2	219906066	rs11674400	C	A	908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=0;PP=686;SC=AAGACTCAGTCCCATGGGGCT;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=27;WE=219906074;WS=219906065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	219920037	rs394452	A	G	6791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=134;NR=102;PP=2965;SC=CCTCCCCCGGAGTCCAGCTGC;SOR=0.885;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=236;TCF=134;TCR=102;TR=236;WE=219920045;WS=219920019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr2	219920412	rs3731881	A	G	7406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQ=59.96;MQRankSum=0.000;NF=132;NR=129;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.140;SC=TCAGCCTGTGAGGCTCGCGGT;SOR=0.729;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=263;TCF=133;TCR=130;TR=261;WE=219920420;WS=219920402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,285:0.99:287
chr2	219922073	rs34694069	G	GC	1639.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=21;NR=11;PP=1334;SC=CCCCGGGCGGGCTCTTCACCT;SOR=2.200;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=36;TCF=25;TCR=11;TR=32;WE=219922081;WS=219922063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr2	219923410	rs71974827	G	GAGA	5276.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.182;NF=30;NR=49;PP=2971;ReadPosRankSum=-0.851;SC=AGCTGACTCTGAGAAGAAGCT;SOR=1.143;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=99;TCF=33;TCR=66;TR=79;WE=219923418;WS=219923400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,190:0.99:192
chr2	219941063	rs897477	G	A	3993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=54;PP=2300;SC=CTTGGAAGCTGTTCTCCAAGT;SOR=0.992;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=82;TCR=54;TR=136;WE=219941071;WS=219941053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr2	220012576	rs7585742	G	C	1433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=35;PP=1034;SC=TTCCAATTCAGTATTAGGTAC;SOR=2.078;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=13;TCR=35;TR=48;WE=220012584;WS=220012566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	220022176	rs6436120	C	T	336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=1;PP=283;SC=CCCAACCCCACATTCGAATTA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=220022184;WS=220022166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	220022435	rs2030452	G	C	2218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=55;PP=1359;SC=TACAGAGTAAGGGTGCTAAAA;SOR=1.845;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=25;TCR=55;TR=80;WE=220022443;WS=220022425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr2	220022968	.	T	C	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.644;ClippingRankSum=0.000;DP=210;ExcessHet=3.0103;FS=0.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.95;ReadPosRankSum=1.275;SOR=0.880;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:189,20:0.10:209
chr2	220022973	.	C	T	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=0.000;DP=210;ExcessHet=3.0103;FS=0.905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.98;ReadPosRankSum=0.832;SOR=0.738;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:190,19:0.09:209
chr2	220022976	.	A	G	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.457;ClippingRankSum=0.000;DP=211;ExcessHet=3.0103;FS=0.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.86;ReadPosRankSum=0.448;SOR=0.747;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:191,19:0.09:210
chr2	220022986	.	G	A	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.214;ClippingRankSum=0.000;DP=203;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.37;ReadPosRankSum=-1.498;SOR=0.736;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:183,20:0.10:203
chr2	220022989	.	C	G	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.082;ClippingRankSum=0.000;DP=201;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.28;ReadPosRankSum=-1.839;SOR=0.757;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:181,20:0.10:201
chr2	220023196	rs2293069	A	C	225.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=186;SC=CTCCCTGATAAAATAGAAGGC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=220023204;WS=220023186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	220028900	rs6753739	A	G	2636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=33;PP=1529;SC=AGAACTGATCAGGCCACACTG;SOR=1.051;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=57;TCR=33;TR=90;WE=220028908;WS=220028890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr2	220033698	.	G	GC	1923.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.130;ClippingRankSum=0.000;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.275;NF=8;NR=38;PP=710;ReadPosRankSum=-0.580;SC=GGAAACAAGAGCCCCCCCCAA;SOR=0.720;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=137;TCF=28;TCR=109;TR=46;WE=220033706;WS=220033688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,91:0.38:237
chr2	220033830	rs3795986	A	G	3601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=64;PP=2040;SC=GGAGGCTAGGAAAAGTTTGGG;SOR=1.222;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=47;TCR=64;TR=111;WE=220033838;WS=220033820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr2	220033956	rs6436121	T	C	1200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=9;PP=863;SC=ATCTCAATTCTGCACCCACCT;SOR=2.038;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=38;WE=220033964;WS=220033946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr2	220037393	rs4674361	A	G	5220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=97;NR=89;PP=2965;SC=AAGTGAAAGGAGCACCGGGCT;SOR=0.703;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=186;TCF=97;TCR=89;TR=186;WE=220037401;WS=220037383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr2	220037666	rs1127102	A	G	4768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=95;NR=70;PP=2965;SC=GACATTAGCGAGAGACGGCAG;SOR=0.877;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=165;TCF=95;TCR=70;TR=165;WE=220037674;WS=220037656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr2	220037756	rs1043160	A	G	6325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=107;NR=115;PP=2965;SC=AGGTGTAGGGATGCAGGACAG;SOR=0.782;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=222;TCF=107;TCR=115;TR=222;WE=220037764;WS=220037746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr2	220040330	rs1127101	A	G	8522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=159;NR=135;PP=2965;SC=CATGAGCTACATATTTCTTCT;SOR=0.705;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=294;TCF=159;TCR=135;TR=294;WE=220040338;WS=220040320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,334:1.00:334
chr2	220041091	rs6436123	G	A	2328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=50;PP=1535;SC=TGAAGGGCACGGAAAGGTATG;SOR=1.788;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=25;TCR=50;TR=75;WE=220041099;WS=220041081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr2	220041433	rs6436124	C	A	2522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=20;PP=1697;SC=CCGCTCAGGCCGGGAGGGGCG;SOR=2.168;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=56;TCR=20;TR=76;WE=220041441;WS=220041423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr2	220041455	rs6436125	C	T	3831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=86;NR=34;PP=2545;SC=GCCGGGAGGCCGGGGAGGGGG;SOR=1.981;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=86;TCR=34;TR=120;WE=220041463;WS=220041445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr2	220046349	rs2272017	G	C	6940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=138;NR=87;PP=2965;SC=GTTCATCCTGGTTCTCCTGCC;SOR=1.073;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=226;TCF=139;TCR=87;TR=225;WE=220046357;WS=220046339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr2	220046975	rs3731900	C	A	7276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=110;NR=132;PP=2965;SC=GGGTCCCCCCCAGATGGAGTG;SOR=0.937;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=242;TCF=110;TCR=132;TR=242;WE=220046983;WS=220046965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,263:1.00:263
chr2	220047393	rs3731901	C	T	1423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=39;PP=1119;SC=GTAGGGCTTCCTGGCTAGGAG;SOR=3.033;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=8;TCR=39;TR=47;WE=220047401;WS=220047383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr2	220071803	rs6714820	C	G	2373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=53;PP=1670;SC=GCCCAGCGGACAGGGACTTTG;SOR=1.639;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=80;TCF=25;TCR=55;TR=78;WE=220071811;WS=220071793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr2	220071879	rs66491679	TG	T	703.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;HP=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=20;NR=4;SC=GGCTTGAAGCTGGGGGGGGGT;SOR=6.593;Source=Platypus;TR=24;WE=220071888;WS=220071868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	220072766	rs4674366	G	T	1805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=44;PP=1451;SC=GCAGGGTAATGGCAGCCAAGT;SOR=1.942;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=19;TCR=44;TR=63;WE=220072774;WS=220072756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr2	220072852	rs4674367	C	T	1881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=19;PP=1457;SC=AGCTTCAACCCTACCCTGTCG;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=39;TCR=19;TR=58;WE=220072860;WS=220072842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr2	220078006	rs145526996	C	T	5484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=384;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.804;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=128;NR=90;PP=2962;ReadPosRankSum=0.551;SC=TCAATACGGCCCTTCTGAAAG;SOR=0.762;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=353;TCF=203;TCR=150;TR=218;WE=220078014;WS=220077996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,241:0.63:383
chr2	220078496	rs2139823	T	C	3641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=32;PP=2219;SC=GACACAGGCCTCAGGCCCCCT;SOR=1.686;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=74;TCR=32;TR=106;WE=220078504;WS=220078486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr2	220083279	rs1109866	C	T	7115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=120;NR=131;PP=2965;SC=CCAGAGTCCCCAGAGCCATCC;SOR=0.851;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=252;TCF=121;TCR=131;TR=251;WE=220083287;WS=220083269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,270:1.00:270
chr2	220083453	rs1109867	G	T	540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=14;PP=390;SC=GGCCGGGACTGGTCACTCGGA;SOR=2.419;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=19;WE=220083461;WS=220083443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	220085845	rs2276633	A	G	10671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=411;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=189;NR=192;PP=2965;SC=CATGCAGGGCAGTGGTCTCAG;SOR=0.784;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=383;TCF=190;TCR=193;TR=381;WE=220085853;WS=220085835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,410:1.00:410
chr2	220088248	rs908196	A	G	1082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=31;NR=8;PP=768;SC=CGGTTTTCCCAAAGACACTGT;SOR=2.726;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=31;TCR=8;TR=39;WE=220088256;WS=220088238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr2	220089590	rs3216709	T	TG	2757.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=45;PP=2170;SC=CGGGGTGGGGTGGGGAAGAGA;SOR=1.127;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=58;TCF=10;TCR=48;TR=54;WE=220089598;WS=220089580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr2	220089685	rs2276637	G	C	757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=15;PP=619;SC=TTAAGAGACAGTTCCTGATTT;SOR=0.859;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=9;TCR=15;TR=24;WE=220089693;WS=220089675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	220100553	rs150402081	C	A	7663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=132;NR=116;PP=2965;SC=GGAGCGTGAACGAGAAGAGCA;SOR=0.755;SbPval=0.55;Source=Platypus;TCR=116;TR=248;WE=220100561;WS=220100543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
chr2	220111662	rs185901280	G	A	949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.841;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=28;PP=663;ReadPosRankSum=1.005;SC=GGCTGTGTGAGCAGTCCAGCA;SOR=1.270;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=61;TCF=17;TCR=44;TR=37;WE=220111670;WS=220111652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,40:0.59:68
chr2	220113242	rs7601549	T	G	10837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=395;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=167;NR=194;PP=2965;SC=TGGAGGCGCTTCAGCCCCCAG;SOR=0.862;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=361;TCF=167;TCR=194;TR=361;WE=220113250;WS=220113232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,395:1.00:395
chr2	220113384	rs8447	G	A	1193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=28;PP=880;SC=CTTACACTTGGGGGTAGCGGG;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=35;WE=220113392;WS=220113374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr2	220115512	rs141922502	T	C	5244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=363;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.778;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.029;NF=105;NR=104;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.892;SC=GATCACACTTTACCATCTGGT;SOR=0.599;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=334;TCF=162;TCR=172;TR=209;WE=220115520;WS=220115502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,230:0.63:363
chr2	220118076	rs60456844	CG	C	289.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FS=0.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.18;MQRankSum=3.738;QD=1.67;ReadPosRankSum=-0.406;SOR=0.807;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:142,31:0.18:173
chr2	220118531	rs939574	G	C	6289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=120;NR=102;PP=2965;SC=CCCCAAAGGAGAGGGGCAATT;SOR=0.726;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=222;TCF=120;TCR=102;TR=222;WE=220118539;WS=220118521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr2	220135208	rs2891733	C	T	1287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=36;PP=978;SC=GCACTCTGATCGGGGGGCCAA;SOR=6.043;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=1;TCR=36;TR=37;WE=220135216;WS=220135198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr2	220136155	rs7594971	T	C	10267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=389;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-2.179;NF=240;NR=197;PP=2965;ReadPosRankSum=1.119;SC=CATCTGCCACTGCAACCTAGA;SOR=0.842;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=439;TCF=241;TCR=198;TR=437;WE=220136163;WS=220136145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,387:0.99:389
chr2	220136351	rs3731892	G	A	8706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=-0.192;NF=115;NR=157;PP=2965;ReadPosRankSum=1.859;SC=CTGCAGAAAAGGTATACCACG;SOR=0.429;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=272;TCF=115;TCR=157;TR=272;WE=220136359;WS=220136341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,311:1.00:312
chr2	220136371	rs3731894	T	C	7183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=125;PP=2965;SC=GAGCAGCTGTTGGTGGCAGAG;SOR=1.000;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=233;TCF=108;TCR=125;TR=232;WE=220136379;WS=220136361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr2	220194247	rs3832109	A	AATT	997.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=18;PP=950;SC=AGGACCTCTGAATTCTCACAG;SOR=3.352;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=19;WE=220194255;WS=220194237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	220195446	rs6707009	C	G	626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=6;PP=424;SC=TTCCCCCCTCCCCATCTCTAA;SOR=2.215;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=24;WE=220195454;WS=220195436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	220195738	rs34019246	GTCT	G	2413.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=36;PP=1830;SC=TCCACTTCAAGTCTTCTTTAA;SOR=2.066;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=46;TCF=4;TCR=42;TR=40;WE=220195748;WS=220195728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr2	220197207	rs2048737	T	C	283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=3;PP=209;SC=CAGGATCGCTTTCTTGGCCCT;SOR=1.085;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=11;WE=220197215;WS=220197197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	220197321	rs2385405	C	T	3236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=37;PP=1776;SC=TGGAGCCCCTCGGAGCTCCCA;SOR=1.217;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=103;TCF=66;TCR=37;TR=103;WE=220197329;WS=220197311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr2	220197388	rs2385404	C	A	4135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=65;PP=2318;SC=CCGGCCAAGTCTCAGTGAAGG;SOR=0.745;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=75;TCR=65;TR=140;WE=220197396;WS=220197378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr2	220197492	rs2385402	C	G	3036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=54;PP=1775;SC=TTCAGCCAATCGTGAGCGGGC;SOR=1.148;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=43;TCR=54;TR=97;WE=220197500;WS=220197482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr2	220197821	rs5838736	CTA	C	1191.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5167;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=10;PP=492;SC=GTTCGATCTGCTATATATATA;SOR=1.112;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=220197832;WS=220197811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr2	220239534	rs3731904	G	A	1577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=13;PP=1038;SC=GCACTAGAGGGGAAGCAGCCC;SOR=1.835;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=37;TCR=13;TR=50;WE=220239542;WS=220239524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr2	220239561	rs3731905	C	G	2296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=48;NR=27;PP=1341;SC=CAGAGAGGGTCTGGGGTGGGT;SOR=1.151;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=48;TCR=27;TR=75;WE=220239569;WS=220239551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr2	220246218	rs6436148	T	C	9130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=348;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=168;NR=160;PP=2965;SC=GAGTCGGCGCTCGGAACAGCC;SOR=0.705;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=328;TCF=168;TCR=160;TR=328;WE=220246226;WS=220246208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,348:1.00:348
chr2	220249299	rs5838737	C	CT	1740.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.420;NF=1;NR=54;PP=1281;ReadPosRankSum=-1.181;SC=TTTGTTTTTTCTTTTTTTTGA;SOR=2.010;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=1;TCR=73;TR=55;WE=220249307;WS=220249289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,65:0.96:68
chr2	220249329	rs2002892	C	T	916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=24;PP=648;SC=TCGCTCTTGTCGCCCAGTCTG;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=220249337;WS=220249319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	220250147	rs907679	A	G	4803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=104;NR=59;PP=2945;SC=AGTCCTCACCACAGGCTGGGT;SOR=1.204;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=163;TCF=104;TCR=59;TR=163;WE=220250155;WS=220250137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr2	220250322	rs878437	C	A	8413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=127;NR=144;PP=2965;SC=GGGACTCTGCCGCCCTCCCCA;SOR=0.945;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=271;TCF=127;TCR=144;TR=271;WE=220250330;WS=220250312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,309:1.00:309
chr2	220250826	rs2271456	G	A	2417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=53;PP=1415;SC=GGGCACTGCAGCCAGCCAGGC;SOR=1.954;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=24;TCR=54;TR=76;WE=220250834;WS=220250816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr2	220250897	rs11352428	AG	A	529.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=9;PP=402;SC=CAGACTAAGCAGGGTGGTCCT;SOR=2.049;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=11;WE=220250905;WS=220250887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	220251178	rs2271457	T	C	6721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=125;PP=2965;SC=CATGACGATATGTGGAGATGA;SOR=0.916;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=234;TCF=109;TCR=125;TR=234;WE=220251186;WS=220251168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
chr2	220252287	rs138394024	CTCG	C	3948.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=30;PP=2474;SC=TGACTCCTCTCTCGCACCCAC;SOR=1.364;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=21;TCR=30;TR=51;WE=220252297;WS=220252277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr2	220264412	rs13018645	A	G	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.054;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=12;PP=332;ReadPosRankSum=-1.530;SC=GATGAGTATTATTCTGTTAAG;SOR=0.470;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=25;TCR=32;TR=22;WE=220264420;WS=220264402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,23:0.40:58
chr2	220264543	rs58721028	C	CAT	9251.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=63;PP=2965;SC=TGCCTAGGAACGTGTCTGCAC;SOR=0.796;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=24;TCR=66;TR=86;WE=220264551;WS=220264533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr2	220283259	rs1318299	A	G	4465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=64;PP=2715;ReadPosRankSum=-0.720;SC=CGGGCTTCCCACTCGGCTCCC;SOR=0.362;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=94;TCR=64;TR=158;WE=220283267;WS=220283249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,172:0.99:173
chr2	220283277	rs2017800	T	C	5475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=81;PP=2965;SC=CCCCGCTGAGTTCGCCCGTGT;SOR=0.907;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=187;TCF=106;TCR=81;TR=187;WE=220283285;WS=220283267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr2	220283826	rs907677	T	G	3483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=60;NR=61;PP=1972;SC=AGGCCTGGGGTCTGGGGTCCC;SOR=0.921;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=121;TCF=60;TCR=61;TR=121;WE=220283834;WS=220283816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr2	220284779	rs12991025	C	T	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=1.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.42;ReadPosRankSum=1.403;SOR=0.474;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,24:0.36:66
chr2	220285309	rs1058261	C	T	4217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=86;PP=2199;ReadPosRankSum=-1.495;SC=CCCTCAGGGACATCCGGGCTC;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=267;TCF=127;TCR=140;TR=162;WE=220285317;WS=220285299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,196:0.62:315
chr2	220285666	rs12920	G	C	3525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.168;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=79;PP=2280;ReadPosRankSum=-0.142;SC=TTGACGCCCTGAAGGGCACTG;SOR=0.958;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=240;TCF=98;TCR=142;TR=129;WE=220285674;WS=220285656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,149:0.55:273
chr2	220286142	rs1058284	G	A	2989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.424;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=59;PP=1538;ReadPosRankSum=1.819;SC=ACAACATTGCGCGCCTGGAGG;SOR=0.721;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=249;TCF=134;TCR=115;TR=130;WE=220286150;WS=220286132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,149:0.53:282
chr2	220299881	.	G	A	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.095;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=68;ReadPosRankSum=0.023;SC=AGCGACGTGCGGCTGCGGGTG;SOR=0.782;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=19;TCR=9;TR=9;WE=220299889;WS=220299871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,11:0.29:38
chr2	220306413	rs4674398	G	T	1944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=35;PP=1118;SC=CATGTGCCTAGGGCTCCGGAG;SOR=1.276;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=27;TCR=35;TR=62;WE=220306421;WS=220306403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr2	220308581	rs10932805	A	C	878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=2;PP=764;SC=GGGGGTCCCCAGTGCTGGGCA;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=29;WE=220308589;WS=220308571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	220312546	.	C	CGTGGGG	212.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.511;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=3.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.34;ReadPosRankSum=0.847;SOR=0.101;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,5:0.17:29
chr2	220315970	rs10932806	G	A	4342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=96;PP=2732;SC=TGCTGCTCAAGTGTATCATCA;SOR=1.550;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=146;TCF=50;TCR=96;TR=146;WE=220315978;WS=220315960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr2	220316039	rs55692495	G	A	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=361;ReadPosRankSum=-0.910;SC=GGTCGAGGTTGGGAGGGGGTG;SOR=1.092;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=18;WE=220316047;WS=220316029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,20:0.69:29
chr2	220316579	rs4674399	C	T	1881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=28;NR=36;PP=1016;SC=CCGTGACTCTCCCCTGGCCCA;SOR=1.195;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=28;TCR=37;TR=64;WE=220316587;WS=220316569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr2	220330646	rs1976618	C	T	1112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=3;PP=559;SC=TGTGTGTGTGCGCGCGTGTGC;SOR=3.611;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=24;WE=220330654;WS=220330636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	220330661	rs1976617	A	G	1788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=40;NR=10;PP=888;SC=GTGTGCGTGCACGTGTGCGTG;SOR=2.746;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=51;TCF=40;TCR=11;TR=50;WE=220330669;WS=220330651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr2	220330724	rs1567488	C	T	6902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=149;NR=102;PP=2965;SC=CGCGTGCGTGCGCGTATGCTG;SOR=1.036;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=252;TCF=149;TCR=103;TR=251;WE=220330732;WS=220330714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr2	220330804	rs1567487	T	C	7885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=136;NR=156;PP=2965;SC=GGGCCACCTGTGCTCCCCCCG;SOR=0.900;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=293;TCF=137;TCR=156;TR=292;WE=220330815;WS=220330794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,305:1.00:305
chr2	220333950	rs10167209	T	C	5871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=107;NR=96;PP=2965;ReadPosRankSum=0.848;SC=TGTCCATTCCTGACTTCCTGC;SOR=0.238;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=204;TCF=108;TCR=96;TR=203;WE=220333958;WS=220333940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,222:1.00:223
chr2	220336517	rs73991563	C	T	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=320;ReadPosRankSum=1.711;SC=GGACCAGGCCCGGGATGGCAT;SOR=0.941;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=18;WE=220336525;WS=220336507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,17:0.74:23
chr2	220341935	rs201853159	A	AG	282.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=6.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.47;ReadPosRankSum=-1.287;SOR=0.059;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr2	220341938	.	C	CGGGGCCTGGTACAGCGGCT	445.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.364;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=6.300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.92;ReadPosRankSum=-1.761;SOR=0.076;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
chr2	220346596	rs3731906	C	T	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=65;ReadPosRankSum=-0.651;SC=GAAACAGGCTCTAATCAGTGA;SOR=0.963;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=7;WE=220346604;WS=220346586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr2	220348751	rs10755037	C	T	3765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.652;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=74;PP=2368;ReadPosRankSum=-1.511;SC=CCCAGTACCCCTAAGTCTGCA;SOR=0.716;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=292;TCF=151;TCR=141;TR=161;WE=220348759;WS=220348741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,177:0.55:320
chr2	220353013	rs875098	G	A	3281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.037;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=83;PP=2011;ReadPosRankSum=0.312;SC=GCCCTGCACCGCACATCTCCT;SOR=1.103;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=233;TCF=92;TCR=141;TR=128;WE=220353021;WS=220353003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,147:0.57:257
chr2	220353104	rs875097	A	G	895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=16;PP=595;ReadPosRankSum=-0.444;SC=GGGAGGGGCTAGGCCGGAGTG;SOR=0.699;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=97;TCF=58;TCR=39;TR=38;WE=220353112;WS=220353094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,40:0.39:102
chr2	220353440	rs62191888	G	T	2241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.812;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=39;PP=1374;ReadPosRankSum=-1.191;SC=GTGGGACAGGGCTTGAGGGGT;SOR=0.792;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=163;TCF=92;TCR=71;TR=91;WE=220353448;WS=220353430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,104:0.56:185
chr2	220354108	rs55760516	A	G	2295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.518;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=51;PP=1408;ReadPosRankSum=0.214;SC=TGTCACCTCAAGGCCAGCCAG;SOR=0.625;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=184;TCF=82;TCR=102;TR=94;WE=220354116;WS=220354098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,106:0.51:209
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chr2	220354757	rs6742231	G	C	593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.248;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=19;PP=374;ReadPosRankSum=-0.810;SC=TCCTGGCTGGGGTGGGGGGAG;SOR=0.973;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=45;TCF=13;TCR=32;TR=26;WE=220354765;WS=220354747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,28:0.58:48
chr2	220355529	rs12464085	A	G	4447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.775;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=107;PP=2776;ReadPosRankSum=1.519;SC=CTCCACGGCCACCACGTGCTC;SOR=0.592;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=332;TCF=154;TCR=178;TR=203;WE=220355537;WS=220355519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,211:0.59:355
chr2	220356449	rs6747041	G	C	1059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.753;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=12;PP=795;ReadPosRankSum=-0.700;SC=AGCACCCAGGGACCTCCCCCG;SOR=1.371;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=73;TCF=47;TCR=26;TR=41;WE=220356467;WS=220356439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,44:0.57:77
chr2	220356520	rs12473286	G	T	3085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.061;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=55;PP=1658;ReadPosRankSum=-0.345;SC=TGTCAGCTCCGGAGATGGTGA;SOR=0.811;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=204;TCF=112;TCR=92;TR=129;WE=220356528;WS=220356510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,146:0.64:229
chr2	220356806	rs907146	C	T	11008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=418;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=214;NR=177;PP=2965;SC=GGTCTGCATACGTCAATCAAG;SOR=0.909;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=392;TCF=215;TCR=177;TR=391;WE=220356814;WS=220356796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,417:1.00:417
chr2	220357594	rs1078212	C	A	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=34;ReadPosRankSum=0.566;SC=CTGAGCCAGGCGGGCCTGGGG;SOR=1.179;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=3;WE=220357602;WS=220357590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr2	220358198	rs1050816	C	T	1102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=11;PP=758;ReadPosRankSum=-1.100;SC=TCCATGGCCTCTGGCCTTCTT;SOR=0.770;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=74;TCF=57;TCR=17;TR=44;WE=220358206;WS=220358188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,46:0.58:79
chr2	220361265	rs2385541	A	G	804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=20;PP=535;SC=ACTCTTGAGTAGGGTTTGAGT;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=25;WE=220361273;WS=220361255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	220361486	rs2010592	G	A	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=354;ReadPosRankSum=-2.409;SC=GGCTGTGGCCGGGCCTGTCTT;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=17;WE=220361494;WS=220361479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr2	220361520	rs16859986	C	G	1216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.367;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=5;PP=948;ReadPosRankSum=-0.702;SC=CCTGACTCGGCCCGCGGGTAG;SOR=1.048;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=63;TCF=55;TCR=8;TR=41;WE=220361528;WS=220361510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,45:0.65:69
chr2	220362283	rs2010528	C	G	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=203;ReadPosRankSum=0.632;SC=GTCCCTTTAACAGCCAAGGAG;SOR=0.507;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=13;WE=220362291;WS=220362273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr2	220362557	rs12474050	C	T	2126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.570;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=53;PP=1247;ReadPosRankSum=-0.793;SC=GGACCAAGGACGGGGAGGACA;SOR=0.767;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=158;TCF=68;TCR=90;TR=92;WE=220362565;WS=220362547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,102:0.58:176
chr2	220362899	rs2029251	C	G	10949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=411;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=181;NR=200;PP=2965;SC=TCGCTCGCGTCGACGTGGCCT;SOR=0.866;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=382;TCF=181;TCR=201;TR=381;WE=220362907;WS=220362889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,411:1.00:411
chr2	220366953	rs2385539	G	C	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.392;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=243;ReadPosRankSum=-0.795;SC=AAGTAGGGAGGGGGAGGGCAG;SOR=0.417;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=50;TCR=8;TR=20;WE=220366961;WS=220366943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,22:0.34:64
chr2	220371181	rs10932808	T	A	2144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=48;PP=1400;SC=GGGGAACCCCTCAGCTGATGG;SOR=1.580;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=25;TCR=48;TR=73;WE=220371189;WS=220371171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr2	220379560	rs3731909	C	G	3801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=469;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.526;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=91;PP=2382;ReadPosRankSum=0.601;SC=CTGGAGCAGCCCCCCGAGACC;SOR=0.688;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=430;TCF=218;TCR=212;TR=187;WE=220379568;WS=220379548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:263,199:0.43:462
chr2	220380125	rs1872858	G	A	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=93;ReadPosRankSum=-1.238;SC=TCCTCAACAGGGCTTCCCTTC;SOR=0.392;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=7;WE=220380133;WS=220380115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr2	220397811	rs6731344	T	C	941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=28;PP=685;SC=TCAGTGGGGTTGGGGAGAGGT;SOR=3.026;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=34;WE=220397833;WS=220397801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr2	220397825	rs6716083	C	T	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=159;ReadPosRankSum=0.495;SC=GAGAGGTCTGCGGACCTCTGC;SOR=0.602;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=10;WE=220397833;WS=220397801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr2	220401751	rs2385538	G	A	1846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=31;PP=1095;ReadPosRankSum=1.457;SC=CTCAGGAAGAGAGGCCCACAC;SOR=0.690;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=195;TCF=120;TCR=75;TR=79;WE=220401759;WS=220401741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,92:0.42:218
chr2	220402624	rs11689270	G	T	1465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=14;PP=1222;SC=GAGCTCTCCCGGTCCCACTCT;SOR=1.659;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=32;TCR=14;TR=46;WE=220402632;WS=220402614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr2	220402671	rs11689281	G	T	2750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.47;ReadPosRankSum=-0.041;SOR=0.589;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,65:0.60:108
chr2	220402680	rs11695248	T	C	2962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=3.334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.11;ReadPosRankSum=0.484;SOR=0.432;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,82:0.61:134
chr2	220404381	rs1976616	A	G	5339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=86;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.946;SC=GGGCTGCCACATAGTCGGAGT;SOR=0.244;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=180;TCF=92;TCR=88;TR=178;WE=220404389;WS=220404371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,197:0.99:198
chr2	220404484	rs62191582	G	C	3573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.794;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=70;PP=2361;ReadPosRankSum=-1.387;SC=TGGGGCCACAGCTGGGTGGAA;SOR=0.772;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=208;TCF=109;TCR=99;TR=149;WE=220404492;WS=220404474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,158:0.71:223
chr2	220404648	rs1043833	C	T	1679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.488;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=44;PP=1126;ReadPosRankSum=1.543;SC=CCATGAGGCGCAGTGGTGAGG;SOR=0.710;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=262;TCF=133;TCR=129;TR=94;WE=220404656;WS=220404638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,95:0.34:277
chr2	220404726	rs1043832	G	A	1073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.327;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=34;PP=723;ReadPosRankSum=0.366;SC=GCTCTGCCACGTGGGCCTTGA;SOR=0.867;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=156;TCF=66;TCR=90;TR=57;WE=220404734;WS=220404716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,57:0.35:162
chr2	220405230	rs6436154	G	A	1545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.052;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=33;PP=835;ReadPosRankSum=0.203;SC=AGGAGAAAGCGTGCTGCTCCG;SOR=0.604;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=212;TCF=110;TCR=102;TR=73;WE=220405238;WS=220405220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,84:0.36:231
chr2	220405321	rs6436155	T	C	6833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=123;NR=111;PP=2965;ReadPosRankSum=1.379;SC=AGCAGCTGCCTGGTCCCCATC;SOR=0.235;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=236;TCF=125;TCR=111;TR=234;WE=220405329;WS=220405311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,264:1.00:265
chr2	220406239	rs13004994	T	G	1361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=14;PP=738;ReadPosRankSum=-1.110;SC=ATGTCCGAATTGGCATGGAAA;SOR=0.758;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=102;TCF=70;TCR=32;TR=51;WE=220406247;WS=220406229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,62:0.52:119
chr2	220406722	rs3731912	T	C	4360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=352;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.758;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=86;PP=2848;ReadPosRankSum=-1.808;SC=GCTCCTCGCCTAGCGTCACCA;SOR=0.504;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=322;TCF=158;TCR=164;TR=179;WE=220406730;WS=220406712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,198:0.56:352
chr2	220406944	rs7581251	G	A	1302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.59;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	220409701	rs10932811	C	T	2754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=60;PP=1734;SC=CTCTGAATCCCTCTACCATCA;SOR=1.681;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=90;TCF=30;TCR=60;TR=90;WE=220409709;WS=220409691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr2	220412256	rs8179770	T	C	5296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=98;NR=80;PP=2929;SC=CAGTGCTCTTTCTCACTGGGT;SOR=0.723;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=178;TCF=98;TCR=80;TR=178;WE=220412264;WS=220412246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr2	220413661	rs12996466	C	T	1328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=2;PP=1014;SC=AGCCTAGCAACCTTCCATAAA;SOR=5.283;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=40;TCF=38;TCR=2;TR=40;WE=220413669;WS=220413651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr2	220414016	rs6436156	C	T	7694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.72;SOR=1.356;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr2	220414019	rs13023533	T	C	7595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.21;SOR=1.320;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr2	220415595	rs146790993	GGA	G	7397.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=77;PP=2973;SC=ATGGGGCTGGGGAGAGAAGGG;SOR=1.070;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=91;TCF=10;TCR=81;TR=85;WE=220415604;WS=220415585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr2	220415646	rs1043582	T	C	2776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=54;PP=1770;SC=TGGACACCAGTACACAAAGAG;SOR=1.361;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=34;TCR=54;TR=88;WE=220415654;WS=220415636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr2	220415752	rs6745782	C	T	235.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=6;PP=218;SC=GGGCACAGCGCGGCACCTGAA;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=220415760;WS=220415742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	220416164	rs6761575	T	C	497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=12;NR=4;PP=268;SC=CACCCCAAGTTCTGGAAAGCC;SOR=1.493;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=16;WE=220416172;WS=220416163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	220416570	rs4672931	C	T	2105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=30;NR=35;PP=1301;SC=GCATGGCCCCCAGGAGGAGAG;SOR=1.032;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=30;TCR=35;TR=65;WE=220416578;WS=220416560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr2	220416591	rs4672932	C	T	1722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=30;PP=1066;SC=ATGCATCTTCCCTCCCTGAAG;SOR=1.217;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=21;TCR=30;TR=51;WE=220416599;WS=220416581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr2	220416803	rs4672933	A	T	6505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=130;NR=94;PP=2965;SC=CAGGATGTACACTCTCTGTCG;SOR=0.872;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=224;TCF=130;TCR=94;TR=224;WE=220416811;WS=220416793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr2	220416942	rs34490902	G	C	5063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=102;PP=2783;ReadPosRankSum=-1.125;SC=TTCTTCCCTGGGGGTGAGGGG;SOR=1.173;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=178;TCF=75;TCR=103;TR=176;WE=220416950;WS=220416932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,195:0.99:197
chr2	220417228	rs60549465	G	T	3227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=72;NR=38;PP=1905;SC=GGGCAGCGAGGGGCCCGAAAG;SOR=1.274;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=110;TCF=72;TCR=38;TR=110;WE=220417236;WS=220417218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr2	220417266	rs59332477	C	T	5616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=113;NR=85;PP=2965;SC=ACCTTCCTGTCGGATGCGGAC;SOR=0.861;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=198;TCF=113;TCR=85;TR=198;WE=220417274;WS=220417256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr2	220419236	rs10932813	T	C	4968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=74;PP=2665;SC=GGGAATCCGCTGTGAAGGAGA;SOR=0.759;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=165;TCF=91;TCR=74;TR=165;WE=220419244;WS=220419226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr2	220419339	rs10932814	T	C	5879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=104;NR=104;PP=2965;SC=TGGATACAGCTGTACTCCACC;SOR=0.795;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=208;TCF=104;TCR=104;TR=208;WE=220419347;WS=220419329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr2	220420785	rs3087971	G	A	9070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=167;NR=150;PP=2965;SC=GGTGGCTCTCGCAGCCGTAGG;SOR=0.740;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=318;TCF=168;TCR=150;TR=317;WE=220420793;WS=220420775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,346:1.00:346
chr2	220420956	rs10932816	A	G	1986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=38;PP=1316;SC=CGAGACACACATCCTGGCCTT;SOR=1.103;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=29;TCR=38;TR=67;WE=220420964;WS=220420946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr2	220421417	rs1983210	C	G	3330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.436;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=82;PP=2037;ReadPosRankSum=-1.603;SC=GTGGTGTCAGCTCCGAGACCA;SOR=0.724;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=269;TCF=111;TCR=158;TR=142;WE=220421425;WS=220421407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,156:0.54:287
chr2	220421479	rs13010015	A	G	1523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.496;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=47;PP=1137;ReadPosRankSum=-2.081;SC=AGCTGGGCTGAGTCTTTTCTT;SOR=1.075;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=129;TCF=39;TCR=90;TR=65;WE=220421487;WS=220421469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,66:0.50:133
chr2	220422400	rs2278200	C	G	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=272;ReadPosRankSum=-1.003;SC=GAGGAGGGCACGGGGAGGCAT;SOR=0.804;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=21;TCR=11;TR=14;WE=220422408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
chr2	220422774	rs2278201	A	G	1892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.942;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=49;PP=1134;ReadPosRankSum=0.020;SC=CTGGCTCCCCAGGGGCCACAC;SOR=0.588;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=283;TCF=154;TCR=129;TR=101;WE=220422782;WS=220422764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:203,112:0.36:315
chr2	220427347	rs10804275	G	T	1504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.757;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.285;NF=30;NR=36;PP=901;ReadPosRankSum=-0.629;SC=CCAGGCGCACGGCTGCCACAT;SOR=0.842;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=176;TCF=86;TCR=90;TR=66;WE=220427355;WS=220427337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,77:0.37:209
chr2	220427395	rs3183099	G	A	924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.222;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=2.275;NF=24;NR=20;PP=495;ReadPosRankSum=-0.022;SC=ACGAGGAGACGTCTGGAGGAC;SOR=0.521;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=115;TCF=58;TCR=57;TR=44;WE=220427403;WS=220427385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,51:0.37:137
chr2	220427428	rs55904205	GA	G	1156.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.857;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.218;NF=2;NR=19;PP=752;ReadPosRankSum=1.281;SC=TGCCGGGCATGAGGGGTGTGC;SOR=0.291;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=59;TCF=3;TCR=56;TR=21;WE=220427436;WS=220427418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,39:0.39:101
chr2	220427996	rs11904583	T	C	1169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=2;PP=995;SC=AACAGTGGCCTGGGAGTGAAG;SOR=4.351;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=37;TCF=35;TCR=2;TR=37;WE=220428004;WS=220427992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr2	220428381	rs2303543	A	T	4948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=413;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.743;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=117;PP=2962;ReadPosRankSum=0.413;SC=CATTGCACAGACACCCCCGCA;SOR=0.820;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=392;TCF=185;TCR=207;TR=218;WE=220428391;WS=220428371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,229:0.56:412
chr2	220430203	rs1039898	C	T	9686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=363;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=149;NR=185;PP=2965;SC=CAACGACACCCTGTCCTGGGG;SOR=1.051;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=335;TCF=150;TCR=185;TR=334;WE=220430211;WS=220430193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,362:1.00:362
chr2	220431458	rs62191614	A	C	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=116;ReadPosRankSum=-0.135;SC=CCTGGCCCAGATACAAGAAAT;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=6;WE=220431466;WS=220431454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr2	220431631	rs1043537	G	T	2962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.733;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=47;PP=1907;ReadPosRankSum=0.126;SC=GGTGCTTGACGGCATGCAGGA;SOR=0.581;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=194;TCF=122;TCR=72;TR=119;WE=220431639;WS=220431621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,128:0.60:213
chr2	220431919	rs4674412	A	G	786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=16;PP=545;SC=GCGGATGGCAAGCCTGTGAGA;SOR=1.302;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=9;TCR=16;TR=25;WE=220431927;WS=220431909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	220432014	rs61732787	G	A	1793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.880;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=27;PP=1082;ReadPosRankSum=-1.366;SC=CAGAACCGTGGAACACCACGT;SOR=0.484;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=97;TCF=63;TCR=34;TR=73;WE=220432022;WS=220432004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,78:0.74:105
chr2	220433113	rs12623922	T	C	768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.891;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=24;PP=601;ReadPosRankSum=-0.180;SC=GTAGGATACCTAGAAGCGCAT;SOR=1.407;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=67;TCF=25;TCR=42;TR=34;WE=220433121;WS=220433103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,34:0.48:71
chr2	220435034	rs10180675	A	G	15818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=582;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=263;NR=272;PP=2965;SC=CCTGGCAGTAAAGCACCTTGA;SOR=0.760;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=535;TCF=263;TCR=272;TR=535;WE=220435042;WS=220435024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,581:1.00:581
chr2	220437081	rs35118453	C	T	935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.51;ReadPosRankSum=-0.756;SOR=0.641;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,46:0.42:110
chr2	220439678	rs12720063	C	T	1737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.113;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=28;PP=1175;ReadPosRankSum=0.606;SC=CTCACTGGGCCGTGCTGCACC;SOR=1.012;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=189;TCF=115;TCR=74;TR=76;WE=220439686;WS=220439668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,82:0.40:207
chr2	220462640	rs681747	G	T	2750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.403;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=56;PP=1545;ReadPosRankSum=1.487;SC=CAGACGGGGAGGTTCGGTATG;SOR=0.651;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=292;TCF=167;TCR=125;TR=128;WE=220462648;WS=220462630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:187,144:0.44:331
chr2	220466199	rs620698	G	T	1355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=24;PP=895;ReadPosRankSum=-0.635;SC=TGTGCAAGGAGCCCAAGAGAA;SOR=0.908;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=122;TCF=68;TCR=54;TR=57;WE=220466207;WS=220466189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,62:0.47:132
chr2	220471116	rs633200	C	G	1723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.489;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=44;PP=1063;ReadPosRankSum=0.915;SC=GGACCTGGACCCTGCTTACTG;SOR=0.587;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=271;TCF=127;TCR=144;TR=89;WE=220471124;WS=220471106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:197,98:0.33:295
chr2	220476443	rs627530	C	T	1863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.331;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=45;PP=1096;ReadPosRankSum=2.252;SC=CCTTCTCCGTCTGCCAGCCCT;SOR=0.524;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=276;TCF=152;TCR=124;TR=93;WE=220476451;WS=220476433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:203,100:0.33:303
chr2	220476645	rs581547	T	C	5944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=89;PP=2965;SC=GGGGCTGCCATGGGCAGGCTG;SOR=0.731;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=189;TCF=100;TCR=89;TR=189;WE=220476653;WS=220476635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr2	220479312	rs624773	T	C	4657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=84;NR=77;PP=2748;SC=CTCTGTACCCTACCTTGTCAC;SOR=0.704;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=161;TCF=84;TCR=77;TR=161;WE=220479320;WS=220479302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr2	220480639	rs640807	T	C	2455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=49;PP=1393;SC=GGGAGTGACATGGGCCTGGGG;SOR=1.216;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=35;TCR=49;TR=84;WE=220480647;WS=220480629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr2	220480681	rs62181346	A	G	891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.917;HP=1;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=20;PP=656;ReadPosRankSum=-0.105;SC=AGGTGGAGACAGTGAGGCCTT;SOR=0.317;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=65;TCF=28;TCR=37;TR=39;WE=220480701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,40:0.61:66
chr2	220480693	rs665845	G	C	1826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=31;PP=1548;SC=TGAGGCCTTCGCAGAGACCTC;SOR=0.997;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=24;TCR=31;TR=55;WE=220480701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr2	220494118	rs597306	A	C	2815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=46;PP=1738;SC=GAGCCCCCCCACTCAGGGACC;SOR=1.203;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=36;TCR=46;TR=82;WE=220494126;WS=220494100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr2	220495167	rs612078	A	C	1281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=31;PP=962;SC=GTCCCCTGCTAAGGGCTGAGT;SOR=2.726;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=7;TCR=31;TR=38;WE=220495175;WS=220495157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
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chr2	220496762	rs370698520	G	A	2686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=368;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.388;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=58;PP=1638;ReadPosRankSum=0.032;SC=CAGGGCGGGAGGGGCAGTCCC;SOR=0.735;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=338;TCF=189;TCR=149;TR=133;WE=220496770;WS=220496752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:223,144:0.39:367
chr2	220500321	rs2305055	C	G	717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.015;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=12;PP=454;ReadPosRankSum=0.704;SC=TCCTTTGCATCCCTGATCCCA;SOR=0.473;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=64;TCF=41;TCR=23;TR=31;WE=220500329;WS=220500311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,33:0.48:69
chr2	220500423	rs589767	A	G	8676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.27;SOR=0.777;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr2	220500426	rs639214	A	G	8669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.01;SOR=0.788;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr2	220502137	rs621515	C	T	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.661;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=431;ReadPosRankSum=0.036;SC=TGTGTGTGTTCTGTGTGTTCT;SOR=3.014;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=18;WE=220502145;WS=220502127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,22:0.81:27
chr2	220502367	rs635311	A	C	5286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=429;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=111;NR=117;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.046;SC=GGGTCCCTGGATGCTGGTCTG;SOR=0.686;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=396;TCF=196;TCR=200;TR=228;WE=220502375;WS=220502357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:186,243:0.57:429
chr2	220505265	rs684428	T	C	11082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=408;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=200;NR=185;PP=2965;SC=GTCCCAGCGTTTGTTGCTCAT;SOR=0.774;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=385;TCF=200;TCR=185;TR=385;WE=220505273;WS=220505255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,408:1.00:408
chr2	220586231	rs9288551	C	G	63.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5081;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=67;ReadPosRankSum=-0.319;SC=AGGCTATGCGCTTTATCTGCA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=3;WE=220586239;WS=220586221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr2	220586367	rs368069746	AAG	A	356.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.989;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=312;ReadPosRankSum=-0.941;SC=CATCTAGAAAAAGAGAGAGAG;SOR=0.696;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=12;WE=220586378;WS=220586357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,22:0.23:94
chr2	220586444	rs80113724	G	A	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=16;PP=312;ReadPosRankSum=-0.145;SC=GTGGATCTTGGTAAAAGAAAT;SOR=0.797;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=44;TCF=16;TCR=28;TR=24;WE=220586452;WS=220586434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,26:0.54:48
chr2	220771223	rs4674470	C	T	6004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=118;PP=2965;SC=AAGATGCCCCCAGGTGACATC;SOR=0.980;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=210;TCF=92;TCR=118;TR=210;WE=220771231;WS=220771213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr2	220771290	rs4674471	G	A	2472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=56;PP=1702;SC=TGTGCATTTTGCCAGGGAAAC;SOR=2.066;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=22;TCR=56;TR=78;WE=220771298;WS=220771280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr2	220771310	rs4674472	A	G	1926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=44;PP=1357;SC=CCAGAGTTGCACGATTTCTAT;SOR=2.165;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=16;TCR=44;TR=60;WE=220771318;WS=220771300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr2	220771378	rs4674473	A	G	583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=13;PP=338;SC=GCATATGTGTATGGCATGCCT;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=19;WE=220771386;WS=220771368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	222290829	rs35860178	C	T	2678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.006;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=57;PP=1578;ReadPosRankSum=1.539;SC=TATTCTGGTGCGTGATGGCTG;SOR=0.434;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=184;TCF=86;TCR=98;TR=111;WE=222290837;WS=222290819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,125:0.61:206
chr2	222290902	rs2303901	A	G	1468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.785;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=40;PP=968;ReadPosRankSum=-0.598;SC=AAGAAGTCACAGGGACTGACA;SOR=0.588;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=33;TCR=65;TR=60;WE=222290910;WS=222290892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,65:0.60:109
chr2	222301357	rs3213844	T	C	5672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=-0.049;NF=71;NR=121;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.068;SC=AGGAACAATCTCATTAGCATT;SOR=1.422;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=194;TCF=72;TCR=122;TR=192;WE=222301365;WS=222301347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,206:0.99:208
chr2	222320427	rs2288627	G	A	7719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.571;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=114;NR=137;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.108;SC=GTCTTAGGAGGTAGAACTTCT;SOR=0.640;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=252;TCF=115;TCR=137;TR=251;WE=222320435;WS=222320417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,288:1.00:289
chr2	222321225	rs6718949	C	T	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=1;PP=379;SC=AGCAAAATGTCTGCTGAACCA;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=222321233;WS=222321215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	222367139	rs147447817	A	G	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.509;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=374;ReadPosRankSum=0.019;SC=TGTCCTTAGGACTTGTCTATA;SOR=1.759;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=17;WE=222367147;WS=222367129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr2	222367483	rs61623527	G	A	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=330;ReadPosRankSum=-1.563;SC=CTTACTAACTGAAGTTGTTTA;SOR=1.136;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=18;WE=222367491;WS=222367473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
chr2	222435035	rs200647532	TCC	T	238.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=12;HapScore=4;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=279;ReadPosRankSum=2.206;SC=CAAGTTTTTCTCCCCCCCCCC;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=8;WE=222435056;WS=222435025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr2	222435048	rs2710504	A	G	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.065;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=6;HapScore=4;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=253;ReadPosRankSum=2.875;SC=CCCCCCCCCAAAAAAAGAGGG;SOR=2.546;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=7;WE=222435056;WS=222435025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr2	222437136	rs11381414	A	AG	293.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=6;PP=286;SC=AGGGCGGCCGAGCCCCGCCTT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=222437144;WS=222437126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	223065753	.	TAC	T	229.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.328;ClippingRankSum=0.000;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=4.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.17;ReadPosRankSum=-0.832;SOR=0.277;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,18:0.17:106
chr2	223066237	rs13014735	G	A	824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.633;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=23;PP=567;ReadPosRankSum=-0.551;SC=GCTACAGGCTGACAATGTCAT;SOR=0.466;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=41;TCR=54;TR=41;WE=223066245;WS=223066227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,42:0.40:105
chr2	223084833	rs13022712	C	T	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=90;ReadPosRankSum=-1.201;SC=TACAGCAAATCGTCTGTCTAG;SOR=0.512;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=7;WE=223084841;WS=223084823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
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chr2	223436607	rs7185	C	T	1418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.036;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=30;PP=883;ReadPosRankSum=1.969;SC=AAGGGTCCAACATTGATTTCT;SOR=0.767;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=134;TCF=73;TCR=61;TR=66;WE=223436615;WS=223436583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,70:0.47:148
chr2	223484227	rs28572477	A	G	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.260;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.53;ReadPosRankSum=-1.465;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr2	223493435	rs2019357	G	A	953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.194;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=16;PP=533;ReadPosRankSum=-1.294;SC=TGCACATAGTGTAGCGCCTGG;SOR=0.891;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=134;TCF=82;TCR=52;TR=47;WE=223493443;WS=223493425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,53:0.37:145
chr2	223509221	rs17566294	T	G	2890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=354;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.271;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=68;PP=1952;ReadPosRankSum=0.931;SC=GTTAATAAAATTACTGTTTCA;SOR=0.644;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=329;TCF=171;TCR=158;TR=141;WE=223509229;WS=223509211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:209,145:0.41:354
chr2	223520905	rs2166652	G	C	1652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.089;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=39;PP=965;ReadPosRankSum=0.187;SC=CATTCTGCTGGCAACAGTTCC;SOR=0.800;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=195;TCF=90;TCR=105;TR=73;WE=223520913;WS=223520895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,84:0.39:215
chr2	223520978	rs2044537	A	G	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.454;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=219;ReadPosRankSum=-0.105;SC=ATGTATCTTTATGAGACTAAT;SOR=0.336;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=58;TCF=11;TCR=47;TR=18;WE=223520986;WS=223520968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,18:0.29:62
chr2	223536428	rs41272717	G	A	458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.654;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=8;PP=280;ReadPosRankSum=-0.922;SC=GGATCCGGCCGGGCACTTCCC;SOR=0.336;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=45;TCF=31;TCR=14;TR=22;WE=223536436;WS=223536418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,23:0.48:48
chr2	223553284	rs10498142	A	G	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=298;ReadPosRankSum=-0.296;SC=GATTTAGGAGAAGAGTGGAAA;SOR=0.382;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=16;WE=223553292;WS=223553274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr2	223554275	rs2044538	T	C	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=195;ReadPosRankSum=-0.667;SC=TGTGTGTTTATGGTCTCTTAG;SOR=0.946;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=15;WE=223554283;WS=223554265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr2	223559089	rs1868024	T	C	5043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=105;NR=57;PP=2850;ReadPosRankSum=-0.652;SC=AGGGCTGGTTTCAGTTTCCAA;SOR=0.422;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=163;TCF=106;TCR=57;TR=162;WE=223559097;WS=223559079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,189:0.99:190
chr2	223780921	rs12623448	G	A	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.5;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=57;ReadPosRankSum=1.915;SC=TTATTAAAAAGATAATTCTAT;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=4;WE=223780929;WS=223780911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr2	223781018	rs35780866	T	A	1122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=2.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.37;ReadPosRankSum=-0.551;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,50:0.60:84
chr2	223785504	rs6739824	T	C	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=166;ReadPosRankSum=-1.887;SC=GCCACTTGACTATTGTTTCTT;SOR=0.616;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=10;WE=223785512;WS=223785494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr2	223785846	rs6728234	G	A	1118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=29;PP=817;ReadPosRankSum=0.580;SC=GACTTGATCTGTTTTGTTGAT;SOR=0.620;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=67;TCF=19;TCR=48;TR=41;WE=223785854;WS=223785836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,45:0.58:77
chr2	223787559	rs11891410	G	A	1798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.721;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=44;PP=1045;ReadPosRankSum=0.265;SC=GGTAAGTTCAGTGTCTGTGAC;SOR=0.796;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=112;TCF=45;TCR=67;TR=73;WE=223787567;WS=223787549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,81:0.66:123
chr2	223787691	rs10932978	G	A	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-3.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=208;ReadPosRankSum=0.115;SC=TTCTTAGACTGTAAGTACATT;SOR=0.527;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=11;WE=223787699;WS=223787681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr2	223798141	rs6726737	A	C	602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=19;PP=386;ReadPosRankSum=-1.193;SC=TTCTCATTGCAGCCATTAGCT;SOR=0.481;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=25;WE=223798149;WS=223798131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,27:0.77:35
chr2	223799207	rs935030	C	T	1040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=2;PP=752;SC=CAACACAGTTCACCATTTTGT;SOR=4.112;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=30;WE=223799215;WS=223799197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr2	223917629	rs3795886	C	T	5864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=116;NR=71;PP=2965;SC=GTGCGGCCGGCGGCGGCAGCG;SOR=1.158;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=187;TCF=116;TCR=71;TR=187;WE=223917637;WS=223917619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr2	223917812	rs10201907	T	C	3467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=59;PP=2102;SC=AGCCGCTGCCTGTGGTGTCGG;SOR=0.916;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=113;TCF=54;TCR=59;TR=113;WE=223917820;WS=223917802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr2	223917983	rs12621643	T	G	9206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=166;NR=133;PP=2965;SC=GGGCAGACGATGAGCTGGAGG;SOR=0.887;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=299;TCF=166;TCR=133;TR=299;WE=223917991;WS=223917973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,336:1.00:336
chr2	223918080	rs10189762	C	G	11760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=446;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=205;NR=203;PP=2965;SC=GGACCCCTGCCGGTGGCTCCA;SOR=0.767;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=409;TCF=205;TCR=204;TR=408;WE=223918088;WS=223918070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,446:1.00:446
chr2	224462056	rs2230168	G	T	663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.804;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=350;ReadPosRankSum=-1.299;SC=ATATTACAGTGTTAACAGGAT;SOR=0.298;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=59;TCF=44;TCR=15;TR=26;WE=224462064;WS=224462046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,32:0.48:67
chr2	224462714	rs721233	G	A	2062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.875;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=54;PP=1203;ReadPosRankSum=-0.786;SC=CACTGAGCCCGTCTGGTAGGG;SOR=0.763;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=294;TCF=150;TCR=144;TR=105;WE=224462722;WS=224462704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:212,116:0.35:328
chr2	224629876	rs10644138	C	CCATCAT	3984.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=16;PP=1888;SC=ATTATTAACACCATCATCATC;SOR=2.542;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=57;TCF=34;TCR=23;TR=45;WE=224629884;WS=224629866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr2	224702305	rs3738961	G	C	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.365;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=7;PP=133;ReadPosRankSum=0.894;SC=ACAATGCCCTGGCACTGAAAG;SOR=0.368;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=32;TCF=15;TCR=17;TR=15;WE=224702313;WS=224702295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr2	224743373	rs571111	C	T	1931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.637;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=36;PP=1193;ReadPosRankSum=0.896;SC=GTGTGGACGCCGCCCAGCTCT;SOR=0.582;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=231;TCF=147;TCR=84;TR=93;WE=224743381;WS=224743363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,99:0.41:242
chr2	224743591	rs602675	C	T	2135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=55;PP=1570;SC=CATAACACCTCCTTAAGATTT;SOR=3.290;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=11;TCR=55;TR=66;WE=224743599;WS=224743581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr2	224743652	rs547234	A	G	509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=15;PP=394;SC=TGTAATCCCAACACTTTGGGA;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=224743660;WS=224743642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	224744701	rs516849	A	G	1241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=9;PP=739;SC=GAGGCAAGCAATTTGTTACTC;SOR=1.828;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=38;WE=224744709;WS=224744691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr2	224758906	rs625150	C	T	3625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=31;PP=2310;SC=AGCCAGGTTCCTGGGGGTCTC;SOR=1.870;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=117;TCF=86;TCR=31;TR=117;WE=224758914;WS=224758896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr2	224760359	rs150347314	TGA	T	102.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.18;MQRankSum=2.459;QD=0.69;ReadPosRankSum=-1.353;SOR=0.638;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:127,21:0.14:148
chr2	224760494	rs597349	G	A	1227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=27;PP=799;SC=GGTGTACAACGGGTCATTCAA;SOR=1.414;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=16;TCR=27;TR=43;WE=224760502;WS=224760484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr2	224763816	rs530065	C	T	4057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=94;PP=2625;SC=GGATGTAGAACAGAAATCACC;SOR=1.917;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=137;TCF=43;TCR=94;TR=137;WE=224763824;WS=224763806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr2	224765894	rs604990	G	A	2957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=24;PP=1761;SC=TGGCTCTGAAGGATACTGCAG;SOR=1.747;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=92;TCF=67;TCR=25;TR=91;WE=224765902;WS=224765884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr2	224770780	rs622896	C	T	758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=21;PP=599;SC=ACAACAGAAACTTGACTTTCA;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=224770788;WS=224770770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	224777094	rs541712	T	C	9977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=130;PP=2965;SC=CACTTTAAGTTGTTCTTCAAA;SOR=1.402;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=198;TCF=68;TCR=130;TR=198;WE=224777113;WS=224777084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr2	224777105	rs113054269	G	GTGAT	9179.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=95;PP=2957;SC=GTTCTTCAAAGTGATTAAGAA;SOR=1.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=124;TCF=4;TCR=120;TR=98;WE=224777113;WS=224777084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr2	224822043	rs3738960	C	G	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=197;ReadPosRankSum=-0.147;SC=GTCTCCGCCCCTGCCCTCTCT;SOR=0.874;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=13;WE=224822051;WS=224822033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr2	224842150	rs7597833	T	C	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=101;ReadPosRankSum=0.000;SC=TCTGCAACTATTGACATTAGG;SOR=0.836;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=8;WE=224842158;WS=224842140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr2	224842349	rs372168691	G	C	2404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.347;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=61;PP=1211;ReadPosRankSum=-1.278;SC=TTGCAGCTACGGGAAGAAAAG;SOR=0.736;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=289;TCF=145;TCR=144;TR=120;WE=224842357;WS=224842339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:188,130:0.41:318
chr2	224844919	rs729631	C	G	613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=1;PP=498;SC=CCCACACACACTGCCTGGCTG;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=224844927;WS=224844909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	224856650	rs6712954	G	A	4877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=378;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.378;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=114;NR=97;PP=2945;ReadPosRankSum=0.485;SC=AATACACTGCGTTGACGAGGA;SOR=0.664;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=349;TCF=193;TCR=156;TR=211;WE=224856658;WS=224856640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,224:0.59:378
chr2	224862821	rs3795879	C	T	10390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=384;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=184;NR=152;PP=2965;SC=TGACATACTGCGGCCACTCAC;SOR=0.820;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=336;TCF=184;TCR=152;TR=336;WE=224862829;WS=224862811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,383:1.00:383
chr2	224862842	rs12457	A	G	10481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=401;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=202;NR=149;PP=2965;SC=CCCTGGTTTCATTTTTAACCC;SOR=0.913;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=351;TCF=202;TCR=149;TR=351;WE=224862850;WS=224862832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,400:1.00:400
chr2	224863090	rs10170379	C	T	2424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=61;PP=1779;SC=TACAGCAATACTTCCATAAGA;SOR=3.698;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=8;TCR=61;TR=69;WE=224863098;WS=224863080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr2	225368321	rs3738951	A	G	2510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=28;PP=1581;SC=ACACAATCATAATAAACCTCA;SOR=1.364;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=54;TCR=28;TR=82;WE=225368329;WS=225368311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr2	225434445	rs10498163	A	G	2063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=26;PP=985;SC=GAACTACATCATGAGACAAAT;SOR=0.796;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=39;TCR=26;TR=65;WE=225434453;WS=225434435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr2	225449893	.	GGGCGGC	G	887.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.72;QD=42.27;SOR=1.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
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chr2	225665074	rs1560859	G	A	856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=27;PP=700;SC=TTCAAAGTTTGCTGGCATTTT;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=28;WE=225665082;WS=225665064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	225668717	.	A	ATG	237	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=18;MQ=59.74;NF=8;NR=6;PP=237;QD=17.1428571429;SC=AAATAGAAATATGTGTGTGTG;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=42;TCF=18;TCR=24;TR=14;WE=225668728;WS=225668707;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:28,14:0.33:42
chr2	225688061	rs16866194	T	G	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=5.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.229;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=322;ReadPosRankSum=-0.416;SC=TTAAAAAGTATTTCAAGCAAT;SOR=2.732;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=15;WE=225688069;WS=225688051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr2	225751256	rs71734299	TA	T	48.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.62;ReadPosRankSum=-1.276;SOR=0.297;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,7:0.23:30
chr2	225781670	rs13013616	T	C	630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.889;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=25;PP=464;ReadPosRankSum=-0.477;SC=AGAGAAGATGTGGACATTTAT;SOR=1.609;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=40;TCF=5;TCR=35;TR=27;WE=225781678;WS=225781660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,28:0.65:43
chr2	225796151	rs9808089	C	A	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=325;ReadPosRankSum=-2.113;SC=GCTGCAGAGACTGAGATGTAG;SOR=0.693;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=39;TCF=34;TCR=5;TR=19;WE=225796159;WS=225796141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr2	225848579	rs375205	T	C	4343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=342;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.395;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=90;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.643;SC=GTCCCCTAACTCCCTCTGGAC;SOR=0.726;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=324;TCF=170;TCR=154;TR=187;WE=225848587;WS=225848569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,198:0.58:342
chr2	225875158	rs590233	A	C	633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=7;PP=392;ReadPosRankSum=-1.029;SC=ACCTAGAGGAAAATATAAAAT;SOR=0.752;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=51;TCF=39;TCR=12;TR=28;WE=225875166;WS=225875148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,29:0.55:53
chr2	225907150	rs397052	C	T	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.666;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=14;PP=246;ReadPosRankSum=-2.095;SC=GTCTTCCCCGCGCCAACCTTC;SOR=1.528;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=83;TCF=41;TCR=42;TR=23;WE=225907158;WS=225907140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,27:0.30:91
chr2	226273490	rs2048935	T	C	882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=0;PP=753;SC=TGGCCATAATTATTGGAGTTT;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=226273498;WS=226273480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	226273689	rs2048936	T	C	10931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=415;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=186;NR=196;PP=2965;SC=TGAAGGCCTATGATGGCTTGG;SOR=0.783;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=382;TCF=186;TCR=196;TR=382;WE=226273697;WS=226273679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,414:1.00:414
chr2	226447735	rs3828256	C	T	3307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.161;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=73;PP=1764;ReadPosRankSum=-1.027;SC=GCCGGCGCTCCAAAGAGCCTG;SOR=0.837;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=224;TCF=103;TCR=121;TR=132;WE=226447743;WS=226447725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,154:0.60:255
chr2	226447844	rs6436570	G	A	838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=23;PP=671;SC=CACAGAGTACGGGGTCTTGAG;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=226447852;WS=226447834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	226491770	rs3748993	A	C	6804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=135;PP=2965;SC=AACACCAGGGACACCTGTGGT;SOR=1.380;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=221;TCF=86;TCR=135;TR=221;WE=226491778;WS=226491756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr2	226516346	rs11884382	T	C	1613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=35;PP=1054;SC=TAGACAACTTTCGCATTTGCT;SOR=1.692;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=17;TCR=35;TR=52;WE=226516354;WS=226516336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr2	227773354	.	G	GAC	62	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=33;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=62;QD=25.6666666667;SC=TCCCTGTAGGGACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=3;WE=227773362;WS=227773344;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:4,3:0.43:7
chr2	227773466	rs3820928	T	C	800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.872;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=10;PP=546;ReadPosRankSum=-0.943;SC=CAGAGAACTTTCTAATTACTG;SOR=0.543;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=58;TCR=22;TR=36;WE=227773474;WS=227773456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,38:0.44:87
chr2	227779191	rs3820927	C	A	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.063;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=307;ReadPosRankSum=1.211;SC=TAGATGAAAACTGTGTGCAGA;SOR=0.853;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=63;TCF=19;TCR=44;TR=25;WE=227779199;WS=227779181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,25:0.37:68
chr2	227807202	rs6436641	G	T	679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.850;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=11;PP=388;ReadPosRankSum=-0.083;SC=TGATCCACCCGCCTTGGCCTC;SOR=0.551;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=55;TCR=28;TR=32;WE=227807210;WS=227807192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,36:0.40:91
chr2	227872182	rs2228557	G	A	796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.648;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=22;PP=480;ReadPosRankSum=0.349;SC=ACTTATTTGCGAAAAAGTGGC;SOR=1.134;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=105;TCF=49;TCR=56;TR=36;WE=227872190;WS=227872172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,42:0.33:126
chr2	227872995	rs2228555	T	C	2175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.981;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=54;PP=1434;ReadPosRankSum=1.498;SC=GCGTGCTAAATACGGGAAGGC;SOR=0.783;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=232;TCF=104;TCR=128;TR=95;WE=227873003;WS=227872985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,105:0.41:258
chr2	227873028	rs13419076	A	G	1395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.223;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=39;PP=853;ReadPosRankSum=0.412;SC=GACCTTGGGAAGGGAAGAAGA;SOR=0.796;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=155;TCF=64;TCR=91;TR=64;WE=227873036;WS=227873018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,70:0.40:176
chr2	227874957	rs4423583	C	T	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=313;ReadPosRankSum=-2.057;SC=ATTTAAGGTGCTGATGAATCA;SOR=0.665;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=61;TCR=22;TR=26;WE=227874965;WS=227874947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,28:0.30:94
chr2	227877037	rs10188770	G	A	931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=2.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.96;ReadPosRankSum=1.074;SOR=0.492;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,50:0.43:117
chr2	227886773	rs3752895	A	G	1629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.587;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=33;PP=1257;ReadPosRankSum=-1.127;SC=CCTGGTCCTGAGGGGCCTCTC;SOR=0.809;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=235;TCF=144;TCR=91;TR=85;WE=227886781;WS=227886762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,91:0.35:261
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chr2	227892720	rs2229813	C	T	1165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.575;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=27;PP=714;ReadPosRankSum=-1.980;SC=GGGAATCCCACTGGTCCTTAA;SOR=0.625;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=89;TCR=76;TR=58;WE=227892736;WS=227892710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,63:0.35:179
chr2	227895125	rs1917127	A	G	934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=13;PP=493;ReadPosRankSum=0.979;SC=TAACCAAGTTATTCACATATT;SOR=0.660;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=100;TCF=67;TCR=33;TR=40;WE=227895133;WS=227895115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,45:0.42:108
chr2	227896652	rs13423714	C	G	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.948;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=179;ReadPosRankSum=0.165;SC=TGTCATGATTCTCTCATACCT;SOR=0.180;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=38;TCF=35;TCR=3;TR=13;WE=227896660;WS=227896642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,18:0.38:47
chr2	227896886	rs2229812	C	T	2481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=358;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.915;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=69;PP=1756;ReadPosRankSum=0.727;SC=GGGGACCTTTCTTTCCACGAG;SOR=0.852;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=328;TCF=158;TCR=170;TR=125;WE=227896894;WS=227896876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:227,131:0.37:358
chr2	227896976	rs10203363	C	T	931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.462;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=32;PP=658;ReadPosRankSum=-1.900;SC=GACCAGGTGGCCCCACATCAT;SOR=1.411;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=130;TCF=50;TCR=80;TR=45;WE=227896984;WS=227896966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,48:0.35:139
chr2	227897076	rs10179756	A	G	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.546;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=98;ReadPosRankSum=0.910;SC=ACTTCCCAATAGCGGCAGAGG;SOR=0.364;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=10;WE=227897084;WS=227897066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,12:0.33:36
chr2	227912331	rs2272200	G	A	939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.788;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=24;PP=498;ReadPosRankSum=-1.715;SC=ACAGGTGACAGTAACGTTTAT;SOR=0.605;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=87;TCF=31;TCR=56;TR=38;WE=227912339;WS=227912321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,46:0.47:98
chr2	227914625	rs2272202	T	C	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=155;ReadPosRankSum=0.871;SC=AACTGTAGAATATTTGGATCT;SOR=0.098;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=10;WE=227914633;WS=227914621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr2	227914655	rs2272203	C	G	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.559;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=242;ReadPosRankSum=1.739;SC=GACTGTCTAACAAGAGCCCCT;SOR=0.384;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=15;WE=227914663;WS=227914645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,16:0.42:38
chr2	227914975	rs2251223	T	G	1462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=36;PP=1053;SC=AACGAAAGTTTAAATGCATGC;SOR=4.271;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=4;TCR=36;TR=40;WE=227914983;WS=227914965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr2	227915832	rs1800517	G	A	1869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.497;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=39;PP=1143;ReadPosRankSum=-0.053;SC=GTATCTTCCCGGCTCTCCTCT;SOR=0.631;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=203;TCF=101;TCR=102;TR=83;WE=227915840;WS=227915822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,92:0.41:224
chr2	227915847	rs13027659	C	T	3018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.981;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=66;PP=1943;ReadPosRankSum=-2.135;SC=TCCTCTTCTCCCTTGCATCCC;SOR=0.849;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=207;TCF=105;TCR=102;TR=125;WE=227915855;WS=227915837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,135:0.59:228
chr2	227916039	rs2894626	T	C	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.468;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=191;ReadPosRankSum=0.966;SC=AGTGACCTCATTGATGAAAGA;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=9;WE=227916047;WS=227916029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr2	227917240	rs3769644	C	G	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=283;ReadPosRankSum=-0.426;SC=CTACGAAGCTCTATTTATGTA;SOR=0.735;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=18;WE=227917248;WS=227917230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr2	227917270	rs3769643	T	C	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=76;ReadPosRankSum=0.623;SC=ATGTCACCATTGTTGGCTGAT;SOR=0.340;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=7;WE=227917278;WS=227917260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr2	227922104	rs7567789	T	C	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.24;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	227922109	rs7567796	T	A	806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.34;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	227922454	rs2141829	G	A	1541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=42;PP=1123;SC=AAGTCTTTGAGTGGATTTTCT;SOR=4.133;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=5;TCR=42;TR=47;WE=227922462;WS=227922444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr2	227922470	rs2141828	T	C	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=216;ReadPosRankSum=-1.392;SC=TTTCTTATCATAGATGTAATG;SOR=0.399;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=12;WE=227922478;WS=227922460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr2	227925097	rs6436650	C	T	903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=24;PP=651;SC=TTGCCTATCCCGATTTACAAA;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=227925105;WS=227925087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	227927189	rs35717623	GT	G	451.90	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=3.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.30;MQRankSum=0.639;QD=13.29;ReadPosRankSum=0.000;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,28:0.82:34
chr2	227942519	rs7597336	A	G	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.54;ReadPosRankSum=0.566;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr2	227942764	rs145806603	A	G	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=10;PP=269;ReadPosRankSum=1.202;SC=GAAATCCTTTACCACCTGGGG;SOR=0.660;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=46;TCR=27;TR=27;WE=227942772;WS=227942754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,36:0.39:93
chr2	227947053	rs10187611	C	G	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=206;ReadPosRankSum=-0.076;SC=TCCCTGCCTTCCAAGGTAGTC;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=11;WE=227947061;WS=227947043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr2	227954599	rs2229814	G	A	1247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.202;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=35;PP=895;ReadPosRankSum=-1.035;SC=TCTCCTTTTGGGCCTCTTCCT;SOR=0.799;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=167;TCF=83;TCR=84;TR=66;WE=227954607;WS=227954589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,68:0.38:179
chr2	228102723	rs13424243	G	C	3957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.962;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=97;PP=2138;ReadPosRankSum=0.192;SC=CTTCTGTGACGGGGCCAAAGG;SOR=0.612;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=266;TCF=120;TCR=146;TR=176;WE=228102731;WS=228102713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,189:0.66:286
chr2	228102752	rs1882435	C	A	1157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.628;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=34;PP=671;ReadPosRankSum=0.300;SC=TAAAAACAAACCCTAATACTG;SOR=0.470;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=183;TCF=68;TCR=115;TR=60;WE=228102760;WS=228102742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,65:0.33:197
chr2	228102892	.	TA	T	29	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;FR=0.9999;HP=13;HapScore=2;MGOF=21;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=29;QD=11.3333333333;SC=AACATTAACCTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=228102900;WS=228102882;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,3:0.50:6
chr2	228104760	rs7579991	C	T	4374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=95;NR=55;PP=2551;SC=CAAAGAGTCACCATGAAGTCA;SOR=1.207;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=95;TCR=55;TR=150;WE=228104768;WS=228104750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr2	228109626	rs113428834	T	TG	2893.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=1.244;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.52;MQRankSum=0.456;QD=20.97;ReadPosRankSum=-0.612;SOR=0.435;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:12,126:0.91:138
chr2	228109784	rs6750210	C	T	1676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=43;PP=1220;SC=TTAAAACAGTCGTGCAAGAAA;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=14;TCR=43;TR=57;WE=228109792;WS=228109774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr2	228111435	rs10178458	T	C	7052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=141;NR=98;PP=2965;SC=CCAGGGACACTGGGCTACCCA;SOR=0.975;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=241;TCF=143;TCR=98;TR=239;WE=228111443;WS=228111425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,263:1.00:263
chr2	228111600	rs10168566	G	T	4283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.71;SOR=2.030;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr2	228111604	rs10168567	G	T	4283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.06;SOR=1.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr2	228111651	rs10192026	A	G	1118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=29;PP=822;SC=GCTTTGTTTTACTTTTGAGAC;SOR=5.670;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=30;WE=228111659;WS=228111641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr2	228112186	rs4321358	A	G	5121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=73;PP=2965;SC=GGGAGAGGATACACAATAGCA;SOR=0.927;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=177;TCF=104;TCR=73;TR=177;WE=228112194;WS=228112176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr2	228113175	rs6436669	A	G	5340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=87;PP=2965;SC=CCTGCTAAAGAAGAAGATATA;SOR=0.778;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=177;TCF=90;TCR=87;TR=177;WE=228113183;WS=228113165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr2	228118403	rs12621551	T	G	2016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.637;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=56;PP=1359;ReadPosRankSum=-2.688;SC=GTGTCTAGGATGAAGTCCTTG;SOR=1.022;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=120;TCF=36;TCR=84;TR=78;WE=228118411;WS=228118393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,84:0.65:129
chr2	228118696	rs180781098	T	G	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.675;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=182;ReadPosRankSum=-1.668;SC=GTGTATTGGGTTGTGTTAACA;SOR=0.327;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=13;WE=228118704;WS=228118686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,17:0.46:37
chr2	228118949	rs7559693	C	G	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.946;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=27;PP=473;ReadPosRankSum=-0.712;SC=TTAGTATTTACTTTGATGTGT;SOR=1.121;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=102;TCF=32;TCR=70;TR=38;WE=228118957;WS=228118939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,37:0.39:94
chr2	228121147	rs10933172	T	G	1773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=41;PP=1087;ReadPosRankSum=1.535;SC=TTTAATAGGTTGGGTTTTGCC;SOR=0.698;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=206;TCF=103;TCR=103;TR=81;WE=228121155;WS=228121137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,89:0.41:219
chr2	228124702	rs4332918	A	G	1126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.506;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=20;PP=765;ReadPosRankSum=-0.973;SC=GAAAGGGAACAGAGATCTCTT;SOR=0.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=99;TCF=57;TCR=42;TR=49;WE=228124710;WS=228124692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,53:0.50:107
chr2	228128540	rs10205042	C	T	8319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=153;NR=125;PP=2965;SC=ATGGCCAGGCCTGAAAGGAAG;SOR=0.898;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=278;TCF=153;TCR=125;TR=278;WE=228128548;WS=228128530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,309:1.00:309
chr2	228131912	rs10933174	C	A	1237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.121;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=38;PP=841;ReadPosRankSum=-0.216;SC=TTTAGATGAACTTGGAGGGAG;SOR=1.915;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=87;TCF=24;TCR=63;TR=48;WE=228131920;WS=228131902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,52:0.57:92
chr2	228135426	rs73993878	G	A	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.914;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=112;ReadPosRankSum=-0.178;SC=CTGTTTTTAAGATTGACAGAA;SOR=0.050;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=9;WE=228135434;WS=228135416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
chr2	228135631	rs28381984	C	T	3064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.604;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=72;PP=2075;ReadPosRankSum=0.114;SC=CCTGGAACTCCGGGAGTGAAA;SOR=0.839;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=221;TCF=107;TCR=114;TR=133;WE=228135639;WS=228135621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,139:0.59:236
chr2	228144706	rs6729152	G	T	2278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=37;NR=36;PP=1280;SC=ATGTAGAAATGATCAATATAT;SOR=0.979;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=73;TCF=37;TCR=36;TR=73;WE=228144714;WS=228144696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr2	228145543	rs6436671	C	T	5038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=60;PP=2738;SC=AGAAGAATGACTGGTACAGCA;SOR=1.026;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=160;TCF=100;TCR=60;TR=160;WE=228145551;WS=228145533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr2	228146991	rs111486503	AATAT	A,AAT	509.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.63;QD=31.86;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,7,9:0.44,0.56:16
chr2	228149107	rs6436672	A	G	1689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=30;PP=938;SC=GCTGATTCTCAGGCTAATAAA;SOR=1.000;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=27;TCR=31;TR=57;WE=228149115;WS=228149097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr2	228154095	rs7593281	C	T	664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=21;PP=569;SC=CAGAAATTTGCTACTAAATTA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=228154103;WS=228154085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	228158418	rs7569636	T	C	2844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=30;PP=1500;SC=GGCTGAGAAGTGATTAGGTGG;SOR=1.336;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=61;TCR=30;TR=91;WE=228158426;WS=228158408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr2	228158648	rs7608999	G	C	547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=16;PP=450;SC=TTAATTACCTGTTTACCAGCC;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=228158656;WS=228158638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	228159063	rs6436675	T	C	433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=0;PP=306;SC=CTGGACAAAATCATGGGGTGA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=228159071;WS=228159053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
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chr2	228174175	rs34134749	TACAA	T	211.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=230;ReadPosRankSum=-1.465;SC=CTTGAAAATCTACAAACAGAC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=6;WE=228174186;WS=228174165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr2	228194480	rs3211097	AG	TT	5139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=54;PP=2944;ReadPosRankSum=0.974;SC=AGGAACAAGCAGTGACACATC;SOR=0.656;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=170;TCF=87;TCR=83;TR=114;WE=228194489;WS=228194470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,128:0.70:184
chr2	228194570	rs6706656	G	A	2836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=63;PP=1780;SC=GCTTACTGCCGTAGGCTAACC;SOR=1.679;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=37;TCR=64;TR=100;WE=228194578;WS=228194560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr2	228194639	rs11393500	T	TAA	37.52	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=4;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=0;NR=5;PP=109;SC=TCTACTGCATTAAAAAAAAAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=5;WE=228194661;WS=228194629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr2	228197368	rs4500938	A	G	4078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=85;PP=2628;SC=AGAGAAGAGCAAAGAGGCTTT;SOR=1.593;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=41;TCR=85;TR=126;WE=228197376;WS=228197358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr2	228204929	rs4420693	C	T	3750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=84;NR=45;PP=2387;SC=AGCCTTGTATCGAGGTTCTTT;SOR=1.318;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=129;TCF=84;TCR=45;TR=129;WE=228204937;WS=228204919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr2	228204982	rs4442987	C	T	5476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=80;PP=2965;SC=ATTTCTATTTCCTTCCCTCTC;SOR=0.818;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=180;TCF=100;TCR=80;TR=180;WE=228204990;WS=228204972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr2	228207625	rs6738078	G	A	925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.978;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=31;PP=687;ReadPosRankSum=1.160;SC=GGTAATTGACGTATGCTATCC;SOR=0.503;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=79;TCF=20;TCR=59;TR=42;WE=228207633;WS=228207615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,42:0.51:83
chr2	228220288	rs56310237	A	G	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.263;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=177;ReadPosRankSum=-1.408;SC=TTAAGTACCAATTTTCTGAAT;SOR=1.013;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=39;TCF=26;TCR=13;TR=15;WE=228220296;WS=228220278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,17:0.39:44
chr2	228221725	rs74713223	A	G	716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=21;PP=441;ReadPosRankSum=-0.371;SC=ATAGACGTCTACAACTTCTGG;SOR=0.655;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=31;TCR=57;TR=33;WE=228221733;WS=228221715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,36:0.38:94
chr2	228230945	rs76547437	G	A	2393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.895;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=63;PP=1416;ReadPosRankSum=0.345;SC=ACACTGAAAAGTGATGAAAGA;SOR=0.821;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=304;TCF=134;TCR=170;TR=110;WE=228230953;WS=228230935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:206,124:0.38:330
chr2	228337321	rs144327481	C	T	1656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.968;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=54;PP=1123;ReadPosRankSum=1.239;SC=GCGGGGCGGCCGGGCGGGTGT;SOR=0.971;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=225;TCF=86;TCR=139;TR=82;WE=228337329;WS=228337311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,85:0.37:232
chr2	228399480	rs7588620	T	C	1731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=20;PP=1032;SC=TAAGTTTACCTGTGTTTCATG;SOR=1.402;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=40;TCR=20;TR=60;WE=228399488;WS=228399470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr2	228416498	rs7598597	C	T	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=242;ReadPosRankSum=-0.669;SC=CTACAAGTTACGTTAAACTGT;SOR=2.985;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=12;WE=228416506;WS=228416496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr2	228416712	rs13426457	A	G	13186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=506;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=260;NR=205;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.370;SC=GCATGCCCACAGGATTCGGCA;SOR=0.331;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=466;TCF=261;TCR=205;TR=465;WE=228416720;WS=228416696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,505:1.00:506
chr2	228476253	rs2138402	C	G	5473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=97;PP=2965;SC=GCTGAAGCCTCTGCAGTTGGA;SOR=0.859;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=183;TCF=86;TCR=97;TR=183;WE=228476261;WS=228476243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr2	228477814	rs7586824	G	C	1767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.610;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=43;PP=2360;ReadPosRankSum=1.535;SC=CTGAGAGTAAGTAAGGGCCTT;SOR=1.127;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=110;TCF=41;TCR=69;TR=65;WE=228477827;WS=228477804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,74:0.61:122
chr2	228477819	rs11683530	G	A	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.839;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=24;PP=1400;ReadPosRankSum=-0.330;SC=AGTAAGTAAGGGCCTTTGGGT;SOR=0.387;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=102;TCF=38;TCR=64;TR=41;WE=228477827;WS=228477804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,43:0.39:111
chr2	228560800	rs11334205	GA	G	8390.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=165;PP=2983;SC=CACAGCCCCTGAAAAAAAACA;SOR=0.990;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=206;TCF=26;TCR=180;TR=187;WE=228560808;WS=228560790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,304:1.00:304
chr2	228560834	rs79287293	C	CT	3907.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.066;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.207;NF=17;NR=133;PP=2933;ReadPosRankSum=-2.041;SC=AACATAATGACTTTGCATGCA;SOR=0.800;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=163;TCF=18;TCR=145;TR=150;WE=228560842;WS=228560824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,139:0.60:233
chr2	228565656	rs11694828	G	A	942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=13;PP=504;ReadPosRankSum=1.444;SC=TGAGGTTGCTGGAGAAAGCAG;SOR=0.756;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=100;TCF=67;TCR=33;TR=41;WE=228565664;WS=228565646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,48:0.43:111
chr2	228567098	rs6713116	C	T	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.619;HP=2;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=21;PP=419;ReadPosRankSum=1.745;SC=ATCCTTGATGCGATGAAAACC;SOR=0.446;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=44;TCF=9;TCR=35;TR=27;WE=228567119;WS=228567088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,22:0.63:35
chr2	228567111	.	AT	A	69	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;FR=0.5000;HP=16;HapScore=4;MGOF=7;MMLQ=15;MQ=59.3;NF=0;NR=5;PP=69;QD=14.4;SC=TGAAAACCTGATTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=5;WE=228567119;WS=228567088;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:12,5:0.29:17
chr2	228680153	rs34834265	CT	C	186.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=1.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.05;ReadPosRankSum=0.736;SOR=1.414;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
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chr2	228741250	rs7571353	T	A	770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.157;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=20;PP=434;ReadPosRankSum=1.022;SC=TAGGAAAAATTATTCCACTGA;SOR=1.329;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=48;TCF=15;TCR=33;TR=27;WE=228741258;WS=228741240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,32:0.59:54
chr2	228750239	rs4973445	G	T	2238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.319;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=59;PP=1448;ReadPosRankSum=0.254;SC=AATACATTATGTTTTAAAAAT;SOR=0.848;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=146;TCF=52;TCR=94;TR=89;WE=228750247;WS=228750229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,98:0.60:163
chr2	228758456	rs35758334	C	A	2906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=37;PP=1585;ReadPosRankSum=-0.880;SC=AACATGAAGTCTTTATTAACA;SOR=0.698;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=199;TCF=132;TCR=67;TR=115;WE=228758464;WS=228758446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,133:0.59:226
chr2	228767618	rs2949014	T	C	1275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=1;PP=1391;SC=AAGAATTAGATGGAATCTGGT;SOR=5.186;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=37;WE=228767639;WS=228767608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr2	228767631	rs2946931	G	T	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-3.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.114;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=1;PP=394;ReadPosRankSum=0.445;SC=AATCTGGTAAGGTAATTGCAT;SOR=1.483;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=47;TCF=44;TCR=3;TR=22;WE=228767639;WS=228767608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,24:0.46:52
chr2	228776996	rs3748862	T	C	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.726;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=4;PP=457;ReadPosRankSum=-0.479;SC=TCGCCCAGGCTGGAGTGCAGT;SOR=0.221;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=68;TCF=61;TCR=7;TR=28;WE=228777004;WS=228776986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,26:0.40:65
chr2	228783479	rs1533960	C	A	2472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=410;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.199;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=50;PP=1532;ReadPosRankSum=-1.180;SC=ATATATATCCCCACCCCTCTC;SOR=0.846;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=365;TCF=218;TCR=147;TR=126;WE=228783487;WS=228783469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:274,134:0.33:408
chr2	228855958	rs16824284	T	C	4842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=358;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.395;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=105;NR=106;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.757;SC=GCCCAGGCAATTGTGTGTCAA;SOR=0.735;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=340;TCF=168;TCR=172;TR=211;WE=228855966;WS=228855948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,224:0.63:358
chr2	228882970	rs3828161	T	C	2531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.240;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=63;PP=1447;ReadPosRankSum=-0.388;SC=ACTTCTGGACTGGCTGACCGT;SOR=0.956;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=182;TCF=84;TCR=98;TR=109;WE=228882978;WS=228882960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,119:0.58:204
chr2	228883721	rs3811514	T	C	2337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.424;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=48;PP=1284;ReadPosRankSum=-1.114;SC=AGCAATCCCTTGGCAATGGCT;SOR=0.612;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=182;TCF=92;TCR=90;TR=100;WE=228883729;WS=228883711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,110:0.55:200
chr2	228973383	rs67714256	A	C	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=391;ReadPosRankSum=-0.166;SC=ATTAGCTCTGAATGCTATTTT;SOR=0.749;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=18;WE=228973391;WS=228973373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr2	228973660	rs7561798	A	G	1452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.737;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=36;PP=838;ReadPosRankSum=-0.030;SC=AAGAACCTGGAGGAACCCAGA;SOR=0.580;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=105;TCF=41;TCR=64;TR=61;WE=228973668;WS=228973650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,66:0.59:111
chr2	228992763	rs6719186	G	A	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.094;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=125;ReadPosRankSum=0.484;SC=TGATCAAGGTGGTGGACGCTG;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=7;WE=228992771;WS=228992753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr2	228992850	rs6734166	T	C	1007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.797;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=17;PP=572;ReadPosRankSum=-0.077;SC=TCTATTTTCATGAAAGATTTC;SOR=0.855;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=82;TCF=49;TCR=33;TR=47;WE=228992858;WS=228992840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,48:0.53:90
chr2	228996637	rs4479423	G	A	1137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=17;PP=1755;ReadPosRankSum=0.430;SC=TTAAAATTTCGAATTAAATGA;SOR=0.700;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=105;TCF=69;TCR=36;TR=51;WE=228996658;WS=228996625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,56:0.48:117
chr2	228996650	rs4353646	A	G	1495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=19;PP=1755;ReadPosRankSum=0.180;SC=TTAAATGAATATTCAAGTTCA;SOR=0.752;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=125;TCF=83;TCR=42;TR=62;WE=228996658;WS=228996625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,71:0.50:142
chr2	228996672	rs4585022	G	A	1965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.729;HP=5;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=26;PP=1084;ReadPosRankSum=-1.651;SC=CTGACAAGAAGAAAGTGGCGT;SOR=1.000;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=145;TCF=93;TCR=52;TR=80;WE=228996680;WS=228996662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,90:0.56:162
chr2	229034865	rs75675564	G	A	1084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.167;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=17;PP=670;ReadPosRankSum=1.360;SC=TGACTTAATTGCTGCAATCTC;SOR=1.168;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=51;TCR=30;TR=46;WE=229034873;WS=229034855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,50:0.57:87
chr2	229035351	rs12618108	T	G	1484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.62;ReadPosRankSum=-0.020;SOR=0.735;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,39:0.54:72
chr2	229035356	rs13408688	T	G	1463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.62;ReadPosRankSum=0.758;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,38:0.54:71
chr2	229035427	rs11685283	T	C	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.268;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=86;ReadPosRankSum=1.732;SC=TGCTATAAAGTACACATAACT;SOR=0.169;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=5;WE=229035435;WS=229035417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
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chr2	230096893	rs55691132	A	T	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=305;ReadPosRankSum=-0.289;SC=TAATCCCAGCACTCTGGGAGG;SOR=1.101;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=17;WE=230096901;WS=230096883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,21:0.75:28
chr2	230135527	rs1227013	C	T	807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=1;PP=621;SC=AACGCCTGAACCCGTGCGTTT;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=230135535;WS=230135517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	230135711	rs67686611	G	GC	4854.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=10;NR=53;PP=2897;SC=CTGGCCCCCGGCTCCCGGGTG;SOR=0.873;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=67;TCF=10;TCR=57;TR=63;WE=230135719;WS=230135701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr2	230231889	rs2302769	A	T	1112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=24;PP=633;ReadPosRankSum=0.446;SC=TTTGAGAATGAGAAGGCCTTT;SOR=0.712;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=80;TCF=39;TCR=41;TR=44;WE=230231897;WS=230231879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,50:0.53:95
chr2	230271780	rs7562609	A	G	575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=20;NR=0;PP=452;SC=AGGCTCACACAATGGGTTGTT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=230271788;WS=230271770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	230282624	rs6760224	G	A	542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=0;PP=454;SC=GACAGGAAAGGGGGTTGTTTC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=230282632;WS=230282623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	230411518	rs369516727	TAGAC	T	268.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.426;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.935;NF=9;NR=0;PP=354;ReadPosRankSum=-0.369;SC=GATAGATAGATAGACAGACAG;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=9;WE=230411529;WS=230411508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr2	230453214	rs11458391	G	GA	2274.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.812;HP=10;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.925;NF=10;NR=60;PP=898;ReadPosRankSum=0.596;SC=CCTGGGAAGGGAAAAAAAAAA;SOR=1.252;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=90;TCF=13;TCR=77;TR=70;WE=230453222;WS=230453204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,102:0.84:122
chr2	230456232	rs56156768	C	T	2158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.550;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=24;PP=1403;ReadPosRankSum=0.146;SC=ATACTAGAACCGCTGGAGTCA;SOR=0.558;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=128;TCF=94;TCR=34;TR=83;WE=230456240;WS=230456222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,90:0.65:139
chr2	230655733	rs722268	C	T	1877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=7;PP=1339;SC=TATTTCTCAACTATATTCAAA;SOR=3.947;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=50;TCR=7;TR=57;WE=230655741;WS=230655723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr2	230663443	rs6749045	A	C	453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=2;PP=367;SC=AAACTGAGAAACTACCTAATT;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=230663451;WS=230663435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	230663576	rs6720868	C	T	5674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.959;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=121;NR=71;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.928;SC=AAACATAAAACTCCCCCCACT;SOR=0.916;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=193;TCF=121;TCR=72;TR=192;WE=230663584;WS=230663566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,208:1.00:209
chr2	230668858	rs13018957	T	C	8579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=153;NR=155;PP=2965;SC=CACCAAATAATGTCTTAATAA;SOR=0.724;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=308;TCF=153;TCR=155;TR=308;WE=230668866;WS=230668848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,325:1.00:325
chr2	230668968	rs4972915	G	A	3496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=77;PP=2275;SC=AAAAATATATGTGCAATCCTG;SOR=1.470;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=45;TCR=78;TR=122;WE=230668990;WS=230668958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr2	230668982	rs4973229	T	G	2753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=68;PP=1973;SC=AATCCTGAAGTGACAGACTTC;SOR=1.935;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=28;TCR=68;TR=96;WE=230668990;WS=230668958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr2	230675716	.	G	A	4984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.079;ClippingRankSum=0.000;DP=366;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=108;NR=104;PP=2962;ReadPosRankSum=0.839;SC=AACAGCTGTTGAACATTTGTA;SOR=0.694;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=335;TCF=172;TCR=163;TR=212;WE=230675724;WS=230675706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,227:0.62:366
chr2	230705516	rs34481385	TA	T	1782.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.20;MQRankSum=0.512;QD=17.83;ReadPosRankSum=-0.170;SOR=0.806;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:10,90:0.90:100
chr2	230744570	rs479492	C	T	213.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=144;SC=TTTTAAGTACCTGGCTCACAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=230744578;WS=230744560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	230914766	rs6748654	T	C	748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=20;PP=575;SC=ATGCCAAACATTTTTAGCATG;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=230914774;WS=230914756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	230923648	rs9750739	C	G	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=40;ReadPosRankSum=-0.350;SC=CGTGCCTGGCCTAAAATGGTA;SOR=0.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=5;WE=230923656;WS=230923638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr2	231037833	rs10498244	T	C	753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=21;PP=477;SC=TGGGGGAAATTGCAAGACAAA;SOR=2.468;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=25;WE=231037841;WS=231037823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	231042276	rs1135791	A	G	12466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=477;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=236;NR=199;PP=2965;ReadPosRankSum=0.609;SC=TCCTAGGGTCATTCCTTCACA;SOR=0.479;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=436;TCF=236;TCR=200;TR=435;WE=231042284;WS=231042266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,475:1.00:476
chr2	231050715	rs3948464	A	G	3072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=442;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=71;PP=1977;ReadPosRankSum=-0.511;SC=CTTACCTTTCAATCTGGACTT;SOR=0.718;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=395;TCF=204;TCR=191;TR=143;WE=231050723;WS=231050705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:279,163:0.37:442
chr2	231072569	rs41309106	T	C	1325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.913;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=15;PP=948;ReadPosRankSum=0.058;SC=GAGCTTACATTGTGTCACTTC;SOR=1.182;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=108;TCF=75;TCR=33;TR=58;WE=231072577;WS=231072559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,58:0.50:115
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chr2	231077725	rs1129411	A	G	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.694;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=11;PP=272;ReadPosRankSum=-0.095;SC=CTGCTCTGCCATTCATAGGAA;SOR=0.597;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=80;TCF=37;TCR=43;TR=25;WE=231077733;WS=231077715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,26:0.32:80
chr2	231077868	rs7601176	A	G	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.903;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=98;ReadPosRankSum=-0.307;SC=CCCCAGGTGCAGAGAACTGAT;SOR=0.293;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=8;WE=231077876;WS=231077858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr2	231077911	rs7601190	A	C	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.44;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,2:0.50:4
chr2	231081405	rs7580912	T	C	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=104;ReadPosRankSum=0.243;SC=TTCCAAACTCTGGAAGCCCTG;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=6;WE=231081413;WS=231081395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr2	231103185	rs2278197	A	G	1399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=38;PP=1057;SC=TTTGACAAATATTTGACTGAG;SOR=2.448;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=11;TCR=38;TR=49;WE=231103193;WS=231103175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	231106244	rs2288328	G	C	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=335;ReadPosRankSum=-0.498;SC=TTAAAGTTTTGCTTCCTTGCC;SOR=0.620;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=74;TCF=19;TCR=55;TR=22;WE=231106252;WS=231106234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,24:0.31:77
chr2	231110737	rs3813464	C	T	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=171;ReadPosRankSum=0.187;SC=CCCATTCCCCCATCTATTCAT;SOR=1.609;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=10;WE=231110745;WS=231110727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr2	231115603	rs9989792	T	C	3519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=76;PP=1956;ReadPosRankSum=-1.255;SC=GCCTGGGTGATGGACAGCCCC;SOR=0.712;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=281;TCF=151;TCR=130;TR=165;WE=231115611;WS=231115593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,171:0.58:294
chr2	231118041	rs3820975	A	C	1235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.717;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=12;PP=837;ReadPosRankSum=-0.586;SC=TTTCTTGTTTATCTGCAGAGA;SOR=0.260;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=66;TCF=52;TCR=14;TR=45;WE=231118049;WS=231118031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,49:0.66:74
chr2	231118186	rs3769840	G	A	2000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.535;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=50;PP=1195;ReadPosRankSum=2.250;SC=TTTCCAGTTGGCATGGGAAAA;SOR=0.805;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=239;TCF=114;TCR=125;TR=94;WE=231118194;WS=231118168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,103:0.40:255
chr2	231120255	rs55829350	CG	C	381.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=11;PP=245;SC=CAGGTAAGGACGGGGGGGGGG;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=231120265;WS=231120245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	231120257	.	G	C	27	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;FR=0.5000;HP=9;HapScore=4;MGOF=5;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=27;QD=15.4428031368;SC=GGTAAGGACGGGGGGGGGGAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=4;WE=231120265;WS=231120245;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,4:0.33:12
chr2	231149097	rs4972945	T	C	1292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.748;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=30;PP=551;ReadPosRankSum=0.581;SC=AGAATGAGAATGAGAAGGCAG;SOR=0.853;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=91;TCF=42;TCR=49;TR=54;WE=231149128;WS=231149087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,65:0.61:107
chr2	231149108	rs4972946	G	A	3349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=41;PP=1474;SC=GAGAAGGCAGGAAAACAGCCA;SOR=1.127;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=73;TCF=31;TCR=42;TR=72;WE=231149128;WS=231149087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr2	231155413	rs3820976	T	A	1843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.507;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=55;PP=1173;ReadPosRankSum=0.297;SC=GGAAGGGATTTCTAAGATGAC;SOR=0.741;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=213;TCF=79;TCR=134;TR=88;WE=231155421;WS=231155403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,93:0.40:232
chr2	231157271	rs7602027	T	C	1377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.315;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=13;PP=804;ReadPosRankSum=-0.294;SC=CATCACAAATTGGGTGGCTCT;SOR=0.976;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=121;TCF=86;TCR=35;TR=55;WE=231157279;WS=231157261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,63:0.46:138
chr2	231175549	rs200258126	T	C	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.84;MQRankSum=0.674;QD=8.46;ReadPosRankSum=-1.150;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr2	231175763	rs78116662	G	A	2855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=38;PP=1819;SC=AGCCACACATGTTAGAGAAAC;SOR=1.343;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=65;TCR=38;TR=103;WE=231175771;WS=231175753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr2	231176040	rs139570354	G	A	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.96;MQRankSum=-2.235;QD=4.94;ReadPosRankSum=0.347;SOR=0.774;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,13:0.34:38
chr2	231177200	rs3086614	CTT	C	204.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=88;ReadPosRankSum=0.849;SC=ACTTACAGTACTTTTTTTTTT;SOR=0.593;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=7;WE=231177209;WS=231177190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr2	231222499	rs4973317	T	C	4417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.052;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=105;NR=76;PP=2889;ReadPosRankSum=2.313;SC=ACCATTTTCATTTGGTGTCCT;SOR=0.539;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=300;TCF=178;TCR=122;TR=181;WE=231222516;WS=231222489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,199:0.60:333
chr2	231222655	rs10498250	G	T	2203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.800;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=59;PP=1333;ReadPosRankSum=1.456;SC=TCCGCGATCGGGAACTCATCA;SOR=0.557;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=181;TCF=69;TCR=112;TR=97;WE=231222663;WS=231222645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,105:0.52:203
chr2	231222675	rs4973318	T	C	1629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.451;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=48;PP=899;ReadPosRankSum=-0.633;SC=ACAAATAAAATGTTTGAAGTA;SOR=0.433;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=128;TCF=39;TCR=89;TR=73;WE=231222683;WS=231222665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,79:0.57:139
chr2	231223994	rs4972951	A	G	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=89;ReadPosRankSum=-0.210;SC=AGTCTTCTTGAAGCCCATGGT;SOR=0.399;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=6;WE=231224002;WS=231223984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr2	231253434	rs7586155	T	G	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=20;PP=500;ReadPosRankSum=-1.181;SC=ATAAACCTATTTCTTTAATTG;SOR=0.631;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=99;TCF=48;TCR=51;TR=40;WE=231253442;WS=231253424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,40:0.40:101
chr2	231254919	rs17332171	C	T	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.191;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=19;PP=374;ReadPosRankSum=-0.108;SC=ACCCATTAGACGCTGACTCGC;SOR=1.791;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=39;TCF=4;TCR=35;TR=20;WE=231254927;WS=231254909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
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chr2	231258150	rs7590429	C	T	789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=20;PP=493;ReadPosRankSum=-0.553;SC=ACCTAATCCTCCAAGAATATA;SOR=0.749;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=150;TCF=76;TCR=74;TR=45;WE=231258158;WS=231258140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,47:0.30:158
chr2	231258218	rs7563909	A	T	2008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.665;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=46;PP=1207;ReadPosRankSum=-0.178;SC=GTCACACAACAGATTTAACAT;SOR=1.047;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=137;TCF=70;TCR=67;TR=82;WE=231258226;WS=231258208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,90:0.60:151
chr2	231258309	rs72495174	T	A	745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.03;ReadPosRankSum=-0.189;SOR=0.807;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,34:0.55:62
chr2	231258322	rs72996292	A	G	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=2.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=965;ReadPosRankSum=-0.579;SC=TTTAATATACACTTTCAGAGT;SOR=0.538;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=41;TCF=7;TCR=34;TR=21;WE=231258330;WS=231258299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,22:0.52:42
chr2	231261620	rs6732940	G	A	2474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.273;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=68;PP=1635;ReadPosRankSum=-1.218;SC=AGTCTCAGTTGGAGTATGTGG;SOR=0.824;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=172;TCF=47;TCR=125;TR=91;WE=231261628;WS=231261610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,104:0.54:192
chr2	231282534	rs35969967	C	CT	203.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=4;PP=99;SC=GGTGTTTGTCCTTTTTTTCGT;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=231282542;WS=231282524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	231309139	rs55637456	A	T	813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.601;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=28;PP=623;ReadPosRankSum=1.404;SC=TCCTACCATGAGTGACATGTT;SOR=1.236;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=54;TCF=7;TCR=47;TR=31;WE=231309147;WS=231309129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,32:0.54:59
chr2	231328696	rs2306274	C	T	1902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.861;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=18;PP=1266;ReadPosRankSum=1.605;SC=CAAGGTTTTCCAGGTTTTCTT;SOR=0.985;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=101;TCF=73;TCR=28;TR=71;WE=231328704;WS=231328686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,77:0.69:111
chr2	231331694	rs1678159	A	G	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.732;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=187;ReadPosRankSum=0.536;SC=CAGATCATGGAGGTTTGAGGC;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=3;WE=231331709;WS=231331684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr2	231331701	rs3214547	A	AG	117.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=158;ReadPosRankSum=-0.317;SC=TGGAGGTTTGAGGCACGGACA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=4;WE=231331709;WS=231331684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr2	231331799	rs1649869	T	C	851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.310;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=10;PP=488;ReadPosRankSum=0.060;SC=TTATCATACATTGAGAGCTCC;SOR=0.917;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=134;TCF=90;TCR=44;TR=41;WE=231331807;WS=231331789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,47:0.30:155
chr2	231331896	rs1050224	G	A	2653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.289;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=66;PP=1698;ReadPosRankSum=0.046;SC=CAGAAGCCTCGAGCGGGGCAC;SOR=0.604;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=312;TCF=157;TCR=155;TR=134;WE=231331904;WS=231331886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:203,143:0.41:346
chr2	231334421	rs1051581	A	C	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=137;ReadPosRankSum=1.195;SC=TATGACAAGCATATATTGCTT;SOR=1.022;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=9;WE=231334429;WS=231334411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr2	231334504	rs139756804	AAAAG	A	446.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.816;HP=11;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=33;PP=1079;ReadPosRankSum=1.734;SC=TTAAAAAAAAAAAAGAAGAAG;SOR=0.532;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=111;TCF=37;TCR=74;TR=47;WE=231334515;WS=231334485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,30:0.28:108
chr2	231334679	rs1678162	A	G	935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=20;PP=598;ReadPosRankSum=-0.011;SC=TTCCCTGCTGATTCCTAAGAC;SOR=0.642;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=99;TCF=49;TCR=50;TR=41;WE=231334687;WS=231334669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,45:0.42:106
chr2	231337960	rs1615190	C	T	3937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=36;PP=2518;SC=GGGGAGTGGGCAGTCACTAAT;SOR=1.785;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=91;TCR=36;TR=127;WE=231337968;WS=231337950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr2	231338211	rs1678169	T	G	642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.413;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=24;PP=516;ReadPosRankSum=1.608;SC=TCACAGACACTGGGTAGGGAT;SOR=1.054;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=61;TCF=9;TCR=52;TR=27;WE=231338219;WS=231338201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,27:0.42:64
chr2	231359098	rs836230	T	G	1458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.306;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=20;PP=873;ReadPosRankSum=0.979;SC=TTTATAGTTCTAAAGGATTAT;SOR=0.975;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=133;TCF=91;TCR=42;TR=68;WE=231359106;WS=231359088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,72:0.51:141
chr2	231363252	rs34979917	TA	T	305.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=4.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.54;ReadPosRankSum=-0.686;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
chr2	231405572	rs4973329	T	G	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.254;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=13;PP=374;ReadPosRankSum=1.065;SC=CATTGCTCACTTTATGCCCCA;SOR=0.344;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=86;TCF=58;TCR=28;TR=33;WE=231405580;WS=231405562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,35:0.37:94
chr2	231406194	rs866270	G	A	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.817;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=204;ReadPosRankSum=0.348;SC=TGAGTTTTTAGTTCAGGCTAC;SOR=1.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=12;WE=231406202;WS=231406184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,12:0.36:33
chr2	231406680	rs836237	T	C	5437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=110;NR=75;PP=2555;ReadPosRankSum=-0.733;SC=AATGAGCAGATGTACACCCGA;SOR=0.936;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=188;TCF=111;TCR=77;TR=185;WE=231406688;WS=231406670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,209:0.99:211
chr2	231406846	rs10199013	G	A	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.523;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=233;ReadPosRankSum=0.536;SC=TGTTACAATCGCCCTTATCAT;SOR=1.105;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=16;WE=231406854;WS=231406836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,20:0.47:43
chr2	231407519	rs6717269	C	T	2550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=24;PP=1723;SC=CATTGCATAACTGCTATATTG;SOR=1.942;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=62;TCR=24;TR=86;WE=231407527;WS=231407509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
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chr2	231860848	rs6722863	A	G	977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.74;SOR=2.925;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	231861032	rs72362780	TCAGCAGCCTAGCCCTGAATCCACACCA	T	13299.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=95;PP=2969;SC=ATTCCACCTCTCAGCAGCCTA;SOR=1.161;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=181;TCF=49;TCR=132;TR=133;WE=231861066;WS=231861022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,323:1.00:323
chr2	231864289	rs2136474	A	C	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=213;ReadPosRankSum=-0.655;SC=TGTCAAGAAGACGCAGGGCTA;SOR=0.622;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=12;WE=231864297;WS=231864279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr2	231864529	rs6436986	A	G	2146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.901;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=56;PP=1467;ReadPosRankSum=-1.002;SC=TCCTGAGGTGAGCAGTCACCT;SOR=0.759;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=288;TCF=142;TCR=146;TR=107;WE=231864537;WS=231864519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:192,112:0.37:304
chr2	231864600	rs7573039	T	C	1744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.373;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=54;PP=1364;ReadPosRankSum=-0.213;SC=CCAACTTCTGTAATCTACTCC;SOR=0.878;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=221;TCF=88;TCR=133;TR=84;WE=231864608;WS=231864590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,86:0.37:235
chr2	231864646	rs11684067	A	G	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=23;PP=452;ReadPosRankSum=-1.087;SC=GCTGAGCCTCAGTTTCCTTAT;SOR=0.585;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=92;TCF=27;TCR=65;TR=32;WE=231864654;WS=231864636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,31:0.32:97
chr2	231865018	rs13406394	A	G	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=54;ReadPosRankSum=-1.465;SC=TGTGTTCCAGACTCCCCCGCC;SOR=0.495;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=4;WE=231865026;WS=231865008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr2	231865047	rs3817173	T	C	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.114;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=163;ReadPosRankSum=1.817;SC=CCAGGGCAGGTGCCTCCCTCA;SOR=1.329;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=9;WE=231865055;WS=231865037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr2	231865090	rs2271376	T	C	750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.292;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=12;PP=360;ReadPosRankSum=-0.495;SC=GGGCCTCTGATTCGCGCCGGC;SOR=0.257;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=68;TCF=47;TCR=21;TR=31;WE=231865098;WS=231865080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,38:0.49:78
chr2	231865144	rs12105962	G	C	2163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.643;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=31;PP=1398;ReadPosRankSum=1.072;SC=AGCTCCGCTTGCTGGCGTCGT;SOR=0.997;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=146;TCF=91;TCR=55;TR=89;WE=231865152;WS=231865134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,97:0.57:169
chr2	231865269	rs2271375	G	T	1376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.558;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=36;PP=745;ReadPosRankSum=-0.409;SC=AGCGCGAGGGGCTGGAGCCTC;SOR=0.632;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=166;TCF=75;TCR=91;TR=67;WE=231865277;WS=231865259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,75:0.41:181
chr2	231867220	rs10933364	A	G	807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=0;PP=647;SC=GGGGTCTTTCAGTAGGGACTT;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=27;WE=231867228;WS=231867213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	231902316	rs186173488	T	C	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.71;ReadPosRankSum=1.019;SOR=0.542;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr2	231902471	rs190787545	C	G	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=42;ReadPosRankSum=1.850;SC=CCAGGCGCGGCCAAGCCGGGC;SOR=1.236;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=5;WE=231902479;WS=231902461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr2	231947467	rs11694724	A	G	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=181;ReadPosRankSum=-1.452;SC=TTTGATTATCACATCCTTTGA;SOR=0.693;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=13;WE=231947475;WS=231947457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr2	232087474	rs1626450	AT	GA	3036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=16;PP=1196;SC=GTTGAAGTTGATAAAGTTTCT;SOR=1.785;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=61;TCF=45;TCR=16;TR=59;WE=232087483;WS=232087464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr2	232225535	rs35889244	C	CG	4953.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=63;PP=2974;ReadPosRankSum=1.245;SC=CCAGCCCCCACGGGACCCCCC;SOR=0.813;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=19;TCR=71;TR=80;WE=232225543;WS=232225525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,157:0.99:159
chr2	232260537	rs4972989	T	G	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.56;ReadPosRankSum=0.786;SOR=0.883;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr2	232262403	rs201032403	CT	C	4271.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.529;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.982;NF=26;NR=61;PP=2963;ReadPosRankSum=1.503;SC=CTGGGCTCATCTTTTCTCTCT;SOR=0.766;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=137;TCF=45;TCR=92;TR=87;WE=232262426;WS=232262393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,152:0.68:224
chr2	232321956	rs7598759	C	T	2027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.289;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=40;PP=1290;ReadPosRankSum=-1.131;SC=ATACTCATGACGTAAGCTAAA;SOR=0.630;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=140;TCF=69;TCR=71;TR=80;WE=232321964;WS=232321946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,87:0.58:150
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chr2	232326801	rs2595514	A	T	4343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.425;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=105;PP=2719;ReadPosRankSum=-0.445;SC=TCCCAATGAGATGTTAGACTC;SOR=0.646;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=296;TCF=122;TCR=174;TR=183;WE=232326809;WS=232326791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,198:0.62:320
chr2	232378231	rs6750795	T	C	4267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.879;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=78;PP=2609;ReadPosRankSum=-0.026;SC=TCTGTACATATAATTACCTCA;SOR=0.590;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=281;TCF=158;TCR=123;TR=173;WE=232378239;WS=232378221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,201:0.62:326
chr2	232389744	rs3752762	A	G	1456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.671;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=20;PP=791;ReadPosRankSum=0.818;SC=AAGCCACTTTAAGGCTCCACT;SOR=0.767;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=103;TCF=62;TCR=41;TR=54;WE=232389752;WS=232389734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,66:0.55:121
chr2	232390151	rs3752763	A	G	1323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=34;PP=820;ReadPosRankSum=-1.317;SC=AGGGACAGAGAAGGGAGGCCG;SOR=0.627;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=106;TCF=38;TCR=68;TR=55;WE=232390159;WS=232390141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,60:0.53:114
chr2	232395200	.	G	A	593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.432;ClippingRankSum=0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=14;PP=377;ReadPosRankSum=1.550;SC=GTCCGGCCGGGAACGCCGCCA;SOR=0.573;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=15;TCR=18;TR=26;WE=232395208;WS=232395190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,27:0.73:37
chr2	232458443	rs10933378	T	C	7997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=131;NR=137;PP=2965;SC=GCCCCTGGACTCCAGCCTGTA;SOR=0.817;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=269;TCF=131;TCR=138;TR=268;WE=232458451;WS=232458433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,289:1.00:289
chr2	232573469	rs181168299	T	C	1529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.515;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.99;MQRankSum=1.164;NF=39;NR=39;PP=794;ReadPosRankSum=-0.115;SC=AAGGTGAGGCTGGACGCCGCC;SOR=0.757;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=188;TCF=96;TCR=92;TR=78;WE=232573489;WS=232573459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,84:0.40:210
chr2	232790053	rs5268	C	T	1007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=2;PP=842;SC=CTCCGAAGGCCGGCTGGGCGG;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=31;WE=232790061;WS=232790043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	232888856	rs896990	T	G	494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=0;PP=387;SC=TTAATGAATATTTCTTATACA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=232888864;WS=232888846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	233028070	rs3116181	A	G	1750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=10;PP=1264;SC=AGGGCAGGAGATTTTAAACTT;SOR=2.794;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=43;TCR=10;TR=53;WE=233028078;WS=233028060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr2	233243660	rs2014448	T	C	5455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=87;PP=2965;SC=CTGACCTGATTTTTGCTCTCC;SOR=0.756;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=178;TCF=91;TCR=87;TR=178;WE=233243668;WS=233243650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr2	233243981	rs13026692	A	T	10043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=379;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=190;NR=168;PP=2965;SC=GGGGCCTGAGATACCCCTGGC;SOR=0.753;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=359;TCF=190;TCR=169;TR=358;WE=233243989;WS=233243971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,379:1.00:379
chr2	233244586	rs2853374	C	G	3092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=58;PP=2181;SC=TGCCTGCCTCCGCCCGCCAGG;SOR=0.995;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=107;TCF=49;TCR=58;TR=107;WE=233244594;WS=233244576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr2	233245090	rs2260307	A	G	1629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=30;PP=1567;SC=TGTGGGGCTCAGGGCTGTGGG;SOR=0.800;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=72;TCF=41;TCR=31;TR=71;WE=233245098;WS=233245080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr2	233245141	rs2260309	T	C	2491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.98;QD=26.79;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr2	233271697	rs3830644	T	TAC	253.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=1.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQRankSum=0.000;QD=2.51;ReadPosRankSum=0.479;SOR=0.461;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,17:0.17:101
chr2	233273244	rs17416141	C	A	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FS=2.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.30;MQRankSum=-4.730;QD=3.13;ReadPosRankSum=-0.502;SOR=0.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:151,45:0.23:196
chr2	233274145	rs2090543	G	C	2293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.93;QD=31.00;SOR=4.033;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr2	233310297	rs796887	T	C	593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.26;QD=26.99;SOR=0.874;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	233310369	rs790045	T	C	344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.42;QD=24.63;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	233310423	rs814220	C	T	234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.34;QD=23.48;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	233310491	rs809327	C	T	54.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.09;QD=18.09;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr2	233320885	rs3762519	G	A	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=103;ReadPosRankSum=0.736;SC=TCCCCACTTCGCCTCCCTCCT;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=8;WE=233320893;WS=233320875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr2	233321641	rs61732032	C	T	2619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=343;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.408;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;ReadPosRankSum=-1.764;SC=TGCCAGACAGCGCAGCCACAG;SOR=0.738;Source=Platypus;TCF=140;WE=233321649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:214,129:0.38:343
chr2	233321836	rs2272422	G	A	1903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=46;PP=1182;ReadPosRankSum=1.147;SC=CTCGGTCACCGATCCTGACCT;SOR=0.690;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=239;TCF=117;TCR=122;TR=90;WE=233321844;WS=233321826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,101:0.39:259
chr2	233322424	rs2246004	T	C	1235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.950;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=29;PP=576;ReadPosRankSum=0.014;SC=TGGGGGCTGGTGGGTGTGGGA;SOR=0.487;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=136;TCF=60;TCR=76;TR=54;WE=233322432;WS=233322414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,64:0.43:150
chr2	233322958	rs41265121	T	C	2176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.477;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=52;PP=1182;ReadPosRankSum=1.287;SC=ATCATGAGGGTGTGGCTTACC;SOR=0.668;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=245;TCF=129;TCR=116;TR=108;WE=233322966;WS=233322948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,114:0.43:267
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chr2	233323205	rs2741269	C	T	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.565;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=214;ReadPosRankSum=-1.808;SC=CAAAAGTGTGCAATGCTGGCA;SOR=1.725;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=46;TCF=20;TCR=26;TR=14;WE=233323213;WS=233323195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,15:0.31:49
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chr2	233345861	rs61731716	G	A	1522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.910;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=42;PP=835;ReadPosRankSum=-0.859;SC=TGTGTTTCCCGTTCACCTGCC;SOR=0.890;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=234;TCF=113;TCR=121;TR=77;WE=233345869;WS=233345851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,87:0.33:261
chr2	233346662	rs909432	A	C	996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=28;PP=773;SC=AGGAGGTGGCACAGGGAGGCC;SOR=4.112;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=31;WE=233346670;WS=233346652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr2	233348647	rs2241755	G	A	5857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=122;NR=69;PP=2965;SC=TTAGGACCATGGCCTCGGGAG;SOR=1.315;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=191;TCF=122;TCR=69;TR=191;WE=233348655;WS=233348637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr2	233349588	rs1529874	G	A	8542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=164;NR=142;PP=2965;SC=AGGTCGTCATGCTCTGACACA;SOR=0.770;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=306;TCF=164;TCR=142;TR=306;WE=233349596;WS=233349578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,322:1.00:322
chr2	233350548	rs113660447	G	A	2144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=23;PP=1389;SC=ATCCGCGGCCGCTGGCAGGGC;SOR=1.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=76;TCF=52;TCR=24;TR=74;WE=233350556;WS=233350538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr2	233385202	rs2741294	C	T	689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.913;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=7;PP=260;ReadPosRankSum=-2.155;SC=ATTCAGTGCCCGGGGGCCGAA;SOR=0.462;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=71;TCF=51;TCR=20;TR=28;WE=233385210;WS=233385192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,36:0.44:82
chr2	233385396	rs1550094	G	A	776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.747;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=21;PP=456;ReadPosRankSum=1.790;SC=GCCCCCCAGCGCCCTGCAAGG;SOR=0.816;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=93;TCF=45;TCR=48;TR=37;WE=233385404;WS=233385386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,40:0.37:108
chr2	233385968	rs62193795	C	T	854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=8;PP=552;ReadPosRankSum=-0.974;SC=GGGCTGGGGCCAGGAGGATGA;SOR=0.688;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=58;TCF=43;TCR=15;TR=33;WE=233385976;WS=233385958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,35:0.59:59
chr2	233386229	rs2853444	T	C	2623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=48;PP=1529;SC=GTCTTCACTCTCCTCTTGGGG;SOR=1.396;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=33;TCR=48;TR=81;WE=233386237;WS=233386219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr2	233386328	rs2741295	C	T	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=169;ReadPosRankSum=-0.790;SC=TGGGGCATGGCCTGTGCAAAG;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=20;TCF=11;TCR=9;TR=12;WE=233386336;WS=233386318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr2	233386432	rs11902035	G	A	777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.470;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=8;PP=523;ReadPosRankSum=-1.723;SC=GGCTGAGCGCGAAAGGAGAGA;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=54;TCF=38;TCR=16;TR=31;WE=233386440;WS=233386422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,32:0.57:56
chr2	233386583	rs2853445	T	C	2025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.442;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=43;PP=1154;ReadPosRankSum=-2.628;SC=CCAGGTGAGGTTGAAAAGGCT;SOR=0.735;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=262;TCF=144;TCR=118;TR=99;WE=233386591;WS=233386573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,110:0.39:285
chr2	233387635	rs733603	A	G	3530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.58;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr2	233388813	rs2741299	T	G	2306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=39;PP=1460;SC=TGCTCGGGCCTCGTCCGGGAC;SOR=0.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=38;TCR=39;TR=77;WE=233388821;WS=233388803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr2	233389918	rs2853447	A	G	1333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.096;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=31;PP=713;ReadPosRankSum=-1.647;SC=CCACTCCTCCATCTGTAGGTC;SOR=0.586;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=193;TCF=106;TCR=87;TR=66;WE=233389926;WS=233389908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,77:0.35:219
chr2	233390937	rs2245601	A	G	776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.756;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=20;PP=488;ReadPosRankSum=-0.407;SC=TGGAGGGGCCAGTGCTGACAC;SOR=0.788;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=95;TCF=46;TCR=49;TR=37;WE=233390945;WS=233390927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,39:0.38:102
chr2	233396025	rs41265125	G	A	808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.812;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=5;PP=574;ReadPosRankSum=0.225;SC=CTCTAGGACCGGTGCCCCAAG;SOR=1.329;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=62;TCF=49;TCR=13;TR=32;WE=233396033;WS=233396015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,34:0.53:64
chr2	233407120	rs2853462	C	T	1619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.243;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=33;PP=1016;ReadPosRankSum=-0.963;SC=CCTCTTTCCTCGGTGACTCCC;SOR=0.859;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=237;TCF=140;TCR=97;TR=84;WE=233407128;WS=233407110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,90:0.35:254
chr2	233408220	rs10714586	AG	A	4095.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=42;PP=2527;SC=AGGAGGCCTGAGGGGGGGCAG;SOR=1.424;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=115;TCF=59;TCR=56;TR=89;WE=233408228;WS=233408210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr2	233408239	rs2573206	C	G	5907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=125;NR=78;PP=2965;SC=AGCCACTAAGCGTGGGGGTGG;SOR=1.268;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=203;TCF=125;TCR=78;TR=203;WE=233408247;WS=233408229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr2	233409013	rs2250451	G	A	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.334;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=199;ReadPosRankSum=0.430;SC=AGCCCTTCACGCCAACCTCTG;SOR=2.437;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=12;WE=233409021;WS=233409003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr2	233415978	rs11899983	T	C	2883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=55;PP=1810;ReadPosRankSum=-0.705;SC=TTAGGAATTATCTTCCTGAGA;SOR=0.705;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=226;TCF=129;TCR=97;TR=125;WE=233415986;WS=233415968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,136:0.54:254
chr2	233416068	rs12617942	C	T	1373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=38;PP=887;ReadPosRankSum=-0.189;SC=ACTTGTTGCCCTCTCCTGCCC;SOR=0.668;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=158;TCF=70;TCR=88;TR=67;WE=233416076;WS=233416058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,71:0.43:167
chr2	233416112	rs62191567	G	A	942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.208;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=30;PP=672;ReadPosRankSum=0.644;SC=CAAACAGTTTGGAGGTACAGA;SOR=1.103;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=76;TCF=18;TCR=58;TR=38;WE=233416120;WS=233416102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,40:0.49:81
chr2	233421284	rs3830645	CT	C	4985.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.545;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.040;NF=6;NR=93;PP=2963;ReadPosRankSum=2.134;SC=GAACTTGAGACTTTTATTATC;SOR=0.575;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=162;TCF=11;TCR=151;TR=99;WE=233421292;WS=233421274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,180:0.65:276
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chr2	233429144	rs111584120	GTATTTTATTT	G	1100.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQRankSum=1.604;QD=16.43;ReadPosRankSum=0.946;SOR=0.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,30:0.45:67
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chr2	233438786	rs2293338	G	A	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.987;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=374;ReadPosRankSum=-1.652;SC=GCCCTGAAAGGGTAGGCTGCT;SOR=0.333;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=50;TCF=43;TCR=7;TR=24;WE=233438794;WS=233438776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,27:0.49:55
chr2	233470843	rs7571133	G	A	2330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.404;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=50;PP=1352;ReadPosRankSum=0.580;SC=GCCAAGATCTGTAACGCTGAC;SOR=0.597;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=280;TCF=162;TCR=118;TR=113;WE=233470851;WS=233470833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:179,123:0.41:302
chr2	233498506	rs112941683	C	T	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-4.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.304;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=201;ReadPosRankSum=-1.186;SC=CCCCTCGGCGCCCCAGCCCCG;SOR=0.299;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=16;WE=233498514;WS=233498496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr2	233502984	rs13029754	A	G	1423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.456;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=18;PP=769;ReadPosRankSum=-0.177;SC=ACTTAAAGGCAGGACCCCAAT;SOR=0.839;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=114;TCF=79;TCR=35;TR=60;WE=233502992;WS=233502970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,68:0.52:130
chr2	233536926	rs11684420	T	C	1400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.690;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=25;PP=731;ReadPosRankSum=-1.312;SC=CTTTCTTAAGTGATTGGCAGA;SOR=0.603;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=107;TCF=66;TCR=41;TR=62;WE=233536934;WS=233536916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,67:0.56:119
chr2	233537125	rs11550699	A	G	3113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.787;HP=2;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=58;PP=1891;ReadPosRankSum=1.276;SC=GAGGGTGTCAAAGGTGCCAAG;SOR=0.457;SbPval=0.43;Source=Platypus;TCF=97;TR=121;WE=233537133;WS=233537113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,139:0.63:221
chr2	233599904	rs11555646	A	C	2665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.485;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=43;PP=1691;ReadPosRankSum=-1.393;SC=AAATACGGAAAAGAATGGCAG;SOR=0.737;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=212;TCF=126;TCR=86;TR=108;WE=233599912;WS=233599894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,120:0.52:230
chr2	233630676	rs77237820	C	T	2782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.705;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=43;PP=1878;ReadPosRankSum=-1.245;SC=TGACCAAGCTCCCAGATGATC;SOR=0.837;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=192;TCF=116;TCR=76;TR=110;WE=233630684;WS=233630666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,123:0.57:214
chr2	233633460	rs1801251	G	A	2403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.569;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=53;PP=1378;ReadPosRankSum=0.157;SC=TACTACTGCTGTGTCAGTAAA;SOR=0.615;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=163;TCF=80;TCR=83;TR=104;WE=233633468;WS=233633450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,113:0.63:180
chr2	233641083	rs737027	G	C	1956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.339;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=26;PP=1379;ReadPosRankSum=0.701;SC=TAGCTCTGTTGCTATTTGCCA;SOR=0.855;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=149;TCF=100;TCR=49;TR=84;WE=233641091;WS=233641073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,87:0.56:155
chr2	233681512	rs1078323	T	G	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=121;ReadPosRankSum=-2.480;SC=CGAATACTACTGGTCAGTGCT;SOR=0.631;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=11;WE=233681520;WS=233681502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr2	233708806	rs3816334	A	G	1526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.541;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=27;PP=854;ReadPosRankSum=-1.703;SC=AGCAGCAGCAACAGCAACAGC;SOR=0.761;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=176;TCF=106;TCR=70;TR=72;WE=233708814;WS=233708796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,79:0.41:194
chr2	233710713	rs4973054	G	C	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=131;ReadPosRankSum=0.736;SC=GAGGTCAACTGCTGCACCTGC;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=8;WE=233710721;WS=233710703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr2	233712049	rs2305137	G	A	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.129;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=7;PP=244;ReadPosRankSum=-0.800;SC=CTCCCCTCCCGTTTTGCAGTT;SOR=0.467;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=53;TCF=39;TCR=14;TR=24;WE=233712057;WS=233712039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,26:0.48:54
chr2	233712226	rs10555297	CACA	C	966.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.916;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=5.041;NF=2;NR=17;PP=617;ReadPosRankSum=-0.550;SC=CAGCAGCTGCCACAGCAGCAG;SOR=0.283;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=56;TCF=2;TCR=54;TR=19;WE=233712237;WS=233712216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,35:0.39:89
chr2	233721455	rs1947105	G	A	1906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.463;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=35;PP=949;ReadPosRankSum=-1.180;SC=AATTTGAGCCGCTTGGTTGCC;SOR=0.658;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=228;TCF=132;TCR=96;TR=86;WE=233721463;WS=233721445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,102:0.40:258
chr2	233723182	rs1284	G	A	4024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=62;PP=2319;SC=ACCATTAAAAGTTGGGGCTCC;SOR=0.706;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=135;TCF=73;TCR=62;TR=135;WE=233723190;WS=233723172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr2	233740227	rs778338	A	G	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.363;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=29;PP=533;ReadPosRankSum=0.242;SC=CCAGGGTTGGAGTGGTGGTCA;SOR=1.109;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=149;TCF=56;TCR=93;TR=42;WE=233740235;WS=233740217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,47:0.30:159
chr2	233744130	rs58821056	GCC	G	633.19	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=37.25;ReadPosRankSum=-1.147;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,16:0.94:17
chr2	233744133	.	C	G	642.22	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=37.78;ReadPosRankSum=-1.549;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,16:0.94:17
chr2	233752639	rs2250665	A	T	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=3.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.88;ReadPosRankSum=0.488;SOR=0.138;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr2	233752944	rs72427034	ACACG	A	986.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.948;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.906;NF=0;NR=24;PP=773;ReadPosRankSum=0.100;SC=ACACACACACACACGCACGCA;SOR=0.195;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=62;TCF=0;TCR=62;TR=24;WE=233752955;WS=233752922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,29:0.36:80
chr2	233757679	rs748002	G	A	2820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=374;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.384;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=64;PP=1825;ReadPosRankSum=0.383;SC=AGAAGTGGTCGGCCGCATAAC;SOR=0.656;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=337;TCF=169;TCR=168;TR=130;WE=233757687;WS=233757669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:227,145:0.39:372
chr2	233757697	rs895432	A	G	9778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=367;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=165;NR=164;PP=2965;SC=AACGGTACACAATGTCACACA;SOR=0.778;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=330;TCF=165;TCR=165;TR=329;WE=233757705;WS=233757687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,365:1.00:365
chr2	233759695	rs938569	G	C	1389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.611;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=43;PP=1038;ReadPosRankSum=0.028;SC=CCTTGGCTGAGACAGAGGAGC;SOR=0.530;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=126;TCF=31;TCR=95;TR=59;WE=233759703;WS=233759685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,60:0.45:133
chr2	233785015	rs778354	G	A	1143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=31;NR=11;PP=795;SC=TAATCTCCTCGGGCTGTAGGA;SOR=1.900;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=42;WE=233785023;WS=233785005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr2	233791608	rs1878289	C	G	2593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=14;PP=1964;SC=CCATTTAGAGCCAAACATGTC;SOR=2.888;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=65;TCR=14;TR=79;WE=233791616;WS=233791598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr2	233791648	rs2592127	G	T	4973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=112;NR=48;PP=2965;SC=GTCAGACGCAGTCCTTCGTAT;SOR=1.762;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=160;TCF=112;TCR=48;TR=160;WE=233791656;WS=233791638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr2	233792565	rs2921705	G	A	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=1.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.07;ReadPosRankSum=1.305;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,23:0.34:67
chr2	233834975	rs4973588	A	G	2689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=27;PP=1508;SC=GCAAGGAGGCATTCTGCTCCA;SOR=1.609;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=91;TCF=64;TCR=27;TR=90;WE=233834983;WS=233834965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr2	233925166	rs1141328	G	A	1938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=45;NR=25;PP=1159;SC=CTGCCGGCCCGGCCGAGGAGG;SOR=1.091;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=45;TCR=25;TR=70;WE=233925174;WS=233925156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr2	233925406	rs34218488	T	G	3749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=77;PP=2440;SC=GTTGTTCTTATGTCACAGGAC;SOR=1.346;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=127;TCF=50;TCR=77;TR=127;WE=233925414;WS=233925396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr2	233925491	rs4246649	A	G	480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=13;PP=387;SC=AGCTGGTCTCATGGCAGGTTT;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=16;WE=233925499;WS=233925481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	233990412	rs55913569	C	T	1471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=16;PP=962;ReadPosRankSum=0.921;SC=CCGGGTTGTGCGCACAGTGTC;SOR=0.554;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=128;TCF=96;TCR=32;TR=61;WE=233990420;WS=233990402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,66:0.49:136
chr2	233990594	rs61752227	A	G	2913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=390;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.885;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=73;PP=1733;ReadPosRankSum=0.178;SC=TCTCCGAGACATTGTTCCAGC;SOR=0.880;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=353;TCF=179;TCR=174;TR=140;WE=233990602;WS=233990584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:236,154:0.39:390
chr2	233998646	rs6738961	C	T	1162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.924;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=16;PP=631;ReadPosRankSum=1.017;SC=CTGGCACATGCGGCTCAACAG;SOR=0.580;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=43;TCR=24;TR=44;WE=233998654;WS=233998636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,51:0.68:75
chr2	234054515	rs147786898	G	A	1681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.562;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=18;PP=1114;ReadPosRankSum=-0.719;SC=AAGGTAACATGCAAGGACAGT;SOR=0.989;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=123;TCF=87;TCR=36;TR=72;WE=234054523;WS=234054505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,74:0.60:124
chr2	234054873	rs1135173	G	A	3748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=540;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.539;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=98;PP=2424;ReadPosRankSum=-0.085;SC=GCCTGTTGTCGTCCATTGAAG;SOR=0.742;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=501;TCF=248;TCR=253;TR=188;WE=234054881;WS=234054863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:340,200:0.37:540
chr2	234054989	rs36180605	T	G	3576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.338;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=94;PP=2357;ReadPosRankSum=1.026;SC=CTTGACCCTCTGTCTCTAACG;SOR=0.903;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=269;TCF=113;TCR=156;TR=156;WE=234054997;WS=234054979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,164:0.58:283
chr2	234055004	rs36189208	T	C	2679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.782;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=80;PP=1603;ReadPosRankSum=-0.477;SC=CTAACGCTGCTGCCCACAGGT;SOR=1.091;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=213;TCF=80;TCR=133;TR=121;WE=234055012;WS=234054994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,128:0.57:226
chr2	234066969	rs36127492	C	G	3184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.937;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=57;PP=2102;ReadPosRankSum=-1.822;SC=TCCTGCAGCTCATTAAGTCAC;SOR=0.771;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=247;TCF=136;TCR=111;TR=129;WE=234066977;WS=234066959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,141:0.53:266
chr2	234067089	rs36165346	A	G	1674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=41;PP=1104;ReadPosRankSum=0.328;SC=AACTTCTAAAATGGGCTGTGA;SOR=0.736;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=102;TCF=39;TCR=63;TR=66;WE=234067097;WS=234067079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,71:0.65:110
chr2	234070171	rs28605534	G	C	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.264;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=122;ReadPosRankSum=2.559;SC=CTTTGTTAAAGTCGCACCTTT;SOR=0.473;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=7;WE=234070179;WS=234070161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr2	234070190	rs28609111	G	A	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=214;ReadPosRankSum=-0.399;SC=TTGCAGGGGAGTGTCTAGGCC;SOR=0.446;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=13;WE=234070198;WS=234070180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr2	234070233	rs28576692	T	C	785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.852;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=9;PP=438;ReadPosRankSum=0.231;SC=TGGACACATGTTTCCAGGTTG;SOR=0.556;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=80;TCF=60;TCR=20;TR=34;WE=234070241;WS=234070223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,39:0.42:92
chr2	234072626	rs141642539	T	C	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=16;PP=354;SC=GAGGCAAGGGTGGGCTCAGCC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=234072634;WS=234072616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	234078056	rs11386687	AC	A	2120.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.536;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.474;NF=7;NR=37;PP=1539;ReadPosRankSum=-0.289;SC=AGGTAATGGAACTCCTTCCCC;SOR=0.768;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=124;TCF=14;TCR=110;TR=44;WE=234078064;WS=234078046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,70:0.32:220
chr2	234078582	rs10754947	G	A	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.635;HP=5;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=315;ReadPosRankSum=0.692;SC=TATGCTCCTCGCCCCACACCT;SOR=1.192;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=56;TCF=40;TCR=16;TR=22;WE=234078590;WS=234078572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,27:0.41:66
chr2	234079895	rs368505722	CA	C	40.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=5.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.26;ReadPosRankSum=-2.069;SOR=0.031;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
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chr2	234178624	rs35705047	CT	C	476.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=2.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.19;MQRankSum=0.777;QD=10.36;ReadPosRankSum=0.339;SOR=0.156;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,33:0.72:46
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chr2	234197717	rs4663136	C	G	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=283;ReadPosRankSum=0.838;SC=AGCAGCATGGCGCAACATCGA;SOR=1.085;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=14;WE=234197725;WS=234197707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr2	234201767	rs78930461	A	G	1006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=14;PP=546;ReadPosRankSum=-1.125;SC=CATGACTAGCACACATTCTGA;SOR=0.779;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=41;TCR=21;TR=42;WE=234201775;WS=234201757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,47:0.65:72
chr2	234224637	rs112149360	C	T	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.690;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=150;ReadPosRankSum=-1.195;SC=TGAGCCACCGCGCCCGGGCTG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=9;WE=234224645;WS=234224627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr2	234227523	rs2304777	A	G	4080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.418;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=95;PP=2479;ReadPosRankSum=-0.519;SC=GGGCATTTACATGGAAGGAGA;SOR=0.660;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=297;TCF=141;TCR=156;TR=181;WE=234227531;WS=234227513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,194:0.61:317
chr2	234235820	rs2304773	C	T	3934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=75;PP=2180;ReadPosRankSum=0.999;SC=GCACCGATGCCGAAGAGGACA;SOR=0.665;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=265;TCF=136;TCR=129;TR=158;WE=234235828;WS=234235810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,184:0.63:294
chr2	234238254	rs745498	T	G	1952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.154;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=46;PP=1338;ReadPosRankSum=3.262;SC=GTAGAGGGCATAGTCTTCTAG;SOR=0.796;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=166;TCF=77;TCR=89;TR=82;WE=234238262;WS=234238244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,89:0.49:182
chr2	234247508	rs13427703	C	G	1516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.753;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=38;PP=930;ReadPosRankSum=1.051;SC=AGGCCCATAGCTTCTACCAAG;SOR=0.856;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=97;TCF=39;TCR=58;TR=60;WE=234247516;WS=234247498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,67:0.60:112
chr2	234247627	rs2241874	T	C	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=57;ReadPosRankSum=0.632;SC=AATGTGTGCATTCTTAGCGCC;SOR=0.368;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=6;WE=234247635;WS=234247617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr2	234255079	rs76175654	T	G	3583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.332;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=81;PP=2411;ReadPosRankSum=-1.019;SC=CTCTTGAATGTGGCCCTGATT;SOR=0.607;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=300;TCF=149;TCR=151;TR=163;WE=234255087;WS=234255069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,171:0.54:318
chr2	234294561	rs3075537	T	TTC	15272.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=112;PP=2965;SC=AGCACTCTTGTTATAAATAAA;SOR=0.759;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=151;TCF=33;TCR=118;TR=144;WE=234294569;WS=234294551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,341:1.00:341
chr2	234294791	rs838716	G	C	171.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.64;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	234354406	.	C	T	3104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.155;ClippingRankSum=0.000;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=75;PP=1899;ReadPosRankSum=-0.413;SC=AGATGCTGGACAGGTGAGTGG;SOR=0.704;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=203;TCF=92;TCR=111;TR=133;WE=234354414;WS=234354396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,143:0.63:227
chr2	234368715	.	TA	T	36.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.362;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.47;MQRankSum=1.637;QD=1.84;ReadPosRankSum=1.269;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr2	234394487	rs1048603	G	A	3123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=415;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.144;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=80;PP=2074;ReadPosRankSum=-0.099;SC=ACGGGAAGACGATAGAAATCG;SOR=0.824;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=376;TCF=173;TCR=203;TR=142;WE=234394495;WS=234394477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:259,155:0.37:414
chr2	234396566	rs10929178	G	C	1177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.323;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=21;PP=556;ReadPosRankSum=0.366;SC=TGAATCCGTTGGATGGCAGAC;SOR=0.710;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=103;TCF=55;TCR=48;TR=49;WE=234396574;WS=234396556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,58:0.49:119
chr2	234405374	rs2602386	A	C	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=209;ReadPosRankSum=-2.726;SC=TTATTACTTAAGAGTTGTCTA;SOR=0.853;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=48;TCF=31;TCR=17;TR=18;WE=234405382;WS=234405364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,19:0.36:53
chr2	234433081	rs6746234	G	A	2259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=41;PP=1459;ReadPosRankSum=0.706;SC=CGGCCATTACGATGACTTTTA;SOR=0.706;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=256;TCF=156;TCR=100;TR=102;WE=234433089;WS=234433071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,113:0.39:291
chr2	234438246	rs56828432	C	CT	6737.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=82;PP=2974;SC=AAGGACTGTCCTAGGAGCTAG;SOR=1.242;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=95;TCF=9;TCR=86;TR=91;WE=234438254;WS=234438236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
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chr2	234442437	rs11332355	CA	C	375.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=260;ReadPosRankSum=-0.580;SC=TACACAGAAACAAAAAAAAAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=17;WE=234442445;WS=234442427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,17:0.94:18
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chr2	234590527	rs7586110	T	G	3295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=48;PP=1979;SC=CTTCTTCCACTTACTATATTA;SOR=0.971;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=120;TCF=72;TCR=48;TR=120;WE=234590535;WS=234590517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr2	234590616	rs7577677	C	A	3048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=47;NR=58;PP=1857;SC=GCCTCCTTCCCCTATATGTGT;SOR=0.990;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=47;TCR=58;TR=105;WE=234590624;WS=234590606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr2	234590970	rs17868323	T	G	3535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.47;QD=43.65;SOR=2.274;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr2	234590974	rs17863778	CG	AA	3490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.34;QD=46.54;SOR=2.334;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr2	234591205	rs11692021	T	C	17002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=651;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=307;NR=295;PP=2965;SC=GGAGAGAGTATGGAACCACAT;SOR=0.734;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=602;TCF=307;TCR=295;TR=602;WE=234591213;WS=234591195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,651:1.00:651
chr2	234598991	rs7563561	T	G	3399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=37;PP=2311;SC=CTGAAAGAGTTAGCACCTTAG;SOR=1.382;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=71;TCR=37;TR=108;WE=234598999;WS=234598981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr2	234599089	rs7608175	C	G	10037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=374;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=196;NR=152;PP=2965;SC=GGTCTCTCCTCTATTCAAAAT;SOR=0.916;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=348;TCF=196;TCR=152;TR=348;WE=234599097;WS=234599079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,374:1.00:374
chr2	234599296	rs45615240	T	C	1891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=58;PP=1761;SC=CCTTGACTCCTACAGCACCAA;SOR=5.211;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=61;TCF=3;TCR=58;TR=61;WE=234599304;WS=234599286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr2	234601669	rs6759892	T	G	3940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=60;PP=2428;SC=CCTCCTTCGCTCATTTCAGAG;SOR=0.895;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=142;TCF=82;TCR=60;TR=142;WE=234601677;WS=234601659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr2	234601965	rs1105880	A	G	7788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=116;NR=139;PP=2965;SC=GATCATTCCTAACTGCTCCTC;SOR=0.898;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=256;TCF=116;TCR=140;TR=255;WE=234601973;WS=234601955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,276:1.00:276
chr2	234602191	rs2070959	A	G	8426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=164;NR=129;PP=2965;SC=CCTGGAGCATACATTCAGCAG;SOR=0.937;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=293;TCF=164;TCR=129;TR=293;WE=234602210;WS=234602181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,299:1.00:299
chr2	234602202	rs1105879	A	C	8927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=167;NR=148;PP=2965;SC=CATTCAGCAGAAGCCCAGACC;SOR=0.810;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=315;TCF=167;TCR=148;TR=315;WE=234602210;WS=234602181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,324:1.00:324
chr2	234626287	rs869283	G	A	1783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=19;PP=1176;SC=ATCCTGGGGCGACCAGGACAA;SOR=1.681;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=63;TCF=44;TCR=19;TR=62;WE=234626295;WS=234626277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr2	234627937	rs2011404	T	C	9940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=372;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=187;NR=156;PP=2965;SC=TTAACCTCTGTGGGGCGGTGC;SOR=0.842;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=343;TCF=187;TCR=156;TR=343;WE=234627945;WS=234627927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,372:1.00:372
chr2	234637803	rs3821242	T	C	1856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=11;PP=1006;SC=TCCCCTGCCGTGGCTGGCCAC;SOR=1.681;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=43;TCR=11;TR=54;WE=234637811;WS=234637793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr2	234637853	rs6706232	G	A	2921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=34;PP=1799;SC=CCTGGGCTGAGAGTGGAAAGG;SOR=1.189;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=61;TCR=34;TR=95;WE=234637861;WS=234637843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr2	234637912	rs6431625	T	C	3992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=63;PP=2640;SC=ATGCGGGAGGTCTTGCGGGAG;SOR=0.779;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=132;TCF=69;TCR=63;TR=132;WE=234637920;WS=234637902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr2	234638249	rs7574296	A	G	11626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=446;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-0.420;NF=214;NR=199;PP=2965;ReadPosRankSum=0.058;SC=TCTGCGCGGCAGTGCTGGCTA;SOR=0.251;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=414;TCF=215;TCR=199;TR=413;WE=234638257;WS=234638239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,445:1.00:446
chr2	234652347	rs13009407	C	G	3360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-4.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=61;PP=2286;ReadPosRankSum=-0.606;SC=CGCCCTCCGCCCCCGCCTCGC;SOR=0.703;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=192;TCF=102;TCR=90;TR=132;WE=234652355;WS=234652337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,141:0.69:205
chr2	234663649	rs10929301	C	G	7441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=149;PP=2965;SC=AGCTGAAGACCTACTCGAAGG;SOR=1.205;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=248;TCF=99;TCR=149;TR=248;WE=234663657;WS=234663639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr2	234668879	rs34983651	C	CAT	370.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=303;ReadPosRankSum=0.274;SC=TGGTTTTTGCCATATATATAT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=7;WE=234668887;WS=234668869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,12:0.86:14
chr2	234688036	rs6431631	C	A	3169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=58;PP=1783;SC=GCAGCAGTAGCCTCAAGTGAG;SOR=1.085;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=47;TCR=58;TR=105;WE=234688044;WS=234688026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr2	234702212	rs6738710	G	C	597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=2;PP=437;ReadPosRankSum=-1.166;SC=CAGCCTGCTCGCTACGGCAAG;SOR=0.685;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=56;TCF=50;TCR=6;TR=24;WE=234702220;WS=234702202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,25:0.44:57
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chr2	234703136	rs6431634	T	C	783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=2.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.26;ReadPosRankSum=0.807;SOR=0.521;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,50:0.34:149
chr2	234704150	rs2885297	T	C	630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.348;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=3;PP=466;ReadPosRankSum=0.613;SC=TCAGCAGGACTGGGGTAGGGC;SOR=0.085;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=68;TCF=64;TCR=4;TR=27;WE=234704158;WS=234704140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,27:0.39:69
chr2	234704318	rs2361503	A	G	4911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=2.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=681;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.137;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=122;NR=115;PP=2962;ReadPosRankSum=0.318;SC=CAGATCCTGGAACTGTCAGTC;SOR=0.754;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=631;TCF=319;TCR=312;TR=237;WE=234704326;WS=234704308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:427,252:0.37:679
chr2	234704495	rs11563248	T	G	1607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.447;HP=2;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=34;PP=1195;ReadPosRankSum=0.410;SC=CGTGCTTCCTTTATCCTGATG;SOR=0.429;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=170;TCF=77;TCR=93;TR=69;WE=234704503;WS=234704485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,71:0.39:182
chr2	234704690	rs759173	T	C	2014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.308;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=55;ReadPosRankSum=-0.833;SC=TCGTAGCCCTTGGTGAGGCTC;SOR=0.963;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=230;TCF=107;TCR=123;TR=97;WE=234704698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,106:0.42:254
chr2	234704746	rs759172	G	C	1486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.544;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=33;PP=967;ReadPosRankSum=0.052;SC=CAGGAGGCCTGTAGGAGTCCC;SOR=0.616;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=186;TCF=99;TCR=87;TR=64;WE=234704754;WS=234704736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,72:0.36:202
chr2	234707341	rs1500479	T	C	2845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=28;PP=1557;SC=AGACAGAACGTGAGGCCCTGA;SOR=1.374;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=62;TCR=28;TR=90;WE=234707349;WS=234707331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr2	234707460	rs11563247	G	C	4353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=77;NR=78;PP=2266;SC=TGGCTATCCGGGTAGTCAAGA;SOR=0.804;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=156;TCF=77;TCR=79;TR=155;WE=234707468;WS=234707450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr2	234708428	rs13013882	G	A	2491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=25;PP=1463;SC=CCCCTCAGGTGAGGATGGCTA;SOR=1.321;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=56;TCR=25;TR=81;WE=234708436;WS=234708418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr2	234708570	rs11563069	G	A	3912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=62;NR=73;PP=2341;SC=TACGCAGACCGCAGAGCAGCT;SOR=0.948;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=135;TCF=62;TCR=73;TR=135;WE=234708578;WS=234708560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr2	234708629	rs13018934	G	A	1736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=21;NR=36;PP=1053;SC=GCCACTCAGCGTACCTGTGTT;SOR=1.467;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=21;TCR=36;TR=57;WE=234708637;WS=234708619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr2	234708720	rs2041652	T	G	1612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=34;NR=13;PP=1106;SC=CCTAGATATATGCACAGCTCT;SOR=1.938;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=34;TCR=13;TR=47;WE=234708728;WS=234708710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr2	234713812	rs2041651	G	T	4526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=92;PP=2831;SC=CCAGGGGTGAGGGAGTGGAGA;SOR=1.284;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=153;TCF=61;TCR=92;TR=153;WE=234713820;WS=234713802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr2	234717669	rs10803663	A	G	1007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=0;PP=806;SC=AAGCACCGCCAGCTGACTCAA;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=34;WE=234717677;WS=234717659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	234720734	rs988344	A	C	936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=29;PP=713;SC=TCTCACTTGGAGGCTCCCCAG;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=34;WE=234720742;WS=234720724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr2	234725502	rs726016	T	C	3442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=55;PP=1909;SC=CTATCTCATGTGGATTTATGT;SOR=0.822;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=61;TCR=55;TR=116;WE=234725510;WS=234725492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr2	234727250	rs719419	T	G	3503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=42;PP=2244;SC=GGGGGGTGGCTGGGCCTTTTG;SOR=1.575;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=132;TCF=89;TCR=43;TR=131;WE=234727258;WS=234727228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr2	234727986	rs6754859	C	T	5754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=112;NR=92;PP=2965;SC=AGTTTAGCTGCGATGAGGTGG;SOR=0.767;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=204;TCF=112;TCR=92;TR=204;WE=234727994;WS=234727976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr2	234728078	rs1500480	T	C	4253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=65;NR=80;PP=2590;SC=TGGATAGCCTTCTTCCTCCAG;SOR=1.143;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=145;TCF=65;TCR=80;TR=145;WE=234728086;WS=234728068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr2	234732317	rs11676792	A	G	2164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.297;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=45;PP=1369;ReadPosRankSum=0.226;SC=CTGCGTGGAAATGAGGCACCG;SOR=0.587;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=147;TCF=73;TCR=74;TR=91;WE=234732325;WS=234732307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,95:0.62:153
chr2	234750542	rs3732215	G	C	6966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=110;NR=113;PP=2965;SC=CCTCCTCCTGGAGTTCCAGTT;SOR=0.805;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=223;TCF=110;TCR=113;TR=223;WE=234750550;WS=234750532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr2	234750831	rs3806589	T	C	4685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=71;NR=90;PP=2475;SC=GGACTCTTTCTGGAGATACGA;SOR=1.110;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=161;TCF=71;TCR=90;TR=161;WE=234750839;WS=234750821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr2	234752638	rs7583713	C	T	358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=295;SC=AGCTAGTAAACTGGAATAAAG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=234752646;WS=234752628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	234753008	rs169925	G	A	1291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=33;PP=980;SC=CTCCCCTGACGATGCGGACTG;SOR=2.584;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=8;TCR=33;TR=41;WE=234753016;WS=234752998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr2	234754273	rs2302156	T	C	864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=0;PP=561;SC=ATGCTCTTTATGGGTTCTGTA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=234754281;WS=234754263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	234754506	rs2302155	G	A	8874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=137;NR=163;PP=2965;SC=AAGAGCTTCTGAGTATAGCTG;SOR=0.977;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=300;TCF=137;TCR=163;TR=300;WE=234754514;WS=234754496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,325:1.00:325
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chr2	234761355	rs554699	G	A	6515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=90;NR=129;PP=2965;SC=CAAAGTGACAGGCAAAAAAAA;SOR=1.222;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=219;TCF=90;TCR=129;TR=219;WE=234761365;WS=234761345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
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chr2	234763137	rs2302154	T	C	1246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.175;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=24;PP=619;ReadPosRankSum=-0.679;SC=GCGCGCAGCGTACCCAGCATC;SOR=0.738;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=158;TCF=85;TCR=73;TR=55;WE=234763145;WS=234763127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,69:0.36:190
chr2	234763226	rs503913	C	T	4470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=81;NR=75;PP=2352;SC=ACTCCGCCCTCCCTGCCTTCC;SOR=0.763;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=156;TCF=81;TCR=75;TR=156;WE=234763234;WS=234763216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr2	234775850	.	T	C	1430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.858;ClippingRankSum=0.000;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.577;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=45;PP=1085;ReadPosRankSum=2.733;SC=ATTTCCCTTTTTGTTTGAAGC;SOR=0.640;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=175;TCF=60;TCR=115;TR=66;WE=234775858;WS=234775840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,72:0.38:188
chr2	234846198	rs1019103	G	A	866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=23;PP=625;SC=ATAGGCCAAAGTGACCTGGGC;SOR=2.093;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=30;WE=234846206;WS=234846188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	234873195	.	C	CA	112	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;FR=1.0000;HP=20;HapScore=2;MGOF=100;MMLQ=16;MQ=56.26;NF=2;NR=0;PP=112;QD=57.5;SC=GACTCCGTCTCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=2;WE=234873203;WS=234873185;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,2:0.29:7
chr2	234888643	rs6745987	T	C	1054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=4;PP=706;SC=GCCAGTGTGCTACCTACTTTC;SOR=3.026;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=31;WE=234888651;WS=234888633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr2	234888721	rs6736916	C	T	934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.369;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=17;PP=614;ReadPosRankSum=-1.803;SC=TAAACAAACACGTCATTGGCT;SOR=0.868;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=145;TCF=93;TCR=52;TR=51;WE=234888729;WS=234888711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,53:0.34:158
chr2	234890391	rs6708995	G	T	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.503;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=120;ReadPosRankSum=0.504;SC=AATATCTCATGAATTCTGTTC;SOR=1.553;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=11;WE=234890399;WS=234890381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,12:0.31:39
chr2	234892127	rs4663995	T	C	272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=7;PP=194;SC=CAATTAACAATGTGGCAATTG;SOR=2.303;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=234892135;WS=234892117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	234905078	rs11563208	C	T	2523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.144;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=47;PP=1645;ReadPosRankSum=-0.390;SC=TCCCCTTCATCGTCTTCGCTT;SOR=0.786;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=179;TCF=100;TCR=79;TR=108;WE=234905086;WS=234905068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,113:0.60:189
chr2	234916831	rs6734618	A	G	706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.37;SOR=2.226;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	234923141	.	A	G	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=0.000;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.998;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=11;PP=267;ReadPosRankSum=-1.023;SC=GCACAGAGCGATAATTTAAAA;SOR=0.673;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=55;TCF=31;TCR=24;TR=23;WE=234923149;WS=234923131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,25:0.42:59
chr2	234923362	rs28948677	G	A	542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=14;PP=373;SC=ACTAATTTAAGATCATGATTT;SOR=2.419;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=18;WE=234923370;WS=234923352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	234967539	rs593668	T	A	7857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=146;NR=127;PP=2965;SC=TCCGGGAGACTACATGCAGGA;SOR=0.735;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=273;TCF=146;TCR=127;TR=273;WE=234967547;WS=234967529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,294:1.00:294
chr2	235950187	rs1469375	T	C	3677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=538;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=91;PP=2002;ReadPosRankSum=-0.574;SC=CCAAGTCCGATGCTCCCACAT;SOR=0.714;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=487;TCF=241;TCR=246;TR=181;WE=235950195;WS=235950177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:338,200:0.37:538
chr2	235951819	rs3795962	A	G	1836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=42;PP=1037;ReadPosRankSum=0.917;SC=CGTCCGTCCTAGAAAAGCTGA;SOR=0.662;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=194;TCF=94;TCR=100;TR=82;WE=235951827;WS=235951809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,95:0.44:218
chr2	235961424	rs57924475	G	A	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.366;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=182;ReadPosRankSum=1.333;SC=CGAGCTCACCGAGCCCCTCTG;SOR=1.013;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=47;TCF=12;TCR=35;TR=14;WE=235961432;WS=235961414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,15:0.29:51
chr2	235962120	rs111554520	A	T	864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.772;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=25;PP=689;ReadPosRankSum=-0.629;SC=CTCGTGAAAGAGTGTCCCAAA;SOR=0.803;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=102;TCF=40;TCR=62;TR=40;WE=235962128;WS=235962110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,39:0.38:102
chr2	235962513	rs10929083	C	T	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.957;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=126;ReadPosRankSum=0.912;SC=TTCTGCCCTGCGTGCCCTGCT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=8;WE=235962521;WS=235962503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr2	236403607	rs3738998	C	A	945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=27;PP=768;SC=CACGCGGCTGCTCCGCCGAGG;SOR=3.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=30;WE=236403615;WS=236403597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	236433161	rs62191529	G	A	3710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.638;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=85;PP=2351;ReadPosRankSum=0.729;SC=GACAGGCCACGGGGCTGCACC;SOR=1.053;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=242;TCF=113;TCR=129;TR=148;WE=236433169;WS=236433151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,165:0.60:276
chr2	236433331	rs11689907	T	C	824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.005;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=21;PP=407;ReadPosRankSum=-0.864;SC=GAAGGGACCCTGTGTCCAAGA;SOR=0.538;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=57;TCF=23;TCR=34;TR=36;WE=236433339;WS=236433321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,41:0.62:66
chr2	236433390	rs10207027	G	A	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.242;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=54;ReadPosRankSum=-0.045;SC=TAGGGACCTCGTCCCTTTCTT;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=5;WE=236433398;WS=236433380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
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chr2	236761396	rs13006916	C	T	1193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.185;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=31;PP=700;ReadPosRankSum=-1.657;SC=AGCCCGTGCCCGTCAGTCCTC;SOR=0.925;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=126;TCF=59;TCR=67;TR=55;WE=236761404;WS=236761386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,61:0.45:136
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chr2	236923361	rs35361765	C	CT	826.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=9;PP=309;ReadPosRankSum=-0.668;SC=CTACTTTGACCTTTTTTTTTC;SOR=0.726;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=61;TCF=35;TCR=26;TR=22;WE=236923369;WS=236923351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,39:0.51:77
chr2	237146409	rs149965726	C	T	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.31;ReadPosRankSum=0.233;SOR=0.791;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr2	237146643	rs72060634	TGTG	T	736.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.264;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=348;ReadPosRankSum=-0.703;SC=GGAGGTTAGTTGTGGTGGTGG;SOR=1.002;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=9;WE=237146653;WS=237146633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr2	237149941	rs6756597	C	T	1513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.264;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=27;PP=953;ReadPosRankSum=1.393;SC=CCAAACGTGGCTGGAGATTTC;SOR=0.458;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=123;TCF=79;TCR=44;TR=70;WE=237149949;WS=237149931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,73:0.57:129
chr2	237150166	rs2015983	A	C	2655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.516;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=58;PP=1324;ReadPosRankSum=0.954;SC=CTCTCCATTGAGATGCCGTCG;SOR=0.759;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=194;TCF=96;TCR=98;TR=116;WE=237150174;WS=237150156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,126:0.60:210
chr2	237247036	rs111440161	G	GA	2168.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=57;PP=864;ReadPosRankSum=-0.075;SC=CTGGGAGAGAGAAAAAAAAAT;SOR=0.673;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=172;TCF=13;TCR=159;TR=64;WE=237247044;WS=237247017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,112:0.40:279
chr2	237252454	rs72978647	C	A	1748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.268;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=39;PP=1014;ReadPosRankSum=0.576;SC=TGAAGACTTTCTGAAATGACA;SOR=0.506;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=219;TCF=100;TCR=119;TR=86;WE=237252462;WS=237252444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,93:0.40:233
chr2	237255303	rs62192371	A	G	737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.557;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=17;PP=435;ReadPosRankSum=-0.745;SC=GGGCAGGAGAAGGCTCCTTCC;SOR=0.606;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=104;TCF=62;TCR=42;TR=37;WE=237255311;WS=237255293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,41:0.35:117
chr2	237374309	rs35432941	C	T	1771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.713;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=45;PP=1199;ReadPosRankSum=-0.024;SC=CCTTTTCAGCCTGGATTACTG;SOR=0.842;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=192;TCF=91;TCR=101;TR=82;WE=237374317;WS=237374299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,88:0.42:210
chr2	237395443	rs1986381	C	G	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.914;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=359;ReadPosRankSum=-1.856;SC=TTTAAGAAAACCAGATGCTAT;SOR=1.003;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=79;TCF=51;TCR=28;TR=26;WE=237395451;WS=237395433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,32:0.37:87
chr2	237396935	rs6751722	G	A	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.540;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=276;ReadPosRankSum=0.398;SC=TCCTGCTAAGGGTCCCCACGG;SOR=0.266;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=51;TCF=8;TCR=43;TR=20;WE=237396943;WS=237396925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,23:0.43:54
chr2	237489904	rs1045879	C	T	2339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.205;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=46;PP=1398;ReadPosRankSum=-0.705;SC=TGTCTGCTGGCTGCCCTACCA;SOR=0.617;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=214;TCF=109;TCR=105;TR=96;WE=237489912;WS=237489894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,110:0.47:236
chr2	238166147	rs4377288	G	A	2065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.171;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=47;PP=1292;ReadPosRankSum=0.974;SC=AGCTATACCCGGTCTGGCTGC;SOR=0.449;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=182;TCF=84;TCR=98;TR=93;WE=238166155;WS=238166137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,99:0.52:191
chr2	238233410	rs4663722	C	G	4246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=357;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=94;PP=2693;ReadPosRankSum=0.765;SC=ATGTTGGCCACCCACGCTTAG;SOR=0.690;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=320;TCF=152;TCR=168;TR=180;WE=238233418;WS=238233400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,195:0.55:356
chr2	238233483	rs13032404	G	A	2210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FS=0.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.33;ReadPosRankSum=-2.256;SOR=0.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:108,106:0.50:214
chr2	238243292	rs1131296	G	A	1115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.834;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=17;PP=527;ReadPosRankSum=0.537;SC=TCCGTGGTAGGTGGCTCTGAC;SOR=0.719;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=87;TCF=45;TCR=42;TR=42;WE=238243300;WS=238243282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,52:0.51:101
chr2	238243464	rs2270669	C	G	4108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=57;PP=2254;SC=GGGGGCTCAGCCCTCTCCCAG;SOR=0.746;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=69;TCR=57;TR=126;WE=238243472;WS=238243454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr2	238244963	rs6728818	A	G	1195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.747;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=25;PP=695;ReadPosRankSum=-1.070;SC=AACAGTGGCCATCTTTGTGGC;SOR=0.833;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=215;TCF=130;TCR=85;TR=66;WE=238244971;WS=238244953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,73:0.31:236
chr2	238249630	rs4433949	C	T	3441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=419;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.746;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=82;PP=2216;ReadPosRankSum=0.978;SC=TGACCAGGTACGCTATGTACT;SOR=0.605;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=395;TCF=207;TCR=188;TR=165;WE=238249638;WS=238249620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:243,175:0.42:418
chr2	238253065	rs2291795	C	T	3544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.986;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=73;PP=2173;ReadPosRankSum=-0.262;SC=CATCTGAGAGCTTGAGCACAG;SOR=0.811;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=262;TCF=130;TCR=132;TR=141;WE=238253073;WS=238253055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,160:0.56:285
chr2	238258814	rs3790993	C	G	9077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=170;NR=147;PP=2965;SC=GGCCCCGGTTCCCGATTCCTC;SOR=0.741;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=317;TCF=170;TCR=147;TR=317;WE=238258822;WS=238258804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,342:1.00:342
chr2	238259675	rs3790995	G	A	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=1.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.37;ReadPosRankSum=0.100;SOR=0.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,32:0.29:112
chr2	238261112	rs4663726	GC	AA	9865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=119;NR=78;PP=2947;SC=AGCCTGCTTGGCAATGTGCCC;SOR=1.102;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=202;TCF=120;TCR=82;TR=197;WE=238261121;WS=238261102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
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chr2	238267058	rs4663731	G	A	988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.246;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=10;PP=628;ReadPosRankSum=0.146;SC=TTTTATCAACGTGTTTTAAAG;SOR=1.377;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=134;TCF=97;TCR=37;TR=47;WE=238267066;WS=238267048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,50:0.35:144
chr2	238267717	rs2646254	C	T	4579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=367;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.800;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=96;PP=2764;ReadPosRankSum=-2.651;SC=AAGAACCAGGCAATCCTTTGT;SOR=0.559;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=330;TCF=177;TCR=153;TR=200;WE=238267725;WS=238267707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,215:0.59:367
chr2	238270545	rs3736341	T	C	4906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.834;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=108;PP=2962;ReadPosRankSum=1.171;SC=AAATGCGCTTTAAGGGTCAAA;SOR=0.766;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=324;TCF=157;TCR=167;TR=203;WE=238270553;WS=238270535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,217:0.62:350
chr2	238305211	rs1553032	C	T	447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=0;PP=370;SC=TCTGAAAAGGCCTATAAATCC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=238305219;WS=238305210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	238457684	rs10173589	A	G	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.087;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=188;ReadPosRankSum=-0.860;SC=CAGGCATTTCATGCTTAATTT;SOR=0.124;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=38;TCF=35;TCR=3;TR=16;WE=238457692;WS=238457674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr2	238461773	rs60687800	G	A	961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=25;PP=567;ReadPosRankSum=-0.627;SC=GTGATCAGTCGCAGGAGGCAA;SOR=0.699;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=91;TCF=40;TCR=51;TR=44;WE=238461781;WS=238461763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,46:0.46:99
chr2	238461855	rs67525826	C	A	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.318;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=156;ReadPosRankSum=1.194;SC=TGGTTGGTTGCGGGAGGGGAC;SOR=1.781;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=9;WE=238461863;WS=238461845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr2	238462069	rs112744921	C	T	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.754;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=32;ReadPosRankSum=0.360;SC=TGTGCACAAACGTGTAATCTA;SOR=2.133;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=4;WE=238462077;WS=238462059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,4:0.21:19
chr2	238462324	rs8260	A	G	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.780;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=16;PP=326;ReadPosRankSum=-0.148;SC=GCTTTCCACTATACACAGTCA;SOR=0.864;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=105;TCF=51;TCR=54;TR=29;WE=238462332;WS=238462314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,32:0.26:121
chr2	238483164	rs6766	T	C	2199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=50;PP=1207;ReadPosRankSum=1.073;SC=CACCAAGATGTGGAAATCCTG;SOR=0.710;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=259;TCF=130;TCR=129;TR=101;WE=238483172;WS=238483154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,115:0.40:287
chr2	238483283	rs147504247	GCCC	G	1024.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.180;HP=5;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=798;ReadPosRankSum=1.189;SC=CCAGGCCAGTGCCCCCATCAA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=0;TCR=54;TR=23;WE=238483293;WS=238483273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,28:0.42:66
chr2	238483475	rs2280288	T	C	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=169;ReadPosRankSum=-0.403;SC=GGGAGCCATGTGACGCCAGAT;SOR=0.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=11;WE=238483483;WS=238483465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,11:0.33:33
chr2	238483654	rs72990107	G	A	1832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.677;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=41;PP=1142;ReadPosRankSum=0.715;SC=CCCCAGGAGTGGCTGCACCTA;SOR=0.584;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=197;TCF=97;TCR=100;TR=85;WE=238483662;WS=238483644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,92:0.44:211
chr2	238483671	rs59945834	G	A	1665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.798;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=40;PP=978;ReadPosRankSum=1.278;SC=CCTAGTGGGCGCAGCATTTGG;SOR=0.560;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=175;TCF=78;TCR=97;TR=76;WE=238483679;WS=238483661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,83:0.43:192
chr2	238483729	rs2280289	A	G	1148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.023;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=32;PP=764;ReadPosRankSum=0.583;SC=ATCCCCCCGTAGAGCCTGGCC;SOR=0.952;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=123;TCF=53;TCR=70;TR=52;WE=238483737;WS=238483719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,58:0.39:147
chr2	238484222	rs10202062	G	A	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.766;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=20;PP=392;ReadPosRankSum=0.554;SC=AGCTGCAGCCGTGGAGCCCGC;SOR=0.807;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=96;TCF=43;TCR=53;TR=34;WE=238484230;WS=238484212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,37:0.35:106
chr2	238485251	rs72990117	G	A	1068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=20;PP=633;ReadPosRankSum=-0.764;SC=GCCCTGAGTTGGGTCTTCCCC;SOR=0.656;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=155;TCF=98;TCR=57;TR=54;WE=238485259;WS=238485241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,60:0.37:162
chr2	238494681	rs34052613	G	A	3268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=456;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.130;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=83;PP=1943;ReadPosRankSum=-2.767;SC=CGTTCTTCACGTACCGAAGAG;SOR=0.800;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=415;TCF=207;TCR=208;TR=162;WE=238494689;WS=238494671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:280,175:0.38:455
chr2	238499863	rs146534321	A	AAATTCTTCAGGAGACTCT	999.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=1.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.87;ReadPosRankSum=-1.402;SOR=0.865;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,19:0.30:63
chr2	238499866	rs114742872	C	T	1109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=6.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.00;ReadPosRankSum=0.119;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,26:0.35:74
chr2	238499874	rs2292870	C	T	1087.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=7;PP=928;ReadPosRankSum=-0.550;SC=AGCCATGAAACTTCCTGGCTT;SOR=0.734;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=66;TCF=42;TCR=24;TR=20;WE=238499882;WS=238499853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,35:0.41:86
chr2	238499997	rs6745883	TA	CG	716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.102;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=537;ReadPosRankSum=1.399;SC=CCGTGAACATTACTCCACACA;SOR=0.992;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=62;TCF=28;TCR=34;TR=18;WE=238500006;WS=238499987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,22:0.29:77
chr2	238500046	rs6742960	A	G	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.114;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=70;ReadPosRankSum=0.593;SC=ATGTCCTCCAAACTCACCCTA;SOR=1.508;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=21;TCF=8;TCR=13;TR=5;WE=238500054;WS=238500036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,5:0.21:24
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chr2	238503463	rs77389661	A	G	1326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.03;ReadPosRankSum=0.174;SOR=0.660;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,33:0.62:53
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chr2	238667501	rs3215064	G	GA	2458.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=17;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=62;PP=1533;SC=TAAAAAAAAAGAAAAAAAATC;SOR=2.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=72;TCF=0;TCR=72;TR=62;WE=238667509;WS=238667491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,90:0.97:93
chr2	238688244	rs1151798	A	G	852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=19;PP=597;SC=TCTCTGTCCTATCTGGGAGCG;SOR=1.942;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=27;WE=238688252;WS=238688234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	238896494	rs59213280	C	CATT	39.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.85;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
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chr2	238933920	rs7560931	G	C	1651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.132;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=29;PP=804;ReadPosRankSum=1.084;SC=GTAAGGCTCTGGCCTGGAGAT;SOR=0.947;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=173;TCF=96;TCR=77;TR=73;WE=238933928;WS=238933910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,83:0.44:190
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chr2	238972827	rs821480	T	C	865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=0;PP=740;SC=ATAAGTAGTGTAGATCTGTAG;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=27;WE=238972835;WS=238972823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	238991733	rs2243417	C	A	3919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.775;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=68;PP=2389;ReadPosRankSum=0.726;SC=TGTGACTCTGCGTGTCAAAAG;SOR=0.536;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=261;TCF=155;TCR=106;TR=163;WE=238991741;WS=238991723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,176:0.64:276
chr2	238991796	rs2278742	C	T	2894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=399;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.674;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=66;PP=1799;ReadPosRankSum=0.115;SC=CATTGCAGAGCATTTCTCCTG;SOR=0.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=378;TCF=204;TCR=174;TR=146;WE=238991804;WS=238991786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:246,153:0.38:399
chr2	238999883	rs1128552	T	C	795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.464;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=12;PP=501;ReadPosRankSum=-0.522;SC=CAATGATTGCTGGCCTTGGGA;SOR=0.940;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=116;TCF=73;TCR=43;TR=36;WE=238999891;WS=238999873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,41:0.33:126
chr2	239000091	rs17069	T	G	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.874;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=20;PP=368;ReadPosRankSum=1.439;SC=TGGCACTTGTTTAGCATTTAA;SOR=1.550;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=71;TCF=24;TCR=47;TR=26;WE=239000099;WS=239000081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,27:0.36:75
chr2	239007755	rs68159827	CATT	C	743.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=3.333;NF=14;NR=5;PP=646;ReadPosRankSum=-0.221;SC=CCCTTTTGATCATTATTAACT;SOR=0.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=60;TCF=44;TCR=16;TR=19;WE=239007765;WS=239007745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,24:0.32:74
chr2	239007806	rs1054640	A	G	1069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.256;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.31;MQRankSum=3.035;NF=37;NR=23;PP=701;ReadPosRankSum=-0.340;SC=GTGCAGCTCCAGGTCATTCCT;SOR=0.839;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=160;TCF=99;TCR=61;TR=60;WE=239007814;WS=239007796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,63:0.36:176
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chr2	239008067	rs3816348	G	A	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=194;ReadPosRankSum=1.026;SC=TGGGGATCCTGTGGTTTCTCT;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=11;WE=239008075;WS=239008057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr2	239008936	rs6431579	A	G	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.53;ReadPosRankSum=-1.180;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr2	239016539	rs935415	C	G	2442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=405;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.469;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=69;PP=1807;ReadPosRankSum=0.482;SC=GACTCCTGCTCATGGGTACCC;SOR=0.761;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=381;TCF=196;TCR=185;TR=128;WE=239016547;WS=239016529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:272,132:0.33:404
chr2	239025523	rs11903074	T	C	3541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.24;SOR=0.902;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr2	239025630	rs11904159	T	C	1785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.642;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=43;PP=839;ReadPosRankSum=-0.323;SC=CGGAGTACCATGGACACCGGG;SOR=0.809;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=121;TCF=55;TCR=66;TR=76;WE=239025638;WS=239025620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,85:0.60:142
chr2	239025645	rs11897736	C	T	1436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.710;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=31;PP=733;ReadPosRankSum=0.625;SC=ACCGGGACTGCGCCCAGTACC;SOR=0.580;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=100;TCF=46;TCR=54;TR=59;WE=239025653;WS=239025635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,66:0.57:115
chr2	239033901	rs10172440	T	C	2023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.573;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=32;PP=957;ReadPosRankSum=2.335;SC=CCAGGCCCATTCACCCACAGG;SOR=0.732;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=141;TCF=79;TCR=62;TR=78;WE=239033909;WS=239033891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,95:0.57:168
chr2	239034043	rs10170048	A	C	1357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=32;PP=772;SC=CACAGCCCCAAGTGGGCCACC;SOR=1.402;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=20;TCR=32;TR=52;WE=239034051;WS=239034033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
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chr2	239036416	rs12692214	T	C	4466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=73;NR=72;PP=2588;SC=CCGGGGCCCCTAGCCAGCCTC;SOR=0.934;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=73;TCR=72;TR=145;WE=239036424;WS=239036406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr2	239037273	rs72989009	C	A	445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.983;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=232;ReadPosRankSum=0.443;SC=CAACCCCCCACGTCCTCTCGG;SOR=0.223;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=15;WE=239037281;WS=239037263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,19:0.70:27
chr2	239038912	rs57813708	T	C	3155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=399;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.759;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=77;PP=1944;ReadPosRankSum=-2.103;SC=ACCTGCAGCTTCGGCGCCGCT;SOR=0.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=374;TCF=183;TCR=191;TR=152;WE=239038920;WS=239038902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:233,166:0.42:399
chr2	239039057	rs13033248	A	G	1689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.598;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=28;PP=638;ReadPosRankSum=-2.012;SC=GGAGGCCTCAATCCCAGCGGC;SOR=0.793;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=170;TCF=80;TCR=90;TR=53;WE=239039065;WS=239039047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,54:0.29:186
chr2	239039075	rs13006204	G	T	1732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=25;PP=623;ReadPosRankSum=0.220;SC=GGCTGAGCCCGCAGGGTCTGC;SOR=0.713;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=170;TCF=87;TCR=83;TR=52;WE=239039083;WS=239039065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,57:0.30:192
chr2	239039637	rs4663845	T	C	2231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=35;PP=1276;SC=CTCAAGACAGTGGCCTGCAGG;SOR=0.717;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=75;TCF=39;TCR=36;TR=74;WE=239039645;WS=239039627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr2	239039841	rs10172220	A	G	5804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=121;NR=81;PP=2965;SC=CTGAGCCGGCAGCCCCGCGGG;SOR=1.103;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=202;TCF=121;TCR=81;TR=202;WE=239039849;WS=239039831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr2	239039896	rs10182906	G	C	8861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=164;NR=129;PP=2965;SC=ACGGGGCTCCGGTGCCCTACA;SOR=0.863;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=293;TCF=164;TCR=129;TR=293;WE=239039904;WS=239039886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,328:1.00:328
chr2	239040187	rs12692215	T	C	8222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=133;NR=142;PP=2965;SC=GCAAGTCAGGTCTGACCCTGC;SOR=0.871;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=277;TCF=134;TCR=143;TR=275;WE=239040195;WS=239040177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,303:1.00:303
chr2	239049540	rs2241985	G	A	3371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=377;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.309;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=68;PP=2141;ReadPosRankSum=1.153;SC=ATGCCACCGCGGCCTCCTGGC;SOR=0.812;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=337;TCF=176;TCR=161;TR=149;WE=239049548;WS=239049530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:213,163:0.43:376
chr2	239050033	rs12692216	C	T	4748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=86;PP=2950;SC=GCCCGGGCCGCCCACCTGCCC;SOR=1.039;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=71;TCR=87;TR=157;WE=239050041;WS=239050023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr2	239051550	rs935411	T	C	1297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.96;SOR=0.770;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr2	239053436	rs12623661	G	C	1374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=5;PP=956;SC=CAGTGAGGGGGGCATTTCTGC;SOR=3.516;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=37;TCR=5;TR=42;WE=239053444;WS=239053426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr2	239053685	rs13013945	A	C	4728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=114;PP=2866;SC=CACTGGGCTCAGTGCAACTCC;SOR=1.636;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=169;TCF=55;TCR=114;TR=169;WE=239053693;WS=239053675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr2	239054504	rs11674140	G	T	5604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=95;NR=93;PP=2965;SC=CTTCCCTGGGGCCTGGTTCTA;SOR=0.841;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=188;TCF=95;TCR=93;TR=188;WE=239054512;WS=239054494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr2	239056746	rs11674655	T	G	560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=17;PP=455;SC=TGGTGAGGATTGGGGCTCCTG;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=239056754;WS=239056736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	239059484	rs7605194	T	C	3749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=80;NR=42;PP=2056;SC=TGCATGAGAATGGCGCGCTGG;SOR=1.307;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=80;TCR=43;TR=122;WE=239059492;WS=239059474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr2	239073046	rs6760421	C	T	2925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.44;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr2	239075812	rs3795905	C	T	6426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.424;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=117;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.116;SC=GGAACTCTGCCCACACTGGCC;SOR=0.538;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=216;TCF=99;TCR=117;TR=215;WE=239075820;WS=239075802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,230:1.00:231
chr2	239075935	rs3820817	A	G	6860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=124;NR=106;PP=2965;SC=CTTATCCAGGAAAGAAAGAGT;SOR=0.776;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=230;TCF=124;TCR=106;TR=230;WE=239075943;WS=239075925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr2	239082166	rs3832064	G	GC	5147.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.49;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=37;PP=2653;SC=CTCTTATAGGGCCTTTTACCT;SOR=0.997;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=64;TCF=27;TCR=37;TR=63;WE=239082174;WS=239082156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr2	239092474	rs2305173	C	T	2899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=63;PP=1868;SC=TCTTATATTTCAAAATGAACC;SOR=1.632;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=34;TCR=63;TR=97;WE=239092482;WS=239092464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr2	239093788	rs6431588	T	C	1559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=10;PP=1079;SC=CAATAACCAATTTGAGTATCA;SOR=2.628;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=51;TCF=40;TCR=11;TR=50;WE=239093796;WS=239093778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr2	239102856	rs3795903	A	G	4077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=43;PP=2549;SC=TAAATTTCACATAAGAGTAAA;SOR=1.640;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=144;TCF=101;TCR=43;TR=144;WE=239102864;WS=239102846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr2	239103574	rs35393292	G	A	10017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=381;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=153;NR=197;PP=2965;ReadPosRankSum=2.046;SC=TTTTCAAAGAGGAAGATCATG;SOR=1.067;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=352;TCF=154;TCR=198;TR=350;WE=239103582;WS=239103564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,379:0.99:381
chr2	239103603	rs7558210	C	G	6726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=136;PP=2965;SC=CCTGCTTTGACACAAGTTTGC;SOR=1.501;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=215;TCF=79;TCR=136;TR=215;WE=239103611;WS=239103593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr2	239112344	rs113428548	G	A	87.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=3;PP=49;SC=AGTCCCGGACGCCACCAATCG;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=239112352;WS=239112334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
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chr2	239134056	rs7572285	A	G	4131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.16;ReadPosRankSum=1.023;SOR=0.718;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:200,114:0.36:314
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chr2	239134138	rs7572392	A	C	1697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.028;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=48;PP=1211;ReadPosRankSum=0.110;SC=ACCATCAGGGACTCTGGAAAC;SOR=0.599;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=228;TCF=101;TCR=127;TR=89;WE=239134146;WS=239134128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,91:0.37:245
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chr2	239139883	rs13425452	G	C	2186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.280;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=64;PP=1614;ReadPosRankSum=0.636;SC=ACACATTCGCGAGGGGAGCGC;SOR=0.883;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=273;TCF=120;TCR=153;TR=108;WE=239139891;WS=239139873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:181,113:0.38:294
chr2	239140403	rs35825433	T	C	709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.191;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=235;ReadPosRankSum=0.975;SC=CCTCAACTTGTGGTGGCCTCT;SOR=0.201;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=16;WE=239140411;WS=239140393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr2	239140426	.	A	AC	1268.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.268;ClippingRankSum=0.000;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=2.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.94;ReadPosRankSum=1.245;SOR=0.373;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,32:0.48:67
chr2	239140434	rs111384196	C	A	1354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.94;ReadPosRankSum=1.346;SOR=0.770;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,39:0.46:85
chr2	239140728	rs11689033	A	G	2180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.430;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=51;PP=1376;ReadPosRankSum=-1.124;SC=CTGGCTGGAGAAATCCGGTGT;SOR=0.642;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=282;TCF=144;TCR=138;TR=103;WE=239140736;WS=239140718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:189,114:0.38:303
chr2	239148970	rs56294817	C	A	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.916;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=8;PP=451;ReadPosRankSum=-1.628;SC=GACCACTGATCTGCCGCGCGT;SOR=0.517;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=80;TCF=61;TCR=19;TR=31;WE=239148978;WS=239148960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,35:0.41:86
chr2	239148996	rs140615710	CCCGT	C	2107.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.637;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=18;PP=1206;ReadPosRankSum=-0.463;SC=CAGGCGTCCACCCGTCCGTCC;SOR=0.766;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=86;TCF=29;TCR=57;TR=28;WE=239149007;WS=239148986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,58:0.40:146
chr2	239160475	.	T	G	218	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=11;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=16;MQ=58.41;NF=0;NR=18;PP=218;QD=14.0428451415;SC=GGGGTGGGGGTGGGGGGCATG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=22;TCR=37;TR=18;WE=239160483;WS=239160465;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:41,18:0.31:59
chr2	239165663	rs2304669	T	C	1478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.357;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=36;PP=688;ReadPosRankSum=-1.192;SC=TGCCCGGCAGTGCCAGCGAGG;SOR=0.476;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=175;TCF=75;TCR=100;TR=70;WE=239165671;WS=239165653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,81:0.40:203
chr2	239181904	rs2304674	A	G	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=1.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-1.558;QD=4.80;ReadPosRankSum=1.118;SOR=0.889;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,35:0.29:122
chr2	239184581	rs10462023	G	A	2779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=69;PP=1864;ReadPosRankSum=0.170;SC=TAGCTTCCTAGGTGTCCTTTC;SOR=0.713;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=184;TCF=77;TCR=107;TR=118;WE=239184589;WS=239184571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,125:0.65:193
chr2	239185922	rs2304673	T	G	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.377;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=295;ReadPosRankSum=0.210;SC=GATAACAGGCTAGATAATACC;SOR=0.187;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=17;WE=239185930;WS=239185912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr2	239229372	rs13398676	C	A	1561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.057;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=35;PP=937;ReadPosRankSum=-0.502;SC=CGCCGCTGACCGAGAAGCTGC;SOR=0.784;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=202;TCF=114;TCR=88;TR=80;WE=239229380;WS=239229362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,87:0.39:223
chr2	239229440	rs112673616	A	G	1705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FS=2.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.16;ReadPosRankSum=0.035;SOR=0.888;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:122,87:0.42:209
chr2	239234396	rs75651012	A	G	627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=403;ReadPosRankSum=1.570;SC=ACAGAAGATAATGCACACTCT;SOR=0.540;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=55;TCF=42;TCR=13;TR=26;WE=239234404;WS=239234386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,28:0.47:60
chr2	239241445	.	AT	A	104.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.827;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.19;ReadPosRankSum=-0.472;SOR=1.880;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr2	239253266	rs56304316	C	A	1533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.519;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=36;PP=793;ReadPosRankSum=-0.231;SC=TTCGCCCTTTCCTGGCGAGAG;SOR=0.647;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=184;TCF=87;TCR=97;TR=69;WE=239253274;WS=239253256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,81:0.39:209
chr2	239306268	rs3739070	A	C	1165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.768;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=34;PP=735;ReadPosRankSum=-1.196;SC=TGAGCTGCAGATGTGGCACAG;SOR=0.273;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=120;TCF=31;TCR=89;TR=51;WE=239306276;WS=239306258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,55:0.44:126
chr2	239307245	rs571820	A	G	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.112;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=102;ReadPosRankSum=-1.845;SC=TTTTGGTTGTAGCAGGGGTTG;SOR=1.022;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=8;WE=239307253;WS=239307235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr2	239342096	rs41264155	G	A	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.391;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=350;ReadPosRankSum=0.155;SC=AAGGTGCCCCGTAGCTGGGAG;SOR=1.445;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=21;WE=239342104;WS=239342086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
chr2	239344263	rs11885523	G	A	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=192;ReadPosRankSum=0.288;SC=GAGGGGGACCGTGTCCATGCT;SOR=0.551;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=13;WE=239344271;WS=239344253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr2	239344412	rs3191996	C	T	1765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.516;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=32;PP=1129;ReadPosRankSum=-2.687;SC=CGTTGCGAATCGCGGCCACTG;SOR=0.792;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=270;TCF=161;TCR=109;TR=86;WE=239344420;WS=239344402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:196,94:0.32:290
chr2	239344663	rs11904390	T	A	973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=31;PP=645;ReadPosRankSum=1.305;SC=AGGCCAGTACTGTGGAGCTCG;SOR=0.650;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=96;TCF=26;TCR=70;TR=43;WE=239344671;WS=239344653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,45:0.45:99
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chr2	240016488	rs62189551	A	G	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=25;ReadPosRankSum=-1.281;SC=AGCCCCAGCCACCTGCGCCAG;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=5;WE=240016496;WS=240016485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
chr2	240016771	rs2279273	C	T	1619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=48;PP=1006;ReadPosRankSum=-0.076;SC=GGGAGGGAGACGGTCAGAGAG;SOR=0.726;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=207;TCF=75;TCR=132;TR=76;WE=240016779;WS=240016761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,82:0.37:219
chr2	240016824	rs2279274	A	G	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.743;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=361;ReadPosRankSum=0.140;SC=CCCTGGGCGCACTCCGGGGTC;SOR=1.539;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=71;TCF=8;TCR=63;TR=22;WE=240016832;WS=240016814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,22:0.30:74
chr2	240024654	rs6543510	G	A	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=4.893;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=374;ReadPosRankSum=-0.466;SC=CAGCTCCACAGACAGAAACTC;SOR=3.160;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=17;WE=240024662;WS=240024644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,19:0.83:23
chr2	240029703	.	G	A	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.934;ClippingRankSum=0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.05;ReadPosRankSum=1.632;SOR=0.293;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr2	240029736	rs7585225	T	C	570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=6;PP=397;SC=CCTGCCCCGGTCGGCGTTACC;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=21;WE=240029744;WS=240029726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	240048481	rs35504237	C	T	1516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=37;PP=1080;SC=GAGACAACTGCGCCCTGTGCC;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=15;TCR=37;TR=52;WE=240048489;WS=240048471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr2	240048568	rs12998494	C	T	137.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=108;SC=GGCTGGGGGCCGTGAGCTGGT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=240048576;WS=240048558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr2	240066417	rs2290087	A	G	8049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=158;NR=124;PP=2965;SC=GAAGCTGCACAAAAAGGAGAT;SOR=0.859;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=282;TCF=158;TCR=124;TR=282;WE=240066425;WS=240066407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,310:1.00:310
chr2	240078488	rs76103770	C	G	10142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=370;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=147;NR=189;PP=2965;SC=AAGGCAAAGACAGATGGTTTA;SOR=0.994;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=336;TCF=147;TCR=189;TR=336;WE=240078496;WS=240078478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,369:1.00:369
chr2	240083528	rs3791515	G	A	4742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=98;PP=2897;SC=CTCCTCCCTGGAAGCCCCCCA;SOR=1.244;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=165;TCF=66;TCR=99;TR=164;WE=240083536;WS=240083518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr2	240084053	rs3791516	T	A	1384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=35;PP=930;SC=TGGCTCCTCATCCTGCCCTTT;SOR=3.080;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=8;TCR=35;TR=43;WE=240084061;WS=240084043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr2	240085403	rs11124182	C	A	560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=2;PP=471;SC=TCCCTGCCTCCGGTGAAGAGC;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=240085411;WS=240085393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	240098068	rs56211861	G	A	1844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=47;NR=23;PP=1347;SC=CCCTCTGCCCGGCCTCCCTCC;SOR=1.483;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=71;TCF=48;TCR=23;TR=70;WE=240098076;WS=240098058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr2	240111521	rs2290092	C	T	1690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=15;PP=979;SC=CCCCGCACCGCGCCTCACCTT;SOR=1.536;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=39;TCR=15;TR=54;WE=240111529;WS=240111511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr2	240111870	rs74761897	CG	C	459.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=0;NR=15;PP=256;SC=CTTCACGGGGCGGGGGGGGGG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=15;WE=240111878;WS=240111860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	240273360	rs62182143	C	T	5826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=435;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=143;NR=114;PP=2962;ReadPosRankSum=1.394;SC=CAGACAAAGACGATTCCACCC;SOR=0.670;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=407;TCF=224;TCR=183;TR=257;WE=240273368;WS=240273350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,272:0.63:433
chr2	240323661	rs1709851	C	A	2793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.055;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=44;PP=1833;ReadPosRankSum=0.794;SC=TGTTGAGTTACAGGTCGGCCC;SOR=0.777;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=204;TCF=125;TCR=79;TR=116;WE=240323669;WS=240323651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,127:0.57:222
chr2	240323905	rs3215239	T	TG	3740.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.035;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.944;NF=17;NR=55;PP=2932;ReadPosRankSum=0.144;SC=CTGGCGGAGATGCGCGTTCGC;SOR=0.806;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=145;TCF=30;TCR=115;TR=72;WE=240323913;WS=240323895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,119:0.53:223
chr2	240500170	rs35846411	G	A	2659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.221;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=37;PP=2962;ReadPosRankSum=0.745;SC=ACACCCTGTCGTCTGCAAGCT;SOR=0.825;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=166;TCF=104;TCR=62;TR=102;WE=240500181;WS=240500160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,115:0.63:183
chr2	240500173	rs10187580	T	C	1491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.555;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=28;PP=2150;ReadPosRankSum=-1.615;SC=CCCTGTCGTCTGCAAGCTGGA;SOR=0.628;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=176;TCF=111;TCR=65;TR=73;WE=240500181;WS=240500160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,76:0.40:192
chr2	240500294	rs11683242	A	C	5783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=497;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.521;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=128;NR=130;PP=2962;ReadPosRankSum=0.792;SC=TCAGTGTTCCAGCTCCAGCAG;SOR=0.655;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=455;TCF=233;TCR=222;TR=258;WE=240500302;WS=240500284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:216,280:0.56:496
chr2	240500413	rs6543554	A	G	9922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=371;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=163;NR=174;PP=2965;SC=TGAATCCACCATCGTACCTGC;SOR=0.789;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=337;TCF=163;TCR=174;TR=337;WE=240500421;WS=240500403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,371:1.00:371
chr2	240500437	rs10180205	C	T	2485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=352;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.309;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=64;PP=1731;ReadPosRankSum=0.902;SC=TCTTGGATGCCGTCCGATTGC;SOR=0.780;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=319;TCF=155;TCR=164;TR=120;WE=240500445;WS=240500427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:224,128:0.36:352
chr2	240504878	rs6719279	C	T	5893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=110;PP=2965;SC=GGTAGCCATTCTAGTCATAGT;SOR=1.106;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=194;TCF=84;TCR=110;TR=194;WE=240504886;WS=240504868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr2	240504931	rs13021357	A	G	1155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=31;PP=693;ReadPosRankSum=1.947;SC=CAAGTAGACCAGCATGACTAT;SOR=0.744;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=84;TCF=27;TCR=57;TR=47;WE=240504939;WS=240504921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,52:0.56:93
chr2	240721384	rs2898872	C	A	1391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.376;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=19;PP=892;ReadPosRankSum=2.263;SC=TGAATTGACTCCTGCTTGGCC;SOR=1.057;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=107;TCF=69;TCR=38;TR=58;WE=240721392;WS=240721374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,65:0.53:123
chr2	240721598	rs12613844	T	G	2204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.645;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=51;PP=1321;ReadPosRankSum=0.429;SC=GACACAGTGATGATTCATACA;SOR=0.787;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=140;TCF=60;TCR=80;TR=88;WE=240721606;WS=240721588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,97:0.65:149
chr2	240900607	rs138479490	TG	T	2190.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.877;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=2.501;NF=9;NR=56;PP=1738;ReadPosRankSum=0.233;SC=CCGGCAGCTGTGGGGGAAAAA;SOR=0.723;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=185;TCF=37;TCR=148;TR=65;WE=240900620;WS=240900597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:190,123:0.39:313
chr2	240909304	rs34036698	CAG	C	2547.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.607;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=33;PP=1299;ReadPosRankSum=-1.266;SC=AACAAATGGACAGAGTCACAG;SOR=0.752;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=105;TCF=8;TCR=97;TR=35;WE=240909313;WS=240909294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,69:0.40:171
chr2	240921463	rs4149551	C	T	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=218;ReadPosRankSum=0.111;SC=CTAATAGTCACACGTTCTGTG;SOR=0.770;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=35;TCF=31;TCR=4;TR=13;WE=240921471;WS=240921453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,14:0.33:42
chr2	240921817	rs77023828	T	C	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=3.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=247;ReadPosRankSum=0.939;SC=AAAACAGCATTTAATTTTGTT;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=11;WE=240921825;WS=240921807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr2	240922822	rs958960	C	A	579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=1;PP=400;SC=CTATGAATTTCCAGAAATGGT;SOR=4.514;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=240922830;WS=240922812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	240923050	rs1530144	C	T	7118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=131;NR=111;PP=2965;ReadPosRankSum=0.081;SC=GTCAGGGCCACGGTGCCAGGC;SOR=0.771;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=244;TCF=132;TCR=112;TR=242;WE=240923058;WS=240923040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,264:0.99:266
chr2	240923146	rs6716293	TC	CT	7782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=93;PP=2947;SC=TAGAGAAACATCGGGCAACCC;SOR=1.191;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=165;TCF=67;TCR=98;TR=154;WE=240923155;WS=240923136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr2	240946766	rs13848	T	C	4405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=86;NR=58;PP=2605;SC=TTGCAGAATATTGTAAAACCT;SOR=0.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=144;TCF=86;TCR=58;TR=144;WE=240946774;WS=240946756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr2	240954005	rs77816205	C	A	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=292;ReadPosRankSum=-0.860;SC=TCCACCCCTGCAGATGCCCTC;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=14;WE=240954013;WS=240953995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
chr2	240954110	rs2289407	A	G	1784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.484;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=30;PP=1166;ReadPosRankSum=-0.632;SC=GTGCTGATCTACATTCAAAAT;SOR=0.736;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=228;TCF=146;TCR=82;TR=84;WE=240954118;WS=240954100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,92:0.36:258
chr2	240958129	rs4149540	C	T	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=132;ReadPosRankSum=0.628;SC=TCACTGCATTCCAGAGAAAAG;SOR=0.638;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=46;TCF=11;TCR=35;TR=13;WE=240958137;WS=240958119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,13:0.24:54
chr2	240961728	rs2083411	T	C	3759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=498;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.787;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=75;PP=2445;ReadPosRankSum=-2.249;SC=CATAGCGCAGTTTGCACTGCA;SOR=0.815;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=457;TCF=241;TCR=216;TR=172;WE=240961736;WS=240961718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:308,189:0.38:497
chr2	240961852	rs7596788	A	G	5629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=122;PP=2965;SC=GAAACCTCTTAGTGATAAAAA;SOR=1.634;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=180;TCF=58;TCR=122;TR=180;WE=240961860;WS=240961842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr2	240969312	rs10187574	A	G	986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=2.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.52;MQRankSum=0.144;QD=7.71;ReadPosRankSum=0.054;SOR=0.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,49:0.38:128
chr2	240981179	rs6731916	T	C	1290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=9;PP=946;SC=TTGTCTCTGGTTCAAAAATGT;SOR=2.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=42;WE=240981187;WS=240981169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr2	240981262	rs6728493	A	C	1956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.480;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=35;PP=1318;ReadPosRankSum=-0.043;SC=TACATGTTAGAAACAAGAAGA;SOR=0.645;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=214;TCF=133;TCR=81;TR=87;WE=240981270;WS=240981252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,99:0.40:248
chr2	240981375	rs6732185	T	A	12622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=480;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=223;NR=217;PP=2965;SC=ATGAAGAGACTTGGATGAAGA;SOR=0.736;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=441;TCF=223;TCR=218;TR=440;WE=240981383;WS=240981365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,478:1.00:478
chr2	240981487	rs60617721	A	G	994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=5.071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.15;MQRankSum=0.362;QD=8.58;ReadPosRankSum=-1.714;SOR=0.343;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,49:0.42:116
chr2	240982059	.	CCGTGGGTG	C	1088.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.750;ClippingRankSum=0.000;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.13;MQRankSum=4.641;QD=26.55;ReadPosRankSum=-0.112;SOR=0.312;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,40:0.98:41
chr2	240982068	.	AAGAGGCATGGACGAAGGGCCGTGGGTGAAGAGGCATGGACGAAGGGCC	A	1089.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=0.000;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.13;MQRankSum=4.641;QD=26.58;ReadPosRankSum=-0.408;SOR=0.312;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,40:0.98:41
chr2	240982228	rs10439373	C	T	1135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=14;SC=GATGAAGGGCCGTGGGTGAAG;SOR=1.900;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=61;TCF=45;TCR=16;TR=56;WE=240982236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr2	240982271	.	G	A	1586	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MMLQ=19;MQ=59.92;NF=29;NR=12;PP=1586;QD=39.5310051841;SC=GTGAAGAGCCGTGGATGAAGG;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=120;TCF=77;TCR=43;TR=41;WE=240982279;WS=240982237;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:79,41:0.34:120
chr2	240982443	rs34596708	C	T	1514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=1.630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.12;ReadPosRankSum=-0.210;SOR=0.503;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,44:0.35:125
chr2	240982449	rs35318485	C	T	1490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=1.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.55;ReadPosRankSum=-1.126;SOR=0.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,40:0.36:110
chr2	240984789	rs12465491	C	T	1654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.760;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.958;NF=38;NR=29;PP=975;ReadPosRankSum=1.517;SC=GGCTCTCCAGCAGCCGGTGGC;SOR=0.444;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=143;TCF=86;TCR=57;TR=67;WE=240984797;WS=240984779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,75:0.47:159
chr2	240984833	rs13389099	C	G	3381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.822;NF=81;NR=53;PP=2106;ReadPosRankSum=0.958;SC=GGGTGATGTGCGCATATGACA;SOR=0.719;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=230;TCF=136;TCR=94;TR=134;WE=240984841;WS=240984823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,151:0.59:255
chr2	240985099	rs150098707	G	A	163.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=27.31;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
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chr2	240985511	rs10933560	A	G	1011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=23;PP=648;SC=TGGGAGCTGCAGGCCTACAAA;SOR=1.739;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=11;TCR=23;TR=34;WE=240985519;WS=240985501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr2	241066280	rs4292120	C	T	5211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=103;PP=2965;SC=ACATTAGCGCCTCCGCCCCCT;SOR=1.173;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=175;TCF=72;TCR=103;TR=175;WE=241066288;WS=241066270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr2	241066325	rs12614632	A	C	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.099;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=21;PP=320;ReadPosRankSum=-1.363;SC=CTCTGTCCAAAGCTGCCACTT;SOR=0.484;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=71;TCF=16;TCR=55;TR=28;WE=241066333;WS=241066315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,30:0.39:76
chr2	241073170	rs747741	C	T	602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.965;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=369;ReadPosRankSum=0.296;SC=AATAAGGCTGCCTGCCAGTGG;SOR=1.773;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=38;TCF=32;TCR=6;TR=22;WE=241073178;WS=241073160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,25:0.61:41
chr2	241073450	rs3749078	C	T	1138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.839;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=30;PP=642;ReadPosRankSum=-1.141;SC=AAGGTTATGTCAGGTGCGTTT;SOR=0.371;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=97;TCF=33;TCR=64;TR=50;WE=241073465;WS=241073440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,55:0.51:107
chr2	241075809	rs13406410	C	T	1588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=40;PP=1174;SC=GGTGCCCGCCCGCTGGGGTGC;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=13;TCR=40;TR=53;WE=241075817;WS=241075799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr2	241078784	rs2279690	A	T	2230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.629;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=59;PP=1355;ReadPosRankSum=0.109;SC=GAAAGACACAAGACACCTGCC;SOR=0.546;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=276;TCF=116;TCR=160;TR=106;WE=241078792;WS=241078774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:181,116:0.39:297
chr2	241375527	rs2352823	C	T	1234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=15;NR=24;PP=665;SC=GCGCCGGGAACCCGGGCCTGG;SOR=1.378;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=15;TCR=24;TR=39;WE=241375535;WS=241375517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr2	241390516	rs3828336	C	T	1781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=35;PP=1189;ReadPosRankSum=1.565;SC=GGTGAGCGGCCGAGTTCCTTT;SOR=0.712;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=203;TCF=121;TCR=82;TR=83;WE=241390524;WS=241390506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,88:0.39:223
chr2	241390827	rs34412658	C	T	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=379;ReadPosRankSum=-0.364;SC=AGTGGGTGTACGGGAAGCTAG;SOR=0.399;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=19;WE=241390835;WS=241390817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,21:0.60:35
chr2	241392491	rs4268920	A	G	1578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=27;NR=25;PP=794;SC=CCTCTCCCGCAGCGCCACCGT;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=27;TCR=25;TR=52;WE=241392499;WS=241392481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr2	241395353	rs12695019	A	G	672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=2;PP=434;SC=GGCCGCCTCGATCCAGCCTGC;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=241395361;WS=241395343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	241395500	rs71428439	A	G	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.14;ReadPosRankSum=1.344;SOR=0.577;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,30:0.55:55
chr2	241395503	rs2292832	T	C	1771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.16;SOR=1.007;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	241395538	rs71428440	T	G	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=3.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.09;ReadPosRankSum=-0.759;SOR=0.313;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr2	241396969	rs11680576	T	C	1102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.307;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=31;PP=764;ReadPosRankSum=-0.520;SC=AGGGGTGACTTCTCTTGCAGT;SOR=1.068;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=67;TCF=17;TCR=50;TR=42;WE=241396977;WS=241396959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,45:0.63:71
chr2	241397325	rs140545467	CG	C	237.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.349;NF=4;NR=0;PP=97;ReadPosRankSum=0.183;SC=CTGCTGACAACGCCCCCCCTT;SOR=0.293;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=4;WE=241397333;WS=241397315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr2	241401566	rs35971355	G	A	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=189;ReadPosRankSum=1.963;SC=CTGCCACGGCGGGGGAAACAT;SOR=0.610;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=32;TCF=22;TCR=10;TR=14;WE=241401574;WS=241401556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr2	241401741	rs1042829	C	T	2316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.567;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=40;PP=1245;ReadPosRankSum=1.988;SC=TGTACTACCGCGGTGCCAACC;SOR=0.756;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=160;TCF=92;TCR=68;TR=93;WE=241401749;WS=241401731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,107:0.61:176
chr2	241403014	rs881029	T	C	881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.345;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=22;PP=565;ReadPosRankSum=-1.422;SC=GTCCCTAGCTTAGAGCTTGGA;SOR=0.193;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=45;TCF=12;TCR=33;TR=32;WE=241403022;WS=241403004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,34:0.71:48
chr2	241403955	rs3830536	GTGACGCCTGCGTGTGCGTGTCAACGCCTGTGTGCGCGCGT	G	2616.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FS=19.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.50;MQRankSum=5.895;QD=9.31;ReadPosRankSum=1.434;SOR=1.705;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:202,79:0.28:281
chr2	241404213	rs41266965	T	C	2430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.391;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=58;PP=1270;ReadPosRankSum=-1.188;SC=GTCCTGGATGTGGCCCCATTG;SOR=0.603;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=277;TCF=132;TCR=145;TR=115;WE=241404221;WS=241404203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,127:0.42:300
chr2	241404317	rs2229458	C	T	2070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=47;PP=1102;ReadPosRankSum=0.144;SC=CCCAGGGCCCCGGGCCTGAGG;SOR=0.717;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=203;TCF=95;TCR=108;TR=87;WE=241404325;WS=241404307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,101:0.45:225
chr2	241405400	rs10700206	C	CGTG	637.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=1;PP=444;SC=TCACCTGGCACGGGCCCTTAC;SOR=3.912;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=10;WE=241405408;WS=241405399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	241405479	rs1126920	C	T	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.926;HP=1;HapScore=4;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=13;PP=1067;ReadPosRankSum=-0.530;SC=TCCCAGGTGACGACGGCAGCG;SOR=0.551;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=65;TCF=45;TCR=20;TR=35;WE=241405493;WS=241405469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,36:0.49:73
chr2	241405485	rs2228330	C	T	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.953;HP=2;HapScore=4;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=7;PP=997;ReadPosRankSum=0.315;SC=GTGACGACGGCAGCGGCTCGG;SOR=1.022;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=69;TCF=47;TCR=22;TR=32;WE=241405493;WS=241405469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,40:0.51:78
chr2	241405528	rs2228331	A	G	3573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=68;NR=58;PP=2067;SC=TGACCTCTGCAGCCGGAAGGT;SOR=0.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=68;TCR=58;TR=126;WE=241405536;WS=241405518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr2	241405608	rs1042841	A	G	1381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.962;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=21;PP=820;ReadPosRankSum=-1.256;SC=AGCAGGAAGGACAGAAGACCT;SOR=0.792;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=126;TCF=72;TCR=54;TR=58;WE=241405616;WS=241405598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,65:0.46:142
chr2	241405864	rs11892254	C	T	812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=26;PP=544;ReadPosRankSum=1.247;SC=CAGCCCCAGGCCTGGCCTCGC;SOR=0.662;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=56;TCF=2;TCR=54;TR=27;WE=241405872;WS=241405854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,32:0.49:65
chr2	241440020	rs12986801	T	C	4921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=407;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.785;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=123;PP=2962;ReadPosRankSum=0.636;SC=CGCAAGGACATCCCGGCTACT;SOR=0.882;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=380;TCF=162;TCR=218;TR=209;WE=241440028;WS=241440010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:180,227:0.56:407
chr2	241448660	rs59967171	G	GGATA	429.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.282;NF=10;NR=2;PP=389;ReadPosRankSum=-0.907;SC=ATGGATGGATGGATAAATGGC;SOR=0.929;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=12;WE=241448668;WS=241448650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr2	241452198	rs12695025	T	C	2539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.531;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=42;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.693;SC=CATACCCCTATCCAGGTCGCG;SOR=0.649;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=177;TCF=106;TCR=71;TR=103;WE=241452220;WS=241452188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,114:0.58:196
chr2	241452212	rs12695026	T	C	3452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.481;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=65;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.902;SC=GGTCGCGAGGTACACACCTTG;SOR=0.598;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=249;TCF=140;TCR=109;TR=144;WE=241452220;WS=241452188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,156:0.58:269
chr2	241500119	.	T	C	3238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.569;ClippingRankSum=0.000;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.009;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=69;PP=1588;ReadPosRankSum=0.479;SC=CGGCAGAAGCTGGGCGCCGCG;SOR=0.581;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=250;TCF=126;TCR=124;TR=143;WE=241500127;WS=241500109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,157:0.57:277
chr2	241500508	rs10933615	T	C	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.447;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5081;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=45;ReadPosRankSum=0.319;SC=GGCGGGCCTTTAGGGGGGCGG;SOR=0.804;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=5;WE=241500516;WS=241500498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr2	241512712	rs2975773	G	C	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=263;ReadPosRankSum=-0.553;SC=CTGGGGCTGCGCAGGCCTCGG;SOR=0.784;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=47;TCF=17;TCR=30;TR=19;WE=241512720;WS=241512702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,19:0.37:51
chr2	241531737	rs2975762	A	G	1185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=2;PP=904;SC=ACCTTCCCCTACTGTCCTCTT;SOR=4.294;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=34;WE=241531745;WS=241531727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr2	241533845	rs2975763	T	C	1335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.062;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=12;PP=896;ReadPosRankSum=2.251;SC=GGCACGGGGTTGCTGGCAGGA;SOR=1.981;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=47;TCF=34;TCR=13;TR=45;WE=241533853;WS=241533835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,47:0.96:49
chr2	241537421	rs3749166	G	A	5226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQ=59.97;NF=109;NR=78;PP=2965;SC=TCCTGCCTGCGGGCACCTACA;SOR=0.925;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=188;TCF=109;TCR=79;TR=187;WE=241537429;WS=241537411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr2	241537617	rs58715822	TC	T	2060.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=28;PP=1661;SC=CCCCTATCTGTCCTGGCAGAC;SOR=0.922;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=42;TCF=13;TCR=29;TR=41;WE=241537625;WS=241537607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr2	241538074	rs2975766	A	G	6142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=111;NR=101;PP=2965;SC=GCAGGTCTCCATCATGGCAGT;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=212;TCF=111;TCR=101;TR=212;WE=241538082;WS=241538064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr2	241538229	rs2975767	A	G	1080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=30;PP=860;SC=CCCTGCCAGGAGGCTGCGGCC;SOR=3.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=34;WE=241538237;WS=241538219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	241555784	rs12052926	G	T	921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=8;PP=653;ReadPosRankSum=0.881;SC=TTCCTCCTCCGTCTCTCTATT;SOR=0.572;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=46;TCF=36;TCR=10;TR=35;WE=241555792;WS=241555774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,36:0.75:48
chr2	241555991	rs1509	G	T	1448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.693;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=39;PP=971;ReadPosRankSum=0.289;SC=CTGCCAGGGGGCTCATGATAT;SOR=1.345;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=89;TCF=33;TCR=56;TR=57;WE=241555999;WS=241555981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,61:0.63:97
chr2	241558397	rs6437353	G	A	1736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.422;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=28;PP=1000;ReadPosRankSum=0.170;SC=ACTCCACACCGTGGCAGTGAA;SOR=0.544;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=121;TCF=73;TCR=48;TR=69;WE=241558405;WS=241558387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,79:0.59:133
chr2	241558547	rs7582275	G	A	2175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=55;PP=1327;ReadPosRankSum=-1.791;SC=GGGGGTTTGTGCCACCTTAGA;SOR=0.714;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=130;TCF=51;TCR=79;TR=90;WE=241558555;WS=241558537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,96:0.70:137
chr2	241569329	rs2975785	A	G	1499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.794;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=20;PP=867;ReadPosRankSum=-0.964;SC=CCCCCTGCTCACTCTCTGCTG;SOR=1.172;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=110;TCF=71;TCR=39;TR=64;WE=241569337;WS=241569319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,71:0.61:117
chr2	241570249	rs3749172	A	C	3502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.984;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=86;PP=1837;ReadPosRankSum=-0.281;SC=CGTGGCTCCCAGTGCTAAGGC;SOR=0.766;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=236;TCF=89;TCR=147;TR=137;WE=241570257;WS=241570239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,162:0.60:269
chr2	241570391	rs2975786	A	G	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=194;ReadPosRankSum=-2.189;SC=AAGGAGCCCGAGATCAGCCCT;SOR=1.127;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=12;WE=241570399;WS=241570381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr2	241619708	rs138708092	G	A	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.67;MQRankSum=-0.842;QD=8.80;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr2	241621869	rs74882485	G	A	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.865;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-1.955;NF=10;NR=2;PP=190;ReadPosRankSum=-0.454;SC=GCAGAGGCGCGTCAGGGTGCA;SOR=1.911;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=34;TCF=23;TCR=11;TR=12;WE=241621877;WS=241621859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,13:0.37:35
chr2	241622209	rs4081908	T	C	1168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.568;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-8.050;NF=31;NR=29;PP=633;ReadPosRankSum=0.406;SC=TCACAGAGGGTGAAGGTGGCA;SOR=0.643;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=163;TCF=88;TCR=75;TR=60;WE=241622217;WS=241622199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,64:0.36:179
chr2	241627928	rs1560619	A	G	1605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.796;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=39;PP=996;ReadPosRankSum=-1.126;SC=TGCACAGGACAGGTAGGCAGA;SOR=0.674;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=205;TCF=112;TCR=93;TR=78;WE=241627936;WS=241627918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,86:0.37:232
chr2	241631267	rs71428453	A	G	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.463;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.679;NF=15;NR=4;PP=236;ReadPosRankSum=-1.369;SC=TGTGGGAACCAGCCAGCTCCT;SOR=0.426;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=19;WE=241631275;WS=241631257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr2	241631413	rs71428454	T	G	750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.583;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-2.372;NF=18;NR=19;PP=366;ReadPosRankSum=0.998;SC=TCCAAGGCCCTGCTCCCAGTG;SOR=0.837;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=109;TCF=60;TCR=49;TR=37;WE=241631421;WS=241631403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,43:0.35:123
chr2	241631476	rs4328629	C	G	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.439;NF=14;NR=11;PP=303;ReadPosRankSum=1.286;SC=GCAGCTCGGGCCCTGCTGCCT;SOR=0.770;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=76;TCF=41;TCR=35;TR=25;WE=241631484;WS=241631466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,25:0.31:81
chr2	241659368	rs6437368	C	A	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.287;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=272;ReadPosRankSum=-0.029;SC=GAAGTGCTGCCCACTGCAGGC;SOR=1.609;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=16;WE=241659376;WS=241659358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
chr2	241666418	rs2060194	G	A	431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.202;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=320;ReadPosRankSum=-0.063;SC=CAGCCAGGCCGGGGACATGCA;SOR=0.486;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=14;TCR=37;TR=21;WE=241666426;WS=241666408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,21:0.39:54
chr2	241674222	rs3755533	T	C	1984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=50;PP=1254;SC=GGGAGCGGGGTGGGGGACAGG;SOR=2.093;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=71;TCF=20;TCR=51;TR=70;WE=241674230;WS=241674212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr2	241684647	rs140364008	C	T	114.88	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5210;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=81;ReadPosRankSum=-0.431;SC=GGCCCCCATGCCCCAGCTGTA;SOR=0.941;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=5;WE=241684655;WS=241684642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr2	241690076	.	G	C	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.009;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.623;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=196;ReadPosRankSum=-0.089;SC=CAAAGCAGAGGGAAGCCGCCG;SOR=1.262;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=39;TCF=8;TCR=31;TR=15;WE=241690084;WS=241690066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,16:0.37:43
chr2	241706757	rs35663732	T	C	2968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=63;PP=1575;ReadPosRankSum=-1.644;SC=TGACGAGGTGTGGTGTCTGCA;SOR=0.666;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=242;TCF=127;TCR=115;TR=132;WE=241706765;WS=241706747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,146:0.55:267
chr2	241713717	rs148957025	T	G	1741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=50;PP=1217;ReadPosRankSum=-0.146;SC=GAGGGGGATCTAGGCCCCAGG;SOR=0.755;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=118;TCF=29;TCR=89;TR=67;WE=241713725;WS=241713707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,72:0.58:125
chr2	241722174	rs187923456	C	A	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=140;ReadPosRankSum=-0.766;SC=CTCCCCCAGGCAGGGTCCCTC;SOR=0.593;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=9;WE=241722182;WS=241722164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr2	241722613	rs2288749	A	G	927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=28;PP=666;ReadPosRankSum=0.441;SC=GGACCTGTGCAGTGTGGAGTG;SOR=0.800;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=9;TCR=41;TR=34;WE=241722621;WS=241722603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,36:0.67:54
chr2	241725637	rs74002922	G	A	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5065;FS=2.452;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=182;ReadPosRankSum=-1.852;SC=CCACACCTCCGCGGGGGCACA;SOR=1.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=11;WE=241725645;WS=241725627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr2	241726646	rs2288746	A	G	2221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=385;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.815;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=56;PP=1478;ReadPosRankSum=0.229;SC=CCCAGCGGCCAACGGCAGGCG;SOR=0.761;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=363;TCF=196;TCR=167;TR=123;WE=241726654;WS=241726636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:253,130:0.34:383
chr2	241728843	rs2288745	C	T	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.391;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=25;PP=538;ReadPosRankSum=0.840;SC=CCAGACAAGCCAGGCCCCCAA;SOR=1.085;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=58;TCF=19;TCR=39;TR=36;WE=241728851;WS=241728833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,38:0.63:60
chr2	241737017	rs10167412	C	A	1930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=24;PP=1229;ReadPosRankSum=1.058;SC=GACCATGGCCCCCAGCAACCC;SOR=0.632;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=88;TCR=39;TR=78;WE=241737025;WS=241737007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,82:0.61:134
chr2	241808825	rs140694338	AGGCCTCCCT	A	420.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.628;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.083;NF=0;NR=10;PP=2976;ReadPosRankSum=2.706;SC=CCATCCTTCAAGGCCTCCCTG;SOR=3.334;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=10;WE=241808841;WS=241808815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr2	241810957	rs10196315	C	T	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=306;ReadPosRankSum=-1.174;SC=TCCTTCTGCCCCTGGTCCCCA;SOR=0.653;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=18;WE=241810965;WS=241810947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr2	241812566	rs12997245	G	A	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=425;ReadPosRankSum=0.310;SC=CCGATGCTGCGGATTCGGCCC;SOR=0.459;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=23;WE=241812574;WS=241812556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,24:0.69:35
chr2	241815308	rs12464426	A	G	3388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.974;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=62;PP=2162;ReadPosRankSum=1.031;SC=ATCTGCCCCCAACCCTGCCCA;SOR=0.783;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=247;TCF=144;TCR=103;TR=151;WE=241815316;WS=241815298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,159:0.60:263
chr2	241815473	rs12695032	G	A	1141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.010;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=39;PP=911;ReadPosRankSum=0.751;SC=CTGGATTGTCGAGGGCGCGGC;SOR=1.006;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=94;TCF=22;TCR=72;TR=49;WE=241815481;WS=241815463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,48:0.51:94
chr2	241816545	rs6732985	C	T	1534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.807;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=19;PP=920;ReadPosRankSum=-0.919;SC=AGCAGTGCTGCGGAGGATGCC;SOR=1.209;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=109;TCF=73;TCR=36;TR=62;WE=241816553;WS=241816535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,68:0.56:122
chr2	241818279	rs4273214	C	A	4182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.864;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=98;PP=2354;ReadPosRankSum=1.899;SC=ACACACCTGTCCCATGCCCAC;SOR=0.807;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=306;TCF=149;TCR=157;TR=186;WE=241818287;WS=241818269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,199:0.61:327
chr2	241827618	rs6707763	T	C	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=1;PP=21;ReadPosRankSum=0.847;SC=GCTGCTGACCTGGGAGAGAAT;SOR=0.105;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=3;WE=241827626;WS=241827608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr2	241827696	rs4675869	A	G	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=120;ReadPosRankSum=-1.174;SC=AGGCCCCCGCAGCCAGCACCC;SOR=0.693;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=25;TCF=16;TCR=9;TR=11;WE=241827704;WS=241827686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr2	241827907	rs199992313	G	A	1572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=41;PP=851;ReadPosRankSum=0.057;SC=GGTCCAGGCCGCTGCCCTGCA;SOR=0.691;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=241;TCF=123;TCR=118;TR=86;WE=241827915;WS=241827897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,91:0.36:255
chr2	241828012	rs6708304	T	C	2186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.283;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=45;PP=1211;ReadPosRankSum=0.080;SC=CGCCCTGCAGTTCTGCCCAGT;SOR=0.584;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=144;TCF=65;TCR=79;TR=86;WE=241828020;WS=241828002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,97:0.61:159
chr2	241828034	rs6707568	A	G	4654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=50;NR=60;PP=1768;SC=CTCGGGCGCCAGGAAGAGCAC;SOR=0.993;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=50;TCR=60;TR=110;WE=241828042;WS=241828024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr2	241830944	rs10171053	G	T	3253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.077;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=27;PP=1132;ReadPosRankSum=1.570;SC=TGACCAGGAGGGTGCGCCTAC;SOR=0.965;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=130;TCF=82;TCR=48;TR=80;WE=241830952;WS=241830934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,87:0.60:144
chr2	241830969	rs10171067	G	A	3762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.003;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=36;PP=1426;ReadPosRankSum=0.678;SC=AGAGCTGGGCGCTGGCCGGCA;SOR=0.864;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=155;TCF=96;TCR=59;TR=99;WE=241830977;WS=241830959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,105:0.62:168
chr2	241831005	rs10195453	C	T	3073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.563;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=51;PP=2016;ReadPosRankSum=0.513;SC=GGCTGAGGATCCTTCTCAAGC;SOR=0.805;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=229;TCF=136;TCR=93;TR=133;WE=241831013;WS=241830995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,139:0.57:245
chr2	241831264	rs6737320	G	A	2538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.492;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=62;PP=1593;ReadPosRankSum=-0.437;SC=CTGCCAACTTGGCCCCTGCCC;SOR=0.732;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=213;TCF=95;TCR=118;TR=113;WE=241831272;WS=241831254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,122:0.55:223
chr2	241831296	rs6709469	C	G	2421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.293;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=58;PP=1522;ReadPosRankSum=-0.539;SC=TCACCTGCAGCCCTCTCTGCT;SOR=0.962;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=186;TCF=86;TCR=100;TR=105;WE=241831304;WS=241831286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,113:0.57:197
chr2	241831471	rs6709742	CA	TG	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-3.650;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=208;ReadPosRankSum=-0.978;SC=CAGCGTCCTACATGAGGTTTT;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=5;WE=241831480;WS=241831461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr2	241834944	rs4468809	T	C	2829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.170;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.336;NF=68;NR=44;PP=1791;ReadPosRankSum=1.303;SC=CGATGGCTGCTACCAGCAGGT;SOR=0.790;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=177;TCF=106;TCR=71;TR=112;WE=241834952;WS=241834934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,123:0.64:193
chr2	241835379	rs12105122	G	A	552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.263;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=370;ReadPosRankSum=-2.704;SC=GCACCTGCACGGCCATGGCTG;SOR=1.136;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=38;TCF=18;TCR=20;TR=24;WE=241835387;WS=241835369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,25:0.61:41
chr2	241835421	rs13426919	A	G	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=199;ReadPosRankSum=-1.174;SC=GCATCCCTTCAACAGTGGCAG;SOR=1.022;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=8;WE=241835440;WS=241835411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr2	241835432	rs10933514	G	A	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.559;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=199;ReadPosRankSum=0.197;SC=ACAGTGGCAGGTGAGGGCCAG;SOR=0.646;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=6;WE=241835440;WS=241835411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr2	241859255	rs4675790	T	G	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.808;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.282;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=52;ReadPosRankSum=0.825;SC=CGGGCTCAGATCTGGGACCCC;SOR=0.105;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=6;WE=241859263;WS=241859245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr2	241861904	rs4514870	G	C	794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.623;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=11;PP=441;ReadPosRankSum=1.431;SC=CCCAGCCCCTGCCTGGCGGGT;SOR=0.333;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=47;TCF=32;TCR=15;TR=31;WE=241861912;WS=241861894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,35:0.66:53
chr2	241865156	rs4675847	T	C	2903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=58;PP=1779;ReadPosRankSum=0.770;SC=CCGGCCTCTGTCAGGTGAACG;SOR=0.670;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=202;TCF=109;TCR=93;TR=124;WE=241865164;WS=241865146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,135:0.61:222
chr2	241868956	rs4407242	G	A	432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=3.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.873;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=362;ReadPosRankSum=-1.219;SC=ACTCCGCTCCGTTACAGCCTA;SOR=3.148;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=18;WE=241868964;WS=241868946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
chr2	241869378	rs6756731	A	T	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=283;ReadPosRankSum=-0.924;SC=ACGTCCCCAGATCATCTCCTG;SOR=1.714;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=15;WE=241869386;WS=241869373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,17:0.77:22
chr2	241871956	rs12472087	G	T	662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.800;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=489;ReadPosRankSum=-0.545;SC=GGTCCCTGCAGTGCACTTTGA;SOR=1.382;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=42;TCF=15;TCR=27;TR=24;WE=241871964;WS=241871946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,26:0.59:44
chr2	241872597	rs4441463	A	G	2266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.556;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=42;PP=1064;ReadPosRankSum=-1.043;SC=GCCAGTCTCCAGGAGCAGCTG;SOR=0.750;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=157;TCF=84;TCR=73;TR=92;WE=241872605;WS=241872587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,108:0.60:180
chr2	241874272	rs73107806	C	T	208.96	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.6715;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=2;PP=148;ReadPosRankSum=1.645;SC=CCTTTCCCAGCGGCAACAGCC;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=10;WE=241874280;WS=241874262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,9:0.90:10
chr2	241874559	rs12618707	T	C	710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.871;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=21;PP=452;ReadPosRankSum=-0.534;SC=CTAGGCCTTCTTTCCATCCTC;SOR=1.078;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=82;TCF=36;TCR=46;TR=33;WE=241874567;WS=241874549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,36:0.39:92
chr2	241889171	rs12479396	G	A	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=112;ReadPosRankSum=-1.531;SC=ACCAGGTCCCGGGGAATGGCA;SOR=0.760;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=8;WE=241889179;WS=241889161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr2	241889937	rs4077132	A	G	1936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=44;PP=1051;ReadPosRankSum=0.472;SC=GGTGATGGTGAGGCTGGGGGG;SOR=0.691;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=147;TCF=64;TCR=83;TR=80;WE=241889945;WS=241889927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,91:0.56:162
chr2	241898824	rs10169006	A	G	1511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=35;PP=933;ReadPosRankSum=0.287;SC=GAGAGCCTCCAGGACCTAGCG;SOR=0.634;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=113;TCF=56;TCR=57;TR=66;WE=241898832;WS=241898814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,72:0.58:124
chr2	241898947	rs10179839	G	T	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=2.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.496;SOR=0.349;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,25:0.64:39
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chr2	241905779	rs12466789	A	G	4368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=75;NR=85;PP=2604;SC=CGTGCAGGACATCCTGCGGGA;SOR=0.938;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=160;TCF=75;TCR=85;TR=160;WE=241905787;WS=241905769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr2	241925219	.	C	T	51	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=4;NR=0;PP=51;QD=21.4428031368;SC=ACCCACTCCACACACACCCAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=4;WE=241925227;WS=241925210;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
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chr2	241929228	rs10200024	A	G	1031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.490;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=23;PP=538;ReadPosRankSum=2.775;SC=CACCAGCAGCAGGTAAAGGTG;SOR=0.820;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=98;TCF=51;TCR=47;TR=46;WE=241929236;WS=241929218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,54:0.47:115
chr2	241973223	rs61746865	C	T	4697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=390;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.211;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=113;PP=2848;ReadPosRankSum=-0.613;SC=ATGAGTCCATCGTGTGGACCA;SOR=0.628;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=358;TCF=164;TCR=194;TR=208;WE=241973231;WS=241973213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,224:0.58:386
chr2	241974289	rs2074822	G	A	376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=11;PP=296;SC=CACCTCAGGCGTGTGAAACTA;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=241974297;WS=241974279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	241976615	rs34203344	CG	C	2509.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.489;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=3.309;NF=21;NR=35;PP=1764;ReadPosRankSum=-1.087;SC=ACTCCTCATCCGGGTTCCCGC;SOR=0.753;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=143;TCF=44;TCR=99;TR=56;WE=241976623;WS=241976605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,94:0.40:237
chr2	241979550	rs7571117	T	C	6416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=117;NR=110;PP=2965;SC=AGGTGGAGAATGGCTCTGCGG;SOR=0.760;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=227;TCF=117;TCR=110;TR=227;WE=241979567;WS=241979540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr2	241980093	rs78127965	C	G	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.026;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=391;ReadPosRankSum=-0.462;SC=AACCCCTTCCCCTCTCTGGGC;SOR=1.338;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=23;WE=241980101;WS=241980083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,27:0.56:48
chr2	241980123	rs2108487	A	G	907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.877;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=14;PP=556;ReadPosRankSum=0.506;SC=CATCTGTGAAATGCCAGGAGG;SOR=0.539;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=75;TCF=51;TCR=24;TR=40;WE=241980131;WS=241980113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,42:0.51:83
chr2	241987554	rs7590504	G	A	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-3.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.062;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=250;ReadPosRankSum=-0.574;SC=GGGAGATGCTGAGCTCCATGG;SOR=0.223;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=17;WE=241987562;WS=241987544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr2	241991029	rs10206324	A	G	1240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=9;PP=675;SC=CCCCTGCTGCAGCCAGGCCCC;SOR=1.708;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=42;WE=241991037;WS=241991019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr2	241991875	rs57214830	G	A	1619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.414;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=38;PP=845;ReadPosRankSum=1.590;SC=TGGGACGCCGGTGCCAGGCAG;SOR=0.936;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=112;TCF=50;TCR=62;TR=68;WE=241991883;WS=241991865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,76:0.62:122
chr2	242002306	rs74820922	G	A	1999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=53;PP=1188;ReadPosRankSum=-1.580;SC=CTATGAGGGCGCCCACTGTGA;SOR=0.734;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=123;TCF=42;TCR=81;TR=80;WE=242002314;WS=242002296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,87:0.64:137
chr2	242002828	rs7581709	C	T	1761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.678;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=17;PP=1002;ReadPosRankSum=-0.770;SC=GGAGGTGGCACGCCTCCCGAG;SOR=0.770;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=125;TCF=91;TCR=34;TR=70;WE=242002836;WS=242002818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,80:0.58:138
chr2	242003487	rs17852471	C	T	2417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.490;HP=6;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=49;PP=1398;ReadPosRankSum=-0.135;SC=AGAGCGGCGGCGGGGCCTACC;SOR=0.652;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=198;TCF=105;TCR=93;TR=103;WE=242003495;WS=242003477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,116:0.53:220
chr2	242003558	rs34771867	T	C	2700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=45;NR=61;PP=1536;SC=GCGGCAGGCCTGCCTGCTCCC;SOR=1.106;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=45;TCR=62;TR=106;WE=242003566;WS=242003548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr2	242004199	rs2286319	G	C	10695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=104;NR=67;PP=2965;SC=GAGCAAGGGCGGGGCTGGAGC;SOR=1.101;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=171;TCF=104;TCR=67;TR=171;WE=242004207;WS=242004189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr2	242004219	rs11464431	T	TG	13423.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=60;NR=86;PP=2957;SC=CAGGGACCCCTGCCACGCCCC;SOR=1.024;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=157;TCF=65;TCR=92;TR=146;WE=242004227;WS=242004209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,311:1.00:311
chr2	242004866	rs2286321	A	G	4312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.781;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=84;PP=2455;ReadPosRankSum=-0.121;SC=ACCGCCGCACAGACTTTGTGG;SOR=0.469;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=302;TCF=143;TCR=159;TR=171;WE=242004874;WS=242004856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,200:0.60:334
chr2	242011151	rs6760731	A	G	2620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=62;PP=2244;SC=TGCCCCACCCATCGGCCCCAT;SOR=1.295;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=107;TCF=45;TCR=62;TR=102;WE=242011159;WS=242011141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr2	242021000	rs140631844	A	ATCAGG	4204.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.266;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=23;PP=2834;ReadPosRankSum=-0.530;SC=GCCACCCTGCATCAGGTCATC;SOR=0.572;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=113;TCF=66;TCR=47;TR=51;WE=242021008;WS=242020990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,100:0.58:173
chr2	242021216	rs2302045	G	A	2340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=67;PP=1659;ReadPosRankSum=-0.803;SC=TCGGTAAGTCGGGGCTTGGCC;SOR=0.683;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=154;TCF=48;TCR=106;TR=98;WE=242021224;WS=242021206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,100:0.63:159
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chr2	242021742	rs2108485	G	T	3478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.874;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=70;PP=2201;ReadPosRankSum=0.347;SC=CGAGACAAAGGCCTTTCCAGT;SOR=0.631;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=277;TCF=149;TCR=128;TR=147;WE=242021750;WS=242021732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,161:0.53:302
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chr2	242047530	rs34777851	G	T	3301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.633;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=63;PP=2044;ReadPosRankSum=0.716;SC=AAAAAAAGTGGCTGGTCTCTA;SOR=0.557;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=257;TCF=148;TCR=109;TR=143;WE=242047538;WS=242047520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,154:0.55:278
chr2	242047750	rs6708265	A	G	1196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.258;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=35;PP=837;ReadPosRankSum=0.275;SC=ACGCCACGGCACTCAGCGCAG;SOR=0.437;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=77;TCF=18;TCR=59;TR=48;WE=242047758;WS=242047740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,49:0.62:79
chr2	242062117	rs2302048	G	A	2298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.718;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=38;PP=1488;ReadPosRankSum=0.467;SC=AGTGGTGCCCGGCGCCACTCC;SOR=0.955;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=161;TCF=96;TCR=65;TR=100;WE=242062133;WS=242062107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,106:0.60:178
chr2	242062410	rs2302051	C	A	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=232;ReadPosRankSum=0.327;SC=AGCAGCCGCCCGAGGCAGGTG;SOR=0.446;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=12;WE=242062418;WS=242062400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr2	242063350	rs13385610	T	C	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.716;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=10;NR=1;PP=182;ReadPosRankSum=-1.665;SC=CAGGCATTGATTGCAAATACC;SOR=1.347;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=11;WE=242063358;WS=242063340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr2	242063448	rs2302052	G	A	1760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.838;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=18;PP=1080;ReadPosRankSum=-1.345;SC=GGGTCCTGGCGGCTGAGTCGC;SOR=1.022;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=102;TCF=72;TCR=30;TR=69;WE=242063456;WS=242063438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,76:0.70:109
chr2	242065594	rs147286655	T	C	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.800;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=269;ReadPosRankSum=-0.891;SC=CTTCTTCCTATGGGGCCCGGG;SOR=1.022;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=95;TCF=64;TCR=31;TR=30;WE=242065602;WS=242065584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,33:0.30:109
chr2	242065624	rs2240541	A	G	3944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=52;PP=2253;ReadPosRankSum=-1.165;SC=GCCGTAAGCCATCTCGATGGT;SOR=1.088;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=146;TCF=92;TCR=54;TR=142;WE=242065632;WS=242065614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,159:0.98:163
chr2	242066314	rs2240542	T	C	3917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.551;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=66;PP=2352;ReadPosRankSum=1.804;SC=CCAGGGCTCCTGCAAGGCTCA;SOR=0.574;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=255;TCF=155;TCR=100;TR=160;WE=242066322;WS=242066304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,170:0.63:270
chr2	242066830	rs2240544	G	A	3352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.308;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=81;PP=2133;ReadPosRankSum=-1.299;SC=CCTGTTCACCGTGCACTGGCA;SOR=0.858;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=215;TCF=92;TCR=123;TR=136;WE=242066838;WS=242066820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,147:0.62:238
chr2	242072280	rs11684830	G	A	2480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.531;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=46;PP=1519;ReadPosRankSum=0.798;SC=CTCCCACCAAGGGACTTACCC;SOR=0.463;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=268;TCF=163;TCR=105;TR=107;WE=242072288;WS=242072270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,120:0.41:294
chr2	242077496	rs1470414	C	T	1992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.283;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=52;PP=1209;ReadPosRankSum=2.514;SC=CATGACGTGACGGTGCCCTGG;SOR=0.891;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=279;TCF=138;TCR=141;TR=98;WE=242077504;WS=242077486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:190,107:0.36:297
chr2	242079007	rs2074828	A	G	2286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.415;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=60;PP=1470;ReadPosRankSum=0.569;SC=ACTGCAAAACATTAGTGAAGC;SOR=0.645;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=291;TCF=139;TCR=152;TR=116;WE=242079015;WS=242078997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:202,124:0.38:326
chr2	242082222	rs2074834	C	A	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.713;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=123;ReadPosRankSum=0.467;SC=TTTCCACGCGCTAAGGCCTGC;SOR=1.981;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=8;WE=242082230;WS=242082212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr2	242082262	rs6709462	T	C	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=234;ReadPosRankSum=0.386;SC=CAGAGAGCGCTGTCCTGCTCT;SOR=0.796;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=41;TCF=28;TCR=13;TR=20;WE=242082270;WS=242082252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,21:0.46:46
chr2	242082480	rs758068	A	C	1071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=25;PP=555;ReadPosRankSum=-0.596;SC=CAAGCTTCCAACTCTAACAAC;SOR=0.690;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=138;TCF=72;TCR=66;TR=51;WE=242082488;WS=242082470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,59:0.38:156
chr2	242082559	rs2066941	T	C	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.43;ReadPosRankSum=0.546;SOR=0.877;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,9:0.20:46
chr2	242088921	rs3806599	A	C	955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=13;PP=593;SC=CACAGCGACTAGCACCGATTG;SOR=1.371;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=21;TCR=13;TR=34;WE=242088929;WS=242088911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr2	242099961	rs2017989	C	T	2407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=50;PP=1435;SC=AGCTAGCGGGCTGTGTGTGGA;SOR=1.408;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=33;TCR=51;TR=83;WE=242099969;WS=242099951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
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chr2	242129524	rs34069570	G	A	2134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.542;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=43;PP=1171;ReadPosRankSum=1.069;SC=CGTCCTGATCGATGTGAGCCC;SOR=0.625;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=166;TCF=90;TCR=76;TR=92;WE=242129539;WS=242129514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,102:0.55:185
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chr2	242139491	rs2013250	C	T	1335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.262;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=21;PP=888;ReadPosRankSum=-0.067;SC=GAGCCACTGACGTTTCCTTCC;SOR=0.837;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=173;TCF=117;TCR=56;TR=66;WE=242139499;WS=242139481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,68:0.37:183
chr2	242140785	rs78154103	C	G	2711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=488;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.176;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=86;PP=1809;ReadPosRankSum=0.193;SC=GTGGGGGTTCCCTGCCGCGGG;SOR=0.798;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=451;TCF=211;TCR=240;TR=151;WE=242140793;WS=242140775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:324,160:0.33:484
chr2	242141719	rs2074840	C	T	1548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.553;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=37;PP=809;ReadPosRankSum=-1.276;SC=CCCTGCATGACGTGAGCTCGG;SOR=0.748;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=162;TCF=71;TCR=91;TR=65;WE=242141727;WS=242141709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,78:0.42:185
chr2	242142737	rs1179530	T	C	912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=7;PP=619;SC=CCACAGGCCGTTCGCCCCCAG;SOR=2.165;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=30;WE=242142745;WS=242142727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr2	242151585	rs7593101	C	T	3447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=524;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.139;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=85;PP=2160;ReadPosRankSum=0.879;SC=TCAACTTCTACTCCTCACCCG;SOR=0.606;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=484;TCF=252;TCR=232;TR=175;WE=242151593;WS=242151575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:331,191:0.37:522
chr2	242151748	rs7566006	G	C	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.83;ReadPosRankSum=0.406;SOR=0.614;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,10:0.19:53
chr2	242157228	rs78605785	G	T	1401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=39;PP=758;ReadPosRankSum=1.967;SC=ACCGGCGCCCGGTGGCCGAGC;SOR=0.701;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=258;TCF=122;TCR=136;TR=75;WE=242157236;WS=242157218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:208,89:0.30:297
chr2	242163359	rs7590653	G	A	2936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=384;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.225;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=68;PP=1850;ReadPosRankSum=1.119;SC=TGAGCAGCCCGAGGGCTCAGA;SOR=0.615;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=338;TCF=165;TCR=173;TR=136;WE=242163367;WS=242163349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:231,153:0.40:384
chr2	242168976	rs15129	T	C	1083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.417;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=9;PP=592;ReadPosRankSum=-2.183;SC=TGGTTGGGTTTGGGTCAGCAG;SOR=1.185;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=60;TCF=44;TCR=16;TR=38;WE=242168984;WS=242168966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,44:0.63:70
chr2	242176019	rs2305073	T	C	1579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.598;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=22;PP=830;ReadPosRankSum=0.860;SC=GGGGGGCACATGGACACATAC;SOR=0.504;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=100;TCF=67;TCR=33;TR=64;WE=242176027;WS=242176009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,72:0.63:115
chr2	242179134	rs10153800	G	A	2232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.434;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=43;PP=1298;ReadPosRankSum=1.415;SC=CCATCACCCCGCCATACTCTT;SOR=0.729;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=261;TCF=145;TCR=116;TR=100;WE=242179142;WS=242179124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,116:0.40:292
chr2	242192848	rs7578199	T	C	3305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=400;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.99;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=80;PP=2324;ReadPosRankSum=-0.536;SC=CTGGGCCACATTGACATCCTC;SOR=0.688;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=367;TCF=179;TCR=188;TR=156;WE=242192856;WS=242192838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:233,166:0.42:399
chr2	242203916	rs11891776	A	C	3001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=49;PP=1679;SC=CAGGCTCCAGAGGGTTCCTGG;SOR=0.841;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=105;TCF=56;TCR=49;TR=105;WE=242203924;WS=242203906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr2	242206956	rs35334418	C	T	7666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=159;NR=108;PP=2965;SC=CTCCTAACAGCGACCTTGGTT;SOR=1.053;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=267;TCF=159;TCR=108;TR=267;WE=242206964;WS=242206946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,289:1.00:289
chr2	242255830	rs13006939	C	T	2417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.898;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=53;PP=1709;ReadPosRankSum=0.864;SC=GCCATTTCCTCCCTGAGGCGT;SOR=0.778;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=284;TCF=154;TCR=130;TR=120;WE=242255838;WS=242255820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,122:0.41:298
chr2	242259614	rs6745662	G	A	3869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=49;PP=2180;SC=CCTTTTCTCTGTAGAGGCTTG;SOR=1.125;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=81;TCR=49;TR=130;WE=242259622;WS=242259604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr2	242274489	rs56390510	G	C	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=208;ReadPosRankSum=-1.012;SC=TTAACCGATTGAATGGTGTCA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=10;WE=242274497;WS=242274479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr2	242283071	rs6750169	C	T	923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=1;PP=734;SC=TTGTAGTCAACAGCAATGTGT;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=30;WE=242283079;WS=242283061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	242283094	rs6707518	A	G	2095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=12;PP=1468;SC=AGTCTGTGCTAATGTTCTCGT;SOR=2.406;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=52;TCR=12;TR=64;WE=242283102;WS=242283084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr2	242287487	rs12619647	T	G	744.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.816;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=5;PP=764;ReadPosRankSum=0.043;SC=TAGAATTTTTTGGGGGGGTAG;SOR=1.402;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=51;TCF=43;TCR=8;TR=34;WE=242287495;WS=242287477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,33:0.65:51
chr2	242289663	rs3217007	C	CATT	2410.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=37;PP=1948;SC=CAGTTACTAACATTGTGTCAG;SOR=2.917;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=38;WE=242289671;WS=242289653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr2	242312477	rs201276541	G	GT	185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=18.58;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,9:0.90:10
chr2	242374238	rs56352948	G	A	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-0.352;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=30;ReadPosRankSum=-2.128;SC=GCAATAGAGCGAGACTCAGTC;SOR=0.223;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=4;WE=242374246;WS=242374228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
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chr2	242402061	rs13011791	T	A	1176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.643;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=39;PP=743;ReadPosRankSum=1.131;SC=GATTTTTTTTTAAAATAAATC;SOR=1.197;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=198;TCF=78;TCR=120;TR=58;WE=242402069;WS=242402042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,64:0.31:209
chr2	242405021	rs2240482	C	T	6422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=520;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.522;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=136;NR=136;PP=2962;ReadPosRankSum=1.078;SC=CAGTGCAGGTCGTGCATTGAC;SOR=0.665;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=487;TCF=248;TCR=239;TR=272;WE=242405029;WS=242405011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:230,289:0.56:519
chr2	242407478	rs10933558	A	G	579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.012;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=4;PP=435;ReadPosRankSum=-0.839;SC=GGCACCTGCCATCAAGGAAAA;SOR=1.578;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=78;TCF=59;TCR=19;TR=30;WE=242407486;WS=242407468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,31:0.36:85
chr2	242407746	rs10933559	A	G	927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.586;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=31;PP=583;ReadPosRankSum=0.239;SC=TGCGCCGCCTATGCGGACATT;SOR=1.003;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=118;TCF=35;TCR=83;TR=42;WE=242407754;WS=242407736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,47:0.36:132
chr2	242415523	rs73006397	C	T	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.197;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=95;ReadPosRankSum=0.000;SC=CACAGTGGCTCATACCTGTAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=7;WE=242415531;WS=242415513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr2	242432704	rs2271030	G	C	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=337;ReadPosRankSum=0.070;SC=ATGCTGTCTTGCAGGATGACT;SOR=0.722;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=52;TCF=43;TCR=9;TR=24;WE=242432712;WS=242432694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,25:0.44:57
chr2	242433348	rs2018761	A	G	2995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=64;NR=39;PP=1563;SC=TGCTTGTCCCATATCCTGGGT;SOR=0.978;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=103;TCF=64;TCR=39;TR=103;WE=242433356;WS=242433338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr2	242440221	rs13013693	G	A	2284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=60;PP=1537;ReadPosRankSum=-0.211;SC=TCTGGGACCGGAGACAAACCC;SOR=0.702;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=306;TCF=154;TCR=152;TR=118;WE=242440229;WS=242440211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:200,123:0.38:323
chr2	242443377	rs35172632	G	A	2402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.568;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=46;PP=1366;ReadPosRankSum=2.472;SC=CGACACTTCCGTGTGAAACTG;SOR=0.431;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=200;TCF=121;TCR=79;TR=106;WE=242443385;WS=242443367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,114:0.51:222
chr2	242573211	rs7424328	T	C	5663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=99;PP=2965;SC=GCTCCTCTGCTGGTGGCGGCA;SOR=0.731;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=201;TCF=102;TCR=99;TR=201;WE=242573219;WS=242573201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr2	242577022	rs4675796	C	T	1219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=24;PP=686;ReadPosRankSum=-0.884;SC=TCGTCTTCGCCGCCTGCGCCG;SOR=0.674;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=145;TCF=82;TCR=63;TR=54;WE=242577030;WS=242577012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,64:0.38:167
chr2	242590237	rs4464318	T	C	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=192;ReadPosRankSum=0.302;SC=AGGGCCTCCTTCTCTTTCCTA;SOR=0.368;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=11;WE=242590245;WS=242590236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr2	242590338	rs35731596	A	G	2689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.314;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=35;PP=1675;ReadPosRankSum=-1.155;SC=TGTTCTCTTCAGCACAGAAAT;SOR=0.950;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=191;TCF=128;TCR=63;TR=115;WE=242590346;WS=242590328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,127:0.60:213
chr2	242593114	rs4567973	A	G	2427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.105;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=66;PP=1604;ReadPosRankSum=-1.302;SC=AGAGCAGACCACAGGTAAAAC;SOR=0.791;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=193;TCF=84;TCR=109;TR=116;WE=242593122;WS=242593104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,117:0.58:203
chr2	242594622	rs6712888	C	T	784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.892;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=14;PP=545;ReadPosRankSum=1.007;SC=CCTGGCACCACGTGCCACCAG;SOR=0.433;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=95;TCF=67;TCR=28;TR=40;WE=242594630;WS=242594612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,40:0.40:100
chr2	242606036	rs6709768	G	C	5898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=446;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=116;NR=127;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.139;SC=TGCTTGGTTAGTGAAAGCATG;SOR=0.709;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=409;TCF=196;TCR=213;TR=243;WE=242606044;WS=242606026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,263:0.59:446
chr2	242607483	rs7565540	GC	TT	1071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;JOINED;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=870;ReadPosRankSum=-0.491;SC=AGGCCCTTGGGCCCCCTATGG;SOR=0.483;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=20;WE=242607492;WS=242607473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,27:0.73:37
chr2	242610253	rs35454903	T	C	1280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.748;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=35;PP=610;ReadPosRankSum=0.301;SC=AGACAGGCAGTGGGGCGTGCA;SOR=0.468;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=95;TCF=27;TCR=68;TR=51;WE=242610261;WS=242610243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,62:0.56:110
chr2	242610773	rs7601000	T	A	4472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.376;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=102;NR=91;PP=2932;ReadPosRankSum=0.965;SC=CTGGTGGAGCTGCAGCCTTCA;SOR=0.500;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=310;TCF=170;TCR=140;TR=193;WE=242610781;WS=242610763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,203:0.62:330
chr2	242611050	rs1130910	C	G	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=3.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.099;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=24;PP=564;ReadPosRankSum=1.669;SC=GCTGCCTGCCCGGGCGCTGTG;SOR=2.368;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=39;TCF=5;TCR=34;TR=26;WE=242611058;WS=242611040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,29:0.67:43
chr2	242613089	rs7943	A	G	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.56;ReadPosRankSum=0.308;SOR=0.545;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
chr2	242613133	rs7740	T	G	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.976;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=4;PP=74;ReadPosRankSum=-0.837;SC=GCTGCAGTGGTAATGTGTGGG;SOR=0.197;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=20;TCF=7;TCR=13;TR=8;WE=242613141;WS=242613123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr2	242615462	rs5860	T	C	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-1.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.222;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=145;ReadPosRankSum=-0.779;SC=GTCTGGACTCTGCTGGGGACG;SOR=0.184;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=12;WE=242615470;WS=242615452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr2	242617792	rs4076640	A	G	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=279;ReadPosRankSum=0.494;SC=TTGCTGACACAACTGTGCCAG;SOR=1.508;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=16;WE=242617800;WS=242617784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr2	242618050	rs1131195	A	G	2706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.008;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=64;PP=1738;ReadPosRankSum=0.417;SC=GTTTACACCAATCTAGGGAAA;SOR=0.614;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=221;TCF=99;TCR=122;TR=118;WE=242618058;WS=242618040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,125:0.53:235
chr2	242622192	rs35052478	A	AG	354.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=373;ReadPosRankSum=0.042;SC=TAGAAAAATTAGCCGGGCGTG;SOR=1.292;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=10;WE=242622200;WS=242622182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr2	242622326	rs4347866	T	C	1184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.729;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=24;PP=519;ReadPosRankSum=-1.342;SC=GCGACAAGAATGAAACTGTCT;SOR=0.575;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=97;TCF=50;TCR=47;TR=54;WE=242622334;WS=242622316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,62:0.57:108
chr2	242658779	rs71351113	A	T	1292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=35;NR=11;PP=848;SC=GCCGCCCCCAACCCCCCAACA;SOR=1.863;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=48;TCF=36;TCR=12;TR=46;WE=242658787;WS=242658767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr2	242659554	rs34766121	C	T	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.118;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-1.168;NF=7;NR=12;PP=186;ReadPosRankSum=-1.306;SC=GTCGGTTGGACCCAAAGCCTG;SOR=0.492;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=50;TCF=17;TCR=33;TR=19;WE=242659562;WS=242659544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,22:0.41:54
chr2	242662761	rs7572153	T	C	1735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=39;PP=934;SC=CAGGAGAAGGTGCTCCATGGC;SOR=1.946;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=18;TCR=39;TR=57;WE=242662769;WS=242662751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr2	242674959	rs62191977	T	G	3826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=79;PP=2334;SC=AGCTGCGGCGTTTCCGCGTCC;SOR=1.368;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=49;TCR=79;TR=128;WE=242674967;WS=242674949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr2	242680366	rs4073890	A	G	1676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=2.559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=1.469;QD=14.21;ReadPosRankSum=0.732;SOR=0.634;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,80:0.68:118
chr2	242680430	rs4073889	A	G	2670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.97;MQRankSum=1.273;NF=66;NR=53;PP=1669;ReadPosRankSum=0.605;SC=GTCTCATAGGATCTTCTTCCT;SOR=0.700;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=186;TCF=103;TCR=83;TR=119;WE=242680438;WS=242680420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,126:0.61:205
chr2	242684115	rs4234097	T	C	1607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.262;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=17;PP=1007;ReadPosRankSum=-0.570;SC=TGCTTCTCTTTGCCCCAAGGT;SOR=0.283;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=96;TCF=74;TCR=22;TR=64;WE=242684123;WS=242684105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,67:0.66:102
chr2	242684387	.	A	ACCC	493.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.394;ClippingRankSum=0.000;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.34;ReadPosRankSum=0.273;SOR=0.675;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
chr2	242684394	rs4675884	G	C	1311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=3.938;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=32.79;ReadPosRankSum=1.274;SOR=2.554;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,38:0.95:40
chr2	242688203	rs34519321	C	T	3834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=70;PP=2370;ReadPosRankSum=-0.832;SC=ACTCTCTGGGCGGCAGTGCCA;SOR=0.669;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=239;TCF=138;TCR=101;TR=163;WE=242688211;WS=242688193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,173:0.66:262
chr2	242688292	rs34767042	C	T	4367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=96;PP=2461;ReadPosRankSum=1.068;SC=ACCTGTGTGCCGCCCGCCTGT;SOR=0.687;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=311;TCF=150;TCR=161;TR=185;WE=242688300;WS=242688282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,203:0.60:336
chr2	242688366	rs35386923	C	T	1804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.529;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=54;PP=1228;ReadPosRankSum=1.140;SC=AGGTCTCAGACAGGAGTCACT;SOR=1.109;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=123;TCF=40;TCR=83;TR=75;WE=242688374;WS=242688356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,80:0.62:130
chr2	242688672	rs78280775	C	T	1705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.497;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=17;PP=1149;ReadPosRankSum=1.515;SC=ACATGGTGCTCGGGTCACAGG;SOR=0.950;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=117;TCF=84;TCR=33;TR=66;WE=242688680;WS=242688662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,71:0.55:128
chr2	242688870	rs113047262	T	C	2322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=60;PP=1543;ReadPosRankSum=-0.794;SC=CCTGCAGACATCTCCACTCAG;SOR=0.717;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=149;TCF=49;TCR=100;TR=89;WE=242688878;WS=242688860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,97:0.60:161
chr2	242707101	rs6756901	A	G	3610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=51;PP=2388;SC=GCCCAGCCTGACCCATGTGCC;SOR=1.000;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=70;TCR=51;TR=121;WE=242707109;WS=242707091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr2	242716380	rs12469459	A	T	2178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.902;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=41;PP=1270;ReadPosRankSum=0.190;SC=GATGATGTCCATGCTGGGCGG;SOR=0.753;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=276;TCF=168;TCR=108;TR=107;WE=242716388;WS=242716370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:187,120:0.39:307
chr2	242742653	rs78145032	T	G	709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=6.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=1;PP=614;ReadPosRankSum=1.802;SC=GATGTGAGGATGGGGGTGCTC;SOR=0.280;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=45;TCF=44;TCR=1;TR=25;WE=242742661;WS=242742643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,25:0.54:46
chr2	242742875	rs62620233	C	T	7221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-4.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=574;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.479;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=147;NR=165;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.167;SC=TTCCGGGGCGCCCCGAGCCTG;SOR=0.844;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=526;TCF=258;TCR=268;TR=312;WE=242742892;WS=242742865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:234,338:0.59:572
chr2	242750460	rs34748986	T	C	9160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=358;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=137;NR=197;PP=2965;SC=ACAGCCTGTCTGGGCTGTGCA;SOR=1.169;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=334;TCF=137;TCR=197;TR=334;WE=242750468;WS=242750450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,354:1.00:354
chr2	242755100	rs11693567	G	A	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.986;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.097;NF=6;NR=1;PP=100;ReadPosRankSum=-0.702;SC=AGAGAGCCCCGTGACTCCCCC;SOR=1.609;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=7;WE=242755108;WS=242755090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr2	242755465	rs34241734	C	G	202.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.35;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	242755599	rs66482163	G	A	1086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.852;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=14;PP=589;ReadPosRankSum=0.205;SC=TCCTGAGCGCGTTCCCCAGTC;SOR=0.536;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=85;TCF=61;TCR=24;TR=45;WE=242755607;WS=242755589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,51:0.55:92
chr2	242756677	.	A	G	35	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=20;MQ=57.56;NF=5;NR=0;PP=35;QD=13.9542425094;SC=CCCGTCCCAGACAAATCCCTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=5;WE=242756685;WS=242756667;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr2	242757582	rs141698191	C	T	3699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.457;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=80;PP=2280;ReadPosRankSum=-1.247;SC=TGCGCTCAGGCGAGTGCCAGC;SOR=0.727;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=250;TCF=122;TCR=128;TR=158;WE=242757590;WS=242757572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,170:0.63:269
chr2	242757820	rs11545301	G	A	1473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.580;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=32;PP=847;ReadPosRankSum=0.745;SC=AGTGGGCCCCGGGAGTCCCCT;SOR=0.635;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=243;TCF=124;TCR=119;TR=72;WE=242757828;WS=242757810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,85:0.32:267
chr2	242758179	rs2293764	C	T	2769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=54;PP=1685;ReadPosRankSum=0.029;SC=GCGGCTACTCCGACCTGGCGT;SOR=0.682;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=231;TCF=133;TCR=98;TR=125;WE=242758187;WS=242758169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,131:0.53:249
chr2	242758203	rs2293763	T	C	3862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=78;PP=2386;ReadPosRankSum=-1.966;SC=TCGGGCCGGCTCCTGAGGGGG;SOR=0.688;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=283;TCF=152;TCR=131;TR=170;WE=242758227;WS=242758193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,181:0.59:307
chr2	242758326	rs2293761	G	A	1902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.330;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=51;PP=1192;ReadPosRankSum=1.204;SC=CCAGCCCCAAGCCGCCCAACC;SOR=1.039;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=171;TCF=80;TCR=91;TR=88;WE=242758334;WS=242758316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,92:0.51:182
chr2	242758447	rs2293760	G	A	673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.106;HP=1;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=20;PP=467;ReadPosRankSum=-0.969;SC=GGTGCCCCACGATAGCTGTGG;SOR=1.359;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=59;TCF=23;TCR=36;TR=29;WE=242758463;WS=242758437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,29:0.44:66
chr2	242758475	rs2293759	A	G	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=268;ReadPosRankSum=0.510;SC=TCTTAGTGCAAGATCCTGTGG;SOR=0.665;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=37;TCF=11;TCR=26;TR=18;WE=242758483;WS=242758465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,22:0.54:41
chr2	242793273	rs2227981	A	G	4989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=111;NR=60;PP=2965;SC=GAGGGCCGTCAGCTGAGCCCC;SOR=1.292;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=171;TCF=111;TCR=60;TR=171;WE=242793281;WS=242793263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr2	242793559	rs6705653	T	C	748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=25;PP=620;SC=CCCCCCACTATGAGCTGCTTA;SOR=3.690;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=28;WE=242793567;WS=242793549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	242793912	rs11568821	C	T	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=311;ReadPosRankSum=1.447;SC=CCCCGGAGACCGCAGGTGGGC;SOR=0.941;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=17;WE=242793920;WS=242793902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,17:0.74:23
chr2	242813124	rs13016102	T	C	6388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=123;NR=100;PP=2965;SC=AACTGAATCATAGCCTCTCAC;SOR=0.789;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=223;TCF=123;TCR=100;TR=223;WE=242813132;WS=242813114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr2	242813241	rs28392509	C	T	1315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=36;PP=991;SC=TCTCCCCAAACCTCTCCTCGC;SOR=3.209;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=7;TCR=36;TR=43;WE=242813249;WS=242813231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr2	242813276	rs62193136	C	T	729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=21;PP=552;SC=CAGGGCTGCCCGGGCCATGAC;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=242813284;WS=242813266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	242814009	rs7420371	G	A	5583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=96;PP=2965;SC=CCCGCACCCGGGGACTGCCAG;SOR=0.830;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=184;TCF=88;TCR=96;TR=184;WE=242814017;WS=242813999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr2	242836535	rs28559662	A	G	1238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.511;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=33;PP=761;ReadPosRankSum=0.271;SC=AAGCTCTCGGAACTTAGTGAC;SOR=0.523;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=203;TCF=94;TCR=109;TR=66;WE=242836543;WS=242836525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,72:0.34:213
chr2	242839363	rs4973668	G	C	3408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.940;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=55;PP=2233;ReadPosRankSum=0.722;SC=TGCGAACCCTGATGTCCTCGT;SOR=0.775;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=253;TCF=154;TCR=99;TR=144;WE=242839371;WS=242839353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,156:0.56:278
chr2	242839614	rs13025557	T	G	1510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=40;PP=1148;SC=CCTTCCTGGTTCGTGGGGGAT;SOR=2.746;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=10;TCR=40;TR=50;WE=242839622;WS=242839604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr2	242842568	rs3934497	C	T	1566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.653;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=40;PP=893;ReadPosRankSum=0.825;SC=GGTCCTCAGCCTGTCCTCTCC;SOR=0.766;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=126;TCF=47;TCR=79;TR=62;WE=242842576;WS=242842558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,72:0.52:138
chr3	239313	rs35603824	C	CG	374.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=2.070;NF=2;NR=6;PP=120;ReadPosRankSum=-1.965;SC=GATCCCAGCCCGGGGGGGGTT;SOR=0.582;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=23;TCF=8;TCR=15;TR=8;WE=239321;WS=239303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr3	386247	rs3736632	C	T	947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.024;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=10;PP=570;ReadPosRankSum=0.014;SC=TGAAAAAATTCTGACTTTTCT;SOR=0.566;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=44;TCR=17;TR=36;WE=386255;WS=386237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,41:0.62:66
chr3	386520	rs1499046	C	T	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=178;ReadPosRankSum=-0.021;SC=TAAATTCTGCCGGGCACTGCA;SOR=0.641;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=12;WE=386528;WS=386510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr3	391001	rs2272524	G	A	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=102;ReadPosRankSum=0.140;SC=TTTACTTTCCGCTTTTAAAAA;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=7;WE=391009;WS=390991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr3	391100	rs13060847	A	G	5125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.71;SOR=1.300;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr3	402273	.	C	CT	84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;FR=0.9998;HP=15;HapScore=2;MGOF=27;MMLQ=20;MQ=59.49;NF=0;NR=6;PP=84;QD=15.0;SC=ATTGTACTTTCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=6;WE=402281;WS=402263;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,6:0.50:12
chr3	403288	rs9824311	G	A	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.064;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.362;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr3	403297	rs9839027	C	A	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=443;ReadPosRankSum=-1.055;SC=TGTTTGTATTCGTATGACTAG;SOR=0.313;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=11;WE=403316;WS=403287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr3	403308	rs9824442	G	A	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=443;ReadPosRankSum=0.100;SC=GTATGACTAGGACATAGAAAA;SOR=0.420;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=14;WE=403316;WS=403287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr3	403345	rs9846775	A	G	2702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=62;NR=35;PP=1708;SC=TTTCTTCCACAAAAGTTTAAA;SOR=1.336;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=98;TCF=63;TCR=35;TR=97;WE=403353;WS=403335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
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chr3	417979	rs3773381	A	G	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.692;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=441;ReadPosRankSum=-0.539;SC=TGTGACAACTATTTGTGATTT;SOR=1.267;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=42;TCF=29;TCR=13;TR=23;WE=417987;WS=417969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,24:0.49:49
chr3	417994	rs930237	A	G	673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.339;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=8;PP=428;ReadPosRankSum=-1.327;SC=TGATTTTGACATGTGACAGAA;SOR=1.220;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=59;TCF=39;TCR=20;TR=31;WE=418002;WS=417984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,34:0.48:71
chr3	418089	rs3773380	C	T	4926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=67;PP=2924;SC=GGCTGGAACACGACATTTTTA;SOR=0.923;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=159;TCF=92;TCR=67;TR=159;WE=418097;WS=418079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr3	439963	rs6442827	A	G	5508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=102;NR=78;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.704;SC=GACTCACCCAATAGAGGTATT;SOR=0.297;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=181;TCF=103;TCR=78;TR=180;WE=439971;WS=439953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,207:1.00:208
chr3	440028	rs6771714	T	C	4635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=75;PP=2359;SC=GGGGCGATAATGATAGCATTT;SOR=0.824;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=153;TCF=78;TCR=75;TR=153;WE=440036;WS=440018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr3	440088	rs6771803	T	A	2180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=43;PP=1237;SC=GAGATTATATTTGGGGAAGTC;SOR=1.700;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=25;TCR=43;TR=68;WE=440096;WS=440078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr3	447069	rs11705894	C	T	553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=0;PP=433;SC=TCAATGCTAACACAAATGTCC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=447077;WS=447059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	1320271	rs3732517	G	A	2952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=50;PP=1645;SC=CTTAGGCTCAGTGATCACCTT;SOR=0.849;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=47;TCR=50;TR=97;WE=1320279;WS=1320261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr3	1337203	rs565499	A	G	413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=343;SC=TGGGGAAGTAAGACAAAGAAT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=1337211;WS=1337196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	1339680	rs10558016	GGTTTTT	G	1185.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.410;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=911;ReadPosRankSum=1.516;SC=TGGAAAGTAAGGTTTTTGTTT;SOR=1.089;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=1;TCR=55;TR=20;WE=1339693;WS=1339670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,31:0.53:58
chr3	1413903	rs3852033	T	A	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=179;ReadPosRankSum=0.329;SC=AAATGAATGATAAAGTATTCA;SOR=0.481;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=11;WE=1413911;WS=1413893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,11:0.33:33
chr3	1414532	.	G	T	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.047;ClippingRankSum=0.000;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=1.631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.24;ReadPosRankSum=0.739;SOR=0.538;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,32:0.24:135
chr3	1415195	rs3765098	C	T	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=167;ReadPosRankSum=-0.677;SC=TATTTTACTTCCTAAGCACAA;SOR=0.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=11;WE=1415203;WS=1415185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr3	1424718	rs2291101	G	A	1383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=22;PP=821;ReadPosRankSum=1.420;SC=AGGAGAAAGTGTCATCTGTGG;SOR=0.725;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=124;TCF=81;TCR=43;TR=61;WE=1424726;WS=1424708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,67:0.48:140
chr3	1424850	rs2291100	T	G	2599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=52;PP=1502;ReadPosRankSum=0.793;SC=TTGTCTACTCTGGGGAAGATG;SOR=0.666;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=229;TCF=123;TCR=106;TR=110;WE=1424858;WS=1424840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,124:0.49:254
chr3	1444243	rs13326014	A	G	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.445;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=243;ReadPosRankSum=-0.232;SC=GCTCCATGAAACCTTCCAGTT;SOR=1.055;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=56;TCF=17;TCR=39;TR=19;WE=1444251;WS=1444233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,21:0.34:62
chr3	2777622	rs1554198	A	G	9333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=3.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.018;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=161;NR=159;PP=2965;ReadPosRankSum=0.615;SC=AATACATAGAAGAGAGAAAGG;SOR=0.116;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=323;TCF=161;TCR=162;TR=320;WE=2777630;WS=2777612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,351:0.99:353
chr3	2968808	rs148044757	T	TA	95.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=123;ReadPosRankSum=1.372;SC=GTTTTAATTTTAAAATGACAC;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=6;WE=2968816;WS=2968798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,3:0.20:15
chr3	2969052	rs12490661	C	T	1725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.613;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=49;PP=1097;ReadPosRankSum=-1.772;SC=ATGCTCTGGACGTTGCCATTG;SOR=0.770;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=144;TCF=47;TCR=97;TR=71;WE=2969060;WS=2969042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,80:0.48:165
chr3	3076218	rs9845519	G	A	767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=5;PP=535;ReadPosRankSum=0.494;SC=TGAATGGGTAGATAAATGAAT;SOR=0.776;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=57;TCF=46;TCR=11;TR=29;WE=3076226;WS=3076208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,32:0.52:62
chr3	3076284	rs6765545	G	C	1639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.566;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=28;PP=1074;ReadPosRankSum=0.669;SC=TGAATACACTGCTCCAATTCT;SOR=0.615;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=158;TCF=98;TCR=60;TR=72;WE=3076303;WS=3076274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,79:0.45:177
chr3	3076401	rs6790908	C	T	1848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.985;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=44;PP=1037;ReadPosRankSum=0.009;SC=GGCCTGACAACCACAGCCCCA;SOR=0.791;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=233;TCF=114;TCR=119;TR=86;WE=3076409;WS=3076391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,99:0.39:257
chr3	3076443	rs6803232	A	G	1526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.359;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=44;PP=924;ReadPosRankSum=-0.381;SC=CCAGGACTCCATTCTCCGTGG;SOR=0.954;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=182;TCF=76;TCR=106;TR=72;WE=3076451;WS=3076433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,79:0.40:199
chr3	3080527	rs163543	C	T	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=209;ReadPosRankSum=0.986;SC=AGAGTACTCACTGAAAGTGAG;SOR=0.352;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=12;WE=3080535;WS=3080517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr3	3081750	rs6802588	A	T	2441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.718;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=53;PP=1604;ReadPosRankSum=-1.709;SC=AGAATGGTCGAGGCTTTGGTT;SOR=0.666;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=244;TCF=123;TCR=121;TR=112;WE=3081758;WS=3081740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,118:0.45:262
chr3	3081825	rs339285	T	C	2308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.502;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.038;NF=47;NR=48;PP=1262;ReadPosRankSum=-0.295;SC=CCTCAGCTGATGCCTCTAGAT;SOR=0.647;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=186;TCF=89;TCR=97;TR=95;WE=3081833;WS=3081815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,109:0.51:212
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chr3	3116438	rs2290611	G	A	3077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=63;PP=1850;ReadPosRankSum=0.346;SC=GGACACATACGGCATATCATA;SOR=0.706;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=283;TCF=150;TCR=133;TR=134;WE=3116446;WS=3116428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,149:0.48:311
chr3	3118142	rs17878995	G	T	1607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=29;PP=828;ReadPosRankSum=1.378;SC=TCTGCCTACCGGATGCATGGT;SOR=0.696;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=166;TCF=92;TCR=74;TR=68;WE=3118150;WS=3118132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,83:0.43:192
chr3	3137155	rs11389765	A	AT	374.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=1.077;NF=0;NR=13;PP=186;ReadPosRankSum=0.323;SC=AAGATCAGTGATTTTTTTTTT;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=13;WE=3137163;WS=3137145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr3	3139383	rs334802	C	A	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=48;ReadPosRankSum=1.085;SC=TCCAGCAAAACTCACTGGTGG;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=3139391;WS=3139375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr3	3139957	rs2290610	T	C	1731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.588;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=45;PP=1159;ReadPosRankSum=0.913;SC=AAATTCACAATTGAGGTTCCA;SOR=0.779;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=146;TCF=60;TCR=86;TR=74;WE=3139965;WS=3139947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,80:0.48:166
chr3	3143267	rs6771148	G	C	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.670;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=110;ReadPosRankSum=1.473;SC=GAGTACTTGAGAAGAACGGGT;SOR=0.277;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=9;WE=3143275;WS=3143257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,11:0.34:32
chr3	3170792	rs334773	C	T	2576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=49;PP=1570;SC=CTGTGCCTTCCGAAGCAGTAT;SOR=1.265;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=35;TCR=49;TR=84;WE=3170800;WS=3170782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr3	3170910	rs334772	A	G	418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=11;PP=281;SC=TTGGAAACCTATATAAATGGA;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=16;WE=3170918;WS=3170900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	3171460	rs334769	C	T	2408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=22;PP=1347;SC=TGACCTGTTACGTGAAAAAGG;SOR=1.504;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=51;TCR=22;TR=73;WE=3171468;WS=3171450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr3	3171502	rs334768	C	A	2019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=2.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.313;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=30;PP=1206;ReadPosRankSum=1.384;SC=AAGTGCTTTGCCTGTGTTTCT;SOR=1.001;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=151;TCF=92;TCR=59;TR=81;WE=3171510;WS=3171492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,93:0.51:181
chr3	3171713	rs113671187	G	GCCTGACT	3952.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-1.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.306;NF=1;NR=38;PP=2713;ReadPosRankSum=1.547;SC=TTAGCTAAGTGCCAGTAGCTT;SOR=0.576;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=1;TCR=47;TR=39;WE=3171721;WS=3171703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,92:0.99:93
chr3	3179262	rs334767	A	T	786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=21;PP=607;SC=TATGCCCGTCATAAACCCTGC;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=3179270;WS=3179252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	3189059	rs1621648	T	C	71.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=0;PP=50;SC=GATACTAAAATGGTGGCAAGG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=3189067;WS=3189057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr3	3189279	rs1705805	A	G	938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.739;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=19;PP=558;ReadPosRankSum=-1.022;SC=TGAAGATCGCAAAAGAGGAGA;SOR=0.671;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=73;TCF=39;TCR=34;TR=38;WE=3189287;WS=3189269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,44:0.51:87
chr3	3189398	rs1669348	A	G	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.812;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=16;PP=484;ReadPosRankSum=-0.332;SC=GTAAGTATATACTAGGCTTGG;SOR=0.582;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=72;TCF=37;TCR=35;TR=34;WE=3189406;WS=3189388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,40:0.47:85
chr3	3192524	rs4183	A	ATAAC	1129.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.986;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=7;PP=759;ReadPosRankSum=0.336;SC=AATTTGTTAGATAACTTTATC;SOR=0.859;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=52;TCF=29;TCR=23;TR=16;WE=3192532;WS=3192514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,28:0.39:71
chr3	3193957	rs1705800	A	C	365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=321;SC=GTGCCTCAGCATCCCGAGCAG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=3193965;WS=3193955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	3195574	rs3846135	C	T	673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=15;PP=415;ReadPosRankSum=-1.210;SC=CTCCATTGGCCCCAACAGAGC;SOR=0.619;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=93;TCF=58;TCR=35;TR=38;WE=3195582;WS=3195564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,38:0.38:100
chr3	3196273	rs11300080	AT	A	517.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=0;PP=420;SC=TAAAATACTCATTTTTTTTCA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=19;WE=3196281;WS=3196263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr3	3197871	rs1705789	T	C	1434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=14;PP=976;SC=TGGCCTACCATATATAAAGTA;SOR=1.893;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=36;TCR=14;TR=50;WE=3197879;WS=3197861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr3	3209242	rs4685612	G	T	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-3.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=349;ReadPosRankSum=1.126;SC=CATGAAAGTTGTGTTTCTTTC;SOR=0.826;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=16;WE=3209250;WS=3209232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr3	3215954	rs1669321	A	G	5221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=111;PP=2965;SC=TACTATATAAAAACATATATA;SOR=1.922;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=158;TCF=47;TCR=111;TR=158;WE=3215962;WS=3215944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr3	3217128	rs11332452	AT	A	39.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=0;NR=4;PP=59;SC=GTCAGTAGCTATTTTTTTTTT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=3217136;WS=3217118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr3	3221430	rs1672753	C	T	1434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=37;PP=912;ReadPosRankSum=0.837;SC=CGAGGGAGGGCCCGTGTCGCG;SOR=0.687;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=48;TCR=69;TR=63;WE=3221438;WS=3221420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,66:0.52:127
chr3	3886580	rs4685689	A	G	6871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=124;NR=111;PP=2965;SC=ATAACATCGCAAAGACTGTGG;SOR=0.709;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=235;TCF=124;TCR=111;TR=235;WE=3886588;WS=3886570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr3	3887093	rs9844909	A	G	3637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.395;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=78;PP=2380;ReadPosRankSum=-1.657;SC=AAGTCCCTCAACTTGCCCTGC;SOR=0.681;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=309;TCF=158;TCR=151;TR=163;WE=3887101;WS=3887083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,171:0.51:335
chr3	3887171	rs75655400	C	T	2973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.526;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=58;PP=1668;ReadPosRankSum=-0.986;SC=AAGAAGGGGACTTCAAAAATA;SOR=0.545;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=262;TCF=127;TCR=135;TR=120;WE=3887182;WS=3887161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,140:0.47:295
chr3	3887876	rs2120609	T	C	2971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.947;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=62;PP=1571;ReadPosRankSum=0.997;SC=TTAAGGTTAATGGGACCCTTC;SOR=0.645;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=233;TCF=117;TCR=116;TR=124;WE=3887884;WS=3887866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,141:0.54:261
chr3	3888101	rs35191979	T	C	4005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=415;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=88;PP=2142;ReadPosRankSum=1.249;SC=CCACAGATTATGAAGTGTGTC;SOR=0.675;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=382;TCF=201;TCR=181;TR=185;WE=3888109;WS=3888091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:212,202:0.49:414
chr3	4110440	rs34308595	T	TAAG	1547.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.547;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.291;NF=0;NR=24;PP=1067;ReadPosRankSum=0.136;SC=CTAAAACAAATAAGAAGAAGA;SOR=0.352;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=65;TCF=1;TCR=64;TR=24;WE=4110448;WS=4110430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,39:0.56:70
chr3	4452737	rs813811	G	A	2325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=54;PP=1537;SC=CAGAAATGCAGCAAGAGCTTT;SOR=2.484;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=18;TCR=54;TR=72;WE=4452745;WS=4452727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr3	4461569	rs711667	G	A	642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=0;PP=473;SC=TGAGCAAGGTGCAGTGTTTGG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=4461577;WS=4461559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	4461698	rs711666	C	T	4944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=70;PP=2904;SC=GCAAAGGGTACCTATTTTGCA;SOR=0.974;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=171;TCF=100;TCR=71;TR=170;WE=4461706;WS=4461688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr3	4562667	rs1038639	T	G	3288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=39;PP=2059;SC=AGAGTTTCATTTTCATACACT;SOR=1.342;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=67;TCR=39;TR=106;WE=4562675;WS=4562657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr3	4669375	.	CT	C	92.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.820;ClippingRankSum=0.000;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=5.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.56;ReadPosRankSum=0.416;SOR=0.292;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:142,24:0.14:166
chr3	4687470	rs5846330	G	GCT	1331.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.556;NF=0;NR=25;PP=1178;ReadPosRankSum=-1.193;SC=CTGTATATAGGCTCTCTCTCT;SOR=0.820;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=25;WE=4687478;WS=4687460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,40:0.89:45
chr3	4687498	rs41289624	T	A	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.189;HP=1;HapScore=2;MGOF=44;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.251;NF=2;NR=10;PP=163;ReadPosRankSum=0.600;SC=CTACAAATATTCATACATACA;SOR=1.312;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=12;WE=4687506;WS=4687488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,16:0.41:39
chr3	4687548	rs4271897	A	G	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=16.28;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr3	4687577	rs4303850	A	G	39.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr3	4693656	rs6442894	C	T	1613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=6;PP=1077;SC=GGATGCTACACGTGACACTGG;SOR=3.098;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=42;TCR=6;TR=48;WE=4693664;WS=4693646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr3	4693937	rs6442895	G	C	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=3.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.62;ReadPosRankSum=-0.394;SOR=1.156;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,35:0.47:74
chr3	4693943	rs28724276	G	A	1352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.05;ReadPosRankSum=-0.006;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,37:0.52:71
chr3	4693953	rs28592010	G	A	1323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.06;ReadPosRankSum=0.886;SOR=0.727;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,33:0.55:60
chr3	4693959	rs28461825	C	T	1274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=1.159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.61;ReadPosRankSum=0.736;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,31:0.57:54
chr3	4693977	rs28562557	G	A	513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=51;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=356;ReadPosRankSum=1.290;SC=GCCTGTAGCCGTCGTGTTGTA;SOR=0.418;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=20;WE=4693985;WS=4693967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,21:0.68:31
chr3	4694010	rs6442896	A	C	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-2.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.441;HP=1;HapScore=4;MGOF=83;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=2;PP=85;ReadPosRankSum=-0.742;SC=AAATACACTCAGTCACCTTGC;SOR=0.033;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=3;WE=4694019;WS=4694000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr3	4694011	rs56896093	G	A	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.441;HP=1;HapScore=4;MGOF=83;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=365;ReadPosRankSum=0.906;SC=AATACACTCAGTCACCTTGCT;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=9;WE=4694019;WS=4694000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr3	4712413	rs2306875	G	A	1006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.629;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=14;PP=538;ReadPosRankSum=0.980;SC=TGTTTTCTAGGTTGGTTCTTT;SOR=1.116;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=102;TCF=62;TCR=40;TR=42;WE=4712421;WS=4712403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,52:0.46:114
chr3	4725619	rs3215005	CA	C	840.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.519;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.018;NF=0;NR=21;PP=710;ReadPosRankSum=1.517;SC=ACCAAGATCACAAGCTGTTTG;SOR=1.042;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=21;WE=4725627;WS=4725609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,28:0.51:55
chr3	4732670	rs4685801	G	A	272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=182;SC=TACTAAAAAAGAAGGTAGTAC;SOR=3.442;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=8;WE=4732678;WS=4732664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	4738774	rs3749382	A	G	1329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=4;PP=988;SC=TGAGGCAGCTAATGAGTTCCA;SOR=3.664;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=34;TCR=4;TR=38;WE=4738782;WS=4738764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	4738999	rs149795767	G	GGTGT	401.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.21;MQRankSum=-0.000;QD=28.70;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,12:0.86:14
chr3	4753712	rs2306881	A	G	1343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=36;PP=990;SC=CTGCCGTTAAAGGGAGCTAAA;SOR=3.209;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=8;TCR=36;TR=44;WE=4753720;WS=4753702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr3	4767262	rs7613447	T	C	2352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=56;PP=1150;ReadPosRankSum=1.676;SC=AGAACGCCACTGAGGTGTGTT;SOR=0.712;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=196;TCF=89;TCR=107;TR=103;WE=4767270;WS=4767252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,116:0.53:217
chr3	4773892	rs76907489	A	T	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.586;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=98;ReadPosRankSum=0.309;SC=TTACTGAACAATGGAGGTTTT;SOR=0.818;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=7;WE=4773900;WS=4773882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr3	4817057	rs6442905	T	C	7346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=134;NR=127;PP=2965;SC=ATGAAAAGAATGTAGCGCTTA;SOR=0.743;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=261;TCF=134;TCR=127;TR=261;WE=4817065;WS=4817047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,285:1.00:285
chr3	4829732	rs13079522	A	G	2876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.413;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=61;PP=1803;ReadPosRankSum=-0.623;SC=ACTATACTACAGAGAGAGACG;SOR=0.651;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=287;TCF=163;TCR=124;TR=138;WE=4829740;WS=4829722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,147:0.47:311
chr3	4842231	rs2291862	C	T	2125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.488;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=48;PP=1403;ReadPosRankSum=0.825;SC=AATTCTACGACTGATATTTTC;SOR=0.457;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=207;TCF=118;TCR=89;TR=99;WE=4842239;WS=4842220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,105:0.45:234
chr3	4856180	rs711631	T	C	3107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=53;NR=55;PP=1640;SC=GCATTGTCACTGTGCTGAGTC;SOR=0.936;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=108;TCF=53;TCR=55;TR=108;WE=4856188;WS=4856170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr3	4856234	rs901854	G	A	1754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.43;SOR=0.844;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr3	4856993	rs6442911	C	G	493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=15;PP=383;SC=GGCGGGGTGCCTGCCCAGTTA;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=4857001;WS=4856983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	4859725	rs9844268	G	A	3079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=24;PP=2072;SC=CTTTACCAAGGCTGCTCAGCT;SOR=2.193;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=69;TCR=24;TR=93;WE=4859733;WS=4859715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr3	4872790	rs147851903	GTCTC	G	206.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;NF=0;NR=7;PP=445;SC=GTCTGTCTTTGTCTCTCTCTC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=7;WE=4872801;WS=4872780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	4927281	rs4685841	T	C	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.119;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=299;ReadPosRankSum=1.030;SC=ACCATCACAATTTAAAAGGCC;SOR=1.325;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=40;TCF=31;TCR=9;TR=20;WE=4927289;WS=4927271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,22:0.51:43
chr3	4927308	rs6794077	A	G	2044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=24;PP=1337;SC=GGTTGCTCACAGAACAAAACA;SOR=1.550;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=49;TCR=24;TR=73;WE=4927316;WS=4927298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr3	4940658	rs72170014	CAGAG	C	77.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.72;ReadPosRankSum=2.369;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr3	4942300	rs3762783	T	C	2868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.542;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=63;PP=1623;ReadPosRankSum=0.783;SC=GTGAACTTTTTTTGCAAAGGA;SOR=0.802;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=258;TCF=129;TCR=129;TR=123;WE=4942308;WS=4942290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,143:0.49:289
chr3	4942430	rs3762784	G	A	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.038;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=349;ReadPosRankSum=-1.963;SC=ATCAGCTGGGGCCTGGATTTC;SOR=0.211;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=11;WE=4942440;WS=4942420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr3	4942432	rs724135	C	G	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.022;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=635;ReadPosRankSum=2.105;SC=CAGCTGGGGCCTGGATTTCTC;SOR=1.561;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=15;WE=4942440;WS=4942420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr3	5025514	rs139879256	G	GGTGT,GGT,GGTGTGTGT	275.75	.	AC=2,0,0;AF=1.00,0.00,0.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=0,0;NR=10,10;PP=117,100;SC=GCAGATTCAGGGTGTGTGTGT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=10,10;WE=5025522;WS=5025504;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:8
chr3	5214126	rs2270750	G	A	84.18	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5950;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=56;ReadPosRankSum=1.282;SC=GCTAAGGGGTGTACATGTTTT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=4;WE=5214134;WS=5214116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr3	5241223	rs377120	C	T	4634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=55;PP=2836;SC=TGTGATGATACAGCCTCAGTT;SOR=1.289;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=158;TCF=103;TCR=55;TR=157;WE=5241231;WS=5241213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr3	5241309	rs410509	C	A	6907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=110;NR=118;PP=2965;SC=TCCAGAAAGCCGTCAAGTTAG;SOR=0.855;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=228;TCF=110;TCR=118;TR=228;WE=5241317;WS=5241299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr3	6828364	rs1533434	A	G	8003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=127;NR=147;PP=2965;SC=ACAGAACCCCAGTCTATAAGG;SOR=0.919;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=274;TCF=127;TCR=147;TR=274;WE=6828372;WS=6828354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,301:1.00:301
chr3	6903297	rs3749380	C	T	3593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.847;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=70;PP=2219;ReadPosRankSum=-1.094;SC=AGAGGGAAAACGGGATCCACA;SOR=0.628;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=295;TCF=162;TCR=133;TR=152;WE=6903305;WS=6903282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,169:0.52:322
chr3	6903601	rs342034	A	G	3637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=76;PP=2191;SC=CCAGGTAGGGATGCGCTCCCT;SOR=1.505;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=120;TCF=44;TCR=76;TR=120;WE=6903609;WS=6903591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr3	6904812	.	G	GT	215	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000;HP=11;HapScore=2;MGOF=20;MMLQ=15;MQ=60.68;NF=1;NR=20;PP=215;QD=10.8095238095;SC=TCTCCTTGCTGTTTTTTTTTT;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=70;TCF=4;TCR=66;TR=21;WE=6904820;WS=6904802;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:49,21:0.30:70
chr3	7188116	rs3749448	G	A	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=67;ReadPosRankSum=0.525;SC=GCACTCTCACGTGGTGCTTTC;SOR=0.368;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=6;WE=7188124;WS=7188106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr3	7348129	rs17047071	C	T	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=241;ReadPosRankSum=0.061;SC=GCAATCTACACGGATTCAGCT;SOR=0.782;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=38;TCF=27;TCR=11;TR=18;WE=7348137;WS=7348119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr3	7456675	rs712774	C	T	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=206;ReadPosRankSum=-1.144;SC=AGCAGTGCCCCGCAAGCAATG;SOR=0.776;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=13;WE=7456683;WS=7456665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
chr3	7494245	.	TTGTGTGTGTG	T,TTGTGTGTG	698.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;QD=36.78;SOR=2.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,14,5:0.74,0.26:19
chr3	7494417	rs2229902	A	T	957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.831;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=21;PP=583;ReadPosRankSum=1.217;SC=TGTGCTGACTACCGGGGTGTC;SOR=0.658;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=43;TCR=39;TR=44;WE=7494425;WS=7494407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,47:0.51:92
chr3	7620000	rs76356172	A	G	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.881;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=82;ReadPosRankSum=2.100;SC=AAACTATTCAACCTCATGCCT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=6;WE=7620008;WS=7619990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr3	7649591	rs2139187	C	A	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=12;PP=379;ReadPosRankSum=0.522;SC=CCCAAGTAGGCCCCAGTGTCT;SOR=0.738;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=55;TCF=35;TCR=20;TR=32;WE=7649599;WS=7649581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,32:0.55:58
chr3	7649747	rs146667493	A	AT	1758.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.046;NF=2;NR=26;PP=1089;ReadPosRankSum=-0.510;SC=AAAAGACATGACTCATGCTTT;SOR=0.757;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=60;TCF=3;TCR=57;TR=28;WE=7649755;WS=7649737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,53:0.49:109
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chr3	7732726	rs5846531	AT	A	193.92	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.9767;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=73;ReadPosRankSum=0.158;SC=AACTTTGCAGATTTTTTTTTT;SOR=1.981;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=5;WE=7732734;WS=7732716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,10:0.91:11
chr3	8299606	rs371460452	AAAGGAAGGAAGGAAGG	A,AAAGG	2263.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.12;QD=39.71;SOR=1.453;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,31,26:0.54,0.46:57
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chr3	8496486	.	GC	AA	213	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=4;NR=1;PP=213;QD=53.2935749724;SC=AATATAAATAGCAGTAGAAGT;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=5;WE=8496495;WS=8496482;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:3,5:0.62:8
chr3	8496487	rs7629563	C	A	172.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=21.60;ReadPosRankSum=-0.921;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr3	8496782	rs200059105	G	GTA	156.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.710;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=93;ReadPosRankSum=-1.113;SC=ATTAAAGGAAGTAGTTTTTAA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=3;WE=8496790;WS=8496772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr3	8543713	rs5846598	G	GT	5972.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=65;PP=2289;SC=ACTTTTTCTTGTTCCCCTTCC;SOR=0.827;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=15;TCR=69;TR=79;WE=8543721;WS=8543703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr3	8543757	rs2324625	A	C	1436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-2.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.674;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=34;PP=694;ReadPosRankSum=-0.178;SC=AAAGGTAATGAGAAGGGAACT;SOR=0.485;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=87;TCF=28;TCR=59;TR=53;WE=8543765;WS=8543747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,68:0.62:110
chr3	8556617	rs12715649	A	G	1759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.533;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=33;PP=1000;ReadPosRankSum=0.985;SC=CTAGATGGTGATCACATGGGA;SOR=0.773;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=167;TCF=94;TCR=73;TR=78;WE=8556625;WS=8556607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,89:0.47:191
chr3	8556671	rs60137047	T	G	1909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=46;PP=1257;ReadPosRankSum=0.403;SC=ATTGGTGCATTTCGACCGCAT;SOR=0.678;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=205;TCF=107;TCR=98;TR=95;WE=8556679;WS=8556661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,98:0.44:225
chr3	8556784	rs12715650	A	C	892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.840;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=26;PP=440;ReadPosRankSum=-1.363;SC=GTGAGGCCAAAGCATGGAAAG;SOR=0.968;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=78;TCF=33;TCR=45;TR=43;WE=8556792;WS=8556774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,47:0.57:83
chr3	8609071	rs3774212	G	A	1300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.652;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=21;PP=809;ReadPosRankSum=-0.794;SC=TAGATATACCGTCTCTACCTA;SOR=0.623;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=114;TCF=74;TCR=40;TR=61;WE=8609079;WS=8609061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,65:0.49:133
chr3	8667896	rs355058	T	C	11477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=424;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=201;NR=180;PP=2965;SC=TGCCACAGCATTGAGACACTG;SOR=0.787;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=381;TCF=201;TCR=180;TR=381;WE=8667904;WS=8667886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,421:1.00:421
chr3	8669361	rs1533001	C	A	9680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=99;NR=94;PP=2965;SC=CACTTCACCGCGGTGCTGGGG;SOR=0.865;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=194;TCF=99;TCR=95;TR=193;WE=8669375;WS=8669351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr3	8669367	rs5846608	TG	T	9604.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=93;PP=2966;SC=ACCGCGGTGCTGGGGAGATGC;SOR=0.867;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=114;TCF=15;TCR=99;TR=108;WE=8669375;WS=8669351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr3	8671319	rs142926392	C	CTGACTCACCAGTGGTTCACAGA	1650.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.52;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=5;PP=2973;SC=CACACCCTCACTGACTCACCA;SOR=1.236;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=21;TCF=7;TCR=14;TR=10;WE=8671327;WS=8671309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr3	8675778	rs11131140	T	C	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.707;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=169;ReadPosRankSum=1.347;SC=TAGAGAGGAATTGTACCATTT;SOR=1.445;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=9;WE=8675786;WS=8675768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr3	8676204	rs3774210	A	G	7309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=123;NR=124;PP=2965;SC=GCACACTTGTATCTCCAGCAT;SOR=0.776;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=247;TCF=123;TCR=124;TR=247;WE=8676212;WS=8676194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,275:1.00:275
chr3	8676945	rs3816911	T	C	4883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=97;NR=64;PP=2942;SC=AATAGTGACATAGGAAATGCA;SOR=1.018;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=161;TCF=97;TCR=64;TR=161;WE=8676953;WS=8676935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr3	8705555	rs34054872	T	C	4126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=74;PP=2658;SC=CAAGACAATGTTGTTTTCTTC;SOR=0.997;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=136;TCF=62;TCR=74;TR=136;WE=8705563;WS=8705545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr3	8757311	rs17049469	G	C	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.923;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=9;PP=400;ReadPosRankSum=0.842;SC=TCATGGTGGCGATCCAGTGAC;SOR=0.955;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=72;TCF=49;TCR=23;TR=30;WE=8757319;WS=8757301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,32:0.41:79
chr3	8757377	rs62242588	A	G	1754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FS=1.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.63;ReadPosRankSum=-0.554;SOR=0.666;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,90:0.55:165
chr3	8757547	rs62242589	G	A	144.03	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.9987;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=85;ReadPosRankSum=0.366;SC=CAAGACCAGCGTCAGTGAGCA;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=5;WE=8757555;WS=8757537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr3	8775457	rs2072583	G	A	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.245;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=174;ReadPosRankSum=0.978;SC=TAGCTGGCAGGGACATAAGTC;SOR=1.942;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=9;WE=8775465;WS=8775455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr3	8775661	rs1008642	C	T	4239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=446;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.092;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=102;PP=2455;ReadPosRankSum=-0.144;SC=AGAACATTAACGAGGACATAG;SOR=0.753;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=400;TCF=201;TCR=199;TR=195;WE=8775669;WS=8775651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:232,214:0.48:446
chr3	8784046	.	CA	CAA,C	143	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.38;FR=0.5056,0.4944;HP=14;HapScore=3;MGOF=40;MMLQ=16;MQ=56.8;NF=9,9;NR=1,1;PP=143,12;QD=14.7;SC=CTGCAAACACCAAAAAAAAAA;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=10,10;WE=8784054;WS=8784036;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.48:21
chr3	8809184	rs237902	G	A	3911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.297;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=77;PP=2437;ReadPosRankSum=-0.242;SC=TGAGCCGCAAGTTCTGCCAGA;SOR=0.695;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=312;TCF=158;TCR=154;TR=163;WE=8809192;WS=8809174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,182:0.53:344
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chr3	8931984	rs656626	A	C	1515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=17;PP=830;SC=CCAGAAAGCAAAAATATAATT;SOR=1.217;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=34;TCR=17;TR=51;WE=8931992;WS=8931974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr3	8932189	rs607531	C	T	987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=21;PP=648;SC=TGTATCGTCCCATTTATATAA;SOR=1.121;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=15;TCR=21;TR=36;WE=8932197;WS=8932179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr3	8943988	rs464302	C	A	230.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=186;SC=AAGTAAATTTCTTTGGTTTAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=8943996;WS=8943978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	8955240	rs430781	T	C	1245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=14;PP=836;SC=AGTAAATGAATAAATTTAATA;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=30;TCR=14;TR=44;WE=8955248;WS=8955230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr3	8955389	rs373572	C	T	2584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=42;NR=46;PP=1372;SC=TTCGATTTCTCGAACTATTTC;SOR=1.007;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=42;TCR=46;TR=88;WE=8955397;WS=8955379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr3	8988809	rs689296	C	T	291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=264;SC=AAATATGCAACCCTGCATTCC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=8988817;WS=8988799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	9005078	rs615967	C	T	4258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=61;PP=2544;SC=ATGGTCGCTCCCGAGGATGCT;SOR=0.813;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=145;TCF=84;TCR=61;TR=144;WE=9005086;WS=9005068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr3	9034558	rs511815	C	T	6831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=135;NR=107;PP=2965;SC=GGATTGACACCAGCAGGGAAA;SOR=0.865;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=244;TCF=135;TCR=109;TR=242;WE=9034566;WS=9034548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,263:1.00:263
chr3	9036010	rs637172	T	G	3956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=77;NR=54;PP=2152;SC=CTTCACAGAATTCTCGACTCC;SOR=0.912;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=77;TCR=54;TR=131;WE=9036018;WS=9036000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr3	9066853	rs421041	T	C	5681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=110;NR=69;PP=2965;SC=CACTGCAGGCTGGCTTCTGCA;SOR=0.991;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=179;TCF=110;TCR=69;TR=179;WE=9066861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr3	9068577	rs1703128	T	C	2678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.461;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=47;PP=1699;ReadPosRankSum=0.085;SC=CTAGCACCTGTTCTGCAGATT;SOR=0.657;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=231;TCF=137;TCR=94;TR=115;WE=9068585;WS=9068567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,127:0.50:252
chr3	9069747	rs416685	A	G	5421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=119;NR=73;PP=2965;SC=AGTTTCCATCACGGTGAATGG;SOR=1.206;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=192;TCF=119;TCR=73;TR=192;WE=9069755;WS=9069737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr3	9069918	rs504153	C	T	1316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.180;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=39;PP=799;ReadPosRankSum=0.680;SC=CCGTGAACGCCGAAATGCAAT;SOR=0.825;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=180;TCF=78;TCR=102;TR=66;WE=9069926;WS=9069908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,71:0.37:193
chr3	9074617	rs9839715	C	T	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=2.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.54;ReadPosRankSum=1.404;SOR=1.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr3	9089254	rs2244864	C	G	2672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=57;PP=1845;SC=GGAAGCCGAACAGAGATCACG;SOR=1.396;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=33;TCR=57;TR=90;WE=9089262;WS=9089244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr3	9091151	rs610457	C	G	4287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=75;PP=2326;SC=CATCAGGCCCCTTCTACCCAG;SOR=0.995;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=142;TCF=67;TCR=75;TR=142;WE=9091159;WS=9091141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr3	9101818	rs115491786	G	T	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=243;ReadPosRankSum=-0.198;SC=ACCCGAGAATGTCAGGTAAAG;SOR=0.255;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=13;WE=9101826;WS=9101808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr3	9122948	rs2664089	A	G	5325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=93;PP=2965;SC=ACCATTGCCTAGATCCTGACA;SOR=0.857;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=179;TCF=86;TCR=93;TR=179;WE=9122956;WS=9122938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr3	9123116	rs2669986	C	T	598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=17;PP=423;SC=CTTTGAGCCTCAGCTACCTCA;SOR=2.737;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=9123124;WS=9123106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	9123134	rs2664088	A	G	525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=14;PP=389;SC=TCACCTATCAAATAAAAAGCT;SOR=3.383;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=9123142;WS=9123124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	9406661	rs2728949	G	A	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=390;ReadPosRankSum=-1.101;SC=TGAAATATGAGATGATAATAT;SOR=0.804;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=19;WE=9406669;WS=9406651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,21:0.52:40
chr3	9406836	rs1054975	T	C	2240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.786;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=54;PP=1156;ReadPosRankSum=0.751;SC=TGACAGAAAGTGACCTCGGAA;SOR=0.773;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=249;TCF=130;TCR=119;TR=104;WE=9406844;WS=9406826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,119:0.43:277
chr3	9407022	rs2648536	T	C	969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.495;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=21;PP=476;ReadPosRankSum=0.410;SC=TGGAGCAATATTTAAAATAGT;SOR=0.560;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=100;TCF=42;TCR=58;TR=39;WE=9407030;WS=9407012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,50:0.41:121
chr3	9408443	rs2648535	A	C	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=33;ReadPosRankSum=0.842;SC=AGAGATGAGAAACTAGGGAGA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=3;WE=9408451;WS=9408433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr3	9416474	rs2596920	A	G	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=20;PP=426;ReadPosRankSum=0.705;SC=CTAATGATCTATTTCTTTCCC;SOR=0.871;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=45;TCF=11;TCR=34;TR=26;WE=9416482;WS=9416464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,27:0.57:47
chr3	9422210	rs2596916	T	C	751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=12;PP=421;ReadPosRankSum=-0.039;SC=GGTCTGACTGTTTCCATATTG;SOR=0.804;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=40;TCR=23;TR=32;WE=9422218;WS=9422200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,37:0.50:74
chr3	9422334	rs34405225	TAG	T	1190.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.763;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=772;ReadPosRankSum=0.810;SC=TAGCATCTTTTAGAGTTAGAG;SOR=0.959;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=52;TCF=8;TCR=44;TR=20;WE=9422343;WS=9422324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,34:0.37:93
chr3	9425911	rs1129170	G	A	815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.949;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=9;PP=496;ReadPosRankSum=0.342;SC=GATCCAAGAAGAGAAACTGGA;SOR=0.495;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=68;TCF=51;TCR=17;TR=33;WE=9425919;WS=9425901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,37:0.48:77
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chr3	9730529	.	GT	G	39.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.074;ClippingRankSum=0.000;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=9.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=1.825;QD=0.75;ReadPosRankSum=0.116;SOR=0.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,10:0.19:53
chr3	9746256	rs201088175	G	A	1475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.379;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=29;PP=790;ReadPosRankSum=-1.107;SC=CTGTCTGTCTGTTGCTTTTCT;SOR=0.493;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=168;TCF=103;TCR=65;TR=71;WE=9746264;WS=9746246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,79:0.42:189
chr3	9754334	rs187310	C	T	3173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.883;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=67;PP=1894;ReadPosRankSum=-0.297;SC=CTTCTCTCCCCGTAAACCCTT;SOR=0.733;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=271;TCF=142;TCR=129;TR=143;WE=9754342;WS=9754324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,154:0.52:295
chr3	9757582	rs369700748	CCCTATGGGCCTCACT	CATGGGCCTCACT,C	838.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.471;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=2963;ReadPosRankSum=0.784;SC=CTTTCCAAGCCCCTATGGGCC;SOR=1.528;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=19;TCF=12;TCR=7;TR=9;WE=9757606;WS=9757572;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.58:38
chr3	9757586	rs372750511	ATGGGCCTCACTT	A	833.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=5.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.84;ReadPosRankSum=0.488;SOR=1.646;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,22:0.55:40
chr3	9757598	.	T	A	646	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=10;NR=2;PP=646;QD=56.7309343789;SC=GGGCCTCACTTCCTTCTGCCA;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=12;WE=9757606;WS=9757572;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:17,12:0.41:29
chr3	9768336	rs3868893	C	G	2392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.540;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=57;PP=1538;ReadPosRankSum=0.144;SC=AGTTCACCCTCTTTCCCCTAC;SOR=0.817;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=225;TCF=105;TCR=120;TR=101;WE=9768344;WS=9768326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,114:0.46:249
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chr3	9783147	rs696513	A	G	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=300;ReadPosRankSum=0.753;SC=GGCCAGCCCTATTTTATAAAA;SOR=1.264;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=18;WE=9783155;WS=9783137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr3	9799113	rs293795	A	G	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.198;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=298;ReadPosRankSum=0.025;SC=GTGGTAGGGAAGCAGGTGAGG;SOR=0.507;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=42;TCF=15;TCR=27;TR=18;WE=9799121;WS=9799103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,19:0.43:44
chr3	9803126	rs17252807	A	G	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=3;PP=67;ReadPosRankSum=-0.614;SC=ACAGCCTACCATGGCCAAGCC;SOR=0.693;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=23;TCF=15;TCR=8;TR=7;WE=9803134;WS=9803116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr3	9822275	rs3868897	C	T	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=103;ReadPosRankSum=0.904;SC=CAGCCCACCTCCAGAGAACAA;SOR=0.693;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=6;WE=9822283;WS=9822265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr3	9829171	rs2290309	G	A	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=6;PP=236;ReadPosRankSum=0.130;SC=AAAGTACAACGAAGATAAAAC;SOR=0.818;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=31;TCF=18;TCR=13;TR=15;WE=9829179;WS=9829161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr3	9829226	rs293786	A	C	1174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=12;PP=838;SC=AAAAAGAACTAAGACACACAC;SOR=1.292;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=26;TCR=12;TR=38;WE=9829234;WS=9829216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr3	9831112	rs293790	A	G	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.228;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=104;ReadPosRankSum=-2.356;SC=AAGATGATGCATGGCTTTGGT;SOR=0.148;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=21;TCF=13;TCR=8;TR=9;WE=9831120;WS=9831102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr3	9831680	rs293791	G	C	676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.325;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=16;PP=413;ReadPosRankSum=-1.112;SC=CTGAGGGGGAGAAGGGAAAAC;SOR=0.398;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=57;TCF=17;TCR=40;TR=24;WE=9831688;WS=9831670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,29:0.46:63
chr3	9841989	rs6443266	A	G	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=22;PP=490;ReadPosRankSum=0.707;SC=AGGTAAGTTCACCATGGAGGA;SOR=0.659;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=68;TCF=21;TCR=47;TR=33;WE=9841997;WS=9841979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,34:0.45:75
chr3	9852059	rs34761997	C	CGAT	637.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=6;PP=408;SC=CCCCGGTCCTCGACCCCTCTC;SOR=1.112;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=8;WE=9852067;WS=9852049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	9852148	rs9827444	G	A	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.984;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=77;ReadPosRankSum=0.553;SC=TGGGGTGGAGGGACTGGGGGT;SOR=1.609;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=16;TCF=10;TCR=6;TR=5;WE=9852156;WS=9852138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr3	9854865	rs11708462	A	C	1814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.678;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=42;PP=912;ReadPosRankSum=1.341;SC=ACTGTCCCAGAGTTGAGGCCT;SOR=0.829;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=192;TCF=96;TCR=96;TR=83;WE=9854873;WS=9854855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,95:0.45:212
chr3	9854913	rs11720113	C	A	1716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.762;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=38;PP=982;ReadPosRankSum=-2.161;SC=CTCATCAGCTCTGGGCTCTGC;SOR=0.574;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=174;TCF=83;TCR=91;TR=76;WE=9854921;WS=9854903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,87:0.45:194
chr3	9859456	rs3806672	C	G	1542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.225;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=34;PP=905;ReadPosRankSum=1.058;SC=AAGGAGACCCCCAGCCCTATG;SOR=0.580;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=138;TCF=66;TCR=72;TR=65;WE=9859464;WS=9859446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,76:0.46:164
chr3	9860274	rs147069178	G	A	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.433;NF=13;NR=7;PP=265;ReadPosRankSum=2.145;SC=GGATGGTCTCGATCTCCTGAC;SOR=0.627;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=40;TCF=27;TCR=13;TR=20;WE=9860282;WS=9860264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr3	9867625	rs3732527	C	T	9318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=347;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=149;NR=155;PP=2965;SC=CCAAGTCCCGCGGACGAGGTG;SOR=0.808;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=304;TCF=149;TCR=155;TR=304;WE=9867633;WS=9867615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,347:1.00:347
chr3	9868577	rs12490900	A	G	323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=1;PP=260;SC=AGCCTTACCCACTCAGCCCTA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=9868585;WS=9868576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	9870857	rs2290303	G	A	2174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.599;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=53;PP=1274;ReadPosRankSum=-1.760;SC=ACACCGTGCAGTGTCGGAAGG;SOR=0.836;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=212;TCF=105;TCR=107;TR=100;WE=9870865;WS=9870847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,108:0.47:231
chr3	9871030	rs2290305	T	G	2175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=40;PP=1199;SC=ATTGACCGGATGCTGGACCGC;SOR=1.236;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=29;TCR=40;TR=69;WE=9871038;WS=9871020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr3	9874670	rs7622954	G	A	988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=4;PP=709;SC=GCTCAGAAACGCCTCTTTGAC;SOR=2.712;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=32;WE=9874678;WS=9874660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr3	9876301	rs13088594	G	T	1835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=19;PP=1289;SC=ACACGTACCTGTTAGGGCAGC;SOR=1.467;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=40;TCR=19;TR=59;WE=9876309;WS=9876291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr3	9876919	rs1057278	G	A	3020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.340;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=66;PP=1709;ReadPosRankSum=-0.575;SC=CAAACCCAGGGCTGAGGCCTG;SOR=0.750;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=279;TCF=139;TCR=140;TR=128;WE=9876927;WS=9876909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,149:0.48:310
chr3	9876987	rs1057281	G	A	1877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.532;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=44;PP=1194;ReadPosRankSum=0.893;SC=CATTCCAGAGGCGCAGGGGCC;SOR=0.751;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=169;TCF=80;TCR=89;TR=80;WE=9877006;WS=9876977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,88:0.46:190
chr3	9885022	rs3846165	T	C	656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=2;PP=535;SC=TTAGGTGGCTTGTCCCAGCTC;SOR=4.615;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=9885030;WS=9885016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr3	9896351	rs279563	A	G	5024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=93;PP=2965;SC=ACAGAAAACAAAAGGTGCGAG;SOR=1.238;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=159;TCF=66;TCR=93;TR=159;WE=9896359;WS=9896341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr3	9932337	rs279558	G	C	1267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=6;PP=916;SC=AATAGGGTCAGTGGGCCGCTT;SOR=2.780;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=32;TCR=6;TR=38;WE=9932345;WS=9932327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr3	9934605	rs279553	T	C	6126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=124;NR=85;PP=2965;SC=ACAGTGTGACTCTCAAGTATG;SOR=0.996;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=211;TCF=125;TCR=86;TR=209;WE=9934613;WS=9934595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr3	9944167	rs279589	G	A	1338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=32;NR=15;PP=914;SC=CCAGTGCTGAGTAGTGCTTAA;SOR=1.755;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=32;TCR=15;TR=47;WE=9944175;WS=9944157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr3	9944937	rs279588	G	T	957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=22;NR=15;PP=562;SC=GAGCTGGGAAGATAAGAGCCA;SOR=0.968;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=22;TCR=15;TR=37;WE=9944945;WS=9944927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr3	9947864	rs279583	T	C	121.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=1;PP=74;SC=ACTTGGGAGGTGGAGGCTGCA;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=9947872;WS=9947854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	9947898	rs279582	T	A	302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=1;PP=164;SC=GCGCCATTGCTCTCCAGCCTG;SOR=2.494;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=9947906;WS=9947888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	9947997	rs279581	C	T	2375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=34;PP=1352;SC=CATCTCCAGGCAGGGGAGGGG;SOR=0.929;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=52;TCR=34;TR=86;WE=9948005;WS=9947987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr3	9951038	rs142612801	TAC	T	184.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.31;ReadPosRankSum=1.169;SOR=0.711;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,15:0.19:80
chr3	9952706	rs279572	A	G	5696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=113;NR=93;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.384;SC=CGAATGCCACAGCTCGAGAGT;SOR=0.798;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=208;TCF=114;TCR=94;TR=206;WE=9952714;WS=9952696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,219:0.99:221
chr3	9952788	rs279571	T	C	6406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=125;NR=98;PP=2965;SC=TTCTCCCTGATGAACTCTCCT;SOR=0.885;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=223;TCF=125;TCR=98;TR=223;WE=9952796;WS=9952778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr3	9956279	rs455863	G	A	5586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=96;PP=2965;SC=TCTTGTGTCCGGATGGTGAGT;SOR=0.884;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=184;TCF=88;TCR=96;TR=184;WE=9956287;WS=9956269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr3	9956894	rs693802	C	T	307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=2;PP=230;SC=CTGAGCAGTCCCTCAGCCGCC;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=9956902;WS=9956884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	9957455	rs1056286	C	T	4353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=59;PP=2428;SC=GCAGCCGGCTCGAACGAGAGG;SOR=0.911;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=139;TCF=80;TCR=59;TR=139;WE=9957463;WS=9957445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr3	9960070	rs708567	C	T	1568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=22;PP=908;SC=GCAGCTGACTCAGGGGTGGAG;SOR=0.865;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=34;TCR=22;TR=56;WE=9960078;WS=9960060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr3	9962157	rs783494	T	C	3994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=86;NR=54;PP=2531;SC=CCAGCCTTCCTCACCCCTCTC;SOR=1.103;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=86;TCR=54;TR=140;WE=9962165;WS=9962147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr3	9962767	rs34198416	TATTC	T	1614.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=22;PP=1268;SC=TCACAGAACATATTCATTCAT;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TCF=0;TR=22;WE=9962778;WS=9962757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr3	9970031	rs279549	A	G	5096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=85;PP=2965;SC=GCCCGACTGCAACTGCTGACC;SOR=0.704;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=176;TCF=91;TCR=85;TR=176;WE=9970039;WS=9970021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr3	9970158	rs279548	C	T	7431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=127;NR=121;PP=2965;SC=CCTGGGAGAACGTCACTGTGG;SOR=0.722;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=248;TCF=127;TCR=121;TR=248;WE=9970166;WS=9970148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr3	9970442	rs279547	C	T	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.22;ReadPosRankSum=0.217;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr3	9972493	rs279545	G	A	2937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=32;PP=1801;SC=TTGATGCTGGGAATTTGGAGA;SOR=1.423;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=66;TCR=32;TR=98;WE=9972501;WS=9972483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr3	9975247	rs183956	C	G	3197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=41;NR=71;PP=2056;SC=TGGGACCAGGCGCGGGACCTG;SOR=1.382;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=41;TCR=71;TR=112;WE=9975255;WS=9975237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr3	9976159	rs279552	A	G	2255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=21;PP=1318;SC=AGTCCCAGCTATGCTCTGGGG;SOR=1.310;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=47;TCR=21;TR=68;WE=9976167;WS=9976149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr3	9991388	rs279601	G	C	8838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=150;NR=146;PP=2965;SC=GCTTCTTGCTGCAGAAGCTCT;SOR=0.731;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=296;TCF=150;TCR=146;TR=296;WE=9991396;WS=9991378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,320:1.00:320
chr3	10028294	rs11551739	G	A	2136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.511;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=43;PP=1203;ReadPosRankSum=-0.670;SC=ACGATGGGTAGGACCACCCAG;SOR=0.634;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=182;TCF=93;TCR=89;TR=91;WE=10028302;WS=10028284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,104:0.51:205
chr3	10030236	rs496181	T	C	1102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.71;QD=33.42;SOR=0.880;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr3	10085035	rs803335	G	T	484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=1;PP=348;SC=CCAGACAGACGACAGTGCAAG;SOR=4.047;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=13;WE=10085043;WS=10085025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	10136817	rs34363202	A	G	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.367;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=286;ReadPosRankSum=0.985;SC=TTTGATTGCAAGGGTATCTTG;SOR=0.259;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=42;TCF=34;TCR=8;TR=19;WE=10136825;WS=10136807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,19:0.42:45
chr3	10142949	rs3172417	C	T	7991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=131;NR=141;PP=2965;SC=CTGATTAGACCCCAGATAAAT;SOR=0.884;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=272;TCF=131;TCR=141;TR=272;WE=10142957;WS=10142939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,307:1.00:307
chr3	10186447	rs1678593	A	T	118.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.78;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	10188428	rs1678607	T	G	649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=20;PP=525;SC=GTCAGGCACGTTATCCAATCT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=10188436;WS=10188418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	10189929	rs1681660	T	C	2305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=53;PP=1629;SC=CCTTATAGAATACCCTCGAGT;SOR=1.497;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=84;TCF=28;TCR=56;TR=81;WE=10189937;WS=10189919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr3	10219510	rs1711109	C	T	6424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=125;NR=102;PP=2965;SC=GAGTTCTCTCCGTCCCTTCCA;SOR=0.869;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=227;TCF=125;TCR=102;TR=227;WE=10219518;WS=10219500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr3	10219567	rs11465864	C	A	2032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=50;PP=1234;ReadPosRankSum=-0.510;SC=AAGATCAAGTCCATGGAGCGG;SOR=0.710;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=191;TCF=87;TCR=104;TR=90;WE=10219575;WS=10219557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,99:0.46:213
chr3	10219729	rs1681663	A	G	698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=19;PP=523;SC=GCCCTCCTTGAGTGGGGCCCA;SOR=3.352;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=22;WE=10219737;WS=10219719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	10241987	rs263410	A	C	198.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=2;PP=127;SC=GACTTCCAGAACCAGTCTCTC;SOR=1.179;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=10241995;WS=10241977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	10251196	rs459864	A	G	931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=3;PP=599;SC=AGACTGGCATAGTCTGAGGAC;SOR=2.093;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=26;WE=10251204;WS=10251186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr3	10254797	rs11465897	C	A	343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=240;SC=TTGATCCCCTCCATCCCTCCA;SOR=2.670;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=10254805;WS=10254790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	10258493	rs2302862	T	C	905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=4;PP=636;SC=GGGGTCAGAGTATGTGGTACC;SOR=2.910;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=27;WE=10258501;WS=10258483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	10258514	rs2302861	T	C	1374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=9;PP=911;SC=TGGGAGGTTATTGGTGGCGTT;SOR=2.400;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=34;TCR=9;TR=43;WE=10258522;WS=10258504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr3	10258762	rs2302860	G	C	2161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=45;PP=1161;SC=TCAGAGAATGGGACCAGGCTG;SOR=1.497;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=28;TCR=45;TR=73;WE=10258770;WS=10258752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr3	10261237	rs3895949	A	C	591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=3;PP=405;SC=CTCCTGAACTAGTGATCTGCC;SOR=2.531;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=10261256;WS=10261227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr3	10261248	rs3895948	T	C	625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=3;PP=445;SC=GTGATCTGCCTGCCTGGGCCT;SOR=2.737;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=10261256;WS=10261227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	10261294	rs3895947	AC	GT	3430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=42;NR=18;PP=2075;SC=GAGCCACCGCACCTGGCTGCC;SOR=1.550;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=44;TCR=19;TR=60;WE=10261303;WS=10261284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr3	10302479	rs402330	G	A	448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=350;SC=GGCCTCCAGGGAACAAACTGA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=10302487;WS=10302469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	10320865	rs2075355	A	G	912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=27;PP=757;SC=TTTGAGTGACATGGTTTGGAA;SOR=4.479;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=29;WE=10320873;WS=10320855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	10334448	.	TA	T	378.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.920;ClippingRankSum=0.000;DP=242;ExcessHet=3.0103;FS=0.635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.65;ReadPosRankSum=0.422;SOR=0.607;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:187,43:0.19:230
chr3	10419856	rs56113011	C	G	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=55;ReadPosRankSum=-1.658;SC=GATGAGGTAACTGAGGCCGAG;SOR=0.495;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=5;WE=10419864;WS=10419846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr3	10420087	rs751122	T	C	1426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.703;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=29;PP=866;ReadPosRankSum=-0.339;SC=CCCCGTCCTGTTGTTTGGCTG;SOR=0.835;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=54;TCR=53;TR=58;WE=10420095;WS=10420077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,65:0.57:115
chr3	10420875	rs4684686	G	A	1080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=3.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.057;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=10;PP=672;ReadPosRankSum=0.305;SC=TGTCAGAGCCGGTGGGGAGGG;SOR=1.094;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=88;TCF=65;TCR=23;TR=41;WE=10420883;WS=10420865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,47:0.49:96
chr3	10421107	rs7616000	A	G	1981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.562;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=54;PP=1280;ReadPosRankSum=-0.034;SC=GTGTGGGGATACGGGTTGGGG;SOR=0.877;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=138;TCF=31;TCR=107;TR=70;WE=10421115;WS=10421097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,81:0.52:156
chr3	10427190	rs725027	C	T	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.623;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=98;ReadPosRankSum=-1.510;SC=ATAGAGATGCCGCAGAGGTTG;SOR=0.693;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=6;WE=10427198;WS=10427180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr3	10442779	rs26797	C	T	1428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.441;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=38;PP=870;ReadPosRankSum=0.165;SC=AGAGGAAGGGCAGGGGAGTCA;SOR=0.537;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=125;TCF=45;TCR=80;TR=61;WE=10442787;WS=10442769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,67:0.49:136
chr3	10452231	rs34907	G	A	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=1.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.414;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=206;ReadPosRankSum=0.853;SC=TGTGTGAGCCGTGAGTGCCCC;SOR=0.982;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=15;WE=10452239;WS=10452221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,15:0.45:33
chr3	10967739	rs2272395	T	C	5542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=92;PP=2965;SC=CCATGATGCCTCTCTCCCCGC;SOR=1.085;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=168;TCF=76;TCR=92;TR=168;WE=10967751;WS=10967729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr3	10976876	rs2245532	A	G	1901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=51;PP=1478;SC=CGGAGGGGACACTGCCCGAGG;SOR=3.611;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=8;TCR=51;TR=59;WE=10976884;WS=10976866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr3	11075503	rs2246543	T	C	391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=299;SC=AGGGAGAAACTTCTAGAGGCA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=11075511;WS=11075493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	11078373	rs2697134	G	A	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.084;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.612;NF=6;NR=1;PP=67;ReadPosRankSum=0.413;SC=CCCATGTGGGGCAGTGGCAGG;SOR=1.692;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=7;WE=11078381;WS=11078363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,8:0.23:35
chr3	11300707	rs901865	T	C	3569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=37;PP=2117;SC=CCATAACTGGTGGCTGCTCTT;SOR=1.521;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=81;TCR=37;TR=118;WE=11300715;WS=11300697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr3	11350553	rs2305686	C	T	1933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=56;PP=1257;ReadPosRankSum=2.143;SC=AATGGGCTCTCGGTTGCACCG;SOR=0.667;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=205;TCF=80;TCR=125;TR=92;WE=11350561;WS=11350543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,99:0.42:233
chr3	11487891	rs2442798	G	A	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.201;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=381;ReadPosRankSum=0.467;SC=TTGTAAATGCGTTATATAAAG;SOR=0.408;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=54;TCF=41;TCR=13;TR=27;WE=11487899;WS=11487881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,28:0.50:56
chr3	11518755	rs4684782	T	C	911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.128;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=31;PP=558;ReadPosRankSum=2.157;SC=AGATGAACAATGATGATAAAA;SOR=0.997;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=73;TCF=20;TCR=53;TR=41;WE=11518763;WS=11518745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,43:0.55:78
chr3	11596302	rs8154	T	C	3854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=429;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=96;PP=2131;ReadPosRankSum=1.146;SC=ACATGAGCGATGATGAGACCA;SOR=0.731;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=395;TCF=189;TCR=206;TR=180;WE=11596310;WS=11596292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:235,194:0.45:429
chr3	11596348	rs14016	C	T	3076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=76;PP=1966;ReadPosRankSum=0.290;SC=GACTTCTCCCCGGCCGCCTGC;SOR=0.674;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=260;TCF=109;TCR=151;TR=133;WE=11596356;WS=11596338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,143:0.51:278
chr3	11643465	rs2276749	T	C	1249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=29;PP=951;SC=GCAGGGTCTGTATTCTGGGTT;SOR=2.247;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=10;TCR=29;TR=39;WE=11643473;WS=11643455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	11667714	rs3856802	C	T	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.352;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=292;ReadPosRankSum=0.163;SC=TAACCAAATACGGAAGCTGAA;SOR=0.432;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=41;TCF=31;TCR=10;TR=22;WE=11667722;WS=11667704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,26:0.57:46
chr3	11734644	.	C	CA	41	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;FR=0.5020;HP=13;HapScore=3;MGOF=4;MMLQ=26;MQ=57.3;NF=4;NR=0;PP=41;QD=11.5;SC=GACCCTGTCTCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=4;WE=11734652;WS=11734634;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,4:0.33:12
chr3	11744544	rs11411195	G	GA	2883.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=50;PP=1738;SC=AATAAAAGGGGAAAAAATAAT;SOR=1.561;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=61;TCF=4;TCR=57;TR=52;WE=11744552;WS=11744534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr3	11744584	rs6781438	C	T	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-4.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.215;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.825;NF=5;NR=12;PP=213;ReadPosRankSum=0.162;SC=CTCTTAGAATCCTAGTCATTA;SOR=0.063;SbPval=0.1;Source=Platypus;TC=41;TCF=6;TCR=35;TR=17;WE=11744592;WS=11744574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,21:0.43:49
chr3	11848874	rs3796330	G	C	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=18;PP=394;ReadPosRankSum=1.075;SC=TAGAGAAGGAGCAACGAAAAC;SOR=0.667;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=127;TCF=74;TCR=53;TR=41;WE=11848882;WS=11848864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,42:0.31:136
chr3	11871215	rs11551661	T	C	1706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.407;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=34;PP=716;ReadPosRankSum=-0.360;SC=GCAATCTCTATGAAGAGGTCT;SOR=0.939;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=145;TCF=79;TCR=66;TR=69;WE=11871223;WS=11871205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,87:0.50:173
chr3	11874762	rs12494203	G	A	1587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.563;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=44;PP=1070;ReadPosRankSum=0.684;SC=AGGGGCATTGGCTTAAAGGGA;SOR=1.101;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=114;TCF=39;TCR=75;TR=64;WE=11874770;WS=11874752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,70:0.56:125
chr3	11924613	rs369394286	AG	A	1295.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.79;QD=33.22;SOR=3.556;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr3	12045891	rs79624759	T	C	1006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.76;SOR=2.737;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	12045899	rs77368781	C	T	1085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.24;SOR=2.925;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	12045923	rs73135622	A	C	1435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=3;PP=929;SC=GGCTAAGCCGACGCCTCAGCC;SOR=4.235;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=33;TCR=3;TR=35;WE=12045931;WS=12045913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	12045986	rs67270413	G	A	4011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=82;NR=57;PP=2352;SC=CCGCGCCACCGGACCCCGTAG;SOR=1.003;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=140;TCF=83;TCR=57;TR=139;WE=12045994;WS=12045976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr3	12046013	rs72624441	A	C	5552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=102;NR=87;PP=2965;SC=GCGCCCCCAGACCTTTAAGCC;SOR=0.770;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=189;TCF=102;TCR=87;TR=189;WE=12046021;WS=12046003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr3	12046076	rs2618395	T	C	6910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=97;NR=120;PP=2965;SC=TCATCGCCAATCTGCCCAACG;SOR=0.985;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=217;TCF=97;TCR=120;TR=217;WE=12046084;WS=12046066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,262:1.00:262
chr3	12046124	rs76272937	AG	GC	6377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.98;SOR=1.251;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr3	12046131	rs74213196	A	C	5675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=48.51;SOR=1.208;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr3	12046148	rs2623874	C	T	3931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.26;SOR=1.233;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr3	12046168	rs2623875	A	C	2716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=30;PP=686;SC=GCCTCGGCCTAGGCGGCGCCC;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=18;TCR=30;TR=48;WE=12046176;WS=12046158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr3	12046196	rs2600233	A	C	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.691;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.6705;FS=7.404;HP=3;HapScore=2;MGOF=61;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=131;ReadPosRankSum=-2.362;SC=CCTCGCCGGGACCGGAGCGGA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=7;WE=12046204;WS=12046186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr3	12046207	rs2600234	C	G	155.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.96;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	12046297	.	A	C	302	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;FR=1.0000;HP=4;HapScore=2;MGOF=31;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=16;NR=4;PP=302;QD=16.8385606274;SC=GCAGCAGCTTATTCAGCTCGC;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=12046305;WS=12046287;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr3	12046362	rs2923856	G	C	2170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.42;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr3	12046372	rs2623877	G	C	2120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.18;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr3	12208652	rs795008	A	G	1765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=20;PP=1172;SC=GCAACAGTGAACTAAAATTCT;SOR=1.366;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=39;TCR=20;TR=59;WE=12208660;WS=12208642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr3	12317739	rs151229409	GAAGGGAGGAAGGA	G	7551.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=64.09;QD=43.65;SOR=1.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr3	12537955	rs299651	T	A	1995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=31;PP=1283;SC=TTTCCTAGATTTTTAGTGTTT;SOR=0.955;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=43;TCR=31;TR=74;WE=12537963;WS=12537945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr3	12557936	.	ACAAAATAT	A	351	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=4;NR=0;PP=351;QD=92.25;SC=AAACAAACAAACAAAATATAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=12557951;WS=12557926;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	12560763	rs1618545	A	T	4242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=85;PP=2674;SC=AGAATATCAAATTGATCTTGT;SOR=1.193;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=145;TCF=60;TCR=85;TR=145;WE=12560771;WS=12560753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr3	12570572	rs299632	C	T	3723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=69;PP=1984;ReadPosRankSum=1.536;SC=CCTCCTTACACACTAATGTCA;SOR=0.430;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=52;TCR=70;TR=121;WE=12570580;WS=12570562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,141:0.99:142
chr3	12571420	rs35445022	GT	G	934.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=3.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQRankSum=0.000;QD=15.08;ReadPosRankSum=1.328;SOR=0.292;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,50:0.81:62
chr3	12573998	rs167257	T	C	1094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=6;PP=763;SC=AAGGTTTATATTGTTACATTC;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=35;WE=12574006;WS=12573988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr3	12598839	rs2255655	C	G	482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=14;PP=381;SC=GCTGCCGCCACAGCCGGGGAT;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=12598847;WS=12598829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	12613866	rs2648307	T	C	5113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=87;PP=2847;SC=GGAAGGCTCATGAAAAGGTAA;SOR=0.734;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=182;TCF=95;TCR=87;TR=182;WE=12613874;WS=12613856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr3	12617996	rs1542848	G	A	2264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=22;PP=1531;SC=TTGGATGATTGTGATTTCATC;SOR=1.854;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=57;TCR=22;TR=79;WE=12618004;WS=12617986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr3	12618269	rs2442805	C	T	4648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=92;PP=2940;SC=CGACGTGCCCCTGCTGCCTGC;SOR=1.206;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=156;TCF=64;TCR=92;TR=156;WE=12618277;WS=12618259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr3	12645007	rs2596828	C	T	9525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=358;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=158;NR=169;PP=2965;SC=GTCTGGACCACGCCCTGGGAG;SOR=0.823;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=327;TCF=158;TCR=169;TR=327;WE=12645015;WS=12644997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,358:1.00:358
chr3	12647547	rs3214791	T	TG	720.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=0;PP=896;SC=TTCTACCTTTTCTGTACCACC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=20;WE=12647555;WS=12647542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr3	12650482	rs2454440	T	A	3109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=75;PP=2010;SC=AAAAGACAACTTCATTTCTTG;SOR=1.971;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=105;TCF=30;TCR=75;TR=105;WE=12650490;WS=12650472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr3	12776428	rs3732687	A	C	2950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=53;PP=1651;SC=GTCTCAATGAACCACAGTCAT;SOR=1.220;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=39;TCR=53;TR=92;WE=12776436;WS=12776418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr3	12779409	rs2271209	A	G	1831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=40;PP=1228;SC=AGATGGGGGTACTGTCCTTGG;SOR=1.681;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=19;TCR=40;TR=59;WE=12779417;WS=12779399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr3	12791172	rs937915	T	C	1086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=26;NR=12;PP=675;SC=GCAACGTGAGTTGAGCAGGGT;SOR=1.347;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=26;TCR=12;TR=38;WE=12791180;WS=12791162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	12810629	rs112818257	CCGGGACTGG	C	1301.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=6;NR=8;PP=2941;SC=CCCTCACTGCCCGGGACTGGC;SOR=1.214;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=16;TCF=7;TCR=9;TR=14;WE=12810645;WS=12810619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr3	12810755	rs7641959	G	C	933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=15;NR=19;PP=523;SC=CATACCTCCCGGAAGGCTGAG;SOR=0.984;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=15;TCR=19;TR=34;WE=12810763;WS=12810745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr3	12810783	rs61606491	C	T	633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=15;PP=397;SC=GCTCCGGCCTCGGCCATCCCA;SOR=1.519;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=7;TCR=15;TR=22;WE=12810791;WS=12810773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	12838179	rs371427654	A	G	2157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=41;PP=1322;ReadPosRankSum=-0.614;SC=CCGCGCCGCCATATTCCCTCC;SOR=0.709;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=174;TCF=105;TCR=69;TR=101;WE=12838187;WS=12838169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,107:0.57:189
chr3	12838293	rs12631514	G	C	1956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.283;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=43;PP=1120;ReadPosRankSum=-0.293;SC=TTCAGGTGCAGCCCGCCGCCG;SOR=0.538;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=210;TCF=100;TCR=110;TR=88;WE=12838301;WS=12838283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,97:0.42:229
chr3	12845158	rs9835677	G	A	476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.467;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=15;PP=321;ReadPosRankSum=-0.015;SC=TGGAGCAGGAGAGGGGGCCCT;SOR=0.361;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=62;TCF=26;TCR=36;TR=27;WE=12845166;WS=12845148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,27:0.40:68
chr3	12848822	rs11718898	T	C	1956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.520;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=41;PP=1309;ReadPosRankSum=0.009;SC=CCTCTGGTGGTCAAAGTGAAG;SOR=0.622;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=185;TCF=109;TCR=76;TR=96;WE=12848830;WS=12848812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,100:0.50:202
chr3	12849011	rs34529773	TA	T	467.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.70;MQRankSum=1.550;QD=12.31;ReadPosRankSum=-1.750;SOR=0.779;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr3	12849031	rs59302336	C	CA	121.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=3.056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.09;ReadPosRankSum=-0.735;SOR=1.949;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr3	12856856	rs2305398	A	G	1689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.545;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=39;PP=1007;ReadPosRankSum=-1.351;SC=CGGCAAACACAGCCCCCGAAG;SOR=0.945;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=154;TCF=78;TCR=76;TR=73;WE=12856864;WS=12856846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,81:0.49:164
chr3	12857493	rs2305397	C	T	1545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.891;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=27;PP=786;ReadPosRankSum=-1.361;SC=GAGCATATGCCTGTGCTGGTA;SOR=0.837;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=149;TCF=84;TCR=65;TR=66;WE=12857501;WS=12857483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,78:0.45:173
chr3	12857823	rs731646	C	T	1151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.795;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=18;PP=511;ReadPosRankSum=0.351;SC=CAGGGAGGGCCGTGTTGCATC;SOR=0.795;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=78;TCF=44;TCR=34;TR=44;WE=12857831;WS=12857813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,52:0.58:89
chr3	12858028	rs3732675	T	C	1835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.043;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=28;PP=1064;ReadPosRankSum=0.252;SC=TGTGGCTGACTCTTTCTACAA;SOR=0.373;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=131;TCF=84;TCR=47;TR=73;WE=12858036;WS=12858018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,84:0.55:154
chr3	12859004	rs3732678	A	C	1956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=34;PP=1076;ReadPosRankSum=0.109;SC=GGGCCAGGCCACCAGCGGGAG;SOR=0.688;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=154;TCF=92;TCR=62;TR=83;WE=12859012;WS=12858994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,96:0.54:177
chr3	12861586	rs4684883	T	C	4635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.434;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=49;PP=1416;ReadPosRankSum=2.358;SC=GTCCTGCAGGTCGGCCACACA;SOR=0.749;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=258;TCF=140;TCR=118;TR=109;WE=12861594;WS=12861576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,124:0.43:286
chr3	12861608	rs3817121	G	A	5498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=344;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.270;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=71;PP=1790;ReadPosRankSum=-4.244;SC=CCGGAGCACCGTCATCACAGC;SOR=0.618;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=308;TCF=158;TCR=150;TR=149;WE=12861616;WS=12861598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:177,166:0.48:343
chr3	12872890	.	G	C	1747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.121;ClippingRankSum=0.000;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=30;PP=995;ReadPosRankSum=-0.552;SC=TGGGGCCTCTGCTCTTTCCCA;SOR=0.658;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=154;TCF=95;TCR=59;TR=77;WE=12872898;WS=12872880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,86:0.51:169
chr3	12875443	rs12629133	G	A	8677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=136;NR=161;PP=2965;SC=GAAGGATTCCGCTTCAGCCCC;SOR=0.975;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=297;TCF=136;TCR=161;TR=297;WE=12875451;WS=12875433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,327:1.00:327
chr3	12942850	rs56387830	GC	G	2114.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=14;PP=2050;SC=TGGGGGGGTGGCCAGGGCTGG;SOR=2.468;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=52;TCF=38;TCR=14;TR=48;WE=12942858;WS=12942830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr3	12954868	rs2600322	A	G	4564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=59;PP=2755;SC=ACAGCCAGACATGGACCCTGG;SOR=1.299;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=165;TCF=106;TCR=59;TR=165;WE=12954876;WS=12954858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr3	12956531	rs2255964	G	A	1754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=12;PP=1290;SC=CTGGGGAGCCGGCGGACTGGC;SOR=2.381;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=59;TCF=47;TCR=12;TR=58;WE=12956539;WS=12956521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr3	12976863	rs2600206	T	C	713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=3;PP=530;SC=TCAAGCTCCGTGCTTGGAAGG;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=12976871;WS=12976853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	12983423	rs72624443	C	T	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=107;ReadPosRankSum=0.814;SC=AACACGACACCGGGCCGTGGG;SOR=0.760;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=6;WE=12983431;WS=12983413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr3	13008814	rs72624444	G	C	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.298;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=281;ReadPosRankSum=-2.053;SC=CTCCCGCACAGGCATCCCCAC;SOR=1.802;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=28;TCF=19;TCR=9;TR=22;WE=13008822;WS=13008804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,24:0.80:30
chr3	13114691	rs74753289	G	A	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.830;HP=5;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=305;ReadPosRankSum=0.694;SC=CGGGAGCGGGGGGCGGCGCCA;SOR=1.201;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=17;WE=13114699;WS=13114681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr3	13359433	rs354477	G	A	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.793;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=117;ReadPosRankSum=-0.761;SC=GGAAGTCCACGGGCACCTGCT;SOR=2.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=7;WE=13359441;WS=13359423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr3	13361238	rs2276748	C	T	892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.747;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=14;PP=532;ReadPosRankSum=1.613;SC=TGGTCTGTCCCAGATGATGTC;SOR=0.830;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=96;TCF=58;TCR=38;TR=39;WE=13361246;WS=13361228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,44:0.42:105
chr3	13361287	rs354478	C	T	1183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.654;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=22;PP=763;ReadPosRankSum=0.878;SC=CGGCGATCCACCACAAAAGCC;SOR=0.602;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=68;TCR=49;TR=52;WE=13361295;WS=13361277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,58:0.45:130
chr3	13361391	rs354479	A	G	2354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.602;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=52;PP=1424;ReadPosRankSum=2.539;SC=CGCGGGGTCCAAGACGCCGAC;SOR=0.715;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=170;TCF=88;TCR=82;TR=101;WE=13361399;WS=13361381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,112:0.60:186
chr3	13364876	rs514084	G	T	2476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.988;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=59;PP=1392;ReadPosRankSum=0.817;SC=CCTGGAAGCTGGTCTGGATGG;SOR=0.773;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=224;TCF=97;TCR=127;TR=103;WE=13364884;WS=13364866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,121:0.49:246
chr3	13367406	rs665064	C	T	1355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.675;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=29;PP=690;ReadPosRankSum=0.981;SC=TGCTGTTGGCCGAGGAGCTCC;SOR=0.580;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=107;TCF=53;TCR=54;TR=60;WE=13367414;WS=13367396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,66:0.54:123
chr3	13368892	rs2271509	G	A	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=14;PP=284;ReadPosRankSum=-1.132;SC=TGCGGACAACGCAGGTGTTGT;SOR=0.769;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=67;TCF=32;TCR=35;TR=25;WE=13368900;WS=13368882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,31:0.38:81
chr3	13379400	rs3773302	C	T	2804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.780;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=51;PP=1613;ReadPosRankSum=-0.179;SC=GCAGCAGCACCTCCACCTGCA;SOR=0.566;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=184;TCF=107;TCR=77;TR=117;WE=13379408;WS=13379390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,130:0.63:205
chr3	13383322	rs151008831	C	T	1473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=31;PP=913;ReadPosRankSum=1.710;SC=CTGGTCTGGCCGATGGCCACA;SOR=0.712;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=167;TCF=95;TCR=72;TR=71;WE=13383330;WS=13383312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,75:0.41:181
chr3	13383540	rs2271504	A	G	3401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.732;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=79;PP=2411;ReadPosRankSum=1.235;SC=TCAGGTCCATAAAGGGGAAGT;SOR=0.774;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=333;TCF=170;TCR=163;TR=154;WE=13383548;WS=13383530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:195,161:0.45:356
chr3	13393166	rs11292029	CT	C	75.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=16;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=77;ReadPosRankSum=0.479;SC=TTTGATTTTTCTTTTTTTTTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=7;WE=13393174;WS=13393157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr3	13395579	rs2280084	C	A	2190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.492;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=54;PP=1372;ReadPosRankSum=0.905;SC=CAGGTCCAGCCGGGGGTTGCG;SOR=0.746;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=205;TCF=94;TCR=111;TR=99;WE=13395587;WS=13395569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,107:0.48:222
chr3	13399786	rs6795271	G	A	706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=6;PP=358;ReadPosRankSum=0.980;SC=GTAGACAGGCGCGAGGGTGAG;SOR=0.634;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=50;TCF=39;TCR=11;TR=27;WE=13399794;WS=13399776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,32:0.54:59
chr3	13399948	rs6807718	T	C	2019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.515;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=48;PP=1182;ReadPosRankSum=0.241;SC=CTCACTCCTCTCTGAGCTATG;SOR=0.638;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=184;TCF=85;TCR=99;TR=89;WE=13399956;WS=13399938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,101:0.50:203
chr3	13407556	rs3732671	T	C	1503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.582;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=37;PP=703;ReadPosRankSum=-1.617;SC=TTTACCCGGATGCCGCTGCAG;SOR=0.609;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=144;TCF=61;TCR=83;TR=67;WE=13407564;WS=13407546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,78:0.46:168
chr3	13415146	rs6810356	G	T	1356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.354;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=11;PP=893;ReadPosRankSum=2.658;SC=TGAAGTCGAGGCTTGCTCAGA;SOR=0.252;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=82;TCF=69;TCR=13;TR=53;WE=13415154;WS=13415136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,58:0.67:87
chr3	13418086	rs6442377	C	A	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.086;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=27;ReadPosRankSum=-1.738;SC=GACGGGTGGGCTGGGCCCTGG;SOR=0.016;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=6;WE=13418094;WS=13418076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr3	13419123	rs35998066	T	TG	672.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.356;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.456;NF=0;NR=16;PP=474;ReadPosRankSum=-1.245;SC=TGGAGGAGGATGGGACCACCA;SOR=0.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=16;WE=13419131;WS=13419113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,26:0.50:52
chr3	13420624	rs6442378	G	A	1246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.727;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=34;PP=752;ReadPosRankSum=-0.357;SC=CTTAGGCCACGTAGAGCAAAG;SOR=0.898;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=93;TCF=30;TCR=63;TR=49;WE=13420632;WS=13420614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,56:0.55:102
chr3	13421150	rs7628051	C	T	3767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=72;PP=2501;ReadPosRankSum=-0.364;SC=ACCGGCCGGGCTGGGTCTCCT;SOR=0.689;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=297;TCF=171;TCR=126;TR=166;WE=13421158;WS=13421140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,176:0.55:320
chr3	13421320	rs7625586	T	C	1029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.847;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=31;PP=763;ReadPosRankSum=-1.446;SC=ATCTCTGCACTCTGCTCTCAG;SOR=1.371;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=82;TCF=22;TCR=60;TR=39;WE=13421328;WS=13421310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,43:0.47:91
chr3	13438830	rs13066607	A	G	645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=6;PP=470;ReadPosRankSum=1.000;SC=GGGCTGCAGAAGACAAACAGG;SOR=0.706;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=50;TCF=38;TCR=12;TR=27;WE=13438838;WS=13438820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,28:0.54:52
chr3	13439005	rs7628923	A	G	1695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=31;PP=908;ReadPosRankSum=-0.653;SC=GAACCCCAGGAAGGGGTCAGC;SOR=0.709;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=148;TCF=76;TCR=72;TR=66;WE=13439013;WS=13438995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,81:0.47:174
chr3	13522973	rs2675232	C	T	795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.779;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=21;PP=445;ReadPosRankSum=1.567;SC=CAACATAAGCCTCAGGCTCTC;SOR=0.581;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=85;TCF=38;TCR=47;TR=38;WE=13522981;WS=13522963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,41:0.42:98
chr3	13523010	rs2655218	T	C	1317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=28;PP=655;SC=AGCCCTCGGATGGCCTTCCAC;SOR=1.702;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=16;TCR=28;TR=44;WE=13523018;WS=13523000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr3	13544593	rs76666620	C	T	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=24;PP=524;ReadPosRankSum=-0.677;SC=TTCATAGCATCCCTGTGAGGT;SOR=0.432;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=44;TCF=4;TCR=40;TR=27;WE=13544601;WS=13544583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,27:0.61:44
chr3	13545697	rs17038240	C	T	1475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.189;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=38;PP=967;ReadPosRankSum=1.434;SC=AGCACCTGCCCGACGTGGTGG;SOR=0.829;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=162;TCF=78;TCR=84;TR=71;WE=13545705;WS=13545687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,76:0.43:176
chr3	13574068	rs35913726	AC	A	769.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=16;PP=422;SC=CTTCCCCATAACCCCCCCATC;SOR=1.136;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=17;WE=13574076;WS=13574058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	13669537	rs1966825	T	G	1950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=42;PP=1247;SC=TGGGGGCTTTTAGGGCTTTAG;SOR=2.035;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=16;TCR=42;TR=58;WE=13669545;WS=13669527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr3	13670481	rs2242023	A	G	6102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=113;NR=103;PP=2965;SC=GCTCCTACACATGCCAGAGGA;SOR=0.710;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=216;TCF=113;TCR=103;TR=216;WE=13670489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr3	13670536	rs9843344	A	G	4913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=70;PP=2965;SC=CGATGATGGGACCAAGTGTGT;SOR=0.716;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=151;TCF=80;TCR=71;TR=150;WE=13670544;WS=13670526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr3	13670776	rs4684968	T	C	1736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=40;PP=980;SC=GGGATGCCTTTGGCCGGGGCT;SOR=1.473;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=22;TCR=40;TR=62;WE=13670784;WS=13670766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr3	13670837	rs4684969	T	G	490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=11;PP=303;SC=ACCTGGCTGGTCCCCTGCCCT;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=13670845;WS=13670827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	13671183	rs877432	T	A	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.922;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=4;PP=123;ReadPosRankSum=1.040;SC=TCTCTTTCCCTGTCCTGGCCT;SOR=0.250;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=20;TCF=13;TCR=7;TR=9;WE=13671191;WS=13671175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr3	13672392	rs3773258	G	C	925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.905;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=30;PP=724;ReadPosRankSum=-0.995;SC=GAGAGTCCCTGCTGGGCCATG;SOR=1.378;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=82;TCF=28;TCR=54;TR=42;WE=13672400;WS=13672382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,39:0.49:79
chr3	13672732	rs3773255	C	T	973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.701;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=4;PP=743;ReadPosRankSum=0.589;SC=AAAATGGGCCCCTAAGCTCTA;SOR=1.473;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=75;TCF=63;TCR=12;TR=35;WE=13672740;WS=13672722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,39:0.47:83
chr3	13679688	rs1061390	T	A	3439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.55;ReadPosRankSum=0.546;SOR=0.565;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,92:0.47:196
chr3	13679695	rs1061398	C	A	3633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.64;ReadPosRankSum=0.013;SOR=0.665;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:106,100:0.49:206
chr3	13679708	rs12968	C	A	2292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.475;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=47;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.883;SC=AGACACGCGACCATGTTGGGG;SOR=0.658;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=206;TCF=110;TCR=96;TR=100;WE=13679716;WS=13679678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,118:0.51:232
chr3	13679829	rs7820	C	T	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.479;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.938;NF=10;NR=21;PP=451;ReadPosRankSum=-1.331;SC=TTTTGTTTAACTATAAAGTAG;SOR=0.393;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=58;TCF=16;TCR=42;TR=31;WE=13679837;WS=13679819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,33:0.55:60
chr3	13679850	rs71773469	TTA	T	362.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.227;NF=0;NR=12;PP=422;ReadPosRankSum=0.650;SC=TACATGTACATTATATAAAAA;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=12;WE=13679859;WS=13679840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr3	14105882	rs4684179	C	A	251.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.98;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	14106310	.	T	TCCAGCACCAGCAGTC	916.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=3;PP=870;SC=CAGCAGCAGCTCCAGCACCAG;SOR=1.911;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=16;TCF=11;TCR=5;TR=12;WE=14106318;WS=14106300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	14106499	rs2607779	G	A	2211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=38;NR=36;PP=1110;SC=GAGAGGCCCCGTGGGTATTCT;SOR=0.788;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=38;TCR=36;TR=74;WE=14106507;WS=14106489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr3	14154231	rs2731316	T	G	1234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=9;PP=832;SC=TATGTCAAGATGTCAAGACCT;SOR=2.247;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=38;WE=14154239;WS=14154221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	14158220	rs2731313	G	A	407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=13;PP=339;SC=GGCAGGAAAAGAAGCACTGAA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=14158228;WS=14158210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	14166280	rs57196972	C	T	4437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=80;NR=81;PP=2711;SC=CCTCCGAAGCCCGCGCGGACC;SOR=0.789;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=161;TCF=80;TCR=81;TR=161;WE=14166288;WS=14166270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr3	14174146	rs4685075	T	C	1823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=39;PP=1008;SC=GGGCCCACAGTGGTGGCTGGA;SOR=1.678;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=21;TCR=39;TR=60;WE=14174154;WS=14174136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr3	14180633	rs2731320	C	T	2440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=21;PP=1485;SC=CGACTGGGTACGCCACTGGCC;SOR=1.863;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=59;TCR=21;TR=80;WE=14180641;WS=14180623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr3	14187449	rs2228001	G	T	2261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=24;PP=1267;SC=GCTCACAGCTGCTCAAATGGG;SOR=1.220;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=48;TCR=24;TR=72;WE=14187457;WS=14187439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr3	14187699	rs2733532	T	C	532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=13;PP=365;SC=AGGCGAGGGTTAGTAATCAGA;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=17;WE=14187707;WS=14187689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	14188700	rs2733533	C	A	4224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=31;PP=2824;SC=TGACTTGAGGCTGGGGCAGAA;SOR=2.206;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=99;TCR=31;TR=130;WE=14188708;WS=14188690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr3	14188762	rs2733534	G	C	10775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=396;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=213;NR=157;PP=2965;SC=CCCTGAGCTTGTCTTCTCTGC;SOR=0.990;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=370;TCF=213;TCR=157;TR=370;WE=14188770;WS=14188752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,396:1.00:396
chr3	14189340	rs2607749	A	G	1835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=15;PP=1155;SC=GGCCTGGGGAAGGAAGAGGCC;SOR=1.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=40;TCR=15;TR=55;WE=14189348;WS=14189330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr3	14190237	rs2279017	T	G	7062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=124;NR=121;PP=2965;SC=GGCACCTGTGTCGGGTGAGCA;SOR=0.755;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=245;TCF=124;TCR=121;TR=245;WE=14190245;WS=14190227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr3	14190268	rs2470353	G	C	5371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=92;PP=2965;SC=TGGCCAGCAGGGGAACAAGGC;SOR=0.754;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=187;TCF=94;TCR=93;TR=186;WE=14190276;WS=14190258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr3	14197987	rs2958057	A	T	6441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=116;NR=105;PP=2965;SC=CCATGTGTTTAGCCTGAAACT;SOR=0.736;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=221;TCF=116;TCR=105;TR=221;WE=14197995;WS=14197977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr3	14199887	rs2228000	G	A	5492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=103;PP=2965;SC=TGAGGATGCCGCTGGCAAGCT;SOR=1.156;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=179;TCF=76;TCR=103;TR=179;WE=14199895;WS=14199877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr3	14199908	rs2227999	C	T	1727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.296;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=37;PP=908;ReadPosRankSum=0.265;SC=TGGGTCCTTACGATGGCTCCC;SOR=0.566;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=135;TCF=58;TCR=77;TR=67;WE=14199916;WS=14199898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,76:0.50:151
chr3	14220095	rs2607775	C	G	15395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=574;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=259;NR=249;PP=2965;SC=AATTCCACTTCGCGAGTGACG;SOR=0.750;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=510;TCF=260;TCR=250;TR=508;WE=14220103;WS=14220085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,572:1.00:572
chr3	14485484	rs36107877	C	A	1764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.511;HP=8;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=40;PP=1053;ReadPosRankSum=-0.586;SC=CTGGCCCCCCCCCTTGACCTC;SOR=0.705;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=200;TCF=104;TCR=96;TR=86;WE=14485492;WS=14485467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,92:0.44:208
chr3	14486392	rs3773189	A	G	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=231;ReadPosRankSum=-0.070;SC=CCCCTGCCCCAATGCTTTGCC;SOR=0.495;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=14;WE=14486400;WS=14486382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr3	14489370	rs2304511	G	T	1217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.247;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=30;PP=701;ReadPosRankSum=-0.781;SC=GGGTGGGGCAGAGAGGATGGC;SOR=0.288;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=107;TCF=43;TCR=64;TR=55;WE=14489378;WS=14489360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,60:0.50:120
chr3	14526538	rs1062540	G	A	1088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.397;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=20;PP=676;ReadPosRankSum=-1.709;SC=CGACGGGGCCGGCGGCTTTCC;SOR=0.970;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=112;TCF=62;TCR=50;TR=50;WE=14526546;WS=14526528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,55:0.48:115
chr3	14526656	rs1126666	A	G	312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.06;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	14548494	rs2276755	A	G	1546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.234;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=36;PP=903;ReadPosRankSum=-0.062;SC=GGGACCTGGGAGGAGAGAGGG;SOR=0.804;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=150;TCF=69;TCR=81;TR=66;WE=14548502;WS=14548484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,75:0.47:161
chr3	14551444	rs9845816	A	G	2022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.568;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=40;PP=1307;ReadPosRankSum=-0.619;SC=CCACTGTGTAACTGACGGCAC;SOR=0.816;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=228;TCF=126;TCR=102;TR=95;WE=14551452;WS=14551434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,100:0.40:248
chr3	14552994	rs4685168	A	G	792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=20;PP=490;ReadPosRankSum=-0.131;SC=GCCGCTGGAGAAAAAGAGGCC;SOR=0.732;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=54;TCF=19;TCR=35;TR=31;WE=14553002;WS=14552984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,35:0.60:58
chr3	14554476	rs4516597	T	C	1008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.711;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=25;PP=691;ReadPosRankSum=1.044;SC=AAGTCACAGTTCTAATCTCAT;SOR=0.523;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=84;TCF=30;TCR=54;TR=41;WE=14554484;WS=14554466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,45:0.47:96
chr3	14555009	rs4685170	C	T	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=67;ReadPosRankSum=0.732;SC=TTCTCCCTCCCGTGCCAAGGC;SOR=0.804;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=5;WE=14555017;WS=14554999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr3	14555216	rs4685171	T	C	1729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=44;PP=971;ReadPosRankSum=-0.128;SC=TGTGGGCCAGTGCGGCGTCCC;SOR=0.713;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=185;TCF=90;TCR=95;TR=84;WE=14555224;WS=14555206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,89:0.45:198
chr3	14555367	rs4685172	T	C	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=216;ReadPosRankSum=0.336;SC=GACAGGTCCATTGGGAGACAA;SOR=0.446;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=13;WE=14555375;WS=14555357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr3	14555739	rs4361268	G	A	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-2.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.813;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=9;PP=248;ReadPosRankSum=0.227;SC=AGGGCTTGGTGCTGTGACTCA;SOR=0.446;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=67;TCF=42;TCR=25;TR=23;WE=14555747;WS=14555729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,41:0.46:90
chr3	14555758	rs138623401	C	CAGTT	1578.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.611;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=704;ReadPosRankSum=1.112;SC=CAGTTTCTCTCAGAGAGTGGC;SOR=0.500;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=55;TCF=17;TCR=38;TR=15;WE=14555766;WS=14555748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,42:0.40:105
chr3	14555811	rs4613440	A	G	811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.472;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=17;PP=533;ReadPosRankSum=0.725;SC=TCTCAGCCGGACTGTCAGGCT;SOR=0.800;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=122;TCF=63;TCR=59;TR=38;WE=14555819;WS=14555801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,43:0.32:135
chr3	14561627	rs5846840	A	AG	1201.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=7;PP=1152;SC=CCTGCCTCTGAGGCCTCAGTG;SOR=2.368;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=28;WE=14561635;WS=14561617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	14563258	rs4234526	A	G	950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.873;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=22;PP=542;ReadPosRankSum=2.259;SC=TTCCATCGACACTGAGCAGCC;SOR=0.452;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=74;TCF=30;TCR=44;TR=39;WE=14563266;WS=14563248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,45:0.55:82
chr3	14565017	rs4685173	G	A	2182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.063;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=33;PP=1217;ReadPosRankSum=-2.445;SC=AGTCAGAACTGAGATACACAT;SOR=0.779;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=188;TCF=115;TCR=73;TR=91;WE=14565025;WS=14565007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,107:0.50:216
chr3	14693535	rs140265615	C	T	660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=21;PP=437;ReadPosRankSum=-0.514;SC=ATTTTCTTCTCCGGCGGGGAT;SOR=0.589;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=10;TCR=44;TR=26;WE=14693543;WS=14693525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,28:0.52:54
chr3	14702848	rs3832217	A	AT	92.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5008;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=100;ReadPosRankSum=0.712;SC=CTTTTTCAAGATTTTTTTGTG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=5;WE=14702856;WS=14702846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr3	14702982	rs2276754	C	A	4204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=88;NR=53;PP=2428;SC=GCTTCTTGTCCATTCCATGTG;SOR=1.143;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=88;TCR=53;TR=141;WE=14702990;WS=14702972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr3	14703297	rs9840626	C	G	2540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.539;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.980;NF=49;NR=58;PP=1384;ReadPosRankSum=-0.212;SC=GGGTTGTTATCGAGCCATTTC;SOR=0.592;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=218;TCF=97;TCR=121;TR=107;WE=14703305;WS=14703287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,122:0.49:247
chr3	14703401	rs55915506	CATAATTACA	C	255.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.645;NF=0;NR=7;PP=1597;ReadPosRankSum=-1.189;SC=CAAATGAAGACATAATTACAA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=7;WE=14703417;WS=14703391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr3	14706745	rs142447115	T	TATTG	45.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=164;ReadPosRankSum=-0.524;SC=AGTAAGGAGATATTGATTGAT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=4;WE=14706753;WS=14706735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr3	14706770	.	A	ATTGG	150	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;FR=0.5103;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=150;QD=40.0;SC=TGATTGATTGAAGCACTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=14706778;WS=14706760;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr3	14708918	rs2280383	A	G	5055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=110;NR=67;PP=2965;SC=TGGGTAATTCATACTTCTTTC;SOR=1.132;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=177;TCF=110;TCR=67;TR=177;WE=14708926;WS=14708908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr3	14709058	rs2280382	G	C	3039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.999;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=68;PP=1831;ReadPosRankSum=-0.712;SC=TGTGAGGAAAGATGTGAGCGC;SOR=0.845;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=251;TCF=114;TCR=137;TR=124;WE=14709066;WS=14709048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,141:0.50:282
chr3	14709436	rs11707480	T	G	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=77;ReadPosRankSum=0.664;SC=CAAGGACAGCTTCTTAGAGGT;SOR=0.223;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=7;WE=14709444;WS=14709426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr3	14712473	rs1901	G	A	1989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.505;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.060;NF=48;ReadPosRankSum=-0.501;SC=AGTTTGCCCCGCCGTCAGATT;SOR=0.737;Source=Platypus;TCF=101;WE=14712481;WS=14712463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,97:0.47:208
chr3	14724413	rs9821143	G	A	3097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.846;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=55;PP=1973;ReadPosRankSum=1.673;SC=TACCCCGTCCGACATCTTGGG;SOR=0.913;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=265;TCF=153;TCR=112;TR=134;WE=14724421;WS=14724403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,148:0.51:293
chr3	14725668	rs12488352	G	A	1644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=8;PP=1167;SC=CTTCTTTCCTGGGCCATTTAC;SOR=3.180;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=43;TCR=8;TR=51;WE=14725676;WS=14725658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr3	14745857	rs17040196	G	A	1992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.532;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=36;PP=1228;ReadPosRankSum=-1.003;SC=AGCTGAAAGGGCCACATGGAA;SOR=0.628;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=180;TCF=110;TCR=70;TR=89;WE=14745865;WS=14745847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,96:0.49:196
chr3	14755572	rs6765537	A	G	1371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.941;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=33;PP=886;ReadPosRankSum=-0.097;SC=AGGGAGAACCATCACCTGCCT;SOR=0.486;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=137;TCF=66;TCR=71;TR=67;WE=14755580;WS=14755562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,70:0.48:145
chr3	14755617	rs6790129	C	G	1226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.673;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=32;PP=788;ReadPosRankSum=-0.717;SC=CTTGCTGGCCCTATTCAATAC;SOR=0.624;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=115;TCF=53;TCR=62;TR=59;WE=14755625;WS=14755607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,61:0.51:120
chr3	14756730	rs9869372	A	G	926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=8;PP=538;SC=TCTGCCCATAACCTGCGGTGA;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=27;WE=14756738;WS=14756720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr3	14763381	rs78080902	T	A	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.279;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=116;ReadPosRankSum=0.647;SC=TTGCTCTTACTCCCCACCACC;SOR=0.283;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=8;WE=14763389;WS=14763371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr3	14768534	rs7636830	A	G	1089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.568;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=26;PP=627;ReadPosRankSum=-0.217;SC=GGCCGCAGGTAAGGAGGCTGA;SOR=0.924;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=89;TCF=46;TCR=43;TR=48;WE=14768542;WS=14768524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,55:0.52:106
chr3	14768554	rs17255247	G	A	674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.868;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=13;PP=357;ReadPosRankSum=1.274;SC=AAAGGTGGGCGAAGGCCTATC;SOR=0.567;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=67;TCF=33;TCR=34;TR=28;WE=14768562;WS=14768544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,33:0.42:79
chr3	14798976	rs61736141	G	A	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=328;ReadPosRankSum=0.091;SC=GAAGACACCCGTGCTGGCTGC;SOR=0.641;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=43;TCF=32;TCR=11;TR=22;WE=14798984;WS=14798966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,24:0.49:49
chr3	14801487	rs36096720	G	A	1409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.537;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=33;PP=845;ReadPosRankSum=0.894;SC=AGAACTCTGTGGTGCAGGGGA;SOR=1.024;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=98;TCF=45;TCR=53;TR=58;WE=14801495;WS=14801477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,64:0.58:111
chr3	14813825	rs294624	G	C	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.479;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=64;ReadPosRankSum=0.275;SC=TCCAACCATCGCTGACATCTA;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=5;WE=14813833;WS=14813815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr3	14905513	rs172429	T	G	1943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=9;PP=1288;SC=GAAGTAGGAATTTTGTGCCTG;SOR=2.869;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=54;TCF=45;TCR=9;TR=53;WE=14905521;WS=14905503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr3	14939198	rs2117775	G	A	1624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=24;NR=30;PP=941;SC=CTGGACCCCCGGGTTCCACTT;SOR=1.071;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=24;TCR=30;TR=54;WE=14939206;WS=14939188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr3	14939364	rs2117774	G	A	431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=2;PP=310;SC=ACCCAGGGATGTGACTCCAGG;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=14939372;WS=14939354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	14939479	rs2164356	G	T	5623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=114;NR=66;PP=2965;SC=ACGTCTTCCTGGCCCGGGAGC;SOR=1.223;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=180;TCF=114;TCR=66;TR=180;WE=14939487;WS=14939469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr3	14939679	rs2307090	G	A	1475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=38;PP=1035;SC=ATGCAAATCAGTGGGACATCT;SOR=3.171;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=8;TCR=38;TR=46;WE=14939687;WS=14939669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr3	14942675	rs293906	G	A	878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=26;PP=668;SC=GCAGGCAACCGTCTCTCTTGT;SOR=4.479;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=28;WE=14942683;WS=14942665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	14949268	rs9818644	C	T	1047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=28;PP=760;SC=GGCGAGGCTCCGATAAGCCCC;SOR=2.242;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=35;WE=14949276;WS=14949258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr3	14960170	rs293916	T	C	674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=4;PP=556;SC=TAGGTGGACATGGTCCCTCTG;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=26;WE=14960178;WS=14960160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	14964043	rs149798859	C	T	1349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.672;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=36;PP=829;ReadPosRankSum=1.261;SC=ATCACTGTCACGCCTGTGGCA;SOR=0.776;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=119;TCF=49;TCR=70;TR=60;WE=14964051;WS=14964033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,63:0.49:128
chr3	14965466	rs4685234	C	T	1874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=10;PP=1253;SC=AAAGACAAGCCGCAGGCACGC;SOR=2.985;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=45;TCR=10;TR=55;WE=14965474;WS=14965456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr3	14965507	rs4685235	A	G	3735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=38;PP=2303;SC=GGCTTCTTTCAGTTACAGAGC;SOR=1.819;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=91;TCR=38;TR=129;WE=14965515;WS=14965497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr3	15065785	rs41284019	G	A	2192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=52;PP=1171;ReadPosRankSum=-1.308;SC=CTAACTGTGTGCACCACTTTC;SOR=0.692;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=212;TCF=106;TCR=106;TR=103;WE=15065793;WS=15065775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,110:0.47:233
chr3	15100801	rs13068576	G	A	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=177;ReadPosRankSum=1.615;SC=TCATCCTGACGCTCCCATAGG;SOR=1.112;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=10;WE=15100809;WS=15100791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr3	15115270	rs3831	G	T	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.657;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=131;ReadPosRankSum=1.749;SC=GGGCCCAAAGGTGCCCTCTCC;SOR=0.368;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=11;WE=15115278;WS=15115260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr3	15127522	rs72400013	CTAG	C	1530.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.908;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=833;ReadPosRankSum=-0.842;SC=CTGAGGGAGCCTAGTCTCTAC;SOR=0.507;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=43;TCF=1;TCR=42;TR=19;WE=15127532;WS=15127512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,40:0.52:77
chr3	15133088	rs9869512	C	T	1331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=35;PP=797;ReadPosRankSum=-2.119;SC=CCAGGTACAACGCAAAGTGCT;SOR=0.752;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=131;TCF=46;TCR=85;TR=54;WE=15133096;WS=15133078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,62:0.42:148
chr3	15216429	rs7639618	C	T	2664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=353;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.274;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=65;PP=1606;ReadPosRankSum=-2.295;SC=ACCCCTACCACATAACACAAC;SOR=0.620;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=327;TCF=180;TCR=147;TR=138;WE=15216437;WS=15216419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:208,145:0.41:353
chr3	15216703	rs11718863	A	T	1699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.179;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=32;PP=1015;ReadPosRankSum=-0.270;SC=TTGTCATTATACTGGGCAAGT;SOR=0.569;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=160;TCF=95;TCR=65;TR=77;WE=15216711;WS=15216693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,83:0.47:177
chr3	15222262	rs2129947	G	A	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=239;ReadPosRankSum=0.845;SC=TTCACTATAAGCTTCCAGATT;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=10;WE=15222270;WS=15222252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr3	15259992	rs35247476	G	A	1934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.447;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=37;PP=1126;ReadPosRankSum=-1.869;SC=TTATGAAACTGCTGATAAAGT;SOR=0.521;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=190;TCF=112;TCR=78;TR=89;WE=15260014;WS=15259982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,97:0.48:203
chr3	15301363	rs2291853	G	A	6739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=124;NR=116;PP=2965;SC=AGTGACCACAGTCAACTCCAC;SOR=0.709;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=240;TCF=124;TCR=116;TR=240;WE=15301371;WS=15301353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
chr3	15311325	rs1287467	A	G	2699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=42;NR=51;PP=1593;SC=CCTTGGCGGCACGGAGCACCT;SOR=1.051;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=42;TCR=51;TR=93;WE=15311333;WS=15311315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr3	15311464	rs1287468	G	T	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.922;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=7;PP=130;ReadPosRankSum=0.668;SC=CAAAAAATAAGCATCCCAAGG;SOR=0.223;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=21;TCF=7;TCR=14;TR=12;WE=15311472;WS=15311454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr3	15455717	rs2290537	A	G	810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.898;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=24;PP=503;ReadPosRankSum=-1.477;SC=ACCCTGTCAAAATAAAACCTG;SOR=1.062;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=86;TCF=32;TCR=54;TR=35;WE=15455725;WS=15455707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,38:0.39:98
chr3	15456550	rs148072600	A	AAAAC	657.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.108;NF=0;NR=11;PP=403;ReadPosRankSum=-0.813;SC=GTCTCTTAAAAAAACAAACAA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=11;WE=15456558;WS=15456540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr3	15471528	rs11322247	AT	A	612.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.32;MQRankSum=1.801;QD=8.17;ReadPosRankSum=1.964;SOR=0.922;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,34:0.45:75
chr3	15473515	rs2290535	G	A	851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.371;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=6;PP=576;ReadPosRankSum=-0.366;SC=ATTTCATCAGGTGGAGTCATC;SOR=0.435;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=70;TCF=60;TCR=10;TR=33;WE=15473523;WS=15473505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,35:0.48:73
chr3	15476011	rs1563415	C	G	3319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=390;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.766;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=79;PP=1916;ReadPosRankSum=-0.594;SC=AAGATAACCCCTCACCTGAAC;SOR=0.638;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=361;TCF=177;TCR=184;TR=161;WE=15476019;WS=15476001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:217,173:0.44:390
chr3	15480598	rs199579790	AT	A	50.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.20;MQRankSum=2.074;QD=0.99;ReadPosRankSum=-1.840;SOR=0.470;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,10:0.20:51
chr3	15498261	rs11128745	T	C	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=202;ReadPosRankSum=0.616;SC=GATTCCCTCATCTTCTCAATC;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=6;WE=15498280;WS=15498251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr3	15498272	rs12494919	G	A	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=202;ReadPosRankSum=1.960;SC=CTTCTCAATCGAGTTCCTAAT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=15498280;WS=15498251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr3	15507761	rs3732722	G	A	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.814;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=230;ReadPosRankSum=0.506;SC=GAAACACAAGGCATCTCTGCT;SOR=1.329;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=14;WE=15507769;WS=15507751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr3	15509212	rs878946	T	C	626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.338;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=394;ReadPosRankSum=0.894;SC=GAGCAGTGATTGACACTTGCC;SOR=0.148;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=25;WE=15509220;WS=15509202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,26:0.63:41
chr3	15509327	rs878945	C	G	1939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.448;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=42;PP=1152;ReadPosRankSum=0.367;SC=CTTGGGACTCCTTTCCAGCCA;SOR=0.518;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=184;TCF=107;TCR=77;TR=89;WE=15509335;WS=15509317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,97:0.49:198
chr3	15515695	rs2305616	C	T	965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.654;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=25;PP=754;ReadPosRankSum=-0.844;SC=GCTACTTGCACTGACATTTAT;SOR=0.673;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=97;TCF=51;TCR=46;TR=45;WE=15515703;WS=15515685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,45:0.44:103
chr3	15515918	rs28632773	C	G	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.447;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=104;ReadPosRankSum=0.623;SC=CAGGTGACTTCTCCAGGGAAG;SOR=1.609;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=7;WE=15515926;WS=15515908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr3	15516481	rs924812	T	C	2846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.870;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=61;PP=1772;ReadPosRankSum=-0.020;SC=AGAAGGTACATTTACAATCAG;SOR=0.799;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=288;TCF=147;TCR=141;TR=132;WE=15516489;WS=15516471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,144:0.46:313
chr3	15516910	rs3816526	T	C	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.271;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=286;ReadPosRankSum=-0.754;SC=TCTGGGAACGTCCATTTGGAC;SOR=0.495;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=25;TCR=12;TR=21;WE=15516918;WS=15516900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,24:0.60:40
chr3	15517025	rs2305615	G	A	1189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=27;PP=790;ReadPosRankSum=1.124;SC=AAAGACCCACGGTGATATTTT;SOR=0.669;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=115;TCF=64;TCR=51;TR=57;WE=15517033;WS=15517015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,60:0.49:123
chr3	15518731	rs2305612	G	C	2293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.531;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=57;PP=1271;ReadPosRankSum=-0.265;SC=CAAAAGTCAGGGCAACTGGGT;SOR=0.809;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=227;TCF=112;TCR=115;TR=109;WE=15518739;WS=15518721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,117:0.47:248
chr3	15518841	rs13095087	G	A	750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=21;PP=478;ReadPosRankSum=-1.682;SC=CCCACTCTCCGAAGACTGATG;SOR=0.715;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=59;TCF=17;TCR=42;TR=30;WE=15518849;WS=15518831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,34:0.48:71
chr3	15518889	rs13074638	T	C	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=186;ReadPosRankSum=0.497;SC=TATCATCAAATAAGACCTTAT;SOR=1.329;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=10;WE=15518897;WS=15518879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr3	15520639	rs2290538	T	G	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=737;ReadPosRankSum=0.309;SC=TCACGGCCCCTCTGCCATGTC;SOR=0.749;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=44;TCF=20;TCR=24;TR=20;WE=15520658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,21:0.44:48
chr3	15520650	rs17484530	G	C	567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=1;HapScore=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=11;PP=967;ReadPosRankSum=-1.000;SC=CTGCCATGTCGATAGGCCACG;SOR=0.797;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=36;TCF=18;TCR=18;TR=19;WE=15520658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr3	15520677	rs2255897	G	T	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.342;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=8;PP=386;ReadPosRankSum=-0.193;SC=TACACCAGTGGTATCCCATAT;SOR=0.416;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=38;TCF=25;TCR=13;TR=21;WE=15520685;WS=15520667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr3	15529543	rs1983085	T	C	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=254;ReadPosRankSum=-0.333;SC=AGAATTTACCTAGCAAAGAGT;SOR=0.507;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=15;WE=15529551;WS=15529533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr3	15537992	.	A	G	47	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=47;QD=20.4428031368;SC=GACTGTCTCTATAGAATTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=4;WE=15538000;WS=15537982;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr3	15539976	rs141810796	C	CCACACA	2873.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.634;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.130;NF=19;NR=28;PP=1536;ReadPosRankSum=-0.380;SC=GCATGTGCATCCACACACACA;SOR=0.802;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=109;TCF=38;TCR=71;TR=47;WE=15539987;WS=15539966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,98:0.52:190
chr3	15613313	.	A	C	68	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=39;MMLQ=27;MQ=57.78;NF=1;NR=6;PP=68;QD=14.6816017925;SC=CAAACACATAAACTTTTTCTT;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=7;WE=15613321;WS=15613303;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:21,7:0.25:28
chr3	15642844	rs41284037	C	T	2670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.598;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=42;PP=1531;ReadPosRankSum=0.251;SC=TCGCGGTCCCCGCCAGCTTCC;SOR=0.592;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=212;TCF=129;TCR=83;TR=107;WE=15642852;WS=15642834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,123:0.53:234
chr3	15643043	rs2019160	A	G	10882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=398;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=172;NR=181;PP=2965;SC=CAAACGCGAAATCGGCAGCAC;SOR=0.809;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=353;TCF=172;TCR=181;TR=353;WE=15643051;WS=15643033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,398:1.00:398
chr3	15717641	rs78957730	G	A	719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=22;PP=457;ReadPosRankSum=-0.447;SC=TAACAAAGATGGGGGCAGGGA;SOR=0.573;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=71;TCF=20;TCR=51;TR=31;WE=15717649;WS=15717631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,34:0.45:75
chr3	15717693	rs2246960	G	A	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=235;ReadPosRankSum=-0.607;SC=CCTTGTCAACGTGTAGCTCGG;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=12;WE=15717701;WS=15717683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr3	15718652	rs2470540	T	A	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=199;ReadPosRankSum=0.862;SC=AGTCCATATATTATGTACAAC;SOR=0.976;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=14;WE=15718660;WS=15718642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr3	15736385	rs2455814	A	T	7394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=113;NR=136;PP=2965;SC=TCTCCCACCCACCCAGTTCAA;SOR=0.965;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=249;TCF=113;TCR=136;TR=249;WE=15736393;WS=15736375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,271:1.00:271
chr3	15737610	rs2470547	T	C	1592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.310;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=22;PP=1103;ReadPosRankSum=0.546;SC=AAACTCCCATTAGGTCTTTCA;SOR=0.818;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=140;TCF=94;TCR=46;TR=70;WE=15737618;WS=15737600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,74:0.48:153
chr3	15737689	rs2470548	G	A	4987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FS=4.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.78;ReadPosRankSum=1.831;SOR=0.538;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,130:0.54:240
chr3	15737698	rs2470549	T	C	4974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FS=5.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.90;ReadPosRankSum=1.436;SOR=0.543;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:109,129:0.54:238
chr3	15752605	rs183897945	T	C	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.518;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=68;ReadPosRankSum=0.854;SC=ACAACTCCTGTTTTGTTTTCT;SOR=2.252;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=6;WE=15752613;WS=15752595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,4:0.19:21
chr3	15752830	rs2455833	T	C	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.409;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=303;ReadPosRankSum=1.251;SC=TATTTTACACTAAAGAATTGT;SOR=1.230;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=34;TCF=14;TCR=20;TR=20;WE=15752838;WS=15752820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,22:0.61:36
chr3	15753641	rs2455834	A	G	2613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=47;PP=1478;ReadPosRankSum=0.238;SC=CAAAGGTTACACTTACCTGAA;SOR=0.682;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=217;TCF=122;TCR=95;TR=110;WE=15753649;WS=15753631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,124:0.52:240
chr3	15756215	rs924754	A	T	601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.435;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=16;PP=347;ReadPosRankSum=-0.152;SC=TAATGTGTAAACCTTAGTTTT;SOR=0.377;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=65;TCF=23;TCR=42;TR=27;WE=15756223;WS=15756205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,30:0.41:73
chr3	15807725	rs6789076	T	A	1320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=21;PP=822;ReadPosRankSum=1.979;SC=TTCTTATTACTCAGAGGTTAC;SOR=0.696;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=96;TCF=62;TCR=34;TR=58;WE=15807733;WS=15807715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,62:0.58:106
chr3	15836723	rs149384714	G	GT	769.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.949;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=555;ReadPosRankSum=-0.440;SC=TGAATTAACTGTTTTACCTGA;SOR=0.906;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=40;TCF=13;TCR=27;TR=18;WE=15836731;WS=15836713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,31:0.48:65
chr3	15900973	rs62243667	A	C	1610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.435;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=32;PP=873;ReadPosRankSum=0.905;SC=GCCGCCGCCGACCGGCCCACT;SOR=0.389;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=112;TCF=51;TCR=61;TR=64;WE=15900981;WS=15900963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,74:0.59:126
chr3	15901053	rs71064238	CT	C	1134.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=16;PP=806;SC=CTGAGAAGACCTGCGGGCAGG;SOR=2.226;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=19;WE=15901061;WS=15901043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	15901087	.	C	CCCG	95.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.207;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.84;ReadPosRankSum=-0.503;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr3	16268769	rs1394908	C	G	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.108;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.40;ReadPosRankSum=0.328;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr3	16268974	rs15767	T	A	1572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=28;PP=2180;ReadPosRankSum=1.436;SC=AGCAGTGGCGTTTTGACCAGA;SOR=0.705;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=155;TCF=93;TCR=62;TR=71;WE=16268994;WS=16268964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,76:0.44:172
chr3	16268986	rs14576	C	A	1659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.811;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=31;PP=2180;ReadPosRankSum=-0.339;SC=TTGACCAGATCAATGCTGTGG;SOR=0.852;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=167;TCF=95;TCR=72;TR=77;WE=16268994;WS=16268964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,84:0.45:186
chr3	16305674	rs14080	C	G	3008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.072;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=66;PP=1838;ReadPosRankSum=0.256;SC=TGTCATAAATCACTTTTATAA;SOR=0.950;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=279;TCF=131;TCR=148;TR=121;WE=16305682;WS=16305664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:184,138:0.43:322
chr3	16310857	rs842258	G	A	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.914;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=335;ReadPosRankSum=0.912;SC=GAAAAACTACGTTTAGTGGTC;SOR=2.030;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=35;TCF=4;TCR=31;TR=18;WE=16310865;WS=16310847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr3	16312564	rs842259	C	T	1223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=30;PP=819;ReadPosRankSum=2.256;SC=CTTTGCGCCACCTTACTCTAA;SOR=0.720;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=103;TCF=49;TCR=54;TR=55;WE=16312572;WS=16312554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,57:0.51:111
chr3	16312716	rs11284055	GT	G	74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=0;NR=5;PP=98;SC=GTTGTTAACCGTTTTTTTTGT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=5;WE=16312724;WS=16312706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	16313320	rs6796483	G	A	1910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.290;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=52;PP=1197;ReadPosRankSum=-0.172;SC=AGATGAGTCTGGTCCTTTTGA;SOR=0.932;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=184;TCF=75;TCR=109;TR=84;WE=16313328;WS=16313310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,92:0.46:199
chr3	16313872	rs6797005	G	C	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=627;ReadPosRankSum=-1.025;SC=TCGGATATTTGATTTTGCTTT;SOR=0.941;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=17;WE=16313886;WS=16313862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr3	16313878	rs842260	G	T	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.251;HP=4;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=435;ReadPosRankSum=-0.628;SC=ATTTGATTTTGCTTTTTTGAA;SOR=0.193;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=12;WE=16313886;WS=16313862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr3	16327855	rs842274	T	G	2221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.387;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=54;PP=1419;ReadPosRankSum=-0.069;SC=TTAGATTGTGTCAGCAGCTAA;SOR=0.893;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=184;TCF=87;TCR=97;TR=96;WE=16327863;WS=16327845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,106:0.51:208
chr3	16327909	rs6777976	C	T	856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.189;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=23;PP=494;ReadPosRankSum=1.440;SC=GAAGAGCCTCCGCTTGCTTGT;SOR=0.368;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=86;TCF=29;TCR=57;TR=38;WE=16327917;WS=16327899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,42:0.43:98
chr3	16343092	rs842283	T	G	982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=9;PP=589;SC=TTTAAGACCTTTGCTACAAAA;SOR=1.483;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=31;WE=16343100;WS=16343082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	16358584	rs690241	T	C	2075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.513;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=44;PP=1028;ReadPosRankSum=0.298;SC=GCTGCTGTCCTGAAACACAGT;SOR=0.438;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=205;TCF=116;TCR=89;TR=93;WE=16358592;WS=16358560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,103:0.47:221
chr3	16364846	rs59223456	C	T	1098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.642;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=20;PP=643;ReadPosRankSum=0.135;SC=TGAAGCCCTGCTGAGGAAAAC;SOR=0.756;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=115;TCF=71;TCR=44;TR=51;WE=16364854;WS=16364836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,57:0.43:134
chr3	16364919	rs690216	A	C	1636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.561;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=35;PP=769;ReadPosRankSum=-1.683;SC=GAGGTAGACAAGGTCTCTGAA;SOR=0.629;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=149;TCF=77;TCR=72;TR=73;WE=16364927;WS=16364909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,84:0.49:171
chr3	16364954	rs11554130	C	T	1215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=30;PP=663;ReadPosRankSum=2.600;SC=TTGGTGGATACACTCCCCTCG;SOR=0.713;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=120;TCF=58;TCR=62;TR=57;WE=16364962;WS=16364944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,64:0.47:136
chr3	16368121	rs690145	T	C	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.412;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=73;ReadPosRankSum=-0.084;SC=GTTAAGAATGTGAAATTCTGG;SOR=0.141;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=6;WE=16368129;WS=16368111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr3	16368436	rs62233922	G	A	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=124;ReadPosRankSum=-2.477;SC=CCAACTCCCAGGCAATGAGAG;SOR=1.162;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=8;WE=16368444;WS=16368426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr3	16399580	rs113108751	TG	T	3374.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=13;HapScore=4;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=48;PP=2330;ReadPosRankSum=1.163;SC=AAGGCGGGGGTGGGGGGGGTC;SOR=0.721;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=100;TCF=4;TCR=96;TR=50;WE=16399598;WS=16399569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,86:0.61:141
chr3	16399590	rs35271329	C	T	3414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=50;PP=2312;ReadPosRankSum=-0.038;SC=TGGGGGGGGTCTGTAAACCGT;SOR=0.719;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=145;TCF=56;TCR=89;TR=83;WE=16399598;WS=16399569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,88:0.62:142
chr3	16450872	rs1546650	T	C	1455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.188;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=28;PP=964;ReadPosRankSum=0.201;SC=ACCCTGACTGTAGCGCTCACC;SOR=0.809;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=160;TCF=90;TCR=70;TR=67;WE=16450880;WS=16450862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,73:0.41:178
chr3	16457509	rs187252228	A	G	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=2.963;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=221;ReadPosRankSum=-0.314;SC=TGGCTCCTTGAAAAAAAAAAA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=10;WE=16457517;WS=16457499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr3	16457917	rs150655938	C	T	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.777;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=95;ReadPosRankSum=0.584;SC=TGGATTGGATCCTGGAACTGA;SOR=1.230;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=6;WE=16457925;WS=16457907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr3	16635866	rs13067997	C	G	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=65;ReadPosRankSum=-0.431;SC=ACTGTTGCTCCCATGGGAGTT;SOR=0.693;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=6;WE=16635874;WS=16635856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr3	16639754	rs3773827	G	T	3352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=55;NR=55;PP=1941;SC=ACTAAAAGAAGGTTCGATGAT;SOR=0.882;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=55;TCR=55;TR=110;WE=16639762;WS=16639744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr3	16646745	rs9847342	C	G	3232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=52;PP=1924;SC=CGACCGGCTCCAGGAGGAGCA;SOR=0.726;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=114;TCF=62;TCR=52;TR=114;WE=16646753;WS=16646735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr3	16646800	rs116172431	G	A	877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.961;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=21;PP=449;ReadPosRankSum=0.938;SC=TGTGAGGTCCGCTGGAACCCG;SOR=1.079;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=85;TCF=42;TCR=43;TR=39;WE=16646808;WS=16646790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,44:0.48:91
chr3	16926491	rs6442654	G	A	46.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=15.43;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
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chr3	16926524	.	CT	C	143	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.67;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr3	16926539	.	CT	C	232.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.80;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	16926544	rs368284573	T	G	241.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.31;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	16926548	.	GT	G	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=52.53;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	16926551	.	CG	C	367.74	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.86;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	16926553	.	T	C	376.78	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.86;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	16926557	rs372006934	T	G	376.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.86;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	16926561	.	CT	C	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.86;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	16926567	rs373958057	T	C	376.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.86;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	16926599	rs7626446	T	G	1130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.23;SOR=2.215;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	16926607	rs7626448	T	C	1255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.86;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr3	16926642	rs6442655	A	G	2516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.76;SOR=1.159;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr3	16926648	rs6442656	T	G	2804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.54;SOR=1.217;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr3	16926666	rs7626542	T	G	3106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=43;NR=23;PP=1149;SC=GGTCGCCTCGTCCACGGGCGG;SOR=1.121;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=67;TCF=44;TCR=23;TR=66;WE=16926674;WS=16926656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr3	16926766	rs148153072	C	T	1506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.185;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-1.103;NF=35;NR=32;PP=843;ReadPosRankSum=-0.286;SC=CCAGGGGACCCCGCGGCGTTG;SOR=0.663;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=120;TCF=62;TCR=58;TR=67;WE=16926774;WS=16926756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,75:0.56:135
chr3	16974610	rs9880307	C	A	3472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=46;PP=1978;SC=ATTGGACAGCCGGAGTATTTT;SOR=1.095;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=73;TCR=46;TR=119;WE=16974618;WS=16974600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr3	17051081	rs28498854	T	A	837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=0;PP=651;SC=GATTTTTTTCTAGGAAATTAA;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=17051089;WS=17051078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	17051450	rs28932173	C	A	4196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=377;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.774;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=78;PP=2477;ReadPosRankSum=1.699;SC=ACATATTCCGCAGCAATGGCA;SOR=0.638;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=333;TCF=174;TCR=159;TR=164;WE=17051458;WS=17051440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:184,193:0.51:377
chr3	17053499	rs4602367	A	G	6964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=126;NR=113;PP=2965;SC=GAGGAGGAGGAAAGCCTCATA;SOR=0.717;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=239;TCF=126;TCR=113;TR=239;WE=17053507;WS=17053489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr3	17077268	rs17272796	C	T	4191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=54;PP=2363;SC=TTCTCTAATACGAGTTGAGGT;SOR=1.074;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=87;TCR=54;TR=141;WE=17077276;WS=17077258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr3	17131421	rs35185988	C	T	1455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.353;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=38;PP=936;ReadPosRankSum=1.130;SC=TTACAATAAACCATTATGGAG;SOR=0.832;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=134;TCF=49;TCR=85;TR=59;WE=17131429;WS=17131411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,67:0.46:147
chr3	17131501	rs11549706	C	T	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=163;ReadPosRankSum=0.930;SC=GAATAATATTCGGGATTTTAA;SOR=0.512;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=11;WE=17131509;WS=17131491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,12:0.34:35
chr3	17208267	rs1138454	T	C	2402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.824;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=48;PP=1166;ReadPosRankSum=0.370;SC=ACCTGTTTAATGGCCCCTGAC;SOR=0.537;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=209;TCF=119;TCR=90;TR=102;WE=17208275;WS=17208257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,118:0.49:243
chr3	17209195	rs2305291	G	A	1117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.459;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=21;PP=643;ReadPosRankSum=0.210;SC=GGCCCTCCCCGCGGCAGGCGG;SOR=0.547;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=105;TCF=64;TCR=41;TR=49;WE=17209203;WS=17209185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,55:0.45:123
chr3	18055231	rs61978649	A	C	1393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.654;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=42;PP=809;ReadPosRankSum=0.290;SC=AGACAGTCACAGTAGTCCAGA;SOR=0.614;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=127;TCF=47;TCR=80;TR=67;WE=18055239;WS=18055221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,69:0.50:139
chr3	18057982	rs9310538	A	G	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.86;ReadPosRankSum=-0.180;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr3	18058059	rs9310539	A	G	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=33;ReadPosRankSum=0.676;SC=CTGAGATCTGATTGTTTAAAC;SOR=0.892;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=6;WE=18058067;WS=18058049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr3	18058093	rs62240226	C	G	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.52;ReadPosRankSum=1.683;SOR=1.075;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr3	18308436	rs7432753	A	G	1058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=12;PP=599;ReadPosRankSum=-0.117;SC=TTGACCAACAAAGGTCTAAAT;SOR=0.625;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=94;TCF=65;TCR=29;TR=40;WE=18308444;WS=18308426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,50:0.45:111
chr3	18419553	rs9310557	C	T	1906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=14;PP=1347;SC=ATCCTAGACACAGAGGCCTCT;SOR=2.448;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=49;TCR=14;TR=63;WE=18419561;WS=18419543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr3	18419859	rs10460976	G	A	1209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=32;PP=909;SC=TTCATTGGCTGAATTGTTTTG;SOR=3.556;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=5;TCR=32;TR=37;WE=18419867;WS=18419849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr3	18427924	rs2229261	G	T	1467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=37;NR=12;PP=984;SC=TGCTGATGAGGGGGGCAGGAC;SOR=2.004;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=37;TCR=12;TR=49;WE=18427932;WS=18427914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr3	19436587	rs10470642	T	C	225.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=1;PP=141;SC=GCTCTGTCTCTTACCACAGGT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=19436595;WS=19436577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	19556990	rs56353870	AT	A	105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.6923;FS=0.000;HP=13;HapScore=3;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=0;NR=9;PP=107;SC=TGTTATGGGCATTTTTTTTTT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=9;WE=19556999;WS=19556980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	19946992	rs2931394	G	A	132.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=0;PP=70;SC=TTTTTTTCTAGTCATCTTGTT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=19947000;WS=19946982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
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chr3	19959756	rs2929366	G	A	4709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.03;SOR=0.868;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr3	19961330	rs2931403	C	T	2572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=34;PP=1675;SC=CTTACCAGTACTGAAATTTTA;SOR=1.313;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=60;TCR=34;TR=94;WE=19961338;WS=19961320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr3	19962044	rs13078867	G	A	6325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=118;NR=98;PP=2965;SC=TAACCAACTGGAATAACTTTT;SOR=0.744;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=216;TCF=118;TCR=98;TR=216;WE=19962052;WS=19962034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr3	19962223	rs13079262	G	A	664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=21;PP=541;SC=ATCTTCATACGTAACAAACAT;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=19962231;WS=19962213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	19974700	rs2929350	T	C	1893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=42;NR=21;PP=868;SC=TTAGTTCCTATGGAAAGTGGA;SOR=1.103;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=42;TCR=21;TR=63;WE=19974708;WS=19974690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr3	19975215	rs17795400	C	A	11151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=414;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=195;NR=181;PP=2965;SC=AGGTTTTGTTCCCTGTGAAGC;SOR=0.758;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=376;TCF=195;TCR=181;TR=376;WE=19975223;WS=19975205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,413:1.00:413
chr3	19975582	rs2929349	A	G	793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=20;PP=532;SC=CTGGCTACAAAGACGCCTCCA;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=19975590;WS=19975572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	19992432	rs6773437	G	T	2041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=10;PP=1325;SC=GGCCAAATACGGGAAATAAAA;SOR=2.973;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=51;TCR=10;TR=61;WE=19992440;WS=19992422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr3	19992588	rs10510496	G	A	2037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.590;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=48;PP=1140;ReadPosRankSum=0.475;SC=TCATTTAATCGAATCATACAT;SOR=1.015;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=151;TCF=65;TCR=86;TR=79;WE=19992596;WS=19992578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,95:0.55:173
chr3	20017388	rs140496148	T	TA	49.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=47;ReadPosRankSum=1.710;SC=AATCTGGTTTTAAAAAAAAAC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=4;WE=20017396;WS=20017378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr3	20017489	rs4858122	GG	CC	409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=398;SC=AAAGATGCTTGGTAACCATTT;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=7;WE=20017498;WS=20017479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	20025665	rs34961993	G	GA	389.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=4;PP=206;SC=AGTCACCTGTGAAAAAAAAAT;SOR=1.911;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=10;WE=20025673;WS=20025655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	20027708	rs11128931	A	G	730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=26;PP=588;ReadPosRankSum=1.516;SC=AGAAATTTTTATCCTAGAGAT;SOR=0.560;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=42;TCF=7;TCR=35;TR=31;WE=20027716;WS=20027698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,30:0.65:46
chr3	20042462	rs13093485	G	A	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.022;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=7;PP=417;ReadPosRankSum=1.473;SC=AGCATGAGGGGTTTTGCTGCA;SOR=1.038;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=79;TCF=57;TCR=22;TR=31;WE=20042470;WS=20042452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,35:0.40:88
chr3	20042834	rs4103004	C	T	5739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=86;PP=2965;SC=TCTATTGCTGCGTATTCTTCT;SOR=0.834;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=188;TCF=102;TCR=86;TR=188;WE=20042842;WS=20042824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr3	20043502	rs9882323	C	T	1930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.233;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=40;PP=1166;ReadPosRankSum=-2.506;SC=CTTTCTAAAACGTTTTCTTTT;SOR=0.458;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=167;TCF=79;TCR=88;TR=82;WE=20043510;WS=20043492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,91:0.49:185
chr3	20043531	rs9882344	C	T	1351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.868;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=27;PP=815;ReadPosRankSum=-1.752;SC=GTAGAATATCCTCATCTGAAT;SOR=0.546;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=135;TCF=69;TCR=66;TR=60;WE=20043539;WS=20043521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,67:0.44:154
chr3	20053581	rs2686326	C	T	1688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.875;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=31;PP=1079;ReadPosRankSum=0.271;SC=TTGGAATTACCTTTCTTTGCC;SOR=0.870;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=162;TCF=94;TCR=68;TR=75;WE=20053589;WS=20053571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,80:0.45:176
chr3	20053676	rs6802632	T	C	645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.073;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=24;PP=417;ReadPosRankSum=0.126;SC=ATGTGATGGCTGTGGCAGAAG;SOR=1.347;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=69;TCF=19;TCR=50;TR=30;WE=20053684;WS=20053666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,33:0.43:76
chr3	20082169	.	C	T	1657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=0.000;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.221;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=20;PP=894;ReadPosRankSum=0.194;SC=GCCGAAGGACCGGGAGGCGGT;SOR=1.003;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=117;TCF=76;TCR=41;TR=65;WE=20082177;WS=20082159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,71:0.54:131
chr3	20141265	rs41285057	G	C	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.253;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr3	20141301	rs11128939	T	C	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.330;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=10.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.65;ReadPosRankSum=1.004;SOR=0.012;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr3	20141308	rs62243131	A	G	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.017;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=12.601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.34;ReadPosRankSum=-0.777;SOR=0.012;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr3	20142360	rs4858764	T	C	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.332;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=101;ReadPosRankSum=2.232;SC=TGATAGCAGGTTTTTGATTAG;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=6;WE=20142368;WS=20142350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr3	20143020	rs4858155	G	C	1479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=41;PP=1000;ReadPosRankSum=-1.733;SC=ACCTAAAATTGTACTTGACTC;SOR=0.722;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=155;TCF=58;TCR=97;TR=64;WE=20143028;WS=20143010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,71:0.42:171
chr3	20156302	rs2365794	T	C	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.949;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=204;ReadPosRankSum=-2.138;SC=AAGGTGATTGTCACAGATAAT;SOR=0.095;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=16;WE=20156310;WS=20156292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr3	20161043	rs17006623	G	T	1069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.460;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.929;NF=27;NR=14;PP=505;ReadPosRankSum=-0.014;SC=TGTTACCTAAGAAAGGAGTCA;SOR=0.899;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=98;TCF=59;TCR=39;TR=41;WE=20161051;WS=20161033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,55:0.45:121
chr3	20179033	.	CT	C	164.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.387;ClippingRankSum=0.000;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=9.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.17;ReadPosRankSum=-0.465;SOR=0.608;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,14:0.27:52
chr3	20188074	rs2686314	C	T	1033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=28;PP=778;SC=GCAAATGTTACCCTTTTATGT;SOR=5.549;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=29;WE=20188082;WS=20188064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr3	20189528	.	AT	A	191.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.968;ClippingRankSum=0.000;DP=311;ExcessHet=3.0103;FS=7.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQRankSum=3.958;QD=0.68;ReadPosRankSum=1.066;SOR=1.066;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:238,42:0.15:280
chr3	20212189	rs1052930	A	G	941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=7;PP=674;SC=AATATCCAACAAAACCTTCAT;SOR=2.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=34;WE=20212197;WS=20212179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr3	20216062	rs115863450	G	A	1329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=41;PP=817;ReadPosRankSum=-0.533;SC=TTTTTTTGGGGAACAGTTTTT;SOR=0.743;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=143;TCF=56;TCR=87;TR=65;WE=20216070;WS=20216039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,70:0.43:162
chr3	20216519	rs61729306	T	A	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.390;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=264;ReadPosRankSum=-0.340;SC=CAACTCCCAGTGTGTCTTGAG;SOR=1.210;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=59;TCF=26;TCR=33;TR=22;WE=20216527;WS=20216509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,27:0.38:72
chr3	20219694	rs6550401	T	G	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.082;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=191;ReadPosRankSum=-0.950;SC=CACATTTCCTTTCATAAATGA;SOR=0.818;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=9;WE=20219702;WS=20219684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr3	20219885	rs6550402	C	T	1073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.977;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=26;PP=553;ReadPosRankSum=0.207;SC=GAAGTATTCACAAGAAAGCAT;SOR=1.023;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=90;TCF=44;TCR=46;TR=47;WE=20219893;WS=20219875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,53:0.54:99
chr3	21462754	rs451242	A	G	1099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.510;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=15;PP=596;ReadPosRankSum=1.420;SC=GAATGGGTCCAGGAGCTGGCC;SOR=0.478;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=105;TCF=75;TCR=30;TR=47;WE=21462762;WS=21462744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,56:0.47:119
chr3	21462787	rs427233	G	A	5250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=108;NR=67;PP=2965;SC=GAGGAAGCGCGGAAGTCTGGA;SOR=1.149;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=176;TCF=109;TCR=67;TR=175;WE=21462795;WS=21462777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr3	21462880	rs4455340	A	G	2195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.050;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=51;PP=1169;ReadPosRankSum=0.103;SC=CTGCTAGAGGATTTGGTAGAA;SOR=0.601;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=196;TCF=84;TCR=112;TR=96;WE=21462888;WS=21462870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,109:0.49:222
chr3	21467245	rs186892	A	C	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.384;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=240;ReadPosRankSum=-0.520;SC=GAGGAAAAAAATCTTAGCTAG;SOR=0.404;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=37;TCF=10;TCR=27;TR=16;WE=21467253;WS=21467235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
chr3	21553315	rs71976575	AT	A	111.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.48;ReadPosRankSum=-0.437;SOR=0.711;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,11:0.24:45
chr3	21606027	rs66546661	AT	A	369.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.55;ReadPosRankSum=1.012;SOR=0.653;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,21:0.66:32
chr3	21706369	rs3821396	G	A	2260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.528;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=50;PP=1423;ReadPosRankSum=0.907;SC=AAATTTGGCAGGTACTTACCG;SOR=0.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=223;TCF=118;TCR=105;TR=106;WE=21706377;WS=21706359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,114:0.46:250
chr3	23364883	rs9844558	G	A	642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=9;PP=503;ReadPosRankSum=-0.073;SC=TATTCTAGACGATTTAAGAAG;SOR=0.636;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=74;TCF=53;TCR=21;TR=30;WE=23364891;WS=23364873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,30:0.38:78
chr3	23364918	rs11921580	C	T	856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.531;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=16;PP=640;ReadPosRankSum=0.635;SC=TTTGGCATGACCCCAGGGCTA;SOR=0.850;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=110;TCF=66;TCR=44;TR=43;WE=23364926;WS=23364908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,44:0.38:117
chr3	23986983	rs7644275	C	G	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=2.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.99;ReadPosRankSum=-1.895;SOR=1.755;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr3	23996371	rs4858095	T	G	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.127;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=312;ReadPosRankSum=0.909;SC=TTCATTTAGGTGGCCATTATG;SOR=1.414;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=16;WE=23996379;WS=23996361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr3	24006477	rs4858097	T	A	2509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=20;PP=1465;SC=GGTTTGTCCATTGAGTAAGTC;SOR=1.802;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=57;TCR=20;TR=77;WE=24006485;WS=24006467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr3	24169361	rs1667765	T	C	458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.641;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=318;ReadPosRankSum=1.273;SC=ACATTTGTCCTGCATTCTTTG;SOR=1.296;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=51;TCF=7;TCR=44;TR=22;WE=24169369;WS=24169351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,23:0.43:54
chr3	25611472	rs67669779	GAC	G	205.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=20.57;ReadPosRankSum=0.674;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,9:0.90:10
chr3	25647632	rs73051956	A	G	614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.732;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=386;ReadPosRankSum=0.136;SC=AAGAAAATAAACACCACAGAG;SOR=1.259;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=46;TCF=13;TCR=33;TR=23;WE=25647640;WS=25647622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,26:0.52:50
chr3	25775253	rs1488992	T	C	958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=0;PP=666;SC=AATATTCTTGTTTATAAAACA;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=24;WE=25775261;WS=25775249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	25775356	rs6550987	A	C	6020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=120;NR=78;PP=2965;SC=AGATAGCCACACCATACCTGC;SOR=1.012;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=198;TCF=120;TCR=78;TR=198;WE=25775364;WS=25775346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr3	25775542	rs144510174	TAGA	T	1221.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.203;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=833;ReadPosRankSum=1.006;SC=ACTAAATACCTAGAATGTATG;SOR=0.938;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=1;TCR=47;TR=20;WE=25775552;WS=25775532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,33:0.47:70
chr3	25805879	rs11129208	T	C	775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=21;PP=485;SC=CACACAGAAATGTATAATGAA;SOR=4.407;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=24;WE=25805887;WS=25805869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	25836023	rs9831075	C	T	955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=26;PP=736;SC=TTTTTAAATGCTATATGTGAA;SOR=2.765;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=32;WE=25836031;WS=25836013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr3	25902401	rs4681082	G	C	106.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=62.65;NF=0;NR=4;PP=80;SC=TGTAGGAATTGAAGATGAGAT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=25902409;WS=25902391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	25904394	rs6550999	T	C	1663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=16;PP=1092;SC=TATAGACTACTCTAGACATTA;SOR=1.850;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=43;TCR=16;TR=59;WE=25904402;WS=25904384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr3	27213416	rs2017568	TA	AG	963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=4.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.433;HP=3;HapScore=2;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=985;ReadPosRankSum=2.173;SC=GCAAATCTTTTATTTTTTATG;SOR=1.061;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=56;TCF=17;TCR=39;TR=23;WE=27213425;WS=27213406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,26:0.44:59
chr3	27242887	rs66472045	G	A	647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=1;PP=472;ReadPosRankSum=1.051;SC=TCTAGATTTGGATTATGTAGG;SOR=1.096;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=38;TCF=36;TCR=2;TR=22;WE=27242895;WS=27242877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,24:0.59:41
chr3	27387462	rs56104872	G	GGTAA	1897.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=22;NR=1;PP=1389;SC=ATTAAGAATCGCTATGGTAAA;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=27387471;WS=27387452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr3	27387463	rs2370957	C	A	1906.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=1;PP=649;SC=TTAAGAATCGCTATGGTAAAT;SOR=4.664;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=41;TCR=10;TR=30;WE=27387471;WS=27387452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr3	27424718	rs1472256	A	G	9094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=350;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=165;NR=147;PP=2965;SC=TATCATCATCATCTTGAAGCA;SOR=0.722;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=312;TCF=165;TCR=147;TR=312;WE=27424726;WS=27424708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,349:1.00:349
chr3	27433397	rs2307035	A	T	429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=13;PP=345;SC=AGATTTTTCAATCATGAGGAT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=27433405;WS=27433387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	27463229	rs79251239	C	T	2493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=56;PP=1569;ReadPosRankSum=-0.134;SC=CGTTGGATGCCTCAGCACCCG;SOR=0.666;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=197;TCF=92;TCR=105;TR=105;WE=27463237;WS=27463219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,116:0.51:227
chr3	27494620	rs12639265	A	T	969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=9;PP=597;SC=TTCAACAAAAAGACTAAACAT;SOR=1.371;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=23;TCR=9;TR=32;WE=27494628;WS=27494610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr3	27759404	rs2581183	C	T	484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=17;PP=508;SC=TTATCTACACCGAAAGTGCTG;SOR=4.407;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=27759412;WS=27759394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	28520417	rs1563656	T	A	3136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=58;PP=1948;SC=CTATCAAAACTACAAGGTGTA;SOR=0.816;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=55;TCR=58;TR=113;WE=28520425;WS=28520407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr3	28520576	rs60690028	T	C	207.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=163;SC=TTTATATCAATGAATAGCATA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=28520584;WS=28520566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	28533458	rs13099814	A	G	854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=8;PP=530;SC=TAAACAATGGACAGCTCAGTT;SOR=1.688;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=27;WE=28533466;WS=28533448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	28533658	rs13100556	G	A	2208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=44;PP=1408;SC=CACTGGTCAAGAAAAGGGTAA;SOR=1.236;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=30;TCR=44;TR=74;WE=28533666;WS=28533648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr3	28552644	rs4680751	G	T	1331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=31;PP=817;SC=TCTGGAAGATGAATTGAATTT;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=14;TCR=31;TR=45;WE=28552652;WS=28552634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr3	28557206	rs139024624	CTGTGTG	CTG,C	278.76	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0,0;NR=8,8;PP=72,83;SC=AAAAGATTTCCTGTGTGTGTG;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=8,8;WE=28557219;WS=28557196;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:7
chr3	28557236	rs7617655	G	A	318.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=48;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=7;PP=186;SC=GTGTGTGTGTGTATACACATA;SOR=1.863;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=28557244;WS=28557226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	29224786	rs11919232	T	C	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.358;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=28;ReadPosRankSum=-0.040;SC=TAAAAAGTCTTTTAAGTGTTT;SOR=0.105;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=3;WE=29224794;WS=29224776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr3	29476428	rs3773018	G	A	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=17;PP=323;ReadPosRankSum=-0.013;SC=TCTGCTGCCCGTGCTGTTTCT;SOR=0.651;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=65;TCF=27;TCR=38;TR=31;WE=29476436;WS=29476418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,35:0.49:71
chr3	29529907	rs2371695	G	A	804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.142;HP=7;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=832;ReadPosRankSum=0.172;SC=AATAACATGGGTTTTTTTCTC;SOR=0.958;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=46;TCF=33;TCR=13;TR=18;WE=29529922;WS=29529897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,22:0.40:55
chr3	29529913	rs5847572	TTC	T	821.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.453;HP=6;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.149;NF=7;NR=6;PP=854;ReadPosRankSum=0.486;SC=ATGGGTTTTTTTCTCTCTCTC;SOR=1.151;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=20;TCR=16;TR=13;WE=29529922;WS=29529897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,24:0.41:59
chr3	29804509	rs1371840	T	C	1828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.139;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=43;PP=975;ReadPosRankSum=-1.784;SC=AGTGACTGAATGATGCCGAGG;SOR=0.704;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=171;TCF=86;TCR=85;TR=83;WE=29804517;WS=29804499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,91:0.49:186
chr3	29922333	rs13324314	C	T	2309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.723;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=56;PP=1457;ReadPosRankSum=0.896;SC=TATTCATTCCCGACCCTTTTG;SOR=0.456;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=240;TCF=107;TCR=133;TR=107;WE=29922341;WS=29922323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,116:0.43:272
chr3	29925518	rs2218724	A	G	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.736;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=139;ReadPosRankSum=-1.790;SC=GGCAGTAAGCATAGAGATATA;SOR=0.112;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=11;WE=29925526;WS=29925508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr3	29977739	rs1449287	T	C	3638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=75;PP=2449;SC=TCAGATGTGATATTCTCCATT;SOR=1.501;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=38;TCR=75;TR=113;WE=29977747;WS=29977729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr3	30032755	rs140758514	C	T	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=21;PP=500;ReadPosRankSum=2.373;SC=CTTGACATCACTCTCTCATGT;SOR=0.706;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=67;TCF=26;TCR=41;TR=34;WE=30032763;WS=30032745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,41:0.52:79
chr3	30648248	rs2306856	C	G	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=126;ReadPosRankSum=-1.221;SC=ACATCTGGCCCGCACATCTGC;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=8;WE=30648256;WS=30648245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr3	30686414	rs1155705	A	G	2050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.262;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=49;PP=1269;ReadPosRankSum=-0.949;SC=TATGGTAAGCAAGCCTTTTAA;SOR=0.815;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=143;TCF=55;TCR=88;TR=78;WE=30686422;WS=30686399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,89:0.54:164
chr3	30732821	rs2276767	C	A	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.222;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=157;ReadPosRankSum=0.039;SC=ACCCTGCTTGCACTCACTATA;SOR=0.088;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=11;WE=30732829;WS=30732811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr3	30769948	rs7617829	C	T	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.658;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=62;ReadPosRankSum=0.232;SC=AAGACCAGAACATCAAGGCAT;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=5;WE=30769956;WS=30769938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr3	30842346	rs10553550	AAGAG	A	555.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.402;HP=2;HapScore=3;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.833;NF=3;NR=11;PP=378;ReadPosRankSum=-0.628;SC=CACACACAGAAAGAGAGAGAG;SOR=0.132;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=26;TCF=12;TCR=14;TR=14;WE=30842357;WS=30842336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr3	30842597	rs59931065	A	AT	557.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.678;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.868;NF=1;NR=12;PP=414;ReadPosRankSum=-1.512;SC=AAAAGAAAAGATTACAAGACT;SOR=0.070;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=13;WE=30842605;WS=30842587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr3	30885806	rs1494738	T	C	2834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.053;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=48;PP=1831;ReadPosRankSum=1.018;SC=AATTAACAGATAATGATACTG;SOR=0.836;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=245;TCF=139;TCR=106;TR=120;WE=30885814;WS=30885796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,130:0.49:268
chr3	30903008	rs6774917	T	C	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.34;ReadPosRankSum=-1.887;SOR=0.045;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,5:0.16:32
chr3	30903304	rs1393745	C	T	1766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.490;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=49;PP=1233;ReadPosRankSum=-0.749;SC=TCTAATTACACCACATAACAA;SOR=0.425;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=123;TCF=35;TCR=88;TR=70;WE=30903312;WS=30903294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,76:0.57:134
chr3	31621228	rs58289734	T	TAAA	1336.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=2;PP=1280;SC=AATGTAATGATGAAGAGTACA;SOR=4.407;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=23;WE=31621236;WS=31621218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	31638394	rs9867914	G	C	775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.765;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=21;PP=454;ReadPosRankSum=0.394;SC=AGTCTAGTAGGTCTCTGGAGG;SOR=0.521;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=76;TCF=31;TCR=45;TR=36;WE=31638402;WS=31638384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,40:0.45:88
chr3	31641835	rs11705765	C	A	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.430;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=270;ReadPosRankSum=0.326;SC=TTTAACTTAGCACTTCTTTTC;SOR=1.110;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=41;TCF=26;TCR=15;TR=20;WE=31641843;WS=31641825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,26:0.53:49
chr3	31642037	rs11713598	A	T	468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=12;PP=323;SC=TATTTGGTCAATATTATGCAT;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=31642045;WS=31642027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	31658678	.	C	CT	47	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=22;HapScore=2;MGOF=29;MMLQ=16;MQ=57.57;NF=0;NR=3;PP=47;QD=16.6666666667;SC=TGATTTTTTTCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=3;WE=31658686;WS=31658668;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,3:0.43:7
chr3	31663515	rs10662891	A	AGTGTG	534.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=1;PP=430;SC=TTGGTTTTATAGTTTTAAGTA;SOR=2.494;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=9;WE=31663523;WS=31663505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	31677395	rs11129457	T	G	531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=1;PP=366;SC=TCATCATAGTTCAGTAAACCA;SOR=3.383;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=31677403;WS=31677385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	31710396	rs376063579	AT	A	34.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.94;ReadPosRankSum=1.339;SOR=0.351;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,7:0.19:37
chr3	31712170	rs75528525	T	C	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=1.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.05;ReadPosRankSum=-0.754;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,20:0.53:38
chr3	31712176	rs3749406	G	T	1570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.91;SOR=2.252;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr3	31712393	rs3749405	C	T	8056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=141;NR=143;PP=2965;SC=GCTCCACCCACGGGATGGTGA;SOR=0.831;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=284;TCF=141;TCR=143;TR=284;WE=31712401;WS=31712383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,308:1.00:308
chr3	31725691	rs2278960	T	C	2098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=43;PP=1418;SC=CAACCACTGTTAAGCAAATTC;SOR=1.319;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=71;TCF=28;TCR=43;TR=71;WE=31725699;WS=31725681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr3	31774971	rs3813824	T	C	2251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=49;PP=1255;SC=ATGAAATATTTGTACTCACTG;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=28;TCR=49;TR=77;WE=31774979;WS=31774961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr3	31839135	rs7653447	A	G	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.42;ReadPosRankSum=-0.521;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr3	31839242	rs7643025	T	C	4434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=51;PP=2240;SC=CACAATACAATGTACCAGAAA;SOR=1.186;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=90;TCR=51;TR=141;WE=31839250;WS=31839232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr3	32022333	rs10610936	GCACA	G,GCACACA	617.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.148;NF=3,3;NR=8,8;PP=248,382;ReadPosRankSum=-1.728;SC=ACACACGCACGCACACACACA;SOR=0.693;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=23;TCF=8;TCR=15;TR=11,11;WE=32022344;WS=32022323;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.62,0.27:26
chr3	32030544	rs11129475	C	T	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.967;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=173;ReadPosRankSum=0.747;SC=GAAGGTCACACTGCAGCACTA;SOR=0.275;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=13;WE=32030552;WS=32030534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr3	32031024	rs4449357	C	T	1809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=35;PP=1144;ReadPosRankSum=0.856;SC=ACAAGCCTATCAAAGATCAGC;SOR=0.673;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=131;TCF=72;TCR=59;TR=74;WE=32031032;WS=32031014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,81:0.56:144
chr3	32031135	rs6419811	A	G	2322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.309;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=52;PP=1347;ReadPosRankSum=0.786;SC=ATGCTTCCTCAGTTCTAACGT;SOR=0.796;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=212;TCF=111;TCR=101;TR=101;WE=32031143;WS=32031125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,115:0.48:242
chr3	32031615	rs13064905	A	C	3987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FS=3.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.62;ReadPosRankSum=0.553;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:134,106:0.44:240
chr3	32031622	rs13087612	T	C	4013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FS=0.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.65;ReadPosRankSum=1.656;SOR=0.746;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:140,101:0.42:241
chr3	32031643	rs13065048	A	G	3884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.535;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=44;PP=1300;ReadPosRankSum=-0.304;SC=TTCACACCTCACACAACACAC;SOR=0.620;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=214;TCF=115;TCR=99;TR=94;WE=32031651;WS=32031633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,109:0.44:250
chr3	32031962	.	A	G	1779	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=55.1;NF=58;NR=65;PP=1779;QD=14.7461074191;SC=AAGACCTTCCATCACAATTCA;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=244;TCF=111;TCR=133;TR=123;WE=32031970;WS=32031952;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:121,123:0.50:244
chr3	32032397	rs4955216	G	T	2818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.664;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.97;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=63;PP=1743;ReadPosRankSum=0.591;SC=CATTCACATCGCATTAGACAT;SOR=0.896;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=254;TCF=127;TCR=127;TR=116;WE=32032405;WS=32032387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,127:0.45:283
chr3	32032587	rs34397293	G	C	828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.684;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.901;NF=15;NR=21;PP=440;ReadPosRankSum=0.358;SC=GCATTGACTTGAGTTTCAGTT;SOR=0.241;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=87;TCF=27;TCR=60;TR=36;WE=32032595;WS=32032577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,41:0.44:94
chr3	32207534	rs147700828	T	C	1835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=47;PP=1168;ReadPosRankSum=2.048;SC=TTTTTACAGGTTCGTTTTTGA;SOR=0.747;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=110;TCF=38;TCR=72;TR=72;WE=32207542;WS=32207524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,80:0.66:122
chr3	32493682	rs342745	A	G	3125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=74;PP=2173;SC=CCCAACCTGGAGGACTGGGGC;SOR=2.641;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=20;TCR=74;TR=94;WE=32493690;WS=32493672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr3	32568145	rs35822941	CCA	C	76.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.281;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=181;ReadPosRankSum=0.601;SC=AAATGGGTAACCACACACACA;SOR=2.484;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=16;TCR=10;TR=5;WE=32568154;WS=32568135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,6:0.19:32
chr3	32746522	rs7429569	A	G	208.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=185;SC=AATTTATGAAACACAAATAGT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=32746530;WS=32746512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	32758763	rs11129531	G	A	1968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=42;PP=1118;SC=TTTTCAATTTGTGTCTTTCTT;SOR=1.577;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=24;TCR=42;TR=66;WE=32758771;WS=32758753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr3	32774782	rs9798936	A	G	137.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=4;NR=0;PP=76;SC=TGTTTCCATTATCACCAAAAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=32774790;WS=32774772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	32815231	rs2396631	A	T	701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=17;PP=470;SC=TACCCCTGACATTTGGCCAAA;SOR=2.494;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=22;WE=32815239;WS=32815221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	32915214	rs6799979	C	G	3724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=74;NR=28;PP=2013;SC=GGAAGCTGGTCGTTCGGTTGT;SOR=1.724;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=74;TCR=28;TR=102;WE=32915222;WS=32915204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr3	32927400	rs36019845	G	A	3153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.412;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=56;PP=1970;ReadPosRankSum=1.076;SC=CTAATGCCTCGAAGTTGTTTC;SOR=0.729;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=274;TCF=153;TCR=121;TR=127;WE=32927408;WS=32927390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,149:0.48:310
chr3	32927509	rs6774703	G	T	4895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=98;PP=2965;SC=AAGCCGTGACGGCGAGGCATA;SOR=1.453;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=156;TCF=58;TCR=98;TR=156;WE=32927517;WS=32927499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr3	32933036	rs13096271	G	A	3014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.060;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=62;PP=1917;ReadPosRankSum=-1.279;SC=ACTGCCAGTCGGCACGCTTTC;SOR=0.654;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=238;TCF=125;TCR=113;TR=123;WE=32933044;WS=32933026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,135:0.51:263
chr3	32933360	.	C	CTT	279.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.361;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=2.917;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.66;ReadPosRankSum=2.207;SOR=1.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr3	32995928	rs2228428	C	T	1467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.597;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=33;PP=947;ReadPosRankSum=0.011;SC=TCCAAATTTACTCTGCTGACA;SOR=0.753;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=139;TCF=72;TCR=67;TR=67;WE=32995936;WS=32995918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,72:0.48:150
chr3	33055721	rs4302331	A	G	4876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=80;PP=2639;SC=AGGTGGCTGCACACTGCATCC;SOR=0.880;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=159;TCF=79;TCR=80;TR=159;WE=33055729;WS=33055711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr3	33093190	rs12632196	T	C	1945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=16;PP=1462;SC=ACACCCCTCCTCAAATTAATC;SOR=2.269;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=51;TCR=16;TR=67;WE=33093198;WS=33093180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr3	33099880	rs7637435	T	C	1017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=27;PP=658;SC=TAATGACTGCTGGAAAAATTT;SOR=2.191;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=36;WE=33099888;WS=33099870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr3	33138544	rs7614776	A	G	15737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=352;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.71;SOR=0.788;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,352:1.00:352
chr3	33138549	rs7637099	G	A	15929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=359;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.37;SOR=0.780;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,359:1.00:359
chr3	33165303	rs4320036	C	G	112.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=1;PP=56;SC=ATTTTTAGTACAGATGGGGTT;SOR=1.609;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=33165311;WS=33165299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	33165436	rs6777433	T	A	2799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=57;NR=40;PP=1677;SC=ATTGAGGTACTATTTATATAC;SOR=0.967;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=57;TCR=40;TR=97;WE=33165444;WS=33165426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr3	33171659	rs4392367	A	G	1505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=32;PP=939;SC=AGAGTTCATCAAGGTCCACTG;SOR=2.880;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=8;TCR=32;TR=40;WE=33171667;WS=33171649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr3	33174156	rs1135127	T	G	3062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=69;PP=2011;SC=ACAGGGACACTTGGGGCCTCT;SOR=1.907;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=99;TCF=30;TCR=69;TR=99;WE=33174176;WS=33174146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr3	33174168	rs1135128	G	A	2560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=56;PP=1699;SC=GGGGCCTCTCGGATGAGCACT;SOR=2.414;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=19;TCR=56;TR=75;WE=33174176;WS=33174146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr3	33175793	rs4234239	C	A	3463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=69;PP=2093;SC=CTGGTGGCTACGAGAAAATAT;SOR=1.445;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=43;TCR=69;TR=112;WE=33175801;WS=33175783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr3	33175854	rs58617854	A	G	1035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=26;PP=730;SC=CCCTGAAGTAAGAAACAGAGG;SOR=2.649;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=33;WE=33175862;WS=33175844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	33216357	rs57072412	G	A	1344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.640;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=14;PP=839;ReadPosRankSum=3.033;SC=CGCGAAGGTGGCCCATCCCTG;SOR=0.894;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=102;TCF=72;TCR=30;TR=53;WE=33216365;WS=33216347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,57:0.52:110
chr3	33255592	rs9637517	A	G	2674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=48;NR=37;PP=1491;SC=AGCACAAAGAACTTTCCTGTG;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=85;TCF=48;TCR=37;TR=85;WE=33255600;WS=33255582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr3	33359050	rs67505561	A	G	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.083;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=264;ReadPosRankSum=1.711;SC=TTTTGTAGCAATGATGAGATT;SOR=0.477;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=58;TCF=19;TCR=39;TR=22;WE=33359058;WS=33359040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,24:0.38:63
chr3	33414923	rs2291898	G	A	832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=26;PP=545;ReadPosRankSum=-0.670;SC=TAATGGTCACGTTGGATCCAG;SOR=0.832;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=69;TCF=17;TCR=52;TR=35;WE=33414931;WS=33414913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,37:0.50:74
chr3	33419422	rs2291897	C	T	535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.474;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=10;PP=346;ReadPosRankSum=1.270;SC=CACTGTAACTCAAAAGGCAGC;SOR=0.182;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=47;TCF=34;TCR=13;TR=27;WE=33419430;WS=33419412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,27:0.54:50
chr3	33426883	rs17030546	C	G	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=354;ReadPosRankSum=2.721;SC=AATTCTACTTCAACTAAGGTG;SOR=0.963;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=15;WE=33426891;WS=33426873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr3	33434831	rs2293250	G	A	1735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.03;ReadPosRankSum=0.496;SOR=0.715;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,87:0.50:173
chr3	33444286	rs623244	T	G	939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=18;PP=585;ReadPosRankSum=0.252;SC=TCACACAAACTAGATACCTGT;SOR=0.696;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=85;TCF=46;TCR=39;TR=40;WE=33444294;WS=33444276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,45:0.48:94
chr3	33454342	rs2272152	G	A	1295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.542;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=35;PP=837;ReadPosRankSum=1.268;SC=TGCGGAAAATGAGTACTTTTA;SOR=0.456;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=105;TCF=39;TCR=66;TR=57;WE=33454350;WS=33454332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,61:0.54:113
chr3	33458266	rs3736563	T	C	1771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.580;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=31;PP=1003;ReadPosRankSum=-0.337;SC=TAATTTTCCATTGATCTCAGG;SOR=0.782;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=138;TCF=79;TCR=59;TR=73;WE=33458274;WS=33458256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,86:0.53:162
chr3	33467364	rs61620772	T	TTTTAA	282.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.874;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.150;HP=9;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=199;ReadPosRankSum=-0.640;SC=ATAGTTTTTTTTTTAAGATCA;SOR=2.636;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=5;WE=33467372;WS=33467354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr3	33481400	rs2272153	G	C	599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.204;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=18;PP=389;ReadPosRankSum=-0.063;SC=GAAGGAGCCGGAGCTCCGCTG;SOR=0.414;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=68;TCF=21;TCR=47;TR=28;WE=33481408;WS=33481390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,30:0.42:72
chr3	33540329	rs6782108	T	C	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.014;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=389;ReadPosRankSum=0.077;SC=CTGGGGGTTATTATAATGCCC;SOR=2.867;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=17;WE=33540337;WS=33540319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr3	33552004	rs2049281	T	C	720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=0.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.93;ReadPosRankSum=0.022;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,40:0.38:104
chr3	33592978	rs34937822	A	AT	99.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.39;MQRankSum=1.315;QD=5.87;ReadPosRankSum=-1.613;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr3	33600553	rs73053686	A	G	1125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.617;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=13;PP=634;ReadPosRankSum=-0.871;SC=AGTTGAATACAGATGCAAACA;SOR=0.895;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=101;TCF=70;TCR=31;TR=48;WE=33600561;WS=33600543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,57:0.52:110
chr3	33605300	rs7643855	G	A	2191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-2.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=32;PP=1361;ReadPosRankSum=-0.156;SC=TTCACTGTCTGTAAGATAATG;SOR=0.736;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=174;TCF=114;TCR=60;TR=94;WE=33605308;WS=33605290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,103:0.54:189
chr3	33615874	rs9841413	G	A	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.179;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=330;ReadPosRankSum=-0.672;SC=CTTCTACTTTGATTTTTAATA;SOR=0.982;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=55;TCF=41;TCR=14;TR=23;WE=33615882;WS=33615864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,24:0.45:53
chr3	33617790	rs4629282	A	G	1331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=36;PP=812;ReadPosRankSum=1.937;SC=AAGAAGGAAAATAGATTTGAA;SOR=0.688;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=143;TCF=61;TCR=82;TR=61;WE=33617798;WS=33617780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,68:0.43:158
chr3	33618551	rs11391504	G	GA	751.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=11.614;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.92;ReadPosRankSum=1.197;SOR=5.279;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,28:0.97:29
chr3	33653622	rs6807542	T	G	689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=15;PP=288;ReadPosRankSum=-0.996;SC=GGTCCTTTCTTCTATTTGCCT;SOR=0.610;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=43;TCF=18;TCR=25;TR=27;WE=33653630;WS=33653612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,34:0.67:51
chr3	33668662	rs72499357	ATTAAGT	A	2080.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=25;PP=1384;ReadPosRankSum=0.466;SC=TCTTTCACCTATTAAGTTTAT;SOR=0.682;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=52;TCF=4;TCR=48;TR=26;WE=33668675;WS=33668652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,54:0.52:104
chr3	33879770	rs3203777	G	A	5475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=91;PP=2965;SC=AGCCGATTTGGTTAACAGATC;SOR=0.783;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=186;TCF=95;TCR=91;TR=186;WE=33879778;WS=33879760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr3	35756952	rs74492876	C	G	1814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.303;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=43;PP=914;ReadPosRankSum=0.459;SC=CCAGGAAAGCCTTTTTGTGGA;SOR=0.965;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=176;TCF=80;TCR=96;TR=77;WE=35756960;WS=35756942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,91:0.47:194
chr3	35778773	rs2278757	A	G	1217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.599;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=32;PP=793;ReadPosRankSum=0.637;SC=AACAGCAGCCACCACAGCAGC;SOR=0.547;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=100;TCF=39;TCR=61;TR=54;WE=35778781;WS=35778763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,57:0.54:106
chr3	35778908	rs11927763	A	G	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.148;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=54;ReadPosRankSum=-1.050;SC=TGAAGGCTACATAGTCCTCAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=4;WE=35778916;WS=35778898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr3	35779750	rs2012153	A	G	1324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.252;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=31;PP=766;ReadPosRankSum=-2.229;SC=TGCAATATCCAGCAGTCTCTT;SOR=0.568;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=143;TCF=69;TCR=74;TR=62;WE=35779758;WS=35779740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,69:0.43:162
chr3	35780734	rs876159	G	T	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.098;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=9;PP=214;ReadPosRankSum=-2.177;SC=AATGTGTCCTGTGTCTGCCTC;SOR=0.455;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=60;TCF=37;TCR=23;TR=18;WE=35780742;WS=35780724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,18:0.29:63
chr3	35785206	rs11712442	G	C	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.563;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=98;ReadPosRankSum=-1.082;SC=ACATAGGCATGGGAGAAGTTT;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=6;WE=35785214;WS=35785196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr3	35785296	rs6550367	T	C	1287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.464;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=17;PP=940;ReadPosRankSum=0.000;SC=TATCTACATTTTCATTCTCTG;SOR=0.893;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=132;TCF=93;TCR=39;TR=59;WE=35785304;WS=35785286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,60:0.42:143
chr3	36527872	rs11926471	A	G	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=108;ReadPosRankSum=-2.429;SC=GGCACCTGCCAAAGAGAAACC;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=36527880;WS=36527862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr3	36570279	rs75665620	A	T	781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.538;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=7;PP=496;ReadPosRankSum=2.284;SC=AGAGAAAATCATTTGGTAACT;SOR=1.274;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=65;TCF=49;TCR=16;TR=30;WE=36570287;WS=36570269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,33:0.45:73
chr3	36587526	rs10717668	CT	C	242.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.157;NF=10;NR=0;PP=270;ReadPosRankSum=1.750;SC=TTTATCAAACCTTTTTCTCAC;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=10;WE=36587534;WS=36587516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr3	36587544	rs7645444	G	A	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.101;NF=14;NR=2;PP=256;ReadPosRankSum=0.705;SC=CACTGTGCTGGTTTCCCACCC;SOR=0.822;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=16;WE=36587552;WS=36587534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
chr3	36869655	rs147241914	C	CCTAT	200.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.273;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.674;NF=4;NR=0;PP=149;ReadPosRankSum=-0.944;SC=GTTAGACTCCCCTATTTTTAA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=4;WE=36869663;WS=36869645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr3	36869928	rs10590354	AGAAG	A	44.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=3.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.49;ReadPosRankSum=1.365;SOR=0.098;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,3:0.17:18
chr3	36876154	rs3796186	C	T	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.87;ReadPosRankSum=-1.272;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,5:0.21:24
chr3	36888575	rs12497299	C	T	809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=6;PP=585;ReadPosRankSum=0.000;SC=CTCAATTCCCCGTTGCTGAGG;SOR=0.836;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=56;TCF=45;TCR=11;TR=32;WE=36888583;WS=36888565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,33:0.57:58
chr3	36896653	rs9818599	G	C	2181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=17;PP=1565;SC=AAACCCAAGAGCTGGACTTAC;SOR=2.242;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=73;TCF=55;TCR=18;TR=71;WE=36896661;WS=36896643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr3	36897812	rs11712950	T	C	1470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=5.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.23;ReadPosRankSum=-1.427;SOR=0.423;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,69:0.53:131
chr3	36898991	rs61732326	T	C	4240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=431;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=101;PP=2289;ReadPosRankSum=0.756;SC=TTCAACCTGCTGAATCAAAAC;SOR=0.722;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=394;TCF=195;TCR=199;TR=196;WE=36898999;WS=36898981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:218,213:0.49:431
chr3	36899593	rs7619089	C	T	1547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=41;PP=872;ReadPosRankSum=0.991;SC=TCTTAGGGGACAGCAGACCCT;SOR=0.760;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=104;TCF=43;TCR=61;TR=69;WE=36899601;WS=36899583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,74:0.67:111
chr3	36915524	rs4510338	T	C	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.010;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=9;PP=549;ReadPosRankSum=-1.148;SC=TGTGTGTATATATATATATAC;SOR=0.470;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=67;TCF=48;TCR=19;TR=30;WE=36915532;WS=36915509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,33:0.45:73
chr3	36915814	rs4296548	T	G	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.191;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=242;ReadPosRankSum=-0.031;SC=TGAGAAGGGGTGTTTGTCATG;SOR=0.148;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=46;TCF=6;TCR=40;TR=18;WE=36915822;WS=36915804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,21:0.43:49
chr3	36934343	rs5847939	CAT	C	488.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.165;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=316;ReadPosRankSum=1.061;SC=CAAAACAAAACATATATATAT;SOR=2.726;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=25;TCF=13;TCR=12;TR=10;WE=36934352;WS=36934333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr3	36934534	rs9832646	G	C	876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.207;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=22;PP=498;ReadPosRankSum=-0.252;SC=GGTTATTAAAGCAAAAAAGTT;SOR=0.351;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=83;TCF=30;TCR=53;TR=38;WE=36934542;WS=36934524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,44:0.47:93
chr3	36937106	rs11129741	G	A	2355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.961;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=45;PP=1326;ReadPosRankSum=1.679;SC=TACTCTCCCCGTGAGAGCCAT;SOR=0.758;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=227;TCF=127;TCR=100;TR=106;WE=36937114;WS=36937096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,118:0.47:251
chr3	36940741	rs9864910	G	T	1608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=34;PP=939;ReadPosRankSum=-0.080;SC=TAACCAGCTCGGTAGTATCCC;SOR=0.723;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=145;TCF=70;TCR=75;TR=68;WE=36940749;WS=36940731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,79:0.46:170
chr3	37034946	rs1800734	G	A	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.390;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=310;ReadPosRankSum=0.789;SC=AGCTACAGCTGAAGGAAGAAC;SOR=0.230;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=38;TCF=35;TCR=3;TR=19;WE=37034954;WS=37034936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr3	37048633	rs4234259	A	G	1458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.074;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=38;PP=972;ReadPosRankSum=-1.655;SC=AATTGCTTCTAAGTTTTCAGG;SOR=0.411;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=95;TCF=27;TCR=68;TR=56;WE=37048641;WS=37048623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,59:0.60:98
chr3	37083740	rs9876116	A	G	1931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.514;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=43;PP=1144;ReadPosRankSum=-0.028;SC=CCTTAAAGTCACTTCATTTTT;SOR=0.654;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=182;TCF=89;TCR=93;TR=83;WE=37083748;WS=37083730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,94:0.47:201
chr3	37096024	rs749072	T	C	3412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.667;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=81;PP=2243;ReadPosRankSum=-0.107;SC=TATGAGAACATAGGCCTCTAG;SOR=0.883;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=243;TCF=111;TCR=132;TR=142;WE=37096032;WS=37096014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,156:0.57:276
chr3	37096109	rs113420512	T	TAAC	1077.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=24;PP=1121;ReadPosRankSum=0.538;SC=CCAAGTAATCTACTAACAAGT;SOR=0.782;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=0;TCR=55;TR=24;WE=37096117;WS=37096099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,29:0.46:63
chr3	37100166	.	CAAA	C	92	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=16;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=17;MQ=57.75;NF=1;NR=6;PP=92;QD=13.5714285714;SC=ACTCCCATCTCAAAAAAAAAA;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=7;WE=37100176;WS=37100156;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr3	37107022	rs7639375	C	A	1706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=13;PP=1122;ReadPosRankSum=-0.103;SC=CTTTGCAGAACAGTTTGTAGT;SOR=0.761;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=114;TCF=89;TCR=25;TR=63;WE=37107030;WS=37107012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,72:0.55:130
chr3	37107470	rs2302503	G	A	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=252;ReadPosRankSum=2.284;SC=CAAAAGGCCCGTATGGAAGCT;SOR=0.730;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=55;TCF=19;TCR=36;TR=21;WE=37107478;WS=37107460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,25:0.39:64
chr3	37116386	rs2302504	G	T	901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-3.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.197;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=5;PP=431;ReadPosRankSum=-0.357;SC=TTGAAAATTTGTAGTGTACAG;SOR=0.435;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=50;TCR=10;TR=29;WE=37116394;WS=37116376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,38:0.54:70
chr3	37133124	rs2302506	A	G	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.188;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=168;ReadPosRankSum=-0.264;SC=ACTTTTGTATATTCCAGACTA;SOR=0.169;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=11;WE=37133132;WS=37133114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr3	37144535	rs2302507	C	A	1827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.576;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=55;PP=1290;ReadPosRankSum=2.978;SC=AAGATGCTTTCAAGGTTAAGA;SOR=0.629;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=177;TCF=59;TCR=118;TR=86;WE=37144543;WS=37144525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,85:0.46:183
chr3	37150988	rs6806252	C	G	967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=17;PP=574;ReadPosRankSum=0.587;SC=CCCACCAGCACTGCACACACT;SOR=0.685;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=115;TCF=71;TCR=44;TR=46;WE=37150996;WS=37150978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,50:0.40:124
chr3	37163039	rs336595	G	A	2871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=35;PP=1530;SC=TGATAAAAATGAAAATAAACA;SOR=0.853;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=55;TCR=35;TR=90;WE=37163047;WS=37163029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr3	37170717	rs3733030	T	C	738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.624;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=24;PP=397;ReadPosRankSum=-0.821;SC=AAATAAAGAATGGGACATTAC;SOR=0.535;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=108;TCF=37;TCR=71;TR=39;WE=37170725;WS=37170707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,42:0.36:117
chr3	37170750	rs3733029	G	C	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=346;ReadPosRankSum=-2.184;SC=GTGGGCAGGAGAAGATATTAT;SOR=0.524;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=57;TCF=14;TCR=43;TR=22;WE=37170758;WS=37170740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,23:0.37:62
chr3	37285152	rs2271548	C	T	976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=26;PP=607;ReadPosRankSum=-1.112;SC=GTTCCGAATACCTCTTGAACC;SOR=1.064;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=11;TCR=32;TR=35;WE=37285160;WS=37285142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,39:0.78:50
chr3	37308262	rs73059487	A	T	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.696;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=127;ReadPosRankSum=-0.831;SC=ACTTTGCAACATGCCATTATG;SOR=0.233;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=12;WE=37308270;WS=37308252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr3	37308532	rs1040073	C	T	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.483;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=344;ReadPosRankSum=0.874;SC=TACCATCTCTCAAAGTATCTT;SOR=1.708;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=17;WE=37308540;WS=37308522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr3	37327629	rs58146171	C	T	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=23;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=178;ReadPosRankSum=2.260;SC=ATATTTCTTTCTTTTTTTTTT;SOR=1.179;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=6;WE=37327637;WS=37327619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr3	37366459	rs11718848	C	A	2916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.995;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=65;PP=1724;ReadPosRankSum=-0.212;SC=CCAAAAAGAACAAATAGAAAG;SOR=0.571;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=254;TCF=122;TCR=132;TR=129;WE=37366467;WS=37366449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,141:0.51:279
chr3	37368755	rs62241896	T	A	1956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.374;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=43;PP=1329;ReadPosRankSum=1.596;SC=GATCAAAGTATGATAGGTCAT;SOR=1.084;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=152;TCF=74;TCR=78;TR=74;WE=37368763;WS=37368745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,83:0.47:176
chr3	37369771	rs5847960	ACTCT	A	403.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.696;NF=11;NR=1;PP=518;ReadPosRankSum=-0.234;SC=TCACTCTCACACTCTCTCTCT;SOR=1.061;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=12;WE=37369782;WS=37369761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr3	37376500	rs11396224	C	CT	675.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.460;HP=10;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.061;NF=10;NR=7;PP=266;ReadPosRankSum=-1.143;SC=ACTAATGCTTCTTTTTTTTCT;SOR=1.173;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=49;TCF=26;TCR=23;TR=17;WE=37376508;WS=37376490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,32:0.48:66
chr3	37388577	rs3832257	C	CA	143.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.830;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=182;ReadPosRankSum=1.359;SC=AATATAAAAGCATGCCTCTCT;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=6;WE=37388585;WS=37388567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr3	37407489	rs17266090	A	G	1895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=26;PP=1138;ReadPosRankSum=2.482;SC=ACTTGAAAAAACAAATATCCC;SOR=0.652;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=142;TCF=92;TCR=50;TR=71;WE=37407497;WS=37407479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,86:0.51:169
chr3	37407664	rs62241901	G	T	911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=28;PP=654;ReadPosRankSum=-0.126;SC=GAATGAAGTTGTCATTCAGGG;SOR=0.651;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=83;TCF=20;TCR=63;TR=36;WE=37407672;WS=37407654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,39:0.45:87
chr3	37512646	rs11713408	TG	CC	4080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=56;PP=2861;ReadPosRankSum=-0.072;SC=ATTACTGCTGTGGTGGAAATG;SOR=0.702;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=218;TCF=88;TCR=130;TR=96;WE=37512655;WS=37512636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,109:0.45:240
chr3	37522828	rs197757	G	A	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.935;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=176;ReadPosRankSum=2.377;SC=CTGATGCCCAGAAAAGTGCCT;SOR=1.639;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=11;WE=37522836;WS=37522818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr3	37567762	rs79181427	A	G	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=112;ReadPosRankSum=-1.980;SC=GCTTGCAGGTATGAGATGATA;SOR=0.671;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=10;WE=37567770;WS=37567752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,12:0.41:29
chr3	37627112	rs1155741	T	C	6805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=114;NR=112;PP=2965;SC=CCATATTACATTCCAAGAAGG;SOR=0.793;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=226;TCF=114;TCR=112;TR=226;WE=37627120;WS=37627102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr3	37627149	rs1155742	G	A	2334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=47;PP=1289;ReadPosRankSum=-0.148;SC=TGTGGCTAAAGAAGTCTCAAC;SOR=0.703;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=178;TCF=79;TCR=99;TR=87;WE=37627157;WS=37627139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,107:0.52:206
chr3	37627286	rs140414819	G	GCC	117.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-2.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.02;MQRankSum=-0.524;QD=7.36;ReadPosRankSum=-1.722;SOR=0.086;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr3	37627287	rs2364183	G	C,GC	503.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;ALERT;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=61.13;QD=29.63;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,8,9:0.47,0.53:17
chr3	37695260	rs57547208	A	G	1304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.063;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=25;PP=756;ReadPosRankSum=0.334;SC=CTGCAGCTTCAGGGTAAACTG;SOR=0.889;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=134;TCF=74;TCR=60;TR=59;WE=37695268;WS=37695250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,67:0.45:148
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chr3	37778615	rs2276866	A	T	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=1.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.29;ReadPosRankSum=0.450;SOR=1.065;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,8:0.20:41
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chr3	37953024	rs13099971	G	C	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=165;ReadPosRankSum=-0.687;SC=AATAATGAAGGCTTCTTTATC;SOR=1.352;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=9;WE=37953032;WS=37953015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr3	37953083	rs13079669	T	A	872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.171;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=9;PP=531;ReadPosRankSum=2.265;SC=ACCCCCAACATGAACCTTTGG;SOR=1.112;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=74;TCF=52;TCR=22;TR=35;WE=37953091;WS=37953073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,40:0.49:82
chr3	37998566	rs73058970	G	A	1151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=1.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.87;ReadPosRankSum=0.206;SOR=0.546;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,58:0.55:106
chr3	38009700	rs11719907	C	T	1369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.172;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=25;PP=941;ReadPosRankSum=2.337;SC=TTCGGCTACTCTCCTAGCAGG;SOR=1.103;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=180;TCF=106;TCR=74;TR=68;WE=38009708;WS=38009690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,72:0.35:204
chr3	38009749	rs1573291	C	T	2401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.872;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=54;PP=1494;ReadPosRankSum=-0.486;SC=TTATGGTGGACTCTCGGGAAA;SOR=0.745;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=240;TCF=126;TCR=114;TR=118;WE=38009757;WS=38009739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,125:0.47:266
chr3	38038533	rs73060812	G	T	627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.735;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=396;ReadPosRankSum=-0.659;SC=GATGCTGGTGGTATGACACTC;SOR=1.234;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=61;TCF=47;TCR=14;TR=27;WE=38038541;WS=38038523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,30:0.45:66
chr3	38038932	rs73060813	G	C	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=310;ReadPosRankSum=0.462;SC=GCTGTGAGAGGGCACACTGGT;SOR=0.582;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=20;WE=38038940;WS=38038922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr3	38044143	rs9311172	C	G	1458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.592;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=39;PP=1018;ReadPosRankSum=1.142;SC=CTCCACAGGGCATGCAGACTT;SOR=0.521;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=107;TCF=37;TCR=70;TR=62;WE=38044151;WS=38044133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,64:0.56:115
chr3	38044592	rs9875248	C	T	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.944;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=10;PP=357;ReadPosRankSum=0.607;SC=ACCCTGTGAACGGGACGTGGG;SOR=0.508;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=71;TCF=50;TCR=21;TR=29;WE=38044600;WS=38044582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,33:0.42:78
chr3	38046023	rs9843506	A	C	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=260;ReadPosRankSum=1.970;SC=GTCACTGAGCAATTGCATTGC;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=14;WE=38046031;WS=38046013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
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chr3	38050691	rs73060835	G	A	2171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.622;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=33;PP=1185;ReadPosRankSum=-0.993;SC=AGGCCTCCTGGTGAGGCCCAA;SOR=0.624;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=144;TCF=88;TCR=56;TR=87;WE=38050699;WS=38050681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,97:0.63:154
chr3	38051941	rs9857730	T	C	1855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.92;ReadPosRankSum=-1.514;SOR=0.710;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,96:0.51:187
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chr3	38061748	rs61751648	A	G	1398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.318;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=20;PP=783;ReadPosRankSum=1.523;SC=TCCTCCTGCAACTTGTAGAAG;SOR=0.578;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=132;TCF=84;TCR=48;TR=57;WE=38061756;WS=38061738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,67:0.45:150
chr3	38080952	rs7625806	T	G	5160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=82;PP=2965;SC=GAGCCTCAGCTGCTTCGTCTG;SOR=0.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=184;TCF=102;TCR=82;TR=184;WE=38080960;WS=38080942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr3	38081031	rs7616776	A	T	3512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=391;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.366;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=83;PP=2008;ReadPosRankSum=-1.024;SC=ACTTGTACTCAGCCGAGGTCA;SOR=0.661;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=355;TCF=180;TCR=175;TR=167;WE=38081039;WS=38081021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:208,182:0.47:390
chr3	38086919	rs61672339	C	T	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=1.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.36;ReadPosRankSum=0.581;SOR=0.323;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,9:0.30:30
chr3	38087123	rs7630340	T	C	1018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=28;PP=530;ReadPosRankSum=-0.195;SC=TTGCGGAAAATGAGCGGGTCA;SOR=0.707;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=113;TCF=55;TCR=58;TR=52;WE=38087131;WS=38087113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,55:0.43:127
chr3	38104353	rs3752614	G	A	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.345;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=323;ReadPosRankSum=-0.222;SC=AACCTAGATGGTCCTCCGTTT;SOR=1.011;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=38;TCF=10;TCR=28;TR=21;WE=38104361;WS=38104343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,21:0.51:41
chr3	38105487	rs375420632	CT	C	196.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=3.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.03;ReadPosRankSum=0.211;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr3	38125500	rs77579651	C	T	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=392;ReadPosRankSum=-1.041;SC=CCATGTACCCCTCAGCCAGCT;SOR=0.927;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=36;TCF=34;TCR=2;TR=19;WE=38125508;WS=38125490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
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chr3	38125844	rs62240733	G	A	1004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=25;PP=649;SC=TAGTAGTAGTGGTGGTGGTAG;SOR=2.649;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=32;WE=38125852;WS=38125834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	38125880	rs374790897	GGTA	G	152.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=88;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=212;ReadPosRankSum=1.465;SC=TGGTAGTAGTGGTAGTAGTAG;SOR=1.179;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=7;WE=38125890;WS=38125870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr3	38128003	rs77108694	G	C	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=195;ReadPosRankSum=-1.190;SC=CTATGCAACTGCCACAACCCG;SOR=0.412;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=10;WE=38128011;WS=38127993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr3	38134438	rs11129778	A	G	2462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=57;PP=1682;SC=GCCACTGACCACAGTAGCATT;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=81;TCF=23;TCR=58;TR=79;WE=38134446;WS=38134428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr3	38138521	rs11129779	G	T	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=280;ReadPosRankSum=0.933;SC=GGTGCTTTTGGGTTGGGAGGC;SOR=0.515;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=19;WE=38138529;WS=38138511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr3	38149770	rs967682	G	A	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=22;ReadPosRankSum=-0.091;SC=CAGCCCTGTCGGTTTTGCTGT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=3;WE=38149778;WS=38149760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr3	38151731	rs12630114	T	C	9974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=373;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=149;NR=175;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.197;SC=AGTTTGAGTATTTCGGGAGCC;SOR=0.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=327;TCF=150;TCR=177;TR=324;WE=38151739;WS=38151721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,369:1.00:370
chr3	38159475	rs200651210	C	T	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.262;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=20;PP=418;ReadPosRankSum=-1.040;SC=ACAGCCTCAGCGGACAAGCAG;SOR=1.061;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=62;TCF=18;TCR=44;TR=26;WE=38159483;WS=38159465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,28:0.41:68
chr3	38164070	rs144512522	CATG	C	3024.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.166;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.584;NF=5;NR=37;PP=1820;ReadPosRankSum=0.255;SC=CCTAGGCCCTCATGATATGTC;SOR=0.809;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=95;TCF=14;TCR=81;TR=42;WE=38164080;WS=38164060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,81:0.45:181
chr3	38170810	rs156265	C	G	2429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=59;PP=1585;ReadPosRankSum=-1.003;SC=CTCTGGCCTTCTCCTTCTCCA;SOR=0.705;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=202;TCF=98;TCR=104;TR=111;WE=38170818;WS=38170800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,116:0.51:227
chr3	38278525	rs113062933	T	C	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=66;ReadPosRankSum=-0.501;SC=AGCTAAAATATAAAGAATACA;SOR=0.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=5;WE=38278533;WS=38278515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr3	38348949	rs818823	G	T	764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=20;PP=601;SC=TGAGGGTAGGGGTTCTCCAGG;SOR=2.584;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=25;WE=38348957;WS=38348939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	38350479	rs818819	T	C	4314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=55;PP=2394;SC=ACCGGGCCCATGCCATTATCC;SOR=1.096;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=89;TCR=55;TR=144;WE=38350487;WS=38350469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr3	38350519	rs818818	G	A	6438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=120;NR=93;PP=2965;SC=TGTTGGGGCCGTGTTGCTGAC;SOR=0.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=213;TCF=120;TCR=93;TR=213;WE=38350527;WS=38350509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr3	38350543	rs818817	A	G	6507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=120;NR=98;PP=2965;SC=GATCGCCTACAGTCTTCCCCA;SOR=0.768;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=218;TCF=120;TCR=98;TR=218;WE=38350551;WS=38350533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr3	38350630	rs704929	C	A	5894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=95;NR=95;PP=2965;SC=AAGCGAGTACCGGGCATGTAC;SOR=0.853;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=190;TCF=95;TCR=95;TR=190;WE=38350638;WS=38350620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr3	38354390	rs695939	A	G	814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.121;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=12;PP=496;ReadPosRankSum=-1.060;SC=GAATCACCTCATGCTGGCACA;SOR=0.904;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=51;TCF=33;TCR=18;TR=36;WE=38354398;WS=38354380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,38:0.69:55
chr3	38354839	rs72867262	G	T	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.423;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=144;ReadPosRankSum=0.038;SC=GCAAGCTGGGGTCTTGGCCCT;SOR=1.136;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=32;TCF=22;TCR=10;TR=15;WE=38354847;WS=38354829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr3	38355176	.	T	TGTGTGTGTGTGTGTGCGCGCGC	1111.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.884;ClippingRankSum=0.000;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=8.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-1.757;QD=19.85;ReadPosRankSum=1.411;SOR=2.170;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,17:0.30:56
chr3	38355184	rs12186097	T	C	969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-1.569;NF=29;NR=16;PP=2176;ReadPosRankSum=4.268;SC=TGTGCGCGCGTGTGCACGCGC;SOR=0.769;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=82;TCF=56;TCR=26;TR=45;WE=38355192;WS=38355166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,47:0.47:100
chr3	38355509	rs696253	C	T	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.329;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=55;ReadPosRankSum=-0.651;SC=CCGCCTGCCACGGCCGGCCAC;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=6;WE=38355517;WS=38355499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr3	38357776	rs149688650	C	T	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=55;ReadPosRankSum=-0.549;SC=CCTCTGAACCCGGCAGACCCC;SOR=0.631;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=6;WE=38357784;WS=38357766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr3	38357961	rs240033	C	G	1647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.446;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=37;PP=986;ReadPosRankSum=0.989;SC=TCCCTGCTGCCGGAAACGCGA;SOR=0.734;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=182;TCF=97;TCR=85;TR=84;WE=38357969;WS=38357951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,89:0.44:200
chr3	38390020	rs2615631	C	A	7188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=139;NR=95;PP=2965;SC=TCTACACTTCCTTTTTTAAAA;SOR=1.022;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=236;TCF=140;TCR=96;TR=234;WE=38390028;WS=38390010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
chr3	38401677	rs818851	C	T	805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=5;PP=613;SC=TTGCAGCCCTCGTGCCTGTTC;SOR=2.670;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=26;WE=38401685;WS=38401667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	38401839	rs818850	T	C	2936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=47;PP=1465;SC=GGACTCAGGGTGGTGTTCATG;SOR=0.822;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=53;TCR=47;TR=100;WE=38401847;WS=38401829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr3	38401918	rs818849	A	G	1677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=25;NR=31;PP=839;SC=AGGGATTCCTATTCTCCTTCT;SOR=1.249;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=25;TCR=31;TR=56;WE=38401926;WS=38401908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr3	38402007	rs818848	T	A	67.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=74;SC=GCATCTGTTGTCACCAGGTCC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=38402015;WS=38401997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr3	38404472	rs17118	C	A	1307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=36;PP=744;ReadPosRankSum=0.835;SC=CGGGCTTCGACTTCTCTCAAG;SOR=0.655;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=135;TCF=56;TCR=79;TR=62;WE=38404480;WS=38404462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,66:0.44:151
chr3	38406648	rs704942	T	C	3731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=61;PP=2073;SC=GCTGTGACACTGGTGTGTGGT;SOR=0.766;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=131;TCF=70;TCR=61;TR=131;WE=38406656;WS=38406638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr3	38406773	rs704943	G	T	3017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=50;PP=1716;SC=ACCAGCAGCTGCAGGTAACTG;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=96;TCF=46;TCR=50;TR=96;WE=38406781;WS=38406763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr3	38406793	rs2234608	T	G	2394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=41;PP=1389;SC=GTGGCTACGTTGTGTGAGTGT;SOR=0.997;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=38;TCR=41;TR=79;WE=38406801;WS=38406783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr3	38408248	rs704946	G	A	3547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=35;PP=2151;SC=GGAGGTAATTGTTCATTCTGT;SOR=1.574;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=119;TCF=84;TCR=35;TR=119;WE=38408256;WS=38408238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr3	38408361	rs843890	G	A	7187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=113;NR=126;PP=2965;SC=ACTCACATACGGAGGTTGGTT;SOR=0.910;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=239;TCF=113;TCR=126;TR=239;WE=38408369;WS=38408351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,262:1.00:262
chr3	38408459	rs2234617	A	G	1329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=37;PP=1072;SC=GACTGAAAACATTGATAAGCA;SOR=3.767;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=5;TCR=37;TR=42;WE=38408467;WS=38408449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr3	38409600	rs704947	T	G	4628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.365;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=54;PP=2791;ReadPosRankSum=1.161;SC=TTTTCATGCTTTGTGTGTGTC;SOR=0.782;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=147;TCF=91;TCR=56;TR=144;WE=38409608;WS=38409575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,172:0.98:175
chr3	38438457	rs196356	G	A	971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.879;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=13;PP=610;ReadPosRankSum=0.762;SC=GGAATGGAAGGGGTCAGAAGA;SOR=0.310;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=74;TCF=54;TCR=20;TR=40;WE=38438465;WS=38438447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,44:0.56:79
chr3	38442490	rs2070488	G	A	2961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.429;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=52;PP=1784;ReadPosRankSum=-0.090;SC=AGAGACCATCGGAATTTGTTT;SOR=0.794;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=249;TCF=139;TCR=110;TR=123;WE=38442498;WS=38442480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,141:0.51:279
chr3	38519424	rs2070489	A	G	4963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=78;NR=87;PP=2923;SC=TCTGCAACGAACGCTTCACTC;SOR=0.932;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=78;TCR=87;TR=165;WE=38519432;WS=38519414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr3	38521156	rs13097628	T	C	8477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=168;NR=118;PP=2965;SC=AGTTCTGTGCTGTCTTCTCTC;SOR=1.043;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=286;TCF=168;TCR=118;TR=286;WE=38521164;WS=38521146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,316:1.00:316
chr3	38524742	rs1046048	C	T	5732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=101;NR=85;PP=2965;SC=GGTCGGTCAACGGCACTACCT;SOR=0.731;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=186;TCF=101;TCR=85;TR=186;WE=38524750;WS=38524732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr3	38618250	rs199473198	T	G	1441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.051;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=33;PP=844;ReadPosRankSum=-0.596;SC=TGTGCTGCCCTCGGAGCAACT;SOR=0.737;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=121;TCF=66;TCR=55;TR=67;WE=38618258;WS=38618240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,73:0.53:137
chr3	38622467	rs7430407	T	C	6860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=140;NR=98;PP=2965;SC=TCTCCTCATCTTCTTCTTGGT;SOR=1.057;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=238;TCF=140;TCR=98;TR=238;WE=38622475;WS=38622457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr3	38627629	rs7645173	A	G	1445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=36;PP=1049;SC=TGAAAGCCCAAGGAGCCCTTG;SOR=2.448;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=11;TCR=36;TR=47;WE=38627637;WS=38627619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr3	38627658	rs112524625	T	TCC	595.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5749;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;NF=1;NR=17;PP=238;SC=TGACACCTATTCCCCCCCCGC;SOR=5.549;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=18;WE=38627666;WS=38627648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	38648062	rs6599222	C	T	518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=1;PP=351;SC=TCCAAAGCTCCCACCAGTGGG;SOR=3.383;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=38648070;WS=38648052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	38674712	rs6599230	T	C	3390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=61;PP=1968;SC=CTTGCTTCTCTGCCATGCGCT;SOR=0.899;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=55;TCR=61;TR=116;WE=38674720;WS=38674702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr3	38739574	rs6599241	T	C	9119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=173;NR=141;PP=2965;SC=ATGTTGACCATGATGAGGAAG;SOR=0.796;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=314;TCF=173;TCR=141;TR=314;WE=38739582;WS=38739564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,345:1.00:345
chr3	38739845	rs6599242	A	G	8237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=138;NR=141;PP=2965;SC=TACCGAAGATAGAGTAGATGA;SOR=0.748;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=279;TCF=138;TCR=141;TR=279;WE=38739853;WS=38739835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,298:1.00:298
chr3	38749026	rs6599248	T	A	1451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=37;PP=1041;SC=TCTTGCCACATCCAGTGTCGG;SOR=2.348;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=12;TCR=37;TR=49;WE=38749034;WS=38749016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr3	38753977	rs6781740	C	T	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=146;ReadPosRankSum=-2.255;SC=TCCCAATGCCCCACCCCCTCT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=8;WE=38753985;WS=38753967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr3	38763863	rs6771157	G	C	2689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.839;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=61;PP=1459;ReadPosRankSum=0.222;SC=ATGGACTCTTGGTGGTATCCA;SOR=0.814;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=289;TCF=150;TCR=139;TR=121;WE=38763871;WS=38763853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:190,138:0.42:328
chr3	38764071	rs61487238	C	T	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=21;ReadPosRankSum=0.414;SC=GGGAGTCCCTCAATCCAGACC;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=3;WE=38764079;WS=38764061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr3	38764782	rs4076737	G	T	1394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=36;NR=6;PP=909;SC=TGTCTGATGCGGGCGCCCTCA;SOR=2.560;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=36;TCR=6;TR=42;WE=38764790;WS=38764772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr3	38764998	rs12632942	A	G	3520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=342;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.310;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=80;PP=2055;ReadPosRankSum=1.935;SC=CTCAGGATCTAGGCAGTCCAC;SOR=0.565;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=309;TCF=145;TCR=164;TR=155;WE=38765006;WS=38764988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,170:0.50:342
chr3	38766675	rs6795970	A	G	2867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=36;PP=1689;SC=CTCAGCAGGGACCTGAGGAAC;SOR=1.036;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=58;TCR=36;TR=94;WE=38766683;WS=38766665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr3	38768247	rs59468016	G	A	2896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.411;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=65;PP=1692;ReadPosRankSum=-1.756;SC=CATCCCTGGGGCCTCTGGGAG;SOR=0.737;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=278;TCF=136;TCR=142;TR=126;WE=38768255;WS=38768237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,143:0.46:314
chr3	38768300	rs57326399	T	C	1779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.014;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=45;PP=970;ReadPosRankSum=-1.635;SC=TTGGCAGCAATGTGGTTCTCA;SOR=0.771;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=207;TCF=101;TCR=106;TR=86;WE=38768308;WS=38768290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,95:0.40:236
chr3	38780971	rs9830687	G	A	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=163;ReadPosRankSum=0.648;SC=AATCTGGGTGGGAGTTTCCCC;SOR=0.481;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=11;WE=38780979;WS=38780961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr3	38784029	rs6599250	T	C	3529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=66;PP=2176;SC=TTCTGCATTATAGTGTGGTCA;SOR=1.392;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=45;TCR=66;TR=111;WE=38784037;WS=38784019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr3	38812708	rs4420804	C	T	3120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=31;PP=1829;SC=AGCCCTGTCTCCTACCCACCA;SOR=1.528;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=70;TCR=31;TR=101;WE=38812716;WS=38812698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr3	38835589	rs111558766	C	T	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=213;ReadPosRankSum=1.404;SC=TGGCCCTGTCCCTCTCATCTG;SOR=0.846;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=12;WE=38835597;WS=38835579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr3	38911972	rs4133368	C	T	173.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=139;SC=GACTGGACTTCAGAGAATACT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=38911980;WS=38911966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	38913569	rs4077939	G	T	600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=3;PP=458;SC=GGCAGGCTGGGAAGTAACCCA;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=38913577;WS=38913559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	38926912	rs6599266	C	G	2562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=59;PP=1766;SC=CAGAACAAAACGAAGGGGGTG;SOR=1.828;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=28;TCR=59;TR=87;WE=38926920;WS=38926902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr3	38946872	rs4514993	A	T	2137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=36;NR=33;PP=1177;SC=TCAAAACTTAACAAACTACTT;SOR=0.770;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=36;TCR=33;TR=69;WE=38946880;WS=38946862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr3	38949363	rs6599267	A	C	2918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=26;PP=1690;SC=TAAATGAATTATTTCAATTTG;SOR=1.352;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=59;TCR=26;TR=85;WE=38949371;WS=38949353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr3	38951437	rs11720056	T	C	685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=1;PP=562;SC=AGACAGATGATAAAAGTGGGG;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=38951445;WS=38951427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	38951753	rs7429404	T	C	734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=20;PP=571;SC=CCAAGCTTCTTTTTCCTTCCA;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=38951761;WS=38951743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	38961537	rs6779297	T	C	873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=29;PP=650;SC=AAAAAAACATTGAAAGGAAAG;SOR=2.899;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=35;WE=38961545;WS=38961527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	38967042	rs73068563	C	T	4301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=90;PP=2672;SC=TTGCTCAGTCCTGCAGCTGCA;SOR=1.504;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=142;TCF=52;TCR=90;TR=142;WE=38967050;WS=38967032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr3	39093326	rs6599003	G	A	3652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=26;PP=2445;SC=TACTTGCACAGTGGTTTTGTT;SOR=2.419;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=88;TCR=26;TR=114;WE=39093334;WS=39093316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr3	39107993	rs10510698	T	G	1569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=14;PP=1055;SC=TTTCAAAGTTTTAAGTCATAC;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=37;TCR=14;TR=51;WE=39108001;WS=39107983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr3	39111140	rs2293312	C	A	7464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=154;NR=97;PP=2965;ReadPosRankSum=1.501;SC=ACAGGTGTTACGGGTATGGGA;SOR=0.431;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=252;TCF=155;TCR=97;TR=251;WE=39111148;WS=39111130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,272:1.00:273
chr3	39118745	rs3732375	A	G	5476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.600;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=98;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.854;SC=ATAAACATGTATTTTGTTATC;SOR=0.666;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=174;TCF=76;TCR=98;TR=173;WE=39118753;WS=39118735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,196:0.99:197
chr3	39121119	rs17038400	G	C	1700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=20;PP=1092;SC=GTTCCTGTTAGATACCAGTTA;SOR=1.270;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=36;TCR=20;TR=56;WE=39121127;WS=39121109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr3	39129742	rs3736573	A	C	5714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=95;PP=2965;SC=TAAGAAAGACAAGAGGTTCTG;SOR=0.949;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=182;TCF=87;TCR=95;TR=182;WE=39129750;WS=39129732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr3	39133085	rs2272217	T	G	2380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.95;NF=56;NR=25;PP=1287;SC=TAATAGAAACTGTTATACCTT;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=56;TCR=25;TR=81;WE=39133093;WS=39133075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr3	39149092	rs6786764	A	G	4445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.280;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=75;PP=2693;ReadPosRankSum=-0.725;SC=GACCGACCCGACGCCAGTAGC;SOR=0.440;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=146;TCF=70;TCR=76;TR=144;WE=39149100;WS=39149082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,165:0.99:166
chr3	39149180	rs6786855	A	G	3937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=56;PP=2407;SC=CAGACACTGGACGCTCCTAGC;SOR=0.811;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=125;TCF=69;TCR=56;TR=125;WE=39149188;WS=39149170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr3	39149489	rs28362643	C	T	2080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=48;PP=1450;SC=TTTTCTTGCCCCACTCCCCCT;SOR=1.488;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=27;TCR=48;TR=75;WE=39149497;WS=39149479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr3	39152248	rs7613766	C	G	360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=13;NR=1;PP=293;SC=GGGGGAGACCCCGAGGTAGTT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=39152256;WS=39152238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	39152345	rs1112438	G	A	2661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=36;PP=1623;SC=TTTACAGACCGAGAAGCAATT;SOR=1.007;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=55;TCR=36;TR=91;WE=39152353;WS=39152335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr3	39152575	rs7614000	C	G	2279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=37;NR=42;PP=1362;SC=AGCAGGGTGGCCCTCATTCCC;SOR=0.922;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=37;TCR=42;TR=79;WE=39152583;WS=39152565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr3	39161456	rs1274972	G	A	15571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=353;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=44.24;ReadPosRankSum=-0.634;SOR=0.705;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,350:0.99:352
chr3	39161464	rs1274971	G	A	15473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=354;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=43.84;ReadPosRankSum=-0.049;SOR=0.757;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,351:0.99:353
chr3	39162426	rs137892380	G	A	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=138;ReadPosRankSum=-1.831;SC=TTTCTGACATGACCTTGCTCA;SOR=0.804;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=9;WE=39162434;WS=39162416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr3	39166743	rs2669852	T	C	349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=4;PP=261;SC=TGCAAGGTGGTCTGGACCTTC;SOR=1.270;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=6;TCR=4;TR=10;WE=39166751;WS=39166733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	39226127	rs3732383	C	T	7319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=120;NR=126;PP=2965;SC=GTTTGACCTCCGACCTCCTGG;SOR=0.779;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=246;TCF=120;TCR=126;TR=246;WE=39226135;WS=39226117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr3	39227664	rs61736155	G	A	4976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=81;PP=2965;SC=TCCGAAGACCGTCCTGGATGG;SOR=0.726;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=169;TCF=88;TCR=81;TR=169;WE=39227672;WS=39227654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr3	39228043	rs11711871	T	G	4431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=65;PP=2672;SC=CTCAGTTGGGTGCAGGCTCTG;SOR=0.796;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=147;TCF=81;TCR=66;TR=146;WE=39228051;WS=39228033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr3	39229900	rs6805248	T	C	6191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=111;NR=100;PP=2965;SC=AAACAGATGCTGCTGCTGCTG;SOR=0.702;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=211;TCF=111;TCR=100;TR=211;WE=39229908;WS=39229890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr3	39230607	rs146075058	C	G	2780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.775;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=64;PP=1580;ReadPosRankSum=-0.029;SC=CAGCTGGCCTCTCGTGTTCTC;SOR=0.598;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=272;TCF=143;TCR=129;TR=128;WE=39230615;WS=39230597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,139:0.46:302
chr3	39230997	rs2271487	A	G	1570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=26;NR=33;PP=957;SC=CTAGATGTTCAGCAGGGTAGA;SOR=1.143;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=26;TCR=33;TR=59;WE=39231005;WS=39230987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr3	39308293	.	A	T	111	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.9314;HP=13;HapScore=4;MGOF=33;MMLQ=25;MQ=57.59;NF=2;NR=11;PP=111;QD=11.2131701959;SC=TTTTTTTTTTAAATGGAGTCT;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=13;WE=39308301;WS=39308282;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr3	39323163	rs11715522	A	C	2152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.607;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=46;PP=1453;ReadPosRankSum=-1.580;SC=CTGCCAACTTAAACGCCTCCA;SOR=0.605;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=142;TCF=60;TCR=82;TR=83;WE=39323171;WS=39323153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,91:0.58:157
chr3	39373902	rs2853699	C	G	2073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.013;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=43;PP=1325;ReadPosRankSum=0.043;SC=CCCTGTGATGCGGAACTTATT;SOR=0.817;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=270;TCF=145;TCR=125;TR=100;WE=39373910;WS=39373892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,108:0.37:290
chr3	39431081	rs2270770	G	A	1426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.694;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=31;PP=806;ReadPosRankSum=-0.426;SC=AAACACGCCTGCAAACCCTCC;SOR=0.525;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=144;TCF=80;TCR=64;TR=65;WE=39431089;WS=39431071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,71:0.45:157
chr3	39433147	rs1995236	G	A	6563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=98;NR=129;PP=2965;SC=AGGATAGTTCGGCTTAGCCAC;SOR=1.104;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=228;TCF=98;TCR=130;TR=227;WE=39433155;WS=39433137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr3	39437702	rs34894781	G	GA	81.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.29;ReadPosRankSum=1.335;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,3:0.23:13
chr3	39437715	rs35086961	T	A	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.03;ReadPosRankSum=-1.202;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr3	39437800	rs9877539	A	G	5607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=123;NR=72;PP=2965;SC=TAAACATGGGATAACAGAGAC;SOR=1.285;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=195;TCF=123;TCR=72;TR=195;WE=39437808;WS=39437790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr3	39448204	rs3772146	C	T	791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.214;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=8;PP=536;ReadPosRankSum=-0.015;SC=CATTTCCTGCCGCCTGTCTTT;SOR=0.446;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=59;TCF=47;TCR=12;TR=33;WE=39448212;WS=39448194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,34:0.55:62
chr3	39448424	rs3772144	T	C	2319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=52;PP=1204;ReadPosRankSum=0.437;SC=AGGCTCGGGCTGGCGGGTTCC;SOR=0.674;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=204;TCF=96;TCR=108;TR=98;WE=39448432;WS=39448414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,113:0.50:225
chr3	39448581	rs3772143	T	G	1205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.155;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=28;PP=775;ReadPosRankSum=-0.231;SC=GCGGTGAGTCTAGGCCCAGGC;SOR=0.367;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=82;TCF=34;TCR=48;TR=52;WE=39448589;WS=39448571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,55:0.60:91
chr3	39449137	rs1803893	T	C	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.450;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.075;NF=13;NR=4;PP=213;ReadPosRankSum=-1.155;SC=TAAAGGGAAATTTTCACAATG;SOR=0.428;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=43;TCF=35;TCR=8;TR=17;WE=39449145;WS=39449127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,17:0.39:44
chr3	39450065	rs3772138	C	T	2062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=48;PP=1264;ReadPosRankSum=1.129;SC=ACAGCCAGGTCAAGTGTTACA;SOR=0.681;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=224;TCF=115;TCR=109;TR=96;WE=39450073;WS=39450055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,105:0.42:250
chr3	39450276	rs34149164	C	CAT	1307.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.263;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=614;ReadPosRankSum=1.254;SC=CATTGTGAGACATAGAAAGAC;SOR=0.273;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=14;WE=39450284;WS=39450266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,34:0.64:53
chr3	39450362	rs34211462	G	A	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=56;ReadPosRankSum=-0.842;SC=GGTGGAGTCCGGCGTATTACG;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=4;WE=39450370;WS=39450352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr3	39452106	rs2077798	A	G	821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.837;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=1;PP=615;ReadPosRankSum=-0.030;SC=GAAGTAAGAGAGGTTAAGGAA;SOR=2.617;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=67;TCF=57;TCR=10;TR=30;WE=39452114;WS=39452096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,32:0.46:69
chr3	39452123	rs2077797	G	A	2176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.26;ReadPosRankSum=0.942;SOR=0.525;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,56:0.50:113
chr3	39452129	rs2077799	G	T	2340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=3.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.58;ReadPosRankSum=0.662;SOR=0.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,64:0.51:126
chr3	39452772	rs1392192	A	G	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.646;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=18;PP=338;ReadPosRankSum=-1.413;SC=GCCTTTGTCCATGTTTCTTGC;SOR=1.264;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=70;TCF=29;TCR=41;TR=27;WE=39452780;WS=39452762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,29:0.37:78
chr3	39453160	rs2269350	G	A	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.365;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.709;NF=22;NR=3;PP=452;ReadPosRankSum=0.153;SC=CAGTGGGTTTGATGTGGTGGA;SOR=1.956;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=50;TCF=42;TCR=8;TR=25;WE=39453168;WS=39453150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,25:0.47:53
chr3	39453610	rs2723	C	T	829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.455;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=13;PP=458;ReadPosRankSum=0.540;SC=CAGTTTTATTCTAACTTTAAT;SOR=1.015;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=110;TCF=68;TCR=42;TR=39;WE=39453618;WS=39453600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,44:0.36:122
chr3	39554786	rs2233204	C	T	914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=2;PP=768;SC=TCAAAATCCACAATTATACTA;SOR=4.548;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=31;WE=39554794;WS=39554776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr3	40231883	rs1317317	C	T	5011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=83;PP=2965;SC=AAGAGCCCGACTGGGCTCAGA;SOR=0.749;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=171;TCF=88;TCR=83;TR=171;WE=40231891;WS=40231873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr3	40286017	rs4618168	T	C	4344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=76;PP=2279;SC=GCATCCACAGTGGCACTGATG;SOR=0.931;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=146;TCF=70;TCR=76;TR=145;WE=40286025;WS=40286007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr3	40351484	rs11709089	C	T	6429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=102;NR=124;PP=2965;SC=GTCGCCGCCGCCTCCCTCCCT;SOR=0.917;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=227;TCF=102;TCR=125;TR=226;WE=40351492;WS=40351474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr3	40352884	rs1454492	C	T	1106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=4;PP=840;SC=ACTGAAATGGCTAATTCTGTT;SOR=3.912;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=31;TCR=4;TR=35;WE=40352892;WS=40352874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr3	40353259	rs1470937	T	G	149.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=5;PP=126;SC=GATCATTTCTTTATATACACA;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=40353267;WS=40353249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	40353425	rs34544743	CAG	C	2211.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=14;PP=952;SC=TTATATTTCTCAGAGTTATTT;SOR=0.952;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=20;WE=40353434;WS=40353415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr3	40435890	rs72861689	A	G	3191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=32;PP=2139;SC=TGGGATTATAAGCATGAGCCA;SOR=1.466;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=70;TCR=32;TR=102;WE=40435898;WS=40435880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr3	40442280	rs9875245	G	T	551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=0;PP=464;SC=TTCCCTAAGCGAAGCAGTGTG;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=40442288;WS=40442270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	40442574	rs112091498	AGAGGTCC	A	768.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=477;SC=GGAGGCCTGGAGAGGTCCTGA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=40442588;WS=40442564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr3	40468896	rs1047855	C	T	7132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=125;NR=116;PP=2965;ReadPosRankSum=1.062;SC=TTCTTCACAGCGGCAGCCTTG;SOR=0.701;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=243;TCF=126;TCR=117;TR=241;WE=40468904;WS=40468886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,265:0.99:267
chr3	40498720	rs17524303	TACGC	T	1495.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=4;PP=1066;SC=AGCGCGTGCGTACGCACGCAC;SOR=3.026;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=21;WE=40498731;WS=40498710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr3	40498933	rs4973904	A	G	2482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=43;NR=39;PP=1413;SC=CTGAGGCGCCAAACGGCTCCC;SOR=0.804;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=43;TCR=39;TR=82;WE=40498941;WS=40498923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr3	40503506	rs148931839	C	T	2187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=43;NR=27;PP=1296;SC=AAAAAAGCACCTGGTACTAAG;SOR=1.031;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=43;TCR=27;TR=70;WE=40503528;WS=40503496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr3	40503520	.	A	ACTGCTG	3026.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-1.638;ClippingRankSum=0.000;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.711;NF=2;NR=21;PP=1473;ReadPosRankSum=-0.408;SC=TACTAAGGGTACTGCTGCTGC;SOR=0.260;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=42;TCF=10;TCR=32;TR=23;WE=40503528;WS=40503496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,70:0.99:71
chr3	40505886	rs11129881	C	G	1887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=14;PP=1352;SC=TGGATGATTTCGGATTACCTG;SOR=2.340;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=46;TCR=14;TR=60;WE=40505894;WS=40505876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr3	40519429	rs4553952	T	C	1477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=31;NR=16;PP=826;SC=TCTTACTTTTTCAAACCTAGA;SOR=1.009;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=31;TCR=16;TR=47;WE=40519437;WS=40519419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr3	40519532	rs4128740	C	A	1440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=24;NR=17;PP=618;SC=ATACTCAGAACAGATATGGAA;SOR=0.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=24;TCR=17;TR=41;WE=40519540;WS=40519522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr3	40557305	.	GT	G	68.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.984;ClippingRankSum=0.000;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=8.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.02;ReadPosRankSum=1.812;SOR=0.066;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,7:0.21:34
chr3	40557307	.	GT	G	304.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.410;ClippingRankSum=0.000;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=7.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.83;ReadPosRankSum=-0.609;SOR=0.055;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr3	40557309	rs58487114	GT	G	538.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=13.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.45;ReadPosRankSum=-1.313;SOR=4.332;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr3	40557311	rs56754874	GA	G	209.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=8.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.77;ReadPosRankSum=-0.243;SOR=3.334;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr3	40557312	.	A	G	1517	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MMLQ=24;MQ=59.97;NF=49;NR=31;PP=1517;QD=19.3971401568;SC=TGTGTGTGTGATATCAGGGAC;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=81;TCF=50;TCR=31;TR=80;WE=40557320;WS=40557302;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,80:0.99:81
chr3	41274764	rs2691680	C	A	504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=0;PP=363;SC=AAGGCTAGAACAGATATTTAG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=41274772;WS=41274754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	41497165	rs9841301	G	A	1117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.503;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=28;PP=607;ReadPosRankSum=-0.124;SC=CCACTCCATCGGGCAGACACA;SOR=1.325;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=92;TCF=36;TCR=56;TR=42;WE=41497173;WS=41497155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,51:0.49:104
chr3	41607701	rs1565957	C	G	1411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=34;PP=1022;SC=CAAATGATGTCCACTGCTTCA;SOR=1.911;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=14;TCR=34;TR=48;WE=41607709;WS=41607691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr3	41723090	rs188590896	C	T	1675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=32;PP=1026;ReadPosRankSum=0.330;SC=TCCTGGTTCACGAGTAGAGAT;SOR=0.702;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=129;TCF=70;TCR=59;TR=71;WE=41723098;WS=41723080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,80:0.59:136
chr3	41756965	rs61744388	C	T	1909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.245;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=15;PP=507;ReadPosRankSum=0.123;SC=TGAAGCACTACAGGCATCAGG;SOR=0.955;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=131;TCF=84;TCR=47;TR=47;WE=41756973;WS=41756955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,53:0.37:144
chr3	41756986	rs61744385	A	T	2363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.900;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=25;PP=797;ReadPosRankSum=-0.560;SC=GGGAGACACAACTTCAGCTGT;SOR=0.873;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=160;TCF=97;TCR=63;TR=67;WE=41756994;WS=41756976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,76:0.43:176
chr3	41759191	rs17060938	T	C	1753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FS=1.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.76;ReadPosRankSum=-0.101;SOR=0.608;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:132,94:0.42:226
chr3	41795841	rs9867627	A	C	1430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.272;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=36;PP=860;ReadPosRankSum=-0.437;SC=AAACCATCAGAGAAAATCTTA;SOR=0.820;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=140;TCF=70;TCR=70;TR=68;WE=41795849;WS=41795831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,71:0.47:152
chr3	41831203	rs17215589	C	T	1847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=37;PP=1026;ReadPosRankSum=-0.060;SC=AACATGGCAGCGAATAAGGTC;SOR=0.715;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=164;TCF=88;TCR=76;TR=82;WE=41831211;WS=41831193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,91:0.50:183
chr3	41831290	rs77615850	C	T	1903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=46;PP=976;ReadPosRankSum=0.010;SC=TTTTCAATAACATTCTGGAAG;SOR=0.663;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=179;TCF=84;TCR=95;TR=88;WE=41831298;WS=41831280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,99:0.49:202
chr3	41841716	rs4973986	A	C	818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.675;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=23;PP=529;ReadPosRankSum=2.677;SC=AAGCCCTGGGACTGAGCAGAA;SOR=0.576;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=129;TCF=62;TCR=67;TR=45;WE=41841724;WS=41841706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,45:0.32:139
chr3	41841811	rs149544106	T	TATTA	270.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.149;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=245;ReadPosRankSum=1.028;SC=ATTAAAATAATATTAGTGTGA;SOR=0.026;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=6;WE=41841819;WS=41841801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,9:0.28:32
chr3	41861013	rs59543183	GA	G	1855.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FS=0.630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.45;ReadPosRankSum=-0.115;SOR=0.800;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,87:0.58:149
chr3	41877414	rs3774372	T	C	1826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.146;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=50;PP=1203;ReadPosRankSum=-1.568;SC=CTGTTTTAATTTGCTGTTCCT;SOR=0.825;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=182;TCF=79;TCR=103;TR=88;WE=41877422;WS=41877404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,90:0.48:187
chr3	41923513	rs59960840	GAGGCC	GGGCC,G	334.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.944;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=636;ReadPosRankSum=-0.299;SC=CCAGTAGAATGAGGCCATCAC;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=9;WE=41923527;WS=41923503;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.38:26
chr3	41923515	rs61575884	GGCCA	G	331.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=2.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.29;ReadPosRankSum=-0.884;SOR=1.659;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr3	41923519	.	A	G	644	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=9;NR=0;PP=644;QD=75.4190236164;SC=GAATGAGGCCATCACATCACC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=9;WE=41923527;WS=41923503;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr3	41925260	rs113374533	CAGAGAAAAAACAAGTGA	C	322.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=1701;ReadPosRankSum=1.542;SC=CACAATCCCACAGAGAAAAAA;SOR=0.346;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=3;WE=41925284;WS=41925257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr3	41925301	rs1716685	T	C	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=66;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=249;ReadPosRankSum=-0.232;SC=CTGCAGGTTCTAAATTACAGA;SOR=0.997;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=14;WE=41925309;WS=41925291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr3	41925398	rs1052501	C	T	2451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.903;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=42;PP=1329;ReadPosRankSum=0.935;SC=TGGAGCTCAGCTGTGTGCGAA;SOR=0.533;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=210;TCF=127;TCR=83;TR=105;WE=41925406;WS=41925388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,122:0.52:235
chr3	41925423	rs1716687	T	C	7462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=136;NR=109;PP=2965;SC=GTAAACCAATTACGTGAGCAA;SOR=0.752;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=246;TCF=136;TCR=110;TR=245;WE=41925431;WS=41925413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,276:1.00:276
chr3	41937000	rs1717003	C	T	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=136;ReadPosRankSum=1.477;SC=AAAATATAAACGTTACTTACA;SOR=1.022;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=9;WE=41937008;WS=41936990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr3	41938500	rs1717005	G	C	3177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=44;NR=55;PP=1803;SC=TATCCACTGCGATGGAAAGAA;SOR=1.149;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=44;TCR=55;TR=99;WE=41938508;WS=41938490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr3	41939993	rs1625226	T	A	2551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FS=4.124;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.78;ReadPosRankSum=0.235;SOR=1.062;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:13,116:0.90:129
chr3	41942199	rs1717007	T	C	2650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.847;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=58;PP=1671;ReadPosRankSum=-2.363;SC=ACTCAGTTGTTAGAGTGTCTT;SOR=0.534;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=265;TCF=145;TCR=120;TR=121;WE=41942207;WS=41942186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,133:0.45:295
chr3	41949301	rs59146151	T	C	1019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=13;PP=629;ReadPosRankSum=-1.818;SC=AGCTTCTACATCTTATGTAGG;SOR=0.743;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=82;TCF=53;TCR=29;TR=40;WE=41949309;WS=41949291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,47:0.49:95
chr3	41952781	rs1716991	C	T	5018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=67;PP=2965;SC=TTGTCTTGCACTGATCCCTCT;SOR=1.172;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=170;TCF=102;TCR=68;TR=169;WE=41952789;WS=41952771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr3	41952852	rs35263917	T	C	3194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.401;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=68;PP=2030;ReadPosRankSum=-0.305;SC=TCAAGAGTACTCTTAGGCCGA;SOR=0.672;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=293;TCF=151;TCR=142;TR=143;WE=41952860;WS=41952842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,157:0.48:326
chr3	41957466	rs1716698	T	G	869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.508;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=17;PP=516;ReadPosRankSum=0.985;SC=CTACTGTCCCTACCTTTTCTG;SOR=0.804;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=113;TCF=59;TCR=54;TR=43;WE=41957474;WS=41957456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,47:0.39:121
chr3	41960006	rs1716975	T	C	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.26;ReadPosRankSum=1.247;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,28:0.61:46
chr3	41961168	rs1716979	T	C	751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.239;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=8;PP=589;ReadPosRankSum=0.336;SC=ACCTGGTTTTTAGTCCAGCTC;SOR=1.127;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=67;TCF=49;TCR=18;TR=33;WE=41961176;WS=41961158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,33:0.47:70
chr3	41977214	rs3934103	C	T	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=57;ReadPosRankSum=-1.668;SC=AAATTTTATCCAAAAATAACA;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=41977222;WS=41977204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr3	41977464	rs73071203	A	C	2811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.911;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-1.965;NF=58;NR=68;PP=1828;ReadPosRankSum=-1.341;SC=CACCCATTTCAACCCCCTACC;SOR=0.620;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=248;TCF=114;TCR=134;TR=126;WE=41977472;WS=41977454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,138:0.49:282
chr3	41977488	rs58069203	CCT	C	4277.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.320;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=2.018;NF=2;NR=55;PP=2348;ReadPosRankSum=0.498;SC=ACAGAGTGCCCCTGAGAGGTT;SOR=0.892;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=119;TCF=5;TCR=114;TR=57;WE=41977497;WS=41977478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,113:0.50:226
chr3	41978640	rs146197255	AG	A	1496.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.779;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=12;PP=1186;ReadPosRankSum=-0.386;SC=GATGAAGGGAAGAGGTATTTG;SOR=0.845;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=77;TCF=46;TCR=31;TR=32;WE=41978648;WS=41978630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,46:0.43:108
chr3	41978738	rs73071208	A	T	2501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.119;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=55;PP=1362;ReadPosRankSum=-1.422;SC=CAGAGATCAGAAACAACAGCT;SOR=0.564;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=232;TCF=114;TCR=118;TR=112;WE=41978746;WS=41978728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,124:0.49:251
chr3	41996136	rs2272007	T	C	4273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=466;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=91;PP=2551;ReadPosRankSum=-0.016;SC=TTCAGGCCTTTTGCACTTATC;SOR=0.714;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=419;TCF=209;TCR=210;TR=184;WE=41996144;WS=41996126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:253,213:0.46:466
chr3	41996275	rs7651623	A	G	4151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=83;PP=2662;ReadPosRankSum=-0.775;SC=TCTCACATACAATAGAATAAC;SOR=0.527;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=135;TCF=51;TCR=84;TR=134;WE=41996283;WS=41996265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,150:0.99:151
chr3	41996304	rs17284472	G	A	910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.266;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=29;PP=659;ReadPosRankSum=0.848;SC=TAGCTCCTAAGAAGTAAACAA;SOR=1.136;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=75;TCF=18;TCR=57;TR=36;WE=41996312;WS=41996294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,38:0.47:81
chr3	42202061	rs4974003	G	T	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=1.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.77;ReadPosRankSum=-3.210;SOR=1.219;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,7:0.13:54
chr3	42218095	rs1010987	G	C	385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=341;ReadPosRankSum=0.254;SC=CAGGGGTTACGAGTCCCCCTA;SOR=1.721;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=15;WE=42218103;WS=42218085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr3	42226151	rs4234445	T	C	1966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.298;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=38;PP=1257;ReadPosRankSum=-0.336;SC=CTTTTGAATCTCTGTTCTCCC;SOR=0.818;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=201;TCF=111;TCR=90;TR=88;WE=42226159;WS=42226141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,97:0.43:223
chr3	42230395	rs3816396	C	T	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=176;ReadPosRankSum=0.369;SC=TTGGGAGAGCCGTCTGGTGGG;SOR=0.223;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=10;WE=42230403;WS=42230385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr3	42230743	rs2290135	G	A	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.623;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=42;ReadPosRankSum=-1.434;SC=TGTACCAGGCGCTCGGCAGAT;SOR=0.061;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=6;WE=42230751;WS=42230733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr3	42234740	rs2290137	G	A	2250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.481;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=55;PP=1343;ReadPosRankSum=0.876;SC=CAATGGCCATGCTGAGACGGG;SOR=0.731;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=208;TCF=102;TCR=106;TR=106;WE=42234748;WS=42234730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,113:0.50:228
chr3	42236415	rs9851455	A	G	2103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.604;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=43;PP=1247;ReadPosRankSum=0.900;SC=GCTACCACTCACTGGGCCTGT;SOR=0.763;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=208;TCF=111;TCR=97;TR=95;WE=42236423;WS=42236405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,105:0.46:229
chr3	42242687	rs9846541	G	A	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.782;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=85;ReadPosRankSum=0.526;SC=GTGGTGGCTCGCGCCTATAAT;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=6;WE=42242695;WS=42242677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr3	42244321	rs9311309	G	A	2364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.387;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=46;PP=1407;ReadPosRankSum=-0.567;SC=TGCGGAAGGCGGGGCACCTCT;SOR=0.679;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=211;TCF=110;TCR=101;TR=105;WE=42244329;WS=42244311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,116:0.49:237
chr3	42251577	rs10634555	C	CGGA	2492.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.127;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=1.193;NF=12;NR=25;PP=1405;ReadPosRankSum=1.340;SC=CCAGCGGCCACGGAGGAGGAG;SOR=0.316;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=113;TCF=41;TCR=72;TR=37;WE=42251587;WS=42251567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,68:0.59:115
chr3	42264393	rs3733053	A	G	1453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.421;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=21;PP=772;ReadPosRankSum=-0.899;SC=TCTGGAGCTCATGGGCATTTC;SOR=0.202;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=86;TCF=61;TCR=25;TR=58;WE=42264401;WS=42264383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,69:0.68:101
chr3	42264422	rs3733054	T	C	2359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.558;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=38;PP=1452;ReadPosRankSum=1.780;SC=AACCTGTCATTTCTTCTTTCA;SOR=0.298;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=150;TCF=98;TCR=52;TR=93;WE=42264430;WS=42264412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,105:0.62:168
chr3	42265270	rs3836498	TCTC	T	1492.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.314;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.830;NF=2;NR=23;PP=1031;ReadPosRankSum=-1.166;SC=AGACCCACGTTCTCCTCTCTT;SOR=1.126;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=61;TCF=3;TCR=58;TR=25;WE=42265280;WS=42265260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,41:0.48:85
chr3	42265634	rs1043610	C	T	1603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.576;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=39;PP=1018;ReadPosRankSum=0.291;SC=CGAGCTGTCACGCGGCACGGG;SOR=0.607;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=146;TCF=66;TCR=80;TR=71;WE=42265642;WS=42265624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,79:0.47:167
chr3	42299870	rs8192472	C	T	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.273;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.392;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=143;ReadPosRankSum=0.451;SC=AGTAGTGGAACTGATGGACCA;SOR=0.238;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=8;WE=42299878;WS=42299860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr3	42304784	rs1868522	A	G	3024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.874;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=64;PP=1904;ReadPosRankSum=0.752;SC=GGACCGCCAGAAATCATGTTG;SOR=0.648;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=275;TCF=139;TCR=136;TR=131;WE=42304792;WS=42304774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,143:0.47:302
chr3	42305131	rs754635	C	G	1295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=22;PP=617;SC=ATGGCTGTAGCGAGCAAAGGA;SOR=1.562;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=13;TCR=22;TR=35;WE=42305139;WS=42305121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr3	42438754	rs13054	T	C	6050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=108;PP=2965;SC=GCCATGCAGGTGGCTACAGCT;SOR=0.932;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=206;TCF=98;TCR=108;TR=206;WE=42438762;WS=42438744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr3	42448296	rs33518	T	C	6395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=118;NR=91;PP=2965;SC=CACAGCACCATAGCCTCCAGT;SOR=0.896;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=210;TCF=118;TCR=92;TR=209;WE=42448304;WS=42448286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
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chr3	42544319	.	C	G	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.785;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=2.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.34;ReadPosRankSum=-0.472;SOR=1.284;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
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chr3	42568929	rs2229722	T	C	2146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.722;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=58;PP=1135;ReadPosRankSum=0.138;SC=GCTACACCATTGGCTACGGCC;SOR=1.032;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=190;TCF=83;TCR=107;TR=98;WE=42568937;WS=42568919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,109:0.50:218
chr3	42569069	rs2276831	C	A	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.831;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5008;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=117;ReadPosRankSum=-1.352;SC=GTGGCCCAGGCGTGCCCCGAC;SOR=1.802;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=6;WE=42569077;WS=42569059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr3	42599049	.	TA	T	143.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.536;ClippingRankSum=0.000;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.18;MQRankSum=1.733;QD=2.66;ReadPosRankSum=2.238;SOR=0.779;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,17:0.31:54
chr3	42610297	rs62248845	T	C	737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.572;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=3;PP=465;ReadPosRankSum=-0.979;SC=TATCACTACATGTAGTTAAAA;SOR=0.460;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=45;TCF=40;TCR=5;TR=28;WE=42610305;WS=42610287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,30:0.62:48
chr3	42687278	rs73085333	C	T	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=214;ReadPosRankSum=0.801;SC=CTTGAAAACACTATTGATGTT;SOR=0.446;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=11;WE=42687286;WS=42687268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr3	42728144	rs6805421	A	G	2447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.805;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=44;PP=1357;ReadPosRankSum=0.392;SC=TCCCTCTCCAACCAGGTCCCC;SOR=0.888;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=222;TCF=124;TCR=98;TR=105;WE=42728152;WS=42728134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,116:0.47:248
chr3	42728214	rs147863385	C	T	2154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.292;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=54;PP=1304;ReadPosRankSum=0.329;SC=GAGGCCTCTTCTACAACGAAG;SOR=0.879;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=195;TCF=89;TCR=106;TR=93;WE=42728222;WS=42728204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,105:0.47:224
chr3	42733468	rs123509	T	C	4232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=83;PP=2303;SC=CAATGTGCTGTGCCTGACTAA;SOR=1.063;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=150;TCF=66;TCR=84;TR=149;WE=42733476;WS=42733458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr3	42735150	rs11079	T	C	5363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=103;NR=76;PP=2965;SC=AGTTTTTGCATCCAGAGCTCA;SOR=0.847;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=179;TCF=103;TCR=76;TR=179;WE=42735158;WS=42735140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr3	42735274	rs339697	A	G	1338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=30;PP=884;SC=CTGGGATCACAGCGGAATGCT;SOR=2.059;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=11;TCR=30;TR=41;WE=42735282;WS=42735264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr3	42738297	rs2290973	G	A	3019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=34;PP=1813;SC=ACACCTGGCAGGATGGCTGTG;SOR=1.200;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=63;TCR=34;TR=97;WE=42738305;WS=42738287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr3	42740696	rs188722087	C	T	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=22;PP=463;ReadPosRankSum=-0.096;SC=GGGGACAGGACGAGCTGGAAC;SOR=0.624;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=59;TCF=13;TCR=46;TR=28;WE=42740704;WS=42740686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,27:0.45:60
chr3	42799554	rs111697736	TAC	TACAC,T	245.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.525;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=116;ReadPosRankSum=0.084;SC=GCTCCGGTGGTACACACACAC;SOR=0.446;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=16;TCF=8;TCR=8;TR=7;WE=42799565;WS=42799544;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.44:18
chr3	42799858	rs339678	T	A	588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=15;PP=439;SC=GCATCAGAAATGAAGCCTCAG;SOR=1.828;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=21;WE=42799866;WS=42799848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	42835889	rs6764909	A	G	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.670;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=380;ReadPosRankSum=-0.466;SC=CCATAATCCTAAAGTTAAAAA;SOR=0.379;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=22;WE=42835897;WS=42835879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,23:0.61:38
chr3	42915878	rs735320	C	T	4196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=89;NR=53;PP=2295;SC=CCCAGCGCTGCGGGTCAACAT;SOR=1.122;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=142;TCF=89;TCR=53;TR=142;WE=42915886;WS=42915868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr3	42917047	rs9865715	A	G	8108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=154;NR=134;PP=2965;SC=TTGAGGATGGAGCCAAAGGAG;SOR=0.746;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=288;TCF=154;TCR=134;TR=288;WE=42917055;WS=42917037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,306:1.00:306
chr3	42947776	rs6789928	T	C	138.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.14;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	42947793	rs9832875	C	T	133.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=1;PP=49;SC=ACCCCAACAGCCTCTGGTCCG;SOR=1.329;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=42947801;WS=42947783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	42950181	rs7617715	C	T	836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=1;PP=638;SC=TAGTTATTTCCGTTTTTTTCC;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=24;WE=42950189;WS=42950171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	42956273	rs1427801	T	C	3727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=65;PP=1968;SC=CACATTGCATTGCACATCAGA;SOR=1.032;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=56;TCR=65;TR=121;WE=42956281;WS=42956263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr3	43021007	rs6773223	C	G	244.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=1;PP=171;SC=GAAACCCGCCCCAGCCGAGTA;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=43021015;WS=43020997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	43021088	rs6763762	G	A	1290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=34;NR=7;PP=821;SC=ATGAGTCTGCGAGCCGGCTGA;SOR=2.110;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=41;WE=43021096;WS=43021078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr3	43021383	rs6775999	C	T	483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=15;PP=388;SC=TACTAATCTGCACTCCTTGAC;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=43021391;WS=43021373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	43074871	rs588335	A	G	5275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=100;NR=85;PP=2965;SC=TCTGGTGGGCACCCGATGTGC;SOR=0.764;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=185;TCF=100;TCR=85;TR=185;WE=43074879;WS=43074861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr3	43095101	rs536119	A	G	6469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=127;NR=99;PP=2965;SC=GAGAAATGCCAGAACCCAGCC;SOR=0.759;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=226;TCF=127;TCR=99;TR=226;WE=43095109;WS=43095091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr3	43121559	rs604033	C	T	8151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=150;NR=128;PP=2965;SC=GAATGAGGGACGGGATGTCCA;SOR=0.789;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=278;TCF=150;TCR=128;TR=278;WE=43121567;WS=43121549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,304:1.00:304
chr3	43122966	rs2936818	G	A	1254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=28;PP=748;ReadPosRankSum=0.598;SC=CGGCCACTGGGAAGCACCACA;SOR=0.729;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=39;TCR=46;TR=52;WE=43122974;WS=43122956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,57:0.62:92
chr3	43414318	rs6441771	A	G	2920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=37;PP=1599;SC=CGTGGAAGAGAGACCAGCTTG;SOR=0.956;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=60;TCR=37;TR=97;WE=43414326;WS=43414308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr3	43591142	rs12638282	G	A	1207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=0;PP=755;SC=GACAGCCCGAGACAGCACTGC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=29;WE=43591150;WS=43591132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr3	43592906	rs9829081	T	C	4126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=36;PP=2748;SC=AATTTACATATAATAAACTGC;SOR=2.014;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=132;TCF=96;TCR=36;TR=132;WE=43592914;WS=43592896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr3	43602803	rs3772165	C	T	5429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=83;PP=2965;SC=CCTCTTCACCCGCACACCATG;SOR=0.703;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=172;TCF=89;TCR=83;TR=172;WE=43602811;WS=43602793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr3	43607136	rs7616708	T	C	376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.16;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	43642126	rs6441785	C	A	1956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=49;PP=1375;SC=AGTTTCAAAACTAAAAACTTT;SOR=1.745;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=21;TCR=49;TR=70;WE=43642134;WS=43642116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr3	43756577	rs10662733	C	CTG,CTGTG	1116.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FS=1.334;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.52;MQRankSum=1.084;QD=18.61;ReadPosRankSum=0.961;SOR=1.135;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:12,27,21:0.45,0.35:60
chr3	44283525	rs9850927	A	G	356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=2;PP=280;SC=GAGGGGCCCCAGCGGGCCGGC;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=44283533;WS=44283515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	44283672	rs9833423	T	C	3118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=61;NR=40;PP=1553;SC=GGCCGGGGGGTGCCGGGAAAA;SOR=0.960;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=62;TCR=40;TR=101;WE=44283680;WS=44283662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr3	44283808	rs7645375	C	A	4904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=72;PP=2795;SC=CGCAGGGGCCCGGTGAGCCCG;SOR=0.704;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=155;TCF=83;TCR=72;TR=155;WE=44283816;WS=44283798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr3	44284584	rs9284879	G	A	2984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=49;PP=1701;SC=AAATATTAAGGTTGAATTCCA;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=43;TCR=49;TR=92;WE=44284592;WS=44284574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr3	44296403	rs4682960	T	C	1552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=12;PP=834;SC=TTTAGAGAAGTGGATAGTTCT;SOR=2.024;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=36;TCR=12;TR=48;WE=44296411;WS=44296393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr3	44310592	rs5004668	T	C	148.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=124;SC=GTGAACTGAATATGAATATTT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=44310600;WS=44310582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	44329394	rs11294162	TG	T	2634.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=37;PP=1211;SC=ATTGTTTCCATGGGGGGGTAC;SOR=0.947;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=48;TCF=7;TCR=41;TR=44;WE=44329402;WS=44329384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr3	44332176	rs1488637	T	C	3917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=44;PP=2516;SC=CTTCTTCCATTAGTGTCTTAG;SOR=1.340;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=82;TCR=44;TR=126;WE=44332184;WS=44332166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr3	44362408	rs9857957	G	A	36.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr3	44399668	rs4682970	T	C	1229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=3;PP=1172;SC=CTTGAGACCTTTATTATCATG;SOR=5.186;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=64;TCF=51;TCR=13;TR=54;WE=44399676;WS=44399658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	44399693	.	CT	C	220.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=0.000;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=8.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.18;MQRankSum=1.572;QD=3.87;ReadPosRankSum=0.250;SOR=0.123;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,17:0.30:57
chr3	44408864	rs372993721	G	GT	511.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=2;PP=495;SC=GTAATAGAATGTTTAAAAGAT;SOR=2.712;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=13;WE=44408872;WS=44408854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	44437870	rs6441838	A	C	2936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=51;PP=1611;SC=TGTTAACATGAGTGTGTGCTC;SOR=0.749;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=52;TCR=52;TR=102;WE=44437878;WS=44437860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr3	44540791	rs36046723	TTC	T	7575.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=84;PP=2969;SC=CATAAGGTTTTTCTCTCCAGT;SOR=0.737;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=31;TCR=96;TR=111;WE=44540800;WS=44540781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr3	44599103	rs2293600	T	G	505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=13;PP=359;SC=AGAGGGAAAATAGTTTTGTGC;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=16;WE=44599111;WS=44599093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	44612050	rs9873604	C	T	6959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=122;NR=104;PP=2965;SC=TCCCGACTCACTGACCACCAG;SOR=0.748;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=226;TCF=122;TCR=104;TR=226;WE=44612058;WS=44612040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,259:1.00:259
chr3	44635461	rs13319803	G	A	2168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=21;PP=1274;SC=CCTTCCTCTGGTACAGAGAAT;SOR=1.771;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=70;TCF=48;TCR=22;TR=69;WE=44635469;WS=44635451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr3	44692564	rs2272044	C	G	1013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=1;PP=761;SC=GAGAAGATGACTGCAGAATTG;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=27;WE=44692572;WS=44692557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr3	44763037	rs7640654	A	C	1349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=23;PP=952;SC=AAATGCAATGAATGTGGGAAT;SOR=0.874;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=21;TCR=23;TR=44;WE=44763045;WS=44763027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr3	44775962	rs4682752	A	G	5812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=124;NR=79;PP=2965;SC=GAGAGTTAACATGCAGAAGAA;SOR=1.002;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=203;TCF=124;TCR=79;TR=203;WE=44775970;WS=44775952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr3	44803108	rs56236286	AAAGACAG	A	15080.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=377;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQ=60.03;NF=18;NR=136;PP=2974;SC=AGCTCTGGGTAAAGACAGAAG;SOR=0.887;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=180;TCF=20;TCR=160;TR=154;WE=44803122;WS=44803098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,336:1.00:336
chr3	44816952	rs10574346	CTT	C	525.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.65;MQRankSum=0.485;QD=29.21;ReadPosRankSum=-0.193;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,17:0.94:18
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chr3	44827793	rs7642843	T	C	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=0;PP=574;SC=ATAGGAAATTTACATCTTGTG;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=44827801;WS=44827783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	44840612	rs5848711	A	AT	1307.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=2;PP=1281;SC=GTCTTTGGAGATATAGAACTG;SOR=4.921;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=29;WE=44840620;WS=44840602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr3	44854563	rs3762636	A	G	3372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.757;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=43;PP=2151;ReadPosRankSum=-0.777;SC=CTTTTTTCCCAAAGCTTTTCT;SOR=0.784;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=121;TCF=77;TCR=44;TR=119;WE=44854571;WS=44854553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,132:0.99:133
chr3	44869026	rs4682999	A	T	5904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=112;PP=2965;SC=AGCAGGTAAAATTCCTGTTAC;SOR=1.096;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=191;TCF=79;TCR=112;TR=191;WE=44869034;WS=44869016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr3	44882784	rs6766221	C	T	238.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=211;SC=GACCAAGTCTCGCTATGTTGC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=44882792;WS=44882774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	44884647	rs3804583	C	A	6343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=110;NR=92;PP=2965;SC=AAACCTACGCCTGGAAAGTCA;SOR=0.755;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=202;TCF=110;TCR=92;TR=202;WE=44884655;WS=44884637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr3	44906746	rs10429	A	G	2084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=48;PP=1350;SC=GTGGGACTGTATCCTAGGGCG;SOR=1.329;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=29;TCR=48;TR=77;WE=44906754;WS=44906736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr3	44929287	rs2271087	G	C	7987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=147;NR=124;PP=2965;SC=CTGGCAAAGAGGTGAGCACCC;SOR=0.866;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=272;TCF=147;TCR=125;TR=271;WE=44929295;WS=44929277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,298:1.00:298
chr3	44932270	rs937837	C	T	3601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=71;PP=2080;SC=GTGACCCCGGCAAAACCTGCT;SOR=1.318;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=121;TCF=50;TCR=71;TR=120;WE=44932278;WS=44932260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr3	44935019	rs62242575	C	T	596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=15;NR=5;PP=361;SC=CAAGCCTGCTCCTGTCCCAGG;SOR=1.931;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=20;WE=44935027;WS=44935009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	44943069	rs1995640	C	T	5673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=114;NR=74;PP=2965;SC=CTGGGGACTACGAAGGTGGCA;SOR=1.008;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=188;TCF=114;TCR=74;TR=188;WE=44943077;WS=44943059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr3	44943389	rs1995641	G	A	4840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=74;PP=2774;SC=TGAGAATGGCGAGAAAATCAC;SOR=0.704;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=160;TCF=85;TCR=75;TR=159;WE=44943397;WS=44943379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr3	44948479	rs3749195	C	T	2780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=25;PP=1690;SC=GACCGCCATCCGCAAAGGTGA;SOR=1.562;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=66;TCR=25;TR=91;WE=44948487;WS=44948469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr3	44948590	rs9876921	G	A	6619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=125;NR=107;PP=2965;SC=GGAGTTACACGTAATTTCAAT;SOR=0.701;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=232;TCF=125;TCR=107;TR=232;WE=44948598;WS=44948580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr3	44948770	rs4622937	G	A	1153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=22;PP=597;SC=TTGGGGGTGGGCCTGGGCAAC;SOR=1.556;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=40;TCF=14;TCR=26;TR=36;WE=44948778;WS=44948760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr3	44952407	rs1520082	G	C	1901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=16;PP=1309;SC=TACTGGGGGGGTATGATGAAT;SOR=1.911;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=45;TCR=16;TR=61;WE=44952415;WS=44952397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr3	44952942	rs6777798	A	C	478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=12;PP=332;SC=TTCTGGACATATATCTTGCAC;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=44952950;WS=44952932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	45017904	rs6441873	AG	TT	8193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=74;PP=2947;SC=TGGGTTTGCCAGTGAGGAGGC;SOR=0.807;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=152;TCF=74;TCR=78;TR=147;WE=45017913;WS=45017894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr3	45049186	rs11130040	A	G	205.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=7;PP=166;SC=AAACTTGGAGATTTGGGAACA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=45049194;WS=45049176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	45052775	rs6794	G	C	5858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=116;NR=76;PP=2965;SC=GCAGAGTGTTGTGCACAAGGA;SOR=1.102;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=192;TCF=116;TCR=76;TR=192;WE=45052783;WS=45052765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr3	45068074	rs2301282	A	G	1176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=26;PP=725;SC=TCATCTAGGGAACTTGAGTAA;SOR=1.662;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=13;TCR=26;TR=39;WE=45068082;WS=45068064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr3	45077123	rs13963	G	A	6730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=120;NR=96;PP=2965;SC=GGGCACCCTGGGCACCCCTCA;SOR=0.770;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=216;TCF=120;TCR=96;TR=216;WE=45077131;WS=45077113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr3	45077458	rs8318	G	A	678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=16;PP=443;SC=GGAGGGCAGGGGCCGCGGGAG;SOR=2.400;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=21;WE=45077466;WS=45077448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	45127515	rs9874077	T	C	5001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=80;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.693;SC=ATTGATGTTGTCATTGTAGAT;SOR=0.223;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=172;TCF=91;TCR=81;TR=170;WE=45127523;WS=45127505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,188:0.99:189
chr3	45132637	rs1879240	T	C	927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=4;PP=650;SC=TGTTCATCACTGTCCCCAAAG;SOR=2.694;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=29;WE=45132645;WS=45132627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr3	45134822	rs3749191	T	C	1468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=27;PP=644;ReadPosRankSum=0.964;SC=GGCCTCTTGTTGGAAGCTGGG;SOR=0.673;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=136;TCF=76;TCR=60;TR=61;WE=45134830;WS=45134812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,75:0.47:159
chr3	45137087	rs2037358	T	G	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=2.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=55;ReadPosRankSum=-1.219;SC=AAAACAGGCATGAAGCATGGA;SOR=0.169;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=5;WE=45137095;WS=45137077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr3	45187671	rs1863837	C	T	5316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=108;NR=65;PP=2847;SC=CACTCCACGCCATCCGCCTCC;SOR=1.219;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=174;TCF=108;TCR=66;TR=173;WE=45187679;WS=45187661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr3	45187785	rs2276862	C	G	2710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.448;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=62;PP=1655;ReadPosRankSum=-1.022;SC=GCCATGACTCCGGGACGCCTC;SOR=0.659;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=238;TCF=116;TCR=122;TR=121;WE=45187793;WS=45187775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,134:0.51:262
chr3	45267058	rs33750	G	A	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=53;ReadPosRankSum=0.446;SC=GGAGGCGGCCGGTGCGGCGAC;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=6;WE=45267066;WS=45267048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr3	45267310	rs41118	C	T	1454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=3.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.15;ReadPosRankSum=-0.034;SOR=1.121;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,43:0.45:96
chr3	45267321	rs395917	C	T	1302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.980;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=20;PP=1123;ReadPosRankSum=-0.479;SC=GCCGCCGCCGCCTCCTCCGGG;SOR=0.945;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=63;TCF=23;TCR=40;TR=29;WE=45267329;WS=45267300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,34:0.44:77
chr3	45461102	rs11383389	G	GT	6000.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=38;PP=2973;SC=TCAAAGTGTAGTTGTGTATGG;SOR=1.325;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=83;TCF=42;TCR=41;TR=78;WE=45461110;WS=45461092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr3	45500174	rs745551	C	A	1642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.82;SOR=0.960;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr3	45515648	rs11919039	T	C	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.552;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=187;ReadPosRankSum=1.117;SC=GTCCCTGCTTTTCCTACCTTA;SOR=0.362;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=12;WE=45515656;WS=45515638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,14:0.37:38
chr3	45517799	rs3733117	T	C	533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=5;PP=422;SC=CTTCTCAGCTTCTTCCAGGCA;SOR=1.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=20;WE=45517807;WS=45517789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr3	45518073	rs71645922	C	A	1897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.871;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=42;PP=1113;ReadPosRankSum=-0.343;SC=TACATGGGCACAGCTCTCTGA;SOR=0.856;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=152;TCF=73;TCR=79;TR=77;WE=45518081;WS=45518063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,89:0.51:175
chr3	45527099	rs7640603	C	G	3316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=42;PP=1985;SC=CTAGTGCTTACTTTTCTCACT;SOR=1.046;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=105;TCF=63;TCR=42;TR=105;WE=45527107;WS=45527089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr3	45527218	rs7610357	T	C	5400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=79;PP=2965;SC=TGAACATGCTTACCCAGCAGG;SOR=0.724;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=174;TCF=95;TCR=79;TR=174;WE=45527226;WS=45527208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr3	45530401	rs3733116	G	A	1213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.730;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=32;PP=657;ReadPosRankSum=0.000;SC=TCCTTCACTCGTCCCCATACC;SOR=0.451;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=92;TCF=30;TCR=62;TR=49;WE=45530409;WS=45530391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,56:0.54:104
chr3	45533224	rs2128361	G	A	4957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=76;NR=90;PP=2730;SC=CCAACATCGCGTCTTTCACTG;SOR=0.994;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=166;TCF=76;TCR=90;TR=166;WE=45533232;WS=45533214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr3	45537973	rs12638088	C	T	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=463;ReadPosRankSum=-0.268;SC=GGGGAAATGCCTGTGCAGATT;SOR=0.582;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=55;TCF=14;TCR=41;TR=29;WE=45537981;WS=45537963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,31:0.54:57
chr3	45542083	rs2306522	T	C	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.649;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=337;ReadPosRankSum=-0.441;SC=TAAGCACTTATACTGCTTTGC;SOR=0.357;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=53;TCF=13;TCR=40;TR=23;WE=45542091;WS=45542073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,25:0.42:60
chr3	45557707	rs11549809	G	A	1853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.143;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=43;PP=1059;ReadPosRankSum=0.551;SC=GGATCGACACGATTCGGCTCT;SOR=0.800;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=167;TCF=76;TCR=91;TR=78;WE=45557715;WS=45557697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,89:0.47:189
chr3	45559519	rs2170549	T	C	4718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=87;PP=2650;SC=AGGAGAAAGCTGAGGCCAGGA;SOR=0.914;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=158;TCF=71;TCR=87;TR=158;WE=45559527;WS=45559509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr3	45559621	rs2276860	C	T	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.374;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=14;PP=360;ReadPosRankSum=0.454;SC=CTTTGGGAACCTTTGCCTGTG;SOR=0.110;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=47;TCF=14;TCR=33;TR=23;WE=45559629;WS=45559611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,24:0.46:52
chr3	45565554	rs267220	A	G	4174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=71;PP=2778;SC=CCCTGATGGTAATGGCTGCTC;SOR=0.854;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=135;TCF=64;TCR=71;TR=135;WE=45565562;WS=45565544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr3	45636335	rs267238	A	G	93.90	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.65;ReadPosRankSum=-1.383;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr3	45637253	rs267237	C	T	2133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.263;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=37;PP=1230;ReadPosRankSum=1.625;SC=AGCCCAGGACCCCTTCTGTGT;SOR=0.530;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=168;TCF=89;TCR=79;TR=85;WE=45637261;WS=45637243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,99:0.51:193
chr3	45637439	rs267236	T	C	1734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=35;PP=1143;ReadPosRankSum=-0.331;SC=CGCCAGCTGGTCTGGACGGTT;SOR=0.651;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=162;TCF=85;TCR=77;TR=75;WE=45637447;WS=45637429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,82:0.47:174
chr3	45637830	rs13086458	A	G	565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.418;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=16;PP=327;ReadPosRankSum=-1.127;SC=GGGGTTCTTGAGATTGGGGAA;SOR=1.162;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=49;TCF=19;TCR=30;TR=24;WE=45637838;WS=45637820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,27:0.49:55
chr3	45677635	rs11379880	C	CT	13795.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.79;SOR=0.706;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,308:1.00:308
chr3	45677637	.	GCA	TGC	2937	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=129;NR=119;PP=2937;QD=20;SC=CTCTTGTCCTGCAAGGAGCCT;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=273;TCF=138;TCR=135;TR=248;WE=45677647;WS=45677627;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:25,248:0.91:273
chr3	45677638	rs5848762	CA	C	13852.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.57;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,304:1.00:304
chr3	45677782	rs36136468	G	A	728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.725;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=23;PP=516;ReadPosRankSum=-0.289;SC=TGGGGGATGCGTAAGGAACAT;SOR=1.347;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=54;TCF=12;TCR=42;TR=27;WE=45677790;WS=45677772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,31:0.50:62
chr3	45677815	rs10662872	G	GAGA	510.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.174;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=471;ReadPosRankSum=0.656;SC=AGGGAGGAGAGAGATCATCTT;SOR=0.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=10;WE=45677823;WS=45677805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr3	45715159	rs35737275	CT	C	264.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=212;ReadPosRankSum=-0.784;SC=AATCCCACCCCTTTTAGGAGG;SOR=0.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=8;WE=45715167;WS=45715149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
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chr3	45748429	rs2742441	G	A	3466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FS=1.140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.84;ReadPosRankSum=0.603;SOR=0.787;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,91:0.49:184
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chr3	45754487	rs2742369	C	A	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=156;ReadPosRankSum=-0.272;SC=TACAGATTTGCGGGGGAGATG;SOR=0.204;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=8;WE=45754495;WS=45754477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr3	45754685	rs2271619	A	G	1229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.507;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=32;PP=749;ReadPosRankSum=-0.254;SC=CTGCACAGCCAGAGGTAATGT;SOR=0.906;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=102;TCF=43;TCR=59;TR=51;WE=45754693;WS=45754675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,58:0.49:119
chr3	45754749	rs2248991	G	A	749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=19;PP=463;ReadPosRankSum=-0.348;SC=TTCAATGCATGCTATAAAGTG;SOR=0.562;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=44;TCF=12;TCR=32;TR=27;WE=45754757;WS=45754739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,32:0.63:51
chr3	45755636	rs6764981	G	C	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=146;ReadPosRankSum=0.582;SC=TTATAAGGCAGATTTAGAGAT;SOR=0.711;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=23;TCF=10;TCR=13;TR=11;WE=45755644;WS=45755626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr3	45761115	rs2064062	G	C	4454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=76;PP=2608;SC=GTCAGCATGGGTCATATCTGT;SOR=0.889;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=145;TCF=69;TCR=76;TR=145;WE=45761123;WS=45761105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr3	45763635	rs2673062	A	G	5484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=104;PP=2965;SC=TTGGATTATAATTTTCTGTCA;SOR=1.317;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=175;TCF=70;TCR=105;TR=174;WE=45763643;WS=45763625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr3	45764246	rs2742448	A	G	600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=0;PP=448;SC=TTGTCGGTAGATTGTATTAGT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=45764254;WS=45764236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	45764544	rs2742449	T	C	1294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=40;PP=956;SC=CATAAATCAATGTTCAACATC;SOR=3.611;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=5;TCR=40;TR=45;WE=45764552;WS=45764534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr3	45772742	rs2531755	T	C	2495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.81;SOR=2.939;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr3	45772742	.	TTC	CTC,CTT	656	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.38;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=48,27;NR=9,4;PP=424,656;QD=8.04861776399;SC=TCTGATACCATTCTCTCCTTT;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=58;TCF=49;TCR=9;TR=57,31;WE=45772752;WS=45772732;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.98:58
chr3	45772744	rs11708140	C	T	905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.32;ReadPosRankSum=0.608;SOR=0.846;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,36:0.53:68
chr3	45772772	rs2673055	G	A	3588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=36;PP=2295;SC=TGGAAACTATGGTGTTTGAAA;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=79;TCR=36;TR=115;WE=45772780;WS=45772762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr3	45773732	rs11709306	G	A	965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=24;PP=655;SC=AGACTTACAAGTACAGTTCAC;SOR=1.885;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=33;WE=45773740;WS=45773722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	45776900	rs1468543	A	G	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.55;ReadPosRankSum=0.764;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr3	45779136	rs1468542	A	T	2249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=41;NR=24;PP=1112;SC=GAGAAGATTTACAAAAATGGT;SOR=0.793;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=41;TCR=24;TR=65;WE=45779144;WS=45779126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr3	45780446	rs55735067	C	T	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=56;ReadPosRankSum=1.465;SC=CAATTTAAAACGTTATATGTG;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=45780454;WS=45780436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr3	45781148	rs3733106	C	T	843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.766;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=23;PP=515;ReadPosRankSum=1.055;SC=TAAGTCTGCTCCACACATTTG;SOR=0.610;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=88;TCF=38;TCR=50;TR=40;WE=45781156;WS=45781138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,43:0.43:99
chr3	45781188	rs3821890	T	G	786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.373;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=18;PP=418;ReadPosRankSum=1.038;SC=ACCTTTCTTTTACAACATCTT;SOR=0.489;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=42;TCF=11;TCR=31;TR=26;WE=45781196;WS=45781178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,32:0.67:48
chr3	45784963	rs9821974	T	C	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=575;ReadPosRankSum=0.272;SC=GCTAAACAGCTGAAAACTGGG;SOR=0.412;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=10;WE=45784981;WS=45784953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr3	45784972	rs10575376	GGT	G	544.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.746;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.861;NF=6;NR=3;PP=560;ReadPosRankSum=0.149;SC=CTGAAAACTGGGTCTGATATC;SOR=0.100;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=9;WE=45784981;WS=45784953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr3	45799871	rs2251347	C	T	3366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=67;NR=46;PP=1866;SC=CTGGACCCACCGTCAGAGACC;SOR=0.895;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=114;TCF=67;TCR=47;TR=113;WE=45799879;WS=45799861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr3	45804391	rs2191027	C	T	2326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.334;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=52;PP=1701;ReadPosRankSum=-1.255;SC=AATGAGGGTCCTGGGCCTCCT;SOR=0.559;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=222;TCF=122;TCR=100;TR=107;WE=45804399;WS=45804381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,110:0.46:241
chr3	45812650	rs3733104	C	T	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.880;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=387;ReadPosRankSum=1.117;SC=CTTGCCCAGGCGACCCTTCAG;SOR=0.358;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=46;TCF=36;TCR=10;TR=26;WE=45812658;WS=45812640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,27:0.54:50
chr3	45817418	rs758386	A	G	8426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=147;NR=141;PP=2965;SC=ACGCCTTCTCACACTCCTCAT;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=290;TCF=148;TCR=142;TR=288;WE=45817426;WS=45817408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,316:1.00:316
chr3	45821624	rs2252547	T	C	1060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.705;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=35;PP=658;ReadPosRankSum=0.255;SC=CGCTGAGGACTGAGGATGGCC;SOR=0.612;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=40;TCR=76;TR=54;WE=45821632;WS=45821614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,54:0.44:123
chr3	45977866	rs4535265	C	T	850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=1;PP=709;SC=TGGTCCCCAGCGCCGGCACTG;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=29;WE=45977874;WS=45977856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	45977899	rs1873002	T	C	1799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=12;PP=1128;SC=CTCCTCCCAATGCCACACCTG;SOR=2.494;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=46;TCR=12;TR=58;WE=45977916;WS=45977889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr3	45979877	rs9875616	G	A	641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=17;PP=437;SC=CTGTGAATCAGTTTAGGAGGT;SOR=2.400;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=22;WE=45979885;WS=45979867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	45989044	rs2234358	T	G	1376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=35;PP=993;SC=AATTTGCAAGTCATGGCTGTG;SOR=3.816;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=4;TCR=35;TR=39;WE=45989052;WS=45989034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr3	45996761	rs1463680	G	A	3040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=38;PP=1829;SC=CATTTGGGTCGAGAGAATCAG;SOR=0.995;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=63;TCR=38;TR=101;WE=45996769;WS=45996751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr3	46001063	rs1532071	G	A	5346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=96;PP=2965;SC=GGAAGAAAAGGAGAGAGAATC;SOR=1.139;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=168;TCF=72;TCR=96;TR=168;WE=46001071;WS=46001053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr3	46007702	rs1994490	T	C	1100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=2;PP=867;SC=AAGGTGCATCTTCCCATGGAC;SOR=4.863;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=33;WE=46007710;WS=46007692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	46008790	rs3796375	G	A	3223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=49;PP=2001;SC=CAGCAAGCTCGCCTCCATCTG;SOR=0.856;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=109;TCF=59;TCR=50;TR=108;WE=46008798;WS=46008780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr3	46009864	rs3733100	C	G	3632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=49;PP=2160;SC=TAGCTCCAGGCCCTGCAGGCA;SOR=0.756;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=65;TCR=49;TR=114;WE=46009872;WS=46009854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr3	46010077	rs4683158	C	T	6655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=119;NR=112;PP=2965;SC=CATGCGCTCCCGTAGCTGCTT;SOR=0.701;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=231;TCF=119;TCR=112;TR=231;WE=46010085;WS=46010067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr3	46016599	rs3821884	T	G	408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=11;NR=1;PP=295;SC=GACAATGATATATGTGGAAGG;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=46016607;WS=46016589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	46016851	rs751552	A	T	4058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=70;PP=2518;SC=GAAAAAGCAGATTACATAGAG;SOR=0.746;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=142;TCF=72;TCR=70;TR=142;WE=46016871;WS=46016841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr3	46016944	rs751553	C	T	1233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=27;PP=766;SC=CAAAAAATGTCACCCAATTTT;SOR=1.464;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=16;TCR=27;TR=43;WE=46016952;WS=46016934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr3	46021218	rs4682801	G	T	2129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=20;PP=1276;SC=ACTTGACAAAGCGGATCCCAT;SOR=1.550;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=48;TCR=20;TR=68;WE=46021226;WS=46021208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr3	46026209	rs11338292	CA	C	2747.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=14;PP=1937;SC=CCAAATATTTCAATATGATGT;SOR=2.432;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=54;TCF=36;TCR=18;TR=48;WE=46026217;WS=46026199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr3	46026259	rs3733097	G	A	4569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=56;PP=2809;SC=GAACAAAAATGAAAGGGTTGA;SOR=1.219;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=96;TCR=56;TR=152;WE=46026267;WS=46026249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr3	46245824	rs371736049	TA	T	65.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=11.698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.27;ReadPosRankSum=0.985;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,10:0.34:29
chr3	46399798	rs1799865	T	C	11695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=428;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=203;NR=175;PP=2965;SC=CTCCCTATAATATTGTCATTC;SOR=0.780;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=379;TCF=204;TCR=175;TR=378;WE=46399806;WS=46399788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,428:1.00:428
chr3	46449978	rs11266744	A	C	3964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=60;PP=2744;ReadPosRankSum=-0.950;SC=TGCACAAGGGAAACTTTTTCT;SOR=0.223;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=127;TCF=66;TCR=61;TR=126;WE=46449986;WS=46449968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,136:0.99:137
chr3	46450070	rs3204849	T	A	6912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=132;NR=109;PP=2965;SC=TTGCCTGAATTCGTGGTTTAT;SOR=0.895;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=241;TCF=132;TCR=109;TR=241;WE=46450078;WS=46450060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr3	46479668	rs3213479	A	G	1398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=38;PP=1046;SC=AGAGGAATTTATGGGTTAAAG;SOR=3.033;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=8;TCR=38;TR=46;WE=46479676;WS=46479658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr3	46480958	rs2073495	C	G	3423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=69;PP=2112;SC=TAGCCCATGCCTCATTGTTAT;SOR=1.463;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=42;TCR=69;TR=111;WE=46480966;WS=46480948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr3	46482980	rs17285324	A	T	2337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.583;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=60;PP=1480;ReadPosRankSum=1.404;SC=GGCACCTAAAATGTTCCAGAA;SOR=0.437;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=212;TCF=85;TCR=127;TR=106;WE=46482988;WS=46482970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,111:0.49:225
chr3	46484898	rs7615975	T	G	750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=4;PP=662;SC=ATGAGGTAAGTCCCCATCCTG;SOR=3.014;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=27;WE=46484906;WS=46484888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	46484964	rs1042073	G	A	3258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=39;PP=2107;SC=AGTATCTCTCGTTGCTGTTGG;SOR=1.382;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=73;TCR=39;TR=112;WE=46484972;WS=46484954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr3	46487003	rs2269435	A	G	2055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=46;PP=1289;SC=GGAGCTGTCTACAGCCCAGGC;SOR=2.147;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=16;TCR=46;TR=62;WE=46487011;WS=46486993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr3	46487750	rs6776504	A	G	609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=455;SC=GTGAAGGTCAATATAAACATT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=46487758;WS=46487740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	46488854	rs2239692	T	C	1674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.241;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=30;PP=963;ReadPosRankSum=0.942;SC=TGTACACATATCCTCCATCCA;SOR=0.576;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=140;TCF=80;TCR=60;TR=70;WE=46488862;WS=46488844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,80:0.50:159
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chr3	46490474	rs2230894	G	A	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=22;PP=558;ReadPosRankSum=-2.087;SC=CACACCACACGACCCGCGCAC;SOR=0.661;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=91;TCF=41;TCR=50;TR=40;WE=46490482;WS=46490464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,42:0.44:96
chr3	46491267	rs17141154	G	A	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5004;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=83;ReadPosRankSum=0.253;SC=AGGAGTGACCGCCACAAAGTA;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=5;WE=46491275;WS=46491257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr3	46491290	rs2269443	G	A	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=84;ReadPosRankSum=1.323;SC=GCCACCTGCTGGGAAGTAGAA;SOR=0.693;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=7;WE=46491298;WS=46491280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr3	46491948	rs6774882	T	A	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=172;ReadPosRankSum=1.459;SC=CTGCCCCCCATATCCAAGCAA;SOR=0.602;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=9;WE=46491956;WS=46491938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr3	46495716	rs17135	C	T	2554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.456;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.930;NF=68;NR=42;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.157;SC=ACTTAGGAATCTAATTAGCTC;SOR=0.729;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=237;TCF=146;TCR=91;TR=110;WE=46495734;WS=46495706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,123:0.47:263
chr3	46495726	rs5848797	CA	C	4498.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.961;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.926;NF=24;NR=59;PP=2948;ReadPosRankSum=0.289;SC=CTAATTAGCTCAAAGGTCAGA;SOR=0.577;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=163;TCF=52;TCR=111;TR=83;WE=46495734;WS=46495706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,153:0.52:293
chr3	46497723	rs4683227	C	G	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.535;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=344;ReadPosRankSum=0.583;SC=TTAATCCACACAGCTCAGGGC;SOR=0.124;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=41;TCF=36;TCR=5;TR=20;WE=46497731;WS=46497713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,20:0.47:43
chr3	46501100	rs17078878	C	A	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.052;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=178;ReadPosRankSum=-1.397;SC=ATTTCTCTCTCCCTTCCATTC;SOR=0.495;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=55;TCF=39;TCR=16;TR=19;WE=46501108;WS=46501090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,24:0.39:61
chr3	46501213	rs1126478	T	C	3722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=61;NR=55;PP=2016;SC=GCCACGCACTTTTCTCATATT;SOR=0.721;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=61;TCR=55;TR=116;WE=46501221;WS=46501203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr3	46501268	rs1126477	C	T	2825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=48;PP=1495;SC=TGGGATACGGCGCACCACTGA;SOR=1.036;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=32;TCR=48;TR=80;WE=46501276;WS=46501258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr3	46501284	rs10662431	C	CCTT	3720.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=38;PP=2108;SC=ACTGAACACTCCTCCTACGGC;SOR=1.192;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=44;TCF=3;TCR=41;TR=41;WE=46501292;WS=46501274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr3	46501842	rs4234463	G	C	640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=18;NR=1;PP=510;SC=ATATACCTGAGTCGGTTGGTA;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=46501850;WS=46501839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr3	46501931	rs4683235	C	T	1261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.394;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=15;PP=712;ReadPosRankSum=-0.166;SC=ATTCACTCTGCACAGAAAGAC;SOR=1.038;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=110;TCF=72;TCR=38;TR=49;WE=46501939;WS=46501921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,59:0.47:125
chr3	46539523	rs2037391	G	A	1866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=22;PP=1162;SC=AGGAGAGCTCGACCCACCCAG;SOR=1.296;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=39;TCR=22;TR=61;WE=46539531;WS=46539513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr3	46539864	rs11130092	C	T	171.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=5;PP=136;SC=CATTAAAGATCGTTTTTTCAC;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=46539872;WS=46539854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	46560721	rs35989475	TTAAG	T	277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=227;SC=TTTGTCACCATTAAGTAAGTC;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=46560732;WS=46560711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	46574256	rs9849400	C	T	2692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=39;PP=1578;SC=AAATGTTTATCTCTTACTTCA;SOR=0.856;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=53;TCR=39;TR=92;WE=46574264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr3	46574418	rs1402152	A	G	1859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=34;PP=1130;SC=AGAAAAAGTTAACATCCATTG;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=26;TCR=34;TR=60;WE=46574426;WS=46574408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr3	46580591	rs17078944	G	T	6267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=107;NR=95;PP=2965;SC=AATTCTCATCGCTTGAAATAA;SOR=0.729;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=202;TCF=107;TCR=95;TR=202;WE=46580599;WS=46580581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr3	46593147	rs1879325	A	G	1095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=26;PP=877;SC=ACAAACAGAAAACAGTTTTAA;SOR=2.649;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=32;WE=46593155;WS=46593137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	46620614	rs11130097	T	C	1248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.437;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=21;PP=751;ReadPosRankSum=0.452;SC=ATTTCTAAAGTCTTTGAACTG;SOR=0.859;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=118;TCF=73;TCR=45;TR=58;WE=46620622;WS=46620604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,63:0.50:125
chr3	46654132	rs2139637	G	A	4807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=65;PP=2965;SC=GGTCAAGTGCGACACATTTGG;SOR=0.988;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=159;TCF=94;TCR=65;TR=159;WE=46654140;WS=46654122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr3	46658737	rs9832679	A	G	10496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=407;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=198;NR=174;PP=2965;SC=GATCTCAAGCATTTCTGGGAA;SOR=0.775;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=372;TCF=198;TCR=174;TR=372;WE=46658745;WS=46658727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,406:1.00:406
chr3	46658872	rs9870935	G	T	3449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=69;PP=2022;SC=AAAATACATCGTATAATTTAG;SOR=1.773;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=34;TCR=69;TR=103;WE=46658880;WS=46658862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr3	46713102	rs6776565	C	T	2671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.896;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=57;PP=1505;ReadPosRankSum=0.874;SC=ACCAAGAGAGCGAGGGAGACA;SOR=0.439;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=223;TCF=126;TCR=97;TR=116;WE=46713110;WS=46713092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,132:0.53:249
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chr3	46717065	rs7635360	C	G	689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=6;PP=401;ReadPosRankSum=-1.205;SC=CGCATGAGGCCTCCCTGGACA;SOR=0.614;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=49;TCF=37;TCR=12;TR=29;WE=46717073;WS=46717055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,33:0.58:57
chr3	46717931	rs6808525	T	C	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=5.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.66;ReadPosRankSum=-0.008;SOR=0.350;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,47:0.48:97
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chr3	46718298	rs6806400	A	G	1265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.178;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=34;PP=911;ReadPosRankSum=0.541;SC=AGCCCTCCCCAGCCCACCCTA;SOR=0.647;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=167;TCF=89;TCR=78;TR=71;WE=46718306;WS=46718288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,75:0.42:177
chr3	46722692	rs13080080	G	T	3707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=67;PP=2279;ReadPosRankSum=2.194;SC=GTGAGGGCCCGGTCCACCCCT;SOR=0.707;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=300;TCF=171;TCR=129;TR=155;WE=46722700;WS=46722682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,169:0.51:330
chr3	46723551	rs4683310	G	A	2350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.479;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=56;PP=1450;ReadPosRankSum=-0.392;SC=AATTCCCCACGTGATTCCGCC;SOR=0.630;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=216;TCF=106;TCR=110;TR=110;WE=46723559;WS=46723541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,114:0.49:232
chr3	46723663	rs4683311	C	T	1751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FS=0.572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.62;ReadPosRankSum=0.298;SOR=0.746;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,86:0.52:165
chr3	46724569	rs9847407	C	T	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=209;ReadPosRankSum=-0.344;SC=CTCTCTGCCCCGCAGACCCCC;SOR=2.985;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=10;WE=46724577;WS=46724559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr3	46750553	rs11130106	G	A	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.767;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=333;ReadPosRankSum=-0.157;SC=GAAGGAAGGCGGATGCCATTC;SOR=0.343;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=19;WE=46750561;WS=46750543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr3	46751073	rs10578999	TAAG	T	3375.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.896;NF=7;NR=38;PP=1680;ReadPosRankSum=-0.492;SC=CCACAGAGGATAAGAAGAAGA;SOR=0.703;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=110;TCF=25;TCR=85;TR=45;WE=46751086;WS=46751063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,89:0.53:167
chr3	46753976	rs9815362	T	C	1784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.555;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=46;PP=997;ReadPosRankSum=0.304;SC=TTAGCTCCTGTGGGAAGGGTT;SOR=0.643;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=162;TCF=74;TCR=88;TR=83;WE=46753984;WS=46753966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,89:0.51:176
chr3	46933960	rs1001284	C	G	2574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.597;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=52;PP=1405;ReadPosRankSum=-1.140;SC=TGCGCTGCCACTCGCGCGCGC;SOR=0.584;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=201;TCF=103;TCR=98;TR=109;WE=46933968;WS=46933950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,125:0.54:230
chr3	46943028	rs1531137	T	C	795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.264;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=24;PP=449;ReadPosRankSum=-0.945;SC=CTGCGTCCCCTGGAACCAGCC;SOR=0.172;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=52;TCF=12;TCR=40;TR=33;WE=46943036;WS=46943018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,36:0.67:54
chr3	46944274	rs1138518	T	C	3225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=375;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.374;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=69;PP=1735;ReadPosRankSum=1.232;SC=GTTTCTGCAATGGCGAGGTAA;SOR=0.716;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=341;TCF=186;TCR=155;TR=153;WE=46944282;WS=46944264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:209,165:0.44:374
chr3	46963502	rs4587	T	C	1496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=12;PP=1004;SC=AAGACCATCCTCTGCAGGACA;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=37;TCR=12;TR=49;WE=46963510;WS=46963492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr3	46965197	rs2290546	C	G	2475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=45;PP=1305;SC=CTGTGGAAAACGCGCTGCCAC;SOR=1.460;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=31;TCR=45;TR=76;WE=46965205;WS=46965187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr3	46967040	rs2290545	G	A	2106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=41;PP=1413;SC=AAGAATAGAGGGAACAAGCAG;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=28;TCR=41;TR=69;WE=46967048;WS=46967030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr3	46982365	rs6804732	T	C	1942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=43;NR=21;PP=1039;SC=AGGACAGCCATGGGCAGAAAG;SOR=1.226;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=64;TCF=43;TCR=21;TR=64;WE=46982373;WS=46982355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr3	47018214	rs936181	T	C	5431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=79;PP=2710;SC=CAGCCGTAGTTGCCTCCATCT;SOR=0.723;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=179;TCF=100;TCR=79;TR=178;WE=47018222;WS=47018204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr3	47021509	rs113932344	CGCGCGCGCGG	C	368.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=2;PP=876;SC=GCCGCGTAGCCGCGCGCGCGG;SOR=0.892;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=3;WE=47021526;WS=47021499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	47029426	rs1108301	G	A	513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=339;ReadPosRankSum=0.176;SC=CTCCCCCACCGTGACTCTGCG;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=33;TCR=13;TR=21;WE=47029434;WS=47029416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
chr3	47029661	rs12152493	G	A	1153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=21;PP=535;ReadPosRankSum=0.360;SC=AATGGTACACGTGTGTCCTGG;SOR=0.656;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=98;TCF=49;TCR=49;TR=45;WE=47029669;WS=47029651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,57:0.50:113
chr3	47033937	rs13066214	C	T	1005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.433;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=12;PP=511;ReadPosRankSum=-0.931;SC=TTGCCTCCTCCACCCTGTGCC;SOR=0.361;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=66;TCF=49;TCR=17;TR=41;WE=47033945;WS=47033927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,45:0.61:74
chr3	47035625	rs936185	G	A	2563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=56;PP=1695;SC=GAGCAAAGCAGGCGAGCTGGG;SOR=2.625;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=17;TCR=56;TR=73;WE=47035633;WS=47035615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr3	47035900	rs749512	C	T	1601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.509;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=29;PP=933;ReadPosRankSum=0.384;SC=GTTTGCCCTCCGGCCCATGTA;SOR=0.887;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=181;TCF=107;TCR=74;TR=76;WE=47035908;WS=47035890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,81:0.42:195
chr3	47036756	rs11720139	C	G	2805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.726;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=49;PP=1613;ReadPosRankSum=-1.360;SC=CCTGGAGGCCCGCTGCCAAGA;SOR=0.744;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=226;TCF=119;TCR=107;TR=116;WE=47036764;WS=47036746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,135:0.53:257
chr3	47038135	rs11396344	C	CA	4356.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=43;PP=2732;SC=GCTAGGGGTCCGGGGGGAGAA;SOR=0.728;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=61;TCF=17;TCR=44;TR=60;WE=47038143;WS=47038125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr3	47043386	rs73075647	C	T	2020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=39;PP=1022;ReadPosRankSum=-0.208;SC=GGCTGGGTGCCACTCATCTCT;SOR=0.680;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=173;TCF=88;TCR=85;TR=81;WE=47043394;WS=47043376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,97:0.48:203
chr3	47043538	rs2305634	C	T	2403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.363;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=45;PP=1296;ReadPosRankSum=-0.698;SC=ACACCTCTTCCTTGGAGTCAG;SOR=0.563;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=190;TCF=99;TCR=91;TR=103;WE=47043546;WS=47043528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,115:0.55:211
chr3	47043622	rs2305635	G	A	1575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.613;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=26;PP=1147;ReadPosRankSum=-0.552;SC=CCTGGCTGGTGCCACTGGTGC;SOR=0.777;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=144;TCF=91;TCR=53;TR=69;WE=47043630;WS=47043612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,72:0.47:153
chr3	47044122	rs11928558	A	T	8617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=132;NR=155;PP=2965;SC=CTGACCTATTACCCCCACCCC;SOR=0.967;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=288;TCF=132;TCR=156;TR=287;WE=47044130;WS=47044112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,319:1.00:319
chr3	47045739	rs1079276	C	G	4655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=465;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=111;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.170;SC=GCCAGACTCCCAGACCCCAGC;SOR=0.651;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=428;TCF=191;TCR=237;TR=201;WE=47045747;WS=47045729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:244,220:0.47:464
chr3	47045846	rs2305637	C	T	2311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=53;PP=1490;ReadPosRankSum=-0.784;SC=AGCAGCCGCTCCCCCCAGGAG;SOR=0.718;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=224;TCF=113;TCR=111;TR=107;WE=47045854;WS=47045836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,113:0.47:239
chr3	47046842	rs2305638	G	C	806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.200;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=27;PP=540;ReadPosRankSum=1.383;SC=GGCAGACTAGGGGGCAGATAA;SOR=1.483;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=64;TCF=15;TCR=49;TR=33;WE=47046850;WS=47046832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,36:0.53:68
chr3	47047176	rs5848810	A	AG	2411.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.180;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.934;NF=16;NR=36;PP=1718;ReadPosRankSum=-0.281;SC=TGGAGTGGCCAGGGGGCAGTC;SOR=0.594;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=115;TCF=28;TCR=87;TR=52;WE=47047184;WS=47047166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,94:0.54:174
chr3	47049615	rs144664865	G	A	1536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.982;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=26;PP=913;ReadPosRankSum=0.176;SC=TATGGGCATGGGGCTGCAGTG;SOR=0.899;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=141;TCF=87;TCR=54;TR=71;WE=47049623;WS=47049605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,78:0.48:161
chr3	47050908	rs3214838	AG	A	1083.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.039;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=32;PP=890;ReadPosRankSum=1.076;SC=TGGGCAGCCCAGGGGGGTGAG;SOR=0.941;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=6;TCR=70;TR=35;WE=47050916;WS=47050898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,43:0.52:83
chr3	47059323	rs2385867	C	T	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-3.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.643;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=257;ReadPosRankSum=0.038;SC=GTGAGTAAAGCCAGCCAATCC;SOR=0.100;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=16;WE=47059331;WS=47059313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,16:0.70:23
chr3	47061183	rs2290547	G	A	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=283;ReadPosRankSum=-1.219;SC=GACATACTTAGGACAAGAAAT;SOR=0.614;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=40;TCF=29;TCR=11;TR=18;WE=47061191;WS=47061173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,19:0.44:43
chr3	47079112	rs6768722	G	A	1035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=14;PP=711;ReadPosRankSum=1.060;SC=GGTCTTGGACGGACTCCCAAA;SOR=0.733;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=74;TCF=52;TCR=22;TR=43;WE=47079120;WS=47079102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,46:0.56:82
chr3	47103861	rs10589946	GTT	G	359.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.48;MQRankSum=0.873;QD=16.35;ReadPosRankSum=-1.185;SOR=0.235;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr3	47125385	rs4082155	G	A	2370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.081;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=48;PP=1613;ReadPosRankSum=-1.342;SC=GCTCTCTTTGGGCTCTATTTC;SOR=0.829;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=239;TCF=131;TCR=108;TR=108;WE=47125393;WS=47125375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,114:0.44:262
chr3	47129781	.	CA	C	64.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=0.000;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=6.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.38;ReadPosRankSum=-1.554;SOR=0.076;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,10:0.21:47
chr3	47142907	rs60548476	TCC	T	1746.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.736;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.680;NF=14;NR=11;PP=789;ReadPosRankSum=-1.075;SC=ACAGCCTATTTCCCCATCAGA;SOR=0.771;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=72;TCF=39;TCR=33;TR=25;WE=47142916;WS=47142897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,50:0.42:119
chr3	47143087	.	AGT	A,AGTGT	538.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.221;ClippingRankSum=0.000;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=2.245;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.14;ReadPosRankSum=-0.100;SOR=1.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:7,15,19:0.37,0.46:41
chr3	47161214	rs11923706	T	C	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=8;PP=389;ReadPosRankSum=-1.411;SC=CAGTCTCGGGTATGTCTTTAT;SOR=0.693;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=43;TCF=31;TCR=12;TR=24;WE=47161222;WS=47161204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,24:0.50:48
chr3	47162661	rs6767907	A	G	3004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.907;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.000;NF=55;NR=67;PP=1725;ReadPosRankSum=1.465;SC=CAGGCAGGCGATTATCTATTT;SOR=0.616;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=255;TCF=114;TCR=141;TR=122;WE=47162669;WS=47162651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,142:0.50:286
chr3	47168219	rs11717033	T	C	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.637;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=157;ReadPosRankSum=0.100;SC=TTAAAAACGATTGAAATAATA;SOR=0.368;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=13;WE=47168227;WS=47168209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr3	47187075	rs6442059	C	G	1071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=22;PP=656;ReadPosRankSum=-1.006;SC=CCCCTCACATCAGGTCATGTG;SOR=0.705;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=105;TCF=55;TCR=50;TR=44;WE=47187083;WS=47187065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,52:0.41:126
chr3	47198826	rs11708451	G	A	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=27;ReadPosRankSum=-0.241;SC=TTGAGCCCAGGAGTTCAGTTA;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=3;WE=47198834;WS=47198816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr3	47205502	.	CGCGGCGGCG	C,CGCG	1591.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.25;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=24;NF=0,0;NR=20,20;PP=417,568;SC=CAGGTCCGACCGCGGCGGCGG;SOR=1.923;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=0;TCR=46;TR=20,20;WE=47205518;WS=47205492;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.49,0.51:39
chr3	47276968	rs2276854	C	T	1241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=25;PP=806;ReadPosRankSum=-1.032;SC=TCACTGAGGCCCCCATCCTCC;SOR=0.735;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=107;TCF=62;TCR=45;TR=60;WE=47276976;WS=47276958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,61:0.54:114
chr3	47277458	rs1874264	A	G	582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=7;PP=490;SC=GAGAACAGACATCAAGGGGCA;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=25;WE=47277466;WS=47277448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	47277885	rs13094438	G	A	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.43;ReadPosRankSum=0.572;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr3	47282303	rs2276853	G	A	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.723;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=455;ReadPosRankSum=-0.031;SC=TGCTTCTCCCGTAGTGACTTC;SOR=1.238;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=55;TCF=44;TCR=11;TR=27;WE=47282311;WS=47282293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,28:0.48:58
chr3	47286227	rs6772449	G	T	544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=1;PP=403;SC=ATCCTCCCATGCACCCACCGA;SOR=3.500;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=47286235;WS=47286217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	47287603	rs35871850	A	AT	2514.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=15;PP=1565;SC=CAAGAAGAGGAGCTCTTGGAG;SOR=1.430;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=37;TCF=21;TCR=16;TR=34;WE=47287611;WS=47287593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr3	47305928	rs140345125	TTTTTA	T	2548.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.770;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.09;MQRankSum=0.877;NF=2;NR=30;PP=1414;ReadPosRankSum=-0.468;SC=TACTGAATGCTTTTTATTTGT;SOR=0.570;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=65;TCF=3;TCR=62;TR=32;WE=47305940;WS=47305918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,65:0.58:113
chr3	47316725	rs903538	G	A	1158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=3;PP=868;SC=AAATGATAGTGAGTGAGCTTT;SOR=4.461;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=33;TCR=3;TR=36;WE=47316733;WS=47316715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr3	47318747	rs924009	T	G	7567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=149;NR=110;PP=2965;SC=GCCCAGTCAGTTGAAGGCAAA;SOR=0.965;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=259;TCF=149;TCR=110;TR=259;WE=47318755;WS=47318737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr3	47322496	rs807936	C	T	3314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=61;PP=1950;ReadPosRankSum=-0.466;SC=GGTTTCAGTTCCCAAAATTAA;SOR=0.703;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=246;TCF=130;TCR=116;TR=132;WE=47322504;WS=47322486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,152:0.56:271
chr3	47361082	rs2302278	G	T	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.75;ReadPosRankSum=0.464;SOR=0.603;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,20:0.36:56
chr3	47363971	rs17410853	G	T	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=75;ReadPosRankSum=-0.231;SC=CCTGGGCTAAGTAATGTCAGT;SOR=2.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=5;WE=47363979;WS=47363961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr3	47376095	rs295450	A	G	2964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=30;PP=1908;SC=TTGGCAGTGGAGAGCCAGGCT;SOR=1.502;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=67;TCR=30;TR=97;WE=47376103;WS=47376085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr3	47449058	rs900688	T	C	9253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=140;NR=168;PP=2965;SC=CATTGGACACTCTTCAGCCTG;SOR=0.914;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=309;TCF=140;TCR=169;TR=308;WE=47449066;WS=47449048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,338:1.00:338
chr3	47451411	rs3736177	C	T	1530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.220;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=33;PP=850;ReadPosRankSum=0.154;SC=CCTTGCCTGTCGCACAGGGAG;SOR=0.592;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=145;TCF=72;TCR=73;TR=67;WE=47451419;WS=47451401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,76:0.47:163
chr3	47451980	.	C	T	1040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.766;ClippingRankSum=0.000;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=27;PP=590;ReadPosRankSum=0.323;SC=CACAGCCCCACGGCCAAACCC;SOR=0.694;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=129;TCF=60;TCR=69;TR=52;WE=47451988;WS=47451970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,57:0.41:138
chr3	47452087	rs900689	G	A	8009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=159;NR=121;PP=2965;SC=AACCCATCCCGGCACAGCACC;SOR=0.832;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=281;TCF=160;TCR=121;TR=280;WE=47452095;WS=47452077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,306:1.00:306
chr3	47452118	rs6780013	G	A	3978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=344;ExcessHet=3.0103;FS=0.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.57;ReadPosRankSum=0.500;SOR=0.722;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:145,199:0.58:344
chr3	47452786	rs1531875	G	A	2640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=54;PP=1600;ReadPosRankSum=1.932;SC=ACCCCTATGAGCATCCTGAGA;SOR=0.725;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=225;TCF=117;TCR=108;TR=111;WE=47452794;WS=47452776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,124:0.50:246
chr3	47453216	rs11707038	G	A	1481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.571;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=29;PP=818;ReadPosRankSum=0.647;SC=GCAGTGTGGGGTGGCAGGGCA;SOR=0.609;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=159;TCF=91;TCR=68;TR=66;WE=47453224;WS=47453206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,74:0.43:173
chr3	47454399	rs6789730	G	A	2864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.87;SOR=1.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr3	47456225	rs6442066	T	C	2058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=38;PP=1415;SC=CTGTTCTTCATCAGGACTCTT;SOR=1.117;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=66;TCF=28;TCR=38;TR=65;WE=47456233;WS=47456215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr3	47459679	rs12487736	C	T	2499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.738;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=40;PP=1301;ReadPosRankSum=0.511;SC=CACACGCAGACGTGGCCTGCC;SOR=0.499;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=209;TCF=136;TCR=73;TR=106;WE=47459687;WS=47459669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,122:0.52:234
chr3	47462200	rs900690	T	C	910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.02;SOR=1.002;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	47462587	rs900691	A	G	3487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=77;PP=2373;SC=GAGGAGCAGTACCCGGACTGC;SOR=1.553;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=119;TCF=41;TCR=78;TR=118;WE=47462595;WS=47462577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr3	47464122	rs1038394	A	G	1917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.148;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=1.000;NF=38;NR=45;PP=1024;ReadPosRankSum=-3.679;SC=GAGGCATGGCAAGGCCCCCCA;SOR=0.604;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=165;TCF=73;TCR=92;TR=83;WE=47464130;WS=47464112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,94:0.51:186
chr3	47539751	rs2170814	T	C	4475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=72;PP=2383;SC=GCAAGAAGCCTGTTGCCCAGG;SOR=0.834;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=72;TCR=72;TR=144;WE=47539759;WS=47539741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr3	47539969	rs13059519	C	T	806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=26;PP=540;ReadPosRankSum=0.787;SC=GGAAAGGACACCCAGAGTCAG;SOR=0.645;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=94;TCF=33;TCR=61;TR=41;WE=47539977;WS=47539959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,41:0.41:100
chr3	47543389	rs3816779	G	A	2404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.490;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=65;PP=1393;ReadPosRankSum=-1.156;SC=CTCTACAGATGTTTATCAAGG;SOR=0.732;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=217;TCF=85;TCR=132;TR=105;WE=47543397;WS=47543379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,114:0.48:236
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chr3	47604299	rs4858839	C	T	469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=14;PP=368;SC=CATACAGCAACCAAATAATAA;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=47604307;WS=47604289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	47614413	rs2280567	G	A	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.513;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=105;ReadPosRankSum=0.269;SC=GGCAGCCACGGCCACAGTAAG;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=7;WE=47614421;WS=47614403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr3	47618953	rs3732530	C	A	2253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.076;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=46;PP=1215;ReadPosRankSum=-0.607;SC=CAGCTCTGGCCCTTGAGGGTC;SOR=0.498;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=190;TCF=90;TCR=100;TR=95;WE=47618961;WS=47618943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,106:0.50:214
chr3	47676902	rs3216712	C	CA	121.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.366;NF=0;NR=5;PP=160;ReadPosRankSum=0.712;SC=TCCTTACCTCCACCACTATAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=5;WE=47676910;WS=47676892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr3	47680066	rs12633923	C	T	1377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=4;PP=934;SC=ATATTATATCCTGTGAGAACT;SOR=4.174;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=34;TCR=4;TR=38;WE=47680074;WS=47680056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr3	47680119	rs12636863	T	C	1440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.658;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=18;PP=911;ReadPosRankSum=-0.418;SC=TAGAATTATTTAGAGTCCCCT;SOR=0.819;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=123;TCF=85;TCR=38;TR=57;WE=47680127;WS=47680109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,66:0.46:144
chr3	47712202	rs1141601	T	C	2209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.764;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=55;PP=1334;ReadPosRankSum=-0.491;SC=CACTAGCACCTTTACTCTAAG;SOR=0.543;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=241;TCF=111;TCR=130;TR=108;WE=47712210;WS=47712192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,115:0.45:255
chr3	47734700	rs12635438	A	G	1136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQ=59.97;MQRankSum=0.766;NF=33;NR=27;PP=647;ReadPosRankSum=-1.835;SC=GACAGAAAGCACAGACCAGTG;SOR=0.660;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=165;TCF=89;TCR=76;TR=60;WE=47734708;WS=47734690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,66:0.36:182
chr3	47762030	rs12495204	A	G	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=233;ReadPosRankSum=-0.620;SC=AAAAGACTCCATAAGTGAGAA;SOR=0.784;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=37;TCF=35;TCR=2;TR=16;WE=47762038;WS=47762020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,16:0.41:39
chr3	47770380	rs6442081	G	A	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=165;ReadPosRankSum=-1.322;SC=CAGCCTGGGCGACAGACTCCA;SOR=0.188;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=10;WE=47770388;WS=47770370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr3	48019232	rs6770467	A	G	1634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=7;PP=1142;SC=CTCCAACAAGAACACTACCAC;SOR=3.056;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=41;TCR=7;TR=48;WE=48019240;WS=48019222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr3	48019258	rs6770477	A	G	2666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=20;PP=1605;SC=GAAATAATTCATATGCTTCCA;SOR=2.208;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=66;TCR=20;TR=86;WE=48019266;WS=48019248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr3	48209486	rs3731539	C	T	4203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=79;PP=2284;SC=ATGGAACTTCCGAAAACATTC;SOR=1.143;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=136;TCF=57;TCR=79;TR=136;WE=48209494;WS=48209476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr3	48219320	rs3731514	AAC	A	7068.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=24;NR=70;PP=2993;SC=AACAAATAGGAACACACACAC;SOR=1.033;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=117;TCF=32;TCR=85;TR=94;WE=48219331;WS=48219310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr3	48225509	rs3731503	T	C	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=186;ReadPosRankSum=0.212;SC=AACACTAGACTTCTAGGTGAA;SOR=0.941;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=10;WE=48225517;WS=48225499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr3	48228059	.	CAA	C	45.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.259;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=4.904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.36;MQRankSum=0.000;QD=2.08;ReadPosRankSum=-0.331;SOR=1.954;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,5:0.23:22
chr3	48414197	rs9852211	A	T	1431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=35;NR=14;PP=830;SC=GGCAAAGCCTATAAATTCAGA;SOR=1.654;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=35;TCR=14;TR=49;WE=48414205;WS=48414187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr3	48414215	rs9815103	G	A	2247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=49;NR=26;PP=1365;SC=AGAGCAGCCCGGAGAGGAGAA;SOR=1.206;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=49;TCR=26;TR=75;WE=48414223;WS=48414205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr3	48414274	rs17080138	C	T	979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.245;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=23;PP=574;ReadPosRankSum=-2.721;SC=ATCCGATTGCCTGACTTAGCT;SOR=0.593;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=148;TCF=87;TCR=61;TR=51;WE=48414282;WS=48414264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,59:0.34:173
chr3	48419723	rs7630741	G	T	388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=267;SC=TTTGGAAGAGGCTTCCAAATA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=48419731;WS=48419713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	48422235	rs6784322	T	A	3375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=35;PP=1960;ReadPosRankSum=0.772;SC=GAAGGCAGTGTTCCTCTGTCT;SOR=0.534;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=109;TCF=74;TCR=35;TR=108;WE=48422243;WS=48422225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,124:0.99:125
chr3	48450706	rs3217706	TC	T	897.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=4;PP=483;SC=CCCTCACCCATCCCCCCCGTG;SOR=2.303;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=18;WE=48450714;WS=48450696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr3	48451300	rs3214871	AG	A	3197.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=34;PP=2170;SC=CTACCTTGGCAGGCCCCACCC;SOR=0.786;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=54;TCF=19;TCR=35;TR=53;WE=48451308;WS=48451290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr3	48454468	rs3214041	C	T	7732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=121;NR=122;PP=2965;SC=GCCCATTCTCCCAGCCACACC;SOR=0.784;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=243;TCF=121;TCR=122;TR=243;WE=48454476;WS=48454458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,274:1.00:274
chr3	48455626	rs6794875	A	G	909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=23;PP=656;SC=CCAGTCACACAGTGTCCTCCA;SOR=3.841;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=26;WE=48455634;WS=48455616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	48461313	rs2362450	C	G	2130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=37;NR=36;PP=1421;SC=CTACCTCTGACGGTGACAGCG;SOR=0.746;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=73;TCF=37;TCR=36;TR=73;WE=48461321;WS=48461303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr3	48462461	rs11130171	A	G	922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=22;PP=631;SC=AAGAGGACCCAGGATGAGGGA;SOR=2.694;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=28;WE=48462469;WS=48462451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr3	48463618	rs9883759	T	A	5456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=100;PP=2965;SC=TCAGAAGCTGTGACAGCAAAG;SOR=0.903;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=185;TCF=85;TCR=100;TR=185;WE=48463626;WS=48463608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr3	48463711	rs9883927	T	C	4174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=62;PP=2626;SC=CTCCCAGCAGTCATGCCCTGG;SOR=0.720;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=133;TCF=71;TCR=62;TR=133;WE=48463719;WS=48463701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr3	48474249	rs2279077	A	G	4848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=81;NR=79;PP=2761;SC=AGGCCCCTCAAGTCCACCATG;SOR=0.739;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=161;TCF=81;TCR=80;TR=160;WE=48474257;WS=48474231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr3	48476431	rs13062723	C	G	4974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=81;PP=2965;SC=CTGGGCTGCACAGAGTCCTGG;SOR=0.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=165;TCF=84;TCR=81;TR=165;WE=48476439;WS=48476421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr3	48481647	rs3774808	G	A	1034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=9;PP=713;SC=GTCTACGACAGAGGGTGGGGC;SOR=1.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=35;WE=48481655;WS=48481637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr3	48505302	rs6442124	A	G	1020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=26;PP=802;SC=TGGGGCGGGCATCTAGACTGC;SOR=1.949;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=11;TCR=26;TR=37;WE=48505310;WS=48505292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr3	48505964	rs2242150	C	A	3658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=55;PP=1962;SC=GATGGAACCACTCTGTTCTTG;SOR=0.751;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=69;TCR=55;TR=124;WE=48505972;WS=48505954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr3	48508585	rs11797	C	T	7932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=136;NR=129;PP=2965;SC=GGAAGAGCTACAGCCTAGGCA;SOR=0.713;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=265;TCF=136;TCR=129;TR=265;WE=48508593;WS=48508575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,299:1.00:299
chr3	48576483	rs7615170	C	G	852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=4;PP=568;SC=GGTTACGAGGCGGAGGTGGGG;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=25;WE=48576491;WS=48576473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	48602523	rs138595277	G	GGGC	6613.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=81;PP=2924;ReadPosRankSum=-2.389;SC=AGACCCCGCTGGCAGCCCCCC;SOR=0.744;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=123;TCF=35;TCR=88;TR=111;WE=48602531;WS=48602513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,238:0.99:240
chr3	48604016	rs17256786	C	G	1950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=41;PP=1228;ReadPosRankSum=2.144;SC=ACAGATGGGACCAGGCTGTGA;SOR=0.692;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=215;TCF=117;TCR=98;TR=90;WE=48604024;WS=48604006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,100:0.40:248
chr3	48604059	rs41290686	G	A	2126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.473;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=50;PP=1235;ReadPosRankSum=-0.075;SC=AAGTCACCCCGATCTCTGACC;SOR=0.600;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=242;TCF=117;TCR=125;TR=100;WE=48604069;WS=48604049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,110:0.40:274
chr3	48624611	rs2255532	C	T	2474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.028;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=57;PP=1483;ReadPosRankSum=-0.143;SC=CTTCCCACTACGCCCACTATA;SOR=0.752;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=249;TCF=127;TCR=122;TR=111;WE=48624619;WS=48624601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,124:0.45:273
chr3	48625266	rs1264194	T	C	6024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=106;NR=101;PP=2965;SC=CTTCTCCAGCTGGCCCTAGGA;SOR=0.729;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=207;TCF=106;TCR=101;TR=207;WE=48625274;WS=48625256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr3	48632057	.	G	T	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=-0.000;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.82;ReadPosRankSum=-0.366;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr3	48658467	rs3895736	C	A	592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=332;ReadPosRankSum=-1.181;SC=GATGCTGAGACCAGGACCAAG;SOR=0.602;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=18;WE=48658475;WS=48658457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,24:0.67:36
chr3	48663046	rs7631574	C	T	292.31	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.9992;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=220;ReadPosRankSum=1.133;SC=CTCCCGAGTCCTTCCTACACC;SOR=2.147;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=10;WE=48663054;WS=48663036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr3	48666923	rs2276852	A	G	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=92;ReadPosRankSum=0.287;SC=AGAGGGGGTCATAGACCTAAA;SOR=0.576;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=10;WE=48666931;WS=48666913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,10:0.33:30
chr3	48668394	rs3821876	G	T	1812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.819;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=31;PP=976;ReadPosRankSum=-0.210;SC=CATACACTTGGATGCCTCCTA;SOR=0.481;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=159;TCF=102;TCR=57;TR=83;WE=48668402;WS=48668384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,89:0.53:167
chr3	48669447	rs13324142	C	T	1961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.857;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=43;PP=1135;ReadPosRankSum=3.245;SC=TAGGTGACCACGAAGCCGAAG;SOR=0.443;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=181;TCF=87;TCR=94;TR=86;WE=48669455;WS=48669437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,95:0.46:207
chr3	48669648	rs2276850	G	A	2061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.768;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=38;PP=1313;ReadPosRankSum=-0.223;SC=AAGTGGTGGTGGGGGGCACAT;SOR=0.485;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=167;TCF=103;TCR=64;TR=93;WE=48669656;WS=48669638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,98:0.57:171
chr3	48670827	rs34368826	G	T	2026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.965;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=48;PP=1212;ReadPosRankSum=0.011;SC=GGAGCACCTAGGGACATGATA;SOR=0.888;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=205;TCF=103;TCR=102;TR=91;WE=48670835;WS=48670817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,99:0.44:225
chr3	48672693	rs66952042	CCGAGGCGTCGCAAGCGGAGAATGCCTGCTCCAG	C	749.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=6.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.09;ReadPosRankSum=0.669;SOR=1.697;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,22:0.35:62
chr3	48675856	rs13096357	C	A	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.572;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=109;ReadPosRankSum=-0.947;SC=TAGACTCAGCCAGGCTCCTTG;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=6;WE=48675864;WS=48675846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr3	48678011	rs2310997	G	C	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.774;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=114;ReadPosRankSum=-1.564;SC=GGAAGAAAATGGGGGGCAGGG;SOR=0.223;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=9;WE=48678019;WS=48678001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
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chr3	48689787	rs12107418	A	G	777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=10;PP=508;ReadPosRankSum=0.669;SC=CCACTTGAATACTGCCTTTCA;SOR=0.622;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=50;TCR=21;TR=33;WE=48689795;WS=48689777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,36:0.49:74
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chr3	48691316	rs12107252	T	C	2578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.376;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=65;PP=1397;ReadPosRankSum=-0.960;SC=CTTACTAAGCTGACAGTCTTT;SOR=0.925;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=243;TCF=118;TCR=125;TR=119;WE=48691324;WS=48691306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,132:0.50:264
chr3	48694147	rs2286651	G	A	1448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=22;PP=911;ReadPosRankSum=0.358;SC=AGCGCGGGCGGCAGACGCACG;SOR=0.703;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=70;TCR=41;TR=60;WE=48694155;WS=48694137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,66:0.51:129
chr3	48697654	rs3821875	C	G	3122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.815;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=61;PP=1925;ReadPosRankSum=-0.208;SC=CCCCTGGGTGCTGATGGCAAA;SOR=0.785;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=269;TCF=140;TCR=129;TR=133;WE=48697662;WS=48697644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,144:0.49:295
chr3	48699519	rs3733086	C	T	2665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=60;PP=1742;ReadPosRankSum=-1.480;SC=AGGACACCGGCTTGGGACCGT;SOR=0.698;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=280;TCF=148;TCR=132;TR=128;WE=48699527;WS=48699509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,134:0.45:299
chr3	48719453	rs34096717	A	C	2477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.425;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=56;PP=1527;ReadPosRankSum=1.926;SC=CCTCCACCTGAATTCCCCTAA;SOR=0.675;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=271;TCF=136;TCR=135;TR=112;WE=48719461;WS=48719443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,127:0.43:298
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chr3	48725707	rs1048940	C	T	1400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.595;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=24;PP=797;ReadPosRankSum=1.258;SC=CTAGCAAGCTCACTCCCCACT;SOR=0.759;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=144;TCF=88;TCR=56;TR=63;WE=48725715;WS=48725697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,69:0.43:159
chr3	48727112	rs4858798	G	A	1788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.502;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=48;PP=1181;ReadPosRankSum=0.416;SC=AAGGCACCTCGTAGCGGGAAG;SOR=0.769;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=198;TCF=98;TCR=100;TR=90;WE=48727120;WS=48727102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,93:0.43:217
chr3	48732223	rs11557629	G	A	2029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.521;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=35;PP=1146;ReadPosRankSum=-0.935;SC=CGTCCCCCCAGTGGGGGACTA;SOR=0.638;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=178;TCF=110;TCR=68;TR=84;WE=48732231;WS=48732205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,97:0.47:208
chr3	48732480	rs17080319	T	C	2987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.467;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=52;PP=1789;ReadPosRankSum=-3.037;SC=ATCTCTCACATCTCCTCGCCA;SOR=0.745;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=220;TCF=122;TCR=98;TR=121;WE=48732488;WS=48732470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,136:0.55:247
chr3	48752654	rs11708786	C	T	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=9;PP=473;ReadPosRankSum=0.292;SC=ATTTGTTACCCAAGATTATCC;SOR=0.960;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=73;TCF=51;TCR=22;TR=33;WE=48752662;WS=48752644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,36:0.46:78
chr3	48754877	rs9834996	G	T	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=136;ReadPosRankSum=-0.316;SC=CTGACGGGCGGTTGGGTGGAT;SOR=0.368;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=9;WE=48754885;WS=48754867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr3	48845251	rs9311430	C	T	1807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.539;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=48;PP=1070;ReadPosRankSum=-1.306;SC=CATAGTCTTCCACACTCAATC;SOR=0.753;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=180;TCF=76;TCR=104;TR=81;WE=48845259;WS=48845241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,89:0.46:192
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chr3	48982732	rs9864243	G	A	311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=214;SC=GAGAGCTTCAGCCAGCTAGAG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=48982740;WS=48982722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
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chr3	48986546	rs371516194	CATTTATTT	C	164.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=5.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.30;MQRankSum=1.585;QD=8.67;ReadPosRankSum=-0.923;SOR=0.045;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
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chr3	49052013	rs200305005	TGTC	T	4301.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.541;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=52;PP=2928;ReadPosRankSum=-1.547;SC=TTGACCAGGCTGTCTTTTCCT;SOR=0.826;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=150;TCF=31;TCR=119;TR=67;WE=49052023;WS=49052003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,113:0.46:248
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chr3	49054692	rs3087866	T	C	4927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=62;PP=2568;SC=AACCAACTTCTGCCAAAGCAG;SOR=1.010;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=158;TCF=96;TCR=62;TR=158;WE=49054700;WS=49054682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr3	49055788	rs3923475	G	T	2008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=45;PP=1234;ReadPosRankSum=0.632;SC=GCCACGGCACGGGGCCCATCT;SOR=0.707;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=199;TCF=107;TCR=92;TR=93;WE=49055796;WS=49055778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,100:0.45:222
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chr3	49064110	rs11706052	A	G	4284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=459;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.520;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=85;PP=2459;ReadPosRankSum=-1.057;SC=CCACCTGTGTAGCAGCTCACC;SOR=0.747;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=414;TCF=215;TCR=199;TR=179;WE=49064118;WS=49064100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:254,205:0.45:459
chr3	49067904	rs61729488	T	C	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.964;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=209;ReadPosRankSum=-0.681;SC=AGTGCTTGCATTGGCCACTGC;SOR=0.098;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=18;WE=49067912;WS=49067894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,20:0.69:29
chr3	49070499	rs4974081	C	T	2752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=35;PP=1693;SC=TCTTGGATAGCTTCCACACTC;SOR=1.103;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=95;TCF=59;TCR=36;TR=94;WE=49070507;WS=49070489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr3	49114544	rs7626445	C	T	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=155;ReadPosRankSum=-0.940;SC=TACCCTTGCACAAGAGTGGAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=9;WE=49114552;WS=49114534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr3	49133310	rs9840050	A	G	663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=10;PP=395;ReadPosRankSum=0.751;SC=TACCACCACCACCAGCATGTC;SOR=0.799;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=47;TCR=22;TR=31;WE=49133318;WS=49133300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,33:0.46:72
chr3	49135961	rs13064784	C	G	3465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=368;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.229;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=75;PP=2060;ReadPosRankSum=2.229;SC=GAACCACAACCAGGACTGCAG;SOR=0.689;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=339;TCF=175;TCR=164;TR=156;WE=49135969;WS=49135951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:192,173:0.47:365
chr3	49137904	rs4521268	G	T	2895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=350;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=66;PP=1796;ReadPosRankSum=-0.047;SC=GGGGCAAAATGAAACAAAGTA;SOR=0.674;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=317;TCF=170;TCR=147;TR=140;WE=49137912;WS=49137894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:200,147:0.42:347
chr3	49139406	rs35673421	G	A	650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=18;PP=344;ReadPosRankSum=0.243;SC=ACAGAACTGAGTAGACCCCTA;SOR=0.680;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=63;TCF=24;TCR=39;TR=29;WE=49139414;WS=49139396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,33:0.48:69
chr3	49139966	rs4513485	G	A	1449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.358;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=28;PP=899;ReadPosRankSum=0.456;SC=GCCCCTGACTGATCCTACCCA;SOR=0.540;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=124;TCF=60;TCR=64;TR=59;WE=49139974;WS=49139956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,66:0.49:136
chr3	49141116	rs5030795	G	A	3093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.835;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=72;PP=1851;ReadPosRankSum=0.357;SC=GCTGGGGCCGGTGCCTGTTAA;SOR=0.822;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=298;TCF=147;TCR=151;TR=138;WE=49141124;WS=49141106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,153:0.47:323
chr3	49145741	rs3212	T	C	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.535;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=369;ReadPosRankSum=-1.079;SC=CAGCTTCCCATTGACAGAGCC;SOR=1.302;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=60;TCF=41;TCR=19;TR=30;WE=49145749;WS=49145731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,33:0.50:66
chr3	49148890	rs4292260	T	C	9861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=360;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=161;NR=153;PP=2965;SC=CCATCCTCCCTTATCCTCCTC;SOR=0.699;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=314;TCF=161;TCR=153;TR=314;WE=49148898;WS=49148880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,359:1.00:359
chr3	49156473	rs11552724	C	G	1786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=38;PP=1180;ReadPosRankSum=0.940;SC=GGATCTCCATCCTTGCTCTCC;SOR=0.660;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=185;TCF=99;TCR=86;TR=81;WE=49156481;WS=49156463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,89:0.43:207
chr3	49161660	rs34290943	T	C	2558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.129;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=46;PP=1529;ReadPosRankSum=1.862;SC=AGTGGAGCTCTTGGCACTCAG;SOR=0.506;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=182;TCF=89;TCR=93;TR=98;WE=49161668;WS=49161650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,115:0.55:209
chr3	49162284	rs34759087	C	T	2875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.296;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=50;PP=1696;ReadPosRankSum=1.998;SC=CCACTGCACTCACACAGTTGG;SOR=0.882;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=243;TCF=135;TCR=108;TR=122;WE=49162292;WS=49162274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,136:0.49:277
chr3	49166069	rs9865051	C	T	5908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=100;NR=92;PP=2965;SC=GAGGTTCAGCCCCAGATTAGA;SOR=0.740;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=193;TCF=100;TCR=93;TR=192;WE=49166077;WS=49166059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
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chr3	49200627	rs4955418	A	G	3806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=411;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.103;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=77;PP=2289;ReadPosRankSum=2.466;SC=GCCTTGGCCCATGCTGCCATG;SOR=0.598;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=370;TCF=209;TCR=161;TR=171;WE=49200635;WS=49200609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:220,191:0.46:411
chr3	49200692	rs4955419	T	A	4006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=515;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.121;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=90;PP=2357;ReadPosRankSum=-1.501;SC=AGCCTTGACCTGTGCTGCCTT;SOR=0.590;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=470;TCF=250;TCR=220;TR=184;WE=49200700;WS=49200682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:309,206:0.40:515
chr3	49210732	rs7617480	A	C	374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=241;SC=TCCAACCTAGATTTGAGCTGC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=49210740;WS=49210722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	49211989	rs10865954	T	C	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.903;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.34;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
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chr3	49215966	rs9837625	C	T	2338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=43;PP=1323;ReadPosRankSum=0.730;SC=GTCGCTGCGCCGGCTCCTTGA;SOR=0.684;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=175;TCF=99;TCR=76;TR=98;WE=49215974;WS=49215956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,108:0.56:194
chr3	49249381	rs9867285	A	G	605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=17;PP=451;SC=AGATCACAAGATCAGGAGATC;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=49249389;WS=49249371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr3	49269758	rs2099526	G	T	2001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=43;PP=1224;SC=AATCTAGCATGATTGACTTTA;SOR=1.852;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=19;TCR=43;TR=62;WE=49269766;WS=49269748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr3	49273996	rs12631989	C	T	1432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.802;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=12;PP=887;ReadPosRankSum=0.464;SC=AGAAGTCATCCAACTGGAATA;SOR=0.872;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=99;TCF=74;TCR=25;TR=53;WE=49274004;WS=49273986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,60:0.53:113
chr3	49294250	rs13068038	C	A	3578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=354;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.413;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=81;PP=2490;ReadPosRankSum=1.109;SC=GGGGGAAAGACAAGAAGCAGC;SOR=0.752;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=332;TCF=169;TCR=163;TR=158;WE=49294258;WS=49294240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:188,165:0.47:353
chr3	49298139	rs7626076	G	A	5191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=83;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.839;SC=CGGGACACCTGTGGCAGGGCT;SOR=0.298;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=186;TCF=102;TCR=84;TR=184;WE=49298147;WS=49298129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,194:0.99:195
chr3	49298205	rs4955417	T	C	7373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=121;NR=134;PP=2965;SC=GGGCCTCTGGTGGCCTGTAGG;SOR=0.849;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=256;TCF=121;TCR=135;TR=255;WE=49298213;WS=49298195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,274:1.00:274
chr3	49313978	rs13077498	C	T	2505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.307;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=47;PP=1630;ReadPosRankSum=-0.496;SC=GGTTTTCTCTCGGGGCACAGA;SOR=0.822;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=252;TCF=137;TCR=115;TR=111;WE=49313986;WS=49313968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,119:0.43:276
chr3	49322027	rs2304442	T	A	1903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.532;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=40;PP=1045;ReadPosRankSum=0.024;SC=CCTATGGGAATCAAAGCACTC;SOR=0.473;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=151;TCF=75;TCR=76;TR=85;WE=49322035;WS=49322017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,93:0.55:168
chr3	49343175	rs2230929	G	A	1430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.647;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=20;PP=833;ReadPosRankSum=0.156;SC=CCACATGGGCGTCCCTTCCAG;SOR=0.492;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=108;TCF=75;TCR=33;TR=61;WE=49343183;WS=49343165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,65:0.57:114
chr3	49362369	rs56038006	C	T	2310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.472;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=52;PP=1528;ReadPosRankSum=-0.611;SC=TGTTGTCTAGCTTGCTCAACT;SOR=0.735;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=211;TCF=102;TCR=109;TR=101;WE=49362377;WS=49362359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,110:0.46:239
chr3	49365269	rs6795772	C	T	1060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.498;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=28;PP=612;ReadPosRankSum=0.873;SC=GAAAAGAGCACATAAGTCACT;SOR=0.436;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=107;TCF=39;TCR=68;TR=47;WE=49365277;WS=49365259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,54:0.45:120
chr3	49373045	rs34514189	A	G	1955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.606;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=49;PP=1201;ReadPosRankSum=0.148;SC=GAGAGACAGAAATTTACTGTA;SOR=0.773;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=146;TCF=54;TCR=92;TR=77;WE=49373053;WS=49373035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,88:0.55:161
chr3	49394834	rs1050450	G	A	1136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.15;QD=28.42;SOR=1.292;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr3	49395673	rs139760138	GGCC	G	957.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=11;PP=516;SC=ACACCGACTGGGCCGCCGCCG;SOR=0.963;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=11;WE=49395683;WS=49395663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	49395757	rs1800668	G	A	615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=11;PP=323;SC=AACAAGCACTGTAAGGGGAGG;SOR=0.859;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=11;TCR=11;TR=22;WE=49395765;WS=49395747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	49406095	rs11716445	G	A	1253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.453;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=47;PP=894;ReadPosRankSum=-0.628;SC=ATGGCAGACGGTCTAAAACAG;SOR=0.456;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=131;TCF=38;TCR=93;TR=66;WE=49406103;WS=49406085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,59:0.46:127
chr3	49450449	rs6779524	C	T	2229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=19;PP=1548;SC=CAGATTCCCACCCCAGCCTTC;SOR=2.124;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=53;TCR=19;TR=72;WE=49450457;WS=49450439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr3	49455330	rs11715915	C	T	4254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=80;PP=2625;SC=CCACACGCCTCCGCTGCACCC;SOR=1.304;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=135;TCF=54;TCR=81;TR=134;WE=49455338;WS=49455320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr3	49463926	rs6762593	A	G	4915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=75;NR=99;PP=2810;SC=AAGCTCAAAGATCAAAGGTGC;SOR=0.986;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=190;TCF=75;TCR=115;TR=174;WE=49463934;WS=49463916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr3	49548008	rs2131107	C	G	2328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=18;PP=1505;SC=CTGCCCCTCTCGGGGAGGACC;SOR=1.824;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=55;TCR=18;TR=73;WE=49548016;WS=49547998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr3	49548294	rs2329024	T	C	3784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=80;PP=2602;SC=GAGTTCTCATTTTCCATTTTA;SOR=1.455;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=46;TCR=80;TR=126;WE=49548302;WS=49548284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr3	49568095	rs2311801	G	A	301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=247;SC=TCTCTAGGGGGGAGGAATCAG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=49568103;WS=49568085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	49570200	rs1801143	C	T	5909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=106;NR=104;PP=2965;SC=TCTACCTGCACACAGTCATTC;SOR=0.730;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=210;TCF=106;TCR=104;TR=210;WE=49570208;WS=49570190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr3	49689210	rs34762726	G	A	3134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=51;PP=1878;SC=CCAGGGCCTGGCCCCAAGTGA;SOR=0.804;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=104;TCF=53;TCR=51;TR=104;WE=49689218;WS=49689200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr3	49690199	rs4855885	G	A	5076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=65;PP=2965;SC=TCCGCAGCACGGCCCGCAAGA;SOR=0.990;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=160;TCF=95;TCR=65;TR=159;WE=49690207;WS=49690189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr3	49690496	rs11709525	C	T	8594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=139;NR=154;PP=2965;SC=AGACACCCTCCGGCAGCTCCA;SOR=0.875;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=293;TCF=139;TCR=154;TR=293;WE=49690504;WS=49690486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,321:1.00:321
chr3	49693055	.	C	T	3646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.338;ClippingRankSum=0.000;DP=371;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.375;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=76;PP=2399;ReadPosRankSum=-0.636;SC=TGAAGCACTCCTACAGCCTGG;SOR=0.666;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=337;TCF=176;TCR=161;TR=157;WE=49693063;WS=49693045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:202,169:0.46:371
chr3	49701983	rs9858542	G	A	4267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=80;PP=2604;SC=GCAAACTGACGGAAGGTATGC;SOR=1.079;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=143;TCF=63;TCR=80;TR=143;WE=49701991;WS=49701973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr3	49713753	rs6778597	T	C	3039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=24;PP=2355;SC=GCACTAGCTTTTAGGAAGCAG;SOR=1.814;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=65;TCR=24;TR=89;WE=49713761;WS=49713743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr3	49714225	rs1131095	T	C	6934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=116;NR=124;PP=2965;ReadPosRankSum=1.705;SC=CCCTGTATTATGTGGACCTCA;SOR=0.272;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=242;TCF=117;TCR=125;TR=240;WE=49714233;WS=49714215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,265:1.00:266
chr3	49715125	rs182355268	C	T	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.147;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=351;ReadPosRankSum=0.717;SC=TTCCTGCCGTCTGTTGCATCC;SOR=0.245;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=40;TCF=5;TCR=35;TR=21;WE=49715133;WS=49715115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,22:0.54:41
chr3	49719729	rs9822268	G	A	1324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=12;PP=933;SC=AGAGCGTCGAGGGGGCTGGGA;SOR=1.931;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=34;TCR=12;TR=46;WE=49719737;WS=49719719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr3	49721532	rs3197999	G	A	4469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=72;PP=2598;SC=GCTGGCCAGCGGGACCTTGCG;SOR=0.717;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=151;TCF=79;TCR=72;TR=151;WE=49721540;WS=49721522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr3	49721798	rs13085791	C	A	5141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=62;PP=2872;SC=TCTCACTCTCCCGCACACGTC;SOR=1.173;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=168;TCF=106;TCR=62;TR=168;WE=49721806;WS=49721788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr3	49722356	rs9837520	G	A	5239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;MQRankSum=6.686;NF=109;NR=90;PP=2917;ReadPosRankSum=-0.558;SC=GTGACTCTCAGTCCATTGCCC;SOR=0.834;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=218;TCF=120;TCR=98;TR=199;WE=49722364;WS=49722346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:10,210:0.95:220
chr3	49723735	rs184629099	C	G	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.64;MQRankSum=-0.917;QD=3.10;ReadPosRankSum=2.855;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr3	49724048	.	TC	T	95	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;FR=0.5000;HP=6;HapScore=2;MGOF=15;MMLQ=25;MQ=40.55;NF=0;NR=4;PP=95;QD=32.25;SC=CCCTCTTACCTCCCCGGCCAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=4;WE=49724056;WS=49724038;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr3	49724808	rs3020779	T	C	8735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=154;PP=2965;SC=TGTGATCATTTGGGAACTTGT;SOR=0.786;Source=Platypus;TCF=154;WE=49724816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,337:1.00:337
chr3	49734860	rs145265101	G	C	990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.737;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=24;PP=555;ReadPosRankSum=-1.412;SC=GCTTTGAGGGGCTTCTCCTGG;SOR=0.455;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=87;TCF=35;TCR=52;TR=42;WE=49734868;WS=49734850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,49:0.51:96
chr3	49736565	rs6785549	G	A	1863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=39;PP=1196;SC=ATGGCTGTGGGCTGCTCAGAA;SOR=1.131;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=25;TCR=39;TR=64;WE=49736573;WS=49736555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr3	49738270	rs112497172	G	A	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.672;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=293;ReadPosRankSum=-1.156;SC=GCTGCCCAACGTGGCATTTTC;SOR=1.954;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=3;TCR=40;TR=16;WE=49738278;WS=49738260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,15:0.35:43
chr3	49739086	rs1491986	C	T	1783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=25;PP=1196;SC=TGGCAAGGCCCCTGGCCTGGG;SOR=0.728;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=27;TCR=25;TR=52;WE=49739094;WS=49739076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr3	49739507	rs1491985	G	C	4996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=76;PP=2965;SC=TTCCTCACCTGACCTCCAGTG;SOR=0.704;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=166;TCF=90;TCR=76;TR=166;WE=49739515;WS=49739497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr3	49744392	rs3749241	A	G	1563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=43;PP=1145;SC=GTCTAGCAAGATTGTGCCAGG;SOR=3.528;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=6;TCR=43;TR=49;WE=49744400;WS=49744382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr3	49749976	rs34823813	G	A	2921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=59;PP=1625;ReadPosRankSum=-0.377;SC=CACGGTGATCGCACAGGGTCT;SOR=0.696;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=292;TCF=163;TCR=129;TR=134;WE=49749984;WS=49749966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,149:0.46:324
chr3	49750188	rs3749240	T	A	3118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=53;PP=1837;SC=AGCAACACACTTCTGTGGGGG;SOR=0.912;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=46;TCR=53;TR=99;WE=49750201;WS=49750178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr3	49753003	rs34614773	T	G	2341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=22;PP=1408;SC=CCTGTCCCCCTGCAGAGCCCT;SOR=1.802;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=55;TCR=22;TR=77;WE=49753011;WS=49752993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr3	49753788	rs11720705	A	G	3945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=49;PP=2256;SC=AAGCAGGAGCATGTGGGTGGC;SOR=1.186;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=85;TCR=49;TR=134;WE=49753796;WS=49753778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr3	49760039	rs1466685	T	C	6619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=125;NR=92;PP=2965;SC=CTGGATGCGCTGCAGCACTGC;SOR=0.998;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=218;TCF=125;TCR=93;TR=217;WE=49760047;WS=49760029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr3	49785133	rs7374183	G	A	718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=3;PP=563;SC=AAGTGACTTCGTGCTTTGAGA;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=24;WE=49785141;WS=49785123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	49832788	rs73079003	G	A	1307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.681;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=24;PP=603;ReadPosRankSum=0.024;SC=CTCTAGGGGCGTGGTGGTCCG;SOR=0.787;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=105;TCF=54;TCR=51;TR=51;WE=49832796;WS=49832778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,61:0.51:119
chr3	49877585	rs9858428	G	T	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.197;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=169;ReadPosRankSum=0.852;SC=GGCACACCCTGACCCAGGAGG;SOR=0.269;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=11;WE=49877593;WS=49877575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr3	49928691	rs7433231	T	C	5336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=106;NR=88;PP=2797;SC=TACTCCATGCTGCGGGCTACC;SOR=0.742;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=194;TCF=106;TCR=88;TR=194;WE=49928699;WS=49928681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr3	50103917	rs2023953	G	A	1646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.579;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=37;PP=817;ReadPosRankSum=-0.390;SC=AACACCAGCAGCTGTCAGACC;SOR=0.779;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=145;TCF=69;TCR=76;TR=71;WE=50103925;WS=50103900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,81:0.49:165
chr3	50114515	rs7061	C	T	3488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=52;PP=1941;SC=ACGAGACTTACCGAGATGCTG;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=111;TCF=59;TCR=52;TR=111;WE=50114523;WS=50114505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr3	50129374	rs5848907	T	TA	1247.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=1;PP=1253;SC=ACTATTTGGATTATCTTATAA;SOR=6.932;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=30;WE=50129382;WS=50129364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr3	50129399	rs2013208	C	T	2003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=13;PP=1490;SC=ATCTGTGGGCCGTGTGTATTT;SOR=2.765;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=65;TCF=52;TCR=13;TR=64;WE=50129407;WS=50129389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr3	50144667	rs3216783	C	CT	756.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.959;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.085;NF=1;NR=20;PP=452;ReadPosRankSum=-0.141;SC=GTAAATTTCCCTTTTTTTAGT;SOR=0.551;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=61;TCF=5;TCR=56;TR=21;WE=50144675;WS=50144657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,34:0.47:72
chr3	50144951	rs1061474	T	C	4923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=90;PP=2965;SC=GCGTCAGCGCTTTCTCTGTAG;SOR=1.098;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=160;TCF=70;TCR=90;TR=160;WE=50144959;WS=50144941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr3	50148305	rs2301166	C	G	380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=11;PP=315;SC=ATATATGACTCAGATTAGTTT;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=50148313;WS=50148295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	50153356	rs1138536	T	C	5850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=110;NR=93;PP=2965;SC=TGGACATCTATCGACGATCCA;SOR=0.768;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=204;TCF=110;TCR=94;TR=203;WE=50153364;WS=50153346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr3	50155887	rs112672304	TGA	T	614.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.868;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.316;NF=2;NR=19;PP=673;ReadPosRankSum=-0.574;SC=TGAGATGGAGTGAGAGAGAGA;SOR=0.868;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=81;TCF=4;TCR=77;TR=21;WE=50155896;WS=50155877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,29:0.27:108
chr3	50197097	rs1046953	C	T	3720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.826;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=67;PP=2276;ReadPosRankSum=-1.214;SC=CCCTACTGACCGGGGCCTGGC;SOR=0.843;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=328;TCF=190;TCR=138;TR=162;WE=50197105;WS=50197087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:179,177:0.50:356
chr3	50222926	rs1046956	T	A	3069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=64;NR=46;PP=1751;SC=TGACCAGGAGTTGGAGGAGCT;SOR=0.914;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=110;TCF=64;TCR=46;TR=110;WE=50222934;WS=50222916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr3	50223593	rs2073726	T	A	3803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=60;PP=2358;SC=CCTAGGGGAGTCTTATGGGTA;SOR=0.708;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=130;TCF=69;TCR=61;TR=129;WE=50223601;WS=50223583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr3	50223977	rs11717349	C	T	2129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=46;NR=18;PP=1313;SC=CCCTCGGTGCCTGCCCCGAAG;SOR=1.810;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=46;TCR=18;TR=64;WE=50223985;WS=50223967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr3	50224225	rs12632110	A	G	3650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=57;PP=1950;SC=GAGTCCTTGCACAGTGGTGAA;SOR=0.898;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=117;TCF=59;TCR=58;TR=116;WE=50224233;WS=50224215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr3	50225029	rs11711407	A	G	3327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=34;PP=1955;SC=TGGAAATCCCACATGGGTGCC;SOR=1.554;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=79;TCR=34;TR=113;WE=50225037;WS=50225019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr3	50251833	rs5848902	A	AG	6779.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQ=60.11;NF=32;NR=72;PP=2936;SC=CTGTGCCTACAGGTCGAGGAC;SOR=0.735;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=110;TCF=34;TCR=76;TR=104;WE=50251841;WS=50251823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr3	50306752	rs67324803	G	GC	1925.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=28;PP=1132;SC=GCCGCCCCCAGCCCCCACGCC;SOR=1.329;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=35;TCF=2;TCR=33;TR=30;WE=50306760;WS=50306742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr3	50308718	rs4688739	A	G	1680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=14;PP=1258;SC=AACCTCACTCACTCCCAGAGC;SOR=2.419;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=46;TCR=14;TR=60;WE=50308726;WS=50308708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr3	50324112	rs147362726	A	G	1851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.762;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=36;PP=1136;ReadPosRankSum=0.638;SC=CAGCAGGCACACTGCGCCCCT;SOR=0.832;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=176;TCF=99;TCR=77;TR=86;WE=50324120;WS=50324102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,93:0.48:192
chr3	50329826	rs1076872	A	G	6976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=148;NR=101;PP=2965;SC=GCCACACGCCACGCGCGCCAC;SOR=1.102;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=249;TCF=148;TCR=101;TR=249;WE=50329834;WS=50329816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
chr3	50332697	rs13100173	G	A	1603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.138;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=27;PP=950;ReadPosRankSum=1.284;SC=AGGCTGTGGTGGATCTGGTAG;SOR=0.500;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=118;TCF=73;TCR=45;TR=65;WE=50332705;WS=50332687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,74:0.52:141
chr3	50339622	rs116482870	C	T	1418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.961;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=24;PP=828;ReadPosRankSum=1.816;SC=TGTGACTTCCCTGTGCCCTCC;SOR=0.934;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=134;TCF=74;TCR=60;TR=59;WE=50339634;WS=50339612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,65:0.44:147
chr3	50357869	rs709210	A	C	1075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=24;PP=670;ReadPosRankSum=-0.316;SC=ATGGCCCATGACACCGCCAGC;SOR=0.709;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=96;TCF=46;TCR=50;TR=46;WE=50357877;WS=50357859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,52:0.48:108
chr3	50378090	rs373116746	G	A	2497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.210;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=58;PP=1392;ReadPosRankSum=-1.299;SC=GGTGGCCACGGCCAGGGACCA;SOR=0.851;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=203;TCF=95;TCR=108;TR=102;WE=50378098;WS=50378080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,119:0.51:235
chr3	50387873	rs73082914	C	T	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=213;ReadPosRankSum=1.146;SC=TCTGACTATCCTCTAGCCTCA;SOR=1.179;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=12;WE=50387881;WS=50387863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr3	50597092	rs1034405	G	A	8539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=137;NR=162;PP=2965;SC=GGCCACTCACGCATGGATGGC;SOR=0.875;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=299;TCF=137;TCR=162;TR=299;WE=50597100;WS=50597082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,321:1.00:321
chr3	50609123	rs636168	T	C	4837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=53;PP=2965;SC=CAGCCACTTATATTCTCTGTG;SOR=1.412;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=157;TCF=104;TCR=53;TR=157;WE=50609131;WS=50609113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr3	50609624	rs2232248	T	G	4584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=81;PP=2943;SC=TGTTTATTCCTCGGCCAGAAA;SOR=0.801;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=159;TCF=78;TCR=81;TR=159;WE=50609632;WS=50609614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr3	50645635	rs621975	T	G	5051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=98;PP=2965;SC=ACCAATCCAGTGCAAGTCAAG;SOR=1.051;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=172;TCF=74;TCR=98;TR=172;WE=50645643;WS=50645625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr3	50645793	rs622502	C	G	5110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=73;PP=2965;SC=TGCCTCCCCCCTCAGACTCAC;SOR=0.919;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=173;TCF=100;TCR=73;TR=172;WE=50645801;WS=50645783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr3	50678001	rs608961	C	T	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=20;PP=532;SC=CTCCCTGCCACGCTTCTAGGG;SOR=2.147;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=27;WE=50678009;WS=50677991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	50683809	rs876105	T	C	2302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=40;PP=1335;SC=TCCCCCTCTTTCCAGCTATGG;SOR=1.039;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=32;TCR=40;TR=72;WE=50683817;WS=50683799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr3	50684489	rs4468971	A	G	3527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=48;PP=2146;SC=AGGATGGAGTAGGGGGAACCA;SOR=0.933;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=116;TCF=67;TCR=49;TR=115;WE=50684497;WS=50684479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr3	50685574	rs35676349	CA	C	128.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=74;ReadPosRankSum=-0.374;SC=ATTCTTTTAACAAAAGGATTA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=4;WE=50685582;WS=50685564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr3	51246360	rs4301044	A	G	2333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=52;PP=1513;SC=CAGCACTTAGATTGGTTGGTG;SOR=1.528;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=30;TCR=52;TR=82;WE=51246368;WS=51246350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr3	51273711	rs1480362	A	G	1420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.658;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=14;PP=702;ReadPosRankSum=0.067;SC=AAATTCATTGATTTATGGAAG;SOR=0.524;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=92;TCF=66;TCR=26;TR=47;WE=51273719;WS=51273701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,62:0.55:112
chr3	51273773	rs1480361	T	C	7127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=126;NR=108;PP=2965;SC=TATGTTGTTTTAGTTTCTGCA;SOR=0.811;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=234;TCF=126;TCR=108;TR=234;WE=51273781;WS=51273763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr3	51274902	rs11386090	T	TA	2158.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.427;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.971;NF=16;NR=19;PP=1309;ReadPosRankSum=-1.299;SC=CCTGATGGCTTACTCTCCATA;SOR=0.534;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=80;TCF=38;TCR=42;TR=35;WE=51274910;WS=51274892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,70:0.52:134
chr3	51349887	rs2170177	C	A	1380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.192;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=24;PP=778;ReadPosRankSum=-0.047;SC=GTCACATTTTCTCTTTCTCTG;SOR=0.522;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=122;TCF=77;TCR=45;TR=60;WE=51349895;WS=51349877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,67:0.49:137
chr3	51393457	rs2306431	C	T	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=181;ReadPosRankSum=0.741;SC=GAGGAGATGACAGGGGTCAGC;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=10;WE=51393465;WS=51393447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr3	51393706	rs35251332	C	CAG	6043.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=62;PP=2930;SC=TCTAGGAAAACGGGCAGTACA;SOR=1.072;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=76;TCF=14;TCR=62;TR=75;WE=51393714;WS=51393696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr3	51394259	rs2306430	G	C	116.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.441;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=107;ReadPosRankSum=-0.366;SC=GAAGTGGAAAGGGTCCAGGGA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=5;WE=51394267;WS=51394249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr3	51395571	rs1542574	C	T	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=172;ReadPosRankSum=0.182;SC=TCCAGACCTACGCCACAAACC;SOR=1.112;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=10;WE=51395579;WS=51395561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr3	51399347	rs146000863	G	A	3166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.401;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=66;PP=1906;ReadPosRankSum=0.077;SC=CCTCACATGCGTCTAGTGAAG;SOR=0.740;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=297;TCF=159;TCR=138;TR=143;WE=51399355;WS=51399337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,157:0.48:327
chr3	51399933	rs3830230	CCTG	C	3075.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.479;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.594;NF=26;NR=56;PP=2964;ReadPosRankSum=-0.003;SC=AGACCTCTATCCTGCTGATTT;SOR=0.569;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=180;TCF=67;TCR=113;TR=82;WE=51399943;WS=51399923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,148:0.48:311
chr3	51411797	rs3828395	T	C	758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.913;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=8;PP=569;ReadPosRankSum=1.458;SC=ACCCTAACTGTAAGGGACACC;SOR=1.557;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=77;TCF=55;TCR=22;TR=33;WE=51411805;WS=51411787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,34:0.41:83
chr3	51418348	rs2241784	G	A	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.382;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=193;ReadPosRankSum=-1.800;SC=GGAGCTTGCTGCTGAAGAAAC;SOR=1.685;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=14;WE=51418356;WS=51418338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,13:0.30:43
chr3	51422741	.	CGGA	C	61	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=61;QD=22.3333333333;SC=GCGGCGGCAGCGGAGGAGGAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=3;WE=51422751;WS=51422731;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:12,3:0.20:15
chr3	51422766	rs13091931	G	T	874.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.73;SOR=0.874;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	51422904	rs72945708	C	G	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.44;ReadPosRankSum=-0.737;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr3	51425481	rs2304512	T	C	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=350;ReadPosRankSum=-0.158;SC=GAATAGGCCTTATTGAAGAAG;SOR=0.756;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=16;WE=51425489;WS=51425471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,17:0.71:24
chr3	51426316	rs73837443	C	A	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.471;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=153;ReadPosRankSum=-0.344;SC=GTCAGTGACTCTCCCTGCTCT;SOR=0.245;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=15;WE=51426324;WS=51426306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,16:0.42:38
chr3	51428887	rs57700326	C	G	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.69;ReadPosRankSum=1.119;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr3	51430657	rs3804766	A	C	2663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.598;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=62;PP=1710;ReadPosRankSum=-0.585;SC=CAACCCATTCACCATATGAGG;SOR=0.791;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=243;TCF=124;TCR=119;TR=122;WE=51430665;WS=51430647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,136:0.49:276
chr3	51457035	rs3749317	T	C	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.670;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=69;ReadPosRankSum=-0.765;SC=AAGGAACCCATGGTTGACAAA;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=5;WE=51457043;WS=51457033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr3	51468217	rs12494979	A	G	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.707;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=267;ReadPosRankSum=1.397;SC=AAGACTACCTATCTTGCATAA;SOR=0.169;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=39;TCF=33;TCR=6;TR=18;WE=51468225;WS=51468207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,20:0.48:42
chr3	51469107	rs4611808	C	T	2480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=46;NR=38;PP=1204;SC=TTTGTTAATACAAAACAAGCA;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=46;TCR=38;TR=84;WE=51469115;WS=51469097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr3	51471298	rs201942404	A	G	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.15;ReadPosRankSum=0.312;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr3	51472033	rs17661242	A	G	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=208;ReadPosRankSum=0.489;SC=ATCTTGGCTAATTTTATACCT;SOR=0.784;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=14;WE=51472041;WS=51472023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr3	51474182	rs17712228	G	A	3832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=374;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=97;PP=2327;ReadPosRankSum=0.637;SC=TAACACCTAAGTTTCTGTAGA;SOR=0.697;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=340;TCF=154;TCR=186;TR=172;WE=51474190;WS=51474172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:184,189:0.51:373
chr3	51505077	rs77859974	CACT	C	5836.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=359;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=4.125;NF=5;NR=76;PP=2968;ReadPosRankSum=0.338;SC=AATGGACCACCACTACAACAG;SOR=0.711;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=192;TCF=18;TCR=174;TR=81;WE=51505087;WS=51505067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:187,160:0.46:347
chr3	51517625	rs72112939	TTG	T,TTGTGTGTG	495.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=22;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;NF=6,6;NR=1,1;PP=204,342;SC=TTAAACTAGTTTGTGTGTGTG;SOR=3.767;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=7,7;WE=51517634;WS=51517615;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.54,0.46:13
chr3	51517653	rs3762714	G	A	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.40;MQRankSum=0.934;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.753;SOR=0.339;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr3	51672170	rs146938598	A	G	1822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.511;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=40;PP=1027;ReadPosRankSum=-0.574;SC=GAGAGGCCACACTGTGCTGAA;SOR=0.717;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=185;TCF=99;TCR=86;TR=89;WE=51672178;WS=51672160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,98:0.48:205
chr3	51697493	rs904145	A	G	5131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=80;NR=97;PP=2965;SC=CACCAAGCTGAAAGGCAGTGA;SOR=1.057;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=177;TCF=80;TCR=97;TR=177;WE=51697501;WS=51697483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr3	51737965	rs11553574	G	A	1240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.719;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=24;PP=753;ReadPosRankSum=-1.991;SC=CTGGACCCTGGGACTGAGCCC;SOR=0.800;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=96;TCF=51;TCR=45;TR=54;WE=51737973;WS=51737955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,57:0.53:107
chr3	51812952	rs11130296	C	T	2476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.800;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=58;PP=1435;ReadPosRankSum=1.780;SC=CAGTAACGTCCGGCGCACCAT;SOR=0.873;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=226;TCF=111;TCR=115;TR=110;WE=51812960;WS=51812942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,121:0.49:246
chr3	51813018	rs73080680	G	A	2007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.072;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=42;PP=1243;ReadPosRankSum=-1.033;SC=CTGATTGGGGGAAAGGAAAAA;SOR=0.788;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=186;TCF=95;TCR=91;TR=83;WE=51813026;WS=51813008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,94:0.45:208
chr3	51863322	rs75800791	G	A	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.663;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=273;ReadPosRankSum=0.577;SC=AGGAGAGCCAGGTATTTTCTC;SOR=2.105;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=15;WE=51863330;WS=51863312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
chr3	51895850	rs986539	C	T	2128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=31;PP=1461;SC=CATTTATGTACTTCCCATTTA;SOR=0.721;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=33;TCR=31;TR=64;WE=51895858;WS=51895840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr3	51907736	rs7635409	A	G	1234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=18;PP=735;ReadPosRankSum=0.356;SC=GGACACAGATATAGCAGACCT;SOR=0.717;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=114;TCF=74;TCR=40;TR=50;WE=51907744;WS=51907726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,57:0.44:129
chr3	51908226	rs1505403	T	C	2253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=42;PP=1615;SC=CAGGGTATGCTAGGAAGGGGC;SOR=1.164;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=28;TCR=42;TR=70;WE=51908234;WS=51908216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr3	51908430	rs6794320	T	C	9001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=144;NR=153;PP=2965;SC=GCTACCTCATTCCATTTTCCA;SOR=0.782;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=297;TCF=144;TCR=153;TR=297;WE=51908438;WS=51908420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,328:1.00:328
chr3	51911057	rs192562621	A	T	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=24;PP=613;ReadPosRankSum=1.299;SC=CTGAATGGGAACTATGTGGGT;SOR=0.685;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=101;TCF=41;TCR=60;TR=38;WE=51911065;WS=51911047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,40:0.36:110
chr3	51911103	rs201734789	TTTTTC	T	245.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.57;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	51929360	rs34574240	GA	G	678.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=16;PP=483;SC=GGGCTTTCAAGAAAAAAAGAG;SOR=2.215;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=17;WE=51929368;WS=51929350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	51936949	rs7635125	T	C	11282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=414;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=210;NR=170;PP=2965;SC=AGACACTAGCTACTAGCACTA;SOR=0.870;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=381;TCF=210;TCR=171;TR=380;WE=51936957;WS=51936939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,414:1.00:414
chr3	51970296	rs115426717	T	G	2611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.476;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=50;PP=1445;ReadPosRankSum=-0.592;SC=CGGTGTCCTGTGAAGGTGTAC;SOR=0.613;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=234;TCF=119;TCR=115;TR=112;WE=51970304;WS=51970286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,129:0.49:264
chr3	51978220	rs28547534	A	G	7784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=124;NR=139;PP=2965;SC=TGCTGGAACCACTGGGGCCGT;SOR=0.852;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=263;TCF=124;TCR=139;TR=263;WE=51978228;WS=51978210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,296:1.00:296
chr3	51990119	rs28587738	A	C	977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=13;PP=577;SC=CCTGCTCGGCACGCCGCCCGC;SOR=0.804;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=19;TCR=13;TR=32;WE=51990127;WS=51990109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr3	51990315	rs28651222	A	G	3943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.44;SOR=0.706;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr3	52110089	rs41292354	C	T	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.063;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=80;ReadPosRankSum=-0.425;SC=ACTTGGCTGCCTCAGCCACTG;SOR=0.551;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=5;WE=52110097;WS=52110079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr3	52272945	rs11441245	C	CG	1037.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=5.006;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.31;ReadPosRankSum=0.548;SOR=1.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,37:0.97:38
chr3	52366296	rs181418923	A	G	3965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=411;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.519;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=82;PP=2551;ReadPosRankSum=0.538;SC=CTGCTGCTCTACAACTTGTAT;SOR=0.729;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=373;TCF=196;TCR=177;TR=176;WE=52366304;WS=52366281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:221,190:0.46:411
chr3	52395870	rs143963612	G	A	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=1.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.92;ReadPosRankSum=-0.336;SOR=0.425;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,11:0.27:41
chr3	52415865	rs770284	A	G	765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=22;PP=626;SC=GAGCGCCTCCAGGGCGTGCTG;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=52415873;WS=52415855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	52430698	rs365048	A	G	7299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=147;NR=115;PP=2965;SC=CTGGAGCGCCATAAGTTTGGG;SOR=0.914;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=262;TCF=147;TCR=115;TR=262;WE=52430706;WS=52430680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,278:1.00:278
chr3	52436552	.	G	T	1058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.362;ClippingRankSum=0.000;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.932;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=20;PP=720;ReadPosRankSum=-0.547;SC=GAGGCCAGGGGAGGGGAGCTG;SOR=0.464;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=74;TCF=43;TCR=31;TR=45;WE=52436560;WS=52436542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,46:0.60:77
chr3	52438427	rs150454901	C	T	2040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.825;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=30;PP=1119;ReadPosRankSum=-0.845;SC=GGATGGGATCCGAAGCACCTA;SOR=0.930;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=146;TCF=89;TCR=57;TR=83;WE=52438435;WS=52438417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,93:0.57:163
chr3	52440200	rs141765555	T	C	1417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.397;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=17;PP=670;ReadPosRankSum=1.049;SC=AGACAAATGCTGTGGGGGAAG;SOR=0.473;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=109;TCF=76;TCR=33;TR=55;WE=52440208;WS=52440190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,67:0.54:125
chr3	52442240	rs187250016	T	C	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.126;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=325;ReadPosRankSum=0.700;SC=CTAATGTTTATTCATTTAACA;SOR=0.050;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=45;TCF=7;TCR=38;TR=22;WE=52442248;WS=52442230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,24:0.50:48
chr3	52453893	rs498778	C	T	1822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=19;PP=1019;SC=CCAACAGAGGCTTCCATGGAT;SOR=1.263;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=41;TCR=19;TR=60;WE=52453901;WS=52453883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr3	52471942	rs82825	G	A	734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=19;NR=8;PP=469;SC=GGCCACAGGGGTGAGTTCCAG;SOR=1.460;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=27;WE=52471950;WS=52471932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	52476364	rs200247801	C	T	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.552;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=11;PP=219;ReadPosRankSum=-1.349;SC=AGAGGGGGTGCCCACCATCTC;SOR=0.358;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=56;TCF=20;TCR=36;TR=22;WE=52476372;WS=52476354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,24:0.51:47
chr3	52477080	rs2016575	T	C	5682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=100;PP=2880;SC=TTTCGGACCATGGCTCCTGGG;SOR=0.878;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=199;TCF=99;TCR=100;TR=199;WE=52477088;WS=52477070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr3	52478815	.	G	A	159	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=26;MQ=59.63;NF=6;NR=6;PP=159;QD=16.1476010456;SC=ACACAAACACGGCACACGCAC;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=12;TCR=12;TR=12;WE=52478823;WS=52478773;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:12,12:0.50:24
chr3	52488202	rs1035002	C	T	414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=13;PP=330;SC=TGAGTCCCCACGTCCTCTGCC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=52488210;WS=52488192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	52489564	rs968588	A	T	363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.98;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	52492085	rs4687614	G	A	1393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=29;PP=825;SC=ATATAACTGCGTTCATTAATA;SOR=1.802;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=15;TCR=29;TR=44;WE=52492093;WS=52492075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr3	52492707	rs1541495	T	C	4469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=65;PP=2529;SC=TTGATAAAAATCTGCTTCCGC;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=75;TCR=65;TR=140;WE=52492715;WS=52492697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr3	52505758	rs3065763	G	GAT	3830.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=25;PP=2365;SC=TGACAGAAAAGGTGGAAATCC;SOR=1.556;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=50;TCF=25;TCR=25;TR=49;WE=52505766;WS=52505748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr3	52506282	rs4312651	A	G	2184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=30;PP=1467;SC=TGGGCATGCGACACTGTTCCC;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=46;TCR=30;TR=76;WE=52506290;WS=52506272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr3	52506426	rs6784615	C	T	2910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=47;PP=1562;SC=TAAGGCCCAGCGCTGCACAGC;SOR=0.808;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=92;TCF=45;TCR=47;TR=92;WE=52506434;WS=52506416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr3	52506491	rs6445486	A	G	1741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=27;PP=841;SC=TGGGTGTCCTAATTTAATCAT;SOR=1.214;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=22;TCR=27;TR=49;WE=52506499;WS=52506481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr3	52510592	rs9856575	G	A	7091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=145;PP=2965;SC=CCACAACAGCGTCTCCGAGAT;SOR=1.232;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=245;TCF=100;TCR=145;TR=245;WE=52510600;WS=52510582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
chr3	52512318	rs2109559	A	G	3762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=56;PP=2397;SC=AGGACCTCACAGTTTTGGGAT;SOR=0.812;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=128;TCF=72;TCR=56;TR=128;WE=52512326;WS=52512308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr3	52513940	rs4687618	T	C	954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=29;PP=671;SC=GGAGCCAGTTTGGGGGGCTTG;SOR=2.712;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=36;WE=52513948;WS=52513930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr3	52518786	rs4687619	T	C	2145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=60;PP=1533;SC=CTCTGCTTTGTGCCACGGTCT;SOR=2.332;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=20;TCR=60;TR=80;WE=52518794;WS=52518776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr3	52519795	rs145370808	C	T	1899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.495;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=34;PP=1080;ReadPosRankSum=1.013;SC=CTCCATCAGGCAGCTTCCGAT;SOR=0.656;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=204;TCF=123;TCR=81;TR=86;WE=52519803;WS=52519778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,96:0.42:226
chr3	52523405	rs887515	C	T	3067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=48;NR=58;PP=2024;SC=CCGGCCCCAGCGGAAGTCCCA;SOR=1.015;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=48;TCR=58;TR=106;WE=52523413;WS=52523395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr3	52524974	rs4687621	A	C	383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=12;PP=324;SC=CCACTTCTTAACCGGGGTGGG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=52524982;WS=52524964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	52536308	rs758801	A	C	799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=19;PP=529;SC=CAGATGCAGTACCTACAACCA;SOR=1.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=26;WE=52536316;WS=52536298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
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chr3	52544470	rs9835659	A	G	3814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=74;PP=2273;SC=TGAGCTGGACATGAGAGGTGG;SOR=1.139;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=56;TCR=74;TR=130;WE=52544478;WS=52544460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr3	52546487	rs7644763	C	T	6702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=111;PP=2965;SC=CTGTCTTCCCCGTGCTTGGGA;SOR=0.826;Source=Platypus;TCF=111;WE=52546495;WS=52546477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr3	52548818	rs740903	C	T	791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.763;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=20;PP=479;ReadPosRankSum=0.174;SC=CAAGTCGCTGCCTGCATAGCC;SOR=0.793;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=82;TCF=41;TCR=41;TR=37;WE=52548826;WS=52548808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,41:0.42:97
chr3	52554304	rs7630214	G	C	3365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.413;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=74;PP=2099;ReadPosRankSum=-0.511;SC=CCGAACGCGGGCCGTGAGTCT;SOR=0.649;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=289;TCF=141;TCR=148;TR=149;WE=52554312;WS=52554294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,161:0.52:309
chr3	52559167	.	CGGG	C,CG	1551.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;QD=31.67;SOR=5.186;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,27,22:0.55,0.45:49
chr3	52721238	rs140310455	G	C	1225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=11;PP=728;ReadPosRankSum=-0.051;SC=TTTGTAAGCAGACAAAATCTC;SOR=0.637;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=81;TCF=63;TCR=18;TR=45;WE=52721246;WS=52721228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,53:0.56:94
chr3	52771529	rs182197885	G	A	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.325;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=3;PP=407;ReadPosRankSum=-0.598;SC=TGTTATGTGTGATTTATATTT;SOR=0.982;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=55;TCF=46;TCR=9;TR=25;WE=52771537;WS=52771519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,27:0.47:58
chr3	52816229	rs146608756	C	T	2463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=61;PP=1454;ReadPosRankSum=0.941;SC=TGAACAAGAACGTGGTTTTTG;SOR=0.689;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=236;TCF=111;TCR=125;TR=115;WE=52816237;WS=52816219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,124:0.48:257
chr3	52840853	rs62255418	C	T	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.937;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=411;ReadPosRankSum=-0.632;SC=AAGGCACACCCCTAAAGGCAA;SOR=0.337;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=23;WE=52840861;WS=52840843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,23:0.70:33
chr3	52848207	rs77347777	C	T	1990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.508;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=40;PP=1187;ReadPosRankSum=0.038;SC=GCCTGGGCCCCGGTAATGGGC;SOR=0.741;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=178;TCF=96;TCR=82;TR=86;WE=52848215;WS=52848197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,97:0.47:206
chr3	52853340	rs7620907	G	C	1324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=7;PP=1038;SC=ACCCCACCCCGCTCTATGGGG;SOR=2.935;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=38;TCR=7;TR=45;WE=52853348;WS=52853330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr3	52853401	rs3821831	C	T	1212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.193;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=23;PP=768;ReadPosRankSum=1.066;SC=GGCCGGAAGGCAGCTTACAGA;SOR=0.506;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=138;TCF=89;TCR=49;TR=62;WE=52853409;WS=52853391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,62:0.43:144
chr3	52867288	rs4687661	A	T	8905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=344;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=168;NR=138;PP=2965;SC=AGTTCCTGGGAAAGGCTCCTG;SOR=0.829;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=306;TCF=168;TCR=138;TR=306;WE=52867296;WS=52867278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,344:1.00:344
chr3	52867595	rs60332615	C	A	2728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=54;NR=29;PP=1592;SC=CACACCTGCACCCCCATCCCC;SOR=1.361;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=54;TCR=29;TR=83;WE=52867603;WS=52867585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr3	52867715	rs6787916	G	C	7645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=133;NR=108;PP=2965;SC=TCAGGTCCTCGTCCTTCACAG;SOR=0.867;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=241;TCF=133;TCR=108;TR=241;WE=52867723;WS=52867705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,272:1.00:272
chr3	52867811	rs6776876	A	T	7900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=128;NR=142;PP=2965;SC=GCCTCGGTAGAAAGGCACACC;SOR=0.905;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=270;TCF=128;TCR=142;TR=270;WE=52867819;WS=52867801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,299:1.00:299
chr3	52868610	rs11922961	T	C	692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=1;PP=580;SC=GCCGGGCCCATAGCTACAAAT;SOR=4.003;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=52868618;WS=52868600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	52868668	rs142854055	G	GCACACA,GCACACACA	1919.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=2.911;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.80;MQRankSum=-0.105;QD=30.00;ReadPosRankSum=1.688;SOR=1.880;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:11,36,17:0.56,0.27:64
chr3	52868670	rs62255421	G	A	3311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=54;NR=19;PP=1112;SC=ACACAGATGCGCACACACACA;SOR=1.609;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=93;TCF=62;TCR=31;TR=73;WE=52868678;WS=52868654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr3	52868716	rs77032405	GC	G	6802.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=92;PP=2770;SC=ATCTATCTAGGCCCCCCCCAC;SOR=0.813;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=147;TCF=41;TCR=106;TR=126;WE=52868732;WS=52868704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr3	52870729	rs11431693	C	CA	6853.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.22;QD=36.85;SOR=0.904;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr3	52874446	rs6769789	C	T	1516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=11;PP=1050;SC=AACGATGCTGCGGGATGACCT;SOR=2.437;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=38;TCR=11;TR=49;WE=52874454;WS=52874436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr3	52874753	.	T	C	229	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=53;MMLQ=16;MQ=57.93;NF=1;NR=9;PP=229;QD=26.3771212547;SC=TCTCACCCTGTCACCCAGGCT;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=52874761;WS=52874743;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	52874779	rs7638431	G	A	46.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=15.43;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr3	52877647	rs55829187	C	CA	5904.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=30;PP=2025;SC=CTGAGGGCTACAGGTGAGCTT;SOR=1.005;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=52;TCF=20;TCR=32;TR=47;WE=52877657;WS=52877637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr3	52877649	rs56008508	G	A	5913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=32;PP=1426;SC=GAGGGCTACAGGTGAGCTTTC;SOR=1.038;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=82;TCF=49;TCR=33;TR=78;WE=52877657;WS=52877637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr3	52877720	rs4687668	T	C	5315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=71;PP=2556;SC=GGGATAAAAATGCAACATGGC;SOR=0.775;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=159;TCF=87;TCR=72;TR=158;WE=52877728;WS=52877710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr3	52878721	rs7650966	G	C	514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=0;PP=369;SC=CAGACCAAATGCAGGACACAT;SOR=4.294;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=52878729;WS=52878711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	52878746	rs10663469	C	CAG	1854.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=3;PP=1414;SC=AGAGTTAAAACAAGTTTGGTT;SOR=3.365;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=35;TCF=31;TCR=4;TR=31;WE=52878754;WS=52878736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr3	52878825	rs7629528	C	A	5632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=115;NR=84;PP=2965;SC=AGGAGCTGCTCATGCAGGGAC;SOR=0.936;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=200;TCF=115;TCR=85;TR=199;WE=52878833;WS=52878815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr3	52881634	rs5848962	T	TG	4459.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=55;PP=2685;SC=AAGAGAGCTGTGGTACCTCTT;SOR=0.976;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=66;TCF=8;TCR=58;TR=62;WE=52881642;WS=52881624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr3	52883654	rs3216716	CT	C	609.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=1;PP=632;SC=GGAGGGTGTGCTCAAACCCAG;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=52883662;WS=52883644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	52886914	rs4687675	A	T	1024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=24;PP=695;SC=GCCTTTGAAAACCCTAAAAGG;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=52886922;WS=52886904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr3	52952675	.	GTA	G	70	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=70;QD=40.5;SC=ATGTGTGTGTGTATATATATA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=2;WE=52952684;WS=52952665;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:3,2:0.40:5
chr3	52960013	rs11360013	GC	G	3409.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=22;PP=2485;SC=CTGCAGCCCTGCCATAGTGGC;SOR=1.994;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=63;TCF=40;TCR=23;TR=61;WE=52960021;WS=52960003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr3	52960256	rs34584015	AG	A	4191.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=56;PP=2392;SC=ATCATTTTAGAGGGGCGAAAA;SOR=2.135;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=1;TCR=67;TR=57;WE=52960269;WS=52960246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr3	52960261	rs34585187	C	A	4233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=58;PP=1892;SC=TTTAGAGGGGCGAAAAGCATT;SOR=2.184;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=81;TCF=22;TCR=59;TR=80;WE=52960269;WS=52960246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr3	52968726	rs2257216	T	C	2115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=20;PP=1254;SC=TCTCTAATAATAACGTTTATT;SOR=1.409;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=69;TCF=49;TCR=20;TR=69;WE=52968734;WS=52968716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr3	52968801	rs2710315	T	C	4683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=87;NR=67;PP=2242;SC=GGGTTTTCCATGCTGATGTGG;SOR=0.786;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=155;TCF=88;TCR=67;TR=154;WE=52968809;WS=52968791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr3	53003021	rs2245424	G	C	1828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=10;PP=1238;SC=ACTTCAAAGAGCTTCCAGTTC;SOR=2.722;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=44;TCR=10;TR=54;WE=53003029;WS=53003011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr3	53125922	rs11242	T	C	1117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.667;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=21;PP=640;ReadPosRankSum=-2.412;SC=CCTGAAGTCATGTCATTTTGT;SOR=1.042;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=94;TCF=55;TCR=39;TR=54;WE=53125930;WS=53125912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,55:0.56:99
chr3	53126143	rs2581786	G	A	979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.816;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=27;PP=597;ReadPosRankSum=-0.028;SC=CCTTCCTCTGGGACCAGCCAG;SOR=0.800;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=86;TCF=32;TCR=54;TR=43;WE=53126151;WS=53126133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,46:0.52:89
chr3	53126672	rs141077598	TTGCCCTGGACAAGGC	T	1730.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.702;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.895;NF=1;NR=22;PP=2930;ReadPosRankSum=1.508;SC=AGTGGTGACCTTGCCCTGGAC;SOR=1.344;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=46;TCF=4;TCR=42;TR=23;WE=53126694;WS=53126662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,45:0.57:79
chr3	53133526	rs2581829	A	G	1081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.017;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=28;PP=687;ReadPosRankSum=2.410;SC=ACTCACTGAGACTCCAGAGCC;SOR=1.147;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=83;TCF=33;TCR=50;TR=43;WE=53133534;WS=53133516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,48:0.51:95
chr3	53139506	rs2564942	CA	TG	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.831;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=180;ReadPosRankSum=-0.066;SC=AAGAGCAAAGCAAGAAGGCCA;SOR=0.169;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=6;WE=53139515;WS=53139504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr3	53154132	rs373476566	ATTAACT	A	37.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.55;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,2:0.40:5
chr3	53154139	rs199819350	GCACT	G	40.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.18;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,2:0.50:4
chr3	53156543	rs148576979	G	C	1328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.644;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=37;PP=870;ReadPosRankSum=0.563;SC=ACCAGATCCAGCCCAGGAATA;SOR=0.938;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=99;TCF=33;TCR=66;TR=52;WE=53156551;WS=53156533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,60:0.55:109
chr3	53212383	rs2306570	C	T	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=99;ReadPosRankSum=-0.444;SC=CCGCTGGTCCCGCCCGGCCGC;SOR=0.569;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=7;WE=53212391;WS=53212373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr3	53212574	rs2306571	C	G	729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.883;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=21;PP=443;ReadPosRankSum=-0.285;SC=AGGCTGGACCCTGGAGAGGGG;SOR=0.926;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=67;TCF=28;TCR=39;TR=33;WE=53212582;WS=53212564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,36:0.47:77
chr3	53212716	rs17052826	C	T	44.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=14.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr3	53213538	rs2035451	C	G	5922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=127;NR=64;PP=2965;SC=TGGAGGTCTACGAGGGAGGGA;SOR=1.465;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=191;TCF=127;TCR=64;TR=191;WE=53213546;WS=53213528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr3	53213657	rs2230493	T	C	3243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.736;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=85;PP=1871;ReadPosRankSum=-1.311;SC=CGACGTTCGATGCCCACATCT;SOR=0.943;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=324;TCF=151;TCR=173;TR=149;WE=53213665;WS=53213647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:192,162:0.46:354
chr3	53213815	.	C	CGTGT	95	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=9;MMLQ=22;MQ=60.0;NF=0;NR=7;PP=95;QD=14.4285714286;SC=CGAGCCGTGCCGTGTGTGTGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=7;WE=53213823;WS=53213805;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:19,7:0.27:26
chr3	53215875	rs11130350	A	C	1536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.565;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=40;PP=982;ReadPosRankSum=0.595;SC=CCCAGTGTAGATACAGCAGCT;SOR=0.914;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=179;TCF=90;TCR=89;TR=74;WE=53215883;WS=53215865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,78:0.41:188
chr3	53216051	rs6445568	T	C	418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=11;PP=298;SC=CCTCTTTTCCTCGGAGAGGCA;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=53216059;WS=53216041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	53220444	rs6793352	T	C	821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=18;PP=625;SC=GTGTCTCCCCTTCAGGCCACT;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=23;WE=53220452;WS=53220434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	53222761	rs2306574	C	T	9495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=354;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=164;NR=141;PP=2965;SC=CAATGTGCTGCTGGACCGGGA;SOR=0.704;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=306;TCF=164;TCR=142;TR=305;WE=53222769;WS=53222751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,354:1.00:354
chr3	53223291	rs7630600	T	G	1561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=25;NR=33;PP=991;SC=GCTGGGCTGGTCTGGGCTGGG;SOR=1.160;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=25;TCR=33;TR=58;WE=53223299;WS=53223281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr3	53223927	rs1075865	C	G	6852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=129;NR=111;PP=2965;SC=TGGGAGTGACCGGAAACATCA;SOR=0.794;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=241;TCF=130;TCR=111;TR=240;WE=53223935;WS=53223917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,269:1.00:269
chr3	53224002	rs900495	T	C	5595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=99;PP=2965;SC=TGGAGCCACCTTTCAGGCCCA;SOR=0.990;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=184;TCF=85;TCR=99;TR=184;WE=53224010;WS=53223992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr3	53259850	rs3163	C	T	2036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.930;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=47;PP=1048;ReadPosRankSum=0.628;SC=GCAGCTCAGCCGGCTTCCCAC;SOR=0.478;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=184;TCF=79;TCR=105;TR=89;WE=53259858;WS=53259840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,102:0.47:215
chr3	53260903	rs2279323	G	C	1438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=34;PP=1011;ReadPosRankSum=0.022;SC=TTCTGTGAGGGAGAGCACACG;SOR=0.637;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=97;TCF=44;TCR=53;TR=60;WE=53260911;WS=53260893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,63:0.58:109
chr3	53261019	rs41275535	C	G	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.719;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=125;ReadPosRankSum=-1.087;SC=GGGCCTGTCCCTGTCCCAGGG;SOR=0.346;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=8;WE=53261027;WS=53261009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr3	53262400	rs3736153	G	C	1507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.548;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=50;PP=899;ReadPosRankSum=-0.288;SC=GATAAACTGAGGATACAGGAT;SOR=0.898;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=182;TCF=75;TCR=107;TR=80;WE=53262408;WS=53262390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,82:0.42:195
chr3	53262472	rs3736154	G	A	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=232;ReadPosRankSum=1.952;SC=CCATGGGAGCGTTAGTTACTG;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=50;TCF=8;TCR=42;TR=18;WE=53262480;WS=53262462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,20:0.36:56
chr3	53263279	rs3736156	A	G	2233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.601;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=56;PP=1528;ReadPosRankSum=-0.395;SC=AGGTGTAAACACCCTGGCTAA;SOR=0.810;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=210;TCF=98;TCR=112;TR=100;WE=53263287;WS=53263269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,107:0.47:229
chr3	53264485	rs1131728	A	G	1440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.082;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=23;PP=948;ReadPosRankSum=0.541;SC=TGTTCTGCTCAGCAATGTAGC;SOR=0.889;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=140;TCF=90;TCR=50;TR=70;WE=53264493;WS=53264475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,73:0.48:153
chr3	53267100	rs2242300	C	A	602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=418;ReadPosRankSum=-0.517;SC=CCTGGATGTGCGGGTCAGAGC;SOR=0.787;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=47;TCF=35;TCR=12;TR=26;WE=53267108;WS=53267090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,26:0.55:47
chr3	53267133	rs6445573	G	C	2612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=33;PP=1757;SC=GTGTCTGGGCGAGGGGTGAAG;SOR=1.190;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=59;TCR=33;TR=92;WE=53267141;WS=53267123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr3	53267296	rs2242302	G	A	1253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=1.008;NF=26;NR=29;PP=651;ReadPosRankSum=-1.883;SC=GCCAACTGGGGACAGGGGGCA;SOR=0.667;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=118;TCF=51;TCR=67;TR=55;WE=53267304;WS=53267286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,62:0.50:125
chr3	53267342	rs2242303	G	A	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.447;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=17;PP=380;ReadPosRankSum=0.322;SC=CCACAACACCGAGGAGCCTTC;SOR=0.369;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=67;TCF=23;TCR=44;TR=29;WE=53267350;WS=53267332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,32:0.45:71
chr3	53269046	rs1051485	T	C	2358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.117;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=49;PP=1273;ReadPosRankSum=1.983;SC=GGTGCTGCAGTGGGGCCGGGT;SOR=0.497;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=197;TCF=115;TCR=82;TR=110;WE=53269054;WS=53269036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,117:0.55:213
chr3	53269163	rs1051483	G	A	2534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.399;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=52;PP=1261;ReadPosRankSum=1.438;SC=ACAGCTCCCCGTCTCCCAGCA;SOR=0.521;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=185;TCF=89;TCR=96;TR=105;WE=53269171;WS=53269153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,122:0.58:212
chr3	53269275	.	T	C	80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=0;NR=6;PP=80;QD=19.1285354245;SC=GGAGCCTGCATTCTGGGTAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=6;WE=53269283;WS=53269265;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,6:0.46:13
chr3	53276052	rs9827244	G	A	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.976;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=266;ReadPosRankSum=-2.394;SC=GCCCAGCCAGGTCTCCTCAAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=14;WE=53276060;WS=53276042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr3	53277476	rs7356056	C	T	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.836;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=213;ReadPosRankSum=1.973;SC=CTCCAATCAGCGCTCCCACCA;SOR=0.355;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=41;TCF=31;TCR=10;TR=17;WE=53277484;WS=53277466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,17:0.39:44
chr3	53277546	rs77351539	G	C	658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.568;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=12;PP=434;ReadPosRankSum=-1.331;SC=CCAGAAAACTGTCCATGCTGG;SOR=0.905;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=113;TCF=65;TCR=48;TR=32;WE=53277554;WS=53277536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,37:0.29:128
chr3	53277653	rs9858133	G	T	1082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.804;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=24;PP=588;ReadPosRankSum=0.229;SC=AAGAGGGAGGGGAGGACATGG;SOR=0.595;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=77;TCF=36;TCR=41;TR=45;WE=53277661;WS=53277643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,51:0.57:90
chr3	53321631	rs9628	A	C	2856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.378;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=59;PP=1785;ReadPosRankSum=-1.990;SC=TCTTGGTCAGAACCTGCAAGT;SOR=0.515;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=247;TCF=118;TCR=129;TR=122;WE=53321639;WS=53321621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,133:0.50:265
chr3	53324819	rs201612547	ATGGCAC	A	3161.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=18;NR=41;PP=2978;SC=CCTTACCGGGATGGCACTGGC;SOR=0.807;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=62;TCF=21;TCR=41;TR=59;WE=53324832;WS=53324809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr3	53324915	rs3732834	A	G	1506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.927;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.381;NF=27;NR=34;PP=910;ReadPosRankSum=-0.046;SC=AAAGACAGACAGATATAAGAA;SOR=0.944;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=122;TCF=56;TCR=66;TR=61;WE=53324923;WS=53324905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,76:0.52:147
chr3	53529013	rs312479	T	A	100.18	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=58;ReadPosRankSum=-0.366;SC=GTTTTTTTTTTAAATCAATTA;SOR=1.179;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=6;WE=53529021;WS=53529003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,6:0.86:7
chr3	53529140	rs312480	T	C	3228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=77;NR=42;PP=2204;SC=CGCCCCCGCCTCAACGCCCAG;SOR=1.123;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=119;TCF=77;TCR=42;TR=119;WE=53529148;WS=53529130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
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chr3	53766026	rs2612033	T	C	5508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=99;NR=103;PP=2868;SC=CCTCCCAAGATGTCTTTGTCA;SOR=0.789;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=202;TCF=99;TCR=103;TR=202;WE=53766034;WS=53766016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr3	53766212	rs2306866	A	T	107.90	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5064;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=40;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CAGCGTGCACATGAGCTGCTG;SOR=0.941;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=4;WE=53766220;WS=53766202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr3	53769479	rs1045958	C	T	3601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=352;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.752;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=81;PP=2009;ReadPosRankSum=-2.520;SC=TGCTGAGCAGCGCTGCCCTGG;SOR=0.593;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=317;TCF=145;TCR=172;TR=155;WE=53769487;WS=53769469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,177:0.50:351
chr3	53776995	rs2612026	T	C	3196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=39;PP=2073;SC=TTCTTTTCCTTTGGAGACAAA;SOR=1.270;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=71;TCR=39;TR=110;WE=53777003;WS=53776985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr3	53777176	rs2680648	T	C	1397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.572;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=35;PP=900;ReadPosRankSum=-0.327;SC=CCCAGAATTGTTGGGCTGAAT;SOR=0.768;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=148;TCF=72;TCR=76;TR=64;WE=53777184;WS=53777166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,71:0.41:172
chr3	53778620	rs28365115	C	G	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=235;ReadPosRankSum=0.986;SC=GCCTCTGAGTCGTGAAGAGAG;SOR=1.179;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=12;WE=53778628;WS=53778610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr3	53778875	rs2253795	G	T	1266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.883;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=32;PP=843;ReadPosRankSum=-0.476;SC=CTCTCCTCCCGGCTGGGCTGG;SOR=0.969;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=80;TCF=26;TCR=54;TR=46;WE=53778883;WS=53778865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,52:0.58:90
chr3	53779825	rs3821860	A	G	2444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.305;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=55;PP=1586;ReadPosRankSum=0.342;SC=GCATTTACTTAACTGCCTGTC;SOR=0.859;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=198;TCF=98;TCR=100;TR=105;WE=53779833;WS=53779815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,113:0.52:217
chr3	53796706	rs17252742	A	C	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-2.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.440;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-1.045;NF=3;NR=27;PP=453;ReadPosRankSum=-0.373;SC=GTTTTCATTAAGTCTGACATA;SOR=1.395;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=63;TCF=11;TCR=52;TR=30;WE=53796714;WS=53796696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,33:0.46:71
chr3	53796744	rs3774567	T	C	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.303;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.139;NF=3;NR=14;PP=296;ReadPosRankSum=1.518;SC=TGCCCTTAAATCTCCACACAC;SOR=0.061;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=17;WE=53796752;WS=53796734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,20:0.54:37
chr3	53806803	rs2278517	G	C	3180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=24;PP=2126;SC=TCAGGCTGTGGCGGGCCGTCA;SOR=1.668;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=53;TCR=24;TR=77;WE=53806825;WS=53806793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr3	53806817	rs35146621	G	A	1486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=22;PP=991;ReadPosRankSum=-0.030;SC=GCCGTCACGGGGACAGCCGGC;SOR=0.677;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=110;TCF=74;TCR=36;TR=63;WE=53806825;WS=53806793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,67:0.57:118
chr3	53814197	rs1829423	G	A	2416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=43;PP=1339;SC=CAGGAAAGGAGAGAGACATCA;SOR=1.312;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=31;TCR=43;TR=74;WE=53814205;WS=53814187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr3	53830440	rs71301852	C	T	2578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.653;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=62;PP=1605;ReadPosRankSum=-0.917;SC=AGGTCCAGGGCGGGGCTCTGG;SOR=0.818;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=203;TCF=93;TCR=110;TR=111;WE=53830448;WS=53830430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,121:0.55:219
chr3	53856653	rs2241808	C	T	3079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=71;PP=2067;SC=AGGCACAGGCCGCGCTCCACC;SOR=1.813;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=30;TCR=71;TR=101;WE=53856661;WS=53856643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr3	53857803	rs12676	A	C	3191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=40;PP=1694;SC=GCTCCCCGCGAGCACGTCCTT;SOR=0.941;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=58;TCR=40;TR=98;WE=53857811;WS=53857793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr3	53880789	rs2232332	A	G	1991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=45;PP=1335;SC=CTGCCGGCTCAAGGGGCATGC;SOR=1.931;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=65;TCF=19;TCR=46;TR=63;WE=53880797;WS=53880779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr3	53882663	rs1025690	G	A	10895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=412;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=148;NR=139;PP=2965;SC=CGGCTTCAACGTGACGCTTGG;SOR=0.733;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=289;TCF=149;TCR=140;TR=287;WE=53882681;WS=53882653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,410:1.00:410
chr3	53882673	rs5849009	G	GT	11793.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=409;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=127;PP=2975;SC=GTGACGCTTGGTTTTTTCTCT;SOR=0.698;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=188;TCF=38;TCR=150;TR=162;WE=53882681;WS=53882653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,383:1.00:383
chr3	53883722	rs1025689	C	G	2974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=65;NR=38;PP=1683;SC=ATCTAATCCCCGGAGACTTGA;SOR=1.009;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=65;TCR=38;TR=103;WE=53883730;WS=53883712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr3	53883910	rs4687751	C	T	1382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=33;PP=923;SC=TCCCCTTCTACGCATAACCAA;SOR=1.911;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=13;TCR=33;TR=46;WE=53883918;WS=53883900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr3	53892603	rs142978915	T	C	1107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.295;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=11;PP=649;ReadPosRankSum=1.560;SC=TACAGATGTGTGACCAAGGGG;SOR=0.222;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=63;TCF=50;TCR=13;TR=41;WE=53892611;WS=53892593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,45:0.66:68
chr3	53905613	.	C	G	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.953;ClippingRankSum=0.000;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.043;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=393;ReadPosRankSum=1.436;SC=TACCCTACTACTATAAAACAA;SOR=1.289;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=45;TCF=9;TCR=36;TR=23;WE=53905621;WS=53905603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,25:0.51:49
chr3	53910919	rs11419180	G	GT	516.79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=30;PP=488;ReadPosRankSum=-1.568;SC=ATGCTCAAGTGTTTTTTTTTC;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=30;WE=53910927;WS=53910909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,22:0.92:24
chr3	54157710	rs2290132	A	T	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.268;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=312;ReadPosRankSum=-0.217;SC=GTGAGCCCCGAGCAGCATCAG;SOR=1.739;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=44;TCF=15;TCR=29;TR=18;WE=54157718;WS=54157700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,23:0.43:53
chr3	54354510	rs9879885	T	C	6700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=116;NR=102;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.684;SC=TAGAAGAAATTGATGGCCTCC;SOR=0.243;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=219;TCF=117;TCR=102;TR=218;WE=54354518;WS=54354500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,252:1.00:253
chr3	54354624	rs150510815	C	T	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-4.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.523;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=21;PP=414;ReadPosRankSum=0.041;SC=CGCCTGAAGGCACAAAGGCAG;SOR=0.116;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=79;TCF=22;TCR=57;TR=35;WE=54354632;WS=54354614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,37:0.44:85
chr3	54401650	rs1868506	C	A	851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=21;PP=485;ReadPosRankSum=1.629;SC=GGGGCTTGAACGACCCCTGGC;SOR=0.608;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=30;TCR=43;TR=36;WE=54401658;WS=54401640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,42:0.46:92
chr3	54401666	rs1868507	G	A	739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.933;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=22;PP=453;ReadPosRankSum=1.739;SC=CTGGCCACAAGCTCTGCCCAT;SOR=0.941;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=62;TCF=23;TCR=39;TR=33;WE=54401674;WS=54401656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,36:0.48:75
chr3	54419977	rs9836159	C	T	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.633;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=14;PP=289;ReadPosRankSum=0.371;SC=TATCCTCTAGCCTATATTTTC;SOR=1.189;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=50;TCF=24;TCR=26;TR=23;WE=54419985;WS=54419967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,25:0.44:57
chr3	54596815	rs9814659	T	C	6909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=121;NR=103;PP=2965;SC=TCTCTCTCTTTCTTTTTTACA;SOR=0.766;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=224;TCF=121;TCR=103;TR=224;WE=54596823;WS=54596791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr3	54604029	rs2359855	C	T	2820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=344;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.292;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=67;PP=1702;ReadPosRankSum=-0.286;SC=TTTTAGTTGACGTCAGTGGCA;SOR=0.790;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=298;TCF=149;TCR=149;TR=132;WE=54604037;WS=54604019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:197,145:0.42:342
chr3	54604188	rs2251788	T	C	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-0.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.595;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=165;ReadPosRankSum=1.598;SC=CTTTTGGTAGTGACTGGTTAA;SOR=1.802;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=14;WE=54604196;WS=54604178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,16:0.37:43
chr3	54615971	rs6782115	A	G	1522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=28;PP=897;SC=TGATTGTTTCACAATAAATCT;SOR=1.047;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=24;TCR=28;TR=52;WE=54615979;WS=54615961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr3	54676441	rs3832224	CA	C	493.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=16;PP=519;SC=TTCTTGTTTTCAAAAAATGAA;SOR=3.500;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=17;WE=54676449;WS=54676431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	54786864	.	G	GT	52	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.9748;HP=13;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=21;MQ=55.91;NF=0;NR=4;PP=52;QD=14.5;SC=TCCAAATTATGTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=4;WE=54786872;WS=54786854;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr3	54798258	rs3732748	G	A	6960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=119;NR=112;PP=2965;SC=TTTTTACCCAGATCTCCACCT;SOR=0.701;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=232;TCF=120;TCR=112;TR=231;WE=54798266;WS=54798248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr3	54880461	rs3773603	A	G	2679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=64;PP=1456;ReadPosRankSum=-0.245;SC=CAAATAATGGATATATCCTGA;SOR=0.681;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=239;TCF=110;TCR=129;TR=120;WE=54880469;WS=54880451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,138:0.51:268
chr3	54919185	.	A	G	34	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=4;NR=0;PP=34;QD=17.1928031368;SC=GCTCCAAGGCAGGTCCCTTAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=54919193;WS=54919175;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr3	54919272	rs1405330	A	G	2845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=29;PP=1768;SC=TGGGGGAGTGATACTTATTCA;SOR=1.563;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=65;TCR=29;TR=94;WE=54919280;WS=54919262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr3	54919480	rs2293662	G	A	1877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=41;PP=1305;ReadPosRankSum=0.191;SC=TGTAAATATTGACATGCTCTT;SOR=0.702;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=177;TCF=94;TCR=83;TR=86;WE=54919488;WS=54919470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,89:0.46:192
chr3	54921903	rs3773594	T	C	583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.503;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=323;ReadPosRankSum=0.418;SC=AGCCTGCAGATGCTGCACAAT;SOR=1.270;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=38;TCF=30;TCR=8;TR=20;WE=54921911;WS=54921893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,23:0.55:42
chr3	54922235	rs2360659	G	A	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.391;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=290;ReadPosRankSum=0.279;SC=GAGCAGATTAGCGGCTCGGGC;SOR=0.201;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=44;TCF=8;TCR=36;TR=21;WE=54922243;WS=54922225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,24:0.49:49
chr3	54928496	rs1526595	T	C	3588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=47;PP=2009;SC=TGAATGTCACTGCCTTAAGTG;SOR=1.089;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=79;TCR=47;TR=126;WE=54928504;WS=54928486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr3	54928762	rs1526594	G	C	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.177;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=341;ReadPosRankSum=-1.580;SC=GTCCAGGTCAGGTTTATGAAG;SOR=0.218;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=40;TCF=5;TCR=35;TR=23;WE=54928770;WS=54928752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,24:0.59:41
chr3	54930699	rs6445708	A	T	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.342;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=9;PP=406;ReadPosRankSum=-1.875;SC=TTACCTGATGAAGGCTGTCGG;SOR=0.211;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=67;TCF=50;TCR=17;TR=30;WE=54930707;WS=54930689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,32:0.44:73
chr3	54930794	rs17054524	C	T	2076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.455;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=48;PP=1262;ReadPosRankSum=-1.797;SC=TGAAAGCTGGCGACAAGGAGA;SOR=0.740;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=226;TCF=120;TCR=106;TR=101;WE=54930802;WS=54930784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,110:0.42:262
chr3	54933763	rs41277455	G	A	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.267;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=383;ReadPosRankSum=0.547;SC=CTCTCTTAACGTGTACACTGT;SOR=1.127;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=54;TCF=36;TCR=18;TR=26;WE=54933771;WS=54933753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,31:0.52:60
chr3	54953022	rs3832225	CTT	C	218.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.651;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=19.88;ReadPosRankSum=-0.577;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr3	54961949	rs4245920	C	T	1666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.876;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=45;PP=1060;ReadPosRankSum=0.321;SC=GACTGAGTCTCCTTGGGCGTC;SOR=1.126;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=190;TCF=94;TCR=96;TR=80;WE=54961957;WS=54961939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,86:0.41:209
chr3	54962013	rs56327704	A	C	1054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.596;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=26;PP=661;ReadPosRankSum=0.013;SC=CACGAAGGGCATGGCAGACTC;SOR=0.180;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=63;TCF=15;TCR=48;TR=37;WE=54962021;WS=54962003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,42:0.62:68
chr3	55038898	rs4955827	A	G	4855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=104;PP=2965;SC=GAAAACAGCCACACATTTCTG;SOR=1.453;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=172;TCF=66;TCR=106;TR=170;WE=55038906;WS=55038878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr3	55041696	rs17321866	T	C	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=331;ReadPosRankSum=-0.256;SC=AACGCCACTGTTTTTTAACAT;SOR=0.906;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=30;TCR=11;TR=22;WE=55041704;WS=55041686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,22:0.50:44
chr3	55108055	rs358076	G	A	1311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=22;PP=967;SC=TCGTTCTTACGTTAGAGAGGG;SOR=0.883;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=20;TCR=22;TR=42;WE=55108063;WS=55108045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr3	55514766	rs73075443	A	T	1040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.811;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=13;PP=601;ReadPosRankSum=-0.978;SC=AACAAATCTTAAAAAAAGAAA;SOR=0.581;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=89;TCF=61;TCR=28;TR=40;WE=55514774;WS=55514756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,48:0.49:97
chr3	55886573	rs10575780	TAA	T	1532.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQRankSum=0.937;QD=17.03;ReadPosRankSum=-1.341;SOR=0.622;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,49:0.54:90
chr3	55989276	.	TTGTGTGTGTGTGTG	T,TTG	2161.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.035;ClippingRankSum=0.000;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=2.831;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.49;MQRankSum=0.644;QD=35.44;ReadPosRankSum=1.851;SOR=1.946;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:4,14,43:0.23,0.70:61
chr3	56019805	rs6806267	T	C	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.831;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=127;ReadPosRankSum=1.160;SC=ACTGACTTATTTCCATCTTTT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=7;WE=56019813;WS=56019795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr3	56019905	rs6445762	C	A	1356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.717;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=17;PP=911;ReadPosRankSum=-0.756;SC=TGCAGTGGCCCGAGGAAAACC;SOR=0.821;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=106;TCF=72;TCR=34;TR=55;WE=56019913;WS=56019895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,61:0.51:120
chr3	56020159	rs7613818	G	A	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=213;ReadPosRankSum=1.204;SC=ATAACTAAACGAAGCAAACTT;SOR=0.148;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=11;WE=56020167;WS=56020149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr3	56037025	rs5849124	C	CAT	3225.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=1.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.677;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=21;PP=1830;ReadPosRankSum=0.100;SC=GGAAGAAACTCAAATATTTTC;SOR=1.013;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=95;TCF=43;TCR=52;TR=46;WE=56037033;WS=56037015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,82:0.48:170
chr3	56037241	rs35658351	CA	C	2699.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=41;PP=1600;SC=ATTAGCTCAACAAAATCCATG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=0;TCR=42;TR=41;WE=56037257;WS=56037231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr3	56037249	rs34984094	A	AG	2670.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=38;PP=1726;SC=AACAAAATCCATGCATTCGCA;SOR=2.958;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=38;WE=56037257;WS=56037231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr3	56052839	rs3816575	G	T	1367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=24;PP=865;ReadPosRankSum=0.441;SC=AGAAAAGCAGGCACATTTAAA;SOR=0.676;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=136;TCF=88;TCR=48;TR=66;WE=56052847;WS=56052829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,69:0.46:149
chr3	56591178	rs73079891	A	G	1726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=37;NR=19;PP=923;SC=CGGCACCCCTATATCCAATTG;SOR=1.234;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=37;TCR=19;TR=56;WE=56591186;WS=56591168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr3	56591278	rs150150392	T	TGGGGTAAGCA	6723.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;BaseQRankSum=0.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.901;NF=12;NR=35;PP=2979;ReadPosRankSum=0.194;SC=GCCATGAACTTGGGGTAAGCA;SOR=0.359;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=73;TCF=21;TCR=52;TR=47;WE=56591286;WS=56591268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,160:0.99:161
chr3	56593543	rs12486047	C	A	748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=5;PP=544;SC=TCTTGCATTACCACCTTAGTA;SOR=2.584;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=24;WE=56593551;WS=56593533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	56593680	rs11130525	T	C	2970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=46;PP=1707;SC=GTTTTATTTATAGTGGTTAGA;SOR=0.827;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=47;TCR=46;TR=93;WE=56593688;WS=56593670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr3	56597688	rs6781293	A	G	1797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=18;PP=1096;SC=AGTTATAAAGAATAAGCTTCT;SOR=1.341;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=38;TCR=18;TR=56;WE=56597696;WS=56597678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr3	56597954	rs6769055	C	T	4927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=64;PP=2754;ReadPosRankSum=1.646;SC=CACCTGCAACCCCTAATATGC;SOR=0.289;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=154;TCF=90;TCR=64;TR=153;WE=56597962;WS=56597944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,177:0.99:178
chr3	56599159	rs73081810	T	C	3775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=67;NR=64;PP=2304;SC=TTTGATATTATAGCTGGGCAT;SOR=0.796;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=131;TCF=67;TCR=64;TR=131;WE=56599167;WS=56599149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr3	56599208	rs55831745	G	C	2301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=30;NR=52;PP=1499;SC=TGATTTCACAGCTAAATAAGA;SOR=1.429;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=30;TCR=52;TR=82;WE=56599216;WS=56599198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr3	56599258	rs10687224	G	GTATT	862.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=18;PP=1019;SC=CAAGATATTTGTATTCCCCTT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=18;WE=56599266;WS=56599248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr3	56601175	rs112310084	T	C	986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=22;PP=687;SC=ATACCAGCACTTTGGGAAGCC;SOR=3.477;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=26;WE=56601183;WS=56601165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr3	56605404	rs139586078	TA	T	204.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=0;NR=11;PP=167;SC=TAAAGCTTATTAAAAAAAAAA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=11;WE=56605412;WS=56605394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	56627048	rs1388256	A	G	1763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=28;PP=879;ReadPosRankSum=-0.522;SC=AAGAACTGCAAAGAAAATGGA;SOR=0.299;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=31;TCR=28;TR=59;WE=56627056;WS=56627038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,70:0.99:71
chr3	56627598	rs1491170	A	G	8161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=150;NR=127;PP=2965;SC=CTGTTCTCTCAGTCAACACAC;SOR=0.803;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=277;TCF=150;TCR=127;TR=277;WE=56627606;WS=56627588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,306:1.00:306
chr3	56628031	rs7637449	G	A	11225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=419;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=168;NR=190;PP=2965;SC=CGAGACAGACGACGACAAAAA;SOR=0.891;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=358;TCF=168;TCR=190;TR=358;WE=56628039;WS=56628021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,418:1.00:418
chr3	56674190	rs1489949	A	C	701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=15;PP=337;ReadPosRankSum=0.509;SC=GAATAGCTTTATTTCCAATTC;SOR=0.627;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=63;TCF=28;TCR=35;TR=28;WE=56674198;WS=56674180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,34:0.47:72
chr3	56683212	.	G	A	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-2.609;ClippingRankSum=-0.000;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=67;ReadPosRankSum=0.852;SC=AAAAAATATTGCTAATGAATT;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=3;WE=56683220;WS=56683202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr3	56808956	rs34038168	A	AC	528.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=3.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.19;MQRankSum=2.765;QD=11.75;ReadPosRankSum=1.139;SOR=0.260;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,19:0.42:45
chr3	56993031	rs4626067	C	T	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.813;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=25;PP=475;ReadPosRankSum=0.075;SC=ATGGCCCAAACAAGGTGGATG;SOR=0.311;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=73;TCF=20;TCR=53;TR=37;WE=56993039;WS=56993021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,42:0.51:82
chr3	57011234	rs13080107	T	C	5596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=110;NR=84;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.630;SC=TTTTTCTGGCTGCCTAATCCA;SOR=0.325;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=195;TCF=111;TCR=84;TR=194;WE=57011242;WS=57011224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,213:1.00:214
chr3	57140095	rs201941339	G	T	2617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.889;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=56;PP=1591;ReadPosRankSum=-0.969;SC=CCATCATAGTGGCGATACTTT;SOR=0.679;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=263;TCF=136;TCR=127;TR=118;WE=57140103;WS=57140085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,130:0.44:296
chr3	57272115	rs147166062	T	C	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.801;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=18;PP=400;ReadPosRankSum=-1.044;SC=GAGCTCTACATTGCAACAGTT;SOR=1.284;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=66;TCF=28;TCR=38;TR=30;WE=57272123;WS=57272105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,32:0.46:69
chr3	57276258	rs11346575	GA	G	476.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.026;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.301;NF=0;NR=18;PP=256;ReadPosRankSum=-0.404;SC=TGTAATAATTGAAAAAAAACC;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=3;TCR=43;TR=18;WE=57276266;WS=57276248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,26:0.38:68
chr3	57294085	rs10510791	C	G	2102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.478;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=53;PP=1540;ReadPosRankSum=-0.218;SC=GTAGAAAAAACATTTACATGA;SOR=1.035;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=166;TCF=69;TCR=97;TR=85;WE=57294093;WS=57294075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,88:0.50:175
chr3	57294884	rs150865255	CAAATT	C	592.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=535;ReadPosRankSum=0.354;SC=TAAATTCTTACAAATTAAATT;SOR=0.502;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=13;WE=57294896;WS=57294874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr3	57321916	rs883244	T	G	907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.086;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=13;PP=559;ReadPosRankSum=0.937;SC=TCAGAAACAATGTATTCATTT;SOR=0.463;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=65;TCF=46;TCR=19;TR=38;WE=57321924;WS=57321906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,41:0.58:71
chr3	57323170	rs528035	A	G	928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=25;PP=524;ReadPosRankSum=-1.185;SC=AAAAAAATACATATGTAATTC;SOR=0.725;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=22;TCR=50;TR=36;WE=57323178;WS=57323160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,42:0.51:83
chr3	57335705	rs67229457	TACACACACAC	T	552.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=1.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.11;ReadPosRankSum=-1.728;SOR=1.292;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr3	57335876	rs4060726	C	T	3839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=358;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.796;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=82;PP=2513;ReadPosRankSum=1.375;SC=AGTAAGCTACCGGAGAGTGCC;SOR=0.747;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=328;TCF=174;TCR=154;TR=175;WE=57335884;WS=57335866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,182:0.51:357
chr3	57401117	rs73074544	T	G	1551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=20;PP=890;ReadPosRankSum=2.265;SC=GACAAAAAAATTAACGATAGA;SOR=0.707;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=110;TCF=72;TCR=38;TR=62;WE=57401125;WS=57401107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,70:0.59:119
chr3	57414097	rs17793014	T	A	657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=10;PP=413;ReadPosRankSum=-0.592;SC=GAGGCACATATTTAAAATAAT;SOR=0.610;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=48;TCF=33;TCR=15;TR=31;WE=57414105;WS=57414087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,32:0.63:51
chr3	57414330	rs11915740	C	A	565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.029;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=13;PP=411;ReadPosRankSum=0.301;SC=AACAAAGAAACTTGAATAGGT;SOR=0.894;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=52;TCF=23;TCR=29;TR=21;WE=57414338;WS=57414320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,23:0.41:56
chr3	57422876	rs78888096	TA	T	217.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=138;ReadPosRankSum=0.678;SC=ATTTACTAGTTAAAAAAAAAC;SOR=0.368;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=11;WE=57422884;WS=57422866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr3	57431721	rs372891308	AAAATAAAT	A	1584.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.998;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=10;PP=1423;ReadPosRankSum=2.227;SC=TCAAAAACATAAAATAAATAA;SOR=0.523;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=37;TCF=20;TCR=17;TR=17;WE=57431736;WS=57431711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,42:0.60:70
chr3	57431945	rs62622492	T	C	4653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=405;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.520;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=98;PP=2873;ReadPosRankSum=1.699;SC=CTCAATTCGATTGAATTCATC;SOR=0.646;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=366;TCF=192;TCR=174;TR=199;WE=57431953;WS=57431935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,221:0.55:404
chr3	57443817	rs6768661	T	C	1616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.587;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=32;PP=956;ReadPosRankSum=-0.416;SC=AATTGATTATTTATCATACCG;SOR=0.643;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=140;TCF=75;TCR=65;TR=71;WE=57443825;WS=57443807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,78:0.51:154
chr3	57456371	rs9871422	T	C	725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=20;PP=524;ReadPosRankSum=0.867;SC=ATACTGAAAGTAAATAAGTTT;SOR=0.783;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=50;TCF=16;TCR=34;TR=29;WE=57456379;WS=57456361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,31:0.54:57
chr3	57457123	rs6445886	C	T	1043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.690;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=14;PP=653;ReadPosRankSum=0.905;SC=TTTTTCTATACTTTTAAATTT;SOR=0.332;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=67;TCF=47;TCR=20;TR=44;WE=57457131;WS=57457113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,47:0.64:73
chr3	57469053	rs9826084	A	C	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.574;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=420;ReadPosRankSum=-0.854;SC=CCATGAAAATAATATTTCACA;SOR=1.712;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=47;TCF=41;TCR=6;TR=21;WE=57469061;WS=57469043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,22:0.44:50
chr3	57469097	rs9863860	C	T	1137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=1.486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.56;ReadPosRankSum=0.277;SOR=0.855;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,56:0.47:119
chr3	57469272	rs9864150	C	T	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.998;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=222;ReadPosRankSum=0.330;SC=AGACTTATGGCAATTAATGTT;SOR=1.650;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=14;WE=57469280;WS=57469262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr3	57475351	rs6806444	T	G	1280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FS=2.908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.54;ReadPosRankSum=1.022;SOR=0.697;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:82,68:0.45:150
chr3	57488279	rs10662782	T	TTTC	626.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.379;NF=0;NR=16;PP=333;ReadPosRankSum=-0.610;SC=ATGTAGATCTTTTTTTTTTTC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=16;WE=57488287;WS=57488269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr3	57494138	rs6445902	A	C	964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=14;PP=481;ReadPosRankSum=0.604;SC=ACAAAACTGTATCAGCAAATG;SOR=0.634;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=85;TCF=52;TCR=33;TR=39;WE=57494146;WS=57494128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,47:0.48:98
chr3	57494724	rs727978	A	G	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=63;ReadPosRankSum=-0.180;SC=AATACCTCTGAGGTAAAAACA;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=57494732;WS=57494720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr3	57545154	rs3732546	T	C	1307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.086;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.572;NF=19;NR=28;PP=663;ReadPosRankSum=0.735;SC=TTAAACACGCTTAAAGTTGTT;SOR=0.898;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=122;TCF=58;TCR=64;TR=47;WE=57545162;WS=57545144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,66:0.45:146
chr3	57545169	.	G	GC	2100.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.483;ClippingRankSum=0.000;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.070;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.516;NF=3;NR=28;PP=1210;ReadPosRankSum=0.462;SC=GTTGTTTAAAGTGTTTTACAC;SOR=0.976;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=72;TCF=13;TCR=59;TR=31;WE=57545177;WS=57545159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,64:0.47:136
chr3	57563120	rs80155592	GA	G	1196.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.690;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.959;NF=4;NR=24;PP=760;ReadPosRankSum=0.292;SC=AGACCCTGGGGAAAAATTGTT;SOR=0.574;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=68;TCF=8;TCR=60;TR=28;WE=57563128;WS=57563110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,53:0.45:119
chr3	57613814	rs77006676	CTG	C	903.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=669;ReadPosRankSum=-0.137;SC=TCTTTCTACCCTGTAACTAGC;SOR=0.634;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=48;TCF=44;TCR=4;TR=17;WE=57613823;WS=57613804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,25:0.41:61
chr3	57627500	rs9873675	T	C	1782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=41;PP=1283;SC=CAAAACAAAATAAAAAAGGTG;SOR=1.727;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=19;TCR=41;TR=60;WE=57627508;WS=57627490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr3	57627580	rs9816093	A	C	356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=298;SC=ACACAGATTGATTTTTCCTTT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=57627588;WS=57627570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	57631400	rs150271072	C	T	631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.764;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=358;ReadPosRankSum=-0.660;SC=AGCTTGGGTACGGGTAGTATA;SOR=1.227;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=50;TCF=35;TCR=15;TR=26;WE=57631408;WS=57631390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,30:0.53:57
chr3	57647371	rs11709815	G	A	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.504;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=16;PP=349;ReadPosRankSum=-2.359;SC=AGCAAAAAGTGTGGATTTTAA;SOR=0.360;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=51;TCF=16;TCR=35;TR=25;WE=57647379;WS=57647361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,28:0.51:55
chr3	57743337	rs13400	C	G	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-4.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=278;ReadPosRankSum=-0.739;SC=GGAGGAACTCCTCTTTGTCCC;SOR=1.519;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=16;WE=57743345;WS=57743327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr3	57846577	.	C	A	96	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=10;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=19;MQ=59.51;NF=3;NR=6;PP=96;QD=14.5301347275;SC=GTATTTCAATCAAAAAAAAAA;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=34;TCF=11;TCR=23;TR=9;WE=57846585;WS=57846567;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:25,9:0.26:34
chr3	57908594	rs3832206	CT	C	1195.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.975;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=11;PP=517;ReadPosRankSum=0.331;SC=TATCTGCACACTTTTTTTTTC;SOR=0.561;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=73;TCF=48;TCR=25;TR=38;WE=57908602;WS=57908584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,56:0.62:91
chr3	57994719	rs1658338	T	A	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=195;ReadPosRankSum=1.524;SC=CAGGGGTGGGTTATAGGGGGC;SOR=0.315;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=13;WE=57994727;WS=57994709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,14:0.38:37
chr3	58080505	rs7644723	G	T	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=5.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.896;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=1;PP=512;ReadPosRankSum=-0.328;SC=TGCAGTGGGCGATGGCTCATG;SOR=2.226;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=47;TCF=43;TCR=4;TR=24;WE=58080513;WS=58080495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,23:0.45:51
chr3	58081888	rs1522384	T	C	1628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=27;PP=814;ReadPosRankSum=-0.352;SC=CCCCTGACAGTGACAAGAACA;SOR=0.702;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=134;TCF=78;TCR=56;TR=67;WE=58081896;WS=58081878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,78:0.53:147
chr3	58083446	rs939882	G	A	669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-3.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.241;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=9;PP=422;ReadPosRankSum=-0.682;SC=ATCATGGGAGGGTAGGAGAGG;SOR=0.289;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=51;TCF=37;TCR=14;TR=29;WE=58083454;WS=58083436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,32:0.58:55
chr3	58089516	rs6445945	A	G	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.025;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=33;ReadPosRankSum=1.100;SC=TAGCTTTGAAATAATCTCCCA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=3;WE=58089524;WS=58089508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr3	58089585	rs6445946	T	A	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.151;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=236;ReadPosRankSum=-0.367;SC=TATGTATGGTTTATGTTTTGT;SOR=0.303;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=37;TCF=29;TCR=8;TR=17;WE=58089593;WS=58089575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr3	58089877	rs1522386	A	G	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.552;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=195;ReadPosRankSum=0.460;SC=ACTCATGGGTAGTTGCTTCCC;SOR=0.362;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=39;TCF=9;TCR=30;TR=15;WE=58089885;WS=58089867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,14:0.37:38
chr3	58094157	rs2259091	A	G	2051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.843;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=42;PP=1421;ReadPosRankSum=0.954;SC=TTACACAGAAAGAGACTTACT;SOR=0.674;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=167;TCF=86;TCR=81;TR=89;WE=58094165;WS=58094147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,95:0.53:179
chr3	58094852	rs7634236	C	T	1560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.566;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=15;PP=918;ReadPosRankSum=-0.908;SC=GTGACCCTGTCTGATAGAGAC;SOR=0.521;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=110;TCF=81;TCR=29;TR=58;WE=58094860;WS=58094842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,68:0.54:125
chr3	58095466	rs2708318	G	T	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.332;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=399;ReadPosRankSum=0.480;SC=TCATTGCTCCGTGGGGAAGGC;SOR=0.968;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=50;TCF=9;TCR=41;TR=22;WE=58095474;WS=58095456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,24:0.46:52
chr3	58095500	rs2686635	G	T	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=147;ReadPosRankSum=-0.638;SC=ACGTTTCAATGCCTTTTGAAC;SOR=0.184;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=9;WE=58095508;WS=58095490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr3	58095866	rs151259375	G	A	1162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.329;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=32;PP=772;ReadPosRankSum=-0.571;SC=GCTGCTGGGCGATACACTATC;SOR=0.566;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=134;TCF=56;TCR=78;TR=53;WE=58095874;WS=58095856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,60:0.40:150
chr3	58109162	rs1131356	G	A	2814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.385;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=57;PP=1712;ReadPosRankSum=-1.111;SC=CCTTAGCGTCGACTGCTCGGA;SOR=0.605;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=278;TCF=153;TCR=125;TR=126;WE=58109170;WS=58109152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,139:0.47:296
chr3	58111285	rs3732633	T	G	1959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.511;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=32;PP=1162;ReadPosRankSum=1.538;SC=CAAATATGCGTTTCTGTTTGT;SOR=0.770;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=184;TCF=107;TCR=77;TR=83;WE=58111293;WS=58111275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,94:0.45:211
chr3	58112440	rs2362903	A	G	1264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.676;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=27;PP=706;ReadPosRankSum=0.442;SC=TTCCTTTCGCACCGGGGGATT;SOR=0.597;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=109;TCF=56;TCR=53;TR=56;WE=58112448;WS=58112430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,64:0.53:121
chr3	58112488	rs2362904	C	T	1382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.554;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=25;PP=721;ReadPosRankSum=1.064;SC=CCCACATCCCCGGTGAGCTAT;SOR=0.504;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=90;TCF=45;TCR=45;TR=52;WE=58112496;WS=58112478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,63:0.59:107
chr3	58112556	rs2362905	G	C	788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=17;PP=430;ReadPosRankSum=1.027;SC=TTTGATTTTGGTTATCTCTCT;SOR=0.811;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=56;TCF=25;TCR=31;TR=30;WE=58112564;WS=58112546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,37:0.55:67
chr3	58116316	rs1573890	A	G	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=59;ReadPosRankSum=-0.398;SC=AACAATGAGTAGGCACATGAG;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=4;WE=58116324;WS=58116306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr3	58116358	rs4475005	C	T	445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.043;HP=1;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=753;ReadPosRankSum=0.327;SC=GGGAGCTGACCGAGGCCTGCA;SOR=0.217;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=19;WE=58116377;WS=58116348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr3	58116369	rs1882692	T	C	471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=753;ReadPosRankSum=1.017;SC=GAGGCCTGCATGGCCGAGGTC;SOR=0.487;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=23;WE=58116377;WS=58116348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,23:0.56:41
chr3	58118555	rs12632456	G	A	1708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.823;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.938;NF=47;NR=29;PP=995;ReadPosRankSum=-2.071;SC=GCCAGTGAACGTGGTGGACAA;SOR=0.945;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=137;TCF=84;TCR=53;TR=76;WE=58118563;WS=58118545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,83:0.53:158
chr3	58118700	rs12638356	A	G	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=14;PP=291;ReadPosRankSum=-1.222;SC=CCATCAGTCTATCTGTCCACC;SOR=0.719;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=68;TCF=29;TCR=39;TR=23;WE=58118708;WS=58118690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,27:0.36:75
chr3	58121626	rs6445948	T	A	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=9;PP=497;ReadPosRankSum=0.937;SC=AGGCACTAATTGGAAAATATG;SOR=0.622;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=72;TCF=51;TCR=21;TR=33;WE=58121634;WS=58121616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,34:0.47:73
chr3	58145263	rs12634123	G	A	966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.504;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=26;PP=592;ReadPosRankSum=-1.674;SC=TAACCTGTCTGATGTATTAAA;SOR=0.694;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=133;TCF=73;TCR=60;TR=50;WE=58145271;WS=58145253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,53:0.37:142
chr3	58154327	rs8640	C	T	1187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.202;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=36;PP=732;ReadPosRankSum=-0.937;SC=ACCTGATCAGCGTCAAATACG;SOR=1.569;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=125;TCF=50;TCR=75;TR=50;WE=58154335;WS=58154317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,58:0.41:141
chr3	58156176	rs4681660	G	A	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.884;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=35;ReadPosRankSum=-0.015;SC=TAATTGCCACGCTCTCCCACC;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=58156184;WS=58156166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr3	58179028	rs3732630	T	C	1872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=28;PP=1162;ReadPosRankSum=-0.174;SC=CTAACTCATCTTTCCAGGACA;SOR=0.690;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=186;TCF=121;TCR=65;TR=83;WE=58179036;WS=58179018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,94:0.45:209
chr3	58179318	rs9812109	C	T	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=100;ReadPosRankSum=-0.210;SC=CCTGTGACCCCAAAGGACAGT;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=6;WE=58179326;WS=58179308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr3	58186911	rs4234389	A	G	739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.786;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=18;PP=440;ReadPosRankSum=-1.998;SC=GAGGGAAACCAGCTGTCCCCT;SOR=0.469;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=81;TCF=35;TCR=46;TR=34;WE=58186919;WS=58186901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,38:0.42:91
chr3	58191266	rs2070117	C	T	1980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.052;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=41;PP=1125;ReadPosRankSum=-0.258;SC=CATAGTTGTACGTTATGCCTC;SOR=0.879;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=194;TCF=101;TCR=93;TR=86;WE=58191274;WS=58191256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,97:0.45:216
chr3	58191433	rs9311671	G	A	1392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.533;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=37;PP=825;ReadPosRankSum=0.677;SC=TCCAATGAGAGGAGCCACCAT;SOR=1.209;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=118;TCF=48;TCR=70;TR=57;WE=58191441;WS=58191423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,66:0.51:130
chr3	58270963	rs6774235	T	C	1416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.771;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=29;PP=987;ReadPosRankSum=0.310;SC=TGAATGTCTCTTTGGGCCCCT;SOR=0.866;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=94;TCF=45;TCR=49;TR=52;WE=58270971;WS=58270953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,57:0.57:100
chr3	58296209	rs59232688	CT	C	874.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=4.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.54;ReadPosRankSum=1.074;SOR=1.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,50:0.60:83
chr3	58302404	rs2292674	A	T	760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=23;PP=514;ReadPosRankSum=1.040;SC=ATGAGAATAAATTTTTTGTTG;SOR=0.719;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=50;TCF=11;TCR=39;TR=29;WE=58302412;WS=58302394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,32:0.58:55
chr3	58303069	rs3773012	C	T	1471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=14;PP=848;ReadPosRankSum=0.785;SC=GCTCCTGCATCAGCTTTGTTT;SOR=0.719;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=90;TCF=67;TCR=23;TR=54;WE=58303077;WS=58303059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,63:0.63:100
chr3	58355273	rs9867320	G	C	1506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=29;PP=785;SC=GGCTGGAGTCGGGGCACGGTG;SOR=1.278;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=50;TCF=21;TCR=29;TR=50;WE=58355281;WS=58355263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr3	58368449	rs11917591	T	C	2007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.097;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=43;PP=1330;ReadPosRankSum=0.151;SC=AATCTGTGAATTATGGTCACA;SOR=0.780;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=184;TCF=95;TCR=89;TR=88;WE=58368457;WS=58368439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,94:0.48:196
chr3	58376992	rs11923253	G	A	1774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.526;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=38;PP=1024;ReadPosRankSum=-1.240;SC=ACTTTAGATGGGTTAATGAAA;SOR=0.751;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=176;TCF=88;TCR=88;TR=76;WE=58377000;WS=58376982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,85:0.43:197
chr3	58380747	rs35065965	C	T	2864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.374;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=64;PP=1796;ReadPosRankSum=0.681;SC=TATCGGGTTACCTTTGCCACA;SOR=0.637;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=273;TCF=142;TCR=131;TR=128;WE=58380755;WS=58380737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,139:0.46:299
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chr3	58385194	rs4075152	T	C	1620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=34;PP=1061;SC=GTAGTAAAGATTCTTGCGGTC;SOR=2.259;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=12;TCR=34;TR=46;WE=58385202;WS=58385184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr3	58389462	rs4339119	A	G	1101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=19;PP=694;ReadPosRankSum=-0.604;SC=GGATTGGGCCAGGGGCTGGAG;SOR=0.682;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=105;TCF=68;TCR=37;TR=52;WE=58389470;WS=58389452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,55:0.49:113
chr3	58394850	rs56232415	C	T	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.987;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=128;ReadPosRankSum=1.811;SC=TCTCAGCCAGCCTTTAGGCTA;SOR=1.609;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=9;WE=58394858;WS=58394840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,10:0.34:29
chr3	58395490	rs140856155	G	GT	2249.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.45;QD=27.77;SOR=1.997;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr3	58395501	rs34734687	G	GA	1231.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=46;PP=621;ReadPosRankSum=-1.012;SC=TTTTTTTGGGGAAAAAAAAAG;SOR=1.569;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=3;TCR=49;TR=49;WE=58395509;WS=58395480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,47:0.98:48
chr3	58395863	rs56384862	A	G	2320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.166;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=52;PP=1258;ReadPosRankSum=-0.057;SC=CATTCAGCGAAGTACAGCAAC;SOR=0.498;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=236;TCF=110;TCR=126;TR=102;WE=58395871;WS=58395853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,116:0.44:262
chr3	58398447	rs62258134	C	T	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.291;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=141;ReadPosRankSum=-2.092;SC=GGACCCTGCACCAGAGTAAAA;SOR=0.160;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=11;WE=58398455;WS=58398437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr3	58398466	rs12635366	C	T	949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=7;PP=726;SC=AAGCCTGTCACTGGGTCCGGT;SOR=2.517;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=32;WE=58398474;WS=58398456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr3	58398813	rs13071422	A	G	366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=10;PP=263;SC=TCTCAAGAGAAATCAGTGGGA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=58398821;WS=58398803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	58409063	rs12631656	T	C	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=66;ReadPosRankSum=1.255;SC=TCAGTTGTTATTGTGTAGAAC;SOR=0.307;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=6;WE=58409071;WS=58409053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr3	58409082	rs12634132	A	G	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.101;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=2;PP=98;ReadPosRankSum=1.958;SC=ACCAATGAACATGTTGGTCAT;SOR=0.084;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=9;WE=58409090;WS=58409072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr3	58409126	rs6767498	C	A	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=253;ReadPosRankSum=0.917;SC=GTATTGCTATCTTTGAGCATT;SOR=0.861;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=49;TCF=38;TCR=11;TR=21;WE=58409134;WS=58409116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,25:0.46:54
chr3	58409300	rs35853090	G	GTT	4387.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.965;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=42;PP=2078;ReadPosRankSum=-0.344;SC=TGAGTATTGTGTTGGTGATTC;SOR=0.770;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=133;TCF=22;TCR=111;TR=51;WE=58409308;WS=58409290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,117:0.46:253
chr3	58410554	rs34579268	C	T	1301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=19;PP=783;ReadPosRankSum=0.210;SC=AGCACCGAGGCACCTGCCCAG;SOR=0.716;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=136;TCF=96;TCR=40;TR=60;WE=58410562;WS=58410544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,65:0.44:147
chr3	58414382	rs62259769	C	T	896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.098;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.922;NF=10;NR=27;PP=571;ReadPosRankSum=-0.902;SC=GCTATTGCAGCACAAATAGAG;SOR=0.990;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=72;TCF=21;TCR=51;TR=37;WE=58414390;WS=58414372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,40:0.53:76
chr3	58415590	rs2070662	C	A	6206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=106;NR=96;PP=2965;SC=ACCACTGTGCCGCCAGCTGTG;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=202;TCF=106;TCR=96;TR=202;WE=58415598;WS=58415580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr3	58416535	rs1126551	C	T	1192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=1.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.18;ReadPosRankSum=0.731;SOR=0.854;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,57:0.44:130
chr3	58416538	rs4264746	T	C	4832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.02;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr3	58416770	rs138623728	T	TTTA	250.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.90;MQRankSum=1.985;QD=11.40;ReadPosRankSum=1.026;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr3	58417416	rs62259772	C	T	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=10;PP=340;ReadPosRankSum=-0.207;SC=TGGACACTAACAGACATGCCC;SOR=0.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=55;TCR=26;TR=31;WE=58417424;WS=58417406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,36:0.39:93
chr3	58494546	rs11716125	G	C	458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=325;ReadPosRankSum=0.537;SC=AATTAAAATGGGAGAACATGA;SOR=0.680;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=60;TCF=44;TCR=16;TR=20;WE=58494554;WS=58494536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,22:0.34:65
chr3	58516383	rs4387990	G	A	2429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.499;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=52;PP=1386;ReadPosRankSum=1.347;SC=GAACAAGGACGGGCACAAGTT;SOR=0.738;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=189;TCF=85;TCR=104;TR=96;WE=58516391;WS=58516373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,114:0.52:218
chr3	58520306	rs7611026	G	C	6608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=98;NR=117;PP=2965;SC=CTGGCACCTTGAAATCTTCTC;SOR=0.973;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=215;TCF=98;TCR=117;TR=215;WE=58520314;WS=58520296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr3	58520859	rs4681862	A	G	2353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=56;PP=1600;SC=TCTGGTGACTATGGAGAGACA;SOR=2.219;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=20;TCR=56;TR=76;WE=58520867;WS=58520849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr3	58553160	rs7637862	T	G	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.123;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=105;ReadPosRankSum=2.004;SC=CAGGGCTGCTTCCTGCGGTGA;SOR=0.141;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=8;WE=58553168;WS=58553150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr3	58555343	rs7632668	C	T	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=275;ReadPosRankSum=0.285;SC=GCTCTGCTTTCCTCCAGGGTC;SOR=0.941;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=15;WE=58555351;WS=58555333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr3	58555386	rs7609991	G	T	783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.696;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=8;PP=549;ReadPosRankSum=0.879;SC=CCAGGTGCTTGCGGGGCCCAG;SOR=1.248;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=61;TCF=43;TCR=18;TR=34;WE=58555394;WS=58555376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,35:0.56:63
chr3	58572577	rs17059434	C	G	5144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=87;PP=2965;SC=GGCGTTGCTCCCACTTACCCG;SOR=0.800;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=178;TCF=91;TCR=87;TR=178;WE=58572585;WS=58572567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr3	58572625	rs80312641	G	A	3711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=67;PP=2252;SC=CGGTGGCATCGGAGGGCCCCC;SOR=1.033;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=57;TCR=67;TR=124;WE=58572633;WS=58572615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr3	58575110	rs6445991	A	G	2768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=43;NR=59;PP=1779;SC=GACTGGTCAGAGTCAAAGTCC;SOR=1.136;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=43;TCR=59;TR=102;WE=58575118;WS=58575100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr3	58621935	rs6791782	C	T	323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=1;PP=226;SC=TTTAAGGCCCCTGGGAGGTGA;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=58621943;WS=58621933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	58625975	rs3749287	C	G	3284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=63;PP=1962;SC=GCTGAAAATGCCTAATCTGTA;SOR=1.133;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=110;TCF=47;TCR=63;TR=110;WE=58625983;WS=58625965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr3	58626075	rs6762192	G	T	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.863;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=152;ReadPosRankSum=-1.335;SC=GGAATGGCTGGGCTCATCTGA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=8;WE=58626083;WS=58626065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr3	58631184	rs111621495	G	GAAATA	3540.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=17;PP=1653;SC=ATGAATGAATGAAATAAAATA;SOR=1.745;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=43;TCF=19;TCR=24;TR=32;WE=58631192;WS=58631174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr3	58635197	rs9811989	G	A	1796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=29;NR=31;PP=881;SC=AACTAAAAATGCCTTGCCACT;SOR=0.941;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=61;TCF=29;TCR=32;TR=60;WE=58635205;WS=58635187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr3	59025434	rs6446005	G	C	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=336;ReadPosRankSum=1.449;SC=CACAAACCACGAACAAGCTGA;SOR=0.712;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=53;TCF=15;TCR=38;TR=18;WE=59025442;WS=59025424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,19:0.35:55
chr3	59996927	rs4679626	T	C	342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=279;ReadPosRankSum=2.234;SC=GGAAACATATTGTTTGGCAGA;SOR=2.985;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=12;WE=59996935;WS=59996917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr3	59996946	rs7612646	T	C	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=170;ReadPosRankSum=-0.682;SC=GAGTTTATAATGTCAGGATTT;SOR=0.352;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=33;TCF=30;TCR=3;TR=13;WE=59996954;WS=59996936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,14:0.40:35
chr3	59996969	rs4679627	C	T	913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=6;PP=675;ReadPosRankSum=-0.667;SC=GGCTCTAACACTGAGGGTCTC;SOR=0.784;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=59;TCF=50;TCR=9;TR=36;WE=59996977;WS=59996959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,38:0.59:64
chr3	59999690	rs13067835	T	C	956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.783;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=17;PP=460;ReadPosRankSum=0.142;SC=TGCCGGGATATGAAAGGGAAG;SOR=0.843;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=48;TCR=35;TR=40;WE=59999698;WS=59999680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,45:0.48:93
chr3	60898271	rs6793737	G	A	963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.950;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=12;PP=646;ReadPosRankSum=1.444;SC=ACAGGATATAGATTTATAAAG;SOR=1.179;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=85;TCF=52;TCR=33;TR=39;WE=60898279;WS=60898261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,44:0.46:96
chr3	60898434	rs11130795	T	C	1828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=41;PP=1211;ReadPosRankSum=0.356;SC=TTCTCACAATTTGCAGAAACT;SOR=0.672;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=176;TCF=87;TCR=89;TR=82;WE=60898442;WS=60898424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,87:0.46:190
chr3	62229553	rs1352882	C	T	5479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=79;PP=2693;SC=ATGAAAGTATCCCTATTATTC;SOR=0.762;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=172;TCF=92;TCR=80;TR=171;WE=62229561;WS=62229543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr3	62267213	.	C	CT	47	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.83;ReadPosRankSum=1.282;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr3	62279049	.	T	A	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=0.000;DP=163;ExcessHet=3.0103;FS=4.065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.75;ReadPosRankSum=1.527;SOR=1.153;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:135,28:0.17:163
chr3	62355666	rs3215030	G	GT	269.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.433;HP=9;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=191;ReadPosRankSum=1.082;SC=CTCTGCTATAGTTTTTTTTTC;SOR=1.022;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=38;TCF=28;TCR=10;TR=15;WE=62355674;WS=62355656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,16:0.37:43
chr3	62357146	rs71296764	G	A	2054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.109;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=41;PP=1217;ReadPosRankSum=-1.576;SC=TCGTATCCCCGGTGTTATCAC;SOR=0.612;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=173;TCF=97;TCR=76;TR=89;WE=62357154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,98:0.51:192
chr3	62431402	rs73840192	C	A	611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=50.98;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	62431415	rs6791296	T	C	1344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=17;PP=971;SC=AAAAACCCCATGAGAAACAAT;SOR=0.929;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=48;TCF=31;TCR=17;TR=47;WE=62431423;WS=62431389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr3	62477233	.	A	AAC	187.52	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.593;ClippingRankSum=-0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=20.84;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr3	62498378	rs1376917	G	A	3201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=36;PP=1924;SC=AAAACTGAATGTAACTCAACA;SOR=1.437;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=71;TCR=36;TR=107;WE=62498386;WS=62498368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr3	62535819	rs9813819	C	G	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=329;ReadPosRankSum=0.444;SC=ACAACTTCTACTAAGCTGAGC;SOR=1.022;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=4;TCR=28;TR=17;WE=62535827;WS=62535809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr3	62536388	rs62243510	C	T	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=237;ReadPosRankSum=-0.208;SC=GCCTTACAACCCCTCCAATCA;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=13;WE=62536396;WS=62536378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
chr3	62556622	rs833663	A	G	11963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=445;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=191;NR=219;PP=2965;SC=ACCTAAGGGAAAGGAGAAAGA;SOR=0.802;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=411;TCF=191;TCR=220;TR=410;WE=62556630;WS=62556612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,443:1.00:443
chr3	62571037	rs2659467	G	A	4756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=74;NR=91;PP=2633;SC=GAAAAGAGAAGCACCATTATG;SOR=1.085;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=165;TCF=74;TCR=91;TR=165;WE=62571045;WS=62571027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr3	62612013	rs2248008	C	T	712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=0;PP=488;SC=CAAGCTGGCACGGATTTACTA;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=62612021;WS=62612003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	62612145	rs2248013	C	A	3042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=344;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.787;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=62;PP=1838;ReadPosRankSum=0.620;SC=TGTGACTCTTCAAGCACAAAT;SOR=0.598;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=311;TCF=177;TCR=134;TR=138;WE=62612153;WS=62612135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:189,154:0.45:343
chr3	62612280	rs2367310	C	T	8524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=118;PP=2965;SC=GAAGGAAGAACGTCTTAAATT;SOR=1.358;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=195;TCF=77;TCR=118;TR=195;WE=62612302;WS=62612270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr3	62612294	rs2367311	T	C	7655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=105;PP=2965;SC=TTAAATTTGCTAAGCCTTTTT;SOR=1.988;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=149;TCF=44;TCR=105;TR=149;WE=62612302;WS=62612270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr3	62612309	rs2367312	G	C	5803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=50;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=90;PP=2703;SC=CTTTTTTGTTGTACAAAGAAG;SOR=2.741;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=114;TCF=24;TCR=90;TR=114;WE=62612317;WS=62612299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr3	62612342	rs2248023	T	C	2110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=74;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=57;PP=1739;SC=ACGTTTGGAGTTCCTTCTGCA;SOR=4.977;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=4;TCR=57;TR=61;WE=62612350;WS=62612332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr3	62612385	rs1349591	G	T	666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=86;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=21;PP=561;SC=TTACTAACATGGTTTTTACTG;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=62612393;WS=62612375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	62631553	rs4588354	G	T	2887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=59;PP=1851;SC=GAGGTTATTGGCAAGGCCCCT;SOR=1.279;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=38;TCR=59;TR=97;WE=62631561;WS=62631543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr3	62636826	rs4688302	C	T	1549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=38;PP=1121;SC=GGTCTTTGTCCCATGGCCCAG;SOR=2.701;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=48;TCF=9;TCR=39;TR=47;WE=62636834;WS=62636816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr3	62647928	rs6770658	A	G	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.703;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=356;ReadPosRankSum=-0.538;SC=TCAATAATCAATGTGCTTCCT;SOR=0.252;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=20;WE=62647936;WS=62647918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr3	62648267	rs112379731	C	T	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=246;ReadPosRankSum=1.067;SC=TGGTAGGCAGCTGCTAAGACA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=12;WE=62648275;WS=62648257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr3	62739092	rs478123	A	G	1242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.259;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=28;PP=817;ReadPosRankSum=-1.101;SC=CCACAGCTCTAGGCCCAGGCG;SOR=0.620;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=112;TCF=63;TCR=49;TR=54;WE=62739100;WS=62739082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,58:0.45:128
chr3	63466382	rs6772726	G	T	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.501;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=293;ReadPosRankSum=0.717;SC=CTGAACCAAGGGCAATGCTCT;SOR=0.167;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=18;WE=63466390;WS=63466372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr3	63649259	rs7612738	G	T	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=119;ReadPosRankSum=0.736;SC=CTTGGGGGTGGTGAGTGAGTT;SOR=1.371;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=8;WE=63649267;WS=63649249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr3	63649492	rs7634688	A	G	1134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.761;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=20;PP=664;ReadPosRankSum=2.988;SC=TTTCTTTATAAATCACTCAGT;SOR=0.610;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=86;TCF=45;TCR=41;TR=43;WE=63649500;WS=63649482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,50:0.53:94
chr3	63813419	rs76275095	T	A	2564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=54;PP=1375;ReadPosRankSum=-1.148;SC=GCTAAATGAATTTGCCTCTGA;SOR=0.722;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=214;TCF=99;TCR=115;TR=101;WE=63813427;WS=63813409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,122:0.49:249
chr3	63821914	rs2637982	C	G	1409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=18;PP=784;SC=GAAATGCCTACGGTAGTTTTC;SOR=1.118;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=49;TCF=31;TCR=18;TR=48;WE=63821922;WS=63821904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr3	63831912	.	CA	TG	3717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.173;ClippingRankSum=0.000;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.738;HP=4;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=31;PP=2352;ReadPosRankSum=-3.022;SC=AGCAGTTAAACAGTTTCCTTA;SOR=0.832;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=176;TCF=101;TCR=75;TR=79;WE=63831921;WS=63831902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,96:0.48:198
chr3	63898360	.	G	GGCA,GGCAGCAGCA	787.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.452;NF=7,7;NR=12,12;PP=224,632;ReadPosRankSum=0.523;SC=GCGGCCGCCCGGCAGCAGCAG;SOR=0.874;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=19,19;WE=63898368;WS=63898350;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.67,0.25:24
chr3	63953727	rs147473367	G	A	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-1.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.803;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=253;ReadPosRankSum=-1.316;SC=TGGACGGTGGGGTAGGTCTTT;SOR=0.307;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=15;WE=63953735;WS=63953717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr3	63968083	rs61736574	A	G	1039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=25;PP=530;ReadPosRankSum=-0.470;SC=CCTGAAGACAATTCCAATAAT;SOR=1.057;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=106;TCF=52;TCR=54;TR=45;WE=63968091;WS=63968073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,53:0.43:123
chr3	63981424	rs1053339	A	G	2310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.605;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.969;NF=52;NR=47;PP=1315;ReadPosRankSum=0.529;SC=GCAGTATGCAATCCAGACAAG;SOR=0.583;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=210;TCF=105;TCR=105;TR=99;WE=63981432;WS=63981414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,111:0.49:227
chr3	63982082	rs3774729	G	A	6086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.283;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=102;NR=104;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.588;SC=AGTGCCAGCCGTGAACAATGT;SOR=0.436;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=207;TCF=103;TCR=104;TR=206;WE=63982090;WS=63982072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,229:1.00:230
chr3	63996262	rs1046025	C	T	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=164;ReadPosRankSum=-0.400;SC=TTTTATACAGCTGACCTGGGC;SOR=0.330;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=10;WE=63996270;WS=63996252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr3	63999322	rs3816157	G	A	879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=27;PP=567;ReadPosRankSum=0.254;SC=TAGACTCTCCGTTTCAGATAA;SOR=0.766;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=14;TCR=47;TR=35;WE=63999330;WS=63999312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,39:0.54:72
chr3	64004409	rs11376250	C	CA	2395.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.639;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=48;PP=1007;ReadPosRankSum=-0.637;SC=AACATATATACAAAAAAAATG;SOR=1.154;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=79;TCF=16;TCR=63;TR=61;WE=64004417;WS=64004399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:6,92:0.94:98
chr3	64004759	rs140387621	C	G	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.183;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=15;PP=325;ReadPosRankSum=-2.641;SC=ACAGACAAGGCCACGTTTTAA;SOR=0.270;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=51;TCF=16;TCR=35;TR=25;WE=64004767;WS=64004749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,30:0.51:59
chr3	64005226	rs2888013	A	G	1007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.261;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=30;PP=701;ReadPosRankSum=0.445;SC=TAGGAGTAGAAGTACAACAAG;SOR=0.408;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=74;TCF=17;TCR=57;TR=40;WE=64005234;WS=64005216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,43:0.54:80
chr3	64133350	rs27673	A	G	4663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=80;PP=2632;SC=AGTGTTGGCCATCATAGGTCA;SOR=0.985;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=72;TCR=80;TR=152;WE=64133358;WS=64133340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr3	64142859	rs17720698	C	T	1257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.332;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=20;PP=617;ReadPosRankSum=0.710;SC=CAGCACAGCGCGGCTTCAGGC;SOR=0.925;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=103;TCF=61;TCR=42;TR=54;WE=64142867;WS=64142849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,63:0.53:119
chr3	64145759	rs2306380	T	C	2411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.495;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=47;PP=1418;ReadPosRankSum=-0.253;SC=CGAACCTGAATAGACACAGAC;SOR=0.640;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=187;TCF=93;TCR=94;TR=93;WE=64145767;WS=64145749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,109:0.50:217
chr3	64430849	.	G	A	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.100;ClippingRankSum=0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=38;ReadPosRankSum=1.526;SC=CCCGCGCCTTGGAGCGCTCTC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=4;WE=64430857;WS=64430839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr3	64431140	rs114898153	C	A	970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=24;PP=727;SC=CCTCGGCGGCCGCTGGCCTGG;SOR=3.056;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=29;WE=64431148;WS=64431130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr3	64518994	rs1017537	T	C	7332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=97;NR=154;PP=2965;SC=TGTGATGTCCTCAAAAAAGCA;SOR=1.213;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=253;TCF=97;TCR=156;TR=251;WE=64519002;WS=64518984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,272:1.00:272
chr3	64525171	rs11130968	G	A	408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.88;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	64525177	rs11130969	C	T	376.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.86;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	64526610	rs11130970	G	A	371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=336;SC=GACTATCCTCGCTGCACTGTA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=64526618;WS=64526604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	64526651	rs3841969	CCAATGTG	C	1125.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=15;NR=1;PP=999;SC=TCCATACTAGCCAATGTGCAA;SOR=4.255;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=16;WE=64526665;WS=64526641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	64526717	rs3796384	G	C	3223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=32;PP=2328;SC=CATGCTTGCTGTCTGAATGGA;SOR=1.588;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=76;TCR=32;TR=108;WE=64526725;WS=64526707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr3	64526942	rs3796383	A	C	2981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=53;PP=1813;SC=AGGATGGGAAAGCATTTCCAG;SOR=0.888;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=102;TCF=49;TCR=53;TR=102;WE=64526950;WS=64526932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr3	64527321	rs1373163	T	C	1744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=41;PP=1405;SC=TCACAAAAAATAGGGTGTGAT;SOR=3.014;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=8;TCR=41;TR=49;WE=64527329;WS=64527311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr3	64527336	rs1036919	C	T	1414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=32;PP=1147;SC=TGTGATGATCCGAGATGTGAA;SOR=2.200;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=9;TCR=32;TR=41;WE=64527344;WS=64527326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr3	64527378	rs1036918	G	A	1290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=13;PP=963;SC=GACATTGTTCGCACTAAAACT;SOR=1.501;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=22;TCR=13;TR=35;WE=64527386;WS=64527368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	64527465	rs1036917	C	T	3785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=46;PP=2174;SC=TGAACAAAGACATCCTGTTCT;SOR=1.076;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=72;TCR=46;TR=118;WE=64527473;WS=64527455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr3	64547477	rs35667547	G	C	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.044;HP=6;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=24;PP=411;ReadPosRankSum=0.577;SC=TTATTTTTTGGGGGGGCGGGG;SOR=1.625;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=81;TCF=31;TCR=50;TR=33;WE=64547485;WS=64547467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,33:0.42:78
chr3	64554254	rs7635677	T	C	2815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.551;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=68;PP=1898;ReadPosRankSum=-0.645;SC=GTTTTTTAATTACACGGAGTT;SOR=0.804;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=213;TCF=95;TCR=118;TR=115;WE=64554262;WS=64554244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,128:0.52:246
chr3	64606709	.	C	T	921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.646;ClippingRankSum=0.000;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.775;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=10;PP=506;ReadPosRankSum=-1.041;SC=CCAGCATCCCCTCCTTTTGCT;SOR=0.837;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=89;TCF=60;TCR=29;TR=37;WE=64606717;WS=64606699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,43:0.42:103
chr3	64640206	rs11326156	TA	T	9104.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=79;PP=2967;SC=AAACATGTAGTAAAACGGTTT;SOR=0.873;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=125;TCF=41;TCR=84;TR=117;WE=64640220;WS=64640196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr3	64640212	rs59517147	G	T	9245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.05;NF=107;NR=82;PP=2965;SC=GTAGTAAAACGGTTTTAGCCA;SOR=0.844;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=194;TCF=109;TCR=85;TR=189;WE=64640220;WS=64640196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr3	64641150	rs6768305	C	G	786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=10;PP=514;ReadPosRankSum=0.012;SC=AGTGCCTAAGCTGAGAAACCC;SOR=0.773;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=45;TCR=19;TR=33;WE=64641158;WS=64641140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,36:0.51:70
chr3	65352633	rs139039420	G	A	2764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.176;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=49;PP=1807;ReadPosRankSum=-0.004;SC=CCAAGGTGATGAATCAGTGAT;SOR=1.055;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=223;TCF=126;TCR=97;TR=125;WE=65352641;WS=65352623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,130:0.54:239
chr3	65353448	rs7634490	G	A	4324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=70;PP=2245;SC=TTTGGTTTACGTAGGAATCAT;SOR=0.905;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=138;TCF=68;TCR=70;TR=138;WE=65353456;WS=65353438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr3	65416648	rs4688566	C	A	1737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=40;PP=1141;SC=TAATTCTTCACGCTTATGCCC;SOR=2.507;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=13;TCR=40;TR=53;WE=65416656;WS=65416638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr3	65425560	rs142043619	T	TCTG	951.06	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.708;NF=8;NR=3;PP=498;ReadPosRankSum=0.813;SC=CAACCTTCTGTCTGCTGCTGC;SOR=0.527;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=11;WE=65425568;WS=65425550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,24:0.89:27
chr3	65464522	rs11409972	G	GT	180.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.214;HP=10;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=2.190;NF=0;NR=13;PP=150;ReadPosRankSum=-1.264;SC=AATACTTTGTGTTTTTTTTTA;SOR=1.414;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=13;WE=65464530;WS=65464512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,12:0.31:39
chr3	65464625	rs7636096	G	A	41.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=3;PP=38;SC=TGGGTTAGAAGAGATATCTTT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=65464633;WS=65464615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr3	65479068	rs7641222	A	C	179.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=201;SC=AGGTGAACTGAAATCTCCTGT;SOR=2.303;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=65479076;WS=65479058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	65583600	.	TG	T	63.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.669;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.98;ReadPosRankSum=-0.272;SOR=1.190;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr3	65595659	.	A	G	72	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=28;MQ=59.93;NF=0;NR=5;PP=72;QD=21.3542425094;SC=AAGAGAAAGAAACTTTGATGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=5;WE=65595667;WS=65595649;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr3	65595659	.	A	AATAGACCATTCTGAGGTAGAAGGAAAGGAAGGAAAGAGAGAAGGGGAAGGAACTGGGAGAAGAGAAGGGGAGAGGGAGAGAGGAAGGGAAAGAG	674.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.396;ClippingRankSum=0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=20.212;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.93;MQRankSum=-0.196;QD=44.98;ReadPosRankSum=-1.316;SOR=5.279;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,13:0.87:15
chr3	65607592	rs112243102	T	TCACACACACA,TCACACACACACACACA	301.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=26;NF=3;NR=0;PP=1198;SC=CCTGGACTTTTCACACACACA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=3;WE=65607600;WS=65607582;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.57,0.43:7
chr3	65607637	rs3749455	A	G	695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=7;PP=479;SC=GCCAAAGTCCAACTACTTACA;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=30;WE=65607645;WS=65607627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr3	65607803	rs59095537	A	G	2350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.173;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=46;PP=1358;ReadPosRankSum=-1.318;SC=ACATCAACACAGGGCCTCCTA;SOR=0.853;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=215;TCF=118;TCR=97;TR=108;WE=65607811;WS=65607793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,120:0.50:241
chr3	66023592	rs28696109	A	G	874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=3;PP=590;SC=GGAGGGAAGCAGGAAATCGAG;SOR=3.126;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=29;WE=66023600;WS=66023582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr3	66287056	rs146159281	G	A	1999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.510;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=44;PP=1153;ReadPosRankSum=0.439;SC=CAAGGATTTAGTAAGGCTGGT;SOR=0.697;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=194;TCF=102;TCR=92;TR=93;WE=66287064;WS=66287046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,102:0.50:206
chr3	66293766	rs66918103	T	C	837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.384;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=21;PP=529;ReadPosRankSum=-0.136;SC=TATAAAATACTTCAGAAATGC;SOR=0.426;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=55;TCF=20;TCR=35;TR=35;WE=66293774;WS=66293756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,38:0.64:59
chr3	66293851	rs1678092	T	C	47.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5051;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=24;ReadPosRankSum=-0.319;SC=AAGTCATAAATGGCAATAAAT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=66293859;WS=66293841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr3	66354911	rs813636	G	C	3125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.189;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=62;PP=1903;ReadPosRankSum=1.957;SC=GGGGAGGCTTGTGAGCTTCTG;SOR=0.540;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=262;TCF=149;TCR=113;TR=138;WE=66354919;WS=66354901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,151:0.53:287
chr3	66396845	rs332354	G	A	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.979;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=230;ReadPosRankSum=-0.571;SC=AAGTTTCTCAGTCTTCACATA;SOR=0.533;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=56;TCF=26;TCR=30;TR=20;WE=66396853;WS=66396835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,26:0.42:62
chr3	66396898	rs71616220	G	GAAGAGTAGA	418.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=2162;ReadPosRankSum=-0.937;SC=TTTGAGTGTGGAAGAGTAGAA;SOR=0.787;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=5;WE=66396906;WS=66396888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,12:0.36:33
chr3	66406415	rs783129	A	G	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.20;ReadPosRankSum=-1.548;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,28:0.52:54
chr3	66413111	rs332387	G	T	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.213;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=111;ReadPosRankSum=0.454;SC=TCTCATTTCTGTGACTTATTT;SOR=0.569;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=7;WE=66413119;WS=66413101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr3	66413130	rs332386	T	A	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.477;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=327;ReadPosRankSum=-0.474;SC=TTTAGAAAGCTGTTAAGTCTT;SOR=0.105;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=19;WE=66413138;WS=66413120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,20:0.74:27
chr3	66419793	rs11277069	CCAGGTGTA	C	769.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.138;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=1714;ReadPosRankSum=-0.211;SC=CTTCAATCAGCCAGGTGTACA;SOR=1.609;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=13;WE=66419808;WS=66419783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,21:0.46:46
chr3	66419883	rs2293193	T	C	2405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.571;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=42;PP=1402;ReadPosRankSum=-0.222;SC=CACTTGGGTGTTGGGTATTAT;SOR=0.593;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=215;TCF=127;TCR=88;TR=101;WE=66419891;WS=66419873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,117:0.49:239
chr3	66419942	rs1129179	A	G	3166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.908;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=72;PP=1922;ReadPosRankSum=0.225;SC=TAGACGTGGCAAAGACAAGAA;SOR=0.768;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=252;TCF=124;TCR=128;TR=138;WE=66419964;WS=66419932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,151:0.54:282
chr3	66419956	rs13874	C	T	7600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=121;NR=123;PP=2965;SC=ACAAGAATTACGCTGGCAAAG;SOR=0.807;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=244;TCF=121;TCR=123;TR=244;WE=66419964;WS=66419932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,277:1.00:277
chr3	66421147	rs332378	T	C	932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=20;PP=499;ReadPosRankSum=-0.561;SC=TTTCTATTTATTGTGCAAAAT;SOR=0.772;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=77;TCF=27;TCR=50;TR=32;WE=66421155;WS=66421137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,40:0.48:84
chr3	66428282	rs1046844	C	T	2596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=61;PP=1709;SC=GCCTGCAGTGCAAACCCTCTT;SOR=1.847;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=26;TCR=61;TR=87;WE=66428290;WS=66428272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr3	66430811	rs2279290	T	G	3533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.522;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=65;PP=2104;ReadPosRankSum=-2.903;SC=AAGCAAGTACTGGGCTTCCGC;SOR=0.585;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=249;TCF=141;TCR=108;TR=151;WE=66430819;WS=66430801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,165:0.62:267
chr3	66431943	rs13094825	C	T	2405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.347;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=58;PP=1444;ReadPosRankSum=-1.564;SC=CTTTCTCCATCGCTTTCCACG;SOR=0.610;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=308;TCF=166;TCR=142;TR=121;WE=66431951;WS=66431933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:194,129:0.40:323
chr3	66432680	rs332371	A	G	4262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=92;NR=55;PP=2590;SC=TCTGCTTCACAGTTACTGAGG;SOR=1.193;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=147;TCF=92;TCR=55;TR=147;WE=66432688;WS=66432670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr3	66432845	rs9868503	G	A	1813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.408;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.426;NF=39;NR=42;PP=1028;ReadPosRankSum=-0.106;SC=AGAACAAATAGAACACCAGGG;SOR=0.426;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=162;TCF=72;TCR=90;TR=81;WE=66432853;WS=66432835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,90:0.50:180
chr3	66432946	rs34392304	T	TG	173.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.784;NF=0;NR=6;PP=181;ReadPosRankSum=-1.079;SC=TGCAGAGAGATGACATGGAGT;SOR=0.730;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=6;WE=66432954;WS=66432936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr3	66433312	rs900172	A	G	236.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=0;PP=187;SC=AACACAGTGCAATTCTTTCAA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=66433320;WS=66433302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	66433676	rs900171	A	G	5208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=92;PP=2965;SC=TCAGGGGTCAAGTGGTGCCGC;SOR=1.006;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=172;TCF=80;TCR=92;TR=172;WE=66433684;WS=66433666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr3	66433937	rs9872772	T	G	409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=11;PP=264;SC=GCATCTGAGATTCTGTCTCAG;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=66433945;WS=66433927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	66434372	rs3830215	T	TCA	946.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.456;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=884;ReadPosRankSum=0.177;SC=TCTCTCTCGCTCACACACACA;SOR=0.412;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=38;TCF=18;TCR=20;TR=26;WE=66434381;WS=66434347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,40:0.71:56
chr3	66444330	rs67550176	T	C	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=223;ReadPosRankSum=0.276;SC=AAGAAATAAATTGCATCCAGC;SOR=0.614;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=15;WE=66444338;WS=66444320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,16:0.42:38
chr3	66444615	rs6793110	G	A	1667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=38;PP=1034;SC=GGAAGCTGTCGCTGCTGATAT;SOR=1.942;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=17;TCR=38;TR=55;WE=66444623;WS=66444605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr3	66451907	rs12494912	T	C	2442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=17;PP=1682;SC=ATTAGTCACATTGACCTGTTT;SOR=2.570;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=60;TCR=17;TR=77;WE=66451915;WS=66451897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr3	66455797	rs3796148	T	C	1909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=45;PP=1087;SC=TGAAGTCCCCTGGGTGCATGC;SOR=2.030;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=65;TCF=19;TCR=46;TR=64;WE=66455805;WS=66455787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr3	66463251	rs4856924	G	A	1300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.46;SOR=6.736;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	66463254	rs12493943	C	G	1300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.36;SOR=6.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr3	66465259	rs4856928	T	C	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.830;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=154;ReadPosRankSum=0.464;SC=AAGGAAAGGGTGGCGTTTGGT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=8;WE=66465267;WS=66465249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr3	66550756	rs1403625	G	C	6110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.28;SOR=0.846;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr3	66550762	rs1403626	G	C	6171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.08;SOR=0.751;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr3	67048762	rs4856833	T	C	1526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=25;NR=24;PP=859;SC=ATAGCTGGAGTCGGGGCCCCA;SOR=0.960;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=49;TCF=25;TCR=24;TR=49;WE=67048770;WS=67048752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr3	67276059	rs9868022	G	T	36.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr3	67411103	rs902320	C	T	3324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=58;NR=48;PP=1704;SC=TGGTGGGCGACGTTCTCTTGG;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=58;TCR=48;TR=106;WE=67411111;WS=67411093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr3	67411166	rs902321	A	G	1577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=27;PP=807;SC=ATGTGCATATAACTTCCTTTT;SOR=1.453;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=17;TCR=27;TR=44;WE=67411174;WS=67411156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr3	67426362	rs79763439	C	G	825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.803;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=24;PP=511;ReadPosRankSum=0.170;SC=ACACACAAGACTCACCTGTCT;SOR=0.925;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=74;TCF=31;TCR=43;TR=39;WE=67426370;WS=67426352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,41:0.49:84
chr3	67459492	rs9824745	G	T	2497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=59;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=54;PP=1558;SC=AAGATATCTTGTATAGGTTTG;SOR=1.718;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=24;TCR=54;TR=78;WE=67459500;WS=67459482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr3	67459509	rs138527816	AATGGGTTTTAGTTCTTTAC	A	1003.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.037;NF=0;NR=14;PP=2925;ReadPosRankSum=0.450;SC=TTTGTGGACCAATGGGTTTTA;SOR=0.889;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=14;WE=67459535;WS=67459499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,27:0.50:54
chr3	67548726	rs150352166	AAAG	A	2741.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.691;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.854;NF=6;NR=31;PP=1535;ReadPosRankSum=0.038;SC=ACAACTAAATAAAGAAGAAAA;SOR=0.779;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=65;TCF=9;TCR=56;TR=37;WE=67548736;WS=67548716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,70:0.59:119
chr3	67548852	rs7630024	G	A	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=23;ReadPosRankSum=-0.703;SC=AGGCAGGAGAGGCTGCTTTGG;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=3;WE=67548860;WS=67548842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr3	67579688	rs114306553	T	C	1270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=3.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.41;ReadPosRankSum=1.234;SOR=0.703;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,66:0.49:135
chr3	67660040	rs2290174	G	A	2046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.64;ReadPosRankSum=-0.702;SOR=0.631;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,56:0.48:116
chr3	67660049	rs2290175	A	G	1980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.01;ReadPosRankSum=-0.434;SOR=0.701;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,53:0.48:110
chr3	67660149	rs11286754	GA	G	125.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.076;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.86;ReadPosRankSum=-0.849;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr3	68587884	rs3828366	A	C	4190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=54;PP=2264;SC=TTGCAAACACAGTTGTTTCCT;SOR=1.121;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=87;TCR=54;TR=141;WE=68587892;WS=68587874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr3	68606548	rs7616164	G	T	2987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.443;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=66;PP=1805;ReadPosRankSum=-1.503;SC=TATTGTGCCTGTTGAGAACCA;SOR=0.745;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=239;TCF=112;TCR=127;TR=121;WE=68606556;WS=68606538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,139:0.51:274
chr3	68782213	rs6549143	A	G	4508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=59;PP=2540;SC=ATTTTCTGCAAAGGGGCCATG;SOR=0.839;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=137;TCF=78;TCR=59;TR=137;WE=68782221;WS=68782203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr3	68788363	rs1504301	G	T	5564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=111;PP=2965;SC=GGAAAACAAAGGCCAAATAAT;SOR=1.277;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=186;TCF=75;TCR=111;TR=186;WE=68788371;WS=68788353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr3	68788465	rs1504300	G	T	495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=15;PP=386;SC=TTAAATTTACGGTTGGTAAAT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=68788473;WS=68788455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	68801921	rs9835691	T	C	805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=0;PP=582;SC=CAACCCTAGGTTTCTTTGGGT;SOR=5.058;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=68801929;WS=68801911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	69036707	rs4855542	G	A	5782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=102;PP=2965;SC=GCATATGCCTGGGTAGATGAA;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=195;TCF=93;TCR=102;TR=195;WE=69036715;WS=69036697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr3	69037633	rs9310136	G	C	1840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=26;PP=1098;SC=AAATATGAATGCTAATGGTAG;SOR=0.754;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=58;TCF=32;TCR=26;TR=58;WE=69037641;WS=69037623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr3	69038217	rs4855543	A	G	2796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=52;PP=1573;SC=AGGATATAACATGACTTTTCA;SOR=1.168;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=40;TCR=52;TR=92;WE=69038225;WS=69038207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr3	69053447	rs9860095	A	T	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.981;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=303;ReadPosRankSum=-1.386;SC=AACATTTTCCATTTGAGAGTC;SOR=1.554;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=55;TCF=43;TCR=12;TR=20;WE=69053455;WS=69053437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,23:0.36:64
chr3	69074930	rs2279936	G	A	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=145;ReadPosRankSum=-2.677;SC=TACCAGGTTCGAACAAAAATG;SOR=0.418;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=12;WE=69074938;WS=69074920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr3	69082657	rs937859	T	C	1654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.619;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=26;PP=905;ReadPosRankSum=-2.539;SC=ATAAACAAGATGGAAGAGCTT;SOR=0.794;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=137;TCF=86;TCR=51;TR=70;WE=69082665;WS=69082647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,77:0.51:152
chr3	69082708	rs1532918	C	G	2610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=51;PP=1736;ReadPosRankSum=-1.019;SC=CCAAGCCTATCAGAAAGATTC;SOR=0.682;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=248;TCF=135;TCR=113;TR=113;WE=69082716;WS=69082698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,124:0.45:275
chr3	69091640	rs9985501	C	T	1817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=21;PP=1019;SC=CCCAGAGTTACACACTTTGAA;SOR=1.196;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=38;TCR=21;TR=59;WE=69091648;WS=69091630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr3	69091716	rs2271120	T	C	970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.005;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=18;PP=361;ReadPosRankSum=1.480;SC=CACAAATTTCTGTCTATTTTA;SOR=0.585;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=84;TCF=49;TCR=35;TR=37;WE=69091724;WS=69091706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,47:0.47:100
chr3	69093598	rs2271118	T	C	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=177;ReadPosRankSum=0.838;SC=AGTATACAGGTTTCCAGAAAA;SOR=0.368;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=11;WE=69093606;WS=69093588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr3	69096614	rs2292199	G	A	2865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.988;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=55;PP=1478;ReadPosRankSum=1.524;SC=TTATTGGTGTGGAAGAAACCA;SOR=0.687;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=247;TCF=132;TCR=115;TR=117;WE=69096622;WS=69096604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,140:0.50:279
chr3	69104695	rs6549179	T	A	2174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=27;NR=42;PP=1296;SC=GAAAAAATATTATTAATACAA;SOR=1.310;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=27;TCR=42;TR=69;WE=69104703;WS=69104685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr3	69104752	rs6549180	C	T	755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=22;PP=590;SC=AAACAAACTACAGAGTATTAC;SOR=3.611;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=25;WE=69104760;WS=69104742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	69106304	rs59405823	CC	TG	3381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=18;PP=2679;SC=AGTTACACAACCCATCCAAGA;SOR=2.093;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=69;TCF=51;TCR=18;TR=65;WE=69106313;WS=69106294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr3	69112049	rs2289245	C	T	696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.337;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=1;PP=525;ReadPosRankSum=-0.174;SC=AATTAACAATCCTAAATATTA;SOR=2.376;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=41;TCF=37;TCR=4;TR=23;WE=69112057;WS=69112039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,25:0.58:43
chr3	69127133	rs3772979	T	C	2395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=58;PP=1475;ReadPosRankSum=-0.762;SC=CCTACAACTATTATGGTATCC;SOR=0.698;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=210;TCF=93;TCR=117;TR=103;WE=69127141;WS=69127123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,115:0.48:239
chr3	69137219	rs3853158	C	T	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=42;ReadPosRankSum=1.124;SC=TTTTTTTTATCATTAAACCTG;SOR=0.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=4;WE=69137227;WS=69137217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr3	69137539	rs3853159	T	C	432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.813;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=284;ReadPosRankSum=0.814;SC=TGTTCAACAATGGTTCCATCC;SOR=1.302;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=19;WE=69137547;WS=69137529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr3	69167851	rs145387235	G	T	1469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.288;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=22;PP=815;ReadPosRankSum=0.363;SC=TCTACTTACAGGTTTAAGATA;SOR=0.955;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=114;TCF=68;TCR=46;TR=63;WE=69167859;WS=69167841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,71:0.56:127
chr3	69225588	rs11128118	T	G	1972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=22;PP=1148;SC=ACCCCTGAACTAGATTATCTG;SOR=1.319;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=44;TCR=22;TR=66;WE=69225596;WS=69225578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr3	69225875	rs9872199	T	A	585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=16;PP=406;SC=TTAAGGTCATTCAGAGGTACA;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=69225883;WS=69225865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr3	69225911	rs9868107	A	G	261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=8;PP=180;SC=TCAGAGGAGAAATTTAAGAGG;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=69225919;WS=69225901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	69229976	rs12054011	G	C	562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=3;PP=422;SC=CATGATCCGTGAGGCGGTTTT;SOR=2.833;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=69229984;WS=69229966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	69230026	rs9818314	T	C	2252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=19;PP=1253;SC=ATCCAGGTGTTGCGTGTTTTT;SOR=1.497;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=50;TCR=19;TR=69;WE=69230034;WS=69230016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr3	69230061	rs9831516	G	A	3683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=82;NR=33;PP=2191;SC=TGAAGAGTACGAGGATGCACG;SOR=1.346;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=82;TCR=33;TR=115;WE=69230069;WS=69230051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr3	69230801	rs9836305	G	A	3404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=73;PP=2060;SC=CGGAGAGCAGGTGGGACTGGG;SOR=1.448;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=46;TCR=73;TR=119;WE=69230809;WS=69230791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr3	69242770	rs11310698	CA	C	1837.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.365;HP=11;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=30;PP=657;ReadPosRankSum=0.555;SC=GTAGGGGACTCAAAAAAAAAA;SOR=0.090;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=74;TCF=34;TCR=40;TR=49;WE=69242779;WS=69242760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,81:0.95:85
chr3	69244162	rs9853587	G	A	1947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=20;PP=1133;SC=GCTCAGAGGCGTTGTTCATAC;SOR=1.445;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=40;TCR=20;TR=60;WE=69244170;WS=69244152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr3	69245454	rs9310141	T	C	8368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=129;NR=135;PP=2965;SC=TGACTTTTCGTCTCCAGTGTC;SOR=0.808;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=264;TCF=129;TCR=135;TR=264;WE=69245462;WS=69245444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,311:1.00:311
chr3	69245623	rs73095903	A	G	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.674;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=339;ReadPosRankSum=0.172;SC=GTTAACATACAATAAAAATAG;SOR=1.799;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=40;TCF=8;TCR=32;TR=16;WE=69245631;WS=69245613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,17:0.40:42
chr3	69245949	rs9860235	G	C	695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=0;PP=585;SC=AAATCTCAGAGAGCAAAAATA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=69245957;WS=69245947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	69246152	rs13059488	A	G	9100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=156;NR=154;PP=2965;SC=TGCACAAACAAGCCACTTTGC;SOR=0.711;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=310;TCF=156;TCR=154;TR=310;WE=69246160;WS=69246142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,333:1.00:333
chr3	69246274	rs13059687	A	G	5352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=102;PP=2965;SC=ATTGTAACAAAGCATGTTCCT;SOR=1.286;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=175;TCF=72;TCR=103;TR=173;WE=69246282;WS=69246264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr3	69265291	rs7643175	T	C	896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=0;PP=791;SC=GGCGACAAAGTGAGACTCCAT;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=28;WE=69265312;WS=69265281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	69265304	rs77475566	C	CA	1001.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=2;PP=783;SC=GACTCCATCTCAAAAAAAACC;SOR=4.863;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=52;TCF=43;TCR=9;TR=31;WE=69265312;WS=69265281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	69265371	rs62254460	G	C	5709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=122;NR=77;PP=2965;SC=TGATTAACATGTTTTGAACAG;SOR=1.157;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=199;TCF=122;TCR=77;TR=199;WE=69265379;WS=69265361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr3	69267578	rs4855301	A	T	1165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=25;PP=733;SC=TAGTTAGAGGACCCTTTTGGG;SOR=1.845;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=12;TCR=25;TR=37;WE=69267586;WS=69267568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	69271032	rs62254461	G	A	1182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.310;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=15;PP=589;ReadPosRankSum=-0.529;SC=GACCTCGAGTGAGACCTTTGA;SOR=0.853;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=134;TCF=87;TCR=47;TR=49;WE=69271040;WS=69271022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,61:0.39:156
chr3	69271206	rs6549189	T	C	1779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=37;PP=1065;SC=GTAGATAGAGTTTGGCTTTTG;SOR=1.539;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=20;TCR=37;TR=57;WE=69271214;WS=69271196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr3	69273656	rs9848940	G	T	4032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=97;NR=32;PP=2791;SC=GATTGGCAATGTGATATTTTT;SOR=2.105;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=129;TCF=97;TCR=32;TR=129;WE=69273664;WS=69273646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr3	69336695	rs4855380	G	A	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.132;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.789;NF=11;NR=0;PP=199;ReadPosRankSum=-0.469;SC=CAGGATTCCCGTGCAGATGGT;SOR=2.147;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=11;WE=69336703;WS=69336685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr3	69336740	rs4855381	A	G	1145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.24;QD=24.91;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr3	69336795	.	CT	C	85.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.749;ClippingRankSum=0.000;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=8.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQRankSum=0.000;QD=0.70;ReadPosRankSum=0.961;SOR=0.176;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,19:0.16:122
chr3	69351460	rs34523072	AAG	A	6329.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=48;PP=2979;SC=ACAGCAAAAAAAGAGGGATGC;SOR=1.231;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=44;TCR=53;TR=88;WE=69351469;WS=69351450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr3	69359734	rs13324422	G	C	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.183;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.25;ReadPosRankSum=1.899;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr3	69359734	.	GAGAGAGAGAGAG	CACACACACACAC,CACAGAGAGAGAG	885	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.35;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MMLQ=28;MQ=54.67;NF=1,2;NR=4,12;PP=885,865;QD=197.0;SC=CACACACACAGAGAGAGAGAG;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=5,14;WE=69359754;WS=69359722;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.22:23
chr3	69359736	rs62254067	G	C	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.183;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.25;ReadPosRankSum=1.723;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr3	69360315	rs13065977	A	G	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=87;ReadPosRankSum=-0.366;SC=ACATGTTCTGAATGCTGGAGG;SOR=0.446;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=6;WE=69360323;WS=69360305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr3	69362706	rs1483895	C	T	2473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.488;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=55;PP=1464;ReadPosRankSum=-0.220;SC=GTCAGGGCCACGGCTGGCAAG;SOR=1.098;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=160;TCF=75;TCR=85;TR=97;WE=69362714;WS=69362696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,109:0.61:179
chr3	69362722	rs2314992	C	A	1376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.577;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=32;PP=812;ReadPosRankSum=0.257;SC=GCAAGCAAACCTTTGGACTCG;SOR=0.625;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=73;TCR=79;TR=63;WE=69362730;WS=69362712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,70:0.42:167
chr3	69987707	rs113310138	C	T	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.361;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.123;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=46;ReadPosRankSum=-0.056;SC=GAGACTTTAACGGAAACGCAA;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=4;WE=69987715;WS=69987697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr3	70014447	rs9863910	T	C	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.258;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=225;ReadPosRankSum=-2.951;SC=CTTTCTTGATTCGTAGATTTA;SOR=1.852;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=47;TCF=18;TCR=29;TR=15;WE=70014455;WS=70014437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,18:0.33:55
chr3	71007347	.	CAA	C	87.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=0.000;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=1.408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.31;MQRankSum=-0.572;QD=1.49;ReadPosRankSum=0.557;SOR=0.777;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,9:0.15:59
chr3	71007361	rs1053797	G	T	3216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.16;QD=25.73;SOR=0.810;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr3	71008341	rs112773801	G	GT	94.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.36;MQRankSum=1.336;QD=3.51;ReadPosRankSum=-0.757;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr3	71015021	rs7638391	G	T	989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=7;PP=658;SC=GCAAAGACCTGTTGGGTGGAC;SOR=2.115;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=33;WE=71015029;WS=71015011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	71019750	rs9874207	T	C	805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=22;NR=5;PP=521;SC=CCAGGGAGTATGATGCTTTGT;SOR=2.468;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=27;WE=71019758;WS=71019740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	71019797	rs139128497	A	T	849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=1.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.00;ReadPosRankSum=0.427;SOR=0.509;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,41:0.48:85
chr3	71036994	rs6802472	A	G	110.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=0;PP=84;SC=ATCATAAAGGATAACCAGAAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=71037002;WS=71036984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	71247572	rs56850311	A	T	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=4.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.12;ReadPosRankSum=-0.225;SOR=1.275;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,17:0.71:24
chr3	71745688	rs9877458	C	T	1558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.073;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=37;PP=911;ReadPosRankSum=-0.689;SC=CAAAGACCAACGTTTAAAGTT;SOR=0.981;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=120;TCF=55;TCR=65;TR=63;WE=71745696;WS=71745678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,73:0.53:138
chr3	71745812	rs12107018	T	A	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-3.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=74;ReadPosRankSum=-0.699;SC=CTTATTTTTGTTTTTTATTTT;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=6;WE=71745820;WS=71745802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr3	71803174	rs3732739	C	A	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.533;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=124;ReadPosRankSum=-2.099;SC=GGCCCCGGGGCGGAGCGCACG;SOR=0.144;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=12;WE=71803182;WS=71803164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr3	71823582	rs3796224	C	T	2501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.901;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=56;PP=1455;ReadPosRankSum=1.257;SC=GTACCACATTCGCATTCTTCT;SOR=0.910;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=204;TCF=103;TCR=101;TR=106;WE=71823590;WS=71823572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,120:0.51:234
chr3	72495777	rs13066407	C	G	7233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=138;NR=103;PP=2965;SC=TTTGGCCTTCCGAGGAGTGGA;SOR=0.943;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=244;TCF=140;TCR=104;TR=241;WE=72495785;WS=72495767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr3	72495945	rs13088771	A	G	8907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=126;NR=173;PP=2965;SC=ACTGGAAGAGAGAGCGAGGAA;SOR=1.113;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=299;TCF=126;TCR=173;TR=299;WE=72495953;WS=72495935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,326:1.00:326
chr3	72496105	.	G	A	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.871;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=76;ReadPosRankSum=-1.179;SC=GGGCTGGGGGGGCCGGGAGGG;SOR=0.551;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=5;WE=72496113;WS=72496095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr3	72799703	rs35178407	C	T	2023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-4.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.970;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=36;PP=1026;ReadPosRankSum=-2.006;SC=TTGCAAAGAACTGACTGTCTC;SOR=0.768;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=173;TCF=93;TCR=80;TR=86;WE=72799711;WS=72799693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,102:0.50:204
chr3	72873809	rs6786469	A	G	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=288;ReadPosRankSum=1.270;SC=ATTTTAATTCAAAGTACATTT;SOR=0.495;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=37;TCF=5;TCR=32;TR=16;WE=72873817;WS=72873799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,19:0.45:42
chr3	72895345	rs1502754	G	T	913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.243;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=27;PP=534;ReadPosRankSum=-0.755;SC=TCTTACTGCAGAGAAAATTAT;SOR=0.907;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=123;TCF=60;TCR=63;TR=49;WE=72895353;WS=72895335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,51:0.38:134
chr3	73046508	rs9834246	G	C	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.752;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=11;PP=283;ReadPosRankSum=-0.702;SC=GGGGACGAGTGGCGGACCCGC;SOR=0.914;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=79;TCF=46;TCR=33;TR=30;WE=73046516;WS=73046498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,35:0.39:89
chr3	73046544	rs9310254	T	C	1129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.792;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=14;PP=414;ReadPosRankSum=-0.069;SC=AGATATCCTCTTTTCTCCACC;SOR=0.775;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=46;TCR=36;TR=31;WE=73046552;WS=73046534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,36:0.38:95
chr3	73046561	rs9873229	C	T	1189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.79;ReadPosRankSum=0.086;SOR=0.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,35:0.38:93
chr3	73096591	rs71277513	A	ATAAT	613.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.779;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.733;NF=0;NR=13;PP=613;ReadPosRankSum=0.467;SC=TGTCTGGTTGATGATTGATTA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=13;WE=73096599;WS=73096581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,18:0.37:49
chr3	73110076	rs726029	G	A	1107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.553;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=18;PP=635;ReadPosRankSum=1.067;SC=GAATCAATGGGAATTTAACCC;SOR=0.895;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=93;TCF=55;TCR=38;TR=46;WE=73110084;WS=73110066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,53:0.50:107
chr3	73111368	rs2231924	T	C	1815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.712;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=35;PP=1249;ReadPosRankSum=0.508;SC=GAACCAATTTTCCACAATGTC;SOR=0.501;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=147;TCF=90;TCR=57;TR=81;WE=73111376;WS=73111358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,85:0.50:169
chr3	73111401	rs202063792	C	G	2072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.525;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=31;PP=1188;ReadPosRankSum=1.642;SC=GGACTCACAGCCCAGCAGCCC;SOR=0.884;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=170;TCF=100;TCR=70;TR=79;WE=73111409;WS=73111391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,93:0.49:188
chr3	73111809	rs2231926	A	G	2425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.573;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=58;PP=1638;ReadPosRankSum=-1.835;SC=TTTGATAGGCATTGCGGCTGG;SOR=0.751;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=217;TCF=107;TCR=110;TR=112;WE=73111817;WS=73111799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,117:0.50:235
chr3	73111973	rs2231928	A	G	2255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.701;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.133;NF=57;NR=49;PP=1325;ReadPosRankSum=-0.138;SC=GCTCAAGACCATGGGTTGGAG;SOR=0.599;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=242;TCF=120;TCR=122;TR=106;WE=73111981;WS=73111963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,116:0.43:267
chr3	73111998	rs1060584	C	T	2570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=57;PP=1549;ReadPosRankSum=-1.076;SC=AATGTTCACACTTCTATTTGG;SOR=0.721;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=254;TCF=129;TCR=125;TR=115;WE=73112006;WS=73111988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,127:0.45:285
chr3	73112919	rs3841614	T	TA	1941.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.381;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.054;NF=5;NR=21;PP=1001;ReadPosRankSum=2.152;SC=AGATTTTTAATACCTACAGAG;SOR=0.740;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=63;TCF=11;TCR=52;TR=26;WE=73112927;WS=73112909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,63:0.48:131
chr3	73112974	rs11708712	A	T	1063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.560;HP=5;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.047;NF=15;NR=22;PP=556;ReadPosRankSum=-1.553;SC=TGTACTTTTTAAAAATTGGGC;SOR=0.905;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=87;TCF=41;TCR=46;TR=37;WE=73112982;WS=73112964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,52:0.49:107
chr3	73433369	rs3205537	G	A	1614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.739;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=35;PP=940;ReadPosRankSum=0.302;SC=GATGCCCTCCGCCGCTCTCCT;SOR=0.512;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=151;TCF=73;TCR=78;TR=72;WE=73433377;WS=73433359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,78:0.48:163
chr3	73433494	rs13091636	T	C	1463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=30;PP=772;ReadPosRankSum=-0.811;SC=CGGTGATATCTGAGAGCTCGT;SOR=0.655;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=160;TCF=86;TCR=74;TR=64;WE=73433502;WS=73433484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,74:0.42:176
chr3	73434086	rs6787588	A	G	1148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.441;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=29;PP=626;ReadPosRankSum=-0.676;SC=CTTCTTCTGCATAAACACAAG;SOR=0.569;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=110;TCF=48;TCR=62;TR=53;WE=73434094;WS=73434076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,59:0.48:123
chr3	73437112	rs6549532	A	G	1254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.610;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=26;PP=842;ReadPosRankSum=-1.789;SC=GTAGGAAGCCAATTTACCTGG;SOR=0.612;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=141;TCF=85;TCR=56;TR=63;WE=73437120;WS=73437102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,65:0.43:152
chr3	73437225	rs3830251	T	TA	306.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.100;HP=9;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=2.026;NF=2;NR=17;PP=208;ReadPosRankSum=-0.261;SC=ATTAATCTTTTAAAAAAAAAG;SOR=1.785;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=49;TCF=5;TCR=44;TR=19;WE=73437233;WS=73437215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,16:0.37:43
chr3	73440108	rs35427155	G	GA	639.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.022;HP=10;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=8;PP=250;ReadPosRankSum=-0.028;SC=TGGTGAACATGAAAAAAAAAA;SOR=0.963;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=49;TCF=21;TCR=28;TR=20;WE=73440116;WS=73440098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,35:0.51:69
chr3	73453201	rs2291464	C	T	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.594;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=181;ReadPosRankSum=-0.566;SC=TGGAGGAAAACTATAGGGTGC;SOR=0.404;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=15;WE=73453209;WS=73453191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr3	73453325	rs2291463	C	T	2018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.097;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=37;PP=1038;ReadPosRankSum=0.165;SC=AGGGATCCAGCACGGGTGGGC;SOR=0.587;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=183;TCF=103;TCR=80;TR=86;WE=73453333;WS=73453315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,98:0.49:200
chr3	73651383	rs6809923	A	T	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=282;ReadPosRankSum=0.410;SC=GGGAAAAGTGAGACTCCCGCT;SOR=0.752;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=67;TCF=49;TCR=18;TR=22;WE=73651391;WS=73651373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,23:0.33:69
chr3	73651469	rs6797804	C	T	2165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.906;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=43;PP=1208;ReadPosRankSum=0.125;SC=GGATGGCATTCAGCCTATTCA;SOR=0.898;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=220;TCF=120;TCR=100;TR=100;WE=73651477;WS=73651459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,108:0.46:234
chr3	73651621	rs11343439	TA	T	1960.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.427;NF=3;NR=52;PP=800;ReadPosRankSum=0.511;SC=TCCTTTGGGTTAAAAAAAAAA;SOR=0.880;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=69;TCF=4;TCR=65;TR=55;WE=73651630;WS=73651611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,86:0.96:90
chr3	73673188	rs79280925	G	A	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=168;ReadPosRankSum=-0.391;SC=TACCCAAAGGGATGGGGCGGG;SOR=0.610;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=12;WE=73673196;WS=73673178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr3	73673578	rs6763344	G	C	979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=22;NR=6;PP=481;SC=GCGCGTCGCAGGCGTCGCGCA;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=28;WE=73673586;WS=73673568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	74315580	rs615824	C	G	4585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=48;PP=2400;SC=CTCACTATGGCGGATAGTAAC;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=134;TCF=86;TCR=48;TR=134;WE=74315588;WS=74315570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr3	74344134	rs1352475	A	G	670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=0;PP=458;SC=ATGGAACATCAGATGAAACAA;SOR=5.058;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=74344142;WS=74344124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	74413676	rs6549590	T	C	11448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=429;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.98;NF=194;NR=193;PP=2965;SC=CTGCTATGCATTGGAACATGC;SOR=0.726;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=388;TCF=194;TCR=194;TR=387;WE=74413684;WS=74413666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,429:1.00:429
chr3	74474166	rs7619184	T	C	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.12;ReadPosRankSum=0.662;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,3:0.20:15
chr3	75386297	rs6769147	G	A	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.254;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.355;NF=12;NR=6;PP=312;ReadPosRankSum=-0.475;SC=GGATACAAAGGCTGTGCTGAG;SOR=1.226;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=31;TCF=18;TCR=13;TR=18;WE=75386305;WS=75386287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr3	75386380	rs4677501	T	G	2000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=40;NR=34;PP=1266;SC=ATGACTTCAGTGGGTGGATTC;SOR=0.719;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=40;TCR=34;TR=74;WE=75386388;WS=75386370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr3	75679937	rs141031386	G	A	956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.28;MQRankSum=-6.591;QD=5.70;ReadPosRankSum=0.649;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:135,33:0.20:168
chr3	75679944	rs201399352	C	T	1636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FS=1.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.41;MQRankSum=-1.468;QD=8.31;ReadPosRankSum=0.880;SOR=0.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,79:0.40:197
chr3	75679958	rs200114452	C	T	1682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FS=2.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.65;MQRankSum=-6.289;QD=6.65;ReadPosRankSum=-0.055;SOR=0.525;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:200,53:0.21:253
chr3	75679963	rs201125883	C	T	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FS=0.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.77;MQRankSum=-2.266;QD=0.94;ReadPosRankSum=-0.515;SOR=0.619;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:239,43:0.15:282
chr3	75679973	rs183720508	A	G	1843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FS=0.486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.14;MQRankSum=-6.960;QD=5.33;ReadPosRankSum=0.349;SOR=0.744;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:273,73:0.21:346
chr3	75679993	rs202177109	C	T	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=380;ExcessHet=3.0103;FS=1.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.16;MQRankSum=-2.673;QD=0.92;ReadPosRankSum=-0.917;SOR=0.578;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:320,60:0.16:380
chr3	75680010	rs75174508	T	C	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=403;ExcessHet=3.0103;FS=2.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.00;MQRankSum=-6.047;QD=1.15;ReadPosRankSum=1.969;SOR=0.935;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:335,68:0.17:403
chr3	75680109	rs199802601	G	T	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=2.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.80;MQRankSum=-0.620;QD=1.16;ReadPosRankSum=0.154;SOR=1.384;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,7:0.14:50
chr3	75680122	.	C	A	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.166;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=2.872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.42;MQRankSum=-0.993;QD=8.12;ReadPosRankSum=1.452;SOR=1.651;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr3	75786440	rs145944373	C	T	223.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.00;QD=24.86;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	75786662	rs202184453	A	T	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.70;MQRankSum=-3.836;QD=13.20;ReadPosRankSum=-2.764;SOR=0.948;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,11:0.32:34
chr3	75786672	rs200017345	C	T	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.72;MQRankSum=-3.914;QD=12.47;ReadPosRankSum=-1.846;SOR=0.871;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,13:0.36:36
chr3	75786681	rs111677009	G	A	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.31;MQRankSum=-3.248;QD=14.11;ReadPosRankSum=-1.449;SOR=0.682;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,14:0.40:35
chr3	75786684	rs201345045	G	T	496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.31;MQRankSum=-3.248;QD=14.19;ReadPosRankSum=-0.860;SOR=0.682;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,14:0.40:35
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chr3	75786748	rs112332186	C	T	1404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=5.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.73;MQRankSum=-0.651;QD=23.81;ReadPosRankSum=0.816;SOR=0.242;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,36:0.61:59
chr3	75786753	rs3009020	C	T	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=3.557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.65;MQRankSum=1.349;QD=8.01;ReadPosRankSum=-0.408;SOR=1.214;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,25:0.40:63
chr3	75786760	rs145576551	TC	T	1496.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=3.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.40;MQRankSum=-1.128;QD=22.34;ReadPosRankSum=-0.396;SOR=0.373;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,40:0.60:67
chr3	75786832	rs11122676	C	T	1015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.902;HP=1;HapScore=4;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.891;NF=21;NR=22;PP=2079;ReadPosRankSum=0.452;SC=TCATTACATACGTAAGGTTTC;SOR=0.577;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=63;TCF=31;TCR=32;TR=43;WE=75786853;WS=75786822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,46:0.63:73
chr3	75786833	rs139448820	G	A	870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.927;HP=1;HapScore=4;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.014;NF=10;NR=10;PP=950;ReadPosRankSum=-0.069;SC=CATTACATACGTAAGGTTTCT;SOR=0.872;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=31;TCR=33;TR=20;WE=75786853;WS=75786822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,26:0.36:73
chr3	75786845	rs62250105	T	C	869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.004;NF=10;NR=10;PP=950;ReadPosRankSum=-0.870;SC=AAGGTTTCTCTCCTGTGTGAG;SOR=0.726;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=57;TCF=27;TCR=30;TR=20;WE=75786853;WS=75786822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,25:0.38:65
chr3	75786888	rs1615736	C	T	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.043;HP=1;HapScore=3;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-2.856;NF=10;NR=11;PP=680;ReadPosRankSum=2.088;SC=TGACTTCTGACGAAAGGTTTT;SOR=0.473;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=54;TCF=23;TCR=31;TR=21;WE=75786902;WS=75786878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,24:0.42:57
chr3	75786894	rs144168413	GT	G	829.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=3;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.456;NF=2;NR=11;PP=684;ReadPosRankSum=2.099;SC=CTGACGAAAGGTTTTTCCACA;SOR=0.626;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=13;WE=75786902;WS=75786878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,24:0.44:54
chr3	75788076	rs146581110	A	C	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.17;MQRankSum=-3.692;QD=1.99;ReadPosRankSum=0.135;SOR=0.735;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,5:0.14:37
chr3	75788085	rs201605431	A	G	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=1.367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.07;MQRankSum=-5.207;QD=3.51;ReadPosRankSum=-1.893;SOR=0.443;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,11:0.21:53
chr3	75788105	.	C	T	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.228;ClippingRankSum=0.000;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=1.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.92;MQRankSum=-6.526;QD=5.67;ReadPosRankSum=-0.531;SOR=0.453;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,16:0.20:79
chr3	75788109	.	G	A	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.080;ClippingRankSum=0.000;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=1.071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.96;MQRankSum=-6.648;QD=5.39;ReadPosRankSum=-0.193;SOR=0.484;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,16:0.20:82
chr3	75788114	rs375615433	C	T	432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=1.061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.99;MQRankSum=-6.684;QD=5.03;ReadPosRankSum=0.105;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,16:0.19:86
chr3	75788130	.	C	T	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.569;ClippingRankSum=0.000;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=1.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.07;MQRankSum=-6.880;QD=3.88;ReadPosRankSum=2.526;SOR=0.524;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,16:0.16:100
chr3	75788137	rs199883677	C	T	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=1.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.98;MQRankSum=-6.777;QD=3.46;ReadPosRankSum=2.989;SOR=0.554;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,16:0.15:107
chr3	75788152	rs148372120	T	C	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.10;MQRankSum=-6.952;QD=0.70;ReadPosRankSum=1.649;SOR=0.656;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,16:0.13:120
chr3	75788192	.	T	C	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.734;ClippingRankSum=0.000;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.96;MQRankSum=-5.244;QD=0.59;ReadPosRankSum=-2.863;SOR=0.809;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,8:0.10:81
chr3	75788195	.	A	T	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.502;ClippingRankSum=0.000;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.06;MQRankSum=-4.691;QD=0.60;ReadPosRankSum=-1.975;SOR=0.932;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,6:0.08:79
chr3	75986663	rs12171318	C	A	933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=2.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.16;MQRankSum=-5.065;QD=27.46;ReadPosRankSum=-0.206;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,21:0.62:34
chr3	75986686	rs62269817	A	G	1975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-4.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.006;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.859;NF=50;NR=27;PP=1212;ReadPosRankSum=-2.012;SC=GGATGTGGACATGGGCTCCGG;SOR=0.183;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=93;TCF=63;TCR=30;TR=77;WE=75986694;WS=75986676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,65:0.79:82
chr3	75986695	rs79015247	G	A	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=1.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.64;MQRankSum=-0.267;QD=0.63;ReadPosRankSum=-0.767;SOR=0.458;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,17:0.16:106
chr3	75986717	rs78834776	G	A	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=6.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.21;MQRankSum=-3.791;QD=0.20;ReadPosRankSum=2.166;SOR=1.525;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:140,20:0.12:160
chr3	75986719	rs62269818	G	C	3157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-6.774;NF=81;NR=61;PP=1927;ReadPosRankSum=5.052;SC=TGACTGTGGTGTTTTGGGGTC;SOR=0.741;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=198;TCF=116;TCR=82;TR=142;WE=75986727;WS=75986707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,106:0.65:164
chr3	75986794	.	G	A	2255	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MMLQ=26;MQ=51.85;NF=74;NR=94;PP=2255;QD=13.6295905509;SC=AGTTGGATGCGAATTTCACTT;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=298;TCF=140;TCR=158;TR=168;WE=75986802;WS=75986784;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:130,168:0.56:298
chr3	75986813	.	T	A	1701	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MMLQ=25;MQ=50.83;NF=54;NR=74;PP=1701;QD=13.560712598;SC=TTTATGATGATATTATGTGAG;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=255;TCF=116;TCR=139;TR=128;WE=75986821;WS=75986803;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:127,128:0.50:255
chr3	75986833	.	C	T	1133	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MMLQ=24;MQ=49.93;NF=29;NR=54;PP=1133;QD=14.0695326813;SC=GTCTTTGGTTCGACGTTTAAG;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=182;TCF=74;TCR=108;TR=83;WE=75986841;WS=75986823;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:99,83:0.46:182
chr3	75986874	rs7610755	G	C	1697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=39;PP=1147;SC=CCAGGTTTTTGTTACACGGTA;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=20;TCR=39;TR=59;WE=75986882;WS=75986864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr3	76484183	rs3849491	T	C	671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-3.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.490;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=20;PP=347;ReadPosRankSum=-0.301;SC=TGATTGAGGATGCAGAGCTGA;SOR=0.195;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=46;TCF=9;TCR=37;TR=27;WE=76484191;WS=76484173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,32:0.59:54
chr3	77090112	rs114060047	C	T	1064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=30;PP=705;ReadPosRankSum=3.424;SC=GTCTGTTAGTCCGTTTTGGCC;SOR=0.642;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=107;TCF=43;TCR=64;TR=48;WE=77090120;WS=77090102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,52:0.44:117
chr3	77542334	rs188137836	G	A	889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.681;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=10;PP=574;ReadPosRankSum=-1.549;SC=TTTTCATAATGTACTTAAAGC;SOR=0.321;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=75;TCF=58;TCR=17;TR=39;WE=77542342;WS=77542324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,41:0.53:77
chr3	77600273	rs3796291	C	A	143.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=5;PP=113;SC=GAATCCAGGTCACATTCTTTT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=77600281;WS=77600263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	77607070	rs5850333	A	AC	5512.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=43;PP=2936;SC=ATGTTAAAATACCTGAAAAGA;SOR=1.208;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=93;TCF=48;TCR=45;TR=83;WE=77607078;WS=77607060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
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chr3	77645984	rs775718	A	G	87.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=17.58;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	77681865	rs1451617	T	A	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.009;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=105;ReadPosRankSum=-0.405;SC=TTGGACACTGTCCTCTTTTCT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=6;WE=77681873;WS=77681855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr3	78663956	rs1027832	G	A	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.74;ReadPosRankSum=0.626;SOR=0.755;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,15:0.35:43
chr3	78663958	rs5850376	GA	G	277.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.31;ReadPosRankSum=-0.667;SOR=0.556;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,15:0.39:38
chr3	78664011	rs3732661	G	T	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.222;HP=2;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=158;ReadPosRankSum=1.198;SC=ATTACAACAGGAACAACAAAA;SOR=0.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=5;TCR=38;TR=10;WE=78664019;WS=78664001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr3	78664093	rs1027833	C	T	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.638;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=124;ReadPosRankSum=1.732;SC=CAAACTCTTCCAGCAAATAAC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=7;WE=78664101;WS=78664083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr3	78666765	rs9839790	T	C	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.858;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=8;PP=397;ReadPosRankSum=-1.015;SC=CCCAGCTTGGTGAAAAGTGTT;SOR=1.270;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=51;TCF=35;TCR=16;TR=29;WE=78666773;WS=78666755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,33:0.58:57
chr3	78676405	rs7625555	T	C	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.408;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=109;ReadPosRankSum=0.109;SC=GGATAGCATTTGGTAACTTCC;SOR=0.400;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=12;WE=78676413;WS=78676395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,14:0.36:39
chr3	78676422	rs7614084	G	A	903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=6;PP=436;ReadPosRankSum=-1.436;SC=TTCCACTGAGGAGTAGAAATT;SOR=0.660;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=50;TCF=40;TCR=10;TR=34;WE=78676430;WS=78676412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,42:0.69:61
chr3	78676467	rs7636043	A	G	2962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=33;PP=1656;SC=TAGTGACAACATACCTCCTGT;SOR=1.250;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=68;TCR=33;TR=101;WE=78676475;WS=78676457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr3	78680578	rs6548592	T	C	647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=21;PP=483;SC=GAGATAAACATGCTTTTTCAT;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=24;WE=78680586;WS=78680568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	78685024	rs35456279	C	T	1632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=34;PP=1024;ReadPosRankSum=-1.156;SC=AGAGTCCCCGCTGCCATTGTT;SOR=0.719;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=137;TCF=72;TCR=65;TR=70;WE=78685032;WS=78685014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,77:0.52:149
chr3	78695185	rs73108203	A	G	1220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=15;PP=783;ReadPosRankSum=-0.203;SC=AAGGAACTAAATAAATTCCAC;SOR=0.618;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=105;TCF=72;TCR=33;TR=50;WE=78695193;WS=78695175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,54:0.49:111
chr3	78700779	rs3925684	C	A	1248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=3;PP=850;SC=TATATTAAAACAAGTTTTAGA;SOR=4.461;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=30;TCR=3;TR=33;WE=78700787;WS=78700769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr3	78711350	rs9864412	T	C	1580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=25;NR=29;PP=957;SC=TGTTCATTCATAGCAACTCTC;SOR=1.034;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=59;TCF=25;TCR=34;TR=54;WE=78711358;WS=78711340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr3	78717508	rs2255164	G	A	1889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=46;PP=1476;SC=ACAGATAAGCGGATAAATGCA;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=14;TCR=46;TR=60;WE=78717516;WS=78717498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr3	78737962	rs967454	G	A	3973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=74;PP=2208;SC=TTAAAAGCACGTTGTTATTGT;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=56;TCR=74;TR=130;WE=78737970;WS=78737952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr3	78796078	rs2304503	C	A	2966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=55;PP=1704;SC=AATCATTATACCCAAAAGTGA;SOR=1.015;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=45;TCR=55;TR=100;WE=78796086;WS=78796068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr3	81548209	rs34988523	T	TAAG	1260.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.167;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=838;ReadPosRankSum=-1.164;SC=AACATTACTATAATAAAAGAG;SOR=1.112;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=51;TCF=31;TCR=20;TR=19;WE=81548217;WS=81548199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,33:0.38:86
chr3	81584268	.	CTT	C	62.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.48;ReadPosRankSum=-0.778;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr3	81630214	rs9870056	G	A	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=201;ReadPosRankSum=0.406;SC=AACTACAGAGGTTTATATTTC;SOR=0.941;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=12;WE=81630222;WS=81630204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr3	81643167	rs2172397	T	C	5060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=90;PP=2913;SC=AATCTTAAAATTTCCCAGCTA;SOR=1.230;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=156;TCF=66;TCR=90;TR=156;WE=81643175;WS=81643157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr3	81792592	rs3772889	T	C	785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=9;PP=537;ReadPosRankSum=0.525;SC=TGAACACACATACACCCCCAC;SOR=0.791;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=75;TCF=56;TCR=19;TR=34;WE=81792600;WS=81792582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,35:0.44:79
chr3	81810516	rs9820490	C	A	1435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.592;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=21;PP=791;ReadPosRankSum=1.827;SC=TGGTGGGATTCCGGCGGTACC;SOR=0.761;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=139;TCF=90;TCR=49;TR=64;WE=81810524;WS=81810506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,75:0.47:159
chr3	81810702	rs11391701	A	AG	1419.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=20;PP=860;SC=GAGGCCCGAGAGGTCGAGTGG;SOR=1.845;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=21;WE=81810710;WS=81810692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	81810770	rs78982329	G	A	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.798;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.63;MQRankSum=0.776;QD=6.74;ReadPosRankSum=0.309;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr3	85851246	rs7613828	T	C	1461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.637;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=24;PP=673;ReadPosRankSum=-0.208;SC=TTGTTGAAGGTGGAACTGCAA;SOR=0.607;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=125;TCF=77;TCR=48;TR=64;WE=85851254;WS=85851236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,73:0.53:138
chr3	86010877	rs56162756	G	T	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.203;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=208;ReadPosRankSum=-0.181;SC=AATTTTAAGTGCAGTGAACAA;SOR=1.885;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=11;WE=86010885;WS=86010867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr3	87100309	rs2575753	T	C	8322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=170;NR=149;PP=2965;SC=ACCACCTTTCTATCTTGAAAC;SOR=0.732;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=319;TCF=170;TCR=149;TR=319;WE=87100317;WS=87100299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,314:1.00:314
chr3	87100434	rs7619398	G	A	1998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=52.92;QD=28.97;SOR=0.980;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr3	87100893	rs2256481	G	A	2433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.405;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=41;PP=1496;ReadPosRankSum=-0.764;SC=TTCCCTGCATGAGCAAGAGCA;SOR=0.545;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=82;TCF=41;TCR=41;TR=81;WE=87100901;WS=87100883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,91:0.99:92
chr3	87275337	.	C	T	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.833;ClippingRankSum=0.000;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=20;PP=410;ReadPosRankSum=1.136;SC=ATCCTTGAGACATGATTCATA;SOR=0.770;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=46;TCF=16;TCR=30;TR=30;WE=87275345;WS=87275327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,31:0.63:49
chr3	87276699	rs2279720	C	T	2975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.841;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=70;PP=1707;ReadPosRankSum=0.824;SC=AGAAGAAAACCGTGGATGGTG;SOR=0.764;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=286;TCF=140;TCR=146;TR=133;WE=87276707;WS=87276689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,150:0.46:326
chr3	87290015	rs140349455	A	G	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=139;ReadPosRankSum=0.722;SC=TTAGCTAACTAGGAAGAAGGC;SOR=0.818;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=9;WE=87290023;WS=87290005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr3	87295049	rs11540913	T	C	1309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=17;NR=20;PP=678;SC=CAATGTCTACTACAGCAAAAG;SOR=1.225;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=17;TCR=20;TR=37;WE=87295057;WS=87295039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr3	87299075	rs1044499	A	C	1158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.713;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=23;PP=655;ReadPosRankSum=-0.157;SC=CATTACAAACAATGCAGAATT;SOR=0.612;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=47;TCR=44;TR=47;WE=87299083;WS=87299065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,56:0.52:108
chr3	88178217	.	CA	C	39.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.410;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.14;ReadPosRankSum=-1.578;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,7:0.20:35
chr3	88188420	rs9813894	G	A	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=4;PP=508;ReadPosRankSum=-0.949;SC=ACAGCTCTCAGTACTTCCAAA;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=52;TCF=45;TCR=7;TR=27;WE=88188428;WS=88188410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,27:0.50:54
chr3	88189341	rs7653652	T	C	2855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.258;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=61;PP=1891;ReadPosRankSum=-0.965;SC=AGTCACAGGATATTTCAGGCT;SOR=0.694;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=210;TCF=106;TCR=104;TR=115;WE=88189349;WS=88189331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,128:0.54:237
chr3	88190768	rs7432826	C	A	1940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.523;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=40;PP=1198;ReadPosRankSum=0.372;SC=ATAAAACTTGCATTAACAGAT;SOR=0.639;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=172;TCF=93;TCR=79;TR=85;WE=88190776;WS=88190758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,94:0.48:195
chr3	88190809	rs7432838	C	T	1592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.658;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=40;PP=991;ReadPosRankSum=0.171;SC=CTGATGAAAACGGTTCAGAAA;SOR=0.899;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=149;TCF=71;TCR=78;TR=72;WE=88190817;WS=88190799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,78:0.46:171
chr3	88199179	rs6551277	T	C	2534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.061;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=37;PP=2962;ReadPosRankSum=1.833;SC=TTGTTGCCGTTGTCTTTCCCC;SOR=0.846;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=242;TCF=141;TCR=101;TR=97;WE=88199193;WS=88199169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,125:0.46:272
chr3	88199185	rs11374933	T	TC	2506.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.910;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=2.495;NF=23;NR=41;PP=2976;ReadPosRankSum=2.202;SC=CCGTTGTCTTTCCCCCCCAGT;SOR=0.911;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=177;TCF=54;TCR=123;TR=64;WE=88199193;WS=88199169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,129:0.45:287
chr3	88199298	rs6551278	T	C	3661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=359;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.384;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=1.659;NF=80;NR=89;PP=1824;ReadPosRankSum=2.344;SC=TATGCGACACTGTCACCAACC;SOR=0.662;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=325;TCF=151;TCR=174;TR=169;WE=88199306;WS=88199288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,187:0.52:357
chr3	89498619	rs1028011	A	G	647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=18;PP=479;SC=CTCCTGGTTTATAACACTGAA;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=89498627;WS=89498609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	90264768	rs6803112	A	G	3581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=50;PP=2014;SC=TTCACTTTCCACTTTCTGAGG;SOR=1.001;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=74;TCR=50;TR=124;WE=90264776;WS=90264758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr3	90276511	rs9815264	G	A	2927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=29;PP=1772;SC=AAGTATCTAGGATCTCTCATT;SOR=1.655;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=64;TCR=29;TR=93;WE=90276519;WS=90276501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr3	90276661	rs9815542	G	A	3271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=50;NR=64;PP=1871;SC=GAGCACACATGTTCTCAGAGC;SOR=1.107;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=116;TCF=50;TCR=66;TR=114;WE=90276669;WS=90276651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr3	90276701	rs150608014	GCA	G	156.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.885;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=291;ReadPosRankSum=-2.914;SC=AAACACGCGCGCACACACACA;SOR=1.201;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=1;TCR=44;TR=10;WE=90276712;WS=90276691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,11:0.28:39
chr3	93593119	rs6123	T	C	3833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=47;PP=2266;SC=TCCAAACTGATGGACATGAGT;SOR=1.334;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=138;TCF=91;TCR=47;TR=138;WE=93593127;WS=93593109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr3	97184962	rs62262775	G	A	2058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.441;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=26;PP=1240;ReadPosRankSum=-0.785;SC=TGGCACATGTGTTAGTCTTTC;SOR=1.041;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=169;TCF=112;TCR=57;TR=88;WE=97184984;WS=97184952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,98:0.53:186
chr3	97194422	rs7624823	T	G	489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=15;PP=408;SC=AGGGATCCCATAAGAATCCAC;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=97194430;WS=97194412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
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chr3	97365074	rs301949	A	G	1004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=21;PP=655;ReadPosRankSum=1.133;SC=ACTGGTCCTCATGTGGAAGAG;SOR=0.638;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=107;TCF=59;TCR=48;TR=45;WE=97365082;WS=97365064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,52:0.43:120
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chr3	97591153	rs17301717	C	T	3697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=338;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.817;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=68;PP=2133;ReadPosRankSum=-1.404;SC=GAACCGGTTTCTCAGACTAAC;SOR=0.646;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=294;TCF=156;TCR=138;TR=148;WE=97591161;WS=97591137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,172:0.51:338
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chr3	97666183	rs2307808	TCTC	T	2794.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.612;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.466;NF=12;NR=24;PP=1403;ReadPosRankSum=-0.661;SC=AGACAGGAAATCTCCTCCTCT;SOR=0.612;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=102;TCF=46;TCR=56;TR=36;WE=97666193;WS=97666173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,74:0.49:152
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chr3	97726747	rs832032	T	A	2309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=55;PP=1510;SC=CATTGTAGGCTTCTAAAACAT;SOR=2.010;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=79;TCF=23;TCR=56;TR=78;WE=97726755;WS=97726737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
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chr3	97727753	rs832029	G	A	3868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=40;PP=2410;SC=GTATGTGATGGTGTGTTCAAA;SOR=1.576;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=90;TCR=40;TR=130;WE=97727761;WS=97727743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr3	97731434	rs11426005	C	CA	341.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.845;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.062;NF=0;NR=12;PP=259;ReadPosRankSum=0.113;SC=AAAAAGAGACCAAAAAAACCA;SOR=1.547;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=12;WE=97731442;WS=97731424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr3	97744611	rs832041	A	G	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=137;ReadPosRankSum=0.168;SC=GCTCAACATAACATGTTCTGA;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=8;WE=97744619;WS=97744601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr3	97753931	rs832070	T	C	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=270;ReadPosRankSum=0.000;SC=AAACAGCATGTCAGGGGAAAT;SOR=1.002;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=13;WE=97753939;WS=97753921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr3	97806944	rs80220955	T	C	1738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.255;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=45;PP=1218;ReadPosRankSum=-0.576;SC=TATAAGGAAGTAAACAGTTCC;SOR=0.519;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=125;TCF=47;TCR=78;TR=73;WE=97806952;WS=97806934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,76:0.55:138
chr3	97806999	rs6439602	T	C	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.619;HP=5;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=17;PP=388;ReadPosRankSum=1.422;SC=TTTGCATAAATAAGTCAACAA;SOR=0.340;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=53;TCF=15;TCR=38;TR=26;WE=97807007;WS=97806989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,28:0.51:55
chr3	97851998	rs9845327	A	C	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=3.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.996;NF=4;NR=6;PP=219;ReadPosRankSum=-0.226;SC=TGTAGGTGGTATTCTTCATGC;SOR=0.627;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=16;TCF=7;TCR=9;TR=10;WE=97852006;WS=97851988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr3	97852083	rs9826076	C	T	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-2.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.034;NF=17;NR=5;PP=307;ReadPosRankSum=0.244;SC=TACTGTGACACTATCCCATTG;SOR=0.749;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=56;TCF=44;TCR=12;TR=22;WE=97852091;WS=97852073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,23:0.40:57
chr3	97868419	rs4241468	G	A	2174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.182;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.233;NF=52;NR=47;PP=1449;ReadPosRankSum=-0.250;SC=CTTACTCCTTGGGAATTTAGC;SOR=0.565;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=218;TCF=122;TCR=96;TR=99;WE=97868427;WS=97868409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,107:0.45:240
chr3	97868795	rs4857076	A	G	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.663;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=14;PP=448;ReadPosRankSum=0.980;SC=AAGATTTCTTATACTGATTCC;SOR=0.890;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=94;TCF=55;TCR=39;TR=37;WE=97868803;WS=97868785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,39:0.40:98
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chr3	97887843	rs377659479	AT	A	4534.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=-2.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=423;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.731;HP=7;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.295;NF=11;NR=92;PP=2291;ReadPosRankSum=-2.415;SC=GCAAGATACAATTTTTTTCCA;SOR=0.837;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=234;TCF=37;TCR=197;TR=103;WE=97887851;WS=97887833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:208,206:0.50:414
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chr3	97983040	rs4241470	C	T	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.620;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=340;ReadPosRankSum=-0.318;SC=TCAATTATAGCACTGATCAAA;SOR=1.476;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=88;TCF=63;TCR=25;TR=27;WE=97983055;WS=97983030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,27:0.28:96
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chr3	97983257	rs2132894	C	G	5366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=342;ExcessHet=3.0103;FS=0.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.146;QD=15.69;ReadPosRankSum=0.872;SOR=0.668;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:195,147:0.43:342
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chr3	97983391	rs2173236	C	G	2415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=4.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.491;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-11.876;NF=55;NR=49;PP=1738;ReadPosRankSum=0.227;SC=GTGGATGCTTCGTTATCATCC;SOR=0.730;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=211;TCF=114;TCR=97;TR=104;WE=97983399;WS=97983381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,102:0.47:219
chr3	97983561	rs9289564	G	C	4405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=405;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.522;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-6.258;NF=98;NR=86;PP=2766;ReadPosRankSum=-2.585;SC=CATTTGCAAAGCTTTACTTTA;SOR=0.622;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=362;TCF=195;TCR=167;TR=184;WE=97983569;WS=97983551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:197,208:0.51:405
chr3	97983711	rs9853887	T	C	1346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.622;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.306;NF=18;NR=33;PP=882;ReadPosRankSum=-0.198;SC=ACACTTTTACTGTGACATTAT;SOR=0.970;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=91;TCF=35;TCR=56;TR=51;WE=97983719;WS=97983701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,60:0.58:104
chr3	97983942	rs9853906	A	G	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=216;ReadPosRankSum=0.392;SC=TGGCCCCCTCACCTTCAAATA;SOR=0.859;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=27;TCF=18;TCR=9;TR=14;WE=97983950;WS=97983932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr3	98002587	rs16839611	A	G	1386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.101;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=38;PP=856;ReadPosRankSum=-0.387;SC=TTATACAATCATAATTCCTTT;SOR=0.914;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=123;TCF=57;TCR=66;TR=64;WE=98002595;WS=98002577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,70:0.47:148
chr3	98073313	rs9822460	A	G	2069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.287;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=43;PP=1307;ReadPosRankSum=-1.250;SC=TTCAATACCAATTCAAATCTT;SOR=0.503;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=172;TCF=90;TCR=82;TR=87;WE=98073321;WS=98073303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,95:0.51:188
chr3	98188365	rs9861575	G	C	1168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.635;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=24;PP=653;ReadPosRankSum=0.715;SC=AATAACTGTGGCATATTATAA;SOR=0.593;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=121;TCF=69;TCR=52;TR=53;WE=98188373;WS=98188355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,61:0.44:139
chr3	98252027	rs1529047	G	A	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=66;ReadPosRankSum=0.972;SC=CAACAAAGAAGGAAGTGTTAA;SOR=0.627;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=7;WE=98252035;WS=98252017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr3	98281349	rs9850648	G	T	1383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.897;NF=29;NR=36;PP=900;ReadPosRankSum=-1.760;SC=TCTAATAGCTGGTATCAAAAT;SOR=0.733;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=144;TCF=66;TCR=78;TR=65;WE=98281357;WS=98281339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,68:0.44:155
chr3	98304467	rs1729995	T	C	1932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.757;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=40;PP=998;ReadPosRankSum=0.291;SC=TGCCCCGCCGTTCTCCACGAT;SOR=0.948;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=142;TCF=70;TCR=72;TR=74;WE=98304475;WS=98304457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,90:0.55:165
chr3	98307630	rs2228056	C	T	2716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.413;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=53;PP=1594;ReadPosRankSum=-0.836;SC=TGAAAATGGACAGCGTCTTCT;SOR=0.785;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=259;TCF=145;TCR=114;TR=124;WE=98307638;WS=98307620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,135:0.47:285
chr3	98307696	rs1131857	T	G	3149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=373;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.757;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=79;PP=2094;ReadPosRankSum=-1.306;SC=CACTGCTTGTTGCCTACCAAA;SOR=0.839;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=346;TCF=172;TCR=174;TR=150;WE=98307704;WS=98307686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:215,158:0.42:373
chr3	98475083	rs893832	A	G	725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=0;PP=421;SC=ATCCTGGAAAACATTTTTTAG;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=98475091;WS=98475081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	98487121	rs3217579	TAGTG	T	1067.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.609;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.825;NF=12;NR=5;PP=740;ReadPosRankSum=1.242;SC=TCTGCACGTTTAGTGAGTATT;SOR=0.033;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=38;TCF=30;TCR=8;TR=17;WE=98487132;WS=98487111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,28:0.62:45
chr3	98489686	rs1440153	A	G	5209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=105;NR=79;PP=2965;SC=AGGGTGCCCGATTCTGGTTTC;SOR=0.974;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=185;TCF=105;TCR=80;TR=184;WE=98489694;WS=98489676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr3	98489915	rs1440152	C	G	1702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=27;PP=1292;SC=AAGTGGACACCCCATATTTAA;SOR=0.796;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=28;TCR=27;TR=55;WE=98489923;WS=98489905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr3	98491619	rs2334230	G	T	1797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=10;PP=1247;SC=AAATATAGTAGGTATTTGGCA;SOR=2.760;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=46;TCR=10;TR=56;WE=98491627;WS=98491609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr3	98501128	rs3772101	A	G	3478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=60;PP=2116;SC=CTGTTTTCCCAGTCACTTTCA;SOR=0.856;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=56;TCR=60;TR=116;WE=98501136;WS=98501118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr3	98503776	rs999147	A	G	5457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=98;PP=2965;SC=TCACTTGTCCATCTGTCCAAC;SOR=0.762;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=192;TCF=94;TCR=98;TR=192;WE=98503784;WS=98503766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr3	98503941	rs62278486	G	A	590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=19;PP=476;SC=ATGGTTTCTTGCCTTAATACA;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=98503949;WS=98503931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr3	98518160	rs62821060	T	TA	1095.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5636;FS=0.000;HP=10;HapScore=3;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.671;NF=17;NR=16;PP=508;ReadPosRankSum=-0.501;SC=CACTAATAATTAAAAAAAAAA;SOR=0.495;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=55;TCF=31;TCR=24;TR=33;WE=98518170;WS=98518150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,49:0.83:59
chr3	98520602	rs9860216	A	G	918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=23;PP=664;SC=TCCTGTGTCCAAGTGTTCTCA;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=98520610;WS=98520592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	98531342	rs9814819	A	G	2187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=48;PP=1404;SC=AAAAAACAACAAAAAATTGGT;SOR=1.730;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=74;TCF=26;TCR=48;TR=73;WE=98531350;WS=98531332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr3	98536571	rs1440150	T	C	1343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=10;PP=804;SC=CAACCACCCATTTAAAAAATG;SOR=1.755;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=42;TCF=32;TCR=10;TR=41;WE=98536579;WS=98536561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr3	98536871	rs62278488	C	T	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.782;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=126;ReadPosRankSum=-2.137;SC=TCCAAGTGCACGTTTTTGTCA;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=7;WE=98536879;WS=98536861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr3	98540931	rs9843214	T	C	405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=1;PP=315;SC=AGCACACTAATGTGAGTGCTT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=98540939;WS=98540921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	98541012	rs866873	G	A	2431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=25;PP=1442;SC=TCTTAGCCCAGTGCTACCCAG;SOR=1.477;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=54;TCR=25;TR=79;WE=98541020;WS=98541002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr3	98542485	rs142035943	G	GAAGAA	907.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=808;SC=ATTCTGCTATGAAGTCATGCT;SOR=3.160;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=14;WE=98542493;WS=98542475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	98542536	rs9845558	A	G	171.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=136;SC=AAGTAACACAATAATTCAGTA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=98542544;WS=98542526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	98544353	rs828622	G	A	1474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=30;PP=865;SC=TAAAAACTTTGCCAACTTTTG;SOR=1.101;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=22;TCR=30;TR=52;WE=98544361;WS=98544343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr3	99536937	rs1718240	C	T	750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=23;PP=443;ReadPosRankSum=-0.564;SC=GGAGCCCTTCCGTGCGCCTCA;SOR=0.744;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=69;TCF=20;TCR=49;TR=33;WE=99536945;WS=99536927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,35:0.49:72
chr3	100015146	rs3772698	G	T	4807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=61;PP=2043;SC=GACCAACTATGTTGTATTTCA;SOR=1.140;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=45;TCR=61;TR=106;WE=100015154;WS=100015136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr3	100015166	rs3772697	C	T	4195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=53;PP=1547;SC=ATATTTTGTACATTGTTTTAT;SOR=1.227;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=35;TCR=53;TR=88;WE=100015174;WS=100015156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr3	100015249	rs5851199	AT	A	104.92	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.12;ReadPosRankSum=1.150;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr3	100016726	rs3832199	A	AT	710.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.411;HP=10;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=196;ReadPosRankSum=0.241;SC=AGAAAGTTTGATTTTTTTTTT;SOR=2.226;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=16;WE=100016734;WS=100016716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,29:0.94:31
chr3	100029173	rs4928168	A	G	643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=4;PP=456;SC=AGTCTATAACATGTAGATAAC;SOR=2.584;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=100029181;WS=100029163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	100030628	rs3217495	A	AT	3540.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=27;PP=1518;ReadPosRankSum=-0.410;SC=AAGCTGTTGCATTTTTTTTAT;SOR=0.440;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=84;TCF=48;TCR=36;TR=65;WE=100030636;WS=100030618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,124:0.98:126
chr3	100034849	rs4928169	A	T	633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=1;PP=461;SC=GTAAGGAATAATTACATTTTG;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=100034857;WS=100034839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	100053684	rs3830303	C	CG	266.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=1;PP=86;SC=GTTCGGGCCGCGGGGGAGGCT;SOR=1.085;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=3;WE=100053692;WS=100053674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	100064829	rs2289505	C	G	794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=0;PP=632;SC=CTCATCTTTACTCCGCTGATG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=23;WE=100064837;WS=100064819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	100064902	rs2289506	C	T	3830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=44;PP=2393;SC=TCTCTGTCCTCAGGTCCTGTG;SOR=1.381;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=86;TCR=44;TR=130;WE=100064910;WS=100064892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr3	100067468	rs277649	C	T	903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=2;PP=610;SC=CTTACGTGTTCGTATTAAAGG;SOR=3.841;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=27;WE=100067476;WS=100067458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	100086861	rs277640	T	C	1270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=5;PP=955;SC=AGCTACCATATATTTCCTAAC;SOR=3.365;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=35;TCR=5;TR=40;WE=100086869;WS=100086851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr3	100092526	rs11384494	A	AG	4403.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.11;QD=44.48;SOR=2.326;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr3	100092527	.	G	GGTGC	2957	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.11;NF=2;NR=48;PP=2957;QD=20;SC=AATTCAACTAGTCCAGTTAAG;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=62;TCF=3;TCR=59;TR=50;WE=100092536;WS=100092517;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:12,50:0.81:62
chr3	100092528	.	T	A	1327	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=14;NR=47;PP=1327;QD=22.3241182385;SC=ATTCAACTAGTCCAGTTAAGT;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=64;TCF=14;TCR=50;TR=61;WE=100092536;WS=100092517;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,61:0.95:64
chr3	100092528	rs3832198	T	TGCA	4404.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.95;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr3	100170600	.	A	ATCCTAGAAGGCATTCTCATGAGGACCAGGAATTCCGATGCCGATCGTCTGACCGTCT	8125.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=62.51;SOR=0.724;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr3	100170825	rs6797397	G	A	2427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=26;NR=54;PP=1519;SC=TATTTAAGCCGCTTTAAAAAA;SOR=1.954;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=26;TCR=54;TR=80;WE=100170833;WS=100170815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr3	100174722	rs1132022	G	A	5444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=97;NR=81;PP=2793;SC=GGAAAGAAGAGCATGGAGAAG;SOR=0.722;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=178;TCF=97;TCR=81;TR=178;WE=100174730;WS=100174712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr3	100274166	.	C	A	1934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.782;ClippingRankSum=0.000;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.655;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=51;PP=1265;ReadPosRankSum=0.729;SC=AAAAGCGAACCTGCTATCTTG;SOR=0.839;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=202;TCF=97;TCR=105;TR=93;WE=100274174;WS=100274156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,97:0.44:221
chr3	100354683	rs1520652	G	A	2406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=54;PP=1575;SC=AAAACTCACAGAGCTTTAAAA;SOR=1.911;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=23;TCR=54;TR=77;WE=100354691;WS=100354673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr3	100354698	rs1718281	T	A	432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.01;ReadPosRankSum=2.439;SOR=0.861;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,25:0.46:54
chr3	100368425	rs7622958	A	G	324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=210;SC=TACAAAAGGAAGATATATCTG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=100368433;WS=100368415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	100368475	rs41272975	G	A	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=140;ReadPosRankSum=-0.392;SC=ACTCTGTGATGTTGACTTTCA;SOR=0.719;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=12;WE=100368483;WS=100368465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr3	100368692	rs1144118	A	G	3265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=76;PP=2304;SC=AGAAATTGCTATCTTGATATA;SOR=1.736;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=36;TCR=76;TR=112;WE=100368700;WS=100368682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr3	100374740	rs9866111	T	C	4100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=85;NR=59;PP=2812;SC=CTTTATCACATAGGAGTCCCA;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=146;TCF=86;TCR=60;TR=144;WE=100374748;WS=100374730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr3	100438784	rs1503838	A	G	482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.40;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	100438797	.	CT	C	38.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=1.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.61;ReadPosRankSum=0.413;SOR=0.287;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr3	100455609	rs3830581	TG	T	1904.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=30;PP=1360;SC=TGTGTAGAAGTGTTTATTACA;SOR=1.524;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=31;WE=100455617;WS=100455599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr3	100467018	rs11353	T	C	3202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=29;PP=2100;SC=AGACTGGACCTCAACAACCTC;SOR=1.828;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=73;TCR=29;TR=102;WE=100467026;WS=100467008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr3	100567592	rs6773877	T	C	1080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.819;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=14;PP=673;ReadPosRankSum=-0.380;SC=TATAAGAAAATGGACATTGTC;SOR=0.958;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=84;TCF=56;TCR=28;TR=47;WE=100567600;WS=100567582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,50:0.56:90
chr3	100567799	rs6807452	C	T	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.835;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=516;ReadPosRankSum=0.783;SC=TTTGCAAACTCCAAGTACAAG;SOR=2.187;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=13;WE=100567819;WS=100567789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr3	100567811	rs6771476	A	T	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=516;ReadPosRankSum=-0.420;SC=AAGTACAAGAACTGCTTTATA;SOR=0.616;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=10;WE=100567819;WS=100567789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr3	100569069	rs79603980	A	G	1019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.819;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=32;PP=684;ReadPosRankSum=0.022;SC=CCACGAGTACATGATTAAAGA;SOR=0.480;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=92;TCF=27;TCR=65;TR=46;WE=100569077;WS=100569059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,49:0.49:100
chr3	100581261	rs10567225	AT	A	391.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.80;MQRankSum=1.749;QD=8.90;ReadPosRankSum=0.729;SOR=0.637;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,26:0.59:44
chr3	100581351	rs75098731	T	G	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.006;HP=7;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.656;NF=7;NR=13;PP=335;ReadPosRankSum=-2.196;SC=ACCAATACAATAAAAAGTCAT;SOR=1.609;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=31;TCF=12;TCR=19;TR=20;WE=100581359;WS=100581341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,19:0.76:25
chr3	100594326	rs3839090	CGGCATA	C	2580.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.556;NF=11;NR=24;PP=1640;ReadPosRankSum=-1.054;SC=TGCTTAATCTCGGCATAGATT;SOR=0.669;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=83;TCF=30;TCR=53;TR=35;WE=100594339;WS=100594316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,69:0.46:151
chr3	100605206	rs1987384	A	G	427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=13;PP=330;SC=AAAATCACAGAGGGATTCAGA;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=16;WE=100605214;WS=100605196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	100617680	rs2245370	C	T	3272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=47;PP=2027;SC=ACAGGAAGACCGAGCTCGGTG;SOR=0.991;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=114;TCF=67;TCR=47;TR=114;WE=100617688;WS=100617670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr3	100621426	rs2576365	C	A	4356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=55;PP=2703;SC=GTTCAAAGTTCATAAAAGAAA;SOR=1.264;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=151;TCF=96;TCR=55;TR=151;WE=100621434;WS=100621416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr3	100712059	rs3732896	G	A	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=175;ReadPosRankSum=2.261;SC=TATTCCCCCCGTATGGTAAAG;SOR=1.609;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=10;WE=100712067;WS=100712049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr3	100712249	rs3732895	T	C	1495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.614;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=35;PP=661;ReadPosRankSum=1.452;SC=CCACCTCGCATGGGGAATGAT;SOR=0.760;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=121;TCF=59;TCR=62;TR=64;WE=100712257;WS=100712239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,75:0.52:145
chr3	100945069	.	TTATATATATATATATATATATATATATATATATATATA	T	499	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=25;MQ=62.13;NF=0;NR=2;PP=499;QD=251.0;SC=CTTCTAAACTTTATATATATA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=2;WE=100945114;WS=100945059;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr3	100945983	rs486352	A	T	201.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=203;SC=TGTGCTAAAAATTTTTTTAAT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=100945991;WS=100945973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	100946742	rs521661	T	G	4987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=95;PP=2965;SC=AAGGGGCAGGTGTTCCACTCA;SOR=0.885;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=179;TCF=84;TCR=95;TR=179;WE=100946750;WS=100946732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr3	100949842	rs348867	G	A	4446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=81;NR=59;PP=2425;SC=GGTGTGCTTGGAGAGTCCTGA;SOR=0.861;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=140;TCF=81;TCR=59;TR=140;WE=100949850;WS=100949832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr3	100963154	rs571391	G	A	6341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=119;NR=94;PP=2965;SC=TGGAAAGTGTGTGGATCTGTC;SOR=0.903;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=213;TCF=119;TCR=94;TR=213;WE=100963162;WS=100963144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr3	100976755	rs7613046	G	C	1634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=34;PP=1072;SC=TCTCTGAAAAGCCTGGACAAC;SOR=2.480;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=12;TCR=34;TR=46;WE=100976763;WS=100976745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr3	100992385	rs348866	C	T	1525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=42;NR=10;PP=1009;SC=ACTAACATAGCAGGCATACTG;SOR=2.833;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=53;TCF=42;TCR=11;TR=52;WE=100992393;WS=100992375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr3	100994497	rs533852	C	T	3312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=43;PP=1782;SC=CAAAACAGAGCATCACTCACA;SOR=0.937;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=67;TCR=43;TR=110;WE=100994505;WS=100994487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr3	101038339	rs546090	G	A	1614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=6;PP=1159;SC=CTAAATTATCGTAAATTTTGA;SOR=3.570;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=50;TCF=43;TCR=7;TR=49;WE=101038347;WS=101038329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr3	101039107	rs573908	A	C	1362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=6;PP=948;SC=TGGAAAGATAAAAACAAATGT;SOR=2.737;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=36;TCR=6;TR=42;WE=101039115;WS=101039097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr3	101066717	rs2433031	T	A	1097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=10;PP=656;SC=TATACTCACATTGCTGGCTTA;SOR=1.788;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=36;WE=101066725;WS=101066707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr3	101066992	rs2553421	A	T	92.28	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=132;ReadPosRankSum=0.674;SC=TACTTTTTTTAAAAAAAAGAG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=6;WE=101067000;WS=101066982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr3	101085683	rs58636547	TAAAAA	T	323.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=263;SC=TTTAAATTCCTAAAAAAAAGT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=8;WE=101085695;WS=101085673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	101231863	rs71625584	GCTGCCGC	G	3195.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=16;NR=24;PP=2357;SC=CGCAACCCCAGCTGCCGCCTG;SOR=1.148;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=45;TCF=19;TCR=26;TR=40;WE=101231877;WS=101231853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr3	101283792	rs3762735	C	G	2478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=359;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.393;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=60;PP=1530;ReadPosRankSum=-1.794;SC=GAGAGTACACCCCCTTCTGAA;SOR=0.655;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=327;TCF=172;TCR=155;TR=125;WE=101283800;WS=101283782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:222,137:0.38:359
chr3	101299031	rs144008875	CAAT	C	106.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.862;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=2;PP=28;ReadPosRankSum=-2.166;SC=AATTTTATCTCAATAAAGCTG;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=2;WE=101299041;WS=101299021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr3	101304414	rs3804776	G	T	794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.868;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=24;PP=530;ReadPosRankSum=0.156;SC=GAAGGTATTAGTGGCAAATTA;SOR=0.832;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=75;TCF=28;TCR=47;TR=36;WE=101304422;WS=101304404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,38:0.45:84
chr3	101308846	rs6441614	G	A	109.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=83;SC=TTTTTCAGCAGTTTTTTTTCT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=101308854;WS=101308843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	101373480	rs34508490	A	G	987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=6;PP=707;ReadPosRankSum=-0.038;SC=TTATCTTCAAATATTTTTTTG;SOR=0.582;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=67;TCF=55;TCR=12;TR=37;WE=101373488;WS=101373470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,39:0.54:72
chr3	101384382	rs33957144	G	T	2571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.508;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=44;PP=1416;ReadPosRankSum=0.740;SC=ACTTGTTGTGGTTCCCTCACT;SOR=0.803;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=227;TCF=126;TCR=101;TR=103;WE=101384390;WS=101384372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,122:0.48:254
chr3	101389864	rs9837549	T	C	3762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=37;PP=2542;SC=CTACTGTTGTTAGTGGGCTTC;SOR=1.758;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=121;TCF=84;TCR=37;TR=121;WE=101389872;WS=101389854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr3	101404813	rs2303473	A	G	1613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=31;PP=889;ReadPosRankSum=-1.793;SC=TTAACTATACAAAGTACAAGA;SOR=0.687;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=128;TCF=67;TCR=61;TR=66;WE=101404821;WS=101404803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,77:0.52:148
chr3	101443461	rs994573	T	C	1342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=8;PP=937;ReadPosRankSum=-0.918;SC=CTCCTTCAGATTACAAGCTCC;SOR=1.487;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=42;TCF=34;TCR=8;TR=41;WE=101443469;WS=101443451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,45:0.98:46
chr3	101484335	rs2625282	G	A	2430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.513;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=54;PP=1535;ReadPosRankSum=-0.184;SC=CAGAAGTTCAGGGGCAGCAGC;SOR=0.803;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=226;TCF=112;TCR=114;TR=105;WE=101484343;WS=101484325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,118:0.47:252
chr3	101504624	rs2625289	A	C	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.551;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=137;ReadPosRankSum=-1.298;SC=TTATCGGAAGATTATCGTAGT;SOR=0.283;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=8;WE=101504632;WS=101504614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr3	101572822	rs2925334	C	A	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=209;ReadPosRankSum=0.540;SC=GTTGGCTAACCAAGATGACTG;SOR=1.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=10;WE=101572830;WS=101572812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr3	101573345	rs11309019	AT	A	257.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=1.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.44;ReadPosRankSum=-0.401;SOR=0.983;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,20:0.34:58
chr3	101574150	rs76012355	T	C	1076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.671;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=18;PP=792;ReadPosRankSum=0.649;SC=AATGATCTATTTTGAGTTAAC;SOR=0.483;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=96;TCF=58;TCR=38;TR=43;WE=101574158;WS=101574140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,45:0.45:100
chr3	101575877	.	AT	A	52.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=0.000;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.75;ReadPosRankSum=1.630;SOR=0.631;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,13:0.19:70
chr3	101575882	rs595788	T	C	1193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=2.950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.71;ReadPosRankSum=-1.247;SOR=1.398;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,61:0.80:76
chr3	101575883	.	T	C	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.608;ClippingRankSum=0.000;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.60;ReadPosRankSum=1.517;SOR=0.519;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,14:0.18:78
chr3	101576029	rs3217713	T	TACTTTTAGAAAGCTTTAATAACC	10452.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.52;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=25;PP=2965;SC=AATGCAAAGGTACACCAGAGT;SOR=0.816;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=89;TCF=25;TCR=64;TR=40;WE=101576037;WS=101576019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr3	105238890	rs11291806	CT	C	1692.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.38;MQRankSum=1.720;QD=12.63;ReadPosRankSum=0.632;SOR=0.714;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,88:0.66:134
chr3	105252377	rs2171146	G	C	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.476;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=297;ReadPosRankSum=0.078;SC=CATTGCCTGAGTTTCTGGAGT;SOR=1.721;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=41;TCF=33;TCR=8;TR=16;WE=105252385;WS=105252367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,16:0.36:44
chr3	105260596	rs599278	T	C	5139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=96;PP=2965;SC=CTTCAACAGCTATCACAGTTC;SOR=1.124;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=170;TCF=74;TCR=96;TR=170;WE=105260604;WS=105260586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr3	105266274	rs16851279	T	C	1741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.742;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=29;PP=974;ReadPosRankSum=-0.160;SC=CTGATCCCAGTGGACTATCTA;SOR=0.911;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=149;TCF=89;TCR=60;TR=81;WE=105266282;WS=105266264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,85:0.52:163
chr3	105404031	rs16851440	T	C	682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=1;PP=533;SC=GGAAATGGTATAATAGGAAGA;SOR=4.804;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=21;WE=105404039;WS=105404021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	105412286	rs10635036	C	CTT	3512.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=26;PP=1858;SC=CAAAACCACTCTACCATATCT;SOR=1.136;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=47;TCF=21;TCR=26;TR=45;WE=105412294;WS=105412276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr3	105422844	rs2305037	C	T	1989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.18;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr3	105438806	rs7624400	G	A	1583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=14;PP=1026;SC=ACTCAAATACGCTGAGTCATA;SOR=1.692;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=38;TCR=14;TR=52;WE=105438814;WS=105438796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr3	105452751	rs1992520	C	T	690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=3;PP=474;SC=TCATTTCAAACAAAGCACTTA;SOR=3.014;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=22;WE=105452759;WS=105452741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	105453034	rs6768096	A	G	1109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=28;PP=803;SC=TTTCCAGCACAAATTGTTAGT;SOR=2.774;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=35;WE=105453042;WS=105453024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr3	105455955	rs2289746	T	C	1466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=17;PP=918;SC=GAGAGTCTTATTTATTTCAAG;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=35;TCR=17;TR=52;WE=105455963;WS=105455945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr3	105468330	rs1443098	C	T	230.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=186;SC=TGTCCACATACTAAATAGCAG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=105468338;WS=105468329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	105495432	rs9809911	G	T	3375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=81;PP=2191;SC=TAAACACCTAGATGCATGCAA;SOR=2.100;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=114;TCF=33;TCR=81;TR=114;WE=105495440;WS=105495422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr3	105586538	rs2221379	G	A	658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=18;PP=484;SC=TTCCTCCATCGATTAGAGCAA;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=105586546;WS=105586528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	105588069	rs11711088	G	A	1743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=20;PP=1103;SC=CTCGCAGCACGTCAGAAAGGA;SOR=1.214;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=40;TCR=20;TR=60;WE=105588077;WS=105588059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr3	107451907	rs4855764	C	T	7241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=122;NR=131;PP=2965;SC=TCTGCTCATACTGTGGGTTGG;SOR=0.807;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=253;TCF=122;TCR=131;TR=253;WE=107451915;WS=107451897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,275:1.00:275
chr3	107510197	rs150873331	A	ATAAG	6143.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=62;PP=2957;SC=TGGAAATGACATAAGTTGTAT;SOR=1.414;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=81;TCF=6;TCR=75;TR=68;WE=107510205;WS=107510187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr3	107519843	rs1532325	T	C	1556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=4;PP=1176;SC=TGGTAGAGAATGTTAGCTCTT;SOR=4.534;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=44;TCR=4;TR=48;WE=107519851;WS=107519833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr3	107524097	rs9842741	A	C	1044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=1;PP=762;SC=TCATTAAATGATGTAAGTAAC;SOR=4.112;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=29;WE=107524105;WS=107524087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr3	107776511	rs709436	C	T	384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=12;PP=295;SC=GTTATTCTAACGATCAAAAAA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=107776519;WS=107776501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	107809798	rs445541	C	T	853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.72;SOR=0.927;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr3	107882643	rs327168	G	A	382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=13;PP=304;SC=TGAATTATGTGTTAAGAAAAT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=107882651;WS=107882633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	107884211	rs327167	T	C	1099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=5;PP=825;SC=GTTAAACCATTTGTAGGTTCT;SOR=2.964;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=33;WE=107884219;WS=107884201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	107910327	.	CT	C	75.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.295;ClippingRankSum=0.000;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=1.973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQRankSum=0.000;QD=2.16;ReadPosRankSum=-0.587;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,10:0.29:35
chr3	107937231	rs1289761	T	C	580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=2;PP=377;SC=TCTAATTTTGTCTATACTGGC;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=107937239;WS=107937221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr3	107937286	rs1289760	A	G	1988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=18;PP=1141;SC=ATAGTCAAAAAGAATAATTCT;SOR=1.512;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=41;TCR=18;TR=59;WE=107937294;WS=107937276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr3	107937571	rs1289759	G	A	260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=8;PP=181;SC=TTTAAGCAAAGAACTGCTGAA;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=107937579;WS=107937561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	107937602	rs1289758	C	T	114.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=4;PP=74;SC=ACTTTTCTTTCAAATGATTTA;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=107937610;WS=107937592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	107938240	rs1289754	G	C	1638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=14;PP=1075;SC=GGAAAAAGAAGGGTCGTTTAC;SOR=2.147;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=56;TCF=42;TCR=14;TR=55;WE=107938248;WS=107938230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr3	108081175	.	CT	C	69.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.387;ClippingRankSum=0.000;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=1.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.42;MQRankSum=4.579;QD=0.68;ReadPosRankSum=-1.453;SOR=0.462;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,17:0.17:103
chr3	108081277	rs6779094	C	A	5213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.27;QD=26.47;SOR=0.879;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr3	108095365	rs2124736	G	A	7112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=135;NR=117;PP=2965;SC=CTCCTGGTGAGCGCTGTCCCA;SOR=0.768;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=253;TCF=136;TCR=117;TR=252;WE=108095373;WS=108095355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,276:1.00:276
chr3	108096098	rs1463426	C	G	6359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=127;NR=73;PP=2965;SC=ATTTTTCTTGCTTCTAGCCTC;SOR=1.336;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=200;TCF=127;TCR=73;TR=200;WE=108096106;WS=108096088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr3	108096227	rs1463425	G	C	6374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=126;PP=2965;SC=GCCTGTCGGAGCAGACAATTC;SOR=1.339;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=211;TCF=85;TCR=126;TR=211;WE=108096235;WS=108096217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr3	108107704	rs1463431	C	T	1219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=2;PP=918;SC=TGAAGGAGAACAAAGATGAAG;SOR=5.136;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=36;TCR=2;TR=38;WE=108107712;WS=108107694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr3	108110570	rs74660263	G	A	3185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=29;PP=2154;SC=TCTTGAATTGGGGACTGTCAA;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=75;TCR=30;TR=104;WE=108110578;WS=108110560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr3	108117716	rs116045645	C	T	966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=23;PP=629;SC=GTCTGGAGTACAGATCCCTCT;SOR=1.675;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=10;TCR=23;TR=33;WE=108117724;WS=108117706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	108129885	rs115872140	G	A	840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=19;PP=483;SC=GTAAGATGGCGCCTCTGCAGT;SOR=2.621;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=25;WE=108129893;WS=108129875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr3	108135606	rs56933265	TAA	T	3562.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=18;PP=1991;SC=CACTATTTTTTAAAAAAAAAA;SOR=1.854;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=56;TCF=33;TCR=23;TR=41;WE=108135617;WS=108135596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr3	108135609	rs116262927	A	T	3571.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.03;SOR=1.816;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr3	108140148	rs4593038	A	G	479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=12;PP=317;SC=GAGTGGCTCCAGGGATCCGCA;SOR=3.258;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=108140156;WS=108140138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	108147295	rs1350235	C	A	254.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=235;SC=CCCCTCCCTACTTCCATGTTC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=108147303;WS=108147285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	108156633	rs113832514	A	AAAAG	996.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=18;PP=980;SC=ACCTTCTGGAAAAAGAAAGAC;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=18;WE=108156641;WS=108156623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	108158574	rs3996040	C	T	3659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=44;PP=2209;SC=CCAGATACACCGTTACTGACC;SOR=1.170;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=117;TCF=73;TCR=44;TR=117;WE=108158582;WS=108158553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr3	108172817	rs6437783	C	T	4466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=70;PP=2701;SC=CACACTATTACCCTAGCAGTT;SOR=0.805;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=155;TCF=85;TCR=70;TR=155;WE=108172825;WS=108172807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr3	108174537	rs3957557	T	C	2997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=66;NR=32;PP=1874;SC=TACACAGTCTTCCCCCCATTC;SOR=1.308;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=66;TCR=32;TR=98;WE=108174545;WS=108174527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr3	108179165	rs61739469	C	T	1778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.40;SOR=0.746;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr3	108188993	rs9868484	G	A	3652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=50;NR=76;PP=2235;SC=ACAAACATGTGCCAATTGAAG;SOR=1.204;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=50;TCR=76;TR=126;WE=108189001;WS=108188983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr3	108189627	rs4299484	C	T	7604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=120;NR=118;PP=2965;SC=CCTGTTGATCCGTGCCACTAG;SOR=0.841;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=238;TCF=120;TCR=118;TR=238;WE=108189635;WS=108189617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,273:1.00:273
chr3	108189750	rs12495639	C	T	3547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=70;PP=2001;SC=ATTTTAATCCCGGGCATTCTC;SOR=1.452;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=41;TCR=70;TR=111;WE=108189758;WS=108189740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr3	108211869	rs140450152	A	AAAGG	2387.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.19;MQRankSum=0.291;QD=43.41;ReadPosRankSum=1.890;SOR=1.362;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,53:0.96:55
chr3	108214537	rs2603140	T	G	452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=0;PP=379;SC=TGGTGTTCTATAATTTTTTCA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=108214545;WS=108214528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	108216807	rs17539094	G	A	3708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=34;PP=2218;SC=GGTGCTTGTGGCCTCACTTCC;SOR=1.758;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=83;TCR=34;TR=117;WE=108216815;WS=108216797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr3	108229171	rs2249886	T	C	1159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=4;PP=772;SC=AGGCTGATCATACCCTAAGCA;SOR=2.670;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=34;WE=108229179;WS=108229161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr3	108276264	.	CA	C	76.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.196;ClippingRankSum=0.000;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=13.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.13;MQRankSum=1.955;QD=1.32;ReadPosRankSum=-1.341;SOR=0.053;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,11:0.19:58
chr3	108285518	rs2603121	T	A	632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=19;PP=486;SC=AACAAAAAAATTCTCACTTTA;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=108285526;WS=108285508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	108298108	rs78023488	T	C	1887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=19;PP=1160;SC=AGTTCTAAAATTGACTGAAGT;SOR=1.478;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=43;TCR=19;TR=62;WE=108298116;WS=108298098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr3	108303958	rs79888562	T	G	3771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=53;PP=2186;SC=GTGAAGCACTTATGTTGGGGT;SOR=0.722;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=118;TCF=65;TCR=53;TR=118;WE=108303966;WS=108303948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr3	108327050	rs10684119	T	TAAC	1782.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.25;QD=44.57;SOR=1.788;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr3	108347811	rs969256	C	A	2057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=25;PP=1291;SC=TATCACCACCCTATTTACCAC;SOR=1.240;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=46;TCR=25;TR=71;WE=108347829;WS=108347801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr3	108355423	rs10711079	AT	A	989.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=11;PP=647;SC=CACATCAGTGATTTTTTTCTA;SOR=1.547;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=29;TCF=17;TCR=12;TR=24;WE=108355431;WS=108355413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr3	108355575	.	CTT	C,CT	1036.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.472;ClippingRankSum=0.000;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.4923,0.5077;FS=1.783;HP=12;HapScore=3;MGOF=14;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.383;NF=0,0;NR=36,36;PP=8,475;ReadPosRankSum=0.314;SC=TTGTTTTGTCCTTTTTTTTTT;SOR=0.603;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=3;TCR=48;TR=36,36;WE=108355595;WS=108355563;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.21,0.70:56
chr3	108356501	rs143129590	T	TTTAAGGTAGTA	143	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=2;PP=955;SC=TGCATTAAATTTTAAGGTATG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=2;WE=108356509;WS=108356491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	108369954	rs2969900	T	C	683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=17;NR=7;PP=405;SC=ATAGTTGATATAGATTACTAA;SOR=1.220;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=24;WE=108369962;WS=108369944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	108373022	rs2969901	G	A	6752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=139;NR=96;PP=2965;SC=AAGAGCAGTTGAGGAAAGAAC;SOR=1.013;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=235;TCF=139;TCR=96;TR=235;WE=108373030;WS=108373012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr3	108403086	rs9856097	T	C	6661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=131;NR=103;PP=2965;SC=TAGGAAGACCTCTTGTGAAAG;SOR=0.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=234;TCF=131;TCR=103;TR=234;WE=108403094;WS=108403076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr3	108474524	rs9878093	A	C	4568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=52;PP=2762;SC=AGAATCAGGAATGGAACAAAT;SOR=1.284;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=151;TCF=99;TCR=52;TR=151;WE=108474532;WS=108474514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr3	108475993	rs5851607	G	GGGGGATTA	2721.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=23;PP=1745;SC=AGCTGGAGAAGGGGGATTAGG;SOR=1.573;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=42;TCF=3;TCR=39;TR=24;WE=108476001;WS=108475983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr3	108541761	rs9879812	T	C	2392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=37;PP=1280;SC=AAGATTTCTCTGAAAAAAAGA;SOR=0.809;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=38;TCR=37;TR=75;WE=108541769;WS=108541751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr3	108541931	rs5851618	CAT	C	671.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=10;PP=466;SC=TATTTTGAAACATGTTAATGA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=108541940;WS=108541921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	108565815	rs2593831	T	C	975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=7;PP=709;SC=TAACCAAGAATAGGCAATAGT;SOR=2.049;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=33;WE=108565823;WS=108565805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	108634973	rs10933973	C	A	4792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=105;NR=47;PP=2965;SC=AGCTCCATTACCATCATTGTT;SOR=1.555;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=105;TCR=47;TR=152;WE=108634981;WS=108634963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr3	108639119	rs2715688	A	G	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.838;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=2;PP=113;ReadPosRankSum=-0.518;SC=GCTGTTGCCCATTCAGTAATC;SOR=0.368;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=9;WE=108639127;WS=108639109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr3	108639423	rs2715687	C	T	581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=14;PP=280;ReadPosRankSum=-1.098;SC=AAAAAGTCAACAAATCCATCC;SOR=0.836;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=52;TCF=23;TCR=29;TR=25;WE=108639431;WS=108639413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,29:0.50:58
chr3	108677821	rs2197737	C	A	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.87;ReadPosRankSum=-0.499;SOR=0.098;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr3	108678002	rs2197738	G	A	644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=18;PP=397;ReadPosRankSum=1.435;SC=ACCAGGGAAAGAAGCTGCAGA;SOR=0.656;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=54;TCF=21;TCR=33;TR=29;WE=108678010;WS=108677992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,31:0.52:60
chr3	108682218	rs2715755	A	G	1685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.286;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=28;PP=878;ReadPosRankSum=2.075;SC=TTCTCGTTCCATAGAGTCTAC;SOR=0.822;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=138;TCF=83;TCR=55;TR=72;WE=108682226;WS=108682208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,84:0.55:153
chr3	108690221	rs2593943	G	A	2811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.939;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=55;PP=1663;ReadPosRankSum=-0.356;SC=GGTAGCTGATGCTCAGGAAAA;SOR=0.829;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=257;TCF=138;TCR=119;TR=128;WE=108690229;WS=108690211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,139:0.47:293
chr3	108698627	rs2953338	G	A	291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=9;PP=210;SC=ACAAGAACATGCGTGTAATGC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=108698635;WS=108698617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	108703422	rs1868195	A	G	261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=0;PP=207;SC=ATTCTTTCACATCTCTGTTGT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=108703430;WS=108703412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	108703518	rs2593958	G	T	608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.899;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=8;PP=297;ReadPosRankSum=-1.613;SC=TTTTCAGCAGGATAATTGCAC;SOR=0.861;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=77;TCF=53;TCR=24;TR=29;WE=108703526;WS=108703508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,32:0.39:83
chr3	108703548	rs2593959	C	T	908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.695;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=16;PP=545;ReadPosRankSum=0.292;SC=ATTTGTATAACTGTAGTACAC;SOR=0.826;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=116;TCF=72;TCR=44;TR=44;WE=108703556;WS=108703538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,48:0.38:125
chr3	108703702	rs2593960	A	T	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.067;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=363;ReadPosRankSum=0.141;SC=AAATGTTAGCAGTTCATTAAC;SOR=0.941;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=60;TCF=18;TCR=42;TR=24;WE=108703710;WS=108703692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,26:0.41:63
chr3	108705715	rs11433147	A	AT	676.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.51;ReadPosRankSum=0.909;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,30:0.91:33
chr3	108719470	rs3762698	C	G	2918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.010;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=58;PP=1789;ReadPosRankSum=0.398;SC=CTACAAAGTTCAGACTCTGCT;SOR=0.582;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=248;TCF=136;TCR=112;TR=125;WE=108719478;WS=108719460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,137:0.50:272
chr3	108724279	rs2290058	T	A	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=2.593;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=93;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=80;ReadPosRankSum=0.912;SC=AAAAAGTTTTTAAATCAGAAG;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=108724287;WS=108724269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr3	108725694	rs2044586	C	T	423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=0;PP=323;SC=TTATATTTTACTTTCTAACTT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=108725702;WS=108725693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	108725759	rs2044587	C	T	738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.238;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=6;PP=506;ReadPosRankSum=0.206;SC=TTAAAATCTACTAGTGCTTCA;SOR=1.112;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=51;TCF=39;TCR=12;TR=27;WE=108725767;WS=108725749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,30:0.54:56
chr3	108725848	rs5851630	ATTGC	A	3318.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.168;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.856;NF=24;NR=26;PP=2944;ReadPosRankSum=-0.127;SC=CATGACACAAATTGCTTAATC;SOR=0.809;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=119;TCF=50;TCR=69;TR=50;WE=108725870;WS=108725838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,86:0.47:183
chr3	108725862	rs2044589	T	C	3552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.417;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.860;NF=56;NR=34;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.546;SC=CTTAATCCTATATTAATTACT;SOR=0.881;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=187;TCF=111;TCR=76;TR=90;WE=108725870;WS=108725838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,96:0.47:205
chr3	108725984	rs2044590	G	C	1683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.611;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=48;PP=1129;ReadPosRankSum=2.544;SC=GTAAAAATAAGCTTCAACTGG;SOR=0.966;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=161;TCF=60;TCR=101;TR=73;WE=108725992;WS=108725965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,78:0.45:175
chr3	108746822	rs142558948	A	G	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.393;HP=3;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=473;ReadPosRankSum=0.072;SC=TTCTACAAGGAGTTACTCTTT;SOR=2.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=13;WE=108746844;WS=108746812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr3	108746836	rs17665933	T	C	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.966;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=296;ReadPosRankSum=0.998;SC=ACTCTTTATGTCATATATCCA;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=6;WE=108746844;WS=108746812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr3	108754146	rs9821261	G	A	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=226;ReadPosRankSum=1.903;SC=ATATTTAAGAGCCCTTAACAT;SOR=0.825;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=43;TCF=28;TCR=15;TR=19;WE=108754154;WS=108754136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,20:0.43:46
chr3	108754238	rs4855576	A	T	1853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.15;QD=26.11;SOR=1.276;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr3	108754260	rs3762696	A	G	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.091;HP=1;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.303;NF=8;NR=12;PP=199;ReadPosRankSum=1.468;SC=GTTTCTCCACATCGATGTCAT;SOR=0.485;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=22;TCR=35;TR=20;WE=108754268;WS=108754250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,23:0.38:60
chr3	108754320	rs11438791	T	TAA	318.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.90;QD=39.84;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	108754346	rs35736028	CA	C	56.90	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.52;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=61;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=46;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CAAAGAATAACAAAAAAAAAT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=108754354;WS=108754336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr3	108773772	rs7653625	A	G	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=274;ReadPosRankSum=-0.258;SC=AATTTGGCTAAAGAAAAAAAT;SOR=0.627;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=15;WE=108773780;WS=108773762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,15:0.79:19
chr3	108776343	rs1031252	C	T	2445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=56;PP=1523;SC=TCTAGAGTTACATTTAAAAAG;SOR=1.662;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=26;TCR=56;TR=82;WE=108776351;WS=108776333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr3	108780831	rs7653651	G	A	1107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=24;PP=552;ReadPosRankSum=-0.804;SC=TTTACATGTCGTACCTTGGCA;SOR=0.765;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=98;TCF=50;TCR=48;TR=50;WE=108780839;WS=108780821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,56:0.51:110
chr3	108782160	rs895738	T	C	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.638;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=106;ReadPosRankSum=0.903;SC=TAAGACTATATGCTCCAGAGA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=7;WE=108782168;WS=108782150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr3	108788461	rs2305238	T	C	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-0.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.606;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=150;ReadPosRankSum=0.313;SC=TGAAGATAACTGAAGAAAGAT;SOR=0.262;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=14;WE=108788469;WS=108788451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,21:0.42:50
chr3	108812154	rs9821382	A	G	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.039;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=202;ReadPosRankSum=0.680;SC=CAACTTTACTAGTAACTAGGG;SOR=0.073;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=13;WE=108812162;WS=108812144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr3	108829765	rs6437822	C	T	302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=248;SC=AACGTTTCACCGTGCTATTAT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=108829773;WS=108829755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	108855774	rs1356071	A	G	2084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=42;PP=1190;SC=TATTTATCATATCTCCTACAG;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=27;TCR=42;TR=69;WE=108855782;WS=108855764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr3	108855801	rs1356072	T	A	1528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=35;PP=921;SC=GGTTGATAATTCCTTTTGTCT;SOR=1.692;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=17;TCR=35;TR=52;WE=108855809;WS=108855791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr3	108867128	rs4855697	A	G	1644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.133;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=31;PP=1003;ReadPosRankSum=1.469;SC=TTTTGTTGGAAGACCCTGCAA;SOR=0.823;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=167;TCF=94;TCR=73;TR=74;WE=108867136;WS=108867118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,83:0.43:192
chr3	109019435	rs9865540	G	A	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.166;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=113;ReadPosRankSum=-0.329;SC=GTGGGAGGCTGAGGAGGGCAG;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=7;WE=109019443;WS=109019425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr3	109027157	rs7611135	C	T	2319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.793;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=61;PP=1478;ReadPosRankSum=2.021;SC=ATGAAATTCACGATGAGTATT;SOR=0.411;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=202;TCF=78;TCR=124;TR=106;WE=109027165;WS=109027147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,113:0.51:220
chr3	109027820	rs7611871	G	A	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.625;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=212;ReadPosRankSum=0.655;SC=GTAGGGACCGGACGAATCATG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=10;WE=109027828;WS=109027810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr3	109049384	rs13059848	T	C	1514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.291;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=33;PP=771;ReadPosRankSum=0.245;SC=AGGCCTCTTGTGGAGATTCCA;SOR=0.924;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=111;TCF=52;TCR=59;TR=59;WE=109049392;WS=109049374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,71:0.56:127
chr3	109049720	rs112463757	C	CTAAGGGT	157.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.798;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=2;PP=33;ReadPosRankSum=-0.409;SC=CAAAAATGGCCTAAGGAGCTC;SOR=1.508;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=2;WE=109049728;WS=109049710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr3	109050980	rs1163438	T	C	313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=10;PP=249;SC=GACAGAATCTTGCTCTGTCGC;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=109050988;WS=109050970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	109052732	rs3762648	T	C	2333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.451;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=54;PP=1594;ReadPosRankSum=-0.186;SC=CTGCCTTTGATAGACATTTTT;SOR=0.746;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=243;TCF=122;TCR=121;TR=105;WE=109052740;WS=109052722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,115:0.43:265
chr3	109052934	rs7642495	G	A	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=277;ReadPosRankSum=0.454;SC=AGGCACCAACGCAGTTACTGG;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=32;TCF=10;TCR=22;TR=20;WE=109052942;WS=109052924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,22:0.63:35
chr3	109056183	rs9836011	A	T	1208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=12.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.56;ReadPosRankSum=1.828;SOR=2.028;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,52:0.71:73
chr3	109178707	rs769534	C	G	1412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.410;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=31;PP=739;ReadPosRankSum=0.037;SC=TTCCCTAATTCCATCCTTTTT;SOR=0.893;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=116;TCF=54;TCR=62;TR=57;WE=109178720;WS=109178697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,65:0.50:130
chr3	109178758	rs769533	C	T	2040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=43;PP=1139;SC=GTTTTCTTCACAATTTCACCA;SOR=1.704;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=23;TCR=43;TR=66;WE=109178766;WS=109178748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr3	110611137	rs1381838	G	A	7308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=145;NR=108;PP=2965;SC=AAGCTCTATCGATTTCAAGTG;SOR=0.883;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=253;TCF=145;TCR=108;TR=253;WE=110611145;WS=110611127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,274:1.00:274
chr3	110791113	rs4682228	A	G	751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=19;PP=664;SC=CGTTCTCTGGAGCAGCGAGGC;SOR=2.400;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=24;WE=110791121;WS=110791103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	110792906	rs2399372	G	A	875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=5;PP=652;SC=GGTAGACACTGGTTTTGTATT;SOR=3.056;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=30;WE=110792914;WS=110792896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr3	110793050	rs2399373	G	A	5684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=103;NR=81;PP=2965;SC=GGGCACAGATGTTGTGACTTA;SOR=0.780;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=184;TCF=103;TCR=81;TR=184;WE=110793058;WS=110793040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr3	110830746	.	ATGTGTG	A	142	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;FR=0.9999;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=2;NR=2;PP=142;QD=36.25;SC=GTGTGTGTGCATGTGTGTGTG;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=4;WE=110830759;WS=110830736;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,4:0.67:6
chr3	110866437	rs62273799	G	A	1244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=35;PP=901;SC=TATGCATTAAGTGTTGTTTAG;SOR=4.125;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=4;TCR=35;TR=39;WE=110866445;WS=110866427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr3	111260975	rs2276873	C	T	2712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=30;PP=1708;SC=ATAAACAGACCCAGGCGTGTG;SOR=1.361;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=59;TCR=30;TR=89;WE=111260983;WS=111260965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr3	111261242	rs3832264	G	GCTGCTGAAATTGATCACCA	1639.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=2973;SC=CCTTGTGACTGCTGCTGAAAT;SOR=3.855;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=1;TCR=38;TR=13;WE=111261250;WS=111261232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr3	111263826	rs1513325	G	A	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=85;ReadPosRankSum=-0.497;SC=GAAGTGACTAGGGTTTTTAAT;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=5;WE=111263834;WS=111263816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr3	111312305	rs7612391	T	C	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=218;ReadPosRankSum=0.788;SC=ACCAAACTACTTTGCTTTACA;SOR=0.569;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=14;WE=111312313;WS=111312295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr3	111316886	rs3215207	C	CTTATG	516.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.639;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=410;ReadPosRankSum=0.191;SC=TTTTTGCCAACTTATATGAAT;SOR=1.194;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=9;WE=111316894;WS=111316876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,14:0.36:39
chr3	111343069	rs73852844	C	T	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=428;ReadPosRankSum=-1.655;SC=AGCACATTTTCAATTTCAGAT;SOR=1.536;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=20;WE=111343077;WS=111343059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,20:0.67:30
chr3	111356083	rs1533270	G	C	2941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=41;PP=1773;SC=GTTCATCCCCGTCAGGTGCAG;SOR=0.808;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=55;TCR=41;TR=96;WE=111356091;WS=111356073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr3	111368813	rs3733176	C	T	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=208;ReadPosRankSum=-0.775;SC=TCACCCTCTTCCATCTCCAAA;SOR=0.610;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=11;WE=111368821;WS=111368803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr3	111426690	rs76262777	T	G	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=2.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.426;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=190;ReadPosRankSum=0.570;SC=TTAATTTTTGTTTTGTTTTGT;SOR=1.136;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=54;TCF=40;TCR=14;TR=16;WE=111426698;WS=111426680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,20:0.29:69
chr3	111451603	rs3821919	G	C	1806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=38;PP=1126;SC=AAAATGAGCAGCATATACAGC;SOR=1.721;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=20;TCR=38;TR=58;WE=111451611;WS=111451593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr3	111564839	rs937557	A	G	2110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=40;PP=1207;SC=TTACTCCATCATACATATTGG;SOR=1.108;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=29;TCR=40;TR=69;WE=111564847;WS=111564829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr3	111604541	rs1283007	G	C	1628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=45;PP=1074;SC=AGAGGAGTTGGGAATTTTATG;SOR=3.538;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=54;TCF=8;TCR=46;TR=53;WE=111604549;WS=111604531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr3	111632614	rs1282947	A	G	4188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=82;PP=2630;SC=CTTTGGCATGAAAACTGATGA;SOR=1.279;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=56;TCR=82;TR=138;WE=111632622;WS=111632604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr3	111637904	rs2399399	G	A	6137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=123;NR=91;PP=2965;SC=CCATTTCTGTGTTGATTAATC;SOR=0.984;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=214;TCF=123;TCR=91;TR=214;WE=111637912;WS=111637894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr3	111638132	rs951660	A	C	393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=330;SC=CTTATTCAGGAATAGGCTTTG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=111638140;WS=111638122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	111638952	rs6779756	C	T	845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=0;PP=645;SC=CTCTCTAGCTCGCTTATATGG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=111638960;WS=111638943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	111639353	rs937551	G	T	138.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=108;SC=TGCATTACTGGGGTTTTGGAT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=111639361;WS=111639343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	111658486	rs712510	T	G	3554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=64;PP=2142;SC=AGGTACTTTTTCCAGGTGTCA;SOR=1.311;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=45;TCR=64;TR=109;WE=111658494;WS=111658476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr3	111659377	rs698358	T	C	4582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=68;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.154;SC=TCTCTTTTCCTCCAGGAAAAA;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=167;TCF=98;TCR=69;TR=165;WE=111659385;WS=111659366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,180:0.99:182
chr3	111677526	rs11713044	G	A	5440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=91;NR=87;PP=2965;SC=CCTTCAAACAGCTATTTCTCT;SOR=0.818;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=178;TCF=91;TCR=87;TR=178;WE=111677534;WS=111677516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr3	111685328	rs774859	T	C	331.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=52;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=265;SC=TGGATTTTGTTATGCACCTCC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=111685336;WS=111685322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	111685348	rs774858	A	G	458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=48;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=0;PP=465;SC=CCTTGACCCCATGTGTGTGTG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=16;WE=111685356;WS=111685337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	111685374	.	G	GGTGT,GGTGTGT	865.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.35;MQRankSum=0.000;QD=37.64;ReadPosRankSum=0.679;SOR=1.528;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:1,6,16:0.26,0.70:23
chr3	111685659	rs80296143	A	G	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=20;PP=525;SC=CCTGGAATAAATCACTCAACC;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=111685667;WS=111685649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	111686738	rs799570	G	A	673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=17;PP=437;SC=GAAGACAGCTGTTCTGTGTCT;SOR=2.494;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=111686746;WS=111686728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	111688578	rs774854	C	T	3041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=27;PP=1946;SC=GGAAGGAAGACTTTGATTTGC;SOR=1.721;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=72;TCR=27;TR=99;WE=111688586;WS=111688568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr3	111692829	rs774852	C	T	209.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=5;PP=142;SC=TGGCCGTTCTCTTTGAGGAAA;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=111692837;WS=111692819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	111705275	rs150902974	G	GTTTGT	1372.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=22;PP=1148;SC=TATTTAAGCTGTTTGTTTTGT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=1;TCR=42;TR=22;WE=111705283;WS=111705265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr3	111710201	rs71773737	AT	A	1737.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=10;PP=1492;SC=AAATACTTTTATTTTTCTTTC;SOR=2.468;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=44;TCF=33;TCR=11;TR=41;WE=111710209;WS=111710191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr3	111718446	rs35978996	G	C	1147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.929;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=31;PP=800;ReadPosRankSum=0.316;SC=TAATGGACGGGACGGTAAGGC;SOR=0.940;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=84;TCF=21;TCR=63;TR=41;WE=111718454;WS=111718436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,46:0.50:92
chr3	111719493	rs774764	A	G	523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=3;PP=397;SC=GTGCCTTCCTAGGGCCCATGA;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=111719501;WS=111719483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	111719786	rs2292583	A	T	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=359;ReadPosRankSum=-0.889;SC=CGGTGGATCTATGGGAAGGTA;SOR=0.576;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=38;TCF=5;TCR=33;TR=20;WE=111719794;WS=111719776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,22:0.55:40
chr3	111730546	rs3749310	G	A	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.307;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=226;ReadPosRankSum=-0.431;SC=GTGTCCAGCCGTATCCTTCCA;SOR=3.973;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=12;WE=111730554;WS=111730536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr3	111730591	rs3749311	G	T	521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.434;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=357;ReadPosRankSum=0.434;SC=TTGGCTTTAAGCTCTTTGTTG;SOR=1.219;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=52;TCF=36;TCR=16;TR=24;WE=111730599;WS=111730581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,25:0.45:56
chr3	111730766	rs3828394	G	A	828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.780;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=19;PP=457;ReadPosRankSum=-1.117;SC=ACCAGAGGGAGGGTCTGAAGC;SOR=0.915;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=68;TCF=33;TCR=35;TR=33;WE=111730774;WS=111730756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,41:0.49:84
chr3	111732608	rs8070	G	A	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=222;ReadPosRankSum=-0.393;SC=CTCCGCTTCCGTTTTCCTGAG;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=12;WE=111732616;WS=111732598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr3	111760771	rs774774	A	G	10289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.49;SOR=0.781;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,282:1.00:282
chr3	111760771	.	AAC	GAC,GAT	1967	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=132,62;NR=116,57;PP=1967,1537;QD=8.07165811511;SC=TTACAGGTAAAACAGAAAGCA;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=252;TCF=134;TCR=118;TR=248,119;WE=111760781;WS=111760761;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.98:252
chr3	111760773	rs11929695	C	T	2976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FS=0.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.933;SOR=0.638;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:142,146:0.51:288
chr3	111763085	rs4682350	C	T	2475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=13;PP=1533;SC=TCAGATACCTCAACTATTCTT;SOR=2.542;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=58;TCR=13;TR=71;WE=111763093;WS=111763075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr3	111763278	rs7650559	G	T	3800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=74;PP=2217;SC=CTTGGAAGTGGTTGGGGATTC;SOR=1.592;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=117;TCF=42;TCR=75;TR=116;WE=111763286;WS=111763268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr3	111765834	rs1561911	G	A	8817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=161;NR=147;PP=2965;SC=GGCTTCGGTCGGATTACTCGT;SOR=0.723;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=308;TCF=161;TCR=147;TR=308;WE=111765842;WS=111765824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,333:1.00:333
chr3	111766215	rs1318554	A	G	5680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=116;NR=73;PP=2965;SC=CTAAACCATGATGAAAACCAC;SOR=1.109;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=189;TCF=116;TCR=73;TR=189;WE=111766223;WS=111766205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr3	111766559	rs1688304	T	G	3067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=40;SC=AAAAAGAAAATAAAGGAAAAT;SOR=0.903;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=56;TCR=40;TR=96;WE=111766567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr3	111768600	rs114815335	G	A	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;BaseQRankSum=-1.345;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=86;ReadPosRankSum=1.732;SC=TGAATGGATGGCCCAGGAAAT;SOR=3.126;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=4;WE=111768608;WS=111768593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr3	111769417	rs7625159	G	A	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=385;ReadPosRankSum=1.967;SC=AAAGCTTGTCGATCAAGGAAG;SOR=0.836;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=18;WE=111769425;WS=111769407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,18:0.72:25
chr3	111776135	rs55971748	T	A	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.140;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=103;ReadPosRankSum=0.263;SC=ATGCAGCTCATGAGTGATGGA;SOR=0.223;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=7;WE=111776143;WS=111776125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr3	111785208	rs11715561	G	A	1863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.583;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=35;PP=1064;ReadPosRankSum=-0.650;SC=TCTCAGGCTCGTGAACTTTCT;SOR=0.629;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=142;TCF=79;TCR=63;TR=76;WE=111785216;WS=111785198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,87:0.54:160
chr3	111793316	rs191454	G	T	853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.940;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=24;PP=556;ReadPosRankSum=-0.489;SC=TTACCTGTTTGTTATATTTTC;SOR=0.859;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=69;TCF=23;TCR=46;TR=34;WE=111793324;WS=111793306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,38:0.51:75
chr3	111794365	rs1907639	A	G	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.823;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=144;ReadPosRankSum=0.352;SC=CCTTACTTTCAAGTGGCACTC;SOR=0.223;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=26;TCF=8;TCR=18;TR=11;WE=111794373;WS=111794355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr3	111799845	rs340151	A	T	7749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=126;NR=141;PP=2965;SC=GGGACATGGAAGTGGACGACC;SOR=0.895;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=267;TCF=126;TCR=141;TR=267;WE=111799853;WS=111799835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,291:1.00:291
chr3	111805438	rs3833596	G	GT	2332.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=31;PP=1504;SC=CGGCGGGACAGTAGTAGGACC;SOR=1.437;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=33;WE=111805446;WS=111805428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr3	111828423	rs340167	G	A	6764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=104;NR=125;PP=2965;SC=GCCCTCTCTGGGTCGTTATTT;SOR=0.981;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=229;TCF=104;TCR=125;TR=229;WE=111828431;WS=111828413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr3	111843883	rs923745	T	C	854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=6;PP=642;SC=CAATAAATTATACAGCAGAAG;SOR=2.546;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=28;WE=111843891;WS=111843873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	111873996	rs7622733	C	T	1114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=26;PP=742;SC=AAATCACACTCAGGACCTGTG;SOR=1.501;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=13;TCR=26;TR=39;WE=111874004;WS=111873986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	111885896	rs4682084	A	G	122.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=75;SC=TAATTTAAAAATGTAACTTCA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=111885904;WS=111885886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	111918215	rs28516377	CA	TG	5668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=63;NR=47;PP=2947;SC=CCTTTTAAGCCAAAAGCCTTA;SOR=0.845;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=112;TCF=63;TCR=49;TR=110;WE=111918224;WS=111918205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr3	111921010	rs9821935	A	G	618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=14;NR=6;PP=311;SC=AGTCAAAGACATCTGCATATA;SOR=1.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=20;WE=111921018;WS=111921000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	111921116	rs9288938	C	A	1404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=30;NR=16;PP=732;SC=CTGTTTAGAACTTGTAATCTG;SOR=0.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=30;TCR=16;TR=46;WE=111921124;WS=111921106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr3	111921225	rs6781844	G	T	1255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=22;PP=798;SC=TCTATTATTTGCAGCAACTTT;SOR=0.883;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=20;TCR=22;TR=42;WE=111921233;WS=111921215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr3	111923047	rs4422273	G	A	339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=223;SC=GAAATTGCACGATTTACTGGT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=111923055;WS=111923037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	111923123	rs4434123	G	A	1688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=12;PP=1164;SC=TATTACTTCAGTCTCATTAAA;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=41;TCR=12;TR=53;WE=111923131;WS=111923113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr3	111936118	rs11921877	A	G	184.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=149;SC=GAGTTAATGAATGAAGCACAC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=111936126;WS=111936109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	111936200	rs1388857	C	A	1920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=15;PP=1260;SC=AGTATAATAACAAAAAATTCA;SOR=2.157;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=59;TCF=43;TCR=16;TR=58;WE=111936208;WS=111936187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr3	111962851	rs6768523	T	C	3230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=56;NR=53;PP=1993;SC=CCTAGTATAGTAACTGCCACT;SOR=0.796;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=56;TCR=53;TR=109;WE=111962859;WS=111962841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr3	111981696	rs5851826	CA	C	656.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=370;SC=TACCTCACTACAAAAAAACAT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=13;WE=111981712;WS=111981691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	111981704	rs5003791	C	T	761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=0;PP=491;SC=TACAAAAAAACATATATTTTA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=111981712;WS=111981691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr3	111981849	rs9860819	C	T	7546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=140;NR=121;PP=2965;SC=TAGGCATCCCCTTCATTTCAC;SOR=0.766;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=261;TCF=140;TCR=121;TR=261;WE=111981857;WS=111981839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,282:1.00:282
chr3	111981878	rs9809384	T	C	8810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=156;NR=148;PP=2965;SC=ATTATGAATATCCAGCGCCAA;SOR=0.705;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=304;TCF=156;TCR=148;TR=304;WE=111981886;WS=111981868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,330:1.00:330
chr3	111981924	rs9809404	T	C	7406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=115;NR=137;PP=2965;SC=AAACAGGGCTTATTAAAAGAA;SOR=0.971;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=252;TCF=115;TCR=137;TR=252;WE=111981932;WS=111981914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,274:1.00:274
chr3	111983197	rs6788397	C	T	2157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=27;NR=38;PP=1095;SC=GAATCTGCATCATTCAGAAAA;SOR=1.310;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=27;TCR=38;TR=65;WE=111983205;WS=111983187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr3	111984970	rs4682098	T	C	451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=0;PP=378;SC=TTTAGTTGGGTAGTTTTCAAG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=111984978;WS=111984969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	111985107	rs9872691	T	C	2581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=40;PP=1615;SC=GTTTCTTCAATTGCTGCTTTA;SOR=0.778;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=49;TCR=40;TR=89;WE=111985115;WS=111985097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr3	111993691	rs11324928	TC	T	245.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=1;PP=221;SC=ACATCAGCTTTCAGAAAATAC;SOR=2.833;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=111993699;WS=111993681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	111993716	rs6805112	G	A	510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=12;NR=5;PP=252;SC=TTCTGATGTTGAGAAAAATTT;SOR=1.402;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=17;WE=111993724;WS=111993706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr3	111993749	rs28413123	G	A	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.260;NF=6;NR=4;PP=98;ReadPosRankSum=-0.111;SC=CTTACCTAAGGTATGGTTTCT;SOR=0.473;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=10;WE=111993757;WS=111993739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,12:0.41:29
chr3	111996554	rs9828502	T	C	4058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=44;PP=2436;SC=AGGTCTCTTATAGCAGCTGCG;SOR=1.141;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=86;TCR=44;TR=130;WE=111996562;WS=111996544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr3	111996730	rs9809174	G	A	1285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=28;PP=825;SC=TTTACAATTAGAAAAATCAGA;SOR=1.880;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=41;WE=111996738;WS=111996720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr3	111997510	rs12632408	T	A	1286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.38;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr3	111997791	rs13314977	G	A	365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=8;PP=202;SC=TCTAACAGTAGAGAAAGACAA;SOR=3.611;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=111997799;WS=111997781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	111999736	rs147052896	A	ACTTGTTTTCT	1036.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=2974;SC=CAGTTTCACTACTTTTCATGA;SOR=1.519;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=14;WE=111999744;WS=111999726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	112005423	rs7621431	T	C	770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=3;PP=573;SC=ATTGAAAATATTGAGCTAAAG;SOR=3.098;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=25;WE=112005431;WS=112005413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	112052173	rs9883527	T	C	1856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=38;NR=23;PP=840;SC=CTTCGGCTCTTGCCACAATCT;SOR=0.869;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=38;TCR=23;TR=61;WE=112052181;WS=112052163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr3	112059768	rs1131199	C	G	3067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=38;PP=1660;SC=ATGCCCTTCTCTCATCTGTCT;SOR=1.061;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=99;TCF=60;TCR=39;TR=98;WE=112059776;WS=112059758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr3	112066360	rs7612748	C	T	1704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.264;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=23;PP=845;ReadPosRankSum=2.043;SC=AGGACTCAGACCAGGTGCTTA;SOR=0.559;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=149;TCF=98;TCR=51;TR=61;WE=112066368;WS=112066350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,78:0.45:173
chr3	112184927	rs2171513	A	G	3580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=28;PP=2217;SC=TGATCATTCAATGGTCCCTGT;SOR=1.850;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=83;TCR=28;TR=111;WE=112184935;WS=112184917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr3	112185025	rs9288952	G	A	8233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=134;NR=135;PP=2965;SC=TCTTGAGTTCGGTCCAATGAC;SOR=0.733;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=269;TCF=134;TCR=135;TR=269;WE=112185033;WS=112185015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,302:1.00:302
chr3	112190137	rs2931761	G	T	6095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=105;NR=94;PP=2965;SC=GGAAGTAAACGATACAGGAGC;SOR=0.784;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=199;TCF=105;TCR=94;TR=199;WE=112190145;WS=112190127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr3	112253058	rs35560667	C	CA	2455.50	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.99;ReadPosRankSum=0.630;SOR=0.796;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,103:0.88:117
chr3	112267523	rs9809247	G	A	4253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=87;PP=2541;SC=TAACTAGCACGTAATCTGCTA;SOR=1.491;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=52;TCR=87;TR=139;WE=112267531;WS=112267513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr3	112280218	rs2279532	G	A	1843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=23;PP=1094;SC=TTGCCCCGCCGGAGAAAGCGG;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=40;TCR=23;TR=63;WE=112280226;WS=112280208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr3	112289320	rs9869455	G	A	440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=3;PP=290;SC=GTAATCAAGTGCAGTGTAATT;SOR=2.049;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=112289328;WS=112289310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	112289372	rs9869579	G	A	1443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=33;NR=15;PP=839;SC=CATTTACACCGTGTTTCTTTC;SOR=1.287;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=33;TCR=15;TR=48;WE=112289380;WS=112289362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr3	112301458	rs5851844	C	CCTTAGTAAT	3246.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=7;PP=2900;SC=TAAGGTTTTCCCTTTAAAAAT;SOR=3.816;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=54;TCF=41;TCR=13;TR=39;WE=112301466;WS=112301448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr3	112335439	.	C	T	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=0.000;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=345;ReadPosRankSum=-2.242;SC=GTAGGTTTTTCTCCAAGGAGG;SOR=0.793;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=68;TCF=52;TCR=16;TR=23;WE=112335447;WS=112335429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,24:0.32:74
chr3	112338027	rs13084615	T	C	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.356;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=132;ReadPosRankSum=1.184;SC=GGTGAAGGCTTTGGGCCTAAT;SOR=2.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=8;WE=112338035;WS=112338017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,8:0.26:31
chr3	112415652	rs10934180	G	C	644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.95;NF=18;NR=3;PP=514;SC=ATCAGGAGCTGAAAGAGGACA;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=112415660;WS=112415642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	112538571	rs35585943	CT	C	895.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.28;MQRankSum=0.329;NF=21;NR=8;PP=522;ReadPosRankSum=0.822;SC=TACAATGATACTTTTTTTTTT;SOR=1.329;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=35;TCF=24;TCR=11;TR=29;WE=112538579;WS=112538561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,37:0.97:38
chr3	112545910	rs58161637	GT	G	1250.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.000;NF=9;NR=15;PP=887;ReadPosRankSum=-0.525;SC=CAGTAGACTTGTGGCCCTCCC;SOR=0.793;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=43;TCF=16;TCR=27;TR=24;WE=112545918;WS=112545900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,38:0.51:74
chr3	112546473	rs1997281	G	A	2178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.602;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.866;NF=59;NR=44;PP=1509;ReadPosRankSum=-0.323;SC=TTCTTAATGCGATAGGAGGGC;SOR=0.819;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=220;TCF=123;TCR=97;TR=103;WE=112546481;WS=112546463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,106:0.46:231
chr3	112642568	rs9865242	C	G	1535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.079;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=28;PP=806;ReadPosRankSum=1.637;SC=TGTAATGCCTCAGATGCCTTC;SOR=0.719;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=120;TCF=66;TCR=54;TR=59;WE=112642576;WS=112642558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,72:0.49:146
chr3	112647613	rs1466872	T	C	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=58;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TTCTTAACTCTTTTAAAAGAA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=4;WE=112647621;WS=112647603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr3	112647832	rs9826308	A	C	1249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=23;PP=726;ReadPosRankSum=-1.431;SC=TCCAGGAGATATGCGCAGCTG;SOR=0.631;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=110;TCF=63;TCR=47;TR=54;WE=112647840;WS=112647822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,60:0.50:120
chr3	112647988	rs9868053	C	T	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.946;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=5;PP=592;ReadPosRankSum=1.102;SC=CATTTGTTTCCGTCACAAATC;SOR=2.018;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=63;TCF=49;TCR=14;TR=29;WE=112647996;WS=112647978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,28:0.43:65
chr3	112648125	rs6438117	G	T	8658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=423;ExcessHet=3.0103;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-2.533;QD=20.57;ReadPosRankSum=1.516;SOR=0.538;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:200,221:0.52:421
chr3	112648125	.	GGT	TGG	2944	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MMLQ=24;MQ=59.9;NF=100;NR=98;PP=2944;QD=20;SC=TGATGGCCACGGTACGAATCT;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=382;TCF=185;TCR=197;TR=198;WE=112648135;WS=112648115;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:184,198:0.52:382
chr3	112648127	rs4596117	T	G	8658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=425;ExcessHet=3.0103;FS=2.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-2.687;QD=20.47;ReadPosRankSum=1.087;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:199,224:0.53:423
chr3	112648222	rs2171509	T	C	1514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.744;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.381;NF=18;NR=40;PP=1091;ReadPosRankSum=1.125;SC=TGTTTCTTTCTTGTAGGCTTT;SOR=0.489;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=104;TCF=30;TCR=74;TR=58;WE=112648230;WS=112648212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,62:0.57:109
chr3	112666859	rs2133946	C	T	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.789;NF=5;NR=17;PP=353;ReadPosRankSum=-1.194;SC=TTTTCACATTCTTCAGACTAT;SOR=0.562;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=65;TCF=13;TCR=52;TR=22;WE=112666867;WS=112666849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,26:0.37:71
chr3	112693753	rs62263759	A	T	973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.828;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=21;PP=432;ReadPosRankSum=-1.433;SC=TCCTCCACACAGGTACAGAAG;SOR=0.584;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=75;TCF=29;TCR=46;TR=36;WE=112693761;WS=112693743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,47:0.53:89
chr3	112709828	rs2272393	C	G	409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=4;PP=294;SC=TCTCTCTGCCCGTCTTCTGGG;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=17;WE=112709836;WS=112709818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	112710242	rs2248029	T	C	2685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.728;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=63;PP=1676;ReadPosRankSum=-1.820;SC=ACCGCTTCCCTGGCCGTCCGG;SOR=0.618;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=242;TCF=125;TCR=117;TR=123;WE=112710250;WS=112710232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,129:0.50:258
chr3	112727184	rs2306857	A	T	6969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=105;NR=126;PP=2965;SC=CTTTGCACAAAACTTTTGGCA;SOR=1.033;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=231;TCF=105;TCR=126;TR=231;WE=112727192;WS=112727174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
chr3	112738318	rs2293560	C	T	3157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=27;PP=1819;SC=CACCCCCGCCCACATGCGCCG;SOR=1.739;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=70;TCR=27;TR=97;WE=112738326;WS=112738308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr3	112738625	rs7633507	C	T	865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=20;PP=562;SC=AGGAGCCCGGCGGGAGGCTGC;SOR=2.910;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=26;WE=112738633;WS=112738615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	112935138	rs4682130	C	G	5705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=104;PP=2965;SC=GAGGTTTTCTCTTCAGTCTGA;SOR=1.217;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=183;TCF=78;TCR=105;TR=181;WE=112935146;WS=112935128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr3	112991312	rs3814398	C	T	1119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.202;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=15;PP=635;ReadPosRankSum=0.126;SC=AAACCATCATCGTCACCAAAG;SOR=1.073;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=120;TCF=76;TCR=44;TR=48;WE=112991320;WS=112991302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,56:0.41:138
chr3	112991842	rs11717833	A	G	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=36;ReadPosRankSum=0.566;SC=GCTCCTAACTACATCCCTCCC;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=3;WE=112991850;WS=112991832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr3	112991959	rs11710894	C	T	849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.652;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=18;PP=622;ReadPosRankSum=-1.530;SC=TGGTCATCCCCTGGGGCCAGA;SOR=1.054;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=101;TCF=59;TCR=42;TR=45;WE=112991967;WS=112991949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,44:0.42:104
chr3	112993367	rs13094203	G	A	1886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.723;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=51;PP=1087;ReadPosRankSum=-0.270;SC=CTGCTTCCCCGCAGTGTCCAG;SOR=0.826;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=183;TCF=78;TCR=105;TR=84;WE=112993375;WS=112993357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,94:0.45:207
chr3	112997554	rs775228	A	G	7052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=108;NR=132;PP=2965;SC=TGGCCAGCAAAGAGCAGCAGA;SOR=0.968;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=240;TCF=108;TCR=132;TR=240;WE=112997562;WS=112997544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr3	112998090	rs3856720	T	C	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.016;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=283;ReadPosRankSum=-1.572;SC=ATACGGTCTTTCCCAGCCCCA;SOR=0.293;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=37;TCF=27;TCR=10;TR=19;WE=112998098;WS=112998080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,20:0.48:42
chr3	112998265	rs2649878	A	G	2020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FS=0.495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.23;ReadPosRankSum=-0.334;SOR=0.759;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:113,106:0.48:219
chr3	112998268	rs2650100	G	A	2218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=43;PP=2620;ReadPosRankSum=1.211;SC=TCCCCCCATCGCGGCTGTCCG;SOR=0.657;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=184;TCF=94;TCR=90;TR=89;WE=112998276;WS=112998255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,106:0.50:212
chr3	112999611	rs775229	A	G	2869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=62;PP=1806;SC=ATAAACCTGCATCTGGTGTGA;SOR=1.879;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=91;TCF=29;TCR=62;TR=90;WE=112999619;WS=112999601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr3	113003595	rs775222	G	C	2256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.486;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=40;PP=1384;ReadPosRankSum=0.905;SC=GGACTCCCCGGCGTGGCCGTC;SOR=0.642;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=215;TCF=132;TCR=83;TR=102;WE=113003603;WS=113003585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,111:0.48:233
chr3	113004155	rs41271355	G	A	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=287;ReadPosRankSum=-0.042;SC=CAGCCAGCAGGGGGATGGGGC;SOR=0.446;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=14;WE=113004163;WS=113004145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr3	113005753	rs76380714	T	A	226.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.20;ReadPosRankSum=1.022;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,12:0.86:14
chr3	113010303	rs17321330	G	A	699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=3;PP=509;SC=ACTTTCAGGCGAGTTCAGTTT;SOR=2.925;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=22;WE=113010311;WS=113010293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	113010466	rs2291905	T	C	1920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=29;PP=1017;SC=AGGATAAGACTGCCTTTCCTA;SOR=0.776;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=34;TCR=29;TR=63;WE=113010474;WS=113010456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr3	113012797	rs810209	G	A	4155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=56;PP=2572;ReadPosRankSum=-0.729;SC=CTTAGCACCTGCATTTTAAAC;SOR=0.465;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=154;TCF=98;TCR=56;TR=153;WE=113012805;WS=113012787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,158:0.99:159
chr3	113012974	rs775217	A	G	1872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=43;PP=1324;SC=TAGAGTTTGGAATATGCTATA;SOR=1.875;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=18;TCR=43;TR=61;WE=113012982;WS=113012964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr3	113013848	rs11398178	A	AT	596.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=17;PP=772;SC=TTGATTAAAGATAAGAATATA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=113013856;WS=113013838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	113015436	rs808949	G	C	1014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=1;PP=834;SC=CAAGGCCTAAGATCCTGGGGC;SOR=5.549;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=32;WE=113015444;WS=113015427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr3	113015553	rs808950	A	C	9585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=363;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=179;NR=146;PP=2965;SC=CCAAAGATCAACCCCCTTCTC;SOR=0.878;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=325;TCF=179;TCR=146;TR=325;WE=113015561;WS=113015543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,363:1.00:363
chr3	113022870	rs4682484	T	C	6866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=115;NR=115;PP=2965;SC=CTGGAGCTCATGGATTCGTTC;SOR=0.803;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=230;TCF=115;TCR=115;TR=230;WE=113022878;WS=113022860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr3	113022996	rs2270782	G	A	1806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=40;PP=1203;SC=AAAGAAAATAGACAAAAACAC;SOR=1.926;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=17;TCR=40;TR=57;WE=113023004;WS=113022986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr3	113027214	rs775231	A	C	642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=17;PP=489;SC=TAGTCACTAGAAAAATAACTC;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=22;WE=113027222;WS=113027204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
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chr3	113323793	rs3732796	C	T	2036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.032;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=52;PP=1329;ReadPosRankSum=0.452;SC=ACGCGCTGCCCGTGATCCAGC;SOR=0.794;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=211;TCF=100;TCR=111;TR=95;WE=113323801;WS=113323783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,100:0.44:227
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chr3	113376110	rs10606566	TTGCTGC	TTGC,T	1868.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5175,0.4825;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;NF=3,3;NR=24,24;PP=1318,7;SC=GTTGTTGCTGTTGCTGCTGCT;SOR=1.154;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=41;TCF=7;TCR=34;TR=27,27;WE=113376123;WS=113376100;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:0.98:46
chr3	113499458	rs1430944	G	A	1392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=29;NR=15;PP=636;SC=CTTTAGGTCTGTCTCTCAAAG;SOR=1.136;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=45;TCF=30;TCR=15;TR=44;WE=113499466;WS=113499438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr3	113557690	rs9990079	G	A	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.132;NF=19;NR=5;PP=377;ReadPosRankSum=-0.508;SC=GCGCGCGCTGGAGGTGGGCGC;SOR=0.646;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=48;TCF=39;TCR=9;TR=24;WE=113557698;WS=113557680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,25:0.45:55
chr3	113557787	rs66781755	AGCC	A	11277.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=42;NR=96;PP=2948;SC=CCGTCAGGTAAGCCGCGGGCC;SOR=1.028;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=152;TCF=46;TCR=106;TR=138;WE=113557797;WS=113557777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr3	113594377	rs13079383	A	G	4259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=401;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.741;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=105;NR=83;PP=2567;ReadPosRankSum=-0.858;SC=AGGGACGACTATACCTTTCAG;SOR=0.854;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=373;TCF=199;TCR=174;TR=188;WE=113594385;WS=113594367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:199,202:0.50:401
chr3	113595156	rs2712350	C	G	2026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=44;PP=1254;SC=AAGAAAATCTCCCTCATACTC;SOR=1.885;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=65;TCF=21;TCR=44;TR=65;WE=113595164;WS=113595146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr3	113619872	rs2632244	C	T	2284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=24;PP=1315;SC=TTTTCTGTCACTTTAGAGCCT;SOR=1.275;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=47;TCR=24;TR=71;WE=113619880;WS=113619862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr3	113659203	rs7630027	C	T	3918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=343;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=85;PP=2385;ReadPosRankSum=-2.156;SC=GTAGGCAACTCGATACATCAC;SOR=0.678;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=308;TCF=154;TCR=154;TR=169;WE=113659211;WS=113659193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,187:0.55:342
chr3	113673125	rs11921691	A	G	2812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.539;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=59;PP=1750;ReadPosRankSum=-0.525;SC=GGCTCTTCCAAGATGCCAGCT;SOR=0.561;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=261;TCF=132;TCR=129;TR=124;WE=113673133;WS=113673115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,136:0.47:289
chr3	113679589	rs12629415	C	A	1994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.974;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=42;PP=1101;ReadPosRankSum=-0.949;SC=GAGCCAACTCCGCTTCCTTCC;SOR=0.605;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=231;TCF=127;TCR=104;TR=91;WE=113679597;WS=113679579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,104:0.40:257
chr3	113679725	rs3732785	C	T	1105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-4.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.871;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=22;PP=631;ReadPosRankSum=-1.689;SC=GATGAGTGATCTTGTGTGGGA;SOR=0.176;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=75;TCF=29;TCR=46;TR=43;WE=113679733;WS=113679715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,50:0.59:85
chr3	113720624	rs6438178	C	T	3587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=73;PP=2151;SC=GATAGTCAAGCGTCTACCAAA;SOR=1.845;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=36;TCR=73;TR=109;WE=113720632;WS=113720614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr3	113775563	rs186436286	T	C	942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.40;ReadPosRankSum=1.354;SOR=0.536;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,45:0.59:76
chr3	113849907	rs149281192	CACTTA	C	538.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-3.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.624;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.239;NF=4;NR=3;PP=246;ReadPosRankSum=-0.776;SC=CTACCAGCTCCACTTAACTTA;SOR=0.126;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=7;WE=113849919;WS=113849897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr3	113858350	rs2251177	C	T	684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=5;PP=496;SC=TACTTACTTGCTGGGGGAAGC;SOR=2.494;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=23;WE=113858358;WS=113858340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	113890815	rs6280	C	T	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.984;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=17;PP=333;ReadPosRankSum=1.175;SC=TTCAGGTGGCCACTCAGCTGG;SOR=1.115;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=80;TCF=39;TCR=41;TR=31;WE=113890823;WS=113890805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,36:0.39:92
chr3	113955055	rs11316836	GA	G	1098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5349;FS=0.000;HP=16;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.611;NF=16;NR=27;PP=425;ReadPosRankSum=1.339;SC=ATGTATCAAAGAAAAAAAAAA;SOR=0.831;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=61;TCF=24;TCR=37;TR=43;WE=113955064;WS=113955044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,60:0.86:70
chr3	113955164	rs3732782	T	G	5720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=104;NR=88;PP=2965;SC=GTAGCCAAAGTCCTTTCTATG;SOR=0.831;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=192;TCF=104;TCR=88;TR=192;WE=113955172;WS=113955154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr3	113955265	rs6438190	G	A	4809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=74;PP=2965;SC=CACATTCTTTGCACTCGTAGG;SOR=0.705;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=156;TCF=82;TCR=74;TR=156;WE=113955273;WS=113955255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr3	113955320	rs6438191	C	T	4958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=73;PP=2965;SC=GAAAACAGAGCGGTAGGTGAA;SOR=0.871;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=165;TCF=92;TCR=73;TR=165;WE=113955328;WS=113955310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr3	113955820	rs3732780	G	C	2495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.316;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=47;PP=1292;ReadPosRankSum=-0.256;SC=TTGGTCCCTGGGAGTCACATT;SOR=0.738;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=220;TCF=116;TCR=104;TR=108;WE=113955828;WS=113955810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,122:0.50:243
chr3	115529360	rs2289269	A	G	2859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.72;SOR=0.904;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr3	115529370	rs2289268	A	G	2545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.46;SOR=1.101;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr3	115535432	rs36098686	T	C	986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.672;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=16;PP=434;ReadPosRankSum=0.686;SC=TTTTGACATATGGAAGGTAAC;SOR=0.446;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=83;TCF=53;TCR=30;TR=41;WE=115535440;WS=115535422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,49:0.51:97
chr3	116163634	rs138580275	GAC	G	482.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.348;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=1.125;NF=23;NR=11;PP=927;ReadPosRankSum=2.398;SC=AAGGAGATCAGACACACACAC;SOR=1.708;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=55;TCF=36;TCR=19;TR=34;WE=116163669;WS=116163624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,19:0.45:42
chr3	116163655	.	AC	A	153.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=0.000;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQRankSum=-0.421;QD=2.17;ReadPosRankSum=1.671;SOR=0.705;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,13:0.18:71
chr3	116728295	rs11381408	G	GA	286.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.188;HP=9;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=156;ReadPosRankSum=-1.280;SC=CTTAATTAAAGAAAAAATACC;SOR=0.090;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=7;WE=116728303;WS=116728285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr3	118269774	rs9816586	A	G	1172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.458;HP=2;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=29;PP=709;ReadPosRankSum=-0.888;SC=CAGGATGGCTATAAAAGAGAA;SOR=0.881;Source=Platypus;TCF=53;TR=53;WE=118269782;WS=118269764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,55:0.45:122
chr3	118269825	rs57227846	GT	G	200.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.03;ReadPosRankSum=1.090;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr3	118649060	rs2903250	G	T	4708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=62;NR=93;PP=2902;SC=AGGACTGCTGGCTGACCCCGG;SOR=1.320;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=155;TCF=62;TCR=93;TR=155;WE=118649068;WS=118649050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr3	118865332	rs11550908	A	G	1635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=32;PP=1083;ReadPosRankSum=-0.128;SC=GATGTTTCTGACCTTAGAGCA;SOR=0.663;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=155;TCF=91;TCR=64;TR=71;WE=118865340;WS=118865322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,76:0.43:176
chr3	118865609	rs10934483	C	T	2289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.163;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=45;PP=1452;ReadPosRankSum=0.802;SC=GAAGAGCTTCCGAGCAGATGG;SOR=0.594;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=223;TCF=111;TCR=112;TR=97;WE=118865617;WS=118865599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,107:0.43:246
chr3	118865801	rs4077931	C	T	2770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.309;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=52;PP=1562;ReadPosRankSum=-1.881;SC=AAAGACCTTCCGTACAGATTG;SOR=0.486;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=209;TCF=99;TCR=110;TR=106;WE=118865809;WS=118865791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,124:0.51:244
chr3	118866515	rs9864127	C	T	1310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=38;PP=1032;SC=AGGGGTACAACGGAAGGGCAC;SOR=6.043;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=39;TCF=1;TCR=38;TR=39;WE=118866523;WS=118866505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	118867047	rs9289122	C	G	1671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=32;NR=25;PP=869;SC=CAGAAATTGACCAAGGAAAGG;SOR=0.723;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=32;TCR=25;TR=57;WE=118867055;WS=118867037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr3	118870025	rs11373158	A	AC	8001.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=52;PP=2966;SC=TGACCACATAATTTTGCTCAG;SOR=1.134;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=97;TCF=44;TCR=53;TR=94;WE=118870033;WS=118870015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr3	118905438	.	T	G	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.160;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.881;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=153;ReadPosRankSum=0.000;SC=TCAAATGTCCTTCATCGCTAA;SOR=1.230;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=43;TCF=37;TCR=6;TR=13;WE=118905446;WS=118905428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,14:0.31:45
chr3	118909159	rs9840317	A	G	3227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=50;PP=1968;SC=GCAACACAACAAGACTTTGTG;SOR=0.793;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=63;TCR=50;TR=113;WE=118909167;WS=118909149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr3	118909962	rs3796356	T	C	1977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=52;PP=1285;SC=GTAAGACCTGTGGTCTTGGGG;SOR=2.802;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=14;TCR=52;TR=66;WE=118909970;WS=118909952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr3	118909987	rs3796357	C	T	1106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=28;PP=789;SC=GCCATTTTTACTTACTGGTGG;SOR=3.383;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=33;WE=118909995;WS=118909977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr3	118912961	rs62263545	T	C	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.703;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=164;ReadPosRankSum=0.227;SC=ATGTAAGATATGGTACACTTT;SOR=0.116;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=12;WE=118912969;WS=118912951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr3	118913337	rs7628485	A	G	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=121;ReadPosRankSum=0.053;SC=GTCTTTCAGTAAGGAATTCTA;SOR=0.425;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=8;WE=118913345;WS=118913327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr3	118922654	rs12186112	A	C	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=102;ReadPosRankSum=-1.102;SC=AACAAACAAAAAAATCTGTTG;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=6;WE=118922662;WS=118922645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr3	118930791	rs5868	G	C	657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-5.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.002;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=2;PP=462;ReadPosRankSum=-0.488;SC=GCTATCAGCAGCTGCAACCAG;SOR=0.160;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=43;TCF=41;TCR=2;TR=24;WE=118930799;WS=118930781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,26:0.58:45
chr3	118931389	rs6784208	C	T	7761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=138;NR=123;PP=2965;SC=CACCAAAAGACCCAGGGTCAT;SOR=0.764;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=262;TCF=138;TCR=124;TR=261;WE=118931397;WS=118931379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,290:1.00:290
chr3	118935276	.	TACACACACACGCAC	T	690	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=19;MMLQ=25;MQ=61.69;NF=0;NR=6;PP=690;QD=118.5;SC=CGAAAATTTATACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=6;WE=118935297;WS=118935266;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr3	118935284	rs68075325	CACGCACAT	C	160.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.53;QD=32.17;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	118935287	.	G	A	196	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=72;MMLQ=27;MQ=62.28;NF=0;NR=3;PP=196;QD=76.9237375157;SC=ACACACACACGCACATACACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=3;WE=118935297;WS=118935266;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,3:0.33:9
chr3	118935300	rs73187814	C	T	139.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.76;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	118945796	rs3764779	G	C	2188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.110;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=39;PP=1386;ReadPosRankSum=0.873;SC=TTACATTCCTGAGGGCGATAC;SOR=0.512;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=188;TCF=113;TCR=75;TR=95;WE=118945804;WS=118945786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,104:0.49:211
chr3	119013987	rs10707359	CT	C	127.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.858;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.39;MQRankSum=0.549;QD=8.52;ReadPosRankSum=0.864;SOR=0.293;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr3	119109837	rs78837524	G	A	747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=1.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.99;ReadPosRankSum=-0.665;SOR=0.883;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,41:0.38:107
chr3	119112559	rs935616	A	G	141.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=111;SC=TAAATTAACTAGGGGAAGAGG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=119112567;WS=119112549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	119118104	rs4688001	A	G	7295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=122;NR=116;PP=2965;SC=CAGTGCCTGTAGAAGGTAAGA;SOR=0.778;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=238;TCF=122;TCR=116;TR=238;WE=119118112;WS=119118094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,269:1.00:269
chr3	119120577	rs10511390	G	C	1632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=13;PP=1051;SC=TGCCTCTCTAGTATTCAAATG;SOR=1.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=39;TCR=13;TR=52;WE=119120585;WS=119120567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr3	119128628	rs1463139	A	G	907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.26;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	119128634	rs1463138	T	C	851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.83;SOR=5.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr3	119133183	rs3732413	G	A	4782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=75;NR=79;PP=2965;SC=TTCAAAGGGCGGCCCGGAAAG;SOR=0.792;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=154;TCF=75;TCR=79;TR=154;WE=119133191;WS=119133173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr3	119153798	rs34023538	G	A	1200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=31;PP=636;ReadPosRankSum=0.795;SC=GGCAAGGCCAGCTGTATTTTT;SOR=0.773;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=94;TCF=36;TCR=58;TR=51;WE=119153806;WS=119153788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,58:0.54:108
chr3	119169978	rs13096213	C	T	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.066;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=190;ReadPosRankSum=-0.484;SC=GTTTCTATTTCCATCCTCTAA;SOR=0.223;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=13;WE=119169986;WS=119169968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr3	119170218	rs2178318	A	G	974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=25;PP=603;ReadPosRankSum=-0.370;SC=TTGTGATTATAGTAACTATTC;SOR=0.685;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=77;TCF=28;TCR=49;TR=40;WE=119170226;WS=119170208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,45:0.53:85
chr3	119171280	rs1919586	C	G	9120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=342;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=158;NR=139;PP=2965;SC=AGAATATAGTCAATGAACTGT;SOR=0.810;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=297;TCF=158;TCR=139;TR=297;WE=119171297;WS=119171270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,341:1.00:341
chr3	119188895	rs6438531	C	G	1518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=34;PP=1001;SC=AAAATGCTCTCGCATGGGAAA;SOR=1.938;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=15;TCR=34;TR=49;WE=119188903;WS=119188885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr3	119196166	rs3732420	T	C	2453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.569;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=50;PP=1223;ReadPosRankSum=0.646;SC=ACAGGTGTAGTGGTGTTGAGC;SOR=0.512;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=218;TCF=120;TCR=98;TR=107;WE=119196174;WS=119196156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,120:0.50:238
chr3	119196334	rs3732419	G	T	476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.509;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=337;ReadPosRankSum=0.373;SC=ATGGAGAGTGGTCCTCTAGGA;SOR=1.759;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=16;WE=119196342;WS=119196324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr3	119197285	rs4688005	A	G	7468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.340;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=124;NR=140;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.742;SC=ATTGTTTGTCATGAAACTCAC;SOR=0.475;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=265;TCF=125;TCR=140;TR=264;WE=119197293;WS=119197275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,286:1.00:287
chr3	119197387	rs13078816	G	A	836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=27;PP=563;ReadPosRankSum=0.435;SC=AAGTATGACCGTCGGTATACT;SOR=0.616;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=63;TCF=8;TCR=55;TR=32;WE=119197395;WS=119197377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,35:0.53:66
chr3	119198873	rs4688007	G	A	10512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=394;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=198;NR=168;PP=2965;SC=ACTGATTTAGGACGACCTGTC;SOR=0.794;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=366;TCF=198;TCR=168;TR=366;WE=119198881;WS=119198863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,393:1.00:393
chr3	119205541	rs2276713	C	T	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=332;ReadPosRankSum=0.638;SC=TATACCCCTCCTCCGCTGTCA;SOR=0.804;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=57;TCF=44;TCR=13;TR=21;WE=119205549;WS=119205531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,22:0.39:57
chr3	119209658	rs62263444	A	G	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.429;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=423;ReadPosRankSum=0.319;SC=CATGTAAGACATTTAGTCCTA;SOR=1.863;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=46;TCF=10;TCR=36;TR=23;WE=119209666;WS=119209648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,23:0.49:47
chr3	119211294	rs1997341	A	G	1574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.528;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=35;PP=871;ReadPosRankSum=-0.454;SC=AGTAGTCATCATAGGACCATA;SOR=0.630;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=183;TCF=95;TCR=88;TR=76;WE=119211302;WS=119211284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,85:0.43:196
chr3	119222456	rs1131265	G	C	1077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.787;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=25;PP=663;ReadPosRankSum=0.423;SC=CAGTGTTTGTGACTATATTCA;SOR=0.970;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=71;TCF=31;TCR=40;TR=41;WE=119222464;WS=119222446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,48:0.54:89
chr3	119305169	rs20569	G	A	1035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.630;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=8;PP=755;ReadPosRankSum=-0.554;SC=AGCTGAAGCCGGGCAAGCCCA;SOR=0.399;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=70;TCF=58;TCR=12;TR=43;WE=119305177;WS=119305159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,43:0.61:71
chr3	119325907	rs2251566	G	A	766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.597;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=24;PP=557;ReadPosRankSum=0.289;SC=GGCAACAAGGGGAGGAATGAA;SOR=1.236;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=52;TCF=15;TCR=37;TR=31;WE=119325915;WS=119325897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,32:0.58:55
chr3	119327604	rs5852212	GC	G	1869.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.819;HP=5;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.887;NF=21;NR=23;PP=1324;ReadPosRankSum=0.658;SC=TTCTTTTTTGGCCCCCTGTCT;SOR=0.365;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=85;TCF=45;TCR=40;TR=44;WE=119327612;WS=119327594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,70:0.57:123
chr3	119327653	rs1723969	T	C	2620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.470;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.996;NF=59;NR=48;PP=1620;ReadPosRankSum=0.233;SC=TTGACACATTTATTAGAACCC;SOR=0.641;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=212;TCF=121;TCR=91;TR=107;WE=119327661;WS=119327643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,123:0.51:243
chr3	119328449	rs3832185	CAGGCTTT	C	1186.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=839;ReadPosRankSum=1.618;SC=GCCCATCCTCCAGGCTTTAGA;SOR=0.638;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=48;TCF=12;TCR=36;TR=18;WE=119328463;WS=119328439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,34:0.33:102
chr3	119331874	rs2272270	C	T	771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.600;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=15;PP=513;ReadPosRankSum=1.534;SC=GCCTGGACCCCGCTGGACCTG;SOR=0.996;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=86;TCF=54;TCR=32;TR=39;WE=119331882;WS=119331864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,41:0.39:105
chr3	119331892	rs2272269	C	G	818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.166;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=14;PP=554;ReadPosRankSum=0.634;SC=CTGAGTACACCAGGGCCAGTG;SOR=1.143;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=89;TCF=54;TCR=35;TR=40;WE=119331900;WS=119331882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,43:0.40:107
chr3	119332042	rs2272268	G	A	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=190;ReadPosRankSum=-0.746;SC=TAGCTCTGTGGCCCTGGGCAG;SOR=1.609;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=11;WE=119332050;WS=119332032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr3	119334986	rs2247660	G	A	1722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.516;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=40;PP=1131;ReadPosRankSum=0.509;SC=TGGCAACCCCGGAGATTGAAA;SOR=0.797;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=179;TCF=95;TCR=84;TR=80;WE=119334994;WS=119334976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,84:0.44:191
chr3	119336728	rs4688020	C	T	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.164;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=127;ReadPosRankSum=-2.830;SC=CACTAATATTCTGAAAAAGTG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=7;WE=119336736;WS=119336718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr3	119338492	rs61733986	G	A	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=18;PP=404;ReadPosRankSum=0.935;SC=CCAGTGCTCCGTACTGCAGTG;SOR=0.703;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=22;TCR=41;TR=28;WE=119338500;WS=119338482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,31:0.44:70
chr3	119338956	rs2280669	A	G	1637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.555;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=30;PP=850;ReadPosRankSum=-0.203;SC=GCTCCTAACCATGGCATTTCC;SOR=0.633;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=148;TCF=90;TCR=58;TR=70;WE=119338964;WS=119338946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,86:0.49:175
chr3	119339010	rs1877595	G	A	1160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.356;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=28;PP=684;ReadPosRankSum=-1.475;SC=TAAATGTGAAGTAAAAATGTG;SOR=0.558;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=128;TCF=60;TCR=68;TR=54;WE=119339018;WS=119339000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,59:0.41:143
chr3	119339054	rs1877594	C	T	794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.243;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=22;PP=474;ReadPosRankSum=1.501;SC=CAAGCTAAACCGTCATCCTTC;SOR=0.332;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=83;TCF=30;TCR=53;TR=38;WE=119339062;WS=119339044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,41:0.44:94
chr3	119367390	rs2688643	T	C	5643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=103;NR=84;PP=2965;SC=AGAGCTTCTCTGAGATGTCAT;SOR=0.782;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=187;TCF=103;TCR=84;TR=187;WE=119367398;WS=119367380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr3	119373301	rs2688630	G	A	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.836;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=162;ReadPosRankSum=0.943;SC=GGATATTGCTGGGCTACAGTG;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=6;WE=119373323;WS=119373291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr3	119373315	rs2688629	T	C	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.389;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=162;ReadPosRankSum=1.499;SC=TACAGTGGGATGGGGTGAGGC;SOR=0.368;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=6;WE=119373323;WS=119373291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr3	119395662	rs523476	C	G	1180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=17;PP=687;ReadPosRankSum=-1.187;SC=ATGTCTACATCTTCGGACCTA;SOR=0.716;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=107;TCF=72;TCR=35;TR=51;WE=119395670;WS=119395652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,59:0.47:125
chr3	119395799	rs2280578	A	C	921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=25;PP=576;ReadPosRankSum=-0.879;SC=GTCAACAGAGACCCGACCACG;SOR=0.765;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=79;TCF=27;TCR=52;TR=36;WE=119395807;WS=119395789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,40:0.49:81
chr3	119395870	.	CGGG	C	212.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.13;QD=35.47;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	119422204	rs7624672	T	C	455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=359;SC=ACGGTTGTCCTTGGTCGGGTG;SOR=3.126;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=119422212;WS=119422194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	119426307	rs9848716	T	C	1142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=18;PP=565;ReadPosRankSum=-0.018;SC=ATCCAAGATATTCTCTATATT;SOR=0.734;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=86;TCF=50;TCR=36;TR=41;WE=119426315;WS=119426297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,56:0.49:115
chr3	119434527	rs6438544	G	C	5315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=96;NR=73;PP=2965;SC=TCCATACTCTGCAGAATATGT;SOR=0.788;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=169;TCF=96;TCR=73;TR=169;WE=119434535;WS=119434517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr3	119451163	.	G	C	725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.000;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=3.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.56;ReadPosRankSum=2.855;SOR=0.428;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,42:0.26:159
chr3	119501580	rs3841391	G	GC	444.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.462;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=326;ReadPosRankSum=1.365;SC=AGTGCTGGCAGCCCCCTGAGG;SOR=1.596;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=11;WE=119501588;WS=119501570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr3	119501780	rs2472668	G	A	2381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=40;PP=1297;SC=AGTGCCACCAGGTCCTTCTTC;SOR=1.375;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=30;TCR=40;TR=70;WE=119501788;WS=119501770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr3	119501798	rs2461831	T	A	1682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=33;PP=927;SC=TTCTCTCCACTTTACAGCCCA;SOR=1.727;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=18;TCR=33;TR=51;WE=119501806;WS=119501788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr3	119529113	rs3732356	G	T	2206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=55;PP=1585;SC=CGTGGGTGTGGGCATGCTTGT;SOR=2.864;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=12;TCR=55;TR=67;WE=119529121;WS=119529103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr3	119533733	rs6785049	G	A	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=47;ReadPosRankSum=0.473;SC=TCTTCCTCTCGCCCCCAACTT;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=4;WE=119533741;WS=119533723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr3	119533773	rs6797879	T	C	1073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=9;PP=808;SC=CTGGTGCCGGTCTGTGGGCTG;SOR=2.133;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=28;TCR=9;TR=37;WE=119533781;WS=119533763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr3	119533910	rs4058490	T	C	6296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=114;NR=100;PP=2965;SC=CAGTGTTCAATGCGGAGACTG;SOR=0.753;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=214;TCF=114;TCR=100;TR=214;WE=119533918;WS=119533900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr3	119535795	rs11929668	C	G	697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.519;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=3;PP=573;ReadPosRankSum=-0.429;SC=TTCAGCCAAGCCTTGTCTCTT;SOR=1.292;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=52;TCF=46;TCR=6;TR=28;WE=119535803;WS=119535785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,28:0.50:56
chr3	119666266	rs13312998	C	T	458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.413;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=320;ReadPosRankSum=0.293;SC=GAACAAGATGCTTCTGAAATA;SOR=0.096;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=44;TCF=11;TCR=33;TR=22;WE=119666274;WS=119666256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,22:0.49:45
chr3	119886548	rs9858566	G	C	2528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.892;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=53;PP=1757;ReadPosRankSum=-0.034;SC=GGCTAAAGCCGAGCTCCTTGG;SOR=0.620;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=275;TCF=148;TCR=127;TR=114;WE=119886568;WS=119886538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,123:0.41:301
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chr3	119900212	rs1488765	G	C	911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.744;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=25;PP=444;ReadPosRankSum=0.878;SC=GCAGACCCTGGGGGGTGAAGA;SOR=0.347;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=63;TCF=20;TCR=43;TR=40;WE=119900220;WS=119900202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,42:0.62:68
chr3	119900260	rs1488764	T	C	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=210;ReadPosRankSum=-0.702;SC=AAGAGGTCAATGAGCAGTAGG;SOR=1.493;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=12;WE=119900268;WS=119900250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr3	119904125	rs902791	A	G	3274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.408;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=65;PP=2041;ReadPosRankSum=-3.613;SC=GACAGAGACCATATCAGATGT;SOR=0.740;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=284;TCF=158;TCR=126;TR=147;WE=119904133;WS=119904115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,161:0.51:318
chr3	119904315	rs902792	G	C	912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.376;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=21;PP=493;ReadPosRankSum=0.477;SC=TTGTGAACATGCTGGAGCATG;SOR=0.351;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=71;TCF=23;TCR=48;TR=35;WE=119904323;WS=119904305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,42:0.55:77
chr3	119905641	rs2319542	G	A	1512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.608;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=32;PP=742;ReadPosRankSum=-0.085;SC=CTGCAAAAGAGTCAAGGTCAA;SOR=0.801;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=129;TCF=70;TCR=59;TR=67;WE=119905649;WS=119905631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,76:0.51:148
chr3	119911667	rs2319543	G	A	664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.523;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=9;PP=399;ReadPosRankSum=1.604;SC=ATGAGAAACAGGAACTTTGGA;SOR=0.192;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=48;TCF=36;TCR=12;TR=29;WE=119911675;WS=119911657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,31:0.58:53
chr3	119912297	rs902793	C	A	1040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.008;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=30;PP=598;ReadPosRankSum=-0.404;SC=AAGAAAGACACTTACAGCCAT;SOR=1.036;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=90;TCF=24;TCR=66;TR=39;WE=119912305;WS=119912287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,47:0.46:102
chr3	120068022	rs6770482	C	G	786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=16;PP=409;ReadPosRankSum=-0.025;SC=TCTCGGTGGACACGCTGAGGC;SOR=0.741;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=75;TCF=38;TCR=37;TR=33;WE=120068030;WS=120068012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,40:0.45:88
chr3	120123953	rs1147701	T	A	738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=21;PP=554;SC=TCAGAGGGCCTTGGCAACAAA;SOR=4.174;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=120123961;WS=120123943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	120130883	.	G	GAC	132.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.015;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=246;ReadPosRankSum=0.984;SC=TCGACACACAGACACACACAC;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=9;WE=120130891;WS=120130873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,7:0.27:26
chr3	120130899	rs1259326	T	C	509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=0.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=218;ReadPosRankSum=1.248;SC=CACACACACATACATGCACAC;SOR=0.458;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=14;WE=120130907;WS=120130889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr3	120134901	rs2272516	C	A	2666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.944;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=55;PP=1592;ReadPosRankSum=0.563;SC=TAAAGGAAACCGTGTGACTGA;SOR=0.607;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=271;TCF=146;TCR=125;TR=117;WE=120134909;WS=120134891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,131:0.45:294
chr3	120169641	rs1147708	T	C	9807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=379;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=153;NR=193;PP=2965;SC=GGCCCCGCGCTGACCTGGGAA;SOR=0.953;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=346;TCF=153;TCR=193;TR=346;WE=120169649;WS=120169631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,378:1.00:378
chr3	120320939	rs12762	C	T	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.933;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=9;PP=192;ReadPosRankSum=-0.017;SC=GTCAGTTGTACGGTGGGTTGT;SOR=0.859;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=66;TCF=36;TCR=30;TR=22;WE=120320947;WS=120320929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,24:0.32:74
chr3	120369575	rs3817627	T	G	3183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.821;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=70;PP=1857;ReadPosRankSum=-0.602;SC=CTGGCCAAAATCCCTTAGAAG;SOR=0.759;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=309;TCF=154;TCR=155;TR=138;WE=120369583;WS=120369565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:181,158:0.47:339
chr3	120371414	rs2551607	G	A	4197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=60;PP=2384;SC=GAGCAGTAGGGAGGGTGTGGA;SOR=0.771;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=140;TCF=79;TCR=61;TR=139;WE=120371422;WS=120371404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr3	120389243	rs1800722	T	C	1081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.610;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=15;PP=573;ReadPosRankSum=-1.010;SC=TTTGGGTATATGATAAGCTTC;SOR=0.902;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=96;TCF=61;TCR=35;TR=44;WE=120389251;WS=120389233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,51:0.48:106
chr3	120389316	rs2255543	T	A	5088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=80;PP=2845;SC=TGTGAGTGACTTGGCCTTCGT;SOR=0.746;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=85;TCR=80;TR=165;WE=120389324;WS=120389306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr3	120389491	rs17140269	A	G	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.459;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=43;ReadPosRankSum=-1.311;SC=AACGACCTGTAGGCTCTAATG;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=4;WE=120389499;WS=120389481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr3	120394521	rs17140396	T	C	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=171;ReadPosRankSum=-1.321;SC=TTGGGAAACCTCTAGACAGTT;SOR=0.269;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=10;WE=120394529;WS=120394511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr3	120409526	rs2288096	C	T	828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=21;PP=554;SC=TCCATAAAAGCCTGCCTCATT;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=27;WE=120409534;WS=120409516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr3	120413158	rs7612975	G	A	1628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=36;PP=987;SC=GCATATTTCTGTAGGCATAAT;SOR=1.688;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=57;TCF=20;TCR=37;TR=56;WE=120413166;WS=120413148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr3	120449742	.	G	T	592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.305;ClippingRankSum=0.000;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.198;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=19;PP=372;ReadPosRankSum=0.773;SC=AAGCATAGTTGTTAGAATGCC;SOR=0.516;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=55;TCF=11;TCR=44;TR=25;WE=120449750;WS=120449732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,28:0.46:61
chr3	120469849	.	T	G	1530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.418;ClippingRankSum=0.000;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.299;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=39;PP=950;ReadPosRankSum=0.268;SC=CTATGACAGGTGAGGTTTATC;SOR=0.565;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=134;TCF=52;TCR=82;TR=63;WE=120469857;WS=120469839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,75:0.47:160
chr3	120673980	rs73185491	T	G	1113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=29;PP=828;SC=CAAATAAAGTTTATTATTTTT;SOR=2.613;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=8;TCR=29;TR=37;WE=120673988;WS=120673970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr3	120976051	rs17249244	C	G	4488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=88;NR=59;PP=2597;SC=GATATTATTACCCCTGAACCA;SOR=0.987;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=88;TCR=59;TR=147;WE=120976059;WS=120976041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr3	121100116	rs35624942	GT	G	1723.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=14;PP=886;SC=AATTTGTGTGGTTTTTTTTTA;SOR=2.267;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=52;TCF=36;TCR=16;TR=45;WE=121100124;WS=121100106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr3	121100414	rs17740072	A	G	3248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=74;PP=2226;SC=CTTCACTGTTACTTTTTCAAA;SOR=2.121;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=28;TCR=74;TR=102;WE=121100422;WS=121100404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr3	121137976	rs6782025	C	T	2524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=42;NR=38;PP=1250;SC=CTTTGAGAAACCATATTCAGG;SOR=0.754;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=42;TCR=38;TR=80;WE=121137984;WS=121137966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr3	121138015	rs6782033	C	T	2042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=35;PP=1076;SC=AGCATCACTACTCAACTGCTA;SOR=1.079;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=30;TCR=35;TR=65;WE=121138023;WS=121138005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr3	121154974	rs1381057	T	C	4817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=90;NR=61;PP=2605;SC=CAAACCTGTTTGGTCACTTTG;SOR=1.108;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=151;TCF=90;TCR=61;TR=151;WE=121154982;WS=121154964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr3	121155198	rs2030531	C	T	2560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=50;PP=1533;SC=GTCCACAGTTCAGTGCTCACA;SOR=1.265;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=35;TCR=50;TR=85;WE=121155206;WS=121155188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr3	121186543	rs1381058	A	G	2053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=46;PP=1373;SC=ATATATGAAAAAGGTCTGATT;SOR=2.082;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=20;TCR=46;TR=66;WE=121186551;WS=121186533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr3	121195302	rs10591564	TACACAC	TAC,T	2877.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;NF=24,24;NR=14,14;PP=170,1625;SC=TTCAGGTAAATACACACACAC;SOR=2.340;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=56;TCF=31;TCR=25;TR=38,38;WE=121195315;WS=121195292;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:72
chr3	121208833	rs3218649	G	C	5006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=82;PP=2965;SC=AATGGAACATGTCTGATGTTC;SOR=0.821;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=164;TCF=82;TCR=82;TR=163;WE=121208841;WS=121208823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr3	121212277	rs11351457	AT	A	2226.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=23;PP=1030;SC=TAAAATTGACATTTTTTTTTT;SOR=2.066;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=66;TCF=38;TCR=28;TR=52;WE=121212286;WS=121212267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr3	121228833	rs3732406	A	C	2305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=15;PP=1593;SC=CAGTCATACAACCTCACTAAA;SOR=2.690;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=56;TCR=15;TR=71;WE=121228841;WS=121228823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr3	121238749	rs702018	G	A	7767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=150;NR=121;PP=2965;SC=TGCCAGCACGGCCAACCATCT;SOR=0.822;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=272;TCF=151;TCR=121;TR=271;WE=121238757;WS=121238739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,294:1.00:294
chr3	121241058	rs13059229	C	G	1706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=45;PP=1263;SC=GTGTATCTGTCTAAATCATAA;SOR=2.468;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=12;TCR=45;TR=57;WE=121241066;WS=121241048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr3	121263720	rs702017	C	A	7777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=112;NR=146;PP=2965;SC=TAGCTTGTCTCTTTCGTAGTC;SOR=1.029;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=258;TCF=112;TCR=146;TR=258;WE=121263728;WS=121263710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,293:1.00:293
chr3	121265176	rs3806614	G	A	2761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=24;PP=1855;SC=AGATTGAGAAGCATTATGCAA;SOR=1.872;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=63;TCR=24;TR=87;WE=121265184;WS=121265166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr3	121265522	rs11714774	A	C	3064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=66;PP=2008;SC=ACCAAGCAAAACTAGTAGGCC;SOR=1.546;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=101;TCF=35;TCR=66;TR=101;WE=121265530;WS=121265512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr3	121295834	rs67439929	C	T	1755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=30;PP=889;SC=AGAGCAAGACCTTGTCTCTAA;SOR=0.949;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=28;TCR=30;TR=58;WE=121295842;WS=121295824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr3	121304981	rs146404354	C	T	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=312;ReadPosRankSum=0.530;SC=TCCCCCAGAACATCCCCCAGT;SOR=0.818;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=61;TCF=23;TCR=38;TR=20;WE=121304989;WS=121304971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,20:0.31:64
chr3	121339354	rs7640859	T	C	769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=10;PP=463;ReadPosRankSum=-0.751;SC=AACCTAACTGTTTTTCTTACT;SOR=0.638;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=78;TCF=54;TCR=24;TR=33;WE=121339362;WS=121339344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,37:0.42:88
chr3	121350583	rs1128159	C	T	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=196;ReadPosRankSum=0.792;SC=AGAGGGAAGTCTGTCCAGAAC;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=4;WE=121350601;WS=121350574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr3	121350593	rs1128158	C	A	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=132;ReadPosRankSum=-0.434;SC=CTGTCCAGAACCTCATCTGGT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=5;WE=121350601;WS=121350574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr3	121350616	rs1128154	G	T	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.318;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=187;ReadPosRankSum=0.535;SC=GACATTTGCAGCAGGAATAGG;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=11;WE=121350624;WS=121350606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr3	121350966	rs9869984	C	G	2149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=35;PP=1359;SC=TAATCATATACAGCCACAGCT;SOR=0.798;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=31;TCR=35;TR=66;WE=121350974;WS=121350956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr3	121351338	rs2070180	C	T	2720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.666;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=71;PP=1785;ReadPosRankSum=-1.754;SC=GGCTCTGCTTCGTACACTGGC;SOR=0.492;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=228;TCF=97;TCR=131;TR=126;WE=121351346;WS=121351328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,126:0.53:239
chr3	121351480	rs9815500	T	C	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.871;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=100;ReadPosRankSum=-0.148;SC=ACTGATAAGATCCCCCGCCCT;SOR=1.329;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=18;TCF=7;TCR=11;TR=9;WE=121351488;WS=121351470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr3	121353254	rs2070179	T	C	5272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=93;NR=80;PP=2965;SC=AGCCCACGGGTACCACTAGAA;SOR=0.703;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=173;TCF=93;TCR=80;TR=173;WE=121353262;WS=121353244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr3	121353291	rs34667636	G	A	1276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.652;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=30;PP=752;ReadPosRankSum=0.860;SC=AGAAAAATTAGGGTTGTCTTG;SOR=0.600;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=123;TCF=54;TCR=69;TR=57;WE=121353299;WS=121353281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,63:0.47:135
chr3	121353328	rs6770842	A	C	812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.104;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=26;PP=606;ReadPosRankSum=-0.930;SC=AGGGCATGGCACTTGAAGGAA;SOR=1.039;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=74;TCF=23;TCR=51;TR=35;WE=121353336;WS=121353318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,36:0.47:77
chr3	121354381	rs7620842	A	T	141.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=111;SC=CACTTTAGCCACCAAAGTGCT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=121354389;WS=121354373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	121361646	rs12487377	G	A	1515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.360;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=26;PP=838;ReadPosRankSum=1.511;SC=TGAACAAAAAGTAAATAAAAT;SOR=0.837;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=79;TCR=47;TR=69;WE=121361654;WS=121361636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,73:0.53:138
chr3	121361787	rs2070178	G	A	1498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.284;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=35;PP=818;ReadPosRankSum=-0.308;SC=TCTGAGATGTGTGCTTCTCCA;SOR=0.580;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=138;TCF=64;TCR=74;TR=67;WE=121361795;WS=121361777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,74:0.49:151
chr3	121363680	rs34440810	C	T	2737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.946;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=48;PP=1482;ReadPosRankSum=-1.410;SC=CTGCCCTGTCCCTCTCAACTC;SOR=0.632;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=228;TCF=131;TCR=97;TR=110;WE=121363688;WS=121363670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,130:0.50:258
chr3	121366123	rs9818402	C	T	1532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.472;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=20;PP=850;ReadPosRankSum=0.689;SC=CCACCGCACCCGGCTTGTATT;SOR=0.567;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=110;TCF=72;TCR=38;TR=59;WE=121366131;WS=121366113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,70:0.56:124
chr3	121366377	rs7356043	A	G	657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.985;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=18;PP=411;ReadPosRankSum=-0.254;SC=GAAGCCTTGAAGTCTGTCCTG;SOR=0.502;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=61;TCF=22;TCR=39;TR=29;WE=121366385;WS=121366367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,32:0.48:66
chr3	121377244	.	G	A	2456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.377;ClippingRankSum=0.000;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.033;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=56;PP=1493;ReadPosRankSum=1.715;SC=AGGATCAAGAGGAGGGAAAAT;SOR=0.805;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=213;TCF=99;TCR=114;TR=102;WE=121377252;WS=121377234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,112:0.50:224
chr3	121387060	rs56109033	T	C	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.397;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=97;ReadPosRankSum=1.349;SC=AGAAAGTGTATTTGAGCAAAA;SOR=1.051;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=26;TCF=12;TCR=14;TR=10;WE=121387068;WS=121387050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
chr3	121388362	rs11363204	AT	A	233.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=146;SC=AAAAAGCATAATTTTTTTTTG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=8;WE=121388370;WS=121388352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	121396060	.	C	A	314	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=14;HapScore=4;MGOF=11;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=9;NR=6;PP=314;QD=23.2514141698;SC=AAAAAAAAAACAAAACCCTGC;SbPval=0.09;Source=Platypus;TC=38;TCF=30;TCR=8;TR=15;WE=121396068;WS=121396039;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:23,15:0.39:38
chr3	121412892	rs11915822	A	G	4398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=420;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.521;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=96;PP=2642;ReadPosRankSum=0.287;SC=GTCTCTTCCAAGTGGACTTTT;SOR=0.760;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=373;TCF=185;TCR=188;TR=187;WE=121412900;WS=121412882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:204,215:0.51:419
chr3	121414217	rs35674179	C	A	2669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.511;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=44;PP=1669;ReadPosRankSum=-0.008;SC=TGTTTCCATACACTCTTTAGC;SOR=0.753;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=198;TCF=118;TCR=80;TR=114;WE=121414225;WS=121414207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,123:0.57:214
chr3	121415610	rs33988592	G	A	2656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.609;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.927;NF=55;NR=47;PP=1530;ReadPosRankSum=0.333;SC=TCTGTGCTTGGGAGTTTTCCG;SOR=0.675;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=200;TCF=102;TCR=98;TR=102;WE=121415618;WS=121415600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,121:0.53:227
chr3	121418765	rs11927625	T	C	1360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=36;PP=913;ReadPosRankSum=-0.452;SC=CTTTAGAAGATATATGTGGAG;SOR=0.790;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=90;TCF=28;TCR=62;TR=51;WE=121418773;WS=121418755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,57:0.60:95
chr3	121433906	rs55964762	T	C	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.309;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr3	121433926	rs9854052	T	A	116.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=74;SC=TAGTTTAGTTTCCTTAGTTAA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=121433934;WS=121433916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	121435621	rs9832267	T	C	7891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.34;SOR=0.811;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr3	121435624	rs9812411	C	T	7923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.54;SOR=0.865;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr3	121437097	rs56286202	C	T	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-2.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=100;ReadPosRankSum=0.977;SC=CACTTAAGTACGAGGTATTTG;SOR=0.307;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=11;WE=121437105;WS=121437087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr3	121447911	rs1919554	A	C	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.127;HP=10;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=212;ReadPosRankSum=1.555;SC=TAAGAAAAAAAAAAACAAAAC;SOR=0.283;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=14;WE=121447919;WS=121447901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr3	121448675	rs28497949	T	A	1215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=14;PP=738;ReadPosRankSum=0.360;SC=CTGTCCTTTATCAAATGCTCC;SOR=0.682;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=103;TCF=74;TCR=29;TR=49;WE=121448683;WS=121448665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,54:0.48:112
chr3	121449612	rs7643293	G	T	1133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.797;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=11;PP=744;ReadPosRankSum=0.349;SC=CTTAATCCTCGCTTCACCTAG;SOR=0.972;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=92;TCF=68;TCR=24;TR=47;WE=121449620;WS=121449602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,50:0.50:101
chr3	121500479	rs368036963	TAC	T	188.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.230;NF=9;NR=0;PP=302;ReadPosRankSum=-0.707;SC=GCAATAAATGTACACACACAC;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=9;WE=121500490;WS=121500469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr3	121507231	rs1141528	A	T	3811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.043;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.243;NF=86;NR=74;PP=2232;ReadPosRankSum=-0.738;SC=TTTCTGGATAATCAGTGCTGA;SOR=0.543;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=284;TCF=156;TCR=128;TR=160;WE=121507239;WS=121507221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,178:0.56:316
chr3	121507371	rs141690316	CTTTTTA	C	1466.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.368;NF=1;NR=23;PP=1054;ReadPosRankSum=-0.477;SC=ATCTTGCATTCTTTTTATTTT;SOR=0.690;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=60;TCF=1;TCR=59;TR=24;WE=121507384;WS=121507361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,39:0.53:74
chr3	121507415	rs4073474	C	T	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.663;HP=1;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=466;ReadPosRankSum=-1.274;SC=CCCAATTCTACTATTTTACCA;SOR=0.293;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=21;WE=121507423;WS=121507405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,22:0.67:33
chr3	121508830	rs6802815	A	T	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=2.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=222;ReadPosRankSum=-0.122;SC=GTCCAAATTTAAAAAAAAATC;SOR=0.941;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=39;TCF=33;TCR=6;TR=17;WE=121508838;WS=121508820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,16:0.36:44
chr3	121514458	rs141330650	TA	T	786.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=8.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.19;MQRankSum=0.615;QD=14.84;ReadPosRankSum=1.862;SOR=0.099;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,43:0.81:53
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chr3	121526099	rs4582090	A	G	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.44;ReadPosRankSum=-0.377;SOR=0.709;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,16:0.37:43
chr3	121526107	rs4280673	C	T	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.91;ReadPosRankSum=0.129;SOR=0.619;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,17:0.35:48
chr3	121526152	rs5852278	TA	T	618.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.97;ReadPosRankSum=-1.414;SOR=0.643;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,32:0.46:69
chr3	121526204	rs4543051	G	A	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=1.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.76;ReadPosRankSum=0.078;SOR=0.474;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,21:0.38:55
chr3	121547527	rs1920320	A	G	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.120;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=160;ReadPosRankSum=0.165;SC=TAATACATCCAGGAGCTATTT;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=8;WE=121547535;WS=121547517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr3	121563271	rs11717089	C	T	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.409;HP=6;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=1004;ReadPosRankSum=0.193;SC=TTACATTTTACAAAAATTGGT;SOR=1.061;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=52;TCF=37;TCR=15;TR=25;WE=121563293;WS=121563261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,26:0.47:55
chr3	121563285	rs11721291	T	C	919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=14;PP=1004;ReadPosRankSum=-1.783;SC=AATTGGTATTTGTATCTATTT;SOR=0.671;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=74;TCF=47;TCR=27;TR=40;WE=121563293;WS=121563261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,43:0.54:79
chr3	121563355	rs9884018	T	C	1027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.665;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=24;PP=516;ReadPosRankSum=-1.931;SC=TTGAGGTTGGTGAAGGTGAAC;SOR=0.773;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=60;TCR=53;TR=50;WE=121563363;WS=121563345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,55:0.44:124
chr3	121613205	rs4603998	G	C	526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=2;PP=422;SC=GAGTTAAACTGAGTTGCTGAA;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=121613213;WS=121613195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	121630328	rs6438687	A	G	1134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=8;PP=794;SC=TCCTCCATTTATCCCCACACT;SOR=2.242;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=34;WE=121630336;WS=121630318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr3	121633964	rs2049331	C	T	1199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=4;PP=829;SC=ATTGTGGAGGCAATATCTGAA;SOR=3.664;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=35;TCR=4;TR=39;WE=121633972;WS=121633954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	121634171	rs3215370	A	AT	6445.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=73;PP=2799;SC=AGAGGTTAGGATTTTTTTGAG;SOR=0.800;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=106;TCF=21;TCR=85;TR=93;WE=121634179;WS=121634161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr3	121634410	rs9812515	T	A	5391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=114;NR=63;PP=2965;SC=GAATAAAACATCAAATATTCA;SOR=1.435;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=177;TCF=114;TCR=63;TR=177;WE=121634418;WS=121634400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr3	121641528	rs7637569	G	A	2100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=12;PP=1388;SC=TAAGTCACTAGAAGTATGGTG;SOR=2.472;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=51;TCR=12;TR=63;WE=121641536;WS=121641518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr3	121641693	rs2293616	G	A	7728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=127;NR=139;PP=2965;SC=TAGACTGGGCGGCTGAGAAAT;SOR=0.795;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=266;TCF=127;TCR=139;TR=266;WE=121641701;WS=121641683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,286:1.00:286
chr3	121641794	.	C	T	1433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.662;ClippingRankSum=0.000;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.496;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=25;PP=962;ReadPosRankSum=1.208;SC=CATTCAACCTCCTCTCTACTG;SOR=0.559;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=105;TCF=57;TCR=48;TR=52;WE=121641802;WS=121641784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,57:0.51:112
chr3	121641821	rs2293615	A	G	3960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=57;PP=2832;SC=GGACACTTCTACTTTAAGCAA;SOR=0.838;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=121;TCF=64;TCR=57;TR=121;WE=121641829;WS=121641811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr3	121642048	rs3817601	A	T	5022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=82;PP=2803;SC=GATTTCTCATAACAGGATCTG;SOR=0.816;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=83;TCR=82;TR=165;WE=121642056;WS=121642038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr3	121643143	rs3215371	A	AT	1616.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.877;HP=9;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.272;NF=18;NR=15;PP=671;ReadPosRankSum=1.608;SC=CTAGGCCAACATTTTTTTTTC;SOR=1.850;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=22;TCR=18;TR=33;WE=121643151;WS=121643133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,61:0.97:63
chr3	121643170	rs2257109	A	T	2774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.43;SOR=1.336;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr3	121643303	rs2257115	T	A	6185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=103;PP=2965;SC=GTATTACGATTAACAACCATA;SOR=0.830;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=204;TCF=101;TCR=103;TR=204;WE=121643311;WS=121643293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr3	121643337	rs2257119	G	A	5004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=92;PP=2885;SC=CTCCTTGTACGCTGATAAGGG;SOR=1.061;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=167;TCF=75;TCR=92;TR=166;WE=121643345;WS=121643327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr3	121643372	rs2257120	C	T	3099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=64;PP=1946;SC=GAAAACATTCCCATTAAGCCC;SOR=1.392;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=103;TCF=39;TCR=64;TR=103;WE=121643380;WS=121643362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr3	121643427	rs2257123	G	A	1578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.55;QD=40.48;SOR=2.891;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr3	121643436	rs2257124	G	A	1344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.74;QD=46.37;SOR=3.334;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	121643447	rs34567530	A	AT	440.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=14;PP=426;SC=TAAGCATTGGATTTTTTTCCA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=14;WE=121643455;WS=121643417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	121643699	rs2257132	G	A	1368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=14;PP=974;SC=GTGTGTAGATGTGAGACAGAG;SOR=1.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=36;TCR=14;TR=50;WE=121643707;WS=121643689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr3	121643804	rs2257212	C	T	5919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=114;NR=88;PP=2965;SC=TCTAAATCCCCTTCTGGTTCT;SOR=0.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=204;TCF=114;TCR=90;TR=202;WE=121643812;WS=121643794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr3	121643893	rs2257214	T	C	4017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=73;PP=2557;SC=AAGTGTTCACTATGTCTGTAT;SOR=1.052;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=131;TCF=58;TCR=73;TR=131;WE=121643901;WS=121643883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr3	121646495	rs1882002	C	T	1260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=2;PP=980;SC=TATTTCTTTACAGCAATGCAA;SOR=5.186;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=39;TCF=37;TCR=2;TR=39;WE=121646503;WS=121646485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	121646641	rs1143670	A	G	8400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=140;NR=151;PP=2965;SC=TGATCCTAGCATGCCTGGCAT;SOR=0.875;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=291;TCF=140;TCR=151;TR=291;WE=121646649;WS=121646631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,321:1.00:321
chr3	121646759	rs3762819	G	A	1446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=35;PP=1007;SC=GACTTGTTCAGTCATGATTCC;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=11;TCR=35;TR=46;WE=121646767;WS=121646749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr3	121647286	rs1143671	C	T	4770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=66;PP=2793;SC=CCCAGCCCAGCCAGGTCCCCA;SOR=0.914;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=158;TCF=92;TCR=66;TR=158;WE=121647294;WS=121647276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr3	121647467	rs1316301	C	T	1073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=25;PP=681;SC=TTTTCCTTAACATTAATTGTA;SOR=2.774;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=32;WE=121647475;WS=121647457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr3	121647782	rs1316397	C	G	865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=1;PP=695;SC=GTCCAATATGCAGTAGAAGGT;SOR=5.136;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=25;WE=121647790;WS=121647772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	121648168	rs1143672	G	A	7514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=134;NR=106;PP=2965;SC=ACAGAAAGCAGAACAACCAAT;SOR=0.823;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=240;TCF=134;TCR=106;TR=240;WE=121648176;WS=121648158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,277:1.00:277
chr3	121658082	rs874741	A	G	1050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=3;PP=757;SC=TTTCCTGAAAATGGCTGAAGA;SOR=3.611;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=30;WE=121658090;WS=121658072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr3	121659197	rs3817599	G	A	1517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=14;PP=1052;SC=CAGTGAAGGGGGTTTGTTTAC;SOR=1.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=37;TCR=14;TR=51;WE=121659205;WS=121659187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr3	121712051	rs2877561	A	C	6329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.297;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=115;NR=93;PP=2965;ReadPosRankSum=1.535;SC=GAGTGATATCAAGTGAGCGGT;SOR=0.446;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=209;TCF=115;TCR=94;TR=208;WE=121712059;WS=121712041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,234:1.00:235
chr3	121712980	rs3915060	C	T	6555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=116;NR=93;PP=2965;SC=CCCATGTTCCCGCCCTTGCCC;SOR=0.770;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=209;TCF=116;TCR=93;TR=209;WE=121712988;WS=121712970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr3	121810427	rs57304749	CT	C	5789.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.346;NF=27;NR=106;PP=2551;ReadPosRankSum=-0.419;SC=CAAGTTTTACCTTTTTTTTTC;SOR=0.943;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=161;TCF=29;TCR=132;TR=133;WE=121810436;WS=121810417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:6,223:0.97:229
chr3	121825197	rs2681417	G	A	6695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=138;NR=82;PP=2965;SC=GTATGATGGTGTTATGCAGAA;SOR=1.345;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=220;TCF=138;TCR=82;TR=220;WE=121825205;WS=121825187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr3	121836966	rs10580127	TGA	T	7092.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=69;PP=2974;SC=GAGACATTGATGAGAGAGAGG;SOR=0.788;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=103;TCF=28;TCR=75;TR=97;WE=121836975;WS=121836956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr3	121838319	rs1129055	G	A	2856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=35;PP=1594;SC=ATCTGATGAAGCCCAGCGTGT;SOR=1.056;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=60;TCR=35;TR=95;WE=121838327;WS=121838309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr3	121976253	rs9869985	G	A	549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=18;PP=457;SC=GCCTTCTCAGGCGGGGCACTG;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=121976261;WS=121976243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	121994941	rs2279802	G	A	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.335;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=235;ReadPosRankSum=0.306;SC=GCAGGAAACTGTGCTGGGCTT;SOR=1.038;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=41;TCF=12;TCR=29;TR=17;WE=121994949;WS=121994931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,18:0.40:45
chr3	122000871	rs4678174	C	T	3028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.606;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=41;PP=1662;ReadPosRankSum=-0.918;SC=TGCCCAAACTCCTCCCTCTTA;SOR=0.681;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=104;TCF=62;TCR=42;TR=103;WE=122000879;WS=122000861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,116:0.99:117
chr3	122003045	rs2036400	G	C	8126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=132;NR=134;PP=2965;SC=CCGCGCCCCCGTCAAGCTACC;SOR=0.783;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=267;TCF=132;TCR=135;TR=266;WE=122003053;WS=122003035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,299:1.00:299
chr3	122003769	rs1042636	A	G	3412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=395;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.125;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=81;PP=2041;ReadPosRankSum=0.768;SC=CATGGCCCACAGGAATTCTAC;SOR=0.802;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=357;TCF=180;TCR=177;TR=161;WE=122003777;WS=122003759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:217,178:0.45:395
chr3	122003832	rs1801726	G	C	9035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NR=142;PP=2965;SC=GACCCGACACGAGCCATTACT;SOR=0.783;Source=Platypus;TCR=142;WE=122003840;WS=122003822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,324:1.00:324
chr3	122004098	rs4677948	A	T	1453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=28;PP=780;SC=GTCCCAGGGAAGAGGAATCGC;SOR=1.791;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=15;TCR=28;TR=43;WE=122004106;WS=122004088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr3	122056432	rs17589	C	T	831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.778;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=12;PP=443;ReadPosRankSum=-0.183;SC=ATGAGACTTACGGAAAATTGG;SOR=0.603;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=87;TCF=58;TCR=29;TR=36;WE=122056440;WS=122056422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,41:0.42:98
chr3	122081659	rs9857709	A	G	1613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.36;SOR=1.666;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	122081659	.	AA	GC	2072	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;FR=1.0000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MMLQ=25;MQ=59.04;NF=9;NR=24;PP=2072;QD=64.4081174201;SC=CCCTCCCCCCAACCCCAAAAG;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=50;TCF=24;TCR=26;TR=33;WE=122081668;WS=122081649;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:17,33:0.66:50
chr3	122081660	rs9857710	A	C	1613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.42;SOR=1.556;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr3	122103028	.	C	T	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.372;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.605;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=77;ReadPosRankSum=-3.464;SC=GCGTCCTTCCCACTCCAACGC;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=6;WE=122103036;WS=122103018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr3	122128466	rs4306808	G	C	1788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=13;PP=1285;SC=TGCTCAGTGTGCAAGCAGCAG;SOR=2.265;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=58;TCF=45;TCR=13;TR=57;WE=122128474;WS=122128456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr3	122128519	rs10511410	G	C	5015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=111;NR=64;PP=2965;SC=GCTGTCATCAGTGCAAGGTAA;SOR=1.267;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=175;TCF=111;TCR=64;TR=175;WE=122128527;WS=122128509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr3	122133830	rs3749213	T	G	10247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=378;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=158;NR=182;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.146;SC=TACCTGACACTATCAAGGACC;SOR=0.295;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=341;TCF=158;TCR=183;TR=340;WE=122133838;WS=122133820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,376:1.00:377
chr3	122145810	rs4677950	T	A	1068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=24;NR=9;PP=676;SC=CTGACACAGGTACGTGAAAGC;SOR=2.012;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=33;WE=122145818;WS=122145800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr3	122168341	rs3749209	C	A	2328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=17;PP=1540;SC=ATGTACAATCCATTAATATTT;SOR=2.191;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=56;TCR=17;TR=73;WE=122168349;WS=122168331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr3	122180187	.	GA	G	49.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.647;ClippingRankSum=0.000;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=3.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.73;ReadPosRankSum=0.200;SOR=0.268;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,11:0.16:68
chr3	122186141	rs75578364	A	G	1182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=15;PP=620;ReadPosRankSum=-0.369;SC=TTCATCACAAAAACACTGAAA;SOR=0.750;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=110;TCF=74;TCR=36;TR=45;WE=122186149;WS=122186131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,56:0.42:134
chr3	122186188	rs4678193	C	T	6239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=115;NR=85;PP=2965;SC=CTCCATGTTACTAATCTGAGC;SOR=0.894;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=200;TCF=115;TCR=85;TR=200;WE=122186196;WS=122186178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr3	122215166	rs9289194	A	AACACACACAC	273.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=329;SC=AGAAGGGGAAAACACACACAC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=6;WE=122215174;WS=122215164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	122247606	rs7628052	A	G	3189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=66;PP=1895;SC=AAAGGAAAAAATAAAATAAAA;SOR=1.382;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=41;TCR=66;TR=107;WE=122247614;WS=122247596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr3	122259606	rs9851180	T	C	6756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=110;NR=105;PP=2965;SC=GTGGGCCTCATACATCTCTTC;SOR=0.735;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=215;TCF=110;TCR=105;TR=215;WE=122259614;WS=122259596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr3	122259738	rs145948621	G	GTT	500.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=22.76;ReadPosRankSum=-1.068;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,20:0.91:22
chr3	122259745	rs9831600	G	T	520.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=3.067;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.67;ReadPosRankSum=-2.237;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,20:0.91:22
chr3	122269380	rs1979853	A	G	210.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.35;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	122274757	rs73192127	G	C	6055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=101;NR=92;PP=2965;SC=CATCTTTCCAGACTGATAACT;SOR=0.711;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=195;TCF=102;TCR=93;TR=193;WE=122274765;WS=122274747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr3	122285005	rs12485294	G	A	1338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=36;PP=1024;SC=CCCATGTGCTGGGCACGTACA;SOR=2.687;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=9;TCR=36;TR=45;WE=122285013;WS=122284995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr3	122287289	rs9839782	T	C	268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=1;PP=209;SC=ATGGTAGGCCTGCATGCTGAG;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=122287297;WS=122287279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	122288210	rs2332285	G	A	6742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=128;NR=94;PP=2965;SC=TCCAAGGACAGGCAGGTAGAT;SOR=0.986;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=223;TCF=129;TCR=94;TR=222;WE=122288218;WS=122288200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr3	122345870	rs17208928	C	T	2576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=44;PP=1287;SC=CCACATTCTCCATGACTACAT;SOR=0.963;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=44;TCR=44;TR=88;WE=122345878;WS=122345860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr3	122354037	rs1106346	A	G	7752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=118;NR=136;PP=2965;SC=GTGCTGGGAAAAATGGTAAGG;SOR=0.926;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=254;TCF=118;TCR=136;TR=254;WE=122354045;WS=122354027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,284:1.00:284
chr3	122354716	rs61754895	C	T	7037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=129;NR=102;PP=2965;SC=CTGCCAAGGACACCTACTCCA;SOR=0.851;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=232;TCF=130;TCR=102;TR=231;WE=122354724;WS=122354706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chr3	122406077	rs790131	G	A	1349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.735;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=37;PP=785;ReadPosRankSum=0.072;SC=GATGTGCTCCGCTGGGAGCTG;SOR=1.103;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=103;TCF=38;TCR=65;TR=56;WE=122406085;WS=122406067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,62:0.56:111
chr3	122423251	rs62263931	C	T	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.22;ReadPosRankSum=1.465;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr3	122437321	rs7645033	T	C	3921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=377;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.205;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=90;PP=2190;ReadPosRankSum=-1.406;SC=GTGTGGAATATGCTATCTCCT;SOR=0.684;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=348;TCF=173;TCR=175;TR=177;WE=122437329;WS=122437311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:186,191:0.51:377
chr3	122437834	rs3821688	A	G	1927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.534;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=50;PP=1145;ReadPosRankSum=-0.941;SC=CTTGTCATCCACTATTTCACA;SOR=0.646;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=186;TCF=70;TCR=116;TR=82;WE=122437842;WS=122437824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,93:0.46:203
chr3	122474305	.	C	A	44	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=39;MMLQ=27;MQ=55.75;NF=0;NR=6;PP=44;QD=13.1285354245;SC=AAAAAAGATACAAGTTAGTAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=6;WE=122474313;WS=122474295;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:18,6:0.25:24
chr3	122477795	rs2137210	G	A	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.218;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.941;NF=8;NR=13;PP=361;ReadPosRankSum=0.912;SC=GCTGACCTGGGAGTGGAATCT;SOR=0.436;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=57;TCF=17;TCR=40;TR=21;WE=122477803;WS=122477785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,26:0.51:51
chr3	122478032	.	C	CCACACACA	288.90	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.765;ClippingRankSum=-0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.9997;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=310;ReadPosRankSum=-0.967;SC=CATGTGCGTTCCACACACACA;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=6;WE=122478040;WS=122478022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr3	122605544	rs9864868	G	A	6301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=117;NR=104;PP=2965;SC=AAACTGTGCAGATATTTTACA;SOR=0.753;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=221;TCF=117;TCR=104;TR=221;WE=122605552;WS=122605534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr3	122630323	rs2303982	T	G	3304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=50;PP=1526;SC=ATGAGGTAGGTCCGGTTTCTT;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=28;TCR=50;TR=78;WE=122630331;WS=122630313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr3	122630346	rs2303983	T	C	2424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=31;PP=959;SC=ACCTGCACAGTCGGTGGCCTC;SOR=1.445;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=19;TCR=31;TR=50;WE=122630354;WS=122630336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr3	122631896	rs2276782	A	T	1609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=37;PP=1136;SC=GCGCAGGAGGACCTCCACCAG;SOR=1.692;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=18;TCR=37;TR=55;WE=122631904;WS=122631886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr3	122642401	rs2276780	G	A	3222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=39;PP=1894;SC=GAATCAGCTTGTGGCTGGTAA;SOR=1.336;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=68;TCR=39;TR=107;WE=122642423;WS=122642391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr3	122642415	rs2276779	G	C	3986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=45;PP=2206;SC=CTGGTAATCTGGGGGTAAGGC;SOR=1.394;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=129;TCF=84;TCR=45;TR=129;WE=122642423;WS=122642391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr3	122642590	rs2276778	G	A	3044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=60;PP=1926;SC=CAGAAGCCGCGATGCTGTTTC;SOR=1.524;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=35;TCR=60;TR=95;WE=122642598;WS=122642580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr3	122680141	rs13094003	A	G	1680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.538;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=32;PP=1015;ReadPosRankSum=0.681;SC=ACCAGCTGGAACCACTCACTG;SOR=0.635;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=167;TCF=96;TCR=71;TR=73;WE=122680149;WS=122680131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,83:0.44:188
chr3	122680171	rs4677985	A	G	1726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.143;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=38;PP=948;ReadPosRankSum=-1.667;SC=AATTTTGGGTAAGTCATGGAT;SOR=0.784;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=164;TCF=81;TCR=83;TR=75;WE=122680179;WS=122680161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,85:0.46:183
chr3	122680240	rs34020905	C	A	767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.211;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=20;PP=392;ReadPosRankSum=0.587;SC=CCCCAGGGACCACATGGTTGC;SOR=0.344;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=83;TCF=30;TCR=53;TR=35;WE=122680248;WS=122680230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,40:0.43:94
chr3	122807995	rs836860	G	A	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.764;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=250;ReadPosRankSum=0.841;SC=ACTCACAGTCGTTGGCTCCTT;SOR=0.223;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=19;WE=122808003;WS=122807985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr3	122811042	rs836863	A	G	710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=3;PP=493;SC=CACAGGCCCTAGCACTGTTGA;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=122811050;WS=122811032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	122811187	.	G	GT	73.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.848;ClippingRankSum=0.000;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.78;ReadPosRankSum=0.879;SOR=1.075;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,14:0.15:95
chr3	122821108	rs2717233	C	T	715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=1;PP=544;SC=CACCCTCTAGCTCTCACAGCC;SOR=4.091;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=122821116;WS=122821098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	122821385	rs2241961	T	C	5279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=106;PP=2858;SC=AAGTGCCAAATGCTTTCATTG;SOR=1.277;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=181;TCF=75;TCR=106;TR=181;WE=122821393;WS=122821375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr3	122821478	rs2241962	T	A	534.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.31;ReadPosRankSum=-0.909;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,21:0.95:22
chr3	122821671	rs2241963	AT	GA	8984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=101;NR=73;PP=2947;SC=GTTCTCAGCAATGGTGGAGTC;SOR=0.888;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=177;TCF=102;TCR=75;TR=174;WE=122821680;WS=122821661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr3	122834887	rs836839	A	T	868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=9;PP=626;SC=CCACTGATACAGTAAGCTCTT;SOR=1.839;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=31;WE=122834895;WS=122834877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr3	122835210	rs836840	A	G	812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=21;PP=581;SC=GAAGGGTGCCAGGGGTGGGGT;SOR=3.180;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=24;WE=122835218;WS=122835200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	122835232	rs2278668	T	C	333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=235;SC=GGGACAGGTTTTGAAATGGTG;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=122835240;WS=122835222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	122843110	rs861375	G	T	8041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=125;NR=161;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.898;SC=GTTTCTCCACGTTTCACAGGA;SOR=1.100;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=288;TCF=126;TCR=162;TR=286;WE=122843118;WS=122843099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,300:0.99:302
chr3	122843212	rs2305051	C	T	4507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=89;PP=2755;SC=GTGTGTGTGTCAGTGGGCGTG;SOR=1.099;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=68;TCR=90;TR=157;WE=122843220;WS=122843202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr3	122864436	rs8739	G	A	1440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.195;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=28;PP=939;ReadPosRankSum=1.386;SC=ATGGAGAAGCGGATGTAAGCT;SOR=0.832;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=157;TCF=87;TCR=70;TR=67;WE=122864444;WS=122864426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,73:0.41:176
chr3	122864587	rs3215241	TAGAC	T	253.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.706;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=265;ReadPosRankSum=1.130;SC=TAGAACATCTTAGACAGATGG;SOR=0.092;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=7;WE=122864598;WS=122864577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr3	122865136	rs2673345	T	A	1090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.704;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=32;PP=695;ReadPosRankSum=-0.221;SC=TAGCACATCCTAACTGCCAGC;SOR=1.205;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=118;TCF=46;TCR=72;TR=49;WE=122865144;WS=122865126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,52:0.40:130
chr3	122873923	rs2717225	G	C	1327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.295;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=33;PP=852;ReadPosRankSum=-0.045;SC=TGATCTGCCTGCAGCTAATTC;SOR=1.124;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=117;TCF=52;TCR=65;TR=56;WE=122873931;WS=122873913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,62:0.48:129
chr3	122880191	rs8935	T	C	1693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=25;PP=951;ReadPosRankSum=-0.239;SC=CTGTTGACTGTGTCAAAGACA;SOR=0.685;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=122;TCF=81;TCR=41;TR=71;WE=122880199;WS=122880181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,78:0.57:137
chr3	123008519	rs4677881	T	G	110.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=0;PP=84;SC=GCGGATGCGGTATGGGGTATG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=123008527;WS=123008516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	123010276	rs9809236	G	A	1905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.781;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=53;PP=1264;ReadPosRankSum=-0.791;SC=CCCAGATGTCGGCCCCTCCAC;SOR=1.000;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=195;TCF=82;TCR=113;TR=85;WE=123010284;WS=123010266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,92:0.42:218
chr3	123014877	rs9881951	C	T	597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=0;PP=461;SC=CTGTTGTCTCCGCCACCTGCT;SOR=4.514;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=123014885;WS=123014867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr3	123015094	rs9882534	G	C	3862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=79;PP=2116;SC=GGCCTGAGACGGCCGTGGCTC;SOR=1.007;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=142;TCF=63;TCR=79;TR=142;WE=123015102;WS=123015084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr3	123018963	rs4482616	A	G	3864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=55;PP=2346;SC=GAGGTGCCCCATACATGGCGT;SOR=1.017;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=132;TCF=77;TCR=55;TR=132;WE=123018971;WS=123018953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr3	123021838	rs9877581	A	G	352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=2;PP=214;SC=GAGCAGCTGCAGTGACAGTGG;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=123021846;WS=123021828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	123021870	rs9844212	G	C	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=104;ReadPosRankSum=-2.402;SC=GGACTCTTCAGCACTCCCTTC;SOR=0.446;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=12;WE=123021878;WS=123021860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr3	123022724	rs67640502	AG	A	59.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.43;ReadPosRankSum=0.651;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr3	123022726	.	AAGAGAAGAGAAGAG	A	59.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.875;ClippingRankSum=-0.000;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.43;ReadPosRankSum=-0.179;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr3	123022734	.	AG	A	166.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=-0.000;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.16;ReadPosRankSum=1.602;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr3	123022736	.	AAGAG	A	166.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.651;ClippingRankSum=-0.000;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.16;ReadPosRankSum=1.922;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr3	123022763	rs4437082	C	A	753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.550;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=3;PP=514;ReadPosRankSum=-0.995;SC=GTGTGAGGCACATTGAGCCAA;SOR=1.802;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=55;TCF=44;TCR=11;TR=29;WE=123022771;WS=123022753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,31:0.53:59
chr3	123037047	rs4327330	A	C	408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=11;PP=302;SC=ACACCCAGGGAAGCCACTCAT;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=123037055;WS=123037037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	123047666	rs9855969	A	G	1026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.490;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=26;PP=623;ReadPosRankSum=-2.006;SC=ATGGAGCAGGAGTAAAGCTGG;SOR=0.405;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=117;TCF=48;TCR=69;TR=49;WE=123047674;WS=123047656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,52:0.43:122
chr3	123049678	rs4678009	C	T	981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=3;PP=779;SC=GTCAGTCAGTCGCTCGGGCTG;SOR=3.545;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=32;WE=123049686;WS=123049668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr3	123049938	rs6806529	A	C	1588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=42;PP=1302;SC=GAGAAGCAAAAAGATTCACCC;SOR=2.925;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=10;TCR=42;TR=52;WE=123049946;WS=123049928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr3	123066555	rs112525497	A	AAAGG	2156.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=9;PP=1697;SC=TGCCCACTTGAAAGGAAGTGG;SOR=2.400;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=38;TCF=26;TCR=12;TR=32;WE=123066563;WS=123066545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr3	123086698	rs146718564	GA	G	90.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=2.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.624;QD=0.99;ReadPosRankSum=0.919;SOR=0.392;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,14:0.15:92
chr3	123167249	rs4678027	G	A	1062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=22;PP=677;SC=CGCGGGCAGAGCCCCCGGGGG;SOR=1.236;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=16;TCR=22;TR=38;WE=123167257;WS=123167239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr3	123338956	.	TA	T	69.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.280;ClippingRankSum=0.000;DP=181;ExcessHet=3.0103;FS=0.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.41;ReadPosRankSum=-2.471;SOR=0.800;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:145,25:0.15:170
chr3	123378534	rs39639	C	G	2506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=47;PP=1479;SC=GATGAAAACTCTCAGAAAAGA;SOR=1.061;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=37;TCR=47;TR=84;WE=123378542;WS=123378524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr3	123411589	rs40305	G	A	1203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.404;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=20;PP=606;ReadPosRankSum=0.253;SC=TACCATCCACGGTGACTTGGC;SOR=0.547;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=118;TCF=74;TCR=44;TR=54;WE=123411597;WS=123411579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,62:0.48:130
chr3	123418913	rs865358	G	A	7087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=123;NR=124;PP=2965;SC=GGGTCTTTCCGTTCAGCGTCC;SOR=0.895;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=247;TCF=123;TCR=124;TR=247;WE=123418921;WS=123418903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,269:1.00:269
chr3	123440967	rs820355	G	A	6812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=124;NR=119;PP=2965;ReadPosRankSum=1.969;SC=GTGCCCAGAGGCTCCTACCAT;SOR=0.724;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=245;TCF=126;TCR=119;TR=243;WE=123440975;WS=123440957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,260:0.99:262
chr3	123444785	rs820329	A	T	2110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.520;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=34;PP=1345;ReadPosRankSum=1.047;SC=GGCAGGGGGAACTCACCATTC;SOR=0.763;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=189;TCF=118;TCR=71;TR=91;WE=123444793;WS=123444775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,102:0.49:210
chr3	123451773	rs9833275	G	C	1939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=43;NR=23;PP=1088;SC=CTACAGGACAGCTGGCCTTGG;SOR=1.288;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=43;TCR=23;TR=66;WE=123451781;WS=123451763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr3	123452838	rs4678047	G	A	1027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.567;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=24;PP=597;ReadPosRankSum=0.391;SC=GAAGGACCGGGGTCTGCGGGG;SOR=1.094;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=97;TCF=47;TCR=50;TR=42;WE=123452846;WS=123452828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,49:0.45:110
chr3	123456432	rs2168439	C	T	3293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=72;PP=1982;SC=CAAATCTGCTCACCTTCTGGC;SOR=1.730;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=110;TCF=38;TCR=72;TR=110;WE=123456440;WS=123456422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr3	123457711	rs2198766	C	A	1338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=7;PP=954;SC=CTAATACAGGCTGGATCAGGG;SOR=3.160;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=35;TCR=7;TR=42;WE=123457719;WS=123457701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr3	123457893	rs9840993	G	A	6769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=113;NR=108;PP=2965;SC=TCCACTGCTGGAGCTGAAAAT;SOR=0.734;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=221;TCF=113;TCR=108;TR=221;WE=123457901;WS=123457883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr3	123458693	rs55956729	G	A	1581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.364;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=24;PP=1006;ReadPosRankSum=-0.293;SC=CCCGCCCTTTGGTTATTATAA;SOR=0.509;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=114;TCF=75;TCR=39;TR=68;WE=123458701;WS=123458683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,73:0.58:125
chr3	123633612	rs11551801	G	A	1426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=12;PP=972;SC=CACCTGATGAGTTTTCTTCTG;SOR=2.004;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=35;TCR=12;TR=47;WE=123633620;WS=123633602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr3	123634046	rs2700373	G	A	5114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=77;PP=2965;SC=CAGCAAGTCCGCTGTTGCTGA;SOR=0.839;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=170;TCF=93;TCR=77;TR=170;WE=123634054;WS=123634036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr3	123650432	rs2271969	A	G	247.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=243;SC=ACAAACTTGGAAAATACCTGT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=10;WE=123650440;WS=123650422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	123650447	.	TA	T	36	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;FR=0.9999;HP=16;HapScore=2;MGOF=42;MMLQ=17;MQ=58.82;NF=0;NR=3;PP=36;QD=13.0;SC=ACCTGTTTCTTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=123650455;WS=123650437;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,3:0.75:4
chr3	123652476	rs6784695	G	A	2051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=15;PP=1459;SC=CAACATTTCCGGAGCCACAAA;SOR=2.049;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=51;TCR=15;TR=66;WE=123652484;WS=123652466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr3	123665902	rs17310144	T	G	7779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=122;NR=134;PP=2965;SC=TCCAGATGCGTTTCTTTTCCA;SOR=0.875;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=256;TCF=122;TCR=134;TR=256;WE=123665910;WS=123665892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,284:1.00:284
chr3	123666192	rs17375977	C	T	1298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=28;PP=784;SC=AACAAGTCTTCAGAAGTATGA;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=40;WE=123666200;WS=123666182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr3	123688760	rs34337446	C	G	2311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=13;PP=1610;SC=TTCAGATCATCCATATTTCAT;SOR=2.802;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=66;TCF=53;TCR=13;TR=65;WE=123688768;WS=123688750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr3	123851972	rs7627646	G	A	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.328;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=32;ReadPosRankSum=0.792;SC=CTGATGGTGCGGGGTTACTTT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=123851980;WS=123851962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr3	124044949	rs2289778	C	T	8446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=136;NR=148;PP=2965;SC=GGAAGAGCTTCGCTGCTGCCC;SOR=0.828;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=284;TCF=136;TCR=148;TR=284;WE=124044957;WS=124044939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,314:1.00:314
chr3	124113929	rs482285	A	T	2105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=25;PP=1371;SC=CCCTCACCCCAGCCCTGGCCT;SOR=1.432;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=47;TCR=25;TR=72;WE=124113937;WS=124113919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr3	124128938	rs647010	A	G	2874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=32;PP=1638;SC=GAAACACCAGATACAGAATCC;SOR=1.396;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=57;TCR=32;TR=89;WE=124128946;WS=124128928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr3	124132263	rs2289846	A	T	857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.339;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=10;PP=560;ReadPosRankSum=0.268;SC=CCTTAACCTAACAATCTCTCG;SOR=1.179;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=81;TCF=54;TCR=27;TR=38;WE=124132271;WS=124132253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,40:0.47:86
chr3	124195987	rs572145	T	C	506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=0;PP=440;SC=TAGACACTGGTGTCTGAGGGT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=17;WE=124195995;WS=124195978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	124201699	rs61740058	C	T	1918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=49;PP=1140;ReadPosRankSum=-1.640;SC=TCTCTTCCTACCTAATTAAGC;SOR=0.934;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=174;TCF=75;TCR=99;TR=82;WE=124201707;WS=124201689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,91:0.47:194
chr3	124281980	rs2256831	T	C	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=12;PP=197;ReadPosRankSum=1.986;SC=AAGGAGGCCATGAGCGCTGGC;SOR=0.602;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=44;TCF=17;TCR=27;TR=21;WE=124281988;WS=124281970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,25:0.51:49
chr3	124303786	rs2250757	G	C	6226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=91;NR=115;PP=2965;SC=GGTGCCTTCTGTTAGCCAGAC;SOR=1.022;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=206;TCF=91;TCR=115;TR=206;WE=124303794;WS=124303776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr3	124351316	rs1708303	G	A	2365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.479;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=51;PP=1403;ReadPosRankSum=0.228;SC=CCGAGTCCGTGGCCAACCTGC;SOR=0.628;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=209;TCF=110;TCR=99;TR=106;WE=124351324;WS=124351306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,116:0.50:232
chr3	124351424	rs1660038	T	C	1918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=40;PP=1187;ReadPosRankSum=-0.926;SC=TGCGTCGGCTTAACAGCGGGA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=196;TCF=100;TCR=96;TR=81;WE=124351432;WS=124351414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,94:0.42:222
chr3	124352573	rs652046	A	G	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=334;ReadPosRankSum=0.540;SC=GGAAATTGCGACTGAACAGTT;SOR=0.965;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=38;TCF=35;TCR=3;TR=17;WE=124352581;WS=124352563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr3	124369640	rs11372663	T	TA	3489.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.725;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.663;NF=14;NR=33;PP=2888;ReadPosRankSum=2.921;SC=TAAGCCTGTTTTTCTCTCTTT;SOR=0.637;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=113;TCF=31;TCR=82;TR=47;WE=124369658;WS=124369630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,94:0.47:202
chr3	124369650	rs2291988	T	C	1849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.790;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.091;NF=30;NR=34;PP=2879;ReadPosRankSum=2.957;SC=TTTCTCTCTTTTCAGAGTCTA;SOR=0.568;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=155;TCF=75;TCR=80;TR=64;WE=124369658;WS=124369630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,88:0.47:187
chr3	124374259	rs4677938	G	A	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.012;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=77;ReadPosRankSum=0.549;SC=TCTGGCCTTGGTGTCCTCAGC;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=5;WE=124374267;WS=124374257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr3	124374405	rs4677939	A	C	2126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.488;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=44;PP=1456;ReadPosRankSum=-1.779;SC=TTTTTGGCTTAACAATGAAGA;SOR=0.637;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=206;TCF=117;TCR=89;TR=97;WE=124374413;WS=124374395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,105:0.46:227
chr3	124376653	rs106520	G	A	2522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.245;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=69;PP=1637;ReadPosRankSum=-1.492;SC=TTAAGCACGTGAGTGTCTCCC;SOR=1.103;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=267;TCF=117;TCR=150;TR=112;WE=124376661;WS=124376643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,124:0.43:288
chr3	124377196	rs10804562	G	A	654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.977;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=11;PP=383;ReadPosRankSum=-1.036;SC=CTTTGTCCACGTGGAGGCCAG;SOR=0.551;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=60;TCF=38;TCR=22;TR=30;WE=124377204;WS=124377186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,32:0.52:62
chr3	124378386	rs333297	C	G	1132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=31;PP=878;SC=GTAGAGCTAGCGGTTCTGTCT;SOR=4.235;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=33;WE=124378394;WS=124378376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	124378412	rs10755078	A	G	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=211;ReadPosRankSum=-0.306;SC=ACACTGTCCCAAAGGACTGTG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=10;WE=124378420;WS=124378402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr3	124379641	rs333291	C	A	934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=1;PP=811;SC=AGCTACTCTACACCATTGCCA;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=29;WE=124379649;WS=124379631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	124379748	rs333290	G	C	6639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=135;NR=91;PP=2965;SC=CCACACTCTTGCCTGCTTCCC;SOR=1.037;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=226;TCF=135;TCR=91;TR=226;WE=124379756;WS=124379738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr3	124379817	rs333289	T	C	8346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=146;NR=141;PP=2965;SC=GTTCAGATATTGAGGTGAGTT;SOR=0.744;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=287;TCF=146;TCR=141;TR=287;WE=124379825;WS=124379807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,320:1.00:320
chr3	124393595	rs333355	A	G	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=314;ReadPosRankSum=-2.874;SC=CCACAGAACCAGTGTTTGAGT;SOR=1.022;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=17;WE=124393603;WS=124393585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,18:0.75:24
chr3	124393610	rs333354	A	G	417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=12;PP=301;SC=TTGAGTGCTGACACCATATGC;SOR=3.126;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=124393618;WS=124393600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	124396338	rs333349	T	G	3286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=32;PP=1899;SC=CACACATTAGTTCTTGTCCCA;SOR=1.382;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=71;TCR=32;TR=103;WE=124396346;WS=124396328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr3	124397249	rs35286809	AT	A	352.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=1.494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.50;MQRankSum=1.069;QD=11.76;ReadPosRankSum=1.741;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,20:0.67:30
chr3	124397321	rs3830412	AT	A	62.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=40;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=80;ReadPosRankSum=-1.834;SC=AGATCAATTTATTTTTTATCT;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=6;WE=124397329;WS=124397311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr3	124398571	rs821365	A	T	1655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=33;PP=846;SC=AGATTTTTTTAAAAAACAAAA;SOR=4.664;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=3;TCR=34;TR=36;WE=124398579;WS=124398561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr3	124398589	rs821364	A	C	1141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=19;PP=545;SC=AAAACTTGTTATCTTGAATGC;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=124398597;WS=124398579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	124412524	rs2289428	T	G	1130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=4.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.19;ReadPosRankSum=-0.094;SOR=0.377;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,55:0.50:111
chr3	124412634	rs333283	G	T	3957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=64;NR=68;PP=2208;SC=AATTTTCTGTGTCTTTTTGTT;SOR=1.007;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=64;TCR=68;TR=132;WE=124412642;WS=124412624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr3	124412691	rs16835881	G	T	1155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.870;HP=5;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=26;PP=604;ReadPosRankSum=-0.030;SC=GAGTTAAAAAGCATTAGAATT;SOR=0.458;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=81;TCF=29;TCR=52;TR=44;WE=124412699;WS=124412681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,52:0.57:91
chr3	124416698	rs333277	A	G	252.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=7;PP=170;SC=GAATAGAGACAGGCTATTGCT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=124416706;WS=124416688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	124418879	rs56047676	T	C	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.063;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=17;PP=303;ReadPosRankSum=-0.944;SC=TTCCAGAATATGGTGAGTCCC;SOR=0.481;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=57;TCF=18;TCR=39;TR=27;WE=124418887;WS=124418869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,33:0.51:65
chr3	124449291	rs1139538	A	G	987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.112;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=9;PP=644;ReadPosRankSum=-0.568;SC=GCGCCTGGGAATTTGAAGCAA;SOR=0.218;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=69;TCF=56;TCR=13;TR=39;WE=124449299;WS=124449281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,42:0.58:72
chr3	124450258	rs4678146	T	C	490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.82;ReadPosRankSum=-1.206;SOR=0.555;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,25:0.50:50
chr3	124458816	rs694897	C	G	742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=12;PP=585;ReadPosRankSum=0.350;SC=TTGGACAAGACGTTAGAGGTT;SOR=0.755;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=63;TCF=42;TCR=21;TR=34;WE=124458824;WS=124458806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,34:0.47:72
chr3	124462646	rs17843844	C	T	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=282;ReadPosRankSum=-0.250;SC=AAAAGGGGAACGAAAGTAGGG;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=13;WE=124462654;WS=124462644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr3	124462986	rs3836305	CT	C	1325.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.909;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.035;NF=1;NR=26;PP=1003;ReadPosRankSum=-1.457;SC=ATATGTGGTCCTCCTGAAAGT;SOR=0.562;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=59;TCF=2;TCR=57;TR=27;WE=124462994;WS=124462976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,43:0.49:87
chr3	124482494	rs150512726	TTTGTTGAAC	T	3531.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.568;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=34;PP=2973;ReadPosRankSum=1.420;SC=CATTGTAGGATTTGTTGAACT;SOR=1.032;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=124;TCF=27;TCR=97;TR=47;WE=124482510;WS=124482484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,95:0.44:218
chr3	124515496	rs61736433	C	T	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=11;PP=322;ReadPosRankSum=-0.729;SC=GTCCCGCTCCCGTTGCACCTG;SOR=0.656;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=75;TCF=42;TCR=33;TR=29;WE=124515504;WS=124515486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,36:0.41:87
chr3	124605736	rs6438861	T	C	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.15;ReadPosRankSum=-0.555;SOR=0.688;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,19:0.33:57
chr3	124627024	rs1127233	T	G	1017.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.769;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=13;PP=655;ReadPosRankSum=1.451;SC=TGCTGCTGTGTCTTGAATAGG;SOR=0.468;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=95;TCF=70;TCR=25;TR=43;WE=124627032;WS=124627014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,48:0.45:106
chr3	124632127	rs2270780	A	G	698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=16;PP=340;ReadPosRankSum=0.309;SC=TTCAGAAACAATCTCTTTAAC;SOR=0.818;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=53;TCF=27;TCR=26;TR=31;WE=124632135;WS=124632117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,35:0.59:59
chr3	124635404	rs4679164	G	A	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=78;ReadPosRankSum=-0.805;SC=CCAGACTCCCGAATCTCCCGG;SOR=0.941;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=30;TCF=11;TCR=19;TR=8;WE=124635412;WS=124635394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,10:0.29:34
chr3	124642586	rs3841931	CT	C	1182.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.347;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.724;NF=0;NR=36;PP=1302;ReadPosRankSum=-0.690;SC=TGCCTCCCCCCTGGGCCCTTT;SOR=1.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=68;TCF=0;TCR=68;TR=36;WE=124642594;WS=124642576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,55:0.49:112
chr3	124646594	rs4679392	A	G	3169.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-0.892;NF=74;NR=67;PP=1952;ReadPosRankSum=3.491;SC=AGCAGTAGGTATAGGAATTGT;SOR=0.714;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=271;TCF=142;TCR=129;TR=141;WE=124646602;WS=124646584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,150:0.51:296
chr3	124646705	rs10630030	A	AAAG	9928.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=87;PP=2924;SC=AGCTGTTGGGAAAGGTGTATT;SOR=0.919;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=15;TCR=93;TR=101;WE=124646713;WS=124646695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr3	124653670	rs116516705	A	G	1176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=28;PP=704;ReadPosRankSum=-1.316;SC=GTCAAACCACAGAAAGGCAAT;SOR=0.754;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=93;TCF=40;TCR=53;TR=48;WE=124653678;WS=124653660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,55:0.51:108
chr3	124653710	rs10934701	A	G	1430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=31;PP=880;SC=AATACCATAGATCTCTTCCGA;SOR=2.004;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=15;TCR=31;TR=46;WE=124653718;WS=124653700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr3	124692689	rs2270778	C	T	3494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.626;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=74;PP=2025;ReadPosRankSum=2.613;SC=ATTCAGCATACGGGGACATTT;SOR=0.637;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=294;TCF=150;TCR=144;TR=159;WE=124692697;WS=124692679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,171:0.53:321
chr3	124692785	rs2270779	C	T	829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.040;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=26;PP=595;ReadPosRankSum=-0.959;SC=AGCTCAATTCCGTAAAGAAGT;SOR=0.485;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=71;TCF=19;TCR=52;TR=37;WE=124692793;WS=124692775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,37:0.51:73
chr3	124728472	rs6438868	C	G	1035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=8;PP=651;ReadPosRankSum=-0.553;SC=TTTTGGTTAGCAAGAAAAATA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=65;TCF=51;TCR=14;TR=37;WE=124728480;WS=124728462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,42:0.58:72
chr3	124728626	rs6438869	A	G	3360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.405;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=76;PP=2071;ReadPosRankSum=-1.044;SC=ATTGTTGCACATGGCTGTGGA;SOR=0.728;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=296;TCF=148;TCR=148;TR=150;WE=124728634;WS=124728616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,164:0.51:319
chr3	124729193	rs6784454	T	G	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=4.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.078;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=204;ReadPosRankSum=-0.166;SC=AAACAGTGTATTTGTCCACAT;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=10;WE=124729201;WS=124729183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr3	124731485	rs10804567	C	G	1971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.807;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=40;PP=1197;ReadPosRankSum=0.162;SC=GAAGAGGACACTGTTGTTGGT;SOR=0.791;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=161;TCF=82;TCR=79;TR=77;WE=124731493;WS=124731475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,89:0.49:182
chr3	124732618	rs6790837	A	G	2658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=52;PP=1729;ReadPosRankSum=0.833;SC=CTGAGCATGAAAAAAGGAGGA;SOR=0.712;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=216;TCF=108;TCR=108;TR=103;WE=124732626;WS=124732608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,116:0.49:237
chr3	124732842	rs6438871	C	A	961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.556;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=31;PP=730;ReadPosRankSum=0.081;SC=CGACTGTAAACGGAAAAGCCA;SOR=0.405;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=55;TCF=7;TCR=48;TR=36;WE=124732850;WS=124732832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,38:0.64:59
chr3	124733649	rs6438873	T	G	1127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.419;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=27;PP=675;ReadPosRankSum=-0.712;SC=TGTTTCTTGGTGCATGGCCGC;SOR=0.685;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=117;TCF=63;TCR=54;TR=54;WE=124733657;WS=124733639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,58:0.46:125
chr3	124738107	rs59232004	C	T	1970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.580;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=26;PP=1208;ReadPosRankSum=-1.049;SC=AAAACTCACTCGAACGTTCTC;SOR=0.906;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=173;TCF=110;TCR=63;TR=80;WE=124738115;WS=124738097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,90:0.48:189
chr3	124739892	rs6438874	G	A	2752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.766;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.04;MQRankSum=-0.996;NF=53;NR=64;PP=1709;ReadPosRankSum=-0.007;SC=TGAACACGGTGGCAACATGCA;SOR=0.879;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=228;TCF=110;TCR=118;TR=117;WE=124739900;WS=124739882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,127:0.50:253
chr3	124746049	rs2981546	A	G	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.969;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=192;ReadPosRankSum=2.292;SC=TGGCACTCACATGAGGAAAGG;SOR=2.120;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=11;WE=124746057;WS=124746039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,14:0.37:38
chr3	124746182	rs2333041	C	A	1439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=25;PP=754;ReadPosRankSum=0.286;SC=GAAGAAAGGACGGGCTCCAAG;SOR=0.734;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=141;TCF=81;TCR=60;TR=60;WE=124746190;WS=124746172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,73:0.43:171
chr3	124746347	rs4404487	T	C	2327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.505;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=56;PP=1193;ReadPosRankSum=1.547;SC=GAAGACTTTCTGAGGCTGAAA;SOR=0.793;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=216;TCF=100;TCR=116;TR=102;WE=124746355;WS=124746337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,119:0.46:256
chr3	124748226	rs2860440	G	A	1321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=24;PP=653;ReadPosRankSum=1.334;SC=GAACCATCACGCCCTCTTTGG;SOR=0.691;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=106;TCF=58;TCR=48;TR=54;WE=124748234;WS=124748216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,65:0.53:122
chr3	124774665	.	G	GCAT	31.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.53;ReadPosRankSum=0.366;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,2:0.29:7
chr3	124774779	rs200147885	A	AGGGCAGC	276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=2;PP=133;SC=GCGCGGGGCGAGGGCAGCGGG;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=2;WE=124774787;WS=124774769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	124802677	rs1574340	A	G	626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.558;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=452;ReadPosRankSum=0.674;SC=GAAGGTCCTGAGCTTGGGTCC;SOR=0.162;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=22;WE=124802685;WS=124802667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,24:0.73:33
chr3	124802881	rs2981483	A	G	2603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FS=6.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.17;ReadPosRankSum=-0.633;SOR=0.655;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:109,105:0.49:214
chr3	124802888	rs2981482	C	T	4203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FS=7.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.02;ReadPosRankSum=-0.315;SOR=0.563;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,111:0.50:221
chr3	124803043	rs2981481	G	A	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.905;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.853;NF=2;NR=15;PP=331;ReadPosRankSum=-0.206;SC=TATATGTACAGGTATATATGA;SOR=0.201;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=17;WE=124803051;WS=124803033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr3	124837684	rs621383	T	C	2879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=48;PP=1319;SC=AAGACGAAGATGATGTACAGA;SOR=0.970;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=45;TCR=48;TR=93;WE=124837692;WS=124837674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr3	124839470	rs863642	G	A	8911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=152;NR=153;PP=2965;SC=CAGGGAGCCCGGGGGAATGCT;SOR=0.754;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=305;TCF=152;TCR=153;TR=305;WE=124839478;WS=124839460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,334:1.00:334
chr3	124854425	rs702048	T	C	1014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=5;PP=716;SC=ATACCAAGAGTACCTGCAGGC;SOR=2.584;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=33;WE=124854433;WS=124854415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	124870443	rs73191256	C	T	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=68;ReadPosRankSum=-0.801;SC=AAGGGGCAGCCCTGCTTCCGG;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=6;WE=124870451;WS=124870433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr3	124896861	rs545103	C	G	1487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=35;PP=992;SC=GGACAGAAAGCCATGGGCCCA;SOR=2.348;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=12;TCR=35;TR=47;WE=124896869;WS=124896851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr3	124911555	rs73193442	C	T	2733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.503;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=61;PP=1605;ReadPosRankSum=-0.661;SC=GAAAATATAACTGGTTTAAAA;SOR=0.820;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=225;TCF=108;TCR=117;TR=113;WE=124911563;WS=124911545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,132:0.52:256
chr3	124912207	rs13322132	C	T	967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.674;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=20;PP=662;ReadPosRankSum=-0.198;SC=GAGTGAGACCCTGTCTCAAAA;SOR=0.753;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=47;TCR=38;TR=44;WE=124912215;WS=124912197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,47:0.51:93
chr3	124930044	rs673881	A	G	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.023;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=73;ReadPosRankSum=-1.550;SC=AGTTAATTACATCTAAAGGGT;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=6;WE=124930052;WS=124930034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr3	124930408	rs686088	A	G	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.842;NF=0;NR=7;PP=128;ReadPosRankSum=0.573;SC=TTTGGTACCCAGGTAGATCCC;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=7;WE=124930416;WS=124930398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr3	124951171	.	CTTT	C	81.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.516;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.43;ReadPosRankSum=-0.522;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr3	124951821	rs1053738	C	T	3261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.976;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=72;PP=2048;ReadPosRankSum=-0.175;SC=CATTCTCTGACGGGGTGACCT;SOR=0.830;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=257;TCF=126;TCR=131;TR=136;WE=124951829;WS=124951811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,149:0.52:284
chr3	125179732	rs112803860	C	CATAA	151.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=343;ReadPosRankSum=-0.469;SC=ACACACATTGCATAGAGTTAC;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=7;WE=125179740;WS=125179722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr3	125195707	rs6785216	T	C	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.195;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=21;ReadPosRankSum=0.543;SC=AACTTGGAAATAGAAAAAAGA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=3;WE=125195715;WS=125195697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr3	125223456	rs2076724	C	T	2445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.046;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=45;PP=1401;ReadPosRankSum=-0.503;SC=GGTGTAATTTCTGTTACCCAC;SOR=0.807;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=196;TCF=111;TCR=85;TR=106;WE=125223464;WS=125223446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,117:0.53:219
chr3	125238792	rs56381562	G	A	598.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.862;NF=22;NR=10;PP=491;ReadPosRankSum=1.700;SC=GGCCCGGCCCGGCCCAGCCCA;SOR=0.746;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=61;TCF=41;TCR=20;TR=32;WE=125238800;WS=125238782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,28:0.50:56
chr3	125270983	rs150910514	GTGTATA	G	1628.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.996;NF=18;NR=16;PP=1228;ReadPosRankSum=-0.902;SC=ATATGTGTGTGTGTATATATA;SOR=0.616;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=54;TCF=30;TCR=24;TR=34;WE=125271000;WS=125270973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,52:0.62:84
chr3	125272968	rs184242634	C	A	2407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.456;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=51;PP=1402;ReadPosRankSum=1.443;SC=CTCAAACCCCCAACTCCACAC;SOR=0.729;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=225;TCF=116;TCR=109;TR=106;WE=125272976;WS=125272958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,119:0.47:252
chr3	125286215	rs16836866	C	T	2225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.561;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=33;PP=1427;ReadPosRankSum=-0.266;SC=ATTGTGAAGCCCTACCTTTAA;SOR=0.616;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=171;TCF=110;TCR=61;TR=93;WE=125286223;WS=125286205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,102:0.55:187
chr3	125301711	rs2979382	C	G	1779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=28;PP=1079;ReadPosRankSum=-0.629;SC=CCTATTCCTGCTCTCTTAGGA;SOR=0.676;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=166;TCF=103;TCR=63;TR=76;WE=125301719;WS=125301701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,85:0.45:188
chr3	125313710	rs113486299	CT	C	815.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.717;NF=2;NR=21;PP=238;ReadPosRankSum=0.791;SC=CTGTAGGTGACTTTTTTTTTT;SOR=0.735;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=43;TCF=3;TCR=40;TR=23;WE=125313719;WS=125313700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,41:0.69:59
chr3	125701099	rs2270986	T	C	1882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.581;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.393;NF=45;NR=30;PP=823;ReadPosRankSum=0.133;SC=CCTCATTTTATGTAACTTTTA;SOR=0.788;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=145;TCF=86;TCR=59;TR=75;WE=125701107;WS=125701089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,91:0.55:166
chr3	125725268	rs111477552	TAACA	T	3075.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.855;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.983;NF=16;NR=25;PP=1754;ReadPosRankSum=1.875;SC=AGGTTTTTGCTAACAAACAAA;SOR=0.871;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=117;TCF=42;TCR=75;TR=41;WE=125725279;WS=125725258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,83:0.44:190
chr3	125725559	rs1044215	C	G	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=220;ReadPosRankSum=-0.812;SC=CTCTTCTTTACCTTCTCAGGC;SOR=0.307;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=11;WE=125725567;WS=125725549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr3	125726048	rs2279819	G	C	3728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.301;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=64;PP=2298;ReadPosRankSum=-0.680;SC=TCACTTCTGCGAGGTACAGCA;SOR=0.458;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=128;TCF=64;TCR=64;TR=127;WE=125726056;WS=125726038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,138:0.99:139
chr3	125734272	rs2279820	G	A	989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.372;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=10;PP=693;ReadPosRankSum=1.508;SC=CTGCTGTTCCGGTCCAACCCA;SOR=1.730;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=77;TCF=54;TCR=23;TR=40;WE=125734280;WS=125734262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,43:0.52:83
chr3	125734308	rs2279821	G	A	1655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.322;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=27;PP=995;ReadPosRankSum=-1.046;SC=CCAACCCAGGGACCACATGGG;SOR=0.574;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=137;TCF=89;TCR=48;TR=72;WE=125734316;WS=125734298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,78:0.52:149
chr3	125734465	rs9862310	G	A	2703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.451;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=63;PP=1541;ReadPosRankSum=-0.126;SC=TACACTTACAGTGGCCCTGCA;SOR=0.746;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=232;TCF=106;TCR=126;TR=115;WE=125734473;WS=125734455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,131:0.49:265
chr3	125741592	rs3817079	C	T	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.254;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=348;ReadPosRankSum=-0.433;SC=CCCCCCTCCACGGAGCCTTTG;SOR=1.743;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=39;TCF=31;TCR=8;TR=21;WE=125741600;WS=125741582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,22:0.52:42
chr3	125741901	rs2270984	A	G	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.515;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=118;ReadPosRankSum=-1.294;SC=GAGGCTGCTCATTAACTTGCC;SOR=0.191;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=10;WE=125741909;WS=125741891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr3	125741925	rs2270983	T	G	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=38;ReadPosRankSum=0.393;SC=CTCCACAAAGTCCTTGACGTG;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=4;WE=125741933;WS=125741915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr3	125745433	rs7646705	C	T	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.430;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=208;ReadPosRankSum=0.559;SC=GCTACTGCCTCCTTTCCCTTA;SOR=1.609;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=12;WE=125745441;WS=125745423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr3	125775228	rs7613944	T	C	3146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=43;PP=1653;ReadPosRankSum=-1.188;SC=CCAGGCCGGCTGTCATCATGC;SOR=1.028;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=114;TCF=70;TCR=44;TR=112;WE=125775236;WS=125775218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,122:0.98:124
chr3	125775428	rs6438964	G	A	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=316;ReadPosRankSum=1.761;SC=CCAGGAGCACGAAGTCAGAGC;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=38;TCF=10;TCR=28;TR=19;WE=125775436;WS=125775418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr3	125786662	rs36125006	G	GA	443.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.943;HP=11;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.901;NF=5;NR=12;PP=249;ReadPosRankSum=-0.835;SC=CCAATATATAGAAAAAAAAAA;SOR=0.397;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=38;TCF=19;TCR=19;TR=17;WE=125786670;WS=125786652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,21:0.58:36
chr3	125786695	rs4308225	G	A	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.983;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.867;NF=24;NR=12;PP=584;ReadPosRankSum=-1.727;SC=AGGACTGCCCGACAACCTTTA;SOR=0.507;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=59;TCF=41;TCR=18;TR=36;WE=125786703;WS=125786685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,40:0.59:68
chr3	125786760	rs4308226	G	A	1720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.857;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=27;PP=903;ReadPosRankSum=1.581;SC=GCAGTGCCCCGCTCCCTGTCC;SOR=0.495;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=137;TCF=88;TCR=49;TR=72;WE=125786768;WS=125786750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,83:0.53:157
chr3	125786879	rs4234270	T	C	5463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=100;PP=2912;SC=ATGGACCAGGTGGTCTCCCTG;SOR=0.824;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=191;TCF=91;TCR=100;TR=191;WE=125786887;WS=125786869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr3	125824334	rs4646755	T	G	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=172;ReadPosRankSum=0.970;SC=GCCTCCTGGCTGGAGTGTCTC;SOR=0.914;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=12;WE=125824342;WS=125824324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr3	125824382	rs10934744	C	A	813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=10;PP=566;ReadPosRankSum=-1.451;SC=CCAGCACGACCCCCCTCTGCA;SOR=0.808;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=69;TCF=51;TCR=18;TR=37;WE=125824390;WS=125824372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,37:0.52:71
chr3	125826059	rs1127717	T	C	2965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=72;PP=1994;ReadPosRankSum=-0.316;SC=GTCTTCCACGTCTGTGAAAAC;SOR=0.704;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=219;TCF=103;TCR=116;TR=130;WE=125826067;WS=125826049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,139:0.57:246
chr3	125831572	rs4646744	GGC	G	513.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.429;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=356;ReadPosRankSum=1.029;SC=CCTCCAGCCAGGCGCTGCTGT;SOR=0.990;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=10;WE=125831581;WS=125831562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,15:0.37:41
chr3	125843400	rs3217578	A	AG	286.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.703;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=224;ReadPosRankSum=-0.472;SC=GCAAGCTGGGAGAGTAGCTGC;SOR=0.146;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=7;WE=125843408;WS=125843390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr3	125844718	rs2278756	G	A	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.153;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=228;ReadPosRankSum=-0.042;SC=GGCAGCTCACGCCTGCTGTTT;SOR=0.083;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=15;WE=125844726;WS=125844708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr3	125848911	rs1868125	A	G	429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=299;SC=CCTTACAACAATGCCTGGCAT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=125848919;WS=125848901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	125848945	rs2365002	T	C	699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=3;PP=407;SC=AAGAAGCACATGGATGGCTGT;SOR=2.215;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=125848953;WS=125848935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	125849031	rs873696	C	T	2031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=31;PP=1256;SC=TGGAAAGCACCGCGAGGCTGC;SOR=0.804;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=38;TCR=31;TR=69;WE=125849039;WS=125849021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr3	125849238	rs2002287	G	A	2185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=37;NR=42;PP=1332;SC=AAGTCAAAGCGACCAGCTTAG;SOR=0.872;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=37;TCR=42;TR=79;WE=125849246;WS=125849228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr3	125850101	rs4646733	CA	TG	995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=2;PP=1047;SC=AAACAGGTGTCATTCCAAGCC;SOR=3.912;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=20;WE=125850110;WS=125850091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	125850169	rs3821451	T	C	2696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=60;NR=40;PP=1740;SC=CTTGGAGTTCTCCTATATGGC;SOR=1.094;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=60;TCR=40;TR=100;WE=125850177;WS=125850159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr3	125850193	rs3816366	A	G	3915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=61;PP=2274;SC=GCCAGTCTGCATGTGCTCACA;SOR=0.875;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=83;TCR=61;TR=144;WE=125850201;WS=125850183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr3	125850381	rs2305228	A	G	1562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=33;PP=1032;SC=TGCCAACCTGACCAGGGTGAG;SOR=1.835;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=16;TCR=33;TR=49;WE=125850389;WS=125850371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr3	125850434	rs2305227	C	T	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=80;ReadPosRankSum=-1.416;SC=GCCTCATCTGCCCTCACAAGG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=6;WE=125850442;WS=125850424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr3	125854311	rs3216713	TC	T	1033.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.641;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.681;NF=15;NR=13;PP=573;ReadPosRankSum=-2.583;SC=TCCACAGAAGTCCCCCCCGTG;SOR=0.970;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=77;TCF=38;TCR=39;TR=28;WE=125854319;WS=125854301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,45:0.42:107
chr3	125854409	rs2276724	T	C	2545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.233;NF=67;NR=49;PP=1452;ReadPosRankSum=-0.466;SC=TCCCGCGCACTGATCTTCCCC;SOR=0.717;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=267;TCF=153;TCR=114;TR=116;WE=125854417;WS=125854399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,129:0.43:298
chr3	125855599	rs2305229	G	T	1722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=29;PP=1010;ReadPosRankSum=-1.545;SC=TGCTGGGCCTGCACTCACACT;SOR=0.673;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=142;TCF=86;TCR=56;TR=70;WE=125855607;WS=125855589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,80:0.50:161
chr3	125856695	rs2305230	C	A	1486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.341;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=30;PP=1075;ReadPosRankSum=1.429;SC=CGTCCCCTCGCAGCTTCCTCA;SOR=0.834;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=124;TCF=71;TCR=53;TR=70;WE=125856703;WS=125856685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,71:0.51:139
chr3	125856916	rs6799991	A	G	336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=11;PP=272;SC=CCCAGCACCGAGAGGTAGCCA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=125856924;WS=125856906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	125865766	rs2886059	C	A	841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.024;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=19;PP=444;ReadPosRankSum=2.020;SC=CGCTGCCAAACACTCTGCAAA;SOR=0.476;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=55;TCF=22;TCR=33;TR=33;WE=125865774;WS=125865756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,39:0.61:64
chr3	125874388	rs2276731	C	T	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=227;ReadPosRankSum=0.109;SC=CAATAGGACCCTGCCTCCTTC;SOR=0.889;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=40;TCF=9;TCR=31;TR=16;WE=125874396;WS=125874378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,15:0.38:39
chr3	126133239	rs6775131	C	T	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=70;ReadPosRankSum=-1.333;SC=TGTCACCACTCTTCTTGGGTC;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=10;TCR=22;TR=9;WE=126133247;WS=126133229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr3	126135070	rs143567171	C	CCGCGTCCCCGGCCTCAGGTCCG	1090.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=1762;ReadPosRankSum=0.179;SC=GCGCGCAAACCCGCGTCCCTA;SOR=1.609;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=8;WE=126135078;WS=126135060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr3	126135365	rs6439010	G	T	1548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.594;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=37;PP=931;ReadPosRankSum=-2.078;SC=CGTCCCCTCCGGCGCGGGGGG;SOR=0.761;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=145;TCF=65;TCR=80;TR=64;WE=126135373;WS=126135355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,71:0.45:158
chr3	126137558	rs4679242	C	T	1650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=34;PP=882;ReadPosRankSum=0.687;SC=AGAAGGACGCCGCCTTGTTCG;SOR=0.699;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=60;TCR=65;TR=67;WE=126137566;WS=126137548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,75:0.53:141
chr3	126138778	rs2271630	T	C	2713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=56;NR=28;PP=1319;SC=TGCTGAAGCTTGGCTGCAGCT;SOR=0.985;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=56;TCR=28;TR=84;WE=126138786;WS=126138768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr3	126138889	rs1877967	G	T	1206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.752;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=31;PP=683;ReadPosRankSum=0.597;SC=CCAGCCTGAGGAGGAGCCTGG;SOR=1.085;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=93;TCF=42;TCR=51;TR=53;WE=126138897;WS=126138879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,58:0.58:100
chr3	126142496	rs13064828	T	C	1025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=26;PP=658;ReadPosRankSum=-1.022;SC=ATGTAGGTGCTATGCGGTGGC;SOR=0.723;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=112;TCF=46;TCR=66;TR=44;WE=126142504;WS=126142486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,50:0.41:121
chr3	126151797	rs35133442	T	C	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=26;ReadPosRankSum=-1.150;SC=CCCATGATCCTTCAGCCCTCA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=3;WE=126151805;WS=126151794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr3	126157464	rs11444454	T	TG	1080.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=19;PP=877;SC=TGTTCTTTGATGAAAAATGAA;SOR=1.911;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=126157472;WS=126157454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr3	126158622	rs1799404	A	C	3439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=61;PP=1617;SC=AGTGCAGCAAAGGTCCTCGTC;SOR=1.102;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=108;TCF=47;TCR=61;TR=108;WE=126158630;WS=126158612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr3	126160601	rs4679121	C	T	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=194;ReadPosRankSum=-0.524;SC=GACTGGCCAGCTCTCACCTGC;SOR=0.507;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=37;TCR=2;TR=14;WE=126160609;WS=126160591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,13:0.34:38
chr3	126169091	rs777493	T	C	5188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=108;NR=74;PP=2868;SC=CAACCTTGGATGCGTAAGGGT;SOR=1.033;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=183;TCF=109;TCR=74;TR=182;WE=126169099;WS=126169081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr3	126169230	rs777494	C	T	7310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=115;NR=133;PP=2965;SC=TAGAGATCCACGCACCCTCCC;SOR=0.851;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=248;TCF=115;TCR=133;TR=248;WE=126169238;WS=126169220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,270:1.00:270
chr3	126169472	rs777495	T	C	488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=11;PP=357;SC=CCTACCCGCATCTCCCTTCCT;SOR=2.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=14;WE=126169480;WS=126169462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	126184941	rs1799389	C	T	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.187;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=83;ReadPosRankSum=-0.818;SC=GGCACTGGCACTGTTCCCGTT;SOR=0.223;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=7;WE=126184949;WS=126184938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr3	126185238	rs1687463	C	T	1728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.288;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=41;PP=1010;ReadPosRankSum=-0.288;SC=TGACACTTCCCCATCAGATCA;SOR=0.583;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=139;TCF=57;TCR=82;TR=72;WE=126185246;WS=126185228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,80:0.52:153
chr3	126189919	rs777499	A	G	887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=21;PP=519;ReadPosRankSum=0.088;SC=AACTCACCATAATTCTTTAAA;SOR=0.768;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=43;TCR=51;TR=39;WE=126189927;WS=126189909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,44:0.41:107
chr3	126191011	rs62264721	G	A	2438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.477;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=48;PP=1405;ReadPosRankSum=0.392;SC=TGGCTCCGCAGGTGAATTTTC;SOR=0.646;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=203;TCF=106;TCR=97;TR=98;WE=126191019;WS=126191001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,112:0.48:233
chr3	126194076	rs812367	T	C	1918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.143;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=56;PP=1021;ReadPosRankSum=0.775;SC=AGCCCTCCAGTGGGCACTTGA;SOR=0.844;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=235;TCF=106;TCR=129;TR=98;WE=126194084;WS=126194066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,107:0.42:257
chr3	126194357	rs7624748	G	C	2687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.59;SOR=1.847;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr3	126207222	rs777483	A	G	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=221;ReadPosRankSum=-0.058;SC=CTGCTAGGCCAGAAGGATGGG;SOR=0.622;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=12;WE=126207230;WS=126207212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr3	126208249	rs777479	A	C	838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=26;PP=617;ReadPosRankSum=-1.090;SC=GCTGTCAGCCAACAGTGTCCA;SOR=0.730;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=16;TCR=52;TR=34;WE=126208257;WS=126208239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,35:0.51:69
chr3	126211186	rs6783680	G	A	1204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.083;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=21;PP=673;ReadPosRankSum=0.959;SC=CGAGGCACACGCAGGAAGGCC;SOR=0.330;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=103;TCF=68;TCR=35;TR=57;WE=126211194;WS=126211176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,59:0.54:109
chr3	126211479	rs2307882	C	CCTCT	2105.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=29;PP=1735;SC=AGCCTGAGCGCCTAACAAGGT;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=30;WE=126211487;WS=126211469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr3	126215130	rs6797423	G	A	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=148;ReadPosRankSum=-0.312;SC=AGCAGTGCCAGTGGCCCCATG;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=10;WE=126215138;WS=126215120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr3	126216829	rs13098666	T	A	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.955;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=199;ReadPosRankSum=-0.488;SC=TAGAAGCTTGTCTCTATGGAG;SOR=0.867;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=59;TCF=38;TCR=21;TR=20;WE=126216837;WS=126216819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,26:0.38:68
chr3	126218167	rs1168595	G	A	1768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.007;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=30;PP=950;ReadPosRankSum=0.982;SC=TGTGGCAGCCGCCCATCACTC;SOR=0.434;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=139;TCF=89;TCR=50;TR=80;WE=126218175;WS=126218157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,87:0.59:148
chr3	126218769	rs35907154	T	C	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.588;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=101;ReadPosRankSum=2.713;SC=AGAGGCACAGTGAAGCCTCGG;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=6;WE=126218777;WS=126218765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr3	126218788	rs6774768	T	C	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.076;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=122;ReadPosRankSum=1.349;SC=GGTCAGGATTTGCTGGGCCAC;SOR=0.124;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=11;WE=126218796;WS=126218778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr3	126219030	rs13072404	T	C	1419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=2.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.007;QD=9.53;ReadPosRankSum=1.357;SOR=0.484;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,74:0.50:149
chr3	126219086	rs13092625	A	G	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=17;PP=344;ReadPosRankSum=1.796;SC=CATGCTCCCCACCAACTTCCA;SOR=0.665;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=46;TCF=17;TCR=29;TR=28;WE=126219094;WS=126219076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,30:0.64:47
chr3	126219117	rs13092793	C	T	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=148;ReadPosRankSum=1.302;SC=CTGGACTGCTCCTGCTCCTCG;SOR=0.509;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=10;WE=126219125;WS=126219107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr3	126219973	rs1177565	T	C	2133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=14;PP=1408;SC=CTTTGTGTCCTGGCAGCTCCT;SOR=2.432;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=69;TCF=54;TCR=15;TR=68;WE=126219981;WS=126219963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr3	126220539	rs9844797	A	G	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.225;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=4;PP=510;ReadPosRankSum=0.457;SC=ATATTTTGGGAAACAGAAGAT;SOR=1.127;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=63;TCF=51;TCR=12;TR=30;WE=126220547;WS=126220529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,34:0.47:72
chr3	126220845	rs7643584	G	A	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=255;ReadPosRankSum=0.667;SC=TCCTCAGCTCGGGGGTTGCGG;SOR=0.616;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=14;WE=126220853;WS=126220835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr3	126224480	.	A	AAGGG	1162.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.000;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.01;ReadPosRankSum=-1.639;SOR=0.963;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,31:0.37:83
chr3	126226518	rs9784244	C	T	2265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=43;PP=1273;ReadPosRankSum=-0.649;SC=AATATCACCACTTTGCTTTAT;SOR=0.675;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=204;TCF=114;TCR=90;TR=97;WE=126226526;WS=126226508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,114:0.48:238
chr3	126227185	rs16837531	G	A	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.892;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=10;PP=281;ReadPosRankSum=-0.866;SC=CTGTGGGTTTGTAAGCTCCTA;SOR=0.826;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=44;TCR=27;TR=26;WE=126227193;WS=126227175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,27:0.34:79
chr3	126228410	rs729456	G	A	1477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.693;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.192;NF=30;NR=33;PP=958;ReadPosRankSum=1.067;SC=GCTGGGCCTCGGTTTCCCTGG;SOR=0.799;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=107;TCF=52;TCR=55;TR=63;WE=126228418;WS=126228400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,69:0.58:119
chr3	126229665	rs139704433	G	A	533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=448;ReadPosRankSum=0.856;SC=AGAGGCAGTCGGGGCTGGGAC;SOR=0.927;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=44;TCF=11;TCR=33;TR=23;WE=126229673;WS=126229655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,22:0.50:44
chr3	126236348	rs1687480	T	C	2157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=27;PP=1352;SC=CAGCTCCCACTAAGAGGGCAG;SOR=1.223;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=46;TCR=27;TR=73;WE=126236356;WS=126236338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr3	126243419	rs7613347	A	C	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.807;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.70;ReadPosRankSum=1.050;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr3	126268953	rs869464	T	G	1076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=30;PP=682;ReadPosRankSum=-1.115;SC=ACGCCTGGCCTTCAGGACCCC;SOR=0.678;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=94;TCF=42;TCR=52;TR=51;WE=126268961;WS=126268943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,53:0.51:104
chr3	126270735	rs2291509	G	A	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=4.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.174;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=283;ReadPosRankSum=-0.943;SC=AAAGTGGCGCGTGCTGGGAGG;SOR=2.564;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=14;WE=126270743;WS=126270725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr3	126270757	rs13071443	G	T	1380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=8;PP=1037;SC=TAACATGAACGTCTGCATGCA;SOR=2.786;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=38;TCR=8;TR=46;WE=126270765;WS=126270747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr3	126328101	rs9856833	A	G	5304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=93;PP=2965;ReadPosRankSum=0.136;SC=CAGTAAAAGCATACAATAGAT;SOR=0.794;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=192;TCF=99;TCR=93;TR=190;WE=126328109;WS=126328091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,206:0.99:208
chr3	126329910	rs777241	A	G	6876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=130;NR=116;PP=2965;SC=TTATCTTTGCATAACAAGTGT;SOR=0.762;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=246;TCF=130;TCR=116;TR=246;WE=126329918;WS=126329900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr3	126340553	rs3732534	G	A	2936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=28;PP=1890;SC=ATCTTGATCAGGACATTATCT;SOR=1.802;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=94;TCF=66;TCR=28;TR=93;WE=126340561;WS=126340543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr3	126365127	rs11453652	C	CT	2510.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=44;PP=1970;SC=GTGAGTTAAACAAAGTGTTAC;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=46;TCF=2;TCR=44;TR=46;WE=126365135;WS=126365117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr3	126373994	rs3108755	A	G	3222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=49;PP=1923;SC=CCGCCCCCCAACACCGCCCCG;SOR=0.710;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=102;TCF=53;TCR=49;TR=102;WE=126374002;WS=126373984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr3	126633419	rs2303994	C	G	2234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=20;PP=1289;SC=CTTTGATGCCCGTCAAGAAAT;SOR=1.725;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=50;TCR=20;TR=70;WE=126633427;WS=126633409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr3	126644974	rs732462	G	C	909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=2;PP=653;SC=CTGAAAGGCTGTCTAAAATCC;SOR=3.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=27;WE=126644982;WS=126644964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr3	126679121	rs113706892	G	C	1812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=44;PP=1085;ReadPosRankSum=-0.396;SC=CACAGCCACTGTGCCCTGCCG;SOR=0.643;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=128;TCF=46;TCR=82;TR=71;WE=126679129;WS=126679105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,78:0.55:141
chr3	126724881	rs12489348	G	C	4035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=53;PP=2136;SC=TGGGAGTCCTGGGCAAGCAGT;SOR=1.076;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=138;TCF=85;TCR=53;TR=137;WE=126724889;WS=126724871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr3	126737268	rs4679323	C	A	4854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=83;NR=70;PP=2521;SC=TGGCTGTGCTCATCGCCTACA;SOR=0.726;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=153;TCF=83;TCR=70;TR=153;WE=126737276;WS=126737258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr3	126739012	rs891762	G	T	2402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=19;PP=1589;SC=GGCCACCAGGGCATGCTGCCC;SOR=2.275;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=59;TCR=19;TR=78;WE=126739020;WS=126739002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr3	126739291	rs6439030	T	C	1913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=48;PP=1175;SC=GCAGCCTGTGTGGCCTGGGGG;SOR=1.917;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=21;TCR=48;TR=69;WE=126739299;WS=126739281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr3	126751689	rs6439031	G	A	5806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=89;NR=118;PP=2965;SC=GGTGAACACCGTGGGAGCCCA;SOR=1.091;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=207;TCF=89;TCR=118;TR=207;WE=126751697;WS=126751679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr3	126880488	rs7625800	T	C	2433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=63;NR=11;PP=1674;SC=CCTGCCCCTCTCTCTGCCTGG;SOR=2.777;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=63;TCR=11;TR=74;WE=126880496;WS=126880478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr3	127323830	rs893293	C	T	6214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=123;NR=87;PP=2965;SC=AGGAGATGATCGAGAGCATCG;SOR=0.941;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=210;TCF=123;TCR=87;TR=210;WE=127323838;WS=127323820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr3	127334598	rs17497118	G	A	708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.656;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=4;PP=422;ReadPosRankSum=0.437;SC=TGTGGAAGTGGGTGTCTTTGA;SOR=1.318;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=51;TCF=39;TCR=12;TR=27;WE=127334606;WS=127334588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,31:0.56:55
chr3	127336934	rs782427	A	G	7438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=123;NR=126;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.027;SC=GGTATAGCTCACATGTGCCCG;SOR=0.266;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=250;TCF=123;TCR=127;TR=249;WE=127336942;WS=127336924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,282:1.00:283
chr3	127337742	rs17497159	G	A	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=95;ReadPosRankSum=-1.288;SC=CTGGCACATGGTCAGTGTAGT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=7;WE=127337750;WS=127337732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr3	127379948	rs34980487	C	T	3072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=74;PP=1909;ReadPosRankSum=1.081;SC=ACCAGCAGCTCCTAGAAGGGC;SOR=0.686;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=254;TCF=113;TCR=141;TR=133;WE=127379956;WS=127379938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,146:0.52:283
chr3	127390525	rs41266485	C	T	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=72;ReadPosRankSum=-0.213;SC=GTGTCCTCATCTGCAAGGGGA;SOR=0.770;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=22;TCF=7;TCR=15;TR=7;WE=127390533;WS=127390515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr3	127391018	rs813633	A	G	538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=2;PP=471;SC=GTGCCGCGGGAACCCCCTGGG;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=127391026;WS=127391008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	127391378	rs1056235	G	A	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=131;ReadPosRankSum=-0.440;SC=GGTGGACCCCGAAACGGACGG;SOR=0.235;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=10;WE=127391386;WS=127391368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr3	127394820	rs35703629	C	T	1103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=16;PP=646;ReadPosRankSum=0.627;SC=CAGGAGCCCGCTGCGAGGCCA;SOR=0.714;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=64;TCF=40;TCR=24;TR=41;WE=127394828;WS=127394810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,50:0.64:78
chr3	127396220	rs1658037	T	C	1253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=14;PP=942;SC=CCTTGTGTGGTCCTGGACCAG;SOR=1.151;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=22;TCR=14;TR=36;WE=127396228;WS=127396210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr3	127410954	.	TTTTTG	T	134	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=20;HapScore=2;MGOF=19;MMLQ=27;MQ=67.73;NF=5;NR=0;PP=134;QD=27.4;SC=TTTTTTTTTTTTTTTGGCAAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=127410966;WS=127410944;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:0,5:1.00:5
chr3	127410959	rs814130	G	T	96.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=70.00;QD=24.01;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	127429567	rs1010174	C	G	1160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.946;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=27;PP=669;ReadPosRankSum=-1.115;SC=CCCGGCTCTTCCGCAGTGACA;SOR=0.347;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=98;TCF=40;TCR=58;TR=50;WE=127429575;WS=127429557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,56:0.47:118
chr3	127434580	rs627498	G	A	1612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.184;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=31;PP=977;ReadPosRankSum=-1.545;SC=GGCAGGTCCCGCACCCAGATG;SOR=0.823;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=166;TCF=94;TCR=72;TR=76;WE=127434588;WS=127434570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,80:0.45:176
chr3	127434856	rs477554	C	T	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=388;ReadPosRankSum=0.741;SC=TGAGACCCCCCGCACCTGCCC;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=45;TCF=10;TCR=35;TR=24;WE=127434864;WS=127434846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,25:0.50:50
chr3	127440083	rs13088071	A	C	445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-5.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.055;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=342;ReadPosRankSum=0.663;SC=TGACCAATGCAGTCCTCTTAA;SOR=2.076;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=2;TCR=44;TR=21;WE=127440091;WS=127440073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,21:0.45:47
chr3	127641968	rs4141499	C	A	781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.961;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=8;PP=466;ReadPosRankSum=-0.814;SC=GAATAAAATTCAGAACATGAA;SOR=0.959;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=64;TCF=46;TCR=18;TR=32;WE=127641976;WS=127641958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,35:0.50:70
chr3	127775788	rs9847934	T	A	130.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.18;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	127820493	rs111737766	TA	T	235.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQRankSum=2.976;QD=1.46;ReadPosRankSum=-0.064;SOR=0.744;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:131,30:0.19:161
chr3	127983495	rs2811544	T	C	6709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=127;NR=99;PP=2965;SC=CAACGAGAGATCCCTCGGGAC;SOR=0.920;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=226;TCF=127;TCR=99;TR=226;WE=127983503;WS=127983485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr3	128181777	rs2659690	A	G	9135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=166;NR=150;PP=2965;SC=CCAGGCCACCAAAAAACTCCC;SOR=0.741;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=317;TCF=167;TCR=150;TR=316;WE=128181785;WS=128181767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,340:1.00:340
chr3	128200806	rs11708606	G	A	2085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.815;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=52;PP=1169;ReadPosRankSum=-1.570;SC=GCAAGGCAGCGTCAGCAGGCT;SOR=0.852;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=166;TCF=78;TCR=88;TR=94;WE=128200814;WS=128200796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,103:0.55:187
chr3	128204951	rs2335052	C	T	1059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.111;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=27;PP=712;ReadPosRankSum=-0.568;SC=CCAGAGTGGGCTGCTGTAGGG;SOR=1.176;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=83;TCF=35;TCR=48;TR=44;WE=128204959;WS=128204941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,47:0.53:88
chr3	128205519	rs4577488	G	A	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.97;ReadPosRankSum=-0.637;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr3	128205860	rs1573858	G	C	805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=18;PP=333;ReadPosRankSum=0.057;SC=GCGGCTGCTCGGGCGCCACCT;SOR=0.802;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=53;TCF=25;TCR=28;TR=33;WE=128205868;WS=128205850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,39:0.63:62
chr3	128292062	rs200346912	CT	C	47.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.846;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQRankSum=-0.000;QD=3.18;ReadPosRankSum=0.516;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr3	128292213	rs2734046	A	G	1713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.061;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=36;PP=1047;ReadPosRankSum=1.746;SC=GCTGGAAACCAGAGCTTGATG;SOR=0.784;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=193;TCF=106;TCR=87;TR=83;WE=128292221;WS=128292203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,91:0.42:215
chr3	128292318	rs147519916	ATC	A	70.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FS=1.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.04;MQRankSum=3.109;QD=0.26;ReadPosRankSum=0.416;SOR=0.900;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:241,26:0.10:267
chr3	128348735	rs11453536	G	GA	1367.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=9;PP=729;SC=ATAATTGAAAGAAAAAAATTC;SOR=1.981;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=32;TCF=20;TCR=12;TR=25;WE=128348743;WS=128348725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr3	128350684	rs4857914	C	T	750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=0;PP=607;SC=GAACATCAGTCAACCCTAAAC;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=128350692;WS=128350680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	128351054	rs9868579	T	C	1886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=45;PP=1381;SC=AATGCACCATTAGTTTAAATC;SOR=2.722;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=10;TCR=45;TR=55;WE=128351062;WS=128351044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr3	128356852	rs1697	C	T	6104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=106;NR=92;PP=2965;SC=GGGTTGGATACGGATGAAGCA;SOR=0.739;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=199;TCF=107;TCR=92;TR=198;WE=128356860;WS=128356842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr3	128363332	rs2811497	C	T	330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=4;PP=185;SC=ACTAAAAATACATACATATAC;SOR=1.609;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=12;WE=128363340;WS=128363322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	128532446	rs139417205	GCA	G	111.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.12;ReadPosRankSum=-0.334;SOR=0.608;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,12:0.12:100
chr3	128622922	rs115532916	G	A	2566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.447;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=52;PP=1512;ReadPosRankSum=0.567;SC=TGCTGAGTACGCCTGCACAAG;SOR=0.635;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=236;TCF=125;TCR=111;TR=105;WE=128622930;WS=128622912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,121:0.45:267
chr3	128720487	rs1871951	A	G	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.018;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=177;ReadPosRankSum=1.148;SC=GCCGGTCAGCACGGGCGCGGA;SOR=1.270;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=16;WE=128720495;WS=128720477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,21:0.58:36
chr3	128722958	rs73210697	A	G	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.51;ReadPosRankSum=1.551;SOR=0.375;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr3	128853622	rs7646403	C	G	2520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=18;PP=1736;SC=TTTCAAAGGACACAACAGAAA;SOR=2.331;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=57;TCR=18;TR=75;WE=128853630;WS=128853612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr3	128859202	rs10664499	C	CTTAG	8010.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=47;PP=2974;SC=CTGTCACAAACTTACTTACGT;SOR=1.651;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=100;TCF=50;TCR=50;TR=88;WE=128859210;WS=128859192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr3	128864520	rs9842978	C	G	5502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.33;SOR=0.916;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr3	128864540	rs9880527	A	G	5745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=66;NR=55;PP=2051;SC=GGCAAGAATGAGCTGGGAACT;SOR=0.784;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=121;TCF=66;TCR=55;TR=121;WE=128864548;WS=128864530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr3	128877521	rs4452346	C	T	1811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=48;PP=1284;SC=CATTCATATACAAATATTGTA;SOR=4.139;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=5;TCR=48;TR=53;WE=128877529;WS=128877511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr3	128890350	rs4303883	G	A	10793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=396;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=174;NR=165;PP=2965;SC=GATAACAAATGTCTGGAAGAG;SOR=0.740;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=339;TCF=174;TCR=165;TR=339;WE=128890358;WS=128890340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,395:1.00:395
chr3	128993993	rs189912496	G	C	3323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.514;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=59;PP=1658;ReadPosRankSum=1.512;SC=GTGGCACAAAGGGCAGATAAG;SOR=0.814;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=242;TCF=136;TCR=106;TR=141;WE=128994001;WS=128993983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,158:0.60:264
chr3	129020778	rs6765930	A	G	1226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.557;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=18;PP=799;ReadPosRankSum=1.469;SC=CCATTGTCTTAACTTCCCTGG;SOR=0.516;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=110;TCF=75;TCR=35;TR=51;WE=129020786;WS=129020768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,56:0.47:120
chr3	129100228	rs113169163	T	C	2716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.911;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.032;NF=65;NR=60;PP=1505;ReadPosRankSum=-1.667;SC=AGACACTGATTGGCGTGCACT;SOR=0.511;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=261;TCF=128;TCR=133;TR=125;WE=129100236;WS=129100218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,136:0.48:283
chr3	129100288	rs62266952	A	G	1966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.732;NF=36;NR=50;PP=1145;ReadPosRankSum=0.435;SC=GAAGGTAAGCATCTAGCCAGC;SOR=0.670;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=168;TCF=72;TCR=96;TR=86;WE=129100296;WS=129100278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,95:0.52:184
chr3	129120743	rs6764765	A	G	1281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.494;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=35;PP=810;ReadPosRankSum=-0.459;SC=GACAGGCCAGAGCTGAGGCTT;SOR=0.545;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=115;TCF=43;TCR=72;TR=57;WE=129120751;WS=129120733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,61:0.50:123
chr3	129130018	rs73202271	G	A	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.43;ReadPosRankSum=1.383;SOR=0.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,11:0.34:32
chr3	129137025	rs56323212	G	A	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=296;ReadPosRankSum=-0.407;SC=GGGAGGGGCGGGGGTGGCAAA;SOR=0.478;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=45;TCF=36;TCR=9;TR=19;WE=129137033;WS=129137015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,18:0.40:45
chr3	129140489	rs3774788	T	C	1464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.941;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=30;PP=902;ReadPosRankSum=0.077;SC=GATTAAGGGGTGTCTGATCCT;SOR=0.543;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=161;TCF=96;TCR=65;TR=68;WE=129140497;WS=129140479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,72:0.42:171
chr3	129140738	rs60414131	A	T	552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=21;PP=490;ReadPosRankSum=1.036;SC=AGGCTGGGCAACAGGGCCCTG;SOR=0.793;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=67;TCF=15;TCR=52;TR=26;WE=129140746;WS=129140728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,25:0.36:69
chr3	129147418	rs3796391	G	A	2087.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=58;PP=1431;ReadPosRankSum=2.685;SC=CGGGGTATCAGATAAACCGTA;SOR=0.728;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=173;TCF=65;TCR=108;TR=89;WE=129147426;WS=129147408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,94:0.51:186
chr3	129151927	rs140697	G	A	2500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.990;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=44;PP=1439;ReadPosRankSum=-0.888;SC=TCCTTTGGGTGTATAGGAAAA;SOR=0.612;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=220;TCF=133;TCR=87;TR=112;WE=129151935;WS=129151917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,123:0.50:245
chr3	129152089	rs140696	G	A	1578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.181;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.849;NF=35;NR=41;PP=950;ReadPosRankSum=0.897;SC=TTGCCATTTTGCCTGGGAAGT;SOR=0.586;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=175;TCF=76;TCR=99;TR=76;WE=129152097;WS=129152079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,77:0.43:181
chr3	129152144	rs140695	T	C	1649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.795;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.261;NF=19;NR=52;PP=1137;ReadPosRankSum=-0.254;SC=GCTGATTTCATGTTCAAGTAG;SOR=1.793;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=77;TCF=20;TCR=57;TR=71;WE=129152152;WS=129152134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,66:0.97:68
chr3	129153036	rs140694	G	C	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=178;ReadPosRankSum=-0.247;SC=AAGCAATATTGAGGGATGCAA;SOR=0.540;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=9;WE=129153044;WS=129153026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr3	129155670	rs10342	C	T	3079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.435;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=68;PP=1741;ReadPosRankSum=-0.805;SC=TCACTTTCAGCATCTGCTTTA;SOR=0.734;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=257;TCF=129;TCR=128;TR=135;WE=129155678;WS=129155660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,149:0.53:279
chr3	129156536	rs140692	A	G	4318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=3.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=376;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.729;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=102;NR=72;PP=2768;ReadPosRankSum=1.247;SC=ATTTGGCTGTACTATCTTTAC;SOR=0.845;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=341;TCF=191;TCR=150;TR=174;WE=129156544;WS=129156526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,191:0.51:376
chr3	129177346	rs2285349	C	T	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=257;ReadPosRankSum=0.995;SC=CTAACACTTACTAGGTACCTT;SOR=0.756;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=38;TCF=32;TCR=6;TR=16;WE=129177354;WS=129177336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,19:0.45:42
chr3	129179623	rs113240923	C	CTG	1210.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.487;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=689;ReadPosRankSum=-0.156;SC=AGGACTAAAACGGGTTGAGAC;SOR=1.091;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=17;WE=129179631;WS=129179613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,31:0.53:58
chr3	129182588	rs55860024	T	C	684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=21;PP=505;ReadPosRankSum=-1.279;SC=TAGGCCCCTGTATTTCCTTTT;SOR=0.836;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=54;TCF=12;TCR=42;TR=27;WE=129182596;WS=129182578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,28:0.49:57
chr3	129185641	rs6770233	T	C	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=192;ReadPosRankSum=0.042;SC=TCACTGCACCTGGCCCCCAGG;SOR=0.223;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=10;WE=129185649;WS=129185631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr3	129185661	rs6805886	C	A	1015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=8;PP=715;SC=GGGCTCCTTGCCAGGATTTTA;SOR=2.368;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=34;WE=129185669;WS=129185651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	129185924	rs56379561	G	A	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.263;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=84;ReadPosRankSum=1.052;SC=GTGTGTCCCAGTGAGTGGGAA;SOR=0.025;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=10;WE=129185932;WS=129185914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr3	129188325	rs7612530	G	A	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.107;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=89;ReadPosRankSum=0.257;SC=CTGAGATTCTGTTACTATTAA;SOR=2.780;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=6;WE=129188333;WS=129188315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr3	129197108	rs58550262	TC	T	471.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.731;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=222;ReadPosRankSum=-0.914;SC=CCATTTGTGCTCCCCCCCCAG;SOR=0.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=1;TCR=45;TR=17;WE=129197116;WS=129197098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,22:0.44:50
chr3	129202316	rs112066509	C	T	2228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.677;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=37;PP=1284;ReadPosRankSum=0.778;SC=CCCCACTGTCCCTGTTCCCCA;SOR=0.839;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=194;TCF=112;TCR=82;TR=92;WE=129202324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,105:0.49:213
chr3	129202644	rs7610149	G	T	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.516;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.458;NF=1;NR=9;PP=168;ReadPosRankSum=-0.609;SC=GCAGCTGTGAGGTCGTGGGAG;SOR=1.179;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=10;WE=129202652;WS=129202634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr3	129207309	rs55991801	C	G	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.660;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.690;NF=3;NR=24;PP=497;ReadPosRankSum=0.389;SC=AGATGGGGACCCAGGTGGCAC;SOR=1.433;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=69;TCF=11;TCR=58;TR=27;WE=129207317;WS=129207299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,29:0.41:70
chr3	129210977	rs2285354	G	C	3039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.915;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=68;PP=1876;ReadPosRankSum=-0.153;SC=TTATTTCTTCGCCACAGGCCT;SOR=0.541;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=307;TCF=166;TCR=141;TR=136;WE=129210985;WS=129210967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:186,152:0.45:338
chr3	129214302	rs111401191	G	A	1840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.997;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.219;NF=49;NR=33;PP=1248;ReadPosRankSum=0.623;SC=AGGAAGAAGCGGGGAGAGACC;SOR=0.543;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=146;TCF=90;TCR=56;TR=82;WE=129214310;WS=129214292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,87:0.54:162
chr3	129214511	rs66556397	G	A	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.384;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=288;ReadPosRankSum=0.185;SC=TCTCACGTGCGGTGTCCAAGT;SOR=0.054;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=17;WE=129214519;WS=129214501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr3	129218944	rs6799876	G	T	1569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.074;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=44;PP=1056;ReadPosRankSum=0.226;SC=AGAAGCATTTGGCAGCATGTC;SOR=0.890;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=144;TCF=56;TCR=88;TR=69;WE=129218952;WS=129218934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,74:0.48:155
chr3	129236364	.	A	C	2089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.987;ClippingRankSum=0.000;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.470;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=48;PP=1059;ReadPosRankSum=-1.587;SC=CTGATGAAGAAGCCATCTCCC;SOR=0.728;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=210;TCF=108;TCR=102;TR=99;WE=129236372;WS=129236354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,108:0.45:239
chr3	129247551	rs7984	A	G	1008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=14;PP=534;ReadPosRankSum=1.308;SC=GGGAGCAGCCACGGGTCAGCC;SOR=0.732;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=62;TCR=27;TR=46;WE=129247559;WS=129247541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,53:0.54:99
chr3	129251263	rs56340615	C	T	2306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FS=1.678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.73;ReadPosRankSum=-1.600;SOR=0.556;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,111:0.52:215
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chr3	129266162	rs2713617	C	G	673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.907;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=10;PP=356;ReadPosRankSum=-0.267;SC=TCACCCACCCCCCACGGGCCA;SOR=1.056;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=80;TCF=51;TCR=29;TR=32;WE=129266170;WS=129266152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,37:0.42:88
chr3	129274363	rs1052910	G	A	1255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=0.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.37;ReadPosRankSum=1.201;SOR=0.588;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,64:0.48:134
chr3	129274456	rs2824	C	T	1212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.339;NF=29;NR=33;PP=721;ReadPosRankSum=0.932;SC=GCTACAGCCTCGGTGCATCTT;SOR=0.668;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=172;TCF=84;TCR=88;TR=62;WE=129274464;WS=129274446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,68:0.36:188
chr3	129275206	rs11920311	C	T	2832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=71;PP=1715;ReadPosRankSum=-0.684;SC=AAGCCACCACCTGCTCAAACT;SOR=0.669;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=259;TCF=107;TCR=152;TR=125;WE=129275214;WS=129275196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,140:0.50:282
chr3	129275403	rs11920368	C	A	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=7;PP=437;ReadPosRankSum=-1.300;SC=AGATGTGTGTCCTTGAGTAGG;SOR=0.717;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=39;TCR=12;TR=29;WE=129275411;WS=129275393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,32:0.57:56
chr3	129275619	rs6801699	T	C	992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=26;PP=626;ReadPosRankSum=-0.242;SC=TTGCACACAATCCCCAACTCC;SOR=0.697;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=59;TCF=18;TCR=41;TR=37;WE=129275627;WS=129275609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,42:0.63:67
chr3	129277481	rs61109754	T	C	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.270;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=11;PP=233;ReadPosRankSum=2.480;SC=CGAGGGACAGTTGTGGAGGAG;SOR=0.468;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=34;TCF=12;TCR=22;TR=19;WE=129277489;WS=129277471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,26:0.62:42
chr3	129278446	rs60442867	GC	G	831.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.667;NF=10;NR=9;PP=401;ReadPosRankSum=-0.413;SC=AGTCCACACGGCCCCCCCACC;SOR=0.734;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=60;TCF=28;TCR=32;TR=19;WE=129278454;WS=129278436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,35:0.43:82
chr3	129279570	rs2170774	T	C	1873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.045;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=31;PP=1146;ReadPosRankSum=-0.759;SC=TCTTTCACTGTGAGAGGAAAA;SOR=0.971;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=174;TCF=108;TCR=66;TR=84;WE=129279578;WS=129279560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,94:0.47:202
chr3	129279597	rs2713627	C	T	6573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=130;NR=90;PP=2965;SC=TAAATAAACACGGGAGAGGAG;SOR=0.956;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=223;TCF=130;TCR=93;TR=220;WE=129279605;WS=129279587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr3	129279720	rs56155536	G	A	1662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.106;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=39;PP=1082;ReadPosRankSum=-1.933;SC=AAACAGAAACGGAGACAGAGA;SOR=0.983;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=122;TCF=52;TCR=70;TR=64;WE=129279728;WS=129279710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,72:0.53:136
chr3	129281866	rs2713626	G	C	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.248;NF=9;NR=14;PP=304;ReadPosRankSum=0.418;SC=AGGCCCTGCAGAGGAAGGCTG;SOR=0.706;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=60;TCF=21;TCR=39;TR=23;WE=129281874;WS=129281856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,27:0.38:71
chr3	129281980	rs2713625	C	T	2703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=53;NR=26;PP=1172;SC=CCACTCCTCACTGAGTGTGTA;SOR=1.015;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=53;TCR=26;TR=79;WE=129281988;WS=129281970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr3	129282137	rs2713624	TG	CA	856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=753;ReadPosRankSum=1.803;SC=CCAGCCCCCATGCTTTGGGCC;SOR=0.892;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=38;TCF=12;TCR=26;TR=19;WE=129282146;WS=129282127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,23:0.53:43
chr3	129284415	rs2625972	G	T	1080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.127;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=29;PP=691;ReadPosRankSum=-0.647;SC=ACTGCACCTTGAGGCCCTAGG;SOR=1.041;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=57;TCF=19;TCR=38;TR=42;WE=129284423;WS=129284405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,46:0.71:65
chr3	129284637	rs2245469	A	G	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.093;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=49;ReadPosRankSum=-0.088;SC=GGGGGTGTCAAGAGCCCCAGA;SOR=0.551;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=5;WE=129284645;WS=129284627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr3	129284818	rs2625973	A	C	2080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.212;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=43;PP=1109;ReadPosRankSum=0.567;SC=GAGGAGAACAAGCTAATTCCC;SOR=0.795;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=153;TCF=81;TCR=72;TR=95;WE=129284826;WS=129284808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,101:0.60:169
chr3	129286413	rs2245285	G	C	1977.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=33;PP=1129;ReadPosRankSum=0.431;SC=GCTCCTTGGTGAGATCTGTCA;SOR=0.717;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=239;TCF=147;TCR=92;TR=89;WE=129286421;WS=129286403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,103:0.38:270
chr3	129286531	rs2245281	C	A	2748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.118;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=57;PP=1743;ReadPosRankSum=0.264;SC=GCAGGGTCCCCGCCCACTACC;SOR=0.691;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=281;TCF=141;TCR=140;TR=123;WE=129286539;WS=129286521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:180,135:0.43:315
chr3	129286635	rs2245278	G	A	2185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.487;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=57;PP=1393;ReadPosRankSum=2.252;SC=TCTTGGTACAGAAGACGAACA;SOR=0.738;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=208;TCF=93;TCR=115;TR=100;WE=129286643;WS=129286625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,108:0.48:227
chr3	129289831	rs2244962	A	G	2671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.916;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=70;PP=1761;ReadPosRankSum=-1.963;SC=CGAGGCCCACAGCTGAGGCTG;SOR=0.613;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=259;TCF=114;TCR=145;TR=126;WE=129289839;WS=129289821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,133:0.47:282
chr3	129290187	rs2285367	T	C	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.162;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=12;PP=271;ReadPosRankSum=0.518;SC=GGATGCAGGATGGACAGATGG;SOR=1.041;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=45;TCF=20;TCR=25;TR=22;WE=129290195;WS=129290177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,24:0.52:46
chr3	129291751	rs2244708	T	C	2805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.786;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=69;PP=1399;ReadPosRankSum=-1.867;SC=CACCTGAGAGTGGTCCTGGGG;SOR=0.925;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=277;TCF=137;TCR=140;TR=131;WE=129291759;WS=129291741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,144:0.48:301
chr3	129293183	rs2625962	T	C	807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=8;PP=540;SC=GCTTACCGCGTGGATCTCGGG;SOR=1.536;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=27;WE=129293191;WS=129293173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr3	129293256	rs2255703	T	C	1065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.679;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=17;PP=618;ReadPosRankSum=0.534;SC=TCACTCCACATGCACAGGTGA;SOR=0.765;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=109;TCF=69;TCR=40;TR=47;WE=129293264;WS=129293246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,53:0.43:123
chr3	129294456	rs2255508	C	T	1415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=35;PP=927;ReadPosRankSum=0.393;SC=GCCTGGGGCTCTGCTGGGGAT;SOR=0.646;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=110;TCF=54;TCR=56;TR=67;WE=129294464;WS=129294446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,69:0.57:120
chr3	129297223	rs1110168	C	G	1171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.724;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=20;PP=730;ReadPosRankSum=-0.271;SC=GGGAGCCACCCGTAGGCACGG;SOR=0.818;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=101;TCF=61;TCR=40;TR=53;WE=129297231;WS=129297213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,57:0.53:108
chr3	129303197	rs2811463	T	C	2536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=55;PP=1853;SC=TCTGCCCCTCTGGGGCTGTGC;SOR=1.508;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=87;TCF=31;TCR=56;TR=86;WE=129303205;WS=129303187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr3	129308096	rs13079843	G	A	625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=5;PP=498;SC=GGGTCAGGCTGGACCTGTAGC;SOR=2.200;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=20;WE=129308104;WS=129308086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	129324193	rs7619850	A	G	322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=3;PP=224;SC=GCTTGCGCTCACAGGCCGGTC;SOR=2.147;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=14;WE=129324201;WS=129324183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	129546729	rs784689	T	C	4610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=73;PP=2757;ReadPosRankSum=0.944;SC=ATAGCAGAGCTGGTAGGTGCA;SOR=0.275;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=158;TCF=85;TCR=73;TR=157;WE=129546737;WS=129546719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,168:0.99:169
chr3	129694934	rs784705	C	A	1068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=27;PP=761;SC=GGAAACCTGCCGGCAAAGGGG;SOR=2.432;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=34;WE=129694942;WS=129694924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr3	129695538	rs784704	C	T	2312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=51;NR=21;PP=1484;SC=CTTTCCTTCCCCAGCGTCCCA;SOR=1.668;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=73;TCF=51;TCR=22;TR=72;WE=129695546;WS=129695528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr3	129695714	rs5660	T	C	11673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=449;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=215;NR=188;PP=2965;SC=GGTCAGTCGATGTAACCCAGC;SOR=0.782;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=405;TCF=216;TCR=189;TR=403;WE=129695722;WS=129695704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,445:1.00:445
chr3	129695954	rs5662	T	C	2786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=47;PP=1651;ReadPosRankSum=-0.794;SC=AAGCGGGCCTTCTGCTGGGGC;SOR=0.284;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=44;TCR=48;TR=91;WE=129695962;WS=129695944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,101:0.99:102
chr3	129696041	rs5663	A	G	2420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=42;PP=1385;SC=CCTGGGTCAGAGAGCCCCTGG;SOR=1.038;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=38;TCR=42;TR=80;WE=129696049;WS=129696031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr3	129696105	rs5664	A	G	1136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=15;NR=23;PP=664;SC=GGATGTCTTGAGCCCTGTGTG;SOR=1.402;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=15;TCR=23;TR=38;WE=129696113;WS=129696095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr3	129811073	rs13066399	T	C	683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=20;PP=462;SC=CAGGTCTGCATGACCACTGGG;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=26;WE=129811081;WS=129811063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	130114408	rs5852594	AC	A	3294.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=56;PP=2385;SC=TATATTTAGAACCATATATTT;SOR=2.007;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=3;TCR=58;TR=59;WE=130114416;WS=130114398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr3	130116696	rs12488457	A	C	5898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=110;NR=92;PP=2965;SC=CAGTGGGCCAACTCATCTGAA;SOR=0.853;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=203;TCF=111;TCR=92;TR=202;WE=130116704;WS=130116686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr3	130122409	rs5852595	TG	T	5992.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.150;NF=11;NR=97;PP=2159;ReadPosRankSum=0.000;SC=TTGACTTTATTGGGGGGGGGT;SOR=0.270;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=119;TCF=11;TCR=108;TR=108;WE=130122418;WS=130122399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,204:1.00:205
chr3	130124270	rs1497313	A	G	1403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=9;PP=954;SC=AAAAACAGACATAAATGAGTG;SOR=2.790;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=40;TCR=9;TR=49;WE=130124278;WS=130124260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr3	130124491	rs10934940	G	A	2991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=61;PP=1738;SC=GTCCAGGGGCGTGGGGTCAGA;SOR=1.871;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=30;TCR=61;TR=91;WE=130124499;WS=130124481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr3	130124989	rs4688761	C	T	5435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=81;PP=2913;SC=GTCATGGAGACGATGGGATTG;SOR=0.733;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=171;TCF=90;TCR=81;TR=171;WE=130124997;WS=130124979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr3	130125116	rs1497312	G	C	2371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=43;PP=1394;SC=TTTTAGGGCTGTCATGGATTT;SOR=1.473;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=25;TCR=43;TR=68;WE=130125124;WS=130125106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr3	130132302	rs11717623	T	A	7965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.52;SOR=0.800;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr3	130132302	.	TAG	AAT	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=87;NR=68;PP=2947;QD=20;SC=TACTTATGTCTAGCAGAGAAT;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=160;TCF=87;TCR=73;TR=155;WE=130132312;WS=130132292;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,155:0.97:160
chr3	130132304	rs11713542	G	T	7965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.25;SOR=0.809;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr3	130132509	rs2219026	A	G	642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=18;PP=449;SC=AATCATATCAATGAGCATTTT;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=130132517;WS=130132499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	130132851	rs10512767	A	G	4780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=62;PP=2965;SC=ATAGTATGAAAAGAAAATCTA;SOR=1.205;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=167;TCF=105;TCR=62;TR=166;WE=130132859;WS=130132841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr3	130134492	rs16827497	T	C	4572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=86;NR=67;PP=2706;SC=ACTAAAGGGGTCACAGGGAAA;SOR=0.829;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=153;TCF=86;TCR=67;TR=153;WE=130134500;WS=130134482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr3	130134563	rs7628563	G	A	4428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=68;NR=79;PP=2474;SC=TGAGTGACTCGGAGACATTAG;SOR=1.085;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=147;TCF=68;TCR=79;TR=147;WE=130134571;WS=130134553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr3	130135456	rs6439233	T	C	2380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=30;PP=1391;SC=TGCCATCTGCTTCTCTCCTCC;SOR=1.116;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=50;TCR=30;TR=80;WE=130135464;WS=130135446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr3	130135575	rs4688798	A	T	4139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=77;NR=63;PP=2466;SC=CGGTGCCAACATTTTAGTCTC;SOR=0.786;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=140;TCF=77;TCR=63;TR=140;WE=130135596;WS=130135565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr3	130137866	rs13062453	G	A	326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=1;NR=11;PP=284;SC=CCCAATTATGGGGGGCATGAA;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=130137874;WS=130137856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	130142587	rs35980322	AT	A	670.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.83;QD=25.80;SOR=4.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	130144984	rs1874599	G	C	264.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=1;PP=207;SC=TTTTTGTTTTGTCTTGTTTTA;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=130144992;WS=130144974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	130158343	rs2403340	C	T	3909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=54;PP=2341;SC=AGCAAACATGCGTTCACTTCT;SOR=1.067;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=140;TCF=85;TCR=55;TR=139;WE=130158351;WS=130158333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr3	130162395	rs9883988	A	G	5313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=102;PP=2965;SC=GAGAATATTCAAAATGATGGT;SOR=1.099;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=179;TCF=77;TCR=102;TR=179;WE=130162403;WS=130162385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr3	130174334	rs819085	G	A	4376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=83;NR=62;PP=2362;SC=TTTTTGGGAGGTAATGGCTTC;SOR=0.915;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=145;TCF=83;TCR=62;TR=145;WE=130174342;WS=130174324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr3	130187817	rs322113	T	C	6693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=113;NR=104;PP=2965;SC=ACTTTCACATTGCCCCCACTC;SOR=0.717;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=218;TCF=113;TCR=105;TR=217;WE=130187825;WS=130187807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr3	130189918	rs10668406	T	TTG	182.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.47;MQRankSum=0.502;QD=14.06;ReadPosRankSum=-0.711;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr3	130190630	rs322117	G	A	6452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=118;NR=88;PP=2965;SC=AATCATAGTAGTGGTTCTGAG;SOR=0.903;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=206;TCF=118;TCR=88;TR=206;WE=130190638;WS=130190620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr3	130190720	rs11355796	AT	A	6871.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.11;NF=25;NR=92;PP=2965;SC=GAAAAAGCACATTTAGAAGAA;SOR=0.894;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=124;TCF=25;TCR=99;TR=117;WE=130190728;WS=130190710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr3	130190777	rs322118	G	A	4638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.153;NF=75;NR=76;PP=2788;ReadPosRankSum=1.358;SC=GAAGGTAATCGTGAGTACCAT;SOR=0.233;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=153;TCF=76;TCR=77;TR=151;WE=130190785;WS=130190767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,170:0.99:171
chr3	130284284	rs9830253	G	A	10927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=408;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=189;NR=182;PP=2965;SC=CATAGAGGGCGCCAGCGACAC;SOR=0.764;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=371;TCF=189;TCR=182;TR=371;WE=130284292;WS=130284274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,408:1.00:408
chr3	130286886	rs9836961	T	C	2637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=28;PP=1649;SC=GTTTTTCCTATGCAGCTTGCA;SOR=1.711;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=91;TCF=63;TCR=28;TR=91;WE=130286894;WS=130286876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr3	130289617	rs10934949	T	C	6636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=145;NR=82;PP=2965;SC=TCCCATGCTGTCCAAAGCTAA;SOR=1.298;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=227;TCF=145;TCR=82;TR=227;WE=130289625;WS=130289607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr3	130300650	rs6439249	T	C	6238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=110;NR=93;PP=2965;SC=ACTGAATAGCTTGAAGGATAT;SOR=0.747;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=203;TCF=110;TCR=93;TR=203;WE=130300658;WS=130300640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr3	130308702	rs4515022	A	G	989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=27;NR=7;PP=613;SC=GTTTGTTTACATGTGTTTTAT;SOR=2.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=34;WE=130308710;WS=130308692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr3	130313017	rs1467015	T	G	207.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=170;SC=AAATAGCCTTTGTAGAAAAAT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=130313025;WS=130313007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	130317341	rs4336088	G	A	5595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=114;PP=2965;SC=TTGGTAGAATGTGAAATGCTT;SOR=1.329;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=182;TCF=68;TCR=114;TR=182;WE=130317349;WS=130317331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr3	130360600	.	TA	T	203.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.894;ClippingRankSum=0.000;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=7.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.27;MQRankSum=2.379;QD=2.87;ReadPosRankSum=1.075;SOR=0.194;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,19:0.27:71
chr3	130569557	rs1316658	T	G	2900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=27;PP=1763;SC=GGAGGGAAGTTGTCGAGCTAC;SOR=1.540;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=63;TCR=27;TR=90;WE=130569565;WS=130569547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr3	130659650	rs73201921	A	T	602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-1.093;NF=10;NR=16;PP=281;ReadPosRankSum=-0.783;SC=AGATACTATTAATCTGACACA;SOR=0.730;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=60;TCF=23;TCR=37;TR=26;WE=130659658;WS=130659640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,31:0.44:70
chr3	130674022	rs218494	A	G	202.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=163;SC=ATTGAGAGCAATATTTTATTC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=130674030;WS=130674012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	130748733	rs9864242	A	G	3194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=69;PP=2165;SC=GTAAGTAAAAATGCTTCCTAT;SOR=1.813;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=33;TCR=69;TR=102;WE=130748741;WS=130748723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr3	130828790	rs9850655	G	A	1661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=33;PP=983;SC=TACTGGGGGAGCATGATATAT;SOR=1.107;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=23;TCR=33;TR=56;WE=130828798;WS=130828780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr3	130851101	rs4974466	A	G	560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=0;PP=474;SC=GTTCTTTATAATTCCATAAAA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=130851109;WS=130851091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	130852185	rs2674613	T	C	2400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=45;PP=1200;SC=GGAATAAAAGTGTGCAACTAG;SOR=1.061;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=39;TCR=45;TR=84;WE=130852193;WS=130852175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr3	130873723	rs1400013	T	G	1949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=16;PP=1288;SC=AAGCTACATGTAATTTTACAT;SOR=2.070;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=46;TCR=16;TR=62;WE=130873731;WS=130873713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr3	130881409	rs1913898	T	C	4884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=84;NR=83;PP=2965;SC=TGCTCGGGACTACTTCTCAGG;SOR=0.808;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=167;TCF=84;TCR=83;TR=167;WE=130881417;WS=130881399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr3	130947435	rs3738000	A	T	5439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=108;NR=89;PP=2945;SC=TCCTATTGTGAAGAGAGTGAT;SOR=0.790;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=197;TCF=108;TCR=89;TR=197;WE=130947443;WS=130947425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr3	131186893	.	CAA	C,CA	70.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=0.000;HP=15;HapScore=3;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-0.736;NF=10;NR=2;PP=146;ReadPosRankSum=1.712;SC=GAGTAAGAAACAAAAAAAAAA;SOR=1.329;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=12;WE=131186902;WS=131186883;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.31:13
chr3	131188377	rs3830301	TAC	T	610.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;QD=32.14;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr3	131220820	rs79180480	A	C	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=64;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TCCCCAAAAAACAGTCCTACC;SOR=0.330;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=5;WE=131220828;WS=131220810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr3	131261662	rs10716194	TG	T	5944.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=-3.760;NF=22;NR=112;PP=2591;ReadPosRankSum=0.193;SC=CCCATGATGATGGGGGGGGGT;SOR=0.842;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=159;TCF=23;TCR=136;TR=134;WE=131261671;WS=131261652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:12,244:0.95:256
chr3	131271180	rs994967	T	C	1850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.117;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=31;PP=1025;ReadPosRankSum=-2.440;SC=AGAGATTCTGTGGACAATCGT;SOR=0.796;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=192;TCF=122;TCR=70;TR=87;WE=131271188;WS=131271170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,92:0.44:207
chr3	131271439	rs2251178	T	C	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=438;ReadPosRankSum=-0.845;SC=ATGCCCATTATATTCATTATG;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=21;WE=131271447;WS=131271429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,23:0.77:30
chr3	131283007	rs6439305	G	A	755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.158;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=11;PP=475;ReadPosRankSum=0.287;SC=GCCAAAGACCGTCTGAACCCA;SOR=0.446;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=47;TCF=32;TCR=15;TR=31;WE=131283015;WS=131282997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,33:0.63:52
chr3	131404572	rs6439314	A	C	932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=27;NR=1;PP=809;SC=TTGCAGTGAGACGAGACTGCG;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=28;WE=131404580;WS=131404562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	131404625	rs113276957	A	AAC	853.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.904;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.912;NF=8;NR=10;PP=464;ReadPosRankSum=0.153;SC=ACTCCACCTCAACACACACAC;SOR=0.948;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=64;TCF=25;TCR=39;TR=18;WE=131404634;WS=131404615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,34:0.38:89
chr3	131404641	rs6439315	C	A	1127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.550;HP=6;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.169;NF=39;NR=27;PP=1029;ReadPosRankSum=3.296;SC=CACACACACACAAAAAGGAGT;SOR=0.859;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=119;TCF=73;TCR=46;TR=66;WE=131404649;WS=131404631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,53:0.48:111
chr3	131415340	rs2369134	C	T	1011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=9;PP=673;ReadPosRankSum=0.779;SC=AAACTGTGTGCTAGCTTTGTT;SOR=0.644;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=74;TCR=19;TR=43;WE=131415348;WS=131415330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,46:0.45:103
chr3	131415435	rs201494241	T	C	4174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=375;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.372;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=84;PP=2699;ReadPosRankSum=-2.115;SC=ATAGTCGTCATTGCCAGATAA;SOR=0.716;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=350;TCF=185;TCR=165;TR=179;WE=131415443;WS=131415425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:180,195:0.52:375
chr3	131418966	rs3883881	T	C	140.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5020;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=4;PP=96;SC=ATTTCAGGGTTTGTCAATGAG;SOR=1.329;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=8;WE=131418974;WS=131418956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	131704852	rs79775365	T	C	732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.922;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=17;PP=355;ReadPosRankSum=0.718;SC=ATTATATCCATCTTTTTATAT;SOR=0.922;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=65;TCF=26;TCR=39;TR=28;WE=131704860;WS=131704842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,35:0.48:73
chr3	131756241	rs2141570	T	C	3115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=29;PP=2220;SC=AGAATTTACTTCCACCTCTTA;SOR=2.027;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=72;TCR=29;TR=101;WE=131756249;WS=131756231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr3	131756348	rs9859988	C	T	3985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=352;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.747;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=87;PP=2962;ReadPosRankSum=1.032;SC=GCCCGCCAGCCACAGTCCCCT;SOR=0.595;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=323;TCF=159;TCR=164;TR=174;WE=131756357;WS=131756338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,192:0.55:352
chr3	131756349	rs1569282	A	G	3060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=352;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.750;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=76;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.534;SC=CCCGCCAGCCACAGTCCCCTC;SOR=0.803;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=325;TCF=160;TCR=165;TR=148;WE=131756357;WS=131756338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:194,158:0.45:352
chr3	131756375	rs1569281	A	G	9544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=363;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=154;NR=181;PP=2965;SC=TTGTAACATCAAAATCCCCTT;SOR=0.892;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=337;TCF=155;TCR=182;TR=335;WE=131756383;WS=131756365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,361:1.00:361
chr3	132063914	rs972774	A	T	1887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.528;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=47;PP=1036;ReadPosRankSum=0.383;SC=GTAAGTATTAAAAAATGAGAG;SOR=0.643;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=174;TCF=73;TCR=101;TR=83;WE=132063922;WS=132063904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,93:0.47:199
chr3	132068831	rs2228402	C	T	1052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.739;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=25;PP=558;ReadPosRankSum=-0.210;SC=ACAAAAAACTCATCATGTATT;SOR=0.998;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=99;TCF=53;TCR=46;TR=48;WE=132068839;WS=132068821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,55:0.48:114
chr3	132068876	rs2290542	G	A	1094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.453;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=20;PP=480;ReadPosRankSum=-0.514;SC=TTTAACATATGTTTGTTCAAG;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=50;TCR=45;TR=42;WE=132068884;WS=132068866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,54:0.49:110
chr3	132068925	rs2290541	A	T	1049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.63;ReadPosRankSum=-0.643;SOR=0.597;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,53:0.49:109
chr3	132069028	rs3217658	CAAG	C	151.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=1.550;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=170;ReadPosRankSum=1.349;SC=TCTAAACTAACAAGAAGACAA;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=5;WE=132069038;WS=132069018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr3	132071452	rs17242113	G	T	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=325;ReadPosRankSum=1.306;SC=AAGTCATTGTGGGCGTATGGG;SOR=0.588;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=35;TCR=4;TR=18;WE=132071460;WS=132071442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr3	132075554	rs3181784	T	C	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.302;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=209;ReadPosRankSum=-2.066;SC=AGATGTACTATCGGAATGAGA;SOR=1.888;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=13;WE=132075562;WS=132075544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,15:0.39:38
chr3	132075707	rs2071505	A	G	3102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=67;PP=1872;ReadPosRankSum=0.160;SC=AAGGTACTGAAGACAGTACAG;SOR=0.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=268;TCF=128;TCR=140;TR=129;WE=132075715;WS=132075697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,147:0.49:298
chr3	132075746	rs1042330	G	A	2258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.090;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=55;PP=1400;ReadPosRankSum=-0.652;SC=CTCTGTAGAAGGAGTAGCTGC;SOR=0.808;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=196;TCF=83;TCR=113;TR=95;WE=132075754;WS=132075736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,103:0.49:209
chr3	132153333	rs10662251	T	TAG	4056.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.453;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=26;PP=2007;ReadPosRankSum=1.107;SC=CTTGGAAAGATTAAAGATATA;SOR=0.913;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=98;TCF=35;TCR=63;TR=47;WE=132153341;WS=132153323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,104:0.52:201
chr3	132166148	rs377096498	AT	A	146.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=2.857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.88;ReadPosRankSum=-0.896;SOR=0.424;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:139,28:0.17:167
chr3	132172395	rs7613098	C	T	1340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.496;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=27;PP=843;ReadPosRankSum=-1.496;SC=CTGATTTTGACGTTTTAAAAA;SOR=0.622;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=102;TCF=50;TCR=52;TR=56;WE=132172403;WS=132172385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,61:0.54:112
chr3	132182443	rs11328911	TG	T	1261.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=6;PP=1102;ReadPosRankSum=-1.032;SC=ACATACTGAATGTTTTTTTCA;SOR=0.795;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=51;TCF=40;TCR=11;TR=31;WE=132182451;WS=132182433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,41:0.59:70
chr3	132196761	rs2369797	G	A	1284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.063;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=36;PP=820;ReadPosRankSum=0.431;SC=ATATCCTGTCGCATTTGTTTT;SOR=0.956;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=130;TCF=60;TCR=70;TR=62;WE=132196769;WS=132196751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,61:0.45:135
chr3	132196816	rs2369796	A	T	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.303;HP=10;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=16;PP=440;ReadPosRankSum=-0.179;SC=TTTTTTTTTTAAAATCTAGGT;SOR=1.194;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=91;TCF=48;TCR=43;TR=36;WE=132196824;WS=132196795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,31:0.35:88
chr3	132218196	rs2088712	C	T	1349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=38;PP=859;ReadPosRankSum=-0.376;SC=CCAGTTTACACACATTATATG;SOR=0.712;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=100;TCF=30;TCR=70;TR=54;WE=132218204;WS=132218186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,60:0.55:109
chr3	132218441	rs3834794	A	AT	87.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=101;ReadPosRankSum=-0.593;SC=TTTACTATTTATTAACAAATG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=4;WE=132218449;WS=132218431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr3	132218623	rs3762672	G	T	2525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.506;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=49;PP=1390;ReadPosRankSum=-0.313;SC=CTTGACTCGTGCTAGTAAACC;SOR=0.577;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=277;TCF=141;TCR=136;TR=109;WE=132218631;WS=132218613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:179,127:0.42:306
chr3	132221139	rs55825559	C	T	1000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=2.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=0.000;QD=8.70;ReadPosRankSum=0.974;SOR=0.457;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,50:0.43:115
chr3	132235344	rs80120242	A	T	1806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.854;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=39;PP=1010;ReadPosRankSum=0.805;SC=GCAAAGGGTAATGTATAGAGT;SOR=0.544;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=153;TCF=69;TCR=84;TR=74;WE=132235352;WS=132235334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,89:0.49:182
chr3	132244313	rs9843883	C	T	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=61;ReadPosRankSum=0.792;SC=TCGTTGTTCTCTTAGGATTAG;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=4;WE=132244321;WS=132244303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr3	132244406	rs754993	G	A	1028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=15;PP=625;ReadPosRankSum=-0.023;SC=GATATTTAGGGCTGTATGAGT;SOR=0.774;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=78;TCF=51;TCR=27;TR=42;WE=132244414;WS=132244396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,46:0.53:87
chr3	132360883	rs821572	C	T	4436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=83;NR=64;PP=2455;SC=ATTCAAGGAACGTAACTGAGC;SOR=0.819;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=147;TCF=83;TCR=64;TR=147;WE=132360891;WS=132360873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr3	132432252	rs193005508	A	C	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=18.72;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr3	133098806	rs34111099	C	T	3288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=349;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.809;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=65;PP=1874;ReadPosRankSum=0.727;SC=ATGGCAACACCGACACCCCGT;SOR=0.749;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=319;TCF=174;TCR=145;TR=146;WE=133098814;WS=133098796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:189,160:0.46:349
chr3	133099245	rs1197314	G	A	3385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.410;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=74;PP=2035;ReadPosRankSum=-0.227;SC=CTGTGGAACCGGAGCCCTCTA;SOR=0.735;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=275;TCF=134;TCR=141;TR=142;WE=133099253;WS=133099235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,162:0.52:314
chr3	133108978	rs1197296	A	G	783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.186;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=9;PP=447;ReadPosRankSum=-0.219;SC=CCCAGGCACCATCCTTGCTGC;SOR=0.461;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=58;TCF=42;TCR=16;TR=33;WE=133108986;WS=133108968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,37:0.57:65
chr3	133114893	rs1197300	C	T	773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=15;PP=409;SC=TATACAAATACATATATTATA;SOR=1.143;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=10;TCR=15;TR=25;WE=133114901;WS=133114883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr3	133166403	rs7644197	A	G	454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=13;PP=375;SC=CCTCCTTGTAAACATAAAGTA;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=16;WE=133166411;WS=133166393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	133167363	rs2276737	G	A	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=9;PP=361;ReadPosRankSum=-0.050;SC=TTCGAAAGGCGGCAGAAGAGG;SOR=0.683;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=65;TCF=42;TCR=23;TR=29;WE=133167371;WS=133167353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,36:0.47:77
chr3	133191093	rs899458	A	G	833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=7;PP=589;SC=GGAATAGTCCAGGCTACCACC;SOR=2.235;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=30;WE=133191101;WS=133191083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr3	133191385	rs79087781	C	A	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.009;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=100;ReadPosRankSum=1.016;SC=TCCTACCACGCCCTGCTGGAC;SOR=1.085;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=8;WE=133191393;WS=133191375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr3	133303079	rs114649403	G	A	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.450;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=120;ReadPosRankSum=-0.210;SC=GTGCATGATTGTGGTAGGGTG;SOR=0.836;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=8;WE=133303087;WS=133303069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr3	133327457	rs1051772	T	C	2211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.030;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=48;PP=1080;ReadPosRankSum=-0.605;SC=TATTAACTCCTGAGTCATCTG;SOR=0.804;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=198;TCF=98;TCR=100;TR=96;WE=133327465;WS=133327447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,112:0.50:224
chr3	133329943	rs1444601	G	A	7345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=135;NR=112;PP=2965;SC=ATTCCAGTCAGAACATCAAGT;SOR=0.730;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=247;TCF=135;TCR=112;TR=247;WE=133329951;WS=133329933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,273:1.00:273
chr3	133331230	rs71317417	C	T	1191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.678;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=15;PP=620;ReadPosRankSum=-2.763;SC=TCTGAATACACACCTGCACGA;SOR=0.931;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=89;TCF=58;TCR=31;TR=47;WE=133331238;WS=133331220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,56:0.56:100
chr3	133335787	rs3732574	C	T	1169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=26;PP=779;SC=GAAAGTTTTACTTTAGAAAAA;SOR=2.133;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=9;TCR=26;TR=35;WE=133335795;WS=133335777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr3	133336999	rs60695717	T	C	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=205;ReadPosRankSum=-0.300;SC=ATCTGTTTATTTTTAAGAGGT;SOR=0.446;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=13;WE=133337007;WS=133336989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr3	133341988	rs10935070	T	C	597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=2.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.578;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=380;ReadPosRankSum=0.939;SC=CTCTTTATTATTGGTGGCCAT;SOR=1.176;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=43;TCF=34;TCR=9;TR=23;WE=133341996;WS=133341978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,27:0.48:56
chr3	133368362	rs3192149	T	G	7668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=130;NR=116;PP=2965;SC=CTTTCAGGCTTATGTGAAACT;SOR=0.778;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=246;TCF=130;TCR=116;TR=246;WE=133368370;WS=133368352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,269:1.00:269
chr3	133371471	rs55633281	G	A	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=7;PP=142;ReadPosRankSum=-1.254;SC=GAAAGAGTACGACCTACATAT;SOR=0.804;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=15;TCF=6;TCR=9;TR=12;WE=133371479;WS=133371461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,14:0.82:17
chr3	133374030	rs7639941	T	C	205.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=194;SC=GCCTGGGCAATAGAGCAAGAC;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=133374038;WS=133374020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	133375475	rs9838963	G	C	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=293;ReadPosRankSum=-0.640;SC=ATGATTGAATGCATCATTTTT;SOR=0.569;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=13;WE=133375483;WS=133375465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr3	133375785	rs2718801	G	A	2044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=52;PP=1397;SC=AATACATTTTGCTGTTGACAG;SOR=3.258;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=10;TCR=52;TR=62;WE=133375793;WS=133375775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr3	133376850	rs9810823	A	G	1003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.200;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=28;PP=586;ReadPosRankSum=-0.862;SC=ACAAAATTACATTTTGTAACA;SOR=0.288;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=69;TCF=20;TCR=49;TR=43;WE=133376858;WS=133376840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,47:0.61:77
chr3	133380128	rs9827019	A	G	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=4.314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.62;ReadPosRankSum=0.274;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,20:0.62:32
chr3	133380128	.	AAT	GAC	226	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=5;NR=11;PP=226;QD=17.4667421789;SC=ATTTCTAAGAAATCCTGGAAC;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=16;WE=133380138;WS=133380118;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr3	133380130	rs2718805	T	C	1143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.85;SOR=2.468;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	133465283	rs1130459	A	G	923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.681;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=28;PP=715;ReadPosRankSum=1.034;SC=CGCACCCGGAAGATGAGGCTC;SOR=0.922;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=93;TCF=36;TCR=57;TR=42;WE=133465291;WS=133465273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,43:0.41:104
chr3	133474328	rs12769	G	A	2188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=50;PP=1305;ReadPosRankSum=0.936;SC=TCGGCTACTCGGGAGCCTTCA;SOR=0.675;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=215;TCF=104;TCR=111;TR=98;WE=133474336;WS=133474318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,109:0.47:232
chr3	133475722	rs1799852	C	T	1632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.751;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=31;PP=958;ReadPosRankSum=0.943;SC=GCTGCTTTGCCTGGACAACAC;SOR=0.962;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=143;TCF=82;TCR=61;TR=77;WE=133475730;WS=133475712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,82:0.50:164
chr3	133475812	rs1799899	G	A	2018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.654;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=47;PP=1262;ReadPosRankSum=0.255;SC=AAGTATGGGCGGCAAGGAGGA;SOR=0.811;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=188;TCF=98;TCR=90;TR=90;WE=133475820;WS=133475802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,99:0.45:219
chr3	133483696	rs1880669	T	C	1498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.866;NF=37;NR=31;PP=1009;ReadPosRankSum=-0.529;SC=TTAATGCCTTTTTCATTTTCT;SOR=0.648;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=154;TCF=88;TCR=66;TR=68;WE=133483704;WS=133483686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,74:0.44:170
chr3	133485133	rs2692696	A	G	5810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=112;NR=84;PP=2965;SC=GTATTTTGCTATAGCAGTGGT;SOR=0.921;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=196;TCF=112;TCR=84;TR=196;WE=133485141;WS=133485123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr3	133493705	rs35736766	GT	G	988.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.482;NF=23;NR=22;PP=458;ReadPosRankSum=0.753;SC=GAATGGGTGAGTTTTTTTTTT;SOR=1.148;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=74;TCF=40;TCR=34;TR=45;WE=133493727;WS=133493695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,52:0.84:62
chr3	133524591	rs60142346	A	G	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.941;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=290;ReadPosRankSum=-0.930;SC=GGGAGAGACTATGGCTTAGGA;SOR=0.275;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=16;WE=133524599;WS=133524581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr3	133546590	.	ACCCCCC	A	81.25	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=20.31;ReadPosRankSum=0.319;SOR=2.788;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr3	133547692	rs2293373	G	A	1710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.552;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=41;PP=942;ReadPosRankSum=0.933;SC=GCTTGATGTCGATCACTGCAG;SOR=0.784;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=164;TCF=74;TCR=90;TR=73;WE=133547700;WS=133547682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,84:0.46:182
chr3	133560005	rs201380383	CGCACACACATGCGTGT	C	774.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=6;PP=2954;ReadPosRankSum=1.336;SC=AGGGAGCAATCGCACACACAT;SOR=0.705;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=37;TCF=18;TCR=19;TR=11;WE=133560028;WS=133559995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,38:0.47:81
chr3	133583577	rs3811646	C	T	1764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.399;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=48;PP=1063;ReadPosRankSum=2.312;SC=ATAACAAAACCAAAAAGCACA;SOR=0.881;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=135;TCF=49;TCR=86;TR=76;WE=133583585;WS=133583567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,83:0.58:144
chr3	133604314	rs200133866	AC	A	3179.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.634;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.000;NF=24;NR=46;PP=2449;ReadPosRankSum=-1.603;SC=GGACTTACACACCCAATGACC;SOR=0.434;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=144;TCF=58;TCR=86;TR=70;WE=133604322;WS=133604304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,110:0.50:218
chr3	133692497	rs4634113	A	G	1306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=9;PP=749;SC=AGGGGTTGGAAGCCACTCACC;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=39;WE=133692505;WS=133692487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr3	133692743	rs4241362	C	T	3130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=45;NR=69;PP=2075;SC=GACCCGATCACACTTCATCCA;SOR=1.238;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=45;TCR=69;TR=114;WE=133692751;WS=133692733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr3	133698280	rs4640563	C	G	3663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=38;PP=2165;SC=TTGTGGTCAGCGTGGTGCACA;SOR=1.266;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=79;TCR=38;TR=117;WE=133698288;WS=133698270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr3	133698349	rs10935090	C	T	2073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.053;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=38;PP=1331;ReadPosRankSum=-1.181;SC=AAATGAGACCCGATGAAGAAC;SOR=0.944;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=222;TCF=123;TCR=99;TR=96;WE=133698357;WS=133698339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,104:0.43:243
chr3	133894761	rs28622917	T	G	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=4;PP=176;ReadPosRankSum=-0.242;SC=AGCGTCAAGCTCATGGCACCT;SOR=0.970;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=10;TCR=7;TR=10;WE=133894769;WS=133894751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr3	133941320	rs1131262	C	T	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=8;PP=251;ReadPosRankSum=-0.044;SC=TACTAACAGACTAAAGGATAG;SOR=0.668;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=31;TCF=18;TCR=13;TR=17;WE=133941328;WS=133941310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,23:0.57:40
chr3	133969352	rs139860270	G	A	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.31;ReadPosRankSum=-2.202;SOR=0.534;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr3	133969437	.	A	AG	186.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=5;PP=192;SC=CGGGGCCCTCAGCCGCGGGCC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=133969445;WS=133969427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	134077470	rs1353776	C	G	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.133;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=12;PP=513;ReadPosRankSum=1.984;SC=CTGGGGGGCCCTCAGTCTGGG;SOR=1.157;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=74;TCF=47;TCR=27;TR=37;WE=134077478;WS=134077460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,35:0.45:78
chr3	134080661	rs1077718	A	G	3269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=54;NR=55;PP=1951;SC=TGTAGGGAGAAAGAGGCTTGA;SOR=0.816;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=54;TCR=55;TR=109;WE=134080669;WS=134080651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr3	134085070	rs67655717	GAAGT	G	2955.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.202;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.282;NF=19;NR=20;PP=1878;ReadPosRankSum=0.741;SC=TAGAACAAAAGAAGTAAGTCC;SOR=0.944;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=89;TCF=46;TCR=43;TR=39;WE=134085081;WS=134085060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,78:0.55:143
chr3	134214042	rs62269547	T	C	702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=2;PP=538;SC=TTTTTCATTATTATGTATGCT;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=134214050;WS=134214032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	134226159	rs6766818	C	T	1872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=44;PP=1244;SC=TTCTTTTTGACATTTTTATCT;SOR=1.716;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=20;TCR=44;TR=64;WE=134226167;WS=134226149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr3	134256159	rs12634127	A	G	1742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=37;PP=1109;SC=GGTTTTGATCAAGTTTGAACT;SOR=1.536;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=20;TCR=37;TR=57;WE=134256167;WS=134256149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr3	134264859	rs1357762	A	C	319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=2;PP=246;SC=CGTAACTTATAGTCTGACTTC;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=134264867;WS=134264849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	134266148	rs12632372	G	C	3349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=43;PP=1989;SC=AGATAAAGGCGTTAACAATCA;SOR=0.968;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=63;TCR=43;TR=106;WE=134266156;WS=134266138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr3	134280395	rs6777283	T	A	2716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=62;PP=1804;SC=AAAAAATCACTATCTTGGAAA;SOR=1.790;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=28;TCR=62;TR=90;WE=134280403;WS=134280373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr3	134293619	rs4586863	A	G	81.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.09;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr3	134322742	rs2293293	A	G	6461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=108;NR=113;PP=2965;SC=CACAGCATACAAGGTAATTAA;SOR=0.809;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=222;TCF=108;TCR=114;TR=221;WE=134322750;WS=134322732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr3	134323156	rs4955535	A	G	4672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=69;PP=2873;SC=TGCCCTTGGCAAAGATCTGCA;SOR=0.812;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=158;TCF=89;TCR=69;TR=158;WE=134323164;WS=134323146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr3	134331874	rs7626611	T	C	2128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=26;PP=1126;SC=CTGCCTAGAATGTCTGTGCAT;SOR=1.236;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=45;TCR=26;TR=71;WE=134331882;WS=134331864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr3	134331980	rs9838119	C	T	3698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=65;PP=2077;SC=ACTGATTTAGCGGCGCTGTGG;SOR=0.895;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=59;TCR=65;TR=124;WE=134331988;WS=134331964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr3	134369716	rs13060869	C	A	2515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=51;PP=1621;ReadPosRankSum=1.335;SC=GGTCTGAGAGCGTACCCTGTG;SOR=0.674;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=253;TCF=146;TCR=107;TR=118;WE=134369724;WS=134369706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,127:0.46:276
chr3	134514579	rs9852662	T	C	7611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=126;NR=139;PP=2965;SC=CCGGCCGCCTTGGGACTGCTG;SOR=0.877;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=265;TCF=126;TCR=139;TR=265;WE=134514587;WS=134514569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,293:1.00:293
chr3	134697009	rs373709784	A	AC	305.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.958;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.912;NF=1;NR=7;PP=291;ReadPosRankSum=0.228;SC=CCACTGAGTTACAAGTCCTAT;SOR=0.293;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=8;WE=134697017;WS=134696999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr3	134880745	rs2270882	G	T	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.682;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=100;ReadPosRankSum=-0.349;SC=GATGACAACTGCTAGCAGATA;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=6;WE=134880753;WS=134880735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr3	134884652	rs1159404	A	C	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=160;ReadPosRankSum=1.458;SC=TATAACTTAAAAATTGCTGTT;SOR=0.324;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=10;WE=134884660;WS=134884642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr3	134898742	rs1042787	C	T	1092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.826;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=20;PP=641;ReadPosRankSum=0.047;SC=CCTTCACTTACGAGGATCCCA;SOR=0.935;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=155;TCF=92;TCR=63;TR=54;WE=134898750;WS=134898732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,60:0.35:170
chr3	134967368	rs11717042	G	A	1898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.885;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=51;PP=1240;ReadPosRankSum=1.227;SC=CTAGTGAAACGGTGATCCCTA;SOR=0.844;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=160;TCF=69;TCR=91;TR=86;WE=134967376;WS=134967358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,90:0.51:175
chr3	134968429	rs115906433	C	A	780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.172;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=20;PP=408;ReadPosRankSum=-0.021;SC=CTGGCCTCATCCCTGGAGCTC;SOR=0.507;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=48;TCF=16;TCR=32;TR=31;WE=134968437;WS=134968419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,36:0.64:56
chr3	134968465	rs4243397	T	C	827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=22;PP=517;SC=CAGGCCTGGATGGGGAGCACC;SOR=2.376;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=29;WE=134968473;WS=134968455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr3	135720241	rs4678432	T	C	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.554;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=376;ReadPosRankSum=0.890;SC=CCACTGAACATTGTTATTAAA;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=18;WE=135720249;WS=135720231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr3	135720540	rs9814557	A	G	2027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=36;PP=1244;ReadPosRankSum=2.523;SC=AAAGATGCAGATCTGAACTCT;SOR=0.697;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=164;TCF=91;TCR=73;TR=80;WE=135720548;WS=135720530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,91:0.48:188
chr3	135720673	rs9872542	T	C	3100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.415;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=55;PP=1898;ReadPosRankSum=-0.978;SC=ACTTAAAGGATATTGCAGGAG;SOR=0.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=244;TCF=128;TCR=116;TR=120;WE=135720681;WS=135720663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,142:0.50:283
chr3	135720851	rs6779903	G	T	2128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.191;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=44;PP=1381;ReadPosRankSum=0.571;SC=CGATGGGAACGCCCCATCCTT;SOR=0.638;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=215;TCF=111;TCR=104;TR=95;WE=135720859;WS=135720841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,104:0.44:239
chr3	135721036	rs34629706	C	T	1096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=23;PP=710;ReadPosRankSum=-0.372;SC=TAAAGATGTGCTTGGACATCT;SOR=0.669;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=107;TCF=62;TCR=45;TR=51;WE=135721044;WS=135721026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,53:0.45:117
chr3	135722264	rs17197552	A	G	2795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=62;PP=1796;ReadPosRankSum=0.742;SC=AGTCTGTAGAAGTCCTGTTGG;SOR=0.667;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=254;TCF=119;TCR=135;TR=116;WE=135722272;WS=135722254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,130:0.46:282
chr3	135742057	rs113986045	G	GTGTTTTGTTT	732.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=3.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.87;ReadPosRankSum=-0.039;SOR=2.391;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr3	135759669	rs3832193	T	TG	1526.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.055;NF=20;NR=11;PP=1133;ReadPosRankSum=0.021;SC=CATTCCCTGTTGGCTTACCCT;SOR=0.646;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=48;TCF=32;TCR=16;TR=31;WE=135759677;WS=135759659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,51:0.65:78
chr3	135768232	rs67039922	T	A	2097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.105;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=51;PP=1305;ReadPosRankSum=-0.456;SC=TGAAAATGGGTTCTAATTTTG;SOR=0.473;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=174;TCF=78;TCR=96;TR=93;WE=135768240;WS=135768222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,102:0.52:197
chr3	135806933	rs78473846	T	A	145.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.069;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.11;ReadPosRankSum=0.306;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr3	135822011	rs75262249	A	G	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=2.450;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=38;ReadPosRankSum=-0.792;SC=ATAAACATATACCTATACTTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=3;WE=135822019;WS=135822006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr3	135913665	rs1992952	A	G	489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=1;PP=309;SC=AAAGTCCCTCAGCAAGTTTCA;SOR=3.500;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=135913673;WS=135913660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	136035737	rs9833162	A	G	2230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=21;PP=1378;SC=TACATCTTATACTTGTCTTTA;SOR=1.519;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=65;TCF=44;TCR=21;TR=65;WE=136035745;WS=136035727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr3	136045213	rs17265675	G	A	1655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=32;PP=869;ReadPosRankSum=0.893;SC=AGGCAGTATCGTCCCTACTTT;SOR=0.710;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=171;TCF=100;TCR=71;TR=77;WE=136045221;WS=136045203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,86:0.45:193
chr3	136057142	rs111861599	AATT	A	811.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.499;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=456;ReadPosRankSum=0.971;SC=TGAGAAACATAATTATTAATT;SOR=0.394;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=25;TCF=10;TCR=15;TR=11;WE=136057152;WS=136057132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,22:0.47:47
chr3	136059537	rs503973	G	C	3255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=71;PP=2239;SC=TTCTAACCAAGTGAAGTATAC;SOR=1.549;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=36;TCR=71;TR=107;WE=136059545;WS=136059527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr3	136088038	rs9860801	G	A	3894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.225;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=54;PP=2422;ReadPosRankSum=-0.691;SC=TATCTGGATTGAACACCAAAG;SOR=0.402;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=126;TCF=71;TCR=55;TR=125;WE=136088046;WS=136088028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,144:0.99:145
chr3	136139878	rs9819496	G	A	1273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=29;NR=14;PP=628;SC=CTCTCAAAGTGTTGGGGTTAC;SOR=1.201;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=29;TCR=14;TR=43;WE=136139886;WS=136139868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr3	136196028	rs16843991	T	C	793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=7;PP=554;SC=AATTTCCACATGATTACAACT;SOR=2.226;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=29;WE=136196036;WS=136196018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	136196071	rs1394092	C	T	2401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=31;PP=1419;SC=TTTTGATTCCCAGCATTTTAG;SOR=1.116;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=82;TCF=51;TCR=31;TR=82;WE=136196079;WS=136196061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr3	136218930	rs900048	C	T	225.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=181;SC=TAGTGTGACACTGACAGCCAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=136218938;WS=136218926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	136573289	rs9865545	G	A	1321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.542;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=13;PP=849;ReadPosRankSum=-0.537;SC=AAATAGAATTGATTATCTGAA;SOR=1.325;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=96;TCF=68;TCR=28;TR=55;WE=136573297;WS=136573279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,60:0.60:100
chr3	136573440	rs9827648	A	G	3367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.635;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=58;PP=2200;ReadPosRankSum=0.332;SC=AAGGCTATGGAAATTTTATGG;SOR=0.841;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=248;TCF=133;TCR=115;TR=128;WE=136573448;WS=136573430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,145:0.53:274
chr3	136574501	rs1052618	A	G	1207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.025;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=37;PP=872;ReadPosRankSum=0.704;SC=AATTTAAGAAAGCAGGACTAC;SOR=1.025;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=82;TCF=22;TCR=60;TR=49;WE=136574509;WS=136574491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,51:0.59:86
chr3	136574521	rs1052620	C	T	870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.157;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=27;PP=654;ReadPosRankSum=-0.233;SC=CCAGGAAATACTAGACTCTCC;SOR=1.007;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=57;TCF=14;TCR=43;TR=35;WE=136574529;WS=136574511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,36:0.61:59
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chr3	136699133	rs5852860	CT	C	81.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.419;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.43;ReadPosRankSum=-2.484;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
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chr3	136739406	rs1385306	C	G	2227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.678;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.25;MQRankSum=2.327;NF=57;NR=39;PP=1519;ReadPosRankSum=0.362;SC=TGCAAACAAACGAGAACAGAT;SOR=0.826;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=190;TCF=111;TCR=79;TR=96;WE=136739414;WS=136739396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,103:0.49:212
chr3	137781923	rs329388	A	C	361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=9;PP=282;SC=AAATGGGGACAAATGCAGACT;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=137781931;WS=137781913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	137783700	rs179282	T	C	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=155;ReadPosRankSum=1.166;SC=CCAGTGTGGATAGAGGGAATG;SOR=0.569;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=32;TCF=9;TCR=23;TR=11;WE=137783708;WS=137783690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,11:0.32:34
chr3	137786442	rs442800	T	C	1251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=21;PP=593;ReadPosRankSum=1.800;SC=CAGTCATCCTTGGGCCGGGGC;SOR=0.758;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=95;TCF=57;TCR=38;TR=54;WE=137786450;WS=137786432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,61:0.56:109
chr3	137786696	rs3856632	G	A	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.328;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr3	137787047	rs374045	C	T	1293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=17;PP=835;SC=CAGTCCGGGGCGTGGAGCGGG;SOR=1.345;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=31;TCR=17;TR=48;WE=137787055;WS=137787037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr3	137787192	rs446644	T	C	4056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=64;PP=2226;SC=GTGACCAGTGTGCTCTGCTGG;SOR=0.706;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=77;TCR=64;TR=141;WE=137787200;WS=137787182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr3	137787282	rs419075	T	C	2491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=50;PP=1280;ReadPosRankSum=-0.993;SC=AGGGAGAAAGTGGCTCCAACA;SOR=1.237;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=39;TCR=51;TR=88;WE=137787290;WS=137787272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,98:0.98:100
chr3	137787355	rs446847	T	C	605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=19;PP=530;SC=TTCATGACTGTTGCCAAATCA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=137787363;WS=137787345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	137787935	rs382629	G	A	1417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=33;NR=16;PP=767;SC=CCACTTATACGTGGATTTTCT;SOR=1.118;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=33;TCR=16;TR=49;WE=137787943;WS=137787925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr3	137787963	rs445025	T	G	1951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=30;PP=1138;SC=CTGCCACCCGTGAGACAGCAA;SOR=0.719;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=39;TCR=30;TR=69;WE=137787971;WS=137787953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr3	137788123	rs425938	T	G	473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=13;PP=364;SC=TTCTTTTCTCTAGCTTACTTT;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=16;WE=137788131;WS=137788113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	137788141	rs407009	T	A	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=3.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=106;ReadPosRankSum=0.473;SC=TTTATTGTAATAATACAGCTT;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=137788149;WS=137788131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr3	137799291	rs384828	A	T	995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.645;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=20;PP=560;ReadPosRankSum=0.592;SC=ATGTCCTTAGATCCCTCCACT;SOR=0.443;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=86;TCF=51;TCR=35;TR=44;WE=137799299;WS=137799281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,51:0.52:99
chr3	137799498	rs405602	T	C	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=178;ReadPosRankSum=0.628;SC=GCACCAGTGCTCTGGACCCCA;SOR=0.465;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=13;WE=137799506;WS=137799488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr3	137800656	rs2622711	A	G	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.989;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=216;ReadPosRankSum=0.287;SC=GAACATTGTGAGAACTCTGCT;SOR=0.916;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=24;TCR=30;TR=20;WE=137800664;WS=137800646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,26:0.39:66
chr3	137807259	rs2724693	G	A	820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.002;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=17;PP=503;ReadPosRankSum=1.059;SC=TGAAGCTCCCGTGCCTGCCGA;SOR=0.650;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=64;TCF=35;TCR=29;TR=35;WE=137807267;WS=137807249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,38:0.55:69
chr3	137816817	rs7629243	A	C	490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=380;ReadPosRankSum=0.604;SC=AATTTAATTTACTGAGCAAGG;SOR=0.892;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=40;TCF=9;TCR=31;TR=20;WE=137816825;WS=137816807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr3	137843018	rs1564496	G	C	737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.906;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=11;PP=594;ReadPosRankSum=-0.239;SC=TGCCCACCCCGCCAAGAGACA;SOR=0.913;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=75;TCF=51;TCR=24;TR=35;WE=137843026;WS=137843008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,35:0.44:79
chr3	137843106	rs2170309	T	C	1570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=33;PP=968;ReadPosRankSum=0.892;SC=AGTGTTAGCTTTATTTGTTAC;SOR=0.649;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=144;TCF=76;TCR=68;TR=72;WE=137843114;WS=137843096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,77:0.48:160
chr3	137843476	rs2246945	G	T	2850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.391;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=70;PP=1829;ReadPosRankSum=1.605;SC=GCCCCAAATGGCTGAATTATA;SOR=0.728;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=324;TCF=158;TCR=166;TR=133;WE=137843484;WS=137843466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:211,144:0.41:355
chr3	137850003	rs2724691	A	G	3134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=63;PP=1706;ReadPosRankSum=-1.165;SC=AAGAAGGCAAACAGAAGAGGC;SOR=0.686;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=221;TCF=108;TCR=113;TR=123;WE=137850014;WS=137849993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,143:0.56:254
chr3	137880695	rs9851548	A	G	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=465;ReadPosRankSum=0.801;SC=TCTCAAAAAAACAAAACAAAC;SOR=0.836;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=48;TCF=38;TCR=10;TR=27;WE=137880703;WS=137880685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,29:0.57:51
chr3	137880743	rs2622736	G	A	2394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.201;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=30;PP=1399;ReadPosRankSum=-0.446;SC=AAGCTGCATCGTCATCATCAT;SOR=0.800;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=173;TCF=114;TCR=59;TR=96;WE=137880751;WS=137880733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,106:0.57:186
chr3	137881265	rs3732839	T	A	2541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.443;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=59;PP=1584;ReadPosRankSum=-0.484;SC=AAAATTCAGTTGTCTGAGGAT;SOR=0.730;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=251;TCF=119;TCR=132;TR=113;WE=137881273;WS=137881255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,123:0.45:272
chr3	137882377	rs2622734	G	T	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=206;ReadPosRankSum=0.486;SC=ATATATATTTGTAACAGTCTA;SOR=0.941;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=14;WE=137882385;WS=137882367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr3	137882752	rs2622733	A	G	1080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.780;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=30;PP=743;ReadPosRankSum=-0.061;SC=AACCACAGGTAATTCTTCATA;SOR=0.784;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=94;TCF=32;TCR=62;TR=45;WE=137882760;WS=137882742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,48:0.47:102
chr3	137893401	.	A	AC	1211.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=0.000;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.791;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=17;PP=755;ReadPosRankSum=-0.086;SC=ACCCAGTCCCACCCCCCCACC;SOR=0.815;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=28;TCR=35;TR=31;WE=137893409;WS=137893391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,50:0.54:92
chr3	137906532	rs13095374	A	G	689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.683;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=19;PP=401;ReadPosRankSum=0.603;SC=CCTCCTGGGCACCACCCCCTG;SOR=0.332;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=53;TCF=13;TCR=40;TR=28;WE=137906540;WS=137906522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,31:0.54:57
chr3	137940905	rs114649189	A	G	1400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.601;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=41;PP=874;ReadPosRankSum=-0.789;SC=CTTACTCTCAATTATAGAACC;SOR=0.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=153;TCF=57;TCR=96;TR=66;WE=137940913;WS=137940895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,72:0.44:165
chr3	137981439	.	TA	T	68.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.655;ClippingRankSum=0.000;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=1.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.60;ReadPosRankSum=-0.014;SOR=0.293;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,11:0.26:43
chr3	137981525	.	TA	T	61.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.233;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=7.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.37;ReadPosRankSum=0.911;SOR=0.081;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,9:0.20:45
chr3	137982718	rs939453	T	G	1403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.991;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=35;PP=795;ReadPosRankSum=2.557;SC=TTAACCTGTTTCCTTTCTGGT;SOR=1.026;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=128;TCF=54;TCR=74;TR=56;WE=137982726;WS=137982708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,66:0.46:144
chr3	138003391	rs77176250	C	T	1228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=31;PP=710;ReadPosRankSum=0.568;SC=CCCCTTTCACCGTAGGATTAG;SOR=0.749;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=127;TCF=52;TCR=75;TR=53;WE=138003399;WS=138003381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,60:0.43:138
chr3	138020275	rs7637162	A	G	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=3.130;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=135;ReadPosRankSum=-0.076;SC=TCAAACTCCTAATCTCAGGTG;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=7;WE=138020283;WS=138020265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr3	138020677	rs6801411	C	T	735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=23;PP=620;SC=AGTCCTGATACGTGTTAGGGA;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=138020685;WS=138020667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	138025136	rs3856636	T	G	701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.155;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=8;PP=392;ReadPosRankSum=-0.007;SC=CCCCTTAGAATTCATCTTTCT;SOR=1.130;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=56;TCF=38;TCR=18;TR=29;WE=138025144;WS=138025126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,32:0.50:64
chr3	138033181	rs9289556	C	T	2991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=358;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.803;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=64;PP=1752;ReadPosRankSum=0.301;SC=CACCCATGTCCTCATCTTCAC;SOR=0.669;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=321;TCF=166;TCR=155;TR=135;WE=138033189;WS=138033171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:204,153:0.43:357
chr3	138043535	.	TACACACACAC	T	592	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=1;NR=4;PP=592;QD=119.0;SC=TCAAGCCAGATACACACACAC;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=5;WE=138043552;WS=138043525;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr3	138091701	rs1199333	G	T	669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=1;PP=522;SC=ATGTCTTGCTGCCGCAGGTCT;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=138091709;WS=138091691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	138117564	rs13083299	A	G	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.726;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=121;ReadPosRankSum=-0.785;SC=CTGCAATTCCAGGAATCCAGG;SOR=0.027;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=11;WE=138117572;WS=138117554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr3	138121198	rs2279241	C	T	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=78;ReadPosRankSum=1.309;SC=CCATTTCTAACCACAACCCTT;SOR=0.941;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=5;WE=138121206;WS=138121188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr3	138170788	rs13095961	T	G	1607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.664;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=20;PP=1063;ReadPosRankSum=1.054;SC=AGGGTTGAGGTGCAGCGCGTG;SOR=0.780;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=127;TCF=87;TCR=40;TR=67;WE=138170796;WS=138170778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,72:0.51:140
chr3	138171042	rs4678418	C	T	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=108;ReadPosRankSum=0.962;SC=CCTTGCCTGACGCGGGCAGGG;SOR=0.602;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=8;WE=138171050;WS=138171032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,9:0.29:31
chr3	138173905	rs56236670	G	A	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=215;ReadPosRankSum=0.887;SC=AGGCAAGCAGGTGAGTGCTGC;SOR=0.425;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=13;WE=138173913;WS=138173895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr3	138176533	rs66644444	A	T	1295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.410;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=30;PP=695;ReadPosRankSum=-2.592;SC=CAGGGGACACAGTGGGAACAG;SOR=0.569;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=118;TCF=53;TCR=65;TR=58;WE=138176541;WS=138176523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,64:0.51:126
chr3	138177895	rs74322740	C	T	630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.388;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=455;ReadPosRankSum=2.606;SC=GGCCATGTGCCCAGTGCATAG;SOR=1.061;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=33;TCR=8;TR=25;WE=138177903;WS=138177885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,26:0.57:46
chr3	138179308	rs67037472	G	A	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.995;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=269;ReadPosRankSum=0.880;SC=CACCCTGGCAGAGGGTGCTCT;SOR=1.270;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=45;TCF=36;TCR=9;TR=17;WE=138179316;WS=138179298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,18:0.35:51
chr3	138179328	rs6763380	C	T	687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=5;PP=479;ReadPosRankSum=-0.391;SC=TGCCTGCTTTCCTCCGAACCC;SOR=1.248;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=69;TCF=53;TCR=16;TR=29;WE=138179336;WS=138179318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,30:0.39:77
chr3	138187568	rs1679167	C	T	2169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.155;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=45;PP=1411;ReadPosRankSum=0.133;SC=CGGTGAGTGGCGACATGTCCA;SOR=0.838;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=223;TCF=127;TCR=96;TR=105;WE=138187576;WS=138187558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,110:0.45:246
chr3	138188485	rs13316499	C	T	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.831;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=257;ReadPosRankSum=0.217;SC=TCAGAATAACCTCACAAAATA;SOR=0.223;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=13;WE=138188493;WS=138188475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr3	138189031	rs2347469	T	C	1986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=34;PP=1120;SC=TAAGAGGTTTTTAAGCCAGGC;SOR=1.117;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=28;TCR=34;TR=62;WE=138189039;WS=138189021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr3	138189658	rs3813264	A	G	1341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=9;PP=774;SC=GGGCTCAGATACTAGTAGTGG;SOR=2.059;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=38;WE=138189666;WS=138189648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr3	138193025	rs71878265	CT	C	84.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=9.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.92;ReadPosRankSum=0.522;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,18:0.20:92
chr3	138195529	rs1679169	C	T	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.224;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=10;PP=370;ReadPosRankSum=0.895;SC=TGAACCCTGGCTGGCCAACTT;SOR=0.223;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=65;TCF=49;TCR=16;TR=30;WE=138195537;WS=138195519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,32:0.44:72
chr3	138244400	rs9878436	C	T	1110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.283;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=26;PP=671;ReadPosRankSum=-1.833;SC=ATTCATGCTGCGTAGGCCTGT;SOR=0.458;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=105;TCF=53;TCR=52;TR=54;WE=138244408;WS=138244390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,57:0.47:121
chr3	138251302	rs7643973	G	T	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.366;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=8;PP=231;ReadPosRankSum=-2.429;SC=AGAAACTTCTGGTGTGAATAC;SOR=0.238;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=21;WE=138251310;WS=138251292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,24:0.69:35
chr3	138251447	rs10549552	CGGTAT	C	1677.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.625;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.572;NF=3;NR=16;PP=894;ReadPosRankSum=-0.615;SC=TTTCAAAATGCGGTATGGTAT;SOR=0.769;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=48;TCF=13;TCR=35;TR=19;WE=138251459;WS=138251437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,45:0.45:99
chr3	138256252	rs542010	G	A	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.939;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=122;ReadPosRankSum=-0.165;SC=TATCCTAACAGTATTGTACAC;SOR=0.495;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=7;WE=138256260;WS=138256242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr3	138289163	rs1673608	T	C	604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=436;ReadPosRankSum=0.031;SC=TCAGTACCTGTAAAGTTTTCT;SOR=0.723;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=35;TCR=13;TR=25;WE=138289171;WS=138289153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,26:0.54:48
chr3	138289221	rs1673607	C	T	2043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.325;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=31;PP=1112;ReadPosRankSum=-2.302;SC=GCAAGCCCTACTTAGTGATTC;SOR=0.838;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=134;TCF=80;TCR=54;TR=83;WE=138289229;WS=138289211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,94:0.62:152
chr3	138329862	rs811322	G	A	2258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.511;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=52;PP=1373;ReadPosRankSum=-0.037;SC=TGGTATCTCCGGACTCTGCCA;SOR=0.756;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=184;TCF=90;TCR=94;TR=101;WE=138329870;WS=138329852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,109:0.53:206
chr3	138400782	rs145780817	GA	G	215.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=8.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.28;MQRankSum=2.231;QD=2.88;ReadPosRankSum=-1.432;SOR=1.192;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,22:0.29:75
chr3	138417989	rs361080	G	A	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=189;ReadPosRankSum=0.518;SC=ACACCACAGCGAACTTTCAGT;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=9;WE=138417997;WS=138417979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr3	138433568	rs497900	C	T	2543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=61;PP=1395;ReadPosRankSum=0.529;SC=GAACCTGTAACGAAGCAGACA;SOR=0.702;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=229;TCF=104;TCR=125;TR=113;WE=138433576;WS=138433558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,125:0.49:254
chr3	138456486	.	AAT	A	38	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=38;QD=14.6666666667;SC=TCAGAAATAAAATATATATAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=3;WE=138456495;WS=138456476;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:17,3:0.15:20
chr3	138668233	.	CGT	C	92	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=11;MMLQ=16;MQ=60.67;NF=4;NR=0;PP=92;QD=24.0;SC=TATGCATGTGCGTGTGTGTGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=4;WE=138668242;WS=138668223;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:10,4:0.29:14
chr3	138724757	rs11924188	C	G	3262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=74;PP=1926;ReadPosRankSum=-0.491;SC=GCCCAGCAGACGAGTCGTCCT;SOR=0.706;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=300;TCF=151;TCR=149;TR=147;WE=138724765;WS=138724747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,162:0.50:327
chr3	138739545	.	C	T	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.180;ClippingRankSum=-0.000;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.97;ReadPosRankSum=-0.366;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr3	138739617	rs1720230	A	G	42.81	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.70;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr3	138882086	rs13097893	G	A	1076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=23;PP=676;SC=CAGTCTTCCCGGTGAATGGCA;SOR=1.552;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=12;TCR=23;TR=35;WE=138882094;WS=138882076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr3	139068346	rs75256094	T	G	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=91;ReadPosRankSum=-0.210;SC=AAAATTATAATCCACATTTCC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=5;WE=139068354;WS=139068336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr3	139069693	rs17316181	C	A	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=295;ReadPosRankSum=0.148;SC=AGCCTGTGTTCTTTCTTTATG;SOR=0.856;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=18;WE=139069701;WS=139069683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr3	139075728	rs78116750	A	G	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=271;ReadPosRankSum=-0.065;SC=CATATGTCCTATTGTTTTAAA;SOR=0.776;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=43;TCF=31;TCR=12;TR=18;WE=139075736;WS=139075718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,21:0.45:47
chr3	139075949	rs74365525	A	G	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.025;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=59;ReadPosRankSum=-1.242;SC=AGATTAAAAGATATCAATTTG;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=4;WE=139075957;WS=139075939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr3	139076820	rs2307031	G	T	1218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.410;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=23;PP=694;ReadPosRankSum=0.468;SC=AAAGGAAGAGGGTAATTAAGT;SOR=0.861;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=102;TCF=56;TCR=46;TR=54;WE=139076828;WS=139076810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,58:0.51:114
chr3	139077177	rs79695313	C	G	603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=17;PP=352;ReadPosRankSum=1.540;SC=TAAAGTTTTCCCCCAAGAAAA;SOR=0.635;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=56;TCF=21;TCR=35;TR=28;WE=139077185;WS=139077167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,30:0.47:64
chr3	139077527	rs150711068	GA	G	649.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=1.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.83;ReadPosRankSum=2.504;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,43:0.52:83
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chr3	139090481	rs75634125	C	T	757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.678;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=2;PP=587;ReadPosRankSum=-1.369;SC=GAATCACAGCCCACATCAAGC;SOR=1.609;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=60;TCF=53;TCR=7;TR=28;WE=139090489;WS=139090471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,29:0.48:61
chr3	139090698	rs80249265	A	G	2711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.333;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=65;PP=1727;ReadPosRankSum=-1.870;SC=GAAGCCAGGGAGGGAAGTACA;SOR=0.873;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=208;TCF=86;TCR=122;TR=110;WE=139090706;WS=139090688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,122:0.55:223
chr3	139093486	rs79654016	G	A	432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=331;ReadPosRankSum=-1.785;SC=TAACCAGCCCGCCCTTAATTT;SOR=0.247;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=18;WE=139093494;WS=139093476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr3	139098195	rs7649535	G	A	1012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.629;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=16;PP=586;ReadPosRankSum=-2.604;SC=CAGAAAATGGGAATAGAGATT;SOR=0.976;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=85;TCF=49;TCR=36;TR=41;WE=139098203;WS=139098185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,46:0.48:96
chr3	139102120	rs7373302	C	A	2290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=42;PP=1527;ReadPosRankSum=-0.970;SC=ATTTCTAATACAGTCCTGAAA;SOR=0.659;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=202;TCF=122;TCR=80;TR=102;WE=139102128;WS=139102110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,108:0.48:223
chr3	139108250	rs3215032	C	CTG	307.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.197;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=374;ReadPosRankSum=0.042;SC=TGGAATCAAACGACCAAGACC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=9;WE=139108258;WS=139108245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr3	139173565	rs2233817	A	G	3300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=364;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.721;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=70;PP=2051;ReadPosRankSum=0.099;SC=AGAACCCAGTACTTACCAGGT;SOR=0.592;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=319;TCF=171;TCR=148;TR=143;WE=139173573;WS=139173555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:200,163:0.45:363
chr3	139180919	rs3046576	ATG	A	2430.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.552;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=14;PP=1456;ReadPosRankSum=-0.451;SC=CTGGCACAGAATGTGTGAATG;SOR=0.873;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=88;TCF=51;TCR=37;TR=34;WE=139180928;WS=139180909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,67:0.50:133
chr3	139236683	rs2071388	C	T	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=377;ReadPosRankSum=0.847;SC=CTCTGCAGCACCCTACAGACA;SOR=0.479;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=20;WE=139236691;WS=139236673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr3	139246382	rs295493	A	G	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=89;ReadPosRankSum=-0.510;SC=GACCTTCCCCATGAAGGCTGA;SOR=0.716;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=22;TCF=7;TCR=15;TR=9;WE=139246390;WS=139246372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr3	139257545	rs34662123	GC	G	368.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.680;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=313;ReadPosRankSum=1.441;SC=TCAGGCCCTTGCCCCCTCTCG;SOR=2.179;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=11;WE=139257553;WS=139257535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr3	139280328	rs35898558	G	GA	1233.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=26;PP=1158;SC=GCTTTTCTTGGATGTATCGAG;SOR=3.675;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=26;WE=139280336;WS=139280318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	139318241	rs1846021	A	T	4530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=83;NR=69;PP=2798;SC=ACTTTTGCCCATTTTCTTCTT;SOR=0.861;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=153;TCF=83;TCR=70;TR=152;WE=139318249;WS=139318231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr3	140122341	rs4683494	G	A	267.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=217;SC=CTGCTGGCTCGTGGACCACAC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=140122349;WS=140122331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	140167536	rs2081803	A	G	4870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=95;PP=2965;SC=AATCCCTTCAAAAGTTATGTG;SOR=1.147;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=69;TCR=96;TR=164;WE=140167544;WS=140167526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr3	140178219	rs17348537	T	C	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=418;ReadPosRankSum=-0.022;SC=ATTTAGCACTTCTTTTCCTAA;SOR=1.071;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=18;WE=140178227;WS=140178209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr3	140178279	rs9836487	G	A	1481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.411;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=21;PP=870;ReadPosRankSum=-0.359;SC=AGTACACTGAGTAGTTCACCT;SOR=0.297;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=114;TCF=82;TCR=32;TR=61;WE=140178287;WS=140178269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,67:0.53:126
chr3	140178381	rs17348572	T	C	2709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.926;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=59;PP=1697;ReadPosRankSum=0.985;SC=TCTGGCATCATTGACCTCTTG;SOR=0.763;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=244;TCF=120;TCR=124;TR=115;WE=140178402;WS=140178371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,127:0.47:270
chr3	140178485	rs7632885	G	A	5758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=87;PP=2965;SC=GGGTGCCAAAGTCCCCGATGG;SOR=0.732;SbPval=0.53;Source=Platypus;TCF=102;TR=189;WE=140178493;WS=140178475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr3	140178638	rs10590825	CCCT	C	3983.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=55;PP=2685;SC=GCCCTTCCACCCCTCCTACCC;SOR=2.007;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=3;TCR=58;TR=58;WE=140178648;WS=140178628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr3	140185294	rs533657	G	A	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.288;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=118;ReadPosRankSum=-0.296;SC=TATCATGTGCGTTATAGAACT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=6;WE=140185302;WS=140185284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr3	140251487	rs349536	T	C	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.751;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=132;ReadPosRankSum=0.963;SC=AGTATAAATCTACAAACTAAA;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=8;WE=140251495;WS=140251477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr3	140281723	rs11714465	C	T	1974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.408;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=35;PP=1202;ReadPosRankSum=-0.049;SC=GTCCGGCTTCCCTTGAGGCCC;SOR=0.890;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=187;TCF=109;TCR=78;TR=87;WE=140281731;WS=140281713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,93:0.45:207
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chr3	140282861	rs10804675	C	T	3318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.986;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=66;PP=1884;ReadPosRankSum=-1.331;SC=TTGTGTTTGTCGTGGCCATGG;SOR=0.606;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=256;TCF=133;TCR=123;TR=136;WE=140282869;WS=140282851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,151:0.54:280
chr3	140285115	rs4683510	T	C	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.79;ReadPosRankSum=-1.282;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr3	140401693	rs698673	A	G	6002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=105;PP=2965;SC=TGCCGCAACAAGCGCATCGCT;SOR=1.004;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=188;TCF=83;TCR=105;TR=188;WE=140401701;WS=140401683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr3	140406947	rs28594654	G	A	3739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=361;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.379;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=81;PP=2066;ReadPosRankSum=0.732;SC=AATAAACTACGTGCCCTTGGA;SOR=0.670;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=334;TCF=167;TCR=167;TR=163;WE=140406955;WS=140406937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,182:0.51:360
chr3	140407260	rs9876490	C	A	1905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=35;PP=1039;ReadPosRankSum=0.429;SC=AGTGCTGGAGCAGACAGCCAG;SOR=0.715;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=145;TCF=77;TCR=68;TR=77;WE=140407268;WS=140407250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,89:0.55:163
chr3	140419715	rs1540506	C	T	5028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=99;NR=74;PP=2965;SC=CATGACTCTTCGCTTCTGATT;SOR=0.950;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=173;TCF=99;TCR=74;TR=173;WE=140419723;WS=140419705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr3	140678384	.	TA	T	219.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=0.000;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.93;ReadPosRankSum=0.784;SOR=0.598;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,25:0.33:75
chr3	140692486	rs2555707	G	T	311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=2;PP=185;SC=TTTATTATTAGAATGACATAT;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=140692494;WS=140692476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	140979184	rs1511378	T	C	568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=19;PP=423;SC=TATAAATGAATGATGAGGCTG;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=140979192;WS=140979174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	140998214	rs13087169	G	A	4672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=61;PP=2824;SC=TGCTTCTCTCGCGCAGGTCAT;SOR=1.172;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=158;TCF=97;TCR=61;TR=158;WE=140998222;WS=140998204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr3	141248515	rs79308158	A	G	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.604;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=9;PP=265;ReadPosRankSum=-0.383;SC=TATACGAAGCATGTTTTCTTA;SOR=0.234;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=42;TCF=29;TCR=13;TR=23;WE=141248523;WS=141248505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,25:0.54:46
chr3	141277651	rs13084444	T	G	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.782;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=112;ReadPosRankSum=0.417;SC=TTGAATATTTTGCAGATGATC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=6;WE=141277659;WS=141277641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr3	141299397	rs10635293	T	TACACAC	110.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.852;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.07;MQRankSum=1.602;QD=10.07;ReadPosRankSum=0.365;SOR=0.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr3	141327474	rs295323	G	A	2157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.451;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=52;PP=1339;ReadPosRankSum=0.191;SC=CTGTGTATCTGAACGGAAATT;SOR=0.741;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=244;TCF=120;TCR=124;TR=101;WE=141327482;WS=141327464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,110:0.41:268
chr3	141327593	rs2312266	C	T	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.343;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=23;PP=450;ReadPosRankSum=1.323;SC=TATATCCATGCAATGTTAATA;SOR=0.204;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=62;TCF=14;TCR=48;TR=32;WE=141327601;WS=141327583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,31:0.48:64
chr3	141331222	rs2172471	G	A	768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.790;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=18;PP=384;ReadPosRankSum=0.337;SC=AATTCATCATGTATTTTGTTC;SOR=0.797;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=77;TCF=39;TCR=38;TR=35;WE=141331230;WS=141331212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,41:0.47:88
chr3	141625999	rs7622417	G	C	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=14;PP=342;ReadPosRankSum=-0.659;SC=TCCCTTTTATGTCTTTATAGG;SOR=0.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=36;TCR=31;TR=30;WE=141626007;WS=141625989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,36:0.45:80
chr3	141641015	rs3765155	C	G	1508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=3.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.540;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=41;PP=995;ReadPosRankSum=0.370;SC=TTAATTTGTGCGTCATCTATT;SOR=1.201;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=116;TCF=39;TCR=77;TR=56;WE=141641023;WS=141641005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,67:0.50:135
chr3	141644274	rs1131029	G	C	453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=3;PP=312;SC=CTGGGCAACAGTCTCAAAAAG;SOR=2.049;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=141644282;WS=141644264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	141709083	rs6440055	A	G	1537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.98;SOR=0.800;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr3	141712296	rs11569212	C	T	647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=10;PP=330;ReadPosRankSum=-0.099;SC=AGAAAAACATCGCATTAAACC;SOR=0.819;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=54;TCF=33;TCR=21;TR=27;WE=141712304;WS=141712286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,32:0.50:64
chr3	141812759	rs9877817	G	A	3377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=50;PP=2030;SC=ATATAGCACAGGATTTGGCAC;SOR=0.862;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=66;TCR=50;TR=116;WE=141812767;WS=141812749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr3	141896522	rs11925747	T	A	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=1.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.62;ReadPosRankSum=-0.544;SOR=0.512;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,26:0.46:56
chr3	141896532	rs11925749	T	C	746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=2.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.56;ReadPosRankSum=-0.378;SOR=0.304;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,21:0.44:48
chr3	141904474	rs6785098	C	T	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=45;ReadPosRankSum=-0.091;SC=AACTAAATACCACTCAGAATT;SOR=0.582;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=5;WE=141904482;WS=141904464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr3	141904977	rs6440065	G	A	1257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.676;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=20;PP=795;ReadPosRankSum=-0.972;SC=TTTTCCCCACGAAACAAAATG;SOR=0.600;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=121;TCF=81;TCR=40;TR=58;WE=141904985;WS=141904967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,62:0.48:128
chr3	141923506	rs9830411	C	T	1591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=24;PP=1242;SC=AAAAAACCAACAATATCCAAA;SOR=0.899;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=73;TCF=49;TCR=24;TR=69;WE=141923514;WS=141923496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr3	141932356	rs6440072	G	A	9440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=165;NR=150;PP=2965;SC=GCTTATCACAGAATGTACTTA;SOR=0.739;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=315;TCF=165;TCR=150;TR=315;WE=141932364;WS=141932346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,354:1.00:354
chr3	141932531	rs11926898	T	C	903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=25;PP=729;SC=AAATCCAATATAATCTTTAAG;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=141932539;WS=141932521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	142048450	rs115294670	A	G	1309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.380;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=28;PP=631;ReadPosRankSum=-2.319;SC=GCTTGTTCATATAAGATGCTA;SOR=0.446;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=106;TCF=46;TCR=60;TR=54;WE=142048458;WS=142048440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,64:0.53:121
chr3	142094816	.	GCA	G	191.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.160;ClippingRankSum=0.000;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=1.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQRankSum=1.849;QD=3.76;ReadPosRankSum=-1.389;SOR=0.313;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,12:0.24:51
chr3	142131378	rs145791361	G	C	1219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.211;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=19;PP=788;ReadPosRankSum=-0.349;SC=ATTATTTCATGCACTGACCTC;SOR=1.070;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=120;TCF=73;TCR=47;TR=55;WE=142131386;WS=142131368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,59:0.45:131
chr3	142215120	.	CTATATATATATATATATATATATATATATATATATATA	C,CTA	814.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.45;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1,1;NR=1,1;PP=150,72;SC=TAATTCCCGACTATATATATA;SOR=2.419;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=2,2;WE=142215165;WS=142215110;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:19
chr3	142257273	rs142734498	A	C	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.419;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=246;ReadPosRankSum=-0.834;SC=TTGAGACATAAAAATACAGTT;SOR=0.963;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=41;TCF=35;TCR=6;TR=16;WE=142257281;WS=142257263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,18:0.40:45
chr3	142259706	rs201551475	CA	C	51.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=1.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.85;ReadPosRankSum=0.637;SOR=1.501;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,7:0.25:28
chr3	142272275	.	AAC	A	106.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=0.000;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=1.579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.43;ReadPosRankSum=1.814;SOR=1.048;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,8:0.18:44
chr3	142413407	rs6789958	C	T	1327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=28;PP=863;ReadPosRankSum=-1.267;SC=TTTTATTGTGCTTCAGCTTTA;SOR=0.703;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=107;TCF=49;TCR=58;TR=49;WE=142413415;WS=142413397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,59:0.46:127
chr3	142417070	rs3773504	G	A	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.40;ReadPosRankSum=-0.484;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr3	142443441	rs78975236	G	A	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.295;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=142;ReadPosRankSum=0.292;SC=CCTCTCGGGCGCCTCCTCCTC;SOR=0.460;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=34;TCR=12;TR=15;WE=142443449;WS=142443431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,15:0.32:47
chr3	142467310	rs56246347	C	T	1849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.206;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=51;PP=1072;ReadPosRankSum=1.114;SC=CAGGTTAGAACATTAAACTTT;SOR=0.798;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=162;TCF=64;TCR=98;TR=82;WE=142467318;WS=142467300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,90:0.51:177
chr3	142503605	rs7621642	G	A	3335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.888;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=77;PP=2258;ReadPosRankSum=-1.004;SC=GACAGATGTCGGGTTACCGAC;SOR=0.778;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=277;TCF=139;TCR=138;TR=146;WE=142503613;WS=142503595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,154:0.50:306
chr3	142522753	rs56239979	A	T	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.645;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=231;ReadPosRankSum=-2.189;SC=TTTGATATAAACAAATGATTC;SOR=0.148;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=16;WE=142522761;WS=142522743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr3	142523349	rs3821647	G	A	2943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.165;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=59;PP=1805;ReadPosRankSum=-2.242;SC=ACAAATGTACGTTACCTCCAC;SOR=0.837;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=222;TCF=119;TCR=103;TR=129;WE=142523357;WS=142523339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,138:0.57:244
chr3	142523555	rs4259003	G	A	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=147;ReadPosRankSum=-0.943;SC=TAAGTATGCAGGTTCCCTAAG;SOR=0.602;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=8;WE=142523563;WS=142523545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr3	142524858	rs1132030	G	A	1373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=21;PP=841;ReadPosRankSum=-1.007;SC=AGGAATGGAGGAATTTGAAAC;SOR=0.690;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=65;TCR=41;TR=54;WE=142524866;WS=142524848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,63:0.53:118
chr3	142537071	rs7772	C	G	478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.987;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=299;ReadPosRankSum=-0.867;SC=CTTTCGGAATCCTCTTTCAGA;SOR=0.223;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=17;WE=142537079;WS=142537061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
chr3	142542244	rs45467800	C	A	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=185;ReadPosRankSum=-1.659;SC=GGTGTATAGGCAAGTATTTTC;SOR=0.914;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=10;WE=142542252;WS=142542234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr3	142567327	rs893883	G	A	1737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.806;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=41;PP=887;ReadPosRankSum=0.135;SC=GCCAAGAAAAGCGCCAATTAG;SOR=0.542;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=163;TCF=70;TCR=93;TR=75;WE=142567335;WS=142567317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,87:0.45:193
chr3	142607767	rs35783198	C	T	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=168;ReadPosRankSum=-2.255;SC=GGTTTGCACCCCACGGCGCGC;SOR=0.519;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=15;WE=142607775;WS=142607757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,15:0.36:42
chr3	142669479	rs4683440	A	G	1570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.172;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.98;MQRankSum=0.842;NF=47;NR=29;PP=1105;ReadPosRankSum=0.086;SC=CTATGGGGTAACTCAGAGAAT;SOR=0.811;Source=Platypus;TCF=107;TR=76;WE=142669487;WS=142669469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,76:0.41:186
chr3	142670467	rs2270767	C	T	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.174;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=281;ReadPosRankSum=1.156;SC=AGAAGAATTACAGGAGTGGAC;SOR=1.609;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=37;TCF=33;TCR=4;TR=18;WE=142670475;WS=142670457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr3	142670616	rs2270768	A	G	3520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.584;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=74;PP=2152;ReadPosRankSum=1.171;SC=CTTTGAGAAAATTGATGTCAG;SOR=0.533;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=287;TCF=155;TCR=132;TR=149;WE=142670624;WS=142670606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,165:0.51:324
chr3	142720348	rs766360	G	A	170.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=0;PP=107;SC=CCCTAAGGTCGCTATCTCGAC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=142720356;WS=142720346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	142730774	rs2124541	T	G	7802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=134;NR=127;PP=2965;SC=TGAATCAGACTTGGGGATTTT;SOR=0.741;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=261;TCF=134;TCR=127;TR=261;WE=142730782;WS=142730764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,299:1.00:299
chr3	142752293	rs1449869	G	A	427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=9;PP=243;SC=AGAATAAGAAGTACAGTCAGC;SOR=2.448;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=142752301;WS=142752283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	142773738	rs10935479	C	T	2215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=17;SC=AATGAATACCCGATCCTTTGC;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=49;TCR=17;TR=66;WE=142773746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr3	142895298	.	T	G	630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.853;ClippingRankSum=0.000;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.697;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-4.350;NF=22;NR=8;PP=409;ReadPosRankSum=-1.156;SC=TAGCGGGGGGTTCCCGGGAGG;SOR=1.609;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=77;TCF=54;TCR=23;TR=30;WE=142895306;WS=142895288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,31:0.34:92
chr3	142985100	rs1046706	G	T	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=0.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.328;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=107;ReadPosRankSum=-2.601;SC=TAAATAGCTGGGCATTCCCTT;SOR=0.972;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=29;TCF=12;TCR=17;TR=11;WE=142985108;WS=142985090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,14:0.40:35
chr3	142985717	rs2289491	T	C	1983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=42;PP=977;ReadPosRankSum=0.115;SC=TGGTAATTTATGGCTAGTTCA;SOR=0.681;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=174;TCF=89;TCR=85;TR=85;WE=142985725;WS=142985697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,95:0.48:197
chr3	143214114	rs838598	T	C	2166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=13;PP=1575;SC=ACAGAATAATTCGTAAAAGTA;SOR=2.505;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=66;TCF=52;TCR=14;TR=65;WE=143214122;WS=143214104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr3	143271365	rs1525861	A	C	914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=25;PP=475;ReadPosRankSum=-0.571;SC=GGGCTATTCCAGTTGGAAAAT;SOR=0.706;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=89;TCF=40;TCR=49;TR=44;WE=143271373;WS=143271355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,48:0.49:98
chr3	143293012	rs6763202	A	G	2096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.885;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=36;PP=1156;ReadPosRankSum=-0.927;SC=TCGGGAACTCACACAGCTTGG;SOR=0.901;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=181;TCF=101;TCR=80;TR=93;WE=143293020;WS=143293002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,104:0.52:201
chr3	143567207	rs11714060	A	G	3244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=72;PP=2165;SC=ACCTGGATAAAGGCTATTTTA;SOR=2.303;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=99;TCF=26;TCR=73;TR=98;WE=143567215;WS=143567197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr3	145788467	rs6710	T	C	1320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=12;PP=897;SC=CAGTCATTCATCCAAAATAAA;SOR=1.559;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=30;TCR=12;TR=42;WE=145788475;WS=145788457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr3	145788803	rs2305274	T	C	1383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=11;PP=1057;SC=TTTTGAAAAATCTAAAAACAC;SOR=2.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=34;TCR=11;TR=45;WE=145788811;WS=145788793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr3	145790948	rs7639592	A	G	407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=339;SC=CAGTAATTGAATCAAATAAAT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=145790956;WS=145790938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	145794776	rs142623177	CTTTA	C	497.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=224;SC=TAATTTCTATCTTTATATTTC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=5;WE=145794787;WS=145794766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	145795559	rs9874388	A	G	563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=1;PP=328;SC=CTAAATGCAAATAAGGCCCTT;SOR=3.500;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=145795567;WS=145795549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	145803138	rs1375583	T	C	1812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.28;SOR=2.461;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr3	145803142	rs1375582	T	A	1705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.38;SOR=3.026;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr3	145804524	rs3804668	C	A	365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=2;PP=274;SC=TTTTTCTTAACGTTTCCTTAG;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=145804532;WS=145804514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	145809750	rs3792341	T	C	1210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=24;PP=770;SC=GGTTTCATTCTATAATCATCT;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=15;TCR=24;TR=39;WE=145809758;WS=145809740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr3	145820684	rs3762691	G	A	2115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=38;PP=1129;SC=TAAAATACGTGTGTGTGTGTC;SOR=1.058;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=33;TCR=38;TR=71;WE=145820692;WS=145820674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr3	145824478	rs9289716	A	G	2347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=51;PP=1591;SC=TTCAAAGACCAAAACTGGTGT;SOR=1.697;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=26;TCR=51;TR=77;WE=145824486;WS=145824468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr3	145824504	rs7614409	G	A	1313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=31;PP=928;SC=TAATTTCACTGACCAGTTGAA;SOR=2.409;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=41;WE=145824512;WS=145824494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr3	145828256	rs3842573	G	GT	1712.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=35;PP=1640;SC=AGGAAAAAATGTGTTTTAAAA;SOR=3.611;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=36;WE=145828264;WS=145828246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr3	145838895	rs4681297	C	T	6941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=139;NR=72;PP=2965;SC=GGTGTTTCTCCTACCATTCAG;SOR=1.298;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=211;TCF=139;TCR=72;TR=211;WE=145838903;WS=145838885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr3	145841294	rs10663012	A	AAAAC	620.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5006;FS=3.096;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.530;NF=0;NR=7;PP=273;ReadPosRankSum=1.344;SC=CCTCTAAATGAAAACAAACAA;SOR=2.049;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=7;WE=145841302;WS=145841284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,16:0.89:18
chr3	145841854	rs6802384	T	C	1212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=8;PP=882;SC=TTACAGATTGTACTGCTGTTA;SOR=2.531;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=32;TCR=8;TR=40;WE=145841862;WS=145841844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr3	145917761	rs1061409	T	C	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.46;ReadPosRankSum=-0.443;SOR=0.713;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,26:0.25:105
chr3	145924591	rs35080966	A	AT	98.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.754;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.793;NF=0;NR=4;PP=48;ReadPosRankSum=-1.764;SC=TATTAACACTAAAGTTAGCAT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=4;WE=145924599;WS=145924581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr3	145924632	rs3762688	C	T	217.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=7;PP=162;SC=ATAGATCACACGACATCCACT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=145924640;WS=145924622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	145938528	rs3762686	C	A	765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=3;PP=579;SC=TTAATTTGTTCGCTTAAAAAG;SOR=3.611;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=25;WE=145938536;WS=145938518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	145938619	rs3762685	T	C	1783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=24;PP=957;ReadPosRankSum=-1.032;SC=AAAATGAGAATTGTATTCAGG;SOR=0.732;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=124;TCF=79;TCR=45;TR=70;WE=145938627;WS=145938609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,83:0.60:138
chr3	145938782	rs9850144	C	T	892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=23;PP=560;ReadPosRankSum=1.741;SC=TATTCTTTTTCCTTTCTTATG;SOR=0.734;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=18;TCR=42;TR=33;WE=145938790;WS=145938772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,37:0.56:66
chr3	145939691	rs3804648	C	T	446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.34;SOR=1.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
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chr3	145939776	rs3804647	T	G	606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.032;HP=5;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=8;PP=283;ReadPosRankSum=0.443;SC=CGAAATAAAGTCCCCCTTTAG;SOR=0.551;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=56;TCF=34;TCR=22;TR=21;WE=145939784;WS=145939766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,20:0.35:57
chr3	146167249	rs3765179	T	C	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=125;ReadPosRankSum=0.105;SC=AATATTATAGTACATTTATGC;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=6;WE=146167257;WS=146167239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr3	146172109	rs6786556	G	A	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=27.35;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr3	146172112	rs11926182	C	T	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=27.35;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr3	146177923	rs6806643	C	T	1089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.315;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=31;PP=672;ReadPosRankSum=-0.442;SC=AGTCATCAATCCTTTTTAGAA;SOR=0.446;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=121;TCF=51;TCR=70;TR=58;WE=146177932;WS=146177913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,59:0.48:124
chr3	146179536	rs6440440	G	T	1980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.526;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=44;PP=1333;ReadPosRankSum=-0.994;SC=ATGCATGGTTGTCACCAAAGC;SOR=0.635;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=175;TCF=94;TCR=81;TR=90;WE=146179544;WS=146179526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,95:0.49:193
chr3	146213570	rs72286809	TTAGG	T	955.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.209;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=781;ReadPosRankSum=-0.297;SC=AAGGTCCCCATTAGGTAGTTC;SOR=0.960;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=50;TCF=37;TCR=13;TR=18;WE=146213581;WS=146213560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,26:0.44:59
chr3	146243369	rs2688693	G	T	710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.729;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=18;PP=458;ReadPosRankSum=1.412;SC=TATAGAAACAGGATTAAAACA;SOR=0.553;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=65;TCF=34;TCR=31;TR=33;WE=146243377;WS=146243359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,34:0.52:66
chr3	146246288	rs2738909	A	G	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=309;ReadPosRankSum=-2.048;SC=CTGTTAGCAGAAAATACAGTT;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=17;WE=146246296;WS=146246278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr3	146251430	rs2738905	A	G	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=1.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.40;ReadPosRankSum=-0.205;SOR=1.420;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr3	146251433	rs2587024	T	G	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=1.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.39;ReadPosRankSum=0.595;SOR=1.236;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr3	146303750	rs342902	G	A	1011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=9;PP=599;SC=ATGAAAAAGAGTTAGATAGCG;SOR=1.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=33;WE=146303758;WS=146303740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr3	146307371	rs343288	G	A	1297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.331;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=22;PP=882;ReadPosRankSum=0.162;SC=AAATGGGATAGGCTATATTGT;SOR=0.497;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=120;TCF=80;TCR=40;TR=59;WE=146307379;WS=146307361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,63:0.47:133
chr3	146307635	rs343289	C	A	873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=22;PP=613;SC=TTAAATTTGACAGTGAAAAAA;SOR=3.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=25;WE=146307643;WS=146307625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	146309715	rs862912	A	T	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.427;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=260;ReadPosRankSum=-1.268;SC=AGGTTATCATATTTTAATTTT;SOR=1.101;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=47;TCF=10;TCR=37;TR=17;WE=146309723;WS=146309705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,19:0.39:49
chr3	146318263	rs9867955	G	A	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.064;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=261;ReadPosRankSum=0.349;SC=GCAAGAGAATGGAAATCCCAA;SOR=0.512;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=43;TCF=19;TCR=24;TR=18;WE=146318271;WS=146318253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,24:0.44:54
chr3	146322886	rs9818634	G	C	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=138;ReadPosRankSum=-0.419;SC=ACAAATGACAGCTTTTAAAGT;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=8;WE=146322894;WS=146322876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr3	147111779	rs62273364	T	C	2900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=58;PP=1501;ReadPosRankSum=-1.183;SC=TTGCCGCTTCTGCTACTCGAG;SOR=1.047;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=47;TCR=59;TR=104;WE=147111787;WS=147111769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,116:0.98:118
chr3	147111904	.	C	CCTCT	81.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.08;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr3	147113586	rs73004638	A	T	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.854;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=178;ReadPosRankSum=0.741;SC=TCCAGACCCGAGGGCCTGCTT;SOR=0.061;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=13;WE=147113594;WS=147113576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr3	148459395	rs5182	C	T	3149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.919;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=66;PP=1865;ReadPosRankSum=0.253;SC=ATTCAACCCTCCCGATAGGGC;SOR=0.570;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=266;TCF=129;TCR=137;TR=133;WE=148459403;WS=148459385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,148:0.50:298
chr3	148459988	rs5186	A	C	1770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.615;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=49;PP=1232;ReadPosRankSum=-0.971;SC=CCAAATGAGCATTAGCTACTT;SOR=0.597;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=154;TCF=52;TCR=102;TR=75;WE=148459996;WS=148459978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,79:0.47:167
chr3	148558447	rs2291671	G	A	750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=6;PP=550;ReadPosRankSum=-0.014;SC=TATGTTCATAGGAACACCCAC;SOR=0.520;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=59;TCF=48;TCR=11;TR=30;WE=148558455;WS=148558437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,31:0.50:62
chr3	148562310	rs1059502	G	A	2751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.508;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=45;PP=1676;ReadPosRankSum=-0.291;SC=AGAGCTTCTCGACAAGTTAGA;SOR=0.770;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=204;TCF=123;TCR=81;TR=119;WE=148562329;WS=148562300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,127:0.58:220
chr3	148562397	rs13318851	G	C	5827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FS=0.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.59;ReadPosRankSum=-1.213;SOR=0.650;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:135,148:0.52:283
chr3	148562397	.	GAG	CAA	2944	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=62;NR=66;PP=2944;QD=20;SC=AATACTGAGAGAGGCTGATGA;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=256;TCF=129;TCR=127;TR=128;WE=148562407;WS=148562387;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:128,128:0.50:256
chr3	148562399	rs13318853	G	A	5827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FS=2.538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.24;ReadPosRankSum=-1.173;SOR=0.641;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:137,151:0.52:288
chr3	148575156	rs2331407	C	T	1317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=6;PP=940;SC=TACTTACATGCTTTGAATGCC;SOR=3.516;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=35;TCR=6;TR=41;WE=148575164;WS=148575146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr3	148575441	rs1356259	C	T	1208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=13;NR=28;PP=731;SC=TGCCTCACAGCAAATTTTTCT;SOR=1.714;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=48;TCF=14;TCR=34;TR=41;WE=148575449;WS=148575431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr3	148575476	.	C	CAA	52	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;FR=0.7009;HP=13;HapScore=2;MGOF=36;MMLQ=16;MQ=63.02;NF=0;NR=4;PP=52;QD=14.25;SC=GTTTTCTGTTCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=148575484;WS=148575466;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:2,4:0.67:6
chr3	148597482	rs1032465	T	G	801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=0;PP=672;SC=ACAGGGGAAATAATTGCTTTG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=148597490;WS=148597472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	148597612	rs12489516	C	T	6593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=133;NR=95;PP=2965;SC=GCTATTTTTACGGATTGTGGC;SOR=0.986;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=228;TCF=133;TCR=95;TR=228;WE=148597620;WS=148597602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr3	148714841	rs151126996	TTG	T	156.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=214;ReadPosRankSum=-1.085;SC=CTGGGAAATATTGTGTGTGTG;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=6;WE=148714850;WS=148714831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr3	148756825	rs6764352	G	A	2130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=21;PP=1364;SC=AAAATTTACAGAACTACTTAC;SOR=1.670;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=50;TCR=21;TR=71;WE=148756833;WS=148756815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr3	148786108	rs812249	C	T	1398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=29;PP=790;ReadPosRankSum=-0.092;SC=CTGCAATGGCCGTAAGAGTTT;SOR=0.487;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=129;TCF=59;TCR=70;TR=58;WE=148786116;WS=148786098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,68:0.47:146
chr3	148858353	rs151222115	A	AAGGT	1407.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.399;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.846;NF=0;NR=21;PP=1068;ReadPosRankSum=1.161;SC=TGGCAGTCTGAAGGTCTGTGG;SOR=0.390;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=1;TCR=43;TR=21;WE=148858361;WS=148858343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,35:0.60:58
chr3	148858987	.	CT	C	44.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.056;ClippingRankSum=0.000;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.35;ReadPosRankSum=0.745;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr3	148868292	rs150286093	GC	G	375.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=452;ReadPosRankSum=-0.853;SC=TGTCACCCCTGCCCATTGCCC;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=13;WE=148868300;WS=148868283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr3	148868361	rs2689232	C	T	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=418;ReadPosRankSum=0.911;SC=TCACTTTGCTCAGCAGCCTGT;SOR=0.542;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=37;TCF=26;TCR=11;TR=26;WE=148868369;WS=148868351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,28:0.68:41
chr3	148872987	rs6440589	G	A	1159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=26;PP=574;ReadPosRankSum=0.287;SC=CACCAGTGCAGCTGTACAAAG;SOR=0.653;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=55;TCR=60;TR=51;WE=148872995;WS=148872977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,59:0.45:131
chr3	148879878	rs61615092	A	G	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.741;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=254;ReadPosRankSum=2.052;SC=GTATTTCTAAAATGGACAATC;SOR=0.287;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=17;WE=148879886;WS=148879868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr3	148881673	rs3732557	C	T	975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.86;ReadPosRankSum=2.866;SOR=0.653;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,50:0.51:99
chr3	148885077	rs2681092	C	T	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.039;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=221;ReadPosRankSum=-0.604;SC=ATAATCAGATCTGATAACCTC;SOR=1.538;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=12;WE=148885085;WS=148885067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr3	148885779	rs11426099	A	AT	665.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.314;HP=10;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.392;NF=2;NR=15;PP=314;ReadPosRankSum=-1.292;SC=AGGTAAAATGATTTTTTTTTT;SOR=1.250;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=17;WE=148885787;WS=148885769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,26:0.96:27
chr3	148885851	rs2681096	G	A	135.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=0;NR=5;PP=105;SC=GTATTTTCATGTGATTCTCAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=148885859;WS=148885841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	148895654	rs34394958	A	G	2520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.468;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=48;PP=1583;ReadPosRankSum=1.208;SC=GGCCGTGAAAATGTACAGTGT;SOR=0.637;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=227;TCF=132;TCR=95;TR=109;WE=148895662;WS=148895644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,118:0.48:247
chr3	148896430	rs16861582	A	G	4922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=85;PP=2965;SC=TGGAAACAAGAAAAATCTTCA;SOR=0.844;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=80;TCR=85;TR=165;WE=148896438;WS=148896420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr3	148897498	.	TAC	TACAC,T	393	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=8;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=0,0;NR=10,10;PP=393,310;QD=39.6;SC=GTTTATATTGTACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=10,10;WE=148897507;WS=148897488;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.50:20
chr3	148901406	.	AC	A	300	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.54;FR=0.5000;HP=10;HapScore=3;MGOF=17;MMLQ=28;MQ=57.85;NF=0;NR=6;PP=300;QD=51.5;SC=AAAAAAAAAAACAACTAAGGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=6;WE=148901414;WS=148901395;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,6:0.43:14
chr3	148916235	rs701753	T	A	4834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=1.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.035;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=-1.081;NF=88;NR=79;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.111;SC=CTTTAGTGGGTTCCACAGCAG;SOR=0.260;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=168;TCF=89;TCR=79;TR=167;WE=148916243;WS=148916225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,174:0.99:175
chr3	149039324	rs2015626	G	A	698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.854;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=523;ReadPosRankSum=-0.440;SC=TTATAAACTTGGCTTGATTAG;SOR=1.282;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=54;TCF=19;TCR=35;TR=29;WE=149039332;WS=149039314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,30:0.51:59
chr3	149042596	rs116569142	G	A	1054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=16;PP=577;ReadPosRankSum=-2.966;SC=TGGAAAATGAGCGTGAGCTTG;SOR=0.760;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=97;TCF=59;TCR=38;TR=43;WE=149042604;WS=149042586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,51:0.47:109
chr3	149050925	rs1526786	T	C	1537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.417;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=19;PP=966;ReadPosRankSum=-0.681;SC=TCATTACTTCTACTAGTTACA;SOR=0.849;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=125;TCF=86;TCR=39;TR=62;WE=149050933;WS=149050915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,71:0.50:141
chr3	149087404	rs8479	T	C	58.81	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5081;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=35;ReadPosRankSum=-1.150;SC=AGTCTGTAAATTACCCCCAGA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=3;WE=149087412;WS=149087394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr3	149087714	rs6776940	T	C	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.450;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.10;ReadPosRankSum=-0.366;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr3	149093238	rs4771	A	G	1331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=23;PP=785;ReadPosRankSum=-0.915;SC=ACTGGCCCTCAGTGCTGGCAA;SOR=0.774;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=114;TCF=71;TCR=43;TR=58;WE=149093246;WS=149093228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,63:0.51:123
chr3	149192676	rs12488126	G	A	2451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=19;PP=1716;SC=TGTGCACTGGGGGCTGTGCCA;SOR=2.247;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=59;TCR=19;TR=78;WE=149192684;WS=149192666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr3	149192851	rs143312618	G	GC	8913.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=102;PP=2957;SC=GAGTAGGGAAGCTTAAAATCC;SOR=1.179;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=113;TCF=8;TCR=105;TR=110;WE=149192859;WS=149192841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr3	149243694	rs9854499	G	C	1132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=9;PP=751;SC=TAAAATAAAAGTTGAAATTAT;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=35;WE=149243702;WS=149243684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr3	149258970	rs5853413	CA	C	667.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=17;PP=635;SC=CTTTTCTCCCCAAAAATGTAG;SOR=2.030;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=18;WE=149258978;WS=149258960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	149459341	rs7633238	A	G	3189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=23;PP=1888;SC=TCCTACAGTGATTTGTCTTCA;SOR=1.739;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=72;TCR=23;TR=95;WE=149459349;WS=149459331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr3	149459413	rs11549572	C	T	2242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.491;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=41;PP=1157;ReadPosRankSum=0.624;SC=GGTCTGTCTGCAGAACTTTGG;SOR=0.656;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=191;TCF=108;TCR=83;TR=95;WE=149459421;WS=149459403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,110:0.50:218
chr3	149468530	rs9843784	T	G	2362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.008;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=52;PP=1409;ReadPosRankSum=-0.235;SC=TCACTCAGAATCGTTCTGATC;SOR=0.732;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=211;TCF=107;TCR=104;TR=103;WE=149468538;WS=149468515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,116:0.50:232
chr3	149469159	rs41267879	C	G	2933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.585;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=64;PP=1904;ReadPosRankSum=-1.240;SC=AAGAATCCAGCCAACACAAAA;SOR=0.559;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=254;TCF=139;TCR=115;TR=134;WE=149469167;WS=149469149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,142:0.51:280
chr3	149479301	rs954714	C	T	7275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=126;NR=117;PP=2965;SC=AGTTTTCACACGCTGTCAGAC;SOR=0.722;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=243;TCF=126;TCR=117;TR=243;WE=149479309;WS=149479291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,276:1.00:276
chr3	149481843	rs73005769	T	C	2845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.693;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=71;PP=2055;ReadPosRankSum=-0.964;SC=CATGAAGGATTACATTAGGTT;SOR=0.859;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=241;TCF=110;TCR=131;TR=122;WE=149481851;WS=149481833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,128:0.48:265
chr3	149481974	rs4681189	G	A	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=226;ReadPosRankSum=1.257;SC=GTCATTTAGAGGGGTGCTCAG;SOR=0.223;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=12;WE=149481982;WS=149481964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr3	149484970	rs75077284	G	A	1886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.122;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=34;PP=1141;ReadPosRankSum=-1.512;SC=AGTAGATTGCGTTCTCCCATG;SOR=0.803;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=174;TCF=104;TCR=70;TR=84;WE=149484978;WS=149484960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,93:0.48:194
chr3	149485293	rs7610425	T	C	3074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.896;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=61;PP=1917;ReadPosRankSum=1.575;SC=GGTTTGCTGCTTGCAGTTTGT;SOR=0.691;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=266;TCF=136;TCR=130;TR=129;WE=149485301;WS=149485283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,146:0.48:303
chr3	149510242	rs151019375	C	A	830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=26;PP=574;ReadPosRankSum=-1.117;SC=CAATTAAGGACAAAAATGATA;SOR=0.586;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=65;TCF=16;TCR=49;TR=35;WE=149510250;WS=149510232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,37:0.54:69
chr3	149510262	rs4681554	A	G	1131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=8;NR=30;PP=839;SC=AGCCAGAGGCAGCTGTCACTG;SOR=2.613;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=8;TCR=30;TR=38;WE=149510270;WS=149510252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr3	149564075	rs6440641	A	G	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.170;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=231;ReadPosRankSum=1.863;SC=CTTGACATTGAGGTACCTTAT;SOR=3.116;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=12;WE=149564083;WS=149564065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,12:0.41:29
chr3	149678534	rs6768054	C	T	2428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.588;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=36;PP=1560;ReadPosRankSum=0.617;SC=CAGCTTATCACTGCAAGTGTG;SOR=0.835;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=231;TCF=150;TCR=81;TR=106;WE=149678542;WS=149678524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,115:0.46:252
chr3	149686367	rs61268501	AC	A	446.37	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=2.689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.88;ReadPosRankSum=0.223;SOR=1.839;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,25:0.83:30
chr3	149700519	rs7630407	T	C	3832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=366;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.210;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.141;NF=79;NR=83;PP=2337;ReadPosRankSum=1.477;SC=AGCTTCTCCATTGACTCTGGT;SOR=0.765;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=337;TCF=170;TCR=167;TR=162;WE=149700527;WS=149700509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:181,185:0.51:366
chr3	149700701	rs150959662	T	C	1955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.283;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.483;NF=45;NR=42;PP=1318;ReadPosRankSum=-0.410;SC=CATGGGATACTCTTCTCCTCC;SOR=0.590;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=198;TCF=106;TCR=92;TR=87;WE=149700709;WS=149700691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,95:0.42:226
chr3	149701113	rs34404328	CG	C	311.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.525;NF=0;NR=6;PP=203;ReadPosRankSum=0.745;SC=GCCAGAGAGCCGGCCCCGGTA;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=6;WE=149701121;WS=149701103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr3	150128154	rs61734437	T	C	2341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.134;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=42;PP=1350;ReadPosRankSum=-0.086;SC=TGTCCCTGCCTCCGCAGCCGG;SOR=0.570;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=219;TCF=131;TCR=88;TR=98;WE=150128162;WS=150128144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,114:0.45:251
chr3	150128392	rs879634	G	A	997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.673;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=24;PP=569;ReadPosRankSum=0.723;SC=CGGCCAGAATGCTTCCTCGGT;SOR=0.528;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=86;TCF=38;TCR=48;TR=44;WE=150128400;WS=150128382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,48:0.51:94
chr3	150128484	rs3749400	C	A	1042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.766;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=16;PP=578;ReadPosRankSum=-0.396;SC=GCGGGCAGGTCGCGCCTTGTC;SOR=0.783;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=81;TCF=47;TCR=34;TR=41;WE=150128492;WS=150128474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,49:0.51:96
chr3	150128994	rs34647320	T	G	3851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=439;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.732;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=99;NR=83;PP=2362;ReadPosRankSum=1.871;SC=TGAAGCCGCCTGTTGCAGATT;SOR=0.796;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=393;TCF=205;TCR=188;TR=182;WE=150129002;WS=150128984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:235,202:0.46:437
chr3	150129171	rs3840253	A	AT	1359.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=27;PP=1245;SC=ACTTTGGGAGATTGTTGTCAA;SOR=2.670;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=28;WE=150129179;WS=150129161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr3	150262318	rs1533816	C	T	820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.731;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=24;PP=495;ReadPosRankSum=-0.427;SC=TTAAAATAAGCTTTGAATAAA;SOR=0.793;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=101;TCF=44;TCR=57;TR=40;WE=150262326;WS=150262308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,44:0.39:112
chr3	150264003	rs1130834	G	C	1536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=47;PP=861;ReadPosRankSum=0.051;SC=TGCGAGGCTCGGCTCGTGGTG;SOR=0.779;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=112;TCF=29;TCR=83;TR=62;WE=150264011;WS=150263993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,72:0.58:125
chr3	150270077	rs12330655	C	G	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.654;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=284;ReadPosRankSum=-1.550;SC=TTTTAAAAAACACATTTGTGT;SOR=0.252;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=17;WE=150270085;WS=150270067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr3	150276391	rs6776252	A	G	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.360;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=137;ReadPosRankSum=0.349;SC=CTCTCGTTACACAAAATACCT;SOR=0.495;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=8;WE=150276399;WS=150276381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr3	150280253	rs4343650	A	T	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.968;NF=20;NR=5;PP=335;ReadPosRankSum=2.141;SC=ATTTGAAAAGAGGTATGAATG;SOR=0.829;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=59;TCF=47;TCR=12;TR=25;WE=150280261;WS=150280243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,27:0.45:60
chr3	150280445	rs1132979	C	G	2836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.542;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.629;NF=52;NR=67;PP=1657;ReadPosRankSum=1.081;SC=CAGCCTTACACTAGTAAGTAT;SOR=0.800;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=225;TCF=98;TCR=127;TR=119;WE=150280453;WS=150280435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,133:0.53:249
chr3	150280506	rs5853483	GA	G	1074.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.279;HP=6;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.726;NF=2;NR=30;PP=954;ReadPosRankSum=0.033;SC=TAGTGGGGGGGAAAAAGTTAT;SOR=1.158;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=62;TCF=3;TCR=59;TR=32;WE=150280514;WS=150280496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,45:0.51:88
chr3	150282211	rs62269102	C	G	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.201;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=192;ReadPosRankSum=0.354;SC=TTACTGTAATCGTATACAGTT;SOR=0.204;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=35;TCF=12;TCR=23;TR=18;WE=150282219;WS=150282201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr3	150286088	rs62283993	T	A	2281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.519;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=61;PP=1296;ReadPosRankSum=-0.154;SC=ACGTGAGTATTCCAGCAGTCT;SOR=0.633;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=192;TCF=79;TCR=113;TR=104;WE=150286096;WS=150286078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,112:0.53:210
chr3	150332199	rs1568586	T	G	84.98	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=17.00;ReadPosRankSum=-1.282;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr3	150332261	rs76738873	A	C	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.376;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=216;ReadPosRankSum=-0.025;SC=GCTAGAAAGGATCTTACACAT;SOR=0.408;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=38;TCF=33;TCR=5;TR=16;WE=150332269;WS=150332251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,18:0.39:46
chr3	150340114	rs2177148	A	G	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.450;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=58;ReadPosRankSum=-0.674;SC=TTAACTAACTACAAAATAAAT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=4;WE=150340122;WS=150340104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr3	150384807	rs6440691	T	G	4326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=82;PP=2580;SC=TATACCCTGGTCAGGAAGGAA;SOR=1.136;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=144;TCF=62;TCR=82;TR=144;WE=150384815;WS=150384797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr3	150387059	rs17215176	A	G	611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=12;PP=427;ReadPosRankSum=1.988;SC=ACAAAATGGCAGCAGCAGGAA;SOR=0.652;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=69;TCF=47;TCR=22;TR=32;WE=150387067;WS=150387049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,33:0.42:78
chr3	150391810	rs73003074	A	C	2983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.436;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=66;PP=1471;ReadPosRankSum=-0.209;SC=TGCTTCTCTAAGAGCTCATTC;SOR=0.720;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=241;TCF=124;TCR=117;TR=131;WE=150391818;WS=150391800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,147:0.53:278
chr3	150403749	rs4680107	T	C	673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=16;PP=337;ReadPosRankSum=0.196;SC=TAAACATTTCTTACCTCCAGC;SOR=0.799;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=70;TCF=29;TCR=41;TR=28;WE=150403757;WS=150403739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,34:0.44:78
chr3	150420588	rs10663389	G	GTTAAA	3319.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.13;QD=45.48;SOR=0.963;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr3	150420606	rs9824030	T	G	964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=3.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=-0.892;QD=15.31;ReadPosRankSum=0.690;SOR=1.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,29:0.46:63
chr3	150420608	rs9879627	G	GT,T	1186.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.17;MQRankSum=0.000;QD=24.22;ReadPosRankSum=-0.037;SOR=0.990;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:5,16,28:0.33,0.57:49
chr3	150420676	.	A	AGTGTGT	397.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.011;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.89;ReadPosRankSum=-0.343;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr3	150420781	rs71676608	CAG	C	589.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.81;ReadPosRankSum=-0.875;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr3	150421419	rs17281287	G	A	1978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=40;PP=1131;ReadPosRankSum=0.947;SC=CTGGGAAGTCGTCGTCGTAGT;SOR=0.660;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=165;TCF=85;TCR=80;TR=85;WE=150421427;WS=150421409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,95:0.54:177
chr3	150601401	rs13069091	C	T	3083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=72;NR=39;PP=1986;SC=ATTCAGATTGCTTTTCTTTTT;SOR=1.356;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=72;TCR=39;TR=111;WE=150601409;WS=150601389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr3	150601544	rs16862957	T	C	4063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=81;PP=2764;SC=TGGTGACATCTAGGTCCATTT;SOR=1.186;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=138;TCF=56;TCR=82;TR=137;WE=150601552;WS=150601534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr3	150603085	rs7649641	T	C	2112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=11;PP=1563;SC=GATTTTTCAATACAAGAGTAC;SOR=3.226;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=52;TCR=11;TR=63;WE=150603093;WS=150603075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr3	150661680	.	G	A	2470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.121;ClippingRankSum=0.000;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.641;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=51;PP=1307;ReadPosRankSum=1.078;SC=TCCTGCACTCGTTCACTCGTG;SOR=0.635;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=199;TCF=103;TCR=96;TR=109;WE=150661688;WS=150661670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,122:0.55:221
chr3	150661842	rs11914988	T	G	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.492;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=117;ReadPosRankSum=-2.610;SC=AATAGGGTAATGGGATTTTGA;SOR=0.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=7;WE=150661850;WS=150661832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr3	150690566	rs3796240	T	C	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.006;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=328;ReadPosRankSum=0.143;SC=AGGGACTGCCTCTTTGACTGC;SOR=0.307;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=19;WE=150690574;WS=150690556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,21:0.64:33
chr3	150834015	rs4680158	G	A	973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=4;PP=812;SC=CCTTTCAAGAGTTCTCCTCTA;SOR=3.477;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=30;WE=150834023;WS=150834005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
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chr3	150910640	rs1231520	G	C	396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=15;PP=316;SC=TCTGTAAATTGGAACACTCCT;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=150910648;WS=150910630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	151011944	rs12492699	A	C	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=277;ReadPosRankSum=-0.230;SC=GATTCCAACAAACAATAAAAG;SOR=0.557;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=55;TCF=38;TCR=17;TR=23;WE=151011952;WS=151011934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,28:0.45:62
chr3	151011969	rs1048408	G	A	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=277;ReadPosRankSum=-0.224;SC=ACACATCAGTGTAATCATAAT;SOR=0.749;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=69;TCF=44;TCR=25;TR=25;WE=151011977;WS=151011959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,30:0.39:77
chr3	151012497	rs2242353	T	C	11351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=406;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=178;NR=186;PP=2965;ReadPosRankSum=0.493;SC=GACCATTTGTTAGGATGATGT;SOR=0.311;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=366;TCF=179;TCR=187;TR=364;WE=151012505;WS=151012487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,405:1.00:406
chr3	151045661	rs1491980	G	C	583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=0;PP=376;SC=TTCTGTACACGAGGATAATAA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=151045669;WS=151045658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	151046308	rs1466684	G	A	4165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;SC=GCTCAAGATCGTATTTGGCAG;SOR=0.821;Source=Platypus;WE=151046316;WS=151046298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr3	151056598	rs6809699	A	C	4602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=87;PP=2909;SC=GACTGGTGTTACCAGGCGCAG;SOR=1.315;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=142;TCF=55;TCR=87;TR=142;WE=151056606;WS=151056588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr3	151056616	rs6785930	G	A	1724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=47;PP=1125;ReadPosRankSum=0.270;SC=CAGAGGTGAGGTTGTCGACGG;SOR=0.680;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=40;TCR=78;TR=71;WE=151056624;WS=151056606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,77:0.56:137
chr3	151067730	rs1565574	C	T	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-4.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=187;ReadPosRankSum=0.206;SC=GAAGGGAGGGCGGGATGCCAC;SOR=0.404;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=11;WE=151067738;WS=151067720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr3	151073033	rs7615865	T	C	3236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=71;PP=2126;SC=CTCAGGTAGCTATTTAAAGCT;SOR=2.024;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=30;TCR=71;TR=101;WE=151073041;WS=151073023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr3	151073937	rs1994730	T	C	1792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=43;PP=1080;SC=CTTGTAATCCTGGCACTTTGG;SOR=1.542;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=23;TCR=43;TR=66;WE=151073945;WS=151073927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr3	151074925	rs3732759	A	G	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.664;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=154;ReadPosRankSum=-0.018;SC=CAGTATATCTATGGTTTATAA;SOR=0.250;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=13;WE=151074933;WS=151074915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr3	151074941	rs3732760	A	C	513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.150;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=308;ReadPosRankSum=0.197;SC=TATAAAAATAAATGTTTTCTC;SOR=0.446;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=55;TCF=41;TCR=14;TR=22;WE=151074949;WS=151074931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,25:0.45:56
chr3	151085578	rs3732764	C	A	5992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=93;PP=2965;SC=CATGAACATCCGTTGCTCTTT;SOR=0.769;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=192;TCF=99;TCR=93;TR=192;WE=151085586;WS=151085568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr3	151090424	rs3732765	G	A	7499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=134;NR=124;PP=2965;SC=AGAGGTTTGCGATGTGATGGG;SOR=0.700;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=258;TCF=134;TCR=124;TR=258;WE=151090432;WS=151090414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,283:1.00:283
chr3	151096112	rs12497065	T	C	425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=14;PP=389;SC=CAAGGCTGTCTTATTCCTAAA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=151096120;WS=151096102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	151100677	rs3821663	T	G	1095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=28;PP=775;SC=CTTCCCTGTTTCTAAAGCCTT;SOR=4.235;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=31;WE=151100685;WS=151100667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	151101691	rs10935841	C	T	4129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=80;PP=2564;SC=GTTTTTATCACTTCACATTGA;SOR=1.329;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=50;TCR=80;TR=130;WE=151101699;WS=151101681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr3	151101746	rs12485508	C	T	1638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=32;PP=1084;SC=ATACTGATGGCGATTTCTGCC;SOR=1.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=14;TCR=32;TR=46;WE=151101754;WS=151101736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr3	151108070	rs56194873	GT	G	404.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=13;PP=390;SC=ACACAGAAATGTTTTTTGTTT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=151108078;WS=151108060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	151131183	rs2276764	G	A	397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=12;PP=319;SC=TCAATTGCCAGATTCCAAGGA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=151131191;WS=151131173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	151143354	rs10653830	T	TTG	767.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.77;ReadPosRankSum=-0.934;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,25:0.81:31
chr3	151143447	rs6440742	G	T	4867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=103;NR=71;PP=2965;SC=ATACCTGACAGTAGTAAGCTG;SOR=1.010;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=175;TCF=103;TCR=72;TR=174;WE=151143455;WS=151143437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr3	151154666	rs2172250	T	C	2719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=31;PP=1644;SC=GCATCTCCCATGTGATTTCTG;SOR=1.044;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=53;TCR=31;TR=84;WE=151154674;WS=151154656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr3	151155620	rs6781302	G	A	7584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=136;NR=118;PP=2965;SC=TAACAGTTCTGTTTGTATACA;SOR=0.791;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=255;TCF=136;TCR=119;TR=254;WE=151155628;WS=151155610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,277:1.00:277
chr3	151158184	rs937126	A	T	394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=0;PP=366;SC=ATTAGAGAAAATTTTTTTTTC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=14;WE=151158192;WS=151158174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	151158265	rs937125	G	A	3181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=33;PP=2127;SC=CTAAAGGAAGGGAAACTGCCA;SOR=1.672;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=75;TCR=33;TR=107;WE=151158273;WS=151158255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr3	151158502	rs10663807	T	TAG	1032.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=18;PP=893;SC=ATAATAATGATGTCTGAGTCT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=18;WE=151158510;WS=151158492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	151165678	rs9871952	T	C	4139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=63;PP=2778;SC=ATGTACGGAGTTGTGCACCTG;SOR=0.721;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=73;TCR=63;TR=136;WE=151165686;WS=151165668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr3	151166422	rs6798252	C	T	8065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=142;NR=131;PP=2965;SC=AGTACTGGATCTGTAATGTAC;SOR=0.756;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=273;TCF=142;TCR=131;TR=273;WE=151166430;WS=151166412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,295:1.00:295
chr3	151171439	rs7619322	A	C	8344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=135;NR=137;PP=2965;SC=TTGAGCCCATAAAAAACCTCT;SOR=0.839;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=272;TCF=135;TCR=137;TR=272;WE=151171447;WS=151171429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,307:1.00:307
chr3	151171542	rs7621591	A	G	2456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=56;PP=1632;SC=TTCGGACTTTATTATAGCTCA;SOR=1.718;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=28;TCR=56;TR=84;WE=151171550;WS=151171532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr3	151283646	rs7631281	T	C	78.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=0;PP=57;SC=ATTCCTGTATTAATTAATGCA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=151283654;WS=151283636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr3	151463421	rs1972977	G	T	2662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=45;PP=1510;ReadPosRankSum=-0.789;SC=AATCTGCATTGCGGGAGACAG;SOR=0.685;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=203;TCF=115;TCR=88;TR=104;WE=151463429;WS=151463411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,126:0.52:242
chr3	151531894	rs2293004	C	T	2019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=42;PP=1211;ReadPosRankSum=-2.407;SC=ACTATTCAGGCATATCATGTA;SOR=0.676;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=194;TCF=112;TCR=82;TR=95;WE=151531902;WS=151531884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,102:0.50:205
chr3	151542408	rs148745568	AAAAC	A	352.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=353;SC=CAGTCTAATCAAAACAAACAA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=8;WE=151542419;WS=151542398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	151542737	rs13098550	G	A	411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=13;PP=350;SC=AGGAGATATTGATTTTTTGAA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=151542760;WS=151542727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	151542749	rs151253803	CTATT	C	412.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=443;SC=TTTTTTGAAACTATTAAAGAG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=151542760;WS=151542727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	151545318	rs2410837	A	T	736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=3;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=1;PP=345;SC=GGGATATTTTATTGTTTTAAA;SOR=3.258;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=16;WE=151545331;WS=151545308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	151545321	rs11306821	GT	G	761.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=3;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=1;PP=611;SC=ATATTTTATTGTTTTAAATGA;SOR=3.383;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=13;WE=151545331;WS=151545308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	151545323	rs62272918	T	G	770.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=1;PP=394;SC=ATTTTATTGTTTTAAATGAAA;SOR=3.500;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=17;WE=151545331;WS=151545308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	151545601	rs1803155	G	A	8344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=143;NR=138;PP=2965;SC=CTTCAAATTTGTTAATTGGAG;SOR=0.745;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=281;TCF=143;TCR=138;TR=281;WE=151545609;WS=151545591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,316:1.00:316
chr3	151546041	rs1042201	G	A	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=80;ReadPosRankSum=-0.355;SC=GTCTTTCTTAGAATGGTCTAG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=151546049;WS=151546031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr3	151599393	rs13079080	C	T	1513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=39;PP=1106;SC=TACAGTTTGCCTTAACTCATA;SOR=3.702;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=6;TCR=39;TR=45;WE=151599401;WS=151599383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr3	152018223	rs17368446	T	G	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.650;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=293;ReadPosRankSum=-1.024;SC=GACATACAGTTCTCTGCATAT;SOR=0.307;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=45;TCF=7;TCR=38;TR=19;WE=152018231;WS=152018213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,21:0.45:47
chr3	152058449	rs13077912	A	G	4070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=362;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.233;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=87;PP=2648;ReadPosRankSum=-1.456;SC=CCAGAGTGTTAGAATCTTATT;SOR=0.626;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=327;TCF=158;TCR=169;TR=168;WE=152058457;WS=152058439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:179,183:0.51:362
chr3	152554357	rs701265	A	G	2804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=2.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.892;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=57;PP=1978;ReadPosRankSum=-0.252;SC=TTTACCTGGTAATCATTGTAC;SOR=0.586;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=271;TCF=149;TCR=122;TR=121;WE=152554365;WS=152554347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:179,132:0.42:311
chr3	153839866	rs12493885	G	C	7981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=127;NR=134;PP=2965;SC=GCCCCACCAGGTTCTGGGCCG;SOR=0.769;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=261;TCF=127;TCR=134;TR=261;WE=153839874;WS=153839856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,297:1.00:297
chr3	153839959	rs59508481	CT	TC	9677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=87;PP=2947;SC=AGGGACGCTCCTCGCAGCGCA;SOR=0.851;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=182;TCF=93;TCR=89;TR=174;WE=153839968;WS=153839949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr3	153847582	rs1626280	T	A	1599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=42;PP=1128;SC=GATTTGGCTTTTGTTCTTTTC;SOR=3.342;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=8;TCR=42;TR=50;WE=153847590;WS=153847572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr3	153870511	rs1727956	G	A	211.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=188;SC=GCTATATTTAGTTCTTTAATT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=153870519;WS=153870501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	153912641	rs12330779	C	A	1055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.257;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=24;PP=528;ReadPosRankSum=0.246;SC=TAGGTAGTTGCAAAACAAAAT;SOR=0.263;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=86;TCF=30;TCR=56;TR=43;WE=153912649;WS=153912631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,50:0.53:95
chr3	153970704	rs2307750	CTT	C	332.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.187;NF=10;NR=0;PP=311;ReadPosRankSum=2.008;SC=CATTCAGACTCTTTTGACAAT;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=10;WE=153970713;WS=153970694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr3	153970796	rs355752	A	G	4498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.087;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.157;NF=93;NR=51;PP=2695;ReadPosRankSum=-0.705;SC=ATACCTCTCTAGAGAATCTCT;SOR=1.008;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=145;TCF=93;TCR=52;TR=144;WE=153970804;WS=153970786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,163:0.99:164
chr3	153972500	rs355749	T	C	3683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=71;NR=55;PP=1880;SC=TGTCCTCTTTTGGCCTCAGCA;SOR=0.767;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=126;TCF=71;TCR=55;TR=126;WE=153972508;WS=153972486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr3	153994502	rs355787	T	C	2513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.91;SOR=1.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr3	153994502	.	TG	CA,CG	428	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=21,43;NR=8,17;PP=405,428;QD=15.8092370642;SC=CTGACTTACATGTAGATTTAA;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=62;TCF=43;TCR=19;TR=29,60;WE=153994511;WS=153994492;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.47:62
chr3	153994503	rs9289943	G	A	725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.770;SOR=0.590;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,34:0.46:74
chr3	154002357	rs200020002	A	AT	347.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.96;MQRankSum=2.547;QD=6.44;ReadPosRankSum=0.507;SOR=0.779;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,23:0.43:54
chr3	154007682	rs355758	G	C	1780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=35;PP=1173;SC=TAGAACTGCAGAGAAAATACT;SOR=1.437;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=57;TCF=22;TCR=35;TR=56;WE=154007690;WS=154007672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr3	154010515	.	AACACAC	A	203	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000;HP=3;HapScore=3;MGOF=6;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=0;NR=7;PP=203;QD=29.4285714286;SC=AAAATGTTAAAACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=7;WE=154010528;WS=154010505;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:27,7:0.21:34
chr3	154018690	rs3732652	G	A	1992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.352;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=30;PP=1110;ReadPosRankSum=-0.598;SC=CTTTAAGTACGTACAGATTCA;SOR=0.554;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=131;TCF=83;TCR=48;TR=78;WE=154018698;WS=154018680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,89:0.60:149
chr3	154018887	rs9438	G	C	1032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.625;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=25;PP=595;ReadPosRankSum=-1.527;SC=CTTAAACTGGGATCTGTGTTC;SOR=0.918;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=92;TCF=37;TCR=55;TR=39;WE=154018895;WS=154018877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,48:0.44:108
chr3	154021063	rs355756	G	A	563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=3;PP=460;SC=TTTGACATGAGAAAAGTGATA;SOR=2.948;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=154021071;WS=154021053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr3	154024165	rs355754	T	C	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=208;ReadPosRankSum=1.415;SC=TCTAGGACTGTTGAAAAATTG;SOR=1.352;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=10;WE=154024173;WS=154024155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr3	154834379	.	G	GTATATATATATA	89.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.918;ClippingRankSum=0.000;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=1.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.23;ReadPosRankSum=-2.147;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,9:0.12:73
chr3	154890512	.	CT	C	152.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.341;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.62;MQRankSum=0.944;QD=11.75;ReadPosRankSum=0.763;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr3	155212325	rs3214639	G	GA	1227.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQ=60.08;MQRankSum=1.133;NF=2;NR=29;PP=792;ReadPosRankSum=-0.177;SC=TTTTAATCGAGAAAAAAGGAA;SOR=0.692;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=92;TCF=5;TCR=87;TR=31;WE=155212333;WS=155212315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,53:0.45:119
chr3	155241593	rs9840061	A	G	876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=8;PP=601;ReadPosRankSum=-0.736;SC=CACAGCCACCATAATTGTGAG;SOR=0.633;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=61;TCF=48;TCR=13;TR=35;WE=155241601;WS=155241583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,38:0.59:64
chr3	155241740	rs9840234	A	G	3880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=462;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.231;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=94;PP=2258;ReadPosRankSum=-0.451;SC=TGTCCTCATCAGAAACTTCCC;SOR=0.827;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=414;TCF=205;TCR=209;TR=173;WE=155241748;WS=155241730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:262,200:0.43:462
chr3	155271825	rs359549	G	A	828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.562;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=12;PP=602;ReadPosRankSum=0.717;SC=TGCTCCATGCGGGAGGCTACC;SOR=0.331;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=85;TCF=61;TCR=24;TR=38;WE=155271833;WS=155271815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,39:0.45:86
chr3	155314034	rs359569	A	G	1033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.363;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=18;PP=501;ReadPosRankSum=0.582;SC=TTGCCTTCTCACTCTTCCTAG;SOR=0.549;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=73;TCR=49;TR=44;WE=155314042;WS=155314024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,56:0.39:143
chr3	155314296	rs359570	A	G	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=73;ReadPosRankSum=0.497;SC=AATTTGGTAGAGGTAATCTGA;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=155314304;WS=155314286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr3	155481609	rs7653384	G	A	2817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=54;NR=39;PP=1630;SC=GAACTGTCCAGTAGATTTTAG;SOR=0.830;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=93;TCF=54;TCR=39;TR=93;WE=155481617;WS=155481599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr3	155485302	rs358733	C	T	1347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=9;PP=981;SC=GCTTACCTTACTCACCAGAAG;SOR=2.511;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=37;TCR=9;TR=46;WE=155485310;WS=155485292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr3	155522044	rs63242260	ATAT	A	842.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.824;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=474;ReadPosRankSum=-0.973;SC=ATTATTTGTAATATTATAACT;SOR=1.270;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=11;WE=155522054;WS=155522034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,23:0.57:40
chr3	155523375	rs10563990	GCGCA	G	547.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=1;PP=400;SC=CGATGGGGTAGCGCACGCAAC;SOR=3.767;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=7;WE=155523386;WS=155523365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	155551206	rs7649631	C	T	1097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=15;PP=706;ReadPosRankSum=-1.298;SC=AGCTGTCTTCCTTATTTTACA;SOR=0.662;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=87;TCF=61;TCR=26;TR=46;WE=155551214;WS=155551196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,50:0.51:98
chr3	155551894	rs422497	A	G	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=147;ReadPosRankSum=-0.507;SC=CTCCATGCATATGTAAGTTCT;SOR=1.022;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=10;WE=155551902;WS=155551884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr3	155611557	rs6441026	T	G	731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=19;PP=556;SC=TTATTAATTTTCTTGAGCACT;SOR=2.215;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=25;WE=155611565;WS=155611547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	155628877	rs10936021	T	G	774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.059;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=10;PP=577;ReadPosRankSum=-0.060;SC=GTTTTGCTCATTTTGATTTTT;SOR=0.235;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=65;TCF=49;TCR=16;TR=33;WE=155628885;WS=155628867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,34:0.45:76
chr3	155637190	rs1356252	A	G	1052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.246;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=32;PP=736;ReadPosRankSum=-0.863;SC=AGAAAAATCAATTCAGACAAT;SOR=0.248;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=62;TCF=10;TCR=52;TR=40;WE=155637198;WS=155637180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,42:0.65:65
chr3	155639959	rs3772117	A	G	810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.824;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=10;PP=337;ReadPosRankSum=0.949;SC=AAATACTATTATTACTCCTAC;SOR=0.809;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=73;TCF=49;TCR=24;TR=31;WE=155639967;WS=155639949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,39:0.46:85
chr3	155654432	rs3772113	T	A	211.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=162;SC=CTTTTTTTTTTAAATTTTCAC;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=155654440;WS=155654422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	155991348	rs1160221	G	T	4013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=75;PP=2526;SC=GCACACAGATGCTCTTTCCAT;SOR=0.915;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=65;TCR=75;TR=140;WE=155991356;WS=155991338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr3	155991410	rs13093003	C	G	597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.715;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=17;PP=385;ReadPosRankSum=0.486;SC=GGCAATTCACCGCTGTCTTTC;SOR=0.246;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=48;TCF=13;TCR=35;TR=26;WE=155991418;WS=155991400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,27:0.56:48
chr3	156175109	rs34093583	C	CTT	1095.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.211;NF=14;NR=6;PP=803;ReadPosRankSum=-2.217;SC=CTTTCCCTCTCCACTAAAACT;SOR=0.765;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=49;TCF=33;TCR=16;TR=20;WE=156175117;WS=156175099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,30:0.42:72
chr3	156175167	rs2293194	GG	AA	2581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.792;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.204;NF=34;NR=23;PP=1758;ReadPosRankSum=-0.569;SC=CCTAAAGACCGGTAGAGGACT;SOR=0.947;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=150;TCF=90;TCR=60;TR=57;WE=156175176;WS=156175157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,69:0.41:167
chr3	156234268	rs4295133	A	G	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.552;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=79;ReadPosRankSum=0.261;SC=TGTGTTGTCCAGGCCAGTGGC;SOR=0.551;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=7;WE=156234276;WS=156234258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr3	156249407	rs2280030	G	C	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.922;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=6;PP=114;ReadPosRankSum=-0.660;SC=GGGGAACAAAGGCAACAGAAC;SOR=0.293;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=9;WE=156249415;WS=156249397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr3	156266642	rs6809188	C	T	1225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.646;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=25;PP=685;ReadPosRankSum=0.823;SC=TCAAAAAATTCTCTTCAAAGT;SOR=0.612;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=115;TCF=63;TCR=52;TR=54;WE=156266650;WS=156266632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,62:0.47:131
chr3	156399180	rs3851992	G	A	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=27;ReadPosRankSum=-0.492;SC=AGTTTATATGGCTTGGTAAAT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=4;WE=156399188;WS=156399170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr3	156421525	rs34277251	G	T	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.430;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=2;PP=31;ReadPosRankSum=-0.497;SC=CAAGACGGCCGGGCGCAGTGG;SOR=0.223;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=9;TCF=4;TCR=5;TR=5;WE=156421533;WS=156421515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr3	156431750	rs61733487	A	G	956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-9.378;NF=29;NR=17;PP=748;ReadPosRankSum=-0.752;SC=TGTGGACTAAATACCTTCTTG;SOR=0.662;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=96;TCF=61;TCR=35;TR=46;WE=156431758;WS=156431740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,45:0.45:101
chr3	156544584	rs344071	C	T	2633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.840;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=56;PP=1665;ReadPosRankSum=1.918;SC=GATGTGAACTCCCGCCTTCAC;SOR=0.538;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=213;TCF=100;TCR=113;TR=109;WE=156544592;WS=156544574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,122:0.51:240
chr3	156570521	rs111501048	T	TA	691.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.39;MQRankSum=1.304;NF=5;NR=6;PP=222;ReadPosRankSum=-1.254;SC=TTTTCAGAATTAAAAAAATTT;SOR=0.576;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=32;TCF=17;TCR=15;TR=11;WE=156570529;WS=156570511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,30:0.56:54
chr3	156570703	rs414683	A	G	1555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=35;PP=916;ReadPosRankSum=1.408;SC=AGAGACTTCAAGAAAAGCTGC;SOR=0.647;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=128;TCF=62;TCR=66;TR=68;WE=156570711;WS=156570693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,73:0.49:148
chr3	156638503	rs7609851	A	G	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=322;ReadPosRankSum=-0.104;SC=AAGAACTGAAAATTATAAAGA;SOR=0.676;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=18;WE=156638511;WS=156638493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,20:0.45:44
chr3	156645196	rs200029200	A	AT	82.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.36;ReadPosRankSum=1.712;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr3	156697055	rs200834448	A	AT	2187.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.707;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.902;NF=8;NR=27;PP=1245;ReadPosRankSum=0.217;SC=AACTATAAAGAAATGCTTATG;SOR=0.613;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=64;TCF=12;TCR=52;TR=35;WE=156697063;WS=156697045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,64:0.56:114
chr3	156697090	rs10558622	TATAAC	T	1424.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=21;PP=1732;ReadPosRankSum=0.704;SC=TTAAACAACTTATAACAGTGC;SOR=0.646;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=44;TCF=4;TCR=40;TR=24;WE=156697105;WS=156697080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,37:0.56:66
chr3	156697097	rs6780427	G	A	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=1375;ReadPosRankSum=-0.224;SC=ACTTATAACAGTGCTCTGTAG;SOR=0.749;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=55;TCF=19;TCR=36;TR=23;WE=156697105;WS=156697080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,26:0.41:63
chr3	157004323	rs4680353	A	C	1953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=4.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.343;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=33;PP=1287;ReadPosRankSum=-0.124;SC=AATGGTTCTTAGCAGCAGGTA;SOR=0.946;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=169;TCF=101;TCR=68;TR=84;WE=157004331;WS=157004313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,89:0.47:189
chr3	157082082	rs3833585	C	CAA	1142.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.218;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=803;ReadPosRankSum=-0.076;SC=ACAAACCAAACGAGTTATACC;SOR=0.509;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=26;TCR=11;TR=20;WE=157082090;WS=157082072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,29:0.57:51
chr3	157188045	rs1456113	A	G	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.556;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=9;PP=304;ReadPosRankSum=-0.419;SC=CAGACATCACAGGTTCACCTA;SOR=0.380;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=48;TCF=33;TCR=15;TR=24;WE=157188053;WS=157188035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,25:0.49:51
chr3	157188378	rs1011060	C	T	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.397;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=19;PP=388;ReadPosRankSum=-0.349;SC=CTTCAAAGGACAAAATACTAA;SOR=0.397;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=56;TCF=16;TCR=40;TR=29;WE=157188386;WS=157188368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,32:0.54:59
chr3	157817517	rs9833383	A	G	291.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=229;SC=GGTCCACTATATCATCTCAAA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=157817525;WS=157817507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	157820423	rs4462902	C	T	339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=1;PP=266;SC=CAACCCCAGGCTCTCTCTGCT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=157820431;WS=157820413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	157841531	rs6789448	G	A	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.781;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=92;ReadPosRankSum=1.457;SC=ATTTATCTCTGTTTGCTTCCA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=6;WE=157841539;WS=157841521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr3	157849957	rs1609526	C	T	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.622;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=136;ReadPosRankSum=2.333;SC=GTATTTTTGGCGGAGATGGGG;SOR=1.609;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=25;TCF=10;TCR=15;TR=11;WE=157849965;WS=157849947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr3	158072776	rs5853823	TA	T	840.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=5.374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.52;ReadPosRankSum=-1.515;SOR=0.243;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,43:0.59:73
chr3	158178856	rs73172119	G	A	676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.067;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=20;PP=438;ReadPosRankSum=0.133;SC=TGAATAGACCGTAGAATATAA;SOR=0.481;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=52;TCF=18;TCR=34;TR=30;WE=158178864;WS=158178846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,32:0.53:60
chr3	158254806	rs73154326	A	G	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.236;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=309;ReadPosRankSum=2.085;SC=TTCTTCATAGAAAGAACATTG;SOR=1.569;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=16;WE=158254814;WS=158254796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr3	158300732	rs2566341	A	G	1335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.69;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr3	158306627	rs1075551	A	G	2997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=55;PP=2111;ReadPosRankSum=1.490;SC=TCATTTGAGGATGTTGTTTCT;SOR=0.712;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=296;TCF=179;TCR=117;TR=141;WE=158306635;WS=158306617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:181,146:0.45:327
chr3	158308875	rs2566339	T	C	1675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.39;SOR=0.754;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr3	158310153	rs6771248	A	G	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=241;ReadPosRankSum=1.206;SC=ATTATTTGTAATATTTACCTG;SOR=0.892;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=15;WE=158310161;WS=158310143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr3	158310391	rs34234841	CAGTT	C	2648.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.335;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.836;NF=1;NR=38;PP=1664;ReadPosRankSum=1.252;SC=TTTTTTAAGACAGTTAGTGAG;SOR=0.836;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=91;TCF=4;TCR=87;TR=39;WE=158310402;WS=158310381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,71:0.48:149
chr3	158310483	rs6780477	G	T	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=277;ReadPosRankSum=-0.537;SC=TCTTGTTCTAGAAATCACTAT;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=15;WE=158310491;WS=158310473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr3	158314810	rs45471897	C	G	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=91;ReadPosRankSum=-1.563;SC=CTTTCAAACACTTTTTTAACC;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=7;WE=158314818;WS=158314800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr3	158314846	rs55999561	A	G	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=21;ReadPosRankSum=0.531;SC=GATACCTTACATGATTAACCC;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=3;WE=158314854;WS=158314836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr3	158318015	rs2639656	C	T	236.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=8;PP=191;SC=AAATAACAGCCGTACTTGATG;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=158318023;WS=158318005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	158320597	rs4875	T	C	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=5.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.31;ReadPosRankSum=-0.081;SOR=0.193;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,26:0.68:38
chr3	158320703	rs15967	C	A	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.999;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=128;ReadPosRankSum=-0.209;SC=CCATGAGAATCCTGGCTCCCG;SOR=1.244;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=31;TCF=13;TCR=18;TR=12;WE=158320711;WS=158320693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,13:0.36:36
chr3	158362441	rs1864507	T	C	1053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=16;PP=654;ReadPosRankSum=0.662;SC=TCCTGGGAGCTGCAGCCGTCG;SOR=0.680;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=79;TCF=53;TCR=26;TR=45;WE=158362449;WS=158362431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,49:0.53:93
chr3	158366900	rs2303909	G	A	1383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=33;PP=878;ReadPosRankSum=0.501;SC=TAAAGGTATTGTAGATCTTAT;SOR=0.742;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=112;TCF=56;TCR=56;TR=63;WE=158366908;WS=158366890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,65:0.53:122
chr3	158378847	rs2291595	A	G	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.120;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=172;ReadPosRankSum=-0.861;SC=TACTTCAGAAAAACAACCACA;SOR=1.352;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=10;WE=158378855;WS=158378837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr3	158384883	rs4680455	C	A	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.493;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=372;ReadPosRankSum=1.332;SC=AAAATAAAAACGTGTTGTTTA;SOR=1.091;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=33;TCF=11;TCR=22;TR=23;WE=158384891;WS=158384873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,24:0.69:35
chr3	158388780	rs8455	T	C	664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.950;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=315;ReadPosRankSum=-0.779;SC=AAATTTAAGGTGATACTTATG;SOR=0.540;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=61;TCF=44;TCR=17;TR=27;WE=158388788;WS=158388770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,33:0.47:70
chr3	158415402	rs10577754	TAGA	T	187.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.590;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=167;ReadPosRankSum=0.114;SC=GCTGTTTTACTAGAAGAATGA;SOR=1.230;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=5;WE=158415412;WS=158415392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr3	158422506	rs4680457	G	A	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=243;ReadPosRankSum=0.425;SC=TTAGAAGTTCGCATGAATTCA;SOR=0.665;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=30;TCR=11;TR=18;WE=158422514;WS=158422496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,19:0.45:42
chr3	158428809	rs3830357	A	AAGGC	536.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.770;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.162;NF=0;NR=18;PP=860;ReadPosRankSum=0.562;SC=TTCATTGTACAAGGCAGGCAG;SOR=2.154;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=61;TCF=0;TCR=61;TR=18;WE=158428817;WS=158428799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,23:0.44:52
chr3	158449965	rs6441223	T	C	631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=10;PP=331;ReadPosRankSum=-2.082;SC=CCAGCACTCGTAGCGCGCTGG;SOR=0.658;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=46;TCR=27;TR=27;WE=158449973;WS=158449955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,33:0.37:89
chr3	158450080	rs7621322	T	C	748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.889;HP=4;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;ReadPosRankSum=0.909;SC=GTCGTCGGGGTCCCCGGACCC;SOR=0.818;SbPval=0.61;Source=Platypus;WE=158450088;WS=158450070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,34:0.49:70
chr3	158450151	rs7609656	C	T	1884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=19;PP=684;ReadPosRankSum=-0.476;SC=CGGTGGGGCGCGGGCCCCTGG;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=55;TCR=35;TR=48;WE=158450159;WS=158450141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,51:0.50:102
chr3	158450169	rs147016103	C	G	2229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=0.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.98;ReadPosRankSum=1.497;SOR=0.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,57:0.46:124
chr3	158450178	rs6786423	A	G	2301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=0.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.56;ReadPosRankSum=1.393;SOR=0.633;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,65:0.47:139
chr3	158450298	rs73015649	C	G	979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.686;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=27;PP=568;ReadPosRankSum=1.118;SC=GGGCCCCTCCCCTCCGCCCCC;SOR=0.799;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=108;TCF=51;TCR=57;TR=49;WE=158450306;WS=158450288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,53:0.44:121
chr3	158450417	rs6441224	T	C	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.204;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=32;ReadPosRankSum=0.431;SC=GGCTTAGTGCTAGGATGCGGC;SOR=0.307;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=9;TCF=4;TCR=5;TR=4;WE=158450425;WS=158450407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr3	158451654	rs73015654	G	A	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.243;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=196;ReadPosRankSum=1.594;SC=GATGGGCGTGGTGCCATCTCT;SOR=0.495;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=15;WE=158451662;WS=158451644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,19:0.42:45
chr3	158451882	rs73015655	A	C	730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=21;PP=537;ReadPosRankSum=1.435;SC=ATATTGGATGAAGTTACATGC;SOR=0.751;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=79;TCF=34;TCR=45;TR=36;WE=158451890;WS=158451872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,36:0.45:80
chr3	158451932	rs73015657	G	A	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=301;ReadPosRankSum=-0.849;SC=ATGGGGAGTTGGGAGGTGGTT;SOR=0.602;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=52;TCF=19;TCR=33;TR=26;WE=158451940;WS=158451922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,26:0.51:51
chr3	158520483	rs2713736	A	G	1510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.447;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=40;PP=964;ReadPosRankSum=-1.063;SC=GTTCCTAAACAACTTTTGTTT;SOR=0.539;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=125;TCF=41;TCR=84;TR=63;WE=158520491;WS=158520473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,69:0.49:140
chr3	158537415	rs146160361	CTTTTT	C	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.98;MQRankSum=0.692;QD=29.80;ReadPosRankSum=-1.114;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,19:0.90:21
chr3	158537443	rs3765083	A	G	1346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.27;MQRankSum=1.224;QD=17.05;ReadPosRankSum=4.003;SOR=0.625;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,46:0.58:79
chr3	158539294	rs1548092	G	A	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=106;ReadPosRankSum=-0.831;SC=GAAAGAAGCTGATTAAACTTG;SOR=0.593;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=11;WE=158539302;WS=158539284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr3	158539486	rs1548093	A	G	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.252;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=111;ReadPosRankSum=-0.137;SC=CATGTGAAGTATGGGTCTTTA;SOR=0.495;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=34;TCF=18;TCR=16;TR=12;WE=158539494;WS=158539476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,14:0.36:39
chr3	158539961	rs6793618	G	A	1331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=34;PP=836;ReadPosRankSum=2.021;SC=GGTGGGGTCAGGGCTTCAGCA;SOR=0.629;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=92;TCF=43;TCR=49;TR=61;WE=158539969;WS=158539951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,63:0.62:102
chr3	158545195	rs6792827	G	T	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=4.592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.67;ReadPosRankSum=-2.162;SOR=1.510;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,17:0.40:43
chr3	158787632	.	TTG	T	85	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=27;MMLQ=16;MQ=59.34;NF=0;NR=4;PP=85;QD=22.0;SC=CCCTCCTTTCTTGTGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=4;WE=158787641;WS=158787622;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:9,4:0.31:13
chr3	158970714	rs1020470	T	C	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.268;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=142;ReadPosRankSum=0.494;SC=ATGTGCTGCATATTATTTCCT;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=7;WE=158970722;WS=158970704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr3	158991715	rs184725132	A	G	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.986;HP=6;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=753;ReadPosRankSum=-0.461;SC=GGTGTATCATATTTTTACAAA;SOR=0.547;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=65;TCF=20;TCR=45;TR=25;WE=158991732;WS=158991705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,29:0.40:72
chr3	158991724	rs2621285	A	T	826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=27;PP=1333;ReadPosRankSum=0.977;SC=TATTTTTACAAATGAAGAGAG;SOR=0.821;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=56;TCF=15;TCR=41;TR=36;WE=158991732;WS=158991705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,37:0.62:60
chr3	159557953	rs13064339	T	C	738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.130;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=4;PP=473;ReadPosRankSum=0.909;SC=CGTTGGGGTCTGCGCCCTAGG;SOR=1.371;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=48;TCF=37;TCR=11;TR=28;WE=159557961;WS=159557943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,32:0.59:54
chr3	159713467	rs568408	G	A	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=139;ReadPosRankSum=1.320;SC=ACATCCACATGATACCTCTGA;SOR=0.392;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=8;WE=159713475;WS=159713457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr3	159733692	rs491966	T	C	687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=342;ReadPosRankSum=-3.374;SC=CTACACTTGATCCTGAGATCT;SOR=0.833;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=55;TCF=40;TCR=15;TR=25;WE=159733700;WS=159733682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,32:0.50:64
chr3	159736893	rs2647930	T	C	2287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=39;PP=1681;ReadPosRankSum=-0.912;SC=TTAAACATCCTAAGTGGTCAA;SOR=0.730;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=206;TCF=128;TCR=78;TR=102;WE=159736901;WS=159736883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,107:0.48:222
chr3	159737076	rs2647931	G	A	1298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.457;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=38;PP=838;ReadPosRankSum=1.468;SC=TCCTCTCGCCGCAAGCACATG;SOR=0.954;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=114;TCF=41;TCR=73;TR=57;WE=159737084;WS=159737066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,58:0.48:121
chr3	159744277	rs2936300	C	T	501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=1;PP=327;SC=TCCACCACAGCGAAACCAGTT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=159744285;WS=159744267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	159744352	rs2279742	C	T	1932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=24;PP=1145;SC=CGAGACCTGACGGGAAGCGGG;SOR=0.963;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=64;TCF=39;TCR=25;TR=63;WE=159744360;WS=159744342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr3	159744438	rs2914119	C	T	7358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.60;SOR=0.705;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr3	159744438	.	CTC	TTT	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=70;NR=66;PP=2947;QD=20;SC=AGGACAGGCACTCGCATGGGT;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=143;TCF=74;TCR=69;TR=136;WE=159744448;WS=159744428;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:7,136:0.95:143
chr3	159744440	rs2936301	C	T	7358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.33;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr3	159976432	.	G	GA	234	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=11;HapScore=3;MGOF=10;MMLQ=15;MQ=60.1;NF=2;NR=14;PP=234;QD=15.375;SC=AGCTGCAATAGAAAAAAAAAA;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=16;WE=159976440;WS=159976422;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:19,16:0.46:35
chr3	159995356	rs3737214	A	G	2418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.641;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=49;PP=1538;ReadPosRankSum=-0.605;SC=ATATGTAAACATTAATTACTT;SOR=0.824;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=197;TCF=111;TCR=86;TR=111;WE=159995364;WS=159995346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,118:0.54:220
chr3	159997061	rs6778728	T	A	1885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.068;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=43;PP=1189;ReadPosRankSum=0.384;SC=GGATATGGTGTTATGCTGATG;SOR=0.793;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=194;TCF=99;TCR=95;TR=84;WE=159997069;WS=159997051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,92:0.43:212
chr3	160021681	rs4680576	G	A	1207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=22;PP=516;ReadPosRankSum=0.393;SC=CCCAGATCCAGTAGTTAAACA;SOR=0.669;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=119;TCF=64;TCR=55;TR=50;WE=160021689;WS=160021671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,64:0.45:143
chr3	160130110	rs2305407	G	A	959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=16;PP=419;ReadPosRankSum=0.695;SC=TTTAATTTCTGTAGTTAAACA;SOR=0.641;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=103;TCF=62;TCR=41;TR=44;WE=160130118;WS=160130100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,53:0.45:119
chr3	160135428	rs1451760	C	T	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.741;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=173;ReadPosRankSum=0.317;SC=TTTCTTAAATCGAATATAAAA;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=10;WE=160135436;WS=160135418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,10:0.34:29
chr3	160142618	rs11718121	A	C	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=4.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.270;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=440;ReadPosRankSum=1.767;SC=CTTTTCTGTCAATCTGAAATG;SOR=1.981;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=21;WE=160142626;WS=160142608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,22:0.56:39
chr3	160148756	rs7631792	C	T	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.325;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=234;ReadPosRankSum=-0.824;SC=TCCTTCATCTCTGTAATGTGA;SOR=1.179;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=46;TCF=32;TCR=14;TR=18;WE=160148764;WS=160148746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,25:0.43:58
chr3	160156951	rs1141023	C	T	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=250;ReadPosRankSum=0.289;SC=GACAAGTTAACTCTTCCTCAA;SOR=0.606;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=46;TCF=18;TCR=28;TR=18;WE=160156959;WS=160156941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,20:0.38:53
chr3	160223032	rs721022	C	T	265.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=217;SC=ATCTTAAAATCAACAACCTGA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=160223040;WS=160223022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	160245948	rs1551190	A	G	206.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=6;PP=141;SC=TTAAAATATAACCTCATTAAA;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=160245956;WS=160245938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	160245980	rs4679890	C	T	54.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.09;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr3	160283126	rs4621370	A	C	2959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=66;PP=1961;SC=GCCCCAACCAACGCGCCGCAC;SOR=1.825;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=96;TCF=30;TCR=66;TR=96;WE=160283134;WS=160283116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr3	160395093	rs1879797	A	G	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.92;ReadPosRankSum=0.585;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,28:0.70:40
chr3	160474540	rs71302254	C	CGTGTGTGT	111.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.41;ReadPosRankSum=0.475;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr3	160679422	rs7616249	T	C	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=1.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=127;ReadPosRankSum=-1.168;SC=AGGGTTGGTTTCACAGTGCTT;SOR=0.392;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=8;WE=160679430;WS=160679412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr3	160679744	rs7629001	A	T	977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=29;PP=797;SC=TGCAAAAAAAATTCATTATAA;SOR=4.680;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=31;WE=160679752;WS=160679734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr3	160821929	rs7651087	T	C	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.516;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=245;ReadPosRankSum=1.237;SC=TCTTATCTGTTAGTAATAAAC;SOR=0.320;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=15;WE=160821937;WS=160821919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr3	160821969	rs7617204	A	G	771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.869;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=9;PP=552;ReadPosRankSum=-0.223;SC=ATACGCGTTCAGTAATTTGTG;SOR=1.362;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=84;TCF=59;TCR=25;TR=38;WE=160821977;WS=160821959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,39:0.44:89
chr3	160939732	rs148371722	A	AATCCCAAC	1171.19	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=3.539;NF=14;NR=5;PP=2897;ReadPosRankSum=1.102;SC=AAGTGATTTAAATCCCAACAT;SOR=0.749;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=19;WE=160939784;WS=160939722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,23:0.92:25
chr3	160939746	.	CTTTTTTTTTTTTTTTTT	C	1460.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.197;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=2.811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQRankSum=3.268;QD=35.63;ReadPosRankSum=0.474;SOR=1.897;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,38:0.93:41
chr3	160939776	rs28711573	T	A	1976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.46;ReadPosRankSum=4.705;SOR=0.769;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,65:0.74:88
chr3	160955879	rs4350933	G	T	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.345;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.80;MQRankSum=1.111;QD=4.88;ReadPosRankSum=0.825;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr3	160964271	rs73026976	G	A	1231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.464;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=26;PP=626;ReadPosRankSum=1.919;SC=CTGCCAATTAGGATTGCAAAT;SOR=1.034;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=93;TCF=47;TCR=46;TR=49;WE=160964279;WS=160964261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,59:0.53:111
chr3	160967354	rs4290817	G	A	1695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=40;PP=914;ReadPosRankSum=0.954;SC=GAAAGGTCTCGCTTTTCTTTA;SOR=0.720;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=175;TCF=80;TCR=95;TR=76;WE=160967362;WS=160967344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,85:0.45:189
chr3	160970437	rs6789388	G	A	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=124;ReadPosRankSum=-1.790;SC=AGTATTCTTAGTCATATCCCA;SOR=0.569;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=10;WE=160970445;WS=160970427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,11:0.32:34
chr3	161064193	rs339101	A	T	663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.949;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=22;PP=505;ReadPosRankSum=0.804;SC=ACATAGAATCACTTTAAAATT;SOR=0.058;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=50;TCF=9;TCR=41;TR=30;WE=161064201;WS=161064183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,29:0.59:49
chr3	161090322	rs62279928	A	G	3330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=353;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.065;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=72;PP=2142;ReadPosRankSum=1.413;SC=AGTGCAGAGAATTAATCTCGG;SOR=0.609;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=331;TCF=162;TCR=169;TR=150;WE=161090330;WS=161090312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:193,160:0.45:353
chr3	161090616	rs2054710	C	T	745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.098;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=21;PP=521;ReadPosRankSum=1.001;SC=GGCCGAGACGCTTTCTGCTCG;SOR=0.462;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=49;TCF=15;TCR=34;TR=31;WE=161090624;WS=161090606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,33:0.56:59
chr3	161216812	rs1506481	G	A	63.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.09;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr3	161216845	rs1506482	C	T	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.101;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=98;ReadPosRankSum=0.654;SC=TCAGATTTTACCATTAGGTCA;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=6;WE=161216853;WS=161216835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr3	161216860	rs1506483	T	C	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=199;ReadPosRankSum=0.264;SC=AGGTCATTGATACTTATTGAT;SOR=1.739;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=10;WE=161216868;WS=161216850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr3	161216912	rs1506484	T	C	760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.679;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=7;PP=435;ReadPosRankSum=1.801;SC=TAATGAACTTTAAAAGAGAAA;SOR=0.210;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=64;TCF=53;TCR=11;TR=29;WE=161216920;WS=161216902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,34:0.50:68
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chr3	161221705	rs3921595	A	C	1411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.375;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=37;PP=733;ReadPosRankSum=0.416;SC=TTGTACCCAGAGGAAACTTCT;SOR=0.417;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=115;TCF=47;TCR=68;TR=65;WE=161221713;WS=161221695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,69:0.55:125
chr3	163889075	rs12494921	C	T	450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=318;SC=GTAAATAAAACATTTAGTTAA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=163889083;WS=163889072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	163889384	rs10936412	T	C	2584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=50;PP=1287;SC=TACGTTCCCGTGAAGCTTTTG;SOR=1.225;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=38;TCR=50;TR=88;WE=163889392;WS=163889374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr3	164059123	rs76722974	G	A	3400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=49;PP=1728;SC=GGAGCCTGGAGCGAGACCGGA;SOR=0.824;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=67;TCR=49;TR=116;WE=164059131;WS=164059113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr3	164714532	rs4855271	C	T	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.214;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=180;ReadPosRankSum=-1.408;SC=TTACATATGACATTCCAAACA;SOR=0.072;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=13;WE=164714540;WS=164714522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr3	164733721	rs2290738	G	A	987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.891;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=12;PP=645;ReadPosRankSum=-0.335;SC=TAAGACTCAGGTAAACTCCAA;SOR=1.128;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=99;TCF=65;TCR=34;TR=43;WE=164733729;WS=164733711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,46:0.45:102
chr3	164758630	rs13099130	G	A	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.174;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=243;ReadPosRankSum=-0.126;SC=AGCAGCAGAAGTTTAATTGAT;SOR=2.437;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=12;WE=164758638;WS=164758620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr3	164760771	rs12381230	T	C	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.499;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=10;PP=307;ReadPosRankSum=-1.076;SC=ATATACTCTATAGATTTAATT;SOR=0.931;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=43;TCF=24;TCR=19;TR=25;WE=164760779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,28:0.60:47
chr3	164764719	rs9838509	C	A	3022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.864;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=58;PP=1702;ReadPosRankSum=0.058;SC=CTAACCAATGCGCAGCATGTC;SOR=0.729;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=270;TCF=142;TCR=128;TR=126;WE=164764727;WS=164764709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,147:0.47:310
chr3	164766807	rs200218470	T	TAA	289.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=5.651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.80;ReadPosRankSum=0.498;SOR=0.082;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr3	164766808	rs67477789	TC	T	289.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=2.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.80;ReadPosRankSum=1.081;SOR=0.121;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr3	164766816	rs9821196	C	A	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=2.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.16;ReadPosRankSum=0.205;SOR=0.193;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr3	164766835	rs9841237	T	C	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.664;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=194;ReadPosRankSum=0.050;SC=TATTTCCTAATTATGAATACA;SOR=0.250;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=14;WE=164766843;WS=164766825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr3	164772957	rs9290256	C	T	930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.829;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.012;NF=23;NR=14;PP=526;ReadPosRankSum=1.183;SC=TTGACCAAAACCATTGGTTTA;SOR=0.808;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=49;TCR=29;TR=37;WE=164772965;WS=164772947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,44:0.52:85
chr3	164773057	rs9290257	G	A	1721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.251;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=38;PP=870;ReadPosRankSum=0.648;SC=TGCAGTTTGGGTTAGTGAAAT;SOR=0.829;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=142;TCF=71;TCR=71;TR=74;WE=164773065;WS=164773047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,85:0.54:158
chr3	164776913	rs60170840	C	CAT	3995.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.662;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=3.527;NF=15;NR=47;PP=2626;ReadPosRankSum=-0.203;SC=TTAACTTACACGTGTAAACAC;SOR=1.078;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=141;TCF=37;TCR=104;TR=62;WE=164776921;WS=164776903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,108:0.50:214
chr3	164777677	rs9290259	T	G	1445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.654;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=21;PP=869;ReadPosRankSum=1.377;SC=CACGGACCCTTTATTCTACTT;SOR=0.776;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=115;TCF=71;TCR=44;TR=59;WE=164777685;WS=164777667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,66:0.51:129
chr3	164781368	rs11718901	G	A	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.873;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=297;ReadPosRankSum=-1.885;SC=TTTCAAATATGTTTAAAACAC;SOR=3.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=5;TCR=34;TR=16;WE=164781376;WS=164781358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,17:0.41:41
chr3	164783165	rs9283633	T	C	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=19;PP=432;ReadPosRankSum=-0.787;SC=GGAAGACGGGTTGAGATCTGT;SOR=0.671;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=62;TCF=26;TCR=36;TR=32;WE=164783173;WS=164783155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,33:0.48:69
chr3	164785338	rs9865476	G	A	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=179;ReadPosRankSum=-0.036;SC=TAATATTCCAGTTCTGAATTA;SOR=1.314;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=11;WE=164785346;WS=164785328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr3	164786382	rs9758479	C	A	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-4.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=607;ReadPosRankSum=-1.169;SC=AGGATGGTCTCCATCTCCTGA;SOR=0.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=10;WE=164786404;WS=164786372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr3	164786396	rs9754967	T	C	742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.200;HP=1;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=607;ReadPosRankSum=-0.017;SC=CTCCTGACCTTGTGATCCGCC;SOR=1.347;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=17;WE=164786404;WS=164786372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr3	164786413	rs9756068	A	G	942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.378;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=4;PP=441;ReadPosRankSum=1.043;SC=CGCCCACGTCAGCTTCCCAAA;SOR=1.508;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=60;TCF=48;TCR=12;TR=29;WE=164786421;WS=164786403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,31:0.49:63
chr3	164786629	rs11313475	TA	T	1021.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.951;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.299;NF=1;NR=30;PP=531;ReadPosRankSum=2.101;SC=CCTTAAAGAATAAAAAAAAGC;SOR=0.474;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=63;TCF=1;TCR=62;TR=31;WE=164786637;WS=164786619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,48:0.55:87
chr3	164793541	rs7432386	G	T	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=62;ReadPosRankSum=-0.792;SC=TAGAAAAAGTGGAAGTAATTG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=164793549;WS=164793531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr3	164905688	rs17449404	G	A	1458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=28;PP=1097;ReadPosRankSum=1.184;SC=CTCTCTGTTAGAACCTGTATG;SOR=0.721;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=104;TCR=61;TR=76;WE=164905696;WS=164905678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,74:0.45:164
chr3	165491280	rs1803274	C	T	1181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=1.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.85;ReadPosRankSum=1.328;SOR=0.546;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,56:0.47:120
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chr3	165495420	rs2686410	G	C	1552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-3.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.886;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=14;PP=472;ReadPosRankSum=-0.839;SC=AAATTTGCAAGTACAAATGTT;SOR=0.364;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=100;TCF=72;TCR=28;TR=44;WE=165495428;WS=165495410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,51:0.44:115
chr3	165496622	rs2686411	A	T	203.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=164;SC=TAAGATGTCCAGAAAACATTC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=165496630;WS=165496612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	166958652	.	T	C	1785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=0.000;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.467;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.300;NF=44;NR=48;PP=1230;ReadPosRankSum=1.502;SC=TCCTCATCTGTACTGCTCTCA;SOR=0.747;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=237;TCF=120;TCR=117;TR=92;WE=166958660;WS=166958642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,97:0.37:259
chr3	166958669	.	G	A	1449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.639;ClippingRankSum=0.000;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.356;NF=36;NR=43;PP=1004;ReadPosRankSum=2.138;SC=CTCAGAAAGTGACAGCAAAGA;SOR=0.687;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=210;TCF=100;TCR=110;TR=79;WE=166958677;WS=166958659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,81:0.36:228
chr3	166960278	rs11923256	G	T	713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.803;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=9;PP=473;ReadPosRankSum=-0.639;SC=TAAATAAACTGCAGGCTTAAC;SOR=1.005;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=62;TCR=23;TR=32;WE=166960286;WS=166960268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,36:0.37:98
chr3	166966436	rs60512741	C	T	1603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=29;PP=894;ReadPosRankSum=-1.721;SC=CAGGCTGAGGCCCTAGAAAGA;SOR=0.676;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=78;TCR=58;TR=67;WE=166966444;WS=166966426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,77:0.48:161
chr3	167000256	rs12638625	G	C	1484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.951;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=39;PP=802;ReadPosRankSum=-0.025;SC=TGGAAAATTTGCTGTTGAAGG;SOR=0.543;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=153;TCF=63;TCR=90;TR=69;WE=167000264;WS=167000246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,79:0.47:169
chr3	167006568	rs7625639	G	T	1184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.202;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=7;PP=720;ReadPosRankSum=0.108;SC=AAACTAAATTGCAGGTGCCTA;SOR=1.132;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=85;TCF=68;TCR=17;TR=42;WE=167006576;WS=167006558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,50:0.51:98
chr3	167006612	rs7625651	G	T	1681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.575;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=24;PP=911;ReadPosRankSum=-0.624;SC=ACTAAAGGAAGTAAGCTGCCA;SOR=0.980;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=158;TCF=100;TCR=58;TR=72;WE=167006620;WS=167006602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,82:0.47:173
chr3	167023493	rs35864545	C	T	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.488;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=8;PP=266;ReadPosRankSum=-1.682;SC=TTGCTCAATTCCAAGGATTCT;SOR=0.779;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=43;TCF=23;TCR=20;TR=21;WE=167023501;WS=167023483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,25:0.52:48
chr3	167023624	rs35190925	A	G	842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.962;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=14;PP=426;ReadPosRankSum=-0.311;SC=TTCTAAACCTATATTTTTCTC;SOR=0.757;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=62;TCF=34;TCR=28;TR=33;WE=167023632;WS=167023614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,39:0.55:71
chr3	167023738	rs13096767	G	C	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=1.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.67;ReadPosRankSum=0.314;SOR=0.430;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,19:0.37:52
chr3	167034814	rs13068132	T	C	2762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=49;PP=1577;ReadPosRankSum=-1.995;SC=CGACTATCTTTAGAGATGGTT;SOR=0.685;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=217;TCF=118;TCR=99;TR=112;WE=167034822;WS=167034804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,130:0.53:244
chr3	167035501	rs4580553	G	A	360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=11;PP=243;SC=TGATGAAACCGTAACTGTACC;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=167035509;WS=167035491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	167040185	rs12632964	A	C	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=54;ReadPosRankSum=1.309;SC=AAAGTATTAAATATTGGTAAT;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=4;WE=167040193;WS=167040175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr3	167051726	rs10936530	A	G	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.336;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=141;ReadPosRankSum=0.238;SC=CATCCTTTATAAACTGATGGG;SOR=1.112;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=35;TCF=15;TCR=20;TR=13;WE=167051734;WS=167051716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,14:0.37:38
chr3	167051769	rs11923054	T	C	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=157;ReadPosRankSum=1.049;SC=TATTTGAGATTTTGCCTATTA;SOR=0.418;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=10;WE=167051777;WS=167051759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr3	167068256	rs4619784	T	A	1064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.583;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=25;PP=527;ReadPosRankSum=0.120;SC=TCTGGTGAACTTTAGCAAAGC;SOR=0.941;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=87;TCF=40;TCR=47;TR=44;WE=167068264;WS=167068246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,53:0.50:106
chr3	167077691	rs4257551	T	A	2767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=48;NR=47;PP=1631;SC=ACTGTCCACATACTTTCCCAT;SOR=0.830;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=48;TCR=47;TR=95;WE=167077699;WS=167077681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr3	167078544	rs9834845	T	C	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=11;PP=322;ReadPosRankSum=0.136;SC=ATTTGTCAGGTATATATTATC;SOR=0.760;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=39;TCF=19;TCR=20;TR=19;WE=167078552;WS=167078534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,19:0.43:44
chr3	167167100	rs6803996	C	T	3412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=384;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=72;PP=2317;ReadPosRankSum=-0.370;SC=ATCATTCACCCTACCAGTTGA;SOR=0.700;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=350;TCF=190;TCR=160;TR=159;WE=167167108;WS=167167090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:212,172:0.45:384
chr3	167167186	rs6770577	T	A	3345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.918;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=84;PP=2053;ReadPosRankSum=2.355;SC=ACACTTCAGATGAATCTGGTT;SOR=0.821;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=278;TCF=117;TCR=161;TR=145;WE=167167204;WS=167167176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,159:0.52:307
chr3	167170829	.	TA	T	352.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.968;ClippingRankSum=0.000;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.697;HP=10;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=168;ReadPosRankSum=0.517;SC=AATCTGTTATTAAAAAAAAAA;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=15;WE=167170837;WS=167170819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr3	167184878	rs9841174	T	C	2187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=33;PP=1393;ReadPosRankSum=1.018;SC=ACTTATCATCTCTGCACAAGC;SOR=0.707;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=172;TCF=111;TCR=61;TR=91;WE=167184886;WS=167184868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,98:0.53:185
chr3	167189607	rs17246389	A	C	1166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=30;PP=484;ReadPosRankSum=-2.171;SC=AGACTCCACAAGAAGATTGTG;SOR=0.626;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=106;TCF=41;TCR=65;TR=50;WE=167189615;WS=167189597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,60:0.50:120
chr3	167191652	rs4129073	C	T	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=170;ReadPosRankSum=-2.241;SC=AGAATAAAAGCGATATGTTAA;SOR=0.646;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=42;TCF=17;TCR=25;TR=18;WE=167191660;WS=167191642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,22:0.42:53
chr3	167217964	rs13060964	A	G	650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.747;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=10;PP=481;ReadPosRankSum=-0.909;SC=CGGGGCCTCCAGAATTTGGGG;SOR=1.391;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=84;TCF=54;TCR=30;TR=34;WE=167217972;WS=167217954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,35:0.38:92
chr3	167218188	rs13061345	A	T	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.195;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=20;PP=455;ReadPosRankSum=1.146;SC=ACTTTTATAAATTTAACCTTC;SOR=0.430;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=59;TCF=23;TCR=36;TR=34;WE=167218196;WS=167218178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,35:0.56:63
chr3	167218241	rs13061499	C	T	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=186;ReadPosRankSum=-0.349;SC=GCAAACCCTACAAACACAGCT;SOR=1.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=10;WE=167218249;WS=167218231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr3	167254536	.	T	C	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.95;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,2:0.40:5
chr3	167254558	rs138019711	TAA	T	274.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=2.388;NF=8;NR=2;PP=229;ReadPosRankSum=0.552;SC=TATATATATATAAAACAACTG;SOR=1.329;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=10;WE=167254567;WS=167254548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr3	167351418	rs9845725	T	C	869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=26;PP=596;ReadPosRankSum=-0.080;SC=TTGCTACAAATTCTTAGTTTT;SOR=0.551;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=62;TCF=10;TCR=52;TR=32;WE=167351426;WS=167351408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,35:0.51:69
chr3	167506937	rs33917740	C	G	796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.139;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=5;PP=500;ReadPosRankSum=-0.305;SC=TTGGACTCTTCTCTTTGCTGG;SOR=1.048;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=73;TCF=56;TCR=17;TR=31;WE=167506945;WS=167506927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,35:0.44:79
chr3	167506967	rs34582040	A	G	979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.647;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=16;PP=577;ReadPosRankSum=-0.794;SC=GTATGGCTACAGGGGCCACTT;SOR=0.402;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=108;TCF=75;TCR=33;TR=48;WE=167506975;WS=167506957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,53:0.45:117
chr3	167508062	rs13090836	T	C	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.148;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=58;ReadPosRankSum=-0.040;SC=GGTGCCTGTTTGGTTAATCTC;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=167508070;WS=167508057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr3	167510472	rs2229697	G	A	2644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.345;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=66;PP=1546;ReadPosRankSum=2.156;SC=ACTGGAAGTCGCAGTTTAGGC;SOR=0.916;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=249;TCF=114;TCR=135;TR=118;WE=167510493;WS=167510462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,129:0.47:272
chr3	167745400	rs74977752	G	A	1115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=14;PP=571;ReadPosRankSum=0.117;SC=TTTTCCTTCTGGGCTGAGGAT;SOR=0.631;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=80;TCF=53;TCR=27;TR=45;WE=167745408;WS=167745390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,53:0.59:90
chr3	167745703	rs9861339	A	G	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=208;ReadPosRankSum=0.540;SC=AAAAGCCACCAGTGGACTTTT;SOR=0.839;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=13;WE=167745711;WS=167745693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr3	167754573	rs6786410	A	G	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=86;ReadPosRankSum=-1.068;SC=CCTCTTGGCAACTTGACAGAG;SOR=0.627;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=6;WE=167754581;WS=167754563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr3	167762678	.	CA	C	36.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.278;ClippingRankSum=0.000;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQRankSum=0.822;QD=1.60;ReadPosRankSum=1.880;SOR=0.665;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr3	168538993	rs603638	A	G	2339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=25;PP=1476;SC=TGTCTCGAGGATGCCTACGGA;SOR=1.220;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=49;TCR=25;TR=74;WE=168539001;WS=168538983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr3	168542454	rs145528794	T	TCA,TCACACA	1067.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.38;ReadPosRankSum=-1.424;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:7,13,19:0.33,0.49:39
chr3	168546914	rs678690	C	T	2232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.368;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=43;PP=1363;ReadPosRankSum=-0.277;SC=CGGTCCAGCCCGATGAAGTAT;SOR=0.841;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=232;TCF=125;TCR=107;TR=98;WE=168546922;WS=168546904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,113:0.42:267
chr3	168818560	rs9857376	C	T	259.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=210;SC=TATTCAGACACGCATAAAATT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=168818568;WS=168818550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	168819788	rs9290358	A	G	181.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=115;SC=AAACAGCAAGACCTTTTGAAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=168819796;WS=168819787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	168825911	rs4955639	T	C	91.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=3;PP=65;SC=GTTATAACTCTGTTGAATTTC;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=168825919;WS=168825901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	168838749	.	C	A	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.28;ReadPosRankSum=0.888;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr3	168840571	rs3851380	A	T	1413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=29;PP=844;SC=AAACGGAACAACATTTTATTG;SOR=2.511;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=10;TCR=29;TR=39;WE=168840579;WS=168840561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr3	168840607	rs3851381	C	T	315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=197;SC=ATTAAAGAAACAAGAAGGAAA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=168840615;WS=168840597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	168851647	rs146273053	G	C	1083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=17;PP=708;ReadPosRankSum=-1.292;SC=TTTCATTCTGGAGTTCTATTT;SOR=0.773;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=62;TCR=32;TR=49;WE=168851655;WS=168851637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,52:0.50:104
chr3	169283921	rs3863106	C	T	1165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=21;PP=578;SC=CTCACTATCACAAGAACAGCA;SOR=0.929;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=17;TCR=21;TR=38;WE=169283929;WS=169283911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr3	169486144	rs9822885	A	G	1334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=35;PP=936;ReadPosRankSum=-1.035;SC=GGTAACTGTAAGGAAAGCAAT;SOR=0.633;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=113;TCF=48;TCR=65;TR=60;WE=169486152;WS=169486134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,62:0.48:129
chr3	169492016	rs34847803	T	TA	1170.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.015;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.697;NF=19;NR=9;PP=985;ReadPosRankSum=0.810;SC=GATGAGAACTTACGGTTACTG;SOR=0.969;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=71;TCF=49;TCR=22;TR=28;WE=169492024;WS=169492006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,40:0.42:96
chr3	169492101	rs10936599	C	T	3309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=363;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.672;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.886;NF=87;NR=65;PP=2126;ReadPosRankSum=-1.979;SC=ATTCGCACCACTGTGAGCACC;SOR=0.928;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=315;TCF=175;TCR=140;TR=152;WE=169492109;WS=169492091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:195,166:0.46:361
chr3	169500487	rs3772190	G	A	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=208;ReadPosRankSum=-0.182;SC=AAGAAAAAGGGGACTTGGGCC;SOR=0.352;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=11;WE=169500495;WS=169500477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr3	169514585	rs10936600	A	T	1703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.578;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=31;PP=891;ReadPosRankSum=0.745;SC=GCATCACATAACTGTTGTATA;SOR=0.639;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=139;TCF=80;TCR=59;TR=71;WE=169514593;WS=169514575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,83:0.52:160
chr3	169518455	rs6793295	T	C	869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=18;PP=409;ReadPosRankSum=0.449;SC=ACCTGTTCACTGTACAGTATA;SOR=0.717;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=75;TCF=35;TCR=40;TR=34;WE=169518463;WS=169518445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,42:0.48:88
chr3	169526272	rs28626343	T	C	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=3.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=137;ReadPosRankSum=0.766;SC=GTGTTGCTCGTGTACTTACTT;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=8;WE=169526280;WS=169526262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr3	169540397	rs1920119	T	C	4514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=447;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=107;NR=98;PP=2832;ReadPosRankSum=0.694;SC=GCCCGCGTCCTTGTGCCAGTG;SOR=0.652;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=412;TCF=216;TCR=196;TR=205;WE=169540405;WS=169540387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:229,218:0.49:447
chr3	169550759	rs12486767	G	A	919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=4.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.983;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=11;PP=712;ReadPosRankSum=-1.490;SC=CCACCATTACGAAAAAATCTT;SOR=1.192;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=64;TCR=23;TR=41;WE=169550767;WS=169550749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,43:0.41:104
chr3	169555162	rs66506858	TTC	T	1077.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.518;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.329;NF=12;NR=5;PP=625;ReadPosRankSum=-2.453;SC=TCACATCCCATTCTCTCCACG;SOR=0.078;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=17;WE=169555171;WS=169555152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,30:0.55:55
chr3	169558025	rs3732451	C	T	1716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.446;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=29;PP=1201;ReadPosRankSum=-1.569;SC=TGGTCCACCCCGCATCACAGA;SOR=0.894;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=116;TCF=69;TCR=47;TR=68;WE=169558033;WS=169558015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,72:0.57:126
chr3	169566090	rs9290375	A	G	1827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.202;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=41;PP=1025;ReadPosRankSum=-0.544;SC=AAGTGATAACAATACGAACAG;SOR=0.506;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=174;TCF=81;TCR=93;TR=80;WE=169566098;WS=169566080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,93:0.47:200
chr3	169574465	rs11919269	T	G	2827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.074;HP=10;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=49;PP=1449;ReadPosRankSum=1.026;SC=ATCTTCACTTTTTTTTTTTCT;SOR=0.453;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=222;TCF=120;TCR=102;TR=115;WE=169574473;WS=169574452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,129:0.61:210
chr3	169684447	rs114016802	G	A	447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=1;PP=345;SC=GAAGAGGGGAGAGAAGGCACC;SOR=3.126;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=169684455;WS=169684443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	169998240	.	CT	C	105.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.620;ClippingRankSum=0.000;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=3.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.78;ReadPosRankSum=-0.168;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
chr3	170078232	rs3772173	C	T	2996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.846;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=68;PP=1760;ReadPosRankSum=0.231;SC=GACATTCATGCAAATGGAAAA;SOR=0.806;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=285;TCF=134;TCR=151;TR=122;WE=170078240;WS=170078222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:180,142:0.44:322
chr3	170105233	rs6786374	C	T	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=271;ReadPosRankSum=1.062;SC=TGTGGCTTTTCATGTCTGGTC;SOR=0.582;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=52;TCF=39;TCR=13;TR=19;WE=170105241;WS=170105223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,20:0.37:54
chr3	170105378	rs6786542	C	T	1263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.197;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=26;PP=630;ReadPosRankSum=-0.148;SC=CTTCGTCAGTCGGACATTTGC;SOR=0.412;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=118;TCF=55;TCR=63;TR=53;WE=170105386;WS=170105368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,63:0.48:132
chr3	170197954	rs989997	T	G	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.925;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=177;ReadPosRankSum=-0.740;SC=AACACAAGGGTCCATAGAACC;SOR=0.138;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=12;WE=170197962;WS=170197944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr3	170218862	rs16855165	T	C	1968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.753;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=37;PP=1248;ReadPosRankSum=2.023;SC=CTTGGTAAGTTTGCATGTTGA;SOR=0.560;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=175;TCF=100;TCR=75;TR=82;WE=170218870;WS=170218852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,92:0.46:199
chr3	170425956	rs495979	G	C	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.599;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=328;ReadPosRankSum=-1.282;SC=GAATGGAATGGGAACGCCAAT;SOR=0.267;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=43;TCF=6;TCR=37;TR=23;WE=170425964;WS=170425946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,25:0.56:45
chr3	170584064	rs35192046	A	C	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.200;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.86;ReadPosRankSum=-0.719;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,2:0.22:9
chr3	170584074	rs35683888	A	G	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.744;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.80;ReadPosRankSum=-0.831;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr3	170586057	rs3732927	C	T	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.988;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=7;PP=116;ReadPosRankSum=-1.399;SC=ACTCTGATTACAAAAATAAGC;SOR=0.846;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=31;TCR=25;TR=15;WE=170586065;WS=170586047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,20:0.29:69
chr3	170727701	.	G	GGT	159.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.672;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.61;ReadPosRankSum=0.916;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr3	170825905	rs6444960	C	G	943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.693;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=22;PP=543;ReadPosRankSum=1.113;SC=GTTTCACCTTCGCAGGCTCAT;SOR=0.807;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=112;TCF=55;TCR=57;TR=43;WE=170825913;WS=170825895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,48:0.40:121
chr3	170825920	rs2291900	G	A	966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.688;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=19;PP=485;ReadPosRankSum=-0.075;SC=GCTCATGGGGGAGCACAGGTG;SOR=0.584;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=109;TCF=56;TCR=53;TR=43;WE=170825928;WS=170825910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,50:0.41:121
chr3	170857167	.	GCACACA	G,GCACACACA	39.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.559;ClippingRankSum=-0.000;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=3.090;HP=2;HapScore=3;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.000;NF=4,4;NR=1,1;PP=333,84;ReadPosRankSum=0.732;SC=ACGCACGCGCGCACACACACA;SOR=0.132;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=5,5;WE=170857180;WS=170857157;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.27:11
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chr3	170885097	rs2292005	C	T	810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=24;PP=636;SC=GATAAAACGGCGATCCAAAGA;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=170885105;WS=170885087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	170893070	rs12637875	G	A	4934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=88;PP=2710;SC=GAGGCGCTGGGTTCCGGGGGA;SOR=1.038;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=159;TCF=71;TCR=88;TR=159;WE=170893078;WS=170893060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr3	170912469	rs6773641	T	A	1277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.519;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=37;PP=852;ReadPosRankSum=-0.633;SC=GATGCTTCACTGCTTCCATTA;SOR=0.893;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=113;TCF=43;TCR=70;TR=57;WE=170912477;WS=170912459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,60:0.50:121
chr3	170928797	rs6444972	T	C	616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=2;PP=411;SC=TGGGGGCTAATGGTTAAAGAA;SOR=3.160;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=170928805;WS=170928787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	170928820	rs11400262	A	AT	556.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.847;NF=9;NR=4;PP=392;ReadPosRankSum=-0.391;SC=AGTTAATCAAATTTTGTCATG;SOR=0.525;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=13;WE=170928828;WS=170928810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,21:0.62:34
chr3	171065031	rs1389047	G	C	481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=43;PP=1372;SC=AAAAAGAAAAGAAAAATGACA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=61;TCF=18;TCR=43;TR=47;WE=171065039;WS=171065021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr3	171087469	rs3796295	G	A	2088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.655;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=55;PP=1252;ReadPosRankSum=-0.800;SC=AGATCCCTGCGGGGTCCTGAA;SOR=0.989;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=159;TCF=55;TCR=104;TR=81;WE=171087477;WS=171087459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,95:0.53:180
chr3	171178018	rs141352018	T	G	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.501;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.264;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=53;ReadPosRankSum=0.955;SC=ATCCCGATCCTCCGCGCGTCG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=4;WE=171178026;WS=171178008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr3	171338237	rs9881788	T	G	2223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=32;NR=31;PP=997;SC=TAAGCTCAGTTACTAGGTTTC;SOR=1.048;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=63;TCF=32;TCR=31;TR=63;WE=171338245;WS=171338227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr3	171395468	rs2124147	A	G	4580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=72;PP=2806;SC=TCTGTAAACTACGGATGGACC;SOR=0.755;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=148;TCF=76;TCR=72;TR=148;WE=171395476;WS=171395458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr3	171405384	rs2305547	A	T	299.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=14;PP=364;SC=GCTGAGAAAAATTTTTTTTTA;SOR=3.767;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=171405392;WS=171405374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	171442635	rs7647840	C	T	9811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=2.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=363;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.372;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.105;NF=149;NR=176;PP=2965;ReadPosRankSum=1.585;SC=CCACTTAGCTCGTACAGCCTC;SOR=0.496;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=327;TCF=150;TCR=177;TR=325;WE=171442646;WS=171442625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,362:1.00:363
chr3	171442750	rs10710862	AG	A	2321.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=41;PP=1810;SC=CGGGTACCCTAGAGGCGAACC;SOR=4.443;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=0;TCR=42;TR=41;WE=171442758;WS=171442740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr3	171443607	rs4131284	C	G	430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=0;PP=331;SC=GTGACAAAGACAGTGGAGCAG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=171443615;WS=171443603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	171443955	rs4131283	T	A	512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=11;PP=291;SC=GCTGTGTGTATATACTGTTTG;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=15;WE=171443963;WS=171443945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	171510238	rs3934620	C	T	1089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=20;PP=605;ReadPosRankSum=0.492;SC=ATCAGGGGCCCCTGGCCATCC;SOR=0.743;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=108;TCF=62;TCR=46;TR=47;WE=171510246;WS=171510228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,55:0.45:123
chr3	171844787	rs4894810	A	T	7827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=135;NR=118;PP=2965;SC=ATGTGAATGCATTGGGAGGTG;SOR=0.700;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=253;TCF=135;TCR=118;TR=253;WE=171844795;WS=171844777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,285:1.00:285
chr3	172003831	rs67373503	CT	C	112.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=5.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.35;MQRankSum=0.862;QD=6.63;ReadPosRankSum=-1.159;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr3	172034350	rs4894416	T	C	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.066;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=137;ReadPosRankSum=-0.106;SC=AAATAAGAACTTTTTATTTTA;SOR=1.609;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=8;WE=172034358;WS=172034340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr3	172034901	rs34251104	T	G	2016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FS=0.557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.46;ReadPosRankSum=-0.419;SOR=0.636;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,101:0.57:176
chr3	172046861	rs2270568	T	C	2178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=47;PP=1432;ReadPosRankSum=1.789;SC=ACGACATTGGTACCAGGTATG;SOR=0.694;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=196;TCF=100;TCR=96;TR=98;WE=172046870;WS=172046851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,105:0.50:208
chr3	172046933	rs6799133	A	G	968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.320;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=29;PP=686;ReadPosRankSum=-0.651;SC=TCTTTTACATAGCTGGAAGGC;SOR=1.204;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=78;TCF=26;TCR=52;TR=40;WE=172046941;WS=172046923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,43:0.49:88
chr3	172059121	rs570549	G	A	718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.249;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=23;PP=520;ReadPosRankSum=1.187;SC=ATGTATCTTGGTAATGCAACC;SOR=1.022;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=48;TCF=14;TCR=34;TR=31;WE=172059129;WS=172059111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,31:0.62:50
chr3	172162829	rs482204	G	A	736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.34;SOR=4.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	172162837	rs477251	T	C	1022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.34;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	172165727	rs572169	C	T	3228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.986;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=65;PP=1956;ReadPosRankSum=-0.557;SC=CCAGCTTCACCCGCCCCTTGG;SOR=0.542;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=292;TCF=161;TCR=131;TR=141;WE=172165735;WS=172165717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,156:0.48:322
chr3	172166033	rs495225	G	A	7771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=137;NR=122;PP=2965;SC=TGCCAGCGATGCCCACCACGA;SOR=0.707;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=259;TCF=137;TCR=122;TR=259;WE=172166041;WS=172166023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,294:1.00:294
chr3	172224303	rs1131532	A	G	1510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.146;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=20;PP=803;ReadPosRankSum=-1.199;SC=AAAAGGCCCCAAAAAAACTGG;SOR=0.936;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=125;TCF=78;TCR=47;TR=61;WE=172224311;WS=172224281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,75:0.52:143
chr3	172224769	rs111284464	GC	G	1180.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.991;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=977;ReadPosRankSum=-0.424;SC=AAAGCAAGGAGCTTTTTTGCA;SOR=0.114;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=45;TCF=2;TCR=43;TR=18;WE=172224779;WS=172224759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,35:0.51:68
chr3	172224771	rs17848019	T	A	1189.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-3.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.853;HP=5;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=985;ReadPosRankSum=-0.452;SC=AGCAAGGAGCTTTTTTGCAGC;SOR=0.121;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=56;TCF=14;TCR=42;TR=23;WE=172224779;WS=172224759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,35:0.52:67
chr3	172227199	rs3815496	C	T	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.292;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=16;PP=319;ReadPosRankSum=-0.078;SC=AATCAGCCATCGTAAGCATAC;SOR=0.426;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=62;TCF=20;TCR=42;TR=25;WE=172227207;WS=172227189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,25:0.40:63
chr3	172236440	rs231983	T	G	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=163;ReadPosRankSum=2.019;SC=ACAGGCTATTTGTGAAGGTCC;SOR=0.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=9;WE=172236448;WS=172236430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr3	172351926	rs77121984	T	C	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.990;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=109;ReadPosRankSum=0.172;SC=TTGCATGCCTTCTTTTATAGG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=6;WE=172351934;WS=172351916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr3	172365619	rs9865941	G	A	2012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=43;NR=14;PP=1194;SC=ACTCAGTTACGCATCTCCCCC;SOR=2.082;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=58;TCF=43;TCR=15;TR=57;WE=172365627;WS=172365609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr3	172428508	rs7629698	C	T	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.336;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=293;ReadPosRankSum=0.392;SC=TGGACCACCTCAAAAAGCGAC;SOR=0.957;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=45;TCF=36;TCR=9;TR=20;WE=172428516;WS=172428498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,22:0.46:48
chr3	172428782	rs2276805	T	C	1853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.966;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=50;PP=1079;ReadPosRankSum=0.433;SC=CATCTTGCCCTGGCTCGGCTC;SOR=0.933;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=193;TCF=97;TCR=96;TR=92;WE=172428790;WS=172428772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,95:0.47:204
chr3	172473484	rs1403088	A	G	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.335;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.48;ReadPosRankSum=0.568;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr3	172480173	rs10654513	A	ATT	205.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.345;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=282;ReadPosRankSum=-1.803;SC=ATTTAAGTTAAACTGGTTTTG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=4;WE=172480182;WS=172480170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr3	172480174	rs11313111	AC	A	205.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=303;ReadPosRankSum=-1.180;SC=TTTAAGTTAAACTGGTTTTGG;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=4;WE=172480182;WS=172480170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr3	172501443	rs7649589	A	C	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.548;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=98;ReadPosRankSum=-0.353;SC=TTATAAAATAAGTTTGTTCTC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=6;WE=172501451;WS=172501433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr3	172520818	rs7644191	G	C	986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=23;PP=639;SC=ATTTTTGTAAGTTCCCTGAAT;SOR=2.115;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=31;WE=172520826;WS=172520808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	172534428	rs10936738	C	T	696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.234;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=419;ReadPosRankSum=0.632;SC=TAAATATTCTCATCAGCTGTA;SOR=0.083;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=38;TCF=32;TCR=6;TR=23;WE=172534436;WS=172534418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,26:0.60:43
chr3	172537850	rs35236458	T	G	542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=379;ReadPosRankSum=-0.564;SC=TTGTAAAATGTAAAAATAATA;SOR=1.008;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=41;TCF=33;TCR=8;TR=19;WE=172537858;WS=172537840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,21:0.50:42
chr3	172634025	rs141570329	T	TTG	438.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=16;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=2;PP=233;SC=CACAGGATTTTTTTTTTTTTT;SOR=2.494;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=12;WE=172634033;WS=172634015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	172694611	rs114023683	G	A	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=191;ReadPosRankSum=-0.479;SC=AATCTACTTCGTTATGAATAC;SOR=0.914;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=10;WE=172694619;WS=172694601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr3	173322248	rs3844523	T	C	945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=2;PP=693;SC=ATCTGCTGTCTGAAGATCTTT;SOR=3.912;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=28;WE=173322256;WS=173322238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr3	173507395	rs4499633	T	C	226.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=142;SC=GAGTTCAAACTAGAACCCAAG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=173507403;WS=173507392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	174581888	rs6445184	T	C	2656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=55;PP=1328;ReadPosRankSum=-2.333;SC=AAGGTGAGTCTGACCTAAATG;SOR=0.719;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=253;TCF=133;TCR=120;TR=116;WE=174581896;WS=174581878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,129:0.47:275
chr3	174935828	rs34537026	C	T	680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.08;ReadPosRankSum=-1.242;SOR=0.868;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,37:0.49:75
chr3	174951756	rs4371530	T	C	1243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.104;NF=40;NR=20;PP=681;ReadPosRankSum=-1.499;SC=GAAGATGACATGGAAATTTCA;SOR=0.729;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=132;TCF=85;TCR=47;TR=60;WE=174951764;WS=174951746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,64:0.44:144
chr3	175165079	rs6802937	C	T	8976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.036;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=164;NR=150;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.404;SC=CATCTCTGCACCCCTCGTTGC;SOR=0.251;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=316;TCF=164;TCR=152;TR=314;WE=175165087;WS=175165069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,339:1.00:340
chr3	175165201	rs2161041	T	G	2241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=47;PP=1412;SC=TACAGTTTTTTTAAAGACCAT;SOR=2.494;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=16;TCR=47;TR=63;WE=175165209;WS=175165191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr3	175189406	rs35213579	CT	C	3193.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=2.560;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=68.97;MQRankSum=6.736;QD=40.95;ReadPosRankSum=-1.891;SOR=0.296;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,75:0.96:78
chr3	175189416	.	TG	AG	2362	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=1.0000,1.0000;HP=9;HapScore=1;MGOF=11;MMLQ=15;MQ=67.48;NF=50,25;NR=19,19;PP=1563,2362;QD=23.1561045297;SC=CTTTTTTTTTTGTTATTTCAG;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=93;TCF=65;TCR=28;TR=69,44;WE=175189424;WS=175189406;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:24,69:0.74:93
chr3	175189416	.	TG	T	2362	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=1.0000,1.0000;HP=9;HapScore=1;MGOF=11;MMLQ=15;MQ=67.48;NF=50,25;NR=19,19;PP=1563,2362;QD=23.1561045297;SC=CTTTTTTTTTTGTTATTTCAG;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=93;TCF=65;TCR=28;TR=69,44;WE=175189424;WS=175189406;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:20,44:0.69:64
chr3	175189417	rs79264590	G	A	3598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=2.587;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=67.89;MQRankSum=3.361;QD=38.70;ReadPosRankSum=-0.609;SOR=0.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,90:0.97:93
chr3	175189447	rs9290555	G	A	4760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=106;NR=64;PP=2906;SC=AGGTTCTTCAGAAAAATGTTG;SOR=1.272;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=170;TCF=106;TCR=64;TR=170;WE=175189455;WS=175189437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr3	175205148	rs7646041	C	T	955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=1;PP=527;SC=CAGGAGGACACTGAGGCATAG;SOR=3.611;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=175205156;WS=175205138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr3	175298953	rs62284484	G	C	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=7;PP=135;ReadPosRankSum=0.515;SC=GAATAGGCCGGACGCGGTGGC;SOR=0.859;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=24;TCF=11;TCR=13;TR=12;WE=175298961;WS=175298943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr3	175345143	rs9866564	C	G	1688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=27;NR=30;PP=941;SC=GAAATGGATCCCTCTTTCAAC;SOR=1.044;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=27;TCR=30;TR=57;WE=175345151;WS=175345133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr3	175373483	rs376781296	TAAATA	T	80.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.598;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.46;ReadPosRankSum=0.598;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr3	175473047	rs9826737	T	C	1932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=18;PP=1398;SC=GCCATGGCGTTACGCCTGCGG;SOR=1.911;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=45;TCR=18;TR=63;WE=175473055;WS=175473037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr3	176765253	rs1201300	G	A	2202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=34;PP=1324;SC=AACAAAGTAAGAAGGAAAATG;SOR=0.818;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=43;TCR=34;TR=77;WE=176765261;WS=176765243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr3	176769388	.	CAGCTGCT	C	1636.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=0.000;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=11;PP=1249;ReadPosRankSum=1.181;SC=GCAGCTGCAGCAGCTGCTGCC;SOR=0.687;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=60;TCF=27;TCR=33;TR=22;WE=176769402;WS=176769378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,45:0.39:115
chr3	176771833	rs138539758	CGTGTGT	CGT,C	410.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=4.616;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-0.000;NF=0,0;NR=14,14;PP=151,408;ReadPosRankSum=1.795;SC=AGACGAAGGTCGTGTGTGTGT;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=14,14;WE=176771846;WS=176771823;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.87:15
chr3	176771855	.	TGTGTGTGCGC	T	251	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=34;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=0;NR=14;PP=251;QD=18.1428571429;SC=TGTGTGTGTGTGTGTGTGCGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=14;WE=176771872;WS=176771845;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:4,14:0.78:18
chr3	178542417	.	A	C	23	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.57;FR=0.9998;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=2;NR=1;PP=23;QD=19.2570708491;SC=CCGCCTCGGCATCCGAAAGTG;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=178542425;WS=178542407;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr3	178545952	rs35616186	C	T	750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.947;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=11;PP=405;ReadPosRankSum=2.004;SC=TTACTCTCACCCCTTTCTCTG;SOR=0.892;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=62;TCF=38;TCR=24;TR=31;WE=178545960;WS=178545942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,36:0.53:68
chr3	178546026	rs9831934	T	C	3958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=63;PP=2492;SC=AAACATTTAATTGCTCCTTCA;SOR=0.735;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=131;TCF=68;TCR=63;TR=131;WE=178546034;WS=178546016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr3	178560581	rs6443583	A	C	5524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=99;PP=2965;SC=TTATCCTAACAAAACTCTACA;SOR=0.960;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=183;TCF=84;TCR=99;TR=183;WE=178560589;WS=178560571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr3	178785549	rs6772028	G	A	1304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=33;PP=895;SC=ATTGGGTAGGGAAGCCTGGGG;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=12;TCR=33;TR=45;WE=178785557;WS=178785539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr3	178917005	rs3729674	A	G	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=240;ReadPosRankSum=0.361;SC=AAATAACCATAAAGCTTAACT;SOR=0.998;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=28;TCF=9;TCR=19;TR=14;WE=178917013;WS=178916995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr3	178921253	rs17550640	G	GTAAA	772.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.17;MQRankSum=1.533;QD=11.89;ReadPosRankSum=-1.806;SOR=0.602;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,20:0.31:65
chr3	178922222	rs3729676	G	T	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.600;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=248;ReadPosRankSum=-0.086;SC=TTATATTTGAGTCTATCGAGT;SOR=4.057;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=13;WE=178922230;WS=178922212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr3	178922274	rs2699896	C	A	899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.833;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=16;PP=500;ReadPosRankSum=-0.145;SC=TAGTATATACCTACTTTTTTC;SOR=0.598;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=74;TCF=45;TCR=29;TR=40;WE=178922282;WS=178922264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,44:0.54:81
chr3	178922430	rs3729679	A	G	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.202;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=169;ReadPosRankSum=0.311;SC=GTTTAGCAGTATGATCCATAA;SOR=1.863;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=11;WE=178922438;WS=178922420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,12:0.34:35
chr3	178927345	rs3729682	T	C	1287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=16;PP=908;ReadPosRankSum=-0.587;SC=ATGAAGACTTTTCTTGATGTA;SOR=0.618;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=65;TCR=29;TR=51;WE=178927353;WS=178927335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,55:0.51:107
chr3	178936227	rs17849071	T	G	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.083;NF=0;NR=11;PP=229;ReadPosRankSum=0.929;SC=TTGGAATAAATAAAGCAGAAT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=11;WE=178936235;WS=178936217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr3	178937877	rs11918324	A	G	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=2.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.14;MQRankSum=-1.383;QD=8.27;ReadPosRankSum=0.461;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr3	178938747	rs6443625	A	T	829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQRankSum=-2.388;QD=11.69;ReadPosRankSum=1.168;SOR=0.715;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,34:0.48:71
chr3	178942431	rs2699889	C	G	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=308;ReadPosRankSum=2.522;SC=AAATAAATTTCAGGGTAAAAT;SOR=0.582;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=38;TCR=8;TR=22;WE=178942439;WS=178942421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,29:0.51:57
chr3	178957783	.	C	T	38	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=4;NR=0;PP=38;QD=18.1928031368;SC=TGTGACTGCACTTACTGTTTA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=4;WE=178957791;WS=178957773;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr3	178957969	rs6782557	G	A	824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.790;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-6.381;NF=17;NR=19;PP=432;ReadPosRankSum=0.748;SC=AAAGCAAGCCGGTGTTGCTAA;SOR=0.797;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=73;TCF=37;TCR=36;TR=36;WE=178957977;WS=178957959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,42:0.48:88
chr3	178959144	rs6786049	C	T	1298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.489;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.122;NF=36;NR=20;PP=766;ReadPosRankSum=-0.885;SC=CAAATAAATCCTACTCTGAGA;SOR=0.899;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=112;TCF=69;TCR=43;TR=56;WE=178959152;WS=178959134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,61:0.51:120
chr3	178960607	rs1059691	A	G	917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=4.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.904;NF=26;NR=2;PP=650;ReadPosRankSum=1.940;SC=CTTTTACATTATTAGTTTGCA;SOR=0.855;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=48;TCF=44;TCR=4;TR=28;WE=178960615;WS=178960597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,33:0.61:54
chr3	178968634	rs7645550	C	T	3320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=56;PP=1953;SC=TCCTCTCCAGCACTGGATGGC;SOR=0.906;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=108;TCF=52;TCR=56;TR=108;WE=178968642;WS=178968624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr3	178984575	rs7612684	A	G	1985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=41;PP=1200;SC=TGAAGCTTAGACATCCACGGA;SOR=1.577;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=23;TCR=41;TR=64;WE=178984583;WS=178984565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr3	179076915	rs200503147	CT	C	66	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=16.50;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	179083079	rs60284816	C	T	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.047;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.52;ReadPosRankSum=0.458;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr3	179085722	rs143669422	G	GTA	79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.6874;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=0;NR=1;PP=35;SC=GGGGGAAAAAGTATATATATA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=1;WE=179085730;WS=179085712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	179085775	rs73043490	C	T	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.195;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=49;ReadPosRankSum=0.834;SC=TACCAGAAAACATATCTTGCT;SOR=0.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=5;WE=179085783;WS=179085765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr3	179092989	rs9865666	C	T	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=66;ReadPosRankSum=-0.137;SC=TAATGTGTTACGGCTTGGGCC;SOR=0.332;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=8;WE=179092997;WS=179092979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
chr3	179096006	.	C	CA	33	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;FR=0.9382;HP=15;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=17;MQ=55.09;NF=2;NR=0;PP=33;QD=18.0;SC=GACCCTGTCTCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=2;WE=179096014;WS=179095996;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:13,2:0.13:15
chr3	179096508	rs7637065	C	G	3301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=72;NR=43;PP=1742;SC=ATTGTATTTCCTTTTTCCCTG;SOR=1.027;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=72;TCR=43;TR=115;WE=179096516;WS=179096498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr3	179103342	rs200984893	C	CTT	87.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;QD=21.94;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	179109735	rs2287209	A	G	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=8;PP=237;ReadPosRankSum=0.330;SC=TGACCTTTATAGTAATTAGAT;SOR=0.586;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=53;TCF=33;TCR=20;TR=19;WE=179109743;WS=179109725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,21:0.36:59
chr3	179118998	rs3774225	C	T	2230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=35;PP=1254;ReadPosRankSum=-0.587;SC=ATGTATGACACTGTTAATTCC;SOR=0.724;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=192;TCF=118;TCR=74;TR=92;WE=179119006;WS=179118988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,107:0.48:224
chr3	179137079	.	C	T	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.291;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=151;ReadPosRankSum=2.585;SC=TTTCTGCAAACGCTTCATGAA;SOR=1.214;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=9;WE=179137087;WS=179137069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr3	179298999	rs1132429	C	T	8654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=137;NR=169;PP=2965;SC=GTGATATTGACATCAGACCAG;SOR=0.946;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=306;TCF=137;TCR=169;TR=306;WE=179299007;WS=179298989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,325:1.00:325
chr3	179301051	rs77765357	G	A	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=110;ReadPosRankSum=1.603;SC=AAGGGAAATTGTAGTAGAGCA;SOR=0.693;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=9;WE=179301059;WS=179301041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr3	179305654	rs6443659	A	T	618.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=2;PP=355;SC=AAAAAAAAAAATTTTTTAAGC;SOR=2.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=17;WE=179305662;WS=179305644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	179371154	rs2276803	C	T	2003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=45;PP=1178;ReadPosRankSum=0.835;SC=TCTACAAGAACGAGTGCGCCT;SOR=0.732;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=171;TCF=89;TCR=82;TR=90;WE=179371162;WS=179371144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,96:0.52:186
chr3	179399570	rs13080037	C	T	3095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=43;PP=1649;SC=TGCCAGGCCTCGTCTTCAGCG;SOR=0.960;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=57;TCR=43;TR=100;WE=179399578;WS=179399560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr3	179448066	rs11309768	AT	A	875.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.258;HP=12;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=24;PP=326;ReadPosRankSum=0.452;SC=CCAGATTTGTATTTTTTTTTT;SOR=1.164;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=37;TCF=1;TCR=36;TR=25;WE=179448074;WS=179448056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:5,40:0.89:45
chr3	179448383	rs3213761	C	T	4224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=56;PP=2663;SC=CTTTTTGTTTCTGTTTCTCTG;SOR=1.114;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=151;TCF=95;TCR=56;TR=151;WE=179448391;WS=179448373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr3	179463076	rs58527921	A	G	1344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.38;SOR=2.694;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr3	179463081	rs59131484	G	A	1344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.38;SOR=2.694;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr3	179469995	rs2239639	A	G	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=207;ReadPosRankSum=-1.043;SC=TGCCTCAGACAAAGTTGATAT;SOR=0.446;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=14;WE=179470003;WS=179469985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr3	179472674	rs2287240	C	T	1886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.618;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=46;PP=1128;ReadPosRankSum=-2.319;SC=ATATGCGCTACCCTCCCACCC;SOR=1.126;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=155;TCF=76;TCR=79;TR=81;WE=179472682;WS=179472664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,89:0.52:170
chr3	179474767	rs3732992	A	G	790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=9;PP=365;ReadPosRankSum=-1.111;SC=GCCCTGGATCAATGGGTTTTC;SOR=0.620;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=81;TCF=56;TCR=25;TR=33;WE=179474775;WS=179474757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,41:0.45:92
chr3	179481971	rs71917525	CTG	C	1215.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5044;FS=2.684;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.340;NF=1;NR=26;PP=1052;ReadPosRankSum=-0.515;SC=GCATGAGAGACTGTGTGTGTG;SOR=0.288;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=51;TCF=2;TCR=49;TR=27;WE=179481982;WS=179481961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,43:0.96:45
chr3	179527459	rs111620765	G	GA	97.79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=13.97;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	179592053	rs1609981	G	A	2444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=23;PP=1626;SC=TGAAAATAAAGCATTTATGCT;SOR=1.995;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=82;TCF=59;TCR=23;TR=81;WE=179592061;WS=179592043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr3	179605647	rs41265425	C	A	1268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.706;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=32;PP=710;ReadPosRankSum=-0.028;SC=TGCAGCCTTGCAACAAAATGA;SOR=0.616;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=106;TCF=41;TCR=65;TR=54;WE=179605655;WS=179605637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,61:0.52:117
chr3	179689173	rs3774255	T	C	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=146;ReadPosRankSum=-0.886;SC=CCATCATTCTTACATACAAAA;SOR=0.512;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=8;WE=179689181;WS=179689163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
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chr3	179689365	rs3774257	C	T	2019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.761;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=39;PP=1062;ReadPosRankSum=0.230;SC=AGAAAATGTACGTAAGTATTC;SOR=0.572;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=164;TCF=83;TCR=81;TR=84;WE=179689373;WS=179689355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,98:0.51:192
chr3	179691094	rs12054457	G	A	3471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=68;PP=2128;ReadPosRankSum=1.866;SC=TTGCTGACCAGAGAACCACAG;SOR=0.694;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=259;TCF=129;TCR=130;TR=137;WE=179691102;WS=179691084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,155:0.54:289
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chr3	180630565	rs1805579	T	C	2675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.550;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=59;PP=1340;ReadPosRankSum=1.025;SC=TTCTGGGTGCTGGAGCGCGTT;SOR=0.573;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=215;TCF=102;TCR=113;TR=114;WE=180630573;WS=180630555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,132:0.54:246
chr3	180633485	rs1805564	G	A	2752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.481;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=66;PP=1490;ReadPosRankSum=-0.476;SC=ACATTTGGCCGTAAGTGTGAA;SOR=0.604;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=240;TCF=108;TCR=132;TR=123;WE=180633493;WS=180633475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,136:0.52:263
chr3	180679156	.	G	A	108	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;FR=1.0000;HP=20;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=2;NR=4;PP=108;QD=23.7952020912;SC=AAAAAAAAAAGGTGTGTGTGT;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=6;WE=180679164;WS=180679146;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,6:0.86:7
chr3	180688997	rs11368900	C	CA	740.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=614;ReadPosRankSum=-0.361;SC=AAAAAAATGTCTATGTCTGCT;SOR=0.722;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=37;TCF=3;TCR=34;TR=16;WE=180689005;WS=180688987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,23:0.47:49
chr3	182546017	rs9814205	C	A	2600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=51;NR=35;PP=1406;SC=ATTACTCAATCTTAAGTTTGT;SOR=0.888;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=51;TCR=35;TR=86;WE=182546025;WS=182546007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr3	182575631	rs661774	G	T	70.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=0;PP=49;SC=TAATACATGAGTTGTATGTTT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=182575639;WS=182575621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr3	182575959	rs140800187	TGCAGAGAA	T	106.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.389;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=1485;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GCATTGCAAATGCAGAGAAGC;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=4;WE=182575974;WS=182575949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr3	182576923	rs645597	T	A	422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=3;PP=264;SC=ATTTTTTCTTTTCAAACAATT;SOR=2.049;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=182576931;WS=182576913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	182590354	rs771156	C	T	1598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=37;PP=1034;SC=AAAAATATTACTTTTCTCTCA;SOR=2.066;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=14;TCR=37;TR=51;WE=182590362;WS=182590344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr3	182598863	rs796406	A	G	898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=22;PP=611;SC=ATTAAAGTACAGTATCAAATT;SOR=2.985;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=27;WE=182598871;WS=182598853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr3	182681740	rs4859146	C	T	748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.755;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=14;PP=450;ReadPosRankSum=0.409;SC=TGAACTTCCACGCAATAATCA;SOR=0.521;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=45;TCR=31;TR=34;WE=182681748;WS=182681730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,37:0.44:85
chr3	182681853	rs4859147	T	C	1131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.677;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=25;PP=565;ReadPosRankSum=1.831;SC=AAAATAACAATGCAATATTAA;SOR=0.589;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=103;TCF=52;TCR=51;TR=50;WE=182681861;WS=182681843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,58:0.48:122
chr3	182735182	rs6786878	C	A	3762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=84;PP=2580;SC=TAGATATGTTCATCTGCTTCA;SOR=1.990;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=33;TCR=84;TR=117;WE=182735190;WS=182735172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr3	182735211	rs2292056	T	G	948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=32;PP=721;ReadPosRankSum=1.627;SC=ACCATTTTACTGTCTATATAT;SOR=0.923;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=60;TCF=9;TCR=51;TR=37;WE=182735219;WS=182735201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,38:0.59:64
chr3	182755209	rs2270968	T	G	1634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.769;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=42;PP=1019;ReadPosRankSum=-0.146;SC=AATGTTGGTGTGCAGTCCAAC;SOR=1.001;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=139;TCF=63;TCR=76;TR=72;WE=182755217;WS=182755199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,79:0.52:153
chr3	182757084	rs2270967	G	A	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=114;ReadPosRankSum=-0.152;SC=GAGGTTCAGAGGGCTTTGAAA;SOR=0.512;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=7;WE=182757092;WS=182757074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr3	182790249	rs7622479	G	A	4984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=87;NR=76;PP=2911;SC=TGTTTTCTGAGAGAAAACCGC;SOR=0.748;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=163;TCF=87;TCR=76;TR=163;WE=182790257;WS=182790239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr3	182804385	rs6806083	G	A	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.510;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=5;PP=425;ReadPosRankSum=0.481;SC=TAAAGATCTTGGGAAAGGCTA;SOR=1.131;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=63;TCF=47;TCR=16;TR=26;WE=182804393;WS=182804375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,25:0.39:64
chr3	182810144	rs3732604	T	G	1218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-2.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.785;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=15;PP=746;ReadPosRankSum=0.119;SC=ACGAAAATACTGACACAGTAA;SOR=0.545;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=93;TCF=69;TCR=24;TR=53;WE=182810152;WS=182810134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,60:0.55:110
chr3	182817328	rs937652	C	G	6141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=115;PP=2965;SC=TGACCCCCGCCGGCCACCGTC;SOR=0.967;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=207;TCF=92;TCR=115;TR=207;WE=182817336;WS=182817318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr3	182853670	rs482912	T	C	1802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.947;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=38;PP=1076;ReadPosRankSum=-1.717;SC=CCTTGGTAAATTGTCTCTGAA;SOR=0.445;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=178;TCF=84;TCR=94;TR=77;WE=182853678;WS=182853660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,90:0.45:201
chr3	182858287	rs522235	C	T	2688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.867;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=48;PP=1867;ReadPosRankSum=0.211;SC=ACAGAAACAGCGTCATGGCTG;SOR=0.927;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=260;TCF=150;TCR=110;TR=119;WE=182858295;WS=182858277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,136:0.47:292
chr3	182858461	rs831256	A	G	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=312;ReadPosRankSum=0.000;SC=ACTTTGTTTAAGATTCCAGCT;SOR=0.536;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=18;WE=182858469;WS=182858451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
chr3	182870082	rs682396	G	A	788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=18;NR=7;PP=380;SC=CTGAAGTGTGGGGTTGCACCA;SOR=1.143;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=25;WE=182870090;WS=182870072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr3	182870436	rs514636	G	A	196.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=185;SC=AACACCTCTCGTTTTCAAACT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=182870444;WS=182870426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	182871962	rs653316	C	T	4593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=50;PP=2778;SC=TTTTTGTAGTCGCTGGGGTAG;SOR=1.329;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=146;TCF=96;TCR=50;TR=146;WE=182871970;WS=182871952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr3	182880495	rs11543123	C	A	1578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.999;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=32;PP=850;ReadPosRankSum=-0.317;SC=GGGCAGGCCCCGAATCGGTGC;SOR=0.636;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=136;TCF=73;TCR=63;TR=66;WE=182880503;WS=182880485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,76:0.49:155
chr3	182880629	rs602762	A	C	888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=26;PP=580;SC=CCTACGGAGCAGGGAGGGGCG;SOR=2.964;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=32;WE=182880637;WS=182880619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	182897920	rs35070271	A	G	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=18;PP=326;ReadPosRankSum=1.981;SC=AAAGGTGTCCATGGAGCTAAA;SOR=0.715;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=36;TCR=47;TR=32;WE=182897928;WS=182897910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,35:0.39:89
chr3	182913092	rs577136	T	G	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.984;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=22;PP=451;ReadPosRankSum=-0.484;SC=TAAGCTAATTTGAATTGATTT;SOR=0.568;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=63;TCF=20;TCR=43;TR=33;WE=182913100;WS=182913082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,36:0.55:66
chr3	182925404	rs6804951	T	C	2615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=28;PP=1581;SC=ACCTTCATGGTCTTCTTGAAG;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=57;TCR=28;TR=85;WE=182925412;WS=182925394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr3	182946002	rs6803121	A	G	6862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=137;NR=88;PP=2965;SC=TAGACCATTGATGTTTCCATT;SOR=1.112;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=225;TCF=137;TCR=88;TR=225;WE=182946010;WS=182945992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr3	182947413	rs1122143	C	G	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=423;ReadPosRankSum=0.780;SC=CCACCCTTCTCTTACTCTCCA;SOR=0.789;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=21;WE=182947421;WS=182947403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,21:0.60:35
chr3	182987515	rs3811732	G	A	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.881;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.18;ReadPosRankSum=-1.829;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr3	183211906	rs1520101	A	G	6409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=132;NR=95;PP=2965;SC=AGGTCTCCACATTGTTGATTC;SOR=0.968;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=227;TCF=132;TCR=95;TR=227;WE=183211914;WS=183211896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr3	183212026	rs2256061	C	T	4726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=96;PP=2847;SC=ACTTGTTGATCGAAGAATTAT;SOR=1.205;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=156;TCF=59;TCR=97;TR=155;WE=183212034;WS=183212016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr3	183226114	rs73188786	G	T	5865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=93;PP=2965;SC=GAGTGTCCACGGGCAGGTCAA;SOR=0.836;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=181;TCF=88;TCR=93;TR=181;WE=183226122;WS=183226104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr3	183368216	rs3755648	A	T	2936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.130;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=72;PP=1794;ReadPosRankSum=1.383;SC=CAACTAAGCGAAAAGTTTTTG;SOR=0.518;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=318;TCF=169;TCR=149;TR=145;WE=183368224;WS=183368206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:192,153:0.44:345
chr3	183368891	rs2293031	C	T	2928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.035;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=56;PP=1874;ReadPosRankSum=0.148;SC=CACTGTTACACGAGCTCCTGA;SOR=0.833;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=246;TCF=134;TCR=112;TR=125;WE=183368899;WS=183368881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,135:0.50:269
chr3	183432983	rs3736535	C	T	4178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=426;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.517;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=90;PP=2529;ReadPosRankSum=3.345;SC=TCAAAGAAACCGACCCTGATT;SOR=0.735;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=389;TCF=201;TCR=188;TR=187;WE=183432991;WS=183432973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:219,207:0.49:426
chr3	183439972	rs3841649	A	AG	1307.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=673;ReadPosRankSum=1.642;SC=GAAGGGAACTATATTTACTAA;SOR=0.590;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=17;WE=183439980;WS=183439962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,38:0.61:62
chr3	183476685	rs262993	G	A	2747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.646;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=48;PP=1560;ReadPosRankSum=1.930;SC=GGCTTCTCAGGTCTCCCAAGG;SOR=0.895;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=250;TCF=139;TCR=111;TR=115;WE=183476693;WS=183476675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,132:0.46:287
chr3	183480108	rs3830564	ATGT	A	355.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.902;NF=1;NR=7;PP=278;ReadPosRankSum=-0.897;SC=CATGTAAATGATGTTGTTTGC;SOR=0.432;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=8;WE=183480118;WS=183480098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr3	183491340	rs262961	T	C	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=227;ReadPosRankSum=0.108;SC=AAAATAAGAATTTATTGCCTT;SOR=0.527;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=15;WE=183491348;WS=183491330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr3	183491720	rs262960	T	C	903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=25;PP=758;SC=TAGCATTTGCTCAGATGGATT;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=27;WE=183491728;WS=183491710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	183493743	rs146705467	CGGA	C	199.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.305;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.246;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=163;ReadPosRankSum=-0.564;SC=GGAGTGGTGCCGGAGGAGGAG;SOR=0.199;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=5;WE=183493753;WS=183493733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr3	183493991	rs2606220	G	A	497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=9;PP=260;SC=TTACCTTTACGGCTCTGGGAT;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=13;WE=183493999;WS=183493981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	183510782	rs263022	T	A	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=1.643;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=125;ReadPosRankSum=-0.504;SC=AACTTGAAAGTTCAGTTTTGT;SOR=0.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=8;WE=183510790;WS=183510772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr3	183521133	rs263042	A	G	763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.793;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=15;PP=409;ReadPosRankSum=-1.568;SC=GGTAACCCACATCTGCCTGTC;SOR=0.838;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=48;TCR=31;TR=37;WE=183521141;WS=183521123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,39:0.42:92
chr3	183524193	rs263034	T	C	1598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FS=1.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.12;ReadPosRankSum=-1.679;SOR=0.745;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:113,84:0.43:197
chr3	183524349	rs263033	C	G	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=187;ReadPosRankSum=-0.046;SC=AAAATCAGGTCAGTCCTTAAT;SOR=2.147;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=8;WE=183524357;WS=183524339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr3	183524379	rs263032	A	G	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.389;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=124;ReadPosRankSum=-0.478;SC=GAGGGGGATGACCTGGTTTTT;SOR=1.828;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=6;WE=183524387;WS=183524369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr3	183524948	rs263031	T	C	705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.790;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=18;PP=431;ReadPosRankSum=1.213;SC=GACGTTCAGCTTCACAGACCC;SOR=0.379;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=47;TCF=12;TCR=35;TR=26;WE=183524956;WS=183524938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,29:0.58:50
chr3	183528442	rs263024	C	T	877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=26;PP=590;ReadPosRankSum=0.170;SC=CCCTGCTGCTCGGGAAGGAGG;SOR=0.623;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=12;TCR=46;TR=33;WE=183528450;WS=183528432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,37:0.56:66
chr3	183535094	rs2582091	C	T	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.044;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=270;ReadPosRankSum=1.416;SC=GTCCTGAGGCCGCTCCCCAGC;SOR=0.215;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=18;WE=183535102;WS=183535084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,17:0.71:24
chr3	183535763	rs897604	A	G	1616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.011;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=14;PP=1022;ReadPosRankSum=1.946;SC=CACCCCTGCTACACCAGCTTC;SOR=0.431;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=96;TCF=74;TCR=22;TR=57;WE=183535771;WS=183535753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,63:0.61:104
chr3	183536063	rs894000	T	C	635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=21;PP=455;SC=GCAAGGCAAGTGCACTCCCGT;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=24;WE=183536071;WS=183536053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	183543291	rs263006	G	A	989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=16;NR=17;PP=437;SC=GCTGGTTCCAGCGCCGCGCCA;SOR=1.096;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=16;TCR=17;TR=33;WE=183543299;WS=183543281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr3	183558402	rs3732581	C	G	2863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.80;SOR=0.711;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr3	183560195	rs13091	A	G	2864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=40;PP=1582;SC=ATAAGGAGAAATGACTGAATG;SOR=0.912;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=58;TCR=40;TR=98;WE=183560203;WS=183560185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr3	183560292	rs7652031	A	T	2461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=47;PP=1384;SC=AATAAAAATTATCCATTTTAA;SOR=1.167;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=37;TCR=47;TR=84;WE=183560300;WS=183560282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr3	183562276	rs3811725	A	C	320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=266;SC=GAATGCTTTTAAAGTATCAGC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=183562284;WS=183562266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	183604723	rs1829515	A	G	2533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=39;PP=1389;SC=TAGCGGTAGCATGTCAAGGAA;SOR=0.714;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=48;TCR=39;TR=87;WE=183604731;WS=183604713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr3	183604801	rs4420923	G	T	1116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=29;PP=825;SC=CTCTTGTGGAGGGCCTGACAT;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=11;TCR=29;TR=40;WE=183604809;WS=183604791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr3	183643585	rs56348509	T	C	880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=20;PP=658;SC=TACTAAAATGTATTTCATTTA;SOR=1.942;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=28;WE=183643593;WS=183643575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	183663833	rs2292998	T	C	3061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=74;PP=1850;SC=ACTGAGCACATGCAGCAGCTG;SOR=1.940;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=31;TCR=74;TR=105;WE=183663841;WS=183663823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr3	183667823	.	G	A	2573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=0.000;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.402;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=56;PP=1659;ReadPosRankSum=-0.339;SC=AAGGAACCACGGGAAGACTCC;SOR=0.612;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=251;TCF=124;TCR=127;TR=118;WE=183667831;WS=183667813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,125:0.48:259
chr3	183669396	rs4148586	C	T	671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=18;PP=508;SC=GGCCCAGGGACGGCTCTGTTC;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=183669404;WS=183669386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	183679532	rs6443924	A	G	1764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=44;PP=1248;SC=TCTACAGGAGACGAGTTAAGC;SOR=2.910;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=55;TCF=10;TCR=45;TR=54;WE=183679540;WS=183679522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr3	183685534	rs939336	A	G	7555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=135;NR=125;PP=2965;SC=CCACACTGCCACAGATTCCAA;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=260;TCF=135;TCR=125;TR=260;WE=183685542;WS=183685524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,284:1.00:284
chr3	183696402	rs1132776	A	G	4904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=77;PP=2965;SC=GGAAGTACCCAGCTTTTTCCA;SOR=0.839;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=174;TCF=96;TCR=78;TR=172;WE=183696410;WS=183696392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr3	183699516	rs7636910	T	C	1895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=20;PP=1171;SC=TAAACTCACTTTGAACACTCT;SOR=1.542;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=44;TCR=20;TR=64;WE=183699524;WS=183699506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr3	183699781	rs2872247	A	C	1444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=30;PP=920;SC=AGGATGGGCCAAATGTTATGT;SOR=2.400;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=11;TCR=30;TR=41;WE=183699789;WS=183699771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr3	183700211	rs2293001	C	T	1574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=15;PP=927;SC=GGAGAAGCTGCCAGGATTCAG;SOR=1.421;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=34;TCR=15;TR=49;WE=183700219;WS=183700201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr3	183706630	rs6443926	A	C	1213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=27;PP=820;SC=GTCTCCCCAGATGATCTAATC;SOR=2.038;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=10;TCR=27;TR=37;WE=183706638;WS=183706620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	183749731	rs939334	T	C	564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=19;PP=456;SC=GTGACACTGATGGCTTTGTAC;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=183749739;WS=183749721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	183754029	rs6792482	T	C	1230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=30;PP=1021;SC=AGAATATGATTATAGGTAGAA;SOR=2.774;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=36;WE=183754037;WS=183754019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr3	183754294	rs6443930	G	C	3291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=46;PP=2006;SC=ATGGACAGAGGTGAACGCTCT;SOR=0.710;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=60;TCR=46;TR=106;WE=183754302;WS=183754284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr3	183755822	rs1000952	G	A	2067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=26;PP=1385;SC=GCCATCAGGCGCAGGTGCAGG;SOR=1.547;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=46;TCR=26;TR=72;WE=183755830;WS=183755812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr3	183756426	rs6799766	T	C	2169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=34;NR=31;PP=1089;SC=AGGGAAGTCATACTTCCTCTT;SOR=0.855;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=65;TCF=34;TCR=31;TR=65;WE=183756434;WS=183756416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr3	183756702	rs6789754	G	A	7421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=146;NR=114;PP=2965;SC=CTGCTCTTCCGCCTCTACCTG;SOR=0.975;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=261;TCF=146;TCR=115;TR=260;WE=183756710;WS=183756692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,279:1.00:279
chr3	183756742	rs55674402	C	T	10340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=391;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=177;NR=160;PP=2965;SC=TCATCACCGTCATATGCCTCT;SOR=0.806;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=337;TCF=177;TCR=160;TR=337;WE=183756750;WS=183756732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,391:1.00:391
chr3	183756780	rs6765152	A	C	9782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=366;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=71;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=145;NR=163;PP=2965;SC=GCTCACCTGCAAACTTCAGTC;SOR=0.832;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=308;TCF=145;TCR=163;TR=308;WE=183756788;WS=183756770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,366:1.00:366
chr3	183756808	rs6789882	G	A	6979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=97;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=117;PP=2965;SC=CTTTTTGCCAGAGAACTCCAG;SOR=1.063;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=198;TCF=81;TCR=117;TR=198;WE=183756816;WS=183756798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chr3	183756836	rs11274156	A	AT,ATGTCAGTCCAAAT	5721.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=40;PP=2970;SC=TCAGGCTCTCAGTCAGCCTTG;SOR=1.875;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=73;TCF=6;TCR=67;TR=41;WE=183756845;WS=183756826;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:132
chr3	183756837	.	G	T	983	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=41;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=6;NR=34;PP=983;QD=25.4442803137;SC=CAGGCTCTCAGTCAGCCTTGT;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=48;TCF=6;TCR=42;TR=40;WE=183756845;WS=183756826;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:8,40:0.83:48
chr3	183756837	rs66883074	G	GTCAGTCCAAATT	5721.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.94;QD=45.41;SOR=1.826;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr3	183756897	rs55953689	A	G	828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=251;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=26;PP=722;SC=GTAGTTTCAGACCAGACCTGA;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=183756905;WS=183756887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	183774762	rs6766410	C	A	2701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=57;PP=1546;ReadPosRankSum=0.843;SC=GCATCTGTAACCTGGACATCT;SOR=0.714;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=291;TCF=158;TCR=133;TR=125;WE=183774770;WS=183774752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:184,139:0.43:323
chr3	183774872	rs11432832	G	GA	1370.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.692;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=28;PP=1015;ReadPosRankSum=0.466;SC=AAGATTCAGGGAAGACATTTG;SOR=0.781;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=88;TCF=2;TCR=86;TR=30;WE=183774880;WS=183774862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,52:0.37:140
chr3	183776469	rs7617316	C	T	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.379;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=393;ReadPosRankSum=-0.582;SC=AAAGAAGCTCCAGGCCGGGTG;SOR=0.363;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=45;TCF=11;TCR=34;TR=25;WE=183776477;WS=183776459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,24:0.55:44
chr3	183777919	rs6807271	G	A	1798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.548;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.088;NF=46;NR=35;PP=945;ReadPosRankSum=0.503;SC=CCATGACTGAGCCTCTGTCCT;SOR=0.512;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=169;TCF=101;TCR=68;TR=81;WE=183777927;WS=183777909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,92:0.49:188
chr3	183778010	rs6807362	G	C	2496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.044;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=38;PP=1506;ReadPosRankSum=0.145;SC=GGGGGCTCAGGATGGACAAAG;SOR=0.591;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=199;TCF=122;TCR=77;TR=96;WE=183778018;WS=183778000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,112:0.50:224
chr3	183815439	rs6765267	A	G	1406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=32;PP=902;SC=TCTCTCTAGTAGAACATCTAG;SOR=2.256;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=11;TCR=32;TR=43;WE=183815447;WS=183815429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr3	183818416	rs7627615	G	A	4935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=83;NR=82;PP=2666;SC=CATCTCCTTCGCGATGTCTGC;SOR=0.803;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=166;TCF=83;TCR=83;TR=165;WE=183818424;WS=183818406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr3	183823576	rs4912524	T	C	2320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=24;PP=1589;SC=GCAGGCCCAGTCTCTATGTCA;SOR=1.725;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=80;TCF=55;TCR=25;TR=79;WE=183823584;WS=183823566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr3	183861243	rs843358	A	G	2887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.521;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=59;PP=1649;ReadPosRankSum=0.350;SC=TGCCTATAACATAAGTCTAAA;SOR=0.500;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=224;TCF=122;TCR=102;TR=122;WE=183861251;WS=183861233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,139:0.56:250
chr3	183861750	rs843357	A	C	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.780;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=130;ReadPosRankSum=0.291;SC=ACAACTCCCAAGTCCCTCTGA;SOR=1.565;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=10;WE=183861758;WS=183861740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr3	183882129	rs142016012	T	A	3834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=412;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NR=87;ReadPosRankSum=0.018;SC=TGCCACCACCTATGGAGCGCA;SOR=0.684;Source=Platypus;TCR=179;WE=183882137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:221,190:0.46:411
chr3	183884895	rs1709638	C	T	561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.104;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=481;ReadPosRankSum=0.168;SC=TCCAGCAACCCCACACTGCAA;SOR=1.821;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=54;TCF=17;TCR=37;TR=24;WE=183884903;WS=183884885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,25:0.45:56
chr3	183896641	rs2231216	T	C	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=270;ReadPosRankSum=-1.392;SC=CTCTTTTCCCTCAGGAGGAAC;SOR=0.728;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=58;TCF=40;TCR=18;TR=25;WE=183896649;WS=183896631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,30:0.43:69
chr3	183904049	rs11539876	A	G	11761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=448;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=206;NR=196;PP=2965;SC=TTGACGGACAAGTCTTCGACT;SOR=0.707;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=402;TCF=206;TCR=196;TR=402;WE=183904057;WS=183904039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,447:1.00:447
chr3	183904232	rs1709624	T	A	1245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=19;PP=901;SC=CTGTCTGGGGTCTGAAACTGC;SOR=0.741;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=19;TCR=19;TR=38;WE=183904240;WS=183904222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	183975365	rs7633387	C	T	5342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=95;PP=2965;SC=GCAGGCTCGCCATGCCCATGT;SOR=0.963;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=176;TCF=81;TCR=95;TR=176;WE=183975373;WS=183975355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr3	183994536	rs843371	A	G	3482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=55;PP=1779;SC=AACAGACTCAAGGCTCAACTC;SOR=1.082;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=106;TCF=51;TCR=55;TR=106;WE=183994544;WS=183994526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr3	183995341	rs1001817	C	T	727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=20;PP=521;SC=AGGCAGTGTCCATGAATGAGG;SOR=3.098;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=183995349;WS=183995331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	183995854	rs2272471	G	A	3595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=77;NR=50;PP=2315;SC=CCACTGAGCCGGTTGAGGGCA;SOR=1.016;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=127;TCF=77;TCR=50;TR=127;WE=183995862;WS=183995844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
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chr3	183996213	rs843372	C	T	1281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=29;NR=12;PP=1085;SC=CCCCTACCCCCGCTCGGGAAT;SOR=1.845;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=29;TCR=12;TR=41;WE=183996221;WS=183996203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	183996484	rs140658066	CTTTCTTCT	C	1188.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.23;QD=42.45;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	183996511	rs1387976	C	T	961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=48.09;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr3	184003194	rs1687230	C	T	836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=0;PP=577;SC=CTTGCATGTTCCTGGGGGCTG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=184003202;WS=184003184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	184010048	rs3914188	G	C	1608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.553;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=42;PP=1111;ReadPosRankSum=0.492;SC=GGGAGAAATGGCCAGCTGTCA;SOR=0.621;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=171;TCF=74;TCR=97;TR=73;WE=184010056;WS=184010038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,79:0.42:190
chr3	184016991	rs2272475	T	G	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.86;ReadPosRankSum=0.812;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr3	184016992	rs2272474	T	C	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.601;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.86;ReadPosRankSum=0.812;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr3	184020100	rs71185698	C	CA	110.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.095;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=106;ReadPosRankSum=0.150;SC=TAAGTGAATTCATGGGGAAAA;SOR=0.330;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=4;WE=184020108;WS=184020094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr3	184020905	rs2272473	A	G	1092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.273;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=31;PP=739;ReadPosRankSum=1.717;SC=TGCCCCTTGTATTGGGAGTGA;SOR=1.001;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=116;TCF=47;TCR=69;TR=50;WE=184020913;WS=184020895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,54:0.40:134
chr3	184037533	rs13319149	A	G	4690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=105;NR=65;PP=2716;ReadPosRankSum=1.412;SC=CGTGGCCCCCACCCCAGTTTT;SOR=1.130;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=171;TCF=105;TCR=66;TR=170;WE=184037541;WS=184037523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,184:0.99:186
chr3	184039666	rs2178403	A	G	1227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.685;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=32;ReadPosRankSum=-0.893;SC=GACAGCATCAATGGCGCCCCC;SOR=0.625;Source=Platypus;TCF=42;TR=54;WE=184039679;WS=184039656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,57:0.47:122
chr3	184045799	rs939317	A	G	1136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.277;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=32;PP=703;ReadPosRankSum=0.112;SC=GGGTATGACCAGCTTCTCTGG;SOR=1.171;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=132;TCF=56;TCR=76;TR=51;WE=184045807;WS=184045789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,57:0.39:145
chr3	184046355	rs1879244	C	T	1180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.229;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=18;PP=693;ReadPosRankSum=-0.770;SC=AGCCATGCCACGTTGCCCCAG;SOR=0.918;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=118;TCF=71;TCR=47;TR=49;WE=184046363;WS=184046345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,57:0.41:138
chr3	184052420	rs62287502	G	T	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.393;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=349;ReadPosRankSum=0.565;SC=GTGCATCAGGGCCTTGTTTGA;SOR=1.896;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=54;TCF=45;TCR=9;TR=21;WE=184052428;WS=184052410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,24:0.40:60
chr3	184056101	rs1881973	G	C	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=10;PP=374;ReadPosRankSum=1.634;SC=GAAATGATACGGCAATACTGG;SOR=0.771;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=76;TCF=49;TCR=27;TR=28;WE=184056109;WS=184056091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,27:0.33:83
chr3	184062776	rs9839000	A	G	1282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.500;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=33;PP=797;ReadPosRankSum=1.611;SC=CATGCCTGGCAGTGGCATGCA;SOR=0.520;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=110;TCF=48;TCR=62;TR=60;WE=184062784;WS=184062766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,64:0.54:118
chr3	184064916	rs2293603	C	A	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.999;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=265;ReadPosRankSum=-1.266;SC=GAGGGGTGCCCCAGATTGGGA;SOR=0.352;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=16;WE=184064924;WS=184064906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr3	184070675	rs3749223	A	G	3076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=55;PP=1898;SC=AGGAAGACACAGGGAGAGGTA;SOR=0.818;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=55;TCR=55;TR=110;WE=184070683;WS=184070653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr3	184071017	rs41266265	G	A	7303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=389;ExcessHet=3.0103;FS=0.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.78;ReadPosRankSum=2.173;SOR=0.648;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:199,190:0.49:389
chr3	184071017	.	GTT	ATC	2944	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=85;NR=80;PP=2944;QD=20;SC=TTTAGGAAGCGTTTGTGGCTT;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=352;TCF=175;TCR=177;TR=165;WE=184071027;WS=184071007;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:187,165:0.47:352
chr3	184071019	rs11920716	T	C	7303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=385;ExcessHet=3.0103;FS=0.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.97;ReadPosRankSum=1.621;SOR=0.645;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:195,190:0.49:385
chr3	184071063	rs9820367	G	C	2848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.437;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=60;PP=1779;ReadPosRankSum=-0.591;SC=AGCCTCAGGGGTAGGGGGACC;SOR=0.741;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=258;TCF=130;TCR=128;TR=124;WE=184071071;WS=184071053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,134:0.48:277
chr3	184072459	rs73189624	G	A	1739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=14.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.45;ReadPosRankSum=1.717;SOR=0.906;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,85:0.56:152
chr3	184075047	rs2228291	A	G	3377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.507;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQRankSum=0.000;NF=71;ReadPosRankSum=0.519;SC=AGAGGGCTGTAATAGTCTCTA;SOR=0.629;Source=Platypus;TCF=143;WE=184075055;WS=184075037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,157:0.53:297
chr3	184075958	rs41266271	C	T	2214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.568;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=47;PP=1381;ReadPosRankSum=-1.001;SC=CTCCCCTTCTCTTCTAACATA;SOR=0.992;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=153;TCF=72;TCR=81;TR=84;WE=184075966;WS=184075948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,97:0.57:171
chr3	184090266	rs6141	C	T	1426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=19;PP=752;ReadPosRankSum=-0.712;SC=GAGCTGTACACGAGACAATGC;SOR=0.269;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=29;TCR=19;TR=48;WE=184090274;WS=184090256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,55:0.98:56
chr3	184091149	rs6142	G	T	1308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=17;PP=723;ReadPosRankSum=0.290;SC=GGTCTTCTAGGGGGACTGAGT;SOR=0.648;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=101;TCF=66;TCR=35;TR=55;WE=184091157;WS=184091139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,60:0.55:109
chr3	184093504	rs56151775	C	T	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=1.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.02;ReadPosRankSum=-1.802;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,7:0.19:37
chr3	184094183	rs956732	A	G	374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=9;PP=257;SC=CCAAGGGTGAAGAATCTATCC;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=184094191;WS=184094173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	184098193	rs1920128	A	C	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.55;ReadPosRankSum=-0.225;SOR=0.732;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,15:0.39:38
chr3	184098647	rs885650	C	T	910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.451;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=32;PP=713;ReadPosRankSum=-0.236;SC=GCGCGGGCGTCGGAGTGGACT;SOR=0.430;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=66;TCF=8;TCR=58;TR=37;WE=184098655;WS=184098637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,37:0.54:69
chr3	184099378	rs35929225	C	A	2972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.131;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=74;PP=1966;ReadPosRankSum=0.924;SC=GGGAGCCAGGCGCTGAGGAGC;SOR=0.850;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=241;TCF=111;TCR=130;TR=135;WE=184099386;WS=184099368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,139:0.55:254
chr3	184100961	rs3833587	G	GT	216.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.569;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.623;NF=3;NR=2;PP=55;ReadPosRankSum=0.056;SC=GGTGAGGCGGGGGGGGGGCCT;SOR=0.495;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=5;WE=184100969;WS=184100951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr3	184106217	rs1881972	A	G	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.371;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=112;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CCATCCATCCATCCGTCCCTT;SOR=1.828;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=8;WE=184106225;WS=184106207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr3	184144585	rs62287529	A	G	2502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.960;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=50;PP=1519;ReadPosRankSum=0.926;SC=ACCTCTCAACACCTTCCTGTG;SOR=0.776;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=218;TCF=112;TCR=106;TR=106;WE=184144593;WS=184144575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,124:0.49:253
chr3	184290348	rs9862375	G	A	1691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=31;PP=974;ReadPosRankSum=-0.783;SC=CATACCAGGTGTGTAATGTGC;SOR=0.651;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=160;TCF=93;TCR=67;TR=73;WE=184290356;WS=184290338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,85:0.47:181
chr3	184293564	rs7640497	C	T	800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=7;PP=526;SC=CTGCGGAGGTCTGGTGTCTGC;SOR=1.781;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=24;WE=184293572;WS=184293554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	184293769	rs7652597	T	C	4936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=74;PP=2965;SC=ACAGTGCCTGTACCAGTGAGT;SOR=0.774;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=157;TCF=82;TCR=75;TR=156;WE=184293777;WS=184293759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr3	184295008	rs7644069	C	A	2185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=44;PP=1340;SC=GCCTGGGTCACTTTCTCCTGG;SOR=1.264;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=31;TCR=44;TR=75;WE=184295016;WS=184294998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr3	184295316	rs7644377	C	T	4956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=89;PP=2841;SC=AAATTACCCCCGGATCATGAT;SOR=1.093;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=160;TCF=70;TCR=90;TR=159;WE=184295324;WS=184295306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr3	184295828	rs4072650	C	A	3465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=59;PP=1919;SC=CCATGGGCCGCCTCGAACTGC;SOR=0.912;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=113;TCF=54;TCR=59;TR=112;WE=184295836;WS=184295818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr3	184295921	rs4072651	C	T	1165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.18;SOR=2.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	184295921	.	CCA	TCG	539	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=4;NR=18;PP=539;QD=26.9303579483;SC=CCTCCTGGGGCCAGCCGTTGC;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=22;WE=184295931;WS=184295911;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,22:0.96:23
chr3	184295923	rs4072652	A	G	1165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.84;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	184297792	rs3935434	A	G	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=0.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=47;ReadPosRankSum=0.000;SC=CCCTCCCACAAGTCAGACAGC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=4;WE=184297800;WS=184297782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr3	184298663	rs11719912	G	A	2839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.074;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=61;PP=1712;ReadPosRankSum=1.115;SC=TGAGCAACCAGGATGTGAGTG;SOR=0.562;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=235;TCF=106;TCR=129;TR=118;WE=184298671;WS=184298653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,133:0.51:263
chr3	184299167	rs1138510	T	C	7411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=130;NR=113;PP=2965;SC=GGTTTGCATCTTTTGACCTGG;SOR=0.779;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=243;TCF=130;TCR=113;TR=243;WE=184299175;WS=184299157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr3	184402122	rs9290796	G	A	372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=1;PP=266;SC=ACCTGACTCTGGTGGCTCCTG;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=184402130;WS=184402112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	184616504	rs9845800	C	T	545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=14;PP=379;SC=TTCTCCTATTCTCCATTTGCT;SOR=2.419;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=18;WE=184616512;WS=184616494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr3	184631103	rs9821657	G	A	462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=2;PP=319;SC=TCTATCTTAGGGTAGCTTATA;SOR=2.584;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=184631111;WS=184631093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	184633247	rs4686879	A	C	1797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=33;PP=1064;SC=GAGAATTTCTAAATGTATTGG;SOR=1.402;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=22;TCR=33;TR=55;WE=184633255;WS=184633237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr3	184647413	rs4643688	T	C	3371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=60;PP=2025;SC=ACCAATATGATAAAATTATTG;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=45;TCR=60;TR=105;WE=184647421;WS=184647403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr3	184654166	rs6444004	A	G	3796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=77;PP=2435;SC=ATCTAGTGGAAAGACAATTAT;SOR=1.263;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=132;TCF=52;TCR=80;TR=129;WE=184654174;WS=184654156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr3	184658058	rs142586532	T	TTATA	276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.54;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	184675359	rs4501092	T	C	3471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=74;PP=2312;SC=CTTAACATTCTCCATTTGACA;SOR=2.001;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=31;TCR=74;TR=105;WE=184675367;WS=184675349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr3	184682214	rs6799328	T	C	797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=6;PP=495;SC=ACTCCACAAATAAGATTGGTG;SOR=1.942;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=26;WE=184682222;WS=184682204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	184684313	rs4470487	G	A	275.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=167;SC=AAACAGAAGAGTTTACTTCTG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=184684321;WS=184684303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	184700356	rs4572747	A	C	4432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.902;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=50;PP=2525;ReadPosRankSum=-0.619;SC=CATTATAGGCACTTTGGTTTC;SOR=0.881;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=144;TCF=94;TCR=50;TR=144;WE=184700364;WS=184700346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,166:0.99:167
chr3	184714014	rs9860814	C	T	709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=1;PP=570;SC=TCAATTTTAGCTGTTGGTAGT;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=184714022;WS=184714004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	184717703	rs2291737	T	C	587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=17;PP=473;SC=CCAATGTCATTTGGGCCTGGT;SOR=3.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=184717711;WS=184717693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr3	184801494	rs9845482	G	A	111.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=55;SC=ATTCAACATTGGTATAGTCAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=184801502;WS=184801484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	184935807	rs35531967	A	C	1079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=9;PP=657;SC=CCCACCTCGGACTCCCAGAGT;SOR=1.802;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=34;WE=184935815;WS=184935797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr3	185046909	rs34308085	AT	A	2080.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.240;NF=21;NR=25;PP=881;ReadPosRankSum=-1.690;SC=CAGTAGTTTTATTTTTTTTTA;SOR=0.501;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=52;TCF=25;TCR=27;TR=46;WE=185046917;WS=185046899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,79:0.99:80
chr3	185046975	rs9863304	T	C	4506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=88;NR=65;PP=2350;SC=ACAGGTCCCGTGTGCACGAAA;SOR=0.867;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=154;TCF=89;TCR=65;TR=153;WE=185046983;WS=185046965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr3	185155430	rs113427759	C	CT	304.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=1.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.83;MQRankSum=1.219;QD=12.70;ReadPosRankSum=0.127;SOR=0.928;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,17:0.71:24
chr3	185212593	rs6798873	T	C	1588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.464;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=39;PP=981;ReadPosRankSum=0.318;SC=AGAAAGGGTCTCCAGGTGTTG;SOR=0.477;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=162;TCF=74;TCR=88;TR=75;WE=185212601;WS=185212583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,82:0.46:179
chr3	185212880	.	C	A	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.253;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=388;ReadPosRankSum=-0.315;SC=TCGCTTCTCTCAAGGCCATGC;SOR=0.895;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=35;TCR=13;TR=25;WE=185212888;WS=185212870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,25:0.50:50
chr3	185226492	rs55854644	C	T	786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=5;PP=424;ReadPosRankSum=-1.699;SC=CTTTTTCTGCCTTGCAGAAAG;SOR=0.795;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=89;TCF=74;TCR=15;TR=33;WE=185226500;WS=185226482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,38:0.37:102
chr3	185229464	rs61730237	T	C	2353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.265;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=63;PP=1589;ReadPosRankSum=0.998;SC=CTTGGTGATATTTCTGAAATG;SOR=0.965;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=185;TCF=76;TCR=109;TR=99;WE=185229472;WS=185229454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,106:0.52:202
chr3	185232169	rs1837882	G	A	1029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=17;PP=665;ReadPosRankSum=1.423;SC=GGGAAATAGCGCACTGCAAAC;SOR=0.780;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=87;TCF=56;TCR=31;TR=47;WE=185232177;WS=185232159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,49:0.50:98
chr3	185252972	rs199752623	TCAAG	T	2592.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.305;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=36;PP=1676;ReadPosRankSum=2.711;SC=TAGCTGGGCATCAAGCAAGAG;SOR=0.577;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=108;TCF=7;TCR=101;TR=40;WE=185252983;WS=185252962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,69:0.44:158
chr3	185327012	rs73175547	C	T	989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-2.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.760;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=14;PP=602;ReadPosRankSum=-2.578;SC=TGGTACTTATCTAACATGCTT;SOR=0.419;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=91;TCF=63;TCR=28;TR=41;WE=185327020;WS=185327002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,48:0.44:108
chr3	185330303	rs73175548	C	T	891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=11;PP=449;ReadPosRankSum=1.164;SC=AGAGGAATGTCTTGATGTTGT;SOR=0.781;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=78;TCF=51;TCR=27;TR=34;WE=185330311;WS=185330293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,43:0.48:89
chr3	185431283	rs17826758	A	G	1645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.739;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=36;PP=993;ReadPosRankSum=1.794;SC=ACAGGTAAGTAAGATAGACTC;SOR=0.550;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=176;TCF=92;TCR=84;TR=78;WE=185431291;WS=185431273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,86:0.42:204
chr3	185542659	rs139618324	C	G	1666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.017;NF=48;NR=26;PP=1012;ReadPosRankSum=-0.027;SC=CCTGTCCCGCCAGGGGCAGCT;SOR=0.704;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=152;TCF=97;TCR=55;TR=74;WE=185542667;WS=185542649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,86:0.49:177
chr3	185635685	rs16860328	A	G	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.491;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=292;ReadPosRankSum=-0.281;SC=GAAATGAGATAGCAATCTTAA;SOR=0.277;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=40;TCF=13;TCR=27;TR=22;WE=185635693;WS=185635675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,24:0.53:45
chr3	185655454	rs1862904	A	G	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.203;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=226;ReadPosRankSum=-1.048;SC=CTATCCACAAAGGCTTTTTTT;SOR=0.165;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=11;WE=185655462;WS=185655445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr3	185879296	rs13073156	T	C	2063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=49;NR=22;PP=1280;SC=ACAGTCCCTGTGACTCTGAGA;SOR=1.641;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=49;TCR=22;TR=71;WE=185879304;WS=185879286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr3	185882643	rs4686741	C	G	2468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=25;PP=1728;SC=AATGTGTACGCAGGCGGGGAG;SOR=1.637;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=57;TCR=25;TR=82;WE=185882651;WS=185882633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr3	185905876	rs13087397	G	A	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=133;ReadPosRankSum=0.420;SC=CAGCATATCCGCAGAGCATGG;SOR=1.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=9;WE=185905884;WS=185905866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr3	185960414	rs12489063	G	A	3332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.322;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=76;PP=2011;ReadPosRankSum=-0.225;SC=AGTGCAGTGCGGAGGGAAGGG;SOR=0.615;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=290;TCF=141;TCR=149;TR=153;WE=185960422;WS=185960404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,164:0.51:320
chr3	185982955	rs3815620	G	A	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.555;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=287;ReadPosRankSum=1.161;SC=ATGCTTTTCTGTAGAACCCAA;SOR=1.772;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=48;TCF=33;TCR=15;TR=20;WE=185982963;WS=185982945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,20:0.39:51
chr3	185983273	rs11354963	CT	C	31.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=69;ReadPosRankSum=-0.054;SC=ACCCCTATGACTTTTTCTAGG;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=4;WE=185983281;WS=185983263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,4:0.22:18
chr3	185990096	rs2193587	C	T	5296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=95;NR=73;PP=2866;SC=AGGAATGTTTCTGGACACACA;SOR=0.776;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=168;TCF=95;TCR=73;TR=168;WE=185990104;WS=185990086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr3	186006566	rs710443	T	C	8344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=143;NR=127;PP=2965;SC=CCTTCAGGTATACCACTGGGG;SOR=0.773;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=270;TCF=143;TCR=127;TR=270;WE=186006574;WS=186006556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,310:1.00:310
chr3	186006618	rs1004588	G	C	2575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.459;HP=5;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=55;PP=1596;ReadPosRankSum=-1.353;SC=TTCCAGGGGGGTCGCAGCCAC;SOR=0.650;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=224;TCF=108;TCR=116;TR=107;WE=186006626;WS=186006608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,123:0.49:251
chr3	186015283	rs3819860	A	G	2634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=40;PP=1795;SC=CTGAGGAAAAAAAAGAAGATT;SOR=0.757;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=48;TCR=40;TR=88;WE=186015291;WS=186015273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr3	186015303	rs3819859	A	G	2610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=44;PP=1626;SC=TTAAAGACCAACCCAGGCCCT;SOR=0.870;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=43;TCR=44;TR=87;WE=186015323;WS=186015293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr3	186015315	rs3819858	T	C	2469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=43;PP=1832;ReadPosRankSum=0.375;SC=CCAGGCCCTCTAGCTTCTTGG;SOR=0.935;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=41;TCR=44;TR=83;WE=186015323;WS=186015293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,90:0.98:92
chr3	186015438	rs3819857	C	T	418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=13;PP=350;SC=GCTGTGTCTCCCCCATTATAG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=186015446;WS=186015428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	186287777	rs2889755	T	C	1394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=32;NR=11;PP=670;SC=ATACGCCCGATGATTTACCGA;SOR=1.524;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=32;TCR=11;TR=43;WE=186287785;WS=186287767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr3	186287980	rs12330397	T	C	4590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=79;PP=2301;SC=CTTATGGAGTTGCTTGGAGAA;SOR=0.929;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=155;TCF=76;TCR=79;TR=155;WE=186287988;WS=186287970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr3	186288565	rs3806714	A	G	990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=5;PP=740;SC=CTGCGGACCAAGGAGACCCCC;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=32;WE=186288573;WS=186288555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr3	186288810	rs3733160	G	A	3612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=45;NR=84;PP=2239;SC=TTGCTGGGGGGTGGGAGGGGG;SOR=1.461;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=132;TCF=45;TCR=87;TR=129;WE=186288818;WS=186288800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr3	186290127	.	CATTT	C	522	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=11;PP=522;QD=48.4545454545;SC=TTTCAGCTCACATTTATTTAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=11;WE=186290138;WS=186290117;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:12,11:0.48:23
chr3	186290143	rs374076917	TA	T	1091.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.43;SOR=2.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	186290145	rs368298566	TTTA	T	1091.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.43;SOR=2.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	186290155	rs2010555	G	A	871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.59;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr3	186293588	rs2280391	A	G	5260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=110;NR=61;PP=2965;SC=ACTGGATATTACCAACTCATG;SOR=1.392;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=171;TCF=110;TCR=61;TR=171;WE=186293596;WS=186293578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr3	186293819	rs56227532	T	C	1021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.018;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=27;PP=663;ReadPosRankSum=-0.570;SC=TCAGAAACTTTTGATGAACAG;SOR=0.420;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=86;TCF=26;TCR=60;TR=42;WE=186293827;WS=186293809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,46:0.49:93
chr3	186295417	rs60278421	AT	A	515.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.42;ReadPosRankSum=-0.219;SOR=0.638;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,26:0.93:28
chr3	186299107	rs11921733	G	A	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.452;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=285;ReadPosRankSum=0.499;SC=ATTGAGGAAAGGAAAGGCTGT;SOR=1.044;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=19;WE=186299115;WS=186299097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,24:0.65:37
chr3	186299905	rs6784026	T	C	4521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=70;NR=77;PP=2625;SC=TGTGATAACTTTTTGCTCTCT;SOR=0.928;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=147;TCF=70;TCR=77;TR=147;WE=186299913;WS=186299895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr3	186300683	rs9851299	G	T	953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=25;PP=698;SC=ACGATGATTTGTAACTCCTCT;SOR=2.517;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=32;WE=186300691;WS=186300673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr3	186301703	rs8147	A	G	5566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=106;NR=79;PP=2965;SC=AAATGTGACAATCTCATTAGT;SOR=0.930;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=186;TCF=107;TCR=79;TR=185;WE=186301711;WS=186301693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr3	186301840	rs13326516	T	G	4040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=70;PP=2416;SC=TATCAGCTGTTTCAGTCATTG;SOR=1.052;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=58;TCR=70;TR=128;WE=186301848;WS=186301830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr3	186302391	.	A	ATTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	2441.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=68.25;QD=33.45;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr3	186330969	rs4831	C	G	11960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=424;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=214;NR=173;PP=2965;SC=TTGCTCAGCTCTGGGGCTGCC;SOR=0.883;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=387;TCF=214;TCR=173;TR=387;WE=186330978;WS=186330959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,423:1.00:423
chr3	186335056	rs140827890	G	A	1353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=20;PP=769;ReadPosRankSum=-0.474;SC=GGTGCACGCCGCGAAAGCTGC;SOR=0.720;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=73;TCR=40;TR=56;WE=186335064;WS=186335046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,65:0.49:134
chr3	186337713	rs4917	T	C	5779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=103;NR=103;PP=2965;SC=GTGACCTGCATGGTGTTCCAA;SOR=0.757;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=206;TCF=103;TCR=103;TR=206;WE=186337721;WS=186337703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr3	186338382	rs4918	G	C	2016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=45;NR=20;PP=1090;SC=CAGCCCGTGAGCTCACAGCCC;SOR=1.358;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=66;TCF=45;TCR=21;TR=65;WE=186338390;WS=186338372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr3	186338425	rs1071592	A	C	3988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=86;NR=41;PP=2268;SC=CAGTCCCCACACCCGTGGTGG;SOR=1.194;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=128;TCF=87;TCR=41;TR=127;WE=186338433;WS=186338415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr3	186338869	rs11540663	C	T	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.195;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.91;ReadPosRankSum=-1.821;SOR=1.508;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr3	186358768	rs66965282	A	G	672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.127;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=6;PP=453;ReadPosRankSum=-1.019;SC=TGGTCTTTCTAGGTTTCTACT;SOR=1.009;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=56;TCF=43;TCR=13;TR=27;WE=186358776;WS=186358758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,30:0.44:68
chr3	186360409	rs3733159	T	G	1279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.818;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=31;PP=801;ReadPosRankSum=0.412;SC=CTTAACCAGGTCTTTGCCAAG;SOR=0.537;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=86;TCF=33;TCR=53;TR=52;WE=186360417;WS=186360399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,57:0.60:95
chr3	186370333	rs1131364	G	T	2473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=48;PP=1513;SC=AGAAGCTGGTGGTCCTGCCTT;SOR=1.382;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=32;TCR=48;TR=80;WE=186370341;WS=186370323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
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chr3	186393091	rs201939393	T	A	167.53	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=27.92;ReadPosRankSum=1.383;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,5:0.83:6
chr3	186393093	rs34359202	T	A	168.53	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=28.09;ReadPosRankSum=1.383;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,5:0.83:6
chr3	186393095	rs2378122	T	A	169.22	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=28.20;ReadPosRankSum=1.383;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,5:0.83:6
chr3	186393097	rs7428891	T	A	294.79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.85;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	186395113	rs2228243	A	G	6970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=146;NR=105;PP=2965;SC=GCCCAAAGACATTCTCATAAT;SOR=0.935;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=251;TCF=146;TCR=105;TR=251;WE=186395121;WS=186395103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,274:1.00:274
chr3	186395180	rs7629680	T	C	9244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=347;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=171;NR=150;PP=2965;SC=AGCATCCCCATGGACACCATC;SOR=0.734;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=321;TCF=171;TCR=150;TR=321;WE=186395193;WS=186395170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,347:1.00:347
chr3	186395572	rs1042464	A	T	8332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=143;NR=141;PP=2965;SC=AAGCCAGACAATCAGCCCTTT;SOR=0.726;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=284;TCF=143;TCR=141;TR=284;WE=186395580;WS=186395562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,311:1.00:311
chr3	186435370	rs1050274	G	A	3698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.139;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=67;PP=2227;ReadPosRankSum=1.153;SC=GCTCCAGGCTGCTACTAAGTT;SOR=0.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=248;TCF=143;TCR=105;TR=160;WE=186435378;WS=186435360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,172:0.64:268
chr3	186438037	rs2304452	T	C	1019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=25;PP=600;ReadPosRankSum=1.129;SC=GGCCTTCTGTTTTCTCCGTTG;SOR=0.582;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=59;TCF=17;TCR=42;TR=36;WE=186438045;WS=186438027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,42:0.62:68
chr3	186440243	rs1469859	G	A	1917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.079;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=42;PP=1137;ReadPosRankSum=-0.803;SC=GAGAATGCACGGCAACCGTGG;SOR=0.605;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=184;TCF=89;TCR=95;TR=84;WE=186440251;WS=186440233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,95:0.46:206
chr3	186442833	rs1656921	G	C	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.519;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=152;ReadPosRankSum=1.307;SC=TGCGAATGCTGATTGCGATCA;SOR=0.090;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=10;WE=186442841;WS=186442823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr3	186443018	rs1656922	T	C	2236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=50;PP=1132;ReadPosRankSum=1.076;SC=TCCCTCTTCATGCTTAATGAA;SOR=0.709;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=227;TCF=115;TCR=112;TR=103;WE=186443026;WS=186443008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,113:0.45:252
chr3	186445186	rs3841557	G	GA	1658.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.624;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=714;ReadPosRankSum=-0.302;SC=TTTACATTTTGTGGTAACTAT;SOR=0.434;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=52;TCF=3;TCR=49;TR=19;WE=186445194;WS=186445176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,50:0.48:105
chr3	186445237	rs5030025	A	C	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.297;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=279;ReadPosRankSum=0.456;SC=TTTAGATGACATTCAGCAATT;SOR=0.199;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=32;TCF=10;TCR=22;TR=15;WE=186445245;WS=186445227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr3	186449582	rs1648698	G	C	592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=480;ReadPosRankSum=0.095;SC=GTACCCCTTCGCTGCCCAGTT;SOR=0.793;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=41;TCF=2;TCR=39;TR=22;WE=186449590;WS=186449572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,22:0.52:42
chr3	186459927	rs710446	T	C	3762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.003;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=75;PP=2487;ReadPosRankSum=-1.663;SC=CCAGCTCCCATACAGAGTGAT;SOR=0.537;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=299;TCF=160;TCR=139;TR=154;WE=186459935;WS=186459917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,167:0.52:319
chr3	186505706	rs12630327	A	C	1686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.635;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=45;PP=1120;ReadPosRankSum=-0.761;SC=ATTGAAAAAAATTCATACGTT;SOR=0.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=137;TCF=52;TCR=85;TR=73;WE=186505714;WS=186505696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,78:0.52:149
chr3	186507757	rs1047148	G	A	3204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.862;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=63;PP=1930;ReadPosRankSum=0.713;SC=ATATATTCACGTTAACAATTC;SOR=0.807;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=285;TCF=159;TCR=126;TR=142;WE=186507765;WS=186507747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,156:0.49:316
chr3	186571123	rs1501299	G	T	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.439;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=10;PP=213;ReadPosRankSum=-1.258;SC=CTATATGAAGGCATTCATTAT;SOR=0.399;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=46;TCF=19;TCR=27;TR=19;WE=186571131;WS=186571113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,22:0.42:53
chr3	186760934	.	T	C	2258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.366;ClippingRankSum=0.000;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.665;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=54;PP=1387;ReadPosRankSum=-0.291;SC=CGGGACCATGTGAATGTATCC;SOR=0.849;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=202;TCF=102;TCR=100;TR=103;WE=186760942;WS=186760924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,108:0.50:214
chr3	186915250	rs187820649	G	T	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-5.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.111;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=443;ReadPosRankSum=0.678;SC=GTGGAAACAGGTTCCACTGCG;SOR=0.086;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=47;TCF=39;TCR=8;TR=27;WE=186915258;WS=186915240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,30:0.60:50
chr3	186915592	rs79843810	G	A	957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.542;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=26;PP=587;ReadPosRankSum=1.809;SC=AGCCCAGGAAGGTGGATCCCT;SOR=0.547;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=99;TCF=38;TCR=61;TR=43;WE=186915600;WS=186915582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,50:0.43:117
chr3	186917751	rs6764714	C	G	5076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=78;PP=2965;SC=GTCGCAGGACCAGACGGGCTC;SOR=0.848;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=173;TCF=95;TCR=78;TR=172;WE=186917759;WS=186917741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr3	186947410	rs850318	C	T	412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=12;NR=1;PP=245;SC=TCCAGTCTAGCCGAGAACTCT;SOR=2.448;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=186947418;WS=186947400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	186953808	rs850312	C	T	2950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.297;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=64;PP=1987;ReadPosRankSum=1.359;SC=TGACATACTGCAGGACATCTG;SOR=0.788;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=319;TCF=168;TCR=151;TR=138;WE=186953816;WS=186953798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:193,146:0.43:339
chr3	186954285	rs710452	A	G	9528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=359;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=160;NR=169;PP=2965;SC=GGAAGAGGCCAGGCTCAGCAT;SOR=0.841;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=329;TCF=160;TCR=169;TR=329;WE=186954293;WS=186954275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,359:1.00:359
chr3	186961478	rs710460	A	G	961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=24;PP=669;SC=TGATGGATCTATCTCATGCAG;SOR=2.517;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=31;WE=186961486;WS=186961468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr3	186969371	rs3214401	C	CG	558.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=588;ReadPosRankSum=-0.514;SC=GGGCAGGTTTCGAGAGTTTCT;SOR=0.608;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=15;WE=186969379;WS=186969361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr3	186969634	rs698092	A	G	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=18;PP=393;ReadPosRankSum=-0.646;SC=ATGAAGGTGAATAAAACATGG;SOR=0.823;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=58;TCF=21;TCR=37;TR=27;WE=186969642;WS=186969624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,31:0.48:65
chr3	186980264	rs710468	C	T	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=364;ReadPosRankSum=0.088;SC=AAGGAGAGGTCACAAGGCAGT;SOR=0.414;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=42;TCF=38;TCR=4;TR=21;WE=186980272;WS=186980254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
chr3	187003495	rs698105	A	G	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-2.748;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=104;ReadPosRankSum=0.079;SC=AATTCATACCATTGTGATGTT;SOR=0.180;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=9;WE=187003503;WS=187003485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr3	187009176	rs16861893	G	A	2975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.380;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=63;PP=1748;ReadPosRankSum=1.480;SC=CTTCAGCAGCGTCCGGAGCAG;SOR=0.727;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=272;TCF=138;TCR=134;TR=126;WE=187009184;WS=187009166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,140:0.48:294
chr3	187009351	rs16861895	C	G	3672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=362;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.362;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=65;PP=2149;ReadPosRankSum=0.469;SC=CAAGGTCAGACCTTCCCTGCT;SOR=0.770;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=324;TCF=175;TCR=149;TR=149;WE=187009359;WS=187009341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:189,172:0.48:361
chr3	187009372	rs16861896	G	A	3550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=358;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.382;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=70;PP=2108;ReadPosRankSum=0.471;SC=ATTTGACACTGGTCCCCAAAA;SOR=0.674;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=318;TCF=171;TCR=147;TR=149;WE=187009380;WS=187009362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:187,171:0.48:358
chr3	187009412	rs72549254	G	A	3185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.308;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=72;PP=1771;ReadPosRankSum=-1.363;SC=CCCCTGGCACGTACCTCATTT;SOR=0.787;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=298;TCF=151;TCR=147;TR=141;WE=187009420;WS=187009402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,158:0.48:327
chr3	187086081	rs5855133	TCAGA	T	1485.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=2;PP=1311;SC=TTCTGTGTACTCAGACAGTCT;SOR=4.863;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=25;WE=187086092;WS=187086071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	187086400	rs41268619	C	T	953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.822;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=27;PP=635;ReadPosRankSum=0.984;SC=TGTGGGTTTCCCAGGCAATAG;SOR=0.976;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=83;TCF=30;TCR=53;TR=39;WE=187086408;WS=187086390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,44:0.48:92
chr3	187088656	rs1047584	C	T	4726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=67;PP=2708;SC=GAGCACTGGACATCCCAGGGT;SOR=0.729;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=146;TCF=79;TCR=67;TR=146;WE=187088664;WS=187088646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr3	187088926	rs1533594	G	A	5655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=99;PP=2965;SC=TTAAAAAGCTGCATGACAAAG;SOR=0.781;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=194;TCF=94;TCR=100;TR=193;WE=187088934;WS=187088916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr3	187386831	rs4988514	T	C	910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.766;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=15;PP=423;ReadPosRankSum=-2.482;SC=AGGTCTGATATGGACAATACT;SOR=0.803;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=87;TCF=53;TCR=34;TR=41;WE=187386839;WS=187386821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,46:0.48:96
chr3	187416253	rs1523468	C	T	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=8;PP=465;ReadPosRankSum=-0.739;SC=ACTCTCAAGCCCATGTGCCCT;SOR=0.586;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=54;TCF=39;TCR=15;TR=29;WE=187416261;WS=187416243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,33:0.53:62
chr3	187416634	rs1973791	C	A	1121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.311;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.513;NF=22;NR=26;PP=746;ReadPosRankSum=0.210;SC=TGTTCTCCTCCAGCATGCTGG;SOR=0.873;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=88;TCF=47;TCR=41;TR=48;WE=187416642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,50:0.54:93
chr3	187416719	rs11707167	T	C	1249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.654;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.439;NF=27;NR=24;PP=531;ReadPosRankSum=-0.321;SC=GCCCGCCCGCTGGGCGCGGTC;SOR=0.580;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=114;TCF=66;TCR=48;TR=51;WE=187416727;WS=187416709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,61:0.47:131
chr3	187419661	rs113681515	G	GCCTGCC	2346.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=4;PP=1968;SC=ACCAGAATAAGCCCGCGACTG;SOR=3.442;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=38;TCF=32;TCR=6;TR=32;WE=187419669;WS=187419651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr3	187419728	rs9812190	G	A	1650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=23;PP=847;ReadPosRankSum=1.075;SC=CTGTCTGCAAGGTCCCTCCCC;SOR=0.717;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=139;TCF=86;TCR=53;TR=61;WE=187419736;WS=187419718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,80:0.48:166
chr3	187420218	rs2293244	C	T	992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.933;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=8;PP=651;ReadPosRankSum=-0.286;SC=GGAGGCCCAACCTCAGACCAC;SOR=0.908;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=82;TCF=62;TCR=20;TR=40;WE=187420226;WS=187420208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,44:0.49:89
chr3	187420445	rs4389470	C	T	2256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=50;PP=1408;SC=TAGCACAAACCGCTTGACCTG;SOR=1.854;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=22;TCR=50;TR=72;WE=187420453;WS=187420435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr3	187440506	rs1005099	C	A	618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.862;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=24;PP=491;ReadPosRankSum=-0.225;SC=TCTTGCCTCTCCAAGGCCAGG;SOR=2.331;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=66;TCF=16;TCR=50;TR=27;WE=187440514;WS=187440496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,28:0.38:73
chr3	187446211	rs2229362	C	T	1437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=34;PP=814;ReadPosRankSum=-1.203;SC=GTGGGGCCAGCGGTGTGGAGG;SOR=0.728;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=102;TCF=44;TCR=58;TR=59;WE=187446219;WS=187446201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,66:0.58:114
chr3	187447032	rs1056932	G	A	2437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=51;PP=1345;ReadPosRankSum=-2.962;SC=TGGCATTCTGGTTGAGGCTGT;SOR=0.680;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=234;TCF=126;TCR=108;TR=107;WE=187447040;WS=187447022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,123:0.45:272
chr3	187447926	rs1491997	C	T	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.178;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=13;PP=299;ReadPosRankSum=-0.822;SC=ACATAGGTGACGTGGCTCTGG;SOR=0.414;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=43;TCF=13;TCR=30;TR=21;WE=187447934;WS=187447916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,25:0.50:50
chr3	187450128	rs4417855	C	T	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=11;PP=471;ReadPosRankSum=0.281;SC=ATTGCATTTACACTTATTTTT;SOR=0.696;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=75;TCF=49;TCR=26;TR=32;WE=187450136;WS=187450118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,34:0.43:79
chr3	187450270	rs4387955	C	G	1709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.796;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=42;PP=1188;ReadPosRankSum=2.036;SC=AGACCCAACTCAAACCCCAAG;SOR=0.841;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=176;TCF=88;TCR=88;TR=81;WE=187450278;WS=187450260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,83:0.44:189
chr3	187451609	rs1880101	A	G	3057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=57;PP=1865;SC=GGTCCCTTGTATTTGATCTTT;SOR=1.089;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=45;TCR=57;TR=102;WE=187451617;WS=187451599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr3	187451701	rs1880100	T	C	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=3.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.76;ReadPosRankSum=-1.161;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr3	187451709	rs1880099	C	T	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.795;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=16.63;ReadPosRankSum=1.020;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr3	188202550	rs2067078	A	T	2825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=43;PP=1252;SC=TCATGTTTATAAGCCATCCTA;SOR=1.550;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=24;TCR=43;TR=67;WE=188202568;WS=188202540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr3	188202582	rs1559814	G	T	1800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=31;PP=878;SC=AATTTCATGAGTGTTTCTGTG;SOR=3.056;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=7;TCR=31;TR=38;WE=188202590;WS=188202572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr3	188326960	.	T	C	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.18;ReadPosRankSum=-0.292;SOR=0.706;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:139,29:0.17:168
chr3	188464248	rs3830584	G	GT	1695.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.393;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=14;PP=1461;ReadPosRankSum=2.381;SC=TGTATTTGTTGTAACTATCTC;SOR=0.991;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=82;TCF=45;TCR=37;TR=37;WE=188464256;WS=188464238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,57:0.43:132
chr3	188478197	.	GGT	G	163.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.135;ClippingRankSum=0.000;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=4.586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.27;MQRankSum=1.461;QD=7.12;ReadPosRankSum=1.003;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr3	188590358	rs4687001	C	T	3956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=45;PP=2366;SC=GTTTCCACCTCTTCCTTTTAC;SOR=1.219;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=126;TCF=80;TCR=46;TR=125;WE=188590366;WS=188590348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr3	188933213	rs3821734	C	T	1071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.546;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=25;PP=551;ReadPosRankSum=0.289;SC=GGAAATACAGCGTTTTCCTTG;SOR=1.005;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=91;TCF=38;TCR=53;TR=41;WE=188933221;WS=188933203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,52:0.47:110
chr3	188956822	rs16864142	A	G	91.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=1;NR=2;PP=25;SC=TGAAATCATGAAAGTTGAAAT;SOR=1.609;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=188956830;WS=188956812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	189033292	rs6773831	C	G	8590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.65;SOR=1.068;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr3	189033292	.	CTACTGC	GTACTGC,GTACTGT	1853	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=59.98;NF=132,58;NR=94,48;PP=1853,1531;QD=8.35296996702;SC=TATGCAGAGACTACTGCTGGG;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=226;TCF=132;TCR=94;TR=226,106;WE=189033306;WS=189033282;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:226
chr3	189033298	rs9827737	C	T	2349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FS=0.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.25;ReadPosRankSum=-1.446;SOR=0.639;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:137,117:0.46:254
chr3	189349247	rs28673064	A	T	1687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.457;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=21;PP=1034;ReadPosRankSum=-0.396;SC=ACACAGGTATATGTGTATATT;SOR=0.527;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=133;TCF=95;TCR=38;TR=68;WE=189349255;WS=189349237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,75:0.51:146
chr3	189507518	rs34201045	C	CAGAG	2252.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=13;PP=1203;ReadPosRankSum=-0.011;SC=GTAAGGGTCTCGGGGTGGGGG;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=74;TCF=36;TCR=38;TR=24;WE=189507526;WS=189507508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,55:0.41:134
chr3	189586630	rs16864880	C	G	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=129;ReadPosRankSum=0.980;SC=GACGTCAGCCCTCAGAGCCAG;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=8;WE=189586638;WS=189586620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr3	189587274	rs6790167	A	G	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=356;ReadPosRankSum=0.553;SC=TCATCATCTCATTATCTGTGA;SOR=0.968;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=45;TCF=5;TCR=40;TR=21;WE=189587282;WS=189587264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,24:0.48:50
chr3	189590871	rs111843185	G	A	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-3.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=195;ReadPosRankSum=-1.629;SC=GAGCAATGTGGAACATAATGG;SOR=0.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=10;WE=189590879;WS=189590861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr3	189604149	rs1554131	T	G	4890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=61;PP=2885;SC=TCAGTGTCCCTTGCTCACCAT;SOR=1.149;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=163;TCF=102;TCR=61;TR=162;WE=189604168;WS=189604139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr3	189604160	rs1345186	T	C	5652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=74;PP=2965;SC=TGCTCACCATTATTTCCATGT;SOR=0.907;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=177;TCF=103;TCR=74;TR=176;WE=189604168;WS=189604139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr3	189688569	rs3732920	C	A	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=99;ReadPosRankSum=-0.779;SC=TGAGCTAAAACATACTAAATA;SOR=0.527;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=11;WE=189688577;WS=189688559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr3	189688786	rs113747051	T	C	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.520;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=211;ReadPosRankSum=-1.438;SC=ATTAGTAAGTTTCCTTTGAAC;SOR=0.394;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=26;TCF=10;TCR=16;TR=14;WE=189688794;WS=189688776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr3	189689904	rs710543	A	G	1104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=19;PP=602;SC=GCAAATGGGCAGAGGCAGACA;SOR=1.445;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=14;TCR=19;TR=33;WE=189689912;WS=189689894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr3	189690816	rs71674435	G	GA	107.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.68;ReadPosRankSum=0.840;SOR=0.250;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr3	189690861	rs710545	T	A	296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=10;PP=269;SC=TCATTGGAGGTCGTAAGAAAA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=189690869;WS=189690851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
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chr3	189692565	rs1985690	G	A	1299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=33;PP=734;ReadPosRankSum=-0.168;SC=TGCAATTCGAGTGAGTCCATT;SOR=0.746;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=104;TCF=40;TCR=64;TR=51;WE=189692573;WS=189692555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,62:0.51:122
chr3	189702200	rs710558	T	C	636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=4;PP=508;SC=GACCTGGATGTAGAGCTCCTA;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=189702208;WS=189702190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	189702395	rs11311050	TA	T	1773.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=38;PP=664;ReadPosRankSum=-0.892;SC=TTGAATCGAGTAAAAAAAAAA;SOR=1.296;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=47;TCF=5;TCR=42;TR=42;WE=189702404;WS=189702385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,77:0.97:79
chr3	189705542	rs3114672	A	G	1391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=37;PP=1136;SC=CGTGTCTACAAAGGTCAGCAT;SOR=4.664;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=40;TCF=3;TCR=37;TR=40;WE=189705550;WS=189705532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr3	189712010	rs1719600	G	A	2025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.270;NF=48;NR=50;PP=1203;ReadPosRankSum=-0.367;SC=CTTGTTCGAAGTGCCTGATAG;SOR=0.676;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=222;TCF=111;TCR=111;TR=98;WE=189712018;WS=189712000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,104:0.41:253
chr3	189712089	rs1719599	GG	AA	3217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=39;PP=2536;SC=TGAAACAGACGGGAAAAAACA;SOR=2.334;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=59;TCF=16;TCR=43;TR=53;WE=189712102;WS=189712079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr3	189712094	rs139834656	A	AAAAC	1065.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=21;PP=955;SC=CAGACGGGAAAAAACAAACAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=21;WE=189712102;WS=189712079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	189713205	rs9821880	T	C	2006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.184;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=43;PP=1218;ReadPosRankSum=-0.167;SC=TGTGAGCTGCTTCCACTGCTT;SOR=0.579;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=151;TCF=72;TCR=79;TR=85;WE=189713213;WS=189713195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,97:0.55:176
chr3	189713346	rs112063135	T	G	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.79;ReadPosRankSum=-1.150;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr3	189837993	rs710596	G	A	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=293;ReadPosRankSum=0.070;SC=TCAAGAGAGCGTGTGAGAGCC;SOR=0.927;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=42;TCF=32;TCR=10;TR=21;WE=189838001;WS=189837983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,22:0.50:44
chr3	190026383	rs12629166	C	T	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.908;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=117;ReadPosRankSum=2.323;SC=TCTGAACATACACGCCAAAGA;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=7;WE=190026391;WS=190026373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr3	190030680	rs9869263	A	G	4141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=85;NR=47;PP=2332;SC=GAAATATCGCACCCCCAATGA;SOR=1.267;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=132;TCF=85;TCR=47;TR=132;WE=190030688;WS=190030670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr3	190157898	rs6767754	G	A	819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.118;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=7;PP=577;ReadPosRankSum=0.457;SC=ACTCTCCTCAGTGCAGGCCTT;SOR=0.083;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=53;TCF=45;TCR=8;TR=31;WE=190157906;WS=190157888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,33:0.59:56
chr3	190282197	rs6764468	G	A	3979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=76;PP=2434;SC=GTAGGGTAATGAGTCCACTCT;SOR=1.435;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=47;TCR=76;TR=123;WE=190282205;WS=190282187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr3	190322044	rs373099766	T	C	2357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.618;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=61;PP=1291;ReadPosRankSum=0.290;SC=CCCATTCAGCTGGCCTTACTC;SOR=0.807;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=213;TCF=93;TCR=120;TR=107;WE=190322052;WS=190322034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,117:0.51:229
chr3	190333162	rs35429399	TG	T	1568.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.421;NF=5;NR=27;PP=1150;ReadPosRankSum=1.290;SC=GTCCTTTTGTTGTTGCTTTTG;SOR=0.725;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=64;TCF=9;TCR=55;TR=32;WE=190333170;WS=190333152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,52:0.50:103
chr3	190338039	rs11368884	C	CT	100.27	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5082;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=69;ReadPosRankSum=-0.000;SC=AAAAAGTAAACTTTTTTTTTT;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=7;WE=190338047;WS=190338029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr3	190341241	rs4687160	C	A	1744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.499;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=37;PP=794;ReadPosRankSum=-2.951;SC=CACTTAGATTCTCTTAATTAC;SOR=0.364;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=124;TCF=48;TCR=76;TR=68;WE=190341249;WS=190341231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,82:0.59:140
chr3	190341292	rs4687161	C	T	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.742;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=228;ReadPosRankSum=-0.451;SC=AGAAAATAGACGACTGTTGTA;SOR=0.352;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=15;WE=190341300;WS=190341282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr3	190347391	rs7611887	C	T	707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=20;PP=417;ReadPosRankSum=0.153;SC=GCACCTAGCCCGACGGCATCT;SOR=0.747;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=16;TCR=47;TR=27;WE=190347399;WS=190347381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,32:0.46:70
chr3	190362220	rs34590034	A	T	870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.902;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=23;PP=492;ReadPosRankSum=-0.016;SC=AACCTCTTCTACTGTCATCTT;SOR=0.853;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=68;TCF=24;TCR=44;TR=34;WE=190362228;WS=190362210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,41:0.53:78
chr3	190576593	rs1393055	A	T	1193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=8;PP=798;SC=CTTTGGACACACCAGTCACTT;SOR=2.419;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=35;WE=190576601;WS=190576583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr3	190577535	rs9855583	A	G	2449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=35;PP=1308;SC=CATACTAACCAGGTCTACTTT;SOR=0.829;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=46;TCR=35;TR=81;WE=190577543;WS=190577525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr3	190577763	rs7640070	G	A	637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=18;PP=516;SC=ATTTAAGTGTGCTTTTAATAT;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=190577771;WS=190577753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	190578566	rs13075089	A	G	1449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.181;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=22;PP=835;ReadPosRankSum=0.668;SC=TCAACACTAGATTCTGACGTT;SOR=1.033;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=113;TCF=66;TCR=47;TR=62;WE=190578574;WS=190578556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,69:0.55:126
chr3	190580150	rs10630111	A	AG	584.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.36;ReadPosRankSum=1.363;SOR=0.910;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr3	190580151	.	A	G	165	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=9;NR=1;PP=165;QD=19.9771212547;SC=TAATAACAGAAAGAGAGAGAG;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=10;WE=190580159;WS=190580147;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr3	190580151	rs371567527	A	AGAG	584.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.39;ReadPosRankSum=1.694;SOR=1.002;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
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chr3	190594309	rs9880320	G	A	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-0.293;NF=11;NR=15;PP=270;ReadPosRankSum=0.554;SC=CCTTCATCGAGCCCCCACCAC;SOR=0.634;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=54;TCF=23;TCR=31;TR=26;WE=190594317;WS=190594299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,26:0.49:53
chr3	190594334	rs9842242	A	G	599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.26;MQRankSum=1.551;QD=13.95;ReadPosRankSum=-1.776;SOR=0.525;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,26:0.60:43
chr3	190594452	rs9842514	A	C	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=1.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQRankSum=-0.520;QD=14.57;ReadPosRankSum=-1.042;SOR=0.883;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,19:0.73:26
chr3	190936482	rs9290979	A	C	2039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.817;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=26;PP=1311;ReadPosRankSum=0.258;SC=GCATATGTACATACTTGGAGT;SOR=0.507;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=162;TCF=115;TCR=47;TR=83;WE=190936490;WS=190936472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,92:0.51:181
chr3	190967718	rs34754526	TA	T	247.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=0.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=338;ReadPosRankSum=-0.403;SC=CTATCATGTTTATTCCAACTC;SOR=1.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=10;WE=190967726;WS=190967708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr3	190980797	rs7644510	A	G	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=238;ReadPosRankSum=-0.646;SC=ATCACATTACAGCATTGTTAC;SOR=0.892;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=15;WE=190980805;WS=190980787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr3	190986110	rs10804933	C	T	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.209;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.123;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=61;ReadPosRankSum=0.917;SC=TTTTATTCCACAGCAATAGTT;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=5;WE=190986118;WS=190986100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr3	190991384	rs9857697	G	A	2538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.833;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=64;PP=1523;ReadPosRankSum=0.708;SC=GTGCTGTGCTGCAAGCATTGG;SOR=0.882;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=216;TCF=99;TCR=117;TR=115;WE=190991392;WS=190991374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,124:0.51:245
chr3	190991439	rs9877400	T	C	1427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.773;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=41;PP=1018;ReadPosRankSum=1.654;SC=AGATTTAGATTACAACTGTTA;SOR=1.114;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=102;TCF=32;TCR=70;TR=57;WE=190991447;WS=190991429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,60:0.52:115
chr3	190995847	rs3214008	T	C	2452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=26;PP=1351;SC=AGCTTGACTTTATGTTTAACT;SOR=1.080;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=50;TCR=26;TR=76;WE=190995858;WS=190995837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr3	190999790	rs6444533	A	G	1071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=0;PP=852;SC=CATTATTTCAACAATGGCAGA;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=31;WE=190999798;WS=190999780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr3	190999872	rs6444534	G	A	4613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=65;PP=2765;SC=TGATATGCACGTACCTTGGGT;SOR=1.075;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=158;TCF=93;TCR=65;TR=158;WE=190999880;WS=190999862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr3	190999917	rs6788319	C	A	6436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=119;NR=123;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.743;SC=TTGTAAAAAACTCAACACGGA;SOR=0.742;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=244;TCF=120;TCR=124;TR=242;WE=190999925;WS=190999906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,248:0.99:250
chr3	190999990	rs6444535	C	T	4709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=89;PP=2792;SC=TTAAAAAAAACCTTCTGGACT;SOR=1.070;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=157;TCF=67;TCR=90;TR=156;WE=190999998;WS=190999980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr3	191047532	rs9847278	A	G	5519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=94;NR=96;PP=2965;SC=CCGGAGGGAGAGCGCGCGGGA;SOR=0.836;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=190;TCF=94;TCR=96;TR=190;WE=191047540;WS=191047522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr3	191074796	.	TA	T	66.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=0.000;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=1.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.13;ReadPosRankSum=0.848;SOR=0.413;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,11:0.19:59
chr3	191074873	rs188384	C	G	5382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=100;NR=88;PP=2965;SC=TCCATCTACTCTAGTATGCCG;SOR=0.733;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=190;TCF=102;TCR=88;TR=188;WE=191074881;WS=191074863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr3	191075012	rs1520203	G	T	877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.688;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=21;PP=491;ReadPosRankSum=-1.127;SC=GTTTCTTAGGGCTTAGGTGGG;SOR=0.575;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=107;TCF=52;TCR=55;TR=42;WE=191075020;WS=191075002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,48:0.39:124
chr3	191075649	rs28627146	A	G	552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=1084;ReadPosRankSum=0.834;SC=GCTCTTTATTATATATTGTTG;SOR=2.066;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=19;WE=191075664;WS=191075639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr3	191075656	rs13434281	G	A	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.641;HP=4;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=723;ReadPosRankSum=-0.715;SC=ATTATATATTGTTGTTGAGAC;SOR=0.315;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=48;TCF=41;TCR=7;TR=22;WE=191075664;WS=191075639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,22:0.45:49
chr3	191075902	rs11542549	C	T	1281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=37;PP=823;ReadPosRankSum=0.285;SC=TCCAGAAGCGCTACAAAGACC;SOR=0.724;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=113;TCF=32;TCR=81;TR=51;WE=191075910;WS=191075892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,58:0.48:122
chr3	191087546	rs4677632	A	G	718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=4.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.43;ReadPosRankSum=0.044;SOR=1.882;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,24:0.62:39
chr3	191087551	rs697905	G	A	1552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.82;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr3	191093053	rs2028572	T	C	6192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=102;NR=94;PP=2965;SC=ACAATCCCCATATTAACAATG;SOR=0.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=196;TCF=102;TCR=94;TR=196;WE=191093061;WS=191093043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr3	191093080	rs2028573	A	G	2894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.943;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=56;PP=1794;ReadPosRankSum=-1.640;SC=ATGAAAGGAAACGGTCCACTC;SOR=0.664;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=230;TCF=117;TCR=113;TR=117;WE=191093088;WS=191093070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,131:0.51:258
chr3	191093175	rs2028574	T	A	9942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=373;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=173;NR=170;PP=2965;SC=GAGACTAAGATTAACCATCAG;SOR=0.720;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=343;TCF=173;TCR=170;TR=343;WE=191093183;WS=191093165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,373:1.00:373
chr3	191093310	rs4677728	A	G	3872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=78;PP=2666;SC=GAGCACAGAAAAAGGAGACAC;SOR=1.256;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=51;TCR=78;TR=129;WE=191093318;WS=191093300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr3	191093384	rs4677729	A	G	1846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=34;PP=1116;SC=CGCAGGTAATAGAGGACAGTC;SOR=1.402;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=22;TCR=34;TR=56;WE=191093392;WS=191093374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr3	191093434	rs293806	A	G	870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=17;PP=497;SC=ACTACAAACCAATGAATTTAA;SOR=1.681;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=9;TCR=17;TR=26;WE=191093442;WS=191093424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr3	191093475	rs4677730	T	C	362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=8;PP=249;SC=TCTTTCTCTCTAGTTCATGCT;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=191093483;WS=191093465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	191097908	rs293812	C	T	125.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.18;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	191097966	rs293813	T	C	1851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.86;QD=26.08;SOR=1.545;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr3	191098121	rs293814	C	T	1928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=44;PP=1290;SC=TTTTGTGAATCTAGTCCATCT;SOR=2.105;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=16;TCR=44;TR=60;WE=191098129;WS=191098111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr3	191098731	rs211043	G	A	4445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=83;PP=2463;ReadPosRankSum=1.657;SC=GGTAGAGTGTGTTTTGTTTGT;SOR=0.996;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=153;TCF=69;TCR=84;TR=151;WE=191098739;WS=191098721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,171:0.99:173
chr3	191100448	rs383529	G	T	496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=0;PP=425;SC=ATAAACATACGTTAAACTTAA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=191100456;WS=191100438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	191100561	rs364519	C	A	5449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=113;NR=67;PP=2965;ReadPosRankSum=1.587;SC=CAGCAAATTCCAAGTCAAAAG;SOR=0.399;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=181;TCF=114;TCR=67;TR=180;WE=191100569;WS=191100551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,202:1.00:203
chr3	191100642	rs9838011	A	T	2348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.603;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=56;PP=1235;ReadPosRankSum=0.686;SC=AAGAAAAATGAGGAAGTTGAC;SOR=0.559;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=260;TCF=126;TCR=134;TR=113;WE=191100650;WS=191100632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,124:0.44:281
chr3	191178925	rs539897	G	A	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=199;ReadPosRankSum=0.742;SC=AGGGCCAGGCGTTGGGAGAGC;SOR=1.112;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=11;WE=191178933;WS=191178915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr3	191179193	rs293833	A	G	2405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.503;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=50;PP=1312;ReadPosRankSum=-0.243;SC=AAGATGAATCAAACGCATCTG;SOR=0.674;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=230;TCF=123;TCR=107;TR=105;WE=191179201;WS=191179183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,123:0.48:256
chr3	191179303	rs176823	C	T	949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.569;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=29;PP=604;ReadPosRankSum=-1.259;SC=CTTGGTTCTGCCTCCATTTTA;SOR=0.543;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=106;TCF=40;TCR=66;TR=47;WE=191179311;WS=191179293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,49:0.44:112
chr3	192125768	rs2249551	A	G	1471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.677;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=25;PP=899;ReadPosRankSum=-1.387;SC=GGAGGGAGAAAGAGGGCGTCC;SOR=0.825;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=110;TCF=64;TCR=46;TR=62;WE=192125788;WS=192125758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,67:0.54:123
chr3	192635348	rs9819230	C	G	546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=2;PP=451;SC=CGAGAAGCGGCAATGGGTTTT;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=192635356;WS=192635338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	192993762	rs13084990	C	A	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.024;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=350;ReadPosRankSum=-1.243;SC=GCTATTTAAACAAACAGCATC;SOR=0.970;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=58;TCF=23;TCR=35;TR=23;WE=192993770;WS=192993752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,23:0.36:64
chr3	192994543	rs2271791	A	G	931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.970;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=13;PP=527;ReadPosRankSum=-1.596;SC=CTTTACCTCTACAAAGAAAGC;SOR=0.438;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=67;TCF=46;TCR=21;TR=38;WE=192994551;WS=192994533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,44:0.57:77
chr3	193016895	rs1878716	T	C	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=10;PP=417;ReadPosRankSum=1.870;SC=AAAAACAATATAGTTTTCTTT;SOR=0.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=29;TCR=17;TR=27;WE=193016903;WS=193016885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,28:0.56:50
chr3	193023255	rs10937578	C	T	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-4.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.903;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=333;ReadPosRankSum=0.838;SC=TCTGTTGCAGCATTTATCACT;SOR=0.029;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=21;WE=193023263;WS=193023245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,23:0.62:37
chr3	193024928	rs10804952	C	T	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.131;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=100;ReadPosRankSum=-0.296;SC=CAGAAAGCATCGGAAGTGTCT;SOR=0.859;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=7;WE=193024936;WS=193024918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr3	193031926	rs2280268	C	T	1941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.859;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=31;PP=1113;ReadPosRankSum=-0.184;SC=ACTTGGCTGCCTGGAGGGATC;SOR=0.846;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=160;TCF=93;TCR=67;TR=79;WE=193031934;WS=193031916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,91:0.51:177
chr3	193036794	rs6788770	G	C	974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=20;PP=631;ReadPosRankSum=1.047;SC=CTAAGTGCTCGACTTCTGAAA;SOR=0.704;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=121;TCF=73;TCR=48;TR=49;WE=193036802;WS=193036784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,53:0.40:133
chr3	193042776	rs11926955	T	C	2379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=57;PP=1204;ReadPosRankSum=0.894;SC=CAGCCTGGCCTGAGGCAAAGC;SOR=0.724;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=217;TCF=104;TCR=113;TR=111;WE=193042784;WS=193042766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,121:0.50:240
chr3	193042964	rs11715170	G	A	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.230;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=139;ReadPosRankSum=0.936;SC=CCTTAGCCTGGTATTCAAAGT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=8;WE=193042972;WS=193042954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr3	193044923	rs1387700	T	C	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.468;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=240;ReadPosRankSum=-0.996;SC=AAAACCCAAGTTTCTAAGATA;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=11;WE=193044931;WS=193044913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr3	193062906	rs6444706	G	A	1994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=53;PP=1391;SC=GATAGTTCATGTTCTGAAAAC;SOR=2.617;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=15;TCR=53;TR=68;WE=193062914;WS=193062896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr3	193068800	rs1038719	G	A	1173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=5;PP=958;SC=AATACCATGGGCTTTACTTCT;SOR=3.556;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=33;TCR=5;TR=38;WE=193068808;WS=193068790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr3	193071888	rs11300573	CA	C	3522.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=36;PP=1581;SC=TCTATTTTTTCAAAAAAAAAA;SOR=1.828;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=101;TCF=51;TCR=50;TR=79;WE=193071897;WS=193071878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr3	193080414	rs6797429	C	G	2932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=70;PP=1998;SC=TTCTGCACTTCCATGCACCGC;SOR=2.147;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=26;TCR=70;TR=96;WE=193080422;WS=193080404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr3	193081206	rs2367605	G	A	1458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=38;PP=1068;SC=AAATTCTCAAGTGTTATTCAG;SOR=3.702;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=6;TCR=38;TR=44;WE=193081214;WS=193081196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr3	193081830	rs923496	A	G	933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=7;PP=736;SC=CCACAGAGTTATGCCACAGAG;SOR=2.376;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=32;WE=193081838;WS=193081820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr3	193081866	rs4386441	T	A	2112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=21;PP=1322;SC=CGATCATGGCTTTCAAAATAG;SOR=1.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=52;TCR=21;TR=73;WE=193081874;WS=193081856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr3	193082138	rs923494	T	C	707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.329;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=20;PP=534;ReadPosRankSum=0.290;SC=TTTCTTTCAATAAACCAAACT;SOR=0.387;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=59;TCF=19;TCR=40;TR=31;WE=193082146;WS=193082128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,32:0.51:63
chr3	193090101	.	A	AAGG	649	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;FR=1.0000;HP=20;HapScore=1;MGOF=7;MMLQ=28;MQ=62.07;NF=12;NR=6;PP=649;QD=36.2222222222;SC=AAAAAAAAAAAGGGGGAAGTT;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=35;TCF=23;TCR=12;TR=18;WE=193090109;WS=193090091;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:17,18:0.51:35
chr3	193090255	rs2171848	C	T	2934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.93;SOR=1.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr3	193090260	rs6444712	T	C	2728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.48;SOR=1.942;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr3	193096529	rs4687419	C	T	2533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=49;PP=1476;SC=ACTCAACCGGCGAGGATCTCT;SOR=1.533;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=31;TCR=49;TR=80;WE=193096537;WS=193096519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr3	193153562	rs1996735	T	C	3117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=72;PP=1921;SC=GATAAAGACATGAAAGTAATG;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=113;TCF=40;TCR=73;TR=111;WE=193153570;WS=193153552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr3	193180400	rs56312820	A	C	1738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=5;PP=1358;SC=TTGAAGAATTAAAGATGAGAA;SOR=4.255;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=46;TCR=5;TR=51;WE=193180408;WS=193180390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr3	193182715	rs12696666	T	G	2287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.30;SOR=0.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr3	193183039	rs7617230	T	C	91.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=5;PP=90;SC=TACAGTGGTGTGATCTCAGCT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=193183047;WS=193183029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	193183817	rs3796181	A	G	4763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=68;PP=2723;SC=AGCTTACCCCACTAAGCACAT;SOR=0.918;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=162;TCF=94;TCR=68;TR=162;WE=193183825;WS=193183807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr3	193201582	rs9842836	C	A	218.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=0;PP=200;SC=AAAAAAAAAACTTAAGTTCCT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=7;WE=193201590;WS=193201576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	193209178	rs6788448	T	C	4832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=78;PP=2847;ReadPosRankSum=1.329;SC=TAGGCCCACATATTAACCTCC;SOR=0.306;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=155;TCF=76;TCR=79;TR=154;WE=193209186;WS=193209168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,176:0.99:177
chr3	193210768	rs2130407	A	G	1103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=20;NR=16;PP=705;SC=TGGCAGAACTAAGCCAGTCTT;SOR=0.743;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=20;TCR=16;TR=36;WE=193210776;WS=193210758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr3	193272442	rs58073069	CGTGTGT	C	249.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=17.84;ReadPosRankSum=-0.179;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr3	193332549	rs201520438	A	G	2941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=47;PP=1746;ReadPosRankSum=-2.192;SC=CAGCTCTGGAATAAAAGGAAG;SOR=0.687;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=248;TCF=151;TCR=97;TR=122;WE=193332557;WS=193332539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,139:0.50:276
chr3	193360957	.	TA	T	163.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.003;ClippingRankSum=-0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=9;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=9;PP=152;ReadPosRankSum=-1.856;SC=GTAGAGCTTTTAAAAAAAAAT;SOR=2.517;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=10;WE=193360965;WS=193360947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr3	194061826	rs11711157	C	T	2181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=48;NR=27;PP=1362;SC=TCGATAGACACGGTGAGCCGC;SOR=1.236;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=48;TCR=27;TR=75;WE=194061834;WS=194061816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr3	194061906	rs4974538	T	C	3117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=53;PP=1651;SC=GGAGCCCTGCTGAGGAGAGAG;SOR=0.778;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=110;TCF=57;TCR=53;TR=110;WE=194061914;WS=194061896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr3	194062519	rs3732477	C	T	5398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=83;PP=2965;SC=GTGCCCTCAGCGACAGTCTCC;SOR=0.778;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=176;TCF=93;TCR=83;TR=176;WE=194062527;WS=194062509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr3	194062565	rs3732476	C	T	7330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=136;NR=114;PP=2965;SC=CAACCAGGCACGGGGTGTGGG;SOR=0.825;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=251;TCF=137;TCR=114;TR=250;WE=194062573;WS=194062555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,273:1.00:273
chr3	194063300	rs62288099	T	C	6705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=111;NR=123;PP=2965;SC=GGATGTCCAGTGGGACGGTGG;SOR=0.943;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=234;TCF=111;TCR=123;TR=234;WE=194063308;WS=194063290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chr3	194118874	rs1223989	T	C	2734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.936;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=42;PP=1631;ReadPosRankSum=-2.398;SC=TGGGCAGGCCTAGCGCGGAGA;SOR=0.757;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=238;TCF=137;TCR=101;TR=108;WE=194118882;WS=194118864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,127:0.48:265
chr3	194124646	rs3836225	TG	T	234.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=117;ReadPosRankSum=-0.919;SC=GTTAAAAAAGTGGGGGGGGGG;SOR=0.793;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=8;WE=194124654;WS=194124636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr3	194219775	rs144732863	GA	G	67.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=1.790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.65;ReadPosRankSum=-0.583;SOR=0.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,9:0.22:41
chr3	194309528	rs789837	G	A	1015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=25;PP=732;SC=CTGTGTTTCTGGGACCTAAGG;SOR=2.115;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=34;WE=194309536;WS=194309518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	194313632	rs7373172	G	A	947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=17;PP=555;ReadPosRankSum=0.643;SC=GTGAGCCACCGCGCCTGGCCT;SOR=0.750;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=51;TCR=31;TR=44;WE=194313640;WS=194313622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,46:0.52:88
chr3	194313832	rs1773184	T	C	3235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=69;PP=1781;SC=ACAGAAAAAGTGTTGGACAGA;SOR=1.270;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=47;TCR=69;TR=116;WE=194313840;WS=194313822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr3	194324939	rs6768028	A	G	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=197;ReadPosRankSum=-0.293;SC=ACAGCTGCACAAGCCCCAAGG;SOR=0.368;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=15;WE=194324947;WS=194324929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr3	194324982	rs745171	C	A	827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.937;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=9;PP=395;ReadPosRankSum=-1.743;SC=ACGATGGCACCCACGCACCCG;SOR=0.871;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=60;TCF=40;TCR=20;TR=32;WE=194324990;WS=194324972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,37:0.54:68
chr3	194325006	rs732124	A	G	847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=0.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.63;ReadPosRankSum=-0.643;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,45:0.51:88
chr3	194325010	rs745168	G	A	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=13;PP=1112;ReadPosRankSum=0.916;SC=GGCAACAGCCGTGTACCTCCA;SOR=0.760;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=81;TCF=53;TCR=28;TR=40;WE=194325018;WS=194324996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,45:0.48:93
chr3	194325325	rs708632	C	T	487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=410;SC=GGCCATCCAGCTCTCCCCAGG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=194325333;WS=194325315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	194331875	rs789993	A	T	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.381;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=354;ReadPosRankSum=1.648;SC=TTTTAACGGCACGTCTCACTT;SOR=0.283;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=44;TCF=8;TCR=36;TR=21;WE=194331883;WS=194331865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,22:0.49:45
chr3	194337708	rs10933663	T	G	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.596;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=99;ReadPosRankSum=0.342;SC=ACCACTCCCTTACTGCTGGGA;SOR=0.399;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=8;TCR=15;TR=8;WE=194337716;WS=194337698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr3	194337901	rs922282	T	C	893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.83;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr3	194338423	rs12695036	C	T	1214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.351;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=35;PP=751;ReadPosRankSum=0.222;SC=GCTGGGAGAACGTGAGGGAGA;SOR=0.425;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=117;TCF=45;TCR=72;TR=58;WE=194338431;WS=194338413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,61:0.48:127
chr3	194344526	rs709011	G	C	1039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.779;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=29;PP=711;ReadPosRankSum=-1.000;SC=ACATGATGCTGAAGCGGGTTC;SOR=0.608;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=97;TCF=35;TCR=62;TR=46;WE=194344534;WS=194344516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,48:0.48:99
chr3	194346544	rs1773191	T	A	7779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.50;SOR=1.555;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr3	194346553	rs1773190	T	C	8555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.74;SOR=1.379;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr3	194346803	rs1773189	A	G	1281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=34;PP=960;SC=ACCCTGTATCACATGGGTTAC;SOR=3.664;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=5;TCR=34;TR=39;WE=194346811;WS=194346793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	194346822	rs1572979	G	A	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=317;ReadPosRankSum=0.000;SC=ACACTGATGCGGTGCTTTCTT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=14;WE=194346830;WS=194346812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr3	194349027	rs1318216	A	G	490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=1;PP=413;SC=CAACAAGACAAAAGCCACCAC;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=194349035;WS=194349017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	194349178	rs1563970	C	T	1865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.417;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=33;PP=1096;ReadPosRankSum=-0.419;SC=GGAGGCAGCACGCAGCACACA;SOR=0.887;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=195;TCF=112;TCR=83;TR=85;WE=194349186;WS=194349168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,93:0.45:205
chr3	194353772	rs11273892	C	CCCGCCCGACAG	526.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=6;NR=0;PP=1745;SC=CGCCCGTTTCCCCGCCCGACA;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=6;WE=194353780;WS=194353762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	194353875	rs1675955	G	T	579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=1.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.18;ReadPosRankSum=0.830;SOR=0.502;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,25:0.57:44
chr3	194362721	rs1060827	G	A	167.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=132;SC=GTCTTGGGACGGTTCCACAGG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=194362729;WS=194362712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	194369579	rs3821402	CC	AA	2664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.829;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=42;PP=2180;ReadPosRankSum=-1.341;SC=TCCCTCCTCCCCATGGCATAC;SOR=0.925;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=161;TCF=57;TCR=104;TR=61;WE=194369588;WS=194369569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,74:0.43:174
chr3	194371496	rs1773206	G	A	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=202;ReadPosRankSum=-0.725;SC=AACTTGTGCAGATCACTAGTA;SOR=1.127;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=11;WE=194371504;WS=194371490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr3	194373832	rs1675953	TG	CA	13833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=126;NR=128;PP=2947;SC=TGTCCAAACTTGGTTGTGTTG;SOR=0.832;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=269;TCF=133;TCR=136;TR=254;WE=194373841;WS=194373822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,310:1.00:310
chr3	194379567	rs1675948	A	G	1317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=3;PP=787;SC=CAGCACACAGAGGAAAAACTC;SOR=4.514;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=32;WE=194379575;WS=194379557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr3	194379596	rs1705971	C	A	2490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=21;PP=1410;SC=ACAGATTTTCCATAAGAATAA;SOR=1.836;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=47;TCR=21;TR=68;WE=194379604;WS=194379586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr3	194379646	rs11438897	T	TC	8301.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=74;PP=2936;SC=AAATCAAAATTCCCTCTTTGA;SOR=0.986;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=125;TCF=50;TCR=75;TR=121;WE=194379654;WS=194379636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr3	194379905	rs11357453	TA	T	590.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=20;PP=539;SC=TTCAAACAAGTAAAAAAATGA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=20;WE=194379913;WS=194379895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	194381530	rs1705969	A	G	1800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=45;NR=19;PP=1201;SC=CGTATAAGAAAGTACAGCAAT;SOR=1.508;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=45;TCR=19;TR=64;WE=194381538;WS=194381520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr3	194381680	rs1675947	G	A	1656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=34;PP=1031;SC=CTCTGTGCTAGATGTTATAAA;SOR=1.421;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=20;TCR=34;TR=54;WE=194381688;WS=194381670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr3	194381716	rs1705968	G	C	740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=19;PP=556;SC=CCGCTGGGAGGACATAAGCTA;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=23;WE=194381724;WS=194381706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	194381742	rs1705967	C	T	408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=11;PP=287;SC=GCATGACTACCTCACGGCAGA;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=194381750;WS=194381732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	194386136	rs1705966	C	T	846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=1;PP=571;SC=ACAAAATATACGGTAGTATCA;SOR=3.334;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=194386144;WS=194386126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	194386881	rs1675944	A	G	4055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=49;PP=2360;SC=CATGCCAAATATCTGAACTCA;SOR=1.037;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=79;TCR=49;TR=128;WE=194386889;WS=194386871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr3	194387300	rs1675943	C	T	1486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.378;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=39;PP=942;ReadPosRankSum=0.194;SC=TATTAAGTTTCTCTGTTCAAA;SOR=0.417;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=125;TCF=44;TCR=81;TR=64;WE=194387308;WS=194387290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,67:0.51:131
chr3	194390617	rs1773230	G	C	1789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=9;PP=1174;SC=CTGATATCACGCCACTGCACT;SOR=2.722;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=45;TCR=9;TR=54;WE=194390625;WS=194390607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr3	194390713	rs1675926	C	A	8536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=155;NR=125;PP=2965;SC=ACAGTCTCACCTGCACTCAGC;SOR=0.868;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=280;TCF=155;TCR=125;TR=280;WE=194390721;WS=194390703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,320:1.00:320
chr3	194390869	rs36028600	G	GA	3451.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=59;PP=2078;SC=GTGCAACTATGAAAAAACACA;SOR=1.568;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=72;TCF=4;TCR=68;TR=62;WE=194390877;WS=194390859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr3	194392683	rs1773231	A	C	2766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=23;PP=2012;SC=TCATCCTTCAAAACCCGGCTG;SOR=2.093;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=70;TCR=23;TR=93;WE=194392691;WS=194392673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr3	194408704	rs4677673	A	G	1861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.533;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=51;PP=1248;ReadPosRankSum=0.876;SC=GCCTGCTGTCAGGCGACAGCA;SOR=0.617;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=179;TCF=77;TCR=102;TR=89;WE=194408712;WS=194408694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,94:0.48:195
chr3	194842876	rs12633541	CA	TG	4329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.785;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=58;PP=2944;ReadPosRankSum=0.947;SC=GAAGGGGTGACAGAGCTCTTC;SOR=0.562;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=175;TCF=70;TCR=105;TR=99;WE=194842885;WS=194842866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,111:0.56:200
chr3	194842911	rs12634646	A	G	1201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.200;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=32;PP=715;ReadPosRankSum=-1.474;SC=CAGGACACTCATCCCATTCAT;SOR=0.276;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=88;TCF=26;TCR=62;TR=50;WE=194842919;WS=194842901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,54:0.53:101
chr3	194877355	rs80244009	G	C	1098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.599;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=29;PP=646;ReadPosRankSum=1.757;SC=TACACCTCCTGGGAGGCTCGG;SOR=0.883;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=98;TCF=38;TCR=60;TR=46;WE=194877363;WS=194877345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,53:0.49:108
chr3	194928138	rs12495970	A	C	2764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.907;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=47;PP=1838;ReadPosRankSum=-1.133;SC=GAAAACAGTGACTTTATTCTA;SOR=0.970;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=241;TCF=138;TCR=103;TR=118;WE=194928146;WS=194928128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,130:0.50:262
chr3	194991220	rs7640099	AA	GC	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=1;PP=438;SC=CCGGGAGCGCAAACTGACCTC;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=194991229;WS=194991210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	194999996	rs7610022	T	A	1222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=30;NR=13;PP=801;SC=AAAATTGTGATTTTTTAGCTG;SOR=1.714;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=30;TCR=13;TR=43;WE=195000004;WS=194999986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr3	195022931	rs72594392	TA	T	31.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQRankSum=0.693;QD=1.38;ReadPosRankSum=-0.842;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr3	195028183	rs13059843	G	A	280.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=231;SC=TTAGAAACAGGGGTTATCAAT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=195028191;WS=195028173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	195029738	rs10636354	G	GAAAGT	321.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=353;SC=GAAAACTACTGAAAGAACAAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=7;WE=195029746;WS=195029728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	195076877	rs6437374	C	G	10056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=373;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=181;NR=156;PP=2965;SC=CCCATGCGCTCGTAGCAACCA;SOR=0.765;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=337;TCF=181;TCR=156;TR=337;WE=195076885;WS=195076867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,373:1.00:373
chr3	195131711	rs144136865	C	G	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=12;PP=234;ReadPosRankSum=1.420;SC=CTGCTGGCATCTTTATCTTGG;SOR=0.612;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=35;TCF=12;TCR=23;TR=19;WE=195131719;WS=195131701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,20:0.53:38
chr3	195245771	rs17847363	C	T	2520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=26;PP=1501;SC=ATCTTAGGCACAGACCATTAC;SOR=1.536;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=61;TCR=26;TR=87;WE=195245779;WS=195245761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr3	195245805	rs17847362	G	A	4626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=98;NR=63;PP=2676;SC=ACATTTTCCAGACATCTAACC;SOR=1.017;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=161;TCF=98;TCR=63;TR=161;WE=195245813;WS=195245795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr3	195300676	rs1568566	A	G	941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=4;PP=690;SC=GTCACTCTGCATCAGCACTCC;SOR=3.675;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=33;WE=195300684;WS=195300666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	195306055	rs4677691	A	G	1370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=2;PP=1119;SC=TGCAGTCTTTATCTCAGCAGA;SOR=5.136;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=39;TCF=37;TCR=2;TR=39;WE=195306063;WS=195306045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr3	195345828	rs148520845	AG	GA	20590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.52;BaseQRankSum=0.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=803;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.473;NF=537;NR=440;PP=2947;ReadPosRankSum=-1.800;SC=CAGTGATCCCAGGGAAGCCAT;SOR=1.246;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=1028;TCF=563;TCR=465;TR=977;WE=195345837;WS=195345817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,801:1.00:803
chr3	195345953	rs145174488	C	T	13383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.53;BaseQRankSum=1.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=727;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.035;NF=237;NR=371;PP=2962;ReadPosRankSum=2.793;SC=CAGAGAGCAGCGCCTCTTCCG;SOR=0.724;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=792;TCF=301;TCR=491;TR=608;WE=195345961;WS=195345943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,587:0.81:727
chr3	195346477	rs7631117	C	T	2584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=352;ExcessHet=3.0103;FS=1.300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.99;MQRankSum=0.115;QD=7.34;ReadPosRankSum=0.692;SOR=0.602;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:213,139:0.39:352
chr3	195347059	rs2410778	C	T	6412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=801;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.138;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.153;NF=121;NR=181;PP=2962;ReadPosRankSum=1.406;SC=ACAGCCACGCCCACCACTGCT;SOR=0.800;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=766;TCF=318;TCR=448;TR=302;WE=195347067;WS=195347049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:486,315:0.39:801
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chr3	195395314	rs79206144	G	A	737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.680;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-2.605;NF=25;NR=12;PP=1887;ReadPosRankSum=1.211;SC=TGCCCTGTCCGTTCTGTGATC;SOR=0.520;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=110;TCF=78;TCR=32;TR=37;WE=195395362;WS=195395304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,41:0.36:114
chr3	195395328	rs62287989	T	C	2047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=4.281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.88;MQRankSum=-3.776;QD=14.52;ReadPosRankSum=1.085;SOR=0.409;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,55:0.39:141
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chr3	195395347	rs78747381	G	A	2417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FS=1.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.27;MQRankSum=-3.850;QD=13.28;ReadPosRankSum=1.437;SOR=0.574;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:116,66:0.36:182
chr3	195395354	rs80181010	A	G	2594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FS=1.130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.66;MQRankSum=-3.818;QD=12.30;ReadPosRankSum=0.744;SOR=0.603;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:134,77:0.36:211
chr3	195395379	rs73216381	T	G	1895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.051;NF=52;NR=36;PP=1215;ReadPosRankSum=-1.393;SC=TGCTCTCTGTTGTTTCCATAG;SOR=0.721;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=249;TCF=151;TCR=98;TR=88;WE=195395387;WS=195395369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,94:0.38:247
chr3	195395533	rs9847770	C	T	3850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=640;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.97;MQRankSum=-3.871;QD=6.02;ReadPosRankSum=-2.256;SOR=0.749;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:426,214:0.33:640
chr3	195395549	rs58717446	C	CAT	16088.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=4.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=575;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.829;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-11.053;NF=12;NR=189;PP=2966;ReadPosRankSum=-2.908;SC=GCGTTCGGCTCGTGTGTCTTG;SOR=0.927;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=293;TCF=12;TCR=281;TR=201;WE=195395557;WS=195395539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,407:0.72:562
chr3	195395564	rs78351752	C	T	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=457;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.76;MQRankSum=-4.290;QD=0.30;ReadPosRankSum=-1.674;SOR=0.629;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:398,59:0.13:457
chr3	195395624	rs74539433	A	G	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=4.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.43;MQRankSum=-4.158;QD=1.84;ReadPosRankSum=-1.885;SOR=1.761;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,8:0.14:57
chr3	195395631	rs201911835	A	T	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.60;MQRankSum=-3.944;QD=1.87;ReadPosRankSum=-3.375;SOR=0.822;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,6:0.15:40
chr3	195398250	rs80193871	C	A	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=2.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.35;MQRankSum=-4.698;QD=9.26;ReadPosRankSum=2.841;SOR=1.204;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,29:0.43:68
chr3	195398271	rs142433257	A	G	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=4.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.845;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-5.080;NF=3;NR=50;PP=1154;ReadPosRankSum=-1.492;SC=GTGTGCAGGCACATGTGCACA;SOR=1.574;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=85;TCF=7;TCR=78;TR=53;WE=195398279;WS=195398261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,28:0.52:54
chr3	195399599	rs2461859	T	C	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=13.678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.04;MQRankSum=-5.549;QD=1.70;ReadPosRankSum=1.879;SOR=1.659;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:138,29:0.17:167
chr3	195399620	rs9840981	C	G	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.576;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-7.868;NF=22;NR=17;PP=390;ReadPosRankSum=2.454;SC=TCGCAGTTGTCTCTTTAGATC;SOR=0.957;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=141;TCF=66;TCR=75;TR=39;WE=195399628;WS=195399610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,32:0.23:142
chr3	195399678	rs9874761	G	T	509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.255;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.707;NF=6;NR=20;PP=463;ReadPosRankSum=0.206;SC=TGTATTGTTTGCTAAATTGCA;SOR=0.408;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=60;TCF=13;TCR=47;TR=26;WE=195399686;WS=195399668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,23:0.40:58
chr3	195412876	rs11185503	T	C	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-2.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.671;NF=0;NR=16;PP=292;ReadPosRankSum=-0.596;SC=TTCTGCACTCTGGGGAAGAAG;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=16;WE=195412884;WS=195412866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,17:0.85:20
chr3	195426490	rs3107775	A	G	3557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=425;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.884;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=106;PP=2469;ReadPosRankSum=0.646;SC=TTTTTTCAATAAGTCAGCCTT;SOR=0.557;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=404;TCF=138;TCR=266;TR=168;WE=195426498;WS=195426480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:252,173:0.41:425
chr3	195447805	.	T	C	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.391;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=1.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQRankSum=-3.623;QD=1.85;ReadPosRankSum=-1.243;SOR=1.165;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,8:0.19:42
chr3	195447886	rs7627924	G	C	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQRankSum=-3.715;QD=5.86;ReadPosRankSum=0.022;SOR=0.663;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,44:0.35:127
chr3	195451810	rs200706535	A	C	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=1.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.32;MQRankSum=-2.793;QD=11.30;ReadPosRankSum=-0.919;SOR=0.372;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr3	195451841	rs201228126	G	A	1120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=3.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.56;MQRankSum=-4.532;QD=7.47;ReadPosRankSum=-0.219;SOR=1.004;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,57:0.38:150
chr3	195451880	rs142096782	AG	GA	7608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.95;MQRankSum=0.243;QD=25.71;ReadPosRankSum=-0.825;SOR=1.002;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,294:0.99:296
chr3	195452770	rs2550231	G	A	802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.96;MQRankSum=-0.667;QD=8.82;ReadPosRankSum=0.451;SOR=0.898;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,37:0.41:91
chr3	195452951	rs2688542	G	C	9854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=360;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=178;NR=143;PP=2965;SC=AGCTGCACCTGATGCCACGGT;SOR=0.912;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=321;TCF=178;TCR=143;TR=321;WE=195452959;WS=195452941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,360:1.00:360
chr3	195453064	rs2550233	T	G	8581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=136;NR=148;PP=2965;SC=GGAATCCCCTTGAAGAAACCT;SOR=0.885;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=284;TCF=136;TCR=148;TR=284;WE=195453072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,316:1.00:316
chr3	195453243	rs3828408	C	T	4060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=422;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.104;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-10.438;NF=101;NR=78;PP=2962;ReadPosRankSum=1.541;SC=TCAGAGACACCGACCATGGAC;SOR=0.817;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=390;TCF=212;TCR=178;TR=179;WE=195453265;WS=195453233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:226,194:0.46:420
chr3	195453257	rs3828406	G	A	4158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=419;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.094;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-9.419;NF=101;NR=83;PP=2962;ReadPosRankSum=1.090;SC=CATGGACATCGCAACCAAGGG;SOR=0.781;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=386;TCF=205;TCR=181;TR=184;WE=195453265;WS=195453233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:219,199:0.48:418
chr3	195460214	rs141976295	A	C	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.370;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=148;ReadPosRankSum=1.663;SC=GTTCCCATGAAGGGCAGCATG;SOR=1.051;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=30;TCF=11;TCR=19;TR=15;WE=195460222;WS=195460204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr3	195460236	rs712011	G	A	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=152;ReadPosRankSum=1.207;SC=CCAAGCCCCTGACCCCAGATG;SOR=0.610;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=22;TCF=7;TCR=15;TR=12;WE=195460244;WS=195460226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr3	195474159	rs62284986	G	A	2745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.451;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=60;PP=1489;ReadPosRankSum=0.997;SC=GCCGCCCAGGGCCCCAAAGAA;SOR=0.648;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=232;TCF=113;TCR=119;TR=119;WE=195474167;WS=195474142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,131:0.50:261
chr3	195476085	rs2688497	A	G	905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=24;PP=639;SC=TCAGATCAGCATGGTGGATAA;SOR=3.912;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=27;WE=195476093;WS=195476075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr3	195477713	rs2291654	G	A	383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.09;QD=34.89;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	195477713	.	GCC	ACA,ACC	139	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.3;FR=0.5000,0.5000;HP=9;HapScore=3;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=50.09;NF=4,11;NR=0,0;PP=24,139;QD=19.3669687156;SC=CTGTTTGCCCGCCCCCCGCAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=4,11;WE=195477723;WS=195477703;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.36:11
chr3	195477715	rs2291653	C	A	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.99;MQRankSum=1.030;QD=5.73;ReadPosRankSum=-0.129;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr3	195477791	rs2291652	G	A	921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.819;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.035;NF=24;NR=12;PP=523;ReadPosRankSum=1.379;SC=CTTCCCCGGAGATGGGCTGGA;SOR=0.946;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=75;TCF=49;TCR=26;TR=36;WE=195477799;WS=195477781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,43:0.51:85
chr3	195478012	rs2291651	G	C	1001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.245;HP=6;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=13;PP=629;ReadPosRankSum=0.778;SC=GTGAGGGGGGGTGGGGGGCTG;SOR=0.477;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=38;TCF=23;TCR=15;TR=36;WE=195478020;WS=195478002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,37:0.97:38
chr3	195478188	rs2291650	G	A	1439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=43;PP=1006;ReadPosRankSum=1.118;SC=GGCCCCATCCGGGGGGGAGAC;SOR=0.694;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=141;TCF=55;TCR=86;TR=70;WE=195478196;WS=195478178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,71:0.46:155
chr3	195479256	rs2258447	T	C	3266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=35;PP=2086;SC=AGGCGTTGACTTCTGCCATGG;SOR=1.417;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=71;TCR=35;TR=106;WE=195479264;WS=195479246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr3	195479489	.	AG	GC	115	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=24;MQ=57.49;NF=2;NR=3;PP=115;QD=33.6935749724;SC=AGGTCGCTGAAGAAACCGGGA;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=5;WE=195479498;WS=195479479;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr3	195484244	rs2550270	G	A	1702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=36;PP=1055;SC=GAGACTCCTCGGCTCTGTGGT;SOR=1.341;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=24;TCR=36;TR=60;WE=195484252;WS=195484234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr3	195487737	rs2246771	A	G	1463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=15;PP=1006;SC=AGGCCTCCCCAGGCCTCGGGC;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=38;TCR=15;TR=53;WE=195487745;WS=195487727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr3	195489009	rs2246901	C	A	3764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=78;NR=54;PP=2231;SC=CTGGCGGAGGCGTGGAGGATG;SOR=0.901;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=133;TCF=79;TCR=54;TR=132;WE=195489017;WS=195488999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr3	195489067	rs2246980	C	G	1673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.200;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=39;PP=1036;ReadPosRankSum=-2.323;SC=CGAAGCTGGCCGAGACCTCAG;SOR=0.571;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=160;TCF=81;TCR=79;TR=79;WE=195489075;WS=195489057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,82:0.48:170
chr3	195489669	rs2550263	C	T	1656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=12;PP=1311;SC=ACGCGGCTTCCCGCCCACCTC;SOR=2.387;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=46;TCR=12;TR=58;WE=195489677;WS=195489659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr3	195489930	rs76733630	C	T	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=236;ReadPosRankSum=0.016;SC=GGGAGGAAGGCGCTGGAGGCC;SOR=0.816;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=35;TCF=4;TCR=31;TR=15;WE=195489938;WS=195489920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr3	195490284	rs2550261	T	C	331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=1;PP=192;SC=GCAGGGAGGTTCCCGGCACCC;SOR=1.981;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=195490292;WS=195490274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	195490838	rs377595393	ATCC	A	211.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.373;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.12;ReadPosRankSum=-1.260;SOR=1.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr3	195490839	rs28406367	T	A	215.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.893;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.38;ReadPosRankSum=1.260;SOR=0.346;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr3	195490842	rs34858176	AGATG	A	205.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=2.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.29;ReadPosRankSum=-2.165;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr3	195492027	rs11926236	T	C	3962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=78;PP=2212;SC=AGGCCCAGGCTGGGGCTGCCA;SOR=0.937;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=148;TCF=68;TCR=80;TR=146;WE=195492045;WS=195492017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr3	195493674	rs73892867	C	T	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=253;ReadPosRankSum=-0.312;SC=GCTCTTGCCTCGCGGTTGCAA;SOR=0.876;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=38;TCF=13;TCR=25;TR=16;WE=195493682;WS=195493664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,19:0.42:45
chr3	195496129	rs2688492	C	T	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=122;ReadPosRankSum=0.511;SC=ACGCACAGCACCTGTTCCTGG;SOR=0.663;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=11;WE=195496137;WS=195496119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr3	195497174	rs2259102	C	G	5448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=101;NR=77;PP=2965;SC=CGTTGTTTGTCATCTTTCTAA;SOR=0.840;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=179;TCF=102;TCR=77;TR=178;WE=195497182;WS=195497164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr3	195497743	rs2260685	T	C	2509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FS=0.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.40;ReadPosRankSum=1.593;SOR=0.620;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:143,124:0.46:267
chr3	195497809	rs2259153	T	C	2550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=58;PP=1801;SC=CCGTCACCTGTAGGTCTTCTC;SOR=1.927;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=25;TCR=58;TR=83;WE=195497817;WS=195497799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr3	195501149	rs2259292	C	T	1006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=19;PP=503;ReadPosRankSum=0.236;SC=GTCCCCGGCGCCTGCCCCATA;SOR=0.735;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=67;TCF=36;TCR=31;TR=40;WE=195501157;WS=195501139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,47:0.61:77
chr3	195501258	rs2259331	T	C	799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=13;NR=18;PP=498;SC=GAGCGCTCCCTGCAGGCTGCC;SOR=1.214;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=13;TCR=18;TR=31;WE=195501266;WS=195501248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr3	195505417	rs2259419	G	A	810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.831;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=20;PP=460;ReadPosRankSum=1.083;SC=GCTGGAAGAGGGAGCTGGAAA;SOR=0.811;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=73;TCF=34;TCR=39;TR=36;WE=195505425;WS=195505407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,40:0.49:82
chr3	195505664	rs2688513	G	A	3785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=57;PP=2234;SC=CAGCTACCTGGTGTTTCCATC;SOR=0.922;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=133;TCF=76;TCR=57;TR=133;WE=195505672;WS=195505654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr3	195505788	rs2550253	G	C	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.273;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-2.580;NF=4;NR=11;PP=196;ReadPosRankSum=-0.501;SC=GAGGGGTGGCGTGACCTGTGG;SOR=1.093;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=55;TCF=21;TCR=34;TR=15;WE=195505796;WS=195505778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,16:0.31:51
chr3	195505835	rs58500707	C	T	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.08;MQRankSum=-2.278;QD=6.79;ReadPosRankSum=-0.450;SOR=1.508;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,6:0.20:30
chr3	195505838	rs59101491	G	C	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.44;MQRankSum=-2.249;QD=5.23;ReadPosRankSum=-0.844;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,6:0.21:29
chr3	195512004	.	T	A,G	1174	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MMLQ=24;MQ=54.19;NF=13,43;NR=10,35;PP=162,1174;QD=8.55527011075;SC=CTGAGGAAGTTTCGGTGACAG;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=101;TCF=56;TCR=45;TR=23,78;WE=195512012;WS=195511983;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.23:101
chr3	195512107	rs374495657	T	A	3954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.30;QD=29.08;SOR=0.953;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr3	195512107	.	TCATGAAGAGC	ACATGAAGAGA,ACATGAAGAGC	1149	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MMLQ=19;MQ=58.37;NF=7,55;NR=10,71;PP=140,1149;QD=11.3804632272;SC=AGCATCGGTGTCATGAAGAGC;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=126;TCF=55;TCR=71;TR=17,126;WE=195512125;WS=195512097;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.13:126
chr3	195512117	.	C	A	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.261;ClippingRankSum=0.000;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=4.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQRankSum=-4.001;QD=3.48;ReadPosRankSum=-0.489;SOR=0.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,20:0.17:121
chr3	195512137	.	A	G	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=0.000;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=2.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQRankSum=-4.505;QD=4.20;ReadPosRankSum=-3.614;SOR=0.844;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,14:0.17:83
chr3	195512145	.	A	AAGGCTGTT	234.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.952;ClippingRankSum=0.000;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=3.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQRankSum=-5.532;QD=3.50;ReadPosRankSum=-4.199;SOR=1.058;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,8:0.12:67
chr3	195512186	rs202060675	T	C	1374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=25;PP=888;SC=CCTGTGGATATTGAGGAAGCG;SOR=0.990;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=19;TCR=25;TR=44;WE=195512194;WS=195512176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr3	195512212	rs75588776	G	T	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=1.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.94;MQRankSum=-0.710;QD=3.99;ReadPosRankSum=0.305;SOR=0.791;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,9:0.24:37
chr3	195515449	rs200672669	A	G	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=2.886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQRankSum=1.201;QD=10.30;ReadPosRankSum=0.380;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr3	195515462	.	C	CGGTGACATGAAGAGGGGTGGTGTGACCTGTGGATGCCGAGGAAGCGTA	857.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=0.000;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=1.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQRankSum=0.930;QD=35.74;ReadPosRankSum=0.442;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr3	195515550	rs59408218	G	C	1069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.783;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=18;PP=647;ReadPosRankSum=0.037;SC=TGAGGGCCGTGGTGAAGGTTT;SOR=0.557;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=85;TCF=56;TCR=29;TR=46;WE=195515558;WS=195515540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,49:0.52:95
chr3	195515594	rs13095016	C	G	1235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=1.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.38;ReadPosRankSum=-0.027;SOR=0.535;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,61:0.51:119
chr3	195515617	rs2641776	G	C	4648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=69;NR=55;PP=2216;SC=TGTAAGCCCAGTGGATGTGAT;SOR=0.770;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=69;TCR=55;TR=124;WE=195515625;WS=195515607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr3	195516630	rs3103954	G	T	9339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=352;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=157;NR=172;PP=2965;SC=TAATTTGTTGGGATGTGTGTC;SOR=0.800;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=329;TCF=157;TCR=172;TR=329;WE=195516638;WS=195516620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,352:1.00:352
chr3	195516730	rs74547899	G	A	2344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.230;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=47;PP=1342;ReadPosRankSum=-0.918;SC=AGCCTCTCCAGTGGTCCCCGT;SOR=0.549;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=204;TCF=99;TCR=105;TR=95;WE=195516738;WS=195516720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,111:0.48:232
chr3	195516878	rs2177336	T	C	4600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=88;NR=77;PP=2965;SC=GTGCCAGCTGTCCCTGTAGAT;SOR=0.857;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=165;TCF=88;TCR=77;TR=165;WE=195516886;WS=195516868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr3	195516980	rs11923648	A	G	2434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.498;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=50;PP=1438;ReadPosRankSum=1.134;SC=CTGGAGAATGAGGAAGGCCAT;SOR=0.744;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=185;TCF=94;TCR=91;TR=98;WE=195516988;WS=195516970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,114:0.53:215
chr3	195517258	rs1106502	G	A	6341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=114;NR=92;PP=2965;SC=GTCTCTGGAGGTTGGCATTCT;SOR=0.845;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=206;TCF=114;TCR=92;TR=206;WE=195517266;WS=195517248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr3	195517321	rs1104760	G	A	7121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=118;NR=116;PP=2965;SC=AGGGGATGAGGTGGTTGTTTC;SOR=0.716;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=235;TCF=118;TCR=117;TR=234;WE=195517329;WS=195517311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,263:1.00:263
chr3	195517553	rs882605	A	C	8393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=141;NR=139;PP=2965;SC=TCTGGATCAAATGTTACTAAG;SOR=0.801;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=280;TCF=141;TCR=139;TR=280;WE=195517561;WS=195517543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,310:1.00:310
chr3	195517909	rs729593	G	A	1580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.608;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=36;PP=976;ReadPosRankSum=-0.341;SC=CCAGGAAGTTGTTCGTGATTG;SOR=0.521;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=156;TCF=76;TCR=80;TR=71;WE=195517917;WS=195517899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,77:0.43:181
chr3	195518112	rs142781032	T	TGTCTCCTGCGTAACA	7945.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=14;NR=39;PP=2957;SC=CTGGAGGAGCTGTCTCCATCA;SOR=0.876;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=87;TCF=17;TCR=70;TR=53;WE=195518120;WS=195518100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr3	195518330	rs3107764	C	G	2396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=32;NR=47;PP=1523;SC=ACTGGGGCAGCAGTTTTACTT;SOR=1.259;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=32;TCR=47;TR=79;WE=195518338;WS=195518320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr3	195538501	rs143120396	TTC	T	724.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.18;ReadPosRankSum=0.078;SOR=0.669;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,26:0.47:55
chr3	195538718	rs73085353	G	A	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=13;PP=296;ReadPosRankSum=-0.801;SC=CTGGCTCCCTGGGGAAGCTCC;SOR=0.776;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=45;TCF=23;TCR=22;TR=24;WE=195538726;WS=195538708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,27:0.49:55
chr3	195594151	rs10579442	CCT	C	8968.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=20;NR=80;PP=2972;SC=CACACCCACCCCTGTCAGCAC;SOR=0.723;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=107;TCF=22;TCR=85;TR=100;WE=195594160;WS=195594141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr3	195594950	rs56260729	G	A	3875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=59;PP=2392;SC=AGAGGGGGCCGGGGAGCCGGC;SOR=0.869;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=136;TCF=76;TCR=60;TR=135;WE=195594958;WS=195594940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
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chr3	195595701	rs78292793	C	T	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=294;ReadPosRankSum=0.558;SC=CCCAACTCCCCCCGAGGTCTG;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=18;WE=195595709;WS=195595691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr3	195596501	rs71637188	T	TAG	3144.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=8;NR=29;PP=1947;SC=GGGCAGAGTGTAGAGAGACGA;SOR=0.941;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=47;TCF=8;TCR=39;TR=37;WE=195596509;WS=195596491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr3	195596636	rs13084875	C	T	296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=1;NR=9;PP=260;SC=TGGAGGAGGCCCCAGGCAGAG;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=195596644;WS=195596626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	195596907	rs2278034	T	C	3999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=83;NR=54;PP=2453;SC=ACAGCAGCCTTAGGGTGGCCT;SOR=0.997;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=138;TCF=83;TCR=55;TR=137;WE=195596915;WS=195596897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr3	195597288	rs2278033	T	C	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.150;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=224;ReadPosRankSum=0.243;SC=GACCCCAGGATGGAAAGCCTA;SOR=1.024;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=69;TCF=21;TCR=48;TR=24;WE=195597296;WS=195597278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,28:0.36:78
chr3	195599085	rs2241413	T	C	1742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=44;NR=18;PP=999;SC=ACGCGTGCCGTGCTGAGGGCC;SOR=1.681;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=44;TCR=18;TR=62;WE=195599093;WS=195599075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr3	195603652	rs9815549	T	G	177.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=5;PP=113;SC=CCCACAACCCTCCCAGGAGCA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=195603660;WS=195603642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	195612034	rs3747672	T	C	747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=19;PP=523;SC=TGCCAAACTGTCAGTGGGGCA;SOR=2.670;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=23;WE=195612042;WS=195612024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	195615376	rs3747669	A	G	2539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=38;NR=50;PP=1455;SC=CGTTGAGGTCATCTCGGAGCC;SOR=1.099;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=38;TCR=50;TR=88;WE=195615384;WS=195615366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr3	195622298	rs71321862	T	C	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.404;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=21;PP=336;ReadPosRankSum=-1.644;SC=CCTCCAGAAGTGCAGGGCCGC;SOR=0.105;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=46;TCF=8;TCR=38;TR=28;WE=195622306;WS=195622288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,30:0.62:48
chr3	195623249	rs112638966	T	G	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.917;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=276;ReadPosRankSum=-0.682;SC=CCCTGGAAGGTCACTAGGTGA;SOR=0.197;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=15;WE=195623257;WS=195623239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr3	195686832	rs201549703	G	A	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.576;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.91;MQRankSum=0.061;QD=8.87;ReadPosRankSum=-1.854;SOR=0.238;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr3	195686891	rs201127123	T	C	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.67;MQRankSum=-0.971;QD=8.17;ReadPosRankSum=0.009;SOR=0.648;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,30:0.48:63
chr3	195686899	rs201656277	C	T	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.73;MQRankSum=-2.299;QD=3.56;ReadPosRankSum=1.841;SOR=0.821;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,18:0.27:66
chr3	195690360	rs201250692	G	A	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=16.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.44;MQRankSum=-4.747;QD=3.07;ReadPosRankSum=-0.584;SOR=0.071;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,19:0.22:88
chr3	195690397	rs148308206	A	G	174.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.84;QD=29.14;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	195692311	rs62282793	T	C	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-5.104;NF=8;NR=0;PP=115;ReadPosRankSum=-2.476;SC=TTCCCAGTGCTGACGTCCACA;SOR=0.458;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=8;WE=195692319;WS=195692301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,7:0.25:28
chr3	195692347	rs62282794	G	A	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-8.142;NF=26;NR=10;PP=439;ReadPosRankSum=-1.097;SC=TTCCTCCAGTGCTCCTCAAAG;SOR=0.629;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=103;TCF=73;TCR=30;TR=36;WE=195692355;WS=195692337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,34:0.34:101
chr3	195692419	rs77887672	C	G	738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FS=3.343;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.51;MQRankSum=-14.213;QD=2.92;ReadPosRankSum=2.064;SOR=0.754;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:193,60:0.24:253
chr3	195701304	rs200047587	C	T	1027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=597;ExcessHet=3.0103;FS=6.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.54;MQRankSum=-4.698;QD=1.72;ReadPosRankSum=-3.159;SOR=1.327;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:535,62:0.10:597
chr3	195701310	.	C	CAA	1174.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.864;ClippingRankSum=0.000;DP=628;ExcessHet=3.0103;FS=4.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.06;MQRankSum=-3.604;QD=1.87;ReadPosRankSum=-2.473;SOR=1.279;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:559,69:0.11:628
chr3	195701331	rs78212497	G	A	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=656;ExcessHet=3.0103;FS=2.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.25;MQRankSum=-2.975;QD=0.06;ReadPosRankSum=2.162;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:576,78:0.12:654
chr3	195701388	rs57251344	GC	AA	1512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=358;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.99;MQRankSum=-0.422;QD=4.23;ReadPosRankSum=0.467;SOR=0.700;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:299,59:0.16:358
chr3	195701444	rs138996350	AAAGG	A	324.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.61;MQRankSum=-3.370;QD=3.65;ReadPosRankSum=-0.214;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,14:0.16:89
chr3	195701472	.	A	G	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.147;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.905;NF=1;NR=13;PP=453;ReadPosRankSum=-1.467;SC=AAATGTCAAGATGCCCATTCC;SOR=0.233;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=57;TCF=4;TCR=53;TR=14;WE=195701493;WS=195701462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,9:0.19:48
chr3	195701483	.	TCCA	T	454	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000;HP=4;HapScore=1;MGOF=16;MMLQ=27;MQ=42.26;NF=0;NR=14;PP=454;QD=34.7857142857;SC=TGCCCATTCCTCCACAAGCCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=14;WE=195701493;WS=195701462;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:24,14:0.37:38
chr3	195706577	rs61196604	C	CAT	55.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.86;MQRankSum=-1.436;QD=3.98;ReadPosRankSum=-0.549;SOR=0.184;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,3:0.21:14
chr3	195706589	rs146645407	T	C	320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.29;QD=29.16;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	195710948	rs368472526	G	A	793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=1.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.77;MQRankSum=4.826;QD=5.22;ReadPosRankSum=-0.073;SOR=0.563;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:105,47:0.31:152
chr3	195710971	rs4927836	G	T	1269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.990;HP=5;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-9.333;NF=47;NR=22;PP=861;ReadPosRankSum=-2.521;SC=GGTGGACGGGGGGCGGCCTTA;SOR=1.322;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=196;TCF=114;TCR=82;TR=69;WE=195710979;WS=195710961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,69:0.34:202
chr3	195710989	rs2620604	G	A	3041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FS=3.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.05;MQRankSum=-12.673;QD=13.70;ReadPosRankSum=-0.064;SOR=0.917;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:140,82:0.37:222
chr3	195710993	rs4927692	A	G	3060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.26;MQRankSum=-12.231;QD=13.25;ReadPosRankSum=0.178;SOR=0.845;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:145,86:0.37:231
chr3	195711016	rs79282413	G	A	1089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FS=1.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.85;MQRankSum=5.489;QD=4.58;ReadPosRankSum=0.224;SOR=0.800;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:170,68:0.29:238
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chr3	195780535	rs9809253	C	T	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.812;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=85;ReadPosRankSum=-0.671;SC=AAAAGGAACTCGCAGATAAGC;SOR=0.044;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=7;WE=195780543;WS=195780525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,8:0.27:30
chr3	195789414	rs2239641	T	C	545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=730;ReadPosRankSum=0.090;SC=CAAAAAAGTTTACCTGAATTC;SOR=0.617;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=36;TCR=16;TR=22;WE=195789436;WS=195789404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,27:0.43:63
chr3	195789428	rs507131	C	A	699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=9;PP=730;ReadPosRankSum=-1.671;SC=TGAATTCATACACAGCTAATG;SOR=0.701;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=64;TCF=42;TCR=22;TR=28;WE=195789436;WS=195789404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,34:0.45:75
chr3	195789708	rs2239640	G	T	2664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.451;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=58;PP=1600;ReadPosRankSum=0.344;SC=AATATGGGAAGGGATGATAAA;SOR=0.507;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=240;TCF=132;TCR=108;TR=121;WE=195789716;WS=195789698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,131:0.51:255
chr3	195789915	rs926149	A	G	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.109;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=10;PP=156;ReadPosRankSum=1.316;SC=CCAAGATAGCAGATTCCAAAA;SOR=0.296;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=38;TCF=11;TCR=27;TR=17;WE=195789923;WS=195789905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,18:0.44:41
chr3	195794788	rs9855973	C	T	2558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.411;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=33;PP=1457;ReadPosRankSum=-0.266;SC=TTACTGCTAACGCCCTCCCAG;SOR=0.865;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=183;TCF=120;TCR=63;TR=100;WE=195794796;WS=195794778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,117:0.54:215
chr3	195798258	rs480760	T	C	11796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=446;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=227;NR=176;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.312;SC=ACTGTTTTGCTTTACTTACAG;SOR=0.905;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=405;TCF=228;TCR=177;TR=403;WE=195798268;WS=195798247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,434:1.00:436
chr3	195800811	rs3817672	C	T	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=403;ReadPosRankSum=-0.396;SC=TTGATGGTGCCGGTGAAGTCT;SOR=0.602;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=50;TCF=39;TCR=11;TR=25;WE=195800819;WS=195800801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,25:0.48:52
chr3	195801025	rs3736651	T	A	2444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.161;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=61;PP=1494;ReadPosRankSum=1.109;SC=AGAGCTGAACTCAGAATTTCA;SOR=0.590;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=181;TCF=74;TCR=107;TR=105;WE=195801033;WS=195801015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,112:0.58:194
chr3	195801938	rs5021790	T	A	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.11;ReadPosRankSum=-0.164;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr3	195926234	rs939892	T	C	336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=0;PP=238;SC=CAAGAGCCTTTGCTGTCATGT;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=195926242;WS=195926232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	195935207	rs12497404	C	G	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=68;ReadPosRankSum=1.621;SC=CTCTGCAGCCCCCTCCTTGGC;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=6;WE=195935215;WS=195935199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr3	195936446	rs4916502	C	T	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-4.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=128;ReadPosRankSum=-0.810;SC=GCGGCGGGGGCAGCTCCACGG;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=9;WE=195936454;WS=195936436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr3	195937410	rs6795707	G	T	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.284;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=9;PP=521;ReadPosRankSum=0.552;SC=TCAGTAGGAAGAGCACTTTAG;SOR=0.433;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=67;TCF=52;TCR=15;TR=33;WE=195937418;WS=195937400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,35:0.47:75
chr3	195937659	rs6795963	G	A	718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=458;ReadPosRankSum=-0.028;SC=CAAAGCCCCCGGCCCAAGGCC;SOR=0.465;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=36;TCF=4;TCR=32;TR=23;WE=195937667;WS=195937649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,28:0.68:41
chr3	195937678	rs12718059	G	A	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=183;ReadPosRankSum=-0.683;SC=CCTGTGGCTTGCTCAGGTCAG;SOR=0.610;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=12;WE=195937686;WS=195937668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,12:0.34:35
chr3	195937977	rs13079891	A	G	1140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.357;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=18;PP=689;ReadPosRankSum=-0.436;SC=CCTCCATCCTATCATCTTCTG;SOR=0.495;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=119;TCF=75;TCR=44;TR=48;WE=195937985;WS=195937967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,55:0.43:127
chr3	195938177	rs1522394	A	G	630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.787;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=23;PP=451;ReadPosRankSum=-0.750;SC=GCATCCGTTAAGAGTGTCATG;SOR=0.330;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=68;TCF=10;TCR=58;TR=28;WE=195938185;WS=195938167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,30:0.40:75
chr3	195941216	rs7642243	C	G	806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.796;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=12;PP=437;ReadPosRankSum=-2.161;SC=TTCCGGCTTCCTGCACACAAA;SOR=0.598;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=93;TCF=65;TCR=28;TR=38;WE=195941224;WS=195941206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,43:0.42:102
chr3	195943481	rs56030157	C	T	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.029;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=13;PP=357;ReadPosRankSum=0.642;SC=GCTTGCCCCCCACCCCGGCCC;SOR=0.526;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=56;TCF=33;TCR=23;TR=28;WE=195943489;WS=195943471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,33:0.59:56
chr3	195953775	rs68119320	C	T	531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=1;PP=427;SC=ATCCGAGGAACAAGCCCAGGC;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=195953783;WS=195953765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	195954069	rs147316733	A	ACGTCACTTC	963.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=1.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.46;MQRankSum=-1.318;QD=9.01;ReadPosRankSum=-0.500;SOR=0.510;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,50:0.47:107
chr3	195954078	rs57985677	C	CCGTCACTTT	1224.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.578;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.666;NF=6;NR=41;PP=479;ReadPosRankSum=1.965;SC=CACGTCACTTCGGCAAAGAGT;SOR=0.874;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=64;TCF=6;TCR=58;TR=47;WE=195954086;WS=195954059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,58:0.53:110
chr3	195955178	rs72611184	C	T	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=2.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.05;ReadPosRankSum=-0.729;SOR=1.432;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr3	195955762	rs939885	G	A	1849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.557;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.023;NF=41;NR=33;PP=1040;ReadPosRankSum=0.780;SC=CCTGTTTCTCGTCCCCGACGG;SOR=0.696;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=151;TCF=82;TCR=69;TR=74;WE=195955770;WS=195955752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,88:0.51:174
chr3	195956726	rs144375332	AAG	A	568.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=10;PP=548;ReadPosRankSum=0.052;SC=CATCTCTTGAAAGAGAGAGAG;SOR=0.543;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=30;TCF=12;TCR=18;TR=17;WE=195956737;WS=195956716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,25:0.50:50
chr3	195956827	rs17852687	T	C	3518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=52;PP=1947;SC=ACACTTTCCTTGGCGTGTCCA;SOR=0.840;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=119;TCF=67;TCR=52;TR=119;WE=195956835;WS=195956817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr3	195956970	rs67261052	C	T	583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.779;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=17;PP=280;ReadPosRankSum=0.298;SC=GTTTCATAACCGAGCTACAGA;SOR=0.815;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=91;TCF=42;TCR=49;TR=31;WE=195956978;WS=195956960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,36:0.34:105
chr3	195959859	rs56867360	C	T	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=71;ReadPosRankSum=-0.083;SC=GCTCAACTCCCGTGCCCGGGC;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=5;WE=195959867;WS=195959854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr3	195959924	rs1476331	T	C	2171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=14;PP=1568;SC=TATTTCACCCTACACTGCAGT;SOR=2.537;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=57;TCR=14;TR=71;WE=195959932;WS=195959914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr3	195960225	rs9343	A	G	1329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=35;PP=1048;SC=ACAATGTTAGAATAAAATTGC;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=8;TCR=35;TR=43;WE=195960233;WS=195960215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr3	195968281	rs57987393	A	G	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.669;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=133;ReadPosRankSum=-0.988;SC=CTGGTCTCAAACTCCTGGCCT;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=7;WE=195968289;WS=195968273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr3	195968643	rs1045075	G	A	2559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=46;PP=1898;SC=AGACCGTAACGGCAGAAACTG;SOR=1.139;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=32;TCR=46;TR=78;WE=195968651;WS=195968633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr3	195975284	rs3772107	C	G	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.155;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=101;ReadPosRankSum=-0.293;SC=ACTCTGTCACCCAGGCTGGAG;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=6;WE=195975292;WS=195975274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr3	196022750	rs2293160	T	C	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=256;ReadPosRankSum=0.349;SC=AGTAAAATCATTTCATTCACA;SOR=0.634;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=17;WE=196022758;WS=196022740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr3	196044894	rs2270769	G	C	1656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.05;ReadPosRankSum=-1.896;SOR=0.657;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,81:0.54:150
chr3	196051087	rs147354585	GTC	G	845.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FS=8.321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQRankSum=3.201;QD=2.82;ReadPosRankSum=1.087;SOR=0.568;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:250,50:0.17:300
chr3	196054439	rs6785339	T	G	1563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=31;PP=890;SC=TGAGCTTGCCTGCGTGCAGGG;SOR=1.160;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=54;TCF=23;TCR=31;TR=54;WE=196054447;WS=196054429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr3	196054488	rs6782336	A	G	573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=13;PP=372;SC=AGGGAGTCGCAGCAGCTCTGC;SOR=2.093;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=18;WE=196054496;WS=196054478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr3	196096271	rs73213952	G	A	1192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.635;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=22;PP=640;ReadPosRankSum=-1.465;SC=GTTAAAAGCTGCGTGCTGATA;SOR=0.605;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=74;TCR=51;TR=54;WE=196096279;WS=196096261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,61:0.44:139
chr3	196199204	rs3796129	G	T	8215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=126;NR=129;PP=2965;SC=AGAAAAGCATGGATCCTTGAC;SOR=0.721;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=256;TCF=126;TCR=130;TR=255;WE=196199212;WS=196199194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,290:1.00:290
chr3	196210590	rs7643192	A	G	478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=2;PP=343;SC=AACAGAAAACACTGGCATACA;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=196210598;WS=196210580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	196210808	rs7646174	T	C	1647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=36;PP=1109;SC=GAGAGAACTTTATGATAAAAT;SOR=1.823;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=17;TCR=36;TR=53;WE=196210816;WS=196210798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr3	196210875	rs77317203	T	C	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=134;ReadPosRankSum=-0.636;SC=ATTATAGTTATATTTAAATTC;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=7;WE=196210883;WS=196210865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr3	196210894	rs7646273	T	C	290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=219;SC=TCTGTACATCTCTTGAAGAAT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=196210902;WS=196210884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	196215451	rs62798260	CA	C	1371.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=1.908;HP=11;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=21;PP=458;ReadPosRankSum=1.441;SC=AGAAATATTCCAAAAAAAAAA;SOR=0.908;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=50;TCF=21;TCR=29;TR=36;WE=196215459;WS=196215441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:5,60:0.92:65
chr3	196215660	rs11185543	G	A	821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=22;PP=529;SC=ATTAATAACTGCAGCAATATC;SOR=2.376;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=28;WE=196215668;WS=196215650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr3	196236244	rs6803596	T	C	782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=3;PP=721;SC=CAAATTAATCTTTTTTTAAAA;SOR=4.174;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=27;WE=196236252;WS=196236234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	196281208	rs9311	T	C	8227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=153;NR=131;PP=2965;SC=TATTTAGCTTTGGTAAAATGT;SOR=0.803;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=284;TCF=153;TCR=131;TR=284;WE=196281216;WS=196281198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,306:1.00:306
chr3	196294104	rs9842616	C	G	6619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=107;NR=120;PP=2965;SC=CTACAGGCTTCGGGTTTCTGA;SOR=0.885;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=227;TCF=107;TCR=120;TR=227;WE=196294112;WS=196294094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr3	196386964	rs1798631	C	G	5133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=91;NR=82;PP=2938;SC=ACATGGCAGCCCTCATGCTCC;SOR=0.745;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=173;TCF=91;TCR=82;TR=173;WE=196386972;WS=196386954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr3	196388023	rs62636585	C	G	3030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.569;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=55;PP=1831;ReadPosRankSum=0.575;SC=ATGGGAGCCTCGCCCCACTCC;SOR=0.846;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=257;TCF=139;TCR=118;TR=123;WE=196388031;WS=196388013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,138:0.49:282
chr3	196443803	rs1906044	T	C	1110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.685;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=22;PP=526;ReadPosRankSum=-0.057;SC=GTAAGTTGCCTGTTGATTTCT;SOR=0.667;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=102;TCF=57;TCR=45;TR=50;WE=196443811;WS=196443793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,57:0.49:117
chr3	196443947	rs35314545	G	A	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=81;ReadPosRankSum=-1.085;SC=CGAGGCAGGCGGATCACAAGG;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=196443955;WS=196443937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
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chr3	196554266	rs62410763	C	T	1332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.374;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=27;PP=694;ReadPosRankSum=-0.735;SC=CGACAGAAAGCTTTCCTAGGG;SOR=0.576;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=109;TCF=58;TCR=51;TR=56;WE=196554274;WS=196554256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,67:0.52:130
chr3	196613683	rs150375675	A	AG	301.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=402;ReadPosRankSum=1.221;SC=TAAACCAGTTAGTCTGCTTGA;SOR=1.483;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=11;WE=196613691;WS=196613673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
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chr3	196627088	rs9825635	A	G	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=3;PP=66;ReadPosRankSum=-1.043;SC=TTTGATTACTATTGGCAGTAA;SOR=0.921;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=14;TCF=8;TCR=6;TR=5;WE=196627096;WS=196627078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr3	196627335	rs6764463	T	C	900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=21;PP=382;ReadPosRankSum=-2.252;SC=TGTATTAAAATGAGTAGTTTT;SOR=0.654;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=74;TCF=32;TCR=42;TR=39;WE=196627343;WS=196627325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,45:0.56:81
chr3	196627356	rs9810317	C	T	798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=1.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.30;ReadPosRankSum=0.789;SOR=0.409;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,23:0.47:49
chr3	196627361	rs6772870	G	A	782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=1.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.20;ReadPosRankSum=0.809;SOR=0.377;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,20:0.47:43
chr3	196656772	rs1602	G	A	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=123;ReadPosRankSum=-1.096;SC=AAGTGTGGGTGTCATCCATGT;SOR=0.148;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=10;WE=196656780;WS=196656762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr3	196657670	rs63736860	CT	C	1813.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.958;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=31;PP=661;ReadPosRankSum=-0.524;SC=TTTCTGGGACCTTTTTTTTTG;SOR=0.330;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=82;TCF=35;TCR=47;TR=46;WE=196657687;WS=196657660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,84:0.65:129
chr3	196666059	rs553783	A	G	2037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.609;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=27;PP=1237;ReadPosRankSum=0.317;SC=AGGGACGCTTATGAGCTACCA;SOR=0.753;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=147;TCF=98;TCR=49;TR=81;WE=196666067;WS=196666049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,90:0.56:160
chr3	196669488	rs3214858	C	CA	649.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.597;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=9;PP=615;ReadPosRankSum=0.480;SC=CCGAGGGCGGCGTGTCGTCAT;SOR=0.891;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=40;TCF=17;TCR=23;TR=17;WE=196669496;WS=196669478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,19:0.41:46
chr3	196669912	rs335824	C	T	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.619;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=21;PP=468;ReadPosRankSum=1.094;SC=GGGCCGAGGCCGCTTGCTTTT;SOR=1.308;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=53;TCF=15;TCR=38;TR=27;WE=196669920;WS=196669902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,28:0.50:56
chr3	196674518	rs1147238	A	G	2238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.870;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=42;PP=1532;ReadPosRankSum=-1.232;SC=GTTGAAGAGGACCACAGTGCC;SOR=0.552;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=164;TCF=92;TCR=72;TR=92;WE=196674526;WS=196674508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,97:0.55:177
chr3	196674916	rs1147240	A	C	3848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=422;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=90;PP=2050;ReadPosRankSum=2.444;SC=TCCTGGATGTAGCGGGGCTGG;SOR=0.666;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=388;TCF=193;TCR=195;TR=182;WE=196674924;WS=196674906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:226,196:0.46:422
chr3	196674972	rs574365	CT	TC	5569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;JOINED;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=59;PP=2944;ReadPosRankSum=-0.943;SC=GCTGTGAGGGCTGCCCCAGGG;SOR=0.700;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=234;TCF=113;TCR=121;TR=112;WE=196674981;WS=196674962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,144:0.53:272
chr3	196749798	rs2288766	T	G	732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=23;NR=7;PP=485;SC=CTCCCTGCCCTCGGCCCCTCC;SOR=1.688;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=30;WE=196749806;WS=196749788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	196750016	rs2288765	A	G	3192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=60;PP=1887;SC=GTCACTCAGCAGAACTTTCTT;SOR=1.010;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=48;TCR=60;TR=108;WE=196750024;WS=196750006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr3	196750841	rs2280294	C	A	1727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.702;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=36;PP=891;ReadPosRankSum=-1.255;SC=ACACAGTGACCTGCGCCCGGT;SOR=0.502;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=145;TCF=70;TCR=75;TR=73;WE=196750849;WS=196750831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,85:0.50:169
chr3	196751474	rs2280296	C	T	354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=12;PP=299;SC=GCTGTACACACGGATGTGTGC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=196751482;WS=196751464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	196754819	rs2276788	C	G	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.206;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=308;ReadPosRankSum=-1.075;SC=CTCCCCCGCCCTGCCCAGCCC;SOR=0.965;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=41;TCF=14;TCR=27;TR=22;WE=196754827;WS=196754809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,23:0.51:45
chr3	196754856	rs12637442	C	A	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.017;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=109;ReadPosRankSum=-0.514;SC=GTGGCTCCAGCAGTTCTGTGT;SOR=1.532;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=8;WE=196754864;WS=196754846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr3	196778438	rs7629533	C	T	3418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.407;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=70;PP=1957;ReadPosRankSum=0.643;SC=TGTTACAACACGGTTCCAACC;SOR=0.740;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=286;TCF=149;TCR=137;TR=150;WE=196778446;WS=196778428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,167:0.53:318
chr3	196793466	rs140259336	T	TA	87.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.85;ReadPosRankSum=0.982;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
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chr3	196795879	rs57032552	A	ACT	841.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.022;NF=2;NR=13;PP=662;ReadPosRankSum=-0.602;SC=CACAAATAATATTTTTATTTT;SOR=0.602;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=15;WE=196795887;WS=196795869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,23:0.51:45
chr3	196846437	rs6776073	C	T	1081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.473;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=29;PP=618;ReadPosRankSum=0.675;SC=ACTTCAAACACGAAACAAGCC;SOR=0.859;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=113;TCF=43;TCR=70;TR=46;WE=196846445;WS=196846427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,53:0.42:126
chr3	196865242	rs1134986	C	T	882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.784;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=27;PP=546;ReadPosRankSum=-0.471;SC=TTCATTTACTCGTAATATACA;SOR=1.063;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=90;TCF=34;TCR=56;TR=39;WE=196865250;WS=196865232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,43:0.43:101
chr3	196869518	rs9866058	T	C	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.523;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=63;ReadPosRankSum=-1.013;SC=GAGATCTCCCTTGGATTCTGT;SOR=0.061;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=6;WE=196869526;WS=196869508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr3	196869688	rs7628652	A	G	3465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=55;PP=1850;ReadPosRankSum=-1.259;SC=TGTAAAATCCAAAATGGCAAG;SOR=0.785;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=62;TCR=56;TR=116;WE=196869696;WS=196869678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,134:0.99:136
chr3	196869820	rs9866550	T	A	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.029;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5006;FS=5.643;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=166;ReadPosRankSum=0.586;SC=CAAATGTGATTAATGAGTTGA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=8;WE=196869828;WS=196869810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr3	196876600	rs73210523	G	A	1957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.499;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=40;PP=1075;ReadPosRankSum=-0.359;SC=ATGTGGGGAGGAAATGGAACT;SOR=0.735;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=184;TCF=101;TCR=83;TR=84;WE=196876608;WS=196876590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,96:0.45:214
chr3	196876775	rs149672384	T	TTA	213.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.079;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.549;NF=0;NR=4;PP=164;ReadPosRankSum=1.033;SC=AGTTATAATCTTATATGAGCT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=4;WE=196876783;WS=196876765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr3	196910315	rs36054755	GA	G	99.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=134;ReadPosRankSum=0.637;SC=CGGATGGACAGAAAACATACA;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=5;WE=196910323;WS=196910307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr3	197020630	rs364644	G	A	1197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=14;PP=668;ReadPosRankSum=0.842;SC=ATAACTCACTGCGGCCTAAAC;SOR=0.735;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=63;TCR=25;TR=49;WE=197020638;WS=197020620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,56:0.55:102
chr3	197020718	rs434681	T	C	2200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.557;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=1.232;NF=46;NR=45;PP=1306;ReadPosRankSum=0.393;SC=AAGACCCCTGTTCTCCTTTAA;SOR=0.773;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=156;TCF=82;TCR=74;TR=91;WE=197020726;WS=197020708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,102:0.57:178
chr3	197020780	rs3836429	G	GA	1023.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.390;NF=3;NR=26;PP=783;ReadPosRankSum=-0.068;SC=CTTACTGAGAGAAAAAACCTT;SOR=0.608;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=64;TCF=7;TCR=57;TR=29;WE=197020788;WS=197020770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,43:0.52:83
chr3	197020871	rs450891	G	A	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.821;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=193;ReadPosRankSum=0.161;SC=GCTTAGGGCAGTTTACAAGCT;SOR=0.097;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=14;WE=197020879;WS=197020861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr3	197023445	rs3852013	C	A	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=265;ReadPosRankSum=-0.177;SC=TAAATAGTTCCGCAAATCCTT;SOR=0.420;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=14;WE=197023453;WS=197023435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr3	197239266	rs9325394	C	G	656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.106;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=22;PP=493;ReadPosRankSum=0.706;SC=ACCTGCTAAGCCGTTACTGCC;SOR=1.050;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=67;TCF=21;TCR=46;TR=30;WE=197239274;WS=197239256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,31:0.43:72
chr3	197362030	rs2451791	C	T	1801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.623;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-15.930;NF=59;NR=39;PP=1089;ReadPosRankSum=0.107;SC=CTTCATCTCACGATAAAGACA;SOR=1.021;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=277;TCF=152;TCR=125;TR=98;WE=197362038;WS=197362020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:200,103:0.34:303
chr3	197362184	rs9867990	C	T	831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=3.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.40;MQRankSum=-5.432;QD=8.40;ReadPosRankSum=0.315;SOR=1.334;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,26:0.26:99
chr3	197362187	rs9867993	C	T	840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=3.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.38;MQRankSum=-5.139;QD=9.14;ReadPosRankSum=-0.230;SOR=1.227;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,25:0.27:92
chr3	197482760	rs13068986	C	G	3815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=55;PP=1982;SC=GGAAAATGGACGCTTCTGCGA;SOR=0.780;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=121;TCF=65;TCR=56;TR=120;WE=197482768;WS=197482750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr3	197483279	rs6794391	A	G	1436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=16;PP=942;ReadPosRankSum=-0.041;SC=AAAATAATTGACATTTCCTCT;SOR=0.772;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=115;TCF=84;TCR=31;TR=58;WE=197483287;WS=197483269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,63:0.50:126
chr3	197495334	rs3205525	G	A	1977.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=34;PP=1095;ReadPosRankSum=-0.272;SC=AGTCTGAATCGTAGAGGAAGA;SOR=0.737;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=153;TCF=92;TCR=61;TR=84;WE=197495342;WS=197495324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,95:0.54:177
chr3	197496984	rs1708460	A	G	2027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=15;PP=1268;SC=GATTAACATAATTTCTTGCCT;SOR=2.517;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=60;TCF=45;TCR=15;TR=59;WE=197496992;WS=197496974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
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chr3	197544200	rs55896070	C	CGTGTGTGTGTGT	199.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.02;MQRankSum=2.125;QD=9.51;ReadPosRankSum=0.187;SOR=1.483;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
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chr3	197574936	rs2306439	G	C	727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.135;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=20;PP=479;ReadPosRankSum=1.230;SC=GACTGGCTAAGTGCTTATTTG;SOR=1.019;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=60;TCF=22;TCR=38;TR=29;WE=197574944;WS=197574926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,32:0.48:66
chr3	197574960	rs77727730	G	A	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.005;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=12;PP=256;ReadPosRankSum=-1.753;SC=GGTCAGGCCCGTTGGTTTTTA;SOR=0.316;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=38;TCF=12;TCR=26;TR=19;WE=197574968;WS=197574950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr3	197579466	rs36078463	C	T	2791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.439;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=63;PP=1687;ReadPosRankSum=-0.221;SC=AAACAGCACCCGCTCCTAGAT;SOR=0.651;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=242;TCF=117;TCR=125;TR=121;WE=197579474;WS=197579456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,132:0.48:276
chr3	197581147	rs9863587	A	G	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.827;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=9;PP=512;ReadPosRankSum=-0.130;SC=CTCTATGTCAACGTCTTCAAA;SOR=0.807;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=90;TCF=65;TCR=25;TR=35;WE=197581155;WS=197581137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,38:0.38:101
chr3	197597194	rs11185486	A	G	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=400;ReadPosRankSum=-0.168;SC=TATTACTGCTATAGATCATAA;SOR=1.002;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=40;TCF=6;TCR=34;TR=22;WE=197597202;WS=197597184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,23:0.56:41
chr3	197639381	rs9809736	A	G	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.481;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=80;ReadPosRankSum=0.457;SC=TTACAGCTATATAAGATATCT;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=5;WE=197639389;WS=197639380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr3	197653147	rs9823673	A	G	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.135;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=66;ReadPosRankSum=-0.619;SC=GTTCCCAAGCAATGCTAACAG;SOR=1.329;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=6;WE=197653155;WS=197653137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr3	197659160	rs67877771	C	G	2428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.647;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=61;PP=1408;ReadPosRankSum=-0.464;SC=GCAATCACATCGCTGAAAAAC;SOR=0.953;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=223;TCF=92;TCR=131;TR=100;WE=197659168;WS=197659150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,116:0.47:245
chr3	197665599	rs9880989	G	T	2575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.518;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=76;PP=1842;ReadPosRankSum=0.395;SC=GATTGTTGAGGCCATTGGAAG;SOR=0.842;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=287;TCF=125;TCR=162;TR=129;WE=197665607;WS=197665589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,130:0.43:304
chr3	197672589	rs148926939	TA	T	1496.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.149;NF=6;NR=25;PP=1131;ReadPosRankSum=-0.300;SC=GAGATTAGTTTATGGGCGTCT;SOR=0.665;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=65;TCF=10;TCR=55;TR=31;WE=197672597;WS=197672579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,50:0.44:114
chr3	197687433	rs113060473	G	GA	356.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.551;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=390;ReadPosRankSum=0.156;SC=GGCAGAGCCTGACTCTTACAG;SOR=1.899;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=11;WE=197687441;WS=197687423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,14:0.33:43
chr3	197710959	rs77196201	T	C	2801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=67;PP=1713;ReadPosRankSum=2.010;SC=CATGCCTTGATTTTCTGCTTA;SOR=0.718;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=213;TCF=89;TCR=124;TR=115;WE=197710967;WS=197710949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,127:0.54:235
chr3	197717568	rs74683446	T	C	2066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.567;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=60;PP=1063;ReadPosRankSum=-0.593;SC=TCAGACTTCATGTCTCATGAG;SOR=0.820;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=224;TCF=94;TCR=130;TR=100;WE=197717576;WS=197717558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,110:0.44:251
chr3	197717643	rs150387425	A	ATATT	677.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=529;ReadPosRankSum=0.082;SC=AGAACTTATAATTAGAGCCTA;SOR=0.844;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=46;TCF=1;TCR=45;TR=13;WE=197717651;WS=197717633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,19:0.35:54
chr3	197762623	rs7640149	G	A	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=204;ReadPosRankSum=-0.222;SC=ATATTTTCCTGTAGTTGAAGG;SOR=1.078;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=11;WE=197762631;WS=197762613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr4	53428	rs2859214	G	A	12157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=428;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=300;PP=2965;SC=GGGAGGCCTCGTCGGAACCGG;SOR=2.242;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=407;TCF=106;TCR=301;TR=406;WE=53436;WS=53406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,427:1.00:427
chr4	60294	.	T	C	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.713;ClippingRankSum=0.000;DP=337;ExcessHet=3.0103;FS=1.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.71;ReadPosRankSum=-0.757;SOR=0.829;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:300,37:0.11:337
chr4	60303	rs3864127	G	A	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=352;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.43;ReadPosRankSum=0.050;SOR=0.726;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:315,37:0.11:352
chr4	60335	rs2780400	A	T	5744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.422;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=120;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.350;SC=TTGCTTTTAGAGACATAGGAG;SOR=0.795;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=315;TCF=149;TCR=166;TR=221;WE=60343;WS=60325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,228:0.69:330
chr4	60400	rs3864128	G	A	683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FS=2.567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.62;ReadPosRankSum=-0.495;SOR=1.008;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:108,40:0.27:148
chr4	60448	rs2780399	G	T	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.301;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=327;ReadPosRankSum=1.724;SC=AATGGGATTTGGTTTAGAAAT;SOR=0.970;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=53;TCF=11;TCR=42;TR=21;WE=60456;WS=60438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,23:0.43:54
chr4	60503	rs4021995	AT	A	121.19	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=63;ReadPosRankSum=0.157;SC=CTGCTTAGTGATTTTTTTTTT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=6;WE=60511;WS=60493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr4	67783	.	CTT	C	270.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.205;ClippingRankSum=0.000;DP=155;ExcessHet=3.0103;FS=20.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.91;ReadPosRankSum=1.345;SOR=1.427;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,19:0.20:93
chr4	67846	rs7437270	C	A	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=1.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.26;ReadPosRankSum=-1.412;SOR=0.260;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr4	85995	rs61336127	C	CA	4415.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.63;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=54;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=26;PP=2157;SC=AGAAACCCTACAATGTGAAAA;SOR=0.769;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=35;WE=86003;WS=85985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr4	86016	rs57253237	G	GC	3871.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.91;QD=45.02;SOR=0.740;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr4	86022	rs74490941	C	A	2896.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.18;QD=45.26;SOR=1.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr4	86022	.	CAG	ATA	1165	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.64;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=42;MMLQ=28;MQ=43.95;NF=2;NR=1;PP=1165;QD=409.489291621;SC=CAAAGCTTTACAGGGTCCACA;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=13;TCF=7;TCR=6;TR=3;WE=86052;WS=86006;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:10,3:0.23:13
chr4	86023	rs78362263	A	T	2896.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.18;QD=45.26;SOR=1.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr4	86024	rs77715101	G	A	2851.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.13;QD=45.27;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr4	86031	rs367720730	CA	C	2707.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.88;QD=46.69;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr4	86032	.	AAT	A	694	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.64;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=42;MMLQ=28;MQ=47.77;NF=2;NR=1;PP=694;QD=240.333333333;SC=CAGGGTCCACAATCCACTGAA;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=86052;WS=86006;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr4	86034	rs57594632	TC	T	2527.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.62;QD=46.81;SOR=0.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr4	86040	rs17853557	G	T	2355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.08;QD=49.08;SOR=1.067;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr4	86042	rs17857099	A	G	2251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.16;QD=45.95;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr4	86044	rs17857100	G	A	2206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.99;QD=46.95;SOR=1.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr4	86101	rs58319295	G	GC	3895.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.56;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=22;PP=2613;SC=ATGTGGCAAAGCTTTAGACGG;SOR=0.791;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=22;TCR=23;TR=44;WE=86109;WS=86091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr4	86738	rs2353625	A	G	6772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=122;NR=107;PP=2965;SC=TCCATTCTGGACAAAAACCTT;SOR=0.726;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=229;TCF=122;TCR=107;TR=229;WE=86746;WS=86728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr4	87277	rs2006764	G	C	6582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=87;NR=79;PP=2965;SC=TGTGGCAAAGGTTTTAATCGG;SOR=0.779;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=167;TCF=88;TCR=79;TR=166;WE=87285;WS=87267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr4	87313	rs60154095	G	GA	10356.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=32;NR=90;PP=2957;SC=GTACACAAGCGATTCATACTG;SOR=0.760;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=125;TCF=33;TCR=92;TR=122;WE=87321;WS=87303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,277:1.00:277
chr4	264941	rs11731285	A	G	1087.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.683;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=16;PP=486;ReadPosRankSum=0.738;SC=TATGAGGACCACTTAAAGGCT;SOR=0.796;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=110;TCF=68;TCR=42;TR=44;WE=264949;WS=264931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,56:0.46:123
chr4	289877	rs62619793	G	T	1881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.384;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.145;NF=52;NR=36;PP=1283;ReadPosRankSum=0.044;SC=ATTCTGCTGGGCAGGGTCCAG;SOR=1.037;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=221;TCF=122;TCR=99;TR=88;WE=289885;WS=289867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,94:0.39:242
chr4	299259	rs6852858	A	T	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.657;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=246;ReadPosRankSum=-0.203;SC=GCTGGCGCAAAAGGCAAAAGC;SOR=1.329;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=17;WE=299267;WS=299249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
chr4	331658	rs3749520	T	C	3328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.19;MQRankSum=-0.636;QD=19.58;ReadPosRankSum=-1.235;SOR=0.664;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:82,88:0.52:170
chr4	331666	rs3749521	G	C	1950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FS=1.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.18;MQRankSum=-0.536;QD=10.72;ReadPosRankSum=-1.283;SOR=0.807;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,89:0.49:182
chr4	331693	rs5855672	G	GC	8917.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=83;PP=2957;SC=TTCGGCCACAGCTCAGCCTCC;SOR=0.864;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=118;TCF=35;TCR=83;TR=115;WE=331701;WS=331683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr4	343795	rs3037605	C	CTGCT	1695.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.819;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=11;PP=1251;ReadPosRankSum=1.391;SC=AGTCACAGGGCTCAGGAGCAC;SOR=1.013;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=55;TCF=27;TCR=28;TR=25;WE=343803;WS=343785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,43:0.50:86
chr4	376888	rs6854214	C	A	2251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.421;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.674;NF=56;NR=50;PP=1298;ReadPosRankSum=1.066;SC=TTTCAGAATTCTTCCATCTCT;SOR=0.602;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=251;TCF=138;TCR=113;TR=106;WE=376896;WS=376878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,121:0.42:291
chr4	420688	rs2280250	C	T	2599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.274;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=59;PP=1682;ReadPosRankSum=0.134;SC=GGTATGAGTTCCTCTACTTCG;SOR=0.805;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=224;TCF=114;TCR=110;TR=111;WE=420696;WS=420678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,122:0.49:247
chr4	429720	rs894534	T	C	2320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=53;PP=1103;ReadPosRankSum=0.915;SC=GATAATGAGATGCTGATGAGT;SOR=0.718;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=236;TCF=116;TCR=120;TR=105;WE=429728;WS=429710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,119:0.45:262
chr4	500500	rs17721401	T	C	707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=6;PP=423;ReadPosRankSum=-1.267;SC=GACAGCTCTATTGGGGGCTGA;SOR=0.693;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=55;TCF=42;TCR=13;TR=28;WE=500508;WS=500490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,32:0.50:64
chr4	500631	rs4690182	A	G	4452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=71;PP=2628;SC=CAGCTTCATCATCCTGCTGGT;SOR=0.753;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=153;TCF=82;TCR=71;TR=153;WE=500639;WS=500621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr4	628673	rs112849920	C	T	618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.159;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=15;PP=283;ReadPosRankSum=0.190;SC=CCTGCCTGCCCGCCCGCCTGT;SOR=0.473;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=48;TCF=16;TCR=32;TR=25;WE=628681;WS=628663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,31:0.57:54
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chr4	648643	rs10902758	G	A	5386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=95;NR=98;PP=2965;SC=GATCGACTACGTCCTCCACGG;SOR=0.806;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=193;TCF=95;TCR=98;TR=193;WE=648651;WS=648633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
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chr4	738512	.	TTCG	CTCG,CTCT	244	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=25;MQ=58.83;NF=3,0;NR=24,10;PP=244,167;QD=10.324859724;SC=AGTGTTAGTGTTCGCCGTGGA;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=27,10;WE=738523;WS=738502;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:27
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chr4	780552	rs80187089	C	T	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.563;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=58;ReadPosRankSum=-0.880;SC=AGCCTCCCTGCGCCAGGGACT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=5;WE=780560;WS=780542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr4	818440	rs2276906	G	A	3855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=338;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.394;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=83;PP=2460;ReadPosRankSum=-1.491;SC=CCCCTGCCTGGCCTTCCCCAG;SOR=0.735;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=311;TCF=159;TCR=152;TR=170;WE=818448;WS=818430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,180:0.53:338
chr4	843622	rs33919242	AC	A,ACC	1835.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=3;MGOF=13;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=7,7;NR=58,58;PP=372,705;ReadPosRankSum=-2.108;SC=GCGGGGCAGGACCCCCCCCCC;SOR=0.745;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=106;TCF=19;TCR=87;TR=65,65;WE=843640;WS=843611;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.73,0.17:104
chr4	843674	rs55728587	G	A	1584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.370;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=34;PP=985;ReadPosRankSum=0.979;SC=TGGCAGCTCTGCTCACCTTGT;SOR=1.018;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=113;TCF=56;TCR=57;TR=64;WE=843682;WS=843664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,71:0.58:122
chr4	843695	rs8093	A	G	4129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=63;PP=2619;SC=CGGGGTGCACAGCCAGCACCG;SOR=0.813;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=139;TCF=76;TCR=63;TR=139;WE=843703;WS=843685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr4	844781	rs75072999	G	A	1545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.577;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=30;PP=906;ReadPosRankSum=0.227;SC=TCTCTGCAATGGTCTTTGGCC;SOR=0.620;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=145;TCF=82;TCR=63;TR=68;WE=844789;WS=844771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,77:0.47:164
chr4	845772	rs10031922	T	C	2132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=47;PP=1211;SC=CCTGTGGAGATGGAGATCGGA;SOR=1.367;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=31;TCR=47;TR=78;WE=845780;WS=845762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr4	858874	rs3214922	T	TC	4020.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=16;NR=37;PP=2416;SC=CAGCTGCACGTCTGGGAGCCC;SOR=0.711;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=56;TCF=18;TCR=38;TR=53;WE=858882;WS=858864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr4	858941	rs1026738	T	C	2318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=39;PP=1362;SC=CCACTGCCGATGCTGCAGTCT;SOR=0.784;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=43;TCR=39;TR=82;WE=858949;WS=858931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr4	860146	rs2306248	A	G	1466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=36;NR=17;PP=853;SC=GGCGAGAGGCACTTACCCAGG;SOR=1.278;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=36;TCR=17;TR=53;WE=860154;WS=860136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr4	860192	rs1064207	A	G	3053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=36;PP=1675;ReadPosRankSum=1.870;SC=GGGGCGGAGCACTGTGGGCAG;SOR=0.432;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=103;TCF=67;TCR=36;TR=102;WE=860200;WS=860182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,119:0.99:120
chr4	862340	rs115244803	C	A	963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.951;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=22;PP=586;ReadPosRankSum=0.079;SC=GCCAGTCCAGCGTGTGCAGGA;SOR=0.423;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=92;TCF=54;TCR=38;TR=45;WE=862348;WS=862330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,49:0.48:102
chr4	871624	rs1564281	C	T	2318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=31;NR=44;PP=1279;SC=CGCGTCACCACGTGACGTGCC;SOR=1.259;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=31;TCR=44;TR=75;WE=871632;WS=871614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr4	871675	rs1564280	A	G	783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=19;PP=537;SC=TTTCGAATAGAAGTTTTTCAT;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=22;WE=871683;WS=871665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	875887	rs2279186	G	A	779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=23;PP=513;ReadPosRankSum=0.039;SC=AAGGGCTCGCGGGGTCCTCGG;SOR=0.733;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=16;TCR=41;TR=32;WE=875895;WS=875877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,34:0.57:60
chr4	877709	rs3736083	T	C	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.854;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=86;ReadPosRankSum=0.155;SC=CCTGTGAGTCTGTGGCCACAG;SOR=0.096;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=5;WE=877717;WS=877699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr4	882625	rs2279182	T	G	2272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=50;PP=1357;ReadPosRankSum=0.376;SC=CTCTGGAGCCTCACACTCACT;SOR=0.678;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=276;TCF=153;TCR=123;TR=110;WE=882633;WS=882615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:181,124:0.41:305
chr4	882643	rs2279181	G	A	2736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.401;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=60;PP=1532;ReadPosRankSum=1.354;SC=ACTTAGCGACGGACTGGATGA;SOR=0.649;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=299;TCF=159;TCR=140;TR=125;WE=882651;WS=882633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:191,142:0.43:333
chr4	887513	rs33951409	AC	A	502.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=5;PP=302;SC=CTCTCTGGAAACCCCCCCCCC;SOR=2.419;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=17;WE=887521;WS=887504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	887868	rs11726912	A	C	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=256;ReadPosRankSum=-0.249;SC=CTGCGGGGAGAGCAGGGGTGA;SOR=1.436;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=16;WE=887876;WS=887858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
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chr4	905400	rs3830208	AG	A	219.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.471;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=222;ReadPosRankSum=-0.498;SC=CTGGGTTAGGAGGCATCAAGC;SOR=0.283;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=7;WE=905408;WS=905390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
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chr4	952009	rs140597786	C	T	1089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=21;PP=587;ReadPosRankSum=1.459;SC=GTTTGGCGGCCGGGAGCATGT;SOR=0.666;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=107;TCF=59;TCR=48;TR=45;WE=952017;WS=951999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,52:0.42:123
chr4	952409	rs748483	A	G	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.414;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=118;ReadPosRankSum=0.524;SC=TTTTATTTTCATTGTGAAATA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=7;WE=952417;WS=952399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr4	954247	rs3733345	G	T	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=118;ReadPosRankSum=0.868;SC=GGATGAGGGCGGGTCCCGCTC;SOR=0.321;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=7;WE=954255;WS=954237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr4	954275	rs3733346	T	C	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=10.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.21;ReadPosRankSum=1.538;SOR=2.513;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,17:0.37:46
chr4	954275	.	TGT	CGC	270	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=15;NR=1;PP=270;QD=20.2167421789;SC=GGGAAGATGCTGTGGTCAGGG;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=38;TCF=32;TCR=6;TR=16;WE=954285;WS=954265;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:22,16:0.42:38
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chr4	954311	rs3733349	C	T	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.733;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=11;PP=448;ReadPosRankSum=-0.896;SC=ACCACAGGGCCGGCCACTGTG;SOR=1.080;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=94;TCF=63;TCR=31;TR=37;WE=954319;WS=954301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,40:0.37:109
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chr4	960331	rs11248059	C	G	1422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.638;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=25;PP=728;ReadPosRankSum=-0.535;SC=GAGGTGAGGGCACAGGCCGTC;SOR=0.439;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=125;TCF=62;TCR=63;TR=60;WE=960339;WS=960321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,70:0.51:136
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chr4	961191	rs1377587	A	G	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=3.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.07;ReadPosRankSum=1.135;SOR=0.715;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr4	961373	rs1377586	G	A	1512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.637;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=25;PP=897;ReadPosRankSum=1.292;SC=GGGACACCGTGACGAGGCGGA;SOR=0.593;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=136;TCF=86;TCR=50;TR=67;WE=961381;WS=961363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,73:0.51:143
chr4	967191	rs17855876	G	A	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.184;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=129;ReadPosRankSum=0.056;SC=GCCCAGCACGGGGCTGCAGGC;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=7;WE=967199;WS=967181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr4	980464	rs4690220	A	G	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.314;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=149;ReadPosRankSum=1.287;SC=AAAATCGCTGAAGCCCCGGAG;SOR=0.074;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=10;WE=980472;WS=980454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr4	980896	rs11248061	C	A	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5051;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=107;ReadPosRankSum=-2.000;SC=GCCCCCGCGCCGCGCTGCTGG;SOR=0.941;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=6;WE=980904;WS=980886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr4	980932	rs10902762	G	A	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=64;ReadPosRankSum=0.622;SC=TCCTGGCCGCGCCCCCGGTGG;SOR=0.892;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=7;WE=980940;WS=980922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr4	980971	rs10794537	T	G	618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=14;NR=7;PP=320;SC=ACCTGGTGCATGTGGACGCGG;SOR=1.051;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=14;TCR=7;TR=21;WE=980979;WS=980961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
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chr4	983060	rs3796622	T	C	6401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=120;NR=102;PP=2965;SC=GTAGAGTGACTGCAGGAAGAA;SOR=0.742;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=223;TCF=120;TCR=103;TR=222;WE=983068;WS=983050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
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chr4	1006200	rs34627176	G	A	3164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.884;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=58;PP=1692;ReadPosRankSum=2.050;SC=GCCCGGGACCGGGGAGGGCGG;SOR=0.579;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=278;TCF=160;TCR=118;TR=135;WE=1006208;WS=1006190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,157:0.51:309
chr4	1018705	rs4647930	C	A	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=183;ReadPosRankSum=0.744;SC=CCAAAACCGCCAGGGCCACCT;SOR=0.722;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=35;TCF=25;TCR=10;TR=16;WE=1018713;WS=1018695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,17:0.44:39
chr4	1019054	rs145808953	CCA	C	160.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FS=3.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.04;MQRankSum=0.000;QD=0.82;ReadPosRankSum=1.741;SOR=1.109;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:170,27:0.14:197
chr4	1050437	rs7680608	C	G	209.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=199;SC=TCATAATTTTCGAAATTCACA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=1050445;WS=1050427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	1050653	rs3816474	G	A	595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.067;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=438;ReadPosRankSum=-0.665;SC=AGCAGGCTGGGGATGCTGATG;SOR=1.368;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=41;TCF=33;TCR=8;TR=25;WE=1050661;WS=1050643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,26:0.57:46
chr4	1050849	rs10003009	GT	AC	1497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=19;PP=1101;ReadPosRankSum=0.806;SC=TGGTGACACGGTAGTTACAGC;SOR=0.675;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=63;TCF=27;TCR=36;TR=32;WE=1050858;WS=1050839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,39:0.51:76
chr4	1050909	rs9992925	A	T	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=131;ReadPosRankSum=-1.254;SC=CATCTCTGAGAACCTCGGAGC;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=9;WE=1050917;WS=1050899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr4	1052009	rs13114658	A	G	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.902;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=142;ReadPosRankSum=1.465;SC=TTTCCTTTAAAACGCTGTGAA;SOR=0.223;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=6;WE=1052017;WS=1052002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr4	1052078	.	A	T	279	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=20;MQ=60.0;NF=15;NR=9;PP=279;QD=13.0738005228;SC=GTTAGAACGCAGTGAAGAAGG;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=51;TCF=37;TCR=14;TR=24;WE=1052086;WS=1052068;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:27,24:0.47:51
chr4	1052355	rs2045067	C	T	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=133;ReadPosRankSum=-0.266;SC=AGGTTGCGGGCAGCCCTGGTG;SOR=1.329;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=9;WE=1052363;WS=1052345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr4	1067267	rs2290408	G	T	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.268;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=79;ReadPosRankSum=-2.166;SC=CCCATGCACCGGGTGGAAGGA;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=5;WE=1067275;WS=1067262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr4	1067638	rs6852155	T	G	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=315;ReadPosRankSum=-0.069;SC=GTGGTAGAGGTGGTGTGGGTG;SOR=0.368;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=37;TCF=3;TCR=34;TR=18;WE=1067646;WS=1067628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr4	1084723	rs658846	G	C	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.520;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=15;PP=361;ReadPosRankSum=-1.328;SC=ACTCTCAGGAGAGCTCACAGT;SOR=0.256;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=35;TCF=11;TCR=24;TR=24;WE=1084731;WS=1084713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,26:0.70:37
chr4	1087168	rs61648964	A	AAT	2459.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.062;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=14;PP=2315;ReadPosRankSum=-0.606;SC=TATTGTAACAAATGCCAATAT;SOR=1.051;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=93;TCF=48;TCR=45;TR=35;WE=1087179;WS=1087158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,64:0.41:156
chr4	1087171	rs59985183	G	T	2459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.992;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=14;PP=2350;ReadPosRankSum=-0.356;SC=TGTAACAAATGCCAATATTTA;SOR=1.130;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=146;TCF=98;TCR=48;TR=51;WE=1087179;WS=1087158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,67:0.41:163
chr4	1087265	rs1670534	T	C	2580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.944;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=50;PP=1027;ReadPosRankSum=-0.723;SC=GCGTTTGTGATGCTCACCTCC;SOR=0.597;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=246;TCF=119;TCR=127;TR=100;WE=1087273;WS=1087255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,131:0.44:295
chr4	1087327	rs138488801	G	GCTGCCCAGGCTGGAGCCAGCC	3454.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=2.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.87;ReadPosRankSum=4.082;SOR=0.932;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,80:0.51:158
chr4	1087329	rs118112880	C	T	3569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=0.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.88;ReadPosRankSum=0.658;SOR=0.630;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,80:0.51:156
chr4	1087338	rs11725984	C	T	2824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=0.627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.89;ReadPosRankSum=0.694;SOR=0.803;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,72:0.51:142
chr4	1087401	rs56889100	G	A	1835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.997;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=39;PP=1179;ReadPosRankSum=-0.889;SC=GGGCTGGCCGGGTCTGCTGGG;SOR=0.779;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=138;TCF=70;TCR=68;TR=81;WE=1087409;WS=1087391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,84:0.58:145
chr4	1087901	rs13106356	A	G	362.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5105;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=296;ReadPosRankSum=0.481;SC=AAGCCCATGAAGGAGAGTGCC;SOR=1.739;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=13;WE=1087909;WS=1087891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,13:0.87:15
chr4	1090625	rs4045481	G	A	3112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.370;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=73;PP=1939;ReadPosRankSum=2.182;SC=TATCTGCGTCGGTCTGAAAGA;SOR=0.908;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=241;TCF=113;TCR=128;TR=132;WE=1090633;WS=1090606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,145:0.54:267
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chr4	1164552	rs13115935	A	G	4998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=92;PP=2965;ReadPosRankSum=1.636;SC=AGGAAGGGGCAGCCTCCTCGG;SOR=0.953;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=177;TCF=84;TCR=93;TR=175;WE=1164560;WS=1164540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,188:0.99:190
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chr4	1165587	rs2242279	C	G	1518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=38;NR=16;PP=907;SC=CGGGGGGCTCCGGCGCCGCAG;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=55;TCF=38;TCR=17;TR=54;WE=1165595;WS=1165577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr4	1165741	rs922697	A	G	6369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.024;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=113;NR=109;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.959;SC=GTATTTGGCCAGGGCTCTGGC;SOR=0.114;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=224;TCF=114;TCR=110;TR=222;WE=1165749;WS=1165719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,245:0.99:247
chr4	1194586	rs77049343	T	A	2533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.518;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=49;PP=1656;ReadPosRankSum=-1.182;SC=CTGCCTTTGCTGTGAGCAAGT;SOR=0.641;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=195;TCF=109;TCR=86;TR=109;WE=1194594;WS=1194576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,116:0.57:204
chr4	1194630	rs56401136	T	C	2345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=54;PP=1587;ReadPosRankSum=-1.341;SC=TGGGGCCAAGTCTGCAGTGTC;SOR=0.709;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=281;TCF=154;TCR=127;TR=118;WE=1194638;WS=1194620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:177,122:0.41:299
chr4	1207517	rs11247979	T	C	334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=11;PP=238;SC=CCCACGGCCCTGCTCTGCTCG;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=1207525;WS=1207507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	1215585	rs1250088	T	C	2654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.978;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=68;PP=1484;ReadPosRankSum=0.978;SC=AACGTGCTGGTGGGTTCATGG;SOR=0.738;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=308;TCF=162;TCR=146;TR=131;WE=1215593;WS=1215575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:195,139:0.42:334
chr4	1217056	rs2004531	G	A	923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=1;PP=677;SC=GGGCAGAGGTGTGAGGAACAG;SOR=4.680;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=29;WE=1217064;WS=1217046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr4	1243329	rs79746330	C	G	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.884;HP=2;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.833;NF=13;NR=3;PP=227;ReadPosRankSum=0.923;SC=AGCTGCCGCCCTCCCGCGCTC;SOR=2.252;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=16;WE=1243337;WS=1243319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr4	1243404	rs1680033	C	T	748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.929;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=12;PP=348;ReadPosRankSum=-0.068;SC=AGGCCGCGGGCCCCCCATCGC;SOR=0.560;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=61;TCF=38;TCR=23;TR=31;WE=1243412;WS=1243394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,35:0.53:66
chr4	1243573	rs1680032	T	C	2576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=47;NR=41;PP=1498;SC=GGAGAACCCCTTCCCCGACCC;SOR=0.714;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=48;TCR=41;TR=88;WE=1243582;WS=1243563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr4	1243617	rs3755920	T	C	743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.851;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=20;PP=517;ReadPosRankSum=-0.010;SC=GGTTTGTAGCTAACCAACGTC;SOR=0.494;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=72;TCF=32;TCR=40;TR=37;WE=1243625;WS=1243607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,38:0.48:79
chr4	1244267	rs2291199	A	G	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.128;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=231;ReadPosRankSum=0.365;SC=AAAAAATTCCAGAAAAATGAG;SOR=0.283;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=15;WE=1244275;WS=1244257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr4	1244416	rs1732115	A	G	3500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=52;PP=2074;SC=CTGTCTGCTCAGCATGGACAG;SOR=0.771;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=117;TCF=65;TCR=52;TR=117;WE=1244424;WS=1244406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr4	1244879	rs1564508	A	G	2765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.421;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=74;PP=1824;ReadPosRankSum=1.681;SC=GCCTCCGTCTACACACAGTGT;SOR=0.798;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=258;TCF=116;TCR=142;TR=127;WE=1244887;WS=1244864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,135:0.47:290
chr4	1291640	rs2293633	T	C	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=68;ReadPosRankSum=-1.670;SC=TGGCCTGTGCTCTCATCTGGC;SOR=0.495;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=8;WE=1291648;WS=1291630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,9:0.27:33
chr4	1291711	rs2293634	T	G	1041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.552;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=14;PP=685;ReadPosRankSum=1.124;SC=TGTAGCCCCATCCCCTGCCCT;SOR=1.016;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=109;TCF=73;TCR=36;TR=49;WE=1291719;WS=1291701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,50:0.45:111
chr4	1291791	rs2293635	A	G	1896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.774;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=43;PP=1262;ReadPosRankSum=0.821;SC=TGCACTGGCCACAGAAGCCGC;SOR=0.809;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=213;TCF=116;TCR=97;TR=100;WE=1291799;WS=1291781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,100:0.45:220
chr4	1303682	rs13112706	G	T	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.745;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=96;ReadPosRankSum=2.074;SC=CCCGGCAGGGGTTGGAAAGTC;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=6;WE=1303690;WS=1303672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr4	1305802	rs34402978	C	T	2378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.479;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=54;PP=1463;ReadPosRankSum=0.753;SC=GCTTTCGCGCCGCTCAGAAGA;SOR=0.769;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=245;TCF=127;TCR=118;TR=110;WE=1305810;WS=1305792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,117:0.44:264
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chr4	1330759	rs1128427	T	C	4303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=421;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.517;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=102;PP=2244;ReadPosRankSum=0.655;SC=CCCTGCAGGCTGGCCTCTCAG;SOR=0.652;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=393;TCF=191;TCR=202;TR=198;WE=1330767;WS=1330749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:206,214:0.51:420
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chr4	1343405	rs2276903	T	C	2661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.809;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=50;PP=1276;ReadPosRankSum=0.166;SC=CCTTCCAGATTGTGGAGGAAC;SOR=0.535;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=216;TCF=125;TCR=91;TR=113;WE=1343413;WS=1343395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,129:0.52:246
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chr4	1348806	rs3903127	A	C	567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=351;ReadPosRankSum=0.938;SC=TGTGCCAGGGACCCCCCGGGC;SOR=0.582;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=44;TCF=37;TCR=7;TR=21;WE=1348814;WS=1348796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,23:0.53:43
chr4	1369093	rs11941200	CT	GG	838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=591;ReadPosRankSum=0.759;SC=CCGGTCTTGCCTGATGTGCCT;SOR=0.631;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=37;TCF=31;TCR=6;TR=18;WE=1369102;WS=1369083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,22:0.54:41
chr4	1369885	rs11724369	G	A	1598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.608;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=27;PP=913;ReadPosRankSum=-1.638;SC=GGGCCCGGGCGCCTGTGGTGC;SOR=0.752;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=138;TCF=86;TCR=52;TR=71;WE=1369893;WS=1369875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,77:0.52:149
chr4	1373699	rs112142388	C	CTTT	388.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=487;ReadPosRankSum=-0.074;SC=TGACCGTGTTCTCCCTGGGTG;SOR=0.313;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=7;WE=1373709;WS=1373693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr4	1373701	rs56108910	C	G	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.291;HP=2;HapScore=4;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=487;ReadPosRankSum=1.764;SC=ACCGTGTTCTCCCTGGGTGCT;SOR=0.269;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=8;WE=1373709;WS=1373693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr4	1373751	rs35735964	G	T	679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=3;PP=450;ReadPosRankSum=-0.678;SC=GTGGTGTTTGGCCTTCCCCTG;SOR=0.850;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=47;TCF=40;TCR=7;TR=26;WE=1373759;WS=1373741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,29:0.58:50
chr4	1374695	rs28614045	C	A	2790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=60;PP=1727;ReadPosRankSum=1.764;SC=GATTGTTCCACGGGACGACGA;SOR=0.699;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=212;TCF=100;TCR=112;TR=114;WE=1374703;WS=1374685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,126:0.52:240
chr4	1374774	rs28522910	C	T	1132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.782;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=29;PP=792;ReadPosRankSum=0.395;SC=CAGGAGCGCCCGGGTAGGTCT;SOR=0.871;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=90;TCF=38;TCR=52;TR=49;WE=1374782;WS=1374764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,51:0.53:97
chr4	1374789	rs28733902	A	G	958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=27;PP=694;ReadPosRankSum=-0.082;SC=AGGTCTGGGCAAGGCGGTCAC;SOR=0.660;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=24;TCR=46;TR=41;WE=1374797;WS=1374779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,42:0.55:76
chr4	1377615	rs9996817	A	G	2384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.076;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=56;PP=1437;ReadPosRankSum=-1.311;SC=ATCTCGGCTCATCCAGGTACA;SOR=0.797;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=191;TCF=92;TCR=99;TR=106;WE=1377623;WS=1377605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,113:0.54:209
chr4	1389117	.	C	CAT	828	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=31;MMLQ=19;MQ=47.91;NF=5;NR=10;PP=828;QD=58.0666666667;SC=CGCCTGCTCACGTGCCGATGT;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=51;TCF=14;TCR=37;TR=15;WE=1389133;WS=1389107;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:36,15:0.29:51
chr4	1397297	rs11945310	T	G	739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=9;NR=15;PP=394;SC=CGGTGGGCCCTGGGCAACGGG;SOR=1.528;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=9;TCR=15;TR=24;WE=1397305;WS=1397287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	1397611	rs13133264	A	C	1020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=29;PP=528;ReadPosRankSum=-1.878;SC=CGTCTGCGGGAGGGAGGGACA;SOR=0.773;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=83;TCF=31;TCR=52;TR=46;WE=1397619;WS=1397601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,51:0.56:91
chr4	1619865	rs11722375	T	C	1582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.792;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=35;PP=831;ReadPosRankSum=-0.382;SC=GGCAGGTGAGTGCTGCCTCTT;SOR=0.918;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=134;TCF=64;TCR=70;TR=63;WE=1619873;WS=1619855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,77:0.49:156
chr4	1698183	rs798719	C	T	1396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=38;PP=1017;SC=TTAAATATTACAGATCACCAG;SOR=3.352;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=7;TCR=38;TR=45;WE=1698191;WS=1698173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr4	1701317	rs2247341	G	A	11414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=426;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=199;NR=172;PP=2965;SC=TATAACGATCGTAGGCAATTG;SOR=0.791;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=371;TCF=199;TCR=172;TR=371;WE=1701325;WS=1701307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,426:1.00:426
chr4	1714161	rs812821	T	C	168.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=4;PP=89;SC=CACTCAGCTGTGCGCGCCTCG;SOR=1.609;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=1714169;WS=1714151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	1718883	rs2236787	A	T	427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.16;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	1719572	rs798751	A	G	770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=19;PP=525;SC=TGGGCACGGGACGGACCTAGG;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=22;WE=1719580;WS=1719562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	1720757	rs798754	A	G	327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=53;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=2;PP=261;SC=CCAGAGCTGAAAAGTTATGTG;SOR=3.258;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=1720765;WS=1720750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	1720793	rs148117097	A	AG	1299.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=68.71;QD=44.82;SOR=2.546;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr4	1720794	rs61675353	T	G	1308.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=68.75;QD=43.63;SOR=2.621;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	1720794	.	TG	GG	848	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=1.0000,1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MMLQ=27;MQ=67.33;NF=19,15;NR=6,6;PP=591,848;QD=25.0308485019;SC=TCTCAAAGAATGATGGGACAT;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=25,21;WE=1720802;WS=1720784;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,25:0.83:30
chr4	1720794	.	TG	TGG	848	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=1.0000,1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MMLQ=27;MQ=67.33;NF=19,15;NR=6,6;PP=591,848;QD=25.0308485019;SC=TCTCAAAGAATGATGGGACAT;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=25,21;WE=1720802;WS=1720784;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:2,21:0.91:23
chr4	1720824	rs798755	A	G	1923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=17;PP=1183;SC=ACACGGAGCCAGCTTCAGGGC;SOR=1.708;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=48;TCR=17;TR=65;WE=1720832;WS=1720814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr4	1725651	rs3099555	T	C	1804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=39;PP=1249;SC=TGTCCGATGGTTCTTGCAGGA;SOR=1.727;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=19;TCR=39;TR=58;WE=1725668;WS=1725641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr4	1737108	rs3752747	C	T	2528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=46;PP=1368;SC=AGAGCAGCCACGGCAGGTCTT;SOR=1.321;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=32;TCR=46;TR=78;WE=1737116;WS=1737098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr4	1737404	rs34859791	C	CCT	8380.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=46;PP=2973;SC=CCTTAGCCCCCGTGTGTGTTA;SOR=1.049;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=85;TCF=36;TCR=49;TR=82;WE=1737412;WS=1737394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr4	1737502	rs11248073	C	T	5144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=83;NR=95;PP=2965;SC=ACCTCAAGTTCGACCCCCTCC;SOR=0.872;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=178;TCF=83;TCR=95;TR=178;WE=1737510;WS=1737492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr4	1737585	rs11729657	T	C	1583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=36;PP=1003;SC=CCCTCCCTCATGCATGAAGCC;SOR=1.107;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=25;TCR=36;TR=61;WE=1737593;WS=1737575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr4	1739518	rs140693140	CGCCATCCCT	C	6786.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQ=60.24;NF=9;NR=63;PP=2982;SC=CAGCCTGACCCGCCATCCCTG;SOR=0.816;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=12;TCR=85;TR=72;WE=1739534;WS=1739508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr4	1739592	rs2305188	A	G	4776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=71;NR=77;PP=2396;SC=GCCTGTCACTACTGCCCAGGT;SOR=0.950;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=148;TCF=71;TCR=77;TR=148;WE=1739600;WS=1739582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr4	1741437	rs141261775	G	T	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.28;ReadPosRankSum=0.066;SOR=0.665;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,17:0.38:45
chr4	1742400	rs4865463	T	C	144.10	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=92;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TAGAAGATCCTGGGTGGAGGG;SOR=0.527;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=6;WE=1742408;WS=1742394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,6:0.86:7
chr4	1742779	rs1530588	G	A	545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=15;PP=402;SC=AAGCCAGCGGGGCTACAAGCT;SOR=3.500;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=1742787;WS=1742769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	1746229	rs2290011	G	T	3605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=79;NR=43;PP=2069;SC=CACAGCTAATGCCTGCCCCTT;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=79;TCR=43;TR=122;WE=1746237;WS=1746219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr4	1746844	rs8389	A	T	2086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=61;PP=1647;SC=CAACTTTTTTAAAAACTAGAT;SOR=2.103;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=24;TCR=61;TR=85;WE=1746852;WS=1746834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr4	1795321	rs4450996	C	A	532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=9;NR=8;PP=329;SC=CTTCCCGCTCCGGAAAGTTTG;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=9;TCR=8;TR=17;WE=1795340;WS=1795311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	1805296	rs3135883	G	A	422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=0;PP=323;SC=CAAGTTGGCGGTGGCTGAGGA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=1805304;WS=1805288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	1805593	rs3135886	G	C	1049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.150;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=26;PP=577;ReadPosRankSum=0.728;SC=CTGCTGCTCCGCACTGTCTGG;SOR=0.407;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=81;TCF=25;TCR=56;TR=41;WE=1805601;WS=1805583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,47:0.53:88
chr4	1806012	rs377096563	TG	T	170.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=2.588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.31;ReadPosRankSum=0.622;SOR=1.280;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,17:0.23:74
chr4	1806519	rs3135890	C	T	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.474;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=7;PP=405;ReadPosRankSum=-1.281;SC=GTCGCCCACGCGGCGCCAACC;SOR=1.173;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=46;TCF=33;TCR=13;TR=29;WE=1806527;WS=1806509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,32:0.59:54
chr4	1806834	rs4865476	G	C	228.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=5;PP=122;SC=GTTCTGTGGAGATGCTCCTGG;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=8;WE=1806842;WS=1806824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	1807894	rs7688609	G	A	8674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=143;NR=149;PP=2965;SC=ACAAGAAGACGACCAACGTGA;SOR=0.812;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=292;TCF=143;TCR=149;TR=292;WE=1807902;WS=1807882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,318:1.00:318
chr4	1809110	.	CTG	C	31.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.219;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.79;ReadPosRankSum=-1.198;SOR=0.709;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,5:0.12:40
chr4	1809127	rs34562534	CGT	C	1359.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.62;QD=33.16;SOR=1.121;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,40:0.98:41
chr4	1818594	rs9328763	C	T	4664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=89;PP=2822;SC=CTTCCACGTACTTTTCTTCAC;SOR=1.275;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=148;TCF=59;TCR=89;TR=148;WE=1818602;WS=1818584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr4	1834447	rs56223366	G	C	1205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.502;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=19;PP=635;ReadPosRankSum=-1.216;SC=CCAGAGCTGTGGCGCGGAGTA;SOR=1.082;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=105;TCF=61;TCR=44;TR=51;WE=1834455;WS=1834437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,58:0.52:112
chr4	1954945	rs489550	A	G	6090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=117;NR=93;PP=2965;SC=CTTTAGCAGCATGGCTGCCTC;SOR=0.853;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=210;TCF=117;TCR=93;TR=210;WE=1954953;WS=1954935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr4	1961137	rs474235	G	A	2617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=64;NR=25;PP=1718;SC=AGTGGTGGGTGTGCAAGGGTA;SOR=1.880;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=64;TCR=25;TR=89;WE=1961145;WS=1961127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr4	2044114	.	ACCG	A	101.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.050;ClippingRankSum=-0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.83;ReadPosRankSum=-0.297;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr4	2044128	rs570712	C	T	216.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5005;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=5;PP=254;ReadPosRankSum=-0.746;SC=CCGCCGCCGCCGCTGCTGCTG;SOR=0.892;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=16;TCF=10;TCR=6;TR=13;WE=2044136;WS=2044104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr4	2074103	rs34676363	G	A	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.547;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=106;ReadPosRankSum=-0.289;SC=CAAGCAGGGGGACAGGGCCTA;SOR=2.925;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=6;WE=2074111;WS=2074093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr4	2158273	rs3216822	GGA	G	3828.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=44;PP=2264;SC=CCTGCACACTGGAGTGCATGG;SOR=1.382;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=5;TCR=45;TR=49;WE=2158282;WS=2158263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr4	2158408	rs428361	C	T	1707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=10;PP=1195;SC=AGTATGAAGTCCCCTCTTGGA;SOR=2.522;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=39;TCR=10;TR=49;WE=2158416;WS=2158398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr4	2172456	rs34574483	T	C	2672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.364;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=62;PP=1578;ReadPosRankSum=1.277;SC=CTGGGGAGACTGTTCCTTTGA;SOR=0.597;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=287;TCF=154;TCR=133;TR=128;WE=2172464;WS=2172446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,134:0.43:309
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chr4	2332799	rs1887364	C	T	516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=4;NR=13;PP=342;SC=CAGGGGTAGACGCTGGGATGG;SOR=2.303;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=17;WE=2332807;WS=2332789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	2341137	rs2071681	C	T	3024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=32;PP=1727;SC=ACAACCGTCCCCCAGCTCATA;SOR=1.350;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=66;TCR=32;TR=98;WE=2341145;WS=2341127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr4	2341194	rs2071680	T	C	7311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=136;NR=117;PP=2965;SC=GCTCAAACTCTGCGAACAGGA;SOR=0.783;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=253;TCF=136;TCR=117;TR=253;WE=2341202;WS=2341184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,278:1.00:278
chr4	2343181	rs2071679	C	T	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.993;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=192;ReadPosRankSum=-0.974;SC=TCAGGACCTCCGAACCCGGGT;SOR=0.172;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=13;WE=2343189;WS=2343171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr4	2428094	rs2269494	C	T	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.477;NF=5;NR=0;PP=57;ReadPosRankSum=-0.312;SC=TGCTACAGGCCCAACACCCTG;SOR=1.688;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=5;WE=2428102;WS=2428084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr4	2438492	rs1203763	T	C	223.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=5;NR=1;PP=139;SC=ACAGGCCCTTTGCAGCCCCGG;SOR=1.863;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=2438500;WS=2438485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	2439670	rs1203762	A	G	2294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=8;PP=1599;SC=TCAGGTGGGCACCAATAGGGT;SOR=3.808;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=63;TCR=8;TR=71;WE=2439678;WS=2439660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr4	2439701	rs1881185	G	A	1740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=1.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.761;HP=1;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.156;NF=42;NR=20;PP=931;ReadPosRankSum=0.476;SC=CTGTGGCTGCGTGCCCTGACA;SOR=0.506;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=140;TCF=99;TCR=41;TR=62;WE=2439709;WS=2439691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,82:0.45:183
chr4	2439738	rs7688771	G	A	3312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.52;BaseQRankSum=-0.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.890;HP=5;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.468;NF=68;NR=51;PP=1696;ReadPosRankSum=1.314;SC=CTCCGGTCCCGCCGTGTGCCT;SOR=0.629;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=215;TCF=127;TCR=88;TR=119;WE=2439746;WS=2439728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,159:0.53:298
chr4	2439756	rs5855731	C	CT	15281.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.52;DB;DP=382;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=114;PP=2936;SC=CCTGGTGCCCCGTGACGTCCC;SOR=0.882;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=178;TCF=55;TCR=123;TR=167;WE=2439764;WS=2439746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,379:1.00:379
chr4	2439900	rs7660914	C	A	2311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-2.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.617;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=58;PP=1286;ReadPosRankSum=-0.560;SC=AGGTGAGCCACCCCTACCTGC;SOR=0.601;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=149;TCF=55;TCR=94;TR=94;WE=2439908;WS=2439890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,105:0.62:169
chr4	2439965	rs17132558	G	C	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=4.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.390;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=481;ReadPosRankSum=-0.849;SC=CCCACCTTTCGTCATTCTGGT;SOR=1.584;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=22;WE=2439973;WS=2439955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr4	2446725	rs11734990	C	G	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.314;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=27;ReadPosRankSum=0.543;SC=GAAGTGAGGCCGTCCATCCCA;SOR=1.508;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=4;WE=2446733;WS=2446715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr4	2451694	rs3108494	T	C	6116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=125;NR=78;PP=2965;SC=CGAGGAACTGTGCTGCGCCAT;SOR=1.052;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=203;TCF=125;TCR=78;TR=203;WE=2451702;WS=2451684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr4	2452791	rs5855732	AC	A	2805.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.353;NF=4;NR=45;PP=1584;ReadPosRankSum=2.731;SC=CTGGGCACCCACCCCTCCAGA;SOR=0.703;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=99;TCF=8;TCR=91;TR=49;WE=2452811;WS=2452781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,100:0.53:190
chr4	2452933	rs3888113	T	C	2960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=37;PP=2014;SC=AGGATGGGCATTTGCTGCTCC;SOR=1.211;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=65;TCR=37;TR=102;WE=2452941;WS=2452923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr4	2460571	rs73205493	C	T	1750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.174;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=42;PP=1097;ReadPosRankSum=1.602;SC=ACGAAGCTCGCGAAGGGCCGA;SOR=0.747;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=163;TCF=85;TCR=78;TR=82;WE=2460579;WS=2460561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,88:0.50:176
chr4	2460803	rs704346	A	G	635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=7;PP=383;ReadPosRankSum=-1.608;SC=GCCACCCACCAGCCACCTCAG;SOR=0.613;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=50;TCF=39;TCR=11;TR=29;WE=2460811;WS=2460793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,31:0.54:57
chr4	2461888	rs3135152	A	G	8045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=150;NR=131;PP=2965;SC=CAGGGCAAGCACACCAAGAGC;SOR=0.794;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=282;TCF=151;TCR=131;TR=281;WE=2461896;WS=2461878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,309:1.00:309
chr4	2464179	rs3135150	A	G	514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=5;PP=301;SC=GGTGGGAGGAAAAGAAGGCCC;SOR=1.292;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=17;WE=2464187;WS=2464169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	2502299	rs55745322	A	ATT	489.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=533;SC=GTAAGCCTATAACATTAGCAG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=2502307;WS=2502289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	2513620	rs3128839	G	A	5293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.11;SOR=0.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr4	2513624	rs4974709	A	G	5244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.83;SOR=0.856;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr4	2513842	rs2269490	A	G	86.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=2;PP=50;SC=GGTCAGACCCACACAGCCAGT;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=4;WE=2513850;WS=2513832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	2664527	rs145961653	T	C	1014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.069;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=11;PP=706;ReadPosRankSum=0.395;SC=TCTTTCACAATTGAATGACCT;SOR=1.609;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=90;TCF=61;TCR=29;TR=43;WE=2664535;WS=2664517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,47:0.47:99
chr4	2698364	rs3733215	C	T	2422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=47;PP=1373;SC=GGTCTGAGGGCATTTGAAGGT;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=36;TCR=47;TR=83;WE=2698372;WS=2698354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr4	2717690	rs2295499	C	T	1615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=7;PP=1255;SC=TGATTTCTTCCGTTCTGATAA;SOR=3.528;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=44;TCR=7;TR=51;WE=2717698;WS=2717680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr4	2743999	rs232712	A	G	175.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=1;PP=112;SC=GGCAGCACTCAGCCACATGCC;SOR=2.584;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=6;WE=2744007;WS=2743989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	2744087	rs2269495	G	A	1295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=10;PP=778;SC=GCCTCTCTGGGCCGCGCCAGG;SOR=1.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=30;TCR=10;TR=40;WE=2744095;WS=2744077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr4	2746285	rs13145281	A	C	5976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=87;PP=2965;SC=GAAGCGCCCCACCAGGCTTCT;SOR=1.008;Source=Platypus;TCF=88;WE=2746293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr4	2746307	rs11728346	A	C	4142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=85;PP=2416;ReadPosRankSum=-0.794;SC=CCACCCCCACAGTGACCACTG;SOR=0.391;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=149;TCF=63;TCR=86;TR=148;WE=2746315;WS=2746297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,160:0.99:161
chr4	2822307	rs56323343	T	C	1256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.400;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=20;PP=829;ReadPosRankSum=-0.875;SC=TGCCTGACCGTAGCTGAGCCA;SOR=0.834;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=124;TCF=76;TCR=48;TR=57;WE=2822315;WS=2822297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,60:0.45:132
chr4	2824848	rs41264713	T	A	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=269;ReadPosRankSum=0.776;SC=GCCTGCCCCTTATTCCCGCCC;SOR=0.770;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=16;WE=2824856;WS=2824838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr4	2826218	rs34274570	C	CA	231.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=167;ReadPosRankSum=1.023;SC=AGGGCCCACCCGATCTGCCCT;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=7;WE=2826226;WS=2826208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr4	2826400	rs3213501	T	C	2846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=352;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=66;PP=1841;ReadPosRankSum=-2.406;SC=AGATCATCCATATCAGCAAGA;SOR=0.678;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=320;TCF=162;TCR=158;TR=136;WE=2826408;WS=2826390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:203,148:0.42:351
chr4	2828527	rs62637096	G	C	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.857;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=10;PP=419;ReadPosRankSum=-1.566;SC=GTGTGAACATGTGTGCTTGTC;SOR=0.815;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=73;TCF=49;TCR=24;TR=32;WE=2828535;WS=2828517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,34:0.43:80
chr4	2828630	rs72613119	G	T	1328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.631;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=27;PP=694;ReadPosRankSum=0.726;SC=CTGTGTCTTTGTGTATATATA;SOR=0.613;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=115;TCF=60;TCR=55;TR=57;WE=2828638;WS=2828620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,68:0.50:137
chr4	2829077	rs2269485	T	C	509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.602;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=20;PP=321;ReadPosRankSum=-0.371;SC=ACTGCCCGTTTGCCTCTCCCC;SOR=1.445;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=52;TCF=12;TCR=40;TR=24;WE=2829085;WS=2829067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,25:0.46:54
chr4	2829478	rs13137906	G	C	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=386;ReadPosRankSum=-3.027;SC=GAGCCCCTCCGAGGCTGGGGA;SOR=0.368;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=19;WE=2829486;WS=2829468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr4	2833226	rs231397	G	C	432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=274;ReadPosRankSum=-1.630;SC=GTGGAGTGGGGAGGGGAGCAG;SOR=0.859;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=17;WE=2833234;WS=2833216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr4	2901349	rs2071695	A	G	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=243;ReadPosRankSum=0.203;SC=GAGGTGAAGGATTCCTGGTAT;SOR=1.154;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=13;WE=2901357;WS=2901339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr4	2906453	rs2239728	T	G	966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=13;PP=552;ReadPosRankSum=-2.162;SC=TTTTGAGATCTGGAATATTGA;SOR=0.757;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=119;TCF=80;TCR=39;TR=46;WE=2906461;WS=2906443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,53:0.40:133
chr4	2906707	rs4961	G	T	1883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.565;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=45;PP=1278;ReadPosRankSum=-1.011;SC=TTCCGAGGAAGGGCAGAATGG;SOR=0.786;SbPval=0.62;Source=Platypus;TCF=79;TR=86;WE=2906715;WS=2906697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,88:0.52:170
chr4	2916762	rs4963	C	G	1046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.366;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=22;PP=529;ReadPosRankSum=-1.291;SC=CAGAAGGGCTCTGAAGGTGAG;SOR=0.577;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=121;TCF=62;TCR=59;TR=50;WE=2916770;WS=2916752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,56:0.41:135
chr4	2928125	rs1263345	C	T	980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.090;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=27;PP=695;ReadPosRankSum=1.458;SC=CTCCTCGTGCCGTGTTGTCAT;SOR=0.465;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=63;TCF=17;TCR=46;TR=38;WE=2928133;WS=2928115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,41:0.61:67
chr4	2928413	rs4964	T	C	1284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.363;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=36;PP=649;ReadPosRankSum=0.969;SC=GTAAGTACCGTGCTGCCTCCG;SOR=0.840;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=124;TCF=52;TCR=72;TR=60;WE=2928421;WS=2928403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,65:0.47:139
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chr4	2934308	rs1263349	G	A	2963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.780;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=63;PP=1649;ReadPosRankSum=0.825;SC=GACCCCAAAGGCCCAGCCTGT;SOR=0.640;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=262;TCF=143;TCR=119;TR=128;WE=2934316;WS=2934298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,147:0.49:300
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chr4	2955145	rs1475977	T	C	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.22;ReadPosRankSum=-1.173;SOR=0.382;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
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chr4	2955465	rs1475975	T	C	573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.735;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=296;ReadPosRankSum=1.358;SC=CACACAGTGATCACTCAGTTG;SOR=1.276;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=39;TCF=13;TCR=26;TR=20;WE=2955473;WS=2955455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,26:0.55:47
chr4	2965611	rs13120295	G	C	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.363;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=233;ReadPosRankSum=1.601;SC=AGGGCCTGCGGAGGCGGCGGC;SOR=1.179;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=16;WE=2965619;WS=2965601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,17:0.46:37
chr4	2965676	rs16843684	C	T	1623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=15;PP=526;ReadPosRankSum=0.245;SC=GGATCGTGTCCGGAGCTCGAG;SOR=0.712;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=98;TCF=65;TCR=33;TR=43;WE=2965684;WS=2965666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,47:0.44:108
chr4	2965695	rs10021191	G	A	2014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.639;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=22;PP=766;ReadPosRankSum=-1.078;SC=AGGAGAGGGTGGTGCCCGGCG;SOR=0.756;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=123;TCF=78;TCR=45;TR=56;WE=2965703;WS=2965685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,62:0.46:136
chr4	2965874	.	AC	A	147.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.166;ClippingRankSum=0.000;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=5.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQRankSum=1.964;QD=2.24;ReadPosRankSum=-1.197;SOR=0.204;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,14:0.21:66
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chr4	2988636	rs2488815	C	T	783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.660;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=15;ReadPosRankSum=0.743;SC=TTGTTGTAACCCCCCCATTGT;SOR=0.881;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=92;TCF=51;TCR=41;TR=36;WE=2988644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,38:0.39:98
chr4	2988752	rs2471324	G	T	2700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.318;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=54;PP=1759;ReadPosRankSum=-0.546;SC=TTAATATATTGAGTTGTGAAA;SOR=0.912;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=251;TCF=140;TCR=111;TR=129;WE=2988760;WS=2988742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,133:0.49:273
chr4	2990338	rs2051556	G	T	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=3.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=107;ReadPosRankSum=0.360;SC=AAAATAATACGGCAAATACTG;SOR=0.850;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=8;WE=2990346;WS=2990331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,10:0.34:29
chr4	2990375	rs2051555	G	A	695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-4.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.515;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=353;ReadPosRankSum=-1.248;SC=TATCGAGTGAGAACTGTAAGG;SOR=0.349;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=74;TCF=61;TCR=13;TR=25;WE=2990383;WS=2990365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,33:0.38:87
chr4	2990499	rs2960306	G	T	4669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=465;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.103;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.981;NF=114;NR=97;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.641;SC=ATAGGAAGACGTCTCTTCAGG;SOR=0.816;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=431;TCF=227;TCR=204;TR=211;WE=2990507;WS=2990489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:238,227:0.49:465
chr4	2993980	rs2515941	T	C	804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=1.502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.60;ReadPosRankSum=0.952;SOR=0.899;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,45:0.37:122
chr4	3006043	rs1024323	C	T	2186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.443;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=50;PP=1304;ReadPosRankSum=1.050;SC=TCCAAAAAAGCCTTTGAGGAA;SOR=0.726;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=245;TCF=132;TCR=113;TR=108;WE=3006051;WS=3006025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,117:0.43:271
chr4	3024044	rs2471325	C	T	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=339;ReadPosRankSum=-0.243;SC=TGTTTTGCCGCGCTAGCCCTT;SOR=1.044;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=18;WE=3024052;WS=3024034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr4	3029588	rs2857844	G	A	1352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.163;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=22;PP=970;ReadPosRankSum=1.195;SC=TTGTTGTTACGGTGTCATTAC;SOR=0.887;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=131;TCF=82;TCR=49;TR=60;WE=3029596;WS=3029578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,65:0.46:140
chr4	3039150	rs1801058	T	C	2115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.027;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=52;PP=1231;ReadPosRankSum=-1.670;SC=CAGTTCTCGGTGGTGAAAGGG;SOR=0.879;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=182;TCF=94;TCR=88;TR=96;WE=3039158;WS=3039140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,103:0.51:200
chr4	3039311	rs2071689	C	T	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.933;HP=1;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=119;ReadPosRankSum=-2.272;SC=TGTGTGTGTCCGTGTGTGTGT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=7;WE=3039319;WS=3039300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr4	3040279	rs11451355	G	GA	43.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.30;ReadPosRankSum=-0.695;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr4	3076603	rs374076986	CCAGCAG	C	222.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5034;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=164;ReadPosRankSum=-0.742;SC=TCAAGTCCTTCCAGCAGCAGC;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=3076616;WS=3076593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr4	3118116	rs2071655	T	G	431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.900;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=267;ReadPosRankSum=1.404;SC=GCGCTGCTCGTTTCCAACCCT;SOR=1.426;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=15;WE=3118124;WS=3118106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr4	3123074	rs1065745	C	T	1306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=31;PP=721;ReadPosRankSum=1.720;SC=AAACCCTGACCGCAGTCGGGG;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=50;TCR=63;TR=56;WE=3123082;WS=3123064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,63:0.50:126
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chr4	3132248	rs363087	T	A	807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.544;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=22;PP=485;ReadPosRankSum=-0.074;SC=TTCCCATCCCTGGGCCTTTAA;SOR=1.177;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=66;TCF=20;TCR=46;TR=30;WE=3132256;WS=3132238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,35:0.48:73
chr4	3132878	rs363068	A	G	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.22;ReadPosRankSum=1.150;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr4	3132920	rs363067	T	G	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=172;ReadPosRankSum=0.016;SC=AGCACCTGGCTTAAGTGCTGC;SOR=0.864;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=14;WE=3132928;WS=3132910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr4	3134726	rs363078	T	C	1369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=39;PP=967;ReadPosRankSum=0.812;SC=ATAGGAAATATTTCCATGCAC;SOR=0.604;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=83;TCF=20;TCR=63;TR=52;WE=3134734;WS=3134716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,54:0.64:84
chr4	3142182	rs3025851	T	A	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.825;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=247;ReadPosRankSum=-0.577;SC=GGGTGGTCTATCACAGGTGAG;SOR=0.096;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=15;WE=3142190;WS=3142172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr4	3174256	rs363098	T	C	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.866;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=209;ReadPosRankSum=-0.806;SC=CAGCACTTTTTGGCTCAGTCC;SOR=1.193;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=43;TCF=12;TCR=31;TR=17;WE=3174264;WS=3174246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,19:0.42:45
chr4	3180021	rs363096	T	C	698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.300;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=6;PP=458;ReadPosRankSum=0.606;SC=GTTTTTGTTTTTAGGGAATCA;SOR=0.493;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=49;TCF=39;TCR=10;TR=27;WE=3180029;WS=3180011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,29:0.58:50
chr4	3180283	rs363095	G	A	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=231;ReadPosRankSum=-1.021;SC=GTGCTTCTCAGGCTCTGCATG;SOR=0.622;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=12;WE=3180291;WS=3180273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr4	3184229	rs363094	A	G	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=253;ReadPosRankSum=-1.487;SC=TTGTTGTTGCATAGTGATGGT;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=12;TCR=26;TR=19;WE=3184237;WS=3184219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr4	3188265	rs363093	C	T	1886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.861;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=29;PP=1038;ReadPosRankSum=0.228;SC=AGCTGGTGTACAGGAAGCTGT;SOR=0.563;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=163;TCF=108;TCR=55;TR=82;WE=3188273;WS=3188255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,92:0.49:187
chr4	3189547	rs363125	C	A	1292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.267;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=34;PP=704;ReadPosRankSum=-0.049;SC=GGGGACAGTACTTCAACGCTA;SOR=0.812;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=148;TCF=60;TCR=88;TR=56;WE=3189555;WS=3189537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,66:0.39:168
chr4	3210456	rs3025825	A	C	940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=7.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.75;ReadPosRankSum=3.275;SOR=1.957;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,37:0.70:53
chr4	3213875	rs362278	T	C	662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=17;PP=453;ReadPosRankSum=-1.812;SC=GTTTGGTAATTAAAATTAAAA;SOR=0.602;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=48;TCF=17;TCR=31;TR=27;WE=3213883;WS=3213865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,29:0.54:54
chr4	3215835	rs362331	T	C	1676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.457;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=39;PP=1133;ReadPosRankSum=-0.562;SC=CTCCCTCATCTACTGTGTGCA;SOR=0.843;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=114;TCF=49;TCR=65;TR=67;WE=3215843;WS=3215825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,73:0.59:124
chr4	3216815	rs916171	C	G	1278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=12;PP=862;ReadPosRankSum=-0.051;SC=AAATTCTTCTCTTTGTTCTGT;SOR=0.741;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=89;TCF=64;TCR=25;TR=46;WE=3216823;WS=3216805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,52:0.53:99
chr4	3219613	rs2857790	A	C	2210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=48;PP=1513;SC=CGCCATTGCTAAGGAACATCA;SOR=1.580;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=24;TCR=48;TR=72;WE=3219621;WS=3219603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr4	3221872	rs362276	C	G	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.934;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=9;PP=489;ReadPosRankSum=0.419;SC=TGTCCTGACTCAACTCGGATG;SOR=1.042;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=65;TCF=46;TCR=19;TR=33;WE=3221880;WS=3221862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,40:0.49:82
chr4	3225389	rs82333	A	G	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.175;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=346;ReadPosRankSum=-0.265;SC=GTTTTCCTTCATTGCTAGAAT;SOR=0.186;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=20;WE=3225397;WS=3225379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,21:0.50:42
chr4	3227592	rs2276882	T	A	748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.743;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=22;PP=520;ReadPosRankSum=2.558;SC=TCCTTTTTTTTAAAAAAAAAT;SOR=0.953;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=89;TCF=40;TCR=49;TR=36;WE=3227600;WS=3227574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,38:0.40:94
chr4	3230804	rs2530598	A	C	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=6.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.49;ReadPosRankSum=-1.150;SOR=0.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,10:0.31:32
chr4	3235184	rs3216820	GC	G	869.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.758;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=25;PP=817;ReadPosRankSum=-0.371;SC=CAGATGGCAGGCCAGGTATCA;SOR=1.212;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=60;TCF=0;TCR=60;TR=25;WE=3235192;WS=3235174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,31:0.37:84
chr4	3235241	rs362314	A	G	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=88;ReadPosRankSum=0.383;SC=GAGACGCAAGAGCACAGGTGC;SOR=0.340;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=6;WE=3235249;WS=3235231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr4	3240159	rs2071704	C	T	726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.200;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=9;PP=314;ReadPosRankSum=0.059;SC=CTCTGACCTGCGTCCCTCCTC;SOR=0.408;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=61;TCF=43;TCR=18;TR=29;WE=3240167;WS=3240149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,35:0.51:69
chr4	3240526	rs2858081	A	G	976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=17;PP=674;SC=ACACTCAGGCACCTGCTTGCT;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=19;TCR=17;TR=36;WE=3240534;WS=3240516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr4	3262960	.	CA	C	203.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.592;ClippingRankSum=0.000;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.71;ReadPosRankSum=1.726;SOR=0.692;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,23:0.19:119
chr4	3318413	rs2236052	A	G	7101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=117;NR=131;PP=2965;SC=GATCCCTTTCAGAGTCGGCCG;SOR=0.837;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=248;TCF=117;TCR=131;TR=248;WE=3318421;WS=3318403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
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chr4	3446132	rs1987546	C	G	794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=22;PP=536;ReadPosRankSum=1.332;SC=GCGAGTGCTTCGGGGGCCGGA;SOR=0.609;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=82;TCF=28;TCR=54;TR=35;WE=3446140;WS=3446121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,37:0.39:94
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chr4	3449781	rs75501914	G	A	903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.354;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=24;PP=570;ReadPosRankSum=0.156;SC=GGAGGGGGGCGCCCAGCGCCC;SOR=0.937;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=104;TCF=50;TCR=54;TR=43;WE=3449789;WS=3449771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,48:0.39:124
chr4	3451109	rs2498323	G	A	3032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.433;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=61;PP=1877;ReadPosRankSum=-0.054;SC=ATCAACGACCGGATACGGCCT;SOR=0.747;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=263;TCF=140;TCR=123;TR=132;WE=3451117;WS=3451099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,144:0.51:282
chr4	3475107	rs2344208	G	A,C	844.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=9;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=15,6;NR=8,4;PP=298,85;SC=GTTGGCTGGCGTCCCTGACGG;SOR=1.061;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=33;TCF=21;TCR=12;TR=23,10;WE=3475115;WS=3475097;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.69,0.31:36
chr4	3475122	rs2344209	G	A	758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=11;PP=341;ReadPosRankSum=-2.067;SC=TGACGGCCACGCTCCTTGCAG;SOR=0.818;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=27;TCR=15;TR=31;WE=3475130;WS=3475112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,35:0.76:46
chr4	3475252	rs4325970	T	C	1867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=27;NR=26;PP=850;SC=CTACGAGGGCTTGGTCCACAC;SOR=0.957;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=53;TCF=27;TCR=26;TR=53;WE=3475260;WS=3475242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr4	3475390	rs77051823	G	A	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.944;SOR=1.508;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr4	3478051	.	T	C	1499	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MMLQ=24;MQ=59.93;NF=55;NR=33;PP=1499;QD=17.4292183244;SC=GATGCCCTCTTGCCCCGCCTG;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=56;TCR=33;TR=88;WE=3478059;WS=3478041;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,88:0.99:89
chr4	3478323	rs2699426	T	C	1691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=41;PP=1028;SC=CCACTTCCCCTGAGAACTGCT;SOR=1.839;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=19;TCR=41;TR=60;WE=3478331;WS=3478313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr4	3478391	rs2857987	C	A	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.424;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5041;FS=4.393;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=125;ReadPosRankSum=-0.473;SC=CCAGAATGCGCCGGCAGGTGG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=7;WE=3478399;WS=3478381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr4	3487099	rs28706421	A	G	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=62;ReadPosRankSum=-2.042;SC=ACCCGGATTCACGGGGCCAGG;SOR=1.071;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=5;WE=3487107;WS=3487089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr4	3487151	rs916189	A	G	2398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=26;PP=1382;SC=GGGGCCAGGCAGGGTGTCATT;SOR=1.265;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=57;TCR=26;TR=83;WE=3487159;WS=3487141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr4	3487237	rs2006791	A	G	4917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=88;NR=79;PP=2797;SC=CTCGGGCCAGACTGACCTGTC;SOR=0.736;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=167;TCF=88;TCR=79;TR=167;WE=3487245;WS=3487227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr4	3494419	rs62272676	G	A	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=299;ReadPosRankSum=-0.842;SC=GGTCCACCAGGCATCAGCCAC;SOR=0.532;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=49;TCF=35;TCR=14;TR=20;WE=3494427;WS=3494409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,20:0.40:50
chr4	3494449	rs34230391	AC	A	635.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=7;PP=535;ReadPosRankSum=0.101;SC=AGACCCCTGTACCCCCACAAC;SOR=0.768;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=50;TCF=29;TCR=21;TR=18;WE=3494457;WS=3494439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,27:0.38:71
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chr4	3498624	rs13130443	G	A	944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-3.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.766;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=27;PP=628;ReadPosRankSum=1.307;SC=AGAGCTCGGGGACAGGAAGGC;SOR=0.600;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=97;TCF=34;TCR=63;TR=44;WE=3498632;WS=3498614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,47:0.46:103
chr4	3501802	rs10805009	G	C	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.350;HP=3;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=112;ReadPosRankSum=-0.205;SC=CTCAGGATGGGGCAGCGCTGG;SOR=0.180;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=10;WE=3501810;WS=3501800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr4	3501835	rs2858035	C	A	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.920;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=129;ReadPosRankSum=0.475;SC=CGGTCAGGAACATGGAGCGGG;SOR=0.200;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=11;WE=3501857;WS=3501825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,11:0.35:31
chr4	3501849	rs2699409	T	C	1538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=11;PP=1005;SC=GAGCGGGAACTTCCAAGGTGC;SOR=2.059;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=32;TCR=11;TR=43;WE=3501857;WS=3501825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
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chr4	3501924	rs2858036	A	G	1776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.085;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=30;PP=1214;ReadPosRankSum=1.591;SC=ACAATCTTTGAGATCTGTGCC;SOR=1.045;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=179;TCF=110;TCR=69;TR=82;WE=3501932;WS=3501914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,86:0.44:194
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chr4	3514938	rs1741553	A	G	343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=10;PP=259;SC=GCAGCTCAGTACTAACTAGAA;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=3514946;WS=3514928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	3516689	rs2515967	T	C	3741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=78;PP=2463;SC=AGTGTTCCCTTCCCGTGCTCG;SOR=1.473;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=121;TCF=43;TCR=78;TR=121;WE=3516697;WS=3516679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr4	3516742	rs1794442	A	G	1079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=26;PP=735;SC=AGGACGCCAAAGGACGGCGCC;SOR=2.554;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=8;TCR=26;TR=34;WE=3516750;WS=3516732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr4	3517732	rs1794444	G	C	2108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.071;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=34;PP=1351;ReadPosRankSum=-0.187;SC=GAAACTGCGAGAATCTTGAGA;SOR=0.614;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=197;TCF=123;TCR=74;TR=88;WE=3517740;WS=3517722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,101:0.47:215
chr4	3519762	rs13325	A	G	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=195;ReadPosRankSum=-0.186;SC=GGCACTCACCAGCCTCAGTGC;SOR=0.495;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=48;TCF=40;TCR=8;TR=17;WE=3519770;WS=3519752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,17:0.33:51
chr4	3521939	rs1741547	T	A	886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.721;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=24;PP=574;ReadPosRankSum=-0.876;SC=GAGGGGAGGTTCTATTTGATA;SOR=0.914;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=83;TCF=38;TCR=45;TR=42;WE=3521947;WS=3521929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,43:0.48:90
chr4	3589623	rs10937959	G	A	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.827;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.404;NF=28;NR=3;PP=610;ReadPosRankSum=0.397;SC=TGGTGCACCTGCACTTCCACA;SOR=1.802;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=61;TCF=50;TCR=11;TR=31;WE=3589631;WS=3589613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,33:0.52:64
chr4	3589689	rs7657417	C	A	4728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.830;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.440;NF=76;NR=48;PP=1712;ReadPosRankSum=-0.589;SC=TGCACCTGCACTTCCTGGTGC;SOR=0.538;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=248;TCF=156;TCR=92;TR=124;WE=3589697;WS=3589679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,125:0.49:253
chr4	3589719	rs59190481	CA	C	6007.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=363;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.179;NF=32;NR=66;PP=2948;ReadPosRankSum=-0.266;SC=GGTTCATCTGCAACTTCCTGG;SOR=0.707;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=221;TCF=76;TCR=145;TR=98;WE=3589727;WS=3589709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:196,167:0.46:363
chr4	3589846	rs7672828	T	C	3219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=84;PP=2092;ReadPosRankSum=-1.501;SC=CTGGTGAGAATCCCTTGAGCA;SOR=0.706;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=267;TCF=112;TCR=155;TR=146;WE=3589854;WS=3589836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,152:0.54:279
chr4	3590537	rs73199384	G	C	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.368;HP=2;HapScore=4;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=428;ReadPosRankSum=-0.060;SC=GGAGACCCTCGCTGGGGAGGG;SOR=0.048;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=11;WE=3590557;WS=3590533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr4	3590549	rs73793633	G	A	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.258;HP=3;HapScore=4;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=428;ReadPosRankSum=-0.354;SC=TGGGGAGGGCGCCAAGCAGTG;SOR=0.051;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=12;WE=3590557;WS=3590533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr4	3590577	rs73793634	G	A	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.539;HP=1;HapScore=4;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=931;ReadPosRankSum=0.745;SC=GGGTTGGGGCGTCAGCCAAGC;SOR=0.111;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=50;TCF=42;TCR=8;TR=24;WE=3590596;WS=3590567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,25:0.49:51
chr4	3590588	rs73199385	A	C	657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.296;HP=1;HapScore=4;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=8;PP=931;ReadPosRankSum=1.249;SC=TCAGCCAAGCATCAGCCCCTA;SOR=0.282;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=62;TCF=48;TCR=14;TR=28;WE=3590596;WS=3590567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,29:0.45:64
chr4	3590683	rs62272966	T	G	5343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=348;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=68;PP=1664;ReadPosRankSum=1.471;SC=AAACGTTCCCTGAACATGCCA;SOR=0.679;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=319;TCF=165;TCR=154;TR=136;WE=3590691;WS=3590673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:196,150:0.43:346
chr4	3590711	rs62272967	G	T	5620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=70;PP=1706;ReadPosRankSum=1.190;SC=AGGATGCTGGGTATCAGGCTA;SOR=0.684;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=320;TCF=157;TCR=163;TR=134;WE=3590719;WS=3590701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:203,150:0.42:353
chr4	3590730	rs62272968	G	A	5256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQ=60.03;MQRankSum=-0.858;NF=60;NR=64;PP=1536;ReadPosRankSum=-0.189;SC=TACCTTTGCTGGACAGCTCCA;SOR=0.686;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=298;TCF=145;TCR=153;TR=124;WE=3590738;WS=3590720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:186,139:0.43:325
chr4	3590817	rs62272969	T	C	1442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.580;HP=1;HapScore=3;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.830;NF=22;NR=13;PP=1779;ReadPosRankSum=0.110;SC=CACACACACATGCACAGACAC;SOR=0.874;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=98;TCF=55;TCR=43;TR=35;WE=3590836;WS=3590807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,44:0.42:105
chr4	3590823	rs72180705	GACAC	G,GAC	3251.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.09;MQRankSum=0.254;QD=32.20;ReadPosRankSum=-0.557;SOR=0.992;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:4,47,50:0.47,0.50:101
chr4	3590878	rs62272970	C	T	2353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.904;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=39;PP=1434;ReadPosRankSum=0.075;SC=CACAGACACACACACACAGAG;SOR=0.971;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=239;TCF=143;TCR=96;TR=106;WE=3590886;WS=3590862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,117:0.44:268
chr4	3590911	rs34447251	A	C	5213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=361;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.801;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=64;PP=1717;ReadPosRankSum=-0.990;SC=GCTCACAAGTAGAGCTCTTCG;SOR=0.755;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=322;TCF=185;TCR=137;TR=151;WE=3590919;WS=3590901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:197,163:0.45:360
chr4	3591015	rs62272971	A	C	6126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=723;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.764;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=156;NR=144;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.123;SC=CTGTGTATAAATTCTTTCCTT;SOR=0.549;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=678;TCF=368;TCR=310;TR=300;WE=3591023;WS=3591005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:409,312:0.43:721
chr4	3591049	rs62272972	C	T	12932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=866;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.528;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=187;NR=166;PP=2962;ReadPosRankSum=1.016;SC=TAGATGATTTCCCCCAGCTTA;SOR=0.740;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=821;TCF=431;TCR=390;TR=353;WE=3591057;WS=3591038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:500,364:0.42:864
chr4	3591069	rs62272973	C	T	12710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=846;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=172;NR=171;PP=2962;ReadPosRankSum=1.643;SC=ACCTTGAGGACTTTCGAGCAA;SOR=0.681;SbPval=0.5;Source=Platypus;TCF=400;TR=343;WE=3591077;WS=3591059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:491,354:0.42:845
chr4	3769789	rs11269124	G	GGGGGAGCTTTCCCAGAGACCC	1272.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.45;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr4	4190507	.	C	CTTG	89.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=0.000;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=2.417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQRankSum=-12.826;QD=0.54;ReadPosRankSum=-2.430;SOR=1.053;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:152,14:0.08:166
chr4	4190508	.	C	T	89.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.485;ClippingRankSum=0.000;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=2.408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQRankSum=-12.865;QD=0.54;ReadPosRankSum=-1.739;SOR=1.040;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:153,14:0.08:167
chr4	4190511	.	G	GTCACTTGTTA	82.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.090;ClippingRankSum=0.000;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQRankSum=-12.865;QD=0.50;ReadPosRankSum=-1.421;SOR=1.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:153,14:0.08:167
chr4	4190792	rs2920255	A	C	731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=17;PP=568;SC=TGGGAGCTGAACCTAATGCAC;SOR=2.400;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=22;WE=4190800;WS=4190782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr4	4199261	rs11736799	C	T	1017.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.608;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-3.827;NF=27;NR=21;PP=465;ReadPosRankSum=-1.567;SC=TACTTCTCCACGATCGCCAGG;SOR=0.758;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=142;TCF=76;TCR=66;TR=48;WE=4199269;WS=4199251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,57:0.36:157
chr4	4199634	rs2916414	A	T	5343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=90;PP=2965;SC=CCATGACCCCATCAGACTTGA;SOR=0.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=173;TCF=83;TCR=90;TR=173;WE=4199642;WS=4199624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr4	4199760	rs17697262	G	A	1095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.96;MQRankSum=-1.049;NF=22;NR=26;PP=770;ReadPosRankSum=-0.500;SC=AGAGGTAGTAGATCCCGTGGG;SOR=0.687;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=102;TCF=47;TCR=55;TR=48;WE=4199775;WS=4199750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,50:0.47:107
chr4	4204299	rs2920182	T	C	3489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=71;PP=2269;SC=AGTGGATCACTCCAAACCTGA;SOR=1.252;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=47;TCR=71;TR=118;WE=4204307;WS=4204289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr4	4228029	rs36055674	A	AAAG	531.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.19;ReadPosRankSum=-0.133;SOR=0.883;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr4	4249297	rs2916469	C	T	3402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FS=0.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.45;ReadPosRankSum=-0.216;SOR=0.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:107,88:0.45:195
chr4	4249300	rs2916468	T	C	3452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FS=0.514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.93;ReadPosRankSum=-0.887;SOR=0.734;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:109,95:0.47:204
chr4	4249414	rs2980101	AT	GC	4911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.404;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=48;PP=2811;ReadPosRankSum=-1.081;SC=AGTCGACCTGATGTGTCAGGT;SOR=0.668;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=282;TCF=143;TCR=139;TR=102;WE=4249423;WS=4249404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:199,133:0.40:332
chr4	4249483	rs2916466	C	T	5130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.67;SOR=1.562;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr4	4249483	.	CA	TA,TC	1252	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.36;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=46,16;NR=80,32;PP=1252,517;QD=10.2124699409;SC=CAGATATTTCCAGTAATTCGC;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=46;TCR=80;TR=126,48;WE=4249492;WS=4249473;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:126
chr4	4249484	rs2916465	A	C	1136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=4.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.84;ReadPosRankSum=1.292;SOR=1.106;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,60:0.41:145
chr4	4249909	rs2272746	C	T	1330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=29;PP=928;ReadPosRankSum=-1.673;SC=GGAGCTGCTGCCGGGCCCGCG;SOR=0.677;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=149;TCF=90;TCR=59;TR=71;WE=4249917;WS=4249899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,71:0.42:168
chr4	4249974	rs2272745	C	A	2014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.239;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=44;PP=1233;ReadPosRankSum=1.023;SC=TCAGACACAGCGCTTCCGGCG;SOR=0.541;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=206;TCF=106;TCR=100;TR=94;WE=4249982;WS=4249964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,102:0.44:233
chr4	4250133	rs2272744	G	C	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=98;ReadPosRankSum=0.970;SC=ACTGAGCTTTGCCGGTGGAAG;SOR=0.321;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=7;WE=4250141;WS=4250123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr4	4275976	rs11723469	A	C	1014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.13;SOR=6.273;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	4275986	rs11723471	A	C	1338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.19;SOR=3.797;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr4	4276132	rs7376390	T	C	6448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=115;NR=101;PP=2965;SC=TGCGCCCACGTGTGCCTCTTC;SOR=0.753;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=216;TCF=115;TCR=101;TR=216;WE=4276140;WS=4276122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr4	4276475	rs2272739	C	T	1137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=27;PP=697;ReadPosRankSum=0.356;SC=GGCCGTTGATCCTGTTCCTTA;SOR=0.719;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=143;TCF=72;TCR=71;TR=53;WE=4276483;WS=4276465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,59:0.37:158
chr4	4283543	rs139653868	G	A	2971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.352;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=63;PP=1709;ReadPosRankSum=0.865;SC=TGTCGCCTTTGTGGGTTTTAC;SOR=0.793;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=282;TCF=146;TCR=136;TR=134;WE=4283551;WS=4283533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,145:0.47:309
chr4	4283676	rs2272738	G	A	7055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=113;NR=125;PP=2965;SC=AGTTGGAGGCGCTAATACCAG;SOR=0.917;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=238;TCF=113;TCR=125;TR=238;WE=4283684;WS=4283666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr4	4285221	rs2980214	A	C	1188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=7;PP=777;SC=AATCAATGGAACATACCAGTT;SOR=2.356;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=38;WE=4285229;WS=4285211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr4	4285265	rs4688927	T	A	1064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.757;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=13;PP=703;ReadPosRankSum=0.366;SC=AATTTGCCACTATTTTTCCAA;SOR=0.507;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=91;TCF=67;TCR=24;TR=47;WE=4285273;WS=4285255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,50:0.50:101
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chr4	4411559	rs7655690	T	C	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=210;ReadPosRankSum=2.902;SC=AGTGTCCCTGTGGAAGGCCCA;SOR=0.627;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=14;WE=4411567;WS=4411549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr4	4417899	rs7678778	G	C	1953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.021;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=46;PP=1292;ReadPosRankSum=-0.338;SC=ACCTGAGATTGAGAGAGAAAA;SOR=0.904;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=140;TCF=62;TCR=78;TR=80;WE=4417907;WS=4417889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,88:0.56:158
chr4	4425422	rs10675705	C	CAG	1348.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=23;PP=940;SC=GTGGGAGAGACAGGGGGCACA;SOR=2.694;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=23;WE=4425430;WS=4425412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	4436436	rs6825715	T	C	777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=16;PP=552;ReadPosRankSum=0.431;SC=AGTTTCTCCTTAGTGAAACAG;SOR=0.763;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=71;TCF=42;TCR=29;TR=35;WE=4436444;WS=4436426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,38:0.47:81
chr4	4463587	rs10004136	G	C	2679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=62;PP=1445;ReadPosRankSum=0.384;SC=GAAAGCATGGGGTGTGCATAT;SOR=0.667;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=250;TCF=123;TCR=127;TR=124;WE=4463595;WS=4463577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,135:0.49:274
chr4	4473216	rs6816884	G	A	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=163;ReadPosRankSum=1.284;SC=AGAGCCTTTTGCTTTGAGGAG;SOR=0.446;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=11;WE=4473224;WS=4473206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr4	5016841	rs6847131	G	T	1031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=11;PP=676;SC=TGACATAACTGTAGTTCTCTT;SOR=1.432;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=23;TCR=11;TR=34;WE=5016849;WS=5016831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr4	5017146	rs67449859	A	AT	411.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.17;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
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chr4	5017150	.	C	A	82	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=82;QD=29.1928031368;SC=AATTTCATTTCCATAATTTTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=5017158;WS=5017139;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	5017150	rs34659865	C	CATTTCA	412.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.27;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	5018702	rs11724788	G	A	3171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=50;NR=58;PP=2255;SC=CTGGGAGTGGGCAATGGGGAG;SOR=0.931;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=109;TCF=51;TCR=58;TR=108;WE=5018710;WS=5018692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr4	5128641	rs11726208	A	G	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=2.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.48;ReadPosRankSum=0.026;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,23:0.53:43
chr4	5128650	rs895679	T	C	1810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.51;SOR=1.314;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr4	5128726	rs17882862	A	G	2141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.175;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=30;PP=1327;ReadPosRankSum=-0.476;SC=CCTTTTGCACAGATGACAGCA;SOR=1.283;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=149;TCF=92;TCR=57;TR=88;WE=5128734;WS=5128716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,100:0.59:169
chr4	5170214	rs3749567	C	T	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=74;ReadPosRankSum=1.313;SC=TGTGGGTTCCCCTGTGGGGAG;SOR=0.922;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=6;WE=5170222;WS=5170204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr4	5418383	rs2301858	G	A	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=283;ReadPosRankSum=-1.623;SC=ATATGCATAAGTTACCAAATG;SOR=0.223;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=14;WE=5418391;WS=5418373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr4	5418539	rs168985	C	T	2646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.914;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=59;PP=1648;ReadPosRankSum=-1.376;SC=CTGCAGCCCACGCTAACTGGA;SOR=0.685;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=256;TCF=133;TCR=123;TR=126;WE=5418547;WS=5418529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,132:0.48:277
chr4	5500511	rs13116133	A	C	591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=1;PP=439;SC=CCATCTGGCTACAGTGCACAG;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=5500519;WS=5500501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	5527115	rs11426893	A	AT	905.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=1.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQRankSum=0.000;QD=8.97;ReadPosRankSum=0.106;SOR=0.973;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,49:0.49:101
chr4	5528115	rs71674563	AT	A	65.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.74;ReadPosRankSum=1.351;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr4	5544739	rs10937650	G	A	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.664;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=353;ReadPosRankSum=-1.019;SC=TAAGTGATGCGGGCAGAGCAG;SOR=1.508;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=19;WE=5544747;WS=5544729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr4	5570221	rs12511039	G	A	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.85;ReadPosRankSum=-1.270;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,12:0.41:29
chr4	5577884	rs6840591	T	C	1040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=6;PP=737;SC=CAGGTGGGTATGGGTGGGCTG;SOR=2.964;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=33;WE=5577892;WS=5577874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
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chr4	5617369	rs10032860	G	T	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.512;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=348;ReadPosRankSum=1.251;SC=AGTTTCTGCAGCTCCCAGAAC;SOR=3.082;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=6;TCR=39;TR=17;WE=5617377;WS=5617359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,18:0.38:47
chr4	5624670	rs730469	T	C	1373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.685;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=26;PP=704;ReadPosRankSum=-0.452;SC=TCCTCAACCGTTCGGAAGGCC;SOR=0.604;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=105;TCF=47;TCR=58;TR=50;WE=5624678;WS=5624660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,60:0.50:121
chr4	5630470	rs35103377	TA	T	642.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=1.667;NF=0;NR=25;PP=298;ReadPosRankSum=-0.470;SC=TCCTGTCAATTAAAAAAAAAA;SOR=0.929;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=25;WE=5630478;WS=5630460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,31:0.76:41
chr4	5642161	rs751841	A	G	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=0;PP=41;ReadPosRankSum=-1.508;SC=AGGCAAATGGACAGATGAGTG;SOR=1.302;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=3;WE=5642169;WS=5642155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr4	5642274	rs13131655	T	C	1756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.406;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=26;PP=1180;ReadPosRankSum=0.815;SC=ACTCTTCTGCTTCCTCCATTG;SOR=0.880;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=123;TCF=79;TCR=44;TR=71;WE=5642282;WS=5642264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,78:0.57:138
chr4	5732982	rs28718969	T	A	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=23;ReadPosRankSum=0.921;SC=GCTGTCGATGTGGCAGAACCT;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=3;WE=5732990;WS=5732979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr4	5743509	rs6446393	C	T	1632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=1.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.21;ReadPosRankSum=0.990;SOR=0.556;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,41:0.68:60
chr4	5743512	rs6414624	T	C	1635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=2.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.26;ReadPosRankSum=0.598;SOR=0.406;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,41:0.68:60
chr4	5746916	rs4689313	C	T	2803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.49;SOR=1.390;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr4	5747078	rs2286342	A	G	4303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=73;PP=2480;SC=TGTGCGTGCCAGACTTTCTTT;SOR=0.892;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=70;TCR=74;TR=142;WE=5747086;WS=5747068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr4	5747131	rs13145958	C	A	2656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=54;PP=1593;SC=AAATTGGCTACATTAGAGAGA;SOR=1.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=27;TCR=54;TR=81;WE=5747139;WS=5747121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr4	5750003	rs33929747	A	G	3757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=80;PP=2486;SC=CCGAAGGGCTATTGTGCGATT;SOR=1.376;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=127;TCF=47;TCR=80;TR=127;WE=5750011;WS=5749993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr4	5754544	rs899691	T	C	4621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=57;PP=2468;SC=GCTATGGTCCTGTGTGTTTCT;SOR=1.127;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=154;TCF=97;TCR=57;TR=154;WE=5754552;WS=5754534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr4	5755542	rs2302075	C	A	2780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=49;PP=1671;SC=GACCTGGTCACGGCGTCTCTG;SOR=0.952;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=43;TCR=49;TR=92;WE=5755550;WS=5755532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr4	5757932	rs5855888	GA	G	124.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=6.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.43;MQRankSum=2.024;QD=2.83;ReadPosRankSum=0.087;SOR=0.117;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,15:0.34:44
chr4	5785442	rs1383180	G	A	4314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=82;PP=2655;SC=AATCGCTTCCGGAGGCAGCAG;SOR=1.223;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=58;TCR=82;TR=140;WE=5785450;WS=5785432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr4	5798627	rs2291152	G	A	722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=4;PP=515;ReadPosRankSum=0.402;SC=AGCAGAGGGCGGTGATTCCAA;SOR=0.874;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=57;TCF=48;TCR=9;TR=31;WE=5798635;WS=5798617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,31:0.53:58
chr4	5803669	rs1031919	T	C	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.020;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=10;PP=429;ReadPosRankSum=0.861;SC=CTTCCTTTCTTCCCTCAGAGG;SOR=0.527;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=61;TCF=42;TCR=19;TR=31;WE=5803677;WS=5803659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,33:0.52:64
chr4	5803904	rs1031918	C	T	1194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.747;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=30;PP=730;ReadPosRankSum=0.601;SC=ATGTCAGATACTGTGAATTTT;SOR=0.602;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=104;TCF=34;TCR=70;TR=46;WE=5803912;WS=5803894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,52:0.46:114
chr4	5811441	rs3733185	C	T	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=244;ReadPosRankSum=0.933;SC=CCTTAGGCATCGTGCCTAGGC;SOR=0.507;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=13;WE=5811449;WS=5811431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr4	5812195	rs2279250	A	G	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=25;PP=575;ReadPosRankSum=-1.096;SC=TGGGCCCCGGACCTGTTGCCT;SOR=0.700;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=73;TCF=20;TCR=53;TR=34;WE=5812203;WS=5812185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,34:0.45:75
chr4	5812566	rs2279247	A	G	1186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.422;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=17;PP=764;ReadPosRankSum=1.188;SC=CAAAGTAAAAATTGTTTTGAT;SOR=0.894;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=120;TCF=78;TCR=42;TR=52;WE=5812574;WS=5812556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,58:0.43:134
chr4	5812778	rs2291151	G	A	1078.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.937;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=24;PP=588;ReadPosRankSum=0.971;SC=AAGACCAGTCGGTGGGACAAG;SOR=0.399;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=80;TCF=28;TCR=52;TR=39;WE=5812786;WS=5812768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,48:0.53:90
chr4	5823666	.	T	TCCACCTTAGCAGAAGTCGTAACCCCGCCCCATCTTCAGGTGTTCG	913.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.190;ClippingRankSum=0.000;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=37.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.06;ReadPosRankSum=1.078;SOR=5.702;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,26:0.40:65
chr4	5827493	rs73206228	A	G	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=388;ReadPosRankSum=1.338;SC=AGGTCACTTCAAATGTGCATG;SOR=1.483;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=10;WE=5827512;WS=5827483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr4	5827503	rs10605297	GCA	G	273.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=412;ReadPosRankSum=0.957;SC=AAATGTGCATGCACACACACA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=4;WE=5827512;WS=5827483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr4	5830414	rs6818391	T	C	5179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=108;PP=2965;SC=ACAGCCTCAGTGTTACTTCCC;SOR=1.267;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=178;TCF=69;TCR=109;TR=177;WE=5830422;WS=5830404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr4	5837871	rs3815264	A	G	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.674;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=388;ReadPosRankSum=-0.136;SC=GAGGAGGGGCAGCTGGGCACA;SOR=0.286;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=19;WE=5837879;WS=5837861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,20:0.67:30
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chr4	5838513	rs12331	C	G	9226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=160;NR=153;PP=2965;SC=CCCAGACGACCGTCATCCGCT;SOR=0.710;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=313;TCF=160;TCR=153;TR=313;WE=5838521;WS=5838503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,351:1.00:351
chr4	5841423	rs71640227	T	TAAAC	5791.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=46;PP=2918;SC=GGGGAAAACATAAGCCTGGTT;SOR=0.709;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=64;TCF=14;TCR=50;TR=60;WE=5841431;WS=5841413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr4	5843196	rs2286283	T	G	2718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=47;PP=1588;ReadPosRankSum=-0.626;SC=GGAAGGCTGGTGTAACAGCTA;SOR=0.397;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=90;TCF=42;TCR=48;TR=89;WE=5843204;WS=5843186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,101:0.99:102
chr4	5843266	rs2286282	T	C	1169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=26;PP=662;SC=CTCCATTGAATGAGAAGGACA;SOR=1.414;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=15;TCR=26;TR=41;WE=5843274;WS=5843256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr4	5843318	rs2286281	G	T	568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.63;SOR=2.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	5843328	rs2286280	T	C	601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.29;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	5851234	.	TA	T	54.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.827;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=2.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.04;ReadPosRankSum=-1.598;SOR=1.536;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr4	5863032	rs13130069	G	A	1394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=37;PP=1052;SC=AAACATTTCTGAGCCAGGCCC;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=7;TCR=37;TR=44;WE=5863040;WS=5863022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr4	5925186	rs4348041	G	A	800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=16;PP=465;SC=CTTTTGTGGCGGGGGCGGCTG;SOR=2.387;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=21;WE=5925194;WS=5925176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	5966574	rs4996083	T	C	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=56;ReadPosRankSum=-1.180;SC=AATTAGATCATAGAAGGAGAC;SOR=1.609;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=5;WE=5966582;WS=5966571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr4	5966618	rs6828891	A	G	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=306;ReadPosRankSum=-0.933;SC=TCGGGAGTCGATTGTGTTCTA;SOR=0.836;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=17;WE=5966626;WS=5966608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr4	5966665	rs7442168	G	A	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.909;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=10;PP=441;ReadPosRankSum=0.275;SC=GGTGTATATCGCTTGGATAAT;SOR=0.871;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=46;TCR=23;TR=30;WE=5966673;WS=5966655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,32:0.42:76
chr4	5966801	rs6839295	T	C	1556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.970;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=36;PP=1096;ReadPosRankSum=-2.692;SC=GGCTCGGGAATAGGCCAGGAC;SOR=0.641;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=79;TCR=73;TR=73;WE=5966809;WS=5966791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,76:0.48:159
chr4	5966905	rs6857900	C	T	1002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.450;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=26;PP=550;ReadPosRankSum=-1.450;SC=AAGCCTCCACCCAGGAACCTA;SOR=0.490;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=99;TCF=43;TCR=56;TR=49;WE=5966913;WS=5966895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,51:0.46:112
chr4	5966943	rs6839512	T	C	642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=19;PP=443;ReadPosRankSum=0.746;SC=TGTCTGAGCCTTGTCATAACC;SOR=0.689;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=58;TCF=20;TCR=38;TR=29;WE=5966951;WS=5966933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,30:0.48:63
chr4	5969113	rs9997727	G	A	1181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=14;PP=619;ReadPosRankSum=0.918;SC=GAGCACACAGGCTTTTCCTGA;SOR=0.735;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=77;TCF=52;TCR=25;TR=45;WE=5969121;WS=5969103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,54:0.59:91
chr4	5969235	rs7690750	A	G	993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.439;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=21;PP=564;ReadPosRankSum=-0.241;SC=GGCACTGGAGAGACAGCCTTG;SOR=0.880;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=111;TCF=59;TCR=52;TR=40;WE=5969243;WS=5969225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,48:0.36:133
chr4	5969252	rs7690889	A	G	893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.719;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=21;PP=461;ReadPosRankSum=0.589;SC=CTTGCACAGAAGACTGCAATT;SOR=0.833;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=99;TCF=46;TCR=53;TR=36;WE=5969260;WS=5969242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,44:0.37:120
chr4	5969292	rs6446420	C	A	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.92;ReadPosRankSum=-0.935;SOR=0.592;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,28:0.44:64
chr4	5969303	rs6446421	T	A	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.121;HP=2;HapScore=4;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=543;ReadPosRankSum=-1.832;SC=AAAAAACCGCTTTCTGTGTAG;SOR=0.876;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=42;TCF=15;TCR=27;TR=18;WE=5969311;WS=5969282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,24:0.47:51
chr4	5969364	rs6446422	T	C	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.268;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=51;ReadPosRankSum=1.427;SC=CTCTCCAGGATGCTCAAAGGA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=5;WE=5969372;WS=5969354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr4	5982167	.	TTTG	T	205.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.054;ClippingRankSum=-0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.07;MQRankSum=0.385;QD=20.57;ReadPosRankSum=-0.549;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr4	5990599	rs751240	T	C	1876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.600;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=39;PP=1053;ReadPosRankSum=-1.476;SC=CCGAGATCAGTGTCTGGAGCT;SOR=0.568;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=218;TCF=125;TCR=93;TR=88;WE=5990607;WS=5990589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,97:0.40:241
chr4	5990868	rs143859826	CCT	C	396.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FS=0.714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.04;MQRankSum=2.396;QD=1.76;ReadPosRankSum=-0.823;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:195,31:0.14:226
chr4	6031632	rs10461053	T	G	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.318;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=134;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GGCAGCCTGATGAGCTCTGAT;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=8;WE=6031640;WS=6031622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr4	6050759	rs60586285	T	G	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=25;PP=536;ReadPosRankSum=0.962;SC=TGTTTTATTATGTTTGTTTGT;SOR=0.732;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=67;TCF=18;TCR=49;TR=34;WE=6050767;WS=6050749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,25:0.48:52
chr4	6052249	.	G	A	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.140;ClippingRankSum=-0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=17.55;ReadPosRankSum=1.949;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr4	6052251	.	C	G	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.172;ClippingRankSum=-0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=16.52;ReadPosRankSum=2.209;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr4	6052253	.	C	A	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.193;ClippingRankSum=-0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=16.52;ReadPosRankSum=2.209;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr4	6062061	rs28553970	T	C	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.390;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=194;ReadPosRankSum=-1.601;SC=CCCCACAGAATGTCCCCCTTG;SOR=1.356;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=40;TCF=32;TCR=8;TR=14;WE=6062069;WS=6062051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,15:0.35:43
chr4	6062117	rs6852114	T	A	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.816;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=13;PP=513;ReadPosRankSum=0.035;SC=ACAGAAAGGCTAAGATTCACA;SOR=1.201;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=111;TCF=70;TCR=41;TR=43;WE=6062125;WS=6062107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,47:0.38:125
chr4	6087371	rs73196084	G	A	1020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=25;PP=617;ReadPosRankSum=-0.126;SC=AAAGGAGAAAGAATAAGCAGT;SOR=0.689;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=105;TCF=48;TCR=57;TR=46;WE=6087379;WS=6087361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,51:0.44:116
chr4	6087394	rs142883340	C	T	1003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.031;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=25;PP=641;ReadPosRankSum=-2.095;SC=GCCCTAGGGGCTCATGACCAA;SOR=1.051;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=71;TCF=29;TCR=42;TR=40;WE=6087402;WS=6087384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,44:0.55:80
chr4	6114420	rs1543965	GCC	TAA	4874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=45;PP=2934;ReadPosRankSum=-0.510;SC=TTGCAGCCCAGCCGCTGCTGA;SOR=0.709;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=229;TCF=132;TCR=97;TR=100;WE=6114430;WS=6114410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,126:0.48:264
chr4	6279047	rs10937714	C	T	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=12.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.99;ReadPosRankSum=-1.256;SOR=0.057;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chr4	6291003	rs4689394	C	G	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.508;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.757;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=7;PP=186;ReadPosRankSum=0.326;SC=TGGTGGCCTTCTCATTTTAGA;SOR=2.093;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=9;WE=6291011;WS=6290993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr4	6292751	.	G	GTGGCAGGGGCA	1578	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=11;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=4;NR=0;PP=1578;QD=405.25;SC=GAGAGTGGGCGTGGCGCGATG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=4;WE=6292766;WS=6292746;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:14,4:0.22:18
chr4	6292755	rs55640037	C	CAGGGGCATG	182.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.42;ReadPosRankSum=1.170;SOR=1.051;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr4	6292758	.	G	A	499	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=11;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=8;NR=0;PP=499;QD=66.7214015684;SC=GGCGTGGCGCGATGTCCTCTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=8;WE=6292766;WS=6292746;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:12,8:0.40:20
chr4	6292758	rs56102017	G	GCA	238.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=5.898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.37;ReadPosRankSum=0.292;SOR=2.461;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr4	6292799	rs5018647	A	C	569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.755;HP=1;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=366;ReadPosRankSum=0.161;SC=CTTCCCTGGTAACCAAGTCCT;SOR=1.773;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=49;TCF=37;TCR=12;TR=23;WE=6292807;WS=6292789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,24:0.47:51
chr4	6292818	rs5018648	C	G	1096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.882;HP=3;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=16;PP=686;ReadPosRankSum=-0.877;SC=CTGACACCTTCTATGAGTCTC;SOR=0.540;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=82;TCF=55;TCR=27;TR=46;WE=6292826;WS=6292808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,49:0.58:85
chr4	6292909	rs9998519	C	T	5285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FS=0.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.48;ReadPosRankSum=-0.755;SOR=0.660;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:148,138:0.48:286
chr4	6292915	rs10010131	A	G	5469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FS=0.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.23;ReadPosRankSum=-1.765;SOR=0.658;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:154,146:0.49:300
chr4	6293446	rs13101355	T	C	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=43;ReadPosRankSum=0.998;SC=CGCTACGTGGTGCTGAGTCCA;SOR=0.941;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=5;WE=6293454;WS=6293436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr4	6293474	rs13147655	A	G	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=158;ReadPosRankSum=0.343;SC=TACTGGAGGTACAGAGGTGTG;SOR=1.091;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=11;WE=6293482;WS=6293464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr4	6293696	rs1801213	C	G	3377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=58;PP=1955;SC=AGCAGAGGCGCATGCTGGAGC;SOR=0.949;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=54;TCR=58;TR=112;WE=6293704;WS=6293686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr4	6293802	rs7655482	T	C	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5026;FS=2.858;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=226;ReadPosRankSum=-0.897;SC=CCTGTGCGACTCCATCCTGGC;SOR=2.303;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=12;WE=6293810;WS=6293792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr4	6302519	rs1801212	G	A	8670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=148;NR=145;PP=2965;SC=CTTCTTCATCGTCAGCAACCT;SOR=0.718;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=293;TCF=148;TCR=145;TR=293;WE=6302527;WS=6302509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,324:1.00:324
chr4	6302545	rs56072215	C	T	3716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.861;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=74;PP=2282;ReadPosRankSum=0.112;SC=TCGACTTCTTCGCCTTCTTCA;SOR=0.689;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=281;TCF=146;TCR=135;TR=155;WE=6302553;WS=6302535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,171:0.55:312
chr4	6302707	rs1801206	C	T	4041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-2.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=384;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.235;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=80;PP=2277;ReadPosRankSum=0.494;SC=AGGCCGAGGTCAACTTCGGCT;SOR=0.583;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=331;TCF=166;TCR=165;TR=165;WE=6302715;WS=6302697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:192,192:0.50:384
chr4	6303022	rs1801214	C	T	2936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.282;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=50;PP=1742;ReadPosRankSum=-1.022;SC=TCGTCCTCAACGTCAGCGTCC;SOR=0.969;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=269;TCF=154;TCR=115;TR=127;WE=6303030;WS=6303012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,139:0.47:297
chr4	6303247	rs2230719	C	T	1840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.649;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=44;PP=1130;ReadPosRankSum=1.633;SC=TCCTGGTGGCCGGCCTGGCCC;SOR=0.820;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=207;TCF=102;TCR=105;TR=83;WE=6303255;WS=6303237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,91:0.41:224
chr4	6303354	rs734312	G	A	2939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.962;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=55;PP=1655;ReadPosRankSum=1.617;SC=CTGCTGTTGCGCTGGTGGACC;SOR=0.629;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=223;TCF=129;TCR=94;TR=127;WE=6303362;WS=6303344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,140:0.55:254
chr4	6303844	rs2230721	G	A	4423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=432;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.418;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=101;PP=2580;ReadPosRankSum=2.139;SC=ACCGCTACAAGTTTGAGATTA;SOR=0.832;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=395;TCF=197;TCR=198;TR=193;WE=6303852;WS=6303834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:218,214:0.50:432
chr4	6303955	rs1046314	G	A	1845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.165;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=47;PP=1302;ReadPosRankSum=-1.700;SC=GCGAGTTCAAGAGCGTGCTGC;SOR=0.796;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=158;TCF=67;TCR=91;TR=80;WE=6303963;WS=6303945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,86:0.48:181
chr4	6304087	rs1046316	A	G	3533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=54;PP=1974;SC=CCCAGCTCTCACCCACCAGGC;SOR=0.770;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=119;TCF=64;TCR=55;TR=117;WE=6304095;WS=6304077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr4	6304242	rs1046317	T	C	648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=14;PP=453;SC=CCATGAGGCCTTTCCCCAGTG;SOR=2.200;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=18;WE=6304250;WS=6304232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	6304285	rs1802453	G	A	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.248;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.80;ReadPosRankSum=-0.210;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr4	6325018	rs3796402	A	T	2489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=24;PP=1589;SC=GGGGCCGGGAACTGCACATAC;SOR=1.718;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=58;TCR=24;TR=82;WE=6325026;WS=6325008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr4	6325086	rs3796403	G	A	5001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=67;PP=2965;SC=TGGTGGCGGCGATGGCAATGA;SOR=1.005;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=163;TCF=96;TCR=67;TR=163;WE=6325094;WS=6325076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr4	6335186	rs4689405	C	T	2453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=57;NR=18;PP=1530;SC=ACCTACATACCGGGCATATGA;SOR=2.066;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=57;TCR=18;TR=75;WE=6335194;WS=6335176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr4	6335203	rs10937722	C	T	3118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=31;PP=1714;SC=ATGAAAGCCACGCCTGGCTAG;SOR=1.453;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=68;TCR=31;TR=99;WE=6335211;WS=6335193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr4	6374189	rs6837903	A	G	1827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.49;SOR=2.406;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr4	6374230	rs35520578	C	CA	2386.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.563;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.915;NF=23;NR=19;PP=1641;ReadPosRankSum=0.395;SC=AGGCACTGGCCAGGCCACAGT;SOR=1.073;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=99;TCF=43;TCR=56;TR=42;WE=6374238;WS=6374220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,80:0.45:176
chr4	6374468	rs12511721	T	C	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=68;ReadPosRankSum=0.480;SC=GAAGGCCAGGTGGTGGCATCA;SOR=0.763;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=10;WE=6374476;WS=6374458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,13:0.36:36
chr4	6374493	rs34231840	G	A	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.891;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=123;ReadPosRankSum=0.719;SC=ATAGCATGCCGTGAGCATGTG;SOR=1.022;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=8;WE=6374501;WS=6374483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr4	6377530	rs4688997	C	G	604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.43;ReadPosRankSum=-0.573;SOR=0.636;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,30:0.52:58
chr4	6377534	rs4688998	A	G	2304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.89;SOR=1.542;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr4	6377713	rs4234738	G	C	1893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=24;NR=36;PP=1095;SC=CCGGATGGAAGAGAAGATCCA;SOR=1.478;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=24;TCR=36;TR=60;WE=6377721;WS=6377703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr4	6384367	rs113499839	C	G	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=4.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.15;MQRankSum=-0.137;QD=12.91;ReadPosRankSum=2.027;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr4	6384985	rs60292172	C	T	692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.034;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=13;PP=356;ReadPosRankSum=-0.053;SC=CCGGCCAAGCCCAGCCTCCAG;SOR=0.271;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=69;TCF=48;TCR=21;TR=32;WE=6384993;WS=6384975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,34:0.46:74
chr4	6578487	rs4689485	A	G	4086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=73;PP=2244;SC=TTGGCCCAGTATCCTGGCAAA;SOR=0.998;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=60;TCR=73;TR=133;WE=6578495;WS=6578477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr4	6594827	rs10937747	A	G	4639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=104;NR=52;PP=2825;SC=CTGGGAGAACATGGCACTTGG;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=156;TCF=104;TCR=52;TR=156;WE=6594835;WS=6594817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr4	6596360	rs2301795	G	A	3774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=44;NR=79;PP=2355;SC=CGGTGTCTCGGTGCAGTATGC;SOR=1.540;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=44;TCR=79;TR=123;WE=6596368;WS=6596350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr4	6611813	rs4689487	T	C	1208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.762;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=41;PP=710;ReadPosRankSum=-0.442;SC=ACGCTCCCAATGGCGCCTTTC;SOR=0.821;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=112;TCF=34;TCR=78;TR=58;WE=6611821;WS=6611803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,60:0.52:115
chr4	6619052	rs4689488	A	G	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.833;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=52;ReadPosRankSum=-0.842;SC=TAGACCAGGGACATTGGGGTT;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=6619060;WS=6619044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr4	6619165	rs4689489	A	G	4240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=51;PP=2719;SC=TCTACCACCTATATGAAGTGG;SOR=1.345;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=88;TCR=51;TR=139;WE=6619173;WS=6619155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr4	6619204	rs4689490	G	A	2864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.891;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=57;PP=1778;ReadPosRankSum=2.566;SC=CTCAGCCAGTGACAGTGAATC;SOR=0.823;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=284;TCF=158;TCR=126;TR=134;WE=6619212;WS=6619194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,146:0.47:308
chr4	6623032	rs4234768	G	T	9810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=375;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=169;NR=170;PP=2965;SC=AGATGCCCCGGCCCCAGGGCT;SOR=0.698;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=339;TCF=169;TCR=170;TR=339;WE=6623040;WS=6623022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,373:1.00:373
chr4	6698500	rs113431497	C	CTGAGCCTGAA	501.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=2978;SC=GGCCCTGGCCCTGACAGCAAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=8;WE=6698508;WS=6698492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	6698667	rs11734898	T	C	3150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=61;NR=43;PP=1662;SC=AGGACCTGGATGCCAATGGAG;SOR=0.816;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=61;TCR=43;TR=104;WE=6698675;WS=6698657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr4	6698706	rs11733989	A	C	3213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=54;PP=1667;SC=GTGAGTTCATAGTGTTCGTGG;SOR=0.865;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=56;TCR=54;TR=110;WE=6698714;WS=6698696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr4	6718775	rs3172604	G	T	175.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=140;SC=TGTCTTCCAAGTTTAAAAAAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=6718783;WS=6718765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr4	6956086	rs56094305	C	T	6531.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=120;NR=99;PP=2965;SC=GCTTTCTTGCCTTTCTTGCTG;SOR=0.803;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=219;TCF=120;TCR=99;TR=219;WE=6956094;WS=6956076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr4	6968942	rs9291126	C	T	979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=1;PP=782;SC=CAGAGGAAAGCTGACTTGTTT;SOR=5.549;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=31;WE=6968950;WS=6968932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr4	6996129	rs3892490	G	A	1328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=37;PP=1053;ReadPosRankSum=-0.798;SC=CAGAAAAGGGGAGAAGAGTAA;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=3;TCR=38;TR=40;WE=6996137;WS=6996119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,42:0.98:43
chr4	7002803	rs2301817	C	T	1596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=17;PP=1027;SC=TGGTTCGGGGCTAGGCACGCA;SOR=1.460;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=37;TCR=17;TR=54;WE=7002811;WS=7002793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
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chr4	7032180	rs11546450	G	A	1956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=47;PP=1397;SC=CCCCTCTGTTGTTTCAGACTG;SOR=2.235;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=17;TCR=47;TR=64;WE=7032188;WS=7032170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
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chr4	7398194	rs9991834	A	G	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.029;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.97;ReadPosRankSum=1.345;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
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chr4	7435009	rs59409649	G	A	1034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.566;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=24;PP=634;ReadPosRankSum=-0.490;SC=CATGGGCCTCGCTAGCAGGCT;SOR=0.375;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=101;TCF=60;TCR=41;TR=49;WE=7435017;WS=7434999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,53:0.45:117
chr4	7435058	rs60816800	C	T	1371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.582;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=29;PP=782;ReadPosRankSum=0.075;SC=TGTTCCCCAGCGTGGAGGTGC;SOR=0.627;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=143;TCF=83;TCR=60;TR=64;WE=7435066;WS=7435048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,71:0.44:162
chr4	7435194	rs12498567	G	A	2281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.492;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=44;PP=1426;ReadPosRankSum=0.207;SC=GGGTCCTGGGGCCGTGGCAGG;SOR=0.635;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=202;TCF=114;TCR=88;TR=99;WE=7435202;WS=7435184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,107:0.48:222
chr4	7435379	rs4689746	A	G	7231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=110;NR=121;PP=2965;SC=TTGCTCTCCAAGTTGTGGGAG;SOR=0.877;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=231;TCF=110;TCR=121;TR=231;WE=7435387;WS=7435369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr4	7435486	rs61738677	G	T	3567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.423;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=67;PP=2542;ReadPosRankSum=0.401;SC=ATCATGGACTGCCCGGGCCCG;SOR=0.735;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=276;TCF=156;TCR=120;TR=153;WE=7435494;WS=7435476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,158:0.53:297
chr4	7435721	rs6850206	C	T	3821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.306;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=73;PP=2358;ReadPosRankSum=0.279;SC=TTCATGCACACCTCACAGGTC;SOR=0.819;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=308;TCF=166;TCR=142;TR=163;WE=7435729;WS=7435711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,178:0.53:339
chr4	7435901	rs56269914	C	T	2207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.019;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=53;PP=1246;ReadPosRankSum=1.013;SC=AGTGCTTGGTCAGCAGGGACA;SOR=0.929;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=195;TCF=92;TCR=103;TR=96;WE=7435909;WS=7435891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,106:0.48:221
chr4	7436073	rs61740031	C	T	3261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.410;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=72;PP=2112;ReadPosRankSum=0.619;SC=CTCCTTCAGGCGCCTGGCGGG;SOR=0.706;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=285;TCF=148;TCR=137;TR=148;WE=7436088;WS=7436063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,156:0.50:311
chr4	7436239	rs56402179	C	T	2511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.500;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=39;PP=1415;ReadPosRankSum=0.828;SC=CGGGGCCCCACGGAGCATGCT;SOR=0.976;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=193;TCF=108;TCR=85;TR=97;WE=7436247;WS=7436229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,116:0.52:222
chr4	7461769	rs12512664	A	G	1803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=3.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.530;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.777;NF=37;NR=32;PP=1125;ReadPosRankSum=-1.188;SC=CATTTAGGGTAACTGAGCTGC;SOR=0.639;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=151;TCF=87;TCR=64;TR=69;WE=7461777;WS=7461759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,84:0.43:195
chr4	7461826	rs10655902	C	CCCA	9183.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=74;PP=2970;SC=CCCAGCAGTCCCTCCCCCTGC;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=100;TCF=23;TCR=77;TR=95;WE=7461834;WS=7461814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr4	7461915	rs12498272	T	A	4829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=91;PP=2856;SC=GCGTGCCAGCTAGTAGAATCC;SOR=1.002;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=163;TCF=72;TCR=91;TR=163;WE=7461923;WS=7461905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr4	7462058	rs34961985	A	T	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.356;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=129;ReadPosRankSum=0.573;SC=GGCACTAACCAGCCAACCCCA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=7;WE=7462066;WS=7462048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr4	7655855	rs2285789	C	T	5139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=71;PP=2643;SC=TTTTTCTGCCCTAAAGCTCTA;SOR=0.735;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=160;TCF=89;TCR=71;TR=160;WE=7655863;WS=7655845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr4	7663167	rs2285788	A	T	1714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.083;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=20;PP=1034;ReadPosRankSum=-2.053;SC=TGTGGGGAGCAGCTGGGGGAC;SOR=1.000;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=135;TCF=91;TCR=44;TR=68;WE=7663175;WS=7663157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,75:0.51:148
chr4	7684641	rs4689820	C	A	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=283;ReadPosRankSum=0.350;SC=TCACATCACACACCATCCTTG;SOR=0.600;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=38;TCF=7;TCR=31;TR=18;WE=7684649;WS=7684631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,20:0.54:37
chr4	7684661	rs4689821	CT	AC	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.188;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=520;ReadPosRankSum=0.314;SC=GGCGTGGATGCTAGATATAAC;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=11;WE=7684670;WS=7684651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr4	7691193	rs929264	G	C	1653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.207;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=30;PP=1037;ReadPosRankSum=2.808;SC=TGACAGTTGCGTCCTTTCTCT;SOR=1.035;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=165;TCF=93;TCR=72;TR=77;WE=7691201;WS=7691183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,83:0.45:186
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chr4	7716932	rs6816604	T	C	10617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=402;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=195;NR=177;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.109;SC=TGAGCGCTCCTCCTCCTCAGA;SOR=0.244;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=374;TCF=197;TCR=177;TR=372;WE=7716940;WS=7716922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,400:1.00:401
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chr4	7731310	rs1544402	G	A	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.246;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=176;ReadPosRankSum=-1.180;SC=AACTCTCCCCGCAGGAGACCA;SOR=1.129;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=55;TCF=42;TCR=13;TR=17;WE=7731318;WS=7731300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,24:0.35:68
chr4	7731560	rs1076226	T	A	708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=19;PP=410;ReadPosRankSum=0.282;SC=TCGCTGCATCTCAGTCTGACT;SOR=0.808;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=46;TCF=15;TCR=31;TR=29;WE=7731568;WS=7731550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,32:0.60:53
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chr4	7736455	rs6843811	G	A	1137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.364;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=24;PP=606;ReadPosRankSum=0.107;SC=TAAGCAGTGTGCCCAAGGTAA;SOR=0.632;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=118;TCF=62;TCR=56;TR=54;WE=7736463;WS=7736445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,59:0.44:135
chr4	7737137	rs4689845	G	A	2216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.525;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=46;PP=1222;ReadPosRankSum=-0.805;SC=TTTCATGTGTGCCCCCGTTCC;SOR=0.468;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=198;TCF=112;TCR=86;TR=99;WE=7737145;WS=7737127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,112:0.49:227
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chr4	7737341	rs4689846	G	A	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.903;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=48;ReadPosRankSum=-0.352;SC=AGGAGTCTGTGGGGCAAAGAA;SOR=0.320;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=7;WE=7737349;WS=7737331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,8:0.27:30
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chr4	7738750	rs373064090	C	T	909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=8;PP=538;ReadPosRankSum=-0.856;SC=GACAGGCGGCCTGGGAAGCCC;SOR=0.685;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=71;TCF=54;TCR=17;TR=35;WE=7738758;WS=7738740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,40:0.52:77
chr4	7738775	rs75849760	G	A	1251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.668;HP=5;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=18;PP=850;ReadPosRankSum=0.828;SC=AAGCTGAGCCGCCCTTGCCTC;SOR=0.776;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=124;TCF=85;TCR=39;TR=57;WE=7738783;WS=7738765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,60:0.45:133
chr4	7765495	rs2240053	G	T	1555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.604;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=32;PP=1047;ReadPosRankSum=0.619;SC=CTGTCCCCTAGGTCCCGTTCT;SOR=0.771;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=146;TCF=84;TCR=62;TR=76;WE=7765503;WS=7765485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,76:0.50:151
chr4	7765617	rs55817815	C	T	857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.993;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=23;PP=499;ReadPosRankSum=-0.326;SC=GGTGGGTGCTCGGCTACTGCA;SOR=0.443;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=71;TCF=24;TCR=47;TR=36;WE=7765625;WS=7765607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,41:0.51:81
chr4	7770723	rs2285761	G	T	2811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-0.974;NF=64;NR=59;PP=1677;ReadPosRankSum=-0.338;SC=GTCCGGTGCCGGAACACTGGA;SOR=0.678;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=238;TCF=127;TCR=111;TR=123;WE=7770731;WS=7770713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,135:0.51:265
chr4	7774610	rs2276967	C	T	979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.067;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=13;PP=550;ReadPosRankSum=-1.340;SC=CGCCCGCCAGCGCTTTCTTCA;SOR=1.244;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=91;TCF=55;TCR=36;TR=43;WE=7774618;WS=7774600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,48:0.48:99
chr4	7783163	rs28542374	G	A	1536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.027;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=26;PP=940;ReadPosRankSum=-0.847;SC=CAGACTGAGCGGAGGCAGGGT;SOR=0.870;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=143;TCF=85;TCR=58;TR=68;WE=7783171;WS=7783153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,75:0.49:152
chr4	7783286	rs10516189	G	A	2168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.051;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=45;PP=1141;ReadPosRankSum=-0.311;SC=ACAGGCCTGCGTTATCATAAA;SOR=0.772;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=172;TCF=92;TCR=80;TR=89;WE=7783294;WS=7783276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,104:0.53:197
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chr4	7820727	rs4447865	T	A	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.718;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=54;ReadPosRankSum=-0.842;SC=TTCTCAGAGATTGTTATCAAA;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=4;WE=7820735;WS=7820717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr4	7840561	.	TCA	T	70	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=70;QD=37.0;SC=ATGAGCAGGTTCACACACACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=2;WE=7840570;WS=7840551;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:11,2:0.15:13
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chr4	7845123	rs62289297	G	C	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=20;PP=534;ReadPosRankSum=-0.708;SC=TCTTTACCTTGAAGTTTACCC;SOR=0.720;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=57;TCF=17;TCR=40;TR=27;WE=7845131;WS=7845113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,28:0.45:62
chr4	7870518	rs34570748	G	A	2507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=72;PP=1532;ReadPosRankSum=-0.804;SC=GCATCTATCAGTTCCTGAACC;SOR=0.711;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=271;TCF=114;TCR=157;TR=122;WE=7870526;WS=7870508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,128:0.44:288
chr4	7995809	.	T	TAAAAGACCTGTCCTGGGTCCCTAAACTGTCTGTCTTTCCAC	1993.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.34;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr4	8000193	.	T	C	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=123;ReadPosRankSum=0.876;SC=TCTGCCCACCTGGGTCCCTGC;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=8;WE=8000201;WS=8000183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr4	8009737	rs16841552	C	T	955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.080;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=8;PP=488;ReadPosRankSum=-0.559;SC=CTCTTTGCCGCGAGGCATTTT;SOR=1.022;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=56;TCF=42;TCR=14;TR=34;WE=8009745;WS=8009727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,42:0.63:67
chr4	8009759	rs17180256	G	A	2827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=65;NR=24;PP=1584;SC=TGCACATCACGGCTCCTTCTT;SOR=1.587;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=65;TCR=24;TR=89;WE=8009767;WS=8009749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr4	8010035	rs116400685	C	T	707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=20;PP=465;ReadPosRankSum=-0.744;SC=ACGAGCTGACCCCACTGTGAG;SOR=0.755;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=43;TCF=13;TCR=30;TR=28;WE=8010043;WS=8010025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,31:0.65:48
chr4	8021417	rs34477140	A	G	1759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FS=1.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.63;ReadPosRankSum=-0.370;SOR=0.570;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,89:0.44:204
chr4	8021478	rs34327175	T	C	1559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.215;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=37;PP=742;ReadPosRankSum=0.904;SC=TACAGCTTTTTGTAAGCAACA;SOR=0.832;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=147;TCF=69;TCR=78;TR=70;WE=8021486;WS=8021468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,81:0.49:167
chr4	8021592	rs13131680	A	C	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.102;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=85;ReadPosRankSum=-1.672;SC=TGCCACCCTCATCTGCAGGAG;SOR=0.082;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=7;WE=8021600;WS=8021582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr4	8031471	rs2385904	A	G	2146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.824;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=36;PP=1284;ReadPosRankSum=0.522;SC=TGGAGGTCCGACACTGCTTGT;SOR=0.742;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=181;TCF=96;TCR=85;TR=89;WE=8031479;WS=8031461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,102:0.50:206
chr4	8034497	rs13151663	G	A	1722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.678;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=45;PP=1039;ReadPosRankSum=-1.505;SC=CAACACAGGCGCAAACACCCA;SOR=0.825;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=194;TCF=93;TCR=101;TR=83;WE=8034505;WS=8034487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,90:0.42:216
chr4	8062638	rs6853485	A	C	3409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=46;PP=2067;SC=GTGTGTGGACATCGAAGAGGG;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=63;TCR=46;TR=109;WE=8062646;WS=8062628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr4	8062689	rs6811028	TG	CA	6402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=57;PP=2947;SC=CATTTTAATTTGTACCTTGAA;SOR=0.707;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=128;TCF=68;TCR=60;TR=119;WE=8062698;WS=8062679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr4	8062871	rs6853901	A	C	349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=11;PP=266;SC=GCATGCCCTGAGCACAGGTAC;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=8062879;WS=8062861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	8108315	rs41266521	C	T	2281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.861;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=50;PP=1357;ReadPosRankSum=-0.419;SC=ACAGGATCGCCGTGCTGGGCG;SOR=0.534;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=220;TCF=107;TCR=113;TR=98;WE=8108323;WS=8108305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,107:0.45:240
chr4	8108471	rs13140321	G	A	768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.375;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.105;NF=18;NR=18;PP=357;ReadPosRankSum=0.522;SC=AGCGGGCCCCGCACCCACCAG;SOR=0.329;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=88;TCF=36;TCR=52;TR=36;WE=8108479;WS=8108461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,41:0.44:93
chr4	8129176	rs78787587	T	C	2927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.906;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=56;PP=1830;ReadPosRankSum=-1.306;SC=CTGAAGCTGATTCATGGAGCT;SOR=0.634;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=262;TCF=154;TCR=108;TR=130;WE=8129184;WS=8129166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,140:0.49:285
chr4	8207083	rs2677605	A	G	726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=15;PP=463;SC=CCAAGGCGCCAGTGAGAGGCG;SOR=1.781;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=9;TCR=15;TR=24;WE=8207091;WS=8207073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	8207154	rs1298878	C	T	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=3;PP=74;ReadPosRankSum=0.027;SC=ACCCCACCCGCCCCGTCCATC;SOR=0.446;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=11;TCF=5;TCR=6;TR=6;WE=8207162;WS=8207144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr4	8211624	rs1712316	C	T	629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=18;PP=445;SC=TCCAAGAGTCCAACCCAGGGC;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=8211632;WS=8211614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr4	8214636	rs1712287	T	C	316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=11;PP=220;SC=TGTCTGAGACTGGGGACACAG;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=8214644;WS=8214626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	8216099	rs2291069	G	A	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.607;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=190;ReadPosRankSum=-0.639;SC=GTCCCCCGCCGGGGCCACATC;SOR=0.160;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=11;WE=8216107;WS=8216089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr4	8216391	rs1618403	C	T	1520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=38;PP=1118;SC=AGATTACAAACTGGTGCTTTG;SOR=2.259;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=13;TCR=38;TR=51;WE=8216399;WS=8216381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr4	8217829	rs1712290	C	A	1438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=32;NR=16;PP=718;SC=CTGGGCCTGGCCTCCACAGGC;SOR=1.199;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=32;TCR=16;TR=48;WE=8217837;WS=8217819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr4	8220029	rs1281138	G	A	2594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.038;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=54;PP=1527;ReadPosRankSum=-1.821;SC=GGACCCCATCGACGATGCCAT;SOR=0.737;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=234;TCF=121;TCR=113;TR=111;WE=8220037;WS=8220019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,125:0.47:266
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chr4	8228632	rs1678300	A	C	2112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.12;SOR=2.880;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr4	8228731	rs1281145	T	C	6703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=135;NR=92;PP=2965;ReadPosRankSum=1.164;SC=TGCCTGAGCCTGGAGCCACAG;SOR=0.355;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=228;TCF=136;TCR=92;TR=227;WE=8228739;WS=8228721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,247:1.00:248
chr4	8228894	rs1292647	T	C	4156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=71;PP=2488;SC=AAGCCGAGGATGACTGGGAGG;SOR=0.861;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=138;TCF=67;TCR=71;TR=138;WE=8228902;WS=8228884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr4	8229218	rs1281146	A	G	5480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.398;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=100;NR=79;PP=2965;ReadPosRankSum=1.374;SC=ACCTGTTCCTAGTGGTGGCTG;SOR=0.522;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=181;TCF=100;TCR=81;TR=179;WE=8229226;WS=8229208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,198:0.99:199
chr4	8229326	rs1281147	T	C	5729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=101;PP=2884;SC=TGGGGACGCCTGACCACATCT;SOR=0.921;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=196;TCF=95;TCR=101;TR=196;WE=8229334;WS=8229316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr4	8229713	rs1281148	A	G	5973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=112;NR=80;PP=2965;SC=TCCCTGCCCAAACTTCCCACT;SOR=0.904;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=192;TCF=112;TCR=80;TR=192;WE=8229721;WS=8229703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr4	8229774	rs1281149	C	T	7627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=136;NR=113;PP=2965;SC=CCAGGCGCTGCGCGGCCCCCT;SOR=0.714;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=249;TCF=136;TCR=113;TR=249;WE=8229782;WS=8229764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,293:1.00:293
chr4	8230070	rs1281150	T	C	2535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=44;NR=38;PP=1221;SC=GGCAGGCAGCTGAGAGCTACT;SOR=0.756;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=44;TCR=38;TR=82;WE=8230078;WS=8230060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr4	8230235	rs1281151	T	C	3246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=58;NR=42;PP=1514;SC=GGCTGCCCCTTGGGGAGTGTG;SOR=0.761;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=101;TCF=58;TCR=43;TR=100;WE=8230243;WS=8230225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr4	8237096	rs1678260	G	C	1392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=33;NR=13;PP=866;SC=GGGGGAGTCCGACCTGGGTGG;SOR=1.565;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=33;TCR=13;TR=46;WE=8237104;WS=8237086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr4	8242466	rs1281103	A	G	6040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=125;NR=81;PP=2965;SC=TGGCGCTGGCAGCCGCCGTGG;SOR=1.054;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=207;TCF=126;TCR=81;TR=206;WE=8242474;WS=8242456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr4	8242499	rs1048506	G	A	3416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=62;PP=1969;ReadPosRankSum=-0.186;SC=AGAAGGCACAGCTGAAGATCT;SOR=0.689;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=285;TCF=164;TCR=121;TR=150;WE=8242507;WS=8242489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,165:0.52:317
chr4	8242740	rs8153	G	C	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.368;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=127;ReadPosRankSum=0.086;SC=TGCCTCTCCTGGTGTCGCCGG;SOR=4.003;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=8;WE=8242748;WS=8242730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr4	8288581	rs7678398	A	C	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=299;ReadPosRankSum=0.987;SC=AGACGCCGGAACCCAGAGGCA;SOR=0.675;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=9;TCR=35;TR=19;WE=8288589;WS=8288571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,21:0.45:47
chr4	8288612	rs7678420	A	G	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=132;ReadPosRankSum=-0.441;SC=ACCTTCCATCAGCCAGGGGGA;SOR=0.346;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=8;WE=8288620;WS=8288602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr4	8293974	rs4235258	C	T	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.397;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=150;ReadPosRankSum=0.654;SC=TGGTTAGAGGCAGATCTGGAG;SOR=0.350;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=35;TCF=24;TCR=11;TR=15;WE=8293982;WS=8293964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,16:0.42:38
chr4	8304038	rs4696797	T	C	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=305;ReadPosRankSum=0.484;SC=GCAGCTTTGCTGGACCGCAGG;SOR=1.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=14;WE=8304046;WS=8304031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr4	8304097	rs4696798	G	T	1154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.910;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=10;PP=710;ReadPosRankSum=1.452;SC=TCCTGGTCCTGCAGGGGAACT;SOR=0.446;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=101;TCF=83;TCR=18;TR=45;WE=8304105;WS=8304087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,50:0.44:113
chr4	8306028	rs4696801	C	T	1388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.463;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=39;PP=925;ReadPosRankSum=-1.154;SC=CAGAGGAGATCGCTCGAGGCA;SOR=0.907;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=117;TCF=45;TCR=72;TR=61;WE=8306036;WS=8306018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,64:0.50:128
chr4	8306091	rs4696802	T	C	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.643;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=405;ReadPosRankSum=-0.964;SC=TCATGTGACCTTGAGCTTCCC;SOR=2.165;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=40;TCF=5;TCR=35;TR=19;WE=8306099;WS=8306081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr4	8358192	rs7657076	A	T	1579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=18;PP=994;ReadPosRankSum=0.863;SC=AGTTTGCTAAACTTGTACATT;SOR=0.674;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=129;TCF=90;TCR=39;TR=62;WE=8358200;WS=8358182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,72:0.50:145
chr4	8358361	rs3733532	G	A	3259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.405;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=77;PP=2005;ReadPosRankSum=-1.008;SC=CAGGTGAGAGGAAGAAAGTGT;SOR=0.726;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=299;TCF=133;TCR=166;TR=138;WE=8358369;WS=8358351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,154:0.48:323
chr4	8454469	.	GA	G	46.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.955;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=2.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.46;ReadPosRankSum=0.868;SOR=0.175;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,7:0.22:32
chr4	8456701	rs2002860	C	G	1309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=32;PP=949;SC=GAAAAAGAGACATGAAACTAG;SOR=2.409;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=10;TCR=32;TR=42;WE=8456709;WS=8456691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr4	8473050	rs2631768	G	A	676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.854;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=19;PP=431;ReadPosRankSum=0.000;SC=AGCAAGTTCCGCGGTGCCCCA;SOR=0.321;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=58;TCF=20;TCR=38;TR=32;WE=8473058;WS=8473040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,33:0.54:61
chr4	8582742	rs17844776	C	T	1609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=16;PP=938;SC=TGGCGGGTCTCCTGGTGATGG;SOR=1.278;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=37;TCR=16;TR=53;WE=8582750;WS=8582732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr4	8582856	rs17844777	T	G	3375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=47;PP=2012;SC=TGAATCTGTCTCTGGGCCACC;SOR=0.790;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=66;TCR=47;TR=113;WE=8582864;WS=8582846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr4	8583312	rs17844778	A	C	6460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=111;NR=86;PP=2965;SC=TGGCACGCAGACACTGCCAGC;SOR=0.778;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=198;TCF=112;TCR=86;TR=197;WE=8583320;WS=8583302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr4	8584448	rs6824455	T	C	4955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=104;PP=2965;SC=CCTCTGAGGTTTCCCAGCAAG;SOR=1.439;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=168;TCF=63;TCR=105;TR=167;WE=8584456;WS=8584438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr4	8584493	rs6857501	C	T	2301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=56;PP=1621;SC=GAGGACCCTCCTCCACACCTG;SOR=2.332;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=19;TCR=56;TR=75;WE=8584501;WS=8584483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr4	8584511	rs6857510	C	A	1620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=43;PP=1229;SC=CTGACGGGCTCAGGGCTGTGC;SOR=2.876;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=10;TCR=43;TR=53;WE=8584519;WS=8584501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr4	8594572	rs76756393	G	C	780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=2.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.93;ReadPosRankSum=2.007;SOR=0.304;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,35:0.71:49
chr4	8594574	rs2302583	T	C	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.825;HP=1;HapScore=3;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=354;ReadPosRankSum=-1.762;SC=CCGCCCCCGCTGCCGCTGCTG;SOR=1.270;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=42;TCF=30;TCR=12;TR=13;WE=8594582;WS=8594562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,14:0.28:50
chr4	8594616	rs79736750	G	C	990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.036;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=12;PP=476;ReadPosRankSum=1.819;SC=GCCGCTGCCCGGCCGGGGTGC;SOR=0.445;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=64;TCF=46;TCR=18;TR=40;WE=8594624;WS=8594606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,47:0.60:78
chr4	8594815	rs4411969	T	G	720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.786;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=22;PP=459;ReadPosRankSum=-2.271;SC=GGACTGGTAGTGTGACCTCTC;SOR=1.236;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=55;TCF=22;TCR=33;TR=34;WE=8594823;WS=8594805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,35:0.61:57
chr4	8601470	rs151215420	CCT	C	252.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=205;ReadPosRankSum=0.926;SC=CCTCTCCATCCCTCTCCAGTC;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=6;WE=8601479;WS=8601460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr4	8602793	rs4299567	T	C	646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.12;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	8602793	.	TGCGTG	CGCGTC,CGCGTG	242	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=11,15;NR=0,0;PP=242,38;QD=26.8607158966;SC=AAATGTCTGATGCGTGACGGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=11,15;WE=8602806;WS=8602783;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.73:15
chr4	8602798	rs2241069	G	C	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.74;ReadPosRankSum=-0.925;SOR=2.049;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr4	8602816	rs4594711	A	G	875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=19;NR=4;PP=456;SC=GGGCCACTGCAGGAGGGACTG;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=23;WE=8602824;WS=8602806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr4	8602884	rs4301095	T	C	2623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=33;PP=1548;SC=GGACCTGCAGTGATGCCGCCT;SOR=1.251;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=57;TCR=33;TR=90;WE=8602892;WS=8602874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr4	8602935	rs4431213	A	G	4714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=71;PP=2755;SC=AGCACCGGTCATGGGAGGTGG;SOR=0.947;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=167;TCF=96;TCR=71;TR=167;WE=8602943;WS=8602925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr4	8603117	rs35993494	A	T	3249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=61;PP=1749;ReadPosRankSum=0.304;SC=GAGGTCTGCCAGCCCGCCTTC;SOR=0.700;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=277;TCF=145;TCR=132;TR=128;WE=8603125;WS=8603107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,154:0.48:324
chr4	8607587	rs4696703	G	A	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.129;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=303;ReadPosRankSum=0.646;SC=ATATACAGAGGTTCTTGAGTC;SOR=0.184;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=16;WE=8607595;WS=8607577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr4	8608634	rs2302580	C	T	1215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.842;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=33;PP=774;ReadPosRankSum=0.955;SC=AGGTAGGAGCCGCCGCTGCCC;SOR=0.804;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=82;TCF=23;TCR=59;TR=45;WE=8608642;WS=8608624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,52:0.52:100
chr4	8608934	rs2302579	C	T	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.89;ReadPosRankSum=0.191;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr4	8608979	rs2302578	G	A	1030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.988;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=11;PP=715;ReadPosRankSum=0.042;SC=GGGCGGCCTCGTCTGTCCTGG;SOR=0.506;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=76;TCF=58;TCR=18;TR=43;WE=8608987;WS=8608969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,45:0.56:81
chr4	8613917	rs12511563	C	G	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;BaseQRankSum=3.087;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.616;HP=9;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=23;ReadPosRankSum=2.744;SC=CGGGACTGGGCGGGGGGTGGG;SOR=0.169;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=3;WE=8613925;WS=8613907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr4	8613918	rs12508541	G	T	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=2.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.65;ReadPosRankSum=2.744;SOR=0.169;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr4	8616054	rs2302572	C	T	1616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=6;PP=765;SC=GCGGCTGACACCCCTGACGTC;SOR=2.712;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=35;WE=8616062;WS=8616044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr4	8616070	rs2302571	T	C	2768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=12;PP=989;SC=ACGTCCCCGCTGTCTCTGTGC;SOR=1.961;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=39;TCR=12;TR=51;WE=8616078;WS=8616060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr4	8616096	rs1131140	T	C	3512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=25;PP=1672;SC=GCATGTCCGATTTCAACTACC;SOR=1.634;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=61;TCR=25;TR=86;WE=8616104;WS=8616086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr4	8616179	rs7378066	T	C	6255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=117;NR=87;PP=2965;ReadPosRankSum=0.491;SC=GCCCTGTACATACTCTGGCAG;SOR=0.312;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=205;TCF=118;TCR=87;TR=204;WE=8616187;WS=8616169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,230:1.00:231
chr4	8620045	rs4444816	A	G	1463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=7;PP=1159;SC=TCTGTGGGGTAGTTCCCCCTA;SOR=2.885;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=35;TCR=7;TR=42;WE=8620053;WS=8620035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr4	8620325	rs4696872	A	G	1091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=33;PP=704;ReadPosRankSum=0.693;SC=GGCAGCCGGCACCCTCAGGCA;SOR=0.668;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=86;TCF=17;TCR=69;TR=42;WE=8620333;WS=8620315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,47:0.49:95
chr4	8620873	rs13132404	G	A	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=101;ReadPosRankSum=-0.812;SC=AGAGGCAAGTGCACATTTGGC;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=6;WE=8620881;WS=8620863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr4	8621194	rs28514374	A	G	5903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=107;PP=2965;SC=CCCACGACCCACTGGGAGGTG;SOR=0.986;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=197;TCF=90;TCR=107;TR=197;WE=8621202;WS=8621184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
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chr4	9783954	.	G	C	1178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.502;ClippingRankSum=0.000;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.299;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.968;NF=32;NR=23;PP=817;ReadPosRankSum=-0.192;SC=GAAGGCAGTCGCCGAGGTGGC;SOR=0.922;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=117;TCF=65;TCR=52;TR=55;WE=9783962;WS=9783944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,58:0.48:122
chr4	9784157	.	C	T	1645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.663;ClippingRankSum=0.000;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.161;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=26;PP=887;ReadPosRankSum=0.795;SC=GGACCTTGTCCATCCTCATCT;SOR=1.047;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=120;TCF=68;TCR=52;TR=67;WE=9784165;WS=9784147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,75:0.57:132
chr4	9784631	rs6283	C	T	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.225;NF=23;NR=16;PP=462;ReadPosRankSum=0.115;SC=GTGGACACCCCGAAGGCCCTC;SOR=0.757;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=93;TCF=54;TCR=39;TR=39;WE=9784639;WS=9784621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,44:0.43:102
chr4	9889448	rs6818572	G	A	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=148;ReadPosRankSum=0.486;SC=CACTCCATCTGCTTATTTTAT;SOR=1.329;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=11;WE=9889456;WS=9889438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr4	9892102	rs10939602	T	C	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=102;ReadPosRankSum=0.184;SC=AGATGAGATGTCCCCGGGGAG;SOR=0.518;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=10;WE=9892110;WS=9892092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,13:0.37:35
chr4	9909923	rs2280205	G	A	5857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=105;NR=95;PP=2965;ReadPosRankSum=0.589;SC=GATCTTTGCCGGAGGGATCCC;SOR=0.759;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=202;TCF=106;TCR=96;TR=200;WE=9909931;WS=9909913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,219:0.99:221
chr4	9922130	rs3733591	C	T	2503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=45;PP=1327;ReadPosRankSum=0.172;SC=CCTCTGCACGCGGCTCTCAGC;SOR=0.725;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=214;TCF=119;TCR=95;TR=104;WE=9922138;WS=9922120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,119:0.50:236
chr4	9922167	rs16890979	C	T	2765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.453;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=56;PP=1492;ReadPosRankSum=-0.130;SC=TCTTGGGAAACGTCTGCTTTA;SOR=0.643;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=228;TCF=119;TCR=109;TR=120;WE=9922175;WS=9922157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,136:0.53:259
chr4	9982330	rs13125646	A	G	2158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=43;PP=1262;ReadPosRankSum=0.849;SC=AGATCTCACTAAGGTACATGG;SOR=0.723;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=237;TCF=129;TCR=108;TR=97;WE=9982338;WS=9982320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,109:0.41:269
chr4	10079377	rs34193855	C	T	1025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.739;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=16;PP=583;ReadPosRankSum=-1.460;SC=CGCCACTCACCGAGTAGCCGT;SOR=0.435;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=89;TCF=62;TCR=27;TR=46;WE=10079385;WS=10079367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,50:0.51:99
chr4	10090178	rs4235349	T	C	6844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=130;NR=101;PP=2965;SC=GGGAGGGCGATGTCTAAGTTC;SOR=0.982;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=231;TCF=130;TCR=101;TR=231;WE=10090186;WS=10090168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chr4	10094671	rs3822247	G	A	5640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.360;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=117;NR=84;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.388;SC=TCTCACCACCGAGGAAACCGA;SOR=0.777;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=206;TCF=119;TCR=87;TR=201;WE=10094679;WS=10094661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,218:0.99:221
chr4	10094783	rs3822245	T	C	5898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=115;PP=2965;SC=AGCACACACATGCTCACTACC;SOR=1.042;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=198;TCF=83;TCR=115;TR=198;WE=10094791;WS=10094773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr4	10099340	rs13441	T	C	2061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=38;NR=29;PP=1202;SC=CTTACGCCAATTGTGAACTTG;SOR=0.892;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=38;TCR=29;TR=67;WE=10099348;WS=10099330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr4	10100801	rs2241484	T	C	406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.93;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	10100812	rs2241485	A	G	188.79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=5;NR=7;PP=279;SC=GGTGGGGTAAAGGGCAGGGGG;SOR=1.179;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=12;WE=10100820;WS=10100791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	10105739	rs3756224	C	T	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.378;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=10;PP=212;ReadPosRankSum=2.076;SC=GTGAAGAAAACCGCAGAAGCA;SOR=0.352;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=35;TCF=12;TCR=23;TR=17;WE=10105747;WS=10105729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr4	10105797	rs3756223	T	C	262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=6;PP=141;SC=CTCTGGGTGATAGAATTTCAT;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=10105805;WS=10105787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	10117728	rs35782983	G	A	2566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=43;PP=1497;ReadPosRankSum=0.936;SC=CGGGGTAGGGGGTACTCACGT;SOR=0.722;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=241;TCF=143;TCR=98;TR=110;WE=10117736;WS=10117718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,124:0.48:260
chr4	10118350	rs34768406	C	A	3968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=68;NR=65;PP=2209;SC=GCCCGCGCTGCGAATTACACC;SOR=0.789;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=133;TCF=68;TCR=65;TR=133;WE=10118358;WS=10118340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr4	10118377	rs11557743	C	G	3108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=51;PP=1652;SC=AGGCCGAGCCCGGGGACTGGA;SOR=0.877;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=101;TCF=50;TCR=51;TR=101;WE=10118385;WS=10118367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr4	10446385	rs9291410	C	T	7200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=127;NR=102;PP=2965;SC=CTGCTGTGAGCTACTGTGTAA;SOR=0.780;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=229;TCF=127;TCR=102;TR=229;WE=10446393;WS=10446375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,263:1.00:263
chr4	10447168	rs66538112	C	G	8370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=145;NR=113;PP=2965;SC=GAGAGAGAAACCTGACAGTTG;SOR=0.882;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=259;TCF=145;TCR=114;TR=258;WE=10447176;WS=10447158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,298:1.00:298
chr4	10492187	rs189381725	A	G	1062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=28;PP=740;ReadPosRankSum=1.726;SC=CAATTAGTATAATGGGAAAAT;SOR=0.706;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=82;TCF=33;TCR=49;TR=46;WE=10492195;WS=10492177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,48:0.52:93
chr4	10502937	rs2903960	T	G	5633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=117;NR=75;PP=2965;SC=CCAGGAAGCGTATTTTTACAT;SOR=1.134;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=192;TCF=117;TCR=75;TR=192;WE=10502945;WS=10502927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr4	10542058	rs1962796	C	G	1209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=0.663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.38;ReadPosRankSum=0.069;SOR=0.606;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,58:0.45:129
chr4	10573410	rs17383033	C	A	8266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=138;NR=130;PP=2965;SC=GGCCTGCCAACACAAACAGAC;SOR=0.739;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=268;TCF=138;TCR=130;TR=268;WE=10573418;WS=10573400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,309:1.00:309
chr4	10586376	rs6816045	C	G	712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=1;PP=563;SC=AAGCTTTGGACAGTCACAGAT;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=10586384;WS=10586366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	10586530	rs6846414	T	C	10352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=407;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=185;NR=176;PP=2965;ReadPosRankSum=1.283;SC=ACCACTTAGGTGACAGAGAGC;SOR=0.698;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=363;TCF=186;TCR=177;TR=361;WE=10586538;WS=10586520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,405:1.00:407
chr4	10669522	rs13136927	A	C	1817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=36;PP=1051;ReadPosRankSum=-0.530;SC=GGTAAGAGGGATCTTCAATTC;SOR=0.675;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=183;TCF=99;TCR=84;TR=81;WE=10669530;WS=10669512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,90:0.45:199
chr4	13475825	rs116326180	C	T	1832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-2.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.269;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=38;PP=991;ReadPosRankSum=0.866;SC=ATTCTCTCTACGTATCAGATA;SOR=0.462;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=153;TCF=85;TCR=68;TR=80;WE=13475833;WS=13475815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,91:0.51:180
chr4	13545792	rs9684692	G	T	1413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.218;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=27;PP=720;ReadPosRankSum=-0.746;SC=TCCGCAGTCCGCCCCGCAGCT;SOR=0.421;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=125;TCF=58;TCR=67;TR=57;WE=13545800;WS=13545782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,69:0.49:141
chr4	13548796	rs2080023	T	G	7923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=128;NR=139;PP=2965;SC=GAGGTGGTTGTATGCCCAGAG;SOR=0.824;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=268;TCF=129;TCR=139;TR=267;WE=13548804;WS=13548786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,290:1.00:290
chr4	13578405	rs2052159	A	G	563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=2;PP=451;SC=ACCCAGAGCAATTTTCAGATG;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=13578413;WS=13578395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	13578682	rs7695814	A	G	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=274;ReadPosRankSum=2.605;SC=AGAGAGAGTCATGGAGTTTAG;SOR=0.704;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=35;TCF=11;TCR=24;TR=17;WE=13578690;WS=13578672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,17:0.46:37
chr4	13589495	rs13104252	G	A	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.862;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=219;ReadPosRankSum=-2.659;SC=GGAATAAGTTGATATATAAAT;SOR=1.230;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=13;WE=13589503;WS=13589485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr4	13590438	rs142952587	G	GA	359.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.237;HP=15;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=121;ReadPosRankSum=-0.790;SC=ATACAAAAAAGAAAAAAAAAT;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=9;WE=13590446;WS=13590428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr4	13593336	rs758975	A	G	130.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=1;PP=89;SC=AAAGTTCTTTATCAGTGGGTA;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=13593344;WS=13593326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	13602229	rs144175591	G	C	1573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.314;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=32;PP=1034;ReadPosRankSum=0.048;SC=TCAGTTCTCAGAGCATCTGAG;SOR=0.708;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=134;TCF=70;TCR=64;TR=65;WE=13602237;WS=13602219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,71:0.49:144
chr4	13606576	rs1971278	A	T	2066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.474;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=37;PP=1059;ReadPosRankSum=0.919;SC=TCTCTTTCTAATTTGGATTCA;SOR=0.649;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=210;TCF=119;TCR=91;TR=88;WE=13606584;WS=13606566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,106:0.45:238
chr4	13615293	rs2109917	C	A	1209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.606;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=39;PP=764;ReadPosRankSum=-1.486;SC=AATCTTCAAGCGGAAAATAAA;SOR=0.630;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=158;TCF=55;TCR=103;TR=60;WE=13615301;WS=13615283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,64:0.37:171
chr4	13629437	rs34798341	G	T	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.275;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=262;ReadPosRankSum=2.010;SC=AGTTTCGACCGTCGCCGGGCG;SOR=0.484;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=40;TCF=31;TCR=9;TR=20;WE=13629445;WS=13629427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,20:0.45:44
chr4	13629721	rs12499127	G	A	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.238;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=209;ReadPosRankSum=0.982;SC=ATAGACATTTGTAATGCGAAC;SOR=1.329;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=54;TCF=18;TCR=36;TR=17;WE=13629729;WS=13629711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,18:0.31:58
chr4	15004655	rs7435318	G	A	9085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=127;NR=154;PP=2965;SC=GAAACTCCCCGACCACCACCC;SOR=1.000;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=282;TCF=127;TCR=155;TR=281;WE=15004663;WS=15004645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,333:1.00:333
chr4	15005604	rs112476821	G	A	5061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=109;NR=64;PP=2814;SC=GGCTCGCTCAGCGCCATGCCG;SOR=1.138;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=173;TCF=109;TCR=64;TR=173;WE=15005612;WS=15005594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr4	15009232	rs1874207	C	T	1098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=32;PP=911;SC=ATGTAAATGACCTTATCTCTA;SOR=4.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=34;WE=15009240;WS=15009222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr4	15055673	rs34991223	C	T	534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=1;PP=437;SC=AATGTTAAATCTTCATAGTAA;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=15055681;WS=15055663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	15443685	rs13108125	T	G	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.403;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=102;ReadPosRankSum=1.655;SC=CACTGTTAAATGTTGCCTGAA;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=6;WE=15443693;WS=15443675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr4	15480225	rs9993580	A	C	399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=1;PP=325;SC=ACTGTCCCCCAACTCACACTC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=15480233;WS=15480215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	15482477	rs10000250	A	G	2841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=45;PP=1462;SC=CCATTCAGCTACTGCTTGTTA;SOR=1.043;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=40;TCR=45;TR=85;WE=15482485;WS=15482467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr4	15482809	rs6810461	G	A	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=11;PP=227;ReadPosRankSum=-0.781;SC=TTCTTGCTCTGTTCACTCACA;SOR=0.596;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=53;TCF=28;TCR=25;TR=24;WE=15482817;WS=15482799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,27:0.45:60
chr4	15513147	rs1058412	C	T	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=148;ReadPosRankSum=-0.587;SC=AACCTGCCACCACCAGGAGAA;SOR=0.604;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=36;TCF=11;TCR=25;TR=16;WE=15513155;WS=15513137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,22:0.52:42
chr4	15530124	rs4698395	C	A	672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.324;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=3;PP=469;ReadPosRankSum=-0.781;SC=GATGCTTGAACATCCGTTCCA;SOR=1.675;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=44;TCF=37;TCR=7;TR=24;WE=15530132;WS=15530114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,27:0.51:53
chr4	15538744	rs1558572	T	G	938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=27;PP=684;ReadPosRankSum=2.151;SC=GGCCAGGAAGTGTCTGGGAGG;SOR=0.616;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=61;TCF=16;TCR=45;TR=37;WE=15538752;WS=15538734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,38:0.60:63
chr4	15539498	rs1861044	A	G	2742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.472;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=45;PP=1673;ReadPosRankSum=-1.054;SC=CCTGTTTGATATCATGTTGCC;SOR=0.915;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=228;TCF=135;TCR=93;TR=114;WE=15539506;WS=15539488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,129:0.50:257
chr4	15568992	rs13121363	T	C	1333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=21;PP=798;ReadPosRankSum=0.636;SC=ATACATTTTCTCTCCTAGCAA;SOR=0.657;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=117;TCF=76;TCR=41;TR=58;WE=15569000;WS=15568982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,67:0.50:133
chr4	15569018	rs73125627	G	A	1969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.546;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=35;PP=1162;ReadPosRankSum=0.072;SC=AGCAGCCGTCGAGGTCTTCAA;SOR=0.751;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=164;TCF=97;TCR=67;TR=89;WE=15569026;WS=15569008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,97:0.53:182
chr4	15569146	rs13116304	A	C	1195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.759;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=33;PP=659;ReadPosRankSum=-0.442;SC=TTGCCCCTTAAGTTTTTAAGA;SOR=0.912;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=144;TCF=71;TCR=73;TR=60;WE=15569154;WS=15569136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,66:0.40:167
chr4	15569453	.	G	A	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.943;ClippingRankSum=0.000;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=0.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.45;ReadPosRankSum=-0.881;SOR=0.552;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:128,38:0.23:166
chr4	15575718	rs4280723	C	G	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.571;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=124;ReadPosRankSum=0.471;SC=ACTTGCCTCTCAACTTCTGTT;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=7;WE=15575726;WS=15575708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr4	15575751	rs4280724	C	T	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.821;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=242;ReadPosRankSum=0.799;SC=AGGATGTTTACCAAGTCATAT;SOR=1.981;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=15;WE=15575759;WS=15575741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr4	15587897	rs6832789	A	T	5740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=126;PP=2965;SC=ACAGATTTAGAAACTTGAGCT;SOR=1.438;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=195;TCF=69;TCR=126;TR=195;WE=15587905;WS=15587887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr4	15589345	rs28419165	C	T	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=30;ReadPosRankSum=0.469;SC=CACTTCAAGACACTAACCTCT;SOR=0.368;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=5;WE=15589353;WS=15589335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr4	15602773	rs80080596	C	CTTA	1096.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=3;PP=1019;SC=ATCCAGAACACTTATCTTAAT;SOR=4.091;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=20;WE=15602781;WS=15602763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	15603069	rs1134634	G	C	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=219;ReadPosRankSum=0.830;SC=TGTACTTTCTGTATCATGTAA;SOR=0.283;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=12;WE=15603077;WS=15603059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr4	15657036	rs184805452	C	T	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=108;ReadPosRankSum=-0.955;SC=CGCGCCCGGTCGGCTTGGCCG;SOR=0.293;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=7;WE=15657044;WS=15657026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr4	15689928	rs4235380	G	A	1796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=36;PP=983;ReadPosRankSum=0.020;SC=AATGAACTGAGTTTAAAACTA;SOR=0.732;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=137;TCF=74;TCR=63;TR=78;WE=15689936;WS=15689918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,85:0.57:148
chr4	15690233	rs6449160	C	A	5482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=110;NR=69;PP=2965;SC=TGCTTTTCGACACCCTGAATC;SOR=1.106;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=180;TCF=111;TCR=69;TR=179;WE=15690241;WS=15690223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr4	15717321	rs3213710	G	A	2091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=19;PP=1196;SC=TTCAAGAAATGTTTCTCAGTT;SOR=1.550;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=48;TCR=19;TR=67;WE=15717329;WS=15717311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr4	15737882	rs4698413	C	T	3284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=70;PP=2028;SC=CTGAGTGCATCGTCCTCTTGC;SOR=1.495;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=41;TCR=70;TR=111;WE=15737890;WS=15737872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr4	15739488	rs4283655	A	G	1538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=27;PP=859;SC=CTCCCACAGCAAGGAAGCCGA;SOR=1.567;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=17;TCR=27;TR=44;WE=15739496;WS=15739478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr4	15818391	rs3796868	G	A	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=199;ReadPosRankSum=-1.151;SC=AGTGTGGTTGGTAGGAATGGA;SOR=0.495;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=13;WE=15818399;WS=15818381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,13:0.37:35
chr4	15849986	rs3796863	G	T	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=154;ReadPosRankSum=-0.353;SC=TTTTTGACCAGCAGGTGGCAT;SOR=1.022;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=11;WE=15849994;WS=15849976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr4	15937526	rs1042510	G	A	1598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.610;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=26;PP=1089;ReadPosRankSum=0.268;SC=CATCTCTTAAGGGAACCCGTT;SOR=0.760;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=140;TCF=90;TCR=50;TR=69;WE=15937534;WS=15937516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,74:0.49:150
chr4	15937731	rs2072313	T	C	2510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.134;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=42;PP=1564;ReadPosRankSum=0.493;SC=TCTCTTTGCCTTTGATGTGCT;SOR=0.495;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=189;TCF=113;TCR=76;TR=100;WE=15937739;WS=15937721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,112:0.53:210
chr4	15964040	rs2286460	G	A	1833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.651;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=27;PP=970;ReadPosRankSum=-0.164;SC=CTCTGTATATGAGTAAAGGAA;SOR=0.613;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=79;TCR=46;TR=73;WE=15964048;WS=15964030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,82:0.59:138
chr4	15964485	rs758329	G	A	1106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=21;PP=686;ReadPosRankSum=0.137;SC=TTCCAGTAAGGTTTGGGGTCA;SOR=0.655;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=69;TCR=49;TR=50;WE=15964493;WS=15964475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,54:0.42:129
chr4	15964501	rs2286459	G	A	1691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=29;PP=1042;ReadPosRankSum=-1.246;SC=GGTCAGCAGCGAAAGCCTGGC;SOR=0.698;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=124;TCF=74;TCR=50;TR=72;WE=15964509;WS=15964491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,78:0.59:133
chr4	15964573	rs758328	A	G	5267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=104;NR=76;PP=2965;SC=GGCAGTCGACACGAAGCCAGA;SOR=0.988;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=180;TCF=104;TCR=76;TR=180;WE=15964581;WS=15964563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr4	15964763	rs4698432	C	T	630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=471;ReadPosRankSum=1.261;SC=GGCGATACTCCGATAAACTTG;SOR=0.582;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=54;TCF=15;TCR=39;TR=29;WE=15964771;WS=15964753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,29:0.51:57
chr4	15972905	rs11735976	T	C	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.395;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=120;ReadPosRankSum=-0.451;SC=AAAAACAGCATAGAAGATAAA;SOR=1.002;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=40;TCF=10;TCR=30;TR=10;WE=15972913;WS=15972895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,16:0.34:47
chr4	15977572	rs11734657	T	C	454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=1;PP=354;SC=ACCCTTGGAGTTCTACTATAG;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=15977580;WS=15977562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	15977731	rs3796861	C	T	1775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.198;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=33;PP=963;ReadPosRankSum=-0.328;SC=CAATGTCTGTCGTAAGCAGAA;SOR=0.583;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=149;TCF=85;TCR=64;TR=75;WE=15977739;WS=15977721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,85:0.50:169
chr4	15977823	rs3796860	A	C	1873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=3.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.73;ReadPosRankSum=0.356;SOR=0.444;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,50:0.45:112
chr4	15977828	rs3796859	C	G	1854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=6.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.17;ReadPosRankSum=0.189;SOR=0.333;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,50:0.46:108
chr4	15977980	rs3796858	C	A	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=29;ReadPosRankSum=1.282;SC=GCTGTTCCAGCAATGTGAGTA;SOR=0.148;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=4;WE=15977988;WS=15977970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr4	15980975	rs11725522	G	A	3031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.409;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=68;PP=1924;ReadPosRankSum=-0.024;SC=GAGATGAGACGGTTTATCATA;SOR=0.728;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=286;TCF=146;TCR=140;TR=136;WE=15980983;WS=15980965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,146:0.46:314
chr4	15981885	rs3841512	G	GA	190.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.84;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	15982163	rs34269395	A	AG	314.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=0.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=181;ReadPosRankSum=0.742;SC=AACAAATTCTAGGAAAAAAAA;SOR=0.542;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=41;TCF=4;TCR=37;TR=15;WE=15982174;WS=15982153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,17:0.36:47
chr4	15982166	rs6449209	A	G	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.23;ReadPosRankSum=-0.621;SOR=0.872;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,30:0.64:47
chr4	15982230	rs7668131	T	A	125.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.18;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	15985984	rs3815344	G	C	1457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.207;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=36;PP=756;ReadPosRankSum=-0.828;SC=CTGATCTAGGGGGGTGGAAAC;SOR=0.819;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=162;TCF=72;TCR=90;TR=65;WE=15985992;WS=15985974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,74:0.42:175
chr4	15986042	rs7675574	G	A	2229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=49;PP=1467;SC=GGAATGAGACGTGCCATTTAC;SOR=1.795;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=24;TCR=49;TR=73;WE=15986050;WS=15986032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr4	15986113	rs7659341	T	C	906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=26;PP=607;SC=CCCCAACTCCTGGGTCACAGA;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=30;WE=15986121;WS=15986103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr4	15987509	.	T	TTTAAG	578.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=48.23;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	15987512	.	T	TGCTTATTTAATCTGTATTAAATATTTAATACAGATAA	1312.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=93.77;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	15989190	rs139574888	TC	T	847.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.552;HP=8;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=5;PP=397;ReadPosRankSum=0.270;SC=GCTTTTTTTTTCAACTTAAAG;SOR=1.133;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=55;TCF=42;TCR=13;TR=31;WE=15989199;WS=15989180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,41:0.68:60
chr4	15989191	rs2191004	C	T	279.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=1.552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.66;ReadPosRankSum=-0.239;SOR=0.389;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,19:0.32:60
chr4	15991275	rs2240685	G	A	1273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=4.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.443;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=15;PP=847;ReadPosRankSum=0.366;SC=AGCATGTGTCGTGAGGCTAAA;SOR=0.853;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=119;TCF=82;TCR=37;TR=52;WE=15991283;WS=15991265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,58:0.43:135
chr4	16002050	rs6449212	T	C	1511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=8;PP=1120;SC=CTTAAAGTAATGCACAATATA;SOR=2.970;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=40;TCR=8;TR=48;WE=16002058;WS=16002040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr4	16002288	rs17478107	T	C	1183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=28;PP=677;ReadPosRankSum=-1.422;SC=AATGATTCAATATTACCTACT;SOR=0.749;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=75;TCF=20;TCR=55;TR=39;WE=16002296;WS=16002278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,48:0.56:86
chr4	16024885	rs2013854	A	G	1203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.198;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=17;PP=827;ReadPosRankSum=-0.268;SC=AAGAGTGAGCAAGCCTGCCAA;SOR=1.081;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=137;TCF=95;TCR=42;TR=57;WE=16024893;WS=16024875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,62:0.42:149
chr4	16025837	rs17478336	C	T	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.229;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=342;ReadPosRankSum=2.842;SC=CTTTCACGTACGTCATTTCTT;SOR=0.960;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=22;WE=16025845;WS=16025827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,25:0.51:49
chr4	16026696	rs17478392	C	T	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=139;ReadPosRankSum=0.556;SC=ACAGATAACACCAGTCTACGC;SOR=0.914;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=9;WE=16026704;WS=16026687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr4	16037352	rs2078622	C	T	1720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.374;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=34;PP=1154;ReadPosRankSum=1.096;SC=CAGACAAGGACTTTACCTTTA;SOR=0.869;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=195;TCF=113;TCR=82;TR=85;WE=16037360;WS=16037342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,90:0.42:213
chr4	16164453	rs1046234	G	C	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.167;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=403;ReadPosRankSum=0.927;SC=CTTGACTTATGTTTAATTTTT;SOR=1.811;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=19;WE=16164461;WS=16164443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,20:0.54:37
chr4	16192413	rs7666361	C	T	887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.686;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=19;PP=499;ReadPosRankSum=-0.387;SC=GATTTTCATACGCTGAATGCT;SOR=0.776;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=107;TCF=58;TCR=49;TR=43;WE=16192421;WS=16192403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,48:0.40:120
chr4	16215537	rs12651110	T	G	3012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.878;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=69;PP=1879;ReadPosRankSum=1.137;SC=GAAAAGAAAATGACAGAAAAC;SOR=0.639;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=279;TCF=131;TCR=148;TR=132;WE=16215545;WS=16215527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,143:0.48:297
chr4	16227781	rs3749543	A	G	295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=1;PP=142;SC=AGGCAACGGCAGCCGCGCGGC;SOR=1.981;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=16227789;WS=16227771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	16597280	rs1506462	T	A	454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=1;PP=365;SC=TCTTTAATGCTCTCAGAGTAG;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=16597288;WS=16597270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	16675898	rs4698505	C	A	770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.356;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=18;PP=436;ReadPosRankSum=-2.268;SC=TCCGAATCCCCGAGCTGGTTG;SOR=0.540;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=142;TCF=74;TCR=68;TR=40;WE=16675906;WS=16675888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,48:0.29:166
chr4	16676046	rs7699941	A	C	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.744;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=40;ReadPosRankSum=-0.414;SC=GTGATAATTCAGGAGCACCCA;SOR=0.293;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=6;WE=16676054;WS=16676036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr4	16753863	rs283027	A	C	70.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=0;PP=50;SC=TCAGTGAACAAGATACAGAGC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=16753871;WS=16753853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr4	17489003	rs2597767	T	C	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.729;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=156;ReadPosRankSum=-0.115;SC=CTGGGCGCCATGGCTCACACC;SOR=1.142;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=48;TCF=16;TCR=32;TR=15;WE=17489011;WS=17488993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,15:0.30:50
chr4	17492145	rs731437	T	C	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=211;ReadPosRankSum=-1.170;SC=TGATGTGCAATGCATCCTCAG;SOR=0.730;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=15;WE=17492153;WS=17492135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr4	17494054	rs2597772	A	G	2543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=56;PP=1726;SC=TCTATTCCCTAAAAACTTTAT;SOR=1.485;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=31;TCR=56;TR=87;WE=17494062;WS=17494044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr4	17503382	rs2597775	C	T	811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=10;PP=482;ReadPosRankSum=0.141;SC=CAGCCAAGGTCAGGAGGCCTC;SOR=0.773;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=68;TCF=47;TCR=21;TR=34;WE=17503390;WS=17503372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,40:0.51:78
chr4	17503544	rs2597776	C	T	660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=18;PP=427;ReadPosRankSum=-0.542;SC=GTGAGCTCAACTCATGCAGCC;SOR=0.728;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=30;TCR=42;TR=31;WE=17503552;WS=17503534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,33:0.41:80
chr4	17506164	rs2315248	G	A	2257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.498;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=54;PP=1348;ReadPosRankSum=-0.694;SC=GCATCTTTACGGATACTCAGT;SOR=0.990;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=163;TCF=70;TCR=93;TR=92;WE=17506172;WS=17506151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,103:0.57:182
chr4	17513498	rs3217604	GC	G	3441.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=39;PP=2150;SC=CCTCTAGACTGCCCCCCGCCG;SOR=1.329;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=80;TCF=35;TCR=45;TR=68;WE=17513506;WS=17513488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr4	17517099	rs1551091	A	G	2996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=58;PP=1865;ReadPosRankSum=-0.788;SC=GAGGGTGTAAAGTGCGGCAGT;SOR=0.365;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=48;TCR=58;TR=106;WE=17517107;WS=17517089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,112:0.99:113
chr4	17524570	rs13147559	C	G	807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=17;PP=410;ReadPosRankSum=0.959;SC=GGCCCTGGCTCTGGTCAGCAT;SOR=0.793;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=64;TCF=33;TCR=31;TR=34;WE=17524578;WS=17524560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,38:0.51:74
chr4	17581617	rs10939736	T	A	4101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=85;PP=2527;SC=CGAAACAGTATTTTTTCTTTC;SOR=1.386;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=55;TCR=85;TR=140;WE=17581625;WS=17581607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr4	17581643	rs35153429	CAG	C	3264.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.28;NF=1;NR=46;PP=2182;SC=TTTTTTGAAACAGAGTCTTGC;SOR=2.062;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=51;TCF=1;TCR=50;TR=47;WE=17581652;WS=17581633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr4	17583200	rs5856433	TAA	T	468.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=14;HapScore=3;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;NF=8;NR=3;PP=162;SC=TGTCTCTATTTAAAAAAAAAA;SOR=2.670;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=11;WE=17583210;WS=17583190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	17586703	rs3733576	T	C	5233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=82;PP=2810;SC=CCAGATTTGCTGAAATTATTG;SOR=0.810;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=181;TCF=99;TCR=82;TR=181;WE=17586711;WS=17586693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr4	17590671	rs17499929	G	A	2311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.25;QD=27.52;SOR=1.275;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr4	17590686	rs35467396	AT	A	275.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.42;MQRankSum=0.573;QD=12.53;ReadPosRankSum=0.401;SOR=1.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,20:0.91:22
chr4	17590734	rs11737120	A	T	139.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=71;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=0;NR=19;PP=503;SC=CCCAGGCTAGAGTGCAGTGGC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=17590742;WS=17590724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	17599894	rs3775927	G	T	228.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=157;SC=GGTGCTGGGGGATTATTAAAT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=17599902;WS=17599891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	17608620	rs4698628	A	G	2703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=54;PP=1622;SC=CAAAATAGCTATTTTCAATTT;SOR=1.081;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=41;TCR=54;TR=95;WE=17608628;WS=17608610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr4	17608884	rs4698629	C	G	1271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=1;PP=940;SC=TATTCTGAAACTGATATGTGG;SOR=5.031;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=33;WE=17608892;WS=17608874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr4	17625209	rs11733730	G	C	906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=0;PP=679;SC=CTTAGTCCATGACTTTCATCT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=17625217;WS=17625207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr4	17627294	rs2315552	A	G	5175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=106;NR=79;PP=2965;SC=TTACTGGGTGATGAATAATCC;SOR=0.890;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=187;TCF=107;TCR=80;TR=185;WE=17627302;WS=17627284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr4	17627332	rs2315553	T	C	6126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=115;NR=94;PP=2965;SC=GCTGCTAACTTTTTCAGGGAG;SOR=0.757;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=210;TCF=115;TCR=95;TR=209;WE=17627340;WS=17627322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr4	17634213	rs6825562	A	G	4204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=75;NR=56;PP=2276;SC=TTTCTGCTGGACTTCTTTGGC;SOR=0.839;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=131;TCF=75;TCR=56;TR=131;WE=17634221;WS=17634203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr4	17634255	rs6847966	G	A	6483.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=48;NR=55;PP=1858;SC=GGTCCTAAAAGCAAAAAAAGG;SOR=0.840;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=113;TCF=54;TCR=59;TR=103;WE=17634264;WS=17634245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr4	17634256	rs142873186	C	CAA	6366.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=49;PP=1364;SC=GTCCTAAAAGCAAAAAAAGGT;SOR=0.838;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=68;TCF=13;TCR=55;TR=59;WE=17634264;WS=17634245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr4	17635556	rs140729140	CAAAAT	C	1571.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=17;PP=962;SC=ATGCAAAAAACAAAATAAAGC;SOR=0.927;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=19;WE=17635568;WS=17635546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr4	17636507	rs3214318	G	GT	206.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.8399;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=143;ReadPosRankSum=0.752;SC=AAACAAGTGGGTTTTTTTTTT;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=9;WE=17636515;WS=17636497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,10:0.83:12
chr4	17638302	rs148915854	T	TA	4125.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.428;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.368;NF=10;NR=54;PP=2318;ReadPosRankSum=-0.301;SC=AAGTCCCCCTTACAGCAATTA;SOR=0.728;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=153;TCF=27;TCR=126;TR=64;WE=17638310;WS=17638292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,136:0.48:286
chr4	17640858	rs6811887	C	T	6544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.410;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=129;NR=96;PP=2965;ReadPosRankSum=0.667;SC=CCCTGGGGCCCGAGGCCTCAC;SOR=0.527;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=228;TCF=130;TCR=98;TR=225;WE=17640866;WS=17640848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,249:1.00:250
chr4	17643620	rs28501187	G	A	352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=10;NR=3;PP=196;SC=TAGGGGGAGGGGGGGTGGCGG;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=17643628;WS=17643610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	17643848	rs2286771	G	A	1421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=27;PP=673;ReadPosRankSum=0.794;SC=GGGCCGCCCCGCTCCTGAGGA;SOR=0.426;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=48;TCF=20;TCR=28;TR=47;WE=17643856;WS=17643838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,57:0.98:58
chr4	17649233	rs3733577	T	G	1010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=7;PP=703;SC=GGAGGGGTATTGCTGGTGCAA;SOR=2.049;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=31;WE=17649241;WS=17649223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr4	17649494	rs6813374	T	C	1457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.65;SOR=1.308;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr4	17649499	rs6813375	T	G	1400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.77;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr4	17654648	rs3815413	T	C	3110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=53;NR=59;PP=1652;SC=AAAGTGGGCATGAGGGTGGGA;SOR=1.046;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=53;TCR=59;TR=112;WE=17654656;WS=17654638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr4	17659936	rs10939742	G	T	2856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=31;PP=1615;SC=CCTAGCAGGTGCCCGGCACAG;SOR=1.300;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=63;TCR=31;TR=94;WE=17659944;WS=17659926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr4	17660082	rs1860596	C	T	2733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=36;NR=48;PP=1405;SC=CTGGAGCTCACGCTGCAGCTT;SOR=1.329;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=85;TCF=36;TCR=49;TR=84;WE=17660090;WS=17660072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr4	17689901	rs11306510	AT	A	119.75	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.97;ReadPosRankSum=2.287;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr4	17689974	rs4698646	T	C	1601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=34;NR=22;PP=1079;SC=CAGCATGTGTTACTGGGGACA;SOR=1.278;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=34;TCR=22;TR=56;WE=17689982;WS=17689964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr4	17694880	rs6449324	G	C	1453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=37;NR=5;PP=1045;SC=AAGCTCCCAGGGACCAGAAAC;SOR=3.033;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=37;TCR=5;TR=42;WE=17694888;WS=17694870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr4	17694916	rs3822235	A	G	2789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=31;PP=1808;SC=GCATTTGGTCAGGGCTCACCT;SOR=1.677;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=68;TCR=31;TR=99;WE=17694924;WS=17694906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr4	17694943	rs3733579	A	G	4484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=51;PP=2863;SC=GAGAATTCTGAAGCTTCACAT;SOR=1.383;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=93;TCR=51;TR=144;WE=17694951;WS=17694933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr4	17707301	rs72619125	C	T	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=32;ReadPosRankSum=0.842;SC=GGGGACTGGCCTCTACCTGAC;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=3;WE=17707309;WS=17707291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr4	17707361	rs57570581	G	A	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.459;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=323;ReadPosRankSum=-0.477;SC=CCCCAGGGCTGGGTCAGACAC;SOR=0.361;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=47;TCF=39;TCR=8;TR=23;WE=17707369;WS=17707351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,23:0.46:50
chr4	17707627	rs62295656	C	A	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.831;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=85;ReadPosRankSum=0.414;SC=TCCAACATCCCCTGTGTAATT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=7;WE=17707635;WS=17707617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr4	17711076	rs3733583	T	C	767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.783;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=12;PP=387;ReadPosRankSum=-0.894;SC=TCAGCCTCTTTTGCAGCTCCA;SOR=0.836;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=85;TCF=50;TCR=35;TR=32;WE=17711084;WS=17711066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,38:0.40:96
chr4	17813711	rs1395371	T	C	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=34;ReadPosRankSum=0.084;SC=GTTTGGATAATTAAGAGTTTA;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=3;WE=17813719;WS=17813706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr4	17841465	rs2286537	A	G	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=10;PP=216;ReadPosRankSum=-0.703;SC=CTGGAGGTAAAGTAGTTTCTC;SOR=0.813;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=42;TCF=22;TCR=20;TR=19;WE=17841473;WS=17841455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,20:0.43:47
chr4	17844029	rs17585261	G	A	6589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=126;PP=2965;SC=TAGAATATATGGAGGCCTATC;SOR=1.316;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=212;TCF=86;TCR=126;TR=212;WE=17844037;WS=17844019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr4	17875735	rs78581007	TCTC	T	4834.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-1.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=54;PP=2457;ReadPosRankSum=0.471;SC=ATCTTAAGTTTCTCCTTTTAG;SOR=0.701;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=154;TCF=19;TCR=135;TR=61;WE=17875745;WS=17875725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,127:0.45:280
chr4	17885296	rs377596412	AAC	A,AACAC	384.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.72;QD=27.48;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,4,10:0.29,0.71:14
chr4	20256722	rs1323066	G	A	2281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=52;PP=1541;SC=TCGCGGTTGCGTGTGGGCCGG;SOR=1.668;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=28;TCR=52;TR=80;WE=20256730;WS=20256712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
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chr4	20259622	rs61790829	A	T	304.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=307;ReadPosRankSum=1.103;SC=AAATACTTAAATTTCAAGCAT;SOR=0.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=6;WE=20259630;WS=20259611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr4	20270600	rs2196476	G	A	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=18;PP=354;ReadPosRankSum=-0.420;SC=CCTGGAATCTGTTCATCAATA;SOR=0.910;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=37;TCF=8;TCR=29;TR=22;WE=20270608;WS=20270590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,23:0.59:39
chr4	20482251	rs2125207	G	T	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.719;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=52;ReadPosRankSum=0.417;SC=TGTGTCCAGGGTATCATAGAC;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=5;WE=20482259;WS=20482241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr4	20490710	rs543593	T	G	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.740;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.410;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=6;PP=105;ReadPosRankSum=0.832;SC=TCACTAATGTTCAATTGTGCA;SOR=0.061;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=9;WE=20490718;WS=20490700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr4	20492380	rs485909	A	G	910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.309;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=9;PP=639;ReadPosRankSum=2.124;SC=ACAGTTCGTTACTAACCACTT;SOR=0.425;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=67;TCF=53;TCR=14;TR=36;WE=20492388;WS=20492370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,38:0.52:73
chr4	20520993	rs519813	T	C	699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=9;PP=385;ReadPosRankSum=-1.042;SC=TCATTTAAAATATTTTTTTCA;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=34;TCR=15;TR=29;WE=20521001;WS=20520983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,33:0.59:56
chr4	20526985	rs146437952	C	CAT	196.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=63.02;NF=0;NR=6;PP=236;SC=TGATGTTAAACATATATTATT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=6;WE=20526993;WS=20526975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr4	20533700	rs3215198	A	AT	824.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.058;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=351;ReadPosRankSum=-1.051;SC=CTTGTTAGCTATTTTTTTTAT;SOR=1.096;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=2;TCR=45;TR=20;WE=20533708;WS=20533690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,38:0.47:80
chr4	20535460	rs74466092	T	TTC	253.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.522;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.67;MQRankSum=0.566;NF=0;NR=6;PP=204;ReadPosRankSum=-1.137;SC=CTCTTTCACATTCTCTGTTAC;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=6;WE=20535468;WS=20535450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr4	20541005	rs35993588	AG	A	3018.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.240;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=14;PP=2179;ReadPosRankSum=-0.180;SC=ATCCTCAGATAGGCAAAATTG;SOR=1.078;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=75;TCF=35;TCR=40;TR=31;WE=20541016;WS=20540995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,76:0.54:142
chr4	20541008	rs3842004	C	A	3027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.210;HP=4;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=17;PP=2193;ReadPosRankSum=-0.759;SC=CTCAGATAGGCAAAATTGATT;SOR=0.952;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=127;TCF=85;TCR=42;TR=61;WE=20541016;WS=20540995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,80:0.55:146
chr4	20547838	rs2292439	C	T	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.845;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=52;ReadPosRankSum=-0.820;SC=CAGTTAGATGCTTCCCTCCTT;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=4;WE=20547846;WS=20547828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr4	20611818	rs35891001	C	T	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=356;ReadPosRankSum=0.274;SC=TTCAGGTGGTCCTGAAACCCT;SOR=0.723;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=43;TCF=13;TCR=30;TR=24;WE=20611826;WS=20611808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,26:0.54:48
chr4	20620683	rs1379659	G	A	1030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.670;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=29;PP=649;ReadPosRankSum=0.244;SC=CTTCTTGACCGTGTGGGACTA;SOR=0.501;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=92;TCF=35;TCR=57;TR=50;WE=20620691;WS=20620673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,51:0.50:101
chr4	20760683	rs17623902	A	G	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=1.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.485;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=235;ReadPosRankSum=1.607;SC=TGTTTGTTCCAGTTCTCACAA;SOR=2.059;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=12;WE=20760691;WS=20760673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr4	20852166	rs3765121	A	G	1152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=15;PP=708;SC=AAGTTCTTACATTCTTAAATC;SOR=1.105;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=26;TCR=15;TR=41;WE=20852174;WS=20852156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr4	20852244	rs3765122	A	G	1647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=31;PP=1117;SC=CAAGGGCTTCAGGCCGATGCC;SOR=0.724;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=31;TCR=31;TR=62;WE=20852252;WS=20852234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr4	21764761	rs717531	C	T	2199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=53;PP=1407;ReadPosRankSum=-1.268;SC=AATTCCTTCACTGTGGTTGAA;SOR=0.692;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=222;TCF=105;TCR=117;TR=102;WE=21764769;WS=21764751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,111:0.46:242
chr4	21950259	rs6448102	A	G	7132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=132;NR=116;PP=2965;SC=ATTCATGTCTAGGGACGCAGG;SOR=0.700;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=248;TCF=132;TCR=116;TR=248;WE=21950267;WS=21950249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,277:1.00:277
chr4	21950414	rs149211629	G	C	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=0.904;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5210;FS=3.424;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=66;ReadPosRankSum=-0.205;SC=CGCGCGGAGCGGGCTGCAGGT;SOR=2.636;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=5;WE=21950422;WS=21950404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr4	22390167	rs9002	C	T	3399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=69;PP=1988;ReadPosRankSum=0.507;SC=TGGTGGACCACGAAGAACGCA;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=271;TCF=147;TCR=124;TR=153;WE=22390175;WS=22390157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,163:0.55:296
chr4	22416133	rs7658234	C	G	828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=4;PP=590;SC=AACAATTAACCATCTAAAAAC;SOR=3.056;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=29;WE=22416141;WS=22416123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	22416195	rs13106386	C	G	2602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=35;PP=1631;SC=CTTCTAACCTCTCTTCTTCTA;SOR=1.099;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=93;TCF=57;TCR=36;TR=92;WE=22416203;WS=22416185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr4	22439914	rs6823735	A	C	109.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQ=57.24;NF=4;NR=0;PP=83;SC=CCCTCTCTGGAGGACAGTACT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=22439922;WS=22439904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	22444251	rs374500461	CA	C	183.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=1.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.37;ReadPosRankSum=-0.365;SOR=1.012;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,18:0.43:42
chr4	22444692	rs10018144	C	T	2479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=37;PP=1538;SC=AATTTCATAACCAGTTCTGAC;SOR=0.852;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=50;TCR=37;TR=87;WE=22444700;WS=22444682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr4	22457478	rs16872669	C	T	5410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=104;PP=2965;SC=GGACTTAGCCCTATGCAAGAA;SOR=1.219;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=179;TCF=75;TCR=104;TR=179;WE=22457486;WS=22457468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr4	22463510	.	CA	C	383.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=107;ReadPosRankSum=0.912;SC=ACCTGCTATACAAAAAAAACA;SOR=0.507;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=8;WE=22463518;WS=22463500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr4	22715639	rs1963996	A	G	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=2.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.736;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=300;ReadPosRankSum=0.283;SC=ATTCTGTTATATATTATACTG;SOR=1.362;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=18;WE=22715647;WS=22715629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr4	22715657	rs34299764	C	G	758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.083;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=11;PP=500;ReadPosRankSum=-0.706;SC=CTGGTTCAGTCAACAAATGAG;SOR=0.473;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=59;TCF=41;TCR=18;TR=34;WE=22715665;WS=22715647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,35:0.58:60
chr4	22749783	.	GTA	G	77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=7;MMLQ=27;MQ=59.55;NF=0;NR=4;PP=77;QD=20.75;SC=ACAGGCATATGTATATATATA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=4;WE=22749794;WS=22749773;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr4	22820504	rs358231	A	T	2070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.298;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=46;PP=1263;ReadPosRankSum=0.658;SC=CCAAGGAATAAGCCAAGATCA;SOR=0.481;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=174;TCF=78;TCR=96;TR=87;WE=22820512;WS=22820494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,99:0.51:193
chr4	23815924	rs2970847	T	C	1441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=39;PP=848;ReadPosRankSum=0.787;SC=TGAGTATTTCTGTTTTGGAAT;SOR=0.737;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=176;TCF=81;TCR=95;TR=71;WE=23815932;WS=23815914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,75:0.40:188
chr4	23822328	rs2932976	G	A	2462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.972;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=48;PP=1421;ReadPosRankSum=0.749;SC=AAAGAAGTCAGACCAGCTGGC;SOR=0.621;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=218;TCF=116;TCR=102;TR=99;WE=23822353;WS=23822318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,116:0.47:247
chr4	23886323	rs2946385	G	T	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.537;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=441;ReadPosRankSum=-0.077;SC=CATGTTAGTCGGGCCCAAGCC;SOR=1.179;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=61;TCF=49;TCR=12;TR=25;WE=23886331;WS=23886313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,25:0.40:63
chr4	24534687	rs3828558	T	C	3407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.875;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=73;PP=2208;ReadPosRankSum=0.503;SC=TCTAAAAAGGTAGAAGGCGGG;SOR=0.637;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=264;TCF=126;TCR=138;TR=140;WE=24534695;WS=24534677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,159:0.53:301
chr4	24538573	rs4697063	A	G	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.719;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=166;ReadPosRankSum=0.058;SC=GGTTTCTAATATAAGTTGTCA;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=8;WE=24538581;WS=24538563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr4	24801315	rs2536512	G	A	2073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.819;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=46;PP=1167;ReadPosRankSum=0.023;SC=CGACGACGGCGCGCTCCACGC;SOR=0.538;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=166;TCF=75;TCR=91;TR=86;WE=24801323;WS=24801305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,97:0.52:187
chr4	24801354	rs8192291	C	T	1204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=27;PP=789;ReadPosRankSum=-0.936;SC=GTCGGCCACGCTGGACGCCGC;SOR=0.771;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=42;TCR=54;TR=49;WE=24801362;WS=24801344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,53:0.50:106
chr4	24801949	rs2695232	C	T	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=2;PP=27;ReadPosRankSum=-0.207;SC=AACAGACACCCTCCACTCTGA;SOR=1.179;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=12;TCF=6;TCR=6;TR=3;WE=24801957;WS=24801939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,3:0.23:13
chr4	24809884	rs1019229	T	C	575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=0;PP=449;SC=ACAGGATCAGTGCGTTTTCTC;SOR=4.514;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=24809892;WS=24809875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	24821760	rs144507372	TG	T	218.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=152;ReadPosRankSum=-1.383;SC=CTTACACTATTGCACCACCCT;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=5;WE=24821768;WS=24821750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr4	25001439	rs7689760	T	C	2319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.072;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=39;PP=1388;ReadPosRankSum=0.637;SC=CCAGTGTGCTTCCTGAAGGCT;SOR=0.785;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=187;TCF=111;TCR=76;TR=97;WE=25001447;WS=25001429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,110:0.52:210
chr4	25001576	rs7665497	C	T	5385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FS=4.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.63;ReadPosRankSum=-0.448;SOR=0.935;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,138:0.55:249
chr4	25001576	.	CTC	TTT	2944	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=52;NR=66;PP=2944;QD=20;SC=CCTCAACATCCTCCCCATAGC;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=223;TCF=110;TCR=113;TR=118;WE=25001600;WS=25001566;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:105,118:0.53:223
chr4	25001578	rs7665498	C	T	5385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FS=5.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.72;ReadPosRankSum=-0.107;SOR=0.990;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:112,136:0.55:248
chr4	25001632	rs7690185	T	A	1517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.455;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=43;PP=1072;ReadPosRankSum=-1.082;SC=TCCTCCTTAGTACAACAGAAA;SOR=1.377;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=117;TCF=39;TCR=78;TR=59;WE=25001640;WS=25001622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,65:0.51:128
chr4	25001685	rs7670138	A	C	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=257;ReadPosRankSum=-0.179;SC=TGGGGCCTTGAATGTAAAAAG;SOR=1.051;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=11;WE=25001693;WS=25001675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,14:0.39:36
chr4	25005193	rs2232028	G	A	2141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=37;PP=1111;ReadPosRankSum=-0.631;SC=GCGCCTGCACGTAAATCTCCT;SOR=0.708;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=182;TCF=104;TCR=78;TR=89;WE=25005201;WS=25005183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,104:0.51:205
chr4	25253995	rs313567	C	T	8920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=160;NR=143;PP=2965;SC=CAGAATTTGCCGATATTATGC;SOR=0.741;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=304;TCF=161;TCR=143;TR=303;WE=25254003;WS=25253985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,338:1.00:338
chr4	25316815	rs12508686	T	C	208.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=171;SC=TTTTGTTTTCTCCTGAAATGA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=25316823;WS=25316805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	25363901	rs315675	T	A	5976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=108;PP=2965;SC=CACTGTGAGCTCTGTAATTCT;SOR=0.917;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=207;TCF=99;TCR=108;TR=207;WE=25363909;WS=25363891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr4	25370962	rs315689	A	T	536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=16;PP=440;SC=CTCTGGAGACATGGGGAGTTG;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=25370970;WS=25370952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	25382216	rs315676	C	G	254.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=7;PP=166;SC=ATAAATATCACTTTGGGAACT;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=25382224;WS=25382206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	25391584	rs186408	G	A	35.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=17.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr4	25393889	rs2292407	C	T	2347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=32;PP=1387;SC=TAGTTTGACCCACACTCTAAA;SOR=1.055;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=51;TCR=32;TR=83;WE=25393897;WS=25393879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr4	25394078	rs2292408	A	G	394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=5;NR=9;PP=206;SC=GTGAATATTTATTATCGGCTT;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=14;WE=25394086;WS=25394068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr4	25395674	rs17605267	C	A	708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=19;PP=550;SC=TCAGATTTGCCAAAAGGGCTC;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=22;WE=25395682;WS=25395664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr4	25404553	rs10023139	C	T	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.823;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=10;PP=241;ReadPosRankSum=0.429;SC=ATCCCCCACACACTAATCTTA;SOR=0.806;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=82;TCF=47;TCR=35;TR=23;WE=25404561;WS=25404543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,28:0.28:101
chr4	25407356	rs3756202	A	G	1534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.300;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=40;PP=1067;ReadPosRankSum=-0.183;SC=CAGGATGTAGACGTTAGATCC;SOR=0.848;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=137;TCF=62;TCR=75;TR=69;WE=25407364;WS=25407346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,72:0.47:152
chr4	25408516	rs3214034	T	A	1276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.782;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=31;PP=733;ReadPosRankSum=-2.714;SC=AGGTAAGAAGTTGATATTTCT;SOR=0.546;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=94;TCF=39;TCR=55;TR=57;WE=25408524;WS=25408506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,60:0.60:100
chr4	25408724	rs28616687	A	G	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.476;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=49;ReadPosRankSum=0.141;SC=ACTGCCACTCACAGCTCTCTT;SOR=0.330;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=5;WE=25408732;WS=25408714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr4	25417244	rs3816587	C	T	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.224;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=67;ReadPosRankSum=-0.799;SC=GACTCAGTTACGGTGGTAATA;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=5;WE=25417252;WS=25417234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr4	25419283	rs9174	T	C	2803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.333;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=61;PP=1593;ReadPosRankSum=-0.041;SC=CCATGCATTTTGAGAAGCACT;SOR=0.615;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=283;TCF=154;TCR=129;TR=131;WE=25419291;WS=25419273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:177,141:0.44:318
chr4	25674905	.	TCACA	T	322.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.34;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	25674911	.	G	GAGGGA	322.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.34;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	25674913	rs62409436	A	G	331.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.47;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	25678199	rs6448389	A	G	3373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=64;NR=53;PP=2327;SC=TTGCTGTGTGACTGCCCCAAG;SOR=0.871;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=117;TCF=64;TCR=53;TR=117;WE=25678207;WS=25678189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr4	25758580	rs4401441	G	A	1004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.131;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=26;PP=576;ReadPosRankSum=-0.138;SC=CAGTTTCTTAGGCTTTTTAAA;SOR=0.433;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=71;TCF=12;TCR=59;TR=33;WE=25758588;WS=25758570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,42:0.50:84
chr4	25767133	rs6823220	A	T	581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=426;ReadPosRankSum=-1.283;SC=TGGCGCATTCACATGAATGCA;SOR=0.527;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=24;WE=25767141;WS=25767123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,24:0.65:37
chr4	25769135	rs2290577	T	C	2472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.032;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=34;PP=1439;ReadPosRankSum=0.512;SC=TGCACCGTTTTTCTATACATA;SOR=0.771;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=205;TCF=132;TCR=73;TR=101;WE=25769143;WS=25769125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,114:0.49:233
chr4	25780891	rs4697619	A	G	798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.185;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=22;PP=483;ReadPosRankSum=0.603;SC=AGACAAGGTGATGAGATGCTT;SOR=0.465;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=51;TCF=16;TCR=35;TR=33;WE=25780899;WS=25780881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,36:0.65:55
chr4	25790077	rs9985515	G	A	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=21;PP=481;ReadPosRankSum=0.487;SC=CCTACTTTACGATGTTTTAGA;SOR=0.646;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=9;TCR=40;TR=26;WE=25790085;WS=25790067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,28:0.54:52
chr4	25864284	.	G	C	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.071;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.42;ReadPosRankSum=-1.369;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr4	25915858	rs2305670	C	A	2004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.968;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=43;PP=1261;ReadPosRankSum=1.621;SC=CGAGCGGGGTCACGGCCCGGC;SOR=0.621;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=226;TCF=128;TCR=98;TR=95;WE=25915866;WS=25915848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,105:0.41:258
chr4	26097294	rs142549871	GAAGGAAGGAAGGAAGGA	G	2743.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.84;MQRankSum=0.568;QD=39.20;ReadPosRankSum=-1.277;SOR=1.108;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,67:0.96:70
chr4	26122858	rs6825116	G	T	419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=322;SC=AAGCCAGTGGGCTGCCCTGCT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=26122866;WS=26122848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	26274274	rs7680528	T	A	4665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=50;PP=2645;SC=GCATTTTGTCTTCATTTTTTC;SOR=1.361;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=149;TCF=99;TCR=50;TR=149;WE=26274282;WS=26274264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr4	26322759	rs113697915	C	A	1068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=26;PP=757;SC=GGGGCCGCGGCGCGCTTGGCG;SOR=2.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=33;WE=26322767;WS=26322749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr4	26364300	rs13116873	C	G	2099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=33;NR=37;PP=1142;SC=ATAGAATGAACACTCATGATT;SOR=1.068;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=33;TCR=37;TR=70;WE=26364308;WS=26364290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr4	26387959	rs56122711	AT	A	1160.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.18;MQRankSum=0.347;QD=20.73;ReadPosRankSum=0.080;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,52:0.93:56
chr4	26407681	rs3109839	A	G	692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=2;PP=474;SC=TGTTTTTAAGATTTGCTTATT;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=26407689;WS=26407671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr4	26417136	rs2270226	T	C	3034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=67;NR=36;PP=1570;SC=TTATGGGCAGTGGATGGAAGA;SOR=1.336;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=105;TCF=69;TCR=36;TR=103;WE=26417153;WS=26417126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr4	26422362	.	C	T	2054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=0.000;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.489;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=41;PP=1106;ReadPosRankSum=-2.724;SC=GTATGCTTTTCTTATTTATCC;SOR=0.732;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=192;TCF=89;TCR=103;TR=80;WE=26422370;WS=26422347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,98:0.43:228
chr4	26491156	rs6850415	G	A	1181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.576;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=33;PP=722;ReadPosRankSum=-0.304;SC=GATGACAGCAGAATGCTAAAA;SOR=0.895;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=102;TCF=35;TCR=67;TR=48;WE=26491164;WS=26491146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,55:0.45:121
chr4	26585881	rs4692549	C	T	6177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=100;NR=110;PP=2965;SC=TCAAGGGCTCCAATTTGTACT;SOR=0.877;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=211;TCF=100;TCR=111;TR=210;WE=26585889;WS=26585871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr4	26615982	rs260954	C	T	740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=7;PP=420;SC=TGTATGTTTACTTAAAAACTA;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=24;WE=26615990;WS=26615972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr4	26673761	rs9997999	T	A	1228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.14;SOR=1.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr4	26673787	rs7691219	A	G	1620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=35;NR=16;PP=838;SC=TTGAAAATGAACATGTACGTA;SOR=1.071;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=35;TCR=16;TR=51;WE=26673795;WS=26673777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr4	26721578	rs4590010	T	C	105.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=0;PP=79;SC=TTTCATATCATGAAATGACAT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=26721586;WS=26721568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	26737063	rs33992685	C	CT	269.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=5.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.79;ReadPosRankSum=0.000;SOR=2.215;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr4	27000995	rs6822297	A	G	3795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=71;PP=2118;SC=CACTCAGAGGATGATGTAAAA;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=54;TCR=71;TR=125;WE=27001003;WS=27000985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr4	27004011	rs10028164	G	A	751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=16;PP=511;SC=TGGACTTACAGGAGAGGTAAG;SOR=2.215;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=21;WE=27004019;WS=27004001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	27022679	.	CA	C	100.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.881;ClippingRankSum=0.000;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=4.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.02;ReadPosRankSum=-0.005;SOR=0.293;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,18:0.18:99
chr4	27022800	rs10031905	A	G	530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=14;PP=374;SC=CCTACCGTAAACTTGCCACTC;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=27022808;WS=27022790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	27162341	rs17649944	C	G	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.331;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=4;PP=332;ReadPosRankSum=-0.294;SC=GCTTTCTGGCCTCTACCTACA;SOR=1.078;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=63;TCF=50;TCR=13;TR=26;WE=27162349;WS=27162331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,29:0.40:72
chr4	28821172	.	CT	C	53.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.122;ClippingRankSum=0.000;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQRankSum=2.398;QD=0.66;ReadPosRankSum=0.291;SOR=0.576;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,15:0.18:82
chr4	30132766	.	A	ATG	798.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-1.478;ClippingRankSum=0.000;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.977;HP=2;HapScore=3;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=2.867;NF=9;NR=13;PP=491;ReadPosRankSum=-1.315;SC=TAACATATATATGTGTGTGTG;SOR=0.874;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=56;TCF=23;TCR=33;TR=22;WE=30132777;WS=30132756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,37:0.43:86
chr4	30279658	rs78294545	T	C	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.312;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=12;PP=431;ReadPosRankSum=0.267;SC=GATACCTATATACACATGTGT;SOR=0.193;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=42;TCF=26;TCR=16;TR=27;WE=30279666;WS=30279648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,26:0.68:38
chr4	30279745	rs61794114	G	A	1090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.81;QD=34.09;SOR=0.957;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr4	30279782	.	C	T	454	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=57;MMLQ=24;MQ=48.39;NF=4;NR=10;PP=454;QD=34.9122294677;SC=CACGCGTGTACGGATACATAT;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=35;TCF=12;TCR=23;TR=14;WE=30279797;WS=30279772;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:21,14:0.40:35
chr4	30279789	rs61794115	A	C	807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=57;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=10;PP=501;SC=GTACGGATACATATACACGCA;SOR=1.022;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=29;TCF=9;TCR=20;TR=17;WE=30279797;WS=30279772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	30279815	rs79831746	A	C	339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.76;QD=21.24;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr4	30480934	rs7655003	A	G	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.470;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=135;ReadPosRankSum=0.059;SC=ACATATGTGCATATGTGTATA;SOR=1.179;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=37;TCF=26;TCR=11;TR=14;WE=30480942;WS=30480924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,14:0.36:39
chr4	30725696	rs1047012	G	A	3765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.018;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=76;PP=2422;ReadPosRankSum=1.316;SC=TCATTGGCGTGGTTGCTGGCA;SOR=0.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=322;TCF=165;TCR=157;TR=163;WE=30725704;WS=30725686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:179,177:0.50:356
chr4	30725987	rs977931	G	A	1567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.961;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=35;PP=1026;ReadPosRankSum=0.232;SC=GGCGATACAGGTCCGTTAATG;SOR=0.957;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=132;TCF=66;TCR=66;TR=64;WE=30725995;WS=30725977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,70:0.48:145
chr4	30732274	rs3756025	G	T	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.236;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=309;ReadPosRankSum=1.995;SC=TCTTAGCTCCGAAATCTCTAC;SOR=1.981;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=18;WE=30732282;WS=30732264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,21:0.51:41
chr4	31107765	rs4580617	G	C	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.21;ReadPosRankSum=1.125;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,25:0.38:66
chr4	31116375	rs10006845	A	G	650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.885;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=15;PP=365;ReadPosRankSum=0.667;SC=AGAGAGGTGAACATATACAGC;SOR=0.520;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=67;TCF=39;TCR=28;TR=32;WE=31116383;WS=31116365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,34:0.46:74
chr4	36069805	rs7657166	G	A	2118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=37;PP=1309;SC=CCAGGCAGTGGGCCACCATGG;SOR=1.012;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=33;TCR=37;TR=70;WE=36069813;WS=36069795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr4	36081878	rs4833069	C	T	7316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=133;NR=112;PP=2965;SC=CGTCTGAGTTCGTGAACTATC;SOR=0.769;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=245;TCF=133;TCR=112;TR=245;WE=36081886;WS=36081868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,270:1.00:270
chr4	36109409	rs7688562	C	G	182.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=147;SC=CATTTGAAAACATCTGTAGGC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=36109417;WS=36109399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr4	36121140	rs143366422	G	GT	135.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=2.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.22;ReadPosRankSum=-0.486;SOR=1.276;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr4	36122737	rs4832795	A	T	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.15;ReadPosRankSum=-1.645;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr4	36123024	rs1397423	A	G	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.591;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=310;ReadPosRankSum=-1.258;SC=CAGTTTATCAATTTTTAAACA;SOR=0.392;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=47;TCF=11;TCR=36;TR=21;WE=36123032;WS=36123014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,24:0.43:56
chr4	36126393	rs2271331	G	A	880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.137;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=14;PP=557;ReadPosRankSum=-2.009;SC=GAGTTCTTATGATACGTAGAA;SOR=0.202;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=56;TCF=39;TCR=17;TR=38;WE=36126401;WS=36126383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,40:0.65:62
chr4	36126696	rs3817165	G	A	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.364;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=96;ReadPosRankSum=0.857;SC=CATTTTAATAGGTGATACAAT;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=6;WE=36126704;WS=36126686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr4	36130099	rs6148397	T	TACACAC,TACAC	659	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=5.611;HP=2;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10,10;NR=2,2;PP=225,109;ReadPosRankSum=0.092;SC=GTCTATATTATACACACACAC;SOR=3.611;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=12,12;WE=36130107;WS=36130089;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.88:17
chr4	36130122	.	A	ACACACG	304	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=11;MMLQ=28;MQ=60.38;NF=10;NR=2;PP=304;QD=25.5833333333;SC=ACACACACACACACATATCTA;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=38;TCF=25;TCR=13;TR=12;WE=36130135;WS=36130112;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:26,12:0.32:38
chr4	36130123	.	CACAT	C	257.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.682;ClippingRankSum=0.000;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=7.361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.21;MQRankSum=-0.594;QD=4.96;ReadPosRankSum=-2.327;SOR=0.140;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,15:0.29:52
chr4	36130375	rs5857473	TA	T	1319.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=34;PP=496;ReadPosRankSum=-0.189;SC=AACCTTTGTTTAAAAAAAAAA;SOR=1.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=34;WE=36130383;WS=36130365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,44:0.96:46
chr4	36130393	rs1397419	C	T	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=384;ReadPosRankSum=-2.201;SC=AAAAGTTATACTTTAAAAGTC;SOR=0.836;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=41;TCF=6;TCR=35;TR=20;WE=36130401;WS=36130383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,19:0.45:42
chr4	36148837	rs73225587	T	C	683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.217;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=8;PP=422;ReadPosRankSum=-0.112;SC=TATTGTTTTCTCCCTCAAGAT;SOR=1.098;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=59;TCF=41;TCR=18;TR=28;WE=36148845;WS=36148827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,33:0.49:67
chr4	36149025	rs1567483	G	A	2812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=54;PP=1625;SC=TTAAAACACTGTAATAAACAC;SOR=1.292;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=33;TCR=54;TR=87;WE=36149033;WS=36149015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr4	36149113	rs1567484	C	T	1957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=16;PP=1378;SC=AAGGCTATCACTATTGTATGC;SOR=1.793;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=42;TCR=16;TR=58;WE=36149121;WS=36149103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr4	36160340	rs1546495	G	T	2427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=20;PP=1383;SC=CTAAAAAGAAGAGAAAAAATA;SOR=1.863;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=54;TCR=20;TR=74;WE=36160348;WS=36160330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr4	36160603	rs17457286	G	A	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.718;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=59;ReadPosRankSum=-0.180;SC=ATTTACCAAAGAATAATTACA;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=36160611;WS=36160593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr4	36162273	rs11431961	C	CA	294.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.98;QD=19.65;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,12:0.80:15
chr4	36162923	rs2271330	G	A	650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=1;PP=520;SC=TTCTCAAAGAGTTACTACTAT;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=36162931;WS=36162918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr4	36168706	rs3055951	CAAAA	C	394.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.419;HP=12;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=121;ReadPosRankSum=0.071;SC=TATAAAGAAACAAAAAAAAAG;SOR=1.897;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=6;WE=36168717;WS=36168696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr4	36211914	rs4394022	C	A	256.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=2;PP=189;SC=GTGTGTGTGGCGGTGGAGTGG;SOR=2.093;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=36211922;WS=36211904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	36258197	rs7686575	T	C	2842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=61;NR=30;PP=1396;SC=CTCACTTCCTTGCTTGTTCGC;SOR=1.136;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=61;TCR=30;TR=91;WE=36258205;WS=36258187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr4	36283313	rs7695130	A	C	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=454;ReadPosRankSum=-0.813;SC=TAACAATCACAAAGTTTGAAT;SOR=0.743;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=45;TCF=38;TCR=7;TR=24;WE=36283321;WS=36283303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,24:0.51:47
chr4	36285929	rs6824507	A	C	1525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.639;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=25;PP=987;ReadPosRankSum=-0.061;SC=ATGGACGTGTACTGGGGCAAG;SOR=0.762;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=120;TCF=69;TCR=51;TR=60;WE=36285937;WS=36285919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,66:0.49:134
chr4	36292018	rs1995319	T	A	4402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=86;NR=71;PP=2469;SC=CTGAGTGATGTTACTGGCCCC;SOR=0.777;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=157;TCF=86;TCR=71;TR=157;WE=36292026;WS=36292008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr4	36317970	rs9995922	T	C	4268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=64;NR=68;PP=2530;SC=GAAACTATAGTTGCCCTCATT;SOR=0.920;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=64;TCR=68;TR=132;WE=36317980;WS=36317960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr4	36340891	rs56246836	T	C	1886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=40;PP=1206;SC=AGAAAGTGACTTTCCAATCAA;SOR=2.093;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=58;TCF=17;TCR=41;TR=57;WE=36340899;WS=36340881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr4	37247021	rs892825	C	T	258.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=6;PP=169;SC=CCCTCGCTGGCCGGTTTTGCC;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=37247029;WS=37247011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	37327583	rs73130327	A	C	1835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.105;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=41;PP=1037;ReadPosRankSum=0.149;SC=GACAGGCGCTAAGAGAAAATG;SOR=0.793;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=176;TCF=85;TCR=91;TR=80;WE=37327591;WS=37327573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,92:0.47:196
chr4	37445315	rs4634233	C	A	2798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.657;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=55;PP=1737;ReadPosRankSum=-0.421;SC=CTACATCGAGCTGATTCCCCG;SOR=0.842;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=252;TCF=137;TCR=115;TR=125;WE=37445323;WS=37445292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,132:0.49:269
chr4	37636750	rs2276943	T	G	3947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=97;PP=2785;SC=ACGGGGCTAATGTGGGGAGGA;SOR=2.996;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=120;TCF=23;TCR=97;TR=120;WE=37636758;WS=37636740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr4	37651138	rs200460599	T	C	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.690;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=172;ReadPosRankSum=-1.526;SC=GAAAGAAACATGCATGCTGCA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=11;WE=37651146;WS=37651128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr4	37651155	rs2292298	A	G	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.232;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=79;ReadPosRankSum=-0.308;SC=TGCATTAGATATCTGTCCAGG;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=5;WE=37651163;WS=37651145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr4	37666995	rs1221653	T	C	6540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=127;PP=2965;SC=CAGAAGTTTCTAGTTTGCAAA;SOR=1.274;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=211;TCF=84;TCR=127;TR=211;WE=37667003;WS=37666985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr4	37828175	rs2059484	T	C	524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=0;PP=290;SC=TCCCACCCCCTGCAGCGCACC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=37828194;WS=37828172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	37828186	rs2059483	C	T	640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=15;NR=2;PP=377;SC=GCAGCGCACCCGCAAACGGCA;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=37828194;WS=37828172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	37828470	rs187036608	C	T	1668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=44;PP=1262;SC=GCGCCTGGAGCGGGGCCGGGT;SOR=2.468;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=58;TCF=14;TCR=44;TR=57;WE=37828478;WS=37828460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr4	37831850	rs2911907	C	T	278.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=229;SC=ACATGTCTTACCAGCTTGGCT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=37831858;WS=37831840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	37850312	rs35704131	TG	T	2722.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=50;PP=2195;SC=AATAATATTTTGAAATGTTCT;SOR=2.115;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=53;TCF=1;TCR=52;TR=51;WE=37850320;WS=37850302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr4	37857106	rs6531590	G	A	434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=0;PP=364;SC=ATTTCCTCCAGAATGTTTTTC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=37857114;WS=37857096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	37857166	rs6842360	A	G	1840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=12;PP=1221;SC=CTTATGCAAGAGAAGATATTG;SOR=2.194;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=44;TCR=12;TR=56;WE=37857174;WS=37857156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr4	37863013	rs28402184	C	T	1158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=29;NR=3;PP=638;SC=CTTTTTTTTCCTATTTAGTCC;SOR=2.419;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=32;WE=37863021;WS=37863003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr4	37863045	rs3832307	AT	A	3038.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=14;PP=1480;SC=TTATATTTTCATTGTCACTTG;SOR=1.501;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=40;TCF=25;TCR=15;TR=38;WE=37863053;WS=37863035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr4	37903756	rs2279027	T	C	3768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=47;PP=2330;SC=ACATCTGCTTTCTAACGAGGT;SOR=1.082;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=78;TCR=47;TR=125;WE=37903764;WS=37903746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr4	37922307	rs2925957	G	C	1846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.113;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=36;PP=872;ReadPosRankSum=-0.011;SC=TTAATATCCCGGGAGCAAGGA;SOR=0.801;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=166;TCF=94;TCR=72;TR=84;WE=37922315;WS=37922297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,96:0.50:193
chr4	37922416	rs60244784	A	T	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=17;PP=301;ReadPosRankSum=0.615;SC=CATTGTCCCAAAACAGTAGGG;SOR=0.765;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=64;TCF=29;TCR=35;TR=30;WE=37922424;WS=37922406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,32:0.44:72
chr4	37962186	rs6811863	G	C	3101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.508;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=55;PP=2056;ReadPosRankSum=0.342;SC=GTTTTAACACGACGTTTTGGC;SOR=0.737;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=201;TCF=109;TCR=92;TR=121;WE=37962194;WS=37962176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,131:0.61:215
chr4	38016395	rs10501	T	G	4116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=63;PP=2607;SC=CAGGAGCCTGTGCGCAGGCCC;SOR=0.907;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=59;TCR=64;TR=122;WE=38016403;WS=38016385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr4	38022087	rs10015663	A	G	1304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=10;PP=888;SC=CAACAAGAGTAAAATTCCATC;SOR=1.775;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=39;WE=38022095;WS=38022077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr4	38022219	rs112261209	G	A	2218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=44;PP=1272;ReadPosRankSum=3.140;SC=CAGGGCATCAGACACGTGGAC;SOR=0.711;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=174;TCF=91;TCR=83;TR=91;WE=38022227;WS=38022200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,109:0.54:203
chr4	38047545	rs6845120	A	G	7305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=114;NR=128;PP=2965;SC=TTCTCTTTATACGACACCCTG;SOR=0.921;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=242;TCF=114;TCR=128;TR=242;WE=38047553;WS=38047535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,270:1.00:270
chr4	38053788	rs58659939	CTGTGTGTGTGTG	CTG,C	1405.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;NF=0,0;NR=25,25;PP=39,1215;SC=AGCAGAGCCACTGTGTGTGTG;SOR=3.545;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=25,25;WE=38053807;WS=38053778;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:36
chr4	38138856	rs13110318	G	A	1093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=21;PP=593;SC=GAACTGGAGCGGTCGGCCCTG;SOR=1.206;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=36;TCF=14;TCR=22;TR=35;WE=38138864;WS=38138846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr4	38628540	rs168086	A	G	80.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=3;PP=54;SC=AGGTGCGAGCAGGAACCGGGG;SOR=1.609;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=5;WE=38628548;WS=38628530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	38628725	rs62294474	C	T	119.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=3;PP=78;SC=ACCGGCGCTGCGCTCGATTTC;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=5;WE=38628733;WS=38628715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	38698924	rs36023504	C	T	2098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=47;PP=1217;ReadPosRankSum=1.557;SC=CCCCACTCACCTGGCTCTCTC;SOR=0.676;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=176;TCF=82;TCR=94;TR=86;WE=38698932;WS=38698914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,101:0.50:203
chr4	38930985	.	T	TA	576.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.023;ClippingRankSum=0.000;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=14.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.15;ReadPosRankSum=-0.495;SOR=2.355;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,26:0.23:112
chr4	38930995	rs58035134	C	A	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=14.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.53;ReadPosRankSum=-0.249;SOR=2.228;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,24:0.21:113
chr4	38932922	rs2291493	C	A	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=82;ReadPosRankSum=-0.571;SC=TTATCTTTTTCGGGGGTTGAA;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=6;WE=38932930;WS=38932912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr4	38933869	rs36058104	C	T	3022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.858;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=59;PP=1900;ReadPosRankSum=1.215;SC=GTATACATGTCGTCCATTGAA;SOR=0.754;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=286;TCF=160;TCR=126;TR=136;WE=38933877;WS=38933859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,146:0.47:313
chr4	38934000	rs114164425	G	A	1533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=46;PP=951;ReadPosRankSum=-1.563;SC=AATAAAGTAAGTAAATGTTAC;SOR=0.669;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=131;TCF=42;TCR=89;TR=67;WE=38934008;WS=38933990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,72:0.51:142
chr4	38937372	rs2271031	T	C	928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.894;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=14;PP=701;ReadPosRankSum=0.688;SC=AAGTGGCCTCTTTATCAAAGA;SOR=0.439;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=92;TCF=64;TCR=28;TR=44;WE=38937380;WS=38937362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,42:0.48:87
chr4	38942697	.	CT	C	51.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQRankSum=0.000;QD=3.23;ReadPosRankSum=-0.273;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
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chr4	38990334	rs3821986	C	T	1127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=3;PP=846;SC=GTTTTATCTACGTTTTTATTC;SOR=4.351;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=34;WE=38990342;WS=38990324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr4	38995310	rs11721954	A	G	1129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=4;PP=883;SC=AATTTTACATATCTATATCGG;SOR=3.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=34;WE=38995318;WS=38995300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr4	38995374	rs10212770	T	C	4230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=37;PP=2625;SC=TATCCATCTCTAGGTGCAAAG;SOR=1.625;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=94;TCR=37;TR=131;WE=38995382;WS=38995364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr4	39000305	rs11542133	A	G	1118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.291;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=19;PP=756;ReadPosRankSum=-1.736;SC=TTTCCTTTAGACTCACAAACC;SOR=0.843;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=147;TCF=93;TCR=54;TR=53;WE=39000313;WS=39000295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,59:0.35:167
chr4	39000569	rs73236699	C	T	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.035;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=104;ReadPosRankSum=1.009;SC=TACTGTAAAGCTTTGAGTTTT;SOR=0.116;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=10;WE=39000577;WS=39000559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr4	39046586	rs111344840	CA	C	639.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=3;PP=219;SC=GCTGCCCGGACAGGGTCTAGG;SOR=1.493;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=11;WE=39046595;WS=39046576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	39046651	rs76308346	C	G	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.35;ReadPosRankSum=-2.364;SOR=0.839;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,17:0.46:37
chr4	39064126	rs2711942	G	C	1278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=11;PP=926;SC=AGTAATTGTAGATATATATAT;SOR=2.059;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=33;TCR=11;TR=44;WE=39064134;WS=39064116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr4	39064162	rs2711941	A	C	2743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=23;PP=1556;SC=TCCTTTACATATTTTTGTTGT;SOR=1.585;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=61;TCR=23;TR=84;WE=39064170;WS=39064152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr4	39065091	rs2711940	G	A	229.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=185;SC=GAAAGGTTTTGCAAAGAGATG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=39065099;WS=39065081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	39094738	rs2566149	G	A	5389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=102;NR=82;PP=2965;SC=CCATCAACTGGTGAATGGATA;SOR=0.806;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=184;TCF=102;TCR=82;TR=184;WE=39094746;WS=39094728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr4	39094954	rs2712007	G	C	1834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.096;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=36;PP=1032;ReadPosRankSum=-0.097;SC=GTGCTTGGGAGAGAAGATGGG;SOR=0.790;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=174;TCF=89;TCR=85;TR=75;WE=39094962;WS=39094944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,89:0.44:200
chr4	39104837	rs35745478	CTG	C	67.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=71;ReadPosRankSum=-0.732;SC=ATTTTTGTATCTGTAATTTCA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=3;WE=39104846;WS=39104827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr4	39109399	rs12508577	A	G	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=211;ReadPosRankSum=1.274;SC=CACCAAATTTATTAAGCTATA;SOR=0.791;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=38;TCF=12;TCR=26;TR=17;WE=39109407;WS=39109389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,18:0.44:41
chr4	39109428	rs2711939	T	A	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=130;ReadPosRankSum=0.221;SC=AATTTAAAGATATACATAAAT;SOR=0.346;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=8;WE=39109436;WS=39109418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr4	39114929	rs3796510	G	A	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.746;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=52;ReadPosRankSum=0.481;SC=TTTGGAGAACGTGTTGGAGAA;SOR=2.461;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=5;WE=39114937;WS=39114919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
chr4	39114945	rs3839126	A	AG	53.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=66;ReadPosRankSum=0.000;SC=GAGAATTGGAAGGGAAAGTCG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=4;WE=39114953;WS=39114935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr4	39116775	rs10026775	A	T	955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.688;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=11;PP=537;ReadPosRankSum=-0.138;SC=AAATTTTCTTACAGATATGAT;SOR=1.021;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=87;TCF=57;TCR=30;TR=38;WE=39116783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,44:0.44:99
chr4	39116911	rs3733276	T	C	1754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.174;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=36;PP=993;ReadPosRankSum=-0.206;SC=ACCTTAATACTGTGGAGGCTT;SOR=0.591;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=153;TCF=82;TCR=71;TR=75;WE=39116919;WS=39116901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,84:0.48:175
chr4	39117103	rs3733277	G	A	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=217;ReadPosRankSum=-0.162;SC=AAGAGGCAATGTTTAATTTTA;SOR=0.760;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=13;WE=39117111;WS=39117093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr4	39122577	rs3733274	A	G	1129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=2.667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.89;ReadPosRankSum=-0.140;SOR=0.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,51:0.54:95
chr4	39122697	rs3733275	C	T	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=15;PP=321;ReadPosRankSum=-2.278;SC=TTTAGTGCCCCGTTTTCTACA;SOR=0.793;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=47;TCF=19;TCR=28;TR=24;WE=39122705;WS=39122687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,26:0.49:53
chr4	39128101	rs7694760	A	T	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=240;ReadPosRankSum=0.371;SC=CCGTATTGACAGATGTGGGTA;SOR=2.448;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=11;WE=39128109;WS=39128095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,12:0.80:15
chr4	39187522	rs6839511	G	T	572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.87;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	39205365	rs1451817	C	T	6829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=147;PP=2965;SC=ATCAAATCCACGTGCAAATCA;SOR=1.335;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=237;TCF=90;TCR=147;TR=237;WE=39205373;WS=39205355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr4	39207318	rs17584431	A	G	1521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.785;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=40;PP=1005;ReadPosRankSum=0.576;SC=TTGCAGTATCACAGACTCTTA;SOR=0.588;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=99;TCF=31;TCR=68;TR=59;WE=39207326;WS=39207308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,65:0.60:109
chr4	39216221	rs2167494	C	T	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.793;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=333;ReadPosRankSum=0.756;SC=TGTTTTTCAGCATTAAAATCC;SOR=2.066;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=61;TCF=41;TCR=20;TR=24;WE=39216229;WS=39216211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,25:0.38:65
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chr4	39271541	rs3733280	A	G	2276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=2.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.360;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=23;PP=1506;ReadPosRankSum=-1.180;SC=GGGTCCATAGAATGTCCTCAG;SOR=1.222;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=136;TCF=96;TCR=40;TR=85;WE=39271549;WS=39271531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,96:0.59:162
chr4	39276623	rs11096989	A	AG	2373.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.100;NF=1;NR=35;PP=1442;ReadPosRankSum=-1.264;SC=TATTTCTCAAAGTATTTCCAA;SOR=0.647;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=61;TCF=3;TCR=58;TR=36;WE=39276631;WS=39276613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,75:0.63:119
chr4	39279724	rs12648082	T	C	1348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.090;NF=43;NR=17;PP=1103;ReadPosRankSum=1.360;SC=TAAAGATGAATTTAACTCTTA;SOR=0.641;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=106;TCF=78;TCR=28;TR=60;WE=39279732;WS=39279714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,59:0.55:107
chr4	39279907	rs2276888	A	G	1970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.535;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=49;PP=1121;ReadPosRankSum=-1.108;SC=CTTCCGAAGCATTCTTCTATT;SOR=0.641;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=173;TCF=69;TCR=104;TR=83;WE=39279915;WS=39279897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,96:0.48:198
chr4	39297200	rs2306597	G	A	2183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.356;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=43;PP=1305;ReadPosRankSum=1.346;SC=ACACCAAATCGATAAAATACC;SOR=0.540;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=198;TCF=116;TCR=82;TR=99;WE=39297208;WS=39297190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,106:0.50:213
chr4	39301605	rs2066788	G	C	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-5.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.752;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=392;ReadPosRankSum=0.624;SC=CTTAGTAAAAGCAGAGCCTGC;SOR=0.025;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=43;TCF=37;TCR=6;TR=25;WE=39301613;WS=39301595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,26:0.59:44
chr4	39302029	rs2066786	T	C	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.996;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=19;PP=309;ReadPosRankSum=0.425;SC=CAACATCAAATGGGCCCTGAA;SOR=0.998;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=83;TCF=31;TCR=52;TR=28;WE=39302037;WS=39302019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,28:0.31:90
chr4	39308187	rs2066789	G	A	1134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=6;PP=857;SC=TTATCTGTCCGACCACACTGT;SOR=3.145;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=31;TCR=6;TR=37;WE=39308195;WS=39308177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr4	39318706	rs2066790	A	G	925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=28;PP=631;ReadPosRankSum=0.000;SC=TTTAAAATACATATCTAGAAA;SOR=0.602;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=52;TCF=14;TCR=38;TR=39;WE=39318714;WS=39318696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,40:0.75:53
chr4	39329102	rs11096992	G	A	749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.997;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=12;PP=440;ReadPosRankSum=0.648;SC=TAGTGAATGGGTATAAATCCT;SOR=0.558;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=37;TCR=21;TR=33;WE=39329110;WS=39329092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,35:0.56:62
chr4	39343940	rs2306596	C	A	1643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.168;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=24;PP=909;ReadPosRankSum=0.296;SC=CACACGGCATCTCATATACCA;SOR=0.813;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=168;TCF=103;TCR=65;TR=72;WE=39343948;WS=39343930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,81:0.43:188
chr4	39352910	rs11729890	T	C	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
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chr4	39368083	rs3736168	C	T	864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=21;PP=560;SC=CGAGGGCAGGCGGGCCGCTGA;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=29;WE=39368091;WS=39368073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	39409416	rs900563	C	A	1379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=32;PP=737;ReadPosRankSum=-0.836;SC=CTAGCTTCTTCTTATAGCTTC;SOR=0.678;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=123;TCF=58;TCR=65;TR=62;WE=39409424;WS=39409406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,69:0.51:134
chr4	39448542	rs7685429	C	G	6106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=103;PP=2965;SC=AGTTCAGGCCCTCACAGCGCG;SOR=0.765;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=205;TCF=102;TCR=103;TR=205;WE=39448550;WS=39448532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr4	39448586	rs35372803	C	T	3100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.490;HP=5;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=66;PP=1811;ReadPosRankSum=-0.704;SC=GCGGACTGGGCGGAACCCGCC;SOR=0.749;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=235;TCF=120;TCR=115;TR=133;WE=39448594;WS=39448576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,144:0.55:262
chr4	39450229	rs4975017	C	A	2330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=56;PP=1402;ReadPosRankSum=0.366;SC=TTTTCAAAGGCAGAAGAGAAG;SOR=0.720;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=178;TCF=77;TCR=101;TR=97;WE=39450237;WS=39450219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,106:0.55:191
chr4	39456392	rs1463478	G	A	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=151;ReadPosRankSum=0.443;SC=AATTTAAAAAGCTAATCAAAT;SOR=0.622;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=46;TCF=18;TCR=28;TR=14;WE=39456400;WS=39456382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,16:0.33:49
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chr4	39457857	rs1015450	T	C	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.748;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=345;ReadPosRankSum=0.991;SC=AACCCTTAAGTAGCACCAACA;SOR=0.308;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=47;TCF=33;TCR=14;TR=22;WE=39457878;WS=39457847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,24:0.47:51
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chr4	39469416	rs9990499	C	G	476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=342;ReadPosRankSum=0.347;SC=ATCTATGTCTCTTACATAAAA;SOR=0.641;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=41;TCF=5;TCR=36;TR=19;WE=39469424;WS=39469406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
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chr4	39478832	rs1048140	G	A	973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=29;PP=662;ReadPosRankSum=0.320;SC=CAGTGGATGTGCCCCACCTCT;SOR=0.749;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=94;TCF=35;TCR=59;TR=47;WE=39478840;WS=39478822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,47:0.49:95
chr4	39478946	rs11934814	C	T	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.78;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=0.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
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chr4	39510122	rs11735116	G	T	1016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=8;PP=688;ReadPosRankSum=-0.993;SC=CTAAAGTGCTGCGATTACAGG;SOR=0.723;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=78;TCF=61;TCR=17;TR=39;WE=39510130;WS=39510112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,43:0.48:89
chr4	39528752	rs4975020	G	A	939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.089;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=25;PP=566;ReadPosRankSum=1.462;SC=AAGCCCCAAAGAGACGAAGGT;SOR=0.491;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=62;TCF=24;TCR=38;TR=42;WE=39528760;WS=39528742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,44:0.69:64
chr4	39606533	rs73240622	A	T	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=3.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=143;ReadPosRankSum=2.079;SC=GCCCGGTCACATTTTAATCAT;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=8;WE=39606541;WS=39606525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr4	39700173	rs1055582	C	T	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=125;ReadPosRankSum=-0.457;SC=CGCCGCCTTCCCCTCCCCTCC;SOR=0.813;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=16;TCF=7;TCR=9;TR=9;WE=39700181;WS=39700163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr4	39747536	rs302931	A	G	395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=10;PP=237;SC=AGCTTTATGAATTGCTTACTG;SOR=2.448;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=39747544;WS=39747526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	39757480	rs11389468	A	AT	1533.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=29;PP=1115;SC=CAGTAACTTTAAAAGTCTCTT;SOR=2.419;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=29;WE=39757488;WS=39757470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr4	39776376	rs183562294	T	A	780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=3.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.55;ReadPosRankSum=1.175;SOR=1.150;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,39:0.53:74
chr4	39827204	rs200023345	CT	C	95.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.841;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.90;MQRankSum=1.542;QD=6.38;ReadPosRankSum=-1.760;SOR=1.501;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr4	39827804	rs34109809	GT	G	129.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.60;MQRankSum=0.603;QD=10.77;ReadPosRankSum=-0.290;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr4	39864448	rs4547806	G	A	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-2.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=116;ReadPosRankSum=0.454;SC=TGGATACATTGACAAAATATA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=7;WE=39864456;WS=39864438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr4	39871117	rs34039605	G	GA	348.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.695;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=185;ReadPosRankSum=-1.197;SC=CTATTAGCATGAAAAAAAAAA;SOR=1.519;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=15;WE=39871125;WS=39871107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr4	39910172	rs35396203	GA	G	1225.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.784;NF=0;NR=31;PP=540;ReadPosRankSum=-0.849;SC=TGTAATAAGAGAAAAAAAACT;SOR=0.813;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=0;TCR=59;TR=31;WE=39910180;WS=39910162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,55:0.62:88
chr4	39915454	rs11725674	G	C	534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.827;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=351;ReadPosRankSum=0.985;SC=GCTTATAACTGTGAGAAGTTT;SOR=0.202;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=38;TCF=7;TCR=31;TR=20;WE=39915462;WS=39915444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,22:0.52:42
chr4	39918636	rs10001599	A	T	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=1.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.11;ReadPosRankSum=0.905;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr4	39921942	rs28449663	A	G	729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=14;PP=412;ReadPosRankSum=0.376;SC=TACATACATTAGCAATGCATG;SOR=0.754;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=71;TCF=40;TCR=31;TR=34;WE=39921950;WS=39921932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,37:0.48:77
chr4	39930196	rs28643320	T	C	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=123;ReadPosRankSum=-0.665;SC=AAAATTGCTATTTCATTTCAT;SOR=0.512;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=7;WE=39930204;WS=39930186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr4	40044833	rs28550618	C	A	620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-4.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.509;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=3;PP=346;ReadPosRankSum=0.491;SC=AAGCCCTTCTCGTCCTGGGTC;SOR=0.368;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=48;TCF=43;TCR=5;TR=24;WE=40044841;WS=40044823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,29:0.52:56
chr4	40045025	rs73229741	T	C	2042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.497;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=43;PP=1156;ReadPosRankSum=-0.079;SC=ATGGTCTTGATGCAGCCTTTT;SOR=0.649;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=196;TCF=109;TCR=87;TR=92;WE=40045033;WS=40045015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,103:0.48:215
chr4	40045340	rs17439810	G	C	2401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.628;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=49;PP=1628;ReadPosRankSum=-2.184;SC=TCCTGCTCCTGCCGGAAATAC;SOR=0.820;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=200;TCF=107;TCR=93;TR=109;WE=40045348;WS=40045330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,115:0.52:221
chr4	40045727	rs1704151	T	G	1597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=26;PP=848;SC=CTGGATGGCGTTCGGCGTCTT;SOR=1.022;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=24;TCR=26;TR=50;WE=40045735;WS=40045717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr4	40108750	rs1704154	C	T	202.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=163;SC=GACAGGGTCTCGCTGTGTTGC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=40108758;WS=40108740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	40115239	rs4974962	A	T	3142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=72;PP=2261;ReadPosRankSum=-0.916;SC=TTGTAACTTAATTTCTATTGC;SOR=0.859;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=105;TCF=32;TCR=73;TR=104;WE=40115247;WS=40115229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,108:0.99:109
chr4	40121562	rs794001	G	A	538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=3;PP=397;SC=CCCAAGAGACGATGAAGATAT;SOR=2.833;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=40121570;WS=40121552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	40337566	rs10015231	C	T	2574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=47;PP=1370;SC=GCTGGTGACACGTAACCTATC;SOR=1.122;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=39;TCR=47;TR=86;WE=40337574;WS=40337556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr4	40337588	.	G	A	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.170;ClippingRankSum=0.000;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.701;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=13;PP=318;ReadPosRankSum=1.122;SC=TGTCTCATCTGGGGCTATTGC;SOR=0.321;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=53;TCF=19;TCR=34;TR=23;WE=40337596;WS=40337578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,31:0.48:64
chr4	40337908	rs10022491	T	C	4251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=72;PP=2551;SC=AAGATTATTCTAATGCTCTTC;SOR=0.839;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=143;TCF=71;TCR=72;TR=143;WE=40337916;WS=40337898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr4	40337968	rs55974552	G	A	1033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.380;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=29;PP=638;ReadPosRankSum=-0.091;SC=TGCAGATTACGCTCTCTCAGA;SOR=1.436;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=70;TCF=25;TCR=45;TR=42;WE=40337976;WS=40337958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,46:0.60:77
chr4	40350763	rs10029872	T	C	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.718;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=60;ReadPosRankSum=-0.000;SC=ATTCCAGACTTCCGAGCCACA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=4;WE=40350771;WS=40350753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr4	40356422	rs10009228	A	G	2041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.510;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=46;PP=1216;ReadPosRankSum=0.046;SC=AAGGCCACCAATTCCAAGGGG;SOR=0.740;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=185;TCF=93;TCR=92;TR=88;WE=40356430;WS=40356412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,98:0.48:204
chr4	40428010	rs278981	T	C	1462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=29;PP=649;ReadPosRankSum=-0.594;SC=CCTCCATACATGGCGGCCGCG;SOR=0.719;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=135;TCF=69;TCR=66;TR=59;WE=40428018;WS=40428000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,75:0.49:153
chr4	40438576	rs2307046	A	G	6000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=107;PP=2965;SC=ATATACCACGACCAGCAGAAT;SOR=0.919;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=199;TCF=92;TCR=107;TR=199;WE=40438584;WS=40438566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr4	40438709	rs190402259	G	A	682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=14;PP=480;ReadPosRankSum=-1.251;SC=AACAGTGACGGTGCTGGAGGC;SOR=0.700;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=59;TCF=31;TCR=28;TR=30;WE=40438717;WS=40438699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,31:0.50:62
chr4	40438931	rs12503550	T	C	1170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.925;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=31;PP=846;ReadPosRankSum=1.064;SC=AAAACATTCATAGACTACCCA;SOR=0.951;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=88;TCF=36;TCR=52;TR=52;WE=40438939;WS=40438921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,52:0.63:82
chr4	40438957	rs56769284	CG	C	159.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=1.577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.20;ReadPosRankSum=-0.242;SOR=0.316;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,11:0.29:38
chr4	40438961	.	A	C	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.616;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=1.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.96;ReadPosRankSum=0.430;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,9:0.26:34
chr4	40440215	rs2291580	T	C	9563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=358;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=170;NR=149;PP=2965;SC=CGATCTCAGGTTCGGCCCAGT;SOR=0.762;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=319;TCF=170;TCR=149;TR=319;WE=40440223;WS=40440205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,358:1.00:358
chr4	40440854	rs1052153	G	C	2730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=66;PP=1634;SC=GCACCTTGGCGGAGGACCCGG;SOR=1.677;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=33;TCR=66;TR=99;WE=40440862;WS=40440844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr4	40778146	rs2465570	C	T	3416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=67;NR=47;PP=1901;SC=TCAATACAGGCTCATGGTACA;SOR=0.840;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=114;TCF=67;TCR=47;TR=114;WE=40778154;WS=40778136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr4	40778162	rs2437323	T	G	3249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=57;NR=49;PP=1889;SC=GTACACAGTTTCCCACATGTC;SOR=0.726;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=57;TCR=49;TR=106;WE=40778170;WS=40778152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr4	40788210	rs2437314	T	C	1736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.475;NF=28;NR=45;PP=1123;ReadPosRankSum=-1.224;SC=TATTCTGGGTTTGGACTGTGC;SOR=0.703;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=141;TCF=56;TCR=85;TR=73;WE=40788218;WS=40788200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,81:0.51:159
chr4	40788544	rs2953325	A	G	1433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=6;PP=1000;SC=CAAGATTTGAAGAACTCATTG;SOR=3.516;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=35;TCR=6;TR=41;WE=40788552;WS=40788534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr4	40810663	rs4861066	A	G	1755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=35;PP=1006;ReadPosRankSum=2.256;SC=TGTGAAGAACACTTGTCCCTC;SOR=0.694;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=167;TCF=84;TCR=83;TR=72;WE=40810671;WS=40810653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,86:0.43:202
chr4	40810747	rs2261167	A	G	7157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=128;NR=121;PP=2965;SC=GAAACCCATCAAGATTGTTCT;SOR=0.738;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=249;TCF=128;TCR=121;TR=249;WE=40810755;WS=40810737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,270:1.00:270
chr4	40810978	rs882733	G	A	1783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.643;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=46;PP=1183;ReadPosRankSum=-1.284;SC=TTTTTATAGGGGCCAAAGAGC;SOR=0.914;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=158;TCF=64;TCR=94;TR=72;WE=40810986;WS=40810968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,83:0.45:186
chr4	40828084	rs111972439	C	T	1214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.721;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=29;PP=668;ReadPosRankSum=-0.218;SC=CAGGACACGCCCTGTGCCATA;SOR=0.606;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=101;TCF=41;TCR=60;TR=51;WE=40828092;WS=40828074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,57:0.51:112
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chr4	40937219	rs5857759	GA	G	125.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.621;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=2.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.40;MQRankSum=0.502;QD=9.67;ReadPosRankSum=2.256;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr4	41015823	rs2292234	G	T,A	7058.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;NF=66,69;NR=64,71;PP=1748,2263;SC=GCAGCAAATCGCCATTCCCAA;SOR=0.700;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=270;TCF=135;TCR=135;TR=130,140;WE=41015831;WS=41015813;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.50,0.50:287
chr4	41015899	rs4861358	C	T	6871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=116;NR=116;PP=2965;SC=GTGATTGCCTCGGTTCTGCTC;SOR=0.742;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=233;TCF=116;TCR=117;TR=232;WE=41015907;WS=41015889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr4	41016484	rs10025369	T	C	1332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.140;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=34;PP=913;ReadPosRankSum=0.840;SC=TGAGTAAATATTTTTATATAG;SOR=0.356;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=97;TCF=34;TCR=63;TR=56;WE=41016492;WS=41016474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,59:0.57:104
chr4	41259149	rs11556273	T	C	1438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.263;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=37;PP=1620;ReadPosRankSum=-0.456;SC=ACAAAGTGAGTGGCGTCTCGC;SOR=0.931;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=120;TCF=51;TCR=69;TR=63;WE=41259170;WS=41259139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,71:0.54:131
chr4	41259162	rs11556272	C	A	1235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.571;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=31;PP=1620;ReadPosRankSum=0.148;SC=CGTCTCGCGCCGTCTCTGGCC;SOR=0.894;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=100;TCF=39;TCR=61;TR=50;WE=41259170;WS=41259139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,58:0.52:112
chr4	41526250	rs10014221	G	A	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=238;ReadPosRankSum=-0.616;SC=CCAACTTGATGTTGGCAAAGC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=12;WE=41526258;WS=41526240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr4	41526503	rs4266323	C	T	2827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.006;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=75;PP=1756;ReadPosRankSum=-0.151;SC=CTGGTGAGTACGTGGAATTGA;SOR=0.786;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=229;TCF=96;TCR=133;TR=126;WE=41526511;WS=41526493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,134:0.54:246
chr4	41601116	.	A	C	540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.274;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.430;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=350;ReadPosRankSum=1.304;SC=ATGATGTTGTAAGTTCTAAGA;SOR=0.417;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=44;TCF=9;TCR=35;TR=21;WE=41601124;WS=41601106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,23:0.48:48
chr4	41607754	rs11943304	T	C	531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=0;PP=456;SC=TTAAAGTGATTTTACATTTAA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=41607762;WS=41607747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	41611575	rs1105886	A	G	6251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=114;NR=107;PP=2965;SC=AATGTTGAGCAGTAAAAGAGA;SOR=0.701;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=221;TCF=114;TCR=107;TR=221;WE=41611583;WS=41611565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr4	41615249	rs66955637	A	AT	148.50	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.9997;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.157;NF=1;NR=8;PP=190;ReadPosRankSum=0.887;SC=TTATTTGGGGATTTTTTTAAA;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=9;WE=41615257;WS=41615239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr4	41615690	rs13146318	T	A	1131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=33;PP=867;SC=TAGGTTGGAGTCTTAATAAAC;SOR=3.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=4;TCR=33;TR=37;WE=41615698;WS=41615680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr4	41629036	rs5857808	G	GGTGT	447.19	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.33;ReadPosRankSum=-1.441;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr4	41691709	rs77420897	T	C	1817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.891;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=42;PP=1056;ReadPosRankSum=0.409;SC=TTTGGCATCGTTCCGTGCTGA;SOR=0.557;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=158;TCF=69;TCR=89;TR=78;WE=41691717;WS=41691699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,88:0.51:174
chr4	41984118	rs2660320	C	T	3697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.830;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=72;PP=2186;ReadPosRankSum=0.593;SC=GCATCATCAGCCTGCGAACTC;SOR=0.763;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=291;TCF=155;TCR=136;TR=154;WE=41984126;WS=41984108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,176:0.53:332
chr4	41985101	rs2660332	A	G	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=196;ReadPosRankSum=-0.756;SC=CGTGTTGTATATAGATCGCAT;SOR=0.208;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=12;WE=41985109;WS=41985091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,12:0.32:38
chr4	41992677	rs2581434	C	G	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.631;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=19;PP=469;ReadPosRankSum=-3.096;SC=GGATGTTACCCGGCTTGGCCG;SOR=0.776;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=144;TCF=77;TCR=67;TR=42;WE=41992685;WS=41992667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,48:0.29:166
chr4	42003671	rs1047626	A	G	2518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.973;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=46;PP=1388;ReadPosRankSum=-0.113;SC=CTTTTCAAACATGGTTCCCTG;SOR=0.615;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=218;TCF=132;TCR=86;TR=109;WE=42003679;WS=42003661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,126:0.50:251
chr4	42003835	rs2581453	C	G	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.646;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=298;ReadPosRankSum=0.012;SC=TTTCTGTATACTGGAATAGTT;SOR=1.179;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=46;TCF=7;TCR=39;TR=18;WE=42003843;WS=42003825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,19:0.40:47
chr4	42020142	rs2581423	A	G	1561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.19;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr4	42020347	rs2581422	A	G	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=101;ReadPosRankSum=1.067;SC=ATTCTCTTACATATAAACTAA;SOR=1.609;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=9;WE=42020355;WS=42020337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr4	42022464	rs15857	C	A	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.035;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=298;ReadPosRankSum=1.822;SC=GGGAGTATGGCTCAAAGTACA;SOR=1.297;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=44;TCF=22;TCR=22;TR=20;WE=42022472;WS=42022454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,22:0.43:51
chr4	42024982	rs13107768	A	G	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.190;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=19;PP=464;ReadPosRankSum=0.994;SC=AAAAGTGCAAACCAAATTTTG;SOR=0.445;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=57;TCF=20;TCR=37;TR=31;WE=42024990;WS=42024972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,34:0.54:63
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chr4	42025207	rs3213767	A	G	1601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=8;PP=1246;SC=ATGTTTCTCCAAAAGCACCTT;SOR=3.296;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=47;TCR=8;TR=55;WE=42025215;WS=42025197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
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chr4	42040947	rs12641900	C	T	1487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.129;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=20;PP=867;ReadPosRankSum=0.855;SC=CCACCAGTTACAGTGCTTCTC;SOR=0.914;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=123;TCF=78;TCR=45;TR=58;WE=42040955;WS=42040937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,70:0.48:146
chr4	42051608	rs4241696	T	G	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=34;ReadPosRankSum=1.465;SC=GCTTGTGGGATAAAATAAAAG;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=42051616;WS=42051598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr4	42065269	rs3804190	A	G	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.501;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=59;ReadPosRankSum=0.623;SC=GTAGGGTTATATATCTATAGT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=4;WE=42065277;WS=42065259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr4	42069029	rs12643893	T	C	692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=397;ReadPosRankSum=-1.756;SC=TGGATACTTATTAAAATGTTA;SOR=0.613;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=51;TCF=40;TCR=11;TR=27;WE=42069037;WS=42069019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,31:0.54:57
chr4	42069331	rs11409064	C	CA	164.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=155;SC=ATGTTAATTCCTACTAATCAT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=42069339;WS=42069321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	42127762	.	GT	G	52.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.590;ClippingRankSum=0.000;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.64;ReadPosRankSum=0.662;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr4	42400112	rs11733156	G	T	2990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=64;NR=30;PP=1591;SC=TCCTTGGCTGGCTGCGCTGGG;SOR=1.295;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=64;TCR=30;TR=94;WE=42400120;WS=42400102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr4	42448789	rs35005173	T	TA	99.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=6.021;HP=11;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=90;ReadPosRankSum=1.611;SC=GAAATGAGATTAAAAAAAAAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=42448797;WS=42448779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr4	42571074	rs6845603	A	T	1070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.18;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr4	42582047	rs6447171	A	C	553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=15;PP=429;SC=ATGATTTAGCAATCTATACTT;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=42582055;WS=42582037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	42592935	rs3833615	C	CA	295.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=3;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=29;PP=410;ReadPosRankSum=0.637;SC=TTAAAATGGCCAAAAAAAAAA;SOR=0.693;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=51;TCF=5;TCR=46;TR=30;WE=42592943;WS=42592924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,16:0.70:23
chr4	42596461	rs77305935	TAC	T	173.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=61.78;NF=0;NR=5;PP=188;SC=AAGCATAGAATACACAGTAAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=5;WE=42596470;WS=42596451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	42602606	rs6819419	A	C	1057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=20;PP=665;SC=ATGAAATAATAATTTTAAACG;SOR=1.432;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=12;TCR=20;TR=32;WE=42602614;WS=42602596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr4	42617935	rs10003317	A	G	386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=2;PP=147;SC=AATCTACCCCAAAACAAAAAC;SOR=1.765;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=42617943;WS=42617925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	42618021	rs113477520	T	TA	2609.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=17;PP=1358;SC=GTTTGACAAATATGAGAAAAA;SOR=1.163;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=33;TCF=16;TCR=17;TR=31;WE=42618029;WS=42618011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr4	42618138	rs10033628	A	G	1532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=31;PP=941;SC=AAATGTGAATAAGATTACTAA;SOR=1.445;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=19;TCR=31;TR=50;WE=42618146;WS=42618128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr4	42626659	rs11306052	GA	G	290.92	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.7798;FS=0.000;HP=14;HapScore=4;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=206;ReadPosRankSum=0.715;SC=TTGCTGTTTGGAAAAAAAAAA;SOR=0.859;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=20;WE=42626681;WS=42626647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,16:0.89:18
chr4	42627805	rs1460358	A	C	336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=10;PP=269;SC=TCTGTTACTAACATATAAAAA;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=42627813;WS=42627795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	42639186	rs898500	A	G	4467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.579;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=62;PP=2632;ReadPosRankSum=-0.643;SC=TTTTCTGATCAACATGGAATG;SOR=0.654;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=151;TCF=88;TCR=63;TR=150;WE=42639194;WS=42639176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,170:0.99:171
chr4	42659028	rs12503784	T	C	437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=12;PP=285;SC=AGGGCAGAGCTGCCGCCGGGC;SOR=1.739;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=17;WE=42659036;WS=42659018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	42895308	rs78136490	G	A	664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-3.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.535;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=385;ReadPosRankSum=-1.056;SC=GATGAAGCCAGAAAGTGACAG;SOR=0.399;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=47;TCF=34;TCR=13;TR=25;WE=42895316;WS=42895298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,29:0.53:55
chr4	42895715	rs41493449	A	G	1416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=38;PP=840;ReadPosRankSum=-1.979;SC=CTAACTCACCATCTGAACACC;SOR=0.768;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=101;TCF=38;TCR=63;TR=60;WE=42895723;WS=42895705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,66:0.60:110
chr4	42965159	rs10213360	A	C	7787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=119;NR=156;PP=2965;SC=GGGGTAAGTAAGCTGCCCAGG;SOR=1.062;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=275;TCF=119;TCR=156;TR=275;WE=42965167;WS=42965149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,295:1.00:295
chr4	43032612	rs4861050	G	A	2202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=48;PP=1320;SC=CAATACTTTGGTTTATATATA;SOR=1.668;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=24;TCR=48;TR=72;WE=43032620;WS=43032602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr4	44295839	rs13117500	G	A	1202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.412;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=25;PP=627;ReadPosRankSum=-2.688;SC=CAAAGACATCGTCAGAGAACC;SOR=0.871;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=112;TCF=58;TCR=54;TR=52;WE=44295847;WS=44295829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,61:0.48:127
chr4	44295943	rs13145563	A	G	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=2.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=178;ReadPosRankSum=-1.081;SC=CATTTGTTTAACAATTTTCTT;SOR=0.693;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=10;WE=44295951;WS=44295933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr4	44652187	rs1113098	C	G	185.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=150;SC=TATTTACAAACATCAAATGAC;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=44652195;WS=44652177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr4	44682465	rs6447368	T	C	2180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=49;NR=24;PP=1220;SC=TAGGAAAAACTTGACATGTCT;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=49;TCR=24;TR=73;WE=44682473;WS=44682455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr4	44684455	rs13117025	C	T	1837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=28;NR=34;PP=1026;SC=AACAGTGTTGCTATTTCACTT;SOR=1.117;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=28;TCR=34;TR=62;WE=44684463;WS=44684445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr4	44684507	rs9291245	C	T	442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=297;SC=TTGTACTATTCATTATATGAG;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=44684515;WS=44684497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	44685224	rs112232487	T	TA	1492.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=7;PP=1145;SC=TTTATTATACTTCACATAATG;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=25;WE=44685244;WS=44685214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr4	44685225	rs58659516	T	A	1501.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=7;PP=681;SC=TTATTATACTTCACATAATGG;SOR=2.303;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=37;TCF=27;TCR=10;TR=32;WE=44685244;WS=44685214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr4	44690320	rs1491304	A	T	245.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=201;SC=GTTTATAATTACATATGTGTG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=44690328;WS=44690310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	44696538	rs12641137	C	G	1112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=17;NR=20;PP=605;SC=CAAGTAAGTTCAATAGAAACT;SOR=1.127;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=17;TCR=20;TR=37;WE=44696546;WS=44696528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr4	44699484	rs6851576	T	G	2578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=37;NR=41;PP=1332;SC=TTGTATTTATTCTACTTTATA;SOR=0.999;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=37;TCR=41;TR=78;WE=44699492;WS=44699474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr4	44699506	rs6821295	C	T	2191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=33;NR=37;PP=1143;SC=CTTTTATGGGCTTTAAATCAA;SOR=1.013;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=33;TCR=37;TR=70;WE=44699514;WS=44699496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr4	44700453	rs1547526	G	C	43.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr4	44709695	rs1491302	C	T	245.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=201;SC=GAGATTTAACCCCACAGTCAC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=44709703;WS=44709688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	44712908	rs3749582	T	C	1615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=11;PP=1207;SC=GCATCATAACTCCTCCAAAAT;SOR=2.387;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=42;TCR=11;TR=53;WE=44712916;WS=44712898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr4	44713235	rs1124828	A	G	548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=15;PP=422;SC=GAACAAAAAAAAAATCACCTT;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=44713243;WS=44713225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	44719048	rs1873522	A	T	561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=3;PP=342;SC=TACATTACACAATGGGAAGAT;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=44719056;WS=44719038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	44720248	rs3792705	T	A	1165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=9;PP=733;SC=CAAATATACTTGTATTCTAAA;SOR=1.900;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=38;WE=44720256;WS=44720238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr4	46086060	rs976156	T	C	831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=21;PP=424;ReadPosRankSum=-0.378;SC=TTTCAATTACTGTGGGCCTCA;SOR=0.660;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=67;TCF=29;TCR=38;TR=38;WE=46086068;WS=46086050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,42:0.55:77
chr4	46263862	rs35496835	A	AG	936.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=1111;ReadPosRankSum=-1.085;SC=CTTTAATGTCAGTTTTTAGAA;SOR=0.782;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=45;TCF=34;TCR=11;TR=20;WE=46263872;WS=46263852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,24:0.43:56
chr4	46263864	rs10938435	T	A	945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=1119;ReadPosRankSum=-1.133;SC=TTAATGTCAGTTTTTAGAAAC;SOR=0.741;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=45;TCR=12;TR=24;WE=46263872;WS=46263852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,27:0.44:61
chr4	46314593	rs279858	T	C	1626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.227;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=29;PP=861;ReadPosRankSum=0.335;SC=CTACTGATTTTTTCCCATTGT;SOR=0.507;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=66;TCR=52;TR=65;WE=46314601;WS=46314583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,76:0.58:132
chr4	46334702	rs279827	A	G	1122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.021;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=23;PP=717;ReadPosRankSum=0.620;SC=AATACTGTCTAATATGAGAAA;SOR=0.538;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=62;TCF=32;TCR=30;TR=46;WE=46334710;WS=46334692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,49:0.72:68
chr4	46334810	rs279828	A	C	205.85	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.8374;FS=4.616;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=164;ReadPosRankSum=-0.447;SC=ATTCGGGAGTACTGGGTTTTA;SOR=3.056;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=9;WE=46334818;WS=46334800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr4	46994972	rs34464680	G	GA	384.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=4.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=1.124;QD=7.54;ReadPosRankSum=-0.477;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,23:0.45:51
chr4	46995366	rs2229940	G	T	1919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.198;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=27;PP=1007;ReadPosRankSum=-0.959;SC=CAAACCGCCAGGCACAGGAAG;SOR=0.818;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=152;TCF=95;TCR=57;TR=79;WE=46995374;WS=46995356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,93:0.53:175
chr4	47033767	rs200686643	ATCTCGC	A	2530.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.412;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.239;NF=8;NR=41;PP=2602;ReadPosRankSum=3.724;SC=CTGTTGTTGAATCTCGCTCTC;SOR=1.141;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=103;TCF=20;TCR=83;TR=49;WE=47033782;WS=47033757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,76:0.53:144
chr4	47034075	rs45460902	G	A	620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.369;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=18;PP=351;ReadPosRankSum=-1.809;SC=CTCCTTTTCTGTCAAAGATAA;SOR=1.148;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=78;TCF=27;TCR=51;TR=29;WE=47034083;WS=47034065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,29:0.49:59
chr4	47034104	.	G	A	219	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;FR=1.0000;HP=17;HapScore=2;MGOF=35;MMLQ=29;MQ=53.33;NF=2;NR=16;PP=219;QD=14.0984006971;SC=AAAAAAAAAAGAAAAGGCATG;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=18;WE=47034112;WS=47034092;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,18:0.82:22
chr4	47034144	.	G	GACACACAC	101	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=54;MMLQ=16;MQ=57.35;NF=0;NR=7;PP=101;QD=28.7142857143;SC=CTATACCCTGGGCACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=7;WE=47034153;WS=47034134;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,7:0.54:13
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chr4	47408709	rs6289	A	G	1487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.765;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=27;PP=847;ReadPosRankSum=-0.212;SC=GAATCACGACAGTGCTTACAA;SOR=0.512;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=148;TCF=89;TCR=59;TR=66;WE=47408717;WS=47408699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,74:0.46:162
chr4	47525009	rs5858076	T	A	2322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.70;ReadPosRankSum=-0.618;SOR=0.613;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,86:0.99:87
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chr4	47560859	rs79884646	A	C	143.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=5;NR=0;PP=113;SC=TTTAGTGTGGATAAAACTACT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=47560867;WS=47560849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	47582387	rs2351791	A	C	13337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=490;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=238;NR=190;PP=2965;SC=TAATCTTACTACCTCCCCGTT;SOR=0.881;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=430;TCF=239;TCR=191;TR=428;WE=47582395;WS=47582377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,486:1.00:486
chr4	47666981	rs17462881	A	G	1551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=10;PP=1115;SC=TCCAAACTCAACTAAGTCTTC;SOR=2.215;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=38;TCR=10;TR=48;WE=47666989;WS=47666971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr4	47667064	rs11934749	T	C	4277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=58;PP=2308;SC=AGGAGGGATATGCTCGCCTGT;SOR=0.990;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=141;TCF=82;TCR=59;TR=140;WE=47667072;WS=47667054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr4	47682174	rs10517195	A	G	9403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=359;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=169;NR=151;PP=2965;SC=TGACCTCGTCAGACTTATCCA;SOR=0.811;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=320;TCF=169;TCR=151;TR=320;WE=47682182;WS=47682164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,358:1.00:358
chr4	47853843	rs6822668	T	C	1565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.828;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=16;PP=1144;ReadPosRankSum=1.132;SC=AGGCCACTAGTCTTTAAAATG;SOR=1.552;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=147;TCF=101;TCR=46;TR=68;WE=47853851;WS=47853833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,71:0.44:163
chr4	47857040	rs7690499	T	C	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.323;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=29;ReadPosRankSum=0.682;SC=AAACAACTTATATAGAAAAGT;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=5;WE=47857048;WS=47857030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr4	47887536	rs2053404	T	C	2027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.525;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=40;PP=1211;ReadPosRankSum=0.195;SC=GCTTTATTAATGCTTGATCAT;SOR=0.574;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=249;TCF=152;TCR=97;TR=100;WE=47887544;WS=47887526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,106:0.39:271
chr4	47887991	rs6818556	G	A	1230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.970;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=33;PP=759;ReadPosRankSum=0.254;SC=TCACATCTACGGTTTCTGGGC;SOR=0.547;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=152;TCF=69;TCR=83;TR=62;WE=47887999;WS=47887981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,66:0.40:166
chr4	47888137	rs11940441	T	A	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.361;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=86;ReadPosRankSum=-2.402;SC=ATGAAGAAACTACAACAACAT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=6;WE=47888145;WS=47888127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
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chr4	47901088	rs34323060	C	T	1110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.805;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=31;PP=735;ReadPosRankSum=0.253;SC=GTTTTGCTTTCTTACAGTAAC;SOR=1.055;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=90;TCF=35;TCR=55;TR=48;WE=47901096;WS=47901078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,51:0.54:95
chr4	47905158	rs2119204	A	G	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.456;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=224;ReadPosRankSum=0.997;SC=TGACAAGAGCAAAACTCCATC;SOR=1.508;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=16;WE=47905166;WS=47905148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
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chr4	47916346	rs6826122	C	G	143.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=4;PP=85;SC=TGCAGGGCGGCGACCGGGTTT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=47916354;WS=47916336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
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chr4	47951945	rs1972883	G	A	2316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.821;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=53;PP=1336;ReadPosRankSum=0.465;SC=TGAAATCACAGTAGTCACCAT;SOR=0.538;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=211;TCF=103;TCR=108;TR=104;WE=47951953;WS=47951935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,117:0.48:243
chr4	47953515	rs3845160	A	T	940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=24;PP=576;ReadPosRankSum=0.184;SC=CAGAGAGAGAAGAGTTAATGT;SOR=0.627;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=85;TCF=37;TCR=48;TR=42;WE=47953523;WS=47953505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,47:0.49:96
chr4	47973185	rs71200905	TTG	T	160.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.624;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=300;ReadPosRankSum=0.319;SC=ATATCTATATTTGTGTGTGTG;SOR=1.085;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=9;WE=47973194;WS=47973175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
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chr4	48018761	rs77335151	A	G	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=134;ReadPosRankSum=-0.657;SC=AGGGCGCCCCATTCCCAGACC;SOR=1.179;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=16;TCF=11;TCR=5;TR=10;WE=48018769;WS=48018751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr4	48069696	rs2230594	G	C	5106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=102;PP=2943;SC=GCAGCAGCTCGGCAAATGTAG;SOR=0.966;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=183;TCF=81;TCR=102;TR=183;WE=48069704;WS=48069686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr4	48069725	rs9996535	G	A	3401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=76;PP=2359;SC=TCAGGTTTCTGGAAAAGGGAA;SOR=1.690;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=35;TCR=76;TR=111;WE=48069733;WS=48069715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr4	48073501	rs906486	G	T	5158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=78;PP=2965;SC=TGCTGGGACTGCCAACCTTCA;SOR=0.935;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=177;TCF=99;TCR=78;TR=177;WE=48073509;WS=48073491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr4	48081896	rs11358014	CA	C	2331.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.913;HP=12;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;MQRankSum=0.426;NF=33;NR=28;PP=867;ReadPosRankSum=1.872;SC=AGGTATGATACAAAAAAAAAA;SOR=1.741;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=95;TCF=53;TCR=42;TR=61;WE=48081905;WS=48081885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:5,102:0.95:107
chr4	48082208	rs2352590	T	C	2423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=50;PP=1617;SC=TGTTTGAACATAACTGGTAGT;SOR=1.952;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=22;TCR=50;TR=72;WE=48082216;WS=48082198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr4	48088446	rs6858664	A	G	2461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=23;PP=1465;SC=ACACCAGGGCATGGTATGATA;SOR=1.686;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=59;TCR=23;TR=82;WE=48088454;WS=48088436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr4	48107096	rs6825925	T	A	212.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=173;SC=AGTGTTTTTTTAAATTCAGAT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=48107104;WS=48107086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	48115264	rs7658300	C	T	5788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=106;PP=2965;SC=CGGCCTGCGACGCTGGGTGTA;SOR=1.135;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=186;TCF=80;TCR=106;TR=186;WE=48115272;WS=48115254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr4	48139306	rs3062021	ATTAT	A	1101.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.119;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=882;ReadPosRankSum=0.958;SC=CTAGAAGCAAATTATTTATGT;SOR=2.044;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=50;TCF=39;TCR=11;TR=20;WE=48139317;WS=48139296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,30:0.46:65
chr4	48139565	rs2661529	C	A	3534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=47;NR=70;PP=2164;SC=ATCCATTCCACAAAACCTCTC;SOR=1.288;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=47;TCR=70;TR=117;WE=48139573;WS=48139541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr4	48143201	rs17470892	T	C	731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=4;PP=483;SC=TAACAGGCTATACTACCACCT;SOR=2.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=48143209;WS=48143191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	48147309	rs17574371	T	C	6479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=109;NR=93;PP=2965;SC=GGTGTGTCAGTTTCCTGGGAA;SOR=0.756;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=202;TCF=109;TCR=93;TR=202;WE=48147317;WS=48147299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr4	48147612	rs2661547	T	G	2050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=41;PP=1327;SC=GGACAGAAAGTGAAAGTGTTC;SOR=1.340;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=26;TCR=41;TR=67;WE=48147620;WS=48147602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr4	48148435	rs3749503	G	A	6330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=107;NR=102;PP=2965;SC=CAAAGAAAGCGTTGCAGTCAA;SOR=0.836;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=209;TCF=107;TCR=102;TR=209;WE=48148443;WS=48148425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr4	48158524	rs882715	G	A	313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=1;PP=264;SC=CTAGAAACTGGATTTGTCAGC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=48158532;WS=48158514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	48165888	rs139950746	CTTA	C	1195.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=19;PP=893;SC=TTGCTTAAAGCTTATTATAAG;SOR=1.863;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=20;WE=48165898;WS=48165878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr4	48169769	rs7689953	A	G	9320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=347;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=182;NR=145;PP=2965;SC=CCCACTGCATATCACACACAT;SOR=0.887;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=327;TCF=182;TCR=145;TR=327;WE=48169777;WS=48169759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,347:1.00:347
chr4	48170669	rs2243840	A	G	2760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=58;PP=1668;SC=ACAAAAACAGATTAAAATGCT;SOR=1.279;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=40;TCR=58;TR=98;WE=48170677;WS=48170659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr4	48380162	rs115502524	G	C	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.183;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=30;ReadPosRankSum=0.086;SC=TCTGCAGTTCGAGTTCATTTT;SOR=0.132;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=5;WE=48380170;WS=48380152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr4	48486193	rs6845250	C	G	8166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=125;NR=153;PP=2965;SC=ATTCCTTGGGCATCTGTCTCA;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=279;TCF=126;TCR=153;TR=278;WE=48486201;WS=48486183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,304:1.00:304
chr4	48487297	rs7676578	T	A	357.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.52;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	48491010	rs3811759	A	G	208.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=171;SC=TCATATTTATAGCCTGTGGTA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=48491018;WS=48491000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	48492434	rs10008444	G	C	2232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=42;NR=31;PP=1197;SC=GCTGGCAGCAGCGCGGCAGGG;SOR=0.740;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=42;TCR=31;TR=73;WE=48492442;WS=48492424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr4	48493388	rs7340880	T	C	92.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=2;PP=58;SC=AAGCGTGGGCTACTTCCGTAT;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=4;WE=48493396;WS=48493378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	48494708	rs35912975	A	T	1442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=8;PP=1020;SC=AATATCAAGTAGATCCTTCCC;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=36;TCR=8;TR=44;WE=48494716;WS=48494698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr4	48496368	rs17472127	A	G	231.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=159;SC=AAGGCAGTGTATTCTGAAAAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=48496376;WS=48496358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	48516970	rs7434721	C	T	868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=5;PP=457;SC=TAAACTGAAACAGAGGGGCAC;SOR=2.235;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=27;WE=48516978;WS=48516960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr4	48517352	rs7661515	C	A	103.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=79;SC=TTTTACAACACAATAAATAAG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=48517360;WS=48517342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	48529683	rs11356838	TA	T	297.52	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.66;ReadPosRankSum=0.466;SOR=0.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,17:0.89:19
chr4	48529733	rs4695385	G	A	313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=18;PP=508;SC=TGCGTATGAGGTATCAGTACC;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=48529741;WS=48529723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	48537603	rs3838234	T	TACAC	277.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=9;NR=0;PP=397;SC=TATATACACATACACACACAC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=9;WE=48537611;WS=48537593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	48546796	rs78799039	A	G	1046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.716;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=13;PP=619;ReadPosRankSum=0.527;SC=TTCTTAAAAGATACCTGAGCT;SOR=0.809;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=102;TCF=69;TCR=33;TR=41;WE=48546804;WS=48546786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,49:0.40:121
chr4	48547041	rs952289	A	C	1451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=38;PP=1099;SC=TAAATAGGTCACAGTCTACTA;SOR=2.880;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=9;TCR=38;TR=47;WE=48547049;WS=48547031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr4	48558882	rs4694898	C	T	721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=0;PP=577;SC=GTCTTCATCCCGGCCCTTGCC;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=48558890;WS=48558874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	48563715	rs75165298	A	G	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.448;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=207;ReadPosRankSum=0.673;SC=AAGTTTAACTATAATTTTATA;SOR=1.002;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=39;TCF=9;TCR=30;TR=15;WE=48563723;WS=48563705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,17:0.40:42
chr4	48565101	rs13138269	A	T	696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=16;PP=423;SC=GCTTATAGGCATCTATCTTCT;SOR=2.215;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=22;WE=48565109;WS=48565091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	48577121	rs28558226	C	T	7153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=118;NR=109;PP=2965;SC=AAAAAATGTACGAACATAGTT;SOR=0.732;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=227;TCF=118;TCR=109;TR=227;WE=48577129;WS=48577111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,259:1.00:259
chr4	48582836	rs4695390	A	T	3684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=34;PP=2324;SC=TGTGTCTGTCATAAGTCTCAA;SOR=1.455;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=84;TCR=34;TR=118;WE=48582844;WS=48582826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr4	48588742	rs34558821	C	T	4696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=82;PP=2741;SC=GTTTTCTTTCCCCCCTGAAAA;SOR=1.070;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=65;TCR=83;TR=146;WE=48588750;WS=48588730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr4	48596036	.	TA	T	67.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.891;ClippingRankSum=0.000;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=1.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.21;MQRankSum=2.001;QD=1.41;ReadPosRankSum=-1.905;SOR=0.375;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,10:0.21:48
chr4	48607938	rs2940319	T	C	273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=8;PP=222;SC=GAACACTCTGTCATTTTACCA;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=48607946;WS=48607928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	48611149	rs2354348	A	G	620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.38;SOR=4.047;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	48611153	rs776603	A	T	620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.38;SOR=4.047;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	48611639	.	G	GA	109	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=13;HapScore=4;MGOF=6;MMLQ=18;MQ=60.83;NF=3;NR=5;PP=109;QD=14.75;SC=CTTGCCTCAAGAAAAAAAAAA;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=10;TCF=5;TCR=5;TR=8;WE=48611658;WS=48611629;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:2,8:0.80:10
chr4	48625213	rs776579	C	A	419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=13;PP=232;SC=TTAAAAAAAACAAACATTAAA;SOR=1.911;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=24;TCF=10;TCR=14;TR=22;WE=48625221;WS=48625202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	48655635	rs776580	T	A	2322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=55;NR=30;PP=1285;SC=AACAGCTTTTTATCTATTTGG;SOR=1.095;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=55;TCR=31;TR=85;WE=48655643;WS=48655625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr4	48655824	rs141132438	AAGCAGC	A	351.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=325;SC=TCAGCTGCAAAAGCAGCAGCA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=7;WE=48655837;WS=48655814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	48851937	rs3761729	C	T	3332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=26;PP=2065;SC=CATTCAGTTACACTTTTTGTT;SOR=2.224;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=80;TCR=26;TR=106;WE=48851945;WS=48851927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr4	48988450	rs3747690	C	A	829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.432;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=13;PP=491;ReadPosRankSum=-0.811;SC=CGCGGCGATGCCCTCGCTGTG;SOR=0.930;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=112;TCF=74;TCR=38;TR=42;WE=48988458;WS=48988440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,45:0.37:123
chr4	48988705	rs2572344	G	A	548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=16;PP=398;SC=TCTGCGAGGCGCCCGCGAGAG;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=48988713;WS=48988695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	48990476	rs10537617	CT	C	774.06	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=2.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.19;MQRankSum=0.426;QD=15.18;ReadPosRankSum=-0.971;SOR=1.780;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,45:0.88:51
chr4	48994138	rs28678278	G	T	2131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=44;PP=1293;SC=TTTTCTCTTTGCAGAGCTTAC;SOR=1.281;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=28;TCR=44;TR=72;WE=48994146;WS=48994128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr4	49000599	rs146230326	T	A	3221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.413;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=74;PP=1967;ReadPosRankSum=1.620;SC=AGAACACGACTGAGCTTGGTT;SOR=0.650;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=282;TCF=133;TCR=149;TR=142;WE=49000607;WS=49000589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,157:0.51:309
chr4	49019232	rs28610228	T	A	1220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=13;PP=769;SC=TTATTTATTTTAAAAAAACCC;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=42;TCF=29;TCR=13;TR=41;WE=49019240;WS=49019222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr4	49063872	rs1051447	C	A	2331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=27;PP=1347;SC=AAACAACCATCATTTTCATAT;SOR=1.101;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=47;TCR=27;TR=74;WE=49063880;WS=49063862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr4	52744120	.	GGT	G	41	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=41;QD=16.3333333333;SC=TTCAAATTTGGGTGTGTGTGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=3;WE=52744129;WS=52744110;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:13,3:0.19:16
chr4	52896050	rs225170	A	G	596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.502;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=21;PP=417;ReadPosRankSum=0.385;SC=ACACAAGTCCACTGTTGGTAG;SOR=0.404;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=66;TCF=14;TCR=52;TR=28;WE=52896058;WS=52896040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,30:0.43:70
chr4	52927113	rs999634	C	A	1064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.175;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=30;PP=721;ReadPosRankSum=1.565;SC=TGAGATAAAACGAATCAGAAA;SOR=0.929;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=133;TCF=61;TCR=72;TR=51;WE=52927121;WS=52927103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,55:0.37:149
chr4	52927229	rs784944	A	G	556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=15;PP=375;SC=TTGAACAGGTAGAGATCAGAC;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=19;WE=52927237;WS=52927219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	52938243	rs3860707	T	C	1565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.013;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=28;PP=984;ReadPosRankSum=1.263;SC=AGAAGCCATGTCCGATTATAA;SOR=0.519;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=142;TCF=84;TCR=58;TR=63;WE=52938251;WS=52938233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,73:0.46:160
chr4	52942779	rs55839120	G	T	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.763;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=70;ReadPosRankSum=1.541;SC=CAGAAGTCTGGTACCAGATGC;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=5;WE=52942787;WS=52942772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr4	52945207	rs12641673	G	A	86.81	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=76;ReadPosRankSum=-0.524;SC=TTACTTGGTAGCACCTGCCAT;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=52945215;WS=52945197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr4	52945799	rs7689145	C	T	702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=0;PP=589;SC=CTTTAACTTGCTTTGGCTCAC;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=52945807;WS=52945789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr4	52946161	rs7657148	A	G	1354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=38;PP=1062;SC=AAACAATTTAAGGAAAAGAAC;SOR=6.091;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=39;TCF=1;TCR=38;TR=39;WE=52946169;WS=52946151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr4	52948834	rs35414474	C	G	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.375;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=145;ReadPosRankSum=1.192;SC=AGAACTGATTCTTTTCTTTGA;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=8;WE=52948842;WS=52948824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr4	52951213	rs147423128	CTT	C	771.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.16;SOR=1.519;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	52960908	rs3214049	T	A	1637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.273;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=27;PP=965;ReadPosRankSum=-1.170;SC=GCAGGTCCCATGGGTCATGTA;SOR=0.508;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=115;TCF=72;TCR=43;TR=68;WE=52960916;WS=52960898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,76:0.58:131
chr4	54011424	rs4864727	C	T	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=235;ReadPosRankSum=0.344;SC=CCTCCTCTTCCCAAAACAGTA;SOR=0.606;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=14;WE=54011432;WS=54011414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,14:0.40:35
chr4	54011603	rs17082453	C	T	2430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.596;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=44;PP=1460;ReadPosRankSum=-1.073;SC=CTTTGTCTACCGTGAGCTCTC;SOR=0.614;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=185;TCF=95;TCR=90;TR=98;WE=54011611;WS=54011593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,110:0.50:218
chr4	54245476	rs1471596	A	T	180.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=4;PP=100;SC=GGTTGTGTGAAACAATGGTTC;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=54245484;WS=54245466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	54248418	rs56007140	A	G	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.004;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=346;ReadPosRankSum=0.286;SC=AATGCCTGACATGTATACTTA;SOR=0.865;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=62;TCF=42;TCR=20;TR=26;WE=54248426;WS=54248408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,26:0.39:66
chr4	54250189	rs10012853	T	G	456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=323;SC=TCATCATGAATATACTTCTTT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=54250197;WS=54250179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	54256167	rs9994692	G	A	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.261;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=33;ReadPosRankSum=0.379;SC=GTACAGTGGCGCAATCTTAGT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=4;WE=54256175;WS=54256157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr4	54257865	rs62325162	A	G	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=320;ReadPosRankSum=0.293;SC=CTATTATACTAACAAATGCCG;SOR=0.446;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=18;WE=54257873;WS=54257855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,18:0.69:26
chr4	54310188	rs11722866	A	G	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.020;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=301;ReadPosRankSum=1.389;SC=TGTACCAGACATAAAAATATA;SOR=0.982;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=54;TCF=36;TCR=18;TR=26;WE=54310196;WS=54310178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,27:0.46:59
chr4	54310281	rs11723755	T	G	913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=2.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQRankSum=1.000;QD=10.15;ReadPosRankSum=0.036;SOR=0.465;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,46:0.51:90
chr4	54310340	rs59279367	TA	T	380.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.686;HP=7;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.002;NF=0;NR=14;PP=440;ReadPosRankSum=-0.284;SC=TTTAAAGCAATAAAAACGTGT;SOR=1.236;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=14;WE=54310348;WS=54310330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr4	54327032	rs34823651	C	CTAT	1466.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.963;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=7;PP=786;ReadPosRankSum=1.199;SC=ACTTCTTAGCCTATTTGTGAT;SOR=0.941;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=45;TCF=24;TCR=21;TR=20;WE=54327040;WS=54327022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,37:0.48:77
chr4	54327211	.	TA	T	43.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=0.000;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=12.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQRankSum=0.514;QD=0.86;ReadPosRankSum=0.116;SOR=0.030;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,9:0.18:51
chr4	54327235	rs3811785	T	C	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-4.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.928;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=27;PP=499;ReadPosRankSum=2.244;SC=AAACAAGATATGATTAGTATT;SOR=2.338;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=8;TCR=43;TR=32;WE=54327243;WS=54327225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,25:0.60:42
chr4	54327584	rs3765158	A	G	696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.620;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=7;PP=467;ReadPosRankSum=-1.330;SC=AGTATTTTTGATTAGTCATTA;SOR=0.389;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=54;TCF=44;TCR=10;TR=29;WE=54327592;WS=54327574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,31:0.56:55
chr4	54362676	rs2271559	A	G	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.761;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=291;ReadPosRankSum=0.791;SC=CTGCTCTCCCACCTCATCCTG;SOR=0.148;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=37;TCF=9;TCR=28;TR=21;WE=54362684;WS=54362666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,25:0.61:41
chr4	54364673	rs2292578	T	C	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.569;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=97;ReadPosRankSum=0.280;SC=CAGAGAGTCATAAAATGATAG;SOR=1.828;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=6;WE=54364681;WS=54364663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr4	54373464	rs10021772	C	T	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=383;ReadPosRankSum=-0.175;SC=TCCATCCAGCCTTATGGGGAG;SOR=0.911;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=22;WE=54373472;WS=54373454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,19:0.41:46
chr4	54423948	rs59900244	A	ATTCCTCT	1193.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=8;PP=980;ReadPosRankSum=-0.266;SC=TGTGGAATTTAAAATGGATAT;SOR=0.639;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=60;TCF=30;TCR=30;TR=18;WE=54423956;WS=54423938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,31:0.36:86
chr4	54852693	rs149656971	CTTTTATTTTATTTTATTTTATTTTA	C,CTTTTATTTTATTTTATTTTA	805.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;QD=40.29;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,16,4:0.80,0.20:20
chr4	54876132	rs4437313	C	A	882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.35;QD=24.52;SOR=0.927;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr4	54915527	rs75090248	T	C	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=166;ReadPosRankSum=-0.151;SC=GCCAAAAATGTAGACCATTTA;SOR=0.495;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=8;TCR=14;TR=11;WE=54915535;WS=54915517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr4	54930269	rs139920029	CAG	C	277.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=220;ReadPosRankSum=1.747;SC=CAGACGGACACAGGGGAAACG;SOR=0.368;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=6;WE=54930278;WS=54930259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
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chr4	54966830	rs13144341	G	A	3287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=55;PP=2057;SC=TCTGCTTAAGGGCCAGTTCTC;SOR=0.800;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=52;TCR=55;TR=107;WE=54966838;WS=54966820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr4	54966919	rs1132998	T	C	1834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.595;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=28;PP=1091;ReadPosRankSum=-0.695;SC=AGCACCACCATCACCATCATC;SOR=0.761;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=135;TCF=82;TCR=53;TR=71;WE=54966927;WS=54966909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,79:0.51:155
chr4	54967214	rs6554148	C	T	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=225;ReadPosRankSum=0.024;SC=TTAGTGTAACCGTAGAGTCAG;SOR=0.223;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=13;WE=54967222;WS=54967204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr4	54967709	rs2278142	C	A	849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.946;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=12;PP=558;ReadPosRankSum=-0.178;SC=AGCACCTTGCCCGAGCCTTAC;SOR=0.508;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=74;TCF=55;TCR=19;TR=41;WE=54967717;WS=54967699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,41:0.53:78
chr4	55141055	rs1873778	A	G	8430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=163;NR=132;PP=2965;SC=CAATCAGCCCAGATGGACATG;SOR=0.789;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=296;TCF=163;TCR=133;TR=295;WE=55141063;WS=55141045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,327:1.00:327
chr4	55146406	rs6148442	T	TTGTAGGTCCCCCAG	659.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=2679;SC=ACCTGGCACATAATCATCATC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=9;WE=55146414;WS=55146405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	55151711	rs2412559	C	A	5147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=105;PP=2965;SC=GGAGTGTGGACGGAGATGCTA;SOR=1.434;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=167;TCF=62;TCR=105;TR=167;WE=55151719;WS=55151701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr4	55151958	rs3830355	T	TA	1330.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=3;PP=1124;SC=GGTGATGCTATTCAGCTACAG;SOR=3.675;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=27;WE=55151966;WS=55151948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr4	55152284	rs4864872	T	G	568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=16;PP=451;SC=TTGCCCAGGTTTGAGTGCCAG;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=55152292;WS=55152274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	55153837	rs7695657	A	G	1391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=25;PP=750;SC=TGCTGCAGCCACCTCAAACCA;SOR=1.755;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=14;TCR=25;TR=39;WE=55153845;WS=55153827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr4	55156380	rs4864506	G	A	1110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=2;PP=878;SC=GTAGTTTGGAGATATGTACAG;SOR=4.235;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=34;WE=55156388;WS=55156370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr4	55156400	rs2276948	A	G	1598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=8;PP=1175;SC=GTTAAATAATAGTAAGTTCTG;SOR=2.584;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=42;TCR=8;TR=50;WE=55156408;WS=55156390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr4	55161254	rs3733540	C	T	2711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=28;PP=1681;SC=TAGTTCTGTGCAGGAGTTGTA;SOR=1.634;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=62;TCR=28;TR=90;WE=55161262;WS=55161244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr4	55161391	rs7685117	T	C	4287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=75;PP=2125;SC=ACATGATGGATGACATCGGCA;SOR=0.934;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=145;TCF=70;TCR=75;TR=145;WE=55161399;WS=55161381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr4	55524304	rs999020	T	C	3860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=85;PP=2177;ReadPosRankSum=-1.155;SC=AGCCTGTGCCTGGGAGGGTGG;SOR=0.566;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=138;TCF=52;TCR=86;TR=137;WE=55524312;WS=55524294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,149:0.99:150
chr4	55599159	rs4864921	G	A	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.183;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=284;ReadPosRankSum=-0.364;SC=CAACACTATAGTATTAAAAAG;SOR=0.202;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=35;TCR=4;TR=18;WE=55599167;WS=55599149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr4	55599436	rs1008658	T	C	1005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.628;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=31;PP=744;ReadPosRankSum=1.495;SC=TTTCCTGTGATTTTCATAATG;SOR=1.503;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=69;TCF=17;TCR=52;TR=38;WE=55599444;WS=55599426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,40:0.54:74
chr4	55603217	rs3752400	A	G	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.784;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=115;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TATGTTATCTATATGTCAGTC;SOR=1.371;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=7;WE=55603225;WS=55603207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr4	55946081	rs4421048	A	G	825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=7;PP=471;SC=TGTGATGTCCAGGAGTTGGGG;SOR=1.911;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=28;WE=55946089;WS=55946071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr4	55948108	rs2412617	A	G	2400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=20;PP=1423;SC=TCTTTTTAATATGGCTGAGTC;SOR=1.666;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=52;TCR=20;TR=72;WE=55948116;WS=55948098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr4	55955232	rs1531289	T	C	3007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=69;PP=1722;ReadPosRankSum=0.345;SC=TGTAAAGAGCTGACGAGGTGA;SOR=1.437;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=40;TCR=70;TR=108;WE=55955240;WS=55955222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,118:0.98:120
chr4	55955592	.	C	T	3092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.961;ClippingRankSum=0.000;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=71;PP=2015;ReadPosRankSum=1.000;SC=TTCTTTCAATCGCCTACAAAA;SOR=0.669;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=292;TCF=145;TCR=147;TR=139;WE=55955600;WS=55955582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,148:0.46:319
chr4	55955737	rs3217703	A	AT	285.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=150;ReadPosRankSum=0.380;SC=CTATGTATCTATTTTTTTTTT;SOR=0.507;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=11;WE=55955745;WS=55955727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,15:0.45:33
chr4	55961159	rs2219471	T	C	2462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.463;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=57;PP=1611;ReadPosRankSum=1.567;SC=ACTCCTTGAATACAAAATGAG;SOR=0.515;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=182;TCF=78;TCR=104;TR=104;WE=55961167;WS=55961149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,113:0.55:204
chr4	55962545	rs3214870	T	TG	2505.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.174;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.443;NF=16;NR=33;PP=1921;ReadPosRankSum=0.297;SC=ATCATAGGTATGGACATTTCC;SOR=0.704;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=98;TCF=29;TCR=69;TR=49;WE=55962553;WS=55962535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,87:0.49:176
chr4	55964101	rs6838752	T	C	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.906;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=223;ReadPosRankSum=-0.795;SC=CCCCCTTCACTCTCCAAATGT;SOR=0.223;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=12;WE=55964109;WS=55964091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
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chr4	55980239	rs7692791	C	T	4297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=51;PP=2563;SC=GCAAACTTCACTGGGGCTTAT;SOR=1.281;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=143;TCF=92;TCR=51;TR=143;WE=55980247;WS=55980229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr4	56262374	rs1128141	A	G	4040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=51;PP=2498;SC=CCGCGGCTCCAGGGAACGGCC;SOR=1.294;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=88;TCR=51;TR=139;WE=56262382;WS=56262364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr4	56290496	rs6828454	C	T	722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=0;PP=555;ReadPosRankSum=-0.475;SC=TGGGTTATTTCAACTTTTAGG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=56290504;WS=56290495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,23:0.96:24
chr4	56290558	rs11732723	C	T	2271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=20;PP=1418;ReadPosRankSum=-0.972;SC=CATTACACCTCTCATAAATTT;SOR=0.789;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=50;TCR=20;TR=70;WE=56290566;WS=56290548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,81:0.99:82
chr4	56290573	rs6810483	T	C	2821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=31;PP=1801;ReadPosRankSum=0.248;SC=AAATTTATTATACACCTGCAT;SOR=0.553;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=60;TCR=31;TR=91;WE=56290581;WS=56290563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,104:0.99:105
chr4	56291479	rs7677952	C	T	5048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=63;PP=2916;SC=GCTCCCTTTTCATTTTGTACA;SOR=1.216;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=171;TCF=108;TCR=63;TR=171;WE=56291487;WS=56291469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr4	56291528	rs7660517	T	C	6836.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=119;NR=111;PP=2965;SC=TTGACTTTTTTTCTCTCTCTT;SOR=0.725;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=230;TCF=119;TCR=111;TR=230;WE=56291536;WS=56291518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chr4	56291620	rs35154686	CAA	C	5040.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=67;PP=2950;SC=TGGTTTTTAACAAGCTGTTTG;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=5;TCR=68;TR=72;WE=56291629;WS=56291610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr4	56309992	rs3736544	A	G	2091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=46;PP=1339;SC=GTTGCTGGATATTAGATGAAT;SOR=1.519;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=24;TCR=46;TR=70;WE=56310000;WS=56309982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr4	56314757	rs201717317	GCGCA	G	78.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.08;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr4	56319088	rs4864996	A	C	331.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=189;SC=ATAAGTAGTAAAGTATAATCA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=56319096;WS=56319078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	56319105	rs2412647	C	T	398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=261;SC=ATCACATCCCCGTTATAAGTG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=56319113;WS=56319095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	56322244	rs10529254	TG	T	419.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=13;PP=251;SC=AAATAAACTTTGGGGGGGGGG;SOR=2.584;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=16;WE=56322252;WS=56322234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr4	56329773	rs1522112	T	C	1237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=29;NR=10;PP=627;SC=TAAAGAAGTCTGTATTTTTCA;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=39;WE=56329781;WS=56329763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr4	56337041	rs3805151	T	C	567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.63;NF=1;NR=16;PP=480;SC=AAATAAAAATTTGAGATAAAT;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=56337049;WS=56337031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	56342326	rs9312661	G	A	1436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=30;PP=788;SC=GATGACAACCGTAGGCATTAA;SOR=2.004;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=13;TCR=30;TR=43;WE=56342334;WS=56342316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr4	56428820	rs2279458	C	T	891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=17;PP=469;SC=AATAAATGGGCTACTCATCTC;SOR=1.542;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=11;TCR=17;TR=28;WE=56428828;WS=56428810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr4	56447146	rs34437483	GA	G	242.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=6;PP=175;SC=TCAATGTCTAGAAAAAAACCG;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=7;WE=56447154;WS=56447136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	56465418	rs1387198	T	C	2236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=39;PP=1218;SC=AGAAACAGATTGATGATTTAG;SOR=0.867;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=37;TCR=39;TR=76;WE=56465426;WS=56465408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr4	56471551	rs3805382	A	G	6778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=116;NR=112;PP=2965;SC=GAATAAGTGCATGGCTTCTCA;SOR=0.781;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=228;TCF=116;TCR=112;TR=228;WE=56471559;WS=56471541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,259:1.00:259
chr4	56502178	rs3792703	G	A	426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=8;PP=292;SC=AGAGGGTGGAGGAGAGCGGTG;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=8;TCR=8;TR=16;WE=56502186;WS=56502168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr4	56734701	rs3213948	C	T	1914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.556;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=50;PP=1164;ReadPosRankSum=-0.913;SC=TAAGACTTTCCTGAATTCTAT;SOR=0.608;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=160;TCF=63;TCR=97;TR=84;WE=56734709;WS=56734691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,93:0.50:186
chr4	56736794	rs150749988	T	TTTTG	606.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=429;ReadPosRankSum=-0.276;SC=CAAGTATGTTTTTTGTTTGTT;SOR=0.746;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=9;WE=56736802;WS=56736784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
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chr4	56835413	rs1811473	C	T	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.15;ReadPosRankSum=0.674;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
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chr4	57176955	.	T	TC	1379	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;FR=1.0000;HP=9;HapScore=2;MGOF=15;MMLQ=15;MQ=59.78;NF=5;NR=49;PP=1379;QD=25.7962962963;SC=ACTTTCATCTTCCCCCCCCCT;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=101;TCF=13;TCR=88;TR=54;WE=57176984;WS=57176943;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:47,54:0.53:101
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chr4	57176965	rs5858374	T	C	61.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.01;ReadPosRankSum=-2.274;SOR=0.353;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,13:0.21:61
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chr4	57180473	rs6823339	C	A	919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.870;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=26;PP=504;ReadPosRankSum=0.474;SC=AAGGCAGGAGCTCTTGGAGGA;SOR=0.589;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=72;TCF=23;TCR=49;TR=37;WE=57180481;WS=57180463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,44:0.52:85
chr4	57180563	rs59615456	G	C	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=4;PP=36;ReadPosRankSum=0.828;SC=GGAAGCGCCAGGTTGGGAGGA;SOR=1.022;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=5;TCR=7;TR=7;WE=57180571;WS=57180553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr4	57180616	rs11723379	G	C	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.40;ReadPosRankSum=0.366;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr4	57181632	rs7672073	G	C	4505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=70;PP=2965;ReadPosRankSum=1.607;SC=GCTAAGCCCCGCCAGGAGTCT;SOR=0.972;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=172;TCF=100;TCR=72;TR=168;WE=57181640;WS=57181621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,176:0.98:180
chr4	57181995	rs3796547	C	T	2037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.617;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=44;PP=1229;ReadPosRankSum=-0.170;SC=CCGGAGAAGTCGGAGATGCAC;SOR=0.624;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=210;TCF=110;TCR=100;TR=90;WE=57182003;WS=57181985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,101:0.45:225
chr4	57182647	rs3822003	G	A	2221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.968;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=53;PP=1393;ReadPosRankSum=0.223;SC=CTCGCCGAGCGGGGAGGCCGG;SOR=0.764;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=234;TCF=108;TCR=126;TR=97;WE=57182655;WS=57182637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,108:0.42:256
chr4	57182758	rs28559894	C	T	1508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FS=0.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.62;ReadPosRankSum=0.108;SOR=0.638;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,79:0.45:175
chr4	57189498	rs2292985	G	A	1105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.837;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=16;PP=727;ReadPosRankSum=-0.968;SC=AGGTAAGTCCGCAGTTAAGTT;SOR=0.885;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=82;TCF=56;TCR=26;TR=49;WE=57189506;WS=57189488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,51:0.57:89
chr4	57190356	rs7695701	G	A	2647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.039;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=44;PP=1395;ReadPosRankSum=0.832;SC=AAGAGAAGAGGCCCGAGACTG;SOR=0.791;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=199;TCF=123;TCR=76;TR=112;WE=57190364;WS=57190346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,126:0.56:227
chr4	57193762	rs6826795	G	A	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=269;ReadPosRankSum=0.401;SC=AAAATTTGTAGTGTGGCTGTG;SOR=0.340;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=14;WE=57193770;WS=57193752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr4	57194329	rs11733474	G	T	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.198;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=101;ReadPosRankSum=0.350;SC=GCCAACCTTTGGTAATGGTTT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=6;WE=57194337;WS=57194320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr4	57194460	rs6811153	A	G	2242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.712;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=36;PP=1176;ReadPosRankSum=1.389;SC=AAGAACACCCATTCTCCTGAA;SOR=0.577;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=188;TCF=118;TCR=70;TR=95;WE=57194468;WS=57194450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,111:0.53:210
chr4	57194525	rs6834736	C	G	3553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=73;PP=2052;ReadPosRankSum=-2.265;SC=CTGTGCCCATCTTAGTTTTCA;SOR=0.712;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=290;TCF=147;TCR=143;TR=150;WE=57194533;WS=57194515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,167:0.54:312
chr4	57208955	rs9996468	A	T	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.259;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=6.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.43;ReadPosRankSum=1.557;SOR=3.516;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr4	57215677	rs3796544	G	A	3857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.664;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.902;NF=88;NR=68;PP=2119;ReadPosRankSum=-0.553;SC=AGTCCCTATCGCAGGTTTCCC;SOR=0.852;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=287;TCF=157;TCR=130;TR=156;WE=57215689;WS=57215667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,177:0.55:319
chr4	57219523	rs6554347	A	G	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.457;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=320;ReadPosRankSum=1.276;SC=TATGAATACAATTAGTATTAT;SOR=0.446;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=23;WE=57219531;WS=57219513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,24:0.63:38
chr4	57219592	rs6554348	G	A	1358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=24;PP=850;ReadPosRankSum=1.590;SC=ATGGTAGAGAGTCGATCAATA;SOR=0.705;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=100;TCF=59;TCR=41;TR=56;WE=57219600;WS=57219582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,61:0.55:110
chr4	57237683	rs6554354	G	A	2989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=360;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.384;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=71;PP=1836;ReadPosRankSum=0.792;SC=GCAACTTGACGGAAGTTGGTA;SOR=0.665;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=334;TCF=166;TCR=168;TR=140;WE=57237691;WS=57237673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:207,153:0.43:360
chr4	57261372	.	GA	G	129.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.998;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=5.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.93;ReadPosRankSum=0.325;SOR=0.088;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,11:0.33:33
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chr4	57269591	rs34121369	T	TA	1543.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.405;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=28;PP=1084;ReadPosRankSum=-0.628;SC=AAGAGAAGTTTAATCATCAGA;SOR=0.878;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=89;TCF=5;TCR=84;TR=31;WE=57269599;WS=57269581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,58:0.41:143
chr4	57269646	rs112538106	A	AAAAG	890.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=682;ReadPosRankSum=-0.986;SC=AACCATAATGAAAATAAGGCA;SOR=0.774;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=16;WE=57269654;WS=57269636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,27:0.55:49
chr4	57270197	rs7661712	T	C	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.504;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=7;PP=358;ReadPosRankSum=-0.127;SC=AGACTGGTACTAGTCCCTAGC;SOR=1.204;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=48;TCF=32;TCR=16;TR=24;WE=57270205;WS=57270187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,27:0.52:52
chr4	57273840	rs11538098	C	G	2673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=68;PP=1680;ReadPosRankSum=0.462;SC=ATGTTGGCACCGAACTCCCAT;SOR=0.697;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=308;TCF=153;TCR=155;TR=134;WE=57273848;WS=57273830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:193,143:0.43:336
chr4	57276739	rs2176785	G	C	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.481;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=8;PP=333;ReadPosRankSum=0.201;SC=TTTGCTAAGTGTCTGGGCAGA;SOR=0.407;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=43;TCF=28;TCR=15;TR=22;WE=57276747;WS=57276729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,27:0.55:49
chr4	57425520	rs76480778	A	AT	1576.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=3;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.335;NF=24;NR=11;PP=467;ReadPosRankSum=-0.463;SC=CTAGCAATCAATTTTTTTTTA;SOR=0.551;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=47;TCF=31;TCR=16;TR=35;WE=57425528;WS=57425510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:5,64:0.93:69
chr4	57425658	.	G	A	1921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.784;ClippingRankSum=0.000;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.920;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=49;PP=1279;ReadPosRankSum=-0.027;SC=CCAGCCCAAGGAAGTTTCCTG;SOR=0.912;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=212;TCF=99;TCR=113;TR=87;WE=57425666;WS=57425648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,97:0.40:244
chr4	57686821	rs3733303	T	A	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.520;NF=5;NR=14;PP=268;ReadPosRankSum=-0.497;SC=TTTTTTTTTTTAAATGAAGTC;SOR=0.608;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=19;WE=57686829;WS=57686811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,19:0.73:26
chr4	57843114	rs200929636	C	G	2549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.446;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=60;PP=1575;ReadPosRankSum=0.240;SC=CAGGGAGGGGCCGGGCCGCCG;SOR=0.598;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=255;TCF=117;TCR=138;TR=117;WE=57843122;WS=57843103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,129:0.47:277
chr4	57843320	rs4865167	A	G	3467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=56;PP=2055;SC=GCTCTGCCCCACAGCCCGAGC;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=117;TCF=61;TCR=56;TR=117;WE=57843328;WS=57843310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr4	57857188	rs3733309	A	G	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=352;ReadPosRankSum=-0.590;SC=TACTTACAGCACCGTCAATCA;SOR=0.906;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=17;WE=57857196;WS=57857178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr4	57861117	rs1713951	G	A	185.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=99;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=122;SC=AAAAAAGAAAGAAAGATTTTC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=57861125;WS=57861107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	57861358	rs2293175	C	T	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.668;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=84;ReadPosRankSum=-1.465;SC=ATTTTACTCTCTTTTCTCTTC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=5;WE=57861366;WS=57861351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr4	57871400	rs41553919	AT	A	545.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.205;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=347;ReadPosRankSum=0.589;SC=TTTTATTTAAATTGTCTGATA;SOR=0.124;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=23;TCF=14;TCR=9;TR=11;WE=57871408;WS=57871390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr4	57871750	.	T	TTC	531.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=7.106;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.51;MQRankSum=0.500;QD=26.59;ReadPosRankSum=2.333;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,18:0.90:20
chr4	57876955	rs1718878	G	A	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.674;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=42;ReadPosRankSum=-1.739;SC=CCTTGATGGCGTATATTTCAG;SOR=1.270;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=7;WE=57876963;WS=57876945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr4	57881715	rs1713982	G	A	2099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.55;ReadPosRankSum=1.867;SOR=0.751;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,101:0.51:199
chr4	57883175	rs1718866	G	C	1453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=15;PP=973;SC=TAAAATACTTGAGGAAGTAGA;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=33;TCR=15;TR=48;WE=57883183;WS=57883165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr4	57886946	rs1718831	T	G	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=4.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.485;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=341;ReadPosRankSum=2.213;SC=GCAGTTACCATGATAACAAAC;SOR=2.059;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=15;WE=57886954;WS=57886936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr4	57888510	rs1718830	T	C	875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.856;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=27;PP=492;ReadPosRankSum=1.474;SC=TGCCTGCCCCTGTCCTCCTCT;SOR=0.871;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=83;TCF=28;TCR=55;TR=40;WE=57888518;WS=57888500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,45:0.49:91
chr4	57889332	rs1718862	G	A	457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=0;PP=339;SC=TTCTGTGTGGGCTGTAGTATT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=57889340;WS=57889331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr4	57889677	rs1056364	C	T	2372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.456;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=53;PP=1326;ReadPosRankSum=1.689;SC=TCAGAACTAGCGAGACGGGCA;SOR=0.644;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=229;TCF=114;TCR=115;TR=110;WE=57889685;WS=57889667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,121:0.47:256
chr4	57891239	rs6843644	G	A	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.245;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.14;ReadPosRankSum=2.376;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr4	57897570	rs12621	G	T	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.734;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=365;ReadPosRankSum=1.094;SC=TGAATTGGCAGGTAGTTGAGT;SOR=2.097;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=38;TCF=13;TCR=25;TR=19;WE=57897578;WS=57897560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,21:0.48:44
chr4	57976487	rs11573021	G	A	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=105;ReadPosRankSum=0.695;SC=GCGGCGCCGAGGAGCAGGGCG;SOR=0.818;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=22;TCF=12;TCR=10;TR=10;WE=57976495;WS=57976477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr4	62382943	rs335311	A	G	606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=3;PP=391;SC=GGCGGCAGAGAGCAGCCTTGG;SOR=2.200;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=62382951;WS=62382933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	62383315	rs335312	G	C	306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=7;PP=213;SC=GGAAATGCCCGAAATGTGTCT;SOR=2.303;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=62383323;WS=62383305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
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chr4	62449316	rs3075153	GTA	G	1133.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.737;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.164;NF=10;NR=6;PP=546;ReadPosRankSum=0.112;SC=TTCACTAGCTGTATGTTTGAT;SOR=0.330;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=52;TCF=36;TCR=16;TR=16;WE=62449325;WS=62449306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,31:0.44:71
chr4	62453209	rs2172802	A	G	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.678;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=240;ReadPosRankSum=-0.058;SC=AACCTTCAACATCAATCTGTG;SOR=2.694;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=13;WE=62453217;WS=62453199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr4	62542879	rs1391319	G	C	108.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=0;PP=53;SC=ATATGAATACGTGTTCTAACA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=62542887;WS=62542869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	62542957	rs4860425	C	A	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=190;ReadPosRankSum=2.154;SC=TATACCAATTCTCCAGGTCCA;SOR=0.610;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=16;WE=62542965;WS=62542947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chr4	62598689	rs10434219	C	T	2557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-3.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.065;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=52;PP=1362;ReadPosRankSum=-0.574;SC=AGCTCCCTCACAGGGTGGATG;SOR=0.826;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=228;TCF=120;TCR=108;TR=108;WE=62598697;WS=62598679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,126:0.48:260
chr4	62599289	rs9312082	G	A	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.405;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=19;PP=390;ReadPosRankSum=0.567;SC=TCAACCTTTTGTGGTACTCTT;SOR=2.376;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=37;TCF=5;TCR=32;TR=20;WE=62599297;WS=62599279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr4	62758251	rs7691112	A	G	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=152;ReadPosRankSum=1.077;SC=ATCAGGTTGAAGACTTCTAGA;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=9;WE=62758259;WS=62758241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr4	62775483	rs12648576	G	A	402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.77;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	62800554	rs2305339	G	A	3479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=45;PP=2122;SC=TCATCCTCTTGTAGGCAATGG;SOR=1.241;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=76;TCR=46;TR=121;WE=62800562;WS=62800544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr4	62800728	rs734644	T	C	2231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=33;NR=43;PP=1396;SC=TCAGGGAGAATACAGACAATA;SOR=1.139;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=33;TCR=43;TR=76;WE=62800736;WS=62800718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr4	62845388	rs1397547	G	C	4054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=81;NR=49;PP=2161;SC=GCTTTTTCCGGGGGCTCCAGA;SOR=1.112;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=81;TCR=49;TR=130;WE=62845396;WS=62845378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr4	62845490	rs1397548	A	G	6764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=105;NR=115;PP=2965;SC=CTGACCAACCAGTAAGCAACC;SOR=0.914;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=220;TCF=105;TCR=115;TR=220;WE=62845498;WS=62845480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr4	62861941	rs17226398	G	C	2651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.511;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=54;PP=1437;ReadPosRankSum=1.444;SC=CTCTGTCACAGGTTCACTCTT;SOR=0.593;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=222;TCF=123;TCR=99;TR=118;WE=62861949;WS=62861931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,131:0.52:254
chr4	62861964	rs56038622	A	T	2887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=59;PP=1699;ReadPosRankSum=1.765;SC=TGTATGTCCCATACCCAGTCC;SOR=0.722;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=242;TCF=127;TCR=115;TR=125;WE=62861984;WS=62861954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,139:0.50:278
chr4	65142710	rs1483713	C	T	1676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=35;NR=26;PP=962;SC=TTAATATTGACAACAAGATGG;SOR=0.818;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=35;TCR=26;TR=61;WE=65142718;WS=65142700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr4	65142835	rs1483712	G	T	961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=19;PP=535;SC=CTTTAACTAAGGTATGTCTGC;SOR=1.371;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=12;TCR=19;TR=31;WE=65142843;WS=65142825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr4	65145955	rs1483711	T	G	1773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=28;PP=772;SC=TTCTTTCTTATTTCTATGAAA;SOR=1.880;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=11;TCR=28;TR=39;WE=65145974;WS=65145945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr4	65145966	rs5858871	T	TAA	1496.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=24;PP=1205;SC=TTCTATGAAATGTTATATTAG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=24;WE=65145974;WS=65145945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr4	65146700	rs10012755	A	G	1119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=8;PP=737;SC=TTTTCTCAGAAACCATTTATC;SOR=2.012;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=33;WE=65146719;WS=65146690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr4	65146711	rs1483709	T	C	1273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=12;PP=752;SC=ACCATTTATCTTAAAGATGCA;SOR=1.414;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=26;TCR=12;TR=38;WE=65146719;WS=65146690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr4	65147404	rs10001161	T	C	186.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=152;SC=GTATTTATAGTAACCTATTTT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=65147412;WS=65147394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr4	65165660	rs190339457	C	T	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=10.361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.86;ReadPosRankSum=-0.957;SOR=2.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,15:0.33:46
chr4	65165660	.	CG	TA	100	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=10;NR=1;PP=100;QD=13.9516249875;SC=AAAATTAGAGCGTGAATAGCA;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=42;TCF=30;TCR=12;TR=11;WE=65165669;WS=65165650;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:31,11:0.26:42
chr4	65165661	rs11935568	G	A	1456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=12;PP=412;SC=AAATTAGAGCGTGAATAGCAA;SOR=1.609;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=42;TCF=30;TCR=12;TR=39;WE=65165669;WS=65165650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr4	65165849	rs13139627	G	A	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=208;ReadPosRankSum=1.547;SC=CAATAGAACTGTCTAGTATGT;SOR=0.743;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=14;WE=65165857;WS=65165839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr4	65165909	rs13121693	T	A	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.97;ReadPosRankSum=-0.328;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr4	65180308	rs71203156	GGTGTGT	G	746.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.30;SOR=2.948;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	65240750	rs6551826	T	A	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr4	65240805	rs6551827	A	T	215.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.17;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	65240805	.	ACA	TCT	197	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=4;NR=0;PP=197;QD=62.6169687156;SC=ATACACTCTAACATATATTGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=4;WE=65240815;WS=65240795;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,4:0.80:5
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chr4	66189753	rs111537275	C	CT	689.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.78;MQRankSum=1.897;QD=12.54;ReadPosRankSum=0.541;SOR=0.714;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,30:0.55:55
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chr4	66218728	rs3792649	C	T	2746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=29;PP=1712;SC=ATAAATAACACCTTGAATAAC;SOR=1.540;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=59;TCR=29;TR=88;WE=66218736;WS=66218718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr4	66218980	.	G	GAAAT	177	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=19;MQ=61.53;NF=0;NR=5;PP=177;QD=51.8077008746;SC=TTTATTAAATGAAAGATATTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=5;WE=66218988;WS=66218970;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,5:0.71:7
chr4	66231686	rs36050417	C	T	2076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.616;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=44;PP=1165;ReadPosRankSum=0.551;SC=ATACATGATGCTTCTATCTCC;SOR=0.574;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=199;TCF=110;TCR=89;TR=93;WE=66231694;WS=66231676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,106:0.47:226
chr4	66233029	rs2198104	A	G	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=7;PP=338;ReadPosRankSum=-0.092;SC=ATAACAATAAAGTGTCCCCTA;SOR=0.612;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=54;TCR=21;TR=24;WE=66233037;WS=66233019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,28:0.35:80
chr4	66280062	.	G	A	2145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.434;ClippingRankSum=0.000;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.862;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=48;PP=1283;ReadPosRankSum=0.999;SC=GCTGCTGTACGTGCTCGAATT;SOR=0.539;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=210;TCF=113;TCR=97;TR=99;WE=66280070;WS=66280052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,108:0.46:237
chr4	66286088	rs6551921	G	A	242.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.98;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	66286100	rs6551922	T	C	655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.32;SOR=2.925;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	66286113	rs138755728	G	GA	219.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=1.703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.10;ReadPosRankSum=2.305;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,13:0.36:36
chr4	66286414	rs6551923	T	C	217.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=178;SC=ATTTTAGTTTTTCTATATAAG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=66286422;WS=66286404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	66468046	rs5858973	TA	T	959.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.25;NF=1;NR=27;PP=627;SC=AATAGAAAGATAAAAAAAATT;SOR=3.026;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=28;WE=66468054;WS=66468036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr4	66509194	rs4343775	T	C	1965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=46;PP=1422;SC=TTATCATGAATATTGTATCTC;SOR=2.267;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=15;TCR=46;TR=61;WE=66509202;WS=66509184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr4	68214270	.	GAGGAAGGAAGGAAGGA	G	37.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;ClippingRankSum=-0.000;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.55;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,2:0.40:5
chr4	68359499	rs41278557	G	A	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=65;ReadPosRankSum=0.601;SC=ATTTGGGGGGGTGATGATTAA;SOR=0.184;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=7;WE=68359507;WS=68359489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr4	68360694	rs2632453	T	C	71.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=0;PP=50;SC=AATAGACTAATTCAAGTGGCT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=68360702;WS=68360684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr4	68360955	rs2646282	A	G	2084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=36;PP=1196;SC=AGATAATATCATAAGAAATGA;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=40;TCR=36;TR=76;WE=68360963;WS=68360945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr4	68374597	rs1056789	C	T	1379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.636;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=33;PP=751;ReadPosRankSum=-0.680;SC=GCTCACTCAGCGAACATCTGG;SOR=0.618;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=59;TCR=64;TR=64;WE=68374605;WS=68374587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,71:0.52:136
chr4	68376708	rs190255	T	C	1378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.183;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=24;PP=730;ReadPosRankSum=-0.199;SC=TGTTTATGTATTCATCTGCCA;SOR=0.448;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=117;TCF=72;TCR=45;TR=59;WE=68376716;WS=68376698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,67:0.51:131
chr4	68380215	rs11250	G	A	1368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.681;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=22;PP=797;ReadPosRankSum=0.780;SC=CTACCTTGAAGGAGTGCAGTG;SOR=0.765;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=107;TCF=66;TCR=41;TR=59;WE=68380223;WS=68380205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,66:0.55:120
chr4	68384861	rs355507	G	T	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.13;ReadPosRankSum=-0.218;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr4	68396525	rs355477	G	C	882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.810;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=10;PP=625;ReadPosRankSum=-0.925;SC=CATGGAGATGGCACCAACCTG;SOR=0.949;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=87;TCF=63;TCR=24;TR=39;WE=68396533;WS=68396515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,42:0.44:95
chr4	68406626	rs3836713	TATTA	T	3097.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.070;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.936;NF=11;NR=31;PP=1896;ReadPosRankSum=-1.227;SC=CTGCATTTGATATTAATTACC;SOR=0.890;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=84;TCF=24;TCR=60;TR=42;WE=68406637;WS=68406616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,80:0.54:148
chr4	68406882	rs3775861	A	G	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=35;ReadPosRankSum=-0.067;SC=TATGTAAAATATCTTTACTAT;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=4;WE=68406890;WS=68406872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr4	68410009	rs17625547	C	T	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=4;PP=46;ReadPosRankSum=0.743;SC=GCATGCTATACACCAAACATC;SOR=0.446;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=17;TCF=8;TCR=9;TR=8;WE=68410017;WS=68409999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr4	68416639	.	GTTGTTTTGTTTTGTT	G	1059	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=25;MQ=61.78;NF=1;NR=3;PP=1059;QD=267.0;SC=AAAAGTAAGAGTTGTTTTGTT;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=4;WE=68416661;WS=68416629;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,4:0.67:6
chr4	68436883	rs13111555	T	C	2993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=52;PP=1896;SC=AGTAAGTAAATATGTTGAGCT;SOR=0.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=48;TCR=52;TR=100;WE=68436891;WS=68436873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
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chr4	68490650	rs12508337	G	A	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.778;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=159;ReadPosRankSum=1.252;SC=TTGGTATGACGGGGAAGTCAG;SOR=1.165;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=44;TCF=30;TCR=14;TR=13;WE=68490658;WS=68490640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,15:0.32:47
chr4	68492060	rs34742870	A	G	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=213;ReadPosRankSum=-1.388;SC=AAACATTTTTATAAAGATTTT;SOR=0.518;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=38;TCF=26;TCR=12;TR=18;WE=68492068;WS=68492050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,20:0.47:43
chr4	68492244	rs35602179	T	TAA	492.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.559;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.339;NF=0;NR=10;PP=508;ReadPosRankSum=0.685;SC=TTCCTGCATCTGTTTGGTTAC;SOR=2.120;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=10;WE=68492252;WS=68492234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr4	68496080	rs354866	G	A	1591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=14;PP=961;SC=ATCAAAAAGAGTGATTCTTAT;SOR=1.919;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=36;TCR=14;TR=50;WE=68496088;WS=68496070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr4	68497333	rs4146407	G	A	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.79;ReadPosRankSum=-1.282;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
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chr4	68543240	rs17571825	C	T	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.965;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=121;ReadPosRankSum=1.275;SC=TTTCTCAATACACTAGGTTAA;SOR=1.179;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=9;WE=68543248;WS=68543230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr4	68544318	rs28483797	C	T	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.175;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=296;ReadPosRankSum=0.145;SC=TCCAGTATTACTGACAATGTA;SOR=1.609;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=49;TCF=17;TCR=32;TR=19;WE=68544326;WS=68544308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,19:0.34:56
chr4	68547165	rs11394457	T	TA	147.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5103;FS=6.021;HP=7;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.319;NF=6;NR=0;PP=132;ReadPosRankSum=0.619;SC=TGATTTTTTTTAAAAAGTAGA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=6;WE=68547173;WS=68547155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr4	68547809	rs34482936	A	ATAC	1093.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.721;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=682;ReadPosRankSum=-1.022;SC=CAAAAGTGTCAAAAATTAGGA;SOR=1.336;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=50;TCF=35;TCR=15;TR=21;WE=68547817;WS=68547799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,30:0.40:75
chr4	68562176	rs10660788	T	TACAC	52.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.221;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.990;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=76;ReadPosRankSum=-2.010;SC=CACATATATATACATATACAT;SOR=0.012;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=5;WE=68562184;WS=68562166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,2:0.20:10
chr4	68562236	rs10573467	TAC	T	337.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.320;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=332;ReadPosRankSum=1.709;SC=CATATATACATACACACACAC;SOR=0.999;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=22;TCF=11;TCR=11;TR=9;WE=68562249;WS=68562226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,16:0.41:39
chr4	68562365	rs17572160	A	G	490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=13;PP=352;ReadPosRankSum=0.630;SC=ATTCTTACCTATACAATGCAT;SOR=0.617;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=73;TCF=37;TCR=36;TR=27;WE=68562373;WS=68562355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,27:0.34:79
chr4	68566878	rs377196781	A	AG	1041.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=936;ReadPosRankSum=-0.965;SC=GAAGGTAGGAAGGGGCGGGAC;SOR=0.573;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=4;TCR=35;TR=18;WE=68566899;WS=68566858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,31:0.61:51
chr4	68566891	rs34378415	TG	T	922.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.922;HP=8;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=941;ReadPosRankSum=-1.992;SC=GGCGGGACCGTGGGGGGGTCA;SOR=0.208;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=16;WE=68566899;WS=68566858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,26:0.63:41
chr4	68586315	rs13124793	G	A	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=269;ReadPosRankSum=0.325;SC=CCTGCACACAGAGCAGCAGAT;SOR=1.508;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=13;WE=68586323;WS=68586305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
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chr4	68700956	rs6824984	A	G	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=7;PP=163;ReadPosRankSum=0.809;SC=TGGGGTTGGGAGGTGGTCCTC;SOR=0.610;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=34;TCF=19;TCR=15;TR=16;WE=68700964;WS=68700946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
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chr4	68780253	rs1371933	G	A	1940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=14;PP=1273;SC=AATATATTCTGAGCCAGATAC;SOR=2.551;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=63;TCF=49;TCR=14;TR=62;WE=68780261;WS=68780243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr4	68780399	rs1371932	A	G	7880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=124;NR=134;PP=2965;SC=TGCAGACATCATCACTTATGA;SOR=0.888;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=259;TCF=125;TCR=134;TR=258;WE=68780407;WS=68780389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,301:1.00:301
chr4	68780512	rs10025303	C	A	1362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=34;PP=961;SC=GTGAAGTGAGCAGACTTTCCT;SOR=2.985;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=7;TCR=34;TR=41;WE=68780520;WS=68780502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr4	68784774	rs353163	T	C	7425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.245;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=127;NR=131;PP=2965;ReadPosRankSum=0.933;SC=CAAACAAATCTGGCGTATGTC;SOR=0.406;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=259;TCF=128;TCR=131;TR=258;WE=68784782;WS=68784764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,284:1.00:285
chr4	68788694	rs353159	G	A	1976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=39;PP=1174;SC=TGTAATTACAGGAAATGACCC;SOR=1.394;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=23;TCR=39;TR=62;WE=68788702;WS=68788684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr4	68788719	rs2119382	T	C	987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=25;PP=580;SC=CTTACTTGCCTGAAGACATTT;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=34;WE=68788727;WS=68788709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr4	68789693	rs149179048	GT	G	263.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.748;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=176;ReadPosRankSum=-0.703;SC=CAGTCCATGAGTTAGAAAAAA;SOR=1.426;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=6;WE=68789701;WS=68789683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr4	68789778	rs6839279	G	T	758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=14;PP=544;ReadPosRankSum=0.394;SC=GCAAGTATGAGCAAATATTTG;SOR=0.642;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=57;TCF=37;TCR=20;TR=35;WE=68789786;WS=68789768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,35:0.57:61
chr4	68795815	rs17578509	A	G	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.175;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=18;PP=354;ReadPosRankSum=2.188;SC=ATTGTCCTTCAGTCTTACCTG;SOR=0.203;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=69;TCF=19;TCR=50;TR=30;WE=68795823;WS=68795805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,35:0.45:77
chr4	68812283	rs11930532	C	T	5091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=82;PP=2619;SC=TGCCAAATCCCACTGTCCTGA;SOR=0.938;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=164;TCF=82;TCR=82;TR=163;WE=68812291;WS=68812273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr4	68812444	.	T	TAA	145	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;FR=1.0000;HP=12;HapScore=2;MGOF=30;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=0;NR=7;PP=145;QD=21.5714285714;SC=GAAGATGTGTTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=7;WE=68812452;WS=68812434;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,7:0.70:10
chr4	68829207	rs6552134	G	A	2037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=52;PP=1523;SC=AGAAGTCTACGGCTCAAAGAA;SOR=3.160;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=11;TCR=52;TR=63;WE=68829215;WS=68829197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr4	68904637	rs6552141	A	C	4458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.10;QD=29.14;SOR=0.733;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr4	68904834	rs9999589	T	G	2233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=44;PP=1597;SC=TTGACAACCTTTTTATTGACA;SOR=1.349;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=73;TCF=28;TCR=45;TR=72;WE=68904842;WS=68904824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr4	68919617	rs10018943	G	A	4001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=39;PP=2545;SC=TAACTCATGGGCAATCCACAC;SOR=1.697;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=91;TCR=39;TR=130;WE=68919625;WS=68919607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr4	68928740	rs1837215	G	A	4078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=82;PP=2609;SC=TTTCTGACACGCTCATTTGGG;SOR=1.334;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=51;TCR=82;TR=133;WE=68928748;WS=68928730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr4	68934306	rs10004522	G	A	527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=1;PP=347;SC=ACTGTGAAAAGAAGGCTCACA;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=68934314;WS=68934296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	68956422	rs57121360	T	A	912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=1.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.85;ReadPosRankSum=1.915;SOR=0.464;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,46:0.60:77
chr4	68956498	rs13115830	C	T	774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=16;PP=431;SC=GAAGACACTTCTCAAATACTC;SOR=1.863;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=23;WE=68956506;WS=68956488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr4	68995529	rs10030708	C	T	1898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.976;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=38;PP=986;ReadPosRankSum=-0.983;SC=AATACTTACGCGTACATCATG;SOR=0.730;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=225;TCF=122;TCR=103;TR=87;WE=68995537;WS=68995519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,101:0.39:257
chr4	69057073	rs4860284	G	A	2327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=29;PP=1465;SC=TCAAATTCCAGTACTTATATT;SOR=1.048;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=45;TCR=29;TR=74;WE=69057081;WS=69057063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr4	69078113	rs4463136	T	C	5998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=115;NR=86;PP=2965;SC=AGACCAATAGTTATTCCAAAG;SOR=1.015;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=201;TCF=115;TCR=86;TR=201;WE=69078121;WS=69078103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr4	69083563	rs10008636	C	T	1611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=36;NR=18;PP=858;SC=GGGAGTCATACTGGGGAGATA;SOR=1.197;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=36;TCR=18;TR=54;WE=69083571;WS=69083553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr4	69094507	rs2319797	T	A	3598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=65;PP=2297;SC=CATAACATTGTATCAGTCACA;SOR=0.962;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=122;TCF=57;TCR=65;TR=122;WE=69094515;WS=69094497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr4	69094575	rs2319796	T	G	1467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=36;PP=1094;SC=CTTCAAAAAGTCTTCTTGAAG;SOR=2.256;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=11;TCR=36;TR=47;WE=69094583;WS=69094565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr4	69094926	rs63181060	TTAAA	T	423.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=62.89;NF=8;NR=1;PP=415;SC=GATTGATTGATTAAATAGTTA;SOR=2.494;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=9;WE=69094937;WS=69094916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	69095197	rs12331141	T	C	2338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=41;PP=1491;SC=TTTACTACAATTCCAAAGTTG;SOR=0.897;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=35;TCR=41;TR=76;WE=69095205;WS=69095187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr4	69096810	rs10024748	G	T	178.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=1;PP=143;SC=CTATGTGATTGTAAATTTCAT;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=69096818;WS=69096800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
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chr4	69434217	rs28672900	G	A	6889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=98;NR=141;PP=2965;SC=GTCTTATGCAGTGCTTCTTTT;SOR=1.112;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=239;TCF=98;TCR=141;TR=239;WE=69434225;WS=69434207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr4	69885683	rs148467728	T	C	2317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.284;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.618;NF=45;NR=46;PP=1680;ReadPosRankSum=-1.453;SC=TTGACTCTTGTAGTTTTTTCA;SOR=0.451;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=168;TCF=80;TCR=88;TR=91;WE=69885691;WS=69885673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,97:0.53:182
chr4	69886151	rs11730623	A	T	1933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=46;PP=1305;SC=TATACAGAGAAAAATCAATCA;SOR=1.897;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=19;TCR=46;TR=65;WE=69886159;WS=69886141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr4	70079838	rs4694697	T	C	4353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=51;PP=2933;SC=TTTGATCACTTAATTTTGACA;SOR=1.233;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=135;TCF=84;TCR=51;TR=135;WE=70079846;WS=70079828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr4	70146704	rs7689398	G	A	6913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=125;NR=113;PP=2965;SC=TGCTGGCTGCGCTACTTAACA;SOR=0.716;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=238;TCF=125;TCR=113;TR=238;WE=70146712;WS=70146687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,263:1.00:263
chr4	70283908	rs2642841	T	A	1880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=34;PP=1057;SC=AGCTTATTGATTATTTGTTAT;SOR=1.296;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=25;TCR=34;TR=59;WE=70283916;WS=70283898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr4	70288954	rs2736507	C	T	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=3.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.78;MQRankSum=-3.848;QD=1.52;ReadPosRankSum=-0.262;SOR=0.228;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,10:0.18:57
chr4	70288981	rs2736505	C	T	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.169;HP=1;HapScore=3;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.758;NF=2;NR=8;PP=74;ReadPosRankSum=1.689;SC=TTTCTTCCTACGACAAAAAAA;SOR=0.218;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=41;TCF=6;TCR=35;TR=10;WE=70288992;WS=70288971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,9:0.23:39
chr4	70346711	rs28679647	G	C	3415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=72;PP=2191;SC=AATCCCAGCAGTTTCCGAGGT;SOR=1.479;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=112;TCF=40;TCR=72;TR=112;WE=70346719;WS=70346701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr4	70352181	rs41297425	C	T	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.182;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.49;ReadPosRankSum=-0.936;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr4	70352266	rs1826690	A	G	1771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=35;NR=24;PP=1019;SC=TTTCATGATAACTATTAACAC;SOR=0.957;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=35;TCR=24;TR=59;WE=70352274;WS=70352256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr4	70355211	rs1845555	T	C	981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=13;PP=665;SC=TTTCTTCTGATGTGTTACTGA;SOR=1.061;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=22;TCR=13;TR=35;WE=70355219;WS=70355201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr4	70391344	rs10021990	G	T	805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=8;PP=482;SC=ATCTACTCAGGTATCTATGCA;SOR=1.536;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=25;WE=70391352;WS=70391334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	70391429	rs11732968	G	A	5100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=44;PP=1605;SC=GATGAGACATGTAAGAGAGCA;SOR=0.816;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=58;TCR=44;TR=102;WE=70391437;WS=70391419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr4	70391454	rs11732996	G	A	5068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=47;PP=1603;SC=ACATTATGATGTAGTCCCTGT;SOR=0.710;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=55;TCR=47;TR=102;WE=70391462;WS=70391444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr4	70391536	rs66653481	C	T	1271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=25;PP=715;SC=GAAAGGGCTCCAGGCTGGGCG;SOR=2.368;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=32;WE=70391544;WS=70391526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr4	70391561	rs68096061	G	A	877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=17;PP=434;SC=GGCTCACACCGTTAATCCCAG;SOR=3.160;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=70391569;WS=70391551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	70455478	rs2288741	G	T	1245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=27;PP=778;SC=ATAGTTACGTGGAGAAAATAT;SOR=2.147;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=11;TCR=27;TR=38;WE=70455486;WS=70455468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr4	70460328	rs4148304	C	T	1664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.008;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=33;PP=1020;ReadPosRankSum=1.158;SC=AACATGGGAACTCCCACCATA;SOR=0.542;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=144;TCF=82;TCR=62;TR=72;WE=70460336;WS=70460318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,79:0.51:154
chr4	70501451	rs6811810	G	A	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=166;ReadPosRankSum=1.181;SC=AGGCTGAGGCGGGAGAATCGC;SOR=0.765;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=20;TCF=9;TCR=11;TR=13;WE=70501459;WS=70501441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr4	70501544	rs377656136	ACC	A	50.92	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=2;PP=57;ReadPosRankSum=0.967;SC=AGTCCACCTCACCAAAAAAAA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=2;WE=70501553;WS=70501534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,2:0.67:3
chr4	70513139	rs1347046	C	T	6566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=113;NR=101;PP=2965;SC=AAAGGGCACCCTATATATTTC;SOR=0.710;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=215;TCF=113;TCR=102;TR=214;WE=70513147;WS=70513129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr4	70592790	rs2292092	G	T	3847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=75;NR=46;PP=2089;SC=TTCTTCAGATGTGTGATTTAG;SOR=1.016;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=75;TCR=46;TR=121;WE=70592798;WS=70592780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr4	70599073	rs1847366	C	T	3046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=40;PP=1798;SC=CAAATATCAACCCTTTTACAG;SOR=0.927;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=103;TCF=62;TCR=41;TR=102;WE=70599081;WS=70599063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr4	70615308	rs1503723	G	A	564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=0;PP=444;SC=TACGTACAACGTGAGTGGGTA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=70615316;WS=70615298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	70620708	rs2134668	G	A	1620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=17;PP=1223;SC=ATTTAGAATGGTAATGATTTT;SOR=1.654;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=35;TCR=17;TR=52;WE=70620716;WS=70620698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr4	70707945	rs1220724	A	G	480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=12;PP=319;SC=CTCAATTTTAAGAATCAAATG;SOR=3.258;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=70707953;WS=70707935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr4	70802218	rs962689	T	C	2058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=23;PP=1198;SC=TCAATGAAATTTAAATTATGT;SOR=1.061;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=42;TCR=23;TR=65;WE=70802226;WS=70802208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr4	70805829	.	TCACACA	TCA,T	356	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.06;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=12;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=0,0;NR=10,10;PP=356,60;QD=35.9;SC=GCACTTACTTTCACACACACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=10,10;WE=70805842;WS=70805819;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.56:18
chr4	70807747	rs62305467	T	C	1095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.90;SOR=0.990;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr4	70807771	rs10030475	C	T	1024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=17;NR=19;PP=591;SC=TAGCAAGCTGCCCATGCCCAG;SOR=1.096;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=17;TCR=19;TR=36;WE=70807779;WS=70807761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr4	70808097	rs3775766	T	C	292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=2;PP=229;SC=CATTAGAAAATAAAAAGTGTT;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=70808105;WS=70808087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	70826810	.	CA	C	275.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.217;ClippingRankSum=0.000;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=4.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.13;ReadPosRankSum=1.430;SOR=0.241;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,17:0.38:45
chr4	70865621	rs17698678	G	A	298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=6;PP=129;SC=TCTCAAATATGTGTAGTAGTT;SOR=1.445;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=70865629;WS=70865611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	70934964	rs4694266	A	G	616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=16;PP=418;SC=CTTTTAGTCTATGATCAATGA;SOR=3.160;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=70934972;WS=70934954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	70936305	rs17644242	C	T	1407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=28;PP=844;SC=ATTGCTTGAACGTATGGGGAG;SOR=1.702;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=16;TCR=28;TR=44;WE=70936313;WS=70936295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr4	70938311	rs72651138	G	C	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.044;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=14;PP=293;ReadPosRankSum=0.998;SC=ATATTTGATTGACAATATGTA;SOR=0.501;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=54;TCF=20;TCR=34;TR=23;WE=70938319;WS=70938301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,26:0.44:59
chr4	70944452	rs1399812	G	A	3143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=61;NR=47;PP=1692;SC=AAGATGTCTTGTCTTTTCTTT;SOR=0.796;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=108;TCF=61;TCR=47;TR=108;WE=70944460;WS=70944442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr4	70947318	rs2063819	C	T	4001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=91;PP=2729;SC=GTTTGCCCTTCTAAAAATATA;SOR=1.659;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=44;TCR=92;TR=135;WE=70947326;WS=70947308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr4	70947376	rs2063820	T	A	1142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=30;PP=800;SC=AAATGAAATTTAAAAAAGAAT;SOR=3.556;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=35;WE=70947384;WS=70947366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr4	70948533	rs7675265	T	C	1243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=31;PP=924;SC=TTAAATACTTTAGATAAATTC;SOR=2.476;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=9;TCR=31;TR=40;WE=70948541;WS=70948523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr4	71008313	rs777398	G	T	1872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=34;PP=1075;SC=ATAGTTATCTGTTGTGCTAAA;SOR=1.211;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=26;TCR=34;TR=60;WE=71008321;WS=71008303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr4	71008375	rs777399	T	C	551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=14;PP=387;SC=CAAGTAGAAGTTGAAACAAAT;SOR=2.419;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=18;WE=71008383;WS=71008365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	71009033	rs777400	A	G	332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=8;PP=217;SC=TCATATTTTCATTTATAAAGT;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=71009041;WS=71009023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	71020205	rs1709273	C	G	1273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=30;PP=897;SC=TGTTTATAGGCATTTGTGCTT;SOR=2.007;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=12;TCR=30;TR=42;WE=71020213;WS=71020195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr4	71021888	rs1709274	C	T	260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=7;PP=160;SC=TACAGTGAAACTTAATGACTG;SOR=2.303;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=71021896;WS=71021878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	71024010	rs111347259	T	TACAA	882.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=4;PP=625;SC=ACAGGACAAATACAATCAACT;SOR=2.948;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=16;WE=71024018;WS=71024000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	71024099	rs1612460	A	G	2942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=44;PP=1812;SC=TCCTTATGGCATACGGAATTT;SOR=0.946;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=62;TCR=44;TR=106;WE=71024107;WS=71024089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr4	71201388	rs1351419	C	T	6301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=94;PP=2965;SC=ACTGATTCCACTATTCCTGAG;SOR=0.756;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=198;TCF=104;TCR=94;TR=198;WE=71201396;WS=71201378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr4	71227802	rs1842478	A	G	2208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=4.747;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.51;MQRankSum=0.867;QD=26.94;ReadPosRankSum=3.376;SOR=2.242;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:6,76:0.93:82
chr4	71227998	rs1842477	A	T	2410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.75;QD=42.29;SOR=2.428;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr4	71228001	rs1842476	G	A	2352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.72;QD=47.06;SOR=2.925;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr4	71232430	rs10024123	T	C	7326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=147;NR=113;PP=2965;SC=TCCTCCACCATGTTTTCCTTT;SOR=0.955;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=260;TCF=147;TCR=113;TR=260;WE=71232438;WS=71232420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,281:1.00:281
chr4	71232701	rs6853742	C	T	7130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=121;NR=117;PP=2965;SC=CTCCCTACTCCTGCACCCTAA;SOR=0.708;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=238;TCF=121;TCR=117;TR=238;WE=71232709;WS=71232691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
chr4	71250308	rs2233586	T	A	1161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.74;QD=28.34;SOR=0.843;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr4	71250399	rs7676909	A	G	773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=19;PP=587;SC=ATTAATCATCAATGAAACACT;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=26;WE=71250407;WS=71250389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	71255370	rs7674958	A	T	1708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=14;PP=1172;SC=TTTACTTCTTATTTCCACAGC;SOR=2.080;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=42;TCR=14;TR=56;WE=71255378;WS=71255360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr4	71255593	rs2988	G	A	5599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=97;NR=96;PP=2965;SC=TGATGCCCCAGGTTATCCACA;SOR=0.803;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=193;TCF=97;TCR=96;TR=193;WE=71255601;WS=71255583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr4	71255767	rs3733493	A	G	5360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=87;PP=2965;SC=TACTGCTTCTACTACCCAAAA;SOR=0.796;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=177;TCF=90;TCR=87;TR=177;WE=71255775;WS=71255757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr4	71275012	rs1352689	T	C	1065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=8;PP=694;SC=AGTAGATATATTAATACATAG;SOR=2.242;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=33;WE=71275020;WS=71275002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr4	71384488	rs28674149	C	T	2726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=24;PP=1771;SC=AGGTAGCAATCTGAAACATGA;SOR=1.790;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=63;TCR=24;TR=87;WE=71384496;WS=71384478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr4	71384579	rs35692424	G	A	6116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=109;NR=98;PP=2965;SC=TTATATGCCAGCCAGTTTCAA;SOR=0.747;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=207;TCF=109;TCR=98;TR=207;WE=71384587;WS=71384569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr4	71388379	rs28754427	A	T	2669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=27;PP=1848;SC=TAAAAGATAGACATGTTTGCA;SOR=1.896;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=67;TCR=27;TR=94;WE=71388387;WS=71388369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr4	71388394	rs4123809	T	G	3536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=41;PP=2265;ReadPosRankSum=-0.713;SC=TTTGCATTGGTGGCAACCTGG;SOR=0.587;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=119;TCF=78;TCR=41;TR=118;WE=71388402;WS=71388384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,129:0.99:130
chr4	71390795	rs17733287	C	A	1815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=39;PP=1172;SC=TATTAACTGACGAATGTTCTG;SOR=2.722;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=12;TCR=39;TR=51;WE=71390803;WS=71390785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr4	71396989	rs17676820	C	T	4514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=79;PP=2549;SC=CACATGCCATCGAGGAAGCCA;SOR=0.912;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=71;TCR=79;TR=150;WE=71396997;WS=71396979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr4	71398064	rs3852099	G	A	1191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=11;PP=569;SC=ACTAAAGAATGATATGGATGC;SOR=1.038;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=25;TCR=11;TR=36;WE=71398072;WS=71398054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr4	71691743	rs6814981	C	T	853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=4;PP=660;SC=AACGCAGAAACACTATATTTT;SOR=3.334;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=29;WE=71691751;WS=71691733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr4	71698183	rs4694081	C	A	5503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=122;PP=2965;SC=AAGAAAAAACCCAACAGGGAT;SOR=1.506;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=190;TCF=67;TCR=123;TR=189;WE=71698191;WS=71698173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr4	71704965	rs3775728	C	T	9651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=368;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=180;NR=145;PP=2965;SC=CGACCAGAGACTCGAGGCGAG;SOR=0.778;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=325;TCF=180;TCR=145;TR=325;WE=71704973;WS=71704955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,367:1.00:367
chr4	71705262	rs6813092	A	G	1274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=19;PP=628;SC=CGGAGGGCAGAGTAGGACGCG;SOR=0.866;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=20;TCR=19;TR=39;WE=71705270;WS=71705252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr4	71768079	rs1871048	C	G	1614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=37;NR=13;PP=867;SC=CGCCCCCTCCCCCTGCCATTG;SOR=1.536;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=51;TCF=38;TCR=13;TR=50;WE=71768087;WS=71768069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr4	71864013	rs6446988	A	G	199.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=160;SC=CTTTAGGTATATATCTTCATC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=71864021;WS=71864003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	71892513	rs1486271	A	T	2457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=42;PP=1291;SC=TGTTTTTTCTAAAAAAGTGTA;SOR=0.947;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=40;TCR=42;TR=82;WE=71892521;WS=71892503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr4	71894321	.	C	CTTTT	120	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=11;HapScore=2;MGOF=16;MMLQ=17;MQ=61.78;NF=3;NR=1;PP=120;QD=34.25;SC=AACAATATTTCTTTTTTTTCT;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=4;WE=71894329;WS=71894311;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,4:0.67:6
chr4	71894941	rs77592672	A	G	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.044;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=112;ReadPosRankSum=2.308;SC=AGTAAATGCAATGGCATTGTG;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=6;WE=71894949;WS=71894931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr4	71895260	rs4643786	C	T	90.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.51;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	72316822	rs10022349	C	T	931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=6;PP=727;SC=ACTCCATCTCCCCATTAGCCA;SOR=2.376;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=30;WE=72316830;WS=72316812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	72397710	rs3775162	C	T	938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=1;PP=753;SC=GTTCTTCATTCAGTTCAAACA;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=28;WE=72397718;WS=72397700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr4	72397964	rs10446504	T	C	2971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=74;PP=1805;SC=TAATTTATTGTGTTTCTCTTT;SOR=2.121;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=28;TCR=74;TR=102;WE=72397972;WS=72397954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr4	72411967	rs4694097	A	G	145.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=0;PP=86;SC=CAAGCAAAGCAAGTCAGTTTC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=72411975;WS=72411957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr4	72423624	rs1453474	C	T	3569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=65;PP=2117;SC=TTTAATTGAACGTACCTGTGA;SOR=1.127;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=49;TCR=65;TR=114;WE=72423632;WS=72423614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr4	72425863	rs1453458	C	T	4690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=75;NR=86;PP=2645;SC=TCTCCCAGCACGACCTCAGCT;SOR=0.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=161;TCF=75;TCR=86;TR=161;WE=72425871;WS=72425853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr4	72429452	rs2290397	G	A	1141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=3;PP=775;ReadPosRankSum=-0.975;SC=GATGCTAGGAGATAGGAAGGG;SOR=2.584;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=34;WE=72429460;WS=72429442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,38:0.97:39
chr4	72432991	rs965606	A	C	287.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=207;SC=CCTAGTTACTATTACAAATAA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=72432999;WS=72432981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
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chr4	72433759	rs1453453	C	T	86.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=1;PP=20;SC=CTTGCATAGACACAATCAAGA;SOR=0.693;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=72433767;WS=72433749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
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chr4	72620865	rs71673486	C	CTATTTATT,CTATT	1252.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;NF=0,0;NR=23,23;PP=701,36;SC=TATATATTTCCTATTTATTTA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=65;TCF=0;TCR=65;TR=23,23;WE=72620873;WS=72620855;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:29
chr4	72622403	rs222033	A	C	4230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=48;PP=2497;SC=AAAATGGGAAAACGTTTTCAC;SOR=1.150;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=91;TCR=48;TR=139;WE=72622411;WS=72622382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr4	72629669	rs56097748	T	C	1264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.868;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=29;PP=718;ReadPosRankSum=-2.883;SC=GAGGAAAAAATAGAATTGGTC;SOR=0.891;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=81;TCF=26;TCR=55;TR=42;WE=72629677;WS=72629659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,51:0.57:90
chr4	72634975	rs222016	G	A	3705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=49;PP=2062;SC=TCCATGCTGAGTCAAAGTTAC;SOR=1.038;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=74;TCR=49;TR=123;WE=72634983;WS=72634965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr4	72897698	.	CG	C	2929.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.084;ClippingRankSum=0.000;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.443;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=45;PP=1874;ReadPosRankSum=0.291;SC=GACAAGGAGGCGGGGAGGGAG;SOR=0.429;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=144;TCF=30;TCR=114;TR=59;WE=72897706;WS=72897688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,106:0.47:227
chr4	72934539	.	A	C	32	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=53;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=4;NR=0;PP=32;QD=16.6928031368;SC=TAGAATATGAATGCCTGAGGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=4;WE=72934547;WS=72934529;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr4	72934578	.	C	CT	106	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;FR=0.5000;HP=7;HapScore=2;MGOF=15;MMLQ=18;MQ=60.0;NF=2;NR=2;PP=106;QD=32.75;SC=TTTATCTTATCTTTTTTCCTG;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=9;TCR=12;TR=4;WE=72934586;WS=72934568;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:17,4:0.19:21
chr4	72934632	rs9884478	C	T	611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=2.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.56;ReadPosRankSum=-1.700;SOR=0.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,31:0.48:64
chr4	73154640	.	TACAC	T	228	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=228;QD=57.75;SC=ACCATGCACATACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=73154651;WS=73154630;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,4:0.57:7
chr4	73175093	rs10024487	C	T	2842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=63;NR=30;PP=1733;SC=AATACTAAATCCATGAGAGAC;SOR=1.413;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=63;TCR=30;TR=93;WE=73175101;WS=73175083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr4	73280747	rs146286125	C	G	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=229;ReadPosRankSum=1.276;SC=CTTCAGCTCACAAGCACATCT;SOR=0.481;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=11;WE=73280755;WS=73280737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr4	73433315	rs6830556	G	C	1192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=28;PP=838;SC=TTGGGGAAGGGAGTTGTTTGC;SOR=2.670;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=36;WE=73433323;WS=73433305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr4	73434379	rs5859330	GT	G	4369.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.406;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.352;NF=36;NR=57;PP=1792;ReadPosRankSum=-0.260;SC=TTGGGTTTGAGTTTTTTTTTA;SOR=0.854;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=101;TCF=37;TCR=64;TR=93;WE=73434387;WS=73434369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,167:0.98:170
chr4	73615956	rs1350836	C	T	2016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=51;PP=1263;ReadPosRankSum=-1.469;SC=GGGATATTAACCAAGACCCAG;SOR=0.707;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=247;TCF=121;TCR=126;TR=97;WE=73615964;WS=73615946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,108:0.39:274
chr4	73930552	rs3762883	G	A	4070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=63;PP=2510;SC=AAGTGGAGTCGGGTGCAGTGA;SOR=0.774;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=142;TCF=78;TCR=64;TR=141;WE=73930560;WS=73930542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr4	73930893	rs2126115	T	G	250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.27;QD=22.80;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	73933671	rs68113340	ATGTGTG	A,ATG	1527.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=61.25;QD=37.26;SOR=3.312;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,19,22:0.46,0.54:41
chr4	73956736	rs6855349	G	A	7030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQ=59.96;NF=113;NR=114;PP=2965;SC=GATTGACACTGAGGACTGCAA;SOR=0.892;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=228;TCF=113;TCR=115;TR=227;WE=73956744;WS=73956726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,262:1.00:262
chr4	73991006	rs6822576	T	C	3963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=77;PP=2094;SC=CAAGTGTTAGTGCCGTGTCAT;SOR=1.121;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=135;TCF=58;TCR=77;TR=135;WE=73991014;WS=73990996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr4	74007870	rs12500051	A	G	320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=237;SC=TTAGAACAAAAAAAAACCCTA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=74007878;WS=74007860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	74012462	rs13149759	A	T	3242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=38;PP=1979;SC=ATTAAGATTTAAAAAGTAACA;SOR=1.247;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=67;TCR=38;TR=105;WE=74012470;WS=74012452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr4	74275201	rs58639526	A	G	2807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.580;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=65;PP=1778;ReadPosRankSum=1.172;SC=GCCTGTTGCCAAAGGTATTAT;SOR=0.864;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=253;TCF=126;TCR=127;TR=125;WE=74275209;WS=74275191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,138:0.49:283
chr4	74281012	rs6832260	T	A	413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=285;SC=TGGTTTCAATTCTGGAATCTT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=74281020;WS=74281002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	74282092	rs35807836	A	AT	243.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=154;ReadPosRankSum=-0.660;SC=TTATTGACTGATTTTTTTTAT;SOR=0.430;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=10;WE=74282100;WS=74282082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr4	74285239	rs962004	C	T	2031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.46;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr4	74302071	rs3796678	T	A	1401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=21;NR=26;PP=704;SC=ATAGGTGAGATATTTTGTGTT;SOR=1.220;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=21;TCR=26;TR=47;WE=74302079;WS=74302061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr4	74302151	rs3796677	A	T	225.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=6;PP=141;SC=TTGATTTATTATTCATATTTA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=74302159;WS=74302141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	74304118	rs6446932	T	A	242.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=198;SC=AATGCATTTATATATTTGAAG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=74304126;WS=74304108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	74310844	rs2298839	A	G	4385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=84;PP=2644;SC=GATGGGGTGAAGAGTCTTGCT;SOR=1.091;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=63;TCR=84;TR=147;WE=74310852;WS=74310834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr4	74313169	rs7667494	T	C	983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=20;NR=12;PP=511;SC=CTTTATTTTCTCTGTTGCAGG;SOR=0.914;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=20;TCR=12;TR=32;WE=74313177;WS=74313159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr4	74318330	rs4235117	A	G	908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=21;PP=625;SC=CGCTGCAAACAATGAAGCAAG;SOR=1.751;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=10;TCR=21;TR=31;WE=74318338;WS=74318320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr4	74321014	rs186736620	A	G	808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.969;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=17;PP=579;ReadPosRankSum=-0.297;SC=TCAGGTAACAAAACATTCAGA;SOR=0.566;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=81;TCF=42;TCR=39;TR=37;WE=74321022;WS=74321004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,40:0.43:92
chr4	74349604	.	GAAAAATGTTAGA	G	1268.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.653;ClippingRankSum=0.000;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.305;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.219;NF=6;NR=9;PP=2971;ReadPosRankSum=-0.784;SC=TTATTTATTTGAAAAATGTTA;SOR=1.254;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=46;TCF=17;TCR=29;TR=15;WE=74349623;WS=74349594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,35:0.41:85
chr4	74349867	rs11939341	A	G	578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=1;PP=400;SC=TATAGCCATTACAATAGATAA;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=74349875;WS=74349866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	74350157	.	C	CTCTT	47.86	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.98;QD=23.93;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr4	74357851	rs11733262	A	G	809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=21;PP=629;SC=AAAGAAACTTATAAGATTTGA;SOR=3.611;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=24;WE=74357859;WS=74357841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	74361254	rs10212657	T	C	2221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=47;PP=1476;SC=GAAAATGTGATTGGCTAATCT;SOR=1.580;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=25;TCR=47;TR=72;WE=74361262;WS=74361244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr4	74447452	rs1247670	C	T	3026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=44;PP=1685;SC=CAGAATGAGGCAAACTGTTCT;SOR=0.877;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=101;TCF=57;TCR=44;TR=101;WE=74447460;WS=74447442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr4	74447510	rs1247671	A	C	4301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=74;NR=67;PP=2527;SC=GAGTCAGGTAAAAAGTGTGAT;SOR=0.768;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=74;TCR=67;TR=141;WE=74447518;WS=74447500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr4	74453782	rs10009048	A	G	1025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=26;PP=731;SC=CAAAGTTATAACAATTTTATG;SOR=4.680;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=28;WE=74453790;WS=74453772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr4	74458987	rs34169741	C	T	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.904;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=71;ReadPosRankSum=-0.712;SC=CCTGCCTTGGCCTCCCGAAGT;SOR=2.636;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=5;WE=74458995;WS=74458978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr4	74464285	rs10632092	T	TTG	1167.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=0.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=7;PP=696;ReadPosRankSum=-1.135;SC=TCTTCCAGAATTGTGTGTGTG;SOR=0.871;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=17;TCF=10;TCR=7;TR=15;WE=74464293;WS=74464275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,34:0.87:39
chr4	74464443	rs11368217	TA	T	825.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=20;PP=406;SC=TCCCTAAAAATAAAAAAAAAT;SOR=1.839;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=20;WE=74464451;WS=74464433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr4	74486052	rs1247591	C	G	1685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=39;NR=18;PP=1022;SC=CATCGTTGTTCGGCTGAACTT;SOR=1.498;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=39;TCR=18;TR=57;WE=74486060;WS=74486042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr4	74486264	rs1247590	G	A	4375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=79;PP=2579;ReadPosRankSum=-0.626;SC=CAGCGATCCTGGAGCCCCAGG;SOR=0.286;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=159;TCF=79;TCR=80;TR=158;WE=74486279;WS=74486254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,170:0.99:171
chr4	74711842	rs34821794	C	T	3787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=58;NR=62;PP=1980;SC=TATAGGTATACTTCTGTATCT;SOR=0.889;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=122;TCF=58;TCR=64;TR=120;WE=74711850;WS=74711832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr4	74713831	rs61710848	A	C	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.478;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=183;ReadPosRankSum=-0.107;SC=CATTATACTAACAACTCCAAT;SOR=0.058;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=13;WE=74713839;WS=74713821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
chr4	74713950	rs7658970	T	C	905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.371;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=7;PP=635;ReadPosRankSum=0.707;SC=AGAGGTACAATTACTGTCAAT;SOR=0.470;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=56;TCF=47;TCR=9;TR=36;WE=74713958;WS=74713940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,37:0.63:59
chr4	74714003	rs6815457	A	G	1579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.034;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=19;PP=1044;ReadPosRankSum=-0.718;SC=GCCACTAATAAATCACATTTT;SOR=0.862;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=147;TCF=101;TCR=46;TR=66;WE=74714011;WS=74713993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,74:0.44:169
chr4	74714084	rs16850078	T	C	2810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.373;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=62;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.915;SC=AGTCAGCCTCTGGAATTCATC;SOR=0.755;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=284;TCF=148;TCR=136;TR=131;WE=74714106;WS=74714074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:184,145:0.44:329
chr4	74714098	rs2367288	G	A	3756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.364;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=75;PP=2962;ReadPosRankSum=3.477;SC=ATTCATCCCAGCAACATCATC;SOR=0.836;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=288;TCF=141;TCR=147;TR=144;WE=74714106;WS=74714074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,175:0.53:328
chr4	74718941	rs941758	C	A	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=7;PP=260;ReadPosRankSum=0.099;SC=CGCTGTCCACCCCAGGCTTCC;SOR=0.631;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=52;TCF=34;TCR=18;TR=20;WE=74718949;WS=74718931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,21:0.38:55
chr4	74719925	rs11723868	G	A	658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.318;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=472;ReadPosRankSum=0.195;SC=TTATATTAACGAAATAAATCA;SOR=1.179;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=63;TCF=18;TCR=45;TR=29;WE=74719933;WS=74719915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,30:0.45:67
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chr4	74735244	rs2071425	A	G	911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.464;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-1.680;NF=23;NR=23;PP=499;ReadPosRankSum=-2.006;SC=TGCGAGTGGCACTGCTGCTCC;SOR=0.854;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=109;TCF=56;TCR=53;TR=46;WE=74735252;WS=74735234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,50:0.41:121
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chr4	74847292	rs352007	G	C	1310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.70;SOR=1.201;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
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chr4	75023709	rs2289443	C	T	10781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=399;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=178;NR=188;PP=2965;SC=CCGCTCTTTACCCCACTCTGC;SOR=0.792;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=366;TCF=178;TCR=188;TR=366;WE=75023717;WS=75023699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,399:1.00:399
chr4	75023737	.	G	T	3141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.319;ClippingRankSum=0.000;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.345;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=72;PP=1892;ReadPosRankSum=-1.276;SC=CCGGAACCTGGCTGGGAAGCG;SOR=0.516;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=313;TCF=150;TCR=163;TR=149;WE=75023745;WS=75023727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:177,160:0.47:337
chr4	75040944	rs13116686	T	G	2232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=42;PP=1430;ReadPosRankSum=-1.287;SC=ACACTATTGATGAAAAACCAT;SOR=0.680;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=244;TCF=143;TCR=101;TR=104;WE=75040952;WS=75040934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,112:0.42:268
chr4	75046310	rs4694183	A	C	785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=2;PP=447;ReadPosRankSum=0.442;SC=GTTTCCATGCATCTCATTTGA;SOR=0.434;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=40;TCF=37;TCR=3;TR=23;WE=75046318;WS=75046300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,30:0.61:49
chr4	75046372	rs561583	A	G	4552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=51;PP=2773;SC=TGGTACTGGGACTGTCACAAG;SOR=1.413;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=142;TCF=91;TCR=51;TR=142;WE=75046380;WS=75046362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr4	75046465	rs561844	C	G	7802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=126;NR=124;PP=2965;SC=CAGGCTTGCTCTTTGTCCAGT;SOR=0.817;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=250;TCF=126;TCR=124;TR=250;WE=75046473;WS=75046455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,289:1.00:289
chr4	75107255	rs4694184	T	C	1761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.53;SOR=0.910;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr4	75231244	rs1460006	C	G	850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.44;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	75245343	rs7660209	T	A	588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=5;NR=15;PP=408;SC=GATAATTTTTTAAAAAAGGGT;SOR=2.200;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=20;WE=75245351;WS=75245333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	75246617	rs4694187	A	T	568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=1;PP=433;SC=TCTCCTTGACAGATTGGCATC;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=75246625;WS=75246610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	75248434	rs2367707	A	G	5395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=91;PP=2859;SC=TAAGCAAAGAATATGTGGCTT;SOR=0.946;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=172;TCF=81;TCR=91;TR=172;WE=75248442;WS=75248424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr4	75248544	rs2367708	C	T	961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=21;PP=571;SC=TCTGCTTTTACAAATTACTTT;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=29;WE=75248552;WS=75248534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr4	75482263	rs201229958	A	G	148.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.70;QD=29.78;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	75485813	rs78161216	C	T	154.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.90;QD=19.35;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	75673455	rs7699847	T	A	1352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.06;SOR=1.519;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr4	75681217	rs11734944	A	G	3295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=67;PP=2070;SC=CAATAAATCAACTCTCTTTAA;SOR=1.589;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=35;TCR=67;TR=102;WE=75681225;WS=75681207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr4	75937971	rs3822109	C	T	3539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=357;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.380;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=75;PP=2266;ReadPosRankSum=-0.939;SC=GAACACAGCTCGGGCACTCCT;SOR=0.760;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=332;TCF=171;TCR=161;TR=159;WE=75937979;WS=75937961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:189,167:0.47:356
chr4	75938179	rs3775527	G	A	3708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=354;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=86;PP=2141;ReadPosRankSum=0.670;SC=CAGAGTCCCCGACAGAGGAGT;SOR=0.672;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=326;TCF=152;TCR=174;TR=162;WE=75938187;WS=75938169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,179:0.51:349
chr4	75938236	rs1062293	A	G	2101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.478;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=53;PP=1304;ReadPosRankSum=0.343;SC=CTGAGCCAGTACCCCAGGAGA;SOR=0.732;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=214;TCF=96;TCR=118;TR=92;WE=75938244;WS=75938226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,104:0.44:238
chr4	75938373	rs919052	C	G	638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.509;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=331;ReadPosRankSum=-0.483;SC=GAGTCTCTATCCAGTCCACTA;SOR=0.368;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=64;TCF=21;TCR=43;TR=26;WE=75938381;WS=75938363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,30:0.43:70
chr4	76415985	rs6833496	G	A	526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=15;PP=402;SC=AGAAGATGCAGGCTAACTGCC;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=76415993;WS=76415975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	76416779	rs2045863	G	A	2911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=53;NR=45;PP=1555;SC=ACACAAAAAAGTCAAACATCT;SOR=0.730;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=99;TCF=53;TCR=46;TR=98;WE=76416787;WS=76416769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr4	76446921	rs112121251	G	GATT	4000.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=23;PP=2562;SC=CTCACTTGATGATTATTATTA;SOR=1.770;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=61;TCF=34;TCR=27;TR=51;WE=76446929;WS=76446911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr4	76467577	rs11722735	A	G	783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.825;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=15;PP=479;ReadPosRankSum=-0.721;SC=GCTGATCGCAATTTTCATAAA;SOR=0.813;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=40;TCR=30;TR=34;WE=76467585;WS=76467567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,38:0.46:82
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chr4	76474892	rs6535532	A	T	152.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=3;NR=4;PP=82;SC=GGCTCAAGTGATCCTTCCACC;SOR=0.941;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=7;WE=76474900;WS=76474882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
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chr4	76481628	rs62318656	A	C	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.193;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=169;ReadPosRankSum=-1.199;SC=AACAATATCCATCGTTATGGG;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=9;WE=76481636;WS=76481618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr4	76489345	rs2306175	C	T	2715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.409;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=56;PP=1802;ReadPosRankSum=-0.756;SC=GTATTTACGCCTCCTGGAGAT;SOR=0.794;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=274;TCF=155;TCR=119;TR=131;WE=76489353;WS=76489335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,134:0.46:289
chr4	76521414	rs78774736	G	A	1463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=21;PP=694;ReadPosRankSum=0.687;SC=TTCTACTACTGAGAACTGCTT;SOR=0.629;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=95;TCF=59;TCR=36;TR=57;WE=76521422;WS=76521404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,67:0.62:108
chr4	76570994	rs35597810	C	A	917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=27;PP=737;SC=ACACTTTTATCAGCCCCCCAC;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=28;WE=76571002;WS=76570984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr4	76571732	rs884871	C	T	933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=28;PP=761;SC=GTTATCTCCCCGATCCATTTT;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=28;WE=76571740;WS=76571722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr4	76572191	rs2175766	A	C	1568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=11;PP=980;SC=TAAAAACTCCAACAGCAAAAT;SOR=2.066;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=36;TCR=11;TR=47;WE=76572199;WS=76572181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr4	76573688	rs13129043	G	A	377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=1;PP=297;SC=TTAGCAGGTTGCTCACATCAC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=76573696;WS=76573678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	76580894	rs17000733	G	A	3089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=30;PP=1988;SC=TCTAGGAACAGAAACCACCTT;SOR=1.675;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=67;TCR=30;TR=97;WE=76580902;WS=76580884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr4	76649924	rs2280095	C	G	1448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=11;PP=960;SC=GGGATTGGGGCCCAGGCCCTG;SOR=2.049;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=37;TCR=11;TR=48;WE=76649932;WS=76649914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr4	76650176	rs7657871	C	G	301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=238;SC=ATGGAGGGGGCATCCACATGC;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=76650184;WS=76650166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	76670180	rs3853184	T	C	11866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=443;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=194;NR=190;PP=2965;SC=CTCTTAAATTTAGGTCTTTCC;SOR=0.702;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=386;TCF=195;TCR=191;TR=384;WE=76670188;WS=76670170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,442:1.00:442
chr4	76678576	rs4859552	A	G	1676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=23;PP=1094;SC=TAAAATTGCTAAATAACTAAA;SOR=1.107;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=35;TCR=23;TR=58;WE=76678584;WS=76678566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr4	76691828	rs324715	G	C	919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=16;SC=GATCCACATGGATGTTTCAAG;SOR=1.382;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=10;TCR=16;TR=26;WE=76691836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr4	76695769	.	T	C	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.084;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=206;ReadPosRankSum=0.793;SC=ATTTTTGAAGTAATTTAAAAA;SOR=0.336;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=12;WE=76695777;WS=76695759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr4	76695810	rs10588680	TTCTC	T	3439.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=19;PP=2174;SC=CCACTAAACATTCTCTTTCTT;SOR=1.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=24;TCR=20;TR=41;WE=76695821;WS=76695800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr4	76711200	rs67037358	TA	T	106.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.761;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.89;ReadPosRankSum=0.076;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr4	76720885	rs13119659	T	C	3025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=58;PP=1610;SC=ATGTTCCATTTGTATCCTTTA;SOR=1.093;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=47;TCR=58;TR=105;WE=76720893;WS=76720875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr4	76721414	rs13145290	C	G	1441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=4;PP=1134;SC=CTTATGGGAACTCTTATGTGA;SOR=3.865;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=40;TCR=4;TR=44;WE=76721422;WS=76721404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr4	76721459	rs4859409	G	A	3523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=80;NR=44;PP=2159;SC=ATTGCAAAATGTACTAGATAT;SOR=1.371;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=80;TCR=44;TR=124;WE=76721467;WS=76721449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr4	76721705	rs2271472	C	G	1034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=24;NR=27;PP=1058;SC=ATTATGTAGACCAAGCTTTTA;SOR=0.914;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=53;TCF=25;TCR=28;TR=51;WE=76721713;WS=76721695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr4	76722041	rs324727	G	A	974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=30;PP=799;SC=AGGTTATATGGTAACTCTAAA;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=35;WE=76722049;WS=76722031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr4	76722353	rs324726	G	A	3555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=56;PP=2017;SC=TTCGAGAGCAGGTAAGTACTA;SOR=0.873;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=114;TCF=58;TCR=56;TR=114;WE=76722361;WS=76722343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr4	76722422	rs13133472	T	C	1994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=43;PP=1301;SC=GGGAGCCTTTTTTTCTGACAT;SOR=2.015;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=19;TCR=43;TR=62;WE=76722430;WS=76722412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr4	76725245	rs381067	G	T	2702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=18;PP=1924;SC=TAATGCTAACGAGTATGACTT;SOR=2.610;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=69;TCR=18;TR=87;WE=76725253;WS=76725235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr4	76726528	.	T	C	194	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=11;HapScore=3;MGOF=51;MMLQ=27;MQ=57.53;NF=0;NR=8;PP=194;QD=28.5964015684;SC=TTTTTTTTTTTCCTTGGATCT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=8;WE=76726547;WS=76726518;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,8:0.89:9
chr4	76726539	.	C	T	172	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=3;HapScore=3;MGOF=51;MMLQ=19;MQ=58.88;NF=0;NR=7;PP=172;QD=29.5387446496;SC=CCTTGGATCTCTTAAGCCAGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=76726547;WS=76726518;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	76727576	rs11312984	GT	G	663.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=5;PP=386;SC=GTACAGTTCTGTTTTTTTTTC;SOR=2.670;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=20;WE=76727584;WS=76727566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	76730004	rs324687	G	C	214.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=1;PP=183;SC=GATTTTAAAAGTAGGAGGTTG;SOR=4.407;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=76730012;WS=76729994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	76730061	rs324688	T	A	1094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=7;PP=662;SC=CCTTGATGAATTTAATACCAT;SOR=2.012;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=32;WE=76730069;WS=76730051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr4	76730258	rs324690	T	C	1517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=28;PP=849;SC=GTTGATGTATTATTTCTTAGC;SOR=1.893;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=41;WE=76730266;WS=76730248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr4	76730309	rs145662788	CTTTAGATTACTTACTAGCCGG	C	403.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=1774;SC=AGCACCTTCTCTTTAGATTAC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=76730337;WS=76730299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	76785716	rs1394913	C	T	759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.99;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	76785723	rs1394914	A	G	701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.78;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	76785736	rs1394915	T	C	355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=9;PP=244;SC=TGTTCCAATATATAATTAACA;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=76785744;WS=76785706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	76787673	rs7654738	T	C	1409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=32;PP=967;SC=GAAGCTAGGCTTGCCAGATAA;SOR=2.030;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=12;TCR=32;TR=44;WE=76787681;WS=76787663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr4	76788692	rs2135234	C	T	714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=20;PP=535;SC=GCTCAGTTTTCGAGGGAGAGC;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=76788700;WS=76788682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr4	76793228	rs1394916	A	G	4250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.98;NF=72;NR=65;PP=2611;SC=GATACTGCACAATATGTGGGG;SOR=0.706;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=137;TCF=72;TCR=65;TR=137;WE=76793236;WS=76793218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr4	76794345	rs6858658	T	G	8307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=149;NR=120;PP=2965;SC=AGGAATTGCATGTTGTATTTT;SOR=0.832;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=270;TCF=149;TCR=121;TR=269;WE=76794353;WS=76794335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,306:1.00:306
chr4	76800729	rs13130621	A	G	966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.367;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=12;PP=646;ReadPosRankSum=0.506;SC=TTTTTTTGTCAGATTCTTCTG;SOR=1.250;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=39;TCF=26;TCR=13;TR=38;WE=76800737;WS=76800719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,40:0.98:41
chr4	76800991	rs68095351	A	AT	197.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.97;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	76804067	rs4859564	A	G	5746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=130;NR=74;PP=2965;SC=GTATTATTTCATTAACCACTA;SOR=1.421;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=204;TCF=130;TCR=74;TR=204;WE=76804075;WS=76804057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr4	76805902	rs1976518	C	T	5132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=94;NR=74;PP=2600;SC=GTTCTGGCGACGGGAGGCCAT;SOR=0.798;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=168;TCF=94;TCR=74;TR=168;WE=76805910;WS=76805892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr4	76805962	rs1976517	G	A	3189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=56;PP=1803;SC=GAAGGAAATAGGAAATCAGGT;SOR=1.159;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=42;TCR=56;TR=98;WE=76805970;WS=76805952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr4	76805978	rs1566975	C	T	2379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=43;PP=1351;SC=CAGGTTAAAACCAATAGGCAT;SOR=1.528;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=26;TCR=43;TR=69;WE=76805986;WS=76805968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr4	76809319	rs7691712	A	G	1427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=12;PP=873;SC=CAGGTAGAGCATTCTTCTTTG;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=36;TCR=12;TR=48;WE=76809327;WS=76809309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr4	76809386	rs7691755	A	G	3856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=52;PP=2254;SC=TGATCTCCTCACTGTAACAGG;SOR=1.017;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=81;TCR=52;TR=133;WE=76809394;WS=76809376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr4	76812673	rs13116688	C	G	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=3;PP=263;SC=GCCATTTACTCCTCAGCCCCT;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=76812681;WS=76812663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	76839729	rs2869456	A	C	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.993;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=168;ReadPosRankSum=-0.501;SC=CACCCCACCCATATTAGTCCC;SOR=1.845;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=10;WE=76839737;WS=76839726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr4	76857303	.	G	A	1117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.412;ClippingRankSum=0.000;DP=339;ExcessHet=3.0103;FS=1.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.30;ReadPosRankSum=2.357;SOR=0.822;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:257,82:0.24:339
chr4	76861137	rs6847716	G	C	1448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=9;PP=917;SC=TACTCCGCGCGGGCTTGGGGC;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=46;TCF=37;TCR=9;TR=45;WE=76861145;WS=76861127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr4	76877402	rs9790644	G	A	771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=19;PP=523;SC=CAAGGGCACAGAATGGACAGG;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=76877410;WS=76877392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	76881392	rs67906710	C	T	1278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=21;NR=20;PP=664;SC=GATCATAAAACCTTAATCATG;SOR=0.818;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=21;TCR=20;TR=41;WE=76881400;WS=76881382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr4	76885423	rs2271527	T	C	3926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=72;NR=63;PP=2339;SC=CACAAACACATAAGAATGAAA;SOR=0.706;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=135;TCF=72;TCR=63;TR=135;WE=76885431;WS=76885413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr4	76888235	rs12648437	A	G	763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=1;PP=574;SC=TGTTGTTTTAAAAAAACAATA;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=76888243;WS=76888225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr4	76928729	rs2276885	A	G	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=165;ReadPosRankSum=-0.037;SC=CTGATTGGCTAGTATCTTTAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=9;WE=76928737;WS=76928719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr4	76942943	rs3921	C	G	1942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.140;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.949;NF=51;NR=32;PP=1299;ReadPosRankSum=0.254;SC=TGGTGACCATCATTGGTCACC;SOR=0.788;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=177;TCF=109;TCR=68;TR=83;WE=76942951;WS=76942933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,89:0.47:190
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chr4	76943235	rs4859586	T	C	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=212;ReadPosRankSum=1.296;SC=TTATGGATTATAGGGGTTGCT;SOR=0.602;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=11;WE=76943243;WS=76943225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
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chr4	76956188	rs4241580	T	C	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.129;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=13;PP=413;ReadPosRankSum=0.545;SC=TGGGAGTAATTTGGTAACTTA;SOR=0.941;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=45;TCF=18;TCR=27;TR=21;WE=76956196;WS=76956178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,22:0.46:48
chr4	76956289	rs5859488	C	CAA	2079.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.385;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=23;PP=1186;ReadPosRankSum=1.716;SC=AAAGAACATACAAGAGTCTTA;SOR=0.441;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=71;TCF=28;TCR=43;TR=31;WE=76956297;WS=76956279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,55:0.45:121
chr4	76956528	rs4859415	A	G	1887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.676;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=48;PP=1123;ReadPosRankSum=0.183;SC=TTAGTAATGCATCTGATTGCA;SOR=0.583;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=126;TCF=39;TCR=87;TR=71;WE=76956536;WS=76956518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,84:0.59:143
chr4	76957043	rs6817952	G	A	1226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.749;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=18;PP=662;ReadPosRankSum=0.041;SC=CATTAGAAAAGGAACTTATAG;SOR=0.413;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=99;TCF=67;TCR=32;TR=51;WE=76957051;WS=76957033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,58:0.54:108
chr4	76957171	rs6819597	C	T	1520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.778;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=36;PP=996;ReadPosRankSum=-1.943;SC=GCTGGTGCTGCTGCTGCTACT;SOR=0.594;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=171;TCF=86;TCR=85;TR=72;WE=76957179;WS=76957161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,81:0.41:197
chr4	76996958	rs6532172	G	A	764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=3;PP=556;ReadPosRankSum=0.108;SC=GAAAAAATACGCAGTGTCATC;SOR=0.936;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=48;TCF=42;TCR=6;TR=28;WE=76996966;WS=76996948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,31:0.61:51
chr4	77002905	rs150056837	TAATA	T	742.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-1.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=584;ReadPosRankSum=1.768;SC=AAGGTGGGGGTAATAATGTGA;SOR=0.337;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=13;WE=77002916;WS=77002895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr4	77002934	rs61693363	G	A	887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-0.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.678;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=3;PP=556;ReadPosRankSum=1.549;SC=GATATTCACTGAATTTCTTAT;SOR=2.135;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=64;TCF=52;TCR=12;TR=30;WE=77002942;WS=77002924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,36:0.48:75
chr4	77021288	rs7654988	G	C	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.561;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=133;ReadPosRankSum=-0.417;SC=CATTTAGACTGTGACCGACAA;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=7;WE=77021296;WS=77021278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr4	77025273	rs7682766	C	T	809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.737;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=25;PP=566;ReadPosRankSum=-0.924;SC=GCTGGGGAAGCGTAGAGAAGT;SOR=1.312;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=54;TCF=14;TCR=40;TR=32;WE=77025281;WS=77025263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,34:0.60:57
chr4	77025810	rs17224545	G	A	1479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.700;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=29;PP=798;ReadPosRankSum=1.591;SC=ATGCCAGAGGGGAACATGCCA;SOR=0.924;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=145;TCF=78;TCR=67;TR=59;WE=77025818;WS=77025800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,71:0.41:173
chr4	77033721	rs62318929	G	A	708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.204;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=22;PP=543;ReadPosRankSum=-0.939;SC=ATAACTATAGGGATCCACAGG;SOR=0.137;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=27;WE=77033729;WS=77033711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,27:0.75:36
chr4	77036369	rs1127695	G	A	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=38;ReadPosRankSum=-0.378;SC=CAGATTTGATGAACAGTAATT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=4;WE=77036377;WS=77036359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr4	77036406	rs17001433	T	G	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.960;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=188;ReadPosRankSum=0.187;SC=AAAAAACCAATCCAAGAAAGA;SOR=1.204;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=11;WE=77036414;WS=77036396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,11:0.34:32
chr4	77038807	rs7657846	C	T	1846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FS=1.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.33;ReadPosRankSum=2.174;SOR=0.568;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,94:0.47:198
chr4	77038974	rs6532201	T	A	1295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.294;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=34;ReadPosRankSum=0.543;SC=CGAAGACTTGTAAAAGACAAT;SOR=0.452;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=124;TCF=43;TCR=81;TR=56;WE=77038982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,63:0.46:136
chr4	77039174	rs6813732	G	C	2427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.604;HP=6;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=38;PP=1600;ReadPosRankSum=0.288;SC=ATAACTTTTTGTCTGCAGATC;SOR=0.931;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=166;TCF=99;TCR=67;TR=98;WE=77039182;WS=77039164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,108:0.57:189
chr4	77039193	rs6840007	A	T	2786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.114;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=44;PP=1710;ReadPosRankSum=-1.124;SC=TCCACCTGAAACAAATTTTAG;SOR=0.927;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=196;TCF=116;TCR=80;TR=114;WE=77039201;WS=77039183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,127:0.58:219
chr4	77045728	rs7692789	A	T	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=459;ReadPosRankSum=0.657;SC=TTTCTATTTTAAAAATCTATA;SOR=0.804;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=9;WE=77045747;WS=77045718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr4	77045736	rs142448247	ATATT	A	413.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=461;ReadPosRankSum=-0.023;SC=TTAAAAATCTATATTTAGTAC;SOR=0.770;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=18;TCF=11;TCR=7;TR=7;WE=77045747;WS=77045718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr4	77045762	rs7697701	T	G	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=1.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.61;ReadPosRankSum=0.627;SOR=0.479;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,17:0.39:44
chr4	77045777	rs10567711	TGG	T	758.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.052;HP=7;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=155;ReadPosRankSum=0.240;SC=TTATAAACACTGGGGGGGAAA;SOR=0.885;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=7;WE=77045786;WS=77045767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,23:0.43:54
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chr4	77051703	rs57765272	G	T	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-4.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.544;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=3;PP=494;ReadPosRankSum=-0.887;SC=ATGCTACATTGTTTCCTGATT;SOR=0.120;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=33;TCF=30;TCR=3;TR=23;WE=77051711;WS=77051693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,22:0.63:35
chr4	77052031	rs62300572	A	G	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=2.863;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=64;ReadPosRankSum=2.034;SC=ATCTATGACTATGAGATAACC;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=5;WE=77052039;WS=77052021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr4	77052288	rs60523248	T	C	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=70;ReadPosRankSum=0.344;SC=AATAAACTTGTCTCATATGTA;SOR=0.582;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=7;WE=77052296;WS=77052278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr4	77052530	rs13126384	T	C	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.464;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=33;ReadPosRankSum=-1.593;SC=ACCCTATACCTAGAAGCTATA;SOR=0.223;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=4;WE=77052538;WS=77052520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr4	77053558	rs7698392	A	G	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.57;ReadPosRankSum=-0.046;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr4	77053562	rs4859619	C	T	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.57;ReadPosRankSum=-0.322;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr4	77055474	rs11097244	A	G	1162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.665;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=28;PP=637;ReadPosRankSum=-0.760;SC=CCACTAGCCCATCTTCATCTT;SOR=0.773;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=108;TCF=52;TCR=56;TR=53;WE=77055482;WS=77055464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,60:0.48:124
chr4	77057501	rs11558468	A	G	3228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.488;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=75;PP=2032;ReadPosRankSum=1.396;SC=GAGCACTCGCAGTATTTATCA;SOR=0.589;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=254;TCF=123;TCR=131;TR=147;WE=77057509;WS=77057491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,156:0.58:268
chr4	77060903	rs58695482	C	T	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.561;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=121;ReadPosRankSum=-0.656;SC=TGAAATGACACGCTTGGGATT;SOR=1.981;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=8;WE=77060911;WS=77060893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr4	77061130	rs60913446	G	A	525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=1.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.06;ReadPosRankSum=-0.503;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,28:0.48:58
chr4	77061266	rs62300624	G	A	90.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=1;NR=2;PP=54;SC=GGTGAAGACTGGGGAACGGAG;SOR=1.609;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=77061274;WS=77061256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	77065223	rs11724260	A	G	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.49;BaseQRankSum=4.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=303;ReadPosRankSum=-0.468;SC=AAAGTCCACTAAAGTATTCTG;SOR=0.598;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=14;WE=77065231;WS=77065213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr4	77065264	rs11736522	C	T	1312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.48;BaseQRankSum=-2.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=6;PP=714;ReadPosRankSum=-0.410;SC=CTAGTATCATCACGGTTTTGT;SOR=0.739;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=82;TCF=69;TCR=13;TR=39;WE=77065272;WS=77065254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,53:0.51:104
chr4	77065318	rs36024409	C	CTGT	5776.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.5;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.480;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=5.180;NF=35;NR=40;PP=2979;ReadPosRankSum=0.032;SC=GCTGCTGCTGCTGTGTATTAA;SOR=0.601;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=157;TCF=73;TCR=84;TR=75;WE=77065326;WS=77065308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,158:0.56:280
chr4	77065476	rs200401097	TAAA	T	2340.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=1.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.18;ReadPosRankSum=0.807;SOR=0.871;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,75:0.74:101
chr4	77065518	rs11946345	T	C	1555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.298;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=43;PP=1095;ReadPosRankSum=0.373;SC=TTTACTTCTATGAATGACTTA;SOR=0.929;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=148;TCF=70;TCR=78;TR=79;WE=77065526;WS=77065508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,75:0.59:127
chr4	77065580	rs11558469	T	C	1642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.570;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=43;PP=826;ReadPosRankSum=-1.206;SC=AAAAGCTGAATGCAGAACCTG;SOR=0.891;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=177;TCF=88;TCR=89;TR=82;WE=77065588;WS=77065570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,87:0.48:180
chr4	77066887	rs61102074	G	T	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.667;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=159;ReadPosRankSum=0.052;SC=GAATTATATTGCAGATTTTTT;SOR=1.127;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=40;TCF=16;TCR=24;TR=12;WE=77066895;WS=77066877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,16:0.36:45
chr4	77067133	rs735696	C	T	742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.12;ReadPosRankSum=0.742;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr4	77067133	.	CAC	TAA	626	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=14;NR=4;PP=626;QD=37.7482152701;SC=AAAAGTCACCCACAGTACTAA;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=29;TCR=8;TR=18;WE=77067143;WS=77067123;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr4	77067135	rs60015167	C	A	742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=1.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.27;ReadPosRankSum=0.927;SOR=0.946;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,20:0.47:43
chr4	77067330	rs62300636	T	C	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.689;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=167;ReadPosRankSum=0.404;SC=TATCAGCCCTTTGCTGAAGGT;SOR=1.802;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=11;WE=77067338;WS=77067320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,13:0.36:36
chr4	77067368	rs735697	A	G	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=58;ReadPosRankSum=0.781;SC=GTTAAAACATATTACATTATC;SOR=0.784;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=6;WE=77067376;WS=77067358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr4	77069679	rs3806733	G	T	1696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.635;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=48;PP=1153;ReadPosRankSum=-0.017;SC=GGCGTAGGAGGTGGGTGGTTG;SOR=1.179;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=117;TCF=38;TCR=79;TR=67;WE=77069687;WS=77069669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,74:0.57:130
chr4	77069733	rs3806732	T	A	576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=3.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=387;ReadPosRankSum=-0.640;SC=GGGCTTCACATGCTGTGGGGT;SOR=1.536;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=17;WE=77069741;WS=77069723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,21:0.66:32
chr4	77083070	rs3836573	TCAG	T	537.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.239;NF=0;NR=14;PP=565;ReadPosRankSum=0.167;SC=TCTTGAAGATTCAGCAGGCCT;SOR=2.419;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=14;WE=77083080;WS=77083060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr4	77091006	rs35369082	A	T	1391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.142;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=19;PP=795;ReadPosRankSum=-0.816;SC=TACCAGGAGGAAGTATGTACT;SOR=0.881;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=129;TCF=85;TCR=44;TR=58;WE=77091014;WS=77090996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,68:0.46:147
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chr4	77097758	rs6532232	T	C	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=257;ReadPosRankSum=1.171;SC=TGGTGCCCAGTTGTTTGGTCA;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=12;WE=77097766;WS=77097748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr4	77105938	rs35947779	CA	C	2861.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.52;MQRankSum=1.859;QD=23.46;ReadPosRankSum=1.529;SOR=0.718;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,81:0.66:122
chr4	77105952	rs59335499	A	T	1697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=0.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.43;MQRankSum=2.256;QD=11.55;ReadPosRankSum=1.644;SOR=0.754;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,81:0.55:147
chr4	77117096	rs3733259	G	A	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.612;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=57;ReadPosRankSum=-0.832;SC=AGGAAGGGACGCCCCCTATTC;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=5;WE=77117104;WS=77117086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr4	77177415	rs61740422	C	T	1756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.979;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=32;PP=1129;ReadPosRankSum=1.532;SC=AGGGGCTGGACGACTTCAGGA;SOR=1.129;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=183;TCF=103;TCR=80;TR=81;WE=77177423;WS=77177405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,87:0.44:200
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chr4	77190069	rs1876539	C	T	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.450;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=49;ReadPosRankSum=-0.566;SC=TCCTCAAAGTCGTAAAGGAAT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=77190077;WS=77190059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr4	77192688	rs3733253	G	T	1010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.636;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=8;PP=640;ReadPosRankSum=-0.038;SC=TTCACCGATTGCCCTCAATTC;SOR=1.513;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=73;TCF=53;TCR=20;TR=38;WE=77192696;WS=77192678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,43:0.55:78
chr4	77192868	rs3733250	G	A	1996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.671;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=44;PP=1274;ReadPosRankSum=0.216;SC=TAAACTGCAGGAGACAGAGTT;SOR=0.340;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=120;TCF=46;TCR=74;TR=76;WE=77192876;WS=77192858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,87:0.63:138
chr4	77199414	rs964051	C	A	640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.686;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=454;ReadPosRankSum=-0.768;SC=ATCTGAGCTTCAGATGATCAC;SOR=0.223;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=22;WE=77199422;WS=77199404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,24:0.71:34
chr4	77201332	rs1036787	G	A	769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=3;PP=614;SC=TACTTTATAAGGAACTAAATG;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=25;WE=77201340;WS=77201322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	77201487	rs1036788	C	T	4391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=70;PP=2597;SC=GGCTACAGGACGCCACGTGTG;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=151;TCF=80;TCR=71;TR=150;WE=77201495;WS=77201477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr4	77204398	rs74988469	CAT	C	355.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=183;ReadPosRankSum=1.960;SC=AGATTATTAACATGTGATTTT;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=6;WE=77204407;WS=77204388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr4	77204500	rs1542096	C	T	662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=2.061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.20;ReadPosRankSum=-1.240;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,33:0.51:65
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chr4	77289047	rs78736198	CTT	C	101.06	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=5.441;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.44;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=2.225;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,6:0.86:7
chr4	77290561	rs72657825	G	A	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=246;ReadPosRankSum=0.737;SC=CGATGGCACAGCCTGTGCAGG;SOR=0.922;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=13;WE=77290569;WS=77290551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr4	77296600	rs1876535	T	C	1417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.108;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=20;PP=900;ReadPosRankSum=-0.410;SC=TGGCGGTGCATTGGCAGAACT;SOR=1.099;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=132;TCF=83;TCR=49;TR=63;WE=77296608;WS=77296590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,68:0.48:141
chr4	77303898	rs6844174	C	T	1602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=40;PP=1122;SC=TGGTGATTGTCATTTGATACA;SOR=2.107;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=14;TCR=40;TR=54;WE=77303906;WS=77303888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr4	77305346	rs17001890	A	G	3224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.394;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=67;PP=2003;ReadPosRankSum=-0.713;SC=ACATGCTGTCATGTTCACATA;SOR=0.706;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=294;TCF=153;TCR=141;TR=148;WE=77305354;WS=77305336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,158:0.49:320
chr4	77494534	rs71212430	CAAT	C	232.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=4;NR=0;PP=190;SC=TGCTGGTTGGCAATAATAATA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=4;WE=77494544;WS=77494524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr4	77494564	rs143035086	T	C	438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.56;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	77637502	rs344122	A	C	2554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.054;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=47;PP=1644;ReadPosRankSum=-0.971;SC=TTATTCCACGACTGAATATGA;SOR=0.570;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=238;TCF=143;TCR=95;TR=114;WE=77637510;WS=77637492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,126:0.46:272
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chr4	77660162	rs344140	G	C	2319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.425;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=60;PP=1591;ReadPosRankSum=1.236;SC=GGCATCTCTGGCCGGGAGCGT;SOR=0.661;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=273;TCF=127;TCR=146;TR=113;WE=77660170;WS=77660152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:189,120:0.39:309
chr4	77660731	rs344141	C	G	1607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.135;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=32;PP=879;ReadPosRankSum=-0.611;SC=CAGCATCTACCCGGTACCTTC;SOR=0.590;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=166;TCF=85;TCR=81;TR=69;WE=77660739;WS=77660721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,82:0.43:190
chr4	77662248	rs344142	G	A	921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=21;PP=599;ReadPosRankSum=0.088;SC=CCGAGGCGTCGGCCTCCGCCT;SOR=0.724;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=97;TCF=45;TCR=52;TR=38;WE=77662256;WS=77662238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,42:0.40:106
chr4	77663262	rs344144	T	C	1522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.240;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=43;PP=991;ReadPosRankSum=1.762;SC=GGTTTCCTTATAAAGATATAG;SOR=0.594;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=161;TCF=56;TCR=105;TR=68;WE=77663270;WS=77663252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,75:0.43:176
chr4	77669991	rs11097499	A	T	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.579;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.68;ReadPosRankSum=1.465;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr4	77817362	rs2703131	T	C	2545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.677;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=49;PP=1695;ReadPosRankSum=-1.019;SC=GTTTTAGTGATAAACCTGCAT;SOR=0.433;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=190;TCF=104;TCR=86;TR=100;WE=77817370;WS=77817352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,113:0.53:212
chr4	77818103	.	CTGCAGGGTCGAATAA	C	966.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.766;ClippingRankSum=0.000;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=2.595;NF=8;NR=13;PP=2982;ReadPosRankSum=-0.671;SC=GCTGCTGCTGCTGCAGGGTCG;SOR=0.727;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=66;TCF=18;TCR=48;TR=21;WE=77818125;WS=77818093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,29:0.32:92
chr4	77818202	rs2645674	T	C	1313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.319;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.596;NF=31;NR=31;PP=753;ReadPosRankSum=-0.106;SC=AAGCCCTGCTTGTCGCAGCCT;SOR=0.664;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=135;TCF=74;TCR=61;TR=62;WE=77818210;WS=77818192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,66:0.46:144
chr4	77818548	rs2703129	T	C	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.866;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=12;PP=353;ReadPosRankSum=3.281;SC=CCTACGGGAGTCGCTGCCCGG;SOR=0.808;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=74;TCF=44;TCR=30;TR=25;WE=77818556;WS=77818538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,28:0.32:87
chr4	77871016	rs873090	T	G	873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.92;ReadPosRankSum=0.666;SOR=0.686;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,45:0.56:80
chr4	77871187	rs141562324	C	CGCG	304.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=2;PP=53;ReadPosRankSum=-1.634;SC=TGCTCGGCCCCGCGGCGGCGG;SOR=0.711;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=2;WE=77871195;WS=77871177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr4	77916865	rs6532758	G	A	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=321;ReadPosRankSum=-0.249;SC=AAATCACCCAGTGATTTTACT;SOR=0.551;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=40;TCF=32;TCR=8;TR=22;WE=77916873;WS=77916855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,23:0.51:45
chr4	77917194	rs7356354	A	G	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.913;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=54;ReadPosRankSum=1.335;SC=TTTTTTCACTATGAGTTGACA;SOR=0.223;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=5;WE=77917202;WS=77917184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr4	77917458	rs7685131	A	G	945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.133;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=7;PP=612;ReadPosRankSum=-1.597;SC=GCAGCTGTGGAGGGTCTCCTT;SOR=1.118;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=77;TCF=59;TCR=18;TR=37;WE=77917466;WS=77917448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,40:0.50:80
chr4	77969825	.	GA	G	89.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.330;ClippingRankSum=0.000;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=1.571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQRankSum=0.000;QD=1.34;ReadPosRankSum=0.645;SOR=0.346;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,15:0.22:67
chr4	77987351	rs4241602	A	G	1843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=14;PP=1260;SC=GTATGGCAGTAGTATGTTTAT;SOR=2.019;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=45;TCR=14;TR=59;WE=77987359;WS=77987341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr4	78034309	rs4859743	A	C	3191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=375;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.339;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=77;PP=2081;ReadPosRankSum=1.465;SC=GTTCCAGATGATCCTCAGGTC;SOR=0.818;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=337;TCF=170;TCR=167;TR=146;WE=78034317;WS=78034299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:217,157:0.42:374
chr4	78081744	rs28648488	G	C	403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=0;PP=306;SC=TGTGGGTAAAGAGCCAGTACA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=78081752;WS=78081734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	78106123	rs28503908	C	T	293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=239;SC=TTGGATGTAACAGTGAGACTA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=78106131;WS=78106113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	78532232	rs1052563	T	C	2194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.068;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=60;PP=1585;ReadPosRankSum=0.211;SC=ATTCTTCCCTTATCCCTGCTC;SOR=0.789;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=196;TCF=86;TCR=110;TR=103;WE=78532240;WS=78532222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,103:0.49:212
chr4	78669278	rs80337171	C	T	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=39;ReadPosRankSum=1.309;SC=GGCTGCATTACTGTGAAAGAT;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=4;WE=78669286;WS=78669268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr4	78695894	.	TA	T	1510.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.856;ClippingRankSum=0.000;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.095;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.013;NF=1;NR=42;PP=570;ReadPosRankSum=0.329;SC=TACTGAAGTGTAAAAAAAAAC;SOR=0.500;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=103;TCF=2;TCR=101;TR=43;WE=78695902;WS=78695884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,75:0.49:152
chr4	78740203	.	G	GAC	185	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=5;HapScore=3;MGOF=9;MMLQ=22;MQ=60.0;NF=1;NR=4;PP=185;QD=37.8;SC=GGCCACCCCCGACACACACAC;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=5;WE=78740214;WS=78740193;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:9,5:0.36:14
chr4	78783818	rs60135456	G	T	1170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=4;PP=878;SC=CAGGGTCCTGGGCAACACGGA;SOR=3.967;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=33;TCR=4;TR=37;WE=78783826;WS=78783808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr4	78830272	rs10551874	AAC	A	85.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=94;ReadPosRankSum=1.150;SC=AATGAATGTGAACACCAGGAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=3;WE=78830281;WS=78830262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
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chr4	78979257	rs144106232	CGT	C	174.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=2.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQRankSum=3.523;QD=1.76;ReadPosRankSum=0.635;SOR=1.032;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,14:0.14:99
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chr4	79186047	rs6856362	G	A	1042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-2.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=13;PP=647;ReadPosRankSum=0.972;SC=ACTAAGAAATGTTAAATGAGA;SOR=0.637;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=110;TCF=77;TCR=33;TR=45;WE=79186055;WS=79186037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,52:0.41:128
chr4	79186090	rs75643057	A	C	2220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.438;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=45;PP=1400;ReadPosRankSum=-1.322;SC=TGGGGGCATGATTTAGTTGGC;SOR=0.469;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=205;TCF=116;TCR=89;TR=98;WE=79186098;WS=79186080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,110:0.46:237
chr4	79186171	rs2867014	G	A	6624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=113;PP=2965;SC=CCTGTTCTGCGTGTTAAGGAT;SOR=0.954;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=212;TCF=99;TCR=113;TR=212;WE=79186179;WS=79186161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr4	79187832	rs2008587	G	A	937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=3;PP=745;SC=TTTTCATAGAGGCTATTCCTA;SOR=3.912;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=30;WE=79187840;WS=79187822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	79187900	rs7694740	T	G	1177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.730;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=15;PP=723;ReadPosRankSum=-0.212;SC=ACAAATGTAATGAAAATTGGG;SOR=0.793;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=69;TCR=30;TR=49;WE=79187908;WS=79187890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,55:0.49:112
chr4	79188160	rs2008786	C	T	445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=611;ReadPosRankSum=-0.298;SC=CTTCTTATTCCGGTGTGTCCT;SOR=0.646;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=46;TCF=16;TCR=30;TR=18;WE=79188169;WS=79188150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,22:0.43:51
chr4	79188161	rs2198635	G	A	638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=18;PP=986;ReadPosRankSum=0.475;SC=TTCTTATTCCGGTGTGTCCTT;SOR=0.743;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=46;TCF=16;TCR=30;TR=27;WE=79188169;WS=79188150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,29:0.57:51
chr4	79202486	rs35419939	A	G	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.488;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=275;ReadPosRankSum=-0.565;SC=TCCTAATGAAAAAATAAAATA;SOR=0.098;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=17;WE=79202494;WS=79202476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr4	79202779	rs34535077	G	A	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=116;ReadPosRankSum=0.059;SC=TCTTTAGCCAGTTGTTTTATG;SOR=1.112;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=9;WE=79202787;WS=79202769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
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chr4	79205747	rs6815945	A	G	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=307;ReadPosRankSum=0.635;SC=TGTGTGGGAGATAGACTCATC;SOR=0.877;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=17;WE=79205755;WS=79205737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
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chr4	79238448	rs345515	T	C	1282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=11;PP=899;SC=CCCAGGCCCGTGAAGCCCAGC;SOR=2.200;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=32;TCR=11;TR=43;WE=79238456;WS=79238438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
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chr4	79240063	rs345513	A	G	1525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.303;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=31;PP=1011;ReadPosRankSum=-0.281;SC=CAGCTGTCTGACGTGGGCATC;SOR=0.574;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=131;TCF=64;TCR=67;TR=63;WE=79240071;WS=79240053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,70:0.48:145
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chr4	79240674	rs11937525	C	T	1253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=33;PP=832;ReadPosRankSum=-0.380;SC=TTATAGTTTCCTTTCTGTTCC;SOR=0.651;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=111;TCF=44;TCR=67;TR=56;WE=79240682;WS=79240664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,59:0.50:117
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chr4	79291275	rs11098158	G	A	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=94;ReadPosRankSum=-0.000;SC=ACAATTGTGTGTGTATGTATA;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=79291283;WS=79291265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr4	79295156	rs7687731	A	G	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.208;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=38;ReadPosRankSum=1.691;SC=TCCTTTGCCCAGTACACTAGG;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=5;WE=79295164;WS=79295146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr4	79295418	rs34889042	C	CTG	951.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.254;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=596;ReadPosRankSum=0.216;SC=AACTTGGAGACTGCTGATTAT;SOR=1.031;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=13;WE=79295426;WS=79295408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,26:0.43:60
chr4	79300993	rs12512164	G	A	1394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.359;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=29;PP=862;ReadPosRankSum=-0.354;SC=GGGTAGGGTCGAAGATCTCCT;SOR=0.598;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=109;TCF=60;TCR=49;TR=61;WE=79301001;WS=79300983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,66:0.55:119
chr4	79305148	rs7694602	C	G	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-2.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.713;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=156;ReadPosRankSum=0.212;SC=GTTTTTAAGCCTTTTCTGTGT;SOR=0.307;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=14;WE=79305156;WS=79305138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,15:0.45:33
chr4	79305177	rs7677133	T	G	834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.661;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=7;PP=587;ReadPosRankSum=-1.600;SC=ATGTAATGATTGTATTTTCTT;SOR=1.286;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=61;TCF=47;TCR=14;TR=32;WE=79305185;WS=79305167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,35:0.49:71
chr4	79321770	rs144058401	A	ATC	205.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.142;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=290;ReadPosRankSum=0.515;SC=GAAGCTGTGAATCTCTCTGTC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=7;WE=79321778;WS=79321760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr4	79339950	rs12649596	G	C	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=50;ReadPosRankSum=-0.241;SC=CAATGCAAGAGACCAGATCCT;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=4;WE=79339958;WS=79339940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr4	79345650	rs1471752	A	G	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.010;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=423;ReadPosRankSum=-0.208;SC=TGTTCCCATCATCATTATTTT;SOR=0.250;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=39;TCF=6;TCR=33;TR=24;WE=79345658;WS=79345640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,23:0.61:38
chr4	79350200	rs112867538	C	CTGTG,CTGTGTGTG	1740.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=9,9;NR=8,8;PP=387,444;SC=GTGCGTGTCTCTGTGTGTGTG;SOR=1.483;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=30;TCF=14;TCR=16;TR=17,17;WE=79350208;WS=79350190;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.50,0.47:38
chr4	79359885	rs2170899	T	G	802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.335;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=28;PP=602;ReadPosRankSum=0.139;SC=ACATAATCACTTTGTATTATT;SOR=1.844;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=67;TCF=19;TCR=48;TR=35;WE=79359893;WS=79359875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,35:0.51:69
chr4	79365479	rs7678731	C	T	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.652;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr4	79366655	rs3749489	G	C	2300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.388;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=35;PP=1430;ReadPosRankSum=0.515;SC=AGGTAAAAATGCTCTCTTGAT;SOR=0.957;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=219;TCF=133;TCR=86;TR=95;WE=79366663;WS=79366645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,108:0.44:245
chr4	79372856	rs10026662	A	C	4866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=57;PP=2965;SC=AATTGAATTCACACCTCTTGC;SOR=1.146;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=93;TCR=57;TR=150;WE=79372864;WS=79372846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr4	79372930	rs753752	C	T	8565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=150;NR=134;PP=2965;SC=TTATAGGCCACGTAGAATATA;SOR=0.758;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=284;TCF=150;TCR=134;TR=284;WE=79372938;WS=79372920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,318:1.00:318
chr4	79373254	rs753751	T	C	315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=2;PP=263;SC=ACCTTACTTCTTGGCACCAGG;SOR=2.303;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=79373262;WS=79373244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	79385719	rs6851427	G	A	1105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=30;PP=698;ReadPosRankSum=-3.410;SC=AGCTTAAGGCGGTGGATGCTG;SOR=0.742;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=33;TCR=55;TR=48;WE=79385727;WS=79385709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,51:0.54:95
chr4	79385803	rs11933507	G	A	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.346;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=60;ReadPosRankSum=-0.411;SC=CAGCTATCACGTTGCAGCTGT;SOR=0.368;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=6;WE=79385811;WS=79385793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr4	79387442	rs7660664	C	T	2278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=50;PP=1386;ReadPosRankSum=-0.130;SC=AGCATTTCCACCTCACCTCCA;SOR=0.689;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=260;TCF=147;TCR=113;TR=113;WE=79387450;WS=79387432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,121:0.41:292
chr4	79387464	rs7684722	A	G	7943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=142;NR=120;PP=2965;SC=CTTCACCATGAAAGATATCTA;SOR=0.713;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=262;TCF=142;TCR=120;TR=262;WE=79387472;WS=79387454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,297:1.00:297
chr4	79391020	rs7681619	C	T	1425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=1;PP=768;SC=TTGCCCATCCCTCATCTCTGA;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=27;WE=79391028;WS=79391010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	79391036	rs1496602	T	C	1744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=11;PP=897;SC=TCTGAAGTGTTAGCAGACTTC;SOR=2.252;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=29;TCR=11;TR=40;WE=79391044;WS=79391026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
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chr4	79391424	rs6533688	C	T	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=48;ReadPosRankSum=0.444;SC=TGTGTAGGATCGGTTACGATT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=79391432;WS=79391414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
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chr4	79440425	rs2903471	T	C	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.829;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=72;ReadPosRankSum=-0.824;SC=GATGTGGTGATAGTATGTCTT;SOR=0.169;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=6;WE=79440433;WS=79440415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr4	79442873	.	C	T	24	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=7;HapScore=2;MGOF=31;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=24;QD=19.5904041824;SC=CAGTAAAAAACAGTCAACAAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=3;WE=79442881;WS=79442863;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
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chr4	79455714	rs4975070	C	G	2450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=56;PP=1532;ReadPosRankSum=-1.115;SC=TAATGGATCCCAATACATCTG;SOR=0.720;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=220;TCF=103;TCR=117;TR=106;WE=79455722;WS=79455704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,119:0.49:243
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chr4	79455858	rs4975140	T	A	822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=19;PP=525;SC=TCTGCTCATATGCTCTCAGTC;SOR=4.255;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=79455866;WS=79455848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
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chr4	79512800	rs10003947	T	A	5066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.665;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=92;PP=2773;ReadPosRankSum=-0.638;SC=TTTTTATTTTTTAACTCCCCA;SOR=0.712;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=168;TCF=76;TCR=92;TR=167;WE=79512808;WS=79512790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,192:0.99:193
chr4	79531186	rs5944	C	T	860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.045;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=13;PP=540;ReadPosRankSum=-0.418;SC=TGTATTTGTTCTTCATTGATT;SOR=0.289;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=65;TCF=48;TCR=17;TR=37;WE=79531194;WS=79531176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,40:0.53:75
chr4	79531308	rs4612	C	T	2193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.437;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=41;PP=1175;ReadPosRankSum=0.191;SC=GATGGGCTTTCCCAACAGCTC;SOR=0.536;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=168;TCF=83;TCR=85;TR=86;WE=79531316;WS=79531298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,105:0.53:198
chr4	79697892	rs201253367	AGGCTC	A	37.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.55;ReadPosRankSum=-1.645;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,2:0.40:5
chr4	79697925	.	T	TGTG	76.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=-0.000;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.96;ReadPosRankSum=-1.368;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
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chr4	79786974	rs2288254	T	C	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=308;ReadPosRankSum=0.423;SC=TATTGTAAAGTAGATAACATA;SOR=0.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=16;WE=79786982;WS=79786964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
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chr4	79845007	rs13108247	C	A	1195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.080;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=19;PP=731;ReadPosRankSum=-0.012;SC=AAAGAGATACCTACCTGGAAA;SOR=1.053;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=117;TCF=72;TCR=45;TR=53;WE=79845015;WS=79844997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,59:0.42:140
chr4	79854436	rs10857059	T	C	1000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.909;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=31;PP=606;ReadPosRankSum=-0.080;SC=TGAATGTAAATGGATCAAATC;SOR=0.529;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=80;TCF=23;TCR=57;TR=45;WE=79854444;WS=79854426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,48:0.56:85
chr4	80828668	rs10027070	A	T	795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.902;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=23;PP=445;ReadPosRankSum=0.727;SC=GCCATTATTTAAAAAAGCATG;SOR=0.821;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=71;TCF=23;TCR=48;TR=33;WE=80828676;WS=80828658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,39:0.48:81
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chr4	81529380	rs2903671	T	C	751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.820;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=11;PP=315;ReadPosRankSum=1.125;SC=AATAGATAACTGATTCCAACA;SOR=0.538;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=87;TCF=60;TCR=27;TR=33;WE=81529388;WS=81529370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,39:0.41:94
chr4	81529518	rs2867782	T	C	3981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=68;PP=2374;ReadPosRankSum=-1.096;SC=GCTGCTCATATCTTGAAGAAG;SOR=0.850;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=133;TCF=65;TCR=68;TR=132;WE=81529526;WS=81529508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,149:0.99:151
chr4	81884610	rs11452353	A	AT	1587.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.94;MQRankSum=0.524;QD=29.40;ReadPosRankSum=-0.803;SOR=1.284;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,53:0.98:54
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chr4	81967188	rs6831040	C	T	5801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=92;PP=2965;SC=TATCACTCAACTCTTGAGGAA;SOR=0.721;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=192;TCF=100;TCR=92;TR=192;WE=81967210;WS=81967178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
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chr4	81973253	rs148742600	C	T	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=2.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.04;ReadPosRankSum=0.105;SOR=1.071;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,29:0.29:101
chr4	81973260	rs1390318	C	T	3154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.93;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr4	82377681	rs184242606	G	A	2548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.465;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=51;PP=1562;ReadPosRankSum=0.436;SC=ATGTGATGTGGAGGGCTTGCC;SOR=0.633;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=222;TCF=118;TCR=104;TR=109;WE=82377697;WS=82377671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,120:0.49:246
chr4	83276430	rs3838641	C	CA	70.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.066;HP=10;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=2;PP=36;ReadPosRankSum=-0.100;SC=TTGTAAATGACAAAAAAAAAC;SOR=1.402;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=17;TCF=11;TCR=6;TR=5;WE=83276438;WS=83276420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr4	83347309	rs34583014	TAAGA	T	2380.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.016;NF=6;NR=21;PP=1155;ReadPosRankSum=0.002;SC=GAATTCTCATTAAGATAGTTT;SOR=0.695;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=57;TCF=11;TCR=46;TR=27;WE=83347320;WS=83347299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,63:0.50:126
chr4	83352177	rs10646358	C	CTT	3143.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=46;PP=2377;SC=GGCGGTGTGGCTGCCTCTTGT;SOR=3.943;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=0;TCR=52;TR=46;WE=83352185;WS=83352167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr4	83369287	rs4285076	A	G	604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.794;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=421;ReadPosRankSum=-0.664;SC=GATAGGGGATAGAAGTTGCAG;SOR=1.314;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=46;TCF=13;TCR=33;TR=24;WE=83369295;WS=83369277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,26:0.49:53
chr4	83375719	rs6853622	T	C	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=137;ReadPosRankSum=-0.433;SC=TTGGGCAGTATGTTTATTAGA;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=8;WE=83375727;WS=83375718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr4	83375746	rs17351082	G	A	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=207;ReadPosRankSum=0.704;SC=GGAGTTTGTAGTCTCAGGGAG;SOR=1.061;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=12;WE=83375754;WS=83375736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr4	83424089	.	TA	T	41.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.913;ClippingRankSum=0.000;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=12.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.64;ReadPosRankSum=0.576;SOR=0.052;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,12:0.18:65
chr4	83483562	rs35866205	C	T	1231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=30;PP=828;SC=TTCTCCTCCACTCAGCGCTGT;SOR=2.147;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=45;TCF=11;TCR=34;TR=41;WE=83483570;WS=83483552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
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chr4	83552809	rs3857138	A	C	716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=21;PP=586;SC=TTGGTTACTGACTCCAAAGGC;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=83552817;WS=83552799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
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chr4	83774687	rs13112559	C	G	1126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.812;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=15;PP=703;ReadPosRankSum=0.447;SC=AAAGACAACACTAAAAATTAA;SOR=0.569;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=99;TCF=70;TCR=29;TR=47;WE=83774695;WS=83774677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,49:0.48:103
chr4	83778378	rs4235054	A	T	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=283;ReadPosRankSum=-2.098;SC=ATATATATACATGAATGGAGA;SOR=0.368;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=16;WE=83778386;WS=83778368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
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chr4	83788139	rs2290739	C	A	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.228;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=243;ReadPosRankSum=1.267;SC=ATAACATAAGCATCCGACCAT;SOR=0.999;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=46;TCF=15;TCR=31;TR=17;WE=83788147;WS=83788129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,19:0.39:49
chr4	83788166	.	T	C	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.877;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.971;HP=6;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=182;ReadPosRankSum=-0.336;SC=AGTTTCATTTTTTTCCAGTCA;SOR=1.329;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=10;WE=83788174;WS=83788156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
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chr4	83788562	rs2045479	T	C	1451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=39;PP=1133;SC=ACAAGTATAGTTAAATTGAAT;SOR=3.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=5;TCR=39;TR=44;WE=83788570;WS=83788552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
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chr4	83791649	rs3762902	G	T	816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=1.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=23;PP=501;ReadPosRankSum=-0.241;SC=TTCTGCCTAGGTTTTGTAGAT;SOR=0.729;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=48;TCF=8;TCR=40;TR=28;WE=83791657;WS=83791639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,34:0.60:57
chr4	83792464	rs35679019	TAC	T	480.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.713;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=4;PP=248;ReadPosRankSum=1.404;SC=TATACATGCATACACACACAC;SOR=0.355;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=6;TCR=8;TR=7;WE=83792473;WS=83792454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr4	83792498	rs7685043	G	T	592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=1.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.82;ReadPosRankSum=0.271;SOR=0.405;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
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chr4	83793243	rs4693525	A	C	1265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=34;PP=893;ReadPosRankSum=0.503;SC=AATGCATCTGAAGATAGTTAA;SOR=0.642;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=117;TCF=46;TCR=71;TR=55;WE=83793251;WS=83793233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,59:0.45:131
chr4	83793354	rs143845447	A	ATTTTG	166.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=6;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=203;ReadPosRankSum=1.309;SC=GCTGTGGCTTATTTTATTTAT;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=83793376;WS=83793344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr4	83793368	rs11942312	C	T	105.90	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.7500;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=172;ReadPosRankSum=1.383;SC=TATTTATGATCTATTTATTGT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=83793376;WS=83793344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr4	83795806	rs10025654	T	C	1762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=35;PP=1172;ReadPosRankSum=0.356;SC=GCTCATTTTTTCTAAGATCCC;SOR=0.723;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=156;TCF=89;TCR=67;TR=77;WE=83795814;WS=83795796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,84:0.49:173
chr4	83822457	rs13130011	C	T	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.108;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=87;ReadPosRankSum=0.438;SC=TGCTGTTAGCCGAGCTGTGCA;SOR=0.148;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=7;WE=83822465;WS=83822447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr4	83825823	rs13140582	A	G	787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.578;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=7;PP=527;ReadPosRankSum=0.791;SC=GGTTTATATAATAAATACTAC;SOR=0.179;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=51;TCF=43;TCR=8;TR=30;WE=83825831;WS=83825813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,32:0.58:55
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chr4	83838217	rs1031639	G	A	6696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=120;NR=106;PP=2965;SC=TAAAAAGTATGCCTCTCAAGC;SOR=0.785;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=226;TCF=120;TCR=106;TR=226;WE=83838225;WS=83838207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr4	83838262	rs897945	G	T	3496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.882;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=71;PP=2227;ReadPosRankSum=0.010;SC=GTCACAGTTTGCAGGGGTTTA;SOR=0.782;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=276;TCF=142;TCR=134;TR=147;WE=83838270;WS=83838252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,164:0.53:307
chr4	83839799	rs6535411	A	G	2874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=47;PP=1843;SC=TGGGCATATTAATCTTTTTGT;SOR=0.909;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=92;TCF=45;TCR=47;TR=92;WE=83839807;WS=83839789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr4	83852065	rs985899	G	A	1565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=14;PP=1003;SC=TATTTGGGAAGTACTATAAAA;SOR=1.877;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=37;TCR=14;TR=51;WE=83852073;WS=83852055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr4	83857108	rs6535413	AT	GA	4904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=47;PP=2944;ReadPosRankSum=-0.396;SC=TTTAAAAGATATTATTTTCCG;SOR=0.685;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=245;TCF=148;TCR=97;TR=113;WE=83857117;WS=83857098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,126:0.46:272
chr4	83857402	rs6535415	T	C	1033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=10;NR=22;PP=801;SC=TGGATATTTCTGTCAGTTAAA;SOR=1.483;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=10;TCR=22;TR=32;WE=83857410;WS=83857392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr4	83900043	rs6535422	A	G	5487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=107;NR=70;PP=2965;SC=AACCTGCAATAACTGGTGGTG;SOR=1.117;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=177;TCF=107;TCR=70;TR=177;WE=83900051;WS=83900033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr4	83900260	rs7674484	A	G	601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=18;PP=494;SC=ATGTAAAACCAGCTCACTTAA;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=83900268;WS=83900250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	83905258	rs9994716	C	G	852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.151;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=9;PP=686;ReadPosRankSum=-1.090;SC=AACTATGAATCAGTTAAATTT;SOR=0.954;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=59;TCF=43;TCR=16;TR=36;WE=83905266;WS=83905248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,34:0.58:59
chr4	83977975	rs6535432	C	T	400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=287;SC=GATTCCCTTACGGTACCAGAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=83977983;WS=83977969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	83984433	rs13116756	A	G	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=140;ReadPosRankSum=0.522;SC=TATGGTAGTCAATGTTTAGGT;SOR=0.703;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=51;TCF=19;TCR=32;TR=15;WE=83984441;WS=83984423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,21:0.36:59
chr4	83989516	rs2868747	T	C	549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=6;PP=417;SC=AACCAGAAGCTTTCTGTTCTC;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=19;WE=83989524;WS=83989506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	84189012	rs11448409	G	GT	238.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=145;SC=CAGATTTAGTGTTTTTTTGTA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=84189020;WS=84189002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	84191031	rs6535454	A	G	6314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=126;NR=76;PP=2965;SC=CATAAATAGTATCATATATTA;SOR=1.288;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=203;TCF=126;TCR=77;TR=202;WE=84191039;WS=84191021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr4	84193366	rs6841889	C	T	2352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=46;PP=1449;SC=ATTACCACTACCTCTTAGAAA;SOR=1.725;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=25;TCR=46;TR=71;WE=84193374;WS=84193356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr4	84205618	rs13113787	A	C	1721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=20;PP=968;SC=GCCGACTCGGAGGCTGCTACT;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=37;TCR=20;TR=57;WE=84205626;WS=84205608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr4	84205872	rs6818847	C	A	2330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=50;NR=29;PP=1548;SC=GCCAGTGCCACAGCCCGCAGG;SOR=1.347;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=51;TCR=30;TR=79;WE=84205880;WS=84205862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr4	84223461	rs4285078	G	C	3625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=80;PP=2463;SC=AAAAATAGATGTTTACTTATG;SOR=1.826;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=36;TCR=80;TR=116;WE=84223469;WS=84223451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr4	84255641	rs6832713	G	C	894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.18;SOR=0.746;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr4	84338076	rs72944430	T	C	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=295;ReadPosRankSum=1.651;SC=AAAAGAAAATTAAGCACTTTA;SOR=0.641;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=34;TCF=11;TCR=23;TR=17;WE=84338084;WS=84338066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr4	84362443	rs4693088	T	C	752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=11;PP=325;ReadPosRankSum=0.923;SC=GGAATTTAAATGTTATCAATG;SOR=0.751;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=80;TCF=48;TCR=32;TR=32;WE=84362451;WS=84362433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,39:0.43:90
chr4	84364604	rs6845316	C	T	353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=216;ReadPosRankSum=-0.498;SC=CCTATGTTTACTACTTTCATT;SOR=0.678;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=16;WE=84364612;WS=84364594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr4	84364808	rs6535473	T	C	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.061;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=21;PP=590;ReadPosRankSum=-0.217;SC=TTAAGGAAAATATGTTATTTA;SOR=0.551;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=55;TCF=20;TCR=35;TR=34;WE=84364816;WS=84364798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,36:0.62:58
chr4	84367050	rs11099599	G	A	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.119;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=21;ReadPosRankSum=1.120;SC=TAAAACAAAGGCAAAAAGCTT;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=3;WE=84367058;WS=84367040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr4	84367286	rs11099600	G	A	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.886;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=20;PP=339;ReadPosRankSum=0.945;SC=TCTTCATATAGTGCTCATATA;SOR=0.543;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=82;TCF=26;TCR=56;TR=29;WE=84367294;WS=84367276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,32:0.36:90
chr4	84368225	rs11272773	GCATTGTGGCCAATGCCTGTAATCC	G	158.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.884;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=1988;ReadPosRankSum=1.611;SC=AATTGGCCAGGCATTGTGGCC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=4;WE=84368256;WS=84368215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr4	84370124	rs10718573	TA	T	132.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.32;ReadPosRankSum=-0.142;SOR=0.465;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
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chr4	84388475	rs56271349	C	T	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=196;ReadPosRankSum=-1.183;SC=TCAGAAGGTACATAGCCTTCA;SOR=0.990;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=13;WE=84388483;WS=84388465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
chr4	84393475	rs6535478	C	T	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.15;ReadPosRankSum=0.405;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr4	84393485	rs75295148	A	G	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=21.92;ReadPosRankSum=0.842;SOR=0.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr4	84397620	rs17352824	G	A	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=85;ReadPosRankSum=1.652;SC=AGAAAGAACTGCTAGGGTTGA;SOR=0.425;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=8;WE=84397628;WS=84397610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr4	84401623	rs6838354	T	C	115.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=89;SC=ATCCATGAAATAGTAGTTGCC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=84401631;WS=84401613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	84403178	rs144237623	G	T	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=170;ReadPosRankSum=-0.836;SC=GATTACAGGTGTGAGCCACCT;SOR=0.368;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=13;WE=84403186;WS=84403168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr4	84403491	rs35608460	A	AG	144.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.831;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=202;ReadPosRankSum=1.693;SC=TATGTATACAATATGTGCTAC;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=6;WE=84403499;WS=84403481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr4	84458001	rs55833887	A	G	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.456;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=198;ReadPosRankSum=0.187;SC=AGTGGTCGCGAGTCAGGGGTG;SOR=1.105;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=36;TCF=11;TCR=25;TR=14;WE=84458009;WS=84457991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,14:0.35:40
chr4	84458028	rs56139069	C	G	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.157;NF=1;NR=10;PP=191;ReadPosRankSum=0.686;SC=CGCGCGTGTGCATGCGTGCGT;SOR=0.914;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=11;WE=84458036;WS=84458018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr4	84465613	rs10516690	C	T	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=300;ReadPosRankSum=2.298;SC=AATTTCACTTCTGTATAATCA;SOR=0.829;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=19;WE=84465621;WS=84465603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr4	84465855	rs28360718	A	C	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=34;ReadPosRankSum=-1.579;SC=AGTGTGTTCTATAGGGTTTGG;SOR=0.223;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=4;WE=84465863;WS=84465845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr4	84502602	rs17355321	A	C	945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=3;PP=804;SC=GATGTCACCCATTAAACTTAT;SOR=3.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=32;WE=84502610;WS=84502592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	84509465	rs11394944	T	TG	8694.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=-1.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=73;PP=2936;ReadPosRankSum=1.445;SC=GAGTATCTGCTCCAATGTGCC;SOR=0.237;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=110;TCF=32;TCR=78;TR=105;WE=84509473;WS=84509455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,234:1.00:235
chr4	84515968	rs3733327	C	T	3203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=37;PP=1989;SC=GTGCCTTTTACGTTTTTTCCT;SOR=1.473;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=69;TCR=37;TR=106;WE=84515976;WS=84515958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr4	84518558	rs3733329	C	T	1646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=18;PP=788;SC=AAAATATTCACGCTCCTACCC;SOR=1.010;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=34;TCR=18;TR=52;WE=84518566;WS=84518548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr4	84519775	rs71668661	AT	A	1150.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.55;MQRankSum=0.904;QD=15.76;ReadPosRankSum=-0.240;SOR=0.749;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,63:0.86:73
chr4	84519828	rs62303973	G	A	904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=6.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.30;MQRankSum=1.894;QD=8.38;ReadPosRankSum=-1.103;SOR=0.327;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,50:0.46:108
chr4	84525973	rs35602893	CT	C	4705.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.12;NF=5;NR=94;PP=2751;SC=AATGGAATGGCTTTTTTTGTT;SOR=1.553;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=112;TCF=5;TCR=107;TR=99;WE=84525981;WS=84525963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr4	85166020	rs348700	C	T	2625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=35;PP=1895;ReadPosRankSum=-0.647;SC=CCAAGGCCTTCCCTGGCATGT;SOR=1.080;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=49;TCR=36;TR=83;WE=85166028;WS=85166010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,89:0.98:91
chr4	85414741	rs13123447	C	T	836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=24;PP=655;SC=GAGGCAAGGGCGAGGAATTAA;SOR=3.334;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=30;WE=85414749;WS=85414731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr4	85416797	rs2278671	T	G	286.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=254;SC=GCGGTACCTATCCCTCCAGGT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=85416805;WS=85416787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	85465390	rs3835099	AT	A	1253.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.18;MQRankSum=0.340;QD=20.90;ReadPosRankSum=0.967;SOR=1.220;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,56:0.93:60
chr4	85560000	.	TTA	T	70	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=3;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=2;NR=1;PP=70;QD=25.0;SC=AGGAAATAGTTTATATATATA;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=3;WE=85560011;WS=85559990;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr4	85710785	.	A	AAC	70	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MMLQ=15;MQ=58.7;NF=5;NR=0;PP=70;QD=14.6;SC=ATATCCCTGTAACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=5;WE=85710793;WS=85710784;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,5:0.38:13
chr4	85710824	rs13137042	C	A	705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.41;SOR=4.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	85765541	rs2869216	T	C	1251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=9;PP=924;SC=AAAACAATATTAGAACTCACA;SOR=2.247;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=40;TCF=31;TCR=9;TR=39;WE=85765549;WS=85765531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr4	86491590	rs71599418	T	C	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.326;HP=10;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.864;NF=13;NR=3;PP=301;ReadPosRankSum=-0.868;SC=CTCTCTTTTTTTTTTTCTGGA;SOR=1.688;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=16;WE=86491598;WS=86491580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,17:0.77:22
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chr4	86844835	rs6824722	A	G	1676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.140;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=35;PP=1076;ReadPosRankSum=1.055;SC=CAAATCATGAAAGCTACCTCC;SOR=0.699;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=121;TCF=63;TCR=58;TR=68;WE=86844843;WS=86844825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,76:0.54:140
chr4	86851884	rs13126782	T	G	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=36;ReadPosRankSum=0.598;SC=GAAAAGGAAGTTTTTTTTTGC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=3;WE=86851892;WS=86851876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr4	86852207	rs60002814	AT	A	2034.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.716;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.684;NF=3;NR=33;PP=1328;ReadPosRankSum=0.497;SC=TAGGTAGATAATATGTTCATG;SOR=0.609;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=76;TCF=7;TCR=69;TR=36;WE=86852215;WS=86852197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,61:0.52:117
chr4	86863467	rs11097083	T	A	705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=15;PP=434;SC=ACTGAGAAATTCAGACTCAAC;SOR=1.445;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=9;TCR=15;TR=24;WE=86863475;WS=86863457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	86915848	rs10003909	T	C	7829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=133;NR=139;PP=2965;SC=GCAACAACAATGAAATTCAGA;SOR=0.836;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=273;TCF=134;TCR=139;TR=272;WE=86915856;WS=86915838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,298:1.00:298
chr4	86915923	rs11547776	G	A	6581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=109;NR=113;PP=2965;SC=GCCCTAGTAGGCAGTGCTCCT;SOR=0.815;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=223;TCF=109;TCR=114;TR=222;WE=86915931;WS=86915913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr4	86921612	rs12505097	C	G	2435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=12.382;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.59;ReadPosRankSum=-0.277;SOR=0.149;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:5,126:0.96:131
chr4	87019904	rs4133139	G	A	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=132;ReadPosRankSum=-0.045;SC=TCAAACCAGCGCTATGCTATT;SOR=0.425;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=8;WE=87019912;WS=87019894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr4	87024232	rs202025861	G	GTA	128.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.839;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.13;MQRankSum=1.020;QD=9.20;ReadPosRankSum=-2.339;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr4	87024234	rs140180714	G	A	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=6.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.88;MQRankSum=-0.888;QD=3.17;ReadPosRankSum=1.477;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr4	87024409	rs28529458	T	C	2921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=55;PP=1434;ReadPosRankSum=-0.659;SC=TGAAAGAGAGTGGAAGGGACA;SOR=0.359;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=49;TCR=56;TR=104;WE=87024417;WS=87024399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,116:0.99:117
chr4	87666225	rs61750815	A	G	3257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=72;PP=1900;ReadPosRankSum=-0.840;SC=TCTTACCAGCATAAGTTCCAG;SOR=0.694;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=292;TCF=146;TCR=146;TR=146;WE=87666233;WS=87666215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,165:0.50:332
chr4	87679642	rs1420624	A	C	919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.104;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=28;PP=710;ReadPosRankSum=-0.408;SC=AAGCCCATCAACCTACCCGCC;SOR=0.540;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=66;TCF=15;TCR=51;TR=37;WE=87679650;WS=87679632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,37:0.56:66
chr4	87684031	rs710832	A	G	1470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.346;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=26;PP=820;ReadPosRankSum=-2.054;SC=CCTTTGGGCCATCTGGGGGCC;SOR=0.761;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=119;TCF=61;TCR=58;TR=58;WE=87684039;WS=87684021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,70:0.51:138
chr4	87808810	rs3035472	G	GCA	4259.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=16;PP=2240;SC=CCACCAGTGGGCATTCAAATA;SOR=1.765;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=53;TCF=36;TCR=17;TR=46;WE=87808818;WS=87808800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr4	87809387	rs1550931	G	T	8142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=138;NR=150;PP=2965;SC=TAGGTTTGTGGACCAGGTCTT;SOR=0.874;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=288;TCF=138;TCR=150;TR=288;WE=87809395;WS=87809377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,310:1.00:310
chr4	87812586	rs55723875	TA	T	3671.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.336;NF=29;NR=60;PP=1577;ReadPosRankSum=0.542;SC=TACCCTGATTTAAAAAAAAAA;SOR=0.523;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=104;TCF=38;TCR=66;TR=89;WE=87812595;WS=87812576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,155:0.98:158
chr4	87957989	rs340629	T	C	3368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.77;SOR=1.273;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr4	88005203	rs236996	G	A	2533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=27;PP=1523;SC=CATTAATACAGTCATCCACCA;SOR=1.414;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=56;TCR=27;TR=83;WE=88005211;WS=88005193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr4	88056925	rs342464	A	G	3474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=62;PP=1794;SC=CAGTCCAGACATTTGTTTCAT;SOR=1.205;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=113;TCF=51;TCR=62;TR=112;WE=88056933;WS=88056915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr4	88226533	rs7692397	C	A	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.525;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=79;ReadPosRankSum=-0.777;SC=TGTTTTTGGTCATTTAGAATA;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=5;WE=88226541;WS=88226523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr4	88231339	rs59716219	CA	C	69.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=1.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.68;ReadPosRankSum=-0.029;SOR=0.754;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,7:0.27:26
chr4	88234874	rs7698974	C	T	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=29;ReadPosRankSum=-1.006;SC=ATTTTTCCTTCTTCATTTTCT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=3;WE=88234882;WS=88234864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr4	88238448	rs6531975	A	G	701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=486;ReadPosRankSum=-0.230;SC=ATATAATCCAAAGATGAGAGT;SOR=0.527;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=22;WE=88238456;WS=88238438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,25:0.64:39
chr4	88258483	rs9991501	T	C	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.106;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=15;PP=307;ReadPosRankSum=1.915;SC=ACTGATTTTTTGTTTTAAAAC;SOR=0.209;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=51;TCF=18;TCR=33;TR=27;WE=88258491;WS=88258473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,28:0.54:52
chr4	88261828	rs7679024	A	C	1106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=27;PP=738;ReadPosRankSum=1.679;SC=GGTGCTAACCAACAGCTTTAG;SOR=0.638;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=48;TCR=66;TR=47;WE=88261836;WS=88261818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,53:0.38:139
chr4	88356111	rs28736552	T	C	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.066;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=233;ReadPosRankSum=-0.140;SC=TTATGTAAAATGTTTTTCTTT;SOR=0.252;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=45;TCF=36;TCR=9;TR=20;WE=88356119;WS=88356101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,24:0.50:48
chr4	88362904	rs13104303	C	T	1135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.750;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=14;PP=654;ReadPosRankSum=-0.351;SC=CTTATGTTCTCTTCTTTTGGG;SOR=0.576;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=88;TCF=60;TCR=28;TR=45;WE=88362912;WS=88362894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,53:0.50:105
chr4	88363217	rs35607673	C	T	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=267;ReadPosRankSum=2.186;SC=TCATGCATTGCTTAACAATGA;SOR=1.739;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=12;WE=88363225;WS=88363207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr4	88401616	rs9933	A	G	2141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.500;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=51;PP=1354;ReadPosRankSum=2.317;SC=TTAAGAGAAGATCAATGGGAT;SOR=0.624;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=200;TCF=99;TCR=101;TR=101;WE=88401624;WS=88401606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,106:0.50:214
chr4	88416223	rs8342	A	G	1687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=38;PP=1039;ReadPosRankSum=-1.702;SC=CAGTGTTGTCAGGTGCTACCG;SOR=0.724;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=134;TCF=62;TCR=72;TR=70;WE=88416231;WS=88416213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,80:0.52:154
chr4	88532182	.	A	AGTGT,AGT	329.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.250;ClippingRankSum=-0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=107;ReadPosRankSum=-1.189;SC=TACAAAATGTAGTGTGTGTGT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=9;WE=88532190;WS=88532172;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.65:17
chr4	88533441	rs13131929	T	C	2160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.82;ReadPosRankSum=-1.642;SOR=0.758;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,57:0.52:109
chr4	88533445	rs13131936	T	C	2137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=3.613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.92;ReadPosRankSum=-0.589;SOR=1.070;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,57:0.50:113
chr4	88534235	rs2736982	A	G	1920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.557;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=38;PP=1094;ReadPosRankSum=1.481;SC=GTCAAAATTCAGATAGTAAAG;SOR=0.576;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=162;TCF=80;TCR=82;TR=79;WE=88534243;WS=88534225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,91:0.51:180
chr4	88535832	.	A	ATAGCAGTGACAGCAGCAG	1002.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.991;ClippingRankSum=0.000;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.04;MQRankSum=4.303;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.107;SOR=0.676;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,24:0.42:57
chr4	88537737	rs2615489	G	A	3504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=37;NR=76;PP=2089;SC=AGAAAAACCCGTAAGATTCCT;SOR=1.743;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=113;TCF=37;TCR=76;TR=113;WE=88537745;WS=88537727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr4	88577573	rs2615480	A	G	3545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=38;PP=2268;SC=AAAAGTTGAAACTACTTTATT;SOR=1.482;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=116;TCF=78;TCR=38;TR=116;WE=88577581;WS=88577563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr4	88578310	rs2615479	A	G	465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=10;PP=250;SC=CATTGCAAATATTGAAACTGC;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=14;WE=88578318;WS=88578300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	88583135	rs10019009	A	T	1343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.272;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=20;PP=701;ReadPosRankSum=-0.696;SC=CCCCAGTGACAGCACTCAGTC;SOR=1.095;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=122;TCF=71;TCR=51;TR=57;WE=88583143;WS=88583125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,64:0.46:140
chr4	88584160	rs2615497	G	A	2848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.666;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=54;PP=1706;ReadPosRankSum=-0.977;SC=AATCCAGTGAGAGCCTCAACT;SOR=0.711;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=193;TCF=105;TCR=88;TR=120;WE=88584168;WS=88584150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,133:0.60:222
chr4	88584507	rs2627724	G	A	927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=27;PP=602;ReadPosRankSum=2.228;SC=GTCACATAAAGGAGTCTTAGG;SOR=0.634;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=29;TCR=62;TR=40;WE=88584515;WS=88584497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,43:0.44:98
chr4	88732453	rs4693183	C	T	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.751;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=61;ReadPosRankSum=0.055;SC=CATGAAATGACGGCCTTAAAT;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=5;WE=88732461;WS=88732443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr4	88732531	rs4693878	T	C	717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.377;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=10;PP=439;ReadPosRankSum=1.336;SC=ATATAACAAATAAAGCTACAA;SOR=0.372;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=68;TCF=47;TCR=21;TR=30;WE=88732539;WS=88732521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,35:0.45:78
chr4	88732692	rs1054627	G	A	1702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.373;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=33;PP=1137;ReadPosRankSum=-0.232;SC=AGCAGCGGAGGAGACAATGGA;SOR=0.887;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=196;TCF=108;TCR=88;TR=78;WE=88732700;WS=88732682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,85:0.39:219
chr4	88732746	rs13144371	A	G	1460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.556;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=27;PP=1044;ReadPosRankSum=-0.371;SC=AATGCAGAAGACACCACAGAG;SOR=1.159;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=173;TCF=97;TCR=76;TR=69;WE=88732754;WS=88732736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,73:0.38:191
chr4	88732918	rs1054629	A	T	3217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=338;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.825;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=67;PP=1904;ReadPosRankSum=-1.430;SC=GCGCCAATGAATACGACAATG;SOR=0.630;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=314;TCF=165;TCR=149;TR=143;WE=88732926;WS=88732908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:179,157:0.47:336
chr4	88755828	rs7698623	T	C	3953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=44;PP=2031;SC=CAATGCTTTGTGGTAAGATAT;SOR=1.226;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=79;TCR=44;TR=123;WE=88755836;WS=88755818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr4	88759690	rs6835632	T	C	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.42;ReadPosRankSum=0.812;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr4	88767008	rs17013285	G	A	2408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.653;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=44;PP=1340;ReadPosRankSum=0.006;SC=GGCAGATGCTGTTGATGTCAG;SOR=0.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=192;TCF=105;TCR=87;TR=98;WE=88767016;WS=88766998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,112:0.52:214
chr4	88813269	rs71594826	G	GC	5752.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FS=2.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQRankSum=0.904;QD=17.81;ReadPosRankSum=-0.144;SOR=0.561;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:171,152:0.47:323
chr4	88813270	.	C	CCAAT	2970	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=59.64;NF=16;NR=44;PP=2970;QD=20;SC=CAGGCATTGGCATGACCAAAG;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=169;TCF=35;TCR=134;TR=60;WE=88813279;WS=88813259;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:109,60:0.36:169
chr4	88813271	.	A	T	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=59.57;NF=40;NR=43;PP=2962;QD=20;SC=AGGCATTGGCATGACCAAAGC;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=243;TCF=114;TCR=129;TR=83;WE=88813279;WS=88813259;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:160,83:0.34:243
chr4	88813271	rs35753589	A	AATT	5794.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FS=1.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQRankSum=0.264;QD=18.00;ReadPosRankSum=0.564;SOR=0.596;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:173,149:0.46:322
chr4	88813503	rs6532031	T	C	7223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=112;NR=120;PP=2965;SC=TGCATGCTGATCATGGTGAGC;SOR=0.852;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=232;TCF=112;TCR=120;TR=232;WE=88813511;WS=88813493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
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chr4	88815163	rs3061166	A	ATTAGG	3790.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=382;ExcessHet=3.0103;FS=0.416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.80;MQRankSum=-14.909;QD=10.53;ReadPosRankSum=-2.223;SOR=0.666;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:252,108:0.30:360
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chr4	88903019	.	TATTC	T	52.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.144;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=2.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.52;ReadPosRankSum=1.372;SOR=0.155;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,3:0.20:15
chr4	88929305	rs2728118	G	A	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.245;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=122;ReadPosRankSum=0.301;SC=GGAGCCGGGGGCTTGGGGGCT;SOR=2.599;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=35;TCF=12;TCR=23;TR=10;WE=88929313;WS=88929295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,10:0.27:37
chr4	88959381	rs2725221	G	A	1798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=23;PP=1003;ReadPosRankSum=-1.389;SC=AACTTTTTCAGAGATGTTTCC;SOR=0.623;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=102;TCF=68;TCR=34;TR=70;WE=88959389;WS=88959371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,81:0.69:117
chr4	88967919	rs75762896	T	G	1483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=29;PP=917;ReadPosRankSum=-0.509;SC=ATCTTTTGTTTCTTTATCTTT;SOR=0.642;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=51;TCR=57;TR=56;WE=88967927;WS=88967909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,63:0.52:121
chr4	89015857	rs2231164	C	T	2266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=48;PP=1441;SC=TTTTAAATTTCAAGAAGTTTC;SOR=1.445;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=28;TCR=48;TR=76;WE=89015865;WS=89015847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr4	89016782	rs2231162	A	G	2549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=60;PP=1785;SC=CAAATACTAAAAGTCAGGCCT;SOR=2.387;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=19;TCR=60;TR=79;WE=89016790;WS=89016772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr4	89018565	rs2231157	A	G	1512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.331;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=22;PP=879;ReadPosRankSum=0.988;SC=ATGAAGGAAAAAAACAATTCC;SOR=0.873;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=128;TCF=82;TCR=46;TR=63;WE=89018573;WS=89018555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,73:0.50:146
chr4	89022362	rs2231153	C	T	3017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=35;PP=1826;SC=GCCCCGTTCCCAGAACAAAGA;SOR=1.445;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=67;TCR=35;TR=102;WE=89022370;WS=89022352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr4	89028478	rs2231148	T	A	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=2.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.151;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=229;ReadPosRankSum=0.448;SC=TAAAAACTTATACACACCATT;SOR=1.911;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=13;WE=89028486;WS=89028468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr4	89036353	rs2725261	C	T	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=3.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.777;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.710;NF=1;NR=18;PP=371;ReadPosRankSum=1.506;SC=CTTCTTCCCACGTAATTTTAC;SOR=2.521;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=35;TCF=4;TCR=31;TR=19;WE=89036361;WS=89036343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,23:0.53:43
chr4	89036384	.	G	GTCTCTCTCTCTCTCTGTC	97	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MMLQ=22;MQ=64.48;NF=0;NR=4;PP=97;QD=25.25;SC=TATATATTCAGTCTCTCTCTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=4;WE=89036392;WS=89036374;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,4:0.44:9
chr4	89311962	rs12510688	T	C	2002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.022;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.561;NF=50;NR=47;PP=1148;ReadPosRankSum=-0.083;SC=CCTGTCTCTCTGTGGGACTTC;SOR=0.599;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=210;TCF=103;TCR=107;TR=97;WE=89311970;WS=89311952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,103:0.45:229
chr4	89319296	rs17014118	T	C	2854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=57;NR=44;PP=1693;SC=TCTTTTAGACTTCGTGGATGT;SOR=0.730;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=102;TCF=57;TCR=45;TR=101;WE=89319304;WS=89319286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr4	89352469	rs57584452	CT	C	394.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FS=9.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQRankSum=2.461;QD=3.32;ReadPosRankSum=-0.588;SOR=0.216;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,36:0.30:119
chr4	89378760	rs150387057	C	CG	128.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=-1.611;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=68;ReadPosRankSum=-0.854;SC=GGCGGGCAGCCGGGGGTCCGC;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=89378768;WS=89378750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr4	89389640	rs4585264	C	A	869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=15;PP=495;SC=TCTAGTATCCCAGTTTGGTGA;SOR=0.880;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=13;TCR=15;TR=28;WE=89389648;WS=89389630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr4	89397091	rs7699006	A	G	6776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=98;NR=113;PP=2965;SC=AGAATGTCCTATGATGCATAT;SOR=0.957;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=211;TCF=98;TCR=113;TR=211;WE=89397099;WS=89397081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr4	89415396	rs6857425	T	C	8906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=168;NR=133;PP=2965;SC=TTGCCAACCTTCCTTTCCCAC;SOR=0.933;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=301;TCF=168;TCR=133;TR=301;WE=89415404;WS=89415386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,332:1.00:332
chr4	89526864	rs3775418	A	T	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=52;ReadPosRankSum=-0.746;SC=GGTTATTTTTAAAATTGGTTA;SOR=0.515;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=7;WE=89526872;WS=89526854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr4	89571260	rs2860420	A	G	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=86;ReadPosRankSum=-0.366;SC=TTTCCTTTGCACCACTCCTGT;SOR=0.446;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=6;WE=89571268;WS=89571250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr4	89575324	rs2860427	T	A	2211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.119;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=66;PP=1513;ReadPosRankSum=2.322;SC=GCTGGGGATATGATGGGTGAT;SOR=0.846;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=245;TCF=100;TCR=145;TR=106;WE=89575332;WS=89575314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,112:0.42:267
chr4	89577214	rs2972040	A	T	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=3.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.38;ReadPosRankSum=-0.121;SOR=0.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,30:0.53:57
chr4	89585235	rs2972018	A	G	1056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.325;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=17;PP=550;ReadPosRankSum=0.195;SC=TTACTTTATTATTGATGCTTA;SOR=0.327;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=85;TCF=57;TCR=28;TR=43;WE=89585243;WS=89585225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,51:0.52:98
chr4	89588689	rs3017921	C	T	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.511;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=296;ReadPosRankSum=-1.654;SC=ATTTTTGTATCGATGAATTCA;SOR=1.112;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=11;TCR=18;TR=22;WE=89588697;WS=89588679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,25:0.71:35
chr4	89589069	.	G	T	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.279;ClippingRankSum=0.000;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.088;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=386;ReadPosRankSum=0.318;SC=AAAGTTGTCTGATTCCCCAGT;SOR=0.301;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=57;TCF=43;TCR=14;TR=25;WE=89589077;WS=89589059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,28:0.46:61
chr4	89599421	rs2604227	A	C	530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=15;PP=409;SC=TTAATCACCTACTTTTGTCAA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=89599429;WS=89599411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
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chr4	89711690	.	TA	T	105.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=0.000;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=2.000;QD=1.79;ReadPosRankSum=0.569;SOR=0.646;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,13:0.22:59
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chr4	89711854	rs2290781	C	T	8628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.71;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
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chr4	89726283	rs2276936	A	C	284.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=211;SC=TTCTACCTGTAAAAAATGTTG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=89726291;WS=89726273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	89744300	rs41284761	C	T	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=21;PP=431;ReadPosRankSum=0.178;SC=ACAACTTGCTCTGCAGTTGGC;SOR=0.644;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=55;TCF=10;TCR=45;TR=25;WE=89744308;WS=89744290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,26:0.45:58
chr4	89827492	rs13132415	G	T	1330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=25;PP=725;ReadPosRankSum=-0.706;SC=CCATGCTAAAGATTTCACATG;SOR=0.667;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=141;TCF=85;TCR=56;TR=60;WE=89827500;WS=89827482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,69:0.43:159
chr4	89978281	rs11097210	G	A	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=2;PP=21;SC=TTTAGGAAGAGTGGTTTTGCT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=89978289;WS=89978271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr4	90168825	rs7672015	T	C	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=211;ReadPosRankSum=0.671;SC=AGTGAATACTTGCTTTTTCTT;SOR=0.616;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=15;WE=90168833;WS=90168815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr4	90169925	rs7653897	A	G	5522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=92;PP=2965;SC=CTCTTCCCTCACTGGAGTCAT;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=189;TCF=96;TCR=93;TR=188;WE=90169933;WS=90169915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr4	90749132	rs1442149	A	T	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.40;ReadPosRankSum=0.541;SOR=0.193;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr4	90749469	.	AAT	A	43	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000;HP=6;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=43;QD=13.5;SC=GAAAGAAAAAAATATATATAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=4;WE=90749478;WS=90749459;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr4	90855932	rs1038140	T	C	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=99;ReadPosRankSum=1.229;SC=TAATTAAAACTATGTATTATT;SOR=1.426;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=6;WE=90855940;WS=90855922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr4	90874095	rs3832297	A	AC	571.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.271;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=274;ReadPosRankSum=0.525;SC=ATAAGGAAAGAAAAATAAGAT;SOR=0.458;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=29;TCF=17;TCR=12;TR=10;WE=90874103;WS=90874085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,19:0.41:46
chr4	91246905	rs9284586	C	G	607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=16;PP=460;SC=TTATTTTATACTTATTTTATG;SOR=2.030;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=22;WE=91246924;WS=91246895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr4	91246916	rs9284587	G	A	492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=14;PP=381;SC=TTATTTTATGGTGTTGAAATT;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=18;WE=91246924;WS=91246895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	91584811	rs6842658	A	T	259.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=8;NR=2;PP=229;SC=ATACTTTATTATTCTTCACAA;SOR=2.093;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=91584819;WS=91584801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	91584992	rs6842926	A	G	1813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=26;PP=1020;SC=ATTGTTACTTATAGGTTCACT;SOR=0.754;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=30;TCR=26;TR=56;WE=91585000;WS=91584982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr4	91585060	rs6843110	A	T	1664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=28;PP=917;SC=TTCTAGTTGTATGAAAGTGAA;SOR=0.976;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=24;TCR=28;TR=52;WE=91585068;WS=91585050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr4	92240031	rs9999729	C	G	890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=4;PP=678;SC=TGTGCATATTCCCTCATTAGT;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=27;WE=92240039;WS=92240021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr4	92240080	rs9999885	G	A	2032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=20;PP=1284;SC=ATTTCATGGAGAGGAAAAAAA;SOR=1.577;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=46;TCR=20;TR=66;WE=92240088;WS=92240070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr4	92240278	rs7653977	A	T	1259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=26;PP=809;SC=CTTCTGGATAATTTTTTCTAA;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=8;TCR=26;TR=34;WE=92240286;WS=92240268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr4	92240317	rs7683541	T	C	554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=13;PP=375;SC=AGATGATGCATAAGTTTACAT;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=92240325;WS=92240307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	92240802	rs6532289	C	T	2060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=43;NR=23;PP=1104;SC=CTACCTAATACAAAACCCAGT;SOR=1.108;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=43;TCR=23;TR=66;WE=92240810;WS=92240792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr4	92240892	rs6816636	C	A	4406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=81;NR=61;PP=2462;SC=GAGGCAGAAGCACCATTTGTT;SOR=0.808;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=142;TCF=81;TCR=61;TR=142;WE=92240900;WS=92240882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr4	92240925	rs6532290	T	G	4399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=83;NR=64;PP=2254;SC=GCTGCTTCTCTTATGCTCTAA;SOR=0.717;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=147;TCF=83;TCR=64;TR=147;WE=92240933;WS=92240915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr4	92241031	rs6817404	G	T	1324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=32;PP=926;SC=CTTACTTGTGGTCACCCACAA;SOR=1.814;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=13;TCR=32;TR=45;WE=92241039;WS=92241021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr4	92241071	rs6816883	A	G	503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=15;PP=410;SC=AATTCCAGAAACAAACCAATC;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=92241079;WS=92241061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr4	92246344	rs3762827	G	A	4467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=66;PP=2469;SC=AGCATAGTAGGTGGCTCTTGC;SOR=0.766;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=148;TCF=82;TCR=66;TR=148;WE=92246352;WS=92246334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr4	92246541	rs1528572	T	A	327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=8;PP=226;SC=CATCTATAGATGAAAGGGAGC;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=92246549;WS=92246531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	93218844	rs35863353	AT	A	1094.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=22;PP=446;SC=AGCCTCCTTTATTTTTTTTTA;SOR=1.721;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=23;WE=93218852;WS=93218834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr4	93225752	.	G	GA	49.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=0.000;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=2.517;QD=0.78;ReadPosRankSum=-0.686;SOR=0.506;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,9:0.14:64
chr4	94316763	rs1385405	T	G	6964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.99;NF=126;NR=112;PP=2965;SC=TTCAGCTTGGTTGCTGGAATC;SOR=0.709;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=238;TCF=126;TCR=112;TR=238;WE=94316771;WS=94316753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr4	94376675	rs6819866	A	T	1024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=5;PP=693;SC=TAAGAAGTCTATGCAGTGTTT;SOR=2.649;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=32;WE=94376683;WS=94376665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr4	94750058	rs10009502	C	G	1286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.75;SOR=1.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr4	95129540	rs41275676	A	G	798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.700;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=9;PP=518;ReadPosRankSum=-0.898;SC=GGTGCTTTCTACCAATATGAA;SOR=0.897;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=95;TCF=66;TCR=29;TR=37;WE=95129548;WS=95129530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,39:0.38:102
chr4	95134165	rs10433970	C	G	982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.772;HP=10;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=18;PP=658;ReadPosRankSum=1.214;SC=TCCTTTTTTTCTTTGACTTTT;SOR=0.792;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=85;TCF=48;TCR=37;TR=42;WE=95134173;WS=95134155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,44:0.48:92
chr4	95134348	rs75021203	A	G	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=52;ReadPosRankSum=1.242;SC=ATAAAACCATATAATAGGGCA;SOR=0.223;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=5;WE=95134356;WS=95134338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr4	95161996	rs2306803	C	T	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.670;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=131;ReadPosRankSum=-1.960;SC=CTTTGTTTTACATTAAATTGA;SOR=1.930;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=26;TCF=17;TCR=9;TR=10;WE=95162004;WS=95161986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr4	95169682	rs10034781	G	T	2415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.024;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=56;PP=1552;ReadPosRankSum=-0.021;SC=TTTTGAAATGGTTTCTCCAGA;SOR=0.781;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=203;TCF=98;TCR=105;TR=105;WE=95169690;WS=95169672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,114:0.51:225
chr4	95169772	rs7435106	T	A	803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.884;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=22;PP=428;ReadPosRankSum=-1.147;SC=TAGGCTTTATTCCATGTTAGC;SOR=0.580;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=77;TCF=24;TCR=53;TR=33;WE=95169780;WS=95169762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,39:0.46:85
chr4	95170839	rs11722476	G	A	953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.07;ReadPosRankSum=1.007;SOR=0.706;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,50:0.63:79
chr4	95173779	rs7439869	T	C	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=228;ReadPosRankSum=-2.005;SC=ATGCAATATGTATCACAAAGT;SOR=0.818;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=45;TCF=30;TCR=15;TR=18;WE=95173787;WS=95173769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,18:0.35:51
chr4	95186055	rs2306802	A	G	671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=17;PP=408;ReadPosRankSum=-1.152;SC=TTCTAAACCAAAGGTAATCTT;SOR=0.813;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=63;TCF=22;TCR=41;TR=26;WE=95186063;WS=95186045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,31:0.46:68
chr4	95197520	rs6823404	C	T	2205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.497;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=41;PP=1317;ReadPosRankSum=1.188;SC=GTTCTGATGACCGTAGTCTGT;SOR=0.650;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=190;TCF=110;TCR=80;TR=91;WE=95197528;WS=95197510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,106:0.49:217
chr4	95199479	rs35670996	C	G	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.219;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.62;ReadPosRankSum=-0.219;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr4	95202492	rs35361491	G	A	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=114;ReadPosRankSum=1.871;SC=TAAAGAAGCAGTTTATCACAG;SOR=0.368;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=10;WE=95202500;WS=95202482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr4	95206252	rs67631469	TTATC	T	2360.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.714;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.549;NF=6;NR=25;PP=1489;ReadPosRankSum=1.169;SC=ACTTCAATATTTATCTATATG;SOR=0.788;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=54;TCF=9;TCR=45;TR=31;WE=95206263;WS=95206242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,62:0.56:110
chr4	95255637	rs2289186	T	G	573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.075;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=329;ReadPosRankSum=-0.478;SC=TTTATTATTTTTGCTACTTAC;SOR=0.447;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=55;TCF=39;TCR=16;TR=25;WE=95255645;WS=95255627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,28:0.47:59
chr4	95377729	.	GT	G	141.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=99;ReadPosRankSum=0.347;SC=AGGTATGTGTGTTTTTTTAAA;SOR=0.656;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=6;WE=95377737;WS=95377719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,10:0.29:35
chr4	95496882	rs2452600	C	T	7669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=132;NR=121;PP=2965;SC=GGTTCTGTGTCTTCACCAAAA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=254;TCF=133;TCR=121;TR=253;WE=95496890;WS=95496872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,278:1.00:278
chr4	95498617	rs35078286	GAT	G	372.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.674;HP=1;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=266;ReadPosRankSum=-0.122;SC=CTAAAGTTCTGATATATATAT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=11;WE=95498630;WS=95498607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,14:0.78:18
chr4	95503670	rs3857212	G	T	346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=201;SC=TTCATTTTTTGGTCTGTGTTT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=95503678;WS=95503664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	95506214	rs2172448	G	A	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.094;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=291;ReadPosRankSum=-0.420;SC=TATAAGTGCAGTTTTTTACTT;SOR=0.914;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=49;TCF=16;TCR=33;TR=22;WE=95506222;WS=95506204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,26:0.48:54
chr4	95529430	rs10033359	C	T	268.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=197;SC=GATTACAGAACGGACATCATT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=95529452;WS=95529420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	95529444	rs9307146	C	A	165.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=130;SC=CATCATTAACCTATAGACAAG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=95529452;WS=95529420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr4	95531417	rs10017461	A	G	3577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=64;NR=65;PP=2156;SC=TGAGCAGCGCAGCTGCTACTG;SOR=0.814;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=64;TCR=65;TR=129;WE=95531425;WS=95531407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr4	95531562	rs10007050	TG	CA	601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=479;SC=ATAGCTCTATTGTGAGCTCTT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=95531571;WS=95531552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	95539267	rs966845	G	A	3207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=57;PP=1800;SC=CAGCCTCACAGCTGCAGCTGC;SOR=1.112;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=103;TCF=46;TCR=57;TR=103;WE=95539275;WS=95539257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr4	95575601	rs2280003	C	T	4709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=66;PP=2808;SC=GCCTCTTTTTCTTCTGTCAGA;SOR=0.841;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=151;TCF=85;TCR=66;TR=151;WE=95575609;WS=95575585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr4	95578588	rs13107595	G	A	6970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=139;NR=94;PP=2965;SC=GAAGTCATCAGTGCGTTGAAA;SOR=1.161;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=233;TCF=139;TCR=94;TR=233;WE=95578596;WS=95578578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr4	95583827	rs10031423	C	T	465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=362;SC=TTGTAAATTTCGAAAGTTGTT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=95583835;WS=95583817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	95585038	rs56921499	G	A	1300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=5;PP=976;SC=CCATTGGGGGGAAAAATCACT;SOR=3.467;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=36;TCR=5;TR=41;WE=95585046;WS=95585028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr4	96073753	rs144298602	AAAT	A	115.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=1;PP=125;ReadPosRankSum=0.000;SC=ACTTCACAGAAAATAATAATA;SOR=0.941;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=18;TCF=11;TCR=7;TR=4;WE=96073763;WS=96073743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,5:0.21:24
chr4	96104277	rs79624449	C	T	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.869;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=142;ReadPosRankSum=0.438;SC=CTCAGATGGTCTGCTGCCAGG;SOR=0.108;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=12;WE=96104285;WS=96104267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr4	96106322	rs2289043	A	G	3214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=61;PP=1733;SC=CTGTCCTCCCATCTGTCTCTC;SOR=1.550;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=38;TCR=61;TR=99;WE=96106330;WS=96106312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr4	96123981	rs3733212	C	T	3165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=56;PP=1961;SC=TGAGGCGCTTCGCAGCCGCTT;SOR=0.762;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=57;TCR=57;TR=113;WE=96123989;WS=96123971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr4	96127869	rs2276322	T	G	3189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=45;PP=1694;ReadPosRankSum=1.548;SC=TGAGGACGACTGGGCGGGTGA;SOR=0.725;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=62;TCR=45;TR=106;WE=96127877;WS=96127859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,124:0.98:126
chr4	96137512	rs995062	T	C	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=208;ReadPosRankSum=1.754;SC=CCTTCCTCATTGGCCTCCTTA;SOR=0.829;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=47;TCF=13;TCR=34;TR=19;WE=96137520;WS=96137502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,19:0.39:49
chr4	96169733	rs13118653	G	T	2397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.953;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=49;PP=1456;ReadPosRankSum=0.611;SC=GACAGGACTAGCAGAGTGATC;SOR=0.619;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=231;TCF=128;TCR=103;TR=109;WE=96169741;WS=96169723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,121:0.47:258
chr4	96171681	rs34875919	A	G	3181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.986;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=77;PP=2044;ReadPosRankSum=-3.085;SC=TCTTGGCAACAATGTTTTTGG;SOR=0.856;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=296;TCF=144;TCR=152;TR=146;WE=96171689;WS=96171671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,157:0.49:318
chr4	96256673	rs1843018	G	A	5733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=105;PP=2965;SC=ACAGGTTCACGGGCTTATTCT;SOR=0.949;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=190;TCF=85;TCR=105;TR=190;WE=96256681;WS=96256663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr4	96469708	rs4699431	A	T	102.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.881;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.27;ReadPosRankSum=-2.148;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr4	96761363	rs142094055	T	A	1530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.531;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=20;PP=892;ReadPosRankSum=0.330;SC=GCTCGCAGAGTGCTGGTGGCA;SOR=0.521;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=111;TCF=74;TCR=37;TR=60;WE=96761371;WS=96761353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,71:0.58:122
chr4	98893437	rs783960	A	G	3220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=45;PP=1907;SC=TTACCTGATAATCAGCAGGTC;SOR=0.950;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=110;TCF=65;TCR=45;TR=110;WE=98893445;WS=98893427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr4	98893476	rs783959	C	T	3838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=63;PP=2238;SC=CTTTCTGAACCGAGAAGAAAG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=70;TCR=63;TR=133;WE=98893484;WS=98893466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr4	99218108	rs34325900	G	GA	2663.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=24;PP=1424;SC=ACCATAAAGTGTGCCATACAG;SOR=0.723;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=30;WE=99218116;WS=99218098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr4	99337881	rs10516430	C	T	881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.946;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=11;PP=495;ReadPosRankSum=-0.200;SC=TTATTTTGTTCACGTTGTTCT;SOR=0.283;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=72;TCF=53;TCR=19;TR=35;WE=99337889;WS=99337871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,40:0.48:83
chr4	99341156	rs12512920	C	G	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.072;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.187;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=3;PP=133;ReadPosRankSum=0.980;SC=ACCATAGTCTCTCTTTTTCTC;SOR=0.293;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=10;WE=99341164;WS=99341146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr4	99355017	rs12507118	G	C	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.494;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=99;ReadPosRankSum=0.783;SC=ACAATGAGTTGACTGATTTTA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=6;WE=99355025;WS=99355007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr4	99358083	rs11386407	A	AT	631.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.677;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=8;PP=536;ReadPosRankSum=-0.117;SC=ACTTTGTTTTATTTGTAGGCA;SOR=1.302;SbPval=0.08;Source=Platypus;TC=42;TCF=12;TCR=30;TR=16;WE=99358091;WS=99358073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,27:0.35:77
chr4	99399748	rs4303985	G	T	738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=1;PP=565;SC=TAAGAAGAGGGTTCAACCAAA;SOR=4.174;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=99399756;WS=99399738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	99408106	rs6838913	T	C	1476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=39;PP=992;SC=TAAAGATTATTGCATTTGTCC;SOR=1.877;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=56;TCF=16;TCR=40;TR=55;WE=99408114;WS=99408096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr4	99802300	.	GA	G	101.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.058;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=4.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQRankSum=0.000;QD=3.91;ReadPosRankSum=0.709;SOR=0.169;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr4	99802395	rs11729285	C	T	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=207;ReadPosRankSum=0.140;SC=TATTAAAAAACATAGACTTGA;SOR=0.793;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=13;WE=99802403;WS=99802385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr4	99808872	rs994636	T	C	775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.239;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=7;PP=507;ReadPosRankSum=0.722;SC=TCAATTTTTATAAACAAATAG;SOR=1.093;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=61;TCF=43;TCR=18;TR=31;WE=99808880;WS=99808862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,35:0.51:68
chr4	99850126	rs11723037	A	G	976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.843;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=14;PP=548;ReadPosRankSum=-0.596;SC=TCCAACATGAAGGGGAAGGGG;SOR=0.486;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=72;TCF=48;TCR=24;TR=39;WE=99850134;WS=99850116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,46:0.54:85
chr4	99918661	rs10035037	A	C	1560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.01;SOR=0.906;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr4	99926965	rs2123782	T	C	3593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=58;NR=64;PP=2019;SC=GAAGTAACTCTGGAATGGAAA;SOR=0.969;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=122;TCF=58;TCR=64;TR=122;WE=99926973;WS=99926955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr4	99952607	rs1037476	C	T	3292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=32;PP=2090;SC=TAATACTTTTCCTTCCACTCC;SOR=1.589;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=71;TCR=32;TR=103;WE=99952615;WS=99952597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr4	99952710	rs1037475	A	G	7592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=137;NR=123;PP=2965;SC=CTTTGTGACCATGGGTTATTC;SOR=0.742;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=261;TCF=138;TCR=123;TR=260;WE=99952718;WS=99952700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,289:1.00:289
chr4	99966568	rs11721765	G	C	449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=15;PP=404;SC=GGTTGCCCCTGTTCTACCTGA;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=99966576;WS=99966558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	100001247	rs1154412	T	C	278.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=8;PP=229;SC=ATATTTACAGTAAGAGACACT;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=100001255;WS=100001237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	100006645	rs1154410	A	G	4678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=61;PP=2815;SC=GCATATGCAAAAGCAGGTTAA;SOR=0.925;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=146;TCF=85;TCR=61;TR=146;WE=100006653;WS=100006635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr4	100009738	rs1154401	G	C	10376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=396;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=194;NR=167;PP=2965;SC=GCCAGATCCCGTCTTGGGCGC;SOR=0.839;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=361;TCF=194;TCR=167;TR=361;WE=100009746;WS=100009728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,393:1.00:393
chr4	100021124	rs2851279	T	C	124.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=1;PP=54;SC=ACTGGAGCTGTTCCTATTCAG;SOR=1.022;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=100021132;WS=100021114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	100021253	rs2851278	G	C	93.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=3;PP=56;SC=TGATTATGCAGTAAACATAGT;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=100021261;WS=100021243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	100045500	rs1042365	T	G	744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=20;NR=9;PP=499;SC=TTGTTTAAACTCATGGCTTTC;SOR=1.536;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=29;WE=100045508;WS=100045490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	100045574	rs1042364	T	C	1513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=29;NR=25;PP=790;SC=GATAGTATTCTGAATTGCTCC;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=29;TCR=25;TR=54;WE=100045582;WS=100045564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr4	100045616	rs1126673	C	T	1506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=23;PP=780;SC=ATTGTTCGGACGCTGTTAATA;SOR=0.800;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=26;TCR=23;TR=49;WE=100045624;WS=100045606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr4	100045647	rs2602894	A	G	1196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=18;PP=641;SC=ATTAATAAGTATAATTTTCAT;SOR=1.055;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=17;TCR=18;TR=35;WE=100045655;WS=100045637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr4	100047929	rs10009145	G	A	1643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=37;PP=1077;SC=CACTTGACACGAAGTAGTTTA;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=15;TCR=37;TR=52;WE=100047937;WS=100047919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr4	100048327	rs9307234	G	A	1868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=20;PP=1684;SC=ACTAGGAAAAGAATTTAAAGC;SOR=1.263;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=81;TCF=61;TCR=20;TR=80;WE=100048335;WS=100048317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr4	100048414	rs1126671	T	C	6965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=138;NR=118;PP=2965;SC=TCTGGAAAAATAGTCAATCCT;SOR=0.723;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=257;TCF=139;TCR=118;TR=256;WE=100048422;WS=100048404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,268:1.00:268
chr4	100048506	rs6836440	G	A	3900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=80;PP=2272;SC=CTGTGATGGAGCATAAAAGAA;SOR=1.308;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=48;TCR=80;TR=128;WE=100048514;WS=100048496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr4	100052733	rs1126670	C	A	2283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=26;PP=1341;SC=CTTCCTGGATCGGTTTATGTA;SOR=1.139;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=44;TCR=26;TR=70;WE=100052741;WS=100052723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr4	100062819	rs2032349	A	G	4150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=77;PP=2550;ReadPosRankSum=1.055;SC=TATGGCACAGAGAGGTAGCAA;SOR=0.375;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=140;TCF=62;TCR=78;TR=139;WE=100062827;WS=100062809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,153:0.99:154
chr4	100064166	rs5860566	G	GA	104.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=4;NR=1;PP=96;SC=TTTATTTCTTGAAAAAAAAAC;SOR=1.981;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=5;WE=100064174;WS=100064156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	100064305	rs4699715	C	G	4093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=58;PP=2575;SC=TTTGAAATCACCTCTGAATTA;SOR=1.022;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=143;TCF=85;TCR=58;TR=143;WE=100064313;WS=100064295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr4	100065509	rs1800759	T	G	1205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=26;PP=791;SC=TCCAATCACTTCCTTTTCTCC;SOR=2.038;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=11;TCR=26;TR=37;WE=100065517;WS=100065499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr4	100140306	rs4699735	A	T	5181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=77;PP=2965;SC=CCTGTAGTACACATGCTGATT;SOR=0.704;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=167;TCF=90;TCR=77;TR=167;WE=100140314;WS=100140296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr4	100205819	rs28364312	C	A	3279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.88;ReadPosRankSum=1.095;SOR=0.705;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,85:0.52:165
chr4	100205829	rs28364311	T	G	3349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.30;ReadPosRankSum=-0.504;SOR=0.701;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,89:0.54:165
chr4	100212173	rs13134764	A	T	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=5.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.00;ReadPosRankSum=0.266;SOR=0.650;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:112,43:0.28:155
chr4	100212197	rs4147531	G	A	1330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.739;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=35;PP=680;ReadPosRankSum=-2.420;SC=AATAACACCCGATTCCAGTTC;SOR=0.564;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=124;TCF=46;TCR=78;TR=52;WE=100212205;WS=100212187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,40:0.34:119
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chr4	100235053	rs1789882	A	G	3691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;BaseQRankSum=3.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=387;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.768;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-11.525;NF=83;NR=92;PP=2844;ReadPosRankSum=1.543;SC=GCACTTCCTGAATGGGTTTCT;SOR=0.650;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=385;TCF=188;TCR=197;TR=175;WE=100235061;WS=100235043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:218,168:0.44:386
chr4	100239284	rs6413413	T	A	2671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.210;HP=6;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=39;PP=1557;ReadPosRankSum=0.133;SC=GGAAGGGGGGTCACCAGGTTG;SOR=0.940;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=184;TCF=111;TCR=73;TR=107;WE=100239292;WS=100239274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,122:0.58:209
chr4	100239319	rs1229984	T	C	7303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=132;NR=115;PP=2965;SC=GTCATCTGTGTGACAGATTCC;SOR=0.773;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=247;TCF=132;TCR=115;TR=247;WE=100239327;WS=100239309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,283:1.00:283
chr4	100258007	rs1612735	T	C	11545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=427;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=185;NR=197;PP=2965;SC=GTCCAAGGAGTATTTGAGGTG;SOR=0.746;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=382;TCF=185;TCR=197;TR=382;WE=100258015;WS=100257997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,427:1.00:427
chr4	100258054	rs1693453	C	A	8509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=119;NR=163;PP=2965;SC=CAGCCACTCCCTTCCCATCCC;SOR=1.140;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=282;TCF=119;TCR=163;TR=282;WE=100258062;WS=100258044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,320:1.00:320
chr4	100260667	rs66502432	ACGCC	A	1509.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=24;NR=5;PP=1474;SC=CTGCTAGACAACGCCCCCCCC;SOR=2.649;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=29;WE=100260685;WS=100260658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr4	100260677	rs2298754	C	G	1620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.81;QD=40.52;SOR=2.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr4	100260789	rs698	T	C	7069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=118;NR=117;PP=2965;SC=AAAGGTAAAATATTTGTTATT;SOR=0.773;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=236;TCF=119;TCR=117;TR=235;WE=100260797;WS=100260779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr4	100261577	rs55753621	AT	A	193.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.53;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	100261589	.	A	C	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.84;ReadPosRankSum=0.781;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr4	100263834	rs1693481	C	T	1848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=11;PP=1109;SC=AAAAAGATGACGGGAAATTTC;SOR=2.412;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=46;TCR=11;TR=57;WE=100263842;WS=100263824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr4	100263942	rs1789912	C	T	9278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=184;NR=133;PP=2965;SC=GGGCATGTCACGGATCATACC;SOR=0.988;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=317;TCF=184;TCR=133;TR=317;WE=100263950;WS=100263932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,345:1.00:345
chr4	100263965	rs1693482	C	T	9744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=362;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=185;NR=159;PP=2965;SC=GGTGTCAAGCCGACCGATGAC;SOR=0.797;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=345;TCF=186;TCR=159;TR=344;WE=100263973;WS=100263955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,362:1.00:362
chr4	100266112	rs1693425	C	T	7058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=101;NR=127;PP=2965;SC=CAATTTTGGCCACTGCATTCT;SOR=1.105;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=228;TCF=101;TCR=127;TR=228;WE=100266120;WS=100266102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chr4	100266330	rs1693426	A	G	4492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=76;PP=2733;SC=AGCATCAGAAACTTACTCATT;SOR=0.921;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=71;TCR=76;TR=147;WE=100266338;WS=100266320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr4	100266371	rs1789915	A	G	2971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=50;PP=1704;SC=CTGGGTTTTTACAAATTCTGC;SOR=1.244;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=38;TCR=50;TR=88;WE=100266379;WS=100266361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr4	100266583	rs1662053	A	C	147.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=195;SC=CTGCCAAGGCATTGTTTTTTA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=100266591;WS=100266573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	100268190	rs283413	A	C	2062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=11;PP=1367;SC=ACCCCTTCTCAAACACTTTCC;SOR=2.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=50;TCR=11;TR=61;WE=100268198;WS=100268180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr4	100269202	rs1789921	G	A	697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=21;PP=576;SC=AAGATAAACAGAGTTAAGTAC;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=100269210;WS=100269192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	100341643	rs1154460	G	A	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.132;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=11;PP=347;ReadPosRankSum=0.341;SC=CCTTGTGCATGTCTAATAACT;SOR=0.465;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=68;TCF=46;TCR=22;TR=30;WE=100341651;WS=100341633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,30:0.45:66
chr4	100341861	rs971074	C	T	1434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.160;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=32;PP=800;ReadPosRankSum=0.409;SC=TCCCAATGATCCTAGATGCAC;SOR=0.586;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=156;TCF=75;TCR=81;TR=63;WE=100341869;WS=100341851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,75:0.40:188
chr4	100349204	rs75076500	A	C	1384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.189;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=24;PP=955;ReadPosRankSum=-1.018;SC=TAGCATAGGAAAAATGTAAAT;SOR=0.930;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=133;TCF=78;TCR=55;TR=62;WE=100349212;WS=100349194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,65:0.47:138
chr4	100349669	rs1573496	C	G	3062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.148;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=50;PP=1753;ReadPosRankSum=-3.832;SC=TGTAGTCACTCCTTCTCCAAT;SOR=0.887;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=262;TCF=147;TCR=115;TR=127;WE=100349677;WS=100349659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,145:0.49:295
chr4	100356584	rs34925826	A	G	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5729;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=119;ReadPosRankSum=-0.180;SC=TTGCAGACCAACTTATAAAAA;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=6;WE=100356592;WS=100356574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr4	100443561	rs13142939	A	G	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=277;ReadPosRankSum=-0.134;SC=ATTTAATGATATTTGGTTGGG;SOR=1.061;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=13;WE=100443569;WS=100443551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr4	100443720	rs13143848	G	A	2103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.643;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=52;PP=1376;ReadPosRankSum=1.899;SC=ACATTGTGGGGAGTTGGCCAG;SOR=0.941;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=153;TCF=74;TCR=79;TR=92;WE=100443728;WS=100443710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,98:0.58:170
chr4	100443782	rs13119384	T	C	1982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=2.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.03;ReadPosRankSum=-0.047;SOR=1.068;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,52:0.53:99
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chr4	100457117	rs111869659	A	ACAGT	720.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=505;ReadPosRankSum=1.961;SC=TTTTCTTCTAACAGGCCACTC;SOR=0.743;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=31;TCF=19;TCR=12;TR=11;WE=100457125;WS=100457107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,18:0.40:45
chr4	100457344	rs10019266	C	T	353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.720;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=221;ReadPosRankSum=-0.172;SC=GGAGGTATTACCGGGTCAGGA;SOR=0.407;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=15;WE=100457352;WS=100457334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
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chr4	100478624	rs3817083	C	T	620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=20;PP=403;ReadPosRankSum=0.994;SC=TGTCTATGGCCATTCTATGAT;SOR=0.664;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=46;TCF=11;TCR=35;TR=26;WE=100478632;WS=100478614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,28:0.57:49
chr4	100485244	rs11944749	G	C	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.052;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=811;ReadPosRankSum=-2.218;SC=CGGCCATTTCGAACCCGCAAT;SOR=2.093;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=42;TCF=27;TCR=15;TR=18;WE=100485263;WS=100485234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,20:0.45:44
chr4	100485255	rs11944752	G	A	658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.333;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=811;ReadPosRankSum=-1.260;SC=AACCCGCAATGGAAGAAAGGG;SOR=2.288;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=44;TCF=32;TCR=12;TR=19;WE=100485263;WS=100485234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,20:0.42:48
chr4	100491772	rs11933337	T	C	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.654;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=322;ReadPosRankSum=-0.271;SC=CCAGAACCTGTGATAGTCTAA;SOR=0.425;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=21;WE=100491780;WS=100491762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,20:0.62:32
chr4	100504664	rs3816873	T	C	1951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.134;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=39;PP=1111;ReadPosRankSum=1.332;SC=CTTCATCTAATCCATGGAAAG;SOR=0.591;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=171;TCF=93;TCR=78;TR=84;WE=100504672;WS=100504654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,96:0.51:187
chr4	100534041	rs2718684	G	A	1013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.309;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=12;PP=528;ReadPosRankSum=0.030;SC=GGGAGCTTGCGTCATGAACAT;SOR=1.117;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=61;TCF=40;TCR=21;TR=37;WE=100534049;WS=100534031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,45:0.62:72
chr4	100543745	rs2255119	A	G	1422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.085;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=18;PP=986;ReadPosRankSum=-2.448;SC=TGGAACAGAAACTTCAAGTAC;SOR=0.380;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=86;TCF=61;TCR=25;TR=56;WE=100543753;WS=100543735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,59:0.62:95
chr4	100570681	rs4699384	T	A	1549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.124;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=31;PP=864;ReadPosRankSum=2.201;SC=TCTGCCACCATTGGGGAGAGC;SOR=0.510;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=128;TCF=65;TCR=63;TR=66;WE=100570689;WS=100570671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,74:0.52:141
chr4	100738035	rs715239	G	T	710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.113;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=8;PP=467;ReadPosRankSum=-0.961;SC=GAGCAGCCCAGTTGTGTCTCT;SOR=0.969;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=54;TCF=38;TCR=16;TR=31;WE=100738043;WS=100738025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,34:0.60:57
chr4	100774532	rs144829888	GCT	G	1795.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.796;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.970;NF=2;NR=24;PP=1056;ReadPosRankSum=0.268;SC=GTGACCACAAGCTCTCTCCCT;SOR=0.871;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=62;TCF=5;TCR=57;TR=26;WE=100774541;WS=100774522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,50:0.53:95
chr4	100784883	.	T	C	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.60;ReadPosRankSum=2.100;SOR=0.020;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,2:0.25:8
chr4	100789416	rs4699768	G	A	1760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.333;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=46;PP=1000;ReadPosRankSum=0.457;SC=TCTGCAGCAGGCTTCAAATGA;SOR=0.838;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=139;TCF=55;TCR=84;TR=75;WE=100789424;WS=100789406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,81:0.55:148
chr4	101109385	rs3749603	A	C	527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.096;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=350;ReadPosRankSum=-1.885;SC=TAGAAAAAAAACACCAAGATA;SOR=0.070;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=20;WE=101109393;WS=101109375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,22:0.73:30
chr4	101337150	rs4699401	C	T	476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.908;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=19;PP=386;ReadPosRankSum=-1.147;SC=ATTAACACCACAGTAATCAGC;SOR=0.908;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=86;TCF=36;TCR=50;TR=32;WE=101337158;WS=101337140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,30:0.34:87
chr4	101338217	rs3733437	T	C	1305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.905;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=16;PP=790;ReadPosRankSum=-0.322;SC=AGAGTAACAATAATTTTCACT;SOR=1.176;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=94;TCF=59;TCR=35;TR=51;WE=101338225;WS=101338207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,59:0.55:107
chr4	101368661	rs1157180	A	G	1260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=0.668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.17;ReadPosRankSum=-2.092;SOR=0.640;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,61:0.49:124
chr4	101953322	rs2851060	C	T	1189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=13;PP=694;ReadPosRankSum=0.810;SC=GAAGAAGAACCGAAGACCAAG;SOR=0.721;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=57;TCR=22;TR=47;WE=101953330;WS=101953312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,53:0.59:90
chr4	102116994	rs2659542	G	A	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.444;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=150;ReadPosRankSum=0.583;SC=AAGACTCACTGGTAACTAGGA;SOR=2.187;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=8;WE=102117002;WS=102116984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr4	102117323	rs2850991	A	G	724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.754;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=25;PP=546;ReadPosRankSum=0.314;SC=TCAACAACAAACAATGCAATA;SOR=1.497;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=64;TCF=14;TCR=50;TR=30;WE=102117331;WS=102117313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,31:0.44:70
chr4	102171591	rs2583404	T	G	881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=21;PP=592;SC=ATTTAATAGATTATTGTTATG;SOR=2.235;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=29;WE=102171599;WS=102171581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr4	102171606	rs2850958	A	G	560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=16;PP=395;SC=GTTATGTTACATAGAAAGGAT;SOR=2.200;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=21;WE=102171614;WS=102171596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	102251501	rs28664200	T	C	902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.637;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=6;PP=560;ReadPosRankSum=-0.379;SC=GCAAAGAAGATAGTTTCTTTA;SOR=0.316;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=67;TCF=57;TCR=10;TR=33;WE=102251509;WS=102251491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,39:0.50:78
chr4	102267821	rs2850327	AA	CG	1553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.996;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=10;PP=1138;ReadPosRankSum=-0.693;SC=GGAGGGGAGGAAAGGCGAGGC;SOR=0.478;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=111;TCF=84;TCR=27;TR=35;WE=102267830;WS=102267811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,41:0.37:112
chr4	102268034	rs3974660	A	ACGCCGC	970.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=5.241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=1.505;QD=17.33;ReadPosRankSum=-0.008;SOR=1.745;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,27:0.48:56
chr4	102642453	rs10856962	T	C	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.962;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=336;ReadPosRankSum=0.747;SC=TTGAATTTTTTAATTGTCTTA;SOR=2.467;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=56;TCF=42;TCR=14;TR=19;WE=102642461;WS=102642443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,20:0.34:59
chr4	102642526	rs12506517	T	C	1668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.119;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=32;PP=1038;ReadPosRankSum=-1.058;SC=TACAGTAGTCTCTGCTTATCC;SOR=0.815;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=178;TCF=104;TCR=74;TR=79;WE=102642534;WS=102642516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,88:0.45:197
chr4	102839362	rs3733198	A	T	1145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.46;SOR=2.252;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr4	102965043	rs3113676	T	C	1873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=32;NR=32;PP=886;SC=TGACAAGTTCTGTGGTCTTCC;SOR=0.859;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=32;TCR=32;TR=64;WE=102965051;WS=102965033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr4	103174491	rs151370	A	G	5393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.544;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=106;NR=80;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.654;SC=GGTCATAACTATGTCATATGC;SOR=0.626;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=187;TCF=106;TCR=81;TR=186;WE=103174499;WS=103174481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,198:0.99:199
chr4	103225513	rs11097773	T	C	2307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.665;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=44;PP=1340;ReadPosRankSum=1.922;SC=AATGGATATGTCCATTAGCTT;SOR=0.564;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=196;TCF=112;TCR=84;TR=99;WE=103225521;WS=103225503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,111:0.52:215
chr4	103228545	rs1462947	G	A	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.210;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=165;ReadPosRankSum=-0.402;SC=GTGCTAAAACGTTCAAAAGAA;SOR=0.297;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=12;WE=103228553;WS=103228535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr4	103228734	rs35411892	C	T	2656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.641;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=55;PP=1531;ReadPosRankSum=0.478;SC=GATTAATAATCGTCACTGACA;SOR=0.573;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=200;TCF=98;TCR=102;TR=110;WE=103228742;WS=103228724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,124:0.56:222
chr4	103505784	rs10711129	CA	C	409.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.39;MQRankSum=0.560;QD=14.63;ReadPosRankSum=2.085;SOR=0.507;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,23:0.82:28
chr4	103514658	rs1609993	T	C	2488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=46;NR=39;PP=1329;SC=GTAGTGGTGCTGGAGCTGGAG;SOR=0.823;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=46;TCR=39;TR=85;WE=103514666;WS=103514648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr4	103514741	rs4648050	T	C	2232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=34;NR=37;PP=1270;SC=AAAATACTTATTCTTCCTAAA;SOR=1.031;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=34;TCR=37;TR=71;WE=103514749;WS=103514731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr4	103534560	rs3817685	C	G	1525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=19;PP=757;SC=GAACATGCTCCTCCTTCCTTT;SOR=1.123;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=31;TCR=19;TR=50;WE=103534568;WS=103534550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr4	103553447	rs5860729	GA	G	1838.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=16;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=1;NR=44;PP=832;SC=GCCTGAAAAAGAAAAAAAAAA;SOR=1.547;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=48;TCF=1;TCR=47;TR=45;WE=103553466;WS=103553436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr4	103553543	rs735403	C	T	292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=219;SC=AAGGAGTCCACTTCCCACAAC;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=103553551;WS=103553533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	103555992	rs2272697	A	G	2085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=16;PP=1550;ReadPosRankSum=-0.840;SC=GGTGAGGACAAGAAGTGGTAG;SOR=1.204;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=70;TCF=54;TCR=16;TR=69;WE=103556000;WS=103555982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,71:0.99:72
chr4	103556316	rs909349	T	C	944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=24;PP=531;SC=TAAGAGACTATGAAACCTGAG;SOR=2.494;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=32;WE=103556324;WS=103556306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr4	103556367	rs11436517	G	GT	186.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=192;SC=ATGTGACTAAGTAACTTCTCA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=103556375;WS=103556357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr4	103557077	rs2866413	G	A	6427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=128;NR=90;PP=2965;SC=GATATAGAACGTGTTTTCATT;SOR=0.971;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=219;TCF=128;TCR=91;TR=218;WE=103557085;WS=103557067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr4	103557192	rs4547797	C	T	4312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=77;PP=2563;SC=TGTCAGGAGACGGCAAGGTCA;SOR=0.924;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=145;TCF=68;TCR=77;TR=145;WE=103557200;WS=103557182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr4	103557219	rs2866414	C	T	3215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=66;PP=2111;SC=CAGAGAGGCACTGTCCAATGG;SOR=1.432;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=41;TCR=66;TR=107;WE=103557227;WS=103557209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr4	103557251	rs10027437	G	A	2161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=43;PP=1381;SC=GTGGCTCATCGGGGTTCTAAG;SOR=1.673;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=67;TCF=23;TCR=44;TR=66;WE=103557259;WS=103557241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr4	103557311	rs4496586	G	C	787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=20;PP=568;SC=CCATGTTTGTGAAGCGCTCTG;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=103557319;WS=103557301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
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chr4	103911069	rs2715591	C	A	3083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=42;PP=1701;SC=TAGTTTCTTCCTGTGCAGTAT;SOR=0.877;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=61;TCR=42;TR=103;WE=103911077;WS=103911059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr4	104000922	rs12508269	T	C	1153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=27;PP=693;ReadPosRankSum=0.356;SC=ACTGCAGTGATAAACACAAGG;SOR=0.708;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=130;TCF=67;TCR=63;TR=56;WE=104000930;WS=104000912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,60:0.43:138
chr4	104000973	rs12504262	G	C	885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.649;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=26;PP=588;ReadPosRankSum=-0.628;SC=GCTGTATTTTGAAATTTTCCT;SOR=0.910;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=99;TCF=40;TCR=59;TR=42;WE=104000981;WS=104000963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,44:0.43:102
chr4	104003148	rs2306478	C	T	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=28;ReadPosRankSum=1.834;SC=ATATATGCCACAAACTCTCTA;SOR=0.368;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=4;WE=104003156;WS=104003141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr4	104003993	rs56412006	A	C	1598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=2.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=17;PP=959;ReadPosRankSum=0.820;SC=ATTTATTAACAAAAGGTTTAA;SOR=1.030;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=112;TCF=77;TCR=35;TR=60;WE=104004001;WS=104003983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,71:0.55:129
chr4	104004064	rs79460377	T	C	2966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.874;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=61;PP=1934;ReadPosRankSum=-3.202;SC=TTCTTTCTTGTAGAGATGGCG;SOR=0.766;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=269;TCF=143;TCR=126;TR=133;WE=104004072;WS=104004054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,146:0.49:301
chr4	104013040	rs12506157	G	C	1064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.028;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=29;PP=696;ReadPosRankSum=-0.879;SC=ACAAGTGTCTGAACATCTCAG;SOR=0.533;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=69;TCF=17;TCR=52;TR=39;WE=104013048;WS=104013030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,44:0.57:77
chr4	104013796	rs1054707	T	C	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=372;ReadPosRankSum=0.290;SC=CTCAACTTCATTGGCAAACTG;SOR=0.559;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=57;TCF=42;TCR=15;TR=26;WE=104013804;WS=104013786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,24:0.41:58
chr4	104016200	rs7668568	C	G	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=141;ReadPosRankSum=-2.076;SC=AGATTTTTGTCTATAGGTTCA;SOR=0.495;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=32;TCF=22;TCR=10;TR=14;WE=104016208;WS=104016190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,17:0.46:37
chr4	104061845	rs3052340	CTTA	C	310.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=217;ReadPosRankSum=-1.594;SC=CAGATAGTGCCTTATTATTGG;SOR=0.593;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=6;WE=104061855;WS=104061835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr4	104061993	rs1381657	C	G	1064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.289;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=19;PP=593;ReadPosRankSum=0.023;SC=TTCTTGCAGGCTTTCCTTGAG;SOR=0.911;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=110;TCF=64;TCR=46;TR=49;WE=104062001;WS=104061983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,54:0.43:127
chr4	104062223	rs1381658	C	T	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.353;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=149;ReadPosRankSum=-0.019;SC=CTTTTTTTAACGTAATAAGTT;SOR=0.284;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=14;WE=104062231;WS=104062213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr4	104063071	rs2711898	C	T	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=17;PP=353;ReadPosRankSum=1.112;SC=AGATCCTTTACCATTAGAGAA;SOR=0.627;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=69;TCF=27;TCR=42;TR=29;WE=104063079;WS=104063061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,31:0.42:74
chr4	104066890	rs2169508	T	A	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=172;ReadPosRankSum=0.725;SC=TATAACTATTTTGTTGTAATT;SOR=0.693;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=21;TCF=7;TCR=14;TR=11;WE=104066898;WS=104066880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr4	104079424	rs2251322	C	T	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=2.022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.26;ReadPosRankSum=0.159;SOR=0.478;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,30:0.42:71
chr4	104082349	rs2251634	C	T	640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.855;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=16;PP=399;ReadPosRankSum=-0.616;SC=TTGCCTCCAACTGGCTTTGAT;SOR=0.740;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=68;TCF=37;TCR=31;TR=31;WE=104082357;WS=104082339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,34:0.43:80
chr4	104084179	rs80039447	T	C	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr4	104101723	rs12504143	G	A	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.362;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=55;ReadPosRankSum=-0.038;SC=ATTTGTATATGAACTATAAGA;SOR=0.399;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=5;WE=104101731;WS=104101713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr4	104104186	rs3835129	T	TACTA	196.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.049;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.154;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=235;ReadPosRankSum=-0.621;SC=AGATTAAAACTACTAAAAAAT;SOR=2.236;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=6;WE=104104194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr4	104104239	rs3765086	A	G	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.651;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=385;ReadPosRankSum=-0.462;SC=AATCATATGTATAAGTTTTTG;SOR=1.270;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=19;WE=104104247;WS=104104229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr4	104119326	rs185238151	G	A	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=43;ReadPosRankSum=1.180;SC=GAGCCGGGAAGCAGCGGCTCC;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=4;WE=104119334;WS=104119316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr4	104510766	rs2765	G	A	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=391;ReadPosRankSum=1.634;SC=GACAGGACTGGTAAATAGGAG;SOR=1.402;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=18;WE=104510774;WS=104510756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,22:0.73:30
chr4	105393361	rs4413407	A	G	232.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=0;PP=159;SC=AGCCCTATACATAAAATGAAA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=105393369;WS=105393351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	106154990	rs71971966	TATAGATAG	T	2320.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=9;PP=2329;SC=TTAGTATTTTTATAGATAGAT;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=36;TCF=22;TCR=14;TR=25;WE=106155005;WS=106154980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr4	106196951	rs2454206	A	G	5096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=78;PP=2965;SC=ACCTTCTCACATAATCCATAA;SOR=0.736;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=170;TCF=92;TCR=78;TR=170;WE=106196959;WS=106196941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr4	106292121	rs2726526	G	C	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=237;ReadPosRankSum=0.631;SC=AATTATAGAAGAAAGTTTACA;SOR=0.560;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=10;TCR=13;TR=18;WE=106292129;WS=106292111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,20:0.77:26
chr4	106317370	rs145622118	T	TATAAA	202.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=149;ReadPosRankSum=1.465;SC=TACCAATTAATATAACATTAC;SOR=2.303;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=4;WE=106317378;WS=106317360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr4	106317429	rs13787	C	G	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=0.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.345;NF=15;NR=5;PP=290;ReadPosRankSum=0.446;SC=CTCCATTACACTTCTTCATAA;SOR=0.950;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=20;WE=106317437;WS=106317419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,24:0.65:37
chr4	106317498	rs34331553	CCAAA	C	1346.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=0.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.036;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.598;NF=5;NR=14;PP=834;ReadPosRankSum=-0.132;SC=AAGCCTAGCTCCAAACAAACA;SOR=0.264;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=34;TCF=14;TCR=20;TR=19;WE=106317509;WS=106317488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,36:0.55:65
chr4	106320399	rs1490593	G	C	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.014;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=11;PP=199;ReadPosRankSum=-1.706;SC=TTGGACTGAGGGAGCCAGGAA;SOR=0.553;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=49;TCF=22;TCR=27;TR=21;WE=106320407;WS=106320389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,25:0.43:58
chr4	106320446	rs1490594	G	A	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=86;ReadPosRankSum=-0.533;SC=ACAATTGATTGTGATACCTAG;SOR=0.602;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=21;TCF=7;TCR=14;TR=9;WE=106320454;WS=106320436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr4	106359209	rs2713862	T	A	555.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.393;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=19;PP=452;ReadPosRankSum=1.007;SC=ATTTTTTTTTTAAAAAAAAGC;SOR=0.392;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=60;TCF=25;TCR=35;TR=33;WE=106359217;WS=106359199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,30:0.50:60
chr4	106395181	rs4699179	G	A	754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=27;PP=544;ReadPosRankSum=-0.833;SC=GGGCACCCGTGCGCAGCAGCC;SOR=0.933;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=59;TCF=8;TCR=51;TR=30;WE=106395189;WS=106395171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,33:0.50:66
chr4	106474096	rs6533206	T	C	2730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=53;PP=1467;SC=CTGACAGGACTGAATACAACC;SOR=1.056;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=44;TCR=53;TR=97;WE=106474104;WS=106474086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr4	106510470	rs2276970	A	G	2410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.479;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=53;PP=1349;ReadPosRankSum=-1.473;SC=AGAGCATCATATGAAGAGGAT;SOR=0.677;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=214;TCF=110;TCR=104;TR=107;WE=106510478;WS=106510460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,117:0.51:231
chr4	106534425	rs3214769	CAGAA	C	444.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=61.34;MQRankSum=1.718;NF=10;NR=1;PP=476;ReadPosRankSum=-0.117;SC=AGAATGTTAACAGAAATGGTT;SOR=0.257;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=11;WE=106534436;WS=106534415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr4	106534691	rs2305212	A	G	1550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=38;PP=947;ReadPosRankSum=-0.013;SC=CTCGAGTTCTACAATACAACA;SOR=0.640;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=130;TCF=56;TCR=74;TR=68;WE=106534699;WS=106534681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,72:0.52:139
chr4	106569976	rs76964186	C	T	978.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=5.280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.54;ReadPosRankSum=3.596;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,41:0.65:63
chr4	106580340	rs13147012	A	G	1794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.857;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=42;PP=1145;ReadPosRankSum=-0.499;SC=GCAGCGATCAACGGGAGAGGA;SOR=0.867;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=160;TCF=78;TCR=82;TR=79;WE=106580348;WS=106580330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,86:0.49:177
chr4	106587316	rs56277608	T	C	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=359;ReadPosRankSum=0.423;SC=AACAATGCCATATTATTTCTA;SOR=0.680;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=53;TCF=36;TCR=17;TR=25;WE=106587324;WS=106587306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,28:0.47:59
chr4	106848314	rs4546247	C	T	320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=262;SC=ACATACATAACACATGTGTGT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=106848322;WS=106848313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	106848703	rs10856978	C	T	666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=19;PP=488;SC=TGTGAGCTGCCATTTTGCTGA;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=106848711;WS=106848693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	106859549	rs35132891	G	C	1255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.691;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=26;PP=724;ReadPosRankSum=0.651;SC=CTGGCCTGCAGCTGGCTCCTG;SOR=0.194;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=64;TCF=23;TCR=41;TR=44;WE=106859557;WS=106859539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,52:0.72:72
chr4	106861557	rs4627867	A	T	890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=16;PP=699;SC=ATCTGCCAATATTATGTAGAT;SOR=1.528;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=9;TCR=16;TR=25;WE=106861565;WS=106861553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	106861730	rs4340795	A	G	5150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=78;PP=2938;SC=ATGTTATAACATACGTGGGTC;SOR=0.868;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=173;TCF=95;TCR=78;TR=173;WE=106861738;WS=106861720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr4	106891531	rs6817700	A	G	2337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=20;PP=1503;SC=ATTTTCTGCTATTTTTGCCAG;SOR=1.609;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=77;TCF=57;TCR=20;TR=76;WE=106891539;WS=106891521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr4	106892210	rs4449421	T	G	957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=33;NR=3;PP=708;SC=TTTCTTCATGTTAAAGGTATA;SOR=3.981;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=40;TCF=33;TCR=7;TR=36;WE=106892218;WS=106892200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	106892254	rs71672810	AT	A	45.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.68;ReadPosRankSum=-1.269;SOR=0.846;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,12:0.18:67
chr4	106924753	rs115149004	C	A	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.920;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=152;ReadPosRankSum=-0.292;SC=GTAAAACACACGTTTATATAC;SOR=0.275;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=9;WE=106924761;WS=106924743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr4	106924931	rs17258724	G	A	2176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.050;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=42;PP=1103;ReadPosRankSum=0.798;SC=ACAAGGTGTAGTTCTCCATGT;SOR=0.620;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=185;TCF=97;TCR=88;TR=94;WE=106924939;WS=106924921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,107:0.50:212
chr4	107037630	rs78488187	C	T	226.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=182;SC=AACAATACAGCATATAAGAGA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=107037638;WS=107037620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	107092169	rs10516532	A	G	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=258;ReadPosRankSum=-1.949;SC=TGACACCATTAAGAACAATAA;SOR=0.602;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=40;TCF=35;TCR=5;TR=16;WE=107092177;WS=107092159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,18:0.42:43
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chr4	107158823	rs11729801	C	T	595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=20;PP=397;ReadPosRankSum=-0.895;SC=ATCTTTTACTCAAACTAAGAA;SOR=0.769;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=19;TCR=42;TR=29;WE=107158831;WS=107158813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,29:0.46:63
chr4	107163773	rs9996386	T	C	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=367;ReadPosRankSum=-0.136;SC=ATCCAGTTTATTGTTTCTTCT;SOR=1.101;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=19;WE=107163781;WS=107163763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr4	107168431	rs3775091	G	C	4592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=80;PP=2889;SC=TTCATTAATTGATCTGGGGTT;SOR=1.193;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=60;TCR=80;TR=140;WE=107168439;WS=107168421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr4	107168520	rs3775090	G	T	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.319;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=186;ReadPosRankSum=1.462;SC=ACATTCAAGAGAATGGATAAA;SOR=0.257;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=13;WE=107168528;WS=107168510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr4	107171637	rs139991421	TAAATA	T	412.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.853;HP=3;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=447;ReadPosRankSum=-1.374;SC=TTTTCTTCCCTAAATAAAATG;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=7;WE=107171655;WS=107171627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr4	107171647	rs41277029	G	A	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=5.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.89;ReadPosRankSum=0.509;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr4	107172182	rs12641015	C	T	1459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.462;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=28;PP=957;ReadPosRankSum=1.092;SC=TATTTCCTTACTAGTCTGCCT;SOR=0.525;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=113;TCF=69;TCR=44;TR=67;WE=107172190;WS=107172172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,70:0.56:125
chr4	107176104	rs12639869	C	A	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=11;PP=331;ReadPosRankSum=-1.530;SC=ACATACATACCTTTTAGTTTC;SOR=0.667;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=62;TCF=40;TCR=22;TR=30;WE=107176112;WS=107176094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,32:0.48:67
chr4	107216072	rs72174253	CTA	C	67.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.77;ReadPosRankSum=-1.960;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr4	107246136	rs3737498	C	A	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=101;ReadPosRankSum=-1.195;SC=TTTATTTTTCCTATAGGATTT;SOR=1.179;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=7;WE=107246144;WS=107246126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr4	107248890	rs3792718	T	C	111.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.76;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	107257975	rs3737497	A	T	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=222;ReadPosRankSum=-1.084;SC=TCTGGATATGATTAGGCTTAA;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=13;WE=107257983;WS=107257965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr4	107279450	rs7654865	C	T	855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.904;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=11;PP=470;ReadPosRankSum=2.222;SC=TACTGGAAAACGTATTTGTGC;SOR=0.830;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=64;TCF=44;TCR=20;TR=36;WE=107279458;WS=107279440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,40:0.56:72
chr4	107279482	rs12645490	T	A	1106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=17;PP=596;ReadPosRankSum=2.262;SC=TAGCAGCGTTTTCAGGGTATC;SOR=0.708;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=90;TCF=56;TCR=34;TR=47;WE=107279490;WS=107279472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,53:0.52:101
chr4	107279518	rs75431821	T	C	1284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=22;PP=650;ReadPosRankSum=1.055;SC=ATATTTATCTTCAGTAAGCCC;SOR=0.694;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=104;TCF=57;TCR=47;TR=51;WE=107279526;WS=107279508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,61:0.51:120
chr4	107288117	rs3018064	T	A	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.83;ReadPosRankSum=0.141;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr4	107288449	rs2949646	G	A	1417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.201;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=30;PP=739;ReadPosRankSum=-0.720;SC=TGCGGCCCAGGCTACAACATG;SOR=0.802;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=149;TCF=76;TCR=73;TR=61;WE=107288457;WS=107288439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,72:0.42:171
chr4	108048977	rs2158182	A	C	1828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=18;PP=865;SC=GCAAGATGTAAGGCTGAAGGC;SOR=1.352;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=38;TCR=18;TR=56;WE=108048985;WS=108048967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr4	108581002	rs11291153	GC	G	803.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=6;PP=427;SC=CAACATCTTTGCCCCCCCAGC;SOR=1.781;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=20;TCF=12;TCR=8;TR=16;WE=108581010;WS=108580992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	108603314	rs112365258	G	A	1152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.735;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=35;PP=808;ReadPosRankSum=1.646;SC=AGATAATAGAGTAGGGTGGAA;SOR=0.917;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=89;TCF=31;TCR=58;TR=51;WE=108603322;WS=108603304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,53:0.54:99
chr4	108608100	rs45502094	CTCTAACACT	C	2213.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=9;PP=2965;SC=CTCCAAGTCACTCTAACACTT;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=33;WE=108608116;WS=108608090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr4	108615226	rs371693146	CT	C	2140.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.792;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.428;NF=2;NR=54;PP=1057;ReadPosRankSum=-0.352;SC=TGTAGTAATACTTTTTTTTTC;SOR=1.788;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=70;TCF=2;TCR=68;TR=56;WE=108615234;WS=108615216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,82:0.98:84
chr4	108622241	rs17510783	C	T	4436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=90;NR=47;PP=2372;SC=GAACAGAGCTCAAAATTTAAA;SOR=1.193;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=137;TCF=90;TCR=47;TR=137;WE=108622249;WS=108622231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr4	108622475	rs13110240	C	T	2193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=53;PP=1378;SC=TTCTAGTTTACATGAGTCCTT;SOR=1.582;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=28;TCR=53;TR=81;WE=108622483;WS=108622465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr4	108641169	rs2074372	C	G	1827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=11;PP=1271;SC=CCTCCGCGCTCCTGGAAGGAT;SOR=2.419;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=47;TCR=11;TR=58;WE=108641177;WS=108641159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr4	108641300	rs973126	T	C	6933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=117;NR=113;PP=2965;SC=TATTGCTCAGTTTGACTTTCT;SOR=0.772;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=230;TCF=117;TCR=113;TR=230;WE=108641308;WS=108641290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr4	108641317	rs1127006	G	A	6115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=101;PP=2965;SC=TTCTTGCACAGGCTCCCGGGG;SOR=0.881;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=200;TCF=99;TCR=101;TR=200;WE=108641325;WS=108641307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr4	108641437	rs2074374	C	G	1050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=27;PP=800;SC=GGGGCCTCCTCGCGTCGGAGC;SOR=2.012;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=10;TCR=27;TR=37;WE=108641445;WS=108641427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr4	108641464	rs1319253	AA	GC	1076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=20;PP=1087;SC=GCGCTGACTTAAGCACGCGCC;SOR=3.014;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=22;WE=108641473;WS=108641454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	108820650	.	T	C	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.880;ClippingRankSum=-0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=104;ReadPosRankSum=0.489;SC=TTCTTTATCCTGTTAAACATT;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=6;WE=108820658;WS=108820640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr4	108853384	rs6849089	C	G	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.050;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=244;ReadPosRankSum=-0.899;SC=TCCGGCCGCCCGCGCCCCCAG;SOR=0.257;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=22;TCF=7;TCR=15;TR=17;WE=108853392;WS=108853374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,19:0.76:25
chr4	108866058	rs10002671	G	A	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.845;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=219;ReadPosRankSum=0.926;SC=AATGCACTCCGTGGTAGGTCT;SOR=0.352;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=16;WE=108866066;WS=108866048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr4	108868515	rs6856745	T	C	1449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=16;PP=811;ReadPosRankSum=2.198;SC=CTGGTTTATTTTTCCCTTTTT;SOR=0.660;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=98;TCF=69;TCR=29;TR=53;WE=108868523;WS=108868505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,63:0.56:113
chr4	108925994	rs17510991	A	G	1370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.244;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=30;PP=842;ReadPosRankSum=0.696;SC=AGGAAGGAACATGACCCTGCG;SOR=0.595;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=149;TCF=70;TCR=79;TR=62;WE=108926002;WS=108925984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,68:0.42:161
chr4	108926170	rs3775973	T	G	917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=23;PP=668;SC=ATGTTTATTTTATACTGTAAC;SOR=2.376;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=30;WE=108926178;WS=108926160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	108931039	rs4956145	T	C	3352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=44;NR=57;PP=1779;SC=GCAGAAAACCTTAAGGTAATT;SOR=1.151;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=101;TCF=44;TCR=57;TR=101;WE=108931047;WS=108931029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr4	108935770	rs7677408	T	C	1621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.16;SOR=0.899;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr4	108935871	rs4956147	G	A	222.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=0;NR=9;PP=206;SC=ATATTGTGTAGTGGTGAAGTC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=108935879;WS=108935861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	108944579	rs4956032	C	T	3598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=42;PP=2134;SC=ACCATTCTACCGAAGTTGCTT;SOR=1.232;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=120;TCF=77;TCR=43;TR=119;WE=108944587;WS=108944569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr4	108944732	rs17511214	G	A	1687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.156;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=41;PP=940;ReadPosRankSum=-0.444;SC=AAGAGTATGGGTAGCTTGGGA;SOR=0.575;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=166;TCF=72;TCR=94;TR=77;WE=108944740;WS=108944722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,85:0.46:186
chr4	108944821	rs4956033	C	T	872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=24;PP=624;SC=AAAGAAGGAGCATTGTATACT;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=108944829;WS=108944811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr4	108944846	rs4956034	A	G	465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=13;PP=333;SC=GCTTGTCCACATGCTGTAAAG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=108944854;WS=108944836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	108969590	rs4245927	A	G	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.236;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=278;ReadPosRankSum=-0.589;SC=CGCAGATATGAGGGGAGAAAA;SOR=0.069;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=15;WE=108969598;WS=108969580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr4	108985388	rs4613638	A	G	4488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=94;NR=44;PP=2822;SC=AAAGCATCATAAGTTACAGTC;SOR=1.421;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=138;TCF=94;TCR=44;TR=138;WE=108985396;WS=108985378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr4	108991979	rs2276335	C	T	1405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=33;PP=861;SC=ATAGCAATAGCATATTTTATG;SOR=2.170;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=12;TCR=33;TR=45;WE=108991987;WS=108991969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr4	108999300	rs4956156	G	T	3398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=81;NR=23;PP=2115;SC=ACCTGATATGGGATTAAATTG;SOR=2.264;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=81;TCR=23;TR=104;WE=108999308;WS=108999290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr4	108999366	rs4956157	G	A	3020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.478;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=56;PP=1856;ReadPosRankSum=-1.015;SC=CACATGACTCGGCTACTTACC;SOR=0.939;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=270;TCF=150;TCR=120;TR=131;WE=108999374;WS=108999356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,146:0.48:302
chr4	109000536	rs6819640	T	C	552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=3;PP=313;SC=CAGAGGTGCATTGAGTTTCAC;SOR=1.721;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=109000544;WS=109000526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr4	109002986	rs7681524	T	C	892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=23;PP=681;SC=TCCCCTTCCTTACCCTCCACC;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=109002994;WS=109002976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	109010207	rs16996935	A	G	1071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=26;NR=8;PP=623;SC=GGCATCTGGAAGGTCACTCAG;SOR=1.445;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=34;WE=109010215;WS=109010197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr4	109461985	rs17583662	A	G	1226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=17;PP=560;ReadPosRankSum=1.021;SC=AAGGCAGAGAAATAAAATGTC;SOR=0.746;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=122;TCF=75;TCR=47;TR=49;WE=109461993;WS=109461975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,62:0.42:148
chr4	109478108	rs11731416	C	G	1999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.229;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=47;PP=1216;ReadPosRankSum=1.443;SC=TATTCATTTTCATTGATGGCT;SOR=0.813;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=148;TCF=60;TCR=88;TR=78;WE=109478116;WS=109478098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,90:0.53:169
chr4	109541499	rs7677415	C	T	3132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=72;PP=1830;ReadPosRankSum=-0.651;SC=GCGTTTGTTTCCACAGCGATT;SOR=0.689;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=293;TCF=144;TCR=149;TR=140;WE=109541507;WS=109541475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,157:0.48:329
chr4	109541603	rs3796936	T	A	687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.725;HP=2;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=864;ReadPosRankSum=0.630;SC=AACGTGGTGGTTCCCTGCATC;SOR=0.321;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=56;TCF=13;TCR=43;TR=29;WE=109541624;WS=109541593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,31:0.51:61
chr4	109541616	rs3796935	T	C	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.897;HP=1;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=864;ReadPosRankSum=0.144;SC=CCTGCATCTCTGCCCACGTCG;SOR=0.236;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=47;TCF=11;TCR=36;TR=23;WE=109541624;WS=109541593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,25:0.49:51
chr4	109541661	rs3796934	T	G	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.031;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=61;ReadPosRankSum=0.250;SC=ACACGGATACTCTCTCTCTGA;SOR=0.023;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=6;WE=109541669;WS=109541651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr4	109576843	rs2851380	G	T	3434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=57;PP=2000;SC=ATGATTTGGTGGTGGGAAAGA;SOR=0.824;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=113;TCF=56;TCR=57;TR=113;WE=109576851;WS=109576833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr4	109588238	rs2851374	G	C	231.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=7;NR=2;PP=185;SC=GGTGAGGGGGGCAAAATATGA;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=109588246;WS=109588228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	109664819	rs6533381	T	C	991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=2;PP=778;SC=CAACAATAAGTGAACCTAATA;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=30;WE=109664827;WS=109664809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	109669319	rs33958723	TA	T	38.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=10.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.84;ReadPosRankSum=1.205;SOR=0.067;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,9:0.20:46
chr4	109683509	rs57603342	A	G	1228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.766;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=19;PP=709;ReadPosRankSum=-1.350;SC=ACCCTTCATCACTTAACCAAG;SOR=1.056;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=133;TCF=87;TCR=46;TR=57;WE=109683517;WS=109683499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,67:0.42:161
chr4	109683688	rs3733622	G	A	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.173;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=21;PP=393;ReadPosRankSum=-0.008;SC=CTGGAATGGTGTCTGCTAGGG;SOR=1.025;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=56;TCF=13;TCR=43;TR=26;WE=109683696;WS=109683678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,31:0.49:63
chr4	109735133	rs2305436	T	C	1171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.057;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=14;PP=696;ReadPosRankSum=1.729;SC=TTAGTAGTCTTGAATTAAAAT;SOR=1.070;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=52;TCF=25;TCR=27;TR=25;WE=109735154;WS=109735123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,35:0.51:68
chr4	109735146	rs2305435	T	G	1046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=4.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.79;ReadPosRankSum=-0.567;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,26:0.59:44
chr4	109735209	rs11733727	T	C	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.75;ReadPosRankSum=-0.253;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr4	109748227	rs13104307	C	T	1269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=20;PP=655;ReadPosRankSum=0.234;SC=AAGGGTTAACCGTGTCAGTGA;SOR=0.721;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=159;TCF=103;TCR=56;TR=60;WE=109748235;WS=109748217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,68:0.38:180
chr4	109759469	rs4956063	C	T	1322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=35;PP=1010;SC=TTGTCTTGCACGAAACATTAA;SOR=4.174;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=4;TCR=35;TR=39;WE=109759477;WS=109759459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr4	109762918	rs11942576	C	A	2120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=41;PP=1237;SC=GAATTGATTCCCTGTTTCCCA;SOR=1.108;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=31;TCR=41;TR=72;WE=109762926;WS=109762908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr4	109766177	rs10015534	G	C	425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=0;PP=327;SC=TATACTTTGTGTATCACTGTG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=109766185;WS=109766173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	109766290	rs11098004	T	G	4016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=42;PP=2686;SC=GTAAGTAACATGTCAGTGTGT;SOR=1.493;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=85;TCR=42;TR=127;WE=109766298;WS=109766280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr4	109767453	rs5860952	C	CA	8289.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=95;PP=2936;SC=AACAGAATTCCGATCAATTTC;SOR=1.413;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=108;TCF=7;TCR=101;TR=102;WE=109767461;WS=109767443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr4	109769844	rs13130308	C	T	1507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=8;PP=936;SC=GACATTTTGGCTTCAAACCTA;SOR=2.628;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=37;TCR=8;TR=45;WE=109769852;WS=109769834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr4	109769899	rs13135591	C	T	3638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=41;PP=2074;SC=TAATAGTATACATCTTTGAAA;SOR=1.256;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=121;TCF=80;TCR=41;TR=121;WE=109769907;WS=109769889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr4	109782249	rs13133634	C	T	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.935;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=195;ReadPosRankSum=-0.580;SC=TGAAAAACAACAGCAACCACC;SOR=1.639;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=12;WE=109782257;WS=109782239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr4	109783755	rs146165021	ACAG	A	1594.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=5.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.328;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.786;NF=2;NR=29;PP=1351;ReadPosRankSum=1.988;SC=AGAGATAAGAACAGAAAAATA;SOR=1.872;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=59;TCF=3;TCR=56;TR=31;WE=109783765;WS=109783745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,43:0.49:87
chr4	109790346	.	C	CAATAAATAAATA	104.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.906;ClippingRankSum=0.000;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.241;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=1763;ReadPosRankSum=0.122;SC=AATCATTTGACAATAAATAAA;SOR=0.192;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=1;TCR=53;TR=22;WE=109790354;WS=109790336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,9:0.22:41
chr4	109790373	rs142515007	TAAATA	T	1177.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=13.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.17;ReadPosRankSum=-1.084;SOR=3.219;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,30:0.67:45
chr4	109811003	rs12641411	T	C	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.113;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=18;PP=323;ReadPosRankSum=0.293;SC=ATGACTAATGTGCCTAACTAC;SOR=0.420;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=70;TCF=27;TCR=43;TR=32;WE=109811011;WS=109810993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,37:0.46:80
chr4	109817962	rs10856995	C	T	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=225;ReadPosRankSum=0.153;SC=ATGAACACTACATATTAAAAT;SOR=0.538;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=44;TCF=14;TCR=30;TR=20;WE=109817970;WS=109817952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,21:0.44:48
chr4	109820141	rs144167011	A	ATATATCTC	442.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.140;HP=2;HapScore=3;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.623;NF=6;NR=1;PP=417;ReadPosRankSum=0.488;SC=ATCTATATCTATATATCTATA;SOR=0.132;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=7;WE=109820149;WS=109820131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
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chr4	109820195	rs6853368	C	A	1768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=4.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.61;MQRankSum=2.172;QD=20.33;ReadPosRankSum=0.396;SOR=0.376;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,46:0.53:87
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chr4	109842038	rs2030844	T	A	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=58;ReadPosRankSum=-1.341;SC=ATTGTTTTTTTAAAAAATACC;SOR=0.527;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=8;WE=109842046;WS=109842028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr4	109859053	.	C	A	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=0.000;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.976;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.716;NF=10;NR=15;PP=293;ReadPosRankSum=-1.348;SC=TAAAAAAAAACCCTTCAATCA;SOR=0.862;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=66;TCF=29;TCR=37;TR=25;WE=109859061;WS=109859033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,24:0.36:67
chr4	109969183	rs3096481	T	C	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.056;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=129;ReadPosRankSum=-0.272;SC=CCACCGCGACTGACCACTTTA;SOR=1.949;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=8;WE=109969191;WS=109969173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr4	109969337	rs3108954	G	T	2000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.167;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=47;PP=1166;ReadPosRankSum=1.874;SC=AGGACCTATGGGGGGAGCAGG;SOR=0.606;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=165;TCF=80;TCR=85;TR=93;WE=109969345;WS=109969327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,99:0.56:177
chr4	109969456	rs3096482	T	A	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=223;ReadPosRankSum=1.208;SC=GAAGTTTTTTTAAATTCACTG;SOR=0.622;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=12;WE=109969464;WS=109969446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr4	109971414	rs1863292	T	A	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=201;ReadPosRankSum=-2.606;SC=ATAATTTATATATATTTTCTC;SOR=0.853;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=40;TCF=14;TCR=26;TR=17;WE=109971422;WS=109971404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,18:0.43:42
chr4	110354973	rs72896632	C	T	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=3;PP=27;ReadPosRankSum=-1.791;SC=CCCGCCTTCCCTTCCCTCCGC;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=8;TCR=7;TR=6;WE=110354981;WS=110354963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr4	110370867	rs13123618	C	T	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5004;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=194;ReadPosRankSum=-0.112;SC=TCATGGTGGTCCTGCCTTCAT;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=9;WE=110370875;WS=110370857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,10:0.83:12
chr4	110384047	rs70949082	G	GCTTTT	5811.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=27;PP=2957;SC=GTAAATACTTGCTTTTTCAGG;SOR=1.387;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=65;TCF=33;TCR=32;TR=56;WE=110384055;WS=110384037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr4	110384790	rs33911248	A	G	2418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.444;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.873;NF=50;NR=62;PP=1501;ReadPosRankSum=-0.227;SC=ACAACAACCCAACCATTACTG;SOR=0.752;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=252;TCF=112;TCR=140;TR=112;WE=110384798;WS=110384780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,120:0.43:280
chr4	110384938	rs10002595	T	C	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=55;ReadPosRankSum=-1.177;SC=TGGCTTTTTGTAGCACCTCTT;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=4;WE=110384946;WS=110384928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr4	110442148	rs35364322	C	CA	127.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.230;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=7;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=4;PP=115;ReadPosRankSum=2.722;SC=AACTCCATCTCAAAAAAATAA;SOR=0.074;SbPval=0.1;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=7;WE=110442156;WS=110442138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr4	110445835	rs34224638	G	A	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-3.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.006;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=22;ReadPosRankSum=-1.733;SC=TTATCATAGGGAATCTGCACC;SOR=0.045;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=5;WE=110445843;WS=110445830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr4	110446454	rs6812906	A	G	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.080;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.90;ReadPosRankSum=-0.880;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr4	110448702	rs6827006	A	G	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.034;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=129;ReadPosRankSum=1.175;SC=GCTGAGGCGGACGGACCACGA;SOR=1.375;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=9;WE=110448710;WS=110448692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr4	110451678	rs9994676	C	T	750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.937;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=24;PP=457;ReadPosRankSum=-0.198;SC=CAGATATGTACATGAAGAAAG;SOR=1.028;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=80;TCF=29;TCR=51;TR=35;WE=110451686;WS=110451668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,38:0.44:87
chr4	110453908	rs34727629	C	G	1496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.466;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=32;PP=870;ReadPosRankSum=0.240;SC=CTGTAAGCACCCTTTACTGGC;SOR=0.603;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=167;TCF=82;TCR=85;TR=72;WE=110453916;WS=110453898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,77:0.41:186
chr4	110454039	rs35940980	T	C	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.414;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=87;ReadPosRankSum=0.384;SC=TAACTAGCACTGGAGGTCAAT;SOR=2.546;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=7;WE=110454047;WS=110454029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr4	110454861	rs34133579	C	G	597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=3.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.79;ReadPosRankSum=-2.467;SOR=0.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,32:0.47:68
chr4	110460884	rs15821	C	A	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.102;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=51;ReadPosRankSum=-0.775;SC=AAAGCATAATCTGTCAGAGAA;SOR=0.082;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=6;WE=110460892;WS=110460874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr4	110602430	rs4698780	T	G	1485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.368;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=22;PP=949;ReadPosRankSum=0.903;SC=AAGGAAAAGGTCCTTGAGTCT;SOR=0.571;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=132;TCF=91;TCR=41;TR=60;WE=110602438;WS=110602420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,68:0.45:152
chr4	110603784	rs3733611	T	C	2383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.462;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=48;PP=1519;ReadPosRankSum=-2.242;SC=ACATGAAATCTTTGGTTCACA;SOR=0.649;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=221;TCF=124;TCR=97;TR=103;WE=110603792;WS=110603774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,117:0.47:250
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chr4	110619534	rs2301717	T	G	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.769;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=18;PP=437;ReadPosRankSum=-0.277;SC=AATTATTTTTTACTTATGGCA;SOR=1.255;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=51;TCF=13;TCR=38;TR=22;WE=110619542;WS=110619524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,21:0.38:55
chr4	110638810	rs2285714	C	T	1740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.565;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=32;PP=947;ReadPosRankSum=1.359;SC=TGCCACAGGTCTCATAGCACC;SOR=0.507;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=170;TCF=101;TCR=69;TR=76;WE=110638818;WS=110638800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,86:0.46:188
chr4	110661937	rs551	G	A	2380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=46;NR=26;PP=1188;SC=AAAATATCCAGTGAGATTTGC;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=46;TCR=26;TR=72;WE=110661959;WS=110661927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr4	110667345	rs9998151	T	C	738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=8;PP=474;ReadPosRankSum=0.975;SC=TTCCAACTCATGGCTTCTGAT;SOR=0.624;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=70;TCF=56;TCR=14;TR=33;WE=110667353;WS=110667335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,35:0.44:79
chr4	110670807	rs7441380	G	C	684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=20;PP=602;SC=ACCCATTAGCGTTTTTAACAC;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=110670815;WS=110670797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	110678925	rs11098044	T	C	1329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.441;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=20;PP=662;ReadPosRankSum=-0.033;SC=TTACCTTGAGTCACAGATGCA;SOR=0.595;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=38;TCF=18;TCR=20;TR=37;WE=110678933;WS=110678915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,52:0.98:53
chr4	110678979	rs146158558	T	TTTTAA	1267.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=12;PP=1128;SC=AAAGGATAATTTTTGGAAAAA;SOR=0.906;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=23;TCF=9;TCR=14;TR=19;WE=110678987;WS=110678969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr4	110679002	rs7437142	G	T	1237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=44;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=11;PP=595;SC=GCACACTATAGCAATATACTA;SOR=0.997;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=14;TCR=11;TR=25;WE=110679010;WS=110678992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr4	110681618	rs4382037	C	T	3945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=59;PP=2613;SC=AGTAAAGTTGCTTTTCCTCTT;SOR=0.722;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=66;TCR=59;TR=125;WE=110681626;WS=110681608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr4	110737389	rs2276326	T	C	868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=6;PP=372;SC=TCAACCGAGGTGGCAGCAGCA;SOR=1.329;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=23;WE=110737397;WS=110737379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	110737549	rs6828254	G	A	3810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=68;NR=65;PP=1983;SC=GCAGTCTTCAGTATTTAGCTT;SOR=0.776;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=133;TCF=68;TCR=65;TR=133;WE=110737568;WS=110737539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr4	110745425	rs3188897	G	A	1040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=5;PP=685;SC=GAAAAATAAAGGTGTAATATG;SOR=2.712;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=32;WE=110745433;WS=110745415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr4	110756670	rs114750487	G	A	1468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.684;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=39;PP=938;ReadPosRankSum=1.012;SC=CTTGACTAATGGCCACTCAAT;SOR=0.628;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=117;TCF=43;TCR=74;TR=62;WE=110756686;WS=110756660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,68:0.54:125
chr4	110765361	rs7681770	T	G	5519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=115;PP=2965;SC=TGAAATAAGATAAAAGGACAC;SOR=1.537;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=179;TCF=64;TCR=115;TR=179;WE=110765380;WS=110765351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr4	110765372	rs7657133	A	G	4533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=101;PP=2965;SC=AAAAGGACACACTATCAAAAC;SOR=1.747;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=149;TCF=48;TCR=101;TR=149;WE=110765380;WS=110765351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr4	110773067	rs4698797	G	A	7147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=130;NR=109;PP=2965;SC=TTCCTGGAGAGCTGGACTCAT;SOR=0.771;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=239;TCF=130;TCR=109;TR=239;WE=110773075;WS=110773057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
chr4	110786290	rs7679048	C	T	4365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=53;PP=2721;SC=TAGAACGTTACGGCTGTAAAA;SOR=1.222;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=146;TCF=93;TCR=53;TR=146;WE=110786298;WS=110786280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr4	110786517	rs7679303	A	G	889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=24;PP=647;SC=ACTAATACGTACAATAATGAC;SOR=3.056;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=29;WE=110786525;WS=110786507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	110790911	rs764205	A	T	6265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=114;NR=104;PP=2965;SC=TCTGGCTGGGATGTCAGAAGC;SOR=0.727;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=218;TCF=114;TCR=104;TR=218;WE=110790919;WS=110790901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr4	110865271	rs10470911	T	G	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.831;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=343;ReadPosRankSum=-1.396;SC=TCATTTGAAGTCCACAAGATA;SOR=1.426;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=19;WE=110865279;WS=110865261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,23:0.68:34
chr4	110866178	rs4698755	A	C	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=342;ReadPosRankSum=2.664;SC=TTCTAATAAGACAAGGAACAA;SOR=1.022;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=17;WE=110866186;WS=110866168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr4	110866442	rs4698756	G	A	1643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.684;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=42;PP=996;ReadPosRankSum=-2.431;SC=GTGAGTCATCGTTGACCTTGC;SOR=0.537;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=103;TCF=38;TCR=65;TR=68;WE=110866450;WS=110866432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,74:0.67:110
chr4	110866508	rs4698800	C	T	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=328;ReadPosRankSum=-0.372;SC=GACAATGAGGCGTTGTAGGGG;SOR=1.101;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=17;WE=110866516;WS=110866498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr4	110880364	rs2067004	T	C	1186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.170;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=11;PP=640;ReadPosRankSum=-0.090;SC=GATGCAGCTGTAGACGTTGTA;SOR=0.218;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=65;TCF=51;TCR=14;TR=40;WE=110880372;WS=110880354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,50:0.63:79
chr4	110883121	rs11568943	G	A	1968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.012;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=47;PP=1212;ReadPosRankSum=0.181;SC=GTGCTTGAGAGAGATGGGAAA;SOR=0.784;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=208;TCF=104;TCR=104;TR=91;WE=110883129;WS=110883111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,101:0.43:235
chr4	110884319	rs11568952	G	T	1773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=28;PP=1170;ReadPosRankSum=0.803;SC=CTAAGCAATTGTTTTTGTAGG;SOR=0.653;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=147;TCF=95;TCR=52;TR=76;WE=110884327;WS=110884309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,84:0.51:165
chr4	110896050	rs10002971	A	C	957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.524;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=21;PP=607;ReadPosRankSum=0.420;SC=ACCAGAAACCAAGAAAATCCA;SOR=0.149;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=81;TCF=28;TCR=53;TR=39;WE=110896058;WS=110896040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,45:0.49:91
chr4	110901198	rs2237051	G	A	5864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=110;NR=85;PP=2965;SC=CATCAGTAATGAGAGTAAACA;SOR=0.902;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=195;TCF=110;TCR=85;TR=195;WE=110901206;WS=110901188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr4	110902111	rs11569017	A	T	1705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.018;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=38;PP=1014;ReadPosRankSum=1.932;SC=CTGGCTCTGGATGGTCATCAG;SOR=0.476;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=182;TCF=85;TCR=97;TR=75;WE=110902119;WS=110902101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,89:0.44:203
chr4	110904502	rs6825106	G	A	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.588;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=149;ReadPosRankSum=-0.658;SC=ATGAATAGTCGTAAACATAAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=8;WE=110904510;WS=110904492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr4	110914427	rs4698803	A	T	2272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=49;NR=27;PP=1171;SC=CAACTGGGGGAGCACAGCTGT;SOR=0.997;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=49;TCR=27;TR=76;WE=110914435;WS=110914417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr4	111398208	rs10004516	A	G	876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=25;PP=603;ReadPosRankSum=-0.928;SC=GAGAACGGACAAGTCAAGTAA;SOR=0.575;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=63;TCF=19;TCR=44;TR=37;WE=111398216;WS=111398198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,39:0.57:68
chr4	111398252	rs11734805	C	A	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=261;ReadPosRankSum=0.679;SC=CTTAAGCTCACATATCTGCTT;SOR=1.493;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=13;WE=111398260;WS=111398242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr4	111437103	rs2348432	C	T	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=138;ReadPosRankSum=0.557;SC=ACTGGTTCCACCATAAGAGTC;SOR=0.674;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=34;TCF=14;TCR=20;TR=13;WE=111437111;WS=111437093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,14:0.36:39
chr4	111454153	rs671841	A	G	1276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=8;PP=1008;SC=CTGGTAAAAGACATAATAAGA;SOR=2.780;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=35;TCR=8;TR=43;WE=111454161;WS=111454143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr4	111474659	rs12501626	C	A	608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.914;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=19;PP=357;ReadPosRankSum=-0.510;SC=TTCATACTATCTACTGGTTCC;SOR=1.003;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=79;TCF=29;TCR=50;TR=29;WE=111474667;WS=111474649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,32:0.37:87
chr4	111539437	rs148191851	C	T	3171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.429;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=64;PP=2002;ReadPosRankSum=0.269;SC=GAGGAGTCGGCGGCGCGTAAG;SOR=0.738;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=270;TCF=148;TCR=122;TR=142;WE=111539445;WS=111539427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,150:0.52:288
chr4	111781650	rs10213399	C	T	1018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=14;PP=573;SC=TGTGGTCTGTCGTTGACTGGA;SOR=0.968;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=22;TCR=14;TR=36;WE=111781658;WS=111781640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr4	113066831	rs10002700	G	A	189.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=3;PP=114;SC=GCAGGGACCGGGTGGGATCCC;SOR=1.179;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=8;WE=113066839;WS=113066821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	113178894	rs147158310	ATTTGT	A	238.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.545;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=3;PP=231;ReadPosRankSum=0.137;SC=TAGCTAATGAATTTGTTTTAA;SOR=0.941;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=12;TCF=5;TCR=7;TR=7;WE=113178906;WS=113178884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr4	113179077	rs4834247	C	T	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.68;ReadPosRankSum=-0.610;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr4	113179080	rs4834248	A	T	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.385;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.68;ReadPosRankSum=-0.610;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr4	113199075	rs701759	A	G	1154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.823;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=11;PP=676;ReadPosRankSum=-0.212;SC=AGCAGAGCGAATAAGTGCCAT;SOR=1.402;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=71;TCF=49;TCR=22;TR=40;WE=113199083;WS=113199065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,47:0.59:79
chr4	113199691	rs6834298	C	T	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=84;ReadPosRankSum=0.259;SC=GGCAATTTATCTGGACTTTAA;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=5;WE=113199699;WS=113199681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr4	113344685	rs1989924	C	T	807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=4;PP=544;SC=GAAAGAATCTCCTCACTCCCC;SOR=2.753;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=26;WE=113344693;WS=113344675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	113344826	rs1989925	A	G	4686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=72;PP=2712;SC=TACTCCTCAAACCCTGCTCTA;SOR=0.751;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=157;TCF=85;TCR=72;TR=157;WE=113344834;WS=113344816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr4	113344925	rs1989926	C	T	2433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=49;PP=1593;SC=AAAACTTCATCTTTCTTTTCA;SOR=1.477;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=30;TCR=49;TR=79;WE=113344933;WS=113344915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr4	113346714	rs916868	T	C	493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=356;SC=ACGAGATTGTTTCTCAAAATG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=113346722;WS=113346704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	113346996	rs10017209	G	A	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=25;PP=514;ReadPosRankSum=-1.383;SC=CTTTTATCAGGCTAAAATTGT;SOR=0.697;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=60;TCF=18;TCR=42;TR=37;WE=113347004;WS=113346986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,40:0.60:67
chr4	113347496	rs9994944	A	G	1073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=9;PP=820;SC=ATCTAAGCCTAAGTTTTCCTA;SOR=1.949;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=34;WE=113347504;WS=113347486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr4	113347609	rs35182774	C	CT	462.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.73;ReadPosRankSum=-0.554;SOR=0.675;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,36:0.29:124
chr4	113349020	rs4834277	C	G	494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=14;PP=386;SC=AGCACTGTAACAGACACTCAG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=113349028;WS=113349010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
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chr4	113350415	rs11944513	C	T	1512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.435;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=41;PP=971;ReadPosRankSum=1.691;SC=CTGTGGTAAACGAATGCAGCC;SOR=0.854;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=120;TCF=44;TCR=76;TR=63;WE=113350423;WS=113350405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,68:0.50:135
chr4	113350498	rs17444613	C	G	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.532;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=230;ReadPosRankSum=0.441;SC=AAGGTTTAACCTTCAAACAGG;SOR=3.126;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=12;WE=113350506;WS=113350488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr4	113351521	rs1029447	G	T	342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-3.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=184;ReadPosRankSum=-0.413;SC=TCAAATGACTGTCCTCCAGAA;SOR=0.776;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=10;WE=113351529;WS=113351511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr4	113352272	rs34815402	G	A	1644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=30;PP=1052;ReadPosRankSum=-0.944;SC=CCTCCCTAATGGGTAAGAATG;SOR=0.650;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=130;TCF=77;TCR=53;TR=69;WE=113352280;WS=113352262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,78:0.52:151
chr4	113352397	rs2074388	G	A	2191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.692;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=44;PP=1232;ReadPosRankSum=-1.417;SC=TACAGCAATGGTGAGGGAGCT;SOR=0.856;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=189;TCF=97;TCR=92;TR=91;WE=113352405;WS=113352387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,104:0.50:208
chr4	113352628	rs13148353	A	G	2460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.517;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=53;PP=1521;ReadPosRankSum=-0.840;SC=CATTCATTGCATTCACAGCTT;SOR=0.624;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=193;TCF=98;TCR=95;TR=110;WE=113352636;WS=113352618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,117:0.57:205
chr4	113352745	rs35519493	G	A	1772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.073;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=37;PP=1050;ReadPosRankSum=-1.445;SC=AATACCCCAGGCATTTTCTTG;SOR=0.583;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=65;TCR=68;TR=74;WE=113352753;WS=113352735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,81:0.55:146
chr4	113352899	rs2074379	G	A	2440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.748;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=50;PP=1422;ReadPosRankSum=-0.508;SC=CCAAGAATATGGGCACACATC;SOR=0.623;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=179;TCF=95;TCR=84;TR=102;WE=113352907;WS=113352889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,116:0.58:201
chr4	113353285	rs11726117	T	C	1937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.405;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=48;PP=1075;ReadPosRankSum=-1.119;SC=CTCGACAGCATGGATGTTCCC;SOR=0.657;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=163;TCF=85;TCR=78;TR=92;WE=113353293;WS=113353275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,96:0.54:178
chr4	113353842	rs6841595	A	C	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.588;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=169;ReadPosRankSum=-1.679;SC=AAGGTATAGAACCCTGGTATG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=8;WE=113353850;WS=113353832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr4	113356259	rs3815071	C	T	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=229;ReadPosRankSum=-0.057;SC=TGAATTGTAACGTCCTTTTGA;SOR=0.484;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=13;WE=113356267;WS=113356249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
chr4	113359703	rs231247	A	G	4343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=366;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.230;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=96;PP=2832;ReadPosRankSum=0.508;SC=ATGTGGAGCGACAGATGACCG;SOR=0.765;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=337;TCF=167;TCR=170;TR=187;WE=113359711;WS=113359693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,199:0.55:365
chr4	113359801	rs35756863	T	C	1359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.793;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=45;PP=819;ReadPosRankSum=1.204;SC=ACAATACTACTGGTAAGATTA;SOR=1.004;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=152;TCF=59;TCR=93;TR=68;WE=113359809;WS=113359791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,71:0.43:166
chr4	113359883	rs231248	A	T	579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-4.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=397;ReadPosRankSum=0.906;SC=GGTTCCACATAATCAGGCTAG;SOR=0.481;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=19;WE=113359891;WS=113359873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,22:0.63:35
chr4	113436044	rs901474	T	G	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=9;PP=322;ReadPosRankSum=-0.206;SC=CGGCGCTGGCTCCTCCCGGGC;SOR=0.677;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=57;TCF=37;TCR=20;TR=25;WE=113436052;WS=113436034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,26:0.43:60
chr4	113483446	rs6838559	C	A	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.776;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=102;ReadPosRankSum=-0.605;SC=CATTTATATACTGTACTTTTA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=6;WE=113483454;WS=113483439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr4	113502707	rs58897804	T	G	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=59;ReadPosRankSum=-0.191;SC=TACTATTAAATTATACTTTTA;SOR=0.495;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=6;WE=113502715;WS=113502697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr4	113539969	rs7696816	T	C	1615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.574;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=32;PP=976;ReadPosRankSum=0.168;SC=ACTGCTTTCATTGAATGAAGG;SOR=0.640;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=142;TCF=73;TCR=69;TR=66;WE=113539977;WS=113539959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,76:0.47:163
chr4	113545165	rs6853745	T	G	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=53;ReadPosRankSum=-0.335;SC=GAACTTGGATTTGAAAATTCA;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=4;WE=113545173;WS=113545155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr4	113549989	rs12054518	G	A	705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.856;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=18;PP=386;ReadPosRankSum=0.868;SC=ATATCTACAAGATTTTAAAGA;SOR=0.808;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=30;TCR=43;TR=31;WE=113549997;WS=113549979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,35:0.44:80
chr4	113551181	.	GA	G	35.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.890;ClippingRankSum=0.000;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.58;ReadPosRankSum=3.068;SOR=0.656;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,10:0.16:62
chr4	113554385	rs13104310	A	T	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.303;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=71;ReadPosRankSum=1.294;SC=GAAATATTCAACTATTTATAC;SOR=0.446;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=6;WE=113554393;WS=113554375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr4	113565440	rs35051735	C	T	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.041;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=94;ReadPosRankSum=0.974;SC=TGGGGTGGGGCGGGGGCGGGG;SOR=0.569;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=7;WE=113565448;WS=113565430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr4	113568743	rs71597609	A	ATTTTAATTAATTAGT	254.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.435;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.84;MQRankSum=2.610;QD=14.98;ReadPosRankSum=0.423;SOR=1.828;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr4	113569135	rs13136737	G	T	1638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.316;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=36;PP=925;ReadPosRankSum=-0.805;SC=GGGCGTTAACGCAATTGCTGA;SOR=0.813;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=172;TCF=89;TCR=83;TR=74;WE=113569143;WS=113569125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,83:0.43:191
chr4	113570639	rs4513633	C	A	848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=9;PP=481;SC=AGATATTTCCCTATTTACTTT;SOR=1.352;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=29;WE=113570647;WS=113570629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr4	114081411	rs147941643	G	A	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=35;ReadPosRankSum=-1.025;SC=AATAGAGACAGGGTCTCACTA;SOR=0.160;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=5;WE=114081419;WS=114081401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr4	114081490	rs436855	A	G	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.106;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=189;ReadPosRankSum=-0.641;SC=TCAAAGTGCTAGGATTACAGG;SOR=1.050;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=59;TCF=38;TCR=21;TR=21;WE=114081498;WS=114081480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,24:0.33:72
chr4	114117472	rs2285710	C	T	2562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.839;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=15;PP=1796;ReadPosRankSum=-0.969;SC=GATCAGGGCACTATTTTCCTC;SOR=1.045;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=117;TCF=73;TCR=44;TR=45;WE=114117482;WS=114117462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,69:0.45:155
chr4	114117474	rs3214164	A	AT	2553.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.906;HP=5;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=15;PP=1797;ReadPosRankSum=-0.836;SC=TCAGGGCACTATTTTCCTCAT;SOR=1.102;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=74;TCF=28;TCR=46;TR=29;WE=114117482;WS=114117462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,67:0.44:151
chr4	114209691	rs29357	C	T	1294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=30;PP=843;ReadPosRankSum=1.495;SC=AAAGGTTCAGCCATCTGGATG;SOR=0.733;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=48;TCR=66;TR=52;WE=114209699;WS=114209681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,59:0.46:129
chr4	114209732	rs29356	T	C	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=22;PP=495;ReadPosRankSum=-0.329;SC=TACAAGTGTATTTTTTTCTTC;SOR=0.715;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=64;TCF=18;TCR=46;TR=31;WE=114209740;WS=114209722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,34:0.48:71
chr4	114209763	rs29355	T	C	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=327;ReadPosRankSum=-1.992;SC=CTAAAGTGATTTTGACGAGGT;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=18;WE=114209771;WS=114209753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr4	114254454	.	ATG	A	63	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=63;QD=16.5;SC=GTGTGTGTATATGTGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=4;WE=114254463;WS=114254444;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:10,4:0.29:14
chr4	114267023	rs9968405	G	A	6018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=118;NR=75;PP=2965;SC=CAAATCAAATGTGGGTGAAGC;SOR=1.159;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=194;TCF=119;TCR=75;TR=193;WE=114267031;WS=114267013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr4	114286357	.	ATGTG	A,ATG	799.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=0.000;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.11;MQRankSum=0.392;QD=25.80;ReadPosRankSum=0.578;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:1,15,15:0.48,0.48:31
chr4	114309839	rs6533681	C	T	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.279;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=194;ReadPosRankSum=-1.118;SC=ACTTTTCTTCCGGAAAAAATT;SOR=0.976;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=33;TCF=22;TCR=11;TR=16;WE=114309847;WS=114309829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr4	114310106	.	CTGTGTG	C	34.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.79;ReadPosRankSum=-1.111;SOR=0.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,2:0.33:6
chr4	114375410	rs112542962	G	A	39.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr4	114421712	rs17446453	C	T	693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.233;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=12;PP=366;ReadPosRankSum=-0.728;SC=CAATGAATAGCTTGATTTCCT;SOR=0.791;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=64;TCF=32;TCR=32;TR=30;WE=114421720;WS=114421702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,35:0.49:72
chr4	114426077	rs5861139	CA	C	351.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.48;ReadPosRankSum=-0.528;SOR=0.540;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,25:0.53:47
chr4	114426315	rs4834348	G	T	765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.620;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=26;PP=537;ReadPosRankSum=-0.337;SC=AGATGAACGTGAAAGACATGG;SOR=1.136;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=58;TCF=12;TCR=46;TR=31;WE=114426323;WS=114426305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,33:0.54:61
chr4	114429407	rs11098193	C	T	1632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.596;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=36;PP=953;ReadPosRankSum=0.230;SC=TCTGAACACTCGAACTGGACT;SOR=0.621;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=134;TCF=69;TCR=65;TR=73;WE=114429415;WS=114429397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,83:0.54:154
chr4	114458402	rs734348	G	A	728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.996;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=11;PP=372;ReadPosRankSum=1.449;SC=TTAGGATGAAGTTTTCCATTT;SOR=0.936;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=56;TCF=33;TCR=23;TR=30;WE=114458410;WS=114458392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,33:0.55:60
chr4	114530150	rs3764805	T	A	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=51;ReadPosRankSum=1.030;SC=CAATGCTGAGTAGTATCCTCT;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=114530158;WS=114530144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr4	114530230	rs3764806	G	A	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.110;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=7;PP=307;ReadPosRankSum=-1.186;SC=AATTTGGACTGTACAGTGAGA;SOR=0.468;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=50;TCF=37;TCR=13;TR=24;WE=114530238;WS=114530220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,25:0.45:55
chr4	114582860	rs3775975	C	T	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=8;PP=146;ReadPosRankSum=0.208;SC=ATTAAAAATACGTTCTCACCA;SOR=0.723;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=32;TCF=20;TCR=12;TR=15;WE=114582868;WS=114582850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr4	114827812	rs77445993	C	G	2496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.433;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=54;PP=1617;ReadPosRankSum=-0.055;SC=GTTTTGGAATCAAACAGACCT;SOR=0.728;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=258;TCF=138;TCR=120;TR=116;WE=114827820;WS=114827802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,125:0.44:282
chr4	115544713	rs4148254	C	T	2389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.45;ReadPosRankSum=1.443;SOR=0.663;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:142,111:0.44:253
chr4	115544713	.	CA	TG	1462	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=59.92;NF=51;NR=47;PP=1462;QD=15.4639579068;SC=AACCTGCTGCCAGAGAAGTCC;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=232;TCF=123;TCR=109;TR=98;WE=115544722;WS=115544703;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:134,98:0.42:232
chr4	115544714	rs6851610	A	G	8851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.71;SOR=0.766;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr4	115577997	rs34115976	C	G	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=326;ReadPosRankSum=-0.101;SC=CTTCATTTCCCCATATCTACT;SOR=0.824;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=18;WE=115578005;WS=115577987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,24:0.62:39
chr4	115585042	rs56147891	T	C	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=2.722;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=66;ReadPosRankSum=1.227;SC=TACTTTCTAATTGTTTAAGAA;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=5;WE=115585050;WS=115585039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr4	115586696	rs4833463	A	G	247.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=1;PP=118;SC=ATTTGCTGTTACCAAAGCATG;SOR=2.093;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=115586704;WS=115586686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	115589159	rs6831964	C	T	872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=4;PP=656;SC=TACTGTAGTGCCGATTTTTAA;SOR=3.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=29;WE=115589167;WS=115589149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	115589302	rs11098261	A	G	6337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=112;NR=100;PP=2965;SC=TTGAAACTATATATCATGGTG;SOR=0.763;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=212;TCF=112;TCR=100;TR=212;WE=115589310;WS=115589292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr4	115748914	.	A	AT	126	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5002;HP=3;HapScore=4;MGOF=29;MMLQ=27;MQ=59.17;NF=6;NR=0;PP=126;QD=26.0;SC=ATAAAGGTGGATTTATTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=6;WE=115748926;WS=115748904;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr4	115748918	.	A	T	192	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5002;HP=13;HapScore=4;MGOF=29;MMLQ=28;MQ=59.17;NF=5;NR=0;PP=192;QD=45.3542425094;SC=AGGTGGATTTATTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=5;WE=115748926;WS=115748904;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr4	115749005	rs6843860	C	T	490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.616;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=302;ReadPosRankSum=-0.872;SC=GTCTCAGCCACGATGGCAGAG;SOR=1.609;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=53;TCF=37;TCR=16;TR=25;WE=115749013;WS=115748995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,25:0.43:58
chr4	119035837	rs62326125	C	T	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.659;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=105;ReadPosRankSum=0.000;SC=AAGCCTTATACGTAAAACAGA;SOR=0.041;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=9;WE=119035845;WS=119035827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr4	119216142	rs374737501	G	A	1222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.196;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=23;PP=779;ReadPosRankSum=0.237;SC=ACTCAGGAGCGTAGCCCCGCA;SOR=0.772;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=118;TCF=65;TCR=53;TR=52;WE=119216150;WS=119216132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,58:0.43:135
chr4	119217114	rs788665	C	G	2527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=62;PP=1851;SC=ATGTCAAAATCCCTTTTCTCT;SOR=2.698;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=17;TCR=62;TR=79;WE=119217122;WS=119217104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr4	119409225	.	C	T	268	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=44.15;NF=16;NR=0;PP=268;QD=18.9232007842;SC=ATTACCAGACCCCCTCAAGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=47;TCR=7;TR=16;WE=119409233;WS=119409215;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:38,16:0.30:54
chr4	119414256	rs113100030	AAGG	A	592.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=405;SC=TTGGATTGATAAGGAGGAGGG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=9;WE=119414266;WS=119414246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	119414828	rs145087150	G	A	879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.65;QD=32.58;SOR=6.666;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	119428155	.	CT	C	35.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQRankSum=-0.427;QD=1.32;ReadPosRankSum=1.022;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,6:0.22:27
chr4	119434892	rs200608654	G	A	231.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.87;QD=25.75;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	119435061	rs147652632	C	T	1758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.49;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=44;PP=1322;SC=GATAAGGAAACTTCTTTGGTA;SOR=1.066;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=26;TCR=44;TR=70;WE=119435069;WS=119435051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr4	119436130	rs72551018	G	A	1392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.88;QD=27.86;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr4	119436487	rs2728182	T	C	528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.86;QD=33.05;SOR=5.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr4	119444456	rs28720014	G	A	5250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=113;NR=78;PP=2965;SC=AAACATACCCGTCTATGTACT;SOR=0.776;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=191;TCF=113;TCR=78;TR=191;WE=119444464;WS=119444446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr4	119461284	rs60711916	G	T	818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=5;PP=557;SC=AATAACTTCTGTCTAATTATA;SOR=2.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=23;WE=119461292;WS=119461274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	119472425	.	A	G	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=2.739;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.270;NF=0;NR=14;PP=310;ReadPosRankSum=-0.873;SC=TGCTTTTTCAAAAGAAGATAT;SOR=1.051;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=14;WE=119472433;WS=119472415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr4	119475430	rs2787272	G	A	156.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.06;QD=26.14;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr4	119609039	rs9968326	G	A	4540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=49;PP=2879;SC=AGGCTATCCAGTGCATTGCAA;SOR=1.363;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=145;TCF=96;TCR=49;TR=145;WE=119609047;WS=119609029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr4	119609246	rs13130107	A	G	111.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.38;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	119625273	rs298995	G	A	1028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=30;PP=825;SC=CCAAATAACTGTATACTGTTT;SOR=2.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=37;WE=119625281;WS=119625263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr4	119718988	rs11730993	C	T	5117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=101;PP=2965;SC=AAAGGATACACTTAAAACTTG;SOR=1.405;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=64;TCR=101;TR=165;WE=119718996;WS=119718978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr4	119726949	rs2303513	G	A	3477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=36;PP=2215;SC=CTTTAAAAACGGTGAGAAATT;SOR=1.590;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=73;TCR=36;TR=109;WE=119726957;WS=119726939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr4	119736598	rs6843524	C	T	920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=2;PP=636;SC=GCACCCTGTCCGCCTTACCCT;SOR=3.841;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=28;WE=119736606;WS=119736588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr4	119736796	rs2389688	A	C	4577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=76;PP=2612;SC=GCAAAATGGAAGGCTGTGGAG;SOR=0.740;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=159;TCF=83;TCR=76;TR=159;WE=119736804;WS=119736786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr4	119737860	rs3775840	G	A	4685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=34;PP=1782;SC=ATAAATGGCCGACTGTGCTGT;SOR=1.279;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=63;TCR=34;TR=97;WE=119737868;WS=119737850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr4	119737885	rs3775839	T	C	6014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=85;NR=54;PP=2356;SC=ACAGTGGAGCTTTCCATGACT;SOR=1.026;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=140;TCF=86;TCR=54;TR=139;WE=119737893;WS=119737875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr4	119944566	rs138607209	C	CT	2025.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.416;HP=9;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=17;PP=824;ReadPosRankSum=1.208;SC=ACTATGTCTTCTTTTTTTACT;SOR=0.849;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=80;TCF=35;TCR=45;TR=34;WE=119944574;WS=119944556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,82:0.60:137
chr4	119944611	rs1459058	G	T	1671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.636;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=30;PP=848;ReadPosRankSum=1.122;SC=AAGCCTCTGGGTCTGGGCTCT;SOR=0.572;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=186;TCF=109;TCR=77;TR=75;WE=119944619;WS=119944601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,90:0.38:235
chr4	119947961	rs70944826	AAAG	A	5061.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.116;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.622;NF=16;NR=74;PP=2964;ReadPosRankSum=2.951;SC=GCTGAGAACCAAAGAAGTGGT;SOR=0.882;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=200;TCF=33;TCR=167;TR=90;WE=119947971;WS=119947951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,135:0.43:311
chr4	119950975	rs111780874	A	AT	149.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.74;ReadPosRankSum=-2.124;SOR=0.746;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,13:0.32:40
chr4	119951647	rs7698598	A	G	3433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.174;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=67;PP=2270;ReadPosRankSum=0.642;SC=CTTCAGTGGGACATCTGAGAC;SOR=0.510;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=307;TCF=170;TCR=137;TR=145;WE=119951655;WS=119951637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:179,160:0.47:339
chr4	119952955	rs61732241	C	T	2660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.921;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=46;PP=1498;ReadPosRankSum=0.063;SC=TCTTCCTCCCCGGCCAGTGAA;SOR=0.746;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=234;TCF=122;TCR=112;TR=107;WE=119952963;WS=119952945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,123:0.47:262
chr4	120071926	rs6853794	T	C	675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=0;PP=574;SC=TACTTATGATTATGCAATTAG;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=120071934;WS=120071916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr4	120072233	rs6828875	G	C	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.99;ReadPosRankSum=0.028;SOR=0.616;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr4	120072238	rs6828349	A	G	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.44;ReadPosRankSum=-0.241;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr4	120079159	rs11721566	A	G	1156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.797;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=15;PP=621;ReadPosRankSum=-0.116;SC=AGCAGAGTTTACTTTTGATTA;SOR=0.557;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=87;TCF=58;TCR=29;TR=46;WE=120079167;WS=120079149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,53:0.55:97
chr4	120079387	rs11729978	G	A	974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.165;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=28;PP=632;ReadPosRankSum=-0.274;SC=AGCCTTTATTGAATAGTATTT;SOR=0.381;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=100;TCF=28;TCR=72;TR=42;WE=120079395;WS=120079377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,45:0.43:105
chr4	120107098	rs112369914	G	GT	316.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.098;HP=11;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=246;ReadPosRankSum=-0.185;SC=ATTGAGATCTGTTTTTTTTTT;SOR=1.598;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=37;TCF=26;TCR=11;TR=17;WE=120107106;WS=120107088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,17:0.41:41
chr4	120133712	rs6851130	G	A	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=197;ReadPosRankSum=-1.597;SC=AGCCCGCTCCGAGGGGCGGGC;SOR=0.283;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=11;WE=120133720;WS=120133702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr4	120187611	rs11098499	C	T	244.31	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.9992;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=171;ReadPosRankSum=0.385;SC=AGCAGCACTTCGTGTTGGTAT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=8;WE=120187619;WS=120187601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,9:0.90:10
chr4	120194718	rs35610634	G	GT	4068.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=0.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.196;HP=11;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.406;NF=21;NR=65;PP=999;ReadPosRankSum=0.789;SC=AACAAATGTTGTTTTTTTTTA;SOR=0.664;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=107;TCF=25;TCR=82;TR=86;WE=120194726;WS=120194708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:11,164:0.94:175
chr4	120212207	rs35703931	T	TG	96.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=117;ReadPosRankSum=0.393;SC=AGAGATTACCTTTTATAGAAA;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=5;WE=120212215;WS=120212197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
chr4	120212425	rs34076547	AT	A	99.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.80;MQRankSum=2.168;QD=3.99;ReadPosRankSum=-0.408;SOR=0.327;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr4	120214030	rs3749591	T	G	1840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.069;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=37;PP=1075;ReadPosRankSum=-0.614;SC=CGAAGCACAGTTTAAGTACAG;SOR=0.608;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=184;TCF=88;TCR=96;TR=75;WE=120214038;WS=120214020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,90:0.42:213
chr4	120220085	rs111948904	A	AAAAC	1191.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.126;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.190;NF=2;NR=14;PP=760;ReadPosRankSum=-1.834;SC=TCAGGTCATAAAAACACACAC;SOR=0.988;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=16;WE=120220093;WS=120220075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,32:0.63:51
chr4	120423645	rs3733521	T	G	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=3.332;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=70;ReadPosRankSum=0.792;SC=ATTGTGGTCCTAAGGAAAGAT;SOR=2.303;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=6;WE=120423653;WS=120423635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr4	120423691	rs3733522	A	G	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.480;HP=9;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=254;ReadPosRankSum=0.694;SC=ACAATTAAAAAAAAAACAATT;SOR=0.365;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=18;WE=120423699;WS=120423681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr4	120425777	rs3775841	A	C	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=361;ReadPosRankSum=1.636;SC=AAAGAAACCCAAAACTCCTAT;SOR=0.617;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=56;TCF=24;TCR=32;TR=24;WE=120425785;WS=120425767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,27:0.43:63
chr4	120441971	rs3832309	TG	T	230.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=137;ReadPosRankSum=-0.000;SC=ATTATGTAAGTGGCAGCAAAT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=5;WE=120441979;WS=120441961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr4	120446868	rs3832310	GA	G	631.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.90;ReadPosRankSum=-0.582;SOR=0.799;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,34:0.48:71
chr4	120460306	rs1552095	T	C	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.922;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=122;ReadPosRankSum=-0.451;SC=AAATCTTGTTTGCTGTTTTCT;SOR=0.307;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=12;WE=120460314;WS=120460296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr4	120463856	rs2622497	A	C	1976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=43;PP=1336;SC=GACTTTAACAAACACACCCAA;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=18;TCR=43;TR=61;WE=120463864;WS=120463846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr4	120474859	rs11947234	A	G	1411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.869;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=27;PP=766;ReadPosRankSum=-0.150;SC=TATTTTTGACATACTGAGCAT;SOR=0.764;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=83;TCF=43;TCR=40;TR=56;WE=120474867;WS=120474849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,64:0.70:91
chr4	120481431	rs34308924	T	C	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=150;ReadPosRankSum=-0.497;SC=TAAAGACAAGTAGAGAATACG;SOR=0.450;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=18;TCR=10;TR=11;WE=120481439;WS=120481421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
chr4	120486402	rs55825515	A	G	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.195;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.041;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=65;ReadPosRankSum=-1.602;SC=AATCATCTGCATACATTACTT;SOR=0.116;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=8;WE=120486410;WS=120486392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr4	120528327	rs3733526	G	A	3415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=48;PP=1944;SC=TGTTCCAGGGGCACTGTTATC;SOR=0.816;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=103;TCF=54;TCR=49;TR=102;WE=120528335;WS=120528317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr4	120528524	rs10536068	ATCT	A	794.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.143;NF=0;NR=13;PP=480;ReadPosRankSum=-1.052;SC=GCTCCTAAACATCTTCTCATG;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=13;WE=120528534;WS=120528514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,23:0.45:51
chr4	120548074	rs3839163	A	AAAAAC	366.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=209;ReadPosRankSum=-0.148;SC=TCCTTAGGAAAAAAACAAAAC;SOR=0.430;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=5;WE=120548082;WS=120548064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr4	120550059	rs11342908	GC	G	2251.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.229;NF=10;NR=25;PP=696;ReadPosRankSum=-1.508;SC=CAGCTGCTGCGCCCCCCCCAC;SOR=0.245;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=37;TCF=10;TCR=27;TR=35;WE=120550067;WS=120550049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,76:0.99:77
chr4	120550125	rs10639733	A	AGGC	1083.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=29;PP=399;ReadPosRankSum=-0.282;SC=GGTTCCCAGGAGGCGGCGGCG;SOR=0.596;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=38;TCF=9;TCR=29;TR=35;WE=120550133;WS=120550115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,28:0.47:60
chr4	120550141	rs140532689	GGCA	G	1125.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.975;HP=1;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=26;PP=837;ReadPosRankSum=2.001;SC=CGGCGGCGGCGGCAGCGGCAG;SOR=0.968;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=39;TCF=12;TCR=27;TR=32;WE=120550152;WS=120550131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,31:0.50:62
chr4	120550144	rs2953291	A	G	1093.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.64;ReadPosRankSum=-1.755;SOR=0.588;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,30:0.48:62
chr4	120983259	rs2908989	T	C	10146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=362;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=171;NR=146;PP=2965;SC=ATCTGCAACATATAAAAAGGA;SOR=0.785;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=317;TCF=171;TCR=146;TR=317;WE=120983267;WS=120983249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,362:1.00:362
chr4	121631375	.	GAC	G	54.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.28;ReadPosRankSum=-0.071;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,5:0.21:24
chr4	121737767	rs2136998	G	A	857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=23;PP=658;SC=GGAAGAAATGGTGAAGACATA;SOR=2.910;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=29;WE=121737775;WS=121737757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr4	121774515	rs3115310	T	C	1564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.161;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=21;PP=1152;ReadPosRankSum=-1.061;SC=AGTACAGTCATATATTAATTC;SOR=1.072;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=133;TCF=88;TCR=45;TR=71;WE=121774523;WS=121774505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,72:0.51:140
chr4	121828519	rs1901135	C	T	823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=0;PP=699;SC=TAAAACATTTCAATACTTAAA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=29;WE=121828527;WS=121828509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	121957734	rs1397645	T	C	2412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.951;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=57;PP=1202;ReadPosRankSum=-1.980;SC=CCACGGTGGCTGAGGAACAGG;SOR=0.910;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=253;TCF=123;TCR=130;TR=107;WE=121957742;WS=121957724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,125:0.44:284
chr4	121958091	rs3733558	T	G	2539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.441;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=48;PP=1656;ReadPosRankSum=0.414;SC=TCCCATCTTTTAGCTCGACTG;SOR=0.748;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=246;TCF=135;TCR=111;TR=109;WE=121958099;WS=121958081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,119:0.43:278
chr4	121958187	rs3822230	A	G	2832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.728;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=67;PP=1676;ReadPosRankSum=1.057;SC=CCACAAATACATCAAAGTAGT;SOR=0.858;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=282;TCF=139;TCR=143;TR=126;WE=121958195;WS=121958177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,140:0.45:308
chr4	121958697	rs3733560	G	A	2532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.734;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=57;PP=1527;ReadPosRankSum=-0.769;SC=GATATAAACCGGATGGGGAAC;SOR=0.832;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=185;TCF=82;TCR=103;TR=101;WE=121958705;WS=121958687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,114:0.56:204
chr4	121966807	rs2276959	C	T	1263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=24;PP=819;ReadPosRankSum=-1.260;SC=GAGAATACCTCTTAGGTGTAT;SOR=0.656;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=141;TCF=85;TCR=56;TR=58;WE=121966815;WS=121966797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,64:0.42:152
chr4	122137662	rs7663440	T	G	999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=23;PP=641;ReadPosRankSum=0.709;SC=GAATCTAAAATAAAAAAATAT;SOR=0.755;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=117;TCF=65;TCR=52;TR=49;WE=122137670;WS=122137652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,53:0.40:133
chr4	122148787	rs2044970	A	G	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.22;ReadPosRankSum=-0.566;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr4	122250734	rs2302310	A	G	1183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.400;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=32;PP=794;ReadPosRankSum=-0.021;SC=AACTGCAGACAAAACATTTTT;SOR=0.849;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=126;TCF=53;TCR=73;TR=53;WE=122250742;WS=122250724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,57:0.42:135
chr4	122251500	rs56169343	C	T	838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.718;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=409;ReadPosRankSum=0.396;SC=AAGTGAACAGCGACACATTTC;SOR=0.330;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=50;TCF=38;TCR=12;TR=30;WE=122251508;WS=122251490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,37:0.64:58
chr4	122254119	rs33977434	G	A	1673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.508;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=33;PP=911;ReadPosRankSum=0.861;SC=GGATGACAAGGATGAAGGTGG;SOR=0.621;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=185;TCF=88;TCR=97;TR=70;WE=122254127;WS=122254109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,85:0.39:220
chr4	122255895	rs56351803	A	G	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=112;ReadPosRankSum=2.002;SC=TCACTTGAAAATTGATAAATA;SOR=0.512;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=7;WE=122255903;WS=122255885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr4	122257942	rs4558890	A	C	4191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=81;NR=51;PP=2359;SC=ATATGATTATACATCTCAACT;SOR=1.106;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=132;TCF=81;TCR=51;TR=132;WE=122257950;WS=122257932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr4	122258063	rs4490481	A	G	5482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=85;PP=2965;SC=GACTCAGTTGAGTAAAACACA;SOR=0.830;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=171;TCF=86;TCR=85;TR=171;WE=122258071;WS=122258053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr4	122261475	rs2276957	T	C	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.681;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=96;ReadPosRankSum=0.576;SC=GGGAAAGCACTGAAACTCTCA;SOR=0.129;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=10;WE=122261483;WS=122261465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr4	122261874	rs13104309	G	A	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.946;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=254;ReadPosRankSum=1.465;SC=CTGCCAAAAAGTTTGATAATT;SOR=1.356;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=15;WE=122261882;WS=122261864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr4	122301351	rs111833066	A	G	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.63;MQRankSum=1.164;QD=7.79;ReadPosRankSum=-0.347;SOR=0.716;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,20:0.44:45
chr4	122301622	rs17438900	A	C	2497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.054;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=63;PP=1416;ReadPosRankSum=-1.600;SC=GCATTGCCAAAGAGCGCCAGG;SOR=0.785;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=202;TCF=88;TCR=114;TR=108;WE=122301630;WS=122301612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,120:0.55:220
chr4	122590883	.	TA	T	87.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=0.000;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=4.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.25;ReadPosRankSum=1.988;SOR=0.193;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr4	122617631	rs2306415	C	G	1040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.714;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=21;PP=685;ReadPosRankSum=1.951;SC=AGCAGGTTCCCTTTCCTCCTA;SOR=0.951;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=185;TCF=115;TCR=70;TR=61;WE=122617639;WS=122617621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,63:0.31:200
chr4	122617654	rs72678604	C	T	1254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.237;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=25;PP=825;ReadPosRankSum=-0.385;SC=CTTTTTGGCTCTCAGACAAAT;SOR=0.953;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=209;TCF=122;TCR=87;TR=67;WE=122617662;WS=122617644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,72:0.31:230
chr4	122617688	rs2306416	T	C	1769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.200;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=36;PP=1135;ReadPosRankSum=-2.138;SC=CGTCGCAGCATACAAAGTTGT;SOR=0.867;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=233;TCF=126;TCR=107;TR=87;WE=122617696;WS=122617678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,95:0.38:251
chr4	122617718	rs2306417	G	C	1983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.821;HP=5;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=45;PP=989;ReadPosRankSum=1.706;SC=CAGCGCAGTGGGGGGCGCACG;SOR=0.574;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=229;TCF=113;TCR=116;TR=97;WE=122617726;WS=122617708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,105:0.42:248
chr4	122617745	rs1131239	G	A	2122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.638;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.99;MQRankSum=0.978;NF=48;NR=48;PP=1220;ReadPosRankSum=1.114;SC=CCTGTGCCATGGCGACTACTC;SOR=0.584;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=202;TCF=96;TCR=106;TR=96;WE=122617753;WS=122617735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,106:0.48:219
chr4	122681373	rs4342205	T	C	1033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.971;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=12;PP=572;ReadPosRankSum=0.628;SC=AGATCCACCATCATCTTCTTC;SOR=0.555;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=69;TCF=50;TCR=19;TR=42;WE=122681381;WS=122681363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,46:0.61:76
chr4	122682720	rs138330999	C	T	3589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=362;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.109;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=63;PP=2107;ReadPosRankSum=1.456;SC=CCCCTGCAAGCGAACCAAAAA;SOR=0.979;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=331;TCF=186;TCR=145;TR=158;WE=122682728;WS=122682710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,175:0.49:360
chr4	122683007	rs4370153	G	A	1342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.503;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=39;PP=938;ReadPosRankSum=-1.279;SC=TAGTGCAACAGCCAAGATTGT;SOR=0.547;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=42;TCR=72;TR=62;WE=122683015;WS=122682997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,62:0.51:122
chr4	122723106	rs67772833	G	A	1536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.587;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=42;PP=1073;ReadPosRankSum=0.266;SC=ATACACATTCGGAAGGGAGAA;SOR=0.551;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=107;TCF=35;TCR=72;TR=63;WE=122723114;WS=122723096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,66:0.55:119
chr4	122732899	rs4295291	A	G	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.207;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=51;ReadPosRankSum=0.473;SC=TTTTAGTATAAGCAAGCTTTA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=4;WE=122732907;WS=122732889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr4	122735225	rs141260260	C	CTTA	299.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.674;NF=0;NR=8;PP=322;ReadPosRankSum=1.912;SC=TTATGGCACACTTACTATATA;SOR=0.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=8;WE=122735233;WS=122735215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr4	122737278	rs3217780	T	C	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.360;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=23;ReadPosRankSum=-2.195;SC=GCCTGGCTAATTTTTCTATTA;SOR=1.179;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=4;WE=122737286;WS=122737268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr4	122739121	rs3217773	A	G	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=179;ReadPosRankSum=-0.053;SC=TGGCAGATTCATGAATAAGGT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=11;WE=122739129;WS=122739111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr4	122740162	rs2071486	C	T	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=162;ReadPosRankSum=-0.260;SC=CCTTTGATAACGGCTCTGTAG;SOR=0.793;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=9;WE=122740170;WS=122740152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr4	122740454	rs1396080	T	G	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=3.087;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=148;ReadPosRankSum=2.287;SC=CTAGGTTCCTTTACAAAGGAA;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=7;WE=122740462;WS=122740444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr4	122742217	rs769242	T	C	2620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.131;NF=50;NR=47;PP=1422;ReadPosRankSum=0.155;SC=TCTTCTAATATAATTGACATG;SOR=0.714;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=188;TCF=96;TCR=92;TR=97;WE=122742225;WS=122742207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,117:0.56:210
chr4	122749436	rs2706793	G	T	1611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.378;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=23;PP=1028;ReadPosRankSum=-0.937;SC=TATTTAAAATGAAAAACAGAA;SOR=0.933;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=109;TCF=65;TCR=44;TR=62;WE=122749444;WS=122749426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,68:0.57:119
chr4	122749541	rs1507994	C	T	3134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.187;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=67;PP=1862;ReadPosRankSum=0.204;SC=CAGTCCACGACGACACATGTA;SOR=0.549;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=258;TCF=141;TCR=117;TR=133;WE=122749549;WS=122749531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,150:0.52:291
chr4	122754323	rs114900933	G	A	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.335;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=162;ReadPosRankSum=0.471;SC=TAACTTAAAGGAAAACTTAGA;SOR=0.593;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=9;WE=122754331;WS=122754313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr4	122769967	rs6824258	T	C	1416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.737;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=17;PP=907;ReadPosRankSum=-2.278;SC=TTGTTGACTCTTTCTTCAATT;SOR=0.813;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=107;TCF=75;TCR=32;TR=58;WE=122769975;WS=122769957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,64:0.53:120
chr4	122782879	rs56159666	G	A	1046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=30;PP=689;ReadPosRankSum=-0.158;SC=TTACTTTATTGTGAGCATTTT;SOR=0.663;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=86;TCF=30;TCR=56;TR=46;WE=122782887;WS=122782869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,50:0.48:104
chr4	122872719	rs1396082	G	A	1351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.075;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=20;PP=595;ReadPosRankSum=-0.207;SC=CGCCCCTCCAGCCCCGGCGGC;SOR=0.387;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=78;TCF=50;TCR=28;TR=52;WE=122872727;WS=122872709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,61:0.68:90
chr4	123108762	rs7670081	G	A	422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=10;PP=238;SC=AAATTAAATAGTTTTGTGGAG;SOR=3.126;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=123108770;WS=123108752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	123113352	rs72687029	A	G	650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=374;ReadPosRankSum=0.022;SC=ATTTTAAATAACTGCCTTTAT;SOR=0.375;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=56;TCF=44;TCR=12;TR=24;WE=123113360;WS=123113342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,29:0.45:64
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chr4	123175900	rs66570627	G	A	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.038;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=195;ReadPosRankSum=-0.066;SC=AGGTATGGGAGATTGTTTGGA;SOR=0.211;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=13;WE=123175908;WS=123175890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr4	123184827	rs45515895	G	A	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.150;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=269;ReadPosRankSum=-0.096;SC=TTTTTCAGGGGATGGGTTAAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=12;WE=123184835;WS=123184817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr4	123185682	rs7664976	C	A	278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=3;NR=6;PP=130;SC=TCTAGTGAGGCTATACCTTAC;SOR=1.802;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=123185690;WS=123185672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	123277226	rs34791626	G	GT	392.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=453;ReadPosRankSum=0.358;SC=TGGATTTTTTGTAATACTAAT;SOR=0.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=12;WE=123277234;WS=123277216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr4	123280860	rs1127348	T	C	1117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.756;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=25;PP=598;ReadPosRankSum=-1.856;SC=ATACATGGCATCTAGAACCTA;SOR=0.965;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=76;TCF=34;TCR=42;TR=42;WE=123280868;WS=123280850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,52:0.57:92
chr4	123283163	rs33976078	AAT	A	732.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.050;NF=13;NR=3;PP=641;ReadPosRankSum=0.155;SC=ACTCCTTAATAATAACTGTAA;SOR=1.012;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=16;WE=123283172;WS=123283153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr4	123374819	rs368686382	CT	C	402.50	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=3.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.91;ReadPosRankSum=-0.203;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,23:0.85:27
chr4	123377482	rs2069763	C	A	1257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=17;PP=812;ReadPosRankSum=-0.892;SC=GTAAATCCAGCAGTAAATGCT;SOR=0.628;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=92;TCF=61;TCR=31;TR=52;WE=123377490;WS=123377472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,56:0.57:98
chr4	123536963	rs4833837	G	A	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.376;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=8;PP=170;ReadPosRankSum=0.809;SC=CCTTCTGAAAGCAGGAAAAAG;SOR=0.392;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=51;TCF=22;TCR=29;TR=17;WE=123536971;WS=123536953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,19:0.31:61
chr4	123662997	rs309368	A	T	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.559;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=7;PP=396;ReadPosRankSum=-1.031;SC=ATAACTATGAATTATACTGAA;SOR=1.292;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=94;TCF=66;TCR=28;TR=29;WE=123663005;WS=123662987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,30:0.29:102
chr4	123664204	rs309370	G	A	3074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=4.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.252;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=54;PP=1956;ReadPosRankSum=-1.756;SC=GATAGCATGCGGCTTCAAGAA;SOR=1.042;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=310;TCF=172;TCR=138;TR=134;WE=123664212;WS=123664194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:191,149:0.44:340
chr4	123664427	rs13135766	G	C	2264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.491;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=50;PP=1547;ReadPosRankSum=0.655;SC=TTACACAAGTGAATGAAGATT;SOR=0.716;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=206;TCF=102;TCR=104;TR=97;WE=123664435;WS=123664417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,104:0.47:221
chr4	123664446	rs13135778	G	A	2521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.476;HP=1;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=50;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.221;SC=TTGTGTGGGCGACGGGGTCTG;SOR=0.748;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=220;TCF=115;TCR=105;TR=108;WE=123664465;WS=123664436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,116:0.49:235
chr4	123664457	rs13135445	C	T	2563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=54;PP=2962;ReadPosRankSum=0.804;SC=ACGGGGTCTGCGTGACCTTCT;SOR=0.679;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=248;TCF=131;TCR=117;TR=116;WE=123664465;WS=123664436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,123:0.47:264
chr4	123664919	rs13102440	A	G	2106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.078;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=41;PP=1329;ReadPosRankSum=1.156;SC=ATCATCTGCAAAATGCCACAG;SOR=0.783;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=181;TCF=94;TCR=87;TR=86;WE=123664927;WS=123664909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,97:0.48:204
chr4	123748086	rs1449683	C	T	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=8;PP=146;ReadPosRankSum=-1.533;SC=GACACCCATCCGTGAACCCCA;SOR=0.693;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=29;TCF=14;TCR=15;TR=15;WE=123748094;WS=123748076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr4	123748616	rs2922979	C	G	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.134;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=10;PP=178;ReadPosRankSum=0.553;SC=GACCCTAGCGCTCCGTGTGGT;SOR=0.490;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=40;TCF=18;TCR=22;TR=19;WE=123748624;WS=123748606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,23:0.49:47
chr4	123814308	rs1048201	C	T	2092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.952;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=52;PP=1327;ReadPosRankSum=1.332;SC=GTGCTGTTGCCGAATACTCAG;SOR=0.632;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=244;TCF=119;TCR=125;TR=103;WE=123814316;WS=123814298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,106:0.40:265
chr4	123833918	rs55691042	T	C	736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.347;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=528;ReadPosRankSum=0.492;SC=GTATTCCTTATCTAAAATGTT;SOR=1.071;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=46;TCF=12;TCR=34;TR=29;WE=123833926;WS=123833908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,30:0.64:47
chr4	123838758	rs12648093	A	G	4361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=63;PP=2473;SC=TGGTGAAAGCAGAAGCCCAGG;SOR=0.705;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=139;TCF=76;TCR=63;TR=139;WE=123838766;WS=123838748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr4	123843716	rs13134412	T	C	2274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=55;PP=1311;SC=CCCAGCTCAGTGGCTGCCGCA;SOR=2.387;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=16;TCR=55;TR=71;WE=123843724;WS=123843706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr4	123854495	rs1563706	T	C	531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=1;PP=441;SC=ATTCTTTTGATTAAGTCTATA;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=123854503;WS=123854485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	123855553	rs17006342	G	T	2645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.830;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=48;PP=1624;ReadPosRankSum=-0.402;SC=ATGTTTTGCTGGATGTTACAC;SOR=0.889;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=220;TCF=118;TCR=102;TR=110;WE=123855561;WS=123855543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,121:0.50:243
chr4	123868279	rs11098682	G	T	747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=0;PP=599;SC=GGACTTAGTAGCCTGGACAGT;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=123868287;WS=123868272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	123949267	rs7665828	T	C	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=216;ReadPosRankSum=0.690;SC=CTGTTAATGATATGTTTTTTA;SOR=0.876;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=13;WE=123949275;WS=123949257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr4	123949556	rs1472949	G	A	2194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=47;PP=1430;SC=TAAAGGTAGGGTGTTAAATTT;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=25;TCR=47;TR=72;WE=123949564;WS=123949546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr4	123977748	rs62322468	T	A	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=1.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.29;ReadPosRankSum=-1.600;SOR=0.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,22:0.47:47
chr4	126237971	rs72928772	C	T	2791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.496;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=59;PP=1790;ReadPosRankSum=0.226;SC=CCCCCGTTTTCCCGGACCCCT;SOR=0.620;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=229;TCF=119;TCR=110;TR=121;WE=126237979;WS=126237961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,131:0.51:257
chr4	126238305	rs191329848	C	A	4211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=391;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.366;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=94;PP=2507;ReadPosRankSum=-2.369;SC=TAATGACAACCCCCCGGTTTT;SOR=0.732;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=352;TCF=183;TCR=169;TR=190;WE=126238313;WS=126238295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:184,206:0.53:390
chr4	126238924	rs6847454	A	T	4693.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=2.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=427;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=100;NR=94;PP=2847;ReadPosRankSum=0.266;SC=GCAGCAGTCCAGGCGCGCTCT;SOR=0.714;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=376;TCF=196;TCR=180;TR=194;WE=126238932;WS=126238914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:202,218:0.52:420
chr4	126239986	rs1039808	C	T	2977.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.006;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=67;PP=1941;ReadPosRankSum=-0.441;SC=GAGAACGTGGCGCTGGGATAT;SOR=0.829;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=251;TCF=125;TCR=126;TR=129;WE=126239994;WS=126239976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,139:0.51:275
chr4	126240510	rs2940779	T	C	2688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=51;PP=1688;ReadPosRankSum=1.135;SC=TAGTGTCATCTTAACAGTTTA;SOR=0.707;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=260;TCF=139;TCR=121;TR=111;WE=126240518;WS=126240500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,130:0.43:300
chr4	126241871	rs2710555	C	T	3804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=403;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=83;PP=2247;ReadPosRankSum=0.855;SC=ACATTCCCATCGGTACATCTG;SOR=0.686;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=359;TCF=177;TCR=182;TR=167;WE=126241879;WS=126241861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:217,185:0.46:402
chr4	126315034	rs925243	T	C	3454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=43;PP=2279;SC=ACCAGAGTTTTACTGCTCAGG;SOR=1.197;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=73;TCR=43;TR=116;WE=126315042;WS=126315024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr4	126315282	rs925242	A	G	252.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=7;PP=164;SC=TGCAGAAAACATGGAAGTGCC;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=126315290;WS=126315272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	126329789	rs958415	T	C	2921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=47;PP=1749;SC=GAGCAGAAGATGGTGGGGGAC;SOR=0.811;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=48;TCR=47;TR=95;WE=126329797;WS=126329779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr4	126335978	rs4605670	G	C	1115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=26;NR=9;PP=657;SC=AAAAGTTTTGGTATAGCTTGT;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=35;WE=126335986;WS=126335968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr4	126336025	rs190218898	C	T	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.855;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=9;PP=427;ReadPosRankSum=-0.528;SC=ATTTTTTCTTCCCTTTAATTT;SOR=0.931;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=80;TCF=53;TCR=27;TR=30;WE=126336033;WS=126336015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,33:0.38:87
chr4	126336990	rs10010000	G	T	1238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=33;PP=979;SC=AGCAAGTATTGTCTTAATTAT;SOR=4.461;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=36;WE=126336998;WS=126336980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr4	126337555	rs7675556	A	G	1712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=5;PP=1354;SC=TTATTTCATGAGATGCATTGT;SOR=4.294;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=48;TCR=5;TR=53;WE=126337563;WS=126337545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr4	126355609	rs7656135	T	G	2402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=54;PP=1476;SC=GTAAAGTTTGTCTGTTTTCTC;SOR=2.503;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=19;TCR=54;TR=73;WE=126355617;WS=126355599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr4	126369554	rs115240175	C	T	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.890;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=172;ReadPosRankSum=-0.110;SC=ATGCACTTATCTGCTACCAAA;SOR=0.241;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=13;WE=126369562;WS=126369544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,14:0.36:39
chr4	126369872	rs988863	G	C	10238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=369;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=166;NR=167;PP=2965;SC=TCCCTAAAGTGAGAGCCAAAG;SOR=0.726;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=334;TCF=167;TCR=167;TR=333;WE=126369880;WS=126369862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,368:1.00:368
chr4	126373570	rs75380987	C	T	2018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.523;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=40;PP=1381;ReadPosRankSum=-1.246;SC=AAGGTGGAATCTGTGGATCAT;SOR=0.741;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=179;TCF=95;TCR=84;TR=86;WE=126373578;WS=126373560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,94:0.48:194
chr4	126373789	rs12650153	G	A	4331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=55;PP=2582;SC=CCTTGCCACAGTGGTGGAACC;SOR=0.818;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=75;TCR=55;TR=130;WE=126373797;WS=126373779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr4	126389627	rs6814158	A	G	2931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=34;PP=1656;SC=TAAAATTTTCATGAAATTTTA;SOR=1.356;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=68;TCR=34;TR=102;WE=126389635;WS=126389617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr4	126390010	rs35304021	A	G	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.016;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=25;ReadPosRankSum=-2.450;SC=TGTATATCCAACTGGATCTTC;SOR=0.078;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=4;WE=126390018;WS=126390000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr4	126397321	rs17009761	C	T	2658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.497;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=64;PP=1607;ReadPosRankSum=-1.780;SC=TCTCTTGCTTCGTAGGCAGCC;SOR=0.767;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=204;TCF=97;TCR=107;TR=117;WE=126397329;WS=126397311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,128:0.57:223
chr4	126400825	rs1506361	G	T	1256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=14;PP=943;SC=TAATAAAAGTGTATATTGAGT;SOR=1.714;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=31;TCR=14;TR=45;WE=126400833;WS=126400815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr4	126402890	rs6824160	G	A	1568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.241;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=30;PP=695;ReadPosRankSum=-0.225;SC=ACACTACTGTGAAGGTGAGAT;SOR=0.937;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=112;TCF=44;TCR=68;TR=49;WE=126402898;WS=126402880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,69:0.50:139
chr4	126402921	rs11098815	T	G	1124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=0.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.201;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=31;PP=723;ReadPosRankSum=-1.442;SC=GGTGACTTCATTTGATTAGAC;SOR=1.427;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=70;TCF=22;TCR=48;TR=42;WE=126402929;WS=126402911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,48:0.56:85
chr4	126408586	rs17009825	C	T	2931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.805;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=61;PP=1711;ReadPosRankSum=0.175;SC=ATGTTGCAGACGGCCACTGGC;SOR=0.803;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=295;TCF=159;TCR=136;TR=136;WE=126408594;WS=126408576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,151:0.45:334
chr4	126412575	rs1014866	A	G	5186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=66;PP=2965;SC=ATACTTCCAGAATGCCCAAAT;SOR=0.904;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=161;TCF=95;TCR=66;TR=161;WE=126412583;WS=126412565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr4	128544514	rs12650360	C	G	1936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=26;PP=1146;SC=GGGCTGGGACCTGGGTGACCT;SOR=1.121;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=44;TCR=26;TR=70;WE=128544522;WS=128544504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr4	128544696	rs4834207	A	G	5256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=85;PP=2965;SC=CTTGCCCCGGAAATGTTGGCG;SOR=0.812;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=175;TCF=89;TCR=86;TR=174;WE=128544704;WS=128544686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr4	128554404	rs2255457	G	A	2138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=48;PP=1421;SC=TGGGCTGGGGGAACTGCAAGG;SOR=1.281;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=29;TCR=48;TR=77;WE=128554412;WS=128554394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr4	128565000	rs3749507	A	G	7689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=144;NR=124;PP=2965;SC=TCCAACAGCGATACAAAGATG;SOR=0.721;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=268;TCF=144;TCR=124;TR=268;WE=128565008;WS=128564990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,294:1.00:294
chr4	128584580	rs4833380	G	A	2356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=31;PP=1500;SC=AAAGGGAGACGTCCCATCCAA;SOR=1.192;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=50;TCR=31;TR=81;WE=128584588;WS=128584570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr4	128621272	rs12331481	A	C	896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.24;SOR=1.121;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr4	128627050	rs7683627	C	T	667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=19;PP=504;SC=AGGGATGCAGCGGTAGGTAGG;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=128627058;WS=128627040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	128635022	rs34240473	C	T	341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=1;PP=323;SC=ATTCAGATTACTCTGTGAAAA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=128635030;WS=128635012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	128665981	rs769293	T	C	594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=7;NR=16;PP=399;SC=TTTACTTTTTTCTTCCAATAT;SOR=1.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=23;WE=128665989;WS=128665971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	128689936	rs2305958	A	G	3333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=73;NR=43;PP=1890;SC=AGAAAACTCCATTTCTTGTCT;SOR=1.044;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=73;TCR=43;TR=116;WE=128689944;WS=128689926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr4	128723042	rs1380154	T	C	3741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=65;NR=61;PP=1789;SC=TATCAGGTCTTGGTTTGTGCT;SOR=0.764;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=65;TCR=61;TR=126;WE=128723050;WS=128723032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr4	128803159	rs3811741	G	A	360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=270;SC=GAAACTCCTTGTCTACTAGCC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=128803167;WS=128803149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	128807219	rs3811740	T	A	5684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=88;PP=2965;SC=TGAAATGCCATCTTTTTTGTC;SOR=0.763;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=179;TCF=91;TCR=88;TR=179;WE=128807227;WS=128807209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr4	128814964	rs17012739	G	T	8145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=139;NR=120;PP=2965;SC=CAACGAGAGAGAGAGCATCTT;SOR=0.713;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=259;TCF=139;TCR=120;TR=259;WE=128814972;WS=128814954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,303:1.00:303
chr4	128923001	rs35200534	GT	G	251.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.98;ReadPosRankSum=1.592;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
chr4	128930847	rs74956857	G	C	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=149;ReadPosRankSum=0.000;SC=AGGCTGCTTTGAAATGGGCAC;SOR=0.784;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=10;WE=128930855;WS=128930837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr4	128995989	rs6534661	A	G	846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=4;PP=594;SC=CTGAATATAAATGATTATTTA;SOR=2.468;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=25;WE=128995997;WS=128995979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr4	128996230	rs78710408	A	G	385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=7;PP=191;SC=TTTACTTAAAATGTAAAGAAT;SOR=1.473;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=128996238;WS=128996220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	128996298	rs12642346	C	T	71.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=17.76;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	129012181	rs2306054	G	A	3009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=40;PP=1721;SC=GAGAAAAAAGGGATGATCAAG;SOR=0.846;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=55;TCR=40;TR=95;WE=129012189;WS=129012171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr4	129012638	rs1064205	A	G	2225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=38;PP=1215;SC=TGGAAGAAGCATTGCTTAAAG;SOR=0.922;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=39;TCR=38;TR=77;WE=129012646;WS=129012628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr4	129028679	rs11098950	T	C	91.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=7;PP=135;SC=AGCTGTCTTATGTTTCTTGTT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=129028687;WS=129028669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	129029009	rs34678812	G	GA	5006.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=34;PP=2335;SC=TCCCTCTTGGGAAAAAATGTG;SOR=1.413;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=88;TCF=46;TCR=42;TR=76;WE=129029022;WS=129028999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr4	129043204	rs12508837	C	G	1555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=15;PP=1066;SC=AAAAAACATCCTGGAGGAGAT;SOR=1.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=40;TCR=15;TR=55;WE=129043212;WS=129043194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr4	129043286	rs3733320	C	T	3898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=61;PP=2459;SC=ATGGCTTATACTATTATGAAC;SOR=0.707;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=130;TCF=69;TCR=61;TR=130;WE=129043294;WS=129043276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr4	129043601	rs3832282	T	TG	4397.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.67;QD=45.81;SOR=1.735;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr4	129043614	rs3733321	G	T	5821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.34;QD=45.48;SOR=1.317;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr4	129043617	rs3733322	T	G	5887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.28;QD=43.94;SOR=1.376;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr4	129043809	rs12509092	G	A	2017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=49;PP=1298;SC=AGTCTATGGTGCATGATCTAA;SOR=2.617;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=15;TCR=49;TR=64;WE=129043817;WS=129043799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr4	129100643	rs12645577	G	A	6557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=124;PP=2965;SC=TCCAGAGACCGTGGGCCAGGA;SOR=1.049;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=220;TCF=96;TCR=124;TR=220;WE=129100651;WS=129100633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
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chr4	129873636	rs72683673	A	G	1975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.341;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=46;PP=1229;ReadPosRankSum=1.296;SC=TTTCCCAGATAAACTCAGCAT;SOR=0.941;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=168;TCF=74;TCR=94;TR=79;WE=129873644;WS=129873626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,90:0.48:189
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chr4	129924977	rs3113487	C	A	7528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=136;NR=114;PP=2965;SC=CCTCTGTGCCCAGGGGAAAGG;SOR=0.815;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=250;TCF=136;TCR=114;TR=250;WE=129924985;WS=129924967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,276:1.00:276
chr4	129961179	rs3113489	A	G	842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=3;PP=488;SC=GTGCTTCCTAAGCTAAAGGAG;SOR=2.468;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=129961187;WS=129961169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr4	129965026	rs1450727	T	C	66.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5040;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=43;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TCTTGTCAATTCAAGAACAAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=3;WE=129965034;WS=129965016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr4	130023759	rs1757935	A	T	3502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=40;PP=2231;SC=TCTTTTAGAGACTTCAGATGG;SOR=1.306;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=119;TCF=79;TCR=40;TR=119;WE=130023767;WS=130023749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr4	130027782	rs116359595	T	C	1077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=29;PP=675;ReadPosRankSum=-0.297;SC=CTGAGCAATATTTAGAAGTTG;SOR=0.677;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=117;TCF=57;TCR=60;TR=57;WE=130027790;WS=130027772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,58:0.47:123
chr4	130030652	rs337277	A	G	5223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=90;NR=81;PP=2925;SC=ATCGTTCAGAATGTCCAGAGG;SOR=0.767;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=171;TCF=90;TCR=81;TR=171;WE=130030660;WS=130030642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr4	133357204	rs17494286	A	C	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=146;ReadPosRankSum=-0.503;SC=CTGCAACTTAAGTGATCCTCA;SOR=0.719;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=12;WE=133357212;WS=133357194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr4	133367588	rs1827132	T	C	2051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=32;PP=1005;SC=AGTCCTGAATTGCAGGTGCCA;SOR=0.718;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=39;TCR=32;TR=71;WE=133367596;WS=133367578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr4	133367655	rs1827133	G	A	776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=16;PP=378;ReadPosRankSum=1.351;SC=TGGGCACTGGGGGAAGGAGAA;SOR=0.681;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=54;TCF=26;TCR=28;TR=31;WE=133367663;WS=133367645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,36:0.59:61
chr4	133368361	rs70948202	T	TC	648.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=508;SC=TGGGTAAGGCTTGAGACTTGC;SOR=3.383;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=13;WE=133368369;WS=133368351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	134074058	rs3749589	A	G	743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=5;NR=17;PP=517;SC=TTGTGGGAGCAGAGATGGGCG;SOR=2.215;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=22;WE=134074066;WS=134074048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	134076285	rs2271172	C	G	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=2.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.74;ReadPosRankSum=-2.212;SOR=0.211;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr4	134084449	rs145558488	A	G	806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.961;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=20;PP=474;ReadPosRankSum=0.626;SC=TAAGTATTACACAAAGGGCTC;SOR=0.572;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=58;TCF=23;TCR=35;TR=34;WE=134084457;WS=134084439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,37:0.58:64
chr4	134085208	rs4461537	C	T	1101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.262;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=27;PP=614;ReadPosRankSum=1.990;SC=ATTGTAGTGACAACAATAGGT;SOR=1.132;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=113;TCF=56;TCR=57;TR=47;WE=134085216;WS=134085198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,56:0.41:136
chr4	135121066	rs11099273	T	G	1843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=21;PP=1106;SC=TCTTTCCTAGTGTCTCTGGGC;SOR=1.127;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=37;TCR=21;TR=58;WE=135121074;WS=135121056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr4	135121368	rs2044116	G	T	7809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=133;NR=133;PP=2965;SC=CCTGTCGCTCGACTTTCTTTT;SOR=0.841;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=266;TCF=133;TCR=133;TR=266;WE=135121376;WS=135121358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,288:1.00:288
chr4	135121601	rs10009368	C	T	7606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=132;NR=114;PP=2965;SC=TTTATGTAAACATTGGTGAAT;SOR=0.700;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=247;TCF=132;TCR=115;TR=246;WE=135121609;WS=135121591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,281:1.00:281
chr4	138449683	rs10018837	A	G	10756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=400;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=190;NR=170;PP=2965;SC=CCTTCACCCAACAGCCTATCT;SOR=0.803;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=361;TCF=191;TCR=170;TR=360;WE=138449704;WS=138449673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,399:1.00:399
chr4	138449812	rs10006580	C	G	6211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=106;PP=2965;SC=AGATAAATCACAAAAAAAAAT;SOR=0.846;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=203;TCF=96;TCR=107;TR=202;WE=138449820;WS=138449802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr4	138453529	rs78432334	T	C	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=441;ReadPosRankSum=-0.614;SC=GTAGTCGGAATCCATCTATTG;SOR=0.437;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=21;WE=138453537;WS=138453519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,21:0.72:29
chr4	139093228	rs4504306	T	C	513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=15;PP=435;SC=GCATTAAAAATAGCAAAATAT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=139093236;WS=139093218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	139100372	rs4479754	C	T	735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=2;PP=492;SC=AATTCTTACCCGACATTATTC;SOR=3.442;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=139100380;WS=139100362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	139103366	rs10016559	A	G	834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=4;PP=534;SC=AGAAAGTAAAATACTATCTAA;SOR=3.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=23;WE=139103374;WS=139103356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	139104415	rs35701885	C	T	3424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.332;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=71;PP=2231;ReadPosRankSum=1.046;SC=CAACAAAGATCGGAACTGCTA;SOR=0.471;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=274;TCF=129;TCR=145;TR=146;WE=139104423;WS=139104405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,157:0.53:295
chr4	139140388	rs10025342	G	A	7690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=147;NR=103;PP=2965;SC=AATGAACTACGCAAACCACCA;SOR=0.956;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=250;TCF=147;TCR=103;TR=250;WE=139140396;WS=139140378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,288:1.00:288
chr4	139937071	rs3749515	C	T	287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.98;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	139965724	rs3805213	C	T	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.398;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=142;ReadPosRankSum=-0.104;SC=TGAGTGATGCCAAACCTCCTG;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=9;WE=139965732;WS=139965714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr4	139994863	rs17050688	T	C	128.90	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5267;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=95;ReadPosRankSum=1.383;SC=CTCTAAGCCATTGATATCTAT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=5;WE=139994871;WS=139994853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr4	140005294	rs4863628	A	G	10343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=400;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=189;NR=167;PP=2965;ReadPosRankSum=-2.156;SC=TACCGGCCCGAATGAGCAGAT;SOR=0.821;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=359;TCF=191;TCR=168;TR=356;WE=140005302;WS=140005284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,396:0.99:398
chr4	140039162	rs34114214	CAACT	C	949.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.050;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.277;NF=3;NR=14;PP=631;ReadPosRankSum=1.254;SC=TGATGGATACCAACTGTGATT;SOR=0.854;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=17;WE=140039173;WS=140039152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,27:0.39:69
chr4	140058672	.	T	C	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.235;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=111;ReadPosRankSum=-1.318;SC=ACATGTATAATTTCATGCTTT;SOR=0.512;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=7;WE=140058680;WS=140058662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr4	140216412	rs6816703	C	T	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.576;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=251;ReadPosRankSum=1.115;SC=TCCCCCATCTCCCACTTAAAC;SOR=3.150;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=12;WE=140216420;WS=140216402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr4	140217010	rs71606834	G	C	2681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=62;PP=1616;ReadPosRankSum=-0.484;SC=CCACCTGGCGGCCGGAAGTGC;SOR=0.681;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=241;TCF=125;TCR=116;TR=123;WE=140217018;WS=140217000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,135:0.49:275
chr4	140263849	rs11944434	G	A	652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=3;PP=477;SC=TGATCCACCCGCCTTAGCCTC;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=140263857;WS=140263839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	140270875	rs2044810	G	A	100.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=74;SC=GCAGTGGCTCGTGCCTGTAAT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=140270883;WS=140270865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	140308984	rs998310	C	A	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=379;ReadPosRankSum=0.061;SC=TAATAAATTCCCAGTAAGAAC;SOR=0.341;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=42;TCF=40;TCR=2;TR=19;WE=140308992;WS=140308974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
chr4	140375296	rs13128486	C	G	834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=13;PP=530;ReadPosRankSum=-0.403;SC=GGCGTAATCTCTCAGCCTTTC;SOR=0.623;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=59;TCF=38;TCR=21;TR=35;WE=140375304;WS=140375286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,37:0.59:63
chr4	140417471	rs4863655	G	T	1541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=19;PP=1058;SC=GCCATTATCAGTAGGCAGAGT;SOR=1.421;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=39;TCR=19;TR=58;WE=140417479;WS=140417461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr4	140417671	rs4863656	G	C	3354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=63;PP=1977;SC=TGATTCTTCTGGCCACTGAAA;SOR=1.099;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=52;TCR=63;TR=115;WE=140417679;WS=140417661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr4	140587261	.	C	CGT	328.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.232;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.94;ReadPosRankSum=-0.197;SOR=1.162;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr4	140587263	rs2646047	C	T	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=6.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.94;ReadPosRankSum=0.609;SOR=3.033;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr4	140587271	.	C	CGCGCGCGCGT	265.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.651;ClippingRankSum=0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=6.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.99;ReadPosRankSum=1.612;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr4	140625323	rs925424	A	G	6213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=118;PP=2965;SC=TCCCTTTAATACTTGCAGAAG;SOR=0.953;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=214;TCF=96;TCR=118;TR=213;WE=140625331;WS=140625313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr4	140651584	rs5862430	TCTG	T	6613.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;NF=15;NR=61;PP=2993;SC=TCCGCCAAAATCTGCTGCTGC;SOR=0.776;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=20;TCR=80;TR=76;WE=140651597;WS=140651574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr4	140809656	rs6839194	C	A	1438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.287;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=27;PP=818;ReadPosRankSum=0.631;SC=CAGGGTAGAACAAATGTTATA;SOR=0.582;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=135;TCF=78;TCR=57;TR=62;WE=140809664;WS=140809646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,72:0.48:149
chr4	140809710	rs3775241	C	G	2195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.665;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=42;PP=1294;ReadPosRankSum=-0.420;SC=GATGAAGAGACTGAAAAGCTT;SOR=0.777;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=187;TCF=100;TCR=87;TR=91;WE=140809718;WS=140809700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,103:0.49:210
chr4	140810334	rs3733381	T	C	4618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=50;PP=2754;SC=CCTTTTCCATTTCTTAGGAGA;SOR=1.343;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=148;TCF=96;TCR=52;TR=145;WE=140810342;WS=140810324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr4	140810637	rs11100342	C	T	1188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=19;PP=990;SC=GTGGAGGTGGCGGCTGCTGCT;SOR=0.741;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=20;TCR=19;TR=39;WE=140810648;WS=140810627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr4	140810700	rs11729794	C	T	794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.039;NF=26;NR=12;PP=567;ReadPosRankSum=-0.953;SC=GCTGGATATACGGCATCAAGG;SOR=0.659;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=74;TCF=53;TCR=21;TR=38;WE=140810708;WS=140810690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,38:0.49:77
chr4	140811063	.	TTGCTGCTGCTGC	T	2903	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MMLQ=28;MQ=61.02;NF=0;NR=16;PP=2903;QD=20;SC=TTGAGTGCTGTTGCTGCTGCT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=7;TCR=52;TR=16;WE=140811104;WS=140811053;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:43,16:0.27:59
chr4	140811083	rs373804063	GC	G	1543.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.67;MQRankSum=-1.918;QD=24.12;ReadPosRankSum=0.583;SOR=0.487;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,60:0.94:64
chr4	140811085	rs58287721	TGCTGCTGCTGC	T	1543.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.60;MQRankSum=-1.918;QD=24.12;ReadPosRankSum=0.610;SOR=0.487;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,60:0.94:64
chr4	140811096	.	C	T	809	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MMLQ=28;MQ=61.72;NF=15;NR=20;PP=809;QD=24.1077489299;SC=GCTGCTGCTGCTGCTGCTGCT;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=51;TCF=20;TCR=31;TR=35;WE=140811104;WS=140811053;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:16,35:0.69:51
chr4	140811135	rs3733382	T	C	3169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=31;PP=1415;SC=GCTGTTGCTGTTTCTGCTGCA;SOR=1.116;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=47;TCR=31;TR=78;WE=140811143;WS=140811125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr4	141290574	rs2668577	C	T	2227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=41;PP=1462;SC=GGAACATGTTCTGCAAATTAA;SOR=1.058;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=74;TCF=33;TCR=41;TR=74;WE=141290582;WS=141290564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr4	141311960	rs358329	T	C	321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=12;PP=258;SC=ATACAATAAATGGGATTTATT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=141311968;WS=141311950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	141321425	rs2252427	A	G	237.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=9;NR=0;PP=188;SC=TGGGGTACACATTTGTTTTCT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=141321433;WS=141321415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	141372485	rs6536966	T	C	245.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=201;SC=GTGTCTTATGTCACCACTTCT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=141372493;WS=141372475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	141383034	rs10644682	T	TAC	762.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.752;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.875;NF=7;NR=15;PP=755;ReadPosRankSum=0.991;SC=AATTGGTGTATACACACACAC;SOR=1.292;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=43;TCF=13;TCR=30;TR=22;WE=141383047;WS=141383024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,40:0.66:61
chr4	141400570	rs12502712	A	G	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.408;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=6;PP=416;ReadPosRankSum=-0.089;SC=AATGGATTACATCTTAAAACT;SOR=0.409;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=46;TCF=38;TCR=8;TR=30;WE=141400578;WS=141400560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,31:0.65:48
chr4	141400788	rs112616154	G	GA	274.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.003;NF=0;NR=11;PP=243;ReadPosRankSum=-0.522;SC=GCAACTGAAAGAAAAAAATAA;SOR=0.874;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=11;WE=141400796;WS=141400778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr4	141446510	rs3833618	C	CTAAT	949.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.747;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=625;ReadPosRankSum=-1.547;SC=GTTGTATAAACTTTTTAAATT;SOR=0.336;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=37;TCF=31;TCR=6;TR=18;WE=141446518;WS=141446500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,23:0.53:43
chr4	141446767	rs3828535	G	T	642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.830;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=25;PP=473;ReadPosRankSum=-0.213;SC=AAAGTTTAACGGAGTGTTTTT;SOR=1.284;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=79;TCF=18;TCR=61;TR=30;WE=141446775;WS=141446757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,31:0.38:82
chr4	141458485	rs882930	T	G	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=3.923;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=186;ReadPosRankSum=0.890;SC=GCTTTCTAAATAGACATATGA;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=9;WE=141458493;WS=141458476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr4	141483471	rs2270565	T	A	1198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.485;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=29;PP=604;ReadPosRankSum=1.202;SC=GGGGAGGACATAGCTGTTGCG;SOR=0.841;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=111;TCF=42;TCR=69;TR=48;WE=141483479;WS=141483461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,56:0.46:123
chr4	141484765	rs112019388	AT	A	47.06	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.41;ReadPosRankSum=-1.282;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr4	141489068	rs45539933	C	T	2776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.426;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=57;PP=1710;ReadPosRankSum=-1.762;SC=TTTACCACAGCGGTGATTGTT;SOR=0.653;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=267;TCF=150;TCR=117;TR=129;WE=141489076;WS=141489058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,140:0.48:292
chr4	141489996	rs10011540	T	G	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=273;ReadPosRankSum=-0.354;SC=CCGATTTCTGTTTTTTGAACC;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=13;WE=141490004;WS=141489986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,16:0.70:23
chr4	141543997	rs1560440	G	A	5977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=104;NR=93;PP=2965;SC=CTGCCGTGGCGTGGTACAGCT;SOR=0.711;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=198;TCF=105;TCR=93;TR=197;WE=141544005;WS=141543987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr4	141545564	rs5862491	G	GA	3512.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=52;PP=1970;SC=TGGTTCAGAAGAAAAAAGTAG;SOR=1.121;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=69;TCF=8;TCR=61;TR=59;WE=141545572;WS=141545554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr4	141545653	rs5862492	GCAAA	G	612.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=17;PP=640;SC=GCCTGATTTAGCAAACAAACA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=17;WE=141545664;WS=141545643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	141592206	rs4956473	A	G	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.368;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=54;ReadPosRankSum=-0.566;SC=ATTTTATTGAAGCAAAACTGA;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=141592214;WS=141592196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr4	141598126	rs2303911	C	T	2199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.541;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=49;PP=1265;ReadPosRankSum=-0.725;SC=ACACAAACATCTGCCCCAAAA;SOR=0.705;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=217;TCF=116;TCR=101;TR=99;WE=141598134;WS=141598116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,112:0.46:246
chr4	141598290	rs2303912	A	G	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.607;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=121;ReadPosRankSum=1.859;SC=CATAAGAAAAATGTTTCCATA;SOR=0.061;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=9;WE=141598298;WS=141598280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr4	141600320	rs4956329	A	G	2168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=42;PP=1323;SC=CATTCTTCTCAAGCTGAGTGA;SOR=1.409;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=27;TCR=42;TR=69;WE=141600328;WS=141600310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr4	141607679	rs13112073	C	T	609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=369;ReadPosRankSum=-0.990;SC=AAAAACCAGGCTCACTTTTTC;SOR=0.648;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=39;TCF=8;TCR=31;TR=20;WE=141607687;WS=141607669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,25:0.49:51
chr4	141677006	rs70943501	A	AG	1384.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=15;NR=6;PP=876;SC=CCTGCAGCCCAGGCCGCGGGC;SOR=2.191;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=23;TCF=15;TCR=8;TR=21;WE=141677014;WS=141676996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr4	141771715	rs374724826	GGT	G	249.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=2.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.54;MQRankSum=2.941;QD=4.46;ReadPosRankSum=-0.870;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,15:0.27:56
chr4	141832180	rs17338203	A	G	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=2.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.08;ReadPosRankSum=1.328;SOR=0.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,5:0.24:21
chr4	141847077	rs13138724	G	A	1690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.186;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=35;PP=1056;ReadPosRankSum=-0.751;SC=TCCCTGCTTTGAGGGCAACGC;SOR=0.597;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=158;TCF=91;TCR=67;TR=79;WE=141847085;WS=141847067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,84:0.49:173
chr4	141847110	rs13120735	T	C	2086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.394;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=45;PP=1120;ReadPosRankSum=-0.076;SC=ATTATAATGCTGTAGGCTGTG;SOR=0.520;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=187;TCF=103;TCR=84;TR=96;WE=141847118;WS=141847100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,103:0.50:206
chr4	141847279	rs12503723	G	A	509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=349;ReadPosRankSum=0.423;SC=GAGAATACCTGGTCCACCATG;SOR=0.680;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=42;TCF=13;TCR=29;TR=21;WE=141847287;WS=141847269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,24:0.46:52
chr4	141866754	rs71584389	ATACATATATATAC	A	457.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQ=61.94;NF=2;NR=4;PP=849;SC=ATATACATATATACATATATA;SOR=0.859;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=141866774;WS=141866744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	141868736	rs2321687	G	T	683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=1;PP=429;SC=CCAGCAGGTCGGGGCCAGGGA;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=141868744;WS=141868726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	141869062	rs6857782	C	T	1170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=28;PP=820;SC=CTTCCAACCTCTACTTCTTGT;SOR=2.613;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=36;WE=141869070;WS=141869052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr4	141870648	rs4956494	G	A	837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=20;PP=540;SC=ATGAATGCTAGCAATGACGAC;SOR=3.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=141870656;WS=141870638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr4	141889161	rs28393501	A	G	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.392;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=6;PP=120;ReadPosRankSum=-0.269;SC=CTGGGCTAAGAAGACCTAATA;SOR=0.175;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=9;WE=141889169;WS=141889151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr4	141927365	rs138771695	CATATATATACACATATATATGTGTATGTAT	C	470.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.11;ReadPosRankSum=0.804;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr4	141927449	rs146785909	T	TAC	1236.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.741;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.020;NF=12;NR=15;PP=1042;ReadPosRankSum=-0.348;SC=CGTATATATATACACACACAC;SOR=1.081;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=70;TCF=26;TCR=44;TR=27;WE=141927463;WS=141927439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,44:0.43:102
chr4	141940074	rs4245936	T	C	2562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.63;SOR=0.775;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr4	141940234	.	A	G	62	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=2;HapScore=2;MGOF=285;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=62;QD=48.3856062736;SC=ATATATATATATGGAACTTTA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=141940242;WS=141940224;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr4	141974816	rs60653888	A	C	1726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.032;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=34;PP=996;ReadPosRankSum=0.389;SC=AGGCTAAAGCATACCTGAGGA;SOR=0.768;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=194;TCF=109;TCR=85;TR=81;WE=141974824;WS=141974806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,93:0.41:227
chr4	141983473	rs28430438	A	G	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.968;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=99;ReadPosRankSum=-1.476;SC=ATAAACATGCATCTTATATAT;SOR=0.346;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=8;WE=141983481;WS=141983463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr4	142153856	rs367794846	CT	C	157.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=3.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.21;MQRankSum=1.211;QD=5.26;ReadPosRankSum=2.579;SOR=0.245;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr4	142640462	rs1493013	CC	TT	2479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=18;PP=2116;SC=TTAATTCCCTCCCTTTCTTTT;SOR=1.781;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=54;TCF=35;TCR=19;TR=53;WE=142640471;WS=142640452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr4	142640538	rs2254514	T	C	5098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=96;NR=79;PP=2493;SC=TAGGAGGCATTGTGGATGGAT;SOR=0.810;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=175;TCF=96;TCR=79;TR=175;WE=142640546;WS=142640528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr4	142640637	rs2857261	A	G	2796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=56;PP=1801;SC=TCGGTAAGAAAAAAAATAGAT;SOR=1.538;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=30;TCR=56;TR=86;WE=142640645;WS=142640627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr4	142651159	rs12510030	T	C	6115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=90;PP=2965;ReadPosRankSum=1.571;SC=AACAGTTGCTTAGAGTTGCAT;SOR=0.238;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=189;TCF=99;TCR=90;TR=188;WE=142651180;WS=142651149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,224:1.00:225
chr4	142651265	rs17007610	T	C	2318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=52;PP=1264;SC=AGTGGAGTGGTGTGCAAAAGT;SOR=1.954;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=23;TCR=52;TR=75;WE=142651273;WS=142651255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr4	143003155	rs11446749	G	GA	1639.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=13;PP=1079;SC=GACCTTAAAAGAAAAAAACTT;SOR=1.981;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=47;TCF=30;TCR=17;TR=38;WE=143003163;WS=143003145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr4	143007197	rs336325	C	T	2858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=21;PP=1720;SC=TGACACCTGGCAACCCAAAGT;SOR=2.004;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=69;TCR=21;TR=90;WE=143007205;WS=143007187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr4	143007419	rs336324	A	G	806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=20;PP=604;SC=TCTGAAGGGGAAAAAACAAAG;SOR=3.098;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=24;WE=143007427;WS=143007409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	143007460	rs336323	T	G	335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=237;SC=GTGTTCACATTAAGCTGCCCA;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=143007468;WS=143007450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	143044666	rs2645786	A	C	253.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=7;PP=179;SC=AGATTCGATTATCAGGTATGT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=143044674;WS=143044656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	143130034	rs1907123	A	T	4069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=91;NR=48;PP=2370;SC=GTAAGTAGAGAAATTGCTTCC;SOR=1.319;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=91;TCR=49;TR=139;WE=143130042;WS=143130024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr4	143130219	rs1994217	T	A	705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=17;PP=435;SC=TATTTTTATCTTAAATCCATA;SOR=2.584;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=22;WE=143130227;WS=143130209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	143181747	rs66750380	AT	A	354.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=6.690;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.34;ReadPosRankSum=1.736;SOR=2.788;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
chr4	143192086	rs150117601	T	TTG	123	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=20.50;ReadPosRankSum=1.383;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,5:0.83:6
chr4	143226768	rs2627808	G	T	2307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=46;PP=1615;SC=CAAACAAAATGAGTCTTTAGA;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=30;TCR=46;TR=76;WE=143226776;WS=143226758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr4	143226784	rs2636640	G	A	1852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=32;PP=1329;SC=TTAGAAGAATGAAATATTAAA;SOR=1.057;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=25;TCR=32;TR=57;WE=143226792;WS=143226774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr4	143268528	rs882004	T	A	899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=9;PP=527;ReadPosRankSum=0.596;SC=TCCAATTACCTGATTATTATT;SOR=0.612;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=56;TCF=42;TCR=14;TR=35;WE=143268536;WS=143268518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,40:0.65:62
chr4	143324036	rs1982965	T	C	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=277;ReadPosRankSum=-0.435;SC=AAAAATCCAATCGTGTGGAAA;SOR=1.091;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=15;WE=143324044;WS=143324026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr4	143324094	rs1982966	G	A	1155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.514;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=16;PP=731;ReadPosRankSum=-1.837;SC=TACTTACGGTGTCATGAGACT;SOR=0.874;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=112;TCF=75;TCR=37;TR=51;WE=143324102;WS=143324084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,55:0.45:123
chr4	143326312	rs138973882	AAGAG	A	383.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=5;PP=418;ReadPosRankSum=2.119;SC=GCGAGCCAGCAAGAGAGAGAG;SOR=0.732;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=21;TCF=13;TCR=8;TR=11;WE=143326323;WS=143326302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr4	143344785	rs3775712	T	G	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=128;ReadPosRankSum=-0.522;SC=ATTGTACCAGTACATATTGTT;SOR=0.446;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=10;WE=143344793;WS=143344775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
chr4	143344904	rs146684481	G	A	976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-1.012;NF=24;NR=19;PP=567;ReadPosRankSum=2.017;SC=ACAATCATCCGCTTCCATAGA;SOR=0.644;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=88;TCF=47;TCR=41;TR=43;WE=143344912;WS=143344894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,46:0.52:89
chr4	143348680	rs3775718	C	T	752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.550;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=14;PP=411;ReadPosRankSum=0.030;SC=ACTTGGCTTTCTAAACAAACA;SOR=0.859;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=93;TCF=56;TCR=37;TR=37;WE=143348688;WS=143348670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,42:0.38:111
chr4	144107352	.	T	C	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=0.000;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.145;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=288;ReadPosRankSum=-0.981;SC=CACACACACATTCACACCATG;SOR=0.919;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=61;TCF=18;TCR=43;TR=20;WE=144107360;WS=144107342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,21:0.34:62
chr4	144124492	rs4234886	G	A	688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=18;NR=3;PP=352;SC=TTTGTGTTCTGTTTGTAGGCT;SOR=2.215;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=144124500;WS=144124482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	144125549	.	CT	C	153.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.504;ClippingRankSum=0.000;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.29;MQRankSum=1.461;QD=3.42;ReadPosRankSum=0.603;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,15:0.33:45
chr4	144130979	rs148666231	A	AT	50.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=58;SC=AAATATCTAGATTTTTTTTAT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=144130987;WS=144130969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr4	144135718	rs4285045	G	A	6914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=115;NR=111;PP=2965;SC=CTTATGCCAGGAATATCACAA;SOR=0.742;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=226;TCF=115;TCR=111;TR=226;WE=144135726;WS=144135708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr4	144136193	rs10000911	T	G	182.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=117;SC=GAGTTTTTATTAAATTCTGAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=144136201;WS=144136183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr4	144264722	rs300919	T	C	7453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=132;NR=121;PP=2965;SC=AGGCCCACTCTCTGCCCTTAA;SOR=0.715;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=253;TCF=132;TCR=121;TR=253;WE=144264730;WS=144264712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,281:1.00:281
chr4	144317039	rs2048408	C	T	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.720;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=313;ReadPosRankSum=-0.060;SC=ATTGATGGACCGCCCCCCGCC;SOR=2.022;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=19;WE=144317047;WS=144317029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr4	144380399	rs13114896	G	A	207.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=169;SC=AACATTCATGGACCTCATTTC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=144380407;WS=144380389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	144381401	rs3795246	A	G	500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=0;PP=423;SC=ATGAATGATTATAAACATAAG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=144381409;WS=144381395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	144381463	rs28924068	A	G	1524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=15;PP=978;ReadPosRankSum=1.728;SC=TTGGGGAATAATTTTAGATAT;SOR=0.676;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=96;TCF=73;TCR=23;TR=56;WE=144381471;WS=144381453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,65:0.58:112
chr4	144390372	.	GA	G	1503.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=0.000;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.097;NF=2;NR=31;PP=1010;ReadPosRankSum=0.220;SC=CTGAACAAAAGAAAACTGAAT;SOR=0.648;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=81;TCF=4;TCR=77;TR=33;WE=144390380;WS=144390362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,59:0.46:128
chr4	144438595	rs35601522	C	T	2633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=47;PP=1496;SC=ATGTTCTAGGCTTGTGAATAG;SOR=1.007;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=88;TCF=41;TCR=47;TR=87;WE=144438603;WS=144438585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr4	144442735	rs11541117	C	T	5741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=83;NR=111;PP=2965;SC=GCAGAACTTACTATCCGTTGG;SOR=1.096;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=194;TCF=83;TCR=111;TR=194;WE=144442743;WS=144442725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr4	144445789	rs6857360	C	T	302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=254;SC=GAGCATATTACAGGATAGTAG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=144445797;WS=144445779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	144456124	rs6818251	A	G	4371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=78;PP=2706;SC=AATGGTATGTATTCTCAGATG;SOR=0.823;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=74;TCR=78;TR=152;WE=144456132;WS=144456114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr4	144467104	rs13139128	T	C	3080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=45;PP=1602;SC=AGCTGCCTAATGCAGCACAGG;SOR=0.859;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=108;TCF=62;TCR=46;TR=107;WE=144467112;WS=144467094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr4	144617554	rs61732656	G	T	2971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.910;NF=68;NR=62;PP=1779;ReadPosRankSum=-2.133;SC=CCTCAGGGAAGACGCTGTCTA;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=281;TCF=145;TCR=136;TR=130;WE=144617562;WS=144617544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,146:0.46:320
chr4	144617842	rs1545437	G	T	2128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.037;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=42;PP=1258;ReadPosRankSum=0.036;SC=TGGCCTTGAGGATCCGATTTG;SOR=0.595;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=203;TCF=119;TCR=84;TR=98;WE=144617850;WS=144617832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,105:0.47:223
chr4	144618610	rs1034494	G	C	4468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=58;PP=2965;SC=ACTCCCCGACGAAGACCTTGG;SOR=1.108;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=144;TCF=86;TCR=58;TR=144;WE=144618618;WS=144618600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr4	144620758	rs61427459	C	T	1421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.863;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=32;PP=778;ReadPosRankSum=-2.098;SC=CCTGTTGCCCCGGGTGCCCTG;SOR=0.936;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=138;TCF=69;TCR=69;TR=60;WE=144620766;WS=144620748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,69:0.45:153
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chr4	144621779	rs55935372	A	G	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=4.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.26;ReadPosRankSum=-0.062;SOR=0.247;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,18:0.43:42
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chr4	144797848	rs6537203	G	T	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=4.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.811;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=57.86;MQRankSum=-2.518;NF=22;NR=2;PP=462;ReadPosRankSum=0.511;SC=TAAACCCTCCGAGAGCTGTTC;SOR=1.542;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=46;TCF=41;TCR=5;TR=24;WE=144797856;WS=144797838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,24:0.51:47
chr4	144799840	rs3775246	G	A	2187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.998;NF=35;NR=52;PP=1388;ReadPosRankSum=0.863;SC=CCTATAAAGCGAAATTTCAAT;SOR=0.645;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=131;TCF=52;TCR=79;TR=87;WE=144799848;WS=144799830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,95:0.66:143
chr4	144801662	rs1132785	C	G,T	12554.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=676;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=57.36;MQRankSum=-6.506;QD=18.57;ReadPosRankSum=-1.629;SOR=0.676;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:161,336,179:0.50,0.26:676
chr4	144801662	.	CCTGTATAAA	GCTGTATAAC,TCTGTATAAA	2944	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.41;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MMLQ=27;MQ=57.5;NF=105,74;NR=142,95;PP=2944,259;QD=20;SC=GCTCACAATTCCTGTATAAAA;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=610;TCF=265;TCR=345;TR=247,169;WE=144801679;WS=144801652;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.40:610
chr4	144801671	rs146400730	A	C	11306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=589;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.13;MQRankSum=-7.906;QD=19.20;ReadPosRankSum=0.028;SOR=0.720;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:302,287:0.49:589
chr4	144801728	rs201075956	CA	TG	1988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=21.371;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-8.551;NF=1;NR=44;PP=2197;ReadPosRankSum=-1.955;SC=TAAAGCATATCACAAAAGACA;SOR=2.539;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=137;TCF=26;TCR=111;TR=45;WE=144801737;WS=144801718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,57:0.36:159
chr4	144802964	rs6824687	T	C	703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.613;NF=22;NR=6;PP=421;ReadPosRankSum=-0.401;SC=CTCTTTGAGATATTCAAATGA;SOR=0.628;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=60;TCF=48;TCR=12;TR=28;WE=144802972;WS=144802954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,33:0.46:71
chr4	144803130	rs6819885	A	G	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=6.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.801;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-7.750;NF=6;NR=21;PP=558;ReadPosRankSum=-1.848;SC=CTACTCAAGGAAAGAGTTCTA;SOR=2.556;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=65;TCF=27;TCR=38;TR=27;WE=144803138;WS=144803120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,23:0.31:75
chr4	144809800	rs143390057	C	A	2971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.326;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-10.856;NF=77;NR=86;PP=2330;ReadPosRankSum=-0.991;SC=TTGTCTTGGACAGAATTAACG;SOR=0.902;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=306;TCF=154;TCR=152;TR=163;WE=144809808;WS=144809790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,146:0.53:273
chr4	144811428	rs4095436	A	G	384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=12;PP=307;SC=GCATATTCCAATCTGGTCACT;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=144811436;WS=144811418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	144811470	rs4095435	A	G	72.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=81;SC=AGAACAAAAGAGGATTTCACA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=144811478;WS=144811460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr4	144824194	rs138724961	T	C	4082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-4.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=489;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.524;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-20.240;NF=112;NR=100;PP=2552;ReadPosRankSum=-0.488;SC=CTGTCCTCTTTTCCCAGAATT;SOR=0.760;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=464;TCF=239;TCR=225;TR=212;WE=144824202;WS=144824184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:271,218:0.45:489
chr4	144824269	rs1899967	C	T	10695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.16;QD=35.42;SOR=1.248;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,302:1.00:302
chr4	144824269	.	CTCCC	TTCCC,TTCCT	1963	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=27;MQ=49.31;NF=106,44;NR=166,77;PP=1849,1963;QD=6.92562945789;SC=CAGAAAATAACTCCCTGCTAC;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=272;TCF=106;TCR=166;TR=272,121;WE=144824281;WS=144824259;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:272
chr4	144824273	rs6818201	C	T	3140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FS=2.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.23;MQRankSum=12.704;QD=11.22;ReadPosRankSum=-0.930;SOR=0.838;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:138,142:0.51:280
chr4	144824308	rs202179013	TG	CC	1540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.950;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.510;NF=7;NR=28;PP=1441;ReadPosRankSum=-2.912;SC=TCGGCATTCATGTTTATCATC;SOR=0.544;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=90;TCF=19;TCR=71;TR=35;WE=144824317;WS=144824298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,42:0.42:100
chr4	144917514	rs1980037	A	C	3137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=64;PP=2087;SC=ATGAGCTAAGACTCCACTTCA;SOR=1.085;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=49;TCR=64;TR=113;WE=144917522;WS=144917504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr4	144918712	rs1132783	C	G	1193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.708;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=15;PP=731;ReadPosRankSum=-1.238;SC=TCGGCGAATACTGTAAGAAAT;SOR=0.604;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=116;TCF=80;TCR=36;TR=50;WE=144918720;WS=144918702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,56:0.45:125
chr4	144918867	rs1473055	A	G	1358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.329;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=36;PP=845;ReadPosRankSum=-0.794;SC=TAACATCAGCATAACATCACC;SOR=0.570;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=137;TCF=53;TCR=84;TR=61;WE=144918875;WS=144918857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,67:0.44:151
chr4	144918893	rs4835126	A	G	1018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=2.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.26;ReadPosRankSum=0.232;SOR=1.034;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,46:0.42:110
chr4	144918900	rs1849110	G	A	3423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=60;PP=860;SC=ACAAAGTACAGTTAACATACT;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=28;TCR=60;TR=88;WE=144918908;WS=144918883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr4	144920480	rs7661933	A	T	1675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=4.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.877;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.081;NF=48;NR=17;PP=1146;ReadPosRankSum=-0.240;SC=GTTTTAAGATAGACACATTTT;SOR=1.362;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=130;TCF=85;TCR=45;TR=65;WE=144920488;WS=144920470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,72:0.50:144
chr4	144920596	rs7683365	G	A	2529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=3.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.479;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=61;PP=1624;ReadPosRankSum=0.165;SC=AAGTTGTCCCGTTTCTCCTAT;SOR=0.973;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=206;TCF=94;TCR=112;TR=104;WE=144920604;WS=144920586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,118:0.51:231
chr4	144920638	rs7662277	A	T	1528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.567;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.174;NF=30;NR=37;PP=905;ReadPosRankSum=-0.118;SC=TCCAAATAAGAAAGACATGTG;SOR=0.641;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=148;TCF=67;TCR=81;TR=67;WE=144920646;WS=144920627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,76:0.44:171
chr4	144921607	rs1849119	C	T	2249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=43;PP=1242;SC=ATGAGCTGGACATGTGTCCCG;SOR=1.192;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=34;TCR=43;TR=77;WE=144921615;WS=144921597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr4	144938033	rs5862681	A	AT	184.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.57;QD=30.80;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr4	144938081	rs28373876	C	T	171.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.00;QD=28.64;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr4	144938120	rs4561879	TG	CC	241.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.84;QD=40.31;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr4	145020647	rs13135548	C	T	1053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.016;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.708;NF=18;NR=10;PP=839;ReadPosRankSum=-0.798;SC=TGCAGCCAGTCTGCATAAGCA;SOR=0.495;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=57;TCF=39;TCR=18;TR=28;WE=145020666;WS=145020637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,27:0.44:61
chr4	145020658	rs13110331	A	G	1094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.197;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.614;NF=20;NR=12;PP=839;ReadPosRankSum=-0.543;SC=TGCATAAGCAAGAGAACAGCA;SOR=0.398;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=69;TCF=47;TCR=22;TR=32;WE=145020666;WS=145020637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,32:0.43:75
chr4	145038318	rs62334650	C	T	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=4.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.775;NF=0;NR=10;PP=162;ReadPosRankSum=-0.603;SC=TGTCCAAGGTCGCAAAATAGT;SOR=0.352;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=10;WE=145038326;WS=145038308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr4	145040784	rs62334651	T	C	3081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=38;PP=1937;SC=CTCGTGTAAATAGAGTTCAAT;SOR=1.302;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=65;TCR=38;TR=103;WE=145040792;WS=145040774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr4	145040962	rs6857144	CA	GT	2061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=35;PP=2066;SC=TGAGAAAGGGCACAAGAATGA;SOR=2.560;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=44;TCF=8;TCR=36;TR=43;WE=145040971;WS=145040952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr4	145040999	rs62334652	T	C	574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=51;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=16;PP=494;SC=TAGAGCGTATTATGAAAGACA;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=145041019;WS=145040989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	145041011	rs70953778	AC	A	362.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=51;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=417;SC=TGAAAGACAAACTCTCCCACA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=145041019;WS=145040989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	145041577	rs111643702	C	T	1651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.48;BaseQRankSum=-1.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-2.126;NF=33;NR=11;PP=1346;ReadPosRankSum=0.236;SC=GACAGGTCCCCTAAAATGGGT;SOR=0.719;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=69;TCF=53;TCR=16;TR=44;WE=145041585;WS=145041567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,66:0.63:105
chr4	145041686	rs4867	A	G	1616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=38;PP=1138;SC=CTGAAGAAGAAGTTGAAGTGT;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=13;TCR=38;TR=51;WE=145041694;WS=145041676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr4	145041707	rs7658293	C	A	753.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.67;MQRankSum=1.273;QD=37.70;ReadPosRankSum=0.609;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,19:0.95:20
chr4	145041708	rs7687256	T	C	753.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.15;MQRankSum=1.236;QD=41.88;ReadPosRankSum=0.677;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,17:0.94:18
chr4	145041720	rs7682260	A	G	302.31	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.04;MQRankSum=1.213;QD=25.19;ReadPosRankSum=-0.881;SOR=0.477;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr4	145041741	rs4449373	T	G	648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=51.45;QD=40.55;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr4	145041750	rs45468202	A	C	648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=51.45;QD=40.55;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr4	145579907	rs6537301	G	A	2136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=23;PP=1418;SC=TATGACATTAGGTGCTTCTAA;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=47;TCR=23;TR=70;WE=145579915;WS=145579897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr4	145580172	rs114633728	T	C	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.081;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=246;ReadPosRankSum=0.474;SC=TGACAGTGAATCAACTGTCTG;SOR=2.066;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=12;WE=145580180;WS=145580162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr4	146046138	rs4835203	T	C	355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=14;NR=0;PP=326;SC=TTTTTTTCTCTTAGTCCTCAA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=146046146;WS=146046128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	146048554	rs4148234	T	C	831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=12;PP=399;ReadPosRankSum=1.284;SC=ACAGATGGTATGTGCAGAACA;SOR=0.731;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=77;TCF=50;TCR=27;TR=35;WE=146048562;WS=146048544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,41:0.48:86
chr4	146048583	rs1378314	T	G	3164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=44;PP=1582;SC=AGGCACTGTTTTAAGCACAGC;SOR=0.778;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=103;TCF=59;TCR=44;TR=103;WE=146048591;WS=146048573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr4	146065006	rs9991890	C	T	1159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=5;PP=812;SC=TATAAAATTTCGAAATTATTT;SOR=2.613;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=35;WE=146065014;WS=146064996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr4	146073850	rs12501862	C	T	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.08;ReadPosRankSum=-1.052;SOR=0.874;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,22:0.65:34
chr4	146076632	rs36225839	TA	T	1190.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.22;MQRankSum=0.945;QD=14.18;ReadPosRankSum=0.886;SOR=0.619;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,59:0.70:84
chr4	146086269	rs17726651	C	T	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=8;PP=288;ReadPosRankSum=0.336;SC=CCACTGGTTTCATTTTCTTTT;SOR=0.560;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=33;TCF=20;TCR=13;TR=19;WE=146086277;WS=146086259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,21:0.54:39
chr4	146463966	rs1497126	T	C	609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=16;PP=451;SC=AAAAATAGAGTCCAATGTTAA;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=146463974;WS=146463956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	146601680	rs7683750	C	T	611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.004;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=324;ReadPosRankSum=-1.222;SC=CCCTGAGAGACTTCATAGACT;SOR=1.302;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=17;WE=146601688;WS=146601670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr4	146601701	rs7682360	G	A	353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.520;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=87;ReadPosRankSum=-0.999;SC=TTAACCCTCTGTATTTTCTTT;SOR=0.184;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=8;WE=146601709;WS=146601691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr4	146653620	rs10008599	G	A	1900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.233;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=43;PP=1183;ReadPosRankSum=-0.436;SC=TGGACGGTGCGATTCTGAAAG;SOR=0.568;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=152;TCF=73;TCR=79;TR=85;WE=146653628;WS=146653610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,90:0.55:164
chr4	146686396	rs76846242	C	G	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.193;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=174;ReadPosRankSum=1.061;SC=AGCTCCTCCCCACTTCCTCCC;SOR=2.655;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=9;WE=146686404;WS=146686386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr4	146686414	rs79822587	C	T	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=119;ReadPosRankSum=1.217;SC=CCCGCCTCCTCCGACGCCTGA;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=7;WE=146686422;WS=146686404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
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chr4	146770400	rs28497499	T	A	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.029;SOR=0.880;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,21:0.54:39
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chr4	147177822	rs28406249	A	G	1218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=35;PP=829;ReadPosRankSum=0.625;SC=CTCTGGATACAAACAGATTTC;SOR=0.622;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=30;TCR=66;TR=51;WE=147177830;WS=147177812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,55:0.53:103
chr4	147177865	rs58191358	A	T	1010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=1067;ReadPosRankSum=-0.151;SC=AGACTTTGTCATTTCCCCTCC;SOR=0.646;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=43;TCF=13;TCR=30;TR=25;WE=147177876;WS=147177855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,27:0.60:45
chr4	147177868	rs34063596	T	TC	1001.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=1068;ReadPosRankSum=-0.286;SC=CTTTGTCATTTCCCCTCCCAC;SOR=0.846;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=16;WE=147177876;WS=147177855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,26:0.60:43
chr4	147213912	rs4516736	T	C	171.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=0;PP=136;SC=CCCTTTGTAATGTCTACAATT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=147213920;WS=147213903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr4	147213975	rs59811977	T	C	573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.199;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=371;ReadPosRankSum=-0.597;SC=GAAAAACATATGTAAAAGGAG;SOR=0.140;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=23;WE=147213983;WS=147213965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,24:0.80:30
chr4	147214029	rs12711434	C	A	648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=10;PP=375;ReadPosRankSum=-0.877;SC=CCAAGTAGACCGCATGATTCC;SOR=0.758;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=76;TCF=50;TCR=26;TR=31;WE=147214037;WS=147214019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,34:0.40:84
chr4	147227034	.	A	G	1095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=0.000;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.893;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=16;PP=629;ReadPosRankSum=-0.799;SC=AGATTTCACAATTTGATCCAT;SOR=0.869;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=65;TCF=40;TCR=25;TR=43;WE=147227042;WS=147227024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,49:0.63:78
chr4	147247359	rs76976798	A	G	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.195;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.119;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=134;ReadPosRankSum=1.344;SC=GCCTGAAAGCACAACCACCAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=7;WE=147247367;WS=147247349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr4	147364052	rs1344140	C	T	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.129;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=133;ReadPosRankSum=1.228;SC=TCATTCTCCCCTCCCCCACTA;SOR=1.765;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=16;TCF=7;TCR=9;TR=10;WE=147364060;WS=147364042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr4	147425114	rs7439061	A	T	2401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=56;PP=1651;SC=AAATAATTTTATAATCATAGA;SOR=2.219;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=19;TCR=56;TR=75;WE=147425122;WS=147425104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr4	147431302	rs6816737	G	A	278.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=200;SC=CTTAATTTTGGGTTTTTTCAT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=147431310;WS=147431292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	147560457	.	T	TGGC	1027.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.9830;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.400;NF=7;NR=8;PP=698;ReadPosRankSum=0.935;SC=ACGCTGGTGGTGGCGGCGGCG;SOR=0.425;SbPval=0.1;Source=Platypus;TC=45;TCF=12;TCR=33;TR=15;WE=147560465;WS=147560447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,25:0.96:26
chr4	147560692	rs1504360	T	A	1179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=8;NR=34;PP=914;SC=TCCAACCAATTTTCCCCTCTC;SOR=2.726;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=8;TCR=34;TR=42;WE=147560700;WS=147560682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr4	147788709	rs10013280	C	T	1650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.291;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=39;PP=1006;ReadPosRankSum=0.402;SC=TAGTAAGAGGCTTCCGCTTCC;SOR=0.579;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=63;TCR=73;TR=73;WE=147788717;WS=147788699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,77:0.52:148
chr4	147824864	rs17610219	G	A	919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-3.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.358;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=27;PP=515;ReadPosRankSum=-1.349;SC=AAGTTATTATGTACATCTTCG;SOR=0.365;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=68;TCF=16;TCR=52;TR=37;WE=147824872;WS=147824854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,43:0.56:77
chr4	147830499	rs3810844	C	T	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.496;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=101;ReadPosRankSum=0.736;SC=ATCATGTTGCCTTTTATCCCT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=6;WE=147830507;WS=147830489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr4	148457009	rs71594223	T	TTC	1962.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=6.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.98;MQRankSum=1.413;QD=30.20;ReadPosRankSum=1.753;SOR=0.188;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,50:0.77:65
chr4	148461037	rs5333	T	C	2391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.559;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=53;PP=1642;ReadPosRankSum=0.916;SC=TCCCTCTTCATTTAAGCCGTA;SOR=0.688;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=224;TCF=117;TCR=107;TR=111;WE=148461045;WS=148461027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,115:0.48:239
chr4	148461073	rs5334	G	A	2190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.516;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=52;PP=1475;ReadPosRankSum=-0.169;SC=TGTATAACGAGATGGACAAGA;SOR=0.749;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=186;TCF=91;TCR=95;TR=97;WE=148461081;WS=148461063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,102:0.51:201
chr4	148461378	rs2292765	G	A	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.638;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=14.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.78;ReadPosRankSum=0.308;SOR=2.778;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr4	148560357	rs2654935	C	T	228.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=184;SC=TAGTACTTGACAGAATGCTTT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=148560365;WS=148560347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	148578917	.	TA	T	118.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.333;ClippingRankSum=0.000;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=0.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.14;MQRankSum=3.342;QD=0.81;ReadPosRankSum=0.927;SOR=0.559;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:121,25:0.17:146
chr4	148589677	rs2718454	C	T	3763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=49;PP=2420;SC=TGAAAATGGACTAATACACTT;SOR=1.270;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=84;TCR=49;TR=133;WE=148589685;WS=148589667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr4	148591769	rs2036502	G	T	5223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=117;NR=58;PP=2965;SC=TTAATCAGTTGTAAGTATTTT;SOR=1.454;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=175;TCF=117;TCR=58;TR=175;WE=148591777;WS=148591759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr4	148601729	rs7666065	C	T	472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=14;PP=350;SC=CACTATTGAACAATCACCTTA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=148601737;WS=148601719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr4	148778685	rs11410393	G	GT	552.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=5.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.06;ReadPosRankSum=0.317;SOR=2.215;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,25:0.86:29
chr4	148787669	rs4240341	G	A	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=0;PP=23;SC=AGGGAAAAAAGCATCATTTTC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=148787677;WS=148787665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr4	148796464	rs7663294	C	G	817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=21;PP=630;SC=TTAGGAGAAACACATTCCAGC;SOR=3.098;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=25;WE=148796472;WS=148796454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	148800299	rs13147854	A	G	2754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=27;PP=1646;SC=CGTTTTAGACATTTCCTCTTT;SOR=1.702;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=67;TCR=27;TR=94;WE=148800307;WS=148800289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr4	148827697	rs35780665	T	TA	1233.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.234;HP=10;HapScore=3;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=17;PP=522;ReadPosRankSum=0.911;SC=CAGATAAAAGTAAAAAAAAAA;SOR=0.481;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=50;TCF=23;TCR=27;TR=33;WE=148827705;WS=148827687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,52:0.80:65
chr4	148827747	rs12509618	A	C	3737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=48;PP=2139;SC=CTTGCCTTTTAGTGGCCAAGG;SOR=0.892;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=127;TCF=79;TCR=48;TR=124;WE=148827755;WS=148827737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr4	148827973	rs11099672	A	G	525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=12;PP=310;SC=GTTCCCTTCTATAACAGGTAT;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=148827981;WS=148827963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	148831070	rs4627844	A	G	1467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=35;PP=972;SC=ATAATCCTCTATTGCATGTGT;SOR=1.697;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=16;TCR=35;TR=51;WE=148831078;WS=148831060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr4	148985720	rs3775327	T	C	3692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=74;PP=1964;SC=GTCTGCAGCATGGAGTGAGCA;SOR=1.307;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=47;TCR=74;TR=121;WE=148985728;WS=148985710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr4	149002016	rs10708334	AT	A	2129.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=48;PP=1407;SC=ATCTGTATATATTTTTTTATT;SOR=2.124;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=59;TCF=3;TCR=56;TR=51;WE=149002024;WS=149002006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr4	149035449	rs1879829	T	C	3281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=57;PP=1686;SC=ATTTCCAGGATGGAAAACAAC;SOR=1.057;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=49;TCR=57;TR=106;WE=149035457;WS=149035439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr4	149073555	rs2272089	C	T	566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=2;PP=406;SC=TTAGAAATTACTGAAAGAAAT;SOR=3.056;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=149073563;WS=149073545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr4	149076195	rs7668847	A	G	72.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=2;PP=55;SC=AAGAGAAAATATATAAAGCTC;SOR=1.609;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=149076203;WS=149076185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	149116035	rs4835500	A	G	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=121;ReadPosRankSum=-0.140;SC=AATAAAAAATAACTGTTAAAA;SOR=0.602;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=9;WE=149116043;WS=149116025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr4	149356516	rs5525	A	G	5929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=93;PP=2965;SC=AATAGCTCCCATCATCTGGTT;SOR=0.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=200;TCF=106;TCR=94;TR=199;WE=149356524;WS=149356502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr4	149357475	rs5522	C	T	7174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=129;NR=114;PP=2965;SC=CTTTTAACAACGGCGCGCATG;SOR=0.747;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=243;TCF=129;TCR=114;TR=243;WE=149357483;WS=149357465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr4	149358014	rs2070951	G	C	1860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=43;PP=1351;SC=GGTCTCCATCGCTAACAAATA;SOR=1.758;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=20;TCR=43;TR=63;WE=149358022;WS=149358004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr4	151161470	rs11931842	A	G	1945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.094;HP=2;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=34;PP=1136;ReadPosRankSum=1.251;SC=TTTTCCTAACAAATAAAGGCA;SOR=0.601;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=181;TCF=111;TCR=70;TR=86;WE=151161478;WS=151161460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,100:0.49:206
chr4	151161490	rs6838238	T	C	6724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=130;NR=92;PP=2965;SC=AATACTCCAGTACCATGGAAG;SOR=0.963;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=222;TCF=130;TCR=92;TR=222;WE=151161510;WS=151161480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr4	151161502	rs6813035	G	T	7232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=136;NR=110;PP=2965;SC=CCATGGAAGGGTCTTGGGAGC;SOR=0.799;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=246;TCF=136;TCR=110;TR=246;WE=151161510;WS=151161480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,276:1.00:276
chr4	151170869	rs200934621	C	T	695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.368;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=21;PP=443;ReadPosRankSum=0.043;SC=GGCCTGACTGCGGAGCCGGCC;SOR=1.194;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=49;TCF=9;TCR=40;TR=24;WE=151170877;WS=151170859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,29:0.50:58
chr4	151177340	rs13152819	CC	TG	1073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=14;PP=815;SC=CACCCCCCACCCTCCTCCCGC;SOR=3.014;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=23;TCF=8;TCR=15;TR=20;WE=151177349;WS=151177330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	151177428	rs13101461	C	G	196.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.38;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	151177432	rs13101258	A	C	196.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.38;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	151231371	rs1813134	T	C	1509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=15;PP=1025;SC=ATAAAGAAAATGAAAATTACC;SOR=1.835;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=37;TCR=15;TR=52;WE=151231379;WS=151231361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr4	151408800	rs7674989	T	C	675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=3;PP=502;SC=TACAGATTAATGTTAATAAGA;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=151408808;WS=151408790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr4	151505322	rs13105060	T	A	2794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=58;PP=1774;SC=CACACAACTCTGCTATAAACA;SOR=1.657;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=29;TCR=58;TR=87;WE=151505330;WS=151505312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr4	151511715	rs4401437	T	G	574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=0;PP=379;SC=AAGGAGAAACTGTAGAAGGGG;SOR=4.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=151511723;WS=151511713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	151656589	rs1993109	C	T	1562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=41;PP=1133;SC=TCACTGCTTACGGTGGAGAGG;SOR=3.788;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=6;TCR=42;TR=47;WE=151656597;WS=151656579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr4	151765243	rs186080	G	A	6151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=122;NR=88;PP=2965;SC=AAGACATATTGTAACTTACTA;SOR=0.978;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=210;TCF=122;TCR=88;TR=210;WE=151765251;WS=151765233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr4	151792401	rs41280457	T	G	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=275;ReadPosRankSum=1.183;SC=TCTCAAAAAATAAAATAAAAA;SOR=0.368;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=14;WE=151792409;WS=151792391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr4	151829659	rs1201207	T	C	728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=13;PP=511;SC=TCAATGATTTTTTTTCCAAAA;SOR=0.963;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=7;TCR=13;TR=20;WE=151829667;WS=151829649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr4	151835502	.	GA	G	70.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.000;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=7.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.28;MQRankSum=1.650;QD=2.95;ReadPosRankSum=0.764;SOR=0.525;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr4	151850226	.	GA	G	115.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.843;ClippingRankSum=0.000;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=5.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.46;ReadPosRankSum=-0.610;SOR=0.100;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,12:0.26:47
chr4	152024326	rs4696658	T	G	749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=22;PP=583;SC=AAAGGTCTGTTGAAATCCTGT;SOR=3.611;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=25;WE=152024334;WS=152024316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	152048936	rs11099782	A	T	1048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.019;HP=8;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=32;PP=886;ReadPosRankSum=-1.488;SC=AACATTTTTTAAAAAAAAACG;SOR=1.954;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=47;TCF=14;TCR=33;TR=45;WE=152048944;WS=152048925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,43:0.96:45
chr4	152053408	rs7664483	G	A	1795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=19;PP=995;SC=ATATTCTCTTGAAAATTATGA;SOR=1.318;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=39;TCR=19;TR=58;WE=152053416;WS=152053398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr4	152069406	rs150487703	TACACACACACACACAC	T	641.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=3000;SC=TGTCCTGTCTTACACACACAC;SOR=2.448;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=9;WE=152069429;WS=152069396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	152070633	rs3792611	T	A	4635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=88;NR=65;PP=2555;SC=TTTCTCTAACTTTTCCCACAT;SOR=0.904;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=153;TCF=88;TCR=65;TR=153;WE=152070641;WS=152070623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr4	152201053	rs36097019	G	A	1341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.336;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=25;PP=724;ReadPosRankSum=-1.158;SC=AACTTTATCTGTGGAGGTTCC;SOR=0.790;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=123;TCF=70;TCR=53;TR=61;WE=152201061;WS=152201043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,68:0.49:139
chr4	152201204	rs1875308	A	G	530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=15;PP=448;SC=AAAGTGGTAAAATAGGCAGGG;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=152201212;WS=152201194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr4	152212486	rs13126069	C	T	2359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.450;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=52;PP=1358;ReadPosRankSum=-0.751;SC=GGCTCTCCTGCGTCCCTCCTG;SOR=0.714;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=234;TCF=120;TCR=114;TR=108;WE=152212494;WS=152212476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,118:0.45:263
chr4	152212603	rs2407221	T	G	3429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=62;PP=2075;SC=CAGGGGCAGATAACTCACAGG;SOR=1.255;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=108;TCF=45;TCR=63;TR=107;WE=152212611;WS=152212593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr4	152212704	rs13102005	T	A	353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=221;ReadPosRankSum=-0.410;SC=GGGGTTGGAATGTGAAGAGTT;SOR=0.507;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=14;WE=152212712;WS=152212694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr4	152498625	rs17275536	C	T	1327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.291;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.130;NF=33;NR=23;PP=803;ReadPosRankSum=0.083;SC=TGGAGAAGCACGACCCCTTGA;SOR=0.828;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=132;TCF=76;TCR=56;TR=56;WE=152498633;WS=152498615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,65:0.43:150
chr4	152507998	rs10683925	G	GCA	2453.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.787;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.780;NF=4;NR=27;PP=1183;ReadPosRankSum=-0.763;SC=TTCATTCAGAGCACAAGCACT;SOR=0.322;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=82;TCF=6;TCR=76;TR=31;WE=152508006;WS=152507988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,66:0.49:134
chr4	152508014	rs7664663	G	C	1989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-2.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.125;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=21;PP=379;ReadPosRankSum=0.282;SC=GCACTGCAAAGGATTAATTTT;SOR=0.332;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=86;TCF=27;TCR=59;TR=33;WE=152508022;WS=152508004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,49:0.46:106
chr4	152510130	rs2165789	A	T	1616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.590;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=44;PP=1010;ReadPosRankSum=1.036;SC=AGTGATGGACACTGAGGAGGG;SOR=0.779;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=149;TCF=60;TCR=89;TR=72;WE=152510138;WS=152510120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,79:0.48:164
chr4	152592469	rs112033226	A	ATTAC	2029.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.769;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=23;PP=1325;ReadPosRankSum=1.706;SC=AAGGACAGAAATTACTTACTT;SOR=0.809;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=81;TCF=5;TCR=76;TR=26;WE=152592477;WS=152592459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,53:0.50:105
chr4	152601146	rs907237	T	G	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.804;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=134;ReadPosRankSum=0.986;SC=GGGGTAAATATCGGACCCACG;SOR=1.179;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=10;WE=152601154;WS=152601136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr4	152609694	rs6535814	A	G	669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=1.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.56;ReadPosRankSum=1.116;SOR=1.238;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,19:0.41:46
chr4	152609700	rs6535815	A	C	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.25;ReadPosRankSum=0.019;SOR=0.635;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,25:0.45:56
chr4	152609920	rs11292952	TA	T	460.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=5.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQRankSum=0.581;QD=12.12;ReadPosRankSum=-1.004;SOR=0.146;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,30:0.79:38
chr4	152609998	rs11390610	C	CA	265.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.535;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.57;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=13;PP=273;ReadPosRankSum=-1.153;SC=CTGAAACTGTCCCCTCTGCCT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=13;WE=152610006;WS=152609988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr4	152643184	rs6817586	G	A	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.628;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=163;ReadPosRankSum=-2.633;SC=ATAAGCATCAGTCATCACACG;SOR=0.036;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=12;WE=152643192;WS=152643174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr4	152679816	rs3828546	A	G	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=99;ReadPosRankSum=1.930;SC=CTCCCTAAATAAGTATTTCCA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=5;WE=152679824;WS=152679815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr4	152681952	rs1429559	A	G	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.60;ReadPosRankSum=-0.165;SOR=0.632;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,36:0.46:78
chr4	153247176	.	A	G	2847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.436;ClippingRankSum=0.000;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.156;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=46;PP=1909;ReadPosRankSum=-0.070;SC=AATAGACTCTATTAGTATGCC;SOR=0.554;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=239;TCF=150;TCR=89;TR=117;WE=153247184;WS=153247166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,126:0.49:259
chr4	153267968	rs2714803	A	G	1219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=8;PP=932;SC=TGATTTCAAAATTCATCCACA;SOR=2.476;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=33;TCR=8;TR=41;WE=153267976;WS=153267958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr4	153332910	.	C	CAGG	1729.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.273;ClippingRankSum=0.000;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.399;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.08;MQRankSum=1.305;NF=5;NR=22;PP=1149;ReadPosRankSum=-0.444;SC=AGAGAGCCTCCAGTTCGTCGT;SOR=0.982;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=15;TCR=69;TR=27;WE=153332918;WS=153332900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,47:0.38:125
chr4	153549745	rs138358407	C	A	240.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.43;QD=24.08;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	153690842	rs4696354	T	C	2178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.022;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=43;PP=1228;ReadPosRankSum=-1.227;SC=TTGGTGCATATGGAATCACCA;SOR=0.779;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=204;TCF=109;TCR=95;TR=100;WE=153690850;WS=153690832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,108:0.48:226
chr4	153750918	rs10010297	G	A	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.815;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=22;PP=415;ReadPosRankSum=1.467;SC=AAGAATCATGGTAAGTCTTTA;SOR=1.759;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=74;TCF=23;TCR=51;TR=27;WE=153750926;WS=153750908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,29:0.34:85
chr4	153793489	rs35670437	CT	C	197.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=156;ReadPosRankSum=-0.293;SC=TTGTGGGAACCTTTTTTTCTT;SOR=0.330;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=8;WE=153793497;WS=153793479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr4	153870273	.	TAATAAGAAGAAGAAGAAGAAG	T	411.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;ClippingRankSum=0.000;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.11;SOR=0.573;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr4	153870355	rs12651510	T	C	1226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FS=0.602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.12;ReadPosRankSum=-0.852;SOR=0.678;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,67:0.44:151
chr4	153881625	.	T	G	693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.366;ClippingRankSum=0.000;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.298;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=5;PP=438;ReadPosRankSum=1.830;SC=AAAATCCTATTTTTTTAGAAG;SOR=0.476;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=61;TCF=51;TCR=10;TR=26;WE=153881633;WS=153881615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,29:0.45:65
chr4	153881835	rs3811834	C	T	1797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.239;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=41;PP=1056;ReadPosRankSum=2.455;SC=TTATTCTTCACGCAGTAAGAT;SOR=0.574;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=144;TCF=61;TCR=83;TR=74;WE=153881843;WS=153881825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,83:0.50:165
chr4	153884092	.	G	GGT	355.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.199;ClippingRankSum=0.000;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=3.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.86;ReadPosRankSum=0.333;SOR=0.936;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr4	153896358	rs3811833	C	T	4927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=84;PP=2965;SC=CAGAGCTCGGCGCCAGGGCGT;SOR=0.846;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=165;TCF=81;TCR=84;TR=165;WE=153896366;WS=153896348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr4	153897770	rs3811832	G	A	3509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=50;PP=1872;SC=GTGCCAACACGGAGGCCCCTC;SOR=0.741;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=107;TCF=57;TCR=50;TR=107;WE=153897778;WS=153897752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr4	154091111	rs34284701	C	T	659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=4;PP=460;SC=TAACTTCATCCGCATCTAAAG;SOR=2.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=21;WE=154091119;WS=154091101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	154178697	rs12643843	A	G	2203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.236;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=49;PP=1232;ReadPosRankSum=-0.864;SC=CTGTGCATGAACTGGCACATC;SOR=0.849;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=206;TCF=106;TCR=100;TR=98;WE=154178705;WS=154178687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,110:0.48:228
chr4	154191710	rs1470104	G	A	487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.960;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=271;ReadPosRankSum=-0.180;SC=AGTTTCGCAGGCTGACCTCCT;SOR=0.235;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=17;WE=154191718;WS=154191700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,21:0.66:32
chr4	154197234	rs2289409	T	G	1825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.559;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=42;PP=1062;ReadPosRankSum=-0.640;SC=AGACAGTCACTGCTGTGGCTG;SOR=0.612;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=159;TCF=78;TCR=81;TR=85;WE=154197242;WS=154197224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,92:0.53:175
chr4	154216710	rs893805	G	A	9018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=159;NR=142;PP=2965;SC=ACCTCGGGACGATCTTAACCA;SOR=0.742;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=301;TCF=159;TCR=142;TR=301;WE=154216718;WS=154216700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,334:1.00:334
chr4	154265827	rs71620253	T	G	1679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.755;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=23;PP=1114;ReadPosRankSum=-2.071;SC=AAACGCGTCCTGGCCTGTCCC;SOR=1.321;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=140;TCF=96;TCR=44;TR=78;WE=154265835;WS=154265817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,81:0.54:151
chr4	154479430	rs6848033	T	C	1480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.559;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=31;PP=956;ReadPosRankSum=-0.142;SC=TTGGCACTCGTAGAATCTCTA;SOR=0.620;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=162;TCF=85;TCR=77;TR=67;WE=154479438;WS=154479420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,74:0.42:178
chr4	154542814	rs7663417	G	T	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=1.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.00;ReadPosRankSum=-0.233;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,24:0.48:50
chr4	154544267	rs2289319	G	A	532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=12;PP=321;SC=AGGCACTCTCGGTGGCCCTTC;SOR=3.500;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=154544275;WS=154544257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	154553833	rs41280471	A	G	3347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=37;PP=2156;SC=GGGCCAGGTGAGGATAGGGTG;SOR=1.437;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=73;TCR=37;TR=110;WE=154553841;WS=154553823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr4	154553973	rs35897141	G	A	5894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=98;NR=107;PP=2965;SC=TTCAGGAGTCGGCCCCGGTTC;SOR=0.807;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=205;TCF=98;TCR=107;TR=205;WE=154553981;WS=154553963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr4	154624656	rs3804099	T	C	2411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=56;PP=1417;ReadPosRankSum=-0.773;SC=CAATTCAGAATGTAAGTCATC;SOR=0.678;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=181;TCF=84;TCR=97;TR=107;WE=154624664;WS=154624646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,112:0.58:194
chr4	154631543	rs2405432	A	T	6913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=126;NR=111;PP=2965;SC=TAGTGAATAGATAATGCCTTG;SOR=0.756;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=237;TCF=126;TCR=111;TR=237;WE=154631551;WS=154631533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr4	154633580	rs33952548	GA	G	828.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.261;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=648;ReadPosRankSum=-1.458;SC=TATATCCCCAGAAACATTCAA;SOR=1.127;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=41;TCF=32;TCR=9;TR=20;WE=154633588;WS=154633570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,30:0.50:60
chr4	154641489	rs1439166	T	C	955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.214;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=25;PP=530;ReadPosRankSum=1.425;SC=GAAATAAGAATGTGGCATATT;SOR=0.292;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=59;TCF=17;TCR=42;TR=38;WE=154641497;WS=154641479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,43:0.66:65
chr4	154644454	rs1456384	T	C	3487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=33;PP=1820;SC=CAGGTGAGTGTGCCAAGCAAG;SOR=1.536;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=69;TCR=33;TR=102;WE=154644462;WS=154644444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
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chr4	154709856	rs6535952	A	C	5519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.84;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
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chr4	155161666	rs6535989	C	T	4415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=47;PP=2757;SC=GCTTTGGTTTCGGCATCTCTT;SOR=1.550;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=138;TCF=91;TCR=47;TR=138;WE=155161674;WS=155161656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr4	155190927	rs11412936	T	TA	533.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=1;PP=481;SC=TAGGCTAGCTTAAAAAATTCT;SOR=4.407;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=15;WE=155190935;WS=155190917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	155225784	rs70947158	AAAACAAAC	A	759.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=1;PP=889;SC=CTGTCTTAAAAAAACAAACAA;SOR=4.407;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=10;WE=155225799;WS=155225779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	155243573	rs13109747	C	T	5998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=103;NR=102;PP=2965;SC=TATAATCATACGAAAGTATTG;SOR=0.794;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=205;TCF=103;TCR=102;TR=205;WE=155243581;WS=155243563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr4	155243604	rs1352714	T	C	4492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=87;PP=2826;SC=TATTTCACCATTGTTGGCGTC;SOR=1.144;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=151;TCF=64;TCR=87;TR=150;WE=155243612;WS=155243594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr4	155244401	rs140019361	TTTTG	T	1057.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=14;PP=706;SC=CAGGTCAGGATTTTGTTTGTT;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=15;WE=155244412;WS=155244391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	155244475	rs12500437	G	T	135.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=46;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=1;NR=7;PP=144;SC=CAGAGGCATAGGTCTAGCTGC;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=8;WE=155244483;WS=155244465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	155250786	rs34249493	G	A	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.489;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=246;ReadPosRankSum=0.012;SC=GTGGGGAGCCGCGGTCTGTCA;SOR=0.257;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=48;TCF=15;TCR=33;TR=20;WE=155250794;WS=155250776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,21:0.42:50
chr4	155250915	rs993975	G	C	107.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=4;PP=62;SC=AGGCGCACCAGGGCCAGAACC;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=155250923;WS=155250905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	155252934	rs4696548	C	T	1658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=27;PP=933;SC=CTCGAGCTATCTGAGTTTCAG;SOR=0.865;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=28;TCR=27;TR=55;WE=155252942;WS=155252924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr4	155256205	rs6858712	G	A	5479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=104;PP=2965;ReadPosRankSum=1.048;SC=GACCATCAACGAAAGTGTGGT;SOR=1.008;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=199;TCF=92;TCR=107;TR=195;WE=155256213;WS=155256194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,209:0.99:211
chr4	155287317	rs10005849	G	C	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=94;ReadPosRankSum=0.391;SC=TAGTTAAGCAGAAACTTTATA;SOR=1.085;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=7;WE=155287325;WS=155287307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr4	155287535	rs10017772	T	C	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.916;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=17;PP=434;ReadPosRankSum=1.056;SC=AAACACAGGATGATTATCATT;SOR=0.602;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=76;TCF=38;TCR=38;TR=37;WE=155287543;WS=155287525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,38:0.45:84
chr4	155295076	rs11721758	A	G	2476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.937;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=67;PP=1578;ReadPosRankSum=0.471;SC=CCTTACCTTCACCAGGGCTAA;SOR=0.785;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=259;TCF=116;TCR=143;TR=121;WE=155295084;WS=155295066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,124:0.45:274
chr4	155305491	rs34927139	C	T	981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.960;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=10;PP=693;ReadPosRankSum=-0.947;SC=TATGGCCCTCCTCCTCATGCA;SOR=0.543;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=76;TCF=57;TCR=19;TR=41;WE=155305499;WS=155305481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,43:0.54:80
chr4	155305772	rs55809190	C	T	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=284;ReadPosRankSum=1.015;SC=AGAGGAGAATCTTATCCTTGC;SOR=0.816;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=15;WE=155305780;WS=155305762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr4	155407407	rs4346631	A	T	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=312;ReadPosRankSum=0.288;SC=AGGTCTCGTCAGGGCATGAGA;SOR=0.492;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=18;WE=155407415;WS=155407397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr4	155407569	rs12501998	T	C	1702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.209;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=38;PP=812;ReadPosRankSum=1.340;SC=TTTTATCAGATGACATGGTAT;SOR=0.572;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=144;TCF=69;TCR=75;TR=77;WE=155407577;WS=155407559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,87:0.51:169
chr4	155407680	rs13151559	A	G	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=231;ReadPosRankSum=-1.311;SC=AAGCTGTAAAAGAGGAAAACT;SOR=0.588;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=47;TCF=20;TCR=27;TR=18;WE=155407688;WS=155407670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,20:0.38:52
chr4	155410409	rs13121403	A	G	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=7;PP=360;ReadPosRankSum=-0.553;SC=AACCCTCTCCATCCCTTCCCA;SOR=0.739;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=49;TCF=35;TCR=14;TR=28;WE=155410417;WS=155410399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,32:0.56:57
chr4	155410650	rs72731014	T	C	4265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.269;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=46;PP=1461;ReadPosRankSum=-0.695;SC=CGGTCTAGAGTCCGGATAGTG;SOR=0.707;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=204;TCF=106;TCR=98;TR=102;WE=155410658;WS=155410640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,113:0.50:224
chr4	155410667	rs55810732	G	A	4367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.008;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=48;PP=1418;ReadPosRankSum=0.432;SC=AGTGCTGATCGCACCGCTTTC;SOR=0.798;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=209;TCF=112;TCR=97;TR=107;WE=155410675;WS=155410657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,118:0.51:232
chr4	155410731	rs72731016	G	C	1901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.815;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=42;PP=1231;ReadPosRankSum=-0.724;SC=ATCTTTGATTGCAGGGAGCCG;SOR=0.684;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=169;TCF=87;TCR=82;TR=86;WE=155410739;WS=155410721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,91:0.50:183
chr4	155410909	rs35172627	A	G	3118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.409;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=58;PP=1767;ReadPosRankSum=1.227;SC=GTGGTTGGTCATTGAGGTCAG;SOR=0.738;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=285;TCF=157;TCR=128;TR=135;WE=155410917;WS=155410899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,154:0.49:315
chr4	155411065	rs7656522	T	C	3272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.173;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=66;PP=2140;ReadPosRankSum=-1.116;SC=GGCCGCCGGGTAGCAACGCGA;SOR=0.519;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=312;TCF=174;TCR=138;TR=142;WE=155411073;WS=155411055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:181,155:0.46:336
chr4	155411104	rs6536016	A	C	10731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=392;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=195;NR=165;PP=2965;SC=CCAAGGACAGAGAGATGCTCC;SOR=0.795;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=361;TCF=195;TCR=166;TR=360;WE=155411112;WS=155411094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,391:1.00:391
chr4	155411649	rs13130030	G	A	7038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=121;NR=121;PP=2965;SC=TTCTCATCCAGCACGCGCAGC;SOR=0.811;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=242;TCF=121;TCR=121;TR=242;WE=155411657;WS=155411639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr4	155411939	rs17373874	A	C	4649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=70;PP=2965;SC=ATCGTGGGCAACTGGCAGGCG;SOR=0.830;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=157;TCF=87;TCR=70;TR=157;WE=155411947;WS=155411929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr4	155412464	rs13149269	C	T	3291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=66;PP=2053;SC=CGGAGCCCGCCGCTGCTGACG;SOR=1.453;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=38;TCR=66;TR=104;WE=155412472;WS=155412454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr4	155484015	rs1800787	C	T	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.80;ReadPosRankSum=-1.132;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr4	155486381	rs2227401	C	T	2908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.474;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=56;PP=1712;ReadPosRankSum=-0.343;SC=CCCAAGGTCTCATAGCTGTAA;SOR=0.730;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=221;TCF=120;TCR=101;TR=124;WE=155486389;WS=155486371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,135:0.57:238
chr4	155486470	rs2227402	T	A	1591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.366;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=39;PP=917;ReadPosRankSum=-0.360;SC=TTATTACAAATAAATTCCAAG;SOR=0.922;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=116;TCF=46;TCR=70;TR=64;WE=155486478;WS=155486460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,72:0.58:125
chr4	155488821	rs6056	C	T	3226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=55;PP=1818;ReadPosRankSum=-1.417;SC=CTGTGAATAGCAATATCCCAA;SOR=0.673;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=249;TCF=148;TCR=101;TR=132;WE=155488829;WS=155488810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,151:0.53:283
chr4	155489085	rs2227411	A	G	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=388;ReadPosRankSum=0.180;SC=ACAGATCATAATGACATTACA;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=10;WE=155489103;WS=155489075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr4	155489095	rs2227412	A	G	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=809;ReadPosRankSum=0.988;SC=ATGACATTACAGTACATCATA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=13;WE=155489103;WS=155489075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr4	155490649	rs140114081	TTTTG	T	954.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.266;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.075;NF=13;NR=3;PP=642;ReadPosRankSum=1.132;SC=TGAGATTTTATTTTGTTTTTC;SOR=1.022;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=16;WE=155490660;WS=155490639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,26:0.48:54
chr4	155490832	rs4681	C	T	3170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.876;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=61;PP=1823;ReadPosRankSum=0.426;SC=TGAACAAATACAGAGGAACAG;SOR=0.629;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=267;TCF=137;TCR=130;TR=130;WE=155490840;WS=155490822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,150:0.50:299
chr4	155491759	rs4220	G	A	2348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.620;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=53;PP=1419;ReadPosRankSum=1.711;SC=TACTCAATGAGGAAGATGAGT;SOR=0.805;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=202;TCF=105;TCR=97;TR=102;WE=155491767;WS=155491749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,110:0.50:220
chr4	155508627	rs2070018	G	A	9170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=171;NR=134;PP=2965;SC=CCTCTACTCAGAAACAAGGAC;SOR=0.885;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=306;TCF=172;TCR=134;TR=305;WE=155508635;WS=155508617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,351:1.00:351
chr4	155510224	rs7656433	A	T	345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=9;PP=262;SC=TTCCTACCCTATCTCTTCCAG;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=155510232;WS=155510214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	155511897	rs2070011	T	C	2543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=44;PP=1381;SC=AAAGGATTGCTGCCACTCCTA;SOR=1.006;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=39;TCR=44;TR=83;WE=155511905;WS=155511887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr4	155525970	rs1049636	G	A	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.569;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=146;ReadPosRankSum=-0.794;SC=GTCAATAGAAGTTAGCAGTTA;SOR=1.085;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=23;TCF=14;TCR=9;TR=11;WE=155525978;WS=155525960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr4	155718171	.	A	ATT	88	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;FR=0.6232;HP=11;HapScore=3;MGOF=13;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=0;NR=9;PP=88;QD=10.7777777778;SC=GCTTTAAGACATTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=9;WE=155718179;WS=155718161;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:7,9:0.56:16
chr4	155719919	rs33918255	AT	A	2092.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.21;SOR=1.031;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr4	155720274	rs156502	T	C	6179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=112;NR=93;PP=2965;SC=AGCATCTTAATGGTCAGATTA;SOR=0.841;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=205;TCF=112;TCR=93;TR=205;WE=155720282;WS=155720264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr4	156135676	rs1047214	C	T	2777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.226;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=64;PP=1740;ReadPosRankSum=-0.410;SC=TTGAGATCATCCCGGACTTTG;SOR=0.892;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=212;TCF=106;TCR=106;TR=118;WE=156135684;WS=156135665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,128:0.55:234
chr4	156136027	rs2880415	C	T	2474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.018;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=50;PP=1372;ReadPosRankSum=-0.315;SC=TGTTCCACATCATCGCCATGT;SOR=0.798;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=201;TCF=103;TCR=98;TR=103;WE=156136035;WS=156136017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,117:0.51:228
chr4	156276100	rs3775250	A	G	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.260;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=58;ReadPosRankSum=0.847;SC=AAAACCGGAAATCATTTCTTT;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=4;WE=156276108;WS=156276090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr4	156276289	rs2341894	C	T	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.281;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=281;ReadPosRankSum=0.983;SC=CATGTAAATACACATTTTTCT;SOR=1.420;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=56;TCF=25;TCR=31;TR=22;WE=156276297;WS=156276279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,23:0.35:65
chr4	156276317	rs2880181	A	G	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.317;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=321;ReadPosRankSum=-1.031;SC=CCACTCCTATAAGAACAAGAA;SOR=1.501;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=46;TCF=17;TCR=29;TR=20;WE=156276325;WS=156276307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,20:0.38:52
chr4	156281311	rs17032890	T	G	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.158;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=294;ReadPosRankSum=-0.940;SC=TATGAATTTTTACAAATACCT;SOR=0.223;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=39;TCF=32;TCR=7;TR=21;WE=156281319;WS=156281301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,23:0.55:42
chr4	156294333	rs34082815	T	C	1171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.549;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=23;PP=640;ReadPosRankSum=0.718;SC=TTAGGTTTCATTTTTATTTTG;SOR=0.665;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=94;TCF=49;TCR=45;TR=46;WE=156294341;WS=156294323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,56:0.52:107
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chr4	156296821	rs1037028	T	C	661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.229;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=7;PP=417;ReadPosRankSum=-1.707;SC=TCAAAAGTAATATAAGATTTA;SOR=1.161;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=72;TCF=50;TCR=22;TR=30;WE=156296829;WS=156296811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,33:0.42:78
chr4	156632391	rs11944673	A	G	5238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=94;PP=2939;SC=ACTCTGTGAAAAAATCTTCAA;SOR=1.197;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=162;TCF=68;TCR=94;TR=162;WE=156632399;WS=156632381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr4	156706412	rs17033527	C	T	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.114;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=11;PP=366;ReadPosRankSum=-0.310;SC=TTTATGAAGCCTAGAAGAATG;SOR=0.953;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=76;TCF=43;TCR=33;TR=29;WE=156706420;WS=156706402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,33:0.37:90
chr4	156706482	rs1459853	G	A	2258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=29;PP=1263;SC=GTGCTGCAATGTAAGAGTTTA;SOR=0.843;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=43;TCR=29;TR=72;WE=156706490;WS=156706472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr4	156716436	rs56246223	A	G	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=9;PP=387;ReadPosRankSum=0.565;SC=ATTAATATCAAAGTATAAAAA;SOR=0.745;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=65;TCF=43;TCR=22;TR=29;WE=156716444;WS=156716426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,35:0.47:74
chr4	156723747	rs17313765	C	T	1591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.275;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=45;PP=1106;ReadPosRankSum=-1.205;SC=TGTTCTTTATCGCTGACTGCA;SOR=0.560;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=153;TCF=57;TCR=96;TR=73;WE=156723755;WS=156723737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,76:0.47:162
chr4	156725681	.	T	TA	216.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.767;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.74;ReadPosRankSum=0.195;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr4	156757789	rs113590442	G	GA	114.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=3;NR=0;PP=52;SC=TTTCAATAAAGAAAAAAAAAT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=3;WE=156757797;WS=156757779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr4	156757818	rs1399046	A	C	533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=13;NR=7;PP=377;SC=ATTATCAATAATTTAAAAGGC;SOR=1.721;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=13;TCR=7;TR=20;WE=156757826;WS=156757808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr4	156784970	rs932081	C	T	356.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=253;ReadPosRankSum=-0.905;SC=TAATGCTATCCGTAAAAAAAC;SOR=2.448;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=12;WE=156784978;WS=156784960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
chr4	156787214	rs1399044	A	G	326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=1;PP=223;SC=TATATTACTTATATTGTGTTC;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=156787222;WS=156787208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	156787340	rs6848883	G	A	4064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=58;PP=2233;SC=TTTACTCACCGTTCTCAGCAT;SOR=0.931;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=138;TCF=80;TCR=58;TR=138;WE=156787348;WS=156787330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr4	156826166	rs2137778	C	G	932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=4;PP=735;SC=TACTAAAGTTCATAAAAACCA;SOR=3.334;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=29;WE=156826174;WS=156826156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr4	156832841	rs12502494	C	T	383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=321;SC=TTCTCTTAACCTTTTCTCTTT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=12;WE=156832849;WS=156832831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	156839462	rs2292537	C	T	978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=20;PP=585;SC=TATACATTTGCTATCTAAAAA;SOR=1.675;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=9;TCR=20;TR=29;WE=156839470;WS=156839452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr4	156847230	rs1543108	A	G	1703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=22;NR=35;PP=1097;SC=TACCTAAGGGAAAAAAAAGGA;SOR=1.654;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=59;TCF=22;TCR=37;TR=57;WE=156847245;WS=156847220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr4	156847237	rs10714400	AG	A	1694.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=33;PP=1102;SC=GGGAAAAAAAAGGAATTATTA;SOR=1.654;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=33;WE=156847245;WS=156847220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr4	156874833	rs2292538	G	A	1001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=1.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.87;ReadPosRankSum=0.456;SOR=0.857;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,27:0.56:48
chr4	156874849	rs7671674	G	T	1152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.075;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=12;PP=335;ReadPosRankSum=-0.859;SC=ATCCCGGGGAGGCGCGCGCTC;SOR=0.811;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=47;TCF=28;TCR=19;TR=30;WE=156874857;WS=156874839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,33:0.61:54
chr4	157563266	rs7658059	A	G	249.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=0;PP=176;SC=TTGCCTGAGAAAGGCTAGACA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=157563274;WS=157563263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	158065038	rs12507409	T	C	1195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=16;PP=749;SC=ACGCCCCAACTCTGCTCATTG;SOR=1.085;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=25;TCR=16;TR=41;WE=158065046;WS=158065028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr4	158142775	rs41280505	G	A	606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.945;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=8;PP=368;ReadPosRankSum=1.967;SC=TTTCCCTCCCGGGGCACTGAC;SOR=0.877;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=66;TCF=45;TCR=21;TR=28;WE=158142783;WS=158142765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,31:0.43:72
chr4	158238830	rs4302506	T	C	2776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=42;PP=1495;ReadPosRankSum=-0.700;SC=TTGGAAAACATGTTAAAGGGT;SOR=0.712;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=50;TCR=43;TR=91;WE=158238838;WS=158238820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,105:0.98:107
chr4	158242540	rs4475186	G	A	408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=1;PP=291;SC=ATGTTAAGTAGCATTTTGTTC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=158242548;WS=158242530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	159076679	rs6830475	C	A	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.643;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=94;ReadPosRankSum=-0.464;SC=ATAAAAACTCCAGGTGCTGAA;SOR=0.156;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=9;WE=159076687;WS=159076669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
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chr4	159894199	rs1820511	T	A	748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=3.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.786;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=5;PP=525;ReadPosRankSum=0.046;SC=GAAAACAGTATACTATGAAAA;SOR=1.802;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=47;TCF=36;TCR=11;TR=28;WE=159894207;WS=159894189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,31:0.55:56
chr4	159894250	rs619128	C	T	3423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=35;PP=1911;SC=AAAGCCACTCCCCAGTCTTGA;SOR=1.479;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=69;TCR=35;TR=104;WE=159894258;WS=159894240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr4	159894305	rs662473	T	C	6097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=97;PP=2965;SC=CCAATTTCACTGACGTACTCA;SOR=0.745;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=204;TCF=107;TCR=97;TR=204;WE=159894313;WS=159894295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr4	160107918	rs10014197	T	C	755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=21;PP=514;ReadPosRankSum=0.202;SC=TTGAAGCATGTAACAATTTAA;SOR=0.592;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=49;TCF=16;TCR=33;TR=31;WE=160107926;WS=160107908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,33:0.60:55
chr4	160114277	rs6834634	G	C	949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=6;PP=666;SC=GACTGTATGTGTCATTTAAGG;SOR=2.448;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=29;WE=160114285;WS=160114267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr4	160162315	rs11944449	T	C	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.257;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=127;ReadPosRankSum=1.210;SC=GGAAATGTTGTGTTTGGAGAA;SOR=0.283;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=38;TCF=30;TCR=8;TR=13;WE=160162323;WS=160162305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,16:0.39:41
chr4	160251417	.	A	ATGTGTGTGTGTG	134.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.07;MQRankSum=-0.000;QD=16.84;ReadPosRankSum=0.319;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr4	160251447	rs370894212	G	A	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=65.61;MQRankSum=3.974;QD=7.77;ReadPosRankSum=-1.778;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr4	160260209	rs13127789	G	T	1116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.740;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=15;PP=759;ReadPosRankSum=1.759;SC=TTGCTTAATTGCATTGCCATA;SOR=0.925;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=69;TCR=30;TR=49;WE=160260217;WS=160260199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,50:0.49:102
chr4	160271268	.	G	GT	153.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.767;HP=11;HapScore=3;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=104;ReadPosRankSum=1.149;SC=CATATTTAAGGTTTTTTTTTT;SOR=2.891;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=10;WE=160271276;WS=160271258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr4	160274180	rs10034898	G	C	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.297;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=112;ReadPosRankSum=0.933;SC=GAATTTTTCTGCCATCCCAGT;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=160274188;WS=160274170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
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chr4	162680450	rs73860714	T	C	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=147;ReadPosRankSum=-0.384;SC=CACTAAATTATATAATTTTTC;SOR=0.384;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=11;WE=162680458;WS=162680440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr4	162697014	rs34423160	T	G	805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=11;PP=586;ReadPosRankSum=-0.269;SC=TTTGTTAATATAGTCACTAAT;SOR=0.616;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=53;TCF=37;TCR=16;TR=35;WE=162697022;WS=162697004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,35:0.61:57
chr4	162841814	rs5863499	T	TA	3111.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.394;NF=2;NR=62;PP=908;ReadPosRankSum=1.079;SC=CCTGAAGAATTAAAAAAAAAT;SOR=1.024;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=79;TCF=3;TCR=76;TR=64;WE=162841822;WS=162841804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:5,118:0.96:123
chr4	164048199	rs4691895	G	C	2911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.876;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=64;PP=1868;ReadPosRankSum=0.863;SC=AAACCAAAAAGTTTGTGTGAC;SOR=0.736;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=275;TCF=144;TCR=131;TR=135;WE=164048207;WS=164048189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,148:0.49:299
chr4	164050186	rs200516616	C	T	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.469;HP=2;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=77;ReadPosRankSum=-1.879;SC=GTAGCCCAACCCATGTTTACA;SOR=0.105;Source=Platypus;TCF=24;TR=9;WE=164050194;WS=164050176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
chr4	164058512	rs62335064	T	C	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.642;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=21;PP=527;ReadPosRankSum=1.157;SC=GTTCAACCTTTAATTTTGCAA;SOR=2.809;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=38;TCF=8;TCR=30;TR=23;WE=164058520;WS=164058502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,23:0.56:41
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chr4	164087954	rs936562	A	T	902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.489;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=25;PP=517;ReadPosRankSum=1.487;SC=CCAGAAATAGAAAAACAACTT;SOR=0.327;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=67;TCF=19;TCR=48;TR=37;WE=164087962;WS=164087944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,42:0.55:77
chr4	164415734	rs2276979	A	G	1917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.590;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=35;PP=1027;ReadPosRankSum=-0.414;SC=GTTGGGCTAGAGCTTAAAAGC;SOR=0.641;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=134;TCF=72;TCR=62;TR=78;WE=164415742;WS=164415724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,91:0.58:157
chr4	164435265	rs2304802	A	C	927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.561;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.656;NF=33;NR=11;PP=664;ReadPosRankSum=0.504;SC=CTTGATCCCCAAAAAAAGAGA;SOR=0.882;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=103;TCF=71;TCR=32;TR=44;WE=164435273;WS=164435255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,50:0.42:119
chr4	164438523	rs12643109	G	A	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.032;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=205;ReadPosRankSum=-1.578;SC=ATTATTTGTTGTACATAAAAT;SOR=0.882;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=45;TCF=31;TCR=14;TR=19;WE=164438531;WS=164438513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,25:0.44:57
chr4	164438790	rs140868699	TACAA	T	151.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=121;ReadPosRankSum=0.078;SC=AAGTTGGGCGTACAAACAGTT;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=4;WE=164438801;WS=164438780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr4	164440581	rs1561736	T	C	2552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.967;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQ=59.98;MQRankSum=-1.016;NF=65;NR=44;PP=1503;ReadPosRankSum=-0.102;SC=AGGAAAACTATTATAACTGTA;SOR=0.770;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=226;TCF=131;TCR=95;TR=109;WE=164440589;WS=164440571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,123:0.49:252
chr4	164440743	rs4362779	T	A	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=317;ReadPosRankSum=0.106;SC=CTAATTGTCATGATACAAAAA;SOR=0.582;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=15;WE=164440751;WS=164440733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr4	164450255	rs372244193	A	AT	168.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=2.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.27;ReadPosRankSum=-0.779;SOR=0.289;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr4	164466824	rs13130399	C	T	3801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.424;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=76;PP=2188;ReadPosRankSum=0.397;SC=CACAGGTGATCGCGATTACGT;SOR=0.662;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=271;TCF=148;TCR=123;TR=163;WE=164466832;WS=164466814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,179:0.59:301
chr4	164466970	rs11726828	C	T	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.082;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=335;ReadPosRankSum=0.865;SC=TTCCCAGACACAGATCATGAA;SOR=1.609;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=55;TCF=16;TCR=39;TR=23;WE=164466978;WS=164466960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,26:0.45:58
chr4	164477252	rs33943246	A	AT	1061.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.225;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=25;PP=486;ReadPosRankSum=0.180;SC=ACATTATTAGATTTTTTTTCG;SOR=1.162;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=55;TCF=2;TCR=53;TR=26;WE=164477260;WS=164477242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,47:0.53:88
chr4	164533316	rs907431	A	G	737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=2;PP=540;SC=AAAAAGAACAATGTAAATAAA;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=164533324;WS=164533306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr4	164621883	rs9308064	T	C	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=145;ReadPosRankSum=1.679;SC=CAGATAACAATTATAGGTTAA;SOR=0.693;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=10;WE=164621891;WS=164621873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr4	165118652	rs2288675	C	T	8759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=148;NR=147;PP=2965;SC=CCCTGAGACTCTTAGTTCAAG;SOR=0.750;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=295;TCF=148;TCR=147;TR=295;WE=165118660;WS=165118642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,321:1.00:321
chr4	165118796	rs2288674	G	A	3471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=60;PP=1980;SC=GTTGTCCAGGGCAAGTTCTTT;SOR=1.143;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=45;TCR=60;TR=105;WE=165118804;WS=165118786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr4	165878609	rs3196673	T	A	793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=23;PP=518;ReadPosRankSum=-0.646;SC=GGTTTGGGTCTGCAGTGGGCT;SOR=0.560;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=53;TCF=14;TCR=39;TR=32;WE=165878617;WS=165878599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,34:0.61:56
chr4	165891214	rs201160598	T	C	1057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-6.428;NF=26;NR=45;PP=973;ReadPosRankSum=0.077;SC=GGCCTAGCTCTCTAGAGCTCA;SOR=0.646;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=190;TCF=70;TCR=120;TR=71;WE=165891222;WS=165891204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,56:0.38:148
chr4	165891229	.	C	T	1221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.514;ClippingRankSum=0.000;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=1.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.89;MQRankSum=-5.458;QD=11.98;ReadPosRankSum=-0.704;SOR=0.928;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,39:0.38:102
chr4	165891236	.	A	G	1097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.951;ClippingRankSum=0.000;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.63;MQRankSum=-5.239;QD=14.44;ReadPosRankSum=-0.730;SOR=0.763;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,28:0.37:76
chr4	165891247	rs201936482	A	C	886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.15;MQRankSum=-2.112;QD=17.39;ReadPosRankSum=0.431;SOR=0.916;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,35:0.69:51
chr4	166199345	rs55806488	C	T	5318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.393;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=-0.769;NF=104;NR=65;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.817;SC=TCAAACCGCTCCATCGTGACG;SOR=0.832;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=172;TCF=105;TCR=67;TR=169;WE=166199353;WS=166199335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,194:0.98:197
chr4	166227031	.	T	C	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.790;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=110;ReadPosRankSum=-0.578;SC=CTCATATGCCTCTCAAGACAT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=6;WE=166227039;WS=166227021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr4	166231868	rs28678193	A	G	1548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=36;PP=1088;SC=TAAATGGATTATTATACGCTG;SOR=1.739;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=17;TCR=36;TR=53;WE=166231876;WS=166231858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr4	166243082	rs60759634	A	G	1078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=6;PP=609;SC=TGATTTGTACAGTTCCTCCTG;SOR=2.191;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=32;WE=166243090;WS=166243072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr4	166258905	rs72701627	G	A	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.067;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=349;ReadPosRankSum=0.937;SC=TCTGATAGCAGAGACTAATAT;SOR=0.929;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=55;TCF=37;TCR=18;TR=25;WE=166258913;WS=166258895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,25:0.44:57
chr4	166261589	rs7679322	A	G	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=222;ReadPosRankSum=-0.596;SC=TCATGGCCATAAGATTATCAT;SOR=0.743;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=16;WE=166261597;WS=166261579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,18:0.40:45
chr4	166261609	rs7679808	G	T	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=69;ReadPosRankSum=1.167;SC=TATTTCTAAGGAGACTAATAG;SOR=0.593;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=26;TCF=8;TCR=18;TR=9;WE=166261617;WS=166261599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr4	166262864	rs72701630	G	A	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.560;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=171;ReadPosRankSum=2.131;SC=CATTTGAGATGTATTTATTCC;SOR=1.179;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=12;WE=166262872;WS=166262854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr4	166263047	rs17585739	G	A	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.945;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=11;PP=234;ReadPosRankSum=0.277;SC=CAGACTCTCAGTATAATGCCT;SOR=0.297;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=45;TCF=18;TCR=27;TR=21;WE=166263055;WS=166263037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,28:0.51:55
chr4	166388825	.	CT	C	290.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.425;ClippingRankSum=0.000;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=3.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.49;ReadPosRankSum=0.442;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,22:0.42:53
chr4	166403574	rs2289230	A	G	1172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=30;PP=726;ReadPosRankSum=1.731;SC=AGGTTTTATAAGATGATTTCT;SOR=0.614;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=80;TCF=29;TCR=51;TR=48;WE=166403582;WS=166403564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,52:0.60:86
chr4	166405584	rs4690821	C	T	2241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.028;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=45;PP=1234;ReadPosRankSum=-0.605;SC=GTAGTGCTCACGAATACAGCT;SOR=0.845;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=242;TCF=129;TCR=113;TR=98;WE=166405592;WS=166405574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,115:0.41:280
chr4	166405800	rs2304592	T	C	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.080;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=367;ReadPosRankSum=-0.034;SC=TGTAGCTTATTTACAATGACC;SOR=0.130;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=35;TCF=2;TCR=33;TR=19;WE=166405808;WS=166405790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr4	166408517	rs2276931	T	C	1207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=16;PP=742;ReadPosRankSum=-0.281;SC=TGGTTCTTGATTCAGAAGACT;SOR=0.734;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=110;TCF=74;TCR=36;TR=49;WE=166408525;WS=166408507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,56:0.47:119
chr4	166408782	rs3822062	T	G	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.856;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=28;PP=636;ReadPosRankSum=-0.346;SC=TTCAAACCTGTCCTACAATGG;SOR=0.811;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=86;TCF=27;TCR=59;TR=39;WE=166408790;WS=166408772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,40:0.43:93
chr4	166416643	rs7692951	A	G	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.980;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=390;ReadPosRankSum=-0.503;SC=CTTAGATGGCATAATTATGCA;SOR=1.591;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=47;TCF=36;TCR=11;TR=25;WE=166416651;WS=166416633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,24:0.51:47
chr4	166960481	rs41280515	C	T	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.485;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=233;ReadPosRankSum=-0.020;SC=TGCTTACCTCCATTTTGCAGA;SOR=1.220;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=54;TCF=36;TCR=18;TR=21;WE=166960489;WS=166960471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,22:0.39:56
chr4	167012241	rs377180243	GTTT	G,GTT	1075.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=2;PP=411;SC=TGAGTGATTTGTTTTTTTTTA;SOR=4.003;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=14;WE=167012258;WS=167012231;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:23
chr4	167012250	.	T	TAA	1367.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.16;SOR=2.910;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr4	167012381	rs2654492	G	A	6544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=117;NR=112;PP=2965;SC=TTGGACGACTGTGTGGCAACA;SOR=0.717;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=229;TCF=117;TCR=112;TR=229;WE=167012389;WS=167012371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr4	167012480	rs2646914	T	C	2974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=60;PP=1939;SC=GCTTTCAAGCTACACATTCTA;SOR=1.418;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=36;TCR=60;TR=96;WE=167012488;WS=167012470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr4	167012506	rs2254420	A	G	1924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=40;PP=1257;SC=CAGCAAATTCAAGTCATGCTT;SOR=1.542;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=23;TCR=40;TR=63;WE=167012514;WS=167012496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr4	167012543	rs2654493	T	C	929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=22;PP=636;SC=ATCCAGGTTTTTCTTCTGGTG;SOR=2.165;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=30;WE=167012551;WS=167012533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr4	167833973	rs62354113	A	G	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.851;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=181;ReadPosRankSum=-0.262;SC=CCTCTCCTAAACTGCCATTCC;SOR=0.269;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=14;WE=167833981;WS=167833963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr4	167932509	rs10517920	C	T	1527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.083;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=47;PP=988;ReadPosRankSum=0.484;SC=CCTATTCAAACAACCTCTCTA;SOR=0.904;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=149;TCF=51;TCR=98;TR=70;WE=167932517;WS=167932499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,74:0.45:164
chr4	168004426	rs13117458	C	T	2625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-1.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=64;PP=1401;ReadPosRankSum=-0.714;SC=TTCCTCCAACCAAGCCCAAAT;SOR=0.716;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=266;TCF=115;TCR=151;TR=113;WE=168004434;WS=168004416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,133:0.44:304
chr4	168004478	rs7654164	A	G	1775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.656;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=44;PP=1046;ReadPosRankSum=0.131;SC=GATGCCCCACAGTTCCCCACC;SOR=0.368;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=119;TCF=41;TCR=78;TR=72;WE=168004486;WS=168004468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,80:0.61:132
chr4	168155013	.	G	A	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.588;ClippingRankSum=-0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=147;ReadPosRankSum=0.942;SC=CTGCGCCGCCGCGTTTCCCTA;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=8;WE=168155021;WS=168155009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr4	169049106	rs10002305	T	C	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.104;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=139;ReadPosRankSum=0.181;SC=AACTCCTGACTTCAGGTGATC;SOR=0.052;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=10;WE=169049114;WS=169049096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr4	169190129	rs33910888	CA	C	184.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.37;MQRankSum=0.000;QD=2.64;ReadPosRankSum=-1.419;SOR=0.730;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,18:0.26:70
chr4	169279170	rs497151	A	G	312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=1;PP=255;SC=AGCAGAGCTGATATCTGAGTT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=169279178;WS=169279160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	169282112	rs2684346	C	T	492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=2;PP=383;SC=AAAAAAACAGCGTGACAGTGT;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=169282120;WS=169282102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	169282232	rs2684347	G	A	2360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=27;PP=1389;SC=CTTACACAAAGGAAGAGCTAT;SOR=1.013;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=46;TCR=27;TR=73;WE=169282240;WS=169282222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr4	169282355	rs2684348	T	C	3005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=43;NR=48;PP=1627;SC=AGCTGTCCCATACGCATCCTA;SOR=0.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=43;TCR=48;TR=91;WE=169282363;WS=169282345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr4	169292759	rs6829368	T	C	1576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=39;NR=10;PP=904;SC=ACCCATAAACTTACCCATTTT;SOR=1.823;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=39;TCR=10;TR=49;WE=169292767;WS=169292749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr4	169294859	rs13133439	C	T	3104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=64;PP=1815;ReadPosRankSum=-1.163;SC=TATCTGTGTTCCCCGAAAGAC;SOR=0.706;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=268;TCF=136;TCR=132;TR=131;WE=169294867;WS=169294849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,148:0.50:295
chr4	169299528	rs13110927	T	C	1347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=12;PP=904;SC=AAACTTAAATTAGCATTTTGG;SOR=1.814;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=31;TCR=12;TR=43;WE=169299536;WS=169299518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr4	169299676	rs10517990	T	G	1128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=24;PP=710;SC=TTGATTCCATTTATTTTCTGC;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=12;TCR=24;TR=36;WE=169299684;WS=169299666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr4	169301059	rs1489232	T	C	376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=11;PP=305;SC=ATAGTACACATACATACTATA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=169301067;WS=169301049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	169312801	rs6840397	A	G	946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.09;ReadPosRankSum=-1.400;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,40:0.98:41
chr4	169315571	rs11337868	TA	T	968.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=0;PP=1045;SC=TTCAGCATCATAATATGCACA;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=26;WE=169315579;WS=169315561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	169315760	rs3749499	C	A	6080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=118;PP=2965;SC=GTAATACCCTCTCCAAAGTCT;SOR=1.164;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=204;TCF=86;TCR=118;TR=202;WE=169315768;WS=169315750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr4	169317081	rs1826028	C	A	824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=9;PP=526;SC=ACAACTGTAACGTATTATATT;SOR=1.329;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=16;TCR=9;TR=25;WE=169317089;WS=169317071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	169336662	rs4692661	T	C	1569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=26;NR=22;PP=876;SC=TCTCTCTCCATAGAGCACTAG;SOR=0.841;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=26;TCR=22;TR=48;WE=169336670;WS=169336652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr4	169340639	rs1021318	C	A	757.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=18;PP=519;SC=TATGCTGCTGCTGATAGCAGT;SOR=2.670;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=169340647;WS=169340629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	169341435	rs2130145	A	G	5499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=118;NR=70;PP=2965;SC=ACATTGTGACAATAATCTCTT;SOR=1.195;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=188;TCF=118;TCR=70;TR=188;WE=169341443;WS=169341425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr4	169341608	rs141226900	TACACATACACACACACACACAC	TAC,T	1864.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=0,0;NR=17,17;PP=909,119;SC=ACCGAATCCATACACATACAC;SOR=2.078;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=2;TCR=40;TR=17,17;WE=169341637;WS=169341598;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:49
chr4	169362557	rs13151700	C	G	1842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.502;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=37;PP=1227;ReadPosRankSum=-2.644;SC=GACTTTCCAACGTTAAATTCT;SOR=0.735;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=195;TCF=108;TCR=87;TR=84;WE=169362565;WS=169362547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,92:0.43:214
chr4	169369820	rs2712113	T	A	1565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=18;PP=1099;SC=AGTAGAAGGCTATATTCTTTA;SOR=1.651;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=37;TCR=18;TR=55;WE=169369828;WS=169369810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr4	169369853	rs2712114	A	T	2510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=33;PP=1612;SC=CATACAAGTCAGAAACATGAT;SOR=1.216;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=87;TCF=53;TCR=34;TR=86;WE=169369861;WS=169369843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr4	169369920	rs12507582	C	T	987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=26;PP=616;ReadPosRankSum=-0.128;SC=GAAATATTCACACCACTTGTT;SOR=0.763;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=105;TCF=51;TCR=54;TR=49;WE=169369928;WS=169369910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,51:0.44:115
chr4	169374487	rs2634953	A	G	2865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=53;PP=1696;SC=GTGAAATGGCATTGAAATAGG;SOR=1.136;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=41;TCR=53;TR=94;WE=169374495;WS=169374477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr4	169382822	rs5863935	A	AC	304.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.854;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=144;ReadPosRankSum=0.537;SC=AGAAATCAGGAAAAAAATGAG;SOR=2.387;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=7;WE=169382830;WS=169382812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr4	169392091	rs7680471	G	A	1899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.043;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=47;PP=1203;ReadPosRankSum=0.488;SC=AGGATGGACTGGGCAGGGGCA;SOR=0.786;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=205;TCF=105;TCR=100;TR=93;WE=169392099;WS=169392081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,98:0.44:221
chr4	169393179	rs12505232	T	G	277.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=228;SC=AGCTACTGTTTGTTGAGTACC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=169393187;WS=169393169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	169393595	rs13149639	A	G	3062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=47;PP=1805;SC=TTTTTACTTCACAGTACTTAC;SOR=0.763;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=60;TCR=47;TR=106;WE=169393603;WS=169393585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr4	169393972	rs113626526	G	GA	3968.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=77;PP=2763;SC=TGTAATAAAAGAAAAAATAGA;SOR=1.721;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=95;TCF=7;TCR=88;TR=83;WE=169393980;WS=169393962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr4	169432673	rs61051061	C	T	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.937;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=9;PP=389;ReadPosRankSum=-0.036;SC=GGACCTCCTCCCATGAGTCCT;SOR=0.826;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=58;TCF=37;TCR=21;TR=23;WE=169432681;WS=169432663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,27:0.39:69
chr4	169432841	rs1806729	G	A	1378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=27;PP=862;ReadPosRankSum=-1.142;SC=ACTCGGAAAAGGAGATCTCGC;SOR=0.723;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=135;TCF=73;TCR=62;TR=61;WE=169432849;WS=169432831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,67:0.43:155
chr4	169433326	rs7655494	TG	CA	3291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FS=3.253;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.71;ReadPosRankSum=0.913;SOR=0.939;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,86:0.44:197
chr4	169433333	rs7673220	C	T	3212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FS=1.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.14;ReadPosRankSum=1.274;SOR=0.795;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:112,87:0.44:199
chr4	169589214	rs2723705	T	C	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.074;HP=1;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=187;ReadPosRankSum=-0.909;SC=AACACTGACATTGTTTTTTTT;SOR=2.007;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=11;WE=169589224;WS=169589204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr4	169799448	rs62333013	A	G	1341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.40;SOR=0.729;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
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chr4	169835048	rs1532651	C	G	2961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=27;PP=1988;SC=TTTTAAATAGCAAATCATTTA;SOR=1.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=66;TCR=27;TR=93;WE=169835056;WS=169835038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr4	169846255	rs3733656	T	C	1886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=36;PP=1269;ReadPosRankSum=-0.638;SC=TCTCATTTCATTGCGTTTACT;SOR=0.405;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=29;TCR=37;TR=65;WE=169846263;WS=169846245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,68:0.99:69
chr4	169846359	rs66895777	GCT	G	3021.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=25;PP=1850;SC=AATTCATATTGCTCTCTCTCT;SOR=1.136;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=50;TCF=22;TCR=28;TR=39;WE=169846368;WS=169846349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr4	169847646	rs35375934	TA	T	225.52	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.90;MQRankSum=0.603;QD=18.79;ReadPosRankSum=0.754;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
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chr4	169931268	rs28371817	G	A	5483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.52;SOR=0.937;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr4	169931274	rs2279038	G	A	5386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.04;SOR=0.936;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr4	169931288	rs2279039	T	C	4318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=40;NR=48;PP=1467;SC=TGGGAGCCCCTCTCCAGGTTC;SOR=1.061;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=96;TCF=42;TCR=54;TR=88;WE=169931296;WS=169931258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr4	170037323	rs10017472	G	A	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.203;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=284;ReadPosRankSum=-1.991;SC=TTGTTGAACAGTGAGTCCTCT;SOR=0.283;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=20;WE=170037331;WS=170037313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,25:0.61:41
chr4	170037572	rs3811813	G	A	2368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.312;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=52;PP=1379;ReadPosRankSum=0.717;SC=GAAGTCAGTGGAGCAGCTGCT;SOR=0.863;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=196;TCF=91;TCR=105;TR=95;WE=170037580;WS=170037562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,111:0.51:219
chr4	170041864	rs147918956	T	TAAC	283.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.167;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=161;ReadPosRankSum=0.280;SC=CTTGGCTATGTAACAGGCAAT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=5;WE=170041872;WS=170041854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr4	170077432	rs9312445	A	G	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.29;ReadPosRankSum=1.501;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr4	170077459	rs35455310	AT	A	91.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.976;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=39;ReadPosRankSum=0.618;SC=CAAAACTTGTATTTTTTTTTG;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=4;WE=170077467;WS=170077449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr4	170077540	rs10024401	A	G	1258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.739;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=17;PP=791;ReadPosRankSum=1.515;SC=GAAAACAAGCACATTCTACCT;SOR=0.850;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=67;TCR=29;TR=56;WE=170077548;WS=170077530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,62:0.55:113
chr4	170077789	rs10518039	A	G	1160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=35;PP=761;ReadPosRankSum=-1.314;SC=CTTTTCCTTCATAGTTGTATA;SOR=0.623;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=108;TCF=38;TCR=70;TR=55;WE=170077797;WS=170077779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,56:0.51:109
chr4	170315496	rs4692721	C	T	1012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=8;PP=659;SC=AGAATCTTCACTGAAAAATGG;SOR=2.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=34;WE=170315504;WS=170315486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr4	170345632	rs72691049	T	A	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.448;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=393;ReadPosRankSum=0.146;SC=CTCAATATTATGGTTTATAAA;SOR=1.258;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=20;WE=170345640;WS=170345622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr4	170345893	rs7655924	C	T	1713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.976;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=35;PP=997;ReadPosRankSum=2.089;SC=AAAATGGTTCCGGTTGCACAG;SOR=0.551;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=73;TCR=66;TR=74;WE=170345901;WS=170345883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,80:0.51:156
chr4	170354836	rs7680152	C	T	2092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=19;NR=46;PP=1341;SC=ATAAACGTAACGAGAGACATC;SOR=1.842;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=19;TCR=46;TR=65;WE=170354844;WS=170354826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr4	170354873	rs13139925	T	C	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=223;ReadPosRankSum=0.158;SC=CAAGAGAATATTGAATAAACT;SOR=0.656;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=13;WE=170354881;WS=170354863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr4	170398717	rs67794467	C	T	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-1.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=90;ReadPosRankSum=-0.761;SC=AAAAATATTACATCCTCGTTA;SOR=1.022;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=7;WE=170398725;WS=170398707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr4	170428086	rs11335571	GA	G	92.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.191;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=45;ReadPosRankSum=-0.369;SC=TGAAAAAACAGAAAAAAAAAA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=5;WE=170428094;WS=170428076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr4	170428331	rs6855803	G	T	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=8.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.71;ReadPosRankSum=0.589;SOR=0.537;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr4	170429241	rs66858776	T	G	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.593;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.472;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=32;ReadPosRankSum=1.531;SC=AAATCACATATATAAGATTTA;SOR=0.061;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=5;WE=170429249;WS=170429231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr4	170429359	rs66509122	C	T	1781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.734;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=31;PP=1116;ReadPosRankSum=1.355;SC=CCTACTATGACATCATTCAAT;SOR=1.011;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=149;TCF=90;TCR=59;TR=82;WE=170429367;WS=170429349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,86:0.53:163
chr4	170429402	rs17544885	T	C	3023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.006;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=60;PP=1854;ReadPosRankSum=1.169;SC=AACCTACCTTTTCACCACGAA;SOR=0.572;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=248;TCF=140;TCR=108;TR=131;WE=170429410;WS=170429392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,144:0.52:278
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chr4	170483483	rs11381394	T	TA	75.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5344;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=67;ReadPosRankSum=-1.309;SC=TACATTATCTTAAAAAAAAAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=6;WE=170483491;WS=170483473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
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chr4	170501954	rs7670271	T	C	906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.552;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=20;PP=422;ReadPosRankSum=0.658;SC=GGTTGATTATTGCAAACAGAT;SOR=0.912;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=95;TCF=51;TCR=44;TR=39;WE=170501962;WS=170501944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,46:0.41:111
chr4	170508586	rs9993493	T	C	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=229;ReadPosRankSum=0.000;SC=AATTCAAAAATGGACTTAGAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=11;WE=170508594;WS=170508576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr4	170581570	rs4692739	G	A	5726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=113;NR=84;PP=2965;SC=GGAGGAGACAGTATTCCCCTG;SOR=0.853;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=197;TCF=113;TCR=84;TR=197;WE=170581578;WS=170581560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr4	170616918	rs2062609	G	A	341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=10;PP=236;SC=TTTCAGTTTTGTAGGTGATGT;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=170616926;WS=170616908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	170628524	rs9996636	A	G	295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=9;PP=241;SC=GGCAAGGGACATTATTTTATG;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=170628532;WS=170628514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	170634408	rs1010713	A	G	898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=26;PP=566;ReadPosRankSum=-0.502;SC=ATATTTTCCGAAAGCTGGGAC;SOR=0.670;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=94;TCF=30;TCR=64;TR=38;WE=170634416;WS=170634398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,43:0.41:105
chr4	170663235	rs1047642	C	T	1306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=20;PP=643;SC=CGTTATTTCTCTAAGTTTTTT;SOR=0.963;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=20;TCR=20;TR=40;WE=170663243;WS=170663225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr4	170663321	rs6849004	C	G	652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=10;PP=336;SC=AAAGACCTTTCAAAGTTGAGC;SOR=1.051;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=10;TCR=10;TR=20;WE=170663329;WS=170663311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	170678993	rs11540095	T	C	3824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=47;PP=2368;SC=GCGGCCCCTCTCCGCCGGGCC;SOR=0.933;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=74;TCR=47;TR=121;WE=170679001;WS=170678983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr4	170985855	rs201368750	A	ACCT	4882.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.352;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.03;MQRankSum=1.204;NF=13;NR=35;PP=1976;ReadPosRankSum=1.253;SC=CCAGCCCTTCACCTCCCAGTT;SOR=0.596;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=162;TCF=45;TCR=117;TR=48;WE=170985863;WS=170985845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:188,131:0.41:319
chr4	170987636	rs1480544	A	G	6371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=121;PP=2965;SC=AACCCTAGAAAAAGAAAACAA;SOR=1.188;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=207;TCF=86;TCR=121;TR=207;WE=170987644;WS=170987626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr4	170989708	rs3214945	C	CA	245.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;QD=22.34;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	170990029	rs17628775	T	C	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.853;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=110;ReadPosRankSum=-1.035;SC=CAAGATCGACTACGTATTTCG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=6;WE=170990037;WS=170990019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr4	170991811	rs149355054	AGGTT	A	528.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.485;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.156;NF=1;NR=9;PP=396;ReadPosRankSum=0.633;SC=AAGCTAAAAAAGGTTGAAGTA;SOR=0.204;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=10;WE=170991822;WS=170991801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,15:0.45:33
chr4	170994554	rs5864015	GT	G	512.25	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=5.071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.42;MQRankSum=0.662;QD=16.01;ReadPosRankSum=-1.154;SOR=0.746;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,28:0.88:32
chr4	170999860	rs2622068	G	A	2117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=53;PP=1502;SC=TTGTTTATAAGGGGCCAAACA;SOR=2.124;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=74;TCF=20;TCR=54;TR=73;WE=170999868;WS=170999850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr4	172735897	rs3796654	C	G	1441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=31;PP=968;SC=AAAGATCACACAAGGATTGGT;SOR=1.958;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=13;TCR=31;TR=44;WE=172735905;WS=172735887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr4	172973421	rs1505494	G	A	1435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=5;PP=824;SC=AGAGCCTCAAGGCAGAGAGGA;SOR=2.774;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=32;WE=172973432;WS=172973411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr4	172973423	rs10572855	CAG	C	798.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.716;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=515;ReadPosRankSum=1.346;SC=AGCCTCAAGGCAGAGAGGATA;SOR=1.547;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=13;WE=172973432;WS=172973411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr4	172973580	rs1505495	C	A	1935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.997;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=50;PP=1221;ReadPosRankSum=0.218;SC=TTTACCCCAACCCATTCACCA;SOR=1.029;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=183;TCF=89;TCR=94;TR=89;WE=172973588;WS=172973570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,94:0.48:194
chr4	173232679	rs2136033	A	G	832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=0;PP=712;SC=AATAGGCGATAATACACATTC;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=173232687;WS=173232669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	173232805	rs9312524	G	A	1986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=42;PP=1453;ReadPosRankSum=0.556;SC=TTACTGAAGAGGACCATGATG;SOR=0.706;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=220;TCF=127;TCR=93;TR=97;WE=173232813;WS=173232795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,102:0.40:256
chr4	173269638	rs333399	T	C	1689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=21;PP=1053;ReadPosRankSum=0.468;SC=AAGAGTTTTGTATTTGACACA;SOR=0.772;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=102;TCF=70;TCR=32;TR=65;WE=173269646;WS=173269628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,73:0.63:116
chr4	173269915	rs333398	C	T	143.90	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5268;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=105;ReadPosRankSum=0.366;SC=TTAAAAAAGACAATGGGAGCT;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=6;WE=173269923;WS=173269905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr4	173873170	rs11322401	TG	T	4001.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=40;PP=2698;SC=ATGACATTTTTGTTTTCCTGC;SOR=1.074;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=22;TCR=40;TR=62;WE=173873178;WS=173873160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr4	173930479	rs4696042	A	G	878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=23;PP=596;SC=GGCAGTGGGAACCAGTCGGGG;SOR=3.407;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=26;WE=173930487;WS=173930469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	174090004	rs3733477	G	A	6431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=113;NR=99;PP=2965;SC=TGAAGATTGGGTTCATCTTAC;SOR=0.760;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=212;TCF=113;TCR=99;TR=212;WE=174090012;WS=174089994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr4	174217122	rs4696055	A	G	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.458;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.472;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=181;ReadPosRankSum=0.983;SC=GTTATCCCTCATCTATTTGTT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=9;WE=174217130;WS=174217112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr4	174235079	.	GATAT	G	75	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=5;NR=2;PP=75;QD=12.0;SC=TTTTTATAACGATATATATAT;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=7;WE=174235090;WS=174235069;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:26,7:0.21:33
chr4	174310777	rs4695833	A	T	322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=236;SC=AGGTCTGGGGAGGAGTCCAAG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=174310785;WS=174310767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	174537063	rs4413383	G	A	705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=4;PP=659;SC=TGGAGATCCAGACATAAGTGA;SOR=4.003;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=28;WE=174537071;WS=174537053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr4	174537221	rs11726970	T	C	2316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=2.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.757;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.326;NF=71;NR=38;PP=1714;ReadPosRankSum=-0.304;SC=CTCTTCTCATTCAGAGGTGTA;SOR=1.154;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=263;TCF=160;TCR=103;TR=109;WE=174537229;WS=174537211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,110:0.40:276
chr4	174537356	rs34402795	T	A	3581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=404;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.745;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.248;NF=71;NR=87;PP=2250;ReadPosRankSum=0.084;SC=TCAAATTTGTTGAGTAGCTGG;SOR=0.820;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=367;TCF=172;TCR=195;TR=158;WE=174537364;WS=174537346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:227,175:0.44:402
chr4	174537471	rs13103221	G	A	2063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.451;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.677;NF=47;NR=46;PP=1255;ReadPosRankSum=-0.721;SC=AATTTGCATAGTCCTCAAGAA;SOR=0.586;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=263;TCF=130;TCR=133;TR=93;WE=174537479;WS=174537461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:188,107:0.36:295
chr4	174537658	rs62342044	C	T	2569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.300;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=55;PP=1368;ReadPosRankSum=0.911;SC=CCTTTTCTTTCGAGGAGGCTG;SOR=0.479;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=224;TCF=104;TCR=120;TR=110;WE=174537666;WS=174537648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,125:0.50:249
chr4	175225452	rs4695918	G	A	2356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FS=1.712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.39;ReadPosRankSum=-1.797;SOR=0.566;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,116:0.56:207
chr4	175237408	rs1553669	T	C	2227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.257;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=52;PP=1146;ReadPosRankSum=0.724;SC=GAGCCTCTACTGTTAATTACT;SOR=0.494;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=173;TCF=77;TCR=96;TR=96;WE=175237416;WS=175237398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,109:0.55:200
chr4	175237536	rs72993320	C	T	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=216;ReadPosRankSum=-1.298;SC=AAATAGCAAACGCGAATCTTA;SOR=0.631;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=11;WE=175237544;WS=175237526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr4	175413296	rs17060532	C	T	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.034;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=170;ReadPosRankSum=1.124;SC=GGCATATTACCACTTCATTTT;SOR=1.375;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=11;WE=175413304;WS=175413286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr4	175414246	rs2612694	A	G	148.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=149;SC=TTTATAGCTTATCTAAATAAT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=175414254;WS=175414236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	175429213	rs3846298	C	T	943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=14;PP=590;ReadPosRankSum=-0.247;SC=CCATGTTCTTCTTCTCTTTCT;SOR=0.760;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=101;TCF=68;TCR=33;TR=43;WE=175429221;WS=175429203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,48:0.44:110
chr4	175429370	rs5864277	GT	G	7695.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=12;NR=109;PP=2951;SC=TGATGTACGAGTTAAGGAATG;SOR=1.011;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=125;TCF=12;TCR=113;TR=121;WE=175429378;WS=175429360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr4	175429808	rs3775977	G	A	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.885;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=177;ReadPosRankSum=1.042;SC=CAAATTACCAGTAAGAAAATG;SOR=0.241;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=41;TCF=31;TCR=10;TR=17;WE=175429816;WS=175429798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,17:0.38:45
chr4	175443156	rs1050145	C	T	6383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=114;NR=95;PP=2965;SC=GAGGTTCAAACTGCTCATCCA;SOR=0.810;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=209;TCF=114;TCR=95;TR=209;WE=175443164;WS=175443146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr4	175443261	rs45567139	G	T	1599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-3.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.063;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=44;PP=895;ReadPosRankSum=-2.332;SC=CGCAGCTCACGAAATAGACGG;SOR=0.538;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=142;TCF=55;TCR=87;TR=74;WE=175443269;WS=175443251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,81:0.52:157
chr4	175443424	rs11433148	C	CT	1471.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.955;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=12;PP=991;ReadPosRankSum=1.194;SC=CGCGGCCTCCCTGTCTCCGCC;SOR=0.900;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=41;TCF=19;TCR=22;TR=25;WE=175443432;WS=175443414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,45:0.63:71
chr4	175580119	rs6553802	T	C	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=188;ReadPosRankSum=1.335;SC=TCCCAATTGCTTCTCTTTTCA;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=9;WE=175580127;WS=175580109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr4	175598334	rs6812439	T	C	2720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=52;PP=1541;SC=TGATCCAGAATGAAACCCAGG;SOR=1.212;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=40;TCR=52;TR=92;WE=175598342;WS=175598324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr4	175649861	rs1872548	T	G	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=4.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.51;MQRankSum=1.373;QD=5.99;ReadPosRankSum=0.329;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr4	175688138	rs7696263	A	G	3140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=61;PP=1730;ReadPosRankSum=0.569;SC=CGATAGAGCCAAAGCTGTTGA;SOR=0.706;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=229;TCF=122;TCR=107;TR=130;WE=175688146;WS=175688128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,151:0.58:261
chr4	176561114	rs113096961	T	C	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=2.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=246;ReadPosRankSum=0.141;SC=TGGGGTTTAGTCTTGTTGTTG;SOR=0.990;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=10;WE=176561122;WS=176561104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr4	176561168	rs17313697	C	A	733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.790;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=9;PP=468;ReadPosRankSum=-0.608;SC=AATCTGATGACATAAATGTGT;SOR=0.313;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=51;TCF=38;TCR=13;TR=30;WE=176561176;WS=176561158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,33:0.61:54
chr4	176562088	rs150679897	T	C	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.983;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=59;ReadPosRankSum=0.629;SC=CATTTTATCTTATGTTATGTT;SOR=1.501;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=26;TCF=8;TCR=18;TR=6;WE=176562096;WS=176562078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,7:0.25:28
chr4	176562144	rs729721	A	C	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.287;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=143;ReadPosRankSum=1.139;SC=ATAACTATGCATAGAATTATG;SOR=0.495;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=8;WE=176562152;WS=176562134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr4	176733450	rs62338073	G	T	582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=65.19;QD=38.85;SOR=2.448;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
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chr4	177049880	rs28607147	T	C	787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.952;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=14;PP=398;ReadPosRankSum=-0.080;SC=TTTTCCCTGATCTGACTAGAT;SOR=0.418;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=75;TCF=45;TCR=30;TR=34;WE=177049888;WS=177049870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,40:0.49:81
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chr4	177050062	rs71830098	CTATCAAATAAAA	C	30.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=2;PP=753;ReadPosRankSum=0.311;SC=ATTGTGTTTTCTATCAAATAA;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=2;WE=177050081;WS=177050047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,3:0.21:14
chr4	177052925	rs7699831	G	C	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.519;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=19;PP=355;ReadPosRankSum=0.197;SC=ATACATAATAGTTTTTTGTGT;SOR=0.397;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=67;TCF=13;TCR=54;TR=25;WE=177052933;WS=177052915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,26:0.34:77
chr4	177058580	rs9884643	A	T	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.077;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=99;ReadPosRankSum=0.499;SC=TCTGCAAATCACAGTTCTTAC;SOR=1.781;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=8;WE=177058588;WS=177058570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr4	177063096	rs9995480	G	A	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.482;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=101;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TGTATTTAGAGTATTGTTTTT;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=8;WE=177063104;WS=177063086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr4	177073026	rs4690661	G	A	7736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=139;NR=125;PP=2965;SC=TGGTGTACCTGCTAAAGAGGA;SOR=0.756;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=264;TCF=139;TCR=125;TR=264;WE=177073034;WS=177073016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,293:1.00:293
chr4	177081358	rs9683850	C	T	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=22;PP=453;ReadPosRankSum=-0.588;SC=ACTGGCTCACCCTTACATAAT;SOR=0.683;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=85;TCF=29;TCR=56;TR=33;WE=177081366;WS=177081348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,35:0.38:92
chr4	177082032	rs10520338	A	G	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.579;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=334;ReadPosRankSum=0.571;SC=AATTAGCTAAAGAATAATTCA;SOR=1.136;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=19;WE=177082040;WS=177082022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr4	177082069	rs7693453	G	C	1056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=16;PP=779;ReadPosRankSum=0.253;SC=TAGGCTGCTTGTGAAGGAAAT;SOR=0.787;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=81;TCF=53;TCR=28;TR=47;WE=177082077;WS=177082059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,48:0.55:88
chr4	177083166	rs2877924	A	G	894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=6;PP=584;SC=AAAAAGTATTAGTTTGCTTTT;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=27;WE=177083174;WS=177083156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	177087322	rs4388031	C	T	619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=14;PP=371;SC=TTTAAGAACACATTCCTTTAA;SOR=1.708;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=7;TCR=14;TR=21;WE=177087330;WS=177087312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr4	177093505	rs4538426	T	G	701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.467;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=9;PP=434;ReadPosRankSum=-0.877;SC=TAACATTGTTTTCAAATCAAT;SOR=1.296;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=68;TCF=47;TCR=21;TR=31;WE=177093513;WS=177093495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,34:0.42:81
chr4	177100644	rs11736872	G	A	4044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.028;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=51;PP=1150;ReadPosRankSum=0.406;SC=CGGGAAATCTGCTATCTCCTT;SOR=0.734;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=245;TCF=126;TCR=119;TR=105;WE=177100652;WS=177100634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,119:0.43:275
chr4	177100663	.	C	A	3909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.706;ClippingRankSum=0.000;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=48;PP=1079;ReadPosRankSum=-1.950;SC=TTGAATGATGCTTTGATGTGG;SOR=0.669;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=232;TCF=113;TCR=119;TR=96;WE=177100671;WS=177100653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,110:0.42:260
chr4	177113764	rs6857056	A	C	1285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=6;PP=936;SC=CAGCTGTTTCAAAGGAAAACT;SOR=3.109;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=35;TCR=6;TR=41;WE=177113772;WS=177113754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr4	177113779	rs12502935	T	C	1841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=21;PP=1079;SC=AAAACTTACCTGGATTCAATT;SOR=1.410;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=41;TCR=21;TR=62;WE=177113787;WS=177113769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr4	177113956	rs2291244	A	G	1264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.734;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=26;PP=734;ReadPosRankSum=-2.528;SC=TCTGGTAGCTATAGTCCGTGA;SOR=0.578;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=43;TCR=49;TR=50;WE=177113964;WS=177113946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,58:0.55:106
chr4	177116463	rs994252	C	G	3947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.91;SOR=1.539;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr4	177116779	rs4565028	T	C	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=53;ReadPosRankSum=0.210;SC=GGCGGCGCGGTCTCGTGGGGC;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=4;WE=177116787;WS=177116769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr4	177137988	rs6827525	C	T	692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.255;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=8;PP=488;ReadPosRankSum=-1.009;SC=GAAGCAATATCCTTTCCACCA;SOR=1.058;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=62;TCF=44;TCR=18;TR=32;WE=177137996;WS=177137978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,32:0.51:63
chr4	177142488	rs34466424	C	T	2630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-3.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=65;PP=1483;ReadPosRankSum=-0.364;SC=ATCCACCCCACACACCTCACC;SOR=0.673;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=199;TCF=77;TCR=122;TR=106;WE=177142496;WS=177142478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,122:0.55:221
chr4	177142776	rs10032098	C	A	4535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.85;SOR=1.196;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr4	177142776	.	CA	AA,AC	1014	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000,0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=51,21;NR=69,25;PP=1014,575;QD=8.73976010456;SC=AATATCCAAACATAAGATTCA;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=122;TCF=51;TCR=71;TR=120,46;WE=177142785;WS=177142753;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.98:122
chr4	177142777	rs13120838	A	C	1021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=1.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.74;ReadPosRankSum=-0.525;SOR=0.536;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,55:0.42:132
chr4	177143417	rs13147229	C	T	808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.134;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=8;PP=429;ReadPosRankSum=-0.432;SC=TGTTGGATTCCCTCCGTCAGT;SOR=1.063;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=52;TCF=36;TCR=16;TR=29;WE=177143425;WS=177143407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,34:0.59:58
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chr4	177249533	rs2278903	A	G	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=305;ReadPosRankSum=1.067;SC=ATTGTATCTCATTAATCTCTT;SOR=0.760;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=18;WE=177249541;WS=177249523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr4	177605081	rs5864401	CTCA	C	8042.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=62;PP=2969;SC=ACAATCTTAGCTCATCATTTG;SOR=1.123;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=111;TCF=45;TCR=66;TR=94;WE=177605091;WS=177605071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr4	177608707	rs7664413	C	T	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=16;PP=307;ReadPosRankSum=-1.800;SC=TTTACTATACCTTACTTGGTT;SOR=0.712;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=56;TCF=19;TCR=37;TR=24;WE=177608715;WS=177608697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,27:0.45:60
chr4	177608775	rs4604006	T	C	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.260;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=91;ReadPosRankSum=1.050;SC=ATGTTTTCCATCAAAGGATTG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=5;WE=177608783;WS=177608765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr4	177608875	rs4529000	A	C	849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=22;NR=0;PP=589;SC=TCACTTATTTAGAAGAATGAT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=177608883;WS=177608865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	177609098	.	C	A	2198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.420;ClippingRankSum=0.000;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.476;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=51;PP=1294;ReadPosRankSum=-0.301;SC=AAGAAACAGACGAGGTTTAGC;SOR=0.729;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=205;TCF=97;TCR=108;TR=94;WE=177609106;WS=177609088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,108:0.46:233
chr4	177609203	rs13136065	G	A	1244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-1.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=31;PP=729;ReadPosRankSum=1.975;SC=AGAATTATGAGATAAAATGTG;SOR=0.653;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=70;TCF=23;TCR=47;TR=46;WE=177609211;WS=177609193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,54:0.64:84
chr4	177609259	rs2877962	C	T	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.647;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=19.70;ReadPosRankSum=1.229;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr4	177609264	rs2333495	C	T	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.429;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=23.07;ReadPosRankSum=0.023;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr4	177650614	rs3836595	T	TA	454.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=0;PP=565;SC=ACACTGAAATTAAAGAACCAG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=15;WE=177650622;WS=177650607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	177713326	rs55728985	T	A	3773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=354;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=94;PP=2215;ReadPosRankSum=0.666;SC=TACCGTGGCCTCGCCCGCGTC;SOR=0.688;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=326;TCF=154;TCR=172;TR=178;WE=177713334;WS=177713316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,188:0.53:353
chr4	178167074	rs2118922	G	A	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=104;ReadPosRankSum=-0.075;SC=TAGTGCCAACGTTTCGTATTT;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=7;WE=178167082;WS=178167064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr4	178167282	rs1347894	G	A	5060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=88;NR=84;PP=2792;SC=GACCTAAACAGTCACTGAAAC;SOR=0.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=172;TCF=88;TCR=84;TR=172;WE=178167290;WS=178167272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr4	178169500	rs3828517	G	A	2490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.92;ReadPosRankSum=0.464;SOR=0.665;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,122:0.58:209
chr4	178231219	rs34007209	C	T	860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.563;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=16;PP=394;ReadPosRankSum=-0.378;SC=TCTGCAGGGCCGCGCCTTGCG;SOR=0.797;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=62;TCF=34;TCR=28;TR=33;WE=178231227;WS=178231209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,41:0.56:73
chr4	178256759	rs3215157	CA	C	253.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQ=60.98;NF=7;NR=2;PP=159;SC=GCTTATAATCCAAAAAAAAAA;SOR=2.494;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=9;WE=178256767;WS=178256749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	178257364	rs17064658	G	C	2958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.366;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=54;PP=1673;ReadPosRankSum=1.094;SC=TTAAAAAACAGAAAGGCCGGA;SOR=0.603;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=268;TCF=152;TCR=116;TR=122;WE=178257372;WS=178257354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,146:0.48:307
chr4	178257516	rs2271102	G	A	2051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=47;PP=1308;SC=TTGATTTTTCGGTACTGTGAA;SOR=2.472;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=14;TCR=47;TR=61;WE=178257524;WS=178257506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr4	178272748	rs1054753	G	A	738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.855;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=26;PP=522;ReadPosRankSum=-0.511;SC=TTCTAAGAGGGTTAATTATAC;SOR=0.543;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=89;TCF=27;TCR=62;TR=38;WE=178272756;WS=178272738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,38:0.39:98
chr4	178274565	rs2048074	A	G	971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=19;PP=620;ReadPosRankSum=1.320;SC=AGATCAACAGAAAAACTGCAT;SOR=0.748;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=121;TCF=69;TCR=52;TR=45;WE=178274573;WS=178274555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,50:0.36:138
chr4	178274694	rs10007075	T	G	2338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.464;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=45;PP=1333;ReadPosRankSum=-0.622;SC=CTGCTAGTGTTTGTTTGAATG;SOR=0.642;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=227;TCF=125;TCR=102;TR=98;WE=178274729;WS=178274684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,114:0.46:249
chr4	178274750	rs13112358	C	T	2082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.468;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=46;PP=1177;ReadPosRankSum=-1.462;SC=ATAACTCAACCATCCAGCAAA;SOR=0.652;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=222;TCF=110;TCR=112;TR=94;WE=178274758;WS=178274740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,105:0.43:246
chr4	178274835	rs13112390	A	C	3513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=47;NR=65;PP=2032;SC=AAACAGCCCAATACTCATCAC;SOR=1.270;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=113;TCF=47;TCR=66;TR=112;WE=178274843;WS=178274825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr4	178281754	rs1876268	G	A	6566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=108;NR=117;PP=2965;SC=CCGAGTTGTGGGGAAGGATGG;SOR=0.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=225;TCF=108;TCR=117;TR=225;WE=178281762;WS=178281744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr4	178352679	rs1061814	T	G	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=61;ReadPosRankSum=0.847;SC=TAAGAAAGGTTAAATAAAAAT;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=4;WE=178352687;WS=178352675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr4	178353046	rs3805167	G	C	357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=3;NR=10;PP=277;SC=TATTTGACTAGACACTGGCTA;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=178353054;WS=178353036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	178355668	rs4690521	C	G	5469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=91;PP=2965;SC=TAACAATTTACGGCAGGAAAT;SOR=0.888;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=178;TCF=87;TCR=91;TR=178;WE=178355676;WS=178355658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr4	178357514	.	TA	T	153.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.865;ClippingRankSum=0.000;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=8.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.85;ReadPosRankSum=0.280;SOR=0.113;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,15:0.28:54
chr4	178359719	rs2271101	A	G	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=21;ReadPosRankSum=-0.598;SC=ATATGCACCCAATGCAGCTAG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=3;WE=178359727;WS=178359709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr4	178359960	rs2228119	G	C	3827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=61;NR=66;PP=2246;SC=TTGAGAAGCAGTGGTAGATAA;SOR=0.842;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=127;TCF=61;TCR=66;TR=127;WE=178359968;WS=178359950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr4	178360811	rs76491548	G	T	2164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-2.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=54;PP=1218;ReadPosRankSum=0.478;SC=ATTCGTCTGAGATCTCCTACT;SOR=0.675;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=281;TCF=144;TCR=137;TR=111;WE=178360819;WS=178360801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:195,120:0.38:315
chr4	178361621	rs3792607	T	A	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.75;ReadPosRankSum=0.889;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr4	178363378	rs11131799	G	A	638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.118;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=333;ReadPosRankSum=1.016;SC=CGGCGCAGCCGCCCGCCCAGG;SOR=0.455;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=47;TCR=16;TR=27;WE=178363386;WS=178363368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,32:0.45:71
chr4	178881982	rs13109967	G	T	884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=14;PP=469;ReadPosRankSum=0.899;SC=TCTTTCCGGGGATCAAAAGAA;SOR=0.700;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=70;TCF=44;TCR=26;TR=36;WE=178881990;WS=178881972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,44:0.53:83
chr4	178882120	rs9994032	A	T	839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=23;PP=597;SC=CCTGAAATGAAATATTTGAAT;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=31;WE=178882128;WS=178882110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	178887795	rs113648256	T	TTTTC	1749.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=3.468;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=819;ReadPosRankSum=-0.434;SC=ATTCTCGTCATTTTCTTTCTT;SOR=0.633;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=20;WE=178887803;WS=178887785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,39:0.98:40
chr4	178896816	rs1979357	C	A	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=145;ReadPosRankSum=-0.860;SC=CTACAGGTAGCATGCATGTTC;SOR=2.517;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=8;WE=178896824;WS=178896806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr4	183268148	rs11373586	C	CG,CGG	465.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;QD=29.11;SOR=2.049;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,7,9:0.44,0.56:16
chr4	183268174	rs6552554	C	T	293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.48;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	183370056	rs11721730	C	T	2376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=21;PP=1491;SC=AGGGGTTAAGCGGCGCACCGC;SOR=1.809;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=54;TCR=21;TR=75;WE=183370064;WS=183370046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr4	183370244	rs35591339	AGCG	A	2506.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=30;PP=1570;SC=AAGGTGGGTGAGCGGCGGCGG;SOR=1.453;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=43;TCF=2;TCR=41;TR=32;WE=183370254;WS=183370234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr4	183522409	rs149533994	TTTG	T	1420.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=2.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.43;MQRankSum=1.301;QD=24.50;ReadPosRankSum=-0.958;SOR=0.386;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,38:0.66:58
chr4	183601590	rs34738241	A	AG	59.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=1.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.40;MQRankSum=1.873;QD=2.39;ReadPosRankSum=-0.350;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,6:0.24:25
chr4	183601594	rs11934254	G	A	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.524;HP=8;HapScore=4;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.170;NF=5;NR=11;PP=563;ReadPosRankSum=1.718;SC=AAAGAAAGGGGGGGGGAGACT;SOR=1.493;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=31;TCF=10;TCR=21;TR=16;WE=183601602;WS=183601580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr4	183601847	rs2871328	T	C	1768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.451;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.962;NF=43;NR=38;PP=984;ReadPosRankSum=-0.875;SC=TCATGGGCTCTTGTGCTTGCA;SOR=0.660;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=238;TCF=121;TCR=117;TR=81;WE=183601855;WS=183601837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:187,98:0.34:285
chr4	183650100	rs13340295	G	A	1153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.765;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=13;PP=778;ReadPosRankSum=0.124;SC=TCTTACTGGGGAACATTTCTC;SOR=0.866;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=88;TCF=60;TCR=28;TR=43;WE=183650108;WS=183650090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,50:0.50:100
chr4	183652175	rs10866256	T	C	5650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=89;PP=2965;SC=AAGAGAATGATATTCCCAGCT;SOR=0.783;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=180;TCF=91;TCR=89;TR=180;WE=183652183;WS=183652165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr4	183659722	rs74988363	G	C	1798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.180;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=48;PP=1205;ReadPosRankSum=0.931;SC=ATAGATAACTGATGTTGTAAT;SOR=0.835;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=167;TCF=72;TCR=95;TR=82;WE=183659730;WS=183659712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,86:0.47:182
chr4	183664522	rs7654255	T	C	3016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.419;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=58;PP=1489;ReadPosRankSum=0.789;SC=ATTTCAACTATGTGCGGCGGA;SOR=0.732;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=266;TCF=144;TCR=122;TR=131;WE=183664530;WS=183664512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,151:0.51:299
chr4	183664593	rs7676674	G	A	1972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.729;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=46;PP=1200;ReadPosRankSum=0.864;SC=CCTAAATTTGGGCTTTTAACC;SOR=0.511;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=156;TCF=68;TCR=88;TR=85;WE=183664601;WS=183664583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,92:0.55:168
chr4	183665437	rs6835335	C	G	1605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=31;PP=1027;SC=CAGTATCACACATCATCGAAG;SOR=0.941;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=54;TCF=23;TCR=31;TR=54;WE=183665445;WS=183665427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr4	183673247	rs2309770	T	A	132.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=321;SC=AAAAAGGGGTTGAAAATCCAT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=12;WE=183673255;WS=183673237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	183673286	rs139756555	T	TCTAA	187.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=227;SC=TAATGCTGAGTCTAACTTTTT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=5;WE=183673294;WS=183673276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	183674577	rs13130747	G	C	2093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=7;PP=1537;SC=TGAAAAATTAGTAATACTTGC;SOR=3.611;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=62;TCF=55;TCR=7;TR=61;WE=183674585;WS=183674567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr4	183676455	.	TATA	T	211.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.862;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=198;ReadPosRankSum=-0.212;SC=AATACTGTGATATAATAATAT;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=6;WE=183676465;WS=183676445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
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chr4	183815561	rs17331744	T	C	2397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=15;PP=1746;ReadPosRankSum=0.468;SC=AATAGCAATTTAAGATCAAAC;SOR=1.514;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=76;TCF=61;TCR=15;TR=75;WE=183815569;WS=183815551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,79:0.99:80
chr4	183815688	rs4742	A	G	8829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=149;NR=148;PP=2965;SC=GGAACAAGGCAACATACATAC;SOR=0.767;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=297;TCF=149;TCR=148;TR=297;WE=183815696;WS=183815678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,334:1.00:334
chr4	183836490	rs11730323	C	T	2244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=22;PP=1382;SC=AAACGCAGCACAAAAGGCAGA;SOR=1.668;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=52;TCR=22;TR=74;WE=183836498;WS=183836480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr4	183838025	rs13114262	A	G	5623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=94;NR=98;PP=2965;SC=AGAAACAGAGAGAACTGGAGC;SOR=0.853;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=192;TCF=94;TCR=98;TR=192;WE=183838033;WS=183838015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr4	183838103	rs4371655	C	T	1546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=38;PP=1051;SC=CGCTCGCAACCCCGTCAGCTC;SOR=2.437;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=12;TCR=38;TR=50;WE=183838111;WS=183838093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr4	183838633	.	G	GGGGA	131	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5945;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=2;PP=57;SC=GAAGCCCTGAGGGGAGGGAGG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=2;WE=183838641;WS=183838623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	184170025	rs907357	G	A	2055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=44;PP=1247;SC=TAAGTTATCTGTGCTGAAGAG;SOR=1.379;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=28;TCR=44;TR=72;WE=184170033;WS=184170015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr4	184171187	rs10020261	T	C	6012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=104;PP=2965;SC=CTCAAACATTTTCTTTTCCAG;SOR=0.914;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=198;TCF=94;TCR=104;TR=198;WE=184171195;WS=184171177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr4	184180920	rs11132172	G	A	798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=20;PP=423;ReadPosRankSum=-0.840;SC=GCTTTTCTCCGAATAGCATGT;SOR=0.622;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=68;TCF=24;TCR=44;TR=32;WE=184180928;WS=184180910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,38:0.51:75
chr4	184181012	rs17074537	G	A	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.396;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.256;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=93;ReadPosRankSum=2.373;SC=TACTGTTTGAGTGATCAGATT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=6;WE=184181020;WS=184181002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr4	184190355	rs11407064	A	AC	6234.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=5;NR=90;PP=2957;SC=AATAGCACTTAGATTGGGTGG;SOR=1.833;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=99;TCF=5;TCR=94;TR=95;WE=184190363;WS=184190345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr4	184190535	rs6858486	G	A	4743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=105;NR=59;PP=2783;SC=GTGATTTTCTGTAAAAGTTGC;SOR=1.242;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=105;TCR=60;TR=164;WE=184190543;WS=184190525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr4	184192183	rs28647357	T	C	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=280;ReadPosRankSum=-0.409;SC=TTTAAACATTTTATTTTCTCT;SOR=0.518;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=18;WE=184192191;WS=184192173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
chr4	184201909	rs11132173	G	A	611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=4.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=1;PP=437;ReadPosRankSum=-0.469;SC=GTTAATTGCCGTATGCTTTAC;SOR=0.892;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=41;TCF=39;TCR=2;TR=22;WE=184201917;WS=184201899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,24:0.55:44
chr4	184202148	rs11132174	G	T	4287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=98;PP=2739;SC=ATTCCAGAATGATGGAATGCA;SOR=1.655;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=148;TCF=50;TCR=98;TR=148;WE=184202156;WS=184202138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr4	184203706	rs2871353	A	T	740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=2;PP=488;SC=GGATTTTTTTAAATGAGACAT;SOR=3.442;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=20;WE=184203714;WS=184203696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	184203886	rs3814422	G	C	2136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=36;PP=1519;ReadPosRankSum=0.589;SC=AGAGGCCTCTGATGAAATTGT;SOR=0.651;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=164;TCF=93;TCR=71;TR=82;WE=184203894;WS=184203876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,91:0.50:182
chr4	184204099	rs3814421	C	T	1194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.032;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=33;PP=721;ReadPosRankSum=-2.216;SC=TGATACCTTACAGGCACCATG;SOR=0.469;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=80;TCF=23;TCR=57;TR=48;WE=184204107;WS=184204089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,53:0.62:86
chr4	184242959	rs6839940	C	G	1033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.614;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=25;PP=638;ReadPosRankSum=-0.675;SC=GGTAGGGACACTGAGTTTGCA;SOR=0.602;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=142;TCF=73;TCR=69;TR=51;WE=184242967;WS=184242949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,56:0.35:159
chr4	184243528	rs7688467	G	A	3746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.20;SOR=0.857;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr4	184366629	rs11282266	T	TGCACA	1434.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=2;PP=1021;SC=GCCTGTTTTTTGCACAAGTAG;SOR=2.985;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=17;WE=184366637;WS=184366619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	184367558	rs147291711	TCTG	T	10049.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=27;NR=100;PP=2948;SC=TAAACACGGTTCTGCATCATT;SOR=0.747;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=136;TCF=31;TCR=105;TR=127;WE=184367568;WS=184367548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr4	184426387	rs8872	C	T	3399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=48;PP=2022;SC=ACTCGTCGGCCGCGCTCCTGA;SOR=0.902;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=66;TCR=48;TR=114;WE=184426395;WS=184426377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr4	184426526	rs6552675	A	G	2551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=52;PP=1622;SC=TCAAGGTAGGAGCCGCGGGGC;SOR=1.265;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=35;TCR=52;TR=87;WE=184426534;WS=184426516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr4	184570715	rs10015804	T	G	934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.35;ReadPosRankSum=1.940;SOR=0.895;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,39:0.56:70
chr4	184572341	rs56817841	GA	G	2341.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=30;PP=1366;SC=AGAGTGAAATGAAAAGCAGTA;SOR=0.836;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=39;TCF=8;TCR=31;TR=36;WE=184572349;WS=184572331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr4	184587658	rs5864850	G	GTACC	5424.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=5;NR=54;PP=2957;SC=AGGCAATGGAGTACCGTTCAG;SOR=1.207;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=69;TCF=5;TCR=64;TR=59;WE=184587666;WS=184587648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr4	184587701	rs9996255	G	A	1401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=37;PP=1014;SC=TTGACCTCCAGTGAATCTTGT;SOR=2.448;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=11;TCR=37;TR=48;WE=184587709;WS=184587691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr4	184588121	rs4282227	C	T	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.884;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.31;ReadPosRankSum=-0.531;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr4	184588408	rs62357986	T	C	111.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5076;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=49;ReadPosRankSum=-0.792;SC=GTATGTTAACTTTAAAAAGCA;SOR=1.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=5;WE=184588416;WS=184588398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr4	184596446	rs7678174	G	A	1679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=35;PP=1059;SC=AATAACATGTGATGGAAATTT;SOR=1.460;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=21;TCR=35;TR=56;WE=184596454;WS=184596436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr4	184600571	rs62357990	C	A	1726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.528;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=43;PP=1112;ReadPosRankSum=-0.210;SC=GAAAACACATCGACTTGTGTA;SOR=0.631;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=180;TCF=88;TCR=92;TR=86;WE=184600579;WS=184600561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,90:0.46:194
chr4	184600601	rs4241779	A	G	4576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=84;PP=2900;SC=TTGGAAGTGCAGAGCTGTCTT;SOR=1.013;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=155;TCF=71;TCR=84;TR=155;WE=184600609;WS=184600591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr4	184600731	rs4862233	G	A	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=124;ReadPosRankSum=0.330;SC=ACTGAACCAGGTTTTTTGTCA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=8;WE=184600739;WS=184600721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr4	184601195	rs10022122	T	G	1010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=0;PP=770;SC=TGAGGTTAAGTTTCCCAGGAT;SOR=5.486;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=28;WE=184601203;WS=184601185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	184606653	rs11132206	G	A	811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=21;PP=543;SC=TCAAGAAAGAGTTTTCAAAGT;SOR=4.332;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=184606661;WS=184606643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	184607970	rs9312316	T	C	586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=19;PP=434;SC=CTAGATAAAATGAGCTTAGTG;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=184607978;WS=184607960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	184615948	rs36221086	TATAAAATAAGC	T	669.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=2980;ReadPosRankSum=0.072;SC=TTAGTTTACCTATAAAATAAG;SOR=0.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=10;WE=184615966;WS=184615938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr4	184619017	rs12651215	C	G	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.202;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=128;ReadPosRankSum=0.850;SC=CACTTAAAGACCAGGAGAATT;SOR=0.941;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=43;TCF=19;TCR=24;TR=13;WE=184619025;WS=184619007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,14:0.26:54
chr4	184629794	rs9312318	G	A	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=190;ReadPosRankSum=-0.764;SC=TCTTTTTCATGTAAACTTCAC;SOR=0.610;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=12;WE=184629802;WS=184629784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,13:0.37:35
chr4	184922669	rs3749534	G	A	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=218;ReadPosRankSum=0.000;SC=AGGTGGCGGTGTGCTGTGGTC;SOR=0.616;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=12;WE=184922677;WS=184922659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr4	184932609	rs4862282	G	A	3466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=61;PP=2259;SC=ACACACATGCGCCTAGCGGGG;SOR=0.902;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=115;TCF=54;TCR=61;TR=115;WE=184932617;WS=184932599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr4	185012398	rs4479748	T	C	6849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=139;NR=89;PP=2965;SC=GGGGCAGTGCTGGCGCGGCCC;SOR=1.202;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=228;TCF=139;TCR=89;TR=228;WE=185012406;WS=185012388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr4	185074686	rs13147555	A	C	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.320;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=6;PP=226;ReadPosRankSum=1.403;SC=TGAGATTTGGAATGGATGTTC;SOR=0.999;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=33;TCF=21;TCR=12;TR=15;WE=185074694;WS=185074676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr4	185075033	rs35344477	A	AT	286.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=181;ReadPosRankSum=0.630;SC=AAAAAATCAGATTTTTTTTTC;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=12;WE=185075041;WS=185075023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr4	185339517	rs2288246	C	T	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=168;ReadPosRankSum=-0.838;SC=TTCACTGCCTCTGGTGAATCG;SOR=0.473;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=9;WE=185339525;WS=185339507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr4	185350307	rs807684	T	C	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.354;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.98;ReadPosRankSum=-0.586;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr4	185550764	rs4647693	T	C	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.957;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=79;ReadPosRankSum=1.355;SC=ACATAAGTCTTATTAGTCATA;SOR=0.169;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=6;WE=185550772;WS=185550754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr4	185550779	.	T	TA	71	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.9987;HP=14;HapScore=2;MGOF=22;MMLQ=19;MQ=60.0;NF=0;NR=5;PP=71;QD=16.0;SC=GTCATACAAATAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=5;WE=185550787;WS=185550769;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:3,5:0.62:8
chr4	185552135	rs4647688	C	T	728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.067;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=8;PP=400;ReadPosRankSum=-0.019;SC=TATGATCAGTCACAGTTAATT;SOR=0.901;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=47;TCF=33;TCR=14;TR=29;WE=185552143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,33:0.60:55
chr4	185552345	rs4647687	A	T	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.192;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=4;PP=49;ReadPosRankSum=-1.113;SC=TATTTATAAAAATTTGTGTGT;SOR=0.446;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=13;TCF=5;TCR=8;TR=7;WE=185552353;WS=185552335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr4	185553098	rs2705897	T	G	807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=18;PP=514;ReadPosRankSum=-1.041;SC=TTAGAAACTGTAAAGACATTT;SOR=0.596;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=46;TCF=20;TCR=26;TR=31;WE=185553106;WS=185553088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,35:0.65:54
chr4	185556618	rs1405938	C	T	650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=16;PP=345;ReadPosRankSum=0.454;SC=GAAATGACCACGCCTTCTGTT;SOR=0.687;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=26;TCR=40;TR=27;WE=185556626;WS=185556608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,32:0.44:72
chr4	185559487	rs2705901	G	C	2306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=48;PP=1359;ReadPosRankSum=0.374;SC=TTGCCCCACTGCTCGAGGTTT;SOR=0.700;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=211;TCF=114;TCR=97;TR=103;WE=185559495;WS=185559477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,113:0.48:236
chr4	185578229	rs13108061	G	T	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-4.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=153;ReadPosRankSum=-0.889;SC=TTTGTTGTTTGTTTTAGTAGT;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=9;WE=185578237;WS=185578219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr4	185578485	rs56194967	C	T	1432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-1.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.733;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=31;PP=732;ReadPosRankSum=0.548;SC=GTAATTTCCTCCTCCTCCTCT;SOR=0.570;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=96;TCF=28;TCR=68;TR=47;WE=185578493;WS=185578475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,64:0.52:124
chr4	185583092	rs60624489	C	CTATT	5080.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=50;PP=2315;SC=TTATTTCTATCCATCTCTTCA;SOR=1.118;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=56;TCF=5;TCR=51;TR=54;WE=185583100;WS=185583082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr4	185587165	rs2463447	A	G	3910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=70;PP=2229;SC=AAATTCAGCCAGCATTTAATA;SOR=0.930;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=134;TCF=64;TCR=70;TR=134;WE=185587173;WS=185587155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr4	185593699	rs72689277	G	A	921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=27;PP=662;ReadPosRankSum=-0.980;SC=CACCGTGCTCGGGATTCTTGC;SOR=0.808;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=51;TCF=12;TCR=39;TR=35;WE=185593707;WS=185593689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,37:0.70:53
chr4	185593718	rs72689278	C	T	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.639;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=18;PP=383;ReadPosRankSum=0.813;SC=GCTTCCTCCACTGCCCAAGTC;SOR=1.136;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=22;WE=185593726;WS=185593708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,23:0.64:36
chr4	185599489	rs34985821	G	A	609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.871;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=12;PP=323;ReadPosRankSum=-2.625;SC=TTCCTATACAGTCAAAAGATG;SOR=0.818;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=67;TCF=37;TCR=30;TR=29;WE=185599497;WS=185599479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,32:0.43:74
chr4	185612953	rs2696035	A	G	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=1.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.27;ReadPosRankSum=-0.974;SOR=0.280;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr4	185615764	rs14969	C	A	4437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FS=2.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.57;ReadPosRankSum=-0.620;SOR=0.853;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:119,120:0.50:239
chr4	185615768	rs3184982	T	G	4319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FS=2.250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.95;ReadPosRankSum=-1.130;SOR=0.849;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,113:0.50:228
chr4	185616631	rs1527870	T	C	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.366;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=15;PP=363;ReadPosRankSum=1.421;SC=ATCTTATGACTAATGCAAATT;SOR=0.407;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=37;TCF=13;TCR=24;TR=24;WE=185616639;WS=185616621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,25:0.62:40
chr4	185618689	rs141579181	CTG	C	340.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=169;ReadPosRankSum=0.124;SC=TAGGTGGACTCTGTAATTCTG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=5;WE=185618698;WS=185618679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr4	185620623	rs6552801	G	A	1002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.450;NF=28;NR=12;PP=563;ReadPosRankSum=-0.413;SC=GTTAGCATAGGAAGCGTTTAG;SOR=0.746;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=84;TCF=58;TCR=26;TR=40;WE=185620631;WS=185620613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,49:0.49:99
chr4	185620751	rs6552802	C	G	1046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=22;PP=497;ReadPosRankSum=1.501;SC=AGCACCTGTCCAGAGACTCAA;SOR=0.612;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=82;TCF=36;TCR=46;TR=41;WE=185620759;WS=185620741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,49:0.53:93
chr4	185620822	.	C	CTCTT	165	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;FR=0.5000;HP=11;HapScore=2;MGOF=18;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=0;NR=7;PP=165;QD=25.2857142857;SC=GGCAGTCTCTCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=7;WE=185620830;WS=185620812;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,7:0.47:15
chr4	185622046	rs11728389	C	T	676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=15;PP=314;ReadPosRankSum=0.417;SC=CTAAGTAACACAATCATTTGT;SOR=0.680;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=56;TCF=27;TCR=29;TR=29;WE=185622054;WS=185622036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,34:0.52:66
chr4	185623312	rs28660669	C	T	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.898;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=13;PP=349;ReadPosRankSum=-0.803;SC=AAAAAATACACATGTACATCA;SOR=0.826;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=62;TCF=34;TCR=28;TR=27;WE=185623320;WS=185623302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,30:0.43:70
chr4	185631338	rs28666955	A	G	782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.829;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=17;PP=445;ReadPosRankSum=-0.458;SC=GAAGTATCTAAAATATTAAGA;SOR=0.873;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=78;TCF=35;TCR=43;TR=31;WE=185631346;WS=185631328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,37:0.43:86
chr4	185631468	rs28525282	T	C	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.323;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.136;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=67;ReadPosRankSum=0.617;SC=AGAGAGGAGGTGCCGTACTCA;SOR=2.066;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=6;WE=185631476;WS=185631458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr4	185634144	rs4616798	T	C	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=138;ReadPosRankSum=0.667;SC=TGTCATGAGATATCTTCCCTT;SOR=0.551;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=21;TCF=7;TCR=14;TR=9;WE=185634152;WS=185634134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr4	185634171	rs34353251	CA	C	105.90	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.63;ReadPosRankSum=2.100;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr4	185634218	rs28661636	A	C	51.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.36;ReadPosRankSum=0.842;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr4	185637523	rs745656	C	T	959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.960;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=15;PP=622;ReadPosRankSum=-0.500;SC=CTTTTTTTGCCCTCCTAGGGG;SOR=1.080;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=80;TCF=51;TCR=29;TR=44;WE=185637531;WS=185637513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,45:0.52:86
chr4	185637699	rs6552804	A	G	2343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.176;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=54;PP=1408;ReadPosRankSum=0.546;SC=TTGTGTACTTATTTTCTCTGC;SOR=0.659;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=225;TCF=120;TCR=105;TR=110;WE=185637707;WS=185637689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,116:0.48:241
chr4	185638231	rs6552806	C	T	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.025;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=41;ReadPosRankSum=-0.552;SC=ATTTTCTGTACTTGCATCCAA;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=185638239;WS=185638221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
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chr4	185650276	rs61539306	C	T	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.041;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=166;ReadPosRankSum=-1.081;SC=CTTGTAATCACTGCTGCCTAA;SOR=0.169;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=13;WE=185650284;WS=185650266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr4	185652147	rs3806796	G	A	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=2.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQRankSum=0.000;QD=10.62;ReadPosRankSum=-0.042;SOR=0.434;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,32:0.51:63
chr4	185652201	rs7675046	G	A	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQRankSum=0.000;QD=12.21;ReadPosRankSum=0.512;SOR=0.567;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr4	185655192	rs876839	G	C	2133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.489;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=49;PP=1251;ReadPosRankSum=-0.984;SC=TGAGGCCGCGGCCGCCGCCGC;SOR=0.733;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=199;TCF=96;TCR=103;TR=91;WE=185655200;WS=185655182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,105:0.47:223
chr4	185681475	rs6825554	G	C	2693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=16;PP=1899;SC=ATGGCAATGTGTATGCAGCAA;SOR=2.732;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=66;TCR=16;TR=82;WE=185681483;WS=185681465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr4	185683840	rs939040	A	G	633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=19;PP=541;SC=GGTCTGCGAGAGATCTCCAGT;SOR=4.615;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=20;WE=185683848;WS=185683830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr4	185684247	rs41278583	T	C	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.191;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=50;ReadPosRankSum=1.142;SC=TGTTGGGAAATACCACAGCAT;SOR=0.120;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=5;WE=185684255;WS=185684237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr4	185686032	rs2292898	C	T	5538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=98;NR=80;PP=2965;SC=CAGGCATGGTCAGGCAGCACC;SOR=0.799;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=178;TCF=98;TCR=80;TR=178;WE=185686040;WS=185686022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr4	185686856	rs3792314	C	G	769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=2;PP=658;SC=TAATTAGCTTCATTTAGCCAT;SOR=4.091;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=25;WE=185686864;WS=185686846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	185686948	.	AAC	A	71.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.556;ClippingRankSum=0.000;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.55;ReadPosRankSum=0.571;SOR=0.820;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,14:0.11:131
chr4	185687233	rs3749233	C	T	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.523;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=232;ReadPosRankSum=0.154;SC=ACCCCGTTCCCTAACCCATAG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=11;WE=185687241;WS=185687223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr4	185687687	rs12374289	A	C	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.824;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.15;ReadPosRankSum=-0.810;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr4	185687863	rs11727009	A	G	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.540;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=11;PP=355;ReadPosRankSum=1.255;SC=TCTTGGAGGCAAAGTCCAAGA;SOR=0.585;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=67;TCF=33;TCR=34;TR=26;WE=185687871;WS=185687853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,30:0.39:76
chr4	185694776	rs55664922	A	G	1045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=1.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.87;ReadPosRankSum=2.620;SOR=0.553;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,54:0.51:106
chr4	185694877	.	TA	T	286.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.871;ClippingRankSum=0.000;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.94;ReadPosRankSum=1.314;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,23:0.40:58
chr4	185705006	rs2102862	G	A	999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=15;PP=567;ReadPosRankSum=-0.092;SC=GAAACCTTCCGGCTCCAAGAA;SOR=0.662;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=72;TCR=36;TR=44;WE=185705014;WS=185704996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,51:0.42:122
chr4	185735054	rs7676928	G	A	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.192;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=20;PP=425;ReadPosRankSum=1.261;SC=GAAACTGCACGCAGAGAAGGT;SOR=0.435;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=46;TCF=16;TCR=30;TR=32;WE=185735062;WS=185735044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,35:0.65:54
chr4	185736113	rs2280297	G	C	2974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.327;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=48;PP=1849;ReadPosRankSum=-0.410;SC=ACTCTCCTTAGTTCCTGACAA;SOR=0.910;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=236;TCF=141;TCR=95;TR=122;WE=185736121;WS=185736103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,139:0.51:274
chr4	185772232	rs145931056	TCCTATGCCCTCC	T	10762.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=25;NR=100;PP=2967;SC=ATCAACCCTCTCCTATGCCCT;SOR=0.718;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=138;TCF=28;TCR=110;TR=125;WE=185772251;WS=185772222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr4	185772384	rs1032299	A	G	1420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=35;PP=984;SC=GAGACTAGTCACCAAGAGTCC;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=9;TCR=35;TR=44;WE=185772392;WS=185772374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr4	185859505	rs6821859	T	G	3701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=51;PP=2285;SC=TTCAGCTTTATGCATTCATCT;SOR=1.138;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=77;TCR=51;TR=128;WE=185859513;WS=185859495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr4	185859682	rs10446837	A	G	1089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.239;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=33;PP=820;ReadPosRankSum=-0.320;SC=TGAAAATACTAAACTAAGCCA;SOR=0.986;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=62;TCF=13;TCR=49;TR=41;WE=185859690;WS=185859672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,42:0.66:64
chr4	185940461	rs4862491	C	T	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.944;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=257;ReadPosRankSum=0.048;SC=GGAGAGGCGGCTTGCACCCAG;SOR=0.307;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=20;WE=185940469;WS=185940451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,22:0.48:46
chr4	185940952	rs1078461	C	G	1652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=39;PP=941;ReadPosRankSum=-1.092;SC=CGTTCAGTACCTGAGAGCACT;SOR=0.733;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=167;TCF=79;TCR=88;TR=76;WE=185940960;WS=185940942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,86:0.44:196
chr4	185999348	rs10023344	T	C	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.815;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=7;PP=492;ReadPosRankSum=-0.046;SC=AAAACATGGGTGGGTTTCATG;SOR=1.609;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=45;TCF=32;TCR=13;TR=29;WE=185999356;WS=185999338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,30:0.62:48
chr4	185999543	rs6841061	G	A	2668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.069;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=60;PP=1654;ReadPosRankSum=-0.701;SC=CTCGAGGAATGAAATGGTCAA;SOR=0.813;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=195;TCF=93;TCR=102;TR=113;WE=185999551;WS=185999533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,123:0.57:215
chr4	185999587	rs6818170	T	A	1438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=42;PP=966;ReadPosRankSum=-0.278;SC=TAAGCCTTGATCTACCCTATA;SOR=0.732;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=110;TCF=39;TCR=71;TR=64;WE=185999595;WS=185999577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,65:0.56:117
chr4	186084196	rs5864930	G	GA	1003.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=19;PP=811;SC=TCTCGACTAGGATGCACTTCA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=19;WE=186084204;WS=186084186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr4	186091487	rs6820332	G	A	1968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.90;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr4	186097045	rs6855305	C	T	9185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=156;NR=142;PP=2965;SC=TTTTGCTTCCCGGCTTTTCCG;SOR=0.741;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=298;TCF=156;TCR=142;TR=298;WE=186097053;WS=186097035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,338:1.00:338
chr4	186097219	rs370181930	C	CA	578.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.782;HP=12;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.559;NF=0;NR=26;PP=583;ReadPosRankSum=1.157;SC=CAGAAAAGAACAAAAAAAAAA;SOR=3.325;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=1;TCR=38;TR=26;WE=186097227;WS=186097209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,23:0.96:24
chr4	186097284	rs8180220	T	G	55.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=1;NR=4;PP=82;SC=TTTCTCTTTTTAGACGGAGTT;SOR=1.179;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=186097292;WS=186097274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr4	186168387	rs3108252	T	G	149.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=116;SC=CTTTGATTTTTTTTTTTTATG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=186168395;WS=186168378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	186170358	rs3108229	G	A	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=195;ReadPosRankSum=1.602;SC=TTTTAACTTTGTAATAAATTA;SOR=0.776;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=13;WE=186170366;WS=186170348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr4	186320666	rs11287696	TA	T	1103.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=5;PP=606;SC=TTGTAAGATATAAAAAAAAAG;SOR=3.716;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=40;TCF=31;TCR=9;TR=31;WE=186320674;WS=186320656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr4	186321067	rs1053218	C	T	1196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=12;PP=896;SC=ACTGGTTATACTTACCAGAGT;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=25;TCR=12;TR=37;WE=186321075;WS=186321057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr4	186321447	rs3733646	C	G	439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=1;PP=371;SC=TAATTTAAATCGTCAAACTAG;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=186321455;WS=186321441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	186323209	rs3733645	A	G	406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=1;PP=298;SC=CACTGTTTCTACAAGGCAGGG;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=186323217;WS=186323199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	186323593	rs6552880	C	T	261.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=214;SC=CAAAAGACTTCAGTAAACTGA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=186323601;WS=186323583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	186324841	rs13126680	T	A	1997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=52;PP=1521;SC=TCAATTTAAATAGACAGATTA;SOR=3.293;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=8;TCR=52;TR=60;WE=186324849;WS=186324831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr4	186336583	rs10032989	G	A	202.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=4;PP=137;SC=TATATCCTTAGTATAGTAAAA;SOR=1.609;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=6;WE=186336591;WS=186336573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	186339584	rs10003160	A	G	1214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=12;PP=798;SC=GAAGACAGATAGTTTGCTTAC;SOR=1.556;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=27;TCR=12;TR=39;WE=186339592;WS=186339574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr4	186347055	rs2289720	G	A	6540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=106;NR=116;PP=2965;SC=GGGCGCTGACGCCTGCCCAAA;SOR=0.966;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=222;TCF=106;TCR=116;TR=222;WE=186347063;WS=186347045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr4	186347073	rs11132303	G	C	4973.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=73;NR=99;PP=2682;SC=AAAAGTTCCGGGGGCCGGCCC;SOR=1.235;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=173;TCF=74;TCR=99;TR=172;WE=186347081;WS=186347063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr4	186347092	rs10866275	T	C	3587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=78;PP=1981;SC=CCTGAAGTGGTGTCACCGCAC;SOR=1.592;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=44;TCR=78;TR=122;WE=186347100;WS=186347082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr4	186357523	rs7697970	C	G	1080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=26;PP=695;SC=GGTAAAAAATCTGTTTTGAAT;SOR=1.923;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=10;TCR=26;TR=36;WE=186357531;WS=186357513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr4	186361876	rs4476640	A	G	1652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=36;PP=1119;SC=GTAAAAAGGTAAGTTTACAAT;SOR=2.522;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=10;TCR=36;TR=46;WE=186361884;WS=186361866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr4	186361924	.	G	GGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAA	486.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.56;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	186366315	rs2120414	T	C	1849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=50;PP=1569;SC=GCTTACAAACTAAGAAAAAAT;SOR=3.461;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=8;TCR=50;TR=58;WE=186366323;WS=186366305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr4	186366809	rs6833872	C	T	69.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.67;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=2;PP=20;SC=CCAGGTTTTGCATACTCTCAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=186366817;WS=186366799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr4	186370676	rs35349112	T	TA	324.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=12;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=1.145;NF=9;NR=7;PP=173;ReadPosRankSum=-2.007;SC=GACCCGGTCTTAAAAAAAAAA;SOR=0.665;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=30;TCF=19;TCR=11;TR=16;WE=186370684;WS=186370666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr4	186378541	rs11722096	C	G	1983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=37;PP=1075;SC=TCTAAGCTCACTCTCTCCTGT;SOR=1.288;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=25;TCR=37;TR=62;WE=186378549;WS=186378531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr4	186378790	rs4279261	T	C	408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=2;PP=292;SC=AAATATATACTTAATTCCAAT;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=186378798;WS=186378780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	186379104	rs7664578	T	C	1417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.17;SOR=0.735;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr4	186379371	rs7687202	G	A	3913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=72;PP=2296;SC=TTCTTGAAATGTAAGTTGTTT;SOR=1.006;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=57;TCR=73;TR=129;WE=186379379;WS=186379361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr4	186379899	rs35596415	G	C	2199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=32;PP=1329;SC=CTTTTAGCTGGATTATCTCTA;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=39;TCR=32;TR=71;WE=186379907;WS=186379889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr4	186380243	rs59319722	A	C	2329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=30;PP=1645;SC=TCTTTGCTGTATTCTTCTGTT;SOR=0.976;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=43;TCR=30;TR=73;WE=186380251;WS=186380233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr4	186380295	rs36007437	A	G	3109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=59;NR=42;PP=1872;SC=CTTCAACCAGATTCTTAAGTT;SOR=0.946;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=102;TCF=59;TCR=43;TR=101;WE=186380303;WS=186380285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr4	186380515	rs11132306	G	A	2202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=37;PP=1389;SC=CTCATTTTCAGATATTATTGA;SOR=0.850;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=73;TCF=36;TCR=37;TR=73;WE=186380523;WS=186380505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr4	186380846	rs7698680	A	T	3446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=47;PP=1862;SC=TTACCGTCCAAGTTTTCTTCC;SOR=0.892;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=66;TCR=47;TR=113;WE=186380854;WS=186380836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr4	186381115	rs7699687	G	T	2200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=37;NR=27;PP=950;SC=CATCACATTTGGAGGTGCAGT;SOR=0.717;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=37;TCR=27;TR=64;WE=186381123;WS=186381105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr4	186381165	rs7699724	G	A	2438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=28;PP=1291;SC=TCTTCAAGATGTCAGAATTTT;SOR=0.965;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=41;TCR=28;TR=69;WE=186381173;WS=186381155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr4	186382206	rs11132309	A	G	2930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.48;ReadPosRankSum=2.180;SOR=0.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,114:0.99:115
chr4	186382407	rs62345633	A	T	132.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=76;SC=GGTGTGTTTAAATTTCCTGCC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=186382415;WS=186382397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	186391759	rs28715304	G	A	238.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=1;PP=137;SC=GCAACGGAGCGTAGCGTGGTG;SOR=2.093;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=186391767;WS=186391749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	186391868	rs28581909	T	C	2277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=49;NR=25;PP=1322;SC=CCCGTTTCCTTATCTGCAAAA;SOR=1.206;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=49;TCR=25;TR=74;WE=186391876;WS=186391858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr4	186391898	rs66481949	C	T	2964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=61;NR=37;PP=1453;SC=TGGTAGCACCCACCTCGTAAA;SOR=0.922;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=61;TCR=37;TR=98;WE=186391906;WS=186391888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr4	186392287	.	C	A	112	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;FR=1.0000;HP=8;HapScore=2;MGOF=21;MMLQ=27;MQ=53.63;NF=0;NR=5;PP=112;QD=29.3542425094;SC=AGGGATGGGGCGGGGCAGGGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=5;WE=186392295;WS=186392277;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,5:0.62:8
chr4	186393233	rs33974317	GTT	G	1985.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=17.438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.95;MQRankSum=1.703;QD=21.12;ReadPosRankSum=-0.225;SOR=0.040;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,70:0.74:94
chr4	186393372	rs11940504	T	C	1825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.243;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=48;PP=1224;ReadPosRankSum=-0.893;SC=CTCCTATTTTTCAATAATGAA;SOR=0.809;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=156;TCF=63;TCR=93;TR=80;WE=186393380;WS=186393362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,83:0.51:163
chr4	186423637	rs4635850	G	A	4102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=63;NR=67;PP=2229;SC=CCACAGCACCGCTGTTGGGGA;SOR=0.955;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=63;TCR=68;TR=130;WE=186423645;WS=186423627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr4	186423677	rs10866276	G	A	3102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=43;NR=56;PP=1707;SC=AAAAACCACAGAGCAAAAATA;SOR=1.169;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=43;TCR=56;TR=99;WE=186423685;WS=186423667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr4	186427841	rs2306705	T	C	1356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=35;PP=852;SC=CATCGTCAGGTGCTGGGAGGC;SOR=2.701;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=10;TCR=35;TR=45;WE=186427849;WS=186427831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr4	186444698	rs4862543	A	C	432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.34;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	186444704	rs4861669	C	T	401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.18;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	186456617	rs4862545	A	G	2994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=69;PP=2139;SC=ACCGGGCTCTAAGTGTCCCCG;SOR=2.326;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=92;TCF=23;TCR=69;TR=92;WE=186456625;WS=186456607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr4	186510778	rs1160906	A	AAACTC	3143.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.882;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=25;PP=1975;ReadPosRankSum=0.238;SC=GGGAGTGAGCAAACTCAAGCA;SOR=0.879;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=103;TCF=34;TCR=69;TR=38;WE=186510786;WS=186510768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,84:0.45:187
chr4	186528433	rs13144963	T	C	4344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=75;PP=2444;SC=GCCAGTTCCCTGGAGAGCTCC;SOR=0.793;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=151;TCF=75;TCR=76;TR=150;WE=186528441;WS=186528423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr4	186544311	rs141097429	T	C	1402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.894;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=26;PP=764;ReadPosRankSum=1.285;SC=AGGATGCTGTTGTCCGGCAAG;SOR=0.867;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=163;TCF=94;TCR=69;TR=65;WE=186544319;WS=186544301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,72:0.40:178
chr4	186545719	rs13119106	G	T	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.159;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=71;ReadPosRankSum=0.079;SC=AGAGAGGAGAGCATGTCAGTA;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=5;WE=186545736;WS=186545709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr4	186545728	rs3841443	TA	T	391.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=355;SC=AGCATGTCAGTAAAGCATCAG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=186545736;WS=186545709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	186572791	rs4862557	C	T	2973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=25;PP=1820;SC=TTGTTATGCACGCTCTGAGAA;SOR=2.131;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=69;TCR=25;TR=94;WE=186572799;WS=186572781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr4	186587394	rs76458992	T	C	790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=19;PP=529;ReadPosRankSum=-0.477;SC=AGAGATAAATTATCCAATTAA;SOR=0.784;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=51;TCF=18;TCR=33;TR=29;WE=186587402;WS=186587384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,33:0.57:58
chr4	186599992	rs67212481	A	T	742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.850;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=14;PP=412;ReadPosRankSum=-0.296;SC=AGAAAAAAAAATGTTGAAATT;SOR=0.740;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=81;TCF=42;TCR=39;TR=33;WE=186600000;WS=186599973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,37:0.43:87
chr4	186611576	rs55889604	A	G	777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=6;PP=601;SC=AAAGAAAGAAAGTAATGAATC;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=25;WE=186611584;WS=186611566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	186997643	rs1568358	C	G	641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=0;PP=422;SC=TGGCATAAAACTATGAGTAAT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=186997651;WS=186997633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	187004074	rs3775291	C	T	6174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=115;NR=84;PP=2965;SC=CTTACACATACTCAACCTAAC;SOR=0.915;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=199;TCF=115;TCR=84;TR=199;WE=187004082;WS=187004064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr4	187005376	rs6830345	T	C	234.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.35;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	187070937	rs17882808	T	G	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=173;ReadPosRankSum=0.589;SC=CAAAATTATTTTTACCAATTA;SOR=0.610;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=11;WE=187070945;WS=187070927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr4	187072891	rs2276915	G	C	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.788;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=84;ReadPosRankSum=0.546;SC=TCTCAGAAAGGTAACAGCTAG;SOR=1.730;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=6;WE=187072899;WS=187072881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr4	187072932	rs2276914	A	G	1824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=43;NR=16;PP=1138;SC=CAAAGCCACCATCTTTTTACC;SOR=1.828;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=43;TCR=16;TR=59;WE=187072940;WS=187072922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr4	187073000	rs2276913	A	G	5624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.567;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=111;NR=84;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.572;SC=GCGTTGATCCAGAAGCCCGCA;SOR=0.641;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=196;TCF=111;TCR=85;TR=195;WE=187073008;WS=187072990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,215:1.00:216
chr4	187073030	rs2276912	T	C	7110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=129;NR=117;PP=2965;SC=CTTGCAGTGTTGTAACCAAGT;SOR=0.769;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=248;TCF=130;TCR=118;TR=246;WE=187073038;WS=187073020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,270:1.00:270
chr4	187074833	rs4862650	A	G	2515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=43;PP=1458;SC=GCCCACTGACAAAGGCGTCCA;SOR=0.924;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=84;TCF=41;TCR=43;TR=84;WE=187074841;WS=187074823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr4	187077206	rs4862653	A	G	7384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=141;NR=101;PP=2965;SC=GAAATGGCGCAAACTCGGACT;SOR=0.881;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=242;TCF=141;TCR=101;TR=242;WE=187077214;WS=187077196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,276:1.00:276
chr4	187077393	rs7670550	T	C	2082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=42;PP=1279;SC=GTCCCTGTTCTTCGGCCCTGG;SOR=1.885;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=18;TCR=42;TR=60;WE=187077401;WS=187077383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr4	187077437	rs13114283	G	A	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=200;ReadPosRankSum=1.257;SC=GACCTAGAACGTGACCAGTGA;SOR=1.061;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=11;WE=187077445;WS=187077427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr4	187078785	rs2276924	A	G	4714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=76;NR=81;PP=2639;SC=CTCGTTCCACACGCTCACGCC;SOR=0.869;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=158;TCF=77;TCR=81;TR=157;WE=187078793;WS=187078775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr4	187078922	rs2276921	G	C	556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=11;PP=450;SC=CTGTGTGTCTGTCACCTCAGT;SOR=1.179;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=18;TCF=7;TCR=11;TR=17;WE=187078930;WS=187078912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	187079047	rs2276919	A	G	1210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.932;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=11;PP=806;ReadPosRankSum=-0.944;SC=TCACAGTGTCACAATGCCTGG;SOR=1.112;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=100;TCF=75;TCR=25;TR=53;WE=187079055;WS=187079037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,57:0.53:107
chr4	187079183	rs12504044	G	A	2963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.437;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=72;PP=1790;ReadPosRankSum=0.731;SC=ACGGACCAGCGATGGCATCTC;SOR=0.653;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=239;TCF=106;TCR=133;TR=129;WE=187079191;WS=187079173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,144:0.51:282
chr4	187086150	rs73027974	C	T	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=164;ReadPosRankSum=1.046;SC=GGGGCCAGTGCCCACCCCCTT;SOR=1.179;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=8;WE=187086158;WS=187086141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr4	187086562	rs61155675	C	A	2609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.386;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=55;PP=1426;ReadPosRankSum=0.289;SC=GTTCCCCCCGCTAGTCACGGA;SOR=0.607;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=265;TCF=145;TCR=120;TR=118;WE=187086570;WS=187086552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,136:0.46:296
chr4	187088248	rs9991339	C	T	2005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.591;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=41;PP=1179;ReadPosRankSum=-1.089;SC=CCACACGTTCCGGGTGGGTTC;SOR=0.402;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=147;TCF=68;TCR=79;TR=83;WE=187088256;WS=187088238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,92:0.55:167
chr4	187092960	rs7694300	A	G	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.744;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.82;ReadPosRankSum=-1.579;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr4	187093018	rs4241814	G	T	527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=409;ReadPosRankSum=-0.595;SC=TTCTGAGTGGGTGCCTTTGTA;SOR=0.571;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=35;TCR=9;TR=24;WE=187093026;WS=187093008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,24:0.52:46
chr4	187093215	rs76303699	A	G	1823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.309;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=48;PP=1172;ReadPosRankSum=-0.858;SC=TGGAGGAACAAGTGTTATATT;SOR=0.928;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=173;TCF=78;TCR=95;TR=80;WE=187093223;WS=187093205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,88:0.46:190
chr4	187113041	rs1055138	C	G	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.992;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=9;PP=349;ReadPosRankSum=-1.904;SC=GGCGAGTGCCCTTTCCCTGGC;SOR=1.044;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=62;TCF=39;TCR=23;TR=29;WE=187113049;WS=187113031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,33:0.46:71
chr4	187118358	rs62350518	C	T	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.507;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=11;PP=236;ReadPosRankSum=-0.242;SC=CACACTCCACCGGGAAGGCAA;SOR=0.340;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=48;TCF=20;TCR=28;TR=22;WE=187118366;WS=187118348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,23:0.45:51
chr4	187120211	rs13146272	C	A	1557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=36;PP=828;ReadPosRankSum=0.479;SC=AAAGAGCCTTCAGATCCTACA;SOR=0.653;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=137;TCF=65;TCR=72;TR=69;WE=187120219;WS=187120188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,78:0.52:151
chr4	187122204	rs11730880	C	T	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-2.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=33;ReadPosRankSum=1.198;SC=TTGAAATAGGCTTAGAAAAAT;SOR=0.260;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=5;WE=187122212;WS=187122194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr4	187122319	rs3736455	T	G	1502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-1.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.617;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=20;PP=714;ReadPosRankSum=0.973;SC=AGGTCATCGCTGAACGGGCCA;SOR=0.772;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=126;TCF=81;TCR=45;TR=61;WE=187122327;WS=187122309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,76:0.50:151
chr4	187126550	rs3216724	TC	T	2745.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=50;PP=1859;SC=GCAGGAAGGCTCCCCCACGGG;SOR=1.995;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=65;TCF=2;TCR=63;TR=52;WE=187126558;WS=187126540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr4	187129995	rs2276917	A	G	3227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=45;PP=1958;SC=CTTTCAGGTCATCTTATCTAC;SOR=1.143;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=71;TCR=45;TR=116;WE=187130003;WS=187129985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr4	187149200	.	C	CA	38	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5559;HP=9;HapScore=2;MGOF=22;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=38;QD=17.3333333333;SC=ACAAATGTACCAAAAAAAAAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=3;WE=187149208;WS=187149197;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:1,3:0.75:4
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chr4	187171355	rs4253299	A	G	5647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=118;NR=71;PP=2965;SC=ATTTAGCCTCATGTCATTTCC;SOR=1.153;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=189;TCF=118;TCR=71;TR=189;WE=187171363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr4	187173012	rs4253301	T	G	2253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.933;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=54;PP=1523;ReadPosRankSum=1.815;SC=TGGGGACAACTCTGGTGAGTA;SOR=0.406;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=194;TCF=82;TCR=112;TR=102;WE=187173020;WS=187173002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,106:0.52:204
chr4	187178599	rs4253326	C	T	1032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=30;PP=771;SC=TAGCATAATTCAATCATAGTT;SOR=2.554;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=8;TCR=30;TR=38;WE=187178621;WS=187178589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr4	187178613	rs4253327	A	T	663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=24;PP=599;SC=CATAGTTTTTAAAAAAATTCA;SOR=3.098;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=29;WE=187178621;WS=187178589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	187179210	rs925453	T	C	1389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=28;PP=738;ReadPosRankSum=-0.255;SC=GCAAACACAATGGAATGTGGC;SOR=0.710;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=147;TCF=81;TCR=66;TR=64;WE=187179218;WS=187179200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,71:0.44:160
chr4	187202977	rs3775306	G	A	1672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.202;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=14;PP=1064;ReadPosRankSum=0.052;SC=ATTATCTGCTGTACCGAGAAG;SOR=1.534;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=142;TCF=102;TCR=40;TR=66;WE=187202985;WS=187202967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,74:0.49:150
chr4	187207535	rs2289253	G	T	1001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=10;PP=692;ReadPosRankSum=-1.036;SC=TATATTTTGCGTCTCATATTT;SOR=0.582;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=42;TCR=14;TR=40;WE=187207543;WS=187207525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,42:0.70:60
chr4	187207715	rs2289254	C	A	1889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.362;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=47;PP=1074;ReadPosRankSum=0.626;SC=AAGAGCGGAACCTTTTCTGCC;SOR=0.966;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=168;TCF=76;TCR=92;TR=84;WE=187207723;WS=187207705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,92:0.49:187
chr4	187208745	.	AAT	A	79.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=-0.000;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.674;NF=3;NR=0;PP=102;ReadPosRankSum=-2.450;SC=CTCAATTAAAAATATATATAT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=3;WE=187208754;WS=187208743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr4	187209559	rs5966	A	G	916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.623;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=10;PP=556;ReadPosRankSum=-1.985;SC=GAAGATGGGAAGCGTCTGAGT;SOR=0.891;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=84;TCF=61;TCR=23;TR=37;WE=187209567;WS=187209549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,44:0.42:105
chr4	187209702	rs5971	G	T	2105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.518;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=42;PP=1225;ReadPosRankSum=0.442;SC=AAAGGGAGCGGCCAGGTGTTT;SOR=0.773;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=178;TCF=93;TCR=85;TR=87;WE=187209710;WS=187209692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,101:0.50:200
chr4	187209729	rs5976	G	A	1795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=39;PP=1023;ReadPosRankSum=0.216;SC=ACGTGGTCGAGTACGTGGACT;SOR=0.700;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=150;TCF=71;TCR=79;TR=73;WE=187209737;WS=187209719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,85:0.49:172
chr4	187454951	rs8192551	T	C	2945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.623;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=28;PP=796;ReadPosRankSum=-0.506;SC=ACACCCTGGCTGTACAGAGCG;SOR=0.919;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=164;TCF=91;TCR=73;TR=73;WE=187454959;WS=187454941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,80:0.45:178
chr4	187454972	rs8192550	T	C	3291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.508;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=33;PP=1185;ReadPosRankSum=0.591;SC=AGACTATAATTCTCCTGTATT;SOR=0.761;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=186;TCF=109;TCR=77;TR=86;WE=187454980;WS=187454962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,98:0.47:210
chr4	187511861	rs1973352	G	A	1362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=30;PP=775;ReadPosRankSum=0.744;SC=TGAAAACACAGAATTTCCTTA;SOR=0.646;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=130;TCF=56;TCR=74;TR=56;WE=187511869;WS=187511851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,64:0.46:140
chr4	187513623	rs3836618	TA	T	243.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.268;NF=9;NR=0;PP=234;ReadPosRankSum=-1.347;SC=AGATCTCATGTAAATCACTAT;SOR=1.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=9;WE=187513631;WS=187513614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr4	187516814	rs4862721	C	T	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=84;ReadPosRankSum=-0.364;SC=GCAAGCAAAGCGCAGTGTTGC;SOR=0.340;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=7;WE=187516822;WS=187516804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr4	187516880	rs1298865	A	G	1068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.765;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=11;PP=729;ReadPosRankSum=0.391;SC=AGGAGCTCAGAGACTGCACTT;SOR=0.906;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=94;TCF=70;TCR=24;TR=46;WE=187516888;WS=187516870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,49:0.49:101
chr4	187518976	rs2306990	C	T	4634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.953;QD=17.36;ReadPosRankSum=1.815;SOR=0.720;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:141,126:0.47:267
chr4	187518980	rs1280096	T	C	4556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.932;QD=17.94;ReadPosRankSum=2.390;SOR=0.716;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:137,117:0.46:254
chr4	187519206	rs1280097	C	G	6754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=125;NR=110;PP=2965;SC=AGAGGCATGGCTTGGAGGAAC;SOR=0.733;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=237;TCF=126;TCR=111;TR=235;WE=187519214;WS=187519196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr4	187521037	rs10009030	C	A	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=178;ReadPosRankSum=0.225;SC=AAGATGGCAACATTACGGAGC;SOR=0.481;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=10;WE=187521045;WS=187521027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr4	187525020	rs2637777	A	C	1863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.043;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.99;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=41;PP=985;ReadPosRankSum=0.264;SC=TCTCCAGAAGAGGTGATGAAA;SOR=0.586;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=180;TCF=95;TCR=85;TR=83;WE=187525028;WS=187525010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,93:0.47:196
chr4	187527472	rs2584344	A	G	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.117;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=10;PP=182;ReadPosRankSum=-0.544;SC=CCAGTGAGCTACCACTATCTG;SOR=0.497;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=42;TCF=19;TCR=23;TR=20;WE=187527480;WS=187527462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,24:0.49:49
chr4	187530313	rs4862722	C	T	2792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=34;PP=1775;SC=TTGTAAACAACGTAAATCAAC;SOR=1.390;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=62;TCR=34;TR=96;WE=187530321;WS=187530303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr4	187534363	rs2249916	G	A	5300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.421;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=56;PP=2962;ReadPosRankSum=0.064;SC=ATTCGGGGGCGTTATCGTTCA;SOR=0.745;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=264;TCF=146;TCR=118;TR=125;WE=187534383;WS=187534353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,143:0.48:299
chr4	187534375	rs2249917	A	G	5362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=61;PP=2962;ReadPosRankSum=1.716;SC=TATCGTTCACATCTTCTAGCG;SOR=0.705;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=285;TCF=155;TCR=130;TR=133;WE=187534383;WS=187534353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,149:0.47:320
chr4	187534542	rs2249926	T	C	1671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.542;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=40;PP=980;ReadPosRankSum=-1.281;SC=AAGACGTGACTTGCAGTTGTA;SOR=0.763;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=177;TCF=76;TCR=101;TR=69;WE=187534550;WS=187534532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,81:0.42:195
chr4	187538133	rs1280100	A	G	1340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.893;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=23;PP=867;ReadPosRankSum=-1.238;SC=TTCATAACACACAAATGTAAG;SOR=0.845;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=173;TCF=108;TCR=65;TR=66;WE=187538141;WS=187538123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,72:0.38:188
chr4	187538330	rs1280099	G	A	1265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=34;PP=802;ReadPosRankSum=-1.876;SC=TAGTTTCAACGGCAAACTGTC;SOR=0.638;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=29;TCR=68;TR=49;WE=187538338;WS=187538320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,56:0.50:111
chr4	187538942	rs1280098	T	G	1663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.589;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=22;PP=930;ReadPosRankSum=0.657;SC=CACCCCACCTTGGGGGTCATC;SOR=1.078;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=137;TCF=85;TCR=52;TR=67;WE=187538950;WS=187538932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,78:0.47:165
chr4	187539588	rs3733406	T	C	3609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=393;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.422;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=77;PP=2404;ReadPosRankSum=1.006;SC=TCTGTTCCAATAGGCACGTCC;SOR=0.732;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=358;TCF=183;TCR=175;TR=162;WE=187539596;WS=187539578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:214,178:0.45:392
chr4	187540996	rs11931107	C	T	1433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.283;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=33;PP=906;ReadPosRankSum=-1.874;SC=GCTTATATGCCGGGTGGGCCT;SOR=0.923;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=112;TCF=51;TCR=61;TR=57;WE=187541004;WS=187540986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,64:0.51:125
chr4	187557642	rs41278609	G	A	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=130;ReadPosRankSum=0.269;SC=CACTTCAGCCGTTTACAAAAT;SOR=0.465;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=8;WE=187557650;WS=187557633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr4	187557893	rs328418	T	C	3048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.918;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=72;PP=1742;ReadPosRankSum=-1.061;SC=GGCTATGACGTGATAGAGCGG;SOR=0.771;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=252;TCF=120;TCR=132;TR=132;WE=187557901;WS=187557883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,144:0.52:276
chr4	187584771	rs172903	C	G	5724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=109;PP=2965;SC=ATGACACCTACAGAGAAAAAA;SOR=1.162;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=186;TCF=76;TCR=110;TR=185;WE=187584779;WS=187584761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr4	187627792	rs11939575	T	C	2973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.085;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=66;PP=1590;ReadPosRankSum=0.737;SC=CCATCTCTTCTGGCGTCCTCA;SOR=0.547;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=311;TCF=152;TCR=159;TR=137;WE=187627800;WS=187627782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:202,151:0.43:353
chr4	187628398	rs1877731	C	G	2350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=40;PP=1374;ReadPosRankSum=-0.694;SC=GTGTCTGTAACAATTGAGTAC;SOR=0.673;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=190;TCF=111;TCR=79;TR=91;WE=187628406;WS=187628388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,105:0.48:218
chr4	187629137	rs4862726	A	G	3044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=62;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.258;SC=GGTTTAAACTAAAGAAATCCA;SOR=0.708;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=257;TCF=133;TCR=124;TR=128;WE=187629148;WS=187629127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,138:0.49:281
chr4	187629140	rs367863	G	C	3101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=61;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.143;SC=TTAAACTAAAGAAATCCAGTT;SOR=0.706;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=252;TCF=130;TCR=122;TR=128;WE=187629148;WS=187629127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,144:0.52:277
chr4	187629497	rs458021	G	A	2270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.117;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=50;PP=1332;ReadPosRankSum=1.631;SC=TCACGTACCCGTTCTCACCCT;SOR=0.662;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=241;TCF=127;TCR=114;TR=104;WE=187629505;WS=187629487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,111:0.43:256
chr4	187629538	rs3733413	C	T	2274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.441;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=49;PP=1355;ReadPosRankSum=-1.869;SC=AGGCTCATGACAGTAGTACCA;SOR=0.648;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=261;TCF=145;TCR=116;TR=112;WE=187629546;WS=187629528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,119:0.43:278
chr4	187629770	rs3733414	A	C	2511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.461;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.088;NF=54;NR=48;PP=1601;ReadPosRankSum=2.152;SC=TTCCAGGTGTACTTTTAAAAA;SOR=0.652;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=219;TCF=114;TCR=105;TR=102;WE=187629778;WS=187629760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,115:0.46:249
chr4	189060610	rs11934889	G	C	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.850;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=50;ReadPosRankSum=-0.154;SC=AACAACATAGGAACAGGTCAC;SOR=0.061;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=6;WE=189060618;WS=189060600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr4	189061106	rs13131525	G	A	1261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.147;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=31;PP=730;ReadPosRankSum=1.097;SC=CAGCGAGGCTGAGGAGCATCA;SOR=0.916;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=124;TCF=61;TCR=63;TR=58;WE=189061114;WS=189061096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,64:0.46:140
chr4	189061223	rs13131409	C	T	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.67;ReadPosRankSum=-1.755;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,3:0.23:13
chr4	189063361	rs70938702	CGTGTGT	C,CGT	1110.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;NF=19,19;NR=5,5;PP=340,317;SC=AACTTTATCTCGTGTGTGTGT;SOR=3.912;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=24,24;WE=189063378;WS=189063351;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:34
chr4	189064873	rs72725001	C	T	1944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.766;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=35;PP=1176;ReadPosRankSum=-0.352;SC=TGCTCCCACTCATGGTGTGCT;SOR=0.428;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=149;TCF=93;TCR=56;TR=87;WE=189064881;WS=189064863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,94:0.58:161
chr4	189064952	rs28463290	C	G	8732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=155;NR=134;PP=2965;SC=GTGTTATGATCAAAGCGCACC;SOR=0.731;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=289;TCF=155;TCR=134;TR=289;WE=189064960;WS=189064942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,320:1.00:320
chr4	189065055	rs11940009	C	G	1057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=30;PP=654;ReadPosRankSum=1.227;SC=AGCTGCGGGGCAGTGGTGCTG;SOR=0.746;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=125;TCF=44;TCR=81;TR=46;WE=189065063;WS=189065045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,52:0.38:137
chr4	189065104	rs9784566	T	G	1543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=31;PP=1136;SC=TCTGCGCTGTTGCTGGGGGAG;SOR=1.911;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=46;TCF=14;TCR=32;TR=45;WE=189065112;WS=189065094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
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chr4	189065435	rs34012483	C	T	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.72;ReadPosRankSum=1.529;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr4	189065441	rs11940227	G	T	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.489;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.07;ReadPosRankSum=-0.473;SOR=0.120;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr4	189660562	rs146686236	G	A	1242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=2.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.692;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.437;NF=36;NR=23;PP=1052;ReadPosRankSum=1.054;SC=TATGCAAGGAGATTATCTACT;SOR=0.950;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=109;TCF=65;TCR=44;TR=59;WE=189660570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,52:0.54:97
chr4	190328957	rs67780838	C	T	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=246;ReadPosRankSum=0.819;SC=AAGATTCTAACTTGTGTATTT;SOR=0.627;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=16;WE=190328965;WS=190328947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr4	190329166	rs10622647	G	GCA,GCACACACA	607.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=2.609;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.79;MQRankSum=0.855;QD=24.31;ReadPosRankSum=0.593;SOR=2.200;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:4,13,8:0.52,0.32:25
chr4	190394938	rs138612273	CAAGAAG	C,CAAG	1502.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;NF=15,15;NR=8,8;PP=516,459;SC=AGGATGGTGACAAGAAGAAGA;SOR=2.613;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=23,23;WE=190394951;WS=190394928;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.59,0.41:39
chr4	190395259	rs13143685	C	G	1822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.487;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=45;PP=1194;ReadPosRankSum=-1.069;SC=CTGTGAGGAGCTAATCCCTGA;SOR=0.758;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=212;TCF=104;TCR=108;TR=87;WE=190395267;WS=190395249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,92:0.39:238
chr4	190395838	rs70944383	C	CA	781.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=1.908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.53;MQRankSum=2.358;QD=9.31;ReadPosRankSum=-1.164;SOR=0.964;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,41:0.49:84
chr4	190396182	rs114569255	G	A	2392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.668;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=53;ReadPosRankSum=2.356;SC=CTGACTTCGGGCTGGAAGGTC;SOR=0.501;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=209;TCF=95;TCR=114;TR=104;WE=190396190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,113:0.49:231
chr4	190862083	rs1138726	T	C	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.079;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=8;PP=351;ReadPosRankSum=1.023;SC=CGCTTCTGTTTCTCCGCGCCC;SOR=0.525;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=54;TCF=39;TCR=15;TR=24;WE=190862091;WS=190862073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,24:0.41:58
chr4	190862155	rs4145515	T	G	1562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.187;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=29;PP=1085;ReadPosRankSum=-0.993;SC=CGCAGAAGTTTCCCGGAGCCA;SOR=0.796;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=156;TCF=95;TCR=61;TR=75;WE=190862163;WS=190862145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,77:0.44:174
chr4	190862182	rs2411530	C	T	1694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.087;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=35;PP=1063;ReadPosRankSum=-1.037;SC=AGTACTCCTACGTGAAGTCTA;SOR=0.990;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=178;TCF=102;TCR=76;TR=87;WE=190862190;WS=190862172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,90:0.46:196
chr4	190862287	rs4145517	C	T	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.075;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=24;PP=516;ReadPosRankSum=-0.436;SC=TCCACCCCCGCAACTCCGGTG;SOR=0.941;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=60;TCF=18;TCR=42;TR=33;WE=190862295;WS=190862277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,33:0.54:61
chr4	190863127	rs6837422	C	G	873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.925;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=29;PP=618;ReadPosRankSum=-0.660;SC=CTCGAGGAGTCTGGCCTCATG;SOR=1.410;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=68;TCF=17;TCR=51;TR=36;WE=190863135;WS=190863117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,38:0.53:72
chr4	190876195	rs7684300	C	T	6127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=385;ExcessHet=3.0103;FS=32.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.71;MQRankSum=-8.548;QD=15.92;ReadPosRankSum=-2.787;SOR=1.671;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:151,234:0.61:385
chr4	190876204	rs3207892	G	A	2311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=426;ExcessHet=3.0103;FS=62.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.00;MQRankSum=-20.328;QD=5.43;ReadPosRankSum=-6.675;SOR=3.768;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:311,115:0.27:426
chr4	190876242	rs1061653	G	A	5397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;BaseQRankSum=-4.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=511;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.450;HP=1;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-18.303;NF=170;NR=143;PP=2962;ReadPosRankSum=1.021;SC=AATTCAGATGGACTTGTTGTT;SOR=0.520;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=558;TCF=279;TCR=279;TR=313;WE=190876250;WS=190876232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:259,252:0.49:511
chr4	190876319	rs77450681	A	T	4058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=1.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.266;HP=4;HapScore=1;MGOF=42;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.787;NF=44;NR=140;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.132;SC=AAGTGCTGTTATTGTTTATAA;SOR=0.234;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=252;TCF=53;TCR=199;TR=184;WE=190876327;WS=190876309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,157:0.70:223
chr4	190876349	rs199599460	C	T	1274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-6.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=58;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.209;NF=3;NR=61;PP=1277;ReadPosRankSum=-2.589;SC=GTCAGTTTAACAGAAAGTCTG;SOR=0.739;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=107;TCF=5;TCR=102;TR=64;WE=190876357;WS=190876339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,55:0.59:94
chr4	190878452	rs372664630	TG	CA	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=2.249;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.80;MQRankSum=-3.931;QD=4.09;ReadPosRankSum=1.521;SOR=1.532;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,14:0.17:83
chr4	190878463	rs62345288	T	G	1329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=17.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.45;MQRankSum=-6.316;QD=13.85;ReadPosRankSum=3.131;SOR=3.335;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,34:0.35:96
chr4	190878472	rs12641802	A	G	660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=1.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.33;MQRankSum=3.218;QD=6.01;ReadPosRankSum=-1.515;SOR=0.452;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,27:0.25:110
chr4	190878485	rs62345289	G	A	1557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=0.781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.78;MQRankSum=-7.987;QD=11.98;ReadPosRankSum=2.680;SOR=0.817;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,44:0.34:130
chr4	190878506	rs12643923	C	T	1872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FS=11.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.13;MQRankSum=-9.933;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.165;SOR=1.619;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,52:0.36:145
chr4	190878512	rs12511235	A	G	1247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=2.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.97;MQRankSum=9.741;QD=8.49;ReadPosRankSum=0.930;SOR=0.486;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,62:0.42:147
chr4	190878538	rs34697501	A	AT	2017.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=1.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.26;MQRankSum=-9.765;QD=12.23;ReadPosRankSum=-0.576;SOR=0.533;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,71:0.43:165
chr4	190878597	rs62345290	C	T	7851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.5;BaseQRankSum=-1.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=831;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.408;NF=283;NR=295;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.280;SC=TTATTAGATGCAATGAAGCAG;SOR=0.668;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=1212;TCF=629;TCR=583;TR=578;WE=190878605;WS=190878583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:431,399:0.48:830
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chr4	190878661	rs62345291	A	T	10045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;BaseQRankSum=-5.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.104;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.404;NF=335;NR=416;PP=2962;ReadPosRankSum=1.408;SC=GATCAAGGTAATGATGACATT;SOR=0.607;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=1637;TCF=744;TCR=893;TR=751;WE=190878669;WS=190878644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:664,550:0.45:1214
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chr5	174240	rs6875054	GC	AA	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.776;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=434;ReadPosRankSum=0.022;SC=CGCAGGGCCTGCCAGGCTCAG;SOR=0.228;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=14;WE=174249;WS=174230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
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chr5	181730	rs12519352	C	G	1152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.423;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=26;PP=577;ReadPosRankSum=0.807;SC=GATAAGCGACCGGGCTCCCAA;SOR=0.857;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=112;TCF=51;TCR=61;TR=46;WE=181738;WS=181720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,57:0.44:130
chr5	181762	rs11133847	A	G	706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.458;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=17;PP=356;ReadPosRankSum=0.784;SC=TGAGCGACCGAGTCCCCGACA;SOR=0.372;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=65;TCF=22;TCR=43;TR=29;WE=181770;WS=181752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,34:0.47:72
chr5	182077	rs4956924	T	A	3629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=338;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.285;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=73;PP=2289;ReadPosRankSum=-2.054;SC=GCTGCACTTCTGGAGCGGAAG;SOR=0.617;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=312;TCF=171;TCR=141;TR=163;WE=182085;WS=182067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,174:0.51:338
chr5	195507	rs13167067	C	T	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.103;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=18;PP=401;ReadPosRankSum=-0.534;SC=TGCATTTCAGCCTGCAGGTGC;SOR=0.518;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=51;TCF=18;TCR=33;TR=29;WE=195515;WS=195497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,31:0.57:54
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chr5	231111	rs1126417	T	C	2211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.258;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.111;NF=44;NR=42;PP=1292;ReadPosRankSum=-0.809;SC=AGTTCCACCCTACAGGTAGGG;SOR=0.567;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=141;TCF=71;TCR=70;TR=86;WE=231119;WS=231101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,101:0.62:164
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chr5	423906	rs55932239	G	A	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.159;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=208;ReadPosRankSum=0.666;SC=TGTGACACGTGTGTTTTGGCT;SOR=1.691;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=37;TCF=27;TCR=10;TR=14;WE=423914;WS=423896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,15:0.37:41
chr5	428166	rs143087196	GC	G	892.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.056;NF=2;NR=19;PP=604;ReadPosRankSum=0.462;SC=CCTGCTGGCGGCCCCCACAAA;SOR=0.610;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=47;TCF=3;TCR=44;TR=21;WE=428174;WS=428156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,35:0.49:72
chr5	432905	rs72717420	C	A	4379.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=477;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.28;ReadPosRankSum=0.384;SOR=0.635;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:246,226:0.48:472
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chr5	434998	rs72717421	C	T	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=70;ReadPosRankSum=-1.111;SC=CGCTCAGATGCGTCGGTGGCT;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=8;WE=435006;WS=434988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr5	442571	rs56146525	A	C	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.461;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=169;ReadPosRankSum=-0.541;SC=CTCCTCCAGGAAGCGACTCAG;SOR=1.061;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=13;WE=442579;WS=442561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,13:0.34:38
chr5	443059	rs77101200	G	T	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.99;ReadPosRankSum=0.420;SOR=0.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr5	459415	rs80046645	G	C	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.566;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=66;ReadPosRankSum=-0.938;SC=CAGCAAACCTGCACTCTTAGT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=5;WE=459423;WS=459405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,5:0.24:21
chr5	464339	rs72698510	C	A	955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=11;PP=626;ReadPosRankSum=0.781;SC=TGCCTCCCTCCCACATGCACT;SOR=0.729;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=69;TCF=50;TCR=19;TR=37;WE=464347;WS=464329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,41:0.55:75
chr5	465164	rs76667725	A	G	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.703;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.10;ReadPosRankSum=1.803;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr5	466811	rs2434697	T	C	1647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=21;PP=874;ReadPosRankSum=-0.513;SC=GGCTGCTAAGTGGGCATGGGC;SOR=0.693;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=126;TCF=86;TCR=40;TR=62;WE=466819;WS=466801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,74:0.50:148
chr5	472221	rs72698516	G	C	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.235;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=346;ReadPosRankSum=0.098;SC=CTTGCCGTCTGAGGGATGGAT;SOR=1.385;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=15;WE=472229;WS=472211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr5	474940	.	CCT	C	274	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=4;NR=4;PP=274;QD=40.5350359045;SC=GAGGCGGAGACCTGGAGGGAG;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=8;WE=474949;WS=474930;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr5	475104	rs2247114	A	G	1655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=31;PP=924;ReadPosRankSum=1.225;SC=ATCAGGCGGCAGAAGGTGCCG;SOR=0.675;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=73;TCR=58;TR=70;WE=475112;WS=475094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,79:0.56:142
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chr5	475626	rs41282625	C	G	471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.965;NF=7;NR=2;PP=365;ReadPosRankSum=0.621;SC=CCTCCTGGGGCGGCAGGAGCC;SOR=1.061;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=9;WE=475634;WS=475611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr5	476353	rs2230437	C	T	1890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=38;PP=1161;ReadPosRankSum=-0.239;SC=ACAGCTTGGCCGCCTTCTTGT;SOR=0.713;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=198;TCF=109;TCR=89;TR=86;WE=476361;WS=476343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,92:0.42:219
chr5	476530	rs2244240	C	G	976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.673;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=32;PP=697;ReadPosRankSum=2.314;SC=GCTGTGCCCACCGCCGGACAT;SOR=1.301;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=76;TCF=24;TCR=52;TR=43;WE=476538;WS=476520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,44:0.53:83
chr5	476910	rs890977	T	C	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.704;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=94;ReadPosRankSum=-0.409;SC=CGCCTTCCCATGGTGGGCACC;SOR=2.998;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=8;WE=476918;WS=476900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr5	477634	rs4334924	G	A	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.458;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=123;ReadPosRankSum=0.876;SC=GCCCTGGGGGGAAGCGCCCAG;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=7;WE=477642;WS=477624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr5	478571	rs33925304	TG	T	267.75	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=145;ReadPosRankSum=1.093;SC=TGCCGTGGGGTGGGGGGGCGC;SOR=0.446;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=7;WE=478579;WS=478563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,11:0.85:13
chr5	478655	rs3734141	G	A	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.157;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=7;PP=284;ReadPosRankSum=0.852;SC=CCAGGTGTGGGGACCCCCGCT;SOR=0.489;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=39;TCF=27;TCR=12;TR=19;WE=478663;WS=478645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,23:0.49:47
chr5	479050	rs3836908	CCA	C	2746.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.397;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.927;NF=7;NR=33;PP=1623;ReadPosRankSum=2.825;SC=TGGCATGGCCCCAGTCACGGG;SOR=0.854;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=80;TCF=17;TCR=63;TR=40;WE=479059;WS=479040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,71:0.55:130
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chr5	479905	rs890986	A	C	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=362;ReadPosRankSum=-1.342;SC=AGCCAGTGCCAGAGCCTGCTG;SOR=0.598;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=46;TCF=38;TCR=8;TR=22;WE=479913;WS=479895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,22:0.48:46
chr5	481610	rs6872510	T	C	1962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.559;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=33;PP=1291;ReadPosRankSum=0.361;SC=TGGCTTCTGGTTCTTCCGAGT;SOR=0.631;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=162;TCF=102;TCR=60;TR=85;WE=481618;WS=481600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,92:0.51:180
chr5	482186	rs9885312	C	G	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.348;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=7;PP=158;ReadPosRankSum=-2.158;SC=CACTTACGCGCCCGTGCAGCT;SOR=0.360;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=33;TCF=21;TCR=12;TR=16;WE=482194;WS=482176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr5	482653	rs3777230	T	C	901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=13;PP=523;ReadPosRankSum=-0.037;SC=CTGGCTGGGCTGGGCCTCACC;SOR=0.765;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=82;TCF=57;TCR=25;TR=40;WE=482661;WS=482643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,42:0.49:85
chr5	483564	rs56098739	A	G	1679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.541;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=36;PP=922;ReadPosRankSum=0.902;SC=TGGCCTTCACATACTTCTGAC;SOR=0.618;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=163;TCF=80;TCR=83;TR=72;WE=483572;WS=483554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,85:0.45:187
chr5	485259	rs55989315	G	T	3195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=59;PP=1888;ReadPosRankSum=0.050;SC=CTGACCCACAGCTACACACCT;SOR=0.708;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=267;TCF=156;TCR=111;TR=142;WE=485267;WS=485249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,156:0.51:304
chr5	491826	rs11746373	G	C	1662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=34;NR=13;PP=918;SC=ATGAGGCAGCGCCGCCCCTCC;SOR=1.493;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=48;TCF=35;TCR=13;TR=47;WE=491834;WS=491816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr5	612598	.	C	CG	93.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.000;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.39;ReadPosRankSum=-0.712;SOR=0.636;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr5	619022	rs1617985	C	T	211.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=142;SC=GTTTCTACTCCATATCCAACA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=619030;WS=619012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	619042	rs73734331	T	G	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.126;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=74;ReadPosRankSum=0.695;SC=ACCAAGAACTTGACCGTTATT;SOR=1.460;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=7;WE=619050;WS=619032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr5	619304	.	G	A	2396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=0.000;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.641;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=57;PP=1369;ReadPosRankSum=0.228;SC=CAGCAGAAACGGAGTCTGTTT;SOR=0.584;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=206;TCF=87;TCR=119;TR=103;WE=619312;WS=619294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,114:0.50:226
chr5	619320	rs7724252	C	T	1952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.852;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=48;PP=1136;ReadPosRankSum=-1.428;SC=TGTTTTGTAACCCTCTGCTTA;SOR=0.546;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=169;TCF=68;TCR=101;TR=85;WE=619341;WS=619310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,94:0.50:187
chr5	619333	rs1709531	T	C	4297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=94;PP=2962;SC=TCTGCTTACATCTGTATACGG;SOR=1.550;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=144;TCF=50;TCR=94;TR=144;WE=619341;WS=619310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr5	640732	rs113868864	T	G	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=-1.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.263;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=78;ReadPosRankSum=-1.117;SC=GAGCCCGCCCTGGCGCTGTGT;SOR=0.025;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=9;WE=640740;WS=640722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr5	653145	rs62000998	C	G	998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.666;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=12;PP=620;ReadPosRankSum=0.982;SC=AGGAGCTGAGCCAGGTGCGGG;SOR=1.022;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=88;TCF=57;TCR=31;TR=41;WE=653153;WS=653135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,47:0.47:100
chr5	653370	rs78311453	C	G	1371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.833;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=38;PP=867;ReadPosRankSum=-0.055;SC=CAAGAGTTCTCTCTTCTGTTG;SOR=0.452;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=93;TCF=33;TCR=60;TR=60;WE=653378;WS=653360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,63:0.62:102
chr5	665280	rs1697963	T	C	2087.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.245;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=44;PP=1027;ReadPosRankSum=0.318;SC=ACACATAGCCTGACTCGTCCA;SOR=0.591;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=205;TCF=115;TCR=90;TR=96;WE=665288;WS=665270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,107:0.47:227
chr5	666323	rs1697964	A	G	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=410;ReadPosRankSum=0.437;SC=AGAGCTGGACAGCCATGGCCC;SOR=0.693;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=39;TCF=6;TCR=33;TR=22;WE=666331;WS=666313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,28:0.56:50
chr5	733767	rs55778145	T	C	1067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.254;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.868;NF=32;NR=10;PP=772;ReadPosRankSum=-1.805;SC=AGAGTGCTTCTATTCTGAATA;SOR=1.216;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=91;TCF=66;TCR=25;TR=42;WE=733775;WS=733757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,48:0.48:101
chr5	733998	rs4247710	G	A	963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=4.683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.36;MQRankSum=-3.403;QD=16.91;ReadPosRankSum=-1.504;SOR=1.510;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,27:0.47:57
chr5	734004	rs28498541	G	A	966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=5.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.10;MQRankSum=-3.381;QD=18.59;ReadPosRankSum=-1.858;SOR=1.758;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,25:0.48:52
chr5	741736	rs61128505	G	T	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=1.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.38;MQRankSum=-3.689;QD=8.28;ReadPosRankSum=-0.768;SOR=0.990;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,17:0.44:39
chr5	745371	rs62332112	C	G	1907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=352;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.731;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-4.842;NF=69;NR=48;PP=1416;ReadPosRankSum=0.553;SC=CTCTTCTTTGCGGGTATTAAT;SOR=1.019;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=325;TCF=179;TCR=146;TR=117;WE=745379;WS=745361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:237,115:0.33:352
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chr5	766910	rs1809933	C	T	2547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.426;HP=2;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;ReadPosRankSum=-0.484;SC=AGTCACCACCCGGAAGTAGTG;SOR=0.742;Source=Platypus;WE=766918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,125:0.42:297
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chr5	796064	.	T	C	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=27;MQ=59.02;NF=118;NR=113;PP=2962;QD=20;SC=CTCCCATTTCTCAGTACTGTA;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=443;TCF=228;TCR=215;TR=231;WE=796072;WS=796031;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:212,231:0.52:443
chr5	796064	rs144616948	T	TCAGTACTGTATGCCCATTTCC	19901.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=380;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.72;QD=52.37;SOR=0.758;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,380:1.00:380
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chr5	796223	rs373490497	GCCC	G	4085.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=472;ExcessHet=3.0103;FS=1.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQRankSum=-11.540;QD=8.67;ReadPosRankSum=3.593;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:348,123:0.26:471
chr5	796229	rs200391461	A	G	4286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=467;ExcessHet=3.0103;FS=1.263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQRankSum=-11.353;QD=9.18;ReadPosRankSum=3.181;SOR=0.587;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:342,125:0.27:467
chr5	796272	rs199930059	T	A	3819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=436;ExcessHet=3.0103;FS=4.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQRankSum=-12.499;QD=8.78;ReadPosRankSum=-1.761;SOR=1.144;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:322,113:0.26:435
chr5	796277	rs386219	T	C	3693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=428;ExcessHet=3.0103;FS=4.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQRankSum=-12.426;QD=8.65;ReadPosRankSum=-2.183;SOR=1.075;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:317,110:0.26:427
chr5	796297	rs365674	C	T	2715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=360;ExcessHet=3.0103;FS=5.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.49;MQRankSum=-10.827;QD=7.56;ReadPosRankSum=-1.199;SOR=1.003;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:275,84:0.23:359
chr5	796328	rs605011	T	C	1627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FS=4.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.85;MQRankSum=-9.545;QD=6.19;ReadPosRankSum=-0.606;SOR=1.028;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:209,54:0.21:263
chr5	796333	rs610631	G	A	1454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FS=4.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.38;MQRankSum=-8.678;QD=6.30;ReadPosRankSum=-1.272;SOR=1.071;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:183,48:0.21:231
chr5	796343	rs143398223	C	CTCT	1115.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FS=1.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.04;MQRankSum=-7.363;QD=5.75;ReadPosRankSum=-1.620;SOR=0.830;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:156,38:0.20:194
chr5	796352	rs201362497	A	G	674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=6.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.32;MQRankSum=-5.251;QD=4.75;ReadPosRankSum=-1.320;SOR=1.547;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:120,22:0.15:142
chr5	801362	rs3867415	A	G	787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.814;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.810;NF=2;NR=25;PP=592;ReadPosRankSum=-0.265;SC=CAAAATGTGTAAACAAGAGTA;SOR=1.230;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=52;TCF=5;TCR=47;TR=27;WE=801370;WS=801352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,29:0.53:55
chr5	824228	rs71593352	G	A	1634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.830;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=31;PP=984;ReadPosRankSum=-1.044;SC=CAGGGAAGGAGAACACACCTG;SOR=0.859;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=174;TCF=104;TCR=70;TR=78;WE=824236;WS=824218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,83:0.45:185
chr5	834075	rs1260864	G	A	259.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.00;QD=28.86;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	840342	rs3822811	A	G	4629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=357;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.399;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=120;NR=80;PP=2830;ReadPosRankSum=0.299;SC=ACCTGGCACCACTCCTGCAGG;SOR=0.661;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=322;TCF=192;TCR=130;TR=200;WE=840350;WS=840332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,222:0.62:357
chr5	840506	rs7701283	C	T	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FS=10.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.31;MQRankSum=-9.684;QD=3.01;ReadPosRankSum=-1.458;SOR=1.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:200,53:0.21:253
chr5	870740	rs13153992	C	T	699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=24;PP=474;ReadPosRankSum=0.977;SC=AAACGAAAAACGAAATGTTAC;SOR=0.699;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=99;TCF=36;TCR=63;TR=37;WE=870748;WS=870730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,38:0.35:110
chr5	893356	rs13181961	C	G	1343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.113;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=38;PP=861;ReadPosRankSum=0.029;SC=CACAGGCCGCCGGGCCCCGAC;SOR=0.927;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=132;TCF=53;TCR=79;TR=59;WE=893364;WS=893346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,68:0.45:152
chr5	904374	rs12518024	T	G	1572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQRankSum=-0.930;QD=10.28;ReadPosRankSum=1.228;SOR=0.687;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,72:0.47:153
chr5	981019	rs10065177	T	C	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.317;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=344;ReadPosRankSum=-0.781;SC=CAGAAGCTGATTGCTTTTAAA;SOR=0.174;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=21;WE=981027;WS=981009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,21:0.62:34
chr5	1009425	rs10060716	A	G	755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=9;PP=487;SC=TGGAGCCAGCAGTGGGGGGAC;SOR=1.460;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=18;TCR=9;TR=27;WE=1009433;WS=1009415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr5	1035399	rs147352169	T	TAATG	5022.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.309;NF=21;NR=31;PP=2549;ReadPosRankSum=-0.033;SC=ACCAGTGAGTTAATGAATGAA;SOR=1.308;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=71;TCF=33;TCR=38;TR=52;WE=1035407;WS=1035389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,109:0.98:111
chr5	1035482	rs12657514	A	G	6032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=103;PP=2965;SC=GGGAGTGAGTAATGGCAGGAC;SOR=0.938;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=188;TCF=85;TCR=103;TR=188;WE=1035490;WS=1035472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr5	1036521	rs60180971	G	A	1198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.639;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=36;PP=782;ReadPosRankSum=0.587;SC=AGGCCACCCTGGGCGTGAGGC;SOR=0.770;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=135;TCF=54;TCR=81;TR=59;WE=1036529;WS=1036511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,60:0.42:142
chr5	1036900	rs34309815	C	T	687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=14;PP=289;ReadPosRankSum=-0.416;SC=TGTGGATGGCCGGCAGTGTGG;SOR=0.591;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=25;TCR=26;TR=28;WE=1036908;WS=1036890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,35:0.54:65
chr5	1036962	rs34413936	C	A	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.103;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=173;ReadPosRankSum=0.162;SC=CAGACAGTGTCGACAGCAGGC;SOR=0.317;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=11;WE=1036970;WS=1036952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr5	1038526	rs3889678	A	G	2243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=50;NR=27;PP=1203;SC=AGCACACCACAGCCCGCGACC;SOR=1.055;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=50;TCR=27;TR=77;WE=1038534;WS=1038516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr5	1052360	rs3810854	C	T	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=7;PP=179;ReadPosRankSum=-1.293;SC=GCAGCTTGGGCGGCATCACTG;SOR=0.622;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=48;TCF=33;TCR=15;TR=20;WE=1052368;WS=1052350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,23:0.42:55
chr5	1052735	rs4046186	GGAGCA	G	167.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.564;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.389;NF=2;NR=5;PP=268;ReadPosRankSum=-2.052;SC=CAGGCGGGGAGGAGCAGGGCA;SOR=0.804;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=7;WE=1052747;WS=1052725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr5	1053341	rs2241602	A	G	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.434;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=315;ReadPosRankSum=-0.938;SC=TAGCTCCCAGAGCCTGGGGCT;SOR=1.631;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=48;TCF=41;TCR=7;TR=17;WE=1053349;WS=1053331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,20:0.39:51
chr5	1053396	rs2241603	C	G	1534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.970;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=22;PP=755;ReadPosRankSum=0.445;SC=ACCCACAAACCCAGGTCTTAG;SOR=0.880;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=144;TCF=91;TCR=53;TR=66;WE=1053404;WS=1053386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,79:0.48:164
chr5	1057615	rs2241606	A	G	2462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.964;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=51;PP=1415;ReadPosRankSum=1.060;SC=CTTTGAAACCAGATAGGCTGG;SOR=0.790;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=223;TCF=123;TCR=100;TR=114;WE=1057623;WS=1057605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,127:0.50:252
chr5	1057782	rs12108965	T	C	695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=22;PP=503;SC=GCCCGGGACTTGGTGAGACCA;SOR=3.611;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=25;WE=1057790;WS=1057772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr5	1060379	rs35661060	G	A	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.203;HP=1;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=177;ReadPosRankSum=-0.272;SC=GTGGGCTGCAGGAGGGTCCCA;SOR=2.461;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=10;WE=1060387;WS=1060369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr5	1060400	rs4975568	G	A	1096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=3;PP=874;SC=GAAAAGACTCGGCGAAGTCGG;SOR=4.235;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=34;WE=1060408;WS=1060390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr5	1060634	rs4246750	C	T	5318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=77;NR=105;PP=2965;SC=AACACCAGCCCGGTACCCAGA;SOR=1.132;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=182;TCF=77;TCR=105;TR=182;WE=1060642;WS=1060624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr5	1060654	rs4246749	G	A	3729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=82;PP=2300;SC=AGACCGAGCCGCCCTGAGCGG;SOR=1.410;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=48;TCR=82;TR=130;WE=1060662;WS=1060644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr5	1060685	rs2241608	G	A	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.491;HP=3;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=259;ReadPosRankSum=-0.030;SC=CACGCGTCCCGGGCCCCACAG;SOR=1.814;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=64;TCF=18;TCR=46;TR=18;WE=1060693;WS=1060675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,19:0.30:63
chr5	1062900	rs13170649	C	G	1254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-0.179;NF=35;NR=19;PP=787;ReadPosRankSum=-0.742;SC=TCCTGGGGGACAGCGTGACAG;SOR=0.739;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=96;TCF=61;TCR=35;TR=54;WE=1062908;WS=1062890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,59:0.57:104
chr5	1063187	rs6863419	T	C	388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=1;NR=13;PP=313;SC=GCCCACCAGATCCCCAGGATC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=1063195;WS=1063177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	1063998	rs7722287	G	A	2130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.405;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=36;PP=1185;ReadPosRankSum=1.011;SC=TGCGCAAGTGGTACAAGAACA;SOR=0.524;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=179;TCF=112;TCR=67;TR=91;WE=1064006;WS=1063988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,104:0.50:210
chr5	1065290	rs4362981	A	G	4180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.12;QD=44.95;SOR=2.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr5	1065290	.	AGGACAGCGAGGGGACACT	GGGACAGCGAGGGGACACT,GGGACAGTGAGAGGACAGC	2914	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MMLQ=18;MQ=60.22;NF=50,20;NR=13,6;PP=1987,2914;QD=32.0916065484;SC=GGACAGTGAGAGGACAGCGAG;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=75;TCF=56;TCR=19;TR=63,26;WE=1065327;WS=1065280;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.84:75
chr5	1065297	rs62331176	C	T	2121.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-2.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=1.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.11;MQRankSum=-1.236;QD=22.81;ReadPosRankSum=-3.125;SOR=0.508;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,57:0.61:93
chr5	1065298	rs55643147	GAGGGGACACTGAGGAGACACAC	G	1237.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.910;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=1.323;NF=17;NR=13;PP=2971;ReadPosRankSum=3.264;SC=AGAGGACAGCGAGGGGACACT;SOR=0.992;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=41;TCF=24;TCR=17;TR=30;WE=1065327;WS=1065280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,36:0.37:97
chr5	1065301	rs79273934	G	A	2131.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=3.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.31;MQRankSum=-1.247;QD=22.68;ReadPosRankSum=-3.035;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,58:0.62:94
chr5	1065306	.	ACT	A	2094.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=0.000;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=3.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.31;MQRankSum=-1.225;QD=22.77;ReadPosRankSum=-2.609;SOR=0.430;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,56:0.61:92
chr5	1065310	.	A	C	2019.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=0.000;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=3.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.31;MQRankSum=-1.225;QD=21.95;ReadPosRankSum=-2.509;SOR=0.430;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,56:0.61:92
chr5	1065311	.	GGAGACACAC	G	2008.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.679;ClippingRankSum=0.000;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=3.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.31;MQRankSum=-1.225;QD=21.83;ReadPosRankSum=-2.445;SOR=0.430;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,56:0.61:92
chr5	1065399	rs737154	C	T	2527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.433;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQ=60.11;MQRankSum=-0.399;NF=60;NR=57;PP=1426;ReadPosRankSum=1.560;SC=CATGCCTACCCACAAAGTTCT;SOR=0.684;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=253;TCF=131;TCR=122;TR=117;WE=1065407;WS=1065384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,127:0.45:283
chr5	1065683	rs56078134	A	C	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=3.847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.12;ReadPosRankSum=-1.044;SOR=0.201;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,21:0.52:40
chr5	1065689	rs13186367	C	T	1305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=23;PP=282;SC=CACCACCTCCCCTGTGGACCC;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=29;WE=1065697;WS=1065673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	1073689	rs10780095	C	T	901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=5;PP=616;SC=TGCCAGGGCACGTTTCCTGTG;SOR=2.694;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=30;WE=1073697;WS=1073679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	1074560	rs12523242	A	C	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=11;PP=445;ReadPosRankSum=-0.093;SC=TTCACACCCCAGACCTTGCCT;SOR=0.709;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=48;TCR=24;TR=32;WE=1074568;WS=1074550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,33:0.42:79
chr5	1074696	rs12515358	G	A	2090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.435;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=43;PP=1180;ReadPosRankSum=-0.390;SC=AGTTCTTGGTGTGGGGGGGAC;SOR=0.603;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=181;TCF=95;TCR=86;TR=96;WE=1074704;WS=1074686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,104:0.52:199
chr5	1074921	rs7714914	G	A	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=160;ReadPosRankSum=-0.131;SC=TGAGGAGGGAGGCCTCCATGC;SOR=0.430;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=9;WE=1074929;WS=1074911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr5	1076245	rs11951420	G	A	1692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.179;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=27;PP=1150;ReadPosRankSum=-0.475;SC=CGTGCTGAGTGGCCTCACCAG;SOR=0.446;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=130;TCF=84;TCR=46;TR=70;WE=1076253;WS=1076235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,75:0.53:141
chr5	1076459	rs11952124	G	T	2074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=45;PP=1303;SC=CCTGCGCCTTGTCTCCCCATG;SOR=1.578;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=24;TCR=45;TR=69;WE=1076467;WS=1076449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr5	1076521	.	A	ATCCTGTGACCACCT	426.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=2087;ReadPosRankSum=0.116;SC=AGGCCCCCTCAGGTTCCAGCC;SOR=0.904;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=5;WE=1076537;WS=1076509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr5	1076524	.	T	TCCA	343.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.246;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.37;ReadPosRankSum=0.607;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr5	1076526	.	C	CCTGTGACCA,CATCCTGTGACCA	304.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.913;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=2013;ReadPosRankSum=1.677;SC=CCCTCAGGTTCCAGCCATCCT;SOR=0.627;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=5;WE=1076537;WS=1076509;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.40:20
chr5	1076706	rs74673540	C	T	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=31;ReadPosRankSum=-0.674;SC=CACAGCTGGCCATGCCTGTCT;SOR=0.148;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=4;WE=1076714;WS=1076705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr5	1078898	rs4975564	A	G	2460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=53;PP=1514;SC=AAGGAAAGGCAGGTCCGTGGG;SOR=1.662;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=26;TCR=53;TR=79;WE=1078906;WS=1078888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr5	1081668	rs13176210	G	A	2136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.530;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=35;PP=1392;ReadPosRankSum=0.759;SC=AAAGAGAAGGGGAAGCCTGGA;SOR=0.762;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=177;TCF=112;TCR=65;TR=95;WE=1081676;WS=1081658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,101:0.51:198
chr5	1081702	rs6865765	A	G	3124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=59;PP=1884;ReadPosRankSum=0.435;SC=CGGTCACGGAAGGGAAGTAGA;SOR=0.674;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=271;TCF=158;TCR=113;TR=143;WE=1081710;WS=1081692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,154:0.52:296
chr5	1081767	rs4526148	C	T	3468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.398;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=73;PP=1903;ReadPosRankSum=0.090;SC=TAGGGCAGTGCGCTGGCACGG;SOR=0.557;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=291;TCF=144;TCR=147;TR=151;WE=1081775;WS=1081757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,169:0.53:321
chr5	1085604	rs11133624	C	A	1627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.630;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=40;PP=988;ReadPosRankSum=1.914;SC=GGAACAAGGCCGGTCGGGAGG;SOR=1.073;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=151;TCF=70;TCR=81;TR=68;WE=1085612;WS=1085594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,76:0.46:164
chr5	1093609	rs56276350	G	GGGGCGGGGACT	845.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=1;PP=1765;SC=CGGGACACACGGGGCGGGGAC;SOR=2.147;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=8;WE=1093617;WS=1093599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	1093860	rs6883411	CC	GT	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=477;ReadPosRankSum=1.604;SC=GGAGCTCAGGCCCTCCCCGGG;SOR=0.560;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=12;WE=1093869;WS=1093850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr5	1094389	rs4975552	T	A	2941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=64;PP=1660;ReadPosRankSum=0.215;SC=CAATTCAGAGTCAGCTTAGAA;SOR=0.700;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=230;TCF=111;TCR=119;TR=122;WE=1094397;WS=1094379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,137:0.54:254
chr5	1116066	rs6554618	C	T	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.91;ReadPosRankSum=-1.316;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,32:0.47:68
chr5	1208964	rs60992377	T	C	683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=5.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.68;ReadPosRankSum=-2.693;SOR=0.273;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,35:0.55:64
chr5	1210789	rs4358564	G	A	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.874;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=146;ReadPosRankSum=1.135;SC=CAGGTCAGGCGTGGCAGAAAC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=8;WE=1210797;WS=1210779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr5	1212082	rs145216884	ATG	A	208.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=2;PP=192;ReadPosRankSum=1.150;SC=GCCTGTGTGCATGTGTGTGTG;SOR=0.330;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=10;TCF=6;TCR=4;TR=5;WE=1212091;WS=1212072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr5	1212357	rs7727745	C	A	741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=10;PP=494;ReadPosRankSum=0.265;SC=AGCTCAGGGCCTTCCATTCTC;SOR=0.711;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=72;TCF=49;TCR=23;TR=30;WE=1212365;WS=1212347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,33:0.44:75
chr5	1213510	rs77928413	C	T	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=143;ReadPosRankSum=0.181;SC=CCCGCCCCCACGTGCCGCCCC;SOR=1.022;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=8;WE=1213518;WS=1213500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr5	1213668	rs7732589	G	A	2134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.548;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=46;PP=1040;ReadPosRankSum=1.058;SC=CAATGGCATCGTCTTCCTCTT;SOR=0.924;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=166;TCF=83;TCR=83;TR=88;WE=1213676;WS=1213658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,102:0.55:187
chr5	1214264	rs6554663	A	G	1469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.307;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=40;PP=954;ReadPosRankSum=0.223;SC=GGTGGAAAGCACTCTGTGGCT;SOR=0.840;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=140;TCF=59;TCR=81;TR=67;WE=1214272;WS=1214254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,72:0.48:150
chr5	1216775	rs4975629	A	G	10014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=378;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=174;NR=177;PP=2965;SC=TCCGCGCCACACAGCGCTACG;SOR=0.742;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=351;TCF=174;TCR=177;TR=351;WE=1216783;WS=1216765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,377:1.00:377
chr5	1216900	rs35329108	G	A	3027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=342;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.829;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=67;PP=1769;ReadPosRankSum=-0.099;SC=AATCTGACCCGCAGGAACATC;SOR=0.658;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=312;TCF=158;TCR=154;TR=140;WE=1216908;WS=1216890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:189,152:0.45:341
chr5	1219874	rs6869718	G	A	1238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=30;PP=856;SC=TTCAGGGTACGGAGGGAGAGT;SOR=2.476;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=39;TCF=8;TCR=31;TR=38;WE=1219882;WS=1219864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr5	1221199	rs12513763	T	C	3864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=45;PP=2638;SC=TAGCAGAACGTACAGAAAGCT;SOR=1.428;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=131;TCF=85;TCR=46;TR=130;WE=1221207;WS=1221189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr5	1225564	rs7728646	T	C	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.160;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=123;ReadPosRankSum=0.638;SC=GCACCACCCTTGCCCTGAAGC;SOR=0.074;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=10;WE=1225572;WS=1225554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr5	1225613	rs7704058	G	A	689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.104;HP=2;HapScore=4;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=9;PP=1132;ReadPosRankSum=0.304;SC=CCCCAGAACCGGACCCGGCCG;SOR=0.491;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=55;TCF=41;TCR=14;TR=31;WE=1225634;WS=1225603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,32:0.54:59
chr5	1225626	rs7728667	T	A	889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.889;HP=2;HapScore=4;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=15;PP=1132;ReadPosRankSum=-0.128;SC=CCCGGCCGCCTGCGACCTCGG;SOR=0.550;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=75;TCF=50;TCR=25;TR=42;WE=1225634;WS=1225603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,43:0.54:79
chr5	1225687	rs7705355	C	T	5947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.19;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr5	1225687	.	CT	TC,TT	1120	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=40,88;NR=28,61;PP=849,1120;QD=13.271586395;SC=CTGAGCTGCACTGGGTTTGCC;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=90;TCR=62;TR=68,149;WE=1225696;WS=1225677;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.45:152
chr5	1225688	rs7728814	T	C	1752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=2.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.31;ReadPosRankSum=-0.139;SOR=0.934;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,81:0.48:170
chr5	1225703	rs7724858	A	G	5060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=70;PP=2965;SC=TTGCCGTGGGACTGGGGAACA;SOR=0.944;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=164;TCF=94;TCR=70;TR=164;WE=1225711;WS=1225693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr5	1232491	rs4975623	G	C	1525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.86;SOR=0.950;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr5	1240848	rs6554684	A	C	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=25;PP=452;ReadPosRankSum=-0.702;SC=GAGAATCCCAAGGCATGAGGA;SOR=0.674;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=42;TCF=3;TCR=39;TR=27;WE=1240856;WS=1240838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,26:0.60:43
chr5	1243009	rs7721679	A	G	2209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=53;PP=1569;SC=GTAGCCAGGCAGGGCCGTCCA;SOR=2.995;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=13;TCR=53;TR=66;WE=1243017;WS=1242999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr5	1244425	rs4073918	C	T	2364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.518;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=37;PP=1376;ReadPosRankSum=-1.318;SC=GCCGCTTCCCCGAACCTGCTC;SOR=0.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=179;TCF=110;TCR=69;TR=97;WE=1244433;WS=1244415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,109:0.53:205
chr5	1271524	rs11133719	T	C	265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=7;PP=142;SC=TGACACAGAATGTCTCCTCTG;SOR=2.494;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=1271532;WS=1271514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	1280128	rs7734992	T	C	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.075;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=284;ReadPosRankSum=2.148;SC=GCCACCTCACTGTGCGCACAA;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=13;WE=1280136;WS=1280118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr5	1294166	rs61748181	C	T	2217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.023;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=51;PP=1380;ReadPosRankSum=0.664;SC=GCTTCTTCGGCGGGTCTGGCA;SOR=0.595;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=217;TCF=116;TCR=101;TR=107;WE=1294174;WS=1294156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,112:0.50:226
chr5	1294954	.	C	A	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.168;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=3.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.88;ReadPosRankSum=-0.347;SOR=0.663;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,7:0.27:26
chr5	1320722	rs402710	C	T	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=262;ReadPosRankSum=-0.062;SC=CATACGCAGCCGCACTCACCA;SOR=0.786;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=39;TCF=27;TCR=12;TR=21;WE=1320730;WS=1320712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,25:0.54:46
chr5	1320957	rs78766954	G	A	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.630;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=131;ReadPosRankSum=-0.647;SC=GGAACTAACTGGAACTCCTCA;SOR=0.343;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=11;WE=1320965;WS=1320947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr5	1324818	rs62329693	C	A	1102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.810;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=11;PP=590;ReadPosRankSum=-0.652;SC=GTAAAAGACCCGTCTTTGAGG;SOR=0.602;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=85;TCF=62;TCR=23;TR=42;WE=1324826;WS=1324808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,50:0.52:97
chr5	1325767	rs466502	A	G	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.873;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=275;ReadPosRankSum=-0.911;SC=AGAGGCCCGCAGTGACTCATC;SOR=0.231;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=17;WE=1325775;WS=1325757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr5	1325803	rs465498	A	G	776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.900;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=10;PP=507;ReadPosRankSum=-0.602;SC=TACTCTTTGCACAGGGGGCAA;SOR=0.532;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=80;TCF=58;TCR=22;TR=35;WE=1325811;WS=1325793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,39:0.45:87
chr5	1330253	rs452932	T	C	736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=407;ReadPosRankSum=0.031;SC=CCTGCCATCCTACAGCTTCCA;SOR=0.677;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=34;TCR=15;TR=26;WE=1330261;WS=1330243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,32:0.58:55
chr5	1334507	rs5865369	GA	G	1530.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.033;NF=1;NR=44;PP=541;ReadPosRankSum=0.878;SC=CCCTGTCAAGGAAAAAAAAAC;SOR=0.688;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=106;TCF=4;TCR=102;TR=45;WE=1334515;WS=1334497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,75:0.49:153
chr5	1335385	rs3030832	CTG	C	1758.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.514;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=26;PP=1114;ReadPosRankSum=-0.535;SC=CTTCCCATCCCTGTGTGGCCC;SOR=0.357;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=57;TCF=5;TCR=52;TR=28;WE=1335394;WS=1335375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,47:0.62:76
chr5	1344458	rs31490	G	A	3817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=398;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=77;PP=2019;ReadPosRankSum=-0.029;SC=TTTGTCCTACGCCCATACCTT;SOR=0.688;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=346;TCF=184;TCR=162;TR=164;WE=1344466;WS=1344448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:204,193:0.49:397
chr5	1363771	rs75699861	C	T	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=125;ReadPosRankSum=2.620;SC=GTGGGTGGCACTGGGCTCTGT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=9;WE=1363779;WS=1363761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,9:0.30:30
chr5	1363825	rs79744444	T	C	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.136;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=10;PP=472;ReadPosRankSum=-1.330;SC=CGCACTCACATGGCGGTGGGC;SOR=0.288;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=86;TCF=67;TCR=19;TR=35;WE=1363833;WS=1363815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,41:0.44:94
chr5	1400931	rs28363149	A	ATCTACACCAGCCCTG	4866.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FS=6.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.50;ReadPosRankSum=1.553;SOR=1.059;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:153,110:0.42:263
chr5	1409127	rs429699	T	C	2955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=61;NR=44;PP=1880;SC=TTGGCTGCCTTCCCCCGGACT;SOR=1.109;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=61;TCR=44;TR=105;WE=1409135;WS=1409117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr5	1409719	rs2245660	C	T	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.462;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=282;ReadPosRankSum=-0.710;SC=TGGGTGGGTTCGCAGCTCCCT;SOR=0.269;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=18;WE=1409727;WS=1409709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr5	1411256	rs2550936	A	C	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.015;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=445;ReadPosRankSum=-0.799;SC=TGGGGGCCGTACGTGAGCCCA;SOR=0.223;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=27;WE=1411264;WS=1411246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,28:0.61:46
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chr5	1442979	rs2270914	C	T	1894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=8.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.76;ReadPosRankSum=0.718;SOR=1.493;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,51:0.50:101
chr5	1443199	rs6350	G	A	3074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.279;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=65;PP=1842;ReadPosRankSum=-0.247;SC=GCTGCACTCCGTTCTGCTCCT;SOR=0.551;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=210;TCF=102;TCR=108;TR=129;WE=1443207;WS=1443189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,142:0.61:233
chr5	1466813	rs2277007	T	C	2112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=3.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.219;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=32;PP=1469;ReadPosRankSum=1.062;SC=CCACACTCTGTCCAGCCCCCG;SOR=0.922;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=186;TCF=115;TCR=71;TR=90;WE=1466821;WS=1466803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,98:0.48:206
chr5	1466919	rs2277006	G	A	4500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=404;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.525;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=106;PP=2717;ReadPosRankSum=1.919;SC=GGTCGGTCACGGTGAGCTCTG;SOR=0.786;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=367;TCF=178;TCR=189;TR=200;WE=1466927;WS=1466909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,219:0.55:401
chr5	1471109	rs27054	T	C	1273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=41;PP=989;SC=GGGTTTCCCATGGGTGCTGGT;SOR=4.317;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=4;TCR=41;TR=45;WE=1471117;WS=1471099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr5	1479678	rs27059	G	C	1952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=12;PP=1331;SC=CCTGGTGTAAGCTCGTGTCTG;SOR=2.551;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=50;TCR=12;TR=62;WE=1479686;WS=1479668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr5	1481148	rs2447846	A	C	669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.417;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=20;PP=475;ReadPosRankSum=-1.015;SC=GGCCTGCACCAAGCACCTGCG;SOR=1.432;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=63;TCF=18;TCR=45;TR=25;WE=1481156;WS=1481138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,30:0.43:70
chr5	1490019	rs72717531	C	G	1158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.479;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=29;PP=703;ReadPosRankSum=0.430;SC=GCACGGCTCCCGCCAGGCAGG;SOR=0.491;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=100;TCF=40;TCR=60;TR=50;WE=1490027;WS=1490009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,55:0.49:113
chr5	1494764	rs3733797	C	T	1357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.679;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=16;PP=918;ReadPosRankSum=-0.029;SC=GGGGATCTCTCACTCCCAGCA;SOR=0.963;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=100;TCF=71;TCR=29;TR=58;WE=1494772;WS=1494754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,60:0.56:108
chr5	1494909	rs3733796	C	T	2858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.427;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=64;PP=1515;ReadPosRankSum=1.420;SC=ACGAGTGAGGCGCGAGCGTGA;SOR=0.740;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=256;TCF=124;TCR=132;TR=125;WE=1494917;WS=1494899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,143:0.49:291
chr5	1494935	rs28715640	T	C	2145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.347;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=56;PP=1046;ReadPosRankSum=-0.077;SC=GCCGCCTCGGTGGGCAGCGCC;SOR=0.551;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=196;TCF=83;TCR=113;TR=101;WE=1494943;WS=1494925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,111:0.52:215
chr5	1589387	rs6891099	C	G	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.120;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.28;MQRankSum=-1.495;QD=7.31;ReadPosRankSum=-0.241;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr5	1593246	rs6869310	C	T	2375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.286;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.306;NF=70;NR=45;PP=1589;ReadPosRankSum=-1.463;SC=CATGACTCTTCGATGCTCAGG;SOR=0.959;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=243;TCF=140;TCR=103;TR=115;WE=1593254;WS=1593236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,116:0.46:252
chr5	1593266	rs6898538	T	C	2747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.883;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-5.721;NF=74;NR=57;PP=1482;ReadPosRankSum=0.129;SC=GGCACATGCCTGACCAAAGAC;SOR=0.760;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=278;TCF=151;TCR=127;TR=131;WE=1593274;WS=1593256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,140:0.47:296
chr5	1593326	rs6872202	G	A	2688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.149;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.105;NF=53;NR=65;PP=1562;ReadPosRankSum=-0.162;SC=ACCATGTACCGAGGCACAGGC;SOR=0.570;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=228;TCF=97;TCR=131;TR=118;WE=1593334;WS=1593316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,131:0.52:250
chr5	1594664	rs4246747	C	G	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.57;ReadPosRankSum=2.340;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr5	1602785	rs200012695	GGTCC	G	187.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=37.57;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr5	1632758	rs71597631	C	G	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.740;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.390;NF=14;NR=1;PP=291;ReadPosRankSum=0.918;SC=GCAGTTGTTACCTGGCTCGGT;SOR=2.303;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=35;TCF=31;TCR=4;TR=15;WE=1632766;WS=1632748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,14:0.39:36
chr5	1708983	rs12523324	G	A	1062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=28;PP=691;ReadPosRankSum=-1.511;SC=CCTCGACCCAGAGCCAGACAA;SOR=0.751;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=97;TCF=40;TCR=57;TR=46;WE=1708991;WS=1708973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,51:0.46:110
chr5	1709088	rs71602758	TTCCCCACTCTCAG	T	112.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=2;PP=718;ReadPosRankSum=-1.255;SC=TGCCTGGACATTCCCCACTCT;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=2;WE=1709108;WS=1709078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr5	1799172	rs6890404	A	T	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=94;ReadPosRankSum=-1.073;SC=GACCTCGGGGACTGAGGGTGT;SOR=1.022;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=7;WE=1799180;WS=1799162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr5	1801426	rs13176353	G	C	2070.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=2.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.31;MQRankSum=1.727;QD=19.91;ReadPosRankSum=-0.322;SOR=0.483;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,53:0.51:104
chr5	1801427	rs34372448	C	CG	2087.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-2.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.31;MQRankSum=1.760;QD=19.70;ReadPosRankSum=-0.107;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,53:0.50:106
chr5	1801432	rs11745573	A	G	2152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=1.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQRankSum=1.018;QD=18.88;ReadPosRankSum=-0.281;SOR=0.507;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,57:0.50:114
chr5	1801689	rs2242412	A	C	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=217;ReadPosRankSum=-1.205;SC=TACAGGATGCACCTTCCTCCA;SOR=0.763;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=41;TCF=18;TCR=23;TR=18;WE=1801697;WS=1801679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,21:0.46:46
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chr5	1814395	rs36074605	TTGTA	T	1599.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.868;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.11;MQRankSum=1.121;NF=15;NR=9;PP=1111;ReadPosRankSum=1.902;SC=GTGGGTTAAATTGTATGTAGT;SOR=1.094;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=66;TCF=33;TCR=33;TR=24;WE=1814406;WS=1814385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,43:0.45:95
chr5	1814783	rs4147773	T	C	1068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.853;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=33;PP=627;ReadPosRankSum=-0.430;SC=CTTTCAACTGTGAAGTGGTGG;SOR=0.504;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=30;TCR=50;TR=53;WE=1814791;WS=1814773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,53:0.61:87
chr5	1880865	rs4975753	T	C	1769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.200;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=27;PP=983;ReadPosRankSum=0.450;SC=GGCCCAGAGCTGGCTCGTAAG;SOR=0.803;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=160;TCF=100;TCR=60;TR=75;WE=1880873;WS=1880855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,84:0.48:175
chr5	1880891	rs2232376	C	T	2550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.471;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=49;PP=1515;ReadPosRankSum=0.487;SC=TAGGCGGCAGCGGCTGGTGCC;SOR=0.746;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=223;TCF=126;TCR=97;TR=116;WE=1880899;WS=1880881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,125:0.52:242
chr5	1881916	rs2307118	A	C	2890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=50;PP=1881;ReadPosRankSum=-0.500;SC=GGGATGCCCCACTTACCAGCG;SOR=0.699;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=216;TCF=127;TCR=89;TR=124;WE=1881924;WS=1881906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,135:0.57:236
chr5	1882129	rs2232374	T	G	1833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=47;PP=1202;ReadPosRankSum=1.450;SC=GCGTGCGGCCTCCGGACTCGC;SOR=0.722;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=181;TCF=81;TCR=100;TR=83;WE=1882137;WS=1882119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,88:0.45:195
chr5	1882280	rs2232373	C	G	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=3.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=168;ReadPosRankSum=-0.049;SC=CGAGTACCCCCGGGCCTCCCG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=9;WE=1882288;WS=1882270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr5	1882900	rs6876836	C	T	187.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=5;PP=136;SC=AGTCCATCCCCGCGCTCCGCA;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=1882908;WS=1882890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	2755031	rs62333234	A	G	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.511;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=65;ReadPosRankSum=-0.009;SC=AACCCAGGCGATGGGGGCAGT;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=5;WE=2755039;WS=2755021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr5	2755485	rs62333235	C	T	3280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.398;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=77;PP=2063;ReadPosRankSum=1.057;SC=CGAGGCATTTCAATAAAACCT;SOR=0.740;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=296;TCF=147;TCR=149;TR=146;WE=2755493;WS=2755475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,160:0.48:333
chr5	3599320	rs861185	A	G	2493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=47;PP=1519;ReadPosRankSum=-0.405;SC=TCCTCGATGGATCTGCCCTGT;SOR=0.675;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=188;TCF=113;TCR=75;TR=116;WE=3599328;WS=3599310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,124:0.61:203
chr5	3600334	rs844154	T	C	4911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=86;PP=2420;SC=GGGCACTCAATGGAGACAAGG;SOR=1.061;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=159;TCF=73;TCR=86;TR=159;WE=3600342;WS=3600324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr5	3610658	rs1373997	T	C	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=142;ReadPosRankSum=-0.421;SC=AGGAGTGGAGTGGGCCCAGGA;SOR=0.412;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=21;TCF=7;TCR=14;TR=14;WE=3610666;WS=3610648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr5	4087292	rs67060329	C	T	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.17;ReadPosRankSum=0.352;SOR=0.605;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,25:0.53:47
chr5	4087346	rs141424757	C	CTG	139.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=176;ReadPosRankSum=0.556;SC=TTTCGTGTGTCTGTGTGTGTG;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=4;WE=4087354;WS=4087336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr5	4087485	rs6869319	G	T	1001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.07;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr5	4095621	rs16872786	A	G	1903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.560;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.909;NF=26;NR=50;PP=1143;ReadPosRankSum=1.049;SC=CACTGCCACTATAATTTAAGG;SOR=0.527;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=118;TCF=40;TCR=78;TR=76;WE=4095629;WS=4095611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,82:0.63:131
chr5	4095683	rs11442944	C	CT	232.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.17;MQRankSum=-2.000;QD=21.16;ReadPosRankSum=0.926;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr5	4420188	rs140931368	G	GTGTA	5608.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=65;PP=2974;SC=TGCCTGGCATGTGTATGTGTG;SOR=1.239;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=8;TCR=74;TR=72;WE=4420196;WS=4420178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr5	4420474	rs2436584	A	G	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=1.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.21;ReadPosRankSum=-0.425;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,27:0.52:52
chr5	4702352	rs6555310	T	G	203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=4;PP=160;SC=TGTGTGTGTGTGCTCAGGCCC;SOR=0.859;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=10;WE=4702360;WS=4702342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	4702461	rs4315900	C	T	234.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=5;PP=115;SC=TTTTGTTAATCTTTGGTCTAT;SOR=1.402;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=4702469;WS=4702451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	4930051	rs27416	G	T	1774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=8;PP=1010;SC=GTGATATATAGATGTATCCCT;SOR=2.560;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=37;TCR=8;TR=45;WE=4930059;WS=4930041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr5	4930087	rs147939241	G	GTGAA	404.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.257;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=15;PP=781;ReadPosRankSum=1.890;SC=GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAG;SOR=1.427;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=62;TCF=33;TCR=29;TR=32;WE=4930095;WS=4930076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,32:0.32:100
chr5	4930144	rs35167763	AAG	A	3081.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.100;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.671;NF=12;NR=37;PP=1788;ReadPosRankSum=-1.547;SC=CAGAGAAAGAAAGAGAGGAAT;SOR=0.857;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=104;TCF=23;TCR=81;TR=49;WE=4930153;WS=4930134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,90:0.42:214
chr5	4930181	rs560366	C	T	2964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.603;NF=36;NR=38;PP=949;ReadPosRankSum=0.023;SC=CTCATGCAATCGTGGGAGCTG;SOR=0.653;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=163;TCF=79;TCR=84;TR=74;WE=4930189;WS=4930171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,83:0.44:188
chr5	5140632	rs270208	T	C	639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=15;NR=4;PP=292;SC=GTGGATGCTGTTGGCGCAGGT;SOR=1.270;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=19;WE=5140640;WS=5140622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr5	5140713	rs72647738	C	G	1537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=17;PP=838;SC=GGAGGCGAGTCCCCCGCGGCT;SOR=1.061;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=31;TCR=17;TR=48;WE=5140721;WS=5140703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr5	5140958	rs270207	T	A	2584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=33;NR=53;PP=1587;SC=TATTAGGTGCTGTGAATGTTC;SOR=1.313;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=88;TCF=33;TCR=55;TR=86;WE=5140966;WS=5140948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr5	5141009	.	CTT	C,CT	321.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.43;MQRankSum=0.500;QD=18.93;ReadPosRankSum=0.511;SOR=4.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:1,8,8:0.47,0.47:17
chr5	5146200	rs1863969	A	T	4523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=51;PP=2731;SC=TTCTTCTCGGAATTCCGAAAT;SOR=1.347;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=159;TCF=107;TCR=52;TR=158;WE=5146208;WS=5146190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr5	5146223	rs1871468	G	C	5943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=122;NR=81;PP=2965;SC=CTCAGCCTCTGCTCACTCTTT;SOR=0.969;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=204;TCF=122;TCR=82;TR=203;WE=5146231;WS=5146213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr5	5146335	rs2086310	C	G	6371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=110;PP=2965;SC=AAGAGCAGTGCCCGTGTCCGA;SOR=0.773;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=219;TCF=109;TCR=110;TR=219;WE=5146343;WS=5146325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr5	5146377	rs1019747	T	C	4814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=66;NR=89;PP=2965;SC=GCTGAAAGGCTCCAGGCACGA;SOR=1.192;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=156;TCF=66;TCR=90;TR=155;WE=5146385;WS=5146367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr5	5186415	.	GT	G	654.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.18;ReadPosRankSum=-1.602;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,25:0.96:26
chr5	5186417	.	GT	G	654.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.069;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.18;ReadPosRankSum=-1.469;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,25:0.96:26
chr5	5187776	rs1863972	G	A	4520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=56;PP=2381;SC=TTCTAGGCCCGCTAGTAAGTA;SOR=1.030;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=145;TCF=89;TCR=56;TR=145;WE=5187784;WS=5187766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr5	5189950	rs6859975	G	A	351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=2;PP=303;SC=AAATACACGCGTTAGCTTATA;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=5189958;WS=5189940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	5190182	rs34105281	C	T	1911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.548;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=49;PP=1178;ReadPosRankSum=0.338;SC=GTCATGACCACGCCATCTTAC;SOR=0.928;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=165;TCF=78;TCR=87;TR=88;WE=5190190;WS=5190172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,93:0.50:186
chr5	5200220	rs58639468	A	ATC,ATCTC	3942.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=-1.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=2.990;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=11,11;NR=34,34;PP=1038,708;ReadPosRankSum=1.620;SC=TGAAAGAACCATCTCTCTCTC;SOR=0.337;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=13;TCR=39;TR=45,45;WE=5200228;WS=5200210;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.53,0.40:129
chr5	5200281	rs6555335	C	T	4016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=58;PP=1890;SC=GGAACATGTGCAAAAAGTCCG;SOR=0.903;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=109;TCF=51;TCR=58;TR=109;WE=5200289;WS=5200271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr5	5200490	rs17762877	T	C	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=109;ReadPosRankSum=0.637;SC=CCTGATGTGGTTCCCTTTGAA;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=6;WE=5200498;WS=5200480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr5	5232346	rs2913623	G	A	1710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=11;PP=1302;SC=ATTAGGTGCTGCTTGAGTGTA;SOR=2.872;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=46;TCR=11;TR=57;WE=5232365;WS=5232336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr5	5232356	rs150710468	AGG	A	3125.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=15;PP=2077;SC=GCTTGAGTGTAGGGGGAGGCT;SOR=2.681;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=58;TCF=39;TCR=19;TR=53;WE=5232365;WS=5232336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr5	5232398	rs2913624	G	A	3424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=44;PP=2223;SC=ATTCCCCACTGCTCAGCCTTA;SOR=1.384;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=81;TCR=44;TR=124;WE=5232406;WS=5232388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr5	5232703	rs2195290	T	C	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.200;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=97;ReadPosRankSum=1.085;SC=AGTATGCCTGTGTCTCAGCTC;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=7;WE=5232711;WS=5232693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr5	5235028	rs2913630	T	C	429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=1;PP=344;SC=TAATTACCCATTCTAACACTC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=5235036;WS=5235018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	5235096	rs2913631	A	G	2410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=49;NR=28;PP=1391;SC=ACTAAAATATAAAAATTCTAA;SOR=1.105;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=50;TCR=28;TR=77;WE=5235104;WS=5235086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr5	5262766	rs34433845	G	A	2665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.484;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=57;PP=1630;ReadPosRankSum=1.535;SC=ATCCTTGCCTGCAGGACAGAT;SOR=0.673;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=207;TCF=105;TCR=102;TR=116;WE=5262774;WS=5262756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,125:0.55:229
chr5	5460569	rs2578565	C	T	1174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=6;PP=767;SC=TTGGAGAATACACAGATTCCA;SOR=2.476;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=36;WE=5460577;WS=5460559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr5	5460619	rs2619844	G	C	2114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=15;PP=1284;SC=TCTGCTGAGTGTGTTTCAGAA;SOR=1.643;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=45;TCR=15;TR=60;WE=5460627;WS=5460609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr5	5462148	rs2578500	G	A	9329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=350;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=157;NR=159;PP=2965;SC=TATGTCAACTGTAGCAAAATG;SOR=0.788;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=316;TCF=157;TCR=159;TR=316;WE=5462156;WS=5462138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,350:1.00:350
chr5	5476250	rs11416699	T	TG	1356.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.313;NF=1;NR=26;PP=856;ReadPosRankSum=0.000;SC=GGTGGAAGGCTGGGGGGTTAA;SOR=1.609;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=27;WE=5476258;WS=5476240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,46:0.96:48
chr5	6020374	rs464221	A	G	932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=21;PP=560;ReadPosRankSum=-0.886;SC=TCATCCAACCATAATTGTCTA;SOR=0.744;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=39;TCR=39;TR=42;WE=6020382;WS=6020364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,46:0.48:95
chr5	6020418	rs457263	T	G	785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=19;PP=476;ReadPosRankSum=1.313;SC=ATCCAACCCTTTAAGCCAGCA;SOR=0.630;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=22;TCR=30;TR=33;WE=6020426;WS=6020408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,36:0.57:63
chr5	6020488	rs412953	C	T	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=153;ReadPosRankSum=-0.852;SC=CTCCTCAAGTCGGCATTCCTT;SOR=0.551;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=10;WE=6020496;WS=6020478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr5	6312844	rs370741234	CCACACA	C	280.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.11;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
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chr5	6337065	rs70965988	T	TACACACACACACACACACACACACAC	34.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQRankSum=-0.967;QD=5.79;ReadPosRankSum=-0.842;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,2:0.33:6
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chr5	6378614	rs7723985	G	C	7098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=113;NR=126;PP=2965;SC=GCCCGTCCCCGACCCACACAG;SOR=0.927;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=239;TCF=113;TCR=126;TR=239;WE=6378622;WS=6378604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
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chr5	6600492	.	G	GT	82.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=-0.000;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=50;ReadPosRankSum=0.674;SC=CATTTCATCTGGATCCGAGGG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=6600500;WS=6600482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr5	6602544	rs2303711	T	C	1228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.968;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=12;PP=827;ReadPosRankSum=-0.783;SC=AAGGCGTGTGTGTCTAAGGGC;SOR=1.439;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=93;TCF=63;TCR=30;TR=48;WE=6602552;WS=6602534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,52:0.53:99
chr5	6604931	rs6889694	C	T	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=422;ReadPosRankSum=-0.557;SC=CCGAGAAACCCCGGTTAAGAA;SOR=0.481;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=52;TCF=6;TCR=46;TR=23;WE=6604939;WS=6604921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,24:0.44:54
chr5	6604970	rs6888601	G	A	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.078;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=161;ReadPosRankSum=1.561;SC=TTGTGATTACGTCGTTTGGAG;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=10;WE=6604978;WS=6604960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr5	6605532	rs2303707	C	A	1136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.556;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=30;PP=699;ReadPosRankSum=-0.999;SC=CTGTACATAACAACATTGTTG;SOR=0.547;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=104;TCF=38;TCR=66;TR=48;WE=6605540;WS=6605522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,54:0.47:114
chr5	6607125	rs3217325	GAAC	G	1422.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.305;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.065;NF=2;NR=20;PP=1276;ReadPosRankSum=-0.497;SC=GTGCAACATGGAACGGTTTGC;SOR=1.236;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=47;TCF=3;TCR=44;TR=22;WE=6607143;WS=6607115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,40:0.42:95
chr5	6607135	rs114937174	C	T	1257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.447;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=18;PP=1293;ReadPosRankSum=-0.117;SC=GAACGGTTTGCGGCAGATGTT;SOR=1.230;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=67;TCF=29;TCR=38;TR=27;WE=6607143;WS=6607115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,34:0.43:80
chr5	6611757	rs10454287	A	T	1136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.15;ReadPosRankSum=-0.738;SOR=0.496;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,56:0.50:112
chr5	6611983	rs3733776	C	A	720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.779;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=20;PP=351;ReadPosRankSum=-1.028;SC=GTGAAAAAAACCAGACACAGA;SOR=1.074;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=92;TCF=32;TCR=60;TR=26;WE=6611991;WS=6611973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,39:0.35:111
chr5	6612027	rs6884320	T	C	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=187;ReadPosRankSum=-0.540;SC=ACAGAAAATGTCCAGGGAAGG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=11;WE=6612035;WS=6612017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr5	6617011	rs6887702	C	A	1378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.398;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=30;PP=744;ReadPosRankSum=0.868;SC=CAAATGTATCCATGAAGTGCA;SOR=0.547;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=113;TCF=56;TCR=57;TR=61;WE=6617019;WS=6617001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,67:0.52:129
chr5	6618186	rs10475338	T	C	831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.511;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=24;PP=481;ReadPosRankSum=-1.408;SC=GGTGGATGACTGCACTTTAAC;SOR=1.358;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=79;TCF=32;TCR=47;TR=36;WE=6618194;WS=6618176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,42:0.46:92
chr5	6620092	rs2288445	C	T	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=140;ReadPosRankSum=0.108;SC=TTTAGGCTCACGCTATCTTTC;SOR=0.387;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=9;WE=6620100;WS=6620082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr5	6622017	rs2303705	T	G	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-3.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.551;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=292;ReadPosRankSum=0.256;SC=ACCCAACTGCTTGTCATAGGA;SOR=0.346;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=45;TCF=39;TCR=6;TR=20;WE=6622025;WS=6622007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,21:0.40:52
chr5	6623432	.	G	GA	37	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;FR=0.9999;HP=13;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=16;MQ=61.53;NF=0;NR=3;PP=37;QD=14.0;SC=CAACAATTAGGAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=6623440;WS=6623422;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,3:0.75:4
chr5	6632143	rs114793623	T	C	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=398;ReadPosRankSum=0.196;SC=AGTTAATACATTGTATCTTCT;SOR=0.465;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=20;WE=6632151;WS=6632133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,22:0.63:35
chr5	6632875	rs10076470	G	A	1331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=31;PP=777;ReadPosRankSum=0.095;SC=CAGCCCTGAGGAAGGAAAGAG;SOR=0.721;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=106;TCF=50;TCR=56;TR=58;WE=6632883;WS=6632865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,64:0.53:120
chr5	6632909	rs571550	G	A	1791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=27;NR=35;PP=1046;SC=GGCCCAAGGAGCCGCCCCCTC;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=27;TCR=35;TR=62;WE=6632917;WS=6632899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr5	6632942	rs193743	G	T	1228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=21;NR=22;PP=664;SC=CAGGCCTCGGGGTCCGGGAAG;SOR=0.919;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=21;TCR=22;TR=43;WE=6632950;WS=6632932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr5	6633042	rs10062086	C	T	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.412;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.75;ReadPosRankSum=-0.475;SOR=0.069;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr5	6633779	rs248793	C	G	6642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=123;NR=95;PP=2965;SC=TCTTCGCGCGCAATCGTCAGA;SOR=0.828;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=218;TCF=123;TCR=95;TR=218;WE=6633787;WS=6633769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr5	6645016	rs248805	A	G	4788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=62;PP=2816;ReadPosRankSum=-0.931;SC=TGATTCCAAGACGCAGAGAGA;SOR=1.038;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=159;TCF=96;TCR=63;TR=157;WE=6645024;WS=6645006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,179:0.99:181
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chr5	6652252	rs3733773	G	A	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.494;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.282;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=28;ReadPosRankSum=-0.494;SC=GCAGCACCCCGGAGTCCCATG;SOR=0.105;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=5;WE=6652260;WS=6652242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
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chr5	6748659	rs274681	T	C	2767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=50;PP=1215;ReadPosRankSum=-0.556;SC=TCAGCCATGCTGTGTCACCGC;SOR=0.682;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=284;TCF=158;TCR=126;TR=119;WE=6748667;WS=6748649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,142:0.45:313
chr5	6748810	rs2279653	G	A	796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.310;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=26;PP=551;ReadPosRankSum=1.374;SC=ATGTTCTGCCGTATTTCAGTA;SOR=0.256;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=66;TCF=13;TCR=53;TR=34;WE=6748818;WS=6748800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,35:0.51:69
chr5	6754762	rs274676	T	C	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=343;ReadPosRankSum=2.410;SC=ATCCCTGCTCTCTATGTAACA;SOR=0.922;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=19;WE=6754770;WS=6754752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr5	6827854	rs275441	C	T	871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.554;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=8;PP=518;ReadPosRankSum=-0.689;SC=ATCCCTCTTGCAGGGACTTTC;SOR=0.361;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=60;TCF=48;TCR=12;TR=34;WE=6827862;WS=6827844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,38:0.58:66
chr5	7520881	rs13166360	G	T	4386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=402;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=94;PP=2696;ReadPosRankSum=0.889;SC=CATCTTCGTGGTGTACACCAT;SOR=0.671;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=356;TCF=180;TCR=176;TR=189;WE=7520889;WS=7520871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:192,210:0.52:402
chr5	7654097	rs111644211	GAGA	G	1398.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=749;ReadPosRankSum=-2.434;SC=AAGAGCTGTTGAGAAGACCAG;SOR=0.622;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=58;TCF=17;TCR=41;TR=19;WE=7654107;WS=7654087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,40:0.33:121
chr5	7690754	rs2914289	C	T	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=173;ReadPosRankSum=-1.567;SC=ATTTGGTCATCCCCCGAGGTG;SOR=0.941;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=9;WE=7690762;WS=7690744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr5	7695845	rs11134251	C	A	1717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.083;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=31;PP=1098;ReadPosRankSum=1.407;SC=TCTGTCTCCTCACCTCCTTTC;SOR=0.809;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=202;TCF=118;TCR=84;TR=82;WE=7695853;WS=7695835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,89:0.42:213
chr5	7696028	rs11134252	C	T	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=210;ReadPosRankSum=-0.550;SC=CTCTTGGTTTCGTTTTTCTTC;SOR=0.563;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=60;TCF=21;TCR=39;TR=22;WE=7696036;WS=7696018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,26:0.39:67
chr5	7712810	rs6555488	C	T	132.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=102;SC=TTGATTCACACTTAGGATTAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=7712818;WS=7712807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr5	7717396	rs6878196	T	C	690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.953;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=14;PP=361;ReadPosRankSum=-0.566;SC=TTTATTATGTTCCAGTTGTAT;SOR=0.957;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=63;TCF=32;TCR=31;TR=28;WE=7717404;WS=7717386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,33:0.47:70
chr5	7743787	rs62342477	C	T	2457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=59;PP=1497;ReadPosRankSum=0.462;SC=GTAGAACGTCCGTCCTGGGCA;SOR=0.692;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=247;TCF=125;TCR=122;TR=118;WE=7743795;WS=7743777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,124:0.45:277
chr5	7757705	rs4072341	T	C	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.42;ReadPosRankSum=-3.303;SOR=0.465;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr5	7802363	rs2290910	C	T	1150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.770;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=17;PP=684;ReadPosRankSum=0.073;SC=ACTGCGTCTGCGTCATGTTTG;SOR=0.577;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=90;TCF=61;TCR=29;TR=50;WE=7802371;WS=7802353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,53:0.52:102
chr5	7826648	rs141881348	AAAC	A	364.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=266;ReadPosRankSum=-0.123;SC=GCGCTGAATTAAACAACATTG;SOR=1.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=7;WE=7826658;WS=7826638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr5	7826680	rs6887726	T	C	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.460;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=326;ReadPosRankSum=0.039;SC=CTTTTTTTCTTGTGGATTACT;SOR=0.275;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=26;WE=7826688;WS=7826670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,27:0.64:42
chr5	7835616	rs34574678	G	GA	2129.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=45;PP=973;ReadPosRankSum=-0.626;SC=TCCTGTCTAGGAAAAAAAAGA;SOR=0.708;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=149;TCF=29;TCR=120;TR=57;WE=7835624;WS=7835606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,98:0.43:229
chr5	7835685	rs179044	G	T	1386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.601;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=34;PP=750;ReadPosRankSum=1.085;SC=GGAGCACAGAGGCCAGTTCTT;SOR=0.769;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=138;TCF=60;TCR=78;TR=58;WE=7835693;WS=7835675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,70:0.45:156
chr5	7850898	rs36226128	TGCCCAGCCGCCCAGCCGCCCAGCC	T	419.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.48;BaseQRankSum=1.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.160;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=1;PP=505;ReadPosRankSum=1.757;SC=CGCCCGCCCCTGCCCAGCCGC;SOR=0.982;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=2;TCF=1;TCR=1;TR=2;WE=7850929;WS=7850888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,11:0.85:13
chr5	7851181	rs161874	C	A	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=37;ReadPosRankSum=-0.366;SC=CCGTCCCGCCCGCCCAGGGGC;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=5;WE=7851189;WS=7851171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr5	7861985	rs2307116	G	A	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.702;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=261;ReadPosRankSum=-0.170;SC=GCTCAATAACGCTAAACCACA;SOR=1.508;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=17;WE=7861993;WS=7861975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr5	7862926	rs3733784	T	C	353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.817;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=229;ReadPosRankSum=0.339;SC=AAACTCCTTATACTACTTACC;SOR=0.153;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=14;WE=7862934;WS=7862916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
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chr5	7869235	rs72716536	T	C	3364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.898;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=59;PP=1707;ReadPosRankSum=0.341;SC=CTATTGGTCCTGGGTACCGAG;SOR=0.773;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=265;TCF=158;TCR=107;TR=148;WE=7869243;WS=7869225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,163:0.55:296
chr5	7870083	rs326119	C	A	4985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=84;PP=2962;SC=GAAAGCCAAGCTTTTGGTTTG;SOR=0.736;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=173;TCF=88;TCR=85;TR=172;WE=7870103;WS=7870073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr5	7870095	rs12653464	G	A	2365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=47;PP=1361;ReadPosRankSum=0.342;SC=TTTGGTTTGGGTTTCAGTTTA;SOR=0.666;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=183;TCF=95;TCR=88;TR=97;WE=7870103;WS=7870073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,110:0.54:203
chr5	7870973	rs1801394	A	G	2618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.568;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=50;PP=1279;ReadPosRankSum=0.363;SC=CAGAAGAAATATGTGAGCAAG;SOR=0.826;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=203;TCF=107;TCR=96;TR=103;WE=7870981;WS=7870963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,126:0.53:238
chr5	7875307	rs2303079	C	G	1265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.570;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=13;PP=840;ReadPosRankSum=0.422;SC=ATTTTATTTACCTAGTCTTTG;SOR=0.358;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=79;TCF=61;TCR=18;TR=49;WE=7875315;WS=7875297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,53:0.63:84
chr5	7878192	rs161870	T	C	1717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.107;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=33;PP=1027;ReadPosRankSum=0.267;SC=GGACAGACCTTGTGAAGTCAG;SOR=0.940;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=196;TCF=112;TCR=84;TR=83;WE=7878200;WS=7878182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,87:0.39:221
chr5	7883188	rs162035	G	A	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.261;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=10;PP=434;ReadPosRankSum=0.021;SC=GTAAGCCCCTGTGGATCTTGC;SOR=0.297;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=49;TCF=34;TCR=15;TR=29;WE=7883196;WS=7883178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,30:0.59:51
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chr5	7886759	.	ATGT	A	6200.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=0.000;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.901;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.904;NF=8;NR=73;PP=2954;ReadPosRankSum=-1.386;SC=TACCTGCGGGATGTTCTCTCC;SOR=0.828;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=156;TCF=20;TCR=136;TR=81;WE=7886769;WS=7886749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,161:0.53:305
chr5	7891610	rs2303081	A	G	1450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.453;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=37;PP=862;ReadPosRankSum=0.163;SC=GAGTTTACTAATTTATTCAGT;SOR=0.863;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=110;TCF=49;TCR=61;TR=63;WE=7891618;WS=7891600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,68:0.54:125
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chr5	7893121	rs162049	G	A	697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=17;PP=427;SC=ATTCATTACTGTCATAAGAAA;SOR=3.014;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=21;WE=7893129;WS=7893111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	7897191	rs10380	C	T	1834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.418;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=38;PP=1281;ReadPosRankSum=0.146;SC=AGAGCTCAGACATTTCCTTAA;SOR=0.884;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=184;TCF=101;TCR=83;TR=86;WE=7897199;WS=7897181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,89:0.43:205
chr5	7897283	rs12347	G	A	2188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.663;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=53;PP=1410;ReadPosRankSum=0.411;SC=CAAAGTATGTGCAAGACAACA;SOR=0.571;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=194;TCF=93;TCR=101;TR=102;WE=7897291;WS=7897273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,108:0.50:215
chr5	7899909	rs10520874	G	C	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=111;ReadPosRankSum=-1.570;SC=GAGATGTTCTGAGAAGACGGA;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=7;WE=7899917;WS=7899899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr5	8461166	rs341899	T	C	1428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=34;PP=1044;SC=GTTTCTAAGTTTATTATTAAA;SOR=2.078;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=14;TCR=34;TR=48;WE=8461174;WS=8461156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr5	9043142	rs3834271	T	TA	178.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.471;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=120;ReadPosRankSum=1.150;SC=GAAAATATATTAAAAAAAAAC;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=8;WE=9043150;WS=9043132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr5	9050410	rs257098	C	T	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=190;ReadPosRankSum=-0.404;SC=TGACTTTCTCCGGTTTTTCAT;SOR=0.693;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=12;WE=9050418;WS=9050400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr5	9053945	rs257095	C	T	883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.661;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=30;PP=658;ReadPosRankSum=1.047;SC=AGAACTCGTGCTTGAAGCCTT;SOR=0.881;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=97;TCF=35;TCR=62;TR=44;WE=9053953;WS=9053935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,44:0.42:105
chr5	9066464	rs786847	A	G	1292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=20;PP=759;ReadPosRankSum=0.659;SC=CTTGCTGTTTATGACCTTAGA;SOR=0.727;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=110;TCF=74;TCR=36;TR=55;WE=9066472;WS=9066454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,60:0.48:124
chr5	9066802	rs786846	G	A	1865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=53;PP=1283;ReadPosRankSum=-0.561;SC=GGGGTAAACAGAGCAACCTCA;SOR=0.720;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=165;TCF=66;TCR=99;TR=87;WE=9066810;WS=9066792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,89:0.51:174
chr5	9136487	rs6883525	A	C	357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=1;PP=212;SC=GAGAGAGCACAGACTGGGTTT;SOR=2.670;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=9136495;WS=9136480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	9197434	rs3216958	A	AGAG	595.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.54;ReadPosRankSum=1.317;SOR=0.963;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr5	9201973	rs40683	C	T	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.332;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=241;ReadPosRankSum=-0.157;SC=AAGATTTTCTCTAAAGTAAAT;SOR=0.153;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=13;WE=9201981;WS=9201963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
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chr5	9280957	rs6555597	C	A	4166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=93;PP=2809;SC=TAAAATGTAACGTTTTAGCAA;SOR=1.726;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=137;TCF=44;TCR=93;TR=137;WE=9280965;WS=9280947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr5	9380110	rs1805243	T	C	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.709;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=135;ReadPosRankSum=0.734;SC=ACAGAAGCTCTTCTTCTCCTC;SOR=1.347;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=8;WE=9380118;WS=9380100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr5	10227548	rs2136197	C	A	3866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.92;QD=25.95;SOR=0.850;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr5	10227823	rs3080459	C	CCT	801.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=714;SC=CCCAAAATTTCCTGTTTTTAA;SOR=3.716;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=16;WE=10227831;WS=10227813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	10235490	rs2292264	G	A	704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=20;PP=422;ReadPosRankSum=1.495;SC=GGGTTTTGATGAACTCCTAAG;SOR=0.741;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=78;TCF=28;TCR=50;TR=31;WE=10235498;WS=10235480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,35:0.38:91
chr5	10236856	rs11133605	A	G	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.060;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=412;ReadPosRankSum=-0.862;SC=CTAAGACATCATTTTAAAATG;SOR=0.197;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=36;TCF=13;TCR=23;TR=22;WE=10236864;WS=10236846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,22:0.55:40
chr5	10236927	rs2292263	C	T	2566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=27;PP=1613;SC=AACTTAGTTTCCTTGATTGGT;SOR=1.389;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=56;TCR=27;TR=83;WE=10236935;WS=10236917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr5	10237036	rs12653481	A	G	1809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.131;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=36;PP=1054;ReadPosRankSum=0.938;SC=AGGTCGAACAAAACATTGCTG;SOR=0.804;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=164;TCF=83;TCR=81;TR=72;WE=10237044;WS=10237026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,85:0.45:190
chr5	10237155	rs6876650	G	A	893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.024;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=26;PP=558;ReadPosRankSum=0.331;SC=AAAATAACCTGTCAATGAAAA;SOR=0.566;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=62;TCF=19;TCR=43;TR=39;WE=10237163;WS=10237145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,41:0.62:66
chr5	10239261	rs2438652	G	A	3436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.709;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=74;PP=1988;ReadPosRankSum=-1.421;SC=AATCTGCTTCGTAGTTGCAGG;SOR=0.519;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=288;TCF=138;TCR=150;TR=150;WE=10239269;WS=10239251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,164:0.53:310
chr5	10239278	rs2252505	C	T	9977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=120;NR=135;PP=2965;SC=CAGGTACAAACGGCAAACAGA;SOR=0.854;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=255;TCF=120;TCR=135;TR=255;WE=10239286;WS=10239268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,279:1.00:279
chr5	10250042	.	AAAAAC	A	847	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;FR=1.0000;HP=24;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=24;MQ=64.49;NF=12;NR=16;PP=847;QD=30.3571428571;SC=AAAAAAAAAAAAAAACCGGAA;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=32;TCF=15;TCR=17;TR=28;WE=10250054;WS=10250032;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,28:0.88:32
chr5	10250430	rs2548546	G	A	5768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=102;PP=2965;SC=CGGTTGGGGGGAAGTAATTCC;SOR=0.954;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=192;TCF=89;TCR=103;TR=191;WE=10250451;WS=10250420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr5	10250443	rs2578618	T	C	5462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=100;PP=2965;SC=GTAATTCCGGTTGTTGCACCA;SOR=1.106;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=176;TCF=76;TCR=100;TR=175;WE=10250451;WS=10250420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr5	10254817	rs2578617	A	G	6457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=120;NR=101;PP=2965;SC=ATAAGGATGGAGATGTGACTG;SOR=0.808;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=221;TCF=120;TCR=101;TR=221;WE=10254825;WS=10254807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr5	10255021	rs2607294	T	C	1091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=28;PP=713;SC=ACATGCCTGCTGAGATTGTTG;SOR=2.476;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=9;TCR=28;TR=37;WE=10255029;WS=10255011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr5	10255083	rs2578616	A	C	456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=57;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=239;SC=AAAACATGCTACAAAACAAAT;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=10255091;WS=10255073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	10256049	rs11741923	C	G	1394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=25;PP=858;ReadPosRankSum=0.239;SC=AACTGATTGTCTGCTGGCTTA;SOR=0.693;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=137;TCF=84;TCR=53;TR=61;WE=10256057;WS=10256039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,66:0.44:149
chr5	10256161	rs1042392	T	C	4518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=95;PP=2671;SC=AGGCTGCTCGTGTTGCTATTG;SOR=0.932;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=170;TCF=75;TCR=95;TR=170;WE=10256169;WS=10256151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr5	10258125	rs2457156	G	A	1772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=17;PP=966;SC=TCAAAACATCGTTTGATTTAT;SOR=1.402;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=34;TCR=17;TR=51;WE=10258133;WS=10258115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr5	10261542	rs2607327	C	T	1972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=2;PP=1524;SC=GGAGATGTCTCGGTCAAAGTG;SOR=5.926;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=55;TCF=53;TCR=2;TR=55;WE=10261550;WS=10261532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr5	10261966	rs2244717	G	A	1885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=34;PP=1074;SC=AAAAATAATCGTGGTTCTCAA;SOR=1.318;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=24;TCR=34;TR=58;WE=10261974;WS=10261956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr5	10262740	rs2578642	C	A	9765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=376;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=168;NR=167;PP=2965;SC=GGTAAGGGATCTGTGCAGACT;SOR=0.725;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=335;TCF=168;TCR=167;TR=335;WE=10262748;WS=10262730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,376:1.00:376
chr5	10263451	.	TGGAG	T	2099	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=25;MQ=60.87;NF=1;NR=42;PP=2099;QD=50.0413735341;SC=CGCCTCTGCGTGGAGGGGGGG;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=45;TCF=1;TCR=44;TR=43;WE=10263472;WS=10263441;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,43:0.96:45
chr5	10263453	rs147103051	GA	G	3602.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.71;QD=43.94;SOR=2.542;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr5	10263457	rs58620077	G	A	3609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.41;QD=45.69;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr5	10263461	rs370306096	GGGA	G	3424.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.91;SOR=2.400;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
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chr5	10417589	rs2967956	G	T	747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=19;PP=531;SC=GCCAGGCATGGGGCTTACGCC;SOR=3.014;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=22;WE=10417597;WS=10417579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
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chr5	10505585	rs17816571	A	G	2840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.197;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=40;PP=1635;ReadPosRankSum=-0.330;SC=TTATTTCAAGACTGATTATTC;SOR=0.855;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=207;TCF=131;TCR=76;TR=115;WE=10505593;WS=10505575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,134:0.55:245
chr5	10509069	rs1392005	C	T	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=348;ReadPosRankSum=0.805;SC=GAACCAGTGGCGGCCAGTGTT;SOR=1.101;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=18;WE=10509077;WS=10509059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr5	10564846	rs814576	C	T	703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.27;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
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chr5	10624887	rs1531839	T	C	1600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=43;PP=2552;ReadPosRankSum=-0.302;SC=TGGCTCCCAATCTTGCGCCTC;SOR=0.643;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=127;TCF=41;TCR=86;TR=65;WE=10624895;WS=10624856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,73:0.53:139
chr5	10638180	rs11745612	T	C	1690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.568;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=35;PP=828;ReadPosRankSum=-0.050;SC=ACTATTTCCCTGGTCTTGACC;SOR=0.643;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=152;TCF=85;TCR=67;TR=77;WE=10638188;WS=10638170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,84:0.51:166
chr5	10638364	rs6889196	A	G	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=23;PP=489;ReadPosRankSum=-1.765;SC=GAGATTAATCACTCCCATAGA;SOR=0.707;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=30;TCR=44;TR=39;WE=10638372;WS=10638354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,43:0.52:83
chr5	10650150	rs56969869	A	G	609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=1.125;NF=14;NR=13;PP=278;ReadPosRankSum=0.013;SC=AGAGGAAGGCAGAGGAGGCCG;SOR=0.780;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=34;TCR=30;TR=27;WE=10650158;WS=10650140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,34:0.45:75
chr5	10650251	rs140897444	CGGGGCT	C	530.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.680;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=1.564;NF=1;NR=4;PP=181;ReadPosRankSum=-1.074;SC=GCGCTGGGGCCGGGGCTGGGG;SOR=0.368;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=5;WE=10650264;WS=10650241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr5	10650324	rs13354827	T	G	130.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.53;MQRankSum=0.566;QD=18.68;ReadPosRankSum=0.842;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr5	10650324	.	TT	GG	51	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MMLQ=25;MQ=61.34;NF=2;NR=2;PP=51;QD=26.1169687156;SC=ATCGCACCACTTCCGCTCCAT;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=4;WE=10650333;WS=10650314;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:3,4:0.57:7
chr5	10650325	rs13354828	T	G	130.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.53;MQRankSum=0.566;QD=18.68;ReadPosRankSum=0.842;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr5	10664999	rs111384023	C	G	1817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.93;QD=43.28;SOR=1.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr5	10665004	rs115907161	C	T	1817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.93;QD=43.28;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr5	10665259	rs11954194	C	T	730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=19;PP=503;SC=TCTCCCGAAACGACTGGCTTA;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=10665267;WS=10665249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr5	10683822	rs5745289	T	C	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.501;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=283;ReadPosRankSum=1.174;SC=CTCTGCGTTATTTGTTGTAAT;SOR=1.863;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=15;WE=10683830;WS=10683812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
chr5	10748141	rs3217459	TC	T	784.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=3;PP=788;ReadPosRankSum=2.054;SC=AGCCCCCTCCTCCCTGATTAG;SOR=1.075;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=43;TCF=36;TCR=7;TR=23;WE=10748149;WS=10748131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,27:0.57:47
chr5	10748231	rs267944	C	T	6683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=139;NR=86;PP=2965;SC=AATGTTAATGCTTAACCGAAT;SOR=1.183;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=225;TCF=139;TCR=86;TR=225;WE=10748239;WS=10748221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr5	10748462	rs267943	C	T	1628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=39;PP=1133;SC=TGGAAAGGTTCTGGTTGCTCA;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=16;TCR=39;TR=55;WE=10748470;WS=10748452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr5	10761009	rs11740244	C	G	210.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=1;PP=86;SC=GGCATCAAGGCCCGGAACCCG;SOR=1.863;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=10761017;WS=10760999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	10761182	rs267927	A	G	1594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=26;NR=25;PP=770;SC=CGAAGACATGACGCGGCGGGG;SOR=0.986;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=51;TCF=26;TCR=25;TR=51;WE=10761190;WS=10761172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr5	10973927	rs1566624	T	C	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=37;ReadPosRankSum=1.068;SC=AGGCTGTGTATATCCAGGCAT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=3;WE=10973935;WS=10973917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr5	10986684	rs12515637	G	C	857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.628;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=329;ReadPosRankSum=-1.127;SC=CAGATTCACAGCTTTCTTTGT;SOR=0.884;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=74;TCF=45;TCR=29;TR=22;WE=10986692;WS=10986674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,44:0.44:99
chr5	10986722	rs36031475	A	AG	2348.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=1278;ReadPosRankSum=1.703;SC=GCAACATGTAAGGGGAAACAG;SOR=0.692;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=70;TCF=21;TCR=49;TR=22;WE=10986735;WS=10986712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,63:0.43:147
chr5	10986727	rs35210570	A	G	2376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=14;PP=1278;ReadPosRankSum=1.505;SC=ATGTAAGGGGAAACAGTGAAT;SOR=0.663;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=62;TCR=49;TR=31;WE=10986735;WS=10986712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,64:0.43:150
chr5	10986772	rs9312749	G	A	962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=18;PP=407;ReadPosRankSum=-2.558;SC=TAATGAGTTAGGTTCTCCCGT;SOR=0.712;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=103;TCF=50;TCR=53;TR=33;WE=10986780;WS=10986762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,52:0.41:127
chr5	10986947	rs10434650	C	T	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.07;ReadPosRankSum=0.150;SOR=0.459;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr5	10988172	rs879353	T	C	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.662;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=199;ReadPosRankSum=-1.089;SC=CTCTGCCTTGTCGCGGGTCAA;SOR=1.230;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=12;WE=10988180;WS=10988162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,13:0.36:36
chr5	11082762	rs2277053	T	C	6575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=138;NR=83;PP=2965;SC=CTAGAGAAAATATTTTCACTT;SOR=1.307;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=222;TCF=139;TCR=83;TR=221;WE=11082770;WS=11082752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr5	11084189	rs1024621	T	C	3805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=81;PP=2473;SC=CTACTTTGTATCTCAAGCTCT;SOR=1.445;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=129;TCF=48;TCR=81;TR=129;WE=11084197;WS=11084179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr5	11159657	rs1990003	T	C	1282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=4;PP=965;SC=GGGAAGATGGTGGGAGGAGGC;SOR=3.611;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=42;TCF=38;TCR=4;TR=40;WE=11159665;WS=11159647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr5	11365166	rs2074260	C	T	435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=12;PP=362;SC=ATCAGCCTGTCGGCATCACCC;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=11365174;WS=11365156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	11412302	rs31750	C	T	1620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=21;NR=32;PP=938;SC=TTTCCTTTCACTTCTTACTAT;SOR=1.355;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=21;TCR=32;TR=53;WE=11412310;WS=11412292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr5	11564995	rs7719578	A	G	2075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.248;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=41;PP=1248;ReadPosRankSum=-0.755;SC=GAAGAGAAACATCACGATTTA;SOR=0.869;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=209;TCF=120;TCR=89;TR=98;WE=11565003;WS=11564985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,108:0.46:233
chr5	11732144	rs4348210	G	A	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.353;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=148;ReadPosRankSum=-0.094;SC=TCTGCTACATGAGTATGAGTT;SOR=0.284;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=14;WE=11732152;WS=11732134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr5	11732468	rs4466167	C	A	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.547;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=186;ReadPosRankSum=-0.053;SC=AAGATACACACAGAAAAAAAA;SOR=0.404;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=13;WE=11732476;WS=11732458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr5	13692279	rs2166337	A	T	1487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=34;PP=972;SC=ACTTGGTGAAATTTCCACTTT;SOR=1.567;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=18;TCR=34;TR=52;WE=13692287;WS=13692269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr5	13701327	rs3734112	A	G	3434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=35;PP=2281;SC=CTTTAAAACTATAATGATGGA;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=73;TCR=35;TR=108;WE=13701335;WS=13701317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr5	13701525	rs3734111	T	C	8387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=101;PP=2607;ReadPosRankSum=-0.668;SC=AGAAACCCAGTGTACTAGAAA;SOR=1.029;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=190;TCF=87;TCR=103;TR=187;WE=13701544;WS=13701515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,204:0.99:206
chr5	13701536	rs3734110	T	C	8183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=75;NR=92;PP=2950;SC=GTACTAGAAATCCAAGAAGCC;SOR=1.071;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=169;TCF=76;TCR=93;TR=167;WE=13701544;WS=13701515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr5	13701617	rs61338089	GA	G	255.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=11;PP=146;ReadPosRankSum=0.126;SC=TATGTTCACTGAAAAAAAAAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=11;WE=13701625;WS=13701607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,14:0.93:15
chr5	13701654	rs13162313	T	C	368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=311;SC=TTCACTTTTATAATGAAAAAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=13701662;WS=13701644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	13721378	rs17203442	A	G	1157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.648;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=30;PP=702;ReadPosRankSum=-1.686;SC=TATACAAGTCAGTAAAAGTCA;SOR=0.618;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=117;TCF=53;TCR=64;TR=56;WE=13721386;WS=13721368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,60:0.45:132
chr5	13729714	rs3777093	A	G	1431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=35;PP=965;SC=TTCCTTCACTATAAAACAATC;SOR=3.080;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=7;TCR=35;TR=42;WE=13729722;WS=13729704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr5	13735892	rs3734109	T	C	3709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=43;PP=2137;SC=TGCACAGATATAGAATTCAGC;SOR=1.187;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=76;TCR=43;TR=119;WE=13735900;WS=13735882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr5	13737444	rs17263496	G	A	2204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=49;PP=1401;ReadPosRankSum=-1.150;SC=CTCCTCGGCTGTCCTTTTTGT;SOR=0.666;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=220;TCF=122;TCR=98;TR=102;WE=13737452;WS=13737434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,110:0.45:244
chr5	13737700	rs2401811	A	G	268.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=10;PP=247;SC=TGAAGCTCCCATACTGTATTT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=13737708;WS=13737690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	13754394	rs2401809	C	T	5993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=101;NR=91;PP=2965;SC=CACTGATGAGCGTGGAAGCTG;SOR=0.778;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=192;TCF=101;TCR=91;TR=192;WE=13754402;WS=13754384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr5	13759172	rs34516765	TA	T	107.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.108;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.812;NF=0;NR=5;PP=111;ReadPosRankSum=-1.577;SC=AGAACTCAGCTAACGTCACAT;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=5;WE=13759180;WS=13759162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr5	13762972	rs6554812	T	C	3153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.433;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=73;PP=1945;ReadPosRankSum=-0.382;SC=GACTCAAAAATTCTATCACCT;SOR=0.738;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=262;TCF=113;TCR=149;TR=128;WE=13762980;WS=13762956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,143:0.50:287
chr5	13763039	rs6554813	G	A	883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-3.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.098;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=28;PP=607;ReadPosRankSum=1.370;SC=AAATAAAGTCGAAACACTTCT;SOR=0.199;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=70;TCF=11;TCR=59;TR=34;WE=13763047;WS=13763029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,37:0.51:72
chr5	13769257	rs12655133	T	A	1485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.656;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=36;PP=831;ReadPosRankSum=0.226;SC=TAATTCAATATAAAGCAAGCA;SOR=0.776;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=116;TCF=47;TCR=69;TR=57;WE=13769265;WS=13769247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,70:0.52:134
chr5	13769574	.	A	G	2774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=0.000;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.286;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=49;PP=1746;ReadPosRankSum=-0.314;SC=CTGAGAATTCAAAAGGAATGT;SOR=0.891;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=249;TCF=146;TCR=103;TR=123;WE=13769582;WS=13769564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,137:0.49:278
chr5	13770757	rs138234449	C	CA	1528.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=6;PP=1421;SC=CTATGATACACAAAATGTCTC;SOR=3.080;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=40;TCF=32;TCR=8;TR=36;WE=13770765;WS=13770747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr5	13776487	rs34413787	C	T	1189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.652;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=20;PP=769;ReadPosRankSum=2.799;SC=TCAAGCATCCCTGAAAGAACT;SOR=0.760;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=123;TCF=77;TCR=46;TR=56;WE=13776495;WS=13776477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,59:0.43:136
chr5	13788886	rs10513155	C	A	3435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=61;PP=2099;ReadPosRankSum=-1.691;SC=CACAATCCACCAAGAGTTTTT;SOR=0.700;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=296;TCF=172;TCR=124;TR=145;WE=13788894;WS=13788876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,164:0.50:325
chr5	13810529	rs31238	C	G	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=51;ReadPosRankSum=-2.029;SC=AAGAACTGATCTCTGAGAATA;SOR=0.148;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=6;WE=13810537;WS=13810519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr5	13814976	.	G	GA	230.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.682;ClippingRankSum=0.000;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=4.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.72;ReadPosRankSum=0.327;SOR=1.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,16:0.26:62
chr5	13850739	rs4701988	T	A	973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=15;PP=569;ReadPosRankSum=-0.849;SC=ACCGAGAGCTTTCAAAGAGCC;SOR=0.786;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=82;TCF=54;TCR=28;TR=44;WE=13850747;WS=13850729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,47:0.53:89
chr5	13859807	rs1867677	G	T	1132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=32;PP=906;SC=ATTTTTAACCGCTTTCTTTAC;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=32;WE=13859815;WS=13859797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr5	13864728	rs6554827	C	A	1880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.115;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=44;PP=1038;ReadPosRankSum=-0.065;SC=CCTTCAAGGCCCGGGGAAGCT;SOR=0.587;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=177;TCF=86;TCR=91;TR=85;WE=13864736;WS=13864718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,93:0.48:194
chr5	13864885	rs6554828	G	A	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.179;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=60;ReadPosRankSum=-0.185;SC=CTTGCAGGCTGTCTGTTCATA;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=5;WE=13864893;WS=13864875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr5	13865717	rs7720415	A	G	365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=3;PP=236;SC=TTGGCTGCCTATCAAAGAGGA;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=12;WE=13865725;WS=13865707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	13865980	rs7703349	T	C	1308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=26;PP=722;SC=CTCCAGTATATGTGATGTATT;SOR=1.157;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=19;TCR=26;TR=45;WE=13865988;WS=13865970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr5	13866054	rs11958022	A	C	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=50;ReadPosRankSum=0.170;SC=AAAATGATTTATACATGATCA;SOR=0.061;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=6;WE=13866062;WS=13866044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr5	13866450	rs11748811	A	G	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.885;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=23;PP=557;ReadPosRankSum=-0.428;SC=AATTTCATGAACTCAATCCAT;SOR=0.809;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=73;TCF=24;TCR=49;TR=33;WE=13866458;WS=13866440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,35:0.41:86
chr5	13868103	rs35398031	TA	T	271.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=141;ReadPosRankSum=0.793;SC=ATAAGATTCCTAAAAAAAAAT;SOR=0.976;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=8;WE=13868111;WS=13868093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr5	13871925	rs10513159	A	G	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.108;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.392;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=105;ReadPosRankSum=1.359;SC=TGAAAGGCACAATGATATAAG;SOR=0.238;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=7;WE=13871933;WS=13871915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr5	13876664	rs1445804	T	C	1061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=6;PP=763;SC=GCTGAGCACATACAAGATGCT;SOR=2.712;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=34;WE=13876672;WS=13876654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	13876985	rs9312851	G	C	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.335;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=185;ReadPosRankSum=1.922;SC=GTACTTTCAGGAGATGAGGAT;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=8;WE=13876993;WS=13876975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr5	13882841	rs10057007	A	G	385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=287;ReadPosRankSum=1.022;SC=ATTTACCTTGAAGTTCATTTT;SOR=0.582;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=33;TCR=12;TR=18;WE=13882849;WS=13882831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,18:0.40:45
chr5	13894894	rs4701997	T	A	6614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=127;PP=2965;SC=GCAGCAGGTATTTTTGACTTC;SOR=1.015;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=221;TCF=94;TCR=127;TR=221;WE=13894902;WS=13894884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr5	13911405	rs3765045	G	T	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.490;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=10;PP=355;ReadPosRankSum=-0.437;SC=AGATACCTCTGCCTTCTGATT;SOR=0.361;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=61;TCF=44;TCR=17;TR=29;WE=13911413;WS=13911395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,31:0.45:69
chr5	13911704	rs67065537	A	T	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-3.224;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=96;ReadPosRankSum=0.076;SC=TTGCCAGAAAAAAAATAAGTT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=6;WE=13911712;WS=13911694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr5	13919255	rs35925547	T	G	969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.722;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=17;PP=523;ReadPosRankSum=0.667;SC=TTATTCCCATTTCACAAGGCA;SOR=0.507;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=79;TCF=49;TCR=30;TR=42;WE=13919263;WS=13919245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,48:0.53:90
chr5	13928085	rs12659700	T	C	934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=15;PP=535;ReadPosRankSum=-0.257;SC=CACACACGCATCTCCCTCCCG;SOR=0.675;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=56;TCR=31;TR=42;WE=13928093;WS=13928075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,47:0.48:97
chr5	13944512	rs339445	A	C	4177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=68;PP=2579;SC=GAGTGACGCTATGCTTCCAGA;SOR=0.789;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=137;TCF=69;TCR=68;TR=137;WE=13944520;WS=13944502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr5	14183866	rs354302	T	C	89.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=0;PP=49;SC=AGGGAAGGCATGCGGCCGCAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=14183874;WS=14183856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	14183979	rs71597901	CAG	C	1942.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=16;PP=1377;SC=TAACCTTTGGCAGATAGTGAC;SOR=1.364;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=30;TCF=13;TCR=17;TR=29;WE=14183988;WS=14183969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr5	14184022	rs354301	G	A	1643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=26;PP=1051;SC=CGTGGTAACCGTTTTTTAAAA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=29;TCR=26;TR=55;WE=14184030;WS=14184012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr5	14184079	rs354300	G	A	2444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=32;PP=1241;SC=GTAAGGATGTGTCCCAGACTT;SOR=0.715;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=43;TCR=32;TR=75;WE=14184087;WS=14184069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr5	14184116	rs16903264	C	T	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.799;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=13;PP=339;ReadPosRankSum=0.713;SC=TATTTTGGCTCTCTGATGTGT;SOR=0.605;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=79;TCF=48;TCR=31;TR=29;WE=14184124;WS=14184106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,32:0.34:95
chr5	14184211	rs354299	T	C	880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=21;PP=656;SC=ACAGAGAATGTTGTGTGTTTG;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=10;TCR=21;TR=31;WE=14184219;WS=14184201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	14184254	rs354298	A	G	476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=15;PP=394;SC=TAAAAATCCAACCGGCTAGTA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=14184262;WS=14184244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	14316642	rs55920001	G	A	1153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.729;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=19;PP=662;ReadPosRankSum=-0.466;SC=ATGGGAAGTCGCTCCTTGACA;SOR=0.606;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=95;TCF=62;TCR=33;TR=49;WE=14316650;WS=14316632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,55:0.51:108
chr5	14330940	rs2277045	T	C	2519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.412;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=49;PP=1365;ReadPosRankSum=-0.691;SC=AACATACAGGTGTGGGGAAAT;SOR=0.806;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=263;TCF=144;TCR=119;TR=114;WE=14330948;WS=14330930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,128:0.44:291
chr5	14366840	rs30784	T	C	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=237;ReadPosRankSum=-0.613;SC=TTTAGGATGATGAAGGCATCA;SOR=2.049;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=12;WE=14366848;WS=14366830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr5	14378068	rs30770	T	G	1109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.425;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=16;PP=608;ReadPosRankSum=-0.275;SC=AATTTCGCGGTTGTTTTAATT;SOR=0.941;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=102;TCF=64;TCR=38;TR=47;WE=14378076;WS=14378058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,54:0.47:115
chr5	14390989	rs369439579	CT	C	52.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.15;ReadPosRankSum=-0.760;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,10:0.22:46
chr5	14420027	rs30612	A	C	5462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=83;PP=2965;SC=TGGTGCGGACAACTGACCGCT;SOR=0.745;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=176;TCF=93;TCR=83;TR=176;WE=14420035;WS=14420017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr5	14461027	.	C	G	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.869;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=2;PP=315;ReadPosRankSum=1.221;SC=ACGAGGCATCCAGGCCCACTG;SOR=0.641;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=43;TCF=39;TCR=4;TR=23;WE=14461035;WS=14461017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,26:0.57:46
chr5	14462816	rs27100	C	T	3065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=66;NR=36;PP=1797;SC=TGGTCCACGTCTGTGAACTGG;SOR=1.074;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=66;TCR=36;TR=102;WE=14462824;WS=14462806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr5	14472626	rs26186	T	C	1446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=6;PP=1166;SC=GGAGTCCATCTTGACCAGGAG;SOR=3.564;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=40;TCR=6;TR=46;WE=14472634;WS=14472616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr5	14479938	rs26173	G	A	787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.832;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=16;PP=356;ReadPosRankSum=-0.684;SC=TTTACTGCCAGTGTTGTAGTC;SOR=0.387;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=93;TCF=59;TCR=34;TR=38;WE=14479946;WS=14479928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,43:0.42:103
chr5	14509487	rs150510776	T	TTG	305.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=128;ReadPosRankSum=-0.247;SC=CTTTATGGTTTTGTGTGTGTG;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=6;WE=14509503;WS=14509477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr5	14610184	rs25960	C	G	2201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=24;PP=1230;SC=ACACTTCCCCCCACCGTGGCG;SOR=1.259;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=77;TCF=53;TCR=24;TR=76;WE=14610192;WS=14610174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr5	14664821	rs250435	G	A	388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=9;NR=5;PP=222;SC=CGCTCTGCGGGCCCTCGGAAA;SOR=1.112;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=9;TCR=5;TR=14;WE=14664829;WS=14664811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	14678996	rs31930	G	A	329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=10;PP=243;SC=TATAGACGTTGTTATTGGTGT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=14679004;WS=14678986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	14741984	rs2288474	T	C	2249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.576;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=62;PP=1275;ReadPosRankSum=-0.261;SC=TGATGTGGGCTGCCGTGACTG;SOR=1.257;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=214;TCF=92;TCR=122;TR=98;WE=14741992;WS=14741974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,110:0.46:241
chr5	14745814	rs35971379	G	A	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=24;ReadPosRankSum=0.333;SC=ACTTGCCCCTGTTATTTTCTG;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=5;WE=14745822;WS=14745804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr5	14746183	rs111650250	C	T	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.361;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=68;ReadPosRankSum=-0.654;SC=GGACAGAGCCCGCTACACTGG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=5;WE=14746191;WS=14746173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr5	14749551	rs697569	T	C	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=157;ReadPosRankSum=-1.084;SC=TAAGGAAAAGTGTCTGTAGAC;SOR=0.223;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=12;WE=14749559;WS=14749541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr5	14751055	rs16903692	G	T	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=166;ReadPosRankSum=0.363;SC=TTGGCCTCTGGGTATGACATC;SOR=0.818;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=11;WE=14751063;WS=14751045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr5	14751399	rs697570	CT	TC	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.882;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=435;ReadPosRankSum=1.025;SC=CGGGAACCGACTGACAGAAGC;SOR=1.585;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=11;WE=14751408;WS=14751389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr5	14769103	rs17251667	G	A	1543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.395;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=20;PP=833;ReadPosRankSum=-0.021;SC=TGTGAAAGACGGCAGCGATGG;SOR=0.875;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=123;TCF=80;TCR=43;TR=64;WE=14769111;WS=14769093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,74:0.54:136
chr5	14871620	rs139106733	AGGGGCGAC	A	91.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.728;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.020;NF=1;NR=3;PP=277;ReadPosRankSum=-0.312;SC=CGGGGAGGCGAGGGGCGACGG;SOR=0.446;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=4;WE=14871635;WS=14871610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
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chr5	15935149	rs78784383	G	A	1210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-3.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.293;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=14;PP=765;ReadPosRankSum=-1.124;SC=GATTGGCTCTGAGACCTGGGA;SOR=0.340;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=96;TCF=71;TCR=25;TR=48;WE=15935157;WS=15935139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,55:0.50:111
chr5	16091242	rs11389357	G	GA	259.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.9816;FS=0.000;HP=15;HapScore=3;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=0;NR=14;PP=148;SC=AATTAAAAAAGAAAAAAAAAC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=14;WE=16091250;WS=16091232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	16177807	rs2582666	A	G	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.544;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=4;PP=410;ReadPosRankSum=0.551;SC=AAATTATTTCAGGAAAAATAA;SOR=1.550;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=60;TCF=47;TCR=13;TR=27;WE=16177815;WS=16177797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,29:0.45:64
chr5	16179125	rs342550	C	T	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=185;ReadPosRankSum=2.007;SC=CACCGGCTGCCTCGGGGTCTC;SOR=0.724;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=12;WE=16179133;WS=16179115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr5	16477751	rs162850	C	A	1499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=7;PP=925;SC=AAATAAATGTCTCCAGAAATA;SOR=2.259;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=37;TCR=7;TR=44;WE=16477759;WS=16477741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr5	16478120	rs162849	A	G	1156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.696;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=22;PP=751;ReadPosRankSum=-1.959;SC=ACAGGAACAAATTGAAAACTA;SOR=0.588;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=104;TCF=64;TCR=40;TR=52;WE=16478128;WS=16478110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,55:0.47:116
chr5	16478200	rs162848	G	A	2931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=59;PP=1726;SC=TTTTTTCTTTGTCTGCTTCTG;SOR=0.995;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=47;TCR=59;TR=106;WE=16478208;WS=16478190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr5	16479151	rs6883888	A	G	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.550;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=153;ReadPosRankSum=1.913;SC=AAGGCTACGTACATTTCAGTA;SOR=0.352;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=25;TCF=9;TCR=16;TR=14;WE=16479159;WS=16479141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr5	16479220	rs33692	A	G	137.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=4;PP=79;SC=GGGAAATGCCATTGTGAAATA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=16479228;WS=16479210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr5	16481185	rs16868675	A	G	2456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=2.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=61;PP=1530;ReadPosRankSum=-0.518;SC=TGCACACACTACAGACCAGGA;SOR=0.722;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=222;TCF=92;TCR=130;TR=105;WE=16481193;WS=16481175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,118:0.45:261
chr5	16508674	rs332811	A	G	3988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=43;PP=2433;SC=ACGTACGTATATATCACAATT;SOR=1.357;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=127;TCF=84;TCR=43;TR=127;WE=16508682;WS=16508664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr5	16508898	rs33684	T	C	2492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=62;PP=1581;SC=CTCAGAAAGTTGGTGTTTACA;SOR=2.085;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=24;TCR=62;TR=86;WE=16508906;WS=16508888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr5	16617099	rs35003	A	G	318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=7;PP=170;SC=GTGCTTCCAGACAGGGACGGG;SOR=1.179;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=11;WE=16617107;WS=16617089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	16666796	rs55999327	C	T	1227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=20;PP=768;ReadPosRankSum=0.302;SC=GGCTCTGTCCCGCCTTCACCT;SOR=0.660;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=125;TCF=81;TCR=44;TR=57;WE=16666804;WS=16666786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,59:0.47:125
chr5	16667003	rs26743	C	T	2342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=52;PP=1468;SC=CTCCCGTAGCCTTCCATGCTA;SOR=2.010;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=21;TCR=52;TR=73;WE=16667011;WS=16666993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr5	16667065	rs33273	C	G	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=37;ReadPosRankSum=-1.253;SC=CTTTCACCTTCCTCATCAGGG;SOR=0.188;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=4;WE=16667073;WS=16667055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr5	16668256	rs35579	A	G	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=331;ReadPosRankSum=-1.479;SC=GGACCACCACACTGTATTTTC;SOR=1.002;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=40;TCF=36;TCR=4;TR=21;WE=16668264;WS=16668246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,22:0.56:39
chr5	16670618	rs27431	C	T	652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=2;PP=493;SC=CCCCAACACACGGCAGCCAGT;SOR=3.352;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=16670626;WS=16670608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	16673975	rs25901	C	G	1970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.518;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=47;PP=1154;ReadPosRankSum=0.434;SC=TTCCATCTCGCTTCCTGGAAA;SOR=0.738;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=179;TCF=81;TCR=98;TR=86;WE=16673983;WS=16673965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,96:0.48:201
chr5	16676103	rs28057	T	C	1093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.765;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=14;PP=497;ReadPosRankSum=-0.427;SC=AGTGGAATCATGGTCTCTGAG;SOR=0.851;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=86;TCF=56;TCR=30;TR=46;WE=16676111;WS=16676093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,54:0.55:99
chr5	16679914	rs10060411	G	A	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=2.996;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=1;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=592;ReadPosRankSum=0.735;SC=AATTACAGGCGTGAGCCACCG;SOR=2.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=9;WE=16679934;WS=16679904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr5	16679926	rs3217321	G	GC	491.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=1.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.594;HP=2;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=554;ReadPosRankSum=-0.244;SC=GAGCCACCGTGCCGGCCAACC;SOR=1.270;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=11;WE=16679934;WS=16679904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr5	16679966	rs35580	C	T	922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.929;HP=8;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=11;PP=574;ReadPosRankSum=-1.565;SC=AGAAAAAAAACTGAGCTTCAC;SOR=0.567;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=66;TCF=48;TCR=18;TR=36;WE=16679974;WS=16679956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,42:0.54:78
chr5	16681966	rs399833	G	A	2009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=36;PP=1154;ReadPosRankSum=0.599;SC=CGAGGAAGCAGGGCAGGCAGT;SOR=0.694;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=179;TCF=102;TCR=77;TR=83;WE=16681974;WS=16681956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,94:0.46:205
chr5	16711365	rs3214558	CA	C	2079.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.121;HP=10;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=50;PP=657;ReadPosRankSum=1.205;SC=CTAAACCATGCAAAAAAAAAA;SOR=0.468;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=99;TCF=13;TCR=86;TR=57;WE=16711374;WS=16711355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,103:0.64:161
chr5	16711451	rs27552	G	T	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.048;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=20;PP=499;ReadPosRankSum=-0.183;SC=GGTTTACCCCGCTTCAAAACA;SOR=0.276;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=47;TCF=14;TCR=33;TR=31;WE=16711459;WS=16711441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,32:0.68:47
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chr5	16762646	rs31511	T	C	3504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=48;PP=1815;SC=TTGCAGGTTTTGACATACCGC;SOR=0.949;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=63;TCR=48;TR=111;WE=16762654;WS=16762636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr5	16764255	rs375881422	CA	C	575.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=3;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=311;SC=GACTCCTTCTCAAAAAAAAAA;SOR=2.303;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=47;TCF=36;TCR=11;TR=21;WE=16764275;WS=16764245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,26:0.96:27
chr5	16764334	rs250341	C	T	5841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=125;NR=81;PP=2965;SC=AGAGAATTCACGTGCTGCACT;SOR=1.153;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=206;TCF=125;TCR=81;TR=206;WE=16764342;WS=16764324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr5	16766093	rs2561232	C	T	4011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=49;PP=2439;SC=ATTACAGTTACAACTGTTATT;SOR=1.546;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=138;TCF=88;TCR=50;TR=137;WE=16766101;WS=16766083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr5	16783437	rs71595983	T	TAAAC	8464.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=46;PP=2970;SC=AGAAAATCAATAAATACCTGC;SOR=1.458;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=111;TCF=59;TCR=52;TR=95;WE=16783445;WS=16783427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr5	16794916	rs396514	G	A	3449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=57;PP=2269;SC=AGGGGTTCACGGAGGCCAGGA;SOR=0.790;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=121;TCF=64;TCR=57;TR=121;WE=16794924;WS=16794906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr5	16795027	rs35681033	CA	C	2976.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=41;PP=1856;SC=GAGTGTGCGCCAGGGGGAAAG;SOR=1.193;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=3;TCR=42;TR=44;WE=16795035;WS=16795017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr5	16818363	rs12188582	A	G	567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=16;PP=407;SC=ATACAATCTCAGTATAATTTC;SOR=1.931;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=22;WE=16818371;WS=16818353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr5	17276053	rs59080603	CCT	C	185.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.180;NF=0;NR=6;PP=245;ReadPosRankSum=0.792;SC=AAAACAATCTCCTCTCTCTCT;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=6;WE=17276062;WS=17276043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr5	19520932	rs441865	T	C	3313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=72;PP=2320;SC=ATGCACACTTTAGAGGCTCGG;SOR=1.672;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=37;TCR=72;TR=109;WE=19520940;WS=19520922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr5	19544181	rs41270337	G	C	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=108;ReadPosRankSum=-0.892;SC=ACCAAGGAAAGTATTATATCT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=19544189;WS=19544171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr5	19721490	rs12187552	T	C	7565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.152;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=125;NR=123;PP=2965;ReadPosRankSum=0.226;SC=AGGGTTGTCCTTGGAGAATGC;SOR=0.338;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=249;TCF=126;TCR=123;TR=248;WE=19721498;WS=19721480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,280:1.00:281
chr5	21751715	rs10657805	C	CAGAA	184.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=145;ReadPosRankSum=0.805;SC=AATCTTGTCCCAGAGTGTGTG;SOR=0.260;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=4;WE=21751723;WS=21751705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr5	21751741	rs370990145	T	TTGTGTGTGTG	133.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=5.557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQRankSum=-1.561;QD=5.14;ReadPosRankSum=-0.839;SOR=2.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,7:0.27:26
chr5	21752050	rs6451992	A	G	3539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FS=4.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.63;ReadPosRankSum=1.257;SOR=0.458;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:146,96:0.40:242
chr5	21752056	rs6451993	A	G	3506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FS=3.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.31;ReadPosRankSum=1.208;SOR=0.507;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:148,97:0.40:245
chr5	21760602	rs2303748	C	A	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=314;ReadPosRankSum=0.316;SC=AGTATTGATTCCTCCCTTTGT;SOR=0.880;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=17;WE=21760610;WS=21760592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,20:0.54:37
chr5	21802662	rs6897177	C	T	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=67;ReadPosRankSum=0.674;SC=TTCTTAATAACTAGTGGGTAA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=21802670;WS=21802652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr5	23522372	rs62342744	C	T	1160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=17;PP=773;ReadPosRankSum=-0.354;SC=GACAAACACCCCAGATTCCCA;SOR=0.641;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=88;TCF=57;TCR=31;TR=47;WE=23522380;WS=23522362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,50:0.55:91
chr5	23523348	rs1874165	C	T	5753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=88;PP=2965;SC=TAAAATAATTCTTCTGATTTT;SOR=0.712;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=187;TCF=99;TCR=88;TR=187;WE=23523356;WS=23523338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr5	23527777	rs113958470	C	T	1293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=2.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.270;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-0.265;NF=28;NR=34;PP=837;ReadPosRankSum=-0.067;SC=AGAAGCCCTACGTCTGCAGGG;SOR=0.823;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=147;TCF=69;TCR=78;TR=62;WE=23527785;WS=23527767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,65:0.41:158
chr5	23527919	rs2099081	A	G	1131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=25;PP=744;SC=ATAGCCACAAAAAGACAAATG;SOR=1.501;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=14;TCR=25;TR=39;WE=23527927;WS=23527909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr5	23975952	rs10037197	G	C	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=-2.297;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=76;ReadPosRankSum=-0.191;SC=TGCTGTTGTTGTAACAATACA;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=5;WE=23975960;WS=23975942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr5	23976115	rs1501940	G	A	1630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.586;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=32;PP=848;ReadPosRankSum=0.134;SC=GTTGCAGTCCGTAGGCACTTG;SOR=0.637;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=135;TCF=77;TCR=58;TR=71;WE=23976123;WS=23976105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,81:0.52:156
chr5	24509947	rs3797171	C	A	714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=20;PP=582;SC=AAAAATAAATCATCAAATTAG;SOR=2.925;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=25;WE=24509955;WS=24509937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
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chr5	25190830	rs115205484	G	C	741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=13;PP=342;ReadPosRankSum=-1.368;SC=GGGTTTCGTCGAGGCCCAGCA;SOR=0.666;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=99;TCF=57;TCR=42;TR=36;WE=25190838;WS=25190820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,43:0.35:124
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chr5	26886303	.	C	G	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.090;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=74;ReadPosRankSum=0.319;SC=GAAAACAAAGCAAGAAAACAA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=26886311;WS=26886293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr5	26889902	rs13190383	A	C	484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=1;PP=424;SC=TGACTTTGTAAAGAGAAAATA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=26889910;WS=26889892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	26905920	rs5866810	GT	G	106.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=74;ReadPosRankSum=-0.200;SC=GGGAAATTGTGTTTTTTTTTT;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=7;WE=26905928;WS=26905910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr5	26988328	rs2288466	G	A	1047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=28;PP=609;ReadPosRankSum=1.026;SC=TGTCAGACCCGCTATCTTTTT;SOR=0.750;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=50;TCR=72;TR=48;WE=26988336;WS=26988318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,53:0.40:132
chr5	26988424	rs2288467	T	C	864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=19;PP=558;ReadPosRankSum=0.052;SC=TAATGGTATATAATGGTAAGT;SOR=0.828;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=57;TCF=27;TCR=30;TR=35;WE=26988432;WS=26988414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,38:0.60:63
chr5	31322851	rs2962790	A	G	1812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=19;PP=1198;SC=ATTTGAGCACAGTGTTTCTTC;SOR=1.712;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=46;TCR=19;TR=65;WE=31322859;WS=31322841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr5	31401447	rs10719	A	G	6704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=142;NR=92;PP=2965;SC=AGCACACTTCATTCATTGTCT;SOR=1.117;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=234;TCF=142;TCR=92;TR=234;WE=31401455;WS=31401437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
chr5	31472087	rs6885959	T	A	1385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.457;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=17;PP=982;ReadPosRankSum=0.383;SC=ACTTTTAAAATGTGCTGTTAC;SOR=0.983;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=118;TCF=81;TCR=37;TR=60;WE=31472095;WS=31472077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,63:0.51:124
chr5	31472117	rs3763075	G	C	2151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=38;PP=1327;ReadPosRankSum=-0.637;SC=GAAACATTCAGATCTGGAAAA;SOR=0.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=181;TCF=106;TCR=75;TR=93;WE=31472125;WS=31472107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,102:0.53:194
chr5	31483596	rs10052174	G	A	1661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.384;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=28;PP=1064;ReadPosRankSum=0.036;SC=AGACTGAAAGGAAAATGGCAA;SOR=0.358;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=133;TCF=88;TCR=45;TR=73;WE=31483604;WS=31483586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,75:0.54:139
chr5	31485152	rs76723306	C	T	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.939;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=11;PP=220;ReadPosRankSum=-0.649;SC=TGTCAAGTGTCTTTAAAAGTG;SOR=0.546;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=60;TCF=25;TCR=35;TR=21;WE=31485160;WS=31485142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,29:0.42:69
chr5	31485230	rs7712436	T	C	414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=15;PP=338;SC=TAGTTTCAGATGGAAATGAAA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=31485238;WS=31485220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	31486540	rs7735863	A	G	2865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=56;PP=1779;ReadPosRankSum=-0.673;SC=TTAAAATAGTAGTATGGAACA;SOR=0.708;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=229;TCF=127;TCR=102;TR=126;WE=31486548;WS=31486530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,137:0.48:288
chr5	31486578	rs72552345	C	CT	5866.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=0.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.848;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=49;PP=2840;ReadPosRankSum=1.570;SC=CATCAAACCACACACAATCTT;SOR=0.589;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=158;TCF=46;TCR=112;TR=71;WE=31486586;WS=31486568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,170:0.53:318
chr5	31508933	rs56327412	G	GT	260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=4.260;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.30;ReadPosRankSum=-1.532;SOR=1.284;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,15:0.94:16
chr5	31515373	rs7730136	C	T	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.580;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=220;ReadPosRankSum=0.945;SC=TACTCTTCCACTGTAAAAACT;SOR=0.870;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=21;TCF=10;TCR=11;TR=11;WE=31515381;WS=31515363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr5	31515657	rs55656741	G	A	602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.923;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=14;PP=308;ReadPosRankSum=0.640;SC=AGGAACAACCGATAAACCGTA;SOR=0.579;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=59;TCF=27;TCR=32;TR=27;WE=31515665;WS=31515647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,31:0.46:67
chr5	31529299	rs6859527	A	G	651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.74;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	31529306	rs6450850	T	C	581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=48.48;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	31532429	rs2291109	A	T	1391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=33;NR=10;PP=823;SC=GCTGGCCGGGATGAGGCGCCG;SOR=1.893;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=43;WE=31532437;WS=31532419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr5	31532685	rs6877568	C	A	978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.833;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=23;PP=535;ReadPosRankSum=0.423;SC=AGAGAGTTAACCAGAGTTAAA;SOR=0.804;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=73;TCF=30;TCR=43;TR=39;WE=31532693;WS=31532675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,46:0.55:84
chr5	31538249	rs10071110	C	T	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.16;ReadPosRankSum=-1.973;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr5	31538692	rs17410000	A	C	2993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.143;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=70;PP=1877;ReadPosRankSum=1.905;SC=TGCTGCCAGCACTGGGGAAAT;SOR=0.526;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=274;TCF=118;TCR=156;TR=127;WE=31538700;WS=31538682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,145:0.48:304
chr5	31541142	rs17410035	G	T	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.288;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=272;ReadPosRankSum=-2.348;SC=GTTTCTTTGGGGTTTTATTCA;SOR=1.101;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=67;TCF=31;TCR=36;TR=24;WE=31541150;WS=31541132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,26:0.37:70
chr5	31799371	rs116598198	G	A	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.638;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=130;ReadPosRankSum=0.004;SC=CATCACCCAGGACAATGCCGT;SOR=0.223;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=8;WE=31799379;WS=31799361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr5	32000483	rs10054504	T	C	1023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=27;PP=814;SC=TGTGCACTTGTACGTTTGCCT;SOR=3.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=30;WE=32000491;WS=32000473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	32037569	rs923834	A	T	459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=425;SC=AATCATTTTTACCTTGGATGG;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=32037577;WS=32037559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	32054092	rs149414	C	G	387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=11;PP=308;SC=TAGTAGACCTCGGCGGAATCT;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=32054100;WS=32054082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	32057651	rs161545	G	A	602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=2;PP=444;SC=GTTATTTTATGTGGTAGTAAA;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=32057659;WS=32057641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	32058115	rs151861	A	G	5846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.448;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=98;PP=2965;ReadPosRankSum=0.182;SC=GGGGAGCCTCAGCGGGAGGTT;SOR=0.556;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=189;TCF=91;TCR=98;TR=188;WE=32058123;WS=32058093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,218:1.00:219
chr5	32060985	rs35665699	T	TATC	1042.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=1;PP=1162;SC=CGGGAAAAGATATGAGCTTCT;SOR=4.977;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=21;WE=32060993;WS=32060975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr5	32069863	rs79743260	T	C	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.114;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=155;ReadPosRankSum=0.109;SC=AATTATCAGGTTTGGCAAAAG;SOR=0.193;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=10;WE=32069871;WS=32069853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr5	32069910	rs6862076	T	C	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=113;ReadPosRankSum=0.009;SC=CTCTTGGCTGTTAGTTTTGAT;SOR=0.180;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=8;WE=32069918;WS=32069900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr5	32071404	rs77759732	C	T	2851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=50;PP=1683;ReadPosRankSum=1.069;SC=CTGTGTTTGCCGCCTCCTTTT;SOR=0.700;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=244;TCF=143;TCR=101;TR=120;WE=32071412;WS=32071394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,135:0.49:274
chr5	32074173	rs79901850	G	A	4057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=394;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.209;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=93;PP=2418;ReadPosRankSum=-0.661;SC=CACTCCCAGGGGCCCTCCCGG;SOR=0.759;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=355;TCF=182;TCR=173;TR=178;WE=32074181;WS=32074163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:196,197:0.50:393
chr5	32074392	rs2291114	G	A	2802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.839;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=55;PP=1837;ReadPosRankSum=-0.737;SC=CCAACCTCACGGACTCTGCAG;SOR=0.502;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=276;TCF=156;TCR=120;TR=120;WE=32074400;WS=32074382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,133:0.44:299
chr5	32087228	rs157494	C	T	599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.131;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=401;ReadPosRankSum=1.364;SC=GTTTACGTTCCCCACGTAGAA;SOR=1.688;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=22;WE=32087236;WS=32087218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,24:0.52:46
chr5	32087253	rs157495	A	G	978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=15;PP=621;ReadPosRankSum=-1.358;SC=ACAGCTCCTCAGACCTCATCT;SOR=0.638;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=47;TCR=23;TR=45;WE=32087261;WS=32087243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,48:0.63:76
chr5	32087326	rs3101878	C	A	2134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.481;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=40;PP=1458;ReadPosRankSum=0.436;SC=AGACACAGGGCAAGTCAGTCG;SOR=0.466;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=164;TCF=98;TCR=66;TR=90;WE=32087334;WS=32087316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,95:0.53:178
chr5	32087374	rs157496	A	G	2381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.910;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=41;PP=1495;ReadPosRankSum=-1.721;SC=GCCCAGGGTCACCAAGTGCAA;SOR=0.473;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=197;TCF=125;TCR=72;TR=101;WE=32087382;WS=32087364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,113:0.51:220
chr5	32087430	rs3135427	G	A	3612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=361;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.790;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=74;PP=2242;ReadPosRankSum=1.010;SC=GCCCCTCCCCGGGGGAGAAAG;SOR=0.559;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=320;TCF=175;TCR=145;TR=153;WE=32087438;WS=32087420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:186,174:0.48:360
chr5	32087802	rs157497	A	G	2386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.924;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=52;PP=1601;ReadPosRankSum=2.236;SC=ACTGCTGCCCAGGGGGGAGTA;SOR=0.661;SbPval=0.51;Source=Platypus;TCF=127;TR=109;WE=32087810;WS=32087792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,119:0.43:275
chr5	32088500	rs3101873	C	T	3289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.368;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=59;PP=2168;ReadPosRankSum=0.286;SC=CGTGAGAAGGCCGCCTGCTTG;SOR=0.849;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=302;TCF=168;TCR=134;TR=142;WE=32088508;WS=32088490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,154:0.47:330
chr5	32101168	rs2279232	A	T	5588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=106;NR=81;PP=2965;SC=TGGCATGATGAACAACCCTGT;SOR=0.856;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=187;TCF=106;TCR=81;TR=187;WE=32101176;WS=32101158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr5	32135599	rs161539	G	A	1933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=16;PP=1253;SC=GCTATTTTGTGTAGGTTCCTT;SOR=2.269;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=46;TCR=16;TR=62;WE=32135607;WS=32135589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr5	32242381	rs7729256	G	T	71.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=17.76;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	32248077	rs11960898	C	T	2449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.475;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=44;PP=1348;ReadPosRankSum=-0.345;SC=CCCCATATAACACAAAAGTTT;SOR=0.932;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=228;TCF=123;TCR=105;TR=106;WE=32248085;WS=32248067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,119:0.47:253
chr5	32263099	rs61418287	G	T	1419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=12;PP=970;SC=CTTTTTGGGAGGATGAAAATG;SOR=2.256;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=34;TCR=12;TR=46;WE=32263107;WS=32263089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr5	32270747	rs59928961	C	G	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=4.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=172;ReadPosRankSum=-0.481;SC=ATGATACACACGCATGCTTTA;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=9;WE=32270755;WS=32270737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr5	32276634	rs57425852	T	C	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=102;ReadPosRankSum=-1.294;SC=TGTGTAGTTATTGAACTACAA;SOR=0.859;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=7;WE=32276642;WS=32276624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr5	32379210	rs1862636	G	A	5689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=113;NR=77;PP=2965;SC=ATACAGTTACGTACTACTTAC;SOR=1.022;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=190;TCF=113;TCR=77;TR=190;WE=32379218;WS=32379200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr5	32388471	rs889318	T	C	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=536;ReadPosRankSum=0.282;SC=TTAAAACACATAGAACTCACA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=10;WE=32388493;WS=32388461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr5	32388485	rs3811972	G	C	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=425;ReadPosRankSum=0.982;SC=ACTCACACCAGAGTTACCAGT;SOR=0.836;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=12;WE=32388493;WS=32388461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr5	32400266	rs1051489	A	G	1282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.554;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=39;PP=896;ReadPosRankSum=-1.804;SC=GGTTCCTTTTATGTCTTCTGC;SOR=0.878;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=111;TCF=39;TCR=72;TR=57;WE=32400274;WS=32400256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,59:0.49:120
chr5	32403346	rs4867440	C	T	8663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.03;NF=150;NR=143;PP=2965;SC=GACGTTGCAACTGATGACGTA;SOR=0.763;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=293;TCF=150;TCR=143;TR=293;WE=32403354;WS=32403336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,323:1.00:323
chr5	32415360	rs5867145	TA	T	1407.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=31;PP=1116;SC=CCAGTATCCTTAAAAAGCTGG;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=31;WE=32415368;WS=32415350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr5	32417694	rs178935	G	A	2693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=33;PP=1616;SC=TTCATTAAACGCAGTAAGTCA;SOR=1.261;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=57;TCR=33;TR=90;WE=32417702;WS=32417684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
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chr5	32444199	rs2922295	C	G	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.853;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=126;ReadPosRankSum=0.000;SC=GAGAGGCCGCCGGGCTGGGCC;SOR=2.147;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=10;WE=32444207;WS=32444197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr5	32444286	rs183443	A	G	1297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.61;ReadPosRankSum=1.518;SOR=0.701;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,65:0.48:135
chr5	32522994	rs17439827	A	G	1557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.483;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=26;PP=1034;ReadPosRankSum=-1.173;SC=GATTACGCCAACTCGGATCCA;SOR=0.536;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=109;TCF=67;TCR=42;TR=64;WE=32523002;WS=32522984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,70:0.57:122
chr5	32523298	rs687659	T	A	1231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.528;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-6.156;NF=27;NR=30;PP=872;ReadPosRankSum=-2.751;SC=CTCCTATATCTGTCCTGAGGA;SOR=0.738;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=129;TCF=68;TCR=61;TR=57;WE=32523306;WS=32523288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,58:0.43:134
chr5	32523343	rs2457151	C	T	4657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=77;PP=2965;SC=TAAGAATGCTCGGACTGTCAC;SOR=0.781;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=160;TCF=83;TCR=77;TR=160;WE=32523351;WS=32523333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr5	32710896	rs116399912	G	A	2494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.71;ReadPosRankSum=0.203;SOR=0.708;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,122:0.52:233
chr5	32725072	rs1147224	T	C	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.269;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=217;ReadPosRankSum=1.593;SC=GAATCATGTCTTTTGCAGCAA;SOR=0.276;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=12;WE=32725080;WS=32725062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr5	32775047	rs1173743	G	T	2012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=49;PP=1410;SC=CCTTTCCAGCGTCTTGCTTTT;SOR=2.269;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=17;TCR=49;TR=66;WE=32775055;WS=32775037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr5	32784776	rs2246427	A	G	896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.661;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=7;PP=573;ReadPosRankSum=0.415;SC=CCCTTAGAAAATATTTCTGAA;SOR=1.312;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=76;TCF=55;TCR=21;TR=34;WE=32784784;WS=32784766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,39:0.45:86
chr5	32786389	rs2270915	A	G	2885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.173;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.070;NF=76;NR=41;PP=1861;ReadPosRankSum=1.680;SC=AGAAGAAAGTAACCTTGGAAA;SOR=1.146;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=224;TCF=135;TCR=89;TR=117;WE=32786397;WS=32786379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,128:0.53:243
chr5	32786465	.	C	CT	173.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.429;ClippingRankSum=0.000;DP=237;ExcessHet=3.0103;FS=2.490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQRankSum=0.000;QD=0.88;ReadPosRankSum=0.227;SOR=0.943;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:166,32:0.16:198
chr5	32789852	rs1173756	T	C	8960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=347;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.283;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=147;NR=167;PP=2965;ReadPosRankSum=0.572;SC=CAGTCAACAATGAGATGAAGG;SOR=0.432;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=315;TCF=148;TCR=167;TR=314;WE=32789860;WS=32789842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,344:1.00:345
chr5	33441124	rs2304621	C	G	843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.376;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=8;PP=454;ReadPosRankSum=-0.693;SC=GCCCACCTCCCACCCGCCTCT;SOR=1.214;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=64;TCF=45;TCR=19;TR=33;WE=33441132;WS=33441114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,41:0.55:74
chr5	33441403	rs55759090	A	C	212.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=6;PP=131;SC=GAAAGTCGGAACCCCCTTTGG;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=33441411;WS=33441393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	33448962	rs5867190	A	AT	1088.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=32;PP=1312;SC=AATCTGTTTAATTTGCCTACT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=32;WE=33448970;WS=33448952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr5	33452643	rs73074385	A	G	603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.988;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=15;PP=304;ReadPosRankSum=-0.796;SC=GTGCTCTGATATTTCATCACT;SOR=0.456;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=73;TCF=28;TCR=45;TR=28;WE=33452651;WS=33452633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,32:0.40:80
chr5	33455616	rs6880623	A	G	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.744;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.34;ReadPosRankSum=-0.076;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr5	33455943	rs55749081	AT	A	684.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQRankSum=0.917;QD=12.45;ReadPosRankSum=-2.615;SOR=0.877;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,31:0.56:55
chr5	33456210	rs3765144	A	G	738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.391;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=20;PP=454;ReadPosRankSum=-0.452;SC=TCTGGTATGTATGTCATTTTG;SOR=1.189;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=85;TCF=40;TCR=45;TR=33;WE=33456218;WS=33456200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,36:0.40:91
chr5	33457535	rs2270903	T	A	4331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=85;PP=2522;SC=TGATGTGTCTTGACTGAGTTT;SOR=1.506;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=49;TCR=85;TR=134;WE=33457543;WS=33457525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr5	33457618	rs1003000	G	A	492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=15;PP=392;SC=GAGATGTTGTGGCTTTTTAGT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=33457626;WS=33457608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	33458636	rs3765145	G	A	5530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=113;NR=66;PP=2965;SC=TATACGTGACGTACATAAACA;SOR=1.288;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=179;TCF=113;TCR=66;TR=179;WE=33458644;WS=33458626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr5	33458833	rs3765146	T	C	1131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=31;PP=891;SC=TTAAATAAGGTCTACTAAAAG;SOR=4.235;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=34;WE=33458841;WS=33458823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr5	33458881	rs3765147	G	A	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=23;ReadPosRankSum=0.475;SC=TATATAAGACGATAAGTAAAA;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=3;WE=33458889;WS=33458871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr5	33460949	rs58771215	A	G	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.240;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=266;ReadPosRankSum=0.034;SC=AATTAAATATAGCATTACAGA;SOR=0.478;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=40;TCF=32;TCR=8;TR=19;WE=33460957;WS=33460939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,23:0.49:47
chr5	33461226	rs2270904	A	G	1138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=0.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.65;ReadPosRankSum=-1.514;SOR=0.640;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,57:0.48:118
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chr5	33596224	rs10461703	C	T	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=24;ReadPosRankSum=0.241;SC=TGCTCATGGTCAGGTGAGGTA;SOR=0.495;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=4;WE=33596232;WS=33596214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
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chr5	33615904	rs10057235	G	A	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-4.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=353;ReadPosRankSum=-1.462;SC=TAGCACACATGTCAGCAGTTT;SOR=0.446;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=43;TCF=38;TCR=5;TR=22;WE=33615912;WS=33615894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,23:0.51:45
chr5	33616311	rs4078398	T	C	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.080;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=254;ReadPosRankSum=0.196;SC=CCACTGGAATTGGCAGAAGCA;SOR=0.138;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=17;WE=33616319;WS=33616301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr5	33630839	rs4260678	A	G	1095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=12;PP=825;ReadPosRankSum=-1.268;SC=AATTAGTAAAAGTCATGATTT;SOR=0.634;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=100;TCF=74;TCR=26;TR=48;WE=33630847;WS=33630829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,48:0.47:102
chr5	33631098	rs79948421	G	A	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=140;ReadPosRankSum=0.944;SC=CCGTACTTAGGACCCCCAAGT;SOR=0.467;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=10;WE=33631106;WS=33631088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,12:0.36:33
chr5	33637596	rs4076945	G	A	1366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=11;PP=979;SC=TAAGCTTTGTGTGGATCACAG;SOR=2.448;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=37;TCR=11;TR=48;WE=33637604;WS=33637586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr5	33637891	rs4076946	C	A	2690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.40;SOR=1.536;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr5	33637899	rs4076947	G	A	2559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.71;SOR=1.302;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr5	33642163	rs60892887	G	A	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=303;ReadPosRankSum=-0.456;SC=CAAGCAAGCCGGCTTTCTACA;SOR=0.716;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=13;TCR=33;TR=21;WE=33642171;WS=33642153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,22:0.47:47
chr5	33643395	rs10066043	A	T	374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=241;SC=TCCCTTAGAGAGAGTTGCCCT;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=33643403;WS=33643386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	33643617	rs4866409	C	T	4136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=68;PP=2291;SC=TCAAAACCTGCCACAAAGCAT;SOR=0.900;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=68;TCR=68;TR=136;WE=33643625;WS=33643607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr5	33648842	rs34079160	GTT	G	412.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=400;SC=TGGATGTTCAGTTATTTCCAA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=8;WE=33648851;WS=33648839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	33648906	rs6870538	G	C	1166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=7;PP=774;SC=CCTGCATATAGCCACCAAGAG;SOR=2.531;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=36;WE=33648914;WS=33648896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr5	33649220	rs4866353	A	G	137.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=6;PP=136;SC=TAGGCCCATCATGGGAGTTAT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=33649228;WS=33649210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr5	33649637	rs4242082	G	A	1277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=16;PP=845;SC=AGGTGAGGGCGTCATGAGACA;SOR=1.378;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=29;TCR=16;TR=45;WE=33649645;WS=33649627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr5	33649807	rs4504387	C	A	4326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=71;PP=2608;SC=CCGAAGCTGGCAGGGAAGAAC;SOR=0.731;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=76;TCR=71;TR=147;WE=33649815;WS=33649797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr5	33649905	rs4621563	G	A	2031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=41;PP=1200;SC=AGACAGCCACGTTTGTACAGA;SOR=1.432;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=25;TCR=41;TR=66;WE=33649913;WS=33649895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr5	33751389	rs5867210	T	TA	307.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5803;FS=2.754;HP=10;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQ=60.57;MQRankSum=0.645;NF=13;NR=4;PP=261;ReadPosRankSum=-1.355;SC=ATGAAGATATTAAAAAAAAAA;SOR=0.207;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=17;WE=33751397;WS=33751379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,15:0.79:19
chr5	33751454	rs1530507	A	T	4080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=87;NR=53;PP=2400;SC=TTAATAAAACAACCAAAAGAA;SOR=1.097;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=87;TCR=53;TR=140;WE=33751462;WS=33751444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr5	33951693	rs16891982	C	G	4408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=66;PP=2785;SC=AGTTGATGCACAAGCCCCAAC;SOR=0.908;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=146;TCF=80;TCR=66;TR=146;WE=33951701;WS=33951683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr5	33954511	rs2287949	T	C	3720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=68;PP=1940;SC=ACAGGAAGGCTGTCCATCCAA;SOR=0.857;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=130;TCF=62;TCR=68;TR=130;WE=33954519;WS=33954501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr5	33963731	rs141348470	AAAC	A	1177.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=1;PP=938;SC=ACAATTAAAAAAACAACAACA;SOR=4.407;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=21;WE=33963741;WS=33963721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr5	33964210	rs183671	T	G	1793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=39;PP=1171;SC=GTGGGAAAACTCCCTGAAGAC;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=19;TCR=39;TR=58;WE=33964218;WS=33964200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
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chr5	33969149	rs11272324	A	ACTCTCTCTCTCTCTCTCT	621.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.64;QD=44.41;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	33988535	rs15612	C	T	545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=20;PP=410;ReadPosRankSum=-0.237;SC=AAACAGGCCCCGAGTTACTGG;SOR=0.941;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=8;TCR=40;TR=24;WE=33988543;WS=33988525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,23:0.49:47
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chr5	33998768	rs34677	C	A	733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=12;PP=520;ReadPosRankSum=-1.335;SC=GCTCGTAGAACTGGGGTTCTA;SOR=0.669;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=74;TCF=47;TCR=27;TR=33;WE=33998776;WS=33998758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,34:0.43:79
chr5	33998883	rs2287939	A	G	4774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=86;NR=80;PP=2691;SC=CCACAGACTCAATTTCTGAGT;SOR=0.714;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=168;TCF=87;TCR=81;TR=166;WE=33998891;WS=33998873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr5	34033670	rs299594	T	C	793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.173;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=23;PP=578;ReadPosRankSum=0.073;SC=CCATTCAGAATAATCCCAAAT;SOR=1.074;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=60;TCF=15;TCR=45;TR=31;WE=34033678;WS=34033660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,32:0.50:64
chr5	34042866	rs112167551	A	AAAC	262.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=2.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.63;MQRankSum=1.315;QD=15.45;ReadPosRankSum=-0.635;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr5	34687911	rs2279604	G	A	2291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=51;PP=1422;SC=TTGCTTTGCCGTGAATTATAT;SOR=1.854;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=23;TCR=51;TR=74;WE=34687919;WS=34687901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr5	34688210	rs142375133	CGACAAA	C	10384.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQ=60.14;NF=33;NR=79;PP=2957;SC=AAAGAGACTTCGACAAAGACA;SOR=0.993;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=122;TCF=39;TCR=83;TR=112;WE=34688223;WS=34688200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr5	34716120	rs1867714	G	A	1310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.73;ReadPosRankSum=1.262;SOR=0.828;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,33:0.47:70
chr5	34716124	rs1867715	A	G	1334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.11;ReadPosRankSum=1.275;SOR=0.947;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,37:0.47:78
chr5	34716270	rs1867716	A	C	1745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.589;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=37;PP=998;ReadPosRankSum=-1.014;SC=TATTATAAAAAATGCACAGAT;SOR=0.778;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=71;TCR=70;TR=74;WE=34716278;WS=34716260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,84:0.53:158
chr5	34795981	rs6897719	C	T	966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.036;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=16;PP=747;ReadPosRankSum=-0.464;SC=GGGGGAAACTCTGTTGGAGAT;SOR=0.478;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=104;TCF=73;TCR=31;TR=49;WE=34795989;WS=34795958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,45:0.45:100
chr5	34807928	rs6895634	C	T	2140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.996;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=40;PP=1223;ReadPosRankSum=1.781;SC=CCGAAAGTGTCGACAGCTCTG;SOR=0.608;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=218;TCF=130;TCR=88;TR=95;WE=34807936;WS=34807918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,105:0.43:246
chr5	34808652	rs111951383	G	A	1324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=26;PP=710;ReadPosRankSum=2.294;SC=GAATAACTGTGTGATTGGCTG;SOR=0.668;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=124;TCF=68;TCR=56;TR=59;WE=34808660;WS=34808642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,67:0.48:139
chr5	34808797	rs113312119	T	C	1260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.843;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=22;PP=609;ReadPosRankSum=-0.452;SC=GAGGTAGACATTGGTTTCTAG;SOR=0.375;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=87;TCF=41;TCR=46;TR=49;WE=34808805;WS=34808787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,60:0.59:101
chr5	34810971	rs111531050	G	A	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=276;ReadPosRankSum=-0.193;SC=ACTCTATAGGGGTACAGAATA;SOR=0.293;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=15;WE=34810979;WS=34810961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr5	34811131	rs35607113	G	A	2142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=44;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.854;SC=GGAATATACCGCTGCTTCTTG;SOR=0.684;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=214;TCF=115;TCR=99;TR=93;WE=34811145;WS=34811121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,108:0.45:239
chr5	34811137	rs2271522	T	G	2679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.994;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=56;PP=2962;ReadPosRankSum=0.439;SC=TACCGCTGCTTCTTGCTGTAC;SOR=0.673;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=214;TCF=113;TCR=101;TR=119;WE=34811145;WS=34811121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,130:0.54:239
chr5	34811794	rs114935797	T	C	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.030;HP=6;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=443;ReadPosRankSum=-0.187;SC=CTTTTCTCTTTTTTTAAGACA;SOR=0.223;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=36;TCF=31;TCR=5;TR=24;WE=34811802;WS=34811784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,26:0.68:38
chr5	34812165	.	G	GA	25	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;FR=0.5000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=2;NR=1;PP=25;QD=13.0;SC=ACATATTCTTGAAAAAAAAAG;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=3;WE=34812173;WS=34812155;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:5,3:0.38:8
chr5	34812408	rs112990724	A	G	534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.178;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=344;ReadPosRankSum=-0.422;SC=TAGTAAAGTAATAAAGACTAT;SOR=0.948;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=48;TCF=15;TCR=33;TR=24;WE=34812416;WS=34812398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,25:0.51:49
chr5	34812489	rs111847320	A	G	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.243;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=69;ReadPosRankSum=0.552;SC=AAAGGTTGCCAGGCCGGGCCG;SOR=0.141;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=6;WE=34812497;WS=34812479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr5	34814900	rs17522675	A	G	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.209;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=65;ReadPosRankSum=0.480;SC=CCTTTTCACCATGAAGTACCC;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=5;WE=34814908;WS=34814890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr5	34818976	rs3884194	GT	G,GTT	1252.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=3.358;HP=12;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=12,12;NR=29,29;PP=339,407;ReadPosRankSum=0.034;SC=GGAAGCATCTGTTTTTTTTTT;SOR=1.410;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=57;TCF=13;TCR=44;TR=41,41;WE=34818984;WS=34818966;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.59,0.31:75
chr5	34821825	rs10461947	C	T	2064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.144;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=37;PP=1322;ReadPosRankSum=1.095;SC=AAATGGCTTTCTCTTTCCCAA;SOR=0.949;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=184;TCF=103;TCR=81;TR=88;WE=34821833;WS=34821815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,98:0.47:210
chr5	34822926	rs7730728	T	C	191.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=152;SC=GTAGCTGGGATCACAGGCGCC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=34822934;WS=34822916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	34824555	rs1048944	G	T	3244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=67;PP=1963;SC=GAAAAGATACGCTGAGAGCTC;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=37;TCR=67;TR=104;WE=34824563;WS=34824545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr5	34830788	rs17523026	C	T	1974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=34;PP=1143;ReadPosRankSum=-0.304;SC=GTTTGAATATCCTAGGGCCAG;SOR=0.674;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=174;TCF=105;TCR=69;TR=83;WE=34830796;WS=34830778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,96:0.48:200
chr5	34840841	rs6451173	A	G	2915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.454;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=69;PP=1672;ReadPosRankSum=0.233;SC=TTCTGCTTCCATATGTAAGTA;SOR=0.644;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=225;TCF=96;TCR=129;TR=118;WE=34840849;WS=34840831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,139:0.52:265
chr5	34845473	rs336486	C	A	637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=1;PP=586;SC=TTATTCCTTCCGGTTTATGTT;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=34845481;WS=34845463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	34863220	rs3846632	G	T	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.166;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=133;ReadPosRankSum=-0.493;SC=ATGCCAGATGGGTCATCTCAT;SOR=0.495;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=8;WE=34863228;WS=34863210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr5	34918415	rs37434	A	G	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.083;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=10;PP=370;ReadPosRankSum=-0.703;SC=GTCACAAAACAAGATCAGTTC;SOR=0.322;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=49;TCF=35;TCR=14;TR=31;WE=34918423;WS=34918405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,35:0.64:55
chr5	34923435	rs37431	A	C	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.489;NF=1;NR=4;PP=64;ReadPosRankSum=-0.921;SC=CCCAGGCTGGACTGCAGTGGC;SOR=0.330;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=5;WE=34923443;WS=34923425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr5	34945812	rs6868348	A	G	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.76;ReadPosRankSum=-1.018;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr5	34945944	rs37442	A	T	1349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.696;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=30;PP=768;ReadPosRankSum=1.909;SC=TTAAATGCCAACGATAAAGTT;SOR=0.617;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=103;TCF=53;TCR=50;TR=60;WE=34945952;WS=34945934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,66:0.57:115
chr5	34954588	rs37437	T	C	1200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=2;PP=872;SC=TTAATCTTGATATTAAAACCT;SOR=5.031;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=34;WE=34954596;WS=34954578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr5	34998778	rs16899972	C	A	3679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=45;PP=2368;SC=CTTGAACATACGTGGCAAATT;SOR=1.284;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=123;TCF=78;TCR=45;TR=123;WE=34998786;WS=34998768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr5	34998877	rs16899974	C	A	6588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=117;NR=103;PP=2965;SC=AATACTTCTACTGCAAAATCA;SOR=0.717;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=220;TCF=117;TCR=103;TR=220;WE=34998885;WS=34998867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr5	35010138	rs466067	A	G	6907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=125;NR=101;PP=2965;SC=CTATCATGAGACCTTTGCCTC;SOR=0.800;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=227;TCF=126;TCR=101;TR=226;WE=35010148;WS=35010128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr5	35025770	rs344515	G	A	1061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=0;PP=815;SC=TCACAGAGCAGAGGCTTTCTG;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=31;WE=35025778;WS=35025760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr5	35026683	rs344513	A	G	1587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=47;PP=1153;ReadPosRankSum=1.577;SC=ATATTTAGAAACATGGGGAAA;SOR=1.387;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=75;TCF=22;TCR=53;TR=68;WE=35026691;WS=35026673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,65:0.98:66
chr5	35032769	rs237252	G	A	545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=1;PP=411;SC=CTCAGGGATGGGTCTGCCTTT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=35032777;WS=35032759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	35033605	rs180749	G	A	5316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=97;PP=2965;SC=CATCTTGTAGGTCCCTACGTT;SOR=0.988;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=177;TCF=80;TCR=97;TR=177;WE=35033613;WS=35033595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr5	35033706	rs2291702	T	C	1089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=31;PP=712;SC=CCTGGTCCACTGAGTAGGACA;SOR=3.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=37;WE=35033714;WS=35033696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr5	35035579	rs344156	A	G	478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=15;PP=376;SC=TAACCACAGTATGAATTCCAT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=35035587;WS=35035569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	35036997	rs37368	C	T	1322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.635;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=25;PP=812;ReadPosRankSum=1.559;SC=GAGCATCATACCTTTTTTTTT;SOR=0.762;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=124;TCF=74;TCR=50;TR=62;WE=35037006;WS=35036987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,67:0.49:136
chr5	35037115	rs37369	C	T	1563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=36;PP=858;ReadPosRankSum=1.262;SC=TGGAAGAAGACGGTGCTTGTA;SOR=0.705;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=123;TCF=58;TCR=65;TR=68;WE=35037123;WS=35037105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,75:0.55:136
chr5	35037230	rs72734512	C	A	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.373;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=120;ReadPosRankSum=1.510;SC=CTGCACACACCCTGGTCATTG;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=7;WE=35037238;WS=35037220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr5	35039437	rs2279651	A	G	1264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.666;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=21;PP=708;ReadPosRankSum=-1.653;SC=ACGGGTGGCAATGGCCAACAC;SOR=0.768;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=109;TCF=64;TCR=45;TR=53;WE=35039445;WS=35039427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,59:0.48:122
chr5	35039486	rs37370	C	T	1285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.171;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=27;PP=727;ReadPosRankSum=0.143;SC=CAGGTATCTGCTTCCTTCAGC;SOR=0.773;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=120;TCF=64;TCR=56;TR=57;WE=35039494;WS=35039476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,64:0.48:132
chr5	35047807	rs10223180	C	T	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.930;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=21;ReadPosRankSum=-1.534;SC=TAAGACCTCACCCAGGTCTAA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=3;WE=35047815;WS=35047797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr5	35700598	rs6451206	T	C	4268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=54;PP=2389;SC=TTCAATTTAGTGAGATACCTG;SOR=1.164;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=85;TCR=54;TR=139;WE=35700606;WS=35700588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr5	35702209	rs35297265	G	A	956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=2;PP=489;SC=TAAGCCAAGGGAGGACAAATC;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=35702220;WS=35702199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	35702212	rs11357084	GA	G	947.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=2;PP=828;SC=GCCAAGGGAGGACAAATCTTC;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=35702220;WS=35702199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr5	35702306	rs6874120	A	G	3546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=47;PP=2191;SC=GTTGGGTGCAACATGCAGTTC;SOR=1.092;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=72;TCR=47;TR=119;WE=35702314;WS=35702296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr5	35704584	rs7448971	C	T	520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=1;PP=378;SC=GCATCTTTCACCAGTATATTT;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=35704592;WS=35704574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	35704892	rs10058349	G	A	450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=13;PP=350;SC=GGTAAAAGAAGACTAAGTAGT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=35704900;WS=35704882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	35705844	rs72738833	A	C	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=192;ReadPosRankSum=-0.192;SC=TGAAATAGATAAGGAATCTTT;SOR=0.435;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=10;TCR=18;TR=14;WE=35705852;WS=35705834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr5	35709095	rs13170082	C	T	4339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=56;PP=2507;SC=AAAGCAGCAGCTTCCCTGGCT;SOR=0.931;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=138;TCF=81;TCR=57;TR=137;WE=35709103;WS=35709085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr5	35709184	rs13170390	G	C	4374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=68;PP=2299;SC=AAGCCATGTGGCTTCAAAAAC;SOR=0.921;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=67;TCR=69;TR=135;WE=35709192;WS=35709174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr5	35712780	rs10078803	A	G	955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=6;PP=606;SC=TCAAAGTAAAAACCTGAGCCA;SOR=2.376;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=26;WE=35712788;WS=35712770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	35713007	rs10073537	T	G	3377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=71;PP=2269;SC=GATAAAAATATATATAATTAC;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=37;TCR=71;TR=108;WE=35713015;WS=35712997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr5	35739960	rs10043875	A	G	341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=11;NR=1;PP=241;SC=TTCTTTTGACACTATTATTCA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=35739968;WS=35739950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	35753715	rs11957963	T	C	1227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=4;PP=755;SC=ATGCCTGTTTTTTCTGTTCAG;SOR=2.476;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=33;WE=35753723;WS=35753705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr5	35753924	rs62353693	T	C	4830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=88;PP=2787;SC=TCCTCAGTCCTTCATATGACA;SOR=1.218;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=152;TCF=64;TCR=88;TR=152;WE=35753932;WS=35753914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr5	35763877	rs11298650	AG	A	2011.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=29;PP=1397;SC=ATATGCTATAAGTGGAAAATT;SOR=1.981;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=30;WE=35763885;WS=35763867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr5	35763895	rs6876874	T	C	1712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=48;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=27;PP=647;SC=ATTGACACAATGCTCTCAAGC;SOR=2.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=34;WE=35763903;WS=35763885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	35763916	rs6895801	A	G	961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=59;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=19;PP=506;SC=ACTGTAGAAAATTGTACCTTC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=35763924;WS=35763906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	35764587	rs4869466	G	A	2810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=26;PP=1915;SC=CACACCATGGGGAAGATACAC;SOR=1.945;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=66;TCR=26;TR=92;WE=35764595;WS=35764577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr5	35764603	rs4869467	A	G	3469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=40;PP=2246;SC=TACACACAGAATTTAACTCAG;SOR=1.407;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=112;TCF=72;TCR=40;TR=112;WE=35764611;WS=35764593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr5	35764696	rs4242258	C	T	6967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=120;NR=108;PP=2965;ReadPosRankSum=1.470;SC=AAGCCTTCTTCGAGTTTCCAT;SOR=0.246;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=230;TCF=121;TCR=109;TR=228;WE=35764704;WS=35764686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,253:1.00:254
chr5	35792356	rs7730148	A	C	331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=1;PP=272;SC=AGAGAGTTTTAAAATACTCAT;SOR=4.977;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=35792364;WS=35792346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	35795738	rs716971	T	C	330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=9;NR=1;PP=228;SC=TCAGTCTCTGTGGCTTTTAGA;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=35795746;WS=35795728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	35807070	rs36093359	T	C	879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.991;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=24;PP=558;ReadPosRankSum=0.578;SC=TTAAATTATTTTGAAAAAAGT;SOR=0.475;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=66;TCF=17;TCR=49;TR=34;WE=35807078;WS=35807060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,39:0.50:78
chr5	35807114	.	G	T	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.490;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=202;ReadPosRankSum=-0.874;SC=TTATGGAATTGCTCTCAAAAT;SOR=0.608;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=10;WE=35807122;WS=35807104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr5	35807455	rs7736291	T	G	1739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.161;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=43;PP=1084;ReadPosRankSum=-0.035;SC=AAAGAAGCTGTACTCTGCCAG;SOR=1.014;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=127;TCF=47;TCR=80;TR=66;WE=35807463;WS=35807441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,72:0.51:142
chr5	35857177	rs1353252	G	C	4934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=91;PP=2965;SC=TCATTTCTAAGTTTTCTTATG;SOR=1.251;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=67;TCR=91;TR=158;WE=35857185;WS=35857167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr5	35857235	rs1494561	C	G	2901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=53;PP=1755;SC=AGTTCCCTAACAGACCTGAGT;SOR=1.413;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=90;TCF=36;TCR=54;TR=89;WE=35857243;WS=35857225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr5	35857262	rs1353250	A	G	1894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=42;PP=1169;SC=CTGGGTTTGAATGCAGTTTGA;SOR=1.819;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=20;TCR=42;TR=62;WE=35857270;WS=35857252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr5	35857308	rs5867289	T	TC	834.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=16;PP=640;SC=TTTTTAATGTTTAACCACCAT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=16;WE=35857316;WS=35857298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
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chr5	35861152	rs11567705	C	G	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.011;HP=6;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=17;PP=295;ReadPosRankSum=-0.634;SC=TTCATATGCTCTTTTTAATAG;SOR=0.475;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=70;TCF=20;TCR=50;TR=26;WE=35861160;WS=35861142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,29:0.39:75
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chr5	35876274	rs3194051	A	G	1481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=32;PP=824;ReadPosRankSum=-0.945;SC=GGATGTAGTCATCACTCCAGA;SOR=0.679;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=145;TCF=71;TCR=74;TR=65;WE=35876282;WS=35876264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,75:0.44:170
chr5	35904614	rs1833907	G	T	1698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.966;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=33;PP=1019;ReadPosRankSum=0.874;SC=GAGCCACATGGCTGTCCCAGG;SOR=0.584;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=129;TCF=72;TCR=57;TR=68;WE=35904622;WS=35904604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,78:0.53:148
chr5	35910419	rs1445899	C	T	2620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.887;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=50;PP=1494;ReadPosRankSum=0.269;SC=CAACCCAAACCACGTGAAAGC;SOR=0.763;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=268;TCF=151;TCR=117;TR=119;WE=35910427;WS=35910409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,133:0.45:298
chr5	35910529	rs1445898	C	T	1833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=42;PP=1065;ReadPosRankSum=0.047;SC=ATCAAACCTCCGGAAAAGTTC;SOR=0.725;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=166;TCF=73;TCR=93;TR=76;WE=35910537;WS=35910519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,86:0.48:180
chr5	35921069	rs6859892	T	C	6893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=126;NR=111;PP=2965;SC=TCCCTGCCACTTGTAGCTGGG;SOR=0.740;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=237;TCF=126;TCR=111;TR=237;WE=35921077;WS=35921059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr5	35921266	rs3734107	G	A	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-4.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.808;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=257;ReadPosRankSum=0.574;SC=AGGCCTCGCCGCTGCCTCTGG;SOR=0.235;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=16;WE=35921274;WS=35921256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr5	35955682	rs768622	C	G	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.784;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=10;PP=389;ReadPosRankSum=-0.390;SC=AATACATACACAGTATCCCTT;SOR=0.315;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=59;TCF=40;TCR=19;TR=28;WE=35955690;WS=35955672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,29:0.46:63
chr5	35956026	rs768621	T	C	750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=22;PP=529;ReadPosRankSum=-1.572;SC=GAATACCAGGTAAAGCAGAAA;SOR=0.669;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=34;TCR=56;TR=36;WE=35956034;WS=35956016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,38:0.38:101
chr5	35962873	rs76212882	C	T	1343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.275;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=23;PP=790;ReadPosRankSum=0.936;SC=ACCTTTGTTCCGAGGGCTAGG;SOR=0.824;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=146;TCF=89;TCR=57;TR=61;WE=35962881;WS=35962863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,67:0.42:160
chr5	35962984	rs1070895	A	G	6356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=111;NR=117;PP=2965;SC=GGTCAAAGCCATCTCAGTGGT;SOR=0.823;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=228;TCF=111;TCR=117;TR=228;WE=35962992;WS=35962974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr5	36037778	rs2247611	G	A	650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=2;PP=531;SC=CCCATGTCCTGGAAAATACAG;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=36037786;WS=36037768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr5	36051834	rs72303780	ATCCG	A	287.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.143;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.336;NF=7;NR=1;PP=240;ReadPosRankSum=-0.204;SC=CAATCCATCCATCCGTCCATC;SOR=1.646;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=8;WE=36051845;WS=36051824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr5	36111167	rs43189	A	T	68.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=0;PP=47;SC=AGATTAAAAAATATTCACAAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=36111175;WS=36111157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr5	36124514	rs13177876	A	G	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.413;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=136;ReadPosRankSum=-0.917;SC=GTTCTTAAGAACACAAGTAAA;SOR=0.368;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=8;WE=36124522;WS=36124504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr5	36136675	rs267758	C	T	823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.133;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=24;PP=470;ReadPosRankSum=0.976;SC=AGATAAAATGCGACTGCATAA;SOR=1.994;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=76;TCF=21;TCR=55;TR=29;WE=36136683;WS=36136665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,36:0.41:87
chr5	36137620	rs267759	A	G	237.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=193;SC=CCAGAAATATATGAATCTCAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=36137628;WS=36137610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	36141386	rs13156321	T	A	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=406;ReadPosRankSum=0.514;SC=GTGGCCAAGTTAATTTACATT;SOR=0.573;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=43;TCF=7;TCR=36;TR=23;WE=36141394;WS=36141376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,25:0.53:47
chr5	36142589	rs267764	T	A	1260.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.690;HP=7;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=23;PP=920;ReadPosRankSum=1.702;SC=ATATTTTTTTTAAAAAAGGAA;SOR=0.785;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=121;TCF=78;TCR=43;TR=63;WE=36142597;WS=36142579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,66:0.49:136
chr5	36142648	rs12658867	A	G	2506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=50;PP=1454;ReadPosRankSum=-0.387;SC=TAATGTTGCTATTCTCAGGAG;SOR=0.726;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=207;TCF=112;TCR=95;TR=106;WE=36142656;WS=36142638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,120:0.51:236
chr5	36143392	rs267766	C	T	1671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.487;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=34;PP=861;ReadPosRankSum=0.295;SC=ATCGATGAAGCAGAAATAATG;SOR=0.471;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=145;TCF=70;TCR=75;TR=71;WE=36143400;WS=36143382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,85:0.48:176
chr5	36147806	rs10071838	C	T	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.404;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=72;ReadPosRankSum=0.205;SC=GAGTACTTTACGGCTGATAAT;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=5;WE=36147814;WS=36147796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr5	36168582	rs7736391	T	C	3974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=76;PP=2078;SC=CAAAGGCAGTTGATTTTATGT;SOR=1.017;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=139;TCF=63;TCR=76;TR=139;WE=36168590;WS=36168572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr5	36176874	rs40030	G	A	319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=1;PP=251;SC=TTTCTTTTTCGGATGATTCTC;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=36176882;WS=36176864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	36177576	rs62353841	A	C	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.295;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=53;ReadPosRankSum=0.445;SC=GAGTTGATCCAGATTGTTCAC;SOR=0.169;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=8;WE=36177584;WS=36177566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr5	36195448	rs11952882	A	G	3946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=84;PP=2647;SC=TTTAATCCTGAATTTTAACCT;SOR=1.811;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=123;TCF=39;TCR=84;TR=123;WE=36195456;WS=36195438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr5	36201336	rs7705396	C	T	1019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=23;PP=697;SC=GAATAACCTACTTAAAATATA;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=29;WE=36201344;WS=36201326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	36207424	rs2303163	G	T	3541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=82;PP=2247;SC=GTAAATAAGAGAGTCTTCTTC;SOR=2.191;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=27;TCR=82;TR=109;WE=36207432;WS=36207414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr5	36217764	rs111441491	G	GTTAATCA	3573.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=8;PP=2346;SC=CTAAAAACAAGTAAATTATTA;SOR=2.964;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=41;TCF=30;TCR=11;TR=36;WE=36217772;WS=36217754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr5	36241922	rs62356073	G	A	2236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=36;NR=40;PP=1188;SC=CCGCGGCCGCGGGCTTGGGCT;SOR=0.972;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=36;TCR=40;TR=76;WE=36241930;WS=36241912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr5	36241988	rs34888491	G	C	422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=17;PP=360;SC=CGCGCCGCCCGGGCCTCTAAC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=36241996;WS=36241978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	36253937	rs4869473	G	A	5775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=116;PP=2965;SC=CAGTTGACACGGAGGAATTTA;SOR=1.296;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=193;TCF=77;TCR=116;TR=193;WE=36253945;WS=36253927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr5	36257004	rs77621361	G	A	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.411;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=324;ReadPosRankSum=-0.046;SC=TTCCAAGTATGTAAATGCTAC;SOR=1.202;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=21;WE=36257012;WS=36256994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,21:0.54:39
chr5	36257779	rs76783647	T	G	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.282;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=124;ReadPosRankSum=-1.084;SC=CTAGCTGGTATGTTTTTGTTT;SOR=1.609;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=8;WE=36257787;WS=36257769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr5	36260976	rs6881086	T	A	2109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=38;PP=1239;SC=TCTAAGAAAATGAAATAAGCA;SOR=1.150;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=30;TCR=38;TR=68;WE=36260984;WS=36260966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr5	36268218	rs6869599	A	G	2721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=17;PP=1948;SC=TGATCGCTAAAAAAGAAAAGT;SOR=2.546;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=70;TCR=17;TR=87;WE=36268226;WS=36268208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr5	36269551	rs1035480	G	C	5699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=93;NR=95;PP=2965;SC=TACACGCTTTGTTGGAAAACC;SOR=0.783;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=189;TCF=93;TCR=96;TR=188;WE=36269559;WS=36269541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr5	36271491	rs5867310	CT	C	603.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=329;ReadPosRankSum=0.835;SC=TATTTGAAGACTTTTTTTTTT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=20;WE=36271499;WS=36271481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,26:0.96:27
chr5	36301362	rs10941287	T	A	1141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.29;SOR=2.753;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr5	36301369	rs884692	T	G	1222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.76;SOR=2.621;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr5	36301420	rs884694	G	T	2471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=28;PP=1480;SC=TGAGCTGGACGGACTCACCTT;SOR=1.338;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=56;TCR=28;TR=84;WE=36301428;WS=36301410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr5	36613053	rs7728680	A	G	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.038;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=281;ReadPosRankSum=1.966;SC=CTGAAAGCCCACTGGTGAGAC;SOR=1.329;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=15;WE=36613061;WS=36613043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr5	36680125	rs2303716	A	G	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.160;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=51;ReadPosRankSum=0.465;SC=GGGATTCAGGAAATGCCTGGC;SOR=0.042;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=5;WE=36680133;WS=36680115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr5	36683801	.	T	C	104	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=2;HapScore=4;MGOF=19;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=5;NR=1;PP=104;QD=23.1285354245;SC=CAGAGTGAGATACTGTTTCAA;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=36683817;WS=36683791;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr5	36683809	.	CA	C	26	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5945;HP=14;HapScore=4;MGOF=19;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=26;QD=10.0;SC=GATACTGTTTCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=3;WE=36683817;WS=36683791;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr5	36683903	rs56039629	C	T	2250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=12;PP=1188;SC=TATTTTGCAGCGTATATGCTC;SOR=2.226;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=44;TCR=12;TR=56;WE=36683911;WS=36683893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr5	36683920	rs56256473	G	C	864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.057;HP=3;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=11;ReadPosRankSum=1.247;SC=GCTCTACGTGGGGAGCTTTGT;SOR=1.091;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=82;TCF=57;TCR=25;TR=40;WE=36683928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,40:0.45:88
chr5	36686404	rs2229894	G	A	780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.840;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=19;PP=435;ReadPosRankSum=-0.068;SC=TTGAGCACCAGGTGTTAAAAA;SOR=0.864;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=73;TCF=32;TCR=41;TR=31;WE=36686412;WS=36686394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,37:0.42:88
chr5	37142385	.	T	C	878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.661;ClippingRankSum=0.000;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=16;PP=485;ReadPosRankSum=1.570;SC=TAAGAGTATGTGTAAATGAAA;SOR=0.675;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=173;TCF=114;TCR=59;TR=50;WE=37142393;WS=37142375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,55:0.28:193
chr5	37148270	.	A	G	3122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.288;ClippingRankSum=0.000;DP=401;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.189;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=70;PP=1801;ReadPosRankSum=-0.002;SC=AGCCCCTATCAGCCCCTACAA;SOR=0.618;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=342;TCF=183;TCR=159;TR=146;WE=37148278;WS=37148260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:229,168:0.42:397
chr5	37247700	rs6876576	G	A	2700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=40;PP=1635;SC=CTGGTATTGCGTGAATAAAGA;SOR=0.905;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=53;TCR=40;TR=93;WE=37247708;WS=37247690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr5	37294473	rs1045908	T	C	1025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=17;PP=600;ReadPosRankSum=-1.556;SC=GTAGTCTAGGTAATGGTACTC;SOR=0.655;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=108;TCF=66;TCR=42;TR=45;WE=37294481;WS=37294463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,52:0.42:125
chr5	37309371	rs3835198	TAGA	T	1169.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.042;NF=2;NR=16;PP=674;ReadPosRankSum=0.723;SC=CTCATTTGCCTAGAAGAGGAG;SOR=0.607;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=40;TCF=3;TCR=37;TR=18;WE=37309381;WS=37309361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,33:0.43:77
chr5	37318295	rs217797	G	T	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=266;ReadPosRankSum=-0.461;SC=AAATAATTCAGAAGGTTGGGC;SOR=0.287;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=15;WE=37318303;WS=37318285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
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chr5	37752415	rs1549252	A	G	61.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=0;PP=40;SC=TTTCCTGAACATAATTAAATT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=37752423;WS=37752408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr5	37752460	rs1549251	T	C	412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=1;PP=330;SC=AGTTTAATGATTTATATTTAA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=37752468;WS=37752450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	37752497	rs2973079	A	G	921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=28;NR=5;PP=658;SC=TATTCCCCACATTTGCTCCCA;SOR=2.899;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=33;WE=37752505;WS=37752487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr5	38407273	rs111320305	A	AT	418.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=382;ReadPosRankSum=1.055;SC=GAGAGGAAGAAGTGGTGATGA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=11;WE=38407281;WS=38407263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr5	38407888	rs2961882	T	C	664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.504;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=6;PP=428;ReadPosRankSum=1.104;SC=TCTTTTGTGTTGTCTTTTTTC;SOR=1.244;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=57;TCF=43;TCR=14;TR=27;WE=38407896;WS=38407878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,29:0.47:62
chr5	38408093	rs60540056	C	G	1476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.006;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=33;PP=778;ReadPosRankSum=0.179;SC=GGAGAGGAAGCGGGGCAGCAG;SOR=0.544;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=150;TCF=61;TCR=89;TR=61;WE=38408101;WS=38408083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,71:0.44:163
chr5	38412674	rs16903965	C	T	1789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.183;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=44;PP=1018;ReadPosRankSum=-1.424;SC=GGTTGGCACACGGTTATGCTC;SOR=0.820;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=162;TCF=69;TCR=93;TR=77;WE=38412682;WS=38412664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,88:0.48:182
chr5	38418035	rs56070719	A	G	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.884;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=61;ReadPosRankSum=1.383;SC=AAGGTCTTAAAGATAAATACA;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=5;WE=38418043;WS=38418027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr5	38425008	rs3812046	G	A	626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.874;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=11;PP=389;ReadPosRankSum=0.591;SC=TGGGGTCAGCGCCACTGTGTT;SOR=0.339;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=53;TCF=37;TCR=16;TR=29;WE=38425016;WS=38424998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,30:0.53:57
chr5	38435130	rs2956598	T	G	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=251;ReadPosRankSum=1.017;SC=GATGGGTCTCTAGGCTCTGTC;SOR=0.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=16;WE=38435138;WS=38435120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr5	38486065	rs3110234	C	T	919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.877;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=25;PP=552;ReadPosRankSum=1.904;SC=ATATTCTTAACTTTTATGTCA;SOR=0.414;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=86;TCF=31;TCR=55;TR=41;WE=38486073;WS=38486055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,45:0.47:95
chr5	38490271	rs3110971	A	G	918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.947;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=12;PP=481;ReadPosRankSum=-1.904;SC=GCTCTTATAAATAAGTACCCA;SOR=1.167;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=79;TCF=50;TCR=29;TR=38;WE=38490279;WS=38490261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,45:0.48:93
chr5	38504303	rs16903989	A	T	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=59;ReadPosRankSum=-0.566;SC=AGAAGAAAACATAAAAAACAA;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=38504311;WS=38504293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr5	38510481	rs34968906	AC	A	821.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=411;ReadPosRankSum=-0.266;SC=CACTCCTCCCACCCCCCCACT;SOR=0.741;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=38;TCF=17;TCR=21;TR=20;WE=38510489;WS=38510471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,33:0.59:56
chr5	38512154	rs1037033	T	C	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=236;ReadPosRankSum=0.979;SC=ATAGATTCCATACAATCATCA;SOR=0.368;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=13;WE=38512162;WS=38512144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr5	38528951	rs34759137	GAC	G	180.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.670;HP=2;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.167;NF=0;NR=13;PP=182;ReadPosRankSum=0.148;SC=CCCTGGAGGAGACACACACAC;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=13;WE=38528960;WS=38528941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,10:0.31:32
chr5	38528969	rs71604901	CACACACACACAG	C	267.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=3.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.85;MQRankSum=2.404;QD=8.11;ReadPosRankSum=0.225;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,12:0.36:33
chr5	38812945	rs60010968	T	A	2144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=53;PP=1369;ReadPosRankSum=-1.261;SC=AATGATCTGATGAATTATAAT;SOR=0.686;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=231;TCF=109;TCR=122;TR=99;WE=38812953;WS=38812935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,108:0.43:254
chr5	38819530	rs418926	T	C	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.25;ReadPosRankSum=0.328;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr5	38820695	rs446650	G	A	1058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=21;PP=528;ReadPosRankSum=1.369;SC=TCATTGAAGCGTTATTCCCAG;SOR=0.685;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=121;TCF=69;TCR=52;TR=50;WE=38820703;WS=38820685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,57:0.39:146
chr5	38820802	rs542867	A	C	566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.400;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-1.081;NF=4;NR=10;PP=178;ReadPosRankSum=0.894;SC=ATATGTATACATATGTATATA;SOR=0.434;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=35;TCF=9;TCR=26;TR=14;WE=38820810;WS=38820792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,18:0.44:41
chr5	38820823	rs113106049	C	CAT	526.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.235;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.390;NF=0;NR=9;PP=370;ReadPosRankSum=-0.623;SC=TGAATATACACATATGTATAC;SOR=0.172;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=9;WE=38820831;WS=38820813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr5	38820839	rs640966	C	T	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.531;NF=0;NR=7;PP=108;ReadPosRankSum=-0.419;SC=TATACCTATGCATATATGAAT;SOR=1.460;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=7;WE=38820847;WS=38820829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr5	38822040	rs413278	A	G	50.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=16.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr5	38823254	rs369886	C	T	2036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=16;PP=825;SC=TAAGTGTGTACATGTATACAT;SOR=1.197;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=30;TCR=16;TR=46;WE=38823262;WS=38823244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr5	38823318	rs142353288	G	GTGCA	2436.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.751;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-1.409;NF=11;NR=20;PP=1612;ReadPosRankSum=2.416;SC=GTGTATACGTGTACATACATG;SOR=0.581;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=59;TCF=23;TCR=36;TR=31;WE=38823326;WS=38823308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,60:0.58:103
chr5	38823344	.	A	ACGTGCATACATACATGGGTACGTGTGTATACG	744.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.003;ClippingRankSum=0.000;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=7.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.76;MQRankSum=-3.513;QD=21.28;ReadPosRankSum=-0.401;SOR=0.394;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr5	38823358	rs581668	C	A	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.274;HP=1;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=4.162;NF=69;NR=49;ReadPosRankSum=-3.156;SC=GCATACATACCTGGGTACGTG;SOR=1.232;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=165;TCF=96;TCR=69;TR=118;WE=38823366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,32:0.46:70
chr5	38823377	.	C	CGTGCATACATACCTGGGTACGTGTGTATACGT	1823.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.968;ClippingRankSum=0.000;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=3.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.58;MQRankSum=-5.099;QD=19.82;ReadPosRankSum=2.506;SOR=0.378;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,42:0.46:92
chr5	38869251	rs116432854	A	T	2404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.434;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=62;PP=1479;ReadPosRankSum=-0.373;SC=AAAGACAAAAATCACGTCGGG;SOR=0.728;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=261;TCF=118;TCR=143;TR=113;WE=38869259;WS=38869241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,123:0.43:289
chr5	38876573	rs357271	T	C	501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=15;PP=424;SC=GTTTTGGAAATATATTAGCAG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=38876581;WS=38876563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	38881628	rs525735	G	T	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.661;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=132;ReadPosRankSum=-1.144;SC=TTTGGGATAAGTCAAGTCAAG;SOR=1.085;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=10;WE=38881636;WS=38881618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,10:0.33:30
chr5	38884071	rs34675408	T	G	1269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=22;PP=775;ReadPosRankSum=-1.166;SC=AACAGATTCATGGAGAACAAC;SOR=0.664;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=127;TCF=80;TCR=47;TR=58;WE=38884079;WS=38884061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,65:0.44:147
chr5	38885353	rs2289924	C	G	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.548;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=140;ReadPosRankSum=0.360;SC=TCCTTGTTCACAGTAACTCTG;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=7;WE=38885361;WS=38885343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr5	38904363	rs1239334	C	T	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.167;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=2;PP=144;ReadPosRankSum=1.474;SC=ATTTGCTGTGCTCTGGTTTGC;SOR=0.693;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=9;WE=38904371;WS=38904353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr5	38917574	rs357260	G	A	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.834;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=342;ReadPosRankSum=0.992;SC=GTCCTTGACCGTCCTAGAAAA;SOR=0.132;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=44;TCF=34;TCR=10;TR=26;WE=38917582;WS=38917564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,28:0.62:45
chr5	38917904	rs357262	G	C	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=43;ReadPosRankSum=-0.539;SC=TTTGATAGCTGATGCAACTGA;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=4;WE=38917912;WS=38917894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr5	38923171	rs357293	T	C	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.650;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=132;ReadPosRankSum=-0.575;SC=AGCCAACGTGTCATGCCTTTT;SOR=1.002;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=7;WE=38923179;WS=38923161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr5	38931919	rs357277	G	A	581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=6;PP=391;ReadPosRankSum=-1.297;SC=TCATAAACTTGTATTTATTCC;SOR=0.546;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=55;TCF=46;TCR=9;TR=27;WE=38931927;WS=38931909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,28:0.47:60
chr5	38950776	rs2115949	G	A	4653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=79;PP=2516;SC=GGAAAAATGTGCTAGTAGAGC;SOR=0.944;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=155;TCF=76;TCR=79;TR=154;WE=38950784;WS=38950757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr5	38953427	rs2115948	T	C	350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=9;NR=1;PP=262;SC=ACACTTATATTGGCAGGAACA;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=38953435;WS=38953417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	38953447	rs2115947	T	A	554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=3;PP=411;SC=AATCCAGTCTTAAATATTAAT;SOR=2.948;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=38953455;WS=38953437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	38953634	rs146765449	G	A	742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=-1.048;QD=11.09;ReadPosRankSum=1.001;SOR=0.673;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,36:0.54:67
chr5	38953665	rs33912683	G	GA	448.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.471;NF=0;NR=18;PP=363;ReadPosRankSum=-1.007;SC=TCTGGAGAAAGAAAAAAAAAT;SOR=4.514;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=18;WE=38953673;WS=38953655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,18:0.95:19
chr5	38954994	rs9292726	T	C	2004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=25;NR=41;PP=1233;SC=ACTATATCTCTTGGCTAATTT;SOR=1.457;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=25;TCR=41;TR=66;WE=38955002;WS=38954984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr5	38958750	rs6868087	A	G	724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=10;PP=448;ReadPosRankSum=-1.049;SC=GTATTAAATTATAAAAAATGA;SOR=0.648;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=59;TCF=38;TCR=21;TR=30;WE=38958758;WS=38958740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,33:0.49:67
chr5	38958968	rs6868591	A	C	772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.91;SOR=3.528;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	38959794	rs2115946	T	C	401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=4;PP=264;SC=ACCAAACACATGTACACAGAA;SOR=1.911;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=15;WE=38959802;WS=38959784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	38960392	rs143278632	T	C	630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=3.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.013;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=444;ReadPosRankSum=-0.268;SC=AAATACGGCTTATGCATATTC;SOR=2.633;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=20;WE=38960400;WS=38960382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,23:0.55:42
chr5	38962543	rs7729745	A	G	1917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.62;SOR=1.066;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
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chr5	39119723	rs379707	C	A	814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.692;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=13;PP=464;ReadPosRankSum=1.033;SC=GCTTTTCCAACATTAGTTCCT;SOR=1.034;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=89;TCF=53;TCR=36;TR=36;WE=39119731;WS=39119713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,43:0.41:104
chr5	39124508	rs2303807	C	T	960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=25;PP=542;ReadPosRankSum=-1.288;SC=TGTTGACCATCATTTCTTTCT;SOR=0.757;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=70;TCF=28;TCR=42;TR=41;WE=39124516;WS=39124498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,45:0.61:74
chr5	39124593	rs2303806	A	T	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.588;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=95;ReadPosRankSum=1.812;SC=TGAACCCCAAATGTTTGCCAA;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=6;WE=39124601;WS=39124583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr5	39285139	rs261738	T	A	180.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.59;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
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chr5	39364339	rs700231	T	C	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.472;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=242;ReadPosRankSum=2.109;SC=GCACCCTATGTATTTTCTTAT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=12;WE=39364347;WS=39364329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr5	39364358	rs700232	G	A	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=5.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.436;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=343;ReadPosRankSum=-0.715;SC=ATCTCTTTTCGAAGTTTAGAT;SOR=2.742;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=39;TCR=5;TR=18;WE=39364366;WS=39364348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,20:0.43:47
chr5	39364554	rs700233	G	A	918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.051;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=24;PP=555;ReadPosRankSum=0.902;SC=GCAAAGCTCCGGCAGGCTGAC;SOR=0.410;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=77;TCF=22;TCR=55;TR=37;WE=39364562;WS=39364544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,41:0.50:82
chr5	39375082	rs2686162	C	T	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.625;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=17;PP=486;ReadPosRankSum=-1.263;SC=TCACAAAAACCCCTGAGACAG;SOR=0.925;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=110;TCF=59;TCR=51;TR=41;WE=39375090;WS=39375072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,42:0.34:125
chr5	39377418	rs2738238	G	A	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.982;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=14;PP=227;ReadPosRankSum=2.018;SC=CTTATCAGGAGTCAAGCTTGA;SOR=0.512;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=63;TCF=23;TCR=40;TR=23;WE=39377426;WS=39377408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,27:0.39:70
chr5	39390061	rs2855512	C	A	1760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=27;NR=36;PP=1097;SC=CACTGTTATCCGTATTTTAAT;SOR=0.990;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=27;TCR=36;TR=63;WE=39390069;WS=39390051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr5	39394493	rs1050903	G	C	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=1.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=99;ReadPosRankSum=0.149;SC=CGATGGAGAAGTCTCAAATAA;SOR=0.223;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=7;WE=39394501;WS=39394483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr5	40716153	rs10737963	C	A	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=276;ReadPosRankSum=-0.478;SC=TACAACCAGGCGTTCTCCTAT;SOR=0.906;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=15;WE=40716161;WS=40716143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
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chr5	40841741	rs10512747	C	T	1513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.410;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=42;PP=1018;ReadPosRankSum=-1.771;SC=TTTCCACAGTCAGCTGCCATT;SOR=0.863;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=120;TCF=50;TCR=70;TR=68;WE=40841749;WS=40841731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,71:0.54:131
chr5	40852451	rs188934	C	G	7374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=136;NR=108;PP=2965;SC=GAGATGTGACCGCTAGGGATT;SOR=0.807;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=244;TCF=136;TCR=108;TR=244;WE=40852459;WS=40852441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,275:1.00:275
chr5	40928574	rs2443040	A	C	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=54;ReadPosRankSum=0.712;SC=ATTGAGAAATAATAACATCAC;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=40928582;WS=40928564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr5	40928792	rs2459467	T	A	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=385;ReadPosRankSum=1.638;SC=AATGTTTTAGTAATTCTTTAG;SOR=0.686;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=45;TCF=10;TCR=35;TR=23;WE=40928800;WS=40928782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,27:0.54:50
chr5	40931357	rs2271709	A	G	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=87;ReadPosRankSum=1.896;SC=TTTGAAAACTATGTTTGTAAT;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=6;WE=40931365;WS=40931347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
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chr5	40949997	rs1450656	C	T	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=225;ReadPosRankSum=1.238;SC=TTTACATTTTCTCCCCTAGAT;SOR=0.859;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=13;WE=40950005;WS=40949987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
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chr5	40955561	rs1063499	G	C	2132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=52;PP=1462;ReadPosRankSum=1.199;SC=TCTGGCCTTAGTTACCTAGAG;SOR=0.680;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=202;TCF=96;TCR=106;TR=98;WE=40955569;WS=40955551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,103:0.47:220
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chr5	40972111	rs10805655	C	T	5150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=110;NR=59;PP=2801;SC=TAATTTCAGACGGCAAAATAT;SOR=1.197;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=169;TCF=110;TCR=59;TR=169;WE=40972119;WS=40972101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr5	40972769	rs34641824	G	A	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=45;ReadPosRankSum=-1.221;SC=GACCTTCATGGTACTGTATCA;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=4;WE=40972777;WS=40972759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr5	40979790	rs2876849	A	T	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.372;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=6;PP=160;ReadPosRankSum=-1.641;SC=TTACGAACAAAAATCTTGTAA;SOR=0.275;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=27;TCF=18;TCR=9;TR=14;WE=40979798;WS=40979780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr5	40980086	rs1450664	T	C	716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.663;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=19;PP=457;ReadPosRankSum=0.244;SC=ATGTGGTTTCTAGTTTAGCAG;SOR=1.279;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=54;TCF=21;TCR=33;TR=28;WE=40980094;WS=40980076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,31:0.49:63
chr5	40980102	rs2292727	C	T	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.267;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=192;ReadPosRankSum=-0.379;SC=AGCAGTGGGCCGAAGAAGATA;SOR=0.426;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=38;TCF=13;TCR=25;TR=18;WE=40980110;WS=40980092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,22:0.51:43
chr5	40981375	rs3749519	G	A	645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.99;SOR=2.948;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	40981375	.	GTCATT	ATCATC,ATCATT	241	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.45;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=13;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=4,14;NR=1,3;PP=21,241;QD=14.8935749724;SC=AATTTATTATGTCATTCCAGG;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=5,17;WE=40981388;WS=40981365;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.29:17
chr5	40981380	rs7731615	T	C	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.89;ReadPosRankSum=0.847;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr5	40981398	rs41271065	C	T	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-1.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=252;ReadPosRankSum=1.477;SC=GGAGCTTCTACAGCTCTGATC;SOR=0.446;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=15;WE=40981406;WS=40981388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr5	40981689	rs1061429	C	A	947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.023;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=30;PP=612;ReadPosRankSum=1.423;SC=CCTGGAGGCCCTGGTCAGCTT;SOR=0.474;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=89;TCF=21;TCR=68;TR=41;WE=40981697;WS=40981679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,44:0.47:93
chr5	40998196	rs704040	T	C	1820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.568;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=38;PP=1051;ReadPosRankSum=-0.026;SC=TCAGGAGGGTTTGCAAAGCAG;SOR=0.620;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=151;TCF=74;TCR=77;TR=78;WE=40998204;WS=40998186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,86:0.51:169
chr5	40998235	rs722575	C	T	1372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.630;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=29;PP=688;ReadPosRankSum=0.228;SC=CACTAATACACGGATCTTGAC;SOR=0.614;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=122;TCF=58;TCR=64;TR=58;WE=40998243;WS=40998225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,66:0.47:140
chr5	40998814	rs2876850	T	A	1075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.002;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=30;PP=625;ReadPosRankSum=-1.826;SC=ACTGATTTCATTATAGAGGAA;SOR=0.297;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=89;TCF=26;TCR=63;TR=47;WE=40998822;WS=40998804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,50:0.54:93
chr5	40998851	rs2329435	G	A	673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=21;PP=493;ReadPosRankSum=0.909;SC=TAGCAGGTTAGACTCTGCACC;SOR=0.758;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=9;TCR=38;TR=26;WE=40998859;WS=40998841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,27:0.56:48
chr5	40999900	rs1376175	T	A	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.195;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=17;PP=357;ReadPosRankSum=0.073;SC=GATGTGAATTTCAAAGAGGGC;SOR=0.409;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=60;TCF=21;TCR=39;TR=28;WE=40999908;WS=40999890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,32:0.48:66
chr5	41000243	rs1376177	G	A	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.746;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=156;ReadPosRankSum=0.400;SC=GAAATTCCTTGCTACATTGTT;SOR=2.348;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=9;WE=41000251;WS=41000233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr5	41000343	rs1001420	G	A	1481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.251;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=20;PP=894;ReadPosRankSum=1.012;SC=AGAATTGCCTGTAGAAATCCC;SOR=0.951;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=116;TCF=72;TCR=44;TR=58;WE=41000351;WS=41000333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,65:0.49:133
chr5	41001023	rs2167229	G	A	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.235;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=238;ReadPosRankSum=-0.293;SC=CACCCTTCCCGCTTCAGCAAA;SOR=1.385;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=14;WE=41001031;WS=41001013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr5	41004396	rs7712140	G	T	4271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.60;SOR=1.710;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr5	41004396	.	GTTTCTGTTCA	TTTTCTGTTCA,TTTTCTGTTCT	961	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000,0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=78,35;NR=33,15;PP=961,835;QD=8.97091182475;SC=ACCTAAACCTGTTTCTGTTCA;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=78;TCR=33;TR=111,50;WE=41004414;WS=41004386;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:111
chr5	41004406	rs7711722	A	T	1322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=0.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.25;ReadPosRankSum=0.250;SOR=0.774;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,62:0.43:143
chr5	41004807	rs2305314	C	T	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=1.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.45;ReadPosRankSum=-0.755;SOR=0.658;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr5	41005516	.	C	G	25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;FR=0.9998;HP=11;HapScore=4;MGOF=2;MMLQ=17;MQ=56.57;NF=3;NR=0;PP=25;QD=19.9237375157;SC=CTCTATGAAACCCCCCCCCCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=41005535;WS=41005506;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr5	41005527	.	C	CCCTCCT	92	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5000;HP=11;HapScore=4;MGOF=2;MMLQ=27;MQ=58.57;NF=1;NR=1;PP=92;QD=49.0;SC=CCCCCCCCCCCTTGAAGTCTC;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=2;WE=41005535;WS=41005506;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:4,2:0.33:6
chr5	41005791	rs10941529	T	C	1216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.524;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=30;PP=621;ReadPosRankSum=0.657;SC=TACTAAACAATGGAGGAAATC;SOR=0.399;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=108;TCF=43;TCR=65;TR=56;WE=41005799;WS=41005781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,61:0.51:120
chr5	41008780	rs2271704	A	G	3615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=75;NR=48;PP=2190;SC=GGGACAAGTGAGCATCTTCTG;SOR=1.043;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=75;TCR=48;TR=123;WE=41008788;WS=41008770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr5	41009899	rs1878290	A	G	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.207;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=69;ReadPosRankSum=0.911;SC=CAATTGTTAAATTGTTATTCA;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=5;WE=41009907;WS=41009889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr5	41012615	rs6876879	AA	GC	1703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.093;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=7;PP=1388;ReadPosRankSum=0.703;SC=ACAAACAGAGAAAGTGGCTGA;SOR=1.651;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=63;TCF=47;TCR=16;TR=36;WE=41012624;WS=41012605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,42:0.58:72
chr5	41018452	rs10054110	A	T	2147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.589;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=48;PP=1447;ReadPosRankSum=-0.084;SC=CCTCAATATCATTTGTCAGCA;SOR=0.766;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=220;TCF=113;TCR=107;TR=96;WE=41018460;WS=41018442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,103:0.44:235
chr5	41019229	rs896118	A	T	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=3;PP=38;ReadPosRankSum=-0.369;SC=CTAACGTGTCACATTTTCTGA;SOR=0.602;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=4;WE=41019237;WS=41019219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr5	41032998	rs325831	A	G	2712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=52;PP=1806;SC=CAACCTCATCAGACCATTGGG;SOR=1.420;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=32;TCR=52;TR=84;WE=41033006;WS=41032988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr5	41033112	rs4957367	G	A	6557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=123;NR=86;PP=2965;SC=GAATACTCAGGGCCTTTCTTA;SOR=1.089;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=209;TCF=123;TCR=86;TR=209;WE=41033120;WS=41033102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr5	41033931	.	C	CTATT,CTATCTATT	2074.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.871;ClippingRankSum=0.000;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=66.43;MQRankSum=0.459;QD=103.74;ReadPosRankSum=1.393;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:1,12,7:0.60,0.35:20
chr5	41033992	rs67027762	G	T	2366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.640;NF=68;NR=44;PP=1385;ReadPosRankSum=-0.177;SC=GGCAAAATTAGATACTCAATG;SOR=0.717;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=247;TCF=149;TCR=98;TR=112;WE=41034000;WS=41033974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,121:0.45:267
chr5	41034181	rs325833	A	G	1368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=37;PP=1087;SC=TCCCCCAGGTAAGTCATGAGT;SOR=5.186;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=39;WE=41034189;WS=41034171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr5	41039000	rs325849	A	G	3471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=52;PP=2030;SC=TCTGAAGACCAGGAAAGGGAG;SOR=0.723;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=66;TCR=52;TR=118;WE=41039008;WS=41038990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr5	41039430	rs7700901	G	C	338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=240;SC=GGACAGTTCTGACCTGGAATA;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=10;WE=41039438;WS=41039420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	41042284	rs325854	G	T	3110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=52;PP=1937;SC=ATGCTAAGGTGGTTCCCAAGG;SOR=0.784;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=52;TCR=52;TR=104;WE=41042292;WS=41042274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr5	41045730	rs11297360	CT	C	1180.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=6;PP=550;ReadPosRankSum=0.763;SC=AGAGGGAACTCTTTTTTTTTT;SOR=2.107;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=44;TCF=33;TCR=11;TR=35;WE=41045738;WS=41045720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,49:0.98:50
chr5	41045768	rs325860	G	A	2897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=69;NR=34;PP=1939;SC=CTTTGATTGTGATACAGACAA;SOR=1.566;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=69;TCR=34;TR=103;WE=41045776;WS=41045758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr5	41045835	rs6864243	C	G	5886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=115;NR=82;PP=2965;SC=TTCCCCTCAGCTGAAAAACCA;SOR=0.971;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=197;TCF=115;TCR=82;TR=197;WE=41045843;WS=41045825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr5	41048533	rs13173930	C	T	3031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.999;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=58;PP=1697;ReadPosRankSum=-1.153;SC=ACCAGCCCCACGTAACTCCCC;SOR=0.697;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=248;TCF=127;TCR=121;TR=126;WE=41048541;WS=41048523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,145:0.52:278
chr5	41049389	rs325863	T	C	6790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.44;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr5	41049397	rs325864	C	T	6390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.01;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr5	41050936	.	C	T	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.319;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=94;ReadPosRankSum=-0.842;SC=GTGTTGGACACAGCGTTGCAA;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=6;WE=41050944;WS=41050926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr5	41050999	rs325866	C	T	2591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=21;PP=1725;SC=GGAGAACAAACTCATGTCTTT;SOR=1.994;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=66;TCR=21;TR=87;WE=41051007;WS=41050989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr5	41057562	rs618334	T	C	861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=18;PP=538;SC=AAAACAAGCTTCTCATCTTCC;SOR=1.942;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=26;TCF=8;TCR=18;TR=26;WE=41057570;WS=41057552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr5	41061715	rs1023840	C	T	1880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=2.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.26;ReadPosRankSum=0.232;SOR=0.483;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,90:0.54:167
chr5	41061715	.	CA	TG	976	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=26;MQ=60.0;NF=44;NR=34;PP=976;QD=13.198306088;SC=CATTATATACCAGAACAGCAT;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=149;TCF=92;TCR=57;TR=78;WE=41061724;WS=41061705;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:71,78:0.52:149
chr5	41061716	rs865093	A	G	6123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.02;SOR=1.172;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr5	41061871	rs587412	T	C	1165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.907;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.819;NF=20;NR=37;PP=667;ReadPosRankSum=-0.218;SC=AATATAAGGATGGGGCAGACG;SOR=1.008;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=142;TCF=57;TCR=85;TR=57;WE=41061879;WS=41061861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,63:0.41:154
chr5	41069734	rs10512757	C	T	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.192;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=294;ReadPosRankSum=-0.796;SC=AAAATATATACGAAATGTTGC;SOR=0.906;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=41;TCF=32;TCR=9;TR=21;WE=41069742;WS=41069724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,22:0.47:47
chr5	41069852	rs13174484	T	C	1416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=31;PP=818;ReadPosRankSum=0.633;SC=TCCCCAAACATCTCTAAAACG;SOR=0.653;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=108;TCF=54;TCR=54;TR=60;WE=41069860;WS=41069842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,69:0.55:126
chr5	41069952	rs35526955	CCTCT	C	70.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=126;ReadPosRankSum=0.992;SC=ATTCATTTATCCTCTCTCTCT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=4;WE=41069963;WS=41069942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
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chr5	41149284	rs1014588	G	A	893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.189;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=7;PP=612;ReadPosRankSum=0.359;SC=GAAAGATGATGTACTAGCTGA;SOR=1.061;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=76;TCF=61;TCR=15;TR=38;WE=41149292;WS=41149274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,40:0.49:82
chr5	41154150	rs4957374	A	C	2756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=53;PP=1741;SC=GAATAAACAAAAAATTTAGGC;SOR=1.167;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=39;TCR=54;TR=92;WE=41154158;WS=41154140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr5	41158671	rs10075985	T	C	1481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.959;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=6;PP=1127;ReadPosRankSum=1.507;SC=TTAAAGTCAATAGGAGATTAT;SOR=3.372;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=48;TCF=41;TCR=7;TR=46;WE=41158679;WS=41158661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,49:0.98:50
chr5	41158863	rs6866352	G	A	6413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=121;PP=2965;SC=TCATTTCTTCGTCATCATTGA;SOR=1.040;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=215;TCF=94;TCR=121;TR=215;WE=41158871;WS=41158853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr5	41199959	rs1801033	G	T	4799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=69;PP=2720;SC=TACCAGAGGCGCAGTGCATGG;SOR=0.716;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=151;TCF=82;TCR=69;TR=151;WE=41199967;WS=41199949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr5	41381901	rs35812696	T	TC	584.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=4;PP=407;SC=ATTTGAGGTTTCCCCCTGACA;SOR=1.981;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=12;WE=41381909;WS=41381891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
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chr5	41382691	rs545358	C	A	5345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.82;SOR=1.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr5	41510473	.	G	T	636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=448;ReadPosRankSum=1.719;SC=AAAGCAGGGCGGGGCAGGTGG;SOR=0.686;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=45;TCF=38;TCR=7;TR=27;WE=41510481;WS=41510463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,27:0.54:50
chr5	41739684	rs33967331	G	A	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-2.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.330;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=19;PP=413;ReadPosRankSum=-1.667;SC=CAAGTTCGACGAGGTCGGGTG;SOR=0.476;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=45;TCF=11;TCR=34;TR=26;WE=41739692;WS=41739674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,26:0.58:45
chr5	41803415	rs34569700	C	T	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.450;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=53;ReadPosRankSum=-0.921;SC=TCACCCATGGCGCATTATTTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=41803423;WS=41803405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr5	41805575	rs16871955	G	C	1023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=13;PP=579;ReadPosRankSum=-1.882;SC=CCATAGACTAGAGATGACTCA;SOR=0.671;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=61;TCF=42;TCR=19;TR=39;WE=41805583;WS=41805565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,47:0.66:71
chr5	41842746	rs13164201	T	C	1738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.654;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=22;PP=851;ReadPosRankSum=0.176;SC=GTTGCTGATATGCACGAGTGT;SOR=1.014;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=145;TCF=93;TCR=52;TR=70;WE=41842754;WS=41842736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,85:0.51:168
chr5	41843797	rs4957430	C	T	2038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=49;PP=1167;ReadPosRankSum=-0.187;SC=TCATCCCTACCGCACCCCCTA;SOR=0.671;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=163;TCF=69;TCR=94;TR=85;WE=41843805;WS=41843787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,95:0.53:179
chr5	41911068	rs78886931	C	T	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.396;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=239;ReadPosRankSum=-0.119;SC=TGTTTTTAATCGATGAGTTTT;SOR=2.129;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=14;WE=41911076;WS=41911058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr5	41927423	rs277414	A	G	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.126;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=196;ReadPosRankSum=-0.115;SC=ATCCAAGTTAATCCTGACCCT;SOR=0.264;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=14;WE=41927431;WS=41927413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr5	42565843	rs12521020	C	T	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=346;ReadPosRankSum=-0.788;SC=AAAGACTTACCAGGATTCCTT;SOR=0.452;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=19;WE=42565851;WS=42565833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,20:0.69:29
chr5	42566166	rs10941579	A	T	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.508;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=4;PP=73;ReadPosRankSum=0.478;SC=TAGCAGCAAAAAGGAAACTTG;SOR=0.892;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=13;TCF=6;TCR=7;TR=7;WE=42566174;WS=42566156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr5	42646260	rs11415813	C	CT	259.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=376;ReadPosRankSum=1.226;SC=TTTTACTAAACTTTTAGAACA;SOR=0.384;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=12;WE=42646268;WS=42646250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr5	42700044	rs6179	A	G	2161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.224;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=56;PP=1263;ReadPosRankSum=-1.954;SC=TTCAGAAAGGATGGATGGTTC;SOR=0.557;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=216;TCF=85;TCR=131;TR=94;WE=42700052;WS=42700034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,108:0.44:245
chr5	42718335	rs76362844	G	A	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.442;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=287;ReadPosRankSum=-0.954;SC=ATTTTCTTGTGTCTCTTCTCC;SOR=1.828;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=16;WE=42718343;WS=42718325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr5	42769632	rs12055087	C	A	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=100;ReadPosRankSum=0.601;SC=TTAATAATTTCAACTGAGAGA;SOR=0.646;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=9;WE=42769640;WS=42769622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr5	42769647	rs12055266	T	C	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.442;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=154;ReadPosRankSum=1.831;SC=GAGAGAATAATTCCAAAATGA;SOR=1.387;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=12;WE=42769655;WS=42769637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,14:0.35:40
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chr5	42779686	rs11427149	G	GA	644.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=7.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.96;ReadPosRankSum=0.491;SOR=1.205;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,33:0.41:81
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chr5	43161337	rs903391	A	G	793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.676;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=9;PP=420;ReadPosRankSum=-1.423;SC=AAACCCCTACATTATGTATTT;SOR=1.075;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=101;TCF=70;TCR=31;TR=39;WE=43161345;WS=43161327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,45:0.39:114
chr5	43175040	rs115363430	T	G	1843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.550;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=34;PP=1036;ReadPosRankSum=-0.508;SC=AAACTGAACTTCTAGAAGCAG;SOR=0.625;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=160;TCF=92;TCR=68;TR=78;WE=43175048;WS=43175030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,91:0.51:179
chr5	43245922	rs13176855	C	T	1294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.160;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=19;PP=689;ReadPosRankSum=-0.165;SC=TGAACCCCCACTATGCCCGGT;SOR=0.358;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=100;TCF=70;TCR=30;TR=56;WE=43245930;WS=43245912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,62:0.58:106
chr5	43492265	rs6876588	T	C	500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=2;PP=277;SC=GCTTATTCTCTGTTAGTTAAA;SOR=2.584;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=43492273;WS=43492255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	43492978	rs10039298	G	A	4577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=66;NR=83;PP=2510;SC=TATTGCTATCGTTTATCCCAG;SOR=1.039;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=149;TCF=66;TCR=83;TR=149;WE=43492986;WS=43492968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr5	43493592	rs7732089	T	C	983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=6;PP=625;SC=AGTATGGATATAAACAATAAA;SOR=1.949;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=30;WE=43493600;WS=43493582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	43509348	rs6872851	T	A	3915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=75;NR=59;PP=2070;SC=AAAAATTCAGTGCCACAGGGA;SOR=0.746;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=135;TCF=76;TCR=59;TR=134;WE=43509374;WS=43509338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr5	43509462	rs11415989	T	TC	1729.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.25;NF=4;NR=26;PP=1390;SC=GGATAAGATATCTTCTAAGTC;SOR=1.298;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=30;WE=43509470;WS=43509452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr5	43527673	rs4318791	C	G	1029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=23;PP=675;SC=CCTAGACTGACTTATAATAGA;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=11;TCR=23;TR=34;WE=43527681;WS=43527663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr5	43533963	rs114943096	A	G	727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=22;PP=475;ReadPosRankSum=0.494;SC=ACAATAATGAAGCATGGCTGA;SOR=0.601;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=20;TCR=36;TR=34;WE=43533971;WS=43533953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,36:0.60:60
chr5	43533992	rs11741521	A	G	1048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=25;PP=724;SC=GTCTGCACCTAATAATGCAAG;SOR=2.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=34;WE=43534000;WS=43533982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	43704542	rs55984047	C	G	1126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.390;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=33;PP=748;ReadPosRankSum=0.101;SC=ATAATGCCACCTCTGCAGTTT;SOR=0.979;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=113;TCF=45;TCR=68;TR=51;WE=43704550;WS=43704532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,55:0.43:127
chr5	49695048	rs4030567	C	T	1107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=-1.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.312;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.248;NF=40;NR=21;PP=672;ReadPosRankSum=0.494;SC=GAAGGATAAACAAAGCTGAAA;SOR=1.187;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=159;TCF=98;TCR=61;TR=61;WE=49695056;WS=49695038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,59:0.41:144
chr5	49698180	rs13172025	G	A	2005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.310;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-11.209;NF=38;NR=57;PP=1330;ReadPosRankSum=-0.620;SC=GAATTTGACTGTGAAGTTGGT;SOR=0.857;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=202;TCF=86;TCR=116;TR=95;WE=49698188;WS=49698170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,99:0.44:224
chr5	49698986	rs13154223	C	A	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=2.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQRankSum=-2.800;QD=5.05;ReadPosRankSum=-4.191;SOR=0.370;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,16:0.28:57
chr5	49701519	rs34041280	CTGT	C	1844.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.887;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.779;NF=16;NR=11;PP=1090;ReadPosRankSum=-0.709;SC=TAAATGTTTTCTGTTGTTGTT;SOR=0.551;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=69;TCF=42;TCR=27;TR=27;WE=49701529;WS=49701509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,49:0.51:96
chr5	49701755	rs2271236	A	G	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=4.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.973;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.686;NF=0;NR=13;PP=232;ReadPosRankSum=1.399;SC=TAAATGTGCAAATATTGTCTC;SOR=2.002;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=7;TCR=43;TR=13;WE=49701763;WS=49701745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,8:0.17:47
chr5	50040778	rs282561	T	C	212.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=6;PP=142;SC=TTAAGCTTTGTTCTTTCCACG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=50040786;WS=50040768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	50045967	rs2442107	G	T	1476.98	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=13.644;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.69;ReadPosRankSum=0.361;SOR=2.137;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:8,67:0.89:75
chr5	50046139	rs282553	A	G	309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=9;PP=257;SC=TGGTAGAGGAAGCCTTAAAGC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=50046147;WS=50046129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	50052800	rs282551	T	C	453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=12;NR=1;PP=350;SC=GCATAACGTCTTCCATGTTCA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=50052808;WS=50052795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	50052888	rs282550	C	A	2484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=22;PP=1502;SC=TGTGTACCTCCGTTTCTTTAT;SOR=1.528;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=51;TCR=22;TR=73;WE=50052896;WS=50052878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr5	50053015	rs282549	G	A	4643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=78;NR=79;PP=2727;SC=TCCTGGTTCCGTTTCCTGTGG;SOR=0.922;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=157;TCF=78;TCR=79;TR=157;WE=50053023;WS=50053005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr5	50055456	.	C	CT	52	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.52;FR=1.0000;HP=17;HapScore=2;MGOF=43;MMLQ=16;MQ=53.88;NF=2;NR=1;PP=52;QD=18.3333333333;SC=CTTTCATTATCTTTTTTTTTT;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=3;WE=50055464;WS=50055446;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,3:0.38:8
chr5	50057729	rs282547	G	A	2833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=42;PP=1657;SC=ATTACGGAGGGCAGGTAAGGA;SOR=0.872;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=57;TCR=42;TR=99;WE=50057737;WS=50057719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr5	50122645	rs35290606	GT	G	66.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.24;MQRankSum=1.529;QD=2.38;ReadPosRankSum=1.723;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
chr5	50679574	.	C	T	954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.905;ClippingRankSum=0.000;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=26;PP=627;ReadPosRankSum=-1.203;SC=GTGTGCTGTTCTTGTGCGGGG;SOR=0.757;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=108;TCF=46;TCR=62;TR=44;WE=50679582;WS=50679564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,50:0.41:122
chr5	50683655	rs2288468	T	C	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=241;ReadPosRankSum=1.083;SC=CCACAACAACTATGGTAGCTA;SOR=1.179;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=12;WE=50683663;WS=50683645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr5	50685505	rs2303751	A	G	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=9;PP=367;ReadPosRankSum=-0.948;SC=CCAGGCAGCCAGCCCTGCGGC;SOR=0.828;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=58;TCF=37;TCR=21;TR=28;WE=50685513;WS=50685495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,32:0.50:64
chr5	52084365	rs10067659	G	C	2951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=48;NR=53;PP=1474;SC=ATCCACTTTCGGGCATTCCAG;SOR=1.028;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=102;TCF=49;TCR=53;TR=101;WE=52084373;WS=52084355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr5	52084441	rs2897351	C	A	1026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=26;PP=734;SC=AATTAGTTTTCGTGTCTCTCC;SOR=3.611;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=30;WE=52084449;WS=52084431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	52096889	rs1499280	C	A	5609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=93;PP=2965;SC=CTGCGACTACCTGTTTCAACA;SOR=0.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=182;TCF=89;TCR=93;TR=182;WE=52096897;WS=52096879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr5	52097764	rs11886	T	G	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.730;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=302;ReadPosRankSum=0.396;SC=GCTGCAAGAATGGCACTTTTT;SOR=0.257;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=15;WE=52097772;WS=52097754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr5	52157374	rs2447867	T	C	3851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=78;PP=2115;SC=CATTACCTTGTGTAAAGTTGG;SOR=1.061;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=138;TCF=60;TCR=78;TR=138;WE=52157382;WS=52157364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr5	52161500	rs11427012	G	GC	2078.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.113;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.182;NF=14;NR=21;PP=1263;ReadPosRankSum=-1.088;SC=TTCCAAATTTGACAATTGACT;SOR=0.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=88;TCF=37;TCR=51;TR=35;WE=52161508;WS=52161490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,63:0.42:149
chr5	52193287	rs1531545	C	T	1870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.250;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=24;PP=1082;ReadPosRankSum=-0.263;SC=ATGTTATAGCCACAGCTGACC;SOR=0.803;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=99;TCR=46;TR=76;WE=52193295;WS=52193277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,86:0.51:169
chr5	52193414	rs377107895	C	CA	8358.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=102;PP=2972;SC=CTTCCCTTCCCAAACCAACAT;SOR=1.082;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=127;TCF=17;TCR=110;TR=118;WE=52193422;WS=52193404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr5	52204943	rs1478441	C	T	1603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=37;PP=1018;SC=TAATAAATTCCAATTTTTCAC;SOR=2.001;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=15;TCR=37;TR=52;WE=52204951;WS=52204933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr5	52218694	rs61748764	C	T	3018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.513;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=71;PP=1809;ReadPosRankSum=-0.577;SC=TGATGATTCTCTACCAAACTC;SOR=0.597;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=239;TCF=100;TCR=139;TR=126;WE=52218702;WS=52218684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,140:0.54:259
chr5	52223350	rs923837	A	G	2592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=52;PP=1675;ReadPosRankSum=-0.116;SC=GAAAATTCTGAAAGAACACGT;SOR=0.704;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=236;TCF=132;TCR=104;TR=119;WE=52223358;WS=52223340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,123:0.48:254
chr5	52223516	rs10038773	C	A	1133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.952;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=32;PP=766;ReadPosRankSum=-1.009;SC=ATACAAAATACATGTAGAAAT;SOR=1.089;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=91;TCF=30;TCR=61;TR=46;WE=52223524;WS=52223506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,49:0.51:96
chr5	52235802	rs1904165	T	G	2284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=54;PP=1623;SC=TCTATGCACTTATTGAATAAT;SOR=2.073;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=20;TCR=54;TR=74;WE=52235810;WS=52235792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr5	52235854	rs2447874	T	A	629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=15;PP=433;SC=TGCAAGGCACTGTGCTGCTTT;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=19;WE=52235862;WS=52235844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	52240973	rs142523147	CGGT	C	184.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=165;ReadPosRankSum=-2.497;SC=GTATTGCTCTCGGTAAGTGAC;SOR=0.340;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=5;WE=52240983;WS=52240963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr5	52243059	rs3764924	A	G	260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=0;PP=207;SC=ATGTTTTCTCATTATATAGTA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=52243067;WS=52243049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	52243361	rs3764923	A	C	1100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=31;PP=733;ReadPosRankSum=-1.295;SC=AAGCTCTGATATATTCAGACT;SOR=0.704;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=28;TCR=66;TR=44;WE=52243369;WS=52243351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,49:0.49:101
chr5	52248291	rs1054085	T	C	1240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=22;NR=20;PP=675;SC=AAATATTTTATGAAAGAAAAT;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=22;TCR=20;TR=42;WE=52248299;WS=52248281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr5	52285117	rs28095	T	C	827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=1;PP=674;SC=AGGGGCGGGCTGGGGCGGGCC;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=52285125;WS=52285107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr5	52344610	rs1421933	A	G	1102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=27;PP=766;SC=GGTATGGCTAACAGAAATGCA;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=35;WE=52344618;WS=52344600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr5	52347369	rs1126643	C	T	3136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.417;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=69;PP=1796;ReadPosRankSum=-1.173;SC=CAAACACATTCGGAGCAATTC;SOR=0.664;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=272;TCF=131;TCR=141;TR=137;WE=52347377;WS=52347359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,152:0.51:300
chr5	52351413	rs1062535	G	A	2361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.902;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=46;PP=1489;ReadPosRankSum=-0.437;SC=GAAGTGCTACGAAAGTAATGG;SOR=0.514;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=221;TCF=133;TCR=88;TR=111;WE=52351421;WS=52351403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,117:0.49:241
chr5	52351746	rs3212522	G	A	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=54;ReadPosRankSum=-0.566;SC=TTCAAAATAGGCTAGAATGTA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=4;WE=52351754;WS=52351736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr5	52354103	rs996765	A	T	1232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=30;PP=867;SC=AATTTGAAGGATAATAATGTC;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=36;WE=52354111;WS=52354093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr5	52355854	rs2303127	T	C	764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.217;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=25;PP=538;ReadPosRankSum=-1.079;SC=TAAGGCATGGTAATAATTGGC;SOR=1.276;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=97;TCF=36;TCR=61;TR=35;WE=52355862;WS=52355844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,38:0.34:112
chr5	52356692	rs3212538	T	C	2003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.210;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=30;PP=1315;ReadPosRankSum=-1.944;SC=TTTGCTCAGATAGTCAATGTT;SOR=0.593;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=162;TCF=103;TCR=59;TR=85;WE=52356700;WS=52356682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,93:0.53:176
chr5	52358761	rs35940809	TA	T	145.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=1.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.17;ReadPosRankSum=-0.908;SOR=0.377;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,14:0.30:46
chr5	52366138	rs2112290	G	A	4121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=84;PP=2501;SC=TCCTAAAGACGAGAGAGTGGT;SOR=1.334;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=135;TCF=51;TCR=84;TR=135;WE=52366146;WS=52366128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr5	52367666	rs2287872	A	T	2043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=10;PP=1382;SC=ACTGTGCTCTAAATTGTAAAC;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=52;TCR=10;TR=62;WE=52367674;WS=52367656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr5	52367706	rs2287871	T	C	1353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.199;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=22;PP=774;ReadPosRankSum=1.351;SC=TGTTTTAATGTTGCTATGCTC;SOR=0.463;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=127;TCF=84;TCR=43;TR=62;WE=52367714;WS=52367696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,69:0.51:136
chr5	52368922	rs984966	T	A	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.061;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=264;ReadPosRankSum=-2.960;SC=TAATGGCTTTTCCCCCCTCCT;SOR=0.882;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=55;TCF=40;TCR=15;TR=21;WE=52368930;WS=52368912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,23:0.38:60
chr5	52370174	rs3212591	G	A	2090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.240;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=33;PP=1223;ReadPosRankSum=0.906;SC=CACAAATGTTGTATGCCAATT;SOR=0.924;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=182;TCF=111;TCR=71;TR=95;WE=52370182;WS=52370164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,101:0.51:197
chr5	52379277	rs2303122	C	T	1986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.269;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=48;PP=1330;ReadPosRankSum=-0.540;SC=ACGGGACTTTCGCATCAGTAA;SOR=0.870;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=204;TCF=104;TCR=100;TR=90;WE=52379285;WS=52379267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,96:0.42:230
chr5	52396439	rs3214755	GA	G	388.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.19;MQRankSum=1.196;NF=0;NR=15;PP=172;ReadPosRankSum=0.465;SC=CTAGACAGATGAAAAAAAATC;SOR=0.723;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=15;WE=52396447;WS=52396429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,21:0.43:49
chr5	52396500	rs3816326	C	T	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.72;MQRankSum=-1.273;NF=1;NR=9;PP=160;ReadPosRankSum=1.097;SC=CGTAAACATACAGTTAGAAAA;SOR=0.527;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=10;WE=52396508;WS=52396490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr5	52397311	rs2233216	T	C	1726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.730;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.862;NF=19;NR=49;PP=1147;ReadPosRankSum=-2.071;SC=TAATGACTTTTTTCCCTTCAA;SOR=0.791;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=120;TCF=35;TCR=85;TR=68;WE=52397319;WS=52397301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,74:0.58:127
chr5	52397355	rs149759198	A	AAAAG	487.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.26;MQRankSum=1.255;QD=14.35;ReadPosRankSum=-0.473;SOR=0.798;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr5	52398005	rs2233213	T	C	1765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.119;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=46;PP=1155;ReadPosRankSum=-0.875;SC=TTCTCGGCAGTAAAGTTTATA;SOR=0.806;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=176;TCF=76;TCR=100;TR=79;WE=52398013;WS=52397995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,86:0.43:202
chr5	52404276	rs140365238	C	CTTA	774.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.580;HP=5;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.297;NF=15;NR=4;PP=1208;ReadPosRankSum=0.221;SC=CGAAATTAACCTTTTTACTTT;SOR=1.042;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=47;TCF=37;TCR=10;TR=19;WE=52404295;WS=52404266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,22:0.39:57
chr5	52404287	rs3846488	T	G	620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.136;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.786;NF=19;NR=7;PP=1201;ReadPosRankSum=0.006;SC=TTTTTACTTTTATCATTTATG;SOR=0.516;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=65;TCF=51;TCR=14;TR=26;WE=52404295;WS=52404266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,28:0.39:71
chr5	52404312	rs153602	C	T	3453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=31;PP=2244;SC=TTGAAAATATCTAAGTGTTAC;SOR=1.883;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=78;TCR=31;TR=109;WE=52404320;WS=52404302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr5	52405377	rs142643273	C	CCGGGGG	835.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=5;NR=2;PP=358;SC=CAGGAAGGGCCCGGGGGCGGG;SOR=4.174;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=12;TCF=6;TCR=6;TR=7;WE=52405385;WS=52405367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	52781376	rs33951575	GTT	G	610.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=13.222;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.45;ReadPosRankSum=1.128;SOR=2.900;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,22:0.92:24
chr5	52781597	rs722910	A	T	2243.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.656;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=70;PP=1835;ReadPosRankSum=-1.075;SC=CTTTAAAAAAATTTTTTTAAC;SOR=2.359;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=100;TCF=29;TCR=71;TR=98;WE=52781605;WS=52781580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,86:0.98:88
chr5	52856504	rs2279516	G	C	1298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.624;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=26;PP=799;ReadPosRankSum=-1.721;SC=TGGCGGCGGTGTCAATGTCAG;SOR=0.622;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=128;TCF=69;TCR=59;TR=55;WE=52856512;WS=52856494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,62:0.44:141
chr5	52856716	rs1532163	A	G	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=27;ReadPosRankSum=1.150;SC=TCTCGGGAGAAGTCGGGCGGA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=3;WE=52856724;WS=52856706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
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chr5	52942083	rs31304	A	C	3326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=32;PP=2109;SC=CTTTAACTGGAGTTCCAGAAG;SOR=1.649;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=112;TCF=80;TCR=32;TR=111;WE=52942091;WS=52942073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
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chr5	52979097	rs567	G	A	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.971;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=262;ReadPosRankSum=-1.256;SC=AAAGTCAGCTGTGCAGTATTT;SOR=0.286;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=48;TCF=10;TCR=38;TR=22;WE=52979105;WS=52979087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,29:0.51:57
chr5	53450650	.	T	G	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.697;ClippingRankSum=-0.000;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=55;ReadPosRankSum=-0.484;SC=TCTTCTGCCATTATCAAAACA;SOR=1.022;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=4;WE=53450658;WS=53450640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr5	53606295	rs35941	T	C	6245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=104;NR=106;PP=2965;SC=CCTCAGTTATTCGGAGATCAG;SOR=0.792;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=210;TCF=104;TCR=106;TR=210;WE=53606303;WS=53606285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr5	53751901	rs7699	G	A	3635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=372;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=76;PP=2189;ReadPosRankSum=-0.037;SC=AAGGCTGGCTGCTGATAAAAG;SOR=0.697;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=346;TCF=179;TCR=167;TR=163;WE=53751909;WS=53751891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:193,179:0.48:372
chr5	53751988	rs7823	T	C	8646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=147;NR=154;PP=2965;SC=TACCAGATGGTGTGGAAATCA;SOR=0.808;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=301;TCF=147;TCR=154;TR=301;WE=53751996;WS=53751978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,328:1.00:328
chr5	53813830	rs76854460	A	C	2843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.414;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=60;PP=1552;ReadPosRankSum=-0.578;SC=CGGAGAACCCAGGAGAGATCT;SOR=0.720;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=274;TCF=149;TCR=125;TR=130;WE=53813838;WS=53813820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,144:0.47:305
chr5	53814052	rs2548615	T	C	2551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=38;PP=1284;SC=AGCCCCTGCCTGTCGCGCCCC;SOR=0.735;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=45;TCR=38;TR=83;WE=53814066;WS=53814042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr5	53814394	rs2548614	T	C	3129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=43;PP=1957;SC=TGTCCCTGGGTTCCCGCGGCG;SOR=0.804;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=57;TCR=43;TR=100;WE=53814402;WS=53814384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr5	53815066	rs2548613	C	A	1659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.692;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=31;PP=1151;ReadPosRankSum=1.015;SC=AGAGCAAGATCGACGGCTTCA;SOR=0.825;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=144;TCF=76;TCR=68;TR=68;WE=53815074;WS=53815056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,74:0.47:158
chr5	53815495	rs2548612	A	C	6389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=105;NR=101;PP=2965;SC=GGGTTTCAGAATCATATTCTA;SOR=0.757;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=206;TCF=105;TCR=101;TR=206;WE=53815503;WS=53815485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr5	53815722	rs2565014	G	A	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=124;ReadPosRankSum=2.199;SC=TGAGACGAGGGTAGAATTAGA;SOR=0.307;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=9;WE=53815730;WS=53815712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr5	54153803	rs10040872	C	T	5132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=92;PP=2965;SC=GTACATACTGCGGGAAAGCCT;SOR=1.112;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=162;TCF=70;TCR=92;TR=162;WE=54153811;WS=54153793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr5	54154209	rs3916738	G	A	6210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=103;PP=2965;SC=GAAACCTTTCGTATGTAAAGA;SOR=0.773;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=207;TCF=104;TCR=103;TR=207;WE=54154217;WS=54154199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr5	54154328	rs4242050	C	T	1365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=32;PP=910;SC=TTTAGCCCATCGGTTGCCATC;SOR=2.208;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=11;TCR=32;TR=43;WE=54154336;WS=54154318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr5	54253615	rs11954366	C	T	3192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=49;PP=1909;SC=GCTTTTCTTTCTTTGTGATCA;SOR=0.822;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=100;TCF=51;TCR=49;TR=100;WE=54253623;WS=54253605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr5	54253635	rs3815924	T	C	2997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=47;PP=1791;SC=ATTTGCAGGATTCCACACCAC;SOR=0.888;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=48;TCR=47;TR=95;WE=54253643;WS=54253625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr5	54253754	rs6883914	T	C	648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=18;PP=528;SC=GGAGATGCATTAGGCTTTATC;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=54253762;WS=54253744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	54403957	rs3104233	T	C	2602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=52;NR=27;PP=1246;SC=CAACAGCTGATGGAAAAAGCA;SOR=1.274;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=52;TCR=27;TR=79;WE=54403965;WS=54403947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr5	54404015	rs1875506	C	T	5228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.68;SOR=1.071;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr5	54404057	rs1051846	C	G	2139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=43;PP=1209;ReadPosRankSum=0.496;SC=CAGGGTGGGGCAGGACTCACA;SOR=0.674;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=180;TCF=97;TCR=83;TR=92;WE=54404065;WS=54404047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,106:0.52:205
chr5	54410120	rs3104230	A	C	3555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=45;NR=74;PP=2264;SC=GGACTCAAAGACAGGTGCAGC;SOR=1.406;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=45;TCR=74;TR=119;WE=54410128;WS=54410110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr5	54423032	rs10043273	C	G	1755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.787;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=23;PP=1160;ReadPosRankSum=-2.353;SC=TACTCAGGCCCCATAATCAAT;SOR=1.357;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=148;TCF=98;TCR=50;TR=79;WE=54423040;WS=54423022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,86:0.53:161
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chr5	54436068	rs114595843	T	A	1207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.519;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=23;PP=680;ReadPosRankSum=0.586;SC=ATAATATATTTTAAGATTAGG;SOR=0.358;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=122;TCF=77;TCR=45;TR=56;WE=54436076;WS=54436058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,62:0.47:131
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chr5	54517102	rs34101652	C	CT	246.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=0;NR=9;PP=162;SC=AATCAATTTACTTTTTTTTTA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=9;WE=54517110;WS=54517092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	54518660	rs7730048	G	A	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.694;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=373;ReadPosRankSum=0.150;SC=ATGAGTTGCTGGAGAGTCGTT;SOR=0.302;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=40;TCF=33;TCR=7;TR=23;WE=54518668;WS=54518650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,23:0.57:40
chr5	54518687	rs334877	T	C	726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=8;PP=454;ReadPosRankSum=-0.785;SC=TGGCTGGGTTTACCACCTTCA;SOR=0.815;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=68;TCF=48;TCR=20;TR=31;WE=54518695;WS=54518677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,35:0.48:73
chr5	54557438	rs400437	T	C	712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=19;PP=535;SC=CATTTTAAGCTCAGAGTATTT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=54557446;WS=54557428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	54563775	rs143912964	TTTA	T	160.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=141;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TTTTCAATATTTTATTATGTT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=4;WE=54563785;WS=54563765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr5	54572163	rs3761764	T	C	873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.825;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=12;PP=518;ReadPosRankSum=-2.734;SC=CTTCCAGAAATTTCTGACAAT;SOR=0.830;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=79;TCF=53;TCR=26;TR=39;WE=54572171;WS=54572153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,44:0.51:87
chr5	54594285	rs10940461	G	A	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.057;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=26;ReadPosRankSum=-0.398;SC=ATTTTTAGTAGAGATTAGCTC;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=3;WE=54594293;WS=54594275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr5	54603822	rs2290595	T	C	1776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.142;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=31;PP=1026;ReadPosRankSum=-0.815;SC=GAGGGAGATTTGCTCTCACTG;SOR=0.795;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=173;TCF=106;TCR=67;TR=80;WE=54603830;WS=54603812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,85:0.45:191
chr5	54635810	rs13436420	G	T	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=235;ReadPosRankSum=0.497;SC=AGGAAAAGTTGTATGATTATT;SOR=0.507;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=15;WE=54635818;WS=54635800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr5	54635826	rs111348674	T	TC	631.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.555;NF=9;NR=7;PP=577;ReadPosRankSum=0.597;SC=TTATTTGTTTTCACATTTGTA;SOR=0.869;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=35;TCF=19;TCR=16;TR=16;WE=54635834;WS=54635816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,22:0.47:47
chr5	54637758	rs10592648	CAG	C	337.87	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=184;ReadPosRankSum=-1.645;SC=ATTTTTGAAACAGAGTTTCAC;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=5;WE=54637767;WS=54637748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,9:0.90:10
chr5	54639385	rs138200811	T	TA	203.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=175;ReadPosRankSum=2.624;SC=TCCAGAATAATAAAAAAAACA;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=11;WE=54639393;WS=54639375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr5	54640496	rs2305678	A	G	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=346;ReadPosRankSum=-1.158;SC=ATACTTTATTATTAATATCTT;SOR=0.689;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=60;TCF=20;TCR=40;TR=23;WE=54640504;WS=54640486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,25:0.37:67
chr5	54645411	rs2061242	G	A	785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=14;PP=423;ReadPosRankSum=-0.680;SC=ATGAAGAAAAGAAGATGGTTG;SOR=0.746;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=55;TCF=31;TCR=24;TR=33;WE=54645419;WS=54645401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,37:0.61:61
chr5	54646894	rs9885400	A	G	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.539;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.596;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=39;ReadPosRankSum=-1.370;SC=CCCCCATATCATGTTGTATGA;SOR=0.180;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=6;WE=54646902;WS=54646884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr5	54648918	rs9292089	T	C	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.012;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=4;PP=511;ReadPosRankSum=1.658;SC=AGATTAATAATGCATTTACTT;SOR=1.673;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=51;TCF=41;TCR=10;TR=28;WE=54648926;WS=54648908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,29:0.53:55
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chr5	54674963	rs139182599	T	C	716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.07;ReadPosRankSum=2.822;SOR=0.743;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,39:0.49:79
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chr5	54718618	rs230753	G	C	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.971;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=173;ReadPosRankSum=0.685;SC=ATTAATTATCGTGTGTTCTCC;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=11;WE=54718626;WS=54718608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr5	54721619	rs3217330	A	AT	398.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=6;PP=156;ReadPosRankSum=0.569;SC=GATTTTTTGGATTTTTTTTTT;SOR=0.653;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=49;TCF=28;TCR=21;TR=14;WE=54721627;WS=54721609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,22:0.42:53
chr5	54721642	rs230750	A	C	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=5.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.88;ReadPosRankSum=0.323;SOR=0.314;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,38:0.40:95
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chr5	54737791	rs2278257	G	C	1062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.959;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=31;PP=775;ReadPosRankSum=0.358;SC=CAAAAGTATTGTTGATTTCAT;SOR=0.552;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=79;TCF=20;TCR=59;TR=42;WE=54737799;WS=54737781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,44:0.52:85
chr5	54804621	rs7707766	C	T	1306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.408;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=19;PP=728;ReadPosRankSum=-1.151;SC=GAAGTGAAGACCCAGGTGTAC;SOR=0.567;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=116;TCF=76;TCR=40;TR=56;WE=54804629;WS=54804611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,64:0.49:131
chr5	54830295	rs2292280	T	G	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.547;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=260;ReadPosRankSum=0.843;SC=GCCCCACAGCTGCGCACGCGT;SOR=1.101;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=18;WE=54830303;WS=54830285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr5	54830380	rs11745331	A	G	1964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.242;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=37;PP=1198;ReadPosRankSum=-2.488;SC=CGCCCCTCGGACCCGGCGGCG;SOR=0.825;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=154;TCF=87;TCR=67;TR=88;WE=54830388;WS=54830370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,94:0.58:163
chr5	54941810	rs6450329	TG	CA	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.741;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=419;ReadPosRankSum=-1.743;SC=AAAAATCAGTTGTCACTGTTT;SOR=0.287;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=14;WE=54941819;WS=54941800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr5	54944945	rs35843566	TA	T	31.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.682;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=28;ReadPosRankSum=-0.501;SC=ATGCTCAGCATAAAAAAAAAA;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=4;WE=54944953;WS=54944935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr5	54944976	rs11738633	G	C	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=180;ReadPosRankSum=-1.769;SC=TTTTAGAATAGCATATGACAA;SOR=1.352;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=10;WE=54944984;WS=54944966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr5	54948586	rs138550751	C	CA	1862.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-2.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.689;HP=7;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.942;NF=2;NR=22;PP=1523;ReadPosRankSum=-0.064;SC=AAGAAGATGACAAAAAACAAA;SOR=0.483;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=56;TCF=4;TCR=52;TR=24;WE=54948606;WS=54948576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,53:0.54:98
chr5	54948598	rs11424790	C	CA	1781.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=2.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.95;ReadPosRankSum=-0.068;SOR=0.425;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,50:0.53:94
chr5	54952688	rs11393180	C	CT	86.52	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.42;ReadPosRankSum=-0.210;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr5	54960609	rs4865614	A	G	2864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.875;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=60;PP=1854;ReadPosRankSum=-0.228;SC=CCAAGGAGAAAAGGAGACTCG;SOR=0.725;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=259;TCF=135;TCR=124;TR=123;WE=54960617;WS=54960599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,139:0.47:298
chr5	54960673	rs4865615	C	G	1552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-3.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.614;HP=1;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=42;PP=1915;ReadPosRankSum=0.251;SC=ATATTCCCAGCTAGTGGTATC;SOR=0.604;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=131;TCF=51;TCR=80;TR=67;WE=54960695;WS=54960663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,77:0.49:156
chr5	54960687	rs4865616	C	T	1239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.704;HP=2;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=36;PP=1915;ReadPosRankSum=-0.269;SC=TGGTATCCAACGAAACTAGAT;SOR=0.788;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=105;TCF=38;TCR=67;TR=54;WE=54960695;WS=54960663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,60:0.49:122
chr5	54964974	rs7737254	A	G	1130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.734;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=11;PP=616;ReadPosRankSum=0.551;SC=ACACACATGTAGCATATACAC;SOR=1.126;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=112;TCF=78;TCR=34;TR=43;WE=54964982;WS=54964964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,50:0.42:120
chr5	54965513	rs11749883	C	T	661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.223;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=14;PP=435;ReadPosRankSum=0.562;SC=TTAATTGAGACAAAAATTTAA;SOR=0.374;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=75;TCF=44;TCR=31;TR=30;WE=54965521;WS=54965503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,33:0.39:85
chr5	54986963	rs3846505	A	G	2400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.332;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=52;PP=1617;ReadPosRankSum=-0.081;SC=AGAGCACCTGAAATGTTCTCA;SOR=0.712;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=258;TCF=131;TCR=127;TR=113;WE=54986971;WS=54986953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,118:0.43:274
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chr5	54993829	rs3761766	A	G	1424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=35;PP=759;ReadPosRankSum=-0.815;SC=TCCTACACAAAGAAGATAAAT;SOR=0.716;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=129;TCF=58;TCR=71;TR=63;WE=54993837;WS=54993819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,73:0.50:145
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chr5	55155402	rs1009639	C	T	5261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=71;PP=2965;SC=GGATGCTCCCCTCACTCTGCA;SOR=0.915;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=170;TCF=99;TCR=71;TR=170;WE=55155410;WS=55155392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr5	55168328	rs71602921	C	CCTT	104.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=54;ReadPosRankSum=0.405;SC=ATGTTTACCTCCTTCTCTGTT;SOR=2.303;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=3;WE=55168336;WS=55168318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr5	55179052	rs10940491	A	T	1731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.576;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=41;PP=956;ReadPosRankSum=0.028;SC=ATAATATTCCAATTAGAGGCC;SOR=0.781;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=150;TCF=63;TCR=87;TR=71;WE=55179060;WS=55179042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,83:0.49:169
chr5	55196023	rs1148039	C	T	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.180;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=95;ReadPosRankSum=0.302;SC=AGGAGCAGTCCCTGTGCTCTC;SOR=0.116;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=9;WE=55196031;WS=55196013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr5	55206444	rs161704	G	A	1477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-2.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.748;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=29;PP=674;ReadPosRankSum=1.374;SC=GTCATGGCCAGCACCAGTGCT;SOR=0.592;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=135;TCF=75;TCR=60;TR=60;WE=55206452;WS=55206434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,76:0.46:164
chr5	55212446	rs16884641	T	G	906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-3.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=5;PP=605;ReadPosRankSum=0.283;SC=AAATGACCACTTGGGATGTCC;SOR=0.551;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=66;TCF=59;TCR=7;TR=37;WE=55212454;WS=55212436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,41:0.55:74
chr5	55213023	rs161699	C	T	468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=14;PP=362;SC=AGACTCGGCACGCAGCGCTTG;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=55213031;WS=55213013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	55246001	rs4865999	A	G	2543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=44;NR=39;PP=1475;SC=CGAGGGAGGGAAAATGTATTT;SOR=0.780;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=44;TCR=39;TR=83;WE=55246009;WS=55245991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr5	55398269	rs318818	G	C	2195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=18;PP=1522;SC=TTAGTTGTGTGTAGATATGTT;SOR=1.765;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=75;TCF=57;TCR=18;TR=72;WE=55398277;WS=55398259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr5	55412347	rs318805	A	G	871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.229;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=13;PP=611;ReadPosRankSum=0.467;SC=TAATAATATTATTATTGGTTT;SOR=0.290;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=64;TCF=46;TCR=18;TR=38;WE=55412355;WS=55412337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,38:0.57:67
chr5	55422681	rs321768	C	T	338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=2;PP=256;SC=TTAAACATCTCCTTTATTTTA;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=55422689;WS=55422671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	55455600	rs115250350	C	T	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.095;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=404;ReadPosRankSum=-0.512;SC=GGTTCAGAAACGCCCTTCCTT;SOR=1.901;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=21;WE=55455608;WS=55455590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,23:0.62:37
chr5	55472289	rs160936	T	C	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=161;ReadPosRankSum=1.662;SC=TTTTTTTTACTGGCTCTTTTC;SOR=0.610;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=10;WE=55472297;WS=55472279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr5	55528572	.	A	AAC	98	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MMLQ=26;MQ=61.02;NF=5;NR=0;PP=98;QD=20.4;SC=CACGCACATGAACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=5;WE=55528580;WS=55528562;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:10,5:0.33:15
chr5	55528815	rs149489	T	C	2182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.120;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=60;PP=1195;ReadPosRankSum=1.328;SC=ACTGTCAACATGACAGTCAGA;SOR=0.814;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=191;TCF=72;TCR=119;TR=96;WE=55528823;WS=55528805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,107:0.52:204
chr5	55753652	rs16877004	C	T	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.360;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=11;PP=578;ReadPosRankSum=-0.327;SC=GGGAGCTCTGCGCAGTTTTGT;SOR=0.392;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=47;TCF=36;TCR=11;TR=35;WE=55753660;WS=55753642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,37:0.71:52
chr5	55753822	rs148833159	C	CA	2063.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.204;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.702;NF=6;NR=31;PP=1449;ReadPosRankSum=-0.767;SC=TTCATGTCAACAGGTTCACTG;SOR=1.022;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=65;TCF=11;TCR=54;TR=37;WE=55753830;WS=55753812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,67:0.52:130
chr5	55759715	rs157851	T	C	636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.46;SOR=4.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	55759715	.	TTATCG	CTATCA,CTATCG	180	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.1;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=6,16;NR=0,1;PP=81,180;QD=22.411312477;SC=AACTCTCTCATTATCGGTTAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=6,17;WE=55759728;WS=55759705;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.35:17
chr5	55759720	rs4081705	G	A	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.49;ReadPosRankSum=1.522;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr5	55807370	rs464605	C	T	534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=8;PP=366;ReadPosRankSum=-0.363;SC=GATGTAGCTGCCATTGTGTCT;SOR=0.760;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=40;TCF=29;TCR=11;TR=24;WE=55807378;WS=55807360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,25:0.54:46
chr5	55828995	.	T	G	322	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=13;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=0;NR=24;PP=322;QD=14.8654671895;SC=GCATGGGGGGTGGGGGGGAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=61;TCF=29;TCR=32;TR=24;WE=55829003;WS=55828985;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:37,24:0.39:61
chr5	55831021	rs13178412	A	G	937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=20;PP=639;ReadPosRankSum=1.094;SC=AGGCTTTGGTACCCATGCTCT;SOR=0.658;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=84;TCF=43;TCR=41;TR=41;WE=55831029;WS=55831011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,43:0.47:91
chr5	55851796	rs35483518	C	CA	68	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=6;NR=0;PP=82;SC=GACTCCGTCACAAAAAAAAAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=6;WE=55851804;WS=55851786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	55851872	rs78650987	G	A	824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=2.878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.06;ReadPosRankSum=0.726;SOR=0.620;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,44:0.54:82
chr5	56111751	rs28710284	G	C	894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=14;NR=13;PP=470;SC=ACGGAGCCGCGAGCCGCGGCG;SOR=1.022;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=28;TCF=14;TCR=14;TR=27;WE=56111759;WS=56111741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	56152416	rs832567	C	A	1020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.216;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=9;PP=607;ReadPosRankSum=0.511;SC=TTGTTTCTGCCTGCATTTTAG;SOR=1.123;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=63;TCF=46;TCR=17;TR=38;WE=56152424;WS=56152406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,43:0.59:73
chr5	56161078	rs151328107	A	C	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=325;ReadPosRankSum=-0.963;SC=TTAGTATAAAAAGTTGGAAAT;SOR=0.404;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=35;TCF=33;TCR=2;TR=18;WE=56161086;WS=56161068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr5	56161787	rs832575	G	A	7384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=142;PP=2965;SC=GTACTTCTACGTCTAGTTCAG;SOR=1.230;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=236;TCF=94;TCR=142;TR=236;WE=56161795;WS=56161777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,274:1.00:274
chr5	56177148	rs895380	A	G	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=277;ReadPosRankSum=-1.754;SC=TACCCTCCCTACACCCTCCTC;SOR=0.770;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=15;WE=56177156;WS=56177138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr5	56177443	rs702689	G	A	2981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.936;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=55;PP=1836;ReadPosRankSum=0.166;SC=GCAGTCCATTGATAATTCCCA;SOR=0.812;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=272;TCF=157;TCR=115;TR=133;WE=56177451;WS=56177433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,147:0.50:296
chr5	56177743	rs832582	G	A	9087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=154;NR=144;PP=2965;SC=TGAGTGCACAGTCCATTTAGA;SOR=0.699;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=298;TCF=154;TCR=144;TR=298;WE=56177751;WS=56177733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,335:1.00:335
chr5	56177848	rs5868032	TCAA	T	10160.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=1.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=497;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.232;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.17;MQRankSum=0.412;NF=39;NR=162;PP=2992;ReadPosRankSum=1.280;SC=ACCTTCTAGTTCAACAACAAC;SOR=0.579;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=264;TCF=56;TCR=208;TR=201;WE=56177861;WS=56177836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:8,395:0.98:403
chr5	56178217	rs832583	A	C	6786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=104;NR=114;PP=2965;SC=AAAGCCATCTAGACCTACCCC;SOR=0.840;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=218;TCF=104;TCR=114;TR=218;WE=56178225;WS=56178207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr5	56179341	rs16886463	G	A	2956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.252;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=49;PP=1894;ReadPosRankSum=0.873;SC=GATTGCTTTCGTTTAATATGT;SOR=0.559;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=218;TCF=135;TCR=83;TR=126;WE=56179349;WS=56179331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,136:0.56:241
chr5	56180480	rs3736430	A	G	1471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.686;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=20;PP=1039;ReadPosRankSum=2.886;SC=GAACGTGTTTATTTGAAACAG;SOR=0.787;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=122;TCF=84;TCR=38;TR=61;WE=56180488;WS=56180470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,64:0.48:133
chr5	56205643	rs252924	A	G	2095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.402;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=42;PP=978;ReadPosRankSum=0.493;SC=GGCGGGACGCAAAGCGGAGAG;SOR=0.559;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=139;TCF=44;TCR=95;TR=62;WE=56205651;WS=56205633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,68:0.45:150
chr5	56205662	rs252923	T	G	1626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.987;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=30;PP=649;ReadPosRankSum=0.503;SC=AGCCTGAGGCTGACTGCCGGC;SOR=0.954;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=86;TCF=19;TCR=67;TR=38;WE=56205670;WS=56205652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,43:0.47:91
chr5	56206073	rs33321	G	T	947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.473;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=10;PP=434;ReadPosRankSum=-2.193;SC=GAAAAGCCAAGCCAGGGTTTA;SOR=0.866;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=108;TCF=73;TCR=35;TR=41;WE=56206081;WS=56206063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,51:0.40:126
chr5	56207123	rs2257505	T	A	2256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.993;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=43;PP=1514;ReadPosRankSum=-0.815;SC=AGAAATCTTGTCTATGCTTCC;SOR=0.423;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=180;TCF=101;TCR=79;TR=91;WE=56207131;WS=56207113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,99:0.50:198
chr5	56209043	rs72145037	CTTTA	C	1383.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.000;NF=1;NR=22;PP=937;ReadPosRankSum=0.547;SC=AGCATTTGTACTTTATTTATT;SOR=0.770;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=53;TCF=2;TCR=51;TR=23;WE=56209054;WS=56209033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,37:0.51:72
chr5	56209735	rs40497	A	G	1914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=36;PP=1200;ReadPosRankSum=-0.101;SC=CGGCCCTTTAAAAATGAGTGA;SOR=0.687;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=188;TCF=109;TCR=79;TR=85;WE=56209743;WS=56209725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,93:0.44:209
chr5	56210923	rs331499	G	A	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.807;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=72;ReadPosRankSum=0.437;SC=AGATTTTTATGTTCACACCTT;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=6;WE=56210931;WS=56210913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr5	56212595	rs832536	C	T	703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.581;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=5;PP=534;ReadPosRankSum=0.654;SC=AAAATATGAGCTTATATTTGT;SOR=1.143;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=55;TCF=43;TCR=12;TR=28;WE=56212603;WS=56212585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,30:0.51:59
chr5	56212764	rs112920436	A	G	1017.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.102;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=25;PP=631;ReadPosRankSum=-0.459;SC=TTTTCTACTCAGCTATTAATT;SOR=0.370;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=74;TCF=29;TCR=45;TR=43;WE=56212772;WS=56212754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,47:0.57:83
chr5	56221328	rs702679	A	G	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=102;ReadPosRankSum=0.453;SC=ACACAAGACCATTTACATTAG;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=6;WE=56221336;WS=56221318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr5	56224485	rs10684065	T	TTGGC	187.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=0;PP=151;SC=TGAAATGCTATAAGGGAACAT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=56224493;WS=56224475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	56224714	rs252893	T	C	1983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=33;PP=1130;SC=AAATAAAATTTATGGGCCCCC;SOR=0.971;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=29;TCR=33;TR=62;WE=56224722;WS=56224704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr5	56224834	.	T	A	115	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=113;MMLQ=27;MQ=57.88;NF=1;NR=4;PP=115;QD=29.9542425094;SC=ACACACACACTCTCTCTCTCT;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=5;WE=56224842;WS=56224824;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,5:0.71:7
chr5	56226410	rs252890	T	C	3156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.899;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.983;NF=80;NR=56;PP=2016;ReadPosRankSum=-0.637;SC=GATTGCTCTGTCCCTTAGGAT;SOR=0.778;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=265;TCF=156;TCR=109;TR=136;WE=56226418;WS=56226400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,150:0.51:293
chr5	56226605	rs12657396	G	A	893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.184;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=30;PP=628;ReadPosRankSum=-0.468;SC=AGTATTAAAAGTTCATACCTA;SOR=0.381;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=98;TCF=24;TCR=74;TR=42;WE=56226613;WS=56226595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,43:0.43:101
chr5	56229288	rs832529	C	T	552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.544;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=332;ReadPosRankSum=-0.698;SC=TGTACACAAACAATTCTTTGT;SOR=1.061;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=44;TCF=6;TCR=38;TR=20;WE=56229296;WS=56229278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,24:0.51:47
chr5	56246610	rs2662040	A	G	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.128;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=238;ReadPosRankSum=1.417;SC=ACGTAGCTTCACTCGAATCGC;SOR=0.123;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=13;WE=56246618;WS=56246600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr5	56255367	rs111894536	AT	A	323.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.10;ReadPosRankSum=0.700;SOR=0.807;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,26:0.33:79
chr5	56526565	rs1544737	G	T	848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=3;PP=600;SC=GCAATATGTTGTTCTTAATCA;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=26;WE=56526573;WS=56526555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr5	56526783	rs1130203	G	A	3128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.914;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.417;NF=68;NR=71;PP=1862;ReadPosRankSum=1.170;SC=CTGCTATTGGGCGTCCTAATG;SOR=0.580;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=275;TCF=134;TCR=141;TR=139;WE=56526791;WS=56526773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,150:0.50:299
chr5	56526819	rs3214438	GT	G	3614.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.748;HP=4;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.282;NF=15;ReadPosRankSum=-0.240;SC=AAGGAATGATGTTTATGGCTA;SOR=0.374;Source=Platypus;TCF=25;WE=56526827;WS=56526809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,121:0.55:219
chr5	56527224	rs1862172	T	C	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=3.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=212;ReadPosRankSum=-0.105;SC=CCTCAGCCTCTCCAGTATCTG;SOR=0.616;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=10;WE=56527232;WS=56527214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr5	56527247	rs1862173	T	C	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=2.775;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=121;ReadPosRankSum=1.235;SC=ATTACAGGCATCCACCACCAG;SOR=0.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=7;WE=56527255;WS=56527237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr5	56542024	rs11349725	TA	T	104.76	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.862;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.36;MQRankSum=0.549;QD=11.64;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr5	56547059	rs6893468	G	A	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=146;ReadPosRankSum=0.296;SC=AGGTTTATTGGAATACAACTT;SOR=0.784;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=10;WE=56547067;WS=56547049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr5	57750350	rs15009	C	G	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=121;ReadPosRankSum=-1.640;SC=ATTCTTTTGGCTTCCCTGTAG;SOR=0.425;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=7;WE=57750358;WS=57750340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr5	57753456	rs702723	C	T	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=206;ReadPosRankSum=0.340;SC=TATTCCACTACTTAAACTTGG;SOR=0.475;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=14;WE=57753464;WS=57753446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr5	57754005	rs1848510	G	A	3768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.348;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=81;PP=2453;ReadPosRankSum=-0.298;SC=TTCCCTAGACGATAAACAAAA;SOR=0.558;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=292;TCF=155;TCR=137;TR=158;WE=57754013;WS=57753995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,172:0.54:319
chr5	57754132	rs697134	G	C	2294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.606;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=55;PP=1624;ReadPosRankSum=0.897;SC=TTGCAGACACGAGATCCCAAT;SOR=0.494;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=243;TCF=113;TCR=130;TR=108;WE=57754140;WS=57754122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,109:0.45:242
chr5	57754808	rs697133	G	A	3431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.376;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=68;PP=1990;ReadPosRankSum=-0.439;SC=AGAGTCATACGCACCTTTTCC;SOR=0.611;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=266;TCF=144;TCR=122;TR=145;WE=57754816;WS=57754798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,161:0.54:299
chr5	57755703	rs3211270	C	T	1594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.214;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-1.063;NF=30;NR=38;PP=909;ReadPosRankSum=1.310;SC=TCTTCGAGTCCGCTCCGCAAC;SOR=0.526;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=125;TCF=52;TCR=73;TR=68;WE=57755716;WS=57755693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,72:0.54:134
chr5	57790337	rs7704785	T	C	997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.702;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=9;PP=516;ReadPosRankSum=0.071;SC=TAACACCAAATCACTAAACAG;SOR=0.250;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=77;TCF=61;TCR=16;TR=38;WE=57790345;WS=57790327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,45:0.54:83
chr5	57854055	rs35522186	A	T	130.18	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=16.27;ReadPosRankSum=-0.157;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr5	58120753	rs11384049	G	GT	140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=0;PP=160;SC=TGGACATCGTGTTTTTTTTTT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=8;WE=58120761;WS=58120743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	58121059	rs3749734	G	A	612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.201;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=19;PP=422;ReadPosRankSum=-0.434;SC=TACAGAGTCCGAGCTAATTGT;SOR=0.494;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=50;TCF=12;TCR=38;TR=25;WE=58121067;WS=58121049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,27:0.49:55
chr5	58271713	rs112200987	T	TA	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=3;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.320;NF=4;NR=21;PP=355;ReadPosRankSum=-0.178;SC=TCCTTTTTTTTAAAAAAAAAA;SOR=1.179;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=25;WE=58271721;WS=58271703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,22:0.85:26
chr5	58284208	rs3805557	C	T	329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=271;SC=CACATATATACACATCTCAAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=58284216;WS=58284198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	58284283	rs3805556	G	A	2084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=25;PP=1129;SC=AAATGTACAAGGGAAAAATGT;SOR=1.031;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=71;TCF=45;TCR=26;TR=70;WE=58284291;WS=58284273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr5	58285455	rs186110868	A	G	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.722;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=56;ReadPosRankSum=-1.087;SC=ATTTTCCCCCATAAGTCAATA;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=5;WE=58285463;WS=58285445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr5	58286625	rs1553114	C	T	5423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.65;SOR=0.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr5	58286737	.	GA	G	376.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.285;ClippingRankSum=0.000;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=4.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.73;ReadPosRankSum=-0.623;SOR=1.530;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,28:0.50:56
chr5	58286836	rs1973451	A	G	481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=403;SC=GGCCGGGCATAGAGGCTCAAG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=58286844;WS=58286826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	58287553	rs3840337	AAAC	A	715.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=1;PP=856;SC=GAAAAAAAAAAAACCCCAATT;SOR=4.514;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=21;WE=58287563;WS=58287552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	58289046	rs7737685	G	T	710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=5;PP=499;SC=CTCAGAGGCGGATAGTGTCGA;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=25;WE=58289054;WS=58289036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr5	58289334	rs7724713	A	G	747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=20;PP=535;SC=GAAGAGGAAAATTTAAGTGAA;SOR=2.066;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=27;WE=58289342;WS=58289324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr5	58295380	rs35776313	G	GTA	822.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=614;SC=TTGATTATATGTATATATATA;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=12;WE=58295388;WS=58295370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	58297881	rs2968014	A	G	7168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.63;SOR=1.114;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
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chr5	58489218	rs1445950	G	A	1828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=11;PP=1220;SC=ATTTGTATTTGTACTTGTGCT;SOR=2.869;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=59;TCF=48;TCR=11;TR=58;WE=58489226;WS=58489208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr5	58489384	rs27175	G	A	6839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=107;NR=123;PP=2965;SC=ACCAAATCCCGCATTAGAAAT;SOR=0.956;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=230;TCF=107;TCR=123;TR=230;WE=58489392;WS=58489374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr5	58882102	rs1035321	C	T	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.014;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=10;PP=267;ReadPosRankSum=-0.533;SC=GTACCTGTCACGGAATTTGAT;SOR=0.487;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=56;TCF=37;TCR=19;TR=26;WE=58882110;WS=58882092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,29:0.46:63
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chr5	59725679	rs11950623	T	G	2235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=5.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQRankSum=1.103;QD=33.37;ReadPosRankSum=0.755;SOR=0.157;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,58:0.87:67
chr5	59725772	rs6894943	A	G	2827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.681;HP=1;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.423;NF=68;ReadPosRankSum=-1.340;SC=TTAAAGTGGTAACAGGTACGT;SOR=0.689;Source=Platypus;TCF=129;WE=59725780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,133:0.57:234
chr5	59899413	rs11740327	G	A	2630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.734;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=64;PP=1616;ReadPosRankSum=-0.959;SC=AGAGCGGGGTGGGGGGTAAAC;SOR=0.862;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=240;TCF=104;TCR=136;TR=110;WE=59899421;WS=59899402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,125:0.48:262
chr5	59940502	rs6877561	A	T	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.988;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=230;ReadPosRankSum=-1.125;SC=AAGGGTCAGAAAGGAGCTGAT;SOR=0.314;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=44;TCF=38;TCR=6;TR=19;WE=59940510;WS=59940492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,22:0.44:50
chr5	59940727	rs190950359	T	C	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.553;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=331;ReadPosRankSum=0.755;SC=ATTATATTAATTAGTTCTGTC;SOR=2.419;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=37;TCF=10;TCR=27;TR=17;WE=59940735;WS=59940717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,17:0.44:39
chr5	59984897	rs57521726	A	T	3072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.864;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=62;PP=1803;ReadPosRankSum=0.387;SC=GGGGAAAACAAGAGGTATGGA;SOR=0.747;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=271;TCF=144;TCR=127;TR=136;WE=59984905;WS=59984887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,151:0.50:304
chr5	59995820	rs9942410	G	C	2190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.500;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=46;PP=1347;ReadPosRankSum=-0.099;SC=CGCGCGCTGAGTGGGGGCTCG;SOR=0.639;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=197;TCF=105;TCR=92;TR=99;WE=59995828;WS=59995810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,108:0.51:213
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chr5	60083275	rs10072745	C	A	931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=23;PP=476;ReadPosRankSum=-0.603;SC=TAAAATAAAACAGAAATGAGT;SOR=0.762;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=75;TCF=24;TCR=51;TR=35;WE=60083283;WS=60083265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,42:0.51:82
chr5	60170605	rs4647150	T	C	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=38;ReadPosRankSum=-0.674;SC=ATCAGATAAATAGCAATTACA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=60170613;WS=60170595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
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chr5	60186975	rs2306351	C	A	147.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.64;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr5	60199363	rs4647102	C	T	1387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=21;PP=876;SC=TCTCAACAACCAGCACAAAGT;SOR=0.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=31;TCR=21;TR=52;WE=60199384;WS=60199353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr5	60241142	rs158921	G	A	2080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=19;PP=1459;SC=GGGAAGTGAAGGAGCACGTGG;SOR=2.115;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=71;TCF=51;TCR=20;TR=69;WE=60241150;WS=60241132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr5	60241268	rs158920	G	A	2266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.204;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=61;PP=1510;ReadPosRankSum=1.455;SC=CAGTAAAGGAGGGAAAAGTGA;SOR=0.869;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=220;TCF=104;TCR=116;TR=110;WE=60241276;WS=60241258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,114:0.48:237
chr5	60369083	rs10471502	A	G	3098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=50;NR=50;PP=1549;SC=GAGGTAAGTTATATAACAGTA;SOR=0.892;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=50;TCR=50;TR=100;WE=60369091;WS=60369073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr5	60369154	rs34070675	TG	T	454.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=340;ReadPosRankSum=0.703;SC=AAAGTTTTAGTGTCTGAATGT;SOR=0.454;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=10;WE=60369162;WS=60369144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,15:0.39:38
chr5	60448723	rs9885480	G	A	1140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.792;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=26;PP=722;ReadPosRankSum=-0.667;SC=CAGCAGCACTGGTAAAACCTT;SOR=0.882;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=108;TCF=58;TCR=50;TR=49;WE=60448731;WS=60448713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,56:0.45:125
chr5	60448903	rs33927273	T	TAA	670.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=635;SC=CTATTAATCTTGAGTTCATTT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=14;WE=60448911;WS=60448893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	60628574	.	CCGGCCGCAACCTCGG	C	53.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.85;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr5	60981850	rs16893680	T	C	1118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.923;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=11;PP=598;ReadPosRankSum=2.436;SC=AGAGGTATTTTGGCCTCCTTC;SOR=0.875;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=70;TCF=49;TCR=21;TR=39;WE=60981858;WS=60981840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,47:0.59:80
chr5	60982841	rs16893687	G	A	2586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.972;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=62;PP=1598;ReadPosRankSum=0.258;SC=GGATCTGACCGCTGAAGTTTA;SOR=0.627;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=226;TCF=108;TCR=118;TR=116;WE=60982849;WS=60982831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,125:0.51:246
chr5	60999768	rs436696	C	T	2001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.873;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=37;PP=1149;ReadPosRankSum=-0.775;SC=AATAGAGGAACGGAAAGTTTT;SOR=0.876;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=222;TCF=132;TCR=90;TR=93;WE=60999776;WS=60999758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,104:0.43:243
chr5	61604204	rs4700006	C	A	217.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=184;SC=TCTGGGTGCACAGCAACACCT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=61604212;WS=61604201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	61604456	rs4441833	T	C	1274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=15;NR=27;PP=796;SC=TACCACAACATAGATGGACCT;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=15;TCR=27;TR=42;WE=61604464;WS=61604446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr5	61733348	rs153857	G	A	210.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=6;PP=171;SC=AATAGATTCAGATGTTTGGCT;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=61733356;WS=61733338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	61745737	rs11329383	CT	C	2902.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=1.585;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.19;ReadPosRankSum=0.224;SOR=1.183;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:7,130:0.95:137
chr5	61762880	rs35119	A	G	786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=1;PP=564;SC=TAAAACTAAAATATATTACTT;SOR=4.977;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=21;WE=61762888;WS=61762870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr5	61772535	rs26635	G	T	3465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=55;PP=1937;SC=CAGATAATGTGTGTAGAGATA;SOR=0.739;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=115;TCF=60;TCR=55;TR=115;WE=61772543;WS=61772525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr5	61781127	rs26640	C	A	232.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=218;SC=GTTCCCAAGGCTTTGCTCTTA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=61781135;WS=61781117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	61785936	rs26644	T	C	2072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.59;SOR=0.821;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr5	61826663	rs32179	G	T	2012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=37;PP=1204;SC=AACCATAATTGGGAGGCATTG;SOR=0.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=33;TCR=37;TR=70;WE=61826671;WS=61826653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr5	61857118	.	C	CGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGT	1486.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.671;ClippingRankSum=0.000;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=38.12;ReadPosRankSum=-0.314;SOR=3.664;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,38:0.97:39
chr5	61857120	.	A	ATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAG	1493.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.785;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=99.58;ReadPosRankSum=0.580;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,14:0.93:15
chr5	62073118	rs1845526	G	C	7947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=146;NR=134;PP=2965;SC=CCCGGTGCCTGGGGCCGGAGG;SOR=0.713;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=280;TCF=146;TCR=134;TR=280;WE=62073126;WS=62073108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,301:1.00:301
chr5	63665293	rs56066106	TA	T	278.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.67;QD=23.23;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	63665335	rs28615727	G	A	877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=4;PP=676;SC=ACATAACTCCGCTCAGTGAAA;SOR=2.694;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=31;WE=63665343;WS=63665325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	63803508	.	TA	T	200.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.781;ClippingRankSum=0.000;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.46;ReadPosRankSum=0.657;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,15:0.33:45
chr5	63890387	rs4700641	C	T	354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=264;SC=CATGTATATACCTAATTATTT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=63890395;WS=63890377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	63890807	rs11750387	G	T	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.668;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=82;ReadPosRankSum=-1.068;SC=GTATGCCAGAGGAGCATAGTG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=5;WE=63890815;WS=63890797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr5	63905068	rs889248	A	G	2179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.498;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=45;PP=1271;ReadPosRankSum=0.955;SC=GTGTTGTCTCATCTCAAGCTA;SOR=0.756;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=197;TCF=110;TCR=87;TR=104;WE=63905076;WS=63905058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,112:0.51:218
chr5	64070617	rs140062546	A	AAATTATGAC	412.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.37;ReadPosRankSum=1.099;SOR=0.719;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,12:0.21:56
chr5	64070812	rs10057598	C	T	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.10;ReadPosRankSum=0.674;SOR=0.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr5	64077647	rs55793256	A	G	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.283;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=70;ReadPosRankSum=0.478;SC=CGTATTTAACATTCTGGAAAA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=6;WE=64077655;WS=64077637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr5	64077966	rs2011079	A	G	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.224;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=72;ReadPosRankSum=0.322;SC=AGAGGAAAAAACGTTTCACAT;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=5;WE=64077974;WS=64077956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr5	64084746	rs11340181	CT	C	131.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.162;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.23;ReadPosRankSum=0.463;SOR=0.275;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr5	64096046	rs79929128	CT	C	1732.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.477;NF=9;NR=16;PP=887;ReadPosRankSum=-0.570;SC=TATTTCCCCCCTCATGATTAT;SOR=0.691;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=46;TCF=14;TCR=32;TR=25;WE=64096054;WS=64096036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,53:0.59:90
chr5	64096170	rs6449760	G	T	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.974;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.160;NF=10;NR=17;PP=357;ReadPosRankSum=-0.493;SC=TCCATTGTTGGTATGATCCTA;SOR=1.382;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=59;TCF=28;TCR=31;TR=27;WE=64096178;WS=64096160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,29:0.44:66
chr5	64097145	rs7735338	C	G	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.154;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=7;PP=199;ReadPosRankSum=0.092;SC=AGGTGATGCACCAGATTTAGT;SOR=0.665;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=41;TCF=23;TCR=18;TR=16;WE=64097153;WS=64097135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,17:0.34:50
chr5	64103714	rs1870437	C	T	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=238;ReadPosRankSum=-0.760;SC=ATTTTATTTCCTGTCCCTACC;SOR=0.495;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=12;WE=64103722;WS=64103704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
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chr5	64522124	rs11746271	T	C	1005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.606;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=29;PP=717;ReadPosRankSum=-1.675;SC=CTATGGCAAATTTATAATTCA;SOR=0.268;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=65;TCF=16;TCR=49;TR=41;WE=64522132;WS=64522114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,41:0.59:70
chr5	64569381	rs17814262	C	A	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=214;ReadPosRankSum=1.725;SC=ACCCTGGGTACCTTTTGCTGC;SOR=0.765;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=36;TCF=11;TCR=25;TR=18;WE=64569389;WS=64569371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr5	64569405	rs1423424	T	A	621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=17;PP=433;SC=AGCATCGCAGTTGAGGATTTT;SOR=2.030;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=22;WE=64569413;WS=64569395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	64747918	rs3830368	T	TG	923.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.366;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=753;ReadPosRankSum=1.038;SC=CTCTATAGCCTTCTGTTAACA;SOR=1.165;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=47;TCF=33;TCR=14;TR=22;WE=64747926;WS=64747908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,29:0.41:70
chr5	64766519	rs368646553	ATT	A	218.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.223;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.62;ReadPosRankSum=0.376;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
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chr5	64766558	rs34345975	AATT	A	1432.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.246;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.15;MQRankSum=0.948;NF=10;NR=10;PP=905;ReadPosRankSum=-2.788;SC=TACATTGCAAAATTCTTATTT;SOR=0.283;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=49;TCF=32;TCR=17;TR=20;WE=64766568;WS=64766548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,39:0.54:72
chr5	64825102	rs1017576	C	T	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.287;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=103;ReadPosRankSum=-1.221;SC=CAAATTTACACAGTGGTCCAG;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=7;WE=64825110;WS=64825092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
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chr5	64838584	rs6891597	G	A	956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.787;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=15;PP=585;ReadPosRankSum=0.350;SC=AATAGATCTAGTTAGAAATTA;SOR=0.804;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=88;TCF=56;TCR=32;TR=43;WE=64838592;WS=64838574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,46:0.49:94
chr5	64838758	rs6891955	G	C	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.087;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=196;ReadPosRankSum=1.384;SC=GGTTTTCTAAGATACTTCTTT;SOR=1.700;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=11;WE=64838766;WS=64838748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr5	64847543	rs6893491	T	C	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.202;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=350;ReadPosRankSum=-0.071;SC=ATTCTTAATATTTTAAAACTT;SOR=1.082;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=47;TCF=16;TCR=31;TR=21;WE=64847551;WS=64847533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,21:0.44:48
chr5	64848442	rs3213938	T	C	1245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=1.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.89;ReadPosRankSum=2.092;SOR=0.528;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,62:0.49:126
chr5	64850628	.	T	C	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.388;ClippingRankSum=0.000;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.95;ReadPosRankSum=-0.110;SOR=0.566;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,11:0.18:60
chr5	64857424	rs10560318	AACAC	A	780.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=658;ReadPosRankSum=-0.484;SC=GTTTAATTAAAACACACACAC;SOR=0.743;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=0;TCR=49;TR=19;WE=64857435;WS=64857414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,21:0.51:41
chr5	64859592	rs261252	T	A	2716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.737;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=40;PP=1638;ReadPosRankSum=-0.373;SC=CATTTTCCTATTCTTATGTGT;SOR=0.826;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=205;TCF=131;TCR=74;TR=111;WE=64859600;WS=64859582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,122:0.56:218
chr5	64859884	rs35326591	CTG	C	269.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=259;ReadPosRankSum=-0.572;SC=AACCCGAAGTCTGTGGTTTTG;SOR=0.223;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=7;WE=64859893;WS=64859874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr5	64863320	rs56227785	C	T	1232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.922;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=19;PP=721;ReadPosRankSum=-0.081;SC=AGATCTTATACTTTACTTTTT;SOR=0.413;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=93;TCF=64;TCR=29;TR=54;WE=64863333;WS=64863310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,58:0.60:97
chr5	64864657	rs152063	A	C	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=105;ReadPosRankSum=-0.052;SC=GTCTCAAGTTATCAGTGTGGT;SOR=0.743;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=7;WE=64864665;WS=64864647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr5	64865346	rs149512	A	T	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=69;ReadPosRankSum=0.503;SC=GGTTTTTTTTAAAAAAAAACC;SOR=0.105;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=8;WE=64865354;WS=64865336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr5	64865405	rs149208	A	G	876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=13;PP=588;ReadPosRankSum=-0.007;SC=TGGGAATACTAAGTGATTCAT;SOR=0.724;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=58;TCF=36;TCR=22;TR=36;WE=64865413;WS=64865395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,38:0.60:63
chr5	64881936	rs27141	A	G	1476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=38;PP=927;ReadPosRankSum=0.190;SC=ATGACAGGCCATACACACTCA;SOR=0.670;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=129;TCF=54;TCR=75;TR=63;WE=64881944;WS=64881926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,71:0.47:151
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chr5	64920803	rs37254	C	T	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.126;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=288;ReadPosRankSum=0.276;SC=TTTGGTTTTGCCAAACGCGAG;SOR=0.275;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=33;TCF=30;TCR=3;TR=18;WE=64920811;WS=64920793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr5	64925256	rs43207	C	T	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=29;ReadPosRankSum=1.803;SC=GGCAGGGTATCCCTACCATAT;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=3;WE=64925264;WS=64925253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr5	64942799	rs154955	A	G	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.712;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=3.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.80;ReadPosRankSum=-1.957;SOR=2.215;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr5	64946836	rs154853	G	T	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.519;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=252;ReadPosRankSum=0.103;SC=ATTTTTGAATGTGTCATATGA;SOR=0.368;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=18;WE=64946844;WS=64946826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,22:0.65:34
chr5	64954159	rs28084	A	G	1430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.637;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=22;PP=702;ReadPosRankSum=-1.442;SC=TTTAAATGCCACCACACCTTG;SOR=0.630;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=121;TCF=78;TCR=43;TR=60;WE=64954167;WS=64954149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,73:0.52:141
chr5	64956428	rs37349	C	T	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=187;ReadPosRankSum=-0.897;SC=TTGGAGGGTACATCATCCAGT;SOR=1.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=10;WE=64956436;WS=64956425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr5	64957686	rs37347	A	G	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.260;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=48;ReadPosRankSum=-0.838;SC=CAGGTCTGCCAGGCTATTCCA;SOR=0.072;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=5;WE=64957694;WS=64957676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr5	64957718	rs37346	T	C	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=168;ReadPosRankSum=-0.102;SC=TGCAAAAGAATTTAAAATGAG;SOR=0.439;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=12;WE=64957726;WS=64957708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr5	64960311	rs36031543	A	ATCTC	1501.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.775;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=1107;ReadPosRankSum=0.069;SC=ACTTAGACTCATCTCTCTCTC;SOR=0.859;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=68;TCF=13;TCR=55;TR=24;WE=64960319;WS=64960301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,41:0.41:99
chr5	64968170	rs5868414	AT	A	283.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.31;ReadPosRankSum=0.104;SOR=0.560;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,19:0.42:45
chr5	65008946	rs3833969	GT	G	383.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.34;ReadPosRankSum=-1.523;SOR=0.454;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,21:0.46:46
chr5	65018126	rs2548786	C	G	752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.537;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=8;PP=477;ReadPosRankSum=-2.275;SC=CCCGGGCGCCCAGGCGCTGCC;SOR=0.393;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=60;TCF=47;TCR=13;TR=34;WE=65018134;WS=65018116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,37:0.59:63
chr5	65018321	rs2548785	C	G	1186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=30;PP=593;ReadPosRankSum=0.109;SC=CCCGGACCCACCCCTTCCCGA;SOR=0.741;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=137;TCF=63;TCR=74;TR=56;WE=65018329;WS=65018311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,65:0.42:153
chr5	65073224	rs34979	C	A	5341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=111;NR=66;PP=2965;SC=CTGTTTCAACCGAAATGGTTT;SOR=1.208;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=178;TCF=112;TCR=66;TR=177;WE=65073232;WS=65073214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr5	65081745	.	CT	C	206.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.928;ClippingRankSum=0.000;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=2.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.09;ReadPosRankSum=0.395;SOR=0.800;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,20:0.30:67
chr5	65105622	rs2561196	G	A	1245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=34;PP=952;SC=TTCATTTTAAGTGGTATCCCA;SOR=3.664;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=38;WE=65105630;WS=65105612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr5	65108215	rs2254485	A	G	931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=24;PP=700;SC=TAATGAATCCAGAGGTATAGT;SOR=2.165;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=32;WE=65108223;WS=65108205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr5	65288791	rs27132	A	G	304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=209;SC=ATCTAGAAATATGATATTCCT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=65288799;WS=65288781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	65308055	rs706678	C	G	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=58;ReadPosRankSum=0.084;SC=TTATATCAATCTTAAGTCTAT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=65308063;WS=65308045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr5	65317181	rs706679	C	T	1725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=33;NR=25;PP=850;SC=GCTGGAAAGACTGGATTTGGG;SOR=0.723;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=33;TCR=25;TR=58;WE=65317189;WS=65317171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr5	65317332	rs784276	A	T	286.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.97;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	65317338	rs706680	T	C	286.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.97;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	65321311	rs3213837	C	T	898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.597;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=18;PP=469;ReadPosRankSum=-0.303;SC=TCATTAGGTTCGTTGAAGAAT;SOR=0.533;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=49;TCR=40;TR=39;WE=65321319;WS=65321301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,46:0.46:101
chr5	65372793	.	CT	C	61.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.22;MQRankSum=2.056;QD=1.37;ReadPosRankSum=-0.966;SOR=0.665;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,9:0.20:45
chr5	66195701	rs458115	C	T	1403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.52;SOR=0.970;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr5	66195774	rs7711116	T	C	1316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.51;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr5	66212985	rs37567	C	G	2164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=41;PP=1165;SC=ATCTTATTACCCCTGGTCATT;SOR=1.802;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=19;TCR=41;TR=60;WE=66212993;WS=66212975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
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chr5	66282444	rs149234910	A	ATT	96.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.53;MQRankSum=-0.000;QD=8.79;ReadPosRankSum=-2.025;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
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chr5	66386181	rs113710101	C	G	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.891;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.99;ReadPosRankSum=0.548;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
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chr5	66416764	rs2254790	C	A	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.768;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=374;ReadPosRankSum=-0.509;SC=ACAGCATGTCCTTCAAATATT;SOR=1.214;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=52;TCF=41;TCR=11;TR=21;WE=66416772;WS=66416754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,23:0.40:57
chr5	66429329	rs2371882	G	T	5477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=110;NR=75;PP=2965;SC=TTACATGTCCGTCTGCCTCAT;SOR=1.014;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=185;TCF=110;TCR=75;TR=185;WE=66429337;WS=66429319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr5	66458597	rs184920338	C	T	1256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.399;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=37;PP=817;ReadPosRankSum=-0.606;SC=GCTACCGCTCCACCCCTGACT;SOR=0.363;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=87;TCF=21;TCR=66;TR=51;WE=66458605;WS=66458587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,55:0.60:92
chr5	66459878	rs1705399	G	C	3213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=61;PP=1860;SC=TCGGATGGCCGGGTGCCTGCG;SOR=1.309;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=43;TCR=61;TR=104;WE=66459886;WS=66459868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr5	66478919	rs5744526	C	T	2364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.496;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=52;PP=1459;ReadPosRankSum=0.441;SC=AATGAATATTCGAGCAAGTGC;SOR=0.631;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=183;TCF=87;TCR=96;TR=98;WE=66478927;WS=66478909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,112:0.51:219
chr5	66480004	rs1697144	T	C	9713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=358;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=154;NR=167;PP=2965;SC=CTTTGGAAGATCGTTGAATCA;SOR=0.774;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=323;TCF=156;TCR=167;TR=321;WE=66480012;WS=66479994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,356:1.00:356
chr5	67493961	rs12654191	G	A	1080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.645;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=22;PP=755;ReadPosRankSum=0.189;SC=TTTCATTTGGGCATGTGAGGT;SOR=0.611;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=135;TCF=87;TCR=48;TR=58;WE=67493969;WS=67493951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,57:0.40:143
chr5	67494070	rs12658274	A	T	2502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.549;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=45;PP=1517;ReadPosRankSum=0.616;SC=ATTAAAACACACAACAGCAAC;SOR=0.866;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=217;TCF=118;TCR=99;TR=105;WE=67494078;WS=67494060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,119:0.49:243
chr5	67522722	rs706713	C	T	2065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.830;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=49;PP=1360;ReadPosRankSum=2.323;SC=CGGGAACTTACGTAGAATATA;SOR=0.928;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=203;TCF=100;TCR=103;TR=90;WE=67522730;WS=67522712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,97:0.44:218
chr5	67522851	rs706714	A	C	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=20;PP=328;ReadPosRankSum=-1.037;SC=AGTATTGATAAGTGGTTGCTT;SOR=0.766;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=22;TCR=45;TR=30;WE=67522859;WS=67522841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,31:0.42:73
chr5	67569746	rs171649	G	A	1022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.466;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=17;PP=688;ReadPosRankSum=-0.171;SC=TACATGGTCTGTGGTCTGTTT;SOR=0.540;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=126;TCF=87;TCR=39;TR=50;WE=67569754;WS=67569736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,53:0.38:140
chr5	67575344	rs16897620	A	G	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.09;ReadPosRankSum=-0.207;SOR=0.317;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr5	67575642	rs3815701	A	G	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.554;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=289;ReadPosRankSum=-2.072;SC=CATATATAGAAATAGTGGTTA;SOR=0.132;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=15;WE=67575650;WS=67575632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr5	67584512	.	AT	A	266.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.458;ClippingRankSum=0.000;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQRankSum=1.713;QD=2.01;ReadPosRankSum=-0.587;SOR=0.598;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,30:0.23:133
chr5	67584758	rs1862162	A	G	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.198;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=97;ReadPosRankSum=-0.366;SC=TGGGAAAGATAGGGTTTAGGT;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=6;WE=67584766;WS=67584748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr5	67587994	rs3730087	C	T	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.808;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=51;ReadPosRankSum=-0.508;SC=GTTACTCTAACTTTTTATTTT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=5;WE=67588002;WS=67587984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr5	68390203	rs337260	C	G	1726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.594;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=46;PP=988;ReadPosRankSum=-0.840;SC=CCGGCCGGGTCGCTCAGGATG;SOR=0.980;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=206;TCF=97;TCR=109;TR=81;WE=68390211;WS=68390193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,91:0.40:230
chr5	68390284	rs337259	C	T	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=1.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.786;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=225;ReadPosRankSum=-0.810;SC=GCCCTCTCCCCCTGCCTGCCT;SOR=1.306;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=68;TCF=27;TCR=41;TR=18;WE=68390292;WS=68390274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,20:0.25:81
chr5	68396764	rs3833634	T	TG	263.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=1.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.72;MQRankSum=1.851;QD=6.76;ReadPosRankSum=0.405;SOR=0.916;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,15:0.38:39
chr5	68409094	rs164393	A	C	1771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=31;PP=824;SC=TCAAGTCTTGAGGAAAACTAG;SOR=1.054;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=30;TCR=31;TR=61;WE=68409102;WS=68409084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr5	68411010	rs240809	C	T	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=85;ReadPosRankSum=-0.677;SC=TATTTAACGACTGACTGTTGA;SOR=0.260;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=7;WE=68411018;WS=68411000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr5	68412048	rs34215592	A	AT	2911.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=46;PP=2102;SC=TTGTGTAAGCATTCCCCCCTT;SOR=1.356;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=54;TCF=4;TCR=50;TR=50;WE=68412056;WS=68412038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr5	68413042	rs3840519	CT	C	992.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.916;HP=9;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=20;PP=367;ReadPosRankSum=2.556;SC=ATACTCCTCCCTTTTTTTTTG;SOR=0.456;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=55;TCF=21;TCR=34;TR=29;WE=68413051;WS=68413032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,49:0.60:82
chr5	68415902	rs56943665	G	A	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.59;BaseQRankSum=1.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=1;PP=25;ReadPosRankSum=1.309;SC=TTATAATAGTGAAAAAATGGA;SOR=0.941;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=4;WE=68415910;WS=68415892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr5	68415932	rs164391	G	A	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.99;ReadPosRankSum=1.708;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr5	68417643	rs164578	C	T	1913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.845;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=51;PP=1300;ReadPosRankSum=0.073;SC=GCCATTCACACCATATGCATG;SOR=0.936;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=149;TCF=60;TCR=89;TR=82;WE=68417651;WS=68417633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,86:0.53:161
chr5	68417755	rs164577	A	G	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.501;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=143;ReadPosRankSum=1.732;SC=CCTACTTTTCAACTGTGTTCT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=7;WE=68417763;WS=68417745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr5	68419054	rs164572	A	T	2064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.869;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=36;PP=1303;ReadPosRankSum=-0.602;SC=TGGCAGATACACTTGGCAGCA;SOR=0.969;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=198;TCF=119;TCR=79;TR=97;WE=68419062;WS=68419044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,100:0.46:217
chr5	68513599	rs2242350	G	T	1851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=7;PP=1100;SC=AGCTGCCCGGGACTCCAGTGA;SOR=2.448;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=47;TCR=7;TR=54;WE=68513607;WS=68513589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr5	68581389	rs3890705	G	A	922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=27;PP=692;SC=GGACAAGTGAGTCCAGGAGCA;SOR=3.545;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=31;WE=68581397;WS=68581379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr5	68596068	rs28704183	C	G	499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=14;PP=390;SC=CTACCCACAACATCGGGCTCC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=68596076;WS=68596058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	68610009	rs28462372	A	C	238.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=4;PP=142;SC=TTATAATAGAACACCAGGTGC;SOR=0.892;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=8;WE=68610017;WS=68609999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	68616331	rs10471774	C	T	8142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=128;NR=151;PP=2965;SC=CAGAGCTGCACGTCTGACTCA;SOR=0.934;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=279;TCF=128;TCR=151;TR=279;WE=68616339;WS=68616321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,303:1.00:303
chr5	68696035	rs142095225	G	GTTTATTTA	682.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=6;PP=442;SC=AAGAAGTAGGGTTTATTTATT;SOR=1.739;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=7;WE=68696043;WS=68696025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	68706252	rs10940223	G	T	534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=0;PP=402;SC=CATCTTTTCAGGTGCTTATTG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=68706260;WS=68706242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	68706438	rs6871685	G	A	2587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=42;NR=46;PP=1356;SC=AATATGTTCAGTATGAATCAA;SOR=0.930;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=42;TCR=46;TR=88;WE=68706446;WS=68706428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr5	68720419	rs299099	T	G	3641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=66;NR=61;PP=2061;SC=TGAACTCTTTTTGTTCCAGAT;SOR=0.707;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=127;TCF=66;TCR=61;TR=127;WE=68720427;WS=68720409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr5	68728544	rs299075	G	A	3803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=69;PP=2237;SC=AGAAGTTGAGGGGCCCCATTT;SOR=1.364;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=116;TCF=47;TCR=69;TR=115;WE=68728552;WS=68728534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr5	68862361	rs375045774	TG	T	640.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.98;MQRankSum=-4.074;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.015;SOR=0.714;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,32:0.76:42
chr5	68862363	.	TGG	T	32.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.024;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.48;MQRankSum=3.074;QD=0.68;ReadPosRankSum=1.094;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,8:0.17:48
chr5	68862365	rs201465285	G	T	649.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.29;MQRankSum=-4.074;QD=15.47;ReadPosRankSum=-0.606;SOR=0.714;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,32:0.76:42
chr5	69325573	.	CT	C	279.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.987;ClippingRankSum=0.000;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=6.572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.10;MQRankSum=-5.049;QD=4.59;ReadPosRankSum=1.690;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,23:0.38:61
chr5	70307464	rs4976210	T	C	4451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=89;NR=59;PP=2773;SC=GCTCTTTGAGTTCTCAGGGTC;SOR=1.110;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=150;TCF=90;TCR=60;TR=148;WE=70307472;WS=70307454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr5	70308251	rs28409706	C	T	6773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=119;NR=104;PP=2965;SC=TCCTGAAGGACGCAAGTCTAG;SOR=0.814;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=223;TCF=119;TCR=104;TR=223;WE=70308259;WS=70308241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr5	70751818	rs3748043	T	G	5783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=105;NR=83;PP=2965;SC=GGCCGCCGGATCCTGCCACGG;SOR=0.928;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=188;TCF=105;TCR=83;TR=188;WE=70751826;WS=70751808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr5	70762191	rs10079014	A	G	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.691;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=80;ReadPosRankSum=-1.383;SC=TGTAAATAGAAAAGTGGGTTA;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=5;WE=70762199;WS=70762181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr5	70763088	rs7442961	A	G	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=108;ReadPosRankSum=-0.770;SC=TATGATTGCCATGCTAAACCT;SOR=0.392;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=8;WE=70763096;WS=70763078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr5	70786726	rs35267960	G	GAC	235.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.064;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=276;ReadPosRankSum=0.688;SC=TGTAGGAAAAGAGTGTTATAG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=7;WE=70786734;WS=70786716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr5	70791010	rs2059196	T	A	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.80;ReadPosRankSum=-0.396;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr5	70800475	rs3761966	C	T	898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.840;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=14;PP=462;ReadPosRankSum=0.060;SC=AGATCAATCGCGTAAAGATTT;SOR=0.536;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=78;TCF=51;TCR=27;TR=38;WE=70800483;WS=70800465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,44:0.52:85
chr5	70800538	rs3761967	G	A	1096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.336;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=30;PP=650;ReadPosRankSum=-0.769;SC=TTTTCAAAATGTGCAGCCAGA;SOR=0.974;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=108;TCF=54;TCR=54;TR=55;WE=70800546;WS=70800528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,58:0.49:119
chr5	70805272	rs36098798	GC	G	189.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.846;HP=5;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.710;NF=26;NR=4;PP=288;ReadPosRankSum=0.701;SC=TTGATTGTGTGCCCCCTTTTT;SOR=1.609;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=30;WE=70805285;WS=70805262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,13:0.37:35
chr5	70805277	rs60403720	CT	C	324.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.30;MQRankSum=0.000;QD=9.28;ReadPosRankSum=0.090;SOR=0.452;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
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chr5	70806711	rs715747	C	G	4951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=64;PP=2965;SC=ACATTCCCATCATGGAGAAAG;SOR=0.908;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=143;TCF=79;TCR=64;TR=143;WE=70806719;WS=70806701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr5	70806958	rs6886336	G	A	5970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=119;PP=2965;SC=CTTCAGTGCTGTGCCTTCACT;SOR=1.347;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=197;TCF=78;TCR=119;TR=197;WE=70806966;WS=70806948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr5	70807016	rs375426591	CT	C	577.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.577;NF=0;NR=20;PP=476;ReadPosRankSum=-0.084;SC=TTTTTGAATGCTTTTTTCAGA;SOR=0.660;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=0;TCR=51;TR=20;WE=70807024;WS=70807006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,27:0.46:59
chr5	70807073	rs421128	C	T	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.422;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=98;ReadPosRankSum=-1.125;SC=TCCAACAACACTTAAAAATCT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=6;WE=70807081;WS=70807063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr5	70807991	rs418738	G	A	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.804;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=118;ReadPosRankSum=0.526;SC=TTAGAATTTAGTAGACTTTTG;SOR=0.368;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=12;WE=70807999;WS=70807981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr5	70809169	rs1698063	A	G	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=1.330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.91;ReadPosRankSum=1.569;SOR=0.481;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr5	70811821	rs279322	A	G	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-1.003;NF=11;NR=1;PP=138;ReadPosRankSum=0.281;SC=CAAATTTTACATTTTTACATT;SOR=0.551;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=12;WE=70811829;WS=70811811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr5	70818329	.	CAA	C	273.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=0.000;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=0.000;QD=9.44;ReadPosRankSum=-1.181;SOR=0.602;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr5	70834703	rs276591	A	C	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.97;ReadPosRankSum=0.022;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr5	70834833	rs276590	G	A	993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.772;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=15;PP=432;ReadPosRankSum=-0.089;SC=GTTTGGGGAAGTATTTTAAGA;SOR=0.569;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=84;TCF=51;TCR=33;TR=41;WE=70834841;WS=70834823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,49:0.52:95
chr5	70834926	rs276589	T	C	945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.674;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=24;PP=458;ReadPosRankSum=-0.984;SC=TCAAGGAAACTGCTAAGACTA;SOR=1.112;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=92;TCF=46;TCR=46;TR=43;WE=70834934;WS=70834916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,49:0.48:103
chr5	70837295	rs6453014	A	C	1562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=39;NR=21;PP=975;SC=AGTATGTATAATTCCTCATGT;SOR=1.160;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=40;TCR=22;TR=60;WE=70837303;WS=70837285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr5	70840233	rs182190	C	T	1222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=21;PP=808;ReadPosRankSum=-0.187;SC=ATAAAAACCTCGGACCAGTTA;SOR=0.684;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=120;TCF=77;TCR=43;TR=56;WE=70840241;WS=70840223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,59:0.46:129
chr5	70840433	rs279290	A	G	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=138;ReadPosRankSum=0.671;SC=CTGGCCGGGCACGGTGGCTCA;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=24;TCF=8;TCR=16;TR=11;WE=70840441;WS=70840423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr5	70841097	rs78106443	TA	T	57.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=1.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.92;ReadPosRankSum=0.217;SOR=0.432;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,11:0.17:63
chr5	70849021	rs469039	G	T	682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.889;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=9;PP=428;ReadPosRankSum=1.155;SC=CTAAAAAGCCGCCTGATAATT;SOR=1.289;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=56;TCF=35;TCR=21;TR=30;WE=70849029;WS=70849011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,33:0.54:61
chr5	70852611	rs467620	G	A	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.489;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.932;HP=2;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=25;ReadPosRankSum=-0.103;SC=AGCTTTTTGGGAGATAACATA;SOR=1.828;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=3;WE=70852623;WS=70852601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr5	70858194	rs277941	C	T	989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=16;PP=600;ReadPosRankSum=0.008;SC=GTAAGAAACGCCTAAAACCTC;SOR=0.677;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=82;TCF=51;TCR=31;TR=42;WE=70858202;WS=70858184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,47:0.51:92
chr5	70888918	rs13173723	T	A	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=64.78;MQRankSum=4.620;QD=10.13;ReadPosRankSum=-0.531;SOR=0.313;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr5	70892027	rs71612573	GATTAAGT	G	1866.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=0.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.158;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.796;NF=19;NR=8;PP=1403;ReadPosRankSum=2.979;SC=CTATATTTTGGATTAAGTATT;SOR=1.179;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=64;TCF=42;TCR=22;TR=27;WE=70892041;WS=70892017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,50:0.49:102
chr5	70922616	rs12516456	G	A	2135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=39;PP=1132;SC=TGGAAATTAAGTATGCAGAAC;SOR=1.236;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=29;TCR=39;TR=68;WE=70922624;WS=70922606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr5	70927856	rs277980	G	A	950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.095;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=8;PP=699;ReadPosRankSum=-1.133;SC=AAAAAGTACAGGTATAGTCAG;SOR=1.044;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=67;TCF=51;TCR=16;TR=37;WE=70927864;WS=70927846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,40:0.51:78
chr5	70928083	rs277981	C	T	929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=28;PP=587;ReadPosRankSum=-0.394;SC=AGAAGTTTTACGTATTTGTTT;SOR=0.582;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=71;TCF=14;TCR=57;TR=36;WE=70928091;WS=70928073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,40:0.51:79
chr5	70930966	rs277984	A	G	3021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.454;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=53;PP=1886;ReadPosRankSum=-2.195;SC=AACATGATCTATATTTCTGCA;SOR=0.809;SbPval=0.58;Source=Platypus;TCF=146;TR=129;WE=70930974;WS=70930956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,139:0.51:274
chr5	70931883	rs1553314	G	A	600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=5;PP=436;SC=ATATTTTTTTGTTTTACTTTT;SOR=1.931;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=22;WE=70931891;WS=70931873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr5	70932002	rs7444180	G	A	3114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=49;PP=1693;SC=ATGGTAAGTAGTCAGTAACTA;SOR=0.744;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=105;TCF=56;TCR=49;TR=105;WE=70932010;WS=70931992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr5	70932170	rs7444232	G	T	249.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=8;PP=188;SC=ATTTTTAAATGAGGTTTTTAG;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=70932178;WS=70932160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	70945075	rs10064079	A	G	5442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=95;PP=2965;SC=GTGGCAGAGCATATAGGTAGG;SOR=0.857;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=186;TCF=91;TCR=95;TR=186;WE=70945083;WS=70945065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr5	70948385	rs6888301	T	G	1850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=7;PP=1426;SC=ATGCACATGTTAGATGTAACA;SOR=3.258;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=47;TCR=7;TR=54;WE=70948393;WS=70948375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr5	70948654	rs2242372	G	A	574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=15;PP=403;SC=ACAGAGCTCTGTGTAGTTGAG;SOR=2.531;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=70948662;WS=70948644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	70952506	rs7443786	A	G	1600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=11;PP=1020;SC=ATTTCTGCACATGGAGAGTGT;SOR=2.584;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=43;TCR=11;TR=54;WE=70952514;WS=70952496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr5	71403273	rs3112401	T	C	71.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=17.76;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	71403306	rs3112402	T	A	189.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=7;NR=1;PP=157;SC=CCTGCCGCAGTGGAGAGGAGC;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=71403314;WS=71403296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	71412292	rs78329240	A	G	1771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=34;PP=1146;ReadPosRankSum=-1.937;SC=TAAGGATGCAAAAATTTGTCA;SOR=0.707;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=162;TCF=91;TCR=71;TR=77;WE=71412300;WS=71412282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,85:0.47:182
chr5	71488904	rs7736611	C	T	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=354;ReadPosRankSum=-0.458;SC=GGGGAACGAACTTGGCCAAAC;SOR=0.756;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=19;WE=71488912;WS=71488894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr5	71489082	rs34485863	G	GT	1784.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.205;HP=6;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=30;PP=837;ReadPosRankSum=0.115;SC=ACCCACCAAGGTTTTTTCTTT;SOR=0.576;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=89;TCF=9;TCR=80;TR=34;WE=71489090;WS=71489072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,76:0.44:171
chr5	71490962	rs1866374	A	G	7527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=141;NR=114;PP=2965;SC=AGACAAGCCAATAAAAACAGA;SOR=0.815;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=255;TCF=141;TCR=114;TR=255;WE=71490970;WS=71490952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,276:1.00:276
chr5	71491195	rs186623571	G	A	1428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=33;PP=976;ReadPosRankSum=-0.838;SC=CTATCAAGAAGGAGGAAAAAC;SOR=0.751;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=102;TCF=46;TCR=56;TR=59;WE=71491203;WS=71491185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,63:0.57:111
chr5	71491568	rs35473133	G	A	2071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.894;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=45;PP=1282;ReadPosRankSum=-1.039;SC=AGAGGCTGTCGCTGCAGCTGT;SOR=0.732;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=186;TCF=98;TCR=88;TR=88;WE=71491576;WS=71491558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,95:0.47:201
chr5	71494931	rs13153166	A	C	2109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.469;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=48;PP=1130;ReadPosRankSum=0.228;SC=AAAATCTCCAAGTGACAGTGG;SOR=0.757;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=220;TCF=112;TCR=108;TR=94;WE=71494939;WS=71494921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,105:0.42:248
chr5	71495041	rs3805452	T	C	2660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.559;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=56;PP=1583;ReadPosRankSum=-0.328;SC=CTGAAGAGGGTGGGTACTCAT;SOR=0.831;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=221;TCF=111;TCR=110;TR=110;WE=71495049;WS=71495031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,122:0.51:240
chr5	71522125	rs9293821	A	T	461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=15;PP=379;SC=ACCTGGCAGCACTAGAAATAG;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=71522133;WS=71522115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	71618276	rs3749694	C	A	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=54;ReadPosRankSum=-0.566;SC=GCTACAACGTCTACAGCTCTC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=71618284;WS=71618266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr5	71634712	rs10942271	A	G	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=85;ReadPosRankSum=0.715;SC=ATGGCAACCTATATCTATACC;SOR=0.425;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=7;WE=71634720;WS=71634702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr5	71739546	rs4267851	C	G	1234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=13;PP=684;SC=GAACTGCCTCCTTCTCATTTT;SOR=1.426;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=42;TCF=29;TCR=13;TR=41;WE=71739554;WS=71739536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr5	71743024	rs10043295	G	C	4479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=54;PP=2695;SC=GCTCCCATTTGTTGTCCACTG;SOR=1.214;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=147;TCF=93;TCR=54;TR=147;WE=71743032;WS=71743014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr5	71756102	rs7721922	G	A	5753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=109;NR=84;PP=2965;SC=TGGTTCTGCAGCTGGCTCGGG;SOR=0.853;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=193;TCF=109;TCR=84;TR=193;WE=71756110;WS=71756092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr5	71756670	rs2278600	C	T	5408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=99;PP=2965;SC=TCTCCTGGGGCTCGGCTTTCC;SOR=0.988;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=179;TCF=80;TCR=99;TR=179;WE=71756688;WS=71756660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr5	72112421	rs34648	T	C	1730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.38;SOR=1.923;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr5	72112430	rs34647	C	G	1996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.75;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr5	72204773	.	CA	C	105.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.734;ClippingRankSum=0.000;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=2.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.71;ReadPosRankSum=0.024;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,16:0.26:62
chr5	72348272	rs185435	A	G	3815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=59;NR=67;PP=2163;SC=ACATCACACAATGGCTTCTTT;SOR=0.971;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=126;TCF=59;TCR=67;TR=126;WE=72348280;WS=72348262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr5	72419410	rs7731777	A	G	4923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=83;PP=2965;SC=CCGTGGTTGGACTTGGGGCTG;SOR=0.873;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=162;TCF=79;TCR=83;TR=162;WE=72419418;WS=72419400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr5	72419456	rs637450	C	G	4492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=68;PP=2725;SC=ACTTCAGCTCCGTGCAGGGCT;SOR=0.729;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=150;TCF=81;TCR=69;TR=149;WE=72419464;WS=72419446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr5	72419617	rs636926	C	A	8127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.99;NF=137;NR=142;PP=2965;SC=GTGGCTCCAACTGGGCGCAGG;SOR=0.820;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=281;TCF=138;TCR=143;TR=279;WE=72419625;WS=72419607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,300:1.00:300
chr5	72743299	.	G	GGC	277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.68;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	72798502	rs200370518	GTT	G,GT	964.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.44;ReadPosRankSum=1.670;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:3,29,13:0.64,0.29:45
chr5	72800408	rs703882	G	C	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=117;ReadPosRankSum=1.540;SC=GACTTGACTTGGCTTGTTTCT;SOR=0.892;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=10;WE=72800416;WS=72800398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr5	72850282	rs343104	A	G	1190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=28;PP=799;SC=ATGCTGCTGTAAGAAGTTTTA;SOR=1.954;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=11;TCR=28;TR=39;WE=72850290;WS=72850272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr5	72851535	rs819584	A	T	165.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=131;SC=TGCTGACTTTATGTTGGTGTC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=72851543;WS=72851525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr5	72853314	rs1640	T	C	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.345;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.47;ReadPosRankSum=-1.534;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr5	72861459	rs168222	G	A	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=93;ReadPosRankSum=-1.427;SC=CCAGAGCAGAGGAAGCCCCAA;SOR=0.330;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=8;WE=72861467;WS=72861449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr5	72865307	rs347234	C	T	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.084;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=168;ReadPosRankSum=0.638;SC=AATATACTGACCTTCAATCTT;SOR=0.154;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=15;WE=72865315;WS=72865297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr5	72868546	rs1220634	A	G	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.84;ReadPosRankSum=1.314;SOR=0.018;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,6:0.22:27
chr5	72872766	rs1220622	C	T	2672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=32;PP=1682;SC=AAAGCTTTTCCTTTTTATTAG;SOR=1.469;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=59;TCR=32;TR=91;WE=72872774;WS=72872756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr5	72873925	rs7443182	G	A	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.444;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=15;PP=292;ReadPosRankSum=0.021;SC=AGTTCACATGGCACTTTATTT;SOR=0.197;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=49;TCF=14;TCR=35;TR=24;WE=72873933;WS=72873915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,24:0.45:53
chr5	72874801	rs12652195	G	A	1176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.944;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=19;PP=770;ReadPosRankSum=-0.665;SC=TTTTTTTTGTGCTGTTTTGTC;SOR=0.403;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=94;TCF=62;TCR=32;TR=49;WE=72874809;WS=72874791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,51:0.54:95
chr5	72874907	rs343122	A	C	2698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FS=0.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.31;ReadPosRankSum=0.661;SOR=0.755;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:149,141:0.49:290
chr5	72980837	rs16870681	G	A	2571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=55;PP=1597;SC=CACACTGAGCGTTACTGTCTA;SOR=1.536;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=31;TCR=55;TR=86;WE=72980845;WS=72980827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr5	72980869	rs10755296	G	C	1467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=37;PP=1113;SC=TGCATGGAGCGTTTTAAAACT;SOR=3.033;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=8;TCR=37;TR=45;WE=72980877;WS=72980859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr5	73045506	rs17552626	T	C	815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=1;PP=593;SC=ATGTCAAATGTGTTGTTGTTG;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=73045514;WS=73045496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr5	73069581	rs4704097	A	G	127.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=6;NR=0;PP=100;SC=CAACTCTGACATTCTTATTAT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=73069589;WS=73069571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr5	73072354	rs7714670	T	C	3880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=47;PP=2400;SC=TCAGGGCAGATGGTCCCCAAG;SOR=1.373;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=133;TCF=85;TCR=48;TR=132;WE=73072362;WS=73072344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr5	73076457	rs11949860	G	A	4256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.26;MQRankSum=0.196;QD=25.64;ReadPosRankSum=0.564;SOR=0.248;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,165:0.99:166
chr5	73076474	rs35525194	GT	G	3938.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FS=9.566;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.42;MQRankSum=0.502;QD=23.17;ReadPosRankSum=-0.381;SOR=0.290;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:6,164:0.96:170
chr5	73076511	rs6453022	C	A	3979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.20;MQRankSum=0.185;QD=25.03;ReadPosRankSum=-0.512;SOR=0.278;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,158:0.99:159
chr5	73090089	rs12653477	T	G	3475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=33;PP=1701;SC=GAGAGCTGATTTTTAAGAGGC;SOR=1.197;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=59;TCR=33;TR=92;WE=73090097;WS=73090079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr5	73090165	rs10683146	A	AGTT	8836.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=59;PP=2973;SC=GTCAGCTAGTAGTTGTTGTTC;SOR=0.930;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=98;TCF=29;TCR=69;TR=85;WE=73090173;WS=73090155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr5	73090261	rs7716253	T	C	3574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=66;PP=1853;SC=GATCAGCAGCTGAAAAGGAAG;SOR=1.170;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=50;TCR=66;TR=116;WE=73090269;WS=73090251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr5	73091126	rs2973549	T	A	2635.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=37;PP=1703;SC=TGTAATTTTTTAAAAATCCAC;SOR=1.312;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=59;TCR=37;TR=96;WE=73091134;WS=73091116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr5	73091228	rs2973548	C	T	5431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=97;NR=84;PP=2965;SC=TATGAAATAACGCTTTTACCT;SOR=0.753;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=181;TCF=97;TCR=84;TR=181;WE=73091236;WS=73091218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr5	73142296	rs2973571	C	T	2704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=48;PP=1458;SC=AATCTACAGTCGAAGGTATTC;SOR=1.134;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=41;TCR=48;TR=89;WE=73142304;WS=73142286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr5	73144845	rs2973568	A	G	4607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=67;PP=2454;SC=ATTCTTGCTCATCACCCAAAA;SOR=0.871;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=157;TCF=90;TCR=67;TR=157;WE=73144853;WS=73144835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr5	73148481	rs2973566	G	A	2642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=27;PP=1740;SC=GTAGAGCAAAGAGCTTACAGC;SOR=1.414;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=58;TCR=27;TR=85;WE=73148489;WS=73148471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr5	73153389	rs10543482	TACACAC	TAC,T	1997.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;NF=14,14;NR=7,7;PP=955,51;SC=CATATATGTGTACACACACAC;SOR=2.200;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=27;TCF=16;TCR=11;TR=21,21;WE=73153402;WS=73153379;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:50
chr5	73160730	rs1014550	G	A	4846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=85;PP=2821;SC=ATATATATGTGGCATGGTTGC;SOR=0.947;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=164;TCF=79;TCR=85;TR=164;WE=73160738;WS=73160720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr5	73160775	rs1979551	A	G	2848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=59;PP=1718;SC=ACTCTTTTTTATTACCATCTA;SOR=1.633;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=31;TCR=59;TR=90;WE=73160783;WS=73160765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr5	73163831	rs2931423	C	T	2703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=52;PP=1677;SC=GTGTTCCAGGCACCACCTTGG;SOR=0.979;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=43;TCR=52;TR=95;WE=73163839;WS=73163821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr5	73163861	rs2931422	C	T	2606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=45;PP=1664;SC=GCTGAGTGTGCTTTTACATAT;SOR=0.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=43;TCR=45;TR=88;WE=73163869;WS=73163851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr5	73163965	rs2973558	C	A	2416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=35;PP=1317;SC=TGAGAGTGACCATAACAGCTG;SOR=0.715;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=43;TCR=35;TR=78;WE=73163973;WS=73163955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr5	73164138	rs34777247	AT	A	42.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=45;SC=AGATTGAAGCATTTTTTTTTT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=73164146;WS=73164128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr5	73178550	rs2973528	T	G	328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=10;PP=261;SC=GGAGGTGGAATGTTTGTGACA;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=73178558;WS=73178540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	73189145	rs2973529	G	A	3272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=53;NR=57;PP=1827;SC=CTCCCTGGTCGTGGTGTTCTC;SOR=0.950;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=110;TCF=53;TCR=57;TR=110;WE=73189153;WS=73189135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr5	73190119	rs2973530	T	A	732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=0;PP=505;SC=CTTGGAGGTCTTACTGCTTGC;SOR=4.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=73190127;WS=73190110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr5	73197185	rs434065	A	C	2594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=50;PP=1608;SC=CTGGTCTGTCACGGCAGTCAG;SOR=1.190;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=86;TCF=36;TCR=50;TR=86;WE=73197193;WS=73197175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr5	73197200	rs384927	G	A	2342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=49;PP=1383;SC=AGTCAGTGGGGCAAAGGTGCT;SOR=1.356;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=32;TCR=49;TR=81;WE=73197208;WS=73197190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr5	73207372	rs1478453	T	A	5887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.693;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=110;PP=2965;ReadPosRankSum=1.334;SC=TTCCTTTCCATGAAAGCAGCA;SOR=0.730;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=197;TCF=87;TCR=110;TR=196;WE=73207380;WS=73207362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,219:1.00:220
chr5	73218861	rs16871035	G	A	1294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.242;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=22;PP=746;ReadPosRankSum=-1.492;SC=TGGCCAAAATGTGATGGTCTG;SOR=0.837;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=160;TCF=98;TCR=62;TR=62;WE=73218869;WS=73218851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,68:0.40:170
chr5	73218954	rs423333	C	T	2157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.045;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=43;PP=1224;ReadPosRankSum=0.807;SC=ACATCTCCCCCGGGACTGTGG;SOR=0.601;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=199;TCF=100;TCR=99;TR=92;WE=73218962;WS=73218944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,103:0.47:218
chr5	73219109	rs3833638	T	TA	237.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=112;ReadPosRankSum=0.673;SC=TAAAGCATGGTAAAAAAAAAT;SOR=0.793;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=9;WE=73219117;WS=73219099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr5	73339114	rs285599	C	T	2501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FS=2.613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.87;ReadPosRankSum=4.610;SOR=0.538;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:150,132:0.47:282
chr5	73930442	rs300240	C	T	1239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=7;PP=972;SC=CAGATCTCACCCCATGTACTG;SOR=3.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=33;TCR=7;TR=40;WE=73930450;WS=73930432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr5	73930751	rs300239	C	T	8325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=152;NR=130;PP=2965;SC=CATCTCCCACCTTGGTCCACT;SOR=0.824;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=282;TCF=152;TCR=130;TR=282;WE=73930759;WS=73930741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,307:1.00:307
chr5	73931246	rs442425	T	C	8534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=148;NR=148;PP=2965;SC=AGACATCTTTTGAGACCCCAT;SOR=0.770;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=296;TCF=148;TCR=148;TR=296;WE=73931254;WS=73931236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,324:1.00:324
chr5	73932315	rs9176	T	C	2718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=51;PP=1688;SC=TGACATTTTGTTTCCACTCCT;SOR=1.237;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=38;TCR=51;TR=89;WE=73932338;WS=73932305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr5	73981270	rs820878	T	C	13161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=495;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=240;NR=198;PP=2965;SC=CTGCCGCTCTTGGTGAAGATG;SOR=0.892;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=439;TCF=241;TCR=198;TR=438;WE=73981278;WS=73981260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,493:1.00:493
chr5	73985121	rs35711978	C	T	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-3.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.844;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=351;ReadPosRankSum=2.121;SC=TAAAATCCTTCTAAAATGTGT;SOR=0.148;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=42;TCF=39;TCR=3;TR=20;WE=73985129;WS=73985111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,22:0.47:47
chr5	73985215	rs11556045	A	G	2573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=40;PP=1649;ReadPosRankSum=1.489;SC=TTCCAGGCTAAAACCCAGGTT;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=205;TCF=126;TCR=79;TR=105;WE=73985223;WS=73985205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,120:0.50:240
chr5	73992406	rs1696979	T	G	173.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=0;PP=134;SC=GGTATAACACTATATTCAATT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=73992414;WS=73992396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	73992609	rs1665894	G	A	3429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=52;PP=1974;SC=TAGACAAATTGCTAATAGAAA;SOR=0.724;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=64;TCR=52;TR=116;WE=73992624;WS=73992599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr5	74034290	rs186213016	C	T	2192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.348;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=46;PP=1429;ReadPosRankSum=0.901;SC=TAAAGAAGTGCATACAGTTTT;SOR=0.783;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=197;TCF=101;TCR=96;TR=98;WE=74034298;WS=74034280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,102:0.49:208
chr5	74066386	rs1164694	A	G	1212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.502;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=20;PP=758;ReadPosRankSum=-0.265;SC=TTGTACAACTAAAACATATTT;SOR=0.554;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=65;TCR=40;TR=52;WE=74066394;WS=74066376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,57:0.49:117
chr5	74097344	rs149496756	GCA	G	128.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=3.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.81;ReadPosRankSum=0.198;SOR=0.286;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,10:0.14:71
chr5	74109632	rs13184097	C	A	1643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.254;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=23;PP=1024;ReadPosRankSum=-1.359;SC=GACACAAAGACAAGTTTATTA;SOR=0.819;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=159;TCF=105;TCR=54;TR=70;WE=74109640;WS=74109622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,78:0.45:172
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chr5	74324548	rs3811987	G	A	1659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.920;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=28;PP=1207;ReadPosRankSum=-1.371;SC=TTTTCTGAGGGCAAAGTGATC;SOR=0.883;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=156;TCF=92;TCR=64;TR=73;WE=74324556;WS=74324538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,76:0.44:174
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chr5	74376309	rs4447963	A	C	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.57;ReadPosRankSum=1.912;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
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chr5	74387317	rs10462512	C	G	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=271;ReadPosRankSum=-1.441;SC=ACAGGGACCACATATACCCTA;SOR=0.252;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=14;WE=74387325;WS=74387307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr5	74400386	rs961098	G	C	2703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.479;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=63;PP=1901;ReadPosRankSum=-1.220;SC=AATTGGAAAGGTCCTGATCAC;SOR=0.759;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=214;TCF=97;TCR=117;TR=113;WE=74400394;WS=74400376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,119:0.50:236
chr5	74442410	rs1422699	G	A	1682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=25;PP=960;ReadPosRankSum=-0.916;SC=AAAACTGTTGGAAACCCATTT;SOR=0.644;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=128;TCF=80;TCR=48;TR=65;WE=74442418;WS=74442400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,77:0.52:147
chr5	74442920	rs6888707	A	G	3585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.846;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=78;PP=2257;ReadPosRankSum=-0.829;SC=GGTCATTATGAGTTTCTGGAA;SOR=0.693;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=294;TCF=153;TCR=141;TR=156;WE=74442928;WS=74442910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,167:0.52:320
chr5	74443132	rs1422698	C	T	2606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.615;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.940;NF=45;NR=59;PP=1403;ReadPosRankSum=0.123;SC=TATATCTGGTCAAGAGTTGAT;SOR=0.464;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=199;TCF=81;TCR=118;TR=104;WE=74443140;WS=74443122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,121:0.54:226
chr5	74450278	rs7704104	T	A	1562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=43;PP=1081;ReadPosRankSum=0.004;SC=TTGAAAATACTGTTTGGATTT;SOR=0.788;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=96;TCF=29;TCR=67;TR=61;WE=74450286;WS=74450268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,65:0.61:106
chr5	74484275	rs10050948	C	T	656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.985;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=11;PP=375;ReadPosRankSum=-1.172;SC=GCTGAAACTACAAACCACTCT;SOR=0.502;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=58;TCF=37;TCR=21;TR=29;WE=74484283;WS=74484265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,32:0.48:66
chr5	74491715	rs10563854	TTCA	T	3975.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.733;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.05;MQRankSum=0.980;NF=13;NR=39;PP=2422;ReadPosRankSum=0.570;SC=ACTCAATGGGTTCATCAATTC;SOR=0.856;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=119;TCF=29;TCR=90;TR=52;WE=74491725;WS=74491705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,103:0.51:200
chr5	74506658	rs2219745	C	T	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=153;ReadPosRankSum=0.849;SC=CTTACTGTAACAGAGCTTGAT;SOR=0.650;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=51;TCF=28;TCR=23;TR=16;WE=74506666;WS=74506648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,20:0.32:63
chr5	74518317	.	T	TA	25	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=25;QD=13.0;SC=TCATTTCTTCTAAAAAAAAAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=3;WE=74518325;WS=74518307;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,3:0.33:9
chr5	74526489	rs11295265	GT	G	2676.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.913;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.040;NF=3;NR=49;PP=1826;ReadPosRankSum=2.064;SC=GAAGGCACAAGTTGTTAATGT;SOR=0.854;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=106;TCF=9;TCR=97;TR=52;WE=74526497;WS=74526479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,87:0.49:179
chr5	74877758	.	C	A	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5006;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=185;ReadPosRankSum=3.070;SC=CCCACCTTGGCCTCCCAAAGT;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=10;WE=74877766;WS=74877748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,11:0.85:13
chr5	74981322	rs17563610	A	T	1225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.761;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=33;PP=746;ReadPosRankSum=-0.650;SC=ATAAATCACAAATTAATTCCA;SOR=0.824;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=98;TCF=38;TCR=60;TR=54;WE=74981330;WS=74981312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,58:0.56:104
chr5	74984818	rs17563686	A	T	883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.815;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=13;PP=603;ReadPosRankSum=-1.247;SC=AGGCAGAGAAACTTTAATGAA;SOR=0.988;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=78;TCF=49;TCR=29;TR=38;WE=74984826;WS=74984808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,41:0.48:85
chr5	74986481	rs4704230	T	C	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=3.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=126;ReadPosRankSum=-0.379;SC=AGTGTACATATACACATTATT;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=6;WE=74986489;WS=74986471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr5	74988336	rs888788	C	T	1639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.879;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=43;PP=929;ReadPosRankSum=1.078;SC=CTGTAAACAGCAATTAACCCA;SOR=0.973;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=142;TCF=61;TCR=81;TR=72;WE=74988344;WS=74988326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,79:0.51:156
chr5	74988369	rs888789	A	G	1000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=29;PP=625;ReadPosRankSum=-0.821;SC=TTAAAATAACAGCAATTGGTA;SOR=0.704;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=96;TCF=35;TCR=61;TR=46;WE=74988377;WS=74988359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,49:0.48:103
chr5	74998334	rs17563863	G	A	432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=307;ReadPosRankSum=0.240;SC=AAGATTTTTAGAAAGTTTAAC;SOR=0.663;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=16;WE=74998342;WS=74998324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr5	74998426	rs17649248	G	A	1738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.861;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=36;PP=898;ReadPosRankSum=-1.225;SC=CTGCTGTACCGTACCTTAAGA;SOR=0.538;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=165;TCF=94;TCR=71;TR=79;WE=74998434;WS=74998416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,87:0.49:178
chr5	75003678	rs2307111	T	C	2307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.645;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=53;PP=1213;ReadPosRankSum=2.268;SC=TATAGCATAATGAAGCAGTTC;SOR=0.589;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=189;TCF=88;TCR=101;TR=101;WE=75003686;WS=75003665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,114:0.53:217
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chr5	75427518	rs1423099	C	T	1627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=10;PP=1125;SC=AGAGCTGAACCACTGAAAGGA;SOR=2.522;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=43;TCR=10;TR=53;WE=75427526;WS=75427508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
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chr5	75906851	rs7722711	T	C	1771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.997;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=25;PP=1094;ReadPosRankSum=-0.591;SC=CTAGGAGTTGTAGCTGTAGGG;SOR=0.439;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=136;TCF=93;TCR=43;TR=73;WE=75906859;WS=75906841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,82:0.53:156
chr5	75923141	rs2455221	G	A	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=436;ReadPosRankSum=0.924;SC=GAATTTGTGGGAATTATGATT;SOR=0.593;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=51;TCF=36;TCR=15;TR=25;WE=75923149;WS=75923131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,29:0.51:57
chr5	75923285	rs2431351	C	T	2227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FS=3.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.73;ReadPosRankSum=0.571;SOR=0.858;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:123,106:0.46:229
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chr5	75923307	rs2909888	A	G	6146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=99;PP=2962;SC=CAACGTGGACAAGGACAGAGC;SOR=0.812;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=200;TCF=101;TCR=99;TR=200;WE=75923315;WS=75923275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr5	75923393	rs2431353	T	C	1668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=41;PP=815;ReadPosRankSum=-0.294;SC=TGAAGTCATGTGATTTTTAAT;SOR=0.645;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=144;TCF=60;TCR=84;TR=73;WE=75923401;WS=75923383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,84:0.52:163
chr5	75923459	rs2455222	G	A	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=263;ReadPosRankSum=-0.592;SC=TAATTATACCGAAATTAGTTG;SOR=0.752;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=8;TCR=26;TR=17;WE=75923467;WS=75923449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
chr5	75923494	rs2431354	C	T	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=-2.075;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=96;ReadPosRankSum=0.405;SC=AGTGATTTGACTCTATCTCCA;SOR=0.283;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=7;WE=75923502;WS=75923484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr5	75924469	rs3822541	G	T	1958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.497;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=38;PP=2867;ReadPosRankSum=-0.796;SC=GTTGTATCAGGTCAGAGAAGG;SOR=0.749;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=193;TCF=109;TCR=84;TR=91;WE=75924480;WS=75924459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,100:0.46:219
chr5	75924472	rs2455225	A	G	2500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.624;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=48;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.050;SC=GTATCAGGTCAGAGAAGGTTC;SOR=0.590;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=195;TCF=109;TCR=86;TR=104;WE=75924480;WS=75924459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,124:0.55:224
chr5	75927595	rs431160	C	G	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.690;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=253;ReadPosRankSum=1.097;SC=GATACTAATGCATTCCTAAAA;SOR=1.230;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=4;WE=75927614;WS=75927585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr5	75927606	rs3797409	C	T	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=394;ReadPosRankSum=-0.068;SC=ATTCCTAAAACGTTGAATTAT;SOR=0.430;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=11;WE=75927614;WS=75927585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr5	75927938	rs441157	A	T	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=368;ReadPosRankSum=-0.881;SC=AAGACAAGTAATGCTTTCAAA;SOR=0.434;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=19;WE=75927946;WS=75927928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,22:0.54:41
chr5	75927954	rs3797412	A	G	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=221;ReadPosRankSum=-0.516;SC=TCAAATTAACATTTCTGTAAT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=12;WE=75927962;WS=75927944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr5	75932869	rs2910819	C	T	1085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.246;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=13;PP=721;ReadPosRankSum=-0.181;SC=TGTCTAGTGACGGTTCATGGC;SOR=1.139;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=136;TCF=92;TCR=44;TR=51;WE=75932877;WS=75932859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,56:0.36:155
chr5	75932965	rs2455230	G	C	2007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=49;PP=1415;ReadPosRankSum=2.440;SC=AATCATGCTTGTATAAAGAAT;SOR=0.719;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=225;TCF=116;TCR=109;TR=98;WE=75932973;WS=75932955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,102:0.40:253
chr5	75933097	rs2937415	C	T	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=300;ReadPosRankSum=-0.028;SC=GAGGAACTAACTGATTTATCT;SOR=0.960;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=17;WE=75933105;WS=75933087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,17:0.41:41
chr5	75936944	rs457821	G	A	3185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=69;PP=1867;SC=TGGATCACCTGCCACTGTTTA;SOR=1.476;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=42;TCR=69;TR=111;WE=75936952;WS=75936934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr5	75948474	rs2252231	T	C	1717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.991;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=21;PP=1174;ReadPosRankSum=-1.018;SC=CCTGACAGTGTCCCAGCTCCA;SOR=1.042;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=139;TCF=94;TCR=45;TR=71;WE=75948482;WS=75948464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,78:0.51:152
chr5	75948650	rs2431363	A	G	2277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.456;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=43;PP=1334;ReadPosRankSum=0.786;SC=TACTGATTCTATTGTGAAGGT;SOR=0.728;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=225;TCF=123;TCR=102;TR=97;WE=75948658;WS=75948640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,111:0.43:257
chr5	75948685	rs2431362	G	A	2181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.001;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=45;PP=1173;ReadPosRankSum=-1.192;SC=ACCATACCAAGTGCTTGGCTT;SOR=0.612;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=203;TCF=103;TCR=100;TR=95;WE=75948693;WS=75948675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,111:0.47:236
chr5	75948799	rs2455215	T	C	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=358;ReadPosRankSum=-0.212;SC=TGAATCCCAGTTCTGCTGCTC;SOR=1.259;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=17;WE=75948807;WS=75948789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr5	75949844	rs457127	C	A	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr5	75949876	rs466393	T	C	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=28;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GCTTTAGAGATTGATTATTCA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=3;WE=75949884;WS=75949866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr5	75950193	rs462307	A	G	436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=10;PP=264;SC=TTGAATGGTGAACATGAACAC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=75950201;WS=75950183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	75950222	rs3815774	T	G	66.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=58;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TAATGGATCTTAGAACTTCAT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=75950230;WS=75950212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr5	75950707	rs465731	G	A	1452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=11;PP=908;SC=ATTCAAAAATGATGGAGTAGG;SOR=2.215;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=35;TCR=11;TR=46;WE=75950715;WS=75950697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr5	75950997	rs459846	G	A	2070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=52;PP=1514;SC=ACACAGAGGAGCACATGGTGA;SOR=2.584;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=14;TCR=52;TR=66;WE=75951005;WS=75950987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr5	75960818	rs11449450	T	TA	1391.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=4;PP=844;SC=GTATGAGAATTAAAAAGGAGT;SOR=2.621;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=23;WE=75960833;WS=75960808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr5	75960825	rs253092	G	C	1524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=5;PP=802;SC=AATTAAAAAGGAGTAATCTCA;SOR=2.712;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=33;WE=75960833;WS=75960808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	75960865	rs253093	T	C	2161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=17;PP=1399;SC=TAATTTCACATAGTAAAAAGC;SOR=1.734;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=51;TCR=17;TR=68;WE=75960873;WS=75960855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr5	75964462	rs3815778	T	A	689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.898;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=12;PP=446;ReadPosRankSum=0.895;SC=TAACTTATTGTTTTGTGGGAT;SOR=0.578;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=72;TCF=47;TCR=25;TR=33;WE=75964470;WS=75964452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,34:0.44:77
chr5	75964702	rs3764935	G	A	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=53;ReadPosRankSum=-0.328;SC=AAAAATACCAGTGAATCAATC;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=75964710;WS=75964692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr5	75989044	rs10514070	G	A	1087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=4;PP=707;SC=GTGAATATCCGCAAGAATGTT;SOR=3.383;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=30;WE=75989052;WS=75989034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	75998516	rs145804823	A	AGAAAACCAGTGCCAGCCTTATTTGCC	2075.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.67;QD=41.51;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr5	76003254	rs463188	A	T	217.89	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=21.79;ReadPosRankSum=0.674;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,9:0.90:10
chr5	76003258	rs464494	C	T	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.18;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	76114963	rs1529505	C	T	773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=6;PP=537;SC=TTCGAATCGGCGGCGGCGGAT;SOR=2.147;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=27;WE=76114971;WS=76114953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr5	76128521	rs616235	G	A	5648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=121;NR=74;PP=2965;SC=ACAGGAACCAGTAGATCCTCT;SOR=1.250;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=195;TCF=121;TCR=74;TR=195;WE=76128529;WS=76128511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr5	76129053	rs631465	T	C	3511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=60;PP=2355;SC=TGGTCACCATTCCTTTGTATG;SOR=0.848;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=115;TCF=55;TCR=60;TR=115;WE=76129061;WS=76129043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr5	76259011	rs41272248	A	G	62.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5051;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=39;ReadPosRankSum=0.319;SC=TCTCTTTTAAATGTCTTTTAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=3;WE=76259019;WS=76259005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr5	76259350	rs7728378	T	C	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.447;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=218;ReadPosRankSum=0.017;SC=AGCACTCCCCTAATATTTTCT;SOR=1.165;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=30;TCF=11;TCR=19;TR=15;WE=76259358;WS=76259340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr5	76372850	rs1056586	G	A	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.602;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=225;ReadPosRankSum=-0.863;SC=GAAGCCTTAGGGTGTGGAAGA;SOR=1.140;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=15;WE=76372858;WS=76372840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,16:0.36:45
chr5	76376478	rs149659097	G	GT	1102.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.984;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.943;NF=1;NR=21;PP=839;ReadPosRankSum=-1.572;SC=GCCACAGGCCGTAACAGCCTG;SOR=0.568;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=45;TCF=2;TCR=43;TR=22;WE=76376486;WS=76376468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,36:0.55:66
chr5	76607627	rs11413850	C	CT	441.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=304;ReadPosRankSum=0.731;SC=TAAATGGATACTTTTTTTTTA;SOR=1.536;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=18;WE=76607635;WS=76607617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,20:0.67:30
chr5	76621612	rs4133658	A	T	380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=12;PP=317;SC=TAAAACGAATATCATTTATAG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=76621620;WS=76621602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	76627436	rs9687030	A	G	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.837;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=123;ReadPosRankSum=0.612;SC=TCTCATGGGAAAGTAACGAGC;SOR=0.340;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=9;WE=76627444;WS=76627426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr5	76633297	rs7717046	G	A	359.94	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.9997;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=210;ReadPosRankSum=-1.006;SC=CAGTATCTAAGCCAGAAGGCC;SOR=0.892;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=14;WE=76633305;WS=76633287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,15:0.94:16
chr5	76640845	rs11742730	C	G	1063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=27;PP=565;ReadPosRankSum=-0.788;SC=TTCCCATCATCCTCATGTATC;SOR=0.734;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=94;TCF=34;TCR=60;TR=43;WE=76640853;WS=76640835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,49:0.47:105
chr5	76645529	rs2306343	G	A	829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=23;PP=600;SC=AAATGAGTTCGTTTTTAAGTT;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=24;WE=76645537;WS=76645519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
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chr5	76708987	rs335614	A	G	3256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=35;PP=1933;SC=GAGTATGTGAATTTTTAAACT;SOR=1.309;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=70;TCR=35;TR=105;WE=76708995;WS=76708977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr5	76709249	rs335615	A	T	306.22	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.884;HP=8;HapScore=4;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=302;ReadPosRankSum=-0.149;SC=CAGCTTTTTTAAAAAAAAATT;SOR=1.911;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=15;WE=76709257;WS=76709238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,15:0.88:17
chr5	76709268	rs335616	A	G	446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=11;PP=297;SC=TTTTGTTACCAAATTGACTAG;SOR=2.049;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=15;WE=76709276;WS=76709258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	76714380	rs2242159	C	T	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.560;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=213;ReadPosRankSum=1.446;SC=TCCCACTGTACCAGATGATAA;SOR=1.179;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=13;WE=76714388;WS=76714370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr5	76722443	rs40594	G	A	1288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=26;PP=758;SC=TAGCGTAAACGAGAGGCCTTC;SOR=1.514;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=16;TCR=26;TR=42;WE=76722451;WS=76722433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr5	76729193	rs462581	G	C	700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=16;PP=447;SC=ATGTGCGTGTGAGATATGTGC;SOR=2.833;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=76729201;WS=76729183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	76733379	rs919224	C	T	1489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=38;PP=1002;SC=TGACAAAAATCACAATTTAGC;SOR=3.014;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=8;TCR=38;TR=46;WE=76733387;WS=76733369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr5	76734084	rs33204	C	T	5012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=67;PP=2965;SC=AGTCTGGCAACGTGCAGGACA;SOR=0.947;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=157;TCF=90;TCR=67;TR=157;WE=76734092;WS=76734074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr5	76736907	rs2560076	G	C	686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=18;PP=511;SC=TAGTAATGCCGTATAAAACCA;SOR=1.893;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=25;WE=76736915;WS=76736897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	76747087	rs335609	T	C	2216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=29;PP=1401;SC=TCGTTCAAAATACACAAAAAG;SOR=0.961;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=45;TCR=29;TR=74;WE=76747095;WS=76747077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr5	76749605	rs17751147	G	C	1666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.318;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=17;PP=1175;ReadPosRankSum=-0.903;SC=CTTCTAGTCTGTCAATCATAG;SOR=0.929;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=129;TCF=92;TCR=37;TR=66;WE=76749613;WS=76749595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,71:0.50:141
chr5	76758803	rs426381	T	C	650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=3;PP=513;SC=AGAACAAAAATCATTTTTGCT;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=22;WE=76758811;WS=76758793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr5	76760495	rs410620	T	C	3102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=24;PP=2178;SC=CAGTGATATGTAAATGTATCC;SOR=2.237;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=76;TCR=24;TR=100;WE=76760503;WS=76760485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr5	76760657	rs11433376	G	GA	1529.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.067;HP=11;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=1.146;NF=5;NR=43;PP=684;ReadPosRankSum=3.417;SC=AAAGGGTCAAGAAAAAAAAAT;SOR=0.900;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=115;TCF=10;TCR=105;TR=48;WE=76760665;WS=76760647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,77:0.46:167
chr5	76785407	rs75709452	A	G	559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.32;ReadPosRankSum=1.256;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,23:0.96:24
chr5	76787919	rs42764	C	G	5156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=113;NR=70;PP=2965;SC=GGTCGGAACCCAGGAAGGCCG;SOR=1.090;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=183;TCF=113;TCR=70;TR=183;WE=76787927;WS=76787909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr5	76916335	rs5868876	G	GC	2249.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.874;NF=7;NR=29;PP=1345;ReadPosRankSum=-0.002;SC=TGAACAATTAGCTTCATGCAT;SOR=0.706;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=89;TCF=16;TCR=73;TR=36;WE=76916343;WS=76916325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,75:0.47:161
chr5	76926578	rs13357072	T	C	6394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=120;NR=86;PP=2965;SC=TGGTCGTCTTTTTGCGCTTCT;SOR=0.890;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=207;TCF=121;TCR=86;TR=206;WE=76926592;WS=76926568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr5	77004229	rs9791128	A	G	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=17;PP=378;ReadPosRankSum=-0.820;SC=ACCATAAGAAAGAAACTGTGT;SOR=0.686;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=80;TCF=41;TCR=39;TR=34;WE=77004237;WS=77004219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,38:0.40:94
chr5	77004268	rs78984548	C	G	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=281;ReadPosRankSum=0.955;SC=ATTTAAAATACCAAAGTAGAT;SOR=0.653;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=52;TCF=18;TCR=34;TR=21;WE=77004276;WS=77004258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,22:0.39:57
chr5	77011066	rs9791058	T	C	1071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.868;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=18;PP=562;ReadPosRankSum=0.789;SC=ATTTACTTAATGTACTCCAGC;SOR=0.408;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=91;TCF=60;TCR=31;TR=49;WE=77011074;WS=77011056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,52:0.55:95
chr5	77298619	rs11552314	A	T	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.709;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=132;ReadPosRankSum=0.009;SC=AGTGTATTCTACCCCCACTGC;SOR=0.446;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=8;WE=77298627;WS=77298609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr5	77412011	rs42360	A	G	1880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.192;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=40;PP=992;ReadPosRankSum=2.001;SC=AAAACTTCTTAGCAGAATTCT;SOR=0.569;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=147;TCF=71;TCR=76;TR=77;WE=77412019;WS=77412001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,92:0.53:173
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chr5	77461308	rs138987182	AGTT	A	64.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.191;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=65;ReadPosRankSum=0.586;SC=TGAATTTCTTAGTTGTCAGTC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=3;WE=77461318;WS=77461298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
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chr5	78265041	rs3733895	A	G	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.145;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=247;ReadPosRankSum=1.376;SC=ATAAAATTATAGATTAATGAC;SOR=0.437;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=47;TCF=16;TCR=31;TR=20;WE=78265049;WS=78265031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,23:0.42:55
chr5	78317413	rs731124	C	T	2617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=56;PP=1516;ReadPosRankSum=0.984;SC=CAGGTTTTGACAAGAACACGA;SOR=0.682;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=275;TCF=153;TCR=122;TR=122;WE=78317421;WS=78317403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,133:0.45:298
chr5	78324352	rs1805074	A	G	3150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.960;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=57;PP=1883;ReadPosRankSum=-0.866;SC=AGATCTTCAGAGGTCAGTTTC;SOR=0.580;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=270;TCF=161;TCR=109;TR=140;WE=78324360;WS=78324342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,152:0.52:291
chr5	78324482	rs2303129	T	C	1700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.575;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=41;PP=1022;ReadPosRankSum=-1.165;SC=ATCTGCGTTTTAGTCATGAAC;SOR=0.750;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=160;TCF=60;TCR=100;TR=65;WE=78324490;WS=78324472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,77:0.44:175
chr5	78325879	rs41272268	T	C	920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=23;PP=621;ReadPosRankSum=0.469;SC=AATTAAAAATTACCTTAGGAT;SOR=0.647;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=65;TCF=24;TCR=41;TR=37;WE=78325887;WS=78325869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,41:0.55:75
chr5	78326750	rs1805073	G	C	3141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.556;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=61;PP=1973;ReadPosRankSum=-0.515;SC=GTCAGTTACCGCTACTCTTTG;SOR=0.878;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=294;TCF=164;TCR=130;TR=146;WE=78326758;WS=78326740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,158:0.48:329
chr5	78326922	rs140713637	CGGGCAGCGGGGAGTG	C	951.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.091;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=2930;ReadPosRankSum=-0.055;SC=GAAAATCCTACGGGCAGCGGG;SOR=1.781;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=1;TCR=37;TR=14;WE=78326944;WS=78326912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,25:0.54:46
chr5	78340062	rs248384	T	C	1284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.747;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=15;PP=848;ReadPosRankSum=0.634;SC=ACAGCCATCCTCCAGCCATGG;SOR=0.829;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=108;TCF=76;TCR=32;TR=52;WE=78340070;WS=78340052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,58:0.51:114
chr5	78340257	rs248385	C	G	2625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.442;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.189;NF=61;NR=57;PP=1599;ReadPosRankSum=0.317;SC=GGAGCACAGGCAGTTCTCGTT;SOR=0.563;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=283;TCF=138;TCR=145;TR=118;WE=78340265;WS=78340247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:186,133:0.42:319
chr5	78340286	rs532964	A	G	2041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.130;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.186;NF=47;NR=52;PP=1182;ReadPosRankSum=-0.155;SC=TTCACTTCAGATATAGTCGAT;SOR=0.566;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=229;TCF=104;TCR=125;TR=99;WE=78340294;WS=78340276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,108:0.42:258
chr5	78340411	rs531982	T	C	540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.960;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=287;ReadPosRankSum=-0.639;SC=TGTCAGCCCATATATAAACAC;SOR=0.357;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=16;WE=78340419;WS=78340401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,21:0.66:32
chr5	78351512	rs6873326	T	C	1016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=15;PP=706;ReadPosRankSum=-1.128;SC=TCTCATCATATTCCTCTACTA;SOR=0.666;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=86;TCF=58;TCR=28;TR=44;WE=78351520;WS=78351502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,46:0.51:90
chr5	78351636	rs2253262	A	C	3693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=72;PP=2300;SC=CCTTTACCTGACCAGTTTCTT;SOR=1.153;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=53;TCR=72;TR=125;WE=78351644;WS=78351626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr5	78373431	rs682985	C	T	2470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=50;PP=1519;SC=AACACCCAGACGCAGGTTGGT;SOR=1.389;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=33;TCR=50;TR=83;WE=78373439;WS=78373421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr5	78378824	rs41272270	C	T	2184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=57;PP=1350;ReadPosRankSum=-0.794;SC=TTGTTGCTTACGAAATTTAAC;SOR=0.710;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=221;TCF=94;TCR=127;TR=100;WE=78378832;WS=78378814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,111:0.43:259
chr5	78407805	rs56047138	C	T	1489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.364;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=27;PP=746;ReadPosRankSum=-1.028;SC=ATCCCAGCCTCTGGGAGCGCA;SOR=0.550;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=117;TCF=61;TCR=56;TR=60;WE=78407813;WS=78407795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,71:0.53:135
chr5	78416416	rs567754	C	T	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=49;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TACATTTTCTCTACCTTTTGC;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=4;WE=78416424;WS=78416406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
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chr5	78421959	rs3733890	G	A	2374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.505;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=47;PP=1458;ReadPosRankSum=-0.996;SC=GAGGCTGCCCGACTGAAAGCT;SOR=0.748;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=186;TCF=96;TCR=90;TR=97;WE=78421967;WS=78421949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,108:0.52:209
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chr5	78587135	rs17234734	A	T	1290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=38;PP=907;ReadPosRankSum=0.777;SC=AACAAAAATCATCAGAAATAT;SOR=0.647;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=117;TCF=38;TCR=79;TR=56;WE=78587143;WS=78587125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,59:0.45:130
chr5	78596044	rs10514159	T	C	2304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.657;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=54;PP=1456;ReadPosRankSum=0.723;SC=ATTATTATGATCTGCAACTTC;SOR=0.571;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=200;TCF=86;TCR=114;TR=99;WE=78596052;WS=78596034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,111:0.50:221
chr5	78742858	rs12516663	T	C	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.966;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=10;PP=410;ReadPosRankSum=-1.447;SC=TAATTAAGAATAGAAATGATA;SOR=0.469;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=69;TCF=49;TCR=20;TR=29;WE=78742866;WS=78742848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,30:0.38:80
chr5	78742980	rs6862358	G	A	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.591;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=293;ReadPosRankSum=1.209;SC=TGAATGTATAGAGACTACATA;SOR=0.392;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=53;TCF=15;TCR=38;TR=22;WE=78742988;WS=78742970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,24:0.43:56
chr5	78915992	rs3828602	A	C	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.629;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=126;ReadPosRankSum=-0.682;SC=TATTGTATGGACCCTAAGCCC;SOR=0.495;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=8;WE=78916000;WS=78915982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr5	79054468	rs144578287	CTATG	C	490.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=395;ReadPosRankSum=-1.354;SC=TACTTTTATACTATGTATTTC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=9;WE=79054479;WS=79054466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr5	79084949	rs2302979	G	C	2124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=46;PP=1176;ReadPosRankSum=-0.706;SC=TTTGCACACAGTGAGCTATTT;SOR=0.676;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=145;TCF=54;TCR=91;TR=75;WE=79084957;WS=79084939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,92:0.55:166
chr5	79086627	rs2287676	C	T	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-2.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=99;ReadPosRankSum=0.324;SC=CCGGCATCCACGAAGGCCTTA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=7;WE=79086635;WS=79086617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr5	79086649	rs259096	G	A	1043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=8;PP=779;SC=CATGAGTGAAGTTTTCAGCTG;SOR=2.494;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=29;TCR=8;TR=37;WE=79086657;WS=79086639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr5	79095417	rs10043986	C	T	1635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=32;PP=967;ReadPosRankSum=-2.480;SC=ATAGAGCCCCCGGATTCTGTA;SOR=0.724;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=139;TCF=69;TCR=70;TR=66;WE=79095425;WS=79095407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,76:0.49:155
chr5	79172136	rs265005	A	G	3500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.777;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=68;PP=2081;ReadPosRankSum=-0.347;SC=GGACTATAAAATTCTCCAGGG;SOR=0.783;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=310;TCF=161;TCR=149;TR=152;WE=79172144;WS=79172126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,166:0.49:339
chr5	79281658	rs7734858	T	C	1038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=26;PP=784;SC=TCGAATGCTCTAAAACTAAAC;SOR=2.584;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=33;WE=79281666;WS=79281648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr5	79282544	rs2291524	C	T	1199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=25;PP=757;SC=GAAGAAGAAACGTAAAAATCC;SOR=0.976;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=20;TCR=25;TR=45;WE=79282552;WS=79282534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr5	79282798	rs9293796	G	C	1967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.524;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=30;PP=1150;ReadPosRankSum=0.360;SC=TAAAATAACTGCTCAGGATGT;SOR=0.762;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=186;TCF=116;TCR=70;TR=84;WE=79282806;WS=79282788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,95:0.47:203
chr5	79286568	rs76766140	C	T	4848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=500;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.743;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=108;NR=106;PP=2962;ReadPosRankSum=1.149;SC=ACAGCCCCATCCCCCAAAGGC;SOR=0.566;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=449;TCF=236;TCR=213;TR=214;WE=79286576;WS=79286558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:261,237:0.48:498
chr5	79351544	rs412379	G	A	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-4.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.032;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=289;ReadPosRankSum=-0.810;SC=CACACCATTTGTTGACCCTCC;SOR=0.278;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=19;WE=79351552;WS=79351534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,20:0.62:32
chr5	79351852	rs438042	A	T	4673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FS=3.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.53;ReadPosRankSum=1.418;SOR=0.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:170,131:0.44:301
chr5	79351859	rs405482	GG	AA	2175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.27;ReadPosRankSum=2.350;SOR=0.702;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:153,110:0.42:263
chr5	79354147	rs368936	C	T	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.481;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=365;ReadPosRankSum=0.337;SC=GGTGTGGGCTCTTGGGCAGTT;SOR=0.432;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=22;WE=79354155;WS=79354137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,23:0.59:39
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chr5	79354367	rs374170260	A	ATT	161.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.419;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=70;ReadPosRankSum=-1.404;SC=CATTATCATTATTTTTTTTAG;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=4;WE=79354375;WS=79354361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr5	79354647	rs432267	C	G	1157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.157;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=31;PP=724;ReadPosRankSum=1.732;SC=GAAAAGCCCTCGTCTTCTTAG;SOR=0.283;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=80;TCF=24;TCR=56;TR=47;WE=79354655;WS=79354637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,52:0.59:88
chr5	79354702	rs411943	C	T	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=290;ReadPosRankSum=0.071;SC=TGCCCAGGCACGGGGGCAGCC;SOR=1.085;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=17;WE=79354710;WS=79354692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr5	79355192	rs2434302	T	A	1444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.511;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.112;NF=48;NR=25;PP=1256;ReadPosRankSum=-2.472;SC=TAGCTCCACATGGATTCTTTC;SOR=0.488;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=130;TCF=90;TCR=40;TR=73;WE=79355200;WS=79355182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,65:0.56:116
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chr5	79366080	rs256439	T	C	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=118;ReadPosRankSum=-1.029;SC=GCCACCAGCTTCCTGCCAGGC;SOR=0.675;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=10;WE=79366088;WS=79366070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr5	79366249	rs256438	T	G	1394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.108;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=36;PP=926;ReadPosRankSum=0.052;SC=GGGTGTGGGGTGGCAGTAGGC;SOR=0.935;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=127;TCF=61;TCR=66;TR=64;WE=79366257;WS=79366239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,66:0.50:133
chr5	79368016	rs256437	T	C	1870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=20;PP=1000;SC=CAGGCAGAAGTGACTCACCAT;SOR=1.385;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=40;TCR=20;TR=60;WE=79368024;WS=79368006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr5	79439630	rs12652646	G	A	6232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=111;NR=96;PP=2965;SC=TGGCACTTTCGTAGCTGTGGA;SOR=0.719;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=207;TCF=111;TCR=96;TR=207;WE=79439638;WS=79439620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr5	79443169	rs7712447	A	G	5685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=111;PP=2965;SC=CCTCAGCAAGACAACAGTAAC;SOR=1.184;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=186;TCF=75;TCR=111;TR=186;WE=79443177;WS=79443159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr5	79443198	rs78285752	C	T	4111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=82;PP=2575;SC=GAACCACCTCCCAGGCCCTTC;SOR=1.512;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=45;TCR=82;TR=127;WE=79443206;WS=79443188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr5	79473059	rs11429938	C	CT	2162.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=5;PP=1607;SC=ATCAGAGGTACTTGGACTGCG;SOR=2.722;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=45;TCF=38;TCR=7;TR=40;WE=79473067;WS=79473049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr5	79498623	rs7723756	A	G	7657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=158;NR=85;PP=2965;SC=GGGTACATGGACCCCATCTTC;SOR=1.377;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=243;TCF=158;TCR=85;TR=243;WE=79498631;WS=79498613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,281:1.00:281
chr5	79499076	rs35653111	C	CAT	149.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=197;SC=TATATATACACATATATATAT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=4;WE=79499084;WS=79499066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr5	79551867	rs1966470	A	G	2451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=47;PP=1540;SC=AGCCTCGGCGAAGCGCCTAGG;SOR=0.959;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=39;TCR=48;TR=86;WE=79551875;WS=79551857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr5	79731608	rs2544599	G	A	950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=16;NR=14;PP=493;SC=TGCTCAGGCTGGTCTTGAACT;SOR=0.804;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=30;TCF=16;TCR=14;TR=30;WE=79731616;WS=79731598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	79733079	rs2544600	T	C	4162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=67;NR=61;PP=2161;SC=CAGAATGATATCAGTTCTGAA;SOR=0.859;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=128;TCF=67;TCR=61;TR=128;WE=79733087;WS=79733069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr5	79734297	rs259028	T	C	3946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=56;PP=2631;SC=ATTTGTGAAATAGTTGATAAA;SOR=0.846;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=74;TCR=56;TR=130;WE=79734305;WS=79734287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr5	79734409	rs259029	G	A	7344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=135;NR=104;PP=2965;SC=ATCAATTATCGGTCTCTGATA;SOR=0.907;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=240;TCF=135;TCR=105;TR=239;WE=79734417;WS=79734399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr5	79735858	rs168939	A	G	1249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=24;PP=769;SC=AAAGGTGAGTATTAACTTGAT;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=17;TCR=24;TR=41;WE=79735866;WS=79735848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr5	79739685	rs259033	G	A	3867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=84;PP=2339;SC=CAGACTTCCAGCCTGGCATCC;SOR=1.418;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=128;TCF=44;TCR=84;TR=128;WE=79739693;WS=79739675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr5	79741018	rs259034	T	A	1360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=3;PP=787;SC=TTCACAATCTTTTTGGCATTA;SOR=3.080;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=36;TCR=3;TR=39;WE=79741026;WS=79741008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr5	79743821	rs2251759	T	A	1272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=30;NR=15;PP=793;SC=TGATTTGTTATTTTTTTTATT;SOR=1.426;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=30;TCR=15;TR=45;WE=79743829;WS=79743811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr5	79745469	rs249038	A	G	2741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=38;PP=1667;SC=TGAAGGTGAAAGCTTTCATCC;SOR=0.909;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=93;TCF=55;TCR=38;TR=93;WE=79745477;WS=79745459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr5	79747291	rs249039	A	G	1792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=16;PP=1231;SC=TTTACTAATGATTTTATTTGC;SOR=1.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=42;TCR=16;TR=58;WE=79747299;WS=79747281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr5	79751332	rs249040	A	G	95.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=1;PP=69;SC=CAGCCTGGGCAACAGAGTGAG;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=79751340;WS=79751325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	79773028	rs166062	T	G	2367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=26;PP=1550;SC=AGAATTTTTTTTTTTTCTAGG;SOR=1.367;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=77;TCF=51;TCR=26;TR=76;WE=79773036;WS=79773018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr5	79815658	rs369998	T	C	9965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=368;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=163;NR=164;PP=2965;SC=GACACCGTGATATCCTTCTTT;SOR=0.726;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=327;TCF=163;TCR=164;TR=327;WE=79815666;WS=79815648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,368:1.00:368
chr5	79855372	rs32857	A	G	6542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=119;NR=102;PP=2965;SC=CCCACAGGGCAACTTTGCTGT;SOR=0.709;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=223;TCF=121;TCR=102;TR=221;WE=79855380;WS=79855362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr5	79855670	.	C	T	2622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=0.000;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.588;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=51;ReadPosRankSum=-1.384;SC=CTCTGGTGATCGACATGTTTG;SOR=0.812;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=204;TCF=104;TCR=100;TR=103;WE=79855678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,123:0.53:231
chr5	79933933	rs1677697	T	C	2057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=41;PP=1278;SC=TCATCATAAATATGAATCCTT;SOR=1.319;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=28;TCR=41;TR=69;WE=79933941;WS=79933923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr5	79945711	rs836821	C	A	1850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=18;PP=1045;SC=TGGTTTTGCTCTACATTGTTT;SOR=1.508;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=41;TCR=18;TR=59;WE=79945719;WS=79945701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr5	79950389	rs151182735	GC	G	1412.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=22;PP=802;SC=TGGCCGCCCCGCCCCCCTCGT;SOR=2.049;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=26;WE=79950411;WS=79950379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr5	79950403	rs10168	C	T	1389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=20;PP=652;SC=CCCTCGTCCCCATTTGTGCAG;SOR=1.681;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=9;TCR=20;TR=29;WE=79950411;WS=79950379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr5	79950497	rs2250063	C	T	4691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=20;PP=1513;SC=CGGCCGCGGGCTCGCGCTCCT;SOR=1.679;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=62;TCR=20;TR=82;WE=79950505;WS=79950487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr5	79950512	rs1105524	A	G	5696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=33;PP=2095;SC=GCTCCTCGCCAGGCCCTGCCG;SOR=1.643;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=120;TCF=87;TCR=33;TR=120;WE=79950520;WS=79950502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr5	79950699	rs201874762	TGCAGCGGCTGCAGCGGCC	T	10102.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=65;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=49;PP=2981;ReadPosRankSum=1.560;SC=ACCCTGGCGCTGCAGCGGCTG;SOR=1.207;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=128;TCF=16;TCR=112;TR=61;WE=79950724;WS=79950689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,246:0.99:248
chr5	79950741	rs144629981	GCCCCCAGCT	G	6994.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=192;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=64;PP=2616;SC=CGCCCCCAGCGCCCCCAGCTC;SOR=1.715;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=7;TCR=64;TR=71;WE=79950757;WS=79950731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr5	79950781	rs1650697	A	G	2484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.72;QD=27.61;SOR=1.916;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr5	79952154	rs1382539	G	A	343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=286;SC=TCAGTTGTAAGGTTTAAATTG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=79952173;WS=79952144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	79952165	rs1382540	C	G	438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=1;PP=313;SC=GTTTAAATTGCTTCACATACG;SOR=3.126;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=79952173;WS=79952144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	79952390	rs1643639	T	C	4247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=80;PP=2706;SC=CAGTCATGGCTCTGGTATTCT;SOR=1.085;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=61;TCR=80;TR=141;WE=79952398;WS=79952380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr5	79952426	rs1650694	G	C	2958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=35;NR=60;PP=1997;SC=GCAGAAGAGCGTATTAGAATT;SOR=1.436;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=96;TCF=36;TCR=60;TR=95;WE=79952434;WS=79952416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr5	79952541	rs1677667	C	G	356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=10;PP=298;SC=GGTAGAGCTACAATTCTGCAA;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=79952549;WS=79952531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	79960955	rs1382543	G	A	2450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=29;PP=1160;SC=CTTATTTGCTGCCTAAGAGCC;SOR=0.874;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=43;TCR=29;TR=72;WE=79960963;WS=79960945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr5	79961241	rs1824837	G	A	198.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=159;SC=CTGAAGTACTGTCAGGTTCTC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=79961249;WS=79961231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	79968258	rs1650648	T	A	6175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.058;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=117;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.230;SC=TGTAAGGTGGTAGGTAGGCTT;SOR=0.983;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=200;TCF=83;TCR=117;TR=199;WE=79968279;WS=79968248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,223:1.00:224
chr5	79968271	rs1677653	A	G	5447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=109;PP=2965;SC=GTAGGCTTCAATTGGTTTAGA;SOR=1.254;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=181;TCF=72;TCR=109;TR=181;WE=79968279;WS=79968248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr5	79968330	rs1677654	G	A	1620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=40;PP=1150;SC=TTAGTATTATGTATTTATGAG;SOR=2.107;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=15;TCR=40;TR=55;WE=79968338;WS=79968320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr5	79968496	rs1677655	C	T	2249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=15;PP=1456;SC=TTAAACATTTCGAAATGAGTT;SOR=2.334;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=49;TCR=15;TR=64;WE=79968504;WS=79968486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr5	79974646	rs836807	T	C	576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=4;PP=384;SC=TACATACTCCTGAGTGTATCA;SOR=2.093;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=18;WE=79974654;WS=79974636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	79974983	rs836806	T	C	683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=17;PP=512;SC=CTGATACTTATTAAAGTTGCT;SOR=3.816;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=79974991;WS=79974973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	80021193	rs245016	C	T	1891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=50;NR=23;PP=1366;SC=TTTTTTTTTCCTCTTCTGGCC;SOR=1.451;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=74;TCF=50;TCR=24;TR=73;WE=80021201;WS=80021171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr5	80375872	rs72769300	A	C	370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=278;SC=GGCTTTAAGGACTCTGGATTT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=80375880;WS=80375862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	80376142	rs27650	T	C	1617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=27;PP=872;SC=AGCTTCTGTATCCCGGGACCC;SOR=0.758;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=25;TCR=27;TR=52;WE=80376150;WS=80376132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr5	80419349	rs26891	C	G	294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=10;NR=0;PP=211;SC=TATTAAAGCCCTTTAATGAAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=80419357;WS=80419339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	80423109	rs153244	G	A	407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=12;PP=315;SC=TTGGGAAGCCGAAGCAGAAGG;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=80423117;WS=80423099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	80512974	rs6868762	G	T	1092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=23;PP=843;SC=TAGTAAAGCAGGGGCTGTCAT;SOR=1.270;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=14;TCR=23;TR=37;WE=80512982;WS=80512964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr5	80552871	rs2270823	G	A	2564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=48;PP=1449;SC=ATGTTTTTGAGATCACCTGCT;SOR=1.240;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=35;TCR=48;TR=83;WE=80552879;WS=80552861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr5	80552960	rs10525993	AGTGTGTGTGTGTGTGTGT	A	219.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;NF=0;NR=4;PP=1548;SC=CTACTTGGAAAGTGTGTGTGT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=4;WE=80552985;WS=80552950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr5	80562120	rs545	G	A	2083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=54;PP=1573;SC=CTGCTGGTACGACAGACATAA;SOR=2.584;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=14;TCR=54;TR=68;WE=80562128;WS=80562110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr5	80604430	rs1055383	C	T	2487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=50;NR=21;PP=1122;SC=ATTGCCCCGCCGCCCTTGAAA;SOR=1.119;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=50;TCR=21;TR=71;WE=80604438;WS=80604420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr5	80631511	rs6452399	G	A	1084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=3;PP=724;SC=GGACGATGGAGATGGACTTCA;SOR=3.737;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=29;WE=80631519;WS=80631501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr5	80631642	rs10371	C	T	6867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=127;NR=111;PP=2965;SC=AGACGATAAGCCAAATGTGCT;SOR=0.724;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=238;TCF=127;TCR=111;TR=238;WE=80631650;WS=80631632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,262:1.00:262
chr5	80640919	rs147835552	TGCACACCGCTGCCACCTCCTC	T	510.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=12;PP=1557;SC=AGGCCCTCCTTGCACACCGCT;SOR=2.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=12;WE=80640947;WS=80640909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	80667611	.	G	A	1072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.205;ClippingRankSum=0.000;DP=243;ExcessHet=3.0103;FS=0.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.43;ReadPosRankSum=-0.748;SOR=0.768;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:174,68:0.28:242
chr5	80736444	rs9596	A	G	7917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=132;NR=148;PP=2965;SC=CTGACCCAGGACCCATTGGAA;SOR=0.857;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=281;TCF=132;TCR=149;TR=280;WE=80736466;WS=80736434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,301:1.00:301
chr5	80744758	rs3764986	T	C	547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=3;NR=10;PP=275;SC=TCACAAAGTATAGTAAAGGAT;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=80744766;WS=80744748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	80756855	rs6893826	A	T	855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.93;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	80785011	rs66563423	G	A	2759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=30;PP=1544;SC=ATAAATATATGTGACATTTTC;SOR=1.374;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=93;TCF=61;TCR=32;TR=91;WE=80785019;WS=80785001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr5	80911184	rs34307657	T	C	167.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=0;PP=132;SC=GACCAAACAATTTCTTAAGTA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=80911192;WS=80911174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr5	81474225	rs9293290	A	T	447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=2;PP=261;SC=AAGTCATGATATTCTTCCAGG;SOR=2.448;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=81474233;WS=81474215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	81572464	rs226199	G	C	534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=12;PP=330;SC=CTGAGCTGAAGTCCTGTGATG;SOR=1.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=17;WE=81572472;WS=81572454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	81573992	rs226198	C	T	1215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=28;NR=9;PP=710;SC=CGCCGGACCACGTGCCTCCTG;SOR=2.356;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=37;WE=81574000;WS=81573982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr5	82136064	rs113309601	T	TTCTTC	3130.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=33;PP=2081;SC=TTTTTGCTTCTTCTTTGCCTT;SOR=1.852;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=1;TCR=40;TR=34;WE=82136072;WS=82136054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr5	82648943	rs1805377	G	A	4045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=47;PP=2462;SC=TTTCTTTTCAGTTCTAGGCCT;SOR=1.410;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=132;TCF=85;TCR=47;TR=132;WE=82648951;WS=82648933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr5	82648977	rs1056503	T	G	5698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=116;NR=93;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.614;SC=CTGAGACGTCTAAAAAGGAGC;SOR=0.813;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=211;TCF=117;TCR=94;TR=209;WE=82648985;WS=82648966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,227:0.99:229
chr5	82786194	rs12332199	T	C	6374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=116;PP=2965;SC=CCTCCCTCACTGTGGTCAAGC;SOR=0.917;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=223;TCF=107;TCR=116;TR=223;WE=82786202;WS=82786184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr5	82789647	rs4470745	A	G	7554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=132;NR=113;PP=2965;SC=CTCCCAGAGTAGGCTGTTATG;SOR=0.808;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=245;TCF=132;TCR=113;TR=245;WE=82789655;WS=82789637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,273:1.00:273
chr5	82833145	rs2548541	G	A	8326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=147;NR=136;PP=2965;SC=CACCTTCTCAGAATTTCTCGG;SOR=0.803;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=284;TCF=148;TCR=136;TR=283;WE=82833153;WS=82833135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,304:1.00:304
chr5	82833369	rs309559	A	G	6343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=107;NR=99;PP=2965;SC=GGAACAGCCAAAAAAGGGGCA;SOR=0.702;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=207;TCF=107;TCR=100;TR=206;WE=82833377;WS=82833359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr5	82834299	rs188703	G	A	4044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=48;PP=2293;SC=ACTCTCCCACGTAGTCCTGCC;SOR=0.915;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=78;TCR=48;TR=126;WE=82834307;WS=82834289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr5	82834484	.	A	C	8624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=153;NR=145;PP=2965;SC=ACTGGTTTTGAGTACAGTAAT;SOR=0.712;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=298;TCF=153;TCR=145;TR=298;WE=82834492;WS=82834474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,327:1.00:327
chr5	82834630	rs309557	T	C	11013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=414;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=188;NR=184;PP=2965;SC=ATTTCAGTGGTGACTTTAGAG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=372;TCF=188;TCR=184;TR=372;WE=82834638;WS=82834620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,414:1.00:414
chr5	82835545	rs160279	A	G	8075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.460;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=155;NR=122;PP=2965;ReadPosRankSum=1.603;SC=AAGGCATGAGACCAACAATTC;SOR=0.561;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=278;TCF=155;TCR=123;TR=277;WE=82835553;WS=82835520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,294:1.00:295
chr5	82835724	rs160278	T	A	5914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=88;PP=2965;SC=ATTGAAGACTTTAACAGAATG;SOR=0.759;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=190;TCF=102;TCR=88;TR=190;WE=82835732;WS=82835714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr5	82837647	.	G	C	3981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=0.000;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=87;PP=2629;ReadPosRankSum=0.304;SC=CAAGTTTCTGGAGAAGCAATC;SOR=0.712;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=308;TCF=145;TCR=163;TR=166;WE=82837655;WS=82837637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,181:0.54:337
chr5	82843711	rs3842065	T	TATC	941.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=3;PP=866;SC=TCTTGTATGTTATCTTGCAAC;SOR=3.160;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=17;WE=82843719;WS=82843701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	82849120	rs6873404	T	A	1695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=16;PP=1205;SC=TAACACTTGGTTGGGGGTGCC;SOR=1.812;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=41;TCR=16;TR=57;WE=82849128;WS=82849110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr5	82850631	rs2290673	A	G	614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=0;PP=525;SC=AAGGTAGACTAGGAGAGATTT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=82850639;WS=82850630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	82875800	rs308365	C	T	3253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=31;PP=2035;SC=TTCCTTTAGTCGCTTGCGGCC;SOR=1.695;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=101;TCF=70;TCR=31;TR=100;WE=82875808;WS=82875790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr5	82940273	rs2242128	C	G	6649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=116;NR=111;PP=2965;SC=CTGTGTTCTGCCCCCCACAGG;SOR=0.726;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=227;TCF=116;TCR=111;TR=227;WE=82940281;WS=82940263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr5	82940510	rs1457081	T	C	439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=14;PP=354;SC=AGCAAGGAGTTGTTAGAAGCC;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=82940518;WS=82940500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	83343964	rs2301088	A	T	898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=7;PP=528;SC=GATCTTCTTTATAGGTGAACC;SOR=1.911;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=28;WE=83343972;WS=83343954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr5	83433002	.	TAC	T	329.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.614;ClippingRankSum=0.000;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=4.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.62;ReadPosRankSum=-0.755;SOR=0.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,22:0.24:91
chr5	83433004	rs350490	C	T	1601.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.895;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=13;PP=1544;ReadPosRankSum=1.061;SC=TGTATACATACACACACACAC;SOR=1.382;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=98;TCF=80;TCR=18;TR=76;WE=83433014;WS=83432992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,66:0.75:88
chr5	83433006	rs200843007	C	T	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.29;ReadPosRankSum=-0.831;SOR=0.658;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,19:0.19:99
chr5	85586584	rs10038100	C	T	388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.95;QD=27.77;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	86667856	rs35014912	G	GA	735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.126;HP=10;HapScore=3;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=11;PP=270;ReadPosRankSum=-0.957;SC=TGTTGAATTTGAAAAAAAAAA;SOR=0.275;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=35;TCF=20;TCR=15;TR=24;WE=86667864;WS=86667846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,32:0.89:36
chr5	86679495	rs368117332	TA	T	90.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=11.886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.98;MQRankSum=1.005;QD=4.54;ReadPosRankSum=1.283;SOR=2.437;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr5	87497977	rs358289	C	T	2250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=38;NR=36;PP=1098;SC=AGTTAAATAACCTGCCTCAAA;SOR=0.839;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=38;TCR=36;TR=74;WE=87497985;WS=87497967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr5	87963272	rs5869431	G	GA	3125.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=21;PP=1374;SC=TAGGCACCATGGCTTTTTACC;SOR=1.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=14;TCR=23;TR=34;WE=87963280;WS=87963262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr5	87968864	rs6882046	A	G	2275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.12;QD=26.16;SOR=0.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr5	87968912	.	CA	C	85.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=0.000;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=6.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.18;MQRankSum=1.281;QD=3.18;ReadPosRankSum=1.289;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr5	87968953	rs3814424	C	T	1941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=56;PP=2224;SC=ATTCCTCTCCCCTGCTCAACA;SOR=0.898;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=113;TCF=57;TCR=56;TR=111;WE=87968961;WS=87968943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr5	88416255	rs139453030	A	AAC,AACAC	772.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.4984,0.5016;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.459;NF=6,6;NR=5,5;PP=11,327;ReadPosRankSum=1.043;SC=TACATACACAAACACACACAC;SOR=0.693;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=13;TCF=6;TCR=7;TR=11,11;WE=88416263;WS=88416245;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:0.96:25
chr5	88416354	rs9293511	C	T	1743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=22;PP=835;SC=ACTGGAAGAGCGCTTACTATT;SOR=0.754;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=56;TCF=33;TCR=23;TR=55;WE=88416362;WS=88416344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr5	89703641	rs4873	C	G	3119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=45;PP=1566;SC=TTGTCCACTACAAGCTCACTT;SOR=0.946;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=46;TCR=45;TR=91;WE=89703649;WS=89703631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr5	89705752	rs11315430	GC	G	394.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=8;NR=7;PP=398;SC=ACCTCCTAACGCCCCCCCGCC;SOR=0.976;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=18;TCF=8;TCR=10;TR=15;WE=89705760;WS=89705745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	89769728	rs2162986	T	C	8046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=133;NR=126;PP=2965;SC=GGGCTGGGCGTCCGCACCACC;SOR=0.748;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=259;TCF=133;TCR=126;TR=259;WE=89769736;WS=89769718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,296:1.00:296
chr5	89781594	rs2115500	C	T	2643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=56;PP=1616;SC=ATGATTATAGCATCCTCAAGT;SOR=1.321;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=90;TCF=34;TCR=56;TR=90;WE=89781602;WS=89781584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr5	89807711	rs6897910	G	A	1153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=11;PP=756;SC=TGACAAGAGTGGAAGGTGGTG;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=28;TCR=11;TR=39;WE=89807719;WS=89807701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr5	89814604	rs1305059	G	GTGACC	2199.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=4;PP=1395;SC=AGATGCACATGTGACCACTAA;SOR=2.885;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=24;WE=89814612;WS=89814594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr5	89815312	rs34548009	G	GA	1670.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=30;PP=682;ReadPosRankSum=1.074;SC=CTGTGGGGGGGAAAAAAAAGC;SOR=1.217;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=46;TCF=10;TCR=36;TR=38;WE=89815320;WS=89815302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,59:0.97:61
chr5	89816299	rs171790	C	A	8988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=115;NR=140;PP=2965;SC=TAAAAAGAGGCTAAATGCAGA;SOR=0.875;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=255;TCF=115;TCR=140;TR=255;WE=89816318;WS=89816289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,332:1.00:332
chr5	89816309	rs35118083	A	AT	7290.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.358;NF=23;NR=114;PP=2966;ReadPosRankSum=0.583;SC=CTAAATGCAGATTTTAGATAT;SOR=0.947;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=153;TCF=24;TCR=129;TR=137;WE=89816318;WS=89816289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,280:0.99:282
chr5	89816383	rs13182165	G	A	2986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=71;PP=1932;SC=GTAGATATATGTCTGAAACTC;SOR=2.415;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=18;TCR=71;TR=89;WE=89816391;WS=89816373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr5	89820984	rs10069050	T	C	6226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=121;NR=88;PP=2965;SC=TGGATCGAAGTTCATACACTT;SOR=1.005;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=211;TCF=122;TCR=89;TR=209;WE=89820992;WS=89820974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr5	89825210	rs603870	G	A	4234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=84;NR=56;PP=2227;SC=CGCAGCTGGGGCTCAACCCCG;SOR=1.022;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=140;TCF=84;TCR=56;TR=140;WE=89825218;WS=89825200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr5	90002220	.	CT	C	223.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.096;ClippingRankSum=0.000;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=4.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.73;ReadPosRankSum=4.222;SOR=1.525;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,19:0.32:60
chr5	90059001	rs881289	T	A	424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=0;PP=353;SC=ACATGATAATTACATGTAACA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=90059009;WS=90058991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	90075060	rs2443076	C	G	283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=225;SC=ACAGGACATACAAGGGAAATT;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=90075068;WS=90075050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	90078821	rs113674072	A	G	409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=1;PP=362;SC=TAAAAGAACTATGAAAACATA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=90078829;WS=90078811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	90107108	rs2438374	A	G	4886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=89;PP=2894;SC=ATTGTGGAGGAGAAGGATGAT;SOR=0.974;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=76;TCR=89;TR=165;WE=90107116;WS=90107098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr5	90111521	rs41304884	A	G	4749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=78;PP=2819;ReadPosRankSum=-0.930;SC=TTATGAGAAGATTGCACCTTA;SOR=0.787;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=161;TCF=82;TCR=79;TR=159;WE=90111529;WS=90111511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,176:0.99:178
chr5	90119123	rs146689602	G	GA	1040.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=3;PP=811;SC=CTATACTTTGGATGAAGAGGT;SOR=3.258;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=18;WE=90119131;WS=90119113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr5	90119324	rs2438378	G	A	3622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=59;NR=66;PP=2085;SC=GGTAAACCTGGTGGAGGAACT;SOR=0.969;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=59;TCR=66;TR=125;WE=90119332;WS=90119314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr5	90449031	rs7726023	T	C	4325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=77;NR=72;PP=2698;SC=CATCCCAATCTAAAAAGGTGC;SOR=0.705;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=78;TCR=72;TR=149;WE=90449039;WS=90449021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr5	90669400	rs6452952	A	T	102.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=0;PP=49;SC=TGTTCTGTTAACATGATAATC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=90669408;WS=90669392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	93410244	rs7732578	C	T	946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=6;PP=608;SC=ACTTTAGGTACTTATATTCTT;SOR=2.049;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=32;WE=93410252;WS=93410234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr5	93731985	rs308207	A	G	9154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=347;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=166;NR=149;PP=2965;ReadPosRankSum=1.185;SC=ATCTGTCAAGAGAGGCACCTG;SOR=0.245;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=316;TCF=167;TCR=149;TR=315;WE=93731993;WS=93731975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,345:1.00:346
chr5	93752874	rs29911	C	T	3420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=57;PP=1873;SC=ATCTATAGAACATTTCTTTTA;SOR=0.916;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=112;TCF=55;TCR=57;TR=112;WE=93752882;WS=93752864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr5	94043352	rs113202600	C	T	4213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=90;PP=2591;SC=GAATGAGAGACGGTGCTTGGG;SOR=1.673;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=42;TCR=90;TR=132;WE=94043360;WS=94043342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr5	94046387	rs306573	A	G	585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=1;PP=470;SC=ATTTTTAACCAACCTGTCTCT;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=94046395;WS=94046377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	94050447	rs2638	C	T	5153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=65;PP=2716;SC=CCTTATCCCACAGAAGAATGG;SOR=1.127;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=169;TCF=104;TCR=65;TR=169;WE=94050455;WS=94050437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr5	94050487	rs2636	T	A	6754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=122;NR=103;PP=2965;SC=CTCACTTCTTTATCCTTTCGC;SOR=0.766;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=225;TCF=122;TCR=103;TR=225;WE=94050495;WS=94050477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr5	94114594	rs255372	T	C	393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=305;SC=TTGTTTGTTCTTGGCAGAAAA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=94114602;WS=94114584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	94206957	rs201600301	CT	C	92.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=-1.278;QD=4.03;ReadPosRankSum=0.032;SOR=0.922;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr5	94259621	rs34187028	C	T	2225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=49;NR=28;PP=1219;SC=AATTGCTATCCAAAACCAAAA;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=49;TCR=28;TR=77;WE=94259629;WS=94259611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr5	94288790	rs6892227	C	A	104.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=4;NR=0;PP=79;SC=TCATATTATCCATAGATTAGA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=94288798;WS=94288780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	94619545	rs5869672	G	GC	1872.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=20;PP=1058;SC=CTCCGGCCGCGCCACCGGCAC;SOR=0.730;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=24;WE=94619553;WS=94619535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr5	94756261	rs62365043	C	G	1290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=25;PP=722;SC=ATAGAACTTTCAATGCCTCAC;SOR=3.611;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=28;WE=94756269;WS=94756251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	94756278	rs62365044	G	C	1050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=19;PP=433;SC=TCACGCTAGCGGTGAGATTCA;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=94756286;WS=94756268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	94759802	rs17084711	G	A	3347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=49;PP=1887;SC=GCTGAAGTGCGACAGGCTGAG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=57;TCR=49;TR=106;WE=94759810;WS=94759792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr5	94772540	rs6878669	C	T	7399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=116;NR=123;PP=2965;SC=AACTGCCAGTCCTGAGCAAAC;SOR=0.832;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=239;TCF=116;TCR=123;TR=239;WE=94772548;WS=94772530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,274:1.00:274
chr5	94842718	.	TA	T	48.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.245;ClippingRankSum=0.000;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.19;ReadPosRankSum=-1.203;SOR=0.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,8:0.20:41
chr5	94852739	rs144734377	T	A	2788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=45;PP=1733;SC=GATGTAGACATCAGTTTTAAT;SOR=0.797;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=43;TCR=45;TR=88;WE=94852747;WS=94852729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr5	94956619	rs113272282	G	C	3665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=75;NR=45;PP=2075;SC=CTGGCCGGGGGAGCGTCGCTG;SOR=1.006;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=75;TCR=45;TR=120;WE=94956627;WS=94956609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr5	94994339	rs10705	A	G	4400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=55;PP=2796;SC=AGATTTGCTCATTCATTTCAG;SOR=1.489;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=156;TCF=101;TCR=55;TR=156;WE=94994347;WS=94994329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr5	95011426	rs2548125	A	G	479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=299;SC=ACTGACTACTATATAACTACA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=95011434;WS=95011416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	95018382	rs34895	G	T	3920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=48;PP=2525;SC=TGTTTCAAAAGAACATGAAAC;SOR=1.162;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=75;TCR=48;TR=123;WE=95018390;WS=95018372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr5	95194686	rs17366761	C	T	2077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=48;PP=1379;SC=AGTGGGTCTGCGCGCACCCCG;SOR=2.115;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=20;TCR=48;TR=68;WE=95194694;WS=95194676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr5	95732986	rs271920	T	C	3219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=38;PP=2138;SC=TTAAAAGTGCTTCAAAATGTT;SOR=1.402;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=71;TCR=38;TR=109;WE=95732994;WS=95732976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr5	95733112	rs6233	A	G	8072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=137;NR=132;PP=2965;SC=TGAAGTCCCAATTCTTAAAGC;SOR=0.754;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=269;TCF=137;TCR=132;TR=269;WE=95733120;WS=95733102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,303:1.00:303
chr5	95746355	rs156020	T	G	692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=3;PP=577;SC=AAGTGTGAGTTCTCCCAACTG;SOR=2.737;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=95746363;WS=95746345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr5	95865500	rs13186522	T	C	390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=3;PP=201;SC=TTGCTGGGCATTCATTCTGTC;SOR=1.329;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=11;WE=95865508;WS=95865496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	95865526	rs13161802	G	A	425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=4;PP=202;SC=CCACCCTGTGGAGAGGTGCCT;SOR=0.941;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=12;WE=95865534;WS=95865516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	96062617	rs17478897	C	T	5112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=89;PP=2965;SC=TTACATCACCCGCTCAGCATG;SOR=0.971;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=166;TCF=77;TCR=89;TR=166;WE=96062625;WS=96062607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr5	96066366	rs17400685	C	A	520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=1;PP=448;SC=GCAAACATTCCCTTATGGTGT;SOR=4.294;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=96066374;WS=96066356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	96066576	rs17400741	C	G	5714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=83;PP=2965;SC=TGAGCACACACAAGCAGACGG;SOR=0.743;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=178;TCF=95;TCR=83;TR=178;WE=96066584;WS=96066566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr5	96066652	rs151904	C	T	4533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=82;PP=2622;SC=AACCTATCATCTGGCAAAACT;SOR=1.080;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=147;TCF=65;TCR=82;TR=147;WE=96066660;WS=96066642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr5	96078309	rs26503	G	A	3871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=51;PP=2356;SC=TGGATTGTTCGGGCTCCAGAG;SOR=1.079;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=131;TCF=80;TCR=51;TR=131;WE=96078317;WS=96078299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr5	96078337	rs10515244	C	G	4884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=74;PP=2965;SC=TTTTCATGCACAGGATTTTTT;SOR=0.846;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=168;TCF=94;TCR=74;TR=168;WE=96078345;WS=96078327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr5	96079402	rs26506	C	T	4828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=72;PP=2965;SC=AGCTTTGTGACGGTGAACGCA;SOR=0.950;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=168;TCF=96;TCR=72;TR=168;WE=96079410;WS=96079392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr5	96089658	rs27583	G	A	1547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=7;PP=1184;SC=AAAAGATAGCGTGTGCCTTTT;SOR=2.790;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=44;TCR=7;TR=51;WE=96089666;WS=96089648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr5	96101066	.	T	TA	991	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MMLQ=28;MQ=51.98;NF=0;NR=22;PP=991;QD=47.0;SC=AATTCACTAATAGTGAAATTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=96101074;WS=96101056;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr5	96104065	.	G	A	1347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.604;ClippingRankSum=0.000;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=19;PP=735;ReadPosRankSum=2.110;SC=TGGGATTACAGGCTTGAGCCA;SOR=0.738;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=116;TCF=73;TCR=43;TR=52;WE=96104073;WS=96104055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,65:0.48:136
chr5	96107202	rs27689	G	T	2303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=19;PP=1474;SC=TCACAATATTGTGGCCAGATG;SOR=1.966;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=49;TCR=19;TR=68;WE=96107210;WS=96107192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr5	96111726	rs10515247	G	A	555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=6;PP=373;SC=TTCAGTAGTCGACTATTCAGA;SOR=1.721;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=20;WE=96111734;WS=96111716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	96111779	rs17481334	A	G	1684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=51;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=22;PP=961;SC=AATGATAAACATGGGGTACAG;SOR=1.196;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=36;TCR=22;TR=58;WE=96111787;WS=96111769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr5	96111801	rs148692674	C	CTG	3192.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=24;PP=2001;SC=GTTTTGGACACGGGTGCTTAA;SOR=1.011;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=15;TCR=24;TR=39;WE=96111813;WS=96111791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr5	96111805	rs112855255	T	G	3250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=26;PP=1165;SC=TGGACACGGGTGCTTAAGCAT;SOR=0.992;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=63;TCF=34;TCR=29;TR=59;WE=96111813;WS=96111791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr5	96112005	rs10515248	C	T	3386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=46;PP=2323;SC=AAAAGTATCTCCAGTTGGAGC;SOR=1.066;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=65;TCR=46;TR=111;WE=96112013;WS=96111995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr5	96112284	rs56213813	A	T	916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.86;SOR=4.003;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	96112295	rs56325109	C	T	804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=16;PP=406;SC=TTAATTTTATCACATTAATCA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=96112303;WS=96112274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	96116286	rs67140788	A	G	1564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=16;NR=35;PP=1067;SC=TCCTATATATAATAGCTTTCA;SOR=1.835;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=52;TCF=16;TCR=36;TR=51;WE=96116294;WS=96116276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr5	96116660	rs72773922	A	G	2297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=19;PP=1569;SC=TTCAATCAAAAAGTACCTTTA;SOR=2.185;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=52;TCR=19;TR=71;WE=96116668;WS=96116650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr5	96116808	rs17481856	G	A	6567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.99;NF=112;NR=115;PP=2965;SC=TGCCAGGCCAGTGGGTATCCT;SOR=0.769;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=228;TCF=112;TCR=116;TR=227;WE=96116816;WS=96116798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr5	96117300	rs27043	G	A	1534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=13;PP=1090;SC=AGCAGGATAGGCAATTCCTGG;SOR=2.093;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=36;TCR=13;TR=49;WE=96117308;WS=96117290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr5	96117579	rs72773923	G	A	3086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=68;PP=2068;SC=GAACACACTCGGTGAGAATCT;SOR=2.027;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=29;TCR=68;TR=97;WE=96117587;WS=96117569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr5	96117624	rs149958925	G	GACTA	1612.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=26;PP=1473;SC=GCATAATGGTGACTAACTATG;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=26;WE=96117632;WS=96117614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr5	96119579	rs70981840	A	ACT	636.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=49;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=427;SC=AATGATTAACACTTTTTAACA;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=96119587;WS=96119569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	96124447	rs30186	G	C	9307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.50;SOR=1.015;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr5	96124453	rs11743410	A	G	8960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.19;SOR=1.076;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr5	96127833	rs3213809	G	A	9528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=367;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=162;NR=150;PP=2965;SC=TAGACACAGGGTGTGAGGAAT;SOR=0.699;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=313;TCF=163;TCR=150;TR=312;WE=96127841;WS=96127823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,367:1.00:367
chr5	96127905	rs27640	T	C	4278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=82;PP=2501;SC=CCTATTGAGATAGAAAAAAGA;SOR=1.504;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=129;TCF=47;TCR=82;TR=129;WE=96127913;WS=96127895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr5	96129512	rs27434	A	G	4123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=52;PP=2452;SC=ATACCTGGTGAGCCAGTTCAT;SOR=1.085;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=138;TCF=85;TCR=53;TR=137;WE=96129520;WS=96129502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr5	96136525	rs27528	T	C	2776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=29;PP=1816;SC=AGAGAATCAGTAGATTTTCCT;SOR=1.384;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=65;TCR=29;TR=93;WE=96136533;WS=96136515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr5	96139250	rs26653	C	G	3460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=53;PP=2257;SC=TTGCTCCTGACGGGGGTGTTC;SOR=0.710;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=112;TCF=58;TCR=54;TR=111;WE=96139258;WS=96139240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr5	96139595	rs72773968	G	A	1665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=37;PP=1039;SC=AAATGACATGGTTGCAAGGGA;SOR=1.942;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=15;TCR=37;TR=52;WE=96139603;WS=96139585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr5	96150193	rs10515250	T	C	224.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=246;SC=ATCAAAAAAATAACTGGTGAG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=96150201;WS=96150183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	96219738	.	TTATC	T	135	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;FR=1.0000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.63;NF=0;NR=3;PP=135;QD=46.3333333333;SC=TAATTTGTTTTTATCTATCTA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=3;WE=96219749;WS=96219728;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:14,3:0.18:17
chr5	96222627	rs13189819	G	A	452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=13;PP=318;SC=AAAAAACTAAGTTAAAAATTA;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=96222635;WS=96222617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	96230858	rs3832368	T	TA	228.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=1;PP=124;SC=TCCTAACTAATAAAAAAAAAG;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=96230866;WS=96230854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	96230883	rs371137761	A	ATT	1136.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=3;PP=862;SC=TAACTATTGTATTTTTTGCTA;SOR=3.767;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=23;WE=96230891;WS=96230873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr5	96231000	rs2549782	G	T	5199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=84;PP=2965;SC=TTTGGCTTAAGGAGGGTTTTG;SOR=0.788;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=183;TCF=99;TCR=84;TR=183;WE=96231008;WS=96230990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr5	96232142	rs2548538	T	A	4524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=83;NR=68;PP=2651;SC=CATCCCGCCCTATCTCCAAAC;SOR=0.870;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=151;TCF=83;TCR=68;TR=151;WE=96232150;WS=96232132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr5	96232222	rs2548537	G	C	3053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-2.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=54;PP=1353;ReadPosRankSum=0.745;SC=GTAAATATCAGGTGCAGGTGG;SOR=0.441;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=88;TCF=33;TCR=55;TR=87;WE=96232230;WS=96232212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,120:0.99:121
chr5	96232250	rs34701361	G	GAAA	3410.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=32;PP=1846;SC=GCTTTCAGAAGTGTAATAATG;SOR=1.379;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=38;TCF=1;TCR=37;TR=33;WE=96232258;WS=96232240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr5	96232286	rs2549785	C	T	837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.53;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=65;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=17;PP=470;SC=GTTTAAGTCACTGGTGCCAGT;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=96232294;WS=96232276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr5	96232345	rs56321917	CAT	C	412.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=4;PP=353;SC=AGACATCACACATGTTCCGTA;SOR=1.085;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=9;TCF=5;TCR=4;TR=9;WE=96232354;WS=96232335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	96232402	rs2548536	T	A	592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=15;NR=5;PP=273;SC=ATTTTCTTTATCTCTTTTTTC;SOR=2.030;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=20;WE=96232410;WS=96232392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	96232669	.	T	TAAGTCATATGTTGGGTAACGA	208.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.100;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=26.09;ReadPosRankSum=-1.611;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr5	96235896	rs2248374	A	G	5587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=96;PP=2965;SC=GTAACATGGTAAGGATAAAGA;SOR=1.040;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=173;TCF=77;TCR=96;TR=173;WE=96235904;WS=96235886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr5	96237114	rs187265	C	G	1383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=8;PP=842;SC=GTTCCCCAAGCCTTGTTTCTG;SOR=2.160;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=43;TCF=35;TCR=8;TR=42;WE=96237122;WS=96237104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr5	96237326	rs2287988	G	A	3174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=58;PP=1861;SC=GACTGCAACAGGAGCGCTTCC;SOR=1.270;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=44;TCR=58;TR=102;WE=96237334;WS=96237316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr5	96237413	rs171647	C	T	583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=16;PP=441;SC=TTAGGTCTAGCTTACCTCATC;SOR=2.531;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=96237421;WS=96237403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	96239294	rs1423568	A	G	2882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=63;PP=1922;SC=GACTTCATGCAAAATAACTGA;SOR=1.855;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=29;TCR=63;TR=92;WE=96239302;WS=96239284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr5	96244549	rs2549794	C	T	934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=0;PP=703;SC=AACTGAATGGCCCAGCTATAA;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=27;WE=96244557;WS=96244539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr5	96244585	rs2548527	A	C	2080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=8;PP=1475;SC=ATTGTTCTCTATTTCATATTT;SOR=3.126;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=51;TCR=8;TR=59;WE=96244593;WS=96244575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr5	96244638	rs2549795	A	G	6110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=126;NR=71;PP=2965;SC=ATATGCACAAACCACTGACAT;SOR=1.326;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=198;TCF=127;TCR=71;TR=197;WE=96244646;WS=96244628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr5	96245343	rs2549796	C	T	5036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=90;PP=2965;SC=GTGACAAGGGCTCAGTCTGGG;SOR=0.894;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=170;TCF=80;TCR=90;TR=170;WE=96245351;WS=96245333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr5	96245439	rs1056893	C	T	3584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=64;PP=2092;SC=AACTCTTCTCCCAGTGGATGG;SOR=1.127;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=50;TCR=64;TR=114;WE=96245447;WS=96245429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr5	96245518	rs2549797	A	G	993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=23;PP=718;SC=TTTGATGTAAAAGTCTTTGAT;SOR=2.517;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=30;WE=96245526;WS=96245508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	96249115	rs2255546	C	T	9039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=342;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=155;NR=155;PP=2965;SC=GGGGCAGCAACTAGCATGGGA;SOR=0.717;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=311;TCF=155;TCR=156;TR=310;WE=96249137;WS=96249105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,340:1.00:340
chr5	96329857	rs27304	G	T	74.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr5	96332085	rs3836862	TC	T	7940.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=96;PP=2975;SC=TTGTTTTCTCTCCCCCCAGTG;SOR=0.854;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=146;TCF=39;TCR=107;TR=130;WE=96332093;WS=96332075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr5	96339102	rs3214461	AC	A	854.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.19;SOR=1.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	96339273	rs27613	T	G	1759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=29;PP=877;SC=GGTAATTTATTTAGCTCTTAC;SOR=1.196;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=25;TCR=29;TR=54;WE=96339281;WS=96339263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr5	96341750	.	T	TTA	74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=3;HapScore=3;MGOF=13;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=3;NR=2;PP=74;QD=16.2;SC=GGAAAAAGTTTTATATATATA;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=5;WE=96341758;WS=96341740;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:3,5:0.62:8
chr5	96363407	rs27300	C	T	5203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=72;PP=2965;SC=GCTGCCTAATCTTTTTGCTCT;SOR=0.826;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=172;TCF=100;TCR=72;TR=172;WE=96363427;WS=96363382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr5	96364063	rs27712	C	T	4698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=53;PP=2769;SC=TGAGGTTTATCGTCCTTTTCT;SOR=1.294;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=155;TCF=102;TCR=53;TR=155;WE=96364071;WS=96364053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr5	96498783	rs8654	G	A	1842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=22;PP=1088;SC=CCCAAAAGCTGGCTGCTTCCA;SOR=1.211;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=59;TCF=37;TCR=22;TR=59;WE=96498791;WS=96498773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr5	96503523	rs160632	C	T	9216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=159;NR=142;PP=2965;SC=TTTTCTGACCCGTAAACCTCT;SOR=0.748;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=301;TCF=159;TCR=142;TR=301;WE=96503531;WS=96503513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,337:1.00:337
chr5	96509055	rs316194	G	A	681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=17;PP=521;SC=TCTACAACCAGAAAAAAAACA;SOR=3.258;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=20;WE=96509063;WS=96509045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr5	96512865	rs2548319	T	A	4584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.95;SOR=1.157;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr5	96512871	rs2544772	T	A	4700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.13;SOR=1.049;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr5	96513471	rs2544773	G	C	6666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=123;NR=104;PP=2965;SC=GTTTCCAACAGACTCAACTAC;SOR=0.767;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=227;TCF=123;TCR=104;TR=227;WE=96513479;WS=96513461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr5	96518792	rs3734010	T	G	7321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=137;NR=103;PP=2965;SC=TCACACAGTGTTAAGGGGAAG;SOR=0.914;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=242;TCF=137;TCR=105;TR=240;WE=96518800;WS=96518782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr5	96519094	rs3806945	A	G	1405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=12;PP=1163;SC=GTCTTATGAAACACATAGTAT;SOR=1.721;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=28;TCR=12;TR=40;WE=96519102;WS=96519084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr5	98109828	rs2547973	G	A	4029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.12;SOR=0.963;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr5	98109838	rs2662263	A	C	3621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.17;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr5	98115828	rs2302983	A	G	1226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=23;PP=720;SC=TCCCTACTCAACTTTCAAAAG;SOR=1.508;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=12;TCR=23;TR=35;WE=98115836;WS=98115818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr5	98205326	rs370965286	GCA	G	70.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.006;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.605;NF=2;NR=1;PP=71;ReadPosRankSum=1.693;SC=ACGTGCGCGCGCACACACACA;SOR=0.892;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=3;WE=98205335;WS=98205316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr5	101595885	rs148885155	T	TGA	2773.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=0.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.250;NF=2;NR=28;PP=1474;ReadPosRankSum=0.884;SC=TGTATGAGACTGAGAGAGAGA;SOR=1.002;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=30;WE=101595893;WS=101595875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,72:0.97:74
chr5	101627410	.	TC	T	454.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=14;PP=680;SC=TTCTTTTTTTTCTTAAAATGT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=14;WE=101627418;WS=101627400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	101631592	rs3114659	A	G	2408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=23;PP=1501;SC=CCCGAGCCTCAAGCGGGCGCT;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=58;TCR=23;TR=81;WE=101631600;WS=101631582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr5	101724356	rs146230251	T	G	565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=2;PP=405;SC=TAGAAATAATTTTATTTCTCT;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=101724364;WS=101724346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	101726648	rs6874612	C	A	1883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=11;PP=1116;SC=TATCAAAAAACATTTTGATGT;SOR=1.946;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=46;TCR=11;TR=57;WE=101726656;WS=101726638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr5	101726851	rs1452065	A	G	700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=23;PP=601;SC=TGGTGCATCAATTGTACTAAG;SOR=3.442;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=101726859;WS=101726841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr5	101794167	rs114933736	A	G	1692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=34;PP=1018;SC=GAAGCTGTTTACGTTTCCTAG;SOR=1.197;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=22;TCR=34;TR=56;WE=101794175;WS=101794157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr5	101795296	rs139360223	G	A	1531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=5;PP=982;SC=CATTCTATGAGAATAAGAACC;SOR=3.171;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=36;TCR=5;TR=41;WE=101795304;WS=101795286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr5	101795490	rs11746217	A	G	3198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=38;NR=81;PP=2227;SC=TGCTTTAATAAAGAAAAGTGA;SOR=1.476;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=120;TCF=38;TCR=82;TR=119;WE=101795507;WS=101795480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr5	101834073	rs116363961	G	A	409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=0;PP=285;SC=CCTCAGGCTGGGCCACCCCAG;SOR=2.985;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=101834081;WS=101834063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	101834596	rs10038730	T	A	399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=12;PP=319;SC=TGCTCTCGGCTGCCCGTCCTG;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=101834604;WS=101834586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	102262210	rs75448780	G	T	117.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=0;PP=47;SC=TCCCTTTGGAGTTCATAGAAC;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=102262218;WS=102262200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr5	102282472	rs3776873	T	A	207.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=2;PP=138;SC=ATCATTTCTATCTTACTAGTT;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=102282480;WS=102282462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	102282589	rs78753846	C	T	1564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=31;NR=22;PP=807;SC=ACACGTCTGCCGTAAGTACTT;SOR=0.760;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=31;TCR=22;TR=53;WE=102282597;WS=102282579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr5	102283937	rs143408776	G	A	103.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.76;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	102285036	rs138859308	TAAAATA	T	630.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=1;PP=390;SC=TGTTTATGAATAAAATAAAAA;SOR=3.126;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=8;WE=102285049;WS=102285033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	102295504	rs2195272	G	T	751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=4;PP=577;SC=GCAGATCTAAGGGCTTCATTT;SOR=3.098;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=26;WE=102295512;WS=102295494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr5	102295723	rs2217252	C	T	6690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=98;NR=134;PP=2965;SC=TTCCAATTCCCGTGAAGTCTG;SOR=1.129;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=233;TCF=98;TCR=135;TR=232;WE=102295731;WS=102295713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr5	102310130	rs61736661	A	C	4472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=84;PP=2838;SC=GGGAACCAGAACACACAGGAG;SOR=1.258;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=144;TCF=60;TCR=84;TR=144;WE=102310138;WS=102310120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr5	102310166	rs3733939	G	A	3422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=61;PP=1926;SC=CTTTTAAGCAGTAAAGTGTGA;SOR=1.143;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=111;TCF=49;TCR=62;TR=110;WE=102310174;WS=102310156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr5	102323295	rs114937041	C	A	5532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=106;PP=2965;SC=ATTCTAAATACCCTGATTTGA;SOR=1.157;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=184;TCF=78;TCR=106;TR=184;WE=102323303;WS=102323279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr5	102364542	rs2067133	A	AAT	4089.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=15;PP=2563;SC=AAGGTAACAGACATTGCTGCA;SOR=2.128;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=54;TCF=36;TCR=18;TR=51;WE=102364550;WS=102364532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr5	102423576	rs468844	A	G	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.43;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	102423579	rs469094	A	C	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.43;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	102433409	rs34813	G	A	9623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=363;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=164;NR=172;PP=2965;SC=TGTACTTTCCGTTGGGTTAAC;SOR=0.840;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=336;TCF=164;TCR=172;TR=336;WE=102433417;WS=102433399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,363:1.00:363
chr5	102456304	rs26524	A	G	986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=23;PP=645;SC=CCCTAAACACATGCTCCACCG;SOR=2.235;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=30;WE=102456312;WS=102456294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	102472560	rs74429703	A	G	6165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=105;PP=2965;SC=TAAGGGAAGGAAAAATAACAT;SOR=1.184;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=181;TCF=76;TCR=105;TR=181;WE=102472568;WS=102472550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr5	102483600	rs77582921	G	A	1921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=43;NR=23;PP=1101;SC=GAAATAATTTGCTTTTTTATA;SOR=1.209;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=43;TCR=23;TR=66;WE=102483608;WS=102483590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr5	102487110	rs115133733	C	T	684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=17;PP=431;SC=TTTTTACCTTCATATACTAGT;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=102487118;WS=102487100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr5	102490521	rs58392548	A	G	1463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.62;SOR=0.730;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr5	102491539	rs114466760	T	C	422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=1;PP=342;SC=CGGTTACAAATAAAAGGGAGC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=102491547;WS=102491529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	102494751	rs257292	A	G	318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=271;SC=TTTATTTATGATAAACTTAAC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=102494759;WS=102494747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	102512570	rs11408825	C	CA	3358.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=34;PP=2103;SC=GTTTAAAGACCATGATTCTCA;SOR=0.760;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=52;TCF=18;TCR=34;TR=49;WE=102512578;WS=102512560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr5	102513343	rs17155110	A	C	546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=4;PP=441;SC=TGAGAAAATGATTACCACATG;SOR=2.419;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=102513351;WS=102513333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	102513783	rs79968831	T	C	730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=18;PP=558;SC=ATTCTTATTTTAACTTCTAAG;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=102513791;WS=102513773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	102520400	rs26821	A	C	5710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=110;NR=83;PP=2965;SC=TAATTACCTGAGAACACCAAG;SOR=0.959;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=193;TCF=110;TCR=83;TR=193;WE=102520408;WS=102520390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr5	102525049	rs76529229	A	G	479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=15;PP=377;SC=TGTAGTCTAGAGGAACTTAAT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=102525057;WS=102525039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	102612166	rs17155192	T	C	3230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=48;PP=1832;SC=AGCCAGCTGATACAGAAGTGC;SOR=0.899;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=52;TCR=48;TR=100;WE=102612174;WS=102612156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr5	102890560	rs11373550	G	GA	1359.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5909;FS=1.705;HP=10;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.515;NF=1;NR=30;PP=298;ReadPosRankSum=0.333;SC=TGGATCTGTTGAAAAAAAAAA;SOR=1.220;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=31;WE=102890568;WS=102890550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:6,58:0.91:64
chr5	102891695	rs10045774	A	G	8475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=169;NR=121;PP=2965;SC=TTTAAACATAATCTCTTATAG;SOR=1.024;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=290;TCF=169;TCR=121;TR=290;WE=102891703;WS=102891685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,311:1.00:311
chr5	102894447	rs3734087	A	G	723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=6;PP=507;SC=AACTTTAAGAAGTTTCTGATG;SOR=1.893;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=23;WE=102894455;WS=102894437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
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chr5	103978827	.	GGAAGGA	G	809.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.47;QD=35.21;SOR=1.708;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	103978969	rs33818	T	C	1116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=7;PP=848;SC=AGTGGGGATGTCTTAATCAGA;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=31;WE=103978977;WS=103978959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr5	104434339	.	G	GGAAAGAAA	376.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=62.79;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr5	106723326	rs78458639	A	T	5017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=64;PP=2800;SC=AGTAAAAAAAAGTTTTACCGC;SOR=1.018;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=164;TCF=100;TCR=64;TR=164;WE=106723334;WS=106723316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr5	107684324	rs1862195	C	T	918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=25;PP=676;SC=AAAATAACCACGTCAGAGTTA;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=107684332;WS=107684314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr5	108672946	rs246105	C	T	2310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=23;PP=1252;SC=GGTGCTTCTGCAATACTGTCA;SOR=1.218;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=47;TCR=23;TR=70;WE=108672954;WS=108672936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr5	109034177	rs6869581	A	G	2751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=35;PP=1458;SC=CTGAGTCCGAACAAAATGGGG;SOR=0.754;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=43;TCR=35;TR=78;WE=109034185;WS=109034167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr5	109034215	rs10652843	G	GGT	3462.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=31;PP=1775;SC=GTAGTATTAAGGTTAGTGTTA;SOR=0.824;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=39;TCF=7;TCR=32;TR=38;WE=109034223;WS=109034205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr5	109124793	rs17162238	A	G	2260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=42;PP=1273;SC=GTGTAATTCCATTGTTCTTGC;SOR=1.065;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=77;TCF=35;TCR=42;TR=77;WE=109124801;WS=109124783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr5	109125072	rs2112212	C	G	115.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=0;PP=89;SC=ATCTGTTCCTCCTAAACTTGA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=109125080;WS=109125062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	109125258	rs17162241	C	G	1806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=29;PP=1014;SC=CAAATGTTTACCACTTTCTGG;SOR=0.722;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=33;TCR=29;TR=62;WE=109125266;WS=109125248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr5	109125416	rs1019446	T	C	175.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=140;SC=GTGCTTAGTATATTGACTGCT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=109125424;WS=109125406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr5	109152897	rs56239994	G	A	787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=21;NR=7;PP=555;SC=ATATGTATATGTATATCTACA;SOR=2.226;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=28;WE=109152905;WS=109152887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr5	109155658	rs10055921	A	G	670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=18;PP=487;SC=TAGATTAATTAGGCAAAAGGG;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=21;WE=109155666;WS=109155648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr5	109159348	rs28756687	G	A	765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=3;PP=593;SC=TTCTATTTTTGAAACCATAAT;SOR=3.611;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=25;WE=109159356;WS=109159338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr5	109181682	rs3186988	A	T	8114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=123;NR=141;PP=2965;SC=CTGCTCAGTCATTAGGGGTTT;SOR=0.911;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=265;TCF=123;TCR=142;TR=264;WE=109181690;WS=109181672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,302:1.00:302
chr5	110407507	rs2289276	C	T	2287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=25;PP=1364;SC=AGCACTGGCCCCTAAGGCAGG;SOR=1.445;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=49;TCR=25;TR=74;WE=110407515;WS=110407497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr5	110408705	rs11466741	C	T	2343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=62;PP=1804;SC=TATCCTGCTACGTGCAGAACT;SOR=2.613;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=16;TCR=62;TR=78;WE=110408713;WS=110408695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr5	110409067	rs2289277	C	G	704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=4;PP=424;SC=CTACTCAACCCTGACCTCTTC;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=22;WE=110409075;WS=110409057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr5	110434307	rs13153937	G	A	244.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=200;SC=AAAAGTTGGGGTACATTTCTT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=110434315;WS=110434297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	110436450	rs10038177	C	T	1118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=28;PP=778;SC=AATAATATAGCTGTCACCTTA;SOR=2.613;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=9;TCR=28;TR=37;WE=110436458;WS=110436440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr5	110439509	rs11241095	A	G	3541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=56;PP=2101;SC=TGTTGTTGCTATTGGTCTTAT;SOR=0.724;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=117;TCF=61;TCR=56;TR=117;WE=110439517;WS=110439499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr5	110443228	rs10043631	C	T	494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=14;PP=402;SC=ATAATATTGACTGAAAAAACG;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=110443236;WS=110443218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	110446091	rs34962120	G	A	535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=16;PP=432;SC=TAAGTGCTGGGCATTTTGCTA;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=110446099;WS=110446081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	110446741	rs13161853	C	A	993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=4;PP=711;SC=AAATCAGACTCTTTAATAAAG;SOR=3.193;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=30;WE=110446749;WS=110446731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	110448753	rs59359951	T	A	257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.43;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	110454681	rs17553936	A	G	3453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=24;PP=1992;SC=TAGAGTTCAAATACTTTTAAC;SOR=1.931;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=73;TCR=24;TR=97;WE=110454689;WS=110454671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr5	110456704	rs13186912	A	T	1399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=11;PP=855;SC=ATGTAGAAGTATCAGAAGAAA;SOR=1.702;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=32;TCR=11;TR=43;WE=110456712;WS=110456694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr5	110679657	rs446176	C	G	3026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=29;PP=1887;SC=CACTTATTTTCAAGCTTTCCC;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=62;TCR=29;TR=91;WE=110679665;WS=110679647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr5	110679873	rs387238	G	A	3162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=58;PP=1764;SC=CTGATTTGAAGAACAAAGGGG;SOR=1.093;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=44;TCR=58;TR=102;WE=110679881;WS=110679863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr5	110710360	rs306067	G	C	878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=2;PP=591;SC=CTGGCTGTATGTTACGTCAGA;SOR=3.767;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=24;WE=110710368;WS=110710350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr5	110710699	rs5870446	A	AG	2991.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=42;PP=1858;SC=GATAATGAGAAGGGATTCTCC;SOR=1.770;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=50;TCF=3;TCR=47;TR=45;WE=110710707;WS=110710689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr5	110712491	rs306129	A	G	1302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=6;PP=1014;SC=TAGCCATAGTATTAGCTATTT;SOR=3.202;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=31;TCR=6;TR=37;WE=110712499;WS=110712481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr5	110730557	rs523389	C	T	1276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=30;PP=779;SC=AAGAAATGCGCATCTGTGATA;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=11;TCR=30;TR=41;WE=110730565;WS=110730547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr5	111013695	rs10478063	G	T	5419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=111;NR=77;PP=2965;SC=CTCCATGAAAGGGGACAGAGA;SOR=0.962;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=188;TCF=111;TCR=77;TR=188;WE=111013703;WS=111013685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr5	111013858	rs26042	G	A	1590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=43;PP=1187;SC=ACATACACATGCTACAAAATC;SOR=2.428;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=12;TCR=43;TR=55;WE=111013866;WS=111013848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr5	111066820	rs73223651	T	G	6979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=141;PP=2965;SC=AACCATTTTTTAAAATTTTGC;SOR=1.148;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=235;TCF=94;TCR=141;TR=235;WE=111066828;WS=111066810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chr5	111070298	rs3756605	T	G	572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=2;PP=418;SC=GAATTGTTGATACTATTTAGT;SOR=2.948;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=111070306;WS=111070288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	111071106	rs3797722	T	A	743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=0;PP=576;SC=GTGTTAACAATATGGCATCTA;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=111071114;WS=111071102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	111500816	rs145708081	C	CTAAAA	2978.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=35;PP=2105;SC=CATTTCTTCTCTAAAATATAT;SOR=1.681;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=45;TCF=2;TCR=43;TR=36;WE=111500824;WS=111500806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr5	111595745	rs28620667	C	A	1507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=39;PP=1108;SC=TATAATTGACCATACAAATAT;SOR=5.464;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=2;TCR=39;TR=41;WE=111595753;WS=111595735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr5	111610875	rs72781647	T	C	951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=10;PP=636;SC=CATGCAATGCTAGTTTAAATT;SOR=1.418;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=21;TCR=10;TR=31;WE=111610883;WS=111610865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr5	111611160	rs139210661	TATA	T	412.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=399;SC=AAAGTTACAGTATAATATTAT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=9;WE=111611170;WS=111611150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	111754851	rs3749742	C	G	751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=20;PP=539;SC=GAGGGTGAGACGAGCAGCTCC;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=111754859;WS=111754841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr5	111755669	rs57727790	CG	C	5993.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=85;PP=2969;SC=GGGAACGCGGCGGACGGGCGA;SOR=1.258;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=16;TCR=90;TR=100;WE=111755677;WS=111755659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr5	111756062	rs56239103	G	C	1225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=25;PP=609;SC=CGGACCCCACGGTTCGGCGGT;SOR=1.132;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=19;TCR=25;TR=44;WE=111756070;WS=111756052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr5	112162854	rs2229992	T	C	5321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=79;PP=2603;ReadPosRankSum=-0.736;SC=GTGAAATGTATGGGCTTACTA;SOR=0.288;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=183;TCF=104;TCR=79;TR=182;WE=112162862;WS=112162844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,205:1.00:206
chr5	112164561	rs351771	G	A	3753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=46;PP=2196;SC=AGGTTATTGCGAGTGTTTTGA;SOR=1.092;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=123;TCF=77;TCR=46;TR=123;WE=112164569;WS=112164551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr5	112175207	rs121913462	G	T	5942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=109;NR=85;PP=2965;SC=GCAAATAGCAGAAATAAAAGA;SOR=0.822;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=194;TCF=109;TCR=85;TR=194;WE=112175215;WS=112175197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr5	112175770	rs41115	G	A	8831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=142;NR=142;PP=2965;SC=ATTTTGCCACGGAAAGTACTC;SOR=0.737;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=284;TCF=142;TCR=142;TR=284;WE=112175778;WS=112175760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,321:1.00:321
chr5	112176325	rs42427	G	A	4758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=76;PP=2965;SC=TTAGAGGAGGGGCACAGTCAG;SOR=0.741;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=158;TCF=82;TCR=76;TR=158;WE=112176333;WS=112176315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr5	112176559	rs866006	T	G	8440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=149;NR=147;PP=2965;SC=CATCTGCGTCTTCTTCTGCAC;SOR=0.777;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=296;TCF=149;TCR=147;TR=296;WE=112176567;WS=112176549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,321:1.00:321
chr5	112176756	rs459552	T	A	4119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.155;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=69;PP=2495;ReadPosRankSum=-0.759;SC=AATTCCAAGGTCTTCAATGAT;SOR=0.350;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=139;TCF=70;TCR=69;TR=138;WE=112176764;WS=112176746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,152:0.99:153
chr5	112177171	rs465899	G	A	8733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=124;NR=152;PP=2965;SC=AAAATACTCCGGTTTGCTTTT;SOR=0.918;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=276;TCF=124;TCR=152;TR=276;WE=112177179;WS=112177161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,303:1.00:303
chr5	112196949	rs460137	A	C	3195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=39;PP=2050;SC=GCGGACGCGGAACCATTTCTT;SOR=1.238;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=67;TCR=39;TR=106;WE=112196957;WS=112196939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr5	112197986	rs431287	A	T	134.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=104;SC=TCAATCAGAAAGAGGAGTAGG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=112197994;WS=112197979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr5	112198015	rs372492	A	G	256.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=240;SC=CAGTCTGATTAGTTGCTCGAG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=112198023;WS=112198005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	112198071	rs112093457	AAGG	A	1614.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=6;PP=648;SC=CACGCAGAAAAAGGAGGGGTT;SOR=1.802;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=18;TCF=9;TCR=9;TR=14;WE=112198081;WS=112198061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr5	112200098	rs351767	A	G	224.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=154;SC=ACCCAACACTATGGCAGTGTC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=112200106;WS=112200088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	112238300	rs5870516	GA	G	317.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=272;SC=CCTGTCCTCTGATACCACTGA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=112238308;WS=112238290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	112257242	rs33570	G	C	345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=4;PP=232;SC=CCAGGCACCCGCTTCCGCCCT;SOR=1.022;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=11;WE=112257250;WS=112257232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	112312676	rs33555	T	C	11170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=419;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=186;NR=198;PP=2965;SC=CCTGGACGATTTCTGCAGGTA;SOR=0.772;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=384;TCF=186;TCR=198;TR=384;WE=112312684;WS=112312666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,418:1.00:418
chr5	112328377	rs3733969	A	G	6097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=106;NR=91;PP=2965;SC=AGGTACTACTAGTTCAGGGGT;SOR=0.729;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=197;TCF=106;TCR=91;TR=197;WE=112328385;WS=112328367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr5	112343544	rs2052484	G	A	521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=3;PP=344;SC=TAAAAACTTGGTTCAACCAGC;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=112343552;WS=112343534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	112349070	rs9326869	T	C	7983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=147;NR=124;PP=2965;SC=TAGAACATGCTGAGGGACAGC;SOR=0.713;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=271;TCF=147;TCR=124;TR=271;WE=112349078;WS=112349060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,303:1.00:303
chr5	112364945	rs1363333	A	G	431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=12;PP=348;SC=GCAGATTTAAACCCATTTCTT;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=112364953;WS=112364935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	112399934	rs10477486	C	G	1742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=33;PP=1128;SC=AGGGACTATGCATAATTAACT;SOR=1.292;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=22;TCR=33;TR=55;WE=112399942;WS=112399924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr5	112406702	rs6888031	T	C	1451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=87;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=16;NR=11;PP=445;SC=ATATGCCTTCTAAAAGCCTAT;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=16;TCR=11;TR=27;WE=112406710;WS=112406692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	112406718	rs4705771	A	G	1525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=89;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=15;NR=11;PP=405;SC=CCTATTTCCTACTTTTATTCT;SOR=1.121;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=15;TCR=11;TR=26;WE=112406726;WS=112406708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr5	112406785	rs149928825	G	GCCTCGCGCTGTCTT	2939.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=15;NR=11;PP=2971;SC=CCCAGTGTGTGCCTACCTGTA;SOR=0.871;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=30;TCF=15;TCR=15;TR=26;WE=112406793;WS=112406775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr5	112406862	rs2227950	G	A	2150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=45;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=33;PP=1358;SC=TCATCCTCTCGGCATTGCTTT;SOR=0.824;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=40;TCR=33;TR=73;WE=112406870;WS=112406852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr5	112419935	rs62374684	A	C	2608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=59;PP=1501;SC=ACCACTCCTCAGATAAACTGT;SOR=1.586;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=30;TCR=60;TR=88;WE=112419943;WS=112419925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr5	112437714	rs28673913	G	A	1781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=36;PP=1057;SC=AAAATAGGCTGAACAGGAATA;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=21;TCR=36;TR=57;WE=112437722;WS=112437704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr5	112439941	rs6594681	T	C	2485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=45;NR=38;PP=1544;SC=CTCAATGTGCTTGTCCACCTC;SOR=0.737;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=45;TCR=38;TR=83;WE=112439949;WS=112439931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr5	112440142	rs6869399	T	C	713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=14;PP=340;SC=GGTAATGGGATGGCAATGGAG;SOR=1.382;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=9;TCR=14;TR=23;WE=112440150;WS=112440132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr5	112479004	rs2227949	T	C	6438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=121;NR=106;PP=2965;SC=CATAGCGAAGTGTCGTTCGCT;SOR=0.709;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=227;TCF=121;TCR=106;TR=227;WE=112479012;WS=112478994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr5	112487137	rs1947026	A	C	3193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=75;PP=1908;SC=GACAGAAAGGAGGAGATTAGA;SOR=1.903;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=109;TCF=34;TCR=75;TR=109;WE=112487145;WS=112487127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr5	112629887	rs485210	C	T	584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=18;NR=2;PP=435;SC=AGAAAATCTACTAATCTTCAA;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=112629895;WS=112629877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	112676191	rs10900684	A	G	2274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=24;PP=1365;SC=CGAAATATGTATTCCATGAAC;SOR=1.264;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=48;TCR=24;TR=72;WE=112676199;WS=112676181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr5	112824039	rs348942	T	C	3134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=65;PP=1827;SC=CTGCTGCTGCTGCTGCCGCTG;SOR=1.188;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=113;TCF=47;TCR=66;TR=112;WE=112824047;WS=112824029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr5	112849801	rs1862315	A	C	3149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=53;PP=1936;SC=GACAGGGACCATGCTGGCAGT;SOR=0.881;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=50;TCR=53;TR=103;WE=112849809;WS=112849791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr5	112849823	rs2416281	C	T	2535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=46;PP=1683;SC=AGGATACCCCCCTCACCCCAG;SOR=0.990;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=39;TCR=46;TR=85;WE=112849831;WS=112849813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr5	112851109	rs1820057	A	G	376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=11;PP=286;SC=ATTTGCCCAAAAAAGGGAGAA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=112851129;WS=112851099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	112851121	rs1035408	C	T	238.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=194;SC=AAGGGAGAAACGTTTCTGAGT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=112851129;WS=112851099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	112853189	rs1833678	T	C	5675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=121;NR=65;PP=2965;SC=CTGGAATGAATAGATATCTTG;SOR=1.314;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=188;TCF=121;TCR=67;TR=186;WE=112853197;WS=112853179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr5	112868693	rs6594732	C	A	5122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=94;PP=2965;SC=CGCAGAGAGACGGGAAAGGAT;SOR=0.972;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=178;TCF=84;TCR=94;TR=178;WE=112868701;WS=112868683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr5	112874987	rs4334877	C	G	293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=7;PP=228;SC=GTGTTTTTCTCTTGTATATAA;SOR=1.609;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=10;WE=112874995;WS=112874977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	112876889	.	ATTT	A	135.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=11.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.17;ReadPosRankSum=0.214;SOR=2.636;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr5	112884197	rs4444963	C	G	2322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=21;PP=1421;SC=GTTTGAAGTACTTTGGAAATT;SOR=1.824;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=50;TCR=21;TR=71;WE=112884205;WS=112884187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr5	112884380	rs6889574	G	A	2066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=43;PP=1228;SC=TTTAAACTACGTTGATTCTTC;SOR=1.673;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=24;TCR=43;TR=67;WE=112884388;WS=112884370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr5	112884594	rs6889501	A	G	2710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=31;PP=1705;SC=GCCCAGGCTCATCATGAACTA;SOR=1.566;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=68;TCR=31;TR=99;WE=112884602;WS=112884584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr5	112884728	rs4639215	G	A	2455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=54;PP=1466;SC=GTAAAACTTTGTACTATTTTA;SOR=1.744;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=28;TCR=54;TR=82;WE=112884736;WS=112884718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr5	112884752	rs6594734	G	A	1447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=39;PP=1012;SC=TAATTCTACCGTCTCTTAAAA;SOR=2.584;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=11;TCR=39;TR=50;WE=112884760;WS=112884742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr5	112888882	.	A	T	1099	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=53;MMLQ=22;MQ=58.91;NF=21;NR=8;PP=1099;QD=39.0955590534;SC=TTTCAGTGCTACACTGGAATT;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=29;WE=112888890;WS=112888862;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr5	112889065	rs60871281	G	A	1638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=34;PP=876;SC=TGGTAAATACGTGTTGTCTAA;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=53;TCF=18;TCR=35;TR=52;WE=112889073;WS=112889055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr5	112889374	rs10071816	G	A	9761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=364;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=156;NR=164;PP=2965;SC=TTTGCTGACAGTACACATAGG;SOR=0.791;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=320;TCF=156;TCR=164;TR=320;WE=112889382;WS=112889364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,363:1.00:363
chr5	112889566	rs34947411	ATCT	A	3257.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=34;PP=2050;SC=GCTTCATAAAATCTTCTTTTT;SOR=1.300;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=50;TCF=11;TCR=39;TR=45;WE=112889576;WS=112889556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr5	112889608	rs10079758	T	A	1593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=25;PP=889;SC=TTCTGTTTTTTTATTAACTTT;SOR=1.034;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=23;TCR=25;TR=48;WE=112889616;WS=112889598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr5	112889821	rs140119986	CCTCTA	C	103	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=2;PP=79;SC=TTTAATTTTACCTCTACTCAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=112889833;WS=112889811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	112892000	rs2162842	G	A	139.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=3;PP=79;SC=CTTAAAAGTTGAATGTAGGTT;SOR=1.981;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=112892008;WS=112891990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr5	112899250	rs6886199	G	A	719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=21;PP=559;SC=AAACTAAAAGGAAATATGTCT;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=112899258;WS=112899240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr5	112899300	rs6867181	T	A	139.03	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.76;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	112899300	.	TG	AA	145	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=145;QD=66.1559582874;SC=TTTGTCCTCCTGCATGTGTCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=112899309;WS=112899290;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,3:0.75:4
chr5	112899301	rs6886338	G	A	139.03	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.34;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr5	112899702	rs6886628	A	G	6512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=123;NR=99;PP=2965;SC=TTGCTTGCACACTAGCTTATC;SOR=0.787;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=222;TCF=123;TCR=99;TR=222;WE=112899710;WS=112899678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr5	112899876	rs11241214	G	A	4065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=84;PP=2470;SC=GGGTAAACACGTTTCTGGGGC;SOR=1.426;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=134;TCF=50;TCR=84;TR=133;WE=112899884;WS=112899866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr5	112901494	rs3763139	G	C	2627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=20;PP=1698;SC=GCAAATTCACGTCGAGGAATT;SOR=2.128;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=59;TCR=20;TR=79;WE=112901502;WS=112901484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr5	112917278	rs11748794	T	G	5662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=104;PP=2965;SC=AACAACCATCTGGGATTGGCC;SOR=1.011;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=187;TCF=82;TCR=105;TR=186;WE=112917286;WS=112917268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr5	112919941	rs2288449	G	A	2361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=21;PP=1545;SC=ATACATAACTGATCTTTGTAT;SOR=1.967;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=57;TCR=21;TR=78;WE=112919949;WS=112919931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr5	112920108	rs55822801	C	G	5688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=86;NR=100;PP=2965;SC=TCAGTCTTCTCTGAAATCTAC;SOR=0.957;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=186;TCF=86;TCR=100;TR=186;WE=112920116;WS=112920098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr5	112926982	rs2303717	A	G	1847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=44;PP=1221;SC=TGTTCTGGCTATAGGTTAAAT;SOR=2.129;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=15;TCR=44;TR=59;WE=112926990;WS=112926972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr5	112929013	rs1132528	T	A	4015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=49;PP=2548;SC=CTAGAACCTCTGGTTGGTGAA;SOR=1.257;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=89;TCR=49;TR=138;WE=112929021;WS=112929003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr5	113698544	rs40179	G	C	7420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=114;NR=115;PP=2965;SC=GCCGGAACCTGCACGAGATGG;SOR=0.787;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=229;TCF=114;TCR=115;TR=229;WE=113698552;WS=113698534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr5	113698631	rs111266015	T	TGCC	6407.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.844;NF=17;NR=55;PP=2982;ReadPosRankSum=0.104;SC=CTGCAGCCGCTGCCGCCGCCG;SOR=0.505;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=103;TCF=22;TCR=81;TR=72;WE=113698639;WS=113698621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:7,153:0.96:160
chr5	113822205	rs12719181	C	T	447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=0;PP=315;SC=ACGTAGACTCCGTCAGTTAAT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=113822213;WS=113822195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	113829121	rs1841251	A	G	4423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=70;PP=2855;SC=TAAAAATGGAACAGAGGAAAC;SOR=0.745;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=143;TCF=73;TCR=70;TR=143;WE=113829129;WS=113829111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr5	114462355	rs2974617	C	T	5862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=92;PP=2965;SC=TCATAGAAATCTACTTTGCCT;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=184;TCF=92;TCR=92;TR=184;WE=114462363;WS=114462345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr5	114462589	rs2921623	A	C	2154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=38;PP=1251;ReadPosRankSum=0.532;SC=TATCTTCAACAATAGATCTAA;SOR=1.387;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=65;TCF=27;TCR=38;TR=64;WE=114462597;WS=114462579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,80:0.98:82
chr5	114462630	rs2974528	T	C	916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=22;PP=644;SC=CAGGATAATATACATTGATGT;SOR=3.334;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=25;WE=114462638;WS=114462620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
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chr5	115177668	rs144226661	G	GAGATTACGAGGC	260.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=7.396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.06;MQRankSum=2.319;QD=5.11;ReadPosRankSum=0.568;SOR=0.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,9:0.18:51
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chr5	115298232	rs9326980	G	C	3234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=58;PP=2084;SC=GGCAGGGGTCGCAGCACTGAA;SOR=0.874;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=52;TCR=58;TR=110;WE=115298240;WS=115298222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr5	115298378	rs10062297	C	T	2014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=24;PP=1177;SC=GCTGGCTGGGCTGGTAGCCGC;SOR=0.934;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=38;TCR=24;TR=62;WE=115298386;WS=115298368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr5	115298475	rs12520255	T	C	6471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=134;NR=92;PP=2965;SC=CTCAGGGACTTGGAAGCCGAG;SOR=1.012;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=226;TCF=134;TCR=92;TR=226;WE=115298483;WS=115298465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr5	115298518	rs12522632	A	G	7925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=152;NR=133;PP=2965;SC=AGCCGACGCCAACCCCGAAAC;SOR=0.789;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=285;TCF=152;TCR=133;TR=285;WE=115298526;WS=115298508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,304:1.00:304
chr5	115298977	rs1445708	C	T	3563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=61;PP=2055;SC=AGGGACTCTTCCTCAACGTCT;SOR=1.161;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=48;TCR=61;TR=109;WE=115298985;WS=115298967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr5	115323691	rs35321827	G	A	705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=21;PP=526;SC=TGGGCCCTTGGTTGAGGCCTC;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=115323699;WS=115323681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr5	115338704	rs1346479	T	C	255.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=180;SC=AGCCATTTCATTTCAAACTAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=115338712;WS=115338694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	115338732	rs1560080	G	A	166.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=103;SC=TTCTTGTAGAGCATAGAGTTT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=115338740;WS=115338722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr5	115339086	rs6594929	A	G	982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=19;PP=586;SC=AGGTAAGGTTACTTTTGATAC;SOR=1.819;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=10;TCR=19;TR=29;WE=115339094;WS=115339076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr5	115341611	rs10078748	G	T	5340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=80;PP=2796;SC=TTCTGCAGGCGATTCCTGTTA;SOR=0.744;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=167;TCF=87;TCR=80;TR=167;WE=115341619;WS=115341601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr5	115341638	rs10078759	G	C	4429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=69;PP=2476;SC=GACTGCAGTTGATTGATGATG;SOR=0.848;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=140;TCF=71;TCR=69;TR=140;WE=115341646;WS=115341628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr5	115351150	rs10214076	T	G	1208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=24;PP=758;SC=AAAGTTTCTGTTATAGGAATT;SOR=1.556;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=13;TCR=24;TR=37;WE=115351158;WS=115351140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr5	115351498	rs17485148	C	T	4533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=85;PP=2675;SC=TTCATTTAGGCCACTGGTTTG;SOR=1.278;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=144;TCF=59;TCR=85;TR=144;WE=115351506;WS=115351488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr5	115387064	rs2560701	C	T	165.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=159;SC=TAAAGTGAGACGTGTAGGGAG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=115387072;WS=115387054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr5	115387119	rs1541802	T	C	733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=6;PP=547;SC=ATAGATGATATTAATATGTTT;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=27;WE=115387127;WS=115387109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr5	115387421	rs1541801	A	G	425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=11;PP=288;SC=CCCACTGCTCACTGCGGGCTG;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=115387429;WS=115387411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	115389626	rs954763	A	C	909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=4;PP=732;SC=TTTATGGTGAAAGTTACAGAA;SOR=3.477;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=31;WE=115389634;WS=115389616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	115389946	rs2662472	A	C	432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.29;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	115394357	rs6860908	T	C	302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=248;SC=TGATTGTACATTAATTTATTC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=115394365;WS=115394352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	115394396	rs6880121	C	G	1108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=5;PP=731;SC=GCACTGTCATCTTAATGTCAT;SOR=2.712;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=32;WE=115394404;WS=115394386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	115394626	rs6880759	G	A	4687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=74;PP=2740;SC=GCACGCTGCCGTTTAATGTTC;SOR=0.728;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=158;TCF=84;TCR=74;TR=158;WE=115394634;WS=115394616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr5	115426746	rs10065554	T	C	2546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=32;PP=1590;SC=GAATATGTGCTAATATAATAG;SOR=1.119;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=86;TCF=53;TCR=33;TR=85;WE=115426754;WS=115426736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr5	115428334	rs1129494	G	T	6763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=125;NR=107;PP=2965;SC=TTGTCAATACGTGGTCTTCTA;SOR=0.756;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=232;TCF=125;TCR=107;TR=232;WE=115428342;WS=115428324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr5	115428439	rs6894046	T	A	2200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=48;PP=1433;SC=CAATAACATATGGCATAAATT;SOR=2.012;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=18;TCR=48;TR=66;WE=115428447;WS=115428429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr5	115469773	rs1129496	C	T	7568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=133;NR=113;PP=2965;SC=AGCTAGAGACCGTTGGATGGC;SOR=0.790;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=247;TCF=134;TCR=113;TR=246;WE=115469781;WS=115469763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,279:1.00:279
chr5	115813726	rs34966	A	G	9248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=338;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=178;NR=133;PP=2965;SC=CACTTCCCATATCGTTCACAC;SOR=0.957;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=311;TCF=178;TCR=133;TR=311;WE=115813734;WS=115813716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,338:1.00:338
chr5	115814496	rs40102	C	G	2408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=53;PP=1559;SC=ACAGCTGCGACATAGCCTTCT;SOR=2.720;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=15;TCR=53;TR=68;WE=115814504;WS=115814486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr5	115827356	rs154599	C	T	5065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=97;NR=80;PP=2965;SC=TGTGACTCCACGAATCCTCTA;SOR=0.874;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=177;TCF=97;TCR=80;TR=177;WE=115827364;WS=115827342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr5	115827407	rs154600	G	A	6144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.026;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=109;NR=104;PP=2965;ReadPosRankSum=0.027;SC=GCAAAAGCAAGTGCAACGAGG;SOR=0.113;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=215;TCF=109;TCR=106;TR=213;WE=115827415;WS=115827397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,228:0.99:230
chr5	115837772	rs154466	G	A	1464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=10;PP=947;SC=TGCTTGATAAGTTAAAGGAGG;SOR=2.124;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=36;TCR=10;TR=46;WE=115837780;WS=115837762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr5	115838117	rs54100	C	G	228.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=6;PP=175;SC=ACAAAAGAAACCCGTGTTTAA;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=115838125;WS=115838107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	117329051	.	T	TAG	4178.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=-1.578;ClippingRankSum=0.000;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.993;NF=7;NR=58;PP=2462;ReadPosRankSum=1.221;SC=ATATTATATATACACACACAC;SOR=0.730;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=75;TCF=9;TCR=66;TR=65;WE=117329061;WS=117329041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:10,128:0.93:138
chr5	117329138	rs4404718	G	A	831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=23;PP=599;SC=ACATATATACGCATATATATA;SOR=3.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=26;WE=117329146;WS=117329128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr5	117896563	.	T	TATAG	270	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=5;NR=0;PP=270;QD=59.0;SC=TAGATACATATATAATCTATA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=5;WE=117896571;WS=117896553;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,5:0.71:7
chr5	117896625	.	G	GTA	61.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.625;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=2.413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.20;ReadPosRankSum=-0.841;SOR=0.163;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,5:0.18:28
chr5	117938632	.	CACACAT	C	618.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.915;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.997;NF=17;NR=8;PP=1225;ReadPosRankSum=-0.323;SC=CACACACACACACACATATAT;SOR=0.749;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=27;TCF=18;TCR=9;TR=25;WE=117938645;WS=117938622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,26:0.87:30
chr5	118456977	rs10056088	T	A	414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.63;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	118484804	rs7734532	G	A	7703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=118;NR=134;PP=2965;SC=GGGTCCTTGAGCAGACAATTC;SOR=0.860;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=252;TCF=118;TCR=134;TR=252;WE=118484812;WS=118484794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,282:1.00:282
chr5	118513246	rs34139050	C	CTG	2053.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=30;PP=1382;SC=AGTAGAAAGACTTTTAGTTTT;SOR=2.352;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=31;WE=118513254;WS=118513236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr5	118532034	rs6595178	A	C	3982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=56;PP=2209;SC=CTATAGAAATAGTTAACAGAT;SOR=1.002;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=132;TCF=76;TCR=56;TR=132;WE=118532042;WS=118532024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr5	118542406	rs3797335	C	T	246.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=7;NR=0;PP=102;SC=AGAATAGTAACTCCATATAAT;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=118542414;WS=118542396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	118556350	rs2271059	C	T	1413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=30;PP=882;SC=ATTTACTGAACTAAAACTTTC;SOR=1.802;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=15;TCR=30;TR=45;WE=118556358;WS=118556340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr5	118574562	rs11241496	A	G	572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=2;PP=330;SC=TTCAAAGGAAAAAAACGATAC;SOR=2.948;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=118574570;WS=118574552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	118691929	rs6595185	A	T	1407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=30;PP=868;SC=CTTTGTCCGCATGCCCTGCGC;SOR=1.702;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=15;TCR=30;TR=45;WE=118691937;WS=118691919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr5	118728495	.	CT	C	157.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.110;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=2.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.31;ReadPosRankSum=-0.957;SOR=1.460;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr5	118788196	rs26180	C	G	677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=5;PP=358;SC=CCCGCCATTCCCCGCCTCCTC;SOR=1.528;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=24;WE=118788204;WS=118788186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr5	118809533	rs10601221	CCA	C	2400.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.72;QD=34.30;SOR=1.828;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr5	118811533	rs25640	G	A	3042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=49;NR=43;PP=1456;SC=CTGAGGGATCGTTCCTTTGCT;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=49;TCR=43;TR=92;WE=118811541;WS=118811523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr5	118813240	rs457106	T	C	6189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=115;PP=2965;SC=AGATGTTGTGTCTGGGGGTTC;SOR=1.025;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=209;TCF=92;TCR=117;TR=207;WE=118813248;WS=118813230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr5	118813316	rs463513	A	G	2177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=49;PP=1475;SC=AATATGTACAACCTTTTAACA;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=22;TCR=49;TR=71;WE=118813324;WS=118813306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr5	118837658	rs257969	T	C	3266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=65;NR=44;PP=1910;SC=AAAATGTCACTTGCGAGTAAC;SOR=0.906;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=65;TCR=44;TR=109;WE=118837666;WS=118837648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr5	118837833	rs460945	CA	TG	2131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=28;PP=1633;SC=CTTTTATTTCCAGATTAACCT;SOR=1.708;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=40;WE=118837842;WS=118837823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr5	118845089	rs32663	G	A	178.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=3;PP=59;SC=ACCAAGACCAGTCCCTCTTCT;SOR=1.179;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=6;WE=118845097;WS=118845079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	118845139	rs32664	G	A	188.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.60;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	118861713	rs11205	A	G	2713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=52;PP=1591;SC=ATTCAAGGCAATTAAGGTAAA;SOR=1.514;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=33;TCR=52;TR=85;WE=118861721;WS=118861703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr5	118862971	rs2636961	C	T	976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=11;NR=21;PP=641;SC=TTCCATCTTACCATTTTTTTT;SOR=1.483;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=11;TCR=21;TR=32;WE=118862979;WS=118862961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr5	118867173	rs17145464	G	C	1125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=27;PP=775;SC=AACAATTAAAGACCTTTGAAG;SOR=2.133;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=36;WE=118867181;WS=118867163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr5	118965623	rs2434599	A	G	1072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=30;PP=840;SC=GTCTCGCTCTATCGCCCAGGC;SOR=3.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=4;TCR=31;TR=34;WE=118965631;WS=118965613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr5	120021819	rs1158194	G	A	6678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=125;NR=102;PP=2965;SC=CAGCACACCCGTCTGCTATCC;SOR=0.792;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=227;TCF=125;TCR=102;TR=227;WE=120021827;WS=120021809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr5	121187798	.	G	A	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.207;ClippingRankSum=0.000;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=4.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.69;ReadPosRankSum=1.554;SOR=0.331;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,23:0.19:118
chr5	121330223	rs6595336	C	T	1703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=17;PP=949;SC=TCTTAAGATACGGAAAGGAAC;SOR=1.366;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=38;TCR=17;TR=55;WE=121330231;WS=121330213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr5	121362852	.	TA	T	93.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=0.000;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=3.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.56;ReadPosRankSum=1.406;SOR=0.229;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,12:0.20:60
chr5	121488241	.	A	G	545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.594;ClippingRankSum=0.000;DP=183;ExcessHet=3.0103;FS=0.668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.98;ReadPosRankSum=0.292;SOR=0.777;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:144,39:0.21:183
chr5	121518309	rs9112	G	A	5573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=99;PP=2965;SC=GTTCACCAACGATCTTGTAAA;SOR=0.986;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=188;TCF=89;TCR=99;TR=188;WE=121518317;WS=121518299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr5	121726714	rs1946649	G	A	800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=2;PP=571;SC=TTGTTTAAATGTAGACATTAT;SOR=3.258;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=26;WE=121726722;WS=121726704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr5	122131082	rs2161391	A	G	5268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=116;PP=2965;SC=TTTGCAGGTAATTGTCATGTA;SOR=1.597;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=176;TCF=60;TCR=116;TR=176;WE=122131090;WS=122131072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr5	122137708	rs965821	A	G	1477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=21;PP=1020;SC=TCATACATCAATATAGTATTA;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=22;TCR=22;TR=43;WE=122137716;WS=122137698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr5	122152520	.	AG	GG	720	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=1.0000,0.5000;HP=13;HapScore=1;MGOF=5;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=33,0;NR=3,19;PP=720,163;QD=20.5277777778;SC=TGTGGGGGGGAGGGGGGAGGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=71;TCF=43;TCR=28;TR=36,19;WE=122152528;WS=122152510;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:60,19:0.24:79
chr5	122152520	rs148883473	AG	AGG	1401.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000,0.5000;FS=21.741;HP=13;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=33,0;NR=3,19;PP=720,163;ReadPosRankSum=1.551;SC=TGTGGGGGGGAGGGGGGAGGA;SOR=6.398;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=71;TCF=43;TCR=28;TR=36,19;WE=122152528;WS=122152510;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:0.94:52
chr5	122161638	rs3213794	A	C	685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=0;PP=595;SC=ATTAGAATAGAACTTAAATAC;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=122161646;WS=122161628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	122161961	.	A	AT	49	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=6;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=49;QD=34.0;SC=ATTTTTCATAATTTTTTGTAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=122161969;WS=122161951;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr5	122165209	rs6885464	T	G	956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=0;PP=786;SC=TTATGTAGATTTTTTTTTAAT;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=28;WE=122165217;WS=122165199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr5	122165470	rs3990570	TAC	T	96.70	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5004;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.431;NF=0;NR=7;PP=249;ReadPosRankSum=-1.383;SC=TGGTTTTATATACACACACAC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=7;WE=122165479;WS=122165460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr5	122189640	rs7713253	C	G	699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=21;PP=561;SC=TTTAAGAATTCTTAAAAAACT;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=122189648;WS=122189630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	122267456	rs246314	C	T	210.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=172;SC=ATAGAACCCCCGTCTGTATTT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=122267464;WS=122267446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	122272641	rs30042	A	G	1387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=35;PP=1045;SC=CTTTTATCATAAAGTAAATTT;SOR=3.160;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=7;TCR=35;TR=42;WE=122272649;WS=122272631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr5	122281709	.	G	GT	176	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;FR=1.0000;HP=12;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=17;MQ=58.43;NF=9;NR=2;PP=176;QD=16.8181818182;SC=AGACATCTCTGTTTTTTTTTT;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=11;WE=122281717;WS=122281699;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:13,11:0.46:24
chr5	122301079	rs30055	T	G	3686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=66;NR=53;PP=1910;SC=GTTTAAAGAGTCAGGGACTTC;SOR=0.722;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=119;TCF=66;TCR=53;TR=119;WE=122301087;WS=122301069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr5	122359502	rs70988555	A	AAC	88.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.548;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.07;ReadPosRankSum=1.158;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr5	122359839	rs144851383	G	GAC	812.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=483;SC=TGACTACTAAGCGTTTTTTAT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=10;WE=122359854;WS=122359829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	122359840	rs374638812	CGTTTTTT	C	812.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=10;PP=593;SC=GACTACTAAGCGTTTTTTATG;SOR=3.500;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=122359854;WS=122359829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	122372402	rs28373879	G	C	1162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=28;PP=803;SC=TGACGGGACTGCCGGCCGGCT;SOR=3.145;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=34;WE=122372410;WS=122372392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr5	122425832	rs13182369	G	T	3893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=82;PP=2478;SC=GCGGCGCCGCGGGTCTCCTGA;SOR=1.302;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=135;TCF=53;TCR=82;TR=135;WE=122425840;WS=122425822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr5	122425971	rs199942027	A	ACCTCCGCCT	680.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=0;NR=4;PP=1185;SC=TTCCTCTTCCACCTCCGCCTC;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=4;WE=122425979;WS=122425961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	122426334	rs72373561	GGGCGCC	G	1224.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=16;PP=896;SC=CTCTCTCCCGGGGCGCCGGCG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=16;WE=122426347;WS=122426324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr5	122682154	rs2303719	T	G	1872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=6;PP=1255;SC=ACTTTTGAGGTTTTTACAAAG;SOR=4.066;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=44;TCR=6;TR=49;WE=122682162;WS=122682144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr5	122682348	rs1047438	A	G	11503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=430;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=190;NR=193;PP=2965;SC=TCAAATAATCATCCAAACCTT;SOR=0.746;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=383;TCF=190;TCR=193;TR=383;WE=122682356;WS=122682338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,429:1.00:429
chr5	122685801	rs485847	G	A	5263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=96;PP=2965;SC=GAAACAAAGAGACAAGTCATA;SOR=1.149;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=170;TCF=74;TCR=96;TR=170;WE=122685809;WS=122685791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr5	122685906	rs35423173	CT	C	214.87	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.9816;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.612;NF=0;NR=12;PP=154;ReadPosRankSum=-2.150;SC=ACTGCCAATTCTTTTTTTTTT;SOR=2.985;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=12;WE=122685914;WS=122685896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,12:0.86:14
chr5	122714134	rs141010737	TAAAAAA	T	2519.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.38;QD=41.31;SOR=3.139;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr5	122718736	rs6595440	G	C	1811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=38;PP=1221;SC=TAATCTTCTAGAGTCACTGTG;SOR=1.573;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=21;TCR=38;TR=59;WE=122718744;WS=122718726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr5	122722370	rs3893854	T	A	187.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.20;QD=26.83;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	122727026	rs6876883	G	A	4154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=82;PP=2319;SC=CACAGCAGAGGTGAATCTAAT;SOR=1.122;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=142;TCF=60;TCR=82;TR=142;WE=122727034;WS=122727016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr5	122728913	rs35574017	C	T	858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=3;PP=657;SC=AGTTTAGGTACTAAACTCTCG;SOR=3.841;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=27;WE=122728921;WS=122728903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr5	122734724	rs11419318	T	TA	178.92	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=-0.000;NF=12;NR=0;PP=190;ReadPosRankSum=-0.385;SC=TTTCAAAAGTTAAAAAAAAAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=12;WE=122734732;WS=122734715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,9:0.90:10
chr5	122739421	rs7715577	G	C	3372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=53;PP=1901;SC=CGTGGCATCTGTTCGATGATA;SOR=0.845;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=54;TCR=53;TR=107;WE=122739429;WS=122739411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr5	122758167	rs62377766	A	T	3487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=73;NR=43;PP=1820;SC=ACACCTTTTAAGGAATGTATA;SOR=0.957;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=73;TCR=43;TR=116;WE=122758175;WS=122758157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr5	122758268	rs6882791	G	C	4459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=69;PP=2566;SC=ATCGCAGGAAGCCTGTATTCA;SOR=0.781;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=144;TCF=75;TCR=69;TR=144;WE=122758276;WS=122758258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr5	122909345	rs7712330	G	C	268.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=1;NR=6;PP=148;SC=AGCGTTTGACGTAATACAAAT;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=122909353;WS=122909335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	122941007	.	AT	A	59.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.581;ClippingRankSum=0.000;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=1.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.56;ReadPosRankSum=0.176;SOR=0.514;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,17:0.16:106
chr5	123966143	rs72085687	AGTGT	A	490.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.89;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	123973701	rs6896590	T	C	1851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=49;PP=1196;SC=TAGAGTGCCATGGCTCAATCT;SOR=2.269;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=17;TCR=49;TR=66;WE=123973709;WS=123973691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr5	123974608	rs4371750	T	C	2678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=48;NR=47;PP=1759;SC=TCTAAAAAACTAATCAGTTAA;SOR=0.733;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=48;TCR=47;TR=95;WE=123974616;WS=123974598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr5	125696140	rs11241887	G	A	2961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=66;PP=1952;SC=CAGTGGGTCCGGACCTGGAAC;SOR=1.871;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=31;TCR=66;TR=97;WE=125696148;WS=125696130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr5	125904208	rs3734174	A	T	1260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=33;PP=953;SC=TGAGAAGGAAAAAAGTTTTTC;SOR=3.365;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=6;TCR=33;TR=39;WE=125904216;WS=125904198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr5	125913012	rs35617751	GT	G	5152.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.309;NF=8;NR=81;PP=2957;ReadPosRankSum=-1.416;SC=ATGCCTTATAGTGGGAAATTG;SOR=0.601;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=8;TCR=82;TR=89;WE=125913020;WS=125913002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,136:0.99:137
chr5	125919529	rs199930619	CA	C	410.25	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.9842;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=194;ReadPosRankSum=1.532;SC=GACTCCATCTCAAAAAAAAAA;SOR=0.425;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=21;TCF=9;TCR=12;TR=16;WE=125919537;WS=125919519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,21:0.88:24
chr5	125929000	.	A	AACACACAC,AACACAC	597.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.28;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001,0.4999;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3,3;NR=1,1;PP=93,33;SC=ATTTGAATTAAACACACACAC;SOR=3.056;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=4,4;WE=125929008;WS=125928990;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:9
chr5	125929807	rs10519915	T	C	4374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=97;NR=46;PP=2735;SC=TACCTTTCCATTGTATTCTAT;SOR=1.413;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=143;TCF=97;TCR=46;TR=143;WE=125929815;WS=125929797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr5	125931022	rs900641	T	G	1071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=31;PP=885;SC=CCGCCCCGTCTGCCCCTGGTC;SOR=3.912;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=36;WE=125931030;WS=125931012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr5	125944219	rs112502491	G	GTGTTTT	1681.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=26;PP=1603;SC=TGTTTATCCTGTGTTTTTGTT;SOR=3.967;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=1;TCR=37;TR=26;WE=125944227;WS=125944209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr5	125950781	rs6886516	G	A	770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.58;SOR=2.226;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr5	125950801	rs34630842	CT	C	748.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=3;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=10;NR=8;PP=252;SC=CTATACCTTGCTTTTTTTTTT;SOR=2.546;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=24;TCF=12;TCR=12;TR=18;WE=125950810;WS=125950791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	125953144	rs6883308	T	C	1228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=32;PP=911;SC=GATTTTGTTATTATCTTAAGT;SOR=2.531;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=9;TCR=32;TR=41;WE=125953152;WS=125953134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr5	125953183	rs6861893	A	T	422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=13;PP=345;SC=TTATTTATTTATTTTTGAGGC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=125953191;WS=125953173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	126145771	rs2271354	A	G	835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=23;NR=5;PP=716;SC=AACAGGAGGAAGTTCGTGTGT;SOR=3.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=28;WE=126145779;WS=126145761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr5	126156531	rs34618438	GT	G	127.76	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.90;MQRankSum=0.319;QD=11.61;ReadPosRankSum=-1.611;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr5	126168563	rs5871235	TG	T	792.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=668;SC=ACCAAGAGTGTGGTTGGGTTT;SOR=2.400;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=126168571;WS=126168553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	126171999	rs1051643	T	C	3054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=51;PP=1809;SC=TATGGTAATCTTTACCTGTAT;SOR=0.862;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=100;TCF=49;TCR=51;TR=100;WE=126172007;WS=126171989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr5	126746277	rs31483	C	T	2148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=29;NR=43;PP=1239;SC=TCCCTGCCACCTGGAAAACAC;SOR=1.387;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=29;TCR=43;TR=72;WE=126746285;WS=126746267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr5	126792974	rs3812052	T	A	3696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=70;PP=2299;SC=AGGACAGTGGTGGTAGCAGCA;SOR=1.455;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=43;TCR=70;TR=113;WE=126792998;WS=126792964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr5	126993249	rs45074	G	C	5851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=43;PP=2483;SC=CATCCCTAGTGCCCCTTGGGA;SOR=1.521;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=123;TCF=80;TCR=43;TR=122;WE=126993271;WS=126993239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr5	126993263	rs248709	A	T	6754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=61;PP=2607;SC=CTTGGGAACGAATCAGCAGAT;SOR=1.199;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=155;TCF=94;TCR=61;TR=154;WE=126993271;WS=126993239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr5	127469859	rs2228112	A	G	1526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=13;PP=841;SC=TTTTCTAGGAACATTCCATAC;SOR=1.487;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=49;TCF=36;TCR=13;TR=48;WE=127469867;WS=127469849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr5	127477418	rs3805607	T	C	665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=0;PP=445;SC=GGAGTAGATATGTAGTCACTA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=127477426;WS=127477408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	127485599	rs2617618	C	T	1594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=21;PP=949;SC=TGGGGTGTTACGTTGTTATCT;SOR=0.950;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=30;TCR=21;TR=51;WE=127485607;WS=127485589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr5	127493679	rs17164310	A	G	766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=2;PP=626;SC=TAGGGAAACAACTTAAAATCT;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=24;WE=127493687;WS=127493669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr5	127507316	rs3214907	A	AT	425.06	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=276;ReadPosRankSum=-0.315;SC=AATTTTTGTGATTTTTTTTTT;SOR=0.693;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=17;WE=127507324;WS=127507306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,18:0.90:20
chr5	127512873	rs1559263	A	C	1806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=29;NR=31;PP=973;SC=TTTATTTTAAACCCTTTTTCA;SOR=0.844;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=29;TCR=31;TR=60;WE=127512881;WS=127512863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr5	127514436	rs17764954	A	T	2048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.27;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr5	127613791	rs426987	C	G	1200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=30;PP=859;SC=ATGGAGATGACATAACTAACT;SOR=2.948;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=35;WE=127613799;WS=127613781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr5	127614472	rs190450	A	G	4797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=84;PP=2786;SC=GATTGCGACTACTGGATGCCA;SOR=1.017;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=152;TCF=68;TCR=84;TR=152;WE=127614480;WS=127614453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr5	127622983	rs2042327	C	T	5427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=104;NR=75;PP=2802;SC=GAACTACTCCCGAGTCTGAGG;SOR=0.849;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=179;TCF=104;TCR=75;TR=179;WE=127622991;WS=127622973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr5	127625559	rs56131649	T	C	2615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=35;PP=1582;SC=AGGAATAAAATATATCAAAGC;SOR=0.963;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=54;TCR=35;TR=89;WE=127625567;WS=127625549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr5	127640783	rs27713	G	A	2182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=29;NR=50;PP=1573;SC=ATCTAAAACAGAAAAAAATAA;SOR=1.387;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=80;TCF=29;TCR=51;TR=79;WE=127640791;WS=127640773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr5	127640861	rs27855	A	G	465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=14;PP=360;SC=CTAATCTGCTATTAATTATTA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=127640869;WS=127640851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	127648188	rs461146	G	A	378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=245;SC=GTTTCAGAGTGATCACTGAAA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=127648196;WS=127648178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	127671924	rs32221	A	G	3216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=72;PP=2227;SC=GAGGAAGTAAAATGTTCTCCT;SOR=1.718;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=33;TCR=72;TR=105;WE=127671932;WS=127671914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr5	127685135	rs154001	C	T	3025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=53;PP=1817;SC=TTTGGACAAACGCCAGGGAAC;SOR=0.784;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=104;TCF=51;TCR=53;TR=104;WE=127685143;WS=127685125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr5	127701944	rs10594722	ATAAT	A	143	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=3;NR=0;PP=123;SC=GCTCTAGGAGATAATTAATCT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=3;WE=127701955;WS=127701934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	127710244	.	C	T	472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.358;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.298;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=378;ReadPosRankSum=0.476;SC=AATATTACTCCACTGTATAGA;SOR=2.086;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=19;WE=127710252;WS=127710234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr5	128359247	rs31271	T	C	448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=0;PP=351;SC=AAATTGCTTGTACAAGTAACT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=15;WE=128359255;WS=128359237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	128430757	rs1127827	T	C	1613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=29;PP=959;SC=CCTCGTGCCGTTGCAGATCCA;SOR=1.528;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=18;TCR=29;TR=47;WE=128430765;WS=128430747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr5	128441119	rs2287751	T	C	1271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=33;PP=973;SC=ACAATATTATTTATAGAAAAC;SOR=3.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=7;TCR=33;TR=40;WE=128441127;WS=128441109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr5	128732848	rs7443230	C	T	1042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=23;PP=723;SC=AACAGTGCCTCTCTGTGAGAG;SOR=1.329;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=14;TCR=23;TR=37;WE=128732856;WS=128732838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr5	128863471	rs6595908	A	G	1825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=39;NR=20;PP=916;SC=CAAGAGTCTGAGTGTGCAGGT;SOR=1.042;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=39;TCR=20;TR=59;WE=128863479;WS=128863461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr5	128984787	rs30676	A	G	343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=226;SC=AATTTTTTCTACCTGTATGGA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=128984795;WS=128984777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	129015668	rs246443	T	C	982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=22;PP=677;SC=TGGCAAGGAATATTCCCAGTG;SOR=2.448;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=29;WE=129015676;WS=129015658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr5	129072943	rs1465686	G	T	1064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=29;PP=824;SC=CACAGCTCTTGGCAATTACAT;SOR=2.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=8;TCR=29;TR=37;WE=129072951;WS=129072933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	129244133	rs2431206	A	G	552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=16;PP=422;SC=GATTCTATTCATTCTCTCTGT;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=129244141;WS=129244123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	129519874	rs10066410	G	A	1129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=3;PP=888;SC=TTTCTTTTTAGATAAATCTTT;SOR=3.855;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=33;TCR=3;TR=36;WE=129519882;WS=129519864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr5	129521126	rs2015018	A	G	5843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=98;PP=2965;SC=CCCACTGATGATTACTTCATA;SOR=0.841;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=192;TCF=94;TCR=98;TR=192;WE=129521134;WS=129521116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr5	130766662	rs1291602	T	C	6950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=122;NR=116;PP=2965;SC=CAATACTCTCTGTTTAACTGT;SOR=0.716;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=238;TCF=122;TCR=116;TR=238;WE=130766670;WS=130766652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr5	130808198	rs31241	T	C	1878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=21;PP=1225;SC=CAAGTAACTCTAGCACTTGCT;SOR=1.230;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=39;TCR=21;TR=60;WE=130808206;WS=130808188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr5	130831365	rs40400	T	C	3026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=46;PP=1841;SC=TGTGGAAACATAAAAGAGGCA;SOR=0.749;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=51;TCR=46;TR=97;WE=130831373;WS=130831355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr5	130867733	rs1029472	G	A	1537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=8;PP=1077;SC=CTCATTTACAGTTCAAAATAA;SOR=2.628;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=40;TCR=8;TR=48;WE=130867741;WS=130867723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr5	130982768	rs26006	A	G	9550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=349;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=187;NR=133;PP=2965;SC=GCCAAAAAAGAAACCATTAAC;SOR=1.074;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=320;TCF=187;TCR=133;TR=320;WE=130982776;WS=130982758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,349:1.00:349
chr5	131006082	rs27450	A	G	1190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=7;PP=792;SC=GACCAAAAATATAAGGCAATT;SOR=2.613;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=36;WE=131006090;WS=131006072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr5	131006356	rs26007	T	A	1804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.54;SOR=1.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr5	131008194	rs26008	T	C	7200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=117;NR=127;PP=2965;SC=AGAAATCATCTGGCACTCATC;SOR=0.819;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=244;TCF=117;TCR=127;TR=244;WE=131008202;WS=131008184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,268:1.00:268
chr5	131066577	rs7729787	A	C	2112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=13;PP=1263;SC=TGAATAAATAAATGACATCAA;SOR=1.874;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=51;TCR=13;TR=64;WE=131066585;WS=131066567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr5	131066725	rs7730228	C	A	4490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=74;PP=2340;SC=GCATCACTGCCGAGTTTCTGA;SOR=1.193;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=135;TCF=61;TCR=74;TR=135;WE=131066733;WS=131066715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr5	131312327	rs370652	G	T	9082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=344;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=184;NR=140;PP=2965;SC=CAACAGTAATGCTACTTTATT;SOR=0.897;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=324;TCF=184;TCR=140;TR=324;WE=131312335;WS=131312317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,342:1.00:342
chr5	131322494	rs77938	C	T	3882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.06;SOR=0.850;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr5	131322666	rs67212057	CCACACACTCACA	C	534.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=11;PP=1760;SC=ACACACATACCCACACACTCA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=11;WE=131322685;WS=131322656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	131324119	rs71970	T	G	2411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=17;PP=1851;SC=CAGAAGGCCATGGAACCTCCT;SOR=2.613;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=63;TCR=17;TR=80;WE=131324127;WS=131324109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr5	131324250	rs3043838	C	CTG	10769.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=91;PP=2969;SC=GGGCTGTACCCTGTGTGGAGG;SOR=0.797;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=141;TCF=29;TCR=112;TR=116;WE=131324258;WS=131324240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr5	131325888	rs422130	A	G	3901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=63;PP=2438;SC=CTTGTGTCAGAGAGGGGTCAG;SOR=0.720;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=138;TCF=75;TCR=63;TR=137;WE=131325896;WS=131325878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr5	131326522	rs5871439	AC	A	3364.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;MQRankSum=0.187;NF=22;NR=37;PP=1141;ReadPosRankSum=-0.121;SC=GCCCCTCCACACCCCCCCCCA;SOR=0.484;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=75;TCF=29;TCR=46;TR=59;WE=131326530;WS=131326512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,114:0.99:115
chr5	131330054	rs253944	C	G	330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=9;PP=232;SC=GGCAGGCCCTCGGGGAGTTGG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=131330062;WS=131330044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	131658085	rs270600	T	C	2615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=54;PP=1671;SC=CCCTCTGCTGTGGGTCAGCAC;SOR=1.251;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=37;TCR=54;TR=91;WE=131658093;WS=131658075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr5	131705949	rs2631365	T	C	2973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=53;PP=1919;SC=TCTCGGCGCTTGGGCTGGAGC;SOR=0.896;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=45;TCR=53;TR=98;WE=131705957;WS=131705939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr5	131719999	rs4551059	A	G	2208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=43;PP=1295;SC=CCTGGGTATGACCATCAGGTT;SOR=1.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=23;TCR=43;TR=66;WE=131720007;WS=131719989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr5	131720070	rs274559	A	G	533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=16;PP=436;SC=TCTGGAGACAACTGTGATGTC;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=131720078;WS=131720060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	131721174	rs274558	A	G	5855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=82;PP=2965;SC=CGGGGGTGCTATGCGTGGCAC;SOR=0.856;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=190;TCF=107;TCR=83;TR=189;WE=131721182;WS=131721164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr5	131721204	rs274557	T	C	6335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.98;NF=110;NR=97;PP=2965;SC=GAGTGTGACCTTGTGCCCCAT;SOR=0.736;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=210;TCF=111;TCR=99;TR=207;WE=131721216;WS=131721194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr5	131722951	rs274555	C	T	482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=14;PP=362;SC=GCCCTCTCTCCGCCCAAGCCC;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=131722959;WS=131722941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	131730052	rs60522531	CA	C	3614.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=66;PP=2676;SC=CCTTCAGTGACAAAAGGCCTT;SOR=1.898;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=3;TCR=70;TR=69;WE=131730060;WS=131730042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr5	131755477	rs4451042	G	T	191.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=1;PP=153;SC=CGGATGATTGGGGCCGTTGCT;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=131755485;WS=131755467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	131755651	rs1003533	C	T	3054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=48;PP=1699;SC=AGAGCCTGACCGGAGTTTTTC;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=56;TCR=48;TR=104;WE=131755659;WS=131755641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr5	131796498	rs2522048	T	C	7713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=129;NR=127;PP=2965;SC=AACAAAACCATCAGCCCTGCT;SOR=0.730;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=256;TCF=129;TCR=127;TR=256;WE=131796506;WS=131796488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,277:1.00:277
chr5	131796573	rs2522049	T	C	4728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=88;PP=2399;SC=CCTGTAATGGTGGTTGTGAGG;SOR=1.005;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=162;TCF=73;TCR=89;TR=161;WE=131796581;WS=131796563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr5	131796609	rs2522050	C	T	3086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=66;PP=1900;SC=CAGCCACACACGCCAGTTCCC;SOR=1.630;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=101;TCF=35;TCR=66;TR=101;WE=131796617;WS=131796599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr5	131805591	rs2522063	G	T	552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=1;PP=407;SC=GGGAAGCAGGGGTCACTGCAG;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=131805599;WS=131805581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	131805735	rs2706379	C	T	5791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=82;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.769;SC=TCTCTAGCCCCGAACAGCACA;SOR=0.780;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=188;TCF=105;TCR=83;TR=186;WE=131805743;WS=131805725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,215:0.99:217
chr5	131892357	rs2706335	C	T	9222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=349;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=157;NR=159;PP=2965;SC=AGTTTTGACACGAACTGACCC;SOR=0.782;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=316;TCF=157;TCR=159;TR=316;WE=131892365;WS=131892347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,349:1.00:349
chr5	131892979	rs4526098	G	A	3834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=39;PP=2420;SC=GCCTTTGTGGGCTCCAGGTCC;SOR=1.699;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=87;TCR=39;TR=126;WE=131892987;WS=131892969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr5	131915213	rs17166050	G	A	585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=18;PP=494;SC=CCCTTAAATAGACTTTGTAGT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=131915221;WS=131915203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	131973663	rs2074369	T	C	242.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=198;SC=ATTGTTTTCCTCTGGTAATGT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=131973671;WS=131973660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	132035781	rs143317845	T	C	72.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=0;PP=51;SC=CCCAAAAGTATCAGCCCATTT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=132035789;WS=132035771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr5	132036252	rs1468216	T	C	7146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=135;NR=106;PP=2965;SC=TACTGGACCATGTTCCTCCCC;SOR=0.911;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=241;TCF=135;TCR=106;TR=241;WE=132036260;WS=132036242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,271:1.00:271
chr5	132036489	rs1468215	A	T	257.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=182;SC=TGAGTAATAAAAGTCTCAAAA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=132036497;WS=132036479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	132038199	rs3213639	C	T	3753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=39;PP=2182;SC=AAAGAACTCCCTTTTAAAAAA;SOR=1.352;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=83;TCR=39;TR=122;WE=132038207;WS=132038189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr5	132039132	rs2285700	C	A	1011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=6;PP=664;SC=ATCATGAATTCATCTCAATTC;SOR=2.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=33;WE=132039140;WS=132039122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	132046789	rs11740584	G	C	3889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=84;PP=2656;SC=TATCCTGTACGAAGTCATTAG;SOR=1.793;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=122;TCF=38;TCR=84;TR=122;WE=132046797;WS=132046779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr5	132056147	rs2074529	C	A	2231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=13;PP=1391;SC=TTTCATTCATCTATGCTCTCT;SOR=2.804;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=54;TCR=13;TR=67;WE=132056155;WS=132056137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr5	132070242	rs7732520	C	T	191.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=1;NR=6;PP=142;SC=AATTTATAAACTTTAAAAGGC;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=132070250;WS=132070232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	132098242	rs30510	A	G	8503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=158;NR=138;PP=2965;SC=TCTGGACCCCATTGCTGACCA;SOR=0.737;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=296;TCF=158;TCR=138;TR=296;WE=132098250;WS=132098227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,327:1.00:327
chr5	132149684	rs40274	G	C	4646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=73;PP=2897;SC=CCCTTGGTCCGGGTGCCGCGG;SOR=0.803;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=159;TCF=86;TCR=73;TR=159;WE=132149692;WS=132149674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr5	132150948	rs40470	T	G	7241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=115;NR=123;PP=2965;SC=TGCCCAGTTTTCCTCCAACAA;SOR=0.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=238;TCF=115;TCR=123;TR=238;WE=132150956;WS=132150938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr5	132198199	rs254286	G	A	4824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=101;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.734;SC=AGTGTTCAACGGTAGTAATGC;SOR=0.540;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=165;TCF=63;TCR=102;TR=164;WE=132198207;WS=132198189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,173:0.99:174
chr5	132198287	rs254285	C	G	800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=20;PP=577;SC=GCTTGAAAATCAGTCAACACA;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=132198295;WS=132198277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr5	132220748	rs45441396	C	T	2110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.41;SOR=1.379;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr5	132220941	rs142786008	CGTGT	C	323.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=7;PP=324;SC=CACCAAAATACGTGTGTGTGT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=7;WE=132220952;WS=132220931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	132227677	rs6596093	A	G	722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=4;PP=576;SC=CTGACTTACCACCTTCACAGT;SOR=3.528;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=132227685;WS=132227667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	132228133	rs11739417	A	G	822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=22;PP=595;SC=TTCTCCACACAGTAATACAGG;SOR=2.546;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=28;WE=132228141;WS=132228123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr5	132234152	rs34099243	C	CG	560.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=17;PP=756;SC=ACATCCAAATCGACAACCAAC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=17;WE=132234160;WS=132234142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	132270663	rs10039125	T	A	1545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=37;PP=1051;SC=AATAAAATTATAAAATGAGCA;SOR=2.437;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=9;TCR=37;TR=46;WE=132270671;WS=132270653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr5	132273031	rs2288387	T	C	99.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=5;PP=80;SC=AGCTGGGTTTTGGTAATGGTT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=132273039;WS=132273021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr5	132334252	rs3087646	A	G	5345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.95;NF=107;NR=81;PP=2965;SC=TCAGTCCATCAGTCCAATATG;SOR=0.917;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=188;TCF=107;TCR=81;TR=188;WE=132334260;WS=132334242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr5	132335951	rs2059783	A	G	7407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=113;NR=150;PP=2965;SC=CCCCCAAATCATTTTACTCTG;SOR=1.016;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=263;TCF=113;TCR=150;TR=263;WE=132335959;WS=132335941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,282:1.00:282
chr5	132362336	.	A	AG	376	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;FR=1.0000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=10;PP=376;QD=41.0;SC=CAGGCTTCTAAGGGGAGGTAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=10;WE=132362344;WS=132362326;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,10:0.77:13
chr5	132408967	rs61755724	G	A	3790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.30;SOR=0.887;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr5	132425415	rs200901091	G	A	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=34.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQRankSum=-2.308;QD=1.60;ReadPosRankSum=4.024;SOR=5.548;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,15:0.37:41
chr5	132918828	rs13162005	C	T	521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=1;PP=434;SC=CTGTCTCCAGCGGCCAGTGGA;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=132918836;WS=132918818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	132939412	rs72789144	C	T	227.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=143;SC=TTCTTCTGTCCCCACCAAAAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=132939420;WS=132939402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	133316707	.	CT	C	64.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.412;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=9.917;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.40;ReadPosRankSum=0.638;SOR=0.880;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr5	133450497	rs173424	A	G	57.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=1;PP=26;SC=CCGCGATCCGAGCTCGGAGGT;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=133450505;WS=133450487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr5	133537438	rs2302598	T	A	1992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=47;NR=15;PP=1287;SC=TTAAAAAATATCCCCAAAGGG;SOR=2.269;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=47;TCR=15;TR=62;WE=133537446;WS=133537428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr5	133537479	rs2302599	T	G	3814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=48;PP=2205;SC=CATAAGCACCTGAACACTAAA;SOR=1.218;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=80;TCR=48;TR=128;WE=133537487;WS=133537469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr5	133541548	rs2239543	A	G	1036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=25;NR=13;PP=644;SC=TAACTGGGGGAAAAAAAACTT;SOR=1.402;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=25;TCR=13;TR=38;WE=133541556;WS=133541538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr5	133561589	rs3863186	G	C	7430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=108;NR=137;PP=2965;SC=GCTCCGCGCTGCTCCCGCGCC;SOR=1.089;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=246;TCF=108;TCR=138;TR=245;WE=133561597;WS=133561579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,272:1.00:272
chr5	133655029	.	GA	G	136.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.646;ClippingRankSum=0.000;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=1.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.42;ReadPosRankSum=0.537;SOR=0.375;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,13:0.32:40
chr5	133657610	rs139337657	G	GA	5725.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=-1.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.162;NF=7;NR=81;PP=1331;ReadPosRankSum=0.227;SC=ACAGATCAGGGAAAAAAAAAT;SOR=0.330;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=114;TCF=10;TCR=104;TR=88;WE=133657618;WS=133657600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,205:1.00:206
chr5	133873572	rs329126	A	C	2349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=19;PP=1597;SC=TTTCTCCCTCATGAACATTCT;SOR=1.923;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=56;TCR=19;TR=74;WE=133873580;WS=133873562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr5	133887780	rs12163993	G	A	14249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=539;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=239;NR=261;PP=2965;ReadPosRankSum=0.023;SC=TGAAGATCCCGGACTCATACC;SOR=0.406;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=501;TCF=240;TCR=261;TR=500;WE=133887788;WS=133887770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,536:1.00:537
chr5	133896744	rs2589404	A	G	594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=472;SC=TGTGGACAGAAGCCCTTAAGA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=133896752;WS=133896734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	133897829	rs329304	C	T	4869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=73;PP=2874;SC=ATGCAGCTGACTGCTGACCAG;SOR=0.901;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=168;TCF=95;TCR=73;TR=168;WE=133897837;WS=133897819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr5	133900111	rs329311	A	C	4266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=90;NR=57;PP=2586;SC=CAGCAGACAAACCCCCATTTT;SOR=1.036;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=147;TCF=90;TCR=57;TR=147;WE=133900119;WS=133900101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr5	133901934	rs148155246	C	T	9602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=365;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=155;NR=178;PP=2965;SC=AGCACAGTGACGGGGGCCCAC;SOR=0.858;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=333;TCF=155;TCR=178;TR=333;WE=133901942;WS=133901924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,364:1.00:364
chr5	133909475	rs329322	G	A	5901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=87;NR=119;PP=2965;SC=CCCACCTGCCGCCGCCACCTC;SOR=1.138;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=206;TCF=87;TCR=119;TR=206;WE=133909483;WS=133909465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr5	133942492	rs7728741	T	C	1149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=1;PP=878;SC=TCAATTCTCATTCAAATTAAG;SOR=5.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=33;WE=133942500;WS=133942482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	133944043	rs199526981	ATT	A,AT	843.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=7.460;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.63;ReadPosRankSum=1.511;SOR=3.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:1,14,24:0.36,0.62:39
chr5	134011834	.	CT	C	51.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.120;ClippingRankSum=0.000;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.46;ReadPosRankSum=1.812;SOR=0.616;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr5	134015523	rs10042142	C	G	501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=14;PP=349;SC=TTATTTACCTCTAGTCAATCC;SOR=3.383;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=134015531;WS=134015513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	134033777	rs246341	G	A	1464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=38;PP=1070;SC=GCGTAGGACTGAATAATATTT;SOR=3.033;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=7;TCR=38;TR=45;WE=134033785;WS=134033767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr5	134076812	rs12657663	G	A	5018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=80;PP=2965;SC=CTCCCTCAGCGTTCCTTCCGT;SOR=0.704;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=168;TCF=87;TCR=81;TR=167;WE=134076820;WS=134076802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr5	134106761	rs35505581	CTCTT	C	176.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.07;QD=35.37;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr5	134113558	rs254713	G	A	324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=9;PP=258;SC=TACTTTTTCTGAGTACCAGAG;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=134113566;WS=134113548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	134223593	rs3733897	A	G	6290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=113;NR=94;PP=2965;SC=CTGAGGACAAAGTGAGTTCAG;SOR=0.764;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=207;TCF=113;TCR=94;TR=207;WE=134223601;WS=134223583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr5	134305852	.	AT	A	58.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.35;ReadPosRankSum=1.261;SOR=1.002;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr5	134343662	rs139800400	G	A	1584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=14;PP=1059;SC=GATCACCGCCGTGGGGCAGAC;SOR=1.919;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=39;TCR=14;TR=53;WE=134343670;WS=134343652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr5	134344497	rs299376	T	C	1729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=17;PP=1202;SC=CCACTGGGTCTGGGCCCTCAG;SOR=1.981;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=63;TCF=46;TCR=17;TR=61;WE=134344505;WS=134344487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr5	134344929	rs299378	C	G	1588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=9;PP=1163;SC=GCTTGAGTGGCGGCTGGCCCT;SOR=3.014;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=40;TCR=9;TR=49;WE=134344937;WS=134344919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr5	134573448	rs62383169	G	A	7785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=146;NR=115;PP=2965;SC=CATGAGCTCAGGCCAAAAGAG;SOR=0.847;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=261;TCF=146;TCR=115;TR=261;WE=134573456;WS=134573438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,291:1.00:291
chr5	134870913	rs8192559	G	A	3190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=32;PP=2089;SC=CACCGCCTCCGGGCAGCCCTT;SOR=1.524;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=66;TCR=32;TR=98;WE=134870921;WS=134870903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr5	134986006	rs801560	G	A	1163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=30;NR=15;PP=756;SC=TCCTTGACTGGTACACTCCAA;SOR=1.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=30;TCR=15;TR=45;WE=134986014;WS=134985996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr5	134986256	rs149152270	A	AAAC	2761.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.30;QD=43.15;SOR=1.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr5	135138782	rs11738183	T	C	667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=15;PP=360;SC=TAATATCCTATGGAGGTATTA;SOR=1.302;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=10;TCR=15;TR=25;WE=135138790;WS=135138772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr5	135178124	rs2304075	T	C	2993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=38;PP=1364;ReadPosRankSum=-0.178;SC=GTGTCATCGTTGGCCACCCTC;SOR=0.338;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=101;TCF=63;TCR=38;TR=100;WE=135178132;WS=135178114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,116:0.99:117
chr5	135186075	rs2304077	A	G	6075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=110;NR=88;PP=2965;SC=GGCTATGAATAACCTCTGCGC;SOR=0.738;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=198;TCF=110;TCR=88;TR=198;WE=135186083;WS=135186065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr5	135188214	rs2304078	G	C	5677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=119;NR=75;PP=2965;SC=ACGGCAGCCCGGGGTCCTCAC;SOR=1.263;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=194;TCF=119;TCR=75;TR=194;WE=135188222;WS=135188204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr5	135207382	rs2304080	C	T	6150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=114;PP=2965;SC=GCCCCTGTGCCGTGTGGCTGG;SOR=0.955;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=204;TCF=90;TCR=114;TR=204;WE=135207390;WS=135207372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr5	135215575	rs2269926	A	T	1187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=5;PP=847;SC=AGGCAGCACCACTAGCTATTC;SOR=3.202;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=37;WE=135215583;WS=135215565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr5	135365006	rs4976361	A	G	499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=10;PP=251;SC=ACCTTGCAGCATGGAGCGCTC;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=6;TCR=10;TR=16;WE=135365014;WS=135364996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	135379612	rs4976464	A	G	1448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=7;PP=1143;SC=CTTAGCAAATAACTCCTAAGA;SOR=2.935;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=37;TCR=7;TR=44;WE=135379620;WS=135379602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr5	135382989	rs1442	G	C	5081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=75;PP=2965;SC=GTGCCCGGCTGCTGAAAGCCG;SOR=0.920;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=174;TCF=99;TCR=75;TR=174;WE=135382997;WS=135382979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr5	135496820	.	CA	C	172.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=0.000;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.88;ReadPosRankSum=1.348;SOR=0.672;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,18:0.30:60
chr5	135513085	rs55765823	T	TC	7032.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=67;PP=2936;SC=GGATTGAGATTATCTTCATGG;SOR=0.751;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=87;TCF=17;TCR=70;TR=84;WE=135513093;WS=135513075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr5	135561133	rs3734123	C	T	2331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=58;PP=1638;SC=TATCCATATACGGGGCTGTCT;SOR=2.613;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=17;TCR=58;TR=75;WE=135561141;WS=135561123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr5	135700760	rs11307237	GA	G	620.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=1;PP=425;SC=TTCTATAAAAGAAAAAAAAAA;SOR=5.058;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=23;WE=135700768;WS=135700750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	136315200	rs3217011	AT	A	7736.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=105;PP=2967;SC=AGACATGCAGATGATACTCGG;SOR=1.289;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=117;TCF=12;TCR=105;TR=117;WE=136315208;WS=136315190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr5	136602543	rs17171235	A	C	1894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=15;PP=1329;SC=CAATTTGATAAAATAATTTCT;SOR=2.200;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=48;TCR=15;TR=63;WE=136602551;WS=136602533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr5	136833955	.	CCACA	C	386.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=32.25;ReadPosRankSum=1.454;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,11:0.92:12
chr5	136969637	rs7713180	A	G	2577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=55;NR=36;PP=1579;SC=CTGCACATGTACCCTCTAAAT;SOR=1.044;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=55;TCR=36;TR=91;WE=136969645;WS=136969627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr5	136969953	rs2301709	C	T	282.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=233;SC=GCACCCTTACCTCAGAATTCT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=136969961;WS=136969943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	136975687	rs2074348	G	A	6076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=107;PP=2965;SC=ACAAGTGGACGTTAGCGGGGT;SOR=1.061;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=193;TCF=86;TCR=107;TR=193;WE=136975695;WS=136975677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr5	136975819	rs4370266	A	G	505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=14;PP=343;SC=GCTCCTGGTCACCAACAGGTA;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=136975827;WS=136975809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	136997776	rs70979550	AC	A	1491.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=23;PP=987;SC=CTTTCAAACAACCCTCAATCT;SOR=1.455;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=23;WE=136997784;WS=136997766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr5	137013106	rs2967791	C	T	2080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=52;NR=19;PP=1309;SC=CATCGCACTCCAGCCTGGCCG;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=52;TCR=19;TR=71;WE=137013114;WS=137013096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr5	137027953	rs2301710	A	T	591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=16;NR=5;PP=345;SC=GAGGAGGTGCAGCAGTCCGGC;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=21;WE=137027961;WS=137027943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr5	137028029	rs2905608	T	C	1742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.41;SOR=0.886;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr5	137056027	rs6887727	T	C	830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=4;PP=635;SC=GGAACTCAAGTGACTAAGAAT;SOR=2.546;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=28;WE=137056035;WS=137056017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr5	137206560	rs6890689	A	C	7094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=112;NR=114;PP=2965;SC=TGCTTCTCCCAAGCAGCATGC;SOR=0.861;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=226;TCF=112;TCR=114;TR=226;WE=137206568;WS=137206550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
chr5	137241856	rs700605	T	C	1672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=13;PP=1017;SC=ATATAAATGCTTGAAATGAAC;SOR=1.773;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=39;TCR=13;TR=52;WE=137241864;WS=137241846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr5	137244517	rs1880458	G	A	3367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=61;NR=50;PP=1717;SC=GTCCCGTTGTGTTAAAGACAT;SOR=0.757;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=61;TCR=50;TR=111;WE=137244525;WS=137244507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr5	137257288	rs4304074	A	G	1218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=11;PP=869;SC=GTATGTACATAAAGGTATATA;SOR=2.038;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=28;TCR=11;TR=39;WE=137257296;WS=137257278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr5	137259179	rs12187140	T	C	2230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=37;PP=1362;SC=GGCAGAAGGCTAGATTTTGAA;SOR=0.791;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=39;TCR=37;TR=76;WE=137259187;WS=137259169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr5	137259251	rs13188503	C	T	1634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=28;PP=932;SC=CTAAGACAAACCTCATATAGT;SOR=1.123;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=24;TCR=28;TR=52;WE=137259259;WS=137259241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr5	137271968	rs7701617	T	G	1109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=10;PP=800;SC=ACATGAAAGTTTATTACTGAC;SOR=2.073;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=28;TCR=10;TR=38;WE=137271976;WS=137271958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr5	137281708	rs1125979	A	C	4374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=75;PP=2685;SC=AAAAAAAGAAATTGTCTAGTC;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=145;TCF=70;TCR=75;TR=145;WE=137281716;WS=137281698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr5	137292133	rs3836896	C	CA	5029.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-0.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=46;PP=2469;ReadPosRankSum=1.367;SC=CCATAAAAGGCAAAAAAACTA;SOR=0.461;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=91;TCF=39;TCR=52;TR=83;WE=137292141;WS=137292123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,165:0.99:166
chr5	137295823	rs9327802	T	C	1978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=35;NR=20;PP=1027;SC=TAGGCAAGTTTTTAAAGACTA;SOR=1.002;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=35;TCR=20;TR=55;WE=137295831;WS=137295813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr5	137297923	rs4835738	C	T	360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=242;SC=CAAATCCAAACATTTATGGGT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=137297931;WS=137297921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	137323117	rs7714536	A	G	977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=7;PP=743;SC=CAATTTTATAACATTTAATAA;SOR=2.517;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=33;WE=137323125;WS=137323107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	137342589	rs3756686	T	C	939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=3;PP=706;SC=CTTTCACATATAGTTACAGTT;SOR=3.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=29;WE=137342597;WS=137342579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	137347403	rs12187885	G	A	1770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=23;PP=922;ReadPosRankSum=2.826;SC=CACCGTGCCCGGCCTCACATA;SOR=1.211;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=36;TCR=24;TR=58;WE=137347411;WS=137347393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,69:0.97:71
chr5	137347498	rs10064910	G	A	4180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=63;PP=2421;SC=AAGAATTTGCGGACCAAATTT;SOR=0.759;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=137;TCF=74;TCR=63;TR=137;WE=137347506;WS=137347488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr5	137354851	rs66908638	CA	C	565.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=21;PP=348;SC=AAATGAAAGACAAAAAAAAAA;SOR=4.003;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=21;WE=137354859;WS=137354841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	137372207	rs6596419	A	T	6517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=117;NR=104;PP=2965;SC=CTCTGAGCAGATCCATTGAAG;SOR=0.710;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=221;TCF=117;TCR=104;TR=221;WE=137372215;WS=137372197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr5	137420376	rs4835762	T	C	3209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=62;PP=1610;SC=GTGAATGGAGTGGGGCTTGCA;SOR=1.274;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=44;TCR=62;TR=106;WE=137420384;WS=137420366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr5	137426447	rs6596422	G	A	7225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=127;NR=117;PP=2965;SC=GCGCAGAGGCGGAACTGATCT;SOR=0.716;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=245;TCF=128;TCR=117;TR=244;WE=137426455;WS=137426437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr5	137427274	rs3860103	G	C	1191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=30;PP=910;SC=TAGAGTGTTGGATTTTTTATC;SOR=4.863;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=32;WE=137427282;WS=137427264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr5	137454358	.	C	G	26	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=26;QD=30.3856062736;SC=ATTTTTAGTACAGACGGGGTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=137454366;WS=137454348;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr5	137464887	rs11428296	A	AT	1048.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=1.543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.48;ReadPosRankSum=0.936;SOR=1.133;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,51:0.85:60
chr5	137476416	rs412051	T	C	6005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=96;PP=2965;SC=CAGGACTTCTTGCCGCATCTC;SOR=0.711;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=203;TCF=107;TCR=96;TR=203;WE=137476424;WS=137476406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr5	137485292	rs217270	C	T	953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=8;PP=528;SC=AACAGAAGTACGAATCTTAAC;SOR=1.547;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=32;WE=137485300;WS=137485282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	137506434	rs13155519	G	A	2641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=30;PP=1587;SC=CTAAAGGGACGGCAATTGGAG;SOR=1.354;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=56;TCR=30;TR=86;WE=137506442;WS=137506424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr5	137661434	rs3734165	T	C	885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=1;PP=676;SC=CTATGTCTCATTATGATACCA;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=26;WE=137661442;WS=137661424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr5	137708434	rs4835678	C	T	4557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=76;PP=2545;SC=AGGAAGTTATCGTGCTTCTGC;SOR=0.872;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=146;TCF=70;TCR=76;TR=146;WE=137708442;WS=137708424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr5	137717213	rs10073922	G	A	3281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=62;NR=49;PP=1849;SC=AGAGTGGTGAGATCAAGTCGG;SOR=0.793;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=62;TCR=49;TR=111;WE=137717221;WS=137717203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr5	137717265	rs6865472	G	A	3282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=60;PP=1887;SC=GGATAATTCAGCGCCTCAAAG;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=113;TCF=53;TCR=60;TR=113;WE=137717273;WS=137717255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr5	137735754	rs4835680	A	T	1551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=38;PP=1034;SC=GGTATGTCCAAGATGTTGTGG;SOR=3.788;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=4;TCR=38;TR=42;WE=137735762;WS=137735744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr5	137754695	rs7726234	T	C	5420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=79;PP=2821;SC=CCTTCTCTGGTGGAGGAGGAC;SOR=0.805;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=175;TCF=96;TCR=79;TR=175;WE=137754703;WS=137754685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr5	137763615	rs2240334	A	C	752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=0;PP=419;SC=ATTCTTCCAAATATTGGCCCT;SOR=3.014;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=137763623;WS=137763605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	137775581	rs982085	C	G	2396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=52;PP=1530;SC=GAGGACGCTCCGTGGCCTTCA;SOR=1.911;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=23;TCR=52;TR=75;WE=137775589;WS=137775571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr5	137776931	rs2269947	C	T	680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=13;PP=529;SC=TCCCACACAGCGCCTCCAACA;SOR=1.329;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=8;TCR=13;TR=21;WE=137776939;WS=137776921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr5	137777269	rs12516269	A	G	3116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=69;PP=2101;SC=TGACAATTTCATGGGGTCCTT;SOR=1.336;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=111;TCF=41;TCR=70;TR=110;WE=137777277;WS=137777259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr5	137780336	rs4835794	T	C	2161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=18;PP=1504;SC=CCAAAGTGACTTGGCAGGGCT;SOR=1.745;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=47;TCR=18;TR=65;WE=137780344;WS=137780326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr5	137780368	rs2240331	C	A	4160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=44;PP=2699;SC=CCGGAGCAGGCAGGGGCCTCT;SOR=1.516;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=89;TCR=44;TR=133;WE=137780376;WS=137780358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr5	137846155	rs4835685	A	G	5504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=113;NR=69;PP=2965;SC=CAATTAGTATAAGGTTTGGTT;SOR=1.051;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=183;TCF=114;TCR=69;TR=182;WE=137846163;WS=137846145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr5	137847082	rs35404194	C	T	210.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.593;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=3.522;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=23.43;ReadPosRankSum=0.967;SOR=0.916;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,8:0.89:9
chr5	137847086	rs137924468	CACACAT	C	131.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=18.75;ReadPosRankSum=1.465;SOR=1.108;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,6:0.86:7
chr5	138148064	rs13154573	T	C	2487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=48;PP=1560;SC=ATTCTGTGTGTTTTCTGAAAG;SOR=1.638;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=26;TCR=48;TR=74;WE=138148072;WS=138148054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr5	138216625	rs5871683	G	GA	524.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=3;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.474;NF=21;NR=6;PP=330;ReadPosRankSum=-0.474;SC=ATATGGCAAGGAAAAAAAAAA;SOR=0.836;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=27;WE=138216633;WS=138216615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,21:0.95:22
chr5	138221989	rs288028	G	C	2496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=45;PP=1398;SC=CAGGTAATCTGGATGAAAGTG;SOR=0.896;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=43;TCR=45;TR=88;WE=138221997;WS=138221979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr5	138266546	rs1059110	G	A	5407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=77;PP=2965;SC=AAAATACATCGGATGTCATCA;SOR=0.756;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=171;TCF=94;TCR=77;TR=171;WE=138266554;WS=138266536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr5	138356756	rs10077896	G	A	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=0;PP=313;SC=TCATTGAGATGACACTGAAAT;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=138356764;WS=138356746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	138356775	rs10077796	C	A	654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=3;PP=464;SC=ATGTCAGTAGCAACAGGCACA;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=22;WE=138356783;WS=138356765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	138456815	rs3088052	T	C	2396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=30;PP=1151;SC=CTTTTCTCTCTGTTTCTTTGG;SOR=0.990;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=47;TCR=30;TR=77;WE=138456823;WS=138456805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr5	138456994	rs11750382	G	A	565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=16;PP=402;SC=CTGGACACTCGCAATTCCTTT;SOR=4.514;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=138457002;WS=138456984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	138473077	rs11431215	C	CA	4661.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=44;PP=2262;SC=AGTTTGGCCCCAAAGCCATGC;SOR=0.751;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=64;TCF=13;TCR=51;TR=56;WE=138473085;WS=138473067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr5	138642997	rs112107315	A	AT	464.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=1;PP=515;SC=TGGCGTTACCATTTTTGAAGC;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=138643005;WS=138642987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	138643062	rs12153162	T	A	1704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.07;SOR=1.263;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr5	138713959	rs6596474	A	C	2187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.58;SOR=0.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr5	138714474	rs11950646	G	A	4111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=88;PP=2525;SC=TGTGGGGGCTGCAGCTATCAG;SOR=1.658;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=46;TCR=88;TR=134;WE=138714482;WS=138714464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr5	138718476	rs11242461	T	C	167.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=6;PP=113;SC=TCTCCCACTTTGCATTGCTTC;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=138718484;WS=138718466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	138718878	.	C	CA	49	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=6;HapScore=2;MGOF=19;MMLQ=27;MQ=66.83;NF=3;NR=0;PP=49;QD=24.3333333333;SC=CCCCTGCCCCCCCTAGCCCCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=138718886;WS=138718868;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr5	138720156	rs12515989	C	T	5346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=107;NR=78;PP=2965;SC=GCCCGCCTGCCGGTGTCCACA;SOR=0.927;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=185;TCF=107;TCR=78;TR=185;WE=138720164;WS=138720146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr5	138720336	rs6596476	T	C	574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=14;PP=402;SC=CCCCTGCAGATACGGCTCCAT;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=138720344;WS=138720326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	138724126	rs33937093	TG	T	1384.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=8;PP=835;SC=AGGAGGGAGGTGGGGGGCAGG;SOR=2.252;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=35;TCF=22;TCR=13;TR=26;WE=138724134;WS=138724116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr5	138724457	rs9327846	A	G	387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=274;SC=TGGGATGGGGATGGGGGATGG;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=138724465;WS=138724447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	138728483	rs10078623	A	G	4543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=90;NR=51;PP=2520;SC=CTGGGCCTCTACATCCCTGTT;SOR=1.099;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=90;TCR=51;TR=141;WE=138728491;WS=138728473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr5	138732579	rs10900862	C	T	4472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=69;PP=2762;SC=CCATGTAGCTCTCCTGCTGCT;SOR=0.813;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=136;TCF=67;TCR=69;TR=136;WE=138732587;WS=138732569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr5	138738178	rs4074032	C	T	561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=59.54;NF=15;NR=4;PP=376;SC=GTGATTTGCCCGCCTTGGCCT;SOR=2.093;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=19;WE=138738186;WS=138738168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	138754741	rs4835728	T	C	3674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=55;PP=2016;SC=GCACTGTGACTGAAGAGCTAA;SOR=0.829;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=126;TCF=71;TCR=55;TR=126;WE=138754749;WS=138754731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr5	138773090	rs10900864	A	G	4671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=79;PP=2693;SC=GTTCCTCACTATACGTGGAGT;SOR=0.751;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=164;TCF=85;TCR=79;TR=164;WE=138773098;WS=138773080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr5	138775173	rs3923059	T	C	4504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=95;PP=2544;SC=GCCTCCCCCGTGCCCGAGGCT;SOR=1.423;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=154;TCF=59;TCR=95;TR=154;WE=138775181;WS=138775163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr5	138852369	rs13153461	G	A	5649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=93;PP=2965;SC=GCCAGATGGTGGCATCTACCT;SOR=0.856;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=181;TCF=88;TCR=93;TR=181;WE=138852377;WS=138852359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr5	138857919	rs1131769	T	C	3756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=52;PP=2082;SC=GATGCCAGCATGGTCACCGGT;SOR=0.960;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=127;TCF=75;TCR=52;TR=127;WE=138857927;WS=138857909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr5	138861146	rs7447927	C	G	5005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=75;PP=2965;SC=CTAGGTGGAGCACCAGGTACC;SOR=0.824;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=83;TCR=75;TR=158;WE=138861154;WS=138861136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr5	139213452	rs4912884	A	G	928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=4;NR=23;PP=754;SC=TGTGCCTCGTAAAATCCTGGC;SOR=2.910;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=27;WE=139213460;WS=139213442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr5	139216901	rs11440487	A	AG	2873.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=48;PP=2380;SC=GGCACCCCGAAGCCCCAGGCA;SOR=1.824;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=53;TCF=2;TCR=51;TR=50;WE=139216909;WS=139216891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr5	139422232	rs144634106	G	A	4975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=101;NR=65;PP=2965;SC=TGGAGCCGCCGGCTGGGACCA;SOR=1.030;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=166;TCF=101;TCR=65;TR=166;WE=139422240;WS=139422222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr5	139936680	rs143712554	ACCC	A,AC	3306.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=3.208;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=33.40;SOR=0.403;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:1,51,47:0.52,0.47:99
chr5	139941228	rs250430	A	G	5404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=92;PP=2965;SC=ACATCACAGCAAAACACATGG;SOR=0.843;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=180;TCF=88;TCR=92;TR=180;WE=139941236;WS=139941218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr5	140011468	rs4914	C	G	7267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=139;NR=104;PP=2965;SC=CCCCTTGGAGCAGCACCAGGG;SOR=0.917;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=243;TCF=139;TCR=104;TR=243;WE=140011476;WS=140011458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr5	140027592	rs70988770	G	GGT	215.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=2.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.48;ReadPosRankSum=-0.547;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr5	140048267	rs2530245	T	C	4814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=78;PP=2791;SC=AGGTGGTATCTGTCTCTGGGA;SOR=0.716;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=161;TCF=83;TCR=78;TR=161;WE=140048275;WS=140048257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr5	140077699	rs2530234	A	G	1361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=40;PP=1097;SC=GGGACGAAGTATTTCTGCCTT;SOR=5.283;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=42;TCF=2;TCR=40;TR=42;WE=140077707;WS=140077689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr5	140167463	rs3733710	C	T	2046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=24;PP=1224;SC=GGAGCTGGAGCTGCTGCAGTT;SOR=1.164;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=45;TCR=24;TR=69;WE=140167471;WS=140167453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr5	140168070	rs2240696	A	G	2869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=52;NR=41;PP=1722;SC=GAGGGTGCGTATGTGCCGGGC;SOR=0.795;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=52;TCR=41;TR=93;WE=140168078;WS=140168060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr5	140168151	rs2240695	G	T	4196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=58;PP=2566;SC=CAGAGGGTGTGCTCTAGCGAG;SOR=1.017;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=142;TCF=84;TCR=58;TR=142;WE=140168159;WS=140168141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr5	140174622	rs9686540	G	A	3524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=70;PP=2184;SC=CGCAGCCTGGGAGGTGGGGAG;SOR=1.136;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=120;TCF=50;TCR=70;TR=120;WE=140174630;WS=140174612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr5	140174865	rs11167600	G	C	4748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=63;PP=2965;SC=TAGCATCCACGTGGAGGTGAT;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=154;TCF=91;TCR=63;TR=154;WE=140174873;WS=140174855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr5	140180737	rs3806845	C	T	3395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=78;NR=42;PP=2005;SC=TATTTTTAAACTTTGGATCAA;SOR=1.152;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=120;TCF=78;TCR=42;TR=120;WE=140180745;WS=140180727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr5	140181306	rs141677026	CTGAA	C	10815.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=95;PP=2957;SC=CTTGATTCCACTGAATATTTT;SOR=0.744;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=136;TCF=39;TCR=97;TR=132;WE=140181329;WS=140181296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr5	140181734	rs3733708	A	G	9468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=163;NR=144;PP=2965;SC=GTCATATGAAATCCAGGTAGA;SOR=0.796;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=307;TCF=163;TCR=144;TR=307;WE=140181742;WS=140181724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,345:1.00:345
chr5	140181892	rs3733707	T	C	5901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=110;PP=2965;SC=CAGTCATCGCTCTGATCAGCG;SOR=1.173;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=189;TCF=78;TCR=111;TR=188;WE=140181900;WS=140181882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr5	140182101	rs7701755	G	T	3515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=44;PP=1995;SC=GCCACGGCCAGCGTGTCCGTG;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=70;TCR=44;TR=114;WE=140182109;WS=140182091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr5	140183058	rs2240694	G	A	6719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=132;NR=100;PP=2965;SC=CAGAGGGTGTGCTCTGGAGAG;SOR=0.924;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=232;TCF=132;TCR=100;TR=232;WE=140183066;WS=140183048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr5	140186657	rs4151680	A	G	3949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=64;PP=2531;SC=GGAACCATATACACTCTTTGG;SOR=0.846;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=120;TCF=56;TCR=64;TR=120;WE=140186670;WS=140186647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr5	140186988	.	AGG	A	99.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.22;QD=33.08;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr5	140187048	rs3822349	G	C	802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.49;QD=32.11;SOR=5.058;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	140187102	rs3822347	A	G	2813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=31;PP=1776;SC=AGGTGATCGTAGACAGGCCGC;SOR=1.190;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=87;TCF=56;TCR=31;TR=86;WE=140187110;WS=140187092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr5	140187322	rs3822346	C	T	6664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=125;NR=95;PP=2965;SC=GGAAAAACCACCTGATGACGA;SOR=0.850;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=220;TCF=125;TCR=95;TR=220;WE=140187330;WS=140187312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr5	140188353	.	GC	AG	1080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.76;QD=45.03;SOR=1.051;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr5	140188356	rs144593807	A	G	1072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.31;QD=42.91;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	140188383	rs2337987	T	G	1112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=25;NR=13;PP=702;SC=AGGTGACCGCTCGCGATGCCG;SOR=1.127;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=25;TCR=13;TR=38;WE=140188391;WS=140188373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr5	140188401	rs2879086	A	G	1646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=34;NR=21;PP=902;SC=CCGGCGTGCCACCTCTGGGCA;SOR=0.859;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=34;TCR=21;TR=55;WE=140188409;WS=140188391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr5	140188575	rs2879087	G	C	3237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=52;PP=1860;SC=ATGCTGACTCGGGCTACAACG;SOR=0.796;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=111;TCF=59;TCR=52;TR=111;WE=140188583;WS=140188565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr5	140201264	rs4151682	C	T	1894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=9;PP=1263;ReadPosRankSum=-1.011;SC=CTCAGAAAGGCGATAATATAA;SOR=2.012;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=59;TCF=50;TCR=9;TR=58;WE=140201272;WS=140201254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,65:0.98:66
chr5	140201420	rs11958868	T	C	7210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=108;NR=136;PP=2965;ReadPosRankSum=1.263;SC=GGCTTCTCCTTGCCTACTGGA;SOR=0.559;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=247;TCF=109;TCR=138;TR=244;WE=140201428;WS=140201410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,276:0.99:279
chr5	140203432	rs4141841	C	T	3822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=65;PP=2370;SC=CCCGAGGCTGCCCTGGTGGAT;SOR=1.089;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=51;TCR=65;TR=116;WE=140203440;WS=140203422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr5	140209467	rs7710794	T	G	4947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=74;PP=2965;SC=TGCGCGCAGTTGACGCCGACT;SOR=0.857;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=147;TCF=73;TCR=74;TR=147;WE=140209475;WS=140209457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr5	140214381	rs10067182	G	A	3639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=2.848;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=52.73;MQRankSum=-1.376;QD=27.78;ReadPosRankSum=0.086;SOR=1.821;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,129:0.98:131
chr5	140216042	rs61730623	G	A	5072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=87;PP=2965;SC=CCCAGAGACCGAGCTGGTGGA;SOR=1.204;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=152;TCF=65;TCR=87;TR=152;WE=140216050;WS=140216032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr5	140221195	rs199713478	G	C	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=13.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.58;MQRankSum=-3.579;QD=1.07;ReadPosRankSum=-0.794;SOR=0.816;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,15:0.17:88
chr5	140222641	rs6580012	A	G	3884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=75;NR=68;PP=2385;SC=CGCAGCGAGCAAGCTGGTGCC;SOR=0.706;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=143;TCF=75;TCR=68;TR=143;WE=140222649;WS=140222631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr5	140229086	rs251354	C	G	3122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=35;PP=1904;SC=TCATTGTACACTTCTTGTGGA;SOR=1.407;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=68;TCR=35;TR=102;WE=140229094;WS=140229076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr5	140230370	rs369636	AA	CC	9706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=84;PP=2947;SC=TGGCGAGGGTAAGCAGAAGAC;SOR=0.740;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=188;TCF=95;TCR=93;TR=174;WE=140230379;WS=140230360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr5	140237387	rs251364	T	G	3289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=44;PP=1871;ReadPosRankSum=-0.944;SC=CGGTCGGTGGTTGCGGGTCAC;SOR=0.795;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=63;TCR=45;TR=106;WE=140237395;WS=140237377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,122:0.98:124
chr5	140237548	rs630162	A	G	8711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=164;NR=137;PP=2965;SC=TCTGGATGAGACTGACTCGCC;SOR=0.802;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=301;TCF=164;TCR=137;TR=301;WE=140237556;WS=140237538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,327:1.00:327
chr5	140242451	rs11321479	GC	G	2060.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=16;NR=15;PP=1295;SC=ATGTGACGCTGCCAGGTATTA;SOR=1.412;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=35;TCF=20;TCR=15;TR=31;WE=140242459;WS=140242441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr5	140242479	rs251369	T	A	1951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=40;NR=23;PP=1177;SC=AACGACAACTTTGTCTGCGCT;SOR=1.276;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=40;TCR=23;TR=63;WE=140242487;WS=140242469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr5	140256920	rs115718636	G	C	4833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=61;PP=2965;SC=CGCACATCCCGTTCCACGTGG;SOR=1.220;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=155;TCF=94;TCR=61;TR=155;WE=140256928;WS=140256910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr5	140262492	rs11744560	A	T	6842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=106;NR=109;PP=2965;SC=TATTACTGACAGCCAGTGATG;SOR=0.840;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=215;TCF=106;TCR=109;TR=215;WE=140262500;WS=140262482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr5	140263290	rs251380	T	G	3692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=65;PP=2169;SC=CGGTGTCTGCTCAGGACGCGG;SOR=1.066;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=122;TCF=56;TCR=66;TR=120;WE=140263298;WS=140263280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr5	140307284	rs155361	G	A	6461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=115;PP=2965;ReadPosRankSum=0.244;SC=GGGAAGTCCAGTACTCCCTAA;SOR=0.971;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=219;TCF=103;TCR=116;TR=216;WE=140307292;WS=140307274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,242:0.99:244
chr5	140307969	rs246074	C	G	3736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=52;PP=2302;SC=CTCTAGCTTGCTGGCAGTGGA;SOR=0.804;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=64;TCR=52;TR=116;WE=140307977;WS=140307955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr5	140309016	rs155360	C	T	1045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=28;PP=852;SC=ATCAATTGAACTAAACACTCC;SOR=3.193;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=33;WE=140309024;WS=140309006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	140346468	rs155364	T	A	3660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=64;NR=57;PP=2046;SC=TACCTGGCCCTGCGGCCTCCC;SOR=0.753;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=121;TCF=64;TCR=57;TR=121;WE=140346476;WS=140346458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr5	140347398	rs12153295	C	T	9010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=159;NR=128;PP=2965;SC=CAGGTCACTGCAAGGTGCTGG;SOR=0.830;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=287;TCF=159;TCR=128;TR=287;WE=140347406;WS=140347376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,325:1.00:325
chr5	140482483	rs31848	G	A	1094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=33.17;SOR=4.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	140482693	.	C	T	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.863;ClippingRankSum=0.000;DP=208;ExcessHet=3.0103;FS=4.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.42;ReadPosRankSum=-0.860;SOR=0.390;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:165,42:0.20:207
chr5	140517174	rs400562	T	C	546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=5;PP=293;SC=CAGGGCGGCCTCGGTCGGTCG;SOR=1.292;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=11;TCR=5;TR=16;WE=140517182;WS=140517164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	140530585	.	A	C	802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.108;ClippingRankSum=0.000;DP=341;ExcessHet=3.0103;FS=1.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.35;ReadPosRankSum=-2.935;SOR=0.824;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:272,69:0.20:341
chr5	140561983	rs2204704	A	G	360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=1;PP=302;SC=CCTGGAAGCAAAAGAATAGCT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=140561991;WS=140561980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	140567608	rs11167743	C	T	6338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=129;NR=89;PP=2965;SC=AATGACAATGCCCCACAGTTT;SOR=0.978;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=219;TCF=130;TCR=89;TR=218;WE=140567616;WS=140567598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr5	140568034	rs33974901	C	CA	9337.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=97;PP=2957;SC=AATGGAAAGACATTTGCTATG;SOR=0.845;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=129;TCF=32;TCR=97;TR=127;WE=140568042;WS=140568024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr5	140683265	rs11952797	G	A	10163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=373;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.569;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=151;NR=194;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.636;SC=GACCCACTTGGGCGTATGTCT;SOR=0.636;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=347;TCF=152;TCR=195;TR=345;WE=140683273;WS=140683255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,372:1.00:373
chr5	140710705	rs2472647	G	A	3898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=59;PP=1991;SC=AGGTACCAGAGTCTCATTGCC;SOR=0.821;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=121;TCF=62;TCR=59;TR=121;WE=140710713;WS=140710695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr5	140712299	rs62378404	A	T	1157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=8;PP=871;SC=CCCTCCGCCAAACCCAACGAT;SOR=2.726;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=33;TCR=8;TR=41;WE=140712307;WS=140712289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr5	140750044	rs6860609	T	C	4820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=92;NR=71;PP=2965;SC=TTAGACCAGGTTCTCTCCGAA;SOR=0.954;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=163;TCF=92;TCR=71;TR=163;WE=140750052;WS=140750034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr5	140767491	rs145222727	CTGCCAG	C	448.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.86;QD=40.79;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	140774288	rs4912749	T	C	1922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=9;PP=1441;SC=TGGACAGAGATGCGCTCAAGC;SOR=3.407;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=48;TCR=9;TR=57;WE=140774296;WS=140774287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr5	140797951	.	C	T	1152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.205;ClippingRankSum=0.000;DP=283;ExcessHet=3.0103;FS=0.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.09;ReadPosRankSum=0.378;SOR=0.648;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:207,75:0.27:282
chr5	140800862	.	C	T	2034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.548;ClippingRankSum=0.000;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.497;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=44;PP=1220;ReadPosRankSum=-1.598;SC=TTCCTGGGGACGCTGCGGGGG;SOR=0.649;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=197;TCF=108;TCR=89;TR=96;WE=140800870;WS=140800852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,103:0.48:215
chr5	140803317	.	TG	T	75.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=0.000;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=23.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQRankSum=2.135;QD=1.58;ReadPosRankSum=-0.609;SOR=1.133;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,9:0.19:48
chr5	140811189	.	C	T	1500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=0.000;DP=390;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.86;ReadPosRankSum=-0.360;SOR=0.699;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:288,101:0.26:389
chr5	140812775	.	CT	C	31.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.300;ClippingRankSum=0.000;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=1.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.41;ReadPosRankSum=0.845;SOR=0.908;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,13:0.17:78
chr5	141016276	rs32954	T	C	12203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=459;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=214;NR=200;PP=2965;SC=GTGTCCCAACTCCTCATGCAT;SOR=0.706;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=414;TCF=214;TCR=200;TR=414;WE=141016284;WS=141016266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,457:1.00:457
chr5	141025162	rs456998	G	T	243.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=199;SC=TAATAAAAATGTACTGAGGAC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=141025170;WS=141025155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	141025581	rs2052455	A	G	397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=2;PP=240;SC=TCCTCCCACCATCAGAAAGAG;SOR=1.911;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=141025589;WS=141025579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	141025929	rs7711960	A	G	586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=17;PP=489;SC=AAGTCCAGAGAGGTTAAGTCA;SOR=2.531;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=141025937;WS=141025919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	141026094	rs11167754	G	A	498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=2;PP=346;SC=ACCCTCAATGGCTCCAAGATC;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=141026102;WS=141026084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	141027226	rs58908491	G	A	1946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=45;PP=1242;SC=AAAGGCCCTCGTGTGCAGAGC;SOR=2.139;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=15;TCR=45;TR=60;WE=141027234;WS=141027216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr5	141027399	rs468968	T	C	2117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=28;PP=1185;SC=AGAACCAGAGTGCATGTATGT;SOR=1.068;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=46;TCR=28;TR=74;WE=141027407;WS=141027389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr5	141027462	rs3763121	G	A	3669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=73;NR=54;PP=2124;SC=CACTGTCATGGGGATCAAGAA;SOR=0.783;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=127;TCF=73;TCR=54;TR=127;WE=141027470;WS=141027452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr5	141034123	rs6580194	T	A	782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=20;PP=515;SC=CATGTATGATTCTGGAACAAC;SOR=2.468;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=26;WE=141034131;WS=141034113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr5	141034183	rs28655920	A	G	208.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=140;SC=GGGTTAAGTAAGTTGCCCAGC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=141034191;WS=141034173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	141036337	rs7703648	A	G	5336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=105;PP=2965;SC=AGAGCAGGGAAGCTGAGCAGG;SOR=1.265;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=174;TCF=69;TCR=105;TR=174;WE=141036345;WS=141036327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr5	141039160	rs2306338	G	T	1110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=28;PP=924;SC=AAGAACCAAGGGGGTGAGGAT;SOR=1.552;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=41;WE=141039168;WS=141039150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr5	141041435	rs3749759	G	A	545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=11;PP=414;SC=GGATTTTTAGGCACAAATGCA;SOR=1.493;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=6;TCR=11;TR=17;WE=141041443;WS=141041425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	141049407	rs3763120	G	A	6674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.115;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=123;NR=100;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.598;SC=CAGGGAGGAGGATGGGACCAA;SOR=0.313;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=225;TCF=123;TCR=102;TR=223;WE=141049415;WS=141049397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,251:1.00:252
chr5	141051236	rs12514851	C	T	4871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=105;NR=59;PP=2965;SC=GGCCAGGGGTCGCATCTGGAT;SOR=1.251;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=164;TCF=105;TCR=59;TR=164;WE=141051244;WS=141051226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr5	141051925	rs3214933	CT	C	1686.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=34;PP=1573;SC=TCCCATCCCCCTGGCTCTTCC;SOR=3.109;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=35;WE=141051933;WS=141051915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr5	141052870	rs440279	G	C	900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=7;PP=692;SC=TCACTGCCCCGCCCACACACA;SOR=1.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=29;WE=141052878;WS=141052860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr5	141059649	rs417503	A	G	5567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.115;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=91;PP=2965;ReadPosRankSum=0.595;SC=GGAGAGGAGGAGGCCTTGGGC;SOR=0.316;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=190;TCF=99;TCR=91;TR=189;WE=141059657;WS=141059639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,208:1.00:209
chr5	141059868	rs11167756	T	C	7793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=135;NR=130;PP=2965;ReadPosRankSum=0.056;SC=TGCCTGTCTGTAGCAGGCGTA;SOR=0.253;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=266;TCF=135;TCR=131;TR=265;WE=141059876;WS=141059858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,280:1.00:281
chr5	141235916	rs145694332	TGGGAGGTTAGACAAGGGCCC	T	780.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=2927;SC=ACCTAGGGCCTGGGAGGTTAG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=11;WE=141235943;WS=141235906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	141257977	.	A	AGGCGGC	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=2;PP=135;SC=CGAGTGTGTGAGGCGGCGGCG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=2;WE=141257985;WS=141257967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	141304315	.	AT	A	60.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.23;MQRankSum=1.734;QD=2.02;ReadPosRankSum=0.306;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,8:0.27:30
chr5	141325249	rs105633	T	C	4953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=96;PP=2678;SC=GGAAGGTCCTTGGCTCCTCCG;SOR=1.014;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=173;TCF=77;TCR=96;TR=173;WE=141325257;WS=141325239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr5	141337225	rs164077	A	G	6664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=111;NR=116;PP=2965;SC=CCTGGAAGGCAGCCCCAGCTT;SOR=0.821;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=227;TCF=111;TCR=116;TR=227;WE=141337233;WS=141337215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr5	141354220	rs187542	G	C	82.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=0;PP=61;SC=TGGTGGCTACGAAGTTAAAAT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=141354228;WS=141354210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	141357719	rs66768569	TTGTA	T	1087.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=0;PP=1001;SC=TTGTACTGTTTTGTATGTAGC;SOR=5.058;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=19;WE=141357730;WS=141357709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	141364511	rs252099	A	G	8754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=153;NR=149;PP=2965;SC=ATGTATACACAGAATTCCTCA;SOR=0.723;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=302;TCF=153;TCR=149;TR=302;WE=141364519;WS=141364501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,339:1.00:339
chr5	141364637	rs252100	C	T	1409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=38;PP=1026;SC=AAGGAATTTTCATATTATTTT;SOR=2.701;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=10;TCR=38;TR=48;WE=141364645;WS=141364627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr5	141367202	rs374840	GA	TT	6386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=53;PP=2947;SC=GATGTACAAAGATGTTATAAG;SOR=0.809;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=122;TCF=69;TCR=53;TR=120;WE=141367211;WS=141367192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr5	141371557	rs143763915	CTTT	C	182.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5009;FS=0.000;HP=19;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=0;NR=8;PP=91;SC=AGTCAGCAGTCTTTTTTTTTT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=8;WE=141371567;WS=141371547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr5	141382584	rs252114	T	C	1029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=3;PP=792;SC=GGATGAAAGCTGGATCTACTC;SOR=4.174;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=32;WE=141382592;WS=141382574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr5	141511525	.	TA	T	144.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.046;ClippingRankSum=0.000;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=1.678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.89;ReadPosRankSum=1.173;SOR=0.309;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,13:0.26:50
chr5	141975067	rs34003	A	C	4088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=61;PP=2358;SC=GATAAAACCAAAAGAGAGTAG;SOR=0.820;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=125;TCF=64;TCR=61;TR=125;WE=141975075;WS=141975057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr5	141980820	rs34009	G	T	397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=231;SC=CTGCACAGGGGTGCCTTTTAA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=141980828;WS=141980810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	142287159	rs36220244	AAGGGT	A	1009.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=6;PP=741;SC=AACATAGTTTAAGGGTAGGGT;SOR=1.802;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=20;TCF=12;TCR=8;TR=14;WE=142287171;WS=142287149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr5	142287517	rs5871829	T	TC	112	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=2;PP=51;SC=ATATAGTAGTTCAGGAAGCCT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=142287525;WS=142287507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	142311442	rs712176	A	G	1122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=6;PP=780;SC=AATTTGGGCCATCCTTTCTGA;SOR=3.312;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=33;TCR=6;TR=39;WE=142311450;WS=142311432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr5	142311509	rs712177	T	C	4743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=56;PP=2778;SC=GTTGTTAACCTTAGCAGCCAC;SOR=1.172;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=158;TCF=101;TCR=57;TR=156;WE=142311517;WS=142311499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr5	142393562	rs3822397	G	A	5953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=117;NR=75;PP=2965;SC=ACTAGGGAAAGTGAGGAAGAT;SOR=1.067;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=192;TCF=117;TCR=75;TR=192;WE=142393570;WS=142393552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr5	142416741	rs192194	T	C	3705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=42;PP=2186;SC=AACTTGACTGTCCTTCTCTTG;SOR=1.352;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=122;TCF=80;TCR=42;TR=122;WE=142416749;WS=142416731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr5	142421415	rs2270068	T	G	4975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=89;PP=2965;SC=GAATTGTGGGTGTCAACTCCA;SOR=0.861;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=173;TCF=84;TCR=89;TR=173;WE=142421423;WS=142421405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr5	142593652	rs258819	C	T	1296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=17;NR=24;PP=673;SC=TCTTCGATAACGGTGAGTTTC;SOR=1.251;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=48;TCF=17;TCR=31;TR=41;WE=142593660;WS=142593642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr5	142595995	rs258821	C	T	388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=7;PP=227;SC=GGGCCCAGTTCCTGCCCCTCT;SOR=1.329;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=11;WE=142596003;WS=142595985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	142596013	rs258822	C	T	204.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=136;SC=TCTGACCTCACGCCCTCACTT;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=142596021;WS=142596003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	142601811	rs147866000	TACAC	T	62.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.456;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=2;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=84;ReadPosRankSum=-0.891;SC=GCTTCCTTCATACACACACAC;SOR=0.105;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=3;WE=142601822;WS=142601801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr5	145176221	rs338898	C	T	1241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=32;PP=895;SC=AAAATAATATCCTTAATAATT;SOR=2.780;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=8;TCR=32;TR=40;WE=145176229;WS=145176211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr5	145198805	rs624380	T	C	2510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=28;PP=1443;SC=GAATCTCTCTTGGGTTGAAAC;SOR=1.356;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=55;TCR=28;TR=83;WE=145198813;WS=145198795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr5	145199430	rs11293460	AG	A	2029.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=10;PP=1664;SC=CCTTTACATCAGAAAATGCTG;SOR=2.670;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=39;WE=145199438;WS=145199420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr5	145214538	rs12658784	G	A	127.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=97;SC=AGGTGTGAACGTGATGCCAAG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=145214546;WS=145214532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr5	145246085	rs2569006	T	G	2245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.749;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=23;PP=1559;ReadPosRankSum=1.283;SC=GGTTTTGGGGTAATGTGCTTT;SOR=1.759;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=54;TCR=23;TR=76;WE=145246093;WS=145246075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,81:0.98:83
chr5	145252574	rs10037373	C	T	681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=19;PP=496;SC=TCCGTGCAGCCGGTGAAACTT;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=22;WE=145252582;WS=145252564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	145427527	rs1859895	T	A	3070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=66;PP=1879;SC=AAACATCCCATCCAGAGACAA;SOR=1.718;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=101;TCF=35;TCR=66;TR=100;WE=145427535;WS=145427517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr5	145439647	rs2962525	T	C	8261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=154;NR=138;PP=2965;SC=CAGTGAGGCCTGGATCCACTC;SOR=0.725;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=292;TCF=154;TCR=138;TR=292;WE=145439655;WS=145439637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,315:1.00:315
chr5	145512367	rs11321164	TA	T	164.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.59;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	145515379	rs2963919	C	T	104.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=105;SC=AATTTTAGAGCGGTGAAAACT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=145515387;WS=145515369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	145522912	rs2962504	A	G	4606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=64;PP=2715;SC=ATTTAAATACATAAATCAAAT;SOR=1.043;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=160;TCF=96;TCR=64;TR=159;WE=145522920;WS=145522902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr5	145557046	.	AATAT	A	95.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=63.51;QD=31.75;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr5	145647151	rs2963925	C	T	286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=238;SC=AAAAAGTATTCTAAGCATTTC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=145647159;WS=145647141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	145838440	rs11743333	G	A	6364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=130;NR=97;PP=2965;SC=TTTTGCTTCCGCTGCAGGTTT;SOR=1.056;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=227;TCF=130;TCR=97;TR=227;WE=145838448;WS=145838430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr5	145838635	.	TCAGGCCCAGGCCCAGGCC	T	1178.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=10;NR=16;PP=2109;SC=AGGCTCAGGCTCAGGCCCAGG;SOR=0.760;Source=Platypus;TCR=30;TR=26;WE=145838660;WS=145838625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr5	145850459	rs11463725	G	GT	116.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=111;SC=TCTTAATTCAGTTTTTTCTTT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=5;WE=145850467;WS=145850449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr5	145886836	rs79727797	G	A	543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=18;PP=451;SC=TTAAAGCAAAGCATTGATATG;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=145886844;WS=145886826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	145890028	rs4705103	A	G	2911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=29;PP=1710;SC=TCCAAGAATCAGATCAGCACC;SOR=1.631;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=97;TCF=68;TCR=29;TR=95;WE=145890036;WS=145890018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr5	146030055	rs6866598	C	T	4532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=64;PP=2652;SC=AGCCCACTCGCACCTGAATAC;SOR=1.070;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=159;TCF=95;TCR=64;TR=159;WE=146030063;WS=146030045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr5	146434047	rs5872003	TA	T	1180.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=4;PP=666;SC=TGTCCAACTGTAAAAAAAAAG;SOR=3.516;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=38;TCR=5;TR=34;WE=146434068;WS=146434037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr5	146434060	rs2400241	C	T	1789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=8;PP=1346;SC=AAAAAAAGTCCATGAGATATC;SOR=3.461;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=47;TCR=8;TR=55;WE=146434068;WS=146434037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr5	146435163	rs11958187	G	A	517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=3;PP=387;SC=AGCAGAACCCGTGGGAAGTCA;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=146435171;WS=146435153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	146657584	rs6580458	T	C	336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=0;PP=278;SC=TCTGAGATCATGTTTTAGACA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=146657592;WS=146657574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	146657838	rs6580459	G	A	3583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=77;PP=2241;SC=TGCTGGGACCGCAAGGAAAGA;SOR=1.802;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=114;TCF=37;TCR=77;TR=114;WE=146657846;WS=146657828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr5	146728149	rs10072514	C	G	1445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=9;PP=963;SC=CATGAGCATACATAATCTTGT;SOR=2.256;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=35;TCR=9;TR=44;WE=146728157;WS=146728139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr5	146971253	rs7449194	C	T	3244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=69;PP=2024;SC=GGTTACTCTGCAAAACAGAGG;SOR=1.713;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=34;TCR=69;TR=103;WE=146971261;WS=146971243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr5	146981164	rs111740872	TCAAAACAAAACAAAA	T	207.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=1117;SC=AGACTCTGTCTCAAAACAAAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=4;WE=146981186;WS=146981162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr5	147019416	.	G	C	760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=22;PP=649;SC=CTTTTTACAAGAAGTAAAAGG;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=147019424;WS=147019406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr5	147444785	rs2287772	A	G	323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=271;SC=GTGTTCAAAAACCATTTGCGG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=147444793;WS=147444779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	147444989	rs9325061	G	A	4053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=47;NR=48;PP=1384;SC=CCAAAGAAAAGTGGTTTGTGG;SOR=1.069;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=47;TCR=48;TR=95;WE=147444997;WS=147444979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr5	147445023	rs1609851	C	G	2876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=31;PP=953;SC=GTTAATAATACAAACATATTA;SOR=1.270;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=25;TCR=31;TR=56;WE=147445031;WS=147445013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr5	147445108	.	TCACACA	T	170	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;FR=1.0000;HP=2;HapScore=4;MGOF=29;MMLQ=24;MQ=61.78;NF=0;NR=3;PP=170;QD=57.6666666667;SC=AGCCTCTCTCTCACACACACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=3;WE=147445132;WS=147445098;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,3:0.60:5
chr5	147449855	rs1423001	A	G	832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=3;PP=627;SC=ATGTACTTTTAGCTAACACAA;SOR=2.753;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=147449863;WS=147449845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr5	147450085	rs3752676	C	A	1453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=33;PP=922;SC=TAAATGTATTCTTTTTCTTTC;SOR=1.697;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=18;TCR=33;TR=51;WE=147450093;WS=147450075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr5	147468234	rs7711953	C	G	3313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=65;PP=1888;SC=AGTAGGTGCTCTCCTCTTCCT;SOR=1.441;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=39;TCR=65;TR=104;WE=147468242;WS=147468224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr5	147468614	rs10038561	A	G	5188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.60;SOR=1.119;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr5	147468971	rs4529181	G	C	1208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=28;NR=11;PP=935;SC=CAATGTCAGAGGGACTGAGTT;SOR=1.666;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=28;TCR=11;TR=39;WE=147468979;WS=147468961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr5	147475386	rs6892205	A	G	1748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=29;NR=28;PP=895;SC=TCCAGCAAGCAGCGTTTTTCA;SOR=0.844;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=58;TCF=29;TCR=29;TR=57;WE=147475394;WS=147475376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr5	147475488	rs11958432	A	G	1107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.305;NF=16;NR=19;PP=561;ReadPosRankSum=0.552;SC=AGTTTGATCAATCTAGTTACA;SOR=0.330;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=36;TCF=16;TCR=20;TR=35;WE=147475496;WS=147475478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,43:0.98:44
chr5	147475513	rs76839946	G	GT	1257.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.30;MQRankSum=0.000;QD=35.94;ReadPosRankSum=1.437;SOR=0.272;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,34:0.97:35
chr5	147475590	rs11948406	G	A	196.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=66;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=0;NR=6;PP=131;SC=CACACTACTAGTAGGTTTGCT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=147475598;WS=147475580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr5	147475609	rs62388363	A	G	196.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=59;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=109;SC=CTGGAAACTAATTTCTAGTTA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=147475617;WS=147475599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr5	147475627	rs62388364	G	A	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=46;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=3;PP=47;SC=TTATTATTTTGTGAAACTTAG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=147475635;WS=147475617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr5	147477351	rs140268040	T	TTTTAA	861.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=754;SC=AATTTCTCTTTTTTCTTTGTA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=13;WE=147477359;WS=147477341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	147477551	rs34482796	C	T	7441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=115;NR=120;PP=2965;SC=ATGTGTCAAGCCTACTTGTGA;SOR=0.881;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=235;TCF=115;TCR=120;TR=235;WE=147477559;WS=147477541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,276:1.00:276
chr5	147478785	rs1422991	C	T	5112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=95;NR=73;PP=2965;SC=CTTCTTTTTCCCTCTTATTCA;SOR=0.831;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=169;TCF=96;TCR=73;TR=168;WE=147478793;WS=147478775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr5	147478981	rs11168021	C	A	614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=20;PP=512;SC=CCCAGAATATCTTAACTCTTC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=147478989;WS=147478971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	147479991	rs2303061	C	T	7437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=84;NR=65;PP=2462;SC=AAATATATGGCCAACTTACTT;SOR=0.767;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=149;TCF=84;TCR=65;TR=149;WE=147479999;WS=147479981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr5	147480007	rs2303062	A	G	8458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=78;PP=2901;SC=TACTTCTTCTATCTCGGCAGG;SOR=0.725;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=172;TCF=94;TCR=78;TR=172;WE=147480015;WS=147479997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr5	147480027	rs2303063	G	A	7916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=93;NR=81;PP=2951;SC=GAGCTTTGCAGTGAATATCGA;SOR=0.714;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=174;TCF=93;TCR=81;TR=174;WE=147480035;WS=147480017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr5	147480112	rs2303065	T	C	3682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=72;PP=1956;SC=GGAAAGTGCATGGCAACACCT;SOR=0.991;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=62;TCR=72;TR=134;WE=147480120;WS=147480102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr5	147480868	rs2303066	G	A	786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=18;NR=4;PP=377;SC=CACTTCTAATGTGGCGATTCT;SOR=1.688;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=22;WE=147480876;WS=147480858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr5	147480955	rs2303067	A	G	2786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=54;NR=32;PP=1549;SC=GAAGGAAGGTAAATCAAGAAA;SOR=1.081;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=54;TCR=32;TR=86;WE=147480963;WS=147480945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr5	147481018	rs2303068	G	A	4072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=72;NR=63;PP=2173;SC=ATATCCTCCAGCAACTCAGAG;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=136;TCF=72;TCR=64;TR=135;WE=147481026;WS=147481008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr5	147481430	rs6896303	A	G	6411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=111;NR=103;PP=2965;SC=GCCCAGATGGAAAAATGCATG;SOR=0.754;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=214;TCF=111;TCR=103;TR=214;WE=147481438;WS=147481420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr5	147484465	rs34473560	GA	G	787.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5042;FS=2.581;HP=17;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.390;NF=12;NR=7;PP=228;ReadPosRankSum=0.379;SC=TCTCAAAAAAGAAAAAAAAAA;SOR=0.299;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=28;TCF=19;TCR=9;TR=19;WE=147484473;WS=147484455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,35:0.92:38
chr5	147486677	rs880687	C	A	6333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=118;NR=88;PP=2965;SC=CTGTCCGTGGCCCAGATGGCA;SOR=0.839;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=206;TCF=118;TCR=88;TR=206;WE=147486685;WS=147486667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr5	147486818	rs3036740	CGT	C	5248.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=70;PP=2950;SC=GAGTATAGACCGTGAGTTATA;SOR=1.670;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=2;TCR=73;TR=72;WE=147486827;WS=147486808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr5	147488367	rs2303071	C	T	5086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=71;PP=2965;SC=AAGGGAAAGTCGAGGCTGAAA;SOR=1.002;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=168;TCF=97;TCR=71;TR=166;WE=147488375;WS=147488343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr5	147491532	rs2287768	T	C	657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=18;PP=503;SC=AGGGGTGACATTGGAAGTTTT;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=147491540;WS=147491522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	147493871	rs3815735	G	A	1082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=28;NR=11;PP=670;SC=TAGGAACCCAGTAAACTAATT;SOR=1.493;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=40;TCF=28;TCR=12;TR=39;WE=147493879;WS=147493861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr5	147497871	rs6891892	T	C	379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=2;PP=262;SC=TGAGCCACCGTACCCGGCAAT;SOR=2.147;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=12;WE=147497879;WS=147497861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	147497932	rs3777135	T	C	1608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=38;NR=17;PP=991;SC=CTCAGACTGTTAAAACAATTT;SOR=1.316;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=38;TCR=17;TR=55;WE=147497940;WS=147497922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr5	147498019	rs3777134	G	A	4211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=80;NR=64;PP=2580;SC=GCTGAGTATCGGGAACAAATG;SOR=0.785;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=145;TCF=81;TCR=64;TR=144;WE=147498027;WS=147498009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr5	147498523	rs3764926	T	C	2664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=17;PP=1476;SC=GTTAACAAGATGAATATTCAC;SOR=2.204;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=62;TCR=17;TR=79;WE=147498531;WS=147498513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr5	147498652	rs9325073	C	G	6764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=101;NR=110;PP=2965;SC=TGGCAAGAATCGTCTTTCTGT;SOR=0.797;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=211;TCF=101;TCR=110;TR=211;WE=147498660;WS=147498642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr5	147498669	rs9325074	G	A	9834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.91;SOR=0.886;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr5	147498672	rs12518996	G	A	9826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.49;SOR=0.961;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr5	147498763	rs9325075	C	A	1605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=44;PP=1213;SC=ATCAGTGACTCTCACTGATAA;SOR=3.098;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=9;TCR=44;TR=53;WE=147498771;WS=147498753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr5	147499616	rs17704908	C	T	4838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=57;PP=2673;SC=ATGGAAAACTCATCTGCACTC;SOR=1.116;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=93;TCR=57;TR=150;WE=147499624;WS=147499606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr5	147499670	rs33920397	C	T	6082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=88;PP=2965;SC=AGACACATGGCAATAAGTGTA;SOR=0.702;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=184;TCF=96;TCR=88;TR=184;WE=147499678;WS=147499660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr5	147504305	rs3036731	C	CT	303.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5022;FS=0.000;HP=10;HapScore=4;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=6;PP=174;ReadPosRankSum=-0.350;SC=ATTACCCTATCTTTTTTTTTA;SOR=0.352;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=19;TCF=10;TCR=9;TR=11;WE=147504323;WS=147504295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,15:0.79:19
chr5	147504315	rs2052537	A	T	968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=4;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=19;NR=12;PP=567;SC=CTTTTTTTTTAATTATTCTGC;SOR=2.670;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=20;TCR=13;TR=31;WE=147504323;WS=147504295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr5	147504557	rs2052536	T	G	212.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=173;SC=ACAAGATTTTTGGGGGTTTGG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=147504565;WS=147504547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	147505116	rs3764930	G	A	3639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=48;PP=2320;SC=AGAATGAAGCGGAGGATGCAA;SOR=0.983;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=68;TCR=48;TR=116;WE=147505124;WS=147505106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr5	147505227	rs2112767	G	A	6232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=111;NR=91;PP=2965;SC=CAAGTTTGAAGAAATCACTAA;SOR=0.849;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=203;TCF=112;TCR=91;TR=202;WE=147505235;WS=147505217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr5	147510776	rs6895434	T	C	2620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=22;PP=1702;SC=CCACCCCTCTTCTTGAATGCC;SOR=1.688;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=58;TCR=22;TR=80;WE=147510784;WS=147510766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr5	147510866	rs2400478	T	C	8204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=149;NR=114;PP=2965;SC=CCAGGATAGGTTATCTTTGTC;SOR=0.873;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=263;TCF=149;TCR=114;TR=263;WE=147510874;WS=147510856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,299:1.00:299
chr5	147549163	rs4269285	T	C	2525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=19;PP=1782;SC=ATACAATGGGTGGAGTAGAGA;SOR=2.414;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=63;TCR=19;TR=82;WE=147549171;WS=147549153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr5	147554889	rs10052031	A	C	809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=7;PP=473;SC=TTACTAAATGAAATGTTTATT;SOR=1.536;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=24;WE=147554897;WS=147554879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr5	147554997	rs147123556	TTTTTTCC	T	3397.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.53;QD=44.13;SOR=0.828;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr5	147555029	rs10074328	C	T	1921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=33;NR=31;PP=1050;SC=CTCCCTCTTGCGCTTTTTACA;SOR=0.836;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=33;TCR=31;TR=64;WE=147555037;WS=147555019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr5	147585797	.	C	CTCATT	1118.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=865;SC=TTTAAAAGAACCTAACCACAC;SOR=4.332;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=15;WE=147585814;WS=147585787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr5	147585799	.	TAAC	T	1445.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.81;SOR=4.332;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	147585805	.	C	T	1129.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.84;SOR=4.332;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr5	147585806	.	AC	A	1120.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.32;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=15;PP=554;SC=ACCTAACCACACATTCTCATA;SOR=4.332;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=147585814;WS=147585787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr5	147593497	rs12186491	C	A	7012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=124;NR=111;PP=2965;SC=GTTCCAGGACCCCAAGGTCTA;SOR=0.709;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=235;TCF=124;TCR=111;TR=235;WE=147593505;WS=147593487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr5	147795697	.	A	AT	185.52	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.418;ClippingRankSum=0.000;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.25;MQRankSum=0.612;QD=13.25;ReadPosRankSum=0.275;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,12:0.86:14
chr5	147889623	rs3734119	A	G	1419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=13;NR=35;PP=925;SC=TGAGGAAAGGAGGTAAAAAGG;SOR=2.259;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=49;TCF=14;TCR=35;TR=48;WE=147889631;WS=147889613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr5	147902703	rs7725785	C	A	3938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=45;PP=2186;SC=ATTTAGGAACCCCATGCAAAG;SOR=1.308;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=128;TCF=83;TCR=45;TR=128;WE=147902711;WS=147902693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr5	147928225	rs2278392	C	T	4925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=105;NR=55;PP=2817;SC=ATTGTTCTGTCCTTACCTATC;SOR=1.230;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=160;TCF=105;TCR=55;TR=160;WE=147928233;WS=147928215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr5	148016636	rs202064836	G	A	4357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=63;NR=78;PP=2496;SC=TAAAATGGGGGAAGTAAAAAG;SOR=1.096;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=142;TCF=64;TCR=78;TR=141;WE=148016644;WS=148016626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr5	148206375	rs1801704	C	T	390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=1;PP=309;SC=CCAGTGCGCTCACCTGCCAGA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=148206383;WS=148206365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	148206440	rs1042713	G	A	1574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=15;PP=1166;SC=GGCACCCAATGGAAGCCATGC;SOR=2.107;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=42;TCR=15;TR=57;WE=148206448;WS=148206430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr5	148206473	rs1042714	G	C	3097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=40;PP=2040;SC=CGTCACGCAGGAAAGGGACGA;SOR=1.336;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=68;TCR=40;TR=108;WE=148206481;WS=148206463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr5	148407708	rs1432794	A	C	3738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=65;PP=2576;SC=GGAAGCAGAGACGGGCATGGG;SOR=0.820;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=61;TCR=65;TR=126;WE=148407716;WS=148407698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr5	148521799	rs11744532	T	C	507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=14;PP=389;SC=CCCCAGGCTCTTTTTTGGTGC;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=148521807;WS=148521789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	148578566	rs2068262	C	T	2230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=15;PP=1551;SC=TTTTTATTATCCTTTTCATTA;SOR=2.463;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=55;TCR=15;TR=70;WE=148578574;WS=148578556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr5	148578636	rs13362048	T	C	5231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=66;PP=2965;SC=AGCTCATCCCTGCCTCCTGCT;SOR=1.234;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=172;TCF=106;TCR=66;TR=172;WE=148578644;WS=148578626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr5	148578690	rs143710964	G	A	6914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=118;NR=115;PP=2965;SC=GCAAGTGTACGTTAAGACTCC;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=233;TCF=118;TCR=115;TR=233;WE=148578698;WS=148578680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr5	148580025	rs6580602	G	A	1236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=30;PP=871;SC=CCCTGTCCATGGGTGTGATCT;SOR=3.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=36;WE=148580033;WS=148580015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr5	148586451	rs5872113	A	AG	991.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=7;PP=422;SC=TTCCAGTGTCAGGTGGGAGCA;SOR=1.863;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=18;TCF=10;TCR=8;TR=17;WE=148586459;WS=148586441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr5	148622082	rs61733085	C	A	6787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.95;SOR=0.789;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr5	148622085	rs61744926	G	A	6755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.45;SOR=0.803;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr5	148625972	rs77462377	T	A	1656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=1.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.81;ReadPosRankSum=0.876;SOR=0.625;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,80:0.86:93
chr5	148679301	rs171286	C	G	4678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=97;PP=2905;SC=CGCCCCACCCCCACCCCCAGG;SOR=1.121;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=164;TCF=66;TCR=98;TR=163;WE=148679309;WS=148679291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr5	148682188	rs352341	G	C	2294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=52;PP=1533;SC=CTGCAAGCCTGTCACCCTCCC;SOR=1.554;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=28;TCR=52;TR=80;WE=148682196;WS=148682178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr5	148709344	rs138597939	A	C	4036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=68;PP=2462;ReadPosRankSum=1.284;SC=AGCTGATAGCACTGAGACAGG;SOR=0.251;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=140;TCF=71;TCR=69;TR=139;WE=148709352;WS=148709334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,151:0.99:152
chr5	148989122	rs2400891	C	T	3590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=63;PP=2006;SC=TAACATATTTCTGGAATTCCA;SOR=0.994;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=116;TCF=53;TCR=63;TR=116;WE=148989130;WS=148989112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr5	148989259	rs200166388	G	A	523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=12;PP=294;SC=AGGCGGTGGTGTGAGTAGAAC;SOR=1.721;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=18;WE=148989267;WS=148989249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	148989312	rs7443869	A	G	505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.91;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	148989320	rs7447560	T	C	470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.08;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	148997686	rs6579750	A	G	9480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=370;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=190;NR=148;PP=2965;SC=CGTGACATCCACTTTCCTGAG;SOR=0.945;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=338;TCF=190;TCR=148;TR=338;WE=148997694;WS=148997676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,370:1.00:370
chr5	148999881	rs11409449	G	GC	1774.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=11;PP=1662;SC=GCCATGACAGGCATGATTGGA;SOR=2.400;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=26;TCR=11;TR=37;WE=148999889;WS=148999871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr5	149000039	rs7733761	C	T	6406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=112;NR=108;PP=2965;SC=TGAGTGGAACCTTTCCTTTCT;SOR=0.769;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=220;TCF=112;TCR=108;TR=220;WE=149000047;WS=149000029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr5	149001283	rs78820823	T	C	2427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=25;PP=1480;SC=CCCACGCTCATGTCTCCCCAC;SOR=1.775;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=57;TCR=25;TR=82;WE=149001291;WS=149001273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr5	149006837	rs7732873	A	G	1976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=42;PP=1222;SC=CACCGGGGGTACGTGAGCCTT;SOR=1.745;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=21;TCR=42;TR=63;WE=149006845;WS=149006827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr5	149006879	rs7733002	A	G	648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=17;PP=467;SC=GGGGAAAACCACCCCACAGAA;SOR=2.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=149006887;WS=149006869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr5	149008403	rs1056993	A	G	2626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=47;NR=47;PP=1525;SC=CTGGGAAACTACAGCTGTACC;SOR=0.888;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=47;TCR=47;TR=94;WE=149008411;WS=149008393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr5	149008467	rs3733662	C	A	1680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.571;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=32;PP=943;ReadPosRankSum=0.709;SC=GAACAAAGACCCCCGATGTCT;SOR=0.677;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=30;TCR=33;TR=61;WE=149008475;WS=149008457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,65:0.98:66
chr5	149008521	rs1135093	A	G	824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=16;PP=442;ReadPosRankSum=0.000;SC=TATTCCCACCATGAACCAGGT;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=14;TCR=17;TR=29;WE=149008529;WS=149008511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,33:0.94:35
chr5	149151707	rs73796250	G	A	3067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=60;NR=36;PP=1580;SC=GCAATGGTAGGTGTTGGGCCA;SOR=0.965;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=60;TCR=36;TR=96;WE=149151715;WS=149151697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr5	149276124	rs10053292	T	C	2339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=38;PP=1258;SC=GGTGCCCACCTCCTGTCCAGC;SOR=1.206;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=30;TCR=38;TR=68;WE=149276132;WS=149276114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr5	149276373	rs2244836	T	C	6902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=126;NR=102;PP=2965;SC=GGAAAAAAAATAGGTTACAAC;SOR=0.791;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=229;TCF=127;TCR=102;TR=228;WE=149276381;WS=149276354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr5	149276567	rs30818	T	G	689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=21;PP=583;SC=ATGCTTCTGATCTTCAGTTTC;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=149276575;WS=149276557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	149278258	rs30819	A	T	180.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=7;PP=153;SC=CACACTGTACATAAAGCACTA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=149278266;WS=149278248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	149283406	rs251346	C	G	2578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=52;PP=1708;SC=AGACAGTTTTCAATTATTCAC;SOR=1.434;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=30;TCR=52;TR=82;WE=149283414;WS=149283396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr5	149360877	rs30832	T	C	6036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=101;PP=2965;SC=AACCTTCAGATTAAGCCAGGC;SOR=0.780;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=193;TCF=92;TCR=101;TR=193;WE=149360885;WS=149360867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr5	149374879	rs3832324	CT	C	7386.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=90;PP=2969;SC=TCCACCTCTTCTTGATCCTCA;SOR=0.776;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=125;TCF=29;TCR=96;TR=118;WE=149374887;WS=149374869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr5	149374932	rs10875553	T	C	4371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=73;PP=2756;SC=AAGGTGGCTCTGGTACAGTAC;SOR=0.744;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=149;TCF=76;TCR=73;TR=149;WE=149374940;WS=149374922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr5	149380158	rs3812008	CG	TC	13720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=146;NR=124;PP=2947;SC=TTACTAGACCCGCTCCAAGCC;SOR=0.832;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=282;TCF=151;TCR=131;TR=270;WE=149380167;WS=149380148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,306:1.00:306
chr5	149406271	rs6579767	C	T	6085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=104;NR=95;PP=2965;SC=CTTTTCAGAGCTGACCTGCTT;SOR=0.702;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=200;TCF=105;TCR=95;TR=199;WE=149406279;WS=149406261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr5	149406733	rs2304069	G	T	344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=10;PP=261;SC=CTGCTTCCATGTAATGTATCA;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=149406741;WS=149406723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	149424966	rs2276983	G	A	1557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=12;PP=900;SC=GACGGGGTAGGCTGTTGTGTT;SOR=1.919;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=49;TCF=37;TCR=12;TR=48;WE=149424974;WS=149424956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr5	149427387	rs2043284	T	G	3195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=60;PP=1895;SC=ACTTTTTAGGTCAGGGATATG;SOR=1.377;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=40;TCR=60;TR=100;WE=149427395;WS=149427377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr5	149428395	rs216125	C	G	535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=4;NR=14;PP=365;SC=GTGCTACCCCCTGGGCTAGGG;SOR=2.419;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=18;WE=149428403;WS=149428385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	149428424	rs216126	G	C	337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=239;SC=TGGGTCTTCTGTCAGTATTTT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=149428432;WS=149428414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	149431223	rs216131	G	A	2802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=25;PP=1665;SC=GAGTGTTCTCGTCACCAGATG;SOR=1.802;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=90;TCF=65;TCR=25;TR=90;WE=149431231;WS=149431213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr5	149431259	rs216132	A	G	5224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=103;NR=63;PP=2965;SC=ATTCCTTCTTATCAAAATGCA;SOR=1.221;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=166;TCF=103;TCR=63;TR=166;WE=149431267;WS=149431249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr5	149431704	rs61733366	A	G	2571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=50;PP=1539;SC=AGATCAAGACAGAGACAGAGG;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=38;TCR=50;TR=88;WE=149431712;WS=149431694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr5	149433596	rs2066934	TG	GA	4145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.58;SOR=1.305;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr5	149435759	rs216136	G	A	7115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=125;NR=114;PP=2965;SC=CCCCAGCCTGGCCCAAGCCCT;SOR=0.701;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=240;TCF=125;TCR=115;TR=239;WE=149435767;WS=149435749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr5	149437190	rs216138	C	G	2601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=56;PP=1662;SC=GCAGAGGTCACTCATCATCAC;SOR=1.559;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=31;TCR=56;TR=87;WE=149437198;WS=149437180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr5	149440644	rs170037	C	T	2666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=58;PP=1771;SC=GCAGGGCATACCCCAAGACCC;SOR=1.514;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=32;TCR=58;TR=90;WE=149440652;WS=149440634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr5	149441016	rs11286566	AC	A	1140.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=12;NR=21;PP=702;SC=AGCATCTACCACCCCCCATCC;SOR=1.329;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=14;TCR=24;TR=33;WE=149441030;WS=149441005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr5	149447628	rs216150	A	G	509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=5;PP=390;SC=CCAGCAGCTGACTCATGTTGG;SOR=2.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=18;WE=149447636;WS=149447618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	149456771	rs2855781	CT	AA	11840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=125;NR=90;PP=2947;SC=CAGCTTCCTCCTCAAAACCCT;SOR=1.013;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=222;TCF=129;TCR=93;TR=215;WE=149456780;WS=149456761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,263:1.00:263
chr5	149457678	rs2228422	G	A	7141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=136;NR=108;PP=2965;SC=GACTGACCTTGGTGTTGTTGT;SOR=0.840;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=245;TCF=136;TCR=109;TR=244;WE=149457686;WS=149457668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,275:1.00:275
chr5	149460553	rs216123	A	G	5567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=100;PP=2965;SC=CGACCAGCTCAGGGACACTGG;SOR=0.792;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=196;TCF=96;TCR=100;TR=196;WE=149460561;WS=149460543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr5	149497103	rs66630781	GCGCGCA	G	99.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=5;NR=2;PP=290;SC=GCGCGCGCGCGCGCGCACACA;SOR=1.179;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=149497116;WS=149497093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr5	149497133	rs41289061	A	G	682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.53;QD=32.51;SOR=1.508;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	149499796	rs41287106	G	A	849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=24;PP=629;SC=CCACTTCTCCGTCCCATTCCC;SOR=3.334;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=28;WE=149499804;WS=149499786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr5	149504115	rs1077724	A	T	351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=2;PP=221;SC=GAGGCCAGGGAGAGGAACGCT;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=149504123;WS=149504112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	149504158	rs1075846	T	C	816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=4;PP=536;SC=TCGGGAGCAGTGCCTGCTGCA;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=149504166;WS=149504148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr5	149505306	rs10072056	G	A	672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=14;PP=379;SC=CAAGGTCTTCGTGGGCTCGGA;SOR=1.893;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=7;TCR=14;TR=21;WE=149505314;WS=149505296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	149513072	rs2240780	A	G	666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=6;PP=485;SC=TCTCACCATCACTCTGCACCC;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=25;WE=149513080;WS=149513062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr5	149515074	rs740750	G	A	1281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=10;PP=816;SC=GCCTCCAGTTGACAAGAGGGG;SOR=1.931;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=31;TCR=10;TR=41;WE=149515082;WS=149515064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr5	149516480	rs2240781	C	T	1185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=10;PP=822;ReadPosRankSum=-0.902;SC=TGGTGCTTCACGCCCTGCCAC;SOR=1.101;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=44;TCF=34;TCR=10;TR=43;WE=149516488;WS=149516470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,44:0.98:45
chr5	149546426	rs2302274	A	G	4580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=90;NR=70;PP=2732;SC=TGCGCGGGGGACCCCGCGGCC;SOR=0.887;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=160;TCF=90;TCR=70;TR=160;WE=149546434;WS=149546416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr5	149546828	rs2302275	C	G	1109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=18;PP=600;SC=GCGCAGAGGCCGACGCCCTAC;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=19;TCR=18;TR=37;WE=149546836;WS=149546818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr5	149576233	rs2270145	G	A	1499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=11;PP=1117;SC=TGGGCTTTTGGGGGAGCTGCC;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=42;TCR=11;TR=53;WE=149576249;WS=149576223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr5	149576273	rs2270146	C	T	3584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=79;NR=43;PP=2183;SC=ACCCCGCTCCCGGCAGGCGCC;SOR=1.371;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=79;TCR=43;TR=122;WE=149576281;WS=149576263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr5	149578999	rs731376	T	A	923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=25;PP=681;SC=AAGGCAGGGCTTGGACTGAGC;SOR=3.477;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=29;WE=149579007;WS=149578989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	149580819	rs3733680	G	A	2551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=54;PP=1688;SC=CAGAGGGAGGGGCCAGGCCTG;SOR=1.240;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=36;TCR=54;TR=90;WE=149580827;WS=149580809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr5	149582103	rs2240788	C	T	7148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=124;NR=113;PP=2965;SC=GAAAGGAAGGCCCACTCACCC;SOR=0.747;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=237;TCF=124;TCR=113;TR=237;WE=149582111;WS=149582093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr5	149583300	rs2240793	T	C	10673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=126;NR=118;PP=2965;SC=TCTGGTCCTTTCTCTTCTTCT;SOR=0.700;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=246;TCF=127;TCR=119;TR=244;WE=149583308;WS=149583290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,279:1.00:279
chr5	149583336	rs2240794	T	C	8620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=88;NR=94;PP=2965;SC=TCGGCCTAGATAGCCAGGTGA;SOR=0.856;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=186;TCF=88;TCR=98;TR=182;WE=149583344;WS=149583326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr5	149583383	.	G	GGTGT	250.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.471;ClippingRankSum=-0.000;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.13;MQRankSum=-0.000;QD=16.72;ReadPosRankSum=0.057;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr5	149584341	rs6878880	T	C	1320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=15;PP=846;SC=GCTGCTGGCGTTTGTGGGGCC;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=28;TCR=15;TR=43;WE=149584349;WS=149584331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr5	149584863	rs2342283	A	G	241.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=48.37;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr5	149584870	rs4423986	C	A	286.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=1;PP=134;SC=CCAAAGATGGCCCACTTCAGG;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=149584891;WS=149584860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	149584881	rs5024534	G	T	451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.07;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	149584881	.	GTT	TTC	443	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;FR=1.0000;HP=2;HapScore=4;MGOF=41;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=6;NR=1;PP=443;QD=70.9239821232;SC=CCACTTCAGGGTTCGGTACAG;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=7;WE=149584891;WS=149584860;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,7:0.78:9
chr5	149584883	rs5024533	T	C	451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.07;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	149584969	rs11428067	A	AG	3669.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=18;PP=1782;SC=TCGGGCCTTAAGCAGTTTAGA;SOR=1.402;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=42;TCF=23;TCR=19;TR=39;WE=149584989;WS=149584959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr5	149584981	rs4705425	A	G	4275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=24;PP=1429;SC=CAGTTTAGACAAAAGCCCGCA;SOR=1.380;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=57;TCR=24;TR=81;WE=149584989;WS=149584959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr5	149585025	rs4705426	A	C	5639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=105;NR=70;PP=2965;SC=GCAGGCCCTCATGGTGTATAG;SOR=0.997;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=175;TCF=105;TCR=70;TR=175;WE=149585033;WS=149585015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr5	149602608	rs2241694	A	G	7751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=146;NR=108;PP=2965;SC=GCCATTTGCCATCCCGGCGGT;SOR=0.844;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=254;TCF=146;TCR=108;TR=254;WE=149602616;WS=149602598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,297:1.00:297
chr5	149602824	rs2241695	C	T	2051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=50;PP=1442;SC=CAACCGGGGGCCTCCTGTCTC;SOR=2.242;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=68;TCF=18;TCR=50;TR=67;WE=149602832;WS=149602814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr5	149610967	rs139987809	AAATAAT	A,AAAT	641.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=0,0;NR=16,16;PP=611,98;ReadPosRankSum=-0.549;SC=GGGGACACAGAAATAATAATA;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=1;TCR=53;TR=16,16;WE=149610980;WS=149610957;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.26,0.68:19
chr5	149644597	rs891938	T	G	9043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=342;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=146;NR=165;PP=2965;ReadPosRankSum=0.163;SC=CAGAGGCTCATGTGAGTCCCC;SOR=0.272;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=312;TCF=146;TCR=166;TR=311;WE=149644605;WS=149644587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,341:1.00:342
chr5	149677851	rs6579784	A	G	5809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=114;NR=83;PP=2965;SC=CGCGCTGGGCATAAAGCATAG;SOR=0.902;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=198;TCF=114;TCR=84;TR=197;WE=149677859;WS=149677841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr5	149681850	rs200012526	G	A	3883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=64;PP=2445;SC=CGGGCCCGTCGGCCACGAAGC;SOR=0.862;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=125;TCF=61;TCR=64;TR=125;WE=149681871;WS=149681840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr5	149737221	rs4565199	T	G	554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=14;NR=3;PP=385;SC=GCCGGAAGTGTGGCGCGCGAG;SOR=1.981;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=149737229;WS=149737211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	149743976	rs891941	C	T	566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=15;PP=366;SC=GCCCTTCCTCCGTGCCAGGCA;SOR=3.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=149743984;WS=149743966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	149754991	rs2071238	C	T	1294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=11;PP=835;SC=CAGTGCCACCCGGGAAGGTGG;SOR=1.931;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=42;WE=149754999;WS=149754981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr5	149755340	rs7701163	G	T	8003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=131;NR=148;PP=2965;SC=CTGCCAAGGGGCCCCCTCAGA;SOR=0.889;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=279;TCF=131;TCR=148;TR=279;WE=149755348;WS=149755330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,299:1.00:299
chr5	149755421	rs2071239	A	G	4516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=87;PP=2669;SC=GCGAGGAGTCATCGGACAGTG;SOR=1.075;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=155;TCF=68;TCR=87;TR=155;WE=149755429;WS=149755411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr5	149759096	rs7713638	T	C	6362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=114;NR=102;PP=2965;SC=TCCCTCCAGGTGAAGCCTTCA;SOR=0.710;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=216;TCF=114;TCR=102;TR=216;WE=149759104;WS=149759086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr5	149763305	rs7715100	A	G	3610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=57;NR=61;PP=2039;SC=GTTTAGGACCAGGAGTCTTCT;SOR=0.898;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=118;TCF=57;TCR=61;TR=118;WE=149763313;WS=149763295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr5	149769688	rs56287670	G	C	1656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=42;PP=1254;SC=TTGCTGTCACGCCCACACTCC;SOR=2.712;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=11;TCR=42;TR=53;WE=149769696;WS=149769678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr5	149772237	rs78716239	G	A	2383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=27;PP=1452;SC=GGGCCACCTGGGGCTACCAAC;SOR=1.259;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=50;TCR=27;TR=77;WE=149772245;WS=149772227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr5	149772932	rs11743855	C	T	2794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=63;NR=26;PP=1577;SC=TGGGCTTCTTCAGTCTCTCCT;SOR=1.352;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=63;TCR=26;TR=89;WE=149772940;WS=149772922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr5	149778453	rs11744415	C	A	2480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=19;PP=1397;SC=CATCTGTTTGCCTCTGCCCTT;SOR=1.802;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=57;TCR=19;TR=76;WE=149778461;WS=149778443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr5	149914401	rs2545341	T	C	2088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=15;PP=1417;SC=GCCCAGTGGGTGGTTCTGAGC;SOR=2.082;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=51;TCR=15;TR=66;WE=149914409;WS=149914391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr5	149914631	rs2909809	G	A	2546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=60;PP=1618;SC=TAAGGGCTGGGCTGGAGGTCC;SOR=2.128;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=24;TCR=60;TR=84;WE=149914639;WS=149914621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr5	149919739	rs1290147	G	C	4716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=76;NR=80;PP=2791;SC=ACTCCTGGACGAACCTCCGGC;SOR=0.863;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=156;TCF=76;TCR=80;TR=156;WE=149919747;WS=149919729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr5	150051958	rs194134	T	C	10038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=376;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=188;NR=156;PP=2965;SC=CACCGCCATCTCCAAGGGCTA;SOR=0.859;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=346;TCF=189;TCR=157;TR=344;WE=150051966;WS=150051948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,375:1.00:375
chr5	150072693	rs33410	A	G	1118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=16;PP=784;SC=GTAGAGCGGCAACATGAACCA;SOR=0.954;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=24;TCR=16;TR=40;WE=150072701;WS=150072683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr5	150078956	rs252161	A	G	7533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.98;NF=111;NR=138;PP=2965;SC=TAGAGAGAGAAAAACAGCAAC;SOR=0.955;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=249;TCF=111;TCR=138;TR=249;WE=150078964;WS=150078946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,272:1.00:272
chr5	150098028	rs41290555	G	A	4034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=83;PP=2448;SC=TACCATCCCCGCCATTACTCC;SOR=1.366;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=53;TCR=83;TR=136;WE=150098036;WS=150098018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr5	150407456	rs8177447	T	C	4916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=100;NR=60;PP=2965;SC=ACACTCCTCTTATCCCTGCTC;SOR=1.098;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=160;TCF=100;TCR=60;TR=160;WE=150407464;WS=150407446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr5	150410135	rs3924	G	A	921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=5;PP=613;SC=AGGGACTGGTGTACAAGCTGG;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=31;WE=150410143;WS=150410125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	150413406	rs2233305	A	C	718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=10;NR=12;PP=345;SC=ACAGGCTGCAAAGGACACCCA;SOR=1.302;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=10;TCR=12;TR=22;WE=150413414;WS=150413396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr5	150415338	rs2287720	C	T	1097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=27;PP=786;SC=CAGGCCCAGACTCCCATGCCT;SOR=3.026;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=33;WE=150415346;WS=150415328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	150516887	rs2303034	G	C	1611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=26;PP=737;SC=AATGCCCTGGGGGTAGAAAAA;SOR=0.899;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=24;TCR=26;TR=50;WE=150516895;WS=150516877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr5	150562696	rs60344552	CT	C	11321.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=35;NR=120;PP=2966;SC=CAGACTGCCCCTGGGAAAGCC;SOR=0.700;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=162;TCF=36;TCR=126;TR=155;WE=150562704;WS=150562672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,285:1.00:285
chr5	150564975	rs248428	T	C	2506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=27;PP=1485;SC=CCACTCCCAGTCACAGACCAC;SOR=1.240;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=53;TCR=27;TR=80;WE=150564983;WS=150564965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr5	150565008	rs248427	C	T	3219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=61;NR=40;PP=1780;SC=GATCAGCCGCCTGTCCAGCTC;SOR=0.978;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=61;TCR=40;TR=101;WE=150565016;WS=150564998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr5	150565724	rs248426	C	T	3710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=57;PP=2012;SC=CAAAGCCTGCCTCATAAATGC;SOR=0.886;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=112;TCF=55;TCR=57;TR=112;WE=150565732;WS=150565714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr5	150565770	rs193728	G	A	2674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=46;PP=1477;SC=GAGGGAGAACGGTTTTGGGTT;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=36;TCR=46;TR=82;WE=150565778;WS=150565760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr5	150567049	rs35221501	CA	C	5212.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=67;PP=2951;SC=TCCATAAGCTCAAGACACTTC;SOR=0.892;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=9;TCR=68;TR=76;WE=150567057;WS=150567039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr5	150567074	rs36036156	T	TG	3728.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=53;PP=2524;SC=CAAAGCCTTCTGCAGGCCCCT;SOR=1.134;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=4;TCR=55;TR=57;WE=150567082;WS=150567064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr5	150567145	rs454130	G	A	881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=23;PP=637;SC=GTCTAGGAACGGTCTTATTCA;SOR=2.621;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=29;WE=150567153;WS=150567135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr5	150838293	rs35074529	T	C	1198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=6;PP=874;SC=CCACCCCAAATATGGAGCTAA;SOR=2.948;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=33;TCR=6;TR=39;WE=150838301;WS=150838283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
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chr5	150846935	rs357619	A	T	286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=268;SC=ATTTTTTCCAAATCAGCTTTT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=150846943;WS=150846925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	150847505	rs441652	T	C	6385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.44;SOR=1.052;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr5	150847509	rs394736	A	G	6295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.93;QD=44.65;SOR=1.069;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr5	150847554	rs357621	T	C	1694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=21;NR=41;PP=960;SC=TGGTAGCTCATGCCTGTAATC;SOR=1.681;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=21;TCR=41;TR=62;WE=150847562;WS=150847544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr5	150847604	rs189615	A	G	520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=14;PP=366;SC=ATCACCTGAGATCAGGAGTTT;SOR=2.833;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=150847612;WS=150847594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	150848653	rs10709981	TA	T	2296.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.590;NF=42;NR=21;PP=877;ReadPosRankSum=-0.789;SC=AAGCATAACTTAAAAAAAAAA;SOR=1.302;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=89;TCF=53;TCR=36;TR=63;WE=150848662;WS=150848643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,100:0.96:104
chr5	150848701	rs357624	A	G	7109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=156;NR=94;PP=2965;SC=TCATCAGTACATATTCATTAA;SOR=1.114;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=250;TCF=156;TCR=94;TR=250;WE=150848709;WS=150848691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr5	150848874	rs357625	A	G	1997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=52;PP=1449;SC=TTTTGTTTTCATTTTTGAAAC;SOR=3.327;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=9;TCR=52;TR=61;WE=150848882;WS=150848864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr5	150848903	rs357626	A	G	947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=27;PP=723;SC=TTAAAGTTACATGTTCATCTA;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=29;WE=150848911;WS=150848893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	150853193	rs11279332	CTTTTGCTTTG	C	2409.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.258;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.391;NF=21;NR=22;PP=2242;ReadPosRankSum=-0.198;SC=TCTGTATAGCCTTTTGCTTTG;SOR=1.686;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=60;TCF=27;TCR=33;TR=43;WE=150853217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,94:0.96:98
chr5	150853412	rs152722	G	C	1870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=36;PP=1192;SC=GAATGCTGAGGAAACATTGTT;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=19;TCR=36;TR=55;WE=150853420;WS=150853402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr5	150856107	rs165352	T	G	2683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.955;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=44;PP=1940;ReadPosRankSum=-0.677;SC=CATTAACTTTTCTTTTTTCTG;SOR=0.172;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=116;TCF=71;TCR=45;TR=108;WE=150856115;WS=150856097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,106:0.98:108
chr5	150858725	rs165357	G	A	557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=0;PP=478;SC=TATCTGTGAGGTAAATTTCTA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=150858733;WS=150858715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	150889652	rs146458760	C	T	2600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=30;PP=1418;SC=GTTCCACCTTCCAGGCAGGGT;SOR=1.053;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=52;TCR=30;TR=82;WE=150889660;WS=150889642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr5	150920108	rs2288777	A	G	1047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=24;NR=12;PP=547;SC=TACCCACTCCACCCCTCGCCA;SOR=1.292;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=24;TCR=13;TR=36;WE=150920116;WS=150920098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr5	150921805	rs6579879	G	A	1131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=7;PP=830;SC=GATGTTTTTCGATACATTCCA;SOR=2.613;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=38;WE=150921813;WS=150921795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr5	150923405	rs6892335	A	G	4373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=69;PP=2617;SC=GCTGTTAATGAAGAAGTGCCT;SOR=0.785;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=144;TCF=75;TCR=69;TR=144;WE=150923413;WS=150923395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr5	150924769	rs998076	G	A	4585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=78;PP=2944;ReadPosRankSum=2.797;SC=CAGCTGCCCAGTAGACATCCT;SOR=0.861;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=151;TCF=73;TCR=78;TR=150;WE=150924777;WS=150924759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,165:0.99:167
chr5	150925144	rs3797875	A	G	5669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=105;NR=89;PP=2965;SC=CAAATAATACAGGGCTTCCTT;SOR=0.831;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=194;TCF=105;TCR=89;TR=194;WE=150925152;WS=150925134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr5	150942919	rs6872614	A	G	2246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=24;PP=1262;SC=AATCCCATGTAGTTCCCACTG;SOR=0.968;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=68;TCF=43;TCR=25;TR=67;WE=150942927;WS=150942909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr5	150946966	rs1465690	G	A	7033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=121;NR=110;PP=2965;SC=TCCCCAGGTAGGGGTCAATAG;SOR=0.731;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=231;TCF=121;TCR=110;TR=231;WE=150946974;WS=150946956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr5	150948016	rs3734062	C	T	4455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.227;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=71;PP=2557;ReadPosRankSum=-0.687;SC=GGGGCATGTCCTCAGAGATGG;SOR=0.402;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=143;TCF=72;TCR=71;TR=142;WE=150948024;WS=150948006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,163:0.99:164
chr5	150948537	rs1469680	T	C	654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=21;PP=481;SC=AAAGACAGGGTGCAAGTTAGG;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=150948545;WS=150948527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr5	151138211	rs1549921	A	G	1407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=32;PP=902;SC=GAGAGTGCGCACTAGAGGCCT;SOR=1.654;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=15;TCR=32;TR=47;WE=151138219;WS=151138201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr5	151167380	rs7719617	A	T	2610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.51;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=28;PP=1042;SC=TTATGAATGTATTCAATATGA;SOR=1.473;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=41;WE=151167431;WS=151167370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr5	151167387	rs201380366	A	AC	2521.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.51;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=5;PP=406;SC=TGTATTCAATATGAATATTTT;SOR=1.536;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=7;WE=151167431;WS=151167370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr5	151167389	.	GAATATTTTCAATTCATAAAATAAAATTTATGAAT	G	2495.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.51;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=7;PP=2625;SC=TATTCAATATGAATATTTTCA;SOR=2.880;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=151167431;WS=151167370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr5	151167476	.	ATG	A	64	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.68;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=301;MMLQ=18;MQ=59.07;NF=0;NR=6;PP=64;QD=12.1666666667;SC=GTGTGTGTGCATGTGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=6;WE=151167485;WS=151167466;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:4,6:0.60:10
chr5	151771817	rs1363422	C	T	3615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=43;PP=2184;SC=GAGAGGGCTGCTGGGAGGTGA;SOR=1.230;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=124;TCF=81;TCR=43;TR=124;WE=151771825;WS=151771807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr5	151784183	rs3749787	G	A	3634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=63;PP=2199;ReadPosRankSum=-1.164;SC=CGAGGATCCTGAGGGCCCGGC;SOR=0.451;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=52;TCR=64;TR=115;WE=151784191;WS=151784173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,131:0.99:132
chr5	153144216	rs3813470	A	G	3649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=58;NR=63;PP=2163;SC=TTGTCCCAAGACACTTTCACA;SOR=0.898;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=121;TCF=58;TCR=63;TR=121;WE=153144224;WS=153144206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr5	153372525	rs1057772	G	A	4573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=58;PP=2476;SC=AGGTCAAAACGTCTCCATTCT;SOR=1.039;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=153;TCF=95;TCR=58;TR=153;WE=153372533;WS=153372515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr5	153372743	rs6866471	G	A	954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=25;PP=732;SC=TAAGGCAACAGGGGAACAGAT;SOR=2.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=30;WE=153372751;WS=153372733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr5	153382072	rs35082504	GTCT	G	998.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=23;PP=1081;SC=AATAAAGAGTGTCTTCTTCTT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=23;WE=153382082;WS=153382062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	153406644	rs9324765	C	T	940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=0;PP=652;SC=AAAACATACACTTCATCTTCC;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=153406652;WS=153406642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr5	153406987	rs6889563	G	C	994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=19;PP=623;SC=AGACAGGTTAGAGTACAGAGG;SOR=1.209;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=13;TCR=19;TR=32;WE=153406995;WS=153406977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	153413390	rs2578377	C	T	3158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=56;NR=50;PP=1715;SC=TCACTGGGACCAGGGATTCCA;SOR=0.779;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=56;TCR=50;TR=106;WE=153413398;WS=153413380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr5	153414545	rs34907432	C	CA	1439.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.291;NF=2;NR=31;PP=788;ReadPosRankSum=-0.698;SC=AATGAAAGCCCAAAAAAAATT;SOR=1.402;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=33;WE=153414553;WS=153414535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,53:0.96:55
chr5	153429459	rs690592	T	C	7969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=140;NR=134;PP=2965;SC=CGGATGATGATGTCATCATAG;SOR=0.700;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=274;TCF=140;TCR=134;TR=274;WE=153429467;WS=153429449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,297:1.00:297
chr5	153432450	rs11451300	A	AT	3511.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;MQRankSum=0.333;NF=31;NR=35;PP=1381;ReadPosRankSum=-0.072;SC=TTTTGCTATAATTTTTTTTTC;SOR=0.479;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=88;TCF=44;TCR=44;TR=66;WE=153432458;WS=153432440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,129:0.97:133
chr5	153432733	rs2578386	T	C	7060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=109;PP=2965;SC=CTGAGAAGGCTATCAATGAGT;SOR=0.783;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=220;TCF=110;TCR=110;TR=217;WE=153432741;WS=153432723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr5	153432970	rs2255493	C	T	5454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=86;PP=2965;SC=TGCGAGTGGACGACCCTGATG;SOR=0.854;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=168;TCF=82;TCR=86;TR=168;WE=153432978;WS=153432960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr5	153570349	rs201222592	C	CCGGGCGGA	122	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.67;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.9990;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=1;PP=57;SC=GCTGCCGCCGCCGGGCGGACG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=1;TCF=0;TCR=1;TR=1;WE=153570357;WS=153570339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	153674536	.	TTG	T	66.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=2.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.78;ReadPosRankSum=0.096;SOR=0.157;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr5	153677361	.	TGA	T	760.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=67.21;QD=44.75;SOR=5.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	153677362	.	GA	TC	556	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=67.64;NF=11;NR=0;PP=556;QD=55.406170442;SC=TCTTTGTACTGAGCAAAAACT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=11;WE=153677371;WS=153677352;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,11:0.69:16
chr5	153677363	.	A	ATCCCCCT,ACCCCT	760.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.34;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=682;SC=CTTTGTACTGAGCAAAAACTG;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=11;WE=153677371;WS=153677352;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:17
chr5	153709043	rs1004976	G	A	3317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=23;PP=2294;SC=AGGAAGTGGGGTTTGCAGTTA;SOR=2.573;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=82;TCR=23;TR=105;WE=153709051;WS=153709033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr5	153783587	rs4958733	A	G	4824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=65;PP=2882;SC=TGCTGAGTGCACTAAGGGATG;SOR=1.112;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=164;TCF=99;TCR=65;TR=164;WE=153783597;WS=153783577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr5	153788991	rs2112605	G	C	6149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=120;NR=81;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.797;SC=ATTTTTGATGGAACATAAAAT;SOR=0.905;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=204;TCF=121;TCR=83;TR=201;WE=153788999;WS=153788979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,226:0.99:228
chr5	153795209	rs11167678	C	G	959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=8;PP=607;SC=ACTTTTAAAGCTAGGTGGTTA;SOR=1.819;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=31;WE=153795217;WS=153795199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr5	153795274	rs11321246	TA	T	2504.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=32;PP=995;SC=TTCCATAATTTAAAAAAAATG;SOR=0.953;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=51;TCF=16;TCR=35;TR=43;WE=153795282;WS=153795264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr5	153835378	rs1007404	C	G	3947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=35;PP=2558;SC=CAAACAACTCCATTCGCTTCT;SOR=1.869;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=131;TCF=96;TCR=35;TR=130;WE=153835386;WS=153835368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr5	153856974	rs1846966	C	G	3375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=40;PP=2189;SC=TGGCCTGAGGCTGCTCACCGC;SOR=1.355;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=114;TCF=74;TCR=40;TR=114;WE=153856982;WS=153856964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr5	154065381	rs200868230	TTA	T	38.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=7.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.97;ReadPosRankSum=0.779;SOR=0.069;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,9:0.22:40
chr5	154065382	rs33982250	TA	T	628.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=3.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=7.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.12;ReadPosRankSum=-0.718;SOR=2.642;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,30:0.77:39
chr5	154065495	rs11958012	GG	AC	12244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=121;NR=112;PP=2947;SC=CTCGTGATTCGGTTAATCCTC;SOR=0.761;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=235;TCF=121;TCR=114;TR=233;WE=154065504;WS=154065485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,273:1.00:273
chr5	154134818	rs11416035	C	CG	105	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.25;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	154193735	rs863649	A	G	2868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=57;PP=1773;SC=AGTCCCAGGAAAGGGGACAAT;SOR=1.921;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=25;TCR=57;TR=82;WE=154193743;WS=154193725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr5	154247297	rs35471086	TAA	T	4026.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=43;PP=1936;SC=TTGCTTGAGCTAAAAGACATA;SOR=0.982;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=4;TCR=43;TR=47;WE=154247306;WS=154247287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr5	154268902	rs816739	C	T	6594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=113;NR=110;PP=2965;SC=CAGGAAATTTCGCCATTCTCT;SOR=0.725;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=223;TCF=113;TCR=110;TR=223;WE=154268910;WS=154268892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr5	154271391	rs702743	A	C	2839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=38;NR=57;PP=1776;SC=TTTCTTATCAACCAAGAAGCA;SOR=1.396;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=38;TCR=57;TR=95;WE=154271399;WS=154271381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr5	154271948	rs816736	G	A	6674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=130;NR=94;PP=2965;SC=GTCACTTACCGTCAGGGAGAA;SOR=0.992;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=224;TCF=130;TCR=94;TR=224;WE=154271956;WS=154271938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr5	154278888	rs816740	C	T	5455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=95;PP=2965;SC=CAAGAACAGACCCTTTAGCCA;SOR=0.920;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=181;TCF=86;TCR=95;TR=181;WE=154278896;WS=154278871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr5	154282551	rs10515726	T	C	3949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=38;PP=2662;SC=CATTATAATATCACAGGATGA;SOR=1.748;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=96;TCR=38;TR=134;WE=154282559;WS=154282541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr5	154287016	rs76813157	T	TGAAAAAAAA	1070.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=3;PP=2706;SC=GAATAAAGCTTAACAAAAAAA;SOR=1.863;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=14;WE=154287024;WS=154287006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	154287115	rs6580119	T	C	4413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.06;NF=86;NR=56;PP=2197;SC=GACACGACCATGAAATCCTAG;SOR=1.017;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=142;TCF=86;TCR=56;TR=142;WE=154287123;WS=154287105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr5	154291219	rs6580121	A	G	2105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=22;PP=1469;SC=TTCCTTGCTCAATCCTGATCA;SOR=1.795;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=52;TCR=22;TR=74;WE=154291227;WS=154291209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr5	154291409	rs1974777	C	T	5899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=87;NR=106;PP=2965;SC=CAGTCGACCTCGATGTCCTCG;SOR=1.053;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=193;TCF=87;TCR=106;TR=193;WE=154291417;WS=154291399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr5	154291496	rs1974776	G	A	1052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=31;PP=858;SC=GACATTTTCTGGTTATTCTAT;SOR=4.174;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=34;WE=154291504;WS=154291486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr5	154296795	rs348735	A	C	626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=16;PP=481;SC=TACAAGTTACAATGCAAATAG;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=154296803;WS=154296785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	154300940	rs348739	A	C	5229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=93;PP=2908;SC=CCCAGGCTAAAGTATATACAG;SOR=0.733;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=191;TCF=98;TCR=93;TR=191;WE=154300948;WS=154300930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr5	154306972	rs2258437	T	C	2077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=19;PP=1387;SC=TAGAAAGTAATAGCTGTTTGT;SOR=1.842;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=50;TCR=19;TR=69;WE=154306980;WS=154306962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr5	154308282	rs2644743	C	T	1945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=39;PP=1166;SC=ATGAAGTCACCGGTGGTTCAT;SOR=1.644;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=22;TCR=39;TR=61;WE=154308290;WS=154308272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr5	154308307	rs1035368	G	A	1315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=33;PP=890;SC=CACAGTCTGCGCTGTAAAAGC;SOR=2.352;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=11;TCR=33;TR=44;WE=154308315;WS=154308297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr5	154311235	rs2644744	T	C	608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=16;PP=484;SC=AGCTATCTCTTTCATAGGTCT;SOR=2.531;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=154311243;WS=154311225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	154311576	rs2544866	T	C	467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.24;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	154395158	rs6580126	G	T	8625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=155;NR=134;PP=2965;SC=GAATTGGTTCGTGAACTTCAG;SOR=0.792;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=289;TCF=155;TCR=134;TR=289;WE=154395166;WS=154395148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,317:1.00:317
chr5	154395458	rs17116710	G	A	4699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=106;NR=56;PP=2853;SC=GAACGAGACCGTAAGAGGCAA;SOR=1.320;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=162;TCF=106;TCR=56;TR=162;WE=154395466;WS=154395448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr5	154395682	rs56080630	G	A	5871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=98;PP=2965;SC=TGAGGTTATGGTCAGTACTGA;SOR=0.819;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=190;TCF=91;TCR=99;TR=188;WE=154395690;WS=154395672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr5	154396505	rs60928118	G	A	2096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=16;PP=1465;SC=AAACCTTCTCGTGTTAAAGAA;SOR=2.472;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=50;TCR=16;TR=66;WE=154396513;WS=154396495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr5	155756414	rs11740347	G	A	2000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=15;PP=1069;SC=TGGTCAGCCTGCCCTGCCTTC;SOR=1.641;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=48;TCR=15;TR=63;WE=155756422;WS=155756404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr5	155771579	rs1801193	T	C	3170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=34;PP=1774;SC=TGGGGATTTATGGCTGGCGGA;SOR=1.417;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=72;TCR=34;TR=106;WE=155771587;WS=155771569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr5	155771773	rs4434364	A	G	2125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=53;PP=1500;SC=GAAAAGTGATATTATTACAGT;SOR=2.368;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=17;TCR=53;TR=70;WE=155771781;WS=155771763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr5	155820582	rs62380729	G	T	908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=4;PP=711;SC=GCGTGCTCCTGTGCATCTCTT;SOR=3.056;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=31;WE=155820590;WS=155820572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	155820696	rs62380730	A	G	8958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=78;PP=2965;SC=AAGATCATCCATCTCCCAGAG;SOR=0.973;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=185;TCF=107;TCR=78;TR=185;WE=155820704;WS=155820686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr5	155820716	rs10475703	C	A	9632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=114;NR=89;PP=2965;SC=GCCATTGGTACATAGTTACTA;SOR=0.879;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=204;TCF=114;TCR=90;TR=203;WE=155820724;WS=155820706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr5	156074654	rs141437738	TAAATTGA	T	942.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=17;PP=916;SC=CGTGAATACATAAATTGAAAG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=17;WE=156074668;WS=156074644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr5	156349362	rs11134456	T	C	662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=19;PP=463;SC=CAAAAATCTCTGAAAACCCAA;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=22;WE=156349370;WS=156349352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr5	156375372	rs71591078	T	A	503.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=3.244;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.38;ReadPosRankSum=-0.916;SOR=2.124;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,24:0.92:26
chr5	156376703	rs6873053	A	G	3282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=50;PP=1855;SC=AGTAGACTCAACACTACTCCA;SOR=0.710;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=56;TCR=50;TR=106;WE=156376711;WS=156376693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr5	156381370	rs7724832	G	A	820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=5;PP=514;SC=TGATCCCATTGTCCATTAACC;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=23;WE=156381378;WS=156381360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr5	156390297	rs6882076	T	C	4914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=106;PP=2965;SC=GGTGGGACTCTTTAGTTTCAT;SOR=1.466;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=166;TCF=60;TCR=106;TR=166;WE=156390305;WS=156390287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr5	156459856	rs34670839	C	T	2258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=45;PP=1436;SC=GAAATATTTTCGAGCTTACCT;SOR=1.048;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=80;TCF=35;TCR=45;TR=80;WE=156459864;WS=156459846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr5	156464212	rs4704837	T	G	2429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=19;PP=1792;SC=CAGGCAATTTTGCTGTACATC;SOR=2.162;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=57;TCR=19;TR=76;WE=156464220;WS=156464202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr5	156464242	rs2036402	T	C	4505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=105;NR=49;PP=2940;SC=TTAGGAACAATCTCGAAATGA;SOR=1.682;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=154;TCF=105;TCR=49;TR=154;WE=156464250;WS=156464232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr5	156469808	rs13173581	C	T	262.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=8;PP=202;SC=GATAATATGACCAAATTCTGC;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=156469816;WS=156469798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	156479323	rs1553318	G	C	1666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=7;PP=1231;SC=TGGATGGTCCGCAGCTCCTCA;SOR=2.958;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=45;TCR=7;TR=52;WE=156479331;WS=156479313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr5	156479424	rs1553317	A	C	13645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.33;SOR=1.163;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,301:1.00:301
chr5	156479424	.	AGT	CGC	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MMLQ=24;MQ=59.98;NF=154;NR=99;PP=2947;QD=20;SC=AGGTAGAGACAGTTGTTGTCA;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=265;TCF=162;TCR=103;TR=253;WE=156479434;WS=156479414;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:12,253:0.95:265
chr5	156479426	rs12522248	T	C	13645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.59;SOR=1.145;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,306:1.00:306
chr5	156479509	rs1553316	A	G	13883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=529;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=61;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=237;NR=216;PP=2965;SC=CATTGTCGTCAGAACAGTCGT;SOR=0.743;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=453;TCF=237;TCR=216;TR=453;WE=156479517;WS=156479492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,529:1.00:529
chr5	156479557	rs141023871	GTTGGAACAGTCGTCA	G	10205.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=1.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=529;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=-3.693;NF=28;NR=168;PP=2933;ReadPosRankSum=1.709;SC=AACAGTTGTCGTTGGAACAGT;SOR=0.918;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=238;TCF=33;TCR=205;TR=196;WE=156479579;WS=156479547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:6,401:0.99:407
chr5	156482099	rs2270925	T	C	1578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.11;SOR=2.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr5	156482099	.	TTA	CTT	741	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=23;NR=8;PP=741;QD=25.6279959633;SC=GAACAAGAGTTTATTTAAAAA;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=31;WE=156482109;WS=156482089;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,31:0.91:34
chr5	156482101	rs2270924	A	T	1578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.85;SOR=2.432;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	156482459	rs1809941	G	T	4208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=76;NR=66;PP=2238;SC=TCCAGCACATGGATGTGACAG;SOR=0.718;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=142;TCF=76;TCR=66;TR=142;WE=156482467;WS=156482449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr5	156525920	rs371359315	AAG	A	344.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.26;MQRankSum=2.320;QD=5.65;ReadPosRankSum=-2.400;SOR=0.742;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,17:0.28:61
chr5	156589585	rs31208	A	G	5906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=103;NR=93;PP=2965;SC=CTTCTCCACCATCTTAGCCAC;SOR=0.738;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=196;TCF=103;TCR=93;TR=196;WE=156589593;WS=156589575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr5	156590355	rs31220	A	G	4046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=69;PP=2452;SC=TGGTCACTTGACCTGGGCCTG;SOR=0.775;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=137;TCF=68;TCR=69;TR=137;WE=156590363;WS=156590345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr5	156640563	rs143962660	C	CT	534.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=275;ReadPosRankSum=0.474;SC=TAACTTTTTTCTTTTTTTTTG;SOR=0.836;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=18;TCF=8;TCR=10;TR=13;WE=156640571;WS=156640553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,21:0.95:22
chr5	156644775	rs5872504	T	TC	4736.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=39;PP=2782;SC=TCTGTTGTTTTCCTGGGCCCT;SOR=1.102;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=67;TCF=27;TCR=40;TR=65;WE=156644783;WS=156644765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr5	156644939	rs246747	G	A	2966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=63;PP=1891;SC=CGCTAGCTCCGGGTGCAGGTG;SOR=1.480;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=37;TCR=63;TR=100;WE=156644947;WS=156644929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr5	156721863	rs5872508	T	TC	6509.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=61;PP=2913;SC=CCCGGGCCATTCCCAGGTGAG;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=102;TCF=38;TCR=64;TR=97;WE=156721871;WS=156721853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr5	156721986	rs7724099	C	A	4526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=93;PP=2656;SC=TAAAGCAGGTCCTCTTATCCA;SOR=1.172;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=158;TCF=64;TCR=94;TR=157;WE=156721994;WS=156721976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr5	156723913	rs1600014	T	C	128.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=4;PP=89;SC=GCCCTACACATCCCTGGGTGA;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=156723921;WS=156723903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr5	156734632	.	G	A	97	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;FR=1.0000;HP=2;HapScore=4;MGOF=29;MMLQ=26;MQ=59.58;NF=5;NR=0;PP=97;QD=26.3542425094;SC=AATATAATGTGTGTCTCTACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=5;WE=156734652;WS=156734622;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,5:0.50:10
chr5	156734644	rs144622623	G	GGTGTGTGTGT,GGTGTGTGT	218.80	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=568;SC=GTCTCTACAGGGTGTGTGTGT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=6;WE=156734652;WS=156734622;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:5
chr5	156738830	rs393178	G	C	2909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=70;PP=1781;SC=CGTGGGCCCAGGGCCAGAAGG;SOR=1.885;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=101;TCF=31;TCR=70;TR=100;WE=156738838;WS=156738820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr5	156991325	rs11465265	C	T	3032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=59;NR=37;PP=1699;SC=CACCTGCGTCCGGCGTTGACA;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=59;TCR=37;TR=96;WE=156991333;WS=156991315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr5	157094771	.	TAC	T	210	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MMLQ=15;MQ=59.89;NF=9;NR=3;PP=210;QD=17.75;SC=CATACATACATACACACACAC;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=42;TCF=26;TCR=16;TR=12;WE=157094782;WS=157094761;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:30,12:0.29:42
chr5	157178592	rs56398160	TA	T	3680.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=59;PP=2600;SC=ATATCTTCTATAATATTTAAA;SOR=1.431;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=63;TCF=4;TCR=59;TR=63;WE=157178600;WS=157178582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr5	157247160	rs254673	G	A	665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=18;PP=500;SC=AGATCTATTAGAAGTTATTTT;SOR=2.400;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=23;WE=157247168;WS=157247150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	158522577	rs12659540	C	A	1247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=9;PP=823;SC=TCTTGACTGCCCTGAATTTTG;SOR=2.007;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=39;WE=158522585;WS=158522567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr5	158523584	rs6556385	T	C	535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=21;PP=474;SC=CTCCGCCCCCTGTTCCTGACT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=21;WE=158523592;WS=158523574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	158588633	rs139682876	GAAAAA	G	3945.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=7;NR=33;PP=538;SC=CCCAGAACCTGAAAAAAAAAA;SOR=0.693;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=43;TCF=7;TCR=36;TR=40;WE=158588645;WS=158588623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr5	158603571	rs1473247	T	C	3958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=54;PP=2540;SC=AAAAATGAACTATAACTTTAA;SOR=1.073;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=77;TCR=54;TR=131;WE=158603579;WS=158603561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr5	158697481	rs3734104	C	G	2587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=33;PP=1590;SC=TAGAAGTAATCAGTTGTCATG;SOR=0.715;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=42;TCR=33;TR=75;WE=158697489;WS=158697471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr5	158710419	rs1433046	C	T	226.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=160;SC=CATCAGTGACCCCAGTATATA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=158710427;WS=158710409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	159505208	rs4360078	C	A	4063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=87;PP=2650;SC=AAGAAAATGTCGTTAAGCACA;SOR=1.467;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=49;TCR=87;TR=136;WE=159505216;WS=159505198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr5	159516404	rs4590210	C	G	371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=268;SC=GAGATGGCAGCGGGGACGGGG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=159516412;WS=159516403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	159516431	rs4441910	G	C	422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=280;SC=GTTGCCCAGAGTGGTCTCGAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=159516439;WS=159516421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	159640652	rs6556482	G	A	355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=245;SC=GCTGCTATGAGGAGCTCTGCC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=159640660;WS=159640642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	159659273	rs1130435	C	T	3190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=45;NR=67;PP=1926;SC=GGGGGCAAGACGTTCAAGGTG;SOR=1.316;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=45;TCR=67;TR=112;WE=159659281;WS=159659263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr5	159661723	rs2421775	C	T	889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=7;PP=682;SC=CATAAGCCACCGTGCCTGGCC;SOR=2.376;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=31;WE=159661731;WS=159661713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	159665523	rs10071756	C	T	1501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=48.44;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	159665527	rs10056227	G	A	1570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.20;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr5	159665534	rs10079413	A	G	1815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.27;SOR=3.467;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr5	159665599	rs2277954	G	A	4590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=92;NR=61;PP=2429;SC=CTCTGTCCCGGCTGCTTCTTT;SOR=1.065;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=154;TCF=92;TCR=62;TR=153;WE=159665607;WS=159665589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr5	159665726	rs10071871	C	T	10432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.29;SOR=0.806;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr5	159665733	rs2277953	C	T	10145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.70;SOR=0.888;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr5	159738709	rs6556490	A	G	2204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=50;NR=25;PP=1456;SC=CCGCCCCCCAATTCCGCTCAG;SOR=1.522;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=50;TCR=25;TR=75;WE=159738717;WS=159738699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr5	159776637	rs10053189	C	T	5796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=93;NR=87;PP=2965;SC=CTGGCTCCCCCTTCTTGCCCT;SOR=0.703;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=180;TCF=93;TCR=87;TR=180;WE=159776645;WS=159776627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr5	159835658	rs2961944	A	G	2470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=40;PP=1350;SC=ATGTATTACCATCTGAGAATT;SOR=0.756;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=42;TCR=40;TR=82;WE=159835666;WS=159835648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr5	159839317	rs1579074	T	C	107.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=95;SC=ATGAACTGTATACAAAGTATC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=159839325;WS=159839307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	159840688	rs2961949	T	C	1242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=31;PP=1013;SC=GAAAACTTCATACAACTTTTA;SOR=3.855;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=4;TCR=31;TR=35;WE=159840708;WS=159840678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr5	159840700	rs12522744	A	C	734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=21;PP=568;SC=CAACTTTTACAGAGTGGGCAC;SOR=3.611;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=24;WE=159840708;WS=159840678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr5	159841492	.	TA	T	217.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.661;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.96;MQRankSum=1.858;QD=9.07;ReadPosRankSum=-0.117;SOR=1.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr5	159842465	rs2910190	A	G	178.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=6;PP=145;SC=CCCCCTCCTCAAGGTCTCTAC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=159842473;WS=159842455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr5	159851211	rs2910203	G	C	501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=4;PP=334;SC=GACTTCCACTGTCACTAACCC;SOR=1.863;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=17;WE=159851219;WS=159851201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	159901408	.	C	A	47	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=47;QD=27.2570708491;SC=GCTGCTGAATCTTCAGAAAGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=159901416;WS=159901398;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr5	159912418	rs2910164	C	G	2755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=51;NR=36;PP=1520;SC=TGTCAGACCTCTGAAATTCAG;SOR=0.795;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=51;TCR=36;TR=87;WE=159912426;WS=159912408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr5	160043108	rs113179038	A	AT	386.19	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.845;NF=1;NR=21;PP=315;ReadPosRankSum=-0.268;SC=CTTCTCAAAGACTTTTTTTTA;SOR=1.426;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=22;WE=160043117;WS=160043098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,17:0.89:19
chr5	160043109	rs17052845	C	T	1195.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=25;PP=711;SC=TTCTCAAAGACTTTTTTTTAA;SOR=3.545;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=28;WE=160043117;WS=160043098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr5	160044855	rs1363199	G	A	5808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=113;NR=74;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.613;SC=AGCACGCTTGGAGGAATTGTT;SOR=0.424;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=188;TCF=114;TCR=74;TR=187;WE=160044863;WS=160044845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,204:1.00:205
chr5	160047265	rs6862674	C	G	574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=0;PP=442;SC=CCAGGTGACACTACAACTTGA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=160047273;WS=160047261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	160049355	rs2032804	C	T	610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=2;PP=441;SC=GCCTTCTACTCCTCTACCTCC;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=160049363;WS=160049345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	160097429	rs3828604	T	C	3316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=38;PP=2135;SC=CTTGCATCCTTTCTATGACTT;SOR=1.322;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=65;TCR=38;TR=103;WE=160097437;WS=160097419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr5	160097453	rs1990888	A	C	4270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=55;PP=2633;SC=CATTGAAGATATTAGAAAGAG;SOR=1.142;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=135;TCF=80;TCR=55;TR=135;WE=160097461;WS=160097443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr5	160097496	rs958912	A	G	5311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=84;PP=2965;SC=TTCACGACACATCTTTGCTTG;SOR=0.713;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=178;TCF=94;TCR=84;TR=178;WE=160097504;WS=160097486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr5	160097632	rs958911	G	A	1586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=34;PP=933;SC=AGTCTCCCACGCGCACATCCT;SOR=1.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=19;TCR=34;TR=53;WE=160097640;WS=160097622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr5	161116903	rs4921402	C	A	978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=26;PP=733;SC=TGCTGTTTTGCAGTGATGAGT;SOR=3.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=29;WE=161116911;WS=161116893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	161119071	rs12522663	G	T	6251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=115;NR=95;PP=2965;SC=TCTTCTCTGCGCTTATCGAGT;SOR=0.816;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=210;TCF=115;TCR=95;TR=210;WE=161119079;WS=161119061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr5	161128761	rs4277944	C	G	6883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=132;PP=2965;SC=CAATGGAAGTCAGTAGCAGTG;SOR=1.054;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=240;TCF=108;TCR=132;TR=240;WE=161128769;WS=161128751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
chr5	161281245	rs1129647	T	C	7237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=127;NR=122;PP=2965;SC=TCCTAGATGGTTATGACAATC;SOR=0.738;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=249;TCF=127;TCR=122;TR=249;WE=161281253;WS=161281235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,274:1.00:274
chr5	161318123	rs980790	A	G	3392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=71;PP=2093;SC=TATCTGTGACACTGCAAAGAG;SOR=1.311;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=117;TCF=45;TCR=72;TR=116;WE=161318145;WS=161318113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr5	161322652	rs3214859	GT	G	790.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=3.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.26;MQRankSum=1.390;QD=9.53;ReadPosRankSum=1.472;SOR=0.372;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,43:0.52:83
chr5	161322889	rs2279020	G	A	2588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=51;PP=1497;SC=ATGCTTTAATGGTCACTGTAG;SOR=1.536;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=29;TCR=51;TR=80;WE=161322897;WS=161322879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr5	161528280	rs211037	C	T	5024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=105;NR=55;PP=2923;SC=AATTGCACAACTTTCCAATGG;SOR=1.204;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=160;TCF=105;TCR=55;TR=160;WE=161528288;WS=161528270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr5	161576418	rs211014	C	A	1297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=23;PP=1007;SC=GCAGTTTGGGCTCCAAGATGA;SOR=1.151;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=16;TCR=23;TR=39;WE=161576426;WS=161576408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr5	161579441	rs211013	A	G	2780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=36;PP=1693;SC=GTCTAGCAGGAAATTTGACAA;SOR=0.994;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=59;TCR=36;TR=95;WE=161579449;WS=161579431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr5	162866548	rs299322	T	C	1902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=42;PP=1026;SC=GCTACATTTTTGTAATTTTGC;SOR=1.516;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=66;TCF=23;TCR=43;TR=65;WE=162866556;WS=162866538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr5	162866616	rs2069343	T	TG	862.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=20;PP=413;SC=AAACTTGACCTTTTTTTTTTC;SOR=2.215;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=162866624;WS=162866606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	162866664	rs2069345	A	G	154.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=6;PP=136;SC=CTACTACAGCATTAATATTTC;SOR=2.303;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=162866672;WS=162866654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr5	162887648	rs17061707	C	T	5200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=74;PP=2965;SC=AATCCGCATTCAGTTGTCGAG;SOR=0.952;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=180;TCF=106;TCR=74;TR=180;WE=162887656;WS=162887638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr5	162890953	rs380101	G	A	478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.60;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	162891644	rs7722365	G	A	230.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=158;SC=AAAAGAGAAAGACAAAAAAAT;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=162891652;WS=162891634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	162894654	rs2287777	G	C	978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=10;PP=705;SC=AAATTTGGCTGTCATATCTGT;SOR=1.885;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=24;TCR=10;TR=34;WE=162894662;WS=162894644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr5	162896856	rs299283	T	C	1037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=24;PP=736;SC=CTCATGATAATATTTACAATT;SOR=3.912;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=27;WE=162896864;WS=162896846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr5	162898565	rs169920	G	C	805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=24;PP=684;SC=TCAACCTTCTGTTAGTACTTA;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=162898573;WS=162898555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	162901156	rs2303078	G	A	3327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=60;PP=2083;SC=CAACAGGAACGTGAAAAGCTT;SOR=0.850;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=115;TCF=55;TCR=60;TR=115;WE=162901164;WS=162901146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr5	162902707	rs299291	G	A	2085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=49;PP=1398;SC=TCATGTTTATGTATGACTTCA;SOR=2.770;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=14;TCR=49;TR=63;WE=162902715;WS=162902697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr5	162938940	rs11307015	GT	G	1962.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=16;NR=15;PP=1316;SC=AACAACGATGGTGCCTAATAT;SOR=1.390;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=32;TCF=17;TCR=15;TR=31;WE=162938948;WS=162938930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr5	162940739	rs964945	G	A	1466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=28;PP=1012;SC=TAGAAATTAAGGTTTTGTAGA;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=16;TCR=28;TR=44;WE=162940747;WS=162940729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr5	162944709	rs7733775	A	G	4150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=85;PP=2630;SC=AAACCTTTAGATCCATTGCTA;SOR=1.329;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=143;TCF=58;TCR=85;TR=143;WE=162944717;WS=162944699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr5	167182055	rs1862875	G	A	1649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=19;PP=1008;SC=CCCAGCTTACGCCGATGGTGA;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=39;TCR=19;TR=58;WE=167182063;WS=167182045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr5	167420255	rs17069526	T	A	588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=14;PP=377;SC=CATGGACTTGTGAATCTAGAG;SOR=2.531;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=167420263;WS=167420245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	167489049	.	C	CT	70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;FR=0.9991;HP=12;HapScore=2;MGOF=51;MMLQ=18;MQ=58.09;NF=4;NR=0;PP=70;QD=19.0;SC=CTGTTTATTCCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=167489057;WS=167489039;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,4:0.67:6
chr5	167553880	rs10055910	C	T	6831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.121;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=141;NR=111;PP=2965;ReadPosRankSum=1.755;SC=GCATTGAGCACGGGACCTGTA;SOR=0.929;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=265;TCF=147;TCR=118;TR=252;WE=167553888;WS=167553870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:12,271:0.96:283
chr5	167622107	rs1472355	G	T	2510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=28;PP=1509;SC=TGAGGATGAGGGAGCAGAGGC;SOR=1.489;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=60;TCR=28;TR=88;WE=167622115;WS=167622097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr5	167653364	rs3733985	T	C	1498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=40;PP=1197;SC=TGGGAGGACTTCCAGAGACCC;SOR=2.170;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=13;TCR=40;TR=53;WE=167653372;WS=167653354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr5	167653394	rs3733986	A	G	718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=22;PP=569;SC=CTAGCTTTCTATTTTATTCAA;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=25;WE=167653402;WS=167653384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	167671781	rs139210116	CT	C	247.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=0;NR=11;PP=196;SC=ATTCCGGCTTCTTTTTTTTTT;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=167671789;WS=167671771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	167674370	rs3733988	C	T	5558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=89;PP=2965;SC=TCAACCAGATCATCACCACTG;SOR=0.703;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=189;TCF=100;TCR=89;TR=189;WE=167674378;WS=167674360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr5	167835766	rs6887919	T	C	864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=23;PP=651;SC=TGGCCAGGGGTTCTCTGCAGG;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=167835774;WS=167835756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr5	167837202	rs888888	C	T	371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=315;SC=CTTCACAAGACAGAGAGTGAA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=167837210;WS=167837192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	167858462	rs377710964	TCTGG	T	1598.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=0;NR=24;PP=1197;SC=AAGGGCCGTGTCTGGCTGGCT;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=75;TCF=1;TCR=74;TR=24;WE=167858473;WS=167858452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr5	167933673	.	CT	C	60.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=0.000;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.38;ReadPosRankSum=0.029;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,9:0.20:44
chr5	167984721	rs13185224	T	C	1963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=40;PP=960;SC=ACAATCTATTTGTTTAATAAT;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=24;TCR=40;TR=64;WE=167984729;WS=167984711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr5	167986274	rs158894	G	C	87.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=71;SC=ACACAACTACGCTTTATTAGT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=167986282;WS=167986264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	167996014	rs6876924	A	G	626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.25;SOR=2.400;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	168093522	rs1048307	G	A	604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=5;PP=429;SC=ACGAGGAGCCGTCCGTGCACT;SOR=1.931;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=21;WE=168093530;WS=168093512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr5	168097122	rs2303002	T	G	251.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=162;SC=CTTTCTCTGTTTCCTAGGCTG;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=168097130;WS=168097112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	168098463	rs292486	A	G	5586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=111;PP=2965;SC=GGCGCAAGGCAGAGAGGCCGG;SOR=1.120;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=191;TCF=80;TCR=111;TR=191;WE=168098471;WS=168098453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr5	168175205	rs11748347	C	G	3149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=29;PP=2159;SC=CTCCCCCCGGCAGTTTCGCCA;SOR=1.718;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=72;TCR=29;TR=101;WE=168175213;WS=168175195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr5	168175291	rs3822657	A	G	7910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=143;NR=127;PP=2965;ReadPosRankSum=2.329;SC=GCTTGGAGGCAGCTGGGGGTA;SOR=0.754;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=272;TCF=144;TCR=128;TR=270;WE=168175302;WS=168175281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,303:0.99:305
chr5	168176517	rs2304035	A	G	5552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=109;NR=83;PP=2965;SC=CCTGGATGGGAATCTCCTTGA;SOR=0.892;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=193;TCF=110;TCR=83;TR=192;WE=168176525;WS=168176507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr5	168179922	rs10039601	T	C	1566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=10;PP=1120;SC=CAGAGTGGGATCCCAGAGTCC;SOR=2.393;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=38;TCR=10;TR=48;WE=168179930;WS=168179912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr5	168180081	rs10036727	C	T	7307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=121;NR=139;PP=2965;SC=CTCACACAGCCGATCAAGTTA;SOR=0.895;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=261;TCF=121;TCR=140;TR=260;WE=168180089;WS=168180071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr5	168212687	rs2292141	G	A	329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=11;NR=0;PP=262;SC=GCCCTCGGCTGTATCATTTGG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=168212695;WS=168212686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	168212951	rs891921	A	G	5511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=82;NR=101;PP=2965;SC=CAGTCCCTTGACAATCTCGGT;SOR=1.055;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=183;TCF=82;TCR=101;TR=183;WE=168212959;WS=168212941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr5	168233413	rs3797716	G	A	6279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-2.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.802;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=133;NR=87;PP=2965;ReadPosRankSum=1.203;SC=TGAATTCTCCGGCGACAGTTG;SOR=0.806;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=221;TCF=133;TCR=88;TR=220;WE=168233421;WS=168233403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,239:1.00:240
chr5	168244506	rs35712765	G	GA	1263.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=21;PP=948;SC=CATGGTCACAGGTGAAGTGTG;SOR=2.235;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=168244514;WS=168244496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	168250350	rs924875	C	G	3609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=78;PP=2445;SC=TGGAGATAGACAAGGGAGATG;SOR=1.519;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=120;TCF=42;TCR=78;TR=120;WE=168250358;WS=168250340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr5	168250429	rs1875977	C	T	635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=15;PP=392;SC=TGGTTGTGACCGCAAGACCAT;SOR=2.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=19;WE=168250437;WS=168250419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr5	168620435	rs11744813	C	A	2284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=15;PP=1382;SC=CCACATCACCCAAGCCAGGCA;SOR=2.191;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=56;TCR=15;TR=71;WE=168620443;WS=168620425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr5	168620720	rs79192318	C	T	768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=21;PP=564;SC=TCCCTGTTGGCGGGGCTTAGA;SOR=4.174;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=168620728;WS=168620710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	169020337	rs368915167	CT	C	329.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=3.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.87;ReadPosRankSum=0.732;SOR=0.252;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,20:0.42:48
chr5	169021610	rs4493692	C	T	5334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=92;NR=82;PP=2771;SC=AACGTCAGCTCATCAGTATGA;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=176;TCF=93;TCR=83;TR=174;WE=169021618;WS=169021600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr5	169028481	rs3797713	T	C	9710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=353;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=177;NR=142;PP=2965;SC=AGTTTCTATATACACACCAGT;SOR=0.794;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=320;TCF=177;TCR=143;TR=319;WE=169028489;WS=169028471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,353:1.00:353
chr5	169031150	rs3777084	T	C	2896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=44;PP=1573;SC=TGTAAGAAATTACACCCTATT;SOR=1.072;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=42;TCR=44;TR=86;WE=169031170;WS=169031140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr5	169031218	rs2042248	G	T	1378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=26;PP=734;SC=GTAAAGACTTGTCTTTAATAA;SOR=1.480;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=19;TCR=26;TR=45;WE=169031226;WS=169031208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr5	169097474	rs2306564	G	C	1871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=46;NR=7;PP=1181;SC=TTATAAAGACGTAGGGTCATT;SOR=3.647;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=46;TCR=7;TR=53;WE=169097482;WS=169097464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr5	169097940	rs2306565	G	A	1617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=14;PP=1104;SC=GCATAATGTAGTTGGTGTGGC;SOR=2.066;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=54;TCF=40;TCR=14;TR=53;WE=169097948;WS=169097930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr5	169098265	rs12656761	C	T	1058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=30;PP=757;SC=TTGAGTCAGGCAGGTGGAGGT;SOR=3.442;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=35;WE=169098273;WS=169098255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr5	169101599	rs2244445	C	T	1417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=37;PP=1049;SC=GCTTGCGTGCCGTTGTTACCA;SOR=3.033;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=8;TCR=37;TR=45;WE=169101607;WS=169101589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr5	169129422	rs2306559	A	G	2750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=37;NR=46;PP=1387;SC=AGGATGGCAAAACGCTGCCTG;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=83;TCF=37;TCR=46;TR=83;WE=169129430;WS=169129412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr5	169138909	rs2306558	G	A	819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=7;PP=623;SC=TTAACTCATTGTGTTCTGAGC;SOR=2.546;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=30;WE=169138917;WS=169138899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr5	169267589	rs113470914	C	CGAT	168.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=3;NR=0;PP=159;SC=GGAGATATGGCGATGATGATG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=169267597;WS=169267585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr5	169267784	rs261623	G	A	4291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=84;NR=59;PP=2618;SC=ACCATATCCAGGAGATCATGG;SOR=0.828;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=143;TCF=84;TCR=59;TR=143;WE=169267792;WS=169267774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr5	169291605	rs261027	C	T	566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=16;PP=452;SC=GGCTCTTTGACCTTGGGAAAG;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=169291613;WS=169291595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	169422920	rs2059110	A	G	544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.51;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=12;NR=1;PP=312;SC=AACAGCCCCGAGTCTAGAGTG;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=169422928;WS=169422910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	169454831	rs13175232	G	A	8635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.51;SOR=1.220;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr5	169454831	.	GAT	AAC	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=104;NR=67;PP=2947;QD=20;SC=TCAGCCTTCTGATGTTATTGT;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=177;TCF=109;TCR=68;TR=171;WE=169454841;WS=169454821;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,171:0.97:177
chr5	169454833	rs13157227	T	C	8635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.06;SOR=1.214;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr5	169454941	rs9791113	C	G	4465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=80;PP=2772;SC=ACATGCAGCTCCTGGAGTCAA;SOR=0.999;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=68;TCR=80;TR=148;WE=169454949;WS=169454931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr5	169461399	rs3763047	G	A	7675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=144;NR=115;PP=2965;SC=GGTCTCTGCCGCAGCCTGATG;SOR=0.889;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=260;TCF=145;TCR=115;TR=259;WE=169461407;WS=169461389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,288:1.00:288
chr5	169461547	rs3763048	C	T	3014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=60;PP=1715;SC=TGAGCTGCACCGTGAACCTGC;SOR=1.631;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=34;TCR=60;TR=94;WE=169461555;WS=169461537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr5	169468243	rs2270895	A	G	1395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=26;PP=820;SC=AAGAAAAAGAATCCAAATATT;SOR=1.426;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=16;TCR=26;TR=42;WE=169468251;WS=169468233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr5	169468929	rs2270897	A	G	460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=3;PP=320;SC=GTGTGTTGGCAGGGTGGTTCC;SOR=2.833;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=169468937;WS=169468922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	169472765	rs6884561	C	G	2999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=27;PP=1765;SC=CCTCAGCAAGCGCTCTGCAAA;SOR=1.632;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=64;TCR=27;TR=91;WE=169472773;WS=169472755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr5	169474325	rs905155	A	C	620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=2;PP=456;SC=AGAGTGATTAACACAGTCCCT;SOR=3.160;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=169474333;WS=169474315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	169496051	rs6868503	T	C	2825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=29;PP=1861;SC=CCTTGCCCCTTTCAAATTGAA;SOR=1.708;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=92;TCF=63;TCR=29;TR=91;WE=169496059;WS=169496041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr5	169504743	rs1045168	T	C	9882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=373;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=188;NR=155;PP=2965;SC=GAGTGGGCCGTCCCAGGTCTA;SOR=0.836;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=344;TCF=188;TCR=156;TR=343;WE=169504751;WS=169504733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,373:1.00:373
chr5	169504944	rs79354516	T	C	1166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=25;PP=805;SC=ACCTTTCCCTTCCTCCTTTCA;SOR=3.321;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=31;WE=169504952;WS=169504934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr5	169507067	rs9885452	A	G	2947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=33;PP=1854;SC=CATAGAAACCATGCCACGCCC;SOR=1.568;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=107;TCF=73;TCR=34;TR=106;WE=169507075;WS=169507057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr5	169507130	rs138478687	TTG	T	51.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FS=1.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.23;ReadPosRankSum=-0.594;SOR=0.969;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:207,22:0.10:229
chr5	169509664	rs56105279	G	A	1620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=9;PP=935;SC=AAAGCCAAGGGCATAGCAGCT;SOR=2.001;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=40;TCR=9;TR=49;WE=169509672;WS=169509654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr5	169533240	rs2277944	G	A	3020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=38;PP=1850;SC=GAGTGCAGAGGCCGCTGCTGC;SOR=0.936;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=96;TCF=58;TCR=38;TR=96;WE=169533248;WS=169533230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr5	169535522	rs10063424	T	C	10566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=400;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=200;NR=175;PP=2965;SC=TGCTCAGCTATGGAGGATCTG;SOR=0.787;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=376;TCF=200;TCR=176;TR=375;WE=169535530;WS=169535512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,400:1.00:400
chr5	169661994	rs957998	G	C	1362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=33;NR=13;PP=726;SC=GGTAAGAAGCGTGTTACTGAT;SOR=1.358;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=33;TCR=13;TR=46;WE=169662002;WS=169661984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr5	169685163	rs315717	C	T	5034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=76;PP=2442;SC=GCAAAGGTCTCTGATGCACTG;SOR=1.505;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=40;TCR=76;TR=116;WE=169685171;WS=169685153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr5	169685187	rs76219007	A	G	3698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=54;PP=1651;SC=AGAAGTAGAAAACAATGAATG;SOR=2.084;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=21;TCR=54;TR=75;WE=169685195;WS=169685177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr5	169685708	rs1702380	G	T	717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=1;PP=492;SC=TCCATTTTACGATAGTTATGC;SOR=4.003;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=169685716;WS=169685698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	169686007	rs432621	T	C	338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=10;PP=270;SC=CAGTTATACATCTTCATAATA;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=169686015;WS=169685997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	169688155	rs116736533	G	A	8394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=149;NR=128;PP=2965;SC=AAATGAATTAGGGCAAATAAA;SOR=0.753;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=277;TCF=149;TCR=128;TR=277;WE=169688163;WS=169688145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,309:1.00:309
chr5	169689604	rs395407	G	C	1036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=3;PP=727;SC=GCCGGCCACTGTGAGTGACAA;SOR=3.545;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=29;WE=169689612;WS=169689594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr5	169702390	rs2271146	C	A	2663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=48;PP=1355;SC=TAATGGTCTTCTCGATTTAAG;SOR=1.306;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=36;TCR=48;TR=84;WE=169702398;WS=169702380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr5	169715121	rs182052021	G	A	1232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=34;PP=919;SC=GAGTGGTGGGGACTGTGGCAA;SOR=2.636;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=10;TCR=34;TR=44;WE=169715129;WS=169715111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr5	169910084	rs4867968	G	T	3629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=52;PP=2120;SC=AAGTGGAACTGGGGCCCGCAG;SOR=0.771;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=114;TCF=62;TCR=52;TR=114;WE=169910092;WS=169910074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr5	170145584	rs6555913	G	A	484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=1;PP=390;SC=GGTGTTTGACGCAGAGGCTGA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=170145592;WS=170145578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	170149573	rs2277952	C	T	655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=1;PP=491;SC=GAGCTCTTCACAGAGCATAGC;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=170149581;WS=170149564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr5	170149674	rs12514966	A	T	4076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=59;PP=2472;SC=ACACTGTCTGATGGCTTGATG;SOR=0.923;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=137;TCF=78;TCR=59;TR=137;WE=170149682;WS=170149664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr5	170159997	rs17650650	C	T	465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=13;PP=334;SC=TGTGTCCAACCCTGTACTAAG;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=170160005;WS=170159987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	170160749	rs4868018	G	A	2685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=56;NR=38;PP=1471;SC=GCTCCAGCTCGTTACTCTGAG;SOR=0.994;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=56;TCR=38;TR=94;WE=170160757;WS=170160739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr5	170162666	rs1363712	T	C	3314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=72;NR=35;PP=2143;SC=GTTTTCTCCATATAGGAAACC;SOR=1.297;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=72;TCR=35;TR=107;WE=170162674;WS=170162656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr5	170221185	rs6884917	A	G	2531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.13;SOR=1.828;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr5	170237090	rs6555921	T	C	929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=20;PP=673;SC=TTGCAAGTTTTATATTAATAT;SOR=1.473;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=11;TCR=20;TR=31;WE=170237098;WS=170237080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr5	170238904	rs3805458	C	T	1507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=5;PP=1267;SC=TCATTACCTACTTATTTATTT;SOR=3.745;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=45;TCR=5;TR=50;WE=170238912;WS=170238894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr5	170239112	rs1063310	C	A	9323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=136;NR=159;PP=2965;SC=GCGACAAGTTCAAGTTTGTCT;SOR=0.951;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=295;TCF=136;TCR=159;TR=295;WE=170239120;WS=170239102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,337:1.00:337
chr5	170395885	rs2446049	T	C	186.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=152;SC=TTAGCATCAGTAAGTTAAGAT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=170395893;WS=170395875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr5	170640827	rs4867648	C	A	2225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=56;PP=1531;SC=TGGTTTGTGTCTTTCCAAGGT;SOR=2.660;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=15;TCR=56;TR=71;WE=170640835;WS=170640817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr5	170692954	rs957778	T	C	1608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=35;PP=1080;SC=AGACTTTTTATACTGGTAAAA;SOR=1.651;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=19;TCR=35;TR=54;WE=170692962;WS=170692944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr5	170720755	rs2914330	T	A	586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=5;PP=463;SC=CAGAGTCTAGTCCGTTTGTCC;SOR=2.636;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=23;WE=170720763;WS=170720745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	170736824	rs117020618	C	T	3994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=72;PP=2235;ReadPosRankSum=2.863;SC=TCCAGGCCTCCGCCCTCTCGG;SOR=1.027;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=58;TCR=73;TR=129;WE=170736832;WS=170736814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,150:0.99:152
chr5	170837457	rs55876025	A	G	1357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.14;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr5	170847555	rs6555955	T	C	576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=19;PP=413;SC=TCCTGGGCGCTGAGCCCAGTG;SOR=4.804;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=170847563;WS=170847545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr5	171200659	rs27947	T	G	1300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=3;PP=1034;SC=TCAAGCCAGATGCCCTCAAGA;SOR=4.514;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=36;TCR=3;TR=39;WE=171200667;WS=171200649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr5	171200997	rs26400	C	A	1366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=29;PP=868;SC=TTGTGCATTTCTTGTGTGTGC;SOR=1.656;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=17;TCR=29;TR=46;WE=171201005;WS=171200987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr5	171201499	rs12153230	G	C	4532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=72;NR=87;PP=2732;SC=ACCTCGGATGGCCGAGGGGAT;SOR=0.938;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=159;TCF=72;TCR=87;TR=159;WE=171201507;WS=171201489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr5	171217371	rs11950253	G	A	6525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=117;NR=95;PP=2965;SC=ATGTTAAGGGGACCTCCATAA;SOR=0.885;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=212;TCF=117;TCR=95;TR=212;WE=171217379;WS=171217361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr5	171472417	rs4867662	A	G	803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=0;PP=615;SC=TTTTTTTTTCAAAATACACAT;SOR=5.353;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=27;WE=171472425;WS=171472407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr5	171472575	rs4868136	G	A	7942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=144;NR=132;PP=2965;SC=GTGGGACCAAGGCCTTCTGTA;SOR=0.700;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=276;TCF=144;TCR=132;TR=276;WE=171472583;WS=171472555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,299:1.00:299
chr5	171480055	rs4569891	G	A	3617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=67;NR=49;PP=1887;SC=TTCTGGAACAGATTCCAGGCA;SOR=0.708;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=117;TCF=67;TCR=50;TR=116;WE=171480063;WS=171480045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr5	171481606	rs10155597	A	G	2263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=47;NR=28;PP=1230;SC=TGTTGCTCTCACACTGCGCCA;SOR=0.972;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=47;TCR=28;TR=75;WE=171481614;WS=171481596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr5	171509644	rs11741056	T	C	376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=12;PP=266;SC=ACCCCGTTGCTGTGTGACCTG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=171509652;WS=171509634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	171510180	rs10516093	T	C	3612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=71;PP=1942;SC=GGTTGGATCATGGAGCAAAAT;SOR=1.098;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=54;TCR=71;TR=125;WE=171510188;WS=171510170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr5	171533782	rs2306961	T	C	5946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=112;NR=86;PP=2965;SC=AGGGCGTGTCTTTCATGGTCT;SOR=0.817;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=198;TCF=112;TCR=86;TR=198;WE=171533790;WS=171533772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr5	171534682	rs3836825	T	TGCCCACAGGCTGACCGGGC	1382.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=8;NR=0;PP=2811;SC=GCAGGGCGTGTAGCCCTTGTC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=8;WE=171534690;WS=171534672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	171554516	rs2029523	A	G	1478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=36;PP=1005;SC=GGGTCCACCCATGCCCAATGC;SOR=2.746;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=11;TCR=36;TR=47;WE=171554524;WS=171554506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr5	171583610	rs41275267	A	G	2330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=18;PP=1675;SC=GCTGGGACAGACAGGGCGGCA;SOR=2.215;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=58;TCR=18;TR=76;WE=171583618;WS=171583592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr5	171583809	rs2306960	C	G	2685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=56;PP=1755;SC=AGAGGAGATACAGGAGGTCAA;SOR=1.661;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=29;TCR=56;TR=85;WE=171583817;WS=171583799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr5	171760544	rs35951290	TA	T	747.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;QD=41.54;SOR=4.047;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	171760546	rs3204110	A	T	333.79	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.54;ReadPosRankSum=0.000;SOR=1.508;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,15:0.83:18
chr5	171760569	rs12033	A	G	1500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=4;PP=904;SC=GAAAGAAGTCAAATGGTAAAG;SOR=3.816;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=46;TCF=42;TCR=4;TR=44;WE=171760577;WS=171760559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr5	171785892	rs2569232	A	G	3407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=56;PP=1977;SC=CTGGGGAAGCAAGAGTGCAGA;SOR=0.739;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=120;TCF=64;TCR=56;TR=120;WE=171785900;WS=171785882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr5	172196711	rs2431663	G	T	5179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=99;PP=2965;SC=TCAAGGCAGTGATGCCCAAGG;SOR=0.952;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=184;TCF=84;TCR=100;TR=183;WE=172196719;WS=172196701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr5	172196997	rs7702178	T	C	80.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.01;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	172261583	.	G	GC	103.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.135;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.97;ReadPosRankSum=0.414;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr5	172261593	rs63376061	T	C	361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=4;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=11;PP=296;SC=GCCCCCCCCCTGCCGCACACG;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=12;WE=172261601;WS=172261573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	172294194	rs793027	G	T	5545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=94;PP=2965;SC=GACCTTTATCGTGCTACCTGG;SOR=0.817;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=187;TCF=93;TCR=94;TR=187;WE=172294202;WS=172294184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr5	172315872	rs4868227	G	A	1109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.64;SOR=5.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr5	172324128	rs13154777	A	T	1931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=46;PP=1363;SC=GGGACCCCAGACAAGAAGAGG;SOR=2.267;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=16;TCR=46;TR=62;WE=172324136;WS=172324118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr5	172336616	rs2302957	C	T	9686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=365;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.99;NF=186;NR=142;PP=2965;SC=TCCCCCGCAGCTGAGATCTTT;SOR=0.890;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=329;TCF=187;TCR=142;TR=328;WE=172336624;WS=172336606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,365:1.00:365
chr5	172341917	rs17716949	T	C	5491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=92;PP=2965;SC=AAACTGGTTGTGGAGGCACTC;SOR=0.774;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=183;TCF=91;TCR=92;TR=182;WE=172341925;WS=172341907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr5	172342029	rs35941893	G	GT	4395.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.18;MQRankSum=0.193;NF=11;NR=58;PP=1963;ReadPosRankSum=-0.625;SC=GCTCCCTGGGGTTTTAAGCCC;SOR=0.884;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=83;TCF=14;TCR=69;TR=69;WE=172342041;WS=172342019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,173:0.99:175
chr5	172395664	rs11749686	T	C	4434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=86;PP=2933;ReadPosRankSum=1.538;SC=TTCAAAGTTATTGGTGTTTTG;SOR=1.136;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=150;TCF=63;TCR=87;TR=148;WE=172395672;WS=172395654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,160:0.99:162
chr5	172396394	rs505788	C	T	7016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=127;NR=105;PP=2965;SC=GAAATAAAGACCTGTTTTCTC;SOR=0.800;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=232;TCF=127;TCR=105;TR=232;WE=172396402;WS=172396384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr5	172662024	rs2277923	T	C	3918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=67;PP=2453;SC=GCTGCTGCTGTTCCAGGTTTA;SOR=0.823;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=67;TCR=67;TR=134;WE=172662032;WS=172662014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr5	172745269	rs4041247	A	AAG	253.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.08;ReadPosRankSum=-1.078;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr5	173316729	rs359467	G	A	5268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=112;NR=63;PP=2965;SC=TGCTCCTAAAGATAATAAATG;SOR=1.197;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=175;TCF=112;TCR=63;TR=175;WE=173316746;WS=173316719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr5	173382777	rs62378660	A	G	570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=5;PP=410;SC=TCCATATTTCAGTAAATGAAT;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=21;WE=173382785;WS=173382767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr5	174152100	rs2048152	G	A	2386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=48;PP=1400;SC=GGAGCGGGGGGCGGGTGTTCC;SOR=1.338;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=30;TCR=48;TR=78;WE=174152108;WS=174152090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr5	174156168	rs4242182	T	C	7916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=162;NR=120;PP=2965;SC=CTAGGACATATGAGCCCTACC;SOR=0.964;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=282;TCF=162;TCR=120;TR=282;WE=174156176;WS=174156158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,305:1.00:305
chr5	174178697	rs960743	C	G	7586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=128;NR=132;PP=2965;SC=GCCGCGCGCCCCGCCATCAGC;SOR=0.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=261;TCF=128;TCR=133;TR=260;WE=174178705;WS=174178687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,286:1.00:286
chr5	174178774	rs7709117	G	A	4360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=89;PP=2843;SC=GCTCTTGGGCGGCCGCGTTTC;SOR=1.354;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=148;TCF=59;TCR=89;TR=148;WE=174178782;WS=174178764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr5	174868700	rs686	G	A	1675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=15;PP=1080;SC=TTAATAGCAAGCCCCAGAGCA;SOR=1.903;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=39;TCR=15;TR=54;WE=174868708;WS=174868690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr5	174868840	rs155417	T	C	5560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=82;PP=2965;SC=CCAATATGACTGATAGGGCTG;SOR=0.773;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=183;TCF=101;TCR=82;TR=183;WE=174868848;WS=174868830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr5	174870150	rs4532	C	T	2322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=55;PP=1490;SC=CTCAAGTTCCCAAGCAGGGAA;SOR=2.038;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=21;TCR=55;TR=76;WE=174870158;WS=174870140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr5	174943551	rs3215174	GA	G	883.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=6;PP=506;SC=TCAAATGGTTGAAAAAAAAAG;SOR=2.899;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=26;WE=174943559;WS=174943541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr5	175511992	rs62389230	C	T	6954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=133;NR=100;PP=2965;SC=GTTGTTGCCTCGAAGGTATGT;SOR=1.054;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=233;TCF=133;TCR=100;TR=233;WE=175512000;WS=175511982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
chr5	175528527	rs116633144	A	T	200.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.13;QD=25.10;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	175530166	rs146119027	G	C	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.26;MQRankSum=-2.801;QD=10.05;ReadPosRankSum=0.102;SOR=0.653;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,23:0.44:52
chr5	175792605	rs2303667	G	C	4275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=83;NR=61;PP=2117;SC=TGCTGGCGCTGGGCGGCGCCG;SOR=0.944;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=145;TCF=83;TCR=62;TR=144;WE=175792613;WS=175792595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr5	175793717	rs3815898	C	T	937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=25;PP=693;SC=CACCGCTCTCCGGGGCACAGG;SOR=3.477;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=29;WE=175793725;WS=175793707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	175811094	rs56989856	C	CGT	10389.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=30;NR=97;PP=2974;SC=GGAGTGTGCACGTGTGTGTAA;SOR=0.874;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=147;TCF=36;TCR=111;TR=127;WE=175811102;WS=175811084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,262:1.00:262
chr5	175823607	rs376796902	TAG	T	88.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=129;ReadPosRankSum=-0.142;SC=GGCAGAAGGTTAGAGAGAGAG;SOR=0.297;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=7;WE=175823618;WS=175823597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,7:0.27:26
chr5	175843461	rs33956988	CG	C	777.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=22;PP=781;SC=ACCCGAGCCGCGGGGGAGCCG;SOR=5.058;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=22;WE=175843469;WS=175843451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	175915835	rs2963667	C	T	1322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=30;NR=14;PP=736;SC=AGGAACTGTACTTTAGAGGAA;SOR=1.270;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=30;TCR=14;TR=44;WE=175915843;WS=175915825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr5	175923431	rs2963670	G	A	754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=0;PP=582;SC=AAAGTCTAAGGGTTGATCTTT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=175923439;WS=175923426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	175927262	rs377249587	CAG	C	107.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=7.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQRankSum=2.670;QD=1.61;ReadPosRankSum=-2.133;SOR=2.590;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,12:0.18:67
chr5	175933691	rs113700453	TGTGTGTGC	T	908.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=9;NR=0;PP=887;SC=ACTTCAGAGTTGTGTGTGCGT;SOR=3.816;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=9;WE=175933706;WS=175933681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	175956271	rs890835	A	C	7592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=134;NR=130;PP=2965;SC=ACCCAGGAGCAGACCTGGGCA;SOR=0.773;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=264;TCF=134;TCR=130;TR=264;WE=175956279;WS=175956261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,285:1.00:285
chr5	175956516	rs2241585	G	A	4750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=67;PP=2548;SC=GTGGGGCAGGGTACTCACAGC;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=151;TCF=84;TCR=67;TR=151;WE=175956524;WS=175956497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr5	175992258	rs6556275	A	G	4733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.24;SOR=1.265;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr5	175992266	rs11749894	C	G	4856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.98;SOR=1.081;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr5	175994173	rs11392917	C	CT	228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.30;ReadPosRankSum=-0.218;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,15:0.94:16
chr5	175995935	rs10056130	C	T	7353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=143;NR=108;PP=2965;SC=GGCTCACCACCGGCCCCTTCT;SOR=0.903;SbPval=0.53;Source=Platypus;TCF=143;TR=251;WE=175995943;WS=175995925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,270:1.00:270
chr5	176001975	rs1078450	T	C	517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=3;PP=382;SC=CTGGTGCCAGTGGCGTGACTG;SOR=3.383;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=176001983;WS=176001965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	176002144	rs4242200	A	C	7694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=139;NR=117;PP=2965;SC=ATGGCTCCATAGTCCTCAATG;SOR=0.764;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=256;TCF=139;TCR=117;TR=256;WE=176002152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,292:1.00:292
chr5	176002873	rs3762969	C	T	5052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=69;PP=2965;SC=CTGTCAGAACCCTGCTCTCTA;SOR=0.880;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=95;TCR=70;TR=164;WE=176002881;WS=176002863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr5	176002926	rs3762968	C	A	6207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=121;NR=85;PP=2965;SC=TGGCTCTCTGCCCTCTGCCCT;SOR=0.883;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=206;TCF=121;TCR=85;TR=206;WE=176002934;WS=176002916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr5	176004312	rs11749537	A	G	695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=4;PP=592;SC=CGGGCGGGGCATCCAGAGATA;SOR=3.098;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=27;WE=176004320;WS=176004302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr5	176004476	rs11134982	T	C	4029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=70;PP=2242;SC=GAGCGGGCAGTGGGCTCAGCC;SOR=0.706;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=142;TCF=72;TCR=70;TR=142;WE=176004484;WS=176004466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr5	176004846	rs1565149	C	T	2104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=46;PP=1331;SC=AGCAAGCGGGCGTGCATGTGT;SOR=2.115;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=12;TCR=46;TR=58;WE=176004854;WS=176004836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr5	176004866	rs35146200	A	AGT	1170.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.695;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=61.19;MQRankSum=0.814;NF=5;NR=16;PP=954;ReadPosRankSum=-1.300;SC=TGAGTGTGAGAGTGTGTGTGT;SOR=0.156;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=37;TCF=5;TCR=32;TR=21;WE=176004874;WS=176004856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,35:0.92:38
chr5	176005175	rs1565150	A	C	4402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.59;SOR=0.713;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr5	176005184	rs1565151	G	A	2686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.35;ReadPosRankSum=1.080;SOR=0.732;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,104:0.98:106
chr5	176005477	rs2358747	C	T	6111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=110;NR=103;PP=2965;SC=AGGCCACAGACGGCGGGAACC;SOR=0.711;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=214;TCF=110;TCR=104;TR=213;WE=176005485;WS=176005467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr5	176008238	rs4867840	G	T	885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=3;PP=596;SC=CAGGCCTGATGACTGCCTGCG;SOR=3.841;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=25;WE=176008246;WS=176008228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr5	176011264	rs752139	T	C	3182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=63;PP=1909;SC=GATCCAGGTATGTGCTCCCTG;SOR=1.015;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=50;TCR=63;TR=113;WE=176011272;WS=176011254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr5	176012067	rs11745507	C	T	730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=20;PP=499;SC=TTAGGGGCCGCGGGAAGGAGC;SOR=1.382;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=30;WE=176012075;WS=176012057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr5	176017455	rs2291442	C	T	3580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=50;NR=62;PP=2156;SC=GACTCGCTGACGCAGCTGCTG;SOR=1.092;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=112;TCF=50;TCR=62;TR=112;WE=176017463;WS=176017445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr5	176018545	rs11134984	G	A	1368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=36;PP=924;SC=AGTGACGGTGGTGGTGGTGAT;SOR=2.880;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=10;TCR=36;TR=46;WE=176018553;WS=176018535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr5	176024880	rs4868663	C	T	4344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=93;NR=41;PP=2839;SC=CCCCTGCTTCCCCTGGTGCTG;SOR=1.546;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=93;TCR=41;TR=134;WE=176024888;WS=176024870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr5	176025938	rs6556276	T	C	6589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=120;NR=105;PP=2965;SC=TCCAAGGGCATGGGATCTGCC;SOR=0.750;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=225;TCF=120;TCR=105;TR=225;WE=176025946;WS=176025928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr5	176026119	.	TCTCAAAGACCCAGGATCCTCCTTC	T	2965	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=25;MQ=62.79;NF=11;NR=51;PP=2965;QD=20;SC=GATCCACCTTTCTCAAAGACC;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=12;TCR=56;TR=62;WE=176026154;WS=176026109;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,62:0.91:68
chr5	176026121	.	TCAAAGACCCAGGA	T	6379.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.38;QD=44.61;SOR=0.991;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr5	176026135	.	TCCTCCTTCCTC	T	6373.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.52;QD=44.57;SOR=0.991;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr5	176026146	.	C	T	2269	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=63.35;NF=49;NR=51;PP=2269;QD=23.0377121255;SC=CCTCCTTCCTCGGTGACACTG;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=108;TCF=50;TCR=58;TR=100;WE=176026154;WS=176026109;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:8,100:0.93:108
chr5	176053336	rs5873543	GGT	G	356.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.19;MQRankSum=0.787;QD=20.98;ReadPosRankSum=0.496;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,14:0.82:17
chr5	176056529	rs4868669	A	G	3370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=45;PP=1882;ReadPosRankSum=-1.379;SC=CCCGCCCCTTACCCACCGACG;SOR=0.924;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=109;TCF=64;TCR=45;TR=108;WE=176056537;WS=176056519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,123:0.98:125
chr5	176069831	rs901740	G	A	1609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=20;NR=35;PP=922;SC=TCTACCCCCAGTGCACCATGG;SOR=1.850;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=57;TCF=20;TCR=37;TR=55;WE=176069839;WS=176069821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr5	176069866	rs112646659	C	G	33.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=3;PP=30;SC=CCCCCCCCCCCGCCCCAGGTG;SOR=0.693;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=3;WE=176069874;WS=176069856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr5	176070004	rs13176195	G	A	930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=7;PP=718;SC=CCCTCCTGGAGCAGGGGATGG;SOR=1.911;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=30;WE=176070012;WS=176069994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr5	176081856	rs13183320	A	G	6914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=135;NR=92;PP=2965;SC=GGCTCCTGGGATGGGCCTGGC;SOR=1.067;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=227;TCF=135;TCR=92;TR=227;WE=176081864;WS=176081846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr5	176083175	rs6878977	T	G	2224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=45;PP=1391;SC=GGGTACTGGGTTGGGTATGAG;SOR=1.193;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=78;TCF=31;TCR=47;TR=76;WE=176083183;WS=176083165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr5	176083997	rs4868677	G	A	4144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=55;NR=91;PP=2554;SC=CCTGGCCTACGCAGGCCTCTG;SOR=1.390;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=146;TCF=55;TCR=91;TR=146;WE=176084005;WS=176083987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr5	176304399	rs2304517	A	G	1525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=19;PP=1225;SC=GGAAAGAGCTATGCCTAAGCC;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=27;TCR=19;TR=46;WE=176304407;WS=176304389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr5	176305466	rs2304516	T	A	9534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=354;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=161;NR=162;PP=2965;SC=CCTCTCTGCATCCCCATCAGG;SOR=0.763;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=323;TCF=161;TCR=162;TR=323;WE=176305474;WS=176305456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,352:1.00:352
chr5	176305678	rs478253	C	T	1085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.021;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=31;PP=841;ReadPosRankSum=-0.181;SC=GTGACGTGCTCCCACTACCAA;SOR=2.288;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=40;WE=176305686;WS=176305668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,39:0.98:40
chr5	176306676	rs2292257	G	A	1232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=10;PP=875;SC=AGGAGGTGTCGGCTGGGGCCA;SOR=1.556;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=28;TCR=10;TR=38;WE=176306684;WS=176306666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr5	176316344	rs691044	G	A	3459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=37;PP=2348;SC=TCATAGACAGGGCCTGGAACC;SOR=1.590;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=114;TCF=77;TCR=37;TR=114;WE=176316352;WS=176316334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr5	176323298	rs691141	G	A	673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=17;PP=434;SC=GAAGCTGGGAGCAGAATTCAG;SOR=2.494;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=176323306;WS=176323288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr5	176333126	rs2292256	C	T	2625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=40;PP=1331;SC=CTTTTGCTTCCGTGCTCTAGG;SOR=0.969;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=77;TCF=37;TCR=40;TR=77;WE=176333134;WS=176333116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr5	176334195	rs2292255	C	T	5044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=68;PP=2862;SC=CAGAGAAAAACAGATGAAAAG;SOR=1.029;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=171;TCF=103;TCR=68;TR=170;WE=176334203;WS=176334185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr5	176378574	rs365132	G	T	3968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=78;PP=2446;SC=AACTTAGCTGGGTCTCTGTAA;SOR=1.235;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=51;TCR=78;TR=129;WE=176378582;WS=176378564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr5	176402401	rs1700490	G	A	5647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=121;NR=66;PP=2965;SC=ACATACGTGCGATTTTTCTTT;SOR=1.390;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=187;TCF=121;TCR=66;TR=187;WE=176402409;WS=176402391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr5	176471286	rs11448853	A	AG	915.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=6;PP=567;SC=TTAATGTGTGAGGGGGGCCAT;SOR=1.942;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=18;WE=176471294;WS=176471276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr5	176471591	rs149307	C	T	847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=21;PP=585;SC=CAGGGCACTACTGCCAGGGGC;SOR=2.019;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=30;WE=176471599;WS=176471581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr5	176516953	rs434434	A	G	1956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=34;NR=33;PP=1008;SC=TGAGCTCCTTACCTGGGTGTG;SOR=0.920;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=67;TCF=34;TCR=33;TR=67;WE=176516961;WS=176516943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr5	176517136	rs59390048	C	CGT,CGTGT	974.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=18,18;NR=2,2;PP=134,535;ReadPosRankSum=-0.134;SC=TGTGTGTATGCGTGTGTGTGT;SOR=1.765;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=20,20;WE=176517144;WS=176517126;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.27,0.69:26
chr5	176517170	rs387598	G	A	1348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=36;NR=15;PP=1024;SC=GGCCACTGTCGTGTGCACTAA;SOR=1.702;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=36;TCR=15;TR=51;WE=176517178;WS=176517160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr5	176517292	rs442856	A	G	6305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=120;NR=112;PP=2965;SC=CATGCGTTGCAAAGTGCTTGT;SOR=0.710;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=232;TCF=120;TCR=112;TR=232;WE=176517300;WS=176517282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr5	176517326	rs422421	T	C	5401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=94;PP=2965;SC=GGTGTGTTCTTTGTACACAGG;SOR=0.875;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=187;TCF=92;TCR=95;TR=184;WE=176517334;WS=176517316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr5	176517461	rs446382	T	G	1900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=25;PP=1342;SC=AGCCTGTGCGTCTGTGCTGTG;SOR=1.010;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=34;TCR=25;TR=59;WE=176517469;WS=176517451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr5	176517797	rs376618	C	T	14193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=519;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=243;NR=237;PP=2965;SC=CATAGGGACCCCTCGAATAGG;SOR=0.713;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=482;TCF=243;TCR=239;TR=480;WE=176517805;WS=176517787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,519:1.00:519
chr5	176518784	rs452885	C	T	5340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=90;NR=103;PP=2965;SC=GCAGCATCCGCTATAACTACC;SOR=0.920;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=193;TCF=90;TCR=103;TR=193;WE=176518792;WS=176518774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr5	176519287	rs393923	G	A	1023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=6;PP=700;SC=TATGGGTGCCGGTGGTCAGGG;SOR=2.964;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=32;WE=176519295;WS=176519277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr5	176520243	rs351855	G	A	4546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=75;NR=71;PP=2559;SC=GCTGCTGGCCGGGCTGTATCG;SOR=0.872;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=147;TCF=75;TCR=72;TR=146;WE=176520251;WS=176520233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr5	176522728	rs42409	C	T	215.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=7;PP=170;SC=CCGGAAGGTACAGGCGCTAGG;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=176522736;WS=176522718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	176523562	rs31777	C	A	4371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=68;PP=2729;SC=CCCCGGTCGTCGGGAGGGCGC;SOR=0.918;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=154;TCF=86;TCR=68;TR=154;WE=176523570;WS=176523552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr5	176523597	rs31776	A	G	5580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=103;NR=90;PP=2965;SC=CCCTGGCCCTACCTCCAGGTG;SOR=0.772;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=193;TCF=103;TCR=90;TR=193;WE=176523605;WS=176523587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr5	176700885	rs12660023	G	A	908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=22;PP=625;SC=AGCATAGTTCGTTTTAGGTAG;SOR=3.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=26;WE=176700893;WS=176700875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr5	176721198	rs28580074	T	C	7198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=138;NR=102;PP=2965;SC=TCAGAGGCCATTGCTACCTGA;SOR=0.845;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=240;TCF=138;TCR=102;TR=240;WE=176721206;WS=176721188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr5	176721272	rs11740250	G	C	6099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=103;NR=96;PP=2965;SC=ACCTCGCTGGGTCAGGGACCA;SOR=0.711;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=199;TCF=103;TCR=96;TR=199;WE=176721280;WS=176721262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr5	176729736	.	ACC	A,AC	4143.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.153;ClippingRankSum=0.000;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=5.269;HP=12;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.355;NF=25,25;NR=99,99;PP=1434,328;ReadPosRankSum=0.106;SC=GACAGCCCAAACCCCCCCCCC;SOR=0.097;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=156;TCF=30;TCR=126;TR=124,124;WE=176729746;WS=176729726;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.46,0.51:154
chr5	176731452	rs28362590	G	T	803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=1;PP=613;SC=TGGCGGGAGTGGGAATTTGCC;SOR=4.255;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=24;WE=176731460;WS=176731442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr5	176733116	rs4631	A	G	6050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=96;PP=2965;SC=GTCTTGCCCGATTCAAAAGCA;SOR=0.739;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=198;TCF=102;TCR=96;TR=198;WE=176733124;WS=176733106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr5	176733341	rs4073745	A	G	5725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=111;NR=80;PP=2965;SC=CCTGGCCCAGAGGAGATTGGT;SOR=0.908;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=191;TCF=111;TCR=80;TR=191;WE=176733349;WS=176733331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr5	176733616	rs9834	T	C	4535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=73;PP=2770;SC=AGGCTTAGCCTCTCTGCCCTC;SOR=0.801;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=157;TCF=84;TCR=73;TR=157;WE=176733624;WS=176733606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr5	176734855	rs4568379	G	C	1566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=34;PP=899;SC=GCTCCCGCTCGGCCGCCCCTG;SOR=1.532;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=19;TCR=34;TR=53;WE=176734863;WS=176734845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr5	176737720	rs13190036	A	G	4540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=78;NR=70;PP=2560;SC=AGAGAGGATGAGGTGAAGGGG;SOR=0.804;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=148;TCF=78;TCR=70;TR=148;WE=176737728;WS=176737710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr5	176738538	rs62397242	C	A	4903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=93;NR=80;PP=2743;SC=CTGGTCCCAGCGGCAGCCCCA;SOR=0.714;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=174;TCF=93;TCR=81;TR=173;WE=176738546;WS=176738528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr5	176761535	rs11738681	A	G	1447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=35;PP=1027;SC=AGCACTGCCCAGCCGGCTAGG;SOR=2.448;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=11;TCR=35;TR=46;WE=176761543;WS=176761525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr5	176765395	rs11748912	G	A	632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=0;PP=522;SC=TGGTCCCCACGAGCCACAGGC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=176765403;WS=176765385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	176798040	rs56235845	T	G	2736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=63.25;QD=35.09;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr5	176798063	.	GCGGGGCCGGGCCGGGGCCGGGGCCGGGGC	G	2239.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=66.03;QD=43.92;SOR=0.900;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr5	176798306	rs11746443	G	A	6878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=124;NR=100;PP=2965;SC=GAGGAAGGGGGTCCAGGTGGG;SOR=0.791;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=224;TCF=124;TCR=100;TR=224;WE=176798324;WS=176798296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
chr5	176813404	rs3812036	C	T	4925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=84;PP=2965;SC=CCTTGGACAACGCTGGCTCAT;SOR=0.917;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=161;TCF=77;TCR=84;TR=161;WE=176813412;WS=176813394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr5	176814656	rs33921462	G	A	1134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=3;PP=760;SC=AGCATGGCAGGAGCGGCCACT;SOR=3.086;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=32;WE=176814664;WS=176814646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr5	176815124	rs5030873	T	C	5993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=101;PP=2965;SC=TCAACATCCATGGTGGCCGTG;SOR=0.711;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=204;TCF=102;TCR=102;TR=203;WE=176815135;WS=176815114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr5	176823596	rs74723663	C	G	83.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.75;QD=20.76;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	176830627	rs17876032	G	A	674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=13;PP=345;SC=GCCTGCGGGGGGGGTAGGGGA;SOR=2.124;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=19;WE=176830635;WS=176830617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr5	176831119	rs17876031	A	G	5599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=104;PP=2965;SC=CTGAGGACGGAGAGCCCGCGG;SOR=1.051;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=188;TCF=84;TCR=104;TR=188;WE=176831133;WS=176831109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr5	176831177	rs35966430	TC	T	5440.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.689;HP=9;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.382;NF=25;NR=78;PP=1951;ReadPosRankSum=-0.880;SC=GGCTCCTCCTTCCCCCCCCCA;SOR=0.515;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=118;TCF=27;TCR=91;TR=103;WE=176831185;WS=176831167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:5,189:0.97:194
chr5	176831589	rs17876047	G	A	6635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=122;NR=103;PP=2965;SC=ACGGCTGACAGGGCGCACCCG;SOR=0.734;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=225;TCF=122;TCR=103;TR=225;WE=176831597;WS=176831579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr5	176831826	rs17876030	C	G	1541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=15;PP=848;SC=TCGCAGAAGGCTCCGGTGTAG;SOR=1.101;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=31;TCR=15;TR=46;WE=176831834;WS=176831816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr5	176831980	rs17876029	T	C	4492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=90;NR=68;PP=2528;SC=CTCTCCTTCCTGGCACACCAC;SOR=0.900;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=158;TCF=90;TCR=68;TR=158;WE=176831988;WS=176831970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr5	176836532	rs1801020	A	G	6239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=117;PP=2965;SC=CCCTCATGGCATCCGTCCGTT;SOR=1.266;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=200;TCF=82;TCR=118;TR=198;WE=176836540;WS=176836522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr5	176885178	rs28538572	A	G	3559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=52;PP=2212;SC=GCAGCCAGGGACTCCCCTTCC;SOR=0.873;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=66;TCR=52;TR=118;WE=176885186;WS=176885168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr5	176895817	rs446104	GC	AA	11403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=125;NR=88;PP=2947;SC=GGTGGAGAAGGCGGCGAGGGA;SOR=0.918;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=221;TCF=129;TCR=92;TR=213;WE=176895826;WS=176895807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr5	176916516	rs335462	C	T	3273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=49;PP=1877;SC=TGGGCGTGGCCGGCTGGCTGT;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=55;TCR=49;TR=104;WE=176916524;WS=176916506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr5	176917078	rs734825	T	C	2680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=51;PP=1709;SC=GCTCCTGGGGTTCCCCTCATG;SOR=1.251;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=36;TCR=51;TR=87;WE=176917086;WS=176917068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr5	176930135	rs28376231	G	A	3345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=45;PP=1917;SC=GCTTGCGTGCGTGGCTGGCTC;SOR=1.016;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=67;TCR=45;TR=112;WE=176930143;WS=176930125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr5	176930171	rs138153794	AGAG	A	7888.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=19;NR=65;PP=2842;SC=GAGCAGGAGCAGAGGAGGGAA;SOR=0.875;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=95;TCF=24;TCR=71;TR=84;WE=176930186;WS=176930161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr5	176935215	rs55761704	GC	G	595.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=3;PP=420;SC=CAGCCCAATCGCCCCCCTGCT;SOR=2.531;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=14;WE=176935223;WS=176935205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	176936650	rs28565502	T	C	3863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=63;PP=2302;SC=TCCCTCCGTCTAGAGACAGCT;SOR=0.945;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=60;TCR=63;TR=123;WE=176936658;WS=176936640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr5	176938681	rs28695578	C	T	1886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=12;PP=1300;SC=CCTGGCCCATCCCAGGCCAGC;SOR=2.494;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=47;TCR=12;TR=59;WE=176938689;WS=176938671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr5	176939688	rs28544348	C	T	6116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=105;NR=101;PP=2965;SC=CACCATGGGACAGGGGAGTGG;SOR=0.785;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=208;TCF=106;TCR=102;TR=206;WE=176939696;WS=176939678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr5	176939735	rs335436	A	G	6150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=112;NR=95;PP=2965;SC=TAGGTAAAGCACTGCTACTGC;SOR=0.783;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=210;TCF=113;TCR=97;TR=207;WE=176939743;WS=176939725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr5	176940274	rs335437	C	T	1437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=4;PP=1084;SC=GGTGGACCCCCGGCTCCAATC;SOR=4.223;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=36;TCR=4;TR=40;WE=176940282;WS=176940264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr5	176940384	rs335438	G	A	9082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=163;NR=141;PP=2965;SC=CAGCCCCAGCGCGCCCCACAT;SOR=0.851;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=304;TCF=163;TCR=141;TR=304;WE=176940392;WS=176940374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,339:1.00:339
chr5	176940871	rs335439	G	C	5777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=104;PP=2965;SC=GAGAGACCCTGAGGTTGGGGC;SOR=1.134;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=185;TCF=81;TCR=104;TR=185;WE=176940879;WS=176940861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr5	176942371	rs372373486	CAG	C	33.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.99;ReadPosRankSum=-2.538;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,6:0.18:34
chr5	176950794	rs28723606	A	G	557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=0;PP=397;SC=GTGGGTTTTCAGCAGGCAGGC;SOR=4.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=176950802;WS=176950784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	176950879	rs28688891	T	C	4394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=97;NR=58;PP=2876;SC=TTTCTGAGGCTTGAGGCACAA;SOR=1.398;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=155;TCF=97;TCR=58;TR=155;WE=176950887;WS=176950869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr5	176951276	rs337382	A	G	5272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=96;NR=77;PP=2965;SC=GCTGGGCCTGAGGGCTGCACA;SOR=0.792;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=173;TCF=96;TCR=77;TR=173;WE=176951284;WS=176951266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr5	176963349	rs335460	G	A	3319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=63;NR=52;PP=1862;SC=CCTTCATGCAGCACACTTACC;SOR=0.759;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=63;TCR=52;TR=115;WE=176963357;WS=176963339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr5	177019688	rs4607363	G	C	4313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.416;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=83;PP=2160;ReadPosRankSum=-0.025;SC=TGAGCCAACCGCCCCCCTCCT;SOR=0.409;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=192;TCF=104;TCR=88;TR=179;WE=177019696;WS=177019675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:13,184:0.93:197
chr5	177031602	rs28499092	C	G	2200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=50;PP=1470;SC=GCTTCTCAGGCCCTGTGAGAG;SOR=1.501;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=29;TCR=50;TR=79;WE=177031610;WS=177031592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr5	177031954	rs28742937	A	G	3407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=19;PP=1365;SC=GTCTGGCGTTATCCTAAAATC;SOR=1.675;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=48;TCR=19;TR=67;WE=177031975;WS=177031944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr5	177031967	rs28698736	T	C	3911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=30;PP=1554;SC=CTAAAATCCCTGCCCTTACCA;SOR=1.493;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=63;TCR=30;TR=93;WE=177031975;WS=177031944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr5	177036043	rs6600953	A	G	4702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=88;PP=2667;SC=CATTGGGGACAGATAGGTGGT;SOR=1.121;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=157;TCF=69;TCR=88;TR=157;WE=177036051;WS=177036033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr5	177053334	rs5013573	T	C	621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=0;PP=642;SC=CCTCGGCCTCTGAAAATGCTG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=177053342;WS=177053324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	177054672	rs7728458	T	C	905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.54;QD=21.06;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr5	177058525	rs62398479	A	G	3482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.40;QD=28.09;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr5	177058655	rs6876792	A	G	6315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=116;NR=120;PP=2965;SC=GGCATGTCACAGTTCTGTACA;SOR=0.763;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=236;TCF=116;TCR=120;TR=236;WE=177058663;WS=177058645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr5	177161891	rs140979906	A	G	1079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.94;QD=32.72;SOR=7.054;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	177161998	rs200182580	C	G	107.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=26.76;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	177163580	rs201479484	A	G	184.88	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.097;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.29;MQRankSum=-2.362;QD=16.81;ReadPosRankSum=-2.362;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr5	177166053	rs4079422	G	A	3335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=43;PP=2200;SC=AGGCAAGAACGTGTCACCTTT;SOR=1.374;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=120;TCF=77;TCR=43;TR=120;WE=177166061;WS=177166043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr5	177180012	rs199881665	G	A	331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.79;QD=30.16;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	177180236	rs76556918	G	A	1952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=52;PP=1487;SC=ACTAAGCTGCGTTTACTGCCA;SOR=3.716;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=8;TCR=52;TR=60;WE=177180244;WS=177180226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr5	177236527	.	G	A	1352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.120;ClippingRankSum=0.000;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-6.183;NF=28;NR=41;PP=920;ReadPosRankSum=-0.415;SC=GGAATGGTAGGAGGGTGCCCG;SOR=0.672;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=131;TCF=51;TCR=80;TR=69;WE=177236535;WS=177236517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,65:0.59:110
chr5	177305797	rs201185054	G	A	414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.43;QD=31.91;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	177310717	rs139876295	A	G	568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.23;QD=31.60;SOR=5.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	177344152	rs76284623	G	T	464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.49;QD=24.46;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	177347910	rs200509090	G	C	113.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=28.26;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	177348037	.	C	CTTTG	650.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.62;QD=46.48;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	177348098	rs4958970	G	A	1235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.85;QD=42.61;SOR=1.942;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr5	177348106	rs4958971	A	C	1211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.63;QD=44.88;SOR=2.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr5	177348150	rs4958972	C	T	916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.65;QD=43.66;SOR=4.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	177348155	rs4958973	A	G	916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.65;QD=43.66;SOR=4.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	177422876	rs7445271	T	C	4060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=52;PP=2389;SC=AGGCAACAGGTTGCTGCCGAC;SOR=0.992;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=134;TCF=81;TCR=53;TR=133;WE=177422884;WS=177422866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr5	177422908	rs1135320	A	G	4736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=73;PP=2651;SC=TTGGCTTCTCAGCCTGGCGCC;SOR=0.819;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=164;TCF=91;TCR=73;TR=164;WE=177422916;WS=177422898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr5	177483118	rs11953798	T	C	3255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=65;PP=1765;SC=AGCAGGCAAGTGCCCTGAAGA;SOR=1.143;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=49;TCR=65;TR=114;WE=177483126;WS=177483108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr5	177547247	rs7719667	T	C	5330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=91;NR=82;PP=2958;SC=CCATGCAAAGTCTGGCGTCCC;SOR=0.703;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=173;TCF=91;TCR=82;TR=173;WE=177547255;WS=177547237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr5	177562183	rs72536798	C	CTG	264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=286;SC=GGGTCTCACTCTTGCTCAGGC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=177562191;WS=177562173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr5	177562251	rs10060446	G	A	834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=18;NR=12;PP=419;SC=GGCTCAAGCAGTCCTCCGTCC;SOR=0.880;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=18;TCR=12;TR=30;WE=177562259;WS=177562241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	177565520	rs10657977	T	TTGTGTG	154.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=25.79;ReadPosRankSum=0.210;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr5	177570759	rs6601218	T	C	2998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=69;PP=2127;SC=GCCAGCAGCATTCTGCTTCGA;SOR=2.608;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=20;TCR=69;TR=89;WE=177570767;WS=177570749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr5	177574901	rs7380934	C	G	8275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=137;NR=128;PP=2965;SC=TCCCCGTGCTCTACTCCACCT;SOR=0.762;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=265;TCF=137;TCR=128;TR=265;WE=177574909;WS=177574891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,300:1.00:300
chr5	177612634	rs7715618	A	C	118.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.21;QD=23.78;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr5	177612734	rs7720480	T	C	1231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.76;QD=45.62;SOR=2.066;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr5	177612739	rs72648831	G	T	1345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.77;QD=46.41;SOR=1.942;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr5	177612744	rs7715796	A	G	1300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.78;QD=43.36;SOR=2.019;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr5	177613123	rs10479619	T	C	11418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=413;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=165;NR=208;PP=2965;SC=CCTCATGCTATTTCCCTCTAG;SOR=1.014;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=373;TCF=165;TCR=208;TR=373;WE=177613131;WS=177613113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,412:1.00:412
chr5	177614183	rs2913783	T	C	3941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=-0.058;NF=67;NR=61;PP=2219;ReadPosRankSum=-1.025;SC=AAGCCGTAGCTCGCCGCATCG;SOR=0.804;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=130;TCF=68;TCR=62;TR=128;WE=177614191;WS=177614173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,150:0.99:152
chr5	177614387	rs6886332	A	G	1724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=21;PP=589;SC=TTCCCCGAGCACAGGTGCCTA;SOR=1.230;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=14;TCR=21;TR=35;WE=177614409;WS=177614377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr5	177614401	rs11960863	C	G	1445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=19;PP=525;SC=GTGCCTACACCGCCACCTTCT;SOR=1.542;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=9;TCR=19;TR=28;WE=177614409;WS=177614377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	177633116	rs3812089	A	G	693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=16;PP=485;SC=CATGTGATTTAAGTGCTTTGG;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=177633124;WS=177633106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	177634401	rs7705458	T	C	417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=10;PP=299;SC=GAAAGACTTCTCAGGCTGGGA;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=177634409;WS=177634391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	177636571	rs2913752	C	T	768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=23;PP=647;SC=AGGTTGGGGACGAACAGGAAT;SOR=4.174;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=177636579;WS=177636561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	177636990	rs111881090	CT	C	1193.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=4;PP=1163;SC=GCCCAGGGCCCTTATACACCA;SOR=3.611;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=29;WE=177636998;WS=177636980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	177637447	rs2913751	G	A	3713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=43;PP=2291;SC=GAGGAAGGCAGTCTCTGCTGT;SOR=1.162;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=126;TCF=83;TCR=43;TR=125;WE=177637455;WS=177637437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr5	177642177	rs2913748	C	T	3168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=73;NR=32;PP=1766;SC=CTCTTGAGAGCGGACATAACC;SOR=1.417;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=73;TCR=32;TR=105;WE=177642185;WS=177642167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr5	177658625	rs3833653	CG	C	1771.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=24;PP=1014;SC=TTTCTGGTGGCGGGGGGGAAA;SOR=0.871;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=45;TCF=16;TCR=29;TR=36;WE=177658633;WS=177658615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr5	177658883	rs2973729	C	A	473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=13;PP=356;SC=ATGGGATGGGCCAGGGCACCA;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=17;WE=177658904;WS=177658873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	177658896	rs3749810	A	C	281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=8;PP=209;SC=GGGCACCAACATTAGGTGCCT;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=177658904;WS=177658873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	177659429	rs3749806	C	A	227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=3;PP=109;SC=GTGCGTGCGTCGTGCGTGCGC;SOR=1.085;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=9;WE=177659437;WS=177659419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	177659463	rs138665724	C	A	446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.82;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	177659519	rs116735771	C	G	1222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.95;SOR=0.909;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr5	177665554	rs58562702	T	C	229.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=5;NR=2;PP=87;SC=GCCGGTGGCTTTGGGGCTGGG;SOR=1.179;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=177665562;WS=177665544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	177666112	rs73336873	G	C	3266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=74;NR=39;PP=2058;SC=CCTCTCCCAAGCCTGCCCTGG;SOR=1.355;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=113;TCF=74;TCR=39;TR=113;WE=177666120;WS=177666102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr5	177668882	rs2241581	T	C	779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=0;PP=614;SC=ACCGCGATGATGGCAGTAGCA;SOR=5.058;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=177668890;WS=177668872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	177668965	rs2241580	C	T	4359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=66;PP=2554;ReadPosRankSum=1.887;SC=AGCTGAGTTCCGAGGACAGGG;SOR=0.872;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=153;TCF=87;TCR=66;TR=152;WE=177668973;WS=177668955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,168:0.99:170
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chr5	177673153	rs35716676	AGTGCAGGGACCCAGTGAG	A	911.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=1;PP=2930;SC=GGCCCTGCGAAGTGCAGGGAC;SOR=4.003;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=15;WE=177673178;WS=177673149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
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chr5	177674995	rs11746830	C	T	1639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=37;PP=1086;SC=TATAGTGAGCCGAGGTTGTGC;SOR=2.107;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=14;TCR=37;TR=51;WE=177675003;WS=177674985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
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chr5	177715302	rs5873603	CA	C	4085.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=54;PP=2194;SC=GTGAAGAGAGCAAAAAAATAA;SOR=0.952;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=87;TCF=31;TCR=56;TR=79;WE=177715310;WS=177715281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr5	177715477	rs2913833	G	T	1690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=38;PP=1126;SC=TTCCTCTGCAGCGGGAGGACT;SOR=1.812;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=18;TCR=38;TR=56;WE=177715485;WS=177715467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr5	177715581	rs2913832	T	C	1563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=19;PP=899;SC=TCATCGGGGCTCCGGGCACAG;SOR=0.877;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=31;TCR=19;TR=50;WE=177715589;WS=177715571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr5	178288214	rs112879314	C	G	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.99;QD=21.37;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr5	178310446	rs4130052	C	T	7310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=129;NR=120;PP=2965;SC=ACAATCCAGGCAGGAAGGCAT;SOR=0.708;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=249;TCF=129;TCR=120;TR=249;WE=178310454;WS=178310436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,274:1.00:274
chr5	178358220	rs200888524	ATT	A	306.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;QD=30.67;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	178359136	rs961030	A	G	5117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=77;PP=2891;SC=AGTGTAGTCAATGTGGAAAAG;SOR=0.704;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=165;TCF=88;TCR=77;TR=165;WE=178359144;WS=178359126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr5	178391860	rs6867221	G	A	6817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=122;NR=108;PP=2965;SC=TCACAGGAATGTGATGAATCC;SOR=0.733;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=230;TCF=122;TCR=108;TR=230;WE=178391868;WS=178391850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chr5	178396742	rs4700759	G	C	1209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=31;PP=951;SC=ACCTCGGAGCGTTCCGAGACC;SOR=2.191;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=41;WE=178396750;WS=178396732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr5	178401555	rs7728828	G	A	1467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=12;PP=1045;SC=TCCTGACCTCGTGATCCACCT;SOR=2.348;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=38;TCR=12;TR=50;WE=178401563;WS=178401545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr5	178401610	rs11740252	C	T	3793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=53;PP=2244;SC=TGAGCCACCGCGCCCGGCCTC;SOR=0.976;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=129;TCF=76;TCR=53;TR=129;WE=178401618;WS=178401600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr5	178401703	rs11740277	C	G	6051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=108;NR=109;PP=2965;SC=TGCATTGTTCCTACATTATGC;SOR=0.772;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=217;TCF=108;TCR=109;TR=217;WE=178401711;WS=178401693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr5	178407292	rs2856351	C	T	5210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=110;NR=62;PP=2965;SC=GGACATAAAACTCCATAACTT;SOR=1.197;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=172;TCF=110;TCR=62;TR=172;WE=178407300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr5	178410738	rs903988	C	T	5714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=107;NR=87;PP=2965;SC=CCGAGGAGTACTGGAGTCTGT;SOR=0.851;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=194;TCF=107;TCR=87;TR=194;WE=178410746;WS=178410728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr5	178410839	rs2856348	G	A	4292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=63;NR=72;PP=2276;SC=GAACAGGAACGAAGCCACCTG;SOR=0.944;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=135;TCF=63;TCR=72;TR=135;WE=178410847;WS=178410829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr5	178411244	.	CA	C	546	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;FR=0.5000;HP=4;HapScore=1;MGOF=135;MMLQ=25;MQ=60.31;NF=23;NR=34;PP=546;QD=10.1228070175;SC=CGGTAACCACCAAAACGGCCC;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=65;TCF=23;TCR=42;TR=57;WE=178411252;WS=178411234;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:8,57:0.88:65
chr5	178411290	rs11279361	AGCACGCCTC	A	5133.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=11;NR=41;PP=2977;SC=GGAGCGAGCGAGCACGCCTCA;SOR=0.748;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=54;TCF=12;TCR=42;TR=52;WE=178411306;WS=178411280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr5	178411315	rs2645341	C	T	5291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.25;QD=42.00;SOR=0.791;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr5	178412273	rs35715923	T	C	4908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=84;NR=85;PP=2965;SC=TTCACTGTTGTACAGAAAGAT;SOR=0.852;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=170;TCF=85;TCR=85;TR=169;WE=178412281;WS=178412263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr5	178413816	rs2256966	T	C	5851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=108;NR=87;PP=2965;SC=CATGCCCACCTGGGGCTCGGT;SOR=0.798;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=196;TCF=108;TCR=88;TR=195;WE=178413824;WS=178413806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr5	178413947	rs11746675	T	C	6523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=108;NR=103;PP=2965;SC=CGGGCGCATCTCCGTTCTCGT;SOR=0.735;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=211;TCF=108;TCR=103;TR=211;WE=178413955;WS=178413937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr5	178414565	rs2645340	C	T	1612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=33;PP=969;SC=GTCACACATGCGCAAATACCG;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=18;TCR=33;TR=51;WE=178414573;WS=178414555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr5	178415937	rs2067011	A	G	521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=0;PP=378;SC=CCCACTCACCATTGAAGCGGA;SOR=4.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=178415945;WS=178415927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	178415982	rs4701014	A	G	1939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=18;PP=1247;SC=TCCGCCCATCAGTGGGTTCCA;SOR=2.062;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=51;TCR=18;TR=69;WE=178415990;WS=178415972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr5	178416063	rs2645339	G	A	6141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=118;NR=89;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.247;SC=GGGCAATGGCGTACACCGCAT;SOR=0.887;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=209;TCF=119;TCR=90;TR=207;WE=178416071;WS=178416053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,235:0.99:237
chr5	178416203	rs143495088	CCCCTCCCCA	C	2056.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=14.860;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=2974;ReadPosRankSum=1.705;SC=TCCCGCCTTCCCCCTCCCCAC;SOR=3.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=5;TCR=48;TR=16;WE=178416226;WS=178416193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,51:0.96:53
chr5	178416288	rs2071246	G	A	2556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=32;PP=1607;SC=GGGTGGAATCGTCTGACTGGG;SOR=1.076;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=56;TCR=32;TR=88;WE=178416296;WS=178416278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr5	178419279	rs11283410	G	GGGCAAGGTCT	6871.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=33;PP=2967;SC=TGGAAGCTGTGGTGTTTTGCG;SOR=0.787;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=67;TCF=19;TCR=48;TR=50;WE=178419296;WS=178419269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr5	178419288	rs2645335	C	T	6800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=54;PP=2291;SC=TGGTGTTTTGCGAGTGGGCCT;SOR=0.730;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=113;TCF=59;TCR=54;TR=113;WE=178419296;WS=178419269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr5	178419396	rs11449973	A	AC	7357.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=81;PP=2969;SC=CTGAACAAGGACCCCCAGCAG;SOR=0.710;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=126;TCF=31;TCR=95;TR=111;WE=178419404;WS=178419386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr5	178421351	rs2645330	T	C	75.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=1;PP=54;SC=GGAGACTCTTTCAGAAGAAGT;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=178421359;WS=178421341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr5	178421770	rs2645329	T	G	1506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.98;SOR=0.997;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr5	178451854	rs35568336	A	G	151.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=6;NR=0;PP=117;SC=TGGCCTGGGCAGTTCCAGGCT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=178451862;WS=178451844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr5	178451932	rs34881171	C	T	1069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=11;PP=624;SC=GGCATGCAGGCTGGATGAAAA;SOR=1.445;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=25;TCR=11;TR=36;WE=178451940;WS=178451922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr5	178455247	rs2047354	T	C	432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=336;SC=GCTGGGAAGGTAGATCCTTTC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=178455255;WS=178455237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	178459169	rs10516150	G	C	700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=5;PP=427;SC=TTAAAATTCTGAGTTCAAGAG;SOR=1.893;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=23;WE=178459177;WS=178459159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	178459283	rs17078988	A	G	2208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=29;PP=1350;SC=AATTGATGGCACATTTGACTT;SOR=1.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=76;TCF=46;TCR=30;TR=75;WE=178459291;WS=178459273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr5	178459426	rs17078991	A	C	6105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=109;NR=80;PP=2965;SC=AAGGTGTTGAATTTGGGAAAA;SOR=0.880;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=189;TCF=109;TCR=80;TR=189;WE=178459434;WS=178459416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr5	178503338	rs4701030	A	C	2734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=32;PP=1885;SC=AGTTGACGTGAATTATTAGAA;SOR=1.519;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=97;TCF=65;TCR=32;TR=96;WE=178503346;WS=178503328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr5	178504338	rs6601010	G	A	402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=12;PP=281;SC=CCTAATTGCAGTTATCTAATG;SOR=3.126;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=178504346;WS=178504328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	178507069	rs1445846	T	C	3664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.485;HP=5;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=77;PP=2442;ReadPosRankSum=-0.716;SC=TCAGAGATTTTTTAAAGGAGA;SOR=1.280;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=45;TCR=77;TR=121;WE=178507077;WS=178507059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,131:0.99:132
chr5	178507090	rs1445845	G	A	2728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=63;PP=1875;SC=TAAAGCCTATGAGGTTTAGTT;SOR=2.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=22;TCR=63;TR=85;WE=178507098;WS=178507080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr5	178553185	rs2303643	G	A	3407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=76;PP=2136;SC=CTGCCCGAGGGTGCAAGGAGG;SOR=1.397;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=121;TCF=45;TCR=76;TR=121;WE=178553193;WS=178553175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr5	178634619	rs423552	C	T	8394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=139;NR=133;PP=2965;SC=AGTCATCGTCCGCAGCATGCC;SOR=0.805;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=272;TCF=139;TCR=133;TR=272;WE=178634627;WS=178634609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,319:1.00:319
chr5	178634672	rs398829	C	T	3934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=77;PP=2169;SC=TCCTCTAGGACGCCCAGGGCG;SOR=1.577;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=123;TCF=46;TCR=77;TR=123;WE=178634680;WS=178634662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr5	178768401	rs76429249	G	T	473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=8;NR=10;PP=232;SC=AGAGAAAGAGGACAAGCGAAA;SOR=1.127;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=8;TCR=10;TR=18;WE=178768409;WS=178768391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	178770718	rs2271214	A	G	1939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=23;PP=1180;SC=CTTTTCCAAAACCCAGGCGAG;SOR=1.226;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=41;TCR=23;TR=64;WE=178770726;WS=178770708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr5	178770759	rs2271213	C	G	3508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=46;PP=2095;SC=TAGAGAAGTGCGTACTCACCA;SOR=1.005;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=70;TCR=46;TR=116;WE=178770767;WS=178770749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr5	178770981	rs2271212	A	G	8634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=154;NR=136;PP=2965;SC=AGAAGAGGTGACTGCCAGGCT;SOR=0.812;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=291;TCF=154;TCR=137;TR=290;WE=178770989;WS=178770971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,318:1.00:318
chr5	178772259	.	G	GGCA	198.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.969;ClippingRankSum=-0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.276;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=2;PP=185;ReadPosRankSum=-0.979;SC=GAGCGGCGGCGGCAGCAGCAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=2;WE=178772267;WS=178772249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr5	178949465	rs28646142	G	A	143.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.50;QD=28.78;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr5	178949499	rs28689892	C	T	608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.49;QD=30.44;SOR=6.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	178949560	rs28413987	AG	GT	9304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=120;NR=71;PP=2947;SC=AGTGTTATTGAGACAGAGCTG;SOR=1.322;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=198;TCF=122;TCR=76;TR=191;WE=178949569;WS=178949550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr5	178949781	rs28420183	A	G	761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.51;QD=33.12;SOR=3.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	178950207	rs142217072	A	G	56.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.34;QD=18.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr5	178950263	rs34793499	GA	G	55.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=18.42;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr5	178951351	rs145029017	A	C	135.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.61;QD=27.18;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr5	178951365	rs138816614	C	G	289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.80;QD=28.98;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	178951598	rs4701188	G	A	8892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=177;NR=166;PP=2965;SC=GGCCACCTGCGAGCACCCTAT;SOR=0.871;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=343;TCF=177;TCR=166;TR=343;WE=178951606;WS=178951588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,327:1.00:327
chr5	178986978	rs7704349	C	G	1713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=37;NR=18;PP=996;SC=AGTCTGACCTCCCCACGCTCA;SOR=1.270;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=37;TCR=18;TR=55;WE=178986986;WS=178986968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr5	178989386	rs28611242	A	G	403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=1;PP=269;SC=TAGCCTGGGCAGTAGAGTAAG;SOR=2.712;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=178989394;WS=178989376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	178989473	rs28510162	T	G	3073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=65;NR=36;PP=1565;SC=TTGGCTTTTGTGGGGAGAGGC;SOR=0.932;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=65;TCR=36;TR=101;WE=178989481;WS=178989463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr5	178996435	rs11743261	A	G	5921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=107;NR=84;PP=2965;SC=AGGTAAAATGAAATTTTGGCT;SOR=0.818;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=191;TCF=107;TCR=84;TR=191;WE=178996443;WS=178996425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr5	179012968	rs13361148	A	G	4683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=87;PP=2793;SC=GCTGGTAGGAAGGGGACTTGC;SOR=0.902;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=78;TCR=87;TR=165;WE=179012976;WS=179012958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr5	179020622	rs4701135	T	C	6372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=86;NR=115;PP=2965;SC=AAGCGATTAATTTACAGATGT;SOR=1.144;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=201;TCF=86;TCR=115;TR=201;WE=179020630;WS=179020612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr5	179025550	rs4701136	A	G	957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=6;PP=624;SC=GTGACCCTGGAGGAGAGGGAA;SOR=2.235;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=29;WE=179025558;WS=179025540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	179025789	rs72824522	G	A	4818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=90;PP=2965;SC=CTCTACTCAGGATGGAGCTGC;SOR=1.172;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=155;TCF=65;TCR=90;TR=155;WE=179025797;WS=179025779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr5	179032755	rs6877888	C	T	1591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=17;PP=1107;SC=TAACAACTCACGTTCTGGGTC;SOR=1.569;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=37;TCR=17;TR=54;WE=179032763;WS=179032745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr5	179034368	rs72824531	G	A	293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=1;PP=199;SC=GAGGCCAAGAGGTGGAGCACG;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=179034376;WS=179034360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	179034707	rs72824532	C	T	709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=21;PP=543;SC=AGTCGTTGCCCGCTGGATTCC;SOR=2.670;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=26;WE=179034715;WS=179034697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr5	179036608	rs8087	T	A	699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=18;PP=524;SC=TTCCCAAGAGTATCAAAGGAA;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=179036616;WS=179036598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	179043075	rs4515257	T	C	4680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=45;PP=2760;SC=AGTACAGTAATGAACAGGCTT;SOR=1.756;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=148;TCF=103;TCR=45;TR=147;WE=179043083;WS=179043065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr5	179048205	rs4701144	T	C	3141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=36;PP=1729;SC=TATTGTTTAATGCTTTATTTA;SOR=1.258;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=68;TCR=36;TR=104;WE=179048213;WS=179048195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr5	179049138	rs4301193	C	A	279.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=230;SC=ACTGCAAAAACACTTCCCTGG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=179049146;WS=179049128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	179069309	rs6887611	G	C	5183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=117;NR=70;PP=2965;SC=TGTGGGGTGCGCAGATGAGGG;SOR=1.341;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=187;TCF=117;TCR=70;TR=187;WE=179069317;WS=179069299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr5	179069912	rs75942553	C	T	9548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=359;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-0.538;NF=159;NR=168;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.354;SC=TGATAGGGTGCTCGCAGGTGG;SOR=0.825;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=329;TCF=160;TCR=169;TR=327;WE=179069920;WS=179069902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,354:0.99:356
chr5	179071629	rs199764762	A	G	311.56	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=5.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.86;MQRankSum=-2.128;QD=22.25;ReadPosRankSum=-1.784;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,12:0.86:14
chr5	179078391	rs57380196	C	T	2721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=62;PP=1802;SC=GTCCTCCTTCCTACCAGGACC;SOR=2.204;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=23;TCR=62;TR=85;WE=179078399;WS=179078381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr5	179078940	rs6882398	T	C	9113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=160;NR=163;PP=2965;SC=TCAGCTCCTCTCAGCCACCAG;SOR=0.705;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=323;TCF=160;TCR=163;TR=323;WE=179078948;WS=179078930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,334:1.00:334
chr5	179126090	rs1134924	C	T	1202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=23;NR=15;PP=633;SC=CCCGCGGTCCCCGGGAGGCTA;SOR=0.829;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=23;TCR=15;TR=38;WE=179126098;WS=179126080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr5	179135955	rs111374658	T	G	3048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=25;PP=2051;SC=CCATACAGTTTTCTGCTTTTC;SOR=1.751;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=68;TCR=25;TR=93;WE=179135963;WS=179135945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr5	179136138	rs6601068	A	G	1845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=45;PP=1321;SC=GGCCGGGTGCAGTGGCTCACG;SOR=2.457;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=12;TCR=45;TR=57;WE=179136146;WS=179136128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr5	179136986	.	A	G	6991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=101;NR=136;PP=2965;SC=ACGGGTATCTATGAAGAAAAA;SOR=1.101;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=237;TCF=101;TCR=136;TR=237;WE=179136994;WS=179136976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,259:1.00:259
chr5	179160402	rs61751563	G	C	427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=11;PP=236;SC=CGCCGCTGACGGCCCCGAGCA;SOR=2.712;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=179160410;WS=179160392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	179222656	.	C	A	3190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=46;NR=61;PP=1730;SC=CACCGGCCCACCCGAGTTCGA;SOR=1.160;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=46;TCR=61;TR=107;WE=179222664;WS=179222646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr5	179233663	.	A	AGGC	468.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=61.34;NF=0;NR=11;PP=555;SC=AGGGGTCGGAAGGCGGCGGCG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=11;WE=179233671;WS=179233653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	179260153	rs4935	C	T	4772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=74;NR=82;PP=2599;SC=GCTGCTCTGACCCCAGCAAGC;SOR=0.871;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=156;TCF=74;TCR=82;TR=156;WE=179260161;WS=179260143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr5	179260213	rs4797	G	A	1821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=40;PP=1203;SC=AGCAGATGAGGAAGATCGCCT;SOR=1.926;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=15;TCR=40;TR=55;WE=179260221;WS=179260203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr5	179260494	rs155787	G	A	1249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=4;PP=877;SC=GTGTGCATGCGTGCTCCCCGA;SOR=3.312;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=33;TCR=4;TR=37;WE=179260502;WS=179260484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr5	179264731	rs10277	T	C	4536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=77;NR=75;PP=2377;SC=CAGGACAAATTGCGCCCATTT;SOR=0.801;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=153;TCF=77;TCR=76;TR=152;WE=179264739;WS=179264721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr5	179264915	rs1065154	G	T	575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=14;PP=376;SC=TGCCCTCCATGTGTAAGAACA;SOR=2.531;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=18;WE=179264923;WS=179264905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	179267783	rs248247	G	A	5127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=96;NR=72;PP=2675;SC=GGTAGGAATCGCACACTTCGT;SOR=0.879;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=168;TCF=96;TCR=72;TR=168;WE=179267791;WS=179267773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr5	179267949	rs248248	T	C	2257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=53;PP=1366;SC=ACGGTGCTCCTGCTCCACTTC;SOR=1.637;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=26;TCR=53;TR=79;WE=179267957;WS=179267939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr5	179278466	rs4700702	A	G	2222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=47;PP=1511;SC=AAAATAGAGTAAAGATATAGG;SOR=1.463;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=24;TCR=48;TR=71;WE=179278474;WS=179278456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr5	179280379	rs1650893	T	C	5765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=85;PP=2962;SC=AGGACTCACCTGCAAAAAGGA;SOR=0.740;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=185;TCF=100;TCR=85;TR=185;WE=179280387;WS=179280369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr5	179285752	rs10060182	G	A	1817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=15;PP=1303;SC=GGAAGAGGCGGCAGCTGCAGC;SOR=1.888;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=42;TCR=15;TR=57;WE=179285760;WS=179285742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr5	179287207	rs148609553	CGT	C	37.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.301;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=0;PP=51;ReadPosRankSum=-0.586;SC=TATTTTCTGGCGTGTGTGTGT;SOR=0.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=2;WE=179287216;WS=179287197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr5	179287576	rs248254	C	G	8328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.11;QD=43.61;SOR=1.185;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr5	179287585	rs416974	G	C	8628.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.12;QD=46.39;SOR=1.154;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr5	179287586	rs378684	C	T	8477.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.11;QD=45.34;SOR=1.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr5	179287622	rs1611076	G	GTA	7509.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=62;PP=2957;SC=CTCCCTTGCTGTAGCAAGCTC;SOR=0.819;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=94;TCF=21;TCR=73;TR=81;WE=179287630;WS=179287612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr5	179290845	rs30386	T	G	6057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=104;PP=2965;SC=CTGTGGGGCTTTTCCGAGGTG;SOR=0.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=200;TCF=96;TCR=104;TR=200;WE=179290853;WS=179290835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr5	179291279	rs172056	A	G	1139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=4;NR=30;PP=873;SC=CCCATCTCACAGATCAGGACA;SOR=3.797;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=34;WE=179291287;WS=179291269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	179298342	rs248252	G	C	690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=0;PP=362;SC=ATCTGTTTCTGTTTTTCTATT;SOR=3.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=179298350;WS=179298332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	179299867	rs532795	T	C	948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=12;PP=638;SC=GCCCAGCCCCTGCCCAGCCCT;SOR=1.418;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=22;TCR=12;TR=34;WE=179299875;WS=179299857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr5	179305655	rs3734003	C	T	372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=10;PP=292;SC=AGCTGCGAGGCAAGGTTTCCC;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=179305663;WS=179305645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	179321728	rs17079782	A	G	1805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=36;PP=1057;SC=TAAGGGCTACAGGCACAGCTG;SOR=1.473;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=22;TCR=36;TR=58;WE=179321736;WS=179321718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr5	179334857	rs185073	A	G	2668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=56;PP=1635;SC=GGCCCGCGAGACGGAAGCGCC;SOR=1.384;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=35;TCR=56;TR=91;WE=179334865;WS=179334847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr5	179405399	rs27019	C	G	513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=431;ReadPosRankSum=-0.741;SC=GTGTTATAAACTGAAAAATGA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=17;WE=179405407;WS=179405389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,17:0.94:18
chr5	179407229	rs28011	C	T	3654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=82;PP=2491;SC=AAAACAGATACTAAGTGTAAG;SOR=2.068;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=33;TCR=82;TR=115;WE=179407237;WS=179407219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr5	179528991	.	TCCCACCTCGGCGCGAAGACTCACCTTAGAGCTTTCCATCCCAAGCAGCCCCCAGGC	T	3909.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.27;QD=43.93;SOR=1.338;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr5	179542290	.	TA	T	263.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=0.000;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=3.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.84;MQRankSum=3.756;QD=3.61;ReadPosRankSum=-0.732;SOR=0.490;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,23:0.32:73
chr5	179545562	rs62405054	C	G	622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=2;PP=450;SC=AGCCAGCACCCAGGTTCCCTG;SOR=3.352;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=179545570;WS=179545552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	179554522	rs7728345	C	T	671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=15;NR=7;PP=369;SC=CTCCAGCGCTCGCCCAGAGAA;SOR=1.358;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=22;WE=179554530;WS=179554512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	179555407	rs13354066	T	C	1529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=12;PP=885;SC=TGGGCCGGCTTACCAGTTCCA;SOR=1.567;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=34;TCR=12;TR=46;WE=179555415;WS=179555397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr5	179555654	rs6895192	C	T	4543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=75;NR=80;PP=2599;SC=ACACTCATCTCTGCATCTCTA;SOR=0.938;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=155;TCF=75;TCR=80;TR=155;WE=179555662;WS=179555644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr5	179563532	rs2890346	G	C	2535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=55;PP=1385;SC=GCAAGCGAGGGGCACCGCGCT;SOR=1.445;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=34;TCR=55;TR=89;WE=179563540;WS=179563522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr5	179565071	rs4700878	G	C	2658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=40;PP=1265;SC=GCAATGGCAAGGAGCAGTGAG;SOR=0.773;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=48;TCR=40;TR=88;WE=179565079;WS=179565061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr5	179565136	rs4700715	C	A	1613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=25;NR=25;PP=670;SC=GCTGCTGGTCCCGGGGCTCCT;SOR=1.092;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=25;TCR=25;TR=50;WE=179565144;WS=179565126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr5	179663614	rs6601104	C	T	775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=20;PP=585;SC=TTTCTCGGCTCTGTCCTTTTG;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=26;WE=179663622;WS=179663604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr5	179667933	rs6895740	C	G	2454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=54;NR=30;PP=1526;SC=AAATGGAGAACTTGCTACCCA;SOR=1.321;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=54;TCR=30;TR=84;WE=179667941;WS=179667923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr5	179675052	rs55756747	C	A	667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=21;PP=523;SC=GTTGTTGATACCACACCTCCT;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=24;WE=179675060;WS=179675042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	179686378	rs33928286	G	A	5950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=103;NR=87;PP=2965;SC=CCCTTTGACCGTAAGGGATGT;SOR=0.740;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=191;TCF=103;TCR=88;TR=190;WE=179686386;WS=179686368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr5	179691951	.	ACTT	A	44	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MMLQ=27;MQ=65.19;NF=0;NR=2;PP=44;QD=38.5;SC=AGAATTCAGTACTTCTTATTA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=179691961;WS=179691941;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr5	179707194	rs7715540	G	A	168.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=8;PP=195;SC=AAAATGAAAGGAAAAAGAAAC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=179707202;WS=179707184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr5	179728707	rs4700931	T	C	4731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=82;PP=2538;SC=AAGAGACAGATGTTCACCATG;SOR=0.929;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=154;TCF=72;TCR=82;TR=154;WE=179728715;WS=179728697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr5	179729519	rs1035411	A	G	5041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=103;NR=73;PP=2965;SC=GGGGCAGCTCAATTGTCTTAT;SOR=0.969;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=176;TCF=103;TCR=73;TR=176;WE=179729527;WS=179729509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr5	179734200	rs73343449	A	G	1854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=14;PP=993;SC=GGCAGGTGGCATAGTTGTAGC;SOR=1.643;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=47;TCR=14;TR=61;WE=179734208;WS=179734190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr5	179751390	rs1559113	A	G	718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=16;PP=504;SC=TCCCCTCTGAATATGTGTGGG;SOR=1.445;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=10;TCR=16;TR=26;WE=179751398;WS=179751380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr5	179763398	rs6891083	T	G	1556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=7;PP=1112;SC=AGAATCTCCATTCTCCGGCGC;SOR=3.171;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=39;TCR=7;TR=46;WE=179763406;WS=179763388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr5	179765467	rs55946431	C	T	428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=3;PP=284;SC=GGTCCCCAGCCACGAGGCGGG;SOR=2.049;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=179765475;WS=179765457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	179780340	rs5873687	GT	G	2023.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=16;PP=914;SC=TCCAGCTCCCGTCCGCTCGGC;SOR=0.813;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=21;WE=179780348;WS=179780330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr5	179780382	.	AGGGCGGGGAAG	A	966.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=12;PP=1917;SC=GCCCTCCGAGAGGGCGGGGAA;SOR=2.124;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=179780400;WS=179780372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr5	179980302	rs10516143	T	A	1126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=5;PP=847;SC=CTTAGGTGCTTATGTTCCTAG;SOR=3.202;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=37;WE=179980310;WS=179980292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr5	179980527	rs11738129	A	G	2706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=55;PP=1685;SC=TTGAATCTAAAGAAGCCAAGA;SOR=1.225;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=93;TCF=38;TCR=55;TR=93;WE=179980535;WS=179980517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr5	179991841	rs6874985	A	G	109.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.26;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	179996111	rs6877400	C	T	4491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=50;PP=2652;SC=CTAATGTAGCCGGAAAGCCAC;SOR=1.287;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=146;TCF=96;TCR=50;TR=146;WE=179996119;WS=179996101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr5	179998454	rs13164597	C	T	4049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=83;PP=2521;SC=GACTGATAAGCTTTTCAAACC;SOR=1.781;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=39;TCR=83;TR=122;WE=179998462;WS=179998444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr5	180038248	rs35683852	T	TC	9957.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=31;NR=113;PP=2966;SC=GATTTGCTTTTCCCCGATGAC;SOR=0.753;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=166;TCF=41;TCR=125;TR=144;WE=180038256;WS=180038238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,307:1.00:307
chr5	180041001	rs421662	G	C	6347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.34;SOR=1.678;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr5	180041008	rs366388	T	C	6701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.96;SOR=1.550;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr5	180041208	rs659268	T	C	2643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=63;PP=1524;SC=GCTTGTCCCGTGGTGGATGGG;SOR=1.969;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=25;TCR=63;TR=88;WE=180041216;WS=180041198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr5	180045700	rs3214903	G	GGGTTACCCTA	2817.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=8;PP=1700;SC=ACCCCAGGCTGGGGTGCCTGA;SOR=2.608;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=38;TCF=26;TCR=12;TR=29;WE=180045708;WS=180045690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr5	180046209	rs446003	C	T	3676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.41;SOR=0.958;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr5	180046344	rs448012	G	C	5996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=94;NR=104;PP=2965;SC=TCAGCGCGCGGTGCTCGCTGG;SOR=0.888;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=198;TCF=94;TCR=104;TR=198;WE=180046352;WS=180046334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr5	180046426	rs70973949	C	CTGGCCGCTTAGCTAAGGCACAG	2949.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=9;PP=2900;SC=TTCCCCGCCACCCGGCGCTTT;SOR=1.692;SbPval=0.02;Source=Platypus;TC=41;TCF=8;TCR=33;TR=17;WE=180046434;WS=180046416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr5	180046492	rs201407038	CAG	C	4167.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=13;NR=35;PP=2283;SC=CCCACTGAGGCAGAGGGGGTT;SOR=0.802;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=50;TCF=14;TCR=36;TR=48;WE=180046501;WS=180046482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr5	180047412	rs382266	T	C	1986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=45;PP=1458;SC=TCCTGCGGGGTTCTCAGTCAA;SOR=1.828;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=66;TCF=20;TCR=46;TR=65;WE=180047420;WS=180047402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr5	180047863	rs423086	C	G	429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=7;PP=352;SC=AGGGGTGCAGCCTGAGGCCAG;SOR=0.818;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=9;TCR=7;TR=16;WE=180047871;WS=180047853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	180048972	rs79676169	C	A	966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=19;PP=639;SC=CCTGCCGCCCCGGGGTCTCCT;SOR=1.751;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=9;TCR=19;TR=28;WE=180048980;WS=180048962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	180049923	rs67904463	GCAC	G	717.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=14;PP=667;SC=AGGTCGCTGTGCACCACCCCC;SOR=2.179;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=15;WE=180049933;WS=180049913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	180053307	rs402647	A	G	1012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=22;PP=614;SC=AGATCCCACCACAGCCCCAAC;SOR=1.949;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=10;TCR=22;TR=32;WE=180053315;WS=180053297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	180055862	rs383985	T	G	2279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.70;SOR=2.746;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr5	180055862	.	TGG	GGA	1000	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;FR=1.0000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=37;NR=8;PP=1000;QD=23.4103972192;SC=GCGGGGTCGGTGGGGAGCCAG;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=48;TCF=40;TCR=8;TR=45;WE=180055872;WS=180055852;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,45:0.94:48
chr5	180055864	rs438464	G	A	2279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.01;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr5	180056192	rs399108	T	C	1625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=16;PP=1148;SC=TCCTGAGTGCTCAAGGGCACC;SOR=1.487;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=34;TCR=16;TR=50;WE=180056200;WS=180056182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr5	180056620	rs414348	G	A	555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=1;PP=434;SC=CATCCTCCACGCGGAGGCCCA;SOR=3.611;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=180056628;WS=180056610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	180057504	rs12719871	G	A	2246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=23;PP=1501;SC=GGCGGTGTGGGCCCCAGCTGC;SOR=1.734;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=48;TCR=23;TR=71;WE=180057512;WS=180057494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr5	180058591	rs114246897	G	A	1151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=11;PP=775;SC=TCTGCCCTGGGAGGGGGCTGC;SOR=1.954;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=41;WE=180058599;WS=180058581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr5	180165983	rs2054696	G	C	380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=1;PP=259;SC=TGTTCCCCCCGCCACCAAAAA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=180165991;WS=180165973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	180166461	rs10464105	C	G	5686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=83;PP=2965;SC=ACTCGGGCCACAAACATCTTG;SOR=0.734;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=177;TCF=94;TCR=83;TR=177;WE=180166469;WS=180166451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr5	180218668	rs634501	A	G	10164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=388;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=203;NR=153;PP=2965;SC=CTCCCACGTCAGTGGGGGCGC;SOR=0.978;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=356;TCF=203;TCR=153;TR=356;WE=180218678;WS=180218658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,387:1.00:387
chr5	180276402	rs168726	C	T	6934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=117;NR=99;PP=2965;SC=ATGGGGTGTCCTGCCAGGGTG;SOR=0.742;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=216;TCF=117;TCR=99;TR=216;WE=180276410;WS=180276392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr5	180278393	rs705441	C	G	9848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=148;NR=174;PP=2965;SC=TAGATTCAGGCATAGGATCCT;SOR=0.972;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=323;TCF=148;TCR=175;TR=322;WE=180278401;WS=180278383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,354:1.00:354
chr5	180288239	rs2121117	G	A	1539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=33;PP=976;SC=GGCGCCGCGGGAACCCGGCCG;SOR=1.342;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=21;TCR=33;TR=54;WE=180288247;WS=180288229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr5	180326571	rs2619738	T	A	893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=25;PP=703;SC=CCGTGATCGTTGACGGGGACA;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=27;WE=180326579;WS=180326561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr5	180329359	rs7735361	T	C	5061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=112;NR=63;PP=2965;SC=CTCCTCAAGATCGAATGAAGT;SOR=1.333;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=175;TCF=112;TCR=63;TR=175;WE=180329367;WS=180329349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr5	180329458	rs7712020	C	G	6160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=108;NR=114;PP=2965;SC=GAATGTTTCCCCCTGATGCAC;SOR=0.790;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=231;TCF=108;TCR=123;TR=222;WE=180329466;WS=180329448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr5	180329536	rs7712185	C	T	1705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=63;PP=1818;SC=TTTGTTTTTGCTTTTATACTT;SOR=2.024;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=17;TCR=63;TR=80;WE=180329544;WS=180329526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr5	180338300	rs2276994	G	A	570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=19;NR=2;PP=433;SC=GCTTTGGGATGTGATCTTTGC;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=180338308;WS=180338290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	180338368	rs2276995	A	G	1944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=22;PP=1091;SC=CATTTCCATCACGGGATATGT;SOR=1.349;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=43;TCR=22;TR=65;WE=180338376;WS=180338358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr5	180374484	rs3733755	C	A	3310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=36;PP=1970;SC=TCACCAATAACTAAAATGTCT;SOR=1.421;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=110;TCF=74;TCR=36;TR=110;WE=180374492;WS=180374474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr5	180374534	rs3733756	G	A	5835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=116;NR=81;PP=2965;SC=AGCCTATATCGTGGCACCTGG;SOR=0.946;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=197;TCF=116;TCR=81;TR=197;WE=180374542;WS=180374524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr5	180374898	rs7711990	A	G	368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=11;PP=277;SC=ATAATTTTCCATGAACACCAC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=180374906;WS=180374888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	180430797	rs72494581	T	C	4916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-0.259;NF=105;NR=64;PP=2965;ReadPosRankSum=0.347;SC=GGAGCCAGCGTCGTGTTTGTA;SOR=1.154;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=171;TCF=106;TCR=65;TR=169;WE=180430805;WS=180430787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,186:0.99:188
chr5	180430996	rs114244788	G	A	207.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.13;QD=29.69;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	180431009	rs200820251	A	G	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=33.00;QD=21.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr5	180432416	rs7726150	C	T	2019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=20;PP=1486;SC=GAAAAGCTCCCCAGGAGGTGC;SOR=2.082;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=56;TCR=20;TR=76;WE=180432424;WS=180432406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr5	180472498	rs28677846	C	T	11159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=133;NR=101;PP=2965;SC=AGATGGTGGACCTCTCAGTCT;SOR=0.879;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=234;TCF=133;TCR=101;TR=234;WE=180472506;WS=180472488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
chr5	180472513	rs6894087	A	G	11439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=130;NR=113;PP=2965;SC=CAGTCTCCCCAGACTCCTTGA;SOR=0.746;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=244;TCF=130;TCR=114;TR=243;WE=180472521;WS=180472503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,269:1.00:269
chr5	180474814	rs13359580	CA	TG	1275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=4;PP=993;SC=TAGAGTATCTCACCTTTCTTG;SOR=1.942;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=23;WE=180474823;WS=180474804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr5	180477449	rs7702426	C	G	1676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=38;PP=1173;SC=TCTATAAAGACACAATGGTAC;SOR=2.712;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=11;TCR=38;TR=49;WE=180477457;WS=180477439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr5	180482303	rs11353483	TA	T	216.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=7.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.31;MQRankSum=3.672;QD=1.65;ReadPosRankSum=-0.778;SOR=0.705;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,30:0.23:131
chr5	180482795	rs3885614	A	T	5065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=109;NR=74;PP=2965;SC=ATTTCTCCTCATTCATCATTT;SOR=0.994;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=183;TCF=109;TCR=74;TR=183;WE=180482803;WS=180482785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr5	180482899	rs3885615	C	T	4608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=87;PP=2876;SC=GTGGGGGGTGCGGGACAGGGT;SOR=1.070;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=158;TCF=71;TCR=87;TR=158;WE=180482907;WS=180482889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr5	180486224	rs7379015	T	G	673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=9;PP=417;SC=ACTAACGCTGTGGCTCTGCGC;SOR=1.358;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=15;TCR=9;TR=24;WE=180486232;WS=180486214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	180486247	rs6601166	G	T	865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=18;NR=13;PP=500;SC=TGGATGTGACGCTGGACCCGG;SOR=0.941;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=18;TCR=13;TR=31;WE=180486255;WS=180486237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr5	180552412	rs7724668	G	C	405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=10;PP=307;SC=TGCTCTGAGAGATGCAGGAGG;SOR=1.765;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=14;WE=180552420;WS=180552402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	180622615	rs254460	C	T	5557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=101;NR=86;PP=2965;SC=AGGCGCACGCCCTTAAGATCC;SOR=0.781;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=188;TCF=101;TCR=87;TR=187;WE=180622623;WS=180622605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr5	180625254	rs254458	G	A	6869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=120;NR=120;PP=2965;SC=GTGCATGAGCGACACGGGAGA;SOR=0.790;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=240;TCF=120;TCR=120;TR=240;WE=180625262;WS=180625244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr5	180626927	rs416574	A	G	4699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=91;NR=57;PP=2592;SC=GGTGATCTCAACCCCGAGCTG;SOR=0.963;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=91;TCR=57;TR=148;WE=180626935;WS=180626917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr5	180631817	rs2545112	T	C	1766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=18;PP=707;SC=GCGTGGCCACTGCCGCCAGCT;SOR=1.005;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=19;TCR=18;TR=37;WE=180631836;WS=180631807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr5	180631828	rs2770945	G	C	1683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=19;NR=13;PP=666;SC=GCCGCCAGCTGCCGGTTGGGC;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=19;TCR=13;TR=32;WE=180631836;WS=180631807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr6	292694	rs3832447	GC	G	2944.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=57;PP=2544;SC=GGGAGGGGCGGCGCGCCTGGG;SOR=3.412;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=61;TCF=1;TCR=60;TR=58;WE=292702;WS=292684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr6	312029	rs150517961	TAATG	T	4168.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.909;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=2.320;NF=5;NR=63;PP=2889;ReadPosRankSum=-0.631;SC=CCTACGACGTTAATGAAGGCA;SOR=0.532;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=140;TCF=7;TCR=133;TR=68;WE=312040;WS=312019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,109:0.53:204
chr6	335175	rs2671431	A	T	6357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=128;NR=85;PP=2965;SC=TAAGTTTCTTATTTCTGTATT;SOR=1.130;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=213;TCF=128;TCR=85;TR=213;WE=335183;WS=335165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr6	335251	rs3757305	T	C	2954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=361;ExcessHet=3.0103;FS=3.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.18;ReadPosRankSum=2.330;SOR=0.851;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:207,154:0.43:361
chr6	335251	.	TGT	CGC	2944	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=62;NR=69;PP=2944;QD=20;SC=ACTGTGAAGTTGTCAGAGCTC;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=324;TCF=163;TCR=161;TR=131;WE=335261;WS=335241;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:193,131:0.40:324
chr6	335253	rs3757306	T	C	5779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=359;ExcessHet=3.0103;FS=4.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.10;ReadPosRankSum=2.366;SOR=0.819;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:205,154:0.43:359
chr6	335268	rs4959733	C	T	2769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.418;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=71;PP=1741;ReadPosRankSum=-0.791;SC=GCTCACGGGACCCTTGCTGAC;SOR=1.045;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=293;TCF=145;TCR=148;TR=126;WE=335276;WS=335258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:186,138:0.43:324
chr6	346429	rs10642379	G	GACACAC	1348.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=415;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=72;PP=1357;ReadPosRankSum=1.357;SC=ATTTTGTGTAGACACACACAC;SOR=0.651;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=252;TCF=5;TCR=247;TR=74;WE=346440;WS=346419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,68:0.30:224
chr6	348051	rs1877172	A	G	672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=2;PP=492;ReadPosRankSum=-0.732;SC=TTGGGCGATGAACCCGGAGAT;SOR=0.344;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=46;TCF=43;TCR=3;TR=24;WE=348059;WS=348041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,26:0.50:52
chr6	348080	rs2797333	A	G	3535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=33;PP=2220;SC=GCCCTCACACATGTGCTTCTC;SOR=1.946;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=123;TCF=90;TCR=33;TR=122;WE=348088;WS=348070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr6	348906	rs11242812	G	A	1675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=49;PP=1179;ReadPosRankSum=0.167;SC=GCAGTTTTCCGGCACTGGCTC;SOR=0.730;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=147;TCF=39;TCR=108;TR=68;WE=348914;WS=348896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,73:0.47:155
chr6	350939	.	A	AC	617.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-2.599;ClippingRankSum=0.000;DP=337;ExcessHet=3.0103;FS=4.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.52;MQRankSum=14.493;QD=1.87;ReadPosRankSum=-0.500;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:267,64:0.19:331
chr6	350940	rs11408655	T	TA	4267.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.621;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.566;NF=7;NR=85;PP=2962;ReadPosRankSum=0.483;SC=AAAAGCAACATAGAGTTTAAG;SOR=0.831;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=189;TCF=13;TCR=176;TR=92;WE=350948;WS=350929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,168:0.55:305
chr6	367243	rs7776416	T	C	1268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.835;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=23;PP=764;ReadPosRankSum=-2.301;SC=CTCAACCCTCTTCTTTGTTTT;SOR=0.448;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=172;TCF=116;TCR=56;TR=64;WE=367251;WS=367233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,67:0.38:177
chr6	367352	rs7764099	C	T	3611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=448;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.529;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=77;PP=2033;ReadPosRankSum=-0.589;SC=CATGCACATACACACATGTAC;SOR=0.771;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=413;TCF=224;TCR=189;TR=172;WE=367360;WS=367342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:258,190:0.42:448
chr6	367481	rs7738368	T	G	830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.78;ReadPosRankSum=2.458;SOR=0.622;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:233,66:0.22:299
chr6	367552	rs12527701	C	T	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.651;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=255;ReadPosRankSum=0.359;SC=ACACAATACACGCATACCCAC;SOR=1.071;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=73;TCF=14;TCR=59;TR=19;WE=367560;WS=367542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,21:0.26:81
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chr6	397290	rs1775589	T	C	1285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.241;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=39;PP=918;ReadPosRankSum=0.976;SC=GAAGAGCTAATTGCTAATGTG;SOR=1.127;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=88;TCF=20;TCR=68;TR=48;WE=397298;WS=397280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,53:0.53:100
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chr6	597900	rs75327155	T	C	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.519;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=179;ReadPosRankSum=-0.483;SC=CTGCTATTTGTCTTCCCCTTC;SOR=1.473;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=12;WE=597908;WS=597890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,12:0.32:37
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chr6	619600	rs1150856	A	C	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.384;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=259;ReadPosRankSum=-0.190;SC=AAAAATGGAAAAGGTATCACT;SOR=1.938;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=14;WE=619608;WS=619590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr6	630033	rs17756886	T	C	1981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.931;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=49;PP=1356;ReadPosRankSum=1.692;SC=TGGCCTATTGTCTGACTTCTT;SOR=0.527;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=160;TCF=62;TCR=98;TR=79;WE=630041;WS=630023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,86:0.49:177
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chr6	1313121	rs9502890	A	C	1501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.17;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr6	1313952	rs992327	A	G	513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=12;PP=376;SC=GGCGCGCGCGAGGCCGAGGTG;SOR=2.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=16;WE=1313960;WS=1313942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr6	1391085	rs147426137	G	GGGC	828.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=2.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.18;MQRankSum=1.124;QD=16.57;ReadPosRankSum=0.390;SOR=0.824;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,23:0.46:50
chr6	1612017	.	A	ACGG	852.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.376;ClippingRankSum=0.000;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.509;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=7;PP=536;ReadPosRankSum=0.203;SC=TCCCTGAGTCACGGCGGCGGC;SOR=1.179;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=35;TCF=12;TCR=23;TR=13;WE=1612025;WS=1612007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,23:0.49:47
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chr6	1742908	rs3734740	C	G	414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=15;PP=390;SC=ATATGGACATCGACAGCTGGA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=1742916;WS=1742898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
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chr6	2683439	rs898772	T	A	2400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=56;PP=1636;SC=CCGATTTCCTTACCACCATGT;SOR=2.010;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=22;TCR=56;TR=78;WE=2683447;WS=2683429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
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chr6	2749304	rs146454767	C	T	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=193;ReadPosRankSum=-0.072;SC=ACAAGCGGCTCCATGACATTA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=10;WE=2749312;WS=2749300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr6	2766144	rs17851692	T	C	566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.069;SOR=0.616;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,30:0.57:53
chr6	2766465	rs8333	T	C	1153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=16;PP=596;ReadPosRankSum=2.017;SC=TCGGGGCCAGTGGCGGGGGCC;SOR=0.668;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=90;TCF=63;TCR=27;TR=47;WE=2766473;WS=2766455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,55:0.53:103
chr6	2766727	rs3757094	A	G	1388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.634;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=36;PP=795;ReadPosRankSum=-1.101;SC=TCGGCGGTGGATGCAGCTGAT;SOR=0.809;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=131;TCF=57;TCR=74;TR=62;WE=2766735;WS=2766717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,68:0.48:141
chr6	2766779	rs3757093	G	A	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.418;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=285;ReadPosRankSum=-1.448;SC=GAAGCCGCCTGCCTCTCCTGG;SOR=2.998;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=63;TCF=16;TCR=47;TR=19;WE=2766787;WS=2766769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,18:0.28:65
chr6	2783903	.	C	G	172	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;FR=1.0000;HP=8;HapScore=4;MGOF=33;MMLQ=15;MQ=51.75;NF=0;NR=6;PP=172;QD=34.4618687579;SC=GCGGGGTGGGCGGGGGTAGCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=6;WE=2783911;WS=2783880;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,6:0.75:8
chr6	2784571	rs160703	G	A	1004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=12;PP=712;ReadPosRankSum=0.173;SC=TGGCAGACCCGTCTGCGTTAA;SOR=0.765;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=81;TCF=61;TCR=20;TR=42;WE=2784579;WS=2784561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,45:0.49:91
chr6	2833983	.	C	T	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.218;ClippingRankSum=0.000;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.09;ReadPosRankSum=0.376;SOR=0.681;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:124,36:0.22:160
chr6	2948965	rs318426	C	T	4225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=84;PP=2582;SC=CTTTAAGACCCAGGGTGCTGC;SOR=1.223;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=144;TCF=60;TCR=84;TR=144;WE=2948973;WS=2948955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr6	2949387	rs9378746	G	A	4019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=83;PP=2474;SC=GCCACTCTCTGCAGGGAGAAA;SOR=1.298;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=55;TCR=83;TR=138;WE=2949395;WS=2949377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr6	2953252	rs2244693	T	C	1600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=11;PP=1013;SC=ACACAGGCGCTGCTCCTGTCA;SOR=2.179;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=53;TCF=41;TCR=12;TR=52;WE=2953260;WS=2953242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr6	2953445	rs3818276	A	G	3588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=74;PP=2189;SC=TCAAGACCGCATTAGATAGGG;SOR=1.488;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=45;TCR=74;TR=119;WE=2953453;WS=2953435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr6	2955802	rs2295769	T	C	7167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=122;NR=129;PP=2965;SC=CTGTTGGCCATCCTAAGCAAG;SOR=0.769;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=251;TCF=122;TCR=129;TR=251;WE=2955810;WS=2955792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,270:1.00:270
chr6	3077141	rs2272990	T	C	2733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=44;NR=49;PP=1436;SC=GCGGAGGCTTTGGGAAGGTGT;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=44;TCR=49;TR=93;WE=3077149;WS=3077131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr6	3104696	rs10498658	C	T	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=55;ReadPosRankSum=0.524;SC=TAATAATATTCGAGAGTCAAG;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=4;WE=3104704;WS=3104686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr6	3118947	rs2231355	A	G	2035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=43;NR=27;PP=1021;SC=GCGCATGCGCACTCCCGGCAG;SOR=0.821;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=43;TCR=27;TR=70;WE=3118955;WS=3118937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr6	3138194	rs1534998	T	C	3432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.01;SOR=0.889;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr6	3155988	rs115862064	G	A	1468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.544;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=39;PP=937;ReadPosRankSum=-0.946;SC=AATAAGAACTGACTCAGGCCT;SOR=1.039;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=152;TCF=69;TCR=83;TR=65;WE=3155996;WS=3155978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,73:0.43:171
chr6	3157798	rs909964	G	A	351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.45;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr6	3157809	rs909965	C	T	316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=6;NR=5;PP=126;SC=GTCTTTTATACCCGGGGACCC;SOR=0.836;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=11;TCF=6;TCR=5;TR=11;WE=3157817;WS=3157788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	3255163	rs11242830	C	T	773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=0;PP=524;SC=TTCAGCCATTCTCTCACTGGG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=3255171;WS=3255153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr6	3255327	rs9503497	G	A	6046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=105;NR=95;PP=2965;SC=TAAGAAGTTGGCTGCATAGGA;SOR=0.737;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=200;TCF=105;TCR=95;TR=200;WE=3255348;WS=3255317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr6	3255340	rs9503498	A	C	5910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=102;NR=92;PP=2965;SC=GCATAGGAGCACAACATCACC;SOR=0.748;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=194;TCF=102;TCR=92;TR=194;WE=3255348;WS=3255317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr6	3259463	rs9501962	G	T	1279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.76;SOR=2.356;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr6	3263830	rs12193912	C	T	554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=3;PP=342;SC=CTGCCATCGTCGTGAAGAATC;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=3263838;WS=3263820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr6	3264101	rs4959785	A	G	2809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=55;PP=1734;SC=GCTAAGAACCATCACCTCATT;SOR=1.306;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=93;TCF=38;TCR=55;TR=93;WE=3264109;WS=3264091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr6	3264487	rs4959786	T	C	4707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=93;NR=73;PP=2460;SC=TGGCGTAGAGTGGGGATTAAG;SOR=0.773;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=166;TCF=93;TCR=73;TR=166;WE=3264495;WS=3264477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr6	3264502	rs4959787	G	C	4847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=94;NR=80;PP=2427;SC=ATTAAGCAAAGGTCATGAGGC;SOR=0.725;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=174;TCF=94;TCR=80;TR=174;WE=3264510;WS=3264492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr6	3264526	rs4959788	CT	TC	7673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=79;NR=75;PP=2947;SC=ATGCTCCACTCTTCCCACACC;SOR=0.705;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=157;TCF=81;TCR=76;TR=154;WE=3264535;WS=3264516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr6	3264582	rs11757564	G	A	2481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=50;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=55;PP=1767;SC=TGTGCTCTGCGACCCCCAGCC;SOR=1.455;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=31;TCR=55;TR=86;WE=3264590;WS=3264572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr6	3264671	rs13193012	T	C	424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=16;PP=350;SC=CAGCTGCTTCTGCTCTGGAGT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=3264679;WS=3264661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	3285286	rs10793841	A	G	5521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=73;NR=106;PP=2965;SC=GAGACGAGGAAGCACAGCCCA;SOR=1.261;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=179;TCF=73;TCR=106;TR=179;WE=3285294;WS=3285276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr6	3287118	rs6910086	T	C	4269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=60;PP=2241;SC=GCTGCAGGAGTGAGGCCAGGG;SOR=0.879;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=142;TCF=82;TCR=60;TR=142;WE=3287126;WS=3287108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr6	3438650	rs13208786	G	A	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.805;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=357;ReadPosRankSum=1.212;SC=GATCCATCAGGCTTGCTGCCT;SOR=1.179;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=18;WE=3438658;WS=3438640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr6	3438738	rs12197689	G	A	5734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=114;NR=78;PP=2965;SC=GGCCTCCAGCGCTTGGTGTCT;SOR=1.064;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=192;TCF=114;TCR=78;TR=192;WE=3438746;WS=3438728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr6	3439510	rs9503595	T	C	2215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=41;NR=28;PP=1057;SC=TGCCGAATGTTCTCTGGGAGC;SOR=0.815;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=71;TCF=42;TCR=29;TR=69;WE=3439518;WS=3439500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr6	3439595	rs35613438	G	GA	725.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.929;HP=3;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=356;ReadPosRankSum=-0.627;SC=AGGCATTTCTGAAAGTTCCCC;SOR=0.554;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=12;WE=3439603;WS=3439585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,29:0.43:68
chr6	3439637	rs9502003	G	A	1420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.39;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr6	3439637	.	GGCCCTGGAC	AGCCCTGGAC,AGCCCTGGAT	259	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.36;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=12,7;NR=19,12;PP=61,259;QD=3.08939395314;SC=GAGCCACTGCGGCCCTGGACG;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=12;TCR=19;TR=31,19;WE=3439654;WS=3439627;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:31
chr6	3439646	rs13213989	C	T	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.96;ReadPosRankSum=-1.295;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,21:0.72:29
chr6	3439697	rs17136561	T	G	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-1.480;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=45;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=53;ReadPosRankSum=0.805;SC=CTACCTAAAGTTCTGAACAGC;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=3;WE=3439705;WS=3439687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr6	3723764	rs1045778	G	T	84.81	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5081;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=56;ReadPosRankSum=0.842;SC=CAGAGCTGGGGCAGCAGCTGT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=4;WE=3723772;WS=3723760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr6	3727811	rs226959	C	G	1971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=29;PP=1026;ReadPosRankSum=-2.641;SC=CCACGCCCAGCTGCTGGTCTC;SOR=0.673;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=193;TCF=124;TCR=69;TR=80;WE=3727819;WS=3727801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,98:0.45:218
chr6	3738268	rs3215783	GC	G	989.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.579;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=774;ReadPosRankSum=1.262;SC=TCCCTGCCCAGCCCGGGGCCT;SOR=1.259;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=46;TCF=29;TCR=17;TR=23;WE=3738276;WS=3738258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,34:0.59:58
chr6	3738897	rs11390464	A	AG	597.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=517;ReadPosRankSum=1.243;SC=GAAAAAAGTCAGATCTCTGCC;SOR=1.179;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=12;WE=3738905;WS=3738887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,19:0.76:25
chr6	3850338	rs117488732	G	A	1917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.101;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=38;PP=1333;ReadPosRankSum=1.567;SC=GAGGAGCAGCGGCTGCAGCAG;SOR=0.603;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=182;TCF=100;TCR=82;TR=84;WE=3850346;WS=3850328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,92:0.46:201
chr6	4020336	rs9392546	C	T	1325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=2;PP=976;SC=CCACCGCGCCCGGCCCTAACA;SOR=4.565;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=36;TCR=2;TR=38;WE=4020344;WS=4020326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr6	4020356	rs9405217	G	A	1631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=9;PP=1059;SC=ATTTCAAAACGTTTGGAATTC;SOR=2.917;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=43;TCR=9;TR=52;WE=4020364;WS=4020346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr6	4020540	rs78628853	AT	A	507.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=4.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.26;MQRankSum=0.586;QD=14.10;ReadPosRankSum=1.273;SOR=1.406;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,31:0.86:36
chr6	4021554	rs11752006	A	G	4458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=81;NR=78;PP=2638;SC=TCTTCCCTACACGGTCGGCAC;SOR=0.728;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=159;TCF=81;TCR=78;TR=159;WE=4021562;WS=4021544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr6	4031998	rs9503893	A	G	3857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=44;PP=2100;SC=AAGAAAAGAGATTATTGATGC;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=74;TCR=44;TR=118;WE=4032006;WS=4031988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr6	4033065	rs6924389	A	G	1026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=25;PP=726;SC=CTTGTGGACCATTAAAAATGA;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=30;WE=4033073;WS=4033055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr6	4037582	rs7763233	C	A	1335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=37;NR=13;PP=977;SC=AGAAAAAAATCATTTACTTTG;SOR=1.958;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=37;TCR=13;TR=50;WE=4037590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr6	4049137	rs72841285	G	A	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=125;ReadPosRankSum=-0.285;SC=ATTTAATTTGGAATAAAATGC;SOR=1.022;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=9;WE=4049145;WS=4049127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr6	4052167	rs3747761	C	A	1094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=4;PP=860;SC=TTCAATTTTACCCCAATTTTT;SOR=3.737;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=36;WE=4052180;WS=4052157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr6	4052383	rs3747762	G	A	4132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=81;PP=2446;SC=TCATCTTTACGATCTCATTTT;SOR=1.304;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=55;TCR=81;TR=136;WE=4052391;WS=4052373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr6	4052458	rs3833454	G	GT	653.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=19;PP=713;SC=TCTGGTTTTTGTTTTTAACTT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=19;WE=4052466;WS=4052448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr6	4057233	rs853407	C	T	225.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=1;PP=112;SC=TCAGTTTTCTCTATCCTCGTA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=4057241;WS=4057223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	4057428	rs72841293	C	T	1206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=2.343;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.115;SOR=0.505;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,57:0.48:119
chr6	4057428	.	CA	TG	728	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=25;NR=26;PP=728;QD=15.3228995071;SC=TAAGGTAAGACATTAGCATGA;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=107;TCF=50;TCR=57;TR=51;WE=4057437;WS=4057418;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:56,51:0.48:107
chr6	4057429	rs853408	A	G	4088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.95;SOR=0.978;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr6	4058782	rs12198921	C	T	213.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=7;NR=0;PP=129;SC=GTTTTAGGTACAGCATTGGTA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=4058790;WS=4058772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	4069166	rs595413	C	T	7954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=130;NR=131;PP=2965;SC=CTTGTGGAGACCATTTTAACC;SOR=0.749;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=262;TCF=130;TCR=132;TR=261;WE=4069174;WS=4069156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,294:1.00:294
chr6	4070079	rs17853927	G	A	1338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.304;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=29;PP=714;ReadPosRankSum=0.022;SC=TTGTTAATGGGTGGTTCAGAG;SOR=0.445;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=109;TCF=54;TCR=55;TR=59;WE=4070087;WS=4070069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,66:0.54:122
chr6	4119553	rs57858259	AT	A	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.42;MQRankSum=0.282;QD=9.86;ReadPosRankSum=0.674;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr6	4715882	rs3812183	A	G	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.208;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=604;ReadPosRankSum=-0.563;SC=CTCAGATTCAATGTAGAACTG;SOR=0.199;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=37;TCF=33;TCR=4;TR=13;WE=4715902;WS=4715872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,17:0.40:42
chr6	4715894	rs3812182	T	G	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=604;ReadPosRankSum=0.277;SC=GTAGAACTGGTGAAAGTCATT;SOR=0.880;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=44;TCF=38;TCR=6;TR=16;WE=4715902;WS=4715872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,21:0.39:54
chr6	4936074	rs1539004	T	G	1036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=26;PP=703;SC=CCTGCCTGGCTGAACTGGCTC;SOR=3.026;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=32;WE=4936082;WS=4936064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr6	4937662	rs9502253	A	C	428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=0;PP=405;SC=CCCAGGAGTTAGAGAGCACAG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=4937670;WS=4937652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	4937728	rs36001374	C	CA	1130.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.93;ReadPosRankSum=-1.666;SOR=0.781;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,58:0.82:71
chr6	4937742	rs61406305	C	CT	4773.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=29;PP=2293;SC=AAAAAAAATGCTTTAAGATTT;SOR=1.167;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=64;TCF=30;TCR=34;TR=55;WE=4937755;WS=4937718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr6	4937747	rs56133250	A	G	4953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=34;PP=1871;SC=AAATGCTTTAAGATTTTAAAC;SOR=1.169;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=97;TCF=63;TCR=34;TR=92;WE=4937755;WS=4937718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr6	4952413	rs2793263	T	C	687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=4;PP=440;SC=TTGTGAATGTTTCCCTTCGGT;SOR=2.124;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=22;WE=4952421;WS=4952403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr6	4999193	rs396839	A	G	665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=20;PP=532;SC=TAGTAAAATTATTTTATTCTT;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=4999201;WS=4999183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr6	5000721	rs2764108	T	C	32.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=6;NR=0;PP=112;SC=CGTGCCCAGCTGACTTTTTTT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=6;WE=5000729;WS=5000711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr6	5001577	rs912711	G	C	741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=22;PP=637;SC=CCTTGAAATAGATGAAAGGAA;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=24;WE=5001585;WS=5001567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr6	5003952	rs4960056	T	C	1325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=2;PP=1016;SC=GCCACTGGCTTAGAGCAGTTA;SOR=4.565;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=36;TCR=2;TR=38;WE=5003960;WS=5003942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr6	5086070	rs667752	A	G	1673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=35;NR=21;PP=896;SC=CGGAGGACGCACAGCTCGGCC;SOR=0.925;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=35;TCR=21;TR=56;WE=5086078;WS=5086060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr6	5086211	rs584962	G	C	5658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=104;NR=87;PP=2965;SC=TCTCGCGCCTGCGAAGCTTCC;SOR=0.822;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=191;TCF=104;TCR=87;TR=191;WE=5086219;WS=5086201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr6	5086558	rs436556	C	A	6350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=107;PP=2965;SC=CCAGAGGCACCGTCTGGGGCC;SOR=0.834;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=207;TCF=100;TCR=107;TR=206;WE=5086566;WS=5086548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr6	5109592	rs9606	T	G	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=3.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.677;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=326;ReadPosRankSum=-0.018;SC=GGAGCCCCCATCTCAAACAGA;SOR=1.075;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=37;TCF=31;TCR=6;TR=17;WE=5109600;WS=5109582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr6	5138809	rs11301112	GT	G	544.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=7;PP=305;SC=AATAATGACTGTTTTTTTTAT;SOR=1.508;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=8;TCR=8;TR=14;WE=5138817;WS=5138799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr6	5139012	rs463054	C	A	1985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=37;PP=1072;SC=GTTAAGAGTACCAGTTAACAG;SOR=1.121;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=30;TCR=37;TR=67;WE=5139020;WS=5139002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr6	5148454	rs17139551	G	A	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.643;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=109;ReadPosRankSum=0.631;SC=TTGAACATTGGCTCCCAGACC;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=7;WE=5148462;WS=5148444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr6	5217010	rs41302851	C	T	1196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.150;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=35;PP=775;ReadPosRankSum=1.346;SC=AAGGTGTCAGCGTGTCTGAGG;SOR=1.352;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=76;TCF=18;TCR=58;TR=42;WE=5217018;WS=5217000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,48:0.58:83
chr6	5260816	rs4141761	A	G	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.08;ReadPosRankSum=-0.623;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
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chr6	6167558	.	ATTTTTTT	A	130	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;FR=0.5000;HP=21;HapScore=4;MGOF=15;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=5;NR=1;PP=130;QD=22.1666666667;SC=TAGCACTGGTATTTTTTTTTT;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=6;WE=6167587;WS=6167548;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,6:0.43:14
chr6	6167621	rs435048	G	A	1645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=42;NR=19;PP=1068;SC=ATACAAGCACGCATATGCACA;SOR=1.430;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=62;TCF=42;TCR=20;TR=61;WE=6167629;WS=6167611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr6	6174786	rs380058	G	C	725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=1;PP=583;SC=GCGAGTCTCAGAAAGAACCAC;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=6174794;WS=6174776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr6	6250967	rs3024370	G	A	1139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=5;PP=821;SC=TCGATATATGGGATCCTGTAG;SOR=3.442;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=34;WE=6250975;WS=6250957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr6	6320808	rs2815822	T	G	1281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.476;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=21;PP=915;ReadPosRankSum=-2.248;SC=GGGTGCAGGGTCGGTGGCTTA;SOR=0.417;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=125;TCF=85;TCR=40;TR=59;WE=6320816;WS=6320798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,60:0.44:136
chr6	6321128	rs1024231	T	C	828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.125;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=19;PP=466;ReadPosRankSum=1.178;SC=CCCATCCCCATCCCTAGATCT;SOR=0.443;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=48;TCF=19;TCR=29;TR=32;WE=6321136;WS=6321118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,37:0.65:57
chr6	6588881	rs977785	A	C	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.084;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=198;ReadPosRankSum=-1.467;SC=CTGAACATCCAACTGCCTTGG;SOR=0.042;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=14;WE=6588889;WS=6588871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr6	6589192	rs112924538	G	GGA	77.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.876;NF=0;NR=3;PP=55;ReadPosRankSum=0.304;SC=AGTTGGGGTGGGAGGGGAGAG;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=3;WE=6589200;WS=6589182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr6	6649691	rs5743650	G	T	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=26;ReadPosRankSum=1.465;SC=GAATGAATAAGTGAATGAATG;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=4;WE=6649699;WS=6649681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr6	6649974	rs3062400	A	AAGG	2121.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=22;PP=1354;SC=AGAAGGCTAGAAGGAGGGAAA;SOR=1.426;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=26;WE=6649982;WS=6649964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr6	7181993	rs9392862	T	C	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.214;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=136;ReadPosRankSum=-0.303;SC=AAAGACAGCGTTGGATGTTTT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=8;WE=7182001;WS=7181986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr6	7229346	rs2714315	T	C	1244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.660;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=32;PP=630;ReadPosRankSum=0.678;SC=AGCAGACCCATGTGGCGGCAG;SOR=0.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=121;TCF=54;TCR=67;TR=57;WE=7229354;WS=7229336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,63:0.49:129
chr6	7229619	rs12192672	G	A	4542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=444;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.725;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=103;PP=2962;ReadPosRankSum=0.627;SC=TTCTCCCCGCGACCAAGGACA;SOR=0.789;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=409;TCF=199;TCR=210;TR=199;WE=7229627;WS=7229609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:231,212:0.48:443
chr6	7231843	rs9379084	G	A	2251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.514;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=43;PP=1339;ReadPosRankSum=2.001;SC=CGGCGGGGTGGACCTGGACTC;SOR=0.772;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=190;TCF=109;TCR=81;TR=100;WE=7231851;WS=7231833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,109:0.53:205
chr6	7232186	rs9505086	T	C	954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.162;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=25;PP=640;ReadPosRankSum=-0.016;SC=TACTTCCTGGTAGGGGGAGCC;SOR=0.459;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=58;TCF=16;TCR=42;TR=36;WE=7232194;WS=7232176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,39:0.63:62
chr6	7240577	rs2714337	A	T	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.114;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=296;ReadPosRankSum=-0.377;SC=GGGGGGAACAACTGCCAATGA;SOR=1.402;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=17;WE=7240585;WS=7240567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr6	7240876	rs41302867	G	A	858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.553;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=25;PP=567;ReadPosRankSum=0.473;SC=AAGAGGGAGAGAGAGGAGTTC;SOR=0.395;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=59;TCF=14;TCR=45;TR=34;WE=7240884;WS=7240866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,37:0.56:66
chr6	7247248	rs2256596	T	C	2134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.184;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=38;PP=1369;ReadPosRankSum=-0.352;SC=GCGGAAAAGCTCGCGGAGGAG;SOR=0.579;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=162;TCF=93;TCR=69;TR=89;WE=7247256;WS=7247238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,97:0.55:176
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chr6	7290215	rs3799511	T	G	1572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=43;PP=957;ReadPosRankSum=1.252;SC=TATATTGAATTCAAAAGACAT;SOR=0.700;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=116;TCF=35;TCR=81;TR=62;WE=7290223;WS=7290205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,70:0.56:126
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chr6	7303735	rs9505131	C	T	461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=2;PP=285;SC=ACAAGCTCATCGTTTTAAAAT;SOR=2.584;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=7303743;WS=7303725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	7303952	rs3778324	G	A	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=45;ReadPosRankSum=-0.674;SC=GGCCGGGCACGGTGGCTCACA;SOR=0.693;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=4;WE=7303960;WS=7303942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr6	7310060	rs9379088	C	T	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=283;ReadPosRankSum=1.089;SC=ATAAATTACCCAGTCTTGGGT;SOR=0.576;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=14;WE=7310068;WS=7310050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
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chr6	7329873	rs2764095	T	C	155.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=1;PP=105;SC=GGGGATGGTGTGAAGGAGCCC;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=7329881;WS=7329863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	7330194	rs11381590	T	TG	624.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=319;ReadPosRankSum=0.613;SC=GGTGAGCAAGTTGCCATTATT;SOR=0.760;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=10;WE=7330202;WS=7330184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr6	7334396	rs183868904	G	C	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.446;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=432;ReadPosRankSum=-1.690;SC=AGATTCACTGGAGGATTTTAG;SOR=0.384;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=40;TCF=11;TCR=29;TR=25;WE=7334404;WS=7334386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,27:0.64:42
chr6	7355470	rs2764074	T	C	43.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
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chr6	7373249	rs11243160	T	C	411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=1;PP=290;SC=TACGCATCACTAGACCACTAG;SOR=2.985;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=7373257;WS=7373239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
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chr6	7385891	rs147220799	ATT	A	1324.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=11;PP=568;SC=TTTCAATAAGATTTTTTTGTG;SOR=1.308;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=22;TCF=9;TCR=13;TR=19;WE=7385900;WS=7385881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr6	7387236	rs9406026	G	A	3350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=53;PP=2253;SC=AAGTGGTGCCGGTGGTTTCCA;SOR=0.845;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=68;TCR=53;TR=120;WE=7387244;WS=7387226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr6	7387433	rs35613760	T	TA	445.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=10;HapScore=3;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=0;NR=15;PP=158;SC=AAGACTTCTTTAAAAAAAAAA;SOR=3.500;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=15;WE=7387441;WS=7387423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr6	7387462	rs9406027	T	C	407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=320;SC=TTAGTAGGTATAAACAAAAAG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=7387470;WS=7387452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	7390369	rs2296358	T	C	4521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=75;PP=2374;SC=CCCCTTGGGGTGTGGACTCTT;SOR=0.705;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=159;TCF=84;TCR=75;TR=159;WE=7390377;WS=7390359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr6	7395229	rs12527405	A	G	2167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.264;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.045;NF=61;NR=28;PP=1337;ReadPosRankSum=-0.238;SC=AAATGTGATGATGAATCTTAG;SOR=0.965;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=188;TCF=121;TCR=67;TR=89;WE=7395237;WS=7395219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,99:0.47:209
chr6	7395484	rs62386195	C	T	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=61;ReadPosRankSum=-1.080;SC=TGGTGGCTCACGCCTGTAATC;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=4;WE=7395492;WS=7395474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr6	7397125	.	GGT	G	72	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=72;QD=37.5;SC=TCATTATTTTGGTGTGTGTGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=2;WE=7397134;WS=7397115;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:12,2:0.14:14
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chr6	7414657	rs4960314	T	C	2562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=58;PP=1449;SC=TTTTCTTTAGTGTGGGAGCAC;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=29;TCR=58;TR=87;WE=7414665;WS=7414647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
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chr6	7585967	rs2744380	G	C	1080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.719;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=21;PP=798;ReadPosRankSum=-0.225;SC=CGGCTCCGGGGTCCCGCTCCG;SOR=0.609;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=101;TCF=56;TCR=45;TR=45;WE=7585975;WS=7585957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,47:0.44:107
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chr6	7606255	rs2757597	G	A	2265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.243;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=45;PP=1322;ReadPosRankSum=1.584;SC=ATTCTTTTCTGTGTTTTAGGA;SOR=0.946;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=222;TCF=120;TCR=102;TR=102;WE=7606263;WS=7606245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,113:0.45:252
chr6	7608863	rs1535433	T	A	113.85	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5165;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=82;ReadPosRankSum=-0.674;SC=GATTTTTTTTTAATTACGCTT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=5;WE=7608871;WS=7608861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr6	7727271	rs111588693	G	A	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=224;ReadPosRankSum=2.190;SC=CCGCCGCTGCGGCCGCCCTTG;SOR=0.275;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=12;WE=7727279;WS=7727261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
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chr6	7986847	rs197129	G	A	3390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.676;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=60;PP=1856;ReadPosRankSum=0.783;SC=CCTGTACCGCGTCCTCAGCAT;SOR=0.880;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=239;TCF=135;TCR=104;TR=141;WE=7986855;WS=7986824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,160:0.58:275
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chr6	8090270	rs1136044	T	G	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=43;ReadPosRankSum=-0.824;SC=AACGTGCAGGTTTGTTACAAA;SOR=0.260;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=4;WE=8090278;WS=8090260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr6	8095629	rs9392961	G	A	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.195;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=184;ReadPosRankSum=0.869;SC=CCATTTACTCGGGAGGCTGAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=9;WE=8095637;WS=8095619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
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chr6	8413890	rs3757099	A	G	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.468;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=212;ReadPosRankSum=-0.603;SC=TGTAAACATTAAGAAATATAC;SOR=1.244;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=27;TCF=13;TCR=14;TR=14;WE=8413898;WS=8413880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr6	8417521	rs6905235	G	A	615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=6;PP=444;SC=GGCATGTTATGTTAAAGGAGG;SOR=2.030;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=22;WE=8417529;WS=8417511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr6	8419242	rs1360854	G	T	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=159;ReadPosRankSum=0.460;SC=CCACACAAGAGTGTGATATGA;SOR=0.540;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=13;WE=8419250;WS=8419232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr6	8428137	rs3215958	A	AAGT	1452.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.724;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=0;PP=1367;ReadPosRankSum=-1.511;SC=CAACTAATATAGAAATATCAA;SOR=2.734;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=66;TCF=59;TCR=7;TR=30;WE=8428145;WS=8428127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,37:0.45:82
chr6	8430049	rs6918877	G	A	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.773;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=225;ReadPosRankSum=0.949;SC=CATACTGACCGCAATTATTAT;SOR=0.346;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=16;WE=8430057;WS=8430039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr6	8435454	rs6597317	T	C	1076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.755;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=18;PP=584;ReadPosRankSum=-0.222;SC=GTTTCTTCCATCCCGACCTCA;SOR=0.457;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=82;TCF=51;TCR=31;TR=45;WE=8435462;WS=8435444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,51:0.56:91
chr6	9616231	rs143324041	A	AGAAGAAGAAGAG	5561.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=67.58;QD=39.73;SOR=2.155;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,137:0.98:140
chr6	9750430	rs10949284	T	C	978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.782;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=12;PP=731;ReadPosRankSum=-1.942;SC=CTACAGAGGGTAAAAAGGACA;SOR=0.929;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=88;TCF=61;TCR=27;TR=41;WE=9750438;WS=9750420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,43:0.46:94
chr6	9750730	rs375191856	GTAATAATAA	G	205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=6;PP=1419;SC=CCTCCTCTATGTAATAATAAT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=6;WE=9750746;WS=9750720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	9769187	rs147413800	C	T	2490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.985;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=52;PP=1463;ReadPosRankSum=0.787;SC=GGTGTTCCTCCAGTTCCTCCA;SOR=0.600;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=219;TCF=122;TCR=97;TR=114;WE=9769195;WS=9769177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,122:0.50:244
chr6	9776194	rs9370818	A	G	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.691;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=209;ReadPosRankSum=0.159;SC=GTAAGCTTACACTGCTGAAAT;SOR=0.375;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=40;TCF=14;TCR=26;TR=18;WE=9776202;WS=9776184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,18:0.40:45
chr6	9795507	.	A	AGAG	140.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.855;ClippingRankSum=-0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQRankSum=0.319;QD=10.05;ReadPosRankSum=0.183;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr6	9795549	rs70988144	G	GAGA	229.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=2.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.63;MQRankSum=-1.981;QD=9.57;ReadPosRankSum=2.055;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr6	9795586	rs202138583	GGAA	G,GGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA	1772.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.53;QD=35.45;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,29,21:0.58,0.42:50
chr6	9900599	rs59046538	T	TGAG	1443.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.753;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=8;PP=924;ReadPosRankSum=-1.236;SC=TATAGTTTTCTGAGATCTTTG;SOR=1.609;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=63;TCF=27;TCR=36;TR=20;WE=9900607;WS=9900589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,40:0.38:106
chr6	9921965	rs35153317	CATT	C	265.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=3;PP=144;ReadPosRankSum=-0.703;SC=GAAACCAATACATTTACATGA;SOR=0.551;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=4;WE=9921975;WS=9921955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr6	9922006	rs1925775	A	G	799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=10;PP=389;SC=ATGTTATTGTAGTGGTCTAGA;SOR=0.756;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=16;TCR=10;TR=26;WE=9922014;WS=9921996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr6	10398562	rs10456013	G	T	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.62;ReadPosRankSum=1.283;SOR=0.877;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
chr6	10587038	rs539351	C	G	8293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=133;NR=141;PP=2965;SC=TTACCAGAGACTTTGTCGACT;SOR=0.832;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=274;TCF=133;TCR=141;TR=274;WE=10587046;WS=10587028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,306:1.00:306
chr6	10724943	rs4711068	T	C	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.790;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=440;ReadPosRankSum=2.247;SC=GAAAAGAACCTTAAGAGTAGA;SOR=1.552;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=40;TCF=13;TCR=27;TR=21;WE=10724951;WS=10724933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,22:0.51:43
chr6	10729020	rs2153073	C	T	2973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.930;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-2.878;NF=68;NR=63;PP=1862;ReadPosRankSum=0.910;SC=CCCAGGATACCTTATGCATTC;SOR=0.619;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=244;TCF=126;TCR=118;TR=131;WE=10729028;WS=10729010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,142:0.53:269
chr6	10764727	rs126405	A	G	3133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=38;PP=1797;SC=CTGTCCTCCCATGCACTGAGG;SOR=1.188;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=73;TCR=38;TR=111;WE=10764735;WS=10764717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr6	10770206	rs115029448	T	C	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.590;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=104;ReadPosRankSum=-0.061;SC=GACATTTCGGTAAAAACAAAA;SOR=0.116;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=7;WE=10770214;WS=10770196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr6	10775446	rs478791	T	C	2166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=15;PP=1419;SC=TGGAAAACCTTTGTGTATCTC;SOR=2.271;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=50;TCR=15;TR=65;WE=10775454;WS=10775436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr6	10784851	.	G	GATCTCGCCCACCCTCTGCAC	1379.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.54;QD=51.10;SOR=2.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr6	10785011	rs113945134	C	CCAGA	9164.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=57;PP=2918;SC=ATTTCTGATACCAGTATGTGA;SOR=0.971;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=101;TCF=41;TCR=60;TR=95;WE=10785019;WS=10785001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr6	10785227	rs70991044	AAAG	A	2820.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=33;PP=1582;SC=TGAAATGGGGAAAGAAGTGCT;SOR=2.376;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=34;WE=10785237;WS=10785217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr6	10785263	rs6936890	C	G	964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=19;PP=550;SC=TACAATTTCCCGTCACCCTAG;SOR=2.235;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=27;WE=10785271;WS=10785253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr6	10792197	rs521802	T	C	978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=29;PP=718;SC=GTTCCATACATGTAAGGGCAT;SOR=2.494;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=8;TCR=29;TR=37;WE=10792205;WS=10792187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr6	10802045	rs569418	C	G	879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=5;PP=644;SC=TGAGAATAGACCTGCCTTTGT;SOR=2.910;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=28;WE=10802053;WS=10802035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr6	10802101	rs4712966	G	A	3356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=35;PP=2032;SC=ATTTTTAAAGGTCTAACAGGA;SOR=1.460;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=114;TCF=79;TCR=35;TR=113;WE=10802109;WS=10802091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr6	10814091	rs6909367	A	G	3643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=81;PP=2403;SC=ATAGATTTATACTCTTAAAGC;SOR=1.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=37;TCR=81;TR=118;WE=10814099;WS=10814081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr6	10882100	rs2153156	G	A	2113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=33;NR=42;PP=1453;SC=CGCCAGGTGGGTTTTTTTTCT;SOR=1.051;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=33;TCR=42;TR=75;WE=10882108;WS=10882090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr6	10887251	rs9366663	T	C	644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=8.568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.99;ReadPosRankSum=1.094;SOR=3.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,17:0.40:43
chr6	10887251	.	TCG	CCC	800	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=16;NR=0;PP=800;QD=53.3417421789;SC=CAGGGCTCTTTCGGCAGCGCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=36;TCR=5;TR=16;WE=10887261;WS=10887241;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:25,16:0.39:41
chr6	10887253	rs9358956	G	C	644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=6.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.02;ReadPosRankSum=0.542;SOR=2.316;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,19:0.41:46
chr6	10887276	rs9348724	C	G	767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.293;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=7;PP=501;ReadPosRankSum=0.566;SC=GCGGGCGGGGCTCTTGGGCGG;SOR=1.123;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=75;TCF=53;TCR=22;TR=33;WE=10887284;WS=10887266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,35:0.44:79
chr6	10891781	rs1538441	C	T	2330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.57;QD=24.53;SOR=0.947;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr6	10891842	.	CTCTCTGTGTGTGTGTGTGTG	C,CTGTG,CTGTGTG	1213.73	.	AC=2,0,0;AF=1.00,0.00,0.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.525;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=4.357;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=-0.473;NF=1,1;NR=22,22;PP=47,224;ReadPosRankSum=-1.158;SC=TTTATAATCTCTCTCTGTGTG;SOR=1.269;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23,23;WE=10891865;WS=10891832;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:0.97:30
chr6	10898820	rs12190074	C	T	61.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5040;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=39;ReadPosRankSum=-0.319;SC=CATATATAACCGATGTTAAAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=3;WE=10898828;WS=10898810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr6	10906154	rs9357021	A	G	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.075;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=145;ReadPosRankSum=0.700;SC=AAATAGTTTCAGAAACATATA;SOR=1.765;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=12;WE=10906162;WS=10906144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr6	10906256	rs4713039	A	G	791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=16;PP=438;ReadPosRankSum=-0.347;SC=GTTTCAGGAAAGACCTTGCAA;SOR=0.699;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=38;TCR=34;TR=33;WE=10906264;WS=10906246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,39:0.46:84
chr6	10911282	rs4713044	G	A	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=257;ReadPosRankSum=-1.649;SC=ACCAGAATGCGTTACCAGTAA;SOR=0.547;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=18;WE=10911290;WS=10911272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr6	10924992	rs1225764	A	G	777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=21;PP=589;SC=CTGGTCTTTCAAATGCCATGT;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=10925000;WS=10924982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr6	10926514	.	A	AT	82.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.845;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.23;MQRankSum=1.950;QD=1.80;ReadPosRankSum=0.986;SOR=0.616;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,10:0.22:46
chr6	10931587	rs1225729	T	C	2012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=7;PP=1347;SC=TTGCTTTTAGTGTTAGCATAT;SOR=3.545;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=53;TCR=7;TR=60;WE=10931595;WS=10931577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr6	10942964	rs3798751	A	G	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.186;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=13;PP=277;ReadPosRankSum=1.224;SC=TAAGCTGAGAAACTTGGAAGA;SOR=0.521;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=43;TCF=13;TCR=30;TR=23;WE=10942972;WS=10942954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,27:0.61:44
chr6	10955408	rs1225746	C	T	7815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=151;NR=111;PP=2965;SC=AGAGGTTGCTCCGGGATCCCC;SOR=0.968;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=265;TCF=152;TCR=113;TR=262;WE=10955416;WS=10955398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,285:1.00:285
chr6	10955594	rs1225747	T	C	1422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=41;PP=1043;SC=TTTGTGCTTTTGGAGACAAAT;SOR=3.215;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=8;TCR=41;TR=49;WE=10955602;WS=10955584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr6	10989942	rs12195587	G	A	4601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=66;PP=2717;SC=GTACCTGAACGTAAAAATTTA;SOR=0.867;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=159;TCF=93;TCR=66;TR=159;WE=10989950;WS=10989932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
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chr6	11185533	rs1050775	G	A	1324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=27;PP=827;ReadPosRankSum=1.387;SC=CCATGACTATGGTCTTGAGCT;SOR=0.661;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=132;TCF=70;TCR=62;TR=57;WE=11185541;WS=11185523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,64:0.43:148
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chr6	11190626	rs941982	A	G	2010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.128;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=40;PP=1285;ReadPosRankSum=-0.030;SC=GGGAGTCTTCAACTCGTTGCA;SOR=0.610;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=167;TCF=87;TCR=80;TR=87;WE=11190634;WS=11190616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,96:0.52:186
chr6	11192522	rs5874310	C	CT	1285.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.110;NF=19;NR=8;PP=921;ReadPosRankSum=-0.569;SC=CTGCACCCCCCGACACACAGA;SOR=0.672;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=64;TCF=41;TCR=23;TR=27;WE=11192540;WS=11192512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,39:0.46:85
chr6	11192575	rs1465131	C	T	2260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.627;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.063;NF=53;NR=37;PP=1111;ReadPosRankSum=1.354;SC=GTCACTCACTCACCCCTTTTG;SOR=0.840;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=206;TCF=120;TCR=86;TR=90;WE=11192583;WS=11192565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,108:0.47:228
chr6	11192829	.	C	CTT	61	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5000;HP=9;HapScore=3;MGOF=12;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=0;NR=6;PP=61;QD=12.5;SC=GATTTATTGCCTTTTTTTTTA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=6;WE=11192837;WS=11192819;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr6	11200421	rs2078599	C	T	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=341;ReadPosRankSum=-0.255;SC=CTCACCAAGGCAGGGACCCCA;SOR=0.941;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=37;TCF=33;TCR=4;TR=19;WE=11200429;WS=11200411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr6	11200574	rs726230	A	C	2494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.463;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=52;PP=1454;ReadPosRankSum=-2.355;SC=ATGCTTGCCTATGAGGCTGGC;SOR=0.753;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=223;TCF=113;TCR=110;TR=106;WE=11200582;WS=11200564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,118:0.47:249
chr6	11201135	rs3798733	C	G	1000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.715;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=9;PP=611;ReadPosRankSum=0.178;SC=AGATATTTATCCAAGAGAAAG;SOR=0.172;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=70;TCF=59;TCR=11;TR=38;WE=11201143;WS=11201125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,42:0.53:79
chr6	11201157	rs3798734	C	T	1469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.552;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=19;PP=895;ReadPosRankSum=0.494;SC=CGGCAAGCCTCCAAACTCAGG;SOR=0.403;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=111;TCF=80;TCR=31;TR=59;WE=11201165;WS=11201147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,67:0.52:128
chr6	11201437	rs9368610	C	T	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=355;ReadPosRankSum=-0.394;SC=GGCAGAGCAGCGGCAGCAGAG;SOR=0.784;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=42;TCF=5;TCR=37;TR=20;WE=11201445;WS=11201427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,19:0.44:43
chr6	11213468	rs12215094	A	G	822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.810;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=15;PP=542;ReadPosRankSum=-0.327;SC=GTGTAATGGGAAAAAAAAATA;SOR=0.532;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=76;TCF=50;TCR=26;TR=41;WE=11213476;WS=11213458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,45:0.50:90
chr6	11213832	rs3734404	T	C	3247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.409;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=63;PP=1704;ReadPosRankSum=-0.578;SC=GACCGTGTAATGAGCACAGCC;SOR=0.727;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=278;TCF=154;TCR=124;TR=143;WE=11213840;WS=11213822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,159:0.51:313
chr6	11214705	rs1009667	G	A	1788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.141;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=42;PP=1074;ReadPosRankSum=-2.028;SC=CTCCCCTTTCGTCACCTACTT;SOR=0.591;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=173;TCF=85;TCR=88;TR=87;WE=11214713;WS=11214695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,93:0.50:185
chr6	11233375	rs151103358	C	CCT	2060.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.628;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=18;PP=1080;ReadPosRankSum=0.800;SC=CCTGCTGATACCTCTCTCTCT;SOR=0.765;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=78;TCF=29;TCR=49;TR=30;WE=11233383;WS=11233365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,66:0.47:141
chr6	11714806	rs3734273	G	A	2099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.147;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=47;PP=1166;ReadPosRankSum=0.478;SC=GGGTATTTTTGTTGTGGGTAG;SOR=0.425;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=171;TCF=78;TCR=93;TR=89;WE=11714814;WS=11714796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,103:0.54:191
chr6	11723538	rs210905	A	G	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.89;ReadPosRankSum=0.135;SOR=0.602;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,28:0.51:55
chr6	11779088	rs2076189	C	T	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=211;ReadPosRankSum=-1.032;SC=CGGAGAGCTACAAACCACACC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=10;WE=11779096;WS=11779078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr6	12016009	rs6916066	G	C	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.399;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=137;ReadPosRankSum=0.559;SC=TGCCTGGTGAGGAGCGCTATT;SOR=1.127;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=29;TCF=12;TCR=17;TR=14;WE=12016017;WS=12015999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chr6	12038110	.	CT	C	42.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=0.000;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.93;ReadPosRankSum=0.319;SOR=0.620;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,9:0.20:46
chr6	12120445	rs2228215	A	G	3496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=69;PP=2227;ReadPosRankSum=0.328;SC=TTCTGCAGCAACCATCTGAAC;SOR=0.703;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=287;TCF=152;TCR=135;TR=148;WE=12120453;WS=12120435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,163:0.51:317
chr6	12120588	rs2228209	C	T	4595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=393;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=100;NR=86;PP=2599;ReadPosRankSum=0.477;SC=TGTGGCACTACGTCCCCCTCC;SOR=0.689;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=348;TCF=187;TCR=161;TR=186;WE=12120596;WS=12120578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:180,213:0.54:393
chr6	12122174	rs2228210	A	G	1822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.498;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=40;PP=1140;ReadPosRankSum=-0.039;SC=TCTTGTCACCACGTCAACACC;SOR=0.648;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=204;TCF=103;TCR=101;TR=83;WE=12122182;WS=12122164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,92:0.42:219
chr6	12122645	rs6900196	A	G	7404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=123;NR=124;PP=2965;SC=CAAAATTGGCACTTTCTATGA;SOR=0.777;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=247;TCF=123;TCR=124;TR=247;WE=12122653;WS=12122635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,271:1.00:271
chr6	12124587	rs2228212	C	G	2523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.750;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=47;PP=1535;ReadPosRankSum=-0.056;SC=CAAATCCATGCACCGCCTAGC;SOR=0.766;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=232;TCF=121;TCR=111;TR=103;WE=12124595;WS=12124577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,119:0.47:255
chr6	12124855	rs2228213	G	A	3683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=389;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.220;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=93;PP=2167;ReadPosRankSum=-2.202;SC=TTGACAGCATGTCTAATTCGC;SOR=0.850;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=352;TCF=165;TCR=187;TR=168;WE=12124863;WS=12124845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:205,183:0.47:388
chr6	12165363	rs219950	C	T	4247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=452;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.524;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=102;PP=2486;ReadPosRankSum=0.505;SC=AGACTTTACTCGCCTTTCTAC;SOR=0.735;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=410;TCF=189;TCR=221;TR=190;WE=12165371;WS=12165353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:238,212:0.47:450
chr6	12290728	rs1800997	TA	T	514.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=0;PP=650;SC=TTCTCCCCGTTAAAAGGGCAC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=18;WE=12290736;WS=12290718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr6	12292772	rs2070699	G	T	2831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=64;PP=1945;SC=TGTAACCCTAGTCATTCATTA;SOR=2.160;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=22;TCR=64;TR=86;WE=12292780;WS=12292762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr6	12294258	rs5369	A	G	7003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=124;NR=98;PP=2965;SC=CAGACCGTGAAAATAGATGCC;SOR=0.791;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=222;TCF=124;TCR=98;TR=222;WE=12294266;WS=12294248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr6	13182685	rs3778646	G	T	932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=14;PP=533;ReadPosRankSum=1.061;SC=CAGCAGGCGGGAAGTGCCACT;SOR=0.606;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=47;TCR=26;TR=39;WE=13182693;WS=13182675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,43:0.55:78
chr6	13206385	rs114091869	G	A	1069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=2.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.09;ReadPosRankSum=0.603;SOR=0.950;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,51:0.48:106
chr6	13273318	rs202054	A	G	453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=13;PP=350;SC=ACCTCCCCAAAGAGAAGGCAA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=13273326;WS=13273308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	13278648	rs3817735	A	G	592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=13;PP=372;SC=CAGTGGCCTCACCGCTGCCTG;SOR=2.531;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=17;WE=13278656;WS=13278638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr6	13281412	rs3846903	A	G	4625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=86;PP=2786;SC=GACATTAGTAAAATCCAGGTC;SOR=1.159;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=153;TCF=67;TCR=86;TR=153;WE=13281420;WS=13281402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr6	13288535	rs202040	C	T	896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=11;PP=663;SC=GGGAGCGTGACTGTGGGTGTG;SOR=1.483;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=24;TCR=11;TR=35;WE=13288543;WS=13288525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr6	13288578	rs202039	G	A	2028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=18;PP=1211;SC=TAGGGTGTGCGATGAGGCCAG;SOR=1.457;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=46;TCR=18;TR=64;WE=13288586;WS=13288568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr6	13288648	rs202038	A	G	3233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=61;NR=47;PP=1740;SC=GATTTCCTTCATAACAGAGCT;SOR=0.742;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=108;TCF=61;TCR=47;TR=108;WE=13288656;WS=13288638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr6	13288679	rs67298859	GCT	G	4721.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=51;PP=2860;SC=CAGTTGCAGAGCTCTCTCACC;SOR=0.884;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=63;TCF=10;TCR=53;TR=61;WE=13288688;WS=13288669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr6	13288737	rs202036	T	A	1823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=36;PP=1081;SC=GTGGTGGAACTCTCCACCACA;SOR=1.263;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=26;TCR=36;TR=62;WE=13288745;WS=13288727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr6	13294866	rs6910418	G	A	303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=0;PP=249;SC=CTGACGTGTCGTGGCTTTCCC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=13294874;WS=13294856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	13295502	rs4602719	T	C	6175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=54;PP=2281;SC=TTAAGATGCATCTACCCTGAG;SOR=0.874;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=71;TCR=54;TR=125;WE=13295523;WS=13295492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr6	13295515	rs1550526	A	C	6558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=57;PP=2022;SC=ACCCTGAGCCAGAATTCCAGA;SOR=0.823;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=128;TCF=71;TCR=57;TR=128;WE=13295523;WS=13295492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr6	13295536	rs454563	C	T	6238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=58;PP=2475;SC=ACTGGTTCCCCTCCTCATCCA;SOR=0.764;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=127;TCF=69;TCR=58;TR=127;WE=13295544;WS=13295526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr6	13295752	rs35194435	AG	A	472.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=391;SC=CCAGTGTGGCAGGGGGGTCCC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=13;WE=13295760;WS=13295742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	13361088	rs2496162	A	G	1482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.670;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=32;PP=932;ReadPosRankSum=0.704;SC=CCTGGCAAGAACAGGAGGTGC;SOR=0.809;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=113;TCF=56;TCR=57;TR=60;WE=13361096;WS=13361078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,66:0.53:124
chr6	13365913	rs9367440	C	G	1104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=24;PP=647;ReadPosRankSum=0.851;SC=GGGAGGAAGACAGCGGTCAGC;SOR=0.751;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=74;TCF=30;TCR=44;TR=40;WE=13365921;WS=13365903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,49:0.56:88
chr6	13470113	rs766773	A	T	5865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.512;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=105;NR=74;PP=2965;ReadPosRankSum=0.760;SC=TATGTCTCACACCAAATCTGG;SOR=0.602;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=182;TCF=106;TCR=76;TR=179;WE=13470121;WS=13470103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,210:1.00:211
chr6	13487174	rs62385806	C	T	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-1.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.832;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=72;ReadPosRankSum=0.841;SC=CAGTCCAACGCGCGCACACAC;SOR=0.078;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=9;WE=13487182;WS=13487164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr6	13597295	.	CA	C	182.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.616;ClippingRankSum=0.000;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=6.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.86;ReadPosRankSum=2.512;SOR=0.207;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,21:0.21:98
chr6	13642922	rs3752502	C	T	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=3.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=100;ReadPosRankSum=-1.097;SC=GTTATAAAAACGAACCTATTT;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=13642930;WS=13642912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr6	13659079	rs204232	T	G	3290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.836;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=74;PP=1987;ReadPosRankSum=0.450;SC=TGGCGGAGGTTGGGGGAGAGA;SOR=0.586;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=295;TCF=147;TCR=148;TR=154;WE=13659087;WS=13659069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,163:0.51:321
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chr6	13794044	rs6922822	T	C	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.891;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=14;PP=539;ReadPosRankSum=1.032;SC=TGTAACTTCCTATTATCATTA;SOR=0.477;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=69;TCF=44;TCR=25;TR=36;WE=13794052;WS=13794034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,38:0.49:77
chr6	13794110	rs4715568	C	A	979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.505;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=17;PP=646;ReadPosRankSum=1.634;SC=AGAAAAATCACAGTCTTGTTT;SOR=0.776;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=103;TCF=57;TCR=46;TR=42;WE=13794118;WS=13794100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,47:0.40:117
chr6	13814338	rs12206286	G	A	596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.88;ReadPosRankSum=0.745;SOR=0.506;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,17:0.40:43
chr6	13814338	.	GCT	ACC	298	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=4;NR=6;PP=298;QD=35.1467874862;SC=ACCTCCACGCGCTGCTGCGCC;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=32;TCF=11;TCR=21;TR=10;WE=13814348;WS=13814328;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:22,10:0.31:32
chr6	13814340	rs1204145	T	C	596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.21;ReadPosRankSum=-0.393;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,17:0.40:42
chr6	14118034	rs111804875	G	A	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.105;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=208;ReadPosRankSum=0.899;SC=GCGGCGCAGCGCTCCAGCCAT;SOR=0.941;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=49;TCF=34;TCR=15;TR=19;WE=14118042;WS=14118024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,21:0.39:54
chr6	15246896	rs12527988	CT	AG	3673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.162;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=49;PP=2944;ReadPosRankSum=1.078;SC=ATAATTCTGCCTCTGAAGGGT;SOR=0.841;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=237;TCF=104;TCR=133;TR=85;WE=15246905;WS=15246886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,100:0.38:261
chr6	15246915	rs12527989	C	G	1705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.523;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=46;PP=1127;ReadPosRankSum=0.552;SC=GTTTTAAACACAGCGTCCGAT;SOR=0.649;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=195;TCF=77;TCR=118;TR=76;WE=15246923;WS=15246905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,84:0.39:216
chr6	15374428	rs34326651	T	C	2115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.428;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=50;PP=1297;ReadPosRankSum=1.052;SC=AGTTCAAGAATTCCCAGAAGA;SOR=1.022;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=202;TCF=98;TCR=104;TR=91;WE=15374436;WS=15374418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,103:0.46:225
chr6	15374508	rs9383050	A	G	3022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=55;PP=1699;SC=GGAATATCTCATTGGAATGTA;SOR=1.386;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=36;TCR=55;TR=91;WE=15374516;WS=15374498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr6	15374544	rs2072820	C	T	1534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=29;PP=882;SC=TGGACTTGTTCCTGAATTGGA;SOR=1.835;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=15;TCR=29;TR=44;WE=15374552;WS=15374534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr6	15468722	rs147212247	AGGGTGAG	A	592.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=504;SC=CCTTCTGGAAAGGGTGAGGGT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=15468736;WS=15468712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	15497422	rs9349979	A	G	1619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=41;PP=1185;SC=GCGGGGGGTCAGGGGGTGGTG;SOR=2.041;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=17;TCR=41;TR=58;WE=15497430;WS=15497412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr6	15504589	rs760659	T	C	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.410;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=245;ReadPosRankSum=-0.838;SC=CTTCCTTCTCTGCCTGTCATT;SOR=0.048;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=16;WE=15504597;WS=15504579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr6	15507560	rs77409453	C	T	2985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=369;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=73;PP=1800;ReadPosRankSum=2.127;SC=TAACGTCCCTCGTCTTCCCCT;SOR=0.714;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=341;TCF=160;TCR=181;TR=138;WE=15507568;WS=15507550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:216,153:0.41:369
chr6	15511429	rs55742636	C	CCCAT	521.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=3;PP=394;ReadPosRankSum=0.721;SC=CAGAGCCTCTCGTGTGCTCGG;SOR=0.551;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=8;WE=15511437;WS=15511419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr6	15513482	rs2235258	G	A	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=3;PP=419;ReadPosRankSum=-0.343;SC=ATACAGAGCTGCGGCAGCGCA;SOR=0.519;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=43;TCF=38;TCR=5;TR=24;WE=15513490;WS=15513472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,24:0.53:45
chr6	15513744	rs9396589	G	T	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.247;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=219;ReadPosRankSum=-0.546;SC=GGCGCTCTCTGCCCAGGAGAC;SOR=1.773;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=13;WE=15513752;WS=15513734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,14:0.38:37
chr6	15533733	rs11753919	C	T	823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.933;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=17;PP=464;ReadPosRankSum=0.409;SC=AGTCATGCCGCGTTTACAGAC;SOR=0.396;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=83;TCF=35;TCR=48;TR=34;WE=15533741;WS=15533723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,39:0.44:88
chr6	15533951	rs4236167	C	T	2321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.058;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=51;PP=1391;ReadPosRankSum=-1.117;SC=CTTCTCAGGTCGTCCTTCTAC;SOR=0.610;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=188;TCF=91;TCR=97;TR=99;WE=15533959;WS=15533941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,111:0.52:212
chr6	15546213	rs12527121	C	T	2588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=58;PP=1223;ReadPosRankSum=0.632;SC=CACCTCCCACCATGCACCCTG;SOR=0.665;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=207;TCF=89;TCR=118;TR=104;WE=15546221;WS=15546203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,126:0.53:237
chr6	15586009	rs6926401	G	T	3863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=71;PP=2236;SC=GAGACCTGAAGGAGTGAACAG;SOR=1.154;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=123;TCF=52;TCR=71;TR=123;WE=15586017;WS=15585999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr6	15593240	rs7758659	T	C	930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.49;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
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chr6	15660871	rs909706	T	C	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=224;ReadPosRankSum=-0.613;SC=GGGTTCTAACTAGATCCCTTT;SOR=0.527;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=12;WE=15660879;WS=15660861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
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chr6	16290862	rs6926552	T	C	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=19;PP=299;ReadPosRankSum=-2.325;SC=GGTGAGGAGGTGACCCCGGGG;SOR=0.613;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=58;TCF=15;TCR=43;TR=26;WE=16290870;WS=16290852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,30:0.48:62
chr6	16306751	rs16885	G	A	3641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=61;PP=2078;ReadPosRankSum=-0.654;SC=GGCGCTGCAGGCAATCCCATT;SOR=0.710;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=305;TCF=176;TCR=129;TR=145;WE=16306759;WS=16306741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,167:0.50:337
chr6	16326587	rs78115249	G	A	1042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=13;PP=613;ReadPosRankSum=0.643;SC=GCATCACGGTGTGGTGTCCCA;SOR=0.706;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=103;TCF=72;TCR=31;TR=48;WE=16326595;WS=16326577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,52:0.46:112
chr6	16327330	rs2075974	T	C	2430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.597;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=53;PP=1676;ReadPosRankSum=-1.188;SC=AAGGGGAGGCTTCACGATGAG;SOR=0.602;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=212;TCF=111;TCR=101;TR=108;WE=16327338;WS=16327320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,113:0.49:230
chr6	16327615	rs179990	A	G	6419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=105;NR=117;PP=2965;SC=GGCTGCTCTCAGCTTTCTTGG;SOR=0.859;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=222;TCF=105;TCR=117;TR=222;WE=16327623;WS=16327605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr6	16327864	.	G	GTGC,GTGCTGC	568.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=0.000;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.93;ReadPosRankSum=-1.004;SOR=0.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:2,10,7:0.53,0.37:19
chr6	16327909	.	A	C	210	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;FR=0.5000;HP=1;MMLQ=28;MQ=59.21;NF=5;NR=10;SC=GCTGCTGCTGATGCTGATGCT;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=15;WS=16327890;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr6	16327915	.	A	ATGCTGCTGCTGCTGC	396.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=-0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=2.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=28.34;ReadPosRankSum=-0.372;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr6	16327921	.	C	A	207	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=17;MMLQ=27;MQ=59.3;NF=0;NR=8;PP=207;QD=30.2214015684;SC=GCTGATGCTGCTGCTGCTGCT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=12;TCR=19;TR=8;WE=16327929;WS=16327890;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:23,8:0.26:31
chr6	17102429	rs9367941	G	A	1108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.131;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=23;PP=718;ReadPosRankSum=-0.700;SC=AGCGCGGCAGGGAGCGCTCGC;SOR=0.535;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=132;TCF=83;TCR=49;TR=55;WE=17102437;WS=17102419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,60:0.41:148
chr6	17102596	rs1473744	A	G	1290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FS=2.071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.17;ReadPosRankSum=2.911;SOR=0.913;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,63:0.40:158
chr6	17102600	rs2147230	A	G	4644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FS=4.111;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=34.66;ReadPosRankSum=1.841;SOR=1.029;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,133:0.99:134
chr6	17115384	rs34224564	G	C	3166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=64;PP=2048;SC=ACCTCCCTCTGCCCCCATTCA;SOR=1.302;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=42;TCR=64;TR=106;WE=17115392;WS=17115374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr6	17282415	rs1108512	G	C	905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.828;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=11;PP=617;ReadPosRankSum=-0.405;SC=TGGGGCTGTTGCCCTTGTGTC;SOR=0.815;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=80;TCF=57;TCR=23;TR=40;WE=17282423;WS=17282405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,42:0.47:89
chr6	17493690	rs751502	C	G	2402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.970;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=57;PP=1705;ReadPosRankSum=1.246;SC=ACAGACTGTACCCATAATGGA;SOR=0.781;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=230;TCF=119;TCR=111;TR=113;WE=17493698;WS=17493680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,117:0.47:249
chr6	17513954	rs4716146	T	C	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.820;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=126;ReadPosRankSum=0.131;SC=GGTGCCTGGGTTGCAAGGACG;SOR=0.976;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=8;WE=17513962;WS=17513952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr6	17543036	rs2296249	A	G	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=32;ReadPosRankSum=-2.189;SC=ATATATGCTGATGTTTAATAT;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=3;WE=17543044;WS=17543026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr6	17543302	rs9256	A	G	3003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.444;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=61;PP=1693;ReadPosRankSum=-0.763;SC=ACAACTGTAAAAAACTCGGCC;SOR=0.746;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=235;TCF=123;TCR=112;TR=124;WE=17543310;WS=17543292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,147:0.54:270
chr6	17600619	rs6919110	A	G	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=159;ReadPosRankSum=0.247;SC=CAGGTATCCCAGAGGGTGCTG;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=11;WE=17600627;WS=17600609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr6	17605106	rs6916441	A	C	1802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=2.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.723;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=39;PP=1081;ReadPosRankSum=0.526;SC=GTAACTAATTATTTATAACCC;SOR=0.828;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=171;TCF=87;TCR=84;TR=72;WE=17605114;WS=17605096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,88:0.43:203
chr6	17606338	rs201207827	ATATT	A	1210.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.044;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=635;ReadPosRankSum=-0.801;SC=AGATAGGCTTATATTTATTAA;SOR=1.058;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=44;TCF=2;TCR=42;TR=15;WE=17606349;WS=17606328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,33:0.42:79
chr6	17606413	rs1969830	C	T	289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=235;SC=TTTTACAGTACACATTTTCAA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=10;WE=17606421;WS=17606403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	17616493	rs7765156	C	G	2364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.11;QD=24.89;SOR=1.167;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr6	17616513	rs3836949	T	TG	389.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=15.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.21;MQRankSum=1.077;QD=9.99;ReadPosRankSum=0.661;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
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chr6	17633033	rs61744976	G	C	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=17;PP=501;ReadPosRankSum=0.531;SC=AGAAGGCAGAGAGACAGGTAC;SOR=0.784;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=18;TCR=26;TR=29;WE=17633041;WS=17633023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,27:0.68:40
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chr6	17779731	rs9477524	G	A	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.13;ReadPosRankSum=-1.282;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
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chr6	17794774	rs200502612	T	TA	552.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.767;HP=9;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=4;PP=374;ReadPosRankSum=-1.184;SC=GAGAAAACATTAAAAAAAAAC;SOR=1.270;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=83;TCF=60;TCR=23;TR=31;WE=17794782;WS=17794764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,30:0.36:84
chr6	17799766	rs6459573	T	C	235.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=9;PP=187;SC=TGAAACAAATTGGTCATCCAT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=17799774;WS=17799756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	17809199	rs6913612	G	A	3698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=65;PP=2025;SC=AAAATCTAAAGGAAAACTGCA;SOR=1.076;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=54;TCR=65;TR=119;WE=17809207;WS=17809189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr6	17815716	rs6920106	C	T	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.533;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=98;ReadPosRankSum=-0.731;SC=AGGTAATGGGCGCCTTCTCAG;SOR=1.129;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=31;TCF=21;TCR=10;TR=10;WE=17815724;WS=17815706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,11:0.34:32
chr6	17817235	rs9383327	C	G	232.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=0;PP=195;SC=TGGGCTGCCCCCGCTGCAGTT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=17817243;WS=17817225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
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chr6	17821964	rs13211637	CA	TG	2936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.549;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=30;PP=2016;ReadPosRankSum=-0.225;SC=CAATCAGCAGCACTGCTAAAA;SOR=0.753;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=166;TCF=96;TCR=70;TR=70;WE=17821973;WS=17821954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,79:0.44:181
chr6	17825888	rs7771879	T	C	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.056;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=186;ReadPosRankSum=0.392;SC=AGCAGTTTTATGTGTTTAAAA;SOR=0.154;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=12;WE=17825896;WS=17825878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
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chr6	17834316	rs4716191	T	C	2069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.176;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=55;PP=2941;ReadPosRankSum=-0.690;SC=TAAAATGAAATCAGAGATATC;SOR=0.946;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=250;TCF=117;TCR=133;TR=97;WE=17834336;WS=17834306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,107:0.40:267
chr6	17834328	rs4716192	G	A	1747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.447;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=51;PP=2941;ReadPosRankSum=0.139;SC=AGAGATATCTGATGTTCAAAA;SOR=1.054;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=224;TCF=99;TCR=125;TR=83;WE=17834336;WS=17834306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,92:0.38:241
chr6	17834346	rs4716193	A	G	1422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.158;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=43;PP=924;ReadPosRankSum=1.198;SC=AAATTTTTCCACCATCATATA;SOR=0.811;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=188;TCF=75;TCR=113;TR=68;WE=17834354;WS=17834336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,75:0.37:202
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chr6	17855864	rs624105	G	C	1223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.643;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=30;PP=691;ReadPosRankSum=0.356;SC=GAACAGCAAGGAAAAAGAAGA;SOR=0.617;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=126;TCF=52;TCR=74;TR=54;WE=17855872;WS=17855854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,61:0.43:141
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chr6	18134021	rs2842949	C	A	1152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.93;SOR=2.235;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr6	18139214	rs2842934	G	A	3673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=58;PP=2202;SC=CACCTGGATTGATGGCAACTA;SOR=0.737;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=122;TCF=64;TCR=58;TR=122;WE=18139222;WS=18139204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr6	18139964	rs375276814	GA	G	815.87	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=219;ReadPosRankSum=-1.217;SC=ATGAAATAATGAAAAAAAAAT;SOR=0.693;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=20;WE=18139981;WS=18139954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,42:0.88:48
chr6	18148019	rs4449636	G	A	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=143;ReadPosRankSum=-1.511;SC=CATCATTAAGGCAAGATAATT;SOR=1.061;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=12;WE=18148027;WS=18148009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr6	18148155	rs368770445	GA	G	243.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=3.370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.59;ReadPosRankSum=1.191;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,23:0.24:94
chr6	18148247	rs12529220	T	A	676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.945;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=22;PP=453;ReadPosRankSum=-1.855;SC=TAATAAGCAGTTACTATTAAT;SOR=0.909;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=70;TCF=23;TCR=47;TR=32;WE=18148255;WS=18148237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,34:0.45:75
chr6	18149526	rs3930696	C	T	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=102;ReadPosRankSum=-0.354;SC=TTTTTTATTTCTGGTTTTATT;SOR=1.460;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=7;WE=18149534;WS=18149516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr6	18161563	rs4716224	G	A	2433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.511;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=49;PP=1591;ReadPosRankSum=-0.600;SC=CTTAGGCGAAGAAGAAAGCAA;SOR=0.639;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=198;TCF=113;TCR=85;TR=111;WE=18161571;WS=18161553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,116:0.55:210
chr6	18166802	rs912528	T	G	251.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=162;SC=TAGGCTGGGTTTGGTGGCTCA;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=18166810;WS=18166792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	18171477	rs1011620	G	A	2029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=15;PP=1283;SC=ATGCAAGGAGGAGAAAAAATA;SOR=1.997;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=48;TCR=15;TR=63;WE=18171485;WS=18171467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr6	18187916	rs372534	C	T	1251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=2;PP=945;SC=AAAAGCATAGCGGGTTAAGGA;SOR=5.186;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=36;TCR=2;TR=38;WE=18187924;WS=18187906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr6	18201961	rs214612	T	C	1192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=35;PP=947;SC=GCAGTGGCATTGTTCATTTGC;SOR=2.687;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=9;TCR=35;TR=44;WE=18201969;WS=18201951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr6	18212794	rs41267732	A	T	3279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.860;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=59;PP=1900;ReadPosRankSum=1.152;SC=AGAGAAGAAGATGAAGGCTAT;SOR=0.766;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=277;TCF=153;TCR=124;TR=139;WE=18212802;WS=18212784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,159:0.51:312
chr6	18215166	rs66551414	C	CA	2376.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.05;MQRankSum=0.951;QD=12.13;ReadPosRankSum=-2.104;SOR=0.654;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,104:0.53:196
chr6	18215303	rs214585	T	C	5067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=96;PP=2683;SC=GGACCCTGGATGACAAACAGG;SOR=1.071;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=175;TCF=79;TCR=96;TR=175;WE=18215311;WS=18215293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr6	18222102	rs140834	C	CTT	3596.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.600;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.738;NF=16;NR=27;PP=1644;ReadPosRankSum=0.028;SC=CAACTCAACTCTATGCATGAT;SOR=0.511;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=109;TCF=49;TCR=60;TR=43;WE=18222110;WS=18222092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,94:0.50:187
chr6	18226340	rs214503	G	A	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=205;ReadPosRankSum=1.118;SC=AAAATATGGAGTATTTTATGT;SOR=1.314;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=12;WE=18226348;WS=18226330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr6	18256224	rs58144742	CT	C	111.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.42;ReadPosRankSum=0.282;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr6	18256625	rs17336208	A	G	1700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.650;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=29;PP=1122;ReadPosRankSum=-2.169;SC=TTTATATTGGACACTTCCTTT;SOR=0.587;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=130;TCF=84;TCR=46;TR=76;WE=18256633;WS=18256615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,81:0.57:141
chr6	18258516	rs172520	G	A	1761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.071;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=37;PP=1162;ReadPosRankSum=-0.582;SC=AAAATGAAAGGAAGCTAGAAT;SOR=0.780;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=187;TCF=101;TCR=86;TR=80;WE=18258524;WS=18258506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,88:0.42:212
chr6	18264355	rs214514	G	A	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=124;ReadPosRankSum=-0.938;SC=TCCCATAGCCGGGACCGCAGC;SOR=1.426;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=8;WE=18264363;WS=18264345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr6	18368880	rs11757266	G	A	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.256;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=223;ReadPosRankSum=0.726;SC=GCCATGCTGCGGGAGACCCCG;SOR=0.290;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=18;WE=18368888;WS=18368870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,20:0.43:46
chr6	18387815	rs764885	A	C	1591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.626;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=21;PP=786;ReadPosRankSum=0.825;SC=AGCGCGAGGGAGGCTACTGAG;SOR=0.802;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=130;TCF=83;TCR=47;TR=65;WE=18387823;WS=18387805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,76:0.52:145
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chr6	18399837	rs61748576	G	A	2822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.121;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=51;PP=1666;ReadPosRankSum=1.387;SC=ACCTGGCTCCGGCCCCCCTCA;SOR=0.847;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=222;TCF=126;TCR=96;TR=119;WE=18399845;WS=18399827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,134:0.53:252
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chr6	20128852	rs77837628	T	C	596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.116;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=181;ReadPosRankSum=-0.440;SC=AATTAATGTGTAGATATTTTT;SOR=0.480;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=36;TCF=25;TCR=11;TR=18;WE=20128860;WS=20128842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,28:0.56:50
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chr6	20212200	.	A	AACACAC	228.06	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5016;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=1;PP=59;ReadPosRankSum=-0.489;SC=AAGAAGGGAAAACACACACAC;SOR=0.595;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=2;WE=20212208;WS=20212190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
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chr6	20599628	rs9366357	C	T	1512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.908;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=26;PP=954;ReadPosRankSum=0.328;SC=ACGTTTGCTTCGTCTTCAAAG;SOR=0.943;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=132;TCF=75;TCR=57;TR=66;WE=20599636;WS=20599618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,72:0.49:148
chr6	20739907	rs4710942	C	T	1673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=45;PP=1036;ReadPosRankSum=1.708;SC=GTAATAGCTCCGCATTTTATT;SOR=0.692;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=129;TCF=49;TCR=80;TR=71;WE=20739915;WS=20739897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,78:0.54:145
chr6	20758704	rs2820000	A	G	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.146;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=102;ReadPosRankSum=0.496;SC=CTCCAAATACATTAAAGGAAA;SOR=0.627;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=8;WE=20758712;WS=20758694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr6	20758760	rs10946406	A	G	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=242;ReadPosRankSum=0.630;SC=ACTCAAGCATAAGGATAAACA;SOR=0.909;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=44;TCF=34;TCR=10;TR=14;WE=20758768;WS=20758750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,15:0.36:42
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chr6	21201493	rs9465994	G	A	1761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.829;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=41;PP=1086;ReadPosRankSum=0.397;SC=GAGAAGTCTCGGGTTTGACAA;SOR=1.107;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=142;TCF=65;TCR=77;TR=71;WE=21201501;WS=21201483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,79:0.51:156
chr6	21231007	rs9460612	G	A	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.891;SOR=0.141;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr6	21231034	rs12200511	C	G	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.505;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=6;PP=104;ReadPosRankSum=0.716;SC=ACAGGGCTTTCTCTGCATCTA;SOR=0.143;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=33;TCF=23;TCR=10;TR=13;WE=21231042;WS=21231024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr6	22136938	rs6900792	T	C	1978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.873;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=54;PP=1419;ReadPosRankSum=0.789;SC=AGAGTTGTTATAACAATTAGA;SOR=1.095;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=147;TCF=55;TCR=92;TR=81;WE=22136946;WS=22136928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,84:0.52:161
chr6	22292976	rs1205955	A	T	793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=22;PP=454;ReadPosRankSum=-0.792;SC=GTGTAATTTTAAAAAATTAGA;SOR=0.798;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=73;TCF=31;TCR=42;TR=37;WE=22292984;WS=22292966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,40:0.50:80
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chr6	22570245	rs6900627	G	A	416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=10;PP=315;SC=CGCTGAAGAGGAGCGCGGGGG;SOR=1.244;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=6;TCR=10;TR=16;WE=22570253;WS=22570235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
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chr6	24358202	rs9379657	G	A	698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=25;PP=519;ReadPosRankSum=-0.028;SC=GTTTTTCACCGTGGCGTGCAC;SOR=0.850;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=42;TCF=7;TCR=35;TR=29;WE=24358210;WS=24358192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,30:0.67:45
chr6	24418502	rs3736798	A	C	657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.90;SOR=2.737;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr6	24418580	rs67416453	TA	T	275.37	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=564;ReadPosRankSum=1.671;SC=ACATTATTATTATTTTTTTTG;SOR=0.693;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=13;WE=24418588;WS=24418570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,14:0.88:16
chr6	24429249	rs6942189	C	T	3110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=28;PP=1832;SC=TGGGGAAATGCAGTGAAATCT;SOR=1.718;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=71;TCR=28;TR=99;WE=24429257;WS=24429239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr6	24429340	.	CT	C	4602.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.436;ClippingRankSum=0.000;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.342;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.049;NF=15;NR=64;PP=2764;ReadPosRankSum=-0.401;SC=GCAATGACGACTTGGTTCTGT;SOR=0.612;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=176;TCF=39;TCR=137;TR=79;WE=24429348;WS=24429330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,149:0.48:311
chr6	24436760	rs2273605	G	A	2412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=23;PP=1505;SC=TCAGCAATTAGTGATCCTTTC;SOR=1.666;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=53;TCR=23;TR=76;WE=24436768;WS=24436750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr6	24437445	rs1772256	G	A	5429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=87;PP=2965;SC=CGCGTCAGATGTGAGTGCGTA;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=184;TCF=96;TCR=88;TR=183;WE=24437453;WS=24437435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr6	24437524	rs2295649	C	T	4106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=82;PP=2470;SC=TCATCTGAAACGAACCACAGT;SOR=1.045;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=144;TCF=62;TCR=82;TR=144;WE=24437532;WS=24437514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr6	24445718	rs793714	A	G	293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=0;PP=211;SC=CCAATACGACATGTACAAGCA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=24445726;WS=24445708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	24445748	rs60474145	GCA	G	997.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=4;PP=790;SC=CTGAAAGGAAGCACAGTTTCA;SOR=2.400;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=17;WE=24445757;WS=24445738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr6	24445829	rs9358767	G	A	3692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=80;NR=46;PP=2164;SC=TCATCAGTACGTGGCCACTGG;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=80;TCR=46;TR=126;WE=24445837;WS=24445819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr6	24450168	rs5874981	G	GCCT	5010.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=53;PP=2770;SC=CTGAGCCACGGCCTCGGAAAG;SOR=1.695;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=67;TCF=3;TCR=64;TR=55;WE=24450176;WS=24450158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr6	24454196	rs9393558	G	T	3890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=47;PP=2276;SC=CAAAATGCAAGAGTAGCTACT;SOR=1.267;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=129;TCF=82;TCR=47;TR=129;WE=24454204;WS=24454186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr6	24578272	rs2760157	G	A	4222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=45;PP=2451;SC=TTTTATGTGCGTTAATTTAAA;SOR=1.379;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=93;TCR=45;TR=138;WE=24578280;WS=24578262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr6	24580185	rs3215493	C	CA	4931.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=-2.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.629;HP=10;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.340;NF=18;NR=66;PP=1939;ReadPosRankSum=1.221;SC=CTGGCTGTAACAAAAAAAAGG;SOR=0.380;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=91;TCF=19;TCR=72;TR=84;WE=24580193;WS=24580175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:6,175:0.97:181
chr6	24583804	rs6901322	T	A	6490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=113;NR=101;PP=2965;SC=CAGTTCCTAGTGGTCAGGGAG;SOR=0.763;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=214;TCF=113;TCR=101;TR=214;WE=24583812;WS=24583794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr6	24588884	rs4504469	C	T	1637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=35;NR=22;PP=895;SC=GAGGGGGCTGCGCTAGTGGGA;SOR=0.859;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=35;TCR=22;TR=57;WE=24588892;WS=24588874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr6	24596478	rs4576240	T	G	10189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=370;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=176;NR=164;PP=2965;SC=CCTAGAAAGGTCAAGTCCTTT;SOR=0.737;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=340;TCF=176;TCR=164;TR=340;WE=24596486;WS=24596468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,370:1.00:370
chr6	24806594	rs9358799	C	T	2182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.498;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=42;PP=1331;ReadPosRankSum=0.055;SC=AGGCAGTTAACCTGTAATTAA;SOR=0.645;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=198;TCF=120;TCR=78;TR=98;WE=24806602;WS=24806584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,106:0.48:220
chr6	24806739	rs5875006	C	CTT	1864.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.785;HP=5;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.556;NF=2;NR=31;PP=2343;ReadPosRankSum=1.223;SC=CCAATTCAAACAACGTTTTTA;SOR=0.809;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=72;TCF=2;TCR=70;TR=33;WE=24806760;WS=24806729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,50:0.46:109
chr6	24806752	rs4074420	A	C	1053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=3.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.905;HP=2;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.034;NF=7;NR=28;PP=2341;ReadPosRankSum=-0.612;SC=CGTTTTTATTAATTACTCAAA;SOR=0.894;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=77;TCF=19;TCR=58;TR=35;WE=24806760;WS=24806729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,44:0.49:89
chr6	24806777	rs9379689	T	A	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.022;NF=3;NR=15;PP=307;ReadPosRankSum=-0.745;SC=CATAGTGCCATTTGTTTAGGG;SOR=0.527;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=39;TCF=7;TCR=32;TR=18;WE=24806785;WS=24806767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,24:0.51:47
chr6	24809771	rs9379692	A	G	677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=0;PP=563;SC=GGGGTGAGATAGACACTGATC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=24809779;WS=24809761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr6	24809853	rs9393587	C	T	4171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=91;NR=37;PP=2679;SC=CATGAAACTTCTCCTTACTGG;SOR=1.852;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=128;TCF=91;TCR=37;TR=128;WE=24809861;WS=24809843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr6	24809874	rs55640933	A	C	2562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.54;ReadPosRankSum=0.111;SOR=0.728;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:107,115:0.52:222
chr6	24809881	rs9358801	T	A	8608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.17;SOR=1.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr6	24818785	rs9358802	A	G	1197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=23;PP=772;ReadPosRankSum=-0.025;SC=GGATTTTCAGAGCCAGGCAAG;SOR=0.747;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=57;TCR=42;TR=54;WE=24818793;WS=24818775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,57:0.54:106
chr6	24825511	rs9358804	A	G	1695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=15;PP=1190;SC=TCACAGCCTCACTAACTTCGT;SOR=2.231;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=48;TCR=15;TR=63;WE=24825519;WS=24825501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr6	24828318	rs35374726	C	T	476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=1;PP=327;SC=GCAGAGATAACGCCAAATTGA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=24828326;WS=24828308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	24828560	rs45437991	A	G	2061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.679;HP=1;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.97;MQRankSum=1.015;NF=21;NR=39;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.484;SC=AGCTTTAGATAGATGACCATT;SOR=0.830;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=117;TCF=42;TCR=75;TR=60;WE=24828577;WS=24828550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,66:0.50:132
chr6	24828566	rs72205632	CCATT	C,CCATTCATT	3755.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;NF=4,4;NR=40,40;PP=2985,2833;SC=AGATAGATGACCATTCATTCA;SOR=1.656;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=70;TCF=4;TCR=66;TR=44,44;WE=24828577;WS=24828550;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.58,0.42:102
chr6	24836161	rs6901565	C	A	243.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=199;SC=AGGTCAAGTCCACATGGTTTG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=24836169;WS=24836151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	24839746	rs72839911	G	A	1371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.841;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=23;PP=901;ReadPosRankSum=-0.292;SC=TGAAGAATAGGAAACAAGATT;SOR=1.085;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=135;TCF=79;TCR=56;TR=63;WE=24839754;WS=24839736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,68:0.44:153
chr6	24850715	rs7761191	A	G	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.066;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=86;ReadPosRankSum=0.506;SC=CTTGTGCAGAAAAGTCTGTGG;SOR=1.329;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=7;WE=24850723;WS=24850705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr6	24852701	.	TA	T	71.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.089;ClippingRankSum=0.000;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=2.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.11;MQRankSum=2.236;QD=0.76;ReadPosRankSum=1.380;SOR=0.436;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,16:0.17:94
chr6	24873314	rs9467340	C	T	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-2.670;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=107;ReadPosRankSum=-0.424;SC=GGGCAGGAGGCTTTGTATTTT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=6;WE=24873322;WS=24873304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr6	25082262	rs12197057	T	G	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=36;ReadPosRankSum=-0.126;SC=GAATGTGAACTGGAATATGAC;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=25082270;WS=25082252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr6	25084691	rs303007	C	T	3865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=41;PP=2340;SC=CTCCCAAACCCACAGGATATT;SOR=1.476;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=82;TCR=41;TR=123;WE=25084699;WS=25084681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr6	25084718	rs303006	A	G	5379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=110;NR=79;PP=2965;SC=TTGCAAAATCACAGGCCCATT;SOR=1.011;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=189;TCF=110;TCR=79;TR=189;WE=25084726;WS=25084708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr6	25086968	rs895673	G	A	710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.588;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=375;ReadPosRankSum=-0.838;SC=TATCCACAGCGTCCTCAGCAA;SOR=0.154;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=25;WE=25086976;WS=25086958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,29:0.60:48
chr6	25092031	rs9654585	T	A	1568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=40;NR=12;PP=1075;SC=TCTAAAATTATAAGTTTATTT;SOR=2.345;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=40;TCR=12;TR=52;WE=25092039;WS=25092021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr6	25097450	rs392852	T	C	3469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=76;PP=2353;SC=AAAGCATTCCTATGTAAGAAA;SOR=1.590;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=40;TCR=76;TR=116;WE=25097458;WS=25097440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr6	25106745	rs2295737	A	G	4440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=92;PP=2744;SC=GATTTAGATTAGAGTCTCCTC;SOR=1.537;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=53;TCR=92;TR=145;WE=25106753;WS=25106735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr6	25106783	rs1923195	G	A	2083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=52;PP=1367;SC=AAAAACACATGTTCTAGCAGA;SOR=2.334;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=17;TCR=52;TR=69;WE=25106791;WS=25106773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr6	25108989	rs3215685	AC	A	3197.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=42;PP=1996;SC=AATCTTGAACACCCATAGTTT;SOR=2.537;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=1;TCR=44;TR=42;WE=25108999;WS=25108979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr6	25108991	rs79916468	C	T	3206.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=42;PP=1287;SC=TCTTGAACACCCATAGTTTGA;SOR=2.537;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=58;TCF=14;TCR=44;TR=54;WE=25108999;WS=25108979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr6	25115296	rs2273671	G	T	1596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.024;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=39;PP=967;ReadPosRankSum=1.488;SC=AGTTCTAAAAGCAAAAGTCCG;SOR=0.906;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=138;TCF=65;TCR=73;TR=69;WE=25115304;WS=25115286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,75:0.48:155
chr6	25279208	rs6908902	A	T	100.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.55;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5081;FS=4.771;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=33;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GGACAAGGAAATGGAAAGCCC;SOR=1.872;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=3;WE=25279216;WS=25279198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr6	25279839	rs377675604	CT	C	43.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.47;ReadPosRankSum=-0.135;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
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chr6	25420344	rs913455	C	G	3493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=32;PP=1962;SC=TCTTACAGGTCCTTACATCAT;SOR=1.392;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=71;TCR=32;TR=103;WE=25420352;WS=25420334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
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chr6	25554180	rs214049	C	G	3494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=32;PP=2040;SC=AAGGGTGGATCATTTTCCCCT;SOR=1.498;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=75;TCR=32;TR=106;WE=25554188;WS=25554170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
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chr6	25605091	rs1012899	G	A	4165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=70;PP=2476;SC=AGCTTTGAGCGGCGTAGAACG;SOR=0.830;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=138;TCF=68;TCR=70;TR=138;WE=25605099;WS=25605081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr6	25606181	rs2294345	G	A	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=85;ReadPosRankSum=-0.817;SC=TAAAACATCCGTGATGAGAAA;SOR=0.425;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=7;WE=25606189;WS=25606171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr6	25610203	rs11962024	A	T	1885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.018;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=26;PP=1076;ReadPosRankSum=-0.074;SC=ATTTTTATATATAGATTTACC;SOR=0.882;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=149;TCF=98;TCR=51;TR=79;WE=25610211;WS=25610193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,88:0.54:162
chr6	25619581	rs3747526	C	A	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.993;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=240;ReadPosRankSum=-0.315;SC=TCCCCTCCCCCAAACCTTCAA;SOR=2.093;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=12;WE=25619589;WS=25619571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr6	25652568	rs3215471	AG	A	1099.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.963;NF=13;NR=12;PP=844;ReadPosRankSum=1.143;SC=AATACGGTGAAGGAGTCCTTC;SOR=0.796;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=56;TCF=28;TCR=28;TR=25;WE=25652576;WS=25652558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,38:0.45:85
chr6	25653566	rs34327841	T	TA	592.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.579;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=393;ReadPosRankSum=0.083;SC=TGTCATGTGTTTTTTATATGT;SOR=0.105;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=13;WE=25653574;WS=25653556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,18:0.69:26
chr6	25653825	rs62393710	T	C	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.330;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=311;ReadPosRankSum=0.461;SC=CCTAGCAACATAGAGGGATTT;SOR=1.609;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=36;TCF=10;TCR=26;TR=16;WE=25653833;WS=25653815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr6	25653842	rs1406927	T	G	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=166;ReadPosRankSum=0.118;SC=ATTTAGGCAGTTTTTATAAAA;SOR=0.392;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=13;WE=25653850;WS=25653832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr6	25661887	rs2072847	A	T	2014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=48;PP=1086;ReadPosRankSum=0.756;SC=CTTTACTGACAGTATTTTTCA;SOR=0.648;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=156;TCF=58;TCR=98;TR=77;WE=25661895;WS=25661877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,92:0.50:184
chr6	25669636	rs2064127	A	T	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=282;ReadPosRankSum=0.112;SC=TGGAATTTCCATTCAGTTAAG;SOR=0.473;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=14;WE=25669644;WS=25669626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr6	25669669	rs2328891	G	A	533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.141;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=379;ReadPosRankSum=0.018;SC=ATGCTGAACTGTAGTAGATAC;SOR=1.739;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=55;TCF=40;TCR=15;TR=24;WE=25669677;WS=25669659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,25:0.44:57
chr6	25670351	rs79348589	C	A	899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.502;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=32;PP=556;ReadPosRankSum=1.056;SC=TCCCCCACTCCCTCCCCAGAC;SOR=1.182;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=90;TCF=20;TCR=70;TR=39;WE=25670359;WS=25670341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,43:0.46:94
chr6	25682262	rs3765236	A	C	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.028;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=20;PP=433;ReadPosRankSum=0.907;SC=GATATCATACATTCAGAAATA;SOR=0.943;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=62;TCF=20;TCR=42;TR=29;WE=25682270;WS=25682252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,32:0.49:65
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chr6	25689487	rs2294346	G	C	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.868;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.414;NF=11;NR=18;PP=365;ReadPosRankSum=-1.992;SC=TGTCATTGCTGTTTCTCTACG;SOR=0.883;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=78;TCF=33;TCR=45;TR=29;WE=25689495;WS=25689477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,30:0.34:88
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chr6	25770239	rs2328893	A	G	883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.899;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=7;PP=545;ReadPosRankSum=-1.613;SC=AGTCCTCACAATGAAAACTGT;SOR=1.071;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=86;TCF=63;TCR=23;TR=37;WE=25770247;WS=25770229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,41:0.43:95
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chr6	25778260	rs142909296	C	CTGATGAATATTCA	1455.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.931;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.062;NF=1;NR=21;PP=2964;ReadPosRankSum=1.017;SC=GTCAAATGTTCTGATGAATAT;SOR=0.836;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=66;TCF=1;TCR=65;TR=22;WE=25778268;WS=25778250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,39:0.48:81
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chr6	25849779	rs1165189	A	C	1130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.724;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=34;PP=858;ReadPosRankSum=-0.542;SC=TCTATAACTCAATTATATTTC;SOR=1.010;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=100;TCF=29;TCR=71;TR=46;WE=25849787;WS=25849769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,49:0.45:110
chr6	25850845	rs56027330	C	T	2600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=54;PP=1510;ReadPosRankSum=-0.432;SC=TTAGAAGACCCGACCTGAAAA;SOR=0.680;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=242;TCF=125;TCR=117;TR=111;WE=25850853;WS=25850835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,124:0.46:271
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chr6	25914801	rs2071299	G	A	2218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.487;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=47;PP=1240;ReadPosRankSum=1.932;SC=CAATAAACTGGCCCAACCTGA;SOR=0.658;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=197;TCF=95;TCR=102;TR=91;WE=25914809;WS=25914791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,105:0.47:223
chr6	25914901	rs2071298	G	A	966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.622;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=28;PP=623;ReadPosRankSum=-2.961;SC=TTGCATATCTGTGGGAAGATG;SOR=0.981;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=99;TCF=40;TCR=59;TR=45;WE=25914909;WS=25914891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,47:0.45:104
chr6	25916888	rs76376636	G	A	1244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.976;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=15;PP=653;ReadPosRankSum=-0.391;SC=TATCATTTTCGTAGAAGTATA;SOR=0.443;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=84;TCF=59;TCR=25;TR=47;WE=25916896;WS=25916878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,56:0.60:93
chr6	25916979	rs1865760	C	T	2797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.928;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=54;PP=1628;ReadPosRankSum=3.596;SC=TGATGGTGCACAACCAGAAAT;SOR=0.764;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=243;TCF=137;TCR=106;TR=125;WE=25916987;WS=25916969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,137:0.51:271
chr6	25918688	rs3752421	G	A	753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.008;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=9;PP=591;ReadPosRankSum=-0.361;SC=AAATGGAGGCGTTAGGATTTA;SOR=0.560;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=54;TCR=18;TR=36;WE=25918696;WS=25918678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,34:0.47:72
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chr6	25925823	rs7770139	A	G	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.515;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=362;ReadPosRankSum=-0.457;SC=TTAATTTCTCACAGATGATTT;SOR=0.368;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=60;TCF=53;TCR=7;TR=25;WE=25925831;WS=25925813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,25:0.41:61
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chr6	26094367	rs1572982	G	A	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=86;ReadPosRankSum=-0.344;SC=AGGCAAGATGGTGCCTAGGTT;SOR=0.963;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=8;WE=26094375;WS=26094357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr6	26104096	rs198853	T	C	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=1.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.77;ReadPosRankSum=0.245;SOR=1.124;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr6	26104448	rs198852	A	G	961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.613;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=23;PP=609;ReadPosRankSum=0.352;SC=TATATGCCCTAAAACGTCAGG;SOR=0.940;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=94;TCF=42;TCR=52;TR=39;WE=26104456;WS=26104438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,44:0.42:104
chr6	26107790	rs198845	G	T	1893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=42;PP=1292;ReadPosRankSum=0.199;SC=CTCTTCTGCTGTTGCTTACCC;SOR=0.691;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=184;TCF=92;TCR=92;TR=82;WE=26107798;WS=26107780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,89:0.43:205
chr6	26108282	rs198844	C	G	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.224;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=21;PP=482;ReadPosRankSum=1.035;SC=ATAGCGGCTACACCAGCACTG;SOR=1.502;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=79;TCF=27;TCR=52;TR=28;WE=26108290;WS=26108272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,32:0.34:93
chr6	26123629	rs198821	T	C	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.284;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=255;ReadPosRankSum=-0.615;SC=CCAGTTCCTATATTCTAATAC;SOR=0.105;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=15;WE=26123637;WS=26123619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr6	26124243	rs198820	G	A	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.696;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=71;ReadPosRankSum=0.442;SC=AAGACAAACTGCACAGTTGTC;SOR=0.136;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=8;WE=26124251;WS=26124233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr6	26124430	rs198819	C	T	1814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.290;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=25;PP=1101;ReadPosRankSum=-0.929;SC=GAGCTTAGGCCGCTGGTTTTG;SOR=0.813;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=151;TCF=98;TCR=53;TR=76;WE=26124438;WS=26124420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,83:0.52:160
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chr6	26157403	rs112830226	A	C	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.649;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=69;ReadPosRankSum=-0.452;SC=AAACGCTGCTAAGCAGGGGCG;SOR=0.151;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=8;WE=26157411;WS=26157393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr6	26184041	rs16891375	A	G	3461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.826;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=63;PP=2085;ReadPosRankSum=-1.121;SC=AGCCAGCGAAATCCGCTCCCG;SOR=0.762;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=301;TCF=161;TCR=140;TR=139;WE=26184049;WS=26184031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,160:0.48:335
chr6	26189312	rs79868973	C	G	6184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.96;SOR=1.199;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr6	26189312	.	CC	GC,GG	1224	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=64,31;NR=88,48;PP=1038,1224;QD=7.05770534571;SC=CATCTTGAAACCACAGCTGTT;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=153;TCF=64;TCR=89;TR=152,79;WE=26189321;WS=26189302;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.99:153
chr6	26189313	rs78735537	C	G	1944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FS=2.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.31;ReadPosRankSum=0.240;SOR=0.923;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,89:0.52:172
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chr6	26199222	rs113561314	G	A	794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.148;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=20;PP=587;ReadPosRankSum=-0.087;SC=GCCAGCTGCAGGTGTCGGGGG;SOR=0.933;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=72;TCF=36;TCR=36;TR=35;WE=26199230;WS=26199212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,35:0.48:73
chr6	26199454	rs41266803	C	T	1283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.008;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=42;PP=910;ReadPosRankSum=-0.301;SC=TTCCGCCTTGCTTGCCGCGTC;SOR=0.948;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=147;TCF=53;TCR=94;TR=62;WE=26199462;WS=26199444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,63:0.40:157
chr6	26199524	rs438534	A	G	902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=20;PP=564;SC=GTAAAAGTGAATTTTGTTAGC;SOR=2.376;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=27;WE=26199532;WS=26199514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr6	26199678	rs41266805	T	C	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=2.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=200;ReadPosRankSum=-0.215;SC=CCAATCAATGTGTAAGCTTTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=12;WE=26199686;WS=26199668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr6	26199822	rs41266807	A	G	7332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=129;NR=106;PP=2965;SC=CTGCTCCAAAAAAGGGCTCCA;SOR=0.771;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=235;TCF=129;TCR=106;TR=235;WE=26199830;WS=26199812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr6	26200083	rs1059486	A	G	5728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=108;NR=75;PP=2965;SC=AGACGGCCGTACGCCTGCTGC;SOR=0.993;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=184;TCF=108;TCR=76;TR=183;WE=26200091;WS=26200073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr6	26200256	rs16891397	C	T	2844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=66;PP=1899;SC=GCATATTTTCCGTGTTTACCA;SOR=2.016;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=25;TCR=66;TR=91;WE=26200264;WS=26200246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr6	26205052	rs61910695	G	A	3483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=393;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.187;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=84;PP=2325;ReadPosRankSum=0.048;SC=GGGTTCTGAAGGTGTTTCTGG;SOR=0.622;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=364;TCF=188;TCR=176;TR=169;WE=26205060;WS=26205042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:216,176:0.45:392
chr6	26205209	rs41266809	T	A	753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=22;PP=388;ReadPosRankSum=1.341;SC=CGACTCAGCATCTCGACTTCC;SOR=0.791;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=80;TCF=24;TCR=56;TR=32;WE=26205217;WS=26205199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,36:0.40:89
chr6	26216584	rs16891427	C	T	1562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=33;PP=971;ReadPosRankSum=2.167;SC=GCACGGCGGTCTGGATCTCCC;SOR=0.643;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=144;TCF=75;TCR=69;TR=70;WE=26216592;WS=26216574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,76:0.50:152
chr6	26216656	rs41266811	T	C	2001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.154;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=43;PP=1391;ReadPosRankSum=0.263;SC=CTGCGATGCGTTCGAAGATGT;SOR=0.589;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=167;TCF=85;TCR=82;TR=88;WE=26216664;WS=26216646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,92:0.51:181
chr6	26217728	rs1997768	A	G	957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=25;PP=662;SC=CACTGTCCTAATTTTTAACGA;SOR=3.193;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=30;WE=26217736;WS=26217718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr6	26225881	rs56119218	C	A	638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-3.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=445;ReadPosRankSum=0.397;SC=CTTTGAGACGCATTAGACCAC;SOR=0.983;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=47;TCF=3;TCR=44;TR=22;WE=26225889;WS=26225871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,25:0.45:55
chr6	26234476	rs16891458	A	C	749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.705;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=13;PP=378;ReadPosRankSum=1.784;SC=AAATTTTCAAAGGGGAACGTC;SOR=1.020;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=88;TCF=53;TCR=35;TR=36;WE=26234484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,41:0.42:97
chr6	26234883	rs2050950	A	G	4417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=80;NR=69;PP=2595;SC=TCTGCACCAGAGTACCTTTGC;SOR=0.705;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=149;TCF=80;TCR=69;TR=149;WE=26234891;WS=26234873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr6	26234952	rs2050948	A	G	3470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=59;PP=2062;SC=CATCGTAGCCAGCAGCCGCAA;SOR=0.876;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=114;TCF=54;TCR=60;TR=112;WE=26234960;WS=26234942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr6	26235300	rs16891464	A	G	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.69;ReadPosRankSum=0.674;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,2:0.50:4
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chr6	26240649	rs3734534	C	T	3494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=69;PP=2086;ReadPosRankSum=0.200;SC=TGTTTGTCTTCGATCATGTCT;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=326;TCF=186;TCR=140;TR=163;WE=26240657;WS=26240639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,175:0.50:350
chr6	26240752	rs16891477	C	T	2975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.923;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=75;PP=1935;ReadPosRankSum=-0.997;SC=TCACGAAGCCCGCCATCCGTC;SOR=0.913;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=256;TCF=118;TCR=138;TR=130;WE=26240760;WS=26240742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,140:0.50:282
chr6	26247198	rs41266821	A	G	819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.007;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=20;PP=509;ReadPosRankSum=0.399;SC=CTTGCCCCGAACAGACATGAT;SOR=0.527;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=59;TCF=16;TCR=43;TR=29;WE=26247206;WS=26247188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,35:0.51:68
chr6	26250254	rs11759720	C	G	744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=1;PP=505;SC=ATGGCCAAGACACAAAAGCCT;SOR=3.442;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=26250262;WS=26250244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr6	26271713	rs9393690	A	T	1256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=29;PP=860;SC=TTTTCAAAAGACCCGCGCAAC;SOR=1.414;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=15;TCR=29;TR=44;WE=26271721;WS=26271703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
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chr6	26285560	rs2393592	A	G	8526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=147;NR=143;PP=2965;SC=TCAGAACACCACGAGTCTCCT;SOR=0.790;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=291;TCF=147;TCR=144;TR=290;WE=26285568;WS=26285550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,321:1.00:321
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chr6	26411963	rs12214976	T	A	2566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.139;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=61;PP=1601;ReadPosRankSum=0.726;SC=ATCTGAAAAGTGGGCCCATCT;SOR=0.797;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=181;TCF=76;TCR=105;TR=104;WE=26411971;WS=26411953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,114:0.58:197
chr6	26411987	rs28571747	T	C	1704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=45;PP=919;ReadPosRankSum=-0.211;SC=AGACCCTTTCTGCTGAGAGCC;SOR=0.752;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=42;TCR=76;TR=70;WE=26411995;WS=26411977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,79:0.61:129
chr6	26413088	rs6900725	T	C	3078.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.383;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.924;NF=58;NR=73;PP=1961;ReadPosRankSum=-0.435;SC=GCAGAGTGAATATGGGGAGGG;SOR=0.895;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=242;TCF=113;TCR=129;TR=131;WE=26413096;WS=26413078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,144:0.54:265
chr6	26413164	rs34577398	CAG	C	1199.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.17;MQRankSum=0.936;NF=0;NR=24;PP=990;ReadPosRankSum=0.282;SC=TTGGGTTAGGCAGAGATGCTG;SOR=0.745;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=0;TCR=46;TR=24;WE=26413173;WS=26413154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,32:0.55:58
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chr6	26413744	rs4712990	C	A	2137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.599;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=45;PP=1243;ReadPosRankSum=-1.616;SC=ACTTCCTAAGCCCCCTAAGAA;SOR=0.623;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=206;TCF=109;TCR=97;TR=94;WE=26413752;WS=26413734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,105:0.46:229
chr6	26413975	rs56190518	C	T	1221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.464;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=28;PP=720;ReadPosRankSum=-0.844;SC=TCCCTAGAGACACCAGTAACC;SOR=0.846;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=107;TCF=49;TCR=58;TR=52;WE=26413983;WS=26413965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,58:0.49:118
chr6	26414060	rs56325223	G	T	476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.986;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=9;PP=251;ReadPosRankSum=0.515;SC=CCAGCTCAGAGCTGAGGGCCT;SOR=0.859;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=55;TCF=29;TCR=26;TR=21;WE=26414068;WS=26414050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,24:0.40:60
chr6	26422206	rs55786210	A	G	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.395;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.232;NF=11;NR=4;PP=206;ReadPosRankSum=1.149;SC=GATGCAGGGGACTCTCTGAAG;SOR=0.435;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=36;TCR=12;TR=15;WE=26422214;WS=26422196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,15:0.32:47
chr6	26422260	rs1796522	G	A	581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.734;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-2.330;NF=26;NR=15;PP=530;ReadPosRankSum=-1.422;SC=GAGAGGTTGGGCCCGACCAGC;SOR=0.473;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=118;TCF=72;TCR=46;TR=41;WE=26422268;WS=26422250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,34:0.32:105
chr6	26422307	rs56182232	G	T	944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.831;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.083;NF=30;NR=27;PP=607;ReadPosRankSum=0.292;SC=ATTCTCCTCTGTAACCCTAGG;SOR=0.859;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=182;TCF=95;TCR=87;TR=57;WE=26422315;WS=26422297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,54:0.31:176
chr6	26422336	rs55994013	T	C	1836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.264;HP=2;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=-5.020;NF=27;NR=29;PP=566;ReadPosRankSum=1.973;SC=CCCTGCCTGCTCTGGGTGCTC;SOR=0.805;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=180;TCF=84;TCR=96;TR=56;WE=26422344;WS=26422326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,54:0.30:181
chr6	26422354	rs55775018	C	T	1814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FS=0.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.09;MQRankSum=-6.274;QD=9.86;ReadPosRankSum=0.134;SOR=0.626;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:130,54:0.29:184
chr6	26422387	rs141260282	C	CCTTCCTCCTCCT	591.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.860;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-6.843;NF=4;NR=18;PP=1777;ReadPosRankSum=-3.198;SC=CGGCCAGCCTCCCTCCTCCTC;SOR=0.559;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=78;TCF=11;TCR=67;TR=22;WE=26422397;WS=26422377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,26:0.22:117
chr6	26422519	rs111293349	T	C	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-1.273;NF=1;NR=4;PP=212;ReadPosRankSum=1.410;SC=TGTGGAGTTGTTGACTTATCC;SOR=0.223;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=5;WE=26422535;WS=26422509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr6	26422527	rs141119405	TC	T	148.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.869;NF=0;NR=4;PP=198;ReadPosRankSum=0.281;SC=TGTTGACTTATCCTTTCATTC;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=4;WE=26422535;WS=26422509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr6	26423090	rs12191917	C	T	2188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.112;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=37;PP=1484;ReadPosRankSum=-1.652;SC=CCCTGGAATACCTGCTTCCTT;SOR=0.511;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=207;TCF=135;TCR=72;TR=97;WE=26423098;WS=26423080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,106:0.47:227
chr6	26423154	rs12198993	T	C	5296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=538;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=128;NR=112;PP=2703;ReadPosRankSum=0.116;SC=GCCCCTTTGTTGAACAGCCCA;SOR=0.633;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=495;TCF=267;TCR=228;TR=240;WE=26423162;WS=26423144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:274,263:0.49:537
chr6	26423317	rs7745238	G	A	2385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.218;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=45;PP=1561;ReadPosRankSum=-1.699;SC=GTGTATAAGGGTGGAAGAGAG;SOR=0.573;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=160;TCF=78;TCR=82;TR=91;WE=26423325;WS=26423307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,100:0.59:170
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chr6	26443853	rs56036950	C	A	1831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.467;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-9.770;NF=62;NR=52;PP=1425;ReadPosRankSum=-0.126;SC=TTCATGTCTCCCTCTTCTTGG;SOR=0.746;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=282;TCF=152;TCR=130;TR=114;WE=26443861;WS=26443843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,102:0.40:256
chr6	26444168	rs143665311	C	T	2318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=-0.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.587;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-8.514;NF=68;NR=56;PP=1826;ReadPosRankSum=-1.990;SC=GATGGAGCTTCCCCCTTGTGC;SOR=0.721;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=236;TCF=122;TCR=114;TR=124;WE=26444176;WS=26444158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,108:0.50:215
chr6	26445860	rs3846847	C	T	996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.740;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=16;PP=630;ReadPosRankSum=-1.217;SC=TGTGAGTCTGCCATTGATTCC;SOR=0.988;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=89;TCF=57;TCR=32;TR=45;WE=26445868;WS=26445850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,47:0.50:94
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chr6	26463321	rs3734540	A	C	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=129;ReadPosRankSum=-1.426;SC=TTTCTTCCTTACCCTCATCCT;SOR=0.283;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=8;WE=26463329;WS=26463317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr6	26466225	rs1977198	A	C	1403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.432;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=33;PP=1808;ReadPosRankSum=-0.481;SC=TTCCTTAACTACATGTACAAT;SOR=0.889;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=112;TCF=50;TCR=62;TR=57;WE=26466242;WS=26466215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,64:0.51:126
chr6	26466234	rs4712999	A	G	1197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.371;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=28;PP=1687;ReadPosRankSum=1.829;SC=TACATGTACAATTTGAGTTCT;SOR=0.499;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=104;TCF=45;TCR=59;TR=52;WE=26466242;WS=26466215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,58:0.49:119
chr6	26501471	rs3215660	AG	A	321.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.871;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.333;NF=7;NR=2;PP=275;ReadPosRankSum=-1.459;SC=GAAGCTCCTGAGGGGACTCAC;SOR=1.581;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=16;TCF=10;TCR=6;TR=9;WE=26501479;WS=26501461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr6	26501598	rs376454510	GTC	G	50.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.46;ReadPosRankSum=-0.160;SOR=0.815;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,11:0.10:111
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chr6	26505362	rs3736781	G	A	2176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.568;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=44;PP=1129;ReadPosRankSum=-0.114;SC=AGACACTTCTGCGAAAAATGT;SOR=0.658;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=213;TCF=111;TCR=102;TR=96;WE=26505370;WS=26505352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,110:0.46:237
chr6	26505403	rs3736782	C	A	2358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.557;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=47;PP=1292;ReadPosRankSum=0.691;SC=TCCTTCTTGGCCAGGAGAAGA;SOR=0.589;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=217;TCF=110;TCR=107;TR=101;WE=26505411;WS=26505393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,115:0.48:239
chr6	26509330	rs9393728	C	G	950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.464;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=24;PP=534;ReadPosRankSum=-0.341;SC=TGGGGGAGGACTCTGCCCCTA;SOR=0.854;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=108;TCF=53;TCR=55;TR=45;WE=26509338;WS=26509320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,50:0.41:121
chr6	26545308	rs1884946	C	G	663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.218;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=1;PP=479;ReadPosRankSum=-0.125;SC=CGTTTACATTCGTCAGTCTTT;SOR=1.371;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=42;TCF=39;TCR=3;TR=22;WE=26545316;WS=26545298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,24:0.52:46
chr6	26545632	rs4871	G	A	1683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.888;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=37;PP=983;ReadPosRankSum=-0.230;SC=GAAAGGATGGGAACAACCCTG;SOR=1.075;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=140;TCF=71;TCR=69;TR=68;WE=26545640;WS=26545622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,78:0.51:154
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chr6	26598188	rs3800303	A	G	6392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=113;NR=89;PP=2965;SC=CTGCCGGAGGAAAAAAGCGGT;SOR=0.888;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=202;TCF=113;TCR=89;TR=202;WE=26598196;WS=26598178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
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chr6	27356867	rs4713091	A	G	13398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=488;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=232;NR=211;PP=2965;SC=GGGTGCTCTTAGAGGTTCTGG;SOR=0.787;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=443;TCF=232;TCR=211;TR=443;WE=27356875;WS=27356857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,486:1.00:486
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chr6	28360817	.	C	G	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.081;ClippingRankSum=0.000;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=1.557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.57;ReadPosRankSum=0.406;SOR=0.633;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,37:0.29:129
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chr6	33608379	rs4713647	T	C	2272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=54;PP=1590;SC=GCTGCAGGGTTCTGGACCTGC;SOR=2.185;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=20;TCR=54;TR=74;WE=33608387;WS=33608369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
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chr6	33644768	rs2068236	T	C	4892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.48;SOR=0.806;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
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chr6	33646328	rs2274195	T	C	1962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.04;SOR=1.163;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr6	33647594	rs4713653	C	A	2273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=17;PP=1588;SC=TGGTAAGCAACGGAGAGGAGA;SOR=1.996;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=58;TCR=17;TR=75;WE=33647602;WS=33647584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr6	33647651	rs4713654	A	G	4768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=66;PP=2867;SC=GCCCCCTCCCACCCGCAGCTG;SOR=1.100;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=175;TCF=109;TCR=66;TR=175;WE=33647659;WS=33647641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
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chr6	33651322	rs6915136	T	C	135.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=5;PP=86;SC=CTCTACACTCTGGGGCTGCTA;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=33651330;WS=33651312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
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chr6	33653486	rs12528378	G	A	6771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=127;NR=104;PP=2965;SC=AGCCTGCGCCGGGGGCACGAG;SOR=0.811;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=231;TCF=127;TCR=104;TR=231;WE=33653494;WS=33653476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr6	33654378	rs4640882	A	G	1546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=35;PP=1063;SC=TGTCAAGTGTACATAGTGGTG;SOR=2.215;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=14;TCR=35;TR=49;WE=33654386;WS=33654368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr6	33660411	rs653536	T	C	395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=315;SC=GGCTGGGTCCTCAATATCACA;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=33660419;WS=33660404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	33662667	rs684119	C	T	4719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=62;PP=2637;SC=AGGCCGGGCCCACGCCTGCTT;SOR=1.030;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=157;TCF=95;TCR=62;TR=156;WE=33662675;WS=33662657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr6	33703089	rs623813	C	T	7546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=146;NR=115;PP=2965;SC=TCATGGCCAGCGGCAGGGATT;SOR=0.787;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=262;TCF=146;TCR=116;TR=261;WE=33703097;WS=33703079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,287:1.00:287
chr6	33703230	rs545787	G	A	2907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=56;PP=1567;SC=TGTCCCCGGCGTCTGCGCTGT;SOR=1.220;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=95;TCF=39;TCR=56;TR=95;WE=33703238;WS=33703220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr6	34003314	rs34906910	A	T	340.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=6;PP=137;ReadPosRankSum=2.413;SC=GAATGAGGCAAGAAAGAAGGC;SOR=0.818;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=23;TCF=13;TCR=10;TR=12;WE=34003322;WS=34003304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr6	34003336	rs2451381	T	A	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=180;ReadPosRankSum=3.353;SC=GAATGAGGCATGAAAGAAGGC;SOR=0.856;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=24;TCF=14;TCR=10;TR=11;WE=34003344;WS=34003326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr6	34003685	rs2228623	T	C	3673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=387;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.646;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=88;PP=2076;ReadPosRankSum=0.237;SC=GGGGGTCGAGTGTCCGCTGGT;SOR=0.783;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=357;TCF=180;TCR=177;TR=175;WE=34003693;WS=34003675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:202,184:0.48:386
chr6	34008006	rs2229900	A	G	1753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FS=1.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.74;ReadPosRankSum=-0.522;SOR=0.846;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,87:0.48:180
chr6	34026938	rs2451359	C	T	4676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=77;NR=81;PP=2719;SC=AGCCCAGCCGCGTCTGTCCAC;SOR=0.875;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=77;TCR=81;TR=158;WE=34026946;WS=34026928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr6	34069822	rs75813933	G	A	1339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.371;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=20;PP=697;ReadPosRankSum=1.248;SC=CCAAAGCATGGCCCTGAAGTC;SOR=0.845;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=112;TCF=67;TCR=45;TR=51;WE=34069830;WS=34069812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,63:0.47:134
chr6	34211341	rs35381162	GT	G	3521.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=38;PP=2158;SC=GCTCTTTTGAGTTGAGGGTGT;SOR=0.757;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=54;TCF=14;TCR=40;TR=51;WE=34211349;WS=34211331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr6	34212743	rs2780219	A	G	846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.00;QD=22.89;SOR=0.984;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr6	34213296	rs1150783	T	C	3768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=70;NR=51;PP=2034;SC=CCCCCTTCGGTTACAGGAAGG;SOR=0.794;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=70;TCR=51;TR=121;WE=34213304;WS=34213286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr6	34214322	rs1150781	C	G	8484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=145;NR=148;PP=2965;SC=ACCAGCCGCCCCCATCCCAGA;SOR=0.751;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=297;TCF=147;TCR=150;TR=293;WE=34214330;WS=34214312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,319:1.00:319
chr6	34214994	rs3997805	G	GTC	945.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=13;PP=742;SC=TGGCTGCCTCGTCTCCTCCCT;SOR=1.426;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=16;WE=34215002;WS=34214984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr6	34497158	rs34502423	T	TC	1500.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.690;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.467;NF=13;NR=16;PP=755;ReadPosRankSum=0.855;SC=TACTCCCTATTCCCCCCTCCC;SOR=0.622;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=70;TCF=33;TCR=37;TR=29;WE=34497166;WS=34497148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,60:0.49:123
chr6	34622676	rs2252551	A	G	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=332;ReadPosRankSum=0.890;SC=CTCCTGGTATACACGTCTTTA;SOR=0.859;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=16;WE=34622684;WS=34622666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr6	34664207	rs3800456	T	G	829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=13;PP=581;ReadPosRankSum=-0.501;SC=GCGCTGGCACTGCGGGGCCGG;SOR=0.729;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=75;TCF=52;TCR=23;TR=40;WE=34664215;WS=34664197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,39:0.51:77
chr6	34725478	rs7743724	G	A	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.845;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;ReadPosRankSum=-0.557;SC=GAGAGCGCTAGACACCCCATT;SOR=0.845;Source=Platypus;TCF=35;WE=34725486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,35:0.42:83
chr6	34725655	rs34594913	G	GTCA	8506.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=57;PP=2967;SC=CTCAGTGGTTGTCGTCTTTTT;SOR=0.745;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=84;TCF=18;TCR=66;TR=74;WE=34725666;WS=34725645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr6	34725658	rs28398813	G	T	8517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=55;PP=2067;SC=AGTGGTTGTCGTCTTTTTCTC;SOR=0.725;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=125;TCF=59;TCR=66;TR=110;WE=34725666;WS=34725645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr6	34735883	rs3736896	T	C	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=29;ReadPosRankSum=0.792;SC=TGTATGTAGATAGTAATATAA;SOR=0.078;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=4;WE=34735891;WS=34735873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr6	34738203	rs2038841	T	C	4406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=74;PP=2490;SC=TTCTAGTTTGTTCCATTTAGT;SOR=0.902;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=70;TCR=74;TR=144;WE=34738211;WS=34738193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr6	34741094	rs11968972	G	A	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=78;ReadPosRankSum=1.981;SC=CTTCTGTCACGTGTGTCTTTT;SOR=0.527;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=5;WE=34741102;WS=34741084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr6	34741174	rs11968954	C	T	1175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=17;PP=1814;ReadPosRankSum=0.654;SC=CTCCCTAAATCGTATTTTCTG;SOR=0.720;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=102;TCF=69;TCR=33;TR=54;WE=34741183;WS=34741164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,56:0.50:111
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chr6	34759903	rs10525938	T	TGGCGGC,TGGCGGCGGC	826.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=24;NF=12,12;NR=2,2;PP=292,274;SC=GAAAGCGCCATGGCGGCGGCG;SOR=3.611;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=14,14;WE=34759911;WS=34759893;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.42,0.58:19
chr6	34759954	rs6457791	A	G	1624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=44;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=16;PP=1152;SC=AGGTGAGGGGACCGCCTCTTC;SOR=1.919;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=54;TCF=38;TCR=16;TR=53;WE=34759962;WS=34759944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
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chr6	34760228	rs7769820	C	T	516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=12;PP=363;SC=GGACAGCTTCCCCCCGCGCCC;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=34760236;WS=34760218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
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chr6	34791027	rs7774697	A	G	4198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=53;PP=2625;SC=CTTGACTTCTATTTCAGTGTC;SOR=1.149;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=137;TCF=84;TCR=53;TR=137;WE=34791035;WS=34791017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr6	34802999	rs2296362	T	C	1811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.582;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=23;PP=1004;ReadPosRankSum=0.322;SC=CTGAAACTGATTGGGCAACAG;SOR=0.605;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=152;TCF=102;TCR=50;TR=70;WE=34803007;WS=34802989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,88:0.51:173
chr6	34803947	rs4259246	C	T	3171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=44;PP=1897;SC=CTCCACCAGCCCCCAGTGCCC;SOR=0.856;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=108;TCF=62;TCR=46;TR=106;WE=34803955;WS=34803937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr6	34804204	rs7761391	C	T	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.610;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=102;ReadPosRankSum=0.483;SC=GATGAAGGCTCTTTTCAGAAG;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=7;WE=34804212;WS=34804194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr6	34823187	rs3734266	T	C	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.245;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=171;ReadPosRankSum=-1.728;SC=TACTTTCTTTTGGGTCTTTTA;SOR=0.086;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=9;WE=34823195;WS=34823180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr6	34824107	rs16894945	A	C	1598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.005;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=41;PP=1070;ReadPosRankSum=-0.948;SC=TTCAGAGCAAAATGGAGAAGT;SOR=0.867;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=143;TCF=58;TCR=85;TR=66;WE=34824115;WS=34824097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,73:0.45:164
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chr6	34831856	rs13205210	T	C	1009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.11;MQRankSum=-0.961;QD=9.90;ReadPosRankSum=-0.909;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,50:0.49:102
chr6	34831866	rs3734264	G	A	4049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.09;QD=33.47;SOR=1.010;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr6	34838577	rs3734262	C	T	1928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.131;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=29;PP=1128;ReadPosRankSum=-0.962;SC=TATAAGGTGCCTAGAAGACTC;SOR=0.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=177;TCF=108;TCR=69;TR=79;WE=34838585;WS=34838567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,90:0.46:196
chr6	34850660	rs4646933	G	A	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=51;ReadPosRankSum=0.508;SC=TTAAATTTGTGTGGTCAAGTG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=4;WE=34850668;WS=34850650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
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chr6	34855748	rs1051115	G	C	885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.929;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=35;PP=603;ReadPosRankSum=-0.083;SC=GGATAGGATTGGAGGGGAGAG;SOR=1.691;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=79;TCF=15;TCR=64;TR=40;WE=34855756;WS=34855738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,43:0.50:86
chr6	34949607	rs2293242	C	T	5129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=427;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=114;NR=104;PP=2962;ReadPosRankSum=1.235;SC=CAGCACTGTACGGGCGACTGG;SOR=0.717;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=390;TCF=204;TCR=186;TR=218;WE=34949615;WS=34949597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:184,240:0.57:424
chr6	34962019	rs11755713	G	C	1565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=10;PP=1082;SC=ATTTGTTCCAGACTGCCTGTC;SOR=2.437;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=36;TCR=10;TR=46;WE=34962027;WS=34962009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr6	34962060	rs3823438	G	A	1028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.720;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=13;PP=644;ReadPosRankSum=0.094;SC=AAGATACACTGGATGTTTCTC;SOR=0.794;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=95;TCF=63;TCR=32;TR=42;WE=34962068;WS=34962050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,50:0.43:115
chr6	34977813	rs12661991	A	G	1394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.744;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=29;PP=802;ReadPosRankSum=0.798;SC=AAATTTTTAAAAATTAGCTGG;SOR=1.330;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=82;TCF=38;TCR=44;TR=48;WE=34977821;WS=34977803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,60:0.61:99
chr6	35027814	rs820086	G	C	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.462;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=11;PP=406;ReadPosRankSum=1.569;SC=TTGGCTGTTTGATGGTAATGA;SOR=0.352;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=49;TCF=33;TCR=16;TR=29;WE=35027822;WS=35027804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,30:0.56:54
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chr6	35046154	rs820100	T	C	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.191;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=23;ReadPosRankSum=0.084;SC=CAGCTCTGCCTAGCTCCCCTG;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=3;WE=35046162;WS=35046144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
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chr6	35056443	rs2005	A	G	3282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=89;PP=2191;ReadPosRankSum=-0.341;SC=ATAGGCTCCCACTGCCACCAC;SOR=0.675;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=288;TCF=117;TCR=171;TR=150;WE=35056451;WS=35056433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,156:0.51:306
chr6	35058117	rs707968	A	G	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.746;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=89;ReadPosRankSum=1.448;SC=GCCACTGCGCACATGCTGGTG;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=6;WE=35058125;WS=35058107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
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chr6	35086394	rs41270050	C	A	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=288;ReadPosRankSum=0.093;SC=CAACCTGCCCCCCTACCTAGA;SOR=0.631;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=19;WE=35086402;WS=35086384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,22:0.54:41
chr6	35088381	rs2234045	C	G	2336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.180;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=41;PP=1297;ReadPosRankSum=-1.563;SC=GGTGAGGTCTCCTGCTGCTTG;SOR=0.501;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=181;TCF=102;TCR=79;TR=93;WE=35088389;WS=35088371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,107:0.53:202
chr6	35088608	rs35106671	T	C	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=6;PP=390;ReadPosRankSum=-0.169;SC=TAAAAAGAGATAGAGTACTCT;SOR=0.950;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=35;TCF=18;TCR=17;TR=15;WE=35088616;WS=35088598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,17:0.46:37
chr6	35088855	rs13203612	C	G	2263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.063;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=48;PP=1240;ReadPosRankSum=-1.294;SC=ATTTATACTACTAAGCTAGAA;SOR=0.601;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=193;TCF=87;TCR=106;TR=93;WE=35088863;WS=35088845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,108:0.50:215
chr6	35088949	rs13206654	A	G	823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=2.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.98;ReadPosRankSum=-1.350;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,25:0.45:55
chr6	35088956	rs2494096	A	G	807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=5.343;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.56;ReadPosRankSum=-1.643;SOR=0.196;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,20:0.43:46
chr6	35090097	rs2234044	T	C	1182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.078;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=30;PP=805;ReadPosRankSum=1.301;SC=GGCGTGGTAATAGCAGTGATA;SOR=1.217;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=93;TCF=37;TCR=56;TR=47;WE=35090105;WS=35090087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,51:0.50:101
chr6	35107682	rs3777748	T	A	198.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-2.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=98;ReadPosRankSum=0.034;SC=CAAATTTTTTTAAAAAGGAAT;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=7;WE=35107690;WS=35107672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr6	35107774	rs34103100	A	T	4121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.53;ReadPosRankSum=-0.142;SOR=0.723;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:106,105:0.50:211
chr6	35107781	rs34715060	G	A	4321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FS=0.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.08;ReadPosRankSum=0.168;SOR=0.755;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:120,119:0.50:239
chr6	35108553	rs35693439	T	G	1803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=27;PP=1177;ReadPosRankSum=-0.097;SC=GCCGCTCTTGTCTTCCTGGGG;SOR=0.678;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=140;TCF=91;TCR=49;TR=75;WE=35108561;WS=35108543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,81:0.53:152
chr6	35108989	rs142993601	TC	T	242.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.307;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=2;PP=95;ReadPosRankSum=-1.363;SC=CACCTCCTCCTCCCCCGCCGC;SOR=0.197;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=4;WE=35108997;WS=35108979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr6	35109095	rs78614904	A	G	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.47;ReadPosRankSum=0.471;SOR=0.650;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,29:0.49:59
chr6	35109157	rs111624231	C	A	496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.192;HP=7;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=236;ReadPosRankSum=0.289;SC=GGGGCACGTGCCCCCCCCGCC;SOR=1.022;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=36;TCF=17;TCR=19;TR=20;WE=35109165;WS=35109147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,24:0.55:44
chr6	35182249	rs113302940	C	T	915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=2.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.64;ReadPosRankSum=1.936;SOR=1.002;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,46:0.43:106
chr6	35203203	rs13214290	T	G	3445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=51;PP=2064;SC=CCTAAACAGCTTTTTTACAAT;SOR=0.925;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=69;TCR=51;TR=120;WE=35203211;WS=35203193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr6	35205541	rs1929849	T	C	969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=2;PP=674;SC=GAGCCTCCCTTGGCTTAATGC;SOR=3.477;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=28;WE=35205549;WS=35205531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr6	35205881	rs734538	G	A	3777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=79;PP=2449;SC=ATTAGGGGATGACACCTCCTC;SOR=1.523;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=43;TCR=79;TR=122;WE=35205889;WS=35205871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr6	35216296	rs2071920	C	T	1768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=42;NR=13;PP=1086;SC=CCACCCCCGACGGTGAGGCTG;SOR=1.888;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=42;TCR=13;TR=55;WE=35216304;WS=35216286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr6	35258539	rs763157	C	A	1463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=40;PP=1157;SC=GGAGGGTTCTCGTTCTGTTTG;SOR=2.880;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=9;TCR=40;TR=49;WE=35258547;WS=35258529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr6	35259261	rs1894650	C	G	3267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=42;PP=1979;SC=GACCTGGAGCCCAGTGCCATC;SOR=1.197;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=69;TCR=43;TR=111;WE=35259269;WS=35259251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr6	35259646	rs9366883	G	C	3708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=86;PP=2141;SC=GCTGGTCTGGGGGTAGGGTAT;SOR=1.731;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=128;TCF=42;TCR=86;TR=128;WE=35259654;WS=35259636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr6	35260503	rs1557567	C	T	6155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=110;PP=2965;SC=GCAGTGCCCACGGCGAGCTGG;SOR=0.858;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=205;TCF=95;TCR=110;TR=205;WE=35260511;WS=35260493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr6	35260530	rs1557568	C	T	5936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=105;PP=2965;SC=CGGAGGAGAGCGAGCAGGCCC;SOR=0.788;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=207;TCF=101;TCR=106;TR=205;WE=35260538;WS=35260520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr6	35285720	rs2395617	A	C	7202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=140;NR=119;PP=2965;SC=AAGACAGCCAACCGCACGTAT;SOR=0.784;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=260;TCF=140;TCR=120;TR=259;WE=35285728;WS=35285710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,274:1.00:274
chr6	35378778	rs2016520	C	T	2540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=34;PP=1548;SC=ATGGGAACCACCCTGTAGAGG;SOR=1.061;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=49;TCR=34;TR=83;WE=35378786;WS=35378768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr6	35391787	rs2076167	C	T	4782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=106;NR=48;PP=2965;SC=TGACTGCAAACGAGGGGAGCC;SOR=1.840;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=154;TCF=106;TCR=48;TR=154;WE=35391795;WS=35391777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr6	35473252	rs2395628	C	T	1167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.453;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=7;PP=719;ReadPosRankSum=0.666;SC=TGCCCTGCTCCAAGTGAGGCC;SOR=1.473;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=65;TCF=52;TCR=13;TR=41;WE=35473260;WS=35473242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,46:0.57:81
chr6	35474073	rs12215920	C	G	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.14;ReadPosRankSum=2.736;SOR=0.719;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr6	35477025	rs2064318	C	G	3996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.67;SOR=1.483;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr6	35477025	.	CTTCTTTA	GTTCTTTA,GTTCTTTG	753	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=69,32;NR=28,13;PP=753,669;QD=8.12135270667;SC=TTTGATTGCTCTTCTTTATCA;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=69;TCR=28;TR=97,45;WE=35477040;WS=35477015;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:97
chr6	35477032	rs2064317	A	G	1312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.85;ReadPosRankSum=0.082;SOR=0.688;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,59:0.49:121
chr6	35477152	rs7752728	C	T	7997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=143;NR=142;PP=2965;SC=GTGCTTCCAACACCCATGTCT;SOR=0.733;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=285;TCF=143;TCR=142;TR=285;WE=35477160;WS=35477142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,306:1.00:306
chr6	35477303	rs9296155	T	C	985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=20;PP=750;SC=ACTCTAGACCTGGCAAACTCC;SOR=1.751;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=30;WE=35477311;WS=35477293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr6	35478612	rs2273001	G	A	3168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=72;NR=41;PP=2007;SC=TTCCCTGTGAGCTCTCTCAGC;SOR=1.309;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=72;TCR=41;TR=113;WE=35478620;WS=35478602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr6	35479574	rs7764472	G	C	936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=23;PP=652;SC=CGGCCTCCCCGTCCGCCCAGC;SOR=2.448;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=29;WE=35479582;WS=35479564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr6	35479876	rs2273003	C	G	56.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr6	35480262	rs1540910	T	C	443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=5;PP=375;SC=AAACCCCAAGTCCCCAAACAG;SOR=1.473;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=15;WE=35480270;WS=35480252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr6	35610681	rs2143404	T	C	626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=17;PP=481;SC=ATCTTGAATGTCCCTGGGAAC;SOR=5.994;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=18;WE=35610689;WS=35610671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr6	35704831	rs56354119	C	G	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=109;ReadPosRankSum=0.148;SC=CCGGAAGGCCCCCCACAGGTG;SOR=0.804;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=9;WE=35704839;WS=35704821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr6	35705142	rs12193672	A	G	1534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.250;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=44;PP=2578;ReadPosRankSum=0.383;SC=GATGCCTCCAAGTTCCTCTTT;SOR=0.812;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=156;TCF=64;TCR=92;TR=71;WE=35705157;WS=35705132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,73:0.44:166
chr6	35705149	rs151307474	C	A	1846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-4.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.604;HP=4;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=44;PP=2568;ReadPosRankSum=0.536;SC=CCAAGTTCCTCTTTCCTTTGT;SOR=0.605;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=147;TCF=63;TCR=84;TR=81;WE=35705157;WS=35705132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,88:0.56:158
chr6	35705892	rs2817041	T	C	1106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=26;PP=538;ReadPosRankSum=0.088;SC=AGGATGAGTATGCCAAGAGCA;SOR=0.669;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=126;TCF=65;TCR=61;TR=55;WE=35705900;WS=35705882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,60:0.43:139
chr6	35706063	.	T	G	125	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5156;HP=12;HapScore=2;MGOF=64;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=4;NR=2;PP=125;QD=26.6285354245;SC=CTGATAGCGGTGGGGGGGGGG;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=6;WE=35706071;WS=35706053;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:3,6:0.67:9
chr6	35715303	rs2252881	G	C	2706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=65;PP=1781;ReadPosRankSum=-0.823;SC=CTTCCTTGCTGAGGCCCAGAC;SOR=0.713;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=219;TCF=102;TCR=117;TR=119;WE=35715311;WS=35715293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,125:0.52:240
chr6	35744303	rs2766578	C	G	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.291;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.219;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=63;ReadPosRankSum=-1.211;SC=CCTCCTCCGCCGGGGTGGCCT;SOR=1.938;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=5;WE=35744311;WS=35744293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr6	35745655	rs2478467	C	T	2492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=30;PP=1122;SC=GGGCAGGGATCGCATCATATT;SOR=0.757;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=47;TCR=30;TR=77;WE=35745663;WS=35745645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr6	35747108	rs6910332	G	A	1371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.943;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=23;PP=841;ReadPosRankSum=-2.071;SC=GGTGACTCCCGATTCTCATAC;SOR=0.369;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=89;TCF=57;TCR=32;TR=58;WE=35747116;WS=35747098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,63:0.62:101
chr6	35748931	rs34109614	T	C	718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.90;ReadPosRankSum=-0.167;SOR=0.846;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,36:0.40:91
chr6	35755658	rs12211728	A	G	3868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=529;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.543;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.97;MQRankSum=0.000;NF=105;NR=78;PP=2443;ReadPosRankSum=2.385;SC=TCTTTGGCCAATATAGAGCGT;SOR=0.611;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=497;TCF=287;TCR=210;TR=183;WE=35755666;WS=35755648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:325,198:0.38:523
chr6	35761336	rs6457853	T	C	2497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.826;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=55;PP=1272;ReadPosRankSum=-1.765;SC=TGCTAAGGCATGTGGCAACCT;SOR=0.807;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=311;TCF=166;TCR=145;TR=122;WE=35761344;WS=35761326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:203,134:0.40:337
chr6	35763786	rs56279340	C	A	1722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.059;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=58;PP=1353;ReadPosRankSum=-1.309;SC=CTGTGCCCCCCACCCACGTGA;SOR=1.157;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=129;TCF=27;TCR=102;TR=71;WE=35763794;WS=35763776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,71:0.53:135
chr6	35764943	rs3748051	T	C	5041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=415;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.779;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=127;NR=106;PP=2713;ReadPosRankSum=1.523;SC=AGTCTTCATCTGGGGACTCAG;SOR=0.548;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=394;TCF=222;TCR=172;TR=233;WE=35764951;WS=35764933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,246:0.59:415
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chr6	35765151	rs3748049	T	C	785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.965;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=23;PP=569;ReadPosRankSum=0.386;SC=CCTCACGAGATCCACCTGCAT;SOR=1.387;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=26;WE=35765159;WS=35765141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,29:0.74:39
chr6	35765177	rs3748048	G	A	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=252;ReadPosRankSum=0.046;SC=AGGGCTGGCCGTGGGCAGAGG;SOR=0.569;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=14;WE=35765185;WS=35765167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr6	35803192	rs1049649	C	A	3147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=59;PP=1671;ReadPosRankSum=-0.141;SC=CCTCTTCCTGCGACCACTCAT;SOR=0.699;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=283;TCF=155;TCR=128;TR=130;WE=35803200;WS=35803182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,154:0.49:316
chr6	35803283	rs2859420	C	T	2696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.415;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=66;PP=1626;ReadPosRankSum=-1.251;SC=GAAGACAGTACAGAAAAAGCC;SOR=0.646;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=281;TCF=132;TCR=149;TR=126;WE=35803291;WS=35803273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,136:0.43:314
chr6	35836705	rs9296168	T	C	1370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.079;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=18;PP=801;ReadPosRankSum=-0.205;SC=TACAGAATTATGGATGTTTTG;SOR=0.354;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=113;TCF=82;TCR=31;TR=58;WE=35836713;WS=35836695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,63:0.52:120
chr6	35872860	rs9470167	A	G	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.117;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=6;PP=119;ReadPosRankSum=-0.883;SC=GGAGTTTGAGATTGCAGTGAC;SOR=0.169;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=22;TCF=8;TCR=14;TR=12;WE=35872868;WS=35872850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr6	35888067	rs662713	G	C	1991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.504;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=43;PP=1356;ReadPosRankSum=-1.410;SC=GCCTGGCGTTGAGCAACAGCA;SOR=0.654;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=197;TCF=97;TCR=100;TR=86;WE=35888075;WS=35888057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,92:0.44:211
chr6	35943339	.	GT	G	40.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.745;ClippingRankSum=0.000;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=2.679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.32;MQRankSum=-0.525;QD=0.41;ReadPosRankSum=-0.023;SOR=1.197;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,18:0.18:99
chr6	35960390	rs17707331	C	T	1408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.034;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=33;PP=855;ReadPosRankSum=1.271;SC=CAGGTAAGCACTCATTGCAGA;SOR=0.913;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=136;TCF=70;TCR=66;TR=64;WE=35960398;WS=35960380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,70:0.46:153
chr6	35967772	rs17713154	T	C	1437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=23;PP=747;ReadPosRankSum=0.410;SC=AACTCACCAATGGACATTTGA;SOR=0.682;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=114;TCF=71;TCR=43;TR=62;WE=35967780;WS=35967762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,70:0.55:128
chr6	35980121	rs743923	C	T	2593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.446;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=62;PP=1536;ReadPosRankSum=-0.679;SC=ATTGTAAGCACGCATCGTAGG;SOR=0.663;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=253;TCF=115;TCR=138;TR=115;WE=35980129;WS=35980111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,127:0.47:268
chr6	36041431	rs851010	A	G	772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.852;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=13;PP=464;ReadPosRankSum=1.814;SC=TGACAATAGAAGGTTGGAGGT;SOR=0.573;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=73;TCF=48;TCR=25;TR=33;WE=36041439;WS=36041421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,38:0.46:82
chr6	36041707	rs3730326	G	T	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=248;ReadPosRankSum=1.812;SC=GTAGGATGGAGATTGTCTTTT;SOR=0.465;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=15;WE=36041715;WS=36041697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr6	36064036	rs851007	G	A	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.992;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=148;ReadPosRankSum=0.238;SC=GCATGCACAAGTGTGTTTTAT;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=8;WE=36064044;WS=36064026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr6	36075219	rs9470219	A	C	1583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.212;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=27;PP=1072;ReadPosRankSum=-1.096;SC=CTTCCTGTCTATGGTACTGAT;SOR=0.512;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=132;TCF=86;TCR=46;TR=70;WE=36075227;WS=36075209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,73:0.53:139
chr6	36098333	rs12191295	T	C	4729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=101;NR=64;PP=2704;SC=GCCGCCACGCTGGGGCCGCCG;SOR=1.265;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=166;TCF=102;TCR=64;TR=165;WE=36098341;WS=36098323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr6	36098410	rs1059227	A	C	3072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.851;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.802;NF=63;NR=72;PP=1387;ReadPosRankSum=0.034;SC=TCAACAAGACAGCCTGGGAGC;SOR=0.825;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=289;TCF=136;TCR=153;TR=135;WE=36098418;WS=36098400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,154:0.48:319
chr6	36098515	.	C	G	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=0.000;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=4.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.66;MQRankSum=4.038;QD=2.40;ReadPosRankSum=-3.323;SOR=0.146;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,8:0.16:49
chr6	36098517	.	C	G	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.74;ReadPosRankSum=-2.895;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,5:0.12:43
chr6	36103921	rs2252430	G	A	2646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=54;PP=1611;SC=TTGGAGGGAGGGGACACTGCC;SOR=1.402;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=34;TCR=54;TR=88;WE=36103929;WS=36103911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr6	36185681	rs12525283	G	C	840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.471;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=3;PP=525;ReadPosRankSum=-0.141;SC=CTCACTGTGTGTGTCCTTGGC;SOR=1.199;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=59;TCF=48;TCR=11;TR=30;WE=36185689;WS=36185671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,34:0.52:65
chr6	36189887	rs2301422	C	G	1265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=16;PP=636;SC=GAAGGGGAGTCGGCGTTTTAG;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=20;TCR=16;TR=36;WE=36189895;WS=36189877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr6	36190156	rs2157317	C	G	286.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=0;NR=9;PP=237;SC=TGAGCTCCCCCAAACTCTTGG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=9;WE=36190164;WS=36190146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	36259369	.	C	G	173	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000;HP=10;HapScore=2;MGOF=16;MMLQ=15;MQ=58.78;NF=0;NR=15;PP=173;QD=13.8514141698;SC=ACGGAGGGGGCGGGGGAGGGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=15;TCR=27;TR=15;WE=36259377;WS=36259359;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:27,15:0.36:42
chr6	36260914	rs2239796	C	T	1562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.190;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=32;PP=836;ReadPosRankSum=-1.068;SC=GTGAGTGCTTCGGCATGGTGA;SOR=0.636;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=148;TCF=82;TCR=66;TR=68;WE=36260922;WS=36260904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,81:0.47:171
chr6	36261885	rs4713949	A	G	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.099;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=317;ReadPosRankSum=0.165;SC=CTGGTGCCATATCCCATGGGC;SOR=1.358;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=52;TCF=37;TCR=15;TR=18;WE=36261893;WS=36261875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,19:0.32:59
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chr6	36270130	rs12199580	C	A	2850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.461;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=59;PP=1763;ReadPosRankSum=2.083;SC=CCCACTTCACCCAGGCCATCC;SOR=0.639;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=228;TCF=116;TCR=112;TR=120;WE=36270138;WS=36270120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,131:0.52:251
chr6	36274153	rs12197079	C	T	2630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.476;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=69;PP=1655;ReadPosRankSum=-1.693;SC=CCTTATGTAACGTAAGTTTCC;SOR=0.813;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=254;TCF=108;TCR=146;TR=116;WE=36274161;WS=36274143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,127:0.46:274
chr6	36275458	rs4713956	T	C	8562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=135;NR=147;PP=2965;SC=CCCAAGACATTCGGGATCCAA;SOR=0.835;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=282;TCF=135;TCR=147;TR=282;WE=36275466;WS=36275448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,315:1.00:315
chr6	36287312	rs743852	G	C	6003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=98;NR=105;PP=2946;SC=TGGCTGCGCAGGGTGGCTACC;SOR=0.868;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=203;TCF=98;TCR=105;TR=203;WE=36287320;WS=36287302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr6	36288879	rs112374394	G	GGTCTCAGCT	723.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=1603;ReadPosRankSum=0.621;SC=ATGGAACCCAGGTGGGTAGAT;SOR=0.392;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=11;WE=36288887;WS=36288869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr6	36289145	rs763018	A	C	679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.265;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=24;PP=426;ReadPosRankSum=1.594;SC=TGATGGACCCAGACAATTCTT;SOR=0.431;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=68;TCF=18;TCR=50;TR=34;WE=36289153;WS=36289135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,35:0.49:71
chr6	36290030	rs12190546	C	G	1135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=11;PP=810;SC=CCTGTGAACTCCATGTGGAAG;SOR=1.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=25;TCR=11;TR=36;WE=36290038;WS=36290020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr6	36290330	.	G	A	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.196;ClippingRankSum=0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.378;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=326;ReadPosRankSum=2.077;SC=CAGGCTCCTCGGTGAGTTTCC;SOR=1.034;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=33;TCF=10;TCR=23;TR=17;WE=36290338;WS=36290320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr6	36294200	rs763020	T	C	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.660;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.264;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=56;ReadPosRankSum=0.091;SC=CAACGCAACCTTTAAAATGGT;SOR=0.061;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=6;WE=36294208;WS=36294190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr6	36294864	rs41270098	A	G	3784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=373;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.373;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=75;PP=2208;ReadPosRankSum=0.373;SC=TCTGAATGATAGCATCCTCTG;SOR=0.666;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=340;TCF=187;TCR=153;TR=164;WE=36294872;WS=36294854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:190,183:0.49:373
chr6	36294915	rs6923009	T	A	10096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=365;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=163;NR=166;PP=2965;SC=CTAAATGCACTGACAACTCCT;SOR=0.767;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=329;TCF=163;TCR=166;TR=329;WE=36294923;WS=36294905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,365:1.00:365
chr6	36296514	rs41270100	C	T	2607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=52;PP=1476;ReadPosRankSum=-0.373;SC=CGAAAGCAAACGGGTATGTAG;SOR=0.685;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=269;TCF=151;TCR=118;TR=121;WE=36296522;WS=36296504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,132:0.45:295
chr6	36296623	rs12192390	G	A	1461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=47;PP=1005;ReadPosRankSum=-1.040;SC=GCTGCAGCCCGCTCTAGGCTT;SOR=0.651;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=134;TCF=44;TCR=90;TR=70;WE=36296631;WS=36296613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,69:0.50:137
chr6	36322471	.	TA	T	158.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.575;ClippingRankSum=0.000;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=1.417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.17;MQRankSum=-0.549;QD=2.94;ReadPosRankSum=0.780;SOR=0.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,14:0.26:54
chr6	36341294	rs3213530	C	T	1062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=1.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.08;ReadPosRankSum=1.179;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,56:0.48:117
chr6	36353169	rs6901513	G	A	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.520;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=130;ReadPosRankSum=1.122;SC=CTTGAACCCAGGAGCTGGAAG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=7;WE=36353177;WS=36353159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr6	36355372	rs2234071	T	C	939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.928;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=23;PP=432;ReadPosRankSum=-0.558;SC=CTCCCCTGGCTGTGGCTGCTG;SOR=0.538;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=67;TCF=26;TCR=41;TR=39;WE=36355380;WS=36355362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,45:0.60:75
chr6	36359696	rs199820722	TTA	T	240.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.09;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	36368169	rs6917489	G	A	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.298;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=357;ReadPosRankSum=-0.876;SC=CTTGGCAGCCGTAGTTTTGTT;SOR=1.089;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=47;TCF=36;TCR=11;TR=22;WE=36368177;WS=36368159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,24:0.49:49
chr6	36393582	.	A	AC	625.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.365;ClippingRankSum=0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=32.93;ReadPosRankSum=1.120;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,16:0.84:19
chr6	36393583	.	ATATAT	A	625.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=32.93;ReadPosRankSum=1.175;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,16:0.84:19
chr6	36393590	rs113872867	T	A	631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=33.25;ReadPosRankSum=0.168;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,16:0.84:19
chr6	36393592	.	T	A	631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.760;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=4.337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=31.59;ReadPosRankSum=0.899;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,16:0.80:20
chr6	36393594	rs201851804	T	A	631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=4.337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=31.59;ReadPosRankSum=0.899;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,16:0.80:20
chr6	36393816	rs664370	A	G	1706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.832;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=47;PP=1112;ReadPosRankSum=0.397;SC=TGGATTGAGAACTTCTTTAGT;SOR=0.945;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=150;TCF=61;TCR=89;TR=75;WE=36393824;WS=36393791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,80:0.49:164
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chr6	36447287	rs2239807	A	G	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.114;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=260;ReadPosRankSum=0.339;SC=TGCTTTAACAAAACCAGGAAT;SOR=0.307;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=13;WE=36447295;WS=36447279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
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chr6	36493330	rs6927896	C	T	1952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.482;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=42;PP=1071;ReadPosRankSum=-0.611;SC=CAACCTGCCACGCTGGGTTTT;SOR=0.719;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=208;TCF=110;TCR=98;TR=90;WE=36493338;WS=36493320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,100:0.43:233
chr6	36508036	rs6913714	G	T	1971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.282;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=46;PP=1145;ReadPosRankSum=-1.257;SC=AATCCACCCAGTGTGCACTCT;SOR=0.439;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=174;TCF=68;TCR=106;TR=83;WE=36508044;WS=36508026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,94:0.49:193
chr6	36683298	.	G	A	1754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.552;ClippingRankSum=0.000;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.417;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=41;PP=1047;ReadPosRankSum=-0.349;SC=AGGCTCCGCAGAAGGAAGCCA;SOR=0.899;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=160;TCF=79;TCR=81;TR=78;WE=36683306;WS=36683288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,87:0.49:176
chr6	36689961	rs183541	A	C	3508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.777;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=75;PP=1887;ReadPosRankSum=-0.084;SC=ACAAGAGGGCAGAGGTGGGCA;SOR=0.597;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=308;TCF=169;TCR=139;TR=157;WE=36689969;WS=36689951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,174:0.51:340
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chr6	36711406	rs3213534	G	A	599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.707;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=425;ReadPosRankSum=2.534;SC=GGGGTGTGAGGTCCGCCTGGC;SOR=0.151;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=22;WE=36711414;WS=36711396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,23:0.66:35
chr6	36712962	rs743870	C	T	1862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=53;PP=1262;ReadPosRankSum=0.711;SC=GGTCTGTCTGCGGGACCTCTG;SOR=0.735;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=143;TCF=51;TCR=92;TR=82;WE=36712970;WS=36712952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,84:0.56:149
chr6	36713263	rs763046	A	G	2819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=59;NR=40;PP=1541;SC=CGTCGATGCCACAGCATGAGG;SOR=0.888;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=100;TCF=59;TCR=41;TR=99;WE=36713271;WS=36713253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr6	36714139	rs3213535	A	G	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.242;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=67;ReadPosRankSum=1.221;SC=CCCCAGCCTGATCAGTCCTCT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=5;WE=36714147;WS=36714129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
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chr6	36723884	rs236443	C	G	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.621;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.73;ReadPosRankSum=-0.795;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr6	36733132	rs763048	G	A	3112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=375;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=71;PP=1752;ReadPosRankSum=-0.425;SC=GATCCCAGTCGTACACCTCCA;SOR=0.685;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=342;TCF=184;TCR=158;TR=149;WE=36733140;WS=36733122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:212,163:0.43:375
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chr6	36767920	rs11419511	T	TG	424.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=7;PP=288;SC=GGGAGAGCACTGGCTCAGAGC;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=8;WE=36767928;WS=36767910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	36789940	rs3842097	C	CG	2590.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.619;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.060;NF=15;NR=37;PP=1383;ReadPosRankSum=0.175;SC=ACGCACACTGCGGGGGGAGGA;SOR=0.585;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=126;TCF=27;TCR=99;TR=52;WE=36789948;WS=36789930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,106:0.48:223
chr6	36790639	rs4711470	G	A	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.197;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=150;ReadPosRankSum=-0.231;SC=CTTCACAAGCGTGCAGGCTGG;SOR=0.269;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=12;WE=36790647;WS=36790629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr6	36824399	rs2071823	C	T	2845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.489;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=62;PP=1817;ReadPosRankSum=0.332;SC=CATCTTCAAACTGTTTGCCAT;SOR=0.652;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=203;TCF=97;TCR=106;TR=117;WE=36824407;WS=36824389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,129:0.57:227
chr6	36842427	rs2303993	C	G	1001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=4;PP=663;SC=GCCAGGAACGCAGACCCGTGG;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=29;WE=36842435;WS=36842417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr6	36853685	rs11461876	G	GC	701.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=6;NR=4;PP=280;SC=ACAAGGCCTCGCCCAGGAGTG;SOR=1.085;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=6;TCR=4;TR=10;WE=36853693;WS=36853675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
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chr6	36853857	rs5875560	T	TCGC	5498.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=39;PP=2832;SC=TGTGACAGCCTCGCCGCGCCC;SOR=1.266;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=79;TCF=30;TCR=49;TR=61;WE=36853865;WS=36853847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
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chr6	36922385	rs1405070	G	A	534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=1;PP=390;SC=GACCCAAAGCGCCCAGCCCTC;SOR=3.500;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=36922393;WS=36922375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr6	36922684	rs1405069	A	C	1150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=24;PP=724;SC=GGTATCCCCGACGGCCTCAGA;SOR=1.402;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=15;TCR=24;TR=39;WE=36922692;WS=36922674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
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chr6	36931491	rs34165286	G	A	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.596;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=16;PP=389;ReadPosRankSum=-2.284;SC=CACCCTCTGAGTAGGAGCTTC;SOR=1.536;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=41;TCF=16;TCR=25;TR=24;WE=36931499;WS=36931481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,28:0.61:46
chr6	36931549	rs4585544	A	G	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.041;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=256;ReadPosRankSum=1.539;SC=TGGGCGGGACATCAGGCACAG;SOR=1.302;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=33;TCF=21;TCR=12;TR=16;WE=36931557;WS=36931539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr6	36936771	rs7772210	A	G	696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.789;NF=12;NR=18;PP=393;ReadPosRankSum=-1.209;SC=AGGAAAAGTAAGGTGAGTGAA;SOR=0.632;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=81;TCF=31;TCR=50;TR=30;WE=36936779;WS=36936761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,35:0.40:88
chr6	36940343	rs2293383	G	C	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.992;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=174;ReadPosRankSum=1.886;SC=GCCTGATGCTGAGAATCCCAG;SOR=0.264;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=12;WE=36940351;WS=36940333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr6	36943513	rs2293385	G	C	4174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=391;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.182;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=89;PP=2671;ReadPosRankSum=0.832;SC=AGGCAAGACAGAGATACAGGG;SOR=0.767;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=345;TCF=168;TCR=177;TR=172;WE=36943521;WS=36943503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:196,195:0.50:391
chr6	36943573	rs2293386	A	G	2078.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=56;PP=1282;ReadPosRankSum=-1.403;SC=GGCTGAGCCCACCAGTTCTGC;SOR=0.710;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=219;TCF=89;TCR=130;TR=95;WE=36943581;WS=36943550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,105:0.44:241
chr6	36943605	rs2293387	A	G	1151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.684;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=35;PP=740;ReadPosRankSum=0.629;SC=CAGTCCTGGCAGGGATGGGGA;SOR=0.806;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=134;TCF=42;TCR=92;TR=49;WE=36943613;WS=36943595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,56:0.38:149
chr6	36944495	rs708007	A	G	448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=11;PP=308;SC=CCTGGCACCTACCCAGGGCTG;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=36944503;WS=36944485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr6	36945062	rs2293388	G	C	1227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.976;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=35;PP=625;ReadPosRankSum=1.733;SC=CAGGTGATGTGGTGGGCCACA;SOR=0.859;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=147;TCF=74;TCR=73;TR=65;WE=36945070;WS=36945049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,69:0.43:159
chr6	36945282	rs2293389	C	A	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=20;ReadPosRankSum=-0.398;SC=CAGTAGAATACCCCCAACCCC;SOR=0.446;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=9;TCF=5;TCR=4;TR=4;WE=36945290;WS=36945273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr6	36949527	rs2293390	C	T	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=235;ReadPosRankSum=-0.613;SC=ACACCTCTTGCCCCCTTTGCT;SOR=0.806;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=50;TCF=18;TCR=32;TR=20;WE=36949535;WS=36949517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,23:0.43:53
chr6	36954022	rs142461260	C	A	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.687;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.64;ReadPosRankSum=-2.655;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr6	36976637	rs831510	G	C	1251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FS=2.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.18;ReadPosRankSum=2.068;SOR=0.654;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,66:0.43:153
chr6	36976946	rs4714032	G	T	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=295;ReadPosRankSum=-1.670;SC=TTCCCCAGGTGGGGGTATGGT;SOR=1.708;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=14;WE=36976954;WS=36976936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr6	36978745	rs1724088	G	A	2697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.403;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=76;PP=1544;ReadPosRankSum=1.606;SC=CCAATCCTCCGCAGGAGCCAG;SOR=0.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=312;TCF=138;TCR=174;TR=134;WE=36978753;WS=36978735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:190,145:0.43:335
chr6	36978834	rs1753288	A	G	928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=22;PP=545;ReadPosRankSum=0.525;SC=CAGGCCAGTGACCAGGACACC;SOR=0.687;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=86;TCF=31;TCR=55;TR=36;WE=36978842;WS=36978824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,42:0.45:93
chr6	36978879	rs1724087	T	C	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.271;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=7;PP=188;ReadPosRankSum=-0.333;SC=TCTCCTCACCTCACCCCTTCT;SOR=0.127;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=13;WE=36978887;WS=36978869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
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chr6	36982947	rs831494	C	T	586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=18;PP=495;SC=CTGTCTTTTTCTGCTTTGGCA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=36982955;WS=36982937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
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chr6	36988664	.	A	ATGTGTG	197	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=27;MQ=63.02;NF=0;NR=3;PP=197;QD=67.0;SC=GTATGTATGCATGTGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=3;WE=36988672;WS=36988654;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,3:0.43:7
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chr6	36990736	rs831499	T	C	7041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=123;NR=100;PP=2965;SC=TTGCTGAAGGTACCCCTGAAG;SOR=0.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=223;TCF=123;TCR=100;TR=223;WE=36990744;WS=36990726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chr6	37012780	rs41272212	G	A	2343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.061;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-2.150;NF=54;NR=49;PP=1475;ReadPosRankSum=1.805;SC=CGCGCTCCCCGGGGTGGCAGT;SOR=0.458;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=189;TCF=105;TCR=84;TR=103;WE=37012788;WS=37012770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,110:0.55:200
chr6	37012828	rs202223736	G	C	2826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.419;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.757;NF=68;NR=57;PP=1935;ReadPosRankSum=-0.219;SC=GCACCACGGAGAGCACGAGAG;SOR=0.610;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=261;TCF=146;TCR=115;TR=125;WE=37012836;WS=37012818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,134:0.48:281
chr6	37138023	rs59116171	GGCA	G	970.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.45;SOR=1.051;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
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chr6	37139322	rs262938	T	C	976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=29;PP=715;ReadPosRankSum=0.422;SC=CCCGGCCCAGTCCGGAGGCCT;SOR=0.820;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=71;TCF=25;TCR=46;TR=43;WE=37139330;WS=37139312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,44:0.58:76
chr6	37180237	rs1224329	G	A	623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.99;SOR=2.925;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr6	37180355	rs1150789	G	A	2908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.406;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=46;PP=1743;ReadPosRankSum=-0.456;SC=AAGTGCAGGAGCATGTGTGAG;SOR=0.791;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=264;TCF=162;TCR=102;TR=123;WE=37180363;WS=37180345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,140:0.47:296
chr6	37180523	rs1150790	A	G	8251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=131;NR=129;PP=2965;SC=ATACAATAAAAGAGGAAGCAG;SOR=0.755;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=260;TCF=131;TCR=129;TR=260;WE=37180531;WS=37180513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,297:1.00:297
chr6	37237550	rs17572320	A	G	3168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.855;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=81;PP=2042;ReadPosRankSum=-1.031;SC=ATTTTGGACCAGGAGATGAGC;SOR=0.749;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=294;TCF=128;TCR=166;TR=142;WE=37237558;WS=37237540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,154:0.49:317
chr6	37250112	rs195753	A	G	6114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=93;NR=112;PP=2965;SC=AATTCCGTCAACTTCTCTCCA;SOR=1.038;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=205;TCF=93;TCR=112;TR=205;WE=37250120;WS=37250102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr6	37252210	rs3818136	C	T	1671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.866;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=41;PP=1012;ReadPosRankSum=1.608;SC=ACTCTCGAAACGAGGAACATC;SOR=0.845;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=162;TCF=74;TCR=88;TR=74;WE=37252218;WS=37252200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,81:0.46:175
chr6	37254947	rs111507842	A	T	734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=4.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.552;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=24;PP=578;ReadPosRankSum=0.928;SC=CCTTATGTTCATATATGCAGC;SOR=1.821;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=47;TCF=7;TCR=40;TR=26;WE=37254955;WS=37254937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,28:0.53:53
chr6	37280844	rs149708	A	G	983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=21;PP=729;SC=CTAGGTCCAGAGGCTCCCAGC;SOR=1.542;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=10;TCR=21;TR=31;WE=37280852;WS=37280834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr6	37291965	rs77416793	A	G	1019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.946;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=15;PP=641;ReadPosRankSum=-2.130;SC=TAGATACAGTATCTTATTTAA;SOR=0.422;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=78;TCF=53;TCR=25;TR=44;WE=37291973;WS=37291955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,47:0.54:87
chr6	37328399	rs34469147	CT	C	49.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=4.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.40;MQRankSum=1.622;QD=1.84;ReadPosRankSum=-0.186;SOR=1.954;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr6	37348920	rs2284923	C	T	1388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-2.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.104;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=23;PP=747;ReadPosRankSum=-1.867;SC=CACATTCCTACTGTAGGCTGT;SOR=0.506;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=138;TCF=89;TCR=49;TR=61;WE=37348928;WS=37348910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,71:0.47:152
chr6	37418263	rs2270687	A	G	601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=21;PP=454;ReadPosRankSum=-1.208;SC=CTGTGTCAAGAGGGAGTGTCA;SOR=0.809;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=53;TCF=11;TCR=42;TR=26;WE=37418271;WS=37418253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,26:0.48:54
chr6	37446061	rs3830396	TCA	T	2041.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.749;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.001;NF=14;NR=17;PP=1290;ReadPosRankSum=1.316;SC=GCTGTGTGCCTCAGTTTCATC;SOR=0.835;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=29;TCR=35;TR=31;WE=37446070;WS=37446051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,55:0.51:108
chr6	37447075	rs2797790	G	A	984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=29;PP=621;ReadPosRankSum=0.135;SC=GCAGCCTCAAGTACTCCTGCA;SOR=0.802;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=25;TCR=52;TR=43;WE=37447083;WS=37447065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,45:0.56:81
chr6	37447994	rs1874736	C	G	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-3.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=255;ReadPosRankSum=0.057;SC=GCCCACAGTGCTGGCTTCTTC;SOR=1.739;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=12;WE=37448002;WS=37447984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr6	37450914	rs10692	T	C	1221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.642;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=19;PP=805;ReadPosRankSum=0.911;SC=TTGATCCTGATCAAGGGGCCA;SOR=0.809;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=133;TCF=87;TCR=46;TR=56;WE=37450922;WS=37450904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,61:0.42:146
chr6	37475494	.	GGGGGTGGGGGTAGATGGTGATGGGGATGGGGGTAGGTGGTGGT	G	67.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=0.000;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=2.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.94;ReadPosRankSum=-2.093;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,5:0.22:23
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chr6	37522966	rs6942122	T	C	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=20;ReadPosRankSum=-0.480;SC=AAGCTCTTCATTGGGCCATAA;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=3;WE=37522974;WS=37522964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
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chr6	37615258	rs6901281	A	G	423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.49;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	37620129	rs2273109	G	A	3110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=40;NR=66;PP=1989;SC=GTGAGTGGATGGGGAGGGAAG;SOR=1.392;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=106;TCF=40;TCR=66;TR=106;WE=37620137;WS=37620119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr6	37623566	rs3846874	C	T	7516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=136;NR=121;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.578;SC=AGCGGGCAGGCGGGTTGGAGT;SOR=0.736;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=259;TCF=137;TCR=122;TR=257;WE=37623574;WS=37623556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,284:0.99:286
chr6	37631768	rs10947690	A	G	4810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=70;PP=2965;SC=CCCTGTTACAAGGCACTGCAG;SOR=1.043;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=169;TCF=99;TCR=70;TR=169;WE=37631776;WS=37631758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr6	38084569	rs2295791	C	A	450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=349;SC=CACCTTGGCCCAGCTTTGGAA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=38084577;WS=38084559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr6	38147355	rs6458044	A	G	6431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=121;PP=2965;SC=CCCACAGCGCAGCTCCTGCCC;SOR=0.990;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=214;TCF=93;TCR=121;TR=214;WE=38147363;WS=38147345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr6	38455368	rs10559751	CGAGA	C	240.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=26.75;ReadPosRankSum=-0.140;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr6	38472125	rs9380754	GG	CT	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=1;PP=665;SC=AACTGATGATGGGCTATTATT;SOR=4.174;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=13;WE=38472134;WS=38472115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	38472176	rs73426901	A	G	679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.161;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=6;PP=461;ReadPosRankSum=0.302;SC=CACTACCCAAACTACAAAATT;SOR=0.983;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=49;TCF=37;TCR=12;TR=27;WE=38472184;WS=38472166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,29:0.52:56
chr6	38560215	rs2180106	T	G	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.736;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.150;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=171;ReadPosRankSum=-0.001;SC=GGAAAGACATTCCATAGGCTA;SOR=2.636;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=8;WE=38560223;WS=38560205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr6	38560242	rs73733941	C	T	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=174;ReadPosRankSum=2.214;SC=TATAAACGTACATATTTCATG;SOR=0.743;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=37;TCF=31;TCR=6;TR=13;WE=38560250;WS=38560232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,16:0.40:40
chr6	38650628	rs4746	T	G	3105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.796;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=65;PP=1773;ReadPosRankSum=-2.738;SC=ACTCTGGGTCTCATCATCTTC;SOR=0.706;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=283;TCF=143;TCR=140;TR=135;WE=38650636;WS=38650618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,159:0.48:334
chr6	38654488	rs3778443	G	A	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.977;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=134;ReadPosRankSum=-0.073;SC=AGGCTGGCTGGGATAGAGAAG;SOR=1.022;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=8;WE=38654496;WS=38654478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr6	38670837	rs1049346	G	A	2416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.277;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=55;PP=1358;ReadPosRankSum=0.891;SC=CCATGGCTGCGCTGCAGTATC;SOR=0.558;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=249;TCF=137;TCR=112;TR=113;WE=38670845;WS=38670827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,125:0.45:278
chr6	38697839	rs56284095	A	G	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=199;ReadPosRankSum=0.600;SC=TCTCTTATACATAGATAATCC;SOR=0.676;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=36;TCF=10;TCR=26;TR=16;WE=38697847;WS=38697829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,20:0.45:44
chr6	38702111	rs70981586	C	CCA	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.5266;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=158;ReadPosRankSum=-0.967;SC=GACCCCCCCCCAAAAAAATTA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=38702119;WS=38702103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr6	38702169	rs74904743	C	G	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.776;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.331;HP=5;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=98;ReadPosRankSum=0.361;SC=AAACAGGAAACAATAGTGTAA;SOR=1.609;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=8;WE=38702177;WS=38702159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr6	38702212	rs1698996	G	A	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.62;ReadPosRankSum=-0.149;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,26:0.58:45
chr6	38704943	rs6935293	A	G	1966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.486;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=37;PP=984;ReadPosRankSum=-1.435;SC=GCAACAAACAACTGGGGTGCT;SOR=0.684;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=194;TCF=104;TCR=90;TR=82;WE=38704951;WS=38704933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,99:0.43:229
chr6	38718186	rs56323406	C	T	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=97;ReadPosRankSum=-0.721;SC=CTGAATTTCCCGAGTAAACTT;SOR=0.892;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=10;WE=38718194;WS=38718176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,14:0.35:40
chr6	38718402	rs56148146	G	A	820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.783;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=20;PP=397;ReadPosRankSum=0.931;SC=TAAACTGAGGGCAGTGGCTCG;SOR=0.595;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=85;TCF=33;TCR=52;TR=34;WE=38718410;WS=38718392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,42:0.43:98
chr6	38729458	rs2448401	T	C	800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=12;PP=469;ReadPosRankSum=-0.905;SC=ATAATTATTTTGTACCTATAT;SOR=0.612;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=57;TCF=39;TCR=18;TR=34;WE=38729466;WS=38729448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,35:0.60:58
chr6	38746090	rs1033526	A	G	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.16;ReadPosRankSum=0.547;SOR=0.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr6	38746098	rs1033525	C	T	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.84;ReadPosRankSum=0.240;SOR=0.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr6	38746263	rs1738260	A	T	1339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.405;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=30;PP=800;ReadPosRankSum=-0.983;SC=CTTTAAGCAGAGTAGTTTCTG;SOR=0.856;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=113;TCF=55;TCR=58;TR=57;WE=38746271;WS=38746253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,64:0.50:127
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chr6	38747770	rs1738254	G	A	860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.772;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=14;PP=532;ReadPosRankSum=1.426;SC=TCCCTGTCTGGGATTAGAAAT;SOR=0.460;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=83;TCF=56;TCR=27;TR=39;WE=38747778;WS=38747760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,42:0.46:92
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chr6	38838413	.	ATAGT	A	349.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=417;ReadPosRankSum=-1.129;SC=AGAAAAACTCATAGTTAGTCT;SOR=0.610;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=10;WE=38838424;WS=38838403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr6	38874185	.	T	C	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.268;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=195;ReadPosRankSum=2.674;SC=TCAGGGGAGGTAAGTCTCAAA;SOR=0.610;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=11;TCR=21;TR=14;WE=38874193;WS=38874175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
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chr6	38941611	rs4711567	C	G	1220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.621;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=30;PP=705;ReadPosRankSum=-1.326;SC=AACGTCTTTTCATCGAGAGTC;SOR=0.941;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=99;TCF=32;TCR=67;TR=43;WE=38941619;WS=38941601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,54:0.46:118
chr6	38950342	.	TG	T	42	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=42;QD=33.0;SC=CTGAGCCCCATGGAGCCCCCT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=2;WE=38950350;WS=38950332;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:4,2:0.33:6
chr6	38957771	rs3737095	T	C	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.274;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=8;PP=433;ReadPosRankSum=-1.888;SC=ATTTCTTTTGTTTTCTCTCAC;SOR=0.410;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=66;TCF=49;TCR=17;TR=28;WE=38957779;WS=38957761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,30:0.41:73
chr6	38957853	rs3737094	A	G	2680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.169;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=48;PP=1619;ReadPosRankSum=2.061;SC=AAATCCCCTTATGCAAAACCT;SOR=0.896;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=263;TCF=146;TCR=117;TR=116;WE=38957861;WS=38957843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,131:0.44:297
chr6	38976849	rs28360624	G	A	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=86;ReadPosRankSum=-0.223;SC=TGGTGACTATGTGGCAGATTA;SOR=0.693;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=6;WE=38976857;WS=38976839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr6	38979946	rs9296273	T	A	232.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=188;SC=AAGAGAAATGTCAGATGAGAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=38979954;WS=38979936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	38980081	rs10484847	A	G	1160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.421;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=21;PP=626;ReadPosRankSum=1.019;SC=AGTCATTTCAATACTCCGCAG;SOR=0.857;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=116;TCF=67;TCR=49;TR=52;WE=38980089;WS=38980071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,59:0.47:126
chr6	39016636	rs10305420	C	T	683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=1.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.66;ReadPosRankSum=-0.030;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,34:0.63:54
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chr6	39162206	rs2815098	A	G	1237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=16;PP=1021;ReadPosRankSum=-0.625;SC=CTAGAGGAGAAGCTAGCTGGG;SOR=0.404;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=39;TCF=23;TCR=16;TR=38;WE=39162214;WS=39162196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,39:0.98:40
chr6	39162227	rs1541816	G	A	658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.017;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=12;PP=470;ReadPosRankSum=0.836;SC=TACCCAGCCTGACCCGGGAGG;SOR=0.136;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=44;TCF=28;TCR=16;TR=27;WE=39162235;WS=39162217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,28:0.61:46
chr6	39278794	rs72855550	G	C	4623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.83;SOR=0.798;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr6	39278848	.	GCACACACA	G,GCA	1030.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;QD=33.25;SOR=3.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,9,22:0.29,0.71:31
chr6	39282036	rs10947804	T	C	3393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=75;PP=1888;SC=AGCACGGTGCTGGGCACCGCG;SOR=1.703;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=41;TCR=75;TR=116;WE=39282044;WS=39282026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr6	39282165	rs185410067	G	A	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.876;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.34;ReadPosRankSum=-1.892;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr6	39282748	rs11756070	G	A	3877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=54;PP=2139;SC=TGGAGGAAGCGTCTAGGCTGT;SOR=0.930;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=134;TCF=80;TCR=54;TR=134;WE=39282756;WS=39282738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr6	39282806	rs11756091	G	T	4051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=64;PP=2392;SC=CTTGGATATGGGGAAGTCCTG;SOR=0.776;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=68;TCR=64;TR=132;WE=39282814;WS=39282796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr6	39283083	rs11753141	G	A	10785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=407;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=186;NR=179;PP=2965;SC=GAGGCCAGACGTTCATGGAGC;SOR=0.748;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=365;TCF=186;TCR=179;TR=365;WE=39283091;WS=39283073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,407:1.00:407
chr6	39284050	rs1535500	G	T	2185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=46;NR=29;PP=1192;SC=GTCAGAGGCTGCCCCATCCTT;SOR=0.928;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=46;TCR=29;TR=75;WE=39284058;WS=39284040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr6	39284184	rs3734618	A	G	2942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=51;NR=49;PP=1598;SC=CCAGGCTCCGATACACTGAGA;SOR=0.802;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=100;TCF=51;TCR=49;TR=100;WE=39284192;WS=39284174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr6	39290200	rs3734619	C	T	4938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=94;PP=2965;SC=ACTGAGCCTCCGCCTGCCTCT;SOR=1.085;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=71;TCR=94;TR=165;WE=39290208;WS=39290190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr6	39353532	.	GA	G	3098.75	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=0.000;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.934;HP=16;HapScore=3;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=42;PP=1207;ReadPosRankSum=0.821;SC=GCAAGCTACAGAAAAAAAAAA;SOR=0.045;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=69;TCF=4;TCR=65;TR=42;WE=39353546;WS=39353522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,83:0.93:89
chr6	39353538	.	A	G	3104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.193;ClippingRankSum=0.000;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.409;HP=14;HapScore=3;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=37;PP=1172;ReadPosRankSum=1.483;SC=TACAGAAAAAAAAAAAAAAAG;SOR=0.036;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=105;TCF=46;TCR=59;TR=68;WE=39353546;WS=39353522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,84:0.92:91
chr6	39682367	rs303701	G	A	4605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=39;PP=2867;SC=TGCAGCCTAAGTATATAATTG;SOR=1.824;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=141;TCF=102;TCR=39;TR=141;WE=39682375;WS=39682357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr6	39828593	rs2504099	A	T	1296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=2;PP=1044;SC=GGAGGAAGATAGTAGTAGCCT;SOR=5.136;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=40;TCF=38;TCR=2;TR=40;WE=39828601;WS=39828583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr6	39828862	rs2504098	A	C	3582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=60;PP=2323;SC=CTGCCTTGGCATGCTCATGCA;SOR=0.998;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=113;TCF=53;TCR=60;TR=113;WE=39828870;WS=39828852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr6	39832111	rs2504787	A	G	2714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=29;PP=1467;SC=GGCAGAGCTGAGAAATGAATC;SOR=1.167;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=55;TCR=29;TR=84;WE=39832119;WS=39832101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr6	39832964	rs2504093	T	C	1141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=32;PP=754;SC=TGGCCAACTCTGCCTCACCTG;SOR=3.056;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=6;TCR=32;TR=38;WE=39832972;WS=39832954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr6	39839164	rs2504088	T	C	1506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=13;PP=991;SC=TTGCCTTCATTTTGCTTGAAT;SOR=1.567;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=37;TCR=13;TR=50;WE=39839172;WS=39839154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr6	39846137	rs2504086	A	G	2995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=48;PP=2013;SC=CATTACTCACATTCTCTCCTT;SOR=0.820;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=58;TCR=48;TR=106;WE=39846145;WS=39846127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr6	39851818	rs3003929	G	A	4221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=63;NR=68;PP=2158;SC=ATTTTGAAAAGATGTTTTCAG;SOR=0.972;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=131;TCF=63;TCR=68;TR=131;WE=39851826;WS=39851808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr6	39855112	rs3003945	T	G	476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=1;PP=328;SC=TTAGCTATTATCCACCCTCCT;SOR=3.126;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=39855120;WS=39855111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr6	39855288	rs35383047	C	A	1705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.122;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=35;PP=849;ReadPosRankSum=-2.708;SC=CTGAAGACATCTACCTGGCTT;SOR=0.592;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=167;TCF=83;TCR=84;TR=73;WE=39855296;WS=39855278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,88:0.46:192
chr6	39855427	rs3008810	C	T	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.564;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=297;ReadPosRankSum=2.934;SC=GGTGGAGGAACGGAGTGGTGG;SOR=1.085;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=17;WE=39855435;WS=39855417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr6	39855490	rs5875688	C	CTGGA	160.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.808;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=169;ReadPosRankSum=-0.241;SC=AGGCATTGATCTGGAACTGTC;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=4;WE=39855498;WS=39855480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr6	39859102	rs9394632	G	A	1891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=40;PP=1058;ReadPosRankSum=-0.137;SC=TGTGACTTGCGCCTGCTCTTT;SOR=0.671;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=163;TCF=88;TCR=75;TR=86;WE=39859110;WS=39859092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,94:0.52:181
chr6	39859387	rs7740344	G	T	948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.570;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=12;PP=368;ReadPosRankSum=-0.345;SC=GATACCTCAAGATATGGTTCA;SOR=0.527;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=91;TCF=61;TCR=30;TR=38;WE=39859395;WS=39859377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,49:0.45:109
chr6	39859667	rs7760703	T	C	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5210;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=73;ReadPosRankSum=-1.085;SC=TATAAAAATATGCACTTGCTT;SOR=0.368;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=7;WE=39859675;WS=39859657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr6	39864730	rs3008815	C	T	2109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FS=0.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.68;ReadPosRankSum=1.098;SOR=0.731;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,107:0.49:218
chr6	39865047	rs3004067	T	C	5246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=100;PP=2802;SC=TTCCAGAAGCTGCCAAAGTCA;SOR=1.090;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=178;TCF=78;TCR=100;TR=178;WE=39865055;WS=39865037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr6	39866805	rs3830992	A	AACAATGGGC	2693.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.771;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.185;NF=2;NR=27;PP=2972;ReadPosRankSum=1.183;SC=AGGGGCAAAAAACAATGGGTA;SOR=1.038;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=91;TCF=9;TCR=82;TR=29;WE=39866813;WS=39866785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,73:0.46:158
chr6	39869066	rs882559	G	C	1079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.730;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=18;PP=674;ReadPosRankSum=1.059;SC=ATCCTGTTCTGTCCCTTGACA;SOR=0.905;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=170;TCF=103;TCR=67;TR=54;WE=39869074;WS=39869056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,60:0.32:189
chr6	39873309	rs11968491	G	C	1566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.506;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=36;PP=933;ReadPosRankSum=2.089;SC=TGCAAAGTTGGCATCGTAGCT;SOR=0.866;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=110;TCF=44;TCR=66;TR=59;WE=39873317;WS=39873299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,67:0.56:120
chr6	39883802	rs34757428	A	T	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.323;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.256;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=80;ReadPosRankSum=0.061;SC=CCCCATCCACATCCGCTCACC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=6;WE=39883810;WS=39883796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr6	39895410	rs3008822	T	C	1158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=30;PP=713;SC=GTATTCAGCTTGGGGGTCGGG;SOR=1.880;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=13;TCR=30;TR=43;WE=39895418;WS=39895400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr6	40360465	rs3734557	A	G	7082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=121;NR=120;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.339;SC=TGCCGCCCAGAATCTGGCTGT;SOR=0.223;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=243;TCF=122;TCR=121;TR=241;WE=40360473;WS=40360455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,258:1.00:259
chr6	40360755	rs3734555	G	A	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=1.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.49;ReadPosRankSum=1.196;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr6	40360781	rs3734554	C	T	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.550;HP=4;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=3;PP=62;ReadPosRankSum=0.152;SC=AAGACAGACACGGGGACACAG;SOR=0.124;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=23;TCF=8;TCR=15;TR=8;WE=40360789;WS=40360771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
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chr6	41039100	rs56033865	G	A	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.746;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=431;ReadPosRankSum=-0.190;SC=TGTCCCCCACGACTACCTCTC;SOR=0.247;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=46;TCF=10;TCR=36;TR=24;WE=41039108;WS=41039090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,27:0.53:51
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chr6	41196065	rs2803495	A	G	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.049;HP=2;HapScore=2;MGOF=47;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=102;ReadPosRankSum=0.664;SC=GCTGAGAGACACTGGGAACCT;SOR=2.494;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=10;WE=41196073;WS=41196055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,10:0.26:38
chr6	41196095	rs6458205	C	T	1142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=766;ReadPosRankSum=1.139;SC=TCAGACCCAGCGTCTGACTCC;SOR=0.546;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=36;TCF=24;TCR=12;TR=17;WE=41196112;WS=41196085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,29:0.60:48
chr6	41196104	rs10700462	C	CCTT	1131.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.348;HP=1;HapScore=4;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=5;PP=772;ReadPosRankSum=1.716;SC=GCGTCTGACTCCTCCTGAGAG;SOR=0.430;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=29;TCF=15;TCR=14;TR=11;WE=41196112;WS=41196085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,29:0.55:53
chr6	41196156	rs2803496	C	T	2162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.25;QD=25.44;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr6	41196605	rs9369265	T	C	1511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.405;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.946;NF=38;NR=24;PP=971;ReadPosRankSum=-1.219;SC=CTCCAAGCCCTGGACAGCAGT;SOR=0.828;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=118;TCF=71;TCR=47;TR=62;WE=41196613;WS=41196595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,67:0.52:129
chr6	41196727	rs2101269	C	T	2479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.711;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=65;PP=1527;ReadPosRankSum=1.588;SC=GAATCTACAACGCTTCCGAAA;SOR=0.869;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=242;TCF=108;TCR=134;TR=115;WE=41196735;WS=41196717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,124:0.47:266
chr6	41197785	rs9296357	T	C	2228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.045;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=45;PP=1449;ReadPosRankSum=1.785;SC=ACTGTCTTCTTTGTGTCCTCT;SOR=0.772;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=191;TCF=105;TCR=86;TR=99;WE=41197793;WS=41197775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,104:0.49:214
chr6	41197857	rs7769759	C	T	1685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=45;PP=1082;ReadPosRankSum=-0.926;SC=GGCTCTGAGACCAGGTAGGTC;SOR=0.701;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=139;TCF=58;TCR=81;TR=76;WE=41197865;WS=41197847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,81:0.51:159
chr6	41198758	rs2803500	C	T	868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.727;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=13;PP=461;ReadPosRankSum=1.874;SC=CTAGGTTGCACGCTCCTTATG;SOR=0.773;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=88;TCF=57;TCR=31;TR=38;WE=41198766;WS=41198748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,45:0.42:106
chr6	41198909	rs4337930	T	C	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.576;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=213;ReadPosRankSum=1.396;SC=TATTACAACATGATAATAATA;SOR=3.293;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=13;WE=41198917;WS=41198899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr6	41199928	rs1825410	G	T	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.938;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=128;ReadPosRankSum=-0.547;SC=TAAAACCTCTGGATTCTCAAG;SOR=1.151;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=9;WE=41199936;WS=41199918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,10:0.33:30
chr6	41200293	rs12526284	T	C	608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=16;PP=437;SC=ACTGTGCATTTTATTTATTTA;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=41200301;WS=41200283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr6	41243740	rs2234246	C	T	1045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=9;PP=579;SC=TAGAAATAGCCGGTGATTACA;SOR=1.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=33;WE=41243748;WS=41243730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr6	41254470	.	T	C	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.062;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.901;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=246;ReadPosRankSum=0.375;SC=CCTAGAGGCTTCGGAAAGTTG;SOR=0.316;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=14;WE=41254478;WS=41254460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr6	41303592	rs9394782	T	C	3028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.855;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=73;PP=1652;ReadPosRankSum=0.693;SC=TCCCCTCCCATGAGCGCACAG;SOR=0.635;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=290;TCF=153;TCR=137;TR=148;WE=41303600;WS=41303582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,154:0.49:313
chr6	41309552	rs2236369	T	C	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=159;ReadPosRankSum=-1.241;SC=CACACAGACCTCCTGGACTCC;SOR=0.730;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=24;TCF=16;TCR=8;TR=14;WE=41309560;WS=41309542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr6	41309698	rs2236370	G	C	806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.767;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=15;PP=521;ReadPosRankSum=-0.129;SC=AGCCACACAGGCCTGGGCGGG;SOR=0.789;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=83;TCF=50;TCR=33;TR=39;WE=41309706;WS=41309688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,42:0.44:95
chr6	41318438	rs2273962	A	G	824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.437;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=8;PP=504;ReadPosRankSum=-0.208;SC=GTGGAAAACCATGATGGAGCT;SOR=1.835;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=93;TCF=62;TCR=31;TR=39;WE=41318446;WS=41318428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,42:0.42:100
chr6	41470137	rs71305793	T	TG	50.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.464;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.616;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=50;ReadPosRankSum=1.602;SC=AGCTGCGGACTGGGGGGTGGG;SOR=0.169;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=3;WE=41470145;WS=41470127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
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chr6	41533579	rs2104506	C	A	1685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.375;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=40;PP=998;ReadPosRankSum=-0.313;SC=CTGGGCAAGCCGATGGCAGCA;SOR=0.850;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=127;TCF=56;TCR=71;TR=69;WE=41533587;WS=41533569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,78:0.57:138
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chr6	41555363	rs11267985	TCACTCCCTCTC	T	214.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.046;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=3;PP=683;ReadPosRankSum=-0.897;SC=GACCGGAGGTTCACTCCCTCT;SOR=1.262;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=3;WE=41555381;WS=41555353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
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chr6	41617626	rs2073159	G	C	970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.771;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=28;PP=538;ReadPosRankSum=0.460;SC=CTCCAAAGCCGGGTTCCTCGA;SOR=0.587;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=98;TCF=33;TCR=65;TR=43;WE=41617634;WS=41617616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,49:0.47:105
chr6	41617658	rs2281326	G	A	612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.163;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=19;PP=427;ReadPosRankSum=0.476;SC=TGGGCCCACTGGAGCACCTTC;SOR=0.921;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=55;TCF=14;TCR=41;TR=25;WE=41617666;WS=41617648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,27:0.47:57
chr6	41620975	rs2842657	A	G	1481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=17;PP=993;SC=CCGCTGCCGCAGGCCCCCACA;SOR=1.493;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=56;TCF=39;TCR=17;TR=55;WE=41620983;WS=41620965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr6	41621271	rs2230088	G	A	1190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.688;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=23;PP=585;ReadPosRankSum=-1.565;SC=CGGACTGCCTGGAGATCTGCA;SOR=0.592;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=102;TCF=55;TCR=47;TR=52;WE=41621279;WS=41621261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,61:0.52:117
chr6	41652514	rs2073158	C	T	2171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.619;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=45;PP=1171;ReadPosRankSum=0.381;SC=CATGCCCCGGCGCCAGGGGTT;SOR=0.506;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=162;TCF=77;TCR=85;TR=92;WE=41652522;WS=41652504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,102:0.56:181
chr6	41652604	rs1062966	T	C	1880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=25;NR=40;PP=997;SC=GGAATGGGGATGGTGGCTGGG;SOR=1.319;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=25;TCR=40;TR=65;WE=41652612;WS=41652594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr6	41654110	rs1076727	G	A	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=254;ReadPosRankSum=-1.304;SC=GGTGGAGGTGGCTGATCTCAG;SOR=0.569;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=15;WE=41654118;WS=41654100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr6	41655005	rs2073157	G	A	636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=16;PP=404;SC=CTTCAGGGCAGCCTGCAGCTT;SOR=2.400;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=41655013;WS=41654995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr6	41655340	rs9462736	C	T	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.640;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=290;ReadPosRankSum=-0.639;SC=CACCACTGAGCGACAGCAATG;SOR=0.014;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=20;WE=41655348;WS=41655330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,21:0.58:36
chr6	41658566	rs2273068	C	T	3071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.474;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=56;PP=1909;ReadPosRankSum=-0.886;SC=CAAACTTGTTCCCATAGGTCT;SOR=0.812;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=247;TCF=138;TCR=109;TR=132;WE=41658574;WS=41658556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,144:0.54:267
chr6	41658889	rs1015149	C	T	658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.623;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=17;PP=403;ReadPosRankSum=0.709;SC=TGCGCTCCCGCTGCTCCTCCT;SOR=0.916;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=68;TCF=36;TCR=32;TR=32;WE=41658897;WS=41658879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,33:0.49:68
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chr6	41659327	rs59689567	G	A	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=214;ReadPosRankSum=2.142;SC=CCACAAGGTGGGCCCAGCCTA;SOR=1.042;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=14;WE=41659335;WS=41659317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
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chr6	41708938	rs4711690	C	G	1621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.636;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=40;PP=1046;ReadPosRankSum=0.691;SC=TCTCTGGTAGCTGGAGTGTGG;SOR=0.589;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=128;TCF=58;TCR=70;TR=72;WE=41708946;WS=41708928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,76:0.54:140
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chr6	41748263	rs28360509	C	T	674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=15;PP=390;SC=GCCCTTGCACCTGCATGGCAG;SOR=1.697;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=22;WE=41748271;WS=41748253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr6	41748279	rs10947986	A	G	507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=12;PP=304;SC=GGCAGAGGCCATGGAGCCCGC;SOR=1.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=16;WE=41748287;WS=41748269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr6	41753084	rs9394831	C	T	1866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=5;PP=1418;SC=GTGTAGGGAGCTGCTGAAGCC;SOR=4.209;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=59;TCF=54;TCR=5;TR=59;WE=41753092;WS=41753074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr6	41754576	rs9381093	C	T	10423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=383;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=171;NR=183;PP=2965;SC=GAACACTCCTCGCTGCTGCCG;SOR=0.808;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=357;TCF=172;TCR=185;TR=354;WE=41754584;WS=41754563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,383:1.00:383
chr6	41755410	rs9471653	C	G	3754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=41;PP=2238;SC=GGTTCCTCCACCGAGGCCCAT;SOR=1.239;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=77;TCR=41;TR=118;WE=41755418;WS=41755400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr6	41888827	rs2274578	C	G	5599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=90;NR=98;PP=2965;SC=CACAGAAACTCCTTCAGTTCC;SOR=0.878;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=188;TCF=90;TCR=98;TR=188;WE=41888835;WS=41888817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr6	41898096	rs2479726	A	G	484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=11;PP=338;SC=TGCCTGCATCACATACTAAAG;SOR=2.049;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=41898104;WS=41898086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	41903782	rs1051130	A	C	3398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=60;PP=1964;SC=CTGGTCTGAGAGGCTTCCCTG;SOR=0.879;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=115;TCF=55;TCR=60;TR=115;WE=41903790;WS=41903772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr6	41905174	rs2479717	T	A	1092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=27;PP=789;SC=GCTGGAGAAGTGAAGAGGAGG;SOR=3.321;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=32;WE=41905182;WS=41905164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr6	42016246	rs10456506	T	C	4900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=487;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=112;NR=105;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.323;SC=TACCTCCTCGTCAGGTGACCT;SOR=0.694;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=444;TCF=226;TCR=218;TR=217;WE=42016254;WS=42016236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:248,238:0.49:486
chr6	42016319	rs11552783	G	A	2446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.483;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=62;PP=1630;ReadPosRankSum=0.101;SC=CTGCCTTTGGGGAGTGGGGGT;SOR=0.657;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=216;TCF=91;TCR=125;TR=107;WE=42016327;WS=42016309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,114:0.49:233
chr6	42023618	rs142602868	A	ATAC	1240.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.117;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=681;ReadPosRankSum=-0.841;SC=CCATTTGTCCATACTACTACT;SOR=0.984;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=52;TCF=38;TCR=14;TR=15;WE=42023626;WS=42023608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,34:0.46:74
chr6	42025318	rs12208813	G	A	1067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.528;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=27;PP=650;ReadPosRankSum=-1.542;SC=TGACTGTCACGTGGCAGAGTC;SOR=0.871;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=98;TCF=44;TCR=54;TR=46;WE=42025326;WS=42025308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,52:0.46:113
chr6	42036395	rs2492926	A	C	1686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=36;PP=1121;SC=ACTGTCGCACACTGCCCTCAG;SOR=2.522;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=12;TCR=36;TR=48;WE=42036403;WS=42036385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr6	42044945	rs3800286	G	A	4739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=89;PP=2780;SC=CTTATCTGCGGCCGGTGAAGA;SOR=1.192;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=156;TCF=67;TCR=89;TR=156;WE=42044953;WS=42044935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr6	42072989	rs9394863	G	A	3627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=70;PP=2083;ReadPosRankSum=1.709;SC=AGTTGGGCGTGCCCTGGCTGT;SOR=0.670;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=287;TCF=158;TCR=129;TR=155;WE=42072997;WS=42072979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,173:0.55:314
chr6	42073958	rs9394865	C	T	2418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.637;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=47;PP=1535;ReadPosRankSum=-0.798;SC=TCCGGATCTGCCGCACACTGG;SOR=0.820;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=202;TCF=112;TCR=90;TR=108;WE=42073966;WS=42073948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,113:0.52:219
chr6	42074106	rs9394866	A	G	1491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.082;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=39;PP=1055;ReadPosRankSum=0.575;SC=CAGGCTCAGGAGAGTCTCCTT;SOR=1.056;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=126;TCF=59;TCR=67;TR=66;WE=42074114;WS=42074096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,69:0.50:137
chr6	42075069	rs55772414	A	G	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.11;ReadPosRankSum=-0.809;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr6	42075377	rs9394868	A	C	1065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.720;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=30;PP=706;ReadPosRankSum=-1.691;SC=TAGCCCTGCCAATTTCTGTTT;SOR=0.952;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=94;TCF=32;TCR=62;TR=44;WE=42075385;WS=42075367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,48:0.47:103
chr6	42075461	rs9381137	G	A	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.140;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=105;ReadPosRankSum=-1.155;SC=AAGAGAGGGAGCAGCCCTGTG;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=7;WE=42075469;WS=42075451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr6	42077870	rs9471765	A	G	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=80;ReadPosRankSum=0.268;SC=ACCAGCTGTGAAGATGAGCAG;SOR=0.399;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=7;WE=42077878;WS=42077860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr6	42094614	rs9471776	A	G	1095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=18;PP=773;SC=TATTTCAAACAATTTTATCTG;SOR=1.364;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=41;TCF=23;TCR=18;TR=37;WE=42094622;WS=42094604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr6	42094699	rs6940849	G	T	1846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=30;NR=29;PP=902;SC=GACTCATTTGGTTTTTTTCTT;SOR=1.117;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=59;TCF=30;TCR=29;TR=59;WE=42094707;WS=42094689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr6	42110263	rs6911399	T	C	375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=9;PP=241;SC=TCAGCACGGTTTCCCCAGGGG;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=42110271;WS=42110253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr6	42123317	rs1132156	A	C	7440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=117;NR=115;PP=2965;SC=CCAGCCTCACATGTGCGGCTG;SOR=0.786;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=232;TCF=117;TCR=115;TR=232;WE=42123325;WS=42123307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,268:1.00:268
chr6	42153609	rs9471799	C	T	5348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=109;PP=2965;SC=CCCACATCCCCCAGCACCACT;SOR=1.196;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=187;TCF=78;TCR=109;TR=187;WE=42153617;WS=42153599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr6	42162388	rs3749921	A	G	7261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=133;NR=108;PP=2965;SC=TGCCCTCTACATACTGGGAGG;SOR=0.830;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=241;TCF=133;TCR=108;TR=241;WE=42162396;WS=42162378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,278:1.00:278
chr6	42162575	rs1474867	A	G	665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=16;PP=421;SC=CCTGAGGAGCATCAGGGAGCA;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=42162583;WS=42162565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr6	42176120	rs2295278	G	T	2140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=43;NR=34;PP=1191;SC=TCTAAAAAAAGAAAGAAACAA;SOR=0.766;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=43;TCR=34;TR=77;WE=42176128;WS=42176110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr6	42176451	rs6936290	G	A	1327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=11;PP=912;SC=GCCCCCAACCGCTGTGGCAAC;SOR=2.208;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=34;TCR=11;TR=45;WE=42176459;WS=42176441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr6	42176743	rs57369579	TG	T	664.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=13;PP=552;SC=CACGGTTTTTTGTTTTTTTTT;SOR=1.739;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=14;WE=42176757;WS=42176733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr6	42176749	rs55788550	T	C	663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=2;NR=14;PP=302;SC=TTTTTGTTTTTTTTTTTGAGA;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=42176757;WS=42176733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	42181960	rs1884318	A	C	3467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=70;NR=57;PP=1876;SC=GAGAAACCTAAGTAAAATAGC;SOR=0.785;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=127;TCF=70;TCR=57;TR=127;WE=42181968;WS=42181950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr6	42182183	rs1884317	C	T	239.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=213;SC=TTATTTCAGACGAAGATACTG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=42182191;WS=42182173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	42233518	rs17704222	C	T	2096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.533;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=47;PP=1214;ReadPosRankSum=-0.657;SC=GCTGGGCTCTCCCATCAGGTA;SOR=0.758;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=171;TCF=82;TCR=89;TR=90;WE=42233526;WS=42233508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,100:0.52:192
chr6	42541802	rs16895843	G	C	796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=18;PP=532;SC=TGGAACTTTTGAGTTTTTGTT;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=42541810;WS=42541792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr6	42571346	rs16895863	A	T	3004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=66;NR=38;PP=1847;SC=TTCATTTATCAGAAGATGTGA;SOR=1.241;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=105;TCF=66;TCR=39;TR=104;WE=42571354;WS=42571336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr6	42600319	rs5014584	A	G	2134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=15;PP=1359;SC=AAGAAAACTTAATGAGCATTA;SOR=1.965;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=47;TCR=15;TR=62;WE=42600327;WS=42600309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr6	42607841	rs12204274	C	T	451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=350;SC=GATAGGTTCCCAAAGAGAAAA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=42607849;WS=42607831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	42611872	rs12198323	A	G	541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=21;NR=4;PP=476;SC=AAGCCAAACTATCTCTCACTA;SOR=3.611;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=25;WE=42611880;WS=42611862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr6	42612312	rs7767888	C	T	651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=17;PP=466;SC=ATAAATTACACTGACGTTTAT;SOR=2.737;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=42612320;WS=42612302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr6	42613379	rs3749900	A	G	2211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=45;PP=1284;ReadPosRankSum=1.595;SC=TTCCCTGCCTATCAGTCTAGT;SOR=0.675;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=72;TCF=26;TCR=46;TR=71;WE=42613387;WS=42613369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,81:0.99:82
chr6	42627258	rs67388762	TACACAC	T	143	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.75;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr6	42633368	rs16895923	A	G	1078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=23;PP=644;SC=ACTCATTCTAATTTTCCTTGT;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=13;TCR=23;TR=36;WE=42633376;WS=42633358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr6	42638354	rs3835247	TACATA	T	1930.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=3;PP=1411;SC=TATTAAAATATACATAACATA;SOR=4.712;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=37;TCF=31;TCR=6;TR=26;WE=42638366;WS=42638344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr6	42650766	rs34240626	G	GT	1250.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.26;NF=15;NR=8;PP=852;SC=AGTGTTTTGTGTTTTTCCCCC;SOR=1.501;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=26;TCF=18;TCR=8;TR=23;WE=42650774;WS=42650756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr6	42652667	rs434505	G	A	3807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=71;PP=2253;SC=TCTCTACAAAGAATTTGAAGG;SOR=1.108;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=127;TCF=55;TCR=72;TR=126;WE=42652675;WS=42652657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr6	42658752	rs373341	T	C	4348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=57;PP=2536;SC=CTGAGTGACATGTGTCTTCTC;SOR=1.214;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=153;TCF=96;TCR=57;TR=153;WE=42658760;WS=42658742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr6	42666061	rs434102	T	C	3131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=32;PP=1964;SC=CTGGCCTGCGTCTGCGCCCTC;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=67;TCR=32;TR=99;WE=42666069;WS=42666051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr6	42666145	rs425876	C	T	8616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=157;NR=130;PP=2965;SC=CGGCACGCTCCTCTCCAGCAG;SOR=0.841;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=287;TCF=157;TCR=130;TR=287;WE=42666153;WS=42666135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,316:1.00:316
chr6	42666164	rs390659	G	C	9265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=349;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=165;NR=150;PP=2965;SC=AGCCAGCCCTGGCTCTCGCTC;SOR=0.746;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=315;TCF=165;TCR=150;TR=315;WE=42666172;WS=42666154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,349:1.00:349
chr6	42666293	rs41273820	G	A	4660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=94;PP=2879;SC=GAATCGCTGGGAGCTGGACCA;SOR=1.289;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=156;TCF=62;TCR=94;TR=156;WE=42666301;WS=42666283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr6	42666365	rs389999	G	C	1052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=28;PP=818;SC=GAGCACTGTGGAGTGTGGGTT;SOR=4.047;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=31;WE=42666373;WS=42666355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr6	42672416	rs3818086	A	T	3691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=83;PP=2557;SC=CTTCCTCCCAACCCCTGCCTC;SOR=1.779;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=39;TCR=83;TR=122;WE=42672424;WS=42672406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr6	42689755	rs7764439	A	G	10458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=377;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=169;NR=158;PP=2965;SC=TGTTGAAGAGAACACAGATAG;SOR=0.698;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=327;TCF=169;TCR=158;TR=327;WE=42689763;WS=42689745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,377:1.00:377
chr6	42713618	rs2234026	A	G	9201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=151;NR=146;PP=2965;SC=TCGCTCCCGAACAAAGGTGGC;SOR=0.699;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=297;TCF=151;TCR=146;TR=297;WE=42713626;WS=42713608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,333:1.00:333
chr6	42824756	rs9462840	A	G	753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.188;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=10;PP=442;ReadPosRankSum=-0.805;SC=TTTTATTTGCATGCAAATAAA;SOR=0.392;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=80;TCF=59;TCR=21;TR=33;WE=42824764;WS=42824746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,38:0.41:92
chr6	42830484	rs10456518	G	A	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=90;ReadPosRankSum=-0.072;SC=AGCTGGGCACGGTGGCTCACA;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=6;WE=42830492;WS=42830474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr6	42833209	rs201398341	GCCCCGAGACCCCA	G	402.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.222;NF=0;NR=8;PP=2082;ReadPosRankSum=0.196;SC=CCCCTACCCCGCCCCGAGACC;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=8;WE=42833229;WS=42833199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr6	42847830	rs72864269	G	T	1138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=2.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.08;ReadPosRankSum=0.640;SOR=0.406;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,31:0.49:63
chr6	42847833	rs72864272	T	C	1135.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=2.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.62;ReadPosRankSum=-1.014;SOR=0.359;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,31:0.51:61
chr6	42853842	rs2179719	A	G	1945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.94;SOR=0.832;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
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chr6	42883911	rs2235831	G	C	1490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.672;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=30;PP=893;ReadPosRankSum=-0.721;SC=TCAGTCTGCCGAAGCCCATCC;SOR=0.750;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=116;TCF=60;TCR=56;TR=63;WE=42883919;WS=42883901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,69:0.56:124
chr6	42906543	rs137924295	CCT	C	1463.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.642;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.734;NF=6;NR=18;PP=982;ReadPosRankSum=-0.474;SC=CACCCAGCATCCTCTGTCCTG;SOR=0.954;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=53;TCF=12;TCR=41;TR=24;WE=42906552;WS=42906533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,41:0.41:101
chr6	42928461	rs10948059	C	T	828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=24;NR=5;PP=551;SC=AGTGCTTATGCTTTAAGTGCG;SOR=2.376;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=29;WE=42928469;WS=42928451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr6	42928758	rs2296805	T	G	1749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=32;PP=1111;SC=TCGGGGTCTGTCTCAGCCTGT;SOR=0.925;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=63;TCF=30;TCR=33;TR=62;WE=42928766;WS=42928748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr6	42929839	rs7760250	G	A	1151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=1;PP=919;SC=AGGAGGCAGAGGAACGGACTC;SOR=5.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=34;WE=42929847;WS=42929829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr6	42931204	rs4987175	TG	T	2675.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.030;HP=6;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=46;PP=2024;ReadPosRankSum=1.218;SC=CTTGGCTTAGTGGGGGTGAGG;SOR=0.608;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=142;TCF=43;TCR=99;TR=66;WE=42931212;WS=42931194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,103:0.46:224
chr6	42931224	rs4987173	G	A	2733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.186;HP=4;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=47;PP=1559;ReadPosRankSum=-0.165;SC=GCGGTAGTTGGGGGAGCTGAG;SOR=0.841;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=215;TCF=117;TCR=98;TR=110;WE=42931232;WS=42931214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,125:0.53:237
chr6	42931261	rs2296804	C	G	7574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=134;NR=115;PP=2965;SC=GTTGCTGGGGCCTCTGTTACA;SOR=0.768;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=249;TCF=134;TCR=115;TR=249;WE=42931269;WS=42931251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,274:1.00:274
chr6	42932200	rs1129187	G	T	695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.96;ReadPosRankSum=0.737;SOR=0.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,39:0.39:100
chr6	42932200	.	GGC	TGT	378	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=13;NR=21;PP=378;QD=12.6902316136;SC=TGAGCTACCTGGCTCCAGCCC;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=85;TCF=37;TCR=48;TR=34;WE=42932210;WS=42932190;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:51,34:0.40:85
chr6	42932202	rs1129186	C	T	3329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.98;SOR=1.237;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr6	42932715	rs2274517	C	T	5085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.051;NR=91;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.541;SC=CCTCCTCCCTCGAAAGCCAGT;SOR=0.814;Source=Platypus;TCR=93;WE=42932723;WS=42932705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,191:0.99:193
chr6	42932835	rs141238034	C	T	2255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.055;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=44;PP=1397;ReadPosRankSum=0.188;SC=GCACTTAGAACGCGTAGCTGG;SOR=0.592;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=197;TCF=115;TCR=82;TR=101;WE=42932843;WS=42932825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,107:0.50:216
chr6	42934500	rs2274514	C	T	6399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=117;PP=2965;SC=TCCGCCTTTCCGGTGCCCACG;SOR=1.097;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=213;TCF=95;TCR=118;TR=212;WE=42934508;WS=42934490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr6	42934620	rs3818554	C	T	1083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=32;PP=835;SC=GGAAAGGACACATGAGCAGGG;SOR=2.554;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=41;TCF=8;TCR=33;TR=40;WE=42934628;WS=42934610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr6	42935940	rs151180031	G	A	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.660;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=105;ReadPosRankSum=0.733;SC=CACCTGCCTCGGCCTCCCAAT;SOR=1.402;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=7;WE=42935948;WS=42935930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr6	42935998	rs9471982	G	A	1457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=16;PP=995;SC=GGCCCCCCCAGCTTTGAGAGG;SOR=1.314;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=32;TCR=16;TR=48;WE=42936006;WS=42935977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr6	42936900	rs3805953	C	T	895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=24;PP=672;SC=ACACCACCTGCGGTGCTCTGG;SOR=4.479;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=26;WE=42936908;WS=42936890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr6	42942779	rs9986447	A	G	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=201;ReadPosRankSum=0.588;SC=AAGTACCTCTATTAGAGAAAT;SOR=0.518;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=14;WE=42942787;WS=42942769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,13:0.37:35
chr6	42946490	rs9462858	C	A	552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.899;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=17;PP=401;ReadPosRankSum=-1.520;SC=GCGGTCCGGGCACTGGGAGGG;SOR=0.818;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=72;TCF=33;TCR=39;TR=29;WE=42946498;WS=42946480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,28:0.37:75
chr6	42946943	rs9462859	G	A	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=26;ReadPosRankSum=1.732;SC=GAGCCAGAGAGCCAGACGACT;SOR=0.446;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=3;WE=42946951;WS=42946933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
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chr6	42976232	rs6458318	T	G	1099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=22;PP=716;ReadPosRankSum=-2.316;SC=CCTTCCTCCTTATAATGTCCA;SOR=0.770;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=73;TCF=35;TCR=38;TR=41;WE=42976240;WS=42976222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,45:0.56:80
chr6	42978326	rs2236356	G	A	3701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=367;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.783;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=73;PP=2261;ReadPosRankSum=0.329;SC=CTCTCTCCCCGGGAGACTTTC;SOR=0.740;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=326;TCF=170;TCR=156;TR=155;WE=42978334;WS=42978316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:192,174:0.48:366
chr6	42978824	rs41274902	C	T	2142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.481;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=46;PP=1422;ReadPosRankSum=2.523;SC=AATAAGGGGACGGAACAATAG;SOR=0.635;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=213;TCF=117;TCR=96;TR=101;WE=42978832;WS=42978814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,106:0.45:233
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chr6	42981051	rs35628750	C	G	1224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.465;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=28;PP=706;ReadPosRankSum=1.696;SC=GTCCCAGTTCCTCAGTCTGAT;SOR=0.538;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=103;TCF=47;TCR=56;TR=54;WE=42981059;WS=42981041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,61:0.50:121
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chr6	42992825	rs3749903	C	G	2737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.909;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=52;PP=1642;ReadPosRankSum=-0.448;SC=AAGAAACAAGCTTCTAGACCA;SOR=0.762;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=253;TCF=137;TCR=116;TR=118;WE=42992833;WS=42992815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,133:0.47:280
chr6	42995211	rs1138141	A	G	742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=23;PP=543;ReadPosRankSum=2.026;SC=ACTTCCTGAAAAAATGTGAGT;SOR=0.742;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=69;TCF=20;TCR=49;TR=31;WE=42995219;WS=42995201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,33:0.44:75
chr6	43006485	rs149569345	G	C	1046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=6.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.54;ReadPosRankSum=0.019;SOR=0.925;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,46:0.64:72
chr6	43008298	rs2273917	C	T	2345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.515;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=41;PP=1203;ReadPosRankSum=0.738;SC=CCTCCAGCTTCAGGAGTTCCT;SOR=0.763;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=180;TCF=101;TCR=79;TR=98;WE=43008306;WS=43008288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,111:0.54:204
chr6	43013662	rs2273918	T	C	1563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.874;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=18;PP=1164;ReadPosRankSum=-0.592;SC=TAGGGCCAGATAGAAGCAGGA;SOR=1.204;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=109;TCF=75;TCR=34;TR=64;WE=43013670;WS=43013652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,66:0.56:118
chr6	43014022	rs61732148	G	A	1161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=35;PP=852;ReadPosRankSum=0.175;SC=GTGGGAGCCGGCGCTGCCGTT;SOR=0.781;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=89;TCF=30;TCR=59;TR=52;WE=43014030;WS=43014012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,52:0.57:92
chr6	43014177	rs111320577	G	A	749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.766;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=15;PP=495;ReadPosRankSum=-1.875;SC=TGGTGGTCACGGTCAGGTAGG;SOR=0.464;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=81;TCF=52;TCR=29;TR=35;WE=43014185;WS=43014167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,36:0.38:94
chr6	43014298	rs9394939	TT	CC	8190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=60;PP=2947;SC=TGTTGATGGGTTGGTGGGTTC;SOR=1.210;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=164;TCF=102;TCR=62;TR=156;WE=43014307;WS=43014288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr6	43014476	rs73733790	C	A	2881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=65;PP=1889;ReadPosRankSum=-0.271;SC=CCAGATGGGGCAGAGGGGAAG;SOR=0.684;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=291;TCF=146;TCR=145;TR=128;WE=43014484;WS=43014466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,137:0.45:307
chr6	43038977	rs201076057	G	A	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-1.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.018;HP=5;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.426;NF=9;NR=23;PP=571;ReadPosRankSum=1.226;SC=CTCCCTCCATGTTTTGTTCCT;SOR=0.932;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=69;TCF=28;TCR=41;TR=32;WE=43038985;WS=43038967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,30:0.49:61
chr6	43114211	rs60930750	C	CT	313.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=288;SC=TCCCAGTGAACTTCCCCCTGG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=43114219;WS=43114201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	43154091	rs941849	C	G	5051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=92;PP=2965;SC=AGCAGACACTCCAGCCAGGGA;SOR=1.051;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=165;TCF=73;TCR=92;TR=165;WE=43154099;WS=43154081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr6	43182657	rs1214714	G	A	870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=2;PP=638;SC=TGAGGGTGCAGTGAGCTGTGA;SOR=4.332;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=24;WE=43182665;WS=43182647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr6	43227033	rs184113285	T	C	1499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.462;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=39;PP=783;ReadPosRankSum=0.696;SC=GCGAAGGGCGTGGGTGGCCTT;SOR=0.428;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=165;TCF=70;TCR=95;TR=72;WE=43227041;WS=43227023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,79:0.44:180
chr6	43230970	rs3800294	G	C	1707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.009;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=34;PP=1016;ReadPosRankSum=0.924;SC=CTGAGCCAGGGCGATGGCCGT;SOR=0.420;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=132;TCF=78;TCR=54;TR=77;WE=43230978;WS=43230960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,84:0.58:145
chr6	43231163	rs10948069	T	C	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=190;ReadPosRankSum=-1.419;SC=GGGTGCTCCATGTGTGCTGGC;SOR=0.816;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=49;TCF=18;TCR=31;TR=20;WE=43231171;WS=43231153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,23:0.44:52
chr6	43237482	.	T	C	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.397;ClippingRankSum=0.000;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.07;ReadPosRankSum=-1.206;SOR=0.801;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,19:0.14:136
chr6	43250387	rs6936397	G	C	942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.735;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=13;PP=493;ReadPosRankSum=-0.053;SC=AGTCTCCTAGGTTGTGGGTGC;SOR=0.811;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=98;TCF=67;TCR=31;TR=44;WE=43250395;WS=43250377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,49:0.43:113
chr6	43250725	rs113160341	GGAA	G	1114.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=2.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.71;MQRankSum=2.807;QD=15.27;ReadPosRankSum=-1.742;SOR=0.437;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,33:0.45:73
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chr6	43252029	rs3800298	T	C	1040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.705;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=20;PP=443;ReadPosRankSum=1.034;SC=GCCCCAGCATTGGACACAGCC;SOR=0.668;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=102;TCF=56;TCR=46;TR=46;WE=43252037;WS=43252019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,53:0.48:111
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chr6	43306346	rs1459675	A	G	11117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=414;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;PP=2965;SC=GCTGGTACTTACTCCCTCATC;SOR=0.713;Source=Platypus;WE=43306354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,414:1.00:414
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chr6	43323917	rs41281796	G	A	875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.871;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=27;PP=568;ReadPosRankSum=-1.315;SC=TTAGTCTTATGCAGAATCTCA;SOR=0.567;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=78;TCF=26;TCR=52;TR=40;WE=43323925;WS=43323907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,42:0.49:85
chr6	43336771	rs9381238	C	T	1363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=27;PP=808;SC=GGGACTCCCCCCGGCTGCTGC;SOR=1.436;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=17;TCR=27;TR=44;WE=43336779;WS=43336761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr6	43336853	rs188438053	C	G	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.740;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=3;PP=67;ReadPosRankSum=2.152;SC=GCGACGGGCCCGAGGCGGGGA;SOR=0.368;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=17;TCF=8;TCR=9;TR=8;WE=43336861;WS=43336843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr6	43399837	rs700008	A	G	4770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=97;NR=57;PP=2931;SC=CTGGCTCCTGAGTCAGCCACG;SOR=1.127;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=154;TCF=97;TCR=57;TR=154;WE=43399845;WS=43399827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr6	43401105	rs9394952	G	A	1532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.164;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=36;PP=914;ReadPosRankSum=0.783;SC=TAAGGTGAGCGGGTACTTGGG;SOR=1.007;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=107;TCF=50;TCR=57;TR=62;WE=43401113;WS=43401095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,73:0.55:133
chr6	43411659	rs79175380	T	C	1654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.572;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=29;PP=1030;ReadPosRankSum=0.109;SC=AATCTCCCCTTCTACCCTCCA;SOR=0.767;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=90;TCR=62;TR=71;WE=43411667;WS=43411649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,80:0.48:168
chr6	43412865	rs2125739	T	C	1339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.335;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=24;PP=794;ReadPosRankSum=-0.335;SC=CCACCCAGCATCCCAGTGTTC;SOR=0.582;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=124;TCF=78;TCR=46;TR=61;WE=43412873;WS=43412855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,68:0.48:141
chr6	43414147	rs75799355	C	T	1183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.591;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=34;PP=712;ReadPosRankSum=-1.422;SC=TCGCAGGCATCGCTCTGGTGC;SOR=1.089;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=105;TCF=41;TCR=64;TR=52;WE=43414155;WS=43414137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,57:0.50:115
chr6	43414216	rs1214746	T	C	665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=16;PP=480;SC=CCCTACCTCATCCACAAGTTA;SOR=3.160;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=43414224;WS=43414206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr6	43414234	rs1214747	G	C	609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=4;NR=15;PP=425;SC=TTAGTCCACCGCTCTCCCAGA;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=19;WE=43414242;WS=43414224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr6	43418691	rs1214748	G	A	2542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.033;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=47;PP=1436;ReadPosRankSum=-0.530;SC=CAAGCTCACAGGTCTTGCCAC;SOR=0.781;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=190;TCF=100;TCR=90;TR=99;WE=43418699;WS=43418681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,117:0.53:221
chr6	43418733	rs1214749	G	A	2568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=48;PP=1463;ReadPosRankSum=0.076;SC=AGTCGAAGTCGTGGACACGGT;SOR=0.704;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=191;TCF=103;TCR=88;TR=104;WE=43418741;WS=43418723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,121:0.54:223
chr6	43468355	rs2277123	G	A	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=142;ReadPosRankSum=0.000;SC=AGAGAGCCCTGCAGCCCTCTT;SOR=0.941;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=8;WE=43468363;WS=43468345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr6	43469241	rs79019801	T	G	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=134;ReadPosRankSum=1.712;SC=CCCTCTGCCCTTGATCCCACA;SOR=0.569;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=14;WE=43469249;WS=43469231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr6	43469818	.	T	A	47	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=12;MMLQ=26;MQ=53.98;NF=2;NR=0;PP=47;QD=40.8856062736;SC=ACACACACTCTCTCTCTCTCT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=2;WE=43469826;WS=43469811;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:11,2:0.15:13
chr6	43471481	rs78262217	C	G	4254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=394;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.172;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=91;PP=2773;ReadPosRankSum=-0.023;SC=CCACATAGACCATTCCGGCCA;SOR=0.598;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=351;TCF=173;TCR=178;TR=186;WE=43471489;WS=43471471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:190,204:0.52:394
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chr6	43475474	rs6924483	T	C	1062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=22;PP=647;ReadPosRankSum=0.483;SC=TCCTCAGACCTCAACCTGCCA;SOR=0.729;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=98;TCF=48;TCR=50;TR=44;WE=43475482;WS=43475464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,48:0.44:110
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chr6	43481121	rs2231767	C	T	2054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.866;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=35;PP=1299;ReadPosRankSum=-1.834;SC=ACGTCTTCATCCCATGGAGTA;SOR=0.554;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=168;TCF=102;TCR=66;TR=86;WE=43481129;WS=43481111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,95:0.52:181
chr6	43484723	rs201485043	C	CGGG	262.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.613;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=214;ReadPosRankSum=1.111;SC=GGGACGTGGACGGGGGCGGGG;SOR=2.584;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=17;TCF=9;TCR=8;TR=6;WE=43484731;WS=43484716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr6	43487032	rs199836713	GAGC	G	1254.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.519;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.982;NF=14;NR=6;PP=845;ReadPosRankSum=0.407;SC=ATTACACAGAGAGCAGATTTC;SOR=1.272;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=52;TCF=27;TCR=25;TR=20;WE=43487042;WS=43487022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,35:0.44:79
chr6	43488836	rs113209557	C	T	1565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.397;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=34;PP=920;ReadPosRankSum=-0.401;SC=GGTGCTGCAGCTTCCTTCCAG;SOR=0.854;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=114;TCF=54;TCR=60;TR=63;WE=43488844;WS=43488826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,71:0.55:130
chr6	43488894	rs113321982	G	T	968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.144;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=24;PP=552;ReadPosRankSum=-0.270;SC=GCCCTGCCTAGACTAAAGTGT;SOR=1.153;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=76;TCF=31;TCR=45;TR=38;WE=43488902;WS=43488884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,45:0.52:87
chr6	43491335	rs55671916	T	C	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.535;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=2;PP=145;ReadPosRankSum=0.869;SC=GCTCTAGCTTTTCTTGGAAAA;SOR=0.458;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=9;WE=43491343;WS=43491325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr6	43494319	rs1150800	A	G	2928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=34;PP=1844;SC=ACTACATGTAAGGTGTCTTCT;SOR=1.265;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=99;TCF=64;TCR=35;TR=98;WE=43494327;WS=43494309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr6	43496662	rs1106841	A	C	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=366;ReadPosRankSum=-1.127;SC=TTACAAAGACACGTGCTGCAA;SOR=0.756;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=60;TCF=25;TCR=35;TR=26;WE=43496670;WS=43496652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,28:0.41:68
chr6	43496869	rs1111786	G	A	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=200;ReadPosRankSum=-1.115;SC=TCTTAGTTTAGCTGCATTTCC;SOR=0.264;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=11;WE=43496877;WS=43496859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr6	43497064	rs1111785	G	A	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.398;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=225;ReadPosRankSum=0.639;SC=GTGGATCACGGGGTCAAGAGA;SOR=0.098;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=37;TCF=10;TCR=27;TR=20;WE=43497072;WS=43497054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,23:0.61:38
chr6	43498673	rs7769795	G	A	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=20;PP=436;ReadPosRankSum=-2.081;SC=TCAGCCAGAAGAGCAGTTGTA;SOR=0.509;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=42;TCF=8;TCR=34;TR=25;WE=43498681;WS=43498663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,26:0.57:46
chr6	43501580	rs11404474	C	CA	759.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=4;PP=635;SC=TAAAAAACAACAAAAAAGGGG;SOR=2.670;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=20;WE=43501588;WS=43501570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr6	43501833	rs7767973	T	C	2105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.627;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=52;PP=1326;ReadPosRankSum=1.253;SC=TACTACAGTTTCACACAGATC;SOR=0.904;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=163;TCF=69;TCR=94;TR=87;WE=43501841;WS=43501823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,97:0.54:181
chr6	43521247	.	AAC	A	108.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.006;ClippingRankSum=0.000;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=4.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQRankSum=-0.331;QD=0.95;ReadPosRankSum=1.026;SOR=0.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,13:0.11:114
chr6	43521263	.	TAC	T	126.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.247;ClippingRankSum=0.000;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=1.819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQRankSum=2.324;QD=2.04;ReadPosRankSum=-1.858;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,10:0.16:62
chr6	43523739	rs112132990	A	G	2293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.525;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=60;PP=1393;ReadPosRankSum=0.141;SC=ACAGGAATCAATAACTGGTAT;SOR=1.167;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=172;TCF=64;TCR=108;TR=89;WE=43523747;WS=43523729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,102:0.53:193
chr6	43533305	rs11362688	TA	T	51.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.75;ReadPosRankSum=0.366;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr6	43581935	rs9333555	A	G	2597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.445;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=63;PP=1740;ReadPosRankSum=-0.100;SC=TCCTGCAGAGATGGATTTGGC;SOR=0.744;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=243;TCF=111;TCR=132;TR=116;WE=43581943;WS=43581925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,124:0.45:274
chr6	43587991	rs113410952	G	A	1673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=32;PP=920;ReadPosRankSum=-0.617;SC=CCTATTTCACGTGAAAGGCCT;SOR=0.697;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=156;TCF=87;TCR=69;TR=74;WE=43587999;WS=43587981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,82:0.49:168
chr6	43589197	rs113592918	A	G	2071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.876;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=46;PP=1189;ReadPosRankSum=-0.363;SC=CAAGTTTGGCACCTCTCCAGA;SOR=0.972;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=185;TCF=91;TCR=94;TR=87;WE=43589205;WS=43589187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,99:0.46:214
chr6	43590408	rs16896609	G	A	3840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=371;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.216;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=89;PP=2129;ReadPosRankSum=0.341;SC=CCAAGCGCCAGTGTAGCAGCC;SOR=0.762;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=332;TCF=159;TCR=173;TR=168;WE=43590416;WS=43590398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:180,191:0.51:371
chr6	43592496	rs74848862	G	A	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.307;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=7;PP=180;ReadPosRankSum=1.067;SC=AGCAGCAGGAGAGAAGAGTGA;SOR=0.239;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=30;TCF=12;TCR=18;TR=14;WE=43592504;WS=43592486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr6	43596814	rs112851070	C	G	1021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=27;PP=569;ReadPosRankSum=0.151;SC=GCTGCCGGCCCCCCTAGCCTT;SOR=0.680;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=101;TCF=40;TCR=61;TR=45;WE=43596822;WS=43596804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,53:0.45:117
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chr6	43608048	rs35249206	C	T	2306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=48;PP=1489;ReadPosRankSum=-0.721;SC=ATGCCTTTAGCGAGCTTCAGG;SOR=0.675;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=221;TCF=119;TCR=102;TR=102;WE=43608056;WS=43608038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,112:0.47:240
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chr6	43646401	rs2295948	A	G	1422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.424;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=36;PP=845;ReadPosRankSum=-1.017;SC=GAGAGACAGGACCTGCGTGGA;SOR=0.843;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=118;TCF=49;TCR=69;TR=61;WE=43646409;WS=43646391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,68:0.53:128
chr6	43646447	rs2295949	T	G	749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.970;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=20;PP=437;ReadPosRankSum=-0.809;SC=AAAATGATGGTAATGCTGGTG;SOR=0.874;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=66;TCF=22;TCR=44;TR=29;WE=43646455;WS=43646437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,34:0.49:70
chr6	43738350	rs2010963	C	G	2400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=28;PP=1766;SC=GCAGCGAAAGCGACAGGGGCA;SOR=1.528;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=87;TCF=59;TCR=28;TR=86;WE=43738358;WS=43738340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr6	43745095	rs2146323	C	A	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.810;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=104;ReadPosRankSum=-1.732;SC=TTTGGAAGGACTTGCCTGATT;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=6;WE=43745103;WS=43745094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr6	43747371	rs3025007	C	T	791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.130;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=11;PP=387;ReadPosRankSum=-1.618;SC=TGTCTGCCTCCAGTGCTGTGC;SOR=1.085;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=58;TCF=36;TCR=22;TR=32;WE=43747379;WS=43747361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,38:0.58:65
chr6	43747450	rs3025009	G	A	2047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=38;PP=1226;ReadPosRankSum=-0.514;SC=CCAGAGCGAGGGGATGCGGAA;SOR=0.671;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=187;TCF=108;TCR=79;TR=91;WE=43747458;WS=43747440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,100:0.48:208
chr6	43747577	rs3025010	T	C	2048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.518;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=51;PP=1346;ReadPosRankSum=0.528;SC=TCTCTTGGGCTTGGCAGGCAT;SOR=0.642;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=186;TCF=84;TCR=102;TR=93;WE=43747585;WS=43747567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,99:0.49:201
chr6	43747623	rs3025011	A	T	1223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=37;PP=819;ReadPosRankSum=-0.194;SC=GACAGGCTACAGCCTGCCCCC;SOR=0.602;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=94;TCF=26;TCR=68;TR=52;WE=43747631;WS=43747613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,54:0.56:97
chr6	43748350	rs3025015	G	A	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=2.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.713;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=121;ReadPosRankSum=0.402;SC=CACTTCCTCCGGGAAGCGGCC;SOR=1.981;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=8;WE=43748358;WS=43748340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr6	43748643	rs3025052	T	C	583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=12;PP=349;SC=CCCCTGGTCCTTCCCTGGCTC;SOR=1.329;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=19;WE=43748651;WS=43748633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr6	43752536	rs3025039	C	T	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.129;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=282;ReadPosRankSum=0.650;SC=TGACCCAGCACGGTCCCTCTT;SOR=1.426;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=15;WE=43752544;WS=43752526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr6	43970503	.	C	CGCG	862.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.904;ClippingRankSum=0.000;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.171;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.685;NF=2;NR=10;PP=532;ReadPosRankSum=-0.979;SC=CGGTAGAGCGCGCGGCGGCGG;SOR=0.446;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=12;WE=43970511;WS=43970493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,24:0.53:45
chr6	44081510	rs700006	C	T	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.741;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=203;ReadPosRankSum=0.941;SC=CTCCCAAGCTCCCTTAGCAAA;SOR=1.942;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=11;WE=44081518;WS=44081500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,10:0.33:30
chr6	44081718	rs6883	G	A	7250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=128;NR=122;PP=2965;SC=TGTTGGAGTCGAATCTGGGGG;SOR=0.755;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=250;TCF=128;TCR=122;TR=250;WE=44081726;WS=44081708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
chr6	44081987	rs4711767	T	C	1863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=30;NR=39;PP=1280;SC=CTGTATCTCTTATGGTCAGGG;SOR=1.244;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=30;TCR=39;TR=69;WE=44081995;WS=44081977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr6	44102572	rs3841315	C	CT	7196.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=85;PP=2966;SC=CCACCTGCCCCGGTTTCCCAG;SOR=1.342;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=103;TCF=11;TCR=92;TR=96;WE=44102580;WS=44102562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr6	44103019	rs59028814	G	C	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.657;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=460;ReadPosRankSum=-0.051;SC=CTGTCCCCAGGGACTCTCCCC;SOR=0.351;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=52;TCF=41;TCR=11;TR=27;WE=44103027;WS=44103009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,27:0.48:56
chr6	44104306	rs56168551	G	A	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=261;ReadPosRankSum=0.982;SC=CAAAGAAAGTGATTCAACCAA;SOR=0.656;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=26;TCF=8;TCR=18;TR=17;WE=44104314;WS=44104296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr6	44107200	rs11967633	G	A	1627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=27;PP=780;ReadPosRankSum=-0.766;SC=CCGTATGGCTGCAGGGATGAT;SOR=0.700;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=161;TCF=94;TCR=67;TR=70;WE=44107208;WS=44107190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,82:0.45:183
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chr6	44108150	rs7738970	T	C	1450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.864;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=29;PP=870;ReadPosRankSum=0.657;SC=TTCCCTTCCCTTCCCTGCAGG;SOR=0.223;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=109;TCF=42;TCR=67;TR=55;WE=44108158;WS=44108140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,61:0.53:115
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chr6	44140174	rs74993668	G	C	1268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.282;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=29;PP=805;ReadPosRankSum=-0.693;SC=GACAGTGTGAGAGCCACTGTG;SOR=0.851;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=140;TCF=71;TCR=69;TR=56;WE=44140182;WS=44140164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,62:0.39:158
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chr6	44148568	rs58040611	C	T	2693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.172;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=53;PP=1573;ReadPosRankSum=-0.812;SC=CTGCTGCACACGACCCCTCCC;SOR=0.825;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=226;TCF=120;TCR=106;TR=119;WE=44148576;WS=44148558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,129:0.53:242
chr6	44149153	rs149157640	CCACA	C	322.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.34;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	44150634	.	C	A	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.769;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=224;ReadPosRankSum=-0.441;SC=ATTTCAACCACCATGCCATGC;SOR=0.990;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=11;WE=44150642;WS=44150624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr6	44151490	rs7761137	G	A	2452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.059;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=58;PP=1471;ReadPosRankSum=0.098;SC=ATTTGCTTGAGCCTGGAACAG;SOR=0.798;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=196;TCF=94;TCR=102;TR=107;WE=44151498;WS=44151480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,116:0.54:215
chr6	44151765	rs13209117	G	A	599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=16;PP=288;ReadPosRankSum=-0.490;SC=TCAGCTCTCCGGTCTCTGCTG;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=26;TCR=38;TR=27;WE=44151773;WS=44151755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,33:0.46:71
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chr6	44185522	rs57595790	TC	GA	3118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=4.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.276;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=41;PP=2388;ReadPosRankSum=-0.054;SC=AGTAGGATAATCCTGGCACCA;SOR=1.022;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=166;TCF=66;TCR=100;TR=63;WE=44185531;WS=44185512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,83:0.43:195
chr6	44187386	rs66872347	C	T	1086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.717;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=19;PP=547;ReadPosRankSum=0.331;SC=CCGGTCAGGCCCGGCGCGGGC;SOR=0.613;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=100;TCF=58;TCR=42;TR=47;WE=44187394;WS=44187376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,55:0.51:108
chr6	44191254	rs11752118	A	G	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.368;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=77;ReadPosRankSum=-0.890;SC=GGCGTCGGGGAGGTGGCAGTG;SOR=2.964;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=5;WE=44191262;WS=44191244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr6	44216544	rs112518852	GT	G	6267.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.200;HP=11;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.615;NF=25;NR=135;PP=2405;ReadPosRankSum=1.707;SC=ATTTGGCATGGTTTTTTTTTT;SOR=0.911;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=196;TCF=33;TCR=163;TR=160;WE=44216563;WS=44216532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:10,269:0.96:279
chr6	44217374	rs34083426	T	G	2188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.496;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=43;PP=1325;ReadPosRankSum=-0.286;SC=GTTTTTTGCTTCTTTAAAACT;SOR=0.732;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=190;TCF=99;TCR=91;TR=90;WE=44217382;WS=44217364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,102:0.48:214
chr6	44218120	rs13296	A	G	6890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=116;NR=108;PP=2965;SC=ATGAAGAAAAACCCAAGATCG;SOR=0.710;SbPval=0.54;Source=Platypus;TCF=116;TR=224;WE=44218128;WS=44218110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr6	44220076	rs504697	T	C	3714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=84;PP=2720;SC=CATGTTTCTATACAATTAGTG;SOR=1.628;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=125;TCF=41;TCR=84;TR=125;WE=44220084;WS=44220066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
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chr6	44221142	rs34776515	C	T	7513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=362;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.233;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.307;NF=83;NR=81;PP=2962;ReadPosRankSum=0.531;SC=CTTGGTGTGGCAAGGAGTTTG;SOR=0.668;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=315;TCF=160;TCR=155;TR=164;WE=44221160;WS=44221132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,196:0.54:362
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chr6	44222161	rs35131506	C	CTG	1053.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=18;PP=818;SC=GGAAGAGTAACTGGAACCTAC;SOR=2.215;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=18;WE=44222169;WS=44222151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
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chr6	44240193	rs571770	C	G	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.748;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=131;ReadPosRankSum=1.756;SC=ATCCAAAGGACGTGTTAGGCT;SOR=1.136;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=9;WE=44240201;WS=44240183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr6	44240559	rs524533	C	T	2156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=41;PP=1374;ReadPosRankSum=-0.833;SC=TCTCTGCACTCTCCTGTACTG;SOR=0.731;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=167;TCF=88;TCR=79;TR=90;WE=44240567;WS=44240549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,97:0.54:180
chr6	44243559	rs3734710	A	G	2709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.888;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=60;PP=1680;ReadPosRankSum=-0.669;SC=TGGAGAAGCTATTTGGCCTGG;SOR=0.760;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=270;TCF=137;TCR=133;TR=122;WE=44243567;WS=44243549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,132:0.45:294
chr6	44245930	rs325018	C	T	1555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=33;PP=877;ReadPosRankSum=-0.698;SC=GCGGGGAGTGCGAGGGGCCCA;SOR=0.663;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=169;TCF=96;TCR=73;TR=73;WE=44245938;WS=44245920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,85:0.43:198
chr6	44246049	rs325017	A	G	786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.270;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=21;PP=485;ReadPosRankSum=-1.249;SC=AGGCTTGGGCAGGGGAAACAG;SOR=0.177;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=72;TCF=24;TCR=48;TR=38;WE=44246057;WS=44246039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,39:0.51:76
chr6	44247951	rs484757	T	G	10435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=385;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=188;NR=170;PP=2965;SC=CATTGGCAGTTATGGTTGACA;SOR=0.785;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=358;TCF=188;TCR=170;TR=358;WE=44247959;WS=44247941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,383:1.00:383
chr6	44249900	.	C	T	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.518;ClippingRankSum=0.000;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=10;PP=450;ReadPosRankSum=2.085;SC=GTGTTGATGGCGAGCACCTGT;SOR=0.673;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=63;TCF=43;TCR=20;TR=30;WE=44249908;WS=44249890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,31:0.46:68
chr6	44250165	rs516582	A	G	3184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.894;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=64;PP=1928;ReadPosRankSum=-0.235;SC=GCTTGGCAGCACCTCGTGCAC;SOR=0.775;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=265;TCF=143;TCR=122;TR=144;WE=44250173;WS=44250155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,156:0.54:291
chr6	44253617	rs324142	C	T	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.643;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=181;ReadPosRankSum=-0.149;SC=AGGAAGAAGGCAATAATAGAG;SOR=0.105;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=13;WE=44253625;WS=44253607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr6	44253650	rs2297335	A	G	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=4.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.38;ReadPosRankSum=0.318;SOR=0.238;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,21:0.45:47
chr6	44253749	rs324143	A	G	3528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=63;NR=51;PP=1956;SC=AGAGGCAGTCACGGTAGGTGA;SOR=0.754;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=114;TCF=63;TCR=51;TR=114;WE=44253757;WS=44253739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr6	44253765	rs2297336	A	G	1134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.174;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=21;PP=740;ReadPosRankSum=0.426;SC=GGTGAAGAGGAAGAGATTCCA;SOR=1.014;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=118;TCF=67;TCR=51;TR=50;WE=44253773;WS=44253755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,57:0.42:137
chr6	44255459	rs324146	G	A	2017.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.722;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=46;PP=1202;ReadPosRankSum=0.989;SC=TGAGAGCTGTGGGCTTGTGCT;SOR=0.852;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=182;TCF=90;TCR=92;TR=88;WE=44255467;WS=44255449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,98:0.48:203
chr6	44268135	rs325009	C	T	557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=3;PP=382;SC=CCTTGTGTCACGTAGGCCCTG;SOR=2.419;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=44268143;WS=44268128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr6	44268371	rs325008	T	C	3572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=54;NR=65;PP=1749;SC=CCACCACTCGTGAGCCCCACG;SOR=1.001;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=54;TCR=65;TR=119;WE=44268379;WS=44268361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr6	44269023	rs325007	T	C	8546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=158;NR=128;PP=2965;SC=GAAAGACAGATGGTGAGCCCA;SOR=0.804;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=286;TCF=158;TCR=128;TR=286;WE=44269031;WS=44269013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,321:1.00:321
chr6	44269193	rs498512	C	T	1857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.266;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=42;PP=1152;ReadPosRankSum=0.811;SC=CCTGAGTTTTCTTTGCAGCCT;SOR=0.429;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=160;TCF=70;TCR=90;TR=79;WE=44269201;WS=44269183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,89:0.49:183
chr6	44269640	rs325006	G	A	513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=45;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=0;PP=432;SC=TGGGGGAATGGCCTGGGTGAT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=44269648;WS=44269631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	44269664	rs10578812	CAGG	C	587.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=407;ReadPosRankSum=-0.791;SC=TCTCAGCTGGCAGGAGAAGGA;SOR=0.826;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=11;WE=44269688;WS=44269654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr6	44269680	rs325005	C	G	1299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=4;PP=1094;SC=AAGGAAGCTGCCACCACCCCG;SOR=4.073;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=37;TCR=4;TR=41;WE=44269688;WS=44269654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr6	44270365	rs325004	C	G	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=202;ReadPosRankSum=-0.736;SC=AATCAAGGCACCAGCACCAAA;SOR=0.606;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=43;TCF=18;TCR=25;TR=13;WE=44270373;WS=44270355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,13:0.27:48
chr6	44270768	rs325002	G	T	917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.025;NF=14;NR=24;PP=600;ReadPosRankSum=-0.660;SC=AGGATCCGGGGCCCCTGGGCC;SOR=0.593;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=76;TCF=27;TCR=49;TR=38;WE=44270776;WS=44270758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,40:0.50:80
chr6	44270936	rs325001	C	T	2859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.931;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=56;PP=1597;ReadPosRankSum=2.150;SC=GGGACAGGCCCGTTAACTGCC;SOR=0.765;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=246;TCF=133;TCR=113;TR=124;WE=44270944;WS=44270926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,137:0.51:267
chr6	44273546	rs324137	A	C	1968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.186;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=45;PP=1192;ReadPosRankSum=-1.731;SC=AAGACAAAGAATGTTGAGGAG;SOR=0.589;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=156;TCF=72;TCR=84;TR=86;WE=44273554;WS=44273536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,96:0.55:175
chr6	44274797	rs7740535	T	C	8584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=137;NR=158;PP=2965;SC=CAGACATGAATCCCCAGCGGC;SOR=0.889;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=296;TCF=137;TCR=159;TR=295;WE=44274805;WS=44274787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,321:1.00:321
chr6	44275011	rs324136	T	C	6254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=112;NR=98;PP=2965;SC=CCAGGGAAGATGCCATCAGAG;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=211;TCF=112;TCR=99;TR=210;WE=44275019;WS=44275001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr6	44278592	rs10807297	A	G	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=169;ReadPosRankSum=1.208;SC=TATTATCTATAAGGTGTTGAG;SOR=0.467;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=10;WE=44278600;WS=44278582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,12:0.36:33
chr6	44280812	rs167772	C	T	2259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FS=0.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.08;ReadPosRankSum=1.381;SOR=0.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:135,114:0.46:249
chr6	44320548	rs4714783	T	A	5699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=95;PP=2965;SC=CCTCATCTTCTGTGGAAACAG;SOR=0.886;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=191;TCF=96;TCR=95;TR=191;WE=44320556;WS=44320538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr6	44355423	rs2297333	C	T	1896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=9;PP=1233;SC=CGCCCCCTCCCACCTTGCGCT;SOR=2.658;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=55;TCF=46;TCR=9;TR=54;WE=44355431;WS=44355413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr6	44355682	rs34753552	G	A	1343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=32;PP=993;SC=GAGGTCGGGGGGGCGACGAGG;SOR=3.109;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=7;TCR=32;TR=39;WE=44355690;WS=44355672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr6	44355699	rs2297331	T	C	728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=4;NR=20;PP=525;SC=GAGGAGACCCTGTGGGGTCTG;SOR=3.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=24;WE=44355707;WS=44355689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr6	44357884	rs6908640	T	G	507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=0;PP=406;SC=TTAACCTAGGTGGTGTGTATG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=44357892;WS=44357874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	44360680	rs6942323	A	G	120.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=102;SC=AGTAAACCCAAAGCTAAAGCC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=44360688;WS=44360670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	44921320	rs10948187	C	T	395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=12;PP=319;SC=GTGAATGGACCTAGTCATGAT;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=44921328;WS=44921310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	44988149	rs1475534	C	T	110.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=0;PP=54;SC=TCGTCCAAACCATGAAGACTA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=44988157;WS=44988143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr6	45390511	rs6921145	G	A	1307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=24;PP=823;ReadPosRankSum=0.320;SC=CTGCGGCGGCGGCGGCGGCTG;SOR=0.738;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=109;TCF=64;TCR=45;TR=57;WE=45390519;WS=45390492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,62:0.53:118
chr6	45870999	rs35735653	CAG	C	3470.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.11;MQRankSum=1.418;NF=9;NR=43;PP=2075;ReadPosRankSum=0.860;SC=CAATCTAAAACAGAGATGGCA;SOR=0.713;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=104;TCF=20;TCR=84;TR=52;WE=45871008;WS=45870989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,92:0.50:183
chr6	45909349	rs143360018	G	T	995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.226;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=19;PP=677;ReadPosRankSum=-0.922;SC=GTCGATGCCCGCTGTGTTGGA;SOR=1.019;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=123;TCF=70;TCR=53;TR=49;WE=45909357;WS=45909339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,52:0.39:133
chr6	45922849	rs3734206	C	T	8997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=166;NR=143;PP=2965;SC=AAACATACTCCTCATTTATGC;SOR=0.766;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=310;TCF=166;TCR=144;TR=309;WE=45922857;WS=45922839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,340:1.00:340
chr6	46047458	rs3734207	C	T	2778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=34;PP=1670;SC=AGAGGTAAATCTCAGGGTTCA;SOR=1.115;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=62;TCR=34;TR=96;WE=46047466;WS=46047448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr6	46048000	rs1416165	T	C	4170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=83;PP=2210;SC=CCGAGAGATCTGTTTACAGGG;SOR=1.319;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=141;TCF=58;TCR=83;TR=141;WE=46048008;WS=46047990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr6	46107312	rs11752816	G	A	3027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=34;PP=1670;SC=GTCCTTCAACGTGTTCATTAT;SOR=1.138;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=61;TCR=34;TR=95;WE=46107320;WS=46107302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr6	46107752	rs7451713	C	G	9350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=152;NR=153;PP=2965;SC=TACCCATTCACGATACCATCT;SOR=0.756;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=305;TCF=152;TCR=153;TR=305;WE=46107760;WS=46107742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,328:1.00:328
chr6	46129345	rs2235881	G	A	3253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=55;PP=2229;SC=GTGGCATGGCGGTGATATTGA;SOR=0.763;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=108;TCF=53;TCR=55;TR=108;WE=46129353;WS=46129335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr6	46135489	rs6926570	T	C	7868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=148;NR=117;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.883;SC=AACCATTCAATAATTTTGGCA;SOR=0.859;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=267;TCF=149;TCR=118;TR=265;WE=46135497;WS=46135479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,284:0.99:286
chr6	46135984	rs3806995	G	T	6030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=116;PP=2965;SC=GACACCAAGAGAAATTTCGAA;SOR=1.048;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=203;TCF=87;TCR=116;TR=203;WE=46135992;WS=46135974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr6	46293328	rs2277121	G	A	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=95;ReadPosRankSum=-0.584;SC=CCTTGCTCTGGGGACGGCTGG;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=6;WE=46293336;WS=46293318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr6	46521339	rs956297	G	A	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.260;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=89;ReadPosRankSum=-0.135;SC=CTGAATTAAGGAGACCGAGTA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=5;WE=46521347;WS=46521329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr6	46521602	rs699939	C	A	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.400;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=12;PP=281;ReadPosRankSum=1.399;SC=CTGGAAGAAACGAATAAAATT;SOR=0.382;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=34;TCF=13;TCR=21;TR=21;WE=46521610;WS=46521592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,23:0.62:37
chr6	46563817	rs7761731	A	T	2171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.497;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=56;PP=1355;ReadPosRankSum=-0.827;SC=TTAGAAGGAGATTCTCCAGGT;SOR=0.753;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=206;TCF=87;TCR=119;TR=96;WE=46563825;WS=46563807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,105:0.46:226
chr6	46609905	rs2277119	C	T	755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.804;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=16;PP=532;ReadPosRankSum=1.555;SC=TTTACCTGTACGATAAACGAT;SOR=0.569;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=87;TCF=54;TCR=33;TR=40;WE=46609913;WS=46609895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,40:0.44:91
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chr6	46623698	rs3757241	T	C	4005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=61;PP=2261;SC=TGCGCACAGCTCTAGGGATCA;SOR=0.792;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=128;TCF=67;TCR=61;TR=128;WE=46623706;WS=46623688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
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chr6	46649231	rs7740677	C	T	9769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=370;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=198;NR=137;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.913;SC=GAATACATTACTTTCTTCTCT;SOR=1.075;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=339;TCF=200;TCR=139;TR=335;WE=46649239;WS=46649221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,366:0.99:368
chr6	46657057	rs3799277	A	G	4747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=82;PP=2965;SC=TGACCTGAAGACACTGATACT;SOR=0.801;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=157;TCF=75;TCR=82;TR=157;WE=46657065;WS=46657047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr6	46657722	rs151229253	T	G	1726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.510;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=36;PP=1004;ReadPosRankSum=-1.626;SC=CAGTTTCCTTTTTTAAAAAGA;SOR=0.892;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=168;TCF=84;TCR=84;TR=70;WE=46657730;WS=46657712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,82:0.42:194
chr6	46658905	rs9381472	C	G	5224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=68;PP=2965;SC=TATTTTAGAACAGTTGTCATG;SOR=0.821;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=156;TCF=88;TCR=68;TR=156;WE=46658913;WS=46658895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr6	46672215	rs71712514	TCACACA	T	188.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=64.48;QD=37.77;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	46672943	rs1051931	A	G	2098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=23;PP=1201;SC=ATCAATAGCTACATTTGAATC;SOR=1.121;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=43;TCR=23;TR=66;WE=46672951;WS=46672933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr6	46676019	rs2216465	C	G	641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=19;PP=545;SC=TGGGTTATCTCATTGGAATAA;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=46676027;WS=46676009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr6	46682079	rs1362931	A	C	417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=1;PP=307;SC=TATTGAGGAAACCCAACTCCT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=46682087;WS=46682069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	46684222	rs1805017	C	T	6119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=112;PP=2965;SC=GGTGTCAAGGCGATCATTATC;SOR=1.015;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=206;TCF=94;TCR=112;TR=206;WE=46684230;WS=46684206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr6	46714466	rs9367255	C	T	554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.20;SOR=4.514;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr6	46714598	rs9349374	C	T	5810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=110;NR=68;PP=2965;SC=CACCAGACACCTAGGGAAGCT;SOR=1.025;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=178;TCF=110;TCR=68;TR=178;WE=46714606;WS=46714588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr6	46726441	rs9395212	G	C	566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=2;PP=412;SC=AGTTCAGAAGGCTCTCTCTTC;SOR=2.948;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=46726449;WS=46726431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr6	46766467	rs872018	GG	CC	3330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=41;PP=2536;SC=GCCAGCCCTGGGATGGGCACT;SOR=1.432;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=67;TCF=25;TCR=42;TR=64;WE=46766476;WS=46766457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr6	46803018	rs2297020	A	T	611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.81;SOR=1.931;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr6	46803102	rs2297019	A	G	2514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.66;SOR=0.963;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr6	46826508	rs613870	G	A	10079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=377;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=172;NR=148;PP=2965;SC=AAGAAGTCCGGTTCTTGGTCA;SOR=0.753;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=320;TCF=172;TCR=148;TR=320;WE=46826516;WS=46826498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,375:1.00:375
chr6	46826715	rs572248	T	A	11755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=437;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=211;NR=186;PP=2965;SC=CACCTTCTTCTACATAGCACC;SOR=0.799;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=398;TCF=212;TCR=186;TR=397;WE=46826723;WS=46826705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,436:1.00:436
chr6	46826844	rs571247	T	C	8927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=142;NR=150;PP=2965;SC=ATGGCATAGTTGTATTGTGGC;SOR=0.879;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=292;TCF=142;TCR=150;TR=292;WE=46826857;WS=46826834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,326:1.00:326
chr6	46826910	rs611779	G	A	8633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=150;NR=142;PP=2965;SC=GGATATCCTGGGCAAGGATGG;SOR=0.725;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=292;TCF=150;TCR=142;TR=292;WE=46826918;WS=46826900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,313:1.00:313
chr6	46826979	rs9381487	A	G	8497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=148;NR=130;PP=2965;SC=AGTTTTCTAGATAGCTCTTGT;SOR=0.733;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=278;TCF=148;TCR=130;TR=278;WE=46826987;WS=46826969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,306:1.00:306
chr6	46827126	rs610856	C	T	9872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=363;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=172;NR=163;PP=2965;SC=GGCTATCTCCCGACTGTAATG;SOR=0.715;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=335;TCF=172;TCR=163;TR=335;WE=46827134;WS=46827116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,362:1.00:362
chr6	46827239	rs9395218	C	T	4684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=103;PP=2965;SC=CCAAGGATGACATTAACCGTA;SOR=1.568;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=157;TCF=54;TCR=103;TR=157;WE=46827247;WS=46827229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr6	46828670	rs540727	A	G	913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=26;PP=731;SC=AAATTTACCAATCAATTCAGC;SOR=2.694;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=31;WE=46828678;WS=46828660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr6	46831060	rs476374	C	T	8335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=118;NR=159;PP=2965;SC=CTTTTCCTAACAGAATTTTAT;SOR=1.092;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=277;TCF=118;TCR=159;TR=277;WE=46831068;WS=46831046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,311:1.00:311
chr6	46832741	rs529201	T	C	4048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=48;PP=2316;ReadPosRankSum=1.328;SC=GTCCCTGCCCTGACTATAACA;SOR=0.582;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=135;TCF=87;TCR=48;TR=134;WE=46832749;WS=46832731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,148:0.99:149
chr6	46834685	rs586024	G	A	6286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=132;NR=80;PP=2965;SC=TGAGGAACCCGTATGGAAAGT;SOR=1.228;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=212;TCF=132;TCR=80;TR=212;WE=46834693;WS=46834675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr6	46834906	rs5875987	TG	T	931.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=19;PP=757;SC=TGAGATGGAATGGAAATAATC;SOR=4.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=19;WE=46834914;WS=46834896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr6	46836995	rs515866	T	C	151.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=5;PP=116;SC=TTGCTGCTCCTGGGCTTTACT;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=46837003;WS=46836985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	46838659	rs10668775	T	TTG	760.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=518;SC=ACACAACTCTTTGTTAAAACT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=12;WE=46838667;WS=46838649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr6	46856100	rs678312	G	A	6148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=111;NR=92;PP=2965;SC=TCAAAATGTCGGTAATTTGGT;SOR=0.919;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=203;TCF=111;TCR=92;TR=203;WE=46856108;WS=46856090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr6	46856263	rs677439	G	A	4267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=83;PP=2897;SC=AGCACATGAAGGCTGAGAGAA;SOR=1.171;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=142;TCF=59;TCR=83;TR=142;WE=46856271;WS=46856253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr6	46867717	rs220702	C	T	3035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=24;PP=1836;SC=GCAACACATACCATTTGAGTC;SOR=1.959;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=96;TCF=72;TCR=24;TR=96;WE=46867725;WS=46867707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr6	47445927	rs9349406	T	A	1831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=47;NR=16;PP=1222;SC=GAGCCACCACTGGAGGAGGAG;SOR=2.129;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=64;TCF=47;TCR=17;TR=63;WE=47445935;WS=47445917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr6	47512590	rs6916578	C	T	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.520;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.35;ReadPosRankSum=-0.566;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr6	47522357	rs9473132	G	A	2382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.048;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=39;PP=1296;ReadPosRankSum=-0.625;SC=AGTTGTTTTTGCTTTTGAATT;SOR=0.438;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=179;TCF=118;TCR=61;TR=100;WE=47522365;WS=47522347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,114:0.56:203
chr6	47549883	rs2275446	T	C	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.65;ReadPosRankSum=-0.922;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
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chr6	47577064	rs9395287	G	A	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.209;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=14;PP=327;ReadPosRankSum=0.808;SC=CTTTTCTCCTGTGAGTACTAC;SOR=0.928;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=36;TCF=15;TCR=21;TR=23;WE=47577072;WS=47577054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,25:0.60:42
chr6	47624239	rs1485784	A	G	1827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.613;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=28;PP=1100;ReadPosRankSum=1.500;SC=CTGACTGCCTATGGGAACCGC;SOR=0.785;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=138;TCF=88;TCR=50;TR=75;WE=47624247;WS=47624229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,83:0.54:154
chr6	47624299	rs9369730	A	G	3057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.337;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=68;PP=1808;ReadPosRankSum=0.092;SC=ACTCTCATCCATACAAGAGCC;SOR=0.598;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=283;TCF=158;TCR=125;TR=144;WE=47624307;WS=47624289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,158:0.50:316
chr6	47626685	rs6935668	C	T	1125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.767;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=14;PP=667;ReadPosRankSum=0.446;SC=TCCCGATGTACGATTGAAGCT;SOR=0.950;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=88;TCF=61;TCR=27;TR=49;WE=47626693;WS=47626675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,52:0.55:94
chr6	47646748	rs13212023	T	C	1470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=29;PP=817;ReadPosRankSum=0.391;SC=TACAGACTACTCCCAGTGTAC;SOR=0.680;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=153;TCF=87;TCR=66;TR=67;WE=47646756;WS=47646738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,78:0.45:174
chr6	47649265	rs17541107	T	A	6899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=118;NR=106;PP=2965;SC=TGGGAGAGTGTTGATCAGCAG;SOR=0.750;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=224;TCF=118;TCR=106;TR=224;WE=47649273;WS=47649255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr6	47649849	rs184516434	T	G	1487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.191;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=28;PP=981;ReadPosRankSum=0.305;SC=ACAAGGGATGTGTGGCAGCCA;SOR=0.949;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=68;TCR=52;TR=64;WE=47649857;WS=47649839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,68:0.51:134
chr6	47658071	rs72860682	A	G	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.058;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=414;ReadPosRankSum=0.075;SC=GAAAGTGAGTATCCTATGCCA;SOR=0.307;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=53;TCF=42;TCR=11;TR=27;WE=47658079;WS=47658061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,26:0.48:54
chr6	47686101	rs6914013	T	C	2681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=59;NR=29;PP=1627;SC=TCATTACCACTACTGTTATTT;SOR=1.361;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=59;TCR=29;TR=88;WE=47686109;WS=47686091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr6	47749728	rs7741473	T	G	989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=14;PP=525;ReadPosRankSum=1.702;SC=TATGAAATGGTTCAAGCTGGC;SOR=0.693;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=91;TCF=57;TCR=34;TR=42;WE=47749736;WS=47749718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,48:0.50:96
chr6	47754498	rs1329543	A	G	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.056;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=18;PP=325;ReadPosRankSum=0.354;SC=CGCTTCACAAATCAACTTTCA;SOR=0.968;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=67;TCF=22;TCR=45;TR=26;WE=47754506;WS=47754488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,30:0.38:79
chr6	47754538	rs6900985	T	C	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=125;ReadPosRankSum=-0.696;SC=TGGGGTGCTGTCCGGCTGACA;SOR=0.446;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=9;WE=47754546;WS=47754528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
chr6	47759446	rs9463355	C	T	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.435;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=7;PP=636;ReadPosRankSum=-0.444;SC=CATGTGTCCCCGTGCTTTAGG;SOR=1.213;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=66;TCF=48;TCR=18;TR=34;WE=47759454;WS=47759436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,38:0.51:74
chr6	47762938	rs28625759	C	T	1041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.797;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=19;PP=759;ReadPosRankSum=-0.016;SC=AGATTACATCCGGGTAATGCT;SOR=1.247;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=116;TCF=73;TCR=43;TR=53;WE=47762946;WS=47762928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,54:0.43:127
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chr6	47847401	rs2068006	A	G	3101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=69;PP=2123;ReadPosRankSum=2.584;SC=CTAGTTGGCCAGCAAAGACCA;SOR=0.707;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=247;TCF=128;TCR=119;TR=136;WE=47847409;WS=47847391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,147:0.53:275
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chr6	49421241	rs7769646	G	A	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.814;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=263;ReadPosRankSum=0.529;SC=ACATTGCTCAGAAAAAATATA;SOR=0.307;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=17;WE=49421254;WS=49421231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr6	49425521	rs2229384	C	T	815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=13;PP=529;ReadPosRankSum=0.854;SC=TACCAGTAAGCTTCTCTTTAG;SOR=0.699;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=91;TCF=58;TCR=33;TR=35;WE=49425529;WS=49425511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,40:0.39:102
chr6	49439805	rs4267943	G	A	5098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=497;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.521;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=115;NR=109;PP=2962;ReadPosRankSum=2.662;SC=CCTAAAACACGGAAAGACAGC;SOR=0.735;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=441;TCF=222;TCR=219;TR=224;WE=49439813;WS=49439795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:247,248:0.50:495
chr6	49440363	rs4348317	C	A	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=127;ReadPosRankSum=-0.508;SC=TTTAAAGTGTCTTTAATATGA;SOR=0.527;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=11;WE=49440371;WS=49440353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr6	49440614	rs4469291	A	T	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.434;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=89;ReadPosRankSum=1.857;SC=CATAATTTTTAAAAACCTGAC;SOR=0.180;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=9;WE=49440622;WS=49440604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr6	49456545	rs2501965	G	A	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=116;ReadPosRankSum=-1.372;SC=TTATGTTTACGCTATACTGTA;SOR=0.724;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=10;WE=49456553;WS=49456535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr6	49459978	rs2501968	A	G	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=3.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.96;ReadPosRankSum=-0.010;SOR=1.058;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,25:0.47:53
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chr6	49483578	rs113145900	A	ACTAT	287.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.067;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.294;NF=0;NR=6;PP=192;ReadPosRankSum=-0.569;SC=AGCTTACAACACTGTTTCACC;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=6;WE=49483586;WS=49483568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr6	49485266	rs9367358	C	A	2634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.157;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=66;PP=1658;ReadPosRankSum=0.651;SC=TTTTCAAATACAAGGTGAGGT;SOR=0.556;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=229;TCF=89;TCR=140;TR=112;WE=49485274;WS=49485256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,125:0.49:254
chr6	49485384	rs2501969	C	A	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-4.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=188;ReadPosRankSum=1.701;SC=CTATACACACCTGTATGTATA;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=10;WE=49485392;WS=49485374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr6	49494241	rs9367359	A	G	3370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=387;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.653;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=69;PP=2152;ReadPosRankSum=-1.455;SC=GAGTGTTGCCAATGCGGATCT;SOR=0.780;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=337;TCF=185;TCR=152;TR=153;WE=49494249;WS=49494231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:213,173:0.45:386
chr6	49518914	rs6919674	C	G	8518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=150;NR=138;PP=2965;SC=CTTTCAACGACAAAAGCGAAT;SOR=0.753;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=288;TCF=150;TCR=138;TR=288;WE=49518922;WS=49518904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,307:1.00:307
chr6	49660418	rs12624	A	C	2665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=26;PP=1887;SC=TACAATTTCCACTGGTATGTC;SOR=1.872;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=64;TCR=26;TR=90;WE=49660426;WS=49660408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr6	49701439	rs1864312	C	A	5505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=109;NR=81;PP=2965;ReadPosRankSum=1.820;SC=CCAACCACTGCGTTGGGAGTC;SOR=0.380;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=193;TCF=111;TCR=82;TR=190;WE=49701447;WS=49701429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,208:1.00:209
chr6	49701523	rs495335	A	G	7019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=119;NR=121;PP=2965;SC=CATGAGCTGGAGGCACTTGAC;SOR=0.771;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=242;TCF=119;TCR=123;TR=240;WE=49701531;WS=49701513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
chr6	49755030	rs28372930	G	C	147.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=4;PP=117;SC=TCTCCTCACTGTCTCCAGCAC;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=49755038;WS=49755020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	50682765	rs45599639	C	G	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.140;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=96;ReadPosRankSum=-1.088;SC=GAGAGCGGCGCCTTGGTTGCA;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=6;WE=50682773;WS=50682755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
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chr6	50683460	.	TCTCA	T	69	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=28;MQ=62.65;NF=0;NR=2;PP=69;QD=36.0;SC=TCTCTCTCTCTCTCACACACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=2;WE=50683471;WS=50683450;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:2,2:0.50:4
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chr6	51512707	rs2580009	T	C	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=79;ReadPosRankSum=-0.200;SC=AAGGAGTTTCTTCCCAAATTA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=5;WE=51512715;WS=51512697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
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chr6	51640787	rs7775050	A	G	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.171;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=221;ReadPosRankSum=-1.484;SC=GAGAAATTGCAGTATAATTTC;SOR=0.105;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=13;WE=51640795;WS=51640777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
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chr6	51732628	rs9382044	G	A	2193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.544;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=31;PP=1256;ReadPosRankSum=0.875;SC=CATGCCCATCGGCAAGCTAAA;SOR=0.753;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=176;TCF=113;TCR=63;TR=91;WE=51732643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,103:0.54:190
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chr6	51947237	rs9474143	G	A	6166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=100;NR=108;PP=2965;SC=CAGGAAAGACGTCACAGGGAA;SOR=0.890;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=208;TCF=100;TCR=108;TR=208;WE=51947245;WS=51947227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
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chr6	52109408	rs3215541	GT	G	53.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.254;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.13;ReadPosRankSum=2.091;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
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chr6	52144081	rs2073036	T	C	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.084;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=89;ReadPosRankSum=-0.207;SC=CTCTGGAATATGGCAAACTGG;SOR=3.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=6;WE=52144089;WS=52144071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr6	52268008	rs3748066	T	G	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=338;ReadPosRankSum=-1.302;SC=TGCGGGCCGCTGCCATGACGA;SOR=0.680;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=52;TCF=36;TCR=16;TR=26;WE=52268016;WS=52267998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,32:0.54:59
chr6	52268890	rs17591381	G	A	2549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.898;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=57;PP=1519;ReadPosRankSum=-0.553;SC=CCATCTGTACGCTCTCCCAGC;SOR=0.632;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=264;TCF=137;TCR=127;TR=120;WE=52268898;WS=52268874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,130:0.45:287
chr6	52269046	rs3799274	C	G	2243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.162;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=49;PP=1543;ReadPosRankSum=0.700;SC=GGCACAAAGTCAAGGCCAGAC;SOR=0.672;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=219;TCF=119;TCR=100;TR=102;WE=52269054;WS=52269036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,107:0.44:245
chr6	52288586	rs62407871	G	C	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.017;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=105;ReadPosRankSum=0.233;SC=TTATAGGCACGAGCCACCATG;SOR=1.721;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=7;WE=52288594;WS=52288576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr6	52303291	rs3804506	C	T	3589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=372;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=76;PP=2126;ReadPosRankSum=3.126;SC=CAAGAATGACCGGGGTGACCA;SOR=0.676;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=336;TCF=173;TCR=163;TR=157;WE=52303299;WS=52303281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:196,172:0.47:368
chr6	52355206	rs2273120	T	C	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.582;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=353;ReadPosRankSum=0.719;SC=ATCATTCTTTTCTAAAGGCAA;SOR=1.426;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=39;TCF=7;TCR=32;TR=18;WE=52355214;WS=52355196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,17:0.44:39
chr6	52387719	rs17664241	T	C	1275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=31;PP=864;ReadPosRankSum=-0.822;SC=GCCTTTACATTTCCCAGTCCT;SOR=0.640;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=100;TCF=42;TCR=58;TR=53;WE=52387727;WS=52387709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,58:0.51:113
chr6	52541811	rs13211066	G	A	1559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=2.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.804;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=12;PP=907;ReadPosRankSum=-0.306;SC=CCATATAAGCGTATCATTTTT;SOR=0.820;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=98;TCF=73;TCR=25;TR=56;WE=52541819;WS=52541801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,67:0.57:117
chr6	52546789	rs2281484	C	T	1093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.797;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=33;PP=753;ReadPosRankSum=-0.459;SC=GCTAGATATACTAGAACATAT;SOR=1.897;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=66;TCF=16;TCR=50;TR=39;WE=52546797;WS=52546779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,44:0.61:72
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chr6	52617731	rs2180314	C	G	3055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.809;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=77;PP=1864;ReadPosRankSum=-0.301;SC=CTCAGGTTGACTAAAGGGCAG;SOR=0.753;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=322;TCF=147;TCR=175;TR=137;WE=52617739;WS=52617721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:201,154:0.43:355
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chr6	52622814	rs2254050	C	T	1133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=32;PP=875;SC=ATAATTGAAACGATAGAATCA;SOR=4.921;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=34;WE=52622822;WS=52622804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr6	52657552	rs4715326	C	T	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=7;PP=397;ReadPosRankSum=-0.971;SC=CACTGAAGGCCTGGAGAAGAC;SOR=0.749;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=39;TCR=16;TR=24;WE=52657560;WS=52657542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,26:0.43:60
chr6	52658962	rs1051775	T	C	3763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=0.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.396;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=78;PP=2395;ReadPosRankSum=3.250;SC=TTATTTTCTCTTTGATCAAGG;SOR=0.652;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=293;TCF=148;TCR=145;TR=155;WE=52658970;WS=52658952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,177:0.53:335
chr6	52661253	rs70977384	CTATATATATATATATATATA	C	511.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.64;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr6	52662263	rs2397106	C	T	2529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=26;PP=1824;SC=TAACCACTTTCTCCCTCTGCA;SOR=1.900;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=61;TCR=26;TR=87;WE=52662271;WS=52662253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr6	52697601	rs55815585	T	G	612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.579;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=11;PP=437;ReadPosRankSum=-0.945;SC=GGCCCAGATATGAGATCCCAA;SOR=0.307;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=76;TCF=52;TCR=24;TR=30;WE=52697609;WS=52697591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,31:0.37:83
chr6	52697825	rs4715345	A	C	6931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.29;QD=42.53;SOR=0.921;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr6	52697834	rs4715346	C	A	6626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.03;QD=44.47;SOR=1.082;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr6	52701143	rs2397118	C	T	3684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=49;PP=2256;ReadPosRankSum=0.529;SC=ACCATTGGTACTTGCTGGAAC;SOR=1.334;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=138;TCF=88;TCR=50;TR=136;WE=52701151;WS=52701133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,145:0.99:147
chr6	52702324	rs4715350	T	C	8482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=121;NR=149;PP=2965;SC=TACTAGAAACTCTCATCAGAG;SOR=0.934;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=270;TCF=121;TCR=149;TR=270;WE=52702332;WS=52702314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,312:1.00:312
chr6	52843131	rs367836	G	T	955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=0;PP=637;SC=AGATGATCTCGTTGACACAAA;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=52843139;WS=52843121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr6	52843477	rs375887	A	G	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=189;ReadPosRankSum=-0.169;SC=GCCCACCAAAATTTGTTCAAT;SOR=0.914;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=10;WE=52843485;WS=52843467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr6	52847551	rs316133	G	C	5656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=114;PP=2965;SC=CATGGAGAGAGTGATGAGGCT;SOR=1.428;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=181;TCF=67;TCR=114;TR=181;WE=52847559;WS=52847541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr6	52849146	rs316128	G	T	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=155;ReadPosRankSum=-1.144;SC=TTAGCGCTTAGGTTAGTTCAA;SOR=0.610;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=10;WE=52849154;WS=52849136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr6	52849230	rs4986947	G	A	1385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=19;PP=824;ReadPosRankSum=-1.125;SC=TGGTTTGGTTGCTCTGTGTAT;SOR=0.652;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=135;TCF=90;TCR=45;TR=57;WE=52849238;WS=52849220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,68:0.43:160
chr6	52849325	rs1802061	C	T	3241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.395;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=66;PP=1988;ReadPosRankSum=-0.019;SC=CTTCCTTTTGCTGATCATCTG;SOR=0.708;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=295;TCF=151;TCR=144;TR=146;WE=52849333;WS=52849315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,156:0.49:320
chr6	52850408	rs41273862	G	A	1749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.865;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=31;PP=999;ReadPosRankSum=0.926;SC=AGAGTTAGAAGTGATCTTTTC;SOR=0.827;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=176;TCF=94;TCR=82;TR=76;WE=52850416;WS=52850398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,87:0.43:202
chr6	52850467	rs45466496	C	T	1290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=34;PP=877;ReadPosRankSum=0.391;SC=TGAAAAGAAACGGTGGAATCA;SOR=0.736;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=132;TCF=53;TCR=79;TR=56;WE=52850475;WS=52850457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,61:0.42:146
chr6	52850534	rs17615213	G	A	595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=21;PP=467;ReadPosRankSum=-0.646;SC=ACTTCATTCAGGAGAGCAGAT;SOR=0.728;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=41;TCF=7;TCR=34;TR=25;WE=52850542;WS=52850524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,25:0.57:44
chr6	52878637	rs2297211	T	C	1247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.477;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=31;PP=758;ReadPosRankSum=-0.734;SC=GCTTGGCTGGTGGCTGGGCAG;SOR=0.847;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=122;TCF=64;TCR=58;TR=58;WE=52878645;WS=52878627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,62:0.47:133
chr6	52938468	rs5876299	AT	A	254.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.6227;FS=2.602;HP=13;HapScore=4;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=1.321;NF=0;NR=17;PP=204;ReadPosRankSum=0.332;SC=AACAAATTACATTTTTTTTTT;SOR=2.049;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=17;WE=52938477;WS=52938458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,16:0.80:20
chr6	52943841	rs35757290	TA	T	1467.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=33;PP=1389;SC=AGAAATTTTTTAATTAGGGAA;SOR=3.056;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=1;TCR=37;TR=34;WE=52943849;WS=52943831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr6	52958479	rs2816350	A	G	854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=26;PP=758;SC=GCAATCATTCAGGGTCTTAGG;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=27;WE=52958487;WS=52958469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr6	52962715	rs2744455	C	T	512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.99;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr6	52963071	rs2876	A	G	6154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=110;PP=2965;SC=GCATGGCATAATGTTTTTGCA;SOR=1.005;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=201;TCF=91;TCR=110;TR=201;WE=52963079;WS=52963061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr6	52998788	rs2816346	G	A	414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=0;PP=217;SC=GCCCTTGGGCGGTGCTGGGAC;SOR=2.448;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=52998796;WS=52998778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr6	52998834	rs2816345	C	T	1238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=6;PP=665;SC=CTGAGGGATGCCAGCTTTTTT;SOR=2.409;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=34;WE=52998842;WS=52998824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr6	52998856	rs2518573	T	G	1895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=11;PP=1090;SC=CTGGTGCCACTAAGCTCTACT;SOR=2.082;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=44;TCR=11;TR=55;WE=52998864;WS=52998846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
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chr6	53134104	rs3830806	C	CACAG	3257.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.786;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=27;PP=1880;ReadPosRankSum=-1.221;SC=ACCAAATGACCACAGTTTTCT;SOR=0.823;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=101;TCF=21;TCR=80;TR=35;WE=53134112;WS=53134094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,86:0.45:191
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chr6	53213855	rs45536535	C	A	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=23;PP=514;ReadPosRankSum=-0.260;SC=TGATGTCATGCGGCCCGGGAG;SOR=0.749;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=63;TCF=19;TCR=44;TR=32;WE=53213863;WS=53213845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,32:0.48:66
chr6	53363784	rs17885800	C	T	881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.11;MQRankSum=1.094;QD=8.91;ReadPosRankSum=0.877;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,46:0.46:99
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chr6	53365019	rs661346	G	C	7233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=118;NR=129;PP=2965;SC=CACAGTGAGGGGTACTGTACA;SOR=0.825;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=247;TCF=118;TCR=129;TR=247;WE=53365027;WS=53365009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,273:1.00:273
chr6	53370107	rs661603	T	C	1536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=9;PP=1061;SC=CAAATGAAATTAGGTGGGAAA;SOR=2.970;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=36;TCR=9;TR=45;WE=53370115;WS=53370097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr6	53370395	rs524553	C	T	601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=408;ReadPosRankSum=0.131;SC=CAAGCCATCTCCTAATTCCCC;SOR=0.671;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=9;TCR=45;TR=23;WE=53370403;WS=53370385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,25:0.45:56
chr6	53373624	rs3830795	G	GCTCCAC	715.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=858;SC=CCCATACAGAGCACATGTACC;SOR=4.294;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=12;WE=53373632;WS=53373614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr6	53378861	rs11385177	A	AT	710.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=0;PP=756;SC=ATATAACTTCATGTTTTTCAG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=17;WE=53378869;WS=53378853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr6	53379405	rs3736729	A	C	948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=27;PP=785;SC=CAAATTAGTTATCTAAGACAA;SOR=4.479;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=30;WE=53379413;WS=53379395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr6	53385475	rs2100375	C	T	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=131;ReadPosRankSum=-1.317;SC=CCATCTGTAACGTATGAGGAT;SOR=0.317;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=9;WE=53385483;WS=53385471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr6	53387242	rs2066508	C	A	3132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=407;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.526;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=67;PP=1905;ReadPosRankSum=-0.221;SC=CCTTCTCTTGCAGAGTTTCAA;SOR=0.735;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=363;TCF=193;TCR=170;TR=145;WE=53387250;WS=53387232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:244,162:0.40:406
chr6	53516876	rs6928338	T	G	6777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=121;NR=102;PP=2965;SC=AGGCGTTGGCTATGTAGCCTC;SOR=0.701;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=223;TCF=121;TCR=102;TR=223;WE=53516892;WS=53516866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr6	53519062	rs10948758	A	G	7181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=123;PP=2965;SC=TCTCTATACAAGATGTCTCTG;SOR=0.950;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=227;TCF=104;TCR=123;TR=227;WE=53519070;WS=53519052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr6	53519605	rs3799260	C	T	4037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=62;PP=2467;SC=CACATCTTTACAAGAGTATGG;SOR=0.749;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=130;TCF=68;TCR=62;TR=130;WE=53519613;WS=53519595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr6	53519857	rs12210809	G	A	7335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=119;NR=131;PP=2965;SC=AAGTCACATAGGAAGTTCTCC;SOR=0.868;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=250;TCF=119;TCR=131;TR=250;WE=53519865;WS=53519847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,270:1.00:270
chr6	53520088	rs2038939	T	C	1772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=40;PP=1196;SC=AATACACTGTTACAGGCAAGA;SOR=1.647;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=59;TCF=18;TCR=41;TR=58;WE=53520096;WS=53520078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr6	53520124	rs2038940	A	G	630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=18;PP=524;SC=AAAAAAAAAAACATGGTTTTG;SOR=3.816;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=20;WE=53520132;WS=53520114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr6	53707098	rs4286781	C	T	2518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=57;PP=1636;SC=AATATAGCTACGAGTGAGAAC;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=25;TCR=57;TR=82;WE=53707106;WS=53707088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr6	53762293	rs71775183	GA	G	229.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.858;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=273;ReadPosRankSum=0.785;SC=GGCACATTTGGAAAAAACATA;SOR=3.312;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=11;WE=53762301;WS=53762283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr6	53767652	rs79494319	C	T	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=242;ReadPosRankSum=-1.196;SC=CATCCCAAAACGGTCTTACAA;SOR=0.368;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=13;WE=53767660;WS=53767642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr6	53785276	rs2294789	C	A	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.198;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.472;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=52;ReadPosRankSum=-0.846;SC=TGTTTTAAAGCCAAACTTGCA;SOR=0.061;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=5;WE=53785284;WS=53785266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr6	53847528	rs9370250	G	A	2302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=26;PP=1279;SC=AATAAGAGGAGCTTGATAAAT;SOR=1.259;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=48;TCR=26;TR=74;WE=53847536;WS=53847518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
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chr6	53989441	rs76743036	C	T	4930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=405;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.104;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=98;PP=2962;ReadPosRankSum=2.050;SC=CTGAATATGTCCTTATTGTGG;SOR=0.579;SbPval=0.45;Source=Platypus;TCF=170;TR=192;WE=53989449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,221:0.55:404
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chr6	54191970	rs1848440	T	A	2253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.540;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=64;PP=1433;ReadPosRankSum=-0.580;SC=AGATGGCCGATCAAGAACAGC;SOR=0.515;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=220;TCF=90;TCR=130;TR=109;WE=54191978;WS=54191960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,116:0.47:249
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chr6	54805688	rs239798	A	C	2358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.815;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=52;PP=1518;ReadPosRankSum=-0.508;SC=TATATATATAAAACCTTGGGT;SOR=0.843;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=165;TCF=77;TCR=88;TR=93;WE=54805696;WS=54805678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,103:0.55:187
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chr6	55113411	rs3122169	C	A	1318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=18;PP=644;ReadPosRankSum=-0.517;SC=TTGTTGAGTGCCTATTCCTTT;SOR=0.757;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=111;TCF=73;TCR=38;TR=54;WE=55113419;WS=55113401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,64:0.52:123
chr6	55142337	rs2653349	A	G	1604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.795;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=43;PP=968;ReadPosRankSum=0.647;SC=GATGTTGATGATTGTGCTTTT;SOR=0.923;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=147;TCF=64;TCR=83;TR=72;WE=55142345;WS=55142327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,79:0.49:160
chr6	55196587	rs12199003	C	T	1625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.591;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=34;PP=989;ReadPosRankSum=0.579;SC=GCAATGCTTACGTGATGCAAA;SOR=0.770;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=75;TCR=63;TR=73;WE=55196595;WS=55196577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,79:0.51:155
chr6	55214808	rs34159730	C	CA	358.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=180;ReadPosRankSum=-1.305;SC=GGACTTTACTCATTTATAAAT;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=14;TCF=9;TCR=5;TR=6;WE=55214816;WS=55214798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr6	55215079	rs1032767	G	A	247.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=158;SC=ATAAAATGCAGCAAAATCATT;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=55215087;WS=55215069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
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chr6	55264362	rs6936510	T	C	699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=20;PP=584;SC=TTAAGACATATTAAATCAAGT;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=55264370;WS=55264352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
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chr6	55266722	rs12529201	C	T	1679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.54;SOR=1.727;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
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chr6	55381262	rs6459082	G	A	3761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=38;PP=2360;SC=TCTTTAAAACGATAAGAGGCC;SOR=1.508;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=123;TCF=85;TCR=38;TR=123;WE=55381270;WS=55381252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
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chr6	55623944	rs202201755	A	C	704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.11;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr6	55623946	.	A	C	704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.11;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr6	55639028	rs41271330	G	A	960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.510;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=23;PP=509;ReadPosRankSum=0.086;SC=CAGATTTTACGTTGATACTGC;SOR=0.473;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=42;TCR=52;TR=42;WE=55639036;WS=55639018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,50:0.46:108
chr6	55929347	rs2235735	T	C	3161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=65;NR=35;PP=1689;SC=TGTTATTTCATTTTTTATCAG;SOR=1.066;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=65;TCR=35;TR=100;WE=55929355;WS=55929337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr6	55935629	rs41271340	A	G	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.684;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=284;ReadPosRankSum=-0.230;SC=GGAGTTTTTTAAAAACAATTC;SOR=1.489;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=48;TCF=18;TCR=30;TR=20;WE=55935637;WS=55935619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,24:0.45:53
chr6	55966418	rs4379279	A	G	1914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=44;PP=1336;SC=AAGAACATTAAATACAAACAG;SOR=1.911;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=18;TCR=44;TR=62;WE=55966426;WS=55966408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr6	56006843	rs2076473	T	C	114.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=3;PP=88;SC=GAGAAGTTCTTCGTTTCAGAA;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=56006851;WS=56006833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr6	56044578	rs2038149	T	C	7552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=122;NR=115;PP=2965;SC=CATCTTGGGATTTGCCATCCG;SOR=0.784;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=238;TCF=122;TCR=116;TR=237;WE=56044586;WS=56044568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,274:1.00:274
chr6	56045043	rs2038150	C	A	115.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=3;PP=45;SC=TTTAAATTGTCTGTGAAATAT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=56045051;WS=56045033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	56365814	rs4283892	A	G	2898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=39;PP=1836;SC=AAATATATCCAAGAAATCTGA;SOR=1.282;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=66;TCR=39;TR=105;WE=56365822;WS=56365804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr6	56374754	rs9296849	C	A	1574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=41;PP=1194;SC=ACATTTTTTACAATTTAATGT;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=10;TCR=41;TR=51;WE=56374762;WS=56374744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr6	56381912	rs4715626	G	A	4302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=56;PP=2813;SC=TGTGGATAACGGAGAAGTGTT;SOR=1.276;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=92;TCR=56;TR=148;WE=56381920;WS=56381902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr6	56394173	rs9357922	T	C	1026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=3;PP=794;SC=CATAAAATTGTACAGAAATAA;SOR=4.112;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=31;WE=56394181;WS=56394163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr6	56395051	rs6939305	C	A	1278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=35;PP=993;SC=TCTAAGGTTACAATTTAAATC;SOR=4.514;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=37;WE=56395059;WS=56395041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr6	56417282	rs4715630	C	T	7993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=130;NR=136;PP=2965;SC=CATTGCTTGCCATGAGGGCTT;SOR=0.854;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=266;TCF=130;TCR=136;TR=266;WE=56417290;WS=56417272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,292:1.00:292
chr6	56417545	rs4715631	T	C	8939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=150;NR=147;PP=2965;SC=ACATCAGAGGTTCCCTTTGAG;SOR=0.705;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=298;TCF=150;TCR=148;TR=297;WE=56417553;WS=56417535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,326:1.00:326
chr6	56425284	rs2067543	A	G	627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.623;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=438;ReadPosRankSum=1.136;SC=CAATAATGATAGAGCATTATT;SOR=0.333;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=24;WE=56425292;WS=56425274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,27:0.63:43
chr6	56425971	rs1884286	A	G	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.337;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=222;ReadPosRankSum=0.871;SC=CACATTAAACAAAACTGTCAA;SOR=2.694;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=13;WE=56425979;WS=56425961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr6	56426931	rs9367689	C	T	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.756;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=13;PP=506;ReadPosRankSum=-0.144;SC=AAAATTAATACTCACCTTTAT;SOR=0.824;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=102;TCF=65;TCR=37;TR=41;WE=56426939;WS=56426921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,45:0.42:107
chr6	56427095	rs79573569	C	CTGAGTGTTGAAA	606.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.627;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.113;NF=0;NR=5;PP=2906;ReadPosRankSum=1.427;SC=ACAGTAATCACACATAAAACA;SOR=0.231;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=5;WE=56427103;WS=56427085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr6	56437465	rs1014309	T	C	1285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=11;PP=793;ReadPosRankSum=-0.173;SC=TTGCCAATTATAATTCTGGCA;SOR=0.776;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=70;TCR=21;TR=47;WE=56437473;WS=56437455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,54:0.53:101
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chr6	56462840	rs9370541	G	A	939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.857;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=26;PP=547;ReadPosRankSum=-0.379;SC=AATTCAGAACGTGGGCCAAGG;SOR=0.090;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=58;TCF=14;TCR=44;TR=38;WE=56462848;WS=56462830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,42:0.66:64
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chr6	56470551	rs13194995	T	A	1426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.277;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=32;PP=899;ReadPosRankSum=-0.491;SC=TTAACCTTTGTGTTTGCTAGA;SOR=0.715;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=75;TCR=66;TR=67;WE=56470559;WS=56470541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,71:0.47:152
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chr6	56471402	rs9382658	G	A	2644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.487;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=53;PP=1787;ReadPosRankSum=-0.393;SC=GCTACCAACTGGTGCCCCCTG;SOR=0.605;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=231;TCF=129;TCR=102;TR=114;WE=56471410;WS=56471392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,124:0.48:259
chr6	56471995	rs16888055	C	T	2317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.719;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=47;PP=1383;ReadPosRankSum=1.677;SC=TTTGACCTGACAACATGGTTT;SOR=0.792;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=218;TCF=116;TCR=102;TR=108;WE=56472003;WS=56471985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,113:0.50:226
chr6	56476182	rs111382742	T	TAAGTA	179.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=133;ReadPosRankSum=-0.788;SC=ATTACTATATTAATTGTGATT;SOR=1.154;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=5;WE=56476190;WS=56476172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,6:0.22:27
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chr6	56476456	rs9396226	T	A	132.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=2.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=123;ReadPosRankSum=1.823;SC=GTATTTTTTTTAAAAAAAAGA;SOR=0.473;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=7;WE=56476464;WS=56476446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr6	56482704	rs9396228	A	C	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=319;ReadPosRankSum=0.153;SC=TGTTTTAAAAATTTAGTCTAG;SOR=0.579;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=19;WE=56482712;WS=56482694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,21:0.52:40
chr6	56482801	rs6459166	C	G	1679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=29;PP=1066;ReadPosRankSum=-0.814;SC=GGTGTCAAAACCTTCACCAGT;SOR=0.660;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=170;TCF=106;TCR=64;TR=77;WE=56482809;WS=56482791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,81:0.44:183
chr6	56484758	rs2230862	C	T	2702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.678;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=60;PP=1853;ReadPosRankSum=-0.076;SC=CTGCTTTCTGCTTGTCATGTT;SOR=0.622;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=256;TCF=128;TCR=128;TR=128;WE=56484766;WS=56484748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,131:0.49:266
chr6	56496649	rs10456737	A	C	851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.819;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=10;PP=489;ReadPosRankSum=-1.990;SC=TAAGAGAGTTAGTTTTTTTCC;SOR=0.823;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=96;TCF=71;TCR=25;TR=37;WE=56496657;WS=56496639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,41:0.38:108
chr6	56507135	rs1024195	T	C	3455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=71;NR=49;PP=2171;SC=AAACATTATGTAAAAGTTTTA;SOR=1.127;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=120;TCF=71;TCR=49;TR=120;WE=56507143;WS=56507125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr6	56818706	rs986245	T	C	742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=4;NR=21;PP=514;SC=AGACCAGGGTTGGGAAAGCAC;SOR=3.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=25;WE=56818714;WS=56818696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr6	56873069	rs6925819	T	C	5509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=97;NR=84;PP=2607;SC=CGGGTCCTGGTGCTAGGAATC;SOR=0.702;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=181;TCF=97;TCR=84;TR=181;WE=56873077;WS=56873059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr6	56917520	rs36113897	T	C	478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.160;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=8;PP=278;ReadPosRankSum=-0.575;SC=ACAGGGTGATTTTTTGCATTT;SOR=1.022;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=65;TCF=41;TCR=24;TR=24;WE=56917528;WS=56917510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,25:0.37:68
chr6	56964127	rs13206250	A	G	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=2.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.038;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=411;ReadPosRankSum=-1.862;SC=CTCTACTTTGAATGAGATTAT;SOR=0.152;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=18;WE=56964135;WS=56964117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr6	57191021	rs11381745	A	AG	317.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=376;SC=CTAGAAGAAAAGGACTCCTTA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=57191029;WS=57191011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	57244672	rs5011404	G	A	1125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.590;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=14;PP=758;ReadPosRankSum=0.488;SC=TCAAATTTTTGTAACAGCTTA;SOR=1.283;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=85;TCF=58;TCR=27;TR=50;WE=57244680;WS=57244662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,52:0.57:92
chr6	57244780	rs5011403	G	A	2025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.557;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=50;PP=1314;ReadPosRankSum=-0.246;SC=GTTGGGGTTCGAGTCCATTTA;SOR=0.887;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=167;TCF=80;TCR=87;TR=90;WE=57244788;WS=57244770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,95:0.52:183
chr6	57244830	rs5011402	T	A	1089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.713;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=32;PP=785;ReadPosRankSum=0.901;SC=TAGGTTTTGTTAAATATGTCG;SOR=1.189;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=108;TCF=48;TCR=60;TR=50;WE=57244838;WS=57244820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,52:0.43:121
chr6	57244893	rs5011401	T	C	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.456;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=220;ReadPosRankSum=2.056;SC=CCTCTCATCATCACAGCTACT;SOR=1.105;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=37;TCF=10;TCR=27;TR=14;WE=57244901;WS=57244883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,14:0.35:40
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chr6	57246815	rs6936571	T	C	3185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=442;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.159;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.304;NF=88;NR=53;PP=2151;ReadPosRankSum=-1.426;SC=TTGCCTGTTTTACTCTTAATT;SOR=0.832;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=398;TCF=236;TCR=162;TR=141;WE=57246823;WS=57246805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:277,164:0.37:441
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chr6	57246884	rs6913546	A	G	5083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=596;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.104;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.129;NF=121;NR=122;PP=2962;ReadPosRankSum=1.295;SC=TATTTGGAAGATGGCTTTGCT;SOR=0.601;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=554;TCF=262;TCR=292;TR=243;WE=57246892;WS=57246874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:333,263:0.44:596
chr6	57246969	rs4256440	G	A	2502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.521;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=70;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.415;SC=CTTTGGCAGTGAGTATTTTAC;SOR=0.633;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=224;TCF=70;TCR=154;TR=104;WE=57246990;WS=57246959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,113:0.47:238
chr6	57246982	rs4585567	G	T	1851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.260;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=54;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.069;SC=TATTTTACTTGATTTCTGTAT;SOR=0.572;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=179;TCF=54;TCR=125;TR=80;WE=57246990;WS=57246959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,88:0.46:192
chr6	57247022	rs4382263	C	T	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.521;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=23;PP=447;ReadPosRankSum=-0.063;SC=AGTTATATACCCCTGGTAGTT;SOR=1.044;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=70;TCF=7;TCR=63;TR=25;WE=57247030;WS=57247012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,26:0.35:74
chr6	57254789	rs2397264	A	G	1192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-6.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.726;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=13;PP=812;ReadPosRankSum=-0.229;SC=CAGCAAATCCATCAATATGCA;SOR=0.311;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=108;TCF=88;TCR=20;TR=57;WE=57254797;WS=57254779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,59:0.51:116
chr6	57254811	rs941685	A	G	6197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=138;NR=60;PP=2962;SC=GTAGCATATCACGATATGCAA;SOR=1.710;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=198;TCF=138;TCR=60;TR=198;WE=57254847;WS=57254801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr6	57254825	rs10456742	T	C	1239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FS=5.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.25;ReadPosRankSum=-0.072;SOR=0.424;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:214,78:0.27:292
chr6	57254839	rs2397265	T	C	915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FS=1.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.03;MQRankSum=-0.505;QD=2.61;ReadPosRankSum=-1.031;SOR=0.766;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:278,73:0.21:351
chr6	57254927	rs2397266	A	G	3891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=443;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.531;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.02;MQRankSum=1.143;NF=63;NR=92;PP=2129;ReadPosRankSum=0.682;SC=AAGCCATGAGACTATTAGGAT;SOR=0.778;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=388;TCF=166;TCR=222;TR=155;WE=57254935;WS=57254917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:250,193:0.44:443
chr6	57254950	rs5876554	A	AT	4630.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.005;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.199;NF=4;NR=56;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.647;SC=TGCAAAAGTAATGTGGTTTTT;SOR=0.829;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=183;TCF=9;TCR=174;TR=60;WE=57254963;WS=57254940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:179,126:0.41:305
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chr6	57254986	rs2397267	G	A	1058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.107;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=36;PP=652;ReadPosRankSum=-1.405;SC=GGCAAAGACTGCAATTACTTT;SOR=1.228;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=134;TCF=30;TCR=104;TR=42;WE=57254994;WS=57254976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,50:0.34:148
chr6	57255001	rs2894843	C	A	627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.670;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=26;PP=1250;ReadPosRankSum=-0.966;SC=TACTTTTGCGCCAACCTAATA;SOR=1.802;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=96;TCF=19;TCR=77;TR=29;WE=57255024;WS=57254991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,30:0.29:102
chr6	57255015	rs2894844	G	C	586.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.785;HP=9;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=1250;ReadPosRankSum=-1.724;SC=CCTAATAACAGAAAAAAAATC;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=57;TCF=6;TCR=51;TR=15;WE=57255024;WS=57254991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,18:0.30:61
chr6	57255016	rs5876555	A	AC	577.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.826;HP=7;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=1027;ReadPosRankSum=-1.912;SC=CTAATAACAGAAAAAAAATCA;SOR=2.633;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=0;TCR=49;TR=15;WE=57255024;WS=57254991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,18:0.30:60
chr6	57255032	rs7769711	C	G	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=147;ReadPosRankSum=0.158;SC=AATCATTTTTCGGGGGAAAAT;SOR=0.661;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=10;WE=57255040;WS=57255022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,9:0.22:41
chr6	57372104	rs2024986	T	C	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=615;ReadPosRankSum=-0.885;SC=ACCATGTAGCTAGCTTTGATC;SOR=0.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=43;TCR=1;TR=11;WE=57372134;WS=57372099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,11:0.24:45
chr6	57372116	rs9382768	T	C	1027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=4.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.56;ReadPosRankSum=-1.291;SOR=2.513;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,31:0.62:50
chr6	57372126	rs9396314	C	G	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=5.354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.76;ReadPosRankSum=-1.830;SOR=0.120;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,23:0.36:64
chr6	57372199	rs9382769	T	C	5560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=381;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.841;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=149;NR=80;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.008;SC=GCCTCCCTATTTGCCCTTCAG;SOR=0.635;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=362;TCF=236;TCR=126;TR=229;WE=57372207;WS=57372189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,242:0.64:378
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chr6	57372374	rs68090917	CT	C	2630.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=361;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.715;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.06;MQRankSum=2.233;NF=9;NR=63;PP=1491;ReadPosRankSum=-0.555;SC=AAGGCACAGCCTTGTTATGCT;SOR=0.548;SbPval=0.05;Source=Platypus;TC=228;TCF=14;TCR=214;TR=72;WE=57372382;WS=57372351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:245,99:0.29:344
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chr6	57398117	rs139574925	T	TA	1168.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.940;HP=1;HapScore=1;MGOF=41;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=33;PP=922;ReadPosRankSum=-3.110;SC=AAAACTCTACTGTTTTTTCTT;SOR=0.968;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=154;TCF=76;TCR=78;TR=67;WE=57398126;WS=57398107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:219,48:0.18:267
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chr6	57398154	rs80081867	T	C	9606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=455;ExcessHet=3.0103;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.11;ReadPosRankSum=-0.379;SOR=0.996;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:210,245:0.54:455
chr6	57398157	rs9476080	A	G	9748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=463;ExcessHet=3.0103;FS=4.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.06;ReadPosRankSum=0.373;SOR=1.027;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:218,245:0.53:463
chr6	57398163	rs9476081	A	G	9946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=491;ExcessHet=3.0103;FS=2.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.26;ReadPosRankSum=0.030;SOR=0.923;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:229,262:0.53:491
chr6	57398186	rs147954160	G	GA	5283.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=572;ExcessHet=3.0103;FS=1.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.06;MQRankSum=2.705;QD=9.52;ReadPosRankSum=-1.943;SOR=0.647;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:393,162:0.29:555
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chr6	57398207	rs71214816	G	T	5778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=571;ExcessHet=3.0103;FS=1.965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.06;MQRankSum=2.771;QD=10.12;ReadPosRankSum=-0.222;SOR=0.883;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:410,161:0.28:571
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chr6	57415121	rs7741368	G	A	1852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=4.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.545;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=11;PP=796;ReadPosRankSum=2.061;SC=TGCTGTTGTCGTAAAGACAGA;SOR=0.840;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=144;TCF=109;TCR=35;TR=50;WE=57415129;WS=57415111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,52:0.34:155
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chr6	57415231	rs7761558	T	C	5487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=526;ExcessHet=3.0103;FS=2.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.02;MQRankSum=1.501;QD=10.45;ReadPosRankSum=-1.462;SOR=0.754;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:363,162:0.31:525
chr6	57415309	rs7741689	G	C	3318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.547;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=84;PP=2187;ReadPosRankSum=0.620;SC=AAAGATAAACGAAAGTTCTAA;SOR=0.743;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=198;TCF=63;TCR=135;TR=121;WE=57415317;WS=57415299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,138:0.62:221
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chr6	57433425	rs2397541	C	T	810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.447;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.916;NF=26;NR=8;PP=554;ReadPosRankSum=0.465;SC=GTCCCATGGCCATACCTTTAC;SOR=0.271;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=65;TCF=52;TCR=13;TR=34;WE=57433433;WS=57433415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,37:0.56:66
chr6	57433455	rs2151625	C	G	685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=1.919;NF=26;NR=15;PP=444;ReadPosRankSum=-2.190;SC=TCATCCAAACCAAACATTAGA;SOR=0.740;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=125;TCF=78;TCR=47;TR=41;WE=57433463;WS=57433445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,40:0.36:112
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chr6	57433616	rs518037	T	C	1426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.922;NF=15;NR=40;PP=987;ReadPosRankSum=-0.303;SC=GATGGCTTGATTTAAAATTTT;SOR=0.695;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=101;TCF=28;TCR=73;TR=55;WE=57433624;WS=57433606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,60:0.55:109
chr6	57433669	rs4464799	A	G	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=4.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=109;ReadPosRankSum=1.876;SC=CACTTTTACTACAGTGTTCAA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=8;WE=57433677;WS=57433659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,8:0.22:36
chr6	57457703	rs111977760	A	AG	169.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=2.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.53;MQRankSum=4.006;QD=8.08;ReadPosRankSum=-1.522;SOR=1.730;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr6	57457704	rs5008381	A	T	178.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=2.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.53;MQRankSum=4.006;QD=8.51;ReadPosRankSum=-1.364;SOR=1.730;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr6	57457704	.	AT	GT	396	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=13;MMLQ=27;MQ=64.64;NF=7,8;NR=0,0;PP=367,396;QD=61.549394353;SC=CTGAGCTTGAATTCTGTTAGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=7,8;WE=57457712;WS=57457694;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr6	57457704	.	AT	ATT	396	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=13;MMLQ=27;MQ=64.64;NF=7,8;NR=0,0;PP=367,396;QD=61.549394353;SC=CTGAGCTTGAATTCTGTTAGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=7,8;WE=57457712;WS=57457694;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
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chr6	57472488	rs9382820	C	T	1538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=50;PP=2481;ReadPosRankSum=1.817;SC=AGGCCTTAGACAGATCTCTCG;SOR=0.660;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=227;TCF=79;TCR=148;TR=79;WE=57472503;WS=57472466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,85:0.34:249
chr6	57472495	rs62400219	C	G	1161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FS=2.679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.30;ReadPosRankSum=-1.531;SOR=0.513;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:152,67:0.31:219
chr6	57472533	rs9367767	T	C	2020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.05;ReadPosRankSum=0.587;SOR=0.953;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,66:0.69:96
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chr6	57498894	rs3846934	G	A	1412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.856;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=17;PP=894;ReadPosRankSum=-1.438;SC=AAGGCCAACAGCTGTGAGCTA;SOR=0.869;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=63;TCR=27;TR=56;WE=57498902;WS=57498884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,60:0.62:96
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chr6	57499042	rs5876654	A	AT	1009.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.392;NF=2;NR=26;PP=554;ReadPosRankSum=-0.842;SC=CAATGTAAGTATTTTTTTAAC;SOR=0.726;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=83;TCF=6;TCR=77;TR=28;WE=57499050;WS=57499032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,49:0.35:142
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chr6	57512510	rs4294007	T	G	14412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=589;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.702;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=278;NR=176;PP=2962;ReadPosRankSum=1.850;SC=ATCCTAATCATTTCTTTTGTG;SOR=0.790;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=551;TCF=336;TCR=215;TR=454;WE=57512518;WS=57512500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,480:0.81:589
chr6	57512529	rs5001076	C	A	3788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=721;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.577;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=123;NR=82;PP=2585;ReadPosRankSum=-1.236;SC=TGAGAGCCAACGTATTCTAAA;SOR=0.767;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=676;TCF=396;TCR=280;TR=205;WE=57512537;WS=57512519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:503,217:0.30:720
chr6	57512565	rs4294008	T	C	14101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=981;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.152;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=326;NR=273;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.112;SC=AAAGAAGGAATCTATCCAACC;SOR=0.804;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=939;TCF=502;TCR=437;TR=599;WE=57512573;WS=57512555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:359,621:0.63:980
chr6	57512678	rs4398719	G	A	8808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=559;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.239;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=118;NR=235;PP=2962;ReadPosRankSum=0.745;SC=AAGGACTAGAGGATTACTTTA;SOR=0.831;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=530;TCF=182;TCR=348;TR=353;WE=57512686;WS=57512668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:191,367:0.66:558
chr6	57512711	rs5001484	G	C	2626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FS=2.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.14;ReadPosRankSum=0.858;SOR=0.907;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:182,77:0.30:259
chr6	57512718	rs5001483	T	A	2555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FS=1.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.52;ReadPosRankSum=0.961;SOR=0.810;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:170,73:0.30:243
chr6	57512775	rs7773110	T	G	1312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=3.906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.794;QD=22.25;ReadPosRankSum=0.356;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,35:0.59:59
chr6	57512779	rs76296076	G	T	1251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=7.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.862;QD=22.35;ReadPosRankSum=1.555;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,31:0.55:56
chr6	57512783	.	T	TGTCACCAAGG	37.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.918;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.405;QD=0.77;ReadPosRankSum=0.664;SOR=0.161;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,5:0.10:49
chr6	57512785	.	TG	T	40.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.121;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.419;QD=0.89;ReadPosRankSum=-1.331;SOR=0.184;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,5:0.11:46
chr6	57512786	.	G	GTCACCAAGGCT	2308	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=45;MMLQ=28;MQ=59.93;NF=0;NR=8;PP=2308;QD=291.875;SC=GTTGCACTCTGTTGTGTAATT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=8;WE=57512794;WS=57512765;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:27,8:0.23:35
chr6	57512787	.	T	TCACCAAGGC	813.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.309;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-1.025;QD=18.08;ReadPosRankSum=1.465;SOR=2.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,21:0.47:45
chr6	57512788	.	T	TTA	829.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=3.272;ClippingRankSum=0.000;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=3.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-1.066;QD=24.40;ReadPosRankSum=-0.388;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr6	57512792	rs372064495	T	C	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=3.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-0.970;QD=17.87;ReadPosRankSum=-1.108;SOR=2.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr6	62390916	rs1204114	T	C	2519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=34;PP=1594;SC=TGGCTGACCTTTGCGGTGGTG;SOR=0.836;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=48;TCR=34;TR=82;WE=62390924;WS=62390906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr6	62407067	rs1555167	G	T	5658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=115;NR=75;PP=2965;SC=TGGATGTTCCGATTTCACAGT;SOR=1.206;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=190;TCF=115;TCR=75;TR=190;WE=62407075;WS=62407057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr6	62611356	rs67450220	ACAAAACG	A	53.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=45;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=207;SC=AAGAAACAAAACAAAACGCAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=62611370;WS=62611346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr6	62757987	rs9346001	C	T	640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=18;PP=512;SC=TATAGGTTTTCCAAACTTTAC;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=62757995;WS=62757977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr6	62887031	rs9346218	C	T	455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=13;NR=0;PP=323;SC=AATTAAAATACCGTCTTCTTT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=62887039;WS=62887021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr6	62887099	rs6921170	C	T	1694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=17;PP=858;SC=CCTTTGGATACTGCTTGACAG;SOR=1.162;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=36;TCR=17;TR=53;WE=62887107;WS=62887089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr6	63921360	rs10943599	CA	AG	371.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=1;PP=287;SC=TATGGGCAGGCAACGCGCTGA;SOR=3.056;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=6;WE=63921369;WS=63921357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	65016977	rs35395170	TGA	T	390.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.205;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=403;ReadPosRankSum=-0.483;SC=TACAGGCATCTGAGAGAGAGA;SOR=0.639;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=32;TCF=9;TCR=23;TR=12;WE=65016988;WS=65016967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,17:0.39:44
chr6	65098515	rs36133910	T	C	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.786;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=354;ReadPosRankSum=-1.547;SC=TTCTTTTTCATTTATCAATAT;SOR=1.488;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=18;WE=65098523;WS=65098505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,21:0.50:42
chr6	65098768	rs587278	A	G	1238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.488;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=26;PP=582;ReadPosRankSum=0.047;SC=GTTTTAGTATAAGTCATATAA;SOR=0.854;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=42;TCR=61;TR=44;WE=65098776;WS=65098758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,59:0.48:123
chr6	65149185	rs9353806	T	A	990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=23;PP=519;ReadPosRankSum=-0.918;SC=ATTTTGTGGATTTAAAGCCAC;SOR=0.638;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=78;TCF=35;TCR=43;TR=41;WE=65149193;WS=65149175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,47:0.55:86
chr6	65300516	rs57312007	T	G	1112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.620;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=20;PP=745;ReadPosRankSum=1.248;SC=TTTGTAAGTTTAACTCAAAAT;SOR=0.576;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=90;TCF=45;TCR=45;TR=42;WE=65300524;WS=65300506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,47:0.47:100
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chr6	65525121	rs1390272	C	T	3260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=52;PP=2081;SC=TTGCTGAAAACGTGAACTTGT;SOR=0.710;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=58;TCR=52;TR=110;WE=65525129;WS=65525111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr6	65596759	rs7743515	G	A	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.298;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=327;ReadPosRankSum=1.162;SC=GAGAAATGAGGAATAGCCATG;SOR=1.089;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=46;TCF=12;TCR=34;TR=21;WE=65596767;WS=65596749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,24:0.49:49
chr6	65611952	rs59518422	T	TATTA	569.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.202;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=4;PP=383;ReadPosRankSum=0.511;SC=GTGCTCACTTTCTTGTTGAAT;SOR=1.061;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=33;TCF=14;TCR=19;TR=9;WE=65611960;WS=65611942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,15:0.27:55
chr6	65622463	rs9294631	A	G	3485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.571;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.98;MQRankSum=-0.982;NF=79;NR=71;PP=2168;ReadPosRankSum=-2.805;SC=TAGGTCACAAAGGTTATAGCG;SOR=0.535;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=300;TCF=167;TCR=133;TR=150;WE=65622471;WS=65622453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,165:0.51:326
chr6	65622662	rs9445437	G	C	1165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=33;PP=862;ReadPosRankSum=-0.905;SC=AAAATTTTTAGAAGTGTGAAC;SOR=0.941;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=58;TCF=12;TCR=46;TR=41;WE=65622670;WS=65622652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,43:0.69:62
chr6	66005740	rs35045551	G	GA	1224.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.687;HP=10;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=1.105;NF=22;NR=17;PP=498;ReadPosRankSum=-2.320;SC=AATTTATCAGGAAAAAAAAAA;SOR=0.572;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=103;TCF=56;TCR=47;TR=39;WE=66005748;WS=66005730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,59:0.46:129
chr6	66005857	rs17411795	T	A	3930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.767;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.087;NF=80;NR=83;PP=2292;ReadPosRankSum=-1.429;SC=AGTATCTATCTCACAGATGTT;SOR=0.784;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=312;TCF=156;TCR=156;TR=163;WE=66005865;WS=66005847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,183:0.53:344
chr6	66005888	rs9342464	C	T	3032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.641;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=65;PP=1971;ReadPosRankSum=-0.408;SC=CTTTGCAGACCGCTACAGTTA;SOR=0.488;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=260;TCF=124;TCR=136;TR=129;WE=66005896;WS=66005878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,140:0.49:285
chr6	66005970	rs9345601	G	A	2388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=60;PP=1454;ReadPosRankSum=0.179;SC=AGTCAACATTGACAACACACA;SOR=0.710;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=189;TCF=78;TCR=111;TR=101;WE=66005978;WS=66005960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,112:0.53:210
chr6	66044927	rs61753610	T	C	1373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=20;PP=709;ReadPosRankSum=-0.145;SC=CTCATTTTCTTGATCATCAGT;SOR=0.656;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=113;TCF=72;TCR=41;TR=54;WE=66044935;WS=66044917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,64:0.50:127
chr6	66045077	rs1502965	C	T	1790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=38;PP=1053;SC=TATGAATTCCCATCACTTACT;SOR=1.681;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=19;TCR=38;TR=57;WE=66045085;WS=66045067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr6	66045118	rs1502964	T	C	678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=19;PP=432;SC=TGAGAGATCATGATAGATGCC;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=25;WE=66045126;WS=66045108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr6	66053835	rs1502963	T	G	146.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=0;PP=116;SC=TTTGAATATTTAAGAATCTGT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=66053843;WS=66053825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	66063248	rs9453265	G	A	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=4.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=279;ReadPosRankSum=0.619;SC=TTTATATTACGTTTTGAGATA;SOR=1.514;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=14;WE=66063256;WS=66063244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr6	66063513	rs1936439	G	A	4365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=55;NR=90;PP=2589;SC=CATACATACTGCAAAAAGGAA;SOR=1.373;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=145;TCF=55;TCR=90;TR=145;WE=66063521;WS=66063503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr6	66112409	rs974110	A	G	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.882;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=14;PP=334;ReadPosRankSum=1.808;SC=TACATGTAGCATTATTCCTCA;SOR=0.289;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=81;TCF=53;TCR=28;TR=32;WE=66112417;WS=66112399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,33:0.37:89
chr6	66115281	rs34154043	G	GAA	405.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.516;HP=11;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=2.688;NF=1;NR=19;PP=267;ReadPosRankSum=-0.718;SC=TCACACACAAGAAAAAAAAAG;SOR=1.055;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=64;TCF=3;TCR=61;TR=20;WE=66115289;WS=66115271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,20:0.26:76
chr6	68599166	rs9342670	A	G	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.27;ReadPosRankSum=0.499;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr6	68599169	rs9342671	A	T	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=31.90;ReadPosRankSum=-0.230;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,10:0.83:12
chr6	69654013	rs139383862	A	G	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=174;ReadPosRankSum=1.382;SC=TTTTCATTGTATCTTGCCTAA;SOR=1.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=10;WE=69654021;WS=69654003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr6	69666195	rs28734080	G	A	186.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=7;PP=185;SC=ATATATATATGTGTGTGTGTG;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=11;WE=69666203;WS=69666185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	69666684	rs1932618	A	G	2680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=46;NR=44;PP=1582;SC=AGAAGATGCAATGAGCAGCGA;SOR=0.754;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=90;TCF=46;TCR=44;TR=90;WE=69666692;WS=69666674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr6	69666747	rs3215965	GA	G	475.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=3;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=183;ReadPosRankSum=-0.573;SC=TTCATAACGTGAAAAAAAAAA;SOR=0.826;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=18;WE=69666755;WS=69666737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,26:0.50:52
chr6	69724069	rs1336655	G	A	835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.875;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=20;PP=516;ReadPosRankSum=0.061;SC=CTAAATTAATGGCTTGCTATT;SOR=0.495;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=72;TCF=30;TCR=42;TR=37;WE=69724077;WS=69724059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,40:0.51:78
chr6	69728522	rs2785573	C	T	67.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=3;PP=46;SC=ATATTTCTAACACTTGGTATC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=69728530;WS=69728512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
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chr6	70642660	rs2345783	C	T	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.72;ReadPosRankSum=-1.097;SOR=0.184;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
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chr6	70812273	rs11759810	A	G	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.144;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=96;ReadPosRankSum=1.046;SC=CATACTCTCTATATTCCTAAC;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=6;WE=70812281;WS=70812263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
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chr6	70852841	rs2296013	A	T	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.268;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=67;ReadPosRankSum=-0.353;SC=TCTATGCCACAAAAACTGATC;SOR=0.169;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=6;WE=70852849;WS=70852831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
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chr6	70854208	rs58591338	CAG	C	2754.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.628;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=31;PP=1496;ReadPosRankSum=-0.394;SC=GAGGAAGAGACAGAGGATCAT;SOR=0.629;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=96;TCF=25;TCR=71;TR=38;WE=70854217;WS=70854198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,74:0.42:177
chr6	70854924	rs3841703	A	AT	788.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.112;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=437;ReadPosRankSum=0.580;SC=TTTTGTTAATATTTTTCTTGC;SOR=0.925;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=14;WE=70854932;WS=70854914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,31:0.62:50
chr6	70856536	rs7762409	C	T	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.750;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=266;ReadPosRankSum=1.084;SC=TGTATTCATACTTTTTTTCTT;SOR=0.352;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=17;WE=70856544;WS=70856526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr6	70859487	rs2346211	A	T	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.034;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=167;ReadPosRankSum=0.727;SC=ACGGTGGCAAACCCTGTTGTT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=9;WE=70859495;WS=70859477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
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chr6	70873331	rs2296010	G	A	2553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.524;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=58;PP=1564;ReadPosRankSum=-0.594;SC=CTGGGGCTTGGAGTGGGAGCA;SOR=0.625;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=183;TCF=79;TCR=104;TR=102;WE=70873339;WS=70873321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,116:0.57:205
chr6	70875976	rs802174	T	G	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.263;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=263;ReadPosRankSum=0.276;SC=AAAGATAAAATTCTTCTGAAT;SOR=0.477;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=53;TCF=11;TCR=42;TR=20;WE=70875984;WS=70875966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,21:0.38:56
chr6	70877980	rs1464159	G	A	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=3.538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.30;ReadPosRankSum=-1.018;SOR=0.256;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,12:0.33:36
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chr6	70916998	rs1736	G	A	996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=1.566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.77;ReadPosRankSum=0.587;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,50:0.49:102
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chr6	70949107	rs45464198	C	T	618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.866;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=22;PP=441;ReadPosRankSum=0.533;SC=AGATTAACTCCGGCACTGCAA;SOR=0.897;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=78;TCF=31;TCR=47;TR=33;WE=70949115;WS=70949097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,33:0.38:88
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chr6	70961833	rs1135056	T	C	1332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=20;PP=768;ReadPosRankSum=-0.627;SC=AGGAAGCCCCTGGGGTCCTCG;SOR=0.695;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=87;TCF=57;TCR=30;TR=56;WE=70961841;WS=70961823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,59:0.63:93
chr6	70962039	rs2274584	C	T	2315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.79;ReadPosRankSum=-0.202;SOR=0.665;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,62:0.53:117
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chr6	70963279	rs701688	T	C	552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.721;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=368;ReadPosRankSum=-0.685;SC=AGTTCCCAAATTCTGCACAGT;SOR=0.203;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=19;WE=70963287;WS=70963269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,21:0.70:30
chr6	70965125	rs633762	A	C	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=351;ReadPosRankSum=-0.775;SC=TTAATACAAGAAAAAGTTACT;SOR=0.716;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=62;TCF=24;TCR=38;TR=26;WE=70965133;WS=70965115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,30:0.42:71
chr6	70966421	rs58271754	CA	C	112.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=3.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.02;ReadPosRankSum=0.814;SOR=1.366;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,24:0.22:111
chr6	70970299	rs2024730	C	T	867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.602;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=7;PP=602;ReadPosRankSum=0.404;SC=TATGTTTAAACGGCCAAAATT;SOR=1.225;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=64;TCF=50;TCR=14;TR=35;WE=70970307;WS=70970289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,39:0.53:73
chr6	70970501	rs12210870	A	G	739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=25;PP=481;ReadPosRankSum=0.473;SC=TAGACAATGGATATTATCATA;SOR=0.711;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=16;TCR=59;TR=32;WE=70970509;WS=70970491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,36:0.43:84
chr6	70976303	rs12195310	A	T	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.03;ReadPosRankSum=-0.390;SOR=0.202;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,6:0.23:26
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chr6	70979193	rs550675	C	T	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.885;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=9;PP=246;ReadPosRankSum=1.043;SC=AGTCCACTAGCGTTACAGACT;SOR=0.297;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=61;TCF=42;TCR=19;TR=25;WE=70979201;WS=70979183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,32:0.45:71
chr6	70990435	rs67240674	T	TC	107.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.77;ReadPosRankSum=-0.241;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr6	71137884	rs13202450	G	A	100.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=0;PP=74;SC=TAAGTACACTGAAATAATTTG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=71137892;WS=71137874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr6	71137992	rs41265349	C	T	1946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=22;PP=1084;SC=GATTTTTTCCCTTTCCTTAAC;SOR=1.209;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=65;TCF=43;TCR=22;TR=64;WE=71138000;WS=71137982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr6	71190577	rs2273210	A	G	2950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=57;NR=30;PP=1502;SC=TCGTATGACAATAATAATGTA;SOR=1.127;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=57;TCR=30;TR=87;WE=71190585;WS=71190567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr6	71232014	rs146416812	GTTTATA	G	1188.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=1;PP=749;SC=AATCATAATAGTTTATATTTA;SOR=3.767;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=14;WE=71232027;WS=71232004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr6	71236216	rs7740873	C	T	9089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=343;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=169;NR=140;PP=2965;SC=ATGGTATAAACATGCCTACTG;SOR=0.850;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=310;TCF=169;TCR=141;TR=309;WE=71236224;WS=71236206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,341:1.00:341
chr6	71236451	rs373718582	TATACACACACACACACATAC	T	589.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQ=69.42;NF=0;NR=16;PP=1045;SC=TACATATATATATACACACAC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=71236478;WS=71236441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	71243085	rs146023593	GTA	G	406.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=351;SC=TAATATAAATGTATATCCAAA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=71243094;WS=71243075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	71243352	rs9283835	A	G	787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=2;PP=515;SC=TAAAACATTGAACTTAACCAT;SOR=3.528;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=23;WE=71243360;WS=71243342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr6	71247863	rs78525529	T	C	392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=11;NR=0;PP=301;SC=AATATATTTTTGATTAGCCAA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=71247871;WS=71247856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr6	71269459	rs16869371	C	T	8366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=149;NR=125;PP=2965;SC=TGCTTCGACCCGTTCTGCAAA;SOR=0.853;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=274;TCF=149;TCR=125;TR=274;WE=71269467;WS=71269449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,307:1.00:307
chr6	71269632	rs16869373	G	A	1184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=34;PP=882;SC=TAGTATAAAAGCATTGTTAGC;SOR=4.021;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=38;WE=71269640;WS=71269622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr6	71276803	rs2293297	T	C	400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=13;PP=257;SC=GCGTGTGTCCTGGCCGTTCGG;SOR=2.712;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=71276811;WS=71276793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr6	71289189	rs1048886	A	G	6857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=120;NR=112;PP=2965;SC=CTTGTCAAACAGTCCCTTAAG;SOR=0.709;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=232;TCF=120;TCR=112;TR=232;WE=71289197;WS=71289179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr6	71298533	rs13654	A	G	151.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=5;PP=105;SC=TGTAGTTTGTATAATGTGTTT;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=71298541;WS=71298523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	71378188	rs781984	A	G	197.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=1;PP=144;SC=GGGTCTGGGCAGAGCTTAGGG;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=71378196;WS=71378186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	71482975	rs1413353	G	A	2517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=58;NR=27;PP=1371;SC=TAGAGTCCCAGCTTTGTGGAG;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=58;TCR=27;TR=85;WE=71482983;WS=71482965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr6	71665473	rs9455275	A	G	1523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.05;ReadPosRankSum=1.767;SOR=0.572;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,38:0.50:76
chr6	71665479	rs62420336	G	A	1582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.40;ReadPosRankSum=1.167;SOR=0.652;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,44:0.51:86
chr6	71665986	rs1574490	G	A	1659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=33;PP=971;ReadPosRankSum=0.109;SC=GGAGTCGGGCGCCCCCGCGGC;SOR=0.719;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=148;TCF=84;TCR=64;TR=75;WE=71665994;WS=71665976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,80:0.50:161
chr6	71666146	rs1320315	T	C	815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=23;PP=437;ReadPosRankSum=1.200;SC=GCACGCTCCCTGGCCTCTCGG;SOR=0.657;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=59;TCF=21;TCR=38;TR=35;WE=71666154;WS=71666136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,39:0.61:64
chr6	72809825	rs9360527	C	T	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.957;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=152;ReadPosRankSum=-1.471;SC=ATTTCCAGCTCTCATGAAAAA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=8;WE=72809833;WS=72809815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr6	72836421	rs2463696	A	C	2155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.29;SOR=0.961;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr6	72858416	rs151080929	GTT	G	704.76	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.37;MQRankSum=0.510;QD=26.10;ReadPosRankSum=-0.881;SOR=0.770;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,25:0.93:27
chr6	72889472	rs2249021	A	G	7805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=123;NR=125;PP=2965;SC=AGACACCCCTAAGCACAGCAG;SOR=0.767;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=248;TCF=123;TCR=125;TR=248;WE=72889480;WS=72889462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr6	72892257	rs2463730	A	G	1311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=28;PP=973;SC=ACCCGAACCTAGCTCGGTACC;SOR=1.775;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=41;WE=72892265;WS=72892247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr6	72945492	rs2807519	C	T	1736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.602;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=40;PP=1000;ReadPosRankSum=0.445;SC=CTGCATTCATCGGAGTTTCTG;SOR=0.606;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=132;TCF=55;TCR=77;TR=69;WE=72945500;WS=72945482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,80:0.48:165
chr6	72945603	rs138366781	A	ATTTTC	237.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=257;ReadPosRankSum=-0.139;SC=AAACTAATGTATTCTGACTAT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=7;WE=72945611;WS=72945593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr6	72947774	rs2807525	C	T	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=198;ReadPosRankSum=-0.039;SC=TTTTAATGCACGAATAAAGAC;SOR=0.914;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=11;WE=72947782;WS=72947764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr6	72961019	.	T	G	883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.562;ClippingRankSum=0.000;DP=315;ExcessHet=3.0103;FS=2.065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-2.540;QD=2.81;ReadPosRankSum=1.150;SOR=0.883;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:273,42:0.13:315
chr6	72961028	.	A	C	838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.391;ClippingRankSum=0.000;DP=315;ExcessHet=3.0103;FS=0.615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-2.576;QD=2.66;ReadPosRankSum=0.977;SOR=0.763;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:274,41:0.13:315
chr6	72961034	.	A	G	808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.994;ClippingRankSum=0.000;DP=314;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-2.608;QD=2.58;ReadPosRankSum=0.535;SOR=0.701;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:274,40:0.13:314
chr6	72961040	.	T	C	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=0.000;DP=302;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-2.708;QD=2.16;ReadPosRankSum=0.214;SOR=0.664;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:266,36:0.12:302
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chr6	72962352	rs9351902	A	G	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=186;ReadPosRankSum=0.428;SC=ATTAGTCTTCATAAGTTTTCA;SOR=0.760;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=13;WE=72962360;WS=72962342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
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chr6	73900562	rs12662845	A	T	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.662;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=38;ReadPosRankSum=1.010;SC=AATTTGCTTTAAACATTGATT;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=4;WE=73900570;WS=73900552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr6	73904189	rs35791353	A	G	881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.898;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=7;PP=620;ReadPosRankSum=-0.698;SC=AGTCCATAGAATCCAAGCTGG;SOR=1.348;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=61;TCF=46;TCR=15;TR=35;WE=73904197;WS=73904179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,36:0.55:66
chr6	73952326	rs142837568	T	C	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.668;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=20;PP=411;ReadPosRankSum=0.057;SC=GGGCCTAGGCTCTGTCCTTAA;SOR=1.190;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=61;TCF=13;TCR=48;TR=24;WE=73952334;WS=73952316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,25:0.38:66
chr6	74072681	rs9446890	G	C	1053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.929;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=28;PP=752;ReadPosRankSum=-0.305;SC=CATACCCACAGCCCACATATT;SOR=0.506;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=76;TCF=23;TCR=53;TR=41;WE=74072689;WS=74072671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,44:0.54:81
chr6	74072937	rs564533	G	C	1559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=28;PP=940;ReadPosRankSum=-0.816;SC=TTCTTACCAGGAGGACACAAT;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=134;TCF=74;TCR=60;TR=64;WE=74072945;WS=74072927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,77:0.50:154
chr6	74073531	rs561930	C	G	2455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=58;PP=1603;ReadPosRankSum=1.104;SC=GCCAGCAAGGCAGTGACCCAG;SOR=0.710;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=265;TCF=133;TCR=132;TR=112;WE=74073539;WS=74073521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,126:0.42:300
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chr6	74104495	rs3832419	C	CG	124.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.140;HP=10;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=171;ReadPosRankSum=0.588;SC=AGAGCGTGGGCGGGGGGGCTA;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=8;WE=74104503;WS=74104488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr6	74104557	rs558198	C	G	1008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.387;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=15;PP=613;ReadPosRankSum=-1.329;SC=TGGCACGCTACTCTTACGACG;SOR=0.382;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=73;TCF=51;TCR=22;TR=44;WE=74104565;WS=74104547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,46:0.61:75
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chr6	74114365	rs5877364	AT	A	1736.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.801;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.047;NF=18;NR=11;PP=1070;ReadPosRankSum=-1.203;SC=CTAAGTATTCATGATGCTGTA;SOR=0.543;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=70;TCF=42;TCR=28;TR=29;WE=74114373;WS=74114355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,52:0.49:107
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chr6	74125875	rs311686	A	G	2821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.143;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=28;PP=2118;ReadPosRankSum=0.114;SC=TGAGAGGTTTAAGGCACATCA;SOR=0.785;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=169;TCF=98;TCR=71;TR=68;WE=74125896;WS=74125865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,77:0.41:189
chr6	74125888	rs311685	A	G	2843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=29;PP=2118;ReadPosRankSum=0.574;SC=GCACATCAACAGAAAAGGGAA;SOR=0.721;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=173;TCF=100;TCR=73;TR=70;WE=74125896;WS=74125865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,78:0.41:192
chr6	74126084	rs311684	C	T	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=42;ReadPosRankSum=-0.736;SC=ACATAATAAACTAGGTGTTAC;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=4;WE=74126092;WS=74126074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,3:0.23:13
chr6	74134849	rs311679	T	C	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.113;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=57;ReadPosRankSum=0.315;SC=GAGCTGGGATTACAGGTGTGA;SOR=1.112;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=5;WE=74134857;WS=74134839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr6	74135016	rs311678	C	T	999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.849;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=11;PP=621;ReadPosRankSum=0.338;SC=TCAGAAATTCCTTACTTCTTT;SOR=0.965;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=49;TCR=20;TR=38;WE=74135024;WS=74135006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,44:0.52:84
chr6	74155491	rs2985419	T	C	1305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=27;PP=901;SC=GTAAAAATAGTACTGAAATAT;SOR=1.329;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=17;TCR=27;TR=44;WE=74155499;WS=74155481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr6	74161503	rs9446904	A	G	2284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.750;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=49;PP=1365;ReadPosRankSum=-0.247;SC=GCCCGGGCGGAGGTCTTGGCT;SOR=0.397;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=154;TCF=62;TCR=92;TR=87;WE=74161511;WS=74161493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,95:0.56:169
chr6	74161801	rs9352000	G	T	978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-3.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.595;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=21;PP=569;ReadPosRankSum=-0.410;SC=CGGAGACTCGGTGGGATCCAT;SOR=0.655;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=88;TCF=50;TCR=38;TR=43;WE=74161809;WS=74161791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,49:0.47:105
chr6	74162010	rs34413328	CA	C	800.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.680;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=629;ReadPosRankSum=-0.406;SC=GGCGGGCACACAAGAGTCTGC;SOR=0.178;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=17;WE=74162018;WS=74162000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,26:0.59:44
chr6	74171467	rs1713862	C	G	1467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=9;PP=1040;SC=GACGTCCTACCCCGTGATATT;SOR=2.753;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=44;TCR=9;TR=53;WE=74171475;WS=74171457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr6	74189574	rs7766570	G	A	4772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=64;PP=2780;SC=CTCGGTAAGGGCAAAATGTCA;SOR=0.855;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=150;TCF=86;TCR=64;TR=150;WE=74189582;WS=74189564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr6	74190448	rs2036039	T	C	3637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=390;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.365;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=79;PP=2273;ReadPosRankSum=0.648;SC=CACCCCTTCCTTGGAGACTCA;SOR=0.715;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=349;TCF=180;TCR=169;TR=160;WE=74190456;WS=74190438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:210,180:0.46:390
chr6	74202160	rs73452507	A	C	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.719;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=66;ReadPosRankSum=0.361;SC=CTGTTGGACCAGCACAGTGTT;SOR=1.230;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=6;WE=74202168;WS=74202150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr6	74228006	rs1874229	A	G	1222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=0.000;QD=8.10;ReadPosRankSum=-0.773;SOR=0.727;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,68:0.45:151
chr6	74228049	rs1874230	A	G	1093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=24;PP=561;ReadPosRankSum=1.736;SC=AGCCTCTGCAATAAGTTAATG;SOR=0.747;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=108;TCF=52;TCR=56;TR=49;WE=74228057;WS=74228039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,57:0.46:123
chr6	74229258	rs2073466	G	T	2944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.879;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=57;PP=1763;ReadPosRankSum=-0.365;SC=ATTAAGAGTCGTTACTTGGTT;SOR=0.816;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=281;TCF=152;TCR=129;TR=130;WE=74229266;WS=74229248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,143:0.46:310
chr6	74229405	rs4708060	C	A	1163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=34;PP=962;SC=TTTTATAAGTCGGATCTTAAC;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=34;WE=74229413;WS=74229395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr6	74320306	rs4708065	C	T	1956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.607;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=52;PP=1239;ReadPosRankSum=-2.214;SC=AAAAAACACCCAGCATTAATA;SOR=0.610;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=147;TCF=59;TCR=88;TR=86;WE=74320314;WS=74320285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,91:0.56:162
chr6	74320391	rs1691343	T	A	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=319;ReadPosRankSum=-0.622;SC=CTATATTGCCTGGAAGACTAA;SOR=0.582;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=16;WE=74320399;WS=74320381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr6	74325257	rs628038	T	C	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-4.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.388;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=118;ReadPosRankSum=-0.734;SC=GACCACCACTTGAAAGCAAAG;SOR=0.144;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=10;WE=74325265;WS=74325247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr6	74348328	rs3757111	C	A	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=302;ReadPosRankSum=-1.375;SC=GGATAAGAATCAAACGAATCA;SOR=0.495;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=39;TCF=7;TCR=32;TR=19;WE=74348336;WS=74348318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr6	74466377	rs6453696	C	T	4502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=88;NR=66;PP=2452;SC=ACCAGACATACTATCAATCAT;SOR=0.801;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=154;TCF=88;TCR=66;TR=154;WE=74466385;WS=74466367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr6	74468860	rs7774119	C	A	1902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=38;PP=1111;SC=TATTAAAATACCTTAGTGGAC;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=26;TCR=38;TR=64;WE=74468868;WS=74468850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr6	74481076	rs4706554	G	A	484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=0;PP=378;SC=CTATATTTTGGGCCAGTGGTC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=74481084;WS=74481066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr6	74490836	rs7742435	G	A	309.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=6;NR=1;PP=95;SC=TTGAGTGAGAGACAGAAAGGT;SOR=1.863;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=74490844;WS=74490826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	74490863	rs7762433	T	A	443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=229;SC=TATGTGCATGTGTATACCTAA;SOR=2.670;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=74490871;WS=74490853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr6	74491138	rs9447019	T	C	1079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=18;PP=861;SC=AACATAGAGATTGTGATTTTC;SOR=0.746;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=20;TCR=18;TR=38;WE=74491146;WS=74491128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr6	74491384	rs111578012	CATATTTTTGAA	C	1319.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=15;PP=2979;SC=AAAGGAGCAACATATTTTTGA;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=15;WE=74491402;WS=74491374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr6	74492618	rs2047670	G	T	132.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=102;SC=TTTAGGAAATGATATTTATTG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=74492626;WS=74492608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	74493432	rs10455097	A	C	4254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=40;PP=2568;SC=GACTTCAGTTACAGGATTTAC;SOR=1.563;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=132;TCF=92;TCR=40;TR=131;WE=74493440;WS=74493422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr6	74493615	rs11301365	AT	A	2502.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=50;PP=976;SC=CAGCTCCTCAATTTTTTTTTT;SOR=1.469;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=59;TCF=2;TCR=57;TR=52;WE=74493623;WS=74493605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr6	74495257	rs6453700	A	G	7315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=137;NR=123;PP=2965;SC=TCGAGGTAGCATGAAGGGATT;SOR=0.722;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=261;TCF=137;TCR=124;TR=260;WE=74495265;WS=74495247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,282:1.00:282
chr6	74497009	rs2351528	A	G	4741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=55;PP=2958;SC=ATGACTTCAAATGAAATAAAT;SOR=1.361;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=157;TCF=102;TCR=55;TR=157;WE=74497017;WS=74496999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr6	74497152	rs5023688	G	A	4780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=94;PP=2796;SC=TTCTGATGCTGTCACCCAGAT;SOR=1.098;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=161;TCF=67;TCR=94;TR=161;WE=74497160;WS=74497142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr6	74497237	rs35066559	G	GT	1128.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=25;PP=818;SC=GAAGCAGAAGGTTTTTTCTCT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=25;WE=74497245;WS=74497227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr6	74498432	rs144408661	TAAG	T	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=305;SC=TGAGTCCTAATAAGAAGAGAT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=7;WE=74498442;WS=74498422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	74502210	rs12662725	C	T	345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=229;SC=GTGTAAAGTTCCAACTCTGTT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=74502218;WS=74502201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	74521787	rs1501192	T	C	1602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=7;PP=1120;SC=TAGCTTTTGATATGTGAGACA;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=48;TCF=40;TCR=8;TR=47;WE=74521795;WS=74521777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr6	74530416	rs11753946	C	T	3032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=69;PP=2008;SC=GTACAGGAGGCGGGGAGGCAG;SOR=1.547;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=37;TCR=69;TR=106;WE=74530424;WS=74530406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr6	74533192	rs2917887	T	G	4309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=73;PP=2390;SC=GGAGACAGGCTGTGAGAAGTT;SOR=0.908;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=72;TCR=73;TR=145;WE=74533200;WS=74533182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr6	75795122	rs112607771	G	GCA,GCACA	2211.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;NF=2,2;NR=26,26;PP=1068,190;SC=GATTTGGAAGGCACACACACA;SOR=1.302;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=28,28;WE=75795130;WS=75795112;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.23,0.77:56
chr6	75796364	.	GTATA	G	143.94	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.99;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr6	75797302	rs970547	C	T	2651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=36;PP=1504;SC=CCTGGATAGCCTTGCCCGTTG;SOR=0.820;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=86;TCF=50;TCR=36;TR=86;WE=75797310;WS=75797292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr6	75798721	rs200070500	AC	A	45.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=4.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-1.514;QD=1.83;ReadPosRankSum=1.278;SOR=0.617;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,7:0.28:25
chr6	75798722	rs672648	C	A	337.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=4.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=1.693;QD=13.51;ReadPosRankSum=-1.004;SOR=1.408;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,18:0.72:25
chr6	75811880	rs556674	G	A	2754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=55;PP=1571;SC=CAGTGTAAGCGTTCAGAATGA;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=30;TCR=55;TR=85;WE=75811888;WS=75811870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr6	75830974	rs499018	G	C	1802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=32;PP=1271;ReadPosRankSum=-0.876;SC=CAAAGGAAAGGCAAGACATCA;SOR=0.726;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=197;TCF=124;TCR=73;TR=87;WE=75830982;WS=75830964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,92:0.42:218
chr6	75833876	rs240722	C	A	1295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.286;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=33;PP=919;ReadPosRankSum=0.532;SC=AATTTTATATCGCATTGTTAT;SOR=0.913;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=111;TCF=51;TCR=60;TR=56;WE=75833884;WS=75833866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,59:0.48:122
chr6	75841722	rs594012	A	T	5473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=92;PP=2965;SC=CAGGTCCTGGAGCAGGGTCCC;SOR=0.703;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=187;TCF=95;TCR=92;TR=187;WE=75841730;WS=75841712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr6	75843845	rs1332778	T	C	319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=9;PP=235;SC=AAGTAGTGAATAAACGACACA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=75843853;WS=75843835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	75844600	rs1332020	C	T	1067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.508;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=23;PP=509;ReadPosRankSum=0.437;SC=TGGTAAGTGTCAGCCTTGCTC;SOR=0.879;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=95;TCF=45;TCR=50;TR=42;WE=75844608;WS=75844590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,53:0.46:114
chr6	75844700	rs1332019	C	A	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.422;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=65;ReadPosRankSum=0.408;SC=ATACCACAGTCAAGGTTTAAC;SOR=2.872;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=4;WE=75844708;WS=75844690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
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chr6	75848181	rs240736	A	G	2539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.059;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=45;PP=1600;ReadPosRankSum=1.674;SC=CTCACTGCCAATCAGGTCATC;SOR=0.591;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=198;TCF=120;TCR=78;TR=107;WE=75848189;WS=75848171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,115:0.53:218
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chr6	75951719	rs240419	A	C	1024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=17;NR=18;PP=576;SC=GAGTTCGAGAACAGCCTGAAC;SOR=0.968;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=36;TCF=17;TCR=19;TR=35;WE=75951727;WS=75951709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
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chr6	75968720	rs147523	G	A	569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=12;PP=406;SC=GGAGTGGGGAGGGGATAAGGA;SOR=1.828;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=18;WE=75968728;WS=75968710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr6	75969187	rs144512821	G	A	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.210;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=12;PP=198;ReadPosRankSum=-0.116;SC=CATTGCCAATGAGAAACAATT;SOR=0.394;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=61;TCF=24;TCR=37;TR=22;WE=75969195;WS=75969177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,25:0.38:65
chr6	75977591	rs240395	T	A	425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=13;PP=326;SC=ACAAAAACTGTTTTTAAGGTC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=75977599;WS=75977581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	76022082	rs9352202	A	G	3395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=1.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.46;ReadPosRankSum=1.140;SOR=0.515;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,87:0.52:166
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chr6	76063133	rs6913979	A	G	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.332;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=31;ReadPosRankSum=-1.242;SC=TCAAAAATTGACATTAGACCC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=3;WE=76063141;WS=76063125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr6	76124792	rs2808201	G	A	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=23;PP=512;ReadPosRankSum=-1.152;SC=TTACCACATCGCCAATAAGGA;SOR=0.476;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=43;TCF=7;TCR=36;TR=28;WE=76124800;WS=76124782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,29:0.63:46
chr6	76138146	rs5877455	C	CAG	915.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.255;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=787;ReadPosRankSum=0.762;SC=TCACCACCTCCAGTTTCTGAA;SOR=1.112;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=37;TCF=24;TCR=13;TR=19;WE=76138154;WS=76138136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,24:0.46:52
chr6	76331457	rs3831261	ACT	A	193.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=130;ReadPosRankSum=-0.316;SC=AAAACATATAACTCTTTCACA;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=76331466;WS=76331447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr6	76333486	rs655471	G	A	770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=4;PP=462;SC=TGCAAAGACTGTGGTTTGGCC;SOR=2.147;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=76333494;WS=76333476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr6	76357593	rs569731	G	A	1718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.594;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=44;PP=1036;ReadPosRankSum=-0.635;SC=ATACGATGCTGGCTTTAGAAT;SOR=0.928;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=160;TCF=74;TCR=86;TR=76;WE=76357601;WS=76357583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,83:0.45:185
chr6	76357657	rs613562	T	A	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=2.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.490;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=322;ReadPosRankSum=2.702;SC=GTAACTGATTTGAGAATTTCT;SOR=1.247;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=37;TCF=8;TCR=29;TR=17;WE=76357665;WS=76357647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,20:0.44:45
chr6	76369054	rs507662	A	G	7563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=136;NR=122;PP=2965;SC=AACAGAAACGACACTGTAGTA;SOR=0.714;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=259;TCF=136;TCR=123;TR=258;WE=76369062;WS=76369044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,289:1.00:289
chr6	76385511	rs2842535	A	G	2363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.568;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=47;PP=1545;ReadPosRankSum=-0.964;SC=TTTCCTCACAATTTCCCCCAT;SOR=0.830;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=224;TCF=126;TCR=98;TR=110;WE=76385519;WS=76385501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,114:0.48:239
chr6	76386712	rs35745959	GT	G	92.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=2.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.64;ReadPosRankSum=0.397;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
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chr6	76532662	.	C	T	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.329;ClippingRankSum=-0.000;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=30;ReadPosRankSum=-1.248;SC=ATACACTGTGCGGGTTCAGAA;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=5;WE=76532670;WS=76532652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr6	76538403	rs1280052	G	A	2590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=39;PP=1488;SC=ATTTTGTCACGCTTGAAATTG;SOR=0.735;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=46;TCR=39;TR=85;WE=76538411;WS=76538393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr6	76554593	rs7760587	G	A	1965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=47;NR=18;PP=1099;SC=TGTTAATTATGTTTAATTTGT;SOR=1.483;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=47;TCR=18;TR=65;WE=76554601;WS=76554583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr6	76558260	rs144408691	A	AT	960.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=1.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.283;HP=12;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.963;NF=0;NR=25;PP=585;ReadPosRankSum=0.879;SC=TTTGCTTTTTATTTTTTTAAG;SOR=1.821;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=1;TCR=55;TR=25;WE=76558268;WS=76558250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,41:0.53:77
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chr6	76568860	rs3818309	C	T	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.682;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=258;ReadPosRankSum=1.181;SC=GCAGAGGCCCCGGGGCTCAGG;SOR=1.981;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=15;WE=76568868;WS=76568850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
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chr6	76644527	rs9360960	C	T	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.114;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=285;ReadPosRankSum=-0.747;SC=CCGTCCCGCCCCTCAACCTTG;SOR=0.914;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=48;TCF=31;TCR=17;TR=23;WE=76644535;WS=76644517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,24:0.48:50
chr6	76656978	rs3215818	AT	A	2414.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=3.159;NF=24;NR=28;PP=1710;ReadPosRankSum=0.007;SC=ACAGAACGAAATTAAAAAAAT;SOR=0.657;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=99;TCF=45;TCR=54;TR=52;WE=76656986;WS=76656968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,87:0.56:154
chr6	76660551	rs3734311	G	C	1222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=31;PP=865;ReadPosRankSum=0.501;SC=TCATCTAGGTGTCTGACCATA;SOR=0.690;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=118;TCF=49;TCR=69;TR=53;WE=76660559;WS=76660541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,55:0.44:125
chr6	76728583	rs377755519	TA	T	127.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=4.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.65;ReadPosRankSum=-0.340;SOR=0.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,14:0.40:35
chr6	76751498	.	C	T	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=76;ReadPosRankSum=-0.231;SC=TTTTATAATTCTTGTGGCTAA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=5;WE=76751506;WS=76751488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr6	76782049	rs1320537	C	A	1089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=25;NR=12;PP=543;SC=CCCGTGAGATCAATTGGTAGC;SOR=1.055;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=25;TCR=12;TR=37;WE=76782057;WS=76782039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr6	78171941	rs6297	C	T	5523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=106;NR=71;PP=2965;SC=CCACTGCAAACGGCAAGTCAA;SOR=1.055;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=177;TCF=106;TCR=71;TR=177;WE=78171949;WS=78171931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr6	78172260	rs6296	C	G	3169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.843;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=65;PP=1862;ReadPosRankSum=0.642;SC=TGACTTGGTTCACATACACAG;SOR=0.685;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=288;TCF=151;TCR=137;TR=135;WE=78172268;WS=78172250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,154:0.48:321
chr6	78172992	rs6298	G	A	1940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.731;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=49;PP=1279;ReadPosRankSum=0.148;SC=GTAGGGAGATGGAGTCCTGGT;SOR=0.836;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=183;TCF=87;TCR=96;TR=90;WE=78173000;WS=78172982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,95:0.47:200
chr6	79424433	rs9352613	A	G	3471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.16;SOR=0.752;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr6	79577644	rs9350789	A	C	3258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=58;PP=1672;SC=AAGAGCCGGAAGACACAAAAG;SOR=0.998;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=50;TCR=58;TR=108;WE=79577652;WS=79577634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr6	79595167	rs146020132	A	ACTTAT	6048.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=43;PP=2957;SC=AGAGGTATGTACTTAACAAAT;SOR=0.867;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=58;TCF=10;TCR=48;TR=51;WE=79595175;WS=79595157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr6	79612800	rs9352675	G	A	9642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=364;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=157;NR=186;PP=2965;SC=CACATCAAATGAACAAATACT;SOR=0.917;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=344;TCF=157;TCR=187;TR=343;WE=79612808;WS=79612790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,363:1.00:363
chr6	79657391	rs1984195	G	A	4162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=59;PP=2512;SC=AAATAAGTCTGACATCTTTAC;SOR=0.944;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=145;TCF=86;TCR=59;TR=145;WE=79657399;WS=79657381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr6	79657668	rs11370597	T	TC	106.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.37;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	79664440	rs9443632	T	C	1147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=5;PP=763;SC=AAATAAACTATAATCATAAAA;SOR=2.419;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=35;WE=79664448;WS=79664430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr6	79664748	rs10455356	T	C	502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=11;PP=341;SC=ACTTTTAATGTAGTCTTAGAT;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=79664756;WS=79664738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	79665210	rs7753358	T	A	124.85	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.81;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	79679577	rs7742431	A	G	3781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=57;PP=2137;SC=TGTATTTTGCATCATCAAATT;SOR=0.707;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=130;TCF=73;TCR=57;TR=130;WE=79679585;WS=79679567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr6	79695029	rs1890229	C	T	2431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=59;NR=20;PP=1550;SC=TTTCTAAAGACTTTATATAAC;SOR=1.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=59;TCR=20;TR=79;WE=79695037;WS=79695019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr6	79707923	rs11752126	C	T	1302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=7;PP=848;SC=GAGATTTAGGCTGTTTCAAAT;SOR=2.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=35;TCR=7;TR=42;WE=79707931;WS=79707913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr6	79708000	rs7747479	A	C	4852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=101;NR=55;PP=2889;SC=ATTACTGATAACTGCTTCACC;SOR=1.205;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=156;TCF=101;TCR=55;TR=156;WE=79708008;WS=79707990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr6	79752792	rs9343863	T	C	1259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=34;PP=1009;SC=TTTTAAGAATTCACATACTCC;SOR=3.611;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=5;TCR=34;TR=39;WE=79752800;WS=79752782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr6	79918309	rs9341761	G	A	6438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=124;PP=2965;SC=AAGGGAATGGGAAAATATACA;SOR=1.131;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=217;TCF=92;TCR=125;TR=215;WE=79918317;WS=79918299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr6	79944096	rs3076135	C	CAG	871.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=8.846;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=770;ReadPosRankSum=-0.680;SC=GTAGGGGGGACAGAGAGAGGA;SOR=3.897;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=18;WE=79944104;WS=79944086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,22:0.96:23
chr6	79944355	rs9361504	T	G	7485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=115;NR=131;PP=2965;SC=TGCCTCTGCCTCTGCAGCTGC;SOR=0.985;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=246;TCF=115;TCR=131;TR=246;WE=79944363;WS=79944345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,278:1.00:278
chr6	80196848	rs1875845	C	T	2024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.653;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=35;PP=1146;ReadPosRankSum=0.651;SC=GAGGAAAAAGCCTTCATCTTC;SOR=0.950;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=212;TCF=122;TCR=90;TR=86;WE=80196856;WS=80196838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,99:0.41:243
chr6	80201519	.	G	GTA	41.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.351;ClippingRankSum=0.000;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=208;ReadPosRankSum=2.001;SC=CAGCTGGCATGTATATATATA;SOR=0.728;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=8;WE=80201528;WS=80201509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,5:0.14:37
chr6	80228541	rs2655655	A	G	3238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=82;PP=2156;ReadPosRankSum=0.932;SC=AAAATCAGATAAGTAAGAATA;SOR=0.678;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=268;TCF=117;TCR=151;TR=140;WE=80228549;WS=80228531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,153:0.50:305
chr6	80228673	rs2803195	T	C	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-2.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=60;ReadPosRankSum=-0.611;SC=GAGGAGACTATGACAATACTG;SOR=0.610;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=6;WE=80228681;WS=80228663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr6	80341320	rs6926093	CG	GC	1256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=20;PP=1025;SC=TGCGCTCAGCCGGTCCGCCCG;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=25;WE=80341329;WS=80341310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr6	80382916	rs1883878	G	T	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=246;ReadPosRankSum=1.185;SC=GAGAACTAAGGCACTCTGTCA;SOR=0.616;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=51;TCF=13;TCR=38;TR=18;WE=80382924;WS=80382906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,20:0.38:53
chr6	80513565	rs149560703	G	GCTCTCTGATATGCCATC	1046.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.266;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=2954;ReadPosRankSum=1.818;SC=TCCATCCTGAGCTGCAGGGCA;SOR=0.568;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=33;TCF=13;TCR=20;TR=9;WE=80513573;WS=80513555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,25:0.45:55
chr6	80579937	rs59710738	A	G	938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.393;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=16;PP=631;ReadPosRankSum=-0.013;SC=ATTGAAATACACTACAGGCTT;SOR=0.932;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=117;TCF=77;TCR=40;TR=49;WE=80579945;WS=80579927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,51:0.40:126
chr6	80580038	rs9361569	T	G	7207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=129;NR=105;PP=2965;SC=CTTATGCTCATCAACGACTGT;SOR=0.822;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=234;TCF=129;TCR=105;TR=234;WE=80580046;WS=80580028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,262:1.00:262
chr6	80631282	rs45466000	C	T	610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.700;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=408;ReadPosRankSum=-0.931;SC=GTTCTCATTGCTTTCCACTGA;SOR=1.179;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=52;TCF=41;TCR=11;TR=25;WE=80631290;WS=80631272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,26:0.47:55
chr6	80631539	rs700483	T	A	1698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=35;PP=1107;SC=GCGTGTTATATACACCAAAAT;SOR=1.649;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=19;TCR=35;TR=54;WE=80631547;WS=80631529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr6	80657086	rs62407622	C	G	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=20;PP=429;ReadPosRankSum=-0.330;SC=ACGGGGCGAGCGGCGGCCGGG;SOR=0.917;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=50;TCF=10;TCR=40;TR=24;WE=80657094;WS=80657076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,24:0.45:53
chr6	80715838	rs240226	T	G	1852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.704;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=34;PP=1229;ReadPosRankSum=-1.640;SC=GGCTACATGATGGCAGGGTTT;SOR=0.834;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=192;TCF=109;TCR=83;TR=86;WE=80715846;WS=80715828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,91:0.43:210
chr6	80720487	.	GCAT	G,GTACAT	979.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.267;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=1051;ReadPosRankSum=0.630;SC=TGGGTGGTGGGCATTTTACTG;SOR=0.985;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=26;TCF=15;TCR=11;TR=12;WE=80720499;WS=80720477;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.51:43
chr6	80720491	rs199573945	T	TAAAGA	979.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-2.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=1.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.78;ReadPosRankSum=0.863;SOR=0.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,22:0.51:43
chr6	80720733	rs151587	G	A	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.799;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=27.16;ReadPosRankSum=-0.349;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr6	80720742	rs239556	A	T	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.723;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=27.16;ReadPosRankSum=-0.246;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr6	80721045	rs239558	A	G	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=64;ReadPosRankSum=-1.282;SC=CTTGGGGACAAGTATTTCCTA;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=80721053;WS=80721035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr6	80722857	rs239562	C	T	62.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5040;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=39;ReadPosRankSum=-0.319;SC=TTATGTCACTCTAAAAAATGT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=3;WE=80722865;WS=80722854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr6	80724156	rs2295840	T	C	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=248;ReadPosRankSum=1.425;SC=TATGGGACTTTATTTGATTTT;SOR=0.776;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=17;WE=80724164;WS=80724146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr6	80724312	rs239566	A	G	823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.823;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=18;PP=431;ReadPosRankSum=-0.168;SC=AGGTAAGAGTAACAAAATCAG;SOR=0.804;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=69;TCF=32;TCR=37;TR=33;WE=80724320;WS=80724302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,40:0.49:82
chr6	80724462	rs239567	C	T	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5064;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=65;ReadPosRankSum=-1.345;SC=ATGAAAAGTACTGAATCCGCA;SOR=0.330;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=5;WE=80724470;WS=80724452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr6	80741328	rs239584	G	A	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=131;ReadPosRankSum=-1.962;SC=TAAACTTTCTGTTTTTTTGTC;SOR=0.903;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=13;WE=80741336;WS=80741318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr6	80747582	.	TATAATA	T	94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=94;QD=33.3333333333;SC=AAACTTAAAGTATAATAATAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=3;WE=80747595;WS=80747572;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
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chr6	80750093	rs2295841	C	G	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=199;ReadPosRankSum=2.295;SC=AATTGGCTACCCTTTGTCAGC;SOR=1.473;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=11;WE=80750101;WS=80750083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
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chr6	80778853	rs6923330	G	C	2303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.723;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.015;NF=39;NR=52;PP=1578;ReadPosRankSum=-1.173;SC=ATTCCAGAAGGTTCCAATGAT;SOR=0.580;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=184;TCF=80;TCR=104;TR=91;WE=80778861;WS=80778843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,100:0.49:205
chr6	80837239	rs9448893	A	G	1039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.862;HP=2;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=8;PP=1680;ReadPosRankSum=-0.944;SC=AACACACGAAATGATTTTTTT;SOR=0.818;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=96;TCF=72;TCR=24;TR=42;WE=80837261;WS=80837229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,46:0.46:99
chr6	80837253	rs9448894	G	T	1211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=0.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.32;ReadPosRankSum=-0.013;SOR=0.769;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,60:0.46:130
chr6	80878508	rs139630496	A	AAGGAAGGGAGGGAGGGAGGG	892.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=7.689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.70;MQRankSum=4.319;QD=12.23;ReadPosRankSum=1.875;SOR=2.484;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,16:0.22:73
chr6	80912746	rs3828753	C	T	1091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.118;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=10;PP=724;ReadPosRankSum=-0.483;SC=CTAATAGTGACATCAGCATTC;SOR=0.409;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=84;TCF=69;TCR=15;TR=45;WE=80912754;WS=80912736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,49:0.53:93
chr6	81053642	rs926733	G	A	2467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=62;PP=1716;SC=GGTAAAGTTGGTAAAAGGCAA;SOR=2.441;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=82;TCF=19;TCR=63;TR=81;WE=81053650;WS=81053632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr6	82461296	rs75207242	G	A	1817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.139;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=32;PP=1154;ReadPosRankSum=-0.155;SC=GTGCATCTCGGGTGGTGTTAC;SOR=0.527;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=135;TCF=84;TCR=51;TR=77;WE=82461304;WS=82461286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,84:0.58:146
chr6	82461727	.	ACCGCCGAAGTCGCCG	A	459.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=0.000;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=3.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.73;ReadPosRankSum=-0.870;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,13:0.81:16
chr6	82910247	.	C	G	92	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=5;NR=0;PP=92;QD=25.3542425094;SC=AAGGGACACACTGGAGAAAAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=82910255;WS=82910237;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	82912153	rs7771978	T	G	394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=1;PP=318;SC=CAGGTAAACATCATTATTCAC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=82912161;WS=82912143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr6	82924645	rs6912968	A	G	288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=223;SC=TTTTTTAACAATATTTAGAAA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=82924653;WS=82924635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	82930437	.	GA	G	215.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.771;ClippingRankSum=0.000;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.32;ReadPosRankSum=0.645;SOR=0.672;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,23:0.25:93
chr6	83075914	rs700494	G	A	2180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=43;PP=1252;ReadPosRankSum=0.345;SC=CCAGATTAACGAACCTCAGTT;SOR=0.658;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=191;TCF=97;TCR=94;TR=90;WE=83075922;WS=83075904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,102:0.49:208
chr6	83602583	rs4706975	C	T	644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.591;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=4;PP=385;ReadPosRankSum=2.282;SC=TTAGAGAATACATGCAAACAA;SOR=1.769;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=67;TCF=48;TCR=19;TR=27;WE=83602591;WS=83602573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,32:0.42:77
chr6	83666936	rs293531	T	C	853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=6.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.89;ReadPosRankSum=1.660;SOR=0.151;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,21:0.54:39
chr6	83666943	rs293532	G	T	910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.22;ReadPosRankSum=1.564;SOR=0.614;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,26:0.52:50
chr6	83667005	rs7739461	G	A	1805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=36;PP=1161;ReadPosRankSum=0.088;SC=GAGAAATCACGGCCTAGAAAA;SOR=0.657;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=158;TCF=90;TCR=68;TR=84;WE=83667013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,88:0.51:171
chr6	83667045	rs7739323	C	T	2052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.527;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=41;PP=1239;ReadPosRankSum=1.627;SC=AAGGAATTCACACGGCGAAGG;SOR=0.753;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=173;TCF=94;TCR=79;TR=91;WE=83667053;WS=83667035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,98:0.51:193
chr6	83733785	rs4235816	C	T	864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.553;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=23;PP=488;ReadPosRankSum=-0.892;SC=AATTAAGACTCTCCCCAATAC;SOR=1.022;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=89;TCF=46;TCR=43;TR=42;WE=83733793;WS=83733775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,47:0.45:105
chr6	83748351	.	C	T	23	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=23;QD=19.2570708491;SC=AGCTTGTATGCATAATTCACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=3;WE=83748359;WS=83748341;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr6	83752057	rs4612135	C	G	2567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=56;PP=1688;SC=AATAACAAAGCCTCCAATAAA;SOR=1.828;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=26;TCR=56;TR=82;WE=83752065;WS=83752047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
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chr6	83754481	rs2027282	T	C	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=67;ReadPosRankSum=-0.921;SC=AACCACAAGGTTTGCAATGCT;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=5;WE=83754489;WS=83754471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
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chr6	83863583	rs647231	G	A	2075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=40;PP=1196;ReadPosRankSum=-0.612;SC=GTTAGGACACGTAGGTTAAGG;SOR=0.669;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=200;TCF=116;TCR=84;TR=94;WE=83863591;WS=83863573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,101:0.47:217
chr6	83877496	rs495944	T	C	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.350;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=64;ReadPosRankSum=0.000;SC=TCTTGACCAATTGCCAAAGTT;SOR=0.180;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=8;WE=83877504;WS=83877486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr6	83880167	rs473267	C	T	1557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=40;PP=895;ReadPosRankSum=-0.144;SC=CTTTCAGCATCGGTAGTGCTA;SOR=0.717;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=186;TCF=84;TCR=102;TR=73;WE=83880175;WS=83880157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,81:0.40:203
chr6	83880274	rs474213	C	T	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.150;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=12;PP=224;ReadPosRankSum=0.342;SC=ATACATTCTACGAAAAGTGCC;SOR=0.053;SbPval=0.1;Source=Platypus;TC=42;TCF=11;TCR=31;TR=21;WE=83880282;WS=83880264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,22:0.54:41
chr6	83881740	rs542948	T	C	3566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=380;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=75;PP=2088;ReadPosRankSum=0.899;SC=CCAAGATTGCTTCAATCACCA;SOR=0.686;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=346;TCF=180;TCR=166;TR=159;WE=83881748;WS=83881730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:201,178:0.47:379
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chr6	83949261	rs1180230	T	C	6723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=136;NR=86;PP=2965;SC=CAAATACCTCTCCAGCTCCTT;SOR=1.124;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=222;TCF=136;TCR=86;TR=222;WE=83949269;WS=83949251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr6	84055783	rs12215595	A	G	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=220;ReadPosRankSum=-0.064;SC=GAGAAAGAGAACCAGACAAAA;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=11;WE=84055791;WS=84055779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr6	84108065	rs4706990	A	T	1279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.671;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=22;PP=868;ReadPosRankSum=1.884;SC=CAAGTTGCATATAAAATAAAA;SOR=0.619;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=119;TCF=74;TCR=45;TR=56;WE=84108073;WS=84108055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,59:0.47:126
chr6	84140772	rs28372716	TGGC	T	280.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.034;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=191;ReadPosRankSum=1.611;SC=ACTGCAGCTGTGGCGGCGGCG;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=84140782;WS=84140762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr6	84233831	rs504593	G	A	2372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.125;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=49;PP=1406;ReadPosRankSum=0.384;SC=GAGCATCTGCGGGAGAGAGCG;SOR=0.802;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=175;TCF=82;TCR=93;TR=94;WE=84233839;WS=84233821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,106:0.55:193
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chr6	84284880	rs2022269	T	A	1290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.952;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=33;PP=698;ReadPosRankSum=0.605;SC=AAACAAAAAATCACAAATCAG;SOR=0.475;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=137;TCF=58;TCR=79;TR=60;WE=84284888;WS=84284870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,67:0.44:153
chr6	84290137	rs147751300	TAAAG	T	473.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.28;ReadPosRankSum=1.676;SOR=0.850;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
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chr6	86277069	rs11342876	CA	C	53.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.275;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=62;ReadPosRankSum=1.383;SC=TGGGAGAGGTCAGGGGTGCTA;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=3;WE=86277077;WS=86277059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
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chr6	87796233	rs2011192	G	A	957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=25;PP=654;SC=AGTAGCTCACGCCTGTAATCC;SOR=2.584;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=32;WE=87796241;WS=87796223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr6	87879217	rs9351117	C	G	619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=0;PP=496;SC=TCAGCTATTTCATATAAATAA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=87879225;WS=87879207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
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chr6	87879376	.	TTC	CTT	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=42;NR=69;PP=2947;QD=20;SC=TTTTGTTTTGTTCTGTTTTGA;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=120;TCF=47;TCR=73;TR=111;WE=87879386;WS=87879366;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:9,111:0.93:120
chr6	87879378	rs9359738	C	T	6008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.58;SOR=1.434;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
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chr6	87953340	.	CT	C	44.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.745;ClippingRankSum=0.000;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=4.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQRankSum=2.259;QD=0.76;ReadPosRankSum=0.455;SOR=1.547;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,10:0.17:59
chr6	87965528	rs6908834	T	C	4731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.99;NF=79;NR=66;PP=2965;SC=GCCAGTACTGTAGGCGGCATT;SOR=0.742;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=145;TCF=79;TCR=66;TR=145;WE=87965536;WS=87965518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr6	87968565	rs9362415	A	G	3977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=64;PP=2317;SC=CACAACTTCAATAAATTCTGA;SOR=0.776;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=134;TCF=70;TCR=64;TR=134;WE=87968573;WS=87968555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr6	87969737	rs3734187	C	T	9465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=354;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=150;NR=175;PP=2965;SC=TACAGCAAAACTTGATTCTCC;SOR=0.890;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=325;TCF=150;TCR=175;TR=325;WE=87969745;WS=87969727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,354:1.00:354
chr6	87970301	rs3812132	C	G	7794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=116;NR=148;PP=2965;SC=ATCGGGGGACCAAGCACAGCA;SOR=1.002;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=264;TCF=116;TCR=148;TR=264;WE=87970309;WS=87970291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,294:1.00:294
chr6	87994015	rs6934603	A	G	7044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=119;NR=101;PP=2965;SC=CACTTAATAAAGCACTTGAGA;SOR=0.792;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=220;TCF=119;TCR=101;TR=220;WE=87994036;WS=87994005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr6	87994572	rs4707358	G	A	9647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=364;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=154;NR=171;PP=2965;SC=AATCCATCCAGTCCCAGTGGA;SOR=0.878;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=325;TCF=154;TCR=171;TR=325;WE=87994580;WS=87994562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,363:1.00:363
chr6	88058675	rs9450659	A	G	494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=15;PP=404;SC=GTTCTTTCACATTTTGGATTT;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=88058683;WS=88058665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr6	88108048	rs67076383	AGAT	A	14503.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=147;PP=2957;SC=GACAGAGAGAAGATGAGTGTT;SOR=0.880;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=168;TCF=14;TCR=154;TR=161;WE=88108058;WS=88108038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,324:1.00:324
chr6	88109304	rs1051550	G	A	1498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=31;PP=1043;SC=GCTTGGGGGTGGGTTGGGGAT;SOR=1.911;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=11;TCR=31;TR=42;WE=88109312;WS=88109294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr6	88123596	rs117489265	C	T	857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.997;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=20;PP=457;ReadPosRankSum=-0.179;SC=AAGTCTACTTCGATATGAATT;SOR=0.394;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=75;TCF=32;TCR=43;TR=39;WE=88123604;WS=88123586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,43:0.52:83
chr6	88170710	rs73492299	A	T	1401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=15;PP=841;SC=ATTTTTTACAAGCACTAACTA;SOR=1.436;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=31;TCR=15;TR=46;WE=88170718;WS=88170700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr6	88182704	rs9450704	G	C	1548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=26;PP=845;SC=CAGTTCCGCGGGGGGCTGTCG;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=58;TCF=32;TCR=26;TR=58;WE=88182712;WS=88182694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr6	88221097	.	AT	A	1375.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=0.000;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.483;HP=12;HapScore=3;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=1.737;NF=21;NR=22;PP=431;ReadPosRankSum=-1.029;SC=AGATAAAGCTATTTTTTTTTT;SOR=1.002;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=98;TCF=45;TCR=53;TR=43;WE=88221116;WS=88221087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,70:0.58:121
chr6	88226641	rs9450723	A	G	5495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=108;PP=2965;SC=GACTGTACACATTACACTAAG;SOR=1.114;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=183;TCF=75;TCR=108;TR=183;WE=88226649;WS=88226631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr6	88240570	rs35862137	C	T	1618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.616;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=39;PP=899;ReadPosRankSum=1.963;SC=AGTGCTTGCACATCGCCCAGT;SOR=0.514;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=214;TCF=122;TCR=92;TR=79;WE=88240578;WS=88240560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,86:0.37:230
chr6	88251869	rs7773906	T	A	469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=14;PP=349;SC=GACCCCATAATCTGACACAAG;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=88251877;WS=88251859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	88255394	.	CTTT	C	1630.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.486;ClippingRankSum=0.000;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.821;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.977;NF=4;NR=20;PP=928;ReadPosRankSum=0.581;SC=CCTAAAGCTTCTTTGAGATTT;SOR=0.495;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=48;TCF=5;TCR=43;TR=24;WE=88255404;WS=88255384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,43:0.52:82
chr6	88255438	rs4707374	T	C	1160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=26;PP=804;SC=ATAAAGTATATAGTTTCTCAT;SOR=1.402;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=15;TCR=26;TR=41;WE=88255446;WS=88255428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr6	88258169	rs34513746	C	T	75.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=0;PP=54;SC=CATCCATTTCCTGAATTGGCA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=88258177;WS=88258160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr6	88273971	rs9450740	G	A	1958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=36;PP=1167;SC=ACATCGAAACGAGATAGAACT;SOR=1.385;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=24;TCR=36;TR=60;WE=88273979;WS=88273961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr6	88274353	rs9450741	C	T	163.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=1;NR=6;PP=127;SC=TGCCACTGCACTCCAGCCTGG;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=88274361;WS=88274343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	88300013	rs9450752	A	G	3964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=77;PP=2421;SC=CTGGCTGGAGAGGAGGGAGGG;SOR=1.334;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=53;TCR=77;TR=130;WE=88300021;WS=88300003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr6	88303967	rs7750207	A	C	1463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=33;NR=16;PP=813;SC=CTCTCCCCTAACATCTTTTTT;SOR=1.009;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=33;TCR=16;TR=49;WE=88303975;WS=88303957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr6	88315741	rs2307391	TA	T	2753.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=43;PP=1782;SC=ATTGTCCAGGTAAAAATATAA;SOR=0.959;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=6;TCR=44;TR=49;WE=88315749;WS=88315731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr6	88317292	rs10706424	CA	C	99.52	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=102;ReadPosRankSum=1.465;SC=CACATTCTACCAAAAAAAAAA;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=6;WE=88317300;WS=88317282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr6	88317675	rs4706294	G	C	624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=18;PP=477;SC=TTAAAAGTAGGTATTTATTTT;SOR=2.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=88317683;WS=88317665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr6	88331299	rs7772561	A	G	1672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=33;PP=1032;SC=GTAGGGAAAGAAATAGTAACC;SOR=1.197;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=22;TCR=34;TR=55;WE=88331307;WS=88331289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
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chr6	88361017	rs7772351	G	A	1661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=38;PP=1106;SC=TCTGCCAGCAGAACCTCACCC;SOR=2.187;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=14;TCR=38;TR=52;WE=88361025;WS=88361007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
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chr6	89814830	rs7753709	A	G	975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=15;PP=626;ReadPosRankSum=-1.016;SC=CAGTCCTCTTATACTCACTCT;SOR=0.675;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=106;TCF=73;TCR=33;TR=44;WE=89814838;WS=89814820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,47:0.41:115
chr6	89858851	rs6926895	G	A	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=220;ReadPosRankSum=0.803;SC=TTGCGTAAGCGTCATAGAACA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=12;WE=89858859;WS=89858841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr6	89862725	rs6937095	T	C	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=306;ReadPosRankSum=-0.297;SC=TTAGCAATAATAACAAAAGTA;SOR=0.487;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=36;TCF=33;TCR=3;TR=18;WE=89862733;WS=89862715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,21:0.52:40
chr6	89864679	rs4053639	A	G	798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.732;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=24;PP=501;ReadPosRankSum=-1.058;SC=GTGGGCTAGCACTGTTAGATT;SOR=0.781;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=95;TCF=42;TCR=53;TR=40;WE=89864687;WS=89864669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,43:0.39:110
chr6	89867980	rs9344910	T	C	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=107;ReadPosRankSum=-0.534;SC=CAATCACTGGTTTGAAAATTA;SOR=0.223;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=6;WE=89867988;WS=89867970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr6	89868190	rs3831213	G	GT	1010.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.243;NF=2;NR=22;PP=570;ReadPosRankSum=1.965;SC=GTAATTAAGTGTTTTTTTATA;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=46;TCF=4;TCR=42;TR=24;WE=89868198;WS=89868180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,42:0.58:73
chr6	89868287	rs2297308	G	A	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.922;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=96;ReadPosRankSum=1.265;SC=TACTACTGACGTTTTTAATAT;SOR=0.307;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=17;TCF=6;TCR=11;TR=10;WE=89868295;WS=89868277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr6	89871759	rs2297309	G	A	1200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.485;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=18;PP=883;ReadPosRankSum=-1.163;SC=TGAGATACGGGTAGCTAACCT;SOR=1.056;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=110;TCF=65;TCR=45;TR=50;WE=89871767;WS=89871749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,52:0.45:115
chr6	89888443	rs3734201	T	C	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.231;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=214;ReadPosRankSum=0.529;SC=CAGTTATTTCTGTAGTGCATG;SOR=1.609;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=12;WE=89888451;WS=89888433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr6	89888744	rs1796743	C	T	1799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=48;PP=1132;ReadPosRankSum=0.698;SC=CGTCCAGCATCGCAGTGCGGG;SOR=0.648;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=52;TCR=88;TR=77;WE=89888752;WS=89888734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,83:0.54:154
chr6	89891582	rs404943	T	C	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.747;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=354;ReadPosRankSum=0.380;SC=TTAATACCTATATTTGCAGAT;SOR=0.336;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=39;TCF=34;TCR=5;TR=20;WE=89891590;WS=89891572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,23:0.53:43
chr6	89894968	rs407206	G	A	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.329;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=132;ReadPosRankSum=-1.390;SC=TATAATAGAGGGTGAACCTTG;SOR=0.227;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=33;TCF=23;TCR=10;TR=13;WE=89894976;WS=89894958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,15:0.42:36
chr6	89895202	rs406462	G	A	1071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=3.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.76;ReadPosRankSum=0.320;SOR=0.336;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,30:0.44:68
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chr6	89913209	rs4590242	C	T	4282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FS=0.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.97;ReadPosRankSum=-0.110;SOR=0.731;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:165,121:0.42:286
chr6	89913218	rs4445034	T	A	3969.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.18;ReadPosRankSum=0.380;SOR=0.703;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:170,110:0.39:280
chr6	89913286	rs4386788	T	C	1567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.171;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=37;PP=937;ReadPosRankSum=0.583;SC=CCCTCCAGATTTGCTTCAAAT;SOR=0.568;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=171;TCF=75;TCR=96;TR=71;WE=89913294;WS=89913276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,76:0.41:187
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chr6	90372574	rs36040566	A	C	3837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=358;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.243;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=78;PP=2359;ReadPosRankSum=-0.004;SC=CTTCCTCCTCATCATCATCAC;SOR=0.730;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=319;TCF=158;TCR=161;TR=157;WE=90372582;WS=90372564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:180,177:0.50:357
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chr6	90390443	rs9353689	C	A	1384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=34;PP=865;ReadPosRankSum=0.350;SC=GAAGGAGCAGCGCCCTGACAC;SOR=0.690;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=144;TCF=73;TCR=71;TR=65;WE=90390451;WS=90390433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,71:0.44:163
chr6	90393483	rs41273329	G	A	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.851;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=4;PP=53;ReadPosRankSum=0.962;SC=TAACTATGTCGTTTTGCTCCC;SOR=0.223;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=24;TCF=15;TCR=9;TR=8;WE=90393491;WS=90393473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr6	90397132	rs34766278	G	C	3757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=364;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.381;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=88;PP=2236;ReadPosRankSum=-0.310;SC=CAAAGACAAAGCTCGACTTGC;SOR=0.720;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=323;TCF=147;TCR=176;TR=161;WE=90397140;WS=90397122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:179,184:0.51:363
chr6	90398011	.	G	GA	51.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=0.000;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.44;ReadPosRankSum=0.580;SOR=0.534;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,7:0.19:36
chr6	90402482	rs9294445	G	A	1761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.473;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=41;PP=1178;ReadPosRankSum=-0.617;SC=ATACTGCTGTGGAGTGAGGTG;SOR=0.743;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=239;TCF=119;TCR=120;TR=81;WE=90402490;WS=90402472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,91:0.35:260
chr6	90402840	rs9351212	C	G	5780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=107;NR=86;PP=2965;SC=TTAAATTATCCAGCCGATCCA;SOR=0.777;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=193;TCF=107;TCR=86;TR=193;WE=90402848;WS=90402830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr6	90405306	rs9294446	T	A	6238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=119;NR=87;PP=2965;SC=CCATGCTCCATACTCTTGCCT;SOR=1.081;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=206;TCF=119;TCR=87;TR=206;WE=90405314;WS=90405296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr6	90405993	rs9362672	C	G	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.744;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.98;ReadPosRankSum=-0.955;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr6	90408589	rs3736984	A	G	2263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.337;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=43;PP=1235;ReadPosRankSum=2.639;SC=CAAACCTTCAATGTGGAGTCC;SOR=0.390;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=161;TCF=93;TCR=68;TR=93;WE=90408597;WS=90408579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,105:0.57:184
chr6	90415764	rs7743484	A	G	4444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=59;PP=2705;SC=ATAAAACAAGATGCAGTTCCT;SOR=1.036;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=88;TCR=59;TR=147;WE=90415772;WS=90415754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr6	90418262	rs2026634	C	T	4364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=72;PP=2816;SC=CAGGCTGGTCCGTTTGTGGGT;SOR=0.744;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=149;TCF=77;TCR=72;TR=149;WE=90418270;WS=90418252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr6	90422627	rs2013736	G	C	287.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=276;SC=ACTCTTCAATGAAAAACACAA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=90422635;WS=90422617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	90426270	rs9342205	C	T	340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=237;SC=TTAAGAAAAACAGTAGCTTCA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=90426278;WS=90426260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr6	90428968	rs6454774	G	A	1204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=25;PP=784;SC=ATAATGCAATGAAAACACAAA;SOR=1.455;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=14;TCR=25;TR=39;WE=90428976;WS=90428958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr6	90432584	rs2016744	A	T	287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=20;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=0;PP=274;SC=AAAAAAAAAAAAAGGCTTGCA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=12;WE=90432592;WS=90432574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	90432662	rs756363	C	T	3054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=30;PP=2032;SC=AAATACCAAGCGTGAAACTCA;SOR=1.791;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=77;TCR=30;TR=107;WE=90432682;WS=90432652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr6	90437699	rs7767196	G	A	6510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=104;NR=114;PP=2965;SC=GAAATGGAAAGAAGCCATTAT;SOR=0.921;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=218;TCF=104;TCR=114;TR=218;WE=90437707;WS=90437689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr6	90440408	.	A	T	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.494;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.15;ReadPosRankSum=-1.227;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr6	90447924	rs72915946	C	T	832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.019;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=6;PP=547;ReadPosRankSum=0.023;SC=ATTTACCTATCTCCTTTCTTC;SOR=1.557;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=75;TCF=56;TCR=19;TR=33;WE=90447932;WS=90447914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,35:0.45:78
chr6	90448092	rs4140446	C	T	7978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=118;NR=138;PP=2965;SC=AAGATTATGACTGATGATCTG;SOR=0.943;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=256;TCF=118;TCR=138;TR=256;WE=90448100;WS=90448082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,293:1.00:293
chr6	90450135	rs2180140	A	G	620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.255;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=20;PP=447;ReadPosRankSum=1.365;SC=AAGGGCTTATACAATCTTTCT;SOR=0.434;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=54;TCF=14;TCR=40;TR=28;WE=90450143;WS=90450125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,28:0.55:51
chr6	90453248	rs2273245	T	C	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.83;ReadPosRankSum=0.123;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr6	90453256	rs3215598	G	GT	538.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.55;ReadPosRankSum=-0.274;SOR=0.963;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr6	90453263	rs2273246	A	G	612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.15;ReadPosRankSum=-0.095;SOR=0.392;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
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chr6	90455084	rs9359861	A	G	5206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=95;PP=2965;SC=TCCACACGATATGGCCAAAGT;SOR=0.998;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=172;TCF=77;TCR=95;TR=172;WE=90455092;WS=90455074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
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chr6	90577725	.	TGGA	T	2945	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=8;NR=32;PP=2945;QD=20;SC=TGCCCAGACATGGAAAGGAAG;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=144;TCF=22;TCR=122;TR=40;WE=90577735;WS=90577696;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:104,40:0.28:144
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chr6	90605836	rs7738845	T	A	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=235;ReadPosRankSum=-0.360;SC=CTTAGAAAAATCTTATTATAT;SOR=0.330;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=14;WE=90605844;WS=90605826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
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chr6	90661576	rs2236181	T	C	2375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.735;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=58;PP=1210;ReadPosRankSum=0.026;SC=AGCCCCTGGCTGTGACCTGCA;SOR=1.008;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=185;TCF=88;TCR=97;TR=102;WE=90661584;WS=90661566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,117:0.54:215
chr6	93956769	rs450238	T	C	1311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=38;PP=908;SC=CCAAATTTCCTGGTAGGCAAA;SOR=3.398;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=7;TCR=38;TR=45;WE=93956777;WS=93956759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr6	93964319	rs345736	C	T	938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=5;PP=794;SC=TAATACTGGCCATTAATGTAT;SOR=3.056;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=32;WE=93964327;WS=93964309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr6	93965492	rs62414217	G	A	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=277;ReadPosRankSum=-1.631;SC=TCCTGCTTTCGTGGTAGAAAA;SOR=0.368;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=14;WE=93965500;WS=93965482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr6	93967851	rs345730	C	T	7002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=135;NR=89;PP=2965;SC=GGACAACATTCGGGTGGTCAA;SOR=0.996;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=224;TCF=135;TCR=89;TR=224;WE=93967859;WS=93967841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
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chr6	96999220	rs2475024	G	C	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.133;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=9;PP=280;ReadPosRankSum=-0.087;SC=TTCCACTCAGGAACTTGTTAC;SOR=0.313;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=30;TCF=17;TCR=13;TR=20;WE=96999228;WS=96999210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,21:0.64:33
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chr6	97339088	rs11402	C	T	5154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.44;SOR=0.838;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr6	97339275	rs34213186	C	CA	1865.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.019;HP=10;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=40;PP=762;ReadPosRankSum=-0.948;SC=TACCTAGTATCAAAAAAAAAA;SOR=0.874;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=66;TCF=6;TCR=60;TR=46;WE=97339283;WS=97339264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,82:0.81:101
chr6	97575196	rs2206094	C	T	1521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=19;PP=767;SC=GTAGCTAATTCTCCTTTAATT;SOR=0.877;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=28;TCR=19;TR=47;WE=97575204;WS=97575186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr6	97575423	rs1612775	G	C	720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=19;PP=546;SC=AATGCCAAGTGTACACACACA;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=22;WE=97575431;WS=97575413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr6	97578888	rs2387931	A	G	1014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=28;PP=740;SC=AACTTGTTTCATAGACATCTT;SOR=2.964;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=33;WE=97578896;WS=97578878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr6	97613163	rs1209290	T	C	3552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=34;PP=2154;SC=ATGATATTGGTGGAATAGTGG;SOR=1.724;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=82;TCR=34;TR=116;WE=97613171;WS=97613153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr6	97626374	rs1737145	A	G	3621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=61;NR=57;PP=1932;SC=TAAATATTCAACTTGGGCCTT;SOR=0.767;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=62;TCR=57;TR=118;WE=97626382;WS=97626364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr6	97627519	rs12202912	C	T	242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=212;SC=AACATTCTAACATCCCTGCAA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=97627527;WS=97627509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	97677118	rs9481410	G	A	7082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=127;NR=107;PP=2965;SC=TCTCTGAGACGTTACAAAAGC;SOR=0.805;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=234;TCF=127;TCR=107;TR=234;WE=97677126;WS=97677108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,262:1.00:262
chr6	97679540	rs34952523	GA	G	2093.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.12;QD=27.19;SOR=1.379;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr6	97694582	rs113639235	A	ATAG	4189.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=42;PP=2522;SC=AAGGGAGAAAATAGTGCATCA;SOR=1.354;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=52;TCF=2;TCR=50;TR=44;WE=97694590;WS=97694572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr6	97702313	rs67917473	AATTT	A	752.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=2;PP=599;SC=ATACATAAATAATTTATCTCT;SOR=2.833;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=13;WE=97702324;WS=97702303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr6	99283376	rs195860	T	G	4141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=76;NR=63;PP=2468;SC=AGCCGGCCGGTCTGCACCACC;SOR=0.746;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=139;TCF=76;TCR=63;TR=139;WE=99283384;WS=99283366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr6	99353272	rs6935315	A	G	1301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=29;PP=1117;ReadPosRankSum=1.830;SC=GCTGGGGGGGAAAAAAACTTC;SOR=0.679;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=169;TCF=108;TCR=61;TR=81;WE=99353280;WS=99353261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,72:0.43:166
chr6	99353427	rs61744041	T	C	3123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.899;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=61;PP=1929;ReadPosRankSum=-1.122;SC=CCCAGTATGGTTGCAGATTGA;SOR=0.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=259;TCF=135;TCR=124;TR=127;WE=99353435;WS=99353417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,143:0.50:285
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chr6	99572651	rs11755926	G	A	2258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.428;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=48;PP=1193;ReadPosRankSum=2.861;SC=GATGCCCATCGTTCACCTCTG;SOR=0.542;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=182;TCF=83;TCR=99;TR=96;WE=99572659;WS=99572641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,110:0.54:202
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chr6	99993188	rs330806	C	A	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.103;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=185;ReadPosRankSum=0.475;SC=ACTACACAACCCTCAGAAAAC;SOR=0.317;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=13;WE=99993196;WS=99993178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
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chr6	100957763	.	CA	C	66.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.926;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.64;MQRankSum=1.304;QD=5.13;ReadPosRankSum=0.159;SOR=1.229;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr6	100964147	rs240780	G	C	1184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.318;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=30;PP=916;ReadPosRankSum=-1.079;SC=TTCAGGAAGGGACTCGATGGA;SOR=0.811;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=139;TCF=69;TCR=70;TR=56;WE=100964155;WS=100964137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,58:0.40:146
chr6	101037718	rs1006398	T	A	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.475;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=415;ReadPosRankSum=1.362;SC=TTCAGACAGGTGCTTTTGAAA;SOR=2.143;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=18;WE=101037726;WS=101037708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr6	101049645	rs141774099	CG	C	928.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.380;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.698;NF=8;NR=10;PP=531;ReadPosRankSum=0.493;SC=TGTCTTATTTCGGGGCAAAAC;SOR=1.159;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=39;TCF=16;TCR=23;TR=18;WE=101049653;WS=101049635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,34:0.52:65
chr6	101049748	rs61746540	C	T	1503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.824;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=1.762;NF=35;NR=33;PP=806;ReadPosRankSum=0.946;SC=ATGCATCTTGCTTAGATGTAA;SOR=0.644;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=133;TCF=73;TCR=60;TR=68;WE=101049756;WS=101049738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,77:0.50:155
chr6	101053683	rs75066083	G	T	566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.202;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=21;PP=415;ReadPosRankSum=-1.490;SC=AAAAGAAATAGAATATTGTGA;SOR=1.681;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=52;TCF=10;TCR=42;TR=24;WE=101053691;WS=101053673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,25:0.47:53
chr6	101053726	rs7452753	C	T	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.104;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=90;ReadPosRankSum=-0.410;SC=GCTACTACTACGTTGAGTTCC;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=4;WE=101053734;WS=101053716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
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chr6	101094450	rs7773317	T	C	1171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.835;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=12;PP=681;ReadPosRankSum=0.638;SC=GTAGTACAGATATTTTTGTTT;SOR=0.865;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=86;TCF=61;TCR=25;TR=46;WE=101094458;WS=101094440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,54:0.57:94
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chr6	101095391	rs77400562	C	T	805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=20;PP=514;ReadPosRankSum=0.160;SC=GTCAATAAATCTATTATTCAA;SOR=0.655;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=23;TCR=40;TR=32;WE=101095399;WS=101095381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,36:0.51:70
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chr6	101100797	rs41288411	G	C	1216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.753;HP=1;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=30;PP=1714;ReadPosRankSum=-0.220;SC=CAGTTGAATAGTGCTTTAGAG;SOR=0.599;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=96;TCF=36;TCR=60;TR=49;WE=101100805;WS=101100773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,56:0.52:107
chr6	101109618	rs80121674	C	T	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=128;ReadPosRankSum=0.868;SC=ACTCAATCTTCATCTTTCTTG;SOR=0.247;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=8;WE=101109626;WS=101109615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
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chr6	101166095	rs41288423	G	A	2157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.550;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=46;PP=1143;ReadPosRankSum=0.450;SC=CAGACAGTCCGAGAATCCTTA;SOR=0.637;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=160;TCF=70;TCR=90;TR=84;WE=101166103;WS=101166085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,96:0.52:183
chr6	101215223	rs11345864	TA	T	3641.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.772;HP=10;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.259;NF=3;NR=71;PP=1374;ReadPosRankSum=0.582;SC=CTGTCCGATCTAAAAAAAAAA;SOR=0.793;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=91;TCF=4;TCR=87;TR=74;WE=101215231;WS=101215213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,142:0.99:143
chr6	101248173	rs41288435	T	C	2565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.239;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=49;PP=1663;ReadPosRankSum=-1.113;SC=TGGCTTTTATTACCTTTGTAT;SOR=0.895;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=254;TCF=142;TCR=112;TR=116;WE=101248181;WS=101248163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,128:0.45:285
chr6	101296389	rs9390698	G	A	2086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-3.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.178;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=38;PP=1240;ReadPosRankSum=-0.940;SC=AGAGCAGTAAGATCATCTTGA;SOR=0.692;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=151;TCF=82;TCR=69;TR=82;WE=101296397;WS=101296379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,95:0.54:176
chr6	101312097	rs846791	C	T	1848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.02;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr6	101312104	rs705600	T	C	1816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.25;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr6	102133993	rs2852565	G	A	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=127;ReadPosRankSum=-1.148;SC=GACTATTTCAGTAATACATGC;SOR=0.330;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=8;WE=102134001;WS=102133983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr6	102134022	rs2786251	C	G	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.962;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=2;PP=461;ReadPosRankSum=-1.367;SC=ATACTCTGTCCATAATAACAA;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=46;TCF=42;TCR=4;TR=27;WE=102134030;WS=102134012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,28:0.58:48
chr6	102247673	rs6922753	T	C	1826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.540;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=50;PP=1201;ReadPosRankSum=1.424;SC=AGAGGTAAGTTAGGAGAAGAA;SOR=0.630;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=173;TCF=67;TCR=106;TR=81;WE=102247681;WS=102247663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,89:0.45:198
chr6	102376517	rs2243355	G	A	1433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.772;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=44;PP=946;ReadPosRankSum=2.440;SC=GGTAAGTTCTGCTGGTTACCT;SOR=0.973;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=102;TCF=28;TCR=74;TR=59;WE=102376525;WS=102376507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,63:0.58:109
chr6	102503196	rs2227281	C	T	1268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.267;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=21;PP=888;ReadPosRankSum=-0.208;SC=ATAACCTCTCCTTTCTTAGGT;SOR=0.935;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=118;TCF=73;TCR=45;TR=60;WE=102503204;WS=102503186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,62:0.47:133
chr6	102503317	rs2227283	G	A	2470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.683;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=46;PP=1474;ReadPosRankSum=0.683;SC=CAGAAGAGGAGAGCAAAGAGG;SOR=0.574;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=193;TCF=107;TCR=86;TR=100;WE=102503325;WS=102503307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,114:0.50:226
chr6	102513865	rs1034253	C	T	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.267;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=13;PP=365;ReadPosRankSum=0.355;SC=CCACATAAATCCTTTAATAGA;SOR=0.255;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=46;TCF=18;TCR=28;TR=25;WE=102513873;WS=102513855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,28:0.56:50
chr6	105192107	rs72218235	TAAC	T	2902.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.065;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.947;NF=5;NR=34;PP=1613;ReadPosRankSum=0.089;SC=CCAGAACCACTAACAACAAGA;SOR=0.864;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=10;TCR=68;TR=39;WE=105192117;WS=105192097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,77:0.52:148
chr6	105198124	rs55772282	T	G	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=58;ReadPosRankSum=0.751;SC=CATTATTTCATTCATCATAAT;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=4;WE=105198132;WS=105198118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
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chr6	105218982	rs7770269	A	G	931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=10;PP=689;ReadPosRankSum=-0.232;SC=AAGTTTTTCTACAAGTGCCAG;SOR=0.631;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=80;TCF=59;TCR=21;TR=39;WE=105218990;WS=105218972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,40:0.49:82
chr6	105219773	rs7741145	T	C	1793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=29;PP=1169;ReadPosRankSum=0.019;SC=TAAATAAATGTCTGCAGAAAT;SOR=0.711;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=138;TCF=89;TCR=49;TR=76;WE=105219781;WS=105219763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,83:0.52:160
chr6	105231930	rs35543340	A	C	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.999;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=215;ReadPosRankSum=-1.910;SC=ATTTCATTAGATAGAATAAAA;SOR=1.565;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=15;WE=105231938;WS=105231920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,16:0.38:42
chr6	105232204	rs2290515	C	T	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.084;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=220;ReadPosRankSum=-1.102;SC=TTGAATAGTACGAGAAATAGT;SOR=1.292;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=41;TCF=30;TCR=11;TR=14;WE=105232212;WS=105232194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,15:0.35:43
chr6	105232233	rs9322817	A	C	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.151;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=384;ReadPosRankSum=-0.081;SC=TGTTTAGATGAAACTGTAAGT;SOR=1.112;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=69;TCF=45;TCR=24;TR=25;WE=105232241;WS=105232223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,27:0.38:71
chr6	105232460	rs71763197	C	CA	206.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.70;ReadPosRankSum=-0.224;SOR=0.531;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,14:0.32:44
chr6	105244526	rs6918700	A	T	1371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=22;PP=753;ReadPosRankSum=-2.396;SC=CACAAATACAATACCATGTTT;SOR=0.729;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=99;TCF=60;TCR=39;TR=58;WE=105244534;WS=105244516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,65:0.60:109
chr6	105259152	rs2168394	C	T	813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.131;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=11;PP=405;ReadPosRankSum=1.914;SC=TATATATGAGCATATATAGCA;SOR=1.000;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=69;TCF=47;TCR=22;TR=37;WE=105259160;WS=105259142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,38:0.58:65
chr6	105300070	.	C	CTGTG	49.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.497;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.805;HP=3;HapScore=4;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=174;ReadPosRankSum=-0.744;SC=TATGTCCAAACTGTCTGTGTG;SOR=1.819;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=11;WE=105300082;WS=105300060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,4:0.22:18
chr6	105300074	rs2499661	C	G	429.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=169;ReadPosRankSum=1.068;SC=TCCAAACTGTCTGTGTGTGTG;SOR=1.179;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=7;WE=105300082;WS=105300060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,12:0.86:14
chr6	105300105	rs2499662	C	T,CGT	1598.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;QD=38.99;SOR=1.075;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,22,19:0.54,0.46:41
chr6	105300262	rs10635352	C	CAG	4103.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=47;PP=663;SC=TAAAAAAAAACAAAGAGTTCA;SOR=1.434;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=4;TCR=47;TR=51;WE=105300270;WS=105300250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr6	105306402	rs4541782	T	A	2653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.814;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=44;PP=1567;ReadPosRankSum=0.146;SC=TAGTGAGACCTCATCTCTATA;SOR=0.529;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=221;TCF=134;TCR=87;TR=104;WE=105306410;WS=105306392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,123:0.48:255
chr6	105307435	rs2499655	G	A	2691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.001;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=64;PP=1728;ReadPosRankSum=-0.124;SC=CCCGCGACCCGGCTCACCCTC;SOR=0.610;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=218;TCF=97;TCR=121;TR=115;WE=105307443;WS=105307425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,124:0.52:240
chr6	105388405	rs7766336	T	G	306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.89;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	105405220	rs61701350	T	TC	845.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=25;PP=729;SC=TCTTAGACCGTCCCCCCCTTC;SOR=5.353;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=25;WE=105405228;WS=105405210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr6	105406274	rs17065417	A	C	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=23;PP=550;ReadPosRankSum=0.706;SC=GAAAGACAAAATCTTCCCTGA;SOR=0.324;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=25;WE=105406282;WS=105406264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,27:0.68:40
chr6	105505969	rs62419624	C	T	866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.723;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=11;PP=473;ReadPosRankSum=-0.818;SC=CCTGGCTTGACGGTGCATTTT;SOR=0.922;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=83;TCF=56;TCR=27;TR=37;WE=105505977;WS=105505959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,44:0.46:95
chr6	105526709	.	A	G	603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=0.000;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.274;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=374;ReadPosRankSum=-0.637;SC=AGTCTACCTCATGCAAGTATA;SOR=0.481;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=52;TCF=12;TCR=40;TR=25;WE=105526717;WS=105526699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,27:0.49:55
chr6	105548850	rs221657	C	T	420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=13;NR=0;PP=352;SC=CCTCCGACTCCACCAGTCTGG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=105548858;WS=105548847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	105577172	rs9404603	A	G	859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=1;PP=518;SC=TATGCTAGATACTTACTCTTA;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=105577180;WS=105577162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr6	105577224	rs9404604	A	C	2626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=13;PP=1837;SC=CTTTAAAATCACTTCCTTATT;SOR=3.134;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=66;TCR=13;TR=79;WE=105577232;WS=105577214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr6	105577401	rs4946656	C	T	6905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=136;PP=2965;SC=AAAGTTAACACGTTAGATAAT;SOR=1.307;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=226;TCF=89;TCR=137;TR=225;WE=105577409;WS=105577391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr6	105595261	rs1190274	G	A	3473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=79;PP=2187;SC=TAAAGGTACTGTTTTATTTAG;SOR=2.000;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=114;TCF=35;TCR=79;TR=114;WE=105595269;WS=105595251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr6	105602108	rs1190280	T	G	857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=21;NR=6;PP=560;SC=TATTTATGGCTTTTGTCAAAC;SOR=2.694;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=27;WE=105602116;WS=105602098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr6	105614712	rs1190292	T	G	1239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=37;PP=958;SC=GGGTTACATATTCAAGCATTT;SOR=4.174;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=4;TCR=38;TR=41;WE=105614720;WS=105614702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr6	105614743	rs67687316	TTG	T	225.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=0;NR=8;PP=384;SC=ACATAGATGGTTGTGTGTGTG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=8;WE=105614752;WS=105614733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
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chr6	105823966	rs9486071	A	G	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.545;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=237;ReadPosRankSum=0.000;SC=TGAGGGTCTTAGGAGTTCCAC;SOR=0.340;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=17;WE=105823974;WS=105823956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr6	105845906	rs6910880	G	A	361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=8;PP=185;SC=GGACAAAAATGCTAATTGGCT;SOR=1.765;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=12;WE=105845914;WS=105845896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	105850712	rs880177	A	G	2587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.14;SOR=0.936;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr6	106555025	rs1010273	G	A	5054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=494;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.415;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=121;NR=101;PP=2962;ReadPosRankSum=1.001;SC=CTGCGGCCCCGGCGCCTGGGC;SOR=0.795;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=451;TCF=234;TCR=217;TR=222;WE=106555033;WS=106555015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:248,245:0.50:493
chr6	106899793	rs7763469	C	T	700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=18;PP=459;SC=CTAAGAAACACATACTTAAAA;SOR=2.584;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=23;WE=106899801;WS=106899783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr6	106959139	rs11752122	A	G	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.374;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.590;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=100;ReadPosRankSum=-0.151;SC=CAAAAGTAAAACCAGAGTTTA;SOR=0.116;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=6;WE=106959147;WS=106959138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr6	106959424	rs4946758	A	G	2584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.525;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=58;PP=1774;ReadPosRankSum=-1.024;SC=CCACCAGATCAAATGCCAAAC;SOR=0.764;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=181;TCF=83;TCR=98;TR=106;WE=106959432;WS=106959414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,111:0.56:200
chr6	106959961	rs4946759	A	G	4763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=79;NR=74;PP=2930;SC=GTGCCGAAGAAGGCTCCCTGG;SOR=0.753;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=153;TCF=79;TCR=74;TR=153;WE=106959969;WS=106959951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr6	106959999	rs1340623	C	G	4699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=65;PP=2869;SC=AGCCAGCCCCCCAAGGGCGCG;SOR=0.932;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=157;TCF=92;TCR=65;TR=156;WE=106960007;WS=106959989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr6	106960039	rs4945755	G	A	2338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=43;PP=1507;ReadPosRankSum=0.172;SC=CTCCGGCCGAGGGCGCAGCGC;SOR=0.732;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=177;TCF=97;TCR=80;TR=95;WE=106960047;WS=106960029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,105:0.54:195
chr6	106960447	rs11152999	G	A	3093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.958;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=67;PP=1865;ReadPosRankSum=0.597;SC=CGAGCCCAGAGTCCAAGCCCA;SOR=0.807;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=262;TCF=131;TCR=131;TR=131;WE=106960455;WS=106960437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,149:0.52:288
chr6	106960957	rs1381552	C	T	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.981;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=94;ReadPosRankSum=1.208;SC=TGTCCGCACACGTGCTGGGGG;SOR=1.643;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=20;TCF=8;TCR=12;TR=8;WE=106960965;WS=106960947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr6	106967185	rs1159148	A	C	3731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=360;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.719;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=79;PP=2359;ReadPosRankSum=0.156;SC=ATTCGAGGCCAAAGGAATACT;SOR=0.591;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=333;TCF=163;TCR=170;TR=163;WE=106967193;WS=106967175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,177:0.49:360
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chr6	106978314	.	G	A	26	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=26;QD=15.1928031368;SC=TAACTGTAAGGTATATTTTTA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=4;WE=106978322;WS=106978304;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:11,4:0.27:15
chr6	106987161	rs783397	A	G	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=289;ReadPosRankSum=-0.173;SC=ACCATTCATTATGTAGGTCCG;SOR=0.705;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=39;TCF=33;TCR=6;TR=17;WE=106987169;WS=106987151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,19:0.44:43
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chr6	106989212	rs783392	G	A	2106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.319;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=44;PP=1139;ReadPosRankSum=-0.035;SC=AAAAAAACTTGCTAGGTCAAA;SOR=0.652;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=189;TCF=97;TCR=92;TR=96;WE=106989220;WS=106989202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,107:0.50:215
chr6	106992464	rs1799693	A	G	3771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=50;PP=2245;SC=CATATGAGAAACCTGGATTTA;SOR=0.980;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=74;TCR=50;TR=124;WE=106992472;WS=106992454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr6	106992592	rs2247335	A	T	4292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=63;PP=2472;SC=GGACAAGCTAATGGCTAATAC;SOR=0.744;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=137;TCF=74;TCR=63;TR=137;WE=106992600;WS=106992582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
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chr6	106999658	rs1676010	A	T	1514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=13;PP=1014;SC=TGATACATAGATATCCAAATA;SOR=1.835;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=37;TCR=13;TR=50;WE=106999666;WS=106999648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
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chr6	107006347	rs4946763	T	C	924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=4.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.475;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=4;PP=631;ReadPosRankSum=0.256;SC=AACATTGTTTTTGTTCCTCAA;SOR=1.158;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=65;TCF=55;TCR=10;TR=31;WE=107006355;WS=107006337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,35:0.49:72
chr6	107050867	rs6568446	A	T	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.190;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=200;ReadPosRankSum=1.491;SC=GTTTTCAACAAATAACTGGTT;SOR=0.955;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=51;TCF=17;TCR=34;TR=17;WE=107050875;WS=107050857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,18:0.34:53
chr6	107069232	rs1870868	G	A	3486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=42;PP=2263;SC=AAAAACACCAGTTATTTCAGA;SOR=1.355;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=115;TCF=73;TCR=42;TR=115;WE=107069240;WS=107069222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr6	107069273	rs1870867	T	C	4807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=59;PP=2629;SC=AACTTTCTAATGCATTTCAGC;SOR=1.278;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=161;TCF=102;TCR=59;TR=161;WE=107069281;WS=107069263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr6	107069422	rs6919395	G	A	2034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.798;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=46;PP=1114;ReadPosRankSum=-1.123;SC=TTTTTTGACCGAAGCTAAGCA;SOR=0.564;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=165;TCF=73;TCR=92;TR=87;WE=107069430;WS=107069412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,100:0.52:191
chr6	107076696	rs1824619	G	A	1738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.600;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=41;PP=1256;ReadPosRankSum=-0.218;SC=GATAGTGTATGATAGGCATCA;SOR=0.768;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=130;TCF=67;TCR=63;TR=78;WE=107076704;WS=107076686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,81:0.54:151
chr6	107076783	rs1987623	A	T	2842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=43;PP=1601;SC=CAGTGCTCCTAGGAGAGGTAG;SOR=0.791;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=48;TCR=43;TR=91;WE=107076791;WS=107076773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr6	107077550	rs3747792	G	A	1531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.616;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=25;PP=991;ReadPosRankSum=-2.698;SC=GGCTGGGCACGAGGACCATGC;SOR=0.772;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=136;TCF=85;TCR=51;TR=69;WE=107077558;WS=107077540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,75:0.50:149
chr6	107088886	rs142129006	CTAAT	C	821.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.291;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=692;ReadPosRankSum=-1.101;SC=TAATCTCAGACTAATTATATC;SOR=1.493;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=11;WE=107088900;WS=107088876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,22:0.41:54
chr6	107088892	.	A	G	830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.224;ClippingRankSum=0.000;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.332;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=700;ReadPosRankSum=-1.355;SC=CAGACTAATTATATCTTTGAA;SOR=1.395;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=41;TCF=14;TCR=27;TR=15;WE=107088900;WS=107088876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,23:0.44:52
chr6	107097123	rs34503502	AAC	A	2691.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=34;PP=1774;SC=CCCAAATACAAACAGTCATAA;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=38;WE=107097132;WS=107097113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr6	107113715	rs2015205	G	A	6978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=129;NR=111;PP=2965;SC=CAATAGGACTGCAGTTTATTG;SOR=0.807;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=240;TCF=129;TCR=111;TR=240;WE=107113723;WS=107113705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr6	107113953	rs2169463	C	G	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=640;ReadPosRankSum=-0.276;SC=CTTTGGGAGGCCAAGGCGAGC;SOR=0.460;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=13;WE=107113975;WS=107113943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
chr6	107113963	rs9373889	C	T	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.04;ReadPosRankSum=-0.073;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr6	107113967	rs9400045	T	A	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.38;ReadPosRankSum=-0.048;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr6	107231881	rs376280113	GTC	G	84.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=3.547;NF=7;NR=4;PP=190;ReadPosRankSum=-0.529;SC=AAGAGGAGAGGTCTCTCTCTC;SOR=0.693;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=43;TCF=21;TCR=22;TR=11;WE=107231890;WS=107231871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,10:0.14:71
chr6	107351195	.	G	GT	179.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.257;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.57;ReadPosRankSum=1.227;SOR=3.014;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr6	107351457	rs1665924	G	T	3156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=62;PP=1918;SC=AGACTTTGCTGTTCTCTGAGT;SOR=1.412;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=42;TCR=62;TR=104;WE=107351465;WS=107351447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr6	107361476	rs311207	A	G	1094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=28;PP=721;SC=GCTCGTAGTCATGTTATTTTA;SOR=2.247;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=10;TCR=28;TR=38;WE=107361484;WS=107361466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr6	107365376	rs7767291	C	T	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.228;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5006;FS=5.825;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=129;ReadPosRankSum=0.956;SC=AGTTTTGTTACGTGGATATAC;SOR=2.636;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=8;WE=107365384;WS=107365366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr6	107365411	rs311249	G	T	709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=3;PP=343;SC=GTCTGGGCTTGAGTGTACCCA;SOR=1.697;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=107365419;WS=107365401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr6	107372242	rs3833659	GTTTTC	G	1390.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.964;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.192;NF=18;NR=9;PP=1090;ReadPosRankSum=2.428;SC=CCAAGCCTCTGTTTTCTTTTA;SOR=0.954;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=70;TCF=43;TCR=27;TR=27;WE=107372254;WS=107372232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,38:0.42:90
chr6	107566946	rs9373933	A	G	87.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=3;PP=51;SC=AAAAAATGGGACTATGCACCA;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=107566954;WS=107566936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
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chr6	107956095	rs9486659	A	G	1048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=18;PP=484;SC=GCGCGAGCCGAGCGCCGCGGA;SOR=1.863;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=11;TCR=18;TR=29;WE=107956103;WS=107956085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
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chr6	108026402	rs1546961	A	C	1777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.054;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=42;PP=909;ReadPosRankSum=0.052;SC=TTTTTAAAAAAGTCAGAACTT;SOR=0.650;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=173;TCF=93;TCR=80;TR=81;WE=108026410;WS=108026392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,91:0.48:191
chr6	108026455	rs1546960	A	G	1377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.583;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=36;PP=767;ReadPosRankSum=1.459;SC=GTTTCAGTGCAGGTCCCAGCT;SOR=0.767;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=146;TCF=62;TCR=84;TR=59;WE=108026463;WS=108026445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,72:0.43:167
chr6	108028967	rs6921672	T	C	671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=7;PP=450;ReadPosRankSum=-0.013;SC=AGAGCACCCCTCCACCACCTC;SOR=0.616;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=60;TCF=45;TCR=15;TR=30;WE=108028975;WS=108028957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,32:0.48:66
chr6	108028996	rs3734751	G	A	2646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=18;PP=837;ReadPosRankSum=-0.017;SC=GCATCCCGCAGCTCCCTGGAC;SOR=0.700;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=134;TCF=93;TCR=41;TR=63;WE=108029004;WS=108028986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,69:0.46:149
chr6	108029020	rs3734752	T	C	3744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.030;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=41;PP=1329;ReadPosRankSum=-2.181;SC=ACTCTCCTTCTGTGCCTGCTC;SOR=0.617;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=210;TCF=133;TCR=77;TR=111;WE=108029028;WS=108029010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,119:0.52:231
chr6	108029109	rs3734754	T	C	4104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=391;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.364;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=85;PP=1966;ReadPosRankSum=-1.860;SC=CCAGAGCCTGTGGGTCGGCGT;SOR=0.722;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=344;TCF=177;TCR=167;TR=175;WE=108029117;WS=108029099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:189,202:0.52:391
chr6	108029180	rs56215636	G	A	2112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.146;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=48;PP=1230;ReadPosRankSum=-1.415;SC=CTCCGTGGCCGCCTGGCATCC;SOR=0.585;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=170;TCF=74;TCR=96;TR=88;WE=108029188;WS=108029170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,99:0.52:190
chr6	108042213	rs846977	G	A	2537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=61;PP=1570;ReadPosRankSum=-1.063;SC=CAATAAGGCAGTACAGAGAAG;SOR=0.659;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=211;TCF=99;TCR=112;TR=114;WE=108042221;WS=108042203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,121:0.53:227
chr6	108042334	rs846978	T	C	576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.652;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=377;ReadPosRankSum=-0.674;SC=GAAATGAACCTCACAACATAA;SOR=0.331;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=22;WE=108042342;WS=108042324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,24:0.63:38
chr6	108066144	rs6922304	A	G	1067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.629;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=16;PP=561;ReadPosRankSum=-1.088;SC=GAAGCAGGACAAGGCCTACCT;SOR=0.452;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=84;TCF=52;TCR=32;TR=40;WE=108066152;WS=108066134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,50:0.51:99
chr6	108068003	rs6934505	C	T	2068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.710;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=48;PP=1297;ReadPosRankSum=0.511;SC=CGCCGATGGCCGCTCGGGCCC;SOR=0.966;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=148;TCF=75;TCR=73;TR=89;WE=108068011;WS=108067993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,93:0.58:161
chr6	108071204	rs150723162	C	CAG	121.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=2;PP=46;ReadPosRankSum=-0.842;SC=GGGTCACACTCAGATCACCTC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=2;WE=108071212;WS=108071194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr6	108076672	rs7750796	C	G	736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=17;PP=456;ReadPosRankSum=0.393;SC=AGGGAGTCACCCATGATTTTG;SOR=0.656;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=72;TCF=42;TCR=30;TR=39;WE=108076680;WS=108076662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,40:0.48:83
chr6	108093328	rs9480798	G	A	1022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=22;NR=11;PP=487;SC=CCAAGTACCCGTGCCCCAGCC;SOR=1.236;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=22;TCR=11;TR=33;WE=108093336;WS=108093318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr6	108193148	rs642954	C	T	1147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=22;PP=600;SC=ACAGCAATTACAAAGAAATAG;SOR=1.455;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=15;TCR=22;TR=37;WE=108193156;WS=108193138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr6	108194241	rs579120	T	C	1916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=17;NR=44;PP=1386;SC=AAAGTCCTAATAAATGTTACT;SOR=2.194;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=17;TCR=44;TR=61;WE=108194249;WS=108194231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr6	108197998	rs570558	A	G	683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=12;PP=402;SC=CAAAATAGGTATTCAAATGAA;SOR=0.922;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=12;TCR=12;TR=24;WE=108198006;WS=108197988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr6	108224422	rs2272886	A	C	1216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.103;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=10;PP=846;ReadPosRankSum=-0.196;SC=TAAAAGAAAAATTATTTGCCT;SOR=1.222;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=102;TCF=78;TCR=24;TR=48;WE=108224430;WS=108224412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,53:0.46:114
chr6	108224599	.	CA	C	300.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.805;ClippingRankSum=0.000;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=0.684;QD=3.50;ReadPosRankSum=0.400;SOR=0.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,26:0.30:86
chr6	108227523	rs6906940	T	G	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.170;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=315;ReadPosRankSum=0.487;SC=CCTCTTTTGTTTATATATTAC;SOR=0.252;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=16;WE=108227531;WS=108227513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr6	108230346	rs617920	A	T	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.329;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=50;ReadPosRankSum=-0.549;SC=CTGAGGTGAGAGGACTGCTTG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=4;WE=108230354;WS=108230336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr6	108233929	rs675117	G	A	1182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.912;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=20;PP=620;ReadPosRankSum=1.815;SC=CCAGAATTGAGTTTTTCTGGT;SOR=0.445;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=42;TCR=32;TR=46;WE=108233937;WS=108233919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,53:0.65:82
chr6	108243115	rs142388422	T	TGGG	956.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=5.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.34;ReadPosRankSum=2.495;SOR=1.858;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,24:0.69:35
chr6	108243121	rs201981258	AAAAC	A	58.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.80;ReadPosRankSum=1.799;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr6	108277287	rs9486756	C	A	2596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=39;NR=42;PP=1206;SC=TCAAGACCAGCCTGGGTAAAT;SOR=1.007;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=39;TCR=42;TR=81;WE=108277295;WS=108277277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr6	108279290	rs2272884	G	A	1335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=34;PP=939;SC=CCAACGCCCCGGCCCGAGTGG;SOR=3.160;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=42;TCF=8;TCR=34;TR=41;WE=108279298;WS=108279280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
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chr6	108487877	rs127501	A	G	721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=8;PP=424;SC=GCTGGAGGGCAGCTGGAGAGC;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=25;WE=108487885;WS=108487867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr6	108489462	rs383319	G	A	965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=28;PP=734;SC=CTGAGCCTCCGTTGCAAAAAC;SOR=2.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=9;TCR=28;TR=37;WE=108489470;WS=108489452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr6	108495950	rs2233492	G	A	237.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=0;PP=193;SC=GCAAGGTCGCGCCTCCACACC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=108495958;WS=108495940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	108498014	rs10563315	CTG	C	1691.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.909;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=1037;ReadPosRankSum=0.909;SC=TTCTTCTGAGCTGTGTGATTG;SOR=0.515;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=43;TCF=9;TCR=34;TR=24;WE=108498023;WS=108498004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,45:0.61:74
chr6	108502642	rs2233495	C	A	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.074;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=196;ReadPosRankSum=0.357;SC=AAGTGATCCGCCTGCCTCGGC;SOR=0.144;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=13;WE=108502650;WS=108502632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr6	108665932	rs12529330	C	G	1762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.837;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=33;PP=1175;ReadPosRankSum=0.745;SC=GTTTTACCCTCCCTTTCTGAA;SOR=0.854;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=166;TCF=96;TCR=70;TR=81;WE=108665940;WS=108665922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,84:0.46:183
chr6	108677003	rs2135941	G	A	2605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=32;NR=49;PP=1396;SC=GTGGGGAAACGCTACAAAATG;SOR=1.420;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=32;TCR=49;TR=81;WE=108677011;WS=108676993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr6	108723152	rs41287536	A	T	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.30;ReadPosRankSum=1.396;SOR=0.568;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,30:0.43:70
chr6	108768591	rs72938657	G	T	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=207;ReadPosRankSum=-0.659;SC=AACGTGAAAGGCTGGTTCTGA;SOR=0.446;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=11;WE=108768599;WS=108768581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr6	108798498	rs1332027	A	G	2222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.211;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=48;PP=1299;ReadPosRankSum=-0.671;SC=GTGAGAGAGTAAGTATCCAGG;SOR=0.558;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=224;TCF=101;TCR=123;TR=94;WE=108798506;WS=108798488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,106:0.44:241
chr6	108840870	rs2274776	A	G	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=4.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.285;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=344;ReadPosRankSum=-1.401;SC=TGTAAAGAGTAACACATTTAC;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=16;WE=108840878;WS=108840860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr6	108882570	rs11757217	C	T	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.682;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.74;MQRankSum=-0.156;QD=9.18;ReadPosRankSum=0.637;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr6	109258284	rs2768558	T	C	597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.762;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=443;ReadPosRankSum=-0.973;SC=GTCTTTATGTTTTGAGTATAT;SOR=0.255;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=21;WE=109258292;WS=109258274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,22:0.65:34
chr6	109330758	rs148473451	CG	C	204.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=6;PP=144;SC=GCACGGACGGCGGGGGGGCGG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=6;WE=109330766;WS=109330748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	109479936	rs62427241	T	C	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.959;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=20;PP=489;ReadPosRankSum=-0.111;SC=GTGATTTTATTTTCTCTGTGT;SOR=0.970;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=66;TCF=25;TCR=41;TR=31;WE=109479944;WS=109479926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,37:0.49:76
chr6	109615482	.	T	G	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.022;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=5.281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.71;ReadPosRankSum=-2.164;SOR=2.484;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,8:0.25:32
chr6	109659589	rs61282496	TCA	T	79.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.28;ReadPosRankSum=0.000;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,8:0.23:35
chr6	109771087	rs947216	G	A	1999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.460;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=31;PP=1281;ReadPosRankSum=-1.761;SC=CTATTCCTCCGTCTATTCACT;SOR=0.882;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=185;TCF=114;TCR=71;TR=84;WE=109771095;WS=109771077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,92:0.45:203
chr6	109787000	rs2232450	G	C	1747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.936;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=45;PP=1128;ReadPosRankSum=1.958;SC=TCAAAATCCAGTCAGAGCTGG;SOR=0.857;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=149;TCF=64;TCR=85;TR=76;WE=109787008;WS=109786990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,82:0.49:166
chr6	109818529	.	TCA	T	132.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.748;HP=1;HapScore=3;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=194;ReadPosRankSum=-1.195;SC=CAGTGCTTGTTCACACACACA;SOR=1.136;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=26;TCF=16;TCR=10;TR=11;WE=109818540;WS=109818519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr6	109818563	.	ACACT	A	201	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MMLQ=17;MQ=59.72;NF=7;NR=6;PP=201;QD=15.6923076923;SC=ACACACACACACACTCTCTCT;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=43;TCF=23;TCR=20;TR=13;WE=109818578;WS=109818553;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:30,13:0.30:43
chr6	109954065	rs146518695	C	CATAG	618.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=276;ReadPosRankSum=-0.211;SC=GACAGATAGACATAGATAGAT;SOR=3.500;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=5;WE=109954073;WS=109954055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,16:0.89:18
chr6	109996751	rs829815	T	G	325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=241;SC=CAATATGTGGTTTTTATTTTT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=109996759;WS=109996741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	110036479	rs6924436	A	T	1048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=28;PP=779;SC=TATTTTTATCATAAATCTAAA;SOR=3.321;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=33;WE=110036487;WS=110036469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr6	110048489	rs11459279	C	CT	345.27	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=10.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.39;ReadPosRankSum=-0.583;SOR=0.392;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,20:0.83:24
chr6	110064255	rs72045093	TATTTC	T	3609.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.404;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.384;NF=34;NR=20;PP=2864;ReadPosRankSum=2.199;SC=CATTGAAAGTTATTTCATTAA;SOR=2.196;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=62;TCF=38;TCR=24;TR=54;WE=110064267;WS=110064245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,86:0.98:88
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chr6	110110943	rs9384723	G	T	840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=23;PP=617;SC=CTTGCAATATGATTTCCACCA;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=31;WE=110110951;WS=110110933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr6	110113763	rs200535694	CT	C	319.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=21.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.23;ReadPosRankSum=2.055;SOR=0.051;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,31:0.31:99
chr6	110551408	rs143209780	CTGA	C	37.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.55;ReadPosRankSum=-0.842;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,2:0.40:5
chr6	110643956	rs6908306	T	C	3192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.39;SOR=0.814;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr6	110644112	rs112341783	A	AG	3115.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=41;PP=2069;SC=TGTGTAAGGAAGAGGAACTGG;SOR=0.979;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=5;TCR=41;TR=46;WE=110644120;WS=110644102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr6	110679062	rs4945854	T	G	726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=15;NR=11;PP=415;SC=GGAGGTCCCATCGAGGCGGCC;SOR=0.836;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=15;TCR=11;TR=26;WE=110679070;WS=110679052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr6	110714205	rs35697832	C	T	3609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.016;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.99;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=69;PP=2114;ReadPosRankSum=0.382;SC=TTGCAGGCTCCGTGGAGGGAG;SOR=0.623;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=255;TCF=130;TCR=125;TR=147;WE=110714213;WS=110714195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,164:0.59:280
chr6	110714584	rs2235989	A	T	2194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=38;PP=1386;SC=TTTGTTAGCGACCTGATCAAC;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=33;TCR=38;TR=71;WE=110714592;WS=110714574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr6	110760008	rs12210538	A	G	1711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.291;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=44;PP=1016;ReadPosRankSum=1.196;SC=GACCTTGTCCATGGCGATGCA;SOR=0.924;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=161;TCF=81;TCR=80;TR=81;WE=110760016;WS=110759998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,87:0.49:176
chr6	110778323	rs717567	G	A	380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=317;SC=ACATATACACGAATGGATAAA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=110778331;WS=110778313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr6	110797214	rs2428188	C	G	3554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=65;PP=2146;SC=GTACCTGGCACGTATTAGGTT;SOR=1.252;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=48;TCR=66;TR=113;WE=110797222;WS=110797204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr6	110797563	rs2494551	A	C	660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=3;PP=835;SC=AAGCCCAGCTAGGGGCCGGCG;SOR=3.160;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=110797584;WS=110797553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr6	110797576	rs112174035	T	C	525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=1.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.48;ReadPosRankSum=2.031;SOR=1.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,23:0.59:39
chr6	110797605	rs2494552	G	A	3533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.50;SOR=1.519;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr6	110797612	rs6920997	A	G	3688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.92;SOR=1.455;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr6	110797703	rs150666553	CCGCGGG	C	5841.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FS=4.529;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.20;ReadPosRankSum=-0.356;SOR=0.386;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,219:0.98:223
chr6	110797713	.	C	CCACCCCT	10813.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=57;PP=2966;SC=CCGCGGGGCCCCTCCCCCATA;SOR=0.853;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=82;TCF=22;TCR=60;TR=76;WE=110797721;WS=110797692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr6	110797821	rs11153236	A	G	2494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=53;PP=1563;SC=AGCTCCGGGGACTGCGGGTAG;SOR=1.584;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=27;TCR=53;TR=80;WE=110797829;WS=110797811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr6	110797905	rs6922017	G	C	475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=15;PP=343;SC=ACCAGCGCGAGGCTGTATTCT;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=110797913;WS=110797895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr6	111213927	rs34637914	T	TC,TCC	466.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.4999,0.5001;FS=0.000;HP=8;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=29;NF=6,6;NR=4,4;PP=15,101;SC=TCGGTCTTTTTCCCCCCCCAG;SOR=1.739;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=10,10;WE=111213935;WS=111213917;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.47,0.53:17
chr6	111493953	rs33965856	C	T	1490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.246;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=29;PP=814;ReadPosRankSum=-0.821;SC=CAATAGTCAGCGTCTTCACAG;SOR=0.587;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=146;TCF=81;TCR=65;TR=66;WE=111493961;WS=111493943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,74:0.47:157
chr6	111527988	rs402940	G	A	1177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.674;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=39;PP=808;ReadPosRankSum=2.018;SC=CTCATCACCCGATGTCTCATT;SOR=0.455;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=118;TCF=31;TCR=87;TR=54;WE=111527996;WS=111527978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,56:0.45:125
chr6	111540372	rs405948	G	A	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=203;ReadPosRankSum=0.953;SC=GCTTTTATGTGTGCCTTACTG;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=10;WE=111540380;WS=111540362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr6	111587266	rs11153279	T	C	8265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=137;NR=149;PP=2965;SC=AATCATCTGATGCTGACTCAG;SOR=0.813;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=286;TCF=137;TCR=149;TR=286;WE=111587274;WS=111587256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,316:1.00:316
chr6	111654680	rs5879102	CT	C	54.37	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.06;ReadPosRankSum=-1.383;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr6	111665023	rs240990	G	A	372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=1;PP=252;SC=GTAAGCCACCGCAACTGGCCT;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=111665031;WS=111665013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	111665071	rs1623806	T	C	1296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=4;PP=914;SC=TTATTACATATAAATTACATC;SOR=3.417;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=35;TCR=4;TR=39;WE=111665079;WS=111665061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr6	111695073	rs455645	C	T	7106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.98;NF=122;NR=111;PP=2965;SC=CTTCTGATAACGACCTCGGTT;SOR=0.748;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=233;TCF=122;TCR=111;TR=233;WE=111695081;WS=111695063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,259:1.00:259
chr6	111695268	rs455732	C	T	10364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=385;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=183;NR=169;PP=2965;SC=CCGCTATGCACACAATCTGCT;SOR=0.763;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=352;TCF=183;TCR=169;TR=352;WE=111695276;WS=111695258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,385:1.00:385
chr6	111695887	rs462779	G	A	2569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=51;PP=1626;SC=CTTAAGTGTTGTATGCTTTCT;SOR=1.265;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=35;TCR=51;TR=86;WE=111695895;WS=111695877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
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chr6	111711232	rs11376056	C	CG	727.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=5;PP=525;SC=CCACCACACCCGCCGGTCATT;SOR=1.721;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=15;TCF=9;TCR=6;TR=13;WE=111711240;WS=111711222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr6	111793561	rs7772141	T	C	115.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=89;SC=GTTATACTTCTTTGTAATCGT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=111793569;WS=111793551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
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chr6	111896777	.	C	T	38	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=17;MQ=47.99;NF=3;NR=1;PP=38;QD=18.1928031368;SC=GGCAACAGAGCGAGACTCCGT;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=111896785;WS=111896767;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
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chr6	111918865	rs174393	G	A	1670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.16;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
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chr6	111983038	rs28763975	G	C	1304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.446;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=33;PP=754;ReadPosRankSum=1.269;SC=GTTCTTCAGGGTCCTTTTTCC;SOR=0.824;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=190;TCF=100;TCR=90;TR=65;WE=111983046;WS=111983028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,76:0.35:217
chr6	111995666	rs3730353	A	G	1191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=19;PP=715;ReadPosRankSum=-0.222;SC=AAAAGCCTCCAATCTCAGGCC;SOR=0.744;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=130;TCF=82;TCR=48;TR=56;WE=111995674;WS=111995656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,62:0.44:142
chr6	112421805	rs916429	T	C	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.860;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=172;ReadPosRankSum=-1.952;SC=AATCAAACTTTGGTGCTCTGA;SOR=0.332;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=40;TCF=29;TCR=11;TR=20;WE=112421813;WS=112421795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,23:0.52:44
chr6	112443134	rs4945897	G	A	342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-3.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.316;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=166;ReadPosRankSum=-1.338;SC=AAGGAAAGATGGGAAAAAACG;SOR=0.197;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=14;WE=112443142;WS=112443124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
chr6	112450351	rs2157550	G	C	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.490;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=370;ReadPosRankSum=0.074;SC=TTATGGAAGTGAAAGAGCTTT;SOR=1.247;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=43;TCF=9;TCR=34;TR=19;WE=112450359;WS=112450341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,20:0.44:45
chr6	112451367	rs34752945	G	T	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=171;ReadPosRankSum=1.267;SC=AAAAGACAGCGAGTTGCCAAA;SOR=0.784;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=11;WE=112451375;WS=112451357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr6	112454185	rs764587	A	G	936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.398;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=23;PP=478;ReadPosRankSum=-0.185;SC=TTGCCTGTTAATTTCTACGTA;SOR=0.392;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=68;TCF=21;TCR=47;TR=36;WE=112454193;WS=112454175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,43:0.57:76
chr6	112454245	rs3734287	T	C	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.209;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=169;ReadPosRankSum=-0.349;SC=AGGCATACACTAGGAGCTCCT;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=8;WE=112454253;WS=112454235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr6	112457390	rs2032567	C	T	3070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.926;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=61;PP=1836;ReadPosRankSum=1.496;SC=ACAGGGCCACCGCTGAATCCA;SOR=0.755;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=259;TCF=132;TCR=127;TR=129;WE=112457398;WS=112457380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,144:0.49:292
chr6	112457471	rs2032568	G	A	1661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.151;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=42;PP=991;ReadPosRankSum=0.339;SC=GGAGAGAAAGGAATTGTAAGA;SOR=1.142;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=132;TCF=48;TCR=84;TR=62;WE=112457479;WS=112457461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,74:0.50:149
chr6	112493872	rs1050348	A	G	986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=16;PP=615;ReadPosRankSum=0.242;SC=TCCCTGACATAGTTAAGGGCC;SOR=0.729;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=83;TCF=51;TCR=32;TR=43;WE=112493880;WS=112493862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,47:0.51:93
chr6	112506375	rs9374309	G	A	1848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.591;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=30;PP=1215;ReadPosRankSum=-0.162;SC=TGACCAGCCAGCCTCACATCA;SOR=0.783;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=148;TCF=92;TCR=56;TR=80;WE=112506383;WS=112506365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,85:0.53:161
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chr6	112508035	rs9400521	C	T	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=0.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.755;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=241;ReadPosRankSum=-0.247;SC=ATATGGAGGGCCAACTGTATT;SOR=1.262;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=33;TCF=20;TCR=13;TR=18;WE=112508043;WS=112508025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,18:0.43:42
chr6	112508769	rs9387061	TG	GT	6479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=69;PP=2947;SC=CTAACCGCAGTGCATCAGTCA;SOR=0.852;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=129;TCF=57;TCR=72;TR=123;WE=112508778;WS=112508759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr6	112521183	rs2237242	G	A	1020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=4.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.252;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=7;PP=779;ReadPosRankSum=0.668;SC=ACTACATATCGTTTAGCTGCC;SOR=1.122;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=92;TCF=73;TCR=19;TR=44;WE=112521191;WS=112521173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,45:0.44:102
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chr6	112522852	rs11757455	G	A	1516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=41;PP=984;ReadPosRankSum=0.276;SC=CAAATGCACCGAACAGCTCCA;SOR=0.741;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=138;TCF=63;TCR=75;TR=73;WE=112522860;WS=112522842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,76:0.51:150
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chr6	114178831	rs113531174	C	CGCT	2071.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.614;NF=17;NR=15;PP=1548;ReadPosRankSum=0.883;SC=TTGCCGCCGCCGCTGCTGCTG;SOR=0.481;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=41;TCF=24;TCR=17;TR=32;WE=114178839;WS=114178821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,52:0.98:53
chr6	114279783	rs2243356	A	T	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.342;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=216;ReadPosRankSum=-0.158;SC=CATTTATCAAAGCAAAACTAC;SOR=0.990;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=28;TCR=9;TR=16;WE=114279791;WS=114279773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,16:0.39:41
chr6	114378970	rs2282237	C	T	3150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.151;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=66;PP=1865;ReadPosRankSum=-0.598;SC=TTTCTGGAACCTCCTCTGTGA;SOR=0.891;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=254;TCF=127;TCR=127;TR=125;WE=114378978;WS=114378960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,143:0.48:295
chr6	116263524	rs12208531	G	A	388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=320;SC=ATTTTGGAATGGATTATTTGA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=116263532;WS=116263514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	116264386	rs57164993	A	AT	48.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=5.541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.92;ReadPosRankSum=0.387;SOR=0.186;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,10:0.19:53
chr6	116288912	.	TA	T	405.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=1.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.24;MQRankSum=0.800;QD=11.93;ReadPosRankSum=0.198;SOR=1.197;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,22:0.65:34
chr6	116323910	rs1338667	T	A	3906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=72;PP=2259;SC=TACCACATTGTCTCAGTGTCA;SOR=1.073;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=130;TCF=58;TCR=72;TR=130;WE=116323918;WS=116323900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr6	116324898	rs3798227	A	G	1257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=6;PP=839;SC=TATTACTCTTAAGTAGTTTAG;SOR=2.948;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=34;WE=116324906;WS=116324888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr6	116439220	rs515745	A	G	1008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=24;PP=751;SC=GATTTAATTTAAGCTTAAATA;SOR=1.885;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=36;TCF=11;TCR=25;TR=35;WE=116439228;WS=116439210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr6	116441229	rs111661664	T	TGGG	2355.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=14;PP=1627;SC=ATTAGCTCTGTGTGTACTCAC;SOR=1.480;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=30;TCF=16;TCR=14;TR=30;WE=116441237;WS=116441219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr6	116446576	rs1064583	A	G	6929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=136;NR=115;PP=2965;ReadPosRankSum=0.977;SC=GCCTGTGGGCATTTGGTATCG;SOR=0.248;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=253;TCF=137;TCR=116;TR=251;WE=116446584;WS=116446566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,270:1.00:271
chr6	116542500	rs12193974	T	C	238.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=10;PP=215;SC=TTTTAAACAATGCTGAGTGAC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=116542508;WS=116542490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	116720487	rs10485183	C	T	7876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=154;NR=120;PP=2965;SC=GCCTACATCACCGACGAGAAC;SOR=0.908;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=275;TCF=154;TCR=121;TR=274;WE=116720495;WS=116720477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,295:1.00:295
chr6	116720514	rs35548455	C	T	2988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=347;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.818;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=64;PP=1742;ReadPosRankSum=-0.327;SC=GTTATGATTCCCTTCACCAAT;SOR=0.629;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=320;TCF=169;TCR=151;TR=136;WE=116720522;WS=116720504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:198,149:0.43:347
chr6	116757557	rs560644	T	C	5830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=112;NR=84;PP=2965;SC=ATCCCTACAATGGGACAAACT;SOR=0.914;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=196;TCF=112;TCR=84;TR=196;WE=116757565;WS=116757547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr6	116758558	.	C	CA	32.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.693;ClippingRankSum=0.000;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=2.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.47;ReadPosRankSum=-0.476;SOR=0.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,11:0.16:69
chr6	116782488	rs2858833	T	C	961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.611;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=13;PP=508;ReadPosRankSum=0.475;SC=GGTAGGGAGATGGAAAGGGTG;SOR=0.984;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=98;TCF=64;TCR=34;TR=43;WE=116782496;WS=116782478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,48:0.45:106
chr6	116783390	rs10784	A	G	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=12;PP=272;ReadPosRankSum=-1.276;SC=CCTGGTGTGCACGCAAATCAG;SOR=0.617;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=62;TCF=32;TCR=30;TR=26;WE=116783398;WS=116783380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,31:0.43:72
chr6	116783619	rs117361304	T	G	932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.378;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=17;PP=545;ReadPosRankSum=-0.288;SC=CAGTCGCAGGTCTGCCGCTGG;SOR=0.418;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=71;TCF=42;TCR=29;TR=38;WE=116783627;WS=116783609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,43:0.54:79
chr6	116784797	rs11544160	G	A	2239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.697;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=49;PP=1294;ReadPosRankSum=-0.809;SC=CAGGTCTACTGAAGGAGATAC;SOR=0.573;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=186;TCF=86;TCR=100;TR=96;WE=116784805;WS=116784787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,107:0.51:208
chr6	116836720	rs881863	G	A	962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.755;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=14;PP=516;ReadPosRankSum=0.475;SC=TCCCTAAATGGCTTTGCTTTC;SOR=0.595;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=92;TCF=63;TCR=29;TR=41;WE=116836728;WS=116836710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,48:0.46:105
chr6	116864570	rs4142087	A	C	1821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.493;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=47;PP=1178;ReadPosRankSum=1.018;SC=TATTCTGGAGAAAAAGGGGTA;SOR=0.753;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=211;TCF=99;TCR=112;TR=86;WE=116864578;WS=116864560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,93:0.41:229
chr6	116875427	rs7762318	G	A	1109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.671;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=23;PP=636;ReadPosRankSum=-1.313;SC=AAGAGATCCTGGCTGGGTTTC;SOR=0.624;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=112;TCF=56;TCR=56;TR=49;WE=116875435;WS=116875417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,55:0.45:121
chr6	116878947	rs6906668	C	T	642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=12;PP=378;ReadPosRankSum=0.770;SC=ATATTTGATGCATTGATACTT;SOR=0.578;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=39;TCR=23;TR=32;WE=116878955;WS=116878937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,32:0.50:64
chr6	116901640	rs1321534	G	A	277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=212;SC=TTACGAATCTGCTATGAATGT;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=116901648;WS=116901630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	116944260	rs113664376	CTTGTTTTGTT	C	389.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.282;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=1.005;NF=1;NR=4;PP=1093;ReadPosRankSum=-0.228;SC=TATTTTATAGCTTGTTTTGTT;SOR=0.223;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=5;WE=116944277;WS=116944250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr6	116950833	rs784133	T	C	1153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=28;PP=664;ReadPosRankSum=1.218;SC=GAAGTGGGGCTTCCTCTTTTG;SOR=0.671;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=44;TCR=62;TR=48;WE=116950841;WS=116950823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,57:0.47:120
chr6	117037616	rs2243367	A	G	177.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=142;SC=TTGCACATATACAGTATTCAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=117037624;WS=117037606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	117045674	rs1150108	A	G	78.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=57;SC=CTGTGTCTTGAAGGATGGTGA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=117045682;WS=117045664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr6	117073874	rs10556522	AATAT	A	364.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.980;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=12;PP=242;ReadPosRankSum=0.160;SC=GGGGGGAAGAAATATATATAT;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=12;WE=117073887;WS=117073864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,12:0.86:14
chr6	117086265	rs641338	C	A	1939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=31;PP=1245;ReadPosRankSum=1.436;SC=CGCACCCTTGCGGCCGGGGAC;SOR=0.649;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=164;TCF=101;TCR=63;TR=82;WE=117086273;WS=117086255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,92:0.50:184
chr6	117113653	rs615199	T	C	1344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.166;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=24;PP=733;ReadPosRankSum=-0.667;SC=TCTCCACAGCTGGTACATATT;SOR=0.526;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=114;TCF=58;TCR=56;TR=54;WE=117113661;WS=117113643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,64:0.48:132
chr6	117114025	rs6901250	G	A	2612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.426;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=53;PP=1702;ReadPosRankSum=1.927;SC=CAAAGCTGAAGGCTAGCAAAA;SOR=0.735;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=278;TCF=144;TCR=134;TR=111;WE=117114033;WS=117114015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,124:0.42:298
chr6	117114223	rs6924002	T	A	3704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=379;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=89;PP=2420;ReadPosRankSum=-0.847;SC=TCACAACAGGTGTGTTCAGGT;SOR=0.699;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=347;TCF=159;TCR=188;TR=164;WE=117114231;WS=117114213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:201,177:0.47:378
chr6	117114290	rs35937022	A	G	2075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.238;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=55;PP=1259;ReadPosRankSum=-1.189;SC=TAGGGAGAGAATCAGGAGTAG;SOR=0.961;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=184;TCF=76;TCR=108;TR=89;WE=117114298;WS=117114280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,99:0.49:203
chr6	117114403	rs6901971	G	A	1213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=28;PP=825;SC=ATAAAAGGCAGTGAGGCATAT;SOR=1.662;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=40;WE=117114411;WS=117114393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr6	117121894	rs6917467	G	A	4405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=88;PP=2562;SC=TTAAATCCCCGTGAGCATCAA;SOR=0.954;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=162;TCF=74;TCR=88;TR=162;WE=117121902;WS=117121884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr6	117130544	rs28360548	A	C	2193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.035;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=40;PP=1196;ReadPosRankSum=-1.527;SC=CCCAGAACCTATGACAGCCTT;SOR=0.792;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=197;TCF=107;TCR=90;TR=90;WE=117130552;WS=117130534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,106:0.48:221
chr6	117130704	rs2274911	G	A	6117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=95;PP=2965;SC=TTGACTCCAGGTAAGAGTGTT;SOR=0.782;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=199;TCF=104;TCR=95;TR=199;WE=117130712;WS=117130694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr6	117149872	rs11753705	A	T	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.297;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=64;ReadPosRankSum=-0.792;SC=TTAAAAATACATATGAGTTTA;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=117149880;WS=117149868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr6	117150057	rs41291914	A	C	2708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.918;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=57;PP=1797;ReadPosRankSum=-2.332;SC=TAGCAAACAAACCTCCAATTA;SOR=0.770;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=244;TCF=130;TCR=114;TR=125;WE=117150065;WS=117150047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,133:0.48:275
chr6	117237584	rs2184343	T	G	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=321;ReadPosRankSum=-1.505;SC=TATGGCTGGATATACACTGTC;SOR=0.527;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=15;WE=117237592;WS=117237574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr6	117246576	rs67292089	G	GA	2601.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.217;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=29;PP=1422;ReadPosRankSum=0.027;SC=AGGAATGTGAGAAAAAATCTC;SOR=0.564;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=106;TCF=48;TCR=58;TR=52;WE=117246584;WS=117246566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,104:0.57:181
chr6	117587054	rs433425	T	C	897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=24;PP=618;ReadPosRankSum=-0.151;SC=GCGCCCCCCGTTTGCGGCGGC;SOR=0.753;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=71;TCF=28;TCR=43;TR=39;WE=117587062;WS=117587044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,40:0.53:76
chr6	117587074	rs439418	A	G	663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.433;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=22;PP=513;ReadPosRankSum=-1.564;SC=CATGGCCTGTACGCCAAGGTC;SOR=1.555;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=52;TCF=15;TCR=37;TR=28;WE=117587082;WS=117587064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,28:0.53:53
chr6	117591619	rs13208901	G	C	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=319;ReadPosRankSum=2.030;SC=TCTCTCGGGCGGGACGTGCAG;SOR=0.553;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=52;TCF=39;TCR=13;TR=26;WE=117591627;WS=117591609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,29:0.50:58
chr6	117591755	rs13194610	T	C	2191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FS=0.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.74;ReadPosRankSum=-0.380;SOR=0.761;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,105:0.51:204
chr6	117622184	rs619203	G	C	1036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.64;ReadPosRankSum=-2.092;SOR=0.787;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,29:0.35:82
chr6	117622188	rs529156	T	G	1091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.87;ReadPosRankSum=-1.662;SOR=0.754;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,32:0.35:92
chr6	117622233	rs529038	C	T	1605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.551;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=27;PP=1068;ReadPosRankSum=-0.827;SC=TGAAGTTGGTCCTGAATTCTA;SOR=0.921;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=182;TCF=107;TCR=75;TR=74;WE=117622241;WS=117622223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,79:0.40:196
chr6	117674087	rs9481703	G	A	1148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.570;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=14;PP=724;ReadPosRankSum=-0.020;SC=TGGAGAAGGAGATGTTATGAG;SOR=1.026;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=98;TCF=65;TCR=33;TR=45;WE=117674095;WS=117674077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,53:0.49:109
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chr6	117680945	rs113151724	T	C	1972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.576;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=30;PP=1405;ReadPosRankSum=-0.757;SC=ACTTCCTTTATTTCGGAAGAA;SOR=0.621;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=166;TCF=113;TCR=53;TR=87;WE=117680953;WS=117680935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,91:0.51:178
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chr6	117724462	rs2243379	C	A	610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.990;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=14;PP=303;ReadPosRankSum=0.460;SC=AGTGATCAATCATCAGCATTA;SOR=0.294;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=52;TCF=20;TCR=32;TR=27;WE=117724470;WS=117724452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,30:0.54:56
chr6	117724499	rs1407179	A	C	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=431;ReadPosRankSum=-1.262;SC=CATTGGGACTAAAAAGCATAG;SOR=0.793;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=12;WE=117724512;WS=117724489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr6	117724504	rs76988725	G	T	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=401;ReadPosRankSum=1.286;SC=GGACTAAAAAGCATAGATTAA;SOR=0.307;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=10;WE=117724512;WS=117724489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr6	117725448	rs1998206	T	G	1699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.249;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=38;PP=1343;ReadPosRankSum=-2.346;SC=CATACCTTAGTATAAGTCCAG;SOR=0.623;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=153;TCF=86;TCR=67;TR=86;WE=117725456;WS=117725438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,81:0.52:157
chr6	117725578	rs2243378	T	A	1496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.984;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=35;PP=888;ReadPosRankSum=-0.282;SC=GAGCAGTTGGTAGGTCTGCAT;SOR=0.909;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=145;TCF=68;TCR=77;TR=65;WE=117725586;WS=117725568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,72:0.44:162
chr6	117730592	rs2273602	G	A	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.150;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=229;ReadPosRankSum=-0.318;SC=TGGCCTATACGTTTGAAATTA;SOR=0.105;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=13;WE=117730600;WS=117730582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr6	117737390	rs2243	G	A	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.306;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=224;ReadPosRankSum=2.714;SC=AGAAACATCAGTATCAAAATA;SOR=0.381;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=41;TCF=30;TCR=11;TR=19;WE=117737398;WS=117737380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,20:0.47:43
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chr6	117858223	rs72965515	G	C	2080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=34;PP=1442;ReadPosRankSum=0.675;SC=GTTTGCAGGGGTGTTGTGAGG;SOR=0.659;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=183;TCF=117;TCR=66;TR=92;WE=117858231;WS=117858213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,96:0.49:197
chr6	117858455	rs112120142	T	C	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.482;NF=1;NR=12;PP=198;ReadPosRankSum=0.484;SC=CCCAGCACTTTGGGAGGCCGA;SOR=0.776;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=13;WE=117858463;WS=117858445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr6	117869286	rs11153674	G	T	1724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.814;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=24;PP=1030;ReadPosRankSum=-0.391;SC=CACGTGCTGCGCGCCCACACG;SOR=1.003;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=138;TCF=87;TCR=51;TR=69;WE=117869294;WS=117869276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,76:0.49:154
chr6	117869424	rs929059	G	A	3849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=348;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=79;PP=2051;ReadPosRankSum=-0.398;SC=AGGCCACACAGCGCACAGCCT;SOR=0.677;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=305;TCF=154;TCR=151;TR=161;WE=117869432;WS=117869414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,185:0.53:347
chr6	117869491	rs210621	G	A	3801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.762;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=81;PP=2142;ReadPosRankSum=0.333;SC=CCGAAAGCGGGCACCCTGACT;SOR=0.622;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=305;TCF=159;TCR=146;TR=165;WE=117869499;WS=117869481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,185:0.54:344
chr6	117996818	rs9767451	T	C	126.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.94;QD=21.14;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	118475798	rs205966	G	A	3225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=68;PP=1985;SC=GCTCACAAAAGCACCAGGAAT;SOR=1.510;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=38;TCR=68;TR=106;WE=118475806;WS=118475788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr6	118556628	rs9489326	T	C	2502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=23;PP=1757;SC=CAATTTATTCTATTTCAGGAA;SOR=1.995;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=55;TCR=23;TR=78;WE=118556636;WS=118556618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr6	118635122	rs283049	G	C	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=278;ReadPosRankSum=0.994;SC=TCATGTTTCTGTGTGCCTCAT;SOR=0.128;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=16;WE=118635130;WS=118635112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr6	118791804	rs7743702	T	C	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.008;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=10;PP=254;ReadPosRankSum=-0.895;SC=TTTCCTTGCATAGACTAGAAT;SOR=0.836;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=50;TCF=28;TCR=22;TR=19;WE=118791812;WS=118791794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,22:0.35:63
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chr6	118803091	rs9489410	C	G	602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.876;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=17;PP=380;ReadPosRankSum=-1.002;SC=CTTCCAGAATCTGCAGCTAAG;SOR=0.559;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=69;TCF=34;TCR=35;TR=33;WE=118803099;WS=118803081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,34:0.45:76
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chr6	119344020	rs9481880	C	T	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.530;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=396;ReadPosRankSum=0.576;SC=CCCGTCTGGGCGACAGAGCAA;SOR=0.368;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=43;TCF=37;TCR=6;TR=25;WE=119344028;WS=119344010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,25:0.52:48
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chr6	119509785	rs2142887	C	G	1550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.934;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=44;PP=1087;ReadPosRankSum=0.374;SC=TTTTCCTGGACAGTGCTTACA;SOR=0.877;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=171;TCF=68;TCR=103;TR=70;WE=119509793;WS=119509775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,73:0.40:181
chr6	119509870	rs2142888	G	A	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=265;ReadPosRankSum=-0.289;SC=AGGACCCTCCGAGGATAACAA;SOR=0.223;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=14;WE=119509878;WS=119509860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr6	119510739	rs2072888	C	T	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-2.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=39;ReadPosRankSum=1.506;SC=ATAGGCAGAGCGGATAGTCTT;SOR=0.188;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=4;WE=119510747;WS=119510735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr6	119510777	rs2072889	T	G	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=312;ReadPosRankSum=0.286;SC=AAAACTGCATTAAATCAAAGC;SOR=0.588;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=36;TCF=31;TCR=5;TR=18;WE=119510785;WS=119510767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
chr6	119510941	rs2072890	C	A	1700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=35;PP=1048;ReadPosRankSum=1.582;SC=ACATGCCCCCCGCGAAGCAGG;SOR=0.717;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=153;TCF=82;TCR=71;TR=77;WE=119510949;WS=119510931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,83:0.50:165
chr6	119522252	rs3822996	G	T	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=199;ReadPosRankSum=0.601;SC=ACAATCCAGTGTCCTAATAAC;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=10;WE=119522260;WS=119522242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr6	119522353	rs9481890	T	C	1868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.075;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=39;PP=994;ReadPosRankSum=0.836;SC=GCTGCTTTTGTGCTTCCTCTC;SOR=0.336;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=148;TCF=86;TCR=62;TR=83;WE=119522361;WS=119522343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,91:0.56:162
chr6	119522553	rs9481891	A	G	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=277;ReadPosRankSum=0.275;SC=AATCTAAAAAACAATTTTCAT;SOR=0.484;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=15;WE=119522561;WS=119522543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
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chr6	119611989	rs9489671	A	T	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.197;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.005;NF=2;NR=8;PP=148;ReadPosRankSum=1.345;SC=CATTATTGTGATAAATTATAC;SOR=0.105;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=10;WE=119611997;WS=119611979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
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chr6	119628029	rs195092	C	T	2691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.986;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=51;PP=1622;ReadPosRankSum=0.228;SC=GAGAAGTTATCGTCACTAAGA;SOR=0.616;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=218;TCF=126;TCR=92;TR=117;WE=119628037;WS=119628019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,127:0.52:242
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chr6	119653186	rs7754482	G	A	789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=20;PP=416;ReadPosRankSum=0.862;SC=ATAAAATGAGGAGAATAATGT;SOR=0.651;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=76;TCF=35;TCR=41;TR=36;WE=119653194;WS=119653176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,41:0.47:88
chr6	121436422	rs7772508	G	T	1345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=28;PP=783;SC=ATAAAGTGCAGAAAAGTTTGC;SOR=1.314;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=19;TCR=28;TR=47;WE=121436430;WS=121436412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr6	121491472	rs1273749	G	A	1561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=9;PP=1157;SC=CATTAAACAAGCTATATCAAA;SOR=2.584;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=50;TCF=40;TCR=10;TR=49;WE=121491480;WS=121491462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr6	121526447	rs9320795	G	C	1427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=22;PP=731;SC=TAAATAATAAGAAGAAGAAGA;SOR=1.371;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=13;TCR=22;TR=35;WE=121526473;WS=121526437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr6	121526459	rs35328788	G	T	1285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.62;SOR=1.528;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr6	121526465	rs35549991	G	T	1141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.67;SOR=1.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr6	121560155	rs12191616	C	T	1386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=10;PP=913;SC=AAAGTATGAACGAATTCATTT;SOR=2.124;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=45;WE=121560163;WS=121560145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr6	121577370	rs7745023	T	C	3766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=67;PP=2413;SC=CCAGAAAATATAGAAATATCT;SOR=0.864;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=128;TCF=61;TCR=67;TR=128;WE=121577378;WS=121577360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr6	121620608	rs9387944	G	T	1731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=22;PP=1091;SC=CTTATATTTCGTTTCAAGAAG;SOR=1.214;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=38;TCR=22;TR=60;WE=121620616;WS=121620598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr6	121632008	rs9372653	T	A	1895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=47;PP=1286;SC=AACACAATTGTCAGGACATTC;SOR=1.785;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=20;TCR=47;TR=67;WE=121632016;WS=121631998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr6	122720813	.	T	TGCCGTAGCTGCC	1556.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.49;BaseQRankSum=1.545;ClippingRankSum=0.000;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.062;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=3.944;NF=12;NR=14;PP=2819;ReadPosRankSum=-0.173;SC=GGGGAGCTGCTGCCGTAGCTG;SOR=0.912;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=78;TCF=28;TCR=50;TR=26;WE=122720821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,66:0.43:153
chr6	122737326	rs150012876	AT	A	1188.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.823;HP=10;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=17;PP=459;ReadPosRankSum=-1.120;SC=TTTTTGATTGATTTTTTTTTT;SOR=0.588;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=71;TCF=34;TCR=37;TR=36;WE=122737334;WS=122737316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,58:0.60:96
chr6	122740474	rs3734595	G	T	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.497;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=9;PP=212;ReadPosRankSum=0.506;SC=TGTGCTTGTTGTCCAAAAAGA;SOR=0.387;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=28;TCF=13;TCR=15;TR=18;WE=122740482;WS=122740464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr6	122743502	rs487487	T	C	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=182;ReadPosRankSum=-1.730;SC=TATTACAGAGTAAAATTCAAA;SOR=0.722;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=11;TCR=15;TR=14;WE=122743510;WS=122743492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr6	122743693	rs2243362	A	G	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=96;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TTCAATCTTTATGGTCTTCTA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=5;WE=122743701;WS=122743687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr6	122749156	rs45503393	G	GTC	2432.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.640;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=25;PP=1329;ReadPosRankSum=-0.364;SC=CTACAAAAACGTCCTAATAAG;SOR=0.763;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=69;TCF=12;TCR=57;TR=31;WE=122749164;WS=122749146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,64:0.48:132
chr6	122752447	rs12192360	C	T	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.987;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=28;ReadPosRankSum=-0.623;SC=AGCCCATTTTCCCTGATGTTT;SOR=0.368;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=4;WE=122752455;WS=122752437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr6	122752471	rs12205759	A	G	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=2.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.18;ReadPosRankSum=0.598;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr6	122768231	rs2277107	T	C	1486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=15;PP=886;ReadPosRankSum=-2.104;SC=GCTAGACTTCTTGTTTAAAGA;SOR=0.670;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=129;TCF=92;TCR=37;TR=59;WE=122768248;WS=122768221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,68:0.47:146
chr6	122772692	rs510283	T	C	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=203;ReadPosRankSum=0.159;SC=ATCAAAACTTTGTACTTTATT;SOR=0.804;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=11;WE=122772700;WS=122772682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr6	122775195	rs499825	A	C	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.08;ReadPosRankSum=0.535;SOR=0.938;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr6	122792765	rs3752573	G	C	820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=3.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.84;ReadPosRankSum=2.049;SOR=0.260;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,22:0.48:46
chr6	122792768	rs3752574	C	T	843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=1.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.22;ReadPosRankSum=1.854;SOR=0.388;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,23:0.47:49
chr6	122793033	rs1267941	A	G	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.458;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=380;ReadPosRankSum=0.775;SC=AGGCCTGGGTAGGATAAAACA;SOR=1.148;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=41;TCF=8;TCR=33;TR=21;WE=122793041;WS=122793023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,25:0.53:47
chr6	122793073	rs3752576	C	A	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=251;ReadPosRankSum=-1.926;SC=ACTGCGCATGCGCGTCACTAG;SOR=0.627;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=14;WE=122793081;WS=122793063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr6	123038887	rs6920792	CT	GC	1855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=10;PP=1394;SC=TGAACATTTACTTCTGAATAG;SOR=1.609;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=38;WE=123038896;WS=123038877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr6	123101348	rs2171068	G	C	510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=2;PP=423;SC=ACTTTAGAACGTGGATTCCAG;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=123101356;WS=123101342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr6	123101647	rs2243372	A	G	822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=18;PP=491;ReadPosRankSum=0.714;SC=GGATGGGGAGAGGGGAATAAA;SOR=0.671;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=64;TCF=29;TCR=35;TR=33;WE=123101655;WS=123101637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,38:0.51:74
chr6	123110621	rs72968540	C	G	2425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.664;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=54;PP=1359;ReadPosRankSum=0.226;SC=GTCCGCGACCCTTCTCTTCCC;SOR=0.486;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=210;TCF=102;TCR=108;TR=110;WE=123110629;WS=123110611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,122:0.52:233
chr6	123122385	rs9372718	A	C	909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.811;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=11;PP=662;ReadPosRankSum=-1.224;SC=GTCAGTGCTCAAGTAGTGTTT;SOR=0.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=94;TCF=67;TCR=27;TR=39;WE=123122393;WS=123122375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,42:0.41:103
chr6	123369910	rs6900862	T	C	3392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=29;NR=77;PP=2343;SC=ATCCTTTCTCTTCCGCCATCC;SOR=2.163;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=106;TCF=29;TCR=77;TR=106;WE=123369918;WS=123369900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr6	123370012	rs4624884	G	T	57.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5032;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=34;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GACATTTTAAGATTCTTCCAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=123370020;WS=123370002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr6	123539609	rs361509	C	T	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.564;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=121;ReadPosRankSum=0.148;SC=CCACCCTTTCCGTCCACACCA;SOR=0.148;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=8;WE=123539617;WS=123539599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr6	123539684	rs361508	C	T	3573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.47;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr6	123539684	.	CT	TC,TT	722	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=35,64;NR=12,26;PP=666,722;QD=15.3078271247;SC=GCCTGAACTACTGTGGACAAA;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=90;TCF=64;TCR=26;TR=47,90;WE=123539693;WS=123539674;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.52:90
chr6	123539685	rs1259	T	C	1122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=0.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.46;ReadPosRankSum=0.965;SOR=0.853;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,50:0.51:98
chr6	123539904	rs7754205	C	T	2661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.260;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=58;PP=1571;ReadPosRankSum=0.089;SC=CAGAGCATGACAGTTTGTTAA;SOR=0.480;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=227;TCF=105;TCR=122;TR=114;WE=123539912;WS=123539894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,127:0.51:251
chr6	123592184	rs113318627	C	CTGTG	143.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.432;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=171;ReadPosRankSum=-1.152;SC=CAGTGAAGGGCTGTGTGTGTG;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=6;WE=123592192;WS=123592174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr6	123599505	rs55704802	A	C	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=18;PP=427;ReadPosRankSum=0.365;SC=AAAAATATAGATGAACATTAG;SOR=0.657;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=68;TCF=28;TCR=40;TR=29;WE=123599513;WS=123599495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,28:0.39:72
chr6	123600100	rs143535631	CA	C	158.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.005;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=3;PP=32;ReadPosRankSum=-0.357;SC=GCAAAATATTCAACATGAAAT;SOR=0.240;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=15;TCF=7;TCR=8;TR=5;WE=123600108;WS=123600090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr6	123658680	rs12216080	A	G	44.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=0;PP=27;SC=ATATTTGCAAAGGGGATGCAG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=123658688;WS=123658670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr6	123687288	rs2873479	A	C	1103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.587;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=28;PP=694;ReadPosRankSum=0.071;SC=ACCTTTTTTAATTGAAACCGC;SOR=0.758;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=149;TCF=78;TCR=71;TR=58;WE=123687296;WS=123687278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,62:0.37:166
chr6	123687432	rs7769808	T	C	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.225;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=77;ReadPosRankSum=-0.747;SC=ATGTTGCACATGAGAGCAAAG;SOR=0.048;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=9;WE=123687440;WS=123687422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr6	123699042	rs6901953	T	C	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=232;ReadPosRankSum=-3.385;SC=TCTTTTCCTGTTCTGAAACAT;SOR=0.770;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=33;TCF=11;TCR=22;TR=16;WE=123699050;WS=123699032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr6	123819847	rs9320940	T	C	2219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=42;PP=1201;SC=TTTCTAGACATGAGATTGTTT;SOR=1.320;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=30;TCR=42;TR=72;WE=123819855;WS=123819837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr6	123833457	rs6902416	G	C	1322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=17;PP=828;SC=CCTTTCGCCAGTGTCTTTGTT;SOR=0.963;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=26;TCR=17;TR=43;WE=123833465;WS=123833447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr6	123851538	rs12196787	G	C	130.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=74;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=1;PP=111;SC=AGTAAATTTAGTTATTTAATA;SOR=1.981;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=123851546;WS=123851528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	123851590	rs12198164	G	A	424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=4;PP=190;SC=ATTTTTTCTCGCATATGAATA;SOR=1.085;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=12;WE=123851598;WS=123851580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	123851610	rs12198167	G	A	555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=4;PP=201;SC=ACACAAAAATGTATATCTAAA;SOR=1.244;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=14;WE=123851618;WS=123851600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	123868665	rs7450199	G	A	140.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=90;SC=CCAAATTCCAGTTTTTAAGTA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=123868673;WS=123868655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	123869607	rs9490809	G	C	2334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=23;PP=1415;SC=ACCTTTATCAGTATCTTCGTC;SOR=1.637;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=81;TCF=58;TCR=23;TR=79;WE=123869615;WS=123869597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr6	124603337	rs72980476	C	T	1064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.246;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=27;PP=551;ReadPosRankSum=-2.694;SC=TTTTTCTCCTCTCACTGCTTA;SOR=1.140;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=117;TCF=54;TCR=63;TR=44;WE=124603345;WS=124603327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,55:0.38:146
chr6	124603378	rs1916790	A	G	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=5.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.82;ReadPosRankSum=-2.582;SOR=1.351;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,20:0.24:85
chr6	124603390	rs802497	A	G	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=1.191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.66;ReadPosRankSum=-1.964;SOR=0.881;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,14:0.20:69
chr6	124604055	rs41284440	G	T	811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.983;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=7;PP=417;ReadPosRankSum=-3.425;SC=ACAGTTATAAGTGCTAATTAT;SOR=0.479;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=73;TCF=59;TCR=14;TR=31;WE=124604063;WS=124604045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,38:0.45:84
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chr6	125139473	rs1923726	TG	GC	2340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.408;HP=4;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=13;PP=1463;ReadPosRankSum=0.034;SC=TCTGTGTGGGTGCTTGATCAT;SOR=0.849;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=120;TCF=81;TCR=39;TR=46;WE=125139482;WS=125139463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,63:0.45:139
chr6	125139677	rs142800239	C	T	608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=346;ReadPosRankSum=-0.430;SC=AACTGTATCACGATACAAAAT;SOR=0.527;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=39;TCF=8;TCR=31;TR=21;WE=125139685;WS=125139667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,26:0.55:47
chr6	125144352	rs2025251	T	G	2895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.456;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=70;PP=1816;ReadPosRankSum=-0.114;SC=AAAAACATCTTTTCTCTCTCT;SOR=0.837;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=287;TCF=137;TCR=150;TR=132;WE=125144360;WS=125144342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,142:0.46:307
chr6	125230075	rs781735	A	C	2159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=39;PP=1236;ReadPosRankSum=-0.868;SC=TTTGCCAACCATTGTTATTAT;SOR=0.418;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=31;TCR=40;TR=70;WE=125230083;WS=125230065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,81:0.99:82
chr6	125232766	.	CA	C	58.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.860;ClippingRankSum=0.000;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=1.678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.28;MQRankSum=1.872;QD=1.73;ReadPosRankSum=0.813;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,8:0.24:34
chr6	125284457	rs9401790	T	C	6812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=122;NR=107;PP=2965;SC=GATCCCTATGTGCCCCTCATG;SOR=0.709;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=231;TCF=123;TCR=108;TR=229;WE=125284465;WS=125284447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
chr6	125330619	rs112538609	GA	G	487.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=15;PP=292;SC=TAAGAAGGCAGAAAAAAAAAA;SOR=3.056;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=16;WE=125330627;WS=125330609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr6	125366289	rs34249175	CA	C	1069.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.11;MQRankSum=0.915;QD=10.81;ReadPosRankSum=1.762;SOR=0.680;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,55:0.56:99
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chr6	125475139	rs2277111	G	A	2686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.468;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=45;PP=1531;ReadPosRankSum=-0.966;SC=CGATCGCCCCGAGAGTCAGGT;SOR=0.730;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=215;TCF=125;TCR=90;TR=109;WE=125475147;WS=125475129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,125:0.51:243
chr6	125573194	rs3799734	A	G	1090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=0.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.09;ReadPosRankSum=2.065;SOR=0.710;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,56:0.47:120
chr6	125573312	rs3799733	C	A	1006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.336;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=22;PP=540;ReadPosRankSum=1.347;SC=AGACAGTTCCCGTGACCAGGA;SOR=0.920;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=100;TCF=54;TCR=46;TR=43;WE=125573320;WS=125573302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,52:0.42:123
chr6	125623268	.	C	CTCCTCT	316.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.392;ClippingRankSum=-0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.629;NF=2;NR=4;PP=226;ReadPosRankSum=0.469;SC=ACTCCTCCTCCTCCTCCCCCA;SOR=0.446;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=6;WE=125623276;WS=125623258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr6	126072853	rs2875881	C	G	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.52;BaseQRankSum=1.377;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=110;ReadPosRankSum=-0.580;SC=TTGAACTGTGCAATCACTCTG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=126072861;WS=126072846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr6	126075709	rs10617027	AT	A	473.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=5.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.50;MQRankSum=0.854;QD=11.55;ReadPosRankSum=2.129;SOR=0.321;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,31:0.76:41
chr6	126210395	rs6919947	T	G	4056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=407;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.435;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=76;PP=2427;ReadPosRankSum=-0.319;SC=CGACACTTCTTCTGCATTTGA;SOR=0.823;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=363;TCF=191;TCR=172;TR=168;WE=126210403;WS=126210385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:213,194:0.48:407
chr6	126221008	rs11154336	G	A	745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.568;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=5;PP=500;ReadPosRankSum=0.830;SC=ACAGTCAGACGTAAGCTCATG;SOR=1.196;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=56;TCF=44;TCR=12;TR=30;WE=126221016;WS=126220998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,33:0.55:60
chr6	126242004	rs4563736	CG	GC	2063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=37;NR=2;PP=2137;SC=TTTTCAAGCACGGGTGTCCCT;SOR=4.849;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=42;TCF=39;TCR=3;TR=39;WE=126242013;WS=126241994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr6	126278230	rs2295005	G	C	7292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=126;NR=115;PP=2965;SC=GAAGCCGCTGGCAAGTCACCA;SOR=0.715;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=241;TCF=126;TCR=115;TR=241;WE=126278238;WS=126278220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,273:1.00:273
chr6	126288023	rs3757212	T	C	3688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=28;PP=2372;SC=ACAAATGTTTTTTCCTTTAGA;SOR=2.068;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=82;TCR=28;TR=110;WE=126288031;WS=126288013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr6	126307962	rs6569448	A	G	351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=293;SC=TCCGAGACCAAACCCCTCGGC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=126307970;WS=126307952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	126319881	rs6569449	T	A	1669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=30;PP=846;SC=TGAAAGCTACTTATTAGGCCT;SOR=1.033;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=24;TCR=30;TR=54;WE=126319889;WS=126319871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr6	126329589	rs146575767	A	G	2178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.620;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=39;PP=1388;ReadPosRankSum=-0.962;SC=TATGGGACAGACATAGACTAC;SOR=0.811;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=194;TCF=109;TCR=85;TR=92;WE=126329597;WS=126329579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,102:0.45:226
chr6	126334041	rs2206941	G	A	3445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=55;PP=2257;SC=CTTGAGAAGAGGCATGTGGCT;SOR=0.742;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=56;TCR=55;TR=111;WE=126334049;WS=126334031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
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chr6	127471533	rs9491699	C	T	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-3.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=309;ReadPosRankSum=0.273;SC=GTTAAGAGAACATAATGCAAG;SOR=0.521;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=37;TCR=9;TR=20;WE=127471541;WS=127471523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,21:0.42:50
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chr6	127651213	rs7761452	T	C	66.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5064;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=43;ReadPosRankSum=-0.319;SC=ATGAAGTGCATAACTGAAAAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=127651221;WS=127651203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr6	127663703	rs13207650	C	T	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.94;ReadPosRankSum=-2.149;SOR=0.293;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
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chr6	127768950	rs2236027	A	C	716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=17;PP=481;SC=TCAAAAGCAAACATAGCTAAA;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=127768958;WS=127768940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr6	127770923	rs3818135	A	C	1994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.17;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
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chr6	127771452	rs3734447	T	G	2444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=50;PP=1445;SC=ATCTTAGCACTTTCATTGATA;SOR=1.280;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=34;TCR=50;TR=84;WE=127771460;WS=127771442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr6	127794289	rs41285272	T	G	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=127;ReadPosRankSum=-1.817;SC=TTGTATCTTTTTAAAGAAATA;SOR=1.179;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=8;WE=127794297;WS=127794279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr6	127796326	rs12194762	G	C	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.723;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=73;ReadPosRankSum=-1.169;SC=GCCCTGAGCGGGGGCTTCCCT;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=5;WE=127796334;WS=127796316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr6	127797179	rs3734448	G	A	2489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=53;PP=1626;ReadPosRankSum=2.398;SC=CCTCCAGGTCGGCCACGTTCC;SOR=0.692;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=190;TCF=92;TCR=98;TR=103;WE=127797187;WS=127797169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,113:0.54:209
chr6	127797374	rs3734450	G	A	2753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.412;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=75;PP=1714;ReadPosRankSum=-1.675;SC=TGCCCAGGATGTTGGCTTCTT;SOR=0.838;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=300;TCF=139;TCR=161;TR=132;WE=127797382;WS=127797364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,140:0.43:323
chr6	128030957	rs490008	G	T	1411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=10;PP=910;SC=TATATCATAGGTTTCTGTAAG;SOR=2.170;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=37;TCR=10;TR=47;WE=128030965;WS=128030947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr6	128040839	rs675531	T	C	5498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=103;NR=74;PP=2965;SC=GTACCTGCTATTGCTGTGGCC;SOR=0.946;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=177;TCF=103;TCR=74;TR=177;WE=128040847;WS=128040829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr6	128176383	rs270032	A	G	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=123;ReadPosRankSum=-0.045;SC=AAACAGTGAAAAACAAAGTAG;SOR=0.090;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=8;WE=128176391;WS=128176373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
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chr6	128304358	rs113581270	A	AC	1947.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=3.206;NF=22;NR=9;PP=879;ReadPosRankSum=-1.982;SC=AAAAATAAAAAAAAGTCCACT;SOR=0.649;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=96;TCF=57;TCR=39;TR=31;WE=128304366;WS=128304343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,64:0.42:154
chr6	128307118	rs4341027	T	G	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.471;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=270;ReadPosRankSum=0.067;SC=CTGACAATGATAACAATAAAA;SOR=0.436;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=44;TCF=8;TCR=36;TR=18;WE=128307126;WS=128307108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,20:0.43:46
chr6	128307155	rs34209700	T	TA	48.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=75;ReadPosRankSum=-0.120;SC=TGCCTTTTCTTAAAAAAAAAA;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=6;WE=128307163;WS=128307145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr6	128312033	rs12055782	A	G	787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.14;MQRankSum=1.050;QD=9.85;ReadPosRankSum=1.098;SOR=0.529;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,39:0.49:80
chr6	128312114	rs5879871	T	TAG	199.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.315;NF=0;NR=4;PP=72;ReadPosRankSum=-0.737;SC=AATAACTCCTTGTCACAATTA;SOR=0.425;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=4;WE=128312122;WS=128312104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr6	128312324	rs9388612	T	C	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.588;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=199;ReadPosRankSum=0.483;SC=AACTAAAATGTTGTGCCTATA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=9;WE=128312332;WS=128312314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr6	128322437	rs34601789	T	C	1043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.466;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=27;PP=655;ReadPosRankSum=0.451;SC=AATCAGTAAGTATTAGCATTA;SOR=0.949;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=101;TCF=48;TCR=53;TR=49;WE=128322445;WS=128322427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,52:0.48:108
chr6	128324241	rs717851	T	C	848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.730;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=11;PP=525;ReadPosRankSum=0.129;SC=ATTTTCAAAATCAAGCTGCCT;SOR=0.995;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=97;TCF=65;TCR=32;TR=38;WE=128324249;WS=128324231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,43:0.42:103
chr6	128327031	rs45582334	A	G	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.943;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=110;ReadPosRankSum=0.494;SC=TAGGTGATAGATAAAGTTTAT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=6;WE=128327039;WS=128327022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr6	128330249	rs9321104	T	C	2153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=21;PP=1291;SC=GGTAAGTGAGTGGGACAGGAC;SOR=1.795;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=73;TCF=52;TCR=21;TR=72;WE=128330257;WS=128330239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr6	128385998	rs4897241	A	G	1692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=45;PP=1282;SC=TTCCTGTTTCATAAACTATAA;SOR=2.194;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=67;TCF=22;TCR=45;TR=66;WE=128386006;WS=128385988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr6	128388799	rs35030557	G	T	6697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=121;NR=108;PP=2965;SC=TTCCCGGGGGGAGTTCTGCAG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=230;TCF=122;TCR=108;TR=229;WE=128388807;WS=128388789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr6	128388990	rs4897242	A	G	3135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=56;PP=1643;SC=ATATTTAGAGATTTAAGATAC;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=36;TCR=56;TR=92;WE=128388998;WS=128388980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr6	128389074	rs4897243	T	C	508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=11;PP=368;SC=TAACCTGGTATACTCTTTTCA;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=128389082;WS=128389064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr6	128403745	rs17828130	A	G	533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.011;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=15;PP=306;ReadPosRankSum=0.612;SC=CAGCCACTGGAACTGCAGGAT;SOR=0.953;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=65;TCF=29;TCR=36;TR=25;WE=128403753;WS=128403735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,28:0.39:71
chr6	128556815	rs77369097	G	A	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.767;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=424;ReadPosRankSum=2.118;SC=TCTGAGTAGCGTGATGAAATC;SOR=3.270;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=38;TCF=7;TCR=31;TR=21;WE=128556823;WS=128556805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,23:0.52:44
chr6	129380843	rs143205326	C	CG	433.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=309;ReadPosRankSum=-0.139;SC=TTGTTTTAACCATTTTTTTTT;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=6;WE=129380852;WS=129380833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr6	129380844	rs74936600	A	G	442.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=338;ReadPosRankSum=0.021;SC=TGTTTTAACCATTTTTTTTTA;SOR=0.460;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=8;WE=129380852;WS=129380833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr6	129381026	rs4404787	C	A	5416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=99;PP=2965;SC=TGACAATTACCCTGGATTTAC;SOR=1.081;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=180;TCF=81;TCR=99;TR=180;WE=129381034;WS=129381016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr6	129612624	rs1015846	C	T	640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=0;PP=506;SC=CCTAACAGGGCACTTAACAAA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=129612632;WS=129612614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr6	129619150	rs1027200	G	A	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=64;ReadPosRankSum=0.389;SC=TTATTTTTACGTTACTTAAAA;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=5;WE=129619158;WS=129619140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr6	129622055	rs902373	A	G	1064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.770;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=24;PP=594;ReadPosRankSum=-1.725;SC=AATTTTTTGGAGAGATTTTTG;SOR=0.563;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=37;TCR=48;TR=43;WE=129622063;WS=129622045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,50:0.52:97
chr6	129799682	rs2784895	C	T	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.454;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=305;ReadPosRankSum=-1.708;SC=AACCAGTAGACAATGGAAACC;SOR=0.446;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=46;TCF=38;TCR=8;TR=20;WE=129799690;WS=129799672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,21:0.44:48
chr6	129802302	rs2275214	G	C	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=221;ReadPosRankSum=-0.159;SC=AACCTATGATGTATTTCATAA;SOR=1.061;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=10;WE=129802310;WS=129802295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr6	129802716	rs2571581	A	T	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.75;ReadPosRankSum=-1.036;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr6	129807483	rs6569604	C	G	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-4.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=228;ReadPosRankSum=-0.276;SC=TTTTCAAAACCGTTTGAGAAA;SOR=0.223;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=15;WE=129807491;WS=129807473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr6	129807629	rs2229848	C	T	2728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.924;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=53;PP=1516;ReadPosRankSum=0.528;SC=GCCTATTATGCAATACTCCTC;SOR=0.626;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=239;TCF=129;TCR=110;TR=114;WE=129807637;WS=129807619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,132:0.49:271
chr6	129807699	rs2229849	G	C	2498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.152;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=51;PP=1463;ReadPosRankSum=-2.947;SC=GGAAAATTGTGATCAGACCAG;SOR=0.841;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=219;TCF=110;TCR=109;TR=100;WE=129807707;WS=129807689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,118:0.48:244
chr6	129807714	rs2229850	G	A	2675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.602;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=61;PP=1725;ReadPosRankSum=1.033;SC=GACCAGAGCCGAATCTGTTTC;SOR=0.590;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=200;TCF=95;TCR=105;TR=117;WE=129807722;WS=129807704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,125:0.54:230
chr6	129807869	rs6938825	C	A	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.588;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=85;ReadPosRankSum=-2.034;SC=GTGTGTGGACCTACTATGCAT;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=6;WE=129807877;WS=129807859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr6	129813053	rs2244008	A	G	2548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.387;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=36;PP=1471;ReadPosRankSum=-0.365;SC=CAGCATCTTTACAGTTCAAGT;SOR=0.401;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=174;TCF=117;TCR=57;TR=101;WE=129813061;WS=129813043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,113:0.57:199
chr6	129813346	rs1889891	C	T	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.377;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=6;PP=258;ReadPosRankSum=-0.584;SC=GGATCTTCAACTTAGACTGAG;SOR=0.693;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=34;TCF=17;TCR=17;TR=14;WE=129813354;WS=129813336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
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chr6	129932894	rs7753754	T	C	224.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=153;SC=AATGCTATTTTACTACCACTG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=129932902;WS=129932884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
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chr6	129950394	rs4295498	A	C	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5130;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=69;ReadPosRankSum=0.842;SC=CTCTCTCTCTATATATATATA;SOR=0.223;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=5;WE=129950402;WS=129950387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr6	129955327	rs12664247	T	C	988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.879;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=27;PP=645;ReadPosRankSum=1.713;SC=AATTTTGTTATTAATCTTTAG;SOR=0.884;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=73;TCF=25;TCR=48;TR=39;WE=129955340;WS=129955317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,44:0.53:83
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chr6	130152452	rs9375666	G	A	1372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=11;PP=786;ReadPosRankSum=-0.230;SC=TTATTTCTGTGCATTAGAGAA;SOR=0.649;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=69;TCF=45;TCR=24;TR=33;WE=130152460;WS=130152430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,41:0.53:78
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chr6	130154686	rs4629709	A	G	2590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.911;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=63;PP=1562;ReadPosRankSum=-0.769;SC=GGAACAAAAAACAATCCACAA;SOR=0.752;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=251;TCF=121;TCR=130;TR=119;WE=130154694;WS=130154676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,131:0.47:277
chr6	130164764	rs9321190	G	A	1231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=28;PP=673;ReadPosRankSum=-0.095;SC=GATGTTATAAGTGAAAACAGT;SOR=0.732;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=120;TCF=60;TCR=60;TR=55;WE=130164772;WS=130164754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,63:0.47:135
chr6	130164856	rs9402185	C	T	1382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=29;PP=764;SC=CTATGCGATTCACCCACATTG;SOR=1.702;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=15;TCR=29;TR=44;WE=130164864;WS=130164846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr6	130166871	rs17475221	G	T	1040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.863;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=15;PP=661;ReadPosRankSum=1.141;SC=CCTATTCAATGTTAGCTTTTT;SOR=0.466;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=80;TCF=55;TCR=25;TR=44;WE=130166879;WS=130166861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,48:0.54:89
chr6	130166908	rs17396809	T	G	1641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.575;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=32;PP=1013;ReadPosRankSum=0.536;SC=AATGTGCTACTTACTCAAACA;SOR=0.399;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=159;TCF=104;TCR=55;TR=80;WE=130166916;WS=130166898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,86:0.49:176
chr6	130167131	rs12189832	A	G	1631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.481;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=48;PP=1164;ReadPosRankSum=0.826;SC=GACCCATGGAATGGGAATGAC;SOR=0.891;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=123;TCF=42;TCR=81;TR=70;WE=130167139;WS=130167121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,73:0.55:132
chr6	130370404	rs75575024	C	CCT	6272.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=29;PP=2930;SC=TTAAATTTTGCCTTTCTGCTG;SOR=1.734;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=85;TCF=51;TCR=34;TR=75;WE=130370412;WS=130370394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr6	130370731	rs142539365	TTG	T	2572.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=61.06;NF=20;NR=15;PP=1555;SC=ACTGTCTTCTTTGTCCTAATG;SOR=2.119;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=43;TCF=24;TCR=19;TR=35;WE=130370740;WS=130370721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr6	130371055	rs3890746	C	T	597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=16;PP=395;ReadPosRankSum=0.332;SC=CTCTTTCTTCCCTAACCCATA;SOR=0.593;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=24;WE=130371063;WS=130371045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,26:0.54:48
chr6	130374102	rs9388768	C	A	5369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=91;PP=2965;SC=AAAGCTGACACCAAGGAGGAT;SOR=0.840;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=181;TCF=90;TCR=91;TR=181;WE=130374110;WS=130374092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr6	130376221	rs13204752	G	T	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.767;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=106;ReadPosRankSum=-0.632;SC=CTGAAGAAAAGAACAACAGAA;SOR=0.057;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=9;WE=130376229;WS=130376211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr6	130378833	rs12661188	T	C	146.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=6;PP=112;SC=ACATGTGCCATGTGTGGGTGC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=130378841;WS=130378823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	130381074	rs34552886	G	A	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.483;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=53;ReadPosRankSum=-0.842;SC=ATTTTTAGAAGTTATGTATTT;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=4;WE=130381082;WS=130381070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
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chr6	130505128	rs144208556	TGA	T	89.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.99;ReadPosRankSum=-0.978;SOR=0.534;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,8:0.18:45
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chr6	130530815	rs1932100	C	T	1868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=27;NR=26;PP=755;SC=GATCTCACAGCAGCTCTGAAG;SOR=1.042;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=53;TCF=27;TCR=26;TR=53;WE=130530823;WS=130530805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr6	130535420	rs4897377	G	A	1168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=6;PP=924;SC=CAAACGTCACGCTCTAGCCAT;SOR=2.948;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=34;TCR=6;TR=40;WE=130535428;WS=130535410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr6	130536494	rs34071457	AT	A	3009.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.326;NF=5;NR=72;PP=1387;ReadPosRankSum=0.533;SC=TTGTGCCTTAATTTTTTTTTT;SOR=0.444;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=91;TCF=5;TCR=86;TR=77;WE=130536502;WS=130536484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,118:0.98:120
chr6	131148382	rs9402288	A	T	356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=265;SC=CAGCTTCCCAAGGTCATTCCC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=131148390;WS=131148373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr6	131148486	rs9402289	C	T	4356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=101;NR=38;PP=2558;SC=AGTAACCTGCCAGCAATCCTA;SOR=1.771;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=139;TCF=101;TCR=38;TR=139;WE=131148494;WS=131148476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr6	131148541	rs4895897	A	G	8026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=164;NR=103;PP=2965;SC=TCCACAAAAAATTCCACTGAG;SOR=1.091;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=267;TCF=164;TCR=103;TR=267;WE=131148549;WS=131148531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,294:1.00:294
chr6	131148737	rs1044303	G	A	5407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=98;PP=2965;SC=CTTCCTCCCCGTGACTTTGCT;SOR=1.202;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=173;TCF=75;TCR=98;TR=173;WE=131148745;WS=131148727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr6	131148863	rs9388856	A	T	657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=17;PP=453;SC=ATACCGATGCACTGTCAGTGT;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=131148871;WS=131148853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr6	131148891	rs113795427	C	CAT	133.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=183;SC=CCAGGAGAAACATATATATAT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=5;WE=131148899;WS=131148881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	131156102	rs6975	G	T	6363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=112;NR=108;PP=2965;SC=GTGAAGTTGGGGACTTTCCAA;SOR=0.726;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=220;TCF=112;TCR=108;TR=220;WE=131156110;WS=131156092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr6	131184770	rs915172	T	G	2998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=39;PP=1874;SC=AGAACTTAACTTATTTACCTG;SOR=1.250;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=67;TCR=39;TR=106;WE=131184778;WS=131184760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr6	131184914	rs915171	C	T	7614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=134;NR=130;PP=2965;SC=CACGTTTACACAGTCAGAGCA;SOR=0.707;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=264;TCF=134;TCR=130;TR=264;WE=131184922;WS=131184904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,288:1.00:288
chr6	131184975	rs867707	C	G	5816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=116;PP=2965;SC=AGGCCACACACAACAAGCAGC;SOR=1.146;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=199;TCF=83;TCR=116;TR=199;WE=131184983;WS=131184965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr6	131197990	rs7741462	T	C	437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=12;PP=371;SC=AAACACAAAATACTGACCCAG;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=131197998;WS=131197980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	131276466	rs34763200	GA	G	1916.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=31;PP=1048;SC=GGCTGTTGAGGAAAAAAAAAT;SOR=3.816;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=31;WE=131276481;WS=131276456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
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chr6	131520655	rs1190788	G	A	3593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=349;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=68;PP=2064;ReadPosRankSum=-0.928;SC=GAGAGCAGAAGTTTTAAACCT;SOR=0.686;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=312;TCF=173;TCR=139;TR=151;WE=131520663;WS=131520645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:177,172:0.49:349
chr6	131540726	rs3822866	A	T	591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=16;NR=3;PP=420;SC=AATCAGGTTCAAAGAAAGTGA;SOR=2.093;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=131540734;WS=131540716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
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chr6	131911655	rs2608955	A	T	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.690;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=224;ReadPosRankSum=-0.108;SC=CATACAGTATATACAAAGTAT;SOR=3.215;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=11;WE=131911663;WS=131911645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
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chr6	131958485	rs9375819	A	C	2947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.902;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.993;NF=66;NR=64;PP=1881;ReadPosRankSum=-3.147;SC=AGGAGCACTAATTTATTCTGA;SOR=0.670;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=254;TCF=132;TCR=122;TR=130;WE=131958493;WS=131958475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,140:0.49:284
chr6	131973932	rs3765562	C	G	1687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.565;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=32;PP=1140;ReadPosRankSum=-1.680;SC=TCTGTCTGTGCTGCAGCAAGT;SOR=0.765;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=163;TCF=96;TCR=67;TR=79;WE=131973940;WS=131973922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,82:0.48:172
chr6	131979652	rs9483311	C	T	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=71;ReadPosRankSum=-0.772;SC=ACTTTTAACGCTGGTGGTTTG;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=5;WE=131979660;WS=131979642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
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chr6	131995313	rs9493048	A	G	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.879;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=99;ReadPosRankSum=-1.816;SC=GCTTGTATCCAGAGTCACATG;SOR=0.073;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=12;WE=131995321;WS=131995303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,15:0.42:36
chr6	131997798	rs2286453	A	C	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=242;ReadPosRankSum=0.493;SC=AAGATATTAAACTTTCTGAAT;SOR=0.299;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=13;WE=131997806;WS=131997788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr6	131998001	.	G	GT	219.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.000;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=6.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQRankSum=0.000;QD=4.31;ReadPosRankSum=-0.843;SOR=0.378;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,17:0.33:51
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chr6	132006735	rs56776570	A	G	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.082;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=380;ReadPosRankSum=-0.408;SC=CAGACCCTCTACTGACTTCTT;SOR=1.007;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=64;TCF=18;TCR=46;TR=23;WE=132006743;WS=132006725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,27:0.39:69
chr6	132007162	rs9493053	C	T	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.006;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.10;ReadPosRankSum=-1.803;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
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chr6	132022419	rs201739285	G	A	828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=1.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.76;MQRankSum=0.005;QD=9.75;ReadPosRankSum=-0.063;SOR=0.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,36:0.42:85
chr6	132039962	rs117570214	C	A	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.062;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.65;ReadPosRankSum=0.830;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr6	132043349	rs378697	A	T	1391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=16;PP=719;ReadPosRankSum=0.039;SC=ACTTTGAACTAATTTTTTCAA;SOR=0.669;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=111;TCF=73;TCR=38;TR=53;WE=132043357;WS=132043339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,65:0.50:131
chr6	132061420	rs17601580	G	A	2660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.452;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=60;PP=1616;ReadPosRankSum=-1.426;SC=GTGCTGACCAGTTGTAAAAAC;SOR=0.588;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=247;TCF=119;TCR=128;TR=117;WE=132061428;WS=132061410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,132:0.49:272
chr6	132061605	rs67914728	C	T	576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=347;ReadPosRankSum=1.379;SC=CTGACTAAAACATTTTTTTTA;SOR=0.582;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=50;TCF=15;TCR=35;TR=25;WE=132061613;WS=132061595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,27:0.51:53
chr6	132113403	rs9493099	T	C	2994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.422;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=64;PP=1459;ReadPosRankSum=0.515;SC=CTTCCAGCTATGTCTGCTGCA;SOR=0.734;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=262;TCF=137;TCR=125;TR=133;WE=132113411;WS=132113393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,149:0.51:295
chr6	132207964	rs10692757	C	CTCT	711.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.106;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=779;ReadPosRankSum=0.564;SC=GAAAGCACAACTGAGTACACA;SOR=0.117;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=16;WE=132207972;WS=132207954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
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chr6	132211534	rs1804025	A	G	2823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=56;PP=1639;ReadPosRankSum=0.678;SC=TACACAGAGCACGGATCACAG;SOR=0.698;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=264;TCF=145;TCR=119;TR=128;WE=132211542;WS=132211524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,143:0.49:292
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chr6	132722527	rs77906164	G	A	1082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.664;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=21;PP=581;ReadPosRankSum=-0.288;SC=CCGTCCCGGGGAGCAGCCCCC;SOR=0.612;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=109;TCF=59;TCR=50;TR=47;WE=132722535;WS=132722517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,56:0.45:125
chr6	132722637	rs111499244	A	G	285.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=1.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.93;ReadPosRankSum=0.098;SOR=0.430;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
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chr6	132824833	rs2842885	G	A	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5340;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=91;ReadPosRankSum=0.712;SC=TAATCTAATAGAGTTGAAATC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=5;WE=132824841;WS=132824823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
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chr6	132910612	rs3813355	G	A	2849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.457;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=56;PP=1888;ReadPosRankSum=0.516;SC=GAGAGCAGCAGGAAGTTGGTG;SOR=0.802;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=242;TCF=133;TCR=109;TR=127;WE=132910620;WS=132910602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,135:0.50:271
chr6	132910634	rs3813354	C	T	3071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.842;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=61;PP=1920;ReadPosRankSum=0.488;SC=GCGTGTGAAGCGCTTTGAAGT;SOR=0.755;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=291;TCF=164;TCR=127;TR=141;WE=132910642;WS=132910624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,152:0.47:325
chr6	132911270	rs17061477	A	C	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.888;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=22;PP=534;ReadPosRankSum=-0.162;SC=AAAGATCTGAACCAAGTGACC;SOR=0.836;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=72;TCF=28;TCR=44;TR=35;WE=132911278;WS=132911260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,37:0.49:76
chr6	132938817	rs61745666	G	T	2376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.561;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=50;PP=1343;ReadPosRankSum=0.189;SC=AGACCACCCCGAAGGCAAATG;SOR=0.581;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=217;TCF=107;TCR=110;TR=102;WE=132938825;WS=132938807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,113:0.47:240
chr6	133015271	rs2272996	T	C	1885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.553;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=46;PP=1177;ReadPosRankSum=-1.449;SC=ATAGATAGAGTTGTTCTTGGC;SOR=0.609;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=166;TCF=75;TCR=91;TR=85;WE=133015279;WS=133015261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,90:0.50:180
chr6	133032759	rs3798792	A	G	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=22;ReadPosRankSum=0.957;SC=AGAATTGATCATGGATCTATG;SOR=0.188;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=4;WE=133032767;WS=133032749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr6	133035098	rs2294757	G	A	1602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.417;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=28;PP=1031;ReadPosRankSum=0.649;SC=AACAGCTGCAGTGAAAGTGTC;SOR=0.830;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=119;TCF=69;TCR=50;TR=68;WE=133035106;WS=133035088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,72:0.57:126
chr6	133035325	rs4897612	A	C	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=112;ReadPosRankSum=0.699;SC=AAAAGACCCTACCTTATTGCA;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=133035333;WS=133035315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr6	133045119	rs45606334	A	G	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.997;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=225;ReadPosRankSum=-0.515;SC=TGCAATTTCAAACTATAAATG;SOR=3.581;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=10;WE=133045127;WS=133045109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr6	133048213	rs9493417	G	A	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=77;ReadPosRankSum=-0.116;SC=GATGTGATCAGTTAAGTCTTT;SOR=0.340;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=6;WE=133048221;WS=133048203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr6	133052616	rs4895943	C	T	2862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.066;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=55;PP=1728;ReadPosRankSum=0.165;SC=TTCTGAATGACAGTGATAGCA;SOR=0.958;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=266;TCF=145;TCR=121;TR=133;WE=133052624;WS=133052606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,141:0.48:291
chr6	133055610	rs764262	G	T	2889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.353;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=61;PP=1754;ReadPosRankSum=1.932;SC=AAGTATAAAAGGGTAATACCT;SOR=0.604;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=285;TCF=143;TCR=142;TR=124;WE=133055618;WS=133055600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,140:0.45:310
chr6	133070995	rs4895944	G	T	4807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=89;PP=2780;SC=CACTTCAGCAGTGTGCAGACC;SOR=1.154;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=156;TCF=67;TCR=89;TR=156;WE=133071003;WS=133070985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr6	133074663	rs9493426	T	C	1534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.281;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=40;PP=990;ReadPosRankSum=-0.370;SC=GTATTTAATTTCCCGATTCCT;SOR=0.909;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=117;TCF=49;TCR=68;TR=65;WE=133074671;WS=133074653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,71:0.55:129
chr6	133076896	rs9483499	A	G	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=78;ReadPosRankSum=0.394;SC=ATATTGTATCATATAGGGAAT;SOR=0.495;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=8;WE=133076904;WS=133076895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr6	133079136	rs3901670	A	T	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=41;ReadPosRankSum=0.412;SC=CTTTATCATCATTTTTCTTCT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=4;WE=133079144;WS=133079126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr6	133135807	rs9493450	C	T	2053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.018;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=33;PP=1270;ReadPosRankSum=-0.634;SC=TGGCTCGTTGCGTTCTTGCTG;SOR=0.968;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=187;TCF=113;TCR=74;TR=90;WE=133135815;WS=133135797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,99:0.48:205
chr6	133135864	rs12202302	T	G	3191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.290;HP=5;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=70;PP=1964;ReadPosRankSum=0.822;SC=ATGCTTTTGTTTTTTAGTGCG;SOR=0.823;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=318;TCF=168;TCR=150;TR=153;WE=133135872;WS=133135854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,162:0.47:344
chr6	133135886	rs9483504	A	G	3031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.397;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=72;PP=1984;ReadPosRankSum=-0.283;SC=TCAAGATTCAACTTCACCCGT;SOR=0.724;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=311;TCF=157;TCR=154;TR=146;WE=133135894;WS=133135876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:180,152:0.46:332
chr6	133135974	rs41286196	G	A	1072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.810;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=29;PP=719;ReadPosRankSum=-0.175;SC=CTGAGGCGTGGGGCTAGAGCT;SOR=0.794;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=85;TCF=29;TCR=56;TR=42;WE=133135982;WS=133135964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,47:0.48:97
chr6	133136041	rs9493451	C	G	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-3.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.528;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=94;ReadPosRankSum=1.401;SC=GTACACTTAGCTTTTGCTGAG;SOR=2.215;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=7;WE=133136049;WS=133136031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr6	133137111	rs3778174	C	T	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.373;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=2.632;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=30;ReadPosRankSum=0.301;SC=GATGGAATTACAGGCACACGC;SOR=0.991;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=6;WE=133137119;WS=133137101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr6	133138010	rs9389034	T	C	2893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.008;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.931;NF=57;NR=69;PP=1899;ReadPosRankSum=1.730;SC=ACCCTTCTGATTACAGCCACC;SOR=0.785;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=230;TCF=104;TCR=126;TR=126;WE=133138018;WS=133138000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,127:0.54:235
chr6	133138067	rs34924584	ATT	A	838.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=5.126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=0.772;QD=18.23;ReadPosRankSum=1.225;SOR=1.643;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,31:0.67:46
chr6	133703325	rs2235485	A	G	358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=239;SC=TTACATACTAATGGAGTCCAG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=133703333;WS=133703315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	133789728	rs9493627	G	A	2668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.898;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=57;PP=1727;ReadPosRankSum=-2.311;SC=TACAGCCTTTGGCCAAAACCA;SOR=0.619;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=263;TCF=147;TCR=116;TR=125;WE=133789736;WS=133789718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,136:0.47:292
chr6	133827148	rs6929656	T	C	1108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=6;PP=800;SC=CATGCAGTCTTCTCCCTCTTC;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=35;WE=133827156;WS=133827138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr6	133827354	rs2277083	A	G	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.350;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=251;ReadPosRankSum=-0.257;SC=TACAAGGTACAAATAGTTGTA;SOR=1.402;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=35;TCF=9;TCR=26;TR=15;WE=133827362;WS=133827344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,17:0.46:37
chr6	133836330	rs3777887	C	T	583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=337;ReadPosRankSum=-0.399;SC=GGACATAAATCTGTATCTCTC;SOR=0.529;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=48;TCF=38;TCR=10;TR=22;WE=133836338;WS=133836320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,27:0.50:54
chr6	133844137	rs41286206	C	A	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.368;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=408;ReadPosRankSum=-1.307;SC=AATTTTAAATCTATTAGAAGT;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=35;TCR=2;TR=20;WE=133844145;WS=133844127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr6	133849789	rs3822939	A	G	1002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.676;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=17;PP=656;ReadPosRankSum=0.699;SC=TCATTGAGACAATGGTTGTGA;SOR=0.598;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=126;TCF=81;TCR=45;TR=53;WE=133849797;WS=133849779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,55:0.41:133
chr6	133852127	rs17053542	A	T	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.53;ReadPosRankSum=-0.090;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr6	134210497	rs5880197	G	GTCTC	254.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.444;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=227;ReadPosRankSum=0.713;SC=CTGTCTCTCTGTCTCTCTCTC;SOR=1.781;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=38;TCF=28;TCR=10;TR=10;WE=134210505;WS=134210487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,11:0.26:43
chr6	134304023	rs2076583	C	T	1646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=23;NR=28;PP=936;SC=TTTCAGGTAACGTTTTCAAAT;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=23;TCR=28;TR=51;WE=134304031;WS=134304013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr6	134308187	rs11553666	T	G	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.978;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.23;ReadPosRankSum=-0.972;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr6	134327815	rs2811676	C	T	755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=2;PP=558;SC=GTCATGGGTACTTCAGGGTCA;SOR=4.255;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=24;WE=134327823;WS=134327805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr6	134494548	rs1743965	C	T	3895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=64;PP=2404;SC=AGGGAGAATACAAAAGAGGAC;SOR=0.736;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=63;TCR=64;TR=127;WE=134494556;WS=134494538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr6	134495291	rs3215438	T	TC	277.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.416;NF=0;NR=9;PP=287;ReadPosRankSum=1.033;SC=AAAGTGAGTTTCTGGCTCTAC;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=9;WE=134495299;WS=134495281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,11:0.35:31
chr6	134536256	rs201147934	T	TTTTC	431.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=13;PP=257;SC=TGAGAGTAAGTTTTCTTTCTT;SOR=2.448;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=13;WE=134536264;WS=134536246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr6	134536309	.	G	A	22	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=29;MQ=65.19;NF=1;NR=1;PP=22;QD=28.3856062736;SC=TGCCCAGGCTGGAGTACAGTG;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=2;TCF=1;TCR=1;TR=2;WE=134536317;WS=134536299;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
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chr6	135514829	rs34931156	TA	T	1378.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.678;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.909;NF=23;NR=13;PP=1148;ReadPosRankSum=0.555;SC=AATTTCACATTAAAAGGTTTT;SOR=1.056;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=80;TCF=46;TCR=34;TR=36;WE=135514837;WS=135514819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,55:0.46:120
chr6	135522939	rs743589	T	C	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=306;ReadPosRankSum=1.042;SC=TGGTGCCTCATGAAATCCTGT;SOR=1.179;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=20;WE=135522947;WS=135522929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,22:0.67:33
chr6	135523774	rs7762830	A	G	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.752;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.722;NF=4;NR=4;PP=112;ReadPosRankSum=1.482;SC=CCAAAGTGCTAGGATTACAGG;SOR=0.132;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=8;WE=135523782;WS=135523764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr6	135524516	rs9385719	A	G	673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=1.902;NF=7;NR=24;PP=1228;ReadPosRankSum=1.759;SC=AAAAACTGTCATCTTTGGTGG;SOR=0.744;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=88;TCF=23;TCR=65;TR=31;WE=135524528;WS=135524506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,33:0.36:91
chr6	135524520	rs113909655	T	TTGG	675.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.400;HP=2;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.779;NF=0;NR=16;PP=1253;ReadPosRankSum=0.367;SC=ACTGTCATCTTTGGTGGTGGT;SOR=0.951;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=63;TCF=1;TCR=62;TR=16;WE=135524528;WS=135524506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,20:0.40:50
chr6	135524553	rs9402696	C	T	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=248;ReadPosRankSum=-0.179;SC=GATGGTAGTGCTGGTGGTCTG;SOR=1.085;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=37;TCF=5;TCR=32;TR=14;WE=135524561;WS=135524543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,14:0.39:36
chr6	135539074	rs111414491	C	T	2193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.237;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=41;PP=1084;ReadPosRankSum=-0.260;SC=CAGTCAAGCTCGTAAATACGT;SOR=0.763;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=202;TCF=107;TCR=95;TR=95;WE=135539082;WS=135539064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,110:0.48:229
chr6	135623833	rs2207000	C	T	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.710;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=135;ReadPosRankSum=1.734;SC=ATTTGACTTCCAAACACCTTT;SOR=0.333;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=12;WE=135623841;WS=135623823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr6	135748200	rs2757639	A	G	113.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=0;PP=87;SC=GGGCACAATTATTATGTGTAC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=135748208;WS=135748190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr6	135752608	rs2614270	T	C	510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=13;PP=377;SC=AATCAAAATGTAACTCACAAA;SOR=1.863;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=18;WE=135752616;WS=135752598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr6	135754471	rs737561	C	T	133.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=103;SC=AGAACCAACACAGCCAATGAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=135754479;WS=135754461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	135763585	rs2614274	T	C	717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=1;PP=573;SC=ACTTTCTTTGTTTGAAGAAAT;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=135763593;WS=135763575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr6	135763866	rs2757645	G	A	1736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=36;PP=957;SC=AAAAACATACGTTTAAAAAAT;SOR=1.376;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=23;TCR=36;TR=59;WE=135763874;WS=135763844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr6	135813251	rs9402709	G	T	134.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=104;SC=AGTATATTTGGTCAATGACAT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=135813259;WS=135813241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	135818897	rs13197384	C	A	139.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.31;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	136268769	rs41288029	A	G	787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.479;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=26;PP=556;ReadPosRankSum=0.090;SC=AGAGGCTGATAGGTTCTTTTG;SOR=1.134;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=59;TCF=7;TCR=52;TR=29;WE=136268777;WS=136268759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,32:0.48:67
chr6	136582417	rs62431283	G	A	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=35.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQRankSum=-4.775;QD=2.74;ReadPosRankSum=-4.093;SOR=5.448;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,16:0.19:86
chr6	136582497	rs62431284	G	T	4235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=398;ExcessHet=3.0103;FS=1.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQRankSum=-6.748;QD=10.72;ReadPosRankSum=0.965;SOR=0.606;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:195,200:0.51:395
chr6	136590613	rs62431285	T	C	1249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.574;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.609;NF=50;NR=20;PP=1102;ReadPosRankSum=-3.073;SC=TGTAATCTTTTGGAGTTTTTT;SOR=0.785;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=195;TCF=126;TCR=69;TR=70;WE=136590625;WS=136590603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,65:0.32:203
chr6	136590640	rs62431286	A	C	2099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=348;ExcessHet=3.0103;FS=1.877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQRankSum=-4.116;QD=6.29;ReadPosRankSum=0.455;SOR=0.581;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:208,126:0.38:334
chr6	136590698	rs62431287	C	T	2239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-3.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=502;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.905;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-5.268;NF=73;NR=75;PP=2962;ReadPosRankSum=1.887;SC=TTTTCTACGGCGATCAATGTC;SOR=0.881;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=467;TCF=238;TCR=229;TR=148;WE=136590720;WS=136590688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:337,149:0.31:486
chr6	136590712	rs62431288	C	T	2024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=488;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.581;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-5.310;NF=58;NR=73;PP=2962;ReadPosRankSum=-4.431;SC=CAATGTCATGCCGAAGGTCAG;SOR=0.775;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=445;TCF=217;TCR=228;TR=131;WE=136590720;WS=136590688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:339,135:0.28:474
chr6	136594292	rs7381749	T	C	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FS=1.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQRankSum=-10.044;QD=2.21;ReadPosRankSum=2.213;SOR=0.675;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:210,57:0.21:267
chr6	136597262	rs1967444	T	C	4940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=495;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.080;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.512;NF=126;NR=94;PP=2962;ReadPosRankSum=1.007;SC=GCCTTTCCACTACATATCCAG;SOR=0.992;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=457;TCF=252;TCR=205;TR=220;WE=136597270;WS=136597252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:259,236:0.48:495
chr6	136597281	rs1967445	A	T	8942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=488;ExcessHet=3.0103;FS=5.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.044;QD=18.36;ReadPosRankSum=-0.370;SOR=1.107;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:252,235:0.48:487
chr6	136597288	rs1967446	A	C	9041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=494;ExcessHet=3.0103;FS=4.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.023;QD=18.34;ReadPosRankSum=-0.882;SOR=1.012;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:253,240:0.49:493
chr6	136598895	rs58951987	T	TA	246.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=9;NR=0;PP=320;SC=AAGTCAAGAGTAAAAACCGCT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=9;WE=136598903;WS=136598885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
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chr6	136599842	rs9942519	G	A	3350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQRankSum=-5.332;QD=15.30;ReadPosRankSum=1.469;SOR=0.685;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:130,89:0.41:219
chr6	136599910	.	T	TGTATCGCTTCTTTCTAGAATGAGATCTTGATCTTGATCG	696.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.372;ClippingRankSum=0.000;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=42.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQRankSum=-6.193;QD=5.49;ReadPosRankSum=-3.553;SOR=5.478;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:102,25:0.20:127
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chr6	136698697	rs2076192	C	A	499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=1;PP=320;SC=GCCTGCCTGGCGTCTGGTGTC;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=136698705;WS=136698689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
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chr6	136932603	.	TA	T	81.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.500;ClippingRankSum=0.000;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.21;ReadPosRankSum=1.099;SOR=0.392;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,9:0.24:37
chr6	136977568	rs2076260	T	C	1350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=34;PP=945;ReadPosRankSum=0.711;SC=GCTTATATATTAAAATTGTCT;SOR=0.714;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=128;TCF=52;TCR=76;TR=57;WE=136977587;WS=136977558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,60:0.45:132
chr6	136990283	rs3765259	T	C	372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=251;SC=AACAAGGAGATATAATAAGTT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=136990291;WS=136990273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr6	137026266	rs9321567	T	G	2304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=29;PP=1498;SC=TCTGGCAAATTATTTCCTGAA;SOR=1.096;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=46;TCR=29;TR=75;WE=137026274;WS=137026256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr6	137113137	rs55666429	G	A	2777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=52;PP=1880;ReadPosRankSum=1.644;SC=CGTTCCAGAAGCTGCCCGGCG;SOR=0.417;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=92;TCF=39;TCR=53;TR=91;WE=137113145;WS=137113127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,98:0.99:99
chr6	137143611	rs1321470	A	T	100.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=99;SC=TTCAGTTTGGATTCACCCAAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=137143619;WS=137143605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr6	137143709	rs1321471	T	C	586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=12;NR=7;PP=316;SC=CACACTTCCGTCCGGTCTGCC;SOR=0.963;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=12;TCR=7;TR=19;WE=137143717;WS=137143699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr6	137143980	rs11283064	G	GGGGGCC	412.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=2;PP=70;SC=AGGCGGAGGCGGGGGCCAGCC;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=2;WE=137143988;WS=137143970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	137166682	rs927181	G	A	2064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=17;PP=1266;SC=TCATTGTTATGTAACAAGAGA;SOR=1.874;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=51;TCR=17;TR=68;WE=137166690;WS=137166672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr6	137167445	rs9321575	T	C	2288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=53;PP=1596;SC=TTCTTTTGTGTTCTTAAGACT;SOR=2.599;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=15;TCR=53;TR=68;WE=137167453;WS=137167435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr6	137187641	rs1884940	G	A	1146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=4;PP=742;SC=AAATAAGTCTGAAGGTGGCAA;SOR=3.855;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=32;WE=137187649;WS=137187631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr6	137245534	rs150994900	G	C	2569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=63;PP=1503;ReadPosRankSum=0.966;SC=TGGAGGCCCAGCCTCGGGGAG;SOR=0.708;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=249;TCF=106;TCR=143;TR=111;WE=137245542;WS=137245524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,125:0.45:278
chr6	137325847	rs1555498	C	T	2695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=41;NR=64;PP=1903;SC=GTAATAGATACGGGCAAAACA;SOR=1.125;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=117;TCF=46;TCR=71;TR=105;WE=137325855;WS=137325837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr6	137338276	rs433243	A	G	9120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=145;NR=163;PP=2965;SC=AGGTCTTAGTAGCAGAAAAGG;SOR=0.896;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=309;TCF=146;TCR=163;TR=308;WE=137338284;WS=137338266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,333:1.00:333
chr6	137338352	rs451371	G	T	4189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.75;SOR=2.400;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr6	137338357	rs442663	A	G	4093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.52;SOR=2.356;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr6	137365680	.	C	G	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.637;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=177;ReadPosRankSum=-0.750;SC=GAAACCTGGCCGGCGGGCAGG;SOR=1.179;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=13;WE=137365688;WS=137365670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr6	137477823	rs2064501	C	T	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=246;ReadPosRankSum=-1.062;SC=GAAATTTATACAATCTTGGTC;SOR=0.976;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=17;WE=137477831;WS=137477813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr6	137482982	rs11154915	C	T	1833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.899;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=46;PP=1036;ReadPosRankSum=0.717;SC=CAATCACTCCCGGGTTTAAGG;SOR=0.530;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=166;TCF=61;TCR=105;TR=76;WE=137482990;WS=137482972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,88:0.47:187
chr6	137519588	rs11914	A	C	3082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.441;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=67;PP=1635;ReadPosRankSum=2.703;SC=CTGTTATACTAGAAAGTTCTT;SOR=0.565;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=280;TCF=135;TCR=145;TR=137;WE=137519596;WS=137519578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,152:0.49:309
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chr6	137536455	rs1327475	G	A	1507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=30;PP=808;ReadPosRankSum=0.746;SC=GACTTCAAAAGCATCTGCTTC;SOR=0.749;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=119;TCF=63;TCR=56;TR=63;WE=137536463;WS=137536445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,72:0.55:132
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chr6	138192324	rs3214646	CT	C	81.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.88;ReadPosRankSum=0.991;SOR=0.761;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,16:0.17:93
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chr6	138539183	rs3841283	A	AG	3314.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.236;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=33;PP=1793;ReadPosRankSum=-0.241;SC=TTCCAGACCTAGGGTCTGAGT;SOR=0.553;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=128;TCF=47;TCR=81;TR=51;WE=138539191;WS=138539173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,119:0.51:232
chr6	138539315	rs6927706	A	G	2932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.007;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=66;PP=1743;ReadPosRankSum=1.393;SC=TGACTGTTCTATGGAATAATC;SOR=0.553;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=288;TCF=135;TCR=153;TR=130;WE=138539323;WS=138539305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,144:0.45:319
chr6	138539556	rs11758517	T	C	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.435;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=239;ReadPosRankSum=0.141;SC=AATTGAATTGTAGCTCTGTAG;SOR=0.354;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=17;WE=138539564;WS=138539546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,19:0.41:46
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chr6	138584685	rs7764091	T	G	1532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=31;PP=1010;ReadPosRankSum=1.363;SC=TCGGCTCCTGTCTCTCTCCAA;SOR=0.749;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=119;TCF=59;TCR=60;TR=61;WE=138584693;WS=138584675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,67:0.51:132
chr6	138599487	rs112246934	T	TA	981.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.261;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=790;ReadPosRankSum=-1.634;SC=AAATATCCTATTGATGCAGTA;SOR=1.127;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=48;TCF=36;TCR=12;TR=23;WE=138599495;WS=138599477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,30:0.50:60
chr6	138613210	rs180780280	C	T	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=17;PP=416;ReadPosRankSum=0.991;SC=GCCGGCCTCCCACGCCCCGGG;SOR=0.566;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=50;TCF=21;TCR=29;TR=30;WE=138613218;WS=138613200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,31:0.60:52
chr6	138614992	rs146565451	GAAT	G	355.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.245;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=312;ReadPosRankSum=1.588;SC=AGAATAGATAGAATAATACCA;SOR=1.942;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=8;WE=138615002;WS=138614982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr6	138619642	rs12665341	G	A	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.039;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=116;ReadPosRankSum=-1.020;SC=CAGAATTGCTGCTTCCACCTC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=7;WE=138619650;WS=138619632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr6	138620000	rs2281149	A	G	438.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=286;ReadPosRankSum=-0.488;SC=TGAGCTTCGCACACTTACTCT;SOR=0.776;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=16;WE=138620008;WS=138619990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,17:0.94:18
chr6	138628598	rs34359396	TAAA	T	625.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.500;HP=12;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=162;ReadPosRankSum=0.259;SC=TTCATGCTATTAAAAAAAAAA;SOR=0.318;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=12;WE=138628608;WS=138628588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr6	138632506	rs2272890	G	T	881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.713;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=19;PP=1189;ReadPosRankSum=-0.958;SC=GCACGCAAGGGTAACACTGTT;SOR=0.612;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=96;TCF=56;TCR=40;TR=43;WE=138632526;WS=138632496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,47:0.43:109
chr6	138632518	rs2272889	G	T	765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.625;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=16;PP=1189;ReadPosRankSum=1.334;SC=AACACTGTTGGTCTCTGTCTC;SOR=0.907;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=94;TCF=52;TCR=42;TR=39;WE=138632526;WS=138632496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,41:0.40:103
chr6	138634896	rs2294443	C	A	870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=12;PP=498;ReadPosRankSum=-0.387;SC=CTTTTTCCAACATATAATTGC;SOR=0.608;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=60;TCR=26;TR=39;WE=138634904;WS=138634886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,43:0.47:92
chr6	138642177	rs3736707	A	G	2194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.711;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=32;PP=1254;ReadPosRankSum=-0.409;SC=CTCTGTTGCTATAGATGGCCA;SOR=0.440;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=156;TCF=104;TCR=52;TR=89;WE=138642185;WS=138642167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,100:0.58:173
chr6	138644775	rs2010579	A	C	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=1.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.09;ReadPosRankSum=0.231;SOR=0.944;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,25:0.45:56
chr6	138645228	rs3734301	G	A	1940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.293;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=31;PP=1185;ReadPosRankSum=2.245;SC=TGCGAGTGGCGGCCCCGTCCT;SOR=0.845;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=140;TCF=83;TCR=57;TR=81;WE=138645236;WS=138645218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,90:0.58:155
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chr6	138656343	rs41289781	C	G	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=237;ReadPosRankSum=0.229;SC=CCTGTGGCCACAGCAGGTGGG;SOR=0.929;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=13;WE=138656351;WS=138656333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,13:0.36:36
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chr6	138754323	rs2327891	A	G	5548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=117;NR=73;PP=2965;SC=AAGTGTCTCAACTCCTGGGAT;SOR=1.239;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=190;TCF=117;TCR=73;TR=190;WE=138754331;WS=138754313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
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chr6	138820293	rs71754767	CACAG	C	216.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.828;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.48;ReadPosRankSum=0.978;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr6	138820324	rs10457670	A	G	1767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=46;NR=22;PP=1382;SC=ACACATATGGAAACATATGCA;SOR=1.503;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=46;TCR=22;TR=68;WE=138820332;WS=138820314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr6	139085576	rs188898411	T	A	59.85	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.78;MQRankSum=-0.967;QD=9.98;ReadPosRankSum=-0.842;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr6	139094805	.	C	A	3037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.145;ClippingRankSum=0.000;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.618;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=56;PP=1979;ReadPosRankSum=0.392;SC=ACAGGGGAAGCAATGAAATGC;SOR=0.680;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=249;TCF=127;TCR=122;TR=123;WE=139094813;WS=139094795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,137:0.50:276
chr6	139114113	rs6570282	A	G	414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=12;PP=346;SC=GCTGTAATTCACCATAACTGG;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=139114121;WS=139114103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	139134558	rs1919691	C	T	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=337;ReadPosRankSum=0.318;SC=CATGTTGCCACATTTTTAAAG;SOR=0.604;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=20;WE=139134566;WS=139134548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr6	139183879	rs12204850	G	A	1492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.091;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=35;PP=957;ReadPosRankSum=-1.005;SC=GGAGCTGAGCGCCACGTCCAA;SOR=0.330;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=149;TCF=63;TCR=86;TR=66;WE=139183887;WS=139183869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,73:0.43:170
chr6	139184044	rs1188827	C	G	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=93;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TTGCTTAGAACAGGATTATTT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=5;WE=139184052;WS=139184034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr6	139186457	rs12198757	C	T	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.923;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=88;ReadPosRankSum=-0.107;SC=GTTGCTCACACGGCCTTTCAA;SOR=1.426;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=6;WE=139186465;WS=139186447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr6	139197609	rs1529151	G	A	2067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.032;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=51;PP=1264;ReadPosRankSum=0.265;SC=CAATCTTCAGGAAAGAAATGT;SOR=0.773;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=208;TCF=98;TCR=110;TR=95;WE=139197617;WS=139197599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,102:0.46:224
chr6	139202014	rs1157050	G	C	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.703;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=29;ReadPosRankSum=0.992;SC=ACCAGCAAGGGGGGTCTCCGT;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=3;WE=139202022;WS=139202004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr6	139206582	rs59052100	TG	T	955.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=819;ReadPosRankSum=0.503;SC=GCTTGCTCAGTGGAACAGTGG;SOR=0.754;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=23;WE=139206590;WS=139206572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,31:0.55:56
chr6	139207910	rs1188831	C	T	311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=242;SC=CTGTATCAAGCGCCATAAAAT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=139207918;WS=139207900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	139208118	rs7764840	T	G	1677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=36;PP=1010;ReadPosRankSum=-2.734;SC=TCCAGTCTTTTGCAAAAGGAG;SOR=0.648;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=151;TCF=75;TCR=76;TR=73;WE=139208126;WS=139208108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,84:0.50:168
chr6	139229695	rs1188867	A	G	1095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=8;PP=835;SC=GCCTCCCAAAATGCTGGGATT;SOR=2.649;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=35;WE=139229703;WS=139229685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr6	139229743	rs1188868	C	T	2498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=31;PP=1606;SC=AGTTTGATTACTTTTAATTGT;SOR=1.440;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=57;TCR=31;TR=88;WE=139229751;WS=139229733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr6	139229872	rs1044418	C	T	2144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.405;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=43;PP=1231;ReadPosRankSum=0.167;SC=TGTTCATCAACTTCTGGCCTT;SOR=0.804;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=240;TCF=125;TCR=115;TR=100;WE=139229880;WS=139229862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,110:0.41:266
chr6	139232579	rs3765191	C	A	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.542;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=364;ReadPosRankSum=1.400;SC=AGAATATGTACCAAATCAGAA;SOR=0.223;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=40;TCF=9;TCR=31;TR=25;WE=139232587;WS=139232569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,26:0.62:42
chr6	139241332	rs9495285	A	G	1387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.212;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=31;PP=813;ReadPosRankSum=1.321;SC=TTCAAATGGAAGATGTAATAC;SOR=0.575;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=118;TCF=64;TCR=54;TR=65;WE=139241340;WS=139241322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,71:0.55:130
chr6	139264930	rs6899737	T	G	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=35;ReadPosRankSum=0.385;SC=ATGTCTTTGATATTATGAAAT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=3;WE=139264938;WS=139264920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr6	139265882	rs1188897	T	A	1081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=30;PP=842;SC=TTTTCTGTTCTATTAGAAATT;SOR=3.026;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=37;WE=139265890;WS=139265872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr6	139456761	rs185694700	T	C	404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.30;SOR=1.244;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
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chr6	139487836	rs3173082	T	C	7653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=125;NR=126;PP=2965;SC=GGCCCCCAAATAAGCCCCAGA;SOR=0.737;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=252;TCF=125;TCR=127;TR=251;WE=139487844;WS=139487826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr6	139598061	.	T	TA	75.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.848;ClippingRankSum=0.000;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.30;MQRankSum=1.815;QD=2.70;ReadPosRankSum=-0.106;SOR=0.665;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,7:0.25:28
chr6	139695061	rs1131400	G	T	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.029;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=12;PP=245;ReadPosRankSum=-0.436;SC=CGTGGTTCATGGCCATCATAT;SOR=0.894;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=48;TCF=21;TCR=27;TR=21;WE=139695069;WS=139695051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,26:0.46:56
chr6	141004964	rs5880480	G	GT	2827.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=23;PP=1139;SC=GTGTCCCCTGGCACGCTATTT;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=26;WE=141004972;WS=141004954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr6	141005059	rs4535568	G	A	1953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.14;QD=25.71;SOR=0.801;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr6	142455130	rs225607	C	T	4274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=67;NR=72;PP=2324;SC=GAGAAGTAAACCTCTTCTGTT;SOR=0.924;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=67;TCR=72;TR=139;WE=142455138;WS=142455120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr6	142455731	rs9376674	C	A	3289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=57;NR=47;PP=1805;SC=CTTTATGCTGCATGTAAAAGC;SOR=0.709;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=57;TCR=47;TR=104;WE=142455739;WS=142455721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr6	142487263	rs225655	T	C	144.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=114;SC=TTTCTAAATTTACTTGAATTT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=142487271;WS=142487255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	142487469	rs225656	C	A	2137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=37;PP=1350;SC=TGTAAGTTAACCACTGATCAT;SOR=0.796;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=39;TCR=37;TR=76;WE=142487477;WS=142487459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr6	142490107	rs225661	T	C	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=0;PP=23;SC=GGGGTTTCACTGTGTTAGCCA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=142490115;WS=142490097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr6	142490211	rs11758623	A	T	626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=12;NR=7;PP=286;SC=CGGCCGAGAGATATTATTTTA;SOR=1.136;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=12;TCR=7;TR=19;WE=142490219;WS=142490201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr6	142491463	rs11446143	C	CG	1614.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.51;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=6;NR=9;PP=641;SC=TAAACTAGACCGCTCTCTTTT;SOR=1.055;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=16;TCF=6;TCR=10;TR=15;WE=142491471;WS=142491453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr6	142491584	rs225663	A	G	1290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=18;PP=640;SC=TTATTGTCTTATTAGCTGAAG;SOR=0.818;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=22;TCR=18;TR=40;WE=142491592;WS=142491574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr6	142491729	rs56185739	C	A	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=2;PP=25;SC=AAATTATTTCCAATAATATAT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=142491737;WS=142491719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr6	142510676	rs3830800	GTATT	G	3231.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=40;PP=1991;SC=ATAATGGTATGTATTTATTTA;SOR=1.949;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=1;TCR=51;TR=41;WE=142510687;WS=142510666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr6	142703137	rs2143390	C	T	1742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.052;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=28;PP=935;ReadPosRankSum=0.002;SC=GCTGTGCAGACCTGGGGACCC;SOR=0.881;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=137;TCF=80;TCR=57;TR=75;WE=142703145;WS=142703127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,83:0.55:150
chr6	142705070	rs41289839	G	A	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.569;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=111;ReadPosRankSum=0.280;SC=CCAACAAAGTGTCTGTTACTG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=7;WE=142705078;WS=142705060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr6	142718801	rs989946	G	A	7969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=126;NR=142;PP=2965;SC=ATACTAATTTGGAAGGAAAAA;SOR=0.915;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=268;TCF=126;TCR=142;TR=268;WE=142718809;WS=142718791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,296:1.00:296
chr6	142724918	rs9496369	C	T	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-3.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=6;PP=424;ReadPosRankSum=-0.863;SC=TTAATAGTGGCATTTTTTGTC;SOR=0.723;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=91;TCF=71;TCR=20;TR=34;WE=142724926;WS=142724908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,43:0.41:105
chr6	142758631	rs1262686	A	G	6771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=125;NR=110;PP=2965;SC=CAGTGGCGGCAGCATCTCTGC;SOR=0.740;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=235;TCF=125;TCR=110;TR=235;WE=142758639;WS=142758621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr6	143074700	rs169098	T	C	2438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.175;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=54;PP=1328;ReadPosRankSum=0.813;SC=GAGTGCTAGGTGGACCAGATG;SOR=0.567;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=213;TCF=104;TCR=109;TR=110;WE=143074708;WS=143074690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,120:0.50:238
chr6	143081847	rs197462	A	G	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.171;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=222;ReadPosRankSum=-1.666;SC=AGATCCAAATATCAAGGTTAG;SOR=0.105;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=13;WE=143081855;WS=143081837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr6	143090633	rs75657229	T	C	949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=16;PP=557;ReadPosRankSum=-0.062;SC=CACTATGTAGTCTGCTCAGCA;SOR=0.631;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=89;TCF=59;TCR=30;TR=46;WE=143090641;WS=143090623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,49:0.49:100
chr6	143090734	rs34530989	T	C	2140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=40;PP=1422;ReadPosRankSum=-0.416;SC=GCTTGCCGGTTCCAGGCCTAT;SOR=0.689;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=192;TCF=107;TCR=85;TR=89;WE=143090742;WS=143090724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,100:0.45:222
chr6	143091263	rs109836	A	G	4965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=72;PP=2965;SC=CTTGCTGGGCAGGAATGGCTC;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=171;TCF=99;TCR=72;TR=171;WE=143091271;WS=143091253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr6	143091769	rs34947356	G	A	2646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=56;PP=1711;ReadPosRankSum=-0.071;SC=TATTCTCATCGACTTTGCATA;SOR=0.665;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=227;TCF=119;TCR=108;TR=114;WE=143091777;WS=143091759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,124:0.50:246
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chr6	143382110	rs7774011	T	C	1362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=23;PP=816;ReadPosRankSum=0.617;SC=TCCTGCTGTCTTACTGCTCTA;SOR=0.744;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=118;TCF=76;TCR=42;TR=62;WE=143382118;WS=143382100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,67:0.51:132
chr6	143382218	.	TC	T	1049	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=9;HapScore=1;MGOF=21;MMLQ=18;MQ=60.0;NF=9;NR=12;PP=1049;QD=51.2380952381;SC=GGCCGTCCCCTCCCCCTGCTC;SbPval=0.04;Source=Platypus;TC=61;TCF=13;TCR=48;TR=21;WE=143382226;WS=143382208;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:40,21:0.34:61
chr6	143382254	.	CGTGTGTGT	C	1129.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.939;ClippingRankSum=0.000;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.190;HP=2;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.265;NF=12;NR=17;PP=1854;ReadPosRankSum=-0.108;SC=CCTGTGTGTGCGTGTGTGTGT;SOR=0.976;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=60;TCF=19;TCR=41;TR=29;WE=143382271;WS=143382244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,39:0.59:66
chr6	143382443	rs72986693	G	A	1364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.009;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=26;PP=622;ReadPosRankSum=-0.764;SC=CTGGCAACTGGGGGACAAATG;SOR=0.880;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=137;TCF=65;TCR=72;TR=49;WE=143382451;WS=143382433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,67:0.42:161
chr6	143382534	rs112521955	C	CAACT	340.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.074;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=320;ReadPosRankSum=-1.055;SC=GAAGAATCTTCAACAAAAGCA;SOR=2.007;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=6;WE=143382542;WS=143382524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr6	143605472	rs9403480	G	T	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.297;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=52;ReadPosRankSum=-0.494;SC=GCTGTGTGCCGCATTTGGTCC;SOR=0.120;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=5;WE=143605480;WS=143605462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr6	143654625	rs2303386	C	T	1589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.543;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=42;PP=914;ReadPosRankSum=-1.442;SC=GAATTACTGCCGGCAACAGTC;SOR=0.636;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=178;TCF=79;TCR=99;TR=76;WE=143654633;WS=143654615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,82:0.44:188
chr6	143792611	rs13203340	A	G	1196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.492;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=27;PP=707;ReadPosRankSum=0.495;SC=TGTGACTTTTATACTAATTTT;SOR=0.529;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=105;TCF=47;TCR=58;TR=52;WE=143792619;WS=143792601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,57:0.48:118
chr6	144069984	rs33958582	GT	G	100.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.601;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=71;ReadPosRankSum=0.637;SC=CAGATCATGTGTTTTTTTTAA;SOR=0.446;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=5;WE=144069992;WS=144069978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr6	144086394	rs9496767	G	A	1184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-2.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.436;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=18;PP=689;ReadPosRankSum=-1.194;SC=TCTCTCTATTGTAGCTGGCTC;SOR=0.557;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=114;TCF=77;TCR=37;TR=52;WE=144086402;WS=144086384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,58:0.42:137
chr6	144104469	rs1012753	A	T	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.70;ReadPosRankSum=2.501;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr6	144258619	rs1884087	G	A	257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=1;PP=77;SC=TTATTTGTCTGTAGCTACCCC;SOR=1.609;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=144258627;WS=144258609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	144258650	rs1884088	C	A	537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.54;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=2;PP=194;SC=CCCTCCCCACCACACTCCCCC;SOR=1.721;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=144258658;WS=144258640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr6	144258670	rs3215583	C	CA	422.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=1.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=4;PP=166;ReadPosRankSum=1.071;SC=CACCTCCCACCAAAAAAAAGG;SOR=1.179;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=8;WE=144258678;WS=144258660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,18:0.82:22
chr6	144742973	rs145453196	G	A	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.561;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=739;ReadPosRankSum=-0.012;SC=AGTTTCTGCTGTTGGCATACC;SOR=0.336;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=38;TCF=32;TCR=6;TR=19;WE=144742994;WS=144742963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,22:0.51:43
chr6	144742986	rs367677472	A	G	627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.129;HP=4;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=798;ReadPosRankSum=-0.932;SC=GGCATACCCCATATTTTATTT;SOR=1.051;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=54;TCF=41;TCR=13;TR=27;WE=144742994;WS=144742963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,30:0.50:60
chr6	144809978	rs113814301	C	T	1002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.750;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=26;PP=564;ReadPosRankSum=1.628;SC=CAGGTATTGCCGTGCATTTGA;SOR=1.078;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=90;TCF=36;TCR=54;TR=41;WE=144809986;WS=144809968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,45:0.46:98
chr6	144835040	rs66905872	T	C	849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.800;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=6;PP=536;ReadPosRankSum=-1.016;SC=TTAATTCCTTTGTAGAACCAT;SOR=1.321;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=71;TCF=52;TCR=19;TR=33;WE=144835048;WS=144835030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,37:0.47:79
chr6	144872051	rs1005974	C	A	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.624;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=226;ReadPosRankSum=0.451;SC=GCTTATTATTCTTCTCATATG;SOR=1.284;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=17;WE=144872059;WS=144872041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr6	144872311	rs1554813	A	G	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.853;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=53;ReadPosRankSum=-1.732;SC=ACACAAACACATTTTCAAAGA;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=4;WE=144872319;WS=144872301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr6	144898368	.	C	T	919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.460;ClippingRankSum=0.000;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.712;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=20;PP=486;ReadPosRankSum=-0.668;SC=TGCCTCTCATCGGGAGAATGC;SOR=0.818;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=105;TCF=56;TCR=49;TR=44;WE=144898376;WS=144898358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,49:0.44:111
chr6	144904655	rs17793810	G	A	3090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.733;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=54;PP=1898;ReadPosRankSum=1.360;SC=TGGTGAGAACGTCTCTGCAGA;SOR=0.997;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=231;TCF=125;TCR=106;TR=129;WE=144904663;WS=144904632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,141:0.55:256
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chr6	145051594	rs4305737	G	A	1431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.608;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=26;PP=758;ReadPosRankSum=0.130;SC=CCCCTGAAGAGCCAAGAAGAA;SOR=0.727;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=128;TCF=72;TCR=56;TR=62;WE=145051602;WS=145051584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,70:0.48:147
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chr6	145114935	rs4243475	A	G	1757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.504;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=24;PP=1121;ReadPosRankSum=-0.560;SC=AACATGGTAGACAGATGAAAG;SOR=1.087;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=161;TCF=99;TCR=62;TR=70;WE=145114943;WS=145114925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,79:0.45:175
chr6	145120682	rs9376859	A	G	890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.191;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=22;PP=528;ReadPosRankSum=-0.063;SC=ACATAGATGTATGGGAGAGGG;SOR=0.359;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=73;TCF=27;TCR=46;TR=38;WE=145120690;WS=145120672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,42:0.52:81
chr6	145148690	rs2066054	A	C	1406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.689;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=16;PP=728;ReadPosRankSum=0.349;SC=CATTTCTAATAGTAACACCTA;SOR=0.613;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=83;TCR=37;TR=51;WE=145148698;WS=145148680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,62:0.45:138
chr6	145162001	rs4895657	A	G	841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.080;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=23;PP=487;ReadPosRankSum=-0.723;SC=CCACAGCTGCACGTGTTCCTT;SOR=0.382;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=84;TCF=34;TCR=50;TR=40;WE=145162009;WS=145161991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,42:0.45:93
chr6	145822992	rs380883	A	G	1471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.689;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=31;PP=903;ReadPosRankSum=0.080;SC=ATCTAAAAGAAGACAGGGATA;SOR=0.364;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=156;TCF=72;TCR=84;TR=66;WE=145823000;WS=145822982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,73:0.42:173
chr6	145823642	rs370653	G	A	647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.238;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=309;ReadPosRankSum=-0.102;SC=CTGGGAGGAGGTGCATACTCA;SOR=0.487;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=22;WE=145823650;WS=145823632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,29:0.64:45
chr6	145823844	rs391524	A	G	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.788;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=190;ReadPosRankSum=-0.568;SC=TGTAATATACATAGTATTTAG;SOR=0.195;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=12;WE=145823852;WS=145823834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr6	145947080	rs1045820	C	T	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-2.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=94;ReadPosRankSum=-1.741;SC=GAATCAAACCCAGCTTTGTAT;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=7;WE=145947088;WS=145947070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr6	146007166	rs702322	G	A	266.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=217;SC=CCCAAGTGAGGCACTGCAGTT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=146007174;WS=146007156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	146007332	rs35230590	C	T	2050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.119;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.063;NF=53;NR=36;PP=1208;ReadPosRankSum=-0.139;SC=CATTGGTGTGCCCAGTGGCCT;SOR=0.794;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=171;TCF=102;TCR=69;TR=89;WE=146007340;WS=146007322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,102:0.53:194
chr6	146012061	rs2142978	T	C	578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.65;QD=24.12;SOR=1.051;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr6	146046048	rs12195987	A	G	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=8;PP=248;ReadPosRankSum=-0.733;SC=GAAAAACTAGACGCCCTTGGA;SOR=0.823;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=55;TCF=31;TCR=24;TR=19;WE=146046056;WS=146046038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,21:0.34:62
chr6	146056476	rs2235482	G	C	1090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.098;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=33;PP=623;ReadPosRankSum=-0.751;SC=GCTCCTGCAGGGCCAGGGCCC;SOR=1.172;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=81;TCF=26;TCR=55;TR=46;WE=146056484;WS=146056466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,51:0.55:92
chr6	146056681	rs111332144	C	T	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=3;PP=33;ReadPosRankSum=-0.473;SC=TCCCCGCGGCCGGCAGGCGCG;SOR=0.941;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=10;TCF=5;TCR=5;TR=6;WE=146056689;WS=146056671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr6	146112348	rs6931553	T	C	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=7;PP=138;ReadPosRankSum=-1.093;SC=GGCCTCCAGGTCTGTGACAGG;SOR=0.512;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=14;TCR=15;TR=14;WE=146112356;WS=146112338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr6	146125466	rs9403747	T	G	1617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.672;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=18;PP=997;ReadPosRankSum=0.207;SC=ATTATTAAAGTCCTCTTTATG;SOR=0.825;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=129;TCF=88;TCR=41;TR=63;WE=146125474;WS=146125456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,72:0.51:141
chr6	146125793	rs3811102	A	T	2403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.526;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=52;PP=1488;ReadPosRankSum=-1.267;SC=ATGACCTCAAATGGCGGTCAT;SOR=0.735;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=220;TCF=113;TCR=107;TR=104;WE=146125801;WS=146125783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,116:0.47:246
chr6	146126419	rs9373475	C	T	3528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.407;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=73;PP=2023;ReadPosRankSum=0.254;SC=ACATTCTTCACGTCCCCTAAG;SOR=0.704;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=276;TCF=141;TCR=135;TR=146;WE=146126427;WS=146126409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,168:0.53:317
chr6	146207465	rs1062068	A	G	697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.092;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=8;PP=431;ReadPosRankSum=0.013;SC=ATACCAGGTCATATAAAACTA;SOR=1.056;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=57;TCF=38;TCR=19;TR=29;WE=146207473;WS=146207455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,35:0.53:66
chr6	146207502	rs11421576	G	GT	1079.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=960;ReadPosRankSum=0.596;SC=TATTCCAACTGTTTTATGAGT;SOR=0.723;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=50;TCF=22;TCR=28;TR=24;WE=146207510;WS=146207492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,42:0.52:81
chr6	146207563	rs1062067	A	G	1041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.671;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=21;PP=529;ReadPosRankSum=0.649;SC=CCCTTGCATCATCAGATATAG;SOR=0.920;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=81;TCF=41;TCR=40;TR=38;WE=146207571;WS=146207553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,50:0.53:95
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chr6	146216184	rs2247206	C	T	1316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.812;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=35;PP=796;ReadPosRankSum=-1.709;SC=AAAAGCAATACAAAGTACTTT;SOR=0.798;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=87;TCF=29;TCR=58;TR=51;WE=146216192;WS=146216174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,59:0.60:99
chr6	146234644	rs9497426	G	A	2531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=36;PP=1311;SC=CACAGATTGGGCAAGGTTCTG;SOR=0.735;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=48;TCR=36;TR=84;WE=146234652;WS=146234634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr6	146243581	rs6917482	C	T	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.633;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.756;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=3;PP=43;ReadPosRankSum=0.731;SC=TTTTTCTTTCCACTAGATATG;SOR=0.078;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=6;WE=146243589;WS=146243571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr6	146244012	rs12214668	G	A	1744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.473;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=50;PP=1227;ReadPosRankSum=-0.745;SC=ACAAAGAAAAGAATAATAGGT;SOR=0.884;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=128;TCF=43;TCR=85;TR=72;WE=146244020;WS=146244002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,74:0.55:134
chr6	146244743	rs6923545	A	G	703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=12;PP=476;ReadPosRankSum=0.224;SC=TGCTTTTAAAATTATGAGTAG;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=41;TCR=25;TR=31;WE=146244751;WS=146244733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,33:0.46:71
chr6	146254100	rs55757353	T	TC	113.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.162;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=91;ReadPosRankSum=0.566;SC=GGGGGAAAAATCCCCCCCCCA;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=8;WE=146254108;WS=146254098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr6	146262697	rs9285508	G	T	5499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=108;NR=74;PP=2965;SC=ACTACTCAAGGTCCCCTAATT;SOR=1.057;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=182;TCF=108;TCR=74;TR=182;WE=146262705;WS=146262687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr6	146268623	rs9386141	T	A	946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-1.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.910;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=15;PP=517;ReadPosRankSum=-0.144;SC=TACTATACCCTCCTACCTCGG;SOR=0.429;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=75;TCF=53;TCR=22;TR=40;WE=146268631;WS=146268613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,45:0.49:91
chr6	146272851	.	G	A	791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.564;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.095;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=9;PP=497;ReadPosRankSum=1.067;SC=AATAACAATCGAAGTTAGAAA;SOR=0.158;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=41;TCF=31;TCR=10;TR=31;WE=146272859;WS=146272841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,34:0.76:45
chr6	146273769	rs9386142	C	T	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=31;ReadPosRankSum=-1.036;SC=ATTTCCCCCACGTGTTTCATT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=146273777;WS=146273759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr6	146480740	.	TTCTCTCTCTCTC	T	78.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=-0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.484;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr6	146756053	.	CGCT	C	57	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=57;QD=37.5;SC=GACAGGAGACCGCTGCTGCTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=2;WE=146756063;WS=146756043;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,2:0.22:9
chr6	146975456	rs71778473	TTA	T	2664.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=43;PP=1821;ReadPosRankSum=1.056;SC=AGTTTTGGTATTATATATATA;SOR=0.511;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=65;TCF=1;TCR=64;TR=43;WE=146975467;WS=146975446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,67:0.97:69
chr6	146975476	rs1322765	T	G	885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=23;PP=520;ReadPosRankSum=0.773;SC=ATATATATAATACCAAAAAAT;SOR=0.839;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=63;TCF=17;TCR=46;TR=31;WE=146975484;WS=146975466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,38:0.55:69
chr6	146987930	rs9403802	C	T	1639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.279;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=25;PP=1096;ReadPosRankSum=0.464;SC=CTACCTGTAACATTATGCATG;SOR=0.814;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=152;TCF=99;TCR=53;TR=74;WE=146987938;WS=146987920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,78:0.48:161
chr6	146993445	rs9497606	T	C	2549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.954;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=56;PP=1632;ReadPosRankSum=-1.675;SC=GAAAGCAAAATAGCAGTGTTA;SOR=0.585;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=257;TCF=137;TCR=120;TR=112;WE=146993453;WS=146993435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,125:0.43:292
chr6	147006845	rs12195808	A	G	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=125;ReadPosRankSum=-1.163;SC=GAATTTTCACAACATAATGTA;SOR=0.412;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=11;WE=147006853;WS=147006835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr6	147012191	rs9403804	T	C	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.07;ReadPosRankSum=0.984;SOR=0.409;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr6	147103358	rs1325701	A	G	2812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=59;PP=1845;SC=TATTTGAGTGACTTAATGATT;SOR=1.586;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=33;TCR=59;TR=92;WE=147103366;WS=147103348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr6	147103416	rs259405	C	T	803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=22;PP=622;SC=AGGACAAAACCGTGAAACATT;SOR=3.611;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=25;WE=147103424;WS=147103406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr6	147106841	rs259391	A	G	7218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=122;NR=114;PP=2965;SC=CTAAACCAAAAGAAGAAGGTG;SOR=0.723;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=236;TCF=122;TCR=114;TR=236;WE=147106849;WS=147106831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,272:1.00:272
chr6	147136244	rs259370	A	G	2781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.407;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-0.197;NF=67;NR=59;PP=1755;ReadPosRankSum=0.682;SC=GAAGCTGAGCACCTAAAGCTG;SOR=0.722;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=290;TCF=149;TCR=141;TR=126;WE=147136252;WS=147136234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,138:0.43:320
chr6	147631201	rs6928919	A	G	1511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=12;PP=1101;SC=AATAATCTTAATATGTATTTT;SOR=2.170;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=37;TCR=12;TR=49;WE=147631209;WS=147631191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr6	147635318	rs5880705	T	TAC	814.52	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=6;PP=579;ReadPosRankSum=0.957;SC=CTGGATTATTTACACACACAC;SOR=0.465;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=28;TCF=12;TCR=16;TR=14;WE=147635326;WS=147635308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,36:0.88:41
chr6	147635341	.	A	ACG	186	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=8;NR=6;PP=186;QD=13.5;SC=ACACACACACACACACGGAGG;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=45;TCF=19;TCR=26;TR=14;WE=147635349;WS=147635331;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:31,14:0.31:45
chr6	147635385	rs1039083	C	G	4803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=43;PP=1773;SC=TTTATACAGTCATCTTTTTTT;SOR=0.781;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=99;TCF=56;TCR=43;TR=98;WE=147635393;WS=147635375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr6	147635413	rs1039084	A	G	5129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=58;NR=51;PP=1912;SC=TGGCCCATCAACGGAGGTAAT;SOR=0.725;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=109;TCF=58;TCR=51;TR=109;WE=147635421;WS=147635403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
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chr6	148701213	rs4897001	G	C	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=204;ReadPosRankSum=0.800;SC=TTCAACCTTAGCTGTATAAAA;SOR=0.639;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=11;TCR=32;TR=15;WE=148701221;WS=148701203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,16:0.36:44
chr6	148761456	rs2272998	G	C	1100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.408;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-0.822;NF=21;NR=35;PP=759;ReadPosRankSum=-0.023;SC=GAAGCCTGCTGCTCTGACCAC;SOR=0.834;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=144;TCF=61;TCR=83;TR=56;WE=148761464;WS=148761446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,54:0.41:131
chr6	148835416	rs1057793	C	T	2006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.06;SOR=0.887;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
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chr6	148853867	rs1465307	T	C	1540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.660;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=16;PP=1080;ReadPosRankSum=2.379;SC=ATACCTTCAATACCTTTCTGC;SOR=0.928;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=106;TCF=79;TCR=27;TR=64;WE=148853875;WS=148853857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,66:0.58:114
chr6	148854870	rs41288415	G	C	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=27;ReadPosRankSum=0.712;SC=TTCATGGAATGTACCTAATGG;SOR=0.105;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=4;WE=148854878;WS=148854860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr6	148865257	rs208696	A	G	7857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=136;NR=127;PP=2965;SC=CCCCTGGAGCAAGACTCTGCT;SOR=0.713;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=264;TCF=136;TCR=128;TR=263;WE=148865265;WS=148865247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,297:1.00:297
chr6	149340390	rs2275423	G	C	4763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=95;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.093;SC=CTAAAGCAGGGTCATGGCATG;SOR=1.172;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=163;TCF=67;TCR=96;TR=161;WE=149340398;WS=149340380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,175:0.99:177
chr6	149539773	rs2272901	G	A	895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.857;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=11;PP=558;ReadPosRankSum=0.692;SC=GAAGACTAATGCTCAGTGAGG;SOR=1.102;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=91;TCF=61;TCR=30;TR=37;WE=149539781;WS=149539763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,42:0.42:99
chr6	149700805	rs2031450	G	A	534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=13;PP=378;SC=AGTATTATATGTATATACATT;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=149700813;WS=149700795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr6	149700873	rs9498341	A	T	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.738;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=129;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TTGGGTTATCAGCTCTTCAGA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=6;WE=149700881;WS=149700863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr6	149700942	rs9498342	C	G	723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.513;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=10;PP=427;ReadPosRankSum=-0.372;SC=TTCAGTTAATCTTATACCTGT;SOR=0.345;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=50;TCF=35;TCR=15;TR=29;WE=149700950;WS=149700932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,32:0.56:57
chr6	149718650	rs237028	C	T	1095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.811;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=13;PP=765;ReadPosRankSum=-0.253;SC=TTTGGGATTTCTGACAAATTC;SOR=0.852;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=96;TCF=68;TCR=28;TR=50;WE=149718658;WS=149718640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,48:0.49:97
chr6	149719400	rs628488	G	A	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5051;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=32;ReadPosRankSum=0.674;SC=ATAGAAGATAGTAAAAATAAG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=149719408;WS=149719390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr6	149721690	rs237025	G	A	5037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=501;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.432;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.99;MQRankSum=-1.014;NF=120;NR=97;PP=2894;ReadPosRankSum=-0.822;SC=GGGATTGTCAGTGAAGCAGAT;SOR=0.861;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=444;TCF=235;TCR=209;TR=217;WE=149721698;WS=149721680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:255,246:0.49:501
chr6	149772645	rs415434	A	G	1569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.383;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=47;PP=1057;ReadPosRankSum=-0.928;SC=AGAGGGCGCGACGTGAGGCCC;SOR=1.156;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=138;TCF=49;TCR=89;TR=68;WE=149772653;WS=149772635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,71:0.50:141
chr6	149780695	rs384163	T	C	472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.004;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=356;ReadPosRankSum=0.528;SC=TTGGAGCACTTCTGGTGGTGG;SOR=1.302;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=19;WE=149780703;WS=149780685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr6	149780737	rs140859	G	GACTA	1117.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=11;PP=1131;ReadPosRankSum=-0.172;SC=AAATCGGGATGACTAACAGGT;SOR=0.608;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=60;TCF=30;TCR=30;TR=24;WE=149780750;WS=149780727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,50:0.57:87
chr6	149782798	rs411091	G	A	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.723;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=178;ReadPosRankSum=-0.321;SC=TAGGTGCTAGGGCTATGGCAT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=9;WE=149782806;WS=149782788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr6	149782847	rs411308	G	A	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.839;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=385;ReadPosRankSum=-0.631;SC=AGCTTATAGCGCAGTGAGGAA;SOR=2.093;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=20;WE=149782855;WS=149782837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,23:0.56:41
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chr6	149795261	rs382720	T	C	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.182;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=81;ReadPosRankSum=-1.182;SC=ATTCAAAGCCTGATCCGTTGG;SOR=0.132;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=6;WE=149795269;WS=149795251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
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chr6	150211123	rs2151910	A	T	3988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=53;PP=2501;SC=CTGGTGGCATATACCTTCTTC;SOR=1.017;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=78;TCR=53;TR=131;WE=150211131;WS=150211113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr6	150263186	rs4343924	A	C	4135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=418;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.516;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=85;PP=2580;ReadPosRankSum=1.413;SC=CAAGTCTCTCATCCCTAGCGC;SOR=0.715;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=378;TCF=195;TCR=183;TR=178;WE=150263194;WS=150263176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:219,199:0.48:418
chr6	150266578	rs149454018	T	C	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=3.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.82;MQRankSum=-6.502;QD=1.03;ReadPosRankSum=-0.913;SOR=0.117;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,9:0.15:62
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chr6	150269761	rs181105068	A	G	1482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.118;NF=49;NR=18;PP=946;ReadPosRankSum=1.520;SC=CCCTTAGTGCAGGGGGCTCTG;SOR=0.639;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=124;TCF=91;TCR=33;TR=67;WE=150269769;WS=150269751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,72:0.54:133
chr6	150322211	rs9397541	C	T	1734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.531;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.332;NF=41;NR=39;PP=969;ReadPosRankSum=-1.319;SC=GATCCTCTGCCGTGTCCGTGG;SOR=0.761;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=171;TCF=90;TCR=81;TR=80;WE=150322219;WS=150322201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,89:0.47:191
chr6	150322381	rs9384023	T	A	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.103;NF=4;NR=7;PP=127;ReadPosRankSum=-0.889;SC=CTCCTCAACCTCTTGGGTGAC;SOR=0.836;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=41;TCF=18;TCR=23;TR=11;WE=150322389;WS=150322371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,11:0.24:45
chr6	150322408	rs11752135	T	A	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.423;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.929;NF=10;NR=11;PP=292;ReadPosRankSum=0.212;SC=TTCTGATTTATTTTTTACAGG;SOR=0.673;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=32;TCF=16;TCR=16;TR=21;WE=150322416;WS=150322398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,22:0.65:34
chr6	150341990	rs9397120	A	G	7603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=52.46;QD=45.81;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr6	150341993	rs9384047	C	A	7603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=52.74;QD=44.21;SOR=1.133;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr6	150342232	rs61730071	G	A	5141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=522;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-6.749;NF=113;NR=112;PP=2962;ReadPosRankSum=1.043;SC=GAGTAGGAAGGTCTGTCCATC;SOR=0.715;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=482;TCF=240;TCR=242;TR=225;WE=150342240;WS=150342222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:279,243:0.47:522
chr6	150342396	rs9479414	G	C	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.67;MQRankSum=-1.236;QD=13.41;ReadPosRankSum=0.170;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
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chr6	150346740	rs1544123	A	G	1438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=29;PP=830;SC=AGTCACCTCGATTCTGAAAAG;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=20;TCR=29;TR=49;WE=150346748;WS=150346730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr6	150385886	rs9478409	C	T	2354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.087;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=59;PP=1383;ReadPosRankSum=0.097;SC=CTCTTGTCCACGCTCCAAATC;SOR=0.831;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=239;TCF=110;TCR=129;TR=106;WE=150385894;WS=150385876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,118:0.45:260
chr6	150387302	rs669009	A	T	8429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.01;SOR=0.777;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr6	150387312	rs6935471	A	G	7989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.19;SOR=0.704;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr6	150390313	rs622317	G	C	1098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=35;PP=825;SC=GGCCCCGTCCGGTCCCGTCCC;SOR=2.780;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=7;TCR=35;TR=42;WE=150390321;WS=150390303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr6	150464356	rs2297672	A	G	567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=6;PP=437;SC=CAGCAGCGAGACGGCCGGCGG;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=19;WE=150464364;WS=150464346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr6	150713769	rs672766	C	T	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=55;ReadPosRankSum=1.465;SC=GGAGGAATTACGGAAGTTAAG;SOR=0.330;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=5;WE=150713777;WS=150713759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
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chr6	151130728	.	G	A	1126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.704;ClippingRankSum=0.000;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.017;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=11;PP=759;ReadPosRankSum=0.500;SC=TCTCATCAGAGGGTCCTGTGG;SOR=0.486;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=76;TCF=58;TCR=18;TR=44;WE=151130736;WS=151130718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,47:0.58:81
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chr6	151219963	rs149723194	G	GATTATT	43.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.58;ReadPosRankSum=-0.967;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
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chr6	151258127	rs742830	G	A	811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.981;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=19;PP=444;ReadPosRankSum=-0.506;SC=TGGGGGGAGAGAATTGTAAAA;SOR=0.392;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=76;TCF=32;TCR=44;TR=37;WE=151258135;WS=151258117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,40:0.49:82
chr6	151259770	rs6933598	C	G	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.308;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=2.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=2.44;ReadPosRankSum=0.736;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr6	151260002	rs3734416	T	C	706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.22;ReadPosRankSum=-0.353;SOR=0.697;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,36:0.57:63
chr6	151266504	rs803445	C	T	210.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=171;SC=CTAAATAGTTCGGTTATAAAT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=151266512;WS=151266494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	151266717	rs803444	G	A	807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=9.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.62;ReadPosRankSum=-0.517;SOR=0.191;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,42:0.50:84
chr6	151270369	rs803471	G	A	919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.339;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=23;PP=537;ReadPosRankSum=0.819;SC=ATCCTGTCCAGTGATCTTCCC;SOR=0.390;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=67;TCF=24;TCR=43;TR=39;WE=151270377;WS=151270359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,42:0.58:73
chr6	151281567	rs1771798	T	C	3422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=60;NR=53;PP=1907;SC=TGTTTCCAACTCGGAAGCTTC;SOR=0.740;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=113;TCF=60;TCR=53;TR=113;WE=151281575;WS=151281557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr6	151281707	rs1771796	A	G	286.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=237;SC=ATGTTTGCCTAACTGCTTCCT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=151281715;WS=151281697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	151286224	rs1627462	A	C	6003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=105;PP=2965;SC=GGATTGCCACACAATGTGAAC;SOR=1.005;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=193;TCF=88;TCR=105;TR=193;WE=151286232;WS=151286214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr6	151336739	rs509474	C	G	6759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=107;NR=120;PP=2965;ReadPosRankSum=0.610;SC=ATCACTGGTCCGTTGGTGGAA;SOR=0.323;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=229;TCF=107;TCR=122;TR=227;WE=151336747;WS=151336729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,255:1.00:256
chr6	151337686	rs479755	T	C	94.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=2;PP=60;SC=CTCAAACTCCTGATCTCATGG;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=5;WE=151337694;WS=151337676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	151362895	rs140096864	CTTG	C	2006.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.374;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=25;PP=1135;ReadPosRankSum=0.553;SC=GAAAGCCCCTCTTGTTGTGTC;SOR=0.535;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=80;TCF=6;TCR=74;TR=28;WE=151362905;WS=151362885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,55:0.39:140
chr6	151362942	rs1983750	T	C	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.918;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=18;PP=385;ReadPosRankSum=-0.096;SC=CTGGCTCTAGTTGGAGAATCC;SOR=0.521;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=27;TCR=50;TR=28;WE=151362950;WS=151362932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,31:0.38:82
chr6	151413828	rs2295734	C	A	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-0.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=65;ReadPosRankSum=0.496;SC=CTGATAAATCCTTTCCTTCCT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=5;WE=151413836;WS=151413818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr6	151665302	rs6941075	T	A	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.55;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr6	151669875	rs10872670	A	G	960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.761;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=16;PP=697;ReadPosRankSum=-2.471;SC=AGATGTGAGCAAAAGAGACTC;SOR=0.569;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=91;TCF=57;TCR=34;TR=43;WE=151669883;WS=151669865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,48:0.47:103
chr6	151670172	rs3734799	A	C	2087.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.026;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=47;PP=1342;ReadPosRankSum=0.740;SC=TGGCGACCACAAGGACCCCAG;SOR=0.799;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=214;TCF=106;TCR=108;TR=89;WE=151670180;WS=151670162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,98:0.43:230
chr6	151670897	rs900654	T	C	3010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.434;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=67;PP=1579;ReadPosRankSum=-3.119;SC=CTCAGGAAGCTGAACCTGCCA;SOR=0.646;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=255;TCF=127;TCR=128;TR=136;WE=151670905;WS=151670887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,147:0.52:281
chr6	151673074	rs41289375	C	G	2382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.086;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=55;PP=1590;ReadPosRankSum=1.213;SC=TTTGACGCACCAGGCACAACC;SOR=0.558;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=241;TCF=118;TCR=123;TR=111;WE=151673082;WS=151673064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,119:0.46:261
chr6	151674116	rs3842128	T	TGAG	8888.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=-0.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=427;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.736;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.601;NF=27;NR=61;PP=2921;ReadPosRankSum=-0.411;SC=GTGTAGCAATTGAGGATTTAG;SOR=0.819;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=220;TCF=57;TCR=163;TR=88;WE=151674124;WS=151674106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:188,222:0.54:410
chr6	151674326	rs3823310	A	C	2427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.725;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=59;PP=1650;ReadPosRankSum=-0.355;SC=AAGGAGAGGAACCTCAGGCCT;SOR=0.831;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=189;TCF=80;TCR=109;TR=100;WE=151674334;WS=151674316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,107:0.52:206
chr6	151686905	rs11155787	C	T	2707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.405;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=64;PP=1674;ReadPosRankSum=0.995;SC=GACTCCCTTCCTCAAATGTGC;SOR=0.803;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=268;TCF=129;TCR=139;TR=120;WE=151686913;WS=151686895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,131:0.45:293
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chr6	151742541	rs4870017	T	C	2232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=43;PP=1238;SC=AAATCTGAAGTGGCATAATTT;SOR=0.972;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=35;TCR=43;TR=78;WE=151742549;WS=151742531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
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chr6	151754273	rs6904364	T	C	10060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=373;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=171;NR=153;PP=2965;SC=CCTAATGGGGTTTCTTTCCTG;SOR=0.731;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=324;TCF=171;TCR=153;TR=324;WE=151754281;WS=151754263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,371:1.00:371
chr6	151766552	rs3734800	G	A	2199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.285;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.952;NF=33;ReadPosRankSum=1.344;SC=AAATGTTTCCGTTGATACAGA;SOR=1.098;Source=Platypus;TCF=73;WE=151766560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,96:0.52:185
chr6	151766822	rs11550103	C	A	928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.974;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=30;PP=695;ReadPosRankSum=-1.033;SC=TGTCAGTGTGCTGCATGTTGT;SOR=0.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=80;TCF=20;TCR=60;TR=39;WE=151766830;WS=151766812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,40:0.49:82
chr6	151773504	rs13201167	T	C	1462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=13;PP=1002;SC=AGATTGGGTCTTCTGGCGAGC;SOR=2.170;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=36;TCR=13;TR=49;WE=151773512;WS=151773494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr6	151789868	rs35972078	G	A	1501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.724;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.893;NF=37;NR=24;PP=951;ReadPosRankSum=-0.595;SC=CAAGTGTGGGGCTGACTGGGA;SOR=0.987;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=138;TCF=77;TCR=61;TR=61;WE=151789876;WS=151789858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,69:0.44:158
chr6	151789912	rs9397054	C	T	2535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-4.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.804;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.98;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=47;PP=1272;ReadPosRankSum=-0.529;SC=GGGTTTACCACAATCATATAT;SOR=0.412;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=183;TCF=103;TCR=80;TR=99;WE=151789920;WS=151789902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,117:0.56:209
chr6	151859146	rs71677524	GT	G	79.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.66;ReadPosRankSum=0.613;SOR=0.646;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,9:0.30:30
chr6	151869645	rs3734803	G	A	1806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.544;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=46;PP=1080;ReadPosRankSum=1.139;SC=TGAAGTATACGTGTGCATCTG;SOR=0.755;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=158;TCF=72;TCR=86;TR=82;WE=151869653;WS=151869635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,89:0.48:184
chr6	151894278	rs4242277	G	T	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.986;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=10;PP=359;ReadPosRankSum=-0.376;SC=ACTTCTAATGGTATTGTCTTC;SOR=0.551;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=50;TCF=34;TCR=16;TR=27;WE=151894286;WS=151894268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,31:0.52:60
chr6	151894505	rs953767	T	C	2196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.795;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=47;PP=1528;ReadPosRankSum=2.503;SC=AGCCAGTACTTCTCATTTAGG;SOR=0.718;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=169;TCF=85;TCR=84;TR=92;WE=151894513;WS=151894495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,98:0.52:187
chr6	151894716	rs1807906	G	A	648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.359;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=342;ReadPosRankSum=-1.660;SC=CTATTCTCACGCTGCTATAAG;SOR=1.942;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=39;TCF=15;TCR=24;TR=23;WE=151894724;WS=151894706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,28:0.65:43
chr6	151907027	rs41290243	G	A	1064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.929;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=12;PP=776;ReadPosRankSum=-1.067;SC=TTTCCAGATGGTCTCCCAGCT;SOR=1.092;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=84;TCF=59;TCR=25;TR=44;WE=151907035;WS=151907017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,47:0.51:92
chr6	151914121	rs73780805	T	C	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.959;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=105;ReadPosRankSum=0.690;SC=CCGTGCTCCGTTCCATGCTCT;SOR=0.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=7;WE=151914129;WS=151914111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr6	151914143	rs17081463	A	G	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=234;ReadPosRankSum=0.231;SC=TGCAAAGGAGAATTACCTGTA;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=13;WE=151914151;WS=151914133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr6	151914191	rs3757319	T	C	1033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.939;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=11;PP=551;ReadPosRankSum=-2.359;SC=GTGAGATCACTCATTAACTTT;SOR=0.563;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=48;TCR=19;TR=38;WE=151914199;WS=151914181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,46:0.60:77
chr6	151914265	rs17081470	T	C	2045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.114;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=36;PP=1124;ReadPosRankSum=0.981;SC=TGGATCAGCTTTCTCAGAAAA;SOR=0.599;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=171;TCF=99;TCR=72;TR=83;WE=151914273;WS=151914255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,97:0.50:195
chr6	151914421	rs9383930	A	G	2344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.538;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=56;PP=1394;ReadPosRankSum=0.447;SC=GAAAGGTAGGAGATATTGAAA;SOR=0.646;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=168;TCF=75;TCR=93;TR=100;WE=151914429;WS=151914411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,110:0.57:192
chr6	151917427	rs3757320	T	C	1688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.416;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=15;PP=969;ReadPosRankSum=1.566;SC=TATTTACTATTGTTCAATTAT;SOR=0.955;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=115;TCF=85;TCR=30;TR=63;WE=151917446;WS=151917417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,73:0.55:132
chr6	151917822	rs112776643	C	T	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=2;PP=132;ReadPosRankSum=0.637;SC=AGATGAAAGCCTCCTCTGATT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=2;WE=151917838;WS=151917812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr6	151917830	rs145300000	A	AT	59.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=2;PP=133;ReadPosRankSum=0.723;SC=GCCTCCTCTGATTTTCTAGAA;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=2;WE=151917838;WS=151917812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr6	151939181	rs3734804	G	A	1913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.327;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=38;PP=973;ReadPosRankSum=0.247;SC=TGAAAGATTGGTCCATTCACA;SOR=0.576;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=190;TCF=99;TCR=91;TR=85;WE=151939189;WS=151939162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,99:0.46:216
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chr6	152265282	rs55740371	A	AT	2910.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.246;NF=29;NR=23;PP=1066;ReadPosRankSum=1.182;SC=AAATAAACTAATTTTTTTTTC;SOR=0.511;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=69;TCF=36;TCR=33;TR=52;WE=152265295;WS=152265272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,106:0.99:107
chr6	152265522	rs1801132	G	C	5668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=94;PP=2965;SC=CTGAGCCCCCGATACTCTATT;SOR=0.930;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=178;TCF=84;TCR=94;TR=178;WE=152265530;WS=152265512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr6	152464839	rs2256135	A	G	5231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=69;PP=2941;SC=GTATCTGAAAACGGCTATCAT;SOR=0.861;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=167;TCF=98;TCR=69;TR=167;WE=152464847;WS=152464829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr6	152489037	rs997389	TT	GC	15716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=349;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=169;NR=133;PP=2947;SC=ATTAACCTTTTTGTCCAGCTC;SOR=0.963;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=316;TCF=176;TCR=140;TR=302;WE=152489046;WS=152489027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,348:1.00:348
chr6	152489294	rs998147	T	C	3432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=78;PP=1994;SC=TCCACACAGCTGTCCTCTGCC;SOR=1.683;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=116;TCF=38;TCR=78;TR=116;WE=152489302;WS=152489284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr6	152501556	rs71575919	C	T	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.642;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=231;ReadPosRankSum=0.828;SC=CCCACTGTTTCCTGAAGTCTA;SOR=2.542;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=12;WE=152501564;WS=152501546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr6	152522812	rs2673776	T	G	1516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=7;PP=1105;SC=GCCATACAAGTTTCACCTGAG;SOR=2.970;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=41;TCR=7;TR=48;WE=152522820;WS=152522802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr6	152522926	rs2253512	G	A	2012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.501;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=43;PP=1232;ReadPosRankSum=-0.594;SC=GAGGCACACAGGTGACGGTGA;SOR=0.717;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=193;TCF=103;TCR=90;TR=91;WE=152522934;WS=152522916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,100:0.47:213
chr6	152523143	rs2635441	G	A	320.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=11;PP=314;SC=ACTGGGGGGGGAAAAGAAAAG;SOR=2.670;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=152523151;WS=152523133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr6	152534946	rs684807	T	A	846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=25;PP=654;SC=TTATTCTTACTTCTCTAGCAT;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=152534954;WS=152534936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr6	152540278	rs2147377	A	C	2241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=42;PP=1368;SC=TCATGGAGAAAAAAGAGGGAA;SOR=1.264;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=31;TCR=42;TR=73;WE=152540286;WS=152540268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr6	152545865	rs17082358	T	C	396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=12;PP=317;SC=ATATATTCAATTGATGGGAAA;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=152545873;WS=152545855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	152552375	rs2274142	G	A	647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=0;PP=521;SC=CAGGTTAAAGGAAGTTTAGGG;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=152552383;WS=152552365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr6	152558197	rs11751190	G	A	132.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=102;SC=TATCAGAGATGTTTGCGTTGG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=152558205;WS=152558187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	152565897	rs3888239	T	C	630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=19;PP=533;SC=ATGTAAAACATTCTCAATATA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=152565905;WS=152565887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr6	152570415	rs6557210	G	A	4994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=100;PP=2965;SC=GGAAAGCAACGGGAAAACTCA;SOR=1.418;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=162;TCF=62;TCR=100;TR=162;WE=152570423;WS=152570405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr6	152629586	rs9371581	G	A	1995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=34;PP=1094;ReadPosRankSum=2.041;SC=AATCAAGCCAGTTTCCTGCCC;SOR=0.731;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=168;TCF=105;TCR=63;TR=87;WE=152629594;WS=152629576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,95:0.52:181
chr6	152629815	rs4112833	C	T	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.080;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=93;ReadPosRankSum=0.876;SC=TTTTTCTCTACCAATAACTAG;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=6;WE=152629823;WS=152629805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr6	152631256	rs11292345	CA	C	151.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=13;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=176;ReadPosRankSum=1.309;SC=AAACATTTTGCAAAAAAAAAA;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=7;WE=152631273;WS=152631246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr6	152631265	rs34118755	A	G	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=12;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=137;ReadPosRankSum=2.148;SC=GCAAAAAAAAAAAAATGTTTA;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=5;WE=152631273;WS=152631246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr6	152647681	rs2306916	A	T	4782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=72;PP=2765;SC=AGCTGTAACAATTCTTGGGCA;SOR=0.715;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=156;TCF=84;TCR=72;TR=156;WE=152647689;WS=152647671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr6	152651557	rs41301343	G	A	3032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.982;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=65;PP=1916;ReadPosRankSum=3.470;SC=AAGGTGACAAGGTGCAGCATC;SOR=0.603;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=218;TCF=101;TCR=117;TR=123;WE=152651565;WS=152651547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,137:0.55:249
chr6	152652034	rs6911096	A	T	4682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=75;PP=2965;SC=TGAAGCTCAGAACTCTCATTC;SOR=0.717;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=154;TCF=79;TCR=75;TR=154;WE=152652042;WS=152652024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr6	152658142	rs9479297	T	C	4071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=70;PP=2416;SC=CTGGACAAGCTTTTGTTCAAT;SOR=0.895;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=63;TCR=70;TR=133;WE=152658150;WS=152658132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr6	152658191	rs9479298	T	C	2643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=58;PP=1416;SC=CAACCATACATGGAAACATTT;SOR=1.519;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=32;TCR=58;TR=90;WE=152658199;WS=152658181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr6	152660451	rs71575926	G	A	5364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=85;PP=2965;SC=TGGAGCAAAGGAGATCTAGGT;SOR=0.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=185;TCF=100;TCR=85;TR=185;WE=152660459;WS=152660441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr6	152679729	rs9478326	G	A	1598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=47;PP=1276;SC=TAAAGCATCAGTGTGCTGTAA;SOR=2.564;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=10;TCR=47;TR=57;WE=152679737;WS=152679719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr6	152683594	rs34721749	G	A	197.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=131;SC=GAGTGAGCAGGCTGCCCAGGG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=152683602;WS=152683584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	152688567	rs7775637	C	T	1587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=38;PP=1133;SC=CAGAGACAAACTGCAAAGCTA;SOR=2.628;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=11;TCR=38;TR=49;WE=152688575;WS=152688557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr6	152697706	rs214955	C	T	4453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=80;PP=2602;SC=GAAAAGGTGACGCAAAAATTT;SOR=1.186;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=138;TCF=58;TCR=80;TR=138;WE=152697714;WS=152697696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr6	152712302	rs9942542	C	T	456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=2;PP=294;SC=TTTGCCCACACAATCCTCATT;SOR=3.258;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=152712310;WS=152712292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	152786963	rs13211693	C	T	396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=0;PP=332;SC=TTGTACAAAGCCAAGGGAACT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=14;WE=152786971;WS=152786955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	152793318	rs41292878	A	G	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=150;ReadPosRankSum=0.980;SC=CCCGCTTTCTATTTACCAAAG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=8;WE=152793326;WS=152793308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr6	152793412	rs4523096	C	A	3075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=36;PP=1759;SC=AAGAGACTTCCTTTAAATGCA;SOR=1.250;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=67;TCR=36;TR=103;WE=152793420;WS=152793402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr6	152826627	rs13200897	C	T	367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=332;SC=TTTTCACCAACGATATGCAGA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=152826635;WS=152826617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr6	152847335	rs2141152	G	A	2006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=34;PP=1006;SC=AGGAATAAGTGCAGAAAATAT;SOR=1.240;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=28;TCR=35;TR=61;WE=152847343;WS=152847325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr6	153043035	rs17710008	G	A	2039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.337;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=47;PP=1329;ReadPosRankSum=-0.388;SC=TTACACCCACGGCCTCAACAG;SOR=0.817;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=191;TCF=95;TCR=96;TR=88;WE=153043043;WS=153043025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,97:0.45:215
chr6	153296541	rs2073260	G	C	7771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=133;NR=128;PP=2965;SC=GTTTCAAGTTGTACAATCCTA;SOR=0.707;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=261;TCF=133;TCR=128;TR=261;WE=153296549;WS=153296531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,284:1.00:284
chr6	153296772	rs9479472	A	G	753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=20;PP=593;SC=AAAAGAACATAACATTTACAT;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=153296780;WS=153296762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr6	153311001	rs3860814	A	C	1542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.69;QD=29.11;SOR=0.808;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr6	153315921	rs3799133	G	A	933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=24;PP=543;ReadPosRankSum=-1.082;SC=AAAAGGAGATGAACATGGAGA;SOR=0.741;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=84;TCF=35;TCR=49;TR=39;WE=153315929;WS=153315911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,46:0.46:101
chr6	153323594	rs3818123	C	T	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.026;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.491;NF=12;NR=20;PP=429;ReadPosRankSum=-1.678;SC=CCGCAGCTCCCGCTCCTTCTC;SOR=1.076;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=64;TCF=28;TCR=36;TR=32;WE=153323602;WS=153323584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,33:0.40:82
chr6	153323709	rs3818125	T	C	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.564;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.434;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.232;NF=4;NR=3;PP=95;ReadPosRankSum=1.237;SC=CCGCCCCGGGTGAACAGCTCC;SOR=1.108;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=13;TCF=6;TCR=7;TR=7;WE=153323717;WS=153323699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr6	153323896	rs3818127	T	C	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=37;ReadPosRankSum=-0.566;SC=ACACCCAGAATTTGGAGATAA;SOR=0.223;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=4;WE=153323904;WS=153323886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr6	153332926	rs34837755	AATAAT	A	610.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=1.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.66;ReadPosRankSum=-0.043;SOR=0.404;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,17:0.44:39
chr6	153345309	rs545323	C	T	79.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=65;SC=CCTCTCCACACCCCATGCCCT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=153345317;WS=153345302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr6	153345647	rs2073259	G	A	1439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.579;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=28;PP=806;ReadPosRankSum=0.080;SC=GAGACAGAACGGGGCCGTGAT;SOR=0.659;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=144;TCF=76;TCR=68;TR=63;WE=153345655;WS=153345637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,73:0.45:164
chr6	153365100	rs2295230	A	C	848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.862;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=10;PP=550;ReadPosRankSum=1.343;SC=GGTTTCCAGGAGCTTGAGACA;SOR=1.008;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=90;TCF=63;TCR=27;TR=39;WE=153365108;WS=153365090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,41:0.44:94
chr6	153365348	rs2295231	G	A	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=52;ReadPosRankSum=0.453;SC=TTTTTAGAAGGATATACTAAA;SOR=0.141;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=5;WE=153365356;WS=153365338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr6	153603782	rs61746762	G	A	3072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=69;PP=1870;ReadPosRankSum=0.839;SC=CGCGGCCGCCGGGGTGCTTCC;SOR=0.672;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=258;TCF=124;TCR=134;TR=132;WE=153603790;WS=153603772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,146:0.51:285
chr6	154360797	rs1799971	A	G	1952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.266;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=40;PP=1178;ReadPosRankSum=-1.829;SC=CTTAGATGGCAACCTGTCCGA;SOR=0.551;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=197;TCF=111;TCR=86;TR=90;WE=154360805;WS=154360787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,101:0.45:226
chr6	154412004	rs2075572	G	C	674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=0;PP=542;SC=GGCTAAAAATGAATGAGCAAA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=19;WE=154412012;WS=154411997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr6	154414375	rs9282821	A	C	4136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=62;SC=AATAATGGCCATTATAAAGTA;SOR=0.801;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=79;TCR=62;TR=141;WE=154414383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr6	154414446	rs540825	A	T	4922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=74;PP=2775;SC=CTCTAGAGCAAGGCTGCTTGG;SOR=0.704;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=156;TCF=82;TCR=74;TR=156;WE=154414454;WS=154414436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr6	154414563	rs675026	A	G	4121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.22;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr6	154414573	rs562859	C	T	3805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.85;SOR=1.248;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr6	154415434	rs660756	G	T	6527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=104;NR=123;PP=2965;SC=AAGTGGAGTGGCGATTTGGCA;SOR=0.939;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=227;TCF=104;TCR=123;TR=227;WE=154415442;WS=154415424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr6	154428702	rs650245	A	G	1980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=40;PP=1387;SC=AGTCTAGAGCATTAATTTTGA;SOR=0.963;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=30;TCR=40;TR=70;WE=154428710;WS=154428692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr6	154429085	rs71021021	AT	A	1119.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=12;PP=567;SC=ATAAACACTGATTTTTTTATT;SOR=0.892;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=24;TCF=11;TCR=13;TR=21;WE=154429093;WS=154429075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr6	154431393	rs497332	C	G	304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=210;SC=AATCTATGTACCTTTGGGGTA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=154431401;WS=154431383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	154520741	rs7341264	C	G	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.982;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=68;ReadPosRankSum=-2.184;SC=ATTAATATTACAGTTCCATAT;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=5;WE=154520749;WS=154520736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr6	154535444	rs2293537	A	G	5894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=115;NR=84;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.748;SC=TGTTGACCAAAGAGATTAGCC;SOR=0.302;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=200;TCF=116;TCR=84;TR=199;WE=154535452;WS=154535434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,219:1.00:220
chr6	154542491	rs2272381	A	G	4598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=95;PP=2932;SC=CAAACACATAAAAAATTAGTG;SOR=1.795;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=143;TCF=48;TCR=95;TR=143;WE=154542499;WS=154542481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr6	154567676	rs7759388	G	A	2567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=18;PP=1501;SC=TGCCTTTAACGTATCCCTCAT;SOR=2.102;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=61;TCR=18;TR=79;WE=154567684;WS=154567666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr6	154567863	rs34427887	C	T	2273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.052;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=52;PP=1215;ReadPosRankSum=1.074;SC=GATCTTTACACGATATCCTCC;SOR=0.781;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=190;TCF=86;TCR=104;TR=97;WE=154567871;WS=154567853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,110:0.51:217
chr6	154727825	rs12528985	C	T	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.028;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=357;ReadPosRankSum=-1.004;SC=CAATCCCAGCCGGGCGTGGTG;SOR=1.302;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=36;TCF=12;TCR=24;TR=21;WE=154727833;WS=154727815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,23:0.59:39
chr6	154735973	rs13219628	C	T	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=70;ReadPosRankSum=1.202;SC=TTGCCTGTTACCCCAGCACTT;SOR=0.340;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=6;WE=154735981;WS=154735963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr6	154743525	rs7771159	T	C	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=222;ReadPosRankSum=-0.333;SC=ATAGGATAATTACATACAAAC;SOR=0.495;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=14;WE=154743533;WS=154743515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr6	154749225	rs9384217	A	T	2695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=25;PP=1822;SC=CTGTTTAAACACACAACAGAT;SOR=1.765;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=88;TCF=62;TCR=26;TR=87;WE=154749233;WS=154749215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr6	154754739	rs9479852	C	T	1735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.168;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=38;PP=1056;ReadPosRankSum=0.740;SC=CAGCTCAAGACGGTCCCTGAC;SOR=0.819;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=148;TCF=74;TCR=74;TR=73;WE=154754747;WS=154754729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,83:0.46:180
chr6	154762394	.	A	AAAAAAG	317.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.451;ClippingRankSum=-0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=2.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=21.18;ReadPosRankSum=-0.755;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr6	154763401	rs6557351	G	A	1598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=39;PP=848;ReadPosRankSum=1.744;SC=AGTTCTTCATGTTATCAGTTT;SOR=0.687;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=163;TCF=80;TCR=83;TR=75;WE=154763409;WS=154763391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,84:0.45:186
chr6	154763522	rs6907693	T	C	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.60;ReadPosRankSum=0.921;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr6	154771277	rs9322467	A	G	1416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=19;PP=881;ReadPosRankSum=-0.361;SC=CCTGGTGTCCAATCCGTGTGA;SOR=0.698;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=99;TCF=68;TCR=31;TR=62;WE=154771285;WS=154771267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,67:0.62:108
chr6	154771449	rs4870285	T	C	3217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.492;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=68;PP=1477;ReadPosRankSum=-0.634;SC=ACCCACCCCCTGCAAACTGCC;SOR=0.591;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=237;TCF=105;TCR=132;TR=130;WE=154771457;WS=154771439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,153:0.57:268
chr6	155094988	rs7762129	G	A	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=52;ReadPosRankSum=-1.834;SC=CTTATGGGCAGTGATGTTGAG;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=4;WE=155094996;WS=155094978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr6	155116285	rs79232250	TTC	T	1935.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.773;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.091;NF=2;NR=30;PP=1248;ReadPosRankSum=-0.225;SC=TGAGCGGTTTTTCTGTTATAT;SOR=1.010;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=61;TCF=3;TCR=58;TR=32;WE=155116294;WS=155116275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,53:0.55:97
chr6	155124583	rs3757291	T	G	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.422;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=78;ReadPosRankSum=-0.980;SC=AAATGATAGATATAACGGAAT;SOR=0.061;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=8;WE=155124591;WS=155124573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr6	155129784	rs66499928	CCTTT	C	3426.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.346;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.054;NF=28;NR=25;PP=2276;ReadPosRankSum=0.874;SC=TCTCAACCAGCCTTTCTGTTT;SOR=1.064;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=117;TCF=53;TCR=64;TR=53;WE=155129795;WS=155129774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,90:0.48:188
chr6	155152311	rs911191	C	G	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.670;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=92;ReadPosRankSum=-1.117;SC=AAAGAGGTTGCCTCTCTGTAT;SOR=0.368;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=10;WE=155152319;WS=155152301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,10:0.31:32
chr6	155451352	rs931312	G	A	2876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=68;PP=1742;ReadPosRankSum=1.067;SC=CTGAGCAACCGTGTCTCTTTT;SOR=0.711;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=270;TCF=128;TCR=142;TR=129;WE=155451360;WS=155451342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,139:0.47:296
chr6	155485535	rs1032140	G	A	1617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.878;HP=6;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=26;PP=996;ReadPosRankSum=-2.040;SC=AATCACCTCTGTTTTTGCTTT;SOR=0.852;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=164;TCF=106;TCR=58;TR=74;WE=155485543;WS=155485525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,81:0.44:185
chr6	155485554	rs1032141	G	A	2208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.470;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=45;PP=1325;ReadPosRankSum=-0.994;SC=TTAAGATCCAGCAATGGGAGC;SOR=0.754;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=218;TCF=125;TCR=93;TR=105;WE=155485562;WS=155485544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,115:0.47:244
chr6	155486519	rs41284214	G	A	2424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.548;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=63;PP=1574;ReadPosRankSum=-1.630;SC=GAAAAGGCAAGGAGAAGAGAC;SOR=0.946;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=276;TCF=137;TCR=139;TR=113;WE=155486527;WS=155486509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,122:0.40:307
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chr6	155489849	rs73795336	G	A	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-3.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.148;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=1;PP=423;ReadPosRankSum=-0.021;SC=TTAGAATAATGATACAAATTG;SOR=1.739;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=48;TCF=44;TCR=4;TR=23;WE=155489857;WS=155489839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,26:0.50:52
chr6	155561760	rs4259257	T	C	6354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=122;NR=98;PP=2965;SC=TCCTCCGAGGTCTCTGGCCCG;SOR=0.872;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=221;TCF=123;TCR=98;TR=220;WE=155561768;WS=155561750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr6	155565034	.	T	G	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.729;ClippingRankSum=0.000;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=27.191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.74;ReadPosRankSum=0.474;SOR=5.129;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,16:0.31:51
chr6	155565744	rs6907595	T	C	2985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.420;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=55;PP=1700;ReadPosRankSum=1.523;SC=CGTGGTGTCCTGAACTTCATG;SOR=0.727;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=281;TCF=163;TCR=118;TR=133;WE=155565752;WS=155565734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,144:0.48:301
chr6	155571113	rs3011902	A	G	6231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=121;PP=2965;SC=GGTCCGTGAGACATCTGCACC;SOR=1.144;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=211;TCF=90;TCR=121;TR=211;WE=155571121;WS=155571103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr6	155571616	.	GA	AG	602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.541;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.862;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=498;ReadPosRankSum=-1.920;SC=AACAGGAAAGGACTGGAGATC;SOR=1.565;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=12;WE=155571625;WS=155571606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr6	155572986	rs3011899	G	A	294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=9;NR=1;PP=200;SC=CATACGTTTGGAGAGTGTTAC;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=155572994;WS=155572976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	155573331	rs3011898	A	G	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.269;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=218;ReadPosRankSum=-0.143;SC=AAAAGAAGATATACAGCTGGG;SOR=0.165;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=13;WE=155573339;WS=155573321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr6	155574207	rs2274824	T	C	4754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=81;NR=80;PP=2426;SC=TCGTGCAGTATGATGCCAGAA;SOR=0.831;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=161;TCF=81;TCR=80;TR=161;WE=155574215;WS=155574197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr6	155575538	rs201028845	TC	T	1483.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.069;NF=21;NR=21;PP=706;ReadPosRankSum=1.056;SC=CTGTTTTCTCTCCCCCCCCAC;SOR=0.664;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=110;TCF=60;TCR=50;TR=42;WE=155575546;WS=155575528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,63:0.47:133
chr6	155575607	rs3011895	G	A	3455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.394;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=71;PP=2142;ReadPosRankSum=-1.589;SC=TTCTGAGGGAGAACTTCAGGC;SOR=0.720;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=320;TCF=173;TCR=147;TR=155;WE=155575615;WS=155575597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,166:0.49:336
chr6	155577823	rs1571766	C	T	6886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.152;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=126;NR=101;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.112;SC=CAGATTTTGCCGACAATCTCA;SOR=0.490;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=230;TCF=127;TCR=103;TR=227;WE=155577831;WS=155577813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,253:0.99:256
chr6	155577913	rs41284228	C	T	2704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.910;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=53;PP=1601;ReadPosRankSum=0.832;SC=CTAAAGACATCGAAATTCAGT;SOR=0.745;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=253;TCF=136;TCR=117;TR=116;WE=155577921;WS=155577903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,128:0.46:281
chr6	155579246	rs3734322	A	C	1801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=39;PP=1104;ReadPosRankSum=-1.373;SC=ACAGAAAAATAAGAATTTTAC;SOR=0.742;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=123;TCF=54;TCR=69;TR=71;WE=155579254;WS=155579236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,80:0.58:139
chr6	155581289	rs4869849	C	A	945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=4;PP=654;SC=CCGTCACAGGCCTGAACTAAG;SOR=3.477;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=28;WE=155581297;WS=155581279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr6	155581619	rs912721	G	A	2024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=41;PP=1297;SC=TAAAACAGGAGGATGGGCTGT;SOR=1.545;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=24;TCR=41;TR=65;WE=155581627;WS=155581609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr6	155596901	rs927718	T	C	5256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.325;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=100;PP=2951;ReadPosRankSum=-0.766;SC=TGGCCTTATCTGGGGTCTCTG;SOR=0.469;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=190;TCF=90;TCR=100;TR=189;WE=155596909;WS=155596891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,199:1.00:200
chr6	155597134	rs34434986	G	A	3637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=372;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.687;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=73;PP=2176;ReadPosRankSum=-1.078;SC=TCTGCTTTGGGGATCTGCACT;SOR=0.691;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=329;TCF=173;TCR=156;TR=159;WE=155597142;WS=155597124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:193,178:0.48:371
chr6	155606325	rs324356	C	T	2173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=44;PP=1313;ReadPosRankSum=0.098;SC=GTCCTGGAATCGTAAAGATGT;SOR=0.699;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=210;TCF=116;TCR=94;TR=96;WE=155606333;WS=155606315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,103:0.44:235
chr6	155606460	rs3734320	T	A	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.518;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=21;PP=416;ReadPosRankSum=2.593;SC=TCCAGCCTGATTAGATGAAAA;SOR=1.179;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=49;TCF=8;TCR=41;TR=24;WE=155606468;WS=155606450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,25:0.48:52
chr6	155635585	rs162981	A	C	676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=19;PP=402;ReadPosRankSum=0.577;SC=GCACCATCCAACCCTACCTCA;SOR=0.771;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=77;TCF=27;TCR=50;TR=29;WE=155635593;WS=155635575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,33:0.41:81
chr6	155635624	rs1334688	A	G	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=506;ReadPosRankSum=-1.493;SC=GCTCCGAAAGAAACGCGCAGG;SOR=0.627;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=15;WE=155635645;WS=155635614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr6	155635637	rs1334687	A	C	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.203;HP=6;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=506;ReadPosRankSum=-2.493;SC=CGCGCAGGGGAGGAACCTGCG;SOR=0.165;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=11;WE=155635645;WS=155635614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
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chr6	155750219	rs231955	G	A	4258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=82;PP=2466;SC=CTTTGTCCTCGAAATAATAAA;SOR=1.491;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=51;TCR=82;TR=133;WE=155750227;WS=155750209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
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chr6	157950346	rs9457707	T	C	1606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=37;PP=1143;SC=AAAGTTTATGTTTTAGCATTG;SOR=1.569;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=19;TCR=37;TR=56;WE=157950354;WS=157950336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr6	157963550	rs17165416	T	C	2598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=27;PP=1598;SC=GACTGCTTACTGTTGATTCCT;SOR=1.584;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=59;TCR=27;TR=86;WE=157963558;WS=157963540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr6	157963743	rs2365611	G	A	4825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=91;PP=2935;SC=CACGAGCCACGCCTGATGAAG;SOR=0.894;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=171;TCF=80;TCR=91;TR=171;WE=157963751;WS=157963733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr6	157963842	rs2886421	C	A	1071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=27;PP=787;SC=ACAGTGGGGACGGCAGGCCGA;SOR=3.321;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=32;WE=157963850;WS=157963832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr6	158014255	rs905924	C	G	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=171;ReadPosRankSum=-2.269;SC=CCCTGCGCCACGGAACACTCA;SOR=0.693;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=12;WE=158014263;WS=158014245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr6	158068481	rs616538	T	C	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.455;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=325;ReadPosRankSum=1.104;SC=CCGCCCGCCCTGGTGGAATGG;SOR=0.994;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=45;TCF=8;TCR=37;TR=22;WE=158068489;WS=158068471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,22:0.45:49
chr6	158074504	rs636169	A	G	3232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=42;PP=1884;SC=GTGCTGCTGCATCTCTGGCTT;SOR=1.151;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=113;TCF=71;TCR=42;TR=113;WE=158074512;WS=158074494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr6	158322886	rs11367433	CT	C	172.84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.40;ReadPosRankSum=0.541;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,10:0.83:12
chr6	158327269	rs9365567	T	C	841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.840;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=24;PP=544;ReadPosRankSum=0.009;SC=TTTTGTTTGCTTTCTTTCTGA;SOR=0.880;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=78;TCF=32;TCR=46;TR=39;WE=158327277;WS=158327259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,41:0.48:85
chr6	158330765	rs3211067	G	A	2250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.484;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=40;PP=1245;ReadPosRankSum=-1.846;SC=CAGATCCCAGGAAAGGCTCCA;SOR=0.643;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=216;TCF=128;TCR=88;TR=97;WE=158330773;WS=158330755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,110:0.47:233
chr6	158331150	rs2076573	G	A	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.978;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=114;ReadPosRankSum=-0.374;SC=TTTCCATCCTGTAGAGCAGCA;SOR=0.061;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=11;WE=158331158;WS=158331140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,10:0.29:34
chr6	158357201	rs724897	T	G	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.743;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=6;PP=123;ReadPosRankSum=-0.529;SC=GTGTATCTTTTTTAATTGTGT;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=9;WE=158357209;WS=158357191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr6	158358654	rs144090871	GAAAC	G	1647.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.041;NF=0;NR=26;PP=1061;ReadPosRankSum=0.665;SC=TATTAAAAAAGAAACAATCTA;SOR=0.643;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=66;TCF=0;TCR=66;TR=26;WE=158358665;WS=158358644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,46:0.43:108
chr6	158359813	rs11324404	GA	G	4771.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.477;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=59;PP=2832;ReadPosRankSum=0.220;SC=GGTGCTGGTGGAAGTTTTTTT;SOR=0.758;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=145;TCF=15;TCR=130;TR=62;WE=158359825;WS=158359803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,128:0.53:240
chr6	158359817	rs113710023	T	G	4780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.472;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=58;PP=2830;ReadPosRankSum=-0.073;SC=CTGGTGGAAGTTTTTTTTTCC;SOR=0.737;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=227;TCF=103;TCR=124;TR=99;WE=158359825;WS=158359803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,130:0.53:243
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chr6	158454377	rs2295891	C	T	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=91;ReadPosRankSum=0.689;SC=TTCGCTGACCCGAAATGCTGC;SOR=0.627;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=8;WE=158454385;WS=158454367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr6	158475941	rs2296510	T	C	1955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=42;NR=27;PP=1113;SC=GGAAAAACCATGGCCTCCTTG;SOR=1.032;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=70;TCF=42;TCR=28;TR=69;WE=158475949;WS=158475931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr6	158487406	rs1009012	A	T	842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.746;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=11;PP=503;ReadPosRankSum=0.880;SC=AGGCAGCCTCATCTGTCTTTT;SOR=0.223;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=52;TCF=39;TCR=13;TR=35;WE=158487414;WS=158487396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,37:0.67:55
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chr6	158490779	rs751873	C	T	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.575;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=240;ReadPosRankSum=1.127;SC=TTTGACTTCCCCCTCCTCCCC;SOR=0.260;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=44;TCF=11;TCR=33;TR=19;WE=158490787;WS=158490769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,25:0.49:51
chr6	158497717	rs2296508	T	C	3133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.826;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=79;PP=1692;ReadPosRankSum=-0.061;SC=AGTATGACGTTGGCTCAGCCG;SOR=0.805;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=301;TCF=144;TCR=157;TR=147;WE=158497725;WS=158497707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,157:0.48:324
chr6	158499097	rs3831094	G	GT	1805.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=27;NR=10;PP=1534;SC=ACGTGGGGTGGTTCGTGGCGC;SOR=2.093;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=39;TCF=28;TCR=11;TR=37;WE=158499105;WS=158499087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr6	158499302	rs2296507	G	T	3629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=64;PP=2308;SC=AGCTACAAGCGTCTGATCACA;SOR=1.068;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=117;TCF=52;TCR=65;TR=116;WE=158499310;WS=158499292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr6	158502137	rs2256014	G	T	946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=3;PP=714;SC=TGTTCCTAACGCAGACCTGTG;SOR=3.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=28;WE=158502145;WS=158502127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr6	158502590	rs173263	C	A	2240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=50;PP=1484;SC=ATCAATCCCTCTTTTTATGTG;SOR=1.952;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=73;TCF=21;TCR=52;TR=71;WE=158502598;WS=158502580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr6	158504981	rs2236401	C	T	4902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=62;PP=2922;SC=GAAGACTGAGCCTTTCCCCCT;SOR=1.117;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=166;TCF=104;TCR=62;TR=166;WE=158504989;WS=158504971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr6	158505088	rs1744173	A	G	7723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=126;NR=135;PP=2965;SC=ATCAGCCTGGAGTCTCGGACA;SOR=0.840;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=261;TCF=126;TCR=135;TR=261;WE=158505096;WS=158505078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,290:1.00:290
chr6	158507981	rs2296506	G	A	6043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=109;NR=138;PP=2965;SC=TCCCCAACCGGCCTCGGCCAC;SOR=1.306;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=249;TCF=110;TCR=139;TR=247;WE=158507989;WS=158507971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr6	158509750	rs350289	A	G	4466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=66;PP=2605;SC=GCACCCATGGACAGTATTCAA;SOR=0.768;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=149;TCF=83;TCR=66;TR=148;WE=158509758;WS=158509740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr6	158514881	rs78383930	C	T	1834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.121;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=28;PP=1090;ReadPosRankSum=0.816;SC=CCTCAGCCTACGAGAGGTTCC;SOR=0.468;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=130;TCF=87;TCR=43;TR=75;WE=158514889;WS=158514871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,83:0.56:147
chr6	158517308	rs2502601	A	G	3787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=67;PP=2429;SC=CCAGATCATGAACACAAAACC;SOR=1.288;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=49;TCR=68;TR=116;WE=158517316;WS=158517298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr6	158517451	rs2502600	A	G	1107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=25;PP=785;SC=CTCCCTCTAGACATCCCTCCA;SOR=1.923;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=11;TCR=25;TR=36;WE=158517459;WS=158517441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr6	158534690	.	T	A	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.136;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.31;ReadPosRankSum=0.288;SOR=0.641;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,5:0.20:25
chr6	158535720	rs150169784	T	TTATAAAATGAGATAATACATTCAAGGAA	753.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=83.75;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	158536116	rs2502604	A	T	517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=19;PP=537;SC=CTTTCTTTTTAAAAAAAATGG;SOR=3.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=22;WE=158536124;WS=158536106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr6	158538747	rs117813106	C	T	2945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=1.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.372;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=70;PP=1729;ReadPosRankSum=0.761;SC=GGTCTAAAGTCGCCTCTGTTA;SOR=0.616;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=267;TCF=114;TCR=153;TR=125;WE=158538755;WS=158538737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,143:0.46:308
chr6	158541618	rs41269577	G	A	936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=27;PP=605;ReadPosRankSum=-0.531;SC=CTGGTGAAAAGTACACATATC;SOR=0.722;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=79;TCF=29;TCR=50;TR=41;WE=158541626;WS=158541608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,45:0.49:92
chr6	158571501	rs6929274	G	A	819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.643;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=9;PP=404;ReadPosRankSum=0.670;SC=TTTCTCCTTTGTCTAAAGAAA;SOR=1.493;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=59;TCF=37;TCR=22;TR=32;WE=158571509;WS=158571491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,38:0.58:66
chr6	158571611	rs112780453	A	T	919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.100;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=21;PP=497;ReadPosRankSum=-0.620;SC=TATGTAAGAAATAAAGAACCT;SOR=1.046;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=81;TCF=44;TCR=37;TR=39;WE=158571619;WS=158571601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,45:0.48:94
chr6	158571655	rs6929520	G	C	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.536;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=384;ReadPosRankSum=0.107;SC=ATCATAAATAGACAATCAAAA;SOR=1.470;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=51;TCF=20;TCR=31;TR=25;WE=158571663;WS=158571645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,27:0.48:56
chr6	158571706	rs6933878	G	C	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=90;ReadPosRankSum=-0.475;SC=GCTTGTCATAGTAAACTTCTT;SOR=0.754;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=8;WE=158571714;WS=158571696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr6	158735087	rs9364951	C	T	2395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.98;ReadPosRankSum=-0.070;SOR=0.830;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,62:0.57:109
chr6	158735090	rs7756620	T	C	2395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=0.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.58;ReadPosRankSum=0.449;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,62:0.56:111
chr6	158923434	rs9364968	G	C	4531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=81;NR=65;PP=2843;SC=CCCAGAACACGTACACCCTCC;SOR=0.718;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=146;TCF=81;TCR=65;TR=146;WE=158923442;WS=158923424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr6	158924088	rs914690	T	C	6303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=120;NR=97;PP=2965;SC=TGGGTGAGGATGTTTGGGTTC;SOR=0.865;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=218;TCF=120;TCR=98;TR=217;WE=158924096;WS=158924078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr6	158927651	rs3828712	A	G	2700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=50;PP=1601;ReadPosRankSum=-0.791;SC=CGTACATTCTAGACTTCCAGT;SOR=0.702;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=253;TCF=146;TCR=107;TR=118;WE=158927659;WS=158927641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,132:0.45:294
chr6	158957104	rs9456318	A	G	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.773;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=7;PP=281;ReadPosRankSum=-1.093;SC=TGTGGGAAGAAGCACCTCACT;SOR=0.208;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=19;WE=158957112;WS=158957094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,20:0.67:30
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chr6	158994577	rs4709217	T	G	6826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=118;NR=121;PP=2965;SC=TTTTTACTCATTGAATCTTTT;SOR=0.866;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=239;TCF=118;TCR=121;TR=239;WE=158994585;WS=158994567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
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chr6	159047382	rs34976165	T	C	1522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.033;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=29;PP=981;ReadPosRankSum=1.540;SC=AGGTAATTGCTTGGTGGTTTA;SOR=0.918;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=195;TCF=106;TCR=89;TR=71;WE=159047390;WS=159047372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,79:0.37:211
chr6	159047668	rs71030180	TTTCA	T	2730.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=352;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.404;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=53;PP=2967;ReadPosRankSum=0.129;SC=TGAACTCAAATTTCATTCAGC;SOR=0.648;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=201;TCF=49;TCR=152;TR=70;WE=159047679;WS=159047658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:199,135:0.40:334
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chr6	159052471	rs9457420	G	A	1970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.529;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=54;PP=1292;ReadPosRankSum=0.442;SC=ATCCCGGCACGGCCTTGCATG;SOR=0.972;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=161;TCF=62;TCR=99;TR=83;WE=159052479;WS=159052461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,91:0.50:181
chr6	159058659	rs35378330	A	C	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.170;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=162;ReadPosRankSum=0.459;SC=AGCGTACGCTAACGTATACTA;SOR=0.117;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=11;WE=159058667;WS=159058649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr6	159065758	rs2306751	C	G	5919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=114;PP=2965;SC=CCGGCGCGTCCCCTCCGGCTC;SOR=1.099;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=202;TCF=87;TCR=115;TR=201;WE=159065766;WS=159065748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr6	159166486	rs6914168	A	G	2097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=13;PP=1508;SC=GAAGTAACTTATTATATCTGT;SOR=2.406;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=54;TCR=13;TR=67;WE=159166494;WS=159166476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr6	159166698	rs199688801	G	GT	961.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=0;NR=17;PP=408;SC=TCCGTAAGTTGTTTTTTTTAA;SOR=1.547;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=17;WE=159166706;WS=159166688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr6	159178345	rs901363	C	T	5021.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=83;PP=2965;SC=AGTGATCATTCCTCTGGCCAC;SOR=0.726;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=166;TCF=83;TCR=83;TR=166;WE=159178365;WS=159178335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr6	159184462	rs2291387	A	G	4181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=64;PP=2506;SC=TGAGGCAGTCAAGCTTGGAGT;SOR=0.839;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=143;TCF=79;TCR=64;TR=143;WE=159184470;WS=159184452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr6	159184507	rs2291386	C	T	4992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=77;PP=2749;SC=TTGGAATGAACGACCGCTTGC;SOR=0.704;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=163;TCF=86;TCR=77;TR=163;WE=159184515;WS=159184497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr6	159184677	rs2291385	C	T	392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=13;PP=336;SC=TTGGAAATGCCTAAGTCTAGT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=159184685;WS=159184667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	159192575	rs3127181	A	G	994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=26;PP=751;SC=TCTCGGCACTAGGAATGTGCA;SOR=2.584;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=33;WE=159192583;WS=159192565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr6	159204426	rs7769862	T	A	1089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=6;PP=747;SC=CTTTAAAAAGTTTCCTACTTT;SOR=2.774;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=32;WE=159204434;WS=159204416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr6	159239004	rs1994350	G	T	1518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=10;PP=1130;SC=CGTCTTCTGCGTGTGAGAAGA;SOR=2.746;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=39;TCR=10;TR=49;WE=159239012;WS=159238994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr6	159262974	rs113978641	A	T	6520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=123;NR=103;PP=2965;SC=TTTACTCTGTAGGCCAAGAAA;SOR=0.761;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=227;TCF=123;TCR=104;TR=226;WE=159262982;WS=159262964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr6	159291490	rs6455609	G	C	919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=23;PP=680;SC=AACACATCAGGAAACCTCAAA;SOR=3.334;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=27;WE=159291498;WS=159291480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr6	159294675	rs10945567	C	T	3888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=79;NR=52;PP=2006;SC=TGCCCCACCACGTGGGGGATT;SOR=0.974;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=132;TCF=79;TCR=53;TR=131;WE=159294683;WS=159294665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr6	159316197	rs113218217	G	A	1736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=34;PP=1103;ReadPosRankSum=0.254;SC=TCATTGACACGTTATTATGTA;SOR=0.734;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=172;TCF=101;TCR=71;TR=80;WE=159316205;WS=159316187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,84:0.44:190
chr6	159316430	rs9457507	C	T	1864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=44;PP=1268;SC=TGATGGAATACGTGGCATCCT;SOR=1.828;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=21;TCR=45;TR=65;WE=159316438;WS=159316420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr6	159398633	rs3756988	T	C	3645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=428;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.765;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=86;PP=2298;ReadPosRankSum=-0.271;SC=GCCCTAAGAGTTCTCTCTCTT;SOR=0.880;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=371;TCF=179;TCR=192;TR=156;WE=159398641;WS=159398623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:245,182:0.43:427
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chr6	159404862	rs2143651	C	T	903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.999;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=25;PP=527;ReadPosRankSum=1.563;SC=TCATATATATCGAGTTTAAAA;SOR=0.188;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=69;TCF=21;TCR=48;TR=40;WE=159404870;WS=159404852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,41:0.57:72
chr6	159407208	rs28627682	G	T	1119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.523;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=20;PP=681;ReadPosRankSum=0.691;SC=AAGTATCAGAGAGCACAGGAG;SOR=0.541;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=112;TCF=77;TCR=35;TR=53;WE=159407216;WS=159407198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,57:0.46:124
chr6	159407355	rs34756688	T	C	1768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=45;PP=1027;ReadPosRankSum=-1.432;SC=CAGGTTCAGGTGTTTGTGGTC;SOR=0.713;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=163;TCF=74;TCR=89;TR=83;WE=159407363;WS=159407345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,87:0.50:173
chr6	159407446	rs34582178	C	T	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.906;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=16;PP=350;ReadPosRankSum=-1.395;SC=AGAATCAGGCCGTCCGAGCTA;SOR=0.471;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=77;TCF=31;TCR=46;TR=29;WE=159407454;WS=159407436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,31:0.37:84
chr6	159420574	rs10945587	T	C	1351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=16;PP=683;ReadPosRankSum=-1.231;SC=CAGTCAGCGCTGAGGCCATGT;SOR=0.679;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=94;TCF=63;TCR=31;TR=52;WE=159420582;WS=159420564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,61:0.58:106
chr6	159420802	rs41267757	G	T	2465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.428;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=51;PP=1468;ReadPosRankSum=2.937;SC=GACCAGCTGCGGGGGCCGCAT;SOR=0.657;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=267;TCF=142;TCR=125;TR=108;WE=159420810;WS=159420792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,122:0.41:294
chr6	159421040	rs45484795	C	T	1013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.711;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=27;PP=682;ReadPosRankSum=-0.420;SC=GGTGGCTGTCCTTGGCCCGGC;SOR=0.484;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=91;TCF=33;TCR=58;TR=44;WE=159421048;WS=159421030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,47:0.47:99
chr6	159459283	rs78232928	T	G	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=13;PP=291;ReadPosRankSum=-2.224;SC=GTAAGCAATTTGTCAGCTTGA;SOR=0.698;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=54;TCF=20;TCR=34;TR=23;WE=159459291;WS=159459273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,23:0.40:57
chr6	159461938	rs16889418	C	T	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.139;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=155;ReadPosRankSum=-0.742;SC=ACCCGGTTTTCGTTCCATCGC;SOR=0.129;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=10;WE=159461946;WS=159461928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr6	159462675	rs74604311	C	G	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=306;ReadPosRankSum=-0.148;SC=CCTTCCTCAACCCTGCTATTT;SOR=1.051;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=15;WE=159462683;WS=159462665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr6	159590734	rs295332	T	C	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.61;ReadPosRankSum=1.178;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr6	159618303	rs371373	C	T	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.627;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=64;ReadPosRankSum=0.726;SC=TTTGTTGTCACACTGTAATGC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=5;WE=159618311;WS=159618298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr6	159642556	rs374875804	C	T	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.098;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=391;ReadPosRankSum=-0.570;SC=GCAGAACCCCCGCTCCAGCCC;SOR=2.030;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=18;WE=159642564;WS=159642546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,18:0.72:25
chr6	159650722	rs57447691	C	T	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.136;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=133;ReadPosRankSum=0.814;SC=GGTGACTTGGCGTGCATTGCT;SOR=2.133;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=8;WE=159650730;WS=159650712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr6	159652931	rs420137	G	C	4560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=61;PP=2779;SC=GGCGGATGTTGAGCAGAACAC;SOR=0.861;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=83;TCR=61;TR=144;WE=159652939;WS=159652921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr6	159653635	rs381639	C	G	5482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=108;NR=75;PP=2965;SC=CCTCGCCGGCCCGGAGGACCC;SOR=0.938;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=184;TCF=109;TCR=75;TR=183;WE=159653643;WS=159653625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr6	159654487	rs404435	G	T	7358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=134;NR=121;PP=2965;SC=CTGCTCGTCCGCCCGCAGCAC;SOR=0.715;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=255;TCF=134;TCR=121;TR=255;WE=159654495;WS=159654477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,271:1.00:271
chr6	159654551	rs370434	C	G	6885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=108;NR=119;PP=2965;SC=CCGGGCCCCACAACAGCAGCC;SOR=0.894;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=228;TCF=109;TCR=119;TR=227;WE=159654559;WS=159654541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr6	159654994	rs402388	A	C	4170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=53;PP=2441;SC=GCGCCCGGGTACCCAGCAGGG;SOR=0.721;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=66;TCR=53;TR=118;WE=159655002;WS=159654984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr6	159655084	rs420054	C	G	6148.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=123;NR=106;PP=2965;ReadPosRankSum=0.146;SC=CCGAGGACGACGAGGAGGAGG;SOR=0.460;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=234;TCF=125;TCR=109;TR=229;WE=159655092;WS=159655068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:5,231:0.98:236
chr6	159655102	rs436743	A	G	7249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=129;NR=109;PP=2965;SC=AGGACGCGGGATTTTTTAAAG;SOR=0.754;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=238;TCF=129;TCR=109;TR=238;WE=159655110;WS=159655092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,270:1.00:270
chr6	159655326	rs3003174	T	C	2467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=35;PP=1493;SC=CCTTCCCGACTGCCGCCTCGC;SOR=0.786;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=80;TCF=45;TCR=35;TR=80;WE=159655334;WS=159655316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr6	159655383	rs2501176	A	G	7078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=95;NR=56;PP=2578;SC=CCCTGGCCGCAGTACACCACG;SOR=1.258;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=151;TCF=95;TCR=56;TR=151;WE=159655391;WS=159655373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr6	159655402	rs2932988	A	G	8304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=117;NR=81;PP=2965;SC=CGCGCGCCCCACCTGGCCACT;SOR=1.068;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=199;TCF=118;TCR=81;TR=198;WE=159655410;WS=159655392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr6	159655516	rs77131924	T	C	1666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.217;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=39;PP=944;ReadPosRankSum=-3.240;SC=GACAAGGTAGTTTATTTTTTC;SOR=0.450;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=169;TCF=75;TCR=94;TR=75;WE=159655524;WS=159655506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,85:0.44:193
chr6	159655593	rs2501177	C	T	1267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=34;PP=894;SC=TATTCTATTGCATTTAGCACC;SOR=6.043;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=35;WE=159655601;WS=159655583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr6	159657195	rs420339	G	T	1263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=3;PP=876;SC=CCAACTTCCCGGGCATGTTGA;SOR=4.021;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=35;WE=159657203;WS=159657185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr6	159659481	rs419836	C	T	547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=400;SC=ACTCACATTACGGTTTCCTTC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=159659489;WS=159659471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr6	159659523	rs450538	A	G	1925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=13;PP=1280;SC=TACATATATAATTGGACTAAT;SOR=2.531;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=44;TCR=13;TR=57;WE=159659531;WS=159659513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr6	159660779	rs141435210	GCCACCACCCGCCGCACGA	G	917.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=3;PP=2976;SC=GCCCACCACTGCCACCACCCG;SOR=0.784;SbPval=0.07;Source=Platypus;TC=23;TCF=9;TCR=14;TR=10;WE=159660804;WS=159660769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr6	159660879	rs386360	C	A	2553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.80;SOR=1.384;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr6	159669953	rs28487880	G	C	265.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.739;HP=2;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=199;ReadPosRankSum=1.330;SC=GTGTGTGTGTGTGTCTGTCTG;SOR=1.306;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=23;TCR=11;TR=15;WE=159669961;WS=159669928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr6	159670276	rs294907	A	G	1425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=33;PP=957;SC=TTGAAGAAAAACATTACTAAT;SOR=2.208;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=12;TCR=33;TR=45;WE=159670284;WS=159670266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr6	159670303	rs294906	G	A	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.142;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=265;ReadPosRankSum=-0.356;SC=GCCTCGCCAAGGCAGTGCATT;SOR=0.105;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=15;WE=159670311;WS=159670293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr6	159672455	rs294899	C	T	3679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=384;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.835;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=81;PP=2145;ReadPosRankSum=-1.011;SC=AGAAGAGTGACCTGCCTCCCC;SOR=0.724;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=343;TCF=179;TCR=164;TR=163;WE=159672463;WS=159672445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:202,181:0.47:383
chr6	159677498	rs294890	C	T	765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.123;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=2;PP=619;ReadPosRankSum=2.378;SC=TGGGTTACATCTTGTGTGTGA;SOR=1.863;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=52;TCF=47;TCR=5;TR=29;WE=159677506;WS=159677488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,29:0.56:52
chr6	159682206	rs294883	C	T	1189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.069;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=20;PP=702;ReadPosRankSum=-0.881;SC=CAAAATATATCTTCTTCCAAC;SOR=0.957;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=131;TCF=78;TCR=53;TR=55;WE=159682214;WS=159682196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,60:0.43:139
chr6	159689004	rs560889	C	G	747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=511;ReadPosRankSum=-0.219;SC=AGGTGGGAGACAAGGATTAAT;SOR=0.648;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=64;TCF=17;TCR=47;TR=29;WE=159689012;WS=159688994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,32:0.44:73
chr6	159692321	rs409691	G	A	1121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.285;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=10;PP=663;ReadPosRankSum=-1.046;SC=TGGTTCAGGGGCCTCTGACGC;SOR=1.529;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=86;TCF=57;TCR=29;TR=43;WE=159692329;WS=159692311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,50:0.51:98
chr6	159692559	rs455162	G	A	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=245;ReadPosRankSum=-0.464;SC=GACAGCCAGCGTGCTCAGCCC;SOR=1.292;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=12;WE=159692567;WS=159692549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,13:0.81:16
chr6	160106088	rs2758332	C	A	1092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.93;ReadPosRankSum=0.580;SOR=0.665;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,51:0.51:100
chr6	160106125	rs2855116	A	C	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=434;ReadPosRankSum=1.244;SC=ATTACAGTAAAATGTTATATT;SOR=0.846;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=40;TCF=10;TCR=30;TR=23;WE=160106133;WS=160106115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,26:0.62:42
chr6	160109051	rs2070994	A	T	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.582;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=172;ReadPosRankSum=0.932;SC=TCTCAAAAAAACAACAACAAA;SOR=0.163;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=12;WE=160109059;WS=160109041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr6	160113872	rs4880	A	G	1041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=29;PP=675;ReadPosRankSum=0.315;SC=ATACCCCAAAACCGGAGCCAG;SOR=0.739;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=87;TCF=33;TCR=54;TR=46;WE=160113880;WS=160113862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,47:0.52:90
chr6	160114168	rs5746094	T	C	1514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=32;PP=885;ReadPosRankSum=0.293;SC=GGGTCCCCTTTCTTCTCACCC;SOR=0.658;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=153;TCF=88;TCR=65;TR=74;WE=160114176;WS=160114158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,80:0.48:166
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chr6	160114366	rs5746091	C	T	148.41	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=21.20;ReadPosRankSum=1.465;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
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chr6	160211697	rs9346795	C	T	4217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FS=0.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.05;MQRankSum=-1.061;QD=20.47;ReadPosRankSum=-0.135;SOR=0.638;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,110:0.53:206
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chr6	160211728	rs11757681	T	G	1505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.075;HP=2;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.131;NF=25;NR=38;PP=955;ReadPosRankSum=-1.251;SC=CACAGTACATTGGAACGTGCG;SOR=0.926;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=145;TCF=62;TCR=83;TR=63;WE=160211736;WS=160211718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,68:0.44:153
chr6	160212268	rs4709371	G	A	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.605;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=352;ReadPosRankSum=0.180;SC=GGTAGAGGCAGGGTTCGCGGA;SOR=0.437;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=20;WE=160212276;WS=160212258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,24:0.67:36
chr6	160218605	rs3777423	A	G	815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.292;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=25;PP=533;ReadPosRankSum=-0.853;SC=TCTTGGCATTAGATAACTTAC;SOR=0.399;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=84;TCF=20;TCR=64;TR=34;WE=160218613;WS=160218595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,38:0.43:88
chr6	160218957	rs2342479	C	T	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=86;ReadPosRankSum=1.604;SC=TCTGAAAAACCGTTGTAGGCT;SOR=0.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=6;WE=160218965;WS=160218947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr6	160219337	rs4739	G	A	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.68;ReadPosRankSum=-1.465;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr6	160221279	rs71927633	GCGTGGGCAGCA	G	1129.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.929;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=2.365;NF=2;NR=7;PP=2983;ReadPosRankSum=0.526;SC=CGACGGAAGCGCGTGGGCAGC;SOR=0.499;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=34;TCF=13;TCR=21;TR=9;WE=160221297;WS=160221269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,31:0.43:72
chr6	160221475	rs733319	A	G	1541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=30;PP=937;SC=GGCGAGCTTGAGGAGGGGGTG;SOR=1.651;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=17;TCR=30;TR=47;WE=160221483;WS=160221465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr6	160221560	rs12211823	G	A	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.154;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=2;PP=79;ReadPosRankSum=0.289;SC=CTCCAGCCCCGGGGCGGTGGG;SOR=0.636;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=5;WE=160221568;WS=160221550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr6	160221690	rs35229038	GCTT	G	1565.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=869;ReadPosRankSum=0.027;SC=ACCTCACTTGGCTTCTTGAGC;SOR=0.687;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=55;TCF=34;TCR=21;TR=21;WE=160221700;WS=160221680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,41:0.55:75
chr6	160221992	rs35619423	CTTT	C	685.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.471;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=8;PP=467;ReadPosRankSum=0.762;SC=GAGGACCTTGCTTTTTTCTGT;SOR=0.634;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=24;TCF=13;TCR=11;TR=15;WE=160222002;WS=160221982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr6	160224346	rs2146163	T	C	6349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=128;PP=2965;SC=CAAACAAGTATGTATCAAGAG;SOR=1.123;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=223;TCF=95;TCR=128;TR=223;WE=160224354;WS=160224336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr6	160225012	rs35435543	T	G	2290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=39;PP=1464;ReadPosRankSum=-0.558;SC=TAGCCCATTCTTGTAACTTCT;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=212;TCF=133;TCR=79;TR=106;WE=160225020;WS=160225002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,115:0.50:230
chr6	160225463	rs11757783	G	T	1340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.859;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=14;PP=882;ReadPosRankSum=-0.146;SC=TGATCTAGACGAACTGGCTTA;SOR=1.106;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=103;TCF=73;TCR=30;TR=55;WE=160225471;WS=160225453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,57:0.53:107
chr6	160225559	rs9364536	G	C	6646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=115;NR=98;PP=2965;SC=TGTTCTGTTTGTTGTTCTGTT;SOR=0.753;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=213;TCF=115;TCR=98;TR=213;WE=160225567;WS=160225549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr6	160226923	rs6910976	A	G	1460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.783;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=15;PP=954;ReadPosRankSum=-0.610;SC=CATGAAAACCAGAGGGTTCAG;SOR=1.105;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=104;TCF=77;TCR=27;TR=62;WE=160226931;WS=160226913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,68:0.58:118
chr6	160229889	rs35872675	T	C	1526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.181;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=33;PP=992;ReadPosRankSum=0.932;SC=GGCTCCATTGTTTCTCTCTCA;SOR=0.753;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=122;TCF=66;TCR=56;TR=68;WE=160229897;WS=160229879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,75:0.55:136
chr6	160236976	rs7739963	T	C	2517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.493;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=42;PP=1542;ReadPosRankSum=0.142;SC=AAATTGTTTTTTATTCTATTT;SOR=0.750;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=199;TCF=117;TCR=82;TR=103;WE=160236988;WS=160236966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,115:0.51:224
chr6	160237489	rs2342480	T	C	3380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=49;PP=1819;SC=TTGTATGAGCTGCAGCCACTG;SOR=0.912;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=70;TCR=49;TR=119;WE=160237497;WS=160237479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr6	160238027	rs77632648	C	G	660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.925;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=386;ReadPosRankSum=0.419;SC=CAGTATGCCCCTGCCGTCCCT;SOR=0.846;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=64;TCF=45;TCR=19;TR=30;WE=160238035;WS=160238017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,34:0.47:73
chr6	160239461	rs41267791	G	A	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=2;PP=431;ReadPosRankSum=-1.197;SC=GACTTGTGAGGGCAGGAGGGA;SOR=0.741;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=42;TCF=39;TCR=3;TR=22;WE=160239469;WS=160239451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,23:0.51:45
chr6	160239712	rs5012271	C	T	2352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.011;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=57;PP=1323;ReadPosRankSum=-0.249;SC=TTGGCCCCCTCGCCCCATTCA;SOR=0.902;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=202;TCF=88;TCR=114;TR=98;WE=160239720;WS=160239702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,113:0.51:223
chr6	160239835	rs9347350	T	C	1612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=16;PP=1166;SC=GTTTCTCCACTAAAGCCAACA;SOR=1.225;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=27;TCR=16;TR=43;WE=160239843;WS=160239825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr6	160445793	rs2277070	A	G	828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.946;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=21;PP=462;ReadPosRankSum=0.535;SC=CTATGGCTTCAATATCTTTGC;SOR=0.862;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=66;TCF=24;TCR=42;TR=32;WE=160445801;WS=160445783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,37:0.51:73
chr6	160448324	rs8191754	C	G	986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=22;PP=452;ReadPosRankSum=-0.256;SC=CCGGGACGGACTGAAGCTGGT;SOR=0.613;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=73;TCF=29;TCR=44;TR=38;WE=160448332;WS=160448314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,46:0.52:89
chr6	160453561	rs4709390	T	G	1035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=18;PP=719;ReadPosRankSum=-0.734;SC=TTATTTTGCTTCTTTCACATT;SOR=0.631;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=127;TCF=85;TCR=42;TR=51;WE=160453569;WS=160453551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,52:0.37:140
chr6	160453978	rs1570070	A	G	1134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=36;NR=1;PP=853;SC=TTTTAGGTTCATCCTATATTT;SOR=5.994;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=38;TCF=37;TCR=1;TR=37;WE=160453986;WS=160453968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr6	160461793	rs8191774	T	C	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.262;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=166;ReadPosRankSum=-0.723;SC=TTAGTCCACATGCTCATGGAA;SOR=1.609;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=10;WE=160461801;WS=160461783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr6	160464289	rs894817	G	A	3484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=65;PP=1957;SC=AGGCACGAGGGTGTCCCGAGG;SOR=1.572;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=41;TCR=65;TR=106;WE=160464297;WS=160464279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr6	160465486	.	TTGTC	T	182	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=24;MQ=60.6;NF=4;NR=1;PP=182;QD=43.0;SC=AGTCACTTCTTTGTCTGCGTG;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=5;WE=160465497;WS=160465476;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:5,5:0.50:10
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chr6	160468278	rs998075	A	G	2661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.453;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=67;PP=1623;ReadPosRankSum=-0.359;SC=GAGGCGGCACACCCTATAACA;SOR=0.756;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=236;TCF=107;TCR=129;TR=118;WE=160468286;WS=160468268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,131:0.50:262
chr6	160468383	rs998074	T	C	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.673;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=166;ReadPosRankSum=-0.061;SC=GAATGTTTGTTCCTCATCGCG;SOR=1.574;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=10;WE=160468391;WS=160468373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,12:0.36:33
chr6	160489215	rs8191867	CAG	C	3953.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.848;NF=22;NR=39;PP=2466;ReadPosRankSum=0.051;SC=CGTTTCTAGACAGAGTGCCCA;SOR=0.669;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=131;TCF=46;TCR=85;TR=61;WE=160489224;WS=160489205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,107:0.47:227
chr6	160494409	rs629849	A	G	3593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=445;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.528;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=92;PP=2275;ReadPosRankSum=2.156;SC=GCCTGAGGCCAGGCCAACCAA;SOR=0.619;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=393;TCF=188;TCR=205;TR=176;WE=160494417;WS=160494399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:256,189:0.42:445
chr6	160494521	rs2282140	C	T	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.057;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=21;PP=390;ReadPosRankSum=0.386;SC=CAGATGGGCACGGGAGAAGTG;SOR=0.497;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=68;TCF=16;TCR=52;TR=28;WE=160494529;WS=160494511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,33:0.43:77
chr6	160505199	rs614754	C	G	2191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=49;PP=1533;SC=CCTGGTCCCTCGTCCACAACG;SOR=1.949;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=21;TCR=49;TR=70;WE=160505207;WS=160505189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr6	160511250	rs1050026	T	A	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=211;ReadPosRankSum=1.031;SC=AACAAAAACCTTGGTCTAATT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=11;WE=160511258;WS=160511240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr6	160523709	rs2297367	C	T	1492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.594;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=30;PP=991;ReadPosRankSum=0.694;SC=AGGAGGTAAGCGGGTGGCAGG;SOR=0.754;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=139;TCF=78;TCR=61;TR=69;WE=160523717;WS=160523699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,73:0.48:152
chr6	160524671	rs2297369	A	G	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=126;ReadPosRankSum=-0.816;SC=AAATGCAGCCACCACCAGCCC;SOR=0.941;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=12;WE=160524679;WS=160524661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr6	160551204	rs683369	G	C	1623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=32;PP=946;ReadPosRankSum=0.346;SC=CGGGCTTCTTGTTTGGCTCTC;SOR=0.705;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=172;TCF=97;TCR=75;TR=75;WE=160551212;WS=160551194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,82:0.44:187
chr6	160553165	rs3737088	C	T	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=205;ReadPosRankSum=0.349;SC=GACAGTGGTGCGGTGGCCTCC;SOR=0.307;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=12;WE=160553173;WS=160553155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr6	160557154	rs4646276	G	A	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=128;ReadPosRankSum=1.919;SC=CAGCCCCAACGTGGGGAGGGC;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=9;WE=160557162;WS=160557144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr6	160560845	rs628031	A	G	2517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.114;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=52;PP=1462;ReadPosRankSum=0.674;SC=CCCCATGGCCATGTCAAATTT;SOR=0.572;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=228;TCF=126;TCR=102;TR=114;WE=160560853;WS=160560835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,127:0.51:250
chr6	160560897	rs113569197	CTGGTAAGT	C	1573.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.131;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.669;NF=2;NR=39;PP=2976;ReadPosRankSum=-0.133;SC=TTTATCTCACCTGGTAAGTTG;SOR=0.814;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=109;TCF=6;TCR=103;TR=41;WE=160560912;WS=160560887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,83:0.42:197
chr6	160575985	rs2297374	C	T	1271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=26;PP=725;SC=TTTTGCAGCTCGGCAGTGGGC;SOR=1.051;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=21;TCR=27;TR=47;WE=160575993;WS=160575975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr6	160579685	rs79476845	C	T	1787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.511;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=45;PP=1133;ReadPosRankSum=-0.864;SC=AATTCCTAGACGCCTTCACTT;SOR=0.636;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=184;TCF=85;TCR=99;TR=80;WE=160579693;WS=160579675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,89:0.42:214
chr6	160645832	rs316003	C	T	8107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=138;NR=147;PP=2965;SC=CCAAGCCAAGCACGCCTGAAA;SOR=0.802;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=287;TCF=138;TCR=149;TR=285;WE=160645840;WS=160645822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,308:1.00:308
chr6	160645921	rs3219197	C	CT	2141.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.324;NF=1;NR=47;PP=1126;ReadPosRankSum=-0.247;SC=TTGTTTAAAACTTTTTTTTAG;SOR=1.532;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=60;TCF=2;TCR=58;TR=48;WE=160645929;WS=160645911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,79:0.96:82
chr6	160663230	rs17588242	T	C	837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=0;PP=572;SC=ACACTGTGTTTTGAAGGTAAG;SOR=4.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=160663238;WS=160663220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr6	160666660	rs11422119	A	AC	2310.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=40;PP=1769;SC=ATAATTTCTTACCGTCCTGAG;SOR=1.758;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=2;TCR=42;TR=42;WE=160666668;WS=160666650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr6	160670282	rs316019	A	C	6868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=124;NR=96;PP=2965;SC=TTGGGCAGAGAAACTGTGAAC;SOR=0.801;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=221;TCF=125;TCR=96;TR=220;WE=160670290;WS=160670272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr6	160670494	rs316018	A	G	1498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=41;PP=1203;SC=AAACTAGAACACCAACCTCAA;SOR=3.352;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=7;TCR=41;TR=48;WE=160670502;WS=160670484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr6	160670533	rs316017	C	T	593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=19;PP=497;SC=GAATATTCTACGCAACTCTCT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=160670541;WS=160670523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr6	160671500	rs316016	T	C	1173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=7;PP=795;SC=GTCCCTTTTCTTGCATGCCGC;SOR=2.362;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=35;WE=160671508;WS=160671490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr6	160677614	rs2774230	G	C	4812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=52;PP=2726;SC=CTTTGGGATTGTTTAAATTCC;SOR=1.139;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=146;TCF=94;TCR=52;TR=145;WE=160677622;WS=160677604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr6	160679400	rs624249	C	A	2309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.964;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=49;PP=1450;ReadPosRankSum=1.596;SC=ACGAGCCAGGCGTCTCGTACA;SOR=0.776;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=232;TCF=121;TCR=111;TR=101;WE=160679408;WS=160679390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,113:0.44:254
chr6	160769423	rs555754	G	A	789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=17;NR=7;PP=356;SC=CCGAGGCGCGGGCTGCGGGCG;SOR=1.214;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=24;WE=160769431;WS=160769413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr6	160769811	rs668871	C	T	4074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.95;SOR=0.870;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr6	160868701	rs2457574	G	A	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.246;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=174;ReadPosRankSum=0.458;SC=CATGGGAGAGGGCCCAGCTGT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=10;WE=160868709;WS=160868691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr6	160969629	rs1801693	A	G	1089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.814;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.568;NF=23;NR=22;PP=651;ReadPosRankSum=-0.533;SC=GCTGGGGTCCATGGTAAAACA;SOR=0.498;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=96;TCF=53;TCR=43;TR=45;WE=160969637;WS=160969619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,52:0.49:106
chr6	161006172	rs41272110	T	G	2093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.553;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=38;PP=1389;ReadPosRankSum=1.047;SC=GTGGAGAGTGTGCCTCGATAA;SOR=0.632;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=169;TCF=103;TCR=66;TR=93;WE=161006180;WS=161006162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,99:0.54:184
chr6	161007496	rs7765781	G	C	1647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=34;PP=965;ReadPosRankSum=-2.002;SC=TCAGAAGGAAGCTCTGTGCTT;SOR=0.680;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=179;TCF=99;TCR=80;TR=77;WE=161007504;WS=161007486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,85:0.44:192
chr6	161007538	rs7765803	G	C	1432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=35;PP=923;ReadPosRankSum=0.481;SC=GTTGTGAGGAGAGTTGATTCC;SOR=0.657;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=154;TCF=73;TCR=81;TR=67;WE=161007546;WS=161007528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,73:0.44:165
chr6	161010766	rs7453899	A	T	2511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.935;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=61;PP=1382;ReadPosRankSum=-0.435;SC=AGAGGAGAAAACAAACTGAGT;SOR=0.771;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=247;TCF=116;TCR=131;TR=116;WE=161010774;WS=161010756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,128:0.48:268
chr6	161097590	rs12525588	A	T	1587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.176;NF=24;NR=42;PP=1067;ReadPosRankSum=-0.799;SC=CTGCTCTGCTAGCAGCTGCAG;SOR=0.656;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=133;TCF=49;TCR=84;TR=66;WE=161097598;WS=161097580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,73:0.50:145
chr6	161132146	rs4757	C	T	1807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-0.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.098;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.232;NF=50;NR=32;PP=1108;ReadPosRankSum=-0.221;SC=ATGGAAAGAACTACAGAGGGA;SOR=0.609;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=191;TCF=118;TCR=73;TR=82;WE=161132154;WS=161132136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,91:0.43:211
chr6	161135667	rs147901890	CTTATTGCCAATT	C	112.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=1603;ReadPosRankSum=0.637;SC=ATCCTGAGTCCTTATTGCCAA;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=4;WE=161135686;WS=161135665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr6	161136058	rs4252105	T	A	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.939;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=46;ReadPosRankSum=0.674;SC=ACGCCTGATGTTTTTAATTTC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=4;WE=161136066;WS=161136048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr6	161137663	rs4252109	T	G	2048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.653;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=36;PP=1212;ReadPosRankSum=3.270;SC=CTAAAATCTTTCTTGTCCATT;SOR=0.584;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=193;TCF=117;TCR=76;TR=88;WE=161137671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,100:0.45:222
chr6	161137779	rs14224	T	C	2636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.484;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=57;PP=1492;ReadPosRankSum=-0.849;SC=GGGAACTTTGTGACATCCCCC;SOR=0.637;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=206;TCF=100;TCR=106;TR=112;WE=161137787;WS=161137769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,125:0.54:230
chr6	161139326	.	C	A	2271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.000;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.195;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=39;PP=1328;ReadPosRankSum=0.979;SC=CCCATTCAAGCAACACCTCCA;SOR=0.865;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=222;TCF=126;TCR=96;TR=102;WE=161139334;WS=161139316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,112:0.47:240
chr6	161139480	rs1130656	C	T	1110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.618;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=36;PP=824;ReadPosRankSum=0.399;SC=CAGAAAACTTCCCCTGCAAGT;SOR=1.172;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=115;TCF=43;TCR=72;TR=52;WE=161139488;WS=161139470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,55:0.43:129
chr6	161139502	rs2295368	G	A	850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.973;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=33;PP=681;ReadPosRankSum=-1.152;SC=AGTCCCCTCCGGTCTCATTCT;SOR=1.676;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=92;TCF=28;TCR=64;TR=41;WE=161139510;WS=161139492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,41:0.41:101
chr6	161139857	rs13231	A	G	1477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.662;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=31;PP=821;ReadPosRankSum=1.346;SC=CCACGGAACAATTGGCTCCCA;SOR=0.597;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=52;TCR=55;TR=61;WE=161139865;WS=161139847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,70:0.55:128
chr6	161143376	rs4252117	A	G	1500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.207;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=20;PP=1060;ReadPosRankSum=-1.310;SC=TTTTGTCATAAATTGCTTCAT;SOR=0.983;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=120;TCF=79;TCR=41;TR=65;WE=161143384;WS=161143366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,68:0.51:133
chr6	161143608	rs4252120	T	C	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=209;ReadPosRankSum=1.036;SC=GCGTATGTCTTTGATTTTTAC;SOR=0.420;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=10;WE=161143616;WS=161143598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,12:0.41:29
chr6	161152240	rs4252125	G	A	1153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.601;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=29;PP=728;ReadPosRankSum=1.264;SC=CCTGCTTCCAGATGTAGAGAC;SOR=0.758;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=138;TCF=73;TCR=65;TR=58;WE=161152248;WS=161152230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,62:0.40:154
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chr6	161153080	rs4252130	A	C	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.354;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=203;ReadPosRankSum=1.009;SC=CAGGGGGCTAAGCTAGAATAT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=13;WE=161153088;WS=161153070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
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chr6	161509003	rs9355332	T	A	1713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=30;PP=1027;SC=CTCATCTCCATCTTTGCAGCA;SOR=0.892;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=59;TCF=29;TCR=30;TR=59;WE=161509011;WS=161508993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr6	161517964	rs2177587	T	C	944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=4;PP=706;SC=TATTTGTATATGTAATATTAT;SOR=3.545;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=31;WE=161517972;WS=161517954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr6	161519350	.	CCTGCTG	C,CCTG	3826.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.23;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;NF=32,32;NR=13,13;PP=2484,115;SC=CCATGGCAGCCCTGCTGCTGC;SOR=2.526;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=66;TCF=41;TCR=25;TR=45,45;WE=161519363;WS=161519340;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.15,0.85:99
chr6	161531006	rs4709493	G	C	275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=7;PP=199;SC=GCCCGTGGGAGGTGCTCTGAA;SOR=1.802;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=10;WE=161531014;WS=161530996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	161532680	rs2280612	G	C	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=380;ReadPosRankSum=1.373;SC=TTAAAATTTTGTTGCTTTTTA;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=18;WE=161532688;WS=161532670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr6	161532855	rs35961625	CT	C	10017.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=135;PP=2974;SC=ACAACTACTTCTTTTCTTTTT;SOR=0.693;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=194;TCF=45;TCR=149;TR=171;WE=161532863;WS=161532845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,308:1.00:308
chr6	161551865	rs371221897	A	G	1728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=30;PP=925;ReadPosRankSum=1.340;SC=AGTCTGAGCCATCCCGTACTA;SOR=0.677;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=184;TCF=111;TCR=73;TR=76;WE=161551873;WS=161551855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,90:0.43:211
chr6	161557703	rs6455706	A	G	4724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=83;PP=2848;SC=GGAGTAGCCCAAACAGACTAC;SOR=1.088;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=150;TCF=67;TCR=83;TR=150;WE=161557711;WS=161557693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr6	161970150	rs111859679	ATGTGTG	A,ATG	1337.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=26;NF=1,1;NR=20,20;PP=507,422;SC=AAAATAATGCATGTGTGTGTG;SOR=1.981;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=21,21;WE=161970163;WS=161970140;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.67,0.33:33
chr6	161990339	rs10945756	G	A	3716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=36;PP=2216;SC=TCTCATTAGCGTCTATCTTTC;SOR=1.592;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=120;TCF=84;TCR=36;TR=120;WE=161990347;WS=161990329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr6	161990483	rs3765474	C	T	4363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=87;PP=2629;SC=AAAAACGTCACTTTCACTCTG;SOR=1.310;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=145;TCF=58;TCR=87;TR=145;WE=161990491;WS=161990473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr6	161990516	rs3765475	G	C	2561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=55;PP=1799;SC=TTCTTACACAGAGTTATGACT;SOR=1.995;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=24;TCR=55;TR=79;WE=161990524;WS=161990506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr6	162137099	rs112078090	CATCTT	C	2346.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.614;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=2.006;NF=10;NR=24;PP=1597;ReadPosRankSum=0.221;SC=GTGCTGGGCCCATCTTACCGA;SOR=0.786;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=78;TCF=19;TCR=59;TR=34;WE=162137111;WS=162137089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,64:0.43:148
chr6	162137147	rs77332950	C	T	1078.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.369;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=28;PP=663;ReadPosRankSum=0.514;SC=CTCTAAGCACCACTGTGTCTC;SOR=0.563;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=123;TCF=57;TCR=66;TR=53;WE=162137155;WS=162137137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,58:0.42:137
chr6	162622304	rs4709583	A	G	1795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=33;PP=1024;SC=AAAAAGCAGAAGAAGTGGCTA;SOR=1.196;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=25;TCR=33;TR=58;WE=162622312;WS=162622294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr6	162864317	rs2075923	A	G	78.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=0;PP=57;SC=CGGCATCCCAAGAACGGCCGC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=162864325;WS=162864307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr6	163149497	rs2276201	T	C	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.637;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=104;ReadPosRankSum=0.915;SC=TTGGCCAGCCTTAGGATGGAC;SOR=1.096;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=32;TCF=9;TCR=23;TR=9;WE=163149505;WS=163149487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,9:0.27:33
chr6	163587146	rs1124951	C	G	3847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=48;PP=2160;SC=GGCTGCAGGGCTTGGCGCGGG;SOR=1.101;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=76;TCR=48;TR=124;WE=163587154;WS=163587136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr6	163587312	rs3064931	CAAA	C	3458.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.226;NF=6;NR=42;PP=1246;ReadPosRankSum=0.248;SC=ACAACAACAACAAAAAAATGT;SOR=0.714;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=111;TCF=13;TCR=98;TR=48;WE=163587322;WS=163587295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,93:0.45:206
chr6	163600225	rs742956	C	A	2033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.484;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=46;PP=1226;ReadPosRankSum=0.726;SC=CGCTGCTCCTCACATGTGCGT;SOR=0.524;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=182;TCF=82;TCR=100;TR=89;WE=163600233;WS=163600215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,98:0.50:195
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chr6	163612152	rs6908111	C	T	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=62;ReadPosRankSum=0.084;SC=TATGTATTCACCCTTAGTCCA;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=163612160;WS=163612142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
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chr6	164962906	rs141835494	CTTCTTTCTTTCCTCT	C	189.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.65;QD=37.97;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	165108555	rs79222572	T	G	3080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-2.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.402;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=59;PP=1871;ReadPosRankSum=-0.220;SC=AATATTCCCCTGATATATGTT;SOR=0.666;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=305;TCF=180;TCR=125;TR=144;WE=165108563;WS=165108545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,161:0.48:332
chr6	165693624	rs1413100	C	T	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=302;ReadPosRankSum=2.403;SC=GAAATGAATACCATAGGTTAG;SOR=0.722;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=52;TCF=19;TCR=33;TR=22;WE=165693632;WS=165693614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,27:0.44:62
chr6	165694945	rs1333501	C	G	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=125;ReadPosRankSum=-0.898;SC=TGCTCTAGTTCTTTTATCATG;SOR=0.446;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=10;WE=165694953;WS=165694935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr6	165712927	rs56325343	G	A	1326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.315;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=22;PP=777;ReadPosRankSum=0.173;SC=GTGATCGATCGTCACCTCGTA;SOR=0.935;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=102;TCF=61;TCR=41;TR=55;WE=165712935;WS=165712917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,62:0.51:121
chr6	165713961	rs510579	A	C	771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=20;PP=477;ReadPosRankSum=-0.148;SC=TGCACGTGCAAATTTTCTGGA;SOR=0.728;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=71;TCF=30;TCR=41;TR=33;WE=165713969;WS=165713951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,38:0.45:85
chr6	165713998	rs573814	C	T	518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.621;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=232;ReadPosRankSum=0.761;SC=CAGAGTCAGCCCATTTCAGGG;SOR=0.313;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=40;TCF=15;TCR=25;TR=20;WE=165714006;WS=165713988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,24:0.50:48
chr6	165715006	rs479273	G	A	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.854;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=311;ReadPosRankSum=0.786;SC=TGCACCGAGAGCTATGCCCTG;SOR=1.539;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=40;TCF=29;TCR=11;TR=19;WE=165715014;WS=165714996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,20:0.47:43
chr6	165715460	rs9459355	G	C	2238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.773;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=51;PP=1239;ReadPosRankSum=3.161;SC=TGGGGACCAGGGCCGTGTGGA;SOR=0.562;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=183;TCF=90;TCR=93;TR=102;WE=165715468;WS=165715450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,104:0.54:192
chr6	165715673	rs9459356	A	G	1742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=44;PP=1185;ReadPosRankSum=0.164;SC=TCTGAAGCCGATTCAGAAGTT;SOR=0.652;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=164;TCF=73;TCR=91;TR=77;WE=165715681;WS=165715663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,82:0.46:178
chr6	165723166	rs575424	A	G	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.608;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=323;ReadPosRankSum=0.595;SC=ACTGCTGAGCAACCAGGCACA;SOR=1.112;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=16;WE=165723174;WS=165723156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr6	165806114	rs220794	A	C	2699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.981;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=53;PP=1361;ReadPosRankSum=-0.297;SC=CGAGAAACAGAGGTAAAGAGT;SOR=0.769;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=210;TCF=112;TCR=98;TR=112;WE=165806122;WS=165806104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,130:0.53:243
chr6	165808605	rs220792	T	C	1125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=15;PP=689;ReadPosRankSum=1.097;SC=GAGGCATATATGTAGAAGGAG;SOR=0.720;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=100;TCF=70;TCR=30;TR=51;WE=165808613;WS=165808595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,53:0.50:105
chr6	165827194	rs220749	A	G	1884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.30;ReadPosRankSum=1.161;SOR=0.657;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,94:0.51:183
chr6	165832227	rs220740	C	T	4785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=101;PP=2965;SC=CCTGGAAAAGCGCACAACGAT;SOR=1.265;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=64;TCR=101;TR=165;WE=165832235;WS=165832217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr6	165845027	rs148704004	AATATACTATATATC	A	567.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.212;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.147;NF=0;NR=8;PP=1930;ReadPosRankSum=-0.708;SC=TACTATATATAATATACTATA;SOR=0.172;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=8;WE=165845048;WS=165845017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr6	165863695	rs57550533	C	CA	5349.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.311;NF=49;NR=46;PP=2936;ReadPosRankSum=-0.035;SC=AATCTTTGCCCATTTTTTCTA;SOR=1.233;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=98;TCF=52;TCR=46;TR=95;WE=165863703;WS=165863685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,172:0.99:174
chr6	165989776	rs1410479	C	T	3807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=30;PP=2619;SC=AAACAAAGTTCTCATCAATTG;SOR=2.266;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=120;TCF=90;TCR=30;TR=120;WE=165989784;WS=165989766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr6	166075362	rs6456003	G	T	939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=4;PP=662;SC=CACCCAGCAGGCCAAGCCCCC;SOR=3.193;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=31;WE=166075370;WS=166075352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr6	166307718	rs6456029	T	C	4266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=52;PP=2441;SC=GAATATCATATGTCTGTCCTG;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=96;TCR=52;TR=148;WE=166307726;WS=166307708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
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chr6	166401512	rs697475	T	A	819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=13;PP=689;SC=TTGGGGGTGCTTGTGCTCTCA;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=15;TCR=13;TR=28;WE=166401520;WS=166401502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
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chr6	166736362	rs7088	C	T	2471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.966;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=17;PP=1252;ReadPosRankSum=1.596;SC=ATGGGATGTACGACAGGCTAT;SOR=1.603;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=75;TCF=57;TCR=18;TR=73;WE=166736370;WS=166736352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,90:0.99:91
chr6	166737980	rs4710041	G	A	7961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=150;NR=118;PP=2965;ReadPosRankSum=0.536;SC=TGCTCGTCACGTCTCAGGCAA;SOR=0.864;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=270;TCF=151;TCR=119;TR=268;WE=166737988;WS=166737970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,302:0.99:304
chr6	166739684	rs10806847	G	A	1954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=34;PP=993;SC=TAGATTATAAGTTTGAGATCC;SOR=1.257;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=27;TCR=34;TR=61;WE=166739692;WS=166739674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr6	166741921	rs9459653	T	A	744.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=24;PP=690;SC=ACTACTTTTTTAAAAAAGAAG;SOR=1.460;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=12;TCR=24;TR=36;WE=166741929;WS=166741911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr6	166743760	rs9348119	G	C	1878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=37;PP=1179;SC=GGAAAATTTAGAATATAGTCT;SOR=1.437;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=59;TCF=22;TCR=37;TR=59;WE=166743768;WS=166743750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
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chr6	166796433	rs1546854	C	A	1728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=42;PP=1198;SC=AATGACACCCCGGCCAACCCC;SOR=2.080;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=16;TCR=42;TR=58;WE=166796441;WS=166796423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr6	166826255	rs909631	G	A	3296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=30;PP=2125;SC=ACCCGCTACAGCCGCGTGGAC;SOR=1.849;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=73;TCR=30;TR=103;WE=166826263;WS=166826245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr6	166826304	rs760670	T	C	6079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=118;NR=100;PP=2965;SC=CCAGGTTGGATGACAGCACGG;SOR=0.879;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=219;TCF=119;TCR=100;TR=218;WE=166826312;WS=166826294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr6	166827436	rs2235295	T	C	3921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=79;PP=2124;SC=GGGAAGGTCATGAGAGTCGGG;SOR=1.186;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=135;TCF=56;TCR=79;TR=135;WE=166827451;WS=166827426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr6	166831694	rs10946164	C	T	1428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.306;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=25;PP=854;ReadPosRankSum=-0.842;SC=TTAAAAGCAACGCTGGGACAT;SOR=0.587;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=132;TCF=83;TCR=49;TR=66;WE=166831702;WS=166831684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,71:0.48:147
chr6	166836792	rs147557165	G	A	1960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.174;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=36;PP=1147;ReadPosRankSum=-0.170;SC=TGAGCAGCCCGTTCCCCGCGC;SOR=0.602;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=164;TCF=99;TCR=65;TR=89;WE=166836800;WS=166836782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,96:0.53:180
chr6	166862136	rs7746519	G	A	391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=2;PP=295;SC=CCTATGCTCCGTGCTCCCACA;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=166862144;WS=166862126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	166862233	rs2230730	T	C	3151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=70;NR=38;PP=1716;SC=ACTCGGTGTCTGTGGCTTTAT;SOR=1.208;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=70;TCR=38;TR=108;WE=166862241;WS=166862223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr6	166862431	rs6932660	A	G	1244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=27;PP=785;SC=GAAGAGAGGCACCGACTGTGA;SOR=1.828;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=13;TCR=27;TR=40;WE=166862439;WS=166862421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr6	166873010	rs2230729	C	T	3179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.337;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=69;PP=1923;ReadPosRankSum=-0.060;SC=CTGGTTTGAACGGTGGCTTGA;SOR=0.674;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=278;TCF=144;TCR=134;TR=140;WE=166873018;WS=166873000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,155:0.49:314
chr6	166889160	rs2235278	A	G	748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.722;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=15;PP=451;ReadPosRankSum=1.854;SC=TTCAGTACACATTCACTGAAC;SOR=0.926;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=84;TCF=47;TCR=37;TR=38;WE=166889168;WS=166889150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,41:0.46:90
chr6	166889281	rs4373344	T	A	1230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.351;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.106;NF=32;NR=27;PP=804;ReadPosRankSum=-2.489;SC=CTCAGAAGCCTAGGAGCCTGG;SOR=0.561;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=130;TCF=74;TCR=56;TR=59;WE=166889302;WS=166889271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,63:0.46:138
chr6	166889331	rs3830731	CAG	C	2265.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.642;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.152;NF=5;NR=35;PP=1632;ReadPosRankSum=1.442;SC=TTCTCACCTGCAGAGTGTAAG;SOR=0.793;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=84;TCF=11;TCR=73;TR=40;WE=166889340;WS=166889321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,61:0.44:140
chr6	166952264	rs1003857	G	A	2244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=53;PP=1484;SC=CCTTCACGACGCCTTCTTCCT;SOR=1.473;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=28;TCR=53;TR=81;WE=166952272;WS=166952254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr6	167184568	.	G	A	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.812;ClippingRankSum=0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.808;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=98;ReadPosRankSum=-0.656;SC=AGTTTCTTTCGCGTTCAGGAA;SOR=0.223;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=8;WE=167184576;WS=167184558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr6	167271632	rs9459780	C	G	2581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=54;PP=1408;ReadPosRankSum=-0.287;SC=CCTTCACCACCTTCTGGGCCC;SOR=0.674;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=247;TCF=136;TCR=111;TR=119;WE=167271640;WS=167271622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,132:0.48:274
chr6	167271711	rs943687	T	C	8760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.33;SOR=0.848;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr6	167271711	.	TGGGCT	CGGGCC,CGGGCT	1730	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000,0.5000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=53,111;NR=59,112;PP=1730,1368;QD=15.9238203113;SC=TCTTCTGTGGTGGGCTCCACA;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=223;TCF=111;TCR=112;TR=112,223;WE=167271724;WS=167271701;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.50:223
chr6	167271716	rs9347162	T	C	2622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FS=1.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.75;ReadPosRankSum=-0.062;SOR=0.829;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:121,123:0.50:244
chr6	167411287	.	A	G	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=37;MMLQ=28;MQ=57.61;NF=91;NR=22;PP=2962;QD=20;SC=TCACAGACAGAAACACAGAGA;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=133;TCF=97;TCR=36;TR=113;WE=167411309;WS=167411277;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:20,113:0.85:133
chr6	167411388	rs73024234	C	G	2535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=363;ExcessHet=3.0103;FS=27.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.000;QD=7.02;ReadPosRankSum=2.290;SOR=1.796;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:276,85:0.24:361
chr6	167411401	rs73024236	C	T	2333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=357;ExcessHet=3.0103;FS=33.651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.000;QD=6.57;ReadPosRankSum=-4.174;SOR=2.037;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:279,76:0.21:355
chr6	167413132	rs34729961	GC	G	227.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=5;PP=203;SC=CTGGGGGCGCGCCCCGGCATG;SOR=1.179;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=6;WE=167413140;WS=167413122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	167413539	rs12212247	T	C	2913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=54;PP=1862;SC=TTCTTAACTTTTTTTTAAGGC;SOR=1.201;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=43;TCR=54;TR=97;WE=167413547;WS=167413529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr6	167424293	rs1322077	T	C	2870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=23;PP=1974;SC=TAAACTAAAATATTTTAGGGT;SOR=2.101;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=70;TCR=23;TR=93;WE=167424301;WS=167424283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr6	167435747	.	AAC	A	37	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=41;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=4;NR=0;PP=37;QD=10.0;SC=GAGCTGCCCCAACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=4;WE=167435756;WS=167435745;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:2,4:0.67:6
chr6	167435798	rs141889698	C	CACAA	949.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=2;PP=1199;SC=GTTGCACACACACAGGTTTGA;SOR=3.912;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=22;WE=167435806;WS=167435788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr6	167436159	rs3752520	T	C	2209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=26;NR=45;PP=1374;SC=AGACTAGGGGTTTAAAAATAA;SOR=1.497;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=26;TCR=45;TR=71;WE=167436167;WS=167436149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr6	167440128	rs2282861	C	T	4199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=79;NR=65;PP=2427;SC=AGTTTTTGTGCTGATCGTTTT;SOR=0.744;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=80;TCR=65;TR=144;WE=167440136;WS=167440118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr6	167440244	rs2282860	T	C	1976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=43;PP=1189;SC=ATGGCTTTTATGTGTTCAGGA;SOR=1.349;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=27;TCR=43;TR=70;WE=167440252;WS=167440234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr6	167447489	.	CT	C	48.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.588;ClippingRankSum=0.000;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=2.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.65;ReadPosRankSum=2.749;SOR=1.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,12:0.16:75
chr6	167453519	rs368396376	A	AT	1247.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.45;MQRankSum=1.053;QD=14.18;ReadPosRankSum=-1.163;SOR=0.575;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,66:0.75:88
chr6	167550042	rs2071171	C	T	4339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=68;PP=2612;SC=GTCATGCCACCGGTGCGTGGG;SOR=0.773;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=137;TCF=69;TCR=68;TR=137;WE=167550050;WS=167550032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr6	167571048	rs6902566	T	C	2503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=51;NR=34;PP=1251;SC=CAGCAGGAAGTGCAGGGCCCA;SOR=0.778;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=51;TCR=34;TR=85;WE=167571056;WS=167571038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr6	167590454	rs71571482	G	A	2979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.04;QD=28.38;SOR=2.465;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr6	167590541	rs3737098	G	A	2958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=0.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.857;HP=4;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-1.460;NF=92;NR=97;PP=2177;ReadPosRankSum=-0.668;SC=AAGAGACAACGCCCAAATACG;SOR=0.757;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=370;TCF=179;TCR=191;TR=189;WE=167590549;WS=167590531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,159:0.51:311
chr6	167590574	rs2989541	G	C	5741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.65;QD=27.21;SOR=1.296;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr6	167591954	rs200583385	G	A	1437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=3.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.57;MQRankSum=-7.522;QD=9.04;ReadPosRankSum=-0.955;SOR=1.048;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,71:0.45:159
chr6	167592464	rs60509455	A	G	709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.61;QD=33.80;SOR=6.184;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr6	167592524	rs2989545	T	C	1980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=24;PP=1375;SC=TCCCGAAGTCTGCAAAACTCC;SOR=1.852;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=53;TCR=24;TR=77;WE=167592532;WS=167592514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr6	167592576	rs60976240	G	A	2856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=4.602;NF=53;NR=55;PP=1749;ReadPosRankSum=1.970;SC=AGGCCGCCACGCTGCAGGAGC;SOR=0.786;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=114;TCF=57;TCR=57;TR=108;WE=167592584;WS=167592566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,111:0.97:115
chr6	167592656	rs4710193	G	C	2238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=50;PP=1256;SC=CTGTAAAGTGGGGGGCTTTCT;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=28;TCR=50;TR=78;WE=167592664;WS=167592646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr6	167622070	rs671511	C	T	890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=10;PP=665;SC=TCTAAGAAAACTCTCTGGCTG;SOR=1.473;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=23;TCR=10;TR=33;WE=167622078;WS=167622060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr6	167622205	rs28588506	G	A	2356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.55;QD=28.06;SOR=1.013;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr6	167704944	rs2076005	T	G	927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=12;PP=523;ReadPosRankSum=-0.250;SC=CAAATTTACGTGTTCACTGGT;SOR=0.746;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=89;TCF=57;TCR=32;TR=39;WE=167704952;WS=167704934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,45:0.44:103
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chr6	167719436	rs2072767	G	A	2306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.678;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=44;PP=1335;ReadPosRankSum=-0.420;SC=CATCCAGTTCGTCGGCTACGT;SOR=0.815;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=186;TCF=103;TCR=83;TR=100;WE=167719444;WS=167719426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,112:0.54:209
chr6	167728640	rs56251147	A	G	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.309;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.601;NF=13;NR=6;PP=232;ReadPosRankSum=-2.318;SC=TGTGGGGCCCATGGCAGAGCT;SOR=0.402;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=38;TCF=27;TCR=11;TR=19;WE=167728648;WS=167728630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,16:0.41:39
chr6	167728774	rs663606	T	C	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=31.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.95;MQRankSum=-7.811;QD=1.60;ReadPosRankSum=-1.023;SOR=4.987;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,14:0.15:95
chr6	167752312	.	G	GTTCCTTCC	317.76	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=232;SC=AAGCCAGGTAGTTCCTTCCTT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=4;WE=167752320;WS=167752302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	167771426	rs4616972	G	A	159.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=52.25;QD=22.83;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	167772755	rs61091709	C	T	6898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=148;NR=76;PP=2965;SC=GGGGATGTTTCGAATTCGCAT;SOR=1.571;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=225;TCF=148;TCR=77;TR=224;WE=167772763;WS=167772745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr6	167786551	rs146852129	T	G	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.139;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.085;NF=12;NR=4;PP=270;ReadPosRankSum=0.539;SC=TAGTTTTGGGTTTTTTTTTAA;SOR=0.269;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=38;TCF=30;TCR=8;TR=16;WE=167786559;WS=167786541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr6	167786961	rs151165498	G	T	1041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=6.408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.07;MQRankSum=-1.955;QD=17.96;ReadPosRankSum=0.307;SOR=0.081;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,28:0.48:58
chr6	167786961	.	GGC	TGT	1212	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=24;MQ=53.19;NF=1;NR=24;PP=1212;QD=50.6187149945;SC=TAAGTCAGTGGGCGCGGCTGA;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=53;TCF=1;TCR=52;TR=25;WE=167786971;WS=167786951;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:28,25:0.47:53
chr6	167786963	rs201342351	C	T	1041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=6.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.93;MQRankSum=-1.987;QD=18.60;ReadPosRankSum=0.341;SOR=0.080;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,27:0.48:56
chr6	167789404	rs28409124	C	G	3219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=40;PP=1801;SC=AGAAAGCCCCCCACTTTACAG;SOR=1.125;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=112;TCF=72;TCR=40;TR=112;WE=167789412;WS=167789394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr6	167789493	rs3010590	T	C	3765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=72;PP=2235;SC=TGCAGCGTGGTGGCCTGGGAA;SOR=0.976;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=138;TCF=66;TCR=72;TR=138;WE=167789501;WS=167789483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr6	167789590	rs3010591	C	T	2046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.22;MQRankSum=-1.532;QD=25.58;ReadPosRankSum=2.469;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,78:0.98:80
chr6	167789622	rs60376002	G	A	450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=7.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.36;MQRankSum=-1.124;QD=10.99;ReadPosRankSum=0.646;SOR=1.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,21:0.51:41
chr6	167791524	rs17855200	C	T	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.69;MQRankSum=0.815;QD=9.57;ReadPosRankSum=-0.655;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,15:0.45:33
chr6	167791530	rs17855837	G	C	651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.28;QD=40.74;SOR=2.049;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	167791549	rs3010594	T	G	125.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=35.47;QD=25.18;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	167796182	rs62428311	C	G	141.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=0;PP=67;SC=ATCAGCGTCCCAGGGTGGCGC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=167796190;WS=167796172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	167796309	rs17855834	C	T	1202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.89;QD=44.55;SOR=1.101;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr6	167796319	rs17855833	T	C	1170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.86;QD=41.81;SOR=0.997;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr6	167796415	rs9457321	A	C	1417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=33;NR=25;PP=1017;SC=TCCTTGGGCTACCCGGCCTCG;SOR=0.813;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=33;TCR=25;TR=58;WE=167796423;WS=167796405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr6	167907609	.	T	TAC	183.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=0;PP=181;SC=CAAATACACCTACACACATGC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=167907617;WS=167907599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr6	167907677	.	T	TAC,TACAC	1850.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=1.573;ClippingRankSum=0.000;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=2.417;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.619;NF=22,22;NR=10,10;PP=626,531;ReadPosRankSum=-1.123;SC=CACTGATACATACACACACAC;SOR=1.958;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=37;TCF=23;TCR=14;TR=32,32;WE=167907685;WS=167907667;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.39,0.54:54
chr6	167907881	rs140818578	C	T	1966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=49;PP=1135;ReadPosRankSum=-1.451;SC=GAAGGCGAGGCGGAGTCCAGA;SOR=0.689;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=204;TCF=90;TCR=114;TR=87;WE=167907889;WS=167907871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,96:0.43:221
chr6	168060277	.	TAC	T	972.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.435;ClippingRankSum=0.000;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.448;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=24;PP=970;ReadPosRankSum=1.660;SC=CATACACACATACACACACAC;SOR=1.143;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=59;TCF=1;TCR=58;TR=25;WE=168060288;WS=168060267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,35:0.55:64
chr6	168226523	rs611440	C	T	7325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=143;NR=105;PP=2965;SC=CAGGGCCCTTCGGAGAGGGCG;SOR=0.977;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=248;TCF=143;TCR=105;TR=248;WE=168226531;WS=168226513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr6	168265102	rs2301530	A	G	775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=24;PP=515;ReadPosRankSum=0.484;SC=ATCTCTCTACATTAGTCTCAG;SOR=0.749;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=92;TCF=38;TCR=54;TR=38;WE=168265110;WS=168265092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,40:0.38:104
chr6	168297757	rs11459878	C	CT	1324.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.753;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=26;PP=887;ReadPosRankSum=-0.620;SC=TAATTACCGACTTGTATTTAA;SOR=0.809;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=67;TCF=3;TCR=64;TR=26;WE=168297765;WS=168297747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,48:0.44:109
chr6	168315978	rs3213590	G	C	1327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.057;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=31;PP=991;ReadPosRankSum=0.865;SC=ATAGATTGGTGACCGACCCAG;SOR=0.476;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=129;TCF=61;TCR=68;TR=61;WE=168315986;WS=168315968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,62:0.45:138
chr6	168316118	rs3213591	T	G	887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.899;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=19;PP=513;ReadPosRankSum=3.294;SC=GTGCAGGTGATTGCTGGTGCC;SOR=0.758;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=72;TCF=41;TCR=31;TR=37;WE=168316126;WS=168316108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,42:0.50:84
chr6	168317816	rs6906754	A	C	1793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.652;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=23;PP=1067;ReadPosRankSum=-0.140;SC=ATGACATTCCAAATATAAACA;SOR=0.611;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=125;TCF=87;TCR=38;TR=70;WE=168317824;WS=168317806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,82:0.57:143
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chr6	168325803	rs2301534	C	T	741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.832;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=23;PP=523;ReadPosRankSum=0.550;SC=GAGTTGTTCTCTCCAGTCTTT;SOR=0.586;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=82;TCF=29;TCR=53;TR=35;WE=168325811;WS=168325793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,37:0.40:92
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chr6	168348424	rs669861	A	G	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=2.265;NF=9;NR=1;PP=149;ReadPosRankSum=1.777;SC=TCTGTGCTGGATACTCACTAG;SOR=0.368;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=10;WE=168348432;WS=168348414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr6	168348504	rs35550837	CT	C	2287.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.545;HP=10;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=2.328;NF=26;NR=35;PP=726;ReadPosRankSum=-0.093;SC=TAATATTACACTTTTTTTTTT;SOR=0.640;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=116;TCF=45;TCR=71;TR=61;WE=168348512;WS=168348494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,111:0.57:194
chr6	168349206	rs12665666	C	A	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.206;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=153;ReadPosRankSum=1.137;SC=TCAAGGAGGACACACTGAGTT;SOR=0.818;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=9;WE=168349214;WS=168349196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr6	168376847	rs77867907	C	G	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=12.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.95;ReadPosRankSum=-2.879;SOR=2.228;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,6:0.22:27
chr6	168376880	.	T	TG	841	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=36;MMLQ=27;MQ=54.95;NF=7;NR=5;PP=841;QD=73.0;SC=CCCTGCAGTGTTGGGGGAGGA;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=41;TCF=17;TCR=24;TR=12;WE=168376900;WS=168376856;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:29,12:0.29:41
chr6	168376882	.	G	GT	899	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;FR=0.5000;HP=4;HapScore=1;MGOF=36;MMLQ=27;MQ=55.09;NF=7;NR=5;PP=899;QD=77.5;SC=CTGCAGTGTTGGGGGAGGAGA;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=43;TCF=19;TCR=24;TR=12;WE=168376900;WS=168376856;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:31,12:0.28:43
chr6	168376953	rs2516607	A	C	771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.950;HP=4;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-1.023;NF=22;NR=19;PP=660;ReadPosRankSum=-0.337;SC=GGGGGTCATTACCCCTGCAGT;SOR=0.885;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=69;TCF=36;TCR=33;TR=41;WE=168376961;WS=168376941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,39:0.59:66
chr6	168377012	.	G	T	285	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.48;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=24;MMLQ=27;MQ=42.52;NF=10;NR=14;PP=285;QD=13.3238005228;SC=CAGTGTGTGGGGAGGAGAAGA;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=53;TCF=24;TCR=29;TR=24;WE=168377020;WS=168377000;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:29,24:0.45:53
chr6	168430555	rs60520213	TA	T	194.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.812;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=134;ReadPosRankSum=-0.872;SC=GAACACCTCATAAGGGTCCCC;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=5;WE=168430563;WS=168430545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr6	168457801	rs3734898	A	G	1142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.574;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=23;PP=710;ReadPosRankSum=-0.164;SC=CCTGTGGTGGAGCCTCTCCGA;SOR=0.546;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=94;TCF=53;TCR=41;TR=49;WE=168457809;WS=168457791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,54:0.53:102
chr6	168459845	rs1548349	G	C	1142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.376;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=22;PP=573;ReadPosRankSum=0.357;SC=GTCCTGACCTGGGTGCAGGGC;SOR=0.823;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=120;TCF=68;TCR=52;TR=55;WE=168459853;WS=168459835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,59:0.45:131
chr6	168462626	rs12197610	G	A	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=2.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.47;ReadPosRankSum=-3.072;SOR=0.674;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,30:0.51:59
chr6	168467737	rs3816861	G	A	3341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=350;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.812;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=86;PP=2249;ReadPosRankSum=0.257;SC=GGCGGGCTTCGGGCGGGCACA;SOR=0.628;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=322;TCF=146;TCR=176;TR=155;WE=168467745;WS=168467727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,165:0.47:350
chr6	168468186	rs6906979	G	T	2431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.315;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=50;PP=1386;ReadPosRankSum=-1.192;SC=GTGTCACCGTGTGTTCAAAAC;SOR=0.490;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=174;TCF=83;TCR=91;TR=101;WE=168468194;WS=168468176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,113:0.58:194
chr6	168475764	rs9364396	G	T	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=320;ReadPosRankSum=0.612;SC=GTACATGTGAGTGGTGTGTAA;SOR=0.608;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=60;TCF=44;TCR=16;TR=23;WE=168475772;WS=168475754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,26:0.39:67
chr6	168475822	rs3816859	A	G	1733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.932;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=26;PP=1044;ReadPosRankSum=-0.052;SC=AGAGTGGTGTATAACTGTGTA;SOR=0.539;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=163;TCF=110;TCR=53;TR=73;WE=168475842;WS=168475812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,81:0.45:180
chr6	168476198	rs2306943	A	G	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.101;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.315;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=2;PP=123;ReadPosRankSum=0.990;SC=CCATCAGAGCACCTGTGAGTG;SOR=2.303;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=10;WE=168476206;WS=168476188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr6	168479604	rs34054991	G	A	2109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.581;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=26;PP=1266;ReadPosRankSum=1.863;SC=GCAGCAGCACGAGGACATCCC;SOR=0.792;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=171;TCF=117;TCR=54;TR=87;WE=168479612;WS=168479594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,98:0.53:184
chr6	168479790	rs11750985	C	T	2325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-3.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.620;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=60;PP=1416;ReadPosRankSum=-1.516;SC=CGTTACTCGGCCCTCCCCCGC;SOR=0.617;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=153;TCF=54;TCR=99;TR=95;WE=168479798;WS=168479780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,103:0.62:165
chr6	168482110	rs4708429	C	T	1292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=31;PP=723;ReadPosRankSum=-0.347;SC=GGGCAGTGGACGGGCAGAGGC;SOR=0.726;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=124;TCF=59;TCR=65;TR=60;WE=168482118;WS=168482100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,65:0.50:131
chr6	168482329	rs4708430	C	T	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=67;ReadPosRankSum=-1.569;SC=AATGCTGTTCCGTGGTGAGAA;SOR=0.473;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=7;WE=168482337;WS=168482319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr6	168694594	rs7764061	C	T	4929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=73;PP=2904;SC=CTTGAAATTCCTGATGATTTT;SOR=0.807;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=165;TCF=92;TCR=73;TR=165;WE=168694602;WS=168694584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr6	168694788	rs56060091	C	G	3232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=37;PP=2266;SC=CCGAAGCACACAGACAGTGAG;SOR=1.407;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=68;TCR=37;TR=105;WE=168694796;WS=168694778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
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chr6	168708751	rs10945499	A	G	869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.834;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=16;PP=423;ReadPosRankSum=-0.030;SC=GGGTGGACTCAGAACAGGAGC;SOR=0.666;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=77;TCF=44;TCR=33;TR=33;WE=168708759;WS=168708741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,43:0.45:95
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chr6	168708816	rs10945501	T	G	1576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=21;PP=961;ReadPosRankSum=-0.445;SC=CCCCTCCCTGTGGGCCAGTGG;SOR=0.656;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=124;TCF=82;TCR=42;TR=62;WE=168708824;WS=168708806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,70:0.50:139
chr6	168709385	rs6925614	T	C	4185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=415;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.447;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=91;PP=2755;ReadPosRankSum=-0.109;SC=CTGTTCTCCCTCGCTACCCTT;SOR=0.536;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=384;TCF=206;TCR=178;TR=187;WE=168709393;WS=168709375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:214,201:0.48:415
chr6	168719924	rs4292501	C	T	411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=10;NR=4;PP=254;SC=CCTTGGAGACCGAACTGCATT;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=14;WE=168719932;WS=168719914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	168720359	rs9364433	G	A	172.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=4;PP=83;SC=AGCGGCGCCGGAGGCCCAGCG;SOR=1.609;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=168720367;WS=168720349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	168928225	rs2224209	G	A	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.88;ReadPosRankSum=0.497;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr6	168928251	rs2609287	C	T	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.619;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=69;ReadPosRankSum=-0.836;SC=GCCTCGCAGCCGTGAGGCGCT;SOR=1.302;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=24;TCF=16;TCR=8;TR=8;WE=168928259;WS=168928241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
chr6	168928519	rs2609286	C	T	793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=20;PP=503;ReadPosRankSum=-0.635;SC=CCAGTTTGGCCGGCATTGTGA;SOR=0.640;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=65;TCF=29;TCR=36;TR=36;WE=168928527;WS=168928509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,38:0.54:70
chr6	169008945	rs3734421	C	T	1731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.689;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=37;PP=938;ReadPosRankSum=2.130;SC=GAGTGTGGCCCGAATCCACAG;SOR=0.585;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=112;TCF=50;TCR=62;TR=69;WE=169008953;WS=169008935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,79:0.62:128
chr6	169064933	rs2275919	T	C	6088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=110;NR=107;PP=2965;SC=GCAAGCTTACTGACTACACCC;SOR=0.763;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=217;TCF=110;TCR=107;TR=217;WE=169064941;WS=169064923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr6	169617840	rs12435	A	G	2081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.39;SOR=0.961;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr6	169617934	rs58423957	GA	G	1711.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=31;PP=741;SC=TCTACAAAAAGAAAAAAAAAA;SOR=0.949;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=44;TCF=8;TCR=36;TR=38;WE=169617943;WS=169617924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr6	169619687	rs9800623	G	A	337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=0;PP=279;SC=GGATCCACCCGCCTTGGCCTC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=169619695;WS=169619677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	169619933	rs113367461	T	TTTCCTTCC	4949.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=63.07;QD=45.00;SOR=0.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr6	169620247	rs9393165	T	C	1476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=10;PP=713;SC=TTTCCCTTTCTGGGTGCCACA;SOR=1.893;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=32;TCR=10;TR=42;WE=169620255;WS=169620237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr6	169620450	rs140725844	AAAG	A	3838.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=43;PP=2134;SC=TGGTGTTTAAAAAGAAGAAGA;SOR=1.429;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=2;TCR=46;TR=45;WE=169620460;WS=169620440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr6	169620541	rs36045897	G	A	519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=14;PP=348;SC=TGGATACTCCGCCCAGGGCTT;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=169620549;WS=169620531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr6	169621536	rs1132742	A	G	4764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=72;PP=2803;SC=TGATGTAGCCAGTCTTGGGCC;SOR=0.716;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=155;TCF=83;TCR=72;TR=155;WE=169621544;WS=169621526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr6	169622490	rs9505895	G	A	10531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=393;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=183;NR=177;PP=2965;SC=AGACGAAGCCGGCATAGTCGT;SOR=0.698;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=361;TCF=183;TCR=178;TR=360;WE=169622498;WS=169622480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,393:1.00:393
chr6	169622638	rs59244158	C	A	2730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=66;PP=1891;SC=GCCTGTAATCCCAGCACTTTG;SOR=2.429;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=21;TCR=66;TR=87;WE=169622646;WS=169622628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr6	169629783	rs6422747	G	A	1701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.540;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=37;PP=1055;ReadPosRankSum=1.530;SC=TCCTGCAATTGGAGAAGGAAG;SOR=0.637;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=166;TCF=89;TCR=77;TR=78;WE=169629791;WS=169629773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,84:0.45:185
chr6	169629861	rs9505891	G	C	1104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.724;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=26;PP=666;ReadPosRankSum=-0.256;SC=CCAGCATGGCGCCGAGGAAGG;SOR=0.495;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=86;TCF=35;TCR=51;TR=45;WE=169629869;WS=169629851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,51:0.52:98
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chr6	169632915	rs13196021	C	T	1208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=34;PP=752;ReadPosRankSum=0.645;SC=GGGCACACTGCGGGGACAAGC;SOR=0.733;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=173;TCF=86;TCR=87;TR=64;WE=169632923;WS=169632905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,70:0.37:189
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chr6	169641971	rs61730651	C	T	2212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.513;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=47;PP=1410;ReadPosRankSum=-0.976;SC=GCCTCCTCTCCGAGCTGGGGC;SOR=0.753;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=186;TCF=96;TCR=90;TR=96;WE=169641979;WS=169641961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,101:0.50:203
chr6	169646199	rs73046008	A	C	2050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.095;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-1.339;NF=59;NR=35;PP=1426;ReadPosRankSum=0.329;SC=TACAAGCATGAATGCACACAC;SOR=0.613;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=189;TCF=118;TCR=71;TR=94;WE=169646220;WS=169646189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,100:0.47:211
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chr6	169648767	rs12178180	G	A	2635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.457;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=51;PP=1498;ReadPosRankSum=-0.014;SC=CCGCGGGGCCGTTGGAGACGA;SOR=0.636;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=229;TCF=115;TCR=114;TR=108;WE=169648775;WS=169648757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,124:0.49:254
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chr6	170058374	rs3800544	C	T	2683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.902;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=68;PP=1641;ReadPosRankSum=-0.248;SC=GTACTGACCACGTCGCTGTTC;SOR=0.754;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=265;TCF=124;TCR=141;TR=125;WE=170058382;WS=170058364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,133:0.47:286
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chr6	170061157	rs78941587	G	C	917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.663;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=15;PP=559;ReadPosRankSum=1.347;SC=CGCAGGAGTGGAGAGCGTGGG;SOR=0.527;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=94;TCF=59;TCR=35;TR=41;WE=170061165;WS=170061147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,43:0.45:96
chr6	170065759	rs3839651	T	TA	1242.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.808;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.584;NF=1;NR=28;PP=1102;ReadPosRankSum=0.525;SC=TTACTTACAGTATTTCTGTTA;SOR=0.806;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=63;TCF=3;TCR=60;TR=29;WE=170065767;WS=170065749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,44:0.44:100
chr6	170067022	rs3800546	C	G	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=99;ReadPosRankSum=1.981;SC=CTCCAAGCATCCATTTAATTT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=5;WE=170067030;WS=170067015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr6	170068058	rs4509126	A	G	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.305;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=105;ReadPosRankSum=1.517;SC=CGGGAACGCCATCCAGCGTCC;SOR=0.495;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=8;WE=170068066;WS=170068048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr6	170068086	rs41265385	C	T	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.262;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=201;ReadPosRankSum=0.970;SC=ACCTTAAAGCCTCTGTCCTCA;SOR=0.223;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=12;WE=170068094;WS=170068076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr6	170068180	rs3823465	A	G	1613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=24;PP=911;ReadPosRankSum=-0.656;SC=GCTCGGCCCGAACAGCCTGAG;SOR=0.648;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=127;TCF=77;TCR=50;TR=62;WE=170068188;WS=170068170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,76:0.52:147
chr6	170068420	rs79843499	A	G	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.348;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5006;FS=6.990;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=167;ReadPosRankSum=-0.431;SC=AAAAGCCGACACTGACTGGAG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=8;WE=170068428;WS=170068410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr6	170070723	rs4236176	A	G	2898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.825;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=64;PP=1739;ReadPosRankSum=-1.599;SC=ATGATCATCCAGGCTCAACTG;SOR=0.704;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=300;TCF=156;TCR=144;TR=130;WE=170070731;WS=170070713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:191,149:0.44:340
chr6	170102180	rs74900588	A	C	1084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.658;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=21;PP=531;ReadPosRankSum=-0.148;SC=CGACAGCTGGAGAAGCCTCGC;SOR=0.766;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=116;TCF=68;TCR=48;TR=52;WE=170102188;WS=170102170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,58:0.46:127
chr6	170102267	rs4716383	A	G	1296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=0.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.07;ReadPosRankSum=0.998;SOR=0.730;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,66:0.46:143
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chr6	170151766	rs3749882	C	T	1133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.165;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=33;PP=788;ReadPosRankSum=0.823;SC=GGAGGTAGGGCGGGTGTAGGG;SOR=1.439;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=83;TCF=30;TCR=53;TR=46;WE=170151774;WS=170151756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,49:0.52:94
chr6	170155331	rs6459658	A	T	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.447;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=292;ReadPosRankSum=1.627;SC=ATTTTATATCATGTGATATGG;SOR=1.730;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=15;WE=170155339;WS=170155321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr6	170159023	rs6459660	G	A	1798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=21;PP=1066;ReadPosRankSum=-0.690;SC=GGTTTATTCAGTAATTCAGTA;SOR=0.743;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=135;TCF=97;TCR=38;TR=72;WE=170159031;WS=170159013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,77:0.53:145
chr6	170162537	rs11966349	C	T	3036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.824;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=62;PP=1821;ReadPosRankSum=1.539;SC=TTGCTGACTGCGCCATATTGT;SOR=0.628;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=296;TCF=166;TCR=130;TR=139;WE=170162545;WS=170162527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,155:0.46:340
chr6	170176146	rs41265401	G	A	3027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.840;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=75;PP=1814;ReadPosRankSum=0.273;SC=GACTTGGATCGTCTTCCTACT;SOR=0.745;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=298;TCF=139;TCR=159;TR=141;WE=170176154;WS=170176136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,151:0.46:327
chr6	170176407	rs4716398	G	A	2638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=51;PP=1424;ReadPosRankSum=0.584;SC=AACACTTGCCGCGTGTCACGG;SOR=0.683;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=218;TCF=120;TCR=98;TR=115;WE=170176415;WS=170176397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,129:0.53:242
chr6	170176467	rs4716345	A	G	2384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.490;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=47;PP=1382;ReadPosRankSum=-0.031;SC=GGCTCCCAGAAAGCCGCAGCC;SOR=0.748;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=199;TCF=103;TCR=96;TR=99;WE=170176475;WS=170176457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,111:0.50:221
chr6	170176647	rs4716399	CA	TG	2995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.129;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=31;PP=1832;ReadPosRankSum=-0.558;SC=TCCGAAGCATCAGCGAACAGT;SOR=0.752;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=170;TCF=87;TCR=83;TR=62;WE=170176656;WS=170176637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,81:0.43:190
chr6	170176787	rs79997179	T	C	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=95;ReadPosRankSum=0.471;SC=CTCACTTTCCTGTTTTGGAGG;SOR=0.646;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=10;WE=170176795;WS=170176777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr6	170179507	rs3828738	C	T	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=95;ReadPosRankSum=-0.106;SC=GTGGCCCCACCGCCATCTCAG;SOR=0.223;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=8;WE=170179515;WS=170179497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr6	170190200	rs3807067	G	A	1652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.694;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=24;PP=958;ReadPosRankSum=-1.295;SC=GGCAGCAGAAGTGCAGCTGAC;SOR=0.990;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=146;TCF=91;TCR=55;TR=68;WE=170190208;WS=170190190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,79:0.48:165
chr6	170190418	rs3823467	T	G	1920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.206;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=36;PP=1202;ReadPosRankSum=-2.189;SC=TGGCGCTCCCTGGTAAAGCAG;SOR=0.719;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=151;TCF=77;TCR=74;TR=74;WE=170190426;WS=170190408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,87:0.52:167
chr6	170591923	rs1033583	T	G	1792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=41;NR=23;PP=1028;SC=ATTTTACTTATTTTAAGAGAA;SOR=1.054;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=41;TCR=23;TR=64;WE=170591931;WS=170591913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr6	170594819	rs2255020	T	C	4969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=87;PP=2965;SC=CAGATGGACGTTGACTGTTGC;SOR=1.098;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=157;TCF=70;TCR=87;TR=157;WE=170594827;WS=170594809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr6	170595430	rs2747757	G	C	2348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=53;PP=1683;SC=CGCCAAGTACGTCCCAACAGG;SOR=2.494;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=17;TCR=53;TR=70;WE=170595438;WS=170595420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr6	170597276	rs2738822	C	T	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=9;PP=321;ReadPosRankSum=0.123;SC=TCCCTGCGCGCGGTCCGTGTT;SOR=0.659;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=65;TCF=45;TCR=20;TR=27;WE=170597284;WS=170597266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,28:0.41:69
chr6	170598136	.	TAG	T	93	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=4;NR=0;PP=93;QD=25.75;SC=TTTTTTTAATTAGAGAGAGAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=4;WE=170598145;WS=170598131;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:12,4:0.25:16
chr6	170598204	rs2295204	G	A	776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=11;PP=478;ReadPosRankSum=-0.126;SC=ATTTTTCTTGGGGGATGGGCA;SOR=0.607;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=54;TCR=23;TR=36;WE=170598212;WS=170598194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,40:0.45:88
chr6	170598227	rs2747756	T	G	4409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=78;NR=44;PP=2141;SC=CTCCGGGTGGTAGCGGTCGCG;SOR=1.092;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=123;TCF=79;TCR=44;TR=122;WE=170598235;WS=170598217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr6	170598352	rs2738821	C	T	1518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.356;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.000;NF=26;NR=37;PP=952;ReadPosRankSum=-1.020;SC=CGGAAATCTCCCGGGCGCGCT;SOR=0.868;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=126;TCF=57;TCR=69;TR=63;WE=170598360;WS=170598342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,71:0.51:140
chr6	170598368	rs67433119	TCTC	T	1500.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.719;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.200;NF=3;NR=24;PP=1071;ReadPosRankSum=-0.150;SC=GCGCTCGGCCTCTCCTCCTCG;SOR=0.970;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=65;TCF=6;TCR=59;TR=27;WE=170598378;WS=170598358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,41:0.42:98
chr6	170626943	rs3800266	T	C	2695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.586;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=56;PP=1680;ReadPosRankSum=-0.166;SC=CTTTGTGTTCTTTGCAGGAAG;SOR=0.581;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=214;TCF=103;TCR=111;TR=109;WE=170626951;WS=170626933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,124:0.53:234
chr6	170627586	rs6917485	G	T	7219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-3.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=412;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.518;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=89;PP=2387;ReadPosRankSum=-0.390;SC=CGTGTATACAGATTCTGAACC;SOR=0.762;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=369;TCF=195;TCR=174;TR=190;WE=170627594;WS=170627576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:204,207:0.50:411
chr6	170627614	rs6905356	T	C	7584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=434;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.090;HP=1;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=99;PP=2453;ReadPosRankSum=1.248;SC=GAAGTTCCCATGTGTTCAGAC;SOR=0.629;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=395;TCF=205;TCR=190;TR=202;WE=170627622;WS=170627604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:212,221:0.51:433
chr6	170627695	.	A	ACCCTGAACCCAGGCAAGAAGTTCCCATGTGTACAGG	3754.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.235;ClippingRankSum=0.000;DP=431;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQRankSum=-4.896;QD=15.91;ReadPosRankSum=3.593;SOR=0.704;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:151,85:0.36:236
chr6	170627761	rs6900199	A	G	4878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=354;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.820;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-4.455;NF=93;NR=87;PP=2487;ReadPosRankSum=1.426;SC=GTTCCCATGTATACAGACTCT;SOR=0.686;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=374;TCF=191;TCR=183;TR=180;WE=170627769;WS=170627751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:214,140:0.40:354
chr6	170627797	rs9366138	A	G	5383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=376;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-1.955;NF=73;NR=81;ReadPosRankSum=-1.736;SC=GTTCCCATGTATACAGACTCT;SOR=0.697;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=327;TCF=161;TCR=166;TR=154;WE=170627805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:194,178:0.48:372
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chr6	170862300	rs12717	G	C	1703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.930;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=38;PP=1076;ReadPosRankSum=0.018;SC=TCTCTGCCAGGAGCCGAATAC;SOR=0.864;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=141;TCF=69;TCR=72;TR=72;WE=170862308;WS=170862290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,80:0.48:166
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chr6	170871037	rs71815788	GCAA	G	305.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.22;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
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chr6	170886531	rs8770	T	C	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.665;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=99;ReadPosRankSum=-1.807;SC=GTAAGCAATCTGTCAACATCT;SOR=0.293;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=6;WE=170886539;WS=170886521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr6	170887693	rs3173219	G	C	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.974;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=293;ReadPosRankSum=-0.618;SC=GTGGAGAGCAGTGTAGATATC;SOR=0.930;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=72;TCF=52;TCR=20;TR=24;WE=170887701;WS=170887683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,30:0.39:77
chr6	170888208	rs960744	A	G	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=111;ReadPosRankSum=-1.383;SC=ACCTGGCTGTACCAGTGTGCC;SOR=1.863;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=7;WE=170888216;WS=170888198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr6	170892100	rs9295417	T	C	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.623;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=129;ReadPosRankSum=-2.741;SC=TTCTTCCAAGTATTATGTTTA;SOR=1.828;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=7;WE=170892108;WS=170892090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr6	170892483	rs17860837	A	AT	381.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=2.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.248;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=1.964;NF=10;NR=6;PP=444;ReadPosRankSum=1.165;SC=GGCATGAAAAATTTTAAAGTA;SOR=0.892;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=52;TCF=31;TCR=21;TR=16;WE=170892491;WS=170892473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,18:0.35:51
chr6	170892848	rs4140615	A	G	862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=25;PP=523;ReadPosRankSum=0.820;SC=AAAAAAGAATACAGAGAAAAG;SOR=0.614;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=76;TCF=27;TCR=49;TR=40;WE=170892856;WS=170892838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,45:0.52:87
chr6	170892919	rs113114915	T	TACTC	196.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=298;ReadPosRankSum=1.260;SC=AAACTGAAAATAACAACAACA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=6;WE=170892927;WS=170892909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr6	170893364	rs4140616	C	T	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.192;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=8;PP=243;ReadPosRankSum=0.922;SC=ATGGCCCCGTCCCGACCCCGT;SOR=0.264;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=22;TCF=13;TCR=9;TR=18;WE=170893372;WS=170893354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,19:0.83:23
chr7	286468	.	G	GGACAGGTGAGCCCTTCCTTCCTCCCTCCATCCGC	2125.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.29;SOR=2.786;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr7	286534	rs146778412	A	G	635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.63;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=21;PP=611;SC=CCGGTGAGTGAGGCCGTCCTG;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=286542;WS=286524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr7	295683	rs36173688	T	TG	307.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.273;NF=12;NR=1;PP=391;ReadPosRankSum=0.369;SC=CTGGGATTGATGGGGAACTGT;SOR=0.776;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=36;TCF=33;TCR=3;TR=13;WE=295691;WS=295682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr7	296557	rs36164325	T	C	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.420;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=203;ReadPosRankSum=1.325;SC=CTGCTCCTCATGGCACGCGCC;SOR=0.374;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=59;TCF=51;TCR=8;TR=18;WE=296565;WS=296547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,19:0.30:63
chr7	299850	rs36170987	G	T	1608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.483;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=43;PP=1076;ReadPosRankSum=1.242;SC=TCCGCGTCGTGCTAAAGGCCG;SOR=0.751;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=237;TCF=114;TCR=123;TR=82;WE=299858;WS=299840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,86:0.33:259
chr7	299881	rs36139924	A	G	1708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.183;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=41;PP=1039;ReadPosRankSum=-0.283;SC=CGTGGAGAGGAACGGGCTCCA;SOR=0.772;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=228;TCF=122;TCR=106;TR=84;WE=299889;WS=299871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,93:0.36:256
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chr7	330882	.	TCA	GCG	1943	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=8;NR=37;PP=1943;QD=44.3659527747;SC=CGCGGCGGCTTCAGGGAGGTC;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=60;TCF=11;TCR=49;TR=45;WE=330892;WS=330872;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:15,45:0.75:60
chr7	330884	rs4077172	A	G	2006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=30.87;ReadPosRankSum=-1.388;SOR=0.864;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,49:0.75:65
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chr7	331219	rs139216305	C	T	603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=22.186;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=3;PP=434;ReadPosRankSum=-0.132;SC=CCGTCCGAGCCGCCCGCCGCT;SOR=3.082;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=91;TCF=60;TCR=31;TR=28;WE=331227;WS=331209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,27:0.30:89
chr7	331427	rs141537626	C	A	4945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.418;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=100;PP=2862;ReadPosRankSum=0.737;SC=GGCTGGAGAACGTGGGACTCC;SOR=0.604;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=293;TCF=138;TCR=155;TR=195;WE=331435;WS=331417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,221:0.68:326
chr7	538277	rs34223855	G	C	6908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FS=3.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.67;ReadPosRankSum=0.863;SOR=0.522;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,180:0.64:280
chr7	538284	rs35782510	T	C	6835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FS=0.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.04;ReadPosRankSum=2.173;SOR=0.662;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,170:0.62:273
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chr7	540518	rs2070958	T	C	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.048;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=200;ReadPosRankSum=-0.030;SC=GAGACCTGAATCTCCTCTCCT;SOR=0.047;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=15;WE=540526;WS=540508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr7	540741	rs1800814	G	A	3815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=626;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.554;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=99;PP=2461;ReadPosRankSum=1.267;SC=GCCGACGAAGGCAGCCACTCA;SOR=0.732;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=582;TCF=288;TCR=294;TR=195;WE=540749;WS=540731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:414,211:0.34:625
chr7	550404	.	AGGAGG	A	553.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=68.90;QD=34.61;SOR=5.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr7	550737	rs62433334	G	C	1784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=51;PP=1468;SC=ACCAGGGTAAGCCACAGGCCA;SOR=4.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=5;TCR=51;TR=56;WE=550745;WS=550727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr7	551946	rs9692018	T	C	1536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=10;PP=932;ReadPosRankSum=1.492;SC=GGACTCACCCTGACCCGGCCC;SOR=0.971;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=50;TCF=40;TCR=10;TR=49;WE=551954;WS=551936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,55:0.98:56
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chr7	590199	rs11545042	A	G	2910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=74;PP=1888;ReadPosRankSum=1.283;SC=GGGCCACGACAGTGGCCGCCC;SOR=0.684;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=190;TCF=72;TCR=118;TR=119;WE=590207;WS=590189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,129:0.63:205
chr7	591125	rs71518309	C	G	3433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=54;PP=1769;SC=TGGAGGTGGACAGACGTGAGT;SOR=1.043;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=43;TCR=54;TR=97;WE=591133;WS=591115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr7	591146	rs118004775	C	T	1328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.154;HP=5;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=26;PP=610;ReadPosRankSum=-0.143;SC=GCCAGCCAGGCGGGTGCAGGG;SOR=0.472;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=59;TCF=19;TCR=40;TR=40;WE=591154;WS=591136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,41:0.67:61
chr7	591174	rs139922622	G	A	1056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=39;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=22;PP=477;ReadPosRankSum=0.857;SC=CACGTGAGGGGTCACCCCACA;SOR=0.516;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=41;TCF=8;TCR=33;TR=28;WE=591182;WS=591164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,28:0.68:41
chr7	591206	rs77124414	C	T	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=4.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.74;ReadPosRankSum=-1.504;SOR=0.114;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,7:0.25:28
chr7	618855	rs62431411	T	C	1248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.123;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=26;PP=1810;ReadPosRankSum=0.535;SC=CCTGCCCCAGTGCACACCCAG;SOR=0.470;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=213;TCF=134;TCR=79;TR=66;WE=618877;WS=618845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,73:0.32:227
chr7	618869	rs62431412	G	A	1630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.249;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=40;PP=1810;ReadPosRankSum=-0.317;SC=CACCCAGAGCGCCCACGTGGG;SOR=0.479;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=262;TCF=149;TCR=113;TR=87;WE=618877;WS=618845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:189,95:0.33:284
chr7	618938	rs3211362	A	G	1911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=415;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=55;PP=1281;ReadPosRankSum=-0.045;SC=CCTGGACCACAATTTTCTCTC;SOR=0.710;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=388;TCF=205;TCR=183;TR=117;WE=618946;WS=618928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:293,122:0.29:415
chr7	624221	rs9330368	T	G	5732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=403;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=131;NR=105;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.296;SC=CGGGAGAAAGTAAAAAACAGA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=374;TCF=205;TCR=169;TR=236;WE=624229;WS=624211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,255:0.63:402
chr7	624344	rs9330367	C	T	2314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=66;PP=1634;ReadPosRankSum=1.775;SC=AAGCCCTCGACGACTCGGAGT;SOR=0.755;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=40;TCR=86;TR=96;WE=624352;WS=624334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,97:0.74:131
chr7	624366	rs13221342	G	A	1776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.394;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=53;PP=1254;ReadPosRankSum=-1.419;SC=TGCGTGAGCTGCCACGGTGTC;SOR=0.496;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=81;TCF=14;TCR=67;TR=65;WE=624374;WS=624356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,70:0.80:88
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chr7	766220	rs79984239	A	G	720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.691;HP=2;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=947;ReadPosRankSum=1.568;SC=GCACGACAAGAGCACAGGCCC;SOR=1.863;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=31;TCF=21;TCR=10;TR=18;WE=766228;WS=766204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr7	766982	rs116986757	C	A	235.31	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5341;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=107;ReadPosRankSum=1.938;SC=CTCCCACACGCCACCCCACAC;SOR=0.495;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=9;WE=766990;WS=766972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr7	772025	rs4072597	G	A	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=121;ReadPosRankSum=-1.953;SC=CCTCAGGTGGGTGACTCATGG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=8;WE=772033;WS=772016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,9:0.30:30
chr7	772174	rs4724987	G	A	11078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=421;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=201;NR=189;PP=2965;SC=CCTTCCGGGAGCAACAGATGT;SOR=0.707;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=391;TCF=202;TCR=189;TR=390;WE=772182;WS=772164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,421:1.00:421
chr7	780687	rs62432212	T	C	3448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=84;PP=2279;SC=GGTGTCCCTTTGTCCCTGTGC;SOR=1.743;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=123;TCF=39;TCR=84;TR=123;WE=780695;WS=780677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr7	780859	rs6943174	T	G	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.264;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=2.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.06;ReadPosRankSum=-1.125;SOR=0.169;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr7	780980	rs6943337	T	G	1738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=19;PP=1061;SC=CTGTTGTGCCTCAGGCAGCTG;SOR=1.341;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=41;TCR=19;TR=60;WE=780988;WS=780970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr7	794471	rs34761279	A	G	2059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=39;PP=1178;SC=AAGTGGCCGTATTCCAGTCGT;SOR=1.150;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=30;TCR=39;TR=69;WE=794479;WS=794461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr7	794576	rs62432239	C	T	270.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=8;PP=221;SC=CCCTCACCCCCGGGCCGCAGG;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=794584;WS=794566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr7	796430	rs73036225	C	T	4374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=106;NR=72;PP=2507;ReadPosRankSum=-0.101;SC=GTACCAGATCCGCAGAGCTCG;SOR=0.728;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=253;TCF=150;TCR=103;TR=178;WE=796438;WS=796420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,194:0.71:275
chr7	801634	rs142752861	T	TTGAGCCCCAGGCCTCAAACATGTC	2649.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=15;PP=2900;SC=CCCTCTGTGCTTGACCAGCAA;SOR=2.794;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=16;WE=801642;WS=801624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr7	803342	rs4495324	G	A	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.110;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=287;ReadPosRankSum=-0.040;SC=GGCCCGGCCTGTGTGGTTCTT;SOR=0.523;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=70;TCF=54;TCR=16;TR=24;WE=803350;WS=803332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,24:0.35:69
chr7	808588	rs6973614	C	T	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.591;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=2;PP=126;ReadPosRankSum=1.357;SC=GACTCGTGCTCTGGCGGGAGG;SOR=0.084;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=9;WE=808596;WS=808578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr7	808749	rs62432865	C	T	1913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=361;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=47;PP=1302;ReadPosRankSum=1.440;SC=AGGGCAGGTGCGGGGGTCTCA;SOR=0.711;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=345;TCF=200;TCR=145;TR=109;WE=808757;WS=808739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:249,112:0.31:361
chr7	808810	rs6946758	C	G	2581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=443;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=72;PP=1636;ReadPosRankSum=-2.062;SC=AGGGAGAAGGCTCACATCGCG;SOR=0.699;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=423;TCF=207;TCR=216;TR=139;WE=808818;WS=808800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:295,148:0.33:443
chr7	810219	rs4720951	T	C	1090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FS=5.734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.26;ReadPosRankSum=1.737;SOR=0.417;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:182,74:0.29:256
chr7	813618	rs4719279	T	C	10870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=403;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=222;NR=151;PP=2965;SC=CATTCATCCCTAGTCTGAAAC;SOR=1.136;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=373;TCF=222;TCR=151;TR=373;WE=813626;WS=813608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,403:1.00:403
chr7	813650	rs62432869	G	A	3644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=610;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=89;PP=2445;ReadPosRankSum=-2.170;SC=GCACCTGTCCGGTCTCCTCAT;SOR=0.708;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=570;TCF=298;TCR=272;TR=190;WE=813658;WS=813640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:407,203:0.33:610
chr7	813867	rs6973746	C	G	1472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=38;PP=1086;SC=CGGTGGACACCGGCCGGGGAC;SOR=4.362;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=41;TCF=3;TCR=38;TR=41;WE=813875;WS=813857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr7	814612	rs34943122	G	A	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=207;ReadPosRankSum=-2.069;SC=GGACAGATGTGAGTCACGTCG;SOR=0.674;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=52;TCF=40;TCR=12;TR=20;WE=814620;WS=814602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,21:0.39:54
chr7	814788	rs3922641	G	A	1367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.868;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=29;PP=772;ReadPosRankSum=-1.045;SC=AAACTCATCAGGATTTATCCT;SOR=0.671;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=218;TCF=110;TCR=108;TR=66;WE=814796;WS=814778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,78:0.32:245
chr7	822523	rs4719314	A	G	13781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=501;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=261;NR=208;PP=2965;SC=CCCTCACACAACGTCAGAAAC;SOR=0.914;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=474;TCF=264;TCR=210;TR=469;WE=822531;WS=822513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,498:1.00:498
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chr7	881668	rs6461378	C	T	3236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=603;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=98;PP=1910;ReadPosRankSum=2.543;SC=TGGCGTCAGCCACGGCGGCAC;SOR=0.678;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=555;TCF=257;TCR=298;TR=178;WE=881676;WS=881658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:412,189:0.31:601
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chr7	891184	rs10628483	C	CGAT	1109.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.07;ReadPosRankSum=1.117;SOR=0.734;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:121,36:0.23:157
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chr7	905786	rs4721952	A	G	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.794;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=146;ReadPosRankSum=0.564;SC=CCACAGCTCCATGGAACTTCG;SOR=0.818;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=9;WE=905794;WS=905776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr7	912755	rs4722034	C	T	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=4.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.72;ReadPosRankSum=1.627;SOR=1.167;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,39:0.27:142
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chr7	926077	rs10267796	G	A	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.207;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=224;ReadPosRankSum=-0.313;SC=GCCAAGGGACGTGGTGCTCAG;SOR=0.223;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=14;WE=926085;WS=926067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr7	926827	rs4722203	T	C	7184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=140;NR=90;PP=2965;SC=CTCTGGGGCATATGGCGCTGG;SOR=1.059;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=230;TCF=140;TCR=90;TR=230;WE=926835;WS=926817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,259:1.00:259
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chr7	933608	rs142047778	G	A	2400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=57;PP=1449;ReadPosRankSum=-2.212;SC=GGGCCTGCTCGGTAAGCCGGG;SOR=0.751;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=151;TCF=67;TCR=84;TR=101;WE=933616;WS=933598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,110:0.69:160
chr7	939007	rs79698027	C	G	4879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.608;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=124;NR=85;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.014;SC=ATCTGGCAACCCCAGCCAGTG;SOR=0.849;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=307;TCF=182;TCR=125;TR=209;WE=939015;WS=938997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,224:0.69:327
chr7	940181	rs10256887	C	T	929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=2.113;NF=23;NR=16;PP=468;ReadPosRankSum=-2.059;SC=TCTGCGTCGCCGGCCCCTGGG;SOR=0.754;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=105;TCF=64;TCR=41;TR=39;WE=940189;WS=940171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,49:0.41:120
chr7	940258	rs113839920	G	GGGCAAAGGCA	1602.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=0.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.19;MQRankSum=2.477;QD=11.45;ReadPosRankSum=0.459;SOR=0.824;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,48:0.34:140
chr7	940267	rs3824079	T	C	1644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=1.417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.23;MQRankSum=2.463;QD=11.75;ReadPosRankSum=-1.474;SOR=0.843;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,47:0.34:140
chr7	940298	rs13224354	C	G	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=4.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.61;ReadPosRankSum=0.436;SOR=1.321;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,24:0.27:88
chr7	940501	rs72074799	AGAAGGGCC	A	480.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.731;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.367;NF=7;NR=3;PP=928;ReadPosRankSum=0.177;SC=CGAAGTCCTGAGAAGGGCCGA;SOR=0.142;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=10;WE=940516;WS=940491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,15:0.37:41
chr7	940724	rs11765973	G	A	1076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=30;PP=597;ReadPosRankSum=-1.222;SC=TTGGAGCTGTGGCCCCTACCG;SOR=0.741;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=119;TCF=42;TCR=77;TR=47;WE=940732;WS=940714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,53:0.41:128
chr7	943998	rs3824077	C	T	1327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=27;PP=823;SC=GTGCTGGCGGCGCACCTGCTG;SOR=1.659;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=15;TCR=27;TR=42;WE=944006;WS=943988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr7	944683	rs1881121	C	T	5393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=117;NR=68;PP=2965;SC=ACCCCACCCCCGTCTGTGACT;SOR=1.249;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=185;TCF=117;TCR=68;TR=185;WE=944691;WS=944673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr7	944874	rs10243781	G	A	2416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.260;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=1.640;NF=51;NR=61;PP=1672;ReadPosRankSum=-0.073;SC=AAGGAGTGACGATGGACAGGA;SOR=1.033;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=163;TCF=64;TCR=99;TR=112;WE=944882;WS=944864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,101:0.80:126
chr7	944922	rs112479370	C	CA	985.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=6.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.86;MQRankSum=2.083;QD=28.99;ReadPosRankSum=2.074;SOR=1.304;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,26:0.76:34
chr7	944929	rs28533260	C	G	952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=11.606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.28;MQRankSum=1.456;QD=34.03;ReadPosRankSum=1.990;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,22:0.79:28
chr7	944934	.	A	G	844.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.130;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=3.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.02;MQRankSum=0.588;QD=40.23;ReadPosRankSum=0.420;SOR=0.278;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,19:0.90:21
chr7	944935	rs372870944	CAG	C	835.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=3.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.02;MQRankSum=0.588;QD=39.80;ReadPosRankSum=0.420;SOR=0.278;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,19:0.90:21
chr7	944945	.	C	G	679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.705;ClippingRankSum=0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=3.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=35.78;ReadPosRankSum=0.532;SOR=0.129;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,17:0.89:19
chr7	944947	.	G	GGAC	670.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=3.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=35.30;ReadPosRankSum=0.466;SOR=0.129;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,17:0.89:19
chr7	944951	rs201301480	G	GGT	655.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=3.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=36.43;ReadPosRankSum=0.635;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,16:0.89:18
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chr7	1062366	rs1057558	T	C	566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.722;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=434;ReadPosRankSum=1.826;SC=GCTCTCAAATTCTTTAAAGGT;SOR=0.146;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=20;WE=1062374;WS=1062356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,21:0.66:32
chr7	1062527	rs3735686	G	A	9593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=366;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=172;NR=172;PP=2965;SC=GCTACAAAGCGCGGCGACGTC;SOR=0.738;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=344;TCF=172;TCR=172;TR=344;WE=1062535;WS=1062517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,366:1.00:366
chr7	1067906	rs2362529	T	C	1001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=19;PP=500;ReadPosRankSum=-0.010;SC=CTGACCCGGCTGTCAGGTCCC;SOR=0.735;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=58;TCF=32;TCR=26;TR=43;WE=1067914;WS=1067896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,47:0.75:63
chr7	1097023	rs78351779	G	C	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=243;ReadPosRankSum=0.702;SC=TCTGTGGTCTGCAGCGATTAC;SOR=0.507;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=42;TCF=35;TCR=7;TR=16;WE=1097031;WS=1097013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,15:0.35:43
chr7	1097183	rs11761941	G	A	2011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.783;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=45;PP=1210;ReadPosRankSum=-1.317;SC=AACGGCACAGGGCTGGTGGAG;SOR=0.702;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=174;TCF=91;TCR=83;TR=90;WE=1097191;WS=1097173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,98:0.52:190
chr7	1097394	rs11767527	T	C	1057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.778;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=26;PP=608;ReadPosRankSum=1.027;SC=CCCTGGCCCCTGTGCACCTGC;SOR=0.845;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=211;TCF=122;TCR=89;TR=63;WE=1097402;WS=1097384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,68:0.29:233
chr7	1097895	rs61910751	A	G	2240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=385;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.391;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=56;PP=1416;ReadPosRankSum=1.128;SC=TCTGGACGCCACACTATCTGA;SOR=0.651;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=371;TCF=211;TCR=160;TR=126;WE=1097903;WS=1097885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:252,132:0.34:384
chr7	1131356	rs3802141	T	C	13906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=521;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=263;NR=222;PP=2965;SC=AGCTGCACGGTGCAGAGACAT;SOR=0.836;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=486;TCF=264;TCR=222;TR=485;WE=1131364;WS=1131346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,521:1.00:521
chr7	1131411	rs11544331	C	T	3121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=550;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=83;PP=1936;ReadPosRankSum=1.190;SC=GAGATGTACCCAGGCACCGCG;SOR=0.694;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=513;TCF=248;TCR=265;TR=163;WE=1131419;WS=1131401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:375,175:0.32:550
chr7	1132153	rs3808352	G	A	1731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.445;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=44;PP=1149;ReadPosRankSum=-0.279;SC=TGATCCTCGCGGTGGTGCTGG;SOR=0.695;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=290;TCF=149;TCR=141;TR=92;WE=1132161;WS=1132143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:210,97:0.32:307
chr7	1132456	rs10246354	C	T	3075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=495;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.552;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=84;PP=1878;ReadPosRankSum=0.203;SC=CAGACAGCACCGAGCAGTCGG;SOR=0.749;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=452;TCF=212;TCR=240;TR=155;WE=1132464;WS=1132446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:326,168:0.34:494
chr7	1132505	rs2070118	G	A	2383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=407;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=63;PP=1500;ReadPosRankSum=-2.336;SC=AGCCTTGGCCGCATAGGCCCA;SOR=0.665;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=375;TCF=185;TCR=190;TR=124;WE=1132513;WS=1132495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:274,132:0.33:406
chr7	1132720	rs12702047	G	A	8772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=540;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=177;NR=190;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.552;SC=ATCCCAAAGCGCTCGCCCCGC;SOR=0.689;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=505;TCF=246;TCR=259;TR=367;WE=1132728;WS=1132710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,390:0.72:538
chr7	1132972	rs3808353	G	A	1682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=46;PP=1145;ReadPosRankSum=-0.408;SC=TGGACGTCGCGGTGTGTCCTC;SOR=0.932;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=7;TCR=65;TR=51;WE=1132980;WS=1132962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,60:0.75:80
chr7	1133305	rs1133043	C	G	10918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=415;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=180;NR=208;PP=2965;SC=ACTCCAGCACCTGTGGCTGAC;SOR=0.910;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=388;TCF=180;TCR=208;TR=388;WE=1133313;WS=1133295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,415:1.00:415
chr7	1192572	rs1133122	C	A	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FS=1.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.41;ReadPosRankSum=-0.577;SOR=0.843;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:145,39:0.21:184
chr7	1195215	rs1133116	A	C	1211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.081;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=33;PP=812;ReadPosRankSum=-1.020;SC=CTGGGACGTGAACATCCTAAA;SOR=0.779;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=222;TCF=115;TCR=107;TR=65;WE=1195223;WS=1195205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,71:0.29:243
chr7	1195293	rs143202029	T	TC	844.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=6.659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.87;ReadPosRankSum=-0.104;SOR=0.297;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,35:0.28:123
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chr7	1473997	rs66502635	C	T	1792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.467;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=33;PP=1057;ReadPosRankSum=0.094;SC=CGTAGGAGTCCGGGGCCATGT;SOR=0.641;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=247;TCF=157;TCR=90;TR=88;WE=1474005;WS=1473987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:180,97:0.35:277
chr7	1474342	rs9986863	A	T	1964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.630;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=58;PP=1281;ReadPosRankSum=0.480;SC=GCCGTGCTCAACGCCGCAGCC;SOR=0.582;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=244;TCF=83;TCR=161;TR=92;WE=1474350;WS=1474332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,98:0.37:266
chr7	1474414	rs4473929	A	G	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.482;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=227;ReadPosRankSum=0.855;SC=ACTGGCCACAATCCGCCCTGG;SOR=0.195;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=15;WE=1474422;WS=1474404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
chr7	1474632	.	A	C	190	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;FR=0.5000;HP=15;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=15;MQ=54.99;NF=16;NR=0;PP=190;QD=14.0482007842;SC=CCCCCCCCCCACCCCCAGCTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=16;WE=1474640;WS=1474622;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr7	1474799	rs67046940	A	G	2298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=458;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.888;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=68;PP=1341;ReadPosRankSum=-0.060;SC=ACGGGACCAGATGGCCATGAG;SOR=0.792;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=419;TCF=212;TCR=207;TR=131;WE=1474807;WS=1474789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:311,144:0.32:455
chr7	1476520	rs60306276	C	A	1671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.620;HP=7;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=43;PP=906;ReadPosRankSum=-0.114;SC=CAGCAGGAGCCCCCCCCACCA;SOR=0.710;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=240;TCF=129;TCR=111;TR=86;WE=1476528;WS=1476510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,93:0.37:252
chr7	1476596	rs10262345	A	G	1431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.570;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=39;PP=898;ReadPosRankSum=-2.050;SC=TTTTGGAGGAAGAAGGTGGGG;SOR=0.604;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=167;TCF=69;TCR=98;TR=67;WE=1476604;WS=1476586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,73:0.40:181
chr7	1476659	rs66491936	G	C	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.715;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=291;ReadPosRankSum=0.860;SC=ATGAAGGAAGGAACGGCCACG;SOR=0.190;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=58;TCF=12;TCR=46;TR=22;WE=1476667;WS=1476649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,22:0.35:63
chr7	1477113	rs10266642	T	C	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=2.698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.06;ReadPosRankSum=-1.332;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,12:0.16:75
chr7	1478407	rs4307248	G	A	1179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.191;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=22;PP=664;ReadPosRankSum=-2.133;SC=GCCCCAGCAGGCATTGCCTCC;SOR=0.599;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=175;TCF=113;TCR=62;TR=58;WE=1478415;WS=1478397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,66:0.33:198
chr7	1478495	rs4492283	A	G	1807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=418;ExcessHet=3.0103;FS=2.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.32;ReadPosRankSum=0.024;SOR=0.829;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:301,117:0.28:418
chr7	1478610	rs4580937	C	T	867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.696;HP=6;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=29;PP=618;ReadPosRankSum=0.093;SC=TCTCCTGCGGCGGGGTGGGGA;SOR=0.577;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=135;TCF=50;TCR=85;TR=47;WE=1478618;WS=1478600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,47:0.34:137
chr7	1478644	rs4307249	G	A	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=366;ReadPosRankSum=0.914;SC=GCCCCCAGGTGGGGAGACAGA;SOR=0.736;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=81;TCF=25;TCR=56;TR=25;WE=1478652;WS=1478634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,24:0.29:82
chr7	1479444	rs28718334	G	A	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.652;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=2.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.44;ReadPosRankSum=1.294;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr7	1479659	rs61287564	T	C	1111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.532;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=34;PP=810;ReadPosRankSum=0.483;SC=GCCTGAGACCTTCCTGGGGGC;SOR=0.738;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=198;TCF=101;TCR=97;TR=64;WE=1479679;WS=1479649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,67:0.30:223
chr7	1479764	rs59814665	AG	A	528.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.809;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=376;ReadPosRankSum=-0.540;SC=CACCAGCCCCAGGGCCTGGCC;SOR=0.315;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=14;WE=1479772;WS=1479754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,20:0.41:49
chr7	1480280	rs58636013	C	T	3816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FS=0.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.78;ReadPosRankSum=-0.032;SOR=0.762;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:170,107:0.39:277
chr7	1480286	rs61741872	G	A	3792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FS=4.351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.15;ReadPosRankSum=-1.469;SOR=0.984;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:164,104:0.39:268
chr7	1481919	rs4236408	C	A	9438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=352;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=196;NR=135;PP=2965;SC=CTGAGGATTCCGCCAAGTTCC;SOR=1.026;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=332;TCF=197;TCR=135;TR=331;WE=1481927;WS=1481909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,351:1.00:351
chr7	1482009	rs61744261	G	C	10107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=676;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=228;NR=192;PP=2962;ReadPosRankSum=2.419;SC=TCCTCGAAGGGAGGCCAAGCA;SOR=0.723;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=634;TCF=343;TCR=291;TR=420;WE=1482017;WS=1481999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:221,451:0.67:672
chr7	1482101	rs12540098	C	G	3036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=484;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.562;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=87;PP=1944;ReadPosRankSum=1.551;SC=CTGGGAACAGCGGCAGTGGCT;SOR=0.616;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=451;TCF=190;TCR=261;TR=155;WE=1482109;WS=1482091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:318,166:0.34:484
chr7	1482134	rs4457225	C	G	2066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.999;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=65;PP=1407;ReadPosRankSum=-1.278;SC=TAAGTAAAAGCGCAGGCATCA;SOR=0.610;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=267;TCF=88;TCR=179;TR=99;WE=1482142;WS=1482124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:180,104:0.37:284
chr7	1484572	rs10435184	A	G	3335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=57;NR=43;PP=1701;SC=GGGCTCCCCCACCCTGGGGTG;SOR=0.900;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=57;TCR=43;TR=100;WE=1484580;WS=1484562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr7	1484587	rs80020804	C	T	693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=19;PP=479;ReadPosRankSum=1.102;SC=GGGGTGTGGCCGGGCGAGGGT;SOR=0.766;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=102;TCF=52;TCR=50;TR=39;WE=1484595;WS=1484577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,38:0.37:103
chr7	1486451	rs75056037	G	A	608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FS=0.631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.42;ReadPosRankSum=-0.289;SOR=0.780;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:132,46:0.26:178
chr7	1486570	rs139483599	GC	G	866.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.988;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=410;ReadPosRankSum=0.028;SC=TGGAGAACTGGCCAGGAGAGG;SOR=0.452;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=40;TCF=9;TCR=31;TR=14;WE=1486578;WS=1486560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,30:0.41:73
chr7	1488149	.	T	TG	64.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=0.000;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.85;ReadPosRankSum=0.669;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,8:0.23:35
chr7	1490091	rs4720782	G	A	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=175;ReadPosRankSum=0.819;SC=CAGGGCTCCCGGCCCTGCTCC;SOR=1.314;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=10;WE=1490099;WS=1490081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
chr7	1515564	rs4720792	C	T	1711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.03;ReadPosRankSum=-1.178;SOR=0.668;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:185,99:0.35:284
chr7	1517700	rs10265526	A	G	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=76;ReadPosRankSum=0.242;SC=GTCCAGCCGGAGCCAGAGAGG;SOR=1.077;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=7;WE=1517708;WS=1517690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,7:0.22:32
chr7	1517971	rs4725131	G	A	1472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.21;ReadPosRankSum=0.801;SOR=0.672;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:152,85:0.36:237
chr7	1522175	rs10224038	A	G	1000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=18;PP=605;ReadPosRankSum=0.369;SC=CCCAGCCTGGACCGTACCGGC;SOR=0.716;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=168;TCF=110;TCR=58;TR=54;WE=1522183;WS=1522165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,58:0.33:177
chr7	1524862	rs111525228	G	A	2041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=354;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.066;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=46;PP=1359;ReadPosRankSum=2.604;SC=TGGTCTGAGCGGCAACAGGGC;SOR=0.884;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=328;TCF=177;TCR=151;TR=105;WE=1524870;WS=1524852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:238,114:0.32:352
chr7	1528947	.	T	TCCCGGGCCCGCCGAGGGGACGTGCGCACTCACTTCAGGCCCTGCTCCCAGC	2289.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.58;QD=99.55;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr7	1534987	rs111391955	T	G	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=35;ReadPosRankSum=0.529;SC=CAGTGGGGTTTGGGGCAGGGG;SOR=0.527;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=6;WE=1534995;WS=1534977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr7	1574016	rs3824069	C	T	1353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.82;ReadPosRankSum=1.014;SOR=0.684;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:200,81:0.29:281
chr7	1574403	rs4720833	A	G	3855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=588;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=96;PP=2385;ReadPosRankSum=0.052;SC=AGCGAGCGGCAGCCCCGATGC;SOR=0.658;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=545;TCF=268;TCR=277;TR=192;WE=1574411;WS=1574393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:372,213:0.36:585
chr7	1574562	rs4720834	T	C	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=370;ReadPosRankSum=-0.570;SC=TCCTAAAAGATAAGGTCTTGC;SOR=0.990;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=17;WE=1574570;WS=1574552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr7	1586653	rs112463195	A	AGCC	1177.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=8.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.80;ReadPosRankSum=0.028;SOR=0.990;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,35:0.38:92
chr7	1586662	rs3779607	T	C	1064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.890;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=15;PP=1035;ReadPosRankSum=1.493;SC=GAGCCGCCGCTGGGGTGGGTG;SOR=0.780;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=83;TCF=40;TCR=43;TR=24;WE=1586670;WS=1586643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,31:0.32:96
chr7	1586866	rs3824072	T	C	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.463;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=135;ReadPosRankSum=-1.766;SC=GCACTCCAGCTCCCCGGACAA;SOR=0.255;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=13;WE=1586874;WS=1586856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr7	1588391	rs3814481	A	G	1008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=29;PP=606;ReadPosRankSum=1.123;SC=CCCTAGAGCCACCGCCGCTGC;SOR=0.650;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=197;TCF=87;TCR=110;TR=56;WE=1588399;WS=1588381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,61:0.30:205
chr7	1588549	rs3814482	G	A	936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.334;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=23;PP=607;ReadPosRankSum=0.214;SC=CAGGGACGTGGCCGTTCTCCC;SOR=0.570;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=148;TCF=84;TCR=64;TR=50;WE=1588557;WS=1588539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,52:0.33:157
chr7	1588768	rs1124871	G	A	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.52;ReadPosRankSum=3.052;SOR=0.687;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:109,38:0.26:147
chr7	1589056	rs4294092	G	A	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=87;ReadPosRankSum=0.941;SC=GGTGGACCTTGGTCCCCTTGG;SOR=0.653;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=49;TCF=38;TCR=11;TR=12;WE=1589064;WS=1589046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,15:0.27:55
chr7	1589083	rs1865348	G	A	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=9;PP=264;ReadPosRankSum=0.210;SC=TGCCCTTAATGCCAAGAGTGC;SOR=0.740;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=89;TCF=58;TCR=31;TR=26;WE=1589091;WS=1589073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,30:0.31:98
chr7	1589417	rs10237660	T	G	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.349;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=229;ReadPosRankSum=1.508;SC=TCCGCCTCGTTGGGCCCCACT;SOR=1.061;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=74;TCF=52;TCR=22;TR=20;WE=1589425;WS=1589407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,19:0.24:79
chr7	1590368	rs6463921	A	G	2685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.43;SOR=2.185;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr7	1590368	.	ACTGGCCAT	GCTGGCCAC,GCTGGCCAT	886	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000,0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=20,57;NR=3,15;PP=413,886;QD=20.2812119505;SC=TGCCCTGGGGACTGGCCATGG;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=72;TCF=57;TCR=15;TR=23,72;WE=1590384;WS=1590358;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.32:72
chr7	1590376	rs2304360	T	C	686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=5.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.87;ReadPosRankSum=-1.291;SOR=1.379;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,36:0.36:100
chr7	1590443	rs2304361	T	C	1835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.77;ReadPosRankSum=0.553;SOR=0.685;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:213,105:0.33:318
chr7	1595068	rs17852421	G	A	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=19;PP=396;ReadPosRankSum=-0.320;SC=CGGCCAGTTCGCTGACACCAG;SOR=0.715;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=130;TCF=64;TCR=66;TR=37;WE=1595076;WS=1595058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,41:0.29:141
chr7	1626835	rs73289427	G	A	1616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.897;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=23;PP=984;ReadPosRankSum=-1.175;SC=CTCAGGCAGCGGCAGATGATG;SOR=1.094;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=124;TCF=73;TCR=51;TR=67;WE=1626843;WS=1626825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,75:0.54:139
chr7	1627632	rs7800178	T	C	11677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=449;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=193;NR=221;PP=2965;SC=CACAGCCACCTGATGGGGAAG;SOR=0.878;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=416;TCF=193;TCR=223;TR=414;WE=1627640;WS=1627618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,446:1.00:446
chr7	1627726	rs62436912	C	G	1539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.063;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=43;PP=1037;ReadPosRankSum=-0.151;SC=CGTTGTAGAACTGCAGTTCCA;SOR=0.546;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=82;TCF=18;TCR=64;TR=57;WE=1627734;WS=1627716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,62:0.70:89
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chr7	1855531	rs7680	G	A	2114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=32;PP=1228;SC=ACGTGGAGAGGGTGCTGGCCG;SOR=0.821;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=43;TCR=32;TR=75;WE=1855539;WS=1855521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr7	1886805	rs11762803	A	G	1330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=11;PP=922;SC=CCTGGGAACAAGGAGTTCCTC;SOR=1.880;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=42;WE=1886813;WS=1886795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr7	1887037	rs73046334	T	C	8389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=163;NR=132;PP=2965;SC=TGGGAAGATGTGGGGGGCCCG;SOR=0.847;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=297;TCF=163;TCR=134;TR=295;WE=1887045;WS=1887027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,319:1.00:319
chr7	1888294	rs4719320	C	G	4786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=100;NR=54;PP=2965;SC=GAGAGCCCAGCGCTGAATCCT;SOR=1.450;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=154;TCF=100;TCR=54;TR=154;WE=1888302;WS=1888284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr7	1888683	rs66991912	TACACACACACAC	TAC,T	2723.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;NF=1,1;NR=44,44;PP=65,2144;SC=GGTGTACATGTACACACACAC;SOR=3.370;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=70;TCF=2;TCR=68;TR=45,45;WE=1888702;WS=1888673;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:67
chr7	1914059	rs55934553	T	C	906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.809;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=6;PP=662;ReadPosRankSum=0.552;SC=GGCCGTGACATCGAGGGTAGC;SOR=0.382;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=46;TCF=39;TCR=7;TR=35;WE=1914067;WS=1914049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,36:0.77:47
chr7	1914350	rs60238952	A	G	1074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=27;PP=764;SC=TGTGTGGCTCAGCAGGACCCA;SOR=2.242;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=36;WE=1914358;WS=1914340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr7	2041887	rs4721296	A	C	1116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=26;PP=829;SC=AGGAGCTGGGAAGTGGGCAGC;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=31;WE=2041895;WS=2041877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr7	2054314	rs142140779	CG	C	3948.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=66;PP=2456;ReadPosRankSum=0.218;SC=GGACCCGGGACGGGGGATGAG;SOR=0.714;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=124;TCF=16;TCR=108;TR=77;WE=2054322;WS=2054304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,141:0.67:212
chr7	2119174	rs7805774	C	T	1538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.369;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=5;PP=1047;ReadPosRankSum=0.859;SC=ATCTCGTCAACTGGAATCACC;SOR=1.153;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=74;TCF=65;TCR=9;TR=52;WE=2119182;WS=2119164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,60:0.72:83
chr7	2257612	rs6951493	G	A	2529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.495;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=30;PP=1524;ReadPosRankSum=-1.467;SC=TCTGCTGCTCGTGGTCTGCTC;SOR=1.032;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=142;TCF=96;TCR=46;TR=100;WE=2257620;WS=2257602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,108:0.72:149
chr7	2258899	rs1639916	G	A	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.119;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.596;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=142;ReadPosRankSum=-0.170;SC=CCAGCCACCAGGAGAGAGGTG;SOR=1.802;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=9;WE=2258907;WS=2258889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr7	2260715	rs1639917	G	T	2107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=54;PP=1230;ReadPosRankSum=0.908;SC=CCTGAGGAGCGGCCACCTCGG;SOR=0.682;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=139;TCF=49;TCR=90;TR=85;WE=2260723;WS=2260693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,93:0.62:149
chr7	2269552	rs1637728	G	T	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=61;ReadPosRankSum=-0.967;SC=ACAGAAGACTGGAAGAGGTCC;SOR=0.148;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=7;WE=2269560;WS=2269542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr7	2278663	rs4721496	T	A	675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.38;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr7	2279851	rs6962067	T	C	1726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=17;PP=1231;ReadPosRankSum=1.239;SC=AGCGAGACTCTGTCTCAAACA;SOR=0.786;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=99;TCF=75;TCR=24;TR=68;WE=2279859;WS=2279841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,71:0.68:105
chr7	2280105	rs62442508	G	A	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=512;ReadPosRankSum=0.586;SC=GTGAGGTCACGGTTCAACGCA;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=22;WE=2280113;WS=2280095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,21:0.70:30
chr7	2284416	rs34185397	C	G	1032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.141;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=29;PP=721;ReadPosRankSum=0.775;SC=CACAGGGATTCGGGCTGTAGG;SOR=1.050;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=61;TCF=21;TCR=40;TR=43;WE=2284424;WS=2284406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,43:0.69:62
chr7	2290522	rs1799832	C	T	3836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.709;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=70;PP=2357;ReadPosRankSum=-0.455;SC=TGTGGCCCGACGACAGCTACT;SOR=0.811;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=252;TCF=134;TCR=118;TR=154;WE=2290530;WS=2290512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,170:0.62:276
chr7	2290685	rs1062492	C	T	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=310;ReadPosRankSum=-0.204;SC=GCTGAACAGCCGCAAACCATC;SOR=0.756;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=18;WE=2290693;WS=2290675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr7	2292881	rs3075440	C	CTG	5463.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.521;NF=3;NR=56;PP=2586;ReadPosRankSum=2.175;SC=TCCTTGGGGGCTGTCAGGAGC;SOR=0.717;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=122;TCF=10;TCR=112;TR=59;WE=2292889;WS=2292871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,142:0.57:250
chr7	2296493	rs2302070	A	G	1061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.082;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=14;PP=637;ReadPosRankSum=0.470;SC=CGGCGGCCGGAGCAGGGCGGA;SOR=0.216;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=56;TCF=39;TCR=17;TR=41;WE=2296501;WS=2296483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,45:0.71:63
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chr7	2304191	rs2286205	A	C	478.81	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=363;ReadPosRankSum=1.658;SC=CACGGGAGACACAGCAGGTCC;SOR=1.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=15;WE=2304199;WS=2304181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,16:0.94:17
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chr7	2315008	rs2398667	G	C	608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=474;ReadPosRankSum=-0.410;SC=CCCTGTGACGGCTTCGTATAT;SOR=1.942;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=20;WE=2315016;WS=2314998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,21:0.72:29
chr7	2317934	rs117886084	G	A	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.391;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=23;PP=512;ReadPosRankSum=-0.220;SC=CTGGGGTGTCGGCAGATCTGC;SOR=1.038;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=53;TCF=9;TCR=44;TR=27;WE=2317942;WS=2317924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,30:0.52:58
chr7	2349470	rs10479970	T	C	5102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=373;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.817;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-1.277;NF=102;NR=111;PP=2962;ReadPosRankSum=1.376;SC=CAGGTAAGGGTTGATGGGAGC;SOR=0.843;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=343;TCF=169;TCR=174;TR=213;WE=2349478;WS=2349460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,232:0.62:373
chr7	2349608	rs7805462	G	A	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=225;ReadPosRankSum=-0.377;SC=AGGTCAACGCGGACAAACAGC;SOR=0.307;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=12;WE=2349616;WS=2349598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr7	2394746	rs9690787	T	C	1053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=20;NR=14;PP=513;SC=CGGGCCGGAGTCCGAGGTGAG;SOR=0.741;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=20;TCR=14;TR=34;WE=2394754;WS=2394736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr7	2400306	rs953770	T	C	4813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=112;NR=47;PP=2965;SC=AATGTTTTTCTTGGTAAAAAT;SOR=1.781;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=160;TCF=112;TCR=48;TR=159;WE=2400314;WS=2400296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr7	2400394	rs58174334	C	T	2093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=427;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.208;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=52;PP=1256;ReadPosRankSum=-0.827;SC=CAGATGGAATCGATTCGGTGA;SOR=0.796;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=390;TCF=202;TCR=188;TR=115;WE=2400402;WS=2400384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:300,127:0.30:427
chr7	2405885	rs2286204	C	A	556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=2;PP=427;SC=CGTGTTCTGGCCGCACAGACA;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=2405893;WS=2405881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr7	2409035	rs2301944	C	T	1713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=12;PP=1168;SC=ATGAGTTGTTCTATTCTCTTC;SOR=2.041;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=42;TCR=12;TR=54;WE=2409043;WS=2409025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr7	2414142	rs886632	A	G	5185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=118;NR=70;PP=2965;SC=AGCTCGTGACAGGCGCGCTCT;SOR=1.219;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=188;TCF=118;TCR=70;TR=188;WE=2414150;WS=2414132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr7	2414365	rs884565	A	G	4852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=98;PP=2965;SC=GGGTTGCCCCAGTGTCAGTGG;SOR=1.147;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=168;TCF=70;TCR=98;TR=168;WE=2414373;WS=2414355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr7	2416822	rs2240347	A	G	5472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=112;PP=2965;SC=TAAAAACGTGACATTTGCAAG;SOR=1.356;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=184;TCF=72;TCR=112;TR=184;WE=2416830;WS=2416812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr7	2418645	rs6461351	A	G	973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=3;PP=831;SC=TGAATGGACTAGCCATTCCTG;SOR=3.841;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=28;WE=2418653;WS=2418635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr7	2434469	rs78687971	G	A	1616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FS=1.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.88;ReadPosRankSum=-0.357;SOR=0.573;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:230,101:0.31:331
chr7	2434522	rs1978169	G	A	4424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=47;NR=99;PP=2699;SC=AAACACACCCGCCCAGCAAGA;SOR=1.639;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=154;TCF=47;TCR=107;TR=146;WE=2434530;WS=2434512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr7	2489415	.	G	T	1787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.388;ClippingRankSum=0.000;DP=376;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.407;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=52;PP=1144;ReadPosRankSum=0.932;SC=GAAGGCGTGGGCCAATGACCA;SOR=0.664;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=354;TCF=183;TCR=171;TR=106;WE=2489423;WS=2489405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:264,112:0.30:376
chr7	2515382	rs5881927	G	GC	12950.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-1.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=375;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.122;NF=70;NR=96;PP=2969;ReadPosRankSum=-0.139;SC=GGAAGGCATTGCCACCACAGT;SOR=0.372;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=185;TCF=77;TCR=108;TR=166;WE=2515390;WS=2515372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,361:1.00:362
chr7	2582153	rs138295649	C	CCCCCAGCCTCCCGGGTGT	6915.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=17;PP=2969;SC=GGATGGGGTGCCCCCAGGTGT;SOR=0.806;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=95;TCF=48;TCR=47;TR=52;WE=2582161;WS=2582143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr7	2604767	rs71550361	AGT	A	360.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FS=0.781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.72;ReadPosRankSum=-0.122;SOR=0.602;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:175,35:0.17:210
chr7	2611878	rs2917751	T	C	3170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=498;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=89;PP=1826;ReadPosRankSum=0.440;SC=ATGCGTGGACTGGCGTCCCCG;SOR=0.702;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=477;TCF=226;TCR=251;TR=171;WE=2611886;WS=2611868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:320,178:0.36:498
chr7	2613042	rs2304540	G	C	525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.914;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=8;PP=340;ReadPosRankSum=-0.083;SC=ATTTGTTTATGTTTCTCTAGG;SOR=0.852;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=62;TCR=30;TR=24;WE=2613050;WS=2613032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,27:0.28:95
chr7	2618070	rs3214664	C	CA	4037.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=520;ExcessHet=3.0103;FS=1.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.86;ReadPosRankSum=-0.034;SOR=0.816;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:365,149:0.29:514
chr7	2619334	rs68086038	GGT	G	1324.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FS=1.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.07;ReadPosRankSum=-1.464;SOR=1.038;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,41:0.62:66
chr7	2619363	rs2917739	G	C	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=0.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.25;ReadPosRankSum=2.576;SOR=0.826;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,27:0.31:88
chr7	2621567	rs7798469	T	C	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=57.57;MQRankSum=-0.566;NF=4;NR=0;PP=59;ReadPosRankSum=-0.566;SC=AGGATGGTCTTGATCTCCTGA;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=4;WE=2621575;WS=2621557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr7	2623351	rs13242369	G	A	771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.538;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=32;PP=596;ReadPosRankSum=0.061;SC=GAGGTGCGCCGTGCTGGGCGG;SOR=1.258;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=102;TCF=25;TCR=77;TR=39;WE=2623359;WS=2623341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,39:0.36:109
chr7	2623801	rs73033665	G	T	1292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FS=3.040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.43;ReadPosRankSum=0.987;SOR=0.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:215,77:0.26:292
chr7	2626038	rs3217437	CCAGGGAATGG	C	257.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=2.606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.61;MQRankSum=3.018;QD=7.58;ReadPosRankSum=-0.426;SOR=1.392;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,9:0.26:34
chr7	2627310	rs2917733	T	A	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.90;ReadPosRankSum=-0.016;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,11:0.25:44
chr7	2627578	rs150431779	CAG	C	662.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.463;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.484;NF=0;NR=13;PP=403;ReadPosRankSum=-0.987;SC=GACGGGCTCACAGGGTGCGGA;SOR=0.346;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=0;TCR=48;TR=13;WE=2627587;WS=2627554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,20:0.32:62
chr7	2629729	rs61753096	G	A	3839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=1.542;NF=66;NR=106;PP=2412;ReadPosRankSum=-0.717;SC=AGGAGCAGCTGCTGCAGAGAG;SOR=0.665;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=246;TCF=92;TCR=154;TR=172;WE=2629737;WS=2629719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,175:0.70:251
chr7	2632477	rs2917730	A	G	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.025;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=5.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.14;ReadPosRankSum=0.723;SOR=0.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr7	2636689	rs12700146	C	T	786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FS=7.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.80;ReadPosRankSum=-1.251;SOR=1.336;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:116,48:0.29:164
chr7	2638347	rs12700147	C	G	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=169;ReadPosRankSum=-0.533;SC=CCAGGAATGACTGGGCCTGGA;SOR=0.404;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=11;WE=2638355;WS=2638337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,12:0.41:29
chr7	2640985	rs4506100	G	C	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.396;NF=15;NR=7;PP=234;ReadPosRankSum=1.174;SC=TTGGCTTGATGGACACCTGTT;SOR=0.798;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=61;TCF=39;TCR=22;TR=22;WE=2640993;WS=2640975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,25:0.37:67
chr7	2641059	.	CT	C	116.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.379;ClippingRankSum=0.000;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=3.268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.41;MQRankSum=0.000;QD=3.07;ReadPosRankSum=0.113;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,11:0.29:38
chr7	2647048	rs12700160	C	G	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=60;ReadPosRankSum=-0.624;SC=CCGCCTTGGCCCAGCTTGTCC;SOR=0.616;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=6;WE=2647056;WS=2647038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr7	2686455	rs3801080	C	A	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.776;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=9;PP=297;ReadPosRankSum=-0.273;SC=TGGGGGTCCACCCCTCCAGCG;SOR=0.907;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=103;TCF=70;TCR=33;TR=30;WE=2686463;WS=2686445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,31:0.28:111
chr7	2686761	rs3801079	G	C	1521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.349;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=34;PP=1016;ReadPosRankSum=1.490;SC=CATCTCACGGGCCCGCCCTCT;SOR=0.531;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=219;TCF=132;TCR=87;TR=80;WE=2686769;WS=2686751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,85:0.36:238
chr7	2689472	rs3801077	A	C	1531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=40;PP=1037;ReadPosRankSum=-1.407;SC=ACTCCAGGGGACGGGTTCTAC;SOR=0.715;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=271;TCF=148;TCR=123;TR=88;WE=2689480;WS=2689462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:201,89:0.31:290
chr7	2691610	rs13225657	G	A	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.378;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=63;ReadPosRankSum=1.676;SC=ACCGGCACACGTGCACACGAA;SOR=0.197;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=7;WE=2691618;WS=2691600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr7	2691736	rs35868808	A	G	631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.57;ReadPosRankSum=-0.900;SOR=0.648;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:133,44:0.25:177
chr7	2699524	rs139527284	ACT	A	232.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.08;MQRankSum=2.488;QD=1.76;ReadPosRankSum=-1.504;SOR=0.672;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:107,25:0.19:132
chr7	2699687	rs56409742	C	CG	10868.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=338;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQ=60.13;NF=10;NR=123;PP=2936;SC=ACTGACCCACCGGTCCCCCAT;SOR=1.003;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=148;TCF=10;TCR=138;TR=133;WE=2699695;WS=2699677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,308:1.00:308
chr7	2749565	rs13224990	G	A	769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=21;PP=584;SC=GTCAACTGCCGGGTTCCAGGC;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=24;WE=2749573;WS=2749555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr7	2752487	rs7776970	G	A	1513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.494;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=36;PP=786;ReadPosRankSum=-0.476;SC=TCGGCCCCCCGTCCCTGGGAT;SOR=0.756;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=210;TCF=106;TCR=104;TR=70;WE=2752499;WS=2752477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,84:0.35:242
chr7	2771504	rs11772508	C	A	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=216;ReadPosRankSum=-0.153;SC=CAGGTTGAACCAGAAACCAAA;SOR=1.292;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=13;WE=2771512;WS=2771494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,15:0.79:19
chr7	2773035	rs34004158	C	CAT	5296.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.969;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.794;NF=37;NR=38;PP=2962;ReadPosRankSum=0.304;SC=TCTCTGGACACGTTTTCTAAC;SOR=0.479;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=122;TCF=64;TCR=58;TR=75;WE=2773043;WS=2773025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,131:0.69:189
chr7	2802173	rs17132665	T	C	4153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.222;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=111;NR=64;PP=2802;ReadPosRankSum=-2.013;SC=CCACCACGCCTTCTATTCTGG;SOR=0.548;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=266;TCF=173;TCR=93;TR=175;WE=2802181;WS=2802163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,184:0.66:279
chr7	2834869	rs2533886	C	T	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.971;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=27;PP=597;ReadPosRankSum=-0.338;SC=ATTGTCATAACGCAGAAAACT;SOR=1.371;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=44;TCF=5;TCR=39;TR=30;WE=2834877;WS=2834859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,34:0.69:49
chr7	2853931	.	C	T	2184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.362;ClippingRankSum=0.000;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.656;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=42;PP=1275;ReadPosRankSum=-1.506;SC=AGGAGTTGAACGGAGTGAGAC;SOR=0.717;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=137;TCF=73;TCR=64;TR=91;WE=2853939;WS=2853921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,99:0.68:146
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chr7	2946461	rs1124581	T	C	1131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.776;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=28;PP=669;ReadPosRankSum=-0.933;SC=CCGTCTCAGGTCGGGGCAGCA;SOR=0.597;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=95;TCF=31;TCR=64;TR=43;WE=2946469;WS=2946451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,50:0.47:107
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chr7	3188738	rs34925290	G	C	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.962;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=188;ReadPosRankSum=-1.579;SC=AGAAAGAACGGGGAGATGCTA;SOR=0.908;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=80;TCF=34;TCR=46;TR=22;WE=3188746;WS=3188728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,22:0.26:84
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chr7	3205581	rs7782623	C	T	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=122;ReadPosRankSum=0.647;SC=AGCAACATAGCGAGACCTCAT;SOR=0.631;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=35;TCF=24;TCR=11;TR=13;WE=3205589;WS=3205571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,14:0.38:37
chr7	3205635	rs7801306	A	G	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=3.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.53;ReadPosRankSum=0.393;SOR=0.340;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,22:0.28:80
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chr7	3205763	rs10951089	A	C	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FS=2.191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.05;ReadPosRankSum=-0.060;SOR=0.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:162,41:0.20:203
chr7	3341390	rs10228086	T	C	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.842;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr7	3990565	rs117632561	C	T	1559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.512;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=33;PP=917;ReadPosRankSum=-1.012;SC=GAGATGTTGGCACACCTGAAA;SOR=0.751;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=208;TCF=119;TCR=89;TR=79;WE=3990573;WS=3990555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,83:0.38:219
chr7	4011331	rs6965800	C	T	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.322;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=226;ReadPosRankSum=-0.484;SC=ACGGTATCTTCTGGTTGTGGG;SOR=0.086;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=54;TCF=14;TCR=40;TR=22;WE=4011339;WS=4011321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,23:0.40:57
chr7	4026944	rs7785899	C	G	3119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.552;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=76;PP=2035;ReadPosRankSum=-2.492;SC=TCGTGGAGCTCTCTGAAAACA;SOR=0.746;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=187;TCF=75;TCR=112;TR=125;WE=4026952;WS=4026934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,136:0.66:206
chr7	4150439	rs150447078	A	G	1581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.853;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=34;PP=935;ReadPosRankSum=0.682;SC=TACAGGAGGAAACACTGGCAG;SOR=0.850;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=163;TCF=80;TCR=83;TR=67;WE=4150447;WS=4150429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,76:0.42:182
chr7	4152863	rs6956409	G	C	2710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=452;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.565;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=56;PP=1879;ReadPosRankSum=-1.806;SC=TTGTGGTTTCGTTCTTTTCCT;SOR=0.778;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=418;TCF=250;TCR=168;TR=143;WE=4152871;WS=4152853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:302,150:0.33:452
chr7	4153824	rs2141076	A	G	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.989;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=12;PP=250;ReadPosRankSum=-0.653;SC=AGTGGATGGAATACGAGCTGC;SOR=0.467;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=78;TCF=37;TCR=41;TR=24;WE=4153832;WS=4153814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,24:0.29:84
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chr7	4185592	rs608271	A	G	2716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.556;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.763;NF=48;NR=63;PP=1706;ReadPosRankSum=0.056;SC=TGTTGTGGGCACAGCTTCCTC;SOR=0.649;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=174;TCF=74;TCR=100;TR=111;WE=4185600;WS=4185582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,122:0.64:191
chr7	4189075	rs659182	G	C	10377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=388;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=169;NR=190;PP=2965;SC=GCCATGAGGCGACAGCATGCG;SOR=0.824;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=359;TCF=169;TCR=190;TR=359;WE=4189083;WS=4189065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,388:1.00:388
chr7	4189123	rs4720177	G	A	3639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.545;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=89;PP=2337;ReadPosRankSum=0.281;SC=GCACCTCCCCGGGGAACGGGG;SOR=0.628;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=207;TCF=71;TCR=136;TR=140;WE=4189131;WS=4189113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,151:0.67:226
chr7	4213749	rs4723444	T	A	1962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=9;PP=1475;SC=CCCACGACTTTCTTCTGTGCA;SOR=3.327;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=57;TCR=9;TR=65;WE=4213757;WS=4213739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr7	4213877	rs601424	T	C	10560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=405;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=198;NR=185;PP=2965;SC=AAAGCCTGAATGGCCTTCTTC;SOR=0.698;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=383;TCF=198;TCR=185;TR=383;WE=4213885;WS=4213867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,405:1.00:405
chr7	4213940	rs671756	T	C	8744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=137;NR=170;PP=2965;SC=GGTCAGGCACTGAGGCCAAGA;SOR=1.132;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=307;TCF=137;TCR=170;TR=307;WE=4213948;WS=4213930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,336:1.00:336
chr7	4213975	rs671694	A	G	5340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=102;PP=2965;SC=ATAGCTTTACATGCTGAGCTC;SOR=1.226;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=179;TCF=77;TCR=102;TR=179;WE=4213983;WS=4213965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr7	4214041	rs4723445	C	T	2040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.42;SOR=2.560;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr7	4214046	rs600537	T	C	2044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.44;SOR=2.461;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr7	4215298	rs4720185	T	C	8126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.502;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=174;NR=102;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.556;SC=GCGTGGGAAGTGGCTGGCATC;SOR=1.089;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=281;TCF=177;TCR=104;TR=276;WE=4215306;WS=4215288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,301:0.99:304
chr7	4217969	rs649494	T	A	1310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=1;PP=1083;SC=CCGGTCACAGTGGATGCAGGT;SOR=6.043;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=40;TCF=39;TCR=1;TR=40;WE=4217977;WS=4217959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr7	4281626	rs79967809	C	T	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=380;ReadPosRankSum=-0.777;SC=CCACTGGCACCTCCTGCATCC;SOR=0.473;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=19;WE=4281634;WS=4281616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,22:0.73:30
chr7	4304692	.	GCCCAGCACGCTCCGGGC	G	1934.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=0.000;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.188;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.156;NF=17;NR=6;PP=2928;ReadPosRankSum=-1.480;SC=CAGGCCTCCTGCCCAGCACGC;SOR=1.352;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=48;TCF=35;TCR=13;TR=23;WE=4304716;WS=4304682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,50:0.61:82
chr7	4304727	rs10270413	A	G	975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.736;HP=2;HapScore=2;MGOF=55;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.171;NF=29;NR=17;PP=608;ReadPosRankSum=-1.687;SC=CCTGCCCTGCACTCACACCTT;SOR=0.380;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=115;TCF=78;TCR=37;TR=46;WE=4304735;WS=4304717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,52:0.41:127
chr7	4308181	rs117603586	G	A	1862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.073;HP=4;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=17;PP=1224;ReadPosRankSum=-0.549;SC=CCACAGCCCCGGGAGGTGGCT;SOR=0.434;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=97;TCF=77;TCR=20;TR=69;WE=4308189;WS=4308171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,77:0.70:110
chr7	4308205	rs10227734	T	A	4712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=1.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.22;ReadPosRankSum=0.256;SOR=0.539;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,117:0.70:167
chr7	4308215	rs10268227	C	A	6035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FS=1.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.59;ReadPosRankSum=0.135;SOR=0.547;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,145:0.71:204
chr7	4308220	rs10227750	T	C	6153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FS=0.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.76;ReadPosRankSum=0.862;SOR=0.619;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,160:0.70:230
chr7	4490854	rs314605	C	T	9178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=349;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=172;NR=145;PP=2965;SC=AGTTATGTTCCTGGATGTTTG;SOR=0.758;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=317;TCF=172;TCR=145;TR=317;WE=4490862;WS=4490844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,349:1.00:349
chr7	4490935	rs369198	C	T	4734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=97;PP=2880;SC=GTACCCTTGACGGAAATAGAT;SOR=1.147;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=169;TCF=72;TCR=97;TR=169;WE=4490943;WS=4490925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr7	4780514	rs3087749	G	T	3642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=789;ExcessHet=3.0103;FS=1.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.62;ReadPosRankSum=-0.584;SOR=0.801;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:563,226:0.29:789
chr7	4791149	rs185314805	C	G	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.395;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=61;ReadPosRankSum=-1.074;SC=CACTTTACAGCTCTTAGCGGC;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=5;WE=4791157;WS=4791139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,6:0.24:25
chr7	4802029	rs6976790	T	G	963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=19;PP=559;SC=AGCCCAGTGGTGCTGTAACCA;SOR=1.483;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=11;TCR=19;TR=30;WE=4802037;WS=4802019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr7	4839990	rs62450182	C	A	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=5.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.22;ReadPosRankSum=0.086;SOR=1.651;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,18:0.22:80
chr7	4839993	rs3816853	C	G	2548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=40;PP=681;SC=GGAATCACGACGAGGAATGGG;SOR=1.387;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=25;TCR=40;TR=65;WE=4840001;WS=4839980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr7	4841313	rs6966329	A	G	5926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.90;SOR=1.205;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr7	4841318	rs6945581	G	A	5919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.21;SOR=1.082;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr7	4841470	rs414035	T	C	5786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=105;PP=2965;SC=CCCCCACGGCTGGGTTGCCTT;SOR=0.799;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=204;TCF=98;TCR=106;TR=203;WE=4841478;WS=4841460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr7	4841655	rs58207166	T	C	2952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=48;PP=1755;SC=ACAGCTCAGGTAGAGGAGTGG;SOR=0.936;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=49;TCR=48;TR=97;WE=4841663;WS=4841645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr7	4845312	rs2306919	T	G	7745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=137;NR=127;PP=2965;SC=CTGGGCTCAGTGCGGGGAACG;SOR=0.742;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=264;TCF=137;TCR=127;TR=264;WE=4845320;WS=4845302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,293:1.00:293
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chr7	5166400	rs73318773	G	A	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.666;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.481;NF=11;NR=3;PP=193;ReadPosRankSum=-0.249;SC=ACATCCATGGGTTCTGCTTTG;SOR=0.352;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=14;WE=5166408;WS=5166390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr7	5166500	rs112252777	A	G	2533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.514;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.376;NF=70;NR=48;PP=1464;ReadPosRankSum=-2.217;SC=TCCTCCATCCATGGCTCCTTC;SOR=0.773;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=212;TCF=122;TCR=90;TR=118;WE=5166508;WS=5166490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,124:0.58:213
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chr7	5254227	rs4587243	C	G	8873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=170;NR=117;PP=2965;SC=TGGCCATCGTCAGCCTTAAAG;SOR=1.097;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=291;TCF=172;TCR=119;TR=287;WE=5254235;WS=5254217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,302:1.00:302
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chr7	5262385	rs4720537	G	A	4160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.978;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=82;PP=2567;ReadPosRankSum=-1.284;SC=CAAACAAGTAGAACCCCCAGG;SOR=0.616;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=245;TCF=115;TCR=130;TR=159;WE=5262393;WS=5262375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,180:0.66:273
chr7	5269424	rs7785898	A	C	1589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=44;PP=1266;SC=CCCGAGTGCTACTGCCTTCTG;SOR=3.788;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=6;TCR=44;TR=50;WE=5269432;WS=5269414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr7	5270631	rs34072945	G	A	919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.824;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=31;PP=590;ReadPosRankSum=-2.276;SC=CTTCACAGAGGACTTTGTGCA;SOR=0.592;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=27;TCR=78;TR=42;WE=5270639;WS=5270621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,44:0.41:107
chr7	5330285	.	G	A	2033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.115;ClippingRankSum=0.000;DP=350;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.413;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=47;PP=1111;ReadPosRankSum=1.103;SC=GGCGGCCGGGGTGGTGGACAT;SOR=0.653;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=332;TCF=192;TCR=140;TR=111;WE=5330293;WS=5330275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:232,118:0.34:350
chr7	5331307	rs12667188	A	G	204.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=1;PP=165;SC=TCCCCTCACTAGCCTCTCCCC;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=5331315;WS=5331297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
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chr7	5334472	rs10623123	C	CCT	4550.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.674;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.328;NF=19;NR=39;PP=2505;ReadPosRankSum=0.321;SC=CTGGGTTGTTCCTCTCTCTCT;SOR=0.735;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=80;TCF=24;TCR=56;TR=58;WE=5334480;WS=5334459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,134:0.92:146
chr7	5334582	rs59119551	C	T	1271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=1.274;NF=30;NR=34;PP=783;ReadPosRankSum=0.705;SC=ATCTGCAGACCCCCCGGGGAG;SOR=0.656;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=166;TCF=78;TCR=88;TR=64;WE=5334590;WS=5334572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,69:0.39:179
chr7	5334636	rs11760864	A	T	1109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.388;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=22;PP=640;ReadPosRankSum=0.183;SC=CTTCCCAGGGACTCCCCATGA;SOR=0.335;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=73;TCF=32;TCR=41;TR=44;WE=5334644;WS=5334626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,50:0.60:84
chr7	5336855	rs137903684	TCCCTTCTCTGTC	T	844.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=2.350;NF=2;NR=8;ReadPosRankSum=-0.195;SC=CCACCTCTGTTCCCTTCTCTG;SOR=0.812;Source=Platypus;TCF=4;TR=10;WE=5336874;WS=5336845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,25:0.36:69
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chr7	5338691	rs138638344	G	A	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=1.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.37;ReadPosRankSum=0.485;SOR=0.489;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,14:0.21:67
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chr7	5415874	rs11766794	T	C	5449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.44;ReadPosRankSum=-1.018;SOR=0.728;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,138:0.62:223
chr7	5415877	rs11769187	G	A	5422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.54;ReadPosRankSum=-0.899;SOR=0.711;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,136:0.62:221
chr7	5416426	rs73055894	C	T	1730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.489;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=33;PP=1148;ReadPosRankSum=-0.431;SC=GAGACCATCTCGCTGGGCATG;SOR=0.741;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=234;TCF=143;TCR=91;TR=85;WE=5416434;WS=5416416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,90:0.36:252
chr7	5427720	rs4724663	A	G	6580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=103;NR=110;PP=2965;SC=GCCTCTCCAGACCCGTGGGCC;SOR=0.850;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=213;TCF=103;TCR=110;TR=213;WE=5427728;WS=5427710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr7	5430283	rs67295626	G	A	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.588;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=78;ReadPosRankSum=0.016;SC=GAGAAAAGCTGGGCTGGGCCA;SOR=1.179;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=39;TCF=11;TCR=28;TR=9;WE=5430291;WS=5430273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,10:0.24:41
chr7	5434107	rs73057725	G	A	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.36;ReadPosRankSum=-1.229;SOR=0.762;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,36:0.27:131
chr7	5434135	rs4724668	A	G	654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=19;PP=385;ReadPosRankSum=-2.345;SC=GGGAGCGGAAAGACAGGTCAG;SOR=0.689;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=134;TCF=67;TCR=67;TR=39;WE=5434143;WS=5434125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,42:0.29:145
chr7	5487458	rs4236392	T	C	3063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=69;PP=1842;SC=CCAGCTCTGCTGGGGGCTCCT;SOR=1.490;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=38;TCR=69;TR=107;WE=5487466;WS=5487448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr7	5528883	rs4724701	G	A	2503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.521;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=46;PP=1437;ReadPosRankSum=-0.058;SC=TTAAAAATCAGATTACAAAAC;SOR=0.619;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=183;TCF=106;TCR=77;TR=107;WE=5528891;WS=5528873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,120:0.58:206
chr7	5529758	rs28566736	G	A	6873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=439;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=138;NR=154;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.763;SC=GGTTGTCGGCGCCCAGTGGCT;SOR=0.728;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=415;TCF=196;TCR=219;TR=292;WE=5529766;WS=5529748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,308:0.70:438
chr7	5529922	rs4077245	A	C	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=215;ReadPosRankSum=1.677;SC=AGGAGCCCTGATCACTCCAGC;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=10;WE=5529930;WS=5529912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr7	5530827	rs3801057	G	A	4283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.923;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=108;NR=68;PP=2790;ReadPosRankSum=0.496;SC=TGATTTCTGCGGCCCCTGAAG;SOR=0.940;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=286;TCF=171;TCR=115;TR=176;WE=5530835;WS=5530817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,190:0.62:308
chr7	5535423	rs143689448	G	A	1901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.734;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=19;PP=1252;ReadPosRankSum=0.153;SC=CTCCCTTGCCGCAGAAGGCAG;SOR=0.514;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=114;TCF=85;TCR=29;TR=73;WE=5535431;WS=5535413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,81:0.66:123
chr7	5540769	rs6953642	A	C	2819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=54;ReadPosRankSum=-0.517;SC=ACGCCACCAGAGTCTCCAGGA;SOR=0.672;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=205;TCF=110;TCR=95;TR=118;WE=5540777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,134:0.60:225
chr7	5541657	rs4724704	G	A	2064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.795;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=37;PP=1015;ReadPosRankSum=1.132;SC=CTTTGTCCTCGCTCGCCTGCG;SOR=0.583;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=105;TCF=50;TCR=55;TR=75;WE=5541665;WS=5541647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,90:0.75:120
chr7	5567596	rs852424	C	T	7328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=117;NR=129;PP=2965;SC=ACCCCACAGCCGACCTGCCCA;SOR=0.856;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=246;TCF=117;TCR=129;TR=246;WE=5567604;WS=5567576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,262:1.00:262
chr7	5568366	rs852423	A	G	11037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=408;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=182;NR=196;PP=2965;SC=AGGCAGAGATACACCATGTCA;SOR=0.812;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=379;TCF=182;TCR=197;TR=378;WE=5568374;WS=5568356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,407:1.00:407
chr7	5569327	rs2908425	G	A	5358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=126;NR=49;PP=2965;SC=TGTGAGCCGAGGTCGCCCCCG;SOR=1.974;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=176;TCF=126;TCR=50;TR=175;WE=5569335;WS=5569317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr7	5751250	rs3735289	G	A	205.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=166;SC=CAAAGTACTCGTCCTCATTTG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=5751258;WS=5751240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
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chr7	5760971	rs4720636	A	T	1026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=30;PP=846;SC=TCTTACCATTAGCCAACCTAC;SOR=5.549;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=31;WE=5760979;WS=5760961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
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chr7	5922100	rs35069590	A	AT	11426.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=-1.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=485;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.562;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.041;NF=63;NR=80;PP=2933;ReadPosRankSum=-1.856;SC=CAAGCGTCAGAATAACCAATT;SOR=0.632;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=253;TCF=106;TCR=147;TR=143;WE=5922108;WS=5922090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,320:0.66:484
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chr7	5944600	rs2528324	C	T	317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.84;QD=28.89;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr7	5965334	rs150333500	C	T	92.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.35;MQRankSum=0.253;QD=18.59;ReadPosRankSum=0.842;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
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chr7	5998509	rs139591741	G	C	1364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-5.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.989;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.168;NF=46;NR=10;PP=1096;ReadPosRankSum=0.345;SC=TCTGCTTAGAGAGAAAATGTT;SOR=0.102;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=78;TCF=68;TCR=10;TR=56;WE=5998517;WS=5998499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,54:0.68:79
chr7	6013049	rs1802683	C	G	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=2.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.57;MQRankSum=-0.365;QD=1.99;ReadPosRankSum=0.475;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,5:0.17:29
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chr7	6036980	rs1805319	G	C	6843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.04;QD=25.44;SOR=0.810;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,269:1.00:269
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chr7	6066005	rs6973250	C	T	4771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.363;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.563;NF=124;NR=84;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.685;SC=GCAAACCCTGCGGGCCCCTCC;SOR=0.835;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=305;TCF=179;TCR=126;TR=208;WE=6066013;WS=6065995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,217:0.62:350
chr7	6066057	rs34019419	G	GC	3568.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=402;ExcessHet=3.0103;FS=0.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.11;MQRankSum=3.047;QD=9.01;ReadPosRankSum=-1.321;SOR=0.713;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:276,120:0.30:396
chr7	6066461	rs2639	T	C	2080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=432;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=55;PP=1147;ReadPosRankSum=-0.425;SC=TGGCTTGCACTGGACACCTTT;SOR=0.753;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=397;TCF=208;TCR=189;TR=117;WE=6066476;WS=6066451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:305,127:0.29:432
chr7	6070856	rs10255418	C	T	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=104;ReadPosRankSum=-0.651;SC=AGTCTGGACGCTTGGTTCCAA;SOR=0.512;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=7;WE=6070864;WS=6070852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
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chr7	6449496	rs2303361	T	C	6193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=439;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.152;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=133;NR=121;PP=2962;ReadPosRankSum=0.439;SC=GGAGACCCCTTGTGCTGGACA;SOR=0.674;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=403;TCF=207;TCR=196;TR=254;WE=6449504;WS=6449486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,281:0.64:437
chr7	6450128	rs836561	T	C	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=207;ReadPosRankSum=-0.024;SC=GAAACCCCGCTTGGAAGACTC;SOR=0.723;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=50;TCF=5;TCR=45;TR=14;WE=6450136;WS=6450118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,14:0.27:51
chr7	6456302	rs2288152	C	T	1317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.027;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=20;PP=848;ReadPosRankSum=0.950;SC=ACCTGACCTGCGGGTAGGCGG;SOR=0.479;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=185;TCF=134;TCR=51;TR=68;WE=6456310;WS=6456292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,70:0.36:195
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chr7	6456347	rs1055428	G	T	7135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=468;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.25;ReadPosRankSum=1.214;SOR=0.709;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:164,304:0.65:468
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chr7	6456669	rs836508	C	T	1659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=50;PP=1438;SC=GGATCTGAGACTGCAGAATCA;SOR=5.630;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=52;TCF=2;TCR=50;TR=52;WE=6456677;WS=6456659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr7	6461310	rs79949326	C	T	3494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.993;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=48;PP=2104;ReadPosRankSum=0.687;SC=CACCCATCTTCTGTGTGGTCA;SOR=0.527;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=193;TCF=127;TCR=66;TR=139;WE=6461318;WS=6461300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,155:0.72:214
chr7	6461534	rs2288153	C	T	5211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=349;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.412;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=115;PP=2962;ReadPosRankSum=0.938;SC=TGGAGGATGGCGGGGATGGCA;SOR=0.727;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=324;TCF=155;TCR=169;TR=218;WE=6461542;WS=6461524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,234:0.67:349
chr7	6465441	rs2272157	C	T	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.944;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=308;ReadPosRankSum=2.838;SC=TGAACCTGCACCAGGGCATCT;SOR=0.188;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=16;WE=6465449;WS=6465431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr7	6465472	rs2272156	G	A	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.460;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=221;ReadPosRankSum=-0.077;SC=CCCAGAGTCTGTGGCCCCTCT;SOR=1.609;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=42;TCF=32;TCR=10;TR=14;WE=6465480;WS=6465462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,15:0.35:43
chr7	6472354	rs836532	G	A	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.16;ReadPosRankSum=0.463;SOR=0.623;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,27:0.28:95
chr7	6476237	rs3750038	C	T	3198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.681;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=83;PP=2057;ReadPosRankSum=1.258;SC=TGCAAAAATACAGCTTTTGCA;SOR=0.358;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=201;TCF=75;TCR=126;TR=139;WE=6476245;WS=6476227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,143:0.68:210
chr7	6485740	.	CA	C	113.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=0.000;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.00;ReadPosRankSum=1.064;SOR=0.437;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,15:0.26:57
chr7	6505901	rs2230263	T	C	4303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=86;PP=2719;SC=TGATCATAAATAGCTGCGGAA;SOR=1.300;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=54;TCR=86;TR=140;WE=6505909;WS=6505891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr7	6537655	rs4574760	C	T	4814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.185;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=114;NR=78;PP=2962;ReadPosRankSum=0.488;SC=CTGGCCCCCACCTCTCCAAAA;SOR=0.954;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=285;TCF=164;TCR=121;TR=192;WE=6537683;WS=6537645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,202:0.68:298
chr7	6537821	rs6463568	G	C	6405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=140;PP=2965;SC=GCAGCCCGTCGAGCGCCCGAA;SOR=1.813;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=201;TCF=61;TCR=140;TR=201;WE=6537829;WS=6537811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr7	6541347	rs7791451	C	T	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=233;ReadPosRankSum=1.120;SC=ACTGGAGCCACAGCCAGCTCT;SOR=0.554;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=51;TCF=45;TCR=6;TR=17;WE=6541355;WS=6541337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,17:0.33:51
chr7	6544691	rs2881698	C	T	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.633;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=246;ReadPosRankSum=-2.015;SC=ACCTCCCCCGCCCCGTGTCCT;SOR=1.762;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=37;TCF=9;TCR=28;TR=15;WE=6544699;WS=6544681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,15:0.39:38
chr7	6545333	rs367862172	AGGCT	A	181.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=166;ReadPosRankSum=-0.124;SC=CAGGGACTGAAGGCTTGAGGA;SOR=1.077;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=7;WE=6545344;WS=6545323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,7:0.22:32
chr7	6545619	rs11980487	T	C	695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.543;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=27;PP=498;ReadPosRankSum=1.510;SC=CTCTGAGGGCTGCCATAGGGG;SOR=2.303;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=28;WE=6545627;WS=6545609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,30:0.75:40
chr7	6547902	rs112305062	G	A	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=2.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.85;ReadPosRankSum=1.985;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,16:0.38:42
chr7	6550494	rs12702520	G	A	2280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=385;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.866;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=59;PP=1269;ReadPosRankSum=1.665;SC=TTGCAGGTGGGAAAACTGAGC;SOR=0.561;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=355;TCF=161;TCR=194;TR=117;WE=6550502;WS=6550484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:253,131:0.34:384
chr7	6566322	rs2881723	T	G	6804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=137;NR=95;PP=2965;SC=GGGCCCGGCGTGCGCGGCACA;SOR=1.028;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=234;TCF=138;TCR=96;TR=232;WE=6566330;WS=6566312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr7	6566442	rs12702526	C	T	4259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=82;PP=2535;SC=TTCCCGGACCCCGGATCTCTG;SOR=1.300;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=140;TCF=57;TCR=83;TR=139;WE=6566450;WS=6566432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr7	6590693	rs6463571	G	A	386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=4;PP=136;SC=CCGCGTCCGGGCGCTTGCGGC;SOR=0.941;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=12;WE=6590701;WS=6590683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr7	6591041	rs4724818	C	G	4294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=78;NR=68;PP=2573;SC=AGCCCTGGTTCGTGGCCGGCG;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=146;TCF=78;TCR=68;TR=146;WE=6591049;WS=6591031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr7	6641635	rs13246348	C	T	8885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=186;NR=112;PP=2965;SC=ATGAGGCGCTCTTGCTGTCTT;SOR=1.240;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=300;TCF=187;TCR=113;TR=298;WE=6641643;WS=6641625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,324:1.00:324
chr7	6641832	rs372354466	G	A	1241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.902;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=39;PP=924;ReadPosRankSum=0.786;SC=AGGGAGGCAAGACAGGGCGAG;SOR=2.680;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=62;TCF=9;TCR=53;TR=43;WE=6641840;WS=6641822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,46:0.72:64
chr7	6647738	rs4416743	T	C	1819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=34;NR=36;PP=1376;SC=TGCCCACGCATCCCGGCCACA;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=34;TCR=36;TR=70;WE=6647746;WS=6647728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr7	6713985	rs2243620	A	G	5918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=437;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.539;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=131;NR=126;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.507;SC=AAATCCTTCCATGTGAAACCA;SOR=0.633;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=403;TCF=207;TCR=196;TR=257;WE=6713993;WS=6713975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,276:0.63:435
chr7	6744957	rs7798471	T	C	3586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.419;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=79;PP=2300;ReadPosRankSum=0.009;SC=GAAGTACATCTTGTGGGAGAC;SOR=0.399;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=202;TCF=87;TCR=115;TR=144;WE=6744965;WS=6744947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,153:0.71:216
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chr7	6865862	rs141173433	G	C	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.86;MQRankSum=-0.792;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.217;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
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chr7	7421365	rs61544045	AAT	A	62.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=1.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQRankSum=2.592;QD=1.21;ReadPosRankSum=1.046;SOR=0.248;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,7:0.13:52
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chr7	7459630	rs145255087	TTATG	T	607.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.487;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=1170;ReadPosRankSum=1.630;SC=TTTAAAGACTTTATGTTTTTT;SOR=1.107;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=1;TCR=54;TR=15;WE=7459641;WS=7459606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,20:0.25:79
chr7	7475945	rs2286839	T	G	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.923;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=199;ReadPosRankSum=-1.705;SC=ACCTCACAAGTAGAAAAATCA;SOR=0.058;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=12;WE=7475953;WS=7475935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr7	7477250	rs5882126	T	TA	96.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.599;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=70;ReadPosRankSum=-0.196;SC=GCATCTTTTGTAACCACTGCT;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=4;WE=7477258;WS=7477240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr7	7480382	rs16878052	A	G	2244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=402;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.387;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=51;PP=1472;ReadPosRankSum=-0.065;SC=GACACAATACAAACTCCTCAA;SOR=0.731;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=363;TCF=209;TCR=154;TR=121;WE=7480390;WS=7480372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:267,133:0.33:400
chr7	7483083	rs10234554	C	T	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.574;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=268;ReadPosRankSum=0.172;SC=GCTTCCAAGACAGTATTCATA;SOR=0.350;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=87;TCF=71;TCR=16;TR=25;WE=7483091;WS=7483073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,25:0.28:88
chr7	7491861	rs77154721	A	G	1099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=2.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.09;ReadPosRankSum=1.319;SOR=0.413;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,32:0.35:91
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chr7	7491908	rs16878062	T	G	1153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.863;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=17;PP=810;ReadPosRankSum=0.560;SC=TATATAATGTTACATAAAGTA;SOR=0.960;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=168;TCF=105;TCR=63;TR=51;WE=7491916;WS=7491898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,59:0.32:187
chr7	7495735	rs55745506	T	C	1035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.696;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=25;PP=590;ReadPosRankSum=-0.456;SC=CCACAGGTCCTATATCCCCCT;SOR=0.465;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=188;TCF=86;TCR=102;TR=56;WE=7495743;WS=7495725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,62:0.29:211
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chr7	7514331	rs6965546	C	T	1131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.76;ReadPosRankSum=-1.392;SOR=0.689;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:225,76:0.25:301
chr7	7516904	rs60977515	T	A	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=2.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQRankSum=-0.433;QD=1.54;ReadPosRankSum=-0.501;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,16:0.18:91
chr7	7528880	rs12671912	G	A	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=209;ReadPosRankSum=-0.094;SC=CAGCCTGGGTGACAGTGAGAT;SOR=1.292;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=11;WE=7528888;WS=7528870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr7	7528951	rs6463696	C	T	2884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=25;PP=1820;SC=GACCATTTATCCTAAACAGAA;SOR=1.855;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=69;TCR=25;TR=94;WE=7528959;WS=7528941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr7	7545691	rs10486176	G	C	1957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.448;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=44;PP=1282;ReadPosRankSum=0.932;SC=TGGAGGTCCAGTAATTCCCTG;SOR=0.802;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=275;TCF=149;TCR=126;TR=100;WE=7545699;WS=7545681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:192,106:0.36:298
chr7	7551288	rs17168350	C	T	781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FS=2.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.78;ReadPosRankSum=-0.215;SOR=0.907;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:156,51:0.25:207
chr7	7551561	rs7798119	C	A	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-4.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.912;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=178;ReadPosRankSum=-0.561;SC=TCTGACATTACCTGTCTGAGA;SOR=0.100;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=12;WE=7551569;WS=7551551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
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chr7	7571094	rs7804532	G	C	5272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.855;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=108;PP=2962;ReadPosRankSum=1.363;SC=CGTAGAAAGTGCAATGGTGAT;SOR=0.644;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=311;TCF=142;TCR=169;TR=200;WE=7571112;WS=7571084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,219:0.64:341
chr7	7613039	rs61744397	C	T	3082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=563;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=83;PP=1907;ReadPosRankSum=-1.305;SC=AAACTGAACCCACAATAATTG;SOR=0.653;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=528;TCF=259;TCR=269;TR=165;WE=7613047;WS=7613029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:388,174:0.31:562
chr7	7622696	rs4720741	C	T	1242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=8;PP=947;SC=AACTGACTTACTTTCCAAATA;SOR=2.584;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=35;TCR=8;TR=43;WE=7622704;WS=7622686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr7	7627994	rs6463702	T	C	701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=2;PP=575;SC=TTAATGGCTCTGCAAGATAAA;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=7628002;WS=7627984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr7	7628275	rs7801367	C	T	792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=23;PP=615;SC=TTTATAATTACATATGTATGA;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=28;WE=7628283;WS=7628265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr7	7645535	rs10276434	A	G	2481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=15;PP=1733;SC=ATAAAATATTATGATATAGTT;SOR=2.720;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=59;TCR=15;TR=74;WE=7645543;WS=7645525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr7	7645806	rs2286209	A	G	3201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=81;PP=2194;ReadPosRankSum=0.411;SC=CCAAAGTATGAATTTTATTTT;SOR=0.655;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=178;TCF=57;TCR=121;TR=118;WE=7645814;WS=7645796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,127:0.66:193
chr7	7646651	rs7806046	G	T	9809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=363;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=186;NR=153;PP=2965;SC=GCCCTGTGTCGGCATGCACGT;SOR=0.886;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=341;TCF=187;TCR=154;TR=339;WE=7646659;WS=7646641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,360:1.00:360
chr7	7646687	rs4222	A	G	10895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=416;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=198;NR=189;PP=2965;SC=TGGATACAACAGGGAATCTGG;SOR=0.703;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=387;TCF=198;TCR=189;TR=387;WE=7646695;WS=7646677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,416:1.00:416
chr7	7679885	rs3735460	G	A	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=5.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.960;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=168;ReadPosRankSum=1.033;SC=TTCATCCCCCGTTATCCAGGC;SOR=1.990;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=46;TCR=5;TR=13;WE=7679893;WS=7679875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,13:0.23:57
chr7	7712941	rs148595964	TAGCAGCAGCAGC	T,TAGCAGCAGCAGCAGC	2390.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=3.345;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.465;NF=9,9;NR=7,7;PP=2119,94;ReadPosRankSum=1.298;SC=CTATTTCAGGTAGCAGCAGCA;SOR=2.272;SbPval=0.05;Source=Platypus;TC=48;TCF=15;TCR=33;TR=16,16;WE=7712963;WS=7712931;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.77,0.18:77
chr7	7841338	rs11555073	C	G	2632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=473;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.562;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=65;PP=1803;ReadPosRankSum=0.719;SC=CAGCAAGAGGCAAAACTTCGG;SOR=0.632;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=431;TCF=239;TCR=192;TR=143;WE=7841346;WS=7841328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:319,152:0.32:471
chr7	7841561	rs2348558	C	T	696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=21;PP=553;SC=TGCTAAACTCCTTTAGTGCTA;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=7841569;WS=7841551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr7	8043504	rs38013	A	G	5777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=131;NR=70;PP=2965;SC=TATTTTATTCACTAATGACTA;SOR=1.453;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=201;TCF=131;TCR=70;TR=201;WE=8043512;WS=8043494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr7	8110475	rs10253861	G	A	2941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=18;PP=1940;SC=ATGAAATCAAGGGAAATACTA;SOR=2.502;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=63;TCR=18;TR=81;WE=8110483;WS=8110465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr7	8110780	rs10486207	A	G	1891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=50;PP=1395;SC=GGAATTGTCCACTTAGAGGGT;SOR=4.443;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=57;TCF=5;TCR=52;TR=55;WE=8110788;WS=8110770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr7	8125964	rs929509	C	T	15420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=566;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=241;NR=274;PP=2965;ReadPosRankSum=0.243;SC=TCAAGAACTCCCCTAACTCTG;SOR=0.456;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=516;TCF=242;TCR=274;TR=515;WE=8125972;WS=8125954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,564:1.00:565
chr7	8126194	rs12847	A	G	1587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=37;PP=1101;ReadPosRankSum=-0.867;SC=CCTCCACCCTATGTTCCATGG;SOR=0.971;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=53;TCF=15;TCR=38;TR=52;WE=8126202;WS=8126184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,55:0.98:56
chr7	8132252	rs4725069	T	C	5839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=94;PP=2965;SC=TAGCTGACTCTCTGTTCACCT;SOR=0.780;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=186;TCF=92;TCR=94;TR=186;WE=8132260;WS=8132242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr7	8181555	rs80350640	C	CCA	3836.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=2.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.04;ReadPosRankSum=2.264;SOR=0.884;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:400,145:0.27:545
chr7	8196529	rs10282493	A	T	7251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=123;NR=167;PP=2965;SC=GGATTGCAGTAGATTCTCATT;SOR=1.332;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=309;TCF=136;TCR=173;TR=290;WE=8196537;WS=8196519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,289:1.00:289
chr7	8196567	rs200840693	AAAAAAAAAAAAAAAAAAG	A	1434.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FS=5.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.93;MQRankSum=1.899;QD=12.93;ReadPosRankSum=3.353;SOR=0.336;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,72:0.65:111
chr7	8475147	rs6949787	C	T	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.88;ReadPosRankSum=0.108;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr7	9765662	rs10240050	C	T	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.160;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.808;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.07;MQRankSum=0.589;NF=3;NR=1;PP=25;ReadPosRankSum=1.085;SC=TATTATTGGACGAGGCGGGTC;SOR=1.518;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=9;TCF=5;TCR=4;TR=4;WE=9765670;WS=9765652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr7	9765716	rs10255217	A	C	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=53.72;MQRankSum=-0.303;NF=2;NR=3;PP=21;ReadPosRankSum=0.180;SC=TGGCCGGGCGAGGAGCGGGGC;SOR=1.022;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=5;WE=9765724;WS=9765706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr7	10973362	rs7789764	C	T	3036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=56;NR=49;PP=1657;SC=CTCAAATACACAGAGACGGTA;SOR=0.745;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=105;TCF=56;TCR=49;TR=105;WE=10973370;WS=10973352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr7	11022230	rs218966	A	G	6556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FS=3.876;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.33;ReadPosRankSum=0.877;SOR=0.857;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,248:1.00:249
chr7	11022564	rs218965	G	A	11468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=417;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=201;NR=183;PP=2965;SC=GGAGATCTGCGTCTCAGAAAG;SOR=0.747;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=385;TCF=202;TCR=183;TR=384;WE=11022572;WS=11022554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,417:1.00:417
chr7	11075263	rs2353340	A	G	1064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.506;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=9;PP=653;ReadPosRankSum=-0.448;SC=CTTTCTTTGTATAGGATATAG;SOR=0.961;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=131;TCF=95;TCR=36;TR=42;WE=11075271;WS=11075253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,49:0.34:146
chr7	11485527	rs10262052	T	C	976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=1;PP=637;SC=TGCCATTGAATGTCCTGTTAC;SOR=4.047;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=27;WE=11485535;WS=11485523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
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chr7	11509561	rs2285744	G	C	3475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=68;PP=2275;ReadPosRankSum=1.336;SC=TCACAATACAGTCCTTCTTAC;SOR=0.696;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=235;TCF=127;TCR=108;TR=146;WE=11509569;WS=11509551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,157:0.63:249
chr7	11521542	rs3735502	T	C	3519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.411;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=77;PP=2023;ReadPosRankSum=-1.467;SC=CTTTCGGGCATGGGGCATCAC;SOR=0.752;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=268;TCF=135;TCR=133;TR=153;WE=11521550;WS=11521532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,166:0.57:289
chr7	11581003	rs2072139	G	A	1597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=358;ExcessHet=3.0103;FS=0.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.46;ReadPosRankSum=-0.204;SOR=0.764;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:258,100:0.28:358
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chr7	11581134	rs2074603	T	C	2115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.437;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=56;PP=1202;ReadPosRankSum=-0.440;SC=CCAGTCTCACTGCTTTCCAGT;SOR=0.556;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=321;TCF=148;TCR=173;TR=108;WE=11581142;WS=11581111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:226,120:0.35:346
chr7	11630298	rs2074602	C	A	2708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=67;PP=1520;ReadPosRankSum=-0.371;SC=CCAGCAGCAACCATAATTATT;SOR=0.690;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=166;TCF=64;TCR=102;TR=110;WE=11630306;WS=11630288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,125:0.66:188
chr7	11633193	rs2354954	G	A	1822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=47;PP=1252;SC=TGTCTTCTACGCTCAAGAGTG;SOR=2.267;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=16;TCR=47;TR=63;WE=11633201;WS=11633183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr7	11676377	rs2074598	G	A	7518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=516;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.547;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=164;NR=150;PP=2962;ReadPosRankSum=0.495;SC=TTGAAATCACGGGCTGACACT;SOR=0.635;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=480;TCF=254;TCR=226;TR=314;WE=11676385;WS=11676367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,337:0.65:515
chr7	12255434	rs6460901	C	T	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=3.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.36;ReadPosRankSum=0.170;SOR=1.000;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:102,41:0.29:143
chr7	12255511	rs6460902	G	A	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=31;ReadPosRankSum=0.955;SC=ATAATCCCCTGTGTGCTGCTT;SOR=0.484;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=6;WE=12255519;WS=12255501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,6:0.21:28
chr7	12263725	rs17165746	T	A	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-4.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=133;ReadPosRankSum=1.387;SC=ATGTGAAAATTTGGTAACATT;SOR=0.134;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=44;TCR=0;TR=11;WE=12263733;WS=12263715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,13:0.27:49
chr7	12263799	rs11509137	TG	CA	3594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=2.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=22;PP=2944;ReadPosRankSum=-1.458;SC=TCTAATGTTGTGTTATATAAT;SOR=0.690;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=249;TCF=177;TCR=72;TR=87;WE=12263808;WS=12263789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,99:0.36:275
chr7	12263971	rs147889591	G	A	4395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.961;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=114;PP=2785;ReadPosRankSum=-0.543;SC=GCCTATGTCAGTTATGATGTT;SOR=0.787;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=278;TCF=95;TCR=183;TR=171;WE=12263979;WS=12263961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,194:0.64:304
chr7	12269260	rs3839691	A	ATGTT	130.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.85;ReadPosRankSum=0.045;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,6:0.18:34
chr7	12269417	rs3173615	C	G	726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.219;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=23;PP=450;ReadPosRankSum=-0.505;SC=AACAACATAACCATTATTGGT;SOR=0.994;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=137;TCF=65;TCR=72;TR=40;WE=12269425;WS=12269407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,44:0.28:156
chr7	12270625	rs2302635	G	A	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.524;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=151;ReadPosRankSum=-2.027;SC=TAAGATAGGAGGGAGAATTTT;SOR=0.404;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=13;WE=12270633;WS=12270615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr7	12270770	rs2302634	T	A	989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=2.667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.11;ReadPosRankSum=0.744;SOR=1.006;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,33:0.27:122
chr7	12270791	rs73677558	T	C	987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=0.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.97;ReadPosRankSum=-1.181;SOR=0.819;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,31:0.25:124
chr7	12270815	rs2302633	C	T	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.49;ReadPosRankSum=0.845;SOR=0.647;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,22:0.18:123
chr7	12270900	rs16877361	C	T	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=3.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.59;ReadPosRankSum=-1.920;SOR=0.272;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,10:0.16:61
chr7	12271452	rs3800842	A	G	1750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.316;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=28;PP=1089;ReadPosRankSum=0.409;SC=CCTCACTTACATTATTTTTAG;SOR=0.959;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=272;TCF=176;TCR=96;TR=91;WE=12271460;WS=12271442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:194,100:0.34:294
chr7	12370657	rs2253353	A	G	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=94;ReadPosRankSum=0.464;SC=TATGATTACAACAGAGATCAT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=5;WE=12370665;WS=12370647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr7	12370702	rs3217131	AT	A	424.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.593;HP=7;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=328;ReadPosRankSum=-0.237;SC=TCTTTAAGATATTTTTTGAAT;SOR=2.200;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=13;WE=12370710;WS=12370692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr7	12370794	rs1059002	T	C	1461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.570;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=19;PP=922;ReadPosRankSum=-1.045;SC=TTGTAATTCATATACTTGATG;SOR=1.080;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=101;TCF=64;TCR=37;TR=59;WE=12370802;WS=12370784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,65:0.58:112
chr7	12370952	rs6954265	C	T	1657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.766;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=34;PP=955;ReadPosRankSum=-0.128;SC=TGCCACTAGACTCAATACTGT;SOR=0.927;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=89;TCF=41;TCR=48;TR=61;WE=12370960;WS=12370942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,70:0.69:101
chr7	12371001	rs6954555	G	A	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=299;ReadPosRankSum=-0.535;SC=CATACTTAAGGTCCAAGCTGT;SOR=0.683;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=37;TCF=11;TCR=26;TR=22;WE=12371009;WS=12370991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,25:0.62:40
chr7	12371019	rs3815534	A	T	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=174;ReadPosRankSum=0.507;SC=TGTCATAACCAAATGGAGCTT;SOR=0.793;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=12;WE=12371027;WS=12371009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr7	12372999	rs6460928	T	G	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=412;ReadPosRankSum=-0.791;SC=TTGGAAATAATAAAAAAACAT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=17;WE=12373007;WS=12372989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,17:0.77:22
chr7	12373082	rs6460929	C	T	2868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.718;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=36;PP=1885;ReadPosRankSum=-0.091;SC=TCTTTAAACTCTGAAATACCT;SOR=0.819;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=152;TCF=105;TCR=47;TR=113;WE=12373090;WS=12373072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,119:0.74:160
chr7	12373353	rs6460930	TG	CA	1707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.593;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=32;PP=1722;ReadPosRankSum=0.174;SC=TATGTACTCTTGTCTTTCAGA;SOR=1.634;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=52;TCF=7;TCR=45;TR=36;WE=12373362;WS=12373343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,43:0.69:62
chr7	12375667	rs35608044	G	GA	1550.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=8;PP=1112;ReadPosRankSum=0.314;SC=GCATGCTGGAGTTTTTTCCCC;SOR=0.834;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=36;TCR=14;TR=28;WE=12375675;WS=12375657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,45:0.60:75
chr7	12376811	rs2192828	A	C	8878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=589;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.167;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=196;NR=178;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.501;SC=ACTTTTTTGGAATCTCCTACC;SOR=0.606;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=562;TCF=296;TCR=266;TR=374;WE=12376819;WS=12376801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:196,392:0.67:588
chr7	12382637	rs1440030	C	T	2932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.682;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=37;PP=1965;ReadPosRankSum=-0.685;SC=GTTCATTTCACGTAGCATTAA;SOR=0.586;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=155;TCF=108;TCR=47;TR=116;WE=12382645;WS=12382627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,125:0.73:172
chr7	12383967	rs1440032	T	A	4203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-4.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.167;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=85;PP=2517;ReadPosRankSum=-1.050;SC=CAAATACAATTTATCATGCAA;SOR=0.780;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=247;TCF=126;TCR=121;TR=168;WE=12383975;WS=12383957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,185:0.67:275
chr7	12391319	rs6967385	G	T	1417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.155;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=41;PP=931;ReadPosRankSum=1.060;SC=GTAGTAAATTGATTTACAAAC;SOR=1.012;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=81;TCF=24;TCR=57;TR=57;WE=12391327;WS=12391309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,60:0.71:85
chr7	12393966	rs6944618	A	G	16227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.84;SOR=1.410;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,354:1.00:354
chr7	12393974	rs6944626	A	C	17425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=415;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.09;SOR=1.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,414:1.00:414
chr7	12394053	rs6945167	G	T	16953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=632;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=298;NR=290;PP=2965;SC=ATTCAGGCATGCTACTCCCTC;SOR=0.696;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=588;TCF=298;TCR=290;TR=588;WE=12394061;WS=12394043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,631:1.00:631
chr7	12394202	rs10267441	A	T	1193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=4.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=40;PP=953;ReadPosRankSum=0.603;SC=TCTACTTTTTATGTCTGTCCT;SOR=1.263;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=58;TCF=3;TCR=55;TR=42;WE=12394210;WS=12394192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,44:0.71:62
chr7	12395813	rs2119141	T	C	4607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=67;PP=2912;SC=AAGGGTTGGATTGGCACCCAC;SOR=0.821;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=151;TCF=84;TCR=67;TR=151;WE=12395821;WS=12395803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr7	12396040	rs4719307	A	G	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.49;ReadPosRankSum=-1.893;SOR=0.072;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr7	12400837	rs2053380	G	A	861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.734;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=15;PP=407;ReadPosRankSum=0.192;SC=ATATATGACCGTTATTTTGGG;SOR=0.577;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=93;TCF=56;TCR=37;TR=36;WE=12400845;WS=12400827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,45:0.42:107
chr7	12406989	rs6460939	C	G	1087.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.315;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=21;PP=717;ReadPosRankSum=-0.187;SC=ATACCTGTAGCTTAGTAACTT;SOR=0.855;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=145;TCF=82;TCR=63;TR=53;WE=12406997;WS=12406979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,57:0.36:157
chr7	12410112	rs963323	G	A	1833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=50;PP=1102;ReadPosRankSum=-0.166;SC=CAGTGTGTCAGACATGCTTTT;SOR=0.678;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=210;TCF=87;TCR=123;TR=87;WE=12410120;WS=12410102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,96:0.41:236
chr7	12417407	rs7793993	C	T	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=1.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.33;ReadPosRankSum=1.617;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,13:0.17:75
chr7	12418938	rs10499421	G	C	2449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=58;NR=18;PP=1776;SC=AAACTTTGTTGCGCATTAGAA;SOR=2.219;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=58;TCR=18;TR=76;WE=12418946;WS=12418928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr7	12418964	rs10270931	T	C	4157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=94;NR=46;PP=2867;SC=GGGGCTTTTCTTCAAATATGG;SOR=1.531;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=140;TCF=94;TCR=46;TR=140;WE=12418972;WS=12418954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr7	12419039	rs10570724	TCA	T	14164.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=136;PP=2965;SC=CATGGACAGATCACAGTTTGG;SOR=0.772;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=191;TCF=52;TCR=139;TR=184;WE=12419048;WS=12419029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,316:1.00:316
chr7	12419108	rs6967241	A	T	9347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=348;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=157;NR=165;PP=2965;SC=CGTACCTTAAAGCCTGCAAAA;SOR=0.801;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=322;TCF=157;TCR=165;TR=322;WE=12419116;WS=12419098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,348:1.00:348
chr7	12420092	rs1025787	G	C	1729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=3;PP=1267;SC=AAAATAAAATGCAACTGTTTT;SOR=5.058;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=44;TCF=41;TCR=3;TR=44;WE=12420100;WS=12420082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr7	12420447	rs6959370	T	G	2938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=62;PP=1979;SC=TATAACTCTGTGGTTTATCTT;SOR=1.522;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=36;TCR=62;TR=98;WE=12420455;WS=12420437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr7	12420517	rs6460941	T	A	701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=21;PP=546;SC=AAAGTAATACTTTCATATTCT;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=12420525;WS=12420507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr7	12609988	rs2240571	G	C	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.260;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=441;ReadPosRankSum=1.351;SC=CCAGAAATAAGAGGATTAGCG;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=20;WE=12609996;WS=12609978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,20:0.62:32
chr7	12610594	rs2240572	A	G	1131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=30;PP=718;ReadPosRankSum=0.773;SC=TTCACCTACCACCTGCACTTC;SOR=0.638;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=102;TCF=43;TCR=59;TR=53;WE=12610602;WS=12610584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,56:0.51:109
chr7	12611252	rs6460967	T	C	3004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.400;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=70;PP=1920;ReadPosRankSum=-0.362;SC=CAGATAGAAGTAAGAAAAAAA;SOR=0.542;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=159;TCF=61;TCR=98;TR=115;WE=12611260;WS=12611242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,125:0.72:173
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chr7	12617552	rs10248067	C	G	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=101;ReadPosRankSum=1.194;SC=AGTATTTTAGCTAAAAGATCT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=7;WE=12617560;WS=12617542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr7	12620804	rs17283717	C	T	2372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.914;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=48;PP=1208;ReadPosRankSum=0.218;SC=TTAGCTGGGACAGTTTCAACA;SOR=0.819;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=157;TCF=81;TCR=76;TR=95;WE=12620812;WS=12620794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,112:0.63:179
chr7	12636026	rs758111	T	C	7255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=114;NR=135;PP=2965;SC=GCCTCCCTGATGTCTGCATTC;SOR=1.071;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=249;TCF=114;TCR=135;TR=249;WE=12636034;WS=12636016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,277:1.00:277
chr7	12644334	rs849778	G	T	1262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FS=1.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQRankSum=2.406;QD=4.18;ReadPosRankSum=0.954;SOR=0.564;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:224,78:0.26:302
chr7	12644348	rs78612532	G	GGT	1121.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQRankSum=2.336;QD=5.72;ReadPosRankSum=0.300;SOR=0.664;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:147,49:0.25:196
chr7	12684340	rs2691810	C	T	4142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=89;PP=2731;SC=TGTAAGTGTCCTTAAAAATAG;SOR=1.778;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=44;TCR=89;TR=133;WE=12684348;WS=12684330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr7	12727826	rs2280633	G	C	3698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-2.294;NF=89;NR=59;PP=2336;ReadPosRankSum=-0.556;SC=AAGAGAAGTTGTAAACCAAGA;SOR=0.701;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=236;TCF=141;TCR=95;TR=148;WE=12727834;WS=12727816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,162:0.64:254
chr7	13946316	rs17167633	C	T	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=360;ReadPosRankSum=-0.676;SC=TATGGTTAAACCACAATCAAC;SOR=2.419;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=16;WE=13946324;WS=13946306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,15:0.79:19
chr7	13947289	rs10950497	G	A	975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.182;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=16;PP=560;ReadPosRankSum=-0.419;SC=CTGCAAGTATGTCATTGTTAG;SOR=0.504;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=56;TCF=35;TCR=21;TR=42;WE=13947302;WS=13947279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,45:0.76:59
chr7	13978645	rs3801098	C	T	1826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=35.13;ReadPosRankSum=-0.333;SOR=1.571;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,45:0.87:52
chr7	13978648	rs3801099	T	A	1856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=33.76;ReadPosRankSum=0.630;SOR=1.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,46:0.84:55
chr7	13978809	rs9639168	T	C	5107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=362;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.577;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=105;NR=112;PP=2806;ReadPosRankSum=-0.818;SC=CAGGCAGAGCTGATTTCTGAA;SOR=0.806;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=323;TCF=162;TCR=161;TR=217;WE=13978817;WS=13978799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,237:0.65:362
chr7	14016939	rs2074670	T	C	1793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=5.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.80;ReadPosRankSum=-1.648;SOR=0.339;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,85:0.65:130
chr7	14017007	rs2066977	CC	TG	3373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.987;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=39;PP=2580;ReadPosRankSum=0.315;SC=AAGAAGGAAACCAGAAAGACA;SOR=0.759;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=130;TCF=67;TCR=63;TR=76;WE=14017016;WS=14016997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,86:0.59:145
chr7	14017126	rs5882424	T	TA	779.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=1.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.67;MQRankSum=1.662;QD=14.44;ReadPosRankSum=-0.240;SOR=0.437;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,33:0.61:54
chr7	14025640	rs3801110	G	A	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.852;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=101;ReadPosRankSum=-0.045;SC=GTCAATTTCAGCAAACATAAC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=6;WE=14025648;WS=14025630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr7	14025727	rs3823704	C	T	2178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.159;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=20;PP=1514;ReadPosRankSum=-0.117;SC=ATTTCCTAAGCATTAGATACA;SOR=1.149;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=147;TCF=104;TCR=43;TR=86;WE=14025735;WS=14025717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,93:0.57:164
chr7	14025766	rs10215655	T	A	4391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.143;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=111;NR=63;PP=2823;ReadPosRankSum=1.441;SC=GTGAACAAGGTGGAAAGAAGA;SOR=0.883;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=287;TCF=174;TCR=113;TR=174;WE=14025774;WS=14025756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,195:0.61:320
chr7	14026357	rs3213661	A	G	1606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=40;PP=1120;SC=CAAATCTTTAATCTTCATTAA;SOR=3.342;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=49;TCF=8;TCR=41;TR=48;WE=14026365;WS=14026347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr7	14027867	rs59844225	G	GCA	994.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.139;NF=0;NR=30;PP=1321;ReadPosRankSum=-0.523;SC=ACACGCGCGCGCACACACACA;SOR=0.760;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=66;TCF=1;TCR=65;TR=30;WE=14027876;WS=14027857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,35:0.60:58
chr7	14028220	.	G	GAA	369	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;FR=1.0000;HP=14;HapScore=2;MGOF=90;MMLQ=16;MQ=51.98;NF=19;NR=4;PP=369;QD=16.2173913043;SC=GTAGAGAAATGAAAAAAAAAA;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=23;WE=14028228;WS=14028210;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,23:0.85:27
chr7	14028245	rs11460974	G	GA	1364.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=0.000;QD=19.50;ReadPosRankSum=-0.605;SOR=0.619;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,60:0.86:70
chr7	14216345	rs3216996	A	AAGACT	1645.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.595;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=4;PP=1656;ReadPosRankSum=1.512;SC=CAACAACAAAAAGACTATTTG;SOR=1.602;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=68;TCF=52;TCR=16;TR=31;WE=14216353;WS=14216335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,41:0.50:82
chr7	14217673	rs6966154	G	A	2669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.780;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=54;PP=1622;ReadPosRankSum=0.473;SC=CCACGCAGGAGCACTGAGCCA;SOR=0.502;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=162;TCF=89;TCR=73;TR=113;WE=14217681;WS=14217663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,121:0.67:180
chr7	14712793	rs34768816	AG	A	862.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.018;NF=0;NR=25;PP=856;ReadPosRankSum=-0.264;SC=AGAGTCATAAAGGAATTCATA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=0;TCR=51;TR=25;WE=14712801;WS=14712783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,29:0.51:57
chr7	14722075	rs117382294	C	G	1146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=4;PP=859;ReadPosRankSum=-0.124;SC=TATGCTTACACTCAGTTTCAG;SOR=1.217;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=43;TCR=5;TR=37;WE=14722083;WS=14722065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,41:0.76:54
chr7	14737622	rs145306944	AAAAG	A	731.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=5.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.94;MQRankSum=2.101;QD=22.87;ReadPosRankSum=0.234;SOR=0.113;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,20:0.62:32
chr7	14741152	rs55766546	C	G	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5004;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=210;ReadPosRankSum=0.293;SC=TCAGATCACTCTCTCGCAAAA;SOR=2.985;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=9;WE=14741160;WS=14741142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,12:0.86:14
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chr7	15458033	rs4469360	C	G	1040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=10;PP=618;SC=TATATATTCACTAAAAACGAA;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=24;TCR=10;TR=34;WE=15458041;WS=15458023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
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chr7	15725797	rs113582077	ATGG	A	4055.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.352;NF=26;NR=62;PP=2994;ReadPosRankSum=0.365;SC=GATGGTGGTGATGGTGGTGGT;SOR=1.142;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=36;TCR=86;TR=88;WE=15725810;WS=15725787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:11,153:0.93:164
chr7	15726066	rs1050290	G	A	14116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=546;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=252;NR=256;PP=2965;ReadPosRankSum=2.811;SC=AGACTTCACGGCGGTTCCAAA;SOR=0.061;Source=Platypus;TCF=252;TR=508;WE=15726074;WS=15726056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,540:0.99:543
chr7	15726117	rs33970897	A	AT,ATT	3839.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.9996;FS=1.833;HP=10;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=108;PP=1381;ReadPosRankSum=1.155;SC=AAACCGTGTGATTTTTTTTTT;SOR=0.401;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=180;TCF=7;TCR=173;TR=114;WE=15726137;WS=15726107;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.18,0.79:166
chr7	15726129	rs11975534	A	C	4526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=41;NR=121;PP=2965;SC=TTTTTTTTTAACCTCCCAAAG;SOR=1.402;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=170;TCF=43;TCR=127;TR=162;WE=15726137;WS=15726107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr7	16129153	rs28379235	C	T	682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=0;PP=363;SC=TATATATGTACGTACATACAT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=16129161;WS=16129143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr7	16129172	rs9691136	A	G	932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=3;PP=606;SC=ATATATATGTATATACATGTA;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=24;WE=16129180;WS=16129162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr7	16129214	rs11773533	G	A	1844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=43;NR=20;PP=1106;SC=ATACATGCATGTATATACATA;SOR=1.512;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=43;TCR=20;TR=63;WE=16129222;WS=16129204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr7	16131260	rs1528137	C	T	2882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=29;PP=1747;SC=AGCGGGGGCACAAAGCACAAT;SOR=1.522;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=66;TCR=29;TR=95;WE=16131268;WS=16131250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr7	16255602	rs4389828	A	T	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.391;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.282;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=67;ReadPosRankSum=0.614;SC=TCACTTATCAATAATATCCTC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=5;WE=16255610;WS=16255592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr7	16298434	rs1295153	T	C	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=199;ReadPosRankSum=1.599;SC=TCTCCAAAAATGTGTAGAAGA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=10;WE=16298442;WS=16298424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr7	16298766	rs5882563	A	AT	215.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.638;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=170;ReadPosRankSum=0.330;SC=AAAAAAATGAAACATGCTGAA;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=6;WE=16298774;WS=16298756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr7	16505054	rs111391406	GA	G	219.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=1.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.28;ReadPosRankSum=1.844;SOR=1.154;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,14:0.40:35
chr7	16505341	rs6945425	T	C	5007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=100;PP=2965;SC=ATTCTTTTGCTTCTGCTTCTG;SOR=1.334;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=167;TCF=67;TCR=100;TR=167;WE=16505349;WS=16505331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr7	16566391	rs6461263	T	G	1180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=6;PP=790;ReadPosRankSum=-0.915;SC=GGCCACACGCTCAAACGTCAC;SOR=0.708;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=55;TCR=8;TR=47;WE=16566399;WS=16566381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,52:0.74:70
chr7	16571973	rs1404173	A	G	825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.49;ReadPosRankSum=-0.114;SOR=1.044;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,21:0.75:28
chr7	16571976	rs1404172	C	G	882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.75;ReadPosRankSum=0.836;SOR=0.743;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,23:0.70:33
chr7	16572051	rs1404171	C	T	2242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.693;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=29;PP=1554;ReadPosRankSum=0.360;SC=GTTATTGTTACTGACTGCAAG;SOR=0.818;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=139;TCF=96;TCR=43;TR=92;WE=16572059;WS=16572041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,96:0.66:145
chr7	16577376	rs6961390	G	A	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=231;ReadPosRankSum=-1.605;SC=TCTTAATTTTGTATTCCTAAT;SOR=0.569;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=15;WE=16577384;WS=16577366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr7	16597114	rs6951596	T	C	703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=19;PP=363;ReadPosRankSum=0.845;SC=AATTAAGTAATAACTTTCAAC;SOR=0.722;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=122;TCF=55;TCR=67;TR=34;WE=16597122;WS=16597104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,41:0.31:133
chr7	16597174	rs6969347	A	G	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.46;ReadPosRankSum=-0.290;SOR=0.523;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,17:0.27:62
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chr7	16685056	rs28362560	C	T	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=102;ReadPosRankSum=0.777;SC=GTCACCCAGGCCAGGAGCGCC;SOR=0.728;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=41;TCF=36;TCR=5;TR=10;WE=16685064;WS=16685046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,10:0.23:43
chr7	16705132	.	TTG	T	193.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=0.000;DP=290;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.78;ReadPosRankSum=0.531;SOR=0.756;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:218,29:0.12:247
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chr7	16745589	rs1149510	T	C	1256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=32;NR=6;PP=964;SC=AGTATGCTGGTGCAATGGCAG;SOR=3.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=32;TCR=6;TR=38;WE=16745597;WS=16745579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr7	16793504	rs6975847	A	G	811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=3;PP=593;ReadPosRankSum=0.936;SC=CGCCTGGGCCAGGCCCCAAAG;SOR=0.822;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=52;TCF=47;TCR=5;TR=33;WE=16793512;WS=16793494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,35:0.66:53
chr7	16793668	rs75735669	A	G	6242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=478;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.128;NF=128;NR=140;PP=2962;ReadPosRankSum=0.946;SC=GAGTATCCCCAGTCCGTTCCT;SOR=0.689;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=438;TCF=209;TCR=229;TR=268;WE=16793676;WS=16793658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,293:0.61:478
chr7	16793779	rs11405941	G	GC	2385.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=40;PP=1931;SC=GGCTTCCCACGTCTGCGCGCC;SOR=2.760;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=2;TCR=43;TR=42;WE=16793787;WS=16793769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr7	16815786	rs2290836	C	G	7106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.23;SOR=1.016;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr7	16816000	rs2290837	T	C	3722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=79;PP=2592;SC=TGTTGCTATTTTTTGTATCCT;SOR=1.452;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=124;TCF=45;TCR=79;TR=124;WE=16816008;WS=16815990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr7	16818799	rs6461276	A	G	3265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=73;PP=2250;SC=GTTTTGCATGACAAAGGGCCT;SOR=2.024;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=104;TCF=31;TCR=73;TR=104;WE=16818807;WS=16818789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr7	16823095	rs11491	G	A	15315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=576;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=259;NR=276;PP=2965;SC=ACCCCCGCGCGAATCCTAGTG;SOR=0.834;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=538;TCF=259;TCR=279;TR=535;WE=16823103;WS=16823085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,574:1.00:574
chr7	16834444	rs2272246	C	T	2691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=15;PP=1749;SC=AAACTGAGTCCGAGGCGTCCC;SOR=2.610;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=64;TCR=15;TR=79;WE=16834452;WS=16834434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr7	16834551	rs4719480	C	A	12942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=482;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=252;NR=205;PP=2965;SC=AATTGAAGGTCACACTTACAC;SOR=0.917;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=457;TCF=252;TCR=205;TR=457;WE=16834559;WS=16834541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,481:1.00:481
chr7	16834597	rs6842	A	G	15480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=578;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=281;NR=262;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.637;SC=CATAGAGACGATTTGAATATC;SOR=0.313;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=545;TCF=282;TCR=263;TR=543;WE=16834605;WS=16834587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,576:1.00:577
chr7	16837404	rs819010	C	T	1247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=32;PP=913;SC=TGTCCATTTCCGGCCAGGCAT;SOR=3.556;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=5;TCR=32;TR=37;WE=16837412;WS=16837394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr7	16839501	rs2272245	A	T	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=350;ReadPosRankSum=0.126;SC=AGCTTTGTTCAATTTTCAGTT;SOR=1.071;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=20;WE=16839509;WS=16839491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr7	16872913	rs4719482	G	A	3347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=63;PP=2026;ReadPosRankSum=1.343;SC=GCTTGACTCAGCATCAGTGTA;SOR=0.695;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=199;TCF=111;TCR=88;TR=141;WE=16872921;WS=16872903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,149:0.69:215
chr7	16899197	rs11798	C	T	4324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=80;NR=71;PP=2509;SC=GGCTTTTTTCCATCATCTCTT;SOR=0.718;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=151;TCF=80;TCR=71;TR=151;WE=16899205;WS=16899187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr7	16901185	rs4236289	C	T	1484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=40;PP=1073;SC=TAATTCCATACAACTTTCTGT;SOR=2.970;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=9;TCR=40;TR=49;WE=16901193;WS=16901175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr7	16913394	rs10249749	A	G	5080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.018;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=121;NR=50;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.721;SC=TGAGCTGAGAAGCATGTTACC;SOR=1.621;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=172;TCF=121;TCR=51;TR=171;WE=16913402;WS=16913384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,180:0.99:181
chr7	16913520	rs4472406	G	A	8810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=123;NR=166;PP=2965;SC=AGAAGAGCTCGGAAATGGGTA;SOR=1.088;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=289;TCF=123;TCR=166;TR=289;WE=16913528;WS=16913510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,320:1.00:320
chr7	16913557	rs2892833	A	T	611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FS=2.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.46;ReadPosRankSum=-2.328;SOR=0.906;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:136,41:0.23:177
chr7	16913617	rs4389824	A	G	1794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=48;PP=1385;SC=CACAATTTTCACAAGATATGG;SOR=4.332;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=5;TCR=48;TR=53;WE=16913625;WS=16913607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
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chr7	17854616	.	T	C	215	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=30;MMLQ=24;MQ=56.52;NF=0;NR=13;PP=215;QD=19.2131701959;SC=ACTGACAGAATGCTAGAAATT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=13;WE=17854624;WS=17854606;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:13,13:0.50:26
chr7	17874259	rs186810663	T	C	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.345;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=23;ReadPosRankSum=0.022;SC=TTGAGAAGTATAATTGCCATA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=3;WE=17874279;WS=17874249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr7	17874271	rs4721660	T	C	465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=1;PP=383;SC=ATTGCCATAGTTTATCTTTTT;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=17874279;WS=17874249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr7	17874300	rs4721661	G	A	837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.874;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=8;PP=590;ReadPosRankSum=-0.542;SC=TCTACTTTTAGAAAGTTTTTA;SOR=0.193;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=46;TCF=36;TCR=10;TR=33;WE=17874308;WS=17874290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,34:0.72:47
chr7	17890413	rs3839705	CA	C	396.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=311;ReadPosRankSum=0.417;SC=AATAATACTTCAAAAAAATAT;SOR=1.101;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=13;WE=17890421;WS=17890403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,18:0.69:26
chr7	17908130	rs2389858	T	A	2309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.707;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=54;PP=1404;ReadPosRankSum=0.154;SC=AAAAAGTAAATAACAAAAACA;SOR=0.803;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=126;TCF=56;TCR=70;TR=93;WE=17908138;WS=17908106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,102:0.72:141
chr7	17913083	rs5882635	A	AC	3826.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=26;PP=2609;SC=GGGTCTTAAGACAAAAATTTT;SOR=1.522;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=34;TCR=28;TR=58;WE=17913091;WS=17913073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr7	17962382	rs11397631	G	GA	2377.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.396;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=44;PP=1157;ReadPosRankSum=-0.610;SC=AAACTACTGGGAAAAAAAGAT;SOR=0.542;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=92;TCF=2;TCR=90;TR=46;WE=17962390;WS=17962372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,96:0.64:150
chr7	17979793	rs3800963	G	A	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-4.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=202;ReadPosRankSum=-0.669;SC=CTCGGGCCCTGGAGCCCACGG;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=43;TCR=1;TR=14;WE=17979801;WS=17979783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,14:0.27:51
chr7	18066569	rs3800962	C	A	5082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.888;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=112;NR=101;PP=2962;ReadPosRankSum=0.309;SC=GCTTCATCTTCTCATCTTGAG;SOR=0.583;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=315;TCF=170;TCR=145;TR=213;WE=18066577;WS=18066559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,224:0.66:340
chr7	18067479	rs35708479	ACT	A	4485.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.184;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.869;NF=7;NR=58;PP=2738;ReadPosRankSum=1.676;SC=TGAAGCACAGACTCTAATGGC;SOR=1.080;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=108;TCF=11;TCR=97;TR=65;WE=18067488;WS=18067469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,114:0.58:198
chr7	18624800	rs2073974	T	C	5695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=127;NR=70;PP=2965;ReadPosRankSum=2.744;SC=TAAAATTTGTTGTACAGGGTC;SOR=1.454;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=199;TCF=128;TCR=71;TR=197;WE=18624808;WS=18624790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,206:0.99:208
chr7	18630208	rs1726610	A	C	1623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=36;PP=1127;SC=AGACTCGTCAAAATTATCTGT;SOR=1.919;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=16;TCR=36;TR=52;WE=18630216;WS=18630198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr7	18631098	.	ATGTG	A,ATG	2291.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=0.000;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.34;ReadPosRankSum=0.359;SOR=0.748;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:6,32,49:0.37,0.56:87
chr7	18674435	rs2285431	T	C	2385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=58;PP=1748;SC=CAAAGTGATATTTCTGAGTTG;SOR=2.055;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=21;TCR=58;TR=79;WE=18674443;WS=18674425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr7	18688033	.	A	ATG	690.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.424;ClippingRankSum=0.000;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.35;ReadPosRankSum=-0.483;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,26:0.58:45
chr7	18767343	rs1178127	A	G	2169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=432;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.183;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=64;PP=1487;ReadPosRankSum=1.881;SC=TACCTCACCCAGCAATGGACC;SOR=0.590;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=390;TCF=185;TCR=205;TR=126;WE=18767351;WS=18767333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:297,134:0.31:431
chr7	18788589	rs1178164	T	C	1925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.923;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=38;PP=1061;ReadPosRankSum=-2.351;SC=TATCTTGTACTGTTACTCAAT;SOR=0.770;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=280;TCF=167;TCR=113;TR=100;WE=18788597;WS=18788579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:197,108:0.35:305
chr7	18993870	rs2389998	C	T	1439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=30;PP=966;SC=CTTTAAAGTTCTCTTAAAAAT;SOR=1.802;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=14;TCR=30;TR=44;WE=18993878;WS=18993860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr7	19761868	rs76009686	T	C	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.263;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=17;PP=406;ReadPosRankSum=-0.781;SC=CTTGCTAAGTTTTGGGGAAAG;SOR=0.078;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=32;TCF=9;TCR=23;TR=26;WE=19761876;WS=19761858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,25:0.81:31
chr7	19763783	rs77583258	T	C	1524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.589;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=20;PP=872;ReadPosRankSum=-1.997;SC=AGCGATACTTTGAGAAACAAC;SOR=0.906;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=107;TCF=70;TCR=37;TR=63;WE=19763791;WS=19763773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,68:0.59:115
chr7	20180425	.	TAC	T	50	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MMLQ=16;MQ=59.71;NF=4;NR=1;PP=50;QD=11.0;SC=CTTTCTTTCCTACACACACAC;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=5;WE=20180434;WS=20180415;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr7	20180507	rs55989776	G	GAC	1183.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.957;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.667;NF=8;NR=11;PP=655;ReadPosRankSum=1.397;SC=GACACACACAGACACACACAC;SOR=1.343;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=27;TCF=11;TCR=16;TR=19;WE=20180515;WS=20180497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,37:0.84:44
chr7	20180717	rs3735615	C	G	7215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=126;NR=126;PP=2965;SC=TAACACATCTCTGTAGTTATT;SOR=0.755;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=253;TCF=126;TCR=127;TR=252;WE=20180725;WS=20180707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
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chr7	20418926	rs1042277	T	C	2256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.862;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=62;PP=1499;ReadPosRankSum=1.546;SC=TGCAGGTATCTAGGGTTTGAT;SOR=0.586;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=315;TCF=141;TCR=174;TR=118;WE=20418934;WS=20418916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:219,125:0.36:344
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chr7	20430900	rs10227623	C	T	453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=351;SC=TAAATGTCTTCAGTAAAACCA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=20430908;WS=20430890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr7	20430960	rs3779506	T	C	2124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=14;PP=1566;SC=TTTCTTCATATTAGATGTTTG;SOR=2.537;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=53;TCR=14;TR=67;WE=20430968;WS=20430950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr7	20434365	rs41273087	A	T	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=32;ReadPosRankSum=0.189;SC=TGGCTGCTCTACTAGGTTGCT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=3;WE=20434373;WS=20434355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr7	20438370	rs6944997	A	C	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=141;ReadPosRankSum=0.235;SC=ATAGAAACAGACTCTTTGATC;SOR=0.346;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=8;WE=20438378;WS=20438364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr7	20438743	rs6945675	C	G	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=287;ReadPosRankSum=-0.713;SC=ATTTATACTTCAAGGAAACTT;SOR=0.446;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=14;WE=20438751;WS=20438733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr7	20444532	rs2074424	C	T	3476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=74;PP=2245;SC=TGTCCTTTTTCGTTCTGACTT;SOR=1.392;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=44;TCR=74;TR=118;WE=20444540;WS=20444522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr7	20685508	rs11983326	T	G	1525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.018;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=41;PP=938;ReadPosRankSum=1.152;SC=TCAAAGGTCTTTCCTTTTAAA;SOR=0.777;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=238;TCF=110;TCR=128;TR=71;WE=20685516;WS=20685498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:180,83:0.32:263
chr7	20689935	rs13244876	C	A	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.087;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.65;ReadPosRankSum=0.269;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr7	20689935	.	CCT	ACA	216	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=6;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=216;QD=67.3669687156;SC=TTATTTAGAGCCTACTATGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=4;WE=20689957;WS=20689925;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,4:0.33:12
chr7	20689937	rs11973722	T	A	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.420;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.65;ReadPosRankSum=0.243;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr7	20689949	rs12674033	G	T	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.275;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=214;ReadPosRankSum=0.060;SC=CTATGTGTCAGGCACTGTTTT;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=3;WE=20689957;WS=20689925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr7	20691013	rs3213623	C	T	2091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=383;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.864;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=36;PP=1372;ReadPosRankSum=0.906;SC=TAAAAGGCATCACAACATGGT;SOR=1.042;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=348;TCF=213;TCR=135;TR=104;WE=20691021;WS=20691003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:263,115:0.30:378
chr7	20691167	rs151326874	G	A	2532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=415;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.443;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=76;PP=1705;ReadPosRankSum=-0.137;SC=AAGTATGGACGAGATGATGTG;SOR=1.049;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=386;TCF=169;TCR=217;TR=124;WE=20691175;WS=20691157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:280,135:0.33:415
chr7	20698270	rs2301641	A	G	2715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=408;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=72;PP=1731;ReadPosRankSum=-0.732;SC=TTCAGAAAGCAAGTCAGCTGT;SOR=0.730;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=381;TCF=186;TCR=195;TR=139;WE=20698278;WS=20698260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:257,150:0.37:407
chr7	20698602	rs12700227	T	C	1329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.480;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=34;PP=972;ReadPosRankSum=0.465;SC=GGCCCACCACTATCATCACTA;SOR=0.760;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=262;TCF=150;TCR=112;TR=78;WE=20698620;WS=20698592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:205,82:0.29:287
chr7	20706645	rs12535128	G	T	235.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=192;SC=TTAGGTCACAGGAATGATCTA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=20706653;WS=20706635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr7	20721084	rs11764760	T	C	1129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FS=11.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.33;ReadPosRankSum=-0.975;SOR=1.498;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:153,59:0.28:212
chr7	20739632	rs11762180	A	C	2398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.205;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=49;PP=1594;ReadPosRankSum=0.562;SC=TATATCAACTAAATGTTACAA;SOR=0.833;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=159;TCF=81;TCR=78;TR=96;WE=20739640;WS=20739622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,105:0.60:175
chr7	20739672	rs12700230	G	A	2715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=59;PP=1626;ReadPosRankSum=-2.120;SC=TTGTTTGTTTGCTTTTCAGGG;SOR=0.722;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=168;TCF=78;TCR=90;TR=109;WE=20739680;WS=20739662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,121:0.66:184
chr7	20739774	rs5882753	AT	A	1204.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=29;PP=596;SC=TGATAAGTTGATTTTTTTTTT;SOR=1.981;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=31;WE=20739782;WS=20739764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr7	20739839	rs13229035	A	C	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=225;ReadPosRankSum=1.144;SC=TCTCAAGTCAATTTTTGACAT;SOR=0.387;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=13;WE=20739847;WS=20739829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,13:0.81:16
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chr7	20803107	rs55827389	T	TC	703.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=19;PP=844;SC=AGTCTGTTTTTCTTTAGTGTT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=20803115;WS=20803097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr7	20824614	rs34908430	C	T	2076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=353;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.855;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=49;PP=1278;ReadPosRankSum=-1.635;SC=GACTCAGGCCCGAGTAATCCG;SOR=0.770;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=316;TCF=174;TCR=142;TR=109;WE=20824622;WS=20824604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:235,118:0.33:353
chr7	20826270	rs112554769	GA	G	100.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=2.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.11;MQRankSum=2.026;QD=1.06;ReadPosRankSum=0.751;SOR=0.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,19:0.20:95
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chr7	21468579	rs39303	G	A	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=44;ReadPosRankSum=0.367;SC=CCTCTTTGAGGGTATAACGCT;SOR=0.117;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=5;WE=21468587;WS=21468569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,5:0.24:21
chr7	21468869	rs141294478	TCC	T	1141.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=2.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.52;MQRankSum=1.420;QD=20.03;ReadPosRankSum=1.813;SOR=1.102;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,35:0.61:57
chr7	21470488	rs76475179	C	T	2895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.022;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=71;PP=1825;ReadPosRankSum=-1.328;SC=TTTTAAGTACCTTTTAAATAG;SOR=0.480;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=129;TCF=44;TCR=85;TR=110;WE=21470496;WS=21470478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,123:0.85:145
chr7	21470513	rs39304	T	C	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.30;ReadPosRankSum=-1.211;SOR=0.714;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,13:0.16:82
chr7	21516627	rs3214203	AT	A	126.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=3.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.53;ReadPosRankSum=-1.465;SOR=0.233;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,12:0.24:50
chr7	21582963	rs2285943	GA	TT	3414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=13;PP=2947;SC=GGGCGCTGTGGAGCTCGAGGA;SOR=2.955;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=59;TCR=13;TR=72;WE=21582972;WS=21582953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr7	21583329	rs2285946	T	C	1134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=27;PP=789;SC=TTTAACAAACTTGGCTTGAAG;SOR=3.026;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=31;WE=21583337;WS=21583319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr7	21584820	rs7781669	A	G	1534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=35;PP=1015;SC=ATGACATTTGAAATTATTTAG;SOR=2.137;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=53;TCF=17;TCR=36;TR=51;WE=21584828;WS=21584810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr7	21599233	rs10950854	C	T	2956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=36;PP=1831;SC=CACCGTCAAACGAAAGGATAA;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=66;TCR=36;TR=102;WE=21599241;WS=21599223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr7	21600902	rs4374884	A	G	1089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.406;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=30;PP=643;ReadPosRankSum=0.990;SC=GTGATTGCTCATGGCTCTTCT;SOR=0.410;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=65;TCF=15;TCR=50;TR=41;WE=21600910;WS=21600892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,48:0.63:76
chr7	21609623	rs62441676	G	A	1121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.782;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=9;PP=757;ReadPosRankSum=1.366;SC=TTGAAACAGAGACGGTTACAG;SOR=0.796;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=105;TCF=79;TCR=26;TR=45;WE=21609631;WS=21609613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,51:0.44:116
chr7	21609691	rs72655982	C	T	4343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.407;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=85;PP=2586;ReadPosRankSum=1.477;SC=TCCTAGGCAACAGCTTACCTT;SOR=0.654;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=306;TCF=171;TCR=135;TR=188;WE=21609699;WS=21609681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,204:0.61:335
chr7	21611399	rs66476925	G	C	1774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.641;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=31;PP=1011;ReadPosRankSum=0.005;SC=GTAGTGGAAAGGTCTTTACTG;SOR=0.787;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=133;TCF=79;TCR=54;TR=79;WE=21611407;WS=21611389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,84:0.60:141
chr7	21611626	rs72655985	A	G	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=58;ReadPosRankSum=-0.449;SC=ATTGCATGGGATCCTATAATT;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=5;WE=21611634;WS=21611616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr7	21621453	rs72655986	G	A	695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.342;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=11;PP=396;ReadPosRankSum=-0.811;SC=GTAAGGTCACGCTTGTGTGAT;SOR=0.411;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=49;TCF=32;TCR=17;TR=29;WE=21621461;WS=21621443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,32:0.58:55
chr7	21621631	rs72655988	G	A	1193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=28;PP=694;ReadPosRankSum=-0.748;SC=CTTAGAAGCTGCATTTAAGGT;SOR=0.772;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=80;TCF=36;TCR=44;TR=50;WE=21621639;WS=21621621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,56:0.62:91
chr7	21628197	rs12670130	A	G	1826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=416;ExcessHet=3.0103;FS=1.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.40;ReadPosRankSum=0.375;SOR=0.813;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:297,118:0.28:415
chr7	21628237	rs6963535	C	T	13674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=436;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.36;SOR=0.789;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,436:1.00:436
chr7	21628237	.	CGCATC	TGCATC,TGCATG	2962	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=201,52;NR=209,51;PP=2962,1222;QD=20;SC=GGTCAAACTTCGCATCTCTCC;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=410;TCF=201;TCR=209;TR=410,103;WE=21628250;WS=21628227;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:410
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chr7	21630982	rs4615458	A	G	9507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=359;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=171;NR=165;PP=2965;SC=GGGTGAGGGCAGCCACGTCCG;SOR=0.750;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=336;TCF=171;TCR=165;TR=336;WE=21630990;WS=21630972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,358:1.00:358
chr7	21639572	rs17144747	A	G	10053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=647;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.185;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=195;NR=208;PP=2962;ReadPosRankSum=2.735;SC=CGTTTTTTCAAGCACAAATGA;SOR=0.571;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=600;TCF=285;TCR=315;TR=403;WE=21639580;WS=21639562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:209,437:0.68:646
chr7	21639801	rs6461585	A	G	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=94;ReadPosRankSum=-0.375;SC=ATTGTGGCTGAGTATGGTAGC;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=6;WE=21639809;WS=21639791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr7	21639818	rs6461586	T	C	297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=9;PP=203;SC=TAGCTCATGCTGGGAATCCCA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=21639826;WS=21639808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr7	21640405	rs10224537	A	G	10532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=403;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=213;NR=158;PP=2965;SC=GGAGACCCACACTTACCTCTG;SOR=0.973;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=371;TCF=213;TCR=158;TR=371;WE=21640413;WS=21640395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,402:1.00:402
chr7	21640570	rs11981446	T	C	7356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=478;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.167;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=125;NR=154;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.801;SC=CCTTAGCATTTAATGTAGTGA;SOR=0.587;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=441;TCF=194;TCR=247;TR=279;WE=21640578;WS=21640560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,311:0.65:478
chr7	21640618	rs17745898	C	G	1826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-4.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.114;HP=6;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=58;PP=1184;ReadPosRankSum=-1.589;SC=TAATCTTTTTCTCACTACAGA;SOR=0.852;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=269;TCF=110;TCR=159;TR=93;WE=21640626;WS=21640608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:193,98:0.34:291
chr7	21641218	rs3827657	G	A	8264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=128;NR=159;PP=2965;SC=TGCCTGAGCAGGTCTATATTC;SOR=0.986;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=287;TCF=128;TCR=159;TR=287;WE=21641226;WS=21641208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,308:1.00:308
chr7	21641269	rs10499531	A	G	1178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.753;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=41;PP=804;ReadPosRankSum=2.261;SC=CATAATTACCATAAATTGAGC;SOR=0.793;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=125;TCF=31;TCR=94;TR=54;WE=21641277;WS=21641259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,56:0.41:135
chr7	21654602	rs7779983	C	T	1178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=4;PP=717;SC=CCAGTAATTACGCTGCAGATT;SOR=2.726;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=31;TCR=4;TR=35;WE=21654610;WS=21654592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr7	21654970	rs55937657	A	G	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.691;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.43;ReadPosRankSum=-0.718;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr7	21657130	rs12539987	C	G	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=99;ReadPosRankSum=-0.342;SC=AATGCTTTCACTCTTTTCTAA;SOR=0.859;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=7;WE=21657138;WS=21657120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr7	21657185	rs8180768	A	G	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=251;ReadPosRankSum=1.901;SC=AATTATTAATATATACTGTGT;SOR=0.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=65;TCF=49;TCR=16;TR=21;WE=21657193;WS=21657175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,24:0.34:70
chr7	21658855	rs57208694	A	G	7693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=114;NR=149;PP=2965;SC=TGTCCTCGGGACTGGGTCATT;SOR=1.059;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=263;TCF=114;TCR=149;TR=263;WE=21658863;WS=21658845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,278:1.00:278
chr7	21658964	rs68184450	C	T	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.046;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=19;PP=376;ReadPosRankSum=-0.296;SC=AGTTTGTTCCCTGCTGTTCAT;SOR=0.964;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=73;TCF=20;TCR=53;TR=25;WE=21658972;WS=21658954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,27:0.35:77
chr7	21659554	rs112373177	A	ATTAAT	2150.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.618;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=17;PP=1867;ReadPosRankSum=0.356;SC=GTGCACATTAATTATATTGTT;SOR=0.590;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=117;TCF=63;TCR=54;TR=36;WE=21659562;WS=21659544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,59:0.32:182
chr7	21659645	rs56029521	T	C	2047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.376;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.471;NF=47;NR=56;PP=1377;ReadPosRankSum=-2.479;SC=GAACAGGCATTCCATTACTAA;SOR=0.786;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=311;TCF=145;TCR=166;TR=103;WE=21659653;WS=21659635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:226,112:0.33:338
chr7	21678643	rs17144835	A	G	7427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=514;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.02;MQRankSum=0.733;NF=145;NR=171;PP=2962;ReadPosRankSum=0.340;SC=TCTTCTGCTGATTTACTTGAC;SOR=0.698;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=474;TCF=218;TCR=256;TR=316;WE=21678651;WS=21678633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,335:0.65:513
chr7	21695649	rs4385378	G	A	3401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-3.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.063;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=91;PP=2114;ReadPosRankSum=-0.020;SC=TTTTCAGCATGCTCTTAGAAG;SOR=0.608;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=223;TCF=80;TCR=143;TR=142;WE=21695657;WS=21695639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,152:0.62:245
chr7	21722375	rs190684500	G	T	1242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=32;PP=826;ReadPosRankSum=0.477;SC=TTTTTTCTGGGTTTTTTTCTC;SOR=0.621;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=37;TCR=54;TR=54;WE=21722383;WS=21722365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,57:0.58:98
chr7	21730575	rs72657338	G	A	3227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.913;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=87;PP=2100;ReadPosRankSum=2.385;SC=CTGTTAAGTGGTTTGCTTTTA;SOR=1.179;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=214;TCF=83;TCR=131;TR=133;WE=21730583;WS=21730565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,142:0.61:231
chr7	21730615	rs140915469	G	T	431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=20;PP=281;ReadPosRankSum=0.551;SC=AATCCTATATGATTTCCTTGG;SOR=0.788;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=89;TCF=22;TCR=67;TR=26;WE=21730623;WS=21730605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,28:0.29:98
chr7	21757287	rs2965409	T	C	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=131;ReadPosRankSum=-0.711;SC=AAACGTGTCCTTGAAGTGTTG;SOR=0.129;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=9;WE=21757295;WS=21757282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,9:0.26:35
chr7	21757636	rs2074760	G	A	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.481;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=205;ReadPosRankSum=-0.262;SC=GCCCAAGAAAGTGAGAAGATT;SOR=0.327;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=58;TCF=10;TCR=48;TR=18;WE=21757644;WS=21757626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,19:0.32:60
chr7	21765452	rs12536928	C	T	1659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.467;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=37;PP=934;ReadPosRankSum=-0.640;SC=AAGCTGACTTCAGTCGGTGGT;SOR=0.788;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=288;TCF=163;TCR=125;TR=91;WE=21765460;WS=21765442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:208,98:0.32:306
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chr7	21765636	rs2965424	T	C	1115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=38;PP=880;SC=TGTATTAGTCTGTTTTCATAT;SOR=5.186;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=40;WE=21765644;WS=21765626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr7	21775153	rs2072219	A	C	1162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=2;PP=941;SC=GATTTCAATTATAAAGTGACT;SOR=4.863;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=34;WE=21775161;WS=21775143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr7	21775210	rs2270022	A	G	3832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=48;PP=2762;SC=TCTCGCACGCACTCTCTCTCT;SOR=1.642;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=99;TCR=49;TR=147;WE=21775218;WS=21775200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr7	21775443	rs2072221	G	A	12999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=476;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=204;NR=250;PP=2965;SC=ACTACTACACGACATCCACAG;SOR=0.915;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=454;TCF=204;TCR=250;TR=454;WE=21775451;WS=21775433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,476:1.00:476
chr7	21778449	rs1109806	C	T	1414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FS=0.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.25;ReadPosRankSum=0.289;SOR=0.662;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:241,92:0.28:333
chr7	21779084	rs2906686	G	A	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=151;ReadPosRankSum=-0.589;SC=GAGTGATTATGAAGATAAGGA;SOR=0.481;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=11;WE=21779092;WS=21779074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr7	21779104	rs933353	C	T	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.439;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=405;ReadPosRankSum=0.188;SC=AGGTAATCTGCGATGAAGACC;SOR=1.659;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=36;TCF=33;TCR=3;TR=19;WE=21779112;WS=21779094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,22:0.56:39
chr7	21779278	rs9639393	A	G	1540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.454;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.660;NF=46;NR=45;PP=919;ReadPosRankSum=-2.169;SC=TTCACCATCAATCCCAGGCTA;SOR=0.601;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=305;TCF=148;TCR=157;TR=91;WE=21779286;WS=21779268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:225,96:0.30:321
chr7	21779331	rs933354	T	C	3446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.494;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=76;PP=2131;ReadPosRankSum=-1.215;SC=TGTAGGTCTGTATTGTATTGT;SOR=0.768;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=220;TCF=96;TCR=124;TR=135;WE=21779339;WS=21779321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,149:0.62:239
chr7	21781807	rs1029598	T	C	2715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.567;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=75;PP=1484;ReadPosRankSum=-0.902;SC=CTCTATGTTATGCCTCTTGAG;SOR=0.612;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=192;TCF=68;TCR=124;TR=119;WE=21781815;WS=21781797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,129:0.63:204
chr7	21789442	rs4355679	T	C	2487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=385;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.751;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=75;PP=1350;ReadPosRankSum=-0.243;SC=ACACATTTCTTGAAAGATCTT;SOR=0.796;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=348;TCF=151;TCR=197;TR=128;WE=21789450;WS=21789432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:245,140:0.36:385
chr7	21805228	.	TCACACACACACACACACA	T	1410	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=1410;QD=471.0;SC=TCAGCCTGCGTCACACACACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=3;WE=21805253;WS=21805218;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:10,3:0.23:13
chr7	21813318	rs11374411	A	AT	2786.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.905;HP=8;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.212;NF=52;NR=11;PP=1513;ReadPosRankSum=0.338;SC=CATTTACTTGATTTTTTTTAA;SOR=3.126;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=83;TCF=66;TCR=17;TR=63;WE=21813326;WS=21813308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,100:0.98:102
chr7	21824122	rs6965750	G	A	9806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=369;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=151;NR=173;PP=2965;SC=AGCCTGCACTGGTGGCTGCTA;SOR=0.926;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=324;TCF=151;TCR=173;TR=324;WE=21824130;WS=21824112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,369:1.00:369
chr7	21857776	rs6957850	A	T	2589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=17;PP=1745;SC=CATTTAAAAAATTTTGAACAT;SOR=2.520;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=82;TCF=65;TCR=17;TR=81;WE=21857784;WS=21857766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr7	21892321	rs28672970	G	A	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=44;ReadPosRankSum=0.313;SC=TGGGCAGTGTGATCAGACTTG;SOR=0.336;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=6;WE=21892329;WS=21892311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,6:0.22:27
chr7	21893993	rs4722064	G	T	14006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=535;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.99;MQRankSum=0.000;NF=256;NR=237;PP=2965;ReadPosRankSum=1.681;SC=TTACAGACCAGTGGCAGCAAG;SOR=0.338;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=495;TCF=257;TCR=238;TR=493;WE=21894001;WS=21893972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,533:1.00:534
chr7	21901540	rs17145720	T	C	626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.307;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=20;PP=447;ReadPosRankSum=-1.100;SC=GGGACGCATCTCTATCCTGAT;SOR=1.304;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=109;TCF=52;TCR=57;TR=33;WE=21901548;WS=21901530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,36:0.30:122
chr7	21901566	rs4722067	T	C	3127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=51;PP=1841;SC=GCATCACCCATGCTGTCTTCC;SOR=0.710;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=57;TCR=51;TR=108;WE=21901574;WS=21901556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr7	21907452	rs5882827	G	GT	3124.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.644;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=19;PP=2837;ReadPosRankSum=0.993;SC=CACTGATCATGTTTTTATATT;SOR=0.910;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=92;TCF=52;TCR=40;TR=45;WE=21907466;WS=21907442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,75:0.64:118
chr7	21907458	rs4995598	A	G	3464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=26;PP=2833;ReadPosRankSum=-0.455;SC=TCATGTTTTTATATTCTTGTT;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=124;TCF=84;TCR=40;TR=79;WE=21907466;WS=21907442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,94:0.67:140
chr7	21907696	rs11773744	T	C	706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=20;PP=607;SC=CCTGCCCTTCTTTTCAGTTCA;SOR=3.352;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=25;WE=21907704;WS=21907686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr7	21908445	rs67401326	T	C	1320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.607;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=28;PP=912;ReadPosRankSum=-2.078;SC=CCCTCCTTCATAGACATTTCC;SOR=1.058;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=244;TCF=137;TCR=107;TR=75;WE=21908453;WS=21908435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,78:0.31:254
chr7	21924014	rs6461613	A	G	1351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=1.866;QD=12.52;ReadPosRankSum=-0.113;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,68:0.63:108
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chr7	21939032	rs56333627	C	A	3919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.440;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=96;PP=2521;ReadPosRankSum=-1.162;SC=TCGTGTGGCTCTCCGGCTTCT;SOR=0.730;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=272;TCF=120;TCR=152;TR=167;WE=21939040;WS=21939022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,176:0.60:291
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chr7	22165180	rs2302000	G	A	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.818;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=10;PP=374;ReadPosRankSum=-0.035;SC=TGGTACCAACGTAGAGTCAAT;SOR=0.555;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=114;TCF=81;TCR=33;TR=31;WE=22165188;WS=22165170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,34:0.27:125
chr7	22190131	.	GAA	G	247.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=0.000;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.76;ReadPosRankSum=2.681;SOR=1.244;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
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chr7	22202117	rs12592	G	A	4146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.796;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=97;PP=2505;ReadPosRankSum=0.976;SC=TACGCGGAACGTCTGAGTTTT;SOR=0.884;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=263;TCF=125;TCR=138;TR=177;WE=22202125;WS=22202107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,191:0.67:283
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chr7	22202485	rs1981601	T	C	4065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.403;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=78;PP=2446;ReadPosRankSum=-0.710;SC=ACAGTGACTCTAAGAAGAGAG;SOR=0.585;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=265;TCF=132;TCR=133;TR=169;WE=22202493;WS=22202475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,189:0.65:293
chr7	22242370	rs4722110	G	T	2106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=13;PP=1416;SC=CAAATTAAACGGATATCCACC;SOR=2.336;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=55;TCR=13;TR=68;WE=22242378;WS=22242360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr7	22242535	rs4719687	T	C	2956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.525;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=62;PP=1752;ReadPosRankSum=-2.286;SC=CCTCAGTAAATAGAGGGCAGA;SOR=0.648;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=184;TCF=81;TCR=103;TR=114;WE=22242543;WS=22242525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,131:0.62:211
chr7	22259670	rs1859807	C	A	1675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=448;ExcessHet=3.0103;FS=0.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.74;ReadPosRankSum=1.748;SOR=0.624;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:336,112:0.25:448
chr7	22347861	rs10499552	G	A	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-4.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.751;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=321;ReadPosRankSum=-0.046;SC=TCCCTCTTAAGTGAGACAGTG;SOR=0.245;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=62;TCF=51;TCR=11;TR=24;WE=22347869;WS=22347851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,25:0.37:68
chr7	22349761	rs55757213	CA	C	3440.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.562;NF=6;NR=76;PP=1924;ReadPosRankSum=-0.910;SC=ATCCGTTTGCCAAAAAAACAA;SOR=0.664;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=136;TCF=10;TCR=126;TR=82;WE=22349769;WS=22349751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,145:0.68:214
chr7	22355166	rs10607345	CTA	C	177.79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=0;NR=7;PP=289;SC=CAATAGCATACTATATATATA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=7;WE=22355175;WS=22355156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr7	22357488	rs62447095	A	G	778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=9;PP=411;ReadPosRankSum=0.570;SC=TCACTGCAGCATCCCTGCAAA;SOR=0.627;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=50;TCF=38;TCR=12;TR=34;WE=22357496;WS=22357478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,37:0.65:57
chr7	22357716	rs10950897	T	G	563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=17;PP=455;SC=TACCAAAAAATGAAAACATAA;SOR=2.200;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=23;WE=22357724;WS=22357706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr7	22459324	rs2177142	G	A	763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=14;PP=523;ReadPosRankSum=-0.295;SC=GTTCATTGTGGCAGAGGGAAA;SOR=0.698;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=96;TCF=64;TCR=32;TR=39;WE=22459332;WS=22459314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,41:0.39:106
chr7	22478207	rs2528843	G	T	1537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.609;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=32;PP=974;ReadPosRankSum=-1.715;SC=TTGAAGGGCTGGCTGCTGATA;SOR=0.581;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=250;TCF=152;TCR=98;TR=78;WE=22478215;WS=22478197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,85:0.32:267
chr7	22526636	rs17146979	C	G	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=1.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.05;ReadPosRankSum=-1.043;SOR=0.877;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:132,37:0.22:169
chr7	22532260	rs62447564	A	G	9061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=1.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=634;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-12.905;NF=230;NR=218;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.059;SC=CAGAGCCAGTATTGCCAGTCC;SOR=0.672;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=701;TCF=366;TCR=335;TR=448;WE=22532268;WS=22532250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:216,417:0.66:633
chr7	22533452	rs201338533	C	T	4381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.15;QD=30.22;SOR=4.086;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr7	22768572	rs2069840	C	G	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-4.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=342;ReadPosRankSum=0.012;SC=AGGAGGCCAACTTCAAGCTTT;SOR=0.428;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=47;TCF=4;TCR=43;TR=20;WE=22768580;WS=22768562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,20:0.43:47
chr7	23030799	rs184637400	T	C	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=308;ReadPosRankSum=-1.836;SC=TTTGAATATATTTTATTTAGT;SOR=0.593;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=25;TCR=66;TR=25;WE=23030807;WS=23030789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,30:0.30:101
chr7	23164526	rs2058275	C	G	2929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.548;HP=3;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=57;ReadPosRankSum=-0.123;SC=GGAAGAGTTTCAGTATCCTAT;SOR=0.751;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=169;TCF=81;TCR=88;TR=109;WE=23164534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,124:0.64:194
chr7	23195555	rs141774430	CTTTAT	C	5430.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=51;PP=2946;SC=ACTCTTAGCACTTTATTTTTA;SOR=0.865;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=80;TCF=29;TCR=51;TR=76;WE=23195567;WS=23195545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr7	23286315	rs858239	G	A	954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=7;PP=597;ReadPosRankSum=1.703;SC=AGATCAGGCAGTGCCGCTTAA;SOR=0.753;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=50;TCF=40;TCR=10;TR=34;WE=23286323;WS=23286305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,38:0.72:53
chr7	23293098	rs199348	C	A	4566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.027;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=111;PP=2858;ReadPosRankSum=1.369;SC=AAGATTCAAACCAAACACCTG;SOR=0.849;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=284;TCF=120;TCR=164;TR=186;WE=23293106;WS=23293088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,202:0.65:310
chr7	23293746	rs199347	A	G	3632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.444;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=49;PP=2171;ReadPosRankSum=-0.092;SC=AACGAAAGGAAAAAGATGCTG;SOR=0.888;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=209;TCF=131;TCR=78;TR=137;WE=23293754;WS=23293736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,158:0.67:235
chr7	23296533	rs199355	G	A	5107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=344;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=112;NR=104;PP=2962;ReadPosRankSum=0.865;SC=CTGCTGATCCGTATGTTTACA;SOR=0.669;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=325;TCF=169;TCR=156;TR=216;WE=23296541;WS=23296523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,229:0.67:344
chr7	23300049	rs199351	A	C	2678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.447;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=20;PP=1716;ReadPosRankSum=0.991;SC=TGCATTCTTTATTTCTTTGGG;SOR=0.502;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=147;TCF=116;TCR=31;TR=93;WE=23300057;WS=23300039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,106:0.65:163
chr7	23352512	rs199653	C	A	2868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=60;PP=1500;ReadPosRankSum=-1.745;SC=AGTTTTAAAACCTTACTTCCT;SOR=0.654;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=164;TCF=80;TCR=84;TR=118;WE=23352520;WS=23352502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,132:0.72:183
chr7	23357321	rs156414	C	T	3819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.529;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=73;PP=2322;ReadPosRankSum=1.677;SC=CTGGTGCTTCCGCTGGAGCAA;SOR=0.592;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=240;TCF=119;TCR=121;TR=149;WE=23357329;WS=23357311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,169:0.64:266
chr7	23387273	.	G	A	705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.776;ClippingRankSum=0.000;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.831;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.945;NF=26;NR=9;PP=436;ReadPosRankSum=-1.323;SC=CTTACAAGCCGCAGAGGTGCC;SOR=0.846;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=116;TCF=86;TCR=30;TR=35;WE=23387281;WS=23387263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,38:0.30:126
chr7	23552392	rs201252500	TA	T	51.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.606;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.70;ReadPosRankSum=1.072;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr7	23624570	rs227933	G	C	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=209;ReadPosRankSum=0.209;SC=ATATAGAGAAGCAGCAGGAAG;SOR=0.549;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=14;WE=23624578;WS=23624560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr7	23719766	rs56391241	G	A	732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=9;PP=1072;ReadPosRankSum=1.061;SC=GCGCGGTACCGGGAGGGAACG;SOR=0.653;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=67;TCF=48;TCR=19;TR=32;WE=23719787;WS=23719756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,35:0.49:71
chr7	23719779	rs56359038	G	A	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.831;HP=3;HapScore=4;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=12;PP=1072;ReadPosRankSum=1.690;SC=AGGGAACGGGGCGGGTCGGGC;SOR=0.587;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=83;TCF=57;TCR=26;TR=35;WE=23719787;WS=23719756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,37:0.42:88
chr7	23724364	rs7791123	C	T	872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.433;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=30;PP=677;ReadPosRankSum=0.239;SC=TTCTACAAATCGTAATGATTG;SOR=2.955;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=47;TCF=4;TCR=43;TR=31;WE=23724372;WS=23724354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,32:0.65:49
chr7	23727944	rs7802834	T	C	108.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=3;PP=55;SC=GGATTACAGGTGTGAGCCACC;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=6;WE=23727952;WS=23727934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr7	23737795	rs5029444	T	C	1614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.055;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=27;PP=1008;ReadPosRankSum=0.125;SC=TTATTCTCCATGTATTGTTTT;SOR=0.897;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=235;TCF=146;TCR=89;TR=77;WE=23737803;WS=23737785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,83:0.33:255
chr7	23757162	rs6945306	G	C	1696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FS=1.370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.78;ReadPosRankSum=-1.149;SOR=0.763;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:249,106:0.30:355
chr7	23768907	rs12176610	A	G	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=27;ReadPosRankSum=1.139;SC=TAATGAAAGTAAAACTATGTG;SOR=0.551;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=4;WE=23768915;WS=23768897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr7	23775454	rs10264952	G	A	3924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=92;PP=2566;ReadPosRankSum=0.059;SC=GCACTTAAGTGAGAAAATGAC;SOR=0.701;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=268;TCF=123;TCR=145;TR=170;WE=23775462;WS=23775444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,176:0.61:287
chr7	23775477	rs10264967	G	T	3276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.483;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=79;PP=2002;ReadPosRankSum=-0.023;SC=TTGACTTGAAGGATGAAAATG;SOR=0.732;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=226;TCF=97;TCR=129;TR=140;WE=23775485;WS=23775467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,148:0.61:243
chr7	23794139	rs34664371	TA	T	1508.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.871;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.23;MQRankSum=1.317;NF=1;NR=33;PP=1180;ReadPosRankSum=-1.301;SC=CTGTTGAACATAAGGAAGTGT;SOR=0.976;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=65;TCF=3;TCR=62;TR=34;WE=23794147;WS=23794129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,49:0.54:90
chr7	23794183	rs4722267	A	G	856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=25;PP=685;SC=ATAACAGGATACATGTGCAGA;SOR=3.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=28;WE=23794191;WS=23794173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr7	23802579	rs2193826	G	C	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=165;ReadPosRankSum=-0.979;SC=ACGTTAAATTGTAAGTTTATT;SOR=0.446;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=9;WE=23802587;WS=23802569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
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chr7	23809303	rs55860134	A	G	6140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=459;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=153;NR=127;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.434;SC=CAGAAGACGCAATGGATAATA;SOR=0.751;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=430;TCF=234;TCR=196;TR=280;WE=23809311;WS=23809293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,289:0.63:459
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chr7	23854717	rs2390814	C	T	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=385;ReadPosRankSum=-0.126;SC=TATAGATTGGCGTATTAATAC;SOR=0.811;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=35;TCR=7;TR=23;WE=23854725;WS=23854707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,22:0.52:42
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chr7	23872024	rs56362098	C	CTTTG	398.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.733;NF=0;NR=9;PP=432;ReadPosRankSum=-0.169;SC=TTTTTAAAAACTTTGGTTTGG;SOR=0.741;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=9;WE=23872032;WS=23872014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr7	23872409	rs2214236	T	A	4919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.342;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=117;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.401;SC=TTCCTTCACCTTCCACCACAA;SOR=0.776;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=329;TCF=148;TCR=181;TR=209;WE=23872417;WS=23872399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,226:0.66:345
chr7	24324759	rs16141	T	G	1324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=9;PP=935;ReadPosRankSum=-0.201;SC=GGGGGTCGCGTGTGGTAGCAG;SOR=0.772;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=59;TCR=13;TR=49;WE=24324767;WS=24324749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,51:0.69:74
chr7	24324879	rs16139	T	C	1751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FS=0.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.32;ReadPosRankSum=-2.040;SOR=0.746;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:225,104:0.32:329
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chr7	24329001	rs113179092	AT	A	660.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.762;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=587;ReadPosRankSum=0.473;SC=CTTGTTACAGATGAACACCTG;SOR=0.341;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=16;WE=24329009;WS=24328991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,20:0.54:37
chr7	24329133	rs5574	C	T	6178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=440;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.828;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=153;NR=112;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.528;SC=GAAAACGATCCAGCCCAGAGA;SOR=0.871;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=422;TCF=239;TCR=183;TR=265;WE=24329141;WS=24329123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,277:0.63:439
chr7	24718710	rs722218	A	C	891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.835;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=9;PP=618;ReadPosRankSum=-0.515;SC=TTATGCCCTAAAATTTCTTTG;SOR=0.535;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=91;TCR=26;TR=40;WE=24718718;WS=24718700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,44:0.35:125
chr7	24742436	rs17149912	TG	CA	2827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.543;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=39;PP=2322;ReadPosRankSum=1.397;SC=GCAGAGCTGCTGCGCTATCTG;SOR=0.623;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=183;TCF=80;TCR=103;TR=70;WE=24742445;WS=24742426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,77:0.38:200
chr7	24742553	rs2240005	G	A	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=143;ReadPosRankSum=-0.589;SC=GTACTTTCCCGCCAGCCAGGC;SOR=0.430;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=11;WE=24742561;WS=24742543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr7	24742576	rs66851582	C	T	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=121;ReadPosRankSum=0.683;SC=GGGAGGTACTCAGCAGTTGCT;SOR=0.269;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=9;WE=24742584;WS=24742566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr7	24747910	rs2721809	G	A	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=333;ReadPosRankSum=1.804;SC=TCATGACTGCGATGCACATCT;SOR=0.479;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=40;TCF=9;TCR=31;TR=20;WE=24747918;WS=24747900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr7	24756810	rs56166822	A	AGTCCCTCTGCTGAGGGATCCTCTGCTGGGG	4118.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=639;ExcessHet=3.0103;FS=1.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.49;MQRankSum=17.722;QD=9.28;ReadPosRankSum=-0.487;SOR=0.789;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:328,116:0.26:444
chr7	24758645	rs876307	G	T	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=168;ReadPosRankSum=0.954;SC=CATGAACGCAGGGCAGCCCGA;SOR=0.527;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=12;WE=24758653;WS=24758635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr7	24758795	rs876305	T	C	1223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.520;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=31;PP=773;ReadPosRankSum=-0.391;SC=CATTCCTTCCTTCCAGCACCT;SOR=0.632;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=209;TCF=112;TCR=97;TR=65;WE=24758803;WS=24758785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,72:0.31:229
chr7	24784403	rs2521768	C	T	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.373;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=296;ReadPosRankSum=1.823;SC=CAGAGGAAGCCGATGATGATA;SOR=1.234;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=84;TCF=21;TCR=63;TR=23;WE=24784411;WS=24784393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,31:0.31:100
chr7	24854765	rs1044956	G	A	2110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=378;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.400;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=60;PP=1326;ReadPosRankSum=1.252;SC=ACCTCTGCCCGCTTAAGATGT;SOR=0.662;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=345;TCF=160;TCR=185;TR=111;WE=24854773;WS=24854755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:255,121:0.32:376
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chr7	24873911	rs2285687	T	G	1324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=4.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.816;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=14;PP=915;ReadPosRankSum=1.125;SC=CCCAACCCCGTCTCCAAATCC;SOR=1.005;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=81;TCF=55;TCR=26;TR=48;WE=24873919;WS=24873901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,53:0.58:92
chr7	24874459	rs2285688	A	G	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=266;ReadPosRankSum=-1.776;SC=CAATGTTACTATTAAACTCAG;SOR=1.179;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=15;WE=24874467;WS=24874449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr7	24874499	rs2285689	C	T	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.050;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=130;ReadPosRankSum=0.931;SC=AGTCAGAAAACCGGCAAAAGA;SOR=0.368;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=8;WE=24874507;WS=24874489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr7	24888620	rs757156	T	C	862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=3;PP=635;SC=GGTCGTGCAATGGGACAGATG;SOR=3.841;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=28;WE=24888628;WS=24888610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr7	24891947	rs6461822	C	T	820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=0;PP=612;SC=GCTATTAAGACTTGGATAGGT;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=24891955;WS=24891937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr7	24902762	rs2285690	C	T	1353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=7;PP=994;SC=TGCTGGCACACGGCATGCAGA;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=37;TCR=7;TR=44;WE=24902770;WS=24902752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr7	24903107	rs2285691	C	G	4297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=71;PP=2558;SC=AAGAGGAGTCCGGCTCACCTG;SOR=0.705;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=145;TCF=74;TCR=71;TR=145;WE=24903115;WS=24903097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr7	24903139	rs17851558	C	T	2568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.520;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=53;PP=1601;ReadPosRankSum=-0.276;SC=TAGCTGGTGCCGAGTATGTCC;SOR=0.570;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=176;TCF=93;TCR=83;TR=109;WE=24903147;WS=24903129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,117:0.61:193
chr7	24903227	rs62449857	G	T	1766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=40;PP=1030;ReadPosRankSum=-1.403;SC=GTCTGTGGGGGAAAAGAGGAC;SOR=0.728;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=110;TCF=50;TCR=60;TR=73;WE=24903235;WS=24903217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,83:0.66:125
chr7	24904868	rs2040689	T	A	6148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.42;SOR=1.812;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr7	24904868	.	TAGGGG	AAGGGA,AAGGGG	2340	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=36,120;NR=15,51;PP=709,2340;QD=14.9503504875;SC=TGGACAAGCATAGGGGAAGGA;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=171;TCF=120;TCR=51;TR=51,171;WE=24904881;WS=24904858;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.30:171
chr7	24904873	rs3735543	G	A	1107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FS=1.305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.62;ReadPosRankSum=-0.142;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:136,61:0.31:197
chr7	24904889	rs2040690	T	C	7236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=159;NR=83;PP=2965;SC=CACAAATGAATCTGAAGTGTA;SOR=1.485;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=244;TCF=161;TCR=83;TR=242;WE=24904897;WS=24904879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr7	24911526	rs10261181	G	A	4543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=70;PP=2939;SC=GGTGCTGAGTGGGGCAGTGTG;SOR=0.743;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=150;TCF=79;TCR=71;TR=149;WE=24911534;WS=24911516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr7	25163744	rs11267038	A	C	2691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=532;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.565;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=68;PP=1853;ReadPosRankSum=0.589;SC=CCCATATTTAATTCTAAAAAC;SOR=0.744;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=499;TCF=270;TCR=229;TR=150;WE=25163752;WS=25163734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:369,161:0.30:530
chr7	25181912	rs2285738	T	C	10904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=420;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=178;NR=203;PP=2965;SC=CATCTTTTCATGGTAATCATC;SOR=0.874;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=381;TCF=178;TCR=203;TR=381;WE=25181920;WS=25181902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,419:1.00:419
chr7	25182001	rs2285737	C	T	3910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=90;PP=2553;SC=CGAAGAACGACAGTTATATTA;SOR=1.768;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=42;TCR=90;TR=132;WE=25182009;WS=25181991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr7	25182172	rs2285736	A	G	1053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=0;PP=802;SC=AAAAGGCAAAAACATGAGAAG;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=28;WE=25182180;WS=25182162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr7	25191044	rs12532548	G	A	314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=1;PP=159;SC=GTTTCACCATGTTGGTCAGGC;SOR=1.981;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=25191052;WS=25191034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr7	25194506	rs12538022	T	C	496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=1;PP=403;SC=TGTGAACAAGTTTCCTGATCT;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=25194514;WS=25194496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr7	25194618	rs2523073	G	A	4211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=61;PP=2486;SC=CTGATTCCAGGTCACATTTTA;SOR=0.868;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=147;TCF=86;TCR=61;TR=146;WE=25194626;WS=25194608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr7	25194665	rs2523072	G	C	4545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=76;PP=2820;SC=ATAAGCCTTGGTTGGCACCGT;SOR=0.754;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=156;TCF=80;TCR=76;TR=156;WE=25194673;WS=25194655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr7	25194753	rs12535348	C	T	3412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=60;PP=1911;SC=GGGAACATGGCGCCGCGACAG;SOR=1.033;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=56;TCR=60;TR=116;WE=25194761;WS=25194743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr7	25194857	rs2717899	A	T	944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=12;NR=25;PP=622;SC=GAACAGAAAGAAGTATGGTTG;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=12;TCR=25;TR=37;WE=25194865;WS=25194847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr7	25194918	rs2523071	A	G	107.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=81;SC=AATGGCAGAAACTGTTCTAAT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=25194926;WS=25194908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr7	25200976	rs13221848	A	G	253.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=8;PP=178;SC=ACATATCCACATATATGTAGA;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=25200984;WS=25200966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr7	25218661	rs10642607	A	AAAACAAAC	578.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=10;NR=0;PP=676;SC=CACCGTCTCAAAAACAAACAA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=10;WE=25218669;WS=25218653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr7	25267963	rs886354	G	C	2824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=36;PP=1703;SC=GAAGATTGGAGATCACTAATT;SOR=1.106;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=63;TCR=37;TR=98;WE=25267977;WS=25267953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
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chr7	26404071	rs2253569	G	A	1121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=9;PP=802;ReadPosRankSum=0.570;SC=TAGAGTGAATGTTGAGATCAT;SOR=0.711;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=70;TCF=57;TCR=13;TR=45;WE=26404079;WS=26404061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,47:0.64:74
chr7	26724279	rs212850	T	G	970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.963;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=11;PP=641;ReadPosRankSum=-1.742;SC=CTTCCCTAGCTCTGTAAATCC;SOR=1.031;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=88;TCF=65;TCR=23;TR=44;WE=26724287;WS=26724269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,48:0.52:93
chr7	26778406	rs10951145	A	G	3425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.599;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=56;PP=2230;ReadPosRankSum=-1.740;SC=ATTGAACACCAACATTACCTT;SOR=0.830;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=235;TCF=143;TCR=92;TR=148;WE=26778414;WS=26778396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,158:0.62:254
chr7	27135314	rs10951154	C	T	5449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=358;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.934;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=159;NR=155;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.363;SC=CTGGGGGTGGCGATGGTGGTG;SOR=0.309;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=333;TCF=167;TCR=166;TR=314;WE=27135323;WS=27135303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,228:0.92:248
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chr7	27141657	rs2428431	C	G	2746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=392;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.792;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=76;PP=1774;ReadPosRankSum=0.326;SC=CCCCTCCCCCCACAGCCACTC;SOR=0.745;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=367;TCF=162;TCR=205;TR=131;WE=27141665;WS=27141636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:248,144:0.37:392
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chr7	27169617	rs6943542	T	C	2390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=37;PP=1938;SC=GCAGCCCGGGTCAGATGGGGG;SOR=0.719;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=37;TCR=37;TR=74;WE=27169625;WS=27169607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr7	27169934	rs10251056	A	G	1497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.711;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=35;PP=1111;ReadPosRankSum=0.803;SC=GGGCGGCGGCAGCTGGGGCTG;SOR=1.739;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=54;TCF=19;TCR=35;TR=53;WE=27169942;WS=27169924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,55:0.96:57
chr7	27170145	rs6944345	T	G	2254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=13;PP=1577;SC=TAGGAGGCAGTGGGCTCTCGG;SOR=2.400;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=68;TCF=55;TCR=13;TR=67;WE=27170153;WS=27170135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
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chr7	27196113	rs2301721	C	T	9703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=373;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=164;NR=174;PP=2965;ReadPosRankSum=2.644;SC=AACAGAGAAGCCCCCGCCGTA;SOR=0.543;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=345;TCF=166;TCR=179;TR=338;WE=27196121;WS=27196103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:5,367:0.99:372
chr7	27203139	rs7810502	G	A	842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.06;SOR=2.910;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr7	27224368	rs143812636	C	G	5277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.433;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=127;NR=92;PP=2962;ReadPosRankSum=0.422;SC=GGACGCCGTTCCTGCCCACGG;SOR=0.814;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=310;TCF=178;TCR=132;TR=219;WE=27224376;WS=27224358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,231:0.70:332
chr7	27238691	rs2071265	C	G	4562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=106;NR=36;PP=2965;SC=AGAACAGAAACGCACCCGGGA;SOR=2.124;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=143;TCF=107;TCR=36;TR=142;WE=27238699;WS=27238681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
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chr7	27497389	rs56098493	G	A	1934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-6.795;NF=46;NR=56;PP=1167;ReadPosRankSum=-0.120;SC=AACTCCTGGAGTTGGGCCAGT;SOR=0.692;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=300;TCF=138;TCR=162;TR=102;WE=27497399;WS=27497379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:213,110:0.34:323
chr7	27571058	rs1014372	C	G	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.237;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=72;ReadPosRankSum=-0.019;SC=CATCTTCTCTCTCCATTTATT;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=5;WE=27571066;WS=27571048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
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chr7	27578167	rs9639553	C	G	897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.097;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=27;PP=612;ReadPosRankSum=-0.400;SC=TTCTCGAGTGCGGAAGAGAAC;SOR=0.490;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=63;TCF=17;TCR=46;TR=38;WE=27578175;WS=27578157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,40:0.60:67
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chr7	27671901	rs73073128	T	C	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.949;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=6;PP=892;ReadPosRankSum=1.771;SC=TTCTAACATGTGAAATTCATG;SOR=0.490;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=76;TCF=59;TCR=17;TR=27;WE=27671909;WS=27671889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,34:0.40:86
chr7	27689338	.	AT	A	45.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.225;ClippingRankSum=0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=2.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.20;MQRankSum=2.028;QD=1.04;ReadPosRankSum=-1.880;SOR=0.146;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,9:0.20:44
chr7	27788354	rs73078762	C	A	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=3.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.74;ReadPosRankSum=0.209;SOR=1.325;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,18:0.19:93
chr7	27807441	rs7807729	G	A	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.599;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=7;PP=223;ReadPosRankSum=0.450;SC=TATAAAGAATGTGAAAATTGC;SOR=1.200;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=68;TCF=41;TCR=27;TR=19;WE=27807449;WS=27807431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,19:0.24:79
chr7	27807521	rs117895637	C	T	1118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.315;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=19;PP=669;ReadPosRankSum=-1.654;SC=CTTTAAAATTCTCACATTCAT;SOR=0.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=62;TCF=32;TCR=30;TR=41;WE=27807529;WS=27807511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,46:0.70:66
chr7	27807589	rs7790914	T	C	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.349;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=10;PP=233;ReadPosRankSum=-1.362;SC=TTATCTGGGGTCCTGTTGACA;SOR=1.046;Source=Platypus;TCR=33;TR=21;WE=27807597;WS=27807579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,22:0.26:86
chr7	27807650	rs7808062	G	A	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.451;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=7;PP=266;ReadPosRankSum=-0.068;SC=CCTTGATTGTGTCCTAGATTT;SOR=1.177;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=63;TCF=34;TCR=29;TR=20;WE=27807668;WS=27807640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,19:0.29:65
chr7	27827103	rs11540483	T	A	1439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.830;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=26;PP=871;ReadPosRankSum=0.499;SC=TTTAAAAAATTTAGATGGGAA;SOR=0.516;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=87;TCF=53;TCR=34;TR=62;WE=27827111;WS=27827093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,65:0.70:93
chr7	27872675	rs56070801	A	G	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=117;ReadPosRankSum=-0.580;SC=TTGGGTCTGGATTGCAGTTCC;SOR=1.179;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=9;WE=27872683;WS=27872665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr7	27886011	rs141603370	C	CATATACGTATACGTGTAT	3802.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=16;NR=2;PP=2972;SC=CGTATATATACATATACGTAT;SOR=3.334;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=18;WE=27886019;WS=27886001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr7	27886171	rs6462054	A	G	8773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=136;NR=148;PP=2965;SC=CATTTTCTGTAGGTATATAAC;SOR=0.866;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=285;TCF=136;TCR=149;TR=284;WE=27886179;WS=27886161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,324:1.00:324
chr7	28319007	rs177483	T	A	7802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=136;NR=125;PP=2965;SC=TTGTGTTGGGTCCAGAATTTG;SOR=0.742;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=261;TCF=136;TCR=125;TR=261;WE=28319015;WS=28318997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,293:1.00:293
chr7	28319234	rs177484	A	C	8107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=159;NR=114;PP=2965;SC=GTCTTTGGAAACTTTTCTGCA;SOR=0.982;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=273;TCF=159;TCR=114;TR=273;WE=28319242;WS=28319224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,296:1.00:296
chr7	28534501	rs3216916	C	CT	2118.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=1.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.32;MQRankSum=0.686;QD=20.77;ReadPosRankSum=1.325;SOR=1.241;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,89:0.87:102
chr7	28662583	rs41289	C	T	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=98;ReadPosRankSum=-0.728;SC=CACTGCAACCCCCGTCTCCCG;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=7;WE=28662591;WS=28662573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,7:0.28:25
chr7	28673541	rs41305	G	A	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.393;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=274;ReadPosRankSum=-0.713;SC=AATCACTGTTGTCTGTAGCCA;SOR=2.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=14;WE=28673549;WS=28673531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr7	28676906	rs41309	A	T	2315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=51;PP=1460;SC=TTTCTATTCAATCATTCATTT;SOR=1.911;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=21;TCR=51;TR=72;WE=28676914;WS=28676896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr7	28758211	rs142563709	T	G	4363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.133;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=81;PP=2669;ReadPosRankSum=-0.277;SC=TTGTGTTTTATTTGTTATTAT;SOR=0.570;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=257;TCF=139;TCR=118;TR=173;WE=28758219;WS=28758201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,190:0.68:281
chr7	28758638	rs879593	T	G	1861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.47;SOR=3.564;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr7	28758648	rs879592	A	G	1534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.14;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr7	28857606	rs12531253	G	A	2653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=31;PP=1649;SC=GAGTTTGCCAGTTTTGTTGTT;SOR=1.313;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=58;TCR=32;TR=89;WE=28857614;WS=28857596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr7	28858456	rs10951205	A	G	6322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=98;NR=116;PP=2965;SC=AAAAAGACAAAATGGGGAAGT;SOR=0.943;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=214;TCF=98;TCR=116;TR=214;WE=28858464;WS=28858446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr7	28858715	.	CT	C	593.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.396;ClippingRankSum=0.000;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=1.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.69;ReadPosRankSum=-0.511;SOR=0.876;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:120,41:0.25:161
chr7	28995800	rs61742220	G	A	6337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=390;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.515;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=151;NR=106;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.496;SC=CAAAGAGCAGGCGGAAGCGCG;SOR=1.016;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=368;TCF=210;TCR=158;TR=257;WE=28995808;WS=28995790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,271:0.69:390
chr7	28996220	rs1006521	G	A	1456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.469;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=40;PP=1005;ReadPosRankSum=-1.004;SC=TCAGCCTTAGGGCGCTGCGGT;SOR=0.633;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=270;TCF=142;TCR=128;TR=82;WE=28996228;WS=28996210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:199,87:0.30:286
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chr7	29103944	rs34641639	A	AT	98.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=163;ReadPosRankSum=0.212;SC=AACATACAACATGGAGAAACG;SOR=1.302;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=5;WE=29103952;WS=29103934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr7	29111620	rs317719	A	C	6234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=136;PP=2965;SC=AATTGTTAATATTGTGCTGGT;SOR=1.913;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=194;TCF=58;TCR=136;TR=194;WE=29111628;WS=29111610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
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chr7	29132212	rs2687636	A	G	4346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.508;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=79;PP=2915;ReadPosRankSum=-1.291;SC=GTCTTAGGAAAGCCAAGAGAA;SOR=0.583;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=274;TCF=160;TCR=114;TR=180;WE=29132220;WS=29132202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,189:0.66:288
chr7	29394220	rs34818186	CT	C	403.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FS=4.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQRankSum=2.151;QD=1.61;ReadPosRankSum=0.429;SOR=0.409;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:197,53:0.21:250
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chr7	29523563	rs12665897	G	A	3333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.230;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=55;PP=1942;ReadPosRankSum=1.321;SC=GAATACATGCGAGTCACTTAT;SOR=0.575;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=181;TCF=104;TCR=77;TR=130;WE=29523571;WS=29523553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,146:0.72:202
chr7	29552463	rs1420145	C	G	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=30;ReadPosRankSum=-1.045;SC=GCTAGAATTTCCTGGACTGCA;SOR=1.179;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=5;WE=29552471;WS=29552453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr7	29605975	rs2302618	C	G	3539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=564;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.545;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=80;PP=2051;ReadPosRankSum=1.879;SC=CTGGCAGCTCCGGCCCCTGGT;SOR=0.753;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=507;TCF=272;TCR=235;TR=178;WE=29605983;WS=29605965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:362,201:0.36:563
chr7	29606288	rs10271996	C	T	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.446;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=30;PP=590;ReadPosRankSum=-0.708;SC=GGGCAGGTCCCCGGAGGAGGC;SOR=0.942;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=131;TCF=43;TCR=88;TR=41;WE=29606296;WS=29606278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,46:0.32:144
chr7	29771546	rs112712037	CT	C	238.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQRankSum=0.000;QD=3.14;ReadPosRankSum=-0.095;SOR=0.648;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,24:0.32:76
chr7	29771597	rs850084	A	C	1255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FS=1.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.000;QD=5.76;ReadPosRankSum=-0.248;SOR=0.571;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:145,73:0.33:218
chr7	29781927	rs850098	T	A	2264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=446;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.246;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=75;PP=1349;ReadPosRankSum=0.926;SC=AAACTACCCATTACACTATGG;SOR=0.851;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=416;TCF=166;TCR=250;TR=122;WE=29781935;WS=29781917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:313,132:0.30:445
chr7	29915329	rs55682334	G	A	911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.157;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=9;PP=548;ReadPosRankSum=0.519;SC=TCTGAGATCAGCCTTGGGAGT;SOR=0.525;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=51;TCF=39;TCR=12;TR=33;WE=29915337;WS=29915319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,38:0.67:57
chr7	29915593	rs2301922	G	C	1752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=46;PP=1102;SC=GTGAGCAGCCGGGCCAGGCCT;SOR=2.015;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=19;TCR=46;TR=65;WE=29915601;WS=29915583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr7	29923974	rs373625381	G	A	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.024;NF=13;NR=22;PP=413;ReadPosRankSum=0.541;SC=ATGCGCAGGAGCCTCCCGCCC;SOR=0.735;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=108;TCF=45;TCR=63;TR=35;WE=29923982;WS=29923964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,33:0.32:102
chr7	29924221	rs13310795	T	C	9446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=625;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.562;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=203;NR=189;PP=2962;ReadPosRankSum=0.800;SC=TAAGGAGCGCTGCCTGGCCCA;SOR=0.635;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=569;TCF=299;TCR=270;TR=392;WE=29924229;WS=29924211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:196,425:0.68:621
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chr7	30177095	rs6954451	G	T	457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=3;PP=351;SC=AGGCCACCCAGATTTTAAATA;SOR=2.584;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=16;WE=30177103;WS=30177085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
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chr7	30485710	rs6958571	A	C	939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.787;HP=7;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=12;PP=1247;ReadPosRankSum=3.249;SC=CCCGCCCCCCACACACACAGC;SOR=1.471;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=143;TCF=89;TCR=54;TR=40;WE=30485718;WS=30485693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,36:0.25:144
chr7	30485741	rs2907749	A	G	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FS=3.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.65;ReadPosRankSum=-0.894;SOR=0.972;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:166,64:0.28:230
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chr7	30536874	rs38405	G	A	5551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.44;ReadPosRankSum=0.421;SOR=0.814;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,208:0.99:210
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chr7	30544360	rs38414	G	A	2367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=454;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=66;PP=1303;ReadPosRankSum=-1.782;SC=GCCTGAAGCAGAGTGTAAGGA;SOR=0.723;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=416;TCF=185;TCR=231;TR=124;WE=30544373;WS=30544350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:311,142:0.31:453
chr7	30634661	rs1049402	C	G	612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=0.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.67;ReadPosRankSum=-0.908;SOR=0.777;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:124,43:0.26:167
chr7	30635600	rs10265589	C	T	964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=26;PP=542;ReadPosRankSum=-1.342;SC=ATATAGACCTCCTTTTCCTAG;SOR=0.638;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=124;TCF=44;TCR=80;TR=42;WE=30635608;WS=30635590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,50:0.36:138
chr7	30643069	rs1558064	C	A	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.389;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=120;ReadPosRankSum=1.742;SC=AGTGCATTGTCCTTTTTCCCA;SOR=0.273;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=39;TCF=31;TCR=8;TR=12;WE=30643077;WS=30643059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,13:0.30:43
chr7	30651938	rs1986756	G	A	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.13;ReadPosRankSum=0.096;SOR=0.648;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:119,36:0.23:155
chr7	30660938	rs10951271	A	C	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.099;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=230;ReadPosRankSum=-0.155;SC=TATAATCTGCATGCATTTGTG;SOR=0.262;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=62;TCF=51;TCR=11;TR=19;WE=30660946;WS=30660928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,20:0.31:65
chr7	30662237	rs10249885	G	A	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=82;ReadPosRankSum=-0.722;SC=TGGCATTATAGCCTGAAAAAA;SOR=0.138;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=8;WE=30662245;WS=30662227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,9:0.26:34
chr7	30673345	rs2240401	C	T	1193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.81;ReadPosRankSum=-0.320;SOR=0.717;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:234,79:0.25:313
chr7	30694260	rs3779250	C	T	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=2.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.09;ReadPosRankSum=0.107;SOR=0.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,33:0.27:121
chr7	30705105	rs8192496	G	A	2341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=58;NR=23;PP=1554;SC=GTGCTGTAGGGGGAGGGATGA;SOR=1.556;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=83;TCF=60;TCR=23;TR=81;WE=30705113;WS=30705095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr7	30728452	rs917195	C	T	12008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=147;NR=103;PP=2965;SC=CCTGTAGCCACGGCAACCAGA;SOR=1.011;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=250;TCF=147;TCR=103;TR=250;WE=30728460;WS=30728442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,272:1.00:272
chr7	30728472	rs917196	C	G	13296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=164;NR=136;PP=2965;SC=AGAATGTTTACCACCTTCTGC;SOR=0.824;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=300;TCF=164;TCR=136;TR=300;WE=30728480;WS=30728462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,322:1.00:322
chr7	30728557	rs58682124	A	G	5785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=117;PP=2965;SC=GCTGACTTCCATCGTGGGAGC;SOR=1.005;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=211;TCF=93;TCR=118;TR=210;WE=30728565;WS=30728547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr7	30791848	rs4723010	G	A	7259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=120;NR=122;PP=2965;SC=CTACAGCTTCGATGGCAGCCC;SOR=0.870;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=242;TCF=120;TCR=122;TR=242;WE=30791856;WS=30791838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,268:1.00:268
chr7	30795288	rs2302339	A	G	1538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.471;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=39;PP=947;ReadPosRankSum=-0.865;SC=CCCGTCCTACATGGTGGGGAA;SOR=0.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=242;TCF=123;TCR=119;TR=79;WE=30795296;WS=30795278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:184,88:0.32:272
chr7	30795436	rs4720015	T	G	3397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=68;PP=2124;SC=GGGGTCTGCTTCATTGTGGCT;SOR=1.532;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=39;TCR=68;TR=107;WE=30795444;WS=30795426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr7	30805811	rs2013200	T	A	1177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.05;QD=45.30;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr7	30805849	.	A	ACC	3315.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=68.29;QD=30.42;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr7	30805913	rs3901848	G	A	10674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.71;QD=32.25;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,331:1.00:331
chr7	30805913	.	GTGTAAAG	ATGTAAAC,ATGTAAAG	2962	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MMLQ=27;MQ=62.9;NF=48,164;NR=41,126;PP=1152,2962;QD=13.5445828636;SC=TGTCCTTCCAGTGTAAAGTCC;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=292;TCF=166;TCR=126;TR=89,290;WE=30805928;WS=30805903;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.30:292
chr7	30805920	rs73085896	G	C	1793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=350;ExcessHet=3.0103;FS=1.390;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.58;MQRankSum=0.255;QD=5.14;ReadPosRankSum=1.926;SOR=0.600;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:242,107:0.31:349
chr7	30811254	rs62446925	C	T	767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=27;PP=504;ReadPosRankSum=0.064;SC=GGCTTTGCAGCTTCTGGGAGG;SOR=0.763;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=107;TCF=40;TCR=67;TR=42;WE=30811262;WS=30811244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,42:0.37:113
chr7	30817998	rs11762566	G	A	7087.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=480;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.854;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=172;NR=115;PP=2962;ReadPosRankSum=0.812;SC=TATGAGAACAGCGGGTTTTGA;SOR=0.872;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=447;TCF=260;TCR=187;TR=287;WE=30818006;WS=30817988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,308:0.64:479
chr7	30825229	rs2269921	C	G	290.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=260;SC=TTCATGATAACGCACTGGCTG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=30825237;WS=30825219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr7	30831082	rs12701034	C	T	10706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=407;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=194;NR=187;PP=2965;SC=AGCACAGACACGGACAGGATG;SOR=0.708;SbPval=0.55;Source=Platypus;TCF=194;TR=381;WE=30831094;WS=30831072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,407:1.00:407
chr7	30876432	rs10258097	A	G	3063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=69;PP=2063;SC=GAATGGATATAGATGGCGTGA;SOR=2.004;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=27;TCR=69;TR=96;WE=30876440;WS=30876422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr7	31011485	rs4988501	A	G	3555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.590;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.602;NF=94;NR=31;PP=2335;ReadPosRankSum=-0.297;SC=GTTTGATTCGATTCACCTCCT;SOR=1.534;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=175;TCF=127;TCR=48;TR=125;WE=31011493;WS=31011475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,138:0.73:190
chr7	31023502	rs28371570	G	A	118.90	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5064;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=65;ReadPosRankSum=-0.566;SC=AGCTCAGCGAGCCGAAGGGGC;SOR=0.527;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=6;WE=31023510;WS=31023492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr7	31102966	rs7807667	G	C	5559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=409;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.152;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=122;NR=123;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.033;SC=GGGAGCCCCAGGCTCACCTGA;SOR=0.610;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=376;TCF=184;TCR=192;TR=245;WE=31102986;WS=31102956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,265:0.65:408
chr7	31102978	rs73688749	T	C	5021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=378;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.386;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=114;PP=2962;ReadPosRankSum=1.331;SC=CTCACCTGAGTCCCCGCTCCA;SOR=0.650;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=347;TCF=164;TCR=183;TR=218;WE=31102986;WS=31102956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,237:0.63:377
chr7	31104564	rs758995	G	A	1772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.893;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=50;PP=1248;ReadPosRankSum=-0.031;SC=TGAGCGGGGCGGCAGGGAGCA;SOR=0.561;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=101;TCF=29;TCR=72;TR=71;WE=31104572;WS=31104554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,73:0.70:105
chr7	31121501	rs2302475	T	C	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.140;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=129;ReadPosRankSum=-0.051;SC=CAGGTGACTTTTTTTCTCTGA;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=7;WE=31121509;WS=31121491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr7	31125082	rs11410563	A	AG	3024.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=38;PP=1740;SC=CAGACCCATTAGGCTCTGCCG;SOR=1.192;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=45;TCF=3;TCR=42;TR=41;WE=31125090;WS=31125072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr7	31132235	rs112436908	CT	C	158.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=4.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.12;ReadPosRankSum=0.959;SOR=1.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,20:0.27:75
chr7	31135471	rs2267734	G	A	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=23;ReadPosRankSum=1.110;SC=GGGCCTCTGCGGGGGGACGGT;SOR=0.631;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=4;WE=31135479;WS=31135461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,4:0.19:21
chr7	31378933	rs2233404	A	G	2386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=62;PP=1552;ReadPosRankSum=-0.580;SC=ATATTTAAAGAGTTTTCATTT;SOR=0.679;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=152;TCF=52;TCR=100;TR=95;WE=31378941;WS=31378923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,102:0.61:166
chr7	31569547	rs12701110	G	A	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=2.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.23;ReadPosRankSum=-0.111;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,27:0.23:117
chr7	31569579	rs2067727	G	T	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=4.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.37;ReadPosRankSum=-1.853;SOR=1.474;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,16:0.22:72
chr7	31592491	rs7793859	T	A	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.507;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.672;NF=16;NR=2;PP=293;ReadPosRankSum=-0.233;SC=CAGGTTCATGTATGACTGTGA;SOR=0.957;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=56;TCF=50;TCR=6;TR=18;WE=31592499;WS=31592481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,20:0.33:60
chr7	31592596	rs143013342	T	TTG	8164.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-0.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=399;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.282;NF=31;NR=72;PP=2984;ReadPosRankSum=-0.161;SC=TCTGATTTGTTTGTGTGTGTG;SOR=0.684;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=193;TCF=53;TCR=140;TR=103;WE=31592604;WS=31592586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,249:0.65:384
chr7	31592733	rs7811042	C	A	5407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=108;PP=2965;SC=AGCGCGTGGGCTCCGCTGGAT;SOR=1.390;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=176;TCF=68;TCR=108;TR=176;WE=31592741;WS=31592723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr7	31594166	rs2286710	C	T	7638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=129;NR=125;PP=2965;SC=GTGTGCCTTACATGTTTCTCT;SOR=0.736;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=254;TCF=129;TCR=125;TR=254;WE=31594174;WS=31594156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,282:1.00:282
chr7	31594258	rs12155214	G	T	4112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=87;PP=2592;SC=TTAATTGTACGTGAAGTATTA;SOR=1.546;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=135;TCF=48;TCR=87;TR=135;WE=31594266;WS=31594248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr7	31611758	rs67930674	G	T	5838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=390;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.278;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=123;NR=122;PP=2962;ReadPosRankSum=1.169;SC=TATCCAGAGGGACCAGTTTCA;SOR=0.709;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=362;TCF=185;TCR=177;TR=245;WE=31611766;WS=31611748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,266:0.68:390
chr7	31617733	rs6945679	T	C	15037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=544;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=272;NR=234;PP=2965;SC=AAGTTTTTGTTCCCTTTACAA;SOR=0.810;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=508;TCF=273;TCR=235;TR=506;WE=31617741;WS=31617723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,542:1.00:542
chr7	31618008	rs10252720	A	G	6111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=106;PP=2965;SC=AGCTTGTCTCATCTTGCAGGC;SOR=0.772;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=212;TCF=106;TCR=106;TR=212;WE=31618016;WS=31617998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr7	31681765	rs10239388	C	T	854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=20;NR=7;PP=387;SC=CCTTTAATAACCTCAAGACCT;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=27;WE=31681773;WS=31681755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr7	31682453	rs4141001	C	T	12204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=445;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=209;NR=195;PP=2965;SC=AGCCAAGAAGCGAATGCCTTG;SOR=0.698;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=404;TCF=209;TCR=195;TR=404;WE=31682461;WS=31682443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,445:1.00:445
chr7	31683410	rs10247620	G	A	14768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=537;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=245;NR=244;PP=2965;SC=TGCATCTGCTGTCATCACCAC;SOR=0.708;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=490;TCF=245;TCR=245;TR=489;WE=31683418;WS=31683400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,536:1.00:536
chr7	31683610	rs38398	G	A	8313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=110;NR=167;PP=2965;SC=AGATGCACCCGTGATAAACAC;SOR=1.279;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=277;TCF=110;TCR=167;TR=277;WE=31683618;WS=31683600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,306:1.00:306
chr7	31691697	rs3735424	T	C	3875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=60;NR=70;PP=2314;SC=TTTGACTATATCCAGCCTACC;SOR=0.971;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=60;TCR=70;TR=130;WE=31691705;WS=31691687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr7	31697913	rs35589779	C	CT	666.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.993;HP=10;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=27;PP=457;ReadPosRankSum=0.006;SC=AGCTGGATCCCTTTTTTTTTT;SOR=0.541;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=72;TCF=14;TCR=58;TR=33;WE=31697921;WS=31697903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,41:0.48:85
chr7	31735263	rs34173	G	C	7218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=98;NR=132;PP=2965;SC=CTGCACAGCTGTAAAGGAGAG;SOR=1.234;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=230;TCF=98;TCR=132;TR=230;WE=31735271;WS=31735253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr7	31735297	rs34174	T	G	2429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.592;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=54;PP=1459;ReadPosRankSum=0.019;SC=GGTTGCATTGTTCGTACACAT;SOR=0.349;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=141;TCF=58;TCR=83;TR=97;WE=31735305;WS=31735287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,106:0.68:156
chr7	31735315	rs79503171	T	C	2169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.540;HP=3;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=54;PP=1408;ReadPosRankSum=0.410;SC=CATTTTTCCTTAAATATTCAG;SOR=0.494;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=120;TCF=42;TCR=78;TR=84;WE=31735323;WS=31735305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,90:0.68:133
chr7	31830095	rs982857	A	G	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.006;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=50;ReadPosRankSum=-0.742;SC=TACATTTGAAATCTTAATAGT;SOR=0.045;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=6;WE=31830103;WS=31830085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr7	31855420	rs1860789	A	G	3032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=24;PP=2140;SC=AAGGAACTGGATGAGCAGGGA;SOR=2.280;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=75;TCR=24;TR=99;WE=31855428;WS=31855410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr7	31855578	rs1860790	G	A	14113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=523;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=251;NR=236;PP=2965;SC=CGGCTTTGGAGTTTTTCCCAC;SOR=0.705;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=487;TCF=251;TCR=236;TR=487;WE=31855586;WS=31855568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,523:1.00:523
chr7	31876766	rs2270218	T	C	7466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=146;NR=105;PP=2965;SC=ATGATGACAGTCCTGATGGAG;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=251;TCF=146;TCR=105;TR=251;WE=31876774;WS=31876756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,278:1.00:278
chr7	31890106	rs917756	T	C	711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=2;PP=552;SC=TTGAAGCTGATCAGACTGATC;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=24;WE=31890114;WS=31890096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr7	31918879	rs1860786	C	T	792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=24;PP=672;SC=TCTGCCTCACCTGCATGTTAG;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=31918887;WS=31918869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr7	32209227	rs977623	A	C	572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=0;PP=486;SC=TTCAGGAAATACAGCCAGAAG;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=32209235;WS=32209223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr7	32209283	rs977624	T	C	2034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=15;PP=1467;SC=TTTTAATTTATTCAGTGCAAA;SOR=2.439;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=51;TCR=15;TR=66;WE=32209291;WS=32209273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr7	32209425	rs977625	A	G	10095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=376;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=168;NR=175;PP=2965;SC=AAGACTTCTGAGCTATCCAGC;SOR=0.782;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=344;TCF=168;TCR=176;TR=343;WE=32209433;WS=32209415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,374:1.00:374
chr7	32209459	rs977626	C	T	8486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=131;NR=158;PP=2965;SC=CAGCTAGGATCTCCTCTGGGG;SOR=0.936;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=289;TCF=131;TCR=158;TR=289;WE=32209467;WS=32209449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,310:1.00:310
chr7	32248984	rs10951324	G	A	1036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.149;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=19;PP=685;ReadPosRankSum=0.367;SC=GATATTTCCTGCATTACTATT;SOR=0.505;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=159;TCF=109;TCR=50;TR=55;WE=32248992;WS=32248974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,58:0.33:175
chr7	32249216	rs2240676	A	G	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=4.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=210;ReadPosRankSum=0.375;SC=ATATGCCCCAATACAGCCAAT;SOR=0.708;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=39;TCF=9;TCR=30;TR=13;WE=32249224;WS=32249206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,11:0.28:39
chr7	32338337	rs215607	G	A	5264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=109;PP=2965;SC=CCTGTTGCCGGCGTCCGTCAT;SOR=1.256;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=182;TCF=73;TCR=109;TR=182;WE=32338345;WS=32338327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr7	32338408	.	C	T	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.976;ClippingRankSum=0.000;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=2.241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.97;ReadPosRankSum=1.152;SOR=0.192;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,9:0.22:41
chr7	32527009	rs7800049	G	A	1899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=381;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.315;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=58;PP=1082;ReadPosRankSum=1.609;SC=TGCACTCCACGTTCCCATTTT;SOR=0.788;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=342;TCF=164;TCR=178;TR=109;WE=32527017;WS=32526999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:263,118:0.31:381
chr7	32528366	rs35608030	C	T	979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.155;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=29;PP=665;ReadPosRankSum=1.177;SC=GACAAAGTCTCGCTCTGTCAT;SOR=1.626;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=53;TCF=11;TCR=42;TR=35;WE=32528374;WS=32528356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,38:0.68:56
chr7	32529936	rs1584614	G	C	1911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.099;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=61;PP=1030;ReadPosRankSum=-0.082;SC=GATTACCTAAGGGCAGCAGCT;SOR=0.934;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=273;TCF=113;TCR=160;TR=98;WE=32529944;WS=32529926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:189,107:0.36:296
chr7	32535493	.	GC	G	1122.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.841;ClippingRankSum=0.000;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.828;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.405;NF=1;NR=27;PP=912;ReadPosRankSum=0.661;SC=GCTTCTGTGTGCTCAGCTCGC;SOR=0.791;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=70;TCF=1;TCR=69;TR=28;WE=32535501;WS=32535483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,37:0.34:108
chr7	32593234	rs10717407	CT	C	586.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=2.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.04;ReadPosRankSum=1.687;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,33:0.85:39
chr7	32598524	rs1466144	G	A	1059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=9;PP=726;ReadPosRankSum=-0.945;SC=GCTGTTCTTTGATATTGCATA;SOR=0.784;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=64;TCF=50;TCR=14;TR=42;WE=32598532;WS=32598514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,45:0.67:67
chr7	32598630	rs2290213	T	A	4336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.512;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=77;PP=2793;ReadPosRankSum=0.615;SC=AAGTAACCCATGTGCAGATGA;SOR=0.806;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=266;TCF=146;TCR=120;TR=174;WE=32598638;WS=32598620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,188:0.66:283
chr7	32598656	rs2290214	C	T	4275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.474;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=77;PP=2489;ReadPosRankSum=0.633;SC=TTTCTGCATCCACTGCTGATG;SOR=0.797;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=270;TCF=148;TCR=122;TR=173;WE=32598664;WS=32598646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,189:0.65:290
chr7	32599204	rs34973430	A	AT	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5005;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=135;ReadPosRankSum=0.180;SC=TGTAAAGTACAACCAAATACA;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=32599212;WS=32599194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr7	32609565	rs2305320	A	G	887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=5;PP=559;ReadPosRankSum=-0.464;SC=CTGTTAGCTCACTAAGTTTAA;SOR=0.562;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=55;TCF=47;TCR=8;TR=33;WE=32609573;WS=32609555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,39:0.65:60
chr7	32615553	rs6462381	C	T	3159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.183;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=32;PP=1930;ReadPosRankSum=-0.575;SC=TTCTTTCAAACATTTACTTGA;SOR=0.907;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=177;TCF=127;TCR=50;TR=120;WE=32615561;WS=32615543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,133:0.69:193
chr7	32623477	rs34778959	C	G	5726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=384;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.481;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=118;NR=120;PP=2962;ReadPosRankSum=0.441;SC=TCACCACTTCCACCTCCCAAA;SOR=0.649;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=358;TCF=182;TCR=176;TR=238;WE=32623485;WS=32623467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,256:0.67:384
chr7	32715474	rs34569336	T	C	1151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.230;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.754;NF=32;NR=16;PP=688;ReadPosRankSum=-0.607;SC=AATTAATCAATGATTAACTAT;SOR=0.226;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=64;TCF=45;TCR=19;TR=48;WE=32715482;WS=32715464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,50:0.75:67
chr7	32772520	rs184276402	G	A	1512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-2.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.536;NF=51;NR=20;PP=1183;ReadPosRankSum=1.117;SC=TTGACTGCAAGGTGGGGAGGA;SOR=0.705;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=104;TCF=74;TCR=30;TR=71;WE=32772528;WS=32772510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,67:0.72:93
chr7	32956941	rs139835645	C	T	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=2.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.22;MQRankSum=-5.307;QD=4.23;ReadPosRankSum=0.563;SOR=0.483;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,36:0.28:127
chr7	33003171	rs3110942	G	A	1816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=4.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.681;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-9.981;NF=66;NR=49;PP=1833;ReadPosRankSum=-3.070;SC=GGGATACAGCGGAGGATAAAG;SOR=1.186;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=202;TCF=112;TCR=90;TR=115;WE=33003179;WS=33003161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,80:0.47:170
chr7	33016120	rs3750116	G	T	2210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.05;QD=27.29;SOR=0.821;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr7	33028487	rs35727868	C	T	540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.474;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=397;ReadPosRankSum=0.272;SC=ACTACAGGCACGCACCACCAC;SOR=2.303;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=20;WE=33028495;WS=33028477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,22:0.73:30
chr7	33059407	rs2392209	A	G	3220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=61;PP=1884;SC=TTATTACAAAACATTCTTCCA;SOR=1.198;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=108;TCF=47;TCR=61;TR=108;WE=33059415;WS=33059397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr7	33060946	rs3750117	A	G	4703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=82;NR=79;PP=2721;SC=CAATAGCGTAATATTTTTCCT;SOR=0.824;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=161;TCF=82;TCR=79;TR=161;WE=33060954;WS=33060936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr7	33063492	rs6955792	A	G	219.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=1;PP=277;SC=ATAATATGGGAAAAAAAACCT;SOR=4.615;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=33063500;WS=33063482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr7	33102462	rs13228639	C	T	2643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=55;PP=1653;SC=CCGCGCAGCTCCGCCCCCACG;SOR=1.514;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=31;TCR=55;TR=86;WE=33102470;WS=33102452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr7	33102514	rs13228827	G	A	934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=21;PP=609;SC=GCCAGGACGCGGCGGGAGGGG;SOR=2.694;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=27;WE=33102522;WS=33102504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr7	33134883	rs150987618	T	C	763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=5.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.15;MQRankSum=1.098;QD=22.46;ReadPosRankSum=-1.218;SOR=0.102;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,27:0.79:34
chr7	33136983	rs6462460	G	A	8196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=115;NR=154;PP=2965;SC=ACCTAAAAACGAAAAGAGAAA;SOR=1.065;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=269;TCF=115;TCR=154;TR=269;WE=33136991;WS=33136973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,293:1.00:293
chr7	33139147	rs17472556	G	A	3595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=80;PP=2417;SC=CTGGGCTTCCGGTGCCAACAT;SOR=1.609;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=121;TCF=41;TCR=80;TR=121;WE=33139155;WS=33139137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr7	33149029	.	C	CCGGCGGCGG	119.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.435;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=12.797;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.04;ReadPosRankSum=-0.422;SOR=0.591;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr7	33186065	rs77462109	TT	GA	3672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.780;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.653;NF=23;NR=51;PP=2771;ReadPosRankSum=-2.081;SC=GTAATCTCAGTTCTTTTGGGA;SOR=0.448;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=119;TCF=34;TCR=85;TR=74;WE=33186074;WS=33186055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,94:0.69:136
chr7	33186082	rs1969575	C	G	2740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=64;PP=1867;SC=GGGAGGCCGACGTGGGCAGAT;SOR=2.687;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=19;TCR=64;TR=83;WE=33186090;WS=33186072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr7	33192502	rs17169881	A	G	1540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.064;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=43;PP=1063;ReadPosRankSum=-0.038;SC=TACTTGGAGTATGTCAATCCT;SOR=0.551;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=84;TCF=18;TCR=66;TR=56;WE=33192510;WS=33192492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,62:0.68:91
chr7	33195119	rs12701275	G	A	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=96;ReadPosRankSum=-0.447;SC=AGTTTAGAATGTTATCTAATG;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=6;WE=33195127;WS=33195109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr7	33217071	.	CT	C	167.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=0.000;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=2.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.02;ReadPosRankSum=1.327;SOR=0.382;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,18:0.22:83
chr7	33303848	rs41276009	T	G	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.84;ReadPosRankSum=-1.441;SOR=0.268;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr7	33304107	rs7810388	A	G	132.10	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5340;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=86;ReadPosRankSum=0.366;SC=TCTTTCCTATATTATGGTTAT;SOR=1.179;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=6;WE=33304115;WS=33304097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr7	33385852	rs6974593	C	T	6517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=141;NR=70;PP=2965;SC=CCAAGATATACAACCATGCAA;SOR=1.455;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=211;TCF=141;TCR=70;TR=211;WE=33385860;WS=33385842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr7	33388618	rs9785054	C	T	425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=1;PP=269;SC=TAAGTAGTTACGATAGTCTAT;SOR=3.126;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=33388626;WS=33388608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr7	33388713	rs11773504	G	A	1670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.396;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=28;PP=931;ReadPosRankSum=-0.334;SC=ATTGCAAAAAGCCAAATTATC;SOR=0.466;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=115;TCF=73;TCR=42;TR=71;WE=33388721;WS=33388703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,77:0.62:125
chr7	33391089	rs35557465	G	A	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.20;ReadPosRankSum=-1.358;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
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chr7	33977125	.	G	GGTGTGTGTGTGT	172.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=-0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.48;MQRankSum=1.559;QD=19.19;ReadPosRankSum=-0.366;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
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chr7	34192762	rs6968741	G	C	9744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=359;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=163;NR=168;PP=2965;SC=GTATCAAGACGTGTGACAACT;SOR=0.762;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=331;TCF=163;TCR=168;TR=331;WE=34192770;WS=34192752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,358:1.00:358
chr7	34685772	rs1582277	A	G	2069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=39;PP=1156;ReadPosRankSum=-1.097;SC=TGGAAAAACTAAAACGCTCAT;SOR=1.252;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=67;TCF=27;TCR=40;TR=65;WE=34685780;WS=34685762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,78:0.98:80
chr7	34698210	rs2530548	A	G	1570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=39;PP=949;ReadPosRankSum=0.148;SC=CTGACTTATAACAATGAGACT;SOR=0.713;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=251;TCF=122;TCR=129;TR=79;WE=34698218;WS=34698200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:191,89:0.32:280
chr7	34698234	rs2530549	A	C	1214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.525;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=36;PP=674;ReadPosRankSum=0.945;SC=GGAACTTAAGAGTGTCAATTG;SOR=0.763;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=214;TCF=93;TCR=121;TR=65;WE=34698242;WS=34698224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,72:0.31:236
chr7	34698251	rs2530550	C	G	951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.600;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=30;PP=604;ReadPosRankSum=0.746;SC=ATTGAAGTATCATAGCCAGTA;SOR=0.774;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=171;TCF=71;TCR=100;TR=52;WE=34698259;WS=34698241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,56:0.30:184
chr7	34698321	rs2530551	A	G	1415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.39;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr7	34698321	.	ACAACAAGCTG	GCAACAAGCTG,GCAACAAGCTT	438	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=2,0;NR=35,10;PP=438,177;QD=12.7776003391;SC=AAGTGCTAAAACAACAAGCTG;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=37,10;WE=34698339;WS=34698311;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:37
chr7	34698331	rs401256	G	T	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.371;SOR=0.874;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr7	34699826	rs35018938	AG	A	11329.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=574;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.566;NF=35;NR=175;PP=2948;ReadPosRankSum=0.592;SC=CCACTGGACAAGGAGAAAAGC;SOR=0.728;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=338;TCF=55;TCR=283;TR=210;WE=34699834;WS=34699816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:213,350:0.62:563
chr7	34699973	rs2530553	T	C	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=4.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=531;ReadPosRankSum=-0.201;SC=ACTTAGCTTATATTTCTTAGT;SOR=1.352;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=20;WE=34699981;WS=34699963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,21:0.64:33
chr7	34724373	rs11290993	CA	C	725.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=7.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.51;ReadPosRankSum=-1.175;SOR=0.103;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,41:0.82:50
chr7	34725283	rs17169985	T	A	2103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.630;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=30;PP=1231;ReadPosRankSum=0.849;SC=TTTCAAAAATTTATGACACTG;SOR=0.764;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=138;TCF=89;TCR=49;TR=86;WE=34725291;WS=34725273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,96:0.62:154
chr7	34725322	rs740623	T	A	1917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=35;PP=1155;ReadPosRankSum=0.323;SC=TAGCCATACATTGTTAGTAAC;SOR=0.717;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=234;TCF=141;TCR=93;TR=89;WE=34725330;WS=34725312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,98:0.37:262
chr7	34725539	rs1419837	C	T	2047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.706;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=55;PP=1386;ReadPosRankSum=0.825;SC=ACTCCTATAACCGTAGAAGTA;SOR=0.372;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=99;TCF=22;TCR=77;TR=73;WE=34725547;WS=34725529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,81:0.76:106
chr7	34818113	rs324981	A	T	6818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=479;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.543;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=143;NR=141;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.665;SC=ACAGATATTAATTGGCGATTC;SOR=0.634;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=443;TCF=229;TCR=214;TR=284;WE=34818121;WS=34818103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,305:0.64:478
chr7	34867182	rs17170011	C	T	1406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.160;NF=25;NR=35;PP=855;ReadPosRankSum=0.080;SC=TCGTGGCCTTCCTGGTGTACT;SOR=0.674;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=99;TCF=39;TCR=60;TR=60;WE=34867190;WS=34867172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,63:0.61:104
chr7	34867255	rs5883474	C	CA	238.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.761;HP=12;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.493;NF=0;NR=8;PP=195;ReadPosRankSum=0.140;SC=GGGGGTGGGGCGGGGGGGGCT;SOR=2.780;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=8;WE=34867263;WS=34867245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr7	34874038	rs727162	C	G	2814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=440;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.147;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=64;PP=1897;ReadPosRankSum=-0.061;SC=GGATTAAAAGCAAAACCTACG;SOR=0.806;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=409;TCF=222;TCR=187;TR=147;WE=34874046;WS=34874028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:280,156:0.36:436
chr7	34885132	rs13231258	C	T	3862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.479;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=71;PP=2207;ReadPosRankSum=-0.055;SC=CTCTGCTCTCCGGTGGTGCCC;SOR=0.763;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=232;TCF=127;TCR=105;TR=156;WE=34885140;WS=34885122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,176:0.67:263
chr7	34888010	rs10270521	T	C	946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.882;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=11;PP=533;ReadPosRankSum=-0.660;SC=AAAGAACCTCTCAGGTAAAAG;SOR=0.507;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=71;TCF=50;TCR=21;TR=35;WE=34888018;WS=34888000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,43:0.52:83
chr7	34889182	rs6972158	A	G	4367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=96;PP=2783;ReadPosRankSum=0.437;SC=TCCAGGGAGCAAAGATCACAG;SOR=0.684;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=323;TCF=160;TCR=163;TR=192;WE=34889190;WS=34889172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,213:0.60:355
chr7	34889222	rs10275028	T	C	3705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.944;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=89;PP=2028;ReadPosRankSum=-0.637;SC=GGGAGAGAACTGAGAGGCATG;SOR=0.772;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=256;TCF=113;TCR=143;TR=156;WE=34889230;WS=34889212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,172:0.61:281
chr7	34979082	rs3735410	C	T	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.385;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=164;ReadPosRankSum=-0.567;SC=GGTAACAGAGCGGAAGCCCAG;SOR=1.086;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=55;TCF=22;TCR=33;TR=17;WE=34979090;WS=34979072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,20:0.33:61
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chr7	35280693	rs2072434	C	T	561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.750;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.929;NF=3;NR=23;PP=409;ReadPosRankSum=0.909;SC=CATACTTATACTGCTAAACAG;SOR=1.802;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=94;TCF=20;TCR=74;TR=26;WE=35280701;WS=35280683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,28:0.29:96
chr7	35288276	rs17675148	T	C	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=1.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.33;ReadPosRankSum=-1.122;SOR=0.969;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,17:0.23:74
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chr7	35289941	rs5883499	C	CA	1708.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=31;PP=1394;SC=AAACTCCAGGCAGGCTGTAGG;SOR=1.814;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=32;WE=35289949;WS=35289931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr7	35293193	rs336283	A	G	618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=24;PP=418;ReadPosRankSum=-0.425;SC=CGTTGGCCCGAGAGGAGAGTT;SOR=0.658;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=136;TCF=55;TCR=81;TR=40;WE=35293201;WS=35293183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,41:0.28:145
chr7	35414453	rs17608167	T	C	2427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=36;PP=1587;ReadPosRankSum=1.267;SC=TCCTCTTCAATCCCAGTCTTC;SOR=0.708;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=147;TCF=96;TCR=51;TR=100;WE=35414461;WS=35414443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,107:0.67:159
chr7	35414769	rs2553113	C	T	7522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FS=1.474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.67;ReadPosRankSum=0.762;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,190:0.65:293
chr7	35414772	rs2553114	C	T	7587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FS=1.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.63;ReadPosRankSum=0.569;SOR=0.814;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,192:0.65:296
chr7	35673799	rs2305333	T	C	653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=1;PP=522;SC=TATATGTTAGTTTTCTTTCAT;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=35673807;WS=35673794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr7	35673870	rs2305334	C	T	4541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=105;NR=42;PP=2965;SC=GGTCCCATACCGTGCTGGGAA;SOR=1.989;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=147;TCF=105;TCR=42;TR=147;WE=35673878;WS=35673860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr7	35678214	rs3816422	C	T	547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=14;PP=403;SC=AAAATACTTACTTTCAACGAT;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=35678222;WS=35678204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr7	35840898	rs59008252	G	GC	5000.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=10;NR=44;PP=2436;SC=TCAGCTTCGGGTGCCGCGACT;SOR=0.709;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=55;TCF=10;TCR=45;TR=54;WE=35840906;WS=35840888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr7	35928551	rs6945909	A	G	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FS=0.667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.70;ReadPosRankSum=0.343;SOR=0.603;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,42:0.26:159
chr7	35928678	rs58918750	T	A	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=407;ReadPosRankSum=-0.371;SC=AGATATGATGTCACCTGTGAC;SOR=1.044;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=19;WE=35928686;WS=35928668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,19:0.76:25
chr7	36124292	rs1986593	G	A	1755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.900;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=46;PP=1036;ReadPosRankSum=-0.931;SC=CGGAGTTCACGTGGAGGACGC;SOR=0.663;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=303;TCF=153;TCR=150;TR=95;WE=36124300;WS=36124282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:230,103:0.31:333
chr7	36320821	rs196586	G	A	6912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=116;NR=122;PP=2965;SC=AAGCCCTCGAGTCAGCTCCAG;SOR=0.846;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=238;TCF=116;TCR=122;TR=238;WE=36320829;WS=36320811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr7	36324435	rs196589	C	T	1651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=38;PP=2062;ReadPosRankSum=-1.627;SC=TCAAGGTACCCGCTCCACGCC;SOR=0.651;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=115;TCF=52;TCR=63;TR=68;WE=36324444;WS=36324425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,77:0.60:129
chr7	36324436	rs13232200	G	A	972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=25;PP=1262;ReadPosRankSum=1.245;SC=CAAGGTACCCGCTCCACGCCG;SOR=0.683;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=114;TCF=52;TCR=62;TR=47;WE=36324444;WS=36324425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,53:0.41:128
chr7	36327307	rs142587467	G	A	2773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=467;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.557;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=66;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.812;SC=CCCTCCTGGGGAGCGAGAATC;SOR=0.741;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=431;TCF=224;TCR=207;TR=140;WE=36327325;WS=36327297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:315,152:0.33:467
chr7	36327317	rs196594	C	T	7780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=495;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.557;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=163;NR=148;PP=2962;ReadPosRankSum=0.888;SC=GAGCGAGAATCCCAGCAAGAA;SOR=0.652;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=458;TCF=242;TCR=216;TR=311;WE=36327325;WS=36327297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,336:0.68:495
chr7	36327410	rs196595	A	G	4529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.030;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=109;PP=2916;ReadPosRankSum=0.411;SC=TTTTGCTGTGACTCGGCCACT;SOR=0.771;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=252;TCF=91;TCR=161;TR=173;WE=36327418;WS=36327400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,191:0.69:277
chr7	36338749	rs196613	T	C	12706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=493;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=221;NR=228;PP=2965;SC=GCAAGAAGGATGCCCCTCGGA;SOR=0.782;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=452;TCF=223;TCR=229;TR=449;WE=36338757;WS=36338739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,489:1.00:489
chr7	36366569	rs196655	A	T	998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.526;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-1.205;NF=16;NR=29;PP=551;ReadPosRankSum=-1.418;SC=ATGTAACTACAATGTACATTT;SOR=0.878;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=40;TCR=72;TR=45;WE=36366577;WS=36366559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,51:0.40:127
chr7	36370499	rs196659	C	G	2752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=31;PP=1690;SC=ACTAAAAATACTGTGAAGCTA;SOR=1.261;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=58;TCR=31;TR=89;WE=36370507;WS=36370489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr7	36370555	rs196660	G	T	5051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=105;NR=71;PP=2965;SC=GCTGATCTGGGGTGTTCGGGG;SOR=1.029;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=176;TCF=105;TCR=71;TR=176;WE=36370563;WS=36370545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr7	36445856	rs197367	G	A	1851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.398;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=47;PP=1259;ReadPosRankSum=-1.384;SC=TCCCCTCCCAGACCTCTGCTT;SOR=0.784;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=313;TCF=165;TCR=148;TR=102;WE=36445864;WS=36445846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:225,106:0.32:331
chr7	36552729	rs59476355	A	AT	14022.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=451;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=163;PP=2936;SC=AGAGAAAGACATTTGCAAAGA;SOR=0.812;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=225;TCF=50;TCR=175;TR=213;WE=36552737;WS=36552719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,424:1.00:424
chr7	36552790	rs57543920	G	GT	10441.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=118;PP=2936;SC=CCCCCATAGGGTTGTGGAATG;SOR=0.700;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=179;TCF=54;TCR=125;TR=170;WE=36552798;WS=36552780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,299:1.00:299
chr7	36561469	rs6462681	G	T	960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=0;PP=817;SC=ATTTCCCTATGGTCCCAAATT;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=29;WE=36561477;WS=36561460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr7	36588405	rs5883561	A	AC	1618.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=37;PP=1619;SC=CCTCTTGGCAACTTTTTGCTA;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=41;TCF=1;TCR=40;TR=38;WE=36588413;WS=36588395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr7	36588955	rs3735397	G	A	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=98;ReadPosRankSum=0.054;SC=TTTATGCTCAGTAAAAATGAT;SOR=1.230;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=6;WE=36588963;WS=36588945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr7	36656035	rs3735386	G	C	2346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=474;ExcessHet=3.0103;FS=2.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.97;ReadPosRankSum=-1.982;SOR=0.961;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:336,136:0.29:472
chr7	36656147	rs2727818	A	T	431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=1.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.57;ReadPosRankSum=0.188;SOR=0.450;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,28:0.23:121
chr7	36661423	rs2727822	T	C	2016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.553;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=49;PP=1036;ReadPosRankSum=-0.358;SC=GGGTTCAGCCTGCTTTGATGT;SOR=0.597;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=285;TCF=140;TCR=145;TR=106;WE=36661431;WS=36661413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:192,113:0.37:305
chr7	36726136	rs60875600	AT	A	214.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=118;ReadPosRankSum=-0.324;SC=TGCCCAGAGCATTTTTTTTTG;SOR=0.527;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=42;TCF=37;TCR=5;TR=13;WE=36726144;WS=36726126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,14:0.33:43
chr7	36726476	rs58947801	CGTGT	C	257.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=12;PP=117;ReadPosRankSum=-1.492;SC=AGAAAGGATGCGTGTGTGTGT;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=12;WE=36726489;WS=36726466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr7	36729757	rs7790095	T	C	980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FS=2.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.30;ReadPosRankSum=1.589;SOR=0.886;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:165,63:0.28:228
chr7	36729822	rs11427708	C	CA	1991.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=342;ExcessHet=3.0103;FS=2.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.19;ReadPosRankSum=1.092;SOR=0.613;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:218,104:0.32:322
chr7	36729951	rs6462691	C	T	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.090;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=299;ReadPosRankSum=0.141;SC=TCATGAACACCCAGGTTGGGC;SOR=0.190;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=42;TCF=6;TCR=36;TR=19;WE=36729959;WS=36729941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,19:0.46:41
chr7	36763560	rs6462703	C	T	741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.863;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=8;PP=440;ReadPosRankSum=0.413;SC=TGATTTATTACGCAAGCAAAG;SOR=1.161;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=110;TCF=78;TCR=32;TR=34;WE=36763568;WS=36763550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,40:0.31:128
chr7	36763688	rs2228411	C	T	2590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=424;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=64;PP=1573;ReadPosRankSum=0.779;SC=CTGGAGAGGCCGAGGACTGAA;SOR=0.719;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=380;TCF=193;TCR=187;TR=128;WE=36763696;WS=36763678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:278,144:0.34:422
chr7	36895342	rs13246439	C	T	509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FS=4.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.23;ReadPosRankSum=-0.299;SOR=0.774;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:120,38:0.24:158
chr7	36895517	rs113406032	G	C	194.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.200;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5565;FS=6.532;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=156;ReadPosRankSum=1.915;SC=ATATAAAGTCGATACTTCTGT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=7;WE=36895525;WS=36895507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr7	36934448	rs6462722	A	G	4226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=53;PP=2485;SC=AGTCAATACTAGGTAACTTAC;SOR=1.079;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=83;TCR=53;TR=136;WE=36934456;WS=36934438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr7	37252929	rs7809365	T	C	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.143;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=8;PP=229;ReadPosRankSum=0.354;SC=TGCTGTCCAATGAGCACTCAC;SOR=1.020;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=58;TCF=33;TCR=25;TR=21;WE=37252937;WS=37252919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,24:0.36:67
chr7	37253093	rs7809548	T	A	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.606;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=4;PP=82;ReadPosRankSum=-0.638;SC=TGAAATTTTTTAAAAAAGAAA;SOR=0.392;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=26;TCF=12;TCR=14;TR=8;WE=37253101;WS=37253083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,8:0.29:28
chr7	37256392	rs7806425	G	A	1568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.104;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=58;PP=1136;ReadPosRankSum=-0.973;SC=GGTGTGCTTCGTAACTGTATA;SOR=1.219;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=234;TCF=85;TCR=149;TR=81;WE=37256400;WS=37256382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,82:0.33:245
chr7	37257580	rs6462745	C	A	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=207;ReadPosRankSum=1.456;SC=AACAAGAAAGCAGGAGCAATG;SOR=0.223;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=11;WE=37257588;WS=37257570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr7	37262140	rs2302668	C	T	1537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.849;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=23;PP=945;ReadPosRankSum=-0.550;SC=AATGAGTCCCCGAATAGAAGG;SOR=0.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=192;TCF=128;TCR=64;TR=72;WE=37262148;WS=37262130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,77:0.37:206
chr7	37298800	rs2717968	C	T	1143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=15;PP=738;ReadPosRankSum=1.419;SC=TGCCGCTCTCCACCATCTGCG;SOR=0.679;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=151;TCF=106;TCR=45;TR=54;WE=37298808;WS=37298790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,58:0.36:162
chr7	37299056	rs2717969	C	T	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=214;ReadPosRankSum=0.880;SC=AAGCCAAAAGCGCAAGACTAT;SOR=0.880;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=79;TCF=26;TCR=53;TR=20;WE=37299064;WS=37299046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,24:0.26:91
chr7	37355590	rs11383031	C	CT	4646.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=72;PP=2936;SC=AAAGGAAATACTTGTTAGTTT;SOR=1.312;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=82;TCF=5;TCR=77;TR=77;WE=37355598;WS=37355580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr7	37780799	rs61729279	C	A	4577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.446;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=105;PP=2732;ReadPosRankSum=1.361;SC=ATAACGAAATCTTCTTGAGTG;SOR=0.657;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=286;TCF=126;TCR=160;TR=192;WE=37780807;WS=37780789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,207:0.67:307
chr7	37889786	rs10271309	A	G	445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=360;ReadPosRankSum=0.428;SC=GTTTTAAAAGATGTTATTTGC;SOR=0.756;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=16;WE=37889794;WS=37889776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr7	37901581	rs2249451	G	A	8998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=175;NR=145;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.994;SC=TTAGTTCTTGGTGTGTTCTCC;SOR=0.862;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=323;TCF=177;TCR=146;TR=320;WE=37901589;WS=37901571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,343:0.99:345
chr7	37903853	rs3816419	A	T	2038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=22;PP=1077;SC=CAATTAACTGATCATTAGAAA;SOR=1.300;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=43;TCR=22;TR=65;WE=37903861;WS=37903843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr7	37903904	rs3816418	C	T	2912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=43;PP=1525;SC=ATCCAGACTTCGTGCCAAGAA;SOR=0.749;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=51;TCR=43;TR=93;WE=37903912;WS=37903894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr7	37904065	rs3841582	TAAC	T	759.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=427;SC=AATTGCAAAATAACAACCTCT;SOR=1.863;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=37904075;WS=37904055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr7	37904099	rs3816417	G	A	132.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=102;SC=AAAGACAAGCGTACCATTTAG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=37904107;WS=37904089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr7	37907304	rs10250905	T	C	3878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=27;PP=2489;SC=TATTTTGTAGTGTGACTTCGA;SOR=2.339;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=93;TCR=27;TR=120;WE=37907312;WS=37907294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr7	37923849	rs1993052	G	A	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.935;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=106;ReadPosRankSum=0.264;SC=TATGTATTGTGTACATAACCA;SOR=1.751;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=7;WE=37923857;WS=37923839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr7	37923923	rs62001870	T	C	1323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.76;ReadPosRankSum=0.675;SOR=0.532;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,60:0.71:84
chr7	37924737	rs1530822	T	G	1376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.094;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=14;PP=748;ReadPosRankSum=-0.112;SC=TTTGTTTTCTTTTCTAATAGT;SOR=0.898;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=155;TCF=108;TCR=47;TR=55;WE=37924745;WS=37924727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,65:0.38:170
chr7	37924879	rs2242027	A	G	2077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=406;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.572;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=63;PP=1316;ReadPosRankSum=-0.158;SC=ATGGGTCACTATCTGTTTTCG;SOR=0.768;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=373;TCF=166;TCR=207;TR=111;WE=37924887;WS=37924869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:284,122:0.30:406
chr7	37927779	rs2251179	T	G	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=4.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.675;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=221;ReadPosRankSum=-0.422;SC=GATCTGGAATTATTTGCTGTT;SOR=0.197;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=12;WE=37927787;WS=37927769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,14:0.32:44
chr7	37933983	rs10260487	C	G	1647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=16;PP=982;SC=ATTAAACTATCATTTTCCTTA;SOR=1.355;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=38;TCR=16;TR=54;WE=37933991;WS=37933973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr7	37934146	rs56128139	TA	CT	936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.984;HP=4;HapScore=2;JOINED;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=13;PP=690;ReadPosRankSum=0.305;SC=CCTGAGCAAATAGAGAAAATT;SOR=0.998;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=66;TCF=31;TCR=35;TR=23;WE=37934155;WS=37934136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,27:0.34:79
chr7	37934234	rs10261071	G	A	557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=11;PP=349;SC=ATACATAATTGTTTGCATTAT;SOR=2.093;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=16;WE=37934242;WS=37934224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr7	37946958	rs17236975	A	T	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=336;ReadPosRankSum=0.141;SC=AGATGTGTCTATGAAGAGCAC;SOR=1.270;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=16;WE=37946966;WS=37946948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr7	37947103	rs1802074	C	T	3221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.767;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=62;PP=1961;ReadPosRankSum=-1.380;SC=CGGGTTTGTTCTCTTCTGGGC;SOR=0.772;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=195;TCF=102;TCR=93;TR=130;WE=37947117;WS=37947093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,141:0.67:212
chr7	37947164	rs1802073	G	T	2437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.609;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=57;PP=1602;ReadPosRankSum=2.161;SC=GGAGCAGGAGGCTTTCCCTTT;SOR=0.639;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=152;TCF=66;TCR=86;TR=100;WE=37947172;WS=37947154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,108:0.66:164
chr7	37951726	rs1132553	G	A	566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.092;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=390;ReadPosRankSum=-0.123;SC=CCTACCTTGAGCGCCACTCGT;SOR=1.095;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=83;TCF=54;TCR=29;TR=27;WE=37951734;WS=37951716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,30:0.33:92
chr7	37953720	rs2248554	C	A	822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.990;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=5;PP=614;ReadPosRankSum=-0.328;SC=GTTTTCTTTACTTTGTGACTA;SOR=0.238;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=50;TCF=44;TCR=6;TR=32;WE=37953728;WS=37953710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,32:0.64:50
chr7	37953840	rs1132552	C	T	6046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=426;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.595;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=153;NR=104;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.475;SC=TGCTGAGATACGTTGCCAAAG;SOR=0.970;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=404;TCF=232;TCR=172;TR=257;WE=37953848;WS=37953830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,270:0.64:425
chr7	37960262	rs201513905	AAGGCAGTGGCAGC	A	2565.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FS=15.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.55;MQRankSum=5.651;QD=12.16;ReadPosRankSum=-0.197;SOR=0.451;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:137,74:0.35:211
chr7	37960955	rs4723716	T	G	2622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=59;NR=37;PP=1592;SC=GAGGAGGGTCTCTTGGGGATA;SOR=1.000;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=59;TCR=37;TR=96;WE=37960963;WS=37960945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr7	37966201	rs12666164	T	C	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=4;PP=411;ReadPosRankSum=0.608;SC=CTTTTAAAGATTGCAGGCCAG;SOR=0.434;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=62;TCF=55;TCR=7;TR=26;WE=37966209;WS=37966191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,25:0.37:67
chr7	37988589	rs2044831	C	T	6394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=113;PP=2965;SC=AGTACTCCATCGGGGGGCCTC;SOR=0.916;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=217;TCF=104;TCR=113;TR=217;WE=37988597;WS=37988579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
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chr7	38370327	rs113726878	A	G	3979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=577;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.536;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=106;NR=89;PP=2435;ReadPosRankSum=-0.493;SC=AAGAAAATAAACAAAACGAAA;SOR=0.747;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=529;TCF=275;TCR=254;TR=195;WE=38370335;WS=38370317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:361,213:0.37:574
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chr7	38388851	rs62445008	T	G	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=4.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.175;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.777;NF=7;NR=0;PP=98;ReadPosRankSum=1.387;SC=CAGAATACAGTAAATTTGGTG;SOR=2.954;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=7;WE=38388859;WS=38388841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,8:0.24:34
chr7	38393403	rs2017501	G	A	2233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=454;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.571;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=64;PP=1446;ReadPosRankSum=1.292;SC=TTGTGCTTCCGTAAGTATCAT;SOR=0.621;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=428;TCF=225;TCR=203;TR=127;WE=38393411;WS=38393393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:319,135:0.30:454
chr7	38397867	rs370983159	G	C	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FS=1.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.01;MQRankSum=1.387;QD=1.12;ReadPosRankSum=-1.720;SOR=0.997;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:130,24:0.16:154
chr7	38398564	rs1810377	AG	GC	3433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.876;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.320;NF=23;NR=56;PP=2879;ReadPosRankSum=-0.216;SC=TAGAAGCACCAGTAGGGCCCA;SOR=0.950;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=243;TCF=77;TCR=166;TR=79;WE=38398573;WS=38398554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,96:0.36:270
chr7	38402496	rs2735118	A	G	2996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=497;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.561;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=63;PP=1910;ReadPosRankSum=0.038;SC=ATAGACCCCAAAGTCATTTTC;SOR=0.604;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=459;TCF=265;TCR=194;TR=149;WE=38402504;WS=38402486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:334,163:0.33:497
chr7	38402781	rs2011898	A	G	2176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=384;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.837;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.066;NF=65;NR=54;PP=1511;ReadPosRankSum=0.468;SC=ACTGGCTGCAATGGGAACAAC;SOR=0.749;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=363;TCF=198;TCR=165;TR=119;WE=38402789;WS=38402771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:266,118:0.31:384
chr7	38424328	rs2810	T	C	766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.048;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=5;PP=428;ReadPosRankSum=0.018;SC=CTGTAAATCATTAAGAGCATA;SOR=0.265;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=51;TCF=43;TCR=8;TR=28;WE=38424336;WS=38424318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,33:0.59:56
chr7	38424663	rs62446763	G	A	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=230;ReadPosRankSum=1.148;SC=GTGCTGTGCCGTGATCAATGG;SOR=0.846;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=71;TCF=15;TCR=56;TR=19;WE=38424671;WS=38424653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,17:0.26:66
chr7	38429370	rs6977263	C	T	4683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.989;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=118;NR=77;PP=2962;ReadPosRankSum=0.450;SC=AAAAAATCAACGTAGCCCAAA;SOR=0.946;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=295;TCF=172;TCR=123;TR=195;WE=38429378;WS=38429360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,207:0.66:313
chr7	38429552	rs36122520	T	A	1784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.970;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.949;NF=20;NR=46;PP=1096;ReadPosRankSum=-1.091;SC=CAGCCAGATTTCAAGCAGACA;SOR=0.500;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=94;TCF=26;TCR=68;TR=66;WE=38429560;WS=38429542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,74:0.70:106
chr7	38429572	rs35606872	GT	G	1703.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.762;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.997;NF=2;NR=32;PP=2138;ReadPosRankSum=-1.155;SC=ACTCTTACAAGTCACTCTCCA;SOR=0.392;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=53;TCF=2;TCR=51;TR=34;WE=38429592;WS=38429562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,49:0.68:72
chr7	38429584	rs34824107	C	G	1022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.205;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=26;PP=2147;ReadPosRankSum=-0.342;SC=CACTCTCCAACCTGGATGAAA;SOR=0.207;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=54;TCF=11;TCR=43;TR=35;WE=38429592;WS=38429562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,40:0.66:61
chr7	38431430	rs6949992	A	G	1109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.940;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=22;PP=714;ReadPosRankSum=-0.101;SC=TGGCTGGTGCAGAAGGCGTGG;SOR=0.709;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=71;TCF=38;TCR=33;TR=46;WE=38431438;WS=38431420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,49:0.64:77
chr7	38431644	rs79759611	G	GC	1583.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=26;PP=1073;SC=CCGTGGCGATGCCGGCAGGGC;SOR=1.378;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=27;WE=38431652;WS=38431634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr7	38457688	rs10247761	C	A	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=6.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.87;ReadPosRankSum=-1.151;SOR=0.016;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,5:0.21:24
chr7	38460546	rs1019287	G	A	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=2.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.71;ReadPosRankSum=1.398;SOR=0.410;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,29:0.49:59
chr7	38467842	rs1544636	A	G	12283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=442;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=216;NR=188;PP=2965;SC=GCTGAATCCAAGCTTGGCTGC;SOR=0.730;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=405;TCF=216;TCR=189;TR=404;WE=38467850;WS=38467832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,442:1.00:442
chr7	38467923	rs6958300	A	G	10554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=391;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=172;NR=191;PP=2965;SC=GTATGACTACAGTTCTCAGTT;SOR=0.829;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=363;TCF=172;TCR=191;TR=363;WE=38467931;WS=38467913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,391:1.00:391
chr7	38468463	rs2267808	C	T	6144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=107;PP=2965;SC=TTTTCATTGGCGTTTGTACTT;SOR=0.796;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=209;TCF=102;TCR=107;TR=209;WE=38468471;WS=38468453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr7	38468695	rs2392572	C	T	8631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=140;NR=153;PP=2965;SC=GAGAATCTTCCATCTTCTGTT;SOR=0.771;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=293;TCF=140;TCR=153;TR=293;WE=38468703;WS=38468685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,318:1.00:318
chr7	38469039	rs2215955	C	A	1965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.939;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=41;PP=1217;ReadPosRankSum=0.680;SC=TCTTGGCTGACCCTGTCTGTA;SOR=0.615;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=258;TCF=152;TCR=106;TR=96;WE=38469047;WS=38469029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,105:0.36:288
chr7	38469636	rs10253674	G	T	476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=12;PP=317;SC=TTCCAAAATTGTTTAAGACCA;SOR=3.258;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=38469644;WS=38469626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr7	38471753	rs10232299	A	G	1235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.230;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=33;PP=737;ReadPosRankSum=-0.207;SC=TCTGGGGATCAAGATACATGA;SOR=0.823;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=170;TCF=71;TCR=99;TR=56;WE=38471761;WS=38471743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,64:0.34:187
chr7	38475832	rs7811443	T	C	5706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=404;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.541;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=144;NR=95;PP=2962;ReadPosRankSum=0.081;SC=CTTACTGAGGTTTATGAAATA;SOR=0.738;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=381;TCF=228;TCR=153;TR=239;WE=38475840;WS=38475822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,251:0.62:404
chr7	38504905	rs722336	C	A	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.493;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=403;ReadPosRankSum=1.214;SC=GAAGGCCAGACATAAATGTAA;SOR=2.303;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=17;WE=38504913;WS=38504895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
chr7	38505014	rs722335	A	C	2345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=35;PP=1428;ReadPosRankSum=-0.159;SC=CCACAGATTGAAGAAATTTTA;SOR=0.763;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=117;TCF=70;TCR=47;TR=87;WE=38505033;WS=38505004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,99:0.74:133
chr7	38505025	rs722334	G	A	3833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=51;PP=2205;SC=AGAAATTTTAGCAAGCAGGAC;SOR=0.874;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=74;TCR=51;TR=125;WE=38505033;WS=38505004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr7	38505712	rs17171372	T	G	1604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.441;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=26;PP=916;ReadPosRankSum=-1.687;SC=TTTCATTTGCTTCCAAAATAA;SOR=1.009;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=106;TCF=67;TCR=39;TR=69;WE=38505720;WS=38505702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,78:0.63:123
chr7	38514803	rs41279582	G	A	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=99;ReadPosRankSum=0.191;SC=ACTGGAAAGCGCAGATAAAGA;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=6;WE=38514811;WS=38514802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr7	38516448	rs73120268	G	T	2658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.574;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=50;PP=1566;ReadPosRankSum=0.379;SC=ATTCACCATGGGCTCAATCCC;SOR=0.906;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=184;TCF=101;TCR=83;TR=116;WE=38516456;WS=38516438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,122:0.63:194
chr7	38516655	rs17171383	G	T	2170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.836;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=47;PP=1184;ReadPosRankSum=-0.186;SC=TGCTTTCCTTGGCCAGAGCTG;SOR=0.513;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=103;TCF=42;TCR=61;TR=80;WE=38516663;WS=38516645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,92:0.78:118
chr7	38530568	rs2043786	G	T	4452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=34;PP=2965;SC=TTGAGGACTTGTAATAATTCT;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=142;TCF=108;TCR=34;TR=142;WE=38530576;WS=38530558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr7	38530807	rs3837078	T	TA	3553.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=84;PP=1549;SC=ACCAAACTTCTAAAAAAATCT;SOR=2.644;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=102;TCF=0;TCR=102;TR=84;WE=38530815;WS=38530797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr7	38543103	rs10225047	TG	GC	2955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=3.206;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.15;ReadPosRankSum=0.622;SOR=2.063;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,103:0.98:105
chr7	38543371	rs6946268	C	T	4449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=104;PP=2965;SC=GTAAGAAGTGCTAAGTCTCAA;SOR=2.120;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=142;TCF=38;TCR=104;TR=142;WE=38543379;WS=38543361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr7	38725804	rs11980087	C	T	14108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=517;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=247;NR=234;PP=2965;SC=GAAAAAGGCTCGCCATCAACT;SOR=0.713;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=481;TCF=247;TCR=234;TR=481;WE=38725812;WS=38725784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,517:1.00:517
chr7	38726473	rs17508140	T	C	3800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=55;NR=74;PP=2410;SC=GGCAGGAAGTTTGAGGAGTAA;SOR=1.154;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=129;TCF=55;TCR=74;TR=129;WE=38726481;WS=38726463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr7	38780883	rs6951429	C	T	3724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=58;PP=2093;SC=AACAACAGTCCGAATTTTTAA;SOR=0.708;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=68;TCR=58;TR=126;WE=38780891;WS=38780873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr7	38780924	rs6975410	T	C	2853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=57;PP=1849;SC=TCTATAGAAGTTACCAGCATC;SOR=1.115;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=42;TCR=57;TR=99;WE=38780932;WS=38780914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr7	38781018	rs3779128	T	C	536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=16;PP=404;SC=ATGAAAATAATGAGTTCCACT;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=38781026;WS=38781008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr7	38782951	rs10254567	G	A	2818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=9;PP=1951;SC=GACATAACTGGTTACACTGAG;SOR=3.962;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=68;TCR=9;TR=76;WE=38782959;WS=38782941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr7	38785062	rs28520398	G	A	2514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=27;PP=1597;SC=TCTGTGTTACGTTGGTCTAAA;SOR=1.533;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=59;TCR=27;TR=86;WE=38785070;WS=38785052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr7	38796748	rs2392599	C	T	696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=20;PP=529;SC=TAACTATACACGACCAATAAG;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=38796756;WS=38796738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr7	38813711	rs976350	C	T	6419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=146;NR=57;PP=2965;SC=TTCATATCTCCTACCTAAATG;SOR=1.885;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=203;TCF=146;TCR=57;TR=203;WE=38813719;WS=38813701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr7	38869708	rs7790054	C	T	2588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=13;PP=1890;SC=TATTTTACTTCAATTATGACC;SOR=3.180;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=67;TCR=13;TR=80;WE=38869716;WS=38869698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
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chr7	39125388	.	GGA	G	680.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.043;ClippingRankSum=0.000;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-2.163;QD=4.73;ReadPosRankSum=-0.332;SOR=0.677;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:119,25:0.17:144
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chr7	39125588	.	T	C	1558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.435;ClippingRankSum=0.000;DP=376;ExcessHet=3.0103;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.16;ReadPosRankSum=1.564;SOR=0.568;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:314,61:0.16:375
chr7	39125590	.	T	C	1558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.070;ClippingRankSum=0.000;DP=371;ExcessHet=3.0103;FS=1.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.21;ReadPosRankSum=1.627;SOR=0.572;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:310,60:0.16:370
chr7	39243750	rs4507668	A	G	4950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=123;NR=59;PP=2965;SC=CCACTCTGTCATATCATCTAT;SOR=1.622;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=182;TCF=123;TCR=59;TR=182;WE=39243758;WS=39243740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr7	39379325	rs2074936	C	T	2632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.266;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=62;PP=1620;ReadPosRankSum=1.327;SC=CAGCCTCCCCCGTCAACCAAC;SOR=0.446;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=150;TCF=58;TCR=92;TR=105;WE=39379333;WS=39379315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,110:0.70:157
chr7	39500352	rs885689	C	G	501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=13;PP=409;SC=CTTCTAGCCGCCCTGGGCCTC;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=16;WE=39500360;WS=39500342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr7	39649055	rs4723883	A	G	595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.359;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=359;ReadPosRankSum=1.383;SC=ATGTTATCAAATTGGGAGAAT;SOR=0.393;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=63;TCF=51;TCR=12;TR=24;WE=39649063;WS=39649045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,28:0.38:74
chr7	39649275	rs4723884	G	A	1435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.477;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=44;PP=1013;ReadPosRankSum=1.797;SC=CCGGAGGTTGGGACGCAACTA;SOR=0.739;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=260;TCF=122;TCR=138;TR=79;WE=39649283;WS=39649265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:203,82:0.29:285
chr7	39649456	rs4723885	G	C	1507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.482;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=40;PP=1065;ReadPosRankSum=-1.189;SC=GCCACCGCCGGCGTTTCAGAC;SOR=0.633;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=250;TCF=131;TCR=119;TR=81;WE=39649464;WS=39649446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:186,83:0.31:269
chr7	39726129	.	T	C	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.824;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=10;NR=0;PP=208;ReadPosRankSum=-0.605;SC=TCACTACAGATTGAAAACTAG;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=10;WE=39726137;WS=39726119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr7	39736826	rs3779202	C	T	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=266;ReadPosRankSum=-2.386;SC=ATCTACCCAACCCCACTTAAG;SOR=0.775;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=44;TCF=35;TCR=9;TR=20;WE=39736834;WS=39736816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,20:0.43:47
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chr7	40234742	.	CTT	C	94.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=-0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.72;MQRankSum=-0.000;QD=11.84;ReadPosRankSum=1.699;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr7	40314165	rs12669315	G	A	3633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-2.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=549;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.805;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=100;PP=2178;ReadPosRankSum=0.271;SC=CCACTGGCCTGTATGCATATG;SOR=0.821;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=500;TCF=239;TCR=261;TR=185;WE=40314173;WS=40314155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:346,203:0.37:549
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chr7	40899967	rs2010706	G	C	10686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=427;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=201;NR=190;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.197;SC=GGCCGCCCCCGCTGCTCGGGC;SOR=0.743;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=394;TCF=203;TCR=191;TR=391;WE=40899975;WS=40899956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,410:1.00:412
chr7	41368666	.	T	TGAAA	854.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5013;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=406;ReadPosRankSum=0.912;SC=GAAGCTCAATTGAAAGAAAGA;SOR=4.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=8;WE=41368674;WS=41368656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,20:0.95:21
chr7	42005678	rs929387	G	A	2333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=39;PP=1479;SC=GCCGTGGCCCGGCGCATCGTG;SOR=1.329;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=29;TCR=39;TR=68;WE=42005686;WS=42005668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr7	42007071	rs4724083	C	T	837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=24;NR=5;PP=491;SC=TAAACATTAACGGATGGTTAC;SOR=2.694;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=29;WE=42007079;WS=42007061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr7	42007446	rs121917710	C	T	3810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.472;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=86;PP=2355;ReadPosRankSum=-0.873;SC=AGCTCGAGCCCACTGTTGGAA;SOR=0.631;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=248;TCF=119;TCR=129;TR=166;WE=42007467;WS=42007436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,173:0.65:265
chr7	42064852	rs846273	C	G	3024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=66;NR=22;PP=1952;SC=TGTGCGGCCTCGGTGTCCTAC;SOR=1.779;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=66;TCR=22;TR=88;WE=42064860;WS=42064842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr7	42187734	rs113509347	GCACACA	G	164.27	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=23.47;ReadPosRankSum=1.465;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,6:0.86:7
chr7	42212210	rs76999720	C	T	1124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FS=1.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.39;ReadPosRankSum=1.381;SOR=0.816;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:186,70:0.27:256
chr7	42262935	rs11266806	GA	G	241.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=2.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.26;MQRankSum=0.000;QD=11.51;ReadPosRankSum=0.919;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr7	42950640	rs643138	C	T	6208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=117;PP=2965;SC=TCTATGAACCCGGGCTTGTGT;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=217;TCF=100;TCR=117;TR=217;WE=42950648;WS=42950630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr7	42951515	rs647117	G	A	2102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=52;NR=23;PP=1352;SC=GCTCCTCACCGGCAGCGCCAG;SOR=1.609;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=76;TCF=53;TCR=23;TR=75;WE=42951523;WS=42951505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr7	42957465	rs71008875	ATT	A	547.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=490;SC=TACTTATATCATTGTTTATAT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=42957474;WS=42957455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr7	42966284	rs76732605	G	A	2040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=2.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.08;ReadPosRankSum=-0.743;SOR=0.705;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,100:0.64:156
chr7	42970733	rs619664	C	T	5341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=111;NR=72;PP=2958;SC=GTACAAGCTGCGGTTAGTTCA;SOR=1.063;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=183;TCF=111;TCR=72;TR=183;WE=42970741;WS=42970723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr7	42974827	rs601057	A	C	4145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=100;PP=2965;SC=ATAAATTATTATCAGATTATA;SOR=2.465;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=131;TCF=30;TCR=101;TR=130;WE=42974835;WS=42974817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr7	42976789	rs630191	A	G	10832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=405;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=196;NR=181;PP=2965;SC=AGGTGGAACTAGATGGTGTAT;SOR=0.728;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=377;TCF=196;TCR=181;TR=377;WE=42976797;WS=42976779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,405:1.00:405
chr7	42977091	rs631132	G	A	5365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=121;PP=2965;SC=TGCTGTACACGGGAGAGACAC;SOR=1.503;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=188;TCF=67;TCR=121;TR=188;WE=42977099;WS=42977081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr7	43400656	rs145865375	CGT	C	220.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;QD=31.53;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr7	43485248	rs6960889	A	G	1046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.836;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=29;PP=720;ReadPosRankSum=-1.271;SC=AAAAACAAGAAGGGCGGGGGA;SOR=1.302;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=65;TCF=13;TCR=52;TR=36;WE=43485256;WS=43485238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,41:0.60:68
chr7	43495878	rs3214631	C	CT	1256.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.416;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.152;NF=8;NR=15;PP=669;ReadPosRankSum=-0.916;SC=TTCTTTTTGCCTTTTTATTAA;SOR=0.524;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=82;TCF=31;TCR=51;TR=23;WE=43495886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,55:0.40:138
chr7	43496142	rs373773879	TGAG	T	2344.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.483;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=37;PP=1466;ReadPosRankSum=-0.387;SC=TCAGACTGTATGAGGAGACTG;SOR=0.372;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=63;TCF=1;TCR=62;TR=38;WE=43496152;WS=43496132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,59:0.65:91
chr7	43506015	rs2304330	C	A	818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FS=2.838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.16;ReadPosRankSum=0.619;SOR=0.947;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:143,54:0.27:197
chr7	43506059	rs2304329	A	G	1247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.145;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=29;PP=777;ReadPosRankSum=-1.127;SC=TAAGGAGAGAAGGGTCACTTT;SOR=0.870;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=225;TCF=119;TCR=106;TR=66;WE=43506067;WS=43506049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,73:0.30:244
chr7	43506158	rs2304328	T	C	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=0.753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.59;ReadPosRankSum=-0.331;SOR=0.547;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,40:0.34:117
chr7	43519337	rs2304327	T	C	1109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.406;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=46;PP=679;ReadPosRankSum=0.167;SC=GTTACAGCGCTGGAGAGGTAA;SOR=1.020;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=211;TCF=77;TCR=134;TR=69;WE=43519345;WS=43519327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,68:0.31:219
chr7	43532823	rs142481201	C	A	941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.668;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=30;PP=513;ReadPosRankSum=-0.694;SC=GTCTTTCCAGCCATTTTTCCC;SOR=0.588;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=148;TCF=51;TCR=97;TR=48;WE=43532831;WS=43532813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,53:0.34:157
chr7	43591832	rs56111512	G	A	1564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.020;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=39;PP=1051;ReadPosRankSum=-0.579;SC=TTGTAGACTCGAGGCTGGTGT;SOR=0.730;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=234;TCF=122;TCR=112;TR=83;WE=43591840;WS=43591822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,87:0.35:250
chr7	43591955	rs4724220	A	G	1068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=30;PP=729;ReadPosRankSum=-2.642;SC=CAGGAGCTGTAATGATGCAAT;SOR=0.739;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=158;TCF=73;TCR=85;TR=54;WE=43591963;WS=43591945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,57:0.34:170
chr7	43622806	rs10251937	T	C	5630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=395;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.262;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=149;NR=98;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.080;SC=CTGCTCGGAGTGAACAGGCGG;SOR=0.815;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=377;TCF=221;TCR=156;TR=247;WE=43622814;WS=43622796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,260:0.66:394
chr7	43623123	rs2241738	C	G	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.374;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5436;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=4;PP=121;ReadPosRankSum=0.610;SC=TAAGTGCCGGCGCCGCGGCGG;SOR=0.697;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=9;TCF=5;TCR=4;TR=7;WE=43623131;WS=43623113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
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chr7	43664477	rs15866	T	C	1341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=35;PP=1039;SC=GATTTCTACATTGAAAATGTT;SOR=3.716;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=5;TCR=35;TR=40;WE=43664485;WS=43664467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr7	43684803	rs2302031	C	G	1028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=4;PP=829;SC=AGACTCTCCTCTCCTTCAGCA;SOR=3.126;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=32;WE=43684811;WS=43684793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr7	43687296	rs2240516	C	T	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.96;ReadPosRankSum=-1.832;SOR=0.512;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,13:0.22:59
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chr7	43810764	rs699512	G	A	11545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=430;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=221;NR=173;PP=2965;SC=CAAGATGAATGCAGAGGTGAG;SOR=0.952;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=394;TCF=221;TCR=173;TR=394;WE=43810772;WS=43810754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,430:1.00:430
chr7	43827414	rs849165	G	A	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.98;ReadPosRankSum=1.474;SOR=0.743;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,29:0.25:114
chr7	43846603	rs7738	A	G	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=9;PP=338;ReadPosRankSum=1.307;SC=AAGAAAAAGGACCTGGTCTAA;SOR=0.606;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=88;TCF=62;TCR=26;TR=26;WE=43846611;WS=43846593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,28:0.30:93
chr7	43908866	rs2730608	C	T	376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.98;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr7	43916727	rs2232108	T	G	10984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=389;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=186;NR=169;PP=2965;SC=CTCAGTCCCATGAGCAGAGTG;SOR=0.773;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=355;TCF=186;TCR=169;TR=355;WE=43916735;WS=43916717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,389:1.00:389
chr7	43917013	rs2232105	G	A	13605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=500;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=222;NR=240;PP=2965;SC=CCAGTCGGACGTGCAGCTCCT;SOR=0.829;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=462;TCF=222;TCR=240;TR=462;WE=43917021;WS=43917003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,500:1.00:500
chr7	43917274	rs2232103	A	G	9767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=364;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=154;NR=182;PP=2965;SC=TGGTGCCCCCATGCTTTGGTC;SOR=0.910;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=337;TCF=155;TCR=182;TR=336;WE=43917282;WS=43917264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,364:1.00:364
chr7	43945982	rs200939452	G	GC	323.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=2;PP=200;SC=CCGCGCGGCCGGTCCGCCCAA;SOR=2.093;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=6;WE=43945990;WS=43945972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr7	43982341	rs2074728	G	C	1254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.082;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=21;PP=762;ReadPosRankSum=-1.631;SC=TAGACAGTGCGCTGTAATTTA;SOR=0.380;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=87;TCF=55;TCR=32;TR=52;WE=43982349;WS=43982331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,58:0.62:94
chr7	43982482	rs2074727	A	C	7272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=140;NR=108;PP=2965;SC=TGAGCGCACCACTCCAGTTTT;SOR=0.879;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=248;TCF=140;TCR=108;TR=248;WE=43982490;WS=43982472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr7	44026116	rs62458706	T	G	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.342;NF=16;NR=2;PP=332;ReadPosRankSum=-0.803;SC=AGCTGACCTGTTCCCCCAGCC;SOR=0.527;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=51;TCF=45;TCR=6;TR=18;WE=44026124;WS=44026106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,15:0.35:43
chr7	44027348	rs2330943	A	G	7177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=124;NR=120;PP=2965;SC=TATCATTGCCAACACGGAGGA;SOR=0.809;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=244;TCF=124;TCR=120;TR=244;WE=44027356;WS=44027338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,271:1.00:271
chr7	44076350	rs28378571	T	C	3818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=593;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.848;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-16.524;NF=112;NR=91;PP=2690;ReadPosRankSum=1.533;SC=GCTGCCAAAGTTCTTTTCCTC;SOR=0.860;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=565;TCF=304;TCR=261;TR=203;WE=44076372;WS=44076340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:387,206:0.35:593
chr7	44081323	rs3099757	C	G	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=3.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.190;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.873;NF=16;NR=1;PP=318;ReadPosRankSum=0.588;SC=AAAGGGCTCTCAATATGGAGA;SOR=2.179;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=49;TCF=43;TCR=6;TR=17;WE=44081331;WS=44081313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,13:0.28:47
chr7	44081535	rs191907231	G	A	877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.684;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=29;PP=602;ReadPosRankSum=1.150;SC=TTTTGATTTGGTTCTAGGAGG;SOR=0.792;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=132;TCF=51;TCR=81;TR=46;WE=44081543;WS=44081525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,47:0.34:140
chr7	44081569	rs10254823	G	C	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.185;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=390;ReadPosRankSum=1.454;SC=GCGTTCTGTTGCCTGCTTCCA;SOR=0.452;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=60;TCF=13;TCR=47;TR=23;WE=44081577;WS=44081559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,23:0.35:65
chr7	44084210	rs17553434	A	G	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.152;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=60;ReadPosRankSum=-0.483;SC=GCTGGCCCCTACCATTTCCGC;SOR=1.329;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=5;WE=44084218;WS=44084200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr7	44084292	rs4430012	C	G	732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.559;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=11;PP=482;ReadPosRankSum=-0.273;SC=CGGCCCGGCCCGGCCCGGAAG;SOR=0.403;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=51;TCF=35;TCR=16;TR=33;WE=44084300;WS=44084282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,35:0.66:53
chr7	44084486	rs6944386	C	T	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=177;ReadPosRankSum=1.232;SC=CTGGGGCGAGCGGGGGACTCG;SOR=0.693;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=42;TCF=13;TCR=29;TR=15;WE=44084494;WS=44084476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,16:0.36:44
chr7	44084526	rs6964599	T	C	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=56;ReadPosRankSum=-1.290;SC=CGCGGAGCGGTGCCCAGGCAG;SOR=0.502;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=7;WE=44084534;WS=44084516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
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chr7	44091343	rs17172569	A	G	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=84;ReadPosRankSum=0.860;SC=CTGGTTTAGAAGCAGCTCGGC;SOR=0.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=6;WE=44091351;WS=44091342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
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chr7	44147485	rs2537188	C	A	4136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.517;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.900;NF=67;NR=87;PP=2247;ReadPosRankSum=0.205;SC=CTGGCCAGAGCCCCCTGAGGA;SOR=0.632;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=216;TCF=92;TCR=124;TR=154;WE=44147493;WS=44147475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,181:0.72:253
chr7	44147567	rs58863562	C	CG	4503.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.192;NF=18;NR=65;PP=2383;ReadPosRankSum=-0.079;SC=GCCATGGCCACGGCGCTCTGG;SOR=0.925;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=88;TCF=18;TCR=70;TR=83;WE=44147577;WS=44147557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,170:0.99:172
chr7	44147788	.	A	C	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.057;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.066;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=64;ReadPosRankSum=0.923;SC=TTGCAACCCCACCTGTGCCCG;SOR=0.283;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=7;WE=44147796;WS=44147778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr7	44148388	rs2075071	C	T	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=87;ReadPosRankSum=2.875;SC=CCCCATCTCCCGTCCTCCTCC;SOR=1.179;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=7;WE=44148396;WS=44148381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr7	44148553	rs2595701	A	G	6483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.919;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=143;NR=86;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.709;SC=AGCGCCAGACAGACGAAGAGA;SOR=0.886;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=231;TCF=143;TCR=88;TR=229;WE=44148561;WS=44148543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,248:1.00:249
chr7	44149374	rs11979310	T	A	2199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=410;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=61;PP=1548;ReadPosRankSum=-1.733;SC=GTTCTCCAGATGGGGCAGCTG;SOR=0.702;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=387;TCF=189;TCR=198;TR=117;WE=44149382;WS=44149364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:284,125:0.31:409
chr7	44152119	rs11377645	A	AG	2177.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=16;PP=1586;SC=TAGTGGCCGGAGCTGCAGCCC;SOR=1.863;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=42;TCF=20;TCR=22;TR=35;WE=44152127;WS=44152109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr7	44152524	rs144604735	A	AG	1947.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FS=0.499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.04;MQRankSum=1.380;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.340;SOR=0.752;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:156,83:0.35:239
chr7	44152549	rs41279612	G	A	1829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.922;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.03;MQRankSum=1.502;NF=52;NR=38;PP=1108;ReadPosRankSum=0.931;SC=GGCCTGGTCCGGAGAGGGGCT;SOR=0.614;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=307;TCF=181;TCR=126;TR=90;WE=44152557;WS=44152539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:226,101:0.31:327
chr7	44153082	rs67670401	G	GC	1291.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=29;PP=1397;SC=GGAGGGCGGTGCTGGGGGCGG;SOR=4.921;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=31;WE=44153090;WS=44153072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr7	44153115	rs34515254	G	GC	765.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=2;PP=949;SC=GGAGGGCGGGGCTGGGGGCAG;SOR=6.184;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=24;WE=44153123;WS=44153105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr7	44153780	rs13928	A	G	2304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=411;ExcessHet=3.0103;FS=5.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.99;ReadPosRankSum=2.700;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:258,127:0.33:385
chr7	44154865	rs5883885	A	AG	9692.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=85;PP=2981;SC=TCAGCAAATCAGCCTGGGCCC;SOR=0.858;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=129;TCF=44;TCR=85;TR=128;WE=44154873;WS=44154855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr7	44156146	rs3087367	G	A	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.666;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=131;ReadPosRankSum=0.000;SC=AGGCCCAGGCGAGTCCCAGGC;SOR=0.180;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=27;TCF=9;TCR=18;TR=9;WE=44156154;WS=44156136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr7	44157770	rs34484835	G	GC	878.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.83;NF=0;NR=21;PP=830;SC=CAGGGCCCTGGCCTTGCCAGG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=21;WE=44157778;WS=44157760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr7	44178626	rs1008384	A	G	1538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.461;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=45;PP=918;ReadPosRankSum=0.688;SC=CTCCACCTGCAGGGGACACTG;SOR=0.468;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=181;TCF=68;TCR=113;TR=77;WE=44178634;WS=44178616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,82:0.42:197
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chr7	44180079	rs5883888	A	AG	3646.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=69;PP=2974;SC=GTCCCCCAGAAGGCCCAGGCC;SOR=2.371;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=2;TCR=73;TR=71;WE=44180087;WS=44180069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
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chr7	44250279	rs200893911	GCACACA	G,GCACA	814.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=32.59;ReadPosRankSum=-0.139;SOR=2.753;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:1,11,13:0.44,0.52:25
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chr7	44250826	rs2072439	G	A	2012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=37;NR=38;PP=1104;SC=TTCTTAGACTGTTGAATCATG;SOR=0.798;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=37;TCR=38;TR=75;WE=44250834;WS=44250816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr7	44252018	rs12670584	C	G	2038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.711;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=55;PP=1435;ReadPosRankSum=0.705;SC=GAAGTTCCTGCGAGAAATGGA;SOR=1.432;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=121;TCF=45;TCR=76;TR=81;WE=44252026;WS=44252008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,86:0.67:128
chr7	44259554	rs149624128	T	TG	727.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.81;SOR=3.383;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
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chr7	44259574	rs35148004	C	T	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.72;MQRankSum=-0.145;QD=13.43;ReadPosRankSum=-0.356;SOR=0.711;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
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chr7	44260399	.	G	GC	1564.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.161;ClippingRankSum=0.000;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.611;HP=9;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=1.073;NF=8;NR=40;PP=737;ReadPosRankSum=-0.972;SC=GTCCTGCACAGCCCCCCCCCA;SOR=0.779;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=118;TCF=21;TCR=97;TR=48;WE=44260407;WS=44260389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,73:0.47:155
chr7	44265979	rs917792	C	T	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=377;ReadPosRankSum=3.405;SC=AAAGCAATTCCCTGGGACCCA;SOR=0.795;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=22;WE=44265987;WS=44265969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,23:0.74:31
chr7	44266077	rs10951758	G	A	897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.83;ReadPosRankSum=0.845;SOR=0.728;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:130,56:0.30:186
chr7	44272314	rs5883896	G	GC	476.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=61.53;NF=11;NR=1;PP=513;SC=GGCGGCCAGGGCATGGGACAT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=44272322;WS=44272304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr7	44280195	rs76144629	G	T	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=3;PP=434;ReadPosRankSum=1.907;SC=GACGCCGAGGGCAGGCCTGCC;SOR=1.380;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=24;WE=44280203;WS=44280185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,25:0.69:36
chr7	44281475	rs2075073	T	A	2077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.832;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=57;PP=1340;ReadPosRankSum=0.395;SC=GGGTCCCCACTTGCCAAGAGC;SOR=0.821;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=112;TCF=32;TCR=80;TR=79;WE=44281483;WS=44281465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,88:0.73:121
chr7	44281702	rs35663812	A	G	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=409;ReadPosRankSum=1.423;SC=AGGGGACCCAAGGGAGCTCTT;SOR=0.598;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=19;WE=44281710;WS=44281693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,20:0.77:26
chr7	44282369	rs35452037	T	C	1253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.298;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=33;PP=858;ReadPosRankSum=0.627;SC=ATTGGGGTCCTCAGCATTCCT;SOR=0.475;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=63;TCF=19;TCR=44;TR=47;WE=44282377;WS=44282359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,51:0.77:66
chr7	44282760	rs74790674	C	T	342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5133;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=274;ReadPosRankSum=0.864;SC=GAGAGCAAGACGTGCTGGCCA;SOR=1.292;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=12;WE=44282768;WS=44282757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,13:0.81:16
chr7	44282868	rs11542228	A	G	5419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FS=2.647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.24;ReadPosRankSum=-1.108;SOR=0.897;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,135:0.68:199
chr7	44282877	rs11542227	A	G	5649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FS=1.714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.78;ReadPosRankSum=0.408;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,148:0.65:228
chr7	44282928	rs17172630	G	A	3950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.446;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=79;PP=2467;ReadPosRankSum=0.082;SC=GTGTGCCAGCGAAACCTAGAG;SOR=0.729;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=263;TCF=144;TCR=119;TR=172;WE=44282936;WS=44282918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,183:0.64:286
chr7	44284564	rs2075069	A	G	6630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=501;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=163;NR=140;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.850;SC=GCCACTGGACATGGTGATTTT;SOR=0.684;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=476;TCF=256;TCR=220;TR=303;WE=44284572;WS=44284554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,317:0.63:500
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chr7	44294388	.	AGC	A	118	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;FR=1.0000;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MMLQ=26;MQ=57.68;NF=0;NR=3;PP=118;QD=48.0;SC=CACCATCACCAGCACCACCAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=44294397;WS=44294370;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,3:0.75:4
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chr7	44606217	rs217381	C	G	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=84;ReadPosRankSum=1.307;SC=CAATTCTGACCCAACTGGCAG;SOR=0.551;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=38;TCF=10;TCR=28;TR=10;WE=44606225;WS=44606207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,11:0.29:38
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chr7	44611077	rs217375	T	C	888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.069;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=21;PP=449;ReadPosRankSum=1.189;SC=ACCAAGATGTTGGCTGTGGCA;SOR=0.426;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=146;TCF=93;TCR=53;TR=47;WE=44611085;WS=44611067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,52:0.32:164
chr7	44612347	rs217374	G	C	2112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=350;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.866;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=49;PP=1580;ReadPosRankSum=0.273;SC=CACAGCTCTGGAGGTGGACAA;SOR=0.759;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=323;TCF=179;TCR=144;TR=110;WE=44612355;WS=44612337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:235,114:0.33:349
chr7	44612382	rs190166771	G	A	5997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=414;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.543;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=124;NR=124;PP=2962;ReadPosRankSum=2.143;SC=GCAGAATGTAGCAGCTGGGAT;SOR=0.738;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=382;TCF=192;TCR=190;TR=248;WE=44612390;WS=44612372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,272:0.66:414
chr7	44612454	rs217373	C	A	1586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.048;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=46;PP=958;ReadPosRankSum=0.584;SC=CACTGTGTAGCTTCATTCAGG;SOR=0.602;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=226;TCF=95;TCR=131;TR=82;WE=44612462;WS=44612444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,87:0.36:241
chr7	44612753	rs217372	T	C	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=1.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.91;ReadPosRankSum=-0.428;SOR=1.015;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,17:0.24:71
chr7	44613103	rs217371	A	G	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.823;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=336;ReadPosRankSum=-1.415;SC=CCAAGAGAAAACCTCAGACAA;SOR=0.200;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=52;TCF=49;TCR=3;TR=21;WE=44613111;WS=44613093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,23:0.39:59
chr7	44613611	rs11308115	CG	C	1437.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FS=0.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQRankSum=3.138;QD=5.55;ReadPosRankSum=1.253;SOR=0.622;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:198,61:0.24:259
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chr7	44798814	rs139333097	C	CT	4286.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.148;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.637;NF=39;NR=32;PP=2617;ReadPosRankSum=0.847;SC=TGAGACTCTACTTCCTTCTGG;SOR=0.504;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=115;TCF=60;TCR=55;TR=71;WE=44798822;WS=44798804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,138:0.72:192
chr7	44802401	rs4720479	A	C	698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=21;NR=11;PP=617;SC=CTGACACACAACCCCCAGCAC;SOR=1.101;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=21;TCR=11;TR=32;WE=44802409;WS=44802391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr7	44803907	rs139430652	C	CA	3278.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.626;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=29;PP=2383;ReadPosRankSum=-1.483;SC=TGCAGTATCTCAGTTATGCAT;SOR=0.601;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=114;TCF=61;TCR=53;TR=61;WE=44803915;WS=44803897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,98:0.60:163
chr7	44803944	rs79784917	G	T	3796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.937;NF=96;NR=58;PP=2254;ReadPosRankSum=1.580;SC=TTCCTGAAAAGGGATTGCAGA;SOR=0.688;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=273;TCF=168;TCR=105;TR=154;WE=44803952;WS=44803934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,172:0.58:299
chr7	44839616	rs6463247	C	T	463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=1;NR=14;PP=334;SC=CATACATAAACGACAAATATA;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=44839624;WS=44839606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr7	44839997	.	CTTT	C	64.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.505;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.05;ReadPosRankSum=0.000;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
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chr7	44924627	rs6966024	A	C	18237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=690;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=309;NR=341;PP=2965;ReadPosRankSum=-2.198;SC=CCTCGGCGCCAGCCGCCAGCT;SOR=0.810;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=653;TCF=311;TCR=342;TR=650;WE=44924635;WS=44924617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,686:1.00:688
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chr7	45007582	rs117610712	G	C	5025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.145;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=123;PP=2701;ReadPosRankSum=1.483;SC=GGCTGGTGAGGGAGCAGGGGC;SOR=0.538;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=326;TCF=135;TCR=191;TR=214;WE=45007590;WS=45007572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,226:0.66:341
chr7	45009325	rs3735484	G	A	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.30;ReadPosRankSum=-1.137;SOR=1.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,14:0.16:87
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chr7	45009723	rs11555636	G	A	1286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.190;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=30;PP=639;ReadPosRankSum=-0.375;SC=GCAGCTTCTCGTTGCAGTAGT;SOR=0.831;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=170;TCF=85;TCR=85;TR=60;WE=45009731;WS=45009713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,68:0.37:186
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chr7	45104131	rs11552377	G	A	2331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.635;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=49;PP=1306;ReadPosRankSum=1.568;SC=TGCGTACAACGTCAAGCTGGC;SOR=0.598;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=145;TCF=77;TCR=68;TR=104;WE=45104139;WS=45104121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,111:0.69:160
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chr7	45112902	rs10272243	T	C	672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=6;PP=478;SC=CCACCCTGCATGCCCAGTCAG;SOR=1.802;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=24;WE=45112910;WS=45112892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
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chr7	45114089	rs2289370	C	T	1721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.070;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.947;NF=23;NR=42;PP=1110;ReadPosRankSum=0.478;SC=GCACACGGACCCCTCAGTGGG;SOR=0.495;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=84;TCF=28;TCR=56;TR=65;WE=45114097;WS=45114079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,70:0.79:89
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chr7	45120225	rs73109832	C	T	2148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.442;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=50;PP=1432;ReadPosRankSum=0.961;SC=GGAAAGGGGCCAGTGCTCACT;SOR=0.638;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=267;TCF=144;TCR=123;TR=104;WE=45120233;WS=45120215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,109:0.38:287
chr7	45120248	rs1132130	G	A	4523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.871;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.757;NF=101;NR=88;PP=2675;ReadPosRankSum=-1.255;SC=CCATGATGGCGTTGACGATGT;SOR=0.622;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=306;TCF=164;TCR=142;TR=189;WE=45120256;WS=45120238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,206:0.63:326
chr7	45120453	rs10264280	C	T	5902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=104;NR=81;PP=2965;SC=CCCTGCGAGGCCCTGGAGCCC;SOR=0.782;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=186;TCF=104;TCR=82;TR=185;WE=45120461;WS=45120430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr7	45122324	rs3735493	C	A	4228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.527;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=77;PP=2549;ReadPosRankSum=1.080;SC=AGACTCTGGGCAGGAGTCCAG;SOR=0.636;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=223;TCF=118;TCR=105;TR=162;WE=45122332;WS=45122314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,176:0.73:242
chr7	45122464	rs10243185	A	C	3013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.625;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=46;PP=2008;ReadPosRankSum=0.154;SC=CAGGAGGCGCATCGGGGACCT;SOR=0.631;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=157;TCF=93;TCR=64;TR=110;WE=45122472;WS=45122454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,122:0.71:172
chr7	45122723	rs61740895	G	A	5306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.878;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=115;PP=2962;ReadPosRankSum=1.220;SC=AGTGGAATCCGCATCTTCCTG;SOR=0.752;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=315;TCF=143;TCR=172;TR=210;WE=45122731;WS=45122713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,229:0.67:340
chr7	45123906	rs61740887	T	G	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.831;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-2.525;NF=6;NR=0;PP=75;ReadPosRankSum=-0.063;SC=TGGGACACAATCGTGGCTGCA;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=6;WE=45123914;WS=45123896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,3:0.14:21
chr7	45123925	rs377425677	C	T	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.781;HP=3;HapScore=4;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.033;NF=11;NR=0;PP=492;ReadPosRankSum=-0.590;SC=CAGCCACAGGCTTTGGGGCTG;SOR=3.521;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=11;WE=45123945;WS=45123915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr7	45123937	rs112035890	T	C	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.832;HP=1;HapScore=4;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.301;NF=15;NR=1;PP=492;ReadPosRankSum=-0.146;SC=TTGGGGCTGATGAGAGATCTG;SOR=2.786;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=16;WE=45123945;WS=45123915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr7	45124008	rs7777835	T	C	4117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=87;NR=43;PP=2840;SC=AGGTCCTCTTTAGCCTGCCTG;SOR=1.296;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=87;TCR=43;TR=130;WE=45124016;WS=45123998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr7	45124286	rs3735494	A	G	4584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=347;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.399;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=109;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.738;SC=TCTGGTAGCCACCTCCACCTG;SOR=0.742;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=327;TCF=148;TCR=179;TR=197;WE=45124294;WS=45124276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,208:0.60:346
chr7	45124465	rs3735495	A	T	3234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.543;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=66;PP=1897;ReadPosRankSum=-1.072;SC=ACACAGTCCCATCCTGAGCCT;SOR=0.782;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=190;TCF=89;TCR=101;TR=123;WE=45124473;WS=45124455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,140:0.67:209
chr7	45125466	rs11760885	G	C	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.496;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=14;PP=363;ReadPosRankSum=-0.357;SC=TCCGTGGACAGAGCCTGGGAA;SOR=0.654;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=101;TCF=56;TCR=45;TR=35;WE=45125474;WS=45125456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,40:0.33:121
chr7	45125665	rs34135761	G	A	854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.292;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=20;PP=451;ReadPosRankSum=1.348;SC=GCTCCCGCCGGTCCCCTCCCA;SOR=0.648;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=110;TCF=59;TCR=51;TR=45;WE=45125673;WS=45125655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,50:0.38:130
chr7	45125775	rs9791417	G	A	490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.491;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=232;ReadPosRankSum=-1.065;SC=GGCCAGGCCCGGGGAGATGAA;SOR=1.201;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=28;TCF=11;TCR=17;TR=16;WE=45125783;WS=45125765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,21:0.62:34
chr7	45139892	rs4553	G	A	3536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=27;PP=2336;SC=ACCTCCGGCGGAGAGGCACGC;SOR=2.207;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=83;TCR=27;TR=110;WE=45139900;WS=45139882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr7	45139919	rs2289373	A	C	3216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.523;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=48;PP=2060;ReadPosRankSum=0.028;SC=TGCTGCTGGCACAAGTCACTT;SOR=0.772;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=208;TCF=131;TCR=77;TR=132;WE=45139927;WS=45139909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,142:0.63:224
chr7	45140914	rs1042984	C	T	1997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=383;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.000;QD=5.24;ReadPosRankSum=1.152;SOR=0.689;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:266,115:0.30:381
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chr7	45143090	rs59494919	G	GGACAGCC	2524.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.944;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=51;PP=2854;ReadPosRankSum=-1.057;SC=TCTCTGCCCAGCACGCTGTCC;SOR=1.890;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=67;TCF=4;TCR=63;TR=53;WE=45143101;WS=45143080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,89:0.98:91
chr7	45143093	.	C	G	4235.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=47;PP=1429;SC=CTGCCCAGCACGCTGTCCTCC;SOR=1.796;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=61;TCF=13;TCR=48;TR=60;WE=45143101;WS=45143080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr7	45143108	rs2119056	T	C	1739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=73;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=44;PP=1083;SC=TCCTCCTGCCTGGCTCTGAGT;SOR=2.448;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=10;TCR=44;TR=54;WE=45143116;WS=45143098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr7	45144403	rs2289375	C	T	506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=7;PP=424;SC=CAGTGCAGCCCCTGTGACAGC;SOR=0.941;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=9;TCR=7;TR=16;WE=45144411;WS=45144393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr7	45144494	rs2289376	T	C	1548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=4;PP=1023;SC=AGGGAACCCCTGGACCTGGAG;SOR=2.970;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=40;TCR=4;TR=44;WE=45144502;WS=45144484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr7	45148322	rs142768320	G	GC	483.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.902;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=481;ReadPosRankSum=-1.592;SC=CACAAGAGATGCAAGGCCCCT;SOR=2.267;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=54;TCF=42;TCR=12;TR=15;WE=45148330;WS=45148312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,19:0.26:72
chr7	45197433	rs67477213	G	A	624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FS=0.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.79;ReadPosRankSum=0.637;SOR=0.706;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:120,45:0.27:165
chr7	45216785	rs17172483	G	T	992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.613;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQ=59.99;MQRankSum=0.682;NF=33;NR=19;PP=573;ReadPosRankSum=0.750;SC=CCGCTGGAACGGTCTCAGGCT;SOR=0.597;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=174;TCF=114;TCR=60;TR=52;WE=45216793;WS=45216775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,58:0.31:187
chr7	45217015	rs2074654	T	C	4236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.494;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=117;PP=2514;ReadPosRankSum=0.492;SC=CGTCTGGAAGTGGTGCAACCT;SOR=1.133;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=291;TCF=127;TCR=164;TR=193;WE=45217023;WS=45217005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,198:0.66:302
chr7	45223018	rs11982639	C	G	3435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=4.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.008;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=93;PP=2364;ReadPosRankSum=-0.957;SC=GTGAGGGTCCCGGTGAGATGG;SOR=0.990;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=225;TCF=74;TCR=151;TR=135;WE=45223026;WS=45223008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,145:0.61:239
chr7	45225609	rs66534022	GGTGTATGT	G	1843.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=12;NR=9;PP=2417;SC=TGCTTGTGTGGGTGTATGTGT;SOR=2.200;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=33;TCF=17;TCR=16;TR=21;WE=45225624;WS=45225599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr7	45225708	rs13222185	A	G	5058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=112;NR=62;PP=2965;SC=TGGAGGCAGCAATAGTGTGTG;SOR=1.109;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=174;TCF=112;TCR=62;TR=174;WE=45225716;WS=45225698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr7	45225788	rs11760627	C	A	1862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.86;ReadPosRankSum=0.018;SOR=0.702;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:176,61:0.26:237
chr7	45225822	rs11760688	G	A	2140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FS=0.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.35;ReadPosRankSum=-0.232;SOR=0.624;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:166,63:0.28:229
chr7	45225838	rs11767359	A	C,T	9033.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;ALERT;AN=2;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;QD=42.02;SOR=1.046;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,61,154:0.28,0.72:215
chr7	45225838	.	AA	CC,TC	2057	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=23,62;NR=24,70;PP=437,2057;QD=10.4354866992;SC=GGACTTGCTGAAGAGTGGTCT;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=184;TCF=86;TCR=98;TR=47,132;WE=45225847;WS=45225828;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.26:184
chr7	45225839	rs11767360	A	C	9686.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.69;SOR=1.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr7	45225854	rs11767365	A	G	8488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=92;PP=2824;SC=GGTCTTTTATATTTTCCTGGC;SOR=1.083;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=169;TCF=76;TCR=93;TR=167;WE=45225862;WS=45225844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr7	45225956	rs71548262	A	G	490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5004;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=400;ReadPosRankSum=0.811;SC=CTCTGGCCAGAGCGGGTCCCT;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=17;WE=45225964;WS=45225946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,17:0.85:20
chr7	45225986	rs67307920	C	T	339.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=280;ReadPosRankSum=-0.726;SC=TGGCAAGTTTCGGGCATGCAG;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=12;WE=45225994;WS=45225976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr7	45697295	rs2461131	C	G	5363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.70;SOR=1.316;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr7	45697295	.	CCT	GCC	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=70;NR=38;PP=2947;QD=20;SC=CAAGGTGGGCCCTAGCCCCAC;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=114;TCF=74;TCR=40;TR=108;WE=45697305;WS=45697285;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,108:0.95:114
chr7	45697297	rs2471231	T	C	5363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.33;SOR=1.285;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr7	45703971	rs1042009	G	A	3974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=77;PP=2250;SC=GACTGTGCACGTAGCTTCAGG;SOR=1.257;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=132;TCF=55;TCR=77;TR=132;WE=45703979;WS=45703961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr7	45724696	rs2461106	T	C	2924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.530;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=78;PP=1564;ReadPosRankSum=-1.865;SC=TGGCATGCGCTGGGGCGGGAG;SOR=0.753;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=208;TCF=83;TCR=125;TR=130;WE=45724704;WS=45724686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,137:0.63:216
chr7	45743128	rs2247685	T	G	5228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=375;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=125;NR=95;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.043;SC=GCACTAGCCCTACACTGCTCT;SOR=0.710;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=340;TCF=189;TCR=151;TR=220;WE=45743136;WS=45743118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,239:0.64:375
chr7	45743403	rs2461114	G	A	3048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=77;PP=2133;SC=ATCCTGTTGCGTGGGCAGAGC;SOR=2.856;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=20;TCR=77;TR=97;WE=45743411;WS=45743393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr7	45954692	rs10255707	T	C	766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=25;PP=535;SC=ACAAGAGCCATGCGTGCCTAG;SOR=3.912;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=28;WE=45954700;WS=45954682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
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chr7	47336893	rs5883997	C	CT	547.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.256;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.479;NF=0;NR=14;PP=462;ReadPosRankSum=-0.666;SC=GGTAGGTCCTCTCCCCTTACT;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=1;TCR=47;TR=14;WE=47336901;WS=47336883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,22:0.34:65
chr7	47341748	rs186678834	C	A	1677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.530;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=28;PP=1074;ReadPosRankSum=1.353;SC=GGCACTAGGGCAGATGCCCAA;SOR=0.619;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=213;TCF=143;TCR=70;TR=81;WE=47341756;WS=47341738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,87:0.38:227
chr7	47408029	rs2255744	A	G	4647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=68;PP=2750;SC=CCCGGAGCCCACCTCCCACGC;SOR=0.962;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=164;TCF=96;TCR=68;TR=164;WE=47408037;WS=47408019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr7	47408974	rs1534136	T	A	11340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=407;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=170;NR=207;PP=2965;SC=GGTCCAACTCTGCCTTCTCCT;SOR=0.963;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=378;TCF=171;TCR=207;TR=377;WE=47408982;WS=47408964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,407:1.00:407
chr7	47436285	rs147014122	A	C	1705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=20;PP=1073;ReadPosRankSum=-2.301;SC=CTCTGAGAAAACAGGGGAAAT;SOR=0.732;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=116;TCF=80;TCR=36;TR=69;WE=47436293;WS=47436275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,78:0.61:128
chr7	47436497	rs17544028	G	A	2555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=61;PP=1643;ReadPosRankSum=1.160;SC=ACAAGTGTTCGGACCCTGCAC;SOR=0.746;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=132;TCF=49;TCR=83;TR=95;WE=47436505;WS=47436487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,106:0.72:148
chr7	47436558	rs2177795	A	C	1265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=33;PP=967;SC=CCTCCATCCAACCGACTCCAC;SOR=3.312;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=5;TCR=33;TR=38;WE=47436566;WS=47436548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr7	47451295	rs834607	A	G	2506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=16;PP=1649;SC=TGGGGACACCAACCCATCTGC;SOR=2.571;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=66;TCR=16;TR=82;WE=47451303;WS=47451285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr7	47453726	rs76621474	C	T	1391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=47;PP=800;ReadPosRankSum=-0.618;SC=TCTGGGAAAGCAGTGCATGGA;SOR=0.716;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=204;TCF=56;TCR=148;TR=64;WE=47453734;WS=47453716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,74:0.34:218
chr7	47463842	rs834599	T	G	3073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=78;PP=2205;SC=ACGTGGGTACTTGACGGGGGA;SOR=2.487;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=24;TCR=78;TR=102;WE=47463850;WS=47463832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr7	47467864	rs1799370	C	T	1640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=13;PP=1153;SC=CCATGCAGGCCCAGCTTTTAG;SOR=2.107;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=42;TCR=13;TR=55;WE=47467872;WS=47467854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr7	47479334	rs139477321	C	T	1370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.900;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=35;PP=811;ReadPosRankSum=0.462;SC=AAGGTGAAGACGACGGACACT;SOR=0.505;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=84;TCF=30;TCR=54;TR=56;WE=47479342;WS=47479324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,61:0.66:92
chr7	47479363	rs1810137	A	G	1359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=32;PP=917;SC=GGGTGTTCACATCAGCACCTG;SOR=1.656;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=16;TCR=32;TR=48;WE=47479371;WS=47479353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr7	47481786	rs1620852	A	T	920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=29;PP=760;SC=TCGTAACTACAAGCCCACCTT;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=30;WE=47481794;WS=47481776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr7	47546375	rs334496	C	T	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.56;ReadPosRankSum=1.050;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr7	47546547	rs334497	G	A	822.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.821;HP=11;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=21;PP=727;ReadPosRankSum=-0.913;SC=TGCAGGCTGGGAAAAAAAAAA;SOR=0.503;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=148;TCF=76;TCR=72;TR=47;WE=47546556;WS=47546534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,51:0.44:116
chr7	47568718	rs10261525	C	T	7041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=495;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=132;NR=163;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.551;SC=TTCTTAAAAGCGTGCAGACTC;SOR=0.668;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=455;TCF=205;TCR=250;TR=295;WE=47568726;WS=47568708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:177,317:0.64:494
chr7	47578772	rs334506	T	C	2129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=45;PP=1517;SC=CCAGGATTCATACTCTCTGGG;SOR=1.516;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=25;TCR=45;TR=70;WE=47578780;WS=47578762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr7	47596534	rs6954946	G	A	357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=2;PP=254;SC=CAGCCAAGAGGCCCTACTCCC;SOR=2.147;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=47596542;WS=47596524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr7	47596775	rs615300	C	T	2679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=54;PP=1676;SC=TCAGAACAATCCTTAAGACCA;SOR=1.274;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=36;TCR=54;TR=90;WE=47596783;WS=47596765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
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chr7	47835027	rs9719534	A	G	733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.411;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=20;PP=465;ReadPosRankSum=0.080;SC=GAGGCCTCCCAAGTCATGTGG;SOR=0.462;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=43;TCF=9;TCR=34;TR=26;WE=47835035;WS=47835017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,29:0.63:46
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chr7	47854956	rs17545564	C	T	3785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.527;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=99;NR=62;PP=2517;ReadPosRankSum=0.451;SC=CACGGGCTGACGGGGTGCCTC;SOR=0.757;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=228;TCF=141;TCR=87;TR=161;WE=47854973;WS=47854946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,167:0.70:239
chr7	47872601	rs17659868	T	C	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.999;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=217;ReadPosRankSum=1.467;SC=TTTGGCCCAATTGTGACTCTG;SOR=0.352;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=15;WE=47872609;WS=47872591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr7	47872845	rs921634	A	G	2800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.526;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=58;PP=1680;ReadPosRankSum=-0.837;SC=TGGCTGATGCAGGTTGCTAGA;SOR=0.749;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=187;TCF=95;TCR=92;TR=116;WE=47872853;WS=47872835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,131:0.63:207
chr7	47874065	rs17710874	G	A	2879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.693;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=78;PP=1918;ReadPosRankSum=-0.373;SC=GATTAGCGGGGACACTACTTT;SOR=0.816;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=160;TCF=47;TCR=113;TR=110;WE=47874073;WS=47874055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,119:0.71:168
chr7	47876567	rs17131842	G	A	823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.728;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=10;PP=410;ReadPosRankSum=1.626;SC=ACGCGTAGACGCACAGCAGGG;SOR=0.781;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=108;TCF=75;TCR=33;TR=38;WE=47876575;WS=47876557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,44:0.36:121
chr7	47876787	rs17710880	A	G	2201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.625;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=55;PP=1377;ReadPosRankSum=0.285;SC=AGCAGAGACCACGAGCTTTCT;SOR=0.892;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=118;TCF=41;TCR=77;TR=83;WE=47876795;WS=47876777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,91:0.71:129
chr7	47878993	rs6960394	C	T	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.474;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=112;ReadPosRankSum=-0.283;SC=AGGTGCCATGCTCTGCCGGTC;SOR=2.991;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=9;WE=47879001;WS=47878983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,9:0.22:40
chr7	47879049	rs76100363	G	A	2132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.379;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=33;PP=1404;ReadPosRankSum=1.951;SC=CCTACCTTCCGGAAGCCGAGT;SOR=0.479;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=135;TCF=89;TCR=46;TR=90;WE=47879057;WS=47879039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,94:0.66:142
chr7	47880144	rs116988549	C	T	1629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.814;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=49;PP=986;ReadPosRankSum=-0.813;SC=AGTCCATTGTCGCCACATAAA;SOR=0.526;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=268;TCF=116;TCR=152;TR=91;WE=47880152;WS=47880134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:184,95:0.34:279
chr7	47884476	rs9639988	T	C	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=397;ReadPosRankSum=0.829;SC=ATTTCAAAAATGCAATGATAG;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=22;WE=47884484;WS=47884466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,23:0.79:29
chr7	47884829	rs1980279	C	A	2038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=48;PP=1467;SC=ATTCACCTGACACCTAAGTTA;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=17;TCR=48;TR=65;WE=47884837;WS=47884819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr7	47905044	rs7782964	T	C	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=203;ReadPosRankSum=1.402;SC=CTGTTGTCTCTGGTTTTCCTT;SOR=0.713;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=40;TCF=9;TCR=31;TR=18;WE=47905052;WS=47905034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,20:0.45:44
chr7	47913459	rs62447062	T	C	2740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=17;PP=1926;SC=GAAATACAAATAATGGCTAGG;SOR=2.277;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=84;TCF=67;TCR=17;TR=82;WE=47913467;WS=47913449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr7	47913560	rs78833972	G	T	1944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=398;ExcessHet=3.0103;FS=2.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.89;ReadPosRankSum=0.672;SOR=0.864;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:284,114:0.29:398
chr7	47913579	rs1470859	TG	CA	17996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=401;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=180;NR=176;PP=2947;SC=TTGGAGCCTTTGCCATCTGTG;SOR=0.698;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=366;TCF=187;TCR=179;TR=356;WE=47913588;WS=47913569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,401:1.00:401
chr7	47913615	rs17131867	G	A	9818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=153;NR=173;PP=2965;SC=ATGACTGTGAGGGAACATGTC;SOR=0.875;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=326;TCF=153;TCR=173;TR=326;WE=47913623;WS=47913605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,356:1.00:356
chr7	47913737	rs73105163	A	G	1518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=42;PP=1231;SC=CCAGGCTCCGAGCCACAGGGA;SOR=3.702;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=6;TCR=42;TR=48;WE=47913745;WS=47913727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr7	47915543	rs12113549	T	G	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=168;ReadPosRankSum=0.468;SC=CTTTCTGCACTAAAAGGTAGA;SOR=0.859;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=12;WE=47915551;WS=47915533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr7	47915651	rs4724654	G	C	6098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=120;NR=76;PP=2965;SC=GTTTAGAACTGTAGGTTGGCA;SOR=1.227;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=196;TCF=120;TCR=76;TR=196;WE=47915659;WS=47915641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr7	47915677	rs4724655	A	G	7379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=139;NR=103;PP=2965;SC=AGTGACTCCAACTGGCACCAT;SOR=0.970;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=242;TCF=139;TCR=103;TR=242;WE=47915685;WS=47915667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr7	47915890	rs4724656	C	T	945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=28;PP=747;SC=CATACACACACAGCTGAGCCT;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=29;WE=47915898;WS=47915880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr7	47916995	rs2348662	T	C	547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=0;PP=389;SC=GGAAGGACATTGCTGTCCATT;SOR=4.294;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=47917003;WS=47916988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr7	47920225	rs17131893	G	C	631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=2;PP=403;SC=TAGCCTTTACGCTGATGTAGA;SOR=2.737;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=47920233;WS=47920215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr7	47920298	rs17131896	G	C	3195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=36;PP=1985;SC=CTCATCCTCTGATAAATGCAA;SOR=1.250;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=66;TCR=36;TR=102;WE=47920306;WS=47920288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr7	47920345	rs62447081	G	A	4298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=63;PP=2508;SC=CTTGCAGGACGTACGTCTCTC;SOR=0.850;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=146;TCF=83;TCR=63;TR=146;WE=47920353;WS=47920335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr7	47920450	rs17131899	A	G	3286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=58;PP=1835;SC=AGTGGTCTCAAGGACAGAGGT;SOR=1.169;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=101;TCF=43;TCR=58;TR=101;WE=47920458;WS=47920440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr7	47920482	rs78574665	AG	GT	3340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=35;PP=1707;SC=CTTGGAAATGAGTTCCACTCT;SOR=1.550;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=65;TCF=24;TCR=41;TR=59;WE=47920491;WS=47920471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr7	47920499	rs62447082	A	G	1310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=51;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=27;PP=883;SC=CTCTTCCCCCAGGGGTGAAAT;SOR=1.464;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=16;TCR=27;TR=43;WE=47920507;WS=47920489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr7	47920583	rs9691249	G	C	175.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=113;SC=TAAACAGCCTGTCCTGCCCAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=47920591;WS=47920573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr7	47943953	rs11766212	C	T	1426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.289;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=18;PP=859;ReadPosRankSum=-0.261;SC=AGAGAGCACTCCGCCGCCTTG;SOR=0.508;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=146;TCF=105;TCR=41;TR=60;WE=47943961;WS=47943943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,66:0.43:154
chr7	47947863	rs1474283	T	C	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=21;PP=322;ReadPosRankSum=0.813;SC=AAAATAAGAATGAACGGACAC;SOR=0.620;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=86;TCF=32;TCR=54;TR=32;WE=47947871;WS=47947853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,34:0.35:96
chr7	47968927	rs2686817	C	A	2871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=521;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=76;PP=1911;ReadPosRankSum=1.638;SC=GCCATATGAACACGGAATCCC;SOR=0.669;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=469;TCF=222;TCR=247;TR=145;WE=47968935;WS=47968917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:358,162:0.31:520
chr7	47971575	rs885337	A	G	1112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=22;PP=710;ReadPosRankSum=-0.354;SC=TCCCAGTAGCACACAGCCGCC;SOR=0.687;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=194;TCF=127;TCR=67;TR=66;WE=47971583;WS=47971565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,70:0.34:207
chr7	47976287	rs2708878	A	G	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-5.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=1;PP=357;ReadPosRankSum=-0.099;SC=TCAGAACACCATTCTTTTTTC;SOR=0.307;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=62;TCF=59;TCR=3;TR=23;WE=47976295;WS=47976277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,24:0.38:64
chr7	47979922	rs2708913	A	G	1653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FS=4.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.24;ReadPosRankSum=2.789;SOR=0.428;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,91:0.51:179
chr7	47987849	.	G	A	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.295;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.037;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=250;ReadPosRankSum=0.082;SC=TGACCCCGCCGGCCAAATGCA;SOR=0.093;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=15;WE=47987857;WS=47987839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,15:0.39:38
chr7	48004962	rs1056663	C	T	1765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.992;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=32;PP=1083;ReadPosRankSum=0.936;SC=GCTAGGACAGCGCAGGGATGA;SOR=0.771;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=255;TCF=156;TCR=99;TR=86;WE=48004979;WS=48004952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,92:0.33:277
chr7	48005122	rs2037483	G	A	1875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.191;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=61;PP=1209;ReadPosRankSum=-0.399;SC=TTCCCAGCCTGCACCTCCTGT;SOR=1.120;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=258;TCF=96;TCR=162;TR=89;WE=48005130;WS=48005112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:179,98:0.35:277
chr7	48009018	rs953595	AA	GT	1614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=29;PP=1331;ReadPosRankSum=0.772;SC=GTACCCTACAAAACCTCAAAA;SOR=0.725;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=122;TCF=45;TCR=77;TR=44;WE=48009027;WS=48009008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,45:0.35:127
chr7	48010978	rs2708864	T	C	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.230;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=6;PP=408;ReadPosRankSum=-1.945;SC=CATCCCCTCATATACCATCGG;SOR=0.295;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=69;TCF=58;TCR=11;TR=27;WE=48010986;WS=48010968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,30:0.39:77
chr7	48017965	rs2242477	C	T	687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.457;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=238;ReadPosRankSum=-1.380;SC=TATGTCTATTCCTTCGAGGCC;SOR=1.609;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=44;TCF=37;TCR=7;TR=15;WE=48017973;WS=48017955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,19:0.39:49
chr7	48017989	rs2242478	T	C	895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.232;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=4;PP=434;ReadPosRankSum=-0.419;SC=ACTTCTGTGTTAGAAACCCTG;SOR=1.005;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=75;TCF=59;TCR=16;TR=26;WE=48017997;WS=48017979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,30:0.38:80
chr7	48018455	rs2242479	T	A	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=1.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.75;ReadPosRankSum=0.279;SOR=0.825;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,19:0.20:94
chr7	48028512	rs3736547	G	C	1806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.861;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=44;PP=1238;ReadPosRankSum=-0.125;SC=AGATTGTAATGAATGGATGCA;SOR=0.822;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=232;TCF=122;TCR=110;TR=86;WE=48028520;WS=48028496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,93:0.36:258
chr7	48035893	rs2708899	T	C	355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=11;PP=238;SC=AGGAAAAGTATGACAGTTTTC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=48035901;WS=48035883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr7	48045416	rs11767002	C	T	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.930;NF=23;NR=1;PP=487;ReadPosRankSum=-0.264;SC=ACTATTTCTACTCTCTTCTTT;SOR=0.560;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=38;TCF=36;TCR=2;TR=24;WE=48045424;WS=48045406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr7	48045447	rs34145615	T	TC	455.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.238;HP=9;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=1.905;NF=27;NR=11;PP=538;ReadPosRankSum=-0.722;SC=TTGATTAATTTCCCCCCCCCA;SOR=0.114;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=71;TCF=53;TCR=18;TR=38;WE=48045455;WS=48045428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,23:0.47:49
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chr7	48075030	rs1915972	C	G	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.682;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=277;ReadPosRankSum=-1.709;SC=ACCGCTCCCCCTCAGGCTTCC;SOR=0.223;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=19;WE=48075038;WS=48075020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,18:0.78:23
chr7	48081095	rs10951942	G	T	3698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.508;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=84;PP=2200;ReadPosRankSum=1.524;SC=TGTGAAGCTCGCGAAACAAGG;SOR=0.736;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=218;TCF=86;TCR=132;TR=137;WE=48081103;WS=48081085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,158:0.66:239
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chr7	48086077	rs2708912	C	T	6099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=123;NR=73;PP=2965;SC=GTCTCCATGCCGGATTACATG;SOR=1.308;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=196;TCF=123;TCR=73;TR=196;WE=48086085;WS=48086067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr7	48086161	rs10233232	T	C	10611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=417;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=196;NR=184;PP=2965;SC=GACTTCGACATGAAAACAGTT;SOR=0.698;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=383;TCF=197;TCR=186;TR=380;WE=48086182;WS=48086151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,417:1.00:417
chr7	48089394	rs909059	T	C	8428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=169;NR=126;PP=2965;SC=AAGCTTTGTATCTTTGCTACC;SOR=1.029;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=295;TCF=169;TCR=126;TR=295;WE=48089402;WS=48089384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,321:1.00:321
chr7	48089542	rs2686788	T	C	6273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=123;PP=2965;SC=GCCCTAAGAATCCTGCAGGAA;SOR=1.169;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=213;TCF=90;TCR=123;TR=213;WE=48089550;WS=48089532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr7	48089571	rs2708890	C	A	3940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=88;PP=2486;SC=TCCTTCCCCCCCGTGTAAGTG;SOR=1.483;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=52;TCR=88;TR=140;WE=48089579;WS=48089561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr7	48092486	rs2686791	T	C	3370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=54;PP=2325;SC=GGCTCCAGGATGCAGAGGCTT;SOR=0.710;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=110;TCF=56;TCR=54;TR=109;WE=48092494;WS=48092476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr7	48092601	rs17547209	C	T	4516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.621;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=102;NR=96;PP=2808;ReadPosRankSum=-1.241;SC=TCACATGATGCGTCTCGTAAT;SOR=0.606;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=313;TCF=158;TCR=155;TR=198;WE=48092609;WS=48092591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,212:0.63:339
chr7	48092644	rs17629333	C	T	4607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.513;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=100;PP=2952;ReadPosRankSum=-0.017;SC=CATGTGAAAACGCCCACAGAA;SOR=0.497;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=303;TCF=144;TCR=159;TR=195;WE=48092652;WS=48092634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,208:0.64:323
chr7	48092847	rs2686792	C	A	315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=232;SC=CAGATCCAAACAATGTTGACC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=48092855;WS=48092837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr7	48211301	rs141832114	C	T	155.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.97;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr7	48232530	.	AT	A	132.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.216;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.99;ReadPosRankSum=0.696;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr7	48237721	rs28637820	G	C	933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=30;NR=1;PP=786;SC=TAAATTAATAGCAAGGTTAAT;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=31;WE=48237729;WS=48237711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr7	48237824	rs17060	C	T	6788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=146;NR=83;PP=2965;SC=TTCTTTGCATCTATTTCTAGG;SOR=1.339;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=233;TCF=146;TCR=87;TR=229;WE=48237832;WS=48237814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr7	48266842	rs150972279	A	AT	1212.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FS=2.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.05;MQRankSum=1.529;QD=5.25;ReadPosRankSum=-0.322;SOR=0.917;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:163,68:0.29:231
chr7	48269679	rs60553397	G	C	971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=23;PP=675;SC=AAAAAAGTATGAATTGTTTCT;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=48269687;WS=48269669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr7	48284168	rs186683711	C	G	2442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.088;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=40;PP=1385;ReadPosRankSum=-1.954;SC=TATTTTTGCCCTCAGATTACA;SOR=0.919;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=201;TCF=120;TCR=81;TR=107;WE=48284176;WS=48284158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,121:0.55:219
chr7	48285485	rs1880738	C	T	1837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=349;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.158;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=47;PP=1304;ReadPosRankSum=-0.433;SC=GCTGTCTGCCCGAATGGTCGT;SOR=0.835;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=330;TCF=171;TCR=159;TR=102;WE=48285493;WS=48285475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:245,104:0.30:349
chr7	48287801	rs4024052	ATT	A	2820.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.230;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.463;NF=28;NR=18;PP=1723;ReadPosRankSum=1.232;SC=GAATTGCTTTATTTATTATAA;SOR=0.453;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=68;TCF=43;TCR=25;TR=46;WE=48287810;WS=48287791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,72:0.75:96
chr7	48312674	rs1358066	G	A	5495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=82;PP=2965;SC=ATGTCAGTGTGTTCAACAAGT;SOR=0.828;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=186;TCF=104;TCR=82;TR=186;WE=48312682;WS=48312664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
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chr7	48313881	rs17712299	T	C	2160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.136;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=35;PP=1351;ReadPosRankSum=1.055;SC=TCCTAATCAGTTTCAAAATAT;SOR=0.631;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=129;TCF=69;TCR=60;TR=82;WE=48313889;WS=48313871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,91:0.64:143
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chr7	48317708	rs78334925	A	C	962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=15;PP=638;ReadPosRankSum=-1.888;SC=CCAAAAGATAAAATTCTAGAA;SOR=0.681;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=80;TCF=54;TCR=26;TR=43;WE=48317716;WS=48317698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,46:0.53:87
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chr7	48336844	rs6583546	C	T	7760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=141;NR=127;PP=2965;SC=CCAAAAGCCTCGAGGAAACTT;SOR=0.813;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=268;TCF=141;TCR=127;TR=268;WE=48336852;WS=48336834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr7	48415892	rs2163938	A	G	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=359;ReadPosRankSum=-0.946;SC=ATTTCATGAAAAGTTATGGCC;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=15;WE=48415900;WS=48415882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,17:0.74:23
chr7	48443570	rs6978753	G	A	2591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.509;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=60;PP=1576;ReadPosRankSum=1.394;SC=TTGTATCCCAGTGAGGCTACA;SOR=0.478;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=170;TCF=71;TCR=99;TR=108;WE=48443578;WS=48443560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,117:0.62:188
chr7	48450036	rs149049743	C	T	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=1;PP=497;ReadPosRankSum=-0.585;SC=TGCCCTGGATCTACCATCCTG;SOR=0.538;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=73;TCF=70;TCR=3;TR=27;WE=48450044;WS=48450026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,27:0.36:76
chr7	48450157	rs17548783	T	C	13228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=506;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=230;NR=234;PP=2965;SC=TGGATGAAGCTGAAGCGCTGA;SOR=0.729;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=464;TCF=230;TCR=234;TR=464;WE=48450165;WS=48450147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,505:1.00:505
chr7	48451933	rs78680236	C	CT	1832.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=2.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.28;MQRankSum=0.935;QD=16.66;ReadPosRankSum=1.040;SOR=0.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,79:0.72:110
chr7	48467355	rs13233421	T	C	2894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.246;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=52;PP=1950;ReadPosRankSum=0.417;SC=TTTTTTTTTCTCCGAAAGGTG;SOR=1.066;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=229;TCF=137;TCR=92;TR=138;WE=48467363;WS=48467334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,145:0.59:247
chr7	48467581	rs13243091	T	C	1980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.879;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=55;PP=1168;ReadPosRankSum=1.048;SC=AGTGAGGAGATGTGAGTGTAT;SOR=0.474;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=36;TCR=72;TR=83;WE=48467589;WS=48467571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,88:0.75:117
chr7	48467634	rs34541457	T	C	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=26;PP=619;ReadPosRankSum=2.068;SC=AAAAAAAACGTTGAGTTTTAT;SOR=2.376;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=26;WE=48467642;WS=48467624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,24:0.77:31
chr7	48467653	rs34529024	GAA	G	388.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5161;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=55;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=202;ReadPosRankSum=-2.729;SC=ATCCTGGCTTGAAAAAAAAAA;SOR=3.126;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=14;WE=48467662;WS=48467643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,13:0.87:15
chr7	48506416	rs4917151	G	C	192.03	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=206;ReadPosRankSum=0.887;SC=AAAATTAGCTGTATCTCACTT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=48506424;WS=48506406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr7	48522769	rs59521533	A	AT	2390.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.200;HP=8;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.947;NF=3;NR=49;PP=1262;ReadPosRankSum=-0.005;SC=AGGTAATCATATTTTTTTATT;SOR=0.521;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=104;TCF=3;TCR=101;TR=52;WE=48522777;WS=48522759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,97:0.62:156
chr7	48522845	rs1918584	C	G	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.72;ReadPosRankSum=1.158;SOR=0.260;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr7	48522845	.	CA	GG	526	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=1;NR=12;PP=526;QD=44.5744519125;SC=GCACAGGGTTCAGAAGGACCA;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=13;WE=48522854;WS=48522835;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr7	48522846	rs1918585	A	G	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.72;ReadPosRankSum=1.191;SOR=0.260;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr7	48545976	rs6583448	A	G	6771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=138;NR=90;PP=2965;SC=CTTGCTGAACAAGGACAAGAT;SOR=1.130;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=229;TCF=139;TCR=90;TR=228;WE=48545984;WS=48545966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr7	48546011	rs12669976	T	C	5448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.463;HP=5;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=118;NR=103;PP=2827;ReadPosRankSum=1.563;SC=TGCTGAGGGGTGTGTGACCCT;SOR=0.561;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=325;TCF=177;TCR=148;TR=221;WE=48546019;WS=48546001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,245:0.69:356
chr7	48654746	rs10255431	C	A	1482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=8;PP=512;ReadPosRankSum=1.728;SC=GATTTGGTTACCATGAGATTT;SOR=0.853;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=53;TCF=39;TCR=14;TR=32;WE=48654754;WS=48654736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,37:0.59:63
chr7	48654761	rs10243913	G	A	1710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=13;PP=634;ReadPosRankSum=0.429;SC=AGATTTCTGTGTAAAAAAATT;SOR=0.793;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=71;TCF=49;TCR=22;TR=43;WE=48654769;WS=48654751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,49:0.60:82
chr7	48682996	rs28610321	C	G	3366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.285;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=98;PP=2337;ReadPosRankSum=1.482;SC=CAAGGTAGTGCTAATATCTTG;SOR=0.870;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=243;TCF=89;TCR=154;TR=150;WE=48683004;WS=48682986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,157:0.62:254
chr7	48886140	rs62454384	T	C	1124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.55;QD=29.60;SOR=2.073;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr7	48886383	rs146940015	G	T	281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.52;QD=28.18;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr7	48886487	rs62454385	T	C	637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.61;QD=28.99;SOR=2.737;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr7	48886648	rs71537796	G	A	2411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.40;QD=28.37;SOR=1.450;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr7	48886746	rs4320498	C	T	6346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.58;QD=27.84;SOR=1.478;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr7	48886783	rs62454386	G	A	8703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=187;NR=182;PP=2965;SC=GCAATAAATCGGTCTGGTATT;SOR=1.033;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=369;TCF=187;TCR=182;TR=369;WE=48886791;WS=48886773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,331:1.00:331
chr7	48887548	rs4404869	G	C	5871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=125;PP=2965;SC=CGTCGTCCTGGGGGTCCCAGC;SOR=1.326;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=204;TCF=79;TCR=125;TR=204;WE=48887556;WS=48887536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr7	49815390	rs769604	C	G	1111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FS=2.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.75;ReadPosRankSum=-0.548;SOR=0.904;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:169,65:0.28:234
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chr7	49951544	rs7792519	T	C	349.79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=52;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=439;ReadPosRankSum=0.438;SC=CACACACACATATATATACTG;SOR=2.147;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=22;WE=49951552;WS=49951534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr7	50023122	rs988392	C	T	1296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=37;PP=1038;SC=TAGCCTAAAACATAAATACAA;SOR=3.767;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=5;TCR=37;TR=42;WE=50023130;WS=50023112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr7	50070921	rs1351691	C	G	181.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.31;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr7	50121269	rs3807322	G	A	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=268;ReadPosRankSum=1.789;SC=AAAAAGAATTGAGGAAATAAC;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=13;WE=50121277;WS=50121259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr7	50135632	rs62447817	G	A	776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=6;PP=517;ReadPosRankSum=0.186;SC=AAATATAAAGGAATTATCAGA;SOR=0.491;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=28;WE=50135640;WS=50135622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,31:0.67:46
chr7	50144059	rs3034461	T	TTA	424.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=1.240;NF=1;NR=12;PP=555;ReadPosRankSum=1.238;SC=TTTCATTGTATTATATATATA;SOR=0.986;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=13;WE=50144067;WS=50144049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,15:0.42:36
chr7	50156916	rs6959792	C	G	2949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=56;PP=1869;ReadPosRankSum=-0.552;SC=AGTAGCTAAGCCATATTTTAA;SOR=0.676;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=226;TCF=129;TCR=97;TR=131;WE=50156924;WS=50156906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,139:0.57:246
chr7	50169508	rs1456900	G	A	987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.821;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=29;PP=597;ReadPosRankSum=-1.988;SC=GACATCAAACGCAGACATTTA;SOR=0.928;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=74;TCF=30;TCR=44;TR=44;WE=50169516;WS=50169498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,48:0.56:85
chr7	50169595	rs1456899	T	A	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.008;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=66;ReadPosRankSum=-1.383;SC=AATAAAACCATAACAGAAAGT;SOR=0.223;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=6;WE=50169603;WS=50169585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr7	50173777	rs998928	A	G	3634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=86;PP=2329;ReadPosRankSum=-0.854;SC=ATTGGAAAAAACCGCTGACCC;SOR=0.678;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=260;TCF=120;TCR=140;TR=158;WE=50173785;WS=50173767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,169:0.61:279
chr7	50175681	rs12672941	C	T	3646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.278;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=73;PP=2089;ReadPosRankSum=-0.787;SC=TTGATTTTGACGATTATTTTT;SOR=0.503;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=212;TCF=104;TCR=108;TR=149;WE=50175689;WS=50175671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,166:0.72:232
chr7	50191216	rs10260654	G	T	2717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.272;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=82;PP=1976;ReadPosRankSum=0.692;SC=CCTAATTGTGGTTATTCCATT;SOR=0.848;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=183;TCF=48;TCR=135;TR=109;WE=50191224;WS=50191206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,114:0.57:199
chr7	50198626	rs4917120	T	C	7825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=155;NR=109;PP=2965;SC=CTCCTTTTTTTCCCATCCTGC;SOR=1.082;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=264;TCF=155;TCR=109;TR=264;WE=50198634;WS=50198616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,288:1.00:288
chr7	50435777	rs12669559	T	G	6696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=130;NR=109;PP=2965;SC=AGTATATGCCTTGCTTCTGGA;SOR=0.843;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=239;TCF=130;TCR=109;TR=239;WE=50435785;WS=50435767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
chr7	50435936	rs182128033	C	T	2093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=432;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.931;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=57;PP=1448;ReadPosRankSum=-0.083;SC=AAGTGCAAAACGAAGGTCTAG;SOR=0.790;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=409;TCF=211;TCR=198;TR=124;WE=50435944;WS=50435926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:305,127:0.29:432
chr7	50436033	rs10899750	A	G	5426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=108;PP=2965;SC=GTTACTTCGCAGATGCTGCTG;SOR=1.237;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=185;TCF=77;TCR=108;TR=185;WE=50436041;WS=50436023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr7	50512857	rs10230307	C	T	324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=266;SC=AAGTACAGAACTTAGAATATA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=50512865;WS=50512847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr7	50512929	rs10230343	C	A	2894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=27;PP=1741;SC=GAAGACTGTACTACAGAGATG;SOR=1.458;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=66;TCR=27;TR=93;WE=50512937;WS=50512919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr7	50537677	.	C	CA	246	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;FR=1.0000;HP=13;HapScore=4;MGOF=12;MMLQ=16;MQ=56.58;NF=15;NR=0;PP=246;QD=16.7333333333;SC=AACTCTGTCTCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=36;TCR=3;TR=15;WE=50537699;WS=50537667;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:24,15:0.38:39
chr7	50537983	rs3757472	A	C	2879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=72;PP=2181;SC=CTGGTGGCCAACCTGCTCCCA;SOR=2.960;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=17;TCR=72;TR=89;WE=50537991;WS=50537973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr7	50544269	rs5884156	AG	A	4696.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=38;NR=36;PP=2957;SC=GCTGTGGCGTAGCCCCCCAGC;SOR=1.669;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=41;TCR=39;TR=74;WE=50544277;WS=50544259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr7	50545191	rs4992502	C	A	2661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=34;PP=1782;ReadPosRankSum=-0.792;SC=CCATAGCAGGCCCTGACCATG;SOR=0.523;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=100;TCF=66;TCR=34;TR=98;WE=50545199;WS=50545181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,99:0.99:100
chr7	50547584	rs11575457	A	C	1898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=30;NR=27;PP=877;SC=AACAAATGAAAGGGCTGATAA;SOR=0.927;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=30;TCR=27;TR=57;WE=50547592;WS=50547574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr7	50547661	rs11575456	AGCCCT	A	978.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=13;PP=767;SC=ACCTGCTCCCAGCCCTGCCCT;SOR=1.426;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=15;WE=50547673;WS=50547651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr7	50566671	rs3807562	G	A	974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=6;PP=707;SC=AGGACAGGCTGTATGGCTGGG;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=31;WE=50566679;WS=50566661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr7	50566762	rs2876829	C	T	4811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=63;PP=2965;SC=TAGCAAGAGACTGGACGTCAG;SOR=1.185;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=165;TCF=102;TCR=63;TR=165;WE=50566770;WS=50566752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
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chr7	50685625	rs2240498	A	T	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.405;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=5;PP=423;ReadPosRankSum=-0.352;SC=CCCTCCCCCCAACCACCCCTC;SOR=1.110;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=79;TCF=61;TCR=18;TR=28;WE=50685633;WS=50685615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,26:0.35:74
chr7	50694457	rs1468450	A	G	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=83;ReadPosRankSum=1.412;SC=TGGCAGCAGCAGTCTTCATTC;SOR=0.269;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=9;WE=50694465;WS=50694454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr7	50800100	.	GA	G	52.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.761;ClippingRankSum=0.000;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.15;ReadPosRankSum=0.260;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,10:0.22:46
chr7	51085127	rs3214180	A	AT	1563.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.147;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=23;PP=1110;ReadPosRankSum=1.346;SC=AACTGTGCGCATTTGGCCTGT;SOR=0.785;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=127;TCF=37;TCR=90;TR=36;WE=51085135;WS=51085117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,65:0.30:217
chr7	51093013	rs2240087	A	T	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=3.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.70;ReadPosRankSum=1.278;SOR=0.397;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,35:0.33:105
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chr7	51097063	rs10230120	T	G	1203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.28;ReadPosRankSum=-0.761;SOR=0.678;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:208,73:0.26:281
chr7	51153024	rs59837144	GT	G	967.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FS=10.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.18;ReadPosRankSum=0.121;SOR=1.629;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:152,35:0.19:187
chr7	51153027	.	CAATCAAAGTACTTTGTACCTATGAAGTACAAAGA	C	945.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.856;ClippingRankSum=0.000;DP=187;ExcessHet=3.0103;FS=9.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.06;ReadPosRankSum=-0.168;SOR=1.503;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:152,35:0.19:187
chr7	51287470	rs801142	A	G	5792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=100;NR=106;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.963;SC=TCTCCAGCCCACTAGGCAGGA;SOR=0.282;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=207;TCF=100;TCR=107;TR=206;WE=51287478;WS=51287460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,225:1.00:226
chr7	53103554	rs11238247	C	G	8875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=146;NR=153;PP=2965;SC=GAGCCATATTCAGTACTTCCA;SOR=0.818;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=300;TCF=146;TCR=154;TR=299;WE=53103562;WS=53103544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,321:1.00:321
chr7	53103571	rs11238248	G	A	7652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=123;NR=134;PP=2965;SC=TCCAGTGGGGGCGCCCGGTGC;SOR=0.920;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=258;TCF=124;TCR=134;TR=257;WE=53103579;WS=53103561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,281:1.00:281
chr7	53103630	.	C	T	609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.930;ClippingRankSum=0.000;DP=225;ExcessHet=3.0103;FS=2.013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.72;ReadPosRankSum=-0.596;SOR=0.548;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:176,48:0.21:224
chr7	53103946	rs12113170	G	C	11611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=434;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=220;NR=181;PP=2965;SC=GGTTCGACGGGCCGTTGTGGT;SOR=0.851;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=401;TCF=220;TCR=181;TR=401;WE=53103954;WS=53103936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,434:1.00:434
chr7	54614535	rs181104695	G	A	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=144;ReadPosRankSum=1.927;SC=CCTGTCCCCAGGTCACCCTGA;SOR=0.527;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=11;WE=54614543;WS=54614525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,11:0.32:34
chr7	54614585	rs657449	A	G	1045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.122;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.186;NF=35;NR=19;PP=633;ReadPosRankSum=0.087;SC=CTCGCGTGGGAGCGGGTGGTC;SOR=0.435;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=150;TCF=101;TCR=49;TR=54;WE=54614593;WS=54614575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,56:0.36:155
chr7	54614698	rs11432820	C	CG	13778.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=457;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=26;NR=142;PP=2966;SC=AGCGTGAGTGCGGGGCGCGCC;SOR=0.803;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=185;TCF=27;TCR=158;TR=168;WE=54614706;WS=54614688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,418:1.00:418
chr7	54618010	rs2293343	C	T	1327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=41;PP=966;ReadPosRankSum=-0.740;SC=AGGTGAGCACCGAGCCTGCAC;SOR=0.728;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=69;TCF=12;TCR=57;TR=50;WE=54618018;WS=54618000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,52:0.73:71
chr7	54621526	rs662136	T	C	2318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.352;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=33;PP=1537;ReadPosRankSum=0.028;SC=ATATACTAAGTCATTCTCTAC;SOR=0.461;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=129;TCF=85;TCR=44;TR=90;WE=54621534;WS=54621516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,100:0.68:146
chr7	54823677	rs3834332	TC	T	1421.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=26;PP=1029;SC=TATACATTTCTCCTGTTAATA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=54823685;WS=54823667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr7	54825019	rs2256906	C	T	167.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=132;SC=AAAATTTAGACGAGTAAAAAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=54825027;WS=54825011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr7	54826830	rs2699226	G	C	9654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=350;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=204;NR=132;PP=2965;SC=CGCCCGTACCGACCGGTGGGA;SOR=1.136;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=336;TCF=204;TCR=132;TR=336;WE=54826838;WS=54826820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,349:1.00:349
chr7	55087139	rs17335738	G	T	1427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=32;PP=971;SC=GCGCACCGGCGCACCGGCTCG;SOR=2.030;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=13;TCR=32;TR=45;WE=55087147;WS=55087129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
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chr7	55214348	rs2072454	C	T	6250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=422;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=154;NR=120;PP=2962;ReadPosRankSum=1.848;SC=CCCTGTGCAACGTGGAGAGCA;SOR=0.678;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=394;TCF=225;TCR=169;TR=274;WE=55214356;WS=55214338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,288:0.68:422
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chr7	55233863	rs9649769	A	C	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=217;ReadPosRankSum=-0.288;SC=AAAACAAAAAAAAAAGCTACT;SOR=1.061;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=12;WE=55233871;WS=55233853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr7	55238268	rs10228436	G	A	1191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.284;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=37;PP=859;ReadPosRankSum=0.472;SC=TGTTCCCCCCGCTTTTCCTTT;SOR=0.988;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=63;TCF=14;TCR=49;TR=47;WE=55238276;WS=55238258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,49:0.74:66
chr7	55238874	rs2227984	T	A	3755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.118;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=65;PP=2380;ReadPosRankSum=1.652;SC=ACAGATGCACTGGGCCAGGTC;SOR=0.432;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=244;TCF=147;TCR=97;TR=154;WE=55238882;WS=55238864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,168:0.64:264
chr7	55240461	rs2241055	G	C	2419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.700;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=26;PP=1638;ReadPosRankSum=-0.981;SC=ATGAGGAAAAGTGTGCCTGGT;SOR=0.577;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=142;TCF=104;TCR=38;TR=92;WE=55240469;WS=55240451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,102:0.66:155
chr7	55242609	rs2017000	A	G	752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=25;PP=543;ReadPosRankSum=0.251;SC=GACCCTGCTCATCTCCACATC;SOR=1.154;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=46;TCF=4;TCR=42;TR=27;WE=55242617;WS=55242599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,29:0.59:49
chr7	55249063	rs1050171	G	A	4657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.294;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=114;NR=68;PP=2667;ReadPosRankSum=1.526;SC=CCACCGTGCAGCTCATCACGC;SOR=0.880;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=257;TCF=155;TCR=102;TR=182;WE=55249071;WS=55249053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,204:0.72:282
chr7	55266417	rs1140475	T	C	10880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=417;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=203;NR=180;PP=2965;SC=CAGGGGTGACTGTTTGGGAGT;SOR=0.793;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=384;TCF=204;TCR=180;TR=383;WE=55266425;WS=55266407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,416:1.00:416
chr7	55272826	rs2692456	G	A	902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=2;PP=700;SC=GGGCCCTCCCGAGGCTCCTGC;SOR=4.479;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=28;WE=55272834;WS=55272816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr7	55433880	rs2272262	G	C	8536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.00;SOR=1.251;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr7	55433884	rs2272263	A	C	8401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.41;SOR=1.267;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr7	55466002	rs6973684	T	C	954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=3;PP=751;SC=GTGTTACCCGTTTGGAAACAT;SOR=3.477;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=30;WE=55466010;WS=55465992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr7	55467923	rs2272226	G	C	710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=18;PP=497;SC=CTCATCAAAAGTAAGAAATAG;SOR=4.003;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=55467931;WS=55467913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr7	55468773	rs815929	C	A	1913.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=6;PP=1450;SC=GCCTCTCTCTCTATATATGTC;SOR=6.184;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=52;TCR=6;TR=58;WE=55468781;WS=55468763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr7	55499058	rs815988	A	G	3010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=68;PP=2137;SC=ACCAAAAGCCACCAGATTGCT;SOR=1.819;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=31;TCR=68;TR=99;WE=55499073;WS=55499048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr7	55540791	rs712819	G	C	8353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=123;NR=163;PP=2965;SC=CCATCACACCGCAAGTATGTG;SOR=1.088;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=286;TCF=123;TCR=163;TR=286;WE=55540799;WS=55540781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,308:1.00:308
chr7	55565247	.	TGGGG	T	431.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.25;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr7	55750390	rs11238374	A	G	1266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=547;ExcessHet=3.0103;FS=6.678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.78;MQRankSum=-7.314;QD=2.32;ReadPosRankSum=-3.282;SOR=1.253;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:438,109:0.20:547
chr7	55759300	rs142045864	C	T	840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.339;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.703;NF=2;NR=29;PP=651;ReadPosRankSum=0.022;SC=GTGAGGAAAACGGGCACCCAG;SOR=2.774;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=51;TCF=7;TCR=44;TR=31;WE=55759308;WS=55759290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,32:0.62:52
chr7	55774888	rs12666519	C	T	2086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.546;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.480;NF=65;NR=35;PP=1413;ReadPosRankSum=-0.794;SC=CATCCAGAAGCGTGCCATTGT;SOR=1.039;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=281;TCF=174;TCR=107;TR=100;WE=55774896;WS=55774878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:195,108:0.36:303
chr7	55779103	rs28695422	C	T	1144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FS=1.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.48;MQRankSum=-2.271;QD=3.79;ReadPosRankSum=-0.962;SOR=0.762;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:223,79:0.26:302
chr7	55779220	rs12536949	A	G	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=6.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.81;MQRankSum=-8.657;QD=0.76;ReadPosRankSum=1.553;SOR=1.766;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,14:0.13:107
chr7	55780176	rs10267547	T	C	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FS=9.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.59;MQRankSum=-12.681;QD=3.79;ReadPosRankSum=-2.149;SOR=1.440;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:148,46:0.24:194
chr7	55832361	rs28670923	T	C	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.57;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.765;NF=4;NR=0;PP=30;ReadPosRankSum=-0.765;SC=CAGTATACCTTGTCAAACATA;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=4;WE=55832369;WS=55832357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
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chr7	55832480	rs4577914	T	C	698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=2.338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.53;MQRankSum=-2.341;QD=4.79;ReadPosRankSum=0.755;SOR=0.492;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,46:0.32:146
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chr7	56047612	rs71543773	G	A	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=12.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.104;SOR=2.595;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,23:0.27:85
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chr7	56051672	rs150298305	T	TTATATGTATA	186.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=2;PP=931;SC=ATGTCTAGCATTATATGTATA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=2;WE=56051680;WS=56051662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
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chr7	56062432	rs71015151	CTT	C	280.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=149;ReadPosRankSum=0.300;SC=AATAAAATAACTTTTGATTTG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=6;WE=56062441;WS=56062429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
chr7	56087278	rs199535022	C	A	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=2.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.76;ReadPosRankSum=-2.347;SOR=0.319;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:119,12:0.09:131
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chr7	56087283	rs201406771	T	C	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=2.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.24;ReadPosRankSum=-1.188;SOR=0.314;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:133,12:0.08:145
chr7	56087291	rs139106189	AC	A	380.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=3.250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.27;ReadPosRankSum=-2.323;SOR=0.385;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:148,20:0.12:168
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chr7	56087364	rs201644817	GA	TG	1196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FS=1.967;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-3.234;QD=4.08;ReadPosRankSum=0.606;SOR=0.862;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:246,47:0.16:293
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chr7	56087379	rs201935398	T	C	1180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FS=1.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-3.202;QD=4.19;ReadPosRankSum=-0.887;SOR=0.855;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:236,46:0.16:282
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chr7	56087423	rs79451216	G	A	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=1.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-3.859;QD=2.40;ReadPosRankSum=0.798;SOR=0.944;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:149,20:0.12:169
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chr7	56088811	rs78599516	T	C	3439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=612;ExcessHet=3.0103;FS=1.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-3.479;QD=5.80;ReadPosRankSum=1.608;SOR=0.603;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:475,118:0.20:593
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chr7	56088902	rs77329757	C	T	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=11.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQRankSum=-6.209;QD=2.70;ReadPosRankSum=-1.012;SOR=2.718;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,19:0.14:137
chr7	56088907	rs201445503	GC	CT	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=4.528;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQRankSum=-6.329;QD=3.47;ReadPosRankSum=-1.571;SOR=1.628;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,15:0.14:111
chr7	56088928	rs200942360	C	T	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQRankSum=-4.628;QD=2.64;ReadPosRankSum=-1.249;SOR=0.543;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,8:0.12:64
chr7	56088931	.	G	GA	135.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=0.000;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQRankSum=-4.463;QD=2.26;ReadPosRankSum=-1.437;SOR=0.612;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,8:0.13:60
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chr7	56129511	rs4927	A	G	4875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=352;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.709;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=133;NR=63;PP=2937;ReadPosRankSum=0.155;SC=ATTCAGAATCAGGTCAGCTTG;SOR=1.122;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=317;TCF=202;TCR=115;TR=196;WE=56129519;WS=56129493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,225:0.64:351
chr7	56136260	rs4245575	C	A	9758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=367;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=165;NR=177;PP=2965;SC=GAGATGGTGACGGGCCTGTGC;SOR=0.845;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=342;TCF=165;TCR=177;TR=342;WE=56136268;WS=56136250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,366:1.00:366
chr7	56140548	rs76519777	T	C	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.747;NF=16;NR=0;PP=300;ReadPosRankSum=0.859;SC=TCACTCAGGCTTCAGGTTAAT;SOR=0.346;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=16;WE=56140556;WS=56140544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,17:0.39:44
chr7	56140618	rs13238899	T	G	1260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=3.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.257;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=18;PP=871;ReadPosRankSum=-0.445;SC=TATCTGAAGTTTCCTGGAGCA;SOR=0.807;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=182;TCF=124;TCR=58;TR=56;WE=56140626;WS=56140608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,63:0.30:209
chr7	56142519	rs4948104	A	G	2642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=65;PP=1901;SC=GGCTGGGCGCAGTGGCTTATG;SOR=2.019;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=28;TCR=65;TR=93;WE=56142527;WS=56142509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr7	56146004	rs3735066	G	A	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=10;PP=376;ReadPosRankSum=1.351;SC=TCAGAGGGTAGGCGGGGTGGT;SOR=0.634;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=74;TCF=46;TCR=28;TR=25;WE=56146012;WS=56145994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,25:0.32:79
chr7	56146737	rs13226699	G	A	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.33;ReadPosRankSum=0.512;SOR=0.798;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,13:0.19:70
chr7	56149475	rs199775883	G	GGC	2493.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.70;ReadPosRankSum=2.543;SOR=0.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:190,67:0.26:257
chr7	56149476	.	A	AGGTC	2492.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=0.000;DP=264;ExcessHet=3.0103;FS=1.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.44;ReadPosRankSum=2.492;SOR=0.777;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:194,70:0.27:264
chr7	56149477	rs199778139	A	C	2500.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=3.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FS=2.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.19;ReadPosRankSum=1.965;SOR=0.893;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:197,75:0.28:272
chr7	56149847	rs17172508	C	T	6753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=486;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.566;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=125;NR=164;PP=2962;ReadPosRankSum=0.870;SC=CCTTTCCCGGCGCACTCACAT;SOR=0.904;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=454;TCF=206;TCR=248;TR=289;WE=56149855;WS=56149837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,308:0.63:486
chr7	56149939	rs13238521	G	A	1283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=40;PP=793;ReadPosRankSum=-0.397;SC=TGGGGGTCCCGCAGACCTCTG;SOR=0.682;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=143;TCF=51;TCR=92;TR=61;WE=56149947;WS=56149929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,65:0.42:154
chr7	56151489	rs2242508	A	G	5749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=390;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.283;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=109;NR=131;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.884;SC=GCTGCCTTCCACCCTGATACC;SOR=0.613;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=367;TCF=164;TCR=203;TR=240;WE=56151497;WS=56151479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,262:0.67:389
chr7	56151816	rs2242510	C	G	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=306;ReadPosRankSum=1.040;SC=CAATGGGCCCCGAGCTGGTGG;SOR=0.773;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=82;TCF=58;TCR=24;TR=26;WE=56151824;WS=56151806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,25:0.29:87
chr7	56155219	rs6945795	C	T	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=154;ReadPosRankSum=-0.429;SC=TGGGGCCACACTCCCTGGCTT;SOR=0.606;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=40;TCF=32;TCR=8;TR=16;WE=56155227;WS=56155209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,22:0.44:50
chr7	56171760	rs6593298	A	C	760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=0;PP=591;ReadPosRankSum=-0.688;SC=GGCCTAAGGCAGTAACTCAAC;SOR=1.501;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=42;TCR=0;TR=26;WE=56171768;WS=56171750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,27:0.66:41
chr7	56174115	rs10043	A	C	6844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=141;NR=95;PP=2965;SC=ATCCTAGGTAAGCGACGGCTA;SOR=1.039;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=237;TCF=142;TCR=95;TR=236;WE=56174123;WS=56174105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,259:1.00:259
chr7	56174140	rs816407	G	T	9413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=361;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=184;NR=144;PP=2965;SC=TCCGGACGTGGGACAACCACC;SOR=0.879;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=328;TCF=184;TCR=144;TR=328;WE=56174148;WS=56174130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,361:1.00:361
chr7	57069935	rs1966122	G	C	342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.76;QD=26.37;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr7	57071671	rs187876791	T	C	671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=54.92;NF=14;NR=4;PP=461;SC=GCAGCAGCAGTGGCTCGGAGA;SOR=0.941;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=18;WE=57071679;WS=57071661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr7	57071725	rs62463099	C	T	1270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.60;QD=25.42;SOR=0.952;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr7	57188016	rs78588121	A	G	3402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=71;PP=2409;SC=CCTATGTCTCATAAGGTTCGA;SOR=0.886;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=143;TCF=72;TCR=71;TR=143;WE=57188024;WS=57188006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr7	57188718	rs62464802	T	C	12610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=460;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=186;NR=230;PP=2965;SC=GTGCACCTCATATTCACCCAC;SOR=0.914;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=418;TCF=187;TCR=231;TR=416;WE=57188726;WS=57188708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,458:1.00:458
chr7	57233554	rs34820155	G	C	8577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.03;NF=147;NR=149;PP=2965;SC=GATTAACATTGGTTAAGTCCA;SOR=0.757;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=296;TCF=147;TCR=149;TR=296;WE=57233576;WS=57233544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,322:1.00:322
chr7	57245247	rs11763159	A	G	8472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=135;NR=158;PP=2965;SC=TAGGGTGTGAAGATTGTGGTT;SOR=0.884;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=293;TCF=135;TCR=158;TR=293;WE=57245255;WS=57245237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,318:1.00:318
chr7	63033167	.	T	TGAG	546.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.047;ClippingRankSum=0.000;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=4.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQRankSum=-3.946;QD=9.94;ReadPosRankSum=-0.707;SOR=0.704;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,18:0.33:55
chr7	63033298	.	C	CGCT	1287.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.062;ClippingRankSum=0.000;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.825;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-2.690;NF=3;NR=11;PP=918;ReadPosRankSum=-1.441;SC=GTCTCCGAGCCGCTGCTGCTG;SOR=0.822;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=48;TCF=8;TCR=40;TR=14;WE=63033308;WS=63033288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,37:0.44:85
chr7	63033332	rs62473979	G	A	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.39;MQRankSum=0.615;QD=0.62;ReadPosRankSum=1.194;SOR=0.534;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,13:0.14:96
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chr7	63537849	rs4717170	G	A	9264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=641;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.031;NF=201;NR=190;PP=2962;ReadPosRankSum=0.732;SC=TCAGCTACCCGTAGCAAAACC;SOR=0.649;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=601;TCF=312;TCR=289;TR=391;WE=63537857;WS=63537839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:230,410:0.64:640
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chr7	63673608	rs10252019	C	T	9292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=153;NR=180;PP=2965;SC=TGAGGTTAACCTCAATACATA;SOR=0.885;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=333;TCF=153;TCR=180;TR=333;WE=63673616;WS=63673598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,351:1.00:351
chr7	63673691	rs13233809	A	G	1218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=40;PP=941;ReadPosRankSum=0.378;SC=AATGAATTTTAGCTCTCCGAT;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=77;TCF=12;TCR=65;TR=47;WE=63673699;WS=63673681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,49:0.60:81
chr7	63674540	rs4718036	G	C	5747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=367;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.876;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=136;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.195;SC=ACAAGTCAAGGAGGTAGCCAG;SOR=0.596;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=338;TCF=140;TCR=198;TR=233;WE=63674548;WS=63674530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,249:0.68:365
chr7	63679733	rs10270226	A	G	7495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=147;NR=106;PP=2965;SC=GCCAGAGCAGAGCATAAAAGA;SOR=0.960;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=253;TCF=147;TCR=106;TR=253;WE=63679741;WS=63679723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,284:1.00:284
chr7	63680098	rs4479992	CC	TA	3787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=50;PP=2661;ReadPosRankSum=1.253;SC=AATCCTTTAACCACTCCTCAA;SOR=0.692;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=288;TCF=135;TCR=153;TR=92;WE=63680107;WS=63680088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:214,107:0.33:321
chr7	63721251	rs12154540	A	G	2525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.846;NF=66;NR=36;PP=1457;ReadPosRankSum=-0.061;SC=ACCTGTCTGGAGCAAAATAAA;SOR=0.734;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=178;TCF=117;TCR=61;TR=102;WE=63721259;WS=63721241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,116:0.58:201
chr7	63721420	rs17767341	A	G	648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=476;ReadPosRankSum=-0.928;SC=AAGAGTTTCTAAGAAGCCCGA;SOR=0.728;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=90;TCF=24;TCR=66;TR=29;WE=63721442;WS=63721410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,32:0.32:100
chr7	63774584	rs812337	G	T	2827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=449;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.544;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=71;PP=1689;ReadPosRankSum=0.491;SC=GTTTGAATCCGGCCGGAACCG;SOR=0.638;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=416;TCF=218;TCR=198;TR=147;WE=63774592;WS=63774574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:288,159:0.36:447
chr7	63796835	rs7787036	T	C	1377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.026;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=30;PP=812;ReadPosRankSum=-1.567;SC=TTTTTGGAGGTTCTGCTTTGC;SOR=0.286;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=81;TCF=27;TCR=54;TR=49;WE=63796843;WS=63796825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,58:0.63:92
chr7	63808867	rs11976837	C	A	3980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=89;PP=2495;ReadPosRankSum=1.106;SC=TGTGGCAAAGCGTTTAAAAAG;SOR=0.669;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=227;TCF=91;TCR=136;TR=151;WE=63808875;WS=63808857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,168:0.67:251
chr7	63981425	rs10243731	A	G	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.52;BaseQRankSum=-1.830;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=35;ReadPosRankSum=-0.736;SC=AGTTTTCTCCAATATAAATTA;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=63981433;WS=63981415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr7	63981563	rs10243954	A	G	1977.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.757;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=35;PP=1137;ReadPosRankSum=0.867;SC=AATTATTGTCACATTTTTCAG;SOR=0.860;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=175;TCF=100;TCR=75;TR=89;WE=63981571;WS=63981553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,100:0.51:196
chr7	64152353	rs4718101	A	G	12446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=464;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=206;NR=219;PP=2965;SC=GTGAGAGTGAAAGTGAATACA;SOR=0.793;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=426;TCF=207;TCR=219;TR=425;WE=64152361;WS=64152343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,462:1.00:462
chr7	64166642	rs35661712	T	TG	2233.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=4;PP=1946;SC=AGATTAGATTTTAAAGTACAT;SOR=4.370;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=43;TCR=4;TR=46;WE=64166650;WS=64166638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr7	64168806	rs4718103	T	C	4111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=62;PP=2678;SC=CAAACCTTACTACACATAAGA;SOR=0.804;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=78;TCR=62;TR=140;WE=64168814;WS=64168796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr7	64169019	rs4717205	G	A	5117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=81;NR=89;PP=2820;SC=ACAAATGTGAGTATGGCAAAA;SOR=0.905;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=170;TCF=81;TCR=89;TR=170;WE=64169027;WS=64169009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr7	64169061	rs4717206	G	A	3878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=53;NR=69;PP=2154;SC=ACTACACATAGGAAAATTCAT;SOR=1.079;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=122;TCF=53;TCR=69;TR=122;WE=64169069;WS=64169051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr7	64254791	rs10949938	G	T	7351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=164;NR=94;PP=2965;SC=TCTTCCGGGAGGCGGCGGGGT;SOR=1.233;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=259;TCF=165;TCR=94;TR=258;WE=64254799;WS=64254781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,277:1.00:277
chr7	64254901	rs11983033	T	C	14605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=548;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=273;NR=247;PP=2965;SC=ATCTGGTTATTGGGAGATTCA;SOR=0.769;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=520;TCF=273;TCR=247;TR=520;WE=64254909;WS=64254891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,548:1.00:548
chr7	64275284	rs7809431	C	T	5579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=126;NR=79;PP=2965;ReadPosRankSum=0.711;SC=TTTGTGTGTGCGTGTTTTTCA;SOR=1.340;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=208;TCF=127;TCR=81;TR=205;WE=64275292;WS=64275276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,207:0.99:209
chr7	64275548	rs10236928	A	G	302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.23;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr7	64276089	rs9654821	A	G	10134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=371;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=140;NR=202;PP=2965;SC=CAAGGAGAAGACCACTCCTTT;SOR=1.130;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=342;TCF=140;TCR=202;TR=342;WE=64276097;WS=64276079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,370:1.00:370
chr7	64291225	rs6460193	G	T	2314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=20;PP=1574;SC=GGATGTGTCAGGTCTGAAATT;SOR=2.191;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=60;TCR=20;TR=80;WE=64291233;WS=64291215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr7	64291244	rs7787287	T	C	3638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=38;PP=2471;ReadPosRankSum=0.794;SC=TTTTTTAGGGTTTTTTTAGTT;SOR=0.765;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=124;TCF=86;TCR=38;TR=123;WE=64291252;WS=64291234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,130:0.99:131
chr7	64291267	rs6460194	A	T	4906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=60;PP=2965;SC=TTCTTGTTTCATCTTAATAGT;SOR=1.347;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=168;TCF=108;TCR=60;TR=168;WE=64291275;WS=64291257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr7	64291333	rs4483043	T	A	9800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=365;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=186;NR=158;PP=2965;SC=GCATTTACCTTTGATCTCAGT;SOR=0.864;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=344;TCF=186;TCR=158;TR=344;WE=64291341;WS=64291323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,365:1.00:365
chr7	64291991	rs4236203	T	A	7877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=117;NR=141;PP=2965;SC=CAAGGAGGTTTTAATGGACTT;SOR=0.928;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=259;TCF=117;TCR=142;TR=258;WE=64291999;WS=64291981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,291:1.00:291
chr7	64312707	rs7804955	T	C	1240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=11;PP=978;SC=TAGTCTTTAATTGAAGCGATG;SOR=2.059;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=34;TCR=11;TR=45;WE=64312715;WS=64312697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr7	64437406	rs4607487	A	G	4875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=84;PP=2965;SC=GTTTGAGGATAAGTTAAAAGC;SOR=1.080;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=66;TCR=84;TR=150;WE=64437414;WS=64437396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr7	64437648	rs10949955	G	A	1963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=35;PP=1083;SC=GGTCTGTAAGGTTTGAAGATC;SOR=0.927;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=30;TCR=35;TR=65;WE=64437656;WS=64437638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr7	64438403	rs4718175	G	A	2156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=25;PP=1524;SC=TGTTTAGTAAGGGTTGAGAAA;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=71;TCF=46;TCR=25;TR=70;WE=64438411;WS=64438393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr7	64438667	rs1404453	G	A	7717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=142;NR=121;PP=2965;SC=GTTGAAGATCGGTTAAAGGCT;SOR=0.846;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=264;TCF=143;TCR=121;TR=263;WE=64438675;WS=64438657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,278:1.00:278
chr7	64439613	rs3807068	T	G	2667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=49;PP=1869;SC=TGCGACATTCTTTACATTTAA;SOR=0.976;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=40;TCR=49;TR=89;WE=64439621;WS=64439603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr7	64439701	rs3807069	C	T	3096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=65;NR=42;PP=1870;SC=ATATTTATTACATTGAAATAT;SOR=0.965;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=107;TCF=65;TCR=42;TR=107;WE=64439709;WS=64439691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr7	64439938	rs1852016	C	T	1713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=38;PP=1106;SC=AAGTAACAAACTACTTCACTT;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=17;TCR=38;TR=55;WE=64439946;WS=64439928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr7	64451558	rs11771269	G	A	9225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=350;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=195;NR=132;PP=2965;SC=TCCAAGGGATGAGAACCAACC;SOR=1.130;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=327;TCF=195;TCR=132;TR=327;WE=64451566;WS=64451548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,348:1.00:348
chr7	64451656	rs4718177	G	A	11703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=438;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=192;NR=214;PP=2965;SC=TTTCTTTGATGACCTTTCCTT;SOR=0.835;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=406;TCF=192;TCR=214;TR=406;WE=64451664;WS=64451644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,435:1.00:435
chr7	64451699	rs4717229	T	C	8062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=109;NR=148;PP=2965;SC=GTTAGTAAGGTTGAACTTTCC;SOR=1.098;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=259;TCF=110;TCR=149;TR=257;WE=64451707;WS=64451689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,278:1.00:278
chr7	64451963	rs4618579	T	C	7464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=136;NR=120;PP=2965;SC=AGGCCATTCATTGTCCTTCCA;SOR=0.767;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=256;TCF=136;TCR=120;TR=256;WE=64451971;WS=64451953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,278:1.00:278
chr7	64452698	rs71539632	T	C	1039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.582;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=19;PP=753;ReadPosRankSum=-1.008;SC=GATATATAGATAGACATAGGC;SOR=0.765;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=180;TCF=111;TCR=69;TR=53;WE=64452706;WS=64452688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,58:0.29:200
chr7	64453136	rs6460219	G	A	5593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=101;NR=93;PP=2965;SC=TTCAAACCAGGTCCCAGGTGA;SOR=0.713;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=195;TCF=101;TCR=94;TR=194;WE=64453144;WS=64453126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr7	64498782	rs34438629	G	T	415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=6;PP=200;SC=GCGTGTCGGTGCCGCGGTGGG;SOR=0.804;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=8;TCR=6;TR=14;WE=64498790;WS=64498776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr7	64535312	rs71533998	C	T	69.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=23.09;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr7	64535417	rs1852024	T	C	1330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=13;PP=755;SC=CCAGCATGGGTTGTTCATCAC;SOR=1.345;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=30;TCR=13;TR=43;WE=64535425;WS=64535407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr7	64535529	rs5001356	C	T	1050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=20;PP=587;SC=TGGGGCCCTCCGCCCTGGCGG;SOR=1.329;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=14;TCR=20;TR=34;WE=64535537;WS=64535519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr7	64639920	rs73699606	C	T	2589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.443;HP=13;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=-0.443;NF=43;NR=105;PP=2383;ReadPosRankSum=0.864;SC=CCCTCACCCCCCCCCCCCCCG;SOR=0.393;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=161;TCF=46;TCR=115;TR=148;WE=64639928;WS=64639910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,115:0.97:118
chr7	64639965	rs113933022	G	A	1754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=53;PP=1495;SC=ACAGTATATCGGGCAGCACAG;SOR=6.556;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=56;TCF=2;TCR=54;TR=54;WE=64639973;WS=64639955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr7	64670116	rs141830477	C	T	3733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=59;PP=2272;SC=AATTATTTTACGTTTCTTTTC;SOR=0.722;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=72;TCR=59;TR=131;WE=64670124;WS=64670106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr7	64852790	.	TTG	T	582.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.285;ClippingRankSum=0.000;DP=194;ExcessHet=3.0103;FS=0.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.05;ReadPosRankSum=-1.226;SOR=0.602;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:157,34:0.18:191
chr7	65150816	.	AC	A	217.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.516;ClippingRankSum=0.000;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=3.633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.61;MQRankSum=-3.636;QD=3.16;ReadPosRankSum=0.241;SOR=1.619;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,19:0.28:69
chr7	65157864	rs2671990	T	C	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.480;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.383;NF=6;NR=28;PP=480;ReadPosRankSum=-2.009;SC=TTATTTTGCATGGGGTAGGGG;SOR=1.193;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=75;TCF=17;TCR=58;TR=34;WE=65157872;WS=65157854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,29:0.40:72
chr7	65220697	rs4718276	G	A	5957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=-1.025;NF=110;NR=100;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.011;SC=TCCAAGAATTGTCTGAACTTT;SOR=0.239;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=210;TCF=110;TCR=100;TR=210;WE=65220705;WS=65220687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,212:1.00:213
chr7	65229721	rs6966573	C	T	595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=15;PP=469;SC=CTGGGGAGGTCGCTCTCGGTG;SOR=3.056;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=19;WE=65229729;WS=65229711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr7	65425894	rs9530	A	G	4703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=59;PP=2877;SC=TCAAGTAAACAGGCTGTTTTC;SOR=1.198;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=167;TCF=107;TCR=60;TR=166;WE=65425902;WS=65425884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr7	65426054	.	CA	C	204.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.621;ClippingRankSum=0.000;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=2.250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=1.440;QD=4.45;ReadPosRankSum=1.876;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,19:0.41:46
chr7	65439879	rs781143	G	C	2397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=20;PP=1648;SC=AAGCAGCCCCGACAAGGACCC;SOR=2.084;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=55;TCR=20;TR=75;WE=65439887;WS=65439869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr7	65444359	rs139791587	T	TGA	1375.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=3;PP=1276;SC=TGGGCCCCGCTGAGAGGATCC;SOR=4.112;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=27;WE=65444367;WS=65444349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr7	65552230	rs60878697	CGT	C	276.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=1.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.46;ReadPosRankSum=1.418;SOR=1.152;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,19:0.31:62
chr7	65552879	rs149410743	G	A	3350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=75;PP=1959;ReadPosRankSum=-0.101;SC=CAGGCTGGTTGTGGTGATATT;SOR=0.698;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=213;TCF=99;TCR=114;TR=140;WE=65552887;WS=65552869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,154:0.66:232
chr7	65751460	rs4291144	T	A	3037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.62;SOR=1.631;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr7	65817333	rs709595	G	C	499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=0;PP=422;SC=TTCCCTCAGTGCTGCCCACTG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=65817341;WS=65817323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr7	65841981	rs6974355	A	G	1035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=14;PP=505;SC=GGCCTAGAGAAGCCTTCGGGA;SOR=0.793;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=18;TCR=14;TR=32;WE=65841989;WS=65841971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr7	65842128	rs11769079	G	A	726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=11;PP=397;SC=CGTGAGGCAGGCGGAAACGTG;SOR=0.765;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=13;TCR=11;TR=24;WE=65842136;WS=65842118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr7	65842221	rs11765965	A	G	739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=11;PP=542;SC=GGGCCGCCGGAAAGCCGAAGG;SOR=0.941;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=14;TCR=11;TR=25;WE=65842229;WS=65842211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr7	65842543	rs112115083	C	CAT	14043.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=38;NR=106;PP=2969;SC=ATCCAACACACGTGCTGTTCC;SOR=0.719;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=152;TCF=39;TCR=113;TR=144;WE=65842553;WS=65842533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,312:1.00:312
chr7	65842545	rs3815685	T	C	8161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.198;NF=101;NR=110;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.117;SC=CCAACACACGTGCTGTTCCTG;SOR=0.745;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=217;TCF=103;TCR=114;TR=211;WE=65842553;WS=65842533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,312:0.99:314
chr7	65904274	rs150544397	T	C	1647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.473;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.746;NF=38;NR=51;PP=1159;ReadPosRankSum=-0.858;SC=CTGGGAGCTTTTGCTTCCTGA;SOR=0.743;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=249;TCF=113;TCR=136;TR=89;WE=65904282;WS=65904264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,92:0.35:266
chr7	66147057	rs1882655	T	C	4303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=77;PP=2307;SC=CCGGAAGTGATGTTTGCGCGC;SOR=0.921;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=149;TCF=72;TCR=77;TR=149;WE=66147065;WS=66147047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr7	66147149	rs3800822	A	G	1707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=25;NR=27;PP=869;SC=GGACTGGGGAACCCAGACCTG;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=53;TCF=25;TCR=28;TR=52;WE=66147157;WS=66147139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr7	66147697	rs5884599	A	AG	4571.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.62;SOR=1.146;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr7	66416137	rs148803801	TTG	T	371.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=350;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.06;MQRankSum=3.831;QD=1.28;ReadPosRankSum=0.850;SOR=0.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:255,35:0.12:290
chr7	66459145	rs11763269	A	C	984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.803;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.245;NF=34;NR=10;PP=697;ReadPosRankSum=1.365;SC=TAATATATCTACAAATACGTT;SOR=0.480;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=108;TCF=85;TCR=23;TR=44;WE=66459153;WS=66459135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,47:0.39:122
chr7	66463195	rs145124227	A	AT	868.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FS=9.494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.08;MQRankSum=2.323;QD=3.97;ReadPosRankSum=-0.045;SOR=0.598;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:161,58:0.26:219
chr7	66520726	rs34783731	CA	C	67.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQRankSum=-2.172;QD=2.71;ReadPosRankSum=1.312;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr7	66532235	rs2711910	A	G	889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.884;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-13.512;NF=41;NR=12;PP=593;ReadPosRankSum=2.030;SC=GTGCTTTGACAATTTTATTCA;SOR=1.079;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=187;TCF=131;TCR=56;TR=53;WE=66532243;WS=66532225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,59:0.27:217
chr7	66785029	rs2537522	G	T	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=4.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.54;MQRankSum=-6.092;QD=2.03;ReadPosRankSum=0.457;SOR=1.238;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,26:0.18:141
chr7	66785137	rs9443	C	A	1797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=478;ExcessHet=3.0103;FS=1.300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQRankSum=-3.108;QD=3.78;ReadPosRankSum=2.686;SOR=0.689;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:359,117:0.25:476
chr7	70193932	rs4718987	T	A	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.662;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=2;PP=112;ReadPosRankSum=-0.671;SC=ATGTCTCCTCTCCTCCCAGTT;SOR=0.458;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=9;WE=70193940;WS=70193931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr7	70194024	rs4718988	G	A	1701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.786;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=22;PP=1025;ReadPosRankSum=0.974;SC=TAGCAGCCTGGGAGGAGCCAC;SOR=0.601;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=98;TCF=67;TCR=31;TR=64;WE=70194032;WS=70194014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,73:0.66:111
chr7	70229595	rs1983487	T	G	303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=8;NR=4;PP=210;SC=GAAAGTGTGCTCGTACAGGGA;SOR=1.445;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=12;WE=70229603;WS=70229585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr7	70229715	rs67892322	T	C	1985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.57;ReadPosRankSum=-1.633;SOR=0.807;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,91:0.81:113
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chr7	70233139	rs3750170	G	A	1793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=359;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.883;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=58;PP=1108;ReadPosRankSum=2.286;SC=ATGACTAGCAGCCTTCCTTAA;SOR=0.632;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=336;TCF=142;TCR=194;TR=103;WE=70233147;WS=70233129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:248,109:0.31:357
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chr7	70597675	rs6957446	T	C	788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.918;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=3;PP=517;ReadPosRankSum=-1.134;SC=GAGCAGGGGCTTGGATCCCTG;SOR=0.361;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=43;TCF=39;TCR=4;TR=27;WE=70597683;WS=70597665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,31:0.65:48
chr7	70598059	rs2903458	A	G	2742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=55;PP=1687;SC=CCGGGGCTCGACGCGGGCGGG;SOR=1.212;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=93;TCF=38;TCR=55;TR=93;WE=70598067;WS=70598049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr7	70765503	rs7806503	C	G	3062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.994;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=61;PP=1782;ReadPosRankSum=-0.335;SC=GTTATTTTCTCATCCTAATAA;SOR=0.539;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=174;TCF=81;TCR=93;TR=120;WE=70765511;WS=70765493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,132:0.70:188
chr7	70772565	rs55690472	A	G	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.197;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=131;ReadPosRankSum=0.287;SC=GCAATCGAGGAAGACTTCCTG;SOR=1.445;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=8;WE=70772573;WS=70772555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr7	70772801	rs4520056	C	G	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.249;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=36;ReadPosRankSum=-0.799;SC=TAGAATAGAACAATGCTTATG;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=5;WE=70772809;WS=70772791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr7	70800407	rs13240200	T	G	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.150;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=245;ReadPosRankSum=-1.413;SC=CTGAGTTGGATAAATTGAGGA;SOR=0.086;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=14;WE=70800415;WS=70800397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,15:0.38:39
chr7	70885883	rs11455717	C	CT	6901.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.601;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.07;MQRankSum=0.903;NF=49;NR=55;PP=2970;ReadPosRankSum=0.728;SC=GTCTATTTCTCTATGTTTCAG;SOR=0.808;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=168;TCF=74;TCR=94;TR=104;WE=70885891;WS=70885873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,209:0.71:293
chr7	70886107	rs11455716	G	GC	2221.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=43;PP=1930;SC=TGGCTGGTGAGCCTGGCGGCC;SOR=3.716;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=52;TCF=1;TCR=51;TR=44;WE=70886115;WS=70886097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr7	71036473	rs10277319	C	T	3593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=73;PP=2272;SC=ATTTAAAGCTCCTTACAGCTG;SOR=1.485;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=45;TCR=73;TR=118;WE=71036481;WS=71036463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr7	71135192	rs2302440	A	G	2513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=56;PP=1561;SC=CATTCATTCAATGAGTGGTTT;SOR=1.770;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=24;TCR=56;TR=80;WE=71135200;WS=71135182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr7	71176900	rs887584	G	A	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.829;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=46;ReadPosRankSum=-0.739;SC=TTTTCTCTTTGTCATTTTCTC;SOR=1.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=8;WE=71176908;WS=71176890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,9:0.24:37
chr7	71252958	.	C	T	791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.379;ClippingRankSum=0.000;DP=198;ExcessHet=3.0103;FS=2.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.00;ReadPosRankSum=0.281;SOR=0.535;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:144,54:0.27:198
chr7	71571436	rs10950296	G	C	1363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.31;SOR=2.059;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr7	72093957	rs28535321	A	G	2400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.323;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-12.064;NF=75;NR=61;PP=1932;ReadPosRankSum=-1.236;SC=TTTCACGAGCATCAGTCTGTA;SOR=1.042;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=291;TCF=156;TCR=135;TR=136;WE=72093965;WS=72093947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,123:0.42:290
chr7	72094075	rs2298399	C	A	1102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.162;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.048;NF=5;NR=37;PP=804;ReadPosRankSum=-0.274;SC=CCCAGAGAACCCAGGGCAGGC;SOR=1.460;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=66;TCF=10;TCR=56;TR=42;WE=72094083;WS=72094065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,44:0.63:70
chr7	72159820	.	AT	A	185.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.280;ClippingRankSum=0.000;DP=219;ExcessHet=3.0103;FS=1.671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQRankSum=-5.000;QD=1.01;ReadPosRankSum=0.182;SOR=0.876;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:151,32:0.17:183
chr7	72193864	rs3015858	T	C	10593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=424;ExcessHet=3.0103;FS=3.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQRankSum=-4.709;QD=24.99;ReadPosRankSum=-0.940;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:155,269:0.63:424
chr7	72193868	rs2960999	G	A	10524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=430;ExcessHet=3.0103;FS=2.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQRankSum=-4.287;QD=24.53;ReadPosRankSum=0.533;SOR=0.675;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:164,265:0.62:429
chr7	72209527	rs11354897	CA	C	12709.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=605;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.156;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.470;NF=35;NR=197;PP=2964;ReadPosRankSum=-0.497;SC=CGATGGCTCTCAATTCCATAG;SOR=0.617;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=350;TCF=53;TCR=297;TR=232;WE=72209535;WS=72209517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:205,395:0.66:600
chr7	72267637	rs200906243	C	CT	161.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-1.979;NF=0;NR=13;PP=157;ReadPosRankSum=0.815;SC=TCTCTAAATTCTTTTTTTTTT;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=13;WE=72267645;WS=72267627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr7	72277630	rs67852668	C	A	3558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.673;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=54;PP=2339;ReadPosRankSum=-0.156;SC=GGGGGAAAGCCTCAAGAGATG;SOR=0.835;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=228;TCF=143;TCR=85;TR=149;WE=72277638;WS=72277620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,157:0.65:243
chr7	72277981	rs2286317	T	C	4016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.903;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-11.700;NF=78;NR=103;PP=2314;ReadPosRankSum=-0.843;SC=GCTAAAAGCATGGTTCTCTAA;SOR=0.634;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=295;TCF=125;TCR=170;TR=181;WE=72277989;WS=72277971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,187:0.61:305
chr7	72280978	rs11281952	G	GTGTGTT	3133.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.402;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.351;NF=36;NR=9;PP=2594;ReadPosRankSum=0.981;SC=GTGTGTGCACGTGTGTGTGTG;SOR=1.515;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=91;TCF=70;TCR=21;TR=45;WE=72280986;WS=72280968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,68:0.59:116
chr7	72281355	rs35534997	C	T	602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.595;NF=1;NR=21;PP=465;ReadPosRankSum=0.887;SC=GAACAAAGGGCACCTTCATAA;SOR=1.418;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=22;WE=72281363;WS=72281345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,23:0.64:36
chr7	72304470	rs5884895	GT	G	2734.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.520;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.925;NF=4;NR=45;PP=1725;ReadPosRankSum=0.119;SC=ACTGATCAAGGTCATAGAAAG;SOR=0.810;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=169;TCF=21;TCR=148;TR=49;WE=72304478;WS=72304460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:203,91:0.31:294
chr7	72413443	rs62463429	G	A	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.82;MQRankSum=-4.629;QD=3.28;ReadPosRankSum=-0.365;SOR=0.750;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:122,35:0.22:157
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chr7	72416333	rs237934	C	G	1044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=24;PP=699;SC=TCTGAGGCCCCGTGAAGATCA;SOR=1.802;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=11;TCR=24;TR=35;WE=72416341;WS=72416323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr7	72418963	rs7056	T	C	853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FS=5.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQRankSum=-11.359;QD=2.89;ReadPosRankSum=1.167;SOR=0.824;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:230,65:0.22:295
chr7	72613683	.	TA	T	137.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.14;MQRankSum=-1.972;QD=2.75;ReadPosRankSum=2.038;SOR=0.792;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,13:0.26:50
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chr7	72711991	rs62465078	C	T	127.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.242;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.39;MQRankSum=-2.100;QD=15.97;ReadPosRankSum=-0.619;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr7	72712121	rs62465079	T	C	324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.64;QD=24.98;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr7	72714710	.	C	T	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.457;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.595;NF=4;NR=15;PP=344;ReadPosRankSum=1.759;SC=GCTCCTGGCCCTCTGAGGCCC;SOR=1.047;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=19;WE=72714718;WS=72714700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,20:0.80:25
chr7	72717933	rs11544043	C	T	2355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.163;NF=64;NR=30;PP=1542;ReadPosRankSum=-0.045;SC=GGAAAGTGAGCGCGTGGCACA;SOR=0.749;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=135;TCF=92;TCR=43;TR=94;WE=72717941;WS=72717923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,100:0.70:143
chr7	72727317	.	AC	A	8366.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=0.000;DP=416;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.141;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.724;NF=30;NR=112;PP=2974;ReadPosRankSum=-0.558;SC=CTTGCTGCCCACCACCACCTC;SOR=0.717;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=236;TCF=46;TCR=190;TR=142;WE=72727325;WS=72727307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,259:0.63:411
chr7	72738350	rs55963844	C	CG	2628.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=17;NR=19;PP=1461;SC=CTGGTCCCCGCGGCCTCTCCA;SOR=1.091;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=38;TCF=17;TCR=21;TR=36;WE=72738358;WS=72738340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr7	72738749	rs28626137	A	G	7175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=94;PP=2912;SC=CACTGAAGCCAGTCCTCCAGC;SOR=1.254;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=156;TCF=62;TCR=94;TR=156;WE=72738771;WS=72738739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr7	72738762	rs6980258	CA	TG	3937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.665;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.787;NF=35;NR=80;PP=2947;ReadPosRankSum=1.567;SC=CCTCCAGCTCCAGCAGGCTCA;SOR=1.695;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=123;TCF=38;TCR=85;TR=115;WE=72738771;WS=72738739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,141:0.99:143
chr7	72750627	rs4717751	G	A	693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=2;PP=512;SC=TTTACAGCATGGGAATAGGCA;SOR=3.442;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=72750635;WS=72750617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr7	72907332	rs143954140	C	T	187.88	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5339;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=4;PP=62;ReadPosRankSum=1.795;SC=CTTAACTGAACGTCTGCTCTT;SOR=1.402;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=9;TCF=4;TCR=5;TR=7;WE=72907340;WS=72907322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr7	72968002	rs3216224	CA	C	137.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=3.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.12;ReadPosRankSum=1.711;SOR=0.264;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,16:0.25:65
chr7	72992858	rs76029572	C	G	1851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.722;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=42;PP=1149;ReadPosRankSum=-0.309;SC=CCCATGAGCTCCGACATCTGC;SOR=0.710;Source=Platypus;TCF=135;TR=86;WE=72992866;WS=72992848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,98:0.35:281
chr7	73014149	rs72649015	G	A	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=239;ReadPosRankSum=-1.137;SC=CGGGCAGAGGGTGGGGGTCCC;SOR=0.821;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=52;TCF=16;TCR=36;TR=18;WE=73014157;WS=73014139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,20:0.36:55
chr7	73020301	rs799157	T	C	1079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=467;ExcessHet=3.0103;FS=1.408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.31;ReadPosRankSum=1.560;SOR=0.575;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:371,96:0.21:467
chr7	73038472	rs370239468	AC	A	62.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=1.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.61;ReadPosRankSum=-0.334;SOR=1.238;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,6:0.25:24
chr7	73096993	rs8891	T	C	1203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.563;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=14;PP=865;ReadPosRankSum=0.545;SC=AGACTATCAATGGCCAAGGGT;SOR=1.117;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=143;TCF=105;TCR=38;TR=58;WE=73097001;WS=73096983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,57:0.38:149
chr7	73097654	rs1128349	C	T	2309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=354;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.414;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=71;PP=1504;ReadPosRankSum=-0.631;SC=GTCCTCGCTCCTAGGCCCAGG;SOR=0.730;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=327;TCF=129;TCR=198;TR=116;WE=73097662;WS=73097644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:229,124:0.35:353
chr7	73097720	rs28494095	G	C	2216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.710;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=51;PP=1399;ReadPosRankSum=1.533;SC=CAAGGTAACAGCCGCTGCCAC;SOR=0.336;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=134;TCF=51;TCR=83;TR=88;WE=73097728;WS=73097710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,98:0.65:150
chr7	73108407	.	G	A	1044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=0.000;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.243;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=34;PP=603;ReadPosRankSum=-0.429;SC=AGCCTGCCCCGGCTGCAGCGG;SOR=0.816;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=181;TCF=71;TCR=110;TR=54;WE=73108415;WS=73108397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,60:0.30:202
chr7	73112057	rs369894399	TG	T	7817.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=99;PP=2975;SC=GCAGGGTGGGTGGGGGGTGGA;SOR=0.742;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=153;TCF=40;TCR=113;TR=131;WE=73112065;WS=73112047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr7	73115201	rs41271241	G	A	6489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=407;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.580;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=157;PP=2962;ReadPosRankSum=0.122;SC=GAGCTCCAGAGGGCCCCCTCC;SOR=0.633;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=381;TCF=151;TCR=230;TR=261;WE=73115209;WS=73115191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,283:0.70:406
chr7	73118033	rs35459363	G	A	825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=21;PP=480;ReadPosRankSum=1.341;SC=GGTCATGGACGTAGGGAACAT;SOR=0.686;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=175;TCF=96;TCR=79;TR=49;WE=73118041;WS=73118023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,53:0.28:190
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chr7	73122923	rs2228607	A	G	1164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.233;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=20;PP=743;ReadPosRankSum=0.046;SC=ACTCACTCTCATCGGGGTTGG;SOR=0.841;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=179;TCF=116;TCR=63;TR=60;WE=73122931;WS=73122913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,65:0.34:191
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chr7	73151220	rs2293484	G	C	1146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.956;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=18;PP=659;ReadPosRankSum=-0.614;SC=GGGCCTGGGCGAGTAAAGCAT;SOR=0.429;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=165;TCF=114;TCR=51;TR=52;WE=73151228;WS=73151210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,62:0.35:178
chr7	73151644	rs6460052	A	G	10449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=390;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=184;NR=188;PP=2965;SC=TGGCTGCCACATAGGTTGCAA;SOR=0.724;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=372;TCF=184;TCR=188;TR=372;WE=73151652;WS=73151634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,390:1.00:390
chr7	73152578	rs367606949	AC	A	3428.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=40;PP=2359;SC=GAGAAGCGGGACCCCCCCTGC;SOR=1.209;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=103;TCF=53;TCR=50;TR=85;WE=73152586;WS=73152568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr7	73153228	rs3812318	G	T	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=22;PP=497;ReadPosRankSum=0.047;SC=CTTGAGCCCCGCCCTCTCCCC;SOR=0.412;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=26;WE=73153236;WS=73153218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,28:0.82:34
chr7	73184435	rs7084	G	C	1932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.733;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=53;PP=1073;ReadPosRankSum=0.894;SC=GGAGACGAGGGGCCGGGGCCG;SOR=0.416;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=118;TCF=40;TCR=78;TR=83;WE=73184443;WS=73184425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,91:0.70:130
chr7	73243786	rs4717822	T	G	8545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=135;NR=164;PP=2965;SC=CCCAGCATGGTTGGGAAGAGA;SOR=0.934;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=299;TCF=135;TCR=164;TR=299;WE=73243794;WS=73243776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,312:1.00:312
chr7	73245519	rs8629	T	C	7162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=128;NR=111;PP=2965;SC=TCAACTCCCGTGGACGCTGAA;SOR=0.745;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=239;TCF=128;TCR=111;TR=239;WE=73245527;WS=73245509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,273:1.00:273
chr7	73249165	rs13246460	T	A	9716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=361;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=155;NR=177;PP=2965;ReadPosRankSum=1.733;SC=GGATACCACCTCCAGCTCGGA;SOR=0.299;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=333;TCF=155;TCR=178;TR=332;WE=73249173;WS=73249155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,360:1.00:361
chr7	73249299	rs13232463	G	C	2870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=36;NR=50;PP=1779;SC=AAGGTTGGACGAGTTGGTCCT;SOR=1.261;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=86;TCF=36;TCR=50;TR=86;WE=73249307;WS=73249289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr7	73254812	rs13241921	T	C	3851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=61;NR=71;PP=1937;SC=GCCGGGGGCCTGGGCCTGTTC;SOR=1.003;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=61;TCR=71;TR=132;WE=73254820;WS=73254802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr7	73254910	rs13242043	T	A	768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=20;PP=570;SC=TCAGTCATGGTTCACACCTGC;SOR=1.781;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=28;WE=73254918;WS=73254900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr7	73255647	rs4717823	G	C	2413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=58;PP=1420;SC=AAGCCTGGCTGGGGCTAGCGT;SOR=1.847;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=27;TCR=58;TR=85;WE=73255655;WS=73255637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr7	73275396	rs4324825	G	A	602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=4;PP=425;SC=GCAGTGGAGCGGCAGGAGCCA;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=73275404;WS=73275386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr7	73275434	.	A	G	944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.340;ClippingRankSum=0.000;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.078;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=9;PP=552;ReadPosRankSum=0.114;SC=ACTGGCGGCAACCGGGTCCCC;SOR=0.882;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=56;TCF=40;TCR=16;TR=36;WE=73275442;WS=73275424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,40:0.66:61
chr7	73275501	rs11770024	T	C	3589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=70;NR=54;PP=1861;SC=TTCTCCCAGCTGGAGTAGGTG;SOR=0.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=124;TCF=70;TCR=54;TR=124;WE=73275509;WS=73275491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr7	73275565	rs11770052	T	A	4317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=77;NR=70;PP=2340;SC=CTTTTGGGGATCCTGTTGCAG;SOR=0.769;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=148;TCF=77;TCR=71;TR=147;WE=73275573;WS=73275555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr7	73275769	rs11767129	C	T	515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=9;PP=283;SC=AACTACAGTGCTGACATTTTC;SOR=0.892;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=9;TCR=9;TR=18;WE=73275777;WS=73275759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr7	73279482	rs13227841	T	C	5585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=114;PP=2965;SC=CCAGGCTCTCTGGGCTGGGCT;SOR=1.103;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=196;TCF=81;TCR=115;TR=194;WE=73279490;WS=73279472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr7	73280020	rs1136647	C	T	7307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=118;NR=120;PP=2965;SC=ATCTCATCACCTGGACCACCT;SOR=0.887;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=238;TCF=118;TCR=120;TR=238;WE=73280028;WS=73280010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,268:1.00:268
chr7	73462625	.	C	G	937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.854;ClippingRankSum=0.000;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.358;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=30;PP=713;ReadPosRankSum=-0.130;SC=CTGAAAGCAGCAGCCCACCCT;SOR=0.867;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=164;TCF=68;TCR=96;TR=47;WE=73462633;WS=73462615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,49:0.28:176
chr7	73467650	.	CTGTG	C	127	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=17;MQ=60.54;NF=0;NR=4;PP=127;QD=32.5;SC=GTGAGCTGGGCTGTGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=4;WE=73467661;WS=73467640;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:10,4:0.29:14
chr7	73469169	rs2239691	C	T	1490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=41;PP=1217;SC=AAGGACCCTCCTCTACTTGCC;SOR=3.080;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=8;TCR=41;TR=49;WE=73469177;WS=73469159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr7	73470714	rs2071307	G	A	4489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=82;PP=2774;ReadPosRankSum=-0.840;SC=AGGTGTCCCTGGTGTCGGAGG;SOR=0.979;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=75;TCR=83;TR=156;WE=73470722;WS=73470704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,172:0.99:174
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chr7	73787153	.	CCT	C	162.19	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=65;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GATGACGCCTCCTCTCTCTCT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=3;WE=73787162;WS=73787152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
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chr7	73803303	rs7790414	C	T	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.691;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=160;ReadPosRankSum=1.190;SC=ACCGTCAAAACTATGCAGTGG;SOR=0.115;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=12;WE=73803311;WS=73803293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,12:0.36:33
chr7	73803644	rs35415684	T	A	857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=24;PP=648;SC=CCCTTGCTCCTCTTCTTGACA;SOR=3.334;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=28;WE=73803652;WS=73803634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr7	73814749	rs2522943	G	C	13011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=495;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=208;NR=250;PP=2965;SC=CTCATCGACCGGTCCTCGGCG;SOR=0.950;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=458;TCF=208;TCR=250;TR=458;WE=73814757;WS=73814739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,495:1.00:495
chr7	73818404	rs2240436	C	T	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.177;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=178;ReadPosRankSum=1.605;SC=GGTACAGCCCCGGCCTGACCC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=9;WE=73818412;WS=73818394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
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chr7	74167356	rs116428284	A	T	637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=6.623;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.41;MQRankSum=-1.889;QD=16.78;ReadPosRankSum=1.440;SOR=0.493;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,36:0.95:38
chr7	74167490	rs373607978	C	T	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=6.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.04;MQRankSum=0.503;QD=14.07;ReadPosRankSum=-0.766;SOR=0.072;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr7	74193668	rs17295741	G	A	2332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.01;MQRankSum=-3.599;QD=19.28;ReadPosRankSum=3.111;SOR=0.648;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,97:0.80:121
chr7	74197598	.	T	A	749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.70;QD=28.84;SOR=3.098;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr7	74251390	rs200184967	A	C	1051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.60;QD=24.46;SOR=1.055;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr7	74470190	rs200459061	C	A	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.00;MQRankSum=0.000;QD=16.27;ReadPosRankSum=-1.912;SOR=1.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr7	74489486	rs6955671	T	C	1991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.866;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=58;PP=1207;ReadPosRankSum=-1.102;SC=CGGGAGCGCCTGGCCGCCGTC;SOR=1.280;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=131;TCF=48;TCR=83;TR=84;WE=74489494;WS=74489476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,92:0.63:145
chr7	74524986	rs142604065	G	A	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.79;MQRankSum=-2.506;QD=15.03;ReadPosRankSum=-1.377;SOR=1.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr7	74608740	.	CT	C	260.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.655;ClippingRankSum=0.000;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=2.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.17;MQRankSum=-4.164;QD=2.80;ReadPosRankSum=1.466;SOR=0.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,32:0.34:93
chr7	75034416	rs375498048	C	A	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.26;MQRankSum=-5.296;QD=5.42;ReadPosRankSum=0.075;SOR=0.534;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,17:0.31:54
chr7	75039300	rs112848269	C	T	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.63;BaseQRankSum=-2.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.259;NF=11;NR=0;PP=201;ReadPosRankSum=0.127;SC=CATATATATACACACACACAT;SOR=0.990;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=11;WE=75039308;WS=75039290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
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chr7	75044463	rs71245954	G	A	1553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.153;HP=6;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.941;NF=42;NR=28;PP=897;ReadPosRankSum=-0.095;SC=TGCCTGTGCCGCCCCAGGCAA;SOR=0.632;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=110;TCF=59;TCR=51;TR=70;WE=75044471;WS=75044453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,73:0.64:114
chr7	75044830	rs236651	G	A	1173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=6.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=54.711;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-10.588;NF=61;NR=17;PP=1408;ReadPosRankSum=-3.483;SC=TAGCTGCTCCGTGCATGCTCA;SOR=3.607;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=189;TCF=123;TCR=66;TR=78;WE=75044838;WS=75044820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,58:0.33:176
chr7	75045496	rs201842651	AG	A	805.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.361;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-10.138;NF=1;NR=30;PP=406;ReadPosRankSum=0.000;SC=AGGGTCGTGGAGGGGGGGGAT;SOR=1.536;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=92;TCF=12;TCR=80;TR=31;WE=75045504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,41:0.30:137
chr7	75048564	rs71560447	A	G	1899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.923;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.779;NF=54;NR=32;PP=1197;ReadPosRankSum=-1.038;SC=ACCTCTCCTCAGACAGACGAG;SOR=0.374;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=122;TCF=81;TCR=41;TR=86;WE=75048572;WS=75048554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,90:0.70:129
chr7	75048750	rs6465926	G	A	1413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.963;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.362;NF=22;NR=37;PP=919;ReadPosRankSum=1.091;SC=ACAGAGAGCTGGCCAGTGAGC;SOR=0.912;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=31;TCR=52;TR=59;WE=75048758;WS=75048740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,60:0.71:84
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chr7	75176196	rs1167800	G	A	879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=6;PP=663;ReadPosRankSum=0.293;SC=GTCTGTCACCGATGCCTCCTC;SOR=0.498;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=52;TCF=44;TCR=8;TR=35;WE=75176204;WS=75176186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,35:0.67:52
chr7	75176300	rs1167801	T	C	5435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=361;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.758;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=121;NR=113;PP=2962;ReadPosRankSum=0.825;SC=CCTGAATAGCTTGCATGAGGC;SOR=0.436;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=341;TCF=183;TCR=158;TR=234;WE=75176308;WS=75176290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,248:0.69:361
chr7	75176385	rs1167802	A	C	4382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.587;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=106;PP=2824;ReadPosRankSum=-1.261;SC=GATCAATGAAAACGACGGTTC;SOR=0.847;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=292;TCF=128;TCR=164;TR=186;WE=75176393;WS=75176375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,198:0.64:308
chr7	75182802	rs117129747	C	T	3941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.406;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=96;PP=2523;ReadPosRankSum=-2.525;SC=GCTGTGCTGTCGGCATTCTCA;SOR=0.590;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=280;TCF=121;TCR=159;TR=171;WE=75182810;WS=75182792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,181:0.60:304
chr7	75183403	rs1167807	A	G	1238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.970;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=18;PP=892;ReadPosRankSum=-0.641;SC=CTCATGCCCCAGTACTCACAG;SOR=0.926;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=80;TCF=53;TCR=27;TR=55;WE=75183411;WS=75183393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,56:0.68:82
chr7	75185985	rs794368	A	G	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.299;HP=2;HapScore=4;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=120;ReadPosRankSum=0.259;SC=AGAAGACTCTATCTCCAAAAA;SOR=0.223;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=10;WE=75185998;WS=75185975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr7	75210763	rs237239	TG	CA	826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=17;PP=945;SC=GTCTTAGCCTTGTGGGTATTA;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=75210772;WS=75210753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr7	75216202	rs1167787	A	G	3536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=55;NR=68;PP=2136;SC=CATAACAGTCAAGAGATCTGC;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=123;TCF=55;TCR=68;TR=123;WE=75216210;WS=75216192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr7	75228483	rs41281695	G	A	4036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.195;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.94;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=71;PP=2388;ReadPosRankSum=-0.737;SC=GGTCTTCCAAGCAACATCCAA;SOR=0.868;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=262;TCF=152;TCR=110;TR=175;WE=75228491;WS=75228473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,183:0.67:272
chr7	75441108	rs11465315	C	T	2537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FS=1.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.26;ReadPosRankSum=-2.186;SOR=0.540;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:137,70:0.34:207
chr7	75441111	rs11465314	G	T	2534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FS=2.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.79;ReadPosRankSum=-1.933;SOR=0.511;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:142,73:0.34:215
chr7	75442587	rs3815261	A	G	1653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=15;PP=985;SC=ACCTGCCCCCACCCCTCTCCT;SOR=1.802;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=40;TCR=15;TR=55;WE=75442595;WS=75442577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr7	75442730	rs2302006	T	G	6032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=101;NR=109;PP=2965;SC=GGAGAGGGGATGACCACAGAG;SOR=0.918;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=210;TCF=101;TCR=109;TR=210;WE=75442738;WS=75442720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr7	75442759	rs2302005	G	A	3783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=78;PP=2335;SC=AGGAGAGAGAGAAGAGCCACG;SOR=1.296;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=51;TCR=78;TR=129;WE=75442767;WS=75442749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr7	75442855	rs2302004	A	G	931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=10;PP=756;SC=TCACTGGGCCACCCTTTCCCC;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=24;TCR=10;TR=34;WE=75442863;WS=75442845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr7	75510561	rs7807392	G	A	885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=2;PP=689;SC=GTTTACCTGTGAGATCGGATA;SOR=5.353;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=29;WE=75510569;WS=75510551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr7	75511134	rs10255642	A	G	3317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=69;NR=38;PP=2031;SC=CTCTAACCCGACTCCCTCTGC;SOR=1.169;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=69;TCR=38;TR=107;WE=75511142;WS=75511124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr7	75511667	rs77273947	C	T	3005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=72;PP=2021;SC=TTTTTCGAAACAGAGTCTCTG;SOR=2.215;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=26;TCR=72;TR=98;WE=75511675;WS=75511657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr7	75513062	rs42183	A	G	10159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=387;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=204;NR=163;PP=2965;SC=AGCGAGTGGCACTGAAGCTCG;SOR=0.940;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=367;TCF=204;TCR=163;TR=367;WE=75513070;WS=75513052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,387:1.00:387
chr7	75513216	rs4728517	T	A	2264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.90;SOR=4.205;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr7	75544455	rs3823884	A	C	3495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=70;NR=49;PP=1730;SC=TGTGGGCCTGAGCCCTGCCCA;SOR=0.902;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=70;TCR=49;TR=119;WE=75544463;WS=75544445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr7	75597545	rs10954724	C	T	775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=15;PP=423;SC=TTCCTCCTGGCGGGGACCTGC;SOR=1.329;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=10;TCR=15;TR=25;WE=75597553;WS=75597535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr7	75609677	rs1135612	A	G	2029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=426;ExcessHet=3.0103;FS=1.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.79;ReadPosRankSum=-0.778;SOR=0.555;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:297,127:0.30:424
chr7	75610763	rs2286819	G	A	3827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=37;PP=2171;SC=GGGTCGGGGCGTGCCTGGCAC;SOR=1.510;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=85;TCR=37;TR=122;WE=75610771;WS=75610753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr7	75610963	rs370164104	G	A	1662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=46;PP=1112;ReadPosRankSum=0.484;SC=TGGCCTGGGCGGGTCCTGTGC;SOR=0.721;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=30;TCR=70;TR=66;WE=75610971;WS=75610953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,70:0.67:105
chr7	75612770	rs13223707	C	G	2889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=12;PP=1505;SC=CAACCAGAAGCGTCCTTGGAG;SOR=2.869;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=52;TCR=12;TR=64;WE=75612791;WS=75612760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr7	75612783	rs13240147	G	A	3337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=16;PP=1801;SC=CCTTGGAGACGGAGACTCAGA;SOR=2.542;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=66;TCR=16;TR=82;WE=75612791;WS=75612760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr7	75613998	rs4732514	C	T	1031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=5;PP=655;SC=CACCTGTTGCCGCAGAGCTGG;SOR=2.649;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=31;WE=75614006;WS=75613988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr7	75614029	rs4732515	T	C	2238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=14;PP=1440;SC=CACCCCCTCCTGCCGCAGCCA;SOR=2.272;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=71;TCF=56;TCR=15;TR=70;WE=75614037;WS=75614019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr7	75614082	rs4732516	C	G	7003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=156;NR=85;PP=2965;SC=TCCTGCCTGTCTCTTCCCTGC;SOR=1.367;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=242;TCF=157;TCR=85;TR=241;WE=75614090;WS=75614072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr7	75614288	rs2286822	C	T	19779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=452;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.86;SOR=0.743;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,451:1.00:451
chr7	75614296	rs2286823	G	A	19670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=454;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.52;SOR=0.702;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,452:1.00:452
chr7	75614863	rs2302431	TG	CT	6684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=85;NR=42;PP=2947;SC=AGGGCCTCGGTGTGGCGGTGG;SOR=1.273;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=137;TCF=89;TCR=48;TR=127;WE=75614872;WS=75614853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr7	75614953	rs2228104	T	C	7385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=140;NR=122;PP=2965;SC=AGACCAAGGCTGGCCGCATCA;SOR=0.790;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=262;TCF=140;TCR=122;TR=262;WE=75614961;WS=75614943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,279:1.00:279
chr7	75616817	rs201142190	GGACA	G	11742.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQ=60.87;NF=29;NR=115;PP=2979;SC=CGCAGAGGACGGACAGACAGA;SOR=0.754;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=160;TCF=32;TCR=128;TR=144;WE=75616828;WS=75616807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,270:1.00:270
chr7	75617223	rs147613710	G	A	7775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=498;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.190;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=173;NR=147;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.124;SC=GCTCAGCACAGACATCTGGGA;SOR=0.824;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=467;TCF=250;TCR=217;TR=320;WE=75617231;WS=75617213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,337:0.68:497
chr7	75621661	rs2286826	G	C	1329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=26;PP=965;SC=AGGGCAAACAGGGCCCAGAGA;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=19;TCR=26;TR=45;WE=75621669;WS=75621651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr7	75621827	rs4732519	A	G	2504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=39;PP=1446;SC=CAATTGTTCTAAAGTTTGGTC;SOR=0.804;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=42;TCR=39;TR=81;WE=75621835;WS=75621817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr7	75621979	rs6467956	T	C	351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=8;PP=208;SC=CTGGGAGGGTTTCGCTCAGCG;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=75621987;WS=75621969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr7	75628461	rs4728538	A	T	1139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=12;PP=562;SC=GTCTCAAAAAAAAATAAATAA;SOR=1.402;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=38;TCF=26;TCR=12;TR=37;WE=75628469;WS=75628451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr7	75629778	rs3801472	T	C	9540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=361;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=156;NR=177;PP=2965;SC=AGTTAGGAGCTCCGAGTTCCG;SOR=0.879;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=333;TCF=156;TCR=177;TR=333;WE=75629786;WS=75629768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,361:1.00:361
chr7	75630274	rs8565	T	C	11233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=414;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=223;NR=166;PP=2965;SC=GGCTGATACCTTGGGTGGAAA;SOR=1.000;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=392;TCF=225;TCR=167;TR=389;WE=75630283;WS=75630264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,414:1.00:414
chr7	75633209	rs2058389	T	C	5462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=114;PP=2965;SC=TCAGGTGGAATGCAGAATGCA;SOR=1.079;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=199;TCF=85;TCR=114;TR=199;WE=75633217;WS=75633199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr7	75634687	rs1044484	G	A	1588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.460;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=45;PP=972;ReadPosRankSum=-0.530;SC=TCCCTGGCACGATTTCAATGG;SOR=0.642;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=277;TCF=132;TCR=145;TR=87;WE=75634695;WS=75634677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:198,92:0.32:290
chr7	75643313	rs7798794	C	T	2275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=45;PP=1386;SC=TATTTATTTTCTGAGACAGAG;SOR=1.387;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=29;TCR=45;TR=74;WE=75643321;WS=75643303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr7	75651115	rs140385731	A	G	1647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.587;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=23;PP=1159;ReadPosRankSum=0.345;SC=TCCTATAACAAATTTGTTCAA;SOR=0.758;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=168;TCF=116;TCR=52;TR=72;WE=75651123;WS=75651105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,77:0.42:184
chr7	75658197	rs13240967	C	T	1516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=37;PP=1056;SC=AACCCCAGCACTTTGGAAGGC;SOR=4.849;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=40;TCF=3;TCR=37;TR=40;WE=75658205;WS=75658187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr7	75659815	rs1044483	T	C	6978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=105;NR=142;PP=2965;SC=AAAGCTCTGTTGGTTCACATA;SOR=1.102;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=247;TCF=105;TCR=142;TR=247;WE=75659823;WS=75659805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
chr7	75677430	rs10231092	C	G	6165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=109;NR=86;PP=2965;SC=AGTCACTTCCCCGTCACCAGC;SOR=0.728;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=195;TCF=109;TCR=86;TR=195;WE=75677438;WS=75677420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr7	75694345	rs3214335	TC	T	2723.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=58;PP=2386;SC=TCAGGAGCTCTCCCTGGCCCT;SOR=3.145;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=63;TCF=1;TCR=62;TR=59;WE=75694353;WS=75694335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr7	75877354	rs1859795	A	G	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.904;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=106;ReadPosRankSum=-0.536;SC=AGTGCTGAAGACCTGGCTTGA;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=7;WE=75877362;WS=75877349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr7	75889151	rs150272766	G	GC	519.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=491;ReadPosRankSum=-1.657;SC=GCTAGGTCAGGCCCCCTGCGC;SOR=1.179;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=15;WE=75889159;WS=75889143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,20:0.77:26
chr7	75889184	rs6950229	T	C	958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=9;PP=622;ReadPosRankSum=0.706;SC=TGAAGAAAAGTCGTCCCGAGA;SOR=0.787;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=43;TCR=14;TR=36;WE=75889192;WS=75889174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,39:0.65:60
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chr7	75896852	.	T	TGGGGGC	56	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000;HP=5;HapScore=4;MGOF=15;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=1;NR=0;PP=56;QD=73.0;SC=AAGTGTGGCATGGGGGCGGGG;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=1;WE=75896866;WS=75896842;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,1:0.14:7
chr7	75914934	rs75544239	G	GC	2333.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=20;PP=1596;SC=TCCCGGCAGCGCCGCAAGCGT;SOR=1.376;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=43;TCF=22;TCR=21;TR=38;WE=75914942;WS=75914924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr7	75959188	rs2072435	G	A	7616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=532;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.527;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=153;NR=152;PP=2962;ReadPosRankSum=0.703;SC=AGGCCTTCTCGGAGGACTCCA;SOR=0.523;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=491;TCF=236;TCR=255;TR=305;WE=75959196;WS=75959178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:199,331:0.62:530
chr7	76019746	rs55920832	C	G	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.600;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.256;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=78;ReadPosRankSum=-1.442;SC=AGGCCACTCCCAAGCTAGGTC;SOR=0.105;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=7;WE=76019754;WS=76019736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr7	76023029	rs10261314	T	C	1273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.170;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=32;PP=811;ReadPosRankSum=-1.307;SC=GTCGCAGCCGTCCACCTGCGG;SOR=0.626;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=187;TCF=100;TCR=87;TR=62;WE=76023037;WS=76023019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,71:0.34:210
chr7	76023088	rs140509712	C	CG	8393.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=46;NR=77;PP=2973;SC=TGCCGGCTCCCGGCAGAGCCC;SOR=0.754;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=131;TCF=47;TCR=84;TR=123;WE=76023096;WS=76023078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr7	76023131	rs35508921	A	AG	9744.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=94;PP=2936;SC=CCGCAGACCCAGGCACCGCCA;SOR=0.738;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=135;TCF=37;TCR=98;TR=127;WE=76023139;WS=76023121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,274:1.00:274
chr7	76024520	rs2286427	C	T	1020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=24;PP=662;ReadPosRankSum=0.896;SC=AGTTCCCAGCCGCACCCACCA;SOR=0.674;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=128;TCF=76;TCR=52;TR=55;WE=76024528;WS=76024510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,55:0.40:136
chr7	76027235	rs6963070	T	C	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=1.568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.13;ReadPosRankSum=0.374;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,10:0.23:44
chr7	76027901	rs113567515	T	C	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=2.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.10;ReadPosRankSum=-1.153;SOR=0.432;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,29:0.43:68
chr7	76027912	rs112701136	A	G	614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=10;PP=652;ReadPosRankSum=-1.481;SC=GTGAGCCACCATGCCCAGCCA;SOR=0.669;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=66;TCF=44;TCR=22;TR=28;WE=76027920;WS=76027891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,34:0.43:79
chr7	76028163	rs75640836	C	T	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.425;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=198;ReadPosRankSum=-0.100;SC=TCTCCATCCTCACACCACGGG;SOR=1.123;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=40;TCF=13;TCR=27;TR=12;WE=76028171;WS=76028153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,13:0.30:43
chr7	76033544	rs11773646	T	C	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=93;ReadPosRankSum=1.412;SC=TTCACAACCCTCCTCCTACTA;SOR=0.635;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=6;WE=76033552;WS=76033543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr7	76033805	rs11773653	A	T	866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=24;PP=435;ReadPosRankSum=0.983;SC=CGCCAGGGAGAAGTCACAGTT;SOR=0.634;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=122;TCF=51;TCR=71;TR=43;WE=76033813;WS=76033795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,49:0.36:137
chr7	76033906	rs11760779	T	C	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.67;ReadPosRankSum=-1.033;SOR=1.214;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,4:0.21:19
chr7	76054372	rs2286428	G	A	2246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=443;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=59;PP=1474;ReadPosRankSum=-0.442;SC=CTTGCAGGGTGGAGCCAGCCA;SOR=0.702;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=416;TCF=229;TCR=187;TR=130;WE=76054380;WS=76054356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:308,135:0.30:443
chr7	76058743	rs149882331	T	C	1153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.770;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=12;PP=727;ReadPosRankSum=2.045;SC=TGTCCCCTTGTGGGCTGCCCT;SOR=1.204;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=129;TCF=91;TCR=38;TR=52;WE=76058751;WS=76058733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,55:0.40:138
chr7	76058767	rs6465128	G	T	1695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.067;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=30;PP=936;ReadPosRankSum=0.976;SC=TGAGCACTCAGGTATGGCTTG;SOR=0.797;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=220;TCF=138;TCR=82;TR=87;WE=76058775;WS=76058757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,91:0.39:233
chr7	76062441	.	T	TTTGGTTTTGG	246.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=-0.000;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.94;MQRankSum=-0.000;QD=11.22;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr7	76069629	rs73363163	G	A	1213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=363;ExcessHet=3.0103;FS=2.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.67;MQRankSum=-0.844;QD=3.35;ReadPosRankSum=-0.423;SOR=0.897;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:279,83:0.23:362
chr7	76069811	rs2906999	T	C	1732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=486;ExcessHet=3.0103;FS=3.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.00;MQRankSum=-11.402;QD=3.57;ReadPosRankSum=0.750;SOR=1.030;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:379,107:0.22:486
chr7	76071003	rs78087397	C	G	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.250;NF=10;NR=2;PP=160;ReadPosRankSum=-0.241;SC=TCACACCTGGCCGAGAAAGCT;SOR=0.653;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=42;TCF=35;TCR=7;TR=12;WE=76071011;WS=76070993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,13:0.31:42
chr7	76111938	rs12534498	G	A	2691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.219;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.091;NF=69;NR=35;PP=1579;ReadPosRankSum=1.719;SC=TGAAGCCAGCGTCTGTGACTA;SOR=0.818;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=167;TCF=111;TCR=56;TR=104;WE=76111946;WS=76111928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,117:0.63:187
chr7	76111994	rs1638075	C	G	1651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=353;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.898;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.314;NF=56;NR=43;PP=1004;ReadPosRankSum=0.986;SC=TGGACTTGGCCCCCCTGGGGT;SOR=0.617;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=333;TCF=191;TCR=142;TR=99;WE=76112002;WS=76111982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:238,105:0.31:343
chr7	76112060	rs1638074	C	T	1947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=406;ExcessHet=3.0103;FS=3.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.43;MQRankSum=-2.179;QD=4.80;ReadPosRankSum=-0.498;SOR=1.006;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:286,120:0.30:406
chr7	76112249	rs147779783	A	C	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=402;ExcessHet=3.0103;FS=1.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.96;MQRankSum=-19.315;QD=0.64;ReadPosRankSum=3.441;SOR=0.824;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:337,59:0.15:396
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chr7	76132962	rs2690526	A	G	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-5.378;NF=4;NR=8;PP=158;ReadPosRankSum=0.901;SC=CCCCGCCCACATCCCAGCAGT;SOR=0.601;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=12;WE=76132970;WS=76132952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,8:0.26:31
chr7	76135134	rs7398	G	A	3923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.623;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=88;PP=2570;ReadPosRankSum=0.810;SC=TGGGGGCTTAGGATGCAGCTA;SOR=0.837;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=241;TCF=115;TCR=126;TR=164;WE=76135142;WS=76135124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,174:0.68:257
chr7	76140449	rs145740550	C	T	71.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.34;QD=23.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr7	76142536	rs2286988	G	A	3640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.218;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=93;PP=2167;ReadPosRankSum=-0.381;SC=TCTCTGGGCCGCCTCTGCTGA;SOR=0.807;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=207;TCF=86;TCR=121;TR=156;WE=76142544;WS=76142526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,166:0.75:222
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chr7	76144483	rs1636632	A	G	4024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.211;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=94;PP=2546;ReadPosRankSum=-1.641;SC=GGTGGGCTGCAAGCCTGGCCT;SOR=0.495;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=266;TCF=119;TCR=147;TR=179;WE=76144491;WS=76144473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,186:0.66:282
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chr7	76239480	rs200882024	C	A	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.08;MQRankSum=-5.878;QD=5.38;ReadPosRankSum=0.336;SOR=0.641;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,29:0.31:95
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chr7	76240677	rs1799211	T	G	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.63;MQRankSum=-4.958;QD=2.87;ReadPosRankSum=-0.267;SOR=0.538;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,8:0.20:41
chr7	76240785	rs71819724	CA	C	2490.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.081;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-7.294;NF=31;NR=25;PP=1837;ReadPosRankSum=0.010;SC=CCTGCGGTTACAGGGAAGCAG;SOR=0.901;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=171;TCF=87;TCR=84;TR=56;WE=76240793;WS=76240775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,83:0.33:255
chr7	76240888	rs1134609	A	G	1010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=494;ExcessHet=3.0103;FS=8.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.05;MQRankSum=-10.577;QD=2.05;ReadPosRankSum=-1.006;SOR=1.156;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:402,92:0.19:494
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chr7	76255452	rs62476699	G	A	2418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=559;ExcessHet=3.0103;FS=0.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.50;MQRankSum=-17.697;QD=4.33;ReadPosRankSum=3.158;SOR=0.695;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:404,155:0.28:559
chr7	76255491	rs71535586	C	T	2553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=479;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-15.421;NF=79;NR=93;PP=2051;ReadPosRankSum=-1.348;SC=ATAGCGTCTTCGAGGTGTTAT;SOR=0.731;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=525;TCF=246;TCR=279;TR=172;WE=76255499;WS=76255481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:328,151:0.32:479
chr7	76255998	rs2006268	T	C	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.691;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.729;NF=13;NR=9;PP=190;ReadPosRankSum=-0.586;SC=AGCCAAAGGATGATCTGGGAA;SOR=0.223;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=57;TCF=38;TCR=19;TR=22;WE=76256006;WS=76255988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,22:0.37:59
chr7	76607938	rs56083327	C	T	766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=6;PP=526;SC=GGGAAGATGGCCATGGCCCCA;SOR=2.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=25;WE=76607946;WS=76607928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr7	76608143	rs2245368	C	T	2714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=48;PP=1614;SC=CCCTCGCTGGCCCGTTACATT;SOR=1.059;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=44;TCR=48;TR=92;WE=76608151;WS=76608133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr7	76610095	rs62473742	C	T	1297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.35;MQRankSum=-1.187;QD=4.51;ReadPosRankSum=-1.807;SOR=0.709;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:209,79:0.27:288
chr7	76610299	rs62473743	A	G	1687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.62;QD=30.14;SOR=2.066;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr7	76610346	rs71552449	C	T	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=3.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.06;MQRankSum=-4.610;QD=2.34;ReadPosRankSum=1.884;SOR=0.250;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,9:0.20:46
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chr7	76610621	rs6956966	T	C	69.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=37.81;QD=23.09;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
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chr7	76922490	rs17151219	C	T	4791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.975;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.018;NF=88;NR=115;PP=2962;ReadPosRankSum=0.390;SC=AAGAAATGCACGCCTTGGCCA;SOR=0.831;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=298;TCF=130;TCR=168;TR=203;WE=76922498;WS=76922480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,213:0.66:322
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chr7	76922575	rs113826533	GCAA	G	1458.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.140;HP=1;HapScore=4;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.31;MQRankSum=0.904;NF=0;NR=27;PP=2421;ReadPosRankSum=-0.931;SC=TTGCATTCAGGCAACCCACAG;SOR=1.341;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=0;TCR=54;TR=27;WE=76922590;WS=76922565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,38:0.57:67
chr7	76922581	rs55803623	C	G	1509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=1.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.88;ReadPosRankSum=-1.064;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,38:0.58:66
chr7	76922581	.	CA	GT	2419	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=21;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=2;NR=24;PP=2419;QD=95.0949182639;SC=TCAGGCAACCCACAGTTATCC;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=58;TCF=7;TCR=51;TR=26;WE=76922590;WS=76922565;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:32,26:0.45:58
chr7	76922582	rs59657581	A	T	1512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=1.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.92;ReadPosRankSum=-1.129;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,38:0.58:66
chr7	76924216	rs1133045	A	G	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.221;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=111;ReadPosRankSum=0.004;SC=CTCAAGGAAAAGACTTCAACC;SOR=0.859;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=7;WE=76924224;WS=76924206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
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chr7	76941547	rs35791980	C	A	3422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.879;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.015;NF=13;NR=41;PP=2813;ReadPosRankSum=-1.393;SC=AAAAATGTAGCGAATACCACA;SOR=0.474;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=81;TCF=21;TCR=60;TR=54;WE=76941557;WS=76941537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,88:0.75:117
chr7	76941549	rs148017002	A	AAT	3413.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.882;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.003;NF=1;NR=39;PP=2875;ReadPosRankSum=-1.535;SC=AAATGTAGCGAATACCACACA;SOR=0.496;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=59;TCF=1;TCR=58;TR=40;WE=76941557;WS=76941537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,87:0.76:115
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chr7	76942959	rs2272316	G	A	183.18	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5436;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=118;ReadPosRankSum=0.489;SC=CATCTTGATAGGACATATCCC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=6;WE=76942967;WS=76942949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
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chr7	76957751	rs112281656	A	T	534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.588;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=389;ReadPosRankSum=0.430;SC=TGGTGCCTAGACAGACATGGG;SOR=1.214;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=23;WE=76957759;WS=76957741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,23:0.59:39
chr7	76958557	rs11520975	A	G	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=402;ReadPosRankSum=0.026;SC=TATGCAACAAAAGTAAACTAC;SOR=1.302;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=17;WE=76958565;WS=76958547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr7	76958730	rs10274222	A	G	8392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=143;NR=133;PP=2965;SC=AACACGTCAGAAATGTGGAAG;SOR=0.746;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=276;TCF=143;TCR=133;TR=276;WE=76958738;WS=76958720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,310:1.00:310
chr7	76982109	rs10714796	AC	A	1241.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.508;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.904;NF=20;NR=7;PP=941;ReadPosRankSum=-0.924;SC=ATTTGCTATTACTTTTCTGCC;SOR=0.418;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=50;TCF=39;TCR=11;TR=27;WE=76982117;WS=76982099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,38:0.57:67
chr7	76982418	rs17806761	C	G	973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.515;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=28;PP=682;ReadPosRankSum=1.198;SC=GTAATGCAACCAAAACACGCA;SOR=0.435;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=51;TCF=10;TCR=41;TR=36;WE=76982426;WS=76982408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,38:0.72:53
chr7	76982480	rs4729347	C	T	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=89;ReadPosRankSum=-0.844;SC=CGGTAACCATCATGATTTTAT;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=6;WE=76982488;WS=76982470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr7	76982761	rs201039073	G	GT	74.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.47;ReadPosRankSum=0.816;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr7	76984426	rs2037751	T	C	1636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.805;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=24;PP=1146;ReadPosRankSum=1.674;SC=ACACCTCAATTAATTGTTACT;SOR=0.509;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=95;TCF=63;TCR=32;TR=68;WE=76984434;WS=76984416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,71:0.69:103
chr7	76984572	rs2037753	G	A	3902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.975;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=70;PP=2393;ReadPosRankSum=0.490;SC=AGTAGAGCGCGCAGTGCAACG;SOR=0.617;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=247;TCF=140;TCR=107;TR=156;WE=76984580;WS=76984562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,173:0.64:269
chr7	76984752	rs35161141	CA	C	265.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=3.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=1.255;QD=6.18;ReadPosRankSum=-1.926;SOR=0.214;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,23:0.53:43
chr7	76990126	rs4727365	C	T	3556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.088;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=55;PP=2238;ReadPosRankSum=0.670;SC=GGGGTGTGATCTCTCCATCAC;SOR=0.796;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=214;TCF=129;TCR=85;TR=142;WE=76990134;WS=76990116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,155:0.67:233
chr7	76990178	rs4727366	C	G	4835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.428;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=105;NR=93;PP=2962;ReadPosRankSum=0.341;SC=TCATGTGTGACCCAACATTCT;SOR=0.725;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=299;TCF=158;TCR=141;TR=198;WE=76990186;WS=76990168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,209:0.66:317
chr7	76991935	rs1527263	C	T	3082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.863;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=54;PP=1836;ReadPosRankSum=-0.794;SC=TGTGATTTGTCCCCAAGAGGC;SOR=0.706;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=182;TCF=97;TCR=85;TR=120;WE=76991943;WS=76991925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,136:0.68:201
chr7	77006114	rs76764879	A	G	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=407;ReadPosRankSum=0.718;SC=AAAAAAAAAGAGAGTAATGTA;SOR=0.446;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=23;WE=77006122;WS=77006104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,23:0.77:30
chr7	77035392	rs6949654	T	C	3649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=47;PP=1945;SC=ATTTAATACATGTAAGCTCTC;SOR=1.114;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=124;TCF=76;TCR=48;TR=123;WE=77035400;WS=77035382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr7	77394763	rs117919640	C	A	1322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.215;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=11;PP=1018;ReadPosRankSum=-0.505;SC=CCATATTCTTCAGGTAAAAAG;SOR=1.038;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=63;TCR=16;TR=54;WE=77394771;WS=77394753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,55:0.63:87
chr7	77539744	rs711309	G	A	5632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=113;PP=2965;SC=TTTATTTAAGGTTTTATATGG;SOR=1.442;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=185;TCF=72;TCR=113;TR=184;WE=77539752;WS=77539734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr7	77552127	rs848486	G	A	1138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=29;PP=761;SC=GTATACATACGTATCTATTTT;SOR=2.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=8;TCR=29;TR=37;WE=77552135;WS=77552117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr7	77578871	rs35896422	ATAAT	A	73.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=0;PP=48;ReadPosRankSum=-0.328;SC=AAAATATTTCATAATTAATGT;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=2;WE=77578882;WS=77578861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr7	77648671	rs13438302	G	C	2499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=64;PP=1572;SC=TGAGGACGCTGGGCAGCTTGT;SOR=2.435;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=20;TCR=64;TR=84;WE=77648679;WS=77648661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr7	77648731	rs2960452	C	G	699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=17;PP=464;SC=CCTTGCGCGCCGGGGCGCCCC;SOR=3.352;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=77648739;WS=77648721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr7	77708105	rs67657112	ATG	A	455.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.70;ReadPosRankSum=0.449;SOR=4.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,17:0.81:21
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chr7	77756724	rs7812015	C	T	1251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=344;ExcessHet=3.0103;FS=3.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.64;ReadPosRankSum=0.988;SOR=0.831;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:257,87:0.25:344
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chr7	79828450	rs57711391	CT	C	684.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=6.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.58;MQRankSum=1.042;QD=12.68;ReadPosRankSum=-0.914;SOR=0.153;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,38:0.70:54
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chr7	79841954	rs10238438	A	G	391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=15;NR=0;PP=325;SC=GTTTTATTACAACACCTTTTA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=79841962;WS=79841944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr7	79842157	rs10241877	T	C	2478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.625;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=41;PP=1576;ReadPosRankSum=-0.930;SC=AAAAGAGCCCTCTCACTATAT;SOR=0.907;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=164;TCF=92;TCR=72;TR=100;WE=79842165;WS=79842147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,111:0.61:183
chr7	80087981	rs2074673	A	G	3088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=26;PP=1961;SC=AAGAGAAAATAGTTGATTAGA;SOR=1.769;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=68;TCR=26;TR=94;WE=80087989;WS=80087971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr7	80088041	rs2074674	G	A	5771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQ=59.97;NF=106;NR=88;PP=2965;SC=CTGTAACTGCGTCAAACACAA;SOR=0.740;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=194;TCF=106;TCR=88;TR=194;WE=80088049;WS=80088031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr7	80091981	rs799936	G	A	2537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=64;PP=1823;SC=AATAAATCTTGCAAATATCCT;SOR=2.753;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=17;TCR=64;TR=81;WE=80091989;WS=80091968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr7	80141069	rs10230573	A	G	4314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=97;NR=40;PP=2856;SC=AAAAGTAAATATATCACAATT;SOR=1.941;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=137;TCF=97;TCR=40;TR=137;WE=80141077;WS=80141059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr7	80290369	rs3211892	A	G	7013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=147;NR=86;PP=2965;SC=GTTTACTGCTATTTCTTTAGA;SOR=1.272;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=233;TCF=147;TCR=86;TR=233;WE=80290377;WS=80290359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr7	80374342	rs1949971	A	G	8474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=143;NR=135;PP=2965;SC=TGTCTTTGCAATATTGGTTAA;SOR=0.706;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=278;TCF=143;TCR=135;TR=278;WE=80374350;WS=80374332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,312:1.00:312
chr7	80374438	rs1949972	T	C	6591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=116;NR=98;PP=2965;SC=CCCAGGTCCATGGGGACCATT;SOR=0.856;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=215;TCF=116;TCR=99;TR=214;WE=80374446;WS=80374428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr7	80378148	rs1405743	T	C	2155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=13;PP=1449;SC=TGAGCCTCGCTGAGGGACAGT;SOR=2.712;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=57;TCR=13;TR=70;WE=80378156;WS=80378138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr7	80378175	rs2886793	T	C	3189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=30;PP=1889;SC=ATGTTCTCTCTGAAGCCCTGA;SOR=1.715;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=105;TCF=75;TCR=30;TR=104;WE=80378183;WS=80378165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr7	80378319	rs2272351	G	C	7462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=125;NR=132;PP=2965;SC=CTCCATACTGGACAATTTCAG;SOR=0.823;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=257;TCF=125;TCR=132;TR=257;WE=80378327;WS=80378309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,277:1.00:277
chr7	80418689	rs17275986	A	G	9805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=359;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=178;NR=147;PP=2965;SC=CTATCTTTGTATACTTGTAGT;SOR=0.861;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=325;TCF=178;TCR=147;TR=325;WE=80418697;WS=80418679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,358:1.00:358
chr7	80434918	rs2030924	C	T	3510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=39;PP=2043;SC=TAGTTTAACACGATACTAAAA;SOR=1.420;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=115;TCF=76;TCR=39;TR=115;WE=80434926;WS=80434908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr7	80456841	rs4461841	C	T	4693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.10;SOR=0.770;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr7	80805175	rs1509911	T	A	3565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.523;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=53;PP=2050;ReadPosRankSum=-1.599;SC=AAGCTCTTACTAGATGATCTT;SOR=0.773;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=215;TCF=134;TCR=81;TR=145;WE=80805183;WS=80805165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,162:0.69:236
chr7	80817269	rs327695	T	C	4367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=86;PP=2712;SC=GTGACAATTGTTAATATGCTT;SOR=1.491;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=139;TCF=52;TCR=87;TR=138;WE=80817277;WS=80817259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr7	81339304	rs2074725	A	C	1580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=8;PP=1138;SC=CAGAGCTTACAGTCTGGCAAG;SOR=3.215;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=41;TCR=8;TR=49;WE=81339312;WS=81339294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr7	81346685	rs1800793	T	C	12754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=493;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=204;NR=250;PP=2965;SC=GATATGACTGTGGAAACAACA;SOR=0.927;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=454;TCF=204;TCR=250;TR=454;WE=81346693;WS=81346675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,492:1.00:492
chr7	81350208	rs12536657	A	G	1270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=29;PP=834;SC=ATATCAAGGCAGATAAAACAA;SOR=1.378;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=17;TCR=29;TR=46;WE=81350216;WS=81350198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr7	81350223	rs10272030	G	A	797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=19;PP=501;SC=AAACAAAAAGGTTTTTTACAA;SOR=1.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=9;TCR=19;TR=28;WE=81350231;WS=81350213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr7	81355066	rs2887069	G	A	2053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=12;PP=1417;SC=GAAAAATCCAGCTTCAAACTT;SOR=2.973;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=50;TCR=12;TR=62;WE=81355074;WS=81355056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr7	81355449	rs2286194	T	A	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=230;ReadPosRankSum=-0.108;SC=GAGTTCTAACTTTTTGGACTC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=12;WE=81355457;WS=81355439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr7	81359116	rs5745686	CA	C	1914.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.27;QD=26.59;SOR=1.997;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr7	81366210	.	G	GGTGTGTGTGT	317.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=-0.000;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.39;MQRankSum=-0.000;QD=28.88;ReadPosRankSum=0.524;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr7	81372156	rs5745676	A	G	2523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=22;PP=1752;SC=ATCAGCTATAAAGATTAGAGA;SOR=1.836;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=61;TCR=22;TR=83;WE=81372164;WS=81372146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr7	81372452	rs2214826	A	G	468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=15;PP=377;SC=AATGTTTTCTATGGATGTGTG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=81372460;WS=81372442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr7	81374500	rs4732406	G	C	3031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=82;PP=2397;SC=CACCACTGTTGCATTTAAAGA;SOR=2.954;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=17;TCR=82;TR=99;WE=81374508;WS=81374490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr7	81381326	rs5745646	C	T	3606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=30;PP=2389;SC=TGCATTTGCACGAACAACATA;SOR=2.229;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=88;TCR=30;TR=118;WE=81381334;WS=81381316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr7	81588636	rs1229502	G	A	10195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=380;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.98;NF=178;NR=178;PP=2965;SC=TTCGGTATCTGGGTTGCTTAA;SOR=0.764;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=356;TCF=178;TCR=178;TR=356;WE=81588644;WS=81588613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,379:1.00:379
chr7	81591114	rs72063149	GTAATGATTATAACAGTATATACAATTTCT	G	1031.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=5;NR=1;PP=1166;SC=AGTTTTTTCTGTAATGATTAT;SOR=5.058;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=6;WE=81591150;WS=81591112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr7	81591716	rs1229503	T	G	2716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=34;PP=1596;SC=AAGAAAATTTTTATTGTTATG;SOR=1.306;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=93;TCF=58;TCR=35;TR=92;WE=81591724;WS=81591706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr7	81600197	rs37067	A	G	487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.49;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr7	81601231	rs1229505	C	G	2760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=60;PP=1897;SC=AAATTATGATCATAATGAAAA;SOR=1.408;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=35;TCR=60;TR=95;WE=81601239;WS=81601221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr7	81603945	rs61006565	AT	A	143.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=0;NR=5;PP=61;SC=TGAAAACACTATTTTTTTTTT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=81603953;WS=81603935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr7	81603966	rs138987517	CA	C	92.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=3;PP=91;SC=TTATTAGCCACAAGACTTTGC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=81603974;WS=81603956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr7	81641570	.	GA	G	125.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=2.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQRankSum=0.850;QD=4.84;ReadPosRankSum=0.718;SOR=1.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr7	82435033	rs12668093	C	T	2344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.347;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=45;PP=1312;ReadPosRankSum=-0.172;SC=GATTAGTCTCCCCTGCAGTGC;SOR=0.582;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=133;TCF=67;TCR=66;TR=92;WE=82435041;WS=82435023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,104:0.68:154
chr7	82497343	rs4628206	T	A	8206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=172;NR=95;PP=2965;SC=ATCAACATGATATGTGGTCTG;SOR=1.353;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=267;TCF=172;TCR=95;TR=267;WE=82497351;WS=82497333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,297:1.00:297
chr7	82544987	rs17156844	A	G	7546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=128;NR=128;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.613;SC=TCACATAACTATGCAATCTAG;SOR=0.769;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=258;TCF=129;TCR=129;TR=256;WE=82544995;WS=82544977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,270:0.99:272
chr7	82581488	rs10630259	T	TTCA	18283.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.49;DB;DP=422;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=122;PP=2969;SC=CAACGGGTTTTTCATCTTCTA;SOR=0.785;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=201;TCF=63;TCR=138;TR=176;WE=82581496;WS=82581478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,406:1.00:406
chr7	82581859	rs976714	C	T	1624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.599;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=37;PP=1038;ReadPosRankSum=0.488;SC=GTGTAACTTGCACTAGCTGTG;SOR=0.801;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=238;TCF=127;TCR=111;TR=82;WE=82581867;WS=82581849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,87:0.34:254
chr7	82582846	rs10954696	C	T	2097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.185;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=48;PP=1019;ReadPosRankSum=0.055;SC=ATTCTTGTAACAGGTAATCCA;SOR=0.517;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=300;TCF=143;TCR=157;TR=103;WE=82582854;WS=82582836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:216,117:0.35:333
chr7	82764425	rs2877	C	G	6277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=426;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.588;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=132;NR=116;PP=2962;ReadPosRankSum=0.719;SC=ATCAAATGGGCTGACTTTTTC;SOR=0.517;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=385;TCF=211;TCR=174;TR=248;WE=82764433;WS=82764415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,271:0.64:422
chr7	82784017	rs6951239	G	T	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-4.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.635;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=311;ReadPosRankSum=-0.013;SC=TTGTATAAGAGGATGATATGG;SOR=0.325;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=66;TCF=58;TCR=8;TR=21;WE=82784025;WS=82784007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,21:0.30:71
chr7	82785097	rs61741659	T	C	1785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.917;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=41;PP=1116;ReadPosRankSum=-1.318;SC=CCTTACTATGTCTGCCTGTTT;SOR=0.617;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=311;TCF=155;TCR=156;TR=92;WE=82785105;WS=82785087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:239,101:0.30:340
chr7	82996831	rs75164403	A	T	1891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=27;PP=1234;ReadPosRankSum=-0.807;SC=AAGAAGTTGGATGATTTATTT;SOR=0.664;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=99;TCF=66;TCR=33;TR=77;WE=82996839;WS=82996821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,83:0.78:107
chr7	83023587	.	TAC	T	5590.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=182;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.06;QD=35.38;SOR=0.792;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr7	83026100	rs150931802	C	CAA	652.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=12;PP=434;SC=GTACGGTTTTCAAAAAAACCA;SOR=2.303;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=13;WE=83026108;WS=83026090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr7	83029280	rs2255906	T	G	698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.76;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr7	83029438	rs2722974	C	T	5392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=107;NR=60;PP=2965;SC=CTGTTTTTACCAATATTGGTT;SOR=1.350;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=167;TCF=107;TCR=60;TR=167;WE=83029446;WS=83029428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr7	83029639	rs2255820	A	T	2669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=67;PP=1896;SC=AATTATGAGAAGAATCAGAAA;SOR=3.134;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=15;TCR=67;TR=82;WE=83029647;WS=83029629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr7	83031907	rs2709930	T	C	3149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.068;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=26;PP=2073;ReadPosRankSum=2.525;SC=ACCAAAAGTATACTTAAAAAT;SOR=1.971;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=102;TCF=76;TCR=26;TR=101;WE=83031915;WS=83031897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,113:0.98:115
chr7	83032187	rs2722976	T	C	622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=20;PP=426;SC=TCAAGTCTTTTGGGTAAAGTG;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=83032195;WS=83032177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr7	83034754	rs2245441	T	A	4087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=65;PP=2720;SC=ATTGACTGTATAAATTTCTCA;SOR=0.820;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=76;TCR=65;TR=141;WE=83034762;WS=83034744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr7	83034899	rs2709935	T	G	1965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=42;PP=1267;SC=CAAAGAAAATTTATTCACCTA;SOR=1.394;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=24;TCR=42;TR=66;WE=83034907;WS=83034889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr7	83035177	rs3735512	G	A	551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=0;PP=377;SC=TACACAGAAAGCAAGTTTCTA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=83035185;WS=83035167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr7	83036367	rs2245312	C	G	9320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=348;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=187;NR=131;PP=2965;SC=AAAGGCCTGACCATAAATTGT;SOR=1.039;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=318;TCF=187;TCR=131;TR=318;WE=83036375;WS=83036357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,346:1.00:346
chr7	83036602	rs2709941	T	A	554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=17;PP=467;SC=ATATTACAACTAAATGCTAAC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=83036610;WS=83036592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr7	83037751	rs2722985	C	A	7500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=134;PP=2965;SC=TGCGGAAGATCGCAGCGTCTC;SOR=0.943;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=242;TCF=108;TCR=134;TR=242;WE=83037759;WS=83037741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr7	83047583	rs2723033	T	C	1140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.88;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr7	83047583	.	TCA	CCC	428	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=19;NR=3;PP=428;QD=21.8849034028;SC=GCTTCGAGCATCAGAAAATAG;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=22;WE=83047593;WS=83047573;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,22:0.96:23
chr7	83047585	rs2713146	A	C	1140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.88;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr7	83047666	rs2713145	C	T	3722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=41;PP=2425;SC=TTTTAAAATCCTTATGACTAC;SOR=1.341;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=119;TCF=78;TCR=41;TR=119;WE=83047674;WS=83047656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr7	83095968	rs2713180	C	A	5672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=114;PP=2965;SC=AAACATGTTTCGTCCTTTTTG;SOR=1.518;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=175;TCF=61;TCR=114;TR=175;WE=83095976;WS=83095958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr7	83098428	rs3842170	A	AT	590.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=0;PP=586;SC=ATGCCTATATATTTTTTCTTC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=18;WE=83098436;WS=83098418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr7	83098696	rs12534772	T	A	1617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=17;NR=44;PP=1202;SC=CACTTTCTTCTACAGTTCAAA;SOR=1.823;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=62;TCF=17;TCR=45;TR=61;WE=83098704;WS=83098686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr7	83098714	rs71074666	CTTT	C	385.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.57;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr7	83098749	rs13225391	G	A	99.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=81;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=13;PP=264;SC=ATAAGATACAGTGGGTCTTTG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=83098757;WS=83098739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr7	83590852	rs797821	T	C	10626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=401;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=177;NR=183;PP=2965;SC=ACTCATCCATTGTGTTGAGAT;SOR=0.755;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=360;TCF=177;TCR=183;TR=360;WE=83590860;WS=83590842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,400:1.00:400
chr7	83592491	rs7809708	T	C	1092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.132;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=15;PP=689;ReadPosRankSum=-0.771;SC=ATCTTAGATATAAATGATCCA;SOR=0.929;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=148;TCF=100;TCR=48;TR=52;WE=83592499;WS=83592481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,58:0.36:161
chr7	83606353	rs35361892	T	TGA	1773.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=10;PP=1070;SC=TTAAGTATTCTGAGAGATGCA;SOR=2.247;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=32;TCF=20;TCR=12;TR=26;WE=83606361;WS=83606343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr7	83606518	rs701320	G	A	3845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=79;PP=2193;SC=TGCGTCTGAAGCAATTACATT;SOR=1.267;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=52;TCR=79;TR=131;WE=83606526;WS=83606508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr7	83610497	rs7789094	C	A	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=109;ReadPosRankSum=0.674;SC=AAACAAAACGCAACAATCCCC;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=6;WE=83610505;WS=83610492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr7	83739762	rs1990044	T	C	7224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=163;NR=85;PP=2965;SC=TGGACAAATATAATTTTTAAA;SOR=1.453;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=249;TCF=164;TCR=85;TR=248;WE=83739770;WS=83739752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr7	83740015	rs1990045	T	C	3363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=57;PP=1703;SC=CTTTCTTTTTTTTTTTTTGGC;SOR=2.219;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=19;TCR=57;TR=76;WE=83740023;WS=83740005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr7	83740030	rs13243696	C	T	2873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=46;PP=1360;SC=TTTGGCATCCCTTTCACAACA;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=11;TCR=46;TR=57;WE=83740038;WS=83740020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr7	83764309	rs17241389	C	G	3758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=81;PP=2519;SC=TAATGTGAAGCACTATATAAG;SOR=2.068;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=114;TCF=32;TCR=82;TR=113;WE=83764317;WS=83764299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr7	83823737	rs67227861	AG	A	3185.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.594;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.250;NF=36;NR=42;PP=2983;ReadPosRankSum=-1.041;SC=CAAGGAATTAAGGGGGGGGGC;SOR=0.629;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=137;TCF=69;TCR=68;TR=78;WE=83823747;WS=83823727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,129:0.68:191
chr7	83823739	rs191868182	G	C	1155.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.594;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.251;NF=40;NR=20;PP=734;ReadPosRankSum=0.877;SC=AGGAATTAAGGGGGGGGGCGG;SOR=0.774;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=178;TCF=117;TCR=61;TR=60;WE=83823747;WS=83823727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,63:0.33:193
chr7	84751259	.	T	TA	182.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.233;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=0.060;QD=5.71;ReadPosRankSum=0.462;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
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chr7	86274210	rs56227688	G	A	942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.676;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=28;PP=613;ReadPosRankSum=0.696;SC=AGAGGAGGACGTGTCCCTCTG;SOR=1.296;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=69;TCF=18;TCR=51;TR=36;WE=86274218;WS=86274186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,40:0.52:77
chr7	86781423	rs2286267	G	A	1331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=8;PP=916;SC=CGGCTCCCTCGGCTCGGAGCC;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=34;TCR=8;TR=42;WE=86781431;WS=86781413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr7	86795947	rs3058402	TAG	T	10340.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=113;PP=2965;SC=TTAAGAGCCATAGAGTTCCCT;SOR=1.097;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=138;TCF=19;TCR=119;TR=132;WE=86795956;WS=86795937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr7	86800351	rs3747807	A	G	13373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=505;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=255;NR=239;PP=2965;SC=CCATGACTGCAACCACAGAAG;SOR=0.733;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=495;TCF=256;TCR=239;TR=494;WE=86800359;WS=86800341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,504:1.00:504
chr7	86814122	rs3214245	CT	C	99.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=2.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.17;ReadPosRankSum=2.591;SOR=0.298;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,17:0.20:85
chr7	86820459	rs1558050	G	A	1766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=40;PP=1140;SC=ATGAATGGTAGACTAAATCAG;SOR=2.419;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=14;TCR=40;TR=54;WE=86820467;WS=86820449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr7	86978347	rs802037	C	A	2387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=24;PP=1381;SC=TGTGAGGGCTCTCTCTCTTTT;SOR=1.583;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=55;TCR=24;TR=79;WE=86978355;WS=86978337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr7	86983715	rs7808249	A	G	7818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=147;NR=123;PP=2965;SC=GCTTGGATTTAACTGGACCTA;SOR=0.787;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=270;TCF=147;TCR=123;TR=270;WE=86983723;WS=86983705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,287:1.00:287
chr7	86998842	rs6966140	G	A	4526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=107;PP=2965;SC=GTCTTATGGTGTTGCTTGAAT;SOR=1.447;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=164;TCF=57;TCR=107;TR=164;WE=86998850;WS=86998832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr7	86998936	rs35374737	AT	A	528.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=14;PP=616;SC=TTAAAAAAAAATCTATTTGTA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=86998944;WS=86998926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr7	87005287	rs59190666	C	CT	650.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.285;HP=12;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=44;PP=610;ReadPosRankSum=-0.146;SC=ACTACCTTCTCTTTTTTTTTT;SOR=1.732;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=66;TCF=1;TCR=65;TR=45;WE=87005295;WS=87005277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,33:0.79:42
chr7	87006567	rs802042	G	C	426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=1;PP=317;SC=TTTGGTTGACGTGAAGAGGAA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=87006575;WS=87006557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr7	87011349	rs31630	G	A	5475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=86;PP=2965;SC=TCTCCTAATAGTTCTATAGAT;SOR=0.845;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=185;TCF=99;TCR=86;TR=185;WE=87011357;WS=87011339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr7	87022024	rs31644	G	C	10037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=357;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=196;NR=139;PP=2965;SC=TTTCTAACCTGAGATTTGGGG;SOR=1.049;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=337;TCF=198;TCR=139;TR=335;WE=87022032;WS=87022014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,357:1.00:357
chr7	87032613	rs31653	A	G	2183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=31;NR=40;PP=1317;SC=AGTTAACCAAATTATAAATAT;SOR=1.207;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=31;TCR=40;TR=71;WE=87032621;WS=87032603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr7	87053150	rs31667	A	G	3792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=45;PP=2547;SC=GGAGCCAGTCAGTGAGGTTGG;SOR=1.659;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=94;TCR=45;TR=139;WE=87053158;WS=87053140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr7	87053206	rs31668	G	A	8959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=174;NR=132;PP=2965;SC=CTGTTATGTGGTGTTTGCAAA;SOR=0.992;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=307;TCF=175;TCR=132;TR=306;WE=87053214;WS=87053196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,325:1.00:325
chr7	87056260	rs10647775	A	AGT	222.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.91;ReadPosRankSum=0.234;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr7	87069758	rs31675	T	C	3200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=76;PP=2326;SC=ATTTAACCATTTAATAGCTGA;SOR=2.833;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=19;TCR=76;TR=95;WE=87069766;WS=87069748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr7	87138511	rs2235048	G	A	1456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=10;PP=958;SC=ACTTCTGGGAGACCAGCCCCT;SOR=2.049;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=38;TCR=10;TR=48;WE=87138519;WS=87138501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr7	87138645	rs1045642	A	G	6929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=135;NR=103;PP=2965;ReadPosRankSum=1.043;SC=CTGCCCTCACAATCTCTTCCT;SOR=0.900;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=241;TCF=136;TCR=105;TR=238;WE=87138653;WS=87138635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,263:0.99:265
chr7	87144816	rs7779562	G	C	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=261;ReadPosRankSum=-1.179;SC=TAACTCTCTCGATTACCAGGT;SOR=0.722;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=58;TCF=14;TCR=44;TR=18;WE=87144824;WS=87144806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,18:0.29:63
chr7	87160561	rs2032583	A	G	706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=3;PP=531;ReadPosRankSum=1.411;SC=AACACTGATTAGAATACTTTA;SOR=0.945;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=24;WE=87160569;WS=87160551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,26:0.68:38
chr7	87160618	rs2032582	A	C	3229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=35;PP=2111;SC=ACCTTCCCAGAACCTTCTAGT;SOR=1.342;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=70;TCR=35;TR=105;WE=87160626;WS=87160608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr7	87165750	rs2235040	C	T	2627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=34;PP=1656;ReadPosRankSum=0.110;SC=TTAAGACAAACACCAGTAGAA;SOR=0.693;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=152;TCF=105;TCR=47;TR=107;WE=87165758;WS=87165740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,115:0.70:164
chr7	87168749	rs4728699	C	T	2496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=50;PP=1496;SC=AGCAGGAGATCAGACAAAGTC;SOR=1.346;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=34;TCR=50;TR=84;WE=87168757;WS=87168739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr7	87174066	rs2235046	T	C	2596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=27;PP=1615;ReadPosRankSum=-0.911;SC=CCACTCCTACTGTAGCCCTAG;SOR=0.684;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=141;TCF=102;TCR=39;TR=99;WE=87174074;WS=87174056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,107:0.70:153
chr7	87178626	rs2235013	C	T	1936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.339;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=29;PP=1267;ReadPosRankSum=0.554;SC=TGTTCTTATGCTTATAAATCA;SOR=1.018;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=127;TCF=79;TCR=48;TR=83;WE=87178634;WS=87178616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,88:0.66:134
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chr7	87199564	rs2235015	C	A	3184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.087;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=75;PP=1922;ReadPosRankSum=-1.666;SC=AACAAACATACCATTTATGTC;SOR=0.807;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=208;TCF=93;TCR=115;TR=134;WE=87199572;WS=87199554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,144:0.64:224
chr7	87215114	rs1211152	A	C	771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=23;PP=668;SC=ACTGATACCAACCTAGTCCAA;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=87215122;WS=87215104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr7	87225206	rs58898486	G	T	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=118;ReadPosRankSum=-0.558;SC=AACATAGAATGTATATTTAAT;SOR=0.425;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=8;WE=87225214;WS=87225196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr7	87229501	rs2214102	T	C	6622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=117;NR=102;PP=2965;SC=CAAGATCCATTCCGACCTGAA;SOR=0.734;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=222;TCF=119;TCR=103;TR=219;WE=87229509;WS=87229491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr7	87323209	.	AT	A	651.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.779;ClippingRankSum=0.000;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=2.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.21;ReadPosRankSum=-1.334;SOR=1.035;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,38:0.36:105
chr7	87526550	.	TA	T	116.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.473;ClippingRankSum=0.000;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.36;MQRankSum=2.566;QD=2.16;ReadPosRankSum=-1.134;SOR=0.674;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,13:0.24:54
chr7	87704799	rs3085476	G	GAGAA	245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=1;PP=208;SC=GTGTGAGTGTGAGAGAGAGAG;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=4;WE=87704807;WS=87704789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr7	87745903	rs2301998	A	T	2437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=58;NR=27;PP=1497;SC=AATACAGGAGAGAATAGGAGG;SOR=1.389;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=58;TCR=27;TR=85;WE=87745911;WS=87745893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr7	87759588	rs200875448	A	AT	44.84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.47;ReadPosRankSum=1.111;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr7	87765476	rs12538777	C	T	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=365;ReadPosRankSum=-0.466;SC=GCAAAATAACCTCTTATTTAT;SOR=0.719;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=67;TCF=13;TCR=54;TR=23;WE=87765484;WS=87765466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,23:0.33:70
chr7	87774727	rs3761806	T	C	1294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.554;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=27;PP=835;ReadPosRankSum=-2.400;SC=TTATATTCCTTAGGAATGTGT;SOR=0.903;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=192;TCF=107;TCR=85;TR=65;WE=87774735;WS=87774717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,70:0.34:204
chr7	87778503	rs2301999	T	A	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=256;ReadPosRankSum=-0.376;SC=CCATTTTTTTTAGGAATTTAA;SOR=1.154;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=13;WE=87778511;WS=87778493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr7	87780704	rs12533109	G	C	1970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=382;ExcessHet=3.0103;FS=3.691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.16;ReadPosRankSum=0.409;SOR=0.904;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:272,110:0.29:382
chr7	87785405	rs2072213	T	C	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.517;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=92;ReadPosRankSum=1.763;SC=TTTCAATTAATGTACATGTTA;SOR=1.238;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=9;WE=87785413;WS=87785395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,8:0.24:33
chr7	87795282	rs17150304	C	G	823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.592;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=25;PP=483;ReadPosRankSum=-0.131;SC=AATTTGGTAACATTATGTAGT;SOR=0.397;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=134;TCF=44;TCR=90;TR=41;WE=87795290;WS=87795272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,46:0.31:149
chr7	87800808	rs11332301	AG	A	831.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=609;ReadPosRankSum=1.599;SC=GTCCTTCCAGAGGTAACTAAC;SOR=0.756;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=51;TCF=11;TCR=40;TR=19;WE=87800816;WS=87800798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,31:0.32:97
chr7	87810955	rs2240467	T	C	2288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=379;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=68;PP=1526;ReadPosRankSum=-0.568;SC=TCTGTCCACATAATCAAGTTC;SOR=0.680;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=345;TCF=131;TCR=214;TR=111;WE=87810963;WS=87810945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:256,122:0.32:378
chr7	87811210	rs2240469	G	A	2264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=403;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.174;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=54;PP=1254;ReadPosRankSum=-2.445;SC=GAAATGCCTCGTAATTAGACA;SOR=0.810;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=371;TCF=198;TCR=173;TR=120;WE=87811218;WS=87811200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:269,134:0.33:403
chr7	87813635	rs3789240	C	T	1159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.091;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=29;PP=623;ReadPosRankSum=0.552;SC=TGAGCCTGGGCACTCCCTCGC;SOR=0.748;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=221;TCF=114;TCR=107;TR=63;WE=87813643;WS=87813625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,71:0.29:242
chr7	87813766	rs3789239	A	C	1025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.966;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=29;PP=624;ReadPosRankSum=0.199;SC=TAATCTCCTTACAAGTCCTTT;SOR=0.893;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=180;TCF=82;TCR=98;TR=52;WE=87813774;WS=87813756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,59:0.30:194
chr7	87840263	rs6964163	T	C	5164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=100;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.874;SC=GAAAAGTACATACATATTAAC;SOR=0.952;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=184;TCF=83;TCR=101;TR=182;WE=87840271;WS=87840253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,197:0.99:199
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chr7	88847369	rs17167529	C	T	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.191;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=134;ReadPosRankSum=-0.555;SC=CAATGTGCTCCGTCATATTTC;SOR=0.859;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=7;WE=88847377;WS=88847359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
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chr7	89797144	rs259136	G	T	3407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=54;NR=65;PP=1822;SC=TATGGCCTATGAAGTGTGGAA;SOR=1.055;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=54;TCR=65;TR=119;WE=89797152;WS=89797134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr7	89854446	rs194520	T	G	2889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=401;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=57;PP=1756;ReadPosRankSum=-0.418;SC=AGTGAAACTTTTTTACCTAAT;SOR=0.716;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=371;TCF=202;TCR=169;TR=131;WE=89854454;WS=89854436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:253,148:0.37:401
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chr7	89861832	rs194524	G	A	1346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.530;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=26;PP=780;ReadPosRankSum=-0.062;SC=TGTATAAGCCGAAAGCTAAAA;SOR=0.764;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=189;TCF=107;TCR=82;TR=65;WE=89861840;WS=89861822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,74:0.35:212
chr7	89861890	rs194525	G	T	6536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=111;NR=106;PP=2965;SC=AAGAAGGTATGGGAGGAACAA;SOR=0.777;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=217;TCF=111;TCR=106;TR=217;WE=89861898;WS=89861880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr7	89861942	rs194526	C	T	3758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=77;PP=2225;SC=AATGTGATGACAAATGGTGTT;SOR=1.286;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=51;TCR=77;TR=128;WE=89861950;WS=89861932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr7	89861957	rs17621350	G	A	805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=22;PP=427;ReadPosRankSum=-1.877;SC=GGTGTTCACAGCTGCCATATA;SOR=0.748;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=97;TCF=36;TCR=61;TR=36;WE=89861965;WS=89861947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,42:0.39:108
chr7	89867369	rs2013992	C	G	3660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.847;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.03;MQRankSum=-1.068;NF=85;NR=74;PP=2296;ReadPosRankSum=1.189;SC=TGCAGCCATGCCTACATCCTC;SOR=0.626;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=290;TCF=155;TCR=135;TR=159;WE=89867377;WS=89867359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,172:0.54:321
chr7	89867446	rs35403811	T	TCTG	1738.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.282;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.309;NF=1;NR=31;PP=1326;ReadPosRankSum=-1.942;SC=CTAAAGAGTTTCTGCTGCTGC;SOR=1.518;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=101;TCF=10;TCR=91;TR=32;WE=89867454;WS=89867436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,49:0.37:131
chr7	89884667	rs11563919	A	G	698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=5;PP=479;ReadPosRankSum=-1.625;SC=TATCATATAAATTAGTGTGTT;SOR=0.589;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=39;TCF=32;TCR=7;TR=26;WE=89884675;WS=89884657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,28:0.70:40
chr7	89884701	rs11563436	G	C	1247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=12;PP=832;ReadPosRankSum=-0.311;SC=TGATATAGAAGATGATCTAGA;SOR=0.811;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=71;TCF=52;TCR=19;TR=48;WE=89884709;WS=89884691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,52:0.69:75
chr7	89887587	rs11771963	G	T	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=21;ReadPosRankSum=-1.732;SC=CCATAAATTTGATGGCTTAAA;SOR=0.593;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=3;WE=89887595;WS=89887577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr7	89901039	rs10280053	A	C	2754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=46;PP=1711;SC=ACTTTTGTTTATGTCTAAAAA;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=43;TCR=46;TR=89;WE=89901047;WS=89901029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr7	89906683	rs13245039	A	G	1209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.329;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=26;PP=590;ReadPosRankSum=2.296;SC=ATCAATAAAAATTGTCTTACT;SOR=0.387;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=74;TCF=31;TCR=43;TR=49;WE=89906691;WS=89906673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,55:0.69:80
chr7	89912301	rs1029365	G	A	1700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=408;ExcessHet=3.0103;FS=2.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.19;ReadPosRankSum=-0.653;SOR=0.860;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:297,109:0.27:406
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chr7	89937027	rs35441907	CA	C	176.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.07;ReadPosRankSum=0.681;SOR=0.602;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
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chr7	89983808	rs42663	T	G	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.110;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=9;PP=421;ReadPosRankSum=-0.357;SC=GAAAAGACTGTGAAATCCCTG;SOR=1.227;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=104;TCF=71;TCR=33;TR=32;WE=89983816;WS=89983798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,35:0.29:122
chr7	89984003	rs17862154	C	T	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.697;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=153;ReadPosRankSum=-0.200;SC=ATTTTTAAAACTTATAAAAGT;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=8;WE=89984011;WS=89983993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr7	89984409	rs42664	A	G	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=4.601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.68;ReadPosRankSum=-0.301;SOR=1.287;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,24:0.24:100
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chr7	90233618	rs6465273	G	A	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=1.349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.52;ReadPosRankSum=1.529;SOR=1.012;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,11:0.17:63
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chr7	90742137	rs376151415	GGT	G	115.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=2.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.62;ReadPosRankSum=-1.523;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,7:0.22:32
chr7	90742168	rs373491068	GGA	G	43.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.19;ReadPosRankSum=-2.455;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,4:0.20:20
chr7	90747315	rs803167	A	T	715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=9.233;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=2;PP=510;ReadPosRankSum=-0.264;SC=CCATTTTTTTAAAAAAAAAAC;SOR=5.486;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=40;TCF=37;TCR=3;TR=37;WE=90747323;WS=90747297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,31:0.94:33
chr7	90894102	rs2232158	C	G	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.229;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.98;ReadPosRankSum=-0.223;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr7	90894459	rs139480179	A	ACCG	101.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.512;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.793;NF=2;NR=3;PP=122;ReadPosRankSum=-0.556;SC=CGGGGCAGCAACCGCCGCCGC;SOR=1.889;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=20;TCF=10;TCR=10;TR=5;WE=90894467;WS=90894449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr7	91503228	rs10266424	C	T	8781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=157;NR=130;PP=2965;SC=TTGATGTTTGCGTAGCTTCTT;SOR=0.811;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=287;TCF=157;TCR=130;TR=287;WE=91503236;WS=91503218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,322:1.00:322
chr7	91570290	rs4727267	G	C	5522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=123;NR=59;PP=2965;SC=GCGGGGGAGCGCCGGACCGAA;SOR=1.585;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=182;TCF=123;TCR=59;TR=182;WE=91570298;WS=91570280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr7	91632306	rs1989779	C	T	2787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.552;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=56;PP=1589;ReadPosRankSum=0.362;SC=GAGTTGTGACCATGACAAGCA;SOR=0.770;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=176;TCF=88;TCR=88;TR=112;WE=91632314;WS=91632296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,124:0.64:193
chr7	91708898	rs35759833	A	G	1841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.375;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=50;PP=1257;ReadPosRankSum=-1.136;SC=ACATACTTCAAATCTTTTGAA;SOR=0.958;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=246;TCF=110;TCR=136;TR=85;WE=91708906;WS=91708888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,92:0.35:263
chr7	91714092	.	AT	A	46.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.429;ClippingRankSum=0.000;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=1.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.19;MQRankSum=2.168;QD=0.85;ReadPosRankSum=2.195;SOR=1.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,10:0.18:55
chr7	91714911	rs1063242	C	T	6656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=139;PP=2965;SC=GGTTTCAGAACCTTGGCTAGA;SOR=1.193;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=230;TCF=91;TCR=139;TR=230;WE=91714919;WS=91714901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr7	91761305	rs66673218	CA	C	943.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=25;PP=506;SC=AAAAAGTTACCAAAAAAAAAG;SOR=1.949;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=25;WE=91761313;WS=91761281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr7	91936975	.	AT	A	109.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.946;ClippingRankSum=0.000;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=3.033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.28;MQRankSum=2.791;QD=1.93;ReadPosRankSum=-0.662;SOR=1.288;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,16:0.28:57
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chr7	92131289	rs10278857	G	T	11718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=437;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=184;NR=218;PP=2965;SC=CCACAAACCCGCCAGTTTCTT;SOR=0.910;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=404;TCF=185;TCR=219;TR=402;WE=92131297;WS=92131279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,435:1.00:435
chr7	92135802	rs6465359	T	A	1041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=26;PP=740;SC=ATACTTCCCATCTCATTTTAT;SOR=2.432;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=8;TCR=26;TR=34;WE=92135810;WS=92135792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr7	92147584	rs38809	C	T	1808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=37;PP=1085;SC=AACCAACAGACGAAAAGATCA;SOR=1.758;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=19;TCR=37;TR=56;WE=92147592;WS=92147574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr7	92158154	rs117787377	G	A	5447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=401;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.831;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=129;NR=110;PP=2962;ReadPosRankSum=0.663;SC=GGGAGCTAGGGAGTTTATTTG;SOR=0.536;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=380;TCF=212;TCR=168;TR=239;WE=92158162;WS=92158144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,252:0.63:401
chr7	92244422	rs42039	C	T	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.011;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=274;ReadPosRankSum=-0.924;SC=GGGTGTTCTCCGCAGGATCAG;SOR=2.093;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=15;WE=92244430;WS=92244412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr7	92244630	rs3731387	TATACA	T	1272.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.760;NF=0;NR=17;PP=779;ReadPosRankSum=1.568;SC=AATTGGTTGATATACAATACA;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=17;WE=92244642;WS=92244620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,33:0.66:50
chr7	92247333	rs42043	A	G	2174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.375;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=29;PP=1410;ReadPosRankSum=1.162;SC=GTCTGGGTAGAGCAGGTGTCT;SOR=0.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=136;TCF=86;TCR=50;TR=84;WE=92247341;WS=92247323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,92:0.63:147
chr7	92252203	rs42046	C	G	673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.253;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=454;ReadPosRankSum=0.055;SC=CATGTCTCCACTCACCACACA;SOR=1.068;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=42;TCF=29;TCR=13;TR=27;WE=92252211;WS=92252193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,27:0.61:44
chr7	92731586	rs3802064	A	G	2722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.197;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=63;PP=1956;ReadPosRankSum=-0.875;SC=TTAGCAGGACAAAGTATTCAT;SOR=0.432;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=156;TCF=65;TCR=91;TR=113;WE=92731594;WS=92731576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,115:0.71:161
chr7	92734451	rs6965201	A	G	1187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.813;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=22;PP=604;ReadPosRankSum=0.541;SC=TAATCTGGAAATAATCATATT;SOR=0.456;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=141;TCF=84;TCR=57;TR=53;WE=92734459;WS=92734441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,61:0.39:158
chr7	92760431	rs116965992	G	A	124.85	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5081;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=66;ReadPosRankSum=-0.210;SC=GTAATTAGAGGTTAGCCATAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=4;WE=92760439;WS=92760421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr7	92760502	rs4268	G	A	1132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=13;PP=727;SC=ATAAATAAACGTATTTGAACT;SOR=1.556;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=27;TCR=13;TR=40;WE=92760510;WS=92760492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr7	92764419	rs2073793	A	G	7528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=477;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.882;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=165;NR=139;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.874;SC=GACTTCCACAAACCTTGGCTC;SOR=0.850;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=444;TCF=237;TCR=207;TR=304;WE=92764427;WS=92764409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,326:0.68:476
chr7	92764982	rs1133906	C	T	3133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.172;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=46;PP=1941;ReadPosRankSum=-0.552;SC=TTGGATTTTTCTGGTGTTCTG;SOR=0.596;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=185;TCF=113;TCR=72;TR=120;WE=92764990;WS=92764972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,135:0.67:202
chr7	92837791	rs73218062	C	G	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-2.468;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=43;ReadPosRankSum=-1.996;SC=ATGAATAATCCCACAATGATT;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=5;WE=92837799;WS=92837782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr7	92861661	rs76810131	C	T	807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.804;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=4;PP=649;ReadPosRankSum=0.773;SC=ACAGGATACCCTGGGTCGGCT;SOR=1.730;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=48;TCF=40;TCR=8;TR=32;WE=92861669;WS=92861651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,31:0.66:47
chr7	92875395	.	CT	C	188.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=0.000;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=2.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.15;ReadPosRankSum=1.403;SOR=0.328;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,17:0.28:60
chr7	92883338	.	CAATT	C	118.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=151;ReadPosRankSum=-1.282;SC=TTTTAACTAACAATTAACATA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=92883349;WS=92883328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr7	92886812	rs722263	A	G	2174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=28;NR=46;PP=1343;SC=CTTTAAGCTGAACAATATTTC;SOR=1.468;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=28;TCR=46;TR=74;WE=92886820;WS=92886802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr7	92900512	rs59890424	GT	G	33.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=10.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.65;ReadPosRankSum=-0.437;SOR=3.104;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,10:0.19:52
chr7	92900516	rs12112676	T	G	908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=3.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.52;ReadPosRankSum=0.724;SOR=0.304;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,42:0.76:55
chr7	92963242	rs4729079	A	G	426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=298;SC=ACACAGGTAAATGTTTCTTTG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=92963250;WS=92963232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
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chr7	92987445	rs2285505	T	C	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=373;ReadPosRankSum=1.076;SC=ATTCTTATTCTCTCCTATTAC;SOR=1.143;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=17;WE=92987453;WS=92987435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
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chr7	93346095	rs2027984	C	A	355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=155;SC=ATCTATCTATCTATATATGCA;SOR=2.147;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=93346103;WS=93346085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
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chr7	93551428	rs4262	C	T	618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=7;PP=410;ReadPosRankSum=-0.156;SC=AGAGCTAGCCCGAGCCCGGTT;SOR=0.591;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=83;TCF=63;TCR=20;TR=31;WE=93551436;WS=93551418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,31:0.36:86
chr7	94033800	rs406226	A	G	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.136;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=215;ReadPosRankSum=0.986;SC=AGTTGGTCATATCTGACCCCA;SOR=0.126;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=12;WE=94033808;WS=94033790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr7	94034848	rs810687	A	G	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.664;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=268;ReadPosRankSum=-1.789;SC=TTAATTTGTCACTCTGTGCTT;SOR=1.508;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=18;WE=94034856;WS=94034838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr7	94038934	rs42518	C	T	8838.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=148;NR=164;PP=2965;SC=AGTATACCTGCGTAGCTAAAA;SOR=0.866;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=314;TCF=149;TCR=165;TR=312;WE=94038942;WS=94038922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,324:1.00:324
chr7	94039032	rs42519	C	T	6710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=111;NR=125;PP=2965;SC=TTTTCCTTCACAGGGCCTTCC;SOR=0.928;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=237;TCF=112;TCR=125;TR=236;WE=94039040;WS=94039022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr7	94039187	rs2521206	A	G	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.068;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=292;ReadPosRankSum=0.029;SC=CTCTGCCATCATTTCATCACT;SOR=0.906;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=68;TCF=21;TCR=47;TR=23;WE=94039195;WS=94039177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,22:0.32:68
chr7	94039900	rs42520	C	T	318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=10;PP=234;SC=TACCCCTTCACTGGGAATTGG;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=94039908;WS=94039890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr7	94040133	rs389328	T	A	764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=4;PP=568;SC=TGCTATTTTTTACAAACTCTA;SOR=2.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=26;WE=94040141;WS=94040123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr7	94040287	rs34026686	G	A	1874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=1.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQRankSum=-1.798;QD=13.49;ReadPosRankSum=-0.007;SOR=0.566;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,86:0.62:139
chr7	94040345	rs35587403	GT	G	110.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.48;MQRankSum=0.959;QD=5.83;ReadPosRankSum=0.913;SOR=0.385;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr7	94043239	rs42524	C	G	7344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=136;NR=115;PP=2965;SC=ACAGGGTCCCCCTGGTCCTCC;SOR=0.817;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=251;TCF=136;TCR=115;TR=251;WE=94043247;WS=94043229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,272:1.00:272
chr7	94043274	rs421587	A	G	1148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FS=0.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.04;ReadPosRankSum=-0.443;SOR=0.733;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:214,70:0.25:284
chr7	94043493	rs2301643	G	A	5404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=378;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.393;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=119;NR=109;PP=2962;ReadPosRankSum=0.794;SC=TCTCCTGAACGTAGCCATGGG;SOR=0.658;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=355;TCF=185;TCR=170;TR=228;WE=94043501;WS=94043483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,249:0.66:377
chr7	94045576	rs42526	G	A	325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=2;PP=199;SC=CTAGTGGAGAGATTAGGAACA;SOR=2.494;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=94045584;WS=94045566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr7	94047903	rs3216182	AT	A	793.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=28;PP=274;ReadPosRankSum=2.510;SC=TCGTACTTGGATTTTTTTTTT;SOR=0.705;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=72;TCF=1;TCR=71;TR=28;WE=94047912;WS=94047893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,44:0.44:99
chr7	94055885	rs62464631	G	A	2034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.408;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=60;PP=1372;ReadPosRankSum=-1.126;SC=TGATCCTGAAGGCCTTCAGCT;SOR=0.785;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=296;TCF=134;TCR=162;TR=106;WE=94055893;WS=94055875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:199,113:0.36:312
chr7	94055933	rs13240759	T	C	2359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.751;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=62;PP=1768;ReadPosRankSum=0.036;SC=ATTGTTCCAGTATAGCCTATA;SOR=0.602;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=133;TCF=41;TCR=92;TR=91;WE=94055941;WS=94055923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,93:0.69:135
chr7	94056006	rs400218	A	G	939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=28;PP=782;SC=GCTATTTCATACCAACATGAA;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=30;WE=94056014;WS=94055996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr7	94056216	rs7805430	G	A	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=88;ReadPosRankSum=-1.219;SC=TTCTCAATCCGGAGTCCATTT;SOR=0.368;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=10;WE=94056224;WS=94056206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr7	94056244	rs413826	C	G	1905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.32;SOR=1.312;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr7	94056251	.	GAAA	G,GA	1898.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;QD=40.40;SOR=1.514;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,28,19:0.60,0.40:47
chr7	94056349	rs1800248	C	T	932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.345;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=20;PP=537;ReadPosRankSum=-0.675;SC=GTGCTCCTGGCTCCGTGGGTC;SOR=0.544;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=144;TCF=86;TCR=58;TR=48;WE=94056357;WS=94056339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,53:0.34:155
chr7	94058410	.	C	CT	96	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.68;FR=1.0000;HP=10;HapScore=2;MGOF=27;MMLQ=28;MQ=50.35;NF=4;NR=0;PP=96;QD=27.5;SC=TTCCTGAGATCTTTTTTTTTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=4;WE=94058418;WS=94058400;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,4:0.80:5
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chr7	94157585	rs57770781	CT	C	605.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.24;QD=21.63;SOR=0.997;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr7	94174854	rs3793326	T	C	2669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=26;PP=1759;SC=TCCTTTTCAATAGGTTTTATT;SOR=1.586;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=64;TCR=26;TR=90;WE=94174862;WS=94174844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr7	94175073	rs3793325	T	C	562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=19;PP=392;SC=GAAATTTCTTTGTAGTTGCTA;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=94175081;WS=94175063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr7	94176627	rs6958243	G	C	659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=19;PP=534;SC=CTGAAGCTGAGTACTCAGTGT;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=94176635;WS=94176617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr7	94178749	rs10272136	T	C	2630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=13;PP=1202;SC=GACTCTTATATAATCCAAACT;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=42;TCR=13;TR=55;WE=94178769;WS=94178739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr7	94178761	rs7801436	C	T	2983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=20;PP=1339;SC=ATCCAAACTTCAGAAAACTAT;SOR=1.997;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=50;TCR=20;TR=70;WE=94178769;WS=94178739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr7	94182373	rs6465417	A	G	1588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=19;PP=1080;SC=GCGTTGTACAACTTATGCAAT;SOR=1.262;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=33;TCR=19;TR=52;WE=94182381;WS=94182363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr7	94183993	rs10280843	G	A	1497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=7;NR=37;PP=1057;SC=TATGAAAATCGGACGTACTTT;SOR=3.126;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=7;TCR=37;TR=44;WE=94184001;WS=94183983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr7	94184691	rs10238176	T	A	857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=1;PP=571;SC=AATAAAATGGTTTTAGGAAAG;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=94184699;WS=94184681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr7	94227276	rs10247562	T	G	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.36;ReadPosRankSum=-0.826;SOR=0.425;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr7	94227319	.	TA	T	106.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.610;ClippingRankSum=0.000;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=1.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.19;MQRankSum=1.915;QD=1.98;ReadPosRankSum=-0.133;SOR=0.937;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,12:0.22:54
chr7	94227509	rs10232398	G	A	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.340;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=161;ReadPosRankSum=-0.202;SC=CCTCACCCTTGTCTACTCCTT;SOR=0.100;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=14;WE=94227517;WS=94227499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr7	94247971	rs6465421	C	A	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.36;ReadPosRankSum=0.595;SOR=0.423;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,11:0.22:50
chr7	94257449	.	TAC	T	261.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.819;ClippingRankSum=0.000;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=1.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.03;ReadPosRankSum=0.165;SOR=0.413;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,14:0.22:65
chr7	94879225	rs12690919	A	T	801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=3;PP=633;SC=TCTCAAGTGGATTCAGTGATT;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=28;WE=94879233;WS=94879215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr7	94937446	rs662	T	C	2742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=499;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.566;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.99;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=79;PP=1594;ReadPosRankSum=-0.428;SC=CTCCCAGGATTGTAAGTAGGG;SOR=0.777;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=452;TCF=202;TCR=250;TR=140;WE=94937454;WS=94937436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:339,158:0.32:497
chr7	94941038	rs1157745	G	T	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=128;ReadPosRankSum=-0.874;SC=GAGAAGCATTGGTGATTGCTC;SOR=1.688;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=8;WE=94941046;WS=94941028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr7	94946255	rs3917498	G	T	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=114;ReadPosRankSum=0.786;SC=TCAAATTGATGAATGCGATTA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=8;WE=94946263;WS=94946245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr7	94947799	rs2074351	G	A	795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.800;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=28;PP=500;ReadPosRankSum=-0.489;SC=CTCCTTCACTGTACTTTGCCT;SOR=0.568;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=117;TCF=33;TCR=84;TR=40;WE=94947807;WS=94947789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,42:0.34:122
chr7	94953913	rs705380	G	C	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=272;ReadPosRankSum=-0.216;SC=CCGCCGGGTCGGCAGCTAGCT;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=17;WE=94953921;WS=94953903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,18:0.69:26
chr7	94992244	rs10953143	T	C	805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=22;PP=657;SC=AAATGCACACTCCTTGAAAGT;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=94992252;WS=94992234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr7	94996913	rs3757708	T	G	74.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=3;PP=53;SC=TCTTGCATTTTACCCTCACAG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=94996921;WS=94996903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr7	95001555	rs1053275	C	T	10697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=395;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=201;NR=176;PP=2965;SC=TGATTTCTAGCGCTTGTGCCC;SOR=0.794;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=377;TCF=201;TCR=176;TR=377;WE=95001563;WS=95001545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,395:1.00:395
chr7	95019355	rs6977389	G	A	4377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=101;NR=40;PP=2947;SC=TGGTTTACCCGGAGGTGGGAT;SOR=1.752;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=101;TCR=40;TR=141;WE=95019363;WS=95019345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr7	95024046	rs11970910	A	G	10942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=414;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=190;NR=182;PP=2965;SC=ATAAAACCCAACCCTGGAAGT;SOR=0.703;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=374;TCF=191;TCR=183;TR=372;WE=95024054;WS=95024036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,412:1.00:412
chr7	95025600	rs13226149	G	A	14424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=535;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=225;NR=259;PP=2965;SC=TAAACGCCAGGAACATCTCCC;SOR=0.898;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=484;TCF=225;TCR=259;TR=484;WE=95025608;WS=95025590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,534:1.00:534
chr7	95034775	rs7493	G	C	1595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FS=0.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.08;ReadPosRankSum=0.133;SOR=0.771;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:224,90:0.29:314
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chr7	95039445	rs2286232	C	T	487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FS=0.679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.84;ReadPosRankSum=-1.026;SOR=0.815;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:132,40:0.23:172
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chr7	95775848	rs72289549	TA	T	303.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.71;ReadPosRankSum=1.724;SOR=0.586;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,35:0.31:112
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chr7	95813831	rs6962870	C	T	723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.637;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=25;PP=570;ReadPosRankSum=0.878;SC=AAGGACAAGACTGAGAAAAGA;SOR=2.115;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=42;TCF=3;TCR=39;TR=26;WE=95813839;WS=95813821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,27:0.63:43
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chr7	95818475	rs6957286	G	T	1971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=20;PP=1090;SC=AAAATTTATCGAGAGTTTTGG;SOR=1.308;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=46;TCR=20;TR=66;WE=95818483;WS=95818465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr7	95864108	rs6957975	T	C	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=12;PP=487;ReadPosRankSum=0.182;SC=GAAGCATGCTTCTTACCAAAA;SOR=0.745;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=122;TCF=78;TCR=44;TR=36;WE=95864116;WS=95864098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,37:0.30:124
chr7	96116813	rs10250692	T	C	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.781;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=12;PP=495;ReadPosRankSum=-0.159;SC=GGTGAGTGGCTGACTCGCCTC;SOR=0.600;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=113;TCF=82;TCR=31;TR=41;WE=96116821;WS=96116803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,42:0.37:114
chr7	97361784	rs2072100	C	T	781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.410;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=0;PP=602;ReadPosRankSum=-0.123;SC=GGTGAGACTTCAGTCCTTATG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=25;WE=97361792;WS=97361774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,27:0.77:35
chr7	97363472	rs67877395	C	G	4960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.913;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=118;NR=80;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.373;SC=GGTGAGAGTACATTTGTCTTG;SOR=0.623;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=291;TCF=175;TCR=116;TR=198;WE=97363480;WS=97363462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,214:0.67:321
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chr7	97488569	rs1049674	A	T	2231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=29;PP=1555;ReadPosRankSum=-0.510;SC=GTGCAGGGGTACATCCCGACA;SOR=0.727;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=148;TCF=100;TCR=48;TR=91;WE=97488577;WS=97488559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,96:0.62:155
chr7	97488790	rs41278833	A	G	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=26;PP=564;ReadPosRankSum=0.445;SC=CATCATCTACATTCCTATTTT;SOR=0.711;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=43;TCF=2;TCR=41;TR=28;WE=97488798;WS=97488780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,30:0.61:49
chr7	97498535	rs6465630	A	G	1818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.123;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=51;PP=1294;ReadPosRankSum=0.695;SC=TCAATATCCAATCCAACTCTG;SOR=0.518;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=88;TCF=20;TCR=68;TR=67;WE=97498543;WS=97498525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,71:0.76:94
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chr7	97784061	rs17435590	T	C	11948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=453;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=217;NR=206;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.251;SC=AACTGTTCTTTGATTTTAGGT;SOR=0.707;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=425;TCF=218;TCR=207;TR=423;WE=97784069;WS=97784051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,449:1.00:451
chr7	97816327	rs6465657	C	T	6448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=98;NR=122;PP=2965;SC=ATTGGCTTACCGTTTTATTAG;SOR=1.059;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=221;TCF=98;TCR=123;TR=220;WE=97816335;WS=97816317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr7	97822115	rs11765552	T	A	13518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=507;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=230;NR=235;PP=2965;SC=TAAGCCAGGCTTGTCTTTGTT;SOR=0.697;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=465;TCF=230;TCR=235;TR=465;WE=97822123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,507:1.00:507
chr7	97822210	rs3801294	G	A	13686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=498;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=237;NR=221;PP=2965;SC=AGTCTTCCCCGGAAGTGCAGG;SOR=0.742;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=458;TCF=237;TCR=221;TR=458;WE=97822218;WS=97822200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,498:1.00:498
chr7	97846856	rs11471393	CGAG	C	7016.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=6;NR=81;PP=2978;SC=CTCGGGGACTCGAGGATCCTG;SOR=0.994;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=90;TCF=7;TCR=83;TR=87;WE=97846866;WS=97846846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr7	97851109	rs4729416	T	C	1512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=37;PP=981;SC=TTCTCCTCCTTGCATGGGCCA;SOR=2.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=14;TCR=37;TR=51;WE=97851117;WS=97851099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr7	97852899	rs2270595	A	G	3488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=26;PP=2663;SC=CCCGGGGTGCAGGGAACCAGA;SOR=2.689;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=99;TCR=26;TR=125;WE=97852907;WS=97852889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr7	97866327	rs180852874	A	G	1575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.134;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=48;PP=1100;ReadPosRankSum=-0.333;SC=AGGGTCCTCCATGTGCAGGTG;SOR=0.465;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=96;TCF=21;TCR=75;TR=63;WE=97866335;WS=97866317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,65:0.66:99
chr7	97874143	rs3816944	C	A	4540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=64;PP=2965;SC=CAGGGACAGGCGGGAGGCACC;SOR=0.927;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=148;TCF=84;TCR=64;TR=148;WE=97874151;WS=97874133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr7	97911618	rs111849767	G	A	3660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=38;PP=2519;SC=GTGGCGGTCCGATTTCTCCTC;SOR=1.539;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=90;TCR=38;TR=128;WE=97911626;WS=97911608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr7	97920270	rs7778015	T	C	774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=5;PP=542;SC=TGTAGCTGGGTGGTGGGGTGG;SOR=2.468;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=27;WE=97920278;WS=97920260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr7	97921834	rs6465664	A	G	591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=3;PP=509;SC=TTGGCAGCCAAAGATGATTTC;SOR=3.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=97921842;WS=97921824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr7	97922773	rs12873	T	C	684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=5;PP=488;SC=GCAGACAGGATGCGCCCATCA;SOR=2.494;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=24;WE=97922781;WS=97922763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr7	97922851	rs12728	C	T	3906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=84;NR=47;PP=2295;SC=TGATGGGTGCCGAGCGATCAT;SOR=1.132;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=84;TCR=47;TR=131;WE=97922859;WS=97922841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr7	97922875	rs13008	G	A	4708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=69;PP=2521;ReadPosRankSum=-1.206;SC=TCACAGTCGGGCGGAGTTTCA;SOR=0.857;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=167;TCF=97;TCR=70;TR=165;WE=97922883;WS=97922865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,182:0.99:184
chr7	97933601	rs1045916	C	T	8191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=160;NR=127;PP=2965;SC=CCCCCATGGACAAGCATTCCA;SOR=0.898;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=288;TCF=160;TCR=128;TR=287;WE=97933609;WS=97933591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,309:1.00:309
chr7	97935671	rs13232181	C	G	5250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=115;NR=47;PP=2965;SC=GCCTGCGACACAGCTAGATGG;SOR=1.597;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=162;TCF=115;TCR=47;TR=162;WE=97935679;WS=97935661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr7	97937258	rs6465666	T	C	13843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=504;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=248;NR=221;PP=2965;SC=TGAGAATCAATAGGCACATTC;SOR=0.828;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=470;TCF=248;TCR=222;TR=469;WE=97937266;WS=97937248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,504:1.00:504
chr7	97939998	rs139666268	C	CTATTTATT	186.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=0;NR=8;PP=655;SC=AAATAATAGGCTATTTATTTA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=8;WE=97940006;WS=97939988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr7	97944744	rs2107716	G	A	4921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=107;NR=64;PP=2937;SC=TTATTAATACGCTCAAGGCAA;SOR=1.166;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=173;TCF=107;TCR=66;TR=171;WE=97944752;WS=97944734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr7	97944931	.	A	AAAT,AAATAAT	937	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.38;FR=0.4999,0.5001;HP=12;HapScore=1;MGOF=3;MMLQ=28;MQ=61.59;NF=0,0;NR=29,29;PP=26,937;QD=1.06896551724;SC=CATACTAAAAAAAAAAAAATA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=29,29;WE=97944945;WS=97944920;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.67:43
chr7	97944933	rs11385557	A	AT	3031.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.55;QD=43.31;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr7	97944935	rs11385558	A	AT	3032.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.38;QD=45.26;SOR=1.716;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr7	97944937	rs372695844	A	ATAAT	2836.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.48;QD=50.66;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr7	97944986	rs6963210	G	A	420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=71;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=13;PP=318;SC=ATCAGATAGCGTGCAGCCTGA;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=97944994;WS=97944976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr7	97991792	rs3801257	A	G	4251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=85;PP=2689;SC=AAAATAAACCAAGTCATCTTC;SOR=1.285;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=56;TCR=85;TR=141;WE=97991800;WS=97991782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr7	98460824	rs10238224	C	A	12296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=459;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=242;NR=180;PP=2965;SC=CGTGGCCGACCACACGGATGG;SOR=0.963;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=424;TCF=244;TCR=180;TR=422;WE=98460832;WS=98460814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,457:1.00:457
chr7	98461062	rs1548622	G	A	4704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=101;PP=2959;SC=TCAGAATGGTGTGTGGCAAGG;SOR=1.388;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=160;TCF=59;TCR=101;TR=160;WE=98461070;WS=98461052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr7	98495299	rs35409546	G	GTT	325.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.28;QD=36.19;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr7	98495304	rs56294747	G	T	592.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=3;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=3;PP=448;SC=GTTTTGTTTTGTTTTTGAATG;SOR=3.056;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=19;WE=98495312;WS=98495289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr7	98500956	rs7777927	C	T	4857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=113;NR=58;PP=2965;SC=TTTTTCTTAACACTCTCCTAT;SOR=1.455;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=171;TCF=113;TCR=58;TR=171;WE=98500964;WS=98500946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr7	98503707	rs3214239	TG	T	1573.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=9;PP=1192;SC=CATATCAGACTGGCGGGCTGG;SOR=2.007;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=30;WE=98503715;WS=98503697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
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chr7	98513300	rs1859662	C	T	1556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=4;PP=1056;SC=GGGTATAGACCCTCCTCATTT;SOR=4.047;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=39;TCR=4;TR=43;WE=98513308;WS=98513290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
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chr7	98550654	rs66469618	TTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	T	4147.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=14;NR=12;PP=3000;SC=TCATGTTACATTGTGTGTGTG;SOR=2.621;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=38;TCF=18;TCR=20;TR=26;WE=98550693;WS=98550644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr7	98553739	rs3214240	T	TC	1086.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=18;NR=6;PP=950;SC=GCTCCCATGTTCCGGCGTGAT;SOR=2.376;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=24;WE=98553747;WS=98553729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr7	98558880	rs160384	G	C	7705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=158;NR=94;PP=2965;SC=GTTGTCCATTGCAGGAGCAGC;SOR=1.154;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=254;TCF=160;TCR=94;TR=252;WE=98558888;WS=98558870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr7	98639904	.	AT	A	33.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.162;ClippingRankSum=0.000;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.19;MQRankSum=3.263;QD=0.46;ReadPosRankSum=0.066;SOR=0.815;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,12:0.16:74
chr7	98648517	rs57957340	TG	T	444.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=19.678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.29;MQRankSum=1.795;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.261;SOR=0.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,24:0.39:61
chr7	98649755	rs371032343	CA	C	63.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=1.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.12;ReadPosRankSum=2.086;SOR=0.323;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,9:0.30:30
chr7	98659812	rs67817120	GGT	G	814.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.93;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr7	98659813	.	GTGA	G	336	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;FR=1.0000;HP=2;HapScore=3;MGOF=5;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=3;NR=4;PP=336;QD=55.361382086;SC=GAACTCCTGGGTGATTCAAGC;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=7;WE=98659825;WS=98659803;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,7:0.88:8
chr7	98659816	rs11295323	AT	A	814.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.74;SOR=1.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr7	98659817	.	T	A	226	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;FR=1.0000;HP=1;HapScore=3;MGOF=5;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=8;NR=5;PP=226;QD=20.0593240421;SC=TCCTGGGTGATTCAAGCAATC;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=16;TCF=10;TCR=6;TR=13;WE=98659825;WS=98659803;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,13:0.81:16
chr7	98771462	rs10499948	A	G	1961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=445;ExcessHet=3.0103;FS=0.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.44;ReadPosRankSum=0.037;SOR=0.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:315,127:0.29:442
chr7	98779740	rs6465740	G	T	6257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=96;NR=119;PP=2965;SC=AACCTAAATAGAGGACACCAA;SOR=0.997;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=215;TCF=96;TCR=119;TR=215;WE=98779748;WS=98779730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr7	98782750	rs10953283	C	T	5936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=399;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.385;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=128;NR=127;PP=2962;ReadPosRankSum=0.326;SC=CATCTGTGCCCGTGACAATGT;SOR=0.679;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=373;TCF=188;TCR=185;TR=255;WE=98782758;WS=98782740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,266:0.67:398
chr7	98785818	rs12673020	A	G	104.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.20;QD=20.98;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr7	98877275	rs115927539	G	A	1001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FS=1.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.39;ReadPosRankSum=1.833;SOR=0.807;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:133,53:0.28:186
chr7	99159333	rs940335	G	C	261.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=2;PP=203;SC=CACGCATAAGGCATGCAAGTA;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=99159341;WS=99159330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr7	99201933	.	ACT	A	535.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.523;ClippingRankSum=0.000;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=434;ReadPosRankSum=0.267;SC=TTCCCCAGCCACTGTCTCCTT;SOR=0.733;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=37;TCF=23;TCR=14;TR=12;WE=99201942;WS=99201923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,16:0.33:49
chr7	99293475	rs2740565	T	A	10501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=388;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=200;NR=168;PP=2965;SC=ACAAACTGAATCAGAAATCAG;SOR=0.801;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=368;TCF=200;TCR=168;TR=368;WE=99293483;WS=99293465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,388:1.00:388
chr7	99293859	rs11401860	C	CT	229.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=4.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.99;ReadPosRankSum=-1.439;SOR=0.184;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,16:0.70:23
chr7	99297601	rs2037500	A	C	7935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=137;NR=132;PP=2965;SC=AGAGGAGCACAAGGCTGACAG;SOR=0.771;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=269;TCF=137;TCR=132;TR=269;WE=99297609;WS=99297591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,293:1.00:293
chr7	99297804	rs2177180	C	T	490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=331;SC=GAGAAGGAGGCGGGGCTGCAG;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=99297812;WS=99297794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr7	99302994	rs10211	C	T	6404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=146;NR=73;PP=2965;ReadPosRankSum=1.297;SC=ACAGAATCCCCGATTATTTAT;SOR=0.603;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=220;TCF=147;TCR=73;TR=219;WE=99303002;WS=99302984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,232:1.00:233
chr7	99303094	rs12360	G	A	10064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=378;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=158;NR=194;PP=2965;SC=CAGCTTTCTTGAAGAGCAAAC;SOR=0.928;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=353;TCF=159;TCR=194;TR=352;WE=99303102;WS=99303084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,376:1.00:376
chr7	99305743	.	A	G	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.365;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.701;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=107;ReadPosRankSum=-2.379;SC=CCTGCTATGCATATTTTGCTA;SOR=0.047;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=12;WE=99305751;WS=99305733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr7	99306566	rs2687077	C	T	2495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=8;PP=1792;SC=GACAAGCAAACGATTGTACAA;SOR=4.255;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=65;TCR=8;TR=73;WE=99306574;WS=99306556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr7	99306685	rs2257401	C	G	13207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=482;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=237;NR=207;PP=2965;SC=CTCAGGCTCTCTCCAGTACTT;SOR=0.816;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=444;TCF=237;TCR=207;TR=444;WE=99306693;WS=99306675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,482:1.00:482
chr7	99312311	.	G	GA	54.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.516;ClippingRankSum=0.000;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=1.313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQRankSum=2.277;QD=0.83;ReadPosRankSum=-0.895;SOR=0.908;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,11:0.17:66
chr7	99314986	rs2687075	A	G	9522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=149;NR=162;PP=2965;SC=GTGACATTGTATAATGAATTT;SOR=0.800;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=311;TCF=149;TCR=162;TR=311;WE=99314994;WS=99314976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,333:1.00:333
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chr7	99370493	rs2738258	T	C	1362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=43;PP=1218;SC=CAGGAGCCACTCAAGTCTTCA;SOR=7.523;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=43;WE=99370501;WS=99370483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
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chr7	99501313	rs2572003	A	T	7830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=114;NR=153;PP=2965;SC=TGACGGTTGCATTTGCTCATG;SOR=1.071;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=267;TCF=114;TCR=153;TR=267;WE=99501321;WS=99501303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,289:1.00:289
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chr7	99567908	rs2527917	C	T	893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=23;PP=534;ReadPosRankSum=0.755;SC=CTCTTGTCACCCAGGCTGTAG;SOR=0.748;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=57;TCF=23;TCR=34;TR=37;WE=99567916;WS=99567898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,41:0.63:65
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chr7	99580907	rs2301806	C	G	1408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.631;NF=45;NR=32;ReadPosRankSum=-1.745;SC=GCCCCTGGGACCATGGAGACA;SOR=0.658;SbPval=0.53;Source=Platypus;TCF=154;TR=77;WE=99580915;WS=99580897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:206,80:0.28:286
chr7	99589843	rs66748925	A	G	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=40;ReadPosRankSum=-0.749;SC=GCGTGGTGTCATGCACCTGTA;SOR=0.105;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=6;WE=99589851;WS=99589833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,5:0.23:22
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chr7	99654689	rs11558476	G	A	1114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.869;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=31;PP=781;ReadPosRankSum=-0.744;SC=CACAGGAGCAGGTGGGGCCTC;SOR=0.814;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=187;TCF=94;TCR=93;TR=59;WE=99654697;WS=99654679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,62:0.31:201
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chr7	99673359	rs56054049	A	C	753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.542;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=29;PP=468;ReadPosRankSum=0.227;SC=GGGACAACACAGGACCCTCTC;SOR=0.978;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=114;TCF=41;TCR=73;TR=42;WE=99673367;WS=99673349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,44:0.34:128
chr7	99686873	rs4729575	G	T	1422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=31;PP=996;ReadPosRankSum=-1.743;SC=AGAACGTGGGGCCCGGACTCT;SOR=0.704;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=195;TCF=111;TCR=84;TR=71;WE=99686881;WS=99686863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,72:0.36:201
chr7	99691740	rs1527423	G	A	12119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=429;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=205;NR=198;PP=2965;SC=AGCACGGTAAGGAGCTACCCC;SOR=0.726;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=403;TCF=205;TCR=198;TR=403;WE=99691748;WS=99691730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,429:1.00:429
chr7	99692040	.	G	C	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.331;ClippingRankSum=0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=418;ReadPosRankSum=2.233;SC=GTTGTTTTCTGTACCAGGGCT;SOR=0.502;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=21;WE=99692048;WS=99692030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,23:0.64:36
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chr7	99693078	rs12267	G	A	792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FS=3.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.05;ReadPosRankSum=-1.660;SOR=0.628;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:105,52:0.33:157
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chr7	99701640	rs4729577	T	C	9004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=186;NR=125;PP=2965;SC=ACTGTCCTGTTCTTTCTCCCT;SOR=1.060;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=312;TCF=187;TCR=125;TR=311;WE=99701648;WS=99701630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,335:1.00:335
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chr7	99704827	rs1050542	A	G	486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=3;PP=248;SC=ACGTGTGTACATGTCTGCATG;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=99704835;WS=99704817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr7	99706303	rs4134923	A	G	724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=18;PP=508;SC=GCCCCTGTTGAAGGCCAAATT;SOR=2.925;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=99706311;WS=99706293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr7	99707712	rs2272338	A	G	13573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=501;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=254;NR=226;PP=2965;SC=AGAAGGGAAAAGGACAAGCAA;SOR=0.776;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=481;TCF=254;TCR=227;TR=480;WE=99707723;WS=99707702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,500:1.00:500
chr7	99707950	rs4134917	C	T	3987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=77;PP=2196;SC=GGATGATTGACAGGGACCTAA;SOR=1.410;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=48;TCR=77;TR=125;WE=99707958;WS=99707940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr7	99710584	rs4134904	A	AG	4294.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=61;PP=2875;SC=TGAGCATAGTAGAAAAGTAAA;SOR=1.460;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=63;TCF=2;TCR=61;TR=63;WE=99710592;WS=99710574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr7	99711040	rs4134903	G	A	2620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.552;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=45;PP=1303;ReadPosRankSum=-0.316;SC=TGCAAGGAAGGCAGGTGTCAA;SOR=0.716;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=169;TCF=95;TCR=74;TR=106;WE=99711048;WS=99711030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,123:0.64:192
chr7	99711461	rs34119670	AC	A	7258.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.472;HP=11;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;MQRankSum=0.200;NF=59;NR=109;PP=2940;ReadPosRankSum=1.972;SC=ATGGCGTCTCACCCCCCCCCC;SOR=0.350;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=210;TCF=78;TCR=132;TR=168;WE=99711479;WS=99711451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:5,266:0.98:271
chr7	99720640	rs1569055	C	G	2403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=50;PP=1535;SC=GGGGAAGGGGCCAGAGTGAGG;SOR=2.010;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=22;TCR=50;TR=72;WE=99720648;WS=99720630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr7	99722266	rs1880949	G	T	2877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.489;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=58;PP=1752;ReadPosRankSum=1.080;SC=TAAGCGTAAGGGTTGAACTCC;SOR=0.629;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=208;TCF=110;TCR=98;TR=121;WE=99722274;WS=99722256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,133:0.58:229
chr7	99746444	rs58185311	CG	C	2314.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.872;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.759;NF=34;NR=14;PP=1895;ReadPosRankSum=-0.284;SC=GGTCTGACGACGTGGCCACTG;SOR=1.029;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=76;TCF=49;TCR=27;TR=48;WE=99746452;WS=99746434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,66:0.65:102
chr7	99747130	rs12878	G	A	14084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=532;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=265;NR=235;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.070;SC=AGACTTCTGCGCTGACCCAGG;SOR=0.364;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=501;TCF=265;TCR=236;TR=500;WE=99747138;WS=99747120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,531:1.00:532
chr7	99747378	rs7785392	G	T	791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=24;PP=672;SC=TGGAATCTTAGTCTCCTAACG;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=99747386;WS=99747368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr7	99751017	rs3736591	A	G	2834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=36;PP=1825;SC=CTCCGTCTGCATGCAGTCATC;SOR=1.232;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=105;TCF=69;TCR=36;TR=104;WE=99751025;WS=99751007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr7	99751281	rs3736590	G	T	7467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=127;NR=112;PP=2965;SC=GGGACTCCCTGGTATCAGAAT;SOR=0.804;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=239;TCF=127;TCR=112;TR=239;WE=99751289;WS=99751271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
chr7	99753121	rs2272337	A	G	4329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=72;PP=2633;SC=GGCTTCCAGGACCCAGGCCTC;SOR=0.783;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=146;TCF=74;TCR=72;TR=146;WE=99753129;WS=99753111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr7	99757612	rs3823646	G	A	6851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=144;NR=89;PP=2965;SC=GAACTGCTTGGCATCCAGCTT;SOR=1.120;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=233;TCF=144;TCR=89;TR=233;WE=99757620;WS=99757602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr7	99758136	rs3800951	T	G	13973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=513;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=223;NR=249;PP=2965;SC=AGTCCAGCCATGCCAGACCCC;SOR=0.808;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=473;TCF=223;TCR=250;TR=472;WE=99758144;WS=99758126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,512:1.00:512
chr7	99768957	rs75779608	C	T	1445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FS=1.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.49;ReadPosRankSum=1.153;SOR=0.797;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,78:0.40:193
chr7	99771305	rs71126309	C	CTCTT	73.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.43;MQRankSum=2.294;QD=3.21;ReadPosRankSum=-0.456;SOR=0.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,4:0.17:23
chr7	99772298	rs10252037	A	C	8593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=171;NR=131;PP=2965;SC=ATACTCAGGCACCCTCCAACC;SOR=0.887;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=302;TCF=171;TCR=131;TR=302;WE=99772306;WS=99772288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,325:1.00:325
chr7	99774122	rs12705073	T	C	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=3;PP=27;ReadPosRankSum=0.783;SC=CCCTCTTCCCTACCTGAACCT;SOR=0.368;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=4;WE=99774130;WS=99774112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr7	99778227	rs11531577	G	T	1448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.034;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=34;PP=996;ReadPosRankSum=-0.059;SC=AGAGGGCCTTGTCTGCATCTT;SOR=0.737;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=238;TCF=122;TCR=116;TR=73;WE=99778235;WS=99778217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,81:0.32:256
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chr7	99811464	rs1727130	C	G	12236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=443;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=211;NR=203;PP=2965;SC=ATGTATCCTTCGGAAATGCTG;SOR=0.721;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=414;TCF=211;TCR=203;TR=414;WE=99811472;WS=99811454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,442:1.00:442
chr7	99816179	rs1727142	T	C	9302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=353;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=187;NR=142;PP=2965;SC=TGAGCTCTGCTGGAAGTGACT;SOR=0.897;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=329;TCF=187;TCR=142;TR=329;WE=99816187;WS=99816169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,353:1.00:353
chr7	99816256	rs1727143	C	A	3602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.481;HP=1;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.672;NF=71;NR=91;PP=2409;ReadPosRankSum=-1.426;SC=GAGAGTCTTCCGTTACTAGGT;SOR=0.812;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=266;TCF=117;TCR=149;TR=162;WE=99816264;WS=99816246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,162:0.58:277
chr7	99816272	rs1636986	A	G	8349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.66;QD=42.38;SOR=1.286;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr7	99816275	rs1636987	G	C	8144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.18;QD=45.76;SOR=1.418;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr7	99817585	rs7786505	G	T	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-2.075;NF=11;NR=4;PP=178;ReadPosRankSum=1.150;SC=ACCTGGACTGGAGGGGGCCAT;SOR=0.541;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=15;WE=99817593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,15:0.42:36
chr7	99817859	rs2906645	A	G	2027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=45;PP=1460;SC=GGGGGGCCCCAACGGTGCTGG;SOR=1.288;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=27;TCR=45;TR=72;WE=99817867;WS=99817849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr7	99818137	rs2906646	G	A	1024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.518;NF=17;NR=22;PP=624;ReadPosRankSum=-0.291;SC=CTCGGGAACTGGCCACCCATC;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=59;TCF=25;TCR=34;TR=39;WE=99818145;WS=99818127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,42:0.68:62
chr7	99818927	rs705867	C	T	3623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.997;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.252;NF=63;NR=81;PP=2207;ReadPosRankSum=-1.020;SC=CTGGGTGTCACCCCCTTACTT;SOR=0.785;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=226;TCF=102;TCR=124;TR=144;WE=99818935;WS=99818917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,164:0.63:259
chr7	99819004	rs141918023	CTCTG	C	2503.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQ=61.81;NF=2;NR=40;PP=2158;SC=CGGATGTGGTCTCTGTGTGTG;SOR=2.872;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=2;TCR=44;TR=42;WE=99819015;WS=99818994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr7	99821381	rs858508	C	G	3098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=68;PP=2144;SC=AACCTCTCACCCTGAGACTCT;SOR=2.494;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=22;TCR=68;TR=90;WE=99821389;WS=99821371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr7	99821470	rs858509	A	G	2819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=24;PP=1880;SC=AGGCGGGCCCAAGTGTGCAAG;SOR=1.848;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=69;TCR=25;TR=93;WE=99821478;WS=99821460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr7	99821685	rs863450	C	T	3336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.310;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=64;PP=2199;ReadPosRankSum=0.346;SC=TCAGGTGCTCCGAGGAGGGCA;SOR=1.167;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=106;TCF=42;TCR=64;TR=105;WE=99821693;WS=99821675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,115:0.99:116
chr7	99821894	.	C	T	140	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=36;MMLQ=16;MQ=58.08;NF=1;NR=6;PP=140;QD=24.9673160782;SC=GGCTGGAGTGCCTGGAGTGGT;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=7;WE=99821902;WS=99821884;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,7:0.88:8
chr7	99956546	rs201245883	A	C	1735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FS=1.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQRankSum=0.440;QD=5.11;ReadPosRankSum=-1.328;SOR=0.591;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:242,98:0.29:340
chr7	99971313	rs2405442	T	C	5639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=389;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.465;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=145;NR=86;PP=2962;ReadPosRankSum=-3.725;SC=CCTACTGCCCTTGCTGCTGCC;SOR=0.878;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=357;TCF=217;TCR=140;TR=231;WE=99971331;WS=99971303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,251:0.65:389
chr7	99971834	rs1859788	A	G	2811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.794;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.273;NF=59;NR=54;PP=1950;ReadPosRankSum=1.184;SC=CCACTTCCACAGGCAGTCCTT;SOR=0.621;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=169;TCF=85;TCR=84;TR=113;WE=99971842;WS=99971824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,120:0.67:179
chr7	100004446	rs1476679	C	T	2763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=73;PP=1740;ReadPosRankSum=-1.598;SC=GATCCTGTTACGGACTCCTGT;SOR=0.754;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=155;TCF=50;TCR=105;TR=109;WE=100004454;WS=100004436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,119:0.70:169
chr7	100006965	rs2286265	C	T	1140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.708;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=7;PP=902;ReadPosRankSum=-1.090;SC=ACTATATTTACGTAGTATTTA;SOR=1.946;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=62;TCF=51;TCR=11;TR=46;WE=100006973;WS=100006955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,45:0.71:63
chr7	100172858	rs3197597	C	T	2431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.569;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=41;PP=1547;ReadPosRankSum=-0.041;SC=ACCCGCTTCACGGCCTCCAGC;SOR=0.699;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=114;TCF=62;TCR=52;TR=95;WE=100172866;WS=100172848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,101:0.83:122
chr7	100175473	rs909152	T	C	8765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=584;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=179;NR=180;PP=2962;ReadPosRankSum=1.025;SC=GTTCTCTGGGTCCCCGGGGCT;SOR=0.710;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=556;TCF=276;TCR=280;TR=359;WE=100175481;WS=100175463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:205,379:0.65:584
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chr7	100198386	rs11768465	C	T	7163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=521;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=158;NR=160;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.988;SC=CAGGACCGCACGGAGAAGATG;SOR=0.682;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=497;TCF=245;TCR=252;TR=318;WE=100198394;WS=100198376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:190,329:0.63:519
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chr7	100202219	rs56328569	C	G	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=251;ReadPosRankSum=2.232;SC=CCTCCAACCCCGGGGGGCCCC;SOR=1.292;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=14;WE=100202227;WS=100202209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr7	100211486	rs7812235	G	C	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.450;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=80;ReadPosRankSum=1.068;SC=TCAGGTGAGGGGGAAAAGACT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=100211494;WS=100211476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr7	100212386	rs202084428	T	TA	677.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=2.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.22;MQRankSum=0.797;QD=11.69;ReadPosRankSum=-0.161;SOR=0.466;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,35:0.60:58
chr7	100212754	rs11764045	C	T	2934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=65;PP=1793;ReadPosRankSum=-1.054;SC=CGACCCTATTCTTTCTTTGTC;SOR=0.659;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=187;TCF=85;TCR=102;TR=120;WE=100212762;WS=100212744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,133:0.64:208
chr7	100212880	.	CCT	C	436.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.937;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.083;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=353;ReadPosRankSum=1.881;SC=GATGCTCATACCTTACCTTGC;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=9;WE=100212889;WS=100212870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr7	100225031	rs2075674	G	A	2295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=40;PP=1353;ReadPosRankSum=0.097;SC=CCTGGGCCACGGCGGGCAGGC;SOR=0.703;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=83;TCR=61;TR=94;WE=100225039;WS=100225021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,106:0.66:161
chr7	100227188	rs7457868	A	C	813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=24;PP=580;SC=TGGGTGCCTGAGGTCATTCTG;SOR=3.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=28;WE=100227196;WS=100227178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr7	100240771	rs1052897	A	T	6525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.39;SOR=1.215;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chr7	100252918	rs2231172	A	G	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.228;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=6;PP=241;ReadPosRankSum=2.094;SC=AGCGAGAAGAACCCTGGCAGC;SOR=0.093;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=15;WE=100252926;WS=100252908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr7	100274063	rs62482252	C	A	3833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.876;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=54;PP=2373;ReadPosRankSum=-0.917;SC=GGCTCAGAATCTGACCCTGTC;SOR=0.535;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=214;TCF=139;TCR=75;TR=155;WE=100274071;WS=100274053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,165:0.72:230
chr7	100280624	rs12531792	G	A	1181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.139;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=18;PP=729;ReadPosRankSum=-2.070;SC=GGAGGTTCCCGGCCTGCTCAC;SOR=0.539;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=60;TCF=38;TCR=22;TR=45;WE=100280632;WS=100280614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,49:0.77:64
chr7	100280896	rs221793	A	C	7163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=137;NR=106;PP=2965;ReadPosRankSum=0.735;SC=AGGGTTGTCCACCCAGCCAGC;SOR=0.890;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=245;TCF=138;TCR=107;TR=243;WE=100280904;WS=100280886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,264:0.99:266
chr7	100281768	rs221794	T	C	6584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=125;NR=108;PP=2965;SC=GCGCGCACTGTGGGAGCTGGC;SOR=0.769;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=233;TCF=125;TCR=108;TR=233;WE=100281776;WS=100281758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr7	100282538	rs11974395	G	A	4441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=86;PP=2769;ReadPosRankSum=0.930;SC=AGAAAAAGAAGAAAGGCTCAG;SOR=0.676;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=274;TCF=146;TCR=128;TR=183;WE=100282546;WS=100282528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,198:0.66:302
chr7	100283261	rs221795	C	T	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5164;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=29;ReadPosRankSum=0.253;SC=AGAGGGAATGCGGTGCCCTGA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=100283269;WS=100283251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr7	100284510	rs35436931	TG	T	4248.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=17;NR=77;PP=2611;SC=CAAGAAACGTTGGGGGGGCCA;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=106;TCF=20;TCR=86;TR=94;WE=100284518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr7	100284913	rs221796	C	G	4296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=65;PP=2860;SC=GCCCCCTCCCCGCCCCACCTG;SOR=0.999;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=151;TCF=86;TCR=65;TR=151;WE=100284921;WS=100284903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr7	100285888	rs2272572	C	T	1600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.492;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=36;PP=937;ReadPosRankSum=-0.389;SC=TTTGAGAGGCCGGGGGTGGGG;SOR=0.845;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=110;TCF=53;TCR=57;TR=68;WE=100285896;WS=100285878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,77:0.64:121
chr7	100285974	rs221797	A	C	3014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=31;PP=2300;SC=ACGAAGGAGAACTTTAAAGCG;SOR=1.679;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=68;TCR=32;TR=98;WE=100285982;WS=100285964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr7	100333192	rs112964818	G	GA	681.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.27;SOR=3.014;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr7	100344359	rs2293769	T	C	5539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=115;PP=2965;SC=TTTACACTGATCTGGGCGCAT;SOR=1.236;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=191;TCF=75;TCR=116;TR=190;WE=100344367;WS=100344349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr7	100344428	rs80134072	G	A	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.432;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=248;ReadPosRankSum=-0.214;SC=AGGGAGGTCTGGAATATGTGC;SOR=0.145;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=54;TCF=4;TCR=50;TR=16;WE=100344436;WS=100344418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,16:0.29:55
chr7	100345106	rs2075671	G	A	1481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.879;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=17;PP=1043;ReadPosRankSum=-0.125;SC=CATCCTCCTAGGTATAGTTCA;SOR=0.902;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=95;TCF=67;TCR=28;TR=61;WE=100345114;WS=100345096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,63:0.65:97
chr7	100348940	rs2075669	T	C	887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=26;PP=613;SC=TGAGGTTCCCTGGAGTTCTCT;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=32;WE=100348948;WS=100348930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
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chr7	100361675	rs2293767	G	A	8286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=511;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.337;NF=171;NR=175;PP=2962;ReadPosRankSum=1.476;SC=CGTGAAGGCCGCTTCCTTCTT;SOR=0.732;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=468;TCF=232;TCR=236;TR=346;WE=100361683;WS=100361665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,376:0.74:509
chr7	100364105	rs11296431	CA	C	6539.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FS=1.709;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.21;MQRankSum=0.361;QD=25.55;ReadPosRankSum=1.789;SOR=1.342;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:6,250:0.98:256
chr7	100365567	rs10953302	C	T	4559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.946;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=102;PP=2736;ReadPosRankSum=0.250;SC=AAGTTCGCTACGACGGGAGCC;SOR=0.813;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=288;TCF=137;TCR=151;TR=188;WE=100365575;WS=100365557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,207:0.65:318
chr7	100365613	rs10953303	G	T	2418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.707;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=61;PP=1530;ReadPosRankSum=-0.069;SC=CTCCTATGGCGGCCAGCTCTG;SOR=0.926;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=164;TCF=68;TCR=96;TR=98;WE=100365621;WS=100365603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,109:0.61:180
chr7	100366203	rs10232130	C	G	11520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=429;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=225;NR=173;PP=2965;SC=GGGGCCCCTTCTTGCCTGTTT;SOR=0.902;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=398;TCF=225;TCR=173;TR=398;WE=100366211;WS=100366193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,429:1.00:429
chr7	100366284	rs10247980	T	C	11271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=413;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=173;NR=208;PP=2965;SC=GACAGAAAGCTTGCAGGCGAT;SOR=1.007;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=381;TCF=173;TCR=208;TR=381;WE=100366292;WS=100366274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,413:1.00:413
chr7	100370800	rs489951	T	C	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.478;NF=13;NR=0;PP=264;ReadPosRankSum=-0.686;SC=GTGCTGGGATTACATGTGCGA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=13;WE=100370808;WS=100370790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr7	100371100	rs2734880	C	A	620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=22;PP=956;ReadPosRankSum=-0.099;SC=ACTGACCCAGCGGGCTCCTAC;SOR=0.662;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=40;TCR=76;TR=34;WE=100371122;WS=100371090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,35:0.28:126
chr7	100371114	rs314298	C	T	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.832;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=956;ReadPosRankSum=0.361;SC=CTCCTACCACCCGGTGAGAGG;SOR=0.312;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=77;TCF=22;TCR=55;TR=22;WE=100371122;WS=100371090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,23:0.27:84
chr7	100371474	rs78193191	G	A	8787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=358;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.373;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=97;PP=2962;ReadPosRankSum=1.508;SC=GGGCTGCTCCGTTTCGGGCCT;SOR=0.850;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=286;TCF=114;TCR=172;TR=155;WE=100371484;WS=100371464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,224:0.63:358
chr7	100371476	rs148800656	T	TG	8809.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=347;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.021;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=95;PP=2933;ReadPosRankSum=1.518;SC=GCTGCTCCGTTTCGGGCCTCA;SOR=0.870;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=178;TCF=12;TCR=166;TR=102;WE=100371484;WS=100371464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,218:0.63:347
chr7	100373077	rs542137	C	G	9216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=635;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=200;NR=191;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.169;SC=CCTTGCCCTTCTTCAAGATCA;SOR=0.694;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=603;TCF=307;TCR=296;TR=391;WE=100373085;WS=100373058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:225,410:0.65:635
chr7	100373271	rs540330	G	T	4305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.632;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=71;PP=2769;ReadPosRankSum=0.013;SC=CCTACTCACCGTCACTGTCCT;SOR=0.815;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=241;TCF=133;TCR=108;TR=163;WE=100373279;WS=100373261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,177:0.69:257
chr7	100373367	rs539445	G	C	6494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=456;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.546;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=139;NR=130;PP=2962;ReadPosRankSum=0.633;SC=AGCATCTACAGCATTGTTAAC;SOR=0.689;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=420;TCF=213;TCR=207;TR=269;WE=100373375;WS=100373357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,294:0.64:456
chr7	100376978	rs314303	T	C	3689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=38;PP=2329;SC=CCAGCCTGGGTGACAGAGCAA;SOR=1.857;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=87;TCR=38;TR=124;WE=100376986;WS=100376968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr7	100377082	rs531503	T	C	8846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=632;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.542;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=195;NR=169;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.406;SC=CAGAGTCTCCTGGTAGATGAG;SOR=0.745;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=576;TCF=307;TCR=269;TR=364;WE=100377090;WS=100377072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:226,404:0.64:630
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chr7	100383570	rs149508616	C	T	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.949;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=216;ReadPosRankSum=0.414;SC=CGTGAGCCGCCGCGCCCAGCC;SOR=0.307;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=63;TCF=53;TCR=10;TR=19;WE=100383578;WS=100383560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,20:0.30:67
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chr7	100410597	rs2230585	G	A	16996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=639;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=288;PP=2965;SC=GCCGCCCCCGGCACACCTCGC;SOR=0.731;Source=Platypus;TCF=288;WE=100410605;WS=100410587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,636:1.00:636
chr7	100467975	rs10627414	C	CCT	3486.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=19;PP=1689;SC=GGACCGAGCCCGATTCCCACC;SOR=1.068;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=17;TCR=20;TR=35;WE=100467983;WS=100467965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
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chr7	100488658	rs1799806	G	C	972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=13;PP=564;SC=GCCGGGCCTCGGAGCAGCCTC;SOR=0.927;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=19;TCR=13;TR=32;WE=100488666;WS=100488648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr7	100494222	rs66793456	G	GC	9648.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=75;NR=73;PP=2965;SC=GCTGGGCGAGGCGCACTCCGC;SOR=1.270;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=159;TCF=81;TCR=78;TR=148;WE=100494230;WS=100494212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr7	100547215	rs77163569	T	C	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=5.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.13;ReadPosRankSum=-2.375;SOR=1.498;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,4:0.14:29
chr7	100547220	rs77805555	A	G	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=5.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.06;ReadPosRankSum=-1.681;SOR=1.486;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,4:0.13:30
chr7	100547225	rs77066311	T	C	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=5.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.65;ReadPosRankSum=-0.742;SOR=1.467;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,4:0.12:32
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chr7	100547485	rs62483689	A	G	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.603;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=126;ReadPosRankSum=0.251;SC=GGAGGGGGCGATGAGGAGAGG;SOR=1.085;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=23;TCF=8;TCR=15;TR=10;WE=100547493;WS=100547461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr7	100547525	rs142704104	ACC	A	675.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=10;PP=428;SC=TGCAGGGAAAACCCCGAGGTT;SOR=1.244;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=100547534;WS=100547515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
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chr7	100549426	rs78724937	A	G	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=7.588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQRankSum=1.784;QD=7.42;ReadPosRankSum=1.249;SOR=1.987;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,22:0.24:90
chr7	100549505	rs74588241	T	C	3689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=453;ExcessHet=3.0103;FS=7.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-3.584;QD=8.15;ReadPosRankSum=-2.859;SOR=1.257;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:345,108:0.24:453
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chr7	100549530	rs77626205	A	G	5524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=584;ExcessHet=3.0103;FS=8.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-3.276;QD=9.46;ReadPosRankSum=-1.607;SOR=1.287;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:425,159:0.27:584
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chr7	100549540	.	A	C	6202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.411;ClippingRankSum=0.000;DP=621;ExcessHet=3.0103;FS=10.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-3.212;QD=9.99;ReadPosRankSum=-0.200;SOR=1.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:447,174:0.28:621
chr7	100549543	rs79492129	G	A	6284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=637;ExcessHet=3.0103;FS=11.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-3.193;QD=9.87;ReadPosRankSum=0.344;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:457,180:0.28:637
chr7	100549547	rs77743944	TG	CC	6562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=654;ExcessHet=3.0103;FS=9.612;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-3.166;QD=10.03;ReadPosRankSum=0.968;SOR=1.424;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:467,187:0.29:654
chr7	100549573	rs73163748	G	T	9222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=713;ExcessHet=3.0103;FS=2.573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-2.701;QD=12.94;ReadPosRankSum=0.633;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:460,253:0.35:713
chr7	100549583	rs73163749	G	A	10253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=732;ExcessHet=3.0103;FS=1.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.833;QD=14.01;ReadPosRankSum=1.091;SOR=0.864;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:459,273:0.37:732
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chr7	100550312	.	T	C	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.305;ClippingRankSum=0.000;DP=706;ExcessHet=3.0103;FS=2.263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQRankSum=-8.742;QD=0.84;ReadPosRankSum=-3.425;SOR=1.123;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:648,57:0.08:705
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chr7	100551565	rs73163757	AT	GC	11152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=903;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.523;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.01;MQRankSum=1.153;NF=151;NR=166;PP=2944;ReadPosRankSum=2.310;SC=CACTGTGAGAATGACCCTCAG;SOR=0.738;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=810;TCF=398;TCR=412;TR=317;WE=100551586;WS=100551555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:506,382:0.43:888
chr7	100551578	rs78584246	T	G	8443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=939;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.01;MQRankSum=1.140;NF=167;NR=174;PP=2962;ReadPosRankSum=2.234;SC=ACCCTCAGAATTACTGAGAAC;SOR=0.719;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=843;TCF=415;TCR=428;TR=341;WE=100551586;WS=100551555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:527,407:0.44:934
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chr7	100551793	rs73398735	G	T	17687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.529;HP=2;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=243;NR=219;PP=2962;ReadPosRankSum=0.945;SC=AACATCACAGGTTCCTATTCC;SOR=0.771;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=1139;TCF=592;TCR=547;TR=462;WE=100551801;WS=100551783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:701,496:0.41:1197
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chr7	100552017	rs9691167	C	T	1396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1184;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.18;ReadPosRankSum=1.153;SOR=0.647;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1003,181:0.15:1184
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chr7	100552018	.	TCC	GCT	2944	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=210;NR=238;PP=2944;QD=20;SC=TCCAGTGTTCTCCACTACCAT;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=1090;TCF=522;TCR=568;TR=448;WE=100552032;WS=100552007;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:642,448:0.41:1090
chr7	100552020	rs78680358	C	T	19164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1152;ExcessHet=3.0103;FS=0.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.64;ReadPosRankSum=-1.237;SOR=0.759;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:656,496:0.43:1152
chr7	100552044	rs73714250	T	G	15541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1038;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=198;NR=210;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.323;SC=CTGTTCCTTCTTCACCATACA;SOR=0.707;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=987;TCF=472;TCR=515;TR=408;WE=100552052;WS=100552034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:609,427:0.41:1036
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chr7	100552117	rs62483699	G	T	15573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=960;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=190;NR=202;PP=2962;ReadPosRankSum=0.868;SC=CTCTTCCTCTGCAACTACCAG;SOR=0.653;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=917;TCF=442;TCR=475;TR=392;WE=100552125;WS=100552107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:553,404:0.42:957
chr7	100552135	rs62483700	T	C	15065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=968;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.109;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=204;NR=204;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.669;SC=CAGCACTTCTTCAACCAGCTC;SOR=0.601;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=926;TCF=450;TCR=476;TR=408;WE=100552143;WS=100552125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:542,423:0.44:965
chr7	100552251	rs9691900	T	C	11270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=714;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.560;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=214;NR=248;PP=2962;ReadPosRankSum=1.538;SC=TCCCTGCCTCTCCCACTGATC;SOR=0.790;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=681;TCF=320;TCR=361;TR=462;WE=100552259;WS=100552240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:230,483:0.68:713
chr7	100552311	rs12535515	C	T	13407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=696;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=255;NR=291;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.231;SC=CTCCCACCACCCCATTAACAG;SOR=0.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=681;TCF=321;TCR=360;TR=546;WE=100552319;WS=100552301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,557:0.80:696
chr7	100552338	rs73398798	C	T	7577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=654;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.141;HP=1;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=110;NR=134;PP=2962;ReadPosRankSum=0.826;SC=CCTTTACTACCGAAATGGTCA;SOR=0.813;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=633;TCF=300;TCR=333;TR=244;WE=100552346;WS=100552328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:402,251:0.38:653
chr7	100552358	rs73714254	C	G	6043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=611;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.144;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=119;PP=2962;ReadPosRankSum=0.600;SC=ACCTGTCCTACCTCCATCAGT;SOR=0.807;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=591;TCF=283;TCR=308;TR=217;WE=100552398;WS=100552348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:385,225:0.37:610
chr7	100552371	rs73714255	C	G	7576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=598;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.144;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=112;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.477;SC=CCATCAGTATCCAAACTACTC;SOR=0.793;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=576;TCF=278;TCR=298;TR=206;WE=100552398;WS=100552348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:379,218:0.37:597
chr7	100552384	rs75597914	A	G	8032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=591;ExcessHet=3.0103;FS=0.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.64;ReadPosRankSum=-1.587;SOR=0.771;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:373,216:0.37:589
chr7	100552390	rs73714257	T	C	7951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=574;ExcessHet=3.0103;FS=0.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.90;ReadPosRankSum=-2.068;SOR=0.785;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:361,211:0.37:572
chr7	100552412	rs73714259	T	C	6712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=503;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.539;HP=1;HapScore=1;MGOF=38;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=91;PP=1991;ReadPosRankSum=-2.049;SC=TCTTCCATGATGCCAGAAAGT;SOR=0.723;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=472;TCF=240;TCR=232;TR=176;WE=100552420;WS=100552402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:312,188:0.38:500
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chr7	100552452	rs112050489	T	C	2206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=526;ExcessHet=3.0103;FS=0.609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.22;ReadPosRankSum=2.864;SOR=0.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:392,131:0.25:523
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chr7	100552549	rs73163760	CT	AC	14532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-3.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=931;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.528;HP=4;HapScore=1;JOINED;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=188;NR=143;PP=2944;ReadPosRankSum=-0.591;SC=TGTGATCCCCCTACCTCTTCC;SOR=0.730;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=857;TCF=473;TCR=384;TR=331;WE=100552558;WS=100552525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:545,385:0.41:930
chr7	100552644	rs2904850	C	A	22875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1513;ExcessHet=3.0103;FS=0.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.13;ReadPosRankSum=0.436;SOR=0.624;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:875,637:0.42:1512
chr7	100552657	rs75471530	A	G	23622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1499;ExcessHet=3.0103;FS=0.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.77;ReadPosRankSum=0.719;SOR=0.653;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:890,608:0.41:1498
chr7	100552657	.	ACT	GCC	2944	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MMLQ=23;MQ=59.98;NF=273;NR=267;PP=2944;QD=20;SC=CCCACCCACCACTAGGACTTC;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=1417;TCF=729;TCR=688;TR=540;WE=100552667;WS=100552634;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:877,540:0.38:1417
chr7	100552659	rs78182596	T	C	23458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1493;ExcessHet=3.0103;FS=0.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.72;ReadPosRankSum=0.806;SOR=0.631;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:890,602:0.40:1492
chr7	100552675	rs73163764	C	T	21881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1535;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=294;NR=293;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.035;SC=TTCAGAGACACCAGTGGCCAC;SOR=0.688;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=1475;TCF=743;TCR=732;TR=587;WE=100552695;WS=100552665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:922,613:0.40:1535
chr7	100552711	rs75799835	T	A	6781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1478;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.62;ReadPosRankSum=-1.234;SOR=0.724;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1055,413:0.28:1468
chr7	100552711	.	TCA	ACG	2944	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=248;NR=264;PP=2944;QD=20;SC=CACCCTTACATCACGCAGGAC;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=1399;TCF=696;TCR=703;TR=512;WE=100552747;WS=100552700;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:887,512:0.37:1399
chr7	100552713	rs75130157	A	G	6849.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1487;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.63;ReadPosRankSum=-2.101;SOR=0.710;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1055,426:0.29:1481
chr7	100552714	.	C	CGT	129.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=0.000;DP=1500;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.09;ReadPosRankSum=0.649;SOR=0.698;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1328,171:0.11:1499
chr7	100552727	rs74529310	G	C	23452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1488;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=281;NR=282;PP=2962;ReadPosRankSum=0.056;SC=AGGACAACTCGCATCACTTCT;SOR=0.710;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=1421;TCF=714;TCR=707;TR=563;WE=100552747;WS=100552700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:886,601:0.40:1487
chr7	100552738	rs79874934	CA	TG	22447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1453;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=252;NR=253;PP=2944;ReadPosRankSum=1.248;SC=CATCACTTCTCAGATGACCAC;SOR=0.677;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=1361;TCF=678;TCR=683;TR=505;WE=100552747;WS=100552700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:866,586:0.40:1452
chr7	100552788	rs73398800	C	T	10184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.526;HP=1;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=233;NR=240;PP=2962;ReadPosRankSum=0.607;SC=GGACCTTCTGCCTCTCTGTTC;SOR=0.608;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=1132;TCF=544;TCR=588;TR=473;WE=100552796;WS=100552778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:681,511:0.43:1192
chr7	100552837	rs73714264	G	A	14230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=915;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.480;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=182;NR=198;PP=2962;ReadPosRankSum=0.542;SC=TGTCACTGAGGTCAGGCTTTA;SOR=0.512;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=876;TCF=396;TCR=480;TR=380;WE=100552845;WS=100552827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:513,400:0.44:913
chr7	100552854	rs73714265	G	A	15337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=806;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.753;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=176;NR=204;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.243;SC=TTTATCCTGAGCTTCCCTTTC;SOR=0.537;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=776;TCF=343;TCR=433;TR=380;WE=100552875;WS=100552844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:415,390:0.48:805
chr7	100552867	rs73714266	T	C	13991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=754;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.106;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=171;NR=195;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.501;SC=TCCCTTTCTTTCTGTGTTTTC;SOR=0.595;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=729;TCF=330;TCR=399;TR=366;WE=100552875;WS=100552844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:379,373:0.50:752
chr7	100552915	rs2904852	A	C	27196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=732;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=352;NR=357;PP=2965;SC=GGGAACAGGGACAGTGTGCTT;SOR=0.724;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=709;TCF=352;TCR=357;TR=709;WE=100552923;WS=100552894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,731:1.00:731
chr7	100552978	rs73163765	T	C	14470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=804;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.04;ReadPosRankSum=-0.558;SOR=0.656;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:420,382:0.48:802
chr7	100552984	rs73163766	T	C	14305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=797;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.99;ReadPosRankSum=0.431;SOR=0.674;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:426,369:0.46:795
chr7	100553002	rs68094465	A	G	13399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=773;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=174;NR=182;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.502;SC=ATGGCCTCAAATGCCAGTGCC;SOR=0.700;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=743;TCF=365;TCR=378;TR=356;WE=100553010;WS=100552968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:406,365:0.47:771
chr7	100553073	rs73714269	T	A	10404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=644;ExcessHet=3.0103;FS=3.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.18;ReadPosRankSum=0.246;SOR=0.929;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:361,282:0.44:643
chr7	100553077	rs73714270	A	C	10269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=613;ExcessHet=3.0103;FS=1.804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.75;ReadPosRankSum=0.153;SOR=0.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:343,270:0.44:613
chr7	100553117	rs73400705	G	A	3348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=350;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.447;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=98;PP=2318;ReadPosRankSum=0.346;SC=GGGTGTCACTGACTCTCCCCA;SOR=0.852;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=329;TCF=113;TCR=216;TR=147;WE=100553125;WS=100553092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:196,154:0.44:350
chr7	100606918	rs4316092	A	G	981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.523;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.450;NF=12;NR=25;PP=623;ReadPosRankSum=-0.825;SC=GGGGTGGAGGAGGTACATAAG;SOR=0.440;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=49;TCF=14;TCR=35;TR=37;WE=100606926;WS=100606908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,40:0.80:50
chr7	100607640	.	G	GCT	2763.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.438;ClippingRankSum=0.000;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=0.734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.08;MQRankSum=1.071;QD=19.19;ReadPosRankSum=-0.604;SOR=0.560;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,68:0.47:144
chr7	100607642	.	C	T	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MMLQ=29;MQ=60.06;NF=43;NR=15;PP=2962;QD=20;SC=TGACCTCTGCCCTCTTTCCCC;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=140;TCF=106;TCR=34;TR=58;WE=100607654;WS=100607632;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:82,58:0.41:140
chr7	100607643	.	CTCT	C,CCT	2736.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.233;ClippingRankSum=0.000;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.334;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.123;NF=25;NR=15;PP=2970;ReadPosRankSum=-0.244;SC=GACCTCTGCCCTCTTTCCCCC;SOR=0.460;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=101;TCF=71;TCR=30;TR=40;WE=100607654;WS=100607632;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.45:163
chr7	100607700	.	CAT	C	6547.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=0.000;DP=451;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.68;ReadPosRankSum=0.080;SOR=0.723;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:271,175:0.39:446
chr7	100607707	.	T	G	6751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.635;ClippingRankSum=0.000;DP=469;ExcessHet=3.0103;FS=0.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.40;ReadPosRankSum=1.309;SOR=0.736;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:293,176:0.38:469
chr7	100607709	.	C	CCT	6802.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.490;ClippingRankSum=0.000;DP=483;ExcessHet=3.0103;FS=0.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.08;ReadPosRankSum=1.241;SOR=0.742;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:301,182:0.38:483
chr7	100607851	rs6960854	C	G	3639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=357;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.298;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=97;PP=2488;ReadPosRankSum=-0.072;SC=AGGAGGGGCTCCAGAACGCCA;SOR=0.787;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=333;TCF=128;TCR=205;TR=154;WE=100607859;WS=100607841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:193,163:0.46:356
chr7	100607871	rs6960868	C	T	2437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.649;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=71;PP=1602;ReadPosRankSum=0.774;SC=AGCCAGGATGCGAACAGCTGC;SOR=1.016;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=223;TCF=79;TCR=144;TR=105;WE=100607879;WS=100607861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,114:0.47:243
chr7	100607903	rs6961167	G	A	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=7.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.12;ReadPosRankSum=-0.808;SOR=1.757;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:120,18:0.13:138
chr7	100608154	rs10250885	G	A	1529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=2.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.93;ReadPosRankSum=-0.513;SOR=1.649;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,43:0.73:59
chr7	100608158	rs79221376	A	G	759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=8.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.87;ReadPosRankSum=-1.013;SOR=2.652;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,22:0.34:64
chr7	100608162	rs79761591	G	C	816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=7.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.50;ReadPosRankSum=-0.314;SOR=2.461;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,23:0.32:71
chr7	100608165	rs76431635	A	G	798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=10.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.432;SOR=2.871;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,24:0.30:79
chr7	100608166	rs75884804	G	C	879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=10.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.86;ReadPosRankSum=0.714;SOR=2.796;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,24:0.30:81
chr7	100608180	rs77646533	C	G	1164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=26.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.78;ReadPosRankSum=0.537;SOR=4.541;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,33:0.31:108
chr7	100608188	.	C	CT	1164.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.664;ClippingRankSum=0.000;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=24.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.55;ReadPosRankSum=1.452;SOR=3.643;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,35:0.29:122
chr7	100608190	.	C	T	1209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.925;ClippingRankSum=0.000;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=24.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.76;ReadPosRankSum=1.791;SOR=3.585;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,35:0.28:124
chr7	100608194	.	C	CGTCTGGG	1560.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.315;ClippingRankSum=0.000;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=26.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.01;ReadPosRankSum=1.517;SOR=3.799;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,37:0.28:130
chr7	100608196	rs77373587	C	G	1742.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=8.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=34.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.27;ReadPosRankSum=0.982;SOR=4.178;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:97,45:0.32:142
chr7	100608197	.	A	AGGG	1733.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=7.016;ClippingRankSum=0.000;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=34.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.21;ReadPosRankSum=0.991;SOR=4.178;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:97,45:0.32:142
chr7	100608201	rs77005990	C	T	1767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=40.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.86;ReadPosRankSum=-0.006;SOR=4.499;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,51:0.34:149
chr7	100608247	rs73163788	T	C	4532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=369;ExcessHet=3.0103;FS=7.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.76;MQRankSum=7.278;QD=12.32;ReadPosRankSum=0.175;SOR=1.073;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:241,127:0.35:368
chr7	100608255	rs79638688	C	G	5176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=419;ExcessHet=3.0103;FS=9.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.13;MQRankSum=9.818;QD=12.38;ReadPosRankSum=0.646;SOR=1.367;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:277,141:0.34:418
chr7	100608268	rs141757611	C	CCTTAACCCCTTGAT	8404.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=520;ExcessHet=3.0103;FS=13.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.75;MQRankSum=14.062;QD=16.19;ReadPosRankSum=0.691;SOR=1.547;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:343,176:0.34:519
chr7	100608370	rs73714276	A	C	15283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=840;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.10;MQRankSum=9.921;QD=18.26;ReadPosRankSum=-0.111;SOR=0.624;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:427,410:0.49:837
chr7	100608375	rs75592954	G	A	14980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=786;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.75;MQRankSum=7.885;QD=19.11;ReadPosRankSum=-0.352;SOR=0.647;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:402,382:0.49:784
chr7	100608406	rs77168191	AT	GC	7385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=447;ExcessHet=3.0103;FS=9.383;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.56;ReadPosRankSum=0.612;SOR=1.369;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:250,196:0.44:446
chr7	100608411	rs79831534	C	T	7022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=408;ExcessHet=3.0103;FS=8.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.25;ReadPosRankSum=0.351;SOR=1.266;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:226,181:0.44:407
chr7	100608416	rs77070494	C	T	6693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=373;ExcessHet=3.0103;FS=7.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.99;ReadPosRankSum=-0.430;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:203,169:0.45:372
chr7	100608419	rs79505270	CT	GG	6429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=347;ExcessHet=3.0103;FS=4.081;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.53;ReadPosRankSum=-0.263;SOR=0.949;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:191,156:0.45:347
chr7	100608423	rs77841377	C	T	5470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FS=3.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.15;ReadPosRankSum=0.218;SOR=0.924;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:178,141:0.44:319
chr7	100608472	rs10251045	C	G	2806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=5.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=79;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=72;PP=1902;ReadPosRankSum=-0.108;SC=GAGACCTTTGCGGGAGGCAAG;SOR=0.990;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=101;TCF=13;TCR=88;TR=82;WE=100608480;WS=100608462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,88:0.80:110
chr7	100608493	rs77278976	T	C	1032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=6.838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.41;ReadPosRankSum=1.970;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,29:0.43:67
chr7	100608498	rs77518728	A	C	1050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=8.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.10;ReadPosRankSum=1.230;SOR=2.241;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,26:0.47:55
chr7	100608502	rs76981580	T	C	972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=8.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.35;ReadPosRankSum=0.759;SOR=2.405;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,26:0.49:53
chr7	100608572	rs10251414	G	C	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.213;HP=4;HapScore=3;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=596;ReadPosRankSum=0.422;SC=GAGGGTGCTGGGGGTGGCCTC;SOR=0.068;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=56;TCF=49;TCR=7;TR=22;WE=100608581;WS=100608562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,22:0.39:57
chr7	100608573	rs10251415	G	C	513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.319;HP=4;HapScore=3;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=2;PP=705;ReadPosRankSum=0.079;SC=AGGGTGCTGGGGGTGGCCTCC;SOR=1.300;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=57;TCF=49;TCR=8;TR=23;WE=100608581;WS=100608562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,22:0.39:57
chr7	100608662	rs74929976	A	G	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=349;ExcessHet=3.0103;FS=5.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.04;ReadPosRankSum=-1.140;SOR=1.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:296,53:0.15:349
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chr7	100609987	rs10274460	T	C	4486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.261;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=78;PP=1749;ReadPosRankSum=-0.753;SC=GCATTTACTCTGTCCCCCTCT;SOR=1.016;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=285;TCF=112;TCR=173;TR=121;WE=100609995;WS=100609977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,126:0.42:301
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chr7	100610069	rs10258821	C	T	2900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=359;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.295;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=67;PP=1877;ReadPosRankSum=1.688;SC=TACAAATTTCCATGTGGCCTT;SOR=0.836;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=349;TCF=185;TCR=164;TR=145;WE=100610077;WS=100610059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:209,146:0.41:355
chr7	100612766	rs71901679	CTGTCCAGGCACTT	C	1045.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.276;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=4.055;NF=9;NR=8;PP=2975;ReadPosRankSum=-2.089;SC=GGGACAGGCACTGTCCAGGCA;SOR=0.277;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=61;TCF=34;TCR=27;TR=17;WE=100612794;WS=100612756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,28:0.31:89
chr7	100612786	rs73168325	G	T	1144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.578;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=3.702;NF=27;NR=14;PP=2383;ReadPosRankSum=-2.396;SC=ACTTTGCTCTGCTTCAAGGCA;SOR=0.249;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=106;TCF=73;TCR=33;TR=41;WE=100612794;WS=100612756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,36:0.35:102
chr7	100612839	rs76449674	A	G	4006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FS=1.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.53;MQRankSum=3.666;QD=17.97;ReadPosRankSum=1.577;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:120,103:0.46:223
chr7	100612842	rs79514982	T	C	4054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FS=1.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.53;MQRankSum=3.663;QD=18.02;ReadPosRankSum=1.970;SOR=0.595;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:121,104:0.46:225
chr7	100612865	rs78097765	C	T	2467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FS=0.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.43;MQRankSum=3.707;QD=9.04;ReadPosRankSum=2.392;SOR=0.638;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:149,124:0.45:273
chr7	100612869	rs74554402	G	A	5344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FS=1.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.42;MQRankSum=3.561;QD=18.75;ReadPosRankSum=1.157;SOR=0.599;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:150,135:0.47:285
chr7	100612875	rs75162633	C	T	5335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FS=1.914;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.39;MQRankSum=3.701;QD=17.55;ReadPosRankSum=1.529;SOR=0.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:166,138:0.45:304
chr7	100612898	rs73168327	T	C	5368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.307;HP=3;HapScore=1;MGOF=44;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=3.060;NF=61;NR=55;PP=1293;ReadPosRankSum=-1.724;SC=GCCCGTTCCCTGGGAGATGCT;SOR=0.614;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=283;TCF=153;TCR=130;TR=116;WE=100612906;WS=100612888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,153:0.47:328
chr7	100612945	rs76619309	C	T	4524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FS=6.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.13;MQRankSum=2.508;QD=13.84;ReadPosRankSum=1.079;SOR=1.038;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:199,128:0.39:327
chr7	100612952	rs79881008	G	A	4318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FS=7.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.13;MQRankSum=2.665;QD=13.29;ReadPosRankSum=2.159;SOR=1.073;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:207,118:0.36:325
chr7	100612955	rs150485202	A	ACTG	4327.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.955;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.681;NF=8;NR=43;PP=2964;ReadPosRankSum=2.018;SC=CGCGTCCGTTACTACAGTGAC;SOR=1.042;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=169;TCF=31;TCR=138;TR=51;WE=100612977;WS=100612935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:206,116:0.36:322
chr7	100612961	rs78487486	G	C	3895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FS=3.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.69;ReadPosRankSum=1.319;SOR=0.935;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:199,108:0.35:307
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chr7	100612996	rs76589634	A	G	2151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FS=1.163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.61;ReadPosRankSum=-2.121;SOR=0.789;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:157,67:0.30:224
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chr7	100615445	rs5021607	A	G	1750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FS=2.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.06;MQRankSum=1.547;QD=10.24;ReadPosRankSum=0.414;SOR=0.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:120,51:0.30:171
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chr7	100615453	rs5021605	T	C	1655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FS=4.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.06;MQRankSum=1.591;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.953;SOR=1.069;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:122,49:0.29:171
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chr7	100615458	rs5021603	A	C	1616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=4.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQRankSum=1.581;QD=9.74;ReadPosRankSum=0.839;SOR=1.044;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,48:0.29:166
chr7	100615460	rs5021602	A	G	1631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=4.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQRankSum=1.581;QD=9.83;ReadPosRankSum=0.723;SOR=1.044;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,48:0.29:166
chr7	100615461	rs5021601	T	A	1631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=4.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQRankSum=1.581;QD=9.83;ReadPosRankSum=0.611;SOR=1.044;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,48:0.29:166
chr7	100615477	rs5021600	G	A	1349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=0.677;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.44;ReadPosRankSum=1.312;SOR=0.761;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:121,39:0.24:160
chr7	100615494	rs33959976	GTA	G	867.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=0.790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.67;ReadPosRankSum=0.816;SOR=0.600;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:102,28:0.22:130
chr7	100615500	rs77817912	A	G	855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.90;ReadPosRankSum=0.006;SOR=0.634;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,28:0.23:124
chr7	100615503	rs33984975	CAG	C	801.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=0.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.57;ReadPosRankSum=-0.093;SOR=0.557;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,27:0.22:122
chr7	100615521	rs79951460	T	C	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=2.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.45;ReadPosRankSum=-1.875;SOR=0.466;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,22:0.23:96
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chr7	100615533	rs75698243	C	A	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=1.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.93;ReadPosRankSum=-1.677;SOR=0.465;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,16:0.21:77
chr7	100615570	rs73168342	T	G	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.64;ReadPosRankSum=0.193;SOR=0.534;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,8:0.18:45
chr7	100615580	rs75806374	T	G	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=4.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.31;ReadPosRankSum=0.873;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,5:0.14:35
chr7	100615583	rs75125684	T	C	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=4.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.54;ReadPosRankSum=0.779;SOR=0.719;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,5:0.14:35
chr7	100615584	rs76813732	G	A	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=4.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.54;ReadPosRankSum=0.731;SOR=0.719;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,5:0.14:35
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chr7	100616181	rs76074645	C	A	1236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FS=2.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-4.456;QD=6.31;ReadPosRankSum=2.218;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:156,40:0.20:196
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chr7	100616472	rs73168347	G	A	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.42;ReadPosRankSum=0.751;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
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chr7	100634476	rs6980143	C	G	2068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=47;PP=1618;SC=TCCCCTGGCACTACCACACCA;SOR=1.576;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=20;TCR=47;TR=67;WE=100634484;WS=100634466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
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chr7	100634933	.	G	C	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MMLQ=28;MQ=58.39;NF=142;NR=50;PP=2962;QD=20;SC=CCTACCACAGGAGCCCGGGCT;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=482;TCF=320;TCR=162;TR=192;WE=100634941;WS=100634911;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:290,192:0.40:482
chr7	100634964	rs4370452	C	A	23442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=849;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=544;NR=340;PP=2965;SC=AATGCACTTCCCTGAAAGCTC;SOR=0.885;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=885;TCF=545;TCR=340;TR=884;WE=100634972;WS=100634954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,849:1.00:849
chr7	100635375	rs10808115	A	C	21204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=805;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=333;NR=450;PP=2965;SC=CTTACCTGCCAGCATGACAAG;SOR=1.060;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=783;TCF=333;TCR=450;TR=783;WE=100635383;WS=100635365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,805:1.00:805
chr7	100635591	rs10953312	C	A	5968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-1.246;NF=140;NR=50;PP=2965;ReadPosRankSum=0.289;SC=CTTCCACAGCCGCCCAGGCTC;SOR=1.057;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=191;TCF=141;TCR=50;TR=190;WE=100635599;WS=100635581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,200:1.00:201
chr7	100635661	rs10953313	T	C	27928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=625;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=378;NR=224;PP=2965;SC=GAAGCATCTATGCCCGTCCAC;SOR=1.330;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=603;TCF=379;TCR=224;TR=602;WE=100635669;WS=100635651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,625:1.00:625
chr7	100635679	rs10953314	C	G	33080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=817;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.06;NF=482;NR=306;PP=2965;SC=CACAGCAGCACCAGATCGCCA;SOR=1.235;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=791;TCF=485;TCR=306;TR=788;WE=100635687;WS=100635669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,815:1.00:815
chr7	100647819	rs11766024	C	T	2964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=52;PP=2127;SC=TACCAGCTACCACAGCAGCCC;SOR=0.912;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=113;TCF=61;TCR=52;TR=113;WE=100647827;WS=100647809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr7	100647875	rs11766048	C	A	4174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.76;NF=79;NR=60;PP=2846;SC=CCACAACCTCCGGCCGTAGTG;SOR=0.806;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=79;TCR=60;TR=139;WE=100647883;WS=100647865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr7	100647920	rs11772963	A	C	6932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=137;NR=86;PP=2965;SC=GCCCAGATACAAATGGAATCA;SOR=1.061;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=223;TCF=137;TCR=86;TR=223;WE=100647928;WS=100647910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr7	100648029	rs10953315	G	A	10544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=396;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=196;NR=178;PP=2965;SC=AGCCAGCACTGCCACAACACC;SOR=0.772;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=374;TCF=196;TCR=178;TR=374;WE=100648047;WS=100648019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,395:1.00:395
chr7	100648117	rs11766125	C	G	9402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.03;NF=152;NR=164;PP=2965;SC=GCCAGCATGACAAGCTCCAGC;SOR=0.892;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=316;TCF=152;TCR=164;TR=316;WE=100648125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,339:1.00:339
chr7	100651855	rs12532750	A	G	4900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=50;PP=2965;SC=GAATGTATCAATCCTGGGGGA;SOR=1.582;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=154;TCF=104;TCR=50;TR=154;WE=100651863;WS=100651845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr7	100652317	rs12540832	T	G	1522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=11;PP=1143;SC=TCAAGAAGGGTAACAGGAGAG;SOR=2.348;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=39;TCR=11;TR=50;WE=100652325;WS=100652307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr7	100656003	rs3924886	G	C	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-4.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.624;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=172;ReadPosRankSum=-0.040;SC=CATTGGCCCAGGGGAGGGCAT;SOR=0.207;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=58;TCF=50;TCR=8;TR=17;WE=100656011;WS=100655993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,19:0.30:63
chr7	100658717	rs10229453	T	C	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=50;ReadPosRankSum=0.084;SC=TGGCCAGTGCTTGCCTTGGTA;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=4;WE=100658725;WS=100658713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr7	100675976	rs56103274	G	A	4387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=704;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.170;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=117;NR=108;PP=2874;ReadPosRankSum=2.392;SC=TGTGACCACTGCTAGTGAAGC;SOR=0.802;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=650;TCF=331;TCR=319;TR=225;WE=100675984;WS=100675966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:463,239:0.34:702
chr7	100679902	rs55974941	A	G	3805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=671;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.195;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.937;NF=94;NR=102;PP=2553;ReadPosRankSum=-1.447;SC=CAACTTCTGAAGGTACCAGCA;SOR=0.824;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=614;TCF=298;TCR=316;TR=196;WE=100679910;WS=100679892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:458,210:0.31:668
chr7	100681762	rs10953316	A	G	3992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=818;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.127;NF=113;NR=115;PP=2756;ReadPosRankSum=-1.257;SC=GTTTTGAAACAAGCACACTTT;SOR=0.669;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=760;TCF=388;TCR=372;TR=228;WE=100681770;WS=100681752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:580,238:0.29:818
chr7	100692341	rs4515470	C	G	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.147;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=167;ReadPosRankSum=0.267;SC=GGGCTGTTCCCTTGTTAGATG;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=5;TCR=36;TR=11;WE=100692349;WS=100692331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,11:0.26:43
chr7	100692680	rs10246021	T	G	1304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.616;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=38;PP=687;ReadPosRankSum=-2.637;SC=GTCTGGGCCCTTGGGAAGAGG;SOR=0.982;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=230;TCF=112;TCR=118;TR=67;WE=100692688;WS=100692670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,79:0.31:255
chr7	100694854	rs67328257	G	A	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.08;ReadPosRankSum=-0.916;SOR=0.546;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,21:0.25:84
chr7	100695058	rs6966570	T	C	1453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.505;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=41;PP=911;ReadPosRankSum=-2.025;SC=ATCACGGCTGTTCCCTGTCCC;SOR=0.917;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=225;TCF=114;TCR=111;TR=77;WE=100695066;WS=100695048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,82:0.33:247
chr7	100731505	rs4524722	C	G	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.003;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=217;ReadPosRankSum=0.841;SC=TGGCCAGGGCCGCAGCCGCCT;SOR=0.990;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=72;TCF=32;TCR=40;TR=22;WE=100731513;WS=100731495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,25:0.30:83
chr7	100731829	rs6948536	T	C	2020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=446;ExcessHet=3.0103;FS=0.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.56;ReadPosRankSum=-1.172;SOR=0.618;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:318,125:0.28:443
chr7	100775087	rs143613360	A	AAAC	172.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=2;PP=90;ReadPosRankSum=-0.207;SC=CTCCATCTCAAAACAACAACA;SOR=0.693;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=15;TCF=8;TCR=7;TR=3;WE=100775095;WS=100775077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr7	100776931	rs2227684	G	A	870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.738;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=10;PP=553;ReadPosRankSum=1.879;SC=TGCCATCAGCGAGAGCTGGAG;SOR=0.829;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=126;TCF=92;TCR=34;TR=42;WE=100776939;WS=100776921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,46:0.34:135
chr7	100780176	rs2227694	A	G	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.45;ReadPosRankSum=-0.450;SOR=0.648;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,15:0.20:75
chr7	100781445	rs7242	T	G	1284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.085;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=38;PP=832;ReadPosRankSum=-0.317;SC=GAGGAAGAAATGTCAGATGCG;SOR=0.585;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=227;TCF=105;TCR=122;TR=72;WE=100781453;WS=100781435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,75:0.32:237
chr7	100800131	rs4727481	T	C	864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=8;NR=23;PP=513;SC=ATGGTCGTCCTGTAGGTCAGG;SOR=2.235;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=31;WE=100800139;WS=100800121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr7	100800635	rs2074686	G	A	2013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=24;PP=1264;SC=TTGTAGCGATGTCTCATGCGC;SOR=1.432;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=46;TCR=24;TR=70;WE=100800643;WS=100800625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr7	100803614	rs2074683	C	T	858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=5;PP=666;SC=CTGGGGCTGGCCCTGGGAGGC;SOR=2.985;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=31;WE=100803622;WS=100803604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr7	100803729	rs73183986	A	G	3871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.897;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=75;PP=2455;ReadPosRankSum=1.694;SC=CTTCCTCGTGACTGCTGTCTT;SOR=0.626;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=280;TCF=156;TCR=124;TR=167;WE=100803737;WS=100803719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,181:0.60:302
chr7	100804140	rs1048303	C	T	4387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=77;NR=74;PP=2407;SC=TGATGTCACCCCAGATGTCCT;SOR=0.804;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=151;TCF=77;TCR=74;TR=151;WE=100804148;WS=100804130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr7	100804240	rs113505007	T	TACCTCC	778.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=12;PP=815;SC=TCCCATAACCTACCTCCACCC;SOR=3.500;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=14;WE=100804248;WS=100804230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr7	100815279	rs740103	G	A	6216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.99;NF=120;NR=84;PP=2965;SC=ACGCAGCGTCGGAAATGGCAG;SOR=1.061;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=204;TCF=120;TCR=84;TR=204;WE=100815287;WS=100815269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr7	100815816	rs12540617	C	T	1083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FS=2.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.79;ReadPosRankSum=-0.991;SOR=0.524;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:215,71:0.25:286
chr7	100816527	rs2009973	A	G	2501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=27;PP=1464;SC=GGGTCTCCCCATATGCCCCAG;SOR=1.445;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=58;TCR=28;TR=85;WE=100816535;WS=100816517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr7	100818101	rs733965	A	G	7127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=107;NR=133;PP=2965;SC=CCCTGCAGAAAAAAAGAGAAT;SOR=1.024;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=240;TCF=107;TCR=133;TR=240;WE=100818109;WS=100818091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,262:1.00:262
chr7	100818193	rs2015923	G	C	1431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=37;PP=1077;SC=TACACAAATAGCCTTTCTTTT;SOR=2.655;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=9;TCR=37;TR=46;WE=100818201;WS=100818183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr7	100841389	rs2158612	A	C	5433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=111;NR=75;PP=2965;SC=CGGATCCCCCATGCAGGGACC;SOR=1.040;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=186;TCF=111;TCR=75;TR=186;WE=100841397;WS=100841379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr7	100842073	.	G	A	2160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.452;ClippingRankSum=0.000;DP=406;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.564;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=64;PP=1222;ReadPosRankSum=-0.217;SC=CGCCCAGCACGTAGTTCCGAT;SOR=0.751;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=392;TCF=188;TCR=204;TR=120;WE=100842081;WS=100842063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:278,126:0.31:404
chr7	100845708	.	A	G	5682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-3.161;ClippingRankSum=0.000;DP=385;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.911;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=139;NR=102;PP=2962;ReadPosRankSum=1.721;SC=CCACCGGGTCACGCTCGGGTC;SOR=0.558;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=352;TCF=207;TCR=145;TR=241;WE=100845716;WS=100845698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,258:0.67:385
chr7	100849578	.	G	A	2803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.376;ClippingRankSum=0.000;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=44;PP=1518;ReadPosRankSum=1.072;SC=GTCGACAAAGGACACCATGAT;SOR=0.729;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=199;TCF=115;TCR=84;TR=112;WE=100849586;WS=100849568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,131:0.59:221
chr7	100853231	rs7777930	C	T	719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.433;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=10;PP=406;ReadPosRankSum=-0.639;SC=CCTTTCTGTTCGGCCTCTGCC;SOR=0.368;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=40;TCF=27;TCR=13;TR=29;WE=100853239;WS=100853221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,33:0.75:44
chr7	100883135	rs183841255	C	T	3491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=78;PP=2106;ReadPosRankSum=-0.172;SC=CGGCCAGTCCCGCCACACCCA;SOR=0.677;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=245;TCF=115;TCR=130;TR=149;WE=100883143;WS=100883125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,161:0.62:259
chr7	100959986	rs34048830	C	T	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=3.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.260;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=201;ReadPosRankSum=0.623;SC=CGGGCGATCACGAGGTCAGGA;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=10;WE=100959994;WS=100959976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr7	100960006	rs34579827	A	C	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=3.012;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.864;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=189;ReadPosRankSum=2.002;SC=AGATCGAGACAATCCTGGCTA;SOR=2.964;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=9;WE=100960014;WS=100959996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr7	100962451	rs34170365	G	A	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=311;ReadPosRankSum=-1.387;SC=GGGTGGTTACGACCTCACTGT;SOR=0.670;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=90;TCF=21;TCR=69;TR=24;WE=100962459;WS=100962441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,24:0.25:97
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chr7	100965096	rs11369267	A	AG	5492.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=94;PP=2936;SC=AGAGGCCCGCAGGGCCGACGG;SOR=1.820;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=112;TCF=3;TCR=109;TR=97;WE=100965104;WS=100965086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
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chr7	101123749	rs36085186	G	A	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=6.300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.53;ReadPosRankSum=0.257;SOR=2.263;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,9:0.20:45
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chr7	101126376	rs190106514	A	G	854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.551;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-0.801;NF=22;NR=16;PP=480;ReadPosRankSum=0.090;SC=AAATCATATGACCATGGTCTG;SOR=0.445;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=101;TCF=62;TCR=39;TR=38;WE=101126384;WS=101126366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,45:0.40:112
chr7	101126511	rs35677699	C	T	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=1.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQRankSum=0.913;QD=3.77;ReadPosRankSum=1.497;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,12:0.27:44
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chr7	101183108	rs6465817	T	C	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.083;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=4;PP=318;ReadPosRankSum=0.169;SC=CATGTCCCTGTGTGTCACGCA;SOR=0.965;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=78;TCF=62;TCR=16;TR=26;WE=101183116;WS=101183098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,30:0.35:85
chr7	101187508	.	CT	C	43.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.000;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=2.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.15;ReadPosRankSum=-0.771;SOR=0.158;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,8:0.21:38
chr7	101188812	rs60933561	CG	C	1929.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.118;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.238;NF=3;NR=31;PP=1224;ReadPosRankSum=-0.947;SC=GGCTGAGCTACGCTGTGTTCT;SOR=0.934;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=85;TCF=11;TCR=74;TR=34;WE=101188820;WS=101188802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,60:0.40:150
chr7	101188852	rs9886175	T	C	794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.713;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=24;PP=437;ReadPosRankSum=1.482;SC=TAAAGGATCCTGGGAAGTGGA;SOR=0.897;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=88;TCF=38;TCR=50;TR=41;WE=101188860;WS=101188842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,42:0.46:91
chr7	101194424	rs17135626	C	T	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.886;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=208;ReadPosRankSum=0.682;SC=TGGGGCCGTCCGTAAGTGTGG;SOR=0.843;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=80;TCF=35;TCR=45;TR=22;WE=101194432;WS=101194414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,27:0.31:88
chr7	101196488	rs12674244	T	C	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.23;ReadPosRankSum=-0.430;SOR=0.874;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,14:0.21:68
chr7	101196688	rs13235234	C	T	1161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=39;PP=758;ReadPosRankSum=0.376;SC=CGTTCCCTCCCGCCTCCTTGG;SOR=0.650;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=182;TCF=67;TCR=115;TR=58;WE=101196696;WS=101196678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,64:0.33:195
chr7	101196756	rs3800980	A	G	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.825;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=275;ReadPosRankSum=-0.982;SC=ACCGTCAGCCAGCCCCGAGCT;SOR=2.356;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=3;TCR=36;TR=15;WE=101196764;WS=101196746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,16:0.40:40
chr7	101199257	rs4729728	G	A	2150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=48;PP=1484;SC=TCCCTCCCTTGCCCCTAGTCT;SOR=1.640;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=26;TCR=48;TR=74;WE=101199265;WS=101199247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr7	101200669	rs36008849	A	AG	12377.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=361;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=149;PP=2969;SC=GCCTCCCCAGAGGAGGTTCTG;SOR=1.020;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=191;TCF=31;TCR=160;TR=177;WE=101200677;WS=101200659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,350:1.00:350
chr7	101200727	rs17393069	G	A	5352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.144;NF=53;NR=102;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.223;SC=GAGGGGTGGCGCCCAACCCGA;SOR=0.567;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=156;TCF=53;TCR=103;TR=155;WE=101200735;WS=101200717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,193:0.99:194
chr7	101200835	rs7809926	A	G	2024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=41;PP=1174;SC=AGGACACCCTATCCTGGCTAG;SOR=1.240;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=28;TCR=41;TR=69;WE=101200843;WS=101200825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr7	101256833	rs2240389	T	C	1095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FS=0.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.39;ReadPosRankSum=-1.568;SOR=0.755;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:247,76:0.24:323
chr7	101257075	rs2240390	T	C	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.935;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=179;ReadPosRankSum=0.201;SC=GAGGGGCAAGTGGGGGCAGGG;SOR=1.994;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=66;TCF=18;TCR=48;TR=18;WE=101257083;WS=101257065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,18:0.26:68
chr7	101265350	rs4263675	T	C	5043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=108;NR=63;PP=2965;SC=CTGCTGCCCCTCCAGGACTCC;SOR=1.280;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=171;TCF=108;TCR=63;TR=171;WE=101265358;WS=101265340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr7	101267435	rs876825	T	C	1878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FS=1.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.24;ReadPosRankSum=0.797;SOR=0.681;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:191,110:0.37:301
chr7	101272465	rs848644	T	C	1698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=33;NR=24;PP=859;SC=AGTGGTGAAGTGAAAAAGTTC;SOR=0.723;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=33;TCR=24;TR=57;WE=101272473;WS=101272455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
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chr7	101740606	rs1637257	T	G	3643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=3.179;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.03;ReadPosRankSum=0.326;SOR=2.042;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,138:0.99:140
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chr7	101740827	rs10638510	T	TTC	6478.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.62;SOR=2.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr7	101747575	rs201480	A	G	1031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=3;PP=1246;SC=ATGGAATTGTATGCTTCTCTT;SOR=5.486;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=49;TCF=45;TCR=4;TR=47;WE=101747583;WS=101747565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr7	101747593	.	G	GT	920.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.913;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.93;ReadPosRankSum=-0.909;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,41:0.93:44
chr7	101754865	rs201493	T	C	1645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=8;PP=1188;SC=TACCCCGTGGTGCGCCTGCCG;SOR=3.098;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=45;TCR=8;TR=53;WE=101754873;WS=101754855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr7	101755060	rs9655774	A	G	3649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.238;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=90;PP=2219;ReadPosRankSum=0.322;SC=AACAGGTTTGATACTCTCCTT;SOR=0.945;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=217;TCF=87;TCR=130;TR=147;WE=101755068;WS=101755050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,161:0.68:236
chr7	101758584	rs201501	G	A	9126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=342;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=142;NR=167;PP=2965;SC=TCCCTTATCCGTACACATTTC;SOR=0.925;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=309;TCF=142;TCR=167;TR=309;WE=101758592;WS=101758574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,342:1.00:342
chr7	101837149	rs11540899	G	A	5396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=357;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=107;NR=112;PP=2962;ReadPosRankSum=0.006;SC=AGTTTGCACCGTCCGAGGGCG;SOR=0.702;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=323;TCF=154;TCR=169;TR=219;WE=101837157;WS=101837139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,244:0.68:357
chr7	101843536	rs34285499	A	AT	1714.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.429;HP=11;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=2.365;NF=1;NR=53;PP=794;ReadPosRankSum=-1.014;SC=GTAATTAACTATTTTTTTTTT;SOR=0.451;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=112;TCF=2;TCR=110;TR=54;WE=101843544;WS=101843526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,79:0.59:133
chr7	101844851	rs60987662	A	G	5414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=397;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.605;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=105;NR=130;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.868;SC=CCAGCTACCCACCTCTCGCCA;SOR=0.926;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=368;TCF=172;TCR=196;TR=235;WE=101844859;WS=101844841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,249:0.63:395
chr7	101870599	rs430841	A	G	3019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=31;PP=2030;SC=TGGTCGTGGTAAAAGACAGCT;SOR=1.477;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=64;TCR=31;TR=95;WE=101870607;WS=101870589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr7	101882503	rs62484935	T	C	1308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.814;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=12;PP=723;ReadPosRankSum=-0.835;SC=TGCAAAGTCCTGCAAGCCGGC;SOR=1.392;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=59;TCF=43;TCR=16;TR=46;WE=101882511;WS=101882493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,53:0.79:67
chr7	101892328	rs368214	C	T	1300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.200;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=40;PP=872;ReadPosRankSum=-0.482;SC=TCTGAGGGGCCGCGGCCCTGG;SOR=0.799;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=175;TCF=72;TCR=103;TR=66;WE=101892336;WS=101892318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,68:0.36:188
chr7	101916647	rs813000	A	G	4123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=51;PP=2391;SC=GACGCTGTGCAGAGCTGCAAG;SOR=1.129;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=89;TCR=51;TR=140;WE=101916655;WS=101916637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr7	101916798	rs2974957	C	A	2265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=383;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.394;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=59;PP=1325;ReadPosRankSum=-0.812;SC=GCCCATCTCGCTACCTGCCCA;SOR=0.741;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=358;TCF=180;TCR=178;TR=117;WE=101916806;WS=101916788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:252,127:0.34:379
chr7	101917521	rs803064	G	A	3742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.537;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=56;PP=2261;ReadPosRankSum=-0.656;SC=GCAGGGTGCCGCTGAGCACCG;SOR=0.816;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=261;TCF=164;TCR=97;TR=159;WE=101917529;WS=101917511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,169:0.62:274
chr7	101917647	rs712839	A	G	6537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=138;PP=2965;SC=GATACCGCCTAAGAACACAGA;SOR=1.362;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=220;TCF=81;TCR=139;TR=218;WE=101917655;WS=101917637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr7	101917772	rs712840	A	G	395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=11;PP=290;SC=CTATAGTCCCAGCTACTTTGG;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=101917780;WS=101917762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr7	101923315	rs57030737	T	TC	13457.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=393;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=122;PP=2967;SC=TCTCTTCCCCTCCTGTCTGTG;SOR=0.736;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=169;TCF=38;TCR=131;TR=158;WE=101923323;WS=101923305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,376:1.00:376
chr7	101925065	rs803069	G	T	991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.153;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=9;PP=779;ReadPosRankSum=1.228;SC=TTTCTGTGAAGCCCAGGCAGC;SOR=1.389;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=74;TCF=55;TCR=19;TR=44;WE=101925073;WS=101925055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,44:0.58:76
chr7	101925338	rs2257738	A	G	1896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=47;PP=1434;SC=CTAGCTTGCGACCATGCCTCT;SOR=2.231;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=15;TCR=47;TR=62;WE=101925346;WS=101925328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr7	101926228	rs803070	T	C	909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=25;NR=15;PP=998;SC=ATCCACTACCTCCTAGCCCCA;SOR=0.957;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=25;TCR=15;TR=40;WE=101926236;WS=101926218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr7	101928495	rs803074	G	C	8470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=175;NR=114;PP=2965;SC=ATCTCAGGACGCTCTCTGGCC;SOR=1.160;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=289;TCF=175;TCR=114;TR=289;WE=101928503;WS=101928485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,308:1.00:308
chr7	101928585	rs803075	G	A	10627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=393;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=175;NR=186;PP=2965;SC=CCCCTCTCCCGGGAGGGTGGA;SOR=0.806;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=363;TCF=177;TCR=186;TR=361;WE=101928593;WS=101928575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,391:1.00:391
chr7	101953534	rs809120	T	G	610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=2;PP=447;SC=GGAGGCAGAGTTTGCAGTGAG;SOR=3.056;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=101953542;WS=101953524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
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chr7	101962247	rs2960257	C	A	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-5.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.123;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=250;ReadPosRankSum=-0.685;SC=TCTCAGAGACCCCCGTCCATC;SOR=0.144;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=70;TCF=3;TCR=67;TR=19;WE=101962255;WS=101962237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,22:0.28:78
chr7	102036396	rs28366045	AC	A	2545.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.406;NF=13;NR=35;PP=1685;ReadPosRankSum=0.477;SC=AAGCTCAGTGACATGTTTGCG;SOR=0.663;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=138;TCF=40;TCR=98;TR=48;WE=102036404;WS=102036386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,82:0.34:242
chr7	102036769	rs56992893	CGGAGACTGCGTATGCG	C	498.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=5;NR=2;PP=2732;SC=TTCCCCTCTGCGGAGACTGCG;SOR=2.670;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=102036792;WS=102036759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr7	102038153	.	CTGTGTG	C,CTG	5955.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.28;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=16;MQ=60.07;NF=4,4;NR=101,101;PP=422,2997;SC=TGGGTAATGGCTGTGTGTGTG;SOR=2.368;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=183;TCF=8;TCR=175;TR=105,105;WE=102038168;WS=102038142;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.19,0.79:154
chr7	102046070	rs6971258	T	A	1004.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=2;PP=1006;ReadPosRankSum=0.803;SC=AATTTTTTTTTAAAAAGCACC;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=41;TCF=39;TCR=2;TR=40;WE=102046078;WS=102046060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,36:0.97:37
chr7	102046359	rs6955864	G	C	3926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=76;PP=2454;SC=ATTTGAAGAAGTCTTGGAAAG;SOR=1.385;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=122;TCF=46;TCR=76;TR=122;WE=102046367;WS=102046349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr7	102063363	rs143532608	GGAAACATCC	G	2668.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=31;NR=5;PP=2983;SC=TCCAAAGTCTGGAAACATCCG;SOR=3.877;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=48;TCF=40;TCR=8;TR=36;WE=102063379;WS=102063353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr7	102063527	rs7384395	G	C	7536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.44;SOR=0.867;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,285:1.00:285
chr7	102065322	rs1983476	A	G	1192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=8;PP=902;SC=GGACTGGTGGACGTGAGGCAT;SOR=2.613;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=29;TCR=8;TR=37;WE=102065330;WS=102065312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr7	102065651	rs1047998	C	T	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.042;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=259;ReadPosRankSum=0.371;SC=CGCAAGGACCCGCTGACCCGC;SOR=0.976;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=62;TCF=20;TCR=42;TR=22;WE=102065659;WS=102065641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,24:0.36:66
chr7	102086891	rs12672132	C	T	668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=3;PP=433;SC=CTCTGCCTGGCAGGTGGCCCT;SOR=2.400;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=102086899;WS=102086881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr7	102098010	rs41275227	G	A	1286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FS=1.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.55;ReadPosRankSum=1.476;SOR=0.597;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:156,76:0.33:232
chr7	102106201	rs3823658	G	A	1300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.643;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=41;PP=897;ReadPosRankSum=0.393;SC=TGAGGTACCCGGGGCAGATTG;SOR=0.839;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=246;TCF=120;TCR=126;TR=75;WE=102106209;WS=102106191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:184,78:0.30:262
chr7	102108532	rs73189880	G	A	1025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.312;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=22;PP=540;ReadPosRankSum=1.164;SC=CCTTGAAACGGCCAGACGACG;SOR=0.842;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=138;TCF=79;TCR=59;TR=53;WE=102108540;WS=102108522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,58:0.38:153
chr7	102136550	rs77782294	G	A	680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=707;ExcessHet=3.0103;FS=7.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.08;MQRankSum=-19.579;QD=0.96;ReadPosRankSum=2.513;SOR=1.550;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:620,87:0.12:707
chr7	102147337	.	A	G	118.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.63;QD=23.78;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr7	102246500	rs144574884	A	G	43.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.39;MQRankSum=-1.150;QD=10.95;ReadPosRankSum=0.319;SOR=0.916;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr7	102257215	.	G	C	185.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.65;QD=37.18;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr7	102257216	.	T	G	185.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.65;QD=37.18;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr7	102279552	.	G	A	1301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.973;ClippingRankSum=0.000;DP=484;ExcessHet=3.0103;FS=0.668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.26;MQRankSum=-10.897;QD=2.70;ReadPosRankSum=1.863;SOR=0.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:381,102:0.21:483
chr7	102279670	.	A	C	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.000;DP=605;ExcessHet=3.0103;FS=0.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.11;MQRankSum=-11.090;QD=0.33;ReadPosRankSum=0.030;SOR=0.555;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:525,78:0.13:603
chr7	102318861	rs374405684	G	A	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.63;MQRankSum=-1.260;QD=3.52;ReadPosRankSum=1.240;SOR=0.671;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:159,50:0.24:209
chr7	102343967	rs4729850	A	G	1888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=77;PP=2193;SC=ATTTAGGAGTATCTTCACCTA;SOR=2.303;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=99;TCF=21;TCR=78;TR=98;WE=102343975;WS=102343957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr7	102389833	rs28695887	G	C	953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=27;PP=834;SC=CCTGGCCCGGGGCGCCGAACT;SOR=1.739;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=16;TCR=27;TR=43;WE=102389841;WS=102389823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr7	102398410	rs199537059	C	CT	122.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=4.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.91;MQRankSum=-2.826;QD=1.50;ReadPosRankSum=0.276;SOR=1.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,16:0.20:82
chr7	102401990	rs11412851	A	T	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-1.649;NF=0;NR=15;PP=265;ReadPosRankSum=-0.467;SC=CCATCTTTTTAAAAAAAAAAA;SOR=2.200;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=15;WE=102401998;WS=102401980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,16:0.76:21
chr7	102412901	rs2539288	T	C	967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=606;ExcessHet=3.0103;FS=0.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.39;MQRankSum=-22.104;QD=1.60;ReadPosRankSum=1.349;SOR=0.762;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:491,112:0.19:603
chr7	102427889	rs116082009	C	T	5656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-0.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=465;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-8.396;NF=144;NR=138;PP=2962;ReadPosRankSum=0.488;SC=GGCTGAAGTTCGTAAAGATGA;SOR=0.746;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=471;TCF=240;TCR=231;TR=282;WE=102427897;WS=102427879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:190,275:0.59:465
chr7	102462636	rs10279449	T	C	5989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=411;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.840;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=133;NR=118;PP=2962;ReadPosRankSum=0.536;SC=ACATCTCCATTGCTGAGTCAG;SOR=0.801;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=381;TCF=200;TCR=181;TR=251;WE=102462644;WS=102462626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,268:0.65:411
chr7	102495434	rs2041094	C	T	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.192;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=80;ReadPosRankSum=0.210;SC=ATTTTAGTTGCTGTCATATTT;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=102495442;WS=102495424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr7	102518909	rs72580510	A	AGT	1206.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FS=0.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.40;MQRankSum=4.319;QD=7.74;ReadPosRankSum=-1.476;SOR=0.591;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,39:0.25:156
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chr7	102668001	rs7805950	A	C	3490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=68;PP=2176;SC=TCCGCAATAGAATATCTGAAG;SOR=1.479;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=42;TCR=68;TR=110;WE=102668009;WS=102667991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr7	102722505	rs4729868	G	A	7160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=153;PP=2965;SC=AATTCTTTCCGTTCTAAAAAG;SOR=1.477;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=242;TCF=89;TCR=153;TR=242;WE=102722524;WS=102722495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,262:1.00:262
chr7	102722516	rs4729869	T	C	6066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=126;PP=2965;SC=TTCTAAAAAGTTGTGTTTTTA;SOR=1.598;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=194;TCF=68;TCR=126;TR=194;WE=102722524;WS=102722495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr7	102724372	rs4729871	A	T	6640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=140;PP=2965;SC=TCAGACCCTCAATTTCCTCAT;SOR=1.247;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=229;TCF=89;TCR=140;TR=229;WE=102724380;WS=102724362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr7	102738574	rs10808123	A	C	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=2;NR=1;PP=27;SC=CTAAGTTATGAAATTTTGGGT;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=102738582;WS=102738564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr7	102738590	rs10808124	G	A	172.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=4;NR=1;PP=77;SC=TGGGTTTTCTGTGACAAAATT;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=102738598;WS=102738580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr7	102739043	rs4729879	C	T	1413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=51.91;QD=26.18;SOR=1.220;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr7	102743893	rs3181009	C	T	333.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=285;SC=TTTTCATCATCATTATTTAGG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=102743901;WS=102743883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr7	102755330	rs4729882	A	G	1756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=2;PP=1150;SC=TTCTGACTGTATATGTGTGTA;SOR=5.421;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=42;TCR=2;TR=43;WE=102755338;WS=102755320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr7	102760511	rs12540583	A	C	2213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=382;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.395;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=68;PP=1291;ReadPosRankSum=-1.725;SC=GAAGCACGAGAGCTAAAGATG;SOR=0.660;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=366;TCF=165;TCR=201;TR=122;WE=102760519;WS=102760501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:254,127:0.33:381
chr7	102760722	rs1974715	A	G	1032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=26;PP=733;SC=AAAAAGTATTATATCATCATA;SOR=3.675;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=30;WE=102760730;WS=102760712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr7	102825871	rs4317507	T	C	4284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=-1.675;NF=107;NR=65;PP=2965;ReadPosRankSum=1.603;SC=AAGAAATACTTATCAGCTGCC;SOR=0.432;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=174;TCF=109;TCR=65;TR=172;WE=102825879;WS=102825861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,161:0.99:162
chr7	102825987	.	GA	G	140.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.180;ClippingRankSum=0.000;DP=156;ExcessHet=3.0103;FS=3.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.25;MQRankSum=-8.428;QD=1.26;ReadPosRankSum=3.084;SOR=0.341;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,23:0.21:112
chr7	102852796	.	G	T	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.775;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.639;NF=0;NR=13;PP=276;ReadPosRankSum=0.386;SC=AAATTTCTTTGTCATCAGCAG;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=13;WE=102852804;WS=102852786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr7	102874366	rs3987883	C	T	1385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.25;QD=31.49;SOR=7.614;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr7	102937914	rs138251541	C	T	890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=10;PP=629;ReadPosRankSum=-0.204;SC=GAAATGGCGGCTGCGGCGGCT;SOR=0.811;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=54;TCF=38;TCR=16;TR=37;WE=102937922;WS=102937904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,38:0.68:56
chr7	102953165	.	A	G	1073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.015;ClippingRankSum=0.000;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.738;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=21;PP=596;ReadPosRankSum=1.338;SC=TTTGGTGTAAAGAATTCAAGC;SOR=0.355;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=59;TCF=25;TCR=34;TR=40;WE=102953173;WS=102953155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,46:0.70:66
chr7	102953544	rs61749913	T	C	1457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.796;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=42;PP=869;ReadPosRankSum=-1.550;SC=AGTCTGTATATGGACCTGATT;SOR=1.099;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=103;TCF=39;TCR=64;TR=64;WE=102953552;WS=102953534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,68:0.62:110
chr7	103007949	rs4520097	A	C	4252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=57;PP=2486;SC=TTTTGATCCTAGAGGCAATAT;SOR=1.157;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=144;TCF=87;TCR=57;TR=144;WE=103007957;WS=103007939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr7	103018016	rs10273883	A	G	3350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=23;PP=2355;SC=GCATAGAGGTATTAAATGACT;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=80;TCR=23;TR=103;WE=103018024;WS=103018006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
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chr7	103029915	rs62482415	A	G	1993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=52;PP=1382;ReadPosRankSum=0.111;SC=TTGTGTCCACAGAGTGTCCTT;SOR=0.678;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=117;TCF=42;TCR=75;TR=82;WE=103029931;WS=103029905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,85:0.69:124
chr7	103033573	rs13240456	T	C	774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=22;PP=633;SC=AAAAAAAACCTTGCGACTGCA;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=103033581;WS=103033563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
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chr7	103136102	rs2528873	C	A	1891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.911;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=36;PP=1090;ReadPosRankSum=0.392;SC=AGTTGTCTGACTAACCATTCT;SOR=0.511;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=244;TCF=157;TCR=87;TR=96;WE=103136110;WS=103136092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,102:0.39:260
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chr7	103141147	rs13232021	A	G	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=168;ReadPosRankSum=0.854;SC=CCTAGGCATGACCCATGATGT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=11;WE=103141155;WS=103141137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,12:0.33:36
chr7	103141437	rs13235135	A	G	828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.816;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=31;PP=597;ReadPosRankSum=-0.174;SC=ATTGTCCTGCATGTGTATTCA;SOR=0.812;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=115;TCF=29;TCR=86;TR=41;WE=103141445;WS=103141427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,42:0.35:121
chr7	103155705	rs2229864	A	G	1677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.237;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=37;PP=982;ReadPosRankSum=-0.277;SC=GGGAGCGCTCATGCTGGGGTA;SOR=0.762;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=229;TCF=119;TCR=110;TR=84;WE=103155725;WS=103155695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,91:0.37:245
chr7	103155864	rs56345626	A	G	943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=30;PP=628;ReadPosRankSum=-0.340;SC=CTTTAGCATCAGGAGGGAGAA;SOR=0.737;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=174;TCF=78;TCR=96;TR=53;WE=103155872;WS=103155854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,56:0.30:186
chr7	103155944	rs2528862	C	G	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.384;HP=2;HapScore=3;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=714;ReadPosRankSum=0.489;SC=AATATCTTCTCTGAGTAAAAG;SOR=0.941;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=42;TCF=12;TCR=30;TR=13;WE=103155959;WS=103155934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,13:0.30:43
chr7	103155951	rs78832383	A	AAAG	313.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.937;HP=3;HapScore=3;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=715;ReadPosRankSum=0.902;SC=TCTCTGAGTAAAAGATTTACA;SOR=1.251;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=10;WE=103155959;WS=103155934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,10:0.30:33
chr7	103155977	rs2528863	A	C	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.191;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=118;ReadPosRankSum=0.617;SC=CCATAAGATAATGTATGTCAC;SOR=0.078;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=8;WE=103155985;WS=103155967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr7	103162370	rs10282605	C	T	1627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.632;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.320;NF=49;NR=9;PP=1086;ReadPosRankSum=1.472;SC=GGTAACTAACCCTGCATCTTG;SOR=1.302;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=91;TCF=74;TCR=17;TR=58;WE=103162378;WS=103162360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,63:0.64:98
chr7	103175965	rs362706	C	T	2394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.127;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=61;PP=1435;ReadPosRankSum=0.511;SC=GATATAAACACATATCTGCAG;SOR=1.013;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=145;TCF=56;TCR=89;TR=97;WE=103175973;WS=103175955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,106:0.67:159
chr7	103180573	.	C	T	1430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.046;ClippingRankSum=0.000;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=19;PP=1032;ReadPosRankSum=1.110;SC=GCAGGTTGAACTAAATGCCTT;SOR=0.663;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=59;TCR=27;TR=60;WE=103180581;WS=103180563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,62:0.70:88
chr7	103191428	rs362721	C	T	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-1.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.483;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=198;ReadPosRankSum=-0.889;SC=GGAAATTTCCCCATGATAAAG;SOR=0.174;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=14;WE=103191436;WS=103191418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr7	103197603	rs41275239	G	A	1371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.383;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=45;PP=1019;ReadPosRankSum=-0.184;SC=TCTCTCTGGGGTACCTAGGAA;SOR=2.058;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=81;TCF=13;TCR=68;TR=50;WE=103197611;WS=103197593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,53:0.63:84
chr7	103206903	rs56259359	T	C	1658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.802;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=41;PP=1090;ReadPosRankSum=-0.461;SC=TTTTGTTACATAGCAATATGA;SOR=0.495;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=94;TCF=28;TCR=66;TR=59;WE=103206911;WS=103206893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,68:0.64:107
chr7	103234683	.	C	CACT	403.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.854;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=336;ReadPosRankSum=-0.636;SC=CAGTGTCAAGCACTAAATCCT;SOR=2.387;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=8;WE=103234691;WS=103234673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr7	103244816	rs41276148	G	A	4036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.519;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=65;PP=2523;ReadPosRankSum=-0.329;SC=GATCGCATGAGCCATGCCCAC;SOR=0.621;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=233;TCF=141;TCR=92;TR=161;WE=103244829;WS=103244806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,170:0.70:244
chr7	103275803	rs362646	T	C	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.688;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=312;ReadPosRankSum=0.057;SC=TTTTATACCATTTGAATTATG;SOR=0.278;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=16;WE=103275811;WS=103275793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
chr7	103276075	.	T	A	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.070;ClippingRankSum=0.000;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=1.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.61;ReadPosRankSum=-0.717;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:102,17:0.14:119
chr7	103294477	rs41276160	T	C	2418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=33;PP=1350;ReadPosRankSum=0.043;SC=TTTGTGGTTTTGACTTGGGCT;SOR=0.748;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=140;TCF=91;TCR=49;TR=96;WE=103294485;WS=103294467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,106:0.70:151
chr7	103389954	rs607755	A	G	906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=21;PP=529;ReadPosRankSum=-0.195;SC=TATTTCAGCTAAAAGAAAAAG;SOR=0.668;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=19;TCR=28;TR=35;WE=103389962;WS=103389944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,40:0.74:54
chr7	103417134	rs262338	G	T	3456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.52;ReadPosRankSum=1.346;SOR=0.696;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,91:0.62:147
chr7	103417139	rs13243284	A	C	3292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=1.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.33;ReadPosRankSum=1.580;SOR=0.545;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,81:0.62:130
chr7	103417557	rs11496125	C	T	1674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.756;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=24;PP=975;ReadPosRankSum=1.541;SC=CTATTCAAAGCTTTCATAATA;SOR=0.837;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=103;TCF=66;TCR=37;TR=68;WE=103417565;WS=103417547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,77:0.67:115
chr7	103557697	rs711443	A	G	1843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=53;PP=1461;SC=TATTTCTGAAATGTTAGACAT;SOR=6.736;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=55;TCF=2;TCR=53;TR=55;WE=103557705;WS=103557687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr7	103629803	.	T	TGCC,TGCCGCC	2614.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.632;ClippingRankSum=0.000;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=2.751;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.269;NF=2,2;NR=32,32;PP=1440,34;ReadPosRankSum=-0.290;SC=CTGCGCTCCATGCCGCCGCCG;SOR=1.765;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=67;TCF=2;TCR=65;TR=34,34;WE=103629811;WS=103629793;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.11,0.86:64
chr7	103807202	rs2307405	G	C	943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=7;PP=599;ReadPosRankSum=0.861;SC=AAAGTGAAAAGAAGTATGTTA;SOR=0.573;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=58;TCF=47;TCR=11;TR=35;WE=103807210;WS=103807192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,41:0.60:68
chr7	103828290	rs714519	A	G	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.241;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=30;ReadPosRankSum=0.308;SC=CTAGACCTCAATCACCGCATA;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=3;WE=103828298;WS=103828280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr7	103848094	rs2075217	T	A	1489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.14;SOR=5.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr7	103848102	rs971813	C	G	1538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.74;SOR=5.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr7	103848133	rs10953406	C	G	2573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=16;PP=1765;SC=GTGGGTGAAGCTGCAGTACAG;SOR=2.625;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=61;TCR=16;TR=77;WE=103848141;WS=103848123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr7	103848413	rs2075218	G	C	2978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=69;PP=2158;SC=GCACAAGACGGAGCCTCTCCC;SOR=2.761;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=18;TCR=69;TR=87;WE=103848421;WS=103848403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr7	103969194	rs71794813	CAGGAGG	C	374.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.546;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.473;NF=3;NR=5;PP=210;ReadPosRankSum=-0.703;SC=GGCGGAGGACCAGGAGGAGGA;SOR=0.364;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=33;TCF=22;TCR=11;TR=8;WE=103969207;WS=103969184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,12:0.33:36
chr7	104110392	rs4727601	C	T	10090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=178;NR=112;PP=2965;SC=ATAGCACAATCATAGAAAACT;SOR=1.233;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=290;TCF=178;TCR=112;TR=290;WE=104110400;WS=104110382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,323:1.00:323
chr7	104110415	rs10216054	G	A	1581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=418;ExcessHet=3.0103;FS=1.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.78;ReadPosRankSum=0.968;SOR=0.834;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:315,103:0.25:418
chr7	104263425	rs1073012	T	C	1293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=14;PP=759;SC=TTATTATAGCTATCCTGGAGG;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=28;TCR=14;TR=42;WE=104263433;WS=104263415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr7	104377453	rs4236573	A	C	1309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=40;PP=959;SC=GCTTCCCCTGAGGTTCTAATT;SOR=2.655;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=11;TCR=40;TR=51;WE=104377461;WS=104377443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr7	104707158	.	CT	C	114.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.373;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=3.941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.34;ReadPosRankSum=0.531;SOR=0.167;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,14:0.29:49
chr7	104767295	rs3815256	A	G	973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=5;PP=670;SC=CTGAGGGGGCATCAAACTCAA;SOR=3.026;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=34;WE=104767303;WS=104767285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr7	104785779	rs7780887	T	G	3253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=59;NR=57;PP=1783;SC=AAACAAAATCTGTATTTAGCA;SOR=0.806;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=116;TCF=59;TCR=57;TR=116;WE=104785787;WS=104785769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr7	104800939	rs4730071	C	T	4390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=98;NR=54;PP=2824;SC=TAGGGGCTGCCGTCAAAAGTC;SOR=1.281;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=98;TCR=54;TR=152;WE=104800947;WS=104800929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr7	104801235	rs117548414	G	T	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.793;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=233;ReadPosRankSum=0.000;SC=AACAAGAACTGACATTACTAA;SOR=0.238;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=14;WE=104801243;WS=104801225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr7	104808386	rs143276009	G	GA	1576.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=8;PP=1090;SC=GTATTACCCAGAAAAATCTTT;SOR=2.348;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=37;TCF=24;TCR=13;TR=29;WE=104808394;WS=104808376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr7	104844416	rs200398298	CAA	C,CA	1264.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.16;MQRankSum=0.280;QD=22.19;ReadPosRankSum=-0.801;SOR=0.458;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:1,19,37:0.33,0.65:57
chr7	104845124	rs2237611	A	C	2747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=65;PP=2022;SC=GCATTTCTGCAACGGCAGCCC;SOR=2.610;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=18;TCR=65;TR=83;WE=104845132;WS=104845114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr7	104845964	.	TCACACACACACA	T	1033.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.83;QD=36.92;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,27:0.96:28
chr7	104846173	rs55712418	A	G	8352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=110;NR=174;PP=2965;SC=AGGAGAGGCAAGTAAGGAACT;SOR=1.296;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=284;TCF=110;TCR=174;TR=284;WE=104846181;WS=104846163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,303:1.00:303
chr7	104846375	rs139433699	A	AAC	4693.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.055;NF=19;NR=41;PP=2496;ReadPosRankSum=0.941;SC=ATTCTCTGAAAACACACACAC;SOR=0.726;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=107;TCF=32;TCR=75;TR=60;WE=104846384;WS=104846362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,152:0.81:188
chr7	105135545	rs76888161	T	C	1604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.827;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=18;PP=952;ReadPosRankSum=0.723;SC=GAATATACGTTTCTGTTGCTT;SOR=0.823;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=85;TCF=59;TCR=26;TR=56;WE=105135553;WS=105135535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,67:0.66:101
chr7	105146593	rs11421080	A	AT	1909.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.04;MQRankSum=1.466;QD=6.94;ReadPosRankSum=0.463;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:187,88:0.32:275
chr7	105146812	rs77972725	A	G	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=19;PP=414;ReadPosRankSum=1.169;SC=CCTTACTATTATGCAAAACAA;SOR=0.502;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=20;WE=105146820;WS=105146802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,21:0.64:33
chr7	105148460	rs55700120	G	T	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=126;ReadPosRankSum=-0.831;SC=GTATAAACAAGCCTTGGAGAT;SOR=1.302;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=8;WE=105148468;WS=105148453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr7	105172685	rs818620	G	C	630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.896;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=289;ReadPosRankSum=-0.900;SC=GCTGGGTAGTGAGTGTGTCGC;SOR=0.322;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=22;WE=105172693;WS=105172675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,28:0.62:45
chr7	105173029	rs818621	T	C	821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=27;PP=651;ReadPosRankSum=0.322;SC=GGGAGGTGGCTCTAGTGAGCA;SOR=0.469;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=45;TCF=5;TCR=40;TR=31;WE=105173037;WS=105173019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,32:0.68:47
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chr7	105732429	rs176485	T	C	954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=26;PP=661;ReadPosRankSum=0.627;SC=TACCTACTTATAAAAATTCAT;SOR=0.890;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=13;TCR=34;TR=36;WE=105732437;WS=105732419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,38:0.73:52
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chr7	105738368	rs12705333	T	C	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.861;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=279;ReadPosRankSum=-0.492;SC=GTATGAATTATTGGACTTTCC;SOR=0.124;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=50;TCF=5;TCR=45;TR=17;WE=105738376;WS=105738358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,18:0.35:52
chr7	105739732	rs176492	C	T	3266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.407;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=88;PP=1912;ReadPosRankSum=-2.205;SC=AAGCAATCTACACAAAGTAAG;SOR=0.897;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=228;TCF=97;TCR=131;TR=151;WE=105739740;WS=105739722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,159:0.67:236
chr7	105752555	rs2240473	G	A	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=294;ReadPosRankSum=0.040;SC=CCGAGCGGCAGGCGGGCCTGG;SOR=0.798;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=53;TCF=38;TCR=15;TR=25;WE=105752563;WS=105752545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,31:0.52:60
chr7	105752691	rs176501	G	A	2146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.578;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=42;PP=1213;ReadPosRankSum=-1.418;SC=TCAGGACGACGGGGCGGAGGA;SOR=0.621;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=152;TCF=80;TCR=72;TR=89;WE=105752699;WS=105752681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,100:0.60:168
chr7	105752820	rs176502	G	A	987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=2.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.565;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=15;PP=864;ReadPosRankSum=2.338;SC=GAGCGGCGGCGGTTGAGCTGC;SOR=1.802;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=58;TCF=37;TCR=21;TR=44;WE=105752828;WS=105752810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,38:0.76:50
chr7	105903904	rs2302559	T	C	4910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=394;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.142;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-6.959;NF=106;NR=120;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.800;SC=GTGTACTTCTTGATACTATTA;SOR=0.947;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=384;TCF=182;TCR=202;TR=226;WE=105903912;WS=105903894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,223:0.57:394
chr7	105904150	rs4730153	A	G	2141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.830;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=62;PP=1493;ReadPosRankSum=1.133;SC=CATGTTTACTATACCAAACCA;SOR=0.439;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=125;TCF=26;TCR=99;TR=80;WE=105904158;WS=105904140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,87:0.64:136
chr7	105909828	.	CT	C	41.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=-0.000;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.60;MQRankSum=1.599;QD=2.98;ReadPosRankSum=0.598;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr7	105910666	rs6947766	C	T	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.800;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=7;PP=177;ReadPosRankSum=-1.838;SC=TAGAAATTCACTTCTTCATTC;SOR=0.298;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=24;TCF=15;TCR=9;TR=16;WE=105910674;WS=105910656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr7	106508978	rs849389	A	G	4020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=403;ExcessHet=3.0103;FS=0.575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.98;ReadPosRankSum=-0.937;SOR=0.743;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:285,118:0.29:403
chr7	106508987	rs849390	T	C	4032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=410;ExcessHet=3.0103;FS=1.914;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.84;ReadPosRankSum=-1.316;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:286,124:0.30:410
chr7	106513011	rs1129293	C	T	2348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=560;ExcessHet=3.0103;FS=1.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.21;ReadPosRankSum=0.421;SOR=0.824;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:406,152:0.27:558
chr7	106519943	rs849370	T	C	2160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=380;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=45;PP=1484;ReadPosRankSum=0.625;SC=GTGTGGGGAATATGTGACTGC;SOR=0.710;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=349;TCF=211;TCR=138;TR=112;WE=106519951;WS=106519933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:259,120:0.32:379
chr7	106685448	rs75385144	G	T	2811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.535;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=50;PP=1631;ReadPosRankSum=-0.457;SC=TGGAGTTCGCGCTGCAGCACT;SOR=0.618;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=181;TCF=95;TCR=86;TR=110;WE=106685456;WS=106685438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,126:0.63:201
chr7	106768839	rs34736852	G	GAC	4798.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.828;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.600;NF=6;NR=57;PP=2902;ReadPosRankSum=-0.974;SC=TTTGTAAGCTGATCACCCTGG;SOR=0.564;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=113;TCF=9;TCR=104;TR=63;WE=106768847;WS=106768829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,123:0.62:200
chr7	106781445	rs2302453	G	A	1821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.979;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=41;PP=998;ReadPosRankSum=0.066;SC=AACCTTTTGTGTAAAATCTCA;SOR=0.965;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=131;TCF=58;TCR=73;TR=73;WE=106781453;WS=106781435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,84:0.57:148
chr7	106786952	rs3729876	T	C	2041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.656;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=50;PP=1295;ReadPosRankSum=-0.907;SC=TTTGTAGCAATTGCTATGACG;SOR=0.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=133;TCF=46;TCR=87;TR=76;WE=106786960;WS=106786942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,86:0.59:147
chr7	106787065	rs3729877	T	G	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=73;ReadPosRankSum=1.035;SC=CACTAAGACTTCACTAAGTCA;SOR=0.223;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=5;WE=106787073;WS=106787055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr7	106799997	rs257376	G	A	1982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=540;ExcessHet=3.0103;FS=0.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.70;ReadPosRankSum=1.061;SOR=0.759;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:400,136:0.25:536
chr7	106826381	rs7794598	C	T	2751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=350;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.999;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=79;PP=1661;ReadPosRankSum=1.078;SC=CAGTAAGACACGAAAGGGTAA;SOR=0.864;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=324;TCF=130;TCR=194;TR=129;WE=106826389;WS=106826371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:211,139:0.40:350
chr7	106826439	rs7794965	G	A	1046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.640;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=30;PP=544;ReadPosRankSum=-2.692;SC=AACAGTTGAAGTACATTAACA;SOR=0.494;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=114;TCF=35;TCR=79;TR=46;WE=106826447;WS=106826429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,51:0.42:122
chr7	106851754	rs1018946	T	C	822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=4.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.629;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=30;PP=664;ReadPosRankSum=2.060;SC=CCTTGTAGAATAGCATTTTTC;SOR=1.141;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=143;TCF=47;TCR=96;TR=40;WE=106851762;WS=106851744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,43:0.26:165
chr7	106897237	rs17349904	A	C	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=13;PP=271;ReadPosRankSum=-0.314;SC=GACTGGAAACAACCTAGAACA;SOR=0.638;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=35;TCR=43;TR=24;WE=106897245;WS=106897227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,28:0.32:88
chr7	106898870	.	T	TTCTC	394	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MMLQ=16;MQ=60.35;NF=1;NR=34;PP=394;QD=11.3714285714;SC=AGAATGATAATTCTCTCTCTC;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=128;TCF=2;TCR=126;TR=35;WE=106898881;WS=106898860;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:93,35:0.27:128
chr7	106898895	rs142552893	T	TCTCA	228.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.355;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=36;PP=770;ReadPosRankSum=-1.627;SC=TCTCTCTCTCTCACACACACA;SOR=0.010;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=68;TCF=1;TCR=67;TR=37;WE=106898917;WS=106898885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,15:0.21:71
chr7	106965039	rs6466164	C	T	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=99;ReadPosRankSum=-1.585;SC=ATGGGTAACACGTAACCTTGA;SOR=0.994;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=9;WE=106965047;WS=106965029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,10:0.27:37
chr7	107002573	rs12536603	T	C	1473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.240;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=35;PP=986;ReadPosRankSum=0.803;SC=GAAACAAATGTAAAGCTTAGG;SOR=0.641;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=229;TCF=117;TCR=112;TR=76;WE=107002581;WS=107002563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,84:0.32:262
chr7	107002806	rs2269970	A	G	1213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FS=0.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.19;ReadPosRankSum=-1.397;SOR=0.652;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:209,81:0.28:290
chr7	107114400	rs11453718	A	AT	776.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=5;PP=375;ReadPosRankSum=1.551;SC=CAATTGAAAGATTTTTTTTCT;SOR=1.911;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=26;WE=107114408;WS=107114390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,31:0.97:32
chr7	107194911	rs2520270	C	A	342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=232;ReadPosRankSum=-0.336;SC=AAAGAAAAAACCACAGGTTTT;SOR=0.343;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=15;WE=107194919;WS=107194901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,16:0.39:41
chr7	107198405	rs2520272	A	T	1234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.105;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=29;PP=755;ReadPosRankSum=-0.200;SC=ATAGGGACCCAGAAGATCAGA;SOR=0.596;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=213;TCF=125;TCR=88;TR=68;WE=107198413;WS=107198395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,72:0.31:234
chr7	107207695	rs4730250	A	G	785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.285;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=24;PP=471;ReadPosRankSum=0.969;SC=TGACTTTTTAAAAGTACTGTA;SOR=0.996;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=134;TCF=56;TCR=78;TR=37;WE=107207703;WS=107207685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,44:0.29:154
chr7	107208118	rs1468335	T	C	804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.306;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=6;PP=559;ReadPosRankSum=0.900;SC=TACCTCTCGATCATTTTTAAG;SOR=0.426;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=59;TCF=50;TCR=9;TR=32;WE=107208126;WS=107208108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,34:0.56:61
chr7	107208250	rs1468336	T	C	9758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=370;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=168;NR=165;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.012;SC=CCACTGTTCCTCACAGCAGCC;SOR=0.749;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=335;TCF=169;TCR=166;TR=333;WE=107208258;WS=107208240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,368:0.99:370
chr7	107216738	rs10276604	C	T	1224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=9;PP=951;SC=AGATGAAATACCATTTTAGTC;SOR=2.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=42;WE=107216746;WS=107216728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr7	107217068	rs3839819	TG	T	6600.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=119;PP=2950;SC=TTCTTTTAATTGGGGGGGGAA;SOR=1.117;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=152;TCF=11;TCR=141;TR=128;WE=107217076;WS=107217058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr7	107218033	rs711442	T	C	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=267;ReadPosRankSum=1.320;SC=TTTTAATATATACTTTTAGAC;SOR=0.906;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=15;WE=107218041;WS=107218023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,19:0.73:26
chr7	107255548	rs3801944	T	C	3517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=6;PP=2548;SC=CAGTTTCTTATGGCCAGTGTC;SOR=4.674;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=93;TCR=6;TR=99;WE=107255556;WS=107255538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr7	107303622	rs2248464	A	T	2945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.97;SOR=3.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr7	107303628	rs2248465	C	T	3135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.38;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr7	107344921	.	CT	C	96.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=0.000;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=2.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQRankSum=1.921;QD=1.33;ReadPosRankSum=1.728;SOR=0.385;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,16:0.22:73
chr7	107384849	rs756872	C	T	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.697;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=75;ReadPosRankSum=0.714;SC=CGCTCCTACTCTGGTTCTGCT;SOR=0.446;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=6;WE=107384857;WS=107384839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr7	107392891	rs3216898	C	CTG	2144.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.986;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=3.240;NF=23;NR=16;PP=1295;ReadPosRankSum=-0.888;SC=ATGTGTCTCTCTGTGTGTGTG;SOR=0.209;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=88;TCF=52;TCR=36;TR=39;WE=107392900;WS=107392881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,79:0.64:124
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chr7	107423907	rs41280236	T	C	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.118;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=429;ReadPosRankSum=1.279;SC=GTGTCTCACTTTGGAGTATGA;SOR=2.391;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=19;WE=107423915;WS=107423897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr7	107427322	rs34407351	A	C	5178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=420;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.756;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=109;NR=120;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.220;SC=TTTTAAAGTCACAGCCGTAGG;SOR=0.812;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=391;TCF=191;TCR=200;TR=229;WE=107427330;WS=107427312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,244:0.58:419
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chr7	107531832	rs11373214	G	GC	3473.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=69;PP=2973;SC=GCTGGCGGAGGCGGGCGCCTG;SOR=3.033;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=2;TCR=73;TR=71;WE=107531840;WS=107531822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr7	107545586	rs17412104	G	A	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.740;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=2.56;ReadPosRankSum=-0.943;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr7	107545799	rs10263341	T	C	1382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.176;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=28;PP=714;ReadPosRankSum=-0.680;SC=AAGATTATTTTGTAAAGGTTG;SOR=0.444;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=205;TCF=132;TCR=73;TR=72;WE=107545807;WS=107545789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,77:0.34:224
chr7	107559502	rs34453495	A	C	1685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=385;ExcessHet=3.0103;FS=3.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.553;QD=4.39;ReadPosRankSum=0.208;SOR=0.729;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:272,112:0.29:384
chr7	107559722	rs8721	A	T	60.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=72;ReadPosRankSum=-0.338;SC=GATTATATATATTTTTTTCTG;SOR=0.534;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=45;TCF=9;TCR=36;TR=10;WE=107559730;WS=107559712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,8:0.17:46
chr7	107564366	rs7561	T	G	1705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.571;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=36;PP=969;ReadPosRankSum=-0.042;SC=TTTTACCTTGTTCACCTCAGC;SOR=0.463;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=227;TCF=136;TCR=91;TR=83;WE=107564374;WS=107564356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,93:0.38:243
chr7	107564539	rs3213673	G	A	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.16;ReadPosRankSum=-0.042;SOR=0.668;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:136,27:0.17:163
chr7	107564542	rs3213674	G	T	514.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.24;ReadPosRankSum=-1.085;SOR=0.703;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:131,28:0.18:159
chr7	107569517	rs1131398	A	G	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.829;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=12;PP=506;ReadPosRankSum=1.214;SC=ACCGAAGTTAACAGGTTCTGG;SOR=0.566;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=96;TCF=68;TCR=28;TR=37;WE=107569525;WS=107569507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,39:0.40:98
chr7	107569962	rs35915664	A	G	8820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=556;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.566;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=166;NR=195;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.461;SC=TCGTTCACGTATATCTTCTGT;SOR=0.617;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=519;TCF=237;TCR=282;TR=361;WE=107569970;WS=107569952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,383:0.69:556
chr7	107577448	rs34337564	CT	C	657.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.363;NF=18;NR=0;PP=533;ReadPosRankSum=-1.638;SC=TATTAGAAAACTTTTTTTTTT;SOR=0.289;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=63;TCF=59;TCR=4;TR=18;WE=107577464;WS=107577438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,21:0.36:58
chr7	107577456	rs56285692	T	C	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.613;NF=15;NR=1;PP=510;ReadPosRankSum=-1.159;SC=AACTTTTTTTTTTCCCCAAAA;SOR=0.318;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=61;TCR=3;TR=16;WE=107577464;WS=107577438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,20:0.29:70
chr7	107580839	rs2158836	A	G	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.599;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=121;ReadPosRankSum=0.676;SC=TGATCTACTTAATCATGAACC;SOR=1.721;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=4;TCR=28;TR=8;WE=107580847;WS=107580829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,8:0.25:32
chr7	107593989	rs20556	T	C	1329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.603;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=21;PP=764;ReadPosRankSum=-1.947;SC=ACAGTCCTGCTGGAGGGCATC;SOR=0.784;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=158;TCF=103;TCR=55;TR=62;WE=107593997;WS=107593979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,67:0.39:171
chr7	107599680	.	C	G	3555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.469;ClippingRankSum=0.000;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.313;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=61;PP=2239;ReadPosRankSum=-0.870;SC=TCCTTACTTTCAGCATCTGCA;SOR=0.492;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=209;TCF=125;TCR=84;TR=145;WE=107599688;WS=107599670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,159:0.70:228
chr7	107603431	rs2230156	A	C	1112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=24;PP=550;ReadPosRankSum=-1.620;SC=AAGCCCCTTCAGGCACTCGGA;SOR=0.649;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=169;TCF=97;TCR=72;TR=55;WE=107603439;WS=107603421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,62:0.32:193
chr7	107669483	.	G	A	3126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.627;ClippingRankSum=0.000;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.483;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=53;PP=2069;ReadPosRankSum=1.166;SC=TAAAAGAACAGATACCTGTTA;SOR=0.743;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=225;TCF=133;TCR=92;TR=138;WE=107669491;WS=107669473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,145:0.60:243
chr7	107738801	.	A	ACATAGGGGTTGATGGACGCCCCCTCCCCGCCCTCCCACTATGGACTTACGCTGGCAGCC	609.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.392;ClippingRankSum=0.000;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=1.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQRankSum=-4.069;QD=4.69;ReadPosRankSum=1.086;SOR=0.951;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:116,14:0.11:130
chr7	107738836	rs6974722	T	C	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FS=0.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQRankSum=-2.957;QD=1.74;ReadPosRankSum=-1.003;SOR=0.717;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:127,29:0.19:156
chr7	107738882	rs1735499	G	A	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=1.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.97;ReadPosRankSum=1.432;SOR=0.846;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:136,33:0.20:169
chr7	107738948	rs451252	G	A	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.11;ReadPosRankSum=1.765;SOR=0.731;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,35:0.23:150
chr7	107743409	rs401487	A	G	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.359;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=188;ReadPosRankSum=-1.028;SC=TTAAGCAGATAAGGTGCGGGC;SOR=0.941;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=46;TCF=35;TCR=11;TR=14;WE=107743417;WS=107743399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,15:0.31:49
chr7	107743664	rs402113	A	G	851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.588;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=30;PP=565;ReadPosRankSum=0.190;SC=TGGAGTGGCTATTACAGCTGC;SOR=0.766;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=183;TCF=85;TCR=98;TR=53;WE=107743672;WS=107743654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,55:0.28:199
chr7	107746214	rs430628	TG	GC	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=4.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=636;ReadPosRankSum=-1.247;SC=ACCAGGACAGTGAAAGGCAGG;SOR=0.389;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=46;TCR=2;TR=14;WE=107746223;WS=107746204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,17:0.31:55
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chr7	107820911	rs414077	G	T	2203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.229;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=60;PP=1539;ReadPosRankSum=0.439;SC=GCAGAAAGGAGCAAACAAGAT;SOR=0.985;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=136;TCF=49;TCR=87;TR=90;WE=107820919;WS=107820901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,94:0.64:147
chr7	107822198	rs2839850	A	G	1667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.120;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=15;PP=974;ReadPosRankSum=0.344;SC=CTCCTGTGGTATGCATGACAA;SOR=0.262;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=82;TCF=63;TCR=19;TR=56;WE=107822206;WS=107822188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,65:0.70:93
chr7	107822396	rs2142325	G	A	2656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.540;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=60;PP=1657;ReadPosRankSum=0.060;SC=GAAAAGGACAGGGAAGTGGTA;SOR=0.641;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=181;TCF=72;TCR=109;TR=102;WE=107822404;WS=107822386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,115:0.58:199
chr7	107824678	rs6970656	A	G	4378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.490;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.700;NF=116;NR=57;PP=2731;ReadPosRankSum=0.463;SC=AAGGCATCATAGCTCACCTTC;SOR=0.745;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=259;TCF=174;TCR=85;TR=173;WE=107824686;WS=107824668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,186:0.68:275
chr7	107824889	rs401433	C	G	3728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.506;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=77;PP=2390;ReadPosRankSum=1.013;SC=ACTGCTCAGACGCCTCGCTGG;SOR=0.627;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=217;TCF=105;TCR=112;TR=150;WE=107824897;WS=107824879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,163:0.68:241
chr7	107825108	rs427909	T	C	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.493;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=334;ReadPosRankSum=0.410;SC=TTCAGTCAACTCAGGGGTAGC;SOR=2.303;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=15;WE=107825116;WS=107825098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
chr7	107831520	rs6962066	T	C	41.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.93;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr7	107834613	rs6958498	G	C	5912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=362;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.407;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=114;NR=113;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.584;SC=ATCCATGTAGGATCTGAAATG;SOR=0.649;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=336;TCF=167;TCR=169;TR=227;WE=107834632;WS=107834603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,245:0.68:362
chr7	107834624	rs6978315	T	C	5834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=365;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=118;NR=111;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.941;SC=ATCTGAAATGTAGAGTCATCG;SOR=0.701;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=338;TCF=174;TCR=164;TR=229;WE=107834632;WS=107834603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,247:0.68:365
chr7	107834734	rs404287	C	T	6716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=449;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=149;NR=133;PP=2962;ReadPosRankSum=1.980;SC=CTTCATTCTTCGCCATCCCTA;SOR=0.666;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=418;TCF=220;TCR=198;TR=282;WE=107834742;WS=107834724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,302:0.67:449
chr7	107836064	rs34680676	G	GA	372.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=246;ReadPosRankSum=0.812;SC=TGTCTCACAAGAAAAAAAAAT;SOR=0.582;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=19;WE=107836072;WS=107836055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr7	107836117	rs35825013	GT	G	1470.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.022;NF=21;NR=13;PP=852;ReadPosRankSum=-0.077;SC=TTCCCTGTTTGTTTTTTGAAT;SOR=0.818;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=78;TCF=42;TCR=36;TR=34;WE=107836125;WS=107836107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,62:0.67:93
chr7	107838464	rs381318	G	T	2617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=53;PP=1444;ReadPosRankSum=1.107;SC=TGCACTGATAGACTGCACTTG;SOR=0.654;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=157;TCF=79;TCR=78;TR=109;WE=107838472;WS=107838454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,120:0.69:175
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chr7	107849908	rs1269621	G	A	3895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=65;PP=2399;ReadPosRankSum=-0.224;SC=CTCCTAATGCGTTTTTTGCTA;SOR=0.691;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=228;TCF=137;TCR=91;TR=160;WE=107849916;WS=107849898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,172:0.70:244
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chr7	111376840	rs2301678	T	C	6494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=140;NR=80;PP=2965;SC=CATTAATCCCTTAAAGAGCAT;SOR=1.300;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=220;TCF=140;TCR=80;TR=220;WE=111376848;WS=111376830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr7	111379582	rs2074115	A	G	2485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.235;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=57;PP=1472;ReadPosRankSum=-1.537;SC=AAGGCTTCCCACGACACTGAC;SOR=0.843;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=157;TCF=66;TCR=91;TR=95;WE=111379590;WS=111379572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,110:0.61:179
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chr7	111379706	rs2074116	A	G	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.330;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=123;ReadPosRankSum=-0.731;SC=GAATTAATGAAAAGTCTGAGA;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=7;WE=111379714;WS=111379696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr7	111382324	rs3757648	C	T	3777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=87;PP=2565;SC=GTAGGAACAGCTGTCACTTTA;SOR=2.321;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=117;TCF=29;TCR=88;TR=116;WE=111382332;WS=111382314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr7	111386511	rs3832524	G	GT	5235.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.217;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.33;MQRankSum=1.614;NF=8;NR=66;PP=2954;ReadPosRankSum=-0.573;SC=CTTTAGTGGAGTACAAGGCAA;SOR=0.584;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=116;TCF=11;TCR=105;TR=74;WE=111386519;WS=111386501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,161:0.73:221
chr7	111400501	rs17158794	T	A	1015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=30;PP=686;ReadPosRankSum=-0.985;SC=ATAACAAAAATTACGCTGGAA;SOR=0.659;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=54;TCF=12;TCR=42;TR=38;WE=111400509;WS=111400491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,43:0.69:62
chr7	111405322	rs80172643	C	T	1209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.557;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=34;PP=630;ReadPosRankSum=-1.450;SC=TCTCATCTTTCGGTTCTATCA;SOR=0.607;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=185;TCF=74;TCR=111;TR=59;WE=111405330;WS=111405312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,69:0.34:204
chr7	111487026	rs10275038	G	A	878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=8;PP=603;ReadPosRankSum=0.581;SC=TTTGAAGGGAGCTATATACTA;SOR=0.641;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=106;TCF=85;TCR=21;TR=38;WE=111487034;WS=111487016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,40:0.36:111
chr7	111512032	rs10224326	A	T	5694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=360;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=118;NR=119;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.051;SC=TAATTACAAGATACAGGGCCT;SOR=0.681;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=335;TCF=168;TCR=167;TR=237;WE=111512040;WS=111512022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,251:0.70:359
chr7	111512165	rs58173189	GC	G	281.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.715;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.826;NF=0;NR=13;PP=422;ReadPosRankSum=2.011;SC=AGAAAATTGAGCTTTATAAAA;SOR=1.395;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=13;WE=111512173;WS=111512155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,12:0.24:50
chr7	111512630	rs28593141	T	C	1457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=32;PP=905;ReadPosRankSum=-0.221;SC=CCTTTCAAAATAGAAAAGGAA;SOR=0.638;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=96;TCF=41;TCR=55;TR=57;WE=111512638;WS=111512620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,65:0.59:110
chr7	111535497	rs2074131	A	G	644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=0;PP=517;SC=ATATGTTCTAAAATATAACCC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=111535505;WS=111535494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr7	111535863	rs2074132	T	C	657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=19;PP=521;SC=GAAATATAACTCATACACAAC;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=111535871;WS=111535853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr7	111541692	rs12154775	T	C	4054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=102;NR=64;PP=2776;ReadPosRankSum=0.113;SC=AAAGCAATTATACAGACTTGT;SOR=0.707;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=270;TCF=167;TCR=103;TR=166;WE=111541700;WS=111541682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,181:0.62:294
chr7	111617088	rs3864649	G	A	1247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.656;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=17;PP=701;ReadPosRankSum=-0.343;SC=AGCTGACGGAGTAAAAAATAT;SOR=1.222;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=200;TCF=127;TCR=73;TR=57;WE=111617096;WS=111617078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,65:0.30:220
chr7	111624522	rs2074127	TA	CG	1170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=17;PP=666;ReadPosRankSum=1.765;SC=TTTTTTACTATATCACTTGGA;SOR=0.657;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=80;TCF=26;TCR=54;TR=26;WE=111624531;WS=111624512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,33:0.35:93
chr7	111629025	rs17401943	T	A	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=262;ReadPosRankSum=-0.016;SC=GTCACTTCCATTGTGTTCACC;SOR=0.623;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=83;TCF=59;TCR=24;TR=23;WE=111629033;WS=111629015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,23:0.26:90
chr7	111634368	rs847541	A	G	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.531;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=377;ReadPosRankSum=-0.179;SC=AGATAACTAGAAAAGAAAGCT;SOR=0.074;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=18;WE=111634376;WS=111634358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,19:0.70:27
chr7	111640504	rs62474283	T	G	1414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.251;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=6;PP=1624;ReadPosRankSum=-0.498;SC=ATAACTATCTTTCTTAATAAA;SOR=1.844;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=48;TCF=36;TCR=12;TR=31;WE=111640519;WS=111640494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,35:0.69:51
chr7	111640508	rs148172772	TAATA	T	1443.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.391;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.023;NF=15;NR=7;PP=1629;ReadPosRankSum=-0.522;SC=CTATCTTTCTTAATAAATTTC;SOR=2.133;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=37;TCF=20;TCR=17;TR=22;WE=111640519;WS=111640494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,37:0.67:55
chr7	111663757	rs254867	G	T	6389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=434;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=129;NR=147;PP=2962;ReadPosRankSum=0.415;SC=CAGGCATTTTGTGCTCCATCC;SOR=0.663;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=412;TCF=194;TCR=218;TR=276;WE=111663765;WS=111663747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,287:0.66:433
chr7	111958382	rs4727766	G	A	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-2.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=394;ReadPosRankSum=1.768;SC=AAACTCATCAGAACATCCCTA;SOR=0.495;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=37;TCF=11;TCR=26;TR=25;WE=111958390;WS=111958372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,25:0.68:37
chr7	112102111	.	A	C	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.779;ClippingRankSum=0.000;DP=326;ExcessHet=3.0103;FS=2.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.86;ReadPosRankSum=0.326;SOR=0.881;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:278,44:0.14:322
chr7	112575149	rs10231221	A	C	669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=2;PP=512;SC=ATTTATTTCAATGATCAGGCA;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=112575157;WS=112575139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr7	112724417	rs2256044	A	G	10524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=378;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=200;NR=153;PP=2965;SC=CGATAGCTAAATATCTGGTGA;SOR=0.889;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=353;TCF=200;TCR=153;TR=353;WE=112724425;WS=112724407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,378:1.00:378
chr7	112724525	rs1608890	A	G	15223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=558;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=266;NR=257;PP=2965;SC=TCCAGGTAGAACCATTTTTGA;SOR=0.737;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=523;TCF=266;TCR=257;TR=523;WE=112724533;WS=112724515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,558:1.00:558
chr7	112757387	rs1051878	T	G	2248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.237;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.889;NF=61;NR=16;PP=1530;ReadPosRankSum=-0.726;SC=ACACACCAAATCTCAGGTTTA;SOR=0.262;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=111;TCF=92;TCR=19;TR=77;WE=112757395;WS=112757377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,85:0.69:123
chr7	112758324	rs2462665	G	C	959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.896;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=22;PP=606;ReadPosRankSum=-2.729;SC=GCAGAGCGTGGAGGCCATATG;SOR=0.853;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=66;TCF=32;TCR=34;TR=41;WE=112758332;WS=112758314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,45:0.61:74
chr7	112758694	rs2250343	A	G	563.41	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=3.750;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=430;ReadPosRankSum=-1.056;SC=CGTTCCCCCTATAAGTAGCAG;SOR=2.494;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=21;WE=112758702;WS=112758684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,22:0.88:25
chr7	113091231	rs12705871	A	G	2438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=451;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.561;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=65;PP=1609;ReadPosRankSum=-0.829;SC=GAGTGCAGGCAAACCAAACAC;SOR=0.730;SbPval=0.53;Source=Platypus;TCR=204;TR=131;WE=113091239;WS=113091221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:309,141:0.31:450
chr7	113518502	rs2974938	A	T	5745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=110;NR=83;PP=2965;SC=AACCTGCCTAAGATCTCTGTT;SOR=0.979;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=193;TCF=110;TCR=83;TR=193;WE=113518510;WS=113518492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr7	113519719	rs2974944	A	T	6514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=107;NR=96;PP=2965;SC=TTACTTCAATATTTTTAGCTC;SOR=0.728;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=203;TCF=107;TCR=96;TR=203;WE=113519727;WS=113519709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr7	113519796	rs2974942	C	T	7991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=141;NR=124;PP=2965;SC=GGTATTTGCACTGTGCCATTG;SOR=0.713;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=265;TCF=141;TCR=124;TR=265;WE=113519804;WS=113519786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,299:1.00:299
chr7	114138751	rs2040658	G	C	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-4.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=372;ReadPosRankSum=1.039;SC=CCAAAAGAAAGATTTTAGTTA;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=18;WE=114138759;WS=114138749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,20:0.71:28
chr7	114210814	rs17137124	T	C	1751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=14;PP=1125;ReadPosRankSum=-0.582;SC=AGCACAAGCCTTAAGATTGAA;SOR=0.688;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=103;TCF=80;TCR=23;TR=64;WE=114210829;WS=114210804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,72:0.64:113
chr7	114293360	.	A	AT	134.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.502;ClippingRankSum=0.000;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQRankSum=2.214;QD=1.12;ReadPosRankSum=-0.625;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,20:0.17:120
chr7	114296545	rs881732	A	C	4658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.582;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=108;NR=76;PP=2962;ReadPosRankSum=0.861;SC=TGCGTTTCTCAAACTATGCAG;SOR=0.559;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=291;TCF=174;TCR=117;TR=184;WE=114296553;WS=114296535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,201:0.64:315
chr7	114303491	rs34735973	A	AT	966.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=1.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.27;MQRankSum=1.219;QD=12.55;ReadPosRankSum=-0.869;SOR=0.498;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,45:0.58:77
chr7	114304563	rs1378771	C	T	1389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.077;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=40;PP=961;ReadPosRankSum=-0.326;SC=AGAATTTTTCCGAAGTTTTTA;SOR=0.542;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=76;TCF=20;TCR=56;TR=55;WE=114304571;WS=114304553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,57:0.71:80
chr7	114304630	rs1378772	A	T	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=211;ReadPosRankSum=-0.764;SC=CCACGTTCATAATATGACAAA;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=11;WE=114304638;WS=114304620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr7	114562833	rs35262508	G	GTT	457.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=4;PP=269;SC=AACTTGCGCTGTAACAGTTTT;SOR=0.859;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=6;WE=114562841;WS=114562823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
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chr7	115624478	rs35695387	C	G	1758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=343;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=47;PP=1193;ReadPosRankSum=0.547;SC=GATTGATGATCTGATGATCAA;SOR=0.690;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=326;TCF=171;TCR=155;TR=99;WE=115624486;WS=115624468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:241,102:0.30:343
chr7	115850675	rs11549785	C	T	1641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.476;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=33;PP=1108;ReadPosRankSum=-0.247;SC=CGCAGGTTTCCCGTGTTCGCA;SOR=0.732;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=261;TCF=162;TCR=99;TR=89;WE=115850683;WS=115850665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:190,91:0.32:281
chr7	115850937	rs1866961	T	C	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.811;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=105;ReadPosRankSum=0.394;SC=CCCAGGGACCTGGCCCCCTGG;SOR=1.022;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=8;WE=115850945;WS=115850927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr7	115874817	rs3030639	TAA	T	210.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.140;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=170;ReadPosRankSum=1.322;SC=GAATACAACATAAAAAGTGTT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=6;WE=115874826;WS=115874807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr7	115890187	rs73222310	A	G	969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.983;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=9;PP=567;ReadPosRankSum=2.068;SC=GGCCAATCCCAGTTAACATTG;SOR=0.973;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=68;TCF=52;TCR=16;TR=38;WE=115890195;WS=115890177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,45:0.57:79
chr7	116140076	rs2535220	T	C	946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=6.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.122;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=34;PP=777;ReadPosRankSum=0.841;SC=CCACCATTGCTACCGGGTCGG;SOR=1.600;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=81;TCF=5;TCR=76;TR=35;WE=116140084;WS=116140066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,35:0.43:82
chr7	116140275	rs11767363	T	C	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.147;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=261;ReadPosRankSum=-0.572;SC=GGCGTCAGGTTGGCTGACAGT;SOR=0.462;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=68;TCF=55;TCR=13;TR=21;WE=116140283;WS=116140265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,25:0.33:75
chr7	116140524	rs2270188	G	T	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.390;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=277;ReadPosRankSum=0.638;SC=ACACCGGGTGGACCGGCTTTC;SOR=0.265;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=57;TCF=9;TCR=48;TR=19;WE=116140532;WS=116140514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,20:0.33:61
chr7	116145957	rs4730743	A	T	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=192;ReadPosRankSum=0.252;SC=ATCTTTTCATACATGTACAAG;SOR=0.963;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=46;TCF=40;TCR=6;TR=13;WE=116145965;WS=116145947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,14:0.27:51
chr7	116165360	rs1997623	A	C	1263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FS=5.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.47;ReadPosRankSum=-0.211;SOR=1.021;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:202,81:0.29:283
chr7	116165463	rs2742125	T	C	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.182;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=267;ReadPosRankSum=-0.992;SC=GGATGCTCCCTTGTCGCGGGA;SOR=0.980;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=54;TCF=15;TCR=39;TR=19;WE=116165471;WS=116165453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,23:0.39:59
chr7	116364823	rs34822187	CA	C	6244.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=22;NR=63;PP=2957;SC=TCTCCCTTTACAGGCAGAAAA;SOR=0.785;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=22;TCR=63;TR=85;WE=116364831;WS=116364813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr7	116381121	rs112241458	GT	G	55.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=3.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.10;ReadPosRankSum=0.715;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr7	116435768	rs41736	C	T	4066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=52;PP=2475;SC=CTTATCCTGACGTAAACACCT;SOR=1.194;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=139;TCF=87;TCR=52;TR=138;WE=116435776;WS=116435758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr7	116436022	rs2023748	G	A	9952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=370;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.111;NF=173;NR=165;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.136;SC=GGATATCAGCGATCTTCTCTA;SOR=0.225;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=339;TCF=173;TCR=166;TR=338;WE=116436030;WS=116436012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,369:1.00:370
chr7	116436097	rs41737	G	A	7899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=122;NR=139;PP=2965;SC=GTGTCGCTCCGTATCCTTCTC;SOR=0.935;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=261;TCF=122;TCR=139;TR=261;WE=116436105;WS=116436087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,292:1.00:292
chr7	116550456	rs2074025	C	T	882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=22;PP=628;SC=GTATATCATACACATTTCTTT;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=30;WE=116550464;WS=116550446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr7	116596697	rs6960131	A	G	6144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=120;PP=2965;SC=TTCTGGAGTCATTCTTGGATA;SOR=1.115;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=211;TCF=91;TCR=120;TR=211;WE=116596705;WS=116596687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr7	116598735	rs6466595	A	G	1938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=53;PP=1478;SC=GGCCACTGCAATAAAGTGAGT;SOR=5.960;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=55;TCF=2;TCR=53;TR=55;WE=116598743;WS=116598725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr7	116600049	rs10262671	A	T	2301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=5;PP=1657;SC=GACTCTTAATACTTAGTGAAT;SOR=4.834;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=64;TCF=59;TCR=5;TR=64;WE=116600057;WS=116600039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr7	116607172	.	CTT	C	28	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;FR=0.5001;HP=16;HapScore=3;MGOF=6;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=28;QD=15.5;SC=TTCTATCACTCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=2;WE=116607181;WS=116607162;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:4,2:0.33:6
chr7	116607501	rs10259502	T	C	2028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=43;PP=1279;SC=GTCAGGCAGCTTGTGCAGGTC;SOR=1.643;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=64;TCF=21;TCR=43;TR=64;WE=116607509;WS=116607491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr7	116660464	rs5886844	AC	A	3226.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=16;PP=2460;SC=TTTCAATCACACCGGGAGAAA;SOR=2.584;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=67;TCF=49;TCR=18;TR=61;WE=116660472;WS=116660454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr7	116660803	rs7788320	A	G	1493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.282;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=40;PP=1020;ReadPosRankSum=-0.544;SC=TTTTGGCTCTAATTACAAAGG;SOR=0.301;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=74;TCF=17;TCR=57;TR=54;WE=116660811;WS=116660793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,59:0.74:80
chr7	116778443	.	AT	A	196.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.186;ClippingRankSum=0.000;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=1.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.45;ReadPosRankSum=0.990;SOR=0.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,17:0.30:57
chr7	116838311	rs193573	G	A	10644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=400;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=205;NR=168;PP=2965;SC=TACCTGCTCAGTACATGTTGG;SOR=0.803;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=373;TCF=205;TCR=168;TR=373;WE=116838319;WS=116838301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,399:1.00:399
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chr7	117023237	rs10278953	A	G	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=219;ReadPosRankSum=0.615;SC=GAAACTGAACATACGATTATC;SOR=0.622;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=13;WE=117023245;WS=117023227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
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chr7	117066718	rs7784156	C	G	686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.227;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=0;PP=554;ReadPosRankSum=0.873;SC=CAAATGCAAGCAGAGAGGAAG;SOR=2.910;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=35;TCR=1;TR=23;WE=117066726;WS=117066714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,24:0.56:43
chr7	117067040	rs10242827	C	T	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=207;ReadPosRankSum=1.826;SC=TTTTTGTTTCCACCTCATCAG;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=11;WE=117067048;WS=117067030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr7	117149147	rs1800076	G	A	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.748;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=16;PP=315;ReadPosRankSum=-0.640;SC=GCCCTTCGGCGATGTTTTTTC;SOR=0.555;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=107;TCF=51;TCR=56;TR=32;WE=117149155;WS=117149137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,36:0.30:121
chr7	117176568	rs34543279	AGATT	A	1542.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.585;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.511;NF=9;NR=11;PP=920;ReadPosRankSum=1.093;SC=TTTTACTATTAGATTGATTGA;SOR=1.185;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=33;TCF=13;TCR=20;TR=20;WE=117176583;WS=117176558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,41:0.71:58
chr7	117176738	rs1800503	C	T	862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=24;PP=592;ReadPosRankSum=0.601;SC=GTAAGTTGTTCCAATAATTTC;SOR=0.807;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=57;TCF=22;TCR=35;TR=38;WE=117176746;WS=117176728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,39:0.65:60
chr7	117188682	rs10229820	G	T	1074.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.174;HP=8;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=1.824;NF=41;NR=26;PP=966;ReadPosRankSum=1.911;SC=GTGTGTGTGTGTTTTTTTAAC;SOR=0.394;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=115;TCF=74;TCR=41;TR=67;WE=117188690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,57:0.63:91
chr7	117188736	rs4727853	C	A	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=0.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.64;MQRankSum=-4.100;QD=3.14;ReadPosRankSum=-0.956;SOR=0.675;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:108,25:0.19:133
chr7	117199457	rs34855237	A	G	1494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=18;PP=1064;ReadPosRankSum=-0.748;SC=TGATAATTGGAGGCAAGTGAA;SOR=0.749;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=65;TCR=27;TR=61;WE=117199465;WS=117199447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,62:0.64:97
chr7	117199533	rs213950	G	A	3510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.513;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=68;PP=2142;ReadPosRankSum=1.406;SC=ACTTCTAATGGTGATTATGGG;SOR=0.515;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=211;TCF=123;TCR=88;TR=153;WE=117199541;WS=117199523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,160:0.70:228
chr7	117359689	rs144520488	A	G	2325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=56;PP=1437;ReadPosRankSum=-1.589;SC=TTCTCTAAAGACCTAACACAA;SOR=0.701;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=108;TCF=33;TCR=75;TR=82;WE=117359697;WS=117359679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,93:0.79:118
chr7	117361034	rs112341621	A	ATAAT	637.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.999;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=4;PP=449;ReadPosRankSum=-2.085;SC=AGTCATTCAAATGAGAACATG;SOR=0.352;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=10;WE=117361042;WS=117361024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr7	117450792	rs2111204	A	C	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.255;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=113;ReadPosRankSum=-0.674;SC=TGTTGTGGGGAAAATGACCAT;SOR=0.307;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=6;WE=117450800;WS=117450786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr7	117451124	rs6973399	T	C	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=255;ReadPosRankSum=-0.149;SC=TTTGTGATTATACTTCCAAAT;SOR=0.871;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=13;WE=117451132;WS=117451114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr7	117874308	rs10267938	C	T	69.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=0;PP=48;SC=AACACACTTGCGCAGCCCTGA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=117874316;WS=117874303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr7	117876264	.	ATGTG	A	145.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.371;ClippingRankSum=-0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=4.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.21;ReadPosRankSum=1.442;SOR=0.074;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr7	120428607	rs41622	G	A	2428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=9;PP=1747;SC=CACAAGTCCAGTAAAACAAGT;SOR=3.316;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=62;TCR=9;TR=71;WE=120428615;WS=120428597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr7	120428799	rs41623	C	A	8156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=118;NR=153;PP=2965;SC=GGTCTGTCCCCGGCTCCCTTC;SOR=0.994;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=271;TCF=118;TCR=153;TR=271;WE=120428807;WS=120428789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,293:1.00:293
chr7	120450658	rs7805733	G	A	5610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.01;QD=25.98;SOR=1.265;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr7	120450678	rs112555207	T	TCA	1264.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.373;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.579;NF=0;NR=52;PP=2282;ReadPosRankSum=-0.472;SC=AGACACAGATTCACACACACA;SOR=0.214;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=107;TCF=3;TCR=104;TR=52;WE=120450687;WS=120450668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,48:0.77:62
chr7	120590786	rs11408222	C	CG	84.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=0;PP=519;SC=AGGCAAGCGCCTCAGGCGCCA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=120590794;WS=120590776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr7	120596743	.	CA	C	111.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.609;ClippingRankSum=0.000;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=1.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.69;ReadPosRankSum=-0.520;SOR=0.452;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,14:0.21:66
chr7	120613419	rs2721369	A	G	818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=17;PP=481;SC=TATTAGTTATATTATGCTAAT;SOR=1.536;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=27;TCF=10;TCR=17;TR=27;WE=120613427;WS=120613409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr7	120655676	rs4730984	G	T	1085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.959;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=23;PP=762;ReadPosRankSum=2.197;SC=CAAGGGAAATGTACTACTTTT;SOR=0.459;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=167;TCF=110;TCR=57;TR=59;WE=120655684;WS=120655666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,60:0.33:181
chr7	120704289	rs2721375	C	T	10952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=406;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=203;NR=171;PP=2965;SC=TCATTCCTTTCAGGCAAACAG;SOR=0.886;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=374;TCF=203;TCR=171;TR=374;WE=120704297;WS=120704279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,406:1.00:406
chr7	120739962	rs199844199	GTT	G,GT	1892.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.28;MQRankSum=0.297;QD=25.58;ReadPosRankSum=0.317;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:2,57,15:0.77,0.20:74
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chr7	120740225	rs1917112	C	G	2666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=71;PP=2133;SC=GCCATTTTCCCACCTTTATGG;SOR=2.833;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=17;TCR=71;TR=88;WE=120740233;WS=120740215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr7	120764477	rs1524498	G	C	9902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=389;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=177;NR=196;PP=2965;SC=TACTGCTAGCGGCTGAAGTAT;SOR=0.806;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=374;TCF=177;TCR=197;TR=373;WE=120764485;WS=120764467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,389:1.00:389
chr7	120764573	rs798948	C	A	2727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=72;PP=2178;SC=AGAAAGAAAGCAACCTATCTT;SOR=2.885;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=18;TCR=72;TR=90;WE=120764581;WS=120764563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr7	120765954	rs798949	T	C	9174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=349;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=165;NR=153;PP=2965;SC=CAGGTCAGTATGCCAAAGGCC;SOR=0.710;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=318;TCF=165;TCR=153;TR=318;WE=120765962;WS=120765944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,349:1.00:349
chr7	120773954	rs61128227	A	G	1812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=44;PP=1223;SC=AAAGGTAAAAATATAGATATT;SOR=1.999;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=17;TCR=44;TR=61;WE=120773962;WS=120773944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr7	120776097	rs41281692	C	G	1201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.57;SOR=2.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr7	120781884	rs11979314	G	T	713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=0;PP=573;SC=TATTTTCATAGTTTAGGTTTC;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=120781892;WS=120781882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr7	120901695	rs10953934	G	A	3257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.619;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=75;PP=2245;ReadPosRankSum=0.089;SC=GTTGGGTGTCGATGTCCAGAG;SOR=0.890;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=212;TCF=104;TCR=108;TR=137;WE=120901703;WS=120901685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,143:0.62:229
chr7	120969769	rs2908004	G	A	4385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.481;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=97;PP=2783;ReadPosRankSum=0.969;SC=TCAGGAGTGCGGGAGCCAGTT;SOR=0.812;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=271;TCF=126;TCR=145;TR=179;WE=120969777;WS=120969759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,192:0.66:293
chr7	120979089	rs2707466	C	T	3107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.509;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=61;PP=2080;ReadPosRankSum=-0.470;SC=TCAGACAAAACAAAGAGGAAA;SOR=0.650;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=211;TCF=113;TCR=98;TR=135;WE=120979097;WS=120979079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,138:0.63:219
chr7	120991489	rs11768996	T	C	620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=21;PP=479;ReadPosRankSum=0.093;SC=GGTTGAATTCTTTAGTGACAA;SOR=1.121;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=39;TCF=4;TCR=35;TR=23;WE=120991497;WS=120991479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,24:0.59:41
chr7	121000021	rs3837124	A	AT	550.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=7;PP=215;ReadPosRankSum=-0.568;SC=TATGTTACAGATTTTTTTTTA;SOR=1.044;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=23;TCF=12;TCR=11;TR=16;WE=121000029;WS=121000011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,25:0.71:35
chr7	121000084	rs111415936	A	AAAGTTTT	1805.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-1.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=1188;ReadPosRankSum=0.427;SC=AAAGTTCTGTAAAGTTTACAT;SOR=0.846;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=38;TCF=16;TCR=22;TR=18;WE=121000092;WS=121000074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,43:0.74:58
chr7	121002876	rs2536164	A	G	1855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=31;PP=1004;ReadPosRankSum=-0.674;SC=TCATTCTCTCATTAATGGGCT;SOR=0.641;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=125;TCF=73;TCR=52;TR=77;WE=121002884;WS=121002866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,88:0.64:138
chr7	121002910	rs2536163	C	T	2250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=36;PP=1106;ReadPosRankSum=-0.644;SC=GTGATTAAGTCAGTGCCAGCA;SOR=0.693;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=133;TCF=75;TCR=58;TR=86;WE=121002918;WS=121002900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,102:0.67:152
chr7	121011615	rs2536155	G	T	717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.577;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=24;PP=579;ReadPosRankSum=-1.237;SC=AAGCTAATTTGTTCCCCTGAG;SOR=0.100;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=46;TCF=10;TCR=36;TR=33;WE=121011623;WS=121011605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,34:0.71:48
chr7	121023196	rs35702337	TA	T	121.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.097;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.77;MQRankSum=0.230;QD=11.07;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr7	121080929	rs6961822	A	G	2697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=39;PP=1709;SC=CCTCTGGCATACTCGAACTTC;SOR=1.029;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=60;TCR=39;TR=99;WE=121080937;WS=121080919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr7	121081052	rs6962156	C	T	4495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=84;NR=76;PP=2681;SC=AGGACGGTGCCGCAGACCTTG;SOR=0.705;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=160;TCF=84;TCR=76;TR=160;WE=121081060;WS=121081042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr7	121081115	rs6466786	A	C	2173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=42;PP=1385;SC=CCCACCCTGAAGATGTGGCTG;SOR=0.968;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=77;TCF=35;TCR=42;TR=77;WE=121081123;WS=121081105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr7	121164363	rs2896305	C	G	2295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.182;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=24;PP=1533;ReadPosRankSum=-1.840;SC=GAAAAGTCAACACCTGAGGGT;SOR=1.121;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=140;TCF=96;TCR=44;TR=86;WE=121164371;WS=121164353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,95:0.61:155
chr7	121513382	.	TCA	T	93	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;FR=0.9998;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=1;NR=1;PP=93;QD=49.0;SC=TCTCTCTCTCTCACACACACA;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=2;WE=121513391;WS=121513372;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,2:0.67:3
chr7	121616250	rs4629793	G	A	1745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=33;PP=1009;ReadPosRankSum=1.141;SC=GCTTTGATGCGGACCGATTTT;SOR=0.636;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=117;TCF=65;TCR=52;TR=73;WE=121616258;WS=121616240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,81:0.64:127
chr7	121653177	rs61732006	A	G	2430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=394;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.238;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=58;PP=1481;ReadPosRankSum=2.068;SC=CTTCTGATACATTTGTATCTA;SOR=0.756;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=353;TCF=183;TCR=170;TR=123;WE=121653185;WS=121653167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:258,136:0.35:394
chr7	121653250	rs61732005	G	A	1858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=367;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.861;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=52;PP=1208;ReadPosRankSum=0.360;SC=TCCCCACAGAGATGGTTCTGT;SOR=0.769;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=330;TCF=172;TCR=158;TR=102;WE=121653258;WS=121653240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:256,111:0.30:367
chr7	121653398	rs1147504	G	A	1455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=338;ExcessHet=3.0103;FS=0.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQRankSum=0.252;QD=4.32;ReadPosRankSum=-1.314;SOR=0.669;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:246,91:0.27:337
chr7	121671425	rs1147496	T	G	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=270;ReadPosRankSum=0.787;SC=TTAGTTAGAATTATACAAATA;SOR=0.845;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=49;TCF=38;TCR=11;TR=18;WE=121671433;WS=121671415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,19:0.37:51
chr7	121684718	rs1147487	A	G	1421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.961;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=38;PP=936;ReadPosRankSum=1.880;SC=AGTGGGCAGTATGGGTACAAT;SOR=0.286;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=76;TCF=19;TCR=57;TR=53;WE=121684726;WS=121684708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,58:0.70:83
chr7	121698827	rs1206381	A	C	692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.249;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=6;PP=508;ReadPosRankSum=1.287;SC=TCACTAACTAACATTACTTTG;SOR=1.022;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=42;TCF=35;TCR=7;TR=29;WE=121698835;WS=121698817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,31:0.62:50
chr7	121699151	rs59593536	AT	A	346.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.6341;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.574;NF=0;NR=22;PP=223;ReadPosRankSum=0.163;SC=AACACAGAACATTTTTTTTTT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=22;WE=121699159;WS=121699141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,19:0.83:23
chr7	121699789	.	CT	C	108.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.446;ClippingRankSum=0.000;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=6.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.19;ReadPosRankSum=0.449;SOR=0.190;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,17:0.19:91
chr7	121719586	rs1206368	C	T	1647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=10;PP=1083;SC=TTAACTTTTTCTGAGTAGAAA;SOR=2.221;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=38;TCR=10;TR=48;WE=121719594;WS=121719576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr7	121719823	rs1206369	G	A	1247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=13;NR=32;PP=918;SC=TTTTTTAATTGACTGAAAAAT;SOR=1.880;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=13;TCR=32;TR=45;WE=121719831;WS=121719813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr7	121732778	rs60690049	C	CA	240.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5006;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=98;ReadPosRankSum=0.705;SC=AACTCAGTCTCAAAAAAAAAA;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=9;WE=121732786;WS=121732768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr7	121758290	rs279677	G	C	2679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=26;PP=1930;SC=CCACAAAATGGCTGCCCACAT;SOR=1.821;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=91;TCF=65;TCR=26;TR=90;WE=121758298;WS=121758280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr7	121766638	rs2302338	A	T	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=225;ReadPosRankSum=-1.616;SC=TTGCTAACAGAAGCTACCATC;SOR=0.990;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=12;WE=121766646;WS=121766628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr7	121942832	rs10685687	G	GACA	14252.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=78;PP=2969;SC=AACCATGAGAGACATTTCCTG;SOR=1.120;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=152;TCF=69;TCR=83;TR=140;WE=121942840;WS=121942822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,305:1.00:305
chr7	121942847	rs6968786	G	C	15548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=372;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=163;NR=117;PP=2965;SC=TTCCTGGTTTGCATACCTTTT;SOR=1.026;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=280;TCF=163;TCR=117;TR=280;WE=121942855;WS=121942837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,372:1.00:372
chr7	121943594	.	GGGAGGGAAGGAAGGAGGGAA	G	518.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.183;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.34;MQRankSum=2.273;QD=16.21;ReadPosRankSum=1.094;SOR=0.853;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr7	121943642	rs111662975	A	G	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.53;MQRankSum=2.792;QD=9.31;ReadPosRankSum=-0.010;SOR=0.954;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,28:0.35:80
chr7	121944527	rs11761299	T	C	2830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=64;PP=2000;SC=CGGGGCTGGGTTGCGCCGTCC;SOR=1.839;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=28;TCR=64;TR=92;WE=121944535;WS=121944517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr7	121960407	rs1348442	T	G	986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=28;PP=663;ReadPosRankSum=-0.302;SC=AGAAAGAAGATAAAATTTGCT;SOR=0.633;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=62;TCF=13;TCR=49;TR=36;WE=121960415;WS=121960397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,38:0.59:64
chr7	121960438	rs1443749	C	T	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.039;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=303;ReadPosRankSum=1.178;SC=AGATTATATGCGTGTACATAG;SOR=0.242;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=19;WE=121960446;WS=121960428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr7	121965437	rs17369598	A	G	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=179;ReadPosRankSum=0.461;SC=GATACTTTTTAGTTACATCAA;SOR=0.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=10;WE=121965445;WS=121965434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr7	121985541	rs798685	T	C	1633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=10;PP=581;ReadPosRankSum=-0.526;SC=AAGGAGACTATGCTTTGCAAA;SOR=0.633;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=49;TCF=36;TCR=13;TR=36;WE=121985549;WS=121985531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,41:0.76:54
chr7	121985556	rs798684	C	G	1902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.185;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=13;PP=822;ReadPosRankSum=0.837;SC=TGCAAACATACCATCAAAATT;SOR=0.487;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=60;TCF=43;TCR=17;TR=45;WE=121985564;WS=121985546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,52:0.74:70
chr7	122194751	rs139130136	G	GA	3981.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.927;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;MQ=60.24;MQRankSum=0.316;NF=4;NR=81;PP=1314;ReadPosRankSum=-0.745;SC=CACCTGTATGGAAAAAAAAAC;SOR=0.191;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=101;TCF=5;TCR=96;TR=85;WE=122194759;WS=122194741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,148:0.97:152
chr7	122303321	rs2251761	C	T	7525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=154;NR=95;PP=2965;SC=GCTGGTGTTCCAGTTTTTTAA;SOR=1.238;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=249;TCF=154;TCR=95;TR=249;WE=122303329;WS=122303311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,275:1.00:275
chr7	122635024	rs860170	C	T	13284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=483;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=210;NR=233;PP=2965;SC=GGCAGTGAAGCGCGCTTTCAT;SOR=0.839;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=443;TCF=210;TCR=233;TR=443;WE=122635032;WS=122635014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,483:1.00:483
chr7	122757505	rs28364221	A	AT	1447.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FS=0.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.04;MQRankSum=1.537;QD=6.03;ReadPosRankSum=-0.148;SOR=0.736;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:168,72:0.30:240
chr7	122769378	.	CTGTGTGTGTGTG	C,CTG	3675.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.000;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=7.056;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.723;NF=22,22;NR=33,33;PP=834,1212;ReadPosRankSum=-1.611;SC=TCTCTCTTCTCTGTGTGTGTG;SOR=1.975;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=97;TCF=28;TCR=69;TR=55,55;WE=122769403;WS=122769368;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:0.95:151
chr7	122774729	rs2470984	C	A	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.481;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=165;ReadPosRankSum=0.908;SC=AAATAGAGTACTTTTACCCCT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=9;WE=122774737;WS=122774719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr7	122808528	rs11976455	A	G	1394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=23;PP=920;ReadPosRankSum=0.094;SC=AATTTGGAAAAATCCCAATCA;SOR=0.737;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=100;TCF=62;TCR=38;TR=63;WE=122808536;WS=122808518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,64:0.59:108
chr7	122809111	rs1880178	T	C	748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=11;PP=483;ReadPosRankSum=0.318;SC=CATGTATAGATGGTTAATTCA;SOR=0.688;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=104;TCF=74;TCR=30;TR=37;WE=122809119;WS=122809101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,38:0.36:107
chr7	123097380	rs12673749	C	T	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.185;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=70;ReadPosRankSum=-0.278;SC=GTCCAGTTATCGCTAATAATT;SOR=1.609;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=6;WE=123097388;WS=123097370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
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chr7	123142588	rs11770523	A	T	1613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.960;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=21;PP=992;ReadPosRankSum=-0.696;SC=AAAGAGACACACTCGGAACAA;SOR=0.438;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=60;TCR=28;TR=65;WE=123142596;WS=123142578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,69:0.71:97
chr7	123142843	rs146753880	C	CTA	297.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.829;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=341;ReadPosRankSum=-1.105;SC=TCAGTATCCCCTATATATATA;SOR=0.976;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=23;TCF=11;TCR=12;TR=8;WE=123142851;WS=123142833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr7	123150194	rs1917708	T	C	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=200;ReadPosRankSum=0.218;SC=TTTAATTACATAGAATACAAG;SOR=0.562;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=15;TCR=21;TR=14;WE=123150202;WS=123150184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,18:0.39:46
chr7	123150236	rs4276609	C	T	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=118;ReadPosRankSum=-1.128;SC=TGCTGTGCCCCAATGATAACA;SOR=0.976;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=9;WE=123150244;WS=123150226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr7	123152019	rs10255061	C	T	1009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.363;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=18;PP=721;ReadPosRankSum=-0.126;SC=GAATCTTCCACTGATTCTTGC;SOR=0.506;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=130;TCF=93;TCR=37;TR=52;WE=123152027;WS=123152009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,53:0.38:141
chr7	123152035	rs10270705	T	C	1037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.979;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=17;PP=713;ReadPosRankSum=2.735;SC=CTTGCAAAGATTCCTTTACAG;SOR=0.938;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=168;TCF=114;TCR=54;TR=53;WE=123152043;WS=123152025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,56:0.31:182
chr7	123196787	rs113495801	C	CA	235.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=179;ReadPosRankSum=1.348;SC=TCAAATGTGTCAAAAAACGCT;SOR=0.859;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=37;TCF=25;TCR=12;TR=9;WE=123196795;WS=123196777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,13:0.31:42
chr7	123197120	rs142377299	G	A	6879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=502;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.133;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=150;NR=132;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.707;SC=GTAATCCAACGCACCTAAGCA;SOR=0.791;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=456;TCF=236;TCR=220;TR=282;WE=123197128;WS=123197110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:189,312:0.62:501
chr7	123256427	rs6962756	C	T	1293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FS=0.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.37;ReadPosRankSum=1.522;SOR=0.654;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:216,80:0.27:296
chr7	123269118	rs4731112	G	C	15861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=574;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=247;NR=277;PP=2965;SC=CTGTATTTTGGCGTTTCTAAT;SOR=0.891;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=525;TCF=247;TCR=278;TR=524;WE=123269126;WS=123269108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,572:1.00:572
chr7	123269976	rs3993666	G	GGC	2209.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=6;PP=1893;SC=TTATGTATATGATATTAAAAA;SOR=3.702;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=47;TCF=39;TCR=8;TR=43;WE=123269984;WS=123269966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr7	123295964	rs7779099	C	T	3218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=26;PP=1907;SC=TGCTTCTGGCCGCCTTGAATG;SOR=1.736;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=74;TCR=26;TR=100;WE=123295972;WS=123295954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr7	123324546	.	AAT	A	21	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.4999;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=26;MQ=60.8;NF=1;NR=2;PP=21;QD=10.0;SC=TCACCTTAAAAATATATATAT;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=19;TCF=10;TCR=9;TR=3;WE=123324555;WS=123324536;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:16,3:0.16:19
chr7	123329060	rs3035629	GTCTC	G,GTC	600.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.31;ReadPosRankSum=1.241;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:2,10,10:0.45,0.45:22
chr7	123329267	rs74521781	A	G	1119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.666;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=26;PP=571;ReadPosRankSum=-0.152;SC=TTGTCTCCAGAAAGTCCTACT;SOR=0.606;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=121;TCF=49;TCR=72;TR=46;WE=123329275;WS=123329257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,56:0.42:134
chr7	123332378	.	GA	G	30.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.450;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=2.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.54;ReadPosRankSum=0.088;SOR=1.483;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
chr7	123334965	rs13243738	T	C	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=188;ReadPosRankSum=-1.928;SC=TATATCCCAATTTAAAAAACA;SOR=0.412;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=10;WE=123334973;WS=123334955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr7	123336804	rs10270793	G	A	2845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=36;NR=64;PP=1751;SC=ATTAGGACCTGCAAATAAAAC;SOR=1.440;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=36;TCR=64;TR=100;WE=123336812;WS=123336794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr7	123360352	rs12674456	T	C	849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=5.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=-1.323;QD=6.34;ReadPosRankSum=-0.202;SOR=1.169;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,48:0.36:134
chr7	123594206	rs2285996	G	A	3797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=536;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=96;PP=2510;ReadPosRankSum=0.589;SC=AATTTGAAAAGGCAGGGAAGG;SOR=0.704;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=505;TCF=245;TCR=260;TR=186;WE=123594214;WS=123594191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:336,199:0.37:535
chr7	123594903	rs6972388	A	T	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=40;ReadPosRankSum=0.388;SC=TTTTATAGTAAGGCAATGGCT;SOR=0.175;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=5;WE=123594911;WS=123594893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr7	124387374	rs724356	A	G	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.087;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=452;ReadPosRankSum=-0.141;SC=ATAAGGTGAAAGTGGTGACTC;SOR=2.670;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=38;TCF=5;TCR=33;TR=21;WE=124387382;WS=124387364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,22:0.55:40
chr7	124465509	rs10250202	A	C	36.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.967;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr7	124469267	rs10263573	A	T	1888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.187;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=28;PP=1099;ReadPosRankSum=0.801;SC=TAACCTTGTAAACAAACAGTT;SOR=0.919;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=124;TCF=75;TCR=49;TR=75;WE=124469275;WS=124469257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,83:0.59:141
chr7	124475296	rs142780416	TAAACA	T	1876.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.677;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=936;ReadPosRankSum=0.435;SC=AAAAGTATAATAAACAAAACA;SOR=1.230;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=45;TCF=26;TCR=19;TR=21;WE=124475308;WS=124475286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,49:0.65:75
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chr7	124533680	rs4377885	C	T	1777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=363;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.810;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=40;PP=1061;ReadPosRankSum=-1.088;SC=GAGAACGAGTCTGCTGATATC;SOR=0.508;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=333;TCF=199;TCR=134;TR=97;WE=124533688;WS=124533670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:253,109:0.30:362
chr7	124533740	rs10954048	C	T	2241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=0.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.33;ReadPosRankSum=1.869;SOR=0.668;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:376,142:0.27:518
chr7	124540841	rs4383910	A	C	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=60;ReadPosRankSum=-0.441;SC=GAACATCGGGACACTCCTGCC;SOR=0.426;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=40;TCF=29;TCR=11;TR=9;WE=124540849;WS=124540831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,9:0.22:41
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chr7	124541022	rs7801755	T	C	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQRankSum=0.000;QD=2.89;ReadPosRankSum=-0.333;SOR=0.553;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,16:0.24:68
chr7	125588500	.	CAAGCAAGA	C	726.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQRankSum=0.478;QD=30.28;ReadPosRankSum=0.868;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,20:0.83:24
chr7	125588526	rs28739406	G	A,GAAGA	1089.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.44;QD=37.58;SOR=1.688;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,22,7:0.76,0.24:29
chr7	125588728	rs17149089	C	T	1002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.026;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=29;PP=699;ReadPosRankSum=-1.101;SC=GCATTCTAAACTGAATCAAAA;SOR=0.866;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=68;TCF=19;TCR=49;TR=40;WE=125588736;WS=125588718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,42:0.58:72
chr7	125753485	rs1419526	C	A	2033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=6;PP=1623;SC=AGGCTCTGTTCATGAATTTCA;SOR=4.375;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=65;TCF=59;TCR=6;TR=65;WE=125753493;WS=125753475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr7	125753551	rs1419527	A	G	11762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.21;QD=46.49;SOR=1.370;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
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chr7	125753603	rs1419528	A	G	11155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=418;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=171;NR=158;PP=2965;SC=AGAGAAGGAGATAAGATTTTA;SOR=0.767;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=330;TCF=172;TCR=158;TR=329;WE=125753611;WS=125753593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,417:1.00:417
chr7	125753636	rs1419529	A	G	11467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=419;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.13;NF=161;NR=185;PP=2965;SC=AGAGTTACAAACATGAACCAA;SOR=0.852;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=346;TCF=161;TCR=185;TR=346;WE=125753644;WS=125753626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,419:1.00:419
chr7	125753737	rs4395830	A	C	2738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=63;PP=1984;SC=TGGGCATGACAAAGGTTTTGA;SOR=2.833;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=18;TCR=63;TR=81;WE=125753745;WS=125753727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr7	126079144	rs712723	A	G	887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.595;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=20;PP=564;ReadPosRankSum=0.941;SC=CATATACCACATCTCTTCAGA;SOR=1.142;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=188;TCF=106;TCR=82;TR=55;WE=126079152;WS=126079134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,58:0.28:206
chr7	126410171	rs35648111	G	C	928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.365;HP=5;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=27;PP=821;ReadPosRankSum=0.278;SC=TCCAATAAAAGACAGCATTAG;SOR=1.508;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=60;TCF=16;TCR=44;TR=34;WE=126410179;WS=126410161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,36:0.59:61
chr7	126544012	rs769199	T	C	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=4.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.725;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-6.176;NF=25;NR=1;PP=551;ReadPosRankSum=-1.778;SC=AAATTCTCTATGGTGCATTCT;SOR=2.371;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=58;TCF=49;TCR=9;TR=26;WE=126544020;WS=126544002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,18:0.35:51
chr7	127017391	rs17862368	A	C	1030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=59.98;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=26;PP=695;ReadPosRankSum=-1.781;SC=TTCCTGAGAGAAAAAAGAAAA;SOR=1.008;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=45;TCF=14;TCR=31;TR=37;WE=127017399;WS=127017381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,41:0.82:50
chr7	127026342	rs6962137	G	A	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=129;ReadPosRankSum=0.514;SC=ACACACACACGCATATATAAT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=2;TCR=45;TR=11;WE=127026350;WS=127026332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,10:0.23:44
chr7	127224193	rs3735643	A	G	1852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.750;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=18;PP=1326;ReadPosRankSum=0.297;SC=TGAAAGAGATATGGATAATTA;SOR=1.371;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=95;TCF=68;TCR=27;TR=70;WE=127224201;WS=127224183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,73:0.72:101
chr7	127250907	rs712700	T	C	4577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=72;PP=2965;SC=CTCTTAAGGCTAGTGTGAGAA;SOR=0.705;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=149;TCF=77;TCR=72;TR=149;WE=127250915;WS=127250897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr7	127251188	rs712701	T	G	2921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=53;PP=1922;SC=ACTGGCCAGGTGACAGTGGGA;SOR=0.896;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=46;TCR=53;TR=99;WE=127251196;WS=127251178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr7	127251732	.	TA	T	264.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.476;ClippingRankSum=0.000;DP=156;ExcessHet=3.0103;FS=10.330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.84;ReadPosRankSum=0.751;SOR=0.188;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:112,32:0.22:144
chr7	127251792	rs327518	G	A	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.249;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=20;PP=395;ReadPosRankSum=-0.892;SC=AGAGAACGCCGGGACCCCAGA;SOR=0.218;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=92;TCF=26;TCR=66;TR=32;WE=127251800;WS=127251782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,34:0.39:88
chr7	127253714	rs3835004	A	AG	1242.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=19;PP=1272;SC=GGCCACTCACACCTGCACCTC;SOR=1.681;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=27;WE=127253722;WS=127253704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr7	127254457	rs594141	G	A	2948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=65;NR=40;PP=1698;SC=ATCCAAGAAAGAACGAGAAAG;SOR=1.009;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=66;TCR=41;TR=105;WE=127254465;WS=127254447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr7	127255285	rs698406	C	G	1681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=38;SC=TCCAGCCTCACCTTTGAGGGC;SOR=2.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=13;TCR=38;TR=51;WE=127255293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr7	127255795	rs327516	C	G	1927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.70;SOR=1.578;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr7	127347733	rs11972774	G	C	1865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=46;PP=1003;ReadPosRankSum=-0.969;SC=GATATGCATAGTGGACATTGC;SOR=0.717;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=266;TCF=121;TCR=145;TR=86;WE=127347741;WS=127347723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:196,103:0.34:299
chr7	127347820	.	AGTGT	A	165.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=27.62;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr7	127361269	rs918793	G	A	752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.829;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=10;PP=406;ReadPosRankSum=-1.287;SC=CTGTGAGGGTGGTGGGCCTTG;SOR=0.827;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=85;TCF=58;TCR=27;TR=34;WE=127361277;WS=127361259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,39:0.43:91
chr7	127447499	rs325440	A	T	1329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=7;PP=848;ReadPosRankSum=-1.586;SC=TTCATTTGATATTGTTCATTC;SOR=0.982;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=60;TCF=50;TCR=10;TR=45;WE=127447507;WS=127447489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,50:0.77:65
chr7	127637816	rs17151639	A	G	2001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=403;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.569;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=58;PP=1400;ReadPosRankSum=-0.762;SC=CTGGCAGTTCACCATATATAC;SOR=0.727;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=373;TCF=189;TCR=184;TR=116;WE=127637824;WS=127637806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:281,122:0.30:403
chr7	127668769	rs117070316	G	T	527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.783;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=9;PP=420;ReadPosRankSum=1.029;SC=CTTGGTATGGGTCTGAATTAT;SOR=0.941;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=115;TCF=83;TCR=32;TR=34;WE=127668777;WS=127668759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,33:0.27:124
chr7	127721507	rs322825	T	C	2782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=449;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.20;ReadPosRankSum=-1.596;SOR=0.702;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:286,163:0.36:449
chr7	127950725	rs12850	G	A	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=185;ReadPosRankSum=0.599;SC=GGGCACCTCCGAGCACAGTGG;SOR=0.249;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=43;TCR=1;TR=13;WE=127950733;WS=127950715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,17:0.35:49
chr7	127957602	rs2290225	A	C	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.851;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=72;ReadPosRankSum=0.405;SC=GGGAACTAGGAGCAAAAAAAC;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=6;WE=127957610;WS=127957592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr7	127957893	rs2290226	T	C	4305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.514;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=104;PP=2962;ReadPosRankSum=0.770;SC=CTTTTTTTTGTCCACTTGCCA;SOR=0.776;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=243;TCF=93;TCR=150;TR=166;WE=127957901;WS=127957873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,177:0.69:255
chr7	127973133	rs359650	T	C	815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=0;PP=556;ReadPosRankSum=-1.381;SC=GAAATCTAAATGAAAACGTGA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=26;WE=127973141;WS=127973123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,30:0.68:44
chr7	127976119	rs359651	G	T	2471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.627;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=64;PP=1589;ReadPosRankSum=1.883;SC=GTAAAGAAAGGAGGAATTCAT;SOR=0.810;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=147;TCF=53;TCR=94;TR=96;WE=127976127;WS=127976109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,103:0.62:167
chr7	127991133	rs891215	G	A	5027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=71;PP=2965;SC=AGGGCAGCGCGGGGGCCTGTC;SOR=0.944;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=170;TCF=99;TCR=71;TR=170;WE=127991141;WS=127991123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr7	127992437	rs1651945	C	G	5364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=102;NR=84;PP=2965;SC=CGGGCGGGCACCGCCAGGGCA;SOR=0.798;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=186;TCF=102;TCR=84;TR=186;WE=127992445;WS=127992427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr7	128000091	rs359642	G	A	935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=24;PP=652;SC=GGACTCAGTTGTTCAGCAGCT;SOR=2.694;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=30;WE=128000099;WS=128000081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr7	128034629	rs2228075	C	T	1553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.811;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=30;PP=820;ReadPosRankSum=-1.083;SC=AGACACCCTGCGCGATCTTCA;SOR=0.895;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=87;TCF=44;TCR=43;TR=58;WE=128034637;WS=128034619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,70:0.69:101
chr7	128040699	rs2278294	C	T	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=18;PP=366;ReadPosRankSum=0.010;SC=GAAGCCAGGACCCTCAGTGGG;SOR=0.555;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=50;TCF=18;TCR=32;TR=29;WE=128040707;WS=128040689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,35:0.64:55
chr7	128095876	rs2732393	A	G	2715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=16;PP=1884;SC=GCGTGCGCGTACCCTCCTGGG;SOR=2.531;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=82;TCF=66;TCR=16;TR=81;WE=128095884;WS=128095866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr7	128102508	rs10647404	C	CTCTT	649.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=2.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.611;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.243;NF=1;NR=10;PP=480;ReadPosRankSum=-1.899;SC=ACATATGGTGCTCTTGTGAGC;SOR=3.209;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=11;WE=128102516;WS=128102498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,19:0.41:46
chr7	128119514	rs1065267	G	A	1671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=551;ExcessHet=3.0103;FS=0.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.01;MQRankSum=-0.166;QD=3.03;ReadPosRankSum=-1.180;SOR=0.820;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:430,121:0.22:551
chr7	128133774	rs141398140	C	A	1296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.722;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.361;NF=45;NR=12;PP=915;ReadPosRankSum=0.733;SC=GCAACAGTTACATTTAAAATT;SOR=0.792;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=165;TCF=129;TCR=36;TR=57;WE=128133782;WS=128133764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,61:0.35:176
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chr7	128137993	rs10245559	T	G	1390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.465;NF=41;NR=20;PP=917;ReadPosRankSum=1.013;SC=GGTGTGTCAGTTGAGGAAGTC;SOR=0.712;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=151;TCF=104;TCR=47;TR=61;WE=128138001;WS=128137983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,67:0.42:161
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chr7	128317882	rs7797745	T	C	1549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.119;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=41;PP=1034;ReadPosRankSum=-0.411;SC=GTGGGCCTCCTTCCGGGACCT;SOR=1.150;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=95;TCF=34;TCR=61;TR=61;WE=128317890;WS=128317872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,65:0.64:102
chr7	128318006	rs67602452	G	T	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=29;ReadPosRankSum=0.674;SC=TTTCTATTCAGTAGTATGAAT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=3;WE=128318014;WS=128317996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr7	128319982	rs2290229	A	T	3422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.740;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=51;PP=2034;ReadPosRankSum=-0.405;SC=TTAGGGTGTGAAACTCAACTG;SOR=0.506;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=188;TCF=120;TCR=68;TR=134;WE=128319990;WS=128319972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,149:0.71:209
chr7	128322918	rs4554406	A	G	708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-3.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.389;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=5;PP=457;ReadPosRankSum=0.051;SC=GGTGTGAGCCACTGCACCCAG;SOR=0.275;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=49;TCF=42;TCR=7;TR=31;WE=128322926;WS=128322908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,33:0.63:52
chr7	128323034	rs1109552	A	G	5784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=418;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=132;NR=122;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.798;SC=TGACACTGCCATTGAAATAGA;SOR=0.718;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=382;TCF=200;TCR=182;TR=254;WE=128323042;WS=128323024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,275:0.66:418
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chr7	128399231	rs41274152	T	C	301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=223;SC=TATATAAGTATTGGCCAGATT;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=128399239;WS=128399221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr7	128409225	rs1043550	A	G	9297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=139;NR=181;PP=2965;SC=GTTCTGAGCTACGGAGGAACC;SOR=1.061;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=320;TCF=139;TCR=181;TR=320;WE=128409233;WS=128409215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,340:1.00:340
chr7	128414484	rs17397588	T	C	2463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=14;PP=1800;SC=ATCTTATGTTTCAGAGCACTC;SOR=2.570;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=64;TCR=14;TR=78;WE=128414492;WS=128414474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
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chr7	128415290	rs17476081	C	T	2178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=58;PP=1554;SC=TCGGGTGGAGCAAGCACAGAG;SOR=2.925;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=15;TCR=58;TR=73;WE=128415298;WS=128415280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
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chr7	128434717	rs377317017	G	A	1709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.212;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=33;PP=1114;ReadPosRankSum=-0.154;SC=CCCTGGATCCGAGCTTGACAC;SOR=0.512;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=121;TCF=60;TCR=61;TR=68;WE=128434725;WS=128434707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,74:0.56:132
chr7	128447054	rs35456642	C	A	801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.360;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=23;PP=457;ReadPosRankSum=1.524;SC=AGAAAGGTGACCTCGGGGAGT;SOR=0.392;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=47;TCF=13;TCR=34;TR=33;WE=128447062;WS=128447044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,37:0.71:52
chr7	128450532	rs7799186	G	A	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.063;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=397;ReadPosRankSum=-0.053;SC=CCAGGGGTAAGGATAAGGCAA;SOR=0.217;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=59;TCF=6;TCR=53;TR=23;WE=128450540;WS=128450522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,25:0.41:61
chr7	128451353	rs111409895	C	CAGAGAGCCTGGGA	6507.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=15;NR=35;PP=2974;SC=AAGCCAGGCCCAACATGCCCA;SOR=0.769;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=55;TCF=16;TCR=39;TR=50;WE=128451361;WS=128451343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr7	128455079	rs117033934	G	A	812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=29;PP=625;ReadPosRankSum=2.085;SC=TTGTAGAGAAGCTTCTGGGAT;SOR=1.662;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=45;TCF=2;TCR=43;TR=30;WE=128455087;WS=128455069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,31:0.67:46
chr7	128455767	rs4728137	C	G	4255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=89;NR=49;PP=2626;SC=GGAAAAAAAGCAAGTGAAAGA;SOR=1.216;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=89;TCR=49;TR=138;WE=128455775;WS=128455757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr7	128455916	rs2270590	G	A	3680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.669;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=72;PP=2393;ReadPosRankSum=2.297;SC=AAGAGGAGGAGGATGACGCCG;SOR=0.568;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=247;TCF=127;TCR=120;TR=142;WE=128455924;WS=128455906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,155:0.57:272
chr7	128477865	rs7787924	G	A	2341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=48;PP=1261;ReadPosRankSum=0.033;SC=ACCAGAGAGCGTGGGGCCAAC;SOR=0.680;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=153;TCF=71;TCR=82;TR=91;WE=128477873;WS=128477855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,105:0.62:169
chr7	128478103	rs2291562	C	T	2418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.287;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=56;PP=1507;ReadPosRankSum=-2.085;SC=TGCCCAAGGTCGCTGGGTTAC;SOR=0.840;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=150;TCF=68;TCR=82;TR=99;WE=128478111;WS=128478093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,108:0.65:167
chr7	128480123	rs2291563	C	A	1589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.296;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=47;PP=976;ReadPosRankSum=-0.048;SC=GCCTGCAGCCCAAGGGTGTTC;SOR=0.789;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=296;TCF=151;TCR=145;TR=89;WE=128480131;WS=128480113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:221,99:0.31:320
chr7	128480791	rs2291564	C	G	2711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.924;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=65;PP=1805;ReadPosRankSum=0.979;SC=ACGAGGGGCACTGGGCTGCGA;SOR=1.097;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=157;TCF=66;TCR=91;TR=106;WE=128480799;WS=128480781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,113:0.66:170
chr7	128481196	rs2291565	T	C	1073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.275;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=13;PP=633;ReadPosRankSum=-1.917;SC=TGATGCTGGATCCCCGACCCT;SOR=0.399;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=67;TCF=49;TCR=18;TR=45;WE=128481204;WS=128481186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,49:0.66:74
chr7	128482440	rs2291566	C	G	3353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.576;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=84;PP=2106;ReadPosRankSum=0.379;SC=TGCGTCCTCCCGGCCTGCCCC;SOR=0.618;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=197;TCF=74;TCR=123;TR=136;WE=128482448;WS=128482430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,149:0.71:211
chr7	128483227	rs2291567	T	C	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.315;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=208;ReadPosRankSum=-0.227;SC=AGCATCTAGCTGAGAGCAGGG;SOR=1.609;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=12;WE=128483235;WS=128483217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr7	128484816	rs3734973	A	G	5332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=365;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.792;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=118;NR=100;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.871;SC=GGCTGACCGTAGAGGGCCCCT;SOR=0.592;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=346;TCF=191;TCR=155;TR=218;WE=128484824;WS=128484806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,235:0.64:365
chr7	128486252	rs138334624	T	TGGGCAGGTGGGCAGGGCC	2805.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.652;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=8.476;NF=9;NR=33;PP=2972;ReadPosRankSum=1.495;SC=TGGGCAGGGCTGGGCAAGTGG;SOR=0.803;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=93;TCF=24;TCR=69;TR=42;WE=128486260;WS=128486242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,72:0.54:133
chr7	128486363	rs34373805	C	T	4103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.889;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.024;NF=101;NR=69;PP=2689;ReadPosRankSum=0.124;SC=AGGCGTGCATCTGGTGGAGGT;SOR=0.902;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=251;TCF=148;TCR=103;TR=170;WE=128486371;WS=128486353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,179:0.67:268
chr7	128486446	rs75770585	C	T	5276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=108;NR=114;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.461;SC=ATCCCACCCGCGTCCGAGCCT;SOR=0.667;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=322;TCF=158;TCR=164;TR=222;WE=128486454;WS=128486436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,236:0.70:338
chr7	128487866	rs2249128	T	C	4124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=70;NR=67;PP=2275;SC=TCACAGTGGATTGCAGTCAAG;SOR=0.811;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=137;TCF=70;TCR=67;TR=137;WE=128487874;WS=128487856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr7	128487893	rs2291568	G	A	1706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.514;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=31;PP=880;ReadPosRankSum=2.442;SC=GGGCGCCCCTGCAGGTGGCTG;SOR=0.435;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=102;TCF=53;TCR=49;TR=68;WE=128487901;WS=128487883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,79:0.66:120
chr7	128490553	rs13227216	T	C	741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.254;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=21;PP=524;ReadPosRankSum=-1.026;SC=GCCCTGTGGCTCCCAGGCATG;SOR=1.368;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=44;TCF=16;TCR=28;TR=31;WE=128490561;WS=128490543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,32:0.64:50
chr7	128491166	rs3816883	T	C	870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=11;PP=673;ReadPosRankSum=-0.751;SC=CTCCACCAGCTGGGTCCCTAC;SOR=0.804;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=46;TCF=31;TCR=15;TR=35;WE=128491174;WS=128491156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,34:0.74:46
chr7	128491603	rs3816884	T	C	6164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=450;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.392;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=125;NR=143;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.081;SC=ATCTGCCGACTGCGCCTGGAG;SOR=0.857;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=415;TCF=201;TCR=214;TR=268;WE=128491611;WS=128491593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,289:0.64:449
chr7	128492527	rs76972396	G	A	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.939;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=407;ReadPosRankSum=-0.815;SC=CGTGCACCTGGGAGTGGCCCC;SOR=0.368;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=22;WE=128492535;WS=128492517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,23:0.66:35
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chr7	128495338	rs3816885	C	T	5375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.407;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=115;NR=103;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.371;SC=TCTCGGATGACGCTCGCCGTC;SOR=0.514;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=301;TCF=161;TCR=140;TR=218;WE=128495346;WS=128495328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,245:0.74:333
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chr7	128498630	rs113516962	TAC	T	491.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.625;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.105;NF=1;NR=15;PP=634;ReadPosRankSum=-1.069;SC=ACACACACATTACACACACAC;SOR=0.283;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=16;WE=128498639;WS=128498620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,18:0.75:24
chr7	128506970	rs4323418	T	C	996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=28;PP=717;ReadPosRankSum=0.793;SC=GGGTCCAGACTATAAACAGAG;SOR=0.752;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=14;TCR=44;TR=37;WE=128506978;WS=128506960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,38:0.64:59
chr7	128508965	rs3736617	A	T	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=149;ReadPosRankSum=1.608;SC=TGAAACTATCAGACCTGCAAG;SOR=0.368;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=10;WE=128508973;WS=128508955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr7	128527093	rs11982744	T	G	5753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.337;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=108;NR=121;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.462;SC=CTACTGAGCCTGCAGGGGCCC;SOR=0.523;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=307;TCF=142;TCR=165;TR=229;WE=128527101;WS=128527083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,248:0.73:340
chr7	128531072	rs3734971	T	A	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=1.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQRankSum=1.435;QD=13.34;ReadPosRankSum=0.609;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,33:0.66:50
chr7	128532980	rs7782976	T	C	3576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.509;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=70;PP=2143;ReadPosRankSum=0.526;SC=GCCCCGCACTTGGGTACCCCA;SOR=0.639;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=230;TCF=127;TCR=103;TR=154;WE=128532988;WS=128532970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,160:0.68:237
chr7	128533514	rs34061445	T	TC	5066.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=57;PP=2906;SC=GATACTGGTGTCCTGGTACTC;SOR=1.117;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=76;TCF=11;TCR=65;TR=68;WE=128533522;WS=128533504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr7	128542982	rs11975930	G	A	2694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=71;PP=1660;ReadPosRankSum=1.173;SC=CAGCCTGCCCGCCTTCCTTGT;SOR=0.746;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=147;TCF=50;TCR=97;TR=107;WE=128542990;WS=128542972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,116:0.73:159
chr7	128543678	rs6955736	C	T	4482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.099;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=116;NR=79;PP=2706;ReadPosRankSum=-0.993;SC=AGCTCCGCCACGGACCAAACC;SOR=0.869;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=307;TCF=179;TCR=128;TR=195;WE=128543686;WS=128543668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,208:0.63:328
chr7	128544133	rs56144153	G	T	3094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.522;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=50;PP=1962;ReadPosRankSum=1.345;SC=GTAGACAAGGGTTGGAGCTGG;SOR=0.776;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=202;TCF=123;TCR=79;TR=130;WE=128544141;WS=128544123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,141:0.64:220
chr7	128547512	rs6948542	G	A	1806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.921;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=43;PP=1175;ReadPosRankSum=1.338;SC=TTATTCTGGAGGAAGGAGATG;SOR=0.762;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=132;TCF=70;TCR=62;TR=83;WE=128547520;WS=128547502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,87:0.59:147
chr7	128548304	.	G	GAAGAAAGA	577.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.51;QD=44.44;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr7	128548463	rs7786945	A	C	9862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=4.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=682;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.144;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=208;NR=195;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.521;SC=GCAAACCAGCACTGTCTCCAT;SOR=0.701;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=642;TCF=322;TCR=320;TR=403;WE=128548471;WS=128548453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:250,431:0.63:681
chr7	128550577	rs75709678	C	T	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=252;ReadPosRankSum=0.000;SC=CAGCCCCTCTCGGCCCCCTCA;SOR=1.179;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=14;WE=128550585;WS=128550567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr7	128550680	rs11335250	GC	G	2783.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=24;NR=22;PP=1690;SC=CAGCGCCAGGGCCCCCGAGGT;SOR=1.329;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=53;TCF=29;TCR=24;TR=46;WE=128550688;WS=128550670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr7	128550894	rs1609545	G	A	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=1.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.13;ReadPosRankSum=-0.971;SOR=0.316;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,19:0.68:28
chr7	128586712	.	C	T	784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.904;ClippingRankSum=0.000;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=24;PP=504;ReadPosRankSum=-0.189;SC=CATGGAGCCCCGTGGCCCTCT;SOR=0.781;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=45;TCF=6;TCR=39;TR=28;WE=128586720;WS=128586702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,32:0.65:49
chr7	128587351	rs199508964	CACTCTGCAGCCGCCCACTCTGCGGCCGCCT	C	3833.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.186;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=8.172;NF=9;NR=37;PP=2954;ReadPosRankSum=0.277;SC=AGTGGCCGCCCACTCTGCAGC;SOR=0.713;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=95;TCF=23;TCR=72;TR=46;WE=128587388;WS=128587341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,106:0.68:155
chr7	128588434	rs34270648	T	TG	1180.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.377;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=24;PP=835;ReadPosRankSum=-0.295;SC=TGGGGAATCCTGGGGCTAGGC;SOR=0.563;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=87;TCF=6;TCR=81;TR=27;WE=128588442;WS=128588424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,51:0.35:147
chr7	128607384	rs8043	G	A	3836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.859;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=68;PP=2373;ReadPosRankSum=0.676;SC=TCACTGTGACGGCTCCCACGG;SOR=0.532;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=236;TCF=138;TCR=98;TR=155;WE=128607392;WS=128607374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,174:0.65:267
chr7	128610484	rs1691779	A	G	1732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=47;PP=1376;ReadPosRankSum=0.077;SC=GTGTGTGTGCACGCGTGGCTG;SOR=0.883;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=13;TCR=47;TR=60;WE=128610492;WS=128610474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,62:0.97:64
chr7	128630227	rs1154329	C	T	7419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=121;NR=129;PP=2965;SC=CAGGCTGTGACGACACACAGC;SOR=0.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=251;TCF=121;TCR=130;TR=250;WE=128630235;WS=128630217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,278:1.00:278
chr7	128630313	rs6969930	T	C	2492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=59;PP=1736;SC=TTTTCAAATCTTCAAAAAAGA;SOR=2.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=22;TCR=59;TR=81;WE=128630321;WS=128630303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr7	128640334	rs4728144	A	T	430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=0;PP=537;SC=TAATTTTTTTAAAAAATTCCA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=128640342;WS=128640324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
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chr7	128694976	rs2242028	C	T	505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=18;PP=481;SC=GGGCAGAAGGCTCTCCGTGGA;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=128694984;WS=128694966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr7	128766505	rs6952057	A	C	380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=59;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=0;PP=273;SC=TAGGCGCCGAACGCTCCCGGC;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=128766513;WS=128766495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
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chr7	128766533	rs10464698	A	C	839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.10;QD=41.99;SOR=3.716;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr7	128766553	rs6952077	A	G	1169.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.04;QD=25.99;SOR=2.554;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr7	128767250	rs61740497	G	A	1542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.962;NF=45;NR=43;PP=1134;ReadPosRankSum=0.256;SC=CAACTCCTTCGTGGGCACGCG;SOR=0.706;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=255;TCF=135;TCR=120;TR=88;WE=128767258;WS=128767240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,88:0.32:271
chr7	128767410	rs10247566	A	G	13125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=492;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-0.215;NF=228;NR=235;PP=2965;ReadPosRankSum=0.897;SC=ATCTTTGGCCAGCCCGTGGTC;SOR=0.739;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=465;TCF=229;TCR=236;TR=463;WE=128767418;WS=128767400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,489:1.00:491
chr7	128767490	rs7809681	T	C	10907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=373;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=175;NR=171;PP=2965;SC=CAACAGCGGTTACGGGATGGA;SOR=0.704;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=346;TCF=175;TCR=171;TR=346;WE=128767498;WS=128767480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,372:1.00:372
chr7	128767506	rs7809687	T	G	10494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=383;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=182;NR=171;PP=2965;SC=ATGGACAGCCTGCCCGCCATG;SOR=0.714;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=354;TCF=183;TCR=171;TR=353;WE=128767514;WS=128767496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,382:1.00:382
chr7	128784723	rs13309419	A	G	56.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=0;PP=258;SC=GGGCTCCTGCACGGCGCGGCT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=13;WE=128784731;WS=128784713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr7	128785008	rs13243618	C	T	1331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.537;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=42;PP=933;ReadPosRankSum=2.628;SC=GCGCGGGAGCCGCACTGCCGA;SOR=1.276;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=81;TCF=15;TCR=66;TR=50;WE=128785016;WS=128784998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,54:0.63:86
chr7	128802526	rs2177950	C	T	2044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=44;PP=1448;SC=GGGTGGCCACCCCCAAGACAG;SOR=1.981;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=65;TCF=20;TCR=45;TR=64;WE=128802534;WS=128802516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr7	128804193	rs71583815	C	T	3349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=33;PP=1881;SC=CATTAGGACTCGGTTCTGATT;SOR=1.304;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=75;TCR=33;TR=108;WE=128804201;WS=128804183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr7	128804474	rs71583817	T	C	2589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=61;PP=1859;SC=AAGAGATGCCTCACCCTCTAT;SOR=1.828;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=26;TCR=61;TR=87;WE=128804482;WS=128804464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr7	128807570	rs73230567	C	G	2531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.901;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=31;PP=1684;ReadPosRankSum=0.695;SC=AAAACAAGGCCATCACTCACT;SOR=0.488;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=128;TCF=94;TCR=34;TR=105;WE=128807578;WS=128807560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,112:0.81:139
chr7	128807732	rs35331287	T	G	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=1.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.30;ReadPosRankSum=-0.315;SOR=0.883;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:123,37:0.23:160
chr7	128807786	rs3173902	G	A	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.66;ReadPosRankSum=0.920;SOR=0.789;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,17:0.22:79
chr7	128843169	rs2566871	C	T	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=355;ReadPosRankSum=0.363;SC=GGTGAAGCTGCGTCTGTGGGT;SOR=0.976;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=18;WE=128843177;WS=128843159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,18:0.75:24
chr7	128844953	rs13223446	C	A	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.838;NF=23;NR=5;PP=352;ReadPosRankSum=0.727;SC=TATCTCCAGCCACCCTGCCAT;SOR=0.535;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=89;TCF=72;TCR=17;TR=28;WE=128844961;WS=128844943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,29:0.31:93
chr7	128845018	rs2703091	C	T	4725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.787;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=114;NR=90;PP=2917;ReadPosRankSum=1.781;SC=TGCCTTGACACCGTCTTTTCC;SOR=0.522;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=308;TCF=175;TCR=133;TR=204;WE=128845039;WS=128845008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,219:0.66:334
chr7	128845277	rs2075777	G	C	1207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.863;HP=5;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=30;PP=898;ReadPosRankSum=-0.180;SC=GGGCAGGCCCGGGGGGCCCTC;SOR=1.367;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=64;TCF=26;TCR=38;TR=47;WE=128845285;WS=128845267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,49:0.72:68
chr7	128845299	rs34894139	T	C	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=7;PP=221;ReadPosRankSum=0.124;SC=GCCTGGAACGTGGGAAGAGAG;SOR=0.756;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=60;TCF=37;TCR=23;TR=18;WE=128845307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,21:0.32:66
chr7	128845325	rs2566872	G	A	1715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=15;PP=1222;ReadPosRankSum=-1.271;SC=GGGAAGGGGGGCAAAGAGGTC;SOR=0.701;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=85;TCF=65;TCR=20;TR=61;WE=128845333;WS=128845315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,67:0.71:95
chr7	128845907	rs2075779	T	C	645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.467;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=358;ReadPosRankSum=-0.770;SC=CCTCAGCAGCTGAGGGTCTGG;SOR=0.264;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=39;TCF=32;TCR=7;TR=24;WE=128845915;WS=128845897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,28:0.64:44
chr7	128846207	rs35678076	G	A	1850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=390;ExcessHet=3.0103;FS=1.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.75;ReadPosRankSum=1.669;SOR=0.650;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:279,111:0.28:390
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chr7	128846469	rs2735842	A	G	1112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=36;PP=827;ReadPosRankSum=0.799;SC=GCAACAAAATATACTGGGCAC;SOR=0.573;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=70;TCF=11;TCR=59;TR=43;WE=128846477;WS=128846459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,45:0.62:72
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chr7	128865370	rs13229264	C	G	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=1.838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.37;ReadPosRankSum=1.499;SOR=0.505;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,32:0.36:88
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chr7	129029093	rs10954231	A	G	1213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=38;PP=878;ReadPosRankSum=0.034;SC=CTTTTTGTCCATATTAATCCC;SOR=0.954;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=63;TCF=9;TCR=54;TR=44;WE=129029101;WS=129029083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,47:0.69:68
chr7	129040018	rs17552411	T	C	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=370;ReadPosRankSum=-0.095;SC=ATCCAAGGAGTATAGCAGAAT;SOR=0.880;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=36;TCF=33;TCR=3;TR=19;WE=129040026;WS=129040008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,20:0.54:37
chr7	129043436	rs13230585	G	A	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.004;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.190;NF=2;NR=9;PP=151;ReadPosRankSum=1.228;SC=CAGGCGCGGTGGCTCACGCCT;SOR=0.317;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=11;WE=129043444;WS=129043426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr7	129045765	rs12706882	A	G	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=28;PP=546;ReadPosRankSum=1.856;SC=TTTGTTTATTAGGTGTTTTAA;SOR=0.742;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=151;TCF=61;TCR=90;TR=45;WE=129045773;WS=129045755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,48:0.28:170
chr7	129049507	rs6467244	A	G	1280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=31;PP=883;SC=ATAGTAGCCCACAAAGCCAGC;SOR=3.056;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=37;WE=129049515;WS=129049497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr7	129062633	rs71579850	C	T	676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=13;PP=407;ReadPosRankSum=-0.362;SC=TCTGTTCCCACAGTGGGGCTT;SOR=0.754;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=71;TCR=37;TR=37;WE=129062641;WS=129062623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,38:0.34:113
chr7	129094195	rs581829	T	C	696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=3;PP=516;SC=AGAGACCATCTCTGAGGTCTG;SOR=2.400;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=22;WE=129094203;WS=129094185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr7	129102743	rs34275118	A	G	11409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=440;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=216;NR=185;PP=2965;SC=CCTCACAACCAAGAAAAAAAA;SOR=0.834;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=404;TCF=217;TCR=187;TR=401;WE=129102753;WS=129102733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,437:1.00:437
chr7	129125750	rs692625	G	A	654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=18;PP=462;SC=CCATACAGGCGCTGTTACCAG;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=129125758;WS=129125740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr7	129142694	rs691332	C	G	6968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=111;NR=127;PP=2965;SC=CTAAAGTACCCGGGGCCAGGG;SOR=0.900;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=240;TCF=113;TCR=127;TR=238;WE=129142702;WS=129142684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,263:1.00:263
chr7	129142775	rs610591	G	A	1976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=49;PP=1451;SC=CCCTGGGGTCGACCTCAACGC;SOR=3.223;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=10;TCR=49;TR=59;WE=129142783;WS=129142765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr7	129297332	rs1882094	T	G	5081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.565;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=121;PP=2962;ReadPosRankSum=1.166;SC=CGCCTTCTTCTCCCGAGGACA;SOR=0.587;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=282;TCF=112;TCR=170;TR=202;WE=129297340;WS=129297322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,214:0.71:303
chr7	129349101	rs11769146	G	A	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.399;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=246;ReadPosRankSum=-1.171;SC=TGAGTTGCCTGGTTGCTTTTC;SOR=0.461;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=33;TCF=10;TCR=23;TR=18;WE=129349109;WS=129349091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,20:0.54:37
chr7	129350170	rs3736626	A	C	611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.951;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=3;PP=448;ReadPosRankSum=0.147;SC=AAATAACCAAAGTTCTTTGTG;SOR=1.254;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=84;TCF=68;TCR=16;TR=26;WE=129350178;WS=129350160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,29:0.33:87
chr7	129351444	rs1962038	C	G	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.751;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=23;PP=411;ReadPosRankSum=0.384;SC=TCTGCATCTTCTTAAATACTT;SOR=0.833;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=119;TCF=45;TCR=74;TR=36;WE=129351452;WS=129351434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,38:0.30:128
chr7	129356939	rs12154342	T	G	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=4.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=125;ReadPosRankSum=-1.481;SC=ATATTGCAGGTCATGTTAATT;SOR=0.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=8;WE=129356947;WS=129356929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr7	129395138	.	CT	C	42.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.297;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=2.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.71;ReadPosRankSum=-2.009;SOR=0.240;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,6:0.24:25
chr7	129410144	rs4467881	G	A	1018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=8;PP=719;SC=CCAGCAGTCCGGGACCTGAGT;SOR=1.949;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=34;WE=129410152;WS=129410134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr7	129410195	rs4541843	G	A	2839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=32;PP=1897;SC=CAGCATGGCCGGCCCTTCCCT;SOR=1.499;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=67;TCR=32;TR=99;WE=129410203;WS=129410185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr7	129519555	rs62491504	C	T	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.30;ReadPosRankSum=1.139;SOR=0.798;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,6:0.23:26
chr7	129520689	rs75328071	A	G	2526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.606;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=35;PP=1657;ReadPosRankSum=2.327;SC=TAAGAAACAGAGTAAAAGACT;SOR=0.606;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=156;TCF=104;TCR=52;TR=99;WE=129520697;WS=129520679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,109:0.63:173
chr7	129592275	rs3840552	CG	C	2580.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=357;ExcessHet=3.0103;FS=0.878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQRankSum=3.294;QD=7.27;ReadPosRankSum=-2.030;SOR=0.771;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:242,113:0.32:355
chr7	129592517	rs1045896	G	A	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=46;ReadPosRankSum=-0.710;SC=CGCGGTCCCGGCGGTCCCGTC;SOR=0.437;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=37;TCF=5;TCR=32;TR=8;WE=129592525;WS=129592507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,8:0.21:38
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chr7	129910818	rs3816830	G	A	546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=16;PP=430;SC=TTCATGTAGGGCCTGAAGTCC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=129910826;WS=129910808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr7	129916390	rs59738706	A	AAC	1464.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.761;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.008;NF=27;NR=7;PP=1352;ReadPosRankSum=1.206;SC=ATCTGGAAAAAACACTACCTT;SOR=1.540;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=59;TCF=44;TCR=15;TR=34;WE=129916398;WS=129916380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,41:0.66:62
chr7	129916515	rs17590	T	C	10938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=410;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=211;NR=162;PP=2965;SC=CCATTCTGGATGCCCTGGATA;SOR=0.919;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=374;TCF=212;TCR=162;TR=373;WE=129916524;WS=129916505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,410:1.00:410
chr7	129962360	rs1569133	A	G	11861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=453;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=233;NR=182;PP=2965;SC=TCGACTGGGCATATGACAACG;SOR=0.911;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=415;TCF=233;TCR=182;TR=415;WE=129962368;WS=129962350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,453:1.00:453
chr7	129986226	rs6955991	T	A	1468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.90;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr7	129986236	rs6955995	T	C	1754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.81;SOR=4.664;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr7	129986338	rs6973851	C	T	7444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=147;NR=99;PP=2965;SC=TGCAGGGCACCCCTGGAGGCG;SOR=1.095;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=246;TCF=147;TCR=99;TR=246;WE=129986346;WS=129986328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,268:1.00:268
chr7	129986521	rs6467306	T	C	2371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=62;PP=1539;SC=GTGGCTGCCCTGCTGGTGCCT;SOR=2.780;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=15;TCR=62;TR=77;WE=129986529;WS=129986511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr7	129987734	rs71579248	G	T	854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.641;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=25;PP=461;ReadPosRankSum=1.051;SC=CCTCCTCAGTGGCTCACACAT;SOR=0.970;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=93;TCF=34;TCR=59;TR=36;WE=129987742;WS=129987724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,45:0.42:107
chr7	129989852	rs17388190	C	T	4168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.033;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=68;PP=2676;ReadPosRankSum=1.018;SC=GCCCAGCCTCCCTGTGGATAT;SOR=0.771;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=250;TCF=149;TCR=101;TR=171;WE=129989860;WS=129989842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,181:0.69:262
chr7	129989878	rs7808823	T	C	7316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=143;NR=119;PP=2965;SC=TTCCTTTCTCTGAACTGAAAG;SOR=0.766;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=263;TCF=144;TCR=119;TR=262;WE=129989886;WS=129989868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,284:1.00:284
chr7	130002317	rs1544705	T	C	9230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=176;NR=152;PP=2965;SC=CCATCTGGATTGACACTGGAA;SOR=0.758;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=329;TCF=177;TCR=152;TR=328;WE=130002325;WS=130002307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,349:1.00:349
chr7	130007901	rs2241272	A	T	2131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.094;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=55;PP=2802;ReadPosRankSum=0.115;SC=GGCAGTGCCAAGGATCTAGCT;SOR=0.908;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=151;TCF=54;TCR=97;TR=83;WE=130007921;WS=130007891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,92:0.57:160
chr7	130007913	rs2241273	T	G	1701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.547;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=44;PP=2802;ReadPosRankSum=0.561;SC=GATCTAGCTGTGCTGGCCCAA;SOR=0.872;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=117;TCF=38;TCR=79;TR=64;WE=130007921;WS=130007891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,71:0.58:123
chr7	130008159	rs2302823	A	G	1109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=8;PP=784;ReadPosRankSum=0.915;SC=TTTGGCTCCCAGGGCTCACTT;SOR=0.780;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=74;TCF=62;TCR=12;TR=50;WE=130008167;WS=130008149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,51:0.65:78
chr7	130020569	rs7790688	A	G	1277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=29;PP=930;SC=GCTGGCAGATAAGCAACCAGG;SOR=1.954;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=12;TCR=29;TR=41;WE=130020577;WS=130020559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr7	130021488	rs1126899	G	C	9298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=227;NR=90;PP=2965;SC=TCTGGCGGGGGCCTGCCCACC;SOR=1.871;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=317;TCF=227;TCR=90;TR=317;WE=130021496;WS=130021464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,329:1.00:329
chr7	130023179	rs6972781	A	G	2973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=46;PP=1888;ReadPosRankSum=-0.681;SC=GGGCAGCAAGATGAGGCCTCA;SOR=0.664;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=180;TCF=113;TCR=67;TR=122;WE=130023187;WS=130023169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,132:0.69:192
chr7	130024308	rs3043750	A	AC,ACC	1844.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=32,32;NR=6,6;PP=202,546;SC=CCTCTGAACCACCCCCCACCC;SOR=2.628;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=37;TCR=7;TR=38,38;WE=130024316;WS=130024298;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.36,0.64:53
chr7	130025895	rs2239606	A	G	923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=28;PP=745;SC=GGCAAGGGCTATTCTGAGGGG;SOR=5.421;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=29;WE=130025903;WS=130025885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
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chr7	130080812	rs2287371	T	G	14812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=558;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=295;NR=229;PP=2965;SC=GGACATATTTTCTCCAACCGA;SOR=0.968;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=524;TCF=295;TCR=229;TR=524;WE=130080820;WS=130080802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,556:1.00:556
chr7	130136902	rs2072573	G	T	2945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.842;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=43;PP=2004;ReadPosRankSum=-0.678;SC=GGTCACAGTTGCTTGTTCTTT;SOR=0.849;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=106;TCF=62;TCR=44;TR=105;WE=130136910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,108:0.99:109
chr7	130138155	rs6968284	A	G	12599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=452;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=219;NR=208;PP=2965;SC=GATGCTAGGAAAGTACATTGT;SOR=0.729;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=427;TCF=219;TCR=208;TR=427;WE=130138163;WS=130138145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,452:1.00:452
chr7	130140766	rs765205	C	A	4463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=79;PP=2748;SC=TTTCCAGAGACGTGTTTTTGT;SOR=1.200;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=144;TCF=65;TCR=79;TR=142;WE=130140774;WS=130140756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr7	130147307	rs2302826	T	G	3996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=96;PP=2939;SC=GGTGGAAGGGTTTGTTGGTGA;SOR=2.025;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=37;TCR=96;TR=133;WE=130147315;WS=130147297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr7	130148507	rs2072575	G	A	2908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=66;PP=2021;SC=GCAACTGGAGGAGAAGGGAGG;SOR=1.832;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=29;TCR=66;TR=95;WE=130148515;WS=130148497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr7	130148562	rs58927323	T	TTCTTAGGAAGTG	1544.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=13;PP=2976;SC=TTTCCATCATTCCATCTGTAC;SOR=1.681;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=18;WE=130148570;WS=130148552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr7	130148903	rs12706941	A	G	2260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=41;PP=1793;SC=CTGTGGTAAAAAGCATACAGA;SOR=1.478;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=71;TCF=30;TCR=41;TR=66;WE=130148911;WS=130148893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr7	130149061	rs12706942	G	C	8302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=139;NR=141;PP=2965;SC=TGAGTTTCTAGTATTGGTAAA;SOR=0.808;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=280;TCF=139;TCR=141;TR=280;WE=130149069;WS=130149051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,311:1.00:311
chr7	130150705	rs12706944	G	A	4914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=101;NR=65;PP=2945;SC=GCCTTTCCATGGCAAGAAAAT;SOR=1.088;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=166;TCF=101;TCR=65;TR=166;WE=130150713;WS=130150695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr7	130292531	rs12706946	T	C	5512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=94;NR=72;PP=2965;SC=GTGATTTTTGTAGAGTTTAAA;SOR=1.022;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=166;TCF=94;TCR=72;TR=166;WE=130292539;WS=130292521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr7	130297119	rs34699820	GA	G	3244.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.039;HP=12;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.297;NF=4;NR=90;PP=1413;ReadPosRankSum=0.620;SC=GCTAAATACAGAAAAAAAAAA;SOR=0.336;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=127;TCF=5;TCR=122;TR=94;WE=130297138;WS=130297108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:10,141:0.93:151
chr7	130298550	rs4731696	C	T	2618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=58;PP=1721;SC=GAAAAACATGCTTATGCAAAA;SOR=2.557;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=17;TCR=58;TR=75;WE=130298558;WS=130298540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr7	130354106	rs10232683	G	C	7893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=103;NR=158;PP=2965;SC=TAAAGGAGACGCACTTGGAGG;SOR=1.296;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=262;TCF=103;TCR=159;TR=261;WE=130354114;WS=130354096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,282:1.00:282
chr7	130356691	.	CTTTAT	C	298	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=2;NR=4;PP=298;QD=51.1666666667;SC=GAACTATTCACTTTATTTTAT;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=6;WE=130356703;WS=130356681;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:13,6:0.32:19
chr7	130418525	rs76603546	G	A	5907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=106;NR=92;PP=2965;SC=CGGAGAAGCCGGACGAGGCGC;SOR=0.748;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=199;TCF=106;TCR=93;TR=198;WE=130418533;WS=130418515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr7	130418720	rs111359117	A	C	1573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=19;PP=1017;SC=CGGACTCCGGATGCGCCGCAC;SOR=1.061;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=32;TCR=19;TR=51;WE=130418728;WS=130418710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr7	130418883	.	C	CGAGCGCCGTCCGAACGCGGCCGGCCGCGGGCGACGGAGTTCCCGGGAGCGTCCGTCCCGCAGCCTCG	1288.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.03;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr7	131060277	rs3823557	G	A	4609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=67;NR=84;PP=2490;SC=ATCCCTTAATGCTGTTTAGAA;SOR=1.088;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=67;TCR=85;TR=151;WE=131060288;WS=131060267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr7	131155588	rs1733861	G	T	3088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=39;PP=1981;SC=TTATCCTTGTGTACATTTTCT;SOR=1.159;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=66;TCR=39;TR=104;WE=131155596;WS=131155578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr7	131155764	rs1684172	T	C	1070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=24;PP=751;SC=TCCTAACTTATATTTAATGAT;SOR=1.885;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=34;WE=131155772;WS=131155754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr7	131195535	rs3847113	G	T	1129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=10;PP=679;SC=GAGCCATCACGCCTGGCCCTG;SOR=1.501;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=36;WE=131195543;WS=131195525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr7	131195712	rs12670788	G	A	3933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=42;PP=2549;SC=AGGATGCGTCGAAGTGGGTTG;SOR=1.290;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=79;TCR=42;TR=121;WE=131195720;WS=131195702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr7	131195959	rs3735035	C	T	9835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=361;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=166;NR=167;PP=2965;SC=TTGCCTGAGCCGCCTCCTCTA;SOR=0.767;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=333;TCF=166;TCR=167;TR=333;WE=131195967;WS=131195949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,361:1.00:361
chr7	131241029	rs11277659	GGGCGAC	G	763.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=1.838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQRankSum=1.871;QD=6.64;ReadPosRankSum=-0.389;SOR=0.486;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,26:0.23:115
chr7	131241085	rs7780021	G	A	822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FS=1.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.05;MQRankSum=1.682;QD=3.74;ReadPosRankSum=1.499;SOR=0.878;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:162,58:0.26:220
chr7	131815118	rs10954359	C	T	828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.633;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=6;PP=564;ReadPosRankSum=-0.796;SC=GAGAGAGAAACAGCGCTGCTC;SOR=0.090;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=42;TCF=36;TCR=6;TR=31;WE=131815126;WS=131815108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,33:0.77:43
chr7	131815220	rs10954360	G	A	2269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.535;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=42;PP=1401;ReadPosRankSum=-0.126;SC=CTCCAGGGCGGCCCTGGAAGG;SOR=0.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=180;TCF=103;TCR=77;TR=97;WE=131815228;WS=131815210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,104:0.54:191
chr7	131815310	rs2671103	A	G	3247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.027;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=71;PP=2006;ReadPosRankSum=-0.205;SC=CACACTGGTCATCGTGGTCCA;SOR=0.608;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=225;TCF=110;TCR=115;TR=141;WE=131815318;WS=131815300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,151:0.63:240
chr7	131815343	rs10954361	G	A	3266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=69;PP=1926;ReadPosRankSum=1.084;SC=TCTGCGGAAGGGCCAAGAACA;SOR=0.660;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=209;TCF=99;TCR=110;TR=133;WE=131815351;WS=131815333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,146:0.65:225
chr7	131817850	rs75848889	T	C	1466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.551;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=34;PP=939;ReadPosRankSum=1.289;SC=TCTCTGAGAGTGCACTCATGG;SOR=0.805;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=275;TCF=162;TCR=113;TR=85;WE=131817858;WS=131817840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:204,87:0.30:291
chr7	131832627	rs1450882	A	G	2272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=64;NR=23;PP=1508;SC=CAGGACACCCAGGCCTCCCTA;SOR=2.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=64;TCR=23;TR=87;WE=131832635;WS=131832617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr7	131849204	rs896167	T	A	683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=20;PP=472;ReadPosRankSum=-0.606;SC=CTTCTCTCCATCTCCTCATCC;SOR=0.843;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=43;TCF=11;TCR=32;TR=26;WE=131849212;WS=131849194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,29:0.60:48
chr7	131852988	.	C	T	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=3;PP=629;ReadPosRankSum=-0.594;SC=GAGCTCCACCCGAGTCTCCCT;SOR=1.179;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=42;TCF=37;TCR=5;TR=29;WE=131852996;WS=131852978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,28:0.67:42
chr7	131859496	rs7808586	G	A	4886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=111;NR=59;PP=2965;SC=TTGCCAACACGCTCCCCTGCT;SOR=1.369;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=170;TCF=111;TCR=59;TR=170;WE=131859504;WS=131859486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr7	131864591	rs3734989	T	C	4812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=96;PP=2689;SC=CGCCAGCCACTGCGATGCTGA;SOR=1.014;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=173;TCF=77;TCR=96;TR=173;WE=131864599;WS=131864581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr7	131866972	rs3734983	A	G	5165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=338;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.352;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=116;NR=105;PP=2962;ReadPosRankSum=0.159;SC=AAAGAAGGAGATGTGTAAATG;SOR=0.489;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=312;TCF=159;TCR=153;TR=221;WE=131866980;WS=131866962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,233:0.69:338
chr7	131908468	rs2290232	T	C	2013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.491;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=51;PP=1379;ReadPosRankSum=2.491;SC=GGCTTGAGTCTCTATGGTCTA;SOR=0.910;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=121;TCF=45;TCR=76;TR=78;WE=131908476;WS=131908458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,84:0.62:136
chr7	131908566	rs2290233	A	T	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=185;ReadPosRankSum=-0.285;SC=ACTCCCCAAGACCTCAGGAAG;SOR=0.412;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=10;WE=131908574;WS=131908556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr7	131913288	rs62464985	G	A	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.351;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=419;ReadPosRankSum=1.320;SC=GGGAGGGGCGGATGCTGAGGT;SOR=1.661;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=58;TCF=9;TCR=49;TR=22;WE=131913296;WS=131913278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,25:0.40:62
chr7	131915507	rs1868781	A	G	4697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=98;PP=2965;SC=GAGAGCTGGTACGGGCTTAAA;SOR=1.343;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=160;TCF=62;TCR=98;TR=160;WE=131915515;WS=131915497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr7	131926112	rs3925378	C	G	338.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5041;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=272;ReadPosRankSum=-0.761;SC=ACATATGCATCCAGGGAGACA;SOR=2.985;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=12;WE=131926120;WS=131926102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,12:0.86:14
chr7	132070054	rs741664	T	C	1493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.17;ReadPosRankSum=-0.102;SOR=0.679;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:201,88:0.30:289
chr7	132409606	rs594208	T	C	5722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=135;NR=55;PP=2965;SC=CAGGGGTGACTCCAACAGCAC;SOR=1.820;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=194;TCF=139;TCR=55;TR=190;WE=132409614;WS=132409596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr7	132719349	rs78193687	G	A	1413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=5.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.44;MQRankSum=-3.221;QD=16.63;ReadPosRankSum=0.834;SOR=0.302;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,64:0.75:85
chr7	132766584	rs11769814	C	G	5981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=113;PP=2965;SC=CCGAGTCCAACCACTGGCCCT;SOR=0.915;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=214;TCF=100;TCR=114;TR=213;WE=132766592;WS=132766574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr7	132990536	rs5887620	C	CT	721.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=0;PP=826;SC=CGTAAGCTCCCTTTGTTAGTA;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=21;WE=132990544;WS=132990526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr7	133682181	rs3735050	T	C	5994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=133;NR=70;PP=2965;SC=CAAAATAATATGTCATTTCAG;SOR=1.473;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=203;TCF=133;TCR=70;TR=203;WE=133682189;WS=133682171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr7	133749164	rs6953296	G	A	7122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=129;NR=105;PP=2965;SC=ACCGCAGCCAGACTGGGGTGG;SOR=0.885;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=235;TCF=129;TCR=106;TR=234;WE=133749172;WS=133749154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr7	133821619	rs13246630	A	G	506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=1;PP=401;SC=TAATATGTATATGTTATCAAC;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=133821627;WS=133821616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr7	133868368	rs1222420	C	T	1793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=13;PP=1251;SC=TATTCTTCTACGCAGGGTCTT;SOR=2.621;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=45;TCR=13;TR=58;WE=133868376;WS=133868358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr7	133868507	rs1222419	C	T	9166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=176;NR=136;PP=2965;SC=GCCTGGATGCCCCTTATCCCA;SOR=0.867;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=312;TCF=176;TCR=136;TR=312;WE=133868515;WS=133868497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,335:1.00:335
chr7	133881919	rs10611703	ATG	A	1111.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.92;QD=35.86;SOR=6.932;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr7	133886356	rs369598961	AT	A	346.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=0.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.91;ReadPosRankSum=1.834;SOR=0.541;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,32:0.27:119
chr7	133933671	rs34245697	G	GT	49.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQRankSum=0.636;QD=1.34;ReadPosRankSum=0.735;SOR=0.395;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,8:0.22:37
chr7	134133291	rs2734653	G	A	3012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.583;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=62;PP=1707;ReadPosRankSum=1.170;SC=GTGGCTACACGCTGATGGGAC;SOR=0.615;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=174;TCF=86;TCR=88;TR=123;WE=134133299;WS=134133281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,134:0.70:191
chr7	134134338	rs71531826	CA	C	338.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.10;ReadPosRankSum=0.985;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,19:0.68:28
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chr7	134136584	rs1732035	A	C	4414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=97;PP=2965;SC=AGCCACCGATACCTGCTGACC;SOR=1.655;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=145;TCF=48;TCR=97;TR=145;WE=134136592;WS=134136574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr7	134217729	rs3735041	A	G	2084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=32;PP=1272;ReadPosRankSum=0.310;SC=TGCAGATTCCAGTAAACTTTT;SOR=0.740;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=131;TCF=86;TCR=45;TR=89;WE=134217737;WS=134217719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,97:0.66:147
chr7	134223127	rs4732035	T	C	746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.410;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=30;PP=600;ReadPosRankSum=-0.452;SC=CATTGTCTTTTGCCCCCTCCC;SOR=2.348;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=57;TCF=5;TCR=52;TR=31;WE=134223135;WS=134223117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,32:0.52:61
chr7	134225788	rs4732036	C	T	2869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.771;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=81;PP=2033;ReadPosRankSum=-1.124;SC=GTTTTTTGTTCTTTCCTGCAG;SOR=0.953;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=184;TCF=64;TCR=120;TR=119;WE=134225796;WS=134225778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,124:0.64:195
chr7	134225827	rs4728329	A	G	1017.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=32;PP=760;ReadPosRankSum=0.404;SC=CTATCCCTTCAATGCAGAATA;SOR=0.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=17;TCR=55;TR=42;WE=134225835;WS=134225817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,43:0.57:76
chr7	134250322	rs4732038	A	C	4513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;MQRankSum=-0.054;NF=98;NR=61;PP=2736;ReadPosRankSum=-0.933;SC=TCTTTGCACAACTTTCTTCTC;SOR=1.101;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=161;TCF=99;TCR=62;TR=159;WE=134250330;WS=134250312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,172:0.99:174
chr7	134254427	rs782538	G	A	1114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=35;PP=926;SC=CCACATTAATGTTTTTATAAT;SOR=5.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=36;WE=134254435;WS=134254417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr7	134261097	rs2161803	C	G	1543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=44;NR=2;PP=1081;SC=CTTTCTGCCCCTAGGGCCAAA;SOR=5.136;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=46;TCF=44;TCR=2;TR=46;WE=134261105;WS=134261087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr7	134261674	rs6979933	C	T	1377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FS=0.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.613;QD=4.46;ReadPosRankSum=-0.323;SOR=0.734;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:226,83:0.27:309
chr7	134262441	rs10241998	T	C	861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.829;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=13;PP=577;ReadPosRankSum=-0.462;SC=TGTATTGGAATTCTTTCCTTT;SOR=0.276;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=140;TCF=109;TCR=31;TR=47;WE=134262449;WS=134262431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,48:0.31:154
chr7	134264233	rs72495463	C	CT	200.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FS=6.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.36;MQRankSum=5.732;QD=1.22;ReadPosRankSum=-0.544;SOR=1.414;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:137,28:0.17:165
chr7	134264286	rs6467538	C	T	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.731;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=23;PP=322;ReadPosRankSum=0.041;SC=ACTTTCCCTTCGATGCAGAAT;SOR=0.240;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=102;TCF=25;TCR=77;TR=31;WE=134264294;WS=134264276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,14:0.22:64
chr7	134576441	rs6953822	T	C	540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.62;ReadPosRankSum=1.447;SOR=0.682;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,26:0.70:37
chr7	134612759	rs11438725	G	GT	4184.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=26;NR=28;PP=2239;SC=CAAAGTCCCGGTTGGTAGTGT;SOR=1.217;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=58;TCF=27;TCR=31;TR=54;WE=134612767;WS=134612749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr7	134618496	rs61757650	G	A	990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.807;NF=14;NR=30;PP=686;ReadPosRankSum=-1.356;SC=AAGGGCAGCAGAGGAGAGGCA;SOR=0.646;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=111;TCF=32;TCR=79;TR=44;WE=134618504;WS=134618486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,45:0.41:111
chr7	134635040	rs7797991	C	T	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=293;ReadPosRankSum=-1.960;SC=GCTGCCTCTCCAACTGTGCTC;SOR=0.646;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=37;TCF=26;TCR=11;TR=21;WE=134635048;WS=134635030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,22:0.52:42
chr7	134645319	rs2230186	C	T	4605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=96;PP=2730;ReadPosRankSum=0.990;SC=TTTCTAGCCGCATCAATGAAT;SOR=0.711;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=283;TCF=146;TCR=137;TR=197;WE=134645327;WS=134645309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,208:0.68:305
chr7	134673958	rs12671813	T	C	839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=5;PP=604;SC=ATTTGAAAACTGTTGGTTTTT;SOR=2.621;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=28;WE=134673966;WS=134673948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr7	134678253	rs2348049	T	A	5150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=116;NR=61;PP=2965;SC=GCTGACTCTTTTGGTGATCCC;SOR=1.313;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=177;TCF=116;TCR=61;TR=177;WE=134678261;WS=134678243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr7	134678523	rs2252826	C	T	1397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=40;PP=1062;SC=TAGAAAACAGCACATTCCAAC;SOR=4.003;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=5;TCR=40;TR=45;WE=134678531;WS=134678513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr7	134694939	rs6958457	T	C	76.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=2;PP=55;SC=GCCACCACGCTCAGCTAATTT;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=134694947;WS=134694929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr7	134701856	rs4236655	G	C	14715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=553;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=265;NR=252;PP=2965;SC=CTTAGAAACGGAACCCCTTTA;SOR=0.708;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=518;TCF=266;TCR=252;TR=517;WE=134701864;WS=134701846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,550:1.00:550
chr7	134719551	rs9656447	C	G	8579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=148;NR=138;PP=2965;SC=TACCCATGCTCAATCCAGATG;SOR=0.719;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=286;TCF=148;TCR=138;TR=286;WE=134719559;WS=134719541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,312:1.00:312
chr7	134730151	rs2348054	G	C	1543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=3;PP=1238;SC=TTTGTTTATAGTGTTTTGCAA;SOR=4.534;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=47;TCR=3;TR=50;WE=134730159;WS=134730141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr7	134730441	rs2348055	A	G	4306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;SC=TTGGGGTTTTAGCACTTAATT;SOR=2.006;Source=Platypus;TCF=41;WE=134730449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr7	134744060	rs146909058	CA	C	1230.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.507;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.868;NF=1;NR=30;PP=467;ReadPosRankSum=-0.748;SC=AATAATCAGGCAAAAAAAATT;SOR=0.527;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=83;TCF=3;TCR=80;TR=31;WE=134744068;WS=134744050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,60:0.47:128
chr7	134849280	rs292501	T	A	11508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=431;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=223;NR=169;PP=2965;SC=GCCTGATGTTTTACGCTCTTC;SOR=1.005;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=393;TCF=223;TCR=170;TR=392;WE=134849288;WS=134849270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,431:1.00:431
chr7	134852432	rs292505	C	T	2475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=23;PP=1701;SC=AGGGTCTAGCCTCTGCCCATG;SOR=1.927;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=82;TCF=59;TCR=23;TR=81;WE=134852440;WS=134852422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr7	134878237	rs2278128	G	C	2992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=65;PP=2164;SC=ATCCTGCACAGGAGATGGGGC;SOR=1.679;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=30;TCR=65;TR=95;WE=134878245;WS=134878227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr7	134882680	rs292582	A	G	6672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=134;NR=91;PP=2965;SC=AGAAGAGAAGACCCCCCACAG;SOR=1.091;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=225;TCF=134;TCR=91;TR=225;WE=134882701;WS=134882670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr7	134882693	rs292583	T	C	7784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=151;NR=108;PP=2965;SC=CCCCACAGTGTTCCTCAGTAG;SOR=1.009;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=259;TCF=151;TCR=108;TR=259;WE=134882701;WS=134882670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,281:1.00:281
chr7	134891961	rs2278130	G	A	12169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=437;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=195;NR=206;PP=2965;SC=ACTGGTGCACGAAGTTAAAGA;SOR=0.789;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=401;TCF=195;TCR=206;TR=401;WE=134891969;WS=134891951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,436:1.00:436
chr7	134896383	rs292602	T	C	989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=30;PP=712;SC=CCGCACGCACTGGGCGACCAG;SOR=4.294;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=33;WE=134896391;WS=134896373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr7	134925241	rs34330846	C	CA	4089.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.548;HP=10;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=78;PP=1780;ReadPosRankSum=0.566;SC=TTATCTAGGGCAAAAAAAAAA;SOR=0.877;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=196;TCF=73;TCR=123;TR=126;WE=134925249;WS=134925230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,182:0.79:231
chr7	134925411	rs7805859	G	A	14058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=521;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=215;NR=257;PP=2965;SC=CCCTGGCAGCGCTCTTCAACA;SOR=0.950;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=473;TCF=216;TCR=257;TR=472;WE=134925419;WS=134925401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,520:1.00:520
chr7	134928033	rs62481958	G	T	6095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=130;NR=81;PP=2965;SC=CTCAACAGAGGCCTGACTTTT;SOR=1.262;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=211;TCF=130;TCR=81;TR=211;WE=134928041;WS=134928023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr7	134930169	rs113633449	A	AGAG	4169.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.85;MQRankSum=0.371;QD=42.55;ReadPosRankSum=1.114;SOR=2.045;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,97:0.99:98
chr7	134939767	rs17168332	G	T	2429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=5;PP=1837;SC=ACATGTGCTTGGTTCATACTG;SOR=4.949;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=65;TCR=5;TR=70;WE=134939775;WS=134939757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr7	134943057	rs11979450	C	T	1274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=2;PP=1007;SC=GCGGAAGAGACGTAGGATAGA;SOR=5.186;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=39;TCF=37;TCR=2;TR=39;WE=134943065;WS=134943047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr7	134943087	rs11979453	C	G	2460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=17;PP=1745;SC=CTGGGCACACCGGAGATGCAG;SOR=2.636;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=66;TCR=17;TR=83;WE=134943095;WS=134943077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr7	134943116	rs11979480	C	G	4379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=93;NR=48;PP=2950;SC=CTATCTGCCTCGGGCCCAAGA;SOR=1.504;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=93;TCR=48;TR=141;WE=134943124;WS=134943106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr7	134943328	rs58802664	C	T	1454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=39;PP=1092;SC=GTTGCACCTGCCTTGGCCTCC;SOR=3.126;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=8;TCR=39;TR=47;WE=134943336;WS=134943318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr7	134961821	rs13235457	A	G	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.696;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=163;ReadPosRankSum=1.172;SC=AATTATGGGTAACAACTTTGA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=9;WE=134961829;WS=134961811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,9:0.29:31
chr7	134962043	rs10239950	C	G	9035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=152;NR=162;PP=2965;SC=GGCCACTAGGCAGTTAGTTGG;SOR=0.799;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=314;TCF=152;TCR=162;TR=314;WE=134962051;WS=134962033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,337:1.00:337
chr7	134968479	rs11762990	A	C	6406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=385;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.370;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=109;NR=156;PP=2962;ReadPosRankSum=1.017;SC=TGAAGGTGGAACTCAATTAAC;SOR=0.780;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=361;TCF=152;TCR=209;TR=265;WE=134968487;WS=134968469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,279:0.72:385
chr7	135047703	rs6969632	T	C	3822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=54;NR=84;PP=2164;SC=GTCTGAAGGCTGTCTGAAAGC;SOR=1.298;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=139;TCF=54;TCR=85;TR=138;WE=135047711;WS=135047693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr7	135048804	rs3812265	C	T	4842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.05;MQRankSum=0.150;QD=23.97;ReadPosRankSum=3.161;SOR=0.842;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,200:0.99:202
chr7	135083052	rs376120582	G	GA	326.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=3;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=0;NR=19;PP=200;SC=CTCCTCAAAAGAAAAAAAAAA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=135083060;WS=135083042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr7	135095270	rs2696877	A	G	1922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=22;PP=1122;SC=CTTACGTATCATACCTCTGCA;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=44;TCR=22;TR=66;WE=135095278;WS=135095260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr7	135123060	rs17480616	G	C	3701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=79;PP=2236;ReadPosRankSum=-0.805;SC=GTCTTCCTTCGCATCAGGACT;SOR=0.667;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=217;TCF=94;TCR=123;TR=142;WE=135123068;WS=135123050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,163:0.68:240
chr7	135256027	.	AT	A	56.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=0.000;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=3.411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.18;MQRankSum=1.769;QD=1.83;ReadPosRankSum=0.974;SOR=0.114;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,8:0.26:31
chr7	135272535	rs35616673	C	CT	3925.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.175;NF=28;NR=70;PP=1623;ReadPosRankSum=-1.628;SC=TTTAAATGTCCTTTTTTTTAT;SOR=0.349;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=130;TCF=34;TCR=96;TR=98;WE=135272543;WS=135272525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,143:0.99:144
chr7	135285788	rs4296989	T	C	356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=267;SC=CTATGTTATATATAAATTAAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=135285796;WS=135285778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr7	135304273	rs7810767	G	C	5415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=105;NR=68;PP=2965;SC=TGAACAGAAGGAAACATCAGT;SOR=1.064;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=173;TCF=105;TCR=68;TR=173;WE=135304281;WS=135304263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr7	135357476	rs3110823	A	C	2092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=2;PP=1595;SC=CATGCACTATAACTCTTACTG;SOR=5.421;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=56;TCF=54;TCR=2;TR=56;WE=135357484;WS=135357466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr7	135376893	rs3112335	C	T	356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=1;PP=253;SC=AACCCCAGACCGGGACTCCAA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=135376901;WS=135376884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr7	135387473	rs3112345	A	G	4012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=88;NR=48;PP=2645;SC=CCTCACTGAAAGGAACTCTAA;SOR=1.394;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=138;TCF=89;TCR=49;TR=136;WE=135387481;WS=135387463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr7	135387495	rs3112346	A	G	5051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=109;NR=65;PP=2965;SC=GTGGATCTGTAGCTGTTGAAA;SOR=1.235;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=174;TCF=109;TCR=65;TR=174;WE=135387503;WS=135387485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr7	135387656	rs3112347	G	A	4427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=86;PP=2815;SC=GAGGACACAGGAGCCACGTCA;SOR=1.267;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=142;TCF=56;TCR=86;TR=142;WE=135387664;WS=135387646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr7	135392876	rs3110800	T	C	10129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=375;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=201;NR=146;PP=2965;SC=CCGGCTTGGCTCCGGCCATCA;SOR=0.935;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=347;TCF=201;TCR=146;TR=347;WE=135392884;WS=135392866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,375:1.00:375
chr7	135406176	rs4596594	A	G	1305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FS=7.826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.12;ReadPosRankSum=-1.215;SOR=1.036;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:231,86:0.27:317
chr7	135406330	rs111545354	G	A	752.84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5064;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=24;PP=575;ReadPosRankSum=-0.197;SC=CTGAGCGTCCGGATGCAACCC;SOR=0.990;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=27;WE=135406338;WS=135406320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,28:0.88:32
chr7	135412273	rs3112369	T	C	5331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=76;PP=2851;SC=AGCTCGTCCTTGGACCCCGCT;SOR=0.982;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=185;TCF=109;TCR=76;TR=185;WE=135412281;WS=135412263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr7	135413626	rs3807338	C	T	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FS=0.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.93;ReadPosRankSum=-0.204;SOR=0.574;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:137,45:0.25:182
chr7	135421790	rs4338044	A	G	1083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.312;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=18;PP=649;ReadPosRankSum=0.033;SC=CAAAAAAGATAGAGAAAGTGC;SOR=0.829;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=148;TCF=88;TCR=60;TR=50;WE=135421798;WS=135421780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,57:0.35:162
chr7	135614740	rs17168527	T	C	5098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.978;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=100;PP=2962;ReadPosRankSum=2.812;SC=CATCTGGGCCTTTCACAGTCT;SOR=0.791;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=270;TCF=134;TCR=136;TR=197;WE=135614748;WS=135614730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,221:0.72:306
chr7	136588109	rs6963819	G	A	1558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.690;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=42;PP=994;ReadPosRankSum=1.702;SC=TCAAAAGGAAGTCTTACTCTT;SOR=1.210;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=81;TCF=29;TCR=52;TR=63;WE=136588117;WS=136588099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,65:0.77:84
chr7	136921062	rs322295	C	T	788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FS=2.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.83;ReadPosRankSum=-0.145;SOR=0.876;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:154,52:0.25:206
chr7	136939582	rs1162122	G	T	8651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=175;NR=115;PP=2965;SC=TGAAGCATCTGGCCTTCAGAA;SOR=1.085;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=291;TCF=175;TCR=116;TR=290;WE=136939590;WS=136939572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,322:1.00:322
chr7	137076100	.	GA	G	35.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.998;ClippingRankSum=0.000;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=0.000;QD=0.39;ReadPosRankSum=0.011;SOR=0.578;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,15:0.16:91
chr7	137082039	rs2241443	T	C	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=182;ReadPosRankSum=0.655;SC=AAATTACCTATGATATGCTCT;SOR=0.780;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=47;TCF=35;TCR=12;TR=17;WE=137082047;WS=137082029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,19:0.38:50
chr7	137092745	rs3217275	CA	C	5299.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=101;PP=2951;SC=CTATTAGCTGCAAAGAGAGAC;SOR=1.997;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=108;TCF=4;TCR=104;TR=104;WE=137092753;WS=137092735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr7	137092781	rs7800454	T	C	2101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=52;PP=1586;SC=CAGGCAGAATTCGGAACAAGG;SOR=3.160;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=11;TCR=52;TR=63;WE=137092789;WS=137092771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr7	137097086	rs1731959	G	C	1496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=34;PP=1011;SC=ATATCTTGGTGAAGCAGACCG;SOR=5.330;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=36;WE=137097094;WS=137097076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr7	137154572	rs2293546	T	C	1083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=39;PP=928;SC=AAAATTAGCATGAGGTTTTTA;SOR=5.943;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=2;TCR=39;TR=41;WE=137154580;WS=137154562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr7	137304765	.	GCA	G	102	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;FR=0.9999;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=19;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=102;QD=35.0;SC=ATGTACACACGCACACACACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=3;WE=137304774;WS=137304755;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,3:0.43:7
chr7	137531147	rs71815938	GT	G	12583.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=66;NR=119;PP=2951;SC=CCCTTGCTGGGTAGAAGAGTG;SOR=1.197;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=200;TCF=71;TCR=129;TR=185;WE=137531155;WS=137531137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,318:1.00:318
chr7	137563914	.	T	TA	166.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.734;ClippingRankSum=0.000;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=11.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.62;ReadPosRankSum=0.080;SOR=1.540;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,19:0.18:103
chr7	137567448	rs145304675	C	T	946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.645;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=26;PP=615;ReadPosRankSum=-1.271;SC=ACTCCAGGTGCTCAGGGCTGG;SOR=0.237;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=59;TCF=14;TCR=45;TR=37;WE=137567456;WS=137567438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,41:0.65:63
chr7	137590369	rs273968	G	A	3208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=43;PP=1986;SC=AGTGCTGGCCGTTGGGAAGGC;SOR=1.227;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=68;TCR=43;TR=110;WE=137590377;WS=137590359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr7	137600690	rs273957	C	T	5035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=80;PP=2729;SC=TCGTCTGTAACTGGCTCTGTC;SOR=0.826;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=158;TCF=78;TCR=80;TR=158;WE=137600698;WS=137600680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr7	137607183	.	CGT	C	258	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=1;HapScore=4;MGOF=52;MMLQ=27;MQ=58.8;NF=6;NR=0;PP=258;QD=50.1666666667;SC=TATATATATACGTATATATAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=6;WE=137607195;WS=137607182;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,6:0.86:7
chr7	137607187	.	T	C	111	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.6265;HP=2;HapScore=4;MGOF=52;MMLQ=27;MQ=58.95;NF=5;NR=0;PP=111;QD=29.1542425094;SC=TATATACGTATATATATATAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=5;WE=137607195;WS=137607182;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:3,5:0.62:8
chr7	137607217	.	C	T	726	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MMLQ=26;MQ=59.43;NF=25;NR=3;PP=726;QD=27.1704004481;SC=TATATATATACACACATATAT;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=28;WE=137607242;WS=137607207;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:7,28:0.80:35
chr7	137607233	.	C	T	1364	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MMLQ=27;MQ=59.69;NF=49;NR=9;PP=1364;QD=24.1167450439;SC=TATATATATACACACACACAC;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=63;TCF=53;TCR=10;TR=58;WE=137607242;WS=137607207;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,58:0.92:63
chr7	137612913	rs66593747	CTGG	C	2122.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=10;PP=1649;SC=GAAGCTGTCACTGGTGGTAAT;SOR=2.400;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=41;TCF=31;TCR=10;TR=35;WE=137612923;WS=137612903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
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chr7	137773291	rs2120846	T	G	2311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=449;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=55;PP=1466;ReadPosRankSum=0.121;SC=GATTAATGATTATTAAAGGAA;SOR=0.723;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=423;TCF=237;TCR=186;TR=126;WE=137773299;WS=137773281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:310,138:0.31:448
chr7	137773563	rs2166188	T	G	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.641;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=144;ReadPosRankSum=0.430;SC=AAGGTTTCAGTTGTTCATTTT;SOR=0.317;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=13;WE=137773571;WS=137773553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,14:0.40:35
chr7	137782593	.	CTTT	C	220.90	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.147;ClippingRankSum=0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.08;ReadPosRankSum=-1.430;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,10:0.91:11
chr7	137798593	rs2306847	A	T	6358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=138;PP=2965;SC=AAGGCTCATAAGAACCCTGAC;SOR=1.404;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=216;TCF=78;TCR=138;TR=216;WE=137798601;WS=137798583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr7	137801413	rs1872929	A	C	7054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=130;NR=133;PP=2965;ReadPosRankSum=1.650;SC=TACTGACTGCAGGGAGTTCCT;SOR=0.768;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=266;TCF=132;TCR=134;TR=263;WE=137801421;WS=137801402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,274:0.99:276
chr7	137801444	rs1872930	C	T	7328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=122;NR=136;PP=2965;SC=TTCACTCCCACGAGTGCCAAG;SOR=0.833;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=259;TCF=123;TCR=136;TR=258;WE=137801452;WS=137801434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,272:1.00:272
chr7	138145778	rs112619223	C	T	1061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.221;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=14;PP=668;ReadPosRankSum=1.045;SC=GGGGGAGGGGCGAGCAGGAGG;SOR=0.150;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=55;TCF=40;TCR=15;TR=42;WE=138145786;WS=138145768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,44:0.75:59
chr7	138188932	rs10488642	A	G	1331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=0;PP=1051;SC=TGAATTTAAAAAGAATGGACA;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=36;WE=138188940;WS=138188930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr7	138200117	rs3757381	A	T	3504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=82;PP=2388;SC=AATAAATGAGATCTTTGCATT;SOR=2.283;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=111;TCF=29;TCR=82;TR=110;WE=138200125;WS=138200107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr7	138229990	rs6959574	G	A	1493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=7;PP=1151;SC=TCTTCCTGGCGTGGAGGCACC;SOR=3.442;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=43;TCR=7;TR=50;WE=138229998;WS=138229980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr7	138261319	rs59147816	TAAC	T	315.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.495;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.396;NF=0;NR=9;PP=337;ReadPosRankSum=0.150;SC=AAAATTTTAATAACTACTATA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=9;WE=138261329;WS=138261309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr7	138265310	rs33935215	A	G	2673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=482;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.95;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=65;PP=1671;ReadPosRankSum=0.481;SC=CTAACAGTGGAGAGTGGATTT;SOR=0.681;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=437;TCF=232;TCR=205;TR=138;WE=138265318;WS=138265300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:331,149:0.31:480
chr7	138268563	rs3213902	A	G	942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=0;PP=807;SC=GAATTTAGCTATTTGTATTAT;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=27;WE=138268571;WS=138268553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr7	138279228	rs1439793	A	T	2038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=18;PP=1342;ReadPosRankSum=1.547;SC=ATATGCCTTTAAAAAAAAAAT;SOR=0.896;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=69;TCF=51;TCR=18;TR=68;WE=138279236;WS=138279218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,73:0.99:74
chr7	138281355	rs1659832	A	G	1282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=35;PP=968;SC=GAGAAAATACAGATTCACTTC;SOR=4.073;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=4;TCR=35;TR=39;WE=138281363;WS=138281345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr7	138281906	rs1659831	T	C	8907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=138;NR=157;PP=2965;SC=TCTCATACTTTAGTTTCTCTT;SOR=0.841;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=296;TCF=138;TCR=158;TR=295;WE=138281914;WS=138281896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,316:1.00:316
chr7	138305743	rs3734946	A	T	2404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=49;PP=1507;ReadPosRankSum=0.690;SC=GGTTCCTCTTACCCCCTCTCT;SOR=0.663;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=162;TCF=91;TCR=71;TR=107;WE=138305751;WS=138305733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,113:0.63:179
chr7	138305782	rs3734945	T	C	2622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.133;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=56;PP=1386;ReadPosRankSum=1.744;SC=GCAGGGTCCTTGGCTGTACCT;SOR=0.693;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=180;TCF=96;TCR=84;TR=115;WE=138305790;WS=138305772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,125:0.63:199
chr7	138310629	rs1673162	G	A	12761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=479;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=239;NR=202;PP=2965;SC=GTCAACAGAAGCCAGGCATGC;SOR=0.870;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=444;TCF=241;TCR=203;TR=441;WE=138310637;WS=138310619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,477:1.00:477
chr7	138312122	rs2305816	A	C	6965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=134;NR=91;PP=2965;SC=GAGGAGAAGGAAGAATAAAGC;SOR=1.138;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=225;TCF=134;TCR=91;TR=225;WE=138312130;WS=138312112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr7	138333933	rs58569190	GA	G	1452.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.437;HP=11;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.453;NF=0;NR=64;PP=978;ReadPosRankSum=-1.330;SC=TTATGACAATGAAAAAAAAAA;SOR=2.572;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=87;TCF=1;TCR=86;TR=64;WE=138333942;WS=138333922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:5,68:0.93:73
chr7	138356659	rs5887893	AG	A	1028.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.73;SOR=6.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr7	138356662	rs5011821	G	A	1172.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=50.99;SOR=6.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr7	138356663	rs5011820	G	C	1172.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.11;SOR=6.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr7	138356664	rs5887894	C	CA	1132.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.31;SOR=6.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr7	138356730	rs202122915	T	TG	4129.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.40;SOR=1.557;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr7	138356732	.	CTG	GCT	1539	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=52;NR=25;PP=1539;QD=20.8112711021;SC=CCCTCAGTTGCTGTGTTCACG;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=88;TCF=59;TCR=29;TR=77;WE=138356742;WS=138356722;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:11,77:0.88:88
chr7	138356733	rs5887896	TG	T	4129.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.41;SOR=1.661;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr7	138417718	rs3807154	A	G	7915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=169;NR=107;PP=2965;SC=GCTGAGATACATGGACGTCAA;SOR=1.079;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=276;TCF=169;TCR=107;TR=276;WE=138417726;WS=138417708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,302:1.00:302
chr7	138418910	rs1026435	G	A	2980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=659;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.54;ReadPosRankSum=1.018;SOR=0.694;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:471,186:0.28:657
chr7	138419085	rs1037692	A	G	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=3.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.581;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=220;ReadPosRankSum=-0.395;SC=AACTTTCCCTAAGCAAACCGC;SOR=1.384;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=3;TCR=46;TR=13;WE=138419093;WS=138419075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,15:0.28:54
chr7	138429823	rs55843107	C	T	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=1.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.61;ReadPosRankSum=-1.433;SOR=0.293;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,10:0.26:39
chr7	138440607	rs296911	G	A	2107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.434;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=57;PP=1234;ReadPosRankSum=-0.165;SC=CTAAGACATCGTTTGCTGACT;SOR=0.649;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=281;TCF=126;TCR=155;TR=104;WE=138440615;WS=138440597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:190,113:0.37:303
chr7	138441124	rs296910	A	G	1973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.440;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=41;PP=1238;ReadPosRankSum=-0.088;SC=AGCCACAGTCATGTGCATTTG;SOR=0.636;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=291;TCF=181;TCR=110;TR=106;WE=138441132;WS=138441114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:199,111:0.36:310
chr7	138453892	rs200396435	GAAA	G,GA	1997.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=31.71;SOR=0.668;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:1,29,33:0.46,0.52:63
chr7	138455988	rs10258719	A	G	7640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=112;NR=139;PP=2965;SC=AAACACAGACACCATCTTGGC;SOR=1.051;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=251;TCF=112;TCR=139;TR=251;WE=138455996;WS=138455978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,277:1.00:277
chr7	138485954	rs6945259	G	T	2172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.017;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=18;PP=1453;ReadPosRankSum=0.651;SC=ATGCCCATGCGGGAGCTTCTA;SOR=0.551;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=105;TCF=84;TCR=21;TR=79;WE=138485962;WS=138485944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,85:0.77:111
chr7	138486096	rs61729750	G	C	7913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=494;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.571;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=154;NR=180;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.050;SC=AACAGCTCAAGCTTGACCGCT;SOR=0.748;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=471;TCF=221;TCR=250;TR=334;WE=138486104;WS=138486086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,346:0.70:492
chr7	138555816	rs35334186	GC	G	820.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.489;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.192;NF=14;NR=7;PP=457;ReadPosRankSum=-1.341;SC=GCCTGCCTTGGCCCCCCCAAG;SOR=1.232;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=40;TCF=24;TCR=16;TR=21;WE=138555824;WS=138555806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,33:0.60:55
chr7	138583840	rs7802841	C	A	1726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=46;PP=1165;ReadPosRankSum=1.771;SC=TGAGCTGTACCGGATTGTCAT;SOR=0.701;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=300;TCF=151;TCR=149;TR=93;WE=138583848;WS=138583830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:232,99:0.30:331
chr7	138588538	.	AGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	A	238.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=0.000;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.31;MQRankSum=0.000;QD=9.55;ReadPosRankSum=-1.669;SOR=1.880;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr7	138596064	rs6969074	G	A	1479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.277;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=43;PP=953;ReadPosRankSum=-0.958;SC=TAAATAGTTCGTAAACCTAGG;SOR=1.165;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=91;TCF=20;TCR=71;TR=53;WE=138596072;WS=138596054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,62:0.58:107
chr7	138597036	rs3735013	A	G	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.390;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=330;ReadPosRankSum=-0.420;SC=TTCCATGGCCATAATCACCTG;SOR=1.584;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=36;TCF=34;TCR=2;TR=20;WE=138597044;WS=138597026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr7	138601473	rs1958658	C	T	3159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=48;PP=2024;ReadPosRankSum=-0.555;SC=CCCAGAGAGGCGGCAGGAAGC;SOR=0.731;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=180;TCF=116;TCR=64;TR=132;WE=138601481;WS=138601463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,139:0.73:191
chr7	138601826	rs2251220	G	A	5964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=433;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=136;NR=113;PP=2962;ReadPosRankSum=0.797;SC=AGAAACAAACGAGGATCCTGA;SOR=0.707;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=404;TCF=221;TCR=183;TR=249;WE=138601834;WS=138601816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,267:0.62:433
chr7	138602417	rs2774960	G	A	5351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.992;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=122;PP=2962;ReadPosRankSum=0.739;SC=CAAGTCACTCGGCATCAGAGA;SOR=0.886;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=332;TCF=157;TCR=175;TR=223;WE=138602425;WS=138602407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,231:0.65:355
chr7	138602523	rs2774962	T	C	6582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=453;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.550;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=153;NR=130;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.468;SC=AAAGCACCTCTGGGTTTATGC;SOR=0.750;SbPval=0.53;Source=Platypus;TCF=229;TR=283;WE=138602531;WS=138602513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,300:0.66:453
chr7	138602916	rs2718131	G	C	4821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=344;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.344;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=109;PP=2793;ReadPosRankSum=1.373;SC=GGTCTGGAGGGGAAAAGCGTA;SOR=0.761;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=320;TCF=158;TCR=162;TR=213;WE=138602924;WS=138602906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,225:0.65:344
chr7	138707177	rs10249949	G	A	1520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.78;SOR=0.796;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr7	138713715	rs11767739	G	C	4919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=67;NR=104;PP=2965;SC=ACCTGGTACAGAAATGAGGGA;SOR=1.312;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=174;TCF=67;TCR=107;TR=171;WE=138713723;WS=138713705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr7	138719194	rs10713373	AG	A	7621.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=77;NR=60;PP=2951;SC=GTTGCTTCGAAGGCAATTAAA;SOR=1.679;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=147;TCF=81;TCR=66;TR=137;WE=138719202;WS=138719184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr7	138719231	rs7810237	T	C	10105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=379;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=208;NR=144;PP=2965;SC=AAAAGAAAAATAAATGGGGAA;SOR=1.053;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=352;TCF=208;TCR=144;TR=352;WE=138719239;WS=138719221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,379:1.00:379
chr7	138732274	rs3087999	C	G	6070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=125;NR=75;PP=2965;SC=CTCCTGTCTGCGGCAATTTAG;SOR=1.259;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=200;TCF=125;TCR=75;TR=200;WE=138732282;WS=138732264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr7	138732457	rs3735008	G	A	16060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=597;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=268;NR=284;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.482;SC=CACAGCTGTCGAACTGTGGAG;SOR=0.767;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=554;TCF=269;TCR=285;TR=552;WE=138732465;WS=138732446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,591:1.00:593
chr7	138732497	rs3735007	G	A	15168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=566;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=248;NR=284;PP=2965;SC=ATTTCCTTCAGTAAACTTTCC;SOR=0.877;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=532;TCF=248;TCR=284;TR=532;WE=138732505;WS=138732487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,566:1.00:566
chr7	138739816	rs10261597	C	G	756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=0;PP=542;SC=GATTACAGGGCTGAGCCACTG;SOR=4.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=138739824;WS=138739815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr7	138740037	rs2297236	G	C	7519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=111;NR=127;PP=2965;SC=TTTGCTGGCTGATGGCTACAA;SOR=0.917;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=238;TCF=111;TCR=127;TR=238;WE=138740045;WS=138740027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr7	138740186	rs2297237	A	G	1841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.86;SOR=2.636;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr7	138740195	rs2297238	T	G	1693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.78;SOR=2.774;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr7	138740224	rs2297239	T	C	858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=66;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=25;PP=731;SC=ATCATGTCTTTTAAAAATGCT;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=138740232;WS=138740214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr7	138740240	rs2297240	T	C	463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=83;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=14;PP=408;SC=ATGCTGCAACTATTCATAATC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=138740248;WS=138740230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr7	138862832	rs73170918	A	C	942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.542;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=7;PP=740;ReadPosRankSum=0.619;SC=GAAAATGTATAATGTCAGAAT;SOR=0.402;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=52;TCF=44;TCR=8;TR=36;WE=138862840;WS=138862822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,36:0.68:53
chr7	138957240	.	TTATG	T	899.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.513;ClippingRankSum=0.000;DP=148;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.36;MQRankSum=1.334;QD=29.02;ReadPosRankSum=0.730;SOR=2.376;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,24:0.77:31
chr7	139026152	rs10265	T	G	4949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.569;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=126;NR=75;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.125;SC=AGGGTCCCCGTCGCACACTTT;SOR=0.550;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=315;TCF=200;TCR=115;TR=201;WE=139026160;WS=139026142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,218:0.65:333
chr7	139077240	rs4732370	C	A	1168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.751;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=26;PP=675;ReadPosRankSum=-1.159;SC=TTATTTGGTCCACATTTCATG;SOR=0.755;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=92;TCF=48;TCR=44;TR=49;WE=139077248;WS=139077230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,55:0.56:99
chr7	139077317	rs4732371	T	A	537.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=305;ReadPosRankSum=-0.241;SC=AAGCATTTTTTAAAAAATCTA;SOR=0.627;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=56;TCF=22;TCR=34;TR=26;WE=139077325;WS=139077307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,29:0.48:61
chr7	139094364	rs368249579	AAG	A	68.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.26;ReadPosRankSum=0.331;SOR=0.732;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:239,26:0.10:265
chr7	139097283	rs200596529	T	C	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=5.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.02;ReadPosRankSum=-0.371;SOR=1.409;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,51:0.55:93
chr7	139102490	rs3778931	A	G	3583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.05;ReadPosRankSum=-1.117;SOR=0.661;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,94:0.63:149
chr7	139102498	rs73154180	A	T	3285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.16;ReadPosRankSum=-0.262;SOR=0.683;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,83:0.61:136
chr7	139102555	rs73154181	T	C	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.153;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=313;ReadPosRankSum=-0.757;SC=TACTTATGTTTAGAGTTCAGA;SOR=2.419;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=14;WE=139102563;WS=139102545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr7	139138551	rs10954649	C	T	1151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=25;PP=709;SC=TCACCTCTACCGGCCTGGGCA;SOR=3.145;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=30;WE=139138559;WS=139138541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr7	139138871	rs11763327	T	G	3636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=60;NR=58;PP=2192;SC=GGGGCGGGAGTGGGGCCTCGT;SOR=0.708;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=119;TCF=61;TCR=58;TR=118;WE=139138879;WS=139138861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr7	139138950	rs17160911	C	G	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=0.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.81;ReadPosRankSum=-1.275;SOR=0.817;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,33:0.26:125
chr7	139164345	rs12707445	C	A	3548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.015;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=80;PP=2112;ReadPosRankSum=-1.364;SC=AGATCTGTACCCCCTTAGATT;SOR=0.575;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=269;TCF=143;TCR=126;TR=164;WE=139164353;WS=139164335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,169:0.60:283
chr7	139167934	rs1860150	T	G	3583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=39;PP=2001;SC=CACCGGCACCTTGAGGAAGCG;SOR=1.256;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=78;TCR=39;TR=117;WE=139167942;WS=139167924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr7	139168063	rs12707447	G	A	4930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=84;PP=2737;SC=AGCCCCGGGCGCCTCGCCATT;SOR=0.947;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=163;TCF=79;TCR=84;TR=163;WE=139168071;WS=139168053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr7	139221155	rs373884806	T	C	5822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=385;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.296;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=100;NR=134;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.372;SC=TAAAAGCACGTCTAATTAGTT;SOR=0.611;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=352;TCF=146;TCR=206;TR=234;WE=139221163;WS=139221145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,257:0.67:385
chr7	139480534	rs147632378	CT	C	5834.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=627;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.173;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.452;NF=19;NR=93;PP=2948;ReadPosRankSum=0.018;SC=CTCATCTTTCCTTAGGCTCAC;SOR=0.597;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=355;TCF=75;TCR=280;TR=112;WE=139480542;WS=139480524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:415,208:0.33:623
chr7	139605869	rs35857550	CT	C	149.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=9.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.13;MQRankSum=1.613;QD=2.88;ReadPosRankSum=0.233;SOR=0.829;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,15:0.29:52
chr7	139653196	rs5768	A	C	9254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=162;NR=148;PP=2965;SC=AAGCCTGCGAACTTCTCCTGG;SOR=0.773;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=310;TCF=162;TCR=148;TR=310;WE=139653204;WS=139653186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,337:1.00:337
chr7	139716145	rs10234812	T	A	1583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.84;ReadPosRankSum=0.600;SOR=0.529;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,69:0.69:100
chr7	139724169	rs13760	A	G	766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=4;PP=566;SC=CTTCTGGTTAATCCACTAGTG;SOR=3.014;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=139724177;WS=139724159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr7	139724358	rs2269996	G	A	1570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.557;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=33;PP=946;ReadPosRankSum=-1.982;SC=ACTCCTGTGCGCTCACTGTCG;SOR=0.805;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=254;TCF=142;TCR=112;TR=79;WE=139724366;WS=139724348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:187,88:0.32:275
chr7	139724555	rs3735352	C	T	2418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=391;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.745;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=60;PP=1441;ReadPosRankSum=0.207;SC=CCTTGGCCGGCGGACGGACAA;SOR=0.598;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=355;TCF=176;TCR=179;TR=120;WE=139724563;WS=139724545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:259,132:0.34:391
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chr7	139762273	rs737321	A	G	5178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.26;SOR=1.159;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
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chr7	139813249	rs138557624	TGTGGCATAAAACACA	T	2631.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.758;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.115;NF=21;NR=39;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.283;SC=TTCCTAATCTTGTGGCATAAA;SOR=0.963;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=123;TCF=37;TCR=86;TR=60;WE=139813271;WS=139813238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,120:0.53:225
chr7	139833527	.	A	C	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.631;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=5.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.35;ReadPosRankSum=-1.714;SOR=2.215;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
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chr7	140037053	rs11331602	CT	C	1161.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=4.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.77;ReadPosRankSum=0.540;SOR=0.336;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,65:0.71:91
chr7	140043373	rs11772729	T	C	1307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.557;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=36;PP=834;ReadPosRankSum=-0.698;SC=CCTGAAGTCATAAACAGGTTC;SOR=0.749;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=174;TCF=81;TCR=93;TR=65;WE=140043381;WS=140043363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,69:0.37:187
chr7	140044979	rs6974016	C	T	2100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=447;ExcessHet=3.0103;FS=1.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.71;ReadPosRankSum=0.151;SOR=0.785;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:313,133:0.30:446
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chr7	140051848	rs12665885	C	T	5439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=97;NR=93;PP=2965;SC=ATAGAAGGGGCGGCTTCTCCT;SOR=0.743;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=190;TCF=97;TCR=93;TR=190;WE=140051856;WS=140051838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr7	140069361	rs4448174	G	C	7215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=151;NR=103;PP=2965;SC=TTTTTCTTTAGCTTTAAGCCC;SOR=1.129;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=255;TCF=151;TCR=104;TR=254;WE=140069369;WS=140069351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,272:1.00:272
chr7	140080087	rs62490396	C	G	9266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=343;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=164;NR=151;PP=2965;SC=CTTACCTCCACAGGCAGCTCA;SOR=0.699;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=316;TCF=164;TCR=152;TR=315;WE=140080095;WS=140080077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,341:1.00:341
chr7	140082363	rs6968618	G	A	7153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=144;PP=2965;ReadPosRankSum=0.072;SC=TTGACCTTAAGGTTTGGATGA;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=244;TCF=99;TCR=145;TR=242;WE=140082371;WS=140082353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,258:0.99:260
chr7	140110677	rs2971690	G	A	4722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=123;NR=40;PP=2965;SC=GTGAGAGGCTGTGTGAATTGG;SOR=2.247;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=164;TCF=124;TCR=40;TR=163;WE=140110685;WS=140110667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr7	140111486	rs2948389	A	T	390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=267;SC=TCCCCAACCAAGGAGGATATC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=140111494;WS=140111476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr7	140111509	rs2971688	G	C	729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=4;PP=503;SC=AGTCATCCAGGGAGCAACTGA;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=22;WE=140111517;WS=140111499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr7	140125524	.	C	CAA	68	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5003;HP=11;HapScore=3;MGOF=15;MMLQ=27;MQ=58.84;NF=7;NR=0;PP=68;QD=11.0;SC=AACTCCATCTCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=7;WE=140125532;WS=140125521;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:9,7:0.44:16
chr7	140158851	rs2272095	C	G	7585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=481;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.932;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=137;NR=176;PP=2962;ReadPosRankSum=0.889;SC=GGATGCAGGACCTGCAGCCCA;SOR=0.532;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=453;TCF=194;TCR=259;TR=313;WE=140158859;WS=140158841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,333:0.69:480
chr7	140159798	rs11763850	A	G	1097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=4.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.244;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=36;PP=860;ReadPosRankSum=0.495;SC=TGTAATCCCAACAGTTTGGGA;SOR=2.989;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=60;TCF=11;TCR=49;TR=40;WE=140159806;WS=140159788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,41:0.67:61
chr7	140173170	rs79453306	A	G	5392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.506;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=119;PP=2962;ReadPosRankSum=1.225;SC=GAATCCCCCTACTGCTGTGCC;SOR=0.810;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=297;TCF=140;TCR=157;TR=222;WE=140173178;WS=140173160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,230:0.72:318
chr7	140218464	rs6852	C	A	1471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.161;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=24;PP=967;ReadPosRankSum=-1.232;SC=GTTTTTAAAGCATAGGGCTGC;SOR=1.243;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=221;TCF=131;TCR=90;TR=72;WE=140218472;WS=140218454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,76:0.32:237
chr7	140225750	rs2252397	G	A	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.487;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=20;PP=444;ReadPosRankSum=1.327;SC=GTAGCCACAGGTAATGAAGAG;SOR=0.211;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=41;TCF=9;TCR=32;TR=27;WE=140225758;WS=140225740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,28:0.61:46
chr7	140244560	rs2293177	C	T	2182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.811;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=62;PP=1508;ReadPosRankSum=-0.619;SC=CGGCACAGTTCGATCACCTGC;SOR=0.976;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=122;TCF=35;TCR=87;TR=86;WE=140244568;WS=140244550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,90:0.72:125
chr7	140244627	rs2293176	G	A	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.674;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=418;ReadPosRankSum=-1.584;SC=GGCCTCTCACGGGTGTCGCAG;SOR=0.246;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=20;WE=140244635;WS=140244617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,21:0.72:29
chr7	140255623	rs4342501	T	C	7349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=107;NR=150;PP=2965;SC=CCACATATCATAGCTCTGGAA;SOR=1.153;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=258;TCF=107;TCR=151;TR=257;WE=140255631;WS=140255613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,270:1.00:270
chr7	140257841	rs10252031	A	G	1044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=5;PP=721;SC=GTGCCTCATCAGGGAATCTCA;SOR=2.891;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=31;TCR=5;TR=36;WE=140257849;WS=140257831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr7	140257907	rs12704002	C	T	4282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=105;NR=33;PP=2904;SC=AGGAAGTCCACGAGGCTCTTG;SOR=2.287;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=105;TCR=33;TR=138;WE=140257915;WS=140257897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr7	140258000	rs12704003	T	C	12673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=476;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=229;NR=218;PP=2965;SC=TTAAGACAAATGAGAATGTTT;SOR=0.714;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=448;TCF=230;TCR=218;TR=447;WE=140258008;WS=140257990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,475:1.00:475
chr7	140301629	rs142818312	C	T	3241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=457;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.183;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=64;PP=2062;ReadPosRankSum=-0.724;SC=GTCAGGAGGGCAGTGTGGGGA;SOR=1.024;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=421;TCF=228;TCR=193;TR=157;WE=140301637;WS=140301619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:285,171:0.38:456
chr7	140301731	rs269243	G	T	9054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=685;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=199;NR=196;PP=2962;ReadPosRankSum=0.841;SC=CACGGAGAGGGGATCGTTCTG;SOR=0.689;SbPval=0.46;Source=Platypus;TCF=328;TR=395;WE=140301739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:267,417:0.61:684
chr7	140396472	rs57717083	C	CG	951.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=3;PP=830;SC=ACGGGAGGCGCGGGCGGAGCG;SOR=2.985;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=20;WE=140396480;WS=140396462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr7	140396720	.	C	G	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.900;ClippingRankSum=0.000;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.22;ReadPosRankSum=1.233;SOR=0.570;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,24:0.23:104
chr7	140404562	.	GT	G	40.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.82;ReadPosRankSum=-1.204;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr7	140426257	rs3829814	A	G	1272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FS=3.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.37;ReadPosRankSum=0.430;SOR=0.938;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:213,78:0.27:291
chr7	140774467	rs477223	C	G	4512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=81;PP=2629;SC=GCTTCGACCCCGAGATCGCCG;SOR=1.013;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=151;TCF=70;TCR=81;TR=151;WE=140774475;WS=140774457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr7	141137554	rs1727491	A	G	923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.082;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=21;PP=495;ReadPosRankSum=-0.075;SC=AGGTAAGGCTACGGGCTCGGC;SOR=0.515;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=143;TCF=72;TCR=71;TR=47;WE=141137562;WS=141137544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,53:0.31:171
chr7	141321434	rs142576028	ATG	A	139.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.27;MQRankSum=2.001;QD=3.68;ReadPosRankSum=-0.092;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,8:0.21:38
chr7	141336974	rs80336838	G	A	118.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=3;PP=48;SC=AATATAGAACGCATTCCTGTT;SOR=1.981;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=141336982;WS=141336964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr7	141362431	rs6949729	T	C	873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=3;PP=641;SC=CCACGTGAAGTGGCTCCCAGT;SOR=3.334;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=28;WE=141362439;WS=141362421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr7	141374030	.	A	AAC	47.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.352;ClippingRankSum=-0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=186;ReadPosRankSum=0.750;SC=CCTGCAGAAAAACACACACAC;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=5;WE=141374038;WS=141374020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr7	141420707	rs6971275	T	C	5762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=118;NR=78;PP=2965;SC=TTGATGTTTTTATTCCTCAAT;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=197;TCF=119;TCR=78;TR=196;WE=141420715;WS=141420697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr7	141420768	rs6967301	A	G	7731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=144;NR=137;PP=2965;SC=ATGCTCACGCAGTGCTTGGGC;SOR=0.707;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=281;TCF=144;TCR=137;TR=281;WE=141420776;WS=141420758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,298:1.00:298
chr7	141429224	rs35399772	TC	T	1702.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=42;NR=0;PP=1760;SC=GCTTTTCGTTTCTGTAAATAC;SOR=6.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=42;TCR=0;TR=42;WE=141429232;WS=141429214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr7	141429515	rs6962507	G	A	1347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=41;PP=1071;SC=GCAGCCGGGCGTGGTGGCTCA;SOR=6.184;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=42;WE=141429523;WS=141429505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr7	141536351	rs370442337	CAG	C	213.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=1.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.27;ReadPosRankSum=-0.117;SOR=0.455;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,18:0.19:94
chr7	141635538	rs5888023	C	CA	1987.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=10;PP=1920;SC=CCCCACTCCCCCAAGTTTCTA;SOR=2.746;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=39;TCR=11;TR=45;WE=141635546;WS=141635528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr7	141672705	rs1726866	G	A	13129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=484;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=205;NR=230;PP=2965;SC=GATGAAGGCAGCACAGGATGA;SOR=0.824;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=435;TCF=205;TCR=230;TR=435;WE=141672713;WS=141672695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,484:1.00:484
chr7	141705515	rs1285964	A	T	2329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=40;PP=1338;SC=CAAACCTTCAACAATGTCAGG;SOR=1.127;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=75;TCF=34;TCR=41;TR=74;WE=141705523;WS=141705505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr7	141705540	rs1285965	A	C	1604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=29;PP=951;SC=TAATGCTTTCATGCTCATGTG;SOR=1.412;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=50;TCF=21;TCR=29;TR=50;WE=141705548;WS=141705530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr7	141708625	rs1465093	A	C	771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=25;PP=586;SC=TTTATGTTGCAGCCATTAGTG;SOR=4.479;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=27;WE=141708633;WS=141708615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr7	141720643	rs1852508	T	C	2924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=25;PP=1770;SC=CCACCTGCCTTGGCCTCCCAA;SOR=1.855;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=67;TCR=25;TR=92;WE=141720651;WS=141720633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr7	141727679	rs34441915	AT	A	74.14	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.6694;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=57;ReadPosRankSum=-0.210;SC=AATACTAGACATTTTTTTTTT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=141727687;WS=141727669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr7	141730618	rs111279755	CTG	C	695.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.13;SOR=3.816;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr7	141731340	rs4374898	G	A	538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=0;PP=451;SC=TGTGAGCACCGCACCTTCTTA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=141731348;WS=141731333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr7	141733994	rs10693852	T	TTG	4797.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=20;NR=35;PP=2475;SC=TCATTTCGGATTGTGATAGTC;SOR=1.168;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=65;TCF=26;TCR=39;TR=55;WE=141734002;WS=141733984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr7	141747658	rs2960746	A	G	14546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=535;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.87;NF=241;NR=238;PP=2965;SC=TTTCTGGGATAATGGGGAAAC;SOR=0.704;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=479;TCF=241;TCR=238;TR=479;WE=141747666;WS=141747648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,533:1.00:533
chr7	141760228	rs6959057	T	C	6983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=678;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.187;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=161;NR=161;PP=2962;ReadPosRankSum=1.232;SC=CAGGGGCAGCTGTTCCTGGGA;SOR=0.525;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=641;TCF=305;TCR=336;TR=322;WE=141760236;WS=141760218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:336,341:0.50:677
chr7	141760293	rs2961073	T	G	4299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.683;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=90;PP=2111;ReadPosRankSum=0.996;SC=AACACTTAGGTGATGTGTCTT;SOR=0.551;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=279;TCF=91;TCR=188;TR=138;WE=141760302;WS=141760283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,156:0.51:306
chr7	141760294	rs2961072	G	C	648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FS=2.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.18;ReadPosRankSum=-1.047;SOR=0.900;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:245,53:0.18:298
chr7	141762625	rs62477625	A	G	1090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=30;PP=843;SC=TGGACATAGCAGACACTTCTT;SOR=7.054;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=31;WE=141762633;WS=141762615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr7	141765752	rs375466275	TG	T	158.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=13.23;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr7	141776541	rs117227399	T	C	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FS=4.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.17;MQRankSum=-9.029;QD=3.33;ReadPosRankSum=0.744;SOR=1.079;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:155,46:0.23:201
chr7	141776782	rs10259247	A	G	3607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.275;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=89;PP=2666;ReadPosRankSum=1.746;SC=TTTTTTGGGGAAAAAAATGAG;SOR=2.396;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=120;TCF=29;TCR=91;TR=117;WE=141776790;WS=141776772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,122:0.99:123
chr7	141784326	rs10952514	G	C	7722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=160;NR=101;PP=2965;SC=TAGTTGATTGGCCGGCCTGTG;SOR=1.211;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=261;TCF=160;TCR=101;TR=261;WE=141784334;WS=141784316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,282:1.00:282
chr7	141794763	rs138070479	ATT	A	1517.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.67;QD=32.99;SOR=4.125;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr7	141794790	rs4259331	A	G	1421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=33;PP=909;SC=TTTGAGACAAAGACTCATTCT;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=34;WE=141794798;WS=141794780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr7	141796131	rs6975672	G	A	2590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.63;MQRankSum=1.745;QD=27.86;ReadPosRankSum=-0.852;SOR=0.280;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,92:0.99:93
chr7	141796250	rs6976953	C	T	3109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=90;PP=2500;SC=GGGAGGATCCCAGCTGTGAGG;SOR=1.278;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=135;TCF=45;TCR=90;TR=135;WE=141796258;WS=141796240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr7	141831259	rs146242312	A	C	3841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FS=1.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.707;QD=15.31;ReadPosRankSum=1.243;SOR=0.815;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,166:0.66:251
chr7	141840581	rs73158439	T	C	3124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.027;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=50;PP=2033;ReadPosRankSum=-0.742;SC=TAGGTTCTGATTGACCAGAGC;SOR=0.786;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=223;TCF=137;TCR=86;TR=131;WE=141840589;WS=141840571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,141:0.59:239
chr7	141844888	rs12154456	C	G	1058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.597;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=37;PP=709;ReadPosRankSum=-0.511;SC=GCCGAAGTCTCTGCAGCAGTG;SOR=0.519;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=136;TCF=36;TCR=100;TR=52;WE=141844896;WS=141844878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,53:0.38:138
chr7	141853951	rs73158444	C	T	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=6.287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.67;ReadPosRankSum=-0.205;SOR=0.259;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,28:0.32:88
chr7	141854436	rs61281471	A	T	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=254;ReadPosRankSum=-0.535;SC=ATGATGTGACAAAGAGGTTCT;SOR=1.042;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=14;WE=141854444;WS=141854426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr7	141854659	rs11770705	A	G	3823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.444;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=78;PP=2362;ReadPosRankSum=-1.663;SC=AGGTCACCAAAAGAAGTGATG;SOR=0.878;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=223;TCF=110;TCR=113;TR=148;WE=141854667;WS=141854649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,166:0.67:249
chr7	141857846	rs7811706	A	G	8834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=143;NR=165;PP=2965;SC=CTTTTCTACCATGCTCACACC;SOR=0.854;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=308;TCF=143;TCR=165;TR=308;WE=141857854;WS=141857836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,333:1.00:333
chr7	141860199	rs60403744	A	G	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.545;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=145;ReadPosRankSum=-0.578;SC=TCCTTTCAAAATTGATCCAAA;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=8;WE=141860207;WS=141860189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr7	141860861	rs34106041	T	C	1918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=27;PP=1135;ReadPosRankSum=-2.053;SC=GGGATGAAGGTGGCTGGTTTC;SOR=0.774;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=103;TCF=68;TCR=35;TR=77;WE=141860869;WS=141860851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,84:0.75:112
chr7	141861072	rs12703440	C	A	1106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.298;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=28;PP=706;ReadPosRankSum=0.124;SC=GAAAATTAGTCATCATAGGCT;SOR=1.051;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=62;TCF=18;TCR=44;TR=38;WE=141861080;WS=141861062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,44:0.61:72
chr7	141873000	rs9986803	T	A	873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=15;PP=618;ReadPosRankSum=-0.761;SC=TAAGAAATCTTTCTGGATGCA;SOR=0.651;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=120;TCF=82;TCR=38;TR=45;WE=141873008;WS=141872990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,47:0.37:128
chr7	141897595	rs3110843	T	C	1016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.417;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=27;PP=623;ReadPosRankSum=2.399;SC=AAAAGCATTTTAAAGATCATC;SOR=0.321;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=111;TCF=30;TCR=81;TR=41;WE=141897603;WS=141897585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,47:0.39:119
chr7	141898522	rs2960768	T	A	6061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=128;PP=2965;SC=AAGAGCCTGCTATGAACACTC;SOR=1.336;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=207;TCF=79;TCR=128;TR=207;WE=141898530;WS=141898512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr7	141899660	.	CT	C	170.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=0.000;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.88;ReadPosRankSum=0.121;SOR=0.871;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
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chr7	141951998	rs1052410	C	T	2037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=7;PP=1523;SC=TAAAGGTGAACGATGGGGACA;SOR=3.578;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=62;TCF=55;TCR=7;TR=60;WE=141952006;WS=141951988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr7	141952023	rs1052408	G	A	3608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=21;PP=2567;SC=GTGTCATATGGTCCACAACTG;SOR=2.594;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=89;TCR=21;TR=110;WE=141952031;WS=141952013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr7	141954706	rs201234582	T	TA	1087.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=1;PP=908;SC=AGCGGGTGAATAAAAAAAACC;SOR=5.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=43;TCR=1;TR=35;WE=141954714;WS=141954700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr7	141954822	rs1894316	G	A	9580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.03;NF=196;NR=127;PP=2965;SC=CAAGAGTCGCGAAGGTGTAGA;SOR=1.075;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=323;TCF=196;TCR=127;TR=323;WE=141954830;WS=141954812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,354:1.00:354
chr7	141955128	rs1894317	C	T	5676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=113;PP=2965;SC=TCACCCGAAGCTTTCTGGAAC;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=187;TCF=74;TCR=113;TR=187;WE=141955136;WS=141955118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr7	141957424	rs12531935	G	A	9442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=354;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=182;NR=143;PP=2965;SC=GCTGTTACCCGTCTTTCATGC;SOR=0.972;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=326;TCF=182;TCR=144;TR=325;WE=141957432;WS=141957414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,354:1.00:354
chr7	142001030	rs56095598	A	G	6787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=105;NR=129;PP=2965;SC=GTGATCTTGCACTGTGTCCCC;SOR=1.019;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=234;TCF=105;TCR=129;TR=234;WE=142001038;WS=142001020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr7	142013384	rs361401	G	C	13550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=497;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=199;NR=245;PP=2965;SC=GAAAGTGTGCGAAGTCGCTTC;SOR=0.961;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=444;TCF=199;TCR=245;TR=444;WE=142013392;WS=142013374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,493:1.00:493
chr7	142028108	rs361428	A	C	1580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.56;SOR=3.664;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr7	142028108	.	ACTTGAGAGTC	CCTTGAGAGTA,CCTTGAGAGTC	377	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000,0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=20,35;NR=0,3;PP=377,365;QD=21.5233937431;SC=AGAATGACCCACTTGAGAGTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=35;TCR=3;TR=20,38;WE=142028126;WS=142028098;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.53:38
chr7	142028118	rs361429	C	A	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=2.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.89;ReadPosRankSum=-0.203;SOR=1.321;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,31:0.56:55
chr7	142028474	.	TC	GG	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.305;ClippingRankSum=0.000;DP=472;ExcessHet=3.0103;FS=4.230;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQRankSum=-20.101;QD=0.15;ReadPosRankSum=-2.188;SOR=1.480;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:442,30:0.06:472
chr7	142028485	.	C	A	478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.277;ClippingRankSum=0.000;DP=508;ExcessHet=3.0103;FS=2.065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQRankSum=-19.980;QD=0.94;ReadPosRankSum=-1.460;SOR=0.996;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:462,46:0.09:508
chr7	142028490	.	A	C	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.957;ClippingRankSum=0.000;DP=514;ExcessHet=3.0103;FS=2.065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQRankSum=-20.678;QD=0.92;ReadPosRankSum=-0.597;SOR=0.986;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:468,46:0.09:514
chr7	142028500	.	A	G	628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.286;ClippingRankSum=0.000;DP=518;ExcessHet=3.0103;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQRankSum=-20.371;QD=1.21;ReadPosRankSum=1.379;SOR=1.029;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:468,50:0.10:518
chr7	142028506	.	CA	TG	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.497;ClippingRankSum=0.000;DP=523;ExcessHet=3.0103;FS=1.987;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQRankSum=-20.740;QD=1.21;ReadPosRankSum=2.638;SOR=1.034;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:473,50:0.10:523
chr7	142028533	.	C	A	804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.553;ClippingRankSum=0.000;DP=516;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQRankSum=-20.489;QD=1.56;ReadPosRankSum=4.217;SOR=0.698;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:462,54:0.10:516
chr7	142028538	.	G	A	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.066;ClippingRankSum=0.000;DP=504;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQRankSum=-20.570;QD=1.41;ReadPosRankSum=3.755;SOR=0.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:452,52:0.10:504
chr7	142028540	.	G	A	770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.445;ClippingRankSum=0.000;DP=501;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQRankSum=-20.105;QD=1.54;ReadPosRankSum=3.647;SOR=0.621;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:449,52:0.10:501
chr7	142028542	.	G	T	794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.131;ClippingRankSum=0.000;DP=493;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQRankSum=-19.939;QD=1.61;ReadPosRankSum=3.146;SOR=0.619;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:441,52:0.11:493
chr7	142028546	.	TC	CT	817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.338;ClippingRankSum=0.000;DP=485;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQRankSum=-19.266;QD=1.69;ReadPosRankSum=2.825;SOR=0.653;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:433,52:0.11:485
chr7	142028551	.	CA	GG	680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.177;ClippingRankSum=0.000;DP=482;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQRankSum=-19.587;QD=1.41;ReadPosRankSum=1.969;SOR=0.637;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:433,49:0.10:482
chr7	142028555	.	C	T	707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.736;ClippingRankSum=0.000;DP=480;ExcessHet=3.0103;FS=0.875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQRankSum=-19.545;QD=1.47;ReadPosRankSum=0.878;SOR=0.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:431,49:0.10:480
chr7	142032115	rs10567930	CTG	C	105.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=1.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.25;MQRankSum=3.300;QD=1.53;ReadPosRankSum=-2.459;SOR=0.998;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,11:0.16:69
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chr7	142032393	.	GGA	G	392.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.090;ClippingRankSum=0.000;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=0.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQRankSum=-21.012;QD=0.76;ReadPosRankSum=5.317;SOR=0.762;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:473,45:0.09:518
chr7	142032400	.	G	C	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.318;ClippingRankSum=0.000;DP=516;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQRankSum=-20.915;QD=0.80;ReadPosRankSum=4.863;SOR=0.735;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:471,44:0.09:515
chr7	142032411	.	G	A	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.509;ClippingRankSum=0.000;DP=501;ExcessHet=3.0103;FS=1.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQRankSum=-21.043;QD=0.47;ReadPosRankSum=2.611;SOR=0.799;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:456,41:0.08:497
chr7	142032417	.	T	G	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.587;ClippingRankSum=0.000;DP=499;ExcessHet=3.0103;FS=1.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQRankSum=-21.043;QD=0.46;ReadPosRankSum=0.694;SOR=0.799;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:456,41:0.08:497
chr7	142032421	.	C	A	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.092;ClippingRankSum=0.000;DP=496;ExcessHet=3.0103;FS=1.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQRankSum=-21.000;QD=0.40;ReadPosRankSum=-0.718;SOR=0.806;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:454,41:0.08:495
chr7	142032429	.	G	C	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.521;ClippingRankSum=0.000;DP=492;ExcessHet=3.0103;FS=2.364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQRankSum=-21.446;QD=0.15;ReadPosRankSum=-2.062;SOR=0.966;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:455,36:0.07:491
chr7	142032610	.	A	G	1904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=0.000;DP=337;ExcessHet=3.0103;FS=15.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.65;ReadPosRankSum=2.897;SOR=1.539;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:272,65:0.19:337
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chr7	142045924	rs1811089	A	G	8877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=138;NR=169;PP=2965;SC=AAGAGCCCCGACAGAAGATTC;SOR=0.969;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=307;TCF=138;TCR=169;TR=307;WE=142045932;WS=142045914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,333:1.00:333
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chr7	142099541	.	T	C	2632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.449;ClippingRankSum=0.000;DP=778;ExcessHet=3.0103;FS=0.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQRankSum=-19.488;QD=3.39;ReadPosRankSum=-2.855;SOR=0.645;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:669,108:0.14:777
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chr7	142119831	rs361390	G	A	1365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-3.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.470;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.874;NF=47;NR=24;PP=892;ReadPosRankSum=0.996;SC=CTAAGCTGCTGGCACAGCGAT;SOR=0.425;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=219;TCF=155;TCR=64;TR=71;WE=142119839;WS=142119821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,75:0.33:229
chr7	142119873	.	A	G	887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.392;ClippingRankSum=0.000;DP=498;ExcessHet=3.0103;FS=6.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQRankSum=-22.206;QD=1.79;ReadPosRankSum=-4.385;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:446,50:0.10:496
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chr7	142119879	.	C	CCA	1330.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.694;ClippingRankSum=0.000;DP=528;ExcessHet=3.0103;FS=9.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQRankSum=-22.829;QD=2.53;ReadPosRankSum=-5.436;SOR=1.634;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:462,63:0.12:525
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chr7	142119942	.	G	T	2100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.409;ClippingRankSum=0.000;DP=695;ExcessHet=3.0103;FS=5.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQRankSum=-25.877;QD=3.04;ReadPosRankSum=5.979;SOR=1.125;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:597,95:0.14:692
chr7	142119946	.	G	A	2106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.105;ClippingRankSum=0.000;DP=702;ExcessHet=3.0103;FS=5.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQRankSum=-26.009;QD=3.01;ReadPosRankSum=5.302;SOR=1.097;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:605,94:0.13:699
chr7	142119959	.	AA	TC	1959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=0.000;DP=681;ExcessHet=3.0103;FS=3.973;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQRankSum=-25.788;QD=2.89;ReadPosRankSum=0.497;SOR=0.973;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:589,90:0.13:679
chr7	142119962	.	T	G	1932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=0.000;DP=675;ExcessHet=3.0103;FS=2.819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQRankSum=-25.673;QD=2.87;ReadPosRankSum=-0.544;SOR=0.933;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:585,88:0.13:673
chr7	142120168	rs57417024	T	TCA	401.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.46;ReadPosRankSum=0.434;SOR=0.649;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,25:0.28:90
chr7	142124170	rs361452	C	T	10556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=394;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.99;NF=221;NR=154;PP=2965;SC=CACAGATGTCCGGGAGGGAGC;SOR=1.107;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=375;TCF=221;TCR=154;TR=375;WE=142124178;WS=142124160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,393:1.00:393
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chr7	142124610	.	A	G	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.594;ClippingRankSum=0.000;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=3.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.17;MQRankSum=-8.949;QD=4.19;ReadPosRankSum=1.416;SOR=0.225;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,14:0.17:82
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chr7	142131710	.	G	A	1481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.759;ClippingRankSum=0.000;DP=431;ExcessHet=3.0103;FS=31.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQRankSum=-14.611;QD=3.44;ReadPosRankSum=-2.350;SOR=3.505;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:383,48:0.11:431
chr7	142131734	.	A	T	3005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.367;ClippingRankSum=0.000;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=3.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQRankSum=-13.508;QD=5.79;ReadPosRankSum=-2.164;SOR=1.032;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:420,99:0.19:519
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chr7	142131894	.	A	C	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.586;ClippingRankSum=0.000;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=15.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQRankSum=-12.065;QD=0.63;ReadPosRankSum=-1.784;SOR=3.484;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:137,10:0.07:147
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chr7	142139271	rs146977487	TG	CA	7633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=3.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=18.186;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=11.763;NF=115;NR=45;PP=2944;ReadPosRankSum=3.682;SC=GACTATGCCATGCTGTGGCTA;SOR=2.021;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=214;TCF=157;TCR=57;TR=160;WE=142139280;WS=142139228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,183:0.84:218
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chr7	142139334	.	CG	C	1184.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.774;ClippingRankSum=0.000;DP=494;ExcessHet=3.0103;FS=7.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.62;MQRankSum=-17.947;QD=2.41;ReadPosRankSum=5.303;SOR=0.834;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:431,61:0.12:492
chr7	142139337	.	C	CCA	1142.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.467;ClippingRankSum=0.000;DP=503;ExcessHet=3.0103;FS=5.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.72;MQRankSum=-18.136;QD=2.27;ReadPosRankSum=5.215;SOR=0.853;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:442,61:0.12:503
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chr7	142139348	rs73742284	C	T,A	14183.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=530;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;NF=241;NR=204;PP=2962;SC=AGAGTGGAGACGGATCCCTCA;SOR=0.796;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=516;TCF=277;TCR=239;TR=445;WE=142139365;WS=142139325;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.89,0.11:530
chr7	142139349	.	G	A	1033.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.551;ClippingRankSum=0.000;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=3.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.92;MQRankSum=-18.767;QD=1.92;ReadPosRankSum=3.170;SOR=0.897;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:479,60:0.11:539
chr7	142139357	.	C	T	986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.780;ClippingRankSum=0.000;DP=553;ExcessHet=3.0103;FS=1.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.00;MQRankSum=-18.936;QD=1.78;ReadPosRankSum=0.184;SOR=0.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:494,59:0.11:553
chr7	142143639	rs377139967	T	G	1415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FS=17.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQRankSum=-7.571;QD=7.69;ReadPosRankSum=3.852;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:139,45:0.24:184
chr7	142143646	rs369634458	G	A	1349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FS=12.811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQRankSum=-8.083;QD=6.75;ReadPosRankSum=3.719;SOR=0.204;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:156,44:0.22:200
chr7	142143675	.	A	C	635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.233;ClippingRankSum=0.000;DP=303;ExcessHet=3.0103;FS=7.033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQRankSum=-11.701;QD=2.10;ReadPosRankSum=-0.059;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:266,37:0.12:303
chr7	142143681	.	A	T	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.393;ClippingRankSum=0.000;DP=314;ExcessHet=3.0103;FS=10.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQRankSum=-12.942;QD=1.64;ReadPosRankSum=-0.758;SOR=0.457;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:282,32:0.10:314
chr7	142143684	.	C	T	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.763;ClippingRankSum=0.000;DP=324;ExcessHet=3.0103;FS=16.495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQRankSum=-13.678;QD=1.34;ReadPosRankSum=-1.920;SOR=0.742;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:291,33:0.10:324
chr7	142143687	.	A	G	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.817;ClippingRankSum=0.000;DP=340;ExcessHet=3.0103;FS=12.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQRankSum=-14.029;QD=1.21;ReadPosRankSum=-2.476;SOR=0.785;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:307,33:0.10:340
chr7	142143804	rs73742281	A	C	14461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=519;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=226;NR=254;PP=2965;ReadPosRankSum=1.528;SC=AGTAGTAAATAAGCCTCAGCC;SOR=0.278;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=482;TCF=227;TCR=255;TR=480;WE=142143812;WS=142143794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,516:1.00:517
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chr7	142143953	rs371156869	G	A	6374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=578;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.746;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-15.901;NF=122;NR=76;PP=2962;ReadPosRankSum=1.003;SC=GGACCTGCAGGGAAGGACAAA;SOR=1.204;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=561;TCF=306;TCR=255;TR=198;WE=142143962;WS=142143931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:381,197:0.34:578
chr7	142143993	rs374220425	C	A	6869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=675;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.355;HP=4;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-15.717;NF=133;NR=117;PP=2962;ReadPosRankSum=1.143;SC=TGGAAAGGGGCTGGGCCTTGA;SOR=0.728;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=647;TCF=321;TCR=326;TR=250;WE=142144012;WS=142143983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:425,250:0.37:675
chr7	142144004	rs368631399	T	A	7007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=679;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.797;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-15.290;NF=127;NR=122;PP=2962;ReadPosRankSum=0.915;SC=TGGGCCTTGATATCCACACAA;SOR=0.601;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=644;TCF=312;TCR=332;TR=249;WE=142144012;WS=142143983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:423,255:0.38:678
chr7	142144022	rs371600923	T	C	6021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=624;ExcessHet=3.0103;FS=0.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQRankSum=-13.781;QD=9.65;ReadPosRankSum=0.850;SOR=0.630;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:394,230:0.37:624
chr7	142144059	.	A	C	3374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.793;ClippingRankSum=0.000;DP=454;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.175;HP=3;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-13.881;NF=61;NR=104;PP=2510;ReadPosRankSum=-2.332;SC=AGAAAAGGCCACACAGCACAG;SOR=0.812;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=427;TCF=165;TCR=262;TR=165;WE=142144067;WS=142144040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:281,173:0.38:454
chr7	142144091	.	GG	AA	3242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.718;ClippingRankSum=0.000;DP=282;ExcessHet=3.0103;FS=11.237;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.04;MQRankSum=-14.335;QD=11.50;ReadPosRankSum=2.286;SOR=1.318;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:190,92:0.33:282
chr7	142144101	.	C	T	2804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.722;ClippingRankSum=0.000;DP=239;ExcessHet=3.0103;FS=4.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.54;MQRankSum=-13.477;QD=11.74;ReadPosRankSum=2.276;SOR=1.041;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:161,78:0.33:239
chr7	142144111	.	T	C	2556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.678;ClippingRankSum=0.000;DP=200;ExcessHet=3.0103;FS=4.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.48;MQRankSum=-12.256;QD=12.78;ReadPosRankSum=0.593;SOR=1.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:130,70:0.35:200
chr7	142144129	.	A	G	1559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.757;ClippingRankSum=0.000;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=7.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.08;MQRankSum=-11.030;QD=11.82;ReadPosRankSum=-0.427;SOR=1.418;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,46:0.35:132
chr7	142144135	.	G	A	1480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.644;ClippingRankSum=0.000;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=12.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.54;MQRankSum=-10.231;QD=12.99;ReadPosRankSum=-1.094;SOR=2.156;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,41:0.36:114
chr7	142144142	.	T	A	1338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.738;ClippingRankSum=0.000;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=8.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.47;MQRankSum=-9.328;QD=14.09;ReadPosRankSum=-1.334;SOR=2.041;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,34:0.36:95
chr7	142148850	.	G	A	887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.521;ClippingRankSum=0.000;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.77;MQRankSum=-9.836;QD=8.38;ReadPosRankSum=-0.970;SOR=0.434;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,28:0.26:106
chr7	142148878	rs370978147	T	C	2444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FS=4.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.61;MQRankSum=-14.022;QD=11.37;ReadPosRankSum=-0.600;SOR=0.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:149,66:0.31:215
chr7	142148881	rs374566766	C	A	2492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FS=7.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.79;MQRankSum=-13.245;QD=10.89;ReadPosRankSum=-1.669;SOR=0.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:153,76:0.33:229
chr7	142148919	rs376682174	C	T	1510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=445;ExcessHet=3.0103;FS=1.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQRankSum=-16.545;QD=3.40;ReadPosRankSum=4.767;SOR=0.571;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:330,114:0.26:444
chr7	142148963	rs371195527	C	T	2262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=660;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQRankSum=-18.358;QD=3.44;ReadPosRankSum=0.875;SOR=0.674;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:560,98:0.15:658
chr7	142148969	.	AA	TC	2040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.854;ClippingRankSum=0.000;DP=685;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQRankSum=-18.308;QD=2.99;ReadPosRankSum=-1.172;SOR=0.631;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:591,92:0.13:683
chr7	142149160	rs17217	T	G	1047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FS=1.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQRankSum=1.350;QD=3.92;ReadPosRankSum=-0.353;SOR=0.774;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:198,69:0.26:267
chr7	142149349	rs140504979	A	C	5479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=108;PP=2965;SC=CTCACCTGCTACCAGGAGACA;SOR=1.219;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=182;TCF=74;TCR=108;TR=182;WE=142149357;WS=142149339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr7	142162001	rs73742263	A	C	15140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=559;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=271;NR=253;PP=2965;SC=AGCGGGAAATACTCTGTGGTT;SOR=0.767;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=524;TCF=271;TCR=253;TR=524;WE=142162009;WS=142161991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,558:1.00:558
chr7	142162050	rs71878	A	G	8978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=574;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.184;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.94;MQRankSum=-1.383;NF=175;NR=191;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.030;SC=CTTCTCCTTTATCAGTGATAC;SOR=0.826;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=546;TCF=267;TCR=279;TR=366;WE=142162058;WS=142162040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,388:0.68:573
chr7	142162148	rs71877	C	T	2060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.814;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.98;MQRankSum=-2.084;NF=43;NR=56;ReadPosRankSum=-0.815;SC=ATATCCTGGGCACACTGCAGT;SOR=0.960;SbPval=0.77;Source=Platypus;TCF=160;TR=99;WE=142162156;WS=142162138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:237,109:0.32:346
chr7	142162278	rs361443	C	T	2647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=471;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.563;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.396;NF=64;NR=73;PP=1551;ReadPosRankSum=0.771;SC=GGGGCTGGGCCTTGAAATCTA;SOR=0.607;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=436;TCF=197;TCR=239;TR=137;WE=142162286;WS=142162257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:317,153:0.33:470
chr7	142162306	rs361442	A	G	2377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=374;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.930;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.495;NF=52;NR=68;PP=1419;ReadPosRankSum=0.810;SC=GGCCCTGTCCAGGACCCACCT;SOR=0.546;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=343;TCF=141;TCR=202;TR=120;WE=142162314;WS=142162296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:241,133:0.36:374
chr7	142168348	.	G	A	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=0.000;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=19.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.39;MQRankSum=-10.913;QD=3.28;ReadPosRankSum=1.188;SOR=3.790;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,18:0.15:121
chr7	142168351	.	T	C	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.148;ClippingRankSum=0.000;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=19.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.59;MQRankSum=-11.365;QD=4.04;ReadPosRankSum=1.737;SOR=3.828;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:113,18:0.14:131
chr7	142168362	.	A	T	983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.993;ClippingRankSum=0.000;DP=206;ExcessHet=3.0103;FS=49.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.30;MQRankSum=-14.216;QD=4.80;ReadPosRankSum=-0.075;SOR=5.641;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:171,34:0.17:205
chr7	142168365	.	C	T	1138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.173;ClippingRankSum=0.000;DP=222;ExcessHet=3.0103;FS=54.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.50;MQRankSum=-14.287;QD=5.15;ReadPosRankSum=-0.097;SOR=5.794;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:184,37:0.17:221
chr7	142168371	.	C	T	1443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.283;ClippingRankSum=0.000;DP=274;ExcessHet=3.0103;FS=35.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.57;MQRankSum=-14.064;QD=5.29;ReadPosRankSum=-2.554;SOR=2.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:214,59:0.22:273
chr7	142168414	rs374005717	G	C	2117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=535;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=23.967;HP=1;HapScore=1;MGOF=53;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-13.619;NF=88;NR=92;PP=2376;ReadPosRankSum=-0.638;SC=GGGCCGAGTCGTCCAGCTCCA;SOR=2.224;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=562;TCF=312;TCR=250;TR=180;WE=142168422;WS=142168404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:394,140:0.26:534
chr7	142168429	rs55634899	A	G	26592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=606;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=44;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=334;NR=295;PP=2965;SC=GCTCCAAGGCATTCACATTCA;SOR=1.245;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=629;TCF=334;TCR=295;TR=629;WE=142168437;WS=142168419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,605:1.00:605
chr7	142168452	rs361355	C	A	27501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=648;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=328;NR=343;PP=2965;SC=TCAGAGCTATCATTAGGGAAC;SOR=1.059;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=672;TCF=329;TCR=343;TR=671;WE=142168482;WS=142168442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,648:1.00:648
chr7	142168662	rs73742240	CG	TC	7075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.628;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=3.924;NF=123;NR=113;PP=2947;ReadPosRankSum=0.150;SC=GTGACTCCAGCGTCCACTGAG;SOR=0.122;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=248;TCF=133;TCR=115;TR=236;WE=142168671;WS=142168652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:6,260:0.98:266
chr7	142168819	rs361350	G	A	801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=3.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.82;MQRankSum=-1.815;QD=5.57;ReadPosRankSum=-0.400;SOR=1.050;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,45:0.31:144
chr7	142168835	.	CA	TG	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.586;ClippingRankSum=0.000;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.50;MQRankSum=-2.913;QD=0.59;ReadPosRankSum=2.594;SOR=0.558;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,10:0.09:114
chr7	142168839	.	G	T	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=0.000;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.94;MQRankSum=-2.563;QD=0.90;ReadPosRankSum=2.134;SOR=0.478;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,10:0.10:104
chr7	142168856	rs73742239	C	G	1885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.638;HP=3;HapScore=1;MGOF=42;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.719;NF=15;NR=51;PP=2241;ReadPosRankSum=-0.485;SC=GCACAGTGGGCCAGGCAGCAC;SOR=1.402;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=82;TCF=19;TCR=63;TR=66;WE=142168870;WS=142168846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,70:0.88:80
chr7	142168862	.	A	G	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.779;ClippingRankSum=0.000;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=3.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.18;MQRankSum=-1.621;QD=2.35;ReadPosRankSum=-0.027;SOR=0.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,10:0.13:77
chr7	142176378	rs361393	A	G	13216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=503;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=259;NR=219;PP=2965;SC=TGCTCTGTGCACTGGATCTTC;SOR=0.851;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=479;TCF=260;TCR=219;TR=478;WE=142176386;WS=142176368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,503:1.00:503
chr7	142180498	.	G	A	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.392;ClippingRankSum=0.000;DP=223;ExcessHet=3.0103;FS=1.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQRankSum=-14.879;QD=0.59;ReadPosRankSum=-2.481;SOR=0.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:205,18:0.08:223
chr7	142180502	.	T	G	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.657;ClippingRankSum=0.000;DP=238;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQRankSum=-15.374;QD=0.56;ReadPosRankSum=-1.915;SOR=0.542;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:219,19:0.08:238
chr7	142180505	.	T	C	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.540;ClippingRankSum=0.000;DP=261;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQRankSum=-16.103;QD=0.50;ReadPosRankSum=-1.515;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:240,21:0.08:261
chr7	142180509	.	G	A	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=0.000;DP=288;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQRankSum=-16.921;QD=0.29;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=0.637;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:266,22:0.08:288
chr7	142180618	.	TG	CA	1506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.672;ClippingRankSum=0.000;DP=929;ExcessHet=3.0103;FS=8.152;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQRankSum=-23.581;QD=1.63;ReadPosRankSum=-3.079;SOR=1.669;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:835,91:0.10:926
chr7	142180625	.	T	C	1947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.213;ClippingRankSum=0.000;DP=932;ExcessHet=3.0103;FS=11.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQRankSum=-21.824;QD=2.10;ReadPosRankSum=-2.173;SOR=1.740;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:825,103:0.11:928
chr7	142180633	.	G	T	2460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.155;ClippingRankSum=0.000;DP=918;ExcessHet=3.0103;FS=10.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQRankSum=-20.046;QD=2.69;ReadPosRankSum=-1.282;SOR=1.614;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:800,114:0.12:914
chr7	142180635	.	T	G	2541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.023;ClippingRankSum=0.000;DP=911;ExcessHet=3.0103;FS=10.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQRankSum=-19.953;QD=2.80;ReadPosRankSum=-1.268;SOR=1.568;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:789,118:0.13:907
chr7	142180640	.	GA	TG	2788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.750;ClippingRankSum=0.000;DP=908;ExcessHet=3.0103;FS=11.857;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQRankSum=-19.446;QD=3.08;ReadPosRankSum=-0.272;SOR=1.546;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:781,123:0.14:904
chr7	142180646	.	AG	CT	3194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.205;ClippingRankSum=0.000;DP=885;ExcessHet=3.0103;FS=13.959;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQRankSum=-18.480;QD=3.63;ReadPosRankSum=0.073;SOR=1.512;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:750,131:0.15:881
chr7	142180704	rs368420989	G	T	3419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=632;ExcessHet=3.0103;FS=6.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQRankSum=-9.365;QD=5.44;ReadPosRankSum=3.657;SOR=0.369;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:435,194:0.31:629
chr7	142180737	rs372013265	T	A	2948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=477;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.563;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-7.108;NF=58;NR=85;PP=2228;ReadPosRankSum=2.653;SC=CTGGGCACACTGCAGTGTCAT;SOR=0.622;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=453;TCF=194;TCR=259;TR=143;WE=142180745;WS=142180727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:321,153:0.32:474
chr7	142180770	rs375278683	T	C	1445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=459;ExcessHet=3.0103;FS=6.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQRankSum=-11.822;QD=3.16;ReadPosRankSum=0.233;SOR=1.139;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:355,102:0.22:457
chr7	142180818	rs377067235	AAGG	A	756.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=576;ExcessHet=3.0103;FS=12.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQRankSum=-23.332;QD=1.32;ReadPosRankSum=0.266;SOR=1.496;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:515,57:0.10:572
chr7	142180849	.	T	C	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.114;ClippingRankSum=0.000;DP=586;ExcessHet=3.0103;FS=10.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQRankSum=-24.142;QD=0.25;ReadPosRankSum=-0.421;SOR=1.614;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:541,44:0.08:585
chr7	142180856	rs373727238	GC	G	88.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=593;ExcessHet=3.0103;FS=9.878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQRankSum=-24.288;QD=0.15;ReadPosRankSum=-1.899;SOR=1.749;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:549,43:0.07:592
chr7	142197606	rs373222208	T	C	1912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=18.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQRankSum=-4.546;QD=14.17;ReadPosRankSum=0.161;SOR=0.508;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,55:0.41:135
chr7	142197613	rs376535639	T	C	1767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=19.293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQRankSum=-5.129;QD=12.63;ReadPosRankSum=0.877;SOR=0.700;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,49:0.35:140
chr7	142197620	rs17281	C	T	1545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.766;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=4.287;NF=45;NR=16;PP=2218;ReadPosRankSum=-1.370;SC=GCTTTGCAGGCTGGATCTTGA;SOR=1.655;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=121;TCF=77;TCR=44;TR=61;WE=142197628;WS=142197596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,72:0.51:142
chr7	142197835	rs17280	C	T	8816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=158;NR=166;PP=2965;SC=ATCTTATATCCGGGAGACTGG;SOR=0.752;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=324;TCF=158;TCR=166;TR=324;WE=142197843;WS=142197825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,313:1.00:313
chr7	142197897	rs17279	C	T	1820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.267;NF=34;NR=47;PP=918;ReadPosRankSum=-0.773;SC=AATTTGAAAACAGAAGGAAAT;SOR=0.685;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=225;TCF=95;TCR=130;TR=81;WE=142197905;WS=142197870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,91:0.38:239
chr7	142197986	rs148941368	T	C	2786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=56;PP=2962;SC=GAGGGCCGCCTAGCAGAGGAG;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=106;TCF=50;TCR=56;TR=105;WE=142197994;WS=142197952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr7	142198022	.	A	C	1050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.473;ClippingRankSum=0.000;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=9.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.12;MQRankSum=-7.057;QD=10.30;ReadPosRankSum=0.169;SOR=1.688;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,32:0.31:102
chr7	142198030	.	G	A	984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.654;ClippingRankSum=0.000;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=8.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.16;MQRankSum=-6.767;QD=10.82;ReadPosRankSum=-1.009;SOR=1.674;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,28:0.31:91
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chr7	142198041	.	A	G	855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.327;ClippingRankSum=0.000;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=9.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.00;MQRankSum=-6.512;QD=11.11;ReadPosRankSum=-2.008;SOR=1.893;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,23:0.30:77
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chr7	142239946	rs17209	T	C	1697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=35;PP=1043;ReadPosRankSum=0.284;SC=GACTTTCAAGTTGTGCCCAGG;SOR=0.706;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=111;TCF=57;TCR=54;TR=71;WE=142239954;WS=142239936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,78:0.64:122
chr7	142242352	rs2734112	C	T	6565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=449;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.556;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=152;NR=130;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.653;SC=CTCAGAGCAACAGTCATGGAA;SOR=0.706;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=419;TCF=220;TCR=199;TR=282;WE=142242360;WS=142242342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,301:0.67:449
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chr7	142247125	rs361365	A	G	6548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FS=2.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.85;ReadPosRankSum=-0.676;SOR=0.515;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,162:0.71:227
chr7	142247133	rs361364	A	G	6679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FS=4.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.42;ReadPosRankSum=-0.676;SOR=0.464;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,167:0.71:235
chr7	142247134	rs361363	T	C	9414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.23;SOR=1.003;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr7	142247148	rs361361	C	T	4279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.476;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=81;PP=2962;ReadPosRankSum=0.546;SC=TGAGTCCCCCCGCTCTGTGCG;SOR=0.461;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=248;TCF=138;TCR=110;TR=175;WE=142247156;WS=142247115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,186:0.69:271
chr7	142247213	rs361360	G	T	5861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=386;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.388;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=129;NR=102;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.255;SC=AGAACCGATCGTTGGGCAGCC;SOR=0.659;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=368;TCF=214;TCR=154;TR=231;WE=142247221;WS=142247203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,251:0.65:386
chr7	142247263	.	G	A	1043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=0.000;DP=469;ExcessHet=3.0103;FS=15.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQRankSum=-9.581;QD=2.24;ReadPosRankSum=-6.977;SOR=2.006;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:411,55:0.12:466
chr7	142247270	rs375846702	TG	CA	1894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=483;ExcessHet=3.0103;FS=11.341;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQRankSum=-8.340;QD=3.95;ReadPosRankSum=-6.858;SOR=1.341;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:408,72:0.15:480
chr7	142247288	.	T	C	1547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.878;ClippingRankSum=0.000;DP=547;ExcessHet=3.0103;FS=7.781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQRankSum=-6.684;QD=2.85;ReadPosRankSum=-1.619;SOR=1.297;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:427,117:0.22:544
chr7	142247347	rs361359	A	C	14843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=603;ExcessHet=3.0103;FS=0.638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQRankSum=-1.924;QD=24.74;ReadPosRankSum=-0.353;SOR=0.764;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:131,469:0.78:600
chr7	142247347	.	AT	CC,CT	2962	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5000,0.5000;HP=5;HapScore=1;MGOF=38;MMLQ=17;MQ=59.6;NF=71,186;NR=87,218;PP=2235,2962;QD=14.4839738915;SC=AGCTCTACATATTTTCCCTTC;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=530;TCF=240;TCR=290;TR=158,404;WE=142247356;WS=142247337;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.30:530
chr7	142247348	rs371674308	T	C	4092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=600;ExcessHet=3.0103;FS=3.411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQRankSum=-4.819;QD=6.86;ReadPosRankSum=0.403;SOR=0.970;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:380,217:0.36:597
chr7	142247380	rs374995027	T	A	4776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=456;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.954;HP=5;HapScore=1;MGOF=45;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.979;NF=47;NR=82;PP=1758;ReadPosRankSum=-0.670;SC=TTACTGGGGGTCTGGGAGACT;SOR=1.301;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=430;TCF=191;TCR=239;TR=129;WE=142247388;WS=142247370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:300,153:0.34:453
chr7	142247396	.	A	T	4176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.611;ClippingRankSum=0.000;DP=397;ExcessHet=3.0103;FS=22.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-2.196;QD=10.55;ReadPosRankSum=1.141;SOR=1.523;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:280,116:0.29:396
chr7	142247410	rs56172210	C	T	3339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=359;ExcessHet=3.0103;FS=26.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-2.845;QD=9.33;ReadPosRankSum=-0.282;SOR=1.717;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:261,97:0.27:358
chr7	142247417	rs370449003	AC	A	2626.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=5.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=29.252;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.168;NF=13;NR=69;PP=2964;ReadPosRankSum=0.392;SC=CTGCGGAGACACAAGTTGAGA;SOR=1.996;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=204;TCF=30;TCR=174;TR=82;WE=142247441;WS=142247386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:250,75:0.23:325
chr7	142247425	.	A	G	2095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.905;ClippingRankSum=0.000;DP=315;ExcessHet=3.0103;FS=31.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-3.300;QD=6.67;ReadPosRankSum=-0.626;SOR=2.137;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:246,68:0.22:314
chr7	142247432	.	G	A	1855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.969;ClippingRankSum=0.000;DP=288;ExcessHet=3.0103;FS=29.783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=-3.376;QD=6.47;ReadPosRankSum=-2.810;SOR=2.181;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:227,60:0.21:287
chr7	142247443	.	C	T	1294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.047;ClippingRankSum=0.000;DP=244;ExcessHet=3.0103;FS=60.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=-4.043;QD=5.31;ReadPosRankSum=-3.519;SOR=4.648;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:206,38:0.16:244
chr7	142247445	.	G	A	922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.956;ClippingRankSum=0.000;DP=240;ExcessHet=3.0103;FS=57.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=-4.134;QD=3.84;ReadPosRankSum=-3.718;SOR=4.496;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:204,36:0.15:240
chr7	142247448	.	G	T	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.008;ClippingRankSum=0.000;DP=231;ExcessHet=3.0103;FS=46.861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=-4.411;QD=3.17;ReadPosRankSum=-3.554;SOR=4.144;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:200,31:0.13:231
chr7	142247451	.	C	G	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.374;ClippingRankSum=0.000;DP=224;ExcessHet=3.0103;FS=39.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=-4.595;QD=2.62;ReadPosRankSum=-3.676;SOR=3.927;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:196,28:0.12:224
chr7	142247455	rs57923366	T	TCACACA	2872.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.612;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.670;NF=9;NR=37;PP=2214;ReadPosRankSum=3.869;SC=GTTGTACTCATCACACACACA;SOR=0.380;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=115;TCF=19;TCR=96;TR=46;WE=142247464;WS=142247445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,83:0.48:174
chr7	142247456	.	C	CACACGAATGCACACAGCCCACCCCT	515.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=5.220;ClippingRankSum=0.000;DP=208;ExcessHet=3.0103;FS=29.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQRankSum=-5.052;QD=2.48;ReadPosRankSum=-4.536;SOR=3.454;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:186,22:0.11:208
chr7	142247494	.	C	A	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=0.000;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=8.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQRankSum=-12.969;QD=1.55;ReadPosRankSum=-3.714;SOR=1.024;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:152,18:0.11:170
chr7	142247517	rs361380	C	A	939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FS=17.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQRankSum=-12.143;QD=5.31;ReadPosRankSum=-0.482;SOR=1.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:145,32:0.18:177
chr7	142247529	.	GGC	G	1319.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.384;ClippingRankSum=0.000;DP=177;ExcessHet=3.0103;FS=19.355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.37;MQRankSum=-11.256;QD=7.46;ReadPosRankSum=0.568;SOR=1.121;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:137,40:0.23:177
chr7	142247530	.	G	A	552.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.875;ClippingRankSum=0.000;DP=175;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.34;MQRankSum=-0.999;QD=3.16;ReadPosRankSum=-3.724;SOR=0.726;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:152,23:0.13:175
chr7	142247535	.	G	GAA	1454.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.157;ClippingRankSum=0.000;DP=182;ExcessHet=3.0103;FS=23.351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.18;MQRankSum=-11.080;QD=7.99;ReadPosRankSum=1.034;SOR=1.123;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:139,43:0.24:182
chr7	142247538	.	CTG	C	1051.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-2.173;ClippingRankSum=0.000;DP=185;ExcessHet=3.0103;FS=0.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.93;MQRankSum=-0.324;QD=5.69;ReadPosRankSum=-3.649;SOR=0.826;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:154,31:0.17:185
chr7	142247539	.	T	C	1907.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=0.000;DP=183;ExcessHet=3.0103;FS=21.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.98;MQRankSum=-11.146;QD=10.42;ReadPosRankSum=1.200;SOR=1.118;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:135,48:0.26:183
chr7	142247540	.	G	A	1889.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.881;ClippingRankSum=0.000;DP=183;ExcessHet=3.0103;FS=23.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.89;MQRankSum=-11.167;QD=10.33;ReadPosRankSum=1.160;SOR=1.177;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:134,49:0.27:183
chr7	142247541	.	C	CAT	1141.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.578;ClippingRankSum=0.000;DP=190;ExcessHet=3.0103;FS=0.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.67;MQRankSum=-0.006;QD=6.01;ReadPosRankSum=-2.829;SOR=0.791;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:159,31:0.16:190
chr7	142247546	.	C	A	2177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.536;ClippingRankSum=0.000;DP=197;ExcessHet=3.0103;FS=20.703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.19;MQRankSum=-10.741;QD=11.05;ReadPosRankSum=-0.093;SOR=0.930;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:135,62:0.31:197
chr7	142247554	rs10265119	C	G	1271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FS=5.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.91;MQRankSum=-0.241;QD=6.42;ReadPosRankSum=-2.082;SOR=1.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:155,43:0.22:198
chr7	142247567	rs372792593	A	G	4596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FS=8.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.97;MQRankSum=-10.419;QD=21.79;ReadPosRankSum=2.211;SOR=0.386;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,115:0.55:211
chr7	142247571	rs376050671	A	G	4623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FS=7.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.91;MQRankSum=-9.894;QD=22.23;ReadPosRankSum=1.987;SOR=0.408;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,119:0.57:208
chr7	142247605	rs370122363	G	A	1234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-1.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.272;HP=2;HapScore=1;MGOF=80;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-6.670;NF=25;NR=29;PP=588;ReadPosRankSum=-0.454;SC=CCAGATCAGGGTCACTGTGAG;SOR=0.446;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=168;TCF=76;TCR=92;TR=54;WE=142247613;WS=142247595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,72:0.36:200
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chr7	142250988	rs361437	G	A	2010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=46;PP=1226;ReadPosRankSum=0.470;SC=GATCCCAGCAGTCACTGGACC;SOR=0.695;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=297;TCF=164;TCR=133;TR=102;WE=142250996;WS=142250978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:211,111:0.34:322
chr7	142251132	rs361436	G	T	973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.508;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=28;PP=559;ReadPosRankSum=0.870;SC=GGAGCCTGATGCTCATGGCAG;SOR=0.529;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=139;TCF=45;TCR=94;TR=44;WE=142251140;WS=142251122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,50:0.33:152
chr7	142326909	rs76454382	C	G	8937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=139;NR=153;PP=2965;SC=ACTACTCACACATAGTAAATG;SOR=0.856;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=292;TCF=139;TCR=153;TR=292;WE=142326917;WS=142326899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,316:1.00:316
chr7	142353577	rs71522189	C	CTTTGT	5314.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.388;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.250;NF=24;NR=41;PP=2992;ReadPosRankSum=0.693;SC=CAGATCCAAGCTTTGTTTTGT;SOR=0.525;SbPval=0.01;Source=Platypus;TC=188;TCF=36;TCR=152;TR=65;WE=142353585;WS=142353567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,119:0.99:120
chr7	142364553	rs17254	G	A	3335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=56;PP=2473;SC=CTGGGCCTACGGTTGATCTAT;SOR=0.800;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=59;TCR=56;TR=115;WE=142364561;WS=142364543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr7	142378708	rs361418	T	G	14655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=540;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=278;NR=220;PP=2965;ReadPosRankSum=0.442;SC=TAATTCCTCTTTGTTGGGTTT;SOR=0.634;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=500;TCF=278;TCR=222;TR=498;WE=142378716;WS=142378698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,538:1.00:539
chr7	142378831	rs76429157	C	G	16593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=595;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.99;NF=269;NR=268;PP=2965;SC=TTGTTATAGGCACAGGAAAGA;SOR=0.713;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=538;TCF=270;TCR=268;TR=537;WE=142378839;WS=142378821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,594:1.00:594
chr7	142423161	rs112325538	A	G	714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=5;PP=454;SC=AGGTGGAGACATTACAGAAAC;SOR=2.753;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=22;WE=142423169;WS=142423151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr7	142423289	rs17251	C	A	6373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=131;NR=91;PP=2965;SC=ACATAGGCAACTTTTGGCCTT;SOR=1.040;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=222;TCF=131;TCR=91;TR=222;WE=142423297;WS=142423279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr7	142423562	rs62001054	C	T	6696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=114;PP=2965;SC=AATGTTGAGGCGACTGATAAG;SOR=0.742;Source=Platypus;TCF=114;WE=142423570;WS=142423552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr7	142428611	rs361326	C	T	6866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=134;NR=92;PP=2965;SC=CCTACTATTTCGAGGTCTTTT;SOR=1.074;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=227;TCF=134;TCR=93;TR=226;WE=142428619;WS=142428601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr7	142428626	rs361327	A	C	8266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=157;NR=120;PP=2965;SC=TCTTTTATACAAAGCTCTTTT;SOR=0.948;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=277;TCF=157;TCR=120;TR=277;WE=142428634;WS=142428616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,296:1.00:296
chr7	142448199	rs112413030	GGGTGGAAA	G	1049.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.831;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=2975;ReadPosRankSum=2.141;SC=TGTTAACACTGGGTGGAAAGG;SOR=0.885;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=62;TCF=4;TCR=58;TR=19;WE=142448214;WS=142448189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,31:0.30:103
chr7	142458304	.	T	A	1897	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=36;MMLQ=27;MQ=54.21;NF=34;NR=12;PP=1897;QD=41.9950263597;SC=AGCCTCACTGTGCTTGTTAAG;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=88;TCF=69;TCR=19;TR=46;WE=142458324;WS=142458294;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:42,46:0.52:88
chr7	142458316	.	A	T	1897	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000;HP=3;HapScore=4;MGOF=36;MMLQ=27;MQ=55.5;NF=42;NR=24;PP=1897;QD=29.2692607962;SC=CTTGTTAAGGATTTCTAATTA;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=127;TCF=88;TCR=39;TR=66;WE=142458324;WS=142458294;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:61,66:0.52:127
chr7	142458371	rs367779270	T	C	1472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=23.225;HP=1;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-12.277;NF=68;NR=56;PP=1561;ReadPosRankSum=2.516;SC=TAACATGCTATTGACTTGCCT;SOR=0.732;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=275;TCF=162;TCR=113;TR=124;WE=142458379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,88:0.36:242
chr7	142458451	rs111033566	A	T	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FS=39.783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.21;MQRankSum=-15.476;QD=0.30;ReadPosRankSum=0.755;SOR=2.625;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:268,35:0.12:303
chr7	142458737	rs370066365	C	G	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=2.683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.15;MQRankSum=-7.238;QD=5.19;ReadPosRankSum=-0.312;SOR=1.274;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,16:0.19:84
chr7	142458739	rs374137559	T	C	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=2.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.19;MQRankSum=-7.285;QD=5.13;ReadPosRankSum=-0.071;SOR=1.244;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,16:0.19:85
chr7	142458829	rs377669553	A	G	3904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FS=1.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.25;MQRankSum=-9.625;QD=11.52;ReadPosRankSum=3.657;SOR=0.820;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:231,108:0.32:339
chr7	142458837	rs370580835	A	T	3926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=350;ExcessHet=3.0103;FS=1.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQRankSum=-10.043;QD=11.22;ReadPosRankSum=2.611;SOR=0.763;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:239,111:0.32:350
chr7	142458841	rs375181092	AT	A	3917.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.867;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-10.158;NF=16;NR=45;PP=2954;ReadPosRankSum=2.324;SC=GCAGGCAAGTATCTTTTGCTG;SOR=0.725;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=196;TCF=38;TCR=158;TR=61;WE=142458849;WS=142458819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:245,111:0.31:356
chr7	142458873	rs373388800	A	C	2960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FS=1.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.07;MQRankSum=-11.733;QD=9.05;ReadPosRankSum=-3.486;SOR=0.585;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:225,102:0.31:327
chr7	142458881	rs376074412	A	T	2401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FS=3.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.96;MQRankSum=-13.271;QD=8.55;ReadPosRankSum=-0.567;SOR=0.930;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:211,70:0.25:281
chr7	142458884	rs370405149	C	G	2323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FS=4.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.89;MQRankSum=-13.710;QD=8.51;ReadPosRankSum=-0.123;SOR=1.035;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:208,65:0.24:273
chr7	142458886	rs373808731	TT	AC	2152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FS=5.960;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.75;MQRankSum=-13.926;QD=8.00;ReadPosRankSum=-0.402;SOR=1.088;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:204,65:0.24:269
chr7	142458898	rs371109898	A	T	1870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FS=3.567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.20;MQRankSum=-14.772;QD=7.96;ReadPosRankSum=-0.720;SOR=0.986;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:179,56:0.24:235
chr7	142458902	.	G	C	1730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.602;ClippingRankSum=0.000;DP=238;ExcessHet=3.0103;FS=2.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.22;MQRankSum=-15.188;QD=7.30;ReadPosRankSum=-0.474;SOR=0.942;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:182,55:0.23:237
chr7	142458906	rs374242167	T	G	1775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FS=2.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.10;MQRankSum=-14.680;QD=7.82;ReadPosRankSum=-1.013;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:173,54:0.24:227
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chr7	142458929	rs371622191	G	C	1034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=11.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.31;MQRankSum=-12.000;QD=6.51;ReadPosRankSum=-0.154;SOR=1.647;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:124,35:0.22:159
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chr7	142460313	rs6666	T	C	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=607;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.68;MQRankSum=3.528;QD=0.88;ReadPosRankSum=0.038;SOR=0.740;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:511,87:0.15:598
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chr7	142460339	rs200973660	G	A	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=528;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.32;MQRankSum=-2.010;QD=0.40;ReadPosRankSum=2.177;SOR=0.805;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:450,66:0.13:516
chr7	142460369	rs201719096	G	A	4150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=427;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.352;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-11.761;NF=55;NR=82;PP=1789;ReadPosRankSum=1.952;SC=AAGATTACCAGCAACATGTTC;SOR=0.982;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=400;TCF=185;TCR=215;TR=137;WE=142460377;WS=142460359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:282,140:0.33:422
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chr7	142460412	.	A	C	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=11.413;ClippingRankSum=0.000;DP=403;ExcessHet=3.0103;FS=51.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQRankSum=-18.891;QD=1.62;ReadPosRankSum=-2.245;SOR=5.983;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:363,40:0.10:403
chr7	142460415	.	T	C	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.380;ClippingRankSum=0.000;DP=403;ExcessHet=3.0103;FS=47.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQRankSum=-19.723;QD=1.26;ReadPosRankSum=-2.661;SOR=5.838;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:366,37:0.09:403
chr7	142460660	.	T	C	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.162;ClippingRankSum=0.000;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=1.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQRankSum=-4.890;QD=4.57;ReadPosRankSum=-1.844;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,9:0.18:49
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chr7	142460671	rs377695327	A	G	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=1.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQRankSum=-5.636;QD=6.07;ReadPosRankSum=-1.403;SOR=0.318;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,11:0.20:56
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chr7	142460744	rs150930992	G	C	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FS=8.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQRankSum=-12.396;QD=0.89;ReadPosRankSum=1.443;SOR=0.389;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:202,21:0.09:223
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chr7	142460865	rs6667	T	C	2715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=483;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.561;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=70;PP=1718;ReadPosRankSum=0.332;SC=TAGCTGCCAATAGCTAAAGCC;SOR=0.632;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=451;TCF=219;TCR=232;TR=139;WE=142460881;WS=142460855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:329,154:0.32:483
chr7	142468205	.	A	C	2598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.820;ClippingRankSum=0.000;DP=207;ExcessHet=3.0103;FS=2.614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.75;MQRankSum=-13.110;QD=12.55;ReadPosRankSum=1.788;SOR=0.513;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:132,75:0.36:207
chr7	142468206	.	G	C	927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.380;ClippingRankSum=0.000;DP=204;ExcessHet=3.0103;FS=0.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.81;MQRankSum=-9.666;QD=4.55;ReadPosRankSum=2.273;SOR=0.595;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:166,38:0.19:204
chr7	142468213	.	A	G	2480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.062;ClippingRankSum=0.000;DP=211;ExcessHet=3.0103;FS=1.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.24;MQRankSum=-13.192;QD=11.76;ReadPosRankSum=1.974;SOR=0.539;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:141,70:0.33:211
chr7	142468218	.	G	A	800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.996;ClippingRankSum=0.000;DP=211;ExcessHet=3.0103;FS=3.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.32;MQRankSum=-6.579;QD=3.80;ReadPosRankSum=-0.479;SOR=0.433;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:178,33:0.16:211
chr7	142468221	.	T	A	788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.027;ClippingRankSum=0.000;DP=217;ExcessHet=3.0103;FS=3.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.39;MQRankSum=-6.744;QD=3.63;ReadPosRankSum=-0.234;SOR=0.414;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:184,33:0.15:217
chr7	142468228	.	A	G	2164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.077;ClippingRankSum=0.000;DP=221;ExcessHet=3.0103;FS=2.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.59;MQRankSum=-13.539;QD=9.80;ReadPosRankSum=0.535;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:158,63:0.29:221
chr7	142468232	.	C	T	656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.980;ClippingRankSum=0.000;DP=221;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.68;MQRankSum=-10.576;QD=2.97;ReadPosRankSum=-0.123;SOR=0.637;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:190,31:0.14:221
chr7	142468241	.	C	G	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.936;ClippingRankSum=0.000;DP=238;ExcessHet=3.0103;FS=0.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.97;MQRankSum=-11.067;QD=2.13;ReadPosRankSum=-1.117;SOR=0.586;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:210,28:0.12:238
chr7	142468244	.	G	A	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.049;ClippingRankSum=0.000;DP=235;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.06;MQRankSum=-11.229;QD=1.79;ReadPosRankSum=-1.484;SOR=0.647;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:209,26:0.11:235
chr7	142470290	rs11769872	T	C	1182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=25;PP=735;ReadPosRankSum=1.088;SC=GGAAGGAGGGTTAAGGAGCAT;SOR=0.669;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=154;TCF=85;TCR=69;TR=57;WE=142470298;WS=142470280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,63:0.39:162
chr7	142470364	rs11770572	T	C	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=28;PP=564;ReadPosRankSum=-0.543;SC=AACAGAAAGGTCCTGGGTCTC;SOR=0.955;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=147;TCF=70;TCR=77;TR=50;WE=142470372;WS=142470354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,53:0.34:156
chr7	142470544	rs377545759	C	T	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FS=2.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.04;MQRankSum=-3.028;QD=0.59;ReadPosRankSum=-1.880;SOR=0.403;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:170,24:0.12:194
chr7	142470574	rs3752404	A	G	4311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-2.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=463;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.820;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=6.851;NF=132;NR=68;PP=2962;ReadPosRankSum=0.219;SC=AGAGCACAACATCGAAGTTCT;SOR=0.881;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=437;TCF=283;TCR=154;TR=200;WE=142470605;WS=142470564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:238,216:0.48:454
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chr7	142470585	.	G	A	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.469;ClippingRankSum=0.000;DP=570;ExcessHet=3.0103;FS=0.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.53;MQRankSum=-2.414;QD=0.90;ReadPosRankSum=3.330;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:510,51:0.09:561
chr7	142470597	.	G	A	6596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-3.680;ClippingRankSum=0.000;DP=667;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.613;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-11.628;NF=111;NR=84;PP=2962;ReadPosRankSum=1.187;SC=AGGGGAATGAGCAGTTCATCA;SOR=0.450;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=626;TCF=371;TCR=255;TR=195;WE=142470605;WS=142470564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:455,202:0.31:657
chr7	142470607	.	A	T	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.814;ClippingRankSum=0.000;DP=753;ExcessHet=3.0103;FS=2.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.91;MQRankSum=-2.287;QD=0.65;ReadPosRankSum=3.267;SOR=1.020;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:683,61:0.08:744
chr7	142470612	rs367807406	A	G	2345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=792;ExcessHet=3.0103;FS=0.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.02;MQRankSum=-10.736;QD=3.00;ReadPosRankSum=4.902;SOR=0.622;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:643,140:0.18:783
chr7	142470614	.	C	T	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=0.000;DP=806;ExcessHet=3.0103;FS=2.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.05;MQRankSum=-2.434;QD=0.46;ReadPosRankSum=2.785;SOR=1.053;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:734,63:0.08:797
chr7	142470645	rs368963025	T	C	5737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=930;ExcessHet=3.0103;FS=1.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQRankSum=-17.889;QD=6.23;ReadPosRankSum=1.946;SOR=0.600;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:707,214:0.23:921
chr7	142470646	rs375588069	T	C	1126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=929;ExcessHet=3.0103;FS=3.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQRankSum=-18.928;QD=1.22;ReadPosRankSum=2.709;SOR=0.763;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:763,157:0.17:920
chr7	142470683	.	C	CCT	1097.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.866;ClippingRankSum=0.000;DP=814;ExcessHet=3.0103;FS=23.683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQRankSum=-18.605;QD=1.47;ReadPosRankSum=-7.058;SOR=3.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:666,79:0.11:745
chr7	142470685	.	ATG	A	1058.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.806;ClippingRankSum=0.000;DP=770;ExcessHet=3.0103;FS=26.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQRankSum=-19.421;QD=1.39;ReadPosRankSum=-7.295;SOR=3.207;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:690,73:0.10:763
chr7	142470691	rs10952531	G	C	3338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=712;ExcessHet=3.0103;FS=1.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQRankSum=3.971;QD=4.72;ReadPosRankSum=0.562;SOR=0.603;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:504,204:0.29:708
chr7	142470693	.	T	C	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.576;ClippingRankSum=0.000;DP=700;ExcessHet=3.0103;FS=16.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQRankSum=-21.362;QD=0.47;ReadPosRankSum=-7.366;SOR=2.696;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:644,55:0.08:699
chr7	142478608	rs73742439	G	A	190.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=4;NR=1;PP=83;SC=TGCAGGAAAGGGCCGCTCTCC;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=142478616;WS=142478598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr7	142478755	rs73742441	T	C	2273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=26;PP=1048;SC=GGAATGGTGATCCTCACCTCA;SOR=0.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=58;TCF=32;TCR=26;TR=58;WE=142478763;WS=142478745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr7	142478771	rs201689354	A	AC	2779.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=25;PP=1612;SC=CCTCACAGACACTCCTCTCTG;SOR=0.774;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=11;TCR=25;TR=35;WE=142478779;WS=142478761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr7	142478865	.	T	C	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.709;ClippingRankSum=0.000;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=4.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQRankSum=-8.647;QD=0.59;ReadPosRankSum=-0.937;SOR=1.629;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,11:0.13:85
chr7	142478881	.	T	TAG	443.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.665;ClippingRankSum=0.000;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=2.265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQRankSum=-8.523;QD=4.31;ReadPosRankSum=0.314;SOR=1.030;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,16:0.16:103
chr7	142478897	rs73742442	T	C	3488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.39;QD=30.08;SOR=0.877;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr7	142478897	.	TCTCAGGCCCCAACCACCCCCCGTTACTGGCAGACAT	CCTCAGGCCCCAACCACCCCCCGTTACTGGCAGACAT,CCTCAGGCTCCAACCATACCCCGTTCCTGGCAGATGC	2962	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MMLQ=28;MQ=57.8;NF=61,13;NR=42,6;PP=2962,2031;QD=20;SC=TCATGCCCTGTCTCAGGCCCC;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=61;TCR=42;TR=103,19;WE=142478941;WS=142478887;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:103
chr7	142478905	.	C	T	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=4.589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQRankSum=-8.619;QD=4.54;ReadPosRankSum=2.737;SOR=1.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,21:0.17:121
chr7	142478913	.	CC	TA	672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.805;ClippingRankSum=0.000;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=1.910;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQRankSum=-8.832;QD=5.51;ReadPosRankSum=2.102;SOR=0.919;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,23:0.19:122
chr7	142479912	rs200484890	C	G	565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=17.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.64;MQRankSum=-0.672;QD=4.32;ReadPosRankSum=0.586;SOR=0.586;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:108,23:0.18:131
chr7	142479915	rs377017470	T	C	855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=8.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=81.575;HP=4;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-9.719;NF=39;NR=1;PP=775;ReadPosRankSum=-2.273;SC=CCAGTTGCTGTCCCCTTTGAT;SOR=7.078;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=127;TCF=89;TCR=38;TR=40;WE=142479925;WS=142479902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,38:0.29:132
chr7	142479917	rs369591097	C	T	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=16.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.76;MQRankSum=-1.144;QD=3.64;ReadPosRankSum=1.352;SOR=0.633;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:116,21:0.15:137
chr7	142479940	rs58649169	C	T	2060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=19.369;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=4.912;NF=42;NR=42;PP=2410;ReadPosRankSum=3.841;SC=ATGACAAGATCGTTGGGGGCT;SOR=0.429;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=200;TCF=119;TCR=81;TR=84;WE=142479962;WS=142479930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,91:0.43:211
chr7	142479954	rs201779716	C	T	3680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.684;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.621;NF=98;NR=62;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.833;SC=GGGGGCTACACCTGTGAGGAG;SOR=1.065;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=246;TCF=141;TCR=105;TR=160;WE=142479962;WS=142479930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,167:0.68:246
chr7	142480002	rs199512312	C	A	5828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-4.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=348;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.971;HP=2;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-6.629;NF=124;NR=125;PP=2962;ReadPosRankSum=1.675;SC=AATTCTGGCTCCCACTTCTGC;SOR=0.733;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=326;TCF=164;TCR=162;TR=249;WE=142480020;WS=142479992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,264:0.77:345
chr7	142480012	rs56146961	C	T	2496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=353;ExcessHet=3.0103;FS=0.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.95;MQRankSum=6.605;QD=7.13;ReadPosRankSum=-0.835;SOR=0.639;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:268,82:0.23:350
chr7	142480034	rs10808019	C	A	1754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.24;MQRankSum=5.888;QD=5.30;ReadPosRankSum=-0.082;SOR=0.692;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:251,80:0.24:331
chr7	142480067	rs201659809	C	T	2903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.922;HP=1;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-6.897;NF=46;NR=84;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.905;SC=CTGCTACAAGCCGTAAGTGTG;SOR=0.949;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=183;TCF=68;TCR=115;TR=130;WE=142480103;WS=142480057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,126:0.69:182
chr7	142480079	rs371397657	T	G	3013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=3.604;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.61;MQRankSum=-8.701;QD=23.36;ReadPosRankSum=-2.748;SOR=1.118;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,80:0.62:129
chr7	142480083	.	A	C	2937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.295;ClippingRankSum=0.000;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=5.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.44;MQRankSum=-8.579;QD=24.69;ReadPosRankSum=-3.503;SOR=1.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,74:0.62:119
chr7	142480095	rs374574556	G	A	990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.266;HP=3;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-7.954;NF=10;NR=44;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.921;SC=TGACTGCAAAGCTCCCAGCCA;SOR=1.739;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=89;TCF=21;TCR=68;TR=54;WE=142480103;WS=142480057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,42:0.52:80
chr7	142480126	rs374398930	C	A	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.39;MQRankSum=-4.401;QD=2.99;ReadPosRankSum=-2.754;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,7:0.24:29
chr7	142480137	rs57353422	A	G	951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.93;QD=43.26;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr7	142480141	rs55775033	C	G	806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.91;QD=47.46;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr7	142480148	rs10808021	G	C	520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.66;MQRankSum=3.883;QD=37.20;ReadPosRankSum=1.247;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
chr7	142481234	rs57725689	T	C	6292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=112;NR=86;PP=2965;SC=AACAGGATTATTCTGAACAAT;SOR=0.819;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=199;TCF=112;TCR=87;TR=198;WE=142481242;WS=142481224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr7	142481376	rs73740310	T	A	1358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=33;PP=934;SC=CCCTGAGCTCTGGGGGTGAGT;SOR=3.467;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=6;TCR=33;TR=39;WE=142481384;WS=142481366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr7	142481807	rs4726591	C	T	2869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=31;PP=1538;SC=AGTGCCTGGACGCTCCTGTGC;SOR=1.072;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=53;TCR=31;TR=84;WE=142481815;WS=142481797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr7	142481867	rs59320698	C	G	4141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=51;PP=2283;SC=TTACCAGCAACATGTTCTGTG;SOR=1.061;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=72;TCR=51;TR=123;WE=142481875;WS=142481857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr7	142482184	rs73740312	A	C	782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=8;PP=556;SC=TCCATCTCTCAATAAAACTTG;SOR=1.528;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=25;WE=142482192;WS=142482174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr7	142482376	.	A	C	471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.382;ClippingRankSum=0.000;DP=177;ExcessHet=3.0103;FS=3.309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.28;MQRankSum=-13.133;QD=2.67;ReadPosRankSum=-4.214;SOR=0.530;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:138,39:0.22:177
chr7	142494361	.	C	A	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.861;ClippingRankSum=0.000;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=0.844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.54;ReadPosRankSum=1.249;SOR=0.562;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:112,24:0.18:136
chr7	142494606	rs2071361	C	G	1417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.569;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=33;PP=902;ReadPosRankSum=-0.538;SC=GCTGAAGCCCCGGAACTGGGG;SOR=0.682;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=178;TCF=90;TCR=88;TR=71;WE=142494614;WS=142494596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,75:0.40:187
chr7	142495126	rs12532977	GG	AT	2304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FS=2.523;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.101;SOR=0.894;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:169,68:0.29:237
chr7	142495308	rs56352733	G	A	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=247;ReadPosRankSum=1.042;SC=CGCTCCTGGGGAAAGACTGGG;SOR=0.551;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=70;TCF=19;TCR=51;TR=20;WE=142495316;WS=142495298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,23:0.32:73
chr7	142498735	rs377360215	A	C	3338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=493;ExcessHet=3.0103;FS=4.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.79;ReadPosRankSum=-7.586;SOR=0.975;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:385,107:0.22:492
chr7	142498738	rs370415932	C	G	3361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=523;ExcessHet=3.0103;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.44;ReadPosRankSum=-5.920;SOR=0.922;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:408,114:0.22:522
chr7	142498833	.	A	T	11722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.723;ClippingRankSum=0.000;DP=698;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.82;ReadPosRankSum=0.003;SOR=0.683;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:385,312:0.45:697
chr7	142498837	rs1042957	C	T	11602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=681;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.09;ReadPosRankSum=0.260;SOR=0.722;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:377,302:0.44:679
chr7	142498897	rs1042959	A	G	6210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=637;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=151;NR=138;PP=2962;ReadPosRankSum=0.289;SC=GGGTCAGCACAGACCCGCAGC;SOR=0.716;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=616;TCF=318;TCR=298;TR=289;WE=142498905;WS=142498887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:333,302:0.48:635
chr7	142499071	rs1042960	T	C	3673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.847;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=100;PP=1965;ReadPosRankSum=-2.545;SC=GGGCCAAACCTGTCACCCAGA;SOR=0.597;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=309;TCF=126;TCR=183;TR=172;WE=142499079;WS=142499061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,183:0.55:331
chr7	142583330	rs17881456	A	C	2862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=67;PP=2032;SC=AGCCTTGGGGACACATCAGCC;SOR=2.327;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=21;TCR=67;TR=88;WE=142583338;WS=142583320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr7	142610003	rs199884521	GATCT	G	164.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.345;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=241;ReadPosRankSum=-1.803;SC=TTCTATCTCTGATCTATCTAT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=5;WE=142610014;WS=142609993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr7	142749417	rs17164102	C	T	1554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.876;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=15;PP=1041;ReadPosRankSum=1.422;SC=CTCTTGCATGCAGGGCCCCAT;SOR=0.947;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=98;TCF=73;TCR=25;TR=64;WE=142749425;WS=142749407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,65:0.64:101
chr7	142749737	rs17164103	C	T	5472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=352;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.148;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=117;NR=106;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.916;SC=TCCAGTTCTACTTCCACTTTT;SOR=0.602;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=329;TCF=166;TCR=163;TR=223;WE=142749745;WS=142749727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,239:0.68:351
chr7	142749953	rs11975892	C	T	7127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=501;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.542;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=163;NR=134;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.444;SC=GCGACGTCATCAACCACTTCT;SOR=0.744;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=470;TCF=253;TCR=217;TR=297;WE=142749961;WS=142749943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,318:0.63:501
chr7	142750147	rs10245778	C	T	3884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.790;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=71;PP=2686;ReadPosRankSum=1.631;SC=AAGGCTTTCTCCACTTGCGGG;SOR=0.597;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=202;TCF=105;TCR=97;TR=142;WE=142750155;WS=142750137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,155:0.70:221
chr7	142832255	rs10234174	C	T	3523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.916;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=61;PP=2209;ReadPosRankSum=1.597;SC=GTCTCTGATCCTGGTGTTCTG;SOR=0.760;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=262;TCF=150;TCR=112;TR=145;WE=142832263;WS=142832245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,159:0.56:283
chr7	142836440	rs6959713	A	G	1665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=37;PP=1253;SC=AGATGGGGAAAGCACCCAGGT;SOR=2.437;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=12;TCR=37;TR=49;WE=142836448;WS=142836430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr7	142919731	rs10260248	C	A	5514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=378;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=128;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.739;SC=AAGTACTTCTCTGAGACCAAT;SOR=0.697;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=356;TCF=155;TCR=201;TR=229;WE=142919739;WS=142919721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,246:0.65:376
chr7	143016928	rs6962852	C	T	3510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.521;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=72;PP=1939;ReadPosRankSum=-1.328;SC=CCAGTTCTACCGTGGACAGCA;SOR=0.648;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=204;TCF=95;TCR=109;TR=136;WE=143016936;WS=143016918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,158:0.69:230
chr7	143016995	rs6948526	T	A	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.781;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=20;PP=368;ReadPosRankSum=-1.146;SC=AATAAAGAAATCTGGAGTAGA;SOR=0.572;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=112;TCF=43;TCR=69;TR=33;WE=143017003;WS=143016985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,34:0.27:124
chr7	143017807	rs10282312	G	T	4940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=99;NR=70;PP=2880;SC=AGGGGAAGACGGGATCTTTCT;SOR=0.932;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=169;TCF=99;TCR=70;TR=169;WE=143017815;WS=143017797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr7	143017960	rs7800971	C	G	1080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=27;PP=779;SC=GGTGTGTTATCGGAAGCGAAT;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=35;WE=143017968;WS=143017950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr7	143020625	rs2272257	T	C	3137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.883;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=50;PP=2255;ReadPosRankSum=-0.541;SC=CTTCCTCGTCTCCCTGTCTGC;SOR=0.470;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=163;TCF=96;TCR=67;TR=115;WE=143020633;WS=143020615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,125:0.69:181
chr7	143020649	rs2272256	G	A	3903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.582;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=99;NR=52;PP=2511;ReadPosRankSum=-0.088;SC=CCCTGGCCACGTGATGCCTCT;SOR=0.531;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=211;TCF=142;TCR=69;TR=151;WE=143020657;WS=143020639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,165:0.70:235
chr7	143020780	rs2272255	T	C	10392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=703;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.542;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=210;NR=223;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.564;SC=CCCTCTGTGTTAGTTTCCCTC;SOR=0.656;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=670;TCF=321;TCR=349;TR=433;WE=143020788;WS=143020770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:253,450:0.64:703
chr7	143020944	rs41276051	G	A	4192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.108;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=94;PP=2771;ReadPosRankSum=-0.697;SC=TCCTGGTGTCGGCCTGTGCAG;SOR=0.800;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=230;TCF=98;TCR=132;TR=161;WE=143020952;WS=143020934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,173:0.71:244
chr7	143028536	rs2242493	G	A	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.029;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=291;ReadPosRankSum=0.322;SC=GGGGATGTGGGCAGATAGGAA;SOR=1.432;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=33;TCF=19;TCR=14;TR=15;WE=143028544;WS=143028526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr7	143029371	rs2367941	G	T	456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=3;PP=327;SC=TCAAATATTGGTTTTTTGTGT;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=143029379;WS=143029361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr7	143036318	rs2272253	G	A	4679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=101;NR=56;PP=2897;SC=GAGTTGAAAGGGTATTCCAAC;SOR=1.199;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=157;TCF=101;TCR=56;TR=157;WE=143036326;WS=143036308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr7	143036337	rs2272252	C	T	5723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=118;NR=71;PP=2965;SC=ACGCTTCTTTCTACTCCAGTT;SOR=1.092;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=189;TCF=118;TCR=71;TR=189;WE=143036345;WS=143036327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr7	143036548	rs6464542	T	A	6576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=116;NR=98;PP=2965;SC=TTCTGAAAACTGAGAGCAAGG;SOR=0.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=214;TCF=116;TCR=98;TR=214;WE=143036556;WS=143036538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr7	143039311	rs940864	A	G	6931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=139;PP=2965;SC=CTGAGCTTAGAGTTAAAGTTT;SOR=1.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=226;TCF=87;TCR=139;TR=226;WE=143039319;WS=143039301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr7	143042552	rs10952548	G	A	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.853;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=111;ReadPosRankSum=0.025;SC=TCAGGAGTGCGGAGCGCGGTG;SOR=1.781;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=27;TCF=18;TCR=9;TR=9;WE=143042560;WS=143042542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
chr7	143042983	rs45554138	A	G	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.169;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=388;ReadPosRankSum=-0.046;SC=GAGGGAGGGGAGAGTCTGGTA;SOR=0.446;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=16;TCR=32;TR=23;WE=143042991;WS=143042973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,23:0.48:48
chr7	143043240	rs13438232	C	T	9783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=365;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=179;NR=155;PP=2965;SC=CAGCTTCCTCCTTCCCTTGCT;SOR=0.767;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=335;TCF=180;TCR=155;TR=334;WE=143043248;WS=143043230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,365:1.00:365
chr7	143043377	rs56680997	C	G	2742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=64;PP=1842;SC=CCCAACTCACCCCTTGTGGGT;SOR=2.486;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=21;TCR=64;TR=85;WE=143043385;WS=143043367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr7	143043607	rs2242492	G	C	2673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=19;PP=1777;SC=TTAGGCACTGGGTGGGGCCCC;SOR=2.468;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=62;TCR=19;TR=81;WE=143043615;WS=143043597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr7	143043890	rs2242491	A	G	3911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=66;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.071;SC=ATGATGAATGAAAAGGAGGCA;SOR=0.708;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=216;TCF=119;TCR=97;TR=151;WE=143043910;WS=143043880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,165:0.71:234
chr7	143043902	rs2242490	C	T	3959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.387;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=60;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.503;SC=AAGGAGGCATCGGTGGTCCTG;SOR=0.883;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=227;TCF=133;TCR=94;TR=157;WE=143043910;WS=143043880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,170:0.69:245
chr7	143047375	rs41277416	C	T	1065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.559;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=4;PP=769;ReadPosRankSum=-0.751;SC=TTCTGGGCAGCGGCTAGGAGG;SOR=1.179;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=51;TCF=45;TCR=6;TR=39;WE=143047383;WS=143047365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,42:0.75:56
chr7	143053723	rs17854363	C	T	7300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=515;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.165;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=168;NR=149;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.209;SC=CGGCTGAGAGCGGTAGACATC;SOR=0.787;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=480;TCF=252;TCR=228;TR=317;WE=143053731;WS=143053713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,337:0.65:515
chr7	143054309	rs4236482	G	A	1653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=18;PP=1023;ReadPosRankSum=0.354;SC=GCTGAGTGGAGGCAGCTGAGA;SOR=0.643;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=87;TCF=61;TCR=26;TR=61;WE=143054317;WS=143054299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,67:0.74:91
chr7	143054585	rs6958357	A	G	2454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=47;PP=1465;SC=GGGGTAGGAAAACATCTTAGT;SOR=1.556;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=27;TCR=47;TR=74;WE=143054593;WS=143054575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr7	143078928	rs10808025	C	G	1352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=36;PP=1061;SC=GGGGGGCAGTCGTTTCGGGAA;SOR=4.615;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=3;TCR=36;TR=39;WE=143078936;WS=143078918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr7	143079806	rs6464546	G	A	3993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=63;PP=2535;ReadPosRankSum=-1.095;SC=AGGAAAAGCAGGGCTCAGGGC;SOR=0.709;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=224;TCF=134;TCR=90;TR=158;WE=143079814;WS=143079796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,170:0.71:239
chr7	143085819	rs6954724	G	A	3223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.136;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=56;PP=2018;ReadPosRankSum=0.211;SC=CTTGCTGTGGGGTGCCGGTTC;SOR=0.580;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=193;TCF=107;TCR=86;TR=125;WE=143085827;WS=143085809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,139:0.66:210
chr7	143088823	rs1804527	T	C	13423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=514;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=222;NR=249;PP=2965;SC=CGGTTCGATATGGGATCCCAT;SOR=0.839;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=472;TCF=223;TCR=249;TR=471;WE=143088831;WS=143088813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,511:1.00:511
chr7	143088867	rs6967117	T	C	9499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=348;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=141;NR=179;PP=2965;SC=CGAAGAGTCATCCTGTGGGAC;SOR=1.030;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=320;TCF=141;TCR=179;TR=320;WE=143088875;WS=143088857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,347:1.00:347
chr7	143092269	rs34372369	G	A	7771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=536;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.596;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=178;NR=130;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.155;SC=GATCATGATCGGCTTTCCTGA;SOR=0.919;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=488;TCF=270;TCR=218;TR=308;WE=143092277;WS=143092259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:191,342:0.64:533
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chr7	143097100	rs4725617	A	G	6910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=105;NR=130;PP=2965;SC=GGAGCCAGACACAAGGTCTCG;SOR=0.984;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=235;TCF=105;TCR=130;TR=235;WE=143097108;WS=143097076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr7	143097320	rs7786333	C	T	352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=220;SC=TCATGCAATCCTCTTATGAGG;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=143097328;WS=143097310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr7	143105830	rs12703524	C	A	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=1.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5248;FS=1.824;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=114;ReadPosRankSum=3.334;SC=CCTTGGCGCGCGCCCCCGGGG;SOR=1.473;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=10;WE=143105838;WS=143105820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr7	143140416	rs58270521	C	T	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.808;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=98;ReadPosRankSum=1.531;SC=TGATAGCCTGCGTCCTCTACT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=8;WE=143140424;WS=143140408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr7	143141475	rs4595035	T	C	1523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=29;PP=874;SC=TGAAGAGTCGTCGTTCCTCAA;SOR=1.697;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=16;TCR=29;TR=45;WE=143141483;WS=143141465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr7	143175154	rs1404635	G	A	2285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=452;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.574;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.98;MQRankSum=0.652;NF=66;NR=57;PP=1521;ReadPosRankSum=0.683;SC=TGGTTGGGACGGTGCACAACT;SOR=0.601;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=417;TCF=230;TCR=187;TR=123;WE=143175162;WS=143175144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:318,133:0.29:451
chr7	143175345	rs10278721	C	T	1036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.987;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=24;PP=644;ReadPosRankSum=-3.454;SC=TGGAGGTTCCCAGGGTGGGTG;SOR=0.291;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=151;TCF=66;TCR=85;TR=50;WE=143175353;WS=143175335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,56:0.33:171
chr7	143956181	rs201948019	A	C	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.97;MQRankSum=-1.447;QD=4.63;ReadPosRankSum=0.880;SOR=0.193;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,11:0.31:36
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chr7	143982776	rs199949243	G	A	931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=1.417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.68;MQRankSum=-3.121;QD=6.61;ReadPosRankSum=2.088;SOR=0.854;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,51:0.36:141
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chr7	144068163	rs146660641	T	C	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.308;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.20;MQRankSum=-3.923;QD=14.42;ReadPosRankSum=2.870;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr7	144068214	rs376311961	T	C	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=2.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.67;MQRankSum=-7.118;QD=2.04;ReadPosRankSum=1.003;SOR=0.978;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,21:0.20:105
chr7	144075749	rs1635079	A	G	1334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=15;PP=929;ReadPosRankSum=0.566;SC=AACAGCCCAAATCTGTCTCTA;SOR=0.674;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=100;TCF=72;TCR=28;TR=55;WE=144075757;WS=144075739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,56:0.54:103
chr7	144095600	rs2699503	A	G	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.914;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=14;PP=275;ReadPosRankSum=-0.975;SC=GAGAACTGGAAGGGTCCTGGC;SOR=0.936;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=89;TCF=43;TCR=46;TR=23;WE=144095608;WS=144095590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,24:0.24:102
chr7	144096456	rs11769787	C	T	1408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.761;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=36;PP=844;ReadPosRankSum=0.083;SC=TCTTTAGTTGCCATTTTCCCC;SOR=0.815;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=187;TCF=98;TCR=89;TR=71;WS=144096446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,77:0.37:206
chr7	144096598	rs11769847	C	T	707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.641;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=17;PP=372;ReadPosRankSum=-0.852;SC=AGAATGAAGACTGTAGCTTTG;SOR=0.508;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=101;TCF=45;TCR=56;TR=34;WE=144096606;WS=144096588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,39:0.36:109
chr7	144096839	rs757388	A	G	777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.718;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=15;PP=570;ReadPosRankSum=0.213;SC=AGAAAGAGGAAGAATTCTGAC;SOR=0.781;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=118;TCF=72;TCR=46;TR=39;WE=144096847;WS=144096829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,40:0.32:125
chr7	144098896	rs727712	T	C	1439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.478;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=34;PP=1035;ReadPosRankSum=-0.215;SC=TTGAAAAATGTAGACAAATTT;SOR=0.746;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=277;TCF=165;TCR=112;TR=82;WE=144098904;WS=144098886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:203,85:0.30:288
chr7	144098992	rs727714	G	A	2176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=426;ExcessHet=3.0103;FS=1.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.12;ReadPosRankSum=-0.312;SOR=0.851;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:300,125:0.29:425
chr7	144100874	rs375024030	ACGGGC	A	721.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.13;MQRankSum=0.000;QD=15.04;ReadPosRankSum=0.356;SOR=0.957;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,20:0.42:48
chr7	144245543	rs111498606	GA	G	3091.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=1.094;QD=15.01;ReadPosRankSum=1.028;SOR=0.667;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,146:0.71:206
chr7	144462951	rs3779087	C	T	3299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=50;PP=1898;SC=AGCAAAGAAACAGAAATGCTA;SOR=0.882;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=114;TCF=63;TCR=51;TR=113;WE=144462959;WS=144462941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr7	144532718	.	TA	T	187.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=0.000;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=2.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.81;ReadPosRankSum=1.772;SOR=0.400;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,24:0.23:104
chr7	144532829	rs111798915	A	AG	686.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=575;ReadPosRankSum=-1.299;SC=TCCGGGACCCAGGAGCCAGCT;SOR=0.732;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=17;WE=144532837;WS=144532819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,24:0.59:41
chr7	144703163	rs35986454	T	G	6674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=118;PP=2965;SC=ACCTGCAGTCTGCCCTGAGCA;SOR=0.866;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=227;TCF=109;TCR=118;TR=227;WE=144703171;WS=144703153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr7	144708145	rs79359669	G	C	2027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=55;PP=1404;ReadPosRankSum=2.316;SC=TTTGGTATAAGTTTGTGTTGC;SOR=0.662;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=40;TCR=88;TR=80;WE=144708153;WS=144708135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,85:0.61:139
chr7	144708192	rs75385443	G	A	792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-4.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.561;HP=5;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=25;PP=560;ReadPosRankSum=-0.168;SC=AATGTGGTTTGTTATTGTAGC;SOR=0.311;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=39;TCF=3;TCR=36;TR=28;WE=144708200;WS=144708182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,31:0.74:42
chr7	145601352	rs6976183	A	G	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.732;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=43;ReadPosRankSum=-1.150;SC=ATATATATGTATACATGTAAT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=4;WE=145601360;WS=145601342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr7	145692060	rs7801400	C	T	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.27;MQRankSum=-0.812;QD=8.09;ReadPosRankSum=-0.732;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr7	145692066	rs373215457	C	T	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.738;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.56;MQRankSum=-1.111;QD=6.07;ReadPosRankSum=-0.389;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr7	145692254	.	A	G	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=1.480;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=93;ReadPosRankSum=0.967;SC=CTGGGGCAACAAGCACACACC;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=5;WE=145692262;WS=145692244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr7	146805228	rs35167289	T	TG	612.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.002;NF=17;NR=2;PP=595;ReadPosRankSum=1.524;SC=TTATTTTTTTTTTTGTTTTAG;SOR=0.811;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=19;WE=146805236;WS=146805218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr7	146997203	rs2692185	T	A	1299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.457;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=18;PP=903;ReadPosRankSum=-1.014;SC=AATTTTAAGATAAAAATGACT;SOR=0.983;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=211;TCF=146;TCR=65;TR=66;WE=146997211;WS=146997193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,71:0.31:231
chr7	147074998	rs6945709	G	T	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=10;PP=329;ReadPosRankSum=-0.753;SC=TTATAAAAATGTTTAATTGGG;SOR=0.617;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=107;TCF=75;TCR=32;TR=31;WE=147075006;WS=147074988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,37:0.30:123
chr7	147092861	rs34592169	G	A	1371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FS=0.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.78;ReadPosRankSum=2.374;SOR=0.759;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:203,84:0.29:287
chr7	147335933	rs113545270	C	CT	361.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=4.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.38;ReadPosRankSum=-1.444;SOR=1.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,23:0.47:49
chr7	147600604	rs2538962	C	A	1946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.366;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=29;PP=1059;ReadPosRankSum=-0.605;SC=GTGTGGCAGTCTAATGACTGA;SOR=0.554;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=128;TCF=84;TCR=44;TR=79;WE=147600612;WS=147600594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,91:0.61:148
chr7	147674912	rs2373284	T	C	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.24;ReadPosRankSum=1.276;SOR=0.700;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:120,48:0.29:168
chr7	147914200	.	CT	C	29	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;FR=0.9999;HP=13;HapScore=2;MGOF=58;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=29;QD=11.3333333333;SC=CTGTTACATGCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=3;WE=147914208;WS=147914193;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,3:0.75:4
chr7	147926734	rs3779031	A	G	5680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=352;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.430;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=137;NR=81;PP=2962;ReadPosRankSum=0.719;SC=TTTTTCTTCTATAGGAAGCTT;SOR=0.726;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=321;TCF=198;TCR=123;TR=218;WE=147926742;WS=147926724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,241:0.69:348
chr7	147926888	rs3779032	A	C	4575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.505;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=110;PP=2945;ReadPosRankSum=-2.503;SC=ATACATGTACATATAAATTAC;SOR=0.631;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=251;TCF=91;TCR=160;TR=175;WE=147926896;WS=147926878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,193:0.70:274
chr7	147963925	rs3801974	C	G	906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=3;PP=675;SC=CACTTACCATCCTCAGATTTT;SOR=3.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=26;WE=147963933;WS=147963915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr7	147963983	rs10248273	G	C	3308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=37;PP=2082;SC=TTTTCTCGGGGTGGTGTTTTA;SOR=1.426;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=114;TCF=77;TCR=37;TR=114;WE=147963991;WS=147963973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr7	147964016	rs3801975	A	G	5566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=123;NR=66;PP=2965;SC=ATGAAATAAGATATCAGAAAA;SOR=1.333;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=189;TCF=123;TCR=66;TR=189;WE=147964024;WS=147964006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr7	147964091	rs3801976	G	A	9902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=367;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=192;NR=148;PP=2965;SC=GTAGAGACGTGCTTCTAAAAG;SOR=0.914;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=340;TCF=192;TCR=148;TR=340;WE=147964099;WS=147964081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,367:1.00:367
chr7	148080647	rs1637841	T	G	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=165;ReadPosRankSum=0.475;SC=GAAACCTAAATGTAAGCTTTG;SOR=0.223;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=35;TCF=33;TCR=2;TR=11;WE=148080655;WS=148080637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,12:0.33:36
chr7	148106376	.	T	C	672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.673;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.337;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.818;NF=23;NR=0;PP=531;ReadPosRankSum=0.377;SC=GAGATTTCATTTGGGAAAACA;SOR=2.621;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=23;WE=148106384;WS=148106366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,24:0.63:38
chr7	148106465	.	C	CTCTT	2977	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.74;NF=59;NR=58;PP=2977;QD=20;SC=TGACACTTGACTCTTTCTTTC;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=172;TCF=84;TCR=88;TR=117;WE=148106498;WS=148106455;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:55,117:0.68:172
chr7	148106475	rs72268642	C	CTT	13428.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.42;QD=47.96;SOR=1.493;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr7	148106477	.	C	G	2965	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.58;NF=163;NR=97;PP=2965;QD=20;SC=CTTTCTTTCTCTACAGCCAGT;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=260;TCF=163;TCR=97;TR=260;WE=148106498;WS=148106455;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr7	148106477	.	C	CTG	14844.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=301;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.36;QD=49.48;SOR=1.376;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,300:1.00:300
chr7	148106490	rs9648691	G	A	15979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=377;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=192;NR=129;PP=2965;SC=CAGCCAGTGCGGATTTTCCAT;SOR=1.092;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=321;TCF=192;TCR=129;TR=321;WE=148106498;WS=148106455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,376:1.00:376
chr7	148106654	rs13241417	T	C	2828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=73;PP=1881;ReadPosRankSum=0.163;SC=AAAAAAAGTTTTCTAGGTTTT;SOR=0.768;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=150;TCF=45;TCR=105;TR=103;WE=148106662;WS=148106644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,113:0.69:164
chr7	148131742	rs2108673	G	A	1429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.094;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=42;PP=904;ReadPosRankSum=1.528;SC=GAAACCAACCGGCTGTCCTCC;SOR=0.517;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=219;TCF=89;TCR=130;TR=74;WE=148131750;WS=148131732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,81:0.33:242
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chr7	148143136	rs2530301	A	G	10626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=402;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=184;NR=182;PP=2965;SC=CCTGGGCCTCACGCCAGGGTC;SOR=0.765;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=366;TCF=184;TCR=182;TR=366;WE=148143144;WS=148143126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,402:1.00:402
chr7	148311115	rs11434056	G	GT	1061.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=2.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.32;ReadPosRankSum=-0.855;SOR=0.883;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:120,48:0.29:168
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chr7	148312520	rs6962292	T	C	1098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=37;PP=675;ReadPosRankSum=-2.150;SC=AAGAGTCACATCTCTAAATTT;SOR=0.683;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=181;TCF=55;TCR=126;TR=53;WE=148312528;WS=148312510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,60:0.31:196
chr7	148463860	rs1014095	T	C	1440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=32;PP=1052;SC=TAATTATCTGTAGTTTTGATA;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=13;TCR=32;TR=45;WE=148463868;WS=148463850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr7	148464675	rs6956231	T	G	3047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=15;PP=2329;SC=TGCAAAATTTTTTTCAGTGCA;SOR=3.166;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=78;TCR=15;TR=93;WE=148464683;WS=148464665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr7	148480990	rs10271133	C	T	7322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=124;NR=115;PP=2965;SC=AAGGTAGGTGCGTGAGGGTTG;SOR=0.724;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=239;TCF=124;TCR=115;TR=239;WE=148480998;WS=148480980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr7	148483760	rs2072406	G	A	2978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=65;PP=1809;SC=AATGTTATTTGTAGATGGCCT;SOR=1.466;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=38;TCR=65;TR=103;WE=148483768;WS=148483750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr7	148487329	rs933436	G	T	1333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=9;PP=958;SC=TGGAACAGTGGGCTTTACTTA;SOR=2.560;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=36;TCR=9;TR=45;WE=148487337;WS=148487319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr7	148487395	rs2007404	T	C	4482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=59;PP=2832;SC=GCTGTCCTTTTATCTAGTTGG;SOR=1.085;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=153;TCF=94;TCR=59;TR=153;WE=148487403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr7	148504716	rs3217095	AG	A	4239.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=45;PP=2468;SC=GTTTCAGAGGAGGGGGGAGGA;SOR=1.196;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=91;TCF=39;TCR=52;TR=78;WE=148504724;WS=148504706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr7	148504854	rs55877618	A	AGACTT	5504.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=44;PP=2750;SC=ACATGTGCTGAGACTTAACAC;SOR=1.143;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=64;TCF=7;TCR=57;TR=49;WE=148504862;WS=148504844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr7	148506064	rs740949	A	G	10914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=420;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=224;NR=156;PP=2965;SC=AAAGTGACCCATCAAAAGAAG;SOR=1.070;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=380;TCF=224;TCR=156;TR=380;WE=148506072;WS=148506054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,420:1.00:420
chr7	148508833	rs2072407	A	G	6856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=137;PP=2965;SC=AAACACAATCACATCATCAAA;SOR=1.151;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=237;TCF=99;TCR=138;TR=235;WE=148508841;WS=148508823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr7	148516102	.	C	A	3199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.985;ClippingRankSum=0.000;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.023;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=62;PP=1968;ReadPosRankSum=-0.790;SC=AATCTTCTGTCCAAAATCCAA;SOR=0.598;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=230;TCF=136;TCR=94;TR=146;WE=148516110;WS=148516092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,152:0.62:245
chr7	148525904	rs2302427	C	G	11934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=442;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=188;NR=213;PP=2965;SC=TCATCATCGTCATCATCATTA;SOR=0.849;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=402;TCF=188;TCR=214;TR=401;WE=148525912;WS=148525878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,440:1.00:440
chr7	148543525	rs10274535	A	G	8349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=175;NR=116;PP=2965;SC=AAACCAAAAGATGATGATAAT;SOR=1.134;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=293;TCF=176;TCR=117;TR=291;WE=148543533;WS=148543515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,307:1.00:307
chr7	148543693	rs3214332	TA	T	3656.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.208;NF=2;NR=100;PP=1682;ReadPosRankSum=0.309;SC=AACATACTCTTAAAAAAAAAA;SOR=0.721;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=123;TCF=2;TCR=121;TR=102;WE=148543712;WS=148543683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,145:0.99:147
chr7	148543753	rs28723387	C	T	1641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=46;PP=1357;SC=ATGTATAACACCTGTAAAGCA;SOR=5.630;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=49;TCF=3;TCR=46;TR=49;WE=148543761;WS=148543743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr7	148638572	rs2035216	G	A	957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=1;PP=731;SC=AGACTCACAGGATAACACAGT;SOR=4.548;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=28;WE=148638580;WS=148638562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr7	148705221	rs2306172	A	G	2728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=26;PP=1897;SC=CGGGGTGTCCAGGGCTGGCAT;SOR=2.016;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=98;TCF=72;TCR=26;TR=96;WE=148705229;WS=148705211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr7	148778355	rs34939910	C	A	353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=271;ReadPosRankSum=-0.107;SC=TGGTGAAACCCCACCTCTACT;SOR=0.420;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=14;WE=148778363;WS=148778345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr7	148801091	rs11525060	G	A	8003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=513;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.638;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=161;NR=163;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.953;SC=GGCTTTTCAGGTTTCCCTTGA;SOR=0.507;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=480;TCF=229;TCR=251;TR=324;WE=148801099;WS=148801081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,348:0.68:513
chr7	148801658	rs1137432	C	T	3924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=70;PP=2296;ReadPosRankSum=0.825;SC=TCCCAATGTGCTGCAGCCCGT;SOR=0.709;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=261;TCF=142;TCR=119;TR=156;WE=148801666;WS=148801648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,178:0.61:290
chr7	148809451	rs6464938	T	C	2614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.126;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=80;PP=1596;ReadPosRankSum=-1.161;SC=TTTGGCCGGGTGTGGTGGCTC;SOR=1.016;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=162;TCF=43;TCR=119;TR=106;WE=148809459;WS=148809441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,117:0.65:179
chr7	148823366	rs10251621	A	G	2078.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.229;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=62;PP=1540;ReadPosRankSum=1.014;SC=GCCCCAACCCAACTCCCAGGT;SOR=1.150;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=149;TCF=47;TCR=102;TR=85;WE=148823374;WS=148823356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,88:0.56:158
chr7	148844884	rs2693317	G	A	1022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.640;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=31;PP=759;ReadPosRankSum=2.250;SC=CGCGAGTGTTGTGAGCCCCCG;SOR=0.683;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=183;TCF=102;TCR=81;TR=63;WE=148844892;WS=148844874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,63:0.31:204
chr7	148848257	rs917122	T	C	5234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.409;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=132;NR=99;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.398;SC=TTAGAAACCATTGGTATGTGG;SOR=0.734;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=340;TCF=193;TCR=147;TR=231;WE=148848265;WS=148848247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,236:0.66:356
chr7	148848358	rs917123	G	A	5250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.854;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=124;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.301;SC=ATTCAAGGCCGGAGGTTAGCT;SOR=0.810;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=326;TCF=147;TCR=179;TR=222;WE=148848366;WS=148848348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,234:0.66:355
chr7	148851213	rs917124	G	A	4553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.405;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=98;PP=2962;ReadPosRankSum=0.305;SC=TCCTACACCTGGAAGGTCGGA;SOR=0.538;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=248;TCF=114;TCR=134;TR=185;WE=148851221;WS=148851203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,194:0.74:263
chr7	148863414	rs71990250	CAGCTCCA	C	6316.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.560;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.781;NF=5;NR=85;PP=2966;ReadPosRankSum=2.947;SC=GAAGTGACAGCAGCTCCAAGA;SOR=1.152;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=147;TCF=9;TCR=138;TR=90;WE=148863428;WS=148863404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,159:0.63:254
chr7	148873497	rs1568944	T	A	3827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=106;NR=42;PP=2413;ReadPosRankSum=-1.742;SC=GCAAACCAACTTGATTATCTT;SOR=0.710;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=215;TCF=154;TCR=61;TR=148;WE=148873505;WS=148873487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,163:0.69:236
chr7	148875632	rs1202461	T	A	411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=1;PP=260;SC=CCTTCTGCTGTATTTCTGATC;SOR=2.985;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=148875640;WS=148875627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr7	148903984	rs12537763	G	A	2191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.880;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=60;PP=1395;ReadPosRankSum=0.541;SC=ATTTGTCCACGTTAGCACCGC;SOR=0.875;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=110;TCF=32;TCR=78;TR=83;WE=148903992;WS=148903974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,91:0.75:122
chr7	148904293	rs147860582	C	CAAGGTTCTTCATAAG	615.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=2088;ReadPosRankSum=0.063;SC=GACTCGTTTTCAGATTACCCG;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=6;WE=148904301;WS=148904283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr7	148904343	rs6464946	A	T	1770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=24;PP=995;ReadPosRankSum=-0.978;SC=GACACCCAGGAGGAGAGGGGG;SOR=0.646;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=68;TCR=32;TR=75;WE=148904351;WS=148904333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,80:0.73:109
chr7	148904624	rs7784122	C	T	1630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.890;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=39;PP=1028;ReadPosRankSum=2.683;SC=GCCGGCTTTCCGCACACTGCT;SOR=0.521;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=91;TCF=33;TCR=58;TR=63;WE=148904632;WS=148904614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,67:0.71:95
chr7	148907849	rs10952805	G	A	5270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.984;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=132;PP=2962;ReadPosRankSum=1.456;SC=AGGGGAGAGGGTTAGCATGGT;SOR=0.631;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=295;TCF=115;TCR=180;TR=217;WE=148907857;WS=148907839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,227:0.73:313
chr7	148907870	rs1202422	C	T	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FS=3.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.76;ReadPosRankSum=-0.715;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:174,56:0.24:230
chr7	148909687	rs1202425	C	T	187.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=5;PP=113;SC=ATTTTTTGTTCTTTGAGACGG;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=148909695;WS=148909677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr7	148936762	rs111428978	A	ACGG,ACGGCGGCGG	760.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.55;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=25;NF=4,4;NR=2,2;PP=242,80;SC=TGGCATCAACACGGCGGCGGC;SOR=1.292;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6,6;WE=148936770;WS=148936758;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.47,0.53:19
chr7	148937136	rs1202427	C	A	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.452;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.291;NF=4;NR=17;PP=328;ReadPosRankSum=1.139;SC=ACTTCTCTGACGCTTGCTTTA;SOR=1.083;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=58;TCF=15;TCR=43;TR=21;WE=148937144;WS=148937126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,24:0.36:66
chr7	148991624	rs76675865	C	T	2779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.603;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=46;PP=1603;ReadPosRankSum=0.452;SC=GGCCTCCCTCCCTCCAGGCCC;SOR=0.635;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=154;TCF=87;TCR=67;TR=107;WE=148991632;WS=148991614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,121:0.70:174
chr7	148991712	rs13236978	A	G	6415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=119;NR=100;PP=2965;SC=AGCTTCGGCCAGAAGGAGCTC;SOR=0.760;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=219;TCF=119;TCR=100;TR=219;WE=148991720;WS=148991702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr7	149148319	rs4727071	T	C	3821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=92;PP=2294;SC=GAGACCACAATGGAAAACCGC;SOR=1.981;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=38;TCR=92;TR=130;WE=149148327;WS=149148309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr7	149152770	rs3735319	A	G	5360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=105;NR=98;PP=2965;SC=GAGAAGGGAGACTTCTTGTTC;SOR=0.775;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=206;TCF=105;TCR=101;TR=203;WE=149152778;WS=149152760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr7	149152906	rs3735318	G	A	9101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=173;NR=143;PP=2965;SC=TGTGGCATCCGGCCAGAAGTC;SOR=0.854;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=316;TCF=173;TCR=143;TR=316;WE=149152914;WS=149152896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,333:1.00:333
chr7	149174265	rs4725816	G	A	625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=16;PP=459;SC=TGGGCACGAGGACCCAACCTC;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=149174273;WS=149174255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr7	149256086	rs1978186	C	T	1395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=38;PP=1058;SC=GGCCAGGAGTCTGAGAGCAGC;SOR=4.712;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=41;TCF=3;TCR=38;TR=41;WE=149256094;WS=149256076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr7	149317216	rs354056	A	G	6882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.96;NF=96;NR=137;PP=2965;SC=GTCTAGAAACAAAATCTCCTG;SOR=1.139;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=233;TCF=96;TCR=137;TR=233;WE=149317224;WS=149317206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
chr7	149318409	rs62490571	T	C	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.06;MQRankSum=1.970;QD=3.07;ReadPosRankSum=-2.429;SOR=0.749;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,19:0.23:83
chr7	149420820	rs11462346	C	CT	7740.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=87;PP=2974;SC=TTCCTTTTTCCTTAGTGAAGA;SOR=0.837;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=26;TCR=99;TR=110;WE=149420828;WS=149420810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr7	149426232	rs855757	C	T	1044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=9;PP=716;SC=TGTGGCAGCACGAGGCCCCGT;SOR=2.242;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=35;WE=149426240;WS=149426222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr7	149426305	rs11424737	G	GC	4589.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=28;NR=29;PP=2460;SC=CTGCGAGTCAGCCGTCTCGGG;SOR=1.170;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=67;TCF=35;TCR=32;TR=57;WE=149426313;WS=149426295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr7	149427409	rs709065	T	G	9317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=164;NR=134;PP=2965;SC=CAGAGCCTGATCTCTGGAAGC;SOR=0.885;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=299;TCF=164;TCR=135;TR=298;WE=149427417;WS=149427399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,327:1.00:327
chr7	149476666	rs57553723	G	GC	6410.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=72;PP=2966;SC=GGCTGTGACAGCCCCTGGGGC;SOR=0.788;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=106;TCF=22;TCR=84;TR=92;WE=149476674;WS=149476656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr7	149481994	rs73168055	G	T	1221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.899;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=11;PP=744;ReadPosRankSum=-0.705;SC=CAGGGAGCTTGTCTATGCCCC;SOR=1.083;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=84;TCF=60;TCR=24;TR=47;WE=149482002;WS=149481984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,53:0.57:93
chr7	149486574	rs855694	G	C	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=176;ReadPosRankSum=1.307;SC=TCACCTCCCCGCTCCTTTGCC;SOR=0.648;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=48;TCF=34;TCR=14;TR=18;WE=149486582;WS=149486564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,20:0.38:52
chr7	149500013	rs2074693	C	G	2665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.711;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=42;PP=1704;ReadPosRankSum=0.049;SC=CTGGTGGACCCACATGCTACC;SOR=0.841;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=138;TCF=83;TCR=55;TR=106;WE=149500021;WS=149500003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,115:0.76:152
chr7	149506211	rs71194663	G	GC	7999.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=24;NR=71;PP=2974;SC=CGAGGCAGCAGCTGCGCAGCC;SOR=0.712;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=99;TCF=24;TCR=75;TR=95;WE=149506219;WS=149506201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr7	149507861	rs55866915	A	C	2420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=16;PP=1539;SC=AGGAGGGCAGAGGGGAGAGCT;SOR=2.331;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=56;TCR=16;TR=72;WE=149507869;WS=149507851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr7	149507964	rs55776327	C	T	11029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=422;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=217;NR=170;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.256;SC=AGGCCCAGCCCATCTGGAGCC;SOR=0.309;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=387;TCF=217;TCR=170;TR=387;WE=149507972;WS=149507954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,421:1.00:422
chr7	149508703	rs55649542	G	C	12059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=471;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=219;NR=209;PP=2965;ReadPosRankSum=1.491;SC=AGGGTTTGGGGGGCCACAATG;SOR=0.706;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=431;TCF=221;TCR=210;TR=428;WE=149508711;WS=149508693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,467:1.00:469
chr7	149509419	rs740109	C	T	1107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=9;PP=706;SC=GGGAGGCCTGCGGAGCCGGAC;SOR=1.445;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=36;WE=149509427;WS=149509409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr7	149509807	rs740110	C	T	1357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.14;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr7	149509817	rs740111	G	T	1233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.70;SOR=3.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr7	149510936	rs62492760	C	T	509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=14;PP=370;SC=GCAGGAGTTGCCCCACTTCAT;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=18;WE=149510944;WS=149510926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr7	149511333	rs62492761	G	A	2243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=53;NR=27;PP=1339;SC=ATGAGGGGAGGGGAGAGGCAG;SOR=1.275;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=53;TCR=27;TR=80;WE=149511341;WS=149511323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr7	149511902	rs62492762	C	T	9837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=359;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=167;NR=168;PP=2965;SC=GGTCTCCCTGCGACATGTGCT;SOR=0.733;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=335;TCF=167;TCR=168;TR=335;WE=149511910;WS=149511892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,359:1.00:359
chr7	149511985	rs10952230	A	G	9732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=352;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=157;NR=171;PP=2965;SC=TGCCCTGGGAACCACACGCAG;SOR=0.845;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=328;TCF=157;TCR=171;TR=328;WE=149511993;WS=149511975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,351:1.00:351
chr7	149512674	rs2074694	G	A	522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=3;PP=328;SC=GCCATGCGGTGGAGGCAAGAG;SOR=2.419;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=149512682;WS=149512670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr7	149512911	rs2074695	A	G	9271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=348;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=157;NR=158;PP=2965;SC=GGCGCATAGAACCCAGGAGGG;SOR=0.722;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=315;TCF=157;TCR=158;TR=315;WE=149512919;WS=149512901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,347:1.00:347
chr7	149513077	rs2240362	G	C	7001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=113;NR=121;PP=2965;SC=GCAGTGTTTCGTGTGGGGGCG;SOR=0.862;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=236;TCF=114;TCR=122;TR=234;WE=149513085;WS=149513067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr7	149513288	rs7778489	T	C	2482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=28;NR=56;PP=1718;SC=CCACCTGTCCTCCAGTGCCCT;SOR=1.481;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=28;TCR=56;TR=84;WE=149513296;WS=149513278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr7	149513560	rs12674102	T	C	4029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=78;NR=60;PP=2078;SC=GCTGCTTCTCTGAGGGCTGCG;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=138;TCF=78;TCR=60;TR=138;WE=149513568;WS=149513550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr7	149513780	rs2074688	A	G	596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=16;PP=448;SC=TGACAGCGTCAGGGGCAGGCA;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=149513788;WS=149513770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr7	149515188	rs60594151	TA	T	730.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=11;PP=484;SC=GGACCTCGAGTAACTGCCCCA;SOR=1.828;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=13;WE=149515196;WS=149515178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr7	149515754	rs740113	A	G	2667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=26;PP=1743;SC=GCTGGGGCCCATGGTCCTCCT;SOR=1.969;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=95;TCF=68;TCR=27;TR=93;WE=149515762;WS=149515744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr7	149516486	rs6464034	A	G	10433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=382;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=196;NR=156;PP=2965;SC=GCAGCTGCGGAGTGGGCCAGC;SOR=0.886;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=354;TCF=197;TCR=157;TR=352;WE=149516494;WS=149516476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,382:1.00:382
chr7	149516790	rs62492765	G	A	646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=10;PP=428;SC=TCAGGTGGCCGTTCTCTTTCC;SOR=0.963;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=13;TCR=10;TR=23;WE=149516798;WS=149516780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr7	149517978	rs12536873	G	T	6062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=118;NR=87;PP=2965;SC=CCCTGGAGCAGGATGGTGGCT;SOR=0.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=206;TCF=118;TCR=88;TR=205;WE=149517986;WS=149517968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr7	149518014	rs185376949	C	T	1583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.484;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=42;PP=1052;ReadPosRankSum=-2.456;SC=ACTGTGACTGCACCGATGCCC;SOR=0.605;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=287;TCF=152;TCR=135;TR=86;WE=149518022;WS=149518004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:210,93:0.31:303
chr7	149518148	rs10233245	A	G	3936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=86;PP=2600;SC=GCCTGGAGCCACTGGTCGGCC;SOR=1.390;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=137;TCF=51;TCR=86;TR=137;WE=149518156;WS=149518138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr7	149518769	rs78529309	T	G	1060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=20;PP=625;SC=AGGTCTGGGCTGCCTCCGGAT;SOR=1.005;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=15;TCR=20;TR=35;WE=149518777;WS=149518759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr7	149518961	rs1008335	T	C	4994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=102;NR=69;PP=2850;SC=TGCCTGAGGCTTGGACGCTGT;SOR=0.950;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=171;TCF=102;TCR=69;TR=171;WE=149518969;WS=149518951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr7	149520413	rs59644006	A	C	1883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=46;NR=20;PP=1216;SC=GTTCCCCCACAAGCCTGCCTC;SOR=1.576;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=46;TCR=20;TR=66;WE=149520421;WS=149520403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr7	149521106	rs59605875	C	A	12431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=473;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=215;NR=220;PP=2965;SC=GCATGACCACCCCCACCCCCC;SOR=0.763;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=436;TCF=215;TCR=221;TR=435;WE=149521118;WS=149521096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,472:1.00:472
chr7	149522366	rs2074697	T	G	11571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=423;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=199;NR=201;PP=2965;SC=GTCGTCAGGTTAGAGCTGCGA;SOR=0.712;SbPval=0.52;Source=Platypus;TCF=199;TR=400;WE=149522374;WS=149522356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,422:1.00:422
chr7	149523137	rs62492769	G	A	11418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=424;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=213;NR=174;PP=2965;SC=CCTGACTGGAGCCCTTTGTGC;SOR=0.866;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=387;TCF=213;TCR=174;TR=387;WE=149523145;WS=149523127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,424:1.00:424
chr7	149523277	rs1004200	A	G	10247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=389;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=162;NR=194;PP=2965;SC=ATGGAGCGACATCGGACTTGT;SOR=0.959;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=356;TCF=162;TCR=194;TR=356;WE=149523285;WS=149523267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,386:1.00:386
chr7	149523584	rs62492839	C	T	6114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=118;NR=87;PP=2965;SC=ACCTCATGCCCGTGCCTCTGC;SOR=0.873;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=205;TCF=118;TCR=87;TR=205;WE=149523592;WS=149523574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr7	149524913	rs12534509	G	A	14635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=555;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=278;NR=242;PP=2965;SC=GGGGCTCTGCGAGCAGACGTG;SOR=0.824;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=523;TCF=281;TCR=242;TR=520;WE=149524921;WS=149524903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,552:1.00:552
chr7	149530894	rs6960187	G	A	5654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=396;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.404;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=144;NR=103;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.093;SC=CGTGTCCCCTGGGAGGTGACT;SOR=0.872;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=369;TCF=211;TCR=158;TR=247;WE=149530902;WS=149530884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,261:0.66:396
chr7	149543219	rs139634052	CT	C	117.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.55;ReadPosRankSum=-0.241;SOR=0.810;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,17:0.22:76
chr7	149544681	rs10569456	GGTGTGTGTGT	G,GGT	563.84	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.14;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=5,5;NR=2,2;PP=262,74;SC=AGAAAATTCAGGTGTGTGTGT;SOR=1.179;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=7,7;WE=149544698;WS=149544674;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:0.93:15
chr7	149556518	rs4725833	C	T	5924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=122;NR=66;PP=2965;SC=CAGGACCTGCCGCTGCCAAGC;SOR=1.158;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=189;TCF=122;TCR=67;TR=188;WE=149556526;WS=149556508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr7	149558409	rs2240361	G	C	1309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=35;PP=957;ReadPosRankSum=0.345;SC=CGCAGCTGCTGCCTGTCCACT;SOR=0.706;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=194;TCF=95;TCR=99;TR=66;WE=149558417;WS=149558399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,69:0.33:206
chr7	149559273	rs2074700	C	T	1419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=395;ExcessHet=3.0103;FS=1.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.60;ReadPosRankSum=-0.798;SOR=0.596;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:299,95:0.24:394
chr7	149559465	rs2074701	C	T	3989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=680;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.175;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=104;PP=2466;ReadPosRankSum=0.621;SC=CTGTGAACGGCGTGGCCGTCA;SOR=0.569;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=631;TCF=292;TCR=339;TR=207;WE=149559475;WS=149559455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:452,224:0.33:676
chr7	149561049	rs3857764	C	G	225.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=7;NR=1;PP=116;SC=AACAGAGTAGCAACAGATGAG;SOR=1.402;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=149561057;WS=149561039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr7	149571095	rs79377053	G	A	2897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.492;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=49;PP=1943;ReadPosRankSum=-3.316;SC=CTGGGGACCCGCGCACCTGCA;SOR=0.379;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=189;TCF=120;TCR=69;TR=121;WE=149571103;WS=149571085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,125:0.63:198
chr7	149572842	rs10240203	G	C	1403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.593;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=41;PP=984;ReadPosRankSum=0.528;SC=AATGCCTCTTGAAAGGCTGAA;SOR=0.634;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=169;TCF=57;TCR=112;TR=62;WE=149572850;WS=149572832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,67:0.35:190
chr7	149573187	rs117051141	C	T	1157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.185;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=33;PP=800;ReadPosRankSum=-0.465;SC=AGGTGAGAGGCCAGACGTGGC;SOR=1.041;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=72;TCF=22;TCR=50;TR=46;WE=149573195;WS=149573177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,48:0.64:75
chr7	149575707	rs6946997	C	G	1067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=59.97;NF=27;NR=5;PP=777;SC=ACCGAGGCCTCCCCTGGGTGT;SOR=2.899;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=32;WE=149575715;WS=149575697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr7	149575725	rs6947011	C	T	1695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=10;PP=1136;SC=TGTGGGAGGACCCTCCTGTGC;SOR=2.381;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=56;TCF=45;TCR=11;TR=55;WE=149575733;WS=149575715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr7	149575747	rs5888369	TG	T	3698.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=28;PP=2386;SC=AGGCTCACCATGCTTTGCTGT;SOR=1.511;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=24;TCR=28;TR=52;WE=149575755;WS=149575737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr7	149575884	rs10246226	T	C	3426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=69;PP=2396;SC=ACCCAGGTACTGTGTGGGCGA;SOR=1.170;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=132;TCF=63;TCR=69;TR=132;WE=149575892;WS=149575874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr7	149576818	rs7785847	A	G	5236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=94;PP=2965;SC=CGGGGGAGTCAGTGCCCAGTC;SOR=0.984;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=176;TCF=82;TCR=94;TR=175;WE=149576826;WS=149576808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr7	149588429	rs4725317	G	A	167.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=51.13;QD=27.97;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr7	149589343	rs2626759	G	A	2071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.64;QD=30.03;SOR=1.478;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr7	149589496	rs11428600	A	AC	9430.19	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=354;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=10.971;NF=20;NR=157;PP=2987;ReadPosRankSum=0.509;SC=ACCTTAAAAAAACACACACAC;SOR=0.680;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=182;TCF=20;TCR=162;TR=177;WE=149589505;WS=149589480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:24,283:0.92:307
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chr7	150094851	rs13225910	A	G	5781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=130;NR=70;PP=2965;SC=GGCCCGGGACACGCTGTGGGG;SOR=1.423;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=200;TCF=130;TCR=70;TR=200;WE=150094859;WS=150094841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr7	150095271	rs7393	T	C	1427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=15;NR=29;PP=989;SC=TTGCTGGCTCTTAGAACCCCT;SOR=1.708;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=15;TCR=29;TR=44;WE=150095279;WS=150095261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
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chr7	150168058	rs111800874	A	AGAAT	2173.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=37;PP=1705;ReadPosRankSum=0.913;SC=CATATAAACCAGAAAATTCAC;SOR=0.703;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=125;TCF=6;TCR=119;TR=38;WE=150168066;WS=150168048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,61:0.36:171
chr7	150171710	rs60114833	T	C	1249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.75;ReadPosRankSum=-1.354;SOR=0.688;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:181,82:0.31:263
chr7	150384048	.	A	AAAAG	330.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=66.43;QD=55.12;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr7	150440192	rs9657881	G	A	2457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.458;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=60;PP=1660;ReadPosRankSum=1.428;SC=TCACCCCATGGAGTCATTGTT;SOR=0.485;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=139;TCF=52;TCR=87;TR=98;WE=150440200;WS=150440182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,103:0.71:145
chr7	150488616	rs2302479	A	G	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.175;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=4;PP=462;ReadPosRankSum=1.239;SC=GGTCTTTGGCAGCTCACAGGA;SOR=1.675;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=47;TCF=38;TCR=9;TR=28;WE=150488624;WS=150488606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,29:0.60:48
chr7	150489373	rs58004396	C	G	1407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.057;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=39;PP=985;ReadPosRankSum=-1.593;SC=CTTGCTGCTCCCACCACAGCT;SOR=0.233;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=73;TCF=17;TCR=56;TR=53;WE=150489381;WS=150489363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,57:0.71:80
chr7	150490075	rs10215370	T	C	513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=380;ReadPosRankSum=-0.997;SC=CAGCATGAAGTCCAAGCTCAA;SOR=0.784;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=18;WE=150490083;WS=150490065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr7	150490130	rs10215721	A	C	1669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.821;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=14;PP=1248;ReadPosRankSum=-1.700;SC=TCCCTGGGAAAAAAGAGCTGT;SOR=0.961;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=105;TCF=81;TCR=24;TR=67;WE=150490138;WS=150490120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,69:0.64:108
chr7	150490424	rs10215381	T	A	3184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=3.667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.76;ReadPosRankSum=1.643;SOR=1.059;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,81:0.68:119
chr7	150490431	rs2072442	C	G	3143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.84;ReadPosRankSum=1.796;SOR=0.883;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,76:0.70:109
chr7	150490436	rs10215048	C	T	2874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.64;ReadPosRankSum=1.607;SOR=0.774;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,70:0.72:97
chr7	150490475	rs10215382	T	C	1688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.193;HP=3;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=25;PP=947;ReadPosRankSum=0.410;SC=CCGCCTCAAATCCCTCTCCTC;SOR=1.112;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=59;TCF=27;TCR=32;TR=44;WE=150490483;WS=150490465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,43:0.74:58
chr7	150490497	rs10215385	T	C	1651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.301;HP=3;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=25;PP=904;ReadPosRankSum=0.268;SC=TCCCCAGCCCTTGTCCAGGAA;SOR=1.038;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=63;TCF=30;TCR=33;TR=46;WE=150490505;WS=150490487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,45:0.71:63
chr7	150491084	rs3173833	T	G	7472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=520;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.558;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=177;NR=141;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.359;SC=CCTGAGGCACTCAGCACAGTC;SOR=0.621;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=486;TCF=271;TCR=215;TR=318;WE=150491092;WS=150491074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,347:0.67:520
chr7	150491775	rs139123517	TC	T	1050.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.898;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=2;PP=1033;ReadPosRankSum=1.604;SC=GCCTGGGAGCTCCCCCACTGG;SOR=1.848;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=56;TCF=47;TCR=9;TR=32;WE=150491783;WS=150491765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,39:0.63:62
chr7	150491995	rs145375921	CCACACACA	C	1311.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.17;MQRankSum=0.755;QD=27.91;ReadPosRankSum=-0.340;SOR=1.121;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,40:0.85:47
chr7	150493442	rs2075080	C	G	1583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.878;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=18;PP=972;ReadPosRankSum=-0.788;SC=CCCCGCACCACCCCAGTCTTA;SOR=0.563;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=93;TCF=65;TCR=28;TR=61;WE=150493450;WS=150493432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,67:0.68:98
chr7	150498836	rs2075079	C	G	1218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=32;PP=881;SC=CCTGCCTCGTCGGGCGGCGGG;SOR=3.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=5;TCR=32;TR=37;WE=150498844;WS=150498826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr7	150499164	.	T	TTTCTCTTCTC	1274.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.11;QD=53.11;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr7	150499267	rs12668797	C	A	8402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=174;NR=124;PP=2965;SC=GGCAGGTCCACCTAGGAGCCG;SOR=1.019;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=299;TCF=175;TCR=124;TR=298;WE=150499275;WS=150499257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,322:1.00:322
chr7	150500356	rs741068	T	C	3724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=79;NR=49;PP=1800;SC=TATCTTACCATGGATAATAAA;SOR=1.058;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=79;TCR=49;TR=128;WE=150500364;WS=150500346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr7	150500455	rs741067	A	G	5598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=95;NR=100;PP=2965;SC=CATTTCCTGTACTAAGCCTGC;SOR=0.834;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=195;TCF=95;TCR=100;TR=195;WE=150500463;WS=150500445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr7	150500729	rs741064	A	G	4747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=105;NR=58;PP=2934;SC=GACTCTGCTAACGCTGGCAGC;SOR=1.185;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=163;TCF=105;TCR=58;TR=163;WE=150500737;WS=150500719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr7	150501455	rs10378	G	T	4826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=108;NR=56;PP=2965;SC=CCCAGGCCTTGTTCAGAACCC;SOR=1.453;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=164;TCF=108;TCR=56;TR=164;WE=150501463;WS=150501445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr7	150501516	rs9088	A	G	8152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=152;NR=122;PP=2965;SC=GGCATCTCTGACCCCTCTGTG;SOR=0.806;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=274;TCF=152;TCR=122;TR=274;WE=150501524;WS=150501506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,298:1.00:298
chr7	150555810	rs45455308	G	A	5881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=128;NR=62;PP=2965;SC=TTCAGTTCTGGCAGCTTGATT;SOR=1.440;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=191;TCF=129;TCR=62;TR=190;WE=150555818;WS=150555800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr7	150556002	rs1049748	T	C	6380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.541;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=111;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.963;SC=GGAAGCTGCCTAAGTACCTGC;SOR=0.622;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=207;TCF=96;TCR=111;TR=206;WE=150556010;WS=150555992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,225:1.00:226
chr7	150556055	rs6943147	CG	GC	8519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=93;PP=2947;SC=CACAAGCGCACGTACCGCCTG;SOR=0.961;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=176;TCF=79;TCR=97;TR=169;WE=150556064;WS=150556045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr7	150556803	rs55671932	A	G	1707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=18;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=46;NR=18;PP=1123;SC=AAAAAAAAAAAAAAAAATCCT;SOR=1.402;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=69;TCF=51;TCR=18;TR=64;WE=150556811;WS=150556780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr7	150557390	rs45615934	G	A	685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=2;PP=535;SC=CATTTGGGGAGGGGGGCGGGG;SOR=3.352;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=150557398;WS=150557386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr7	150558366	rs12539	C	T	5457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQ=60.05;NF=64;NR=125;PP=2965;SC=GACAATAAACCCTCAGAGCCT;SOR=1.574;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=189;TCF=64;TCR=125;TR=189;WE=150558374;WS=150558356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr7	150558444	rs34090933	G	GCA	932.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.400;NF=0;NR=22;PP=1044;ReadPosRankSum=-0.670;SC=GAACAGACGTGCACACACACA;SOR=3.690;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=22;WE=150558452;WS=150558434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,25:0.96:26
chr7	150645534	rs1805123	T	G	2613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.182;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=52;PP=2016;ReadPosRankSum=0.226;SC=CGCCTCACCCTTGTCCGTGCG;SOR=0.571;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=194;TCF=119;TCR=75;TR=125;WE=150645542;WS=150645524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,130:0.66:198
chr7	150645682	rs2968860	G	A	10772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=393;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=156;NR=208;PP=2965;SC=CTGCCCCACCGGGGTCAGGCC;SOR=1.054;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=365;TCF=156;TCR=209;TR=364;WE=150645690;WS=150645672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,391:1.00:391
chr7	150647969	rs2072413	CC	TG	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=706;ReadPosRankSum=-1.741;SC=CCCCACTCTTCCCAGCCTGCC;SOR=0.941;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=14;WE=150647978;WS=150647965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
chr7	150648198	rs1137617	A	G	5664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=99;NR=108;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.485;SC=AGATGCTAGCATACATGAGGG;SOR=0.302;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=208;TCF=99;TCR=109;TR=207;WE=150648206;WS=150648188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,219:1.00:220
chr7	150648789	rs1805121	T	C	1746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.456;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.030;NF=41;NR=43;PP=1162;ReadPosRankSum=-0.728;SC=AGATGCAGGCTAGCCAGTGCG;SOR=0.737;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=263;TCF=133;TCR=130;TR=84;WE=150648797;WS=150648779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:194,94:0.33:288
chr7	150652286	rs887586	C	G	372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=239;SC=GTCCCAGCAACGGAAACTCTG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=150652294;WS=150652276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr7	150652419	rs876088	T	C	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.817;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=15;PP=323;ReadPosRankSum=0.180;SC=TCAGAGCCCTTGGGCCAGCCA;SOR=0.538;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=81;TCF=48;TCR=33;TR=33;WE=150652427;WS=150652409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,34:0.37:91
chr7	150654622	rs11462566	A	AG	1377.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=25;PP=1173;SC=TCAGGCCAGCAGCCCAGGGCC;SOR=2.554;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=150654630;WS=150654612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr7	150655624	rs758891	T	C	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.72;ReadPosRankSum=-1.815;SOR=0.751;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,17:0.28:61
chr7	150655643	rs758890	G	A	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.28;ReadPosRankSum=-0.381;SOR=0.680;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,7:0.18:39
chr7	150672162	rs11410979	T	TC	571.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=16;PP=710;SC=GGGACTGGGGTCCCAGCAGGG;SOR=3.500;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=18;WE=150672170;WS=150672152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr7	150695726	rs1549758	T	C	855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.473;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=31;PP=553;ReadPosRankSum=1.231;SC=GGCAGCAGGATGGCTCTGTGC;SOR=0.879;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=125;TCF=48;TCR=77;TR=47;WE=150695734;WS=150695716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,49:0.35:141
chr7	150696008	rs1007311	A	G	882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=21;PP=579;ReadPosRankSum=2.454;SC=TCAGCCCCAGAACCCCCTCTG;SOR=0.636;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=138;TCF=84;TCR=54;TR=50;WE=150696016;WS=150695998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,52:0.35:150
chr7	150696111	rs1799983	T	G	1154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FS=0.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.41;ReadPosRankSum=0.507;SOR=0.787;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:258,81:0.24:339
chr7	150698879	rs1800780	A	G	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=3.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.90;ReadPosRankSum=0.077;SOR=1.342;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,22:0.23:95
chr7	150703915	rs2853796	G	T	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=274;ReadPosRankSum=0.677;SC=TGGGGCTGGGGCTGGGCCTAG;SOR=0.772;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=87;TCF=59;TCR=28;TR=26;WE=150703923;WS=150703905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,24:0.27:88
chr7	150706383	rs753482	C	A	1369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.685;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=43;PP=861;ReadPosRankSum=1.334;SC=ACCGCCCCCCCACCCCTGTCC;SOR=0.556;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=245;TCF=114;TCR=131;TR=79;WE=150706391;WS=150706373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,82:0.34:243
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chr7	150708089	rs891512	A	G	985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=25;PP=566;ReadPosRankSum=1.087;SC=GTGAGATGGAAGACTTGGTGG;SOR=0.685;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=60;TCR=69;TR=48;WE=150708097;WS=150708079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,54:0.38:142
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chr7	150720902	rs13307588	A	G	2061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=441;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.580;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=58;PP=1379;ReadPosRankSum=0.053;SC=CCAGCCTGGGATAAGTACTGG;SOR=0.620;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=404;TCF=206;TCR=198;TR=120;WE=150720910;WS=150720892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:312,126:0.29:438
chr7	150725722	rs2303922	A	C	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.44;ReadPosRankSum=0.187;SOR=0.639;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,34:0.28:121
chr7	150731338	rs2303923	G	C	431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.915;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=284;ReadPosRankSum=0.208;SC=AAACATTTGTGCCCTCTGTCT;SOR=1.208;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=52;TCF=47;TCR=5;TR=17;WE=150731346;WS=150731328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,19:0.36:53
chr7	150732630	rs41282730	G	A	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.641;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=23;ReadPosRankSum=0.473;SC=GTCATGGTGCGGACGCCGTAG;SOR=0.283;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=4;WE=150732638;WS=150732620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr7	150732812	rs17545756	C	T	2143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=454;ExcessHet=3.0103;FS=1.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.72;ReadPosRankSum=-0.113;SOR=0.880;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:328,126:0.28:454
chr7	150733115	rs76225344	G	A	1309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.273;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=39;PP=892;ReadPosRankSum=0.559;SC=CCAACCCTTCGTGCCAGCCCA;SOR=0.878;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=251;TCF=126;TCR=125;TR=73;WE=150733123;WS=150733105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:197,78:0.28:275
chr7	150733271	rs76802349	T	C	1321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.246;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=28;PP=774;ReadPosRankSum=0.071;SC=AGTGAGCCATTTGGGGGCTGG;SOR=0.738;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=176;TCF=91;TCR=85;TR=63;WE=150733279;WS=150733261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,71:0.36:195
chr7	150734196	rs77329175	C	T	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.616;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=199;ReadPosRankSum=1.241;SC=CCCATTTGCCCTCCCCCAGCC;SOR=1.148;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=12;WE=150734204;WS=150734186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,12:0.32:38
chr7	150734364	rs78023969	G	T	1263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.341;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=38;PP=772;ReadPosRankSum=-0.198;SC=ATTCCCTTCCGCTGCAGGCTG;SOR=0.960;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=186;TCF=85;TCR=101;TR=66;WE=150734372;WS=150734354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,72:0.34:210
chr7	150742408	rs59397762	G	T	656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=3.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.43;ReadPosRankSum=-0.388;SOR=0.379;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,40:0.33:121
chr7	150747650	rs62001897	G	T	3020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=398;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.259;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=71;PP=1794;ReadPosRankSum=-1.565;SC=TGGGCTTGGGGGTGTCCCCGG;SOR=0.551;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=380;TCF=213;TCR=167;TR=153;WE=150747662;WS=150747640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:238,160:0.40:398
chr7	150747746	rs2288645	A	G	3441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=492;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.798;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=88;PP=2066;ReadPosRankSum=-3.104;SC=ACACCACCTCAGACCCTAAAC;SOR=0.807;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=460;TCF=231;TCR=229;TR=170;WE=150747754;WS=150747736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:306,186:0.38:492
chr7	150752066	rs891507	T	C	3277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=512;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=84;PP=1788;ReadPosRankSum=-0.884;SC=CAAAACTCCATGGACTCTCCC;SOR=0.698;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=464;TCF=236;TCR=228;TR=171;WE=150752074;WS=150752056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:327,185:0.36:512
chr7	150752608	rs2069456	T	G	730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.728;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=17;PP=355;ReadPosRankSum=1.128;SC=ATATCCCATCTTCTAGCTCAC;SOR=0.668;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=108;TCF=57;TCR=51;TR=36;WE=150752616;WS=150752598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,41:0.36:114
chr7	150760076	rs34403003	G	C	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.565;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=223;ReadPosRankSum=0.371;SC=CGCCCTTGGAGATCCCGATGC;SOR=1.119;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=46;TCF=36;TCR=10;TR=14;WE=150760084;WS=150760066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,15:0.32:47
chr7	150761150	rs6464122	C	G	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.266;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.06;ReadPosRankSum=0.771;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr7	150761314	rs2303929	G	A	981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.059;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=23;PP=495;ReadPosRankSum=-1.183;SC=TTGGGCCCTGGGACGCCTGGG;SOR=0.527;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=148;TCF=84;TCR=64;TR=51;WE=150761334;WS=150761304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,56:0.34:164
chr7	150761880	rs2303931	C	A	851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FS=1.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.62;ReadPosRankSum=0.470;SOR=0.538;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:177,58:0.25:235
chr7	150763655	rs2229549	T	A	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=3;PP=49;ReadPosRankSum=1.700;SC=CCAGTGGCACTGCAGGGGGTG;SOR=0.489;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=8;WE=150763666;WS=150763645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,8:0.25:32
chr7	150765065	rs2229550	T	C	612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=0.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.42;ReadPosRankSum=-0.366;SOR=0.590;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,39:0.35:113
chr7	150768786	rs2303937	G	A	2119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.922;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=42;PP=1251;ReadPosRankSum=-1.400;SC=GAGAGAAGACGCAGGACCTGA;SOR=0.776;SbPval=0.76;Source=Platypus;TCF=147;TR=101;WE=150768794;WS=150768776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:192,112:0.37:304
chr7	150773072	rs2303939	G	C	894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=11;PP=551;ReadPosRankSum=-0.410;SC=TAGGGAGGAAGCTGGGCTCAC;SOR=0.771;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=100;TCF=70;TCR=30;TR=38;WE=150773080;WS=150773062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,44:0.39:112
chr7	150773807	rs7262	A	T	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=78;ReadPosRankSum=0.598;SC=CCCCACATCAACCCCTCAGCC;SOR=0.399;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=8;WE=150773815;WS=150773797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
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chr7	150783900	.	C	CG	187.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.97;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr7	150783903	.	T	G	196.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.38;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr7	150783906	.	C	G	376.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=62.80;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr7	150783908	.	C	CG	457.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=50.86;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr7	150783911	.	A	G	1006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=62.92;SOR=2.049;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr7	150783917	.	T	G	1366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=48.81;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr7	150783919	.	GTCT	G	1537.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=49.60;SOR=3.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr7	150783922	.	T	TGGGG	1537.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=49.60;SOR=3.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr7	150784407	rs13239507	T	C	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.212;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=67;ReadPosRankSum=-1.168;SC=GTGGTGTCGCTTGGGGGGGCC;SOR=0.132;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=8;WE=150784415;WS=150784397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,9:0.27:33
chr7	150812493	rs6971966	G	C	353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=1.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.86;ReadPosRankSum=0.055;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,19:0.42:45
chr7	150825567	rs2288650	C	T	1225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.128;HP=5;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=13;PP=854;ReadPosRankSum=-0.360;SC=CCAGGAGAAGCGGGGAGGGGG;SOR=1.504;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=181;TCF=129;TCR=52;TR=68;WE=150825575;WS=150825557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,63:0.39:162
chr7	150825839	rs7808252	G	A	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.905;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=230;ReadPosRankSum=-0.163;SC=AACAGAATGCGGGTAGCAGAC;SOR=0.316;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=52;TCF=5;TCR=47;TR=16;WE=150825847;WS=150825829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,17:0.31:54
chr7	150884266	rs372716545	CAG	C	1217.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=399;ExcessHet=3.0103;FS=6.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.03;MQRankSum=0.000;QD=3.51;ReadPosRankSum=-0.365;SOR=0.866;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:277,70:0.20:347
chr7	150916114	rs35656219	CAGG	C	6227.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.07;NF=34;NR=63;PP=2967;SC=TTCTTTCAGACAGGAGGCCAT;SOR=0.781;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=38;TCR=71;TR=97;WE=150916124;WS=150916104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr7	150916228	rs6949587	G	A	6992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=127;NR=116;PP=2965;SC=GCGTCTTCACGTACTGATCAT;SOR=0.701;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=244;TCF=128;TCR=116;TR=243;WE=150916236;WS=150916218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr7	150918914	rs4726007	G	C	1909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=39;PP=1278;SC=CCTAAGCCACGACTCGACAAT;SOR=1.839;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=18;TCR=39;TR=57;WE=150918922;WS=150918904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr7	150921296	.	AT	A	39.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.677;ClippingRankSum=0.000;DP=155;ExcessHet=3.0103;FS=8.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.43;ReadPosRankSum=0.779;SOR=1.826;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,15:0.16:93
chr7	150921950	rs6464133	A	G	10842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=396;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=180;NR=187;PP=2965;SC=CATGAAAGGTAAGTGAGAGGT;SOR=0.788;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=367;TCF=180;TCR=187;TR=367;WE=150921958;WS=150921940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,396:1.00:396
chr7	150931268	rs2608293	C	G	15510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=598;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=304;NR=253;PP=2965;SC=ATCCAGATTCCAGAGCTCGGC;SOR=0.902;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=560;TCF=304;TCR=256;TR=557;WE=150931276;WS=150931258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,597:1.00:597
chr7	150934162	rs2446065	G	C	1609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=37;PP=904;SC=GAGTCCTTTGGGTGTAGGAGA;SOR=2.226;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=15;TCR=37;TR=52;WE=150934170;WS=150934152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr7	150934975	rs2487154	C	G	14658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=560;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=263;NR=250;PP=2965;SC=TCCTCGAGGCCTTTGCAGCCA;SOR=0.715;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=514;TCF=264;TCR=250;TR=513;WE=150934983;WS=150934965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,558:1.00:558
chr7	150937377	rs61667463	C	CG	2444.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=44;PP=2272;SC=TGCCCCCATACGGCCCCAGGG;SOR=1.516;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=66;TCF=12;TCR=54;TR=54;WE=150937385;WS=150937367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr7	150939193	rs4725398	A	G	4755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=103;NR=55;PP=2965;SC=GAGGGTGGCAATTCAAGGGCG;SOR=1.347;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=103;TCR=55;TR=158;WE=150939201;WS=150939183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr7	150939359	rs219227	C	T	4839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=103;PP=2965;SC=AGAACAGGGACGAGGTGGGAG;SOR=1.421;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=164;TCF=61;TCR=103;TR=164;WE=150939367;WS=150939349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr7	150939396	rs219228	C	A	2574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=57;PP=1740;SC=AGTTGGCAGCCGACAGGGCAG;SOR=2.223;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=21;TCR=57;TR=78;WE=150939404;WS=150939386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr7	150940657	rs122815	T	C	793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=1;PP=530;SC=GTGACTGTGATGCTGAAGCTC;SOR=4.332;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=24;WE=150940665;WS=150940647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr7	150972189	rs2072298	G	A	2984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=28;PP=1617;SC=GGCAGGGGAGGAAGCACCTAC;SOR=1.308;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=93;TCF=65;TCR=28;TR=92;WE=150972197;WS=150972179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr7	151038958	rs2142172	T	C	957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.348;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=24;PP=541;ReadPosRankSum=0.251;SC=CCGAGTGTCCTCGACCCCAGC;SOR=0.862;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=128;TCF=66;TCR=62;TR=46;WE=151038966;WS=151038948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,53:0.35:152
chr7	151046112	.	CT	C	33.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.410;ClippingRankSum=-0.000;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.07;ReadPosRankSum=-2.128;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr7	151048484	rs449081	G	A	1675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.739;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=20;PP=1133;ReadPosRankSum=-1.021;SC=ATTCAAGTACGTTTTACTTTG;SOR=0.966;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=102;TCF=70;TCR=32;TR=67;WE=151048492;WS=151048474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,71:0.66:108
chr7	151049002	rs3838706	A	AAC	671.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.050;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=465;ReadPosRankSum=0.650;SC=CCATCTGTAAAACACACACAC;SOR=2.066;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=11;WE=151049010;WS=151048992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,23:0.85:27
chr7	151049025	rs379931	T	C	772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=8;PP=522;ReadPosRankSum=1.618;SC=ACACACACGTTTGCCACATAC;SOR=0.527;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=42;TCF=30;TCR=12;TR=29;WE=151049033;WS=151049015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,31:0.67:46
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chr7	151053043	rs446886	A	G	2240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.793;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=51;PP=1642;ReadPosRankSum=-1.650;SC=AGAGGTACCCAGAGCTCTGGG;SOR=0.465;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=152;TCF=65;TCR=87;TR=93;WE=151053051;WS=151053033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,97:0.61:159
chr7	151057396	rs3217033	AC	A	2777.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.928;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=55;PP=1915;ReadPosRankSum=1.382;SC=TATACAGAACACCCTGCCATG;SOR=0.772;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=188;TCF=18;TCR=170;TR=61;WE=151057404;WS=151057386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:205,105:0.34:310
chr7	151064064	rs386956	C	T	1102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.296;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=19;PP=656;ReadPosRankSum=-1.315;SC=TGGATAACTACGCCGTCCTCC;SOR=0.831;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=164;TCF=106;TCR=58;TR=54;WE=151064072;WS=151064054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,59:0.33:180
chr7	151064305	rs367191	A	G	615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=14;PP=391;SC=GCCAGAAGGTAATTTCATTTT;SOR=4.514;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=151064313;WS=151064295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr7	151066098	.	CT	C	33.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.174;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=2.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.12;ReadPosRankSum=-1.090;SOR=0.146;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,6:0.20:30
chr7	151073093	rs731995	C	T	662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.216;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=24;PP=455;ReadPosRankSum=1.121;SC=TGGGGTAACCCGGGTGAATCA;SOR=0.380;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=97;TCF=25;TCR=72;TR=35;WE=151073101;WS=151073083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,35:0.36:98
chr7	151073658	rs736469	C	G	1820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=22;PP=1298;ReadPosRankSum=-0.873;SC=ACTCGTATGGCTGACGGGGGT;SOR=0.648;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=81;TCR=34;TR=74;WE=151073666;WS=151073648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,77:0.61:126
chr7	151078371	rs2286417	C	G	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.15;ReadPosRankSum=1.102;SOR=0.432;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,5:0.20:25
chr7	151078719	rs4726019	C	A	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.289;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=74;ReadPosRankSum=0.698;SC=TGCTGAAGAGCCGCGAGAGGC;SOR=1.012;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=36;TCF=20;TCR=16;TR=10;WE=151078727;WS=151078709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,13:0.30:43
chr7	151078735	rs4141455	A	G	1627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=25;NR=17;PP=600;SC=GAGGCTGCGCATGGGCGGAGG;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=25;TCR=17;TR=42;WE=151078743;WS=151078725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr7	151078845	rs4141454	G	A	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=255;ReadPosRankSum=-0.222;SC=GCGGGCGCAGGGGCGGGCGTC;SOR=0.670;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=85;TCF=67;TCR=18;TR=24;WE=151078853;WS=151078835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,29:0.30:98
chr7	151097314	rs61741447	A	G	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=3.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.26;ReadPosRankSum=-0.072;SOR=0.786;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:97,48:0.33:145
chr7	151097323	rs11767693	A	G	4323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.79;SOR=0.753;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr7	151110050	rs142551907	ACTT	A	1198.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.784;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=677;ReadPosRankSum=-0.141;SC=TAGAAATTGTACTTCAAGTGC;SOR=0.316;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=48;TCF=1;TCR=47;TR=18;WE=151110060;WS=151110040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,32:0.47:68
chr7	151254175	rs8961	T	C	8845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=170;NR=141;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.627;SC=AAATACCTATTGTTAAACCCT;SOR=0.309;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=312;TCF=171;TCR=141;TR=311;WE=151254183;WS=151254165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,335:1.00:336
chr7	151254445	rs764801	T	C	496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=15;PP=318;SC=AGGAGGGCGATGTGGGAAGGA;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=151254453;WS=151254435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr7	151254462	rs764800	G	A	483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=11;PP=291;SC=AGGAGCAGGTGGCCCAAGCTC;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=151254470;WS=151254452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr7	151292395	rs35348247	A	AT	3028.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=13;PP=2033;SC=CCATCCAAAAAATACCAAAAA;SOR=1.996;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=50;TCF=37;TCR=13;TR=49;WE=151292403;WS=151292385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr7	151432869	rs1547470	T	C	1316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=2;PP=1017;SC=TGATGTTATATCCCAGTTGGA;SOR=5.235;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=40;TCF=38;TCR=2;TR=40;WE=151432877;WS=151432867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr7	151483445	rs12671980	A	G	921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.720;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=14;PP=661;ReadPosRankSum=1.201;SC=GTGCAAGCGGACATGCGGGTG;SOR=0.586;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=140;TCF=99;TCR=41;TR=45;WE=151483453;WS=151483435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,47:0.33:141
chr7	151504019	rs9648725	T	C	1856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.955;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=31;PP=1389;ReadPosRankSum=1.080;SC=ACCATTGCACTCCAGCCTGGG;SOR=0.577;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=114;TCF=72;TCR=42;TR=86;WE=151504038;WS=151504009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,82:0.80:102
chr7	151504499	rs10257529	G	A	4225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=79;PP=2778;ReadPosRankSum=0.582;SC=TGTGGGTGACGGTCATACTTT;SOR=0.690;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=257;TCF=141;TCR=116;TR=173;WE=151504514;WS=151504489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,184:0.67:273
chr7	151506155	rs6464173	A	G	1005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=6;PP=675;SC=TACGCCTTGCACGGATGAGTA;SOR=3.026;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=33;WE=151506163;WS=151506145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr7	151668180	.	C	CTAGA	390	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=7;PP=390;QD=56.4285714286;SC=CTCTCATTCTCTAGATAGATA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=7;WE=151668188;WS=151668170;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:19,7:0.27:26
chr7	151668224	rs58859718	A	AT	457.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.61;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr7	151668225	.	A	T	211	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MMLQ=27;MQ=58.59;NF=0;NR=9;PP=211;QD=27.3079125052;SC=GATAGATAGAAAGAAAACAGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=9;WE=151668233;WS=151668215;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,9:0.90:10
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chr7	151723022	rs72200904	TGCG	T	5079.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=53;PP=2596;SC=CCTCGAGAGCTGCGGCGGCGG;SOR=1.003;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=68;TCF=4;TCR=64;TR=56;WE=151723032;WS=151723012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr7	151800533	rs117258146	C	T	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.36;ReadPosRankSum=0.499;SOR=0.188;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
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chr7	151884279	.	TA	T	153.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.643;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.69;MQRankSum=1.941;QD=5.12;ReadPosRankSum=0.248;SOR=0.984;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
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chr7	151933333	rs148887101	A	G	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.825;NF=0;NR=6;PP=78;ReadPosRankSum=-0.200;SC=CCTGATCCAGATATTTCGAAG;SOR=0.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=6;WE=151933341;WS=151933323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
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chr7	151962176	rs62478356	T	A	9801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=2032;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.63;MQRankSum=-20.541;QD=4.83;ReadPosRankSum=-0.921;SOR=0.682;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1399,632:0.31:2031
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chr7	151970856	rs10454320	T	A	22888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-3.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1517;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.181;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-17.818;NF=653;NR=760;PP=2962;ReadPosRankSum=1.868;SC=TCCTGAAAGGTGCCGGCTCCT;SOR=0.834;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=1906;TCF=895;TCR=1011;TR=1413;WE=151970864;WS=151970846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:504,1011:0.67:1515
chr7	151970931	rs56850341	G	A	2136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=449;ExcessHet=3.0103;FS=25.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.29;MQRankSum=-16.472;QD=4.76;ReadPosRankSum=-6.620;SOR=2.458;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:337,112:0.25:449
chr7	151970977	rs200020144	C	A	608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=4.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.31;MQRankSum=-2.546;QD=4.38;ReadPosRankSum=-0.418;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,36:0.26:139
chr7	152143744	rs6953943	A	G	1784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=435;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.596;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-13.541;NF=64;NR=60;PP=1499;ReadPosRankSum=0.147;SC=CGTCTACCACAGCATTGATGC;SOR=0.789;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=421;TCF=221;TCR=200;TR=124;WE=152143752;WS=152143734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:320,115:0.26:435
chr7	152144203	.	GA	G	281.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=0.000;DP=399;ExcessHet=3.0103;FS=12.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.834;QD=0.87;ReadPosRankSum=-0.077;SOR=0.252;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:273,52:0.16:325
chr7	152511598	rs112910296	C	T	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FS=26.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.21;MQRankSum=-6.440;QD=0.60;ReadPosRankSum=0.233;SOR=4.460;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:153,19:0.11:172
chr7	152513740	rs373004706	TA	T	180.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.48;MQRankSum=-5.076;QD=3.93;ReadPosRankSum=1.449;SOR=0.502;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,16:0.35:46
chr7	152520388	rs151055592	G	A	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.406;NF=27;NR=7;PP=566;ReadPosRankSum=1.018;SC=ACACTGGGCAGTTGTTAATGC;SOR=0.845;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=67;TCR=17;TR=34;WE=152520396;WS=152520378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,27:0.41:66
chr7	152550499	rs4726215	T	C	1113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.642;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=18;PP=637;ReadPosRankSum=0.432;SC=TGGGTGCAGCTGTGGTCTCGT;SOR=0.425;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=110;TCF=79;TCR=31;TR=52;WE=152550507;WS=152550489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,54:0.46:118
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chr7	153749772	rs374262699	TTGC	T	100.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=160;ReadPosRankSum=1.344;SC=TGGGCTTGCCTTGCTGCTGCT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=7;WE=153749782;WS=153749762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr7	153749805	.	CTT	C	155.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.325;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=2.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=-2.581;QD=6.23;ReadPosRankSum=0.342;SOR=1.483;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr7	153750160	rs199977459	TC	T	527.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.411;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=1.549;NF=1;NR=9;PP=341;ReadPosRankSum=0.205;SC=TAAGAGCTTCTCGGGGGCGGG;SOR=0.178;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=10;WE=153750168;WS=153750150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr7	153750234	rs145699571	T	G	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=3.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQRankSum=-0.483;QD=14.54;ReadPosRankSum=1.224;SOR=1.229;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,22:0.76:29
chr7	153750319	.	G	GC	149.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=4;PP=200;SC=CGCGGTCACCGCGTCCCGGAG;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=153750327;WS=153750309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr7	154002658	rs143438546	CGT	C	313.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FS=0.849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.72;ReadPosRankSum=-1.035;SOR=0.572;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:157,25:0.14:182
chr7	154143557	rs34749902	T	C	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=177;ReadPosRankSum=-1.024;SC=TGATATAATATGGTTTCAATT;SOR=0.293;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=13;WE=154143565;WS=154143547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
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chr7	154429560	rs11243339	C	T	1704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.023;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=40;PP=1184;ReadPosRankSum=0.058;SC=CTGGATATTACGTCCTGAGCA;SOR=0.622;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=222;TCF=127;TCR=95;TR=89;WE=154429568;WS=154429550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,91:0.38:239
chr7	154429657	rs6972501	T	C	1718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.478;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=48;PP=1245;ReadPosRankSum=-0.610;SC=GGACGAGCTGTTTAACCCTTA;SOR=0.634;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=244;TCF=113;TCR=131;TR=89;WE=154429665;WS=154429647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,92:0.36:255
chr7	154461112	rs3807218	A	G	10418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=381;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.96;NF=174;NR=175;PP=2965;SC=GCAATGCAAAACTTCAGTATG;SOR=0.725;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=350;TCF=174;TCR=176;TR=349;WE=154461120;WS=154461102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,380:1.00:380
chr7	154461248	rs10580981	TTGTGTG	T,TTGTG	822.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;QD=32.91;SOR=5.058;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,7,18:0.28,0.72:25
chr7	154561188	rs56091483	C	T	1225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=24;PP=712;ReadPosRankSum=0.564;SC=GACTCGCCTACGCCGCCATCA;SOR=0.709;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=161;TCF=93;TCR=68;TR=60;WE=154561196;WS=154561178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,66:0.36:182
chr7	154564677	rs11291131	CA	C	124.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQRankSum=1.054;QD=6.56;ReadPosRankSum=1.592;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr7	154587367	rs10274635	G	A	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.552;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=491;ReadPosRankSum=-0.658;SC=CCACGCACGAGACAAAGAGGA;SOR=1.991;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=49;TCF=40;TCR=9;TR=25;WE=154587375;WS=154587357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,25:0.56:45
chr7	154587502	rs200163118	AAAAAGAAAAG	A	130.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=9.354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.27;MQRankSum=-0.838;QD=1.32;ReadPosRankSum=1.217;SOR=1.899;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,19:0.19:99
chr7	154587503	rs201537690	AAAAGAAAAG	A	1172.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=0.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.27;MQRankSum=1.423;QD=11.85;ReadPosRankSum=1.362;SOR=0.814;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,60:0.61:99
chr7	154592965	rs12531589	C	T	2425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.412;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=35;PP=1346;ReadPosRankSum=-1.230;SC=CCTTAGAAATCACATAGAAAA;SOR=0.550;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=144;TCF=91;TCR=53;TR=94;WE=154592973;WS=154592955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,109:0.69:157
chr7	154596517	rs2280659	G	A	1367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-3.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.487;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=26;PP=847;ReadPosRankSum=-0.741;SC=ACTCCCTGCAGGCCATGGGCG;SOR=0.515;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=224;TCF=150;TCR=74;TR=73;WE=154596525;WS=154596507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,80:0.33:246
chr7	154598908	rs2293357	A	G	2011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=48;PP=1363;SC=GGGAGGGGGCAGCGGCTGTGG;SOR=3.293;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=10;TCR=48;TR=58;WE=154598916;WS=154598898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr7	154645406	rs6962284	A	G	1434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.805;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=8;PP=1775;ReadPosRankSum=1.069;SC=TCTACGTGGCATAAGAAAAGC;SOR=0.498;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=108;TCF=81;TCR=27;TR=32;WE=154645427;WS=154645396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,38:0.32:118
chr7	154645419	rs145928686	G	GTTTTC	1956.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FS=0.658;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.51;ReadPosRankSum=1.437;SOR=0.783;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,53:0.31:170
chr7	154659566	rs56243497	TT	GG	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.659;HP=4;HapScore=2;JOINED;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=574;ReadPosRankSum=0.730;SC=CCAGTTTCTTTTTCTGTACAC;SOR=3.209;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=11;WE=154659575;WS=154659556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr7	154659889	rs60134921	C	G	5185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=73;PP=2962;ReadPosRankSum=0.165;SC=AGCAGGTGCCCTGCAAGGAAG;SOR=0.667;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=177;TCF=77;TCR=100;TR=128;WE=154659908;WS=154659879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,137:0.72:191
chr7	154659900	rs55716573	A	G	4827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=67;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.104;SC=TGCAAGGAAGACTCCCCAAGC;SOR=0.707;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=153;TCF=62;TCR=91;TR=113;WE=154659908;WS=154659879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,119:0.73:162
chr7	154664510	rs2293356	C	T	2503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.401;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=63;PP=1554;ReadPosRankSum=0.479;SC=GGAGAAATGACATTGTTGCAA;SOR=0.853;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=141;TCF=50;TCR=91;TR=95;WE=154664518;WS=154664500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,108:0.68:160
chr7	154664534	rs2293355	C	G	1630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=42;PP=1084;ReadPosRankSum=-1.993;SC=GAAAACATAACATCGTTTAGC;SOR=0.841;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=81;TCF=20;TCR=61;TR=55;WE=154664542;WS=154664524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,63:0.67:94
chr7	154667628	rs2293353	A	G	2815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.177;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=56;PP=1730;ReadPosRankSum=0.644;SC=ATGGCACCCCAGGCAGCCAGA;SOR=0.818;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=181;TCF=100;TCR=81;TR=124;WE=154667636;WS=154667618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,134:0.67:199
chr7	154672551	rs4960632	G	C	1601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.434;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=40;PP=1081;ReadPosRankSum=0.019;SC=AGACAAAGTGGCAGCAGGATG;SOR=0.728;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=318;TCF=183;TCR=135;TR=96;WE=154672559;WS=154672541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:236,100:0.30:336
chr7	154672646	rs3817522	T	C	1971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FS=0.877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.92;ReadPosRankSum=-0.100;SOR=0.774;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:218,115:0.35:333
chr7	154672679	rs3817520	A	T	1471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.490;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=40;PP=762;ReadPosRankSum=0.468;SC=CTGGTCTGAAAACCCCTCAGT;SOR=0.763;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=236;TCF=109;TCR=127;TR=76;WE=154672687;WS=154672669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,83:0.32:258
chr7	154672717	rs3817519	G	A	995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.848;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=32;PP=587;ReadPosRankSum=0.012;SC=CATTACCCACGTCTAATCCTG;SOR=1.077;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=164;TCF=72;TCR=92;TR=52;WE=154672725;WS=154672707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,55:0.31:178
chr7	154672809	rs3817518	G	A	1085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.660;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=31;PP=687;ReadPosRankSum=-0.595;SC=GATTCCAGCCGTGGGAGGTTT;SOR=1.751;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=60;TCF=17;TCR=43;TR=41;WE=154672817;WS=154672799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,45:0.71:63
chr7	154672839	rs3817517	C	T	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.228;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=70;ReadPosRankSum=-0.294;SC=AGCTCATTTTCCTAAGTTTCT;SOR=0.116;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=8;WE=154672847;WS=154672829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,8:0.28:29
chr7	154679302	rs4960642	T	C	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.627;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=193;ReadPosRankSum=-0.093;SC=CCGCACCCGGTCCAGGGCCCT;SOR=0.031;SbPval=0.06;Source=Platypus;TC=46;TCF=43;TCR=3;TR=14;WE=154679310;WS=154679292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,14:0.29:48
chr7	154679447	rs940378	G	A	3039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=521;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=77;PP=1671;ReadPosRankSum=1.600;SC=CATACGAGGTGTGTATGGGCA;SOR=0.687;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=480;TCF=249;TCR=231;TR=160;WE=154679455;WS=154679437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:345,176:0.34:521
chr7	154679591	rs77297860	G	A	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.692;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=308;ReadPosRankSum=0.591;SC=AGAAACCTCCGAAGGATCATT;SOR=0.368;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=45;TCF=6;TCR=39;TR=18;WE=154679599;WS=154679581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,20:0.41:49
chr7	154679610	rs2316537	GA	CC	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=457;ReadPosRankSum=-0.088;SC=TTCCACCAGAGAGTGGATTGA;SOR=0.484;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=12;WE=154679619;WS=154679600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr7	154684153	rs3734960	T	C	2048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=379;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.720;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=70;PP=1128;ReadPosRankSum=-0.498;SC=GACAAACTGCTGACAGTCACA;SOR=0.980;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=349;TCF=153;TCR=196;TR=116;WE=154684161;WS=154684143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:256,123:0.32:379
chr7	154720259	rs11543936	T	C	360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=258;SC=TCAATATCAGTCCCACTGAGC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=154720267;WS=154720249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr7	154748908	rs3817480	G	A	4392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=86;NR=64;PP=2423;SC=AGCCAGCAATGAAAAATTTAA;SOR=0.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=150;TCF=86;TCR=64;TR=150;WE=154748916;WS=154748898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr7	154751774	rs2272174	G	A	1316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=33;PP=877;SC=AAGGATAAATGTAAGTACTAT;SOR=2.030;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=14;TCR=33;TR=47;WE=154751782;WS=154751764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr7	154755628	rs748811	G	A	374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=293;SC=TTCTATTTACGGACTTTTCTA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=154755636;WS=154755618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr7	154759671	rs893942	T	C	1810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=44;PP=1322;SC=ATGAATATGCTTGCACAAAAG;SOR=2.019;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=16;TCR=44;TR=60;WE=154759679;WS=154759661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr7	154760266	rs141168451	TCTG	T	82.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=1.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.65;ReadPosRankSum=1.389;SOR=0.346;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,6:0.12:50
chr7	154760369	rs935037	A	G	1509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=11;PP=1150;SC=GGAGCTGGGCAAGCTGCTGCT;SOR=2.790;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=37;TCR=11;TR=48;WE=154760377;WS=154760359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr7	154760889	rs3800580	A	C	873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=24;PP=678;SC=AAACAGATGAATGATAATTTC;SOR=3.767;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=26;WE=154760897;WS=154760879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr7	154785362	rs306281	A	G	11731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=448;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=249;NR=164;PP=2965;SC=TTTTCACTCCATTAACTATCA;SOR=1.204;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=413;TCF=249;TCR=164;TR=413;WE=154785370;WS=154785352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,448:1.00:448
chr7	154862508	rs3734967	A	G	3440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=100;NR=43;PP=2110;ReadPosRankSum=0.644;SC=CCCACTGGCCAGAGGTTGCAA;SOR=0.704;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=227;TCF=156;TCR=71;TR=143;WE=154862516;WS=154862498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,159:0.63:251
chr7	154863467	rs2241859	G	T	453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=12;PP=338;SC=GTTTGGGAGTGGGGGGAGTAA;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=154863475;WS=154863457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr7	154875780	rs1730208	G	A	2041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=3;PP=1531;SC=GTGGATGTGCGGAATCCAGGC;SOR=4.648;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=59;TCF=56;TCR=3;TR=59;WE=154875788;WS=154875770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr7	154876032	.	C	T	2753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-4.477;ClippingRankSum=0.000;DP=411;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.145;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=66;PP=1579;ReadPosRankSum=0.828;SC=CCTTCTTTCTCACCGAGCTCA;SOR=0.605;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=383;TCF=202;TCR=181;TR=137;WE=154876040;WS=154876022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:259,148:0.36:407
chr7	154876342	rs980442	T	G	955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=22;PP=610;SC=TGCACTGGCCTCTTTTCCACC;SOR=4.548;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=24;WE=154876350;WS=154876332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr7	155094172	rs9718441	C	T	1510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.973;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=41;PP=1024;ReadPosRankSum=0.328;SC=GCTTACTTAACTTTCATTAAA;SOR=0.457;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=92;TCF=25;TCR=67;TR=58;WE=155094180;WS=155094162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,62:0.64:97
chr7	155099855	rs9769506	C	A	669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.610;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=2;PP=502;ReadPosRankSum=2.127;SC=AAGTGTCAATCTTTCCCATGT;SOR=0.280;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=37;TCF=35;TCR=2;TR=27;WE=155099863;WS=155099845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,27:0.73:37
chr7	155150472	rs3922604	G	A	8168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=131;NR=130;PP=2965;SC=CTGTTTCCCCGCAGGGCTGCC;SOR=0.742;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=261;TCF=131;TCR=130;TR=261;WE=155150480;WS=155150462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,293:1.00:293
chr7	155150560	rs6605563	A	G	11681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=428;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=202;NR=190;PP=2965;SC=AAGGACTCCAAGGGAAATGTC;SOR=0.726;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=393;TCF=202;TCR=191;TR=392;WE=155150568;WS=155150550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,427:1.00:427
chr7	155150602	rs6605562	T	C	13073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=480;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=238;NR=205;PP=2965;SC=GTGTACTTCCTCCGGGGCTGC;SOR=0.816;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=443;TCF=238;TCR=205;TR=443;WE=155150610;WS=155150592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,480:1.00:480
chr7	155150765	rs7456618	C	T	17659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=664;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=295;NR=330;PP=2965;SC=CAAGGCCCTCCGTCTGGGAAA;SOR=0.841;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=625;TCF=295;TCR=330;TR=625;WE=155150773;WS=155150755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,664:1.00:664
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chr7	155174801	rs147883222	ATGTGAG	A	529.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.54;ReadPosRankSum=-0.988;SOR=0.673;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,18:0.22:81
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chr7	155747907	rs7810074	T	C	8058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=165;NR=95;PP=2965;SC=CACAGGGGAGTATGAAGCCGG;SOR=1.234;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=260;TCF=165;TCR=95;TR=260;WE=155747915;WS=155747897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,295:1.00:295
chr7	155749951	rs35655547	C	T	9679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=367;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=192;NR=146;PP=2965;SC=GAAACGTCAGCGGTAACATGC;SOR=0.888;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=338;TCF=192;TCR=146;TR=338;WE=155749959;WS=155749941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,367:1.00:367
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chr7	155755336	rs7807731	C	T	2952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.536;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=55;PP=1810;ReadPosRankSum=2.855;SC=TTTAGGAGCACGGGTACTACT;SOR=0.642;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=192;TCF=111;TCR=81;TR=126;WE=155755344;WS=155755326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,135:0.65:207
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chr7	155757502	rs1551630	T	C	2863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=58;PP=1851;SC=TCGCTTGCTGTCACTGCCTGG;SOR=1.887;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=30;TCR=58;TR=88;WE=155757510;WS=155757492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr7	156433243	rs7788200	C	G	3037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.540;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=62;PP=1747;ReadPosRankSum=-2.121;SC=CGTCTAGACGCTGACGCCGTG;SOR=0.622;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=188;TCF=90;TCR=98;TR=123;WE=156433251;WS=156433233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,136:0.66:207
chr7	156436769	rs7804211	C	T	1115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.157;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=34;PP=795;ReadPosRankSum=2.824;SC=CAATCTCTGGCGATATTTACT;SOR=1.099;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=73;TCF=23;TCR=50;TR=47;WE=156436777;WS=156436759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,48:0.62:77
chr7	156468377	rs2886380	GC	CA	4562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.750;HP=7;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=30;PP=2944;ReadPosRankSum=1.771;SC=ACCCGCCCCCGCCTCCTCCTC;SOR=1.404;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=169;TCF=109;TCR=60;TR=97;WE=156468386;WS=156468367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,114:0.61:188
chr7	156468656	rs2365513	G	A	472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=343;ReadPosRankSum=1.010;SC=TCACTTTGGGGAGCCTAGGAG;SOR=0.638;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=19;WE=156468664;WS=156468646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,19:0.68:28
chr7	156468939	rs140092411	G	GTGTA	2639.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.920;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.580;NF=33;NR=18;PP=2343;ReadPosRankSum=0.956;SC=ATATGTGTGTGTATATATATA;SOR=0.500;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=79;TCF=52;TCR=27;TR=51;WE=156468947;WS=156468929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,68:0.65:105
chr7	156469096	rs2302149	C	T	14931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=561;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=258;NR=253;PP=2965;ReadPosRankSum=0.453;SC=GGCCTCTTCCCGTCCTGTGTG;SOR=0.704;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=513;TCF=259;TCR=254;TR=511;WE=156469104;WS=156469086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,559:1.00:561
chr7	156469133	rs2302147	C	G	6733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=443;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=128;NR=142;PP=2962;ReadPosRankSum=2.395;SC=GGGAGACCCACGAGTGCTCCA;SOR=0.702;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=408;TCF=192;TCR=216;TR=270;WE=156469141;WS=156469123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,290:0.66:442
chr7	156469179	rs2302146	C	T	7313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.570;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=91;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.545;SC=TGGCGGTCAGCGCGTGGGTGC;SOR=0.587;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=260;TCF=119;TCR=141;TR=174;WE=156469198;WS=156469169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,192:0.69:279
chr7	156469190	rs2302145	A	G	7335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.157;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=87;PP=2962;ReadPosRankSum=0.664;SC=GCGTGGGTGCAGGCAGGCGTT;SOR=0.562;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=261;TCF=124;TCR=137;TR=173;WE=156469198;WS=156469169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,192:0.68:282
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chr7	156476683	rs3735186	T	A	458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=335;ReadPosRankSum=-2.250;SC=GGGGCCACGGTTGAATGGAAA;SOR=0.826;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=17;WE=156476691;WS=156476673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,18:0.82:22
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chr7	156529062	rs10640672	C	CAGT	2032.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=3;PP=1711;SC=AGCTTGCATTCATTATTTAGT;SOR=4.758;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=31;WE=156529070;WS=156529052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr7	156549195	rs17571054	G	A	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.061;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=21;PP=445;ReadPosRankSum=-0.528;SC=ATAATTCAACGTTATAAAACG;SOR=0.551;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=56;TCF=20;TCR=36;TR=34;WE=156549203;WS=156549185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,36:0.62:58
chr7	156626273	.	ATTG	A,AGAACCAGTGTTG	450.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.586;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=1215;ReadPosRankSum=-0.981;SC=CCAATAGGAGATTGGATTATC;SOR=0.602;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=4;WE=156626285;WS=156626263;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.50:20
chr7	156626277	.	G	GAACCAGTGCTAA	450.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.46;ReadPosRankSum=-0.799;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr7	156685519	rs200299453	G	GC	1033.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=3;PP=896;SC=GGCGCGAGGCGAGGCCCGGAG;SOR=3.180;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=156685527;WS=156685509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr7	156685540	.	C	CG	599.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.338;ClippingRankSum=0.000;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=3.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.65;MQRankSum=2.629;QD=13.95;ReadPosRankSum=-1.008;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,28:0.65:43
chr7	156685545	.	AC	GC	997	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=1.0000,0.5000;HP=4;HapScore=3;MGOF=26;MMLQ=24;MQ=63.02;NF=18,4;NR=6,1;PP=997,239;QD=42.5;SC=GGGTCCGGGGACCGGGGGCCC;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=24,5;WE=156685553;WS=156685530;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:40,5:0.11:45
chr7	156685545	.	AC	ACC	997	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=1.0000,0.5000;HP=4;HapScore=3;MGOF=26;MMLQ=24;MQ=63.02;NF=18,4;NR=6,1;PP=997,239;QD=42.5;SC=GGGTCCGGGGACCGGGGGCCC;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=24,5;WE=156685553;WS=156685530;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,24:0.83:29
chr7	156685545	rs200101319	A	AC,C	1935.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=62.21;QD=37.23;SOR=2.049;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,19,33:0.37,0.63:52
chr7	156685590	rs117769123	G	A	1841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=0.667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.00;MQRankSum=1.474;QD=13.25;ReadPosRankSum=-0.706;SOR=0.581;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,92:0.66:139
chr7	156742501	rs6969990	C	G	1773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.082;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=23;PP=1182;ReadPosRankSum=-0.163;SC=CCGCATGAAGCGCAGAGGCGG;SOR=1.288;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=114;TCF=76;TCR=38;TR=75;WE=156742509;WS=156742491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,80:0.65:124
chr7	156742749	rs6969196	G	A	2577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.557;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=59;PP=1633;ReadPosRankSum=0.113;SC=GCCCCGAACAGGGTCCCGGCC;SOR=0.761;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=174;TCF=81;TCR=93;TR=108;WE=156742757;WS=156742739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,115:0.62:186
chr7	156742796	rs6952214	A	C	2387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.595;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=47;PP=1523;ReadPosRankSum=-0.741;SC=GCCAGCGGTCACCGGCAGGAC;SOR=0.617;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=151;TCF=73;TCR=78;TR=92;WE=156742804;WS=156742786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,103:0.62:165
chr7	156742965	rs61734937	G	C	6962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=460;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.564;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=176;NR=123;PP=2962;ReadPosRankSum=0.815;SC=TTTTAGCGGCGAACGAGGAGG;SOR=0.646;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=445;TCF=263;TCR=182;TR=299;WE=156742973;WS=156742955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,306:0.67:460
chr7	156743264	rs61747373	C	A	5086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.417;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=106;NR=108;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.190;SC=GAAGCAGAAGCGCAGAGCGAG;SOR=0.722;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=323;TCF=160;TCR=163;TR=214;WE=156743272;WS=156743254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,221:0.66:334
chr7	156746701	rs61122657	T	C	1516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.049;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=13;PP=1224;ReadPosRankSum=-2.110;SC=AAATAGAATATATTGTTGGTA;SOR=0.991;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=98;TCF=76;TCR=22;TR=64;WE=156746709;WS=156746691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,63:0.64:99
chr7	156746727	rs58846177	T	C	2641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.319;HP=5;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=35;PP=1753;ReadPosRankSum=-2.289;SC=AACTCTTTAATTTTTTAAAAT;SOR=0.567;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=164;TCF=111;TCR=53;TR=108;WE=156746735;WS=156746717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,116:0.66:177
chr7	156754981	rs3750131	T	C	3887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=3.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=89;PP=2529;ReadPosRankSum=0.981;SC=TTCAATTCTGTTTTGCTCAGA;SOR=0.656;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=187;TCF=60;TCR=127;TR=132;WE=156754989;WS=156754971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,153:0.71:214
chr7	156755350	rs12672076	T	C	6854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=132;NR=110;PP=2965;SC=GCCTCCCTGTTGGAGTGAGTC;SOR=0.798;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=243;TCF=133;TCR=110;TR=242;WE=156755358;WS=156755340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,259:1.00:259
chr7	156759557	rs55701040	T	A	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.25;MQRankSum=1.284;QD=8.55;ReadPosRankSum=-0.332;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,17:0.40:43
chr7	156759597	rs34856615	ATATAT	A	2027.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.188;NF=25;NR=10;PP=1532;ReadPosRankSum=0.999;SC=GTTGTTAGTGATATATTATAG;SOR=0.727;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=115;TCF=79;TCR=36;TR=35;WE=156759609;WS=156759587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,57:0.39:146
chr7	156761751	rs9969350	C	T	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=7.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.46;ReadPosRankSum=-0.475;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,13:0.21:61
chr7	156761818	rs2302445	G	A	745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FS=2.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.69;ReadPosRankSum=-0.645;SOR=0.534;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:154,48:0.24:202
chr7	156761913	rs2302444	C	T	1641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=456;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.60;ReadPosRankSum=1.261;SOR=0.702;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:341,115:0.25:456
chr7	156762224	rs2302443	G	C	948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FS=1.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.584;QD=4.54;ReadPosRankSum=-1.052;SOR=0.563;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:150,59:0.28:209
chr7	156762248	rs12919	G	A	1275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.331;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQ=59.95;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=34;PP=762;ReadPosRankSum=0.822;SC=AAAGCTGGGGGTGTTACGTGA;SOR=0.835;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=230;TCF=120;TCR=110;TR=73;WE=156762256;WS=156762238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,78:0.31:248
chr7	156762446	rs3087905	G	T	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.243;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=62;ReadPosRankSum=-0.278;SC=AAATGTCCTTGGTAAACCCAA;SOR=0.025;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=8;WE=156762454;WS=156762436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
chr7	156802643	.	A	AGCGGCG	102.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.253;NF=0;NR=3;PP=105;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CCAGGCCCCCAGCGGCGGCGG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=3;WE=156802651;WS=156802633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr7	156932094	rs200844106	G	GGGACTCGGGGTT	3239.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=67;PP=2900;SC=GCTCGGGGCTGGGACTCGGGG;SOR=3.234;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=1;TCR=83;TR=68;WE=156932102;WS=156932084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr7	156971581	rs870745	T	C	4509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.057;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=116;PP=2555;ReadPosRankSum=0.580;SC=CTCAGCATCCTGATGGGGAGT;SOR=0.877;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=315;TCF=139;TCR=176;TR=200;WE=156971589;WS=156971571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,213:0.63:337
chr7	157046584	.	CT	C	84.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.596;ClippingRankSum=0.000;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=4.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.87;ReadPosRankSum=-3.228;SOR=0.279;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,16:0.16:97
chr7	157049530	rs1182373	T	G	2043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=56;NR=7;PP=1645;SC=TTTCCGTGGGTGTCTGGACCA;SOR=3.716;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=57;TCR=7;TR=63;WE=157049538;WS=157049520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr7	157151234	rs3802100	C	T	706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=5;PP=457;SC=CCTGTTTTTACTTGCAGGACC;SOR=2.215;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=23;WE=157151242;WS=157151224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr7	157156151	rs3802096	C	T	1320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=37;PP=1064;SC=TAGGTAACCACGAGTGCTGGG;SOR=4.125;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=40;TCF=3;TCR=37;TR=40;WE=157156159;WS=157156141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr7	157159423	rs3779591	G	A	1560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=45;PP=1207;SC=GCATTTAAAAGTCTTTTACGA;SOR=4.534;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=4;TCR=45;TR=49;WE=157159431;WS=157159413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr7	157162068	rs9692250	T	C	8798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=151;NR=158;PP=2965;SC=GGGCAGTGTTTGGGTTGAAGT;SOR=0.831;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=309;TCF=151;TCR=158;TR=309;WE=157162076;WS=157162058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,338:1.00:338
chr7	157162103	rs12672981	A	G	7120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=137;PP=2965;ReadPosRankSum=0.695;SC=GGTGATTCTCATGGTGACCAA;SOR=1.136;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=243;TCF=104;TCR=139;TR=240;WE=157162111;WS=157162093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,268:0.99:270
chr7	157208617	rs1009135	C	T	2912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.196;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=46;PP=1958;ReadPosRankSum=-0.179;SC=GCTTTTTGTTCTTAACATGGG;SOR=0.487;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=213;TCF=142;TCR=71;TR=124;WE=157208625;WS=157208607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,131:0.58:225
chr7	157234112	rs11977865	G	A	2226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.022;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=62;PP=1426;ReadPosRankSum=1.577;SC=GGCTGTTCTGGGCGGCGCCTG;SOR=0.564;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=282;TCF=109;TCR=173;TR=104;WE=157234120;WS=157234102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:188,116:0.38:304
chr7	157234787	.	G	T	139	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MMLQ=16;MQ=59.54;NF=6;NR=8;PP=139;QD=12.4122294677;SC=CGTAGCGTCTGTGGTGGGCTC;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=52;TCF=29;TCR=23;TR=14;WE=157234795;WS=157234777;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:38,14:0.27:52
chr7	157234828	.	G	A	1155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.731;ClippingRankSum=0.000;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=2.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=2.218;QD=16.75;ReadPosRankSum=-1.503;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,57:0.83:69
chr7	157234912	rs12669046	A	G	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.56;ReadPosRankSum=-0.212;SOR=0.636;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,17:0.22:76
chr7	157235034	.	T	G	65	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=15;MQ=53.53;NF=3;NR=5;PP=65;QD=12.4714015684;SC=GCTCTTCCGGTCGGCGCCTGA;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=21;TCF=10;TCR=11;TR=8;WE=157235042;WS=157235024;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:13,8:0.38:21
chr7	157235229	rs6974109	T	C	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.39;ReadPosRankSum=0.176;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr7	157261127	rs34002063	C	T	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=239;ReadPosRankSum=0.181;SC=CCCATCTGCCCGCCCGGCCAG;SOR=1.061;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=11;WE=157261135;WS=157261126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr7	157261201	rs4716743	T	G	2850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.670;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=29;PP=1997;ReadPosRankSum=-0.162;SC=CACCGTCACCTTCACGGGAGA;SOR=2.037;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=108;TCF=78;TCR=30;TR=107;WE=157261209;WS=157261191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,106:0.99:107
chr7	157261258	rs4716744	C	T	15770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=344;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=194;NR=136;PP=2965;SC=GGGACCATCCCTCACCTTTGG;SOR=1.041;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=330;TCF=194;TCR=136;TR=330;WE=157261266;WS=157261248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,344:1.00:344
chr7	157261275	rs4716745	C	T	18856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=413;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=222;NR=168;PP=2965;SC=TTGGTTTGCCCGCGTTCTCAC;SOR=0.953;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=390;TCF=222;TCR=168;TR=390;WE=157261283;WS=157261265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,412:1.00:412
chr7	157261292	rs4716746	A	G	20176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=482;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=245;NR=212;PP=2965;SC=TCACACGGGGACAGCTGTTTA;SOR=0.812;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=461;TCF=247;TCR=214;TR=457;WE=157261300;WS=157261282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,481:1.00:481
chr7	157261945	rs2109830	A	G	3708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=10;PP=1478;SC=CAGCAGGGGCAGGACCCTCGG;SOR=2.777;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=59;TCR=10;TR=69;WE=157261961;WS=157261935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr7	157261953	rs11449038	C	CG	4020.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=11;PP=2681;SC=GCAGGACCCTCGGCCTGGCCA;SOR=2.687;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=68;TCF=53;TCR=15;TR=62;WE=157261961;WS=157261935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr7	157262154	.	C	T	1174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.683;ClippingRankSum=0.000;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.560;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=32;PP=685;ReadPosRankSum=1.064;SC=ACGGAGCTAACGTGCTGAGTA;SOR=0.612;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=186;TCF=80;TCR=106;TR=61;WE=157262162;WS=157262144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,66:0.33:202
chr7	157262170	rs7801907	T	C	4132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=91;PP=2316;SC=GAGTAGGGGGTGCAGACCCGG;SOR=1.424;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=54;TCR=91;TR=145;WE=157262178;WS=157262160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr7	157262226	rs7778458	G	A	1315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=33;PP=924;SC=AGGACATGCCGGCATCGGAGG;SOR=2.737;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=41;TCF=8;TCR=33;TR=40;WE=157262234;WS=157262216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr7	157262920	rs7806450	T	C	458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=9;NR=5;PP=135;SC=GCACTGGGTCTGCTCCCTGCA;SOR=0.793;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=14;WE=157262928;WS=157262910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr7	157263015	rs7784276	C	T	695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.93;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr7	157263025	rs7783247	GA	CG	671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.78;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr7	157263050	rs7802789	A	G	556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=48;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=7;NR=7;PP=172;SC=TGTGTCCGGCACTGGCCTGCG;SOR=0.836;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=7;TCR=7;TR=14;WE=157263058;WS=157263040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr7	157263349	.	C	T	485	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=59;MMLQ=15;MQ=52.9;NF=22;NR=7;PP=485;QD=17.9231452602;SC=GTGTCCGGCGCTGGCCTGCAT;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=29;WE=157263357;WS=157263339;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,29:0.94:31
chr7	157263370	.	T	C	734	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=47;MMLQ=17;MQ=58.55;NF=28;NR=17;PP=734;QD=17.0838047233;SC=TGGGTGTGTCTGTGTGTCCGG;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=46;TCF=29;TCR=17;TR=45;WE=157263378;WS=157263360;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,45:0.98:46
chr7	157263391	.	G	T	1186	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=42;MMLQ=17;MQ=58.5;NF=42;NR=26;PP=1186;QD=17.9525178316;SC=CGCTGGCCTGGGTTGGGTGTG;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=70;TCF=44;TCR=26;TR=68;WE=157263399;WS=157263381;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,68:0.97:70
chr7	157263410	.	C	T	1368	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=32;MMLQ=24;MQ=58.66;NF=48;NR=34;PP=1368;QD=17.1069660067;SC=TGTCCGTGTGCCCGGTGCTGG;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=48;TCR=34;TR=82;WE=157263418;WS=157263400;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr7	157263532	rs7785035	C	T	1895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=27;NR=32;PP=1012;SC=TTGAATCTCCCAACATCCAAC;SOR=1.117;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=59;TCF=27;TCR=32;TR=59;WE=157263540;WS=157263522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr7	157318407	.	TACTGTCGG	CACCGTCTG,CAGTGTCGC	1459	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=19;MMLQ=24;MQ=52.38;NF=20,12;NR=1,6;PP=1459,1319;QD=72.4984702315;SC=GGGCCGTGTGTACTGTCGGAG;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=45;TCF=36;TCR=9;TR=21,18;WE=157318423;WS=157318397;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.47:45
chr7	157318438	.	G	C	1673	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MMLQ=25;MQ=56.93;NF=55;NR=27;PP=1673;QD=20.8264782018;SC=GCCGTGTGCAGTGTCGCAGGG;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=93;TCF=63;TCR=30;TR=82;WE=157318446;WS=157318428;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:11,82:0.88:93
chr7	157333542	rs1124400	C	T	3145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=63;PP=1937;SC=CCTGCCACAGCGTCGGCTCCC;SOR=1.140;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=46;TCR=63;TR=109;WE=157333554;WS=157333532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr7	157361564	rs7789467	C	T	8723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=182;NR=111;PP=2965;SC=AGCTCTGAGCCGCAACAAAGC;SOR=1.260;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=293;TCF=182;TCR=111;TR=293;WE=157361572;WS=157361554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,319:1.00:319
chr7	157361734	rs221294	T	C	12133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=443;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=191;NR=224;PP=2965;ReadPosRankSum=1.194;SC=TAGTGACAGTTCATTTCCTTC;SOR=0.331;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=417;TCF=191;TCR=226;TR=415;WE=157361742;WS=157361724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,442:1.00:443
chr7	157367205	rs146248159	T	TGA	3060.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.981;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.993;NF=4;NR=65;PP=2994;ReadPosRankSum=1.130;SC=AGAGTAATAATGAGAGAGAGA;SOR=1.025;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=120;TCF=8;TCR=112;TR=69;WE=157367214;WS=157367195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,106:0.79:135
chr7	157369564	rs221301	C	G	1291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=30;PP=861;SC=CACGTCTGACCAGAGAAGGGG;SOR=4.021;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=34;WE=157369572;WS=157369554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr7	157370645	rs736940	G	A	1440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=7;PP=574;SC=AATCCCATTCGGAGGAGGAGC;SOR=1.911;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=29;WE=157370653;WS=157370635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr7	157370688	rs122004	C	G	2601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=47;NR=23;PP=1067;SC=GTGGGTCCTGCCCTGGGTGGC;SOR=1.136;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=47;TCR=23;TR=70;WE=157370696;WS=157370678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr7	157396697	rs17853260	G	A	7014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=125;NR=113;PP=2965;SC=CACTTACGATGGGGCTAGCGT;SOR=0.723;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=238;TCF=125;TCR=113;TR=238;WE=157396705;WS=157396687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,268:1.00:268
chr7	157406819	rs10247739	A	C	4748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.09;ReadPosRankSum=0.800;SOR=0.319;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,214:1.00:215
chr7	157414064	rs1130502	G	A	1396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.234;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=12;PP=991;ReadPosRankSum=0.760;SC=AGGTCAGCACGGCCAGGGAGC;SOR=0.265;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=90;TCF=75;TCR=15;TR=57;WE=157414072;WS=157414054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,61:0.63:97
chr7	157691523	rs56112490	T	C	3105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.626;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=72;PP=2018;ReadPosRankSum=0.372;SC=AAAATTTCAATTACATGACTG;SOR=0.533;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=148;TCF=57;TCR=91;TR=119;WE=157691531;WS=157691513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,130:0.80:162
chr7	157800838	rs143545915	AGT	A	4755.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=18;PP=2975;SC=CACATGTGTGAGTGTGTGTGG;SOR=3.277;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=101;TCF=76;TCR=25;TR=90;WE=157800847;WS=157800828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr7	157800899	rs12666418	C	T	10551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=406;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=211;NR=168;PP=2965;SC=TGGGCATGTGCATACACACTG;SOR=0.933;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=379;TCF=211;TCR=168;TR=379;WE=157800907;WS=157800889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,406:1.00:406
chr7	157873975	rs3800863	T	C	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=9;PP=345;ReadPosRankSum=0.705;SC=TACGTGTGTGTGGAAACAGCC;SOR=0.683;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=109;TCF=78;TCR=31;TR=30;WE=157873983;WS=157873965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,30:0.26:115
chr7	157903478	rs3800861	A	G	3042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=672;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.216;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=95;PP=2096;ReadPosRankSum=-1.223;SC=CTCTGCGACCAAGCAACAGGA;SOR=0.657;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=638;TCF=315;TCR=323;TR=192;WE=157903486;WS=157903468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:473,197:0.29:670
chr7	157926349	rs17847428	T	G	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.859;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=380;ReadPosRankSum=2.048;SC=CACAGGAGCTTAGCCAGGGCT;SOR=1.445;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=19;WE=157926357;WS=157926339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,21:0.68:31
chr7	157929223	rs3800858	G	A	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.031;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=381;ReadPosRankSum=-1.424;SC=GAGATTATGAGGGGTTTCTCC;SOR=0.947;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=96;TCF=75;TCR=21;TR=27;WE=157929231;WS=157929213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,27:0.26:102
chr7	157929246	rs3839696	G	GA	615.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FS=1.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.18;MQRankSum=3.266;QD=3.42;ReadPosRankSum=0.761;SOR=0.904;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:140,40:0.22:180
chr7	157930974	rs3752366	C	T	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=1.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.34;ReadPosRankSum=-0.453;SOR=0.875;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,15:0.23:64
chr7	157930979	rs3752367	C	G	534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.43;ReadPosRankSum=-1.382;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,19:0.26:72
chr7	157931119	rs1130500	A	G	1978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.974;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=23;PP=561;ReadPosRankSum=-0.867;SC=CCATCAGCTCAGCCATGCCGT;SOR=0.539;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=150;TCF=90;TCR=60;TR=54;WE=157931127;WS=157931109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,62:0.36:173
chr7	157931144	rs1130499	C	T	1726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=20;PP=455;ReadPosRankSum=1.181;SC=CTCCAGGCCACTCAGGCCCCT;SOR=0.657;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=160;TCF=92;TCR=68;TR=47;WE=157931152;WS=157931134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,54:0.30:181
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chr7	157959604	rs143939066	C	A	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.299;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=275;ReadPosRankSum=0.696;SC=ACAAGAAACACCAAGCGGGGC;SOR=1.609;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=15;WE=157959612;WS=157959594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
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chr7	157985149	rs3800855	C	G	1980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=433;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.60;ReadPosRankSum=-1.426;SOR=0.681;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:312,119:0.28:431
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chr7	158325310	rs55857496	C	CAA	5864.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=29;PP=2966;ReadPosRankSum=-1.647;SC=AAGAAAAGACCAAAAACGTCA;SOR=0.730;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=138;TCF=63;TCR=75;TR=61;WE=158325324;WS=158325300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,136:0.61:223
chr7	158325316	rs34189096	C	A	6149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.730;NF=73;NR=43;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.302;SC=AGACCAAAAACGTCACTAAAC;SOR=0.717;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=209;TCF=130;TCR=79;TR=116;WE=158325324;WS=158325300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,162:0.63:257
chr7	158325338	rs12670231	G	A	4837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.686;NF=105;NR=64;PP=2701;ReadPosRankSum=0.582;SC=TCAAAAACCCGGGACATGATG;SOR=0.690;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=285;TCF=176;TCR=109;TR=169;WE=158325346;WS=158325328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,216:0.64:337
chr7	158325503	rs4909237	C	T	969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=4.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.453;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=33;PP=633;ReadPosRankSum=0.937;SC=TGCAGGCTTCCGTGCAGGAGC;SOR=1.699;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=113;TCF=26;TCR=87;TR=38;WE=158325511;WS=158325493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,44:0.36:122
chr7	158325572	rs4909238	T	C	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=234;ReadPosRankSum=1.131;SC=CAGACCATCTTGATGGCTCAG;SOR=0.631;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=14;WE=158325580;WS=158325562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,17:0.85:20
chr7	158334101	rs10623822	T	TTA	355.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=373;ReadPosRankSum=-0.186;SC=AAAGCAAGCATTATTCCACCC;SOR=0.562;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=10;WE=158334109;WS=158334091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,11:0.35:31
chr7	158384590	rs10277152	T	C	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=28;PP=675;ReadPosRankSum=-0.620;SC=TGGGTTATTCTTTGATTACAA;SOR=2.899;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=28;WE=158384598;WS=158384580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,28:0.67:42
chr7	158424508	rs11973267	A	G	747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=19;PP=505;SC=GTTTGCAACCATGCATTTAAA;SOR=2.670;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=24;WE=158424516;WS=158424498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr7	158438186	rs2290393	G	A	8303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=161;NR=115;PP=2965;SC=CCACCTTCCAGATGACAGAGG;SOR=1.070;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=276;TCF=161;TCR=115;TR=276;WE=158438194;WS=158438176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,296:1.00:296
chr7	158444975	rs1466210	T	G	2943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=38;PP=1836;ReadPosRankSum=0.660;SC=TCCTGGGGAGTTCTGAGTACC;SOR=0.497;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=68;TCR=38;TR=105;WE=158444983;WS=158444965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,110:0.99:111
chr7	158445267	rs5888763	C	CA	117.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=145;SC=AAAATGGTAACAAAAAAGAGA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=5;WE=158445275;WS=158445257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr7	158450965	rs12533939	A	T	1653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=32;PP=992;ReadPosRankSum=0.427;SC=ACATGAATTAATAATTCAGCA;SOR=0.709;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=301;TCF=192;TCR=109;TR=91;WE=158450973;WS=158450955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:225,99:0.31:324
chr7	158455089	rs4484634	G	A	3906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=65;PP=2211;SC=ATTGTGAAAGGATCTAATCAT;SOR=0.869;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=64;TCR=65;TR=129;WE=158455097;WS=158455079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr7	158456710	rs10227735	C	T	839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=5;PP=606;SC=CTACAAAGGACATATAGCAAT;SOR=2.985;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=29;WE=158456718;WS=158456700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr7	158457095	rs2290392	G	C	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.499;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=299;ReadPosRankSum=-1.388;SC=CTATTTTAAGGGAAATCATTC;SOR=0.170;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=18;WE=158457103;WS=158457085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr7	158457458	rs3816466	A	G	5619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=380;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.246;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=143;PP=2962;ReadPosRankSum=0.232;SC=CAAAAAGCACATATGCAGAAG;SOR=0.926;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=353;TCF=145;TCR=208;TR=234;WE=158457466;WS=158457448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,251:0.66:379
chr7	158468437	rs1530967	G	A	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=273;ReadPosRankSum=-0.187;SC=TCAGGGATTCGTAACTTAGAG;SOR=0.941;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=15;WE=158468445;WS=158468427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,16:0.84:19
chr7	158473339	rs2305470	G	T	2296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=20;PP=1577;SC=ATTGTAATTTGGACTTAGAGT;SOR=2.103;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=54;TCR=20;TR=74;WE=158473347;WS=158473329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr7	158476106	rs6970374	C	T	5059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=385;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.195;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=99;NR=118;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.211;SC=ATGCAAAGCACTTGGTGTGTG;SOR=0.816;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=357;TCF=166;TCR=191;TR=217;WE=158476114;WS=158476096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,229:0.59:385
chr7	158476148	rs6969248	G	A	9066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=338;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=141;NR=166;PP=2965;SC=CAAGCAGTGCGGCATTTGAGT;SOR=0.951;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=307;TCF=141;TCR=166;TR=307;WE=158476156;WS=158476138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,337:1.00:337
chr7	158476271	rs6956496	T	C	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.291;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=494;ReadPosRankSum=-0.510;SC=GGTTTTCTTATAGCAAGGAGA;SOR=0.136;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=23;WE=158476279;WS=158476261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,24:0.71:34
chr7	158480274	rs41271193	T	C	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=64;ReadPosRankSum=0.054;SC=TGAGAGCACATGCACGAGTTG;SOR=0.941;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=6;WE=158480282;WS=158480264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr7	158482318	rs73167204	T	C	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.628;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=139;ReadPosRankSum=-0.748;SC=ACCATCCAATTTAATGATGAA;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=7;WE=158482326;WS=158482315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr7	158528158	rs3816461	C	G	5698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=110;NR=76;PP=2965;SC=ATTTTACAAACTGCAGGAACT;SOR=0.973;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=186;TCF=110;TCR=76;TR=186;WE=158528178;WS=158528148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr7	158528170	rs7787974	G	A	5758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=110;NR=78;PP=2965;SC=GCAGGAACTGGTTGAGGATTC;SOR=0.954;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=190;TCF=112;TCR=78;TR=188;WE=158528178;WS=158528148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr7	158534163	rs66689505	T	TG	492.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=3;PP=346;SC=CAGCGTGGGGTGGGGGGCGCT;SOR=2.179;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=11;WE=158534171;WS=158534153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr7	158552331	rs896859	C	G	7085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=151;PP=2965;SC=GATACTATTTCTATCTGATTG;SOR=1.140;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=255;TCF=104;TCR=151;TR=255;WE=158552339;WS=158552321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr7	158552398	rs896860	C	T	1764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=49;PP=1337;SC=ATCCATGCAACAGAGACAGAA;SOR=4.066;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=6;TCR=49;TR=55;WE=158552406;WS=158552388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr7	158555706	rs844521	C	T	4661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=107;NR=48;PP=2965;SC=TTAAAACATACTTTTGATTAT;SOR=1.514;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=155;TCF=107;TCR=48;TR=155;WE=158555714;WS=158555696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr7	158560621	rs2602542	A	C	2706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=67;PP=2165;SC=TACAACCTGCATTTCAATTCT;SOR=3.003;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=15;TCR=67;TR=82;WE=158560629;WS=158560611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr7	158566138	rs842447	T	C	7281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=117;NR=142;PP=2965;SC=TTCCAATTATTGAATCAGGTG;SOR=0.951;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=259;TCF=117;TCR=142;TR=259;WE=158566146;WS=158566128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,276:1.00:276
chr7	158566217	rs842448	C	T	3958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=80;PP=2382;SC=CTTCATCCTTCGTAATATACC;SOR=1.318;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=53;TCR=80;TR=133;WE=158566225;WS=158566207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr7	158586138	rs2602552	T	C	746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=0;PP=608;SC=TTATTTAACATATTTTATGAA;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=158586146;WS=158586136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr7	158590512	rs2788501	T	A	301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=27;NR=2;PP=580;SC=GCCACTGCACTCCAGCCTGGG;SOR=2.494;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=29;WE=158590520;WS=158590502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr7	158590547	rs11404991	G	GA	499.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=1.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.25;MQRankSum=0.781;QD=11.62;ReadPosRankSum=-0.997;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,28:0.65:43
chr7	158591851	rs2709855	C	T	605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=17;PP=453;SC=TCTCATCATACGTCCTATGTT;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=158591859;WS=158591841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr7	158672476	rs2709859	C	G	10631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=393;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=214;NR=152;PP=2965;SC=ATCGAGACAACAAACACCGAG;SOR=1.082;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=367;TCF=214;TCR=153;TR=366;WE=158672494;WS=158672466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,391:1.00:391
chr7	158672619	rs2788478	A	G	4718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=353;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.825;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=106;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.429;SC=GAGAGGCACCAAAGCAACGTG;SOR=0.636;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=324;TCF=147;TCR=177;TR=194;WE=158672627;WS=158672609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,213:0.60:353
chr7	158694530	rs842703	T	C	994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=24;PP=588;ReadPosRankSum=1.480;SC=GTTAAAACTTTCCTTAGCTTA;SOR=0.715;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=64;TCF=25;TCR=39;TR=39;WE=158694538;WS=158694520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,45:0.62:73
chr7	158715219	rs2730238	A	G	834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.626;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=32;PP=668;ReadPosRankSum=-0.653;SC=GGCCACAGAAAGTTCTGATAT;SOR=1.865;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=120;TCF=40;TCR=80;TR=40;WE=158715227;WS=158715209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,41:0.32:128
chr7	158718793	rs2527188	A	G	2171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.276;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=18;PP=1634;ReadPosRankSum=-0.232;SC=ACCCAGAAGCACCTCGTGTTT;SOR=2.112;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=77;TCF=58;TCR=19;TR=75;WE=158718817;WS=158718783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,83:0.98:85
chr7	158718805	rs2527189	T	C	1733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.096;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=16;PP=1195;ReadPosRankSum=-0.822;SC=CTCGTGTTTGTCCCTGTGTGA;SOR=1.086;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=90;TCF=66;TCR=24;TR=64;WE=158718817;WS=158718783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,68:0.67:101
chr7	158719084	rs2244789	C	T	770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.605;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=22;PP=430;ReadPosRankSum=0.025;SC=TTGTTTCTGTCTTCATCAGAA;SOR=0.897;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=106;TCF=44;TCR=62;TR=36;WE=158719092;WS=158719074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,41:0.35:118
chr7	158723014	rs2730241	T	C	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=3.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=39;ReadPosRankSum=-1.001;SC=GGATGCTGTGTATTGATTTGC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=5;WE=158723022;WS=158723004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,5:0.21:24
chr7	158726798	rs34181207	T	TC	524.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.703;NF=5;NR=7;PP=313;ReadPosRankSum=0.720;SC=CATCTGTTCATTTTGTTACTT;SOR=0.787;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=45;TCF=17;TCR=28;TR=12;WE=158726806;WS=158726788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,20:0.26:76
chr7	158727015	rs35962377	C	CT	403.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.31;ReadPosRankSum=2.520;SOR=0.614;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,20:0.26:76
chr7	158727276	rs2657331	T	A	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-3.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=225;ReadPosRankSum=0.898;SC=CCAATTCTTCTTTTTTTGTTT;SOR=0.617;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=55;TCF=8;TCR=47;TR=16;WE=158727284;WS=158727266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,21:0.34:62
chr7	158727303	rs2657332	G	T	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=186;ReadPosRankSum=-0.654;SC=ACAGGGTCTTGCTCTGTCACC;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=11;WE=158727311;WS=158727293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr7	158827326	rs2071624	G	A	1402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FS=0.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.85;ReadPosRankSum=0.677;SOR=0.617;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:204,85:0.29:289
chr7	158827401	rs1017033	A	G	2315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=57;PP=1770;SC=ACAGGTACAGAAGAATGAGCG;SOR=2.395;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=17;TCR=57;TR=74;WE=158827422;WS=158827391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr7	158827414	rs2071623	T	C	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=191;ReadPosRankSum=0.550;SC=AATGAGCGCCTGCCCCTCCCA;SOR=0.580;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=52;TCF=9;TCR=43;TR=18;WE=158827422;WS=158827391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,22:0.39:57
chr7	158829285	rs2730223	T	C	849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=5;PP=573;SC=ATGTGTTGTTTGTAGGAGCCT;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=26;WE=158829293;WS=158829275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr7	158835631	rs2540353	A	G	3275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=66;NR=38;PP=1905;SC=CCCTGACAGGAACCCTGCACC;SOR=1.188;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=66;TCR=38;TR=104;WE=158835639;WS=158835621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr7	158851234	rs2098349	T	G	7252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=132;NR=122;PP=2965;SC=TGTAGCCCAGTGTATAAATGG;SOR=0.700;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=255;TCF=132;TCR=123;TR=254;WE=158851242;WS=158851224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,279:1.00:279
chr7	158851804	rs2730257	C	T	2430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=11;PP=1738;SC=TTAGCAAGGTCCATGGCTTGA;SOR=2.985;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=62;TCR=11;TR=73;WE=158851812;WS=158851794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr7	158935333	rs439204	G	C	1043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=26;PP=771;SC=AACCTCACAGGTTTAAACTGC;SOR=3.193;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=31;WE=158935341;WS=158935323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr8	182934	rs75792622	T	C	3116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=34;PP=2155;SC=CTCGTGCTTCTGCACAATCGC;SOR=1.907;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=77;TCR=34;TR=111;WE=182942;WS=182924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr8	182949	rs3008280	C	A	3513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=44;PP=2465;SC=AATCGCCTCCCACTAGCGGTG;SOR=1.556;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=128;TCF=84;TCR=44;TR=128;WE=182957;WS=182939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr8	194884	rs2906331	C	T	686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=21;PP=537;SC=GACAGGACAACTGTACAAACT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=194892;WS=194874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr8	280241	rs7388619	A	G	2998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=67;NR=35;PP=1730;SC=ACAGCACACCACTCGCACACT;SOR=1.270;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=67;TCR=35;TR=102;WE=280249;WS=280231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr8	441457	rs1064416	C	T	1954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=45;NR=17;PP=1354;SC=GCTCTCAAACCGGTCGTCGAT;SOR=1.681;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=45;TCR=17;TR=62;WE=441465;WS=441447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr8	494658	rs71202629	GGGCGGC	G	586.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=2;PP=271;SC=ACCTGCGCCTGGGCGGCGGCG;SOR=0.976;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=5;WE=494671;WS=494648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr8	494804	rs10105131	C	G	1022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=22;PP=643;SC=CGGGCTGTGGCTCCGCGTCCC;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=16;TCR=22;TR=38;WE=494812;WS=494794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr8	565232	rs1669694	C	G	5211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=98;NR=84;PP=2965;SC=GTTAAGGCAGCCCCTCTCTCT;SOR=0.754;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=182;TCF=98;TCR=84;TR=182;WE=565240;WS=565222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr8	566417	rs13276545	C	T	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=1;PP=172;SC=TGAGGCTGACCGAACCCCGCA;SOR=2.303;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=566440;WS=566407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr8	566429	rs13255197	A	C	716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.80;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr8	566432	rs13276566	C	G	749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.10;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr8	566460	rs13276586	C	G	1186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=28;NR=10;PP=777;SC=GCGGATTCAGCGCTGGCCAAC;SOR=1.845;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=28;TCR=10;TR=38;WE=566468;WS=566450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr8	566619	rs68122960	A	G	2310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=35;NR=42;PP=1417;SC=GTGAGTGGGGAGAGGGAGGCA;SOR=0.979;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=77;TCF=35;TCR=42;TR=77;WE=566627;WS=566609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr8	577101	rs336433	A	G	2611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=32;PP=1700;SC=ACGTATCCCTAGACACCTGCA;SOR=1.203;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=54;TCR=32;TR=86;WE=577109;WS=577091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr8	607380	rs1669658	A	G	509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=13;NR=1;PP=358;SC=TCTGGTCGGAAGGGAGGTTAT;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=607388;WS=607377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr8	607766	rs4735812	C	G	6254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=110;NR=89;PP=2965;SC=TTAAAGGACTCAGTAATGTGC;SOR=0.872;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=199;TCF=110;TCR=89;TR=199;WE=607774;WS=607756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr8	608034	rs10090260	T	C	6172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=114;NR=106;PP=2965;SC=CCACGGACCATGTTTGAGAGA;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=220;TCF=114;TCR=106;TR=220;WE=608042;WS=608024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr8	608279	rs1703925	A	G	133.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=4;PP=68;SC=CTGGGGAGAGAGGCTGGTTCC;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=608287;WS=608269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr8	609833	.	C	G	602	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.52;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=45;MMLQ=27;MQ=47.45;NF=21;NR=3;PP=602;QD=26.5321338561;SC=TGTGCACTGACCATCCTGGGG;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=24;WE=609841;WS=609823;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr8	609867	.	A	G	1681	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MMLQ=24;MQ=57.05;NF=50;NR=24;PP=1681;QD=23.1860974669;SC=CGAGATCTCCAGTGTGCACTG;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=76;TCF=52;TCR=24;TR=74;WE=609888;WS=609857;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,74:0.97:76
chr8	609879	.	AT	GC	2382	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MMLQ=22;MQ=58.16;NF=69;NR=36;PP=2382;QD=23.1949321415;SC=TGTGCACTGAATATCCTGGGG;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=111;TCF=72;TCR=39;TR=105;WE=609888;WS=609857;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,105:0.95:111
chr8	618728	rs2271263	A	G	1979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=42;PP=1255;SC=TGTGTGACGCAAGGCGGTCCA;SOR=2.338;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=14;TCR=42;TR=56;WE=618736;WS=618718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr8	623156	rs6559065	G	C	238.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=194;SC=ACTTATATTAGTTGCCTTACA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=623164;WS=623146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr8	623245	rs55680904	T	A	2499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=25;PP=1727;SC=AATAAACTTTTAAGTGGATGT;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=62;TCR=25;TR=87;WE=623253;WS=623235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr8	642357	rs1703896	A	G	1039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=2;PP=825;SC=TATACAGTGTAACAACATGCT;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=31;WE=642365;WS=642347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr8	642770	rs732195	A	G	138.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=45;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=4;PP=137;SC=ACTGATTTTAATATGTCAAGT;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=642778;WS=642760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr8	960303	rs35654511	T	TCA	7986.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.18;NF=27;NR=56;PP=2965;SC=CACTCAGATATCAGTTTTATA;SOR=0.704;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=88;TCF=28;TCR=60;TR=83;WE=960311;WS=960293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr8	1496767	rs2906568	C	G	8216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=102;NR=64;PP=2965;SC=TCCGGGTGTTCAATGCCGTTT;SOR=1.100;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=166;TCF=102;TCR=64;TR=166;WE=1496775;WS=1496757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr8	1496788	rs2906569	A	G	9010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=111;NR=86;PP=2965;SC=CTGTTTCCCCACAGACCCGCA;SOR=0.816;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=197;TCF=111;TCR=86;TR=197;WE=1496796;WS=1496778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr8	1514009	rs2301963	C	A	2194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=41;PP=1307;SC=GCAATCCTACCAGAGCCGCTG;SOR=1.550;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=24;TCR=41;TR=65;WE=1514017;WS=1513999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr8	1719552	.	C	T	10302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DP=382;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=186;NR=159;PP=2965;SC=ACGACAGCAACGGGATTCTTT;SOR=0.791;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=345;TCF=186;TCR=159;TR=345;WE=1719571;WS=1719542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,382:1.00:382
chr8	1749388	rs7017381	C	T	4632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=85;NR=67;PP=2415;SC=CACTCAGAAGCGGACTCCCTG;SOR=0.849;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=152;TCF=85;TCR=67;TR=152;WE=1749396;WS=1749378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr8	1749410	rs7003112	T	A	4410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=66;PP=2418;SC=CCTGCTAAACTACCCTTGAAA;SOR=0.729;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=142;TCF=76;TCR=66;TR=142;WE=1749418;WS=1749400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr8	1749513	rs12541297	C	T	870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=23;PP=650;SC=GTGACTTGCACGTATATGCCC;SOR=3.334;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=26;WE=1749521;WS=1749503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr8	1806045	rs373033848	GATCTATCT	GATCT,G	954.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;NF=17,17;NR=0,0;PP=698,49;SC=TAGATCGATCGATCTATCTAT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=17,17;WE=1806060;WS=1806035;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:25
chr8	1814588	rs57422654	GAC	G	151.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=2;PP=97;ReadPosRankSum=0.621;SC=TATATATTCTGACACACACAC;SOR=0.382;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=12;TCF=6;TCR=6;TR=4;WE=1814597;WS=1814578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr8	1857293	rs2294035	A	G	90.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.51;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr8	1857366	rs2294036	GT	AC	1140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=1;PP=680;SC=CAATTCAGCAGTGGGAAGTTT;SOR=2.303;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=18;WE=1857375;WS=1857356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr8	1857548	rs2294038	T	C	4062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=81;PP=2197;SC=CCATCGAGTATGGCAGCAGCG;SOR=0.911;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=149;TCF=68;TCR=81;TR=149;WE=1857556;WS=1857538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr8	1857649	rs2294041	T	G	778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=17;PP=477;SC=AAGTGATGCTTTCTCTCACGT;SOR=2.147;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=24;WE=1857657;WS=1857639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr8	1871896	rs2272614	G	C	6378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=118;NR=94;PP=2965;SC=TCACAGGATGGAGCACGTTTT;SOR=0.847;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=212;TCF=118;TCR=94;TR=212;WE=1871904;WS=1871886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr8	1900855	rs7832438	A	G	2537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=27;PP=1350;SC=GAAGCCACTCATGTCTTTCCG;SOR=1.321;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=90;TCF=63;TCR=27;TR=89;WE=1900863;WS=1900845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr8	1901110	rs74808197	G	C	960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=24;PP=698;SC=ATTATCTGTGGTTTTTCAGTG;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=33;WE=1901118;WS=1901100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr8	1901177	rs80299596	A	G	113.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=6;PP=123;SC=ATATTTTTCCATTTTTTACCT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=1901185;WS=1901167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr8	2005414	rs7833424	C	T	223.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=180;SC=TCGGGGGCCACGTGGTTTTCT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=2005422;WS=2005404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr8	2006054	rs3779862	A	G	383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=13;PP=326;SC=CTGAACGTTCACTTTAACTCA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=2006062;WS=2006044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr8	2007116	rs7461903	A	G	356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=1;PP=267;SC=ACCAGTGCGAACTCTGGGCCT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=2007124;WS=2007111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr8	2007230	rs6558591	A	C	5622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=116;NR=60;PP=2965;SC=CACACACAAAATACAACTCTG;SOR=1.263;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=177;TCF=116;TCR=61;TR=176;WE=2007238;WS=2007220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr8	2020377	.	G	GATGCTCTCTGCCCTTCGGCCCTGAAAGCCTCCATCGTTTC	2343.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=117.19;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr8	2021421	rs2272720	G	T	5930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=117;NR=82;PP=2965;SC=TCTTTCAGACGTGCTGTTGAA;SOR=0.929;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=199;TCF=117;TCR=82;TR=199;WE=2021429;WS=2021411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr8	2024207	rs7822836	A	C	1893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=14;PP=1227;SC=TGCCTTTTCTATCCCTGCCCC;SOR=2.093;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=43;TCR=14;TR=57;WE=2024215;WS=2024197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr8	2033641	rs62478375	T	C	214.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=11;PP=224;SC=TCGTGATCTCTGCGTGGCCCC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=2033649;WS=2033631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr8	2040104	rs2235121	C	T	3355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=68;NR=34;PP=1855;SC=TGAAAAGGGCCGGAAGATCTC;SOR=1.402;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=68;TCR=34;TR=102;WE=2040112;WS=2040094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr8	2040337	rs6420202	T	C	2533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=58;PP=1550;SC=ACAAGCCCATTGGATACAACA;SOR=1.711;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=27;TCR=59;TR=85;WE=2040345;WS=2040327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr8	2040401	rs2235123	G	A	665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=19;PP=516;SC=TAGCAAGACCGTTGAGGTCCC;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=2040423;WS=2040391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr8	2040415	rs893877	G	A	459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=13;PP=342;SC=AGGTCCCTGTGGCCCTGGCAC;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=2040423;WS=2040391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr8	2041894	rs35335787	G	A	6864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=135;NR=113;PP=2965;SC=GGAATCAGACGTCATAAAAGT;SOR=0.858;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=248;TCF=135;TCR=113;TR=248;WE=2041902;WS=2041884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr8	2042070	rs7828132	T	C	1421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=37;PP=851;SC=TGAAGCCTCTTGGTTGGCTGC;SOR=2.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=14;TCR=37;TR=51;WE=2042078;WS=2042060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr8	2048811	rs4876227	A	C	9221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=134;NR=172;PP=2965;SC=GGATCACTGTAAATCAGACGA;SOR=1.024;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=306;TCF=134;TCR=172;TR=306;WE=2048819;WS=2048801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,339:1.00:339
chr8	2054012	rs12677887	C	T	1419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=7;PP=760;SC=AGCCGCTCACCTCATACTCTT;SOR=2.030;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=35;TCR=7;TR=42;WE=2054020;WS=2054002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr8	2054171	rs3817705	C	T	5341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=97;NR=72;PP=2965;SC=GGTTTAAAATCGAAACCGTGG;SOR=0.961;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=169;TCF=97;TCR=72;TR=169;WE=2054179;WS=2054161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr8	2054195	rs3817706	C	G	6383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=113;NR=88;PP=2965;SC=ATCAGTAAGTCAGGCCTGGAA;SOR=0.853;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=201;TCF=113;TCR=88;TR=201;WE=2054203;WS=2054185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr8	2054476	rs33927116	GA	G	503.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=421;ReadPosRankSum=1.241;SC=TACTTGCTTAGAAAAAAAGAC;SOR=1.802;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=17;WE=2054484;WS=2054466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,20:0.95:21
chr8	2063920	rs34379172	CAT	C	5033.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=16;NR=61;PP=2965;SC=AATATTTCCACATGTCCATAC;SOR=1.093;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=82;TCF=18;TCR=64;TR=77;WE=2063929;WS=2063910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr8	2064121	rs12548396	C	T	1934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=41;PP=1190;SC=AAAGCAAAGACGATTGGAGTA;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=23;TCR=41;TR=64;WE=2064129;WS=2064111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr8	2077072	rs2280902	A	G	3740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=44;PP=2534;SC=TCACACAGCAAGCACTCCTTT;SOR=1.277;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=78;TCR=44;TR=122;WE=2077080;WS=2077062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr8	2088896	rs3736659	G	A	380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=8;PP=262;SC=TATGAATACAGGAGACAATAT;SOR=1.609;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=12;WE=2088904;WS=2088886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr8	2091184	rs2280904	T	C	2309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=26;PP=1561;ReadPosRankSum=-0.536;SC=AACATATAAATCTTTTTCTTT;SOR=1.364;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=56;TCR=27;TR=81;WE=2091192;WS=2091173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,90:0.98:92
chr8	2112080	rs33945248	G	GTT	1814.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=3.367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.14;MQRankSum=0.000;QD=29.75;ReadPosRankSum=0.412;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,59:0.97:61
chr8	2112130	rs1036689	G	A	2971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=3.643;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.18;ReadPosRankSum=-1.630;SOR=0.707;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,117:0.99:118
chr8	2148368	.	G	GTC	240	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;FR=1.0000;HP=2;HapScore=4;MGOF=57;MMLQ=28;MQ=61.19;NF=6;NR=0;PP=240;QD=43.5;SC=GTATAGTTGTGTGTGTGCATG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=6;WE=2148378;WS=2148362;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,6:0.75:8
chr8	2148370	.	G	C	121	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;FR=1.0000;HP=2;HapScore=4;MGOF=57;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=5;NR=0;PP=121;QD=31.1542425094;SC=ATAGTTGTGTGTGTGCATGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=2148378;WS=2148362;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr8	2148550	rs2618845	G	A	2742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=48;NR=45;PP=1402;SC=TGTGCATGCTGTATTTATGTG;SOR=0.750;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=48;TCR=45;TR=93;WE=2148558;WS=2148540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr8	2148771	rs7008255	C	T	2084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=42;NR=30;PP=1064;SC=CATGTGTTTGCGTCTGTGTGC;SOR=0.743;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=42;TCR=30;TR=72;WE=2148779;WS=2148761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr8	2796277	rs585000	C	T	5557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=98;PP=2965;SC=CTAAGGAAAACAGAAAACAAA;SOR=0.923;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=187;TCF=88;TCR=99;TR=186;WE=2796285;WS=2796267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr8	2910020	rs6558703	A	G	2814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=27;PP=1892;SC=TTACTCCACAACCCATCTTCT;SOR=1.808;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=66;TCR=27;TR=93;WE=2910028;WS=2910010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr8	2910223	rs6420209	C	T	2081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=52;PP=1531;SC=TATTTTCCAGCTATTAAAACC;SOR=1.997;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=19;TCR=52;TR=71;WE=2910231;WS=2910213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr8	2964003	rs10503192	T	C	3814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=78;NR=47;PP=2319;SC=AATACAATTTTCCATGTTGAA;SOR=1.263;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=78;TCR=47;TR=125;WE=2964011;WS=2963993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr8	2965122	rs113534820	C	CTGTTTT	400.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=443;SC=TTCTTTGTTTCTGTTTTTGTT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=7;WE=2965130;WS=2965112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr8	2965209	rs1531351	A	G	2386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=53;NR=26;PP=1309;SC=GTCGTGCTGAATTCATGGTAT;SOR=1.244;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=80;TCF=54;TCR=26;TR=79;WE=2965217;WS=2965199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr8	2965244	rs3824271	T	C	3569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.84;SOR=0.870;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr8	2966072	rs3802291	G	T	1745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=41;NR=18;PP=1022;SC=AACACTGCAGGAAACACCACA;SOR=1.646;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=41;TCR=18;TR=59;WE=2966080;WS=2966062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr8	2966328	rs3802292	T	C	1646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=24;NR=34;PP=905;SC=GTGAGATTTATGGAAACTTTG;SOR=1.270;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=24;TCR=34;TR=58;WE=2966336;WS=2966318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr8	2967639	rs898512	G	T	845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=4;PP=661;SC=CAGAATTGTTGATCACAATTA;SOR=3.258;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=28;WE=2967647;WS=2967629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr8	3045230	rs17319192	G	A	375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=242;SC=CCTGTTTCTTGATGGTCTTAC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=3045238;WS=3045220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr8	3046635	rs898501	G	T	2705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=56;PP=1627;SC=AAGAGAAAATGTACATGAACA;SOR=1.683;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=29;TCR=56;TR=85;WE=3046643;WS=3046625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr8	3059365	rs5888954	TA	T	246.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=259;SC=AAGAATTTGGTAAAAAAATAA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=10;WE=3059373;WS=3059355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr8	3141555	rs10099968	A	G	554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=19;NR=0;PP=428;SC=AATTAGGCTCAATAAATTGCA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=3141563;WS=3141545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr8	3141586	rs4875508	T	A	1586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=10;PP=1135;SC=GAGACGCTGGTGAATATAAAT;SOR=2.670;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=41;TCR=10;TR=51;WE=3141594;WS=3141576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr8	3165207	rs10103770	A	G	3617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=46;PP=2275;SC=AACCAAAATAAAACAAGTACC;SOR=1.119;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=72;TCR=46;TR=118;WE=3165215;WS=3165197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr8	3165471	rs10089504	C	A	1815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.23;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr8	3165478	rs10089513	C	G	1745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.94;SOR=7.328;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr8	3165777	rs10091831	G	A	211.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=190;SC=ATGCAACATGGTGCAAGCACC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=3165785;WS=3165768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr8	3165814	rs1393843	A	C	659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=3;PP=480;SC=GCACAATGGTATGACTGCTTC;SOR=2.737;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=3165822;WS=3165804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr8	3200877	rs2161752	C	T	5186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=99;NR=78;PP=2878;SC=ACTCTAGCCACAGGTGATTGG;SOR=0.866;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=177;TCF=99;TCR=78;TR=177;WE=3200885;WS=3200867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr8	3201012	rs156075	C	T	2634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=34;NR=49;PP=1477;SC=TATGCCTTCACTGGATTCTTA;SOR=1.237;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=34;TCR=49;TR=83;WE=3201020;WS=3201002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr8	3201034	rs156076	G	T	1725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=33;PP=979;SC=GTTAGCAATGGTAATAAACAA;SOR=1.467;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=21;TCR=33;TR=54;WE=3201042;WS=3201024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr8	3205389	rs11136608	C	T	340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=12;NR=1;PP=292;SC=TAAATAAATACAAATAAATCA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=3205397;WS=3205379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr8	3205423	rs75454001	G	T	1057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=24;NR=9;PP=673;SC=ATGTTAATATGTGCATATATC;SOR=1.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=33;WE=3205431;WS=3205413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr8	3205460	rs73173112	G	T	2661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=56;NR=27;PP=1564;SC=GATAGACAATGTATTTTTTGA;SOR=1.361;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=56;TCR=27;TR=83;WE=3205468;WS=3205450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr8	3226919	rs270096	C	T	4593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=86;PP=2669;SC=GAGATGATTACAGCACTAAAG;SOR=1.120;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=151;TCF=65;TCR=86;TR=151;WE=3226941;WS=3226909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr8	3253768	rs3802303	C	T	2402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.12;SOR=0.878;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr8	3253939	rs3802304	A	G	1501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.17;SOR=1.418;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr8	3253942	rs3802305	A	G	1501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.17;SOR=1.418;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr8	3253997	rs3802306	G	A	409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=10;PP=237;SC=AGAAACCCATGTACGTTAACA;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=15;WE=3254005;WS=3253987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr8	3263758	rs12543118	A	G	3793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.72;SOR=1.373;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr8	3265590	rs10088378	C	T	8813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=157;NR=132;PP=2965;SC=GAAAGTCAAACTGAGGCTCAA;SOR=0.801;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=289;TCF=157;TCR=132;TR=289;WE=3265598;WS=3265580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,329:1.00:329
chr8	3265845	rs11775235	C	T	378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=315;SC=CAATTCATGCCTGCAAATAGC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=3265853;WS=3265835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr8	3443799	rs370358989	G	GA	573.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.24;MQRankSum=-0.147;QD=22.07;ReadPosRankSum=0.279;SOR=0.638;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,25:0.96:26
chr8	3565900	rs12674750	C	T	3880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=49;PP=2402;SC=CTTACAAGGGCGTATCAATCC;SOR=1.390;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=84;TCR=49;TR=133;WE=3565908;WS=3565890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr8	3566106	rs10105577	T	C	3539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=77;PP=2410;SC=ATAACTGCTTTCTATCAACCC;SOR=2.167;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=30;TCR=77;TR=107;WE=3566114;WS=3566096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr8	3566161	rs10105599	T	G	1009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=27;PP=759;SC=ACCAAGTCAATGAAGTCAAAG;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=28;WE=3566169;WS=3566151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr8	3611697	rs2720860	T	C	392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=330;SC=CATGTATTAATTGACTTTGAA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=3611705;WS=3611687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr8	3807319	rs2740867	C	G	479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=0;PP=332;SC=GCCTCTAACACATGGAAAGCT;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=3807327;WS=3807309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr8	3807667	rs2627515	C	T	1018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=26;PP=784;SC=CATTTATACACCAGCTGACTT;SOR=2.584;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=33;WE=3807675;WS=3807657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr8	3855302	rs1863475	G	A	501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=5;PP=369;SC=AGAGCAAGGCGAAAAAAGGAA;SOR=1.863;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=18;WE=3855310;WS=3855292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr8	4494811	rs2617007	T	G	765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=1;PP=657;SC=CTAGATTTCATAATCTGTGTA;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=24;WE=4494819;WS=4494801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr8	4495107	rs2617008	G	C	3094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=42;NR=63;PP=2059;SC=ACACAAAAAAGCATATTATTC;SOR=1.302;Source=Platypus;TCF=43;TR=105;WE=4495115;WS=4495097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr8	6264130	rs2305023	G	C	3923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=52;PP=2647;SC=CAGTGCCCGCGCGCGCCGCCA;SOR=1.235;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=138;TCF=86;TCR=52;TR=136;WE=6264138;WS=6264120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr8	6264358	.	CCTCCCCCGCTGCCTGTCCCACCAAAACCCCCTGCTCCTGCTCT	C	269.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=3;PP=892;SC=CCGCCTCCTTCCTCCCCCGCT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=3;WE=6264408;WS=6264348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr8	6266693	rs1550698	C	T	1080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=25;NR=6;PP=618;SC=AGGCGTGAGCCACTGTGCCGG;SOR=1.670;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=31;WE=6266701;WS=6266683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr8	6266774	rs1550697	G	A	3296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=44;PP=1836;SC=TCAAATGTATGTTTCATGTTC;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=67;TCR=44;TR=111;WE=6266782;WS=6266764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr8	6272185	rs2440437	G	T	553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=0;PP=465;SC=TCTGTCAGATGTTGAGAAACA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=6272193;WS=6272177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr8	6272457	rs2305021	T	G	2207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=52;PP=1482;SC=ATTGAAAATGTGTGGAGATAT;SOR=1.893;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=23;TCR=52;TR=75;WE=6272465;WS=6272447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr8	6272477	rs2515415	A	G	2300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.09;SOR=2.066;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr8	6272481	rs2442545	C	G	2217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.19;SOR=2.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr8	6272532	rs2515417	T	A	323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=58;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=7;PP=231;SC=TTACCTCACCTAGTAATTTGA;SOR=1.802;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=10;WE=6272551;WS=6272522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr8	6272543	rs55687318	A	C	227.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=58;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=4;PP=143;SC=AGTAATTTGAAATCCTCCAGC;SOR=1.179;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=7;WE=6272551;WS=6272522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr8	6288879	rs2251956	A	T	525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=1;PP=330;SC=TTGTATTTGCAGTTGTATTTA;SOR=3.500;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=6288887;WS=6288869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr8	6296550	rs2442513	G	T	3356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=55;PP=2241;SC=TTAATAGTAGGCACCACAGCG;SOR=0.848;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=122;TCF=66;TCR=56;TR=121;WE=6296558;WS=6296540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr8	6299532	rs2053618	A	G	4242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=49;PP=2561;SC=TGCTGGCTTCATCTGCTAAGA;SOR=1.373;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=98;TCR=49;TR=147;WE=6299540;WS=6299522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr8	6302183	rs930557	G	C	6059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=109;NR=76;PP=2965;SC=AGTCACCCCTGACCAAAAGCA;SOR=0.961;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=185;TCF=109;TCR=76;TR=185;WE=6302191;WS=6302173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr8	6302418	rs2515569	A	G	5105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=80;NR=77;PP=2965;SC=AGGTCGGAAGACAGGCTGCAG;SOR=0.801;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=157;TCF=80;TCR=77;TR=157;WE=6302426;WS=6302408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr8	6303025	rs2584	G	A	6276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=100;NR=104;PP=2965;SC=ACATGGAGACGTCTACAGAAG;SOR=0.879;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=204;TCF=100;TCR=104;TR=204;WE=6303033;WS=6303015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr8	6312880	rs2515575	C	T	420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=12;PP=307;SC=GTCTTTTATTCTAAAAAATTG;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=6312888;WS=6312870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr8	6390027	rs2515481	A	G	2244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=57;PP=1630;SC=GAACAGTGTTAGAAGGCAGTC;SOR=2.365;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=79;TCF=18;TCR=61;TR=75;WE=6390035;WS=6390017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr8	6390079	rs2515482	G	A	383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=14;PP=328;SC=AATGTTTGTCGTCTCCTCCCT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=14;WE=6390087;WS=6390069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr8	6420534	rs3739391	A	G	697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=17;PP=513;SC=GCTGCCGTCTAAAACGCAGGG;SOR=2.400;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=22;WE=6420542;WS=6420524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr8	6478956	rs2936531	A	G	5135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.66;SOR=1.377;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr8	6478960	rs11137040	C	G	5333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.72;SOR=1.355;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr8	6478986	rs2912010	C	T	4391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=90;NR=58;PP=2633;SC=TGTGCCGAAGCGAGTGCCACT;SOR=1.063;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=148;TCF=90;TCR=58;TR=148;WE=6478994;WS=6478976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr8	6479042	rs1057090	C	T	5403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=83;PP=2965;SC=GACCAGCCAGCGATGTTTGTC;SOR=0.744;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=176;TCF=93;TCR=83;TR=176;WE=6479050;WS=6479032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr8	6479178	rs2912016	C	A	6145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=105;NR=101;PP=2965;ReadPosRankSum=0.275;SC=AGAAGAAAGCCACAGTCAAGT;SOR=0.801;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=208;TCF=106;TCR=102;TR=206;WE=6479186;WS=6479168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,232:0.99:234
chr8	6479282	rs11137041	G	T	1849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=44;PP=1247;ReadPosRankSum=1.758;SC=GGAGGGCGGCGTCAGGCTCAC;SOR=1.124;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=61;TCF=16;TCR=45;TR=60;WE=6479290;WS=6479272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,64:0.98:65
chr8	6500544	rs1057091	C	T	6850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=127;NR=98;PP=2965;SC=GGTCTGTGCCCCTGAAAACTA;SOR=0.854;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=225;TCF=127;TCR=98;TR=225;WE=6500552;WS=6500534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr8	6500751	rs2433149	C	G	888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=24;PP=709;SC=GACTGAATGTCTGTTTCAGAG;SOR=3.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=27;WE=6500759;WS=6500741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr8	6582485	rs2980686	A	C	2437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=46;NR=38;PP=1338;SC=TGCATGAAACATAGGTTTTTC;SOR=0.757;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=46;TCR=38;TR=84;WE=6582493;WS=6582475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr8	6590126	rs17078008	A	G	6834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=117;NR=106;PP=2965;SC=TTAACGAGAAAGAGATGCGAA;SOR=0.717;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=223;TCF=117;TCR=106;TR=223;WE=6590134;WS=6590116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr8	6605453	rs6651450	T	C	1024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=28;PP=827;SC=CTTTTTTCCTTCATTACATTT;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=33;WE=6605461;WS=6605443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr8	6673269	.	TA	T	489.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=0.000;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=0.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQRankSum=-0.863;QD=3.42;ReadPosRankSum=1.460;SOR=0.603;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:102,41:0.29:143
chr8	6673377	rs11338621	CA	C	15057.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=387;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=36;NR=170;PP=2965;SC=GGCTGGTCCACAGATGCCCCC;SOR=0.714;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=213;TCF=37;TCR=176;TR=206;WE=6673385;WS=6673367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,378:1.00:378
chr8	6679300	rs370394378	GCA	G	30.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.75;ReadPosRankSum=0.441;SOR=0.277;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,5:0.12:41
chr8	6686679	rs62498864	T	C	920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=7;PP=652;SC=ATGCTGAACCTGTCTTACATA;SOR=2.448;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=32;WE=6686687;WS=6686669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
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chr8	6692968	rs2977806	C	T	1662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=15;PP=895;SC=GCGCGCTCTGCTCGGCCGCCT;SOR=1.255;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=35;TCR=15;TR=50;WE=6692976;WS=6692958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
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chr8	6793540	rs736227	C	T	7574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=132;NR=121;PP=2965;SC=GACAGCAGAACGTTAATCGAC;SOR=0.714;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=253;TCF=132;TCR=121;TR=253;WE=6793548;WS=6793530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,283:1.00:283
chr8	6794114	rs2741680	G	C	527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=1;PP=415;SC=TATTCAGTTTGGAGATAAGAA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=6794122;WS=6794104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr8	6913125	rs45613133	C	A	728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=18;PP=438;SC=ACAAGCACAGCCAGACTAACT;SOR=3.098;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=6913133;WS=6913115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr8	7308386	rs1042797	T	C	3942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.15;MQRankSum=-1.450;QD=25.94;ReadPosRankSum=-1.221;SOR=0.775;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,150:0.99:152
chr8	7308798	rs4840280	A	G	1386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.15;QD=33.82;SOR=6.043;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr8	7343806	rs148956195	C	G	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.242;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.50;MQRankSum=-2.450;QD=7.97;ReadPosRankSum=0.366;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr8	7686323	rs201085281	G	A	416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.28;QD=23.15;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr8	7717915	rs1071601	C	T	6526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=109;NR=112;PP=2965;SC=TTAAGATCTGCGTGGGCTTTT;SOR=0.880;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=221;TCF=109;TCR=112;TR=221;WE=7717923;WS=7717905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr8	7718266	rs3860876	A	T	2907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.19;QD=28.79;SOR=2.189;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr8	7720995	rs199909847	T	C	489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.22;QD=30.61;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr8	8186052	.	CTTTAT	C	2930.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.09;SOR=2.566;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr8	8186053	.	T	TGGAC	1355	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=22;PP=1355;QD=62.2727272727;SC=CTTGTTTCCCTTTATTTATTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=22;WE=8186066;WS=8186043;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:15,22:0.59:37
chr8	8186058	.	T	TGGACCCAAA	2932.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.12;SOR=2.566;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr8	8186101	rs143704562	T	TTTTCTA	487.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=102;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=15;PP=528;SC=ATGTTACTTCTTTTCTATTTC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=8186109;WS=8186091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr8	8197274	rs11325094	GA	G	420.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.37;SOR=5.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr8	8234077	rs4840952	G	C	4928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=93;PP=2724;SC=CTGACGAGGCGGCAGGCTGGG;SOR=1.002;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=170;TCF=76;TCR=94;TR=169;WE=8234085;WS=8234067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr8	8234192	rs4840953	G	C	4108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=81;NR=55;PP=2510;SC=GCTGCCGCCAGAGCTCCCATC;SOR=1.061;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=137;TCF=82;TCR=55;TR=136;WE=8234200;WS=8234182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr8	8234218	rs4840954	CG	TA	8002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=86;NR=66;PP=2947;SC=GGTCAGCCAGCGGTGACACTG;SOR=0.938;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=160;TCF=93;TCR=67;TR=152;WE=8234235;WS=8234208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr8	8234714	rs3896980	C	T	4421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=67;PP=2608;SC=TGTAGCCTCCCGGGGGTGGGC;SOR=0.706;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=140;TCF=73;TCR=67;TR=140;WE=8234722;WS=8234704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr8	8234868	rs150979349	C	CGCCGCT	8505.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=39;PP=2983;SC=GGGCTACTGGCGCCGCTGCCG;SOR=0.738;SbPval=0.04;Source=Platypus;TC=108;TCF=21;TCR=87;TR=58;WE=8234876;WS=8234858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr8	8559898	rs11995449	G	A	1180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.07;SOR=3.145;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr8	8560602	rs2280560	C	T	9754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=369;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=173;NR=155;PP=2965;SC=GCACCGACCGCCGCCTGCCCA;SOR=0.754;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=328;TCF=173;TCR=155;TR=328;WE=8560610;WS=8560592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,369:1.00:369
chr8	8560909	rs12153	G	C	738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=18;PP=499;SC=TCTGCCTTTCGTGGGACCAAA;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=8560917;WS=8560899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr8	8643387	rs10903311	G	A	379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=13;NR=1;PP=315;SC=TTCCCCAGTCGTCCAAAAAGC;SOR=3.126;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=14;WE=8643395;WS=8643385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr8	8643582	rs2271340	C	G	6987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=116;NR=116;PP=2965;SC=GGGTGGACAACAAGAAAGCAC;SOR=0.797;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=232;TCF=116;TCR=116;TR=232;WE=8643590;WS=8643572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr8	8643725	rs2271341	T	A	733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=18;PP=528;SC=TCAGGCAACTTATGTCCCCAC;SOR=3.442;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=8643733;WS=8643715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr8	8655023	rs3748144	C	T	3521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=71;PP=2195;SC=GAGAGAAAAACGTGTTAGGGA;SOR=1.055;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=123;TCF=52;TCR=71;TR=123;WE=8655031;WS=8655013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
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chr8	8905926	rs2921379	A	G	7121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=127;NR=116;PP=2965;SC=AGTTTAAAAAACGTCCTTAAG;SOR=0.723;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=244;TCF=128;TCR=116;TR=243;WE=8905934;WS=8905916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,272:1.00:272
chr8	8998262	rs434238	CT	TG	2111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=9;PP=1478;SC=CAGAGCTAGGCTTGTCTGTGG;SOR=1.863;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=41;TCF=30;TCR=11;TR=37;WE=8998271;WS=8998252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr8	8999187	rs330924	G	C	3262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=47;NR=67;PP=2137;SC=GGCTAGAACCGTGGAAAGGGA;SOR=1.198;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=114;TCF=47;TCR=67;TR=114;WE=8999195;WS=8999177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr8	9537635	rs12114182	G	A	565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=16;PP=406;SC=AAATCTTTATGTACTTTATAT;SOR=2.419;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=9537643;WS=9537625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr8	9563797	rs11343041	CT	C	619.87	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=1.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.42;ReadPosRankSum=-0.298;SOR=0.336;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,37:0.86:43
chr8	9564437	rs7006985	A	G	3574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=69;PP=2013;SC=CTGATCCTACATTAGTCAACT;SOR=1.196;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=50;TCR=69;TR=119;WE=9564445;WS=9564427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr8	9564600	rs12542457	T	C	125.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=2;PP=55;SC=CCTTCCATTCTTACAAGCAGA;SOR=1.022;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=4;WE=9564608;WS=9564590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr8	9577794	rs72301704	A	AT	1271.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=3;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=9;NR=5;PP=293;SC=TTGAAAGTTGATTTTTTTTTC;SOR=1.688;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=19;TCF=12;TCR=7;TR=14;WE=9577812;WS=9577784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr8	9577804	rs5025210	C	A	1451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=3;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=7;PP=468;SC=ATTTTTTTTTCATAAGAATGT;SOR=1.547;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=25;WE=9577812;WS=9577784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr8	9577940	rs6601360	T	C	3879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=47;PP=2295;SC=CCCTAGCAGGTCACCTGCAGA;SOR=1.011;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=77;TCR=47;TR=124;WE=9577948;WS=9577930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr8	9593081	rs4841208	A	C	1491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=38;PP=1143;SC=GAGGCCGAGGAAGGTAGATCA;SOR=3.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=4;TCR=38;TR=42;WE=9593089;WS=9593071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr8	10102863	rs4841293	A	G	823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=26;PP=705;SC=TATTATTTGTATATATATACT;SOR=3.767;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=33;WE=10102871;WS=10102853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr8	10285825	rs10903326	T	G	4821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=90;PP=2965;SC=AAAAATAATTTCTCCCCACAT;SOR=1.213;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=156;TCF=65;TCR=91;TR=155;WE=10285833;WS=10285815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr8	10383226	rs4521726	C	G	2116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=36;NR=39;PP=1165;SC=CCTCAGCCCCCTCATCCCCCC;SOR=0.987;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=36;TCR=39;TR=75;WE=10383234;WS=10383216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr8	10390526	rs149483545	G	A	5120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=77;NR=88;PP=2855;SC=GCTGTGTGCCGGATACAAGAA;SOR=0.924;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=165;TCF=77;TCR=88;TR=165;WE=10390534;WS=10390516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr8	10411438	rs35201635	AT	A	3331.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.404;NF=36;NR=38;PP=1372;ReadPosRankSum=0.435;SC=TGTCAATTTAATTTTTTTTTT;SOR=1.371;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=82;TCF=39;TCR=43;TR=74;WE=10411446;WS=10411426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,133:0.99:135
chr8	10464307	rs12542104	G	A	448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=1;PP=330;SC=ATGTACTATGGACATCTCCAG;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=10464315;WS=10464297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr8	10464755	rs55642448	C	T	3448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=66;PP=2141;SC=GGAGTGTCTCCACCTGGGGAA;SOR=1.099;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=50;TCR=66;TR=116;WE=10464763;WS=10464745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr8	10464885	rs56382513	T	C	2867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=47;PP=1566;SC=TTTCTCCTTCTGACTCTGGCT;SOR=0.750;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=50;TCR=47;TR=97;WE=10464893;WS=10464875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr8	10465748	rs11783478	T	C	6453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=67;PP=2592;SC=TCTGGCTGGGTCTGCCCTTCT;SOR=0.785;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=135;TCF=68;TCR=67;TR=135;WE=10465756;WS=10465738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr8	10465771	rs11785822	G	T	6429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=61;PP=2264;SC=CTCCTGGGCCGCCTCTTCTGC;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=133;TCF=72;TCR=61;TR=133;WE=10465779;WS=10465761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr8	10467160	rs62490855	G	A	4257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=71;NR=62;PP=2657;SC=CATCATGGTGGCTCCGGGCGG;SOR=0.763;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=134;TCF=72;TCR=62;TR=133;WE=10467168;WS=10467150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr8	10467207	rs4840498	C	A	5311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=102;NR=75;PP=2965;SC=AGCCACTCTGCCTCTCGCTGG;SOR=0.868;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=178;TCF=103;TCR=75;TR=177;WE=10467215;WS=10467197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr8	10467589	rs9657518	T	C	18075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=424;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=194;NR=186;PP=2965;SC=TTCTTTAGTTTCCTCTAACTG;SOR=0.736;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=382;TCF=195;TCR=187;TR=380;WE=10467597;WS=10467579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,423:1.00:423
chr8	10467604	rs74366179	C	A	18366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=433;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=204;NR=190;PP=2965;SC=TAACTGCACCCCCTCTTCTTG;SOR=0.702;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=395;TCF=205;TCR=190;TR=394;WE=10467612;WS=10467594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,432:1.00:432
chr8	10469233	rs35602868	A	G	4466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=71;PP=2685;SC=CTCTTCCCCCAGGCTGGCAGC;SOR=0.830;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=156;TCF=85;TCR=71;TR=156;WE=10469241;WS=10469223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr8	10470941	rs4840503	C	T	3755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=50;NR=72;PP=2100;SC=AAAACAGTCACGAGCCTCCCA;SOR=1.296;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=122;TCF=50;TCR=72;TR=122;WE=10470949;WS=10470931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr8	10474042	rs4388421	T	G	3809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=79;PP=2378;SC=GAAGGCCTCATGCCCGGCACA;SOR=1.228;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=133;TCF=53;TCR=80;TR=132;WE=10474050;WS=10474032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr8	10480305	rs189960401	C	T	3513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=56;PP=1995;SC=TGGGGCTTCACGCTGGCCTTC;SOR=0.787;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=63;TCR=56;TR=119;WE=10480313;WS=10480295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr8	10530037	rs11250057	G	A	400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=12;NR=2;PP=312;SC=CAGGCCCAGCGCATCGCAGGA;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=10530045;WS=10530035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr8	10530218	rs11250058	C	T	5069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=92;NR=76;PP=2694;SC=AGTCTTCCAACTTCAGGTGAA;SOR=0.745;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=169;TCF=93;TCR=76;TR=168;WE=10530226;WS=10530208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr8	10532355	rs4841419	T	C	4384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=87;PP=2481;SC=AAAGGTATGGTGTGTCCAGGG;SOR=1.186;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=148;TCF=61;TCR=87;TR=148;WE=10532363;WS=10532345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr8	10532401	rs4840505	A	G	1945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=40;PP=1261;SC=TGGGGTGGGTACACATAGAAC;SOR=2.129;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=17;TCR=40;TR=57;WE=10532409;WS=10532391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr8	11142389	rs3021505	C	CG	3972.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=32;NR=30;PP=2390;SC=GCTCCGGCCGCGGGGGAGCAT;SOR=1.304;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=71;TCF=34;TCR=37;TR=62;WE=11142397;WS=11142379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr8	11142625	rs2272594	T	C	2083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=48;PP=1480;SC=CGGGGGTCCCTTGTGGGCGCC;SOR=2.704;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=14;TCR=48;TR=62;WE=11142633;WS=11142615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr8	11152957	rs2245937	C	T	169.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=107;SC=CCTGGTTCATCGTCATATGAG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=11152965;WS=11152947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr8	11155613	rs2409754	A	G	316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=8;PP=232;SC=GCAATAAGTTAGTGAAGCTTT;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=11155621;WS=11155603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr8	11157371	rs2736387	A	C	479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=14;NR=0;PP=403;SC=AATCAGCTTCAGTAAGACTAA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=11157379;WS=11157364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr8	11157460	rs3808513	T	G	3288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=29;PP=2240;SC=TGCTTAATACTAATTTGTCAG;SOR=2.113;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=84;TCR=29;TR=113;WE=11157468;WS=11157450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr8	11162496	rs2164272	A	C	5796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=111;PP=2965;SC=TCCCAGTACTAAGCTATTACC;SOR=1.437;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=178;TCF=67;TCR=111;TR=178;WE=11162516;WS=11162486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr8	11162602	rs2256016	C	A	1216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.56;SOR=3.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr8	11162609	rs2060465	T	C	1006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.77;SOR=3.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr8	11164012	rs17797443	T	C	641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=18;PP=548;SC=TCAAATTAACTTCTGCATTAA;SOR=3.716;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=11164020;WS=11164002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr8	11174484	rs11784572	G	C	2529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=56;PP=1702;SC=CCTAGGAGACGACGATTTGGA;SOR=2.196;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=22;TCR=56;TR=78;WE=11174492;WS=11174474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr8	11177410	rs2293855	G	A	2778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=48;PP=1698;SC=GCCTGTGAGTGTGTGCTGTTG;SOR=0.730;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=52;TCR=48;TR=100;WE=11177418;WS=11177400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr8	11177447	rs2293856	C	T	1848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=28;NR=38;PP=1132;SC=GTGAGCTGGACGTGGCCCTCA;SOR=1.085;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=68;TCF=28;TCR=40;TR=66;WE=11177455;WS=11177437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr8	11204165	rs2572387	C	T	5874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=94;PP=2965;SC=CAAAACGAGACAGATTTCACA;SOR=0.767;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=201;TCF=107;TCR=94;TR=201;WE=11204173;WS=11204145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr8	11204184	rs11784458	G	A	6584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=114;NR=106;PP=2965;SC=CAAAATCACAGATTGTTAATG;SOR=0.710;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=220;TCF=114;TCR=106;TR=220;WE=11204192;WS=11204174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr8	11204755	rs11777746	T	C	6013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=120;NR=81;PP=2965;SC=CTCAAGGTCTTCCAACACCCG;SOR=1.103;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=201;TCF=120;TCR=81;TR=201;WE=11204763;WS=11204745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr8	11292542	rs2280803	C	T	3367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=65;NR=49;PP=1835;SC=CTGCCTCCCCCCCTCACTCAA;SOR=0.843;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=65;TCR=49;TR=114;WE=11292550;WS=11292532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr8	11295511	rs2001463	A	G	3165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=38;PP=1760;SC=TTGTCACACCATGCCACTGTG;SOR=1.089;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=67;TCR=38;TR=105;WE=11295519;WS=11295501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr8	11296091	rs1057750	G	A	2183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=52;PP=1521;SC=TTCCTATTTTGGAAACTTCGA;SOR=2.432;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=16;TCR=52;TR=68;WE=11296099;WS=11296081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr8	11301753	rs3021513	A	C	2403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=39;PP=1337;SC=AGGGCCAGGTATGCTCCTCCA;SOR=1.139;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=29;TCR=39;TR=68;WE=11301761;WS=11301743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr8	11400628	rs12386974	C	G	447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=15;NR=0;PP=340;SC=CACTTCCACCCCACCTTTCTA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=11400636;WS=11400618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
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chr8	11403769	rs2244931	C	G	1945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=43;PP=1297;SC=CCTCTTGGGGCGTCTCTTCAG;SOR=1.678;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=64;TCF=21;TCR=43;TR=64;WE=11403777;WS=11403759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
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chr8	11406408	rs76578315	G	A	614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=1;PP=444;SC=CCTGCCTGCCGTACTCTCTAC;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=11406416;WS=11406398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr8	11406593	rs3816668	T	C	6626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=111;NR=111;PP=2965;SC=ATGTGCCCAGTAACTTTGTGG;SOR=0.794;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=222;TCF=111;TCR=111;TR=222;WE=11406601;WS=11406583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr8	11410987	rs936550	C	A	1850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=34;PP=951;SC=GGCCTCAGAGCAGCCAGGCAA;SOR=1.131;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=26;TCR=34;TR=60;WE=11410995;WS=11410977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr8	11415572	rs4841557	A	G	2395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=44;PP=1448;SC=AGGTGCAGAGAAAGGGCGGCA;SOR=0.935;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=38;TCR=44;TR=82;WE=11415580;WS=11415562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr8	11415597	rs4841558	C	T	1521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=33;PP=951;SC=CCACCTGCTGCCCACAATGGC;SOR=1.739;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=16;TCR=33;TR=49;WE=11415605;WS=11415587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr8	11416122	rs2467518	T	C	970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=8;PP=575;SC=TGGACCTCCTTGGCTACCCAG;SOR=1.675;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=32;WE=11416130;WS=11416112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr8	11416171	rs7011778	T	C	2465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=26;PP=1551;SC=CATGCAGAACTTTCTGGACTC;SOR=1.408;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=53;TCR=26;TR=79;WE=11416179;WS=11416161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr8	11416428	rs6988443	C	T	2593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=40;PP=1622;SC=TACCCAGTAGCGCCGCTGCAG;SOR=0.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=48;TCR=40;TR=88;WE=11416436;WS=11416418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr8	11416635	rs11785333	G	A	2105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.29;SOR=2.348;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr8	11416643	rs11785335	G	A	1961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.85;SOR=3.003;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr8	11417493	rs10098664	T	C	1028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=24;PP=695;SC=TCTGGTACTGTTCAATAAATA;SOR=2.368;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=31;WE=11417501;WS=11417483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr8	11418766	rs62490888	G	A	6748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=122;PP=2965;SC=CGGTCTTGGCGTGGAGGCCCC;SOR=1.083;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=216;TCF=94;TCR=122;TR=216;WE=11418774;WS=11418756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr8	11422170	rs7840433	A	G	5672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=119;PP=2965;SC=CACGGGGCGCAGGCGTGGCGC;SOR=1.201;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=197;TCF=77;TCR=120;TR=196;WE=11422178;WS=11422160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr8	11606312	rs3735819	T	C	907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=1;PP=761;SC=TGGTCTTCTCTTTCCAAGGAA;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=28;WE=11606320;WS=11606308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr8	11612698	rs804280	C	A	4084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=86;PP=2443;SC=CTCAGAGTGCCTAAGAATCAT;SOR=1.386;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=138;TCF=51;TCR=87;TR=137;WE=11612706;WS=11612688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr8	11614316	rs3729853	T	C	372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=229;SC=GATAAGGACCTCTGCTGCTGT;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=11614337;WS=11614306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr8	11614329	rs3729854	C	T	515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=3;PP=318;SC=GCTGCTGTCCCCGGCAAATGT;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=14;WE=11614337;WS=11614306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr8	11618998	rs804285	G	C	109.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=0;PP=83;SC=CCCAGCTACTGGGGAAGCGGA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=11619006;WS=11618988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr8	11619163	rs809204	A	G	4446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=55;PP=2923;SC=GGTGGGGAGTATTAGGACAAG;SOR=1.314;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=151;TCF=95;TCR=56;TR=150;WE=11619171;WS=11619153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr8	11619261	rs2740431	T	A	7670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=134;NR=133;PP=2965;SC=TTGGAGTGGGTCTGGGTGTTC;SOR=0.700;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=267;TCF=134;TCR=133;TR=267;WE=11619269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,287:1.00:287
chr8	11619334	rs811966	C	T	7536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=125;NR=126;PP=2965;SC=GTTTGCATCCCTGCCTTGCTT;SOR=0.762;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=252;TCF=126;TCR=126;TR=251;WE=11619342;WS=11619324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,269:1.00:269
chr8	11619504	rs809203	T	A	6569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=117;NR=109;PP=2965;SC=TGAGGCCCTGTCCCTTATCCT;SOR=0.718;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=226;TCF=117;TCR=109;TR=226;WE=11619512;WS=11619494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr8	11619635	rs2645455	T	A	2640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=55;PP=1540;SC=AGAAAAAATCTTCAAAGCGAA;SOR=1.634;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=30;TCR=55;TR=85;WE=11619643;WS=11619625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr8	11629119	rs804269	T	C	5202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.47;SOR=0.710;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr8	11629129	rs804268	C	G	5141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.95;SOR=0.710;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr8	11629241	rs804267	G	A	1028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=25;PP=654;SC=TCAGTCTCACGTGTCTCAGCC;SOR=2.432;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=32;WE=11629249;WS=11629231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr8	11643915	rs804292	G	A	135.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=105;SC=TATAATATTCGTCTCCCTGGA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=11643923;WS=11643905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr8	11660051	rs2645429	A	G	5577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=90;PP=2965;SC=GAGCTTCTAGAGTGTTATCAC;SOR=0.770;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=188;TCF=97;TCR=91;TR=187;WE=11660059;WS=11660041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr8	11660916	rs2252567	C	T	1532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=38;PP=1062;SC=CGCCTTGCTGCCTTCCATCGC;SOR=2.345;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=13;TCR=38;TR=51;WE=11660924;WS=11660906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr8	11665959	rs1032577	C	T	371.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.31;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr8	11665980	.	T	A	445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.15;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr8	11666218	rs71711801	GTCCCAC	G	8822.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=24;NR=74;PP=2990;SC=GCCTGCCCCAGTCCCACTCCC;SOR=1.085;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=121;TCF=32;TCR=89;TR=98;WE=11666231;WS=11666208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr8	11666451	rs1616534	C	T	2644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=57;PP=1664;SC=TGTCCGGGACCTTTGAGTGTG;SOR=1.956;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=26;TCR=57;TR=83;WE=11666459;WS=11666441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr8	11683653	rs904011	T	C	5407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=81;NR=102;PP=2965;SC=GGGCCTGTTTTTGCAGAAAAC;SOR=1.049;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=183;TCF=81;TCR=102;TR=183;WE=11683661;WS=11683643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr8	11687938	rs1293313	G	C	827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=23;PP=535;SC=AGGTAGGGAAGGGGGCTCCTC;SOR=2.694;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=28;WE=11687946;WS=11687928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr8	11689228	rs2409836	T	G	1233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=30;PP=809;SC=CTTTTATGATTTAGTAATGTC;SOR=1.514;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=16;TCR=30;TR=46;WE=11689236;WS=11689218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr8	11695872	rs10903343	T	C	2722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=15;PP=1935;SC=ATAGCACTTATCATTTTTTCC;SOR=2.910;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=68;TCR=15;TR=83;WE=11695880;WS=11695862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr8	11702542	rs8898	T	C	314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=260;SC=TCAGACCCTGTCTGAAACTTG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=11702550;WS=11702537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr8	11705956	.	C	G	2092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=31;NR=37;PP=1143;SC=GGGTAGAACACTGATTCTCAA;SOR=1.108;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=31;TCR=37;TR=68;WE=11705964;WS=11705946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr8	11831948	rs7461062	T	C	3766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=34;PP=2318;SC=GGTGGCCCATTTGATATTGGT;SOR=1.701;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=82;TCR=34;TR=116;WE=11831956;WS=11831938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr8	11832079	rs10108075	A	G	6468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=94;NR=117;PP=2965;SC=TCACCAGGAAAAAGAGTAATG;SOR=1.015;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=211;TCF=94;TCR=117;TR=211;WE=11832087;WS=11832069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr8	11853596	rs11250186	A	G	3280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=35;PP=2124;SC=GCTTTTTTCTAGCTTGAAAAT;SOR=1.569;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=112;TCF=77;TCR=35;TR=112;WE=11853604;WS=11853586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr8	11872723	rs11784716	A	G	239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=4;NR=3;PP=86;SC=TGGCTCTCTGACGCCCTCTGC;SOR=0.693;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=7;WE=11872731;WS=11872713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr8	12584659	rs10095845	C	T	825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=19;NR=11;PP=649;SC=AGCATCTGCTCTGCACCCTCA;SOR=1.402;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=19;TCR=11;TR=30;WE=12584667;WS=12584649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr8	12589179	rs3802269	C	A	247.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=203;SC=ATCCAGCTTGCGGTGAGGTTT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=12589187;WS=12589169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr8	12592956	rs13251315	C	A	2310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=56;PP=1587;SC=AAACTATCCACTGAAAAGCTT;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=21;TCR=56;TR=77;WE=12592964;WS=12592946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr8	12593045	rs13272425	A	G	542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=14;PP=385;SC=GAGGAGAGAAAGGGCAGTGAT;SOR=2.093;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=19;WE=12593053;WS=12593035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr8	12598608	rs4831354	C	T	320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=10;PP=277;SC=AGTGCCGATTCTGGGCCGGGT;SOR=4.977;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=12598616;WS=12598598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr8	12600622	rs7837242	C	T	2159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=20;PP=1226;SC=AATGCATGTCCCTTATAGTTA;SOR=1.522;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=44;TCR=20;TR=64;WE=12600630;WS=12600612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr8	12878637	rs528255	A	G	5892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=112;PP=2965;SC=AAGAACCGTCACTTTGAGAAG;SOR=0.999;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=200;TCF=88;TCR=112;TR=200;WE=12878645;WS=12878627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr8	12878677	rs622106	T	C	4360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=73;PP=2927;SC=GGAACAGGGCTCTGTGTTCCC;SOR=0.830;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=139;TCF=66;TCR=73;TR=139;WE=12878685;WS=12878667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr8	12878807	rs3739310	T	G	5854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=80;PP=2965;SC=TAAAGAGCAGTGTGGTTCAAA;SOR=0.983;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=189;TCF=109;TCR=80;TR=188;WE=12878815;WS=12878797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr8	12878830	rs3739309	C	T	6918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=123;NR=107;PP=2965;SC=GGTCCCACAGCGTGGGCTATG;SOR=0.791;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=230;TCF=123;TCR=107;TR=230;WE=12878838;WS=12878820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
chr8	12879062	rs503550	T	C	10272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=367;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=159;NR=176;PP=2965;SC=ACACTCTAGTTTAGACTTTGA;SOR=0.826;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=335;TCF=159;TCR=176;TR=335;WE=12879070;WS=12879052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,367:1.00:367
chr8	12879099	rs502882	G	A	10581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=379;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=178;NR=171;PP=2965;SC=TCAACAAAAGGGCAAAGTTTA;SOR=0.731;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=350;TCF=179;TCR=171;TR=349;WE=12879107;WS=12879089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,379:1.00:379
chr8	12879334	rs608909	T	C	9177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=163;NR=139;PP=2965;SC=TTTCTGCAGTTGATTCCACAG;SOR=0.907;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=302;TCF=163;TCR=139;TR=302;WE=12879342;WS=12879324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,337:1.00:337
chr8	12879539	rs608052	A	G	5361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=107;PP=2965;SC=AGAGAAAAAGAGAGGTTGTGA;SOR=1.313;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=178;TCF=71;TCR=107;TR=178;WE=12879547;WS=12879529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr8	12879600	rs498852	C	T	1767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=43;PP=1235;SC=CACATTCTTTCCTCTTGGTTT;SOR=2.265;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=14;TCR=43;TR=57;WE=12879608;WS=12879590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr8	12888743	rs13281744	A	G	7385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=115;NR=127;PP=2965;ReadPosRankSum=1.396;SC=CCAGAAACAAACAATCATTTG;SOR=0.876;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=244;TCF=116;TCR=128;TR=242;WE=12888751;WS=12888733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,271:0.99:273
chr8	12888908	rs7826836	T	G	5364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=88;PP=2965;SC=GGGTCATGTCTCGGCTTCATT;SOR=0.733;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=182;TCF=94;TCR=88;TR=182;WE=12888916;WS=12888898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr8	12888997	rs573652	T	C	2749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=61;PP=1830;SC=CTCTCTCAGCTTTCTCTGAGA;SOR=1.814;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=28;TCR=61;TR=89;WE=12889005;WS=12888987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr8	12943691	rs621554	C	T	408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=1;PP=341;SC=TTCATGAAGTCACCAAGAAAA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=12943699;WS=12943684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr8	12948951	rs609020	A	G	4044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=58;NR=74;PP=2313;SC=CCTAGGTAGAAGAAATACAGG;SOR=1.112;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=132;TCF=58;TCR=74;TR=132;WE=12948959;WS=12948941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr8	12950110	rs7829535	G	A	1227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=8;PP=831;SC=CACCTCCCATGCAGCCCGTAC;SOR=2.885;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=41;TCF=33;TCR=8;TR=40;WE=12950118;WS=12950100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr8	12952174	rs5889417	CA	C	1502.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;MQRankSum=0.293;NF=26;NR=16;PP=640;ReadPosRankSum=0.360;SC=GACTCCATCTCAAAAAAAAAA;SOR=1.481;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=52;TCF=33;TCR=19;TR=42;WE=12952182;WS=12952164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,62:0.95:65
chr8	12952230	rs658948	C	T	6504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=132;NR=75;PP=2965;SC=TCCCATTTTTCCCCAATGCCA;SOR=1.208;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=207;TCF=132;TCR=75;TR=207;WE=12952238;WS=12952220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr8	12957475	rs532841	C	T	8308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=138;NR=145;PP=2965;SC=TTCTGCTCCACCACGTTGTTA;SOR=0.815;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=283;TCF=138;TCR=145;TR=283;WE=12957483;WS=12957465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,310:1.00:310
chr8	12960281	rs2280335	T	C	4308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=69;PP=2341;SC=CATTCTATTATGCAATTTGTA;SOR=0.768;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=141;TCF=72;TCR=69;TR=141;WE=12960289;WS=12960271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr8	12972946	rs35858677	C	G	591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=2;PP=401;SC=TTGTTTTCAGCGGTGGGGGTC;SOR=3.611;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=17;WE=12972954;WS=12972936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr8	12972972	rs145012061	A	AT	1673.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=7;PP=357;SC=TGCTTACAACATTTTTTTTAA;SOR=1.863;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=23;TCF=12;TCR=11;TR=17;WE=12972989;WS=12972962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr8	12972981	rs56332333	A	T	1829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=14;PP=660;SC=CATTTTTTTTAAAAATAAAAC;SOR=1.414;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=22;TCR=14;TR=36;WE=12972989;WS=12972962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr8	12973078	rs34462909	T	C	5926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=112;NR=83;PP=2965;SC=TTTTAAAAAGTGGCATTCCCA;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=195;TCF=112;TCR=83;TR=195;WE=12973086;WS=12973068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr8	13258927	rs2306484	G	C	656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=50.52;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr8	13258936	rs289583	T	A	689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.57;SOR=4.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr8	13356424	rs3736135	G	T	220.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=182;SC=GTGGGTAGTCGTTGAATTACA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=13356432;WS=13356421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr8	13356802	rs3816747	G	A	7902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=129;NR=131;PP=2965;SC=TGTGCAAGGAGTATCCAAGAA;SOR=0.792;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=260;TCF=129;TCR=131;TR=260;WE=13356810;WS=13356792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,294:1.00:294
chr8	13356818	rs11203494	TT	CG	12792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=120;NR=117;PP=2947;SC=AAGAACTCATTTTGTACTACA;SOR=0.758;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=242;TCF=122;TCR=120;TR=237;WE=13356827;WS=13356808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,283:1.00:283
chr8	13357587	rs1383942	G	A	2504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=52;PP=1537;SC=ACATGTCATCGTAGTTTAACA;SOR=1.691;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=27;TCR=52;TR=79;WE=13357595;WS=13357577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr8	13425353	rs11203497	T	A	7089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=138;PP=2965;SC=AGAGCAGAAGTTGCAGCGAGA;SOR=1.073;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=243;TCF=105;TCR=138;TR=242;WE=13425361;WS=13425343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,263:1.00:263
chr8	13959749	rs1973167	A	G	426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=3;PP=319;SC=ACCTAATATTACTTTCCTAAG;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=13959757;WS=13959739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr8	13965581	rs11336839	AT	A	2849.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=19;PP=2102;SC=TGGGAGAAACATTTGTCTAGT;SOR=2.055;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=65;TCF=40;TCR=25;TR=53;WE=13965589;WS=13965571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr8	14095250	rs1478030	A	T	1580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=38;PP=1099;SC=TTACAAAAAAATATACTGCAT;SOR=3.014;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=9;TCR=38;TR=47;WE=14095258;WS=14095240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr8	14412311	.	A	C	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.155;ClippingRankSum=0.000;DP=225;ExcessHet=3.0103;FS=1.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.87;ReadPosRankSum=0.984;SOR=0.909;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:172,51:0.23:223
chr8	15095085	rs4831331	C	G	3490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=79;NR=44;PP=2188;SC=CGCCCGGACCCGCACGTACCT;SOR=1.266;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=125;TCF=80;TCR=45;TR=123;WE=15095093;WS=15095075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr8	15095296	rs11782187	A	G	542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=14;PP=392;SC=GGTTAAAAATAAGGAAAATAA;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=15095304;WS=15095286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr8	15095332	rs11782191	A	G	217.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=7;PP=162;SC=AATTCACTTTATTTTACTTCC;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=15095340;WS=15095322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr8	15508200	rs1035972	T	C	5113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=98;NR=69;PP=2965;SC=CCATTATTCTTATCAGGCAAG;SOR=1.088;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=167;TCF=98;TCR=69;TR=167;WE=15508208;WS=15508190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr8	15606182	rs7820648	G	A	3953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=80;PP=2525;SC=CTGACAGCATGTAGTTTCTTT;SOR=1.195;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=56;TCR=80;TR=136;WE=15606190;WS=15606172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr8	15615179	rs3834708	CCT	C	862.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=10;NR=3;PP=590;SC=TCGTCTATCCCCTGTCTTATC;SOR=3.056;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=13;WE=15615188;WS=15615169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr8	15978063	rs4338104	C	T	4910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=64;NR=101;PP=2965;SC=GTATCTCCACCCTCCCCTCGT;SOR=1.481;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=174;TCF=65;TCR=109;TR=165;WE=15978071;WS=15978053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr8	16007617	rs76672020	A	G	113.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=55.68;NF=4;NR=0;PP=87;SC=TACTACATATATAACATTATG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=16007625;WS=16007607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr8	16012710	rs33959637	G	T	2294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=43;PP=1337;SC=AAATGGGTTAGTCATCTGTCA;SOR=1.581;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=26;TCR=43;TR=69;WE=16012718;WS=16012700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr8	16035302	rs414580	T	A	1944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=11;PP=1365;SC=TAACATCCACTTACATTTAAG;SOR=2.730;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=49;TCR=11;TR=60;WE=16035310;WS=16035292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr8	16043667	rs435815	C	T	3726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=42;PP=1953;SC=TTCATGCTCACGGTTTTTTGT;SOR=1.059;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=119;TCF=77;TCR=42;TR=119;WE=16043675;WS=16043657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr8	16043913	rs370067	G	A	366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=282;SC=CCCATAGCTCGTCTCTCAACT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=16043935;WS=16043903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr8	16043927	rs442677	A	G	222.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=159;SC=CTCAACTACAAACCCATATAT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=16043935;WS=16043903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr8	16859398	rs10448135	C	G	2648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=28;PP=1762;SC=GCCCGCCGCGCGCGCTCCGCT;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=57;TCR=28;TR=85;WE=16859406;WS=16859388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr8	17042129	rs75130109	C	CCT	1577.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=4;PP=1192;SC=TTTCCTGCACCCTCTCCACAC;SOR=2.891;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=25;WE=17042137;WS=17042119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr8	17042416	rs2517086	G	C	396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=9;PP=231;SC=ATAAATTGTTGTTTGAGAATG;SOR=1.473;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=17042424;WS=17042406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr8	17063335	rs2904674	A	G	416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=13;PP=332;SC=AATAGATAATATAGGCTTTTC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=17063343;WS=17063325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr8	17068013	rs1548350	T	G	2805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=60;PP=1831;SC=TTTTTTCATTTTACTTTCAAA;SOR=1.563;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=33;TCR=60;TR=93;WE=17068021;WS=17067990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr8	17092164	rs2959606	G	T	10650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=391;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=198;NR=156;PP=2965;SC=GCCTAGGCTCGCATGACAGTC;SOR=0.937;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=354;TCF=198;TCR=156;TR=354;WE=17092172;WS=17092154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,391:1.00:391
chr8	17100357	rs2904701	C	T	793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.37;QD=24.81;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr8	17137687	rs3213601	G	A	1391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=31;NR=13;PP=697;SC=TCTCCTGAGCGCACATTTCCT;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=31;TCR=13;TR=44;WE=17137695;WS=17137677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr8	17157259	rs6992513	G	A	632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=3;PP=490;SC=CTGCATTAAAGTAGTTCTCAA;SOR=2.737;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=22;WE=17157267;WS=17157249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr8	17159812	rs6587028	G	A	6717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=103;NR=116;PP=2965;SC=GCAAAGCGTCGTGATACCACC;SOR=0.894;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=220;TCF=103;TCR=117;TR=219;WE=17159820;WS=17159802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr8	17166765	rs1548353	A	G	2124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=17;PP=1354;SC=AACATTCAAAACAGTCTTAAA;SOR=1.739;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=50;TCR=17;TR=67;WE=17166773;WS=17166755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr8	17166866	rs62498845	G	A	6625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=124;NR=98;PP=2965;SC=ATATCTTGGAGAGAAGCAAAC;SOR=0.858;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=222;TCF=124;TCR=98;TR=222;WE=17166874;WS=17166856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr8	17170645	rs4921749	T	A	1072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=7;PP=767;SC=CGCAAAATCATATCTTCAGCG;SOR=2.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=34;WE=17170653;WS=17170635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr8	17230644	rs7388581	G	C	6270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=99;PP=2965;SC=TCTTTTCTTGGGTCAGGTGAA;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=205;TCF=106;TCR=99;TR=205;WE=17230652;WS=17230634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr8	17270763	rs2073694	G	C	5734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=71;NR=45;PP=1884;SC=CTCCGCCCGCGCTGGTGTCAC;SOR=0.864;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=71;TCR=45;TR=116;WE=17270771;WS=17270753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr8	17270787	rs67972978	A	G	5855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=66;NR=54;PP=2046;SC=CCTTGGGCGTACGGATGTGCT;SOR=0.769;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=120;TCF=66;TCR=54;TR=120;WE=17270795;WS=17270777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr8	17270837	rs72607374	G	C	2324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=37;NR=48;PP=1226;SC=GGGCGGGCGCGGCCTCACGCA;SOR=0.990;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=85;TCF=37;TCR=48;TR=85;WE=17270845;WS=17270827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr8	17401364	rs368416506	CCTT	C	1301.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=19;PP=907;SC=GAAAATGTCTCCTTCTAATTA;SOR=3.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=17401374;WS=17401354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr8	17401878	rs2517252	G	A	3176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=76;NR=34;PP=1996;SC=GTGAACTCATGTTTATCCTAT;SOR=1.589;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=76;TCR=34;TR=110;WE=17401886;WS=17401868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr8	17406183	rs737039	A	G	3292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=32;PP=1941;SC=CCCTTTTTCCATAGGTCTTTT;SOR=1.746;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=76;TCR=32;TR=108;WE=17406191;WS=17406173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr8	17406367	rs11373918	GT	G	1830.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.849;HP=11;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;MQRankSum=0.326;NF=1;NR=66;PP=969;ReadPosRankSum=2.147;SC=AATATTTGAGGTTTTTTTTTT;SOR=1.321;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=89;TCF=2;TCR=87;TR=67;WE=17406376;WS=17406357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:6,80:0.93:86
chr8	17406413	rs2245183	G	A	802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=4;NR=33;PP=863;SC=TTAAGTGGGTGTATTAGTTCA;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=4;TCR=33;TR=37;WE=17406421;WS=17406403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr8	17421279	rs2588173	T	C	8680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=123;NR=181;PP=2965;SC=GAGAGAAACATGCCCTCTCCC;SOR=1.203;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=304;TCF=123;TCR=181;TR=304;WE=17421287;WS=17421269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,334:1.00:334
chr8	17486282	rs2229084	T	C	2440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=64;PP=1653;SC=AGCTGCTCTATGTGGCGGGTA;SOR=2.706;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=18;TCR=64;TR=82;WE=17486290;WS=17486272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr8	17507299	rs17590021	A	G	2136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=14;PP=1472;SC=GCAGGGCTCAATTTCACACAT;SOR=2.336;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=49;TCR=14;TR=63;WE=17507307;WS=17507289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr8	17541784	rs2898459	C	T	688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=5;PP=483;SC=AAGTCCTCCCCGTGCTCCCCC;SOR=2.494;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=23;WE=17541792;WS=17541774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr8	17579135	rs6982255	C	T	1378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=5;PP=1031;SC=GTTACAAAAACAGAAGTCAAG;SOR=3.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=39;TCR=5;TR=44;WE=17579143;WS=17579125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr8	17612456	rs11203910	C	T	10922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=400;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=184;NR=175;PP=2965;SC=CTTGTGTCTCCTTTTCTCCAA;SOR=0.703;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=360;TCF=184;TCR=176;TR=359;WE=17612464;WS=17612446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,398:1.00:398
chr8	17612639	rs209568	T	C	8840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=142;NR=138;PP=2965;SC=TTTCAAAGCTTTCTCTATCAT;SOR=0.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=280;TCF=142;TCR=138;TR=280;WE=17612647;WS=17612629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,327:1.00:327
chr8	17612875	rs3739407	A	G	8482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=166;NR=126;PP=2965;SC=TAGCCTGCACAGTTCAAATTG;SOR=0.883;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=292;TCF=166;TCR=126;TR=292;WE=17612883;WS=17612865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,320:1.00:320
chr8	17726019	rs10112643	A	G	5685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=124;NR=74;PP=2965;SC=GTGAGATATCATCAACTCCAT;SOR=1.319;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=199;TCF=125;TCR=74;TR=198;WE=17726027;WS=17726009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr8	17732084	rs2517294	GC	CA	2149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;JOINED;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=31;PP=1866;SC=TTCTCCCCCCGCCTTAGGGAG;SOR=2.655;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=43;TCF=10;TCR=33;TR=39;WE=17732093;WS=17732074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr8	17739538	rs3739406	T	C	5216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=90;PP=2738;SC=CCAAGATCAATGACAGTATTC;SOR=0.864;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=180;TCF=90;TCR=90;TR=180;WE=17739546;WS=17739528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr8	17742929	rs2073562	A	G	3632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=34;PP=2437;SC=TATAGGTTTAATGCAAAATGA;SOR=1.870;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=84;TCR=35;TR=118;WE=17742937;WS=17742919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr8	17743020	rs484373	G	A	10250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=388;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=188;NR=166;PP=2965;SC=CCTGCCCATTGTCAGAGCGGT;SOR=0.779;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=354;TCF=188;TCR=166;TR=354;WE=17743028;WS=17743010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,388:1.00:388
chr8	17743256	rs369898	G	C	774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=20;PP=574;SC=GAATGACACTGAGTGTTAACT;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=17743264;WS=17743246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr8	17753657	rs500282	G	A	2135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=29;PP=1248;SC=TCCATTAATCGTATTGTGTAA;SOR=1.058;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=47;TCR=29;TR=76;WE=17753665;WS=17753647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr8	17753873	rs3896063	C	T	988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=21;PP=675;SC=TCTTCCTGTCCTTCACGTGGA;SOR=1.542;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=10;TCR=21;TR=31;WE=17753881;WS=17753863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr8	17796382	rs412750	AC	GT	14363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=152;NR=128;PP=2947;SC=GCATCTACAAACCCCCCAAAC;SOR=0.731;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=287;TCF=155;TCR=132;TR=280;WE=17796391;WS=17796372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,322:1.00:322
chr8	17797409	rs2285303	A	G	460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=323;SC=TTATTTTTGTAGTATCTCAGT;SOR=2.985;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=17797417;WS=17797399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr8	17804665	rs28655174	G	A	620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=0;PP=495;SC=TTAATAGTCAGATACAAGTAT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=17804673;WS=17804655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr8	17814680	rs11777618	G	C	211.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=203;SC=AATGTGCTTGGTTTGGTGTTA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=17814688;WS=17814670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr8	17814915	rs208753	A	G	4665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=82;PP=2866;SC=GGCTCTAAACATGCCTCCTTC;SOR=0.775;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=162;TCF=80;TCR=82;TR=162;WE=17814923;WS=17814905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr8	17819572	rs3780103	C	T	9175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=347;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=168;NR=144;PP=2965;SC=GTAACTGTCCCACCAAAAAAT;SOR=0.815;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=312;TCF=168;TCR=144;TR=312;WE=17819580;WS=17819562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,346:1.00:346
chr8	17819761	rs208060	A	G	783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=24;PP=625;SC=GCACATCTCAAGAAAGGAAAC;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=17819769;WS=17819751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr8	17827260	rs3214087	A	AC	6487.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=75;PP=2957;SC=AAACCAAGGTACTGATTGTAA;SOR=1.121;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=84;TCF=5;TCR=79;TR=80;WE=17827268;WS=17827250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr8	17829756	rs34990698	C	CAA	400.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=61.07;NF=4;NR=1;PP=246;SC=TAAATCTACTCGAGTAGACTA;SOR=3.258;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=17829764;WS=17829746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr8	17851248	rs429633	C	A	157.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=124;SC=AAAACTATCACCCATAATTTT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=17851256;WS=17851238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr8	17868029	rs2467556	C	A	2303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=18;PP=1370;SC=GTCTATAATCCCAGTACTTTG;SOR=1.788;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=55;TCR=18;TR=73;WE=17868037;WS=17868019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr8	17868245	rs2467555	C	A	440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=13;PP=350;SC=TAATCGCAGCCCTTTGGGAGG;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=17868253;WS=17868235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr8	17871598	rs13266287	T	A	300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=1;NR=12;PP=277;SC=TTATTTGCTTTAAAGCTAAAA;SOR=3.611;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=13;WE=17871606;WS=17871588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr8	17871619	rs28551649	A	C	112.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.01;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr8	17885091	rs3213605	T	C	818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=7;PP=585;SC=AGAACAATGTTAAATTCTAGT;SOR=1.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=26;WE=17885099;WS=17885081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr8	17891178	rs6586680	C	T	649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=0;PP=538;SC=TATGTAACATCATGTAGTTCA;SOR=4.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=17891186;WS=17891168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr8	17916224	rs420610	A	C	595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=2;PP=366;SC=TTAATAAAAAATCAGTCCTAA;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=17;WE=17916232;WS=17916214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr8	17916553	rs7465164	C	T	4304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=93;PP=2731;SC=CTGTTAGAAACACAGGTAACA;SOR=1.436;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=146;TCF=53;TCR=93;TR=146;WE=17916561;WS=17916543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr8	17916598	rs33985304	CT	C	1271.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=34;PP=1057;SC=TCTCCTTCCCCTTTTTTAAAT;SOR=4.271;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=34;WE=17916606;WS=17916588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr8	17918934	rs10103355	A	G	8553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=158;NR=129;PP=2965;SC=TATCCACATGACATCTTTCTT;SOR=0.970;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=287;TCF=158;TCR=129;TR=287;WE=17918942;WS=17918924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,324:1.00:324
chr8	17920807	rs7824644	A	G	3670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=76;PP=2229;SC=TGGACAATTAATTTTGATTAA;SOR=1.646;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=42;TCR=77;TR=118;WE=17920828;WS=17920797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr8	17920820	rs7824650	A	T	2167.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.15;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr8	17921921	rs2073574	T	C	3260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=63;NR=47;PP=2064;SC=GATTTTTCTTTATGTAGTGCT;SOR=0.871;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=110;TCF=63;TCR=47;TR=110;WE=17921929;WS=17921911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr8	17924609	.	T	TGCACCTGTGCTGTATATCTAAGACATACA	488.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=97.75;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr8	17928711	rs11785746	G	A	202.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=168;SC=GTGAGACTCTGTCTCAAAACA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=17928719;WS=17928701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr8	17928753	rs113896339	G	GAAATA	1469.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=48.99;SOR=2.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr8	18074536	rs7387461	G	A	4118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=81;PP=2469;SC=CTCCAGTTTCGCATACAAAAA;SOR=1.012;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=149;TCF=67;TCR=82;TR=146;WE=18074544;WS=18074526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr8	18077007	rs10106882	G	C	2771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=47;NR=49;PP=1658;SC=AGGTATTAAGGGCCTTTCTGA;SOR=0.836;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=96;TCF=47;TCR=49;TR=96;WE=18077015;WS=18076997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr8	18257795	rs1041983	C	T	6394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=101;NR=114;PP=2965;SC=GGTATTTTTACATCCCTCCAG;SOR=0.905;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=215;TCF=101;TCR=114;TR=215;WE=18257803;WS=18257785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr8	18258103	rs1799930	G	A	6071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=110;NR=88;PP=2965;SC=CTTGAACCTCGAACAATTGAA;SOR=0.858;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=200;TCF=110;TCR=90;TR=198;WE=18258111;WS=18258093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr8	18258316	rs1208	G	A	4126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=68;PP=2276;SC=GAAGTGCTGAGAAATATATTT;SOR=1.041;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=59;TCR=68;TR=127;WE=18258324;WS=18258306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr8	18413875	rs2260920	A	G	1840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=28;NR=39;PP=1168;SC=GCAGGAAATCATGATGCCATT;SOR=1.512;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=67;TCF=28;TCR=39;TR=67;WE=18413883;WS=18413865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr8	18414870	rs2717725	T	A	363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=2;PP=290;SC=ATTTTTTACATAAACAGAAAA;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=18414878;WS=18414860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr8	18415081	rs2634454	G	T	1825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=30;NR=31;PP=929;SC=AAAAGCAGAGGACACGAATGG;SOR=0.904;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=30;TCR=31;TR=61;WE=18415089;WS=18415071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr8	18432578	rs2248559	C	G	2069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=18;PP=1438;SC=TTGTTCCTTGCAATAAAGTAG;SOR=1.965;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=67;TCF=49;TCR=18;TR=66;WE=18432586;WS=18432568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr8	18620703	rs2410595	G	A	812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=23;PP=627;SC=AGGTCAATACGTAACAATAAA;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=18620711;WS=18620693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr8	18656601	rs2248631	G	A	426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=15;NR=1;PP=405;SC=CCAGACACCAGGACGATGGAT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=18656609;WS=18656591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr8	18658750	rs1386692	A	G	842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=6;PP=454;SC=TTGATATAAAAAAGAAATTCA;SOR=1.536;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=26;WE=18658758;WS=18658740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr8	18658929	rs1386691	C	A	1223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=18;NR=21;PP=674;SC=GTGAAATTTTCGAAAATGCTA;SOR=1.154;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=18;TCR=21;TR=39;WE=18658937;WS=18658919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr8	18659019	rs1386690	C	T	143.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=113;SC=ATGAAGTTATCTCCCCCCAAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=18659027;WS=18659009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr8	18659765	rs2638646	A	G	2024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=18;PP=1074;SC=TAGGAAGTGTATCAAAAACCA;SOR=1.308;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=40;TCR=18;TR=58;WE=18659773;WS=18659755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr8	18659780	rs2632848	T	C	2380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=47;NR=22;PP=1196;SC=AAACCACACATTAATCTACTC;SOR=1.218;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=47;TCR=22;TR=69;WE=18659788;WS=18659770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr8	18659882	rs3837206	GA	G	1797.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.13;MQRankSum=0.250;QD=24.29;ReadPosRankSum=-0.233;SOR=1.308;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,72:0.97:74
chr8	18659928	rs2632847	A	G	1279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=23;PP=701;SC=ACTATGGTAAAAAACATACCA;SOR=1.714;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=13;TCR=23;TR=36;WE=18659936;WS=18659918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr8	18660007	rs2638647	A	G	184.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.98;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr8	18660016	rs2632846	A	C	152.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.01;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr8	18661932	rs59596734	TA	T	726.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.381;HP=12;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.369;NF=16;NR=5;PP=347;ReadPosRankSum=1.814;SC=CATGGAGGTTTAAAAAAAAAA;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=21;WE=18661940;WS=18661922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,33:0.94:35
chr8	18666210	rs2638653	G	A	5464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=71;PP=2965;SC=ACAAGAACCGGAATTGCTCCT;SOR=1.000;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=177;TCF=106;TCR=71;TR=177;WE=18666218;WS=18666200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr8	18725072	rs1009482	T	C	933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=4;PP=651;SC=CATTTGCTTATGTCCACAGAA;SOR=3.477;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=28;WE=18725080;WS=18725062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr8	18729817	rs7016219	GT	AG	12707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=131;NR=104;PP=2947;SC=AGCAGGGAGCGTTTTGTTGAC;SOR=0.803;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=247;TCF=138;TCR=109;TR=235;WE=18729826;WS=18729806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,285:1.00:285
chr8	18793697	rs10092681	T	A	2779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=60;PP=1790;SC=AATACATCATTAAAAAACACA;SOR=1.784;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=28;TCR=60;TR=88;WE=18793705;WS=18793687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr8	18941583	rs59435769	G	C	776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=2;PP=587;SC=GCGGCTCGTGGGTACCTCTGC;SOR=3.611;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=25;WE=18941591;WS=18941573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr8	19221700	rs34608771	G	A	4017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=74;NR=56;PP=2113;SC=AGGCTGCAAAGCCCCTTGCGT;SOR=0.895;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=74;TCR=56;TR=130;WE=19221708;WS=19221690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr8	19230955	.	G	GTA	126	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MMLQ=17;MQ=62.13;NF=5;NR=0;PP=126;QD=26.4;SC=ATGTGTGTGTGTATATATATA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=5;WE=19230963;WS=19230945;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:5,5:0.50:10
chr8	19362768	rs7017776	C	T	6464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=139;NR=85;PP=2965;SC=CTCTGCAGGACTGTTCAGGGT;SOR=1.217;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=224;TCF=139;TCR=85;TR=224;WE=19362776;WS=19362758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr8	19363425	rs6984644	C	T	1150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=32;PP=903;SC=CTGGGCTAGACCACAGGAAGC;SOR=3.202;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=6;TCR=32;TR=38;WE=19363433;WS=19363415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr8	19456473	rs4244454	C	T	4368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=51;PP=2698;SC=CAGGAACACACTACCATTGAG;SOR=1.416;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=154;TCF=103;TCR=51;TR=153;WE=19456481;WS=19456463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr8	19680736	rs12547934	T	C	1263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=12;PP=791;SC=AAATGAACTCTGAAAGCTTTT;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=32;TCR=12;TR=44;WE=19680744;WS=19680726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr8	19680979	rs4464983	C	T	596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=15;PP=408;SC=TGTACTTTTACTTAAATAGGC;SOR=3.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=19680987;WS=19680969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr8	19681647	rs2410612	G	A	803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=22;PP=612;SC=GTAATGCGTAGGTATAGTTTT;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=19681655;WS=19681637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr8	19682545	rs3816246	A	G	3720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=78;PP=2391;SC=TGGTAAGGAAAATGAAAGTGT;SOR=1.683;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=119;TCF=41;TCR=78;TR=119;WE=19682553;WS=19682535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr8	19682592	rs7018076	A	G	1406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=38;PP=1053;SC=ACTGTGGGGCAGTACCAGTCC;SOR=3.611;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=6;TCR=38;TR=44;WE=19682600;WS=19682582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr8	19689633	rs4434638	T	C	3519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=52;PP=2320;SC=TAGAGTATTATACATATTTTA;SOR=0.806;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=119;TCF=67;TCR=52;TR=119;WE=19689641;WS=19689623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr8	19689821	rs4615593	G	A	214.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=6;PP=130;SC=CGTGGCTTACGCCTGTAATCC;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=19689829;WS=19689811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr8	19699191	rs34564004	G	T	1655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=19;PP=843;SC=CGTGCTTCTGGAAGGTGTATA;SOR=1.044;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=37;TCR=19;TR=56;WE=19699199;WS=19699181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr8	19699236	rs35843228	T	A	2691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=34;PP=1415;SC=CAACTTCCCATGACCAAGTTG;SOR=0.818;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=52;TCR=34;TR=86;WE=19699244;WS=19699226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr8	20005300	rs1018079	T	C	364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=8;PP=237;SC=CCTCTCCTCCTCCATTTAGTC;SOR=1.609;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=12;WE=20005308;WS=20005290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr8	20005716	rs903997	G	C	606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=15;PP=494;SC=TGCACTCTCAGACTTTCTCAT;SOR=2.419;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=19;WE=20005724;WS=20005706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr8	20022694	rs3779670	G	A	1885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=45;PP=1238;SC=ATCTGAGAAAGTACAATTATG;SOR=2.165;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=18;TCR=45;TR=63;WE=20022702;WS=20022684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr8	20028464	rs11989477	G	A	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=361;SC=TACCTGAAACGTAACCCTATC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=20028472;WS=20028462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr8	20028830	rs17222134	T	C	567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=9;NR=8;PP=468;SC=AAACCGCCCATTCTTAGTGAA;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=9;TCR=8;TR=17;WE=20028838;WS=20028820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr8	20035809	rs1532446	G	A	339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=0;PP=306;SC=AAACAGCAGAGCATTTAAACC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=20035817;WS=20035799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr8	20036018	.	G	GAA	435	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;FR=1.0000;HP=11;HapScore=3;MGOF=42;MMLQ=17;MQ=60.27;NF=4;NR=32;PP=435;QD=12.3333333333;SC=AAAGGGAATTGAAAAAAAAAA;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=46;TCF=6;TCR=40;TR=36;WE=20036026;WS=20036008;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:10,36:0.78:46
chr8	20036043	rs1908809	C	A	1278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=44;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=35;PP=1069;SC=ACAATTCCAACAGGCACTCAC;SOR=2.985;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=11;TCR=35;TR=46;WE=20036051;WS=20036033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr8	20036095	rs2279708	G	A	658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=18;PP=459;SC=GAGCAGAAATGCAGCTATTTG;SOR=3.352;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=20036103;WS=20036085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr8	20036521	rs1390937	A	G	939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=9;PP=559;SC=GACTCCCCTGAGGAATCATAC;SOR=1.819;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=30;WE=20036529;WS=20036511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr8	20036713	rs1390938	A	G	4537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=73;NR=81;PP=2810;SC=GACCCGGGTAATCTCTTCCTC;SOR=0.887;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=154;TCF=73;TCR=81;TR=154;WE=20036721;WS=20036703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr8	20037017	rs2270638	T	C	803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=19;PP=464;SC=AGAGGACAGGTGATGGGGGCT;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=10;TCR=19;TR=29;WE=20037025;WS=20037007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr8	20038466	rs2270641	T	G	3426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=73;PP=2225;SC=TCCAGAATGGTCCGGAGCATG;SOR=1.792;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=32;TCR=73;TR=105;WE=20038474;WS=20038456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr8	20068163	rs7460146	T	G	2707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=33;NR=52;PP=1671;SC=CATGGGTAGGTACAGTAGATG;SOR=1.402;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=33;TCR=52;TR=85;WE=20068171;WS=20068153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr8	20068187	.	G	C	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.880;ClippingRankSum=0.000;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=1.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.01;ReadPosRankSum=-0.192;SOR=0.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,11:0.17:64
chr8	20068619	rs9325865	A	G	1942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=14;PP=1373;SC=TTAATTTGATATGATATCTAA;SOR=2.129;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=47;TCR=14;TR=61;WE=20068627;WS=20068609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr8	20072192	rs62498257	A	G	217.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=148;SC=ATTTTTCTAAATCATTCTTAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=20072200;WS=20072187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr8	20107143	rs904003	A	G	864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=23;NR=6;PP=634;SC=GCGTCTCTCAAAGGGGTCTGA;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=29;WE=20107151;WS=20107133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr8	21550768	rs15881	A	C	4010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=32;PP=2527;SC=TTTCAAAAATATTCTGACTCG;SOR=2.053;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=122;TCF=90;TCR=32;TR=122;WE=21550776;WS=21550758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr8	21550800	rs1128397	A	T	6292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=127;NR=82;PP=2965;SC=CTACAAGGCCAGTTTCAGCAT;SOR=1.144;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=209;TCF=127;TCR=82;TR=209;WE=21550808;WS=21550790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr8	21842023	rs1872220	TT	GA	1018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=0;PP=1099;SC=TCTTCCTTGGTTAAAAGTAAT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=19;WE=21842032;WS=21842013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr8	21890581	rs1947985	T	C	1482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=14;PP=1060;SC=TGCCTGAGGCTAGTCCCCGAG;SOR=2.049;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=37;TCR=14;TR=51;WE=21890589;WS=21890571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr8	21891939	rs10089142	G	A	2459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=50;NR=37;PP=1536;SC=GGAGCTCAGCGGGGACCTTGT;SOR=0.953;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=88;TCF=50;TCR=38;TR=87;WE=21891947;WS=21891929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr8	21891968	rs4871915	C	G	3155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=58;NR=50;PP=1950;SC=GGAATCTGTTCTGGCTCTGGA;SOR=0.745;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=111;TCF=59;TCR=52;TR=108;WE=21891976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr8	21895146	rs11992609	A	G	4222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=67;NR=73;PP=2347;SC=CACACAGATGAGCCCTACACT;SOR=0.911;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=140;TCF=67;TCR=73;TR=140;WE=21895154;WS=21895136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr8	21904212	rs1078363	T	C	2672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=67;PP=1625;SC=TAGGGCATCATGCTCCCCTCT;SOR=1.958;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=30;TCR=67;TR=97;WE=21904220;WS=21904202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr8	21924297	rs9657287	C	T	152.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=4;NR=2;PP=51;SC=AAGCGCGCAGCGCCCAGCAGC;SOR=0.941;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=21924305;WS=21924287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr8	21924743	rs11135821	G	A	2235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=45;PP=1407;SC=GGCTGCTAGCGTGCCTTCCCG;SOR=1.292;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=30;TCR=45;TR=75;WE=21924751;WS=21924733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr8	21924778	rs11135822	T	G	1389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=30;PP=930;SC=TGGTGGTCCCTCCGGTGCTGG;SOR=1.436;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=17;TCR=30;TR=47;WE=21924786;WS=21924768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr8	21924944	rs11135823	A	G	3647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=40;PP=2189;SC=ATGGCGGTCCATTTTCTTGGT;SOR=1.461;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=124;TCF=83;TCR=41;TR=123;WE=21924952;WS=21924934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr8	21925214	rs6997244	C	G	1740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=46;PP=1384;SC=TCCTCTTGGGCAGGACTCCGG;SOR=1.812;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=18;TCR=46;TR=64;WE=21925222;WS=21925204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr8	21927137	rs12680100	G	A	7878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=116;NR=167;PP=2965;SC=CTCGCCTCAGGGCTAAGTAGG;SOR=1.110;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=283;TCF=116;TCR=167;TR=283;WE=21927145;WS=21927127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,294:1.00:294
chr8	21927211	rs12681799	C	G	2219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=50;SC=CTCCCCCAGCCGGAAAAGTGT;SOR=1.897;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=18;TCR=50;TR=68;WE=21927219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr8	21927460	rs7386762	C	G	5414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=107;PP=2965;SC=TGAGGGCGCCCCTGGCTCACC;SOR=1.279;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=181;TCF=73;TCR=108;TR=180;WE=21927468;WS=21927450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr8	21930007	rs3824334	G	A	1634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=37;PP=1006;SC=CAGGAGTCTCGCTCTGTTGCC;SOR=1.773;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=18;TCR=37;TR=55;WE=21930015;WS=21929997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr8	21930068	rs3824336	A	G	440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=12;PP=305;SC=CTCCGCTCCCAGGTTCAAGTG;SOR=4.047;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=21930076;WS=21930058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr8	21931141	.	CAAAAA	C	264	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;FR=0.5000;HP=20;HapScore=2;MGOF=32;MMLQ=18;MQ=49.01;NF=10;NR=2;PP=264;QD=22.25;SC=GACCCTGTCTCAAAAAAAAAA;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=12;WE=21931153;WS=21931131;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr8	21931170	rs199820139	AAAAAAAAAAGAG	A	2750.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=67.91;QD=39.30;SOR=1.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr8	21937667	rs6557781	T	C	7422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=148;NR=105;PP=2965;SC=GGGACTGAACTCAGGACCTTT;SOR=0.957;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=254;TCF=148;TCR=106;TR=253;WE=21937675;WS=21937657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,279:1.00:279
chr8	21937870	rs7835670	G	A	6367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=116;NR=103;PP=2965;SC=AAAGTGAAGGGGACCAAAGGT;SOR=0.755;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=220;TCF=116;TCR=104;TR=219;WE=21937878;WS=21937860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr8	21939435	rs6557782	C	T	5767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=126;NR=101;PP=2965;SC=GCACTGCAGCCTCCTGCTCCT;SOR=0.702;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=227;TCF=126;TCR=101;TR=227;WE=21939443;WS=21939425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr8	21946664	rs7829160	C	T	137.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.97;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr8	21952226	rs1456	T	C	4565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=96;PP=2502;SC=ATGATTTAGCTGCCGGTCCCA;SOR=1.415;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=154;TCF=58;TCR=96;TR=154;WE=21952234;WS=21952216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr8	21955116	rs11352	C	T	3098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=59;NR=46;PP=1783;SC=ACCTCAGCGTCCACAGGCCTG;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=59;TCR=46;TR=105;WE=21955124;WS=21955106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr8	21956108	rs35497596	A	G	4172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=81;PP=2635;SC=AGACATTGCCACCTTAGAGGG;SOR=1.065;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=142;TCF=61;TCR=81;TR=142;WE=21956116;WS=21956098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr8	21958333	rs1552283	T	C	11407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=412;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=190;NR=189;PP=2965;SC=ACTGGTGCCGTACTGCTCTGC;SOR=0.698;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=380;TCF=190;TCR=190;TR=379;WE=21958341;WS=21958323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,411:1.00:411
chr8	21958831	rs1968870	C	G	301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=1;PP=208;SC=ACCGTGCCTGCCCTGAGTTTT;SOR=2.494;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=21958851;WS=21958828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr8	21958843	rs71544853	C	CTCTT	781.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=1;PP=461;SC=CTGAGTTTTACTCTTTGGCCA;SOR=3.258;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=10;WE=21958851;WS=21958828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
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chr8	21959877	rs7812435	T	G	2104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.69;SOR=1.051;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr8	21964802	rs1552286	C	T	2366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=20;PP=1379;SC=TGTCACCTCCCCCACCTCTCT;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=57;TCR=20;TR=77;WE=21964810;WS=21964792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr8	21966700	rs57316099	GC	G	3074.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=6;NR=27;PP=1204;SC=TTCTTCCGCAGCCCGCACGGG;SOR=0.811;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=33;WE=21966715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr8	21966707	rs58343576	CG	C	3211.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=26;PP=1177;SC=GCAGCCCGCACGGGGCGCCGG;SOR=0.749;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=31;WE=21966715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr8	21966891	rs149177341	C	CCCGCTCCCAGTCCCTGCGGAGA	1259.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.54;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=4;PP=1955;SC=CGCTGCGGAGCCCGCTCCCAG;SOR=1.136;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=6;WE=21966899;WS=21966881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr8	21967075	rs7830885	G	T	1604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=23;PP=949;SC=TGGAACTGGGGGGGCACGGGT;SOR=0.831;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=32;TCR=23;TR=55;WE=21967083;WS=21967065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr8	21967304	rs7844781	C	T	17050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=386;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.29;SOR=0.752;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,385:1.00:385
chr8	21967309	rs7817171	A	C	17011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=379;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.00;SOR=0.792;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,378:1.00:378
chr8	21973970	rs6557829	C	A	2093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=35;PP=1196;SC=GACAGTGAGGCTCAAGATCAC;SOR=0.850;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=77;TCF=42;TCR=35;TR=77;WE=21973978;WS=21973960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr8	21974032	rs6557830	A	C	1383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=32;PP=973;SC=TCTAATGACAACCACCCCCGA;SOR=1.567;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=21;TCR=32;TR=53;WE=21974040;WS=21974022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr8	21976872	rs12677278	G	A	3193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=71;PP=2046;SC=CTGTAATCCTGGCACTTTGGG;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=37;TCR=71;TR=108;WE=21976880;WS=21976862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr8	21978072	rs11135859	A	G	3355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=29;NR=43;PP=1301;SC=GGTGCCCGCCATGGCCAGGCA;SOR=1.339;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=29;TCR=43;TR=72;WE=21978080;WS=21978062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr8	21978088	rs11779694	G	A	2952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=21;NR=38;PP=1087;SC=AGGCAAGGGCGTGTTGTAAGG;SOR=1.681;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=21;TCR=38;TR=59;WE=21978096;WS=21978078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr8	21981218	rs117197822	C	T	2331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=49;NR=26;PP=1261;SC=CACACACAGCCGGTGGCTGCA;SOR=1.244;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=49;TCR=26;TR=75;WE=21981226;WS=21981208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr8	21984488	rs12681529	G	A	145.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.83;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr8	21984650	rs12675745	A	G	4102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=62;PP=2585;SC=CAGTGCCTGGAAAAGGGTCCG;SOR=0.962;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=146;TCF=84;TCR=62;TR=146;WE=21984658;WS=21984640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr8	21984945	rs12675375	C	T	4030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=71;PP=2683;SC=AGGGCCAAGACCCCCACCTTT;SOR=0.871;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=138;TCF=67;TCR=71;TR=138;WE=21984960;WS=21984935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr8	22020066	rs13248346	T	C	1002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=5;PP=681;SC=GCCTGTCTCCTTGCCTGCCCC;SOR=2.584;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=32;WE=22020074;WS=22020056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr8	22020294	rs2070684	C	A	3798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=58;NR=68;PP=2133;SC=TGCCAGACAGCGGGGCTAGGT;SOR=1.063;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=58;TCR=68;TR=126;WE=22020302;WS=22020284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr8	22021037	rs4715	C	A	4095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=71;NR=68;PP=2221;SC=GAGGCTCTCACTAGAAAAGTC;SOR=0.843;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=139;TCF=71;TCR=68;TR=139;WE=22021045;WS=22021027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr8	22021517	rs1124	G	A	899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=18;PP=517;SC=ATGGCCGTGAGCACCCTGTGT;SOR=1.911;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=9;TCR=18;TR=27;WE=22021525;WS=22021507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr8	22021739	rs3216166	G	GA	9106.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.49;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=56;PP=2957;SC=CCACTCCCCTGATTCTCTCTG;SOR=1.132;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=100;TCF=40;TCR=60;TR=94;WE=22021747;WS=22021729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr8	22021883	rs7592	G	A	3931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=53;NR=83;PP=2322;SC=GCAGGGACAAGCCCTGGAGAA;SOR=1.355;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=137;TCF=53;TCR=84;TR=136;WE=22021891;WS=22021873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr8	22021934	rs1139547	G	A	1862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=43;PP=1193;SC=CAGAGGTGGCGCCCAGGGGCC;SOR=2.165;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=16;TCR=43;TR=59;WE=22021942;WS=22021924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr8	22053163	.	ATT	A	32.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.164;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=2.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.36;ReadPosRankSum=1.357;SOR=0.197;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,4:0.17:24
chr8	22066855	rs4463424	C	T	569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=2;PP=463;SC=GTGGCCTTCACCCAGGCCTCC;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=22066863;WS=22066845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr8	22079355	rs4872422	A	G	4971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=88;PP=2860;SC=CGTGGCTGCCACTGTTGTCCT;SOR=0.998;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=165;TCF=77;TCR=88;TR=165;WE=22079363;WS=22079345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr8	22081708	rs4075536	G	A	2542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=27;PP=1577;SC=GGAGAGGCCCGGCGGGTCCAG;SOR=1.354;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=58;TCR=27;TR=84;WE=22081716;WS=22081698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr8	22084653	rs4871975	C	T	537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=14;PP=349;SC=TGAGCAGGACCAATCTTGAGG;SOR=2.093;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=19;WE=22084661;WS=22084643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr8	22085260	rs10100426	T	C	5327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=122;PP=2965;SC=GCAAAAGGGCTCCGCCCCGAC;SOR=1.974;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=172;TCF=50;TCR=122;TR=172;WE=22085268;WS=22085250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr8	22105502	rs1126677	T	C	4487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=80;NR=77;PP=2386;SC=AGGGCCCAGCTGAAATGATGA;SOR=0.740;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=157;TCF=80;TCR=77;TR=157;WE=22105522;WS=22105492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr8	22147333	rs4872463	A	G	2348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=21;PP=1714;SC=CTTCTATTAGAAAACTCATAC;SOR=2.191;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=57;TCR=21;TR=78;WE=22147341;WS=22147323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr8	22163331	rs12543697	C	T	295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=241;SC=CTCCTTAGTGCGCAAGGTATA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=22163339;WS=22163321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr8	22211756	rs66554545	T	A	3212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=78;NR=33;PP=1900;SC=ATCCGACCATTTCACTGATTT;SOR=1.590;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=112;TCF=78;TCR=34;TR=111;WE=22211764;WS=22211746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr8	22262098	rs896375	A	G	526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=1;PP=389;SC=GGAGCAGAGAAGCAGAGACTG;SOR=3.383;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=22262106;WS=22262088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr8	22262321	rs896378	T	C	7983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=143;NR=130;PP=2965;SC=GCTTCATCCCTGGGTGCACCA;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=273;TCF=143;TCR=130;TR=273;WE=22262329;WS=22262311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,300:1.00:300
chr8	22262418	rs2293144	A	G	4604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=74;NR=82;PP=2602;SC=TGAAGGCCCTACTCAACCACC;SOR=1.005;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=156;TCF=74;TCR=82;TR=156;WE=22262426;WS=22262408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr8	22266054	rs3817445	G	T	675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=16;PP=480;SC=CATCTCGCCCGCGTCTCACAA;SOR=2.030;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=22;WE=22266062;WS=22266044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr8	22267385	rs3802199	A	G	247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=8;NR=2;PP=174;SC=AATTCAGAACAGGGCCGCCCC;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=22267393;WS=22267375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr8	22277040	rs10101909	G	A	8892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=344;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=165;NR=135;PP=2965;SC=AATTGCAGCTGTGTTGTTTCT;SOR=0.836;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=301;TCF=166;TCR=135;TR=300;WE=22277048;WS=22277030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,343:1.00:343
chr8	22332958	rs139063527	G	T	1655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=11;PP=1260;SC=TTGGTGTAATGCCCTTCGTCT;SOR=2.712;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=45;TCR=11;TR=56;WE=22332966;WS=22332948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr8	22389900	rs2449340	T	G	3019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=64;PP=2039;SC=AGTTTTTTTATAATTGGAATG;SOR=1.587;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=33;TCR=64;TR=97;WE=22389908;WS=22389890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr8	22396781	rs5890041	TC	T	321.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=1;PP=191;SC=TTAGAAACTCTCCCCCACCCC;SOR=1.802;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=5;WE=22396789;WS=22396771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr8	22398220	.	GA	G	6273.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=62;PP=2951;SC=ACCCCGAAAGGATAGCATACA;SOR=0.785;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=32;TCR=62;TR=94;WE=22398228;WS=22398210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr8	22398414	rs7430	G	C	739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=19;PP=599;SC=CAACTTCAACGTGGAGGTGCA;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=22398422;WS=22398404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr8	22398462	rs7431	G	A	352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=289;SC=TAAAAAGGTGGCTGTTTTATA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=22398470;WS=22398452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr8	22419191	rs2469764	T	C	626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=4;PP=501;SC=ATGTAGTAAATGTCGTAAAGC;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=19;WE=22419199;WS=22419185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr8	22421355	rs2449336	A	G	509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=0;PP=295;SC=CCACAGTTTAATCTTGCTTCC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=22421363;WS=22421345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr8	22421395	rs2469762	G	A	1225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=3;PP=778;SC=CAGAGGCAGAGTAGACCCCAC;SOR=3.258;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=32;WE=22421403;WS=22421385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr8	22422923	rs960509	G	A	1381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=31;PP=893;SC=GGGTCGGGGCGAGCCGGGAGC;SOR=1.436;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=18;TCR=31;TR=49;WE=22422931;WS=22422913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr8	22424489	rs11779261	A	G	454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=6;PP=359;SC=GGGGTGAGAGAACTGGGGTGT;SOR=1.112;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=9;TCR=6;TR=15;WE=22424497;WS=22424479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr8	22426650	rs3830695	TC	T	6458.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=73;PP=2967;SC=TCATGACCTTTCTTCATGCAG;SOR=0.818;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=99;TCF=25;TCR=74;TR=98;WE=22426658;WS=22426640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr8	22426859	.	G	C	133	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;FR=1.0000;HP=12;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=25;MQ=58.7;NF=2;NR=6;PP=133;QD=20.9714015684;SC=ACTAAAAACAGTTTTTTTTTT;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=8;WE=22426867;WS=22426849;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,8:0.89:9
chr8	22428658	rs2449331	T	C	4293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=63;NR=76;PP=2610;SC=GCTGACCCCATCGACTTGGGG;SOR=1.026;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=139;TCF=63;TCR=76;TR=139;WE=22428666;WS=22428648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr8	22432377	rs710098	C	A	5546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.026;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=120;NR=99;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.998;SC=CCCCCGCAGCCTTTCCCTCGG;SOR=0.115;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=226;TCF=127;TCR=99;TR=219;WE=22432385;WS=22432367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,221:0.99:223
chr8	22436681	rs11545016	C	T	1280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.62;SOR=0.952;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr8	22437141	rs11786352	G	A	124.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=3;PP=54;SC=AAGGCAGCCGGGGATGGAGCG;SOR=1.981;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=22437149;WS=22437131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr8	22438313	rs922810	T	C	6309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=99;NR=107;PP=2965;SC=GTTCTGGAGCTAGGGATCTGC;SOR=0.834;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=206;TCF=99;TCR=107;TR=206;WE=22438321;WS=22438303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr8	22442287	rs4872003	A	G	4139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=64;PP=2479;SC=TGGGGGTTGCAGGGTGCAGGG;SOR=0.870;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=143;TCF=79;TCR=64;TR=143;WE=22442295;WS=22442277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr8	22442661	rs2294047	A	G	3662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=65;PP=2146;SC=CTGGAGAGGCAGCCATCAGCC;SOR=0.953;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=53;TCR=66;TR=118;WE=22442669;WS=22442651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr8	22447426	rs3830696	CGGTCCGGGAG	C	369.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=4;PP=1687;SC=AAGGAGCTGACGGTCCGGGAG;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=22447443;WS=22447416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr8	22462346	rs11555543	T	G	1156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=18;PP=571;SC=GTCGCTGCCCTGGCCCGCAGG;SOR=1.055;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=16;TCR=18;TR=34;WE=22462354;WS=22462336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr8	22482851	rs900268	A	C	2826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=57;NR=40;PP=1649;SC=GTCCAGGATCAGGCTGCGCAG;SOR=1.029;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=57;TCR=40;TR=97;WE=22482859;WS=22482841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr8	22526449	.	G	A	668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=2;PP=453;SC=GCTCTGGGGCGGAGGGGTCGC;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=22526457;WS=22526439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr8	22526559	rs11550509	G	A	4943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=102;NR=68;PP=2879;SC=TCACTCACCAGCTCATGGTCC;SOR=1.071;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=170;TCF=102;TCR=68;TR=170;WE=22526567;WS=22526549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr8	22785013	rs1553778	T	C	553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=1;PP=378;SC=AGATGGTGCTTCTTGGTTCTG;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=22785021;WS=22785003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr8	22785361	rs2466224	C	A	203.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=166;SC=GGGAGAAGGACAGGCAGCTTC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=7;WE=22785369;WS=22785351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr8	22880162	rs1047275	G	C	5191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=68;PP=2965;SC=GGGAAGGTCTGACTTCCTGAA;SOR=0.852;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=161;TCF=93;TCR=68;TR=161;WE=22880170;WS=22880152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr8	22881852	rs6557609	T	C	5837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=90;NR=95;PP=2965;SC=ACCAGCCAGCTCTGAGACCTG;SOR=0.931;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=185;TCF=90;TCR=95;TR=185;WE=22881860;WS=22881842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr8	22885109	rs1105944	A	G	1344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=5;PP=886;ReadPosRankSum=1.176;SC=AGCCCAGAGCACCCAGGCCAC;SOR=1.942;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=41;TCR=5;TR=45;WE=22885117;WS=22885099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,51:0.98:52
chr8	22885153	rs2293402	GG	AA	5832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=31;PP=2947;SC=AGGACAATGGGGACCCACCCA;SOR=1.646;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=113;TCF=79;TCR=34;TR=101;WE=22885162;WS=22885143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr8	22886020	rs13265018	A	G	5842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=96;NR=97;PP=2965;SC=CACAGCTGGGACTTCCCCACT;SOR=0.840;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=193;TCF=96;TCR=97;TR=193;WE=22886028;WS=22886010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr8	22886130	rs2293399	A	G	1760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=40;PP=1165;SC=GTACACACACAGAGGGAGAGG;SOR=1.926;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=19;TCR=40;TR=59;WE=22886138;WS=22886120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr8	22887013	rs6420148	C	G	1030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=5;PP=792;SC=GCAGCCACAGCCTCAAGGATG;SOR=2.899;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=34;WE=22887021;WS=22887003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr8	22888407	rs10866818	G	A	1313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=26;PP=764;SC=GAGAAAAGCCGGTGAATGAAA;SOR=1.659;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=14;TCR=26;TR=40;WE=22888415;WS=22888397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr8	22926313	rs1129424	G	A	6027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.98;NF=115;NR=86;PP=2965;SC=GGGGACCCGGGGCCCAGGCCT;SOR=0.776;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=201;TCF=115;TCR=86;TR=201;WE=22926321;WS=22926303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr8	22960704	rs6557616	G	C	7618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=122;NR=152;PP=2965;SC=AGTGAGTCCCGGCCGCGGTCC;SOR=0.949;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=274;TCF=122;TCR=152;TR=274;WE=22960712;WS=22960694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,287:1.00:287
chr8	22960873	rs10109912	G	C	2059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=34;PP=1278;SC=TGGGCAGGAGGGACCCGGCCG;SOR=0.719;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=37;TCR=34;TR=71;WE=22960881;WS=22960863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr8	22969091	rs10111172	T	C	1432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=13;PP=1003;SC=AACACAGGTATGAAAGAATGA;SOR=2.259;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=39;TCR=13;TR=52;WE=22969099;WS=22969081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr8	22974325	rs11780493	G	A	1475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=20;NR=43;PP=1291;SC=ACACCAGCCCGGGGACTCCTG;SOR=2.256;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=64;TCF=20;TCR=44;TR=63;WE=22974333;WS=22974315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr8	22974450	.	T	C	2621	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=26;MQ=57.82;NF=86;NR=60;PP=2621;QD=20;SC=GAGACAATGATCACCAGCCCG;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=146;TCF=86;TCR=60;TR=146;WE=22974458;WS=22974440;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr8	22989954	rs4872058	G	A	1006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=22;SC=GTAGGGACCCGTATCTCAATA;SOR=1.911;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=11;TCR=22;TR=33;WE=22989962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr8	22990193	.	TTGTGTGTGTG	T,TTG	1129.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.18;QD=40.35;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,10,18:0.36,0.64:28
chr8	23049292	rs2230229	C	T	5747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=104;NR=80;PP=2965;SC=AATCTTCTCTCTTGCATGTCT;SOR=0.828;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=184;TCF=104;TCR=80;TR=184;WE=23049300;WS=23049282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr8	23054779	rs3824218	T	C	7089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=118;NR=116;PP=2965;SC=TAGTACTGACTCTGACCATCA;SOR=0.780;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=234;TCF=118;TCR=116;TR=234;WE=23054787;WS=23054769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,263:1.00:263
chr8	23059265	rs11294851	TC	T	4381.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=26;PP=2532;SC=TTTTTAGGGTTCCTTGCTTCT;SOR=1.634;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=37;TCR=26;TR=62;WE=23059273;WS=23059255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr8	23059280	rs4872078	G	T	4867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=38;PP=1919;SC=GCTTCTGTGGGTTCTTTGAGG;SOR=1.329;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=109;TCF=71;TCR=38;TR=108;WE=23059288;WS=23059270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr8	23059324	rs20575	C	G	4493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=62;PP=2800;SC=GTCTCACCCTCTGCTGCACTT;SOR=0.951;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=150;TCF=88;TCR=62;TR=149;WE=23059332;WS=23059314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr8	23060256	rs17620	T	C	2002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=52;PP=1262;SC=GGCTCCAGGATGTTCTGATCT;SOR=2.964;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=12;TCR=52;TR=64;WE=23060264;WS=23060246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr8	23104195	rs2294123	G	T	303.10	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=253;ReadPosRankSum=-0.380;SC=AGCCTTGCCGGGGCTGGGGTT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=11;WE=23104203;WS=23104185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr8	23106665	rs2280934	A	G	701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=3;PP=541;SC=GGAGCTAGAGACTGGAATGGG;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=23106673;WS=23106655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr8	23113908	rs4439140	G	A	638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=2;PP=479;SC=CACCACCAGCGCTCCTGGTTG;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=23113916;WS=23113898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr8	23116429	rs4478582	A	C	2586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.60;SOR=2.001;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr8	23116429	.	ACC	CCT	2586	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=41;NR=16;PP=2586;QD=20;SC=CTTTAACGAAACCTGACTTGT;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=59;TCF=42;TCR=17;TR=57;WE=23116439;WS=23116419;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,57:0.97:59
chr8	23116431	rs4872098	C	T	2586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.11;SOR=2.080;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr8	23116675	rs13260347	A	T	219.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.47;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr8	23117643	rs2294125	T	C	3461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.067;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=44;PP=2318;ReadPosRankSum=0.483;SC=CTTTATGTTGTCTTTTCTTTC;SOR=1.000;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=116;TCF=71;TCR=45;TR=115;WE=23117651;WS=23117633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,124:0.99:125
chr8	23118155	rs9828	T	C	6924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=131;PP=2965;SC=GAGACCAGGCTTGCTGGGTGT;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=228;TCF=96;TCR=132;TR=227;WE=23118163;WS=23118145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr8	23152410	rs137952235	CTG	C	153.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQRankSum=3.203;QD=1.16;ReadPosRankSum=0.091;SOR=0.591;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,22:0.17:133
chr8	23167353	rs1063582	T	G	5293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=97;NR=76;PP=2965;SC=CACTGCAGCATGAACATGGGC;SOR=0.745;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=173;TCF=97;TCR=76;TR=173;WE=23167361;WS=23167343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr8	23167560	rs12548642	T	C	1259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=33;PP=1030;SC=TCCTCAAGGTTACCTTCTTGT;SOR=2.726;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=9;TCR=33;TR=42;WE=23167568;WS=23167550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr8	23174425	rs3824213	T	C	808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=0;PP=627;SC=CTGGTCCCCTTGGGAGCCCGG;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=23174433;WS=23174415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr8	23174481	rs7357444	G	A	2000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=16;PP=1384;SC=AGGCAACTCCGGCCCCGTACT;SOR=2.269;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=49;TCR=16;TR=65;WE=23174489;WS=23174471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr8	23174748	rs13250587	A	G	2157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=52;PP=1575;SC=TTCAGATCGAAACAGCACGGA;SOR=2.472;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=16;TCR=52;TR=68;WE=23174756;WS=23174738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr8	23177619	rs13254579	C	A	2257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=52;PP=1454;SC=GAGCTTCCCCCCTACGCTGCC;SOR=1.952;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=23;TCR=52;TR=75;WE=23177627;WS=23177609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr8	23186007	rs1051146	T	C	5048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=91;NR=76;PP=2888;SC=CGGTCCCCCATTCTCCATTTT;SOR=0.704;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=167;TCF=91;TCR=76;TR=167;WE=23186015;WS=23185997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr8	23191153	rs73224454	G	A	1850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=41;PP=1233;SC=ACGATGGGAGGGGACAGGGGA;SOR=1.508;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=24;TCR=41;TR=65;WE=23191161;WS=23191143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr8	23225745	rs2294133	C	T	5210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=71;PP=2801;SC=ACTCAGGAGCCGGTTGCTGGA;SOR=0.779;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=156;TCF=85;TCR=71;TR=156;WE=23225753;WS=23225735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr8	23261651	rs6989053	C	A	3196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=44;NR=58;PP=1632;SC=CTCTTTTCCCCCTTACTTTTA;SOR=1.160;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=44;TCR=58;TR=102;WE=23261659;WS=23261641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr8	23282441	rs11276760	GCATTATACAA	G	8242.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=56;PP=2940;SC=TAACATAATGGCATTATACAA;SOR=1.333;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=37;TCR=61;TR=90;WE=23282458;WS=23282431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr8	23290451	rs17089244	C	T	2633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=31;PP=1588;SC=ACAAGGTCCCCGGGGCATTCT;SOR=0.929;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=50;TCR=31;TR=81;WE=23290459;WS=23290441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr8	23292985	rs3736652	A	G	3607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=63;NR=50;PP=1704;SC=TTGTTGCACAATAATCCTGAA;SOR=0.752;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=63;TCR=50;TR=113;WE=23292993;WS=23292975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr8	23301340	rs11787224	A	C	8462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=166;NR=111;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.975;SC=CCCAAATTTTAAACTGAAGAC;SOR=1.036;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=279;TCF=167;TCR=112;TR=277;WE=23301348;WS=23301330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,308:0.99:310
chr8	23302164	rs2272640	A	G	2563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=58;PP=1692;SC=TATTTTAGCTATAACATGTGA;SOR=2.007;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=22;TCR=58;TR=80;WE=23302172;WS=23302154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr8	23307580	rs11777391	G	T	2048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=44;PP=1294;SC=CTTTAAGTGTGTGCTTAAATC;SOR=1.810;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=22;TCR=44;TR=66;WE=23307588;WS=23307570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr8	23423669	rs2942194	A	G	6276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=117;NR=102;PP=2965;SC=GTACACAAGTATCTACGGAGC;SOR=0.782;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=219;TCF=117;TCR=102;TR=219;WE=23423677;WS=23423659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr8	23423758	rs10992	G	A	8062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=136;NR=127;PP=2965;SC=GTGCAGGGCCGGCCCATGCCA;SOR=0.749;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=264;TCF=137;TCR=127;TR=263;WE=23423766;WS=23423748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,292:1.00:292
chr8	23432326	rs1398232	T	A	1778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=47;PP=1281;SC=CAGTGTAACCTTTGCACGTAC;SOR=3.804;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=6;TCR=47;TR=53;WE=23432334;WS=23432316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr8	23540417	rs11781886	C	T	1249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=29;PP=893;SC=GCGGCCCCGCCTTGGCCTGAA;SOR=1.414;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=18;TCR=29;TR=47;WE=23540425;WS=23540407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr8	23560648	rs35373423	G	A	228.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=6;PP=144;SC=TCACCTGAGCGGTTCCTACTT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=23560656;WS=23560638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr8	23702587	rs1992053	C	T	1671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=30;PP=909;SC=ATGGTGGTCACCCAGTGAGAG;SOR=1.292;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=21;TCR=30;TR=51;WE=23702595;WS=23702577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
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chr8	24208649	rs10092862	C	T	712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=1;PP=571;SC=AAGAAAGACACAATGGGAAAA;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=24208657;WS=24208639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr8	24208934	rs5012230	C	A	2781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=55;PP=1691;SC=TTTGCAGTAACACATTCAGAA;SOR=1.473;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=34;TCR=55;TR=89;WE=24208942;WS=24208924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr8	24211278	rs7815643	C	T	3905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=74;NR=52;PP=2157;SC=TTATAATTAACGTAGCATAAA;SOR=0.963;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=74;TCR=52;TR=126;WE=24211286;WS=24211268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr8	24211331	rs7814768	G	A	4944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=85;NR=79;PP=2597;SC=GGATAATCCAGTGTCTACACC;SOR=0.781;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=164;TCF=85;TCR=79;TR=164;WE=24211339;WS=24211321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr8	24211884	rs10694022	A	ATGTC	2269.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.011;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=18;PP=1391;ReadPosRankSum=-1.252;SC=TTTAGAAGTTATGTCTTTTTT;SOR=1.340;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=48;TCF=26;TCR=22;TR=43;WE=24211897;WS=24211874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,73:0.95:77
chr8	24211993	rs10610134	ACTAT	A	3109.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.197;NF=9;NR=58;PP=2973;ReadPosRankSum=-0.438;SC=AGAGAAATATACTATCTATCT;SOR=0.960;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=71;TCF=9;TCR=62;TR=67;WE=24212004;WS=24211983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,116:0.98:118
chr8	24247556	rs4872231	A	G	1099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=25;NR=13;PP=654;SC=ATAAACATACATAATATAATA;SOR=1.364;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=39;TCF=26;TCR=13;TR=38;WE=24247564;WS=24247546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr8	24256470	rs2291577	C	T	7996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=134;NR=131;PP=2965;SC=TGGTGCCCAGCGCAAGCACCA;SOR=0.762;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=267;TCF=135;TCR=132;TR=265;WE=24256478;WS=24256460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,300:1.00:300
chr8	24257137	rs17799264	T	C	543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=14;PP=387;SC=GCACTGAAGATCCCTTGGGTT;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=24257145;WS=24257127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr8	24261526	rs3765124	A	G	8299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=135;NR=128;PP=2965;SC=GAGTGTACCAATCTCTGCTGT;SOR=0.739;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=263;TCF=135;TCR=128;TR=263;WE=24261534;WS=24261516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,309:1.00:309
chr8	24261653	.	G	T	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.210;ClippingRankSum=0.000;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=1.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.45;ReadPosRankSum=-2.398;SOR=0.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,28:0.25:112
chr8	24321224	rs75467777	G	C	1299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=9;PP=869;SC=TGATATTTAAGTAGAAAGGCT;SOR=2.636;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=39;WE=24321232;WS=24321214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr8	24333601	rs10100176	G	A	1133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=25;PP=730;SC=AGCTTTAATAGGTTTGTTTCA;SOR=2.133;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=35;WE=24333609;WS=24333591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr8	24339679	rs13255694	G	A	1403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=29;NR=13;PP=681;SC=AAACATCCATGTGACGTTGGT;SOR=1.244;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=29;TCR=13;TR=42;WE=24339687;WS=24339669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr8	24339896	rs11348969	GA	G	826.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.26;NF=1;NR=21;PP=489;SC=AAAATTAACAGAAAAAAAACA;SOR=2.093;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=22;WE=24339904;WS=24339886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr8	24348221	rs1492401	T	A	2104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=11;PP=1508;SC=TTTAACTCTATCAGAATCCAC;SOR=3.073;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=53;TCR=11;TR=64;WE=24348229;WS=24348211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr8	24348241	rs2242354	A	G	3391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=24;PP=2387;SC=CAGAAGCACAACTAATTAATT;SOR=2.411;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=78;TCR=24;TR=102;WE=24348249;WS=24348231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr8	24356818	rs13259668	A	C	4165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=64;PP=2469;SC=CTCTCAGTGCAATGAAAATCC;SOR=0.733;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=135;TCF=71;TCR=64;TR=135;WE=24356826;WS=24356808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
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chr8	24358219	rs17739399	A	G	4313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.718;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=44;PP=2571;ReadPosRankSum=-1.208;SC=AATAAGGAGCATTGTAACAGC;SOR=1.430;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=143;TCF=98;TCR=45;TR=141;WE=24358227;WS=24358209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,162:0.99:163
chr8	24359068	rs13277171	G	A	4153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=80;PP=2548;SC=AGCCAATCCTGCCAGAAATTC;SOR=0.952;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=148;TCF=67;TCR=81;TR=147;WE=24359076;WS=24359058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr8	24359125	rs3071035	ATT	A	1541.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.16;QD=33.52;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr8	24363792	rs6982442	G	A	809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=18;PP=518;SC=ATAGCTCTCTGATCGGAGGTA;SOR=2.147;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=25;WE=24363800;WS=24363782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr8	24365157	rs34338646	TCA	T	1783.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;MQ=60.21;NF=2;NR=27;PP=1335;SC=TCTGTACTTATCACAACAGAT;SOR=2.780;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=29;WE=24365166;WS=24365147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr8	24365181	rs11307556	AT	A	324.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.04;ReadPosRankSum=-1.506;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,17:0.94:18
chr8	24366020	rs2290150	T	C	3841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=41;PP=2574;SC=ACAGATTTCATAGGAAACAAT;SOR=1.627;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=127;TCF=86;TCR=41;TR=127;WE=24366028;WS=24366010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr8	24774683	rs196864	C	A	6892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=115;NR=104;PP=2965;SC=GATTCAGAAACCCAAGGTGGA;SOR=0.774;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=220;TCF=116;TCR=104;TR=219;WE=24774691;WS=24774673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr8	24811064	rs11300136	AG	A	2401.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=17;PP=1068;SC=TCTCCTTCAGAGGGGGGGCTC;SOR=1.552;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=45;TCF=26;TCR=19;TR=38;WE=24811073;WS=24811054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr8	25132735	rs4478580	T	A	245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=2;PP=183;SC=CACCATGCTTTTGTGGAGGTA;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=25132743;WS=25132725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr8	25154316	rs147718001	GTA	G	41.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=95;ReadPosRankSum=-0.259;SC=GATGAGGCAGGTATATATATA;SOR=0.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=3;WE=25154325;WS=25154306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr8	25156296	rs2956656	T	G	487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=1;PP=384;SC=GCCCAGGCTGTTCTCAAATTC;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=25156304;WS=25156291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr8	25158026	rs2709639	G	A	3927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=88;NR=43;PP=2245;SC=AGTCTATACTGAGGGTAGCCT;SOR=1.233;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=131;TCF=88;TCR=43;TR=131;WE=25158034;WS=25158016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr8	25158072	rs5890219	AT	A	6947.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.233;NF=41;NR=81;PP=2356;ReadPosRankSum=-1.751;SC=ATTAAGAGCAATTTTTTTTTC;SOR=0.627;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=135;TCF=44;TCR=91;TR=122;WE=25158080;WS=25158062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,262:0.99:265
chr8	25159665	rs868335	T	C	816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=3;PP=649;SC=AAGTCATGTTTTCTGATGCCA;SOR=3.098;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=25;WE=25159673;WS=25159655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr8	25159744	rs73216266	C	T	4153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=94;NR=54;PP=2523;SC=GAAATAAGGTCGGAACAGGAT;SOR=1.208;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=94;TCR=54;TR=148;WE=25159752;WS=25159734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr8	25159885	rs907157	G	A	4254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=70;NR=69;PP=2552;SC=TCAGCCTTGTGTGCCAGATTG;SOR=0.758;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=70;TCR=69;TR=139;WE=25159893;WS=25159875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr8	25160084	rs2709638	CA	TG	511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=8;PP=405;SC=TGCCCTGCTTCAAAACAATCA;SOR=3.611;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=25160093;WS=25160074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr8	25181356	rs2666174	C	T	1879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=14;PP=1279;SC=GTCTTTCTGCCTTTTCAGCCA;SOR=1.911;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=47;TCR=14;TR=61;WE=25181364;WS=25181346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr8	25200148	rs10110351	A	G	494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=15;PP=417;SC=TGCATGCTGAAATGACAGCCC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=25200156;WS=25200138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr8	25202915	rs2468901	A	G	2673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=16;PP=1758;SC=CTGGTCGAGGAAGAGTTGCAG;SOR=2.252;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=64;TCR=16;TR=80;WE=25202923;WS=25202905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr8	25203022	rs2468902	A	G	7903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=144;NR=136;PP=2965;SC=CACTGCTGACAGACCAGCTCA;SOR=0.706;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=280;TCF=144;TCR=136;TR=280;WE=25203030;WS=25203012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,304:1.00:304
chr8	25209144	rs7012335	A	G	4313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=92;NR=39;PP=2750;SC=TTGTAGGGAAAAGCCAAAAAG;SOR=1.625;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=131;TCF=92;TCR=39;TR=131;WE=25209152;WS=25209134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr8	25224513	rs77675545	GG	TT	8379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=95;PP=2947;SC=AGTTAAGATCGGGAAGGGGCT;SOR=1.280;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=152;TCF=56;TCR=96;TR=149;WE=25224522;WS=25224503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr8	25227229	rs2048083	T	G	666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.04;SOR=3.500;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr8	25227234	rs2048082	A	G	561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.81;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr8	25227255	rs2659578	C	T	102.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=69;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=76;SC=TGAGTAGTCTCAGAGTCACTA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=25227263;WS=25227245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr8	25230168	rs2271108	C	T	5236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=94;NR=81;PP=2869;SC=ACCTGCTGGACTATAGAACCA;SOR=0.723;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=175;TCF=94;TCR=81;TR=175;WE=25230176;WS=25230158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr8	25230267	rs2271106	T	C	2142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=28;NR=38;PP=1153;SC=GATGGGAGGGTACTGTCAGGC;SOR=1.236;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=28;TCR=38;TR=66;WE=25230275;WS=25230257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr8	25231044	rs12676152	T	G	590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=1;PP=487;SC=AAGTGAAACTTTTGAAAAGCA;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=25231052;WS=25231034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr8	25231117	rs3215159	C	CT	2911.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=23;PP=1275;ReadPosRankSum=1.771;SC=TTCTGTGATCCTTTTTTTTCC;SOR=0.783;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=76;TCF=50;TCR=26;TR=66;WE=25231125;WS=25231107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:5,109:0.96:114
chr8	25231385	rs2271105	T	C	2448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=62;PP=1830;SC=TGAGGTCATGTCAGGGATCAG;SOR=2.891;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=14;TCR=62;TR=76;WE=25231393;WS=25231375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr8	25234858	rs2659585	A	G	6788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=126;NR=98;PP=2965;SC=TTGCTTCAGAAGGACAGTTAC;SOR=0.880;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=225;TCF=126;TCR=99;TR=224;WE=25234866;WS=25234848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr8	25235055	rs34962551	T	C	2919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=67;PP=1764;SC=TTCAGGGCACTGTCTCCAACG;SOR=1.631;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=104;TCF=37;TCR=67;TR=103;WE=25235063;WS=25235045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr8	25237801	rs11989035	T	C	4239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=87;NR=55;PP=2539;SC=ACTTTTAACCTTACTTTCCTT;SOR=1.129;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=142;TCF=87;TCR=55;TR=142;WE=25237809;WS=25237791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr8	25237963	rs17053525	A	G	4406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=78;PP=2577;SC=TAAAATTAGCACTCATGAAAA;SOR=0.978;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=148;TCF=70;TCR=78;TR=148;WE=25237971;WS=25237953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr8	25246481	rs2709602	G	A	157.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=2;PP=110;SC=TAGATTTTCAGTGAGAACTTG;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=25246489;WS=25246471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr8	25247821	rs113940021	TA	T	100.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=3.337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.40;ReadPosRankSum=1.205;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,12:0.29:42
chr8	25257531	rs3763520	A	G	3507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=75;PP=2250;SC=GCTTTCCTCTACACTCCCAGG;SOR=1.536;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=41;TCR=75;TR=116;WE=25257539;WS=25257521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr8	25267622	rs2709618	A	G	6348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=120;NR=101;PP=2965;SC=TAGGCTCCCCATCGTTGCAGA;SOR=0.750;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=221;TCF=120;TCR=101;TR=221;WE=25267630;WS=25267612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr8	25280666	rs2709608	A	C	3609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=32;PP=2159;SC=TAAATTGAATAAAATCACTAT;SOR=1.434;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=78;TCR=32;TR=110;WE=25280674;WS=25280656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr8	25287556	rs965130	A	G	3234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=55;PP=1817;SC=TTTCTGCTCAAAATGATTTCT;SOR=0.950;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=106;TCF=51;TCR=55;TR=106;WE=25287564;WS=25287546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr8	25317691	rs6987936	A	T	3766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=38;PP=2368;SC=TGAATAAGGTACGTGATCGAA;SOR=1.719;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=122;TCF=84;TCR=38;TR=122;WE=25317699;WS=25317681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr8	25323777	rs10108752	T	C	3794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=59;PP=1927;SC=TAAAGGAAAATGAGAAAATGA;SOR=0.749;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=68;TCR=59;TR=127;WE=25323785;WS=25323767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr8	25365278	rs8537	G	A	1471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=35;PP=1027;SC=CAGAGTCTGTGGCAAGAGGGA;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=12;TCR=35;TR=47;WE=25365286;WS=25365268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr8	25744257	rs6557865	G	A	5184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=69;PP=2807;SC=TCTTGGAATCGTTTTCTCACC;SOR=0.887;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=168;TCF=99;TCR=69;TR=168;WE=25744265;WS=25744247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr8	25766097	rs34200265	A	AT	3335.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=41;PP=1841;SC=GATGTGTTACATTTTTCAGTA;SOR=1.211;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=61;TCF=8;TCR=53;TR=48;WE=25766105;WS=25766087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr8	25890478	rs1872497	G	C	1686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=15;PP=1084;SC=TGTTGGATGAGCTTAGTGACT;SOR=1.649;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=36;TCR=15;TR=51;WE=25890486;WS=25890468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr8	25898565	rs1982768	A	C	4664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=75;NR=82;PP=2782;SC=CAGCCCCCCAAAATGAGGGAA;SOR=0.904;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=157;TCF=75;TCR=82;TR=157;WE=25898573;WS=25898555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr8	26223857	rs34109536	C	T	2727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=50;NR=39;PP=1436;SC=GAAGTAAACTCTGTTCACTGT;SOR=0.770;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=50;TCR=39;TR=89;WE=26223865;WS=26223847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr8	26240646	rs1055479	A	G	8403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=165;NR=128;PP=2965;SC=GCTGTCCGACAATGTCGTCCC;SOR=0.924;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=293;TCF=165;TCR=128;TR=293;WE=26240654;WS=26240636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,324:1.00:324
chr8	26249018	rs2304300	G	A	1908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=48;PP=1289;SC=GGAAAAATCTGTTTGCTTAAA;SOR=2.235;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=17;TCR=48;TR=65;WE=26249026;WS=26249008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr8	26363027	rs2197181	C	T	1221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=33;PP=910;SC=GTGGTGCTACCGCTTTTAAAA;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=6;TCR=33;TR=39;WE=26363035;WS=26363017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr8	26481771	rs327222	T	C	3653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=67;PP=2009;SC=TGGACATCAGTGAGTGGCATA;SOR=1.038;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=58;TCR=67;TR=125;WE=26481779;WS=26481761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr8	26483998	rs141711514	AACACACAC	A,AAC	374.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;QD=26.77;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,5,9:0.36,0.64:14
chr8	26484064	rs4872457	T	G	2637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=23;PP=1771;ReadPosRankSum=-1.582;SC=GTATTATCACTTTCTTATCCC;SOR=0.925;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=94;TCF=71;TCR=23;TR=93;WE=26484072;WS=26484054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,102:0.99:103
chr8	26492529	rs76617667	C	T	495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=14;PP=363;SC=GGGCCACTTGCACCATGTTCT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=26492537;WS=26492519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr8	26510792	rs708621	T	C	5338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=99;NR=78;PP=2826;ReadPosRankSum=1.884;SC=ATGACGGACCTGTGTGTGAAG;SOR=0.299;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=178;TCF=100;TCR=78;TR=177;WE=26510800;WS=26510782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,203:1.00:204
chr8	26716472	rs536401	A	G	979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=5;PP=778;SC=CCTTAGTGGAAAGAAGCTTGG;SOR=3.477;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=32;WE=26716480;WS=26716462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr8	26906433	rs150141473	TTAAAG	T	6459.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=37;PP=2979;SC=CGTAAAGTAATTAAAGTAATG;SOR=1.934;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=52;TCR=42;TR=82;WE=26906445;WS=26906423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr8	26943929	rs1814489	T	C	559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=16;PP=441;SC=CGCGGAGGCTTACCCCTGTAA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=26943937;WS=26943919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr8	26944600	rs2028908	A	G	3069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=26;PP=1983;SC=CCAATGACAAAGCCATTATTC;SOR=1.970;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=69;TCR=26;TR=95;WE=26944608;WS=26944590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr8	27094548	rs10217008	A	G	1802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=20;NR=37;PP=1118;SC=CTCTGTCTGCAAAGGCATCCC;SOR=1.539;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=20;TCR=37;TR=57;WE=27094556;WS=27094538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr8	27096634	rs1542185	C	T	2567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=30;PP=1534;SC=CCAGGGCCTACGCAACATTCA;SOR=1.190;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=54;TCR=30;TR=84;WE=27096642;WS=27096624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr8	27099879	rs3739212	C	T	2868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=24;PP=1866;SC=CAGGGCCCCCCCGCCCCTCAC;SOR=1.945;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=65;TCR=24;TR=89;WE=27099887;WS=27099869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr8	27101204	rs4733040	T	A	5798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.95;SOR=1.196;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr8	27101204	.	TTA	ATC	1816	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;FR=1.0000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=69;NR=42;PP=1816;QD=16.8420529267;SC=CCTACGCCCCTTAACACATGG;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=72;TCR=44;TR=111;WE=27101214;WS=27101194;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,111:0.96:116
chr8	27101206	rs7830662	A	C	5798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.61;SOR=1.170;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr8	27147716	rs12386801	A	C	2877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=49;NR=44;PP=1561;SC=AAAAATAAAAAAATAACACAG;SOR=0.769;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=49;TCR=44;TR=93;WE=27147724;WS=27147706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr8	27204598	rs4534095	A	G	5391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=75;NR=98;PP=2965;SC=TGCCATCTTAAAAAGTCATGG;SOR=1.150;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=174;TCF=76;TCR=98;TR=173;WE=27204606;WS=27204588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr8	27204663	rs2874826	A	G	1143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=30;PP=825;SC=GGAGGCCAAAACGGGTGGATC;SOR=3.500;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=35;WE=27204671;WS=27204653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr8	27204857	rs4629818	A	G	1322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=36;NR=12;PP=806;SC=AGATCCACCCACCTCGGCCTC;SOR=1.848;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=36;TCR=12;TR=48;WE=27204865;WS=27204847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr8	27255080	rs1128433	A	G	260.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=0;PP=222;SC=CAATGTGCCGATCTTAGCTGC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=27255088;WS=27255070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr8	27255128	rs1045510	T	C	896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=23;NR=8;PP=542;SC=AGCCCCTGAGTCGAGTAAAGT;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=31;WE=27255136;WS=27255118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr8	27255146	rs1045511	G	A	1268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=29;NR=13;PP=713;SC=AGTTGGGCACGTTACGCCGGC;SOR=1.514;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=29;TCR=13;TR=42;WE=27255154;WS=27255136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr8	27255263	rs1045512	A	G	4358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=72;NR=69;PP=2430;SC=ATCCTGGGAAAAACTTCAAAC;SOR=0.743;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=141;TCF=72;TCR=69;TR=141;WE=27255271;WS=27255253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr8	27255325	rs2241650	C	T	2091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=62;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=39;PP=1017;SC=AAGTGTCTGCCCTGTCCATCT;SOR=1.150;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=67;TCF=28;TCR=39;TR=67;WE=27255333;WS=27255315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr8	27255368	rs11267627	AGCAGCTCTCCTGCAGCCTC	A	1033.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=2974;SC=TGGGCAGCTGAGCAGCTCTCC;SOR=2.925;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=11;WE=27255394;WS=27255358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr8	27279705	rs2241652	G	A	1440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.40;SOR=2.448;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr8	27288314	rs56373327	T	C	1239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=3;PP=1033;SC=CAGTGGGCAGTCTCTCAGCGA;SOR=4.514;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=40;TCF=37;TCR=3;TR=40;WE=27288322;WS=27288304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr8	27291557	rs919493	T	C	3516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=42;PP=1964;SC=CAGTCACCCATCCAGGTCCCT;SOR=0.945;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=70;TCR=42;TR=112;WE=27291565;WS=27291547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr8	27292287	rs1896959	A	G	958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=26;PP=736;SC=GGGAGGCCAAAGTGGATGGAT;SOR=3.477;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=29;WE=27292295;WS=27292277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr8	27294532	rs2163176	C	G	2844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=72;NR=21;PP=2093;SC=GGAGAAAGGGCCCTTTCCTGG;SOR=2.327;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=72;TCR=21;TR=93;WE=27294540;WS=27294522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr8	27294823	rs6996922	T	C	6270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=111;NR=82;PP=2965;SC=GAGGAGGGGTTCCCGTCCTCC;SOR=1.085;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=194;TCF=112;TCR=82;TR=193;WE=27294831;WS=27294813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr8	27295109	rs2288617	A	G	598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=17;PP=502;SC=TCTGTGTTCCACTGAAATAAG;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=27295117;WS=27295099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr8	27297696	rs2241657	T	C	2429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=15;PP=1823;SC=CGATGGTGCTTCTGGGTGGGA;SOR=2.642;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=62;TCR=15;TR=77;WE=27297704;WS=27297686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr8	27303126	rs4733064	A	G	348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=0;PP=255;SC=GAGAGGCTGCACTGCTCCACC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=27303134;WS=27303116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr8	27308585	rs751019	A	C	3941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=68;NR=67;PP=2028;SC=ATGAATGATAAGTCCCCATTG;SOR=0.789;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=135;TCF=68;TCR=67;TR=135;WE=27308593;WS=27308575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr8	27310546	rs3735758	A	G	443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=3;PP=347;SC=GTAGAGGGGAAGGGGCTCATT;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=27310554;WS=27310536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr8	27311703	rs1879184	T	C	2758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=47;NR=54;PP=1566;SC=TGGACCGGACTGATGACCTGG;SOR=0.961;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=101;TCF=47;TCR=54;TR=101;WE=27311711;WS=27311693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr8	27315726	rs1879183	T	C	1177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=28;NR=13;PP=808;SC=TTGGCCAGCATGCAGGTGGAC;SOR=1.556;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=28;TCR=13;TR=41;WE=27315734;WS=27315716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr8	27315876	rs1879182	A	G	2899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=48;PP=1693;SC=TGCGGCTGGCACAGCAGAACG;SOR=0.729;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=49;TCR=48;TR=97;WE=27315884;WS=27315866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr8	27315900	rs1879181	A	G	2398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=41;PP=1452;SC=TGACCTCCCTAAGTGAGGAGT;SOR=0.987;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=32;TCR=41;TR=73;WE=27315908;WS=27315890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr8	27321597	rs3735757	G	C	319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=8;PP=244;SC=AGGGGAACCCGAAGAACCAAG;SOR=1.802;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=27321605;WS=27321587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr8	27328354	rs2472554	G	C	666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=5;PP=422;SC=CTCCACCTCTGCCAGTGGAAA;SOR=1.802;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=21;WE=27328362;WS=27328344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr8	27358495	rs139234214	C	T	4327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=89;PP=2762;SC=TGCCACTACCCGGCTTATGAA;SOR=1.379;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=55;TCR=89;TR=144;WE=27358503;WS=27358485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr8	27369334	rs7816586	A	G	4384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=53;PP=2709;SC=CTCTCTCACTATACCTTTCCT;SOR=1.339;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=91;TCR=53;TR=144;WE=27369342;WS=27369324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr8	27436236	rs140683899	GTTTGT	G	944.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.24;QD=42.94;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr8	27456253	rs2279590	T	C	1492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=36;PP=1003;SC=TCCTCCTGCTTCTCCAAGGAA;SOR=2.437;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=12;TCR=36;TR=48;WE=27456261;WS=27456243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr8	27462008	rs28541694	C	G	1879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=37;PP=1178;SC=TTTTAATTTACAGACAGGGTC;SOR=1.445;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=59;TCF=22;TCR=37;TR=59;WE=27462016;WS=27461998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr8	27462481	rs7982	A	G	4650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=56;PP=2822;SC=AGGCCGGGCTATGGAAGTGGA;SOR=1.112;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=154;TCF=98;TCR=56;TR=154;WE=27462489;WS=27462471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr8	27467821	rs2070926	C	G	789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=0;PP=613;SC=CCAGGGGCCTCGGAGCTGAGG;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=27467829;WS=27467813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr8	27491654	rs472707	C	G	3413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=73;NR=46;PP=1904;SC=CGCCGGCCGCCCGGCTCCACT;SOR=1.033;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=73;TCR=46;TR=119;WE=27491662;WS=27491644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr8	27507374	rs482078	C	T	4486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=78;PP=2663;SC=TCCCTGTCTCCATCCCCAGGC;SOR=0.948;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=69;TCR=78;TR=147;WE=27507382;WS=27507364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr8	27509153	rs2246847	G	A	3713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=68;NR=53;PP=1958;SC=GGGTGAGTCCGGGGCTTTCCC;SOR=0.783;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=68;TCR=54;TR=121;WE=27509161;WS=27509143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr8	27593650	rs10081527	T	C	207.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=132;SC=GTATTTTATATTTCAGAACAC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=7;WE=27593658;WS=27593640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr8	27598172	rs7842672	A	G	1113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=29;PP=807;SC=TAATCTCTGCACTCAAGGAGA;SOR=3.797;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=31;WE=27598180;WS=27598162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr8	27609830	rs4732744	A	G	919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=2;PP=784;SC=CAAAATGACAAGGGTGGGGAG;SOR=4.479;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=28;WE=27609838;WS=27609823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr8	27614138	rs2280884	A	G	423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=2;PP=298;SC=TTTGCGTACCAACTTATTACT;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=27614146;WS=27614128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr8	27630152	rs7842666	G	A	1432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=29;PP=834;SC=CCTGGCCCCCGGAACTCCTCC;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=20;TCR=29;TR=49;WE=27630160;WS=27630142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr8	27641609	rs1824449	G	A	4392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=69;NR=81;PP=2618;SC=TCCAAGCCTTGTAAATTATAC;SOR=0.951;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=151;TCF=69;TCR=82;TR=150;WE=27641617;WS=27641599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr8	27641706	rs145374594	TATTG	T	1164.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=21;PP=1064;SC=AGGAGAATAATATTGAGAATA;SOR=2.753;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=22;WE=27641717;WS=27641696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr8	27645704	rs6558014	C	T	1236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=35;PP=1060;SC=TTCCTGCACTCTATTTTTTGT;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=35;WE=27645712;WS=27645694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr8	27649426	rs11402833	G	GT	2051.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-1.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;MQRankSum=0.239;NF=32;NR=12;PP=700;ReadPosRankSum=-1.196;SC=TTTAATGTTGGTTTTTTTTCC;SOR=1.080;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=58;TCF=38;TCR=20;TR=44;WE=27649434;WS=27649416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,75:0.99:76
chr8	27661066	rs144484866	T	TAC	317.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.944;NF=1;NR=9;PP=474;ReadPosRankSum=-0.796;SC=CTCACACTCATACACACACAC;SOR=1.473;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=10;WE=27661074;WS=27661056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,11:0.85:13
chr8	27729713	rs11776426	G	A	1675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=41;PP=1126;SC=GCTTCCAGCTGCCCTCTCCAC;SOR=1.812;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=17;TCR=41;TR=58;WE=27729721;WS=27729703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr8	27737198	rs4732610	A	G	8314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=140;NR=150;PP=2965;SC=CGGTGCCCCAACGCCGGTCGT;SOR=0.807;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=290;TCF=140;TCR=150;TR=290;WE=27737206;WS=27737188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,313:1.00:313
chr8	27743535	rs2685381	T	C	4566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=83;PP=2261;SC=TACCATGCATTGAGCAAAGTC;SOR=0.992;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=154;TCF=71;TCR=83;TR=154;WE=27743543;WS=27743525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr8	27762235	rs2726984	T	C	872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=6;PP=539;SC=TGGGGCTGCTTGGGGGACAGC;SOR=1.536;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=26;WE=27762243;WS=27762225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr8	27762537	rs939706	A	G	1093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=28;PP=801;SC=TGGGTACCCCAAGAAGGAGGA;SOR=3.026;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=34;WE=27762545;WS=27762527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr8	27764627	rs2726987	T	C	6797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=124;NR=110;PP=2965;SC=TGCCTGGGACTGGTGGTGAGG;SOR=0.724;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=234;TCF=124;TCR=110;TR=234;WE=27764635;WS=27764617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr8	27767171	rs2726991	G	A	4919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=81;PP=2965;SC=CCAGGGGCACGCTCATTACCT;SOR=0.715;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=167;TCF=86;TCR=81;TR=167;WE=27767179;WS=27767161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr8	27767305	rs2726992	A	G	3266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=59;PP=2037;SC=CTCCCTTCTGAAACAGGACCA;SOR=1.034;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=109;TCF=50;TCR=59;TR=109;WE=27767313;WS=27767295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr8	27767339	rs2726993	C	T	2374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=29;NR=46;PP=1348;SC=GGAAACAAAACGCCCTCTCTG;SOR=1.504;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=29;TCR=46;TR=75;WE=27767347;WS=27767329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr8	27779545	rs10103504	C	T	5500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=108;NR=83;PP=2965;SC=GCAGCCCCCACAGCGCGCCCT;SOR=0.946;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=191;TCF=108;TCR=83;TR=191;WE=27779553;WS=27779535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr8	27779811	rs4732613	C	T	2759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=58;PP=1678;SC=GGAGGAAGGCCCCGGGTGACA;SOR=1.540;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=33;TCR=58;TR=91;WE=27779819;WS=27779801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr8	27779880	rs61455593	T	TA	636.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=3;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=12;PP=426;SC=GATAGACGAATAAAATCACAG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=12;WE=27779893;WS=27779870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr8	27779885	rs59195507	T	G	645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=231;SC=ACGAATAAAATCACAGGTGGT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=27779893;WS=27779870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr8	27898452	rs12675621	A	G	705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=1;PP=485;SC=ATGAGCCGCCATGCCCGGCCC;SOR=3.611;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=23;WE=27898460;WS=27898442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr8	27903069	rs13279787	C	T	859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=390;ReadPosRankSum=-1.235;SC=GGAGTTGAAACTATCTGTGAG;SOR=1.085;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=26;WE=27903077;WS=27903059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,34:0.94:36
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chr8	27918057	rs7817227	T	C	5345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=82;PP=2699;SC=TTCGTGGGCTTGCCCCCCAGA;SOR=0.723;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=175;TCF=93;TCR=82;TR=174;WE=27918065;WS=27918047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
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chr8	27925204	rs4732620	T	C	3117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=58;PP=2125;SC=TCTTCTCTGCTCAGCTCCTCC;SOR=1.189;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=42;TCR=58;TR=100;WE=27925212;WS=27925194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr8	27927849	rs6998705	C	G	2015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=45;PP=1307;SC=TTTTCTCGTTCGTTCTTTATA;SOR=1.778;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=20;TCR=45;TR=65;WE=27927857;WS=27927839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr8	27931751	rs17058573	C	T	547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=0;PP=428;SC=AAACTTGTCACGAGAAAGCAC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=27931759;WS=27931741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr8	27931875	rs17058575	A	G	6937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.573;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=131;NR=90;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.680;SC=AGATACTGCAAAGATGTTACC;SOR=0.643;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=222;TCF=131;TCR=91;TR=221;WE=27931883;WS=27931865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,254:1.00:255
chr8	27932034	rs13255712	C	A	2726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=59;PP=1702;SC=AGAAAGCAAACCCTAAGGATG;SOR=1.784;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=28;TCR=59;TR=87;WE=27932042;WS=27932024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr8	28206275	rs1046511	G	C	6043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=99;PP=2965;SC=TCCACCGGCAGGCCGTGCACC;SOR=0.756;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=200;TCF=101;TCR=99;TR=200;WE=28206283;WS=28206265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr8	28210613	rs6558057	G	C	647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=4;PP=513;SC=AGGGTCCCCTGCTCTCCACGG;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=21;WE=28210621;WS=28210603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr8	28286174	rs1055741	T	G	4354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=59;PP=2904;SC=GGTGGCAGTGTCTGGGAGTCC;SOR=1.054;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=150;TCF=91;TCR=59;TR=150;WE=28286182;WS=28286164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr8	28588904	rs2071340	A	G	3944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=54;NR=73;PP=2504;SC=TTTAGGTTGCAAGTGACAGAA;SOR=1.101;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=128;TCF=54;TCR=74;TR=127;WE=28588912;WS=28588894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr8	28628715	.	A	AT	46.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=5.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.95;ReadPosRankSum=0.334;SOR=0.083;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,6:0.25:24
chr8	28633124	rs7462400	T	C	905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=2;PP=691;SC=CCACCTTGGCTGCCCAAAGTG;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=26;WE=28633132;WS=28633114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr8	28635303	rs11785319	G	C	1042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=12;PP=689;SC=GCCACACCAAGGTGACATGAC;SOR=1.670;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=27;TCR=12;TR=39;WE=28635311;WS=28635293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr8	28638223	rs241196	C	T	439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=1;PP=350;SC=TACAGTAGAACAATGTTTGTA;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=28638231;WS=28638213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr8	28645271	rs241187	C	T	4063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=32;PP=2493;SC=TTTCATCTAACGACCTGCTGT;SOR=1.778;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=128;TCF=96;TCR=32;TR=128;WE=28645279;WS=28645261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr8	28651297	.	A	AC	76.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=6.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.80;ReadPosRankSum=-0.170;SOR=0.069;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr8	28692783	rs28522383	C	T	4147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=55;PP=2361;SC=TACAGTCTCTCGGTAAGAGAG;SOR=0.980;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=134;TCF=79;TCR=55;TR=134;WE=28692791;WS=28692773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr8	28876221	rs7837237	T	C	3382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=37;PP=2197;SC=AAGTAGATGTTATATTGTTTT;SOR=1.476;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=112;TCF=74;TCR=38;TR=111;WE=28876229;WS=28876211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr8	28900087	rs1948132	T	C	2968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=31;PP=1971;SC=AAATGAGGGTTCCAGTTAAGG;SOR=1.565;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=66;TCR=31;TR=97;WE=28900095;WS=28900077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr8	28970865	rs1466627	C	G	112.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=0;PP=86;SC=AAAATCTATACCTTCCCTAAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=28970873;WS=28970861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr8	28979949	rs4732905	C	A	1888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=18;PP=1250;SC=TATGACACACCAATCAGTCCG;SOR=1.751;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=44;TCR=18;TR=62;WE=28979957;WS=28979939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr8	28981063	rs3750263	T	G	3654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=74;PP=2203;SC=CCATTTATCTTTTTGTCCTGA;SOR=1.301;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=47;TCR=74;TR=121;WE=28981071;WS=28981053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr8	28984572	rs3763566	G	A	1229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=31;NR=8;PP=828;SC=AGTTTCGTACGGGTTCCAAAA;SOR=2.356;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=31;TCR=8;TR=39;WE=28984580;WS=28984562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr8	28989771	rs112826611	CA	C	30.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.51;ReadPosRankSum=-0.556;SOR=0.501;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,10:0.17:60
chr8	28989789	rs9644054	T	C	2449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=55;NR=28;PP=1495;SC=AAATTACATATATATAAATGG;SOR=1.216;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=55;TCR=28;TR=83;WE=28989797;WS=28989779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr8	28997850	rs2279444	A	G	1227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=12;PP=975;SC=CAGTTACTCTACCCTAAGAGT;SOR=1.493;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=23;TCR=12;TR=35;WE=28997858;WS=28997847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr8	28998179	rs2246691	A	G	2040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=43;PP=1287;SC=AACCATTTACAATAAATGCAT;SOR=2.636;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=14;TCR=43;TR=57;WE=28998187;WS=28998169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr8	29005093	rs6986672	A	G	6379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=107;NR=104;PP=2965;SC=TGTTGTTCTAAGCTGTTTAAT;SOR=0.718;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=211;TCF=107;TCR=104;TR=211;WE=29005101;WS=29005083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr8	29005143	rs6986829	A	G	4170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=87;PP=2649;SC=TAAAAAAGATACATGATCGAG;SOR=1.294;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=52;TCR=87;TR=139;WE=29005151;WS=29005133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr8	29006063	rs34477845	T	C	190.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=0;PP=126;SC=CAACTGGAACTGATTCTCAAG;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=29006071;WS=29006053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr8	29023421	.	T	TTCGATTGTAGATCGAAGTACC	890.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.37;QD=42.42;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr8	29033422	rs6558098	C	T	607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=0;PP=425;SC=AAAAAACCTACGTTTATTCCA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=29033430;WS=29033412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr8	29053761	.	TAA	T,TA	1536.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=0.000;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=1.806;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.27;MQRankSum=0.410;QD=19.70;ReadPosRankSum=0.071;SOR=0.450;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:5,24,49:0.31,0.63:78
chr8	29923732	rs2271367	G	A	1463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=35;PP=936;SC=TTCCTAAACTGTCAGAAAAAA;SOR=2.540;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=11;TCR=35;TR=46;WE=29923740;WS=29923722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr8	29927300	rs6468093	C	G	4771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=68;PP=2913;SC=AGACTACAAACGCGATCCCAA;SOR=0.803;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=153;TCF=85;TCR=68;TR=153;WE=29927308;WS=29927290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr8	29927321	rs6468094	A	G	5437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=78;PP=2965;SC=GGAGTACCACAATGGTAATCA;SOR=0.819;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=180;TCF=102;TCR=78;TR=180;WE=29927329;WS=29927311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr8	29931375	rs986636	T	C	4316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=45;PP=2567;SC=AGACTGCCATTACTGTAGTGG;SOR=1.276;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=91;TCR=45;TR=136;WE=29931383;WS=29931365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr8	29935696	.	GA	G	249	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;FR=0.9992;HP=14;HapScore=2;MGOF=16;MMLQ=17;MQ=58.51;NF=14;NR=3;PP=249;QD=14.8823529412;SC=ACAGTAGGAGGAAAAAAAAAA;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=47;TCF=33;TCR=14;TR=17;WE=29935718;WS=29935686;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:30,17:0.36:47
chr8	29940271	rs13279112	A	G	730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=1;PP=535;SC=AGGCTCCGGGAAGACGGCGCA;SOR=3.352;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=29940279;WS=29940261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr8	29953256	rs56969689	C	T	831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=3;PP=550;SC=GGCTTCGCCCCGCAGCCCCCA;SOR=2.468;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=24;WE=29953264;WS=29953246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr8	29989399	rs13272159	G	A	2541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=11;PP=1645;SC=TTATCGATGCGTCATCTGGCA;SOR=2.888;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=62;TCR=11;TR=73;WE=29989407;WS=29989389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr8	29989564	rs7844812	A	G	8223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=140;NR=130;PP=2965;SC=GAGAGGAGAGACTCCTGACCT;SOR=0.740;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=270;TCF=140;TCR=130;TR=270;WE=29989572;WS=29989554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,303:1.00:303
chr8	29996158	rs4733141	A	G	1944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=33;PP=1095;SC=CTTGCTGAGGAGCCAGGGAAC;SOR=1.134;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=28;TCR=33;TR=61;WE=29996166;WS=29996148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr8	29996256	rs7813902	T	C	405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=10;PP=269;SC=CCTCCTCCAGTCAGGAGAAAG;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=29996264;WS=29996246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr8	30001915	rs12546113	T	G	1114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=6;PP=763;SC=GCCTCCCAAATTGCAGGGATT;SOR=2.774;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=34;WE=30001923;WS=30001905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr8	30013759	rs7012749	A	C	418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=13;NR=1;PP=338;SC=ACGCGACGCAAACAAGAGTCG;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=30013767;WS=30013749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr8	30494772	rs2978266	T	C	4536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=77;PP=2373;ReadPosRankSum=-0.693;SC=CCCACGCAACTGTATAAACAA;SOR=0.223;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=163;TCF=85;TCR=78;TR=162;WE=30494780;WS=30494762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,176:0.99:177
chr8	30584923	rs2251780	G	A	2705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=61;NR=29;PP=1798;SC=GGGGAGTTGCGGGGGTGGAAA;SOR=1.735;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=62;TCR=29;TR=90;WE=30584931;WS=30584913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr8	30601617	rs73672521	C	T	534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=2;PP=431;SC=CTCTCCCAGCCGGCCCGCGGC;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=30601625;WS=30601607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr8	30608976	rs2911690	C	T	5091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=85;NR=84;PP=2863;SC=CTTACTTTAACTATTTCTGTG;SOR=0.826;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=170;TCF=86;TCR=84;TR=169;WE=30608984;WS=30608966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr8	30620840	rs11388922	G	GT	5339.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=63;PP=2966;SC=TGAGGAGAAGGTTTTGAAGTC;SOR=0.753;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=91;TCF=26;TCR=65;TR=86;WE=30620848;WS=30620830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr8	30620964	rs2956010	T	C	2700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=53;PP=1630;SC=GTCATCTGCATCTCCCATCAG;SOR=1.284;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=90;TCF=37;TCR=53;TR=90;WE=30620972;WS=30620954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr8	30623996	rs2956016	T	C	877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=21;PP=684;SC=CAAATCACACTATACCTTGAT;SOR=1.942;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=29;WE=30624004;WS=30623986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr8	30643538	rs3832549	C	CCTAT	3728.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=38;PP=2307;SC=GTTAGACTGACCTAGAACATA;SOR=1.501;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=47;TCF=3;TCR=44;TR=41;WE=30643546;WS=30643528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr8	30695226	rs2720593	C	T	6368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=108;PP=2965;SC=TCTGCAAAAGCGTCCCATGGT;SOR=1.061;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=201;TCF=93;TCR=108;TR=201;WE=30695234;WS=30695216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr8	30700598	rs61740968	T	C	3874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=58;PP=2262;SC=TGCAAGCAAATTACTGTTAAA;SOR=0.735;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=129;TCF=71;TCR=58;TR=129;WE=30700606;WS=30700588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr8	30701995	rs61732457	A	C	4424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=78;PP=2528;SC=TCAGATGGGAATCAATCAAGT;SOR=1.077;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=62;TCR=78;TR=140;WE=30702003;WS=30701985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr8	30744615	rs184596951	A	T	1832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=14;PP=1156;SC=TAAAAGATGAACATAAACTAA;SOR=2.267;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=40;TCR=14;TR=54;WE=30744623;WS=30744605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
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chr8	30938704	rs1800391	G	A	3782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=64;PP=2343;SC=AAGAGAATATGGAAAGAGCTT;SOR=0.898;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=124;TCF=60;TCR=64;TR=124;WE=30938712;WS=30938694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
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chr8	30958353	rs3087419	CT	C	2661.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=24;PP=1514;SC=ATGTGTTTTTCTTTTTTTACA;SOR=1.634;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=66;TCF=38;TCR=28;TR=55;WE=30958361;WS=30958343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr8	30981971	rs3087417	G	T	1157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=3.481;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.70;ReadPosRankSum=1.166;SOR=2.256;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,49:0.96:51
chr8	30999122	rs3024239	C	T	5209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=89;PP=2965;SC=AAAAGGTAAACGGTGTAGGAG;SOR=1.095;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=162;TCF=73;TCR=89;TR=162;WE=30999130;WS=30999112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr8	31004465	rs17652297	T	A	244.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=200;SC=GAAGAATAAATGTTTGTACTG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=31004473;WS=31004463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr8	31005017	rs3087415	T	TC	5878.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=69;PP=2972;SC=GCATGTGTTCTATTTATTTCC;SOR=1.179;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=79;TCF=6;TCR=73;TR=75;WE=31005025;WS=31005007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr8	31024654	rs1346044	T	C	9917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=383;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=166;NR=176;PP=2965;SC=TCAACCTTCATGTGATGTCAA;SOR=0.791;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=342;TCF=166;TCR=176;TR=342;WE=31024662;WS=31024644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,382:1.00:382
chr8	32453358	rs3924999	G	A	4390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=87;NR=55;PP=2291;SC=TTGCCTCCCCGATTGAAAGAG;SOR=0.902;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=142;TCF=87;TCR=55;TR=142;WE=32453366;WS=32453348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr8	32505909	rs146965117	TAG	T	133.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FS=1.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQRankSum=4.115;QD=0.82;ReadPosRankSum=-1.361;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:142,22:0.13:164
chr8	32613983	rs10503929	T	C	7154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=121;NR=120;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.824;SC=CGAAACAATATGATGAACATT;SOR=0.730;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=242;TCF=122;TCR=120;TR=241;WE=32613991;WS=32613973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,273:0.99:275
chr8	33356825	rs368990473	AT	A	171.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=0.959;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.08;MQRankSum=1.871;QD=1.95;ReadPosRankSum=-0.279;SOR=0.841;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,20:0.23:88
chr8	33451026	rs2044162	C	T	428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=2;PP=261;SC=CCTGTTCTTTCCTGCTCCCAG;SOR=2.049;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=33451034;WS=33451016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr8	35425870	rs2589340	T	A	1280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=32;PP=840;SC=AAATGAGAGGTCTTAAATTTA;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=9;TCR=32;TR=41;WE=35425878;WS=35425860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr8	36664830	rs35671599	C	T	7073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=148;NR=90;PP=2965;SC=GCTGTTATAACGTAGGCTCCC;SOR=1.250;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=238;TCF=148;TCR=90;TR=238;WE=36664838;WS=36664820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr8	36786402	rs62488560	C	G	666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=5;PP=406;SC=ATTCCCATTCCTGTCCATATA;SOR=2.215;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=24;WE=36786410;WS=36786392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr8	37611414	.	CT	C	214.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.337;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.80;ReadPosRankSum=-1.035;SOR=0.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr8	37620076	rs6468438	A	G	1399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=29;NR=19;PP=742;SC=CGACTCAATGATGAGCAATGA;SOR=0.931;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=29;TCR=19;TR=48;WE=37620084;WS=37620066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr8	37630430	rs199508651	T	A	3564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=66;PP=2131;SC=ACCTGAATTGTAGATTTTTCT;SOR=1.214;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=50;TCR=66;TR=116;WE=37630438;WS=37630420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr8	37635649	rs7463174	A	G	1893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=47;PP=1320;SC=AGCACTAACTATGCACTAACC;SOR=2.694;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=13;TCR=47;TR=60;WE=37635657;WS=37635639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr8	37686749	rs6468442	A	G	4708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=59;PP=2922;SC=CCACGTGGCCAACATGCTGAG;SOR=1.257;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=165;TCF=106;TCR=59;TR=165;WE=37686757;WS=37686739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr8	37693302	rs10101560	T	C	500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=14;PP=376;SC=AGGGACTGAATTCCCCGCCCC;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=37693310;WS=37693292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr8	37699195	rs4976898	C	G	1663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=25;PP=981;SC=TCGGGGAGGGCCCCCCCTCCC;SOR=1.022;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=53;TCF=28;TCR=25;TR=52;WE=37699203;WS=37699185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr8	37706057	rs11777510	A	T	3696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=35;PP=2437;SC=GAGCCACAGCACCTGGCCTAG;SOR=1.839;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=119;TCF=84;TCR=35;TR=119;WE=37706065;WS=37706047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr8	37728017	rs7817179	A	G	2079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.33;SOR=1.067;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr8	37728017	.	ATT	GTG	1553	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=18;NR=22;PP=1553;QD=40.1616968716;SC=CTTGGTGGCCATTGCATTCAT;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=18;TCR=22;TR=40;WE=37728027;WS=37728007;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr8	37728019	rs7820872	T	G	2079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.33;SOR=1.067;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr8	37730368	rs12541651	G	A	5460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=105;NR=79;PP=2965;SC=TGATCCCAGGGCAGAAGAACC;SOR=0.804;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=184;TCF=105;TCR=79;TR=184;WE=37730376;WS=37730358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr8	37730456	rs7341564	G	T	3993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=72;PP=2569;SC=GACTTGGCCTGGCCCCTGTCT;SOR=0.952;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=136;TCF=64;TCR=72;TR=136;WE=37730464;WS=37730446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr8	37888017	rs3750243	C	G	622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.08;SOR=1.708;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr8	37985897	rs2843740	A	G	4484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=64;PP=2600;SC=GAGTACGGAAAGGTGCCTGGT;SOR=0.915;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=150;TCF=86;TCR=64;TR=150;WE=37985905;WS=37985887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr8	37986561	rs2517394	G	C	1892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=42;PP=1256;SC=TAGGAACTGAGCCACAGCTCA;SOR=2.194;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=15;TCR=42;TR=57;WE=37986569;WS=37986551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr8	38003787	rs2720050	T	C	8940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=135;NR=180;PP=2965;SC=CCCTGCCACCTGCACCTGGAC;SOR=1.115;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=316;TCF=135;TCR=181;TR=315;WE=38003795;WS=38003777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,336:1.00:336
chr8	38005835	rs2229620	T	C	3891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=81;PP=2633;SC=GAGTCTCTTCTAGCCGAGAAC;SOR=1.163;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=55;TCR=81;TR=136;WE=38005843;WS=38005825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr8	38006330	rs35520501	TC	T	4456.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=57;PP=2951;SC=GATGGACCACTCCCACCCCCT;SOR=0.862;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=78;TCF=18;TCR=60;TR=75;WE=38006338;WS=38006320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr8	38123607	rs141363020	G	A	5356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=115;NR=68;PP=2965;SC=TAGGTGCTAGGAATAAAATGA;SOR=1.219;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=183;TCF=115;TCR=68;TR=183;WE=38123615;WS=38123597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr8	38245598	rs35044708	CT	C	163.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=6.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.80;ReadPosRankSum=0.999;SOR=1.938;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr8	38271271	.	C	A	1526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.640;ClippingRankSum=0.000;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.985;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=29;PP=913;ReadPosRankSum=0.072;SC=CTCCGGGTGTCGGGAAAGCTG;SOR=0.548;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=144;TCF=85;TCR=59;TR=70;WE=38271279;WS=38271261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,75:0.48:157
chr8	38369831	rs4733951	A	C	1207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=29;NR=9;PP=757;SC=GAGAGGAATAAGAAGGAATTC;SOR=2.356;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=40;TCF=30;TCR=10;TR=38;WE=38369839;WS=38369821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr8	38370200	rs146268311	GAGACACAGAC	G	852.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=14;PP=2986;SC=ACATGCAGTGGAGACACAGAC;SOR=2.531;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=14;WE=38370217;WS=38370190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr8	38385795	rs2445020	T	C	626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=2;PP=553;SC=ATTACACACATGGAATGACTC;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=38385803;WS=38385785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr8	38458552	.	G	GTCT	7893.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=16;NR=71;PP=2970;SC=TTCTGGCCGTGCCAGCCACTG;SOR=0.944;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=95;TCF=17;TCR=78;TR=87;WE=38458560;WS=38458542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr8	38458659	rs327934	C	T	2329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=42;PP=1363;SC=TCGCGCCCGCCCCGCCCCGCT;SOR=1.005;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=31;TCR=42;TR=73;WE=38458667;WS=38458649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr8	38458802	rs327935	A	C	178.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=6;PP=144;SC=TATTACCAAGACGCTCCCACT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=38458810;WS=38458792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr8	38646402	rs34210207	G	A	887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=20;PP=585;SC=TATCAATGAAGGAAGGAAAAA;SOR=2.621;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=26;WE=38646410;WS=38646392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr8	38677932	rs2013586	A	G	9107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=148;NR=142;PP=2965;SC=GTCAGTGGGAAAGCCCCAGCT;SOR=0.749;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=290;TCF=148;TCR=142;TR=290;WE=38677940;WS=38677922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,327:1.00:327
chr8	38684853	rs2037204	T	C	4835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=82;PP=2685;SC=CCAATGTTCCTGTGTCTACCA;SOR=0.749;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=166;TCF=84;TCR=82;TR=166;WE=38684861;WS=38684843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr8	38695996	rs2292741	T	C	5358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=111;NR=70;PP=2965;SC=AGATAATTACTAAAGAGATTG;SOR=1.110;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=181;TCF=111;TCR=70;TR=181;WE=38696004;WS=38695986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr8	38697649	rs13262797	T	C	71.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr8	38809663	rs6984871	A	C	1428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=12;PP=1017;SC=AGGCGCTGATACTGACACTGT;SOR=2.004;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=37;TCR=12;TR=49;WE=38809671;WS=38809653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr8	38827185	rs5891050	GC	G	5511.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=15;NR=76;PP=2967;SC=GGAGGGCAGCGCCTCCTGGGG;SOR=0.895;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=93;TCF=17;TCR=76;TR=91;WE=38827193;WS=38827175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr8	38835456	rs4733960	T	C	1179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=6;PP=848;SC=CCCCATCCCTTTTTGGGCACG;SOR=2.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=31;TCR=6;TR=37;WE=38835464;WS=38835446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr8	38835666	rs4733961	T	C	2131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=43;PP=1073;SC=CCACAATTAATGTAAGTCACT;SOR=1.525;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=26;TCR=43;TR=69;WE=38835674;WS=38835656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr8	38839302	.	AT	A	126.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=0.000;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=3.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.24;MQRankSum=3.421;QD=1.31;ReadPosRankSum=-1.085;SOR=1.196;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,20:0.21:97
chr8	38848850	rs4733895	C	T	1025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=4;PP=764;SC=GGCAGCTCTTCTTAGTAAACA;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=32;WE=38848858;WS=38848840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr8	38851204	rs28626007	A	C	8181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=140;NR=139;PP=2965;SC=CCAAGACCAAAACCAACTCAC;SOR=0.740;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=279;TCF=140;TCR=139;TR=279;WE=38851212;WS=38851194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,305:1.00:305
chr8	38854041	rs10105311	C	T	1428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=39;PP=1135;SC=GTGGTCAGGCCTTTCCGCGTA;SOR=4.271;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=42;TCF=3;TCR=39;TR=42;WE=38854049;WS=38854031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr8	38872186	rs7833611	C	A	810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=24;PP=624;SC=GGTATTATACCTTTTTTTCTT;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=26;WE=38872194;WS=38872176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr8	38876466	rs6474518	T	C	11054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.95;QD=43.52;SOR=1.188;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr8	38876466	.	TCC	CCT	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=59.96;NF=88;NR=117;PP=2947;QD=20;SC=TTTCTTCTTTTCCATGAAAAG;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=221;TCF=95;TCR=126;TR=205;WE=38876476;WS=38876456;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:16,205:0.93:221
chr8	38876468	rs6474519	C	T	11054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.95;QD=45.87;SOR=1.232;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr8	38884342	rs10652213	G	GTTCT	7109.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=73;PP=2974;SC=GAGTACCTGGGTTCTTCTTCT;SOR=1.427;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=89;TCF=4;TCR=85;TR=77;WE=38884350;WS=38884332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr8	38911953	rs9643905	C	A	2553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=26;PP=1745;SC=AATGAGTATTCATGTCAATTA;SOR=1.688;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=88;TCF=62;TCR=26;TR=85;WE=38911961;WS=38911943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr8	38964647	rs4517088	G	A	1491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=21;NR=31;PP=929;SC=TCTTTGGAATGTTCACACATC;SOR=1.262;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=21;TCR=31;TR=52;WE=38964655;WS=38964637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr8	38965271	rs59118660	C	T	9650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=362;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=179;NR=154;PP=2965;SC=AACGGCTTCCCGCTGGCAGCC;SOR=0.756;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=333;TCF=179;TCR=154;TR=333;WE=38965279;WS=38965261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,361:1.00:361
chr8	38987347	rs9650316	T	C	512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=10;PP=409;SC=TTTATAATTATGAGTGTAATC;SOR=0.793;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=9;TCR=10;TR=19;WE=38987355;WS=38987337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr8	38991720	rs6997278	A	G	4113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=58;PP=2658;SC=TCAGGATGTAATCTGTTGGGG;SOR=0.945;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=82;TCR=58;TR=140;WE=38991728;WS=38991710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr8	39068890	rs11786404	A	G	1133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=27;PP=794;SC=TATTGTTTTAATTTATCTTTT;SOR=2.554;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=35;WE=39068898;WS=39068880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr8	39080632	rs7845771	C	G	4982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=83;PP=2965;SC=TGTAATGGAACCTCACCAGAA;SOR=0.795;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=82;TCR=83;TR=165;WE=39080640;WS=39080622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr8	39080824	rs4476978	T	A	169.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.26;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr8	39442292	rs7007924	T	G	3608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=80;PP=2364;SC=ACCCTCCCCCTCTCCCTTCTG;SOR=1.628;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=122;TCF=41;TCR=81;TR=121;WE=39442300;WS=39442282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr8	39463063	rs4236751	T	C	123.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=4;NR=0;PP=54;SC=AATTTGTTACTGGTTCGTTAT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=39463071;WS=39463053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr8	39463823	rs13268577	T	C	3898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=57;PP=2389;SC=TGTTTTATTTTAGATGATTTA;SOR=0.971;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=133;TCF=76;TCR=57;TR=133;WE=39463831;WS=39463813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr8	39487022	rs3735881	C	T	3890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=68;NR=70;PP=2164;SC=AAGAACTTTCCTTCTTGCATT;SOR=0.864;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=138;TCF=68;TCR=70;TR=138;WE=39487030;WS=39487012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr8	39495325	rs3824144	G	A	580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=18;PP=488;SC=AGCCCCTTTGGAAGTGTTTAA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=39495333;WS=39495315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr8	39496029	rs12708194	T	C	3217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=57;NR=48;PP=1508;SC=TTCCTGGCACTGTATGCAATA;SOR=0.759;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=57;TCR=48;TR=105;WE=39496037;WS=39496019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr8	39496202	rs13278646	G	A	177.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=142;SC=TTATTTTATTGGGACAAAATT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=39496210;WS=39496192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr8	39503079	rs6474161	G	A	245.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=8;PP=184;SC=TTTATATTCGGCACCACATCA;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=39503087;WS=39503069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr8	39505826	rs3735880	C	A	1790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=22;PP=1107;SC=TTTTATTAGCCAGGCTTATTT;SOR=1.230;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=38;TCR=22;TR=60;WE=39505834;WS=39505816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr8	39521419	rs6988389	T	C	3452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=54;NR=59;PP=1998;SC=GGTAAGTTACTAACATTCATT;SOR=0.971;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=113;TCF=54;TCR=59;TR=113;WE=39521427;WS=39521409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr8	39525750	rs2305392	C	A	3035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=70;PP=2063;SC=TTTTACCTTACATTTGCATCT;SOR=2.027;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=29;TCR=70;TR=99;WE=39525758;WS=39525740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr8	39607083	rs368362038	GGT	G	36.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.291;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=88;ReadPosRankSum=-0.812;SC=TATATGTTTTGGTGTGTGTGT;SOR=1.574;Source=Platypus;TR=5;WE=39607092;WS=39607073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,4:0.17:23
chr8	39618637	rs10093751	G	T	1550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=38;NR=13;PP=984;SC=TTGTTTGATGGTATTTTCAAA;SOR=1.919;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=38;TCR=13;TR=51;WE=39618645;WS=39618627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr8	39618865	rs10097616	C	G	323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=270;SC=ATAACAAATACACTTAAAATT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=39618873;WS=39618855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr8	39644691	rs3779718	C	G	311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=258;SC=ATTAATGTAACATAGCATAAG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=39644699;WS=39644681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr8	39842443	rs140841420	C	CTTAT	3321.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.285;NF=3;NR=32;PP=1872;ReadPosRankSum=-0.093;SC=AGTGAAATAACTTATTTATTT;SOR=1.040;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=54;TCF=3;TCR=51;TR=35;WE=39842451;WS=39842433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,78:0.98:80
chr8	39843139	rs2729472	A	G	403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=14;PP=352;SC=TATATGTATAATATAATATCA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=39843147;WS=39843129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr8	39862881	rs10109853	C	T	4455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=79;PP=2745;SC=TGCAGGCATCCGGATCTTTCT;SOR=0.879;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=71;TCR=79;TR=150;WE=39862901;WS=39862871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr8	39862893	rs35212142	T	A	4447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=79;PP=2691;SC=GATCTTTCTCTCTGGGTAAGT;SOR=0.889;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=153;TCF=74;TCR=79;TR=153;WE=39862901;WS=39862871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr8	39871036	rs2955897	A	G	463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=2;PP=365;SC=AAAATATACCATTACCTCCCT;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=39871044;WS=39871026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr8	39871298	rs5891075	T	TTAA	1944.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=3;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=2;NR=41;PP=530;SC=TTTTTTTTTTTCCAATTGATA;SOR=1.022;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=53;TCF=4;TCR=49;TR=43;WE=39871306;WS=39871287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr8	39872668	rs2955902	C	T	1046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=4;PP=772;SC=AGCAAGATCTCATCTAGAGAA;SOR=3.321;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=31;WE=39872684;WS=39872658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr8	39872676	rs5891076	GA	G	1146.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=8;PP=548;SC=CTCATCTAGAGAAAAAAAAAA;SOR=2.461;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=25;TCR=11;TR=28;WE=39872684;WS=39872658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr8	39872866	rs2981161	A	C	8408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=146;NR=131;PP=2965;SC=ACATCCTGTCATCTGGACAGG;SOR=0.741;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=278;TCF=146;TCR=132;TR=277;WE=39872874;WS=39872856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,299:1.00:299
chr8	39873188	rs2981162	C	T	133.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=103;SC=GAATGAGGGTCAGGGTTCTGC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=39873196;WS=39873178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr8	40011079	rs6474226	G	A	4204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=98;NR=40;PP=2690;SC=CCACCAAGCCGTCATCATGTC;SOR=1.673;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=138;TCF=98;TCR=40;TR=138;WE=40011087;WS=40011069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr8	40389842	rs1429966	T	C	4146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=89;PP=2879;SC=CCCCTGTCTCTCTTCTACTTC;SOR=1.390;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=52;TCR=89;TR=141;WE=40389850;WS=40389832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr8	40389933	rs4038741	TAA	T	1019.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=24;PP=955;SC=CCTGTATATATAAAATATCTC;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=24;WE=40389942;WS=40389923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr8	40554742	rs11781516	C	T	2452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=51;NR=30;PP=1330;SC=GGTCTCCCCACGATCACTGTT;SOR=1.130;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=51;TCR=30;TR=81;WE=40554750;WS=40554732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr8	40554994	rs12546561	C	G	175.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=110;SC=CTTACCCAGACGAACTAGTGT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=40555002;WS=40554984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr8	40665997	rs1512214	A	G	1424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=45;NR=10;PP=1112;SC=CTAACGGTTGACAATGCAGTA;SOR=2.348;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=45;TCR=10;TR=55;WE=40666005;WS=40665987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr8	40666094	.	CA	C	261.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.231;ClippingRankSum=0.000;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=1.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.73;ReadPosRankSum=0.529;SOR=0.511;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,27:0.28:96
chr8	40666189	rs11777437	T	C	2917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=40;NR=66;PP=1999;SC=TCAGGGGAGGTAACAAGAAAG;SOR=1.587;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=109;TCF=41;TCR=68;TR=106;WE=40666197;WS=40666179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr8	40666257	rs11776726	A	C	629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=25;PP=577;SC=AATGTGAAGAAGGAAAAAGAG;SOR=3.352;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=29;WE=40666265;WS=40666247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr8	41128710	rs11779707	T	C	5167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=74;PP=2872;SC=AAGTGAGGCCTAACAAATCAC;SOR=0.815;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=156;TCF=82;TCR=74;TR=156;WE=41128718;WS=41128700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr8	41166637	rs3832595	GGCT	G	4616.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=52;PP=2678;SC=GCACGCCCAGGGCTGCCCCGC;SOR=1.314;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=2;TCR=56;TR=54;WE=41166647;WS=41166627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr8	41297486	rs10637700	T	TTTTG	3942.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.504;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.435;NF=5;NR=57;PP=2992;ReadPosRankSum=0.678;SC=AAGGGTATGTTTTTGTTTGTT;SOR=0.342;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=111;TCF=7;TCR=104;TR=62;WE=41297494;WS=41297476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,94:0.97:97
chr8	41391704	rs10096369	A	G	1524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.00;SOR=0.725;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr8	41391936	.	TAAA	T	98.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.438;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=2.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.58;ReadPosRankSum=1.770;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr8	41517958	rs59908561	A	AG	3909.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=26;PP=2428;SC=TCCCACCCCGAGTATCCTGTA;SOR=1.244;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=54;TCF=28;TCR=26;TR=53;WE=41517966;WS=41517948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr8	41519248	rs516946	T	C	6555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=116;PP=2965;SC=GGAGGTGTCATGCAGACGGCC;SOR=0.885;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=216;TCF=100;TCR=116;TR=216;WE=41519256;WS=41519238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr8	41519462	rs515071	A	G	6986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=100;NR=126;PP=2965;SC=CGAATGATCTAGGAAAGGAAG;SOR=1.051;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=226;TCF=100;TCR=126;TR=226;WE=41519470;WS=41519452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr8	41521663	rs563118	T	C	7745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=134;NR=133;PP=2965;SC=GTGACTTGCTTGAAACCCCAG;SOR=0.792;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=267;TCF=134;TCR=133;TR=267;WE=41521671;WS=41521653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,296:1.00:296
chr8	41521762	rs117183306	G	C	1062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=30;PP=718;SC=GGCCAAGGCCGGAGGACCACT;SOR=2.948;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=37;WE=41521770;WS=41521752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr8	41529856	rs508112	A	G	4101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=57;PP=2683;ReadPosRankSum=-0.815;SC=CCCTGCTCCCACAGTCAAGCT;SOR=0.473;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=153;TCF=96;TCR=57;TR=153;WE=41529864;WS=41529846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,159:0.99:160
chr8	41553928	rs504574	C	G	2825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=66;NR=21;PP=1411;SC=TCCTGCTGGCCAGGCCCTCCT;SOR=1.380;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=66;TCR=21;TR=87;WE=41553936;WS=41553918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr8	41559609	rs2304880	G	A	6467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=125;NR=85;PP=2965;SC=TGAGCACGTCGGTGACAGAAA;SOR=0.973;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=210;TCF=125;TCR=85;TR=210;WE=41559617;WS=41559599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr8	41563685	rs1137177	G	A	3303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=38;PP=1972;SC=CCACCATGACGCCGTGTTTGA;SOR=1.285;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=110;TCF=72;TCR=38;TR=110;WE=41563693;WS=41563675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr8	41571826	rs17660898	C	G	2293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=33;NR=45;PP=1337;SC=GACTTTCTCCCAGGACTCCCT;SOR=1.153;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=33;TCR=45;TR=78;WE=41571834;WS=41571816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr8	41571963	rs74771278	A	T	39.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=1;NR=2;PP=39;SC=ACAGGGGGGAACGTGGGCAGT;SOR=0.693;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=41571971;WS=41571953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr8	41574736	rs575817	A	C	953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=7;NR=27;PP=633;SC=TGTGTGCATGAGCATGTATGT;SOR=2.774;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=34;WE=41574744;WS=41574726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr8	41583294	rs2304873	C	T	872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=11;PP=428;SC=AAAGCACGTCCGGGTTGGGGT;SOR=0.957;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=15;TCR=11;TR=26;WE=41583302;WS=41583284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr8	41591643	rs2304869	C	T	2848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=67;PP=1955;SC=GCTTTCTGCACGTCCCAGTGG;SOR=1.911;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=28;TCR=67;TR=95;WE=41591651;WS=41591633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr8	41615429	rs486223	G	A	743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=6;PP=495;SC=CCACAGGCAGGAGCCCTGGGG;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=25;WE=41615437;WS=41615419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr8	41753843	rs77115522	C	G	1984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=12;PP=1468;SC=GTGCCGCGGTCGCTGGGCTTT;SOR=2.730;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=50;TCR=12;TR=62;WE=41753851;WS=41753833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr8	41794934	rs13748	C	T	8537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=144;NR=137;PP=2965;SC=CGATCTCAAACGTGGGTTCTA;SOR=0.712;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=282;TCF=145;TCR=137;TR=281;WE=41794942;WS=41794924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,315:1.00:315
chr8	41805249	rs10504048	C	T	7099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=125;NR=100;PP=2965;SC=TTCAAACAAACTTTAAGCTGA;SOR=0.866;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=225;TCF=125;TCR=100;TR=225;WE=41805257;WS=41805239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr8	41838503	rs11990460	G	A	3394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=78;PP=2256;ReadPosRankSum=-0.929;SC=AACATGTTACGATCATGACTG;SOR=1.061;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=107;TCF=28;TCR=79;TR=106;WE=41838511;WS=41838493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,118:0.99:119
chr8	42013563	rs150778126	T	TATG	13424.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=104;PP=2973;SC=AAAACGTAAGTATAAGTCCCA;SOR=0.798;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=140;TCF=29;TCR=111;TR=132;WE=42013571;WS=42013553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,299:1.00:299
chr8	42037924	rs2020922	T	A	5689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=92;PP=2965;SC=TTAGAATGCTTTTTTTGCTGT;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=192;TCF=100;TCR=92;TR=192;WE=42037932;WS=42037914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr8	42044954	rs1058720	G	A	2792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=57;PP=1671;SC=GCCTGATGGCGTCTGGCCTCC;SOR=1.201;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=41;TCR=57;TR=98;WE=42044962;WS=42044944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr8	42045655	rs2070713	C	T	406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=13;PP=322;SC=GTGGAACACGCGTATACCAGT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=42045663;WS=42045645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr8	42172017	rs7814513	C	G	2548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=14;NR=57;PP=1670;SC=TCTTGGCTGGCCGTGGTGGCT;SOR=3.126;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=14;TCR=57;TR=71;WE=42172025;WS=42172007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr8	42175303	rs2294100	A	T	6296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=110;PP=2965;SC=AGAATTTGTTATGTTTTGTTT;SOR=0.943;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=211;TCF=100;TCR=111;TR=209;WE=42175311;WS=42175292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr8	42186579	rs2272732	T	C	1823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=12;PP=1233;SC=TATTTTAAAATAGCAGTGTTA;SOR=2.157;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=43;TCR=12;TR=55;WE=42186587;WS=42186569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr8	42188550	rs1057741	A	G	1652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=40;PP=1162;SC=GGCCTTGTGCAGTGGGGGGAC;SOR=2.221;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=53;TCF=12;TCR=41;TR=52;WE=42188558;WS=42188540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr8	42196441	rs3136717	C	T	3013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=34;PP=2262;SC=GTCACTGTCTCTTAGAGGCTG;SOR=1.632;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=71;TCR=34;TR=105;WE=42196449;WS=42196431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr8	42552633	rs4950	G	A	6711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=112;NR=104;PP=2965;SC=CCCTTTTCCAGTGGAAATGCT;SOR=0.741;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=216;TCF=112;TCR=104;TR=216;WE=42552641;WS=42552623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr8	42587796	rs4954	G	A	439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=15;PP=377;SC=TAAATGTGACGTTATATAAGA;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=42587804;WS=42587786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr8	42865753	rs56065225	A	C	212.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=7;PP=169;SC=AATTACCAAGAGGAAAATGTA;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=42865761;WS=42865743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr8	42868455	rs5891200	CT	C	180.76	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.90;ReadPosRankSum=0.672;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr8	42882555	rs111931018	A	ATTTGT	5878.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=27;PP=2914;SC=ACATTCTGTCATTTGTTCTGT;SOR=1.317;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=31;TCR=33;TR=53;WE=42882563;WS=42882545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr8	42959007	rs5024011	C	A	2840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=57;PP=1667;SC=TGCTGTCATCCTGTTATTTCG;SOR=1.279;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=38;TCR=57;TR=95;WE=42959015;WS=42958997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr8	42995624	.	C	CGAGCGGGCGGCGGGCAT	96.37	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.12;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr8	43013936	rs10958738	C	T	1255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=29;PP=813;SC=TTTCTCTTTACAGTATTTTTC;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=14;TCR=29;TR=43;WE=43013944;WS=43013926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr8	43054553	rs1126058	T	C	3561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=49;PP=1888;SC=TTCTGGTATATGTCGGCCACG;SOR=0.905;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=74;TCR=49;TR=123;WE=43054561;WS=43054543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr8	47759712	rs3849804	T	G	4139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=83;PP=2503;SC=ACTATTTGAGTCTATACCCAG;SOR=1.094;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=61;TCR=83;TR=144;WE=47759720;WS=47759702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
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chr8	48685753	.	GA	G	89.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=0.000;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=4.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.28;ReadPosRankSum=1.896;SOR=0.507;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,13:0.19:70
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chr8	48846519	rs1231202	T	C	1048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=12;PP=574;SC=CAATGGTAAATGTTACCATCA;SOR=1.096;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=24;TCR=12;TR=36;WE=48846527;WS=48846509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr8	48852225	rs8178017	C	T	2462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=51;PP=1558;SC=TATTTTTATGCATTTCTGCAT;SOR=1.295;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=35;TCR=51;TR=86;WE=48852233;WS=48852215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr8	48866788	rs1231203	T	G	114.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=88;SC=CAGCAAAAAGTATTCGACTGT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=48866796;WS=48866787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr8	48885436	rs762679	T	A	2969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=40;PP=1640;SC=GATCTTCCTCTTGCTGGACCC;SOR=1.089;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=61;TCR=40;TR=101;WE=48885444;WS=48885426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr8	49641784	rs1482261	A	G	1142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=28;PP=759;SC=TCAAGTGTTAATTTAAAAAAA;SOR=2.419;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=9;TCR=28;TR=37;WE=49641792;WS=49641774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr8	49643243	rs966703	A	G	3458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=71;PP=2178;SC=TGTCCTGCATAATAACTCTCA;SOR=1.629;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=38;TCR=71;TR=109;WE=49643251;WS=49643233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr8	51306785	.	T	A	5087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=98;NR=69;PP=2965;SC=ACATCCTTTGTGGTGCCACAG;SOR=0.967;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=167;TCF=98;TCR=69;TR=167;WE=51306793;WS=51306775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr8	51314749	.	GT	G	115.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.616;ClippingRankSum=0.000;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=3.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.87;ReadPosRankSum=1.186;SOR=0.233;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,13:0.21:62
chr8	51362462	rs1481475	A	G	1312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=28;PP=858;SC=CTCCTGTGGGAGAGGACTTCT;SOR=2.059;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=40;WE=51362470;WS=51362452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr8	51363078	rs7817955	C	T	1176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=5;PP=759;SC=ATAACAAAAACAGTCAATGCA;SOR=2.726;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=37;WE=51363086;WS=51363068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr8	51363430	rs12542191	A	T	48.14	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=3;PP=53;SC=TGTTCTCTTAATTTTTTTTTA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=51363438;WS=51363420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr8	51571370	rs1911831	G	A	581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=15;PP=435;SC=AAAATAAACTGGACAAAAAAG;SOR=2.948;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=51571378;WS=51571360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr8	51617430	rs7003356	T	A	1006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=24;PP=675;SC=CTTGACCTCATATACATTCTA;SOR=2.517;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=31;WE=51617438;WS=51617420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr8	51664541	rs11429292	G	GT	921.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-1.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=7;PP=363;ReadPosRankSum=1.090;SC=GACTTACATTGTTTTTTTTCC;SOR=0.829;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=22;TCF=14;TCR=8;TR=18;WE=51664549;WS=51664531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,34:0.97:35
chr8	51664842	rs6473337	C	A	458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=14;PP=351;SC=TTATTGGCAACTTTTCACTTA;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=51664850;WS=51664832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr8	52232487	rs1052704	G	T	4168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=56;PP=2242;SC=GCATTCCTCGGTCTCTGCAAA;SOR=0.719;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=130;TCF=73;TCR=57;TR=129;WE=52232495;WS=52232477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr8	52232624	rs1370446	A	G	2285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=33;NR=43;PP=1194;SC=GTTTCTTATAATCAAAGTACT;SOR=1.166;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=33;TCR=43;TR=76;WE=52232632;WS=52232614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr8	52233276	rs7827306	C	A	243.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=47;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=2;PP=239;SC=TTGAATTTTTCAAGTATGCTT;SOR=2.093;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=52233284;WS=52233266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr8	52233299	rs3217441	T	TAGG	727.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=55.98;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr8	52233308	.	A	AAC	997.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.98;QD=45.35;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr8	52233310	rs2304552	T	G	1006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.93;QD=43.77;SOR=3.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr8	52233408	rs7827446	C	T	4453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=54;PP=2801;SC=TGGAACCCCTCTAACATCTGT;SOR=1.136;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=90;TCR=54;TR=144;WE=52233416;WS=52233398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr8	52252171	rs11778598	A	G	7706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=155;NR=110;PP=2965;SC=TGTTATTTGAAGAGAAAACAA;SOR=1.080;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=265;TCF=155;TCR=110;TR=265;WE=52252179;WS=52252161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,283:1.00:283
chr8	52252320	rs16916011	A	G	6041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=123;PP=2965;SC=TTGCCTATTTATAACAAGAAG;SOR=1.354;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=203;TCF=79;TCR=124;TR=202;WE=52252328;WS=52252310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr8	52252405	rs1437593	T	C	654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=21;PP=483;SC=TCATTTGGCATGTACAAGGCA;SOR=4.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=52252413;WS=52252395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr8	52284654	rs5891410	C	CA	504.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.031;HP=10;HapScore=3;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=389;ReadPosRankSum=-0.983;SC=GGTAGTCAACCAAAAAAAAAA;SOR=2.636;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=21;WE=52284662;WS=52284644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,21:0.81:26
chr8	52321243	rs2977020	T	C	5989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=106;PP=2965;SC=TCCGTGGCCATCCTGTTGTGT;SOR=0.884;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=198;TCF=92;TCR=106;TR=198;WE=52321251;WS=52321233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr8	52325879	rs1560511	T	G	3085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=63;PP=2009;SC=GGCATGATATTATATGAATGG;SOR=1.386;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=38;TCR=63;TR=101;WE=52325887;WS=52325869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr8	52336041	rs2060107	G	C	2265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=14;PP=1518;SC=AAGTATAAGAGAGCATGATTA;SOR=2.584;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=55;TCR=14;TR=69;WE=52336049;WS=52336031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr8	52361772	rs1431636	G	A	816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=22;PP=637;SC=TATGTCATGTGATCAGAATTT;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=24;WE=52361780;WS=52361762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr8	52366200	rs6473599	G	A	4733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=84;NR=75;PP=2734;SC=ACGTTGCCACGTGCCTGGATC;SOR=0.705;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=159;TCF=84;TCR=75;TR=159;WE=52366208;WS=52366190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr8	52396048	rs1431632	C	T	1336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=14;PP=860;SC=GGTTCTCTATCGCTCTGCAGT;SOR=1.426;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=29;TCR=14;TR=43;WE=52396056;WS=52396038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr8	52412226	rs755311	G	T	7419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=136;NR=105;PP=2965;SC=ATGTAAAGCAGAAGCAAAGGA;SOR=0.917;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=241;TCF=136;TCR=105;TR=241;WE=52412234;WS=52412216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,274:1.00:274
chr8	52721958	rs13252785	T	C	252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=8;PP=159;SC=GAGCAGCAGCTGCAGCTGCAG;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=52721966;WS=52721948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr8	52730521	rs4401853	C	T	9550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=210;PP=2965;SC=ATGATACTTACTGTTTTAACT;SOR=1.704;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=312;TCF=102;TCR=210;TR=312;WE=52730529;WS=52730511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,335:1.00:335
chr8	52733050	rs12335014	T	A	3131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=62;NR=45;PP=1691;SC=CTCTTCTTTGTTATCCTCTTC;SOR=0.877;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=115;TCF=70;TCR=45;TR=107;WE=52733058;WS=52733040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr8	52733121	.	G	A	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.898;ClippingRankSum=0.000;DP=155;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.86;MQRankSum=-3.498;QD=0.44;ReadPosRankSum=0.843;SOR=0.795;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:142,13:0.08:155
chr8	52733128	rs62506083	T	G	1833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.621;HP=1;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-8.281;NF=51;NR=46;PP=1263;ReadPosRankSum=2.995;SC=TACGTAAGTGTTAATTCTCTG;SOR=0.804;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=173;TCF=83;TCR=90;TR=97;WE=52733136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,67:0.45:149
chr8	52733340	rs35006940	A	AT	1320.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=26;PP=789;SC=TCTATTGTTTATTTTTTTCAT;SOR=1.714;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=27;WE=52733348;WS=52733330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr8	52746153	rs9298462	C	T	4501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=72;PP=2609;SC=GGTCTTTCTGCACTCCAGCTC;SOR=0.753;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=152;TCF=79;TCR=73;TR=151;WE=52746161;WS=52746143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr8	52811681	rs10106734	A	G	1783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=37;PP=1106;SC=TGCGCAGAGAACCACGGGCAC;SOR=1.503;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=59;TCF=22;TCR=37;TR=59;WE=52811689;WS=52811671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr8	52811758	rs13263909	C	T	292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=9;PP=229;SC=GCCCCGCCCCCCTCAGGGCTC;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=52811766;WS=52811748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr8	53452359	.	TA	T	61.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.000;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.05;ReadPosRankSum=3.190;SOR=0.852;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,11:0.19:59
chr8	53543263	.	TTTGGTTA	T	817.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=14;PP=843;SC=CATTAGTAAATTTGGTTAGAT;SOR=2.948;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=15;WE=53543277;WS=53543253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr8	53548691	rs7818347	T	C	659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=17;PP=496;SC=TTCAAGATTTTAGAAATTAAA;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=53548699;WS=53548681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr8	53570529	rs12708142	C	A	2575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=46;PP=1719;SC=ACACTAATGACGAAAACTGTT;SOR=0.959;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=40;TCR=46;TR=86;WE=53570537;WS=53570519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr8	53853160	rs75387626	T	C	8016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=142;NR=131;PP=2965;SC=GCCGGCTGCATGCCATGCGGC;SOR=0.720;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=273;TCF=142;TCR=131;TR=273;WE=53853168;WS=53853150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,302:1.00:302
chr8	54866491	rs6981243	C	A	1056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=4;PP=744;SC=TGAGGAAATGCGAACAGTTCT;SOR=3.321;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=32;WE=54866499;WS=54866481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr8	55371080	rs71554162	C	CAG	2276.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=28;PP=1416;SC=AAACCCCAAACTGTTCTTTGC;SOR=1.893;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=28;WE=55371088;WS=55371070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr8	55537138	rs429668	T	C	231.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=1;PP=147;SC=CTCTTTCTTTTTTTGCTGCCT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=55537146;WS=55537128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr8	55539057	rs444772	G	A	3514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=58;PP=2093;SC=CAGAAAAAACGTAAAGGGGAT;SOR=0.808;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=115;TCF=57;TCR=58;TR=115;WE=55539065;WS=55539047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr8	55541450	rs446227	G	A	6937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=133;NR=94;PP=2965;SC=TTCCAGGAAAGCAAGTCTTTA;SOR=0.969;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=227;TCF=133;TCR=94;TR=227;WE=55541458;WS=55541440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr8	55541513	rs414352	T	C	8933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=165;NR=149;PP=2965;SC=TAGTAGTTCATCTATGTTGCA;SOR=0.754;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=314;TCF=165;TCR=149;TR=314;WE=55541521;WS=55541503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,336:1.00:336
chr8	55541617	rs441800	A	G	7920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=125;NR=122;PP=2965;SC=GTACAAAACAAAATGATGATA;SOR=0.707;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=247;TCF=125;TCR=122;TR=247;WE=55541625;WS=55541607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,284:1.00:284
chr8	55565241	rs417969	G	T	347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=289;SC=TCTTCTTAATGAATTGACCCC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=55565249;WS=55565240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr8	55586301	rs4014240	A	AAAC	492.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=1;PP=394;SC=GCCTGTCTCAAAACAACAACA;SOR=3.611;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=8;WE=55586309;WS=55586291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr8	55590975	rs382476	G	A	284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=1;PP=243;SC=GTATTATTAGGCCATATTTAT;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=55590983;WS=55590965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr8	55592336	rs405226	A	G	1099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=12;PP=742;SC=TGGTGTTTTCATTTGTTTTGC;SOR=1.900;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=28;TCR=12;TR=40;WE=55592344;WS=55592326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr8	56047961	rs78435240	T	C	602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=0;PP=509;SC=ATAGTAGATATGCAATATATA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=19;WE=56047969;WS=56047951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr8	56637895	rs10098084	T	A	1103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=31;PP=841;SC=TATTGTACTTTTGCAAATAAC;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=7;TCR=31;TR=38;WE=56637903;WS=56637885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr8	56656195	rs7836019	T	C	4753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=97;PP=2965;SC=TTAGAGTAAATACAATCATTT;SOR=1.511;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=151;TCF=53;TCR=98;TR=150;WE=56656203;WS=56656185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr8	56686224	rs1818	T	C	3724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=44;PP=2318;SC=TTTCTCTTCATTGAGGAGCGG;SOR=1.364;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=125;TCF=80;TCR=45;TR=124;WE=56686232;WS=56686214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr8	56717529	rs34860495	G	A	5352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=92;PP=2965;SC=CAAGTGTGACGTTGTAGTAGA;SOR=1.056;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=168;TCF=76;TCR=92;TR=168;WE=56717537;WS=56717519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr8	56911861	rs2175487	A	G	443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=0;PP=382;SC=CCTGGGTGACAAGAGTGAAAC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=56911869;WS=56911851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr8	57125270	rs6474051	T	C	2177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=21;PP=1496;SC=CTCGATGTTGTAATTCAGCCC;SOR=1.670;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=52;TCR=21;TR=73;WE=57125278;WS=57125260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr8	57129291	rs62515433	A	T	3035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=58;PP=1855;SC=CCTCTAAGCTATAAGAATGCA;SOR=1.462;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=36;TCR=58;TR=94;WE=57129299;WS=57129281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr8	57295200	rs7002482	C	T	2679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=59;PP=1768;SC=TATAAATGCACTTTGTCAATA;SOR=1.994;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=25;TCR=59;TR=84;WE=57295208;WS=57295190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr8	57349380	rs13268089	C	T	1608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=13;PP=1210;SC=AAAACTTGTTCTTTGTGGGAG;SOR=2.522;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=42;TCR=13;TR=55;WE=57349388;WS=57349370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr8	57353826	rs3839874	AG	A	4257.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=35;PP=2909;SC=TAGTGGGAAAAGATATTAAAA;SOR=1.456;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=73;TCF=37;TCR=36;TR=69;WE=57353834;WS=57353816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr8	57358563	rs3840716	CG	C	3338.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=7;NR=48;PP=2111;SC=GGGCGCAGAACGGGGTCCCTC;SOR=1.122;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=60;TCF=7;TCR=53;TR=55;WE=57358571;WS=57358553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr8	59347184	rs1993453	A	G	1962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=38;PP=1440;SC=TATTAAATAAATGGTTGCTGG;SOR=1.284;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=23;TCR=38;TR=61;WE=59347192;WS=59347174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr8	59352506	rs71557723	TATTA	T	53.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=2;PP=69;SC=TATATCATAATATTAATTGTG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=2;WE=59352517;WS=59352496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr8	59411042	rs2162459	G	A	6883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=101;NR=132;PP=2965;SC=TCAGACACAAGTGTATGATAG;SOR=1.099;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=233;TCF=101;TCR=132;TR=233;WE=59411050;WS=59411032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr8	59512334	rs2680903	G	A	8518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=157;NR=121;PP=2965;SC=GAAGCTCCACGTCGTCAACCA;SOR=0.902;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=278;TCF=157;TCR=121;TR=278;WE=59512342;WS=59512324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,314:1.00:314
chr8	59515756	rs2255834	G	A	5456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=107;NR=74;PP=2847;SC=AGAATTCCACGTGTGGCAGTT;SOR=0.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=181;TCF=107;TCR=74;TR=181;WE=59515764;WS=59515746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr8	59739333	rs4737522	C	T	6571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=133;NR=84;PP=2965;SC=TCAAAGTCTGCGCCGAGATGG;SOR=1.083;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=217;TCF=133;TCR=84;TR=217;WE=59739341;WS=59739323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr8	59764368	.	CAATA	C	197	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=197;QD=50.5;SC=CTGGCATCTACAATAAATAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=59764379;WS=59764358;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,4:0.67:6
chr8	60031589	.	A	T	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=0.000;DP=155;ExcessHet=3.0103;FS=2.351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.90;ReadPosRankSum=-0.576;SOR=0.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,43:0.28:154
chr8	61139280	rs12549573	C	T	844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=3;PP=656;SC=TGCTTTTTGACCTATTTCTTT;SOR=3.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=27;WE=61139288;WS=61139270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr8	61144790	rs73683396	G	T	3930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=79;NR=41;PP=2044;SC=TTTACAAAATGATTTAGAAAT;SOR=1.318;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=120;TCF=79;TCR=41;TR=120;WE=61144807;WS=61144780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr8	61178574	rs7464181	T	C	3464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=55;NR=54;PP=1947;SC=ACAGTTCAAATTCATGCCCTT;SOR=0.912;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=55;TCR=54;TR=109;WE=61178582;WS=61178564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr8	61178676	rs5891756	CT	C	540.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=3;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;NF=0;NR=19;PP=350;SC=ACATTAGAGACTTTTTTTTTT;SOR=2.636;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=19;WE=61178685;WS=61178666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr8	61192534	rs28429093	C	T	502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=15;PP=404;SC=CCCTTGATATCATGAAGAGAG;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=61192542;WS=61192524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr8	61193453	rs7002846	A	G	234.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=1;PP=161;SC=CCCGAAACGCACCAGGGGAGT;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=61193461;WS=61193452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr8	61193522	rs7002871	A	G	2367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.43;SOR=2.746;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr8	61193526	rs7003287	G	A	2714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.92;SOR=2.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr8	61193588	rs10086200	C	T	4805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=61;PP=2757;ReadPosRankSum=1.261;SC=CCCGGACACCCCGACTCGCGG;SOR=0.396;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=159;TCF=98;TCR=61;TR=158;WE=61193596;WS=61193578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,180:0.99:181
chr8	61193760	rs10101374	T	G	2197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=48;PP=1425;ReadPosRankSum=-1.041;SC=GCGCCTTCGCTGGGCGCGGGG;SOR=0.607;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=77;TCF=28;TCR=49;TR=76;WE=61193768;WS=61193750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,80:0.99:81
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chr8	61471310	rs76795709	A	T	976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=21;NR=11;PP=606;SC=GATTATTCACAGTGCACCAGA;SOR=1.308;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=21;TCR=11;TR=32;WE=61471318;WS=61471300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
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chr8	61496950	rs3735826	C	T	619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=17;PP=452;SC=CTTTCTGCCCCGGCTACTCAC;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=61496958;WS=61496940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr8	61655690	rs7836586	G	A	877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=27;PP=711;SC=CTGCATTGCAGTGTGAAATTC;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=61655698;WS=61655680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr8	61707725	rs4540437	G	A	3525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=65;PP=2092;SC=TTGGTTATTTGGCATGGGTAA;SOR=1.135;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=48;TCR=65;TR=113;WE=61707733;WS=61707706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr8	61713126	rs5891777	A	ATGGACT	6478.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.49;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=45;PP=2957;SC=CATTTTAAAGATGGACTAGAA;SOR=0.874;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=64;TCF=13;TCR=51;TR=57;WE=61713134;WS=61713116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr8	61713231	rs3890803	C	A	872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=23;PP=642;SC=ATGGGAAATTCGTTGTTTAGC;SOR=3.767;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=61713239;WS=61713221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr8	61714190	rs41272438	A	T	4941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=101;PP=2965;ReadPosRankSum=0.339;SC=TGTGAGGTGTATGTGACTCTT;SOR=1.386;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=166;TCF=64;TCR=102;TR=164;WE=61714198;WS=61714180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,181:0.99:183
chr8	61714245	rs10448027	A	G	1766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.96;SOR=2.119;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr8	61732521	rs6471902	A	G	2430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=60;NR=20;PP=1722;SC=ATTTCATCTTAGGAAATAAGT;SOR=1.911;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=60;TCR=20;TR=80;WE=61732529;WS=61732511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr8	61734295	rs4509369	A	G	2344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=53;NR=23;PP=1496;SC=ATATATGTATATGTATGTATG;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=53;TCR=23;TR=76;WE=61734303;WS=61734285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr8	61748893	rs7005873	C	A	807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=17;PP=417;SC=AATTACCTTCCCAGGGGTCCA;SOR=1.284;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=11;TCR=17;TR=28;WE=61748901;WS=61748883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr8	61750860	rs7844902	A	G	5023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=102;PP=2965;SC=GAAGCATGACAGAGTTCATGT;SOR=1.447;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=169;TCF=66;TCR=103;TR=168;WE=61750868;WS=61750850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr8	61764076	rs4342642	A	G	371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=280;SC=TAGGATAACTATTTCTTTGAT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=61764084;WS=61764066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr8	61851466	rs3748648	T	C	3495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=61;PP=2193;SC=GAGTCTGATCTCCTACAGCTG;SOR=0.895;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=53;TCR=61;TR=114;WE=61851474;WS=61851456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr8	62289060	rs10957192	C	T	217.96	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.6715;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=157;ReadPosRankSum=0.674;SC=ACCCTCCAGGCGGGGTTCATG;SOR=1.802;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=9;WE=62289068;WS=62289053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,9:0.90:10
chr8	62371260	rs2291607	C	T	322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=213;SC=AAACTGAAAACAAATGGGGCT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=62371268;WS=62371250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr8	62416074	rs7005617	G	A	2670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=36;PP=1345;SC=AGGTCCTGCAGCAGAAAGACA;SOR=0.734;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=48;TCR=36;TR=84;WE=62416082;WS=62416064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr8	62416173	rs16918881	G	A	728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=17;PP=470;SC=AACAACCTTTGGGACATAACC;SOR=1.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=24;WE=62416181;WS=62416163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr8	62438530	rs4738904	A	G	1448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=12;PP=1072;SC=GAAGTCAGAAACTCACCTTGC;SOR=2.078;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=34;TCR=12;TR=46;WE=62438538;WS=62438520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr8	62460886	rs10113272	A	G	510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.29;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr8	62460894	rs16927479	G	A	477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=53.09;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr8	62475160	rs3802287	A	G	58.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=0;PP=37;SC=ATGTTAAAACATAGTTTAGAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=62475168;WS=62475150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr8	62475276	rs3802286	C	T	2275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=21;PP=1370;SC=CTTAATTTGACGTAGTTAATA;SOR=1.525;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=55;TCR=21;TR=76;WE=62475284;WS=62475266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr8	62475518	rs3824269	G	C	450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=13;PP=356;SC=TAAGTCATGAGAGACTATTCA;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=62475526;WS=62475508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr8	62479934	rs10090754	C	T	3614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=81;PP=2355;SC=TTTGTAATTACCCAAAATATT;SOR=1.743;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=37;TCR=81;TR=118;WE=62479942;WS=62479924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr8	62538944	rs78469859	T	A	1108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=42;PP=847;ReadPosRankSum=-0.353;SC=ACAAAGTAATTTTTTTTTTTT;SOR=1.568;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=62;TCF=16;TCR=46;TR=57;WE=62538952;WS=62538932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,49:0.94:52
chr8	62545288	rs2882462	C	T	2030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=28;NR=38;PP=1041;SC=AGGCATCCCACATATAACTAA;SOR=1.252;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=28;TCR=39;TR=66;WE=62545296;WS=62545278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr8	62550936	rs998427	A	C	2494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=3.372;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.95;ReadPosRankSum=-1.231;SOR=0.519;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,99:0.99:100
chr8	62563764	rs7016141	A	G	983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=22;PP=615;SC=TGACATTGGTACATACACATT;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=29;WE=62563772;WS=62563754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr8	62593664	rs62505969	T	G	980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=24;PP=718;SC=TATTATAACTTAGTGAAGTCA;SOR=1.819;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=34;WE=62593672;WS=62593654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr8	62595068	rs3750278	C	T	3997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=56;NR=71;PP=2235;SC=AACATGAAAACTGTTATTTGT;SOR=1.163;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=56;TCR=72;TR=127;WE=62595076;WS=62595058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr8	63161462	rs2272014	G	A	790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=4;PP=621;SC=CCGCCCCGCCGGGAAACTAAC;SOR=3.690;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=27;WE=63161470;WS=63161453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr8	63161612	rs2272013	C	G	5216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=82;PP=2965;SC=CAGTCAGCGCCGCTCGGACGC;SOR=0.798;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=181;TCF=99;TCR=82;TR=181;WE=63161620;WS=63161602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr8	63161829	rs5020321	C	A	587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=17;PP=432;SC=CTCCCCACCGCCTGGCTGGGC;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=63161837;WS=63161819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr8	63257441	rs4442138	T	G	245.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=178;SC=CATTAAATTGTTAGATAACTT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=63257449;WS=63257431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr8	63296132	rs10808724	T	G	2772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=40;PP=1475;SC=CCTTTTGGTTTGAAGAACATG;SOR=0.773;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=46;TCR=40;TR=86;WE=63296140;WS=63296122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr8	63659610	rs1319275	G	A	3146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=55;PP=1831;SC=ACGATTACACGTACGTCTCTG;SOR=0.853;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=108;TCF=53;TCR=55;TR=108;WE=63659618;WS=63659600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr8	63942717	rs4617146	C	T	2912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=58;NR=37;PP=1653;SC=ACCAATGCTGCCAACTTACCC;SOR=0.936;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=58;TCR=37;TR=95;WE=63942725;WS=63942707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr8	63948073	rs12682204	C	G	873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=7;PP=609;SC=CCAGGTTGGCCTGGCTGGTCT;SOR=2.235;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=33;WE=63948081;WS=63948063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr8	63948134	rs6998383	A	G	2124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=53;NR=31;PP=1521;SC=AAAGTGCTAGAATTACAGGCA;SOR=0.928;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=53;TCR=31;TR=84;WE=63948142;WS=63948124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr8	63948185	rs199816014	TAA	T	5627.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=16;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=12;NR=59;PP=1015;SC=TTATACAGAGTAAAAAAAAAA;SOR=0.950;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=94;TCF=17;TCR=77;TR=71;WE=63948206;WS=63948175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr8	63948198	rs34099334	A	C	6418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=74;NR=71;PP=2586;SC=AAAAAAAAAAAAAACACTGAA;SOR=1.056;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=148;TCF=75;TCR=73;TR=145;WE=63948206;WS=63948175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr8	63951237	rs11545077	C	T	8763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=157;NR=137;PP=2965;SC=GGCTTCTTGGCGGTGTCGCCG;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=294;TCF=157;TCR=137;TR=294;WE=63951245;WS=63951227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,334:1.00:334
chr8	63951312	rs1800909	A	G	5016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=87;PP=2741;SC=CACAGCAGGCAGCCCGGACTG;SOR=1.075;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=159;TCF=72;TCR=87;TR=159;WE=63951320;WS=63951302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr8	63978658	rs5891887	TA	T	4549.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=105;PP=2467;SC=CCCAGTGTGCTAAAAAAAATA;SOR=1.653;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=121;TCF=4;TCR=117;TR=108;WE=63978666;WS=63978648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr8	64098729	rs58419856	A	AG	2964.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=16;PP=1901;SC=CACCAATGTCAATCCATACAT;SOR=1.917;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=30;TCR=16;TR=46;WE=64098737;WS=64098719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr8	64098881	.	T	C	5621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=90;PP=2965;SC=TACCAGATGGTGTATTTAGTC;SOR=0.703;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=188;TCF=98;TCR=90;TR=188;WE=64098889;WS=64098871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr8	65290650	rs298212	C	T	3802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=70;NR=56;PP=2091;SC=AAGACCAGCTCTCAGCTCTCT;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=126;TCF=70;TCR=56;TR=126;WE=65290658;WS=65290640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr8	65488779	.	G	T	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.251;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.076;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=93;ReadPosRankSum=0.443;SC=CCCACACCTAGCTCCCTCAGC;SOR=0.204;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=12;WE=65488787;WS=65488769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,12:0.34:35
chr8	65711004	rs7842714	T	A	1723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.52;SOR=0.723;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr8	66620359	rs13274205	G	A	4416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=89;PP=2768;ReadPosRankSum=0.659;SC=AAAGGGAGGTGATACAGGATT;SOR=1.439;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=146;TCF=55;TCR=91;TR=143;WE=66620367;WS=66620349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,160:0.99:162
chr8	66657769	.	T	C	765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=19;PP=534;SC=TTTGGAGATATTCCATAGAGA;SOR=1.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=27;WE=66657777;WS=66657759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr8	67068131	rs2446433	T	C	1319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=32;PP=1008;SC=AAGACCTCTTTCTGAGGAGAA;SOR=3.664;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=5;TCR=32;TR=37;WE=67068139;WS=67068121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr8	67411019	rs2251827	T	C	1759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=10;PP=1228;SC=AAATTTAAAATCTATGAAATA;SOR=2.457;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=47;TCR=10;TR=57;WE=67411027;WS=67411009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr8	67755920	rs7008720	C	A	230.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=5;PP=101;SC=TGAACCCAAACCCACATTAGG;SOR=2.093;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=67755928;WS=67755910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr8	67759411	rs374703407	CT	C	45.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=3.349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.99;ReadPosRankSum=0.070;SOR=0.117;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr8	67813633	rs2358008	A	G	1795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=42;PP=1223;SC=TTCAAATGATATGTTTAATTA;SOR=2.419;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=13;TCR=42;TR=55;WE=67813641;WS=67813623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr8	67973984	rs7812572	C	A	1931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=13;PP=1269;SC=CTGTCCCCCTCCCAGTCGGTG;SOR=2.439;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=52;TCR=13;TR=65;WE=67973992;WS=67973974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr8	68183864	.	G	A	310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=1;PP=213;SC=ACTTTGCAGTGTATTCAAATA;SOR=3.442;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=68183872;WS=68183854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr8	68334940	.	CA	C	241.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.257;ClippingRankSum=0.000;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=10.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.55;ReadPosRankSum=0.189;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,20:0.29:68
chr8	68536470	rs10957393	A	G	2157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=46;PP=1368;SC=TTGGGAATAAATCTTATCACT;SOR=1.580;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=25;TCR=46;TR=71;WE=68536478;WS=68536460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr8	68864728	rs61753697	G	A	3215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=39;PP=1766;SC=AGCTCCAGAAGACCGAGCGGG;SOR=0.856;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=60;TCR=39;TR=99;WE=68864736;WS=68864718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr8	69358772	rs16934634	A	G	1051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=28;PP=795;SC=AAAGGTATTAATTGAAGCCCA;SOR=3.321;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=33;WE=69358780;WS=69358762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr8	69728008	rs16935099	A	G	2002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=12;PP=1305;SC=ATGTAGTTTTAATATTAATTT;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=46;TCR=12;TR=58;WE=69728016;WS=69727998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr8	69730432	rs16935106	G	A	808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=8;PP=439;SC=ATGTAAACATGTTATTAAGCA;SOR=1.402;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=28;WE=69730440;WS=69730422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr8	69730488	rs16935109	G	C	1615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=24;PP=855;ReadPosRankSum=1.694;SC=GTGAAACAGAGAGAAGAAGTT;SOR=0.223;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=56;TCF=31;TCR=25;TR=55;WE=69730496;WS=69730478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,62:0.98:63
chr8	70498501	rs2241882	G	A	1041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=1;PP=809;SC=TTGTTTTACCGTCTCTTTTTC;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=31;WE=70498509;WS=70498491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr8	70505272	rs4737996	A	G	6289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=108;NR=114;PP=2965;SC=AATTCATGTGATTGTTTGAAG;SOR=0.834;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=222;TCF=108;TCR=114;TR=222;WE=70505280;WS=70505262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr8	70513855	rs752040	A	G	6525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=137;NR=77;PP=2965;SC=TACCAGCACAATTGATTCTGA;SOR=1.387;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=214;TCF=137;TCR=77;TR=214;WE=70513863;WS=70513845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr8	70514116	rs1155965	A	G	615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=16;PP=426;SC=AAGTGTGTCTAAGATAATTCA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=70514124;WS=70514106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr8	70516940	.	G	T	169	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MMLQ=20;MQ=60.0;NF=10;NR=0;PP=169;QD=20.3771212547;SC=TAAAGAATGTGGAGTCATGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=10;WE=70516948;WS=70516930;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,10:0.91:11
chr8	70516969	rs4737284	G	A	189.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.11;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr8	70539911	rs4738002	G	A	541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=0;PP=414;SC=ATGAATAGCTGTTATTACAGA;SOR=4.514;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=70539919;WS=70539908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr8	70540216	rs3802275	C	T	2444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=53;PP=1609;SC=TCATAGAGTACGATAACCTAA;SOR=1.637;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=23;TCR=53;TR=76;WE=70540224;WS=70540206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr8	70554689	rs7814130	A	G	741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=23;PP=625;SC=ACTGTCCTCAATCTGCCCCAC;SOR=4.255;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=24;WE=70554697;WS=70554679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr8	71071695	rs2272670	C	T	494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=1;PP=391;SC=GTAATATCTCCTCTTAACTTG;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=71071703;WS=71071685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr8	71082718	rs2958370	A	G	722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=21;PP=587;SC=ATTCACACACAGATAGAAAAG;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=71082726;WS=71082708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr8	71129120	rs71558586	A	AAC	494.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=420;SC=ACCAGTAATTAACATTGTTTT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=10;WE=71129128;WS=71129110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr8	71486568	rs268566	G	C	2068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=45;NR=26;PP=1373;SC=GTGTTGTAACGATTATTATGT;SOR=1.194;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=45;TCR=26;TR=71;WE=71486576;WS=71486558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr8	71495308	rs145198874	GAC	G	986.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=0;PP=781;SC=TTCTTTATAAGACACCTTAAA;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=71495317;WS=71495298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr8	71495847	rs61065292	A	G	1991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=16;PP=1287;SC=TATATTATCTAGCTGTATAAA;SOR=2.070;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=43;TCR=16;TR=59;WE=71495855;WS=71495837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr8	71499109	rs61412217	T	C	2292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=28;PP=1377;SC=ACACGAGAAATAGAATGGCTA;SOR=1.065;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=47;TCR=28;TR=75;WE=71499117;WS=71499099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr8	71510093	rs268626	A	G	4559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=54;PP=2890;SC=AATCTTAGATAAGGAAGGAGA;SOR=1.310;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=151;TCF=95;TCR=56;TR=149;WE=71510101;WS=71510083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr8	71550058	rs268571	G	C	1239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=14;PP=823;SC=ACCATTCTCTGAAAGCAAAAT;SOR=1.414;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=29;TCR=14;TR=43;WE=71550066;WS=71550048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr8	71550144	rs35571096	A	G	2651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=47;NR=45;PP=1539;SC=GCTAACTGTAAAAAGAAAATC;SOR=0.795;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=92;TCF=47;TCR=45;TR=92;WE=71550152;WS=71550134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr8	71550904	rs376185421	T	TA	281.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=194;SC=CCTTTTTTTTTAAAAAAAAGA;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=9;WE=71550912;WS=71550894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr8	71574251	rs17760050	A	T	710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=19;PP=502;SC=TTTAACATGCACAAAAACCAG;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=25;WE=71574259;WS=71574241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr8	71593425	rs6991329	G	A	3626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=49;PP=2002;SC=GTGCTTTAGCGTTAAGCTTTA;SOR=0.883;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=70;TCR=49;TR=119;WE=71593433;WS=71593415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr8	71646403	rs146661853	G	C	2655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=40;PP=1651;SC=CCAATGTCTTGTTATTATATT;SOR=0.735;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=44;TCR=40;TR=84;WE=71646411;WS=71646393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr8	72914638	rs12544348	G	A	3798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=77;PP=2245;SC=GGATGAAGACGTCGTTATTTT;SOR=1.559;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=122;TCF=45;TCR=77;TR=122;WE=72914646;WS=72914628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr8	72942210	rs3824151	G	T	8745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=-1.880;NF=118;NR=166;PP=2965;ReadPosRankSum=2.983;SC=CCAATCTGAAGTATGACACAA;SOR=1.123;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=287;TCF=120;TCR=167;TR=284;WE=72942218;WS=72942200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,325:0.99:327
chr8	72948588	rs13280644	C	T	3611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=65;NR=53;PP=1863;SC=ATTGCCACTGCAGATGAGCTG;SOR=0.722;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=118;TCF=65;TCR=53;TR=118;WE=72948596;WS=72948578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr8	72952123	rs3214737	G	GT	408.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=339;SC=TTATAACTGTGTTTGGTATTG;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=9;WE=72952131;WS=72952113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr8	72952145	rs2044271	C	T	229.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=5;PP=104;SC=AAAAGTAACACCTATTTTAGA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=72952153;WS=72952135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr8	72958691	rs11349767	TA	T	178.06	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.70;ReadPosRankSum=1.744;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr8	72959383	rs143973551	A	G	2485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=31;PP=1492;SC=ATAAACTTACATAATAGTCTC;SOR=1.313;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=59;TCR=31;TR=90;WE=72959391;WS=72959373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr8	72959535	rs13255063	T	A	2157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=43;PP=1205;SC=CACAAGACATTCCCTTTCCTT;SOR=1.552;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=23;TCR=43;TR=66;WE=72959543;WS=72959525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr8	72962985	rs2120474	G	A	624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=6;PP=428;SC=GCATAAACCCGGGAAGAATTT;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=21;WE=72962993;WS=72962975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr8	72963109	rs35427625	G	A	2348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=46;NR=41;PP=1427;SC=CATCCCATCTGTAAAAAATAA;SOR=0.738;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=46;TCR=41;TR=87;WE=72963117;WS=72963099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr8	72963135	rs1025927	A	G	2185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=41;PP=1374;SC=TAAGATAAGCACAGGTCTTCA;SOR=0.934;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=77;TCF=36;TCR=41;TR=77;WE=72963143;WS=72963125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr8	72963258	rs1025928	T	C	449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=13;PP=318;SC=GGAACCAACATGTAAAGCAAG;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=17;WE=72963266;WS=72963248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr8	72969220	.	G	A	1048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=28;NR=9;PP=829;SC=AGAAAATTACGTCCAAAATTA;SOR=2.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=28;TCR=9;TR=37;WE=72969228;WS=72969210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr8	73921534	rs113373855	G	GGAGGTCGGGAGA	2002.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=6;NR=13;PP=2972;SC=CGTCGCCGAGGGAGGGGCTGC;SOR=0.941;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=24;TCF=8;TCR=16;TR=19;WE=73921542;WS=73921524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr8	73926236	rs2975841	T	G	956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=19;NR=13;PP=556;SC=GTAAATATGTTTTTTTATTTT;SOR=0.927;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=19;TCR=13;TR=32;WE=73926244;WS=73926226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr8	73926325	rs34859101	A	C	1236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.24;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr8	73982161	rs2291219	A	G	3419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=52;NR=64;PP=1980;SC=GTCAAGGGCCAGTTTTCCAGA;SOR=1.117;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=52;TCR=64;TR=116;WE=73982169;WS=73982151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr8	73983988	rs3830249	TAA	T	7009.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.102;HP=15;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=43;PP=2071;ReadPosRankSum=1.502;SC=AAAACATGATTAAAAAAAAAA;SOR=1.019;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=119;TCF=58;TCR=61;TR=81;WE=73984002;WS=73983977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,163:0.99:164
chr8	73983994	rs114487364	A	T	4663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.527;HP=14;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=48;PP=2126;ReadPosRankSum=0.864;SC=TGATTAAAAAAAAAAAAAAAC;SOR=1.143;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=164;TCF=107;TCR=57;TR=144;WE=73984002;WS=73983977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,167:0.98:170
chr8	73993200	rs10087744	T	G	3067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=32;PP=1716;ReadPosRankSum=1.637;SC=TAGGATGAAGTGGTCAAAAAG;SOR=0.436;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=93;TCF=61;TCR=32;TR=92;WE=73993208;WS=73993190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,112:0.99:113
chr8	74203576	rs4394387	G	A	938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=27;PP=757;SC=GCTGTGAGATGAAAACATAAC;SOR=3.912;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=30;WE=74203584;WS=74203566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr8	74234193	rs9298224	G	A	6742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=106;NR=118;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.005;SC=GTGTCTGTGTGAACATGTGTG;SOR=0.899;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=226;TCF=107;TCR=119;TR=224;WE=74234206;WS=74234182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,243:0.99:245
chr8	74440125	rs143916422	T	TCAGGAAAATTCAAATAATTTA	4486.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=20;PP=2965;SC=GGTCTAGATTTCACAGAACAC;SOR=3.080;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=0;TCR=56;TR=20;WE=74440133;WS=74440115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr8	74463089	rs3088139	T	G	2588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=47;NR=50;PP=1517;SC=TTCGGTGAAGTGAAAAAAAAA;SOR=0.856;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=47;TCR=50;TR=97;WE=74463097;WS=74463079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr8	74463724	rs79320778	TTTAA	T	1952.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.245;NF=14;NR=25;PP=1968;ReadPosRankSum=-1.667;SC=AAATATCATGTTTAATTAACT;SOR=1.022;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=43;TCF=16;TCR=27;TR=39;WE=74463735;WS=74463714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,75:0.97:77
chr8	74463797	rs10112019	T	C	2759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=55;NR=37;PP=1700;SC=ATACTAGCAATAGAATGCAAA;SOR=0.905;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=93;TCF=56;TCR=37;TR=92;WE=74463805;WS=74463787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr8	74473876	rs28418483	G	A	8161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=137;NR=148;PP=2965;SC=AATGTCTACCGCAGCAGCTTC;SOR=0.781;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=286;TCF=138;TCR=148;TR=285;WE=74473884;WS=74473866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,305:1.00:305
chr8	74581290	rs11419133	A	AG	10974.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=97;PP=2957;SC=CAAGGAAAAGACATCTCCTTG;SOR=0.700;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=129;TCF=31;TCR=98;TR=128;WE=74581309;WS=74581280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,273:1.00:273
chr8	74782696	rs34722969	T	C	616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=17;PP=514;SC=TAAAAGATAATTCACCAATTC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=74782704;WS=74782686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr8	74917084	rs6472812	A	G	5326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=67;PP=2729;SC=AGAATTGAAAAGATCCAAAGG;SOR=0.776;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=159;TCF=92;TCR=67;TR=159;WE=74917092;WS=74917074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr8	75227885	rs16938872	G	A	2966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=49;NR=52;PP=1658;SC=AGCACCGTGAGTCGGGGGCAG;SOR=0.903;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=49;TCR=52;TR=101;WE=75227893;WS=75227875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr8	75262798	rs7828201	G	C	7815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=134;NR=117;PP=2965;SC=GGACGCATTCGTTCAGCTCTC;SOR=0.728;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=251;TCF=134;TCR=117;TR=251;WE=75262816;WS=75262788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,291:1.00:291
chr8	75262841	rs4321999	G	A	6304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=111;PP=2965;SC=GGCGGAGGGTGGCGCGGATCG;SOR=1.047;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=202;TCF=91;TCR=111;TR=202;WE=75262849;WS=75262831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr8	75272287	rs3780014	T	C	564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=1;PP=404;SC=ATGTTAATGATGAGTGGATAG;SOR=4.514;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=75272295;WS=75272281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr8	75275312	rs4463412	C	T	2496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=40;PP=1344;SC=TATATTCTTTCTCTCTTTTCA;SOR=1.095;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=38;TCR=40;TR=78;WE=75275320;WS=75275302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr8	75460784	rs150212729	T	TG	322.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=1;PP=304;SC=GTGAAGTTTTTGAAGAGTATT;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=75460797;WS=75460774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr8	75460789	rs150990986	A	AG	322.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=1;PP=222;SC=GTTTTTGAAGAGTATTGCCAC;SOR=2.833;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=6;WE=75460797;WS=75460774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr8	75460940	rs66692547	T	C	917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=19;PP=433;SC=TTTCACATGTTGTTTTTAACA;SOR=1.121;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=15;TCR=19;TR=34;WE=75460948;WS=75460930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr8	75737770	.	CT	C	249.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=0.000;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=2.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.55;MQRankSum=2.468;QD=5.20;ReadPosRankSum=-0.105;SOR=1.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,20:0.42:48
chr8	75761538	.	G	T	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.085;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.675;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=143;ReadPosRankSum=1.094;SC=ACATGGGCATGTATATATATA;SOR=2.538;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=8;TCR=34;TR=10;WE=75761546;WS=75761528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,10:0.22:46
chr8	76452313	rs2943549	G	A	3127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=71;PP=2026;SC=TATAATTCAAGTGGTGAGTTA;SOR=2.024;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=30;TCR=71;TR=101;WE=76452321;WS=76452303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr8	76452421	rs2943551	G	A	292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=7;PP=154;SC=TTGCTGGAGAGTTTAGGGCTT;SOR=2.494;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=76452429;WS=76452411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr8	76459726	rs1800922	G	A	838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=6;PP=588;SC=TTATCGAACCGAATTTGACAA;SOR=2.546;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=27;WE=76459734;WS=76459716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr8	76463571	rs2272668	T	C	1713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=26;PP=1233;SC=ATCTATATTCTAACATACACT;SOR=1.112;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=68;TCF=42;TCR=26;TR=66;WE=76463579;WS=76463561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr8	76465522	rs1800924	T	G	713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=18;PP=529;SC=TAATGCATATTCTATATTACT;SOR=1.893;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=25;WE=76465530;WS=76465512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr8	76468139	rs2941468	C	G	130.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=60;SC=AAAGAACACTCTAAGTTAACA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=76468147;WS=76468129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr8	76468282	rs1805098	G	A	664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=17;NR=10;PP=422;SC=GATCCATGATGTATAAAGATA;SOR=1.302;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=28;TCF=17;TCR=11;TR=27;WE=76468290;WS=76468272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr8	76468309	rs61003427	GTT	G	872.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=5;NR=10;PP=280;SC=TTTTGGGTAAGTTTTTTTTTT;SOR=1.022;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=15;WE=76468318;WS=76468299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr8	76472485	rs2941472	G	A	913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=2;PP=593;SC=CAAAAATAGCGATATTTAAGC;SOR=3.056;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=27;WE=76472493;WS=76472475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr8	76472560	rs2941473	A	T	4010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=40;PP=2325;SC=CTAACACAGCATCTTTTTATC;SOR=1.382;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=128;TCF=88;TCR=40;TR=128;WE=76472568;WS=76472550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr8	76476396	rs1805100	G	A	2926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=63;PP=1937;SC=AAATATCTCAGGATAGCACTT;SOR=1.632;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=33;TCR=63;TR=96;WE=76476404;WS=76476386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr8	76476457	rs2272669	G	A	810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=26;PP=678;SC=ATAAGATGGTGTCCTATTTTC;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=28;WE=76476465;WS=76476447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr8	77768068	.	C	T	8023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=125;NR=145;PP=2965;SC=TCTGCCCAAACGCGTAGTCCA;SOR=0.915;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=271;TCF=125;TCR=146;TR=270;WE=77768076;WS=77768058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,296:1.00:296
chr8	77776848	rs3830275	TA	T	157.27	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.73;ReadPosRankSum=1.645;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,9:0.90:10
chr8	77879257	rs7000529	T	C	1038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=24;PP=716;SC=CCATTGCCTTTTCCTTTGGTA;SOR=1.949;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=33;WE=77879265;WS=77879247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr8	77895865	rs10087163	A	G	8110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.438;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=156;NR=119;PP=2965;ReadPosRankSum=1.030;SC=CCAACTTCACATATGTTTTGA;SOR=0.545;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=276;TCF=156;TCR=120;TR=275;WE=77895873;WS=77895855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,308:1.00:309
chr8	77911986	rs137919839	CTG	C	5324.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=30;PP=2982;SC=TCAACTGCAGCTGTGTGTGTG;SOR=1.680;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=84;TCF=49;TCR=35;TR=75;WE=77911995;WS=77911976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr8	79609647	rs35904168	G	A	5034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=63;PP=2965;SC=TTTAGTATAAGCCACCCGCAC;SOR=1.148;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=163;TCF=100;TCR=63;TR=163;WE=79609655;WS=79609637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr8	79652031	rs143357204	C	CA	252.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=233;SC=AATGGTGAAACAAAAAAAACT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=79652039;WS=79652021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr8	79652134	rs11777205	G	A	2065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=28;PP=1379;SC=TGATCAGGCTGCAAATATTAA;SOR=1.164;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=45;TCR=28;TR=73;WE=79652142;WS=79652124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr8	80523667	rs35479042	G	C	432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=15;PP=334;SC=AGGTAGAAGCGGGTAAGTTGC;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=80523675;WS=80523657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr8	80553512	rs13269060	G	A	955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=1;PP=691;SC=CCTATCTCCCGGAATAACAAC;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=28;WE=80553520;WS=80553502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
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chr8	80576923	rs375568053	C	CCTCT	667.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=653;SC=CCCATATTTTCCTTCTGAAAT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=80576931;WS=80576913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr8	80576942	rs34059899	T	C	736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=3;PP=511;SC=ATGGGAAAAATTCATAAAAGT;SOR=3.098;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=24;WE=80576950;WS=80576932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr8	80678300	rs11448857	C	CA	2236.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.614;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.547;NF=32;NR=12;PP=1440;ReadPosRankSum=0.561;SC=TCAACAACAACAAAAAATACA;SOR=2.334;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=57;TCF=39;TCR=18;TR=44;WE=80678308;WS=80678290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,75:0.97:77
chr8	80678865	rs960978	C	A	2115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=19;PP=1408;SC=TCAGAGCCCCCACTAGGTCTA;SOR=1.670;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=51;TCR=19;TR=70;WE=80678873;WS=80678855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr8	80965039	rs3824267	T	A	1859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=45;PP=1343;SC=TGAGAATCTTTTGATACCTAC;SOR=1.999;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=18;TCR=45;TR=63;WE=80965047;WS=80965029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr8	80965070	rs3780010	C	A	1008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.57;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr8	80965739	rs2303446	C	T	516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=17;PP=429;SC=CACAGAACTACATCCAAAATT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=80965747;WS=80965729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr8	81032301	rs4740118	A	T	345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=9;PP=232;SC=AAGTTAAAAGACAAGTGACAG;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=81032309;WS=81032291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr8	81430889	rs140340413	A	AT	551.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=11;PP=438;SC=CATGTTCTGCATTTTTTAAAA;SOR=0.892;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=14;WE=81430897;WS=81430879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr8	81892766	rs2241972	G	A	5803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=105;PP=2965;SC=AAGTAATTCAGCGTTAACAAT;SOR=1.005;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=192;TCF=87;TCR=105;TR=192;WE=81892774;WS=81892756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr8	81897200	rs7006101	C	T	10348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=381;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=170;NR=170;PP=2965;SC=TTCTGTCCACCGAGGCATATT;SOR=0.747;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=340;TCF=170;TCR=170;TR=340;WE=81897208;WS=81897190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,380:1.00:380
chr8	81905314	rs2016459	A	C	6414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=119;NR=97;PP=2965;SC=TTTAAGGCACAGGTATATACA;SOR=0.832;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=217;TCF=119;TCR=98;TR=216;WE=81905322;WS=81905304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr8	81905397	rs2016465	A	G	5823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=109;PP=2965;SC=TGGCGACAGCAGCCAGACTTC;SOR=0.934;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=201;TCF=91;TCR=110;TR=200;WE=81905405;WS=81905387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr8	81905533	rs895267	G	A	293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=8;PP=199;SC=TGGAGGCAGAGAGCTGTGTCC;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=81905541;WS=81905523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr8	82355621	rs6473276	A	G	3021.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=61;NR=36;PP=1679;SC=ACTTCAATGAAGAAATGATTT;SOR=0.990;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=97;TCF=61;TCR=36;TR=97;WE=82355629;WS=82355611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr8	82391183	rs112313579	T	TG	6512.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=87;PP=2936;SC=GGTCAATCACTGGATTAAACC;SOR=1.402;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=96;TCF=6;TCR=90;TR=93;WE=82391191;WS=82391173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr8	82391874	rs2305319	T	C	821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=27;PP=633;SC=AAGAATATATTGCAACAAGAA;SOR=3.477;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=31;WE=82391890;WS=82391864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr8	82392849	rs8192688	G	A	2076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=46;PP=1428;SC=GTTAGGAAAAGAAAAGATGTC;SOR=1.578;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=69;TCF=22;TCR=47;TR=68;WE=82392857;WS=82392834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr8	82392918	rs60855359	G	A	310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=239;SC=GTGCACACAGGTGCATGTGCA;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=82392926;WS=82392908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr8	82439221	rs16909306	A	G	4975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=73;PP=2965;SC=GTCGTTGCAGAAGGTGGGAAG;SOR=0.911;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=162;TCF=88;TCR=74;TR=161;WE=82439229;WS=82439211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr8	82606782	rs2955006	A	G	3222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=54;PP=1812;SC=GCATTAGGATATTTCTATCAA;SOR=0.868;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=56;TCR=54;TR=110;WE=82606790;WS=82606772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr8	82713930	rs61516400	A	AGAGT	444.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=348;SC=CCTTATAGAAAATTTACATAC;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=7;WE=82713938;WS=82713920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr8	85716963	rs11784597	C	A	600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=14;NR=6;PP=340;SC=GAATATACAGCAAATTTTTAT;SOR=1.426;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=20;WE=85716971;WS=85716953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr8	85785413	rs3780004	A	G	1630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=38;NR=12;PP=916;SC=GTCCTATGTGATTTGACACAG;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=38;TCR=12;TR=50;WE=85785421;WS=85785403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr8	85799827	rs10712255	TC	T	933.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=7;PP=446;SC=ATTTGCTTTCTCCCCCCCCCA;SOR=2.517;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=30;TCF=19;TCR=11;TR=23;WE=85799835;WS=85799817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr8	85833034	rs28592585	C	T	73.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=0;PP=52;SC=TTCCCCTGATCTAACCTTAAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=85833042;WS=85833024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr8	85833168	rs13267859	A	G	2308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.30;SOR=0.848;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr8	86126827	rs112611553	C	CAACATT	4107.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=32;PP=2059;SC=GTAGCTTCATCAACTGGTTTG;SOR=0.714;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=39;TCF=5;TCR=34;TR=37;WE=86126835;WS=86126817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr8	86171816	rs4739699	A	G	2964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=58;PP=1800;SC=CACATGGTGGAATTTAAGGGG;SOR=1.440;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=37;TCR=58;TR=95;WE=86171824;WS=86171806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr8	86351051	rs2072696	G	C	327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=8;NR=4;PP=239;SC=GTGTGCGGGGGAGCTACATAA;SOR=1.445;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=12;WE=86351059;WS=86351041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr8	86389195	rs11780942	C	T	394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=257;SC=GTTAATTTCTCTTTATTTTGT;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=86389203;WS=86389185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr8	87076150	rs981711	C	G	694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=23;NR=1;PP=559;SC=TGGAGAAGCCCCACTCTAAAC;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=24;WE=87076158;WS=87076140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr8	87111368	.	GA	G	148.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.158;ClippingRankSum=0.000;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=0.602;QD=1.62;ReadPosRankSum=1.493;SOR=0.601;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,23:0.25:92
chr8	87126151	rs17602780	G	A	5154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=104;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.968;SC=CAATGTACTCGTGCGGATGAC;SOR=1.297;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=175;TCF=70;TCR=105;TR=173;WE=87126159;WS=87126141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,190:0.99:192
chr8	87126178	rs17660682	G	C	3431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.597;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=66;PP=2112;ReadPosRankSum=0.278;SC=CAATTACAGGGTGGGTATCAA;SOR=1.650;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=103;TCF=36;TCR=67;TR=101;WE=87126186;WS=87126168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,117:0.98:119
chr8	87151606	rs2466326	G	C	517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=0;PP=362;SC=TGTACCTAAAGAGTGTGTGTT;SOR=4.294;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=87151614;WS=87151596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr8	87155037	rs17603897	G	A	431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=1;PP=349;SC=ACCATGAAAAGCTGATCTAGA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=87155045;WS=87155027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr8	87155094	rs1483779	T	C	1515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=13;PP=841;SC=TATGATCTTTTTTCTTTTTAA;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=33;TCR=13;TR=46;WE=87155115;WS=87155084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr8	87155225	rs75594898	C	T	1507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=29;PP=853;SC=AAATAAGGTGCTTACATATTT;SOR=1.487;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=17;TCR=29;TR=46;WE=87155233;WS=87155215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr8	87226963	rs76235312	C	G	1532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=41;PP=1221;SC=TGCAAAGATACAAGCTAATTA;SOR=6.273;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=42;WE=87226971;WS=87226953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr8	87235150	rs2976190	C	T	5977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=112;NR=85;PP=2965;SC=ATGATAGTTACGTTGAAAGGA;SOR=0.921;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=197;TCF=112;TCR=85;TR=197;WE=87235158;WS=87235140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr8	87235273	rs2976189	C	T	5875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=101;PP=2965;ReadPosRankSum=1.664;SC=ACTACAGTCACCAGAGGTAAC;SOR=0.995;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=186;TCF=85;TCR=101;TR=185;WE=87235281;WS=87235263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,217:0.99:219
chr8	87241715	rs2954347	A	G	792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=0;PP=553;SC=CACAAAGAAGAAAGAAACATT;SOR=5.058;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=21;WE=87241723;WS=87241705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr8	87452766	rs4961191	A	G	732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=6;PP=382;SC=GCCCCTTGTAAGAACCTTATT;SOR=1.302;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=20;WE=87452774;WS=87452756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr8	87453030	rs10092164	A	G	638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=11;PP=291;SC=TTATCTTTGCACTTTTCCATT;SOR=1.022;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=11;TCR=11;TR=22;WE=87453038;WS=87453020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr8	87470141	rs148927503	AT	A	3145.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=35;PP=2133;SC=TTCTGTGCTCATTTCCCAGGT;SOR=0.855;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=55;TCF=19;TCR=36;TR=54;WE=87470149;WS=87470131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr8	87482324	rs6471352	C	T	484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=0;PP=402;SC=TATAGAATCACGGCCATTTTC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=87482332;WS=87482314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr8	87489396	rs57638937	T	C	185.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=150;SC=AAAAATTGTTTTACAGTATCT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=87489404;WS=87489386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr8	87519315	rs6980476	T	G	5911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=97;NR=91;PP=2965;SC=AAAGGCCTCTTTTGAAAGTTC;SOR=0.796;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=188;TCF=97;TCR=91;TR=188;WE=87519323;WS=87519305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr8	87540872	rs10956871	G	A	1517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=37;PP=1030;SC=TATGTGTGTTGTTTTTGAATA;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=13;TCR=37;TR=50;WE=87540880;WS=87540862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr8	87543280	rs72690455	C	T	1315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=4;PP=914;SC=TTTCTAATGACTTTAAGTGAA;SOR=3.816;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=42;TCF=37;TCR=5;TR=41;WE=87543288;WS=87543270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr8	87544832	rs72690457	A	G	3110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=54;NR=42;PP=1717;SC=GCAGATTTCAAAAAGGTTGTC;SOR=0.728;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=54;TCR=42;TR=96;WE=87544840;WS=87544822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr8	87552426	rs16915389	T	C	1994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.57;SOR=0.744;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr8	87560151	rs10094332	T	C	306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=10;PP=212;SC=GGGCTCATCATGAAGCTCTCA;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=87560159;WS=87560141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr8	87567031	rs2304790	G	A	2009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=20;PP=1248;SC=TAAACACATTGTGCTTGAGAA;SOR=1.885;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=45;TCR=20;TR=65;WE=87567039;WS=87567021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr8	87567193	rs2304789	C	T	4634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=70;NR=81;PP=2581;SC=GCTGCAGCCACGCAACAGCAG;SOR=0.963;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=151;TCF=70;TCR=81;TR=151;WE=87567201;WS=87567183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr8	87567305	rs3816240	A	C	723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=19;PP=454;SC=CATAATACAAAGTCAGGGCAA;SOR=2.147;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=25;WE=87567313;WS=87567295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr8	87568644	rs2304787	T	G	3541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=64;PP=2052;SC=AGGCAGTTGATTAGGTGTGCA;SOR=1.170;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=49;TCR=64;TR=113;WE=87568652;WS=87568634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr8	87570665	rs1062850	A	C	7701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=113;NR=145;PP=2965;SC=CTTTTGTGTTATGTGGAGCAA;SOR=1.029;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=259;TCF=113;TCR=146;TR=258;WE=87570673;WS=87570655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,286:1.00:286
chr8	87570728	rs1062851	C	T	2888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=64;PP=1836;SC=CTTTTTACCCCCAGCATTTAT;SOR=2.165;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=90;TCF=25;TCR=65;TR=89;WE=87570736;WS=87570718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr8	87581682	rs10660354	T	TCA	2477.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=42;PP=1989;SC=ACATGCACACTCACACACACC;SOR=2.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=0;TCR=55;TR=42;WE=87581690;WS=87581672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
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chr8	87666251	rs4961206	T	G	5259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=97;NR=85;PP=2965;SC=TGAAATTTTGTAGAAGTCCTG;SOR=0.713;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=182;TCF=97;TCR=85;TR=182;WE=87666259;WS=87666241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr8	87679303	rs6471482	A	C	4010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=76;NR=53;PP=2272;SC=GTGGTATAAAACAGCAGTTCC;SOR=0.848;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=130;TCF=76;TCR=54;TR=129;WE=87679311;WS=87679293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr8	87680112	rs7815125	T	A	1154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=1;PP=822;SC=TGCAGGTTATTTAATTTAAAT;SOR=5.838;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=32;WE=87680120;WS=87680102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr8	87680406	rs36008065	G	GA	603.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=5.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.85;ReadPosRankSum=0.954;SOR=1.942;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,34:0.72:47
chr8	87683465	rs1441242	C	T	160.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=4;PP=99;SC=ACAATTCAAACATTAGGTTTA;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=87683473;WS=87683455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr8	87899871	rs66493340	T	G	2973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=51;PP=1690;SC=TTTTCTGTCATTCAAATGAAT;SOR=0.956;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=42;TCR=51;TR=93;WE=87899879;WS=87899861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr8	87899960	rs67958512	A	G	837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=19;PP=503;SC=TATCACACAGATAAAAACAGT;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=27;WE=87899968;WS=87899950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr8	87917236	rs10504828	T	G	417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=1;PP=339;SC=ACGTATATATTGAGTTAAAAA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=87917244;WS=87917226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr8	87951714	rs4644279	A	C	243.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=228;SC=TCTGAAAATGACAAATTTTCT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=87951722;WS=87951704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr8	88218202	.	AT	A	61.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.17;ReadPosRankSum=-0.816;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr8	88622043	rs9694259	T	G	3063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=49;PP=1755;SC=TCAGATTGCATCATGGACAAA;SOR=0.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=50;TCR=49;TR=99;WE=88622051;WS=88622033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr8	89339993	.	G	GCA	38	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5032;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=38;QD=20.5;SC=GCGCGCGCGCGCACACACACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=2;WE=89340001;WS=89339987;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:5,2:0.29:7
chr8	89340162	rs16892543	G	C	6872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=129;NR=108;PP=2965;SC=CCCGCGACAAGGGCCCTGGTT;SOR=0.746;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=238;TCF=130;TCR=108;TR=237;WE=89340170;WS=89340152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,269:1.00:269
chr8	90770609	rs39499	A	G	329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=8;PP=232;SC=CAAGCTTGGGAGATAGGGAGC;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=90770617;WS=90770599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr8	90777510	rs431264	G	A	1715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=9;PP=1167;SC=CTTTCTAAGTGTGAAACATAG;SOR=2.872;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=43;TCR=9;TR=52;WE=90777518;WS=90777500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr8	90781953	rs40377	C	T	2024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=18;PP=1203;SC=GACTTTTGGACTTTTTAAAGA;SOR=1.673;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=50;TCR=18;TR=68;WE=90781961;WS=90781943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr8	90792127	rs39506	A	C	704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=4;PP=441;SC=GATTCTCAACACTATTCCATT;SOR=2.124;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=21;WE=90792135;WS=90792117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr8	90914995	.	G	T	3756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.03;SOR=1.280;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr8	90933284	.	AT	A	62.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.518;ClippingRankSum=0.000;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=1.244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.90;ReadPosRankSum=-0.309;SOR=0.467;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,12:0.17:70
chr8	90948273	rs2735384	C	T	2033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.76;SOR=0.920;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr8	90955358	rs7840099	C	T	1650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=9;PP=1047;SC=CTCAGGAATGCTCCTGAATGA;SOR=2.468;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=41;TCR=9;TR=50;WE=90955366;WS=90955348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr8	90955624	rs3736639	T	A	1912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=48;PP=1266;SC=GTACAGTAAATCATATTAACA;SOR=2.269;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=16;TCR=48;TR=64;WE=90955632;WS=90955614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr8	90958422	rs1061302	T	C	1727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=18;PP=1005;SC=TTATGCCAGATGGATTTCTGG;SOR=1.503;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=41;TCR=18;TR=59;WE=90958430;WS=90958412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr8	90958530	rs2308962	T	C	2790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=47;NR=55;PP=1454;SC=TGTTCTTAAATGGGGTTAAGA;SOR=0.995;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=47;TCR=55;TR=102;WE=90958538;WS=90958520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr8	90967711	rs709816	A	G	3286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=60;PP=1936;SC=CAGTGGGTGCATCTTGTGAAA;SOR=0.986;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=50;TCR=60;TR=110;WE=90967719;WS=90967701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr8	90967862	rs1805786	G	T	226.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=6;PP=142;SC=TCGTTAAATAGTTCTAACGTA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=90967870;WS=90967852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr8	90970862	rs1805818	G	T	725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=2;PP=581;SC=TCTCTCTCAAGAGACAACCTG;SOR=4.174;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=25;WE=90970870;WS=90970852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr8	90970898	rs140614752	A	G	1859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=12;PP=1389;SC=TCCTGAATATACTATTAATTT;SOR=2.381;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=47;TCR=12;TR=59;WE=90970906;WS=90970888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
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chr8	90990479	rs1805794	C	G	3429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=49;PP=1926;SC=TTCTTGGACTCAACTGCTTTC;SOR=0.709;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=114;TCF=64;TCR=50;TR=113;WE=90990487;WS=90990469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
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chr8	91017745	rs1805806	T	C	531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=15;PP=405;SC=AAGCTGGGCCTATCAGCTGGA;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=91017753;WS=91017735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr8	91031074	rs1805867	G	A	1283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=13;PP=809;SC=TGGATTCTCTGTATTCTTCAA;SOR=1.659;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=33;TCR=13;TR=46;WE=91031082;WS=91031064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr8	91064036	rs1476590	G	C	3708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=53;PP=2366;SC=ATGTAAAAAGGACATTAAATT;SOR=0.973;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=122;TCF=69;TCR=53;TR=122;WE=91064044;WS=91064026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr8	91884243	rs7813402	A	G	305.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=0;PP=136;SC=CCTTAACTACATACCATCAAT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=91884251;WS=91884233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr8	91884265	rs7830264	C	A	427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=12;NR=1;PP=314;SC=AATAATATAGCTTGGAGACTA;SOR=5.136;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=91884273;WS=91884255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr8	91884534	rs7829663	G	A	1344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=30;PP=790;SC=ATCTTTACCCGTGAATTTTGC;SOR=1.473;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=16;TCR=30;TR=46;WE=91884542;WS=91884524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr8	91893158	.	C	A	41.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr8	91929652	rs34544744	GA	G	1261.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=1.720;HP=16;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.420;NF=26;NR=13;PP=465;ReadPosRankSum=-0.971;SC=CATGGTAAAAGAAAAAAAAAA;SOR=0.381;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=62;TCF=40;TCR=22;TR=39;WE=91929661;WS=91929642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,63:0.88:72
chr8	91940285	rs2019889	T	C	565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=3;PP=409;SC=CATGGATCTATGGAAATCAAT;SOR=2.948;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=91940293;WS=91940275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr8	91940446	rs1002583	C	T	5956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=112;NR=85;PP=2965;SC=TCCCCCTGGCCCCAGGCTTAT;SOR=0.872;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=199;TCF=113;TCR=86;TR=197;WE=91940454;WS=91940436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr8	91953138	rs7018395	G	A	2949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=40;PP=1566;ReadPosRankSum=-0.959;SC=TAAGTGCTCCGACTCCTGCAC;SOR=0.784;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=98;TCF=57;TCR=41;TR=96;WE=91953146;WS=91953128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,113:0.98:115
chr8	91963466	rs34782158	CT	C	3562.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=36;PP=1458;SC=CTTCTGTGTCCTTTTGTATTT;SOR=1.236;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=43;TCF=2;TCR=41;TR=38;WE=91963480;WS=91963456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr8	91963472	rs71528761	T	G	3607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=37;PP=1160;SC=TGTCCTTTTGTATTTTTGTTT;SOR=1.264;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=26;TCR=37;TR=63;WE=91963480;WS=91963456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr8	91967658	rs2677572	T	C	717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=17;NR=3;PP=438;SC=GCACCTTGAATGTTCTTTGCC;SOR=2.584;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=91967666;WS=91967648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr8	91972899	rs2631017	G	T	262.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=214;SC=TAGAGGTAGAGTCTGATGAAA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=91972907;WS=91972889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr8	91973099	rs2740780	A	G	2299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=50;PP=1551;SC=AACATCAAATATAATGTTAGG;SOR=1.395;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=29;TCR=50;TR=79;WE=91973107;WS=91973089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr8	92201794	rs182104008	A	C	5810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=103;NR=85;PP=2965;SC=AGGGAAACCCACTGTTCCTGC;SOR=0.789;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=188;TCF=103;TCR=85;TR=188;WE=92201802;WS=92201784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr8	92364100	rs10109254	T	C	5677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=110;PP=2965;SC=GACCTTTGCTTTACTGGCTGC;SOR=1.117;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=192;TCF=82;TCR=110;TR=192;WE=92364108;WS=92364090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr8	92406021	rs16912805	C	T	5305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-2.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.628;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=69;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.719;SC=TTTAATTCTTCCAGGTTTACA;SOR=0.686;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=169;TCF=99;TCR=70;TR=167;WE=92406029;WS=92406011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,195:0.99:196
chr8	93328793	.	T	G	740	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MMLQ=28;MQ=56.55;NF=14;NR=4;PP=740;QD=43.0428451415;SC=GAAGGAGAAGTAGAAGTAGAA;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=50;TCF=39;TCR=11;TR=18;WE=93328837;WS=93328783;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:32,18:0.36:50
chr8	93328993	rs200192945	C	CGAA	2248.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.464;NF=0;NR=37;PP=1874;ReadPosRankSum=0.852;SC=AAGACGAAGACGAAGAAGAAG;SOR=1.318;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=58;TCF=2;TCR=56;TR=37;WE=93329001;WS=93328983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,54:0.98:55
chr8	93904087	rs3780016	T	C	524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=2;PP=420;SC=CAAAAACCTTTAAGTCTGGCA;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=93904095;WS=93904077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr8	94752754	rs3813853	G	A	2671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=55;PP=1727;SC=ACTGCCCCCAGATCTAACTGA;SOR=2.226;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=22;TCR=55;TR=77;WE=94752762;WS=94752744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr8	94772165	rs73324992	C	T	5587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=113;NR=70;PP=2965;SC=CTTGAGCCACCGCACCTGACC;SOR=1.070;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=183;TCF=113;TCR=70;TR=183;WE=94772173;WS=94772155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr8	94794620	rs3097427	C	T	1968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=33;PP=1099;SC=TATTTTGCTGCAGCTTTGTCC;SOR=0.719;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=36;TCR=33;TR=69;WE=94794628;WS=94794610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
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chr8	94808165	rs3134031	A	G	8776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=164;NR=136;PP=2965;SC=GCCAATGCCAATTCAGGAAGA;SOR=0.847;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=300;TCF=164;TCR=136;TR=300;WE=94808173;WS=94808155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,332:1.00:332
chr8	94928208	rs4236818	A	C	3663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=39;PP=2368;SC=TTTACCACAGACAATACCAAT;SOR=1.646;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=78;TCR=39;TR=117;WE=94928216;WS=94928198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr8	94935937	rs4735258	T	C	730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=19;PP=560;SC=TCAAATGATATACATTTAAAG;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=19;WE=94935945;WS=94935927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
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chr8	95143186	rs1051623	C	G	6216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=63;NR=70;PP=2452;SC=TCTCCTCAAACTCTGTGTGCC;SOR=0.904;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=63;TCR=70;TR=133;WE=95143194;WS=95143162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr8	95158382	rs1131830	C	T	3471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=57;PP=1962;SC=ACACAGAGCTCAAGGAAGACC;SOR=0.876;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=115;TCF=58;TCR=57;TR=115;WE=95158390;WS=95158372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr8	95182801	rs72670354	G	T	6320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=91;NR=109;PP=2965;SC=CAGAGTTAAGGCAAGACTCAC;SOR=1.012;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=200;TCF=91;TCR=109;TR=200;WE=95182809;WS=95182791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr8	95186295	rs2514813	T	C	2412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=43;PP=1549;SC=CTTTTTCTGATCGAGACAGTC;SOR=1.030;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=37;TCR=43;TR=80;WE=95186303;WS=95186285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr8	95186382	rs3214050	G	A	1873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=33;NR=31;PP=1138;SC=GAAAGTACATGACATTGTTGA;SOR=0.779;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=33;TCR=31;TR=64;WE=95186390;WS=95186372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr8	95188850	rs2243518	T	C	4012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=54;PP=2524;SC=TCCTTCACTTTTATGGTGATA;SOR=0.976;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=72;TCR=54;TR=126;WE=95188858;WS=95188840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr8	95521853	.	TAC	T	344.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.119;ClippingRankSum=0.000;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=2.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.95;ReadPosRankSum=-0.171;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,22:0.19:117
chr8	95547005	rs59429647	AT	A	66.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.21;MQRankSum=2.050;QD=1.33;ReadPosRankSum=0.607;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,10:0.20:50
chr8	95651239	rs7824334	T	G	7077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=128;NR=112;PP=2965;SC=GCGCTATCTGTTCCACCCGGC;SOR=0.763;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=240;TCF=128;TCR=112;TR=240;WE=95651247;WS=95651229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr8	95651590	rs5893292	C	CT	7017.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=69;PP=2957;SC=GCACCCACCTCTGGAACTCAA;SOR=0.980;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=90;TCF=12;TCR=78;TR=81;WE=95651607;WS=95651580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr8	95651599	rs2162237	A	C	6784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=51;NR=69;PP=2394;SC=TCTGGAACTCAAGCAGTGGAC;SOR=1.003;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=51;TCR=69;TR=120;WE=95651607;WS=95651580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr8	95658287	rs149099719	A	AT	585.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=1;PP=707;SC=TAAATTTTAAATTTTTCCATT;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=95658295;WS=95658278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr8	95658526	rs60139063	T	C	2795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=46;PP=1535;SC=CTTTAAATCATTACTCAAGAA;SOR=0.925;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=83;TCF=37;TCR=46;TR=83;WE=95658534;WS=95658516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr8	95658562	rs57602858	A	AAAAT	2380.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=24;PP=1307;SC=GTTCCAGAAAAGGTAATTCAA;SOR=1.371;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=26;WE=95658570;WS=95658548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr8	95673674	rs6471455	A	C	937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=4;PP=693;SC=AGTGGGAAACACAAAAAATTG;SOR=3.193;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=31;WE=95673682;WS=95673664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr8	95718047	rs80191810	T	C	114.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=0;PP=88;SC=AGGCTTTTTTTCCACAAAGTC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=95718055;WS=95718037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr8	95718314	rs11785	T	C	339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=3;NR=11;PP=279;SC=AAATTTGAGCTAGTGAAGCCA;SOR=1.981;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=95718322;WS=95718304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr8	95732283	rs13267007	G	C	1265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=23;NR=15;PP=587;SC=GCTGCCAGTGGTCTCGGGAAG;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=23;TCR=15;TR=38;WE=95732291;WS=95732273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr8	95738717	rs7816645	A	G	1171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=24;PP=699;SC=AATAGTTTACACTAGAAAGTA;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=17;TCR=24;TR=41;WE=95738725;WS=95738707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr8	95750546	rs201512830	CA	C	34.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.884;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.47;ReadPosRankSum=1.981;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr8	95778671	rs11779347	G	A	359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=256;SC=AAGGTCATGGGATTGATTTAT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=95778679;WS=95778661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr8	95780553	rs140835859	TA	T	210.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=167;SC=TTGCTGATATTAAAAAAAATA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=8;WE=95780561;WS=95780543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr8	95792447	rs12056667	A	C	578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=7;PP=381;SC=TCTGTGAACTAGGTTCTATGT;SOR=1.508;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=14;TCR=7;TR=21;WE=95792455;WS=95792437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr8	95793515	rs4398879	G	A	370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=280;SC=AAACTCAGGCGTTTTAGGGAT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=95793523;WS=95793505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr8	95796177	rs4236830	T	A	213.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=6;PP=129;SC=AAAAACCTTTTTAATTAATAA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=95796185;WS=95796167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr8	95844384	.	C	G	4630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=92;PP=2935;SC=AAGTCAAAACCGAAGAAATGC;SOR=1.052;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=159;TCF=67;TCR=92;TR=159;WE=95844392;WS=95844374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr8	95861739	rs148690736	G	A	2826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.92;SOR=0.751;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr8	95868932	rs2467678	C	G	970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=1;PP=716;SC=CCTCTTTGCTCTGTCAACATA;SOR=4.479;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=95868940;WS=95868922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr8	95896106	rs2467670	G	C	5444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=85;PP=2965;SC=CTTCAATTCTGTTTGTCCTCA;SOR=0.724;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=173;TCF=88;TCR=85;TR=172;WE=95896114;WS=95896096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr8	96046094	rs2678823	G	A	1639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=11;PP=1165;SC=AGGGGCGCATGGGAGGAGATT;SOR=2.468;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=42;TCR=11;TR=53;WE=96046102;WS=96046084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr8	96053782	rs79118993	GCT	G	3255.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=25;PP=1975;SC=AACTTATAATGCTCTTTGTTT;SOR=1.319;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=45;TCF=18;TCR=27;TR=42;WE=96053791;WS=96053772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr8	96070181	rs2678832	T	C	2147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=44;PP=1302;SC=TTTCATGGCATTGATGTTAAT;SOR=1.151;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=77;TCF=33;TCR=44;TR=76;WE=96070189;WS=96070171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr8	96085317	rs4641029	C	T	457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=10;PP=261;SC=GCTTATATGGCTGCGGGGACC;SOR=1.371;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=6;TCR=10;TR=16;WE=96085325;WS=96085307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr8	96264242	.	G	GTA	61	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=61;QD=37.0;SC=GAACCACCATGTATATATATA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=2;WE=96264250;WS=96264232;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,2:0.22:9
chr8	96264286	rs62522659	G	A	1199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=14;PP=767;SC=GCATCATAACGCAGCACATGA;SOR=1.414;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=29;TCR=14;TR=43;WE=96264294;WS=96264276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr8	97172403	rs2466129	A	G	1242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=5;PP=880;SC=AAAAGTAAAAAGGAAGTGTCC;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=31;TCR=5;TR=36;WE=97172411;WS=97172393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr8	97332661	rs3735987	A	G	3806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=81;PP=2440;SC=CCTCTTGTGTATCAAAGTTCC;SOR=1.857;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=34;TCR=81;TR=115;WE=97332669;WS=97332651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr8	97342582	rs7001397	C	T	1691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=42;PP=1158;SC=GCTCAGAGCACGTGCCTGTAA;SOR=2.683;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=9;TCR=42;TR=51;WE=97342590;WS=97342572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr8	97343326	rs3830537	ATCTTGT	A	4302.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=12;NR=44;PP=2975;SC=GACAAAAGGTATCTTGTTCTT;SOR=0.734;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=68;TCF=14;TCR=54;TR=56;WE=97343339;WS=97343316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr8	97384315	rs2319815	A	T	2077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=20;PP=1394;SC=CTCCTGCTTCATGTGTCGGAA;SOR=1.739;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=69;TCF=49;TCR=20;TR=68;WE=97384323;WS=97384305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr8	97384408	rs2244423	C	T	6199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=114;NR=97;PP=2965;SC=ATGTGCTGGACGCTTGGTCAA;SOR=0.710;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=212;TCF=114;TCR=98;TR=211;WE=97384416;WS=97384398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr8	97384625	rs34027129	A	AG	425.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=10;PP=376;SC=CCTGGATCTCAGGACCCGACT;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=97384633;WS=97384615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr8	97398106	rs369856367	TTC	T	610.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.798;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.912;NF=5;NR=25;PP=585;ReadPosRankSum=-0.825;SC=GGAAAATAGATTCTCTCTCTC;SOR=0.389;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=101;TCF=26;TCR=75;TR=30;WE=97398119;WS=97398096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,39:0.23:169
chr8	97398842	rs12541366	T	A	2032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=51;PP=1421;SC=TAATTCTATCTCTGTGCTGTG;SOR=2.336;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=17;TCR=51;TR=68;WE=97398850;WS=97398832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr8	97605800	rs1126681	C	T	1757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=38;PP=1023;SC=ACGATGACTACGCTTCTGCGT;SOR=1.721;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=19;TCR=38;TR=57;WE=97605808;WS=97605790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr8	98673139	.	G	GATA	222	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=27;MQ=61.34;NF=5;NR=0;PP=222;QD=59.5948512811;SC=AAACACTAGGGATAATCTATC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=5;WE=98673147;WS=98673129;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,5:0.71:7
chr8	98673250	rs16896067	C	T	3845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.07;NF=85;NR=52;PP=2232;SC=AATCTTTGCACTGATCTGCTA;SOR=1.141;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=138;TCF=85;TCR=53;TR=137;WE=98673258;WS=98673240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr8	98712107	rs76537339	AT	A	2092.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=44;PP=1018;SC=ATTATCAGTTATTTTTTTTCA;SOR=1.493;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=51;TCF=1;TCR=50;TR=45;WE=98712115;WS=98712097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr8	98787930	rs146027280	G	GTGCTTGGAGCTCCAGCAGC	7080.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=42;PP=2900;SC=TACTCACCGGGTGCTTGGAGC;SOR=1.673;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=94;TCF=6;TCR=88;TR=44;WE=98787938;WS=98787920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr8	98787994	rs2449510	A	G	2700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.49;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=120;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=45;PP=1495;SC=TCACATGGCCAAGTCCGCCCC;SOR=1.237;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=31;TCR=45;TR=76;WE=98788002;WS=98787984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr8	98788033	rs2449509	G	C	1893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=31;NR=32;PP=867;SC=CCGCTGCAGCGGTCGCCTTCG;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=63;TCF=31;TCR=32;TR=63;WE=98788041;WS=98788023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr8	98817432	rs4735496	C	G	321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=9;NR=1;PP=124;SC=CTGCTCCCTCCATGGGTGGGG;SOR=1.609;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=98817440;WS=98817422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr8	98817560	rs28538093	T	G	161.31	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.593;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=65.74;MQRankSum=0.140;QD=17.92;ReadPosRankSum=1.150;SOR=0.515;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr8	98827531	rs7818775	G	A	2022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=40;NR=30;PP=1206;SC=CTTTTTTAAAGAAATTCTTTT;SOR=0.914;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=71;TCF=40;TCR=31;TR=70;WE=98827539;WS=98827521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr8	98827636	rs7818662	C	A	2380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=42;PP=1331;SC=CAAGGTAAGCCGCTTGCAGTA;SOR=0.906;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=41;TCR=42;TR=83;WE=98827644;WS=98827626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr8	98828215	rs3073521	A	ACTT	3593.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=14;PP=2098;SC=TTAATAAAATACTTTGAATTT;SOR=2.524;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=51;TCF=32;TCR=19;TR=44;WE=98828223;WS=98828205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr8	98828529	rs2331656	A	G	996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.87;SOR=2.215;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr8	98828532	rs2331657	C	G	889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.83;SOR=2.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr8	98828551	rs2331658	C	T	420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=43;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=6;PP=210;SC=TTTCTTTTTTCTTTTTTTTGA;SOR=0.941;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=8;WE=98828559;WS=98828541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr8	98831577	rs62524114	G	A	2285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=52;PP=1447;SC=CATCCAAATTGCTTTTTGATT;SOR=1.450;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=30;TCR=52;TR=82;WE=98831585;WS=98831567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr8	98943446	rs2290470	T	C	7144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=130;NR=113;PP=2965;SC=GCACCATGACTGGGCTGGCCA;SOR=0.708;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=245;TCF=130;TCR=115;TR=243;WE=98943454;WS=98943436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr8	98954012	rs2513845	T	C	3531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=36;PP=2452;SC=CAGCGGCCCATATGTGCAGCA;SOR=1.743;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=121;TCF=85;TCR=36;TR=121;WE=98954020;WS=98954002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr8	98954272	rs3018906	T	A	1425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=40;PP=1067;SC=GTTTGGTATTTTCTGTTGACC;SOR=5.421;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=42;TCF=2;TCR=40;TR=42;WE=98954280;WS=98954262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr8	98973560	rs62523561	C	T	1606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=6;PP=1091;SC=CTGGAGTTCCCTGTTGCCTCA;SOR=3.014;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=41;TCR=6;TR=47;WE=98973568;WS=98973550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr8	99045866	rs17831160	G	A	5038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=86;PP=2731;SC=AAACGAAGAAGTAAGAAAATT;SOR=0.976;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=168;TCF=82;TCR=86;TR=168;WE=99045874;WS=99045856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr8	99046298	rs2279119	C	T	4691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=57;PP=2614;SC=CTCAGTACTCCAAACTTTTCC;SOR=1.088;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=149;TCF=92;TCR=57;TR=149;WE=99046306;WS=99046288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr8	99115082	rs11537947	C	T	5246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.99;NF=105;NR=73;PP=2965;SC=ATAGTGATGCCGTTGTCAGTG;SOR=0.921;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=179;TCF=105;TCR=74;TR=178;WE=99115090;WS=99115072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr8	99118654	rs2242196	C	T	261.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=7;PP=202;SC=CTTAAATAGCCTATGTTGCAG;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=99118662;WS=99118644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr8	99140544	rs2447508	G	A	1278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=11;PP=983;SC=TTATTCTCCAGTGTTAATTCA;SOR=2.252;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=36;TCR=11;TR=47;WE=99140552;WS=99140534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr8	99205111	rs3735885	T	C	2389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=17;PP=1627;SC=TAGCACATGTTAGCTTATAAA;SOR=2.215;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=54;TCR=17;TR=71;WE=99205119;WS=99205101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr8	99205612	rs3735887	C	T	6379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=130;NR=80;PP=2965;SC=CATTCACTCACCTCCAAGCCT;SOR=1.083;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=211;TCF=130;TCR=81;TR=210;WE=99205622;WS=99205602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr8	99208065	rs13264255	T	C	1151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=11;PP=750;SC=GAAACTGATGTTTCTTATATT;SOR=1.666;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=28;TCR=11;TR=39;WE=99208073;WS=99208055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr8	99592067	.	A	T	583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=16;PP=441;SC=TTTCCGAATTATAGCTAACAA;SOR=2.531;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=99592075;WS=99592057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr8	100026275	rs12547849	T	C	746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=26;PP=560;ReadPosRankSum=-0.914;SC=TTTCTACTGATGTATTTTGAG;SOR=3.126;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=28;WE=100026283;WS=100026265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,29:0.97:30
chr8	100443679	rs3103703	A	T	1664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=17;PP=1174;SC=AAGCAAGGAAAGAAACAATCT;SOR=1.942;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=41;TCR=17;TR=58;WE=100443687;WS=100443669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr8	100479917	rs3134156	T	C	549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=16;PP=453;SC=TTAAAAGCAATTGTTATCCAT;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=100479925;WS=100479907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr8	100548975	rs16897440	C	T	5842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=96;NR=96;PP=2965;SC=AAACGTATTCCCAGTCATTAA;SOR=0.799;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=192;TCF=96;TCR=96;TR=192;WE=100548983;WS=100548965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr8	100975002	rs6468700	A	G	4703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=73;NR=76;PP=2537;SC=AAGCCTGCACAAAAATAAAAG;SOR=0.944;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=150;TCF=73;TCR=77;TR=149;WE=100975010;WS=100974992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr8	101020548	rs3101322	C	G	1865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=14;PP=1302;SC=TAACAGGCGTCAGTATTGTAG;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=45;TCR=14;TR=59;WE=101020556;WS=101020538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr8	101051024	rs930965	C	A	2499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=21;PP=1710;SC=ATTTCAAATACAGTAATCCCA;SOR=2.022;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=60;TCR=21;TR=81;WE=101051032;WS=101051014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr8	101053980	rs922207	C	T	4883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=103;NR=61;PP=2965;SC=TCAGGAGATACTGATCAGTTA;SOR=1.230;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=165;TCF=104;TCR=61;TR=164;WE=101053988;WS=101053970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr8	101059662	rs2980542	G	A	7665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.480;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=142;NR=105;PP=2965;ReadPosRankSum=0.046;SC=TTGCAGAAAAGCACTTAACAC;SOR=0.576;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=248;TCF=142;TCR=106;TR=247;WE=101059670;WS=101059652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,282:1.00:283
chr8	101084647	rs34914779	GT	G	484.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=16;PP=561;SC=CCCCTGGTACGTTTTTAATTC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=16;WE=101084655;WS=101084637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr8	101117554	rs1471294	T	G	2186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=8;PP=1021;SC=ATATTTGCTATTTTTTTAAAG;SOR=1.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=48;TCR=8;TR=56;WE=101117562;WS=101117544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr8	101117734	rs1471293	A	G	6864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=105;NR=119;PP=2965;SC=ACACAGGCAAACGTAGCACAT;SOR=0.937;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=225;TCF=105;TCR=120;TR=224;WE=101117742;WS=101117724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr8	101137897	rs2453626	T	C	3016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=47;PP=1488;SC=GGACCTGAACTGAACACTACC;SOR=0.763;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=101;TCF=54;TCR=47;TR=101;WE=101137905;WS=101137887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr8	101138096	rs1460933	T	C	1073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=29;PP=699;SC=AACCAGGGCCTGCCAATAGGT;SOR=2.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=8;TCR=29;TR=37;WE=101138104;WS=101138086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr8	101153024	rs1460934	G	A	5911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=110;NR=74;PP=2965;SC=TTTTCTTGCCGATCAGTCCTG;SOR=1.064;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=184;TCF=110;TCR=74;TR=184;WE=101153032;WS=101153014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr8	101174426	rs16898015	G	A	564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=3;PP=324;SC=AAAATACAAAGAAGTACCTAC;SOR=2.093;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=101174434;WS=101174416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr8	101203737	rs3802149	T	C	3020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=63;PP=1643;SC=AAGTATAGAATGTGATTTCTC;SOR=1.188;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=46;TCR=63;TR=109;WE=101203745;WS=101203727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr8	101206391	rs17335870	G	A	4828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=82;NR=66;PP=2572;SC=AGCTGCATCTGAGACTCAAAC;SOR=0.783;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=149;TCF=82;TCR=67;TR=148;WE=101206399;WS=101206381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr8	101206459	rs56246127	A	AGAC	8914.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.02;SOR=0.963;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr8	101206531	rs17335911	G	A	2490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.51;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=28;NR=43;PP=1197;SC=TATGTAAAAAGCTGCCTTTTA;SOR=1.240;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=71;TCF=28;TCR=43;TR=71;WE=101206539;WS=101206521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr8	101225241	rs11280812	C	CCCGCGGCCT	2074.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=5;PP=1099;SC=GTCCTGCACCCCCGCGGCCTC;SOR=2.774;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=19;WE=101225249;WS=101225231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr8	101225838	rs2514682	C	G	530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=15;NR=3;PP=395;SC=CTGGGAATGCCGGCATGTTCC;SOR=2.419;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=101225846;WS=101225834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr8	101225894	rs62532740	G	A	1118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=27;NR=8;PP=666;SC=TTCCCTTGGTGGCTGTTGCGG;SOR=1.981;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=35;WE=101225902;WS=101225884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr8	101232421	rs141450399	TCAGTACTG	T	1493.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=2;PP=2067;SC=ATTTGAGAGTTCAGTACTGCA;SOR=4.804;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=24;WE=101232436;WS=101232411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr8	101232701	rs2919471	T	C	2176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=52;PP=1593;SC=AGTTGTTTTATACTGTTTTTC;SOR=2.737;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=14;TCR=52;TR=66;WE=101232709;WS=101232691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr8	101252680	rs6511	T	C	3323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=29;PP=2024;SC=GAGGTCTCCATGGGATGCCTT;SOR=1.951;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=79;TCR=29;TR=108;WE=101252688;WS=101252670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr8	101281238	rs7014862	C	A	1543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=12;NR=37;PP=1007;SC=AATTAGTGCACTATATTAAAA;SOR=2.345;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=12;TCR=37;TR=49;WE=101281246;WS=101281228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr8	101522891	.	TA	T	119.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.975;ClippingRankSum=0.000;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=1.493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.54;MQRankSum=2.165;QD=3.42;ReadPosRankSum=0.210;SOR=0.409;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,11:0.31:35
chr8	101625479	rs1078186	C	T	1436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=38;PP=1061;SC=TGGTATCCATCTTAGAAAATT;SOR=3.611;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=5;TCR=38;TR=43;WE=101625487;WS=101625469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr8	101718932	rs62513920	C	G	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=4.908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQRankSum=-4.588;QD=0.80;ReadPosRankSum=-0.312;SOR=1.999;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,7:0.13:55
chr8	101721727	rs139094790	G	A	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FS=2.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQRankSum=-14.162;QD=0.83;ReadPosRankSum=-4.846;SOR=0.949;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:260,46:0.15:306
chr8	101721756	rs57799615	A	C	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FS=0.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQRankSum=-13.258;QD=2.13;ReadPosRankSum=2.420;SOR=0.748;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:274,70:0.20:344
chr8	101721812	rs200409148	G	A	2051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=352;ExcessHet=3.0103;FS=2.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.39;MQRankSum=-7.247;QD=5.86;ReadPosRankSum=-0.927;SOR=0.750;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:280,70:0.20:350
chr8	101721817	rs201076736	T	C	2051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=352;ExcessHet=3.0103;FS=2.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.09;MQRankSum=-6.661;QD=5.86;ReadPosRankSum=-2.264;SOR=0.762;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:280,70:0.20:350
chr8	101721839	rs202074479	C	A	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FS=18.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.22;MQRankSum=-3.389;QD=0.60;ReadPosRankSum=-1.852;SOR=1.695;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:277,39:0.12:316
chr8	101937370	rs964919	A	T	2224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.62;SOR=1.702;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr8	101937374	rs3105460	A	G	2224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.35;SOR=1.562;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr8	101937455	rs964917	T	C	147.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=117;SC=GGCAGCAATATTTTAAGTTTG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=101937463;WS=101937445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr8	102504974	rs515622	C	G	6617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=130;NR=94;PP=2965;SC=CCAGGAAAAGCGGAGCAAGTT;SOR=0.982;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=224;TCF=130;TCR=94;TR=224;WE=102504982;WS=102504964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr8	102555060	rs470801	G	A	3596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=62;PP=2023;SC=GCAAGAGGGGGTGAAGCTATT;SOR=0.941;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=116;TCF=54;TCR=62;TR=115;WE=102555068;WS=102555050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr8	102585806	rs548564	G	A	534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=1;PP=375;SC=ATTGGTTAATGTTCATGTGAA;SOR=4.407;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=16;WE=102585814;WS=102585796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr8	102676566	rs3029400	T	TGAA	2390.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=13;PP=1488;SC=GACTCATGAGTGAAGAGCACT;SOR=1.848;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=35;TCF=19;TCR=16;TR=31;WE=102676574;WS=102676556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr8	102678798	rs10093032	C	T	4962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=95;NR=67;PP=2632;SC=TTTTCACACCCCTCCCCCCTC;SOR=0.915;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=162;TCF=95;TCR=67;TR=162;WE=102678806;WS=102678788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr8	102678972	rs3735713	G	A	982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=23;PP=605;SC=CTCTCAGTGCGTTCCTCCCTG;SOR=2.584;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=30;WE=102678980;WS=102678962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr8	102701456	rs375965103	CA	C	644.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=4.499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQRankSum=1.124;QD=5.00;ReadPosRankSum=-0.235;SOR=0.741;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,53:0.41:129
chr8	103220351	rs1265117	A	G	3310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=53;PP=2027;SC=GTTTTAAAACAAGAGGTTTTT;SOR=0.892;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=121;TCF=68;TCR=53;TR=121;WE=103220359;WS=103220341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr8	103308106	rs190502365	A	G	665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=21;PP=574;SC=CTGAAACCAGAGAGAGCCCTT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=103308114;WS=103308096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr8	103311016	.	T	G	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.120;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=22.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.34;ReadPosRankSum=0.712;SOR=4.849;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,17:0.41:41
chr8	103372743	rs6468823	G	A	618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=4;PP=437;SC=GAGGGTTACCGAAATCAAAAC;SOR=2.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=21;WE=103372751;WS=103372733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr8	103563907	rs3808357	G	T	2178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=11;PP=1584;SC=ATTTTTTCCCGGAGTGCCATT;SOR=3.258;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=54;TCR=11;TR=65;WE=103563915;WS=103563897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr8	103572551	rs57773710	T	G	836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=0;PP=561;SC=TGTGTAAAGTTTATTTTCACA;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=103572559;WS=103572549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr8	103572992	rs3018444	C	G	11295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=379;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=91;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=129;NR=124;PP=2956;SC=CTTGCAGCCCCTGCAGCCCCT;SOR=0.739;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=295;TCF=144;TCR=151;TR=253;WE=103573000;WS=103572982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
chr8	103573010	.	CTGCAACCCCTGCAGCCCCTGCAACCCG	C	11249.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DP=364;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=34;NR=134;PP=2987;SC=CCTGCAGCCCCTGCAACCCCT;SOR=0.739;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=182;TCF=36;TCR=146;TR=168;WE=103573044;WS=103573000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
chr8	103846823	rs71303443	A	AAAC	1192.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=2;PP=1001;SC=CACAGGCAGAAAATACTTAGT;SOR=3.180;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=20;WE=103846831;WS=103846813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr8	103851052	rs1062048	T	C	3804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=60;PP=2170;SC=CAACTTTTGCTGCATACTTTA;SOR=0.749;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=135;TCF=75;TCR=60;TR=135;WE=103851060;WS=103851042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr8	103852064	rs3217408	TA	T	2046.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=49;PP=966;SC=ATTATGGTTATAAAAAAAAAG;SOR=1.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=0;TCR=53;TR=49;WE=103852072;WS=103852054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr8	103876780	rs2247355	C	T	895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.88;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr8	104145625	rs2515189	A	G	1257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=31;PP=904;SC=GGACAGAAAGAAGACCCAAAG;SOR=3.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=37;WE=104145633;WS=104145615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr8	104166902	rs35605502	G	GC	2154.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.283;NF=12;NR=25;PP=1144;ReadPosRankSum=-1.692;SC=TGATCCCACAGCCCACCTGTC;SOR=0.881;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=42;TCF=13;TCR=29;TR=37;WE=104166913;WS=104166892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,79:0.98:81
chr8	104331088	rs3104026	G	C	505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=14;PP=428;SC=ATGTTAGTGAGAAGCTTTCAT;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=104331096;WS=104331078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr8	104336672	rs827550	G	A	1035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=3;PP=704;SC=CAATAAAAATGTTGATTTCAT;SOR=3.321;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=32;WE=104336680;WS=104336662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr8	104340719	rs2270525	T	C	1782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=47;PP=1177;SC=TTCAAATCAATGTACTAGAGT;SOR=2.730;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=13;TCR=47;TR=60;WE=104340727;WS=104340709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr8	104343822	rs2934725	A	G	1599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=35;PP=991;SC=TCACTGTTACATTCTTCTTTT;SOR=1.649;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=55;TCF=19;TCR=36;TR=54;WE=104343830;WS=104343812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr8	104390224	rs2687364	T	A	2999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=33;PP=1853;SC=TAGAAAATGTTAATTAAATCC;SOR=1.546;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=64;TCR=33;TR=97;WE=104390232;WS=104390214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr8	104394744	rs3098233	T	C	5611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=101;NR=93;PP=2965;SC=TCTGGGTTGGTACTTGTTCAG;SOR=0.731;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=194;TCF=101;TCR=93;TR=194;WE=104394752;WS=104394734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr8	104415695	rs117846978	T	C	225.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=186;SC=CTGTGAAATGTAGTTTCTGAG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=104415703;WS=104415685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr8	104930646	.	CT	C	124.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.278;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=10.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.04;ReadPosRankSum=-0.663;SOR=0.070;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,11:0.27:41
chr8	104934028	rs6468897	G	A	5030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=109;PP=2965;SC=TAGTCATTACGTTTACTCTTC;SOR=1.520;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=167;TCF=58;TCR=109;TR=167;WE=104934036;WS=104934018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr8	104973378	rs35964420	T	G	2453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=36;NR=47;PP=1437;SC=ATTTTAGAATTATTTTATAGT;SOR=0.982;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=36;TCR=47;TR=83;WE=104973386;WS=104973368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr8	105025934	rs34555846	T	C	1437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=33;PP=1025;SC=TGGTCTCTTCTATCATCTTTG;SOR=2.352;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=11;TCR=33;TR=44;WE=105025942;WS=105025924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr8	105053356	rs10086112	A	G	872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=1;PP=731;SC=ACCTATAGTAACAAAATCAAC;SOR=5.136;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=26;WE=105053364;WS=105053346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr8	105053383	rs10086223	C	T	1525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=5;PP=1154;SC=TCAGTTCTTACGTATTTTTTG;SOR=3.788;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=44;TCR=5;TR=49;WE=105053391;WS=105053373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr8	105105846	rs55788818	C	T	5618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=92;NR=99;PP=2965;SC=CCAATCAGAACGCCCAGGAGG;SOR=0.854;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=191;TCF=92;TCR=99;TR=191;WE=105105854;WS=105105836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr8	105106649	rs71297252	G	GACTT	3584.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=21;PP=2257;SC=GTTTTTTCTTGACTTTCTTTT;SOR=1.580;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=27;TCR=24;TR=44;WE=105106657;WS=105106639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr8	105106882	rs9969594	T	G	3599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=69;PP=2451;SC=ACACAAGATATACACGAGCAA;SOR=1.262;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=47;TCR=69;TR=116;WE=105106890;WS=105106872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr8	105263751	rs2252152	T	A	488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=2;PP=353;SC=GAATGTACTTTAGTATTTTAA;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=105263759;WS=105263750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr8	105263979	rs10461	C	T	4740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=86;NR=80;PP=2697;SC=CAACCTTGGCCCCTCTGACAA;SOR=0.822;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=169;TCF=89;TCR=80;TR=166;WE=105263987;WS=105263959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr8	105360755	.	T	TC	909.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.484;ClippingRankSum=0.000;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.792;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.436;NF=5;NR=10;PP=371;ReadPosRankSum=-0.746;SC=CCTTGGTTTCTTTTTCATTTT;SOR=0.511;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=56;TCF=27;TCR=29;TR=15;WE=105360763;WS=105360745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,32:0.33:96
chr8	105367096	rs2458431	T	C	1144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=4;PP=793;ReadPosRankSum=1.240;SC=TTTTATTCTTTCATTTTAGAA;SOR=2.147;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=33;WE=105367104;WS=105367086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,37:0.97:38
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chr8	105440462	rs2246815	A	G	741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=21;PP=514;SC=AGTCAGAAAAATCCAATGGAG;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=105440470;WS=105440452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
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chr8	105478933	rs2298840	G	A	4351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.153;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=76;PP=2773;ReadPosRankSum=0.182;SC=CCATGAAGGGGAACTGCATGT;SOR=0.193;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=157;TCF=80;TCR=77;TR=154;WE=105478941;WS=105478923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,164:0.99:166
chr8	105479149	rs2959023	A	G	947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.62;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr8	105601189	.	ACGACGC	A	99.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-2.427;ClippingRankSum=0.000;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=2.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=64.21;MQRankSum=-0.902;QD=2.27;ReadPosRankSum=0.368;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,6:0.14:44
chr8	105601195	.	CCGA	C	1447.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.921;ClippingRankSum=0.000;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.320;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.964;NF=1;NR=46;PP=1255;ReadPosRankSum=-0.736;SC=GTAGACGACGCCGACGCCGCC;SOR=1.911;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=53;TCF=1;TCR=52;TR=47;WE=105601205;WS=105601179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,38:0.86:44
chr8	105845706	rs145596017	T	TTTTTTTTC	983.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=9;PP=138;SC=AATTTTTTCCTTTTTTTTCTA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=9;WE=105845714;WS=105845696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr8	105845742	rs1380689	G	A	373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=50;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=10;PP=259;SC=TGTTTTGCCCGGGCTCATCTC;SOR=1.765;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=14;WE=105845750;WS=105845732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr8	105907461	rs2290865	G	T	257.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=181;SC=CAAAAGAAAAGTAGCTGCAGG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=105907469;WS=105907454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr8	105907786	rs3214884	GT	G	2648.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=42;PP=1786;SC=ATGGAAAACAGTTAATTTTAA;SOR=1.708;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=45;TCF=2;TCR=43;TR=44;WE=105907794;WS=105907776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr8	105907833	rs2290866	C	T	727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=18;PP=498;SC=AAATAAAAGACCCAGAAATCA;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=25;WE=105907841;WS=105907823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr8	106331094	.	G	GGCGGCGGGA	1418.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=65.85;QD=50.67;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr8	106430676	rs1383592	G	A	697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=8;PP=332;SC=TTAATGTAGCGCACCTCACTC;SOR=0.922;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=22;TCF=14;TCR=8;TR=22;WE=106430684;WS=106430666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr8	106431029	rs11783971	AT	GC	4220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=32;PP=2947;SC=TCTTTACCAGATAGTTAATTC;SOR=0.976;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=85;TCF=49;TCR=36;TR=80;WE=106431038;WS=106431019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr8	106431290	rs3214948	CA	C	837.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=8;PP=651;SC=ACCACTGTAACAAAAAAAGGC;SOR=1.839;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=23;TCR=11;TR=24;WE=106431298;WS=106431280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr8	106431589	rs112841122	T	TA	383.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=309;SC=TGTAATGTTTTAAAAAAATGC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=10;WE=106431597;WS=106431579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr8	106456683	rs11990012	A	G	798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=21;PP=591;SC=TTTCTTGAACATCAGTTAGCT;SOR=2.753;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=26;WE=106456691;WS=106456673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr8	107277717	rs2938306	G	A	702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=0;PP=503;SC=TTTTGAATCCGTTATAATAAA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=107277725;WS=107277707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr8	107630536	rs3134136	C	T	897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=25;PP=673;SC=GGATCTGTGACGATGCAGTTG;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=107630544;WS=107630526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr8	107670141	rs2282510	G	A	1092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=6;PP=722;SC=GCCGGTGGGCGCGCTAGTGGT;SOR=2.554;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=34;WE=107670149;WS=107670131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr8	109241485	rs76865757	T	G	2587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=47;PP=1459;SC=ACATAATGTATGTTTTATACC;SOR=0.884;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=92;TCF=45;TCR=47;TR=92;WE=109241493;WS=109241475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr8	109465432	.	AT	A	118.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.108;ClippingRankSum=0.000;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.11;MQRankSum=1.962;QD=1.88;ReadPosRankSum=-0.493;SOR=0.779;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,15:0.24:63
chr8	110397738	rs7016085	T	C	2930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=56;NR=39;PP=1612;SC=TTACACAGAATCTTTTTGGGG;SOR=0.825;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=95;TCF=56;TCR=39;TR=95;WE=110397746;WS=110397728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr8	110400698	rs66889268	A	AT	1875.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=21;PP=921;SC=ACATAACTTGATTTTTTCTAA;SOR=0.826;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=31;TCF=10;TCR=21;TR=29;WE=110400706;WS=110400688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr8	110402491	rs9642806	C	T	36.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr8	110412519	rs1379369	G	A	7209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=103;NR=129;PP=2965;SC=TCTACATCAAGGGTGATGACC;SOR=1.097;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=232;TCF=103;TCR=129;TR=232;WE=110412527;WS=110412509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr8	110413762	rs964307	T	C	6214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=106;NR=95;PP=2965;SC=TGCCAACAGTTATTTTTCCAG;SOR=0.719;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=201;TCF=106;TCR=95;TR=201;WE=110413770;WS=110413752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr8	110413824	rs2061294	C	T	3914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=82;PP=2492;SC=AAGAGTAAGGCTTTTTCCTGT;SOR=1.464;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=46;TCR=82;TR=128;WE=110413832;WS=110413814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr8	110416813	rs1457286	C	T	2009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=53;NR=10;PP=1327;SC=TGCAGGAGTACAGATTAAGTG;SOR=2.867;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=53;TCR=10;TR=63;WE=110416821;WS=110416803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr8	110418461	rs12679728	G	T	828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=5;PP=549;SC=CAGAGTATAGGTGCTTTAAAA;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=26;WE=110418469;WS=110418451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr8	110420245	rs16879470	T	C	1706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=7;PP=1072;SC=TATTAGTTAATGTCTACAAAT;SOR=3.180;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=42;TCR=7;TR=49;WE=110420253;WS=110420235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr8	110420384	rs13254245	T	C	9003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=153;NR=138;PP=2965;SC=TCACACTGAATTGGGATGGGA;SOR=0.705;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=291;TCF=153;TCR=138;TR=291;WE=110420392;WS=110420374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,336:1.00:336
chr8	110420429	rs13252234	A	G	7651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=110;NR=127;PP=2965;SC=GGTCATCAGAAGCTGAAGTAC;SOR=1.022;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=237;TCF=110;TCR=127;TR=237;WE=110420437;WS=110420419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,278:1.00:278
chr8	110425594	rs4604408	G	A	197.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=158;SC=TTGAATTGTTGTGAAACAATG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=110425602;WS=110425584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr8	110431217	rs7016609	G	T	383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=0;PP=320;SC=CCTGATGGTCGTCTTGTGGGA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=110431225;WS=110431214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr8	110437384	rs4735133	A	G	5488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=85;PP=2926;SC=TCAAAAATTCATATTCAAAGA;SOR=0.712;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=183;TCF=98;TCR=85;TR=183;WE=110437392;WS=110437374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr8	110439166	rs13264587	A	G	182.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=5;NR=1;PP=147;SC=ACAGGCGTGAACCACCACATC;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=110439174;WS=110439162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr8	110439519	rs12544835	G	C	805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=22;PP=506;SC=TTCTTTAAAAGGAAGTTAAGG;SOR=2.985;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=25;WE=110439527;WS=110439509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr8	110455321	rs1673408	C	A	8186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=131;NR=148;PP=2965;SC=GTTTGTGGGTCGCTCTGAAGC;SOR=0.930;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=279;TCF=131;TCR=148;TR=279;WE=110455329;WS=110455311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,307:1.00:307
chr8	110460488	rs1673407	G	T	6729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=132;NR=113;PP=2965;SC=TGATAGTGTGGTGCAGTGCAT;SOR=0.843;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=245;TCF=132;TCR=113;TR=245;WE=110460496;WS=110460478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
chr8	110461518	rs1673405	A	G	1836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=11;PP=1071;SC=ACACAGAAGAAGTTTTATTTT;SOR=1.839;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=40;TCR=11;TR=51;WE=110461526;WS=110461508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr8	110465060	rs1673404	G	C	7410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=114;NR=122;PP=2965;SC=AGACCATTCTGCTGGATCAAA;SOR=0.860;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=236;TCF=114;TCR=122;TR=236;WE=110465068;WS=110465050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,269:1.00:269
chr8	110471673	rs11356938	AT	A	51.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=0;PP=71;SC=AGAATAAAATATTTTTTCTAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=110471681;WS=110471663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr8	110471796	rs5893958	TA	T	1233.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.79;QD=30.09;SOR=2.247;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr8	110473907	rs1026439	T	C	629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=16;NR=3;PP=454;SC=TGAGATCATATGTGAATCAAA;SOR=3.160;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=110473915;WS=110473897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr8	110473965	.	A	AT	3808.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.4;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;NF=34;NR=14;PP=456;SC=GGATTCCGACAATTTTTTTAA;SOR=1.952;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=49;TCF=34;TCR=15;TR=48;WE=110473974;WS=110473955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr8	110473966	rs1026438	A	T	4089.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=14;PP=1337;SC=GATTCCGACAATTTTTTTAAT;SOR=1.821;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=72;TCF=51;TCR=21;TR=62;WE=110473974;WS=110473955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr8	110476993	rs1673398	A	G	7711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=144;NR=124;PP=2965;SC=CAGTGCCTGCACCTGCAATAT;SOR=0.831;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=270;TCF=145;TCR=125;TR=268;WE=110477001;WS=110476983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,291:1.00:291
chr8	110570060	rs2844232	A	G	6621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=106;NR=123;PP=2965;SC=AATTAATGCTATTTGTTTGCA;SOR=0.895;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=230;TCF=106;TCR=124;TR=229;WE=110570068;WS=110570050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr8	110656746	rs59295888	TC	T	4817.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=40;PP=2553;SC=CACCACCACCTCCTTCCACCT;SOR=1.170;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=65;TCF=25;TCR=40;TR=62;WE=110656754;WS=110656736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr8	110656773	rs11774663	T	C	4462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.65;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr8	110657514	rs3108849	G	A	5046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=70;PP=2834;SC=GATCCCTCTCGTACCGGAGCC;SOR=0.829;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=162;TCF=92;TCR=70;TR=162;WE=110657522;WS=110657504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr8	110703333	rs13266567	A	T	923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=2;PP=668;SC=CCAATCAAACAGGAGGGCCTT;SOR=4.479;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=27;WE=110703341;WS=110703323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr8	113237045	rs4876458	C	T	8785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=151;NR=134;PP=2965;SC=CAAATCGTACCGCCTTCCCTT;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=285;TCF=151;TCR=134;TR=285;WE=113237053;WS=113237035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,324:1.00:324
chr8	113241088	rs1592624	T	G	3122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=46;NR=54;PP=1752;SC=TGAGGTTGATTTGAAGAATTT;SOR=1.028;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=101;TCF=46;TCR=55;TR=100;WE=113241096;WS=113241078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr8	113243995	rs10095093	C	A	242.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=198;SC=TTCTCCTTTGCAAAATATAGC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=8;WE=113244003;WS=113243985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr8	113254071	.	G	GCACA	669.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=8.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.12;ReadPosRankSum=-0.902;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,19:0.83:23
chr8	113254073	rs1007815	G	A	757.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=5.855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=34.44;ReadPosRankSum=-0.868;SOR=3.716;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,20:0.91:22
chr8	113254087	rs28698529	G	A	1283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.79;SOR=2.019;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr8	113259132	rs1895014	A	T	220.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=1;PP=168;SC=AATATGTTTTATAATCTAAAA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=113259140;WS=113259122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr8	113266343	rs7830950	C	T	1482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=43;NR=6;PP=1074;SC=CACTCTTTTGCTGTCTGTTAC;SOR=3.398;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=43;TCR=6;TR=49;WE=113266351;WS=113266333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr8	113267709	rs7006723	A	G	1968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=46;PP=1340;SC=ACAGCAGAGTACACAGTTTGG;SOR=2.105;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=18;TCR=46;TR=64;WE=113267717;WS=113267699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr8	113299275	rs10505181	A	G	4359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=47;PP=2725;SC=AATATATTTAATTTCTGCTTG;SOR=1.375;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=134;TCF=87;TCR=47;TR=134;WE=113299283;WS=113299265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr8	113308243	rs4876462	A	G	666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=16;PP=436;SC=CCGCTGAAATACGTTATAAAG;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=113308251;WS=113308233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr8	113323089	rs10505180	T	C	2112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=25;PP=1246;SC=ATGAAAAGAGTTCACAATATG;SOR=1.150;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=41;TCR=25;TR=66;WE=113323097;WS=113323079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr8	113323471	rs17637578	A	G	766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=21;PP=631;SC=ACACCTATACAGCGACTAGTG;SOR=3.014;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=25;WE=113323479;WS=113323461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr8	113347769	rs62514406	A	T	3732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=80;PP=2435;SC=TTTGAACCGTATTTAATAAAA;SOR=2.009;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=36;TCR=80;TR=116;WE=113347777;WS=113347759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr8	113363350	rs7003308	T	C	1097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=27;NR=6;PP=667;SC=CTTTATAGTCTTTTTTTTTAC;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=33;WE=113363358;WS=113363340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr8	113363511	rs7003500	T	C	1424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=21;NR=25;PP=789;SC=TACACATACATAAAAAGTTTA;SOR=1.077;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=21;TCR=25;TR=46;WE=113363519;WS=113363501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr8	113420495	rs35988509	TG	T	2450.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=20;PP=1696;SC=GAATACATCATGGGAAAATTA;SOR=1.609;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=46;TCF=26;TCR=20;TR=43;WE=113420503;WS=113420485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr8	113516209	rs10955625	G	A	859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.66;SOR=2.621;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr8	113585637	rs7014796	A	G	1265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=7;PP=829;SC=TAATAATCAAATATTGGATAT;SOR=3.056;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=33;TCR=7;TR=40;WE=113585645;WS=113585627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr8	113655643	rs112584207	A	AC	3560.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=16;PP=1221;SC=CCTTCATGTAAATTTGCTACA;SOR=1.058;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=28;TCF=11;TCR=17;TR=27;WE=113655652;WS=113655633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr8	113655644	rs55980973	A	T	3569.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=16;PP=781;SC=CTTCATGTAAATTTGCTACAC;SOR=1.058;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=53;TCF=32;TCR=21;TR=46;WE=113655652;WS=113655633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr8	113657607	rs72678429	A	G	180.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=147;SC=CTAGAGAAGAAAAGTGTACTC;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=113657615;WS=113657597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr8	113662299	rs6992564	T	G	510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=1;PP=418;SC=AAACCTAAAATATTTATAATT;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=113662307;WS=113662289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr8	113662583	rs17652171	A	C	3524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=76;PP=2337;SC=TAACACCTGGAAAACAAAGGG;SOR=1.517;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=42;TCR=76;TR=118;WE=113662591;WS=113662573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr8	113697567	rs7839990	A	G	690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=3;PP=496;SC=ACCAATATACATGATCACTTT;SOR=4.174;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=24;WE=113697582;WS=113697557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr8	113842114	.	GCACA	G	162	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=162;QD=55.0;SC=TTGTCTCTCTGCACACACACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=3;WE=113842125;WS=113842104;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,3:0.33:9
chr8	113934059	rs72682123	C	T	935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=26;PP=726;SC=CTGGCAATATCCAATAGGTCA;SOR=3.477;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=30;WE=113934067;WS=113934049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr8	114326853	rs35125143	G	A	831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.755;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=14;PP=426;ReadPosRankSum=-2.379;SC=ATAAGTAGTCGTATTCTTCTT;SOR=1.077;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=89;TCF=49;TCR=40;TR=37;WE=114326861;WS=114326843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,42:0.45:93
chr8	116599199	rs2293889	T	G	2249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=22;PP=1410;SC=TCAAAACAAATGAATTATTTA;SOR=1.497;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=53;TCR=22;TR=75;WE=116599207;WS=116599189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr8	116631278	rs2737218	T	C	1408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=5;PP=1039;SC=TACTGGGACCTTGGTTTTAAC;SOR=3.816;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=36;TCR=5;TR=41;WE=116631286;WS=116631268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr8	116632409	rs10589819	GAA	G	153.87	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.9992;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=117;ReadPosRankSum=-1.465;SC=CTTCCTCTAGGAAAAAAAAAA;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=8;WE=116632418;WS=116632399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr8	116635688	rs2737219	G	A	552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=1;PP=478;SC=CTCCCCTAGCGAGTCGTAAGT;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=116635696;WS=116635678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr8	116635942	rs2721939	C	T	1434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=31;PP=865;SC=TCTTAGAAGACGCTCAGAAGA;SOR=1.747;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=16;TCR=31;TR=47;WE=116635950;WS=116635932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr8	117791733	rs979866	T	C	6648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=124;NR=90;PP=2965;SC=GGATCTCTGCTAGCTTACTAA;SOR=0.980;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=214;TCF=124;TCR=90;TR=214;WE=117791741;WS=117791723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr8	117799012	rs1867840	A	G	493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=15;PP=447;SC=TTTTTACTTGAATTATTTTAT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=117799020;WS=117799002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr8	117950758	rs111477672	G	T	938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=21;PP=603;SC=GGGAGGAGCAGAGCTGGACGG;SOR=1.061;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=36;TCF=14;TCR=22;TR=35;WE=117950766;WS=117950748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr8	118185041	rs2466295	C	T	2034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=45;PP=1245;SC=GTGCAATGCACATTTTATCTA;SOR=1.842;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=20;TCR=45;TR=65;WE=118185049;WS=118185031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr8	118185063	rs2466294	C	G	1124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=29;PP=850;SC=TTATTTAGTTCCATTCACCAT;SOR=3.383;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=33;WE=118185071;WS=118185053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
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chr8	118552374	rs57267838	CT	C	104.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.97;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr8	118830820	rs10955837	T	C	2246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=31;NR=45;PP=1090;SC=TATTTATGTATGCCTCCAACC;SOR=1.364;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=31;TCR=45;TR=76;WE=118830828;WS=118830810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr8	118832020	rs17439693	G	A	1653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=28;PP=914;ReadPosRankSum=1.243;SC=TGAATTTGGAGGGGGGCTTTA;SOR=0.854;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=32;TCR=29;TR=59;WE=118832028;WS=118832010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,65:0.97:67
chr8	119209773	rs2514743	C	T	2803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=24;PP=1717;SC=CACAGCAAAGCAAGATTTTTC;SOR=1.958;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=70;TCR=24;TR=94;WE=119209781;WS=119209763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr8	119391791	rs5020517	T	C	11356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=413;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=179;NR=193;PP=2965;SC=CAGGAAGCAATAGGGTACCTT;SOR=0.854;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=372;TCF=179;TCR=193;TR=372;WE=119391799;WS=119391781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,413:1.00:413
chr8	119451983	rs34337924	ATGT	A	827.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=0;PP=583;SC=CAGCAGGAAGATGTTGTTTCA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=14;WE=119451993;WS=119451973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr8	119941173	rs3134046	A	G	3388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=70;PP=2157;SC=GGGTTCCTACAGAAAATACCA;SOR=1.649;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=38;TCR=70;TR=108;WE=119941181;WS=119941163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr8	120220775	rs71302978	CG	C	2544.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=21;PP=1305;SC=CCCGCCGCCCCGGGGTCACCC;SOR=0.984;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=14;TCR=23;TR=34;WE=120220783;WS=120220765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr8	120580546	rs200158900	T	TA	239.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.99;ReadPosRankSum=0.232;SOR=1.244;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr8	120596023	rs10283100	A	G	4013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=53;PP=2783;SC=TTAAATGTTGAGCCATAACCT;SOR=1.260;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=87;TCR=53;TR=140;WE=120596031;WS=120596013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr8	120602908	rs935359	C	T	3203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=60;PP=1918;SC=TCAGGCAAGACTAAAACGAAA;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=51;TCR=60;TR=111;WE=120602916;WS=120602898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr8	120631657	rs5894488	CA	C	232.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.02;QD=16.62;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr8	120744349	rs956748	T	C	6005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=89;PP=2965;SC=TTGGAGGCTGTAGATTCCTTA;SOR=0.780;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=182;TCF=93;TCR=89;TR=182;WE=120744357;WS=120744339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr8	120744399	rs956749	C	T	4323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=72;PP=2533;SC=TGGATGCATACTCATCTCCAA;SOR=1.065;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=62;TCR=72;TR=134;WE=120744407;WS=120744389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr8	120773124	rs10096846	A	T	511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=15;PP=379;SC=TAGAGTCACAAGCCATATAAA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=120773132;WS=120773114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr8	120790304	rs1509348	T	C	1782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=22;PP=1091;SC=CTAAAATAAATGTTAAGACTT;SOR=1.318;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=38;TCR=22;TR=60;WE=120790312;WS=120790294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr8	120790378	rs35033415	G	GA	2595.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.11;NF=14;NR=31;PP=778;SC=GTCTACAAAAGAAAAAAAAGA;SOR=0.715;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=54;TCF=17;TCR=37;TR=45;WE=120790386;WS=120790368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr8	120793296	rs7002501	C	T	690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=2;PP=550;SC=ACTGTACCTTCTGTAGAAAAT;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=120793304;WS=120793286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr8	120795607	rs13268676	G	A	5123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=109;NR=68;PP=2965;SC=CCTTTATGCTGTATATAATCT;SOR=1.297;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=178;TCF=109;TCR=69;TR=177;WE=120795615;WS=120795597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr8	120801805	rs6469846	C	T	7617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=134;NR=116;PP=2965;SC=CTTCCCCACTCTGTTGAACTG;SOR=0.788;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=250;TCF=134;TCR=116;TR=250;WE=120801813;WS=120801795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,285:1.00:285
chr8	120803637	rs9297605	C	G	4342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=52;NR=39;PP=1462;SC=CTGAAACATACTGTAGTATTC;SOR=0.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=52;TCR=39;TR=91;WE=120803645;WS=120803627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr8	120803654	rs11996390	C	T	4490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=55;NR=42;PP=1385;SC=ATTCCCAGGACAGTGTATGTG;SOR=0.808;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=55;TCR=42;TR=97;WE=120803662;WS=120803644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr8	120814020	rs7813438	A	G	4014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=46;PP=2418;SC=TAAGAGAGGAAAGCTCTGACT;SOR=1.202;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=129;TCF=83;TCR=46;TR=128;WE=120814028;WS=120814010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr8	120816010	rs4871629	A	G	644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=0;PP=527;SC=CTAAATTTGGAAGGGAATAAA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=120816018;WS=120816005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr8	120818697	.	T	TTTTC	254.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.47;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr8	120843775	rs7828086	T	C	652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=1;PP=425;SC=CTTGTAATCATACAGACCCTA;SOR=3.258;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=120843783;WS=120843765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr8	120844846	rs11552092	G	C	1428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=30;PP=970;SC=TTCCTAGGGGGATACGGGGCA;SOR=1.519;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=17;TCR=30;TR=47;WE=120844854;WS=120844836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr8	120847078	rs1055133	C	G	1359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=12;PP=867;SC=TATTTTTCTTCTATCCAGCAA;SOR=1.514;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=29;TCR=12;TR=41;WE=120847086;WS=120847068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr8	120847123	rs1055131	C	T	2155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=19;PP=1245;SC=AAGAAAAGACCGTTGTTCTTT;SOR=1.457;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=45;TCR=19;TR=64;WE=120847131;WS=120847113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr8	120847188	rs1055130	T	C	3081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=58;NR=44;PP=1547;SC=CATCGAAGAATGAGAATATTT;SOR=0.727;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=58;TCR=44;TR=102;WE=120847196;WS=120847178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr8	120862767	rs112349158	T	TA	2494.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=37;PP=1790;SC=CTAGAAATTATATATATCGTA;SOR=1.542;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=2;TCR=39;TR=39;WE=120862775;WS=120862757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr8	120886370	rs7840728	T	A	598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=18;PP=492;SC=CGCGCTTAGCTGCTGCAGCCT;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=120886378;WS=120886360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr8	121013770	rs2271900	A	G	1537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.51;SOR=1.278;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr8	121013824	.	G	A	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.982;ClippingRankSum=0.000;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=3.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.26;ReadPosRankSum=0.067;SOR=0.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,33:0.26:129
chr8	121019300	rs6469889	C	T	335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=277;SC=ACTTCACATGCGTTATTATTA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=121019308;WS=121019290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr8	121256308	.	CT	C	739.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=16;PP=714;SC=TGCTTGTCCCCTGTAATGCAC;SOR=3.056;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=17;WE=121256316;WS=121256298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr8	121267617	rs993823	C	T	2609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=44;PP=1523;SC=CCATCACTTACGTTTTTGTCA;SOR=1.053;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=40;TCR=44;TR=84;WE=121267625;WS=121267607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr8	121290573	rs2305609	T	A	1071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=9;PP=749;SC=TTTAAAGATTTTTTTTTTCAT;SOR=2.073;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=35;WE=121290581;WS=121290563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr8	121292407	rs1869831	G	A	1220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=31;PP=868;SC=TGGTTAAATAGTGAGTCCGAT;SOR=2.780;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=8;TCR=31;TR=39;WE=121292415;WS=121292397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr8	121293179	.	G	A	754	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.5;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=32;MMLQ=26;MQ=59.59;NF=36;NR=14;PP=754;QD=15.7754242509;SC=TGATGGAAATGTTTGGTTTGG;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=108;TCF=72;TCR=36;TR=50;WE=121293200;WS=121293169;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:58,50:0.46:108
chr8	121293331	rs1563388	G	A	3300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.49;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=64;PP=2017;SC=TAAAGTCATCGTATGTTTATT;SOR=1.022;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=89;TCF=24;TCR=65;TR=88;WE=121293339;WS=121293321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr8	121293376	rs10107534	A	G	1112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.68;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=22;PP=625;SC=AACTTGAAATATGGTGTAATA;SOR=3.098;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=26;WE=121293384;WS=121293366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr8	121296045	rs16893819	A	G	1468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=36;PP=1000;SC=GATCACATTCACATATACATG;SOR=3.126;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=7;TCR=36;TR=43;WE=121296053;WS=121296035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr8	121298046	rs73329045	C	A	796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=19;NR=8;PP=468;SC=TTTTAGAAAACAAAATTCACC;SOR=1.329;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=27;WE=121298054;WS=121298036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr8	121298156	rs17833992	G	C	1864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=30;PP=994;SC=TTTTCAAACTGTTACTTTCGA;SOR=0.980;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=28;TCR=30;TR=58;WE=121298164;WS=121298146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr8	121309679	rs7357581	A	T	243.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=171;SC=TATATAATACATAACATAAAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=121309687;WS=121309669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr8	121309862	rs2219241	A	T	612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=15;PP=364;SC=TTGATTTTTTAAATTGTATTT;SOR=2.400;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=20;WE=121309870;WS=121309852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr8	121326263	.	G	T	1737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=31;PP=1234;SC=TTCAAGGAATGCCCGTGAGTT;SOR=0.986;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=25;TCR=31;TR=56;WE=121326271;WS=121326253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr8	121326427	rs10505379	G	T	158.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=5;PP=113;SC=AGCCATTTTTGTGTCCAATGA;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=121326435;WS=121326417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr8	121383048	rs4463470	T	C	981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=22;PP=695;SC=TCCCTGCTCTTCCCTGGTGAT;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=31;WE=121383056;WS=121383038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr8	121383082	rs6469922	A	T	507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=46;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=17;PP=480;SC=GAGATTTTTTAAAAAAATTTC;SOR=2.093;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=121383090;WS=121383072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr8	121408195	rs6650	T	C	3339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=76;NR=38;PP=2056;SC=TGAAGGACTATACCTTCCTGA;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=76;TCR=38;TR=114;WE=121408203;WS=121408185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr8	121426425	rs68086071	AGT	A	443.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=329;SC=ATACTTCATAAGTGTTAAAAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=8;WE=121426434;WS=121426415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr8	121471361	rs6984090	A	G	217.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=178;SC=TTATACATGGATTTCCCCTCA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=121471369;WS=121471351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr8	121483196	rs13248998	G	A	1325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=28;PP=821;SC=TACATGTTTCGGTTGTTTTAA;SOR=2.252;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=11;TCR=28;TR=39;WE=121483204;WS=121483186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr8	121509825	rs35918868	C	CTTT	174.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=239;SC=AATTTTAGTTCGTGTGTGTGT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=121509833;WS=121509815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr8	121530061	rs13258768	C	T	2924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=16;PP=1921;SC=GCTTAATCTACGTTCTTGATT;SOR=2.678;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=72;TCR=16;TR=88;WE=121530069;WS=121530051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr8	121530190	rs13258848	A	G	10301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=380;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=174;NR=171;PP=2965;SC=CACAAACAGAACGGTCCTTAC;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=345;TCF=174;TCR=171;TR=345;WE=121530198;WS=121530180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,380:1.00:380
chr8	121530384	rs34340354	CTT	C	1219.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.34;NF=0;NR=16;PP=598;SC=CATAGGAAGACTTTTTAAATT;SOR=2.621;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=16;WE=121530393;WS=121530374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr8	121531154	rs13269481	G	A	937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=28;PP=759;SC=TACTGAGAGCGTATACTTGCT;SOR=3.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=31;WE=121531162;WS=121531144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr8	123966085	rs3802264	G	A	3880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=60;NR=65;PP=2298;SC=CAGCCGGGACGGCCAGGGTAG;SOR=0.960;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=126;TCF=61;TCR=65;TR=125;WE=123966093;WS=123966075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr8	123966159	rs3802265	G	C	4236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=73;NR=65;PP=2381;SC=AGGAGGATGCGATCTCAGATA;SOR=0.841;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=138;TCF=73;TCR=65;TR=138;WE=123966167;WS=123966149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr8	124027628	rs7159	T	C	1236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=7;PP=787;SC=AGTTGTTAAGTGCACCCAGCA;SOR=2.531;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=32;TCR=7;TR=39;WE=124027636;WS=124027618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr8	124042733	rs2891672	T	C	517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=0;PP=377;SC=ATTTACTATCTTTATGCAGTT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=124042741;WS=124042732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr8	124114333	rs10956116	G	T	2516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=18;PP=1680;SC=TCCATTTCACGAAAATGCATG;SOR=2.414;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=63;TCR=18;TR=81;WE=124114341;WS=124114323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr8	124359749	rs9297666	C	G	1956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=44;PP=1213;SC=AAAAATCAGCCTCGGAATATA;SOR=1.917;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=65;TCF=21;TCR=44;TR=65;WE=124359757;WS=124359739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr8	124440336	rs10628888	A	AAAG	1485.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.98;QD=35.37;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr8	124448689	rs9297669	T	C	4032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=43;PP=2850;SC=ACTTTTACTTTTAGGATTACC;SOR=1.677;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=139;TCF=96;TCR=43;TR=139;WE=124448697;WS=124448679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr8	124448907	rs10561886	CT	C	75.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=1.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.39;MQRankSum=2.618;QD=1.99;ReadPosRankSum=0.780;SOR=0.232;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,9:0.24:38
chr8	124448947	rs6470148	A	G	391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=18;PP=463;SC=ATCTCGTCTGACATCACCATT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=124448955;WS=124448937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr8	124525537	rs35117009	G	A	6868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=122;NR=103;PP=2965;SC=CAGACTTGCCGACTCTTTGGA;SOR=0.789;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=225;TCF=122;TCR=103;TR=225;WE=124525545;WS=124525527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr8	124526607	rs2294088	G	A	2925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=62;PP=1886;SC=CAGGCTTAGAGTACAGAGATA;SOR=1.418;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=37;TCR=62;TR=99;WE=124526615;WS=124526597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr8	124658404	rs11786734	A	G	382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=319;SC=TGGGATGTTGAGCTAACCTGC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=124658412;WS=124658394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr8	124659329	rs11991744	C	A	2428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=55;PP=1591;SC=GTAGTAATTACGAGGGTGAAC;SOR=2.066;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=22;TCR=55;TR=77;WE=124659337;WS=124659319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr8	124663769	rs10109736	A	T	2816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=26;PP=1583;SC=GGTGTGTCCAAGCACACATAC;SOR=1.519;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=61;TCR=26;TR=87;WE=124663777;WS=124663759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr8	124664130	rs11780509	C	T	8162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=144;NR=124;PP=2965;SC=GACCAGACTCCTCCCTGAGCT;SOR=0.741;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=268;TCF=144;TCR=124;TR=268;WE=124664138;WS=124664120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,299:1.00:299
chr8	124664167	rs11784192	T	C	7441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=131;NR=111;PP=2965;SC=AGCACATAGATGCTGCGGTGC;SOR=0.745;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=242;TCF=131;TCR=111;TR=242;WE=124664175;WS=124664157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,277:1.00:277
chr8	124664792	rs7387544	C	T	6380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=103;NR=107;PP=2965;SC=TCTGCAAGTACGAGGAGCAGG;SOR=0.790;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=210;TCF=103;TCR=107;TR=210;WE=124664800;WS=124664782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr8	124664873	rs7387792	AT	GC	8052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=73;PP=2947;SC=CAGTGGCAATATGTGCCTCCC;SOR=0.783;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=159;TCF=80;TCR=79;TR=146;WE=124664882;WS=124664863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr8	124665211	rs7387855	C	T	1526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=37;PP=1036;SC=AAGAGTCAAACCTTTCTCAGC;SOR=2.137;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=13;TCR=37;TR=50;WE=124665219;WS=124665201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr8	124693444	rs3739283	C	T	1221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=9;PP=857;SC=TTGACAAAGGCGGTTCCACCC;SOR=2.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=42;WE=124693452;WS=124693434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr8	124696867	rs2294015	C	T	3128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=49;PP=1985;SC=CTGGTCACGACTATGCGAATC;SOR=0.746;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=55;TCR=49;TR=104;WE=124696875;WS=124696851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr8	124749610	rs6470179	C	T	6856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.54;NF=122;NR=113;PP=2965;SC=TGTATTTCATCAAGAGATCAG;SOR=0.716;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=236;TCF=122;TCR=114;TR=235;WE=124749618;WS=124749600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,259:1.00:259
chr8	124749651	rs11331268	TC	T	6428.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=14;NR=106;PP=2975;SC=ACAACAGTTTTCCCCCCGGAC;SOR=0.936;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=129;TCF=14;TCR=115;TR=120;WE=124749659;WS=124749641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr8	124798783	rs76243620	A	G	1423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=13;PP=965;SC=ATGGAGGGGAAAGTAGGAGTC;SOR=1.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=34;TCR=13;TR=47;WE=124798791;WS=124798773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr8	124824826	rs1946586	G	A	4218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=76;PP=2530;SC=CAGTCATCGTGTGCTGACATG;SOR=0.853;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=144;TCF=68;TCR=76;TR=144;WE=124824834;WS=124824816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr8	124987478	rs7465584	T	C	5636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=115;NR=72;PP=2834;ReadPosRankSum=-1.086;SC=GTGACATCAGTGTCATGGGAA;SOR=1.043;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=189;TCF=116;TCR=73;TR=187;WE=124987486;WS=124987468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,210:0.99:212
chr8	125033678	rs7820272	G	A	555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=1;PP=482;SC=AACAGTCCACGTGAGTGACTC;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=125033686;WS=125033668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr8	125035533	rs4521739	G	A	636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=0;PP=438;SC=TGATGGCATAGATGTTTCAGT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=125035541;WS=125035523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr8	125035788	rs4358790	G	C	3797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=72;PP=2187;SC=CCCCTGTCGCGGGGCAGATGG;SOR=1.063;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=60;TCR=73;TR=131;WE=125035796;WS=125035778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr8	125047370	rs4871451	T	C	177.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=188;SC=GGGGCCATTGTCTTTATTTTG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=125047378;WS=125047360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr8	125051966	rs4269524	A	G	1204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=6;PP=932;SC=TTTCTTCAGGACTTCCATTCC;SOR=3.145;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=36;WE=125051974;WS=125051956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr8	125052018	rs4389914	T	C	3130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=36;PP=2037;SC=TCTCCTTTTGTCTGTCTGTGG;SOR=1.487;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=66;TCR=36;TR=102;WE=125052026;WS=125052008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr8	125061895	rs4870887	G	A	2648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=35;PP=1679;SC=CTGTTGTGAAGCTGGCTGACC;SOR=1.085;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=52;TCR=35;TR=87;WE=125061903;WS=125061885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr8	125072426	rs4483140	T	C	6600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=123;NR=103;PP=2965;SC=GGTAGGTTCCTCCTTCTGGGC;SOR=0.843;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=226;TCF=123;TCR=103;TR=226;WE=125072434;WS=125072416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr8	125076589	rs7012186	T	G	2050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=44;NR=24;PP=1134;SC=TCATTTCAGATATTTCAGATT;SOR=1.121;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=44;TCR=24;TR=68;WE=125076597;WS=125076579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr8	125076988	rs4871460	T	C	382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=11;PP=311;SC=AGCTTTGTTATAGGATCAGAA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=125076996;WS=125076978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr8	125088636	rs9643188	A	G	3190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=69;PP=2158;SC=CTGTGGGGATAGTGCGTGTAT;SOR=1.652;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=35;TCR=69;TR=104;WE=125088644;WS=125088626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr8	125094847	rs10956163	C	G	204.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=6;PP=166;SC=ATCAGCAGAGCTGGCTTGGGG;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=125094855;WS=125094837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr8	125107201	rs6470219	G	A	7369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.21;SOR=1.013;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr8	125107207	rs6470220	C	T	7448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.08;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr8	125110258	rs10956164	C	T	3978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=82;PP=2523;SC=TTAAGGCCACCTTCTTTGTCT;SOR=1.495;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=129;TCF=47;TCR=82;TR=129;WE=125110266;WS=125110248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr8	125711670	rs11358821	TG	T	488.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=2;PP=345;SC=AGCTCAGCTCTGATAACTTAA;SOR=2.147;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=9;WE=125711678;WS=125711660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr8	125739749	rs891542	A	G	3028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=36;PP=1978;SC=CCGTGCCCGGAGGAATCAGGT;SOR=1.380;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=66;TCR=36;TR=101;WE=125739757;WS=125739739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr8	125877486	.	G	A	1730	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MMLQ=27;MQ=60.48;NF=55;NR=55;PP=1730;QD=16.0433746595;SC=ACTGTGTACCGTGTTCTCCCT;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=55;TCR=56;TR=110;WE=125877494;WS=125877476;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,110:0.99:111
chr8	126056215	rs11370883	G	GC	7586.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=62;PP=2974;SC=CCCGCCTCAGGTAGTTTCAGG;SOR=0.704;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=24;TCR=64;TR=85;WE=126056223;WS=126056205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr8	126067646	rs33981879	CAG	C	46.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=9.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.26;ReadPosRankSum=0.974;SOR=0.031;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,5:0.14:37
chr8	126378901	rs149174348	GAC	G	972.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=0;PP=837;SC=TCCTGATTTTGACACTTTTCC;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=19;WE=126378910;WS=126378891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr8	126443348	rs2385113	C	T	1709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=33;NR=26;PP=991;SC=CGCCCTGCAGCCCGCAGCCCC;SOR=0.781;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=33;TCR=26;TR=59;WE=126443356;WS=126443338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr8	126445505	rs13277396	G	C	2330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=22;PP=1528;SC=CAGGGGTTTGGGAGGCTGCCT;SOR=1.788;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=54;TCR=22;TR=76;WE=126445513;WS=126445495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr8	128099242	rs13257371	C	A	5209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=93;NR=73;PP=2876;SC=AGGTGAACGTCTCTTGGTGAC;SOR=0.857;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=166;TCF=93;TCR=73;TR=166;WE=128099250;WS=128099232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr8	128099269	rs4571699	A	G	5198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=90;NR=79;PP=2965;SC=GCTTCTTTGGAAGGTGGAGAA;SOR=0.725;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=169;TCF=90;TCR=79;TR=169;WE=128099277;WS=128099259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr8	128099455	rs1840709	G	C	2361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=36;PP=1261;SC=GGAGTCCTTCGTCGTGGTGGT;SOR=1.651;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=18;TCR=36;TR=54;WE=128099467;WS=128099445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr8	128099457	rs61262194	CGTG	C	2352.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=31;PP=1711;SC=AGTCCTTCGTCGTGGTGGTGG;SOR=1.567;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=40;TCF=6;TCR=34;TR=36;WE=128099467;WS=128099445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr8	128428061	rs4871789	A	G	920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=12;PP=446;SC=ATGAAAAGTAACATAATTGCT;SOR=0.804;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=18;TCR=12;TR=30;WE=128428069;WS=128428051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr8	128428795	rs6998254	G	A	1457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=17;PP=1170;SC=CCCTCATGCAGGCCCGAAAGA;SOR=1.298;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=29;TCR=17;TR=46;WE=128428803;WS=128428785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr8	128428823	rs7002225	G	C	2179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=20;PP=1467;SC=AACCAGTATCGAGAACCGAGT;SOR=1.547;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=47;TCR=20;TR=67;WE=128428831;WS=128428813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr8	128429262	rs9297754	G	C	800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=16;PP=538;SC=GGAGTTTGTGGCAGGGCTTTT;SOR=1.071;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=12;TCR=16;TR=28;WE=128429270;WS=128429252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr8	128748992	.	G	A	1622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=37;PP=1019;SC=TTTTCTCAGAGTAGTTATGGT;SOR=1.688;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=19;TCR=37;TR=56;WE=128749000;WS=128748982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
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chr8	130496365	rs6997249	G	A	1648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=26;PP=956;SC=TGATCTGTAAGAGAAGGTAAA;SOR=1.140;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=22;TCR=26;TR=48;WE=130496373;WS=130496355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
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chr8	130762180	rs77523385	C	T	2811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=34;PP=1583;SC=CAGCTTTTTGCGGGTCCTGGG;SOR=1.189;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=61;TCR=34;TR=95;WE=130762188;WS=130762170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr8	130762837	rs16904150	C	T	8046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=136;NR=129;PP=2965;SC=GCATCAACGCCGACCAGAAAG;SOR=0.748;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=265;TCF=136;TCR=129;TR=265;WE=130762845;WS=130762827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,300:1.00:300
chr8	131124559	rs966185	T	C	3871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=58;NR=66;PP=2434;SC=TCTTTCTTGATAGGGCTTGGC;SOR=1.043;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=124;TCF=58;TCR=66;TR=124;WE=131124567;WS=131124549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr8	131127831	rs2305513	T	C	2733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=70;NR=18;PP=1899;SC=ACTAGAAAAGTTGGGGTAGTT;SOR=2.380;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=70;TCR=18;TR=88;WE=131127839;WS=131127821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr8	131172968	rs10089819	C	T	3971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=59;PP=2423;SC=AACTGCAGAACGAGAACATGG;SOR=0.866;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=75;TCR=59;TR=134;WE=131172976;WS=131172958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr8	131181348	rs11392401	A	AT	711.50	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.512;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.449;NF=2;NR=26;PP=276;ReadPosRankSum=1.635;SC=TACCACCAGTATAAAAAAAAA;SOR=2.093;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=28;WE=131181357;WS=131181337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,31:0.89:35
chr8	131192905	rs28495072	G	C	1362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=14;PP=927;SC=TAATCAAACAGAGTCTGCCTT;SOR=1.656;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=34;TCR=14;TR=48;WE=131192913;WS=131192895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr8	131193153	rs71572332	T	TA	693.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=1.631;HP=12;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=31;PP=393;ReadPosRankSum=-1.423;SC=TGTCATTATTTAAAAAAAAAA;SOR=1.214;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=53;TCF=2;TCR=51;TR=32;WE=131193161;WS=131193143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,34:0.69:49
chr8	131199666	.	ATTT	A	118.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=-0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.84;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr8	131353139	rs13265869	T	C	9445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=368;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=154;NR=180;PP=2965;ReadPosRankSum=1.279;SC=GACCAATCATTGCGATGAATG;SOR=0.318;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=336;TCF=154;TCR=182;TR=334;WE=131353147;WS=131353129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,367:1.00:368
chr8	131373887	rs10091130	C	G	6431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=129;NR=77;PP=2965;SC=TCTGCAATTACAATTTCAAAG;SOR=1.203;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=206;TCF=129;TCR=77;TR=206;WE=131373895;WS=131373877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr8	131413956	rs10090106	A	G	493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=15;NR=1;PP=367;SC=CATAGTAGGCAGTCTACACCT;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=131413964;WS=131413946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr8	131414083	rs10090231	A	G	4277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=59;PP=2422;SC=ATCCCGCTGTATCTCCCACGC;SOR=0.855;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=138;TCF=79;TCR=59;TR=137;WE=131414091;WS=131414073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr8	131414257	rs10090767	G	A	387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=9;PP=242;SC=AGAGTCATCCGGTGAAACTGG;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=131414265;WS=131414247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr8	131833755	rs55879109	A	T	582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=18;PP=450;SC=GTGGTATAAAAAGAAAAAAAC;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=131833763;WS=131833745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr8	131848465	rs2259296	A	G	2562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=56;NR=37;PP=1598;SC=TTTTCCCAACAATTCCACTTC;SOR=1.099;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=57;TCR=37;TR=93;WE=131848473;WS=131848455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr8	131897082	rs4128982	A	G	841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=23;PP=692;SC=AATGTTTTTAAATCATGTTGC;SOR=4.255;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=24;WE=131897090;WS=131897072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr8	132002576	rs1329803	G	A	1759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=40;NR=17;SC=TAAAACAGTAGCTCCATATAA;SOR=1.112;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=40;TCR=17;TR=57;WE=132002584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr8	132916459	rs28627763	T	C	595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=5;PP=464;SC=TTCGCCTCGTTCCGGCCTCCG;SOR=1.828;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=21;WE=132916467;WS=132916449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr8	132947786	rs16904553	C	T	3664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=78;PP=2380;SC=ATATGTCAGTCAATTTCTATT;SOR=1.437;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=47;TCR=78;TR=125;WE=132947794;WS=132947776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr8	132971691	rs3750270	T	C	113.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=87;SC=TTCATGAAGTTCATTACTTAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=132971699;WS=132971681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr8	132980709	rs6471017	G	A	2796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=62;PP=1641;SC=AAAATAGTGCGTTGATCTGGT;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=28;TCR=62;TR=89;WE=132980717;WS=132980699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr8	132996599	rs16904564	A	C	184.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=5;PP=105;SC=AAAGCAGACAACATCTTTGAA;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=132996607;WS=132996589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr8	132997353	rs10085968	T	C	1558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=36;PP=903;SC=TGTACAAAATTGCTAATTTTA;SOR=2.187;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=16;TCR=36;TR=52;WE=132997361;WS=132997343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr8	132998635	rs141130288	GTCATTTAAT	G	306.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=2044;SC=TTTTGTGTCTGTCATTTAATT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=7;WE=132998651;WS=132998625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr8	133008823	rs2270873	G	A	1269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=25;PP=740;SC=CCACACTTTCGAACAGGAGGA;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=19;TCR=25;TR=44;WE=133008831;WS=133008813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr8	133023163	rs4736529	G	C	5479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=96;PP=2965;SC=AAGACCTCAGGATATGATTTG;SOR=1.173;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=169;TCF=73;TCR=96;TR=169;WE=133023171;WS=133023153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr8	133041177	rs6471024	G	A	2850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.55;SOR=2.483;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr8	133041179	rs6471025	A	G	2850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.32;SOR=2.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr8	133041242	rs6471026	C	G	5937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=115;NR=93;PP=2965;SC=GCTTGGGAAACCATCCACAAG;SOR=0.856;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=209;TCF=116;TCR=93;TR=208;WE=133041250;WS=133041232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr8	133045480	rs2202068	C	T	3400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=62;PP=2017;SC=GATGGACATACGAAAGCCAAA;SOR=1.010;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=115;TCF=53;TCR=62;TR=115;WE=133045488;WS=133045470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
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chr8	133046977	rs7834841	A	G	7527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=135;NR=108;PP=2965;SC=GTCAAGGACAAAGGACATAAA;SOR=0.783;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=243;TCF=135;TCR=108;TR=243;WE=133046985;WS=133046967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,278:1.00:278
chr8	133048593	rs1472571	C	T	6137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=118;NR=85;PP=2965;SC=CCAGGCTGTCCTTTTCCAAAT;SOR=0.956;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=203;TCF=118;TCR=85;TR=203;WE=133048601;WS=133048583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr8	133048619	rs7461611	T	C	7088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=133;NR=104;PP=2965;SC=TCTGCTTACTTTTCTTGGAGA;SOR=0.867;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=239;TCF=134;TCR=105;TR=237;WE=133048627;WS=133048609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,259:1.00:259
chr8	133049810	rs6992506	A	G	2389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=45;PP=1454;SC=TCTCAAAGGAAAACAGGCTGG;SOR=1.080;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=33;TCR=45;TR=78;WE=133049818;WS=133049800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr8	133050900	rs871959	A	G	52.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=3;NR=0;PP=42;SC=TCCTAGCCAGAGAAGGCAGGA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=133050908;WS=133050898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr8	133053188	rs2334791	C	T	970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=4;PP=594;SC=CCAGTGGTGACGATGATGTGA;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=28;WE=133053196;WS=133053178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr8	133053309	rs7386782	T	C	6752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.57;SOR=0.759;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr8	133053318	rs7386783	T	C	6596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.98;SOR=0.747;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr8	133053714	rs1466884	G	A	1711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=19;PP=1170;SC=CAAGGTATCAGCCAGGCCTCC;SOR=1.571;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=39;TCR=19;TR=58;WE=133053722;WS=133053704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr8	133067315	rs4736538	G	A	4244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=71;PP=2543;SC=CAACTGGAACGGACTCCTGGG;SOR=0.952;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=138;TCF=67;TCR=71;TR=138;WE=133067323;WS=133067305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr8	133082779	.	A	T	1817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=39;PP=1138;SC=TTAACTCAACACAACATATCT;SOR=2.093;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=17;TCR=39;TR=56;WE=133082787;WS=133082769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr8	133089975	rs2280851	A	G	3849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=59;PP=2437;SC=TCTCTTACCCAAGGTAGGGCT;SOR=0.779;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=129;TCF=70;TCR=59;TR=129;WE=133089983;WS=133089965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr8	133101818	rs6471038	G	A	5249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=98;PP=2965;SC=TAGAATTGCCGATGATATCTA;SOR=1.044;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=177;TCF=79;TCR=98;TR=177;WE=133101826;WS=133101808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr8	133107830	rs7833441	T	C	4860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=72;PP=2965;SC=TGGCGGGGTCTACTGTCTTCA;SOR=0.853;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=159;TCF=87;TCR=72;TR=159;WE=133107838;WS=133107820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr8	133107893	rs10956634	A	G	6031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=117;NR=96;PP=2965;SC=CACACAGACCAGCCCTGCAAC;SOR=0.842;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=213;TCF=117;TCR=96;TR=213;WE=133107901;WS=133107883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr8	133108005	rs55906165	A	G	4517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=85;PP=2721;ReadPosRankSum=-0.679;SC=AGGAAGTGACACTCAGCAAGG;SOR=0.419;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=150;TCF=64;TCR=86;TR=149;WE=133108013;WS=133107995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,169:0.99:170
chr8	133111181	rs72715366	G	A	6157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=121;NR=87;PP=2965;SC=GGTTAAGCGCGGACAGATCGA;SOR=0.922;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=208;TCF=121;TCR=87;TR=208;WE=133111189;WS=133111171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr8	133112392	rs1370568	G	A	4124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=68;NR=68;PP=2430;SC=CTGGGAAGGAGACAGTTTTCA;SOR=0.906;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=68;TCR=68;TR=136;WE=133112400;WS=133112382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr8	133113531	rs34842500	A	T	2922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=63;PP=1840;SC=CTGAAATAAAAGTTTTCATGA;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=32;TCR=63;TR=95;WE=133113539;WS=133113521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr8	133116251	rs6998880	C	T	3187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=68;NR=36;PP=1907;SC=GTGTTAGATGCGGATATAATC;SOR=1.217;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=68;TCR=36;TR=104;WE=133116259;WS=133116241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr8	133117603	rs71526236	G	A	5320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=94;PP=2890;SC=AGAACAGTGCGTGAGGAATCA;SOR=0.946;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=177;TCF=83;TCR=94;TR=177;WE=133117611;WS=133117593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr8	133144334	.	TA	T	46.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=2.326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.12;ReadPosRankSum=-0.083;SOR=0.204;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr8	133175805	rs17653354	G	A	6204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=108;NR=101;PP=2965;SC=ATCCTTCCTCGAAAGATTGCT;SOR=0.702;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=209;TCF=108;TCR=101;TR=209;WE=133175813;WS=133175795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr8	133175971	rs893391	G	C	478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=14;PP=422;SC=TTTTCAGCCAGTCATTCATTC;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=133175979;WS=133175961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr8	133177179	rs16904613	C	T	2087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=50;PP=1494;SC=CTCCACTCACCGGACTTCTGT;SOR=1.673;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=23;TCR=50;TR=73;WE=133177187;WS=133177169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr8	133184644	.	T	TAC	92	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;FR=0.5000;HP=3;HapScore=3;MGOF=12;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=92;QD=31.6666666667;SC=GGCACATTAATACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=5;TCR=4;TR=3;WE=133184653;WS=133184634;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,3:0.33:9
chr8	133184914	rs17575754	G	C	5503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=95;PP=2965;SC=CCTGCACCTTGAGGGCCAGCC;SOR=1.101;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=174;TCF=79;TCR=95;TR=174;WE=133184922;WS=133184904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr8	133186704	rs17653902	C	T	911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=23;PP=596;SC=GCAATGCTCCCATTCATAACA;SOR=2.235;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=30;WE=133186712;WS=133186694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr8	133186749	rs41272377	C	G	330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=11;PP=265;SC=CAAGTACCTACTAACTTATAT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=133186757;WS=133186739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr8	133187675	rs17575971	A	G	1435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=12;PP=900;SC=ATCTCACAGAATTGGCCTCCA;SOR=2.256;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=31;TCR=12;TR=43;WE=133187683;WS=133187665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr8	133192449	rs41272387	A	G	3642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=70;NR=59;PP=2073;SC=TCCAGGTGCCACCTCTCCGGT;SOR=0.707;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=129;TCF=70;TCR=59;TR=129;WE=133192457;WS=133192439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr8	133192521	rs41272389	A	G	3356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=55;PP=1960;SC=TGGCCAGAACATTGCCTTGGT;SOR=0.845;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=55;TCR=55;TR=110;WE=133192529;WS=133192511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr8	133198529	rs62519602	T	C	3054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=59;PP=1449;SC=CTGCAACTTCTGCTGGACATT;SOR=1.188;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=46;TCR=59;TR=105;WE=133198537;WS=133198519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr8	133198672	rs62519603	A	G	777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=7;PP=537;SC=TAACCAGCTAATTAGTAGAAT;SOR=1.781;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=26;WE=133198680;WS=133198662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr8	133199411	rs58417923	G	T	3392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=42;PP=2168;SC=CCTACTCCAGGTACTCTGGTT;SOR=1.215;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=74;TCR=42;TR=116;WE=133199419;WS=133199401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr8	133199557	rs62519605	C	T	4006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=61;NR=73;PP=2170;SC=CACGAGCTCACAGTCCAGATA;SOR=1.071;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=134;TCF=61;TCR=73;TR=134;WE=133199565;WS=133199547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr8	133199615	rs62519606	C	A	1406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=34;PP=967;SC=TGATGTAAGGCGGATGGAAAT;SOR=2.786;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=9;TCR=34;TR=43;WE=133199623;WS=133199605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr8	133492921	rs28606540	C	A	308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=7;NR=11;PP=231;SC=CTCCCCACCCCCCCCCAAAAG;SOR=1.112;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=23;TCF=12;TCR=11;TR=18;WE=133492929;WS=133492911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr8	133634814	rs2272681	C	T	9809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=370;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=189;NR=157;PP=2965;SC=ACACCATTGACTGACACTTTT;SOR=0.789;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=346;TCF=189;TCR=157;TR=346;WE=133634822;WS=133634804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,369:1.00:369
chr8	133637659	rs2293979	G	A	9519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=358;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=163;NR=172;PP=2965;SC=GTGTTCCTCTGTGTCTGGTGC;SOR=0.798;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=335;TCF=163;TCR=172;TR=335;WE=133637667;WS=133637649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,358:1.00:358
chr8	133700036	rs3857933	T	C	3573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=85;PP=2166;SC=CTTTTGGCTTTGATATTGACC;SOR=1.540;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=42;TCR=85;TR=127;WE=133700044;WS=133700026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr8	133723166	rs1895807	A	G	6129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=110;NR=99;PP=2965;SC=GACAATTTCCAGATATTCAGA;SOR=0.710;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=210;TCF=110;TCR=100;TR=209;WE=133723174;WS=133723156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr8	133764263	rs2467986	G	A	1452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=21;NR=31;PP=843;SC=AAAAGATAACGCACTTTAAAT;SOR=1.199;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=21;TCR=31;TR=52;WE=133764271;WS=133764253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr8	133764321	rs1469265	G	A	190.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=6;PP=141;SC=TCATCACTGTGAAGGAAAATA;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=133764329;WS=133764311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr8	133769363	rs184773108	C	T	863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=1;PP=717;SC=AGGATGGTCTCCATCTCCTGA;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=27;WE=133769371;WS=133769353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr8	133769625	rs11778229	T	C	1193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=31;PP=940;SC=ATATGTATAATTGCAAACAGT;SOR=4.294;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=34;WE=133769633;WS=133769615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr8	133770869	rs11314346	AT	A	74.14	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.36;ReadPosRankSum=0.210;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr8	133844711	rs112196551	C	T	1095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=33;PP=901;SC=GAGAATAAAACGTACTCTGTT;SOR=4.863;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=2;TCR=33;TR=35;WE=133844719;WS=133844701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr8	133880334	rs180203	T	C	2629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=31;PP=1409;SC=ACACTCTTCTTTGATGAACCA;SOR=0.985;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=52;TCR=31;TR=83;WE=133880342;WS=133880324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr8	133885554	rs180210	T	C	531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=19;PP=436;SC=ATGTGTCATATGTGCAGCATG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=133885562;WS=133885544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr8	133947859	rs2739062	A	G	790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=8;PP=438;SC=CTGCTTACACATCTGTCTCCT;SOR=1.473;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=28;WE=133947867;WS=133947849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr8	133978711	.	CTG	C	72.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.51;MQRankSum=3.247;QD=1.73;ReadPosRankSum=0.121;SOR=0.378;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,7:0.17:42
chr8	133984058	rs2076740	C	T	7517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=149;NR=104;PP=2965;SC=ATGTGAACGACGGTGCGATGC;SOR=1.043;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=254;TCF=149;TCR=105;TR=253;WE=133984066;WS=133984048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,283:1.00:283
chr8	133985115	rs1403486	A	G	245.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=201;SC=CAACAGAAATAGATTCTGTTT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=133985123;WS=133985105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr8	133995475	rs10105779	A	G	887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=5;PP=597;SC=GGTTGGGACAATCTGTCTGCC;SOR=2.910;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=26;WE=133995483;WS=133995465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr8	134025781	rs10105991	A	T	5167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.33;SOR=1.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr8	134025781	.	AGA	TGG	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=64;NR=34;PP=2947;QD=20;SC=GATGACTGGAAGAATGCATGA;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=105;TCF=66;TCR=39;TR=98;WE=134025791;WS=134025771;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:7,98:0.93:105
chr8	134025783	rs10105992	A	G	5167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.79;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr8	134050678	rs3739266	A	G	1006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=5;PP=777;SC=TGAGGCTCCCAGGGATCAGGG;SOR=3.442;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=37;WE=134050686;WS=134050668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr8	134052198	rs3835182	G	GCA,GCACA	1992.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=2.609;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.303;NF=10,10;NR=14,14;PP=539,239;ReadPosRankSum=0.878;SC=GCACTTGCATGCACACACACA;SOR=0.255;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=15;TCR=21;TR=24,24;WE=134052209;WS=134052188;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.25,0.63:68
chr8	134062912	rs2252807	A	G	1475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=2;PP=1206;SC=TTAAAGAGGAAGGTTGCAGTA;SOR=5.283;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=39;TCR=2;TR=41;WE=134062920;WS=134062902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr8	134062983	rs2252805	C	T	5852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=128;NR=67;PP=2965;ReadPosRankSum=1.255;SC=ACCACTCTAGCTAACAATCAA;SOR=0.578;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=197;TCF=130;TCR=67;TR=195;WE=134062991;WS=134062973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,214:1.00:215
chr8	134125650	.	CT	C	57.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.090;ClippingRankSum=0.000;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=2.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.58;ReadPosRankSum=0.483;SOR=0.301;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,15:0.15:99
chr8	134225396	rs55733525	T	TC	6677.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=71;PP=2967;SC=CGTAAGTGAGTCCTCCATACC;SOR=0.828;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=24;TCR=74;TR=94;WE=134225404;WS=134225386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr8	134225434	rs13258091	T	C	3360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=64;PP=2134;SC=GCACCCCCAGTTCTGGCCCCA;SOR=1.255;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=37;TCR=64;TR=101;WE=134225442;WS=134225424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr8	134239770	rs3739261	T	C	3947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=51;PP=2481;SC=GCATGGACAATAGGTGCTGCA;SOR=1.002;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=135;TCF=84;TCR=51;TR=134;WE=134239778;WS=134239760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr8	134251449	rs2929976	T	C	1301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=27;PP=865;SC=ACATGCTCTTTTACGTGCCAG;SOR=1.464;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=46;TCF=17;TCR=29;TR=44;WE=134251457;WS=134251439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr8	134260817	rs16904873	T	C	1682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=21;PP=881;SC=GGCTGGGTAATGCTCAGTCTC;SOR=1.214;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=36;TCR=21;TR=57;WE=134260825;WS=134260807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr8	134261065	rs2233335	T	G	1687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=34;PP=967;SC=CCTGGAGAAATCTCCCACTCC;SOR=1.430;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=19;TCR=34;TR=53;WE=134261073;WS=134261055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr8	134266653	rs2233333	G	A	357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=2;PP=242;SC=ATTATCTCATGAGCACCAGCT;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=134266661;WS=134266650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr8	134266970	rs2272650	C	G	1060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=27;PP=784;SC=TCAAGGACATCCCCCTTGATA;SOR=2.432;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=35;WE=134266978;WS=134266960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr8	134270548	rs2272651	T	C	4759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=109;NR=52;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.031;SC=TTTTCCAATGTCTTCCTTCAT;SOR=0.619;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=163;TCF=110;TCR=53;TR=161;WE=134270556;WS=134270538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,172:0.99:173
chr8	134271506	rs2233327	G	A	2233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=37;NR=41;PP=1174;SC=ATTAGTGAGCGCCCGGACAGA;SOR=1.005;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=37;TCR=41;TR=78;WE=134271514;WS=134271496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr8	134274226	rs2233324	C	G	6593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=122;NR=99;PP=2965;SC=GAGCAAAGCACCTGAACCCCT;SOR=0.849;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=221;TCF=122;TCR=99;TR=221;WE=134274234;WS=134274216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr8	134292288	rs2977507	T	C	582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=2;PP=450;SC=TCCTGATTCTTTGGCCAGCAC;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=134292296;WS=134292278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr8	134314037	.	C	CCAT	216.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=5;NR=0;PP=240;SC=GTCATCATCACCATCATCATC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=5;WE=134314045;WS=134314030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr8	134314369	rs2976580	A	G	105.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=56;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=7;PP=165;SC=AAAAAAAACCATGAAAGGAAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=134314377;WS=134314359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr8	134474148	rs1048479	C	T	7362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=146;NR=100;PP=2965;SC=AGAAGATGACCGAGAGGATGC;SOR=1.024;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=246;TCF=146;TCR=100;TR=246;WE=134474156;WS=134474138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,269:1.00:269
chr8	135521970	rs11778717	G	A	2837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=62;PP=1791;SC=GGATGTTCACGGCCGTGGGGT;SOR=1.681;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=33;TCR=62;TR=95;WE=135521978;WS=135521960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr8	135522364	rs2289547	A	G	3632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=71;PP=2167;SC=TCCTGGGAGCACCCAGCAAGC;SOR=1.312;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=120;TCF=48;TCR=72;TR=119;WE=135522372;WS=135522354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr8	135522463	rs2289548	G	C	969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=23;PP=712;SC=ATTATTCAACGAGTAGGCTTT;SOR=1.819;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=10;TCR=23;TR=33;WE=135522471;WS=135522453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr8	135524938	rs3739427	T	C	163.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=53;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=6;PP=144;SC=CAAACGCATATAAGAAAGCAA;SOR=2.303;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=135524946;WS=135524928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr8	135614316	rs202155119	G	A	4903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=75;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.872;SC=AGGGGCCTCCGGCTCCTTCCG;SOR=0.761;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=160;TCF=84;TCR=76;TR=158;WE=135614324;WS=135614306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,180:0.99:182
chr8	135649848	rs12541381	G	A	3694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=58;PP=2166;SC=GGAGCCAGCGGGCTGTCCTCA;SOR=0.883;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=121;TCF=63;TCR=58;TR=121;WE=135649856;WS=135649838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr8	135724961	.	CGCGGCCGGCGGCCG	C	234.79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=1;PP=808;SC=CGGATCCCTCCGCGGCCGGCG;SOR=1.329;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=4;WE=135724982;WS=135724954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr8	135725058	rs71528372	C	T	808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.037;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=19;PP=773;ReadPosRankSum=-0.411;SC=ACCCCCACCCCGTCTCACCCC;SOR=1.033;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=51;TCF=32;TCR=19;TR=41;WE=135725066;WS=135725048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,37:0.97:38
chr8	136306291	rs4344113	G	C	118.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=92;SC=CTTACGAAAGGATTCACCAAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=136306299;WS=136306281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr8	136657198	rs4243846	T	C	652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=0;PP=522;SC=ATTTTCAGTCTTGCCCTTCAT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=136657206;WS=136657188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
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chr8	136659426	rs3184618	G	A	1089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=25;PP=731;SC=AAATAAATCAGAATGCTTAAA;SOR=2.073;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=33;WE=136659434;WS=136659416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
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chr8	139149510	rs6577877	A	C	10000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=365;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=146;NR=175;PP=2965;SC=AGCCCTGTAAAAATTAGCCAG;SOR=0.932;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=323;TCF=147;TCR=176;TR=321;WE=139149518;WS=139149500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,361:1.00:361
chr8	139151375	rs4634694	C	T	2417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.12;QD=27.17;SOR=2.076;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr8	139151421	rs4634695	C	T	1115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=26;PP=711;SC=GTGAGATGAACGTTAAACTGA;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=28;WE=139151436;WS=139151411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr8	139151428	rs35147483	C	CTG	1018.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=18;PP=869;SC=GAACGTTAAACTGAATTTTAG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=18;WE=139151436;WS=139151411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr8	139153374	rs4909738	G	C	838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=7;PP=509;SC=AAGTACCTGTGCCCGGTTTCA;SOR=1.942;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=26;WE=139153382;WS=139153364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr8	139158317	rs7006664	T	C	6482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=112;NR=115;PP=2965;SC=ATAACCCCCATCCCAGTCCCG;SOR=0.814;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=228;TCF=112;TCR=116;TR=227;WE=139158325;WS=139158307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr8	139164192	rs3750306	G	A	5183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=82;PP=2965;SC=CTATGTATCCGGGGCCCTGCT;SOR=0.842;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=160;TCF=78;TCR=82;TR=160;WE=139164200;WS=139164182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr8	139165068	rs3763590	C	T	3759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=51;PP=2250;SC=TGTAGGTCAGCACTGGGGCCT;SOR=0.905;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=68;TCR=51;TR=119;WE=139165076;WS=139165058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr8	139165272	rs7835712	TG	CA	14830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=137;NR=141;PP=2947;SC=CATTCTCACCTGGCTCTGGAC;SOR=0.787;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=288;TCF=143;TCR=145;TR=278;WE=139165281;WS=139165262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,333:1.00:333
chr8	139165289	rs7835830	T	C	8102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=123;NR=144;PP=2965;SC=GGACACCTTATAACTTCTTCA;SOR=0.903;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=268;TCF=123;TCR=145;TR=267;WE=139165297;WS=139165279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,301:1.00:301
chr8	139165463	rs11311519	CA	C	253.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=159;SC=TTATGCCCTACAAAAAAAAAA;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=9;WE=139165471;WS=139165453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr8	139189502	rs6985633	T	A	2899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=33;PP=1603;SC=TCTCCTTCACTTCCAGTGAGA;SOR=1.287;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=62;TCR=33;TR=95;WE=139189510;WS=139189492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr8	139190957	rs4909747	T	G	2367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=41;PP=1476;SC=AAAGGTGGTATTCAAGGCTCC;SOR=1.039;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=37;TCR=41;TR=78;WE=139190965;WS=139190947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr8	139269052	rs1512403	A	G	4858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=98;PP=2965;SC=ATCTTGTCCAAATGAAATACT;SOR=1.267;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=164;TCF=66;TCR=98;TR=164;WE=139269060;WS=139269042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr8	139321179	rs6577909	A	G	5807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=115;NR=85;PP=2965;SC=CCCTGAGAGCAGGTTCCTCAA;SOR=0.905;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=201;TCF=115;TCR=86;TR=200;WE=139321187;WS=139321169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr8	139323246	rs56096441	A	G	851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=17;PP=528;SC=TAATCCTGAAAGCCATAGGAA;SOR=1.942;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=24;WE=139323254;WS=139323236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr8	139380103	rs370836089	AAC	A	49.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.99;ReadPosRankSum=1.076;SOR=0.813;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,7:0.14:50
chr8	139614436	rs4394401	G	A	4781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=91;PP=2965;SC=TCATTGCCCCGGGCCCTCTGC;SOR=1.043;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=164;TCF=73;TCR=91;TR=164;WE=139614444;WS=139614426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr8	139614582	rs6993225	C	T	273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=2;NR=7;PP=169;SC=GCACACTGTGCCTTCTCTCCT;SOR=2.303;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=139614590;WS=139614572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr8	139617046	rs12546923	A	C	5974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=116;NR=95;PP=2965;SC=GTGGCTCTGCAGCATCAGCCC;SOR=0.773;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=211;TCF=116;TCR=95;TR=211;WE=139617054;WS=139617036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr8	139618754	rs4471041	T	C	6408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=103;NR=115;PP=2965;SC=CAAGCAGATTTGGAAACCTTG;SOR=0.937;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=218;TCF=103;TCR=115;TR=218;WE=139618762;WS=139618744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr8	139620049	rs12681582	T	G	521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=1;PP=333;SC=TCCAACCTATTTCTACCACTC;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=139620057;WS=139620039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr8	139620267	rs11166829	G	A	4830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=80;PP=2965;SC=ATCCTGCCAGGGCATCAAAGA;SOR=0.841;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=150;TCF=70;TCR=80;TR=150;WE=139620275;WS=139620257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr8	139626176	rs7000261	C	G	2680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=42;PP=1687;SC=GGAACAAAGACAGAGAGATGG;SOR=0.799;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=44;TCR=42;TR=86;WE=139626184;WS=139626166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr8	139631650	rs7009396	A	G	888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=21;NR=9;PP=524;SC=AGAGCCATGTAGCTGATGGGC;SOR=1.352;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=30;WE=139631658;WS=139631640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr8	139635883	rs7836250	A	C	3547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=42;PP=2171;SC=TATCTTCGAGACTGGTTCAAA;SOR=1.259;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=75;TCR=42;TR=117;WE=139635891;WS=139635873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr8	139635920	rs7839790	T	A	4937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=69;PP=2888;SC=AGTAGTTGTTTTTGACATGTA;SOR=1.038;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=169;TCF=100;TCR=69;TR=169;WE=139635928;WS=139635910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr8	139638307	rs3924860	T	C	251.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=176;SC=GTTTCTAATTTTCTACAACAC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=139638315;WS=139638297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
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chr8	139648892	rs11166830	G	A	3413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=37;PP=2245;SC=AGGCAAAGAAGAGACAAGGAA;SOR=1.495;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=74;TCR=37;TR=111;WE=139648900;WS=139648882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr8	139658747	rs4909439	C	T	1429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=10;PP=1003;SC=TGCTTAGACCCAGAACAGGGG;SOR=2.256;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=37;TCR=10;TR=47;WE=139658755;WS=139658737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr8	139668032	rs11166832	T	C	2016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=9;PP=1421;SC=GCTGTTATCGTTAATACTACC;SOR=2.636;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=50;TCR=9;TR=59;WE=139668040;WS=139668022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr8	139668300	rs12675091	C	T	5359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=113;PP=2965;SC=TGACACACTGCGCCGTGCGTG;SOR=1.402;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=181;TCF=68;TCR=113;TR=181;WE=139668308;WS=139668290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr8	139672602	rs4072506	T	C	1588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=9;PP=1113;SC=CCTCTTGAACTTTCTGAGTTG;SOR=2.712;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=41;TCR=9;TR=50;WE=139672610;WS=139672592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr8	139672671	rs3935045	T	C	5345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=110;NR=79;PP=2896;SC=AACCATAAGATGACATACCGG;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=189;TCF=110;TCR=79;TR=189;WE=139672679;WS=139672661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr8	139674213	rs11780732	C	T	696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=2;PP=513;SC=TGGTGGAGGGCGGGCTTTCAG;SOR=3.442;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=23;WE=139674221;WS=139674203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr8	139675869	rs11166835	G	T	1937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=14;PP=1404;SC=AGTTTTTGGTGCTTCCCATTT;SOR=2.412;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=47;TCR=14;TR=61;WE=139675877;WS=139675859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr8	139676082	rs4410946	A	G	4452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=94;PP=2866;SC=CAGTTGTCCTAGGAGGAGTCA;SOR=1.755;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=137;TCF=43;TCR=94;TR=137;WE=139676090;WS=139676072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr8	139688656	.	A	AAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAG	48.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.50;QD=6.96;SOR=0.016;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,0:0:7
chr8	139688697	.	A	AAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGG	2376.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.166;ClippingRankSum=0.000;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=6.693;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.70;MQRankSum=-1.583;QD=25.83;ReadPosRankSum=-0.446;SOR=1.686;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:7,85:0.92:92
chr8	139696635	rs4506262	T	C	7023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=129;NR=112;PP=2965;SC=CGGCAACTCGTGGCACCCACA;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=241;TCF=129;TCR=112;TR=241;WE=139696643;WS=139696625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr8	139697478	rs9644500	T	C	3983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=63;PP=2055;SC=CTTTTCCGGGTGGCCCAGGGA;SOR=0.816;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=142;TCF=78;TCR=64;TR=141;WE=139697486;WS=139697468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr8	139712323	rs4909835	A	G	2355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=23;PP=1501;SC=GCCGAGGCACACTGGGCACCC;SOR=1.691;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=58;TCR=23;TR=81;WE=139712331;WS=139712313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr8	139734462	rs12678237	T	C	3309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=75;PP=2375;SC=GCTCTTTGATTAGCAGGGCCC;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=37;TCR=75;TR=112;WE=139734470;WS=139734452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr8	139737870	.	T	C	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.501;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=4.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.18;ReadPosRankSum=0.924;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,2:0.20:10
chr8	139737878	.	G	T	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.53;ReadPosRankSum=0.765;SOR=0.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,2:0.22:9
chr8	139767349	rs2318338	T	C	2535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=21;PP=1619;SC=CCAAACCCATTGGTAAGAGAA;SOR=1.995;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=81;TCF=60;TCR=21;TR=80;WE=139767357;WS=139767339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr8	139768085	rs7825723	G	A	6858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=99;NR=124;PP=2965;SC=GCACAGAAACGACAAACATTT;SOR=1.036;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=223;TCF=99;TCR=124;TR=223;WE=139768093;WS=139768075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr8	139774852	rs149851445	C	CACACACA	508.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.83;QD=39.13;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr8	139774866	rs12550638	G	A	286.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.97;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr8	139823922	rs2318332	C	G	440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=3;PP=334;SC=AGGGTGCTGTCAGCTGACAGC;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=139823930;WS=139823912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr8	139824057	rs10101430	G	A	1593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.13;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr8	139825393	rs6577951	A	G	1146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=32;PP=938;SC=AGTCCACCCCAGGATACCCCT;SOR=4.294;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=35;WE=139825401;WS=139825383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr8	139838912	rs2292927	T	C	4040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=49;PP=2374;SC=TGTGGGATGCTGTACTGGTCG;SOR=1.186;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=84;TCR=49;TR=133;WE=139838920;WS=139838902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr8	139845520	rs6993839	G	A	1769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=47;PP=1334;SC=TCGGGAGGGAGTTGTTCAAAT;SOR=2.194;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=17;TCR=47;TR=64;WE=139845528;WS=139845510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr8	139889972	rs4736255	A	G	1585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=15;PP=971;SC=GAGGGGCCGCATGGGGCCCGG;SOR=1.812;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=41;TCR=15;TR=56;WE=139889980;WS=139889962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr8	141034189	rs9792174	A	T	4297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FS=1.543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.000;QD=16.99;ReadPosRankSum=-2.731;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,223:0.88:253
chr8	141293914	.	TA	T	187.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.630;ClippingRankSum=0.000;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=1.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.54;MQRankSum=1.776;QD=5.07;ReadPosRankSum=-0.032;SOR=0.375;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr8	141407698	rs3779658	T	C	2298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=25;PP=1385;SC=CTCTTCCACTTACAGGTAGAC;SOR=1.220;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=47;TCR=25;TR=72;WE=141407706;WS=141407688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr8	141436826	rs6998221	C	T	940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=24;PP=661;SC=TCATAATTCACATAGCCTAGA;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=33;WE=141436834;WS=141436816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr8	141445349	rs11267571	AAGAAAACAAAAAACAAAAACC	A	6194.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=52;PP=2926;SC=GCTGGGCATTAAGAAAACAAA;SOR=2.186;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=105;TCF=2;TCR=103;TR=54;WE=141445377;WS=141445339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr8	141461062	rs3735803	G	A	6467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=119;NR=99;PP=2965;SC=AGTCCTCGTAGTTGGGGTAGA;SOR=0.736;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=218;TCF=119;TCR=99;TR=218;WE=141461070;WS=141461052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr8	141461185	rs3735802	A	G	8642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=154;NR=139;PP=2965;SC=GGAACTTCTCAAAGGTCTGTG;SOR=0.737;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=294;TCF=155;TCR=139;TR=293;WE=141461193;WS=141461175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,325:1.00:325
chr8	141461266	rs3735801	A	G	7895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=149;NR=133;PP=2965;SC=TCTGGAAGTCACCCCACTCGT;SOR=0.770;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=283;TCF=150;TCR=133;TR=282;WE=141461274;WS=141461256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,295:1.00:295
chr8	141525465	rs2231527	T	C	738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=19;PP=445;SC=AGTTCCAGTGTGTGGTATTCT;SOR=1.942;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=27;WE=141525473;WS=141525455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr8	141549326	rs115826075	C	T	922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=3;PP=631;SC=GGGACAGCGGCACTGTGGCCA;SOR=3.545;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=29;WE=141549334;WS=141549316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr8	141549346	rs35387146	CT	C	1816.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=8;PP=1319;SC=AGCAGGTTCTCTTGTGAGTGT;SOR=2.540;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=33;WE=141549354;WS=141549336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr8	141557497	rs2292782	T	C	868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=3;PP=672;SC=CCCTGCATACTGCACCCCACC;SOR=3.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=27;WE=141557505;WS=141557487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr8	141561393	rs2292779	G	C	1344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=7;PP=837;SC=CTGCCTGTGGGGGGCTTACTT;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=35;TCR=7;TR=42;WE=141561401;WS=141561383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr8	141568622	rs2292778	G	A	7093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=110;NR=121;PP=2965;SC=CATTGCAGACGCGGTACTTCC;SOR=0.908;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=231;TCF=110;TCR=121;TR=231;WE=141568630;WS=141568612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
chr8	141568699	rs2292777	A	G	2844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=64;PP=1879;SC=AGGCATCGGCATCGGGGCTGT;SOR=2.016;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=27;TCR=64;TR=91;WE=141568707;WS=141568689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr8	141568725	rs2292776	G	A	1813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=41;PP=1257;SC=CCTGAGTGCAGGCGCCACTTG;SOR=2.546;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=13;TCR=41;TR=54;WE=141568733;WS=141568715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr8	141583108	rs34527405	ATT	A	265.52	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=5.119;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.25;MQRankSum=0.000;QD=20.42;ReadPosRankSum=0.964;SOR=1.872;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr8	141669818	rs3835176	AT	A	1318.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=34;PP=575;ReadPosRankSum=-0.488;SC=GTTTTCAGTGATTTTTTTTTT;SOR=0.921;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=50;TCF=3;TCR=47;TR=37;WE=141669826;WS=141669808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:6,59:0.91:65
chr8	141684170	rs3639	T	C	3118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=34;PP=2150;SC=TAAAATCTATTACACTGAGAG;SOR=1.483;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=65;TCR=34;TR=99;WE=141684178;WS=141684160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr8	141685641	rs6998337	C	A	3475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=59;NR=56;PP=1837;SC=GGTATATACACTTGGGCAATG;SOR=0.804;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=59;TCR=56;TR=115;WE=141685649;WS=141685631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr8	141744917	rs45613837	G	A	3030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=62;PP=1836;SC=GGTGGCAAAGGTCAGGAAAGG;SOR=1.428;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=38;TCR=62;TR=100;WE=141744925;WS=141744907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr8	141749052	rs11464275	A	AT	814.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=7;PP=426;SC=AAAAGAGATAATTTTTTTTTG;SOR=2.019;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=24;TCF=15;TCR=9;TR=21;WE=141749060;WS=141749042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr8	141762558	rs6578132	G	A	703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=19;PP=528;SC=GAATGAGAGGGATACTTAAAA;SOR=3.352;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=141762566;WS=141762548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr8	141774282	rs7840381	A	C	1151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=10;PP=662;SC=TTTTAAATGCAAGGAGGCATC;SOR=1.347;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=24;TCR=10;TR=34;WE=141774290;WS=141774272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr8	141774576	rs4378011	A	G	126.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=4;PP=87;SC=ATCATTGTCCAATACGTTATA;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=141774584;WS=141774566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr8	141779826	rs10875458	C	A	881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=22;PP=684;SC=AAATAAAAAACAATTACCCCC;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=29;WE=141779834;WS=141779816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr8	141840645	rs4246127	G	A	2861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=43;NR=48;PP=1461;SC=AAAAAGAAGCGTATTAACAAA;SOR=0.956;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=43;TCR=48;TR=91;WE=141840653;WS=141840635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr8	141840739	rs4246128	G	A	410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=315;SC=ATATTATTTAGGAAGGAAACA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=141840747;WS=141840729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr8	141902735	.	TA	T	124.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=0.000;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.23;MQRankSum=2.050;QD=1.64;ReadPosRankSum=-0.359;SOR=0.511;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,15:0.20:76
chr8	141919468	rs62521903	C	G	37.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr8	141994297	rs4961311	A	G	284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=7;PP=177;SC=AGCATTACATAATCATGTAGT;SOR=1.445;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=12;TCF=5;TCR=7;TR=12;WE=141994305;WS=141994287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr8	142138860	rs3739232	C	G	1604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=31;NR=23;PP=888;SC=TGCTGGAGCTCTGCGCGCTGC;SOR=0.836;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=54;TCF=31;TCR=23;TR=54;WE=142138868;WS=142138850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr8	142146708	rs307772	T	C	8246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=145;NR=127;PP=2965;SC=GACAGTCAAATGGCCGGTGCC;SOR=0.719;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=272;TCF=145;TCR=127;TR=272;WE=142146716;WS=142146698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,314:1.00:314
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chr8	142166214	rs555399	C	T	905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=26;PP=716;SC=ATTTTGTTTTCTGAGATTGAG;SOR=3.912;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=29;WE=142166222;WS=142166204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
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chr8	142367335	rs10875472	T	C	7919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=128;NR=135;PP=2965;SC=GCGACCCTGGTGGAGCAGACC;SOR=0.817;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=265;TCF=129;TCR=136;TR=263;WE=142367343;WS=142367325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,289:1.00:289
chr8	142367400	rs11167054	G	A	5434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=90;NR=93;PP=2965;SC=TGACCAGCAGGGGCAGCAGGA;SOR=0.798;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=183;TCF=90;TCR=93;TR=183;WE=142367408;WS=142367390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr8	142367559	rs11785629	G	A	4788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=76;PP=2910;SC=GGGAGCCTTCGGGCCGCACGA;SOR=0.762;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=159;TCF=83;TCR=76;TR=159;WE=142367567;WS=142367549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr8	142368150	rs7388121	T	G	560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.05;SOR=1.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr8	142368156	rs7388122	T	A	536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.73;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr8	142451177	rs7459842	G	A	1496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=15;PP=871;SC=TTCTGCTGGGGTGTCAAGGAG;SOR=1.287;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=31;TCR=15;TR=46;WE=142451185;WS=142451167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr8	142458039	rs72685417	C	T	3857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=82;NR=45;PP=2198;SC=CCTCCTGGGCCTGCTGCTTGG;SOR=1.203;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=83;TCR=45;TR=127;WE=142458047;WS=142458029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr8	142459814	rs7003306	C	T	1161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=31;PP=873;SC=CGTGGGCTGCCCAGCCCCCAG;SOR=2.948;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=36;WE=142459822;WS=142459804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr8	142459859	rs62522537	G	A	410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=11;PP=288;SC=GCTGTGGGCAGAGAGGGCATG;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=142459867;WS=142459849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr8	142476424	rs28710266	G	A	1771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.29;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr8	142476424	.	GCG	ACA	1177	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=24;NR=6;PP=1177;QD=41.0155958287;SC=GTGGGCCATGGCGGGGGCAGA;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=30;WE=142476434;WS=142476414;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr8	142476426	rs28663233	G	A	1771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.29;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr8	142476474	rs28525328	T	C	2445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=26;PP=1205;SC=GGGGAGAGGATGGGGAGTGGG;SOR=1.414;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=53;TCR=26;TR=79;WE=142476482;WS=142476464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr8	142476555	rs28439396	A	G	4165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=72;PP=2475;SC=ACCAGCTCACAGGTGTGGCTC;SOR=0.718;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=146;TCF=74;TCR=72;TR=146;WE=142476563;WS=142476545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr8	142476611	rs28504323	G	A	3175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=63;PP=2057;SC=CTTGGCTTGCGGGATGTGGAC;SOR=1.140;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=46;TCR=63;TR=109;WE=142476619;WS=142476601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr8	142477453	.	CCCTGGCCCTT	C	1062	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.57;FR=1.0000;HP=4;HapScore=1;MGOF=55;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=4;NR=0;PP=1062;QD=268.75;SC=GCCCTCCGCCCCCTGGCCCTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=4;WE=142477470;WS=142477443;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,4:0.57:7
chr8	142477468	rs377007139	GCCC	G	682.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.52;SOR=3.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr8	142477472	rs370101118	TTCCTGGC	T	682.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.67;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr8	142477479	.	C	T	261	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;FR=0.5168;HP=2;HapScore=3;MGOF=119;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=12;NR=0;PP=261;QD=24.6476010456;SC=CCCTTCCTGGCCCAGCCCCAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=142477498;WS=142477469;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:0,12:1.00:12
chr8	142477490	rs73713679	C	T	723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5170;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=119;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=487;SC=CCAGCCCCAGCGCCCTCACGA;SOR=3.383;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=142477498;WS=142477469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr8	142477517	rs79788097	G	A	1109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=69;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=4;PP=702;SC=GCTTGGCCCCGTGCTCCTGGA;SOR=2.774;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=31;WE=142477525;WS=142477507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr8	142477553	rs73713680	T	C	4091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.46;SOR=1.508;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr8	142477563	rs73713681	C	T	5011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.84;SOR=1.380;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr8	142477588	rs74908317	C	T	6451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.43;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr8	142477592	rs76586547	G	A	6631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.81;SOR=0.997;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr8	142477614	rs72685432	C	T	7538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=43;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=95;NR=70;PP=2699;SC=GATGAGGTCGCTCAACTCTGC;SOR=0.816;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=165;TCF=95;TCR=70;TR=165;WE=142477622;WS=142477604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr8	142477752	rs11775650	T	C	1186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=32;PP=820;SC=CCCAGGATCTTGCAAGTCTCT;SOR=2.059;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=46;TCF=13;TCR=33;TR=45;WE=142477760;WS=142477742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr8	142477771	rs72685433	C	G	738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=19;PP=556;SC=CTGAGCATATCTGGCCTCCTA;SOR=3.014;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=24;WE=142477779;WS=142477761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr8	142480610	rs4907398	C	T	2031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=48;NR=18;PP=1313;SC=AGTGAGCGAGCGCATTTACCC;SOR=1.708;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=48;TCR=18;TR=66;WE=142480618;WS=142480600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
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chr8	142484144	rs2126099	T	C	287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=2;PP=110;SC=AGGTCCCGCCTTGTCTCCTCT;SOR=0.859;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=142484152;WS=142484134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
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chr8	142488662	rs2613643	C	T	1392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=29;NR=16;PP=705;SC=GTCCGGGACTCGGTCTTGGTG;SOR=1.244;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=46;TCF=30;TCR=16;TR=45;WE=142488670;WS=142488652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr8	142488837	rs12547980	G	A	1932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=39;PP=1124;SC=GGTGCTGCTGGCCCATTTCCA;SOR=1.308;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=25;TCR=39;TR=64;WE=142488845;WS=142488827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr8	142489981	rs2748417	C	T	2328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=21;PP=1583;SC=CAGGTGGTGGCGGGGACAGGG;SOR=2.084;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=56;TCR=21;TR=77;WE=142489989;WS=142489971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr8	142490079	rs2613641	G	A	7977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=149;NR=132;PP=2965;ReadPosRankSum=2.848;SC=CCGTGGCACCGTTTTTTTCAG;SOR=0.372;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=284;TCF=152;TCR=132;TR=281;WE=142490087;WS=142490069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,311:0.99:314
chr8	142490120	rs2748416	G	T	7267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=116;NR=124;PP=2965;SC=TAGGTAAACAGGAAGGCCTGT;SOR=0.887;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=240;TCF=116;TCR=124;TR=240;WE=142490128;WS=142490110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,279:1.00:279
chr8	142490166	rs7838192	C	T	3234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=63;PP=1869;SC=CTTGACCCCCCCCAAGGTGGC;SOR=1.437;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=38;TCR=63;TR=101;WE=142490174;WS=142490156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr8	142524759	rs72685453	A	G	2023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=21;PP=1063;SC=TCTCCTGGGCAGCCTAGTAAA;SOR=0.948;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=42;TCR=21;TR=63;WE=142524767;WS=142524749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr8	143257568	rs73375434	A	G	816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=4;PP=602;SC=TCGGCTCACAACATTTATAAA;SOR=2.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=25;WE=143257576;WS=143257558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr8	143257795	rs7007430	G	C	2318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=45;PP=1316;SC=AGGCTGAGTTGGTTTAAATCT;SOR=1.312;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=34;TCR=45;TR=79;WE=143257803;WS=143257785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr8	143352978	rs11777062	T	G	1404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=11;PP=1027;SC=AGGGGGTCAGTTTCAGGCAGG;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=34;TCR=11;TR=45;WE=143352986;WS=143352968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr8	143365913	rs5895710	GT	G	3402.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=54;PP=2350;SC=GCACCTGAAAGTTTCCCATGG;SOR=1.493;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=66;TCF=6;TCR=60;TR=60;WE=143365921;WS=143365903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr8	143382124	rs140537326	G	GGACGATCTGGGTCTGAGGC	789.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.26;QD=41.56;SOR=5.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr8	143425271	rs67990630	C	A	2145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=47;NR=25;PP=1181;SC=GATGGGCCCCCCCCTCCTGCT;SOR=1.151;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=47;TCR=25;TR=72;WE=143425279;WS=143425261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr8	143425720	rs10100935	T	C	5543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=107;NR=86;PP=2965;SC=GCCCGGGTAGTGCTGGGCCCC;SOR=0.772;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=193;TCF=107;TCR=86;TR=193;WE=143425728;WS=143425710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr8	143427178	rs33970858	C	G	10527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=396;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=199;NR=162;PP=2965;SC=CCCCACACAGCGGTTCTGCAG;SOR=0.862;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=361;TCF=199;TCR=162;TR=361;WE=143427186;WS=143427165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,395:1.00:395
chr8	143436034	rs7814359	A	G	5348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=81;PP=2965;SC=GGTCCCCCGAAAGGGCCACGG;SOR=0.790;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=180;TCF=99;TCR=81;TR=180;WE=143436042;WS=143436024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr8	143447503	rs7388487	C	T	324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=13;PP=336;SC=GTTCATGCCACTCTCCAGCCT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=143447511;WS=143447493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr8	143546381	.	TGGGCAGACAGGGGAGGC	T	985.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=0;NR=8;PP=2227;SC=ACAGGGGAGGTGGGCAGACAG;SOR=1.708;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=8;WE=143546405;WS=143546371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr8	143556790	rs55875009	G	A	5682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=111;NR=89;PP=2965;SC=TCCAGGCCACGAGCCCCTGCC;SOR=0.769;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=200;TCF=111;TCR=89;TR=200;WE=143556798;WS=143556780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr8	143559757	rs111988863	T	C	535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=14;PP=421;SC=GGGGGGCACCTAACAAGCAGG;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=143559765;WS=143559747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr8	143599631	rs13281622	A	G	6608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.48;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr8	143599634	rs13254098	T	G	6486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.74;SOR=1.467;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr8	143599651	rs13281652	A	C	3168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=45;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=73;PP=2167;SC=CTCCTGCATCACACGCCTCTT;SOR=1.949;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=107;TCF=34;TCR=73;TR=106;WE=143599673;WS=143599641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr8	143599665	rs13254123	T	C	2495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=45;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=59;PP=1856;SC=GCCTCTTCCCTTGAAGGTCAC;SOR=2.513;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=19;TCR=59;TR=78;WE=143599673;WS=143599641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr8	143599704	rs13281694	A	C	861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=105;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=22;PP=679;SC=CCCTCCCTCCATTTGTCCTCA;SOR=3.258;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=27;WE=143599724;WS=143599694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr8	143599716	rs13278828	G	C	591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=105;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=16;PP=468;SC=TTGTCCTCACGTTCCCAGTCA;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=143599724;WS=143599694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr8	143599734	rs13281922	A	C	371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=100;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=11;PP=300;SC=TCACCTCCGCATTTGCCACGG;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=143599761;WS=143599724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
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chr8	143599753	rs13281945	A	C	400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.53;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
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chr8	143684655	rs58986836	C	T	147.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.64;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
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chr8	143695678	rs28403912	A	G	529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.75;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
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chr8	143696749	rs28660666	G	A	5503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=91;NR=105;PP=2965;SC=GACTTCTAAGGGGATGGAAGA;SOR=0.928;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=198;TCF=92;TCR=106;TR=196;WE=143696757;WS=143696739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr8	143696832	rs28625055	G	A	1517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.60;SOR=1.487;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
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chr8	143761931	rs2294008	C	T	2297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=39;NR=36;PP=1264;SC=CCAGTGACCACGAAGGCTGTG;SOR=0.763;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=39;TCR=36;TR=75;WE=143761939;WS=143761921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr8	143762135	rs2920279	A	C	484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=7;PP=216;SC=TCCTCCAGGGAAGCTCTTGGC;SOR=1.179;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=6;TCR=7;TR=13;WE=143762143;WS=143762125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr8	143762932	rs2976392	G	A	4748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=78;NR=95;PP=2762;SC=GTCCGCATCTGTGTGCTGTTT;SOR=0.971;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=173;TCF=78;TCR=95;TR=173;WE=143762940;WS=143762922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr8	143763043	rs2920298	A	G	590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=15;PP=360;SC=TCCTCCACTCATCTGTCCCTC;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=20;WE=143763051;WS=143763033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr8	143763259	rs71514093	T	TG	668.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=0;PP=710;SC=TTAGGCAGGGTGGGACAGGAG;SOR=4.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=143763267;WS=143763258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
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chr8	143763547	rs1045531	C	A	4440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=71;PP=2840;SC=CCGGCCAGCTCTAGGCTCTGG;SOR=0.892;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=135;TCF=64;TCR=71;TR=135;WE=143763555;WS=143763537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr8	143763618	rs2976393	C	G	11006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.11;SOR=0.928;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr8	143763622	rs2976394	C	T	11088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.36;SOR=0.922;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr8	143763690	rs10216533	G	A	9334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=171;NR=151;PP=2965;SC=GTATGTCTGCGCCCCTGTCCC;SOR=0.728;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=323;TCF=171;TCR=152;TR=322;WE=143763698;WS=143763680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,350:1.00:350
chr8	143763750	rs2976395	G	A	14102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.39;SOR=0.830;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,325:1.00:325
chr8	143763757	rs1045547	T	G	14121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.83;SOR=0.806;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,315:1.00:315
chr8	143763958	rs1045574	G	A	5809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=97;NR=92;PP=2965;SC=AGGAGGGCCCGGTAAAGGCTG;SOR=0.853;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=189;TCF=97;TCR=92;TR=189;WE=143763966;WS=143763948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
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chr8	143764101	rs1045605	C	G	684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=19;PP=569;SC=ATGGCAGCCTCAGCACAGCGT;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=143764109;WS=143764091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr8	143823863	rs13254346	G	C	5140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=87;PP=2965;SC=TTATACCCAGGCCCTTGGGCA;SOR=0.837;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=173;TCF=86;TCR=87;TR=173;WE=143823884;WS=143823853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr8	143823876	rs13254358	G	A	4763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=77;NR=80;PP=2622;SC=CTTGGGCACCGGCTTCTGGGC;SOR=0.899;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=158;TCF=78;TCR=80;TR=157;WE=143823884;WS=143823853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr8	143845950	rs2585187	A	G	1823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.42;SOR=1.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr8	143845953	rs2717554	T	C	1881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.77;SOR=1.662;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr8	143846593	rs12541206	T	C	1952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=48;PP=1172;SC=CACAAACGGATGGGAGGCAGG;SOR=1.874;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=22;TCR=48;TR=70;WE=143846601;WS=143846583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr8	143849626	rs7006366	T	A	649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.94;SOR=3.816;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr8	143856967	rs2304398	C	G	2275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=20;PP=1429;SC=AGAACCTCCCCTTCGTGCTCC;SOR=1.900;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=77;TCF=57;TCR=20;TR=76;WE=143856975;WS=143856957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr8	143857265	rs2585125	G	T	7212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=126;NR=116;PP=2965;SC=CTTCCCTACTGTCAGCCCATC;SOR=0.715;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=242;TCF=126;TCR=116;TR=242;WE=143857273;WS=143857255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,273:1.00:273
chr8	143857441	rs3214637	A	AGG	1100.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=17;PP=763;SC=GATCCAACTCAGGTGGCGCAC;SOR=3.098;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=17;WE=143857449;WS=143857431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr8	143955657	rs5297	A	G	199.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=1;PP=144;SC=CGGGAGTTCCATTTGTGCTGG;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=143955665;WS=143955647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr8	143955916	rs5295	C	G	4389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=73;NR=74;PP=2304;SC=GGACAGAAGCCGGGTTTCCAT;SOR=0.884;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=147;TCF=73;TCR=74;TR=147;WE=143955924;WS=143955906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr8	143956788	.	T	A	91	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=21;MMLQ=27;MQ=41.82;NF=5;NR=0;PP=91;QD=25.1542425094;SC=CTGTGCTCTCTGCACCCTTCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=14;TCR=10;TR=5;WE=143956796;WS=143956766;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:19,5:0.21:24
chr8	143956808	rs6395	A	C	551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=10;PP=594;SC=CTACCGAAGAACCCGCAGAGG;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=16;TCR=10;TR=26;WE=143956816;WS=143956798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr8	143956854	rs61752788	G	A	976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=20;NR=20;PP=609;SC=CGTAGGAAGTGCTTCCTTGCA;SOR=0.850;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=20;TCR=20;TR=40;WE=143956862;WS=143956844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr8	143956925	rs6392	T	C	845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=19;PP=511;SC=AAGGACATGCTCCACGTTAAT;SOR=1.681;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=10;TCR=19;TR=29;WE=143956933;WS=143956915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr8	143956965	rs6391	A	G	204.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=168;SC=GATTCCAGAGAAAGAAGAGCT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=143956973;WS=143956955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr8	143957405	rs6471570	A	C	8573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=118;NR=153;PP=2965;SC=ATACCCTGAGAACGACAGAGC;SOR=1.102;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=271;TCF=118;TCR=153;TR=271;WE=143957413;WS=143957395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,305:1.00:305
chr8	143957856	rs7822986	G	A	4020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=51;NR=86;PP=2576;SC=GGTGCTGGGAGACATCCTTCA;SOR=1.406;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=137;TCF=51;TCR=86;TR=137;WE=143957864;WS=143957846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr8	143957886	rs10105643	A	C	1667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=43;PP=1253;SC=TCCTGCCCAGACTGCCCCGAC;SOR=2.428;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=12;TCR=43;TR=55;WE=143957894;WS=143957876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr8	143957914	rs61752760	C	G	858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=54;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=25;PP=661;SC=TCTCCCTGCTCTCATCCCAAA;SOR=3.841;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=28;WE=143957922;WS=143957904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr8	143958342	rs113759408	G	A	3161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=50;PP=1790;SC=GCAGCCCCGGGCCTCCTGGCT;SOR=0.841;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=50;TCR=50;TR=100;WE=143958350;WS=143958332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr8	143958427	rs6387	C	T	2761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=47;PP=1592;SC=GATCTTCCCACGTGGCCCACA;SOR=0.856;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=46;TCR=47;TR=93;WE=143958435;WS=143958417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr8	143959250	rs7818826	T	C	4985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=87;NR=80;PP=2917;SC=CAGCCACATTTCTGCAAAACT;SOR=0.714;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=168;TCF=88;TCR=80;TR=167;WE=143959258;WS=143959240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr8	143959289	rs7818953	T	C	3949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=73;PP=2387;SC=CAGCTGGCTGTTGTGAGCTGT;SOR=1.052;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=60;TCR=73;TR=133;WE=143959297;WS=143959279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr8	143959412	rs28551743	G	A	293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=6;PP=169;SC=CACCCATGCCGGCACCTGCAC;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=143959420;WS=143959402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr8	143961005	rs6410	T	C	3289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=33;PP=2156;SC=AAATGGGCCCTAGTTCCTGGA;SOR=1.629;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=109;TCF=76;TCR=33;TR=109;WE=143961013;WS=143960995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr8	143993640	rs6433	C	T	823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=22;PP=630;SC=ACCTATCCCACTTCTGACCAG;SOR=3.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=26;WE=143993648;WS=143993630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr8	143994266	rs61757294	A	G	1097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.88;QD=32.29;SOR=3.675;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr8	143994321	rs6435	T	C	809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.436;NF=16;NR=14;PP=429;ReadPosRankSum=1.901;SC=GGGGCATCCATAGAAAGGGTC;SOR=1.002;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=40;TCF=22;TCR=18;TR=30;WE=143994329;WS=143994311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,35:0.85:41
chr8	143994349	rs6397	T	C	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.24;MQRankSum=-2.371;QD=15.18;ReadPosRankSum=1.435;SOR=0.657;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,32:0.74:43
chr8	143994361	rs4736320	T	A	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.77;MQRankSum=-2.628;QD=12.93;ReadPosRankSum=1.031;SOR=0.638;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,31:0.67:46
chr8	143994450	rs62525984	A	G	71.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.00;QD=17.76;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr8	143994702	rs4538	G	T	1438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=1;PP=1006;SC=AGCACCCACCGCAAGGTCTCC;SOR=5.330;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=38;TCF=37;TCR=1;TR=38;WE=143994710;WS=143994692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr8	143994944	rs13252628	T	G	6202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=124;PP=2965;SC=CAGGACAACCTCCCTCTGAGG;SOR=1.326;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=202;TCF=78;TCR=124;TR=202;WE=143994952;WS=143994934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr8	143994978	.	CAAA	C,CAA	5035.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.33;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=69;PP=2943;SC=ATGCCCTGAGCAAAAACAGAG;SOR=2.712;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=73;TCF=1;TCR=72;TR=70;WE=143994990;WS=143994968;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:112
chr8	143994981	.	AA	CG	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;FR=1.0000;HP=4;HapScore=1;MGOF=20;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=20;NR=69;PP=2947;QD=20;SC=CCCTGAGCAAAAACAGAGCCC;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=92;TCF=20;TCR=72;TR=89;WE=143994990;WS=143994968;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,89:0.97:92
chr8	143994982	.	A	ACG	5034.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.56;SOR=2.733;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr8	143995743	rs4543	C	T	4754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=98;NR=69;PP=2687;SC=GTGACAGTTCCGCCTTCAACA;SOR=0.911;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=168;TCF=98;TCR=70;TR=167;WE=143995751;WS=143995733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr8	143995761	rs4536	C	T	5930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=124;NR=81;PP=2965;SC=ACAGGAGCTCCGCCACGATGC;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=206;TCF=124;TCR=82;TR=205;WE=143995769;WS=143995751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr8	144063624	rs61688795	G	A	699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=7;PP=383;SC=GTGTGACCACGGCCTGGGCTC;SOR=1.528;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=24;WE=144063632;WS=144063614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr8	144063784	rs28540461	G	A	2880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=38;PP=1689;SC=GTCTCTGTACGGGGTGGGGAG;SOR=0.961;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=54;TCR=38;TR=92;WE=144063792;WS=144063774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr8	144097453	rs13279735	A	G	509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=13;PP=350;SC=CTCCCCTTTCACCTGCCCCAA;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=19;WE=144097461;WS=144097443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr8	144102493	rs11136286	C	T	1756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=44;PP=1273;SC=GAGCAGACGCCCCAGGGGTCC;SOR=2.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=14;TCR=44;TR=58;WE=144102501;WS=144102483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr8	144105026	rs147881012	TCCCGGTGTTCGGGC	T	3976.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQ=60.36;NF=18;NR=19;PP=2935;SC=AGGACAGAGATCCCGGTGTTC;SOR=2.007;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=48;TCF=24;TCR=24;TR=37;WE=144105047;WS=144105016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr8	144105342	rs7823963	A	G	107.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=4;PP=81;SC=ACGGGGGCGCAGTCATCCCCT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=144105350;WS=144105332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr8	144124609	rs11136300	T	C	6835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=127;NR=100;PP=2965;SC=CAGGGGCTGCTGGCTGCCAGG;SOR=0.892;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=227;TCF=127;TCR=100;TR=227;WE=144124617;WS=144124599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr8	144125727	rs6997455	T	A	1849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=38;PP=1114;SC=GCAGCTGGCGTTGGGAGGCTA;SOR=2.093;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=56;TCF=17;TCR=39;TR=55;WE=144125735;WS=144125717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr8	144126244	rs4612316	T	C	2172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=49;PP=1204;ReadPosRankSum=1.780;SC=GGTGGGTGACTGCAGCACATG;SOR=0.676;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=77;TCF=27;TCR=50;TR=76;WE=144126252;WS=144126234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,84:0.99:85
chr8	144130550	rs12677862	C	G	2490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=28;PP=1640;SC=GGATGTCCCACACCCTGTCAT;SOR=1.302;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=51;TCR=28;TR=79;WE=144130558;WS=144130540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr8	144162364	rs6993880	C	T	917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=7;PP=642;SC=GGGGGGTGCGCCCTGAGTAAA;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=32;WE=144162372;WS=144162354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr8	144162577	rs112209434	G	A	2522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=38;PP=1696;SC=TGGGGGCGTCGGGGCTGGAGC;SOR=0.738;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=45;TCR=38;TR=83;WE=144162585;WS=144162567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr8	144295321	rs13253453	C	G	254.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=7;PP=210;SC=CCCCAGCCCACAGCAGCATGG;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=144295329;WS=144295311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr8	144332012	rs6558339	T	C	4911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=73;PP=2707;SC=AGGAACAGAATGATGGAGAAG;SOR=0.878;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=168;TCF=95;TCR=73;TR=168;WE=144332020;WS=144332002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr8	144332082	rs11136275	T	C	5599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=104;NR=89;PP=2965;SC=TGCAGAAGAGTGCGCTCAGAG;SOR=0.780;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=193;TCF=104;TCR=89;TR=193;WE=144332090;WS=144332072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr8	144351632	rs6558341	A	G	5559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=100;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.634;SC=TCTCATCACCAGGGACACCTG;SOR=0.492;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=198;TCF=96;TCR=102;TR=195;WE=144351640;WS=144351621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,211:0.99:214
chr8	144357213	rs3817675	G	C	6526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=129;NR=94;PP=2965;SC=GTGGCCCCACGTGGACTCCTG;SOR=0.820;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=224;TCF=130;TCR=94;TR=223;WE=144357221;WS=144357203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr8	144357479	rs3812433	C	G	4119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=79;PP=2443;SC=TTTAACAGTGCTGAGCCCTCG;SOR=1.017;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=145;TCF=66;TCR=79;TR=145;WE=144357487;WS=144357469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr8	144357975	rs2293924	C	T	2031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=11;PP=828;SC=TAAGCCCCCCCGTCCAGCTCT;SOR=1.714;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=42;WE=144357983;WS=144357965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr8	144357992	rs2293923	A	G	2561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=18;PP=921;SC=CTCTGCTCTCACTCCCCGTCC;SOR=1.263;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=41;TCR=18;TR=59;WE=144358000;WS=144357982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr8	144358381	rs1056148	G	A	2818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=66;NR=26;PP=1803;SC=CGCGCGGGGGGCCAAGCCGCA;SOR=1.911;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=66;TCR=26;TR=92;WE=144358389;WS=144358371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr8	144378184	rs2235115	C	G	6516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=117;NR=96;PP=2965;SC=CAGGCCCCGGCGCAGAGGGCG;SOR=0.879;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=214;TCF=118;TCR=96;TR=213;WE=144378192;WS=144378174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr8	144378868	rs7386259	A	G	6454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=112;NR=103;PP=2965;SC=GGCACCAGCGACTCCACACGG;SOR=0.726;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=216;TCF=113;TCR=103;TR=215;WE=144378876;WS=144378858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr8	144391452	rs11136285	G	A	1001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=2;PP=779;SC=CAAAGTGCTGGGATTACAGGT;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=29;WE=144391460;WS=144391442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr8	144391728	rs7386475	A	G	3109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=69;PP=2019;SC=GGGAGGCAGCATCAGCCCAGG;SOR=1.674;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=34;TCR=69;TR=103;WE=144391736;WS=144391718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr8	144391796	rs10088567	G	A	796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=19;PP=569;SC=AAGGGCGAGCGTCCTCCATGC;SOR=2.147;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=26;WE=144391804;WS=144391786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr8	144391873	rs10105378	A	G	650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=6;PP=432;SC=CACCCCACGCATGCCGCCACC;SOR=1.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=22;WE=144391881;WS=144391863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr8	144391924	rs10099789	CT	TC	3401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.25;SOR=1.778;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr8	144391930	rs10091561	G	A	3634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.78;SOR=1.504;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
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chr8	144398029	rs13275896	A	G	1435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=21;NR=24;PP=759;SC=GCCCCTCCCCATCCCGCACCA;SOR=1.061;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=21;TCR=24;TR=45;WE=144398037;WS=144398019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
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chr8	144398132	rs2293927	T	C	3665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.63;SOR=1.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr8	144398396	rs2293926	C	T	1296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=35;PP=949;SC=CAGCCCCTTCCACTCACACAG;SOR=3.767;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=5;TCR=35;TR=40;WE=144398404;WS=144398386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr8	144399856	rs3215410	TC	T	378.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=6;NR=2;PP=231;SC=GGGGCCGTGCTCCCCCCGCGC;SOR=2.147;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=8;WE=144399864;WS=144399846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr8	144399885	rs2272637	AG	CT	1309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=5;PP=1138;SC=GGTGTGGGGCAGGCTCACCGC;SOR=2.546;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=26;WE=144399894;WS=144399875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr8	144400089	rs2272634	C	T	4708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=72;PP=2835;ReadPosRankSum=1.120;SC=GACATGTCAGCCGTTGGGTCA;SOR=0.223;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=153;TCF=80;TCR=73;TR=152;WE=144400097;WS=144400079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,172:0.99:173
chr8	144403292	rs12680237	C	T	1848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.315;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=15;PP=1125;ReadPosRankSum=-0.750;SC=ACAGACCCCACGGCAGCTCCG;SOR=1.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=59;TCF=43;TCR=16;TR=58;WE=144403300;WS=144403282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,67:0.99:68
chr8	144406881	rs12680498	G	A	5662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=120;PP=2965;SC=CTGGTCAACCGTCCCACGTGG;SOR=1.296;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=195;TCF=75;TCR=120;TR=195;WE=144406889;WS=144406871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr8	144409934	rs35096181	C	A	6444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=33;PP=2111;SC=TGGCATCAGGCCAAAGAAGAG;SOR=1.448;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=110;TCF=75;TCR=35;TR=108;WE=144409946;WS=144409924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr8	144409938	rs11424162	A	AG	6710.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=38;PP=2969;SC=ATCAGGCCAAAGAAGAGGGTC;SOR=1.390;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=90;TCF=46;TCR=44;TR=82;WE=144409946;WS=144409924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr8	144411759	rs3812436	T	C	618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.25;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr8	144411767	rs2467894	C	A	583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=48.65;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr8	144417051	rs2956274	A	G	456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=12;PP=315;SC=TCCGGGAAAGAGCGACAAGCT;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=144417059;WS=144417041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr8	144425247	rs7837655	C	A	730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=1;PP=560;SC=CTTATTTCACCATAAAATCTT;SOR=4.091;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=144425255;WS=144425237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr8	144459231	.	C	CGT	388.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.593;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5047;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=260;ReadPosRankSum=0.967;SC=TCTGTGTGTGCGCGTGTGTGT;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=7;WE=144459241;WS=144459224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,8:0.89:9
chr8	144459233	rs3889112	C	T	397.79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=257;ReadPosRankSum=0.798;SC=TGTGTGTGCGCGTGTGTGTGT;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=9;WE=144459241;WS=144459224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,10:0.91:11
chr8	144459329	rs901760	C	T	3410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.19;SOR=1.052;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr8	144460569	.	G	A	54	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=54;QD=29.5904041824;SC=AGACACATGCGGAGGCTGAAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=144460577;WS=144460559;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr8	144462169	rs3812440	A	G	5600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=93;NR=91;PP=2965;SC=AGTGCCCACCACACTTGCCCA;SOR=0.874;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=185;TCF=94;TCR=91;TR=184;WE=144462177;WS=144462159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr8	144463267	rs13275994	C	T	594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=1;PP=458;SC=CAGAGGGGGCCGTGTGTTCAG;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=144463275;WS=144463257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr8	144463686	rs3817720	C	T	668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=4;PP=408;SC=GCTAGTCAGGCGGGGTCTCCT;SOR=2.494;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=22;WE=144463694;WS=144463676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr8	144511953	rs141816879	ATGG	A	1694.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5776;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=23;PP=1341;SC=CCGCGCCGCCATGGTGGTGGT;SOR=1.236;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=24;WE=144511966;WS=144511943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr8	144511995	rs1872900	A	G	952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=22;PP=687;SC=CGGCGTGGTGATGGTGGGCGG;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=10;TCR=22;TR=32;WE=144512003;WS=144511985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr8	144512108	.	GGTGGTGCGCGCC	G	1471.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=8;PP=2969;SC=GCGGCCGCCGGGTGGTGCGCG;SOR=1.418;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=12;WE=144512127;WS=144512098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr8	144523018	rs2294115	G	A	265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=8;NR=2;PP=147;SC=TGGAGTTGGCGGGAGCTCAAC;SOR=1.802;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=144523026;WS=144523008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr8	144523323	rs2294114	G	A	1825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=35;PP=1076;SC=TGGGTGGGCCGGCTGGAGGCT;SOR=1.196;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=26;TCR=35;TR=61;WE=144523331;WS=144523313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr8	144567130	rs150961623	C	T	5578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=98;PP=2965;ReadPosRankSum=1.065;SC=GCAAAAACCACGGGAAAACCA;SOR=0.888;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=192;TCF=93;TCR=99;TR=191;WE=144567138;WS=144567120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,211:0.99:213
chr8	144618379	rs11774857	A	G	118.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=0;PP=88;SC=AGCATATCCCATCAGGCAGGC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=144618387;WS=144618369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr8	144641161	rs4292703	A	G	3143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=54;NR=48;PP=1620;SC=GGGTCCCTGCACCACGCTCAG;SOR=0.816;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=54;TCR=48;TR=102;WE=144641169;WS=144641151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr8	144641753	rs4874151	A	C	5208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=128;PP=2965;SC=GCAGAGCCCCAGGGAGGCTGG;SOR=1.993;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=179;TCF=51;TCR=128;TR=179;WE=144641761;WS=144641743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr8	144642151	rs146152826	G	GAGGGCAGGGC	4379.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=30;PP=2984;SC=TGGGCCCGAAGAGGGCAGGGC;SOR=1.765;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=70;TCF=4;TCR=66;TR=33;WE=144642159;WS=144642141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr8	144642178	rs11774948	T	C	2564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=105;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=38;PP=929;SC=GGGCCCCACCTACCCCAAGCA;SOR=1.718;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=18;TCR=38;TR=56;WE=144642186;WS=144642168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr8	144642596	rs7835865	T	C	4974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=84;NR=82;SC=AGTCCACCTTTCCTCATGGGG;SOR=0.795;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=166;TCF=84;TCR=82;TR=166;WE=144642604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr8	144642626	rs7831485	A	G	4750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=88;NR=71;PP=2580;SC=CGTGGGGAGCACACGGAGAGG;SOR=0.737;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=159;TCF=88;TCR=71;TR=159;WE=144642634;WS=144642616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr8	144642986	rs11136298	T	C	1021.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=26;PP=679;SC=CACGTGGGCATGCGGCGGCGG;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=9;TCR=26;TR=35;WE=144642994;WS=144642976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr8	144643169	rs1545536	C	T	7528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=151;NR=125;PP=2965;SC=CTCCATGCCTCAGGGTGAGGG;SOR=0.847;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=276;TCF=151;TCR=125;TR=276;WE=144643177;WS=144643159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,291:1.00:291
chr8	144643321	rs12541790	A	G	3160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=71;PP=2228;SC=TGGCAGAGAAACAGGGAGGCC;SOR=2.193;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=28;TCR=71;TR=99;WE=144643329;WS=144643311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr8	144643603	rs2290414	G	A	6246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=113;NR=96;PP=2965;SC=GGTGAGAGCCGAGAGCCCCCA;SOR=0.764;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=209;TCF=113;TCR=96;TR=209;WE=144643611;WS=144643593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr8	144644583	rs1349806	G	C	1857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=23;PP=965;SC=CCCGGTGGGCGTTCAGAAACC;SOR=0.874;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=35;TCR=23;TR=58;WE=144644591;WS=144644573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr8	144644787	rs1377663	T	A	6966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=133;NR=102;PP=2965;SC=AGGCACAAGATGCCCAGATTT;SOR=0.861;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=235;TCF=133;TCR=102;TR=235;WE=144644795;WS=144644777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
chr8	144649550	rs7010602	A	G	599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=5;PP=239;SC=AGCCCCGGGCACGGGCCAGCA;SOR=1.051;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=18;WE=144649558;WS=144649540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr8	144649601	rs13268196	A	G	1135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.24;SOR=0.829;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr8	144649625	rs10097556	T	C	1167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=12;PP=526;ReadPosRankSum=-1.441;SC=CGCTCTGCAGTCGCCCTAGGT;SOR=0.919;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=37;TCF=25;TCR=12;TR=36;WE=144649633;WS=144649615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,47:0.96:49
chr8	144649650	rs13254352	C	A	1483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.58;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr8	144649690	rs13254590	C	T	1161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.82;SOR=0.737;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr8	144649968	rs13255489	C	T	1842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=30;PP=1076;SC=ATAAGCACGGCGGCTGCCCGG;SOR=0.990;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=27;TCR=30;TR=57;WE=144649976;WS=144649958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr8	144650503	rs13271361	G	A	2586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=59;PP=1824;SC=GGGAAGAGGGGGAGCAAGGGC;SOR=1.354;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=35;TCR=59;TR=94;WE=144650511;WS=144650493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr8	144650550	rs10101426	T	C	1113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=28;PP=844;SC=GGCAGGAGACTGGATTGATTC;SOR=1.402;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=16;TCR=28;TR=44;WE=144650558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr8	144650925	rs13279011	A	T	947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=13;NR=21;PP=557;SC=AGGCGGAGACAGAGAGGGGCT;SOR=1.270;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=13;TCR=21;TR=34;WE=144650933;WS=144650915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr8	144652393	rs11280720	C	CCCCTCCTCA	2503.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=12;PP=2981;SC=CACCCTGGGGCCCCTCCTCAC;SOR=1.007;Source=Platypus;TCF=8;TR=19;WE=144652401;WS=144652383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr8	144652595	rs200070927	G	GGCAGTGGGA	5400.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=22;PP=2900;SC=GAGCTGAGAGGGTGACAGCAT;SOR=1.094;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=51;TCF=18;TCR=33;TR=40;WE=144652608;WS=144652577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr8	144652599	.	A	AGAGGG	5565.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.41;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=22;PP=2094;SC=TGAGAGGGTGACAGCATGCTG;SOR=1.336;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=41;TCF=19;TCR=22;TR=40;WE=144652608;WS=144652577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr8	144652600	.	C	G	5529.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.41;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=22;PP=1170;SC=GAGAGGGTGACAGCATGCTGG;SOR=1.552;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=108;TCF=63;TCR=45;TR=67;WE=144652608;WS=144652577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr8	144653218	rs4874152	A	G	362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=13;PP=346;SC=GTGTCCAGGGAATGTAGGGAG;SOR=2.147;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=16;WE=144653226;WS=144653208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr8	144654255	rs4874153	A	G	2650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=37;PP=1571;SC=CAGGGTGAGCACTGTCGCCTG;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=57;TCR=37;TR=93;WE=144654263;WS=144654245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr8	144654582	rs4874154	C	A	8959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.71;SOR=1.040;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr8	144654586	rs4874155	G	C	8990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.73;SOR=1.048;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr8	144657269	rs2290417	G	C	3134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.847;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=58;PP=1661;ReadPosRankSum=3.292;SC=CACAGCTGCAGGGAGGAGGTA;SOR=0.601;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=111;TCF=53;TCR=58;TR=111;WE=144657277;WS=144657259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,122:0.97:126
chr8	144657969	.	TGGG	T	268	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=7;HapScore=2;MGOF=19;MMLQ=26;MQ=58.53;NF=0;NR=7;PP=268;QD=42.5714285714;SC=CTGCCCTGGGTGGGGAAGGGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=7;WE=144657979;WS=144657959;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,7:0.78:9
chr8	144658370	rs896955	C	T	3533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=57;PP=1800;SC=GGCCACCCCTCGGGTCTTCCT;SOR=1.144;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=49;TCR=57;TR=106;WE=144658378;WS=144658360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr8	144659608	rs12678314	A	G	488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=15;PP=393;SC=CAGGGTGAGGATCACTAGGCC;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=144659616;WS=144659598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
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chr8	144660509	.	T	TCCGGC	1188	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;FR=1.0000;HP=3;HapScore=3;MGOF=5;MMLQ=24;MQ=64.24;NF=1;NR=20;PP=1188;QD=57.7142857143;SC=ACGTCCGGACTCCGCCCCGCC;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=21;WE=144660531;WS=144660499;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,21:0.84:25
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chr8	144671685	rs6985081	G	C	5939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=119;NR=77;PP=2965;SC=TGCGGCTGCCGTCGGGGGCCA;SOR=1.087;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=196;TCF=119;TCR=77;TR=196;WE=144671693;WS=144671675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr8	144687092	rs896962	T	C	4631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=87;NR=66;PP=2303;SC=AGCTTAGGATTGGGAGGAAAG;SOR=0.824;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=153;TCF=87;TCR=66;TR=153;WE=144687100;WS=144687082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr8	144689146	rs2242089	C	T	5892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=107;NR=94;PP=2965;SC=CTCAGAGACACCCCAGCAGCC;SOR=0.720;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=201;TCF=107;TCR=94;TR=201;WE=144689154;WS=144689136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr8	144689588	rs7818082	G	A	1502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=17;PP=885;SC=GCACATGCACGCACTCACGAG;SOR=1.412;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=34;TCR=17;TR=51;WE=144689596;WS=144689578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr8	144689686	rs4874169	A	G	4307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=78;NR=63;PP=2148;SC=GCACAAACACATGCACACACA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=141;TCF=78;TCR=63;TR=141;WE=144689694;WS=144689676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr8	144690014	rs4874170	T	C	5703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=119;NR=75;PP=2965;SC=CACTCACACATGCATACACAC;SOR=1.236;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=195;TCF=119;TCR=76;TR=194;WE=144690027;WS=144690004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr8	144695176	rs2242087	C	T	6447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=97;NR=128;PP=2965;SC=CAGGGAGGGTCGGGGCCGCAT;SOR=1.119;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=225;TCF=97;TCR=128;TR=225;WE=144695184;WS=144695166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr8	144695499	rs2242086	C	A	7514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=116;NR=136;PP=2965;SC=GCGAGAAGAGCACCTCCACCC;SOR=1.019;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=252;TCF=116;TCR=136;TR=252;WE=144695507;WS=144695489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr8	144695867	rs6558377	A	G	3343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=43;PP=1918;SC=TCCCAGGACAACCTTGGATCC;SOR=0.798;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=56;TCR=43;TR=99;WE=144695875;WS=144695857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr8	144696203	rs4634659	T	C	906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=8;PP=707;SC=TGGCTCCTCTTGGAGCTCAGC;SOR=2.019;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=28;WE=144696211;WS=144696198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr8	144732026	rs3750203	G	A	2608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=19;PP=1853;SC=ATCCCCATCTGTTAAGTAAGG;SOR=2.520;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=67;TCR=19;TR=86;WE=144732034;WS=144732016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
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chr8	144732418	rs4874084	A	G	8942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=145;NR=160;PP=2965;SC=CAATCCTTGCAATATCTGTGG;SOR=0.819;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=305;TCF=145;TCR=160;TR=305;WE=144732426;WS=144732408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,336:1.00:336
chr8	144772151	rs35228840	TG	T	5008.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=36;NR=58;PP=2610;SC=ATTTGCTGAGTGGGGGGGCTC;SOR=1.110;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=40;TCR=65;TR=94;WE=144772159;WS=144772141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
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chr8	144774089	rs11136314	A	C	3592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.78;SOR=1.192;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr8	144774233	rs11785723	T	C	4512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=64;PP=2467;SC=GTGATGGCCATGTGGGGTCCC;SOR=0.829;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=147;TCF=83;TCR=64;TR=147;WE=144774241;WS=144774223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr8	144775871	rs6987308	C	A	11590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=439;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=219;NR=185;PP=2965;SC=CCCAAGAGACCTTGTGATCAT;SOR=0.892;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=405;TCF=219;TCR=186;TR=404;WE=144775879;WS=144775861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,438:1.00:438
chr8	144776109	rs11786757	A	G	5556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=99;PP=2965;SC=TAGAGCTGTCATTCATCTGCG;SOR=1.033;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=182;TCF=83;TCR=99;TR=182;WE=144776117;WS=144776099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr8	144776713	rs7464270	A	C	3927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=87;PP=2196;SC=GCGCCCGAAGAGTGGGGTGCT;SOR=1.186;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=147;TCF=59;TCR=88;TR=146;WE=144776721;WS=144776703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr8	144800004	rs12543136	G	A	2628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=55;PP=1671;SC=TGGGGGCAGGGAGGGGCAGCC;SOR=1.536;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=31;TCR=55;TR=86;WE=144800012;WS=144799994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr8	144800552	rs6997797	C	T	1395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=37;PP=1051;SC=TGCGTGTCCCCCTGCGTGTCC;SOR=2.935;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=7;TCR=37;TR=44;WE=144800560;WS=144800542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
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chr8	144801347	rs5895782	AC	A	616.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=6;NR=14;PP=474;SC=GACATCCCCAACCCCCCCTCC;SOR=2.200;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=26;TCF=9;TCR=17;TR=20;WE=144801362;WS=144801337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr8	144801681	rs11778657	G	A	433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=13;PP=376;SC=GCTGGGCACCGGGAATGCTGC;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=144801689;WS=144801671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr8	144803616	rs11783357	C	T	9532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=353;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=174;NR=144;PP=2965;SC=ACGCGGAGCACGGCCCGGGCC;SOR=0.839;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=318;TCF=174;TCR=144;TR=318;WE=144803624;WS=144803606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,350:1.00:350
chr8	144808003	rs4875045	G	C	1889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=18;PP=1148;SC=TGCTCAAGCAGATGAGCAGGG;SOR=1.478;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=43;TCR=18;TR=61;WE=144808011;WS=144807993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr8	144808747	rs11136321	G	A	8963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=137;PP=2965;SC=CCTTTGCGCAGGACTTCCATG;SOR=0.943;Source=Platypus;TCF=137;WE=144808755;WS=144808737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,329:1.00:329
chr8	144809804	rs13254035	G	A	3657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=71;NR=53;PP=1900;SC=CGTCGTCTTCGTAAGCCTCCG;SOR=0.797;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=124;TCF=71;TCR=53;TR=124;WE=144809812;WS=144809794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr8	144810970	rs11136322	C	G	2095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=25;NR=48;PP=1533;SC=GGGTGGGGCGCGGAGGACGCA;SOR=1.641;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=25;TCR=48;TR=73;WE=144810978;WS=144810960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr8	144811338	rs9969600	C	G	5232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=87;PP=2965;SC=CATCCACGTGCTGCAGGTTGA;SOR=0.839;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=173;TCF=86;TCR=87;TR=173;WE=144811346;WS=144811328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr8	144824898	rs7463016	A	C	5631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=106;NR=74;PP=2965;SC=AGGATACACAACCACCCTACC;SOR=0.794;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=180;TCF=106;TCR=74;TR=180;WE=144824906;WS=144824888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr8	144825035	rs4074642	T	G	4838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=79;PP=2965;SC=GTCACGGTGCTAAGGGGCCTG;SOR=0.799;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=170;TCF=91;TCR=79;TR=170;WE=144825043;WS=144825025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr8	144873666	rs9314416	G	C	1859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=28;NR=37;PP=1077;SC=AAACCACCCAGGTGGACGGGT;SOR=1.163;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=28;TCR=37;TR=65;WE=144873674;WS=144873656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr8	144873779	rs9314417	G	A	2264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=22;PP=1473;SC=GAGCGGATGGGGGCGGTGGCA;SOR=1.468;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=51;TCR=22;TR=73;WE=144873787;WS=144873769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr8	144873997	rs6982642	A	C	1378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.38;ReadPosRankSum=-1.158;SOR=0.676;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,66:0.88:75
chr8	144874366	rs7461245	T	C	2811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=47;NR=49;PP=1533;SC=CAGGGCGGGGTGGCGACCCCA;SOR=0.961;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=97;TCF=47;TCR=50;TR=96;WE=144874374;WS=144874356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr8	144874554	rs6991873	T	C	1157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.73;SOR=0.829;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr8	144874957	rs72693351	G	A	3271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=44;PP=1845;SC=CCTGGGGCACGCGCACCTCCA;SOR=0.910;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=64;TCR=44;TR=108;WE=144874965;WS=144874947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr8	144885580	rs13281371	A	G	2629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=58;NR=27;PP=1430;SC=TGCTGGCCTCAAAGCCGTCAC;SOR=1.321;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=58;TCR=27;TR=85;WE=144885588;WS=144885570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr8	144887656	rs7830442	A	G	3379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=70;PP=2126;SC=CGCCACAGACAGCCACGTGCT;SOR=1.590;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=38;TCR=70;TR=108;WE=144887664;WS=144887646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr8	144889172	rs10866915	A	G	7081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=121;NR=107;PP=2965;SC=GCCGCAGGATAGTGAGGGTCA;SOR=0.763;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=228;TCF=121;TCR=107;TR=228;WE=144889180;WS=144889162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr8	144890873	rs10098508	A	T	2889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.01;SOR=0.750;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr8	144894496	rs4875060	G	A	7231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=125;NR=121;PP=2965;SC=CGATGGCCTCGGTCACCTCGC;SOR=0.760;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=246;TCF=125;TCR=121;TR=246;WE=144894504;WS=144894472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,277:1.00:277
chr8	144894641	rs4875061	C	T	1362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=33;PP=855;SC=TCAAGGCAGACAGCAAGGCCC;SOR=1.848;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=48;TCF=14;TCR=34;TR=47;WE=144894649;WS=144894631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr8	144894702	rs11404566	C	CT	401.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=8;PP=353;SC=CCTACCTTGCCCCACAAGCCT;SOR=2.494;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=144894710;WS=144894692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr8	144900756	rs7833632	A	G	992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=26;PP=735;SC=GGCGGCAGGAAGCTGGGCAGC;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=28;WE=144900764;WS=144900746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr8	144904690	rs4875063	A	G	6659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=131;NR=103;PP=2965;SC=CGGGCCACACAAGCCCTGAAG;SOR=0.798;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=234;TCF=131;TCR=103;TR=234;WE=144904698;WS=144904680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,259:1.00:259
chr8	144911360	rs7461986	A	G	1591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=41;NR=17;PP=946;SC=AGACCGCCGCATTCTTGGGAG;SOR=1.647;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=41;TCR=17;TR=58;WE=144911368;WS=144911350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr8	144920991	rs368500407	G	A	4892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=63;PP=2965;SC=GGACCACACAGGTGAGCCAGG;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=156;TCF=93;TCR=63;TR=156;WE=144920999;WS=144920981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr8	144940230	.	G	C	2887	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MMLQ=20;MQ=54.76;NF=152;NR=38;PP=2887;QD=20;SC=AGAAGCTGCAGGTACGTGAGG;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=355;TCF=245;TCR=110;TR=190;WE=144940238;WS=144940220;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:165,190:0.54:355
chr8	144940267	rs28441354	G	A	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=513;ExcessHet=3.0103;FS=5.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQRankSum=-1.992;QD=0.28;ReadPosRankSum=1.312;SOR=1.281;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:447,66:0.13:513
chr8	144940300	rs4977191	G	A	7250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=2.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=551;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.183;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-4.374;NF=181;NR=127;PP=2962;ReadPosRankSum=0.945;SC=CGGCCAGGACGCGGTTCATCT;SOR=1.043;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=533;TCF=301;TCR=232;TR=308;WE=144940308;WS=144940290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:228,323:0.59:551
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chr8	144942903	rs6558399	T	C	6348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=131;NR=83;PP=2965;SC=TCGACCAGGGTGGTGACTGCG;SOR=1.083;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=214;TCF=131;TCR=83;TR=214;WE=144942911;WS=144942893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
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chr8	144945792	rs13255110	T	C	6181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=101;PP=2965;SC=GCGCTCAGCTTAGCGGCCAGC;SOR=0.825;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=199;TCF=97;TCR=102;TR=198;WE=144945800;WS=144945782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr8	144946252	rs11136330	C	T	4636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=58;PP=2788;SC=GCCGCAGTGCCAGTGGCCTGT;SOR=1.008;Source=Platypus;TCF=91;TR=149;WE=144946260;WS=144946242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr8	144946345	rs34753358	G	A	6417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=120;PP=2965;SC=CGGCCTGCTCGGCCACCAGGA;SOR=0.948;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=228;TCF=108;TCR=120;TR=228;WE=144946353;WS=144946335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr8	144946818	rs13260439	C	T	5738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=97;PP=2965;SC=GTGTTGGGGTCGAGGAAGCGC;SOR=0.802;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=193;TCF=96;TCR=97;TR=193;WE=144946826;WS=144946808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr8	145009356	rs12545876	G	A	3193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=57;PP=1917;ReadPosRankSum=1.311;SC=GGAAGGCCACGCAGACGTACC;SOR=0.298;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=51;TCR=58;TR=108;WE=145009364;WS=145009346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,120:0.99:121
chr8	145066886	rs13277282	A	G	9235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=167;NR=136;PP=2965;SC=CCCAGCTGCTACTGGGGAACA;SOR=0.843;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=303;TCF=167;TCR=136;TR=303;WE=145066894;WS=145066876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,327:1.00:327
chr8	145106938	rs60949781	GCC	G	8325.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=28;NR=78;PP=2976;SC=TGCCCCCCGAGCCCCCCGCCG;SOR=0.903;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=115;TCF=33;TCR=82;TR=106;WE=145106947;WS=145106928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr8	145107795	rs11136253	G	A	5342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=59;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.584;SC=AGTCAAACACGGCGCTGCCCT;SOR=1.305;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=164;TCF=104;TCR=60;TR=162;WE=145107803;WS=145107785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,188:0.99:190
chr8	145149823	rs13256214	G	T	71.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=1;PP=50;SC=GCGTGGGGAGGCAGGCGGTGC;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=145149831;WS=145149822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr8	145149860	rs6984764	A	G	146.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=4;NR=1;PP=116;SC=CGCGACCGGGACCAGCGCGCT;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=145149868;WS=145149850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr8	145150101	rs11541475	T	G	1260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=21;PP=680;SC=GCAGCGCGCGTCCCGGGCAGC;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=20;TCR=21;TR=41;WE=145150109;WS=145150091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr8	145150832	rs7820984	A	G	3912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=88;NR=47;PP=2062;SC=GGGGCTGGCCATGGCTCTGCA;SOR=1.240;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=135;TCF=88;TCR=47;TR=135;WE=145150840;WS=145150822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr8	145151665	rs200379271	TGGCAGTGGGCATGTGGAATACTTCTCC	TCAGTGGGCATGTGGAATACTTCTCC,T	8661.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=57;PP=2110;SC=GCCTCCAGTCTGGCAGTGGGC;SOR=1.762;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=68;TCF=5;TCR=63;TR=61;WE=145151701;WS=145151655;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:193
chr8	145151668	.	CAGTGGGCATGTGGAATACTTCTCCA	C	8638.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=195;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.30;SOR=1.787;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr8	145151693	.	A	C	2038	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=25;NR=58;PP=2038;QD=24.9731471391;SC=ATACTTCTCCACTACCCCCAG;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=97;TCF=26;TCR=71;TR=83;WE=145151701;WS=145151655;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:14,83:0.86:97
chr8	145158446	rs12549149	C	T	1616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=23;PP=781;SC=CGCCCTCCGCCCCCACTCACC;SOR=0.725;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=54;TCF=31;TCR=23;TR=52;WE=145158454;WS=145158436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr8	145158503	rs11136254	G	T	1814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.50;SOR=0.754;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr8	145160646	rs11136256	T	C	6279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=118;NR=92;PP=2965;SC=CTGTGGAGACTGGAGATGCCC;SOR=0.809;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=212;TCF=118;TCR=94;TR=210;WE=145160654;WS=145160629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr8	145161823	rs11546144	G	A	2998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=38;PP=1971;SC=AAGCAGAAGCGGGGGCAGTGG;SOR=1.265;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=63;TCR=38;TR=101;WE=145161831;WS=145161813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr8	145161896	rs13263342	T	C	4271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=77;NR=73;PP=2781;SC=ACCCGGGTCCTTGAAGCCTGG;SOR=0.745;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=151;TCF=77;TCR=74;TR=150;WE=145161904;WS=145161886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr8	145162598	rs10091401	G	C	3372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=27;PP=2317;SC=CTGCCGCTGCGGGCCGTGACC;SOR=2.183;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=83;TCR=27;TR=110;WE=145162606;WS=145162588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr8	145163414	rs4977196	C	G	3433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=56;PP=2092;SC=GGCGCCTGTCCGGCTTACGGG;SOR=0.851;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=125;TCF=69;TCR=56;TR=125;WE=145163422;WS=145163404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr8	145163647	rs4977195	T	C	2848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=53;NR=40;PP=1597;SC=GGCAGTTCCGTTCAGGTGGTC;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=53;TCR=40;TR=93;WE=145163655;WS=145163637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr8	145164518	rs34324679	C	A	3373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=44;PP=1847;SC=AGGTGCTCCACGTGCAGGTGG;SOR=0.775;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=64;TCR=44;TR=108;WE=145164526;WS=145164508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr8	145164617	rs13281660	G	T	2923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=55;NR=42;PP=1570;SC=TCCTGTCGGCGGCCACCGGGC;SOR=0.749;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=55;TCR=42;TR=97;WE=145164625;WS=145164607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr8	145164847	rs13250446	A	G	6405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=110;NR=111;PP=2965;SC=ACGGATCTCGAAGGCGCCTTC;SOR=0.753;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=221;TCF=110;TCR=111;TR=221;WE=145164855;WS=145164837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr8	145168298	rs5895787	T	TG	1026.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.968;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.340;NF=16;NR=11;PP=1052;ReadPosRankSum=-0.212;SC=GTGTCCAGGCTGGGGAATCCA;SOR=1.923;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=32;TCF=18;TCR=14;TR=27;WE=145168306;WS=145168288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,39:0.95:41
chr8	145168611	rs7463214	A	G	3188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=49;NR=60;PP=1947;SC=GCCATCCCAAACCCAGTGGCA;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=49;TCR=60;TR=109;WE=145168619;WS=145168601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr8	145168824	rs7836836	T	C	3486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=54;PP=1834;SC=CCACGGGAGGTGGGCTTACAC;SOR=0.723;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=115;TCF=61;TCR=54;TR=115;WE=145168832;WS=145168814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr8	145170440	rs12543080	A	C	2975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=48;PP=1512;SC=CTGGCACCCAAGCGCAGCTGG;SOR=0.804;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=51;TCR=48;TR=99;WE=145170448;WS=145170430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr8	145170704	rs13278106	A	T	4456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=68;NR=76;PP=2544;SC=CACCCGCCAGAGCCCTACACG;SOR=0.927;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=144;TCF=68;TCR=76;TR=144;WE=145170712;WS=145170694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr8	145171003	rs4977193	G	C	942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=12;PP=813;SC=GGCCCCATGCGGTCCCGGCTC;SOR=1.352;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=22;TCR=13;TR=34;WE=145171011;WS=145170993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr8	145171201	rs1132230	A	G	6908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=118;NR=129;PP=2965;SC=AGCTGACCGGACTGGTGGCCT;SOR=0.853;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=247;TCF=118;TCR=129;TR=247;WE=145171209;WS=145171191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,268:1.00:268
chr8	145223191	rs6982878	G	A	194.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=181;SC=AGGCTTTGTCGCTGCAGAGCT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=145223199;WS=145223181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr8	145223288	rs34819224	C	T	1966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=24;PP=1285;ReadPosRankSum=0.906;SC=CTCGGGGAGGCGCGGCCGGTG;SOR=0.619;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=48;TCR=24;TR=71;WE=145223296;WS=145223278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,75:0.99:76
chr8	145223499	rs6558308	G	A	590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=16;PP=434;SC=CTATGTCAGGGTGGGTAACCT;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=145223507;WS=145223489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr8	145234508	rs7842771	G	C	7072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=129;PP=2965;SC=CAGGCCCTCTGGCCTCGCAGA;SOR=1.024;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=238;TCF=109;TCR=129;TR=238;WE=145234516;WS=145234498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,269:1.00:269
chr8	145245631	rs6558318	T	C	711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=2;PP=476;SC=ACATAGGTGCTGAGGATCGTC;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=145245639;WS=145245621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr8	145245647	rs13267392	C	T	1178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=4;PP=752;SC=TCGTCACAAACCCATGGCCTG;SOR=3.611;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=31;TCR=4;TR=35;WE=145245655;WS=145245637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr8	145245944	rs10108542	A	G	1557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=37;PP=1089;SC=TTGCATTGGCAAGCAGAGGTG;SOR=2.259;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=12;TCR=37;TR=49;WE=145245952;WS=145245934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr8	145254159	rs7464776	T	C	2028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=44;PP=1130;SC=ACAGGGTCACTGCCTGCTGTA;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=29;TCR=44;TR=73;WE=145254167;WS=145254149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr8	145255553	rs6558320	C	G	1745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.06;SOR=1.066;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr8	145541836	rs200950681	C	T	4945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=78;NR=87;PP=2965;SC=GCAGAGGCTACGAGCACAGCA;SOR=0.926;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=78;TCR=87;TR=165;WE=145541844;WS=145541826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr8	145577824	rs880701	C	G	8313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.08;SOR=1.121;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr8	145577829	rs880702	A	C	8074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.11;SOR=1.128;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr8	145577999	rs2272664	T	A	1172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=24;PP=672;SC=AGACTGGGGGTGGCGCGGCGC;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=12;TCR=24;TR=36;WE=145578007;WS=145577989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr8	145578296	rs2272663	A	G	2484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=25;PP=1246;ReadPosRankSum=-0.601;SC=CCTGCTGCACAAATGGGTAGA;SOR=0.532;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=84;TCF=59;TCR=25;TR=83;WE=145578304;WS=145578286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,97:0.99:98
chr8	145578527	.	G	A	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.308;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=2.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=2.44;ReadPosRankSum=0.691;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr8	145579949	.	G	GGCCGCT	3259.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.12;QD=45.27;SOR=1.577;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr8	145579951	.	A	ACC	3356.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=50.86;SOR=1.196;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr8	145579954	.	G	GGCACGGCACAAGGGCCCCCACACCTCACGTGCCTGGCCACAACCCAGAACAA	6328.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=97.37;SOR=1.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr8	145580984	rs2272666	A	G	1062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=7;PP=801;SC=CAGGCAGGCAAGCAGACATCC;SOR=2.368;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=33;WE=145580992;WS=145580974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr8	145581557	rs2280840	G	A	655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=4;PP=482;SC=CCAACTGGGCGCCTAAGGGGC;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=145581565;WS=145581548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr8	145582839	rs3817681	T	C	3592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=41;PP=2229;SC=TCTGTTTCTTTCAAGCTAGAA;SOR=1.224;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=114;TCF=73;TCR=41;TR=114;WE=145582847;WS=145582829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr8	145603114	rs6599528	A	C	6783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=125;PP=2965;SC=TGCTGCACAGAAGGCAGAAGC;SOR=1.080;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=218;TCF=93;TCR=125;TR=218;WE=145603122;WS=145603104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr8	145615776	rs1383095	G	A	504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=1;PP=309;SC=AGGGCTGGCCGGGGTGAGGCT;SOR=2.712;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=145615784;WS=145615767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr8	145617534	rs148509143	TGGGGGTGCAAGGTGA	T	1140.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=11;PP=2969;SC=GCAGCCGCACTGGGGGTGCAA;SOR=0.765;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=13;WE=145617556;WS=145617524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr8	145617629	.	C	CCCCT	534.50	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=44.54;ReadPosRankSum=-0.582;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr8	145617870	.	C	T	1437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=0.000;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.330;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=22;PP=763;ReadPosRankSum=0.291;SC=ATCAACGTGGCCCTCGGCGCC;SOR=0.878;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=120;TCF=65;TCR=55;TR=57;WE=145617882;WS=145617860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,67:0.49:137
chr8	145618309	rs1052951	G	A	2392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.73;SOR=1.651;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr8	145618312	rs1052952	G	A	2392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.92;SOR=1.702;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr8	145618597	rs1871532	G	A	89.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.26;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr8	145618862	rs2272661	C	G	2099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.92;SOR=0.855;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr8	145620296	rs2280837	C	G	4995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=90;NR=80;PP=2965;SC=ACCCCACCCCCGCCGGCCCAG;SOR=0.726;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=170;TCF=90;TCR=80;TR=170;WE=145620304;WS=145620286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr8	145621556	rs2280836	A	G	378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=10;NR=3;PP=218;SC=AACCGGCCGGACCCCACCTGT;SOR=1.244;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=13;WE=145621564;WS=145621546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr8	145622923	rs2977835	T	C	5300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=85;NR=88;PP=2965;SC=CCCCAGGGACTCAAGCCCCTA;SOR=0.767;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=173;TCF=85;TCR=88;TR=173;WE=145622931;WS=145622913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr8	145623098	rs2977834	T	C	4254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=73;PP=2369;SC=TGGACTGCTGTGGGGAGAGGG;SOR=0.911;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=142;TCF=69;TCR=73;TR=142;WE=145623106;WS=145623088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr8	145623378	.	CCCCACCACCGTCCCCACCCACCTACCTCCTTCCAGCAGGCGGATG	C	2505.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.36;QD=44.75;SOR=1.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr8	145623382	.	A	AGGGCCCAACCACCTCCCCG	2974	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;FR=1.0000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=29;MQ=58.48;NF=7;NR=4;PP=2974;QD=20;SC=GCGCCTCCCCACCACCGTCCC;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=34;TCF=14;TCR=20;TR=11;WE=145623390;WS=145623372;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:23,11:0.32:34
chr8	145623446	rs56293142	C	G	1968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=11;PP=295;SC=CCACCTCCCCCCCACCGTCCC;SOR=1.151;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=145623454;WS=145623436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr8	145623622	.	C	A	173	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;FR=1.0000;HP=6;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=27;MQ=40.25;NF=9;NR=1;PP=173;QD=20.7771212547;SC=CCACCTCCCCCCCACCGTCCC;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=10;WE=145623630;WS=145623612;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,10:0.91:11
chr8	145623881	rs141269368	C	CCCCAGGT	11075.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.49;BaseQRankSum=-1.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.250;NF=27;NR=58;PP=2982;ReadPosRankSum=0.183;SC=GGGACCCCAGCCCCAGGTCCC;SOR=0.275;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=134;TCF=34;TCR=100;TR=85;WE=145623889;WS=145623871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,239:1.00:240
chr8	145623963	rs4317614	G	A	9940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=0.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=379;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.195;NF=162;NR=158;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.550;SC=GTCTGCGGCCGTCGTCGTCTG;SOR=0.709;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=322;TCF=163;TCR=159;TR=320;WE=145623971;WS=145623953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,377:0.99:379
chr8	145624640	rs2293963	C	T	4554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=59;PP=2501;SC=CTGGCTGGGACGGGGGCCCTG;SOR=0.996;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=148;TCF=89;TCR=59;TR=148;WE=145624648;WS=145624630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr8	145625283	rs2291135	T	C	2890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.14;ReadPosRankSum=-0.942;SOR=0.543;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,114:0.99:115
chr8	145639521	rs4992316	T	C	1566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=28;PP=916;SC=GGTCCCAGGGTGCCTCCCACC;SOR=0.986;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=54;TCF=26;TCR=28;TR=54;WE=145639529;WS=145639511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr8	145640411	rs2977838	A	G	4952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=73;PP=2965;SC=ACAGGGTCCCAGCTGCTGGCT;SOR=0.842;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=171;TCF=98;TCR=73;TR=171;WE=145640419;WS=145640401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr8	145650499	.	G	A	1084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.838;ClippingRankSum=0.000;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=31;PP=908;ReadPosRankSum=-0.559;SC=CTACCCCCTCGGCTGGTCCAG;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=33;WE=145650507;WS=145650489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,34:0.97:35
chr8	145661320	rs2721140	G	A	3205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.655;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=55;PP=2031;ReadPosRankSum=-0.773;SC=GCCAGTCCCCGGCCAGGCACT;SOR=0.716;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=103;TCF=48;TCR=55;TR=102;WE=145661328;WS=145661310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,115:0.99:116
chr8	145661675	rs7830832	G	A	2265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=41;NR=33;PP=1343;SC=CCTGACATGGGCCTGAGAGGC;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=42;TCR=33;TR=74;WE=145661683;WS=145661665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr8	145662377	rs2242270	A	C	8405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=139;NR=147;PP=2965;SC=GTGTCCACCAAGGTGCGCCAG;SOR=0.783;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=286;TCF=139;TCR=147;TR=286;WE=145662385;WS=145662367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,324:1.00:324
chr8	145665516	rs2306383	T	C	3971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=54;PP=2345;SC=TGAGCTCCCGTAGTCTGGTTT;SOR=0.707;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=126;TCF=71;TCR=55;TR=125;WE=145665524;WS=145665506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr8	145665637	rs2620650	A	G	2920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=50;PP=1779;SC=GGGGCTGTGGACGCAGAGAAA;SOR=0.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=98;TCF=48;TCR=50;TR=98;WE=145665645;WS=145665627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr8	145665699	rs2721188	C	T	2315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=37;PP=1558;SC=CTGGGCTCACCGGGGAGCCAG;SOR=0.718;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=41;TCR=37;TR=78;WE=145665707;WS=145665689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr8	145667405	rs2242264	C	G	1037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=0;PP=933;SC=GCCCCATTCGCACCCCCAGGC;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=33;WE=145667413;WS=145667395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr8	145668443	rs760477	G	A	3327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=29;PP=2175;SC=GATTGCCCAAGGAGGCTGCGG;SOR=2.053;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=106;TCF=77;TCR=29;TR=106;WE=145668451;WS=145668433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr8	145668481	rs2242263	C	T	5662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=118;NR=67;PP=2965;SC=CTCTTCGGCCCGAAGTTCAGG;SOR=1.333;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=185;TCF=118;TCR=67;TR=185;WE=145668489;WS=145668471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr8	145677469	rs2245052	A	G	1123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=5;PP=831;SC=CCTTGCAGGGATGGTGAAGCC;SOR=3.383;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=34;WE=145677477;WS=145677459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr8	145677973	rs2256094	C	T	3425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=66;PP=2082;SC=GCAGGTACATCACTCACAGAC;SOR=1.170;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=48;TCR=66;TR=114;WE=145677981;WS=145677963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr8	145678020	rs1871538	C	T	1209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=30;PP=912;SC=AGCTGTCCTCCCATATGGCTT;SOR=3.500;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=35;WE=145678028;WS=145678010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr8	145689915	rs2721167	G	A	4024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=69;PP=2297;SC=GGCAGTCTTCGTGTGTGCTCA;SOR=0.848;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=69;TCR=69;TR=138;WE=145689923;WS=145689905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr8	145690308	rs2721166	C	T	7949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=154;NR=117;PP=2965;SC=GCAGTATGTACGAGGACACAG;SOR=0.908;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=271;TCF=154;TCR=117;TR=271;WE=145690316;WS=145690298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,306:1.00:306
chr8	145690348	rs2620644	G	A	9152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=153;NR=139;PP=2965;SC=GGAGAGGAAGGAAGCGCAGAA;SOR=0.729;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=292;TCF=153;TCR=139;TR=292;WE=145690356;WS=145690338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,336:1.00:336
chr8	145690396	rs2620645	A	C	7130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=111;NR=128;PP=2965;SC=CACTCTAGTAAGCCCAGGTTC;SOR=0.968;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=239;TCF=111;TCR=128;TR=239;WE=145690404;WS=145690386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,269:1.00:269
chr8	145691915	rs112422823	G	C	5621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=113;PP=2965;SC=AGCGGGGCTGGCCGTGCAGCC;SOR=1.190;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=192;TCF=79;TCR=113;TR=192;WE=145691923;WS=145691905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr8	145692110	rs2306388	C	T	290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=4;PP=143;SC=CTGCCTGCCCCCCTCCTCAGG;SOR=0.859;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=9;TCF=5;TCR=4;TR=9;WE=145692118;WS=145692100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr8	145692296	rs2250895	A	C	3819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=69;NR=62;PP=2267;SC=GGCCTGGCTCAAGCACGTGAC;SOR=0.721;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=69;TCR=62;TR=131;WE=145692304;WS=145692286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr8	145692385	rs2250891	C	T	3285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=46;PP=1767;SC=CAGCCGAGGGCCGCGCGGCCG;SOR=0.709;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=103;TCF=57;TCR=46;TR=103;WE=145692393;WS=145692375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr8	145692762	rs2291133	G	T	7588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=137;NR=100;PP=2965;SC=GAACTCTGGAGGGAGCAAATC;SOR=0.866;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=237;TCF=137;TCR=100;TR=237;WE=145692770;WS=145692752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,274:1.00:274
chr8	145692812	rs2250779	C	T	9956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=364;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=195;NR=135;PP=2965;SC=GGGTCATGTTCCGGAAGATTT;SOR=1.013;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=330;TCF=195;TCR=135;TR=330;WE=145692820;WS=145692802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,363:1.00:363
chr8	145693720	rs2250657	A	G	4614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=80;PP=2564;SC=AGGAGGAGGCAGAGGCATTGC;SOR=0.972;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=155;TCF=75;TCR=80;TR=155;WE=145693728;WS=145693710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr8	145697244	rs4925823	G	A	2242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=52;NR=25;PP=1274;SC=ACCTGCCTTCGTGGCACTCCC;SOR=1.347;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=79;TCF=54;TCR=25;TR=77;WE=145697252;WS=145697234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr8	145699601	rs2721176	T	C	2035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=19;PP=1375;SC=GAGGGAGGAGTGGCCCCTGTC;SOR=2.271;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=52;TCR=19;TR=71;WE=145699609;WS=145699591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr8	145732398	rs45592435	G	A	2455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=56;PP=1510;SC=CCCAGCTGGGGCCAGGCTGGG;SOR=1.414;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=32;TCR=56;TR=88;WE=145732406;WS=145732388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr8	145737636	rs4925828	A	G	9219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=342;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=162;NR=160;PP=2965;SC=TCAGCGGTCAAGTCCCCCGGG;SOR=0.741;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=323;TCF=163;TCR=160;TR=322;WE=145737651;WS=145737626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,342:1.00:342
chr8	145738767	rs11342077	CG	C	8754.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=91;PP=2951;SC=CACCACCACCCGGCAACTGGC;SOR=0.874;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=33;TCR=100;TR=121;WE=145738775;WS=145738757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr8	145739218	rs13267993	A	T,G	201.78	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1,8;NR=6,0;PP=127,114;SC=GGGGAGTGAGAAGGGGTCGGC;SOR=4.407;SbPval=0.03;Source=Platypus;TC=15;TCF=9;TCR=6;TR=7,8;WE=145739226;WS=145739208;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:8
chr8	145742514	rs2721190	A	G	3111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=54;PP=1791;SC=CCTGGCGTAGACTGTGGACTC;SOR=1.230;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=41;TCR=54;TR=95;WE=145742522;WS=145742504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr8	145742716	rs2721189	C	A	609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=14;NR=7;PP=411;SC=TGCCCCACGGCGGCCTGGCCG;SOR=1.329;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=14;TCR=7;TR=21;WE=145742724;WS=145742706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr8	145745182	rs2721172	T	C	8003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=158;NR=113;PP=2965;SC=GGCCCTGCCCTTGCTGCCACG;SOR=1.070;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=272;TCF=159;TCR=113;TR=271;WE=145745190;WS=145745172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,296:1.00:296
chr8	145756170	rs873884	G	A	3235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=52;NR=54;PP=1631;SC=CCTCGGGGCTGTCGTAGTGCG;SOR=0.828;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=106;TCF=52;TCR=54;TR=106;WE=145756178;WS=145756160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr8	145806681	rs2620647	A	G	939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=14;NR=17;PP=480;SC=GACAGGGTTAAGGCGGCTGGA;SOR=1.209;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=14;TCR=17;TR=31;WE=145806689;WS=145806671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr8	145830757	rs4541972	A	G	1510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=11;PP=1002;SC=TGAGGGCTGCACTGTGCACAG;SOR=2.262;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=43;TCR=11;TR=54;WE=145830765;WS=145830747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr8	145830894	rs5895822	CT	C	8908.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=25;NR=103;PP=2951;SC=GCCCGGGCAGCTTCCGCAGGT;SOR=0.701;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=133;TCF=26;TCR=107;TR=128;WE=145830902;WS=145830884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr8	145948337	rs145347635	C	T	4670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=68;PP=2676;SC=CACATTCGTACGGCTTCTCCC;SOR=0.753;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=147;TCF=79;TCR=68;TR=147;WE=145948345;WS=145948327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr8	145979138	rs35571769	C	T	3592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=65;NR=59;PP=1958;SC=GTTCCTTCCCCTGCTCCAGCT;SOR=0.723;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=65;TCR=59;TR=124;WE=145979146;WS=145979128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr8	145980057	rs112461908	G	A	5309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=106;NR=74;PP=2965;SC=ATGAAGAGGTGGGCAGGAAGG;SOR=0.963;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=180;TCF=106;TCR=74;TR=180;WE=145980065;WS=145980047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr8	146028061	rs2958527	A	G	228.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=1;PP=165;SC=GTGAGAGCCAAAAAACATTGG;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=146028069;WS=146028051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr8	146028980	rs192155148	C	A	3337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=41;PP=2126;SC=CTGCTGGGTTCTCACCGAGCC;SOR=1.342;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=75;TCR=41;TR=116;WE=146028988;WS=146028970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr8	146033347	rs2976653	T	C	2664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=31;PP=1519;SC=GACGGCGGCGTGGGGCAGGGC;SOR=1.132;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=53;TCR=31;TR=84;WE=146033355;WS=146033337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr8	146036234	rs2958511	A	G	1149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=28;PP=765;SC=TCCAGACGTCAGCACCCAAGG;SOR=2.247;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=9;TCR=28;TR=37;WE=146036242;WS=146036224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr8	146068594	rs1735408	T	C	2461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=47;PP=1503;SC=AATAAACCTATAGCCTTAACT;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=22;TCR=47;TR=69;WE=146068602;WS=146068584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr8	146115367	rs2735906	A	G	7819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=147;NR=126;PP=2965;SC=TTCTGTAGAGACCCCTCTGAG;SOR=0.785;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=273;TCF=147;TCR=126;TR=273;WE=146115375;WS=146115357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,293:1.00:293
chr8	146156247	rs3735789	C	A	4617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=82;NR=58;PP=2607;SC=GGATGAGGACCGAACGCTGAC;SOR=0.832;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=82;TCR=58;TR=140;WE=146156255;WS=146156237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr8	146157339	rs3735787	T	C	4774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=74;PP=2580;SC=TAGAAAAGTCTGAGTGCCCTC;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=160;TCF=86;TCR=74;TR=160;WE=146157347;WS=146157329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr8	146171285	rs3824110	G	A	2851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=33;PP=1754;SC=AGAGTACCCCGTCACCCTCCC;SOR=1.358;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=64;TCR=33;TR=96;WE=146171293;WS=146171275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr8	146171437	rs3735785	A	G	4898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=76;NR=89;PP=2852;SC=CCAGCTCAGTATCACTACAGC;SOR=0.990;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=76;TCR=89;TR=165;WE=146171445;WS=146171427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr8	146203412	rs2979109	A	G	7675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=152;NR=115;PP=2965;SC=GTTTTTCCACACCCAGTACTC;SOR=0.913;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=267;TCF=152;TCR=115;TR=267;WE=146203420;WS=146203402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,289:1.00:289
chr8	146220094	rs2978442	C	T	949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=16;PP=541;SC=GGTCTCTAACCGTGGAGAAAG;SOR=1.002;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=13;TCR=16;TR=29;WE=146220102;WS=146220084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr8	146221823	rs2978409	A	T	602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=2;PP=407;SC=AGTTGTTGCAAGTATCTTCTT;SOR=3.160;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=146221831;WS=146221813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr8	146222122	rs2978441	C	T	555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=15;PP=409;SC=AGGGCAATTGCTGGGTTGTGT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=146222130;WS=146222112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr8	146229040	rs2978419	T	G	1571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=37;PP=1027;SC=GGGGTTTTGCTCTGTCGCCCA;SOR=2.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=14;TCR=37;TR=51;WE=146229048;WS=146229030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr9	154795	rs2785333	T	C	946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.081;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-10.868;NF=28;NR=41;PP=969;ReadPosRankSum=-1.693;SC=AAGCAACTTGTCTAAAATAGC;SOR=1.118;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=150;TCF=73;TCR=77;TR=69;WE=154803;WS=154785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,54:0.36:152
chr9	214706	rs540473	G	C	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.987;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=13;PP=400;ReadPosRankSum=1.872;SC=CCCCAGTATCGGGAGGCCAGT;SOR=0.421;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=73;TCF=44;TCR=29;TR=28;WE=214714;WS=214696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,30:0.38:78
chr9	215057	rs481905	T	C	1845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=50;PP=949;ReadPosRankSum=-0.607;SC=GCGCGCAGGTTGCGGCCGGAC;SOR=0.719;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=170;TCF=74;TCR=96;TR=86;WE=215065;WS=215047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,94:0.50:189
chr9	215269	rs636922	A	C	1778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.545;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=38;PP=855;ReadPosRankSum=1.535;SC=GGATGTCCTCAGCCGCCGGGG;SOR=0.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=162;TCF=82;TCR=80;TR=79;WE=215277;WS=215259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,91:0.50:182
chr9	271638	rs506121	C	T	3429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=38;PP=2077;SC=TATTCTTCAGCGGAAATAAGG;SOR=1.501;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=79;TCR=38;TR=117;WE=271646;WS=271628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr9	286491	rs3209441	G	A	940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.992;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=13;PP=660;ReadPosRankSum=-0.414;SC=GGAGCCAGTGGACTTTGAAGG;SOR=0.446;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=71;TCF=50;TCR=21;TR=39;WE=286499;WS=286481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,41:0.53:78
chr9	286593	rs529208	C	A	1987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.187;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=32;PP=1177;ReadPosRankSum=-0.359;SC=GGTGTTCACGCCAAAGGAATG;SOR=0.913;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=178;TCF=101;TCR=77;TR=80;WE=286601;WS=286583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,94:0.47:199
chr9	289500	.	AC	A	4015.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.833;ClippingRankSum=0.000;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.956;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.214;NF=11;NR=58;PP=2318;ReadPosRankSum=-0.685;SC=TTCATTTTCTACCTCATTAGG;SOR=0.616;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=147;TCF=26;TCR=121;TR=69;WE=289508;WS=289490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,130:0.51:255
chr9	304769	rs13292474	G	A	1752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.367;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=42;PP=1032;ReadPosRankSum=-0.333;SC=CATGCTGTCAGTTTTACAAAC;SOR=0.505;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=117;TCF=47;TCR=70;TR=73;WE=304777;WS=304759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,81:0.63:129
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chr9	312124	rs2039045	T	C	8286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=138;NR=136;PP=2965;SC=GGAGGACCAATAGGCAGGCCG;SOR=0.762;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=275;TCF=138;TCR=137;TR=274;WE=312132;WS=312114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,300:1.00:300
chr9	312194	rs12344468	A	T	1807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.549;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=47;PP=1175;ReadPosRankSum=1.280;SC=CATACTGGAGAATCTCAGTGA;SOR=0.778;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=167;TCF=79;TCR=88;TR=84;WE=312202;WS=312184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,87:0.48:181
chr9	312264	rs12339042	G	A	1241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.446;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=26;PP=799;ReadPosRankSum=1.031;SC=GCAGCCCATGGTGTCAGGGCT;SOR=0.457;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=104;TCF=51;TCR=53;TR=53;WE=312272;WS=312254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,55:0.49:112
chr9	325811	rs3831138	T	TC	1125.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.606;NF=2;NR=18;PP=1031;ReadPosRankSum=-0.346;SC=TGTTTTTAAATTTCTTTGCAG;SOR=0.586;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=20;WE=325825;WS=325801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,31:0.55:56
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chr9	327938	rs2296825	G	C	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=157;ReadPosRankSum=-1.536;SC=AAATTTCTCTGTGGTGTTTTT;SOR=2.517;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=8;WE=327946;WS=327928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
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chr9	376441	.	T	C	579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-4.138;ClippingRankSum=0.000;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=23;PP=381;ReadPosRankSum=-0.140;SC=TGTGGGGACATGCAAACCTCT;SOR=0.709;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=12;TCR=45;TR=29;WE=376449;WS=376431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,29:0.47:62
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chr9	399275	rs3831174	A	AC	586.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.225;HP=12;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=660;ReadPosRankSum=0.310;SC=TGTCCCCCCCACCCCCACCCC;SOR=2.288;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=0;TCR=44;TR=20;WE=399283;WS=399265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,25:0.51:49
chr9	421032	rs2297079	C	G	3153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=59;PP=1844;SC=AGGCTTTGCTCCGTGGGGAAG;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=103;TCF=44;TCR=59;TR=103;WE=421040;WS=421022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr9	421980	rs2297081	T	A	7181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=141;NR=104;PP=2965;SC=GAGCTTGTTATGAACTTCTGG;SOR=0.989;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=245;TCF=141;TCR=104;TR=245;WE=421988;WS=421970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr9	422157	rs10217719	T	C	5039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=106;PP=2876;SC=GGCAACTTTCTGCTACTTTTA;SOR=1.121;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=180;TCF=74;TCR=106;TR=180;WE=422165;WS=422147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr9	429719	rs7854035	T	C	2638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=38;PP=1317;SC=ACTTACTCTTTGAAGAGGAGG;SOR=0.753;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=49;TCR=38;TR=87;WE=429727;WS=429709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr9	432081	rs1329377	T	C	883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=0;PP=782;SC=GAGGAGTTGTTTGTGTCTGGC;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=432089;WS=432071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr9	432140	rs79680407	CTTT	C,CT	1948.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=32.48;ReadPosRankSum=-1.357;SOR=1.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:1,12,47:0.20,0.78:60
chr9	432330	rs7036567	C	G	6826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=112;NR=127;PP=2965;SC=CCCAGGTACACCGAAGCACAT;SOR=0.958;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=239;TCF=112;TCR=127;TR=239;WE=432338;WS=432320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr9	432503	rs7046598	T	C	214.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=175;SC=AATACATCCATCACTGTCCCC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=432511;WS=432493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr9	433697	rs7020380	T	A	406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=338;SC=TCTCATAAACTCCTGGGCTGG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=433716;WS=433687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	433708	rs7041371	C	T	498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=1;PP=376;SC=CCTGGGCTGGCGAAGATGAAA;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=433716;WS=433687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	433978	rs2360712	A	G	4283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=69;PP=2566;SC=ATGTACAGGTAAGCTTTCCTG;SOR=0.828;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=136;TCF=67;TCR=69;TR=136;WE=433986;WS=433968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr9	439102	rs10733508	G	C	404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=13;NR=1;PP=329;SC=AGATACTCTCGGGGTAGAATT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=439110;WS=439092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	439453	rs10758598	G	C	307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=8;PP=213;SC=GGGGTGCTGGGAACACCTGGT;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=439461;WS=439443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	441827	rs10974467	C	T	1156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=13;PP=736;SC=CTCAGTGGCTCCTCAGGATGA;SOR=1.075;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=26;TCR=13;TR=39;WE=441835;WS=441817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr9	441952	rs1887957	G	A	5288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=106;NR=79;PP=2965;SC=ATGAACAGGAGTTTGTCTACA;SOR=0.996;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=185;TCF=106;TCR=79;TR=185;WE=441960;WS=441942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr9	446352	rs10814952	G	C	4910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=100;NR=64;PP=2965;SC=TTCTCCCTCCGTGCCTTTTCC;SOR=1.116;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=164;TCF=100;TCR=64;TR=164;WE=446360;WS=446342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr9	450060	rs10121936	A	G	108.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=82;SC=CCTACACTTAACCTGAACACC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=450068;WS=450050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr9	451957	.	A	G	120	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;FR=0.5564;HP=2;HapScore=2;MGOF=81;MMLQ=25;MQ=52.97;NF=7;NR=0;PP=120;QD=22.110173221;SC=GTGTGTGTGTATATATATATA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=7;WE=451965;WS=451947;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr9	712060	rs4465020	G	C	6001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=115;NR=89;PP=2965;SC=GACACTTGTTGAGATGAGAAA;SOR=1.025;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=204;TCF=115;TCR=89;TR=204;WE=712068;WS=712050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr9	712599	rs11789987	C	T	5160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.033;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=82;PP=2965;ReadPosRankSum=1.715;SC=AGTCTGTGAACGACCTCACAC;SOR=0.257;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=173;TCF=91;TCR=82;TR=173;WE=712607;WS=712589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,190:0.99:191
chr9	732302	rs10815562	T	C	321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=1;PP=254;SC=AATTAGCAAATCCCTTCATAG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=732310;WS=732292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr9	732779	rs10815563	A	G	190.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=5;PP=111;SC=GCAGAGTATTACAACTCTTAG;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=732787;WS=732769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
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chr9	740972	rs7032867	G	C	1619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=37;PP=1127;SC=GAATGCACCCGTAACCAGCAG;SOR=3.486;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=44;TCF=6;TCR=38;TR=43;WE=740980;WS=740962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr9	741001	rs7027152	T	C	839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=20;PP=592;SC=GCGGTGGCCATTCTGGCAGAG;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=741009;WS=740991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr9	742342	rs10733535	A	G	4247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=88;PP=2665;SC=GCGAGCACGGACACGTGGAGA;SOR=1.473;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=53;TCR=88;TR=141;WE=742350;WS=742332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr9	967951	rs138244811	C	CCTTTCTCT	1896.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FS=0.659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.66;MQRankSum=4.555;QD=13.45;ReadPosRankSum=0.986;SOR=0.795;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,48:0.34:141
chr9	967981	rs279895	G	C	1442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.606;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=5.665;NF=34;NR=28;PP=900;ReadPosRankSum=-1.690;SC=ACCTCACTTCGCAGTATTCTC;SOR=0.628;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=156;TCF=82;TCR=74;TR=62;WE=967989;WS=967971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,76:0.42:179
chr9	968150	rs79358387	C	CT	880.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=663;ReadPosRankSum=-1.291;SC=GCAGTGCCTGCTGCCGATGGC;SOR=0.555;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=17;WE=968158;WS=968140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,29:0.53:55
chr9	977312	rs148355218	T	C	727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.186;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=17;ReadPosRankSum=-0.854;SC=GGGGACGCCGTCGCCGCCCCG;SOR=0.368;Source=Platypus;TCF=29;WE=977320;WS=977302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,36:0.49:74
chr9	977556	rs279891	C	A	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.500;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=174;ReadPosRankSum=0.230;SC=AGTTTTGGGACGTGGGCCTGT;SOR=1.194;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=15;WE=977564;WS=977546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr9	989868	rs75785779	G	C	886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.605;HP=8;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=6;PP=664;ReadPosRankSum=0.453;SC=CAGGGTTTTTGTTTCATTTGC;SOR=1.228;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=60;TCF=49;TCR=11;TR=33;WE=989876;WS=989858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,34:0.52:65
chr9	989943	rs6477419	T	C	2893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.974;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=56;PP=1551;ReadPosRankSum=-0.092;SC=GAGATGCATTTGCTCTTCCAA;SOR=0.462;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=244;TCF=147;TCR=97;TR=126;WE=989951;WS=989933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,136:0.52:264
chr9	1056728	rs3824419	G	C	3360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-2.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.817;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=75;PP=2109;ReadPosRankSum=-0.614;SC=CTTGAAGGGAGCACGAGTCCA;SOR=0.564;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=317;TCF=156;TCR=161;TR=153;WE=1056736;WS=1056718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,166:0.47:351
chr9	1057318	rs9140	A	G	1007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.944;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=30;PP=595;ReadPosRankSum=-0.833;SC=GTCTTAGAGCATTATAGCCAT;SOR=0.403;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=86;TCF=29;TCR=57;TR=48;WE=1057326;WS=1057308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,51:0.54:95
chr9	2039593	rs146359524	G	T	1344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.908;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=37;PP=942;ReadPosRankSum=0.138;SC=CAGGTGATCCGCAGGCCATGA;SOR=1.013;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=134;TCF=63;TCR=71;TR=65;WE=2039601;WS=2039583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,67:0.46:145
chr9	2073162	rs3737268	G	C	1262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=21;PP=749;ReadPosRankSum=1.068;SC=GTACAGGACTGGGGGAAGGTC;SOR=0.668;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=110;TCF=69;TCR=41;TR=56;WE=2073170;WS=2073152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,59:0.50:119
chr9	2073292	rs13288443	A	G	2063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=43;PP=1344;ReadPosRankSum=0.116;SC=TGTTCGGACCAGAAGCACCCA;SOR=0.713;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=198;TCF=103;TCR=95;TR=86;WE=2073300;WS=2073282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,101:0.44:227
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chr9	2073839	rs2066111	C	T	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.473;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=104;ReadPosRankSum=1.616;SC=ATGGGGAAACCTGGCACATTC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=6;WE=2073847;WS=2073829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr9	2160660	rs148894349	GGATT	G	3825.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.745;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=40;PP=2114;ReadPosRankSum=0.566;SC=CTACGAGAAAGGATTGATTAT;SOR=0.841;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=100;TCF=16;TCR=84;TR=49;WE=2160671;WS=2160650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,99:0.50:197
chr9	2170512	rs3793511	G	C	5638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=109;NR=89;PP=2965;SC=CTAAATACAGGTATCCCTCGT;SOR=0.882;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=198;TCF=109;TCR=89;TR=198;WE=2170520;WS=2170502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr9	2182062	rs2281786	A	G	1010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=29;NR=6;PP=695;SC=AGGGAAAATCAGGCTTTGTTA;SOR=2.554;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=35;WE=2182070;WS=2182052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr9	2622121	rs12379259	A	G	1564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.604;HP=2;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-0.752;NF=22;NR=23;PP=2408;ReadPosRankSum=1.258;SC=TTTCGGAAGGACTGGTAACTT;SOR=1.136;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=101;TCF=51;TCR=50;TR=45;WE=2622179;WS=2622111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,45:0.37:121
chr9	2622134	rs34881325	C	T	1698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.440;HP=1;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=-0.775;NF=22;NR=22;PP=2292;ReadPosRankSum=0.658;SC=GGTAACTTGTCGTGCGGAGCG;SOR=0.870;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=52;TCR=50;TR=44;WE=2622179;WS=2622111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,50:0.38:130
chr9	2622146	rs369552432	ACGGCGGCGG	A,ACGGCGGCGGCGG	2792.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.284;NF=3,3;NR=31,31;PP=1301,2558;ReadPosRankSum=0.017;SC=TGCGGAGCGAACGGCGGCGGC;SOR=0.569;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=59;TCF=6;TCR=53;TR=34,34;WE=2622179;WS=2622111;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.37,0.57:94
chr9	2622278	rs2219143	G	A	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=181;ReadPosRankSum=0.061;SC=ACCGGTGAGTGAGGACGCGCC;SOR=0.818;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=23;TCF=10;TCR=13;TR=13;WE=2622286;WS=2622268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr9	2645201	rs2290465	C	G	527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=434;ReadPosRankSum=3.300;SC=AACAATGCTGCTAACCTCATA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=19;WE=2645209;WS=2645191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,19:0.73:26
chr9	2717698	rs7029012	C	G	1147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.353;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=19;PP=689;ReadPosRankSum=-0.141;SC=GGACCCCTACCACAGCCAGGA;SOR=0.359;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=81;TCF=53;TCR=28;TR=52;WE=2717706;WS=2717688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,54:0.62:87
chr9	2717922	rs10967705	C	G	2187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=4.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.214;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=44;PP=1471;ReadPosRankSum=1.487;SC=ACGAAGACGGCGAGGAGGAGG;SOR=0.700;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=220;TCF=111;TCR=109;TR=91;WE=2717930;WS=2717912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,100:0.42:240
chr9	2718534	rs12237048	C	G	5432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=95;PP=2965;SC=TCGGGGTGGCCTCCAGCACCT;SOR=0.815;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=184;TCF=89;TCR=95;TR=184;WE=2718542;WS=2718524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr9	2811505	rs2270888	G	A	1866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.660;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=34;PP=1077;ReadPosRankSum=1.291;SC=CTTCTTGGGCGTGTTCTTGCA;SOR=0.847;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=147;TCF=84;TCR=63;TR=84;WE=2811513;WS=2811495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,92:0.57:162
chr9	2828765	rs2173904	C	G	1064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.564;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=19;PP=621;ReadPosRankSum=-0.290;SC=GTCCAGAGTTCGGTGATCTGC;SOR=0.725;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=94;TCF=52;TCR=42;TR=45;WE=2828773;WS=2828755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,51:0.48:106
chr9	2831149	rs2292000	A	C	832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.675;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=16;PP=646;ReadPosRankSum=-0.144;SC=GGAGAAGACAAACCTAAACAA;SOR=0.876;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=88;TCF=51;TCR=37;TR=39;WE=2831157;WS=2831139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,39:0.41:94
chr9	2833267	rs10217194	T	C	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.092;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=9;PP=355;ReadPosRankSum=-0.503;SC=GAAACAATGATAAGATCATCT;SOR=0.469;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=47;TCF=33;TCR=14;TR=27;WE=2833275;WS=2833257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,30:0.56:54
chr9	3228700	rs643429	A	C	138.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=108;SC=TGGAGAAATAATGAAAAGACA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=3228708;WS=3228690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr9	3262803	rs635647	T	C	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=226;ReadPosRankSum=-0.758;SC=AACTCCTCTCTTTCAGAACAC;SOR=0.260;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=11;WE=3262811;WS=3262793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr9	3263224	rs633893	T	C	256.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=212;SC=TGAGAGAGTTTACTTGTAAAT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=3263232;WS=3263214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	3324206	rs2274487	C	T	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=166;ReadPosRankSum=-0.214;SC=TTGAGGCTAACTGTAAAACTT;SOR=0.693;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=38;TCF=7;TCR=31;TR=12;WE=3324214;WS=3324196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,12:0.32:38
chr9	3330151	rs13299535	C	G	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.097;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.802;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=121;ReadPosRankSum=-0.549;SC=CTATCCAACACATTCTTGCCC;SOR=2.419;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=7;WE=3330159;WS=3330141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr9	3344954	rs3012670	C	A	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.882;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=139;ReadPosRankSum=-0.748;SC=AGATTTAATACGGTAACAGAA;SOR=0.338;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=11;WE=3344962;WS=3344944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr9	3829187	rs16919724	C	T	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.764;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=152;ReadPosRankSum=0.646;SC=TTTCAGGGGTCGTTCAACAGG;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=9;WE=3829195;WS=3829177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr9	3829212	rs7029652	T	C	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.454;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=353;ReadPosRankSum=-2.624;SC=GATGCGGTCATGTGCTTGGTC;SOR=0.985;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=42;TCF=35;TCR=7;TR=21;WE=3829220;WS=3829202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,21:0.45:47
chr9	3855963	rs34461578	C	CA	6752.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=53;PP=2965;SC=AGCAACAGCACAATGTCACTT;SOR=1.329;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=105;TCF=50;TCR=55;TR=102;WE=3855971;WS=3855953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr9	3879693	rs4740742	C	T	1759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=38;PP=1174;SC=GAGGGGCTTGCTTGTTTTTCT;SOR=1.467;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=21;TCR=38;TR=59;WE=3879701;WS=3879683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr9	3898509	rs10758532	A	T	677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=0;PP=541;SC=TTATGAGAAAAAACAATCTGC;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=3898517;WS=3898499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr9	3932283	rs535978	C	G	1773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=6;PP=1351;SC=ATTTCAAGTGCCCTGCAGAAG;SOR=3.422;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=47;TCR=6;TR=53;WE=3932291;WS=3932273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr9	3932521	rs587571	T	C	3781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=78;PP=2555;SC=ATAAAGGTAATTGGGGAATGT;SOR=1.743;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=116;TCF=38;TCR=78;TR=116;WE=3932529;WS=3932511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr9	4117713	rs927315	C	T	1039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=34;NR=0;PP=879;SC=AACACACGTACGCAAAGCAAG;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=34;WE=4117721;WS=4117703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr9	4118208	rs806052	A	G	3288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.49;SOR=0.709;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr9	4285986	rs10758591	G	C	7738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=133;NR=139;PP=2965;SC=AATGGGATGGGGGAGAAAAAA;SOR=0.757;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=272;TCF=133;TCR=139;TR=272;WE=4285994;WS=4285976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,289:1.00:289
chr9	4298537	rs12340657	G	A	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.074;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=12;PP=275;ReadPosRankSum=-0.117;SC=AGAGCCGGCGGCTCACTCACG;SOR=0.330;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=35;TCF=11;TCR=24;TR=19;WE=4298545;WS=4298527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr9	4298576	rs12350099	C	G	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.026;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=49;ReadPosRankSum=-1.062;SC=GGGCCGACTTCAAAATACACA;SOR=1.508;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=4;WE=4298584;WS=4298566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
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chr9	4564432	rs2228622	G	A	1491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.604;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=28;PP=873;ReadPosRankSum=0.642;SC=AAGTCAGTACGGTGGATGCCA;SOR=0.751;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=130;TCF=73;TCR=57;TR=64;WE=4564440;WS=4564422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,71:0.49:146
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chr9	4572480	rs3780412	T	C	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.218;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=22;PP=370;ReadPosRankSum=-0.486;SC=TGTCAACTGATGAAGCTAGAG;SOR=1.371;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=43;TCF=3;TCR=40;TR=23;WE=4572488;WS=4572470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,24:0.52:46
chr9	4576432	rs79223902	G	T	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.985;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=180;ReadPosRankSum=1.005;SC=ATTTTGTTTTGTTATTTTCTT;SOR=0.275;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=9;WE=4576440;WS=4576423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr9	4576451	rs2072657	T	G	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-4.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=244;ReadPosRankSum=-1.287;SC=TTTACTTTTCTCGACAAGATT;SOR=1.382;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=15;WE=4576459;WS=4576441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr9	4604425	rs4742015	T	C	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.323;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.880;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=5;PP=82;ReadPosRankSum=-0.478;SC=ATCTTTCTTTTTTTGTAGAGA;SOR=0.082;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=8;WE=4604433;WS=4604415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr9	4622303	rs10758637	T	C	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.30;ReadPosRankSum=1.692;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
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chr9	4622453	rs10974657	T	C	2814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.789;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=63;PP=1780;ReadPosRankSum=1.669;SC=GATTTTCTTCTAGACCTCCTC;SOR=0.596;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=315;TCF=171;TCR=144;TR=134;WE=4622461;WS=4622443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:194,147:0.43:341
chr9	4625429	rs4742022	T	C	1562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.574;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=33;PP=1068;ReadPosRankSum=-0.703;SC=TGGTAGAATATTGAGAGGGCG;SOR=0.772;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=149;TCF=80;TCR=69;TR=70;WE=4625437;WS=4625419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,77:0.47:165
chr9	4627871	rs4742023	A	G	496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.821;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=378;ReadPosRankSum=-1.491;SC=GTGTCCATCAACAGATGAATG;SOR=0.350;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=42;TCF=5;TCR=37;TR=21;WE=4627879;WS=4627861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,21:0.48:44
chr9	4629049	rs55927512	A	T	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=6.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.24;MQRankSum=1.067;QD=10.79;ReadPosRankSum=-2.045;SOR=1.880;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,22:0.49:45
chr9	4629170	rs34533529	T	TAAAA	1658.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.706;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.864;NF=1;NR=17;PP=894;ReadPosRankSum=-1.316;SC=AGCAATGCCCTATAAAACAGC;SOR=0.941;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=46;TCF=7;TCR=39;TR=18;WE=4629178;WS=4629160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,43:0.47:91
chr9	4635232	rs16921669	G	A	1384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.098;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=24;PP=852;ReadPosRankSum=0.209;SC=GGTCCCAAGAGTTTCTCTCCT;SOR=0.908;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=128;TCF=78;TCR=50;TR=64;WE=4635240;WS=4635222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,68:0.47:146
chr9	4635525	rs2273900	A	G	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.25;ReadPosRankSum=0.842;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr9	4646363	rs301469	C	T	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=157;ReadPosRankSum=-0.392;SC=TATAAACTTACAGACACATAA;SOR=0.658;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=12;WE=4646371;WS=4646353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr9	4655915	rs7869353	G	C	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=102;ReadPosRankSum=-1.383;SC=ATTTTACGTAGGCTGTCTTGA;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=6;WE=4655923;WS=4655905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr9	4661749	rs143968076	T	TCCGACTGCGGTTTTGCTTCAAGG	319.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.494;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=26.64;ReadPosRankSum=-0.754;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr9	4661752	rs62543897	G	A	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.923;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=114;ReadPosRankSum=1.055;SC=CAAGTGTTCCGACTGCGGTTT;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=7;WE=4661760;WS=4661746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr9	4661853	rs301489	C	T	1698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.753;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=28;PP=904;ReadPosRankSum=-1.065;SC=TAAGAACTCTCAGGTTATCTT;SOR=0.553;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=182;TCF=109;TCR=73;TR=72;WE=4661861;WS=4661843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,85:0.41:208
chr9	4662016	rs62543898	G	C	2936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.431;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=59;PP=1899;ReadPosRankSum=0.127;SC=TGCCAGGCAGGAACACTCCTG;SOR=0.725;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=252;TCF=122;TCR=130;TR=117;WE=4662024;WS=4662006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,134:0.47:283
chr9	4663124	rs41279553	G	C	3119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=68;PP=1893;ReadPosRankSum=-0.365;SC=GGCCTATCCAGGGTCATGCTG;SOR=0.719;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=260;TCF=135;TCR=125;TR=141;WE=4663132;WS=4663114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,147:0.52:280
chr9	4722685	rs10758645	C	G	3320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=71;PP=2103;SC=TTCCAGGCACCTCGGAACGAG;SOR=1.244;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=48;TCR=71;TR=119;WE=4722693;WS=4722675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr9	4793254	rs841990	G	A	2375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FS=2.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.58;ReadPosRankSum=1.495;SOR=0.508;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,111:0.63:175
chr9	4833436	rs463578	GC	AT	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=23.42;ReadPosRankSum=-1.981;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr9	4834034	rs466547	A	G	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=124;ReadPosRankSum=-0.135;SC=TGGAAGAGCTATGCCTTGTAA;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=6;WE=4834042;WS=4834024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr9	4844459	rs159432	G	A	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.975;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=12;PP=427;ReadPosRankSum=-0.946;SC=TTCTCTTTCCGTTTGCTGGTG;SOR=1.018;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=64;TCF=39;TCR=25;TR=32;WE=4844467;WS=4844449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,34:0.48:71
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chr9	4849647	rs17803780	T	C	904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=28;PP=496;ReadPosRankSum=-1.352;SC=GCCTGCACTATGAACACCTGC;SOR=0.634;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=88;TCF=28;TCR=60;TR=41;WE=4849655;WS=4849637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,46:0.49:94
chr9	4850141	rs12375841	T	C	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.908;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=168;ReadPosRankSum=-0.389;SC=AAGCATTTCCTATTGATAGTA;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=8;WE=4850149;WS=4850131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
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chr9	4850421	.	CCCTTGGGCCA	GCCTTGGGCCA,GCCTTGGGCCG	683	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=4;MMLQ=19;MQ=59.64;NF=20,8;NR=31,11;PP=683,517;QD=14.0739453441;SC=GGGCTATGCACCCTTGGGCCA;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=53;TCF=20;TCR=33;TR=51,19;WE=4850444;WS=4850411;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.96:53
chr9	4850431	rs10974810	A	G	764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=2.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.63;ReadPosRankSum=-1.651;SOR=0.293;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
chr9	4850436	rs462480	G	T	871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.835;HP=2;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=683;ReadPosRankSum=1.197;SC=GGGCCATGGCGTTGGGGGCAT;SOR=1.317;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=39;TCF=12;TCR=27;TR=18;WE=4850444;WS=4850411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,23:0.52:44
chr9	4860300	rs15583	A	G	1526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.524;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=40;PP=859;ReadPosRankSum=2.795;SC=TAAGGCCCCAATGCCTACAGA;SOR=0.516;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=115;TCF=42;TCR=73;TR=66;WE=4860308;WS=4860290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,72:0.58:124
chr9	5335639	rs2146074	C	T	603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=17;PP=450;SC=GGCGTATTCACGTCAAAGAGC;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=5335647;WS=5335629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	5465732	rs2297137	G	A	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=194;ReadPosRankSum=-0.951;SC=CTGTTCAACAGCAATTATATT;SOR=0.892;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=11;WE=5465740;WS=5465722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr9	5467955	rs2297136	G	A	1454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.684;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=39;PP=842;ReadPosRankSum=0.988;SC=GAAGGAATGGGCCCGTGGGAT;SOR=0.821;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=119;TCF=48;TCR=71;TR=64;WE=5467963;WS=5467945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,68:0.54:126
chr9	5557672	rs7854303	T	C	4801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=57;PP=2965;SC=TTCATCCCCTTCTGCATCATT;SOR=1.254;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=156;TCF=99;TCR=57;TR=156;WE=5557680;WS=5557662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr9	5557708	rs7854413	T	C	2507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.132;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=53;PP=1742;ReadPosRankSum=0.488;SC=GCCACAGTGATAGCCCTAAGA;SOR=0.566;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=226;TCF=128;TCR=98;TR=115;WE=5557716;WS=5557698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,122:0.49:249
chr9	5569860	rs7852996	T	A	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=252;ReadPosRankSum=-0.281;SC=TGAACTTTTTTAAAAAAATTA;SOR=0.896;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=14;WE=5569868;WS=5569850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,14:0.40:35
chr9	5656558	.	CT	C	53.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.172;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.24;ReadPosRankSum=-0.602;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr9	5656610	rs12686794	G	C	1484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=3.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.68;ReadPosRankSum=2.813;SOR=0.952;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,73:0.53:139
chr9	5720172	rs10758700	C	G	1857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.594;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=27;PP=1124;ReadPosRankSum=0.500;SC=TTAATTGATTCTACCTACAGT;SOR=0.620;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=142;TCF=93;TCR=49;TR=74;WE=5720180;WS=5720162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,84:0.51:164
chr9	5732483	rs7850299	T	C	2486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=4.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.936;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=60;PP=1721;ReadPosRankSum=-0.640;SC=GTGTGAGGTATAATTGATGTA;SOR=0.901;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=226;TCF=96;TCR=130;TR=105;WE=5732491;WS=5732473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,112:0.48:232
chr9	5732532	rs76581785	GT	G	701.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=9.538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.197;SOR=1.868;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,37:0.58:64
chr9	5745798	rs183729173	G	T	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.148;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=1;PP=29;ReadPosRankSum=-0.398;SC=GTGTTATCACGGTTTCTCCAA;SOR=0.105;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=3;WE=5745806;WS=5745788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr9	5747187	rs10815278	C	T	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.328;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=160;ReadPosRankSum=-2.838;SC=CATCGAGATACATGTACATTT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=9;WE=5747195;WS=5747177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr9	5754988	rs7038447	A	T	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.22;ReadPosRankSum=0.675;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr9	5762533	rs1543526	A	C	2062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=41;PP=1283;ReadPosRankSum=-0.890;SC=CTTTTTCTTAAATTTCAGGCT;SOR=0.687;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=193;TCF=106;TCR=87;TR=91;WE=5762541;WS=5762523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,100:0.47:211
chr9	5763873	rs117881871	C	A	1533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.652;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=42;PP=969;ReadPosRankSum=-0.309;SC=TTACAGGTAACAATTCTCTTC;SOR=0.778;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=123;TCF=45;TCR=78;TR=64;WE=5763881;WS=5763863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,71:0.50:141
chr9	5769494	rs1323273	A	T	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=78;ReadPosRankSum=0.642;SC=ATCTAATCATACTTGGATTAT;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=6;WE=5769502;WS=5769484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr9	5769998	rs734548	A	G	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=130;ReadPosRankSum=0.720;SC=GTAGGCAGGTAGGGGAAGCTA;SOR=0.409;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=8;WE=5770006;WS=5769988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr9	5770047	rs734549	A	G	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.915;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=6;PP=382;ReadPosRankSum=1.259;SC=TGCATCTTCAATTTCTTCCTC;SOR=0.933;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=68;TCF=47;TCR=21;TR=28;WE=5770055;WS=5770037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,34:0.43:79
chr9	5774225	rs3739648	T	G	1313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.757;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=33;PP=769;ReadPosRankSum=0.006;SC=AGGATGGGACTTACGACTGTT;SOR=0.552;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=35;TCR=59;TR=53;WE=5774233;WS=5774215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,60:0.54:111
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chr9	5968416	rs3739649	A	G	9902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=359;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=168;NR=149;PP=2965;SC=CACCTGGACTAAGAGGCTCTC;SOR=0.774;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=318;TCF=169;TCR=149;TR=317;WE=5968424;WS=5968406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,358:1.00:358
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chr9	5969517	rs7030731	C	T	516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=14;PP=379;SC=TTATCTTTAGCCAAAAAGGCA;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=5969525;WS=5969507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	5988333	rs2291055	C	T	2436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=33;PP=1077;ReadPosRankSum=-0.369;SC=GAATTTTTTTCTTAACATTTA;SOR=1.099;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=72;TCR=34;TR=103;WE=5988341;WS=5988315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,101:0.97:104
chr9	6007122	rs77310481	G	A	1022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.718;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=15;PP=670;ReadPosRankSum=2.207;SC=CCCTGGCCCAGCCCATCCTCG;SOR=0.801;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=112;TCF=73;TCR=39;TR=47;WE=6007130;WS=6007112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,51:0.44:117
chr9	6254555	.	TA	T	51.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.027;ClippingRankSum=0.000;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=2.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.08;MQRankSum=2.381;QD=0.53;ReadPosRankSum=0.235;SOR=1.035;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,15:0.15:98
chr9	6254694	rs7857724	A	C	406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=10;PP=311;SC=AAGCACAATCACTTACTACAA;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=6254702;WS=6254684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
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chr9	6330248	rs145971712	C	T	1830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.021;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=43;PP=994;ReadPosRankSum=1.582;SC=GGAACCTGGACGGTGCTTGTT;SOR=0.519;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=145;TCF=59;TCR=86;TR=77;WE=6330256;WS=6330238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,87:0.53:163
chr9	6330915	rs1037885	G	A	668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=4;PP=447;SC=TCTCAACTCCGTAAAAGTAGT;SOR=2.400;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=21;WE=6330923;WS=6330905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr9	6534845	rs2282160	T	C	1466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.436;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=32;PP=848;ReadPosRankSum=1.765;SC=CTTCTCCTCCTACCCTGCACC;SOR=0.417;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=109;TCF=48;TCR=61;TR=61;WE=6534853;WS=6534835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,68:0.57:119
chr9	6553514	rs3215923	A	AT	2475.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.823;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=34;PP=816;ReadPosRankSum=0.085;SC=TTCTTCCTGTATTTTTTTTAA;SOR=0.636;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=122;TCF=29;TCR=93;TR=49;WE=6553530;WS=6553504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,115:0.47:247
chr9	6587454	rs7021684	G	A	68.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=3;PP=47;SC=GGTAAGTACCGTTACTGTCTT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=6587462;WS=6587444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr9	6591972	rs62568998	T	C	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=4.101;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=208;ReadPosRankSum=0.064;SC=CCTACAGCAGTGACCTCCAGC;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=9;WE=6591980;WS=6591962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr9	6602374	rs12683330	C	T	30.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr9	6606746	rs10975681	T	C	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=305;ReadPosRankSum=-0.255;SC=AAAGCAAACATAGTACCGAGG;SOR=0.550;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=12;TCR=52;TR=20;WE=6606754;WS=6606736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,23:0.34:68
chr9	6610326	rs35374927	C	T	1978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.482;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.454;NF=44;NR=38;PP=1168;ReadPosRankSum=0.413;SC=CCTGAGACACCTCAGGCTGGT;SOR=0.508;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=155;TCF=85;TCR=70;TR=82;WE=6610334;WS=6610316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,93:0.53:175
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chr9	6981639	rs117132443	A	G	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.922;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=3;PP=61;ReadPosRankSum=0.153;SC=TATCCTTGTGAACTTTATTCT;SOR=0.132;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=7;WE=6981647;WS=6981629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
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chr9	7174773	rs913589	G	A	769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=18;PP=529;SC=TGGGTTGGAAGAGAGAAGATG;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=24;WE=7174781;WS=7174763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr9	7798435	rs1254	C	T	1138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=6;PP=756;SC=CGATTTTCTTCTCAGTCTTGT;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=33;WE=7798443;WS=7798425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr9	7798518	rs4742410	G	C	5713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=110;NR=82;PP=2965;SC=CATGCCTGCTGTGTGTGTCAC;SOR=0.931;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=192;TCF=110;TCR=82;TR=192;WE=7798536;WS=7798508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr9	7799606	rs14059	C	A	1038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.920;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=18;PP=484;ReadPosRankSum=0.821;SC=AGGTCTTCAACAGGCGGTGTT;SOR=0.848;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=64;TCF=33;TCR=31;TR=39;WE=7799614;WS=7799596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,47:0.64:73
chr9	7799653	rs1127430	G	T	766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.57;ReadPosRankSum=-2.919;SOR=0.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,35:0.57:61
chr9	8319806	rs7873084	C	T	4136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=51;PP=2378;SC=TCTTGAGATGCGAAAAATGCA;SOR=1.106;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=140;TCF=89;TCR=51;TR=138;WE=8319814;WS=8319796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr9	8320065	rs3739578	G	A	635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=20;PP=511;SC=TCCACACTCCGTATCTCTTTA;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=8320073;WS=8320055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr9	8331574	rs146237556	A	AAACTTACCATTCCTGAACTGT	4626.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=11;PP=2900;SC=TCACAAATGGAAACTTACCTG;SOR=1.455;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=37;TCF=15;TCR=22;TR=20;WE=8331582;WS=8331564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr9	8338847	.	CAGAG	C,CAG	2414.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.933;ClippingRankSum=0.000;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.29;MQRankSum=0.254;QD=33.54;ReadPosRankSum=1.709;SOR=0.498;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:1,10,61:0.14,0.85:72
chr9	8338886	rs150903419	G	A	1211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.528;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-1.077;NF=33;NR=23;PP=649;ReadPosRankSum=0.793;SC=CTACTTTTCAGCTAATGGTTA;SOR=0.540;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=108;TCF=65;TCR=43;TR=56;WE=8338894;WS=8338876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,60:0.55:110
chr9	8340321	rs369632509	C	G	1528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.853;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=33;PP=934;ReadPosRankSum=-0.405;SC=TATGAGGAGACACACAAGGGC;SOR=0.405;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=133;TCF=78;TCR=55;TR=69;WE=8340329;WS=8340311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,77:0.51:151
chr9	8341018	rs35000820	TA	T	3052.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=23;PP=2384;SC=AGATGAAATTTATTCTGGTTA;SOR=1.775;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=56;TCF=33;TCR=23;TR=55;WE=8341026;WS=8341008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
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chr9	8376899	rs2291958	T	C	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.52;BaseQRankSum=2.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=3;PP=26;ReadPosRankSum=0.643;SC=CTGATGCCAATATAAACCACA;SOR=0.124;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=3;WE=8376907;WS=8376889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,3:0.23:13
chr9	8389364	rs2279776	C	G	2899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.932;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=63;PP=1748;ReadPosRankSum=-1.206;SC=GCTTCCTATACCCATCTATGT;SOR=0.584;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=269;TCF=133;TCR=136;TR=130;WE=8389372;WS=8389354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,141:0.48:293
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chr9	8436560	rs1359117	A	T	1228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.728;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=17;PP=668;ReadPosRankSum=-0.892;SC=TAACTCTTGAAATTACTGTAA;SOR=0.374;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=112;TCF=80;TCR=32;TR=50;WE=8436568;WS=8436550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,59:0.47:126
chr9	8436703	rs1359118	C	G	3988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=80;PP=2495;SC=TTGAAAAAAGCAAAGAAGAAA;SOR=1.512;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=46;TCR=80;TR=126;WE=8436711;WS=8436693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr9	8437141	rs10977104	G	C	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.402;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=145;ReadPosRankSum=0.465;SC=AAAAGGGAAAGAGTAGTAGCT;SOR=2.093;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=11;WE=8437149;WS=8437131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr9	8437288	.	C	CAAAA	245	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;FR=0.5000;HP=9;HapScore=2;MGOF=17;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=1;NR=7;PP=245;QD=32.375;SC=ACAAATTCTTCAAAAAAAAAT;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=8;WE=8437296;WS=8437278;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,8:0.57:14
chr9	8451816	rs4742505	TT	AC	8281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=68;PP=2947;SC=TCCCTTCCCATTGTGGCTCTG;SOR=0.747;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=162;TCF=91;TCR=71;TR=155;WE=8451825;WS=8451806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr9	8454566	rs7031287	T	C	5998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=101;NR=98;PP=2965;SC=AGGGGTTTGTTCTCTATTCCT;SOR=0.834;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=199;TCF=101;TCR=98;TR=199;WE=8454574;WS=8454556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr9	8518143	rs7026388	T	C	8245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=163;NR=106;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.284;SC=CACTGGATGGTGCTTGCTCTG;SOR=1.190;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=271;TCF=164;TCR=107;TR=269;WE=8518151;WS=8518133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,302:0.99:304
chr9	8526505	.	GA	G	158.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.335;ClippingRankSum=0.000;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=2.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.60;ReadPosRankSum=-0.214;SOR=0.437;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,19:0.19:99
chr9	12704725	rs2733832	C	T	1770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.782;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=39;PP=1025;ReadPosRankSum=0.081;SC=TTTCATATGCCTTTTGCATGC;SOR=0.434;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=139;TCF=61;TCR=78;TR=74;WE=12704733;WS=12704715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,82:0.52:159
chr9	12708910	rs2733834	C	G	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.062;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=163;ReadPosRankSum=-1.086;SC=TAAATTTCATCTGTCCACTTT;SOR=1.270;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=10;WE=12708918;WS=12708900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,12:0.41:29
chr9	12708958	rs147565972	T	TA	1483.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.649;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.624;NF=18;NR=10;PP=1049;ReadPosRankSum=0.197;SC=TTTTTATTTTTATCTTCCTTT;SOR=1.054;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=63;TCF=33;TCR=30;TR=28;WE=12708966;WS=12708948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,49:0.44:112
chr9	12775861	rs139315731	T	TGGCGGCGGC,TGGCGGC	3910.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5021,0.4979;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13,13;NR=23,23;PP=1092,5;SC=GCGGTGGTGGTGGCGGCGGCG;SOR=0.855;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=58;TCF=18;TCR=40;TR=36,36;WE=12775869;WS=12775851;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:84
chr9	12775889	rs3750501	A	G	3318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=67;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=48;PP=1686;SC=CTGCAGTAGCAGCAGCAGCTA;SOR=0.804;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=102;TCF=53;TCR=49;TR=101;WE=12775897;WS=12775879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr9	13109111	rs10732331	C	T	367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=19;PP=471;SC=AAAAACTATACATATATGTTA;SOR=3.126;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=22;WE=13109119;WS=13109101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr9	13112116	rs10809904	A	G	3830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=73;PP=2370;SC=CTCCTCCAGCAATGCTGATTC;SOR=1.147;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=127;TCF=54;TCR=73;TR=127;WE=13112124;WS=13112106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr9	13115422	rs2274647	T	G	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.830;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=185;ReadPosRankSum=0.052;SC=CTTCAAGACTTTTTTGAAAGG;SOR=0.111;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=39;TCF=13;TCR=26;TR=20;WE=13115430;WS=13115412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,21:0.49:43
chr9	13125201	rs2297003	T	C	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.800;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=83;ReadPosRankSum=1.227;SC=CTCTCATGAGTCCAGAGGCCT;SOR=0.473;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=7;WE=13125209;WS=13125191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr9	13126470	rs10738323	C	G	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=237;ReadPosRankSum=-0.059;SC=TAATCATGCCCAAGGATGGGC;SOR=0.829;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=17;WE=13126478;WS=13126460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr9	13136564	rs10809908	A	T	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.092;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQRankSum=-0.674;QD=8.36;ReadPosRankSum=-1.097;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr9	13147723	rs7024892	T	C	807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.866;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=25;PP=431;ReadPosRankSum=0.730;SC=TGTGTGGATATGGAGTTTTAG;SOR=0.841;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=27;TCR=58;TR=37;WE=13147731;WS=13147713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,40:0.43:92
chr9	13150531	rs10756457	T	C	1394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=24;PP=744;ReadPosRankSum=-0.377;SC=TATCTCCAGGTTTCAAGGTTC;SOR=0.736;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=154;TCF=92;TCR=62;TR=63;WE=13150539;WS=13150521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,74:0.43:174
chr9	13150558	rs188840960	A	C	1661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.091;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=31;PP=933;ReadPosRankSum=1.247;SC=TGCCAGCTGGACTATCTTCCA;SOR=0.799;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=181;TCF=102;TCR=79;TR=74;WE=13150566;WS=13150548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,86:0.42:207
chr9	13165218	rs10960959	C	T	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-3.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=232;ReadPosRankSum=0.969;SC=TATGTTCTTACTTAAACAAAG;SOR=0.484;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=12;WE=13165226;WS=13165208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
chr9	13175715	rs3831219	TGAG	T	1136.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.240;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.403;NF=16;NR=5;PP=840;ReadPosRankSum=-1.094;SC=TCAAGGGGGTTGAGGAGTAGG;SOR=0.265;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=48;TCF=39;TCR=9;TR=21;WE=13175725;WS=13175705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,31:0.52:60
chr9	13175987	rs1331674	C	T	816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.075;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=24;PP=538;ReadPosRankSum=-1.611;SC=TTTGCAAGAACCTGCAACCAA;SOR=0.996;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=69;TCF=21;TCR=48;TR=33;WE=13175995;WS=13175977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,36:0.46:78
chr9	13176312	rs2274856	C	T	1342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.182;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=31;PP=717;ReadPosRankSum=1.354;SC=TTATGTCCACCGAAGGTGTAT;SOR=0.586;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=160;TCF=79;TCR=81;TR=65;WE=13176320;WS=13176302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,74:0.42:178
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chr9	13927980	rs35960404	C	A	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=10;PP=238;ReadPosRankSum=0.677;SC=TCTCAAAAGGCCACATGTAGA;SOR=0.627;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=71;TCF=40;TCR=31;TR=23;WE=13927988;WS=13927970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,24:0.32:76
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chr9	14313712	rs2273933	T	G	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.863;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.393;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=104;ReadPosRankSum=-0.076;SC=GCGTGCTAGATTTCCAGGGGT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=6;WE=14313720;WS=14313702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr9	14618856	rs3802482	C	T	3264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=29;PP=2118;SC=ATGCCTAAGACTGGTGGGTGG;SOR=1.786;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=76;TCR=29;TR=105;WE=14618864;WS=14618846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr9	14619168	rs10810187	A	G	343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=10;PP=237;SC=AACAATACAGATTGGCTGGGG;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=14619176;WS=14619158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	14640055	rs6474849	C	T	1695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=34;PP=1055;SC=GAGTTGCTTACATTGCTTACA;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=21;TCR=34;TR=55;WE=14640063;WS=14640045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr9	14662260	rs17215796	A	G	2383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.072;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=49;PP=1290;ReadPosRankSum=0.856;SC=CGCAGCGGCTACAGTGATGGG;SOR=0.613;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=184;TCF=84;TCR=100;TR=94;WE=14662268;WS=14662250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,110:0.53:209
chr9	14690419	rs10961672	T	C	1882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=39;PP=1235;SC=AATCAGAAGCTTGGTTGACAT;SOR=1.508;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=21;TCR=39;TR=60;WE=14690427;WS=14690409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr9	14690447	rs2382477	G	T	1509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=33;PP=935;SC=GAGCATTTTAGGTTAGATTTA;SOR=1.835;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=15;TCR=33;TR=48;WE=14690455;WS=14690437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr9	14693270	rs71476227	G	A	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=85;ReadPosRankSum=0.257;SC=TCTCCCGACCGCCAGCAGCTC;SOR=0.892;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=28;TCF=18;TCR=10;TR=10;WE=14693278;WS=14693260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr9	14720357	rs7036635	C	T	2473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=43;PP=1379;SC=TGAACAACTACTTTTTCACAG;SOR=1.095;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=36;TCR=43;TR=79;WE=14720365;WS=14720347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr9	14722477	rs3747532	G	C	5451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=88;NR=81;PP=2965;SC=AGGGCTGGTGGCTACAAGGTG;SOR=0.797;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=171;TCF=89;TCR=82;TR=169;WE=14722485;WS=14722467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr9	14722616	rs10115703	G	A	3306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=61;PP=1850;SC=TCCTGGTGCCGTGTGGTCTTT;SOR=1.039;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=53;TCR=61;TR=114;WE=14722624;WS=14722606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr9	14746261	rs4124592	T	G	901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.676;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=14;PP=483;ReadPosRankSum=-1.928;SC=CAATACTTGTTGAATGAATGA;SOR=0.101;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=44;TCF=30;TCR=14;TR=36;WE=14746269;WS=14746251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,40:0.82:49
chr9	14747133	rs2270529	T	C	4510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=76;PP=2679;SC=GGTCTTCATTTGTTGGGAAGC;SOR=0.705;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=76;TCR=76;TR=152;WE=14747141;WS=14747123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr9	14747157	rs2270530	A	C	4669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=67;PP=2965;SC=TGTGTTGGGTAAACTATCCCC;SOR=0.771;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=144;TCF=76;TCR=68;TR=143;WE=14747165;WS=14747147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr9	14756318	rs57793294	C	CA	1964.50	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.510;HP=10;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=19;PP=503;ReadPosRankSum=0.906;SC=GACATGCCTACAAAAAAAAAC;SOR=1.432;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=90;TCF=39;TCR=51;TR=42;WE=14756326;WS=14756306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,76:0.86:88
chr9	14756483	rs10810233	A	G	3772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=81;PP=2479;SC=GATAAAAATAAATATTCTACA;SOR=1.900;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=114;TCF=33;TCR=81;TR=114;WE=14756491;WS=14756473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr9	14759725	rs7045154	A	G	4208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=97;NR=36;PP=2915;SC=ACACCAAAGAACAACATAAGT;SOR=2.006;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=97;TCR=36;TR=133;WE=14759733;WS=14759715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr9	14770577	rs116570001	A	G	778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=2.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.70;ReadPosRankSum=2.518;SOR=1.201;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,21:0.48:44
chr9	14770580	rs1874109	G	A	778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=2.689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.93;ReadPosRankSum=2.902;SOR=1.244;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,21:0.46:46
chr9	14770658	rs17219005	G	T	931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.827;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=14;PP=360;ReadPosRankSum=-0.653;SC=TTTTAAAGATGATCTGATCGT;SOR=0.646;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=41;TCR=28;TR=34;WE=14770666;WS=14770648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,45:0.54:83
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chr9	14775779	rs1874108	A	G	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=157;ReadPosRankSum=-1.304;SC=TGTGTTTTTCATACTTGCCTG;SOR=0.941;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=10;WE=14775787;WS=14775769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
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chr9	14846036	rs2779500	C	G	1980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.187;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=51;PP=1204;ReadPosRankSum=-1.287;SC=TTGTCGACAACCTGAAACTGT;SOR=0.577;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=163;TCF=65;TCR=98;TR=86;WE=14846044;WS=14846026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,95:0.52:184
chr9	14846122	rs2642404	C	G	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.386;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=160;ReadPosRankSum=-0.959;SC=GTGTTGGTATCATAGACTGGA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=8;WE=14846130;WS=14846112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr9	14851617	rs2818940	T	C	4681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=90;PP=2904;SC=TTTTGAAGGATAGAGAAAATA;SOR=1.343;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=149;TCF=58;TCR=91;TR=148;WE=14851625;WS=14851607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr9	14851703	rs729492	G	A	809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=24;PP=623;SC=CCACAGCCTAGCGTCTAGCAG;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=26;WE=14851711;WS=14851693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr9	14859356	rs10961757	T	C	3296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.926;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=71;PP=2085;ReadPosRankSum=0.903;SC=TATCAATCGCTTGGGACAAGC;SOR=0.618;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=251;TCF=130;TCR=121;TR=144;WE=14859364;WS=14859346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,157:0.57:276
chr9	14868653	rs7856810	A	T	871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.878;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=9;PP=616;ReadPosRankSum=-0.101;SC=GAGGGGAGACATTTTACATCT;SOR=0.578;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=65;TCR=20;TR=38;WE=14868661;WS=14868643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,39:0.42:93
chr9	15000551	rs7029527	T	C	926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.816;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=12;PP=485;ReadPosRankSum=-1.612;SC=TAAAGGATCTTTTCTTTGCCT;SOR=0.904;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=66;TCF=41;TCR=25;TR=34;WE=15000559;WS=15000541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,43:0.52:82
chr9	15017223	rs2222456	G	A	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.935;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=84;ReadPosRankSum=-0.143;SC=ATTACTACCCGAGGTGGCACA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=6;WE=15017231;WS=15017213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr9	15017240	rs1403562	A	G	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.730;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=270;ReadPosRankSum=-1.382;SC=CACAAGTTGTACTAGTACAAA;SOR=0.257;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=14;WE=15017248;WS=15017230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr9	15017388	rs112344710	G	C	1976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.714;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.101;NF=30;NR=26;PP=891;ReadPosRankSum=0.621;SC=AATAGTTGAGGCTGCAAGTGA;SOR=0.763;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=102;TCF=56;TCR=46;TR=56;WE=15017396;WS=15017378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,59:0.54:110
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chr9	15019447	rs77959631	A	G	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=261;ReadPosRankSum=1.177;SC=GATATCTGCTATGTTATCTGC;SOR=0.760;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=17;WE=15019455;WS=15019437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
chr9	15183532	rs2057478	C	G	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.711;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=239;ReadPosRankSum=0.021;SC=TTCCATAGACCTGGAGAAAGA;SOR=1.835;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=36;TCF=11;TCR=25;TR=14;WE=15183540;WS=15183522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,14:0.37:38
chr9	15188106	rs1407977	T	C	1374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.669;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=40;PP=719;ReadPosRankSum=-1.198;SC=TGAACTGAAATGCATTTTTGA;SOR=0.594;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=44;TCR=79;TR=63;WE=15188114;WS=15188096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,70:0.50:139
chr9	15190494	rs475932	A	C	552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.194;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=315;ReadPosRankSum=0.783;SC=CAGGTGTAACACACCATGTCT;SOR=0.986;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=54;TCF=44;TCR=10;TR=21;WE=15190502;WS=15190484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,25:0.42:60
chr9	15192720	rs566820	A	G	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.375;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=14;PP=260;ReadPosRankSum=0.440;SC=AAGTGACAGCATAAGTTGACC;SOR=0.209;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=73;TCF=26;TCR=47;TR=26;WE=15192728;WS=15192710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,30:0.36:83
chr9	15203652	rs34222215	A	T	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-6.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.957;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=344;ReadPosRankSum=-1.585;SC=AGGAGGAACAAAGCTCTCTAG;SOR=0.018;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=45;TCF=41;TCR=4;TR=23;WE=15203660;WS=15203642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,26:0.50:52
chr9	15214313	.	AGTGT	A	185.76	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.51;QD=14.29;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr9	15267981	rs552693	G	C	3065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=48;PP=1979;SC=AGTTTCTCAAGAATTCTCAAT;SOR=0.765;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=106;TCF=58;TCR=48;TR=105;WE=15267989;WS=15267971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr9	15447361	rs3830477	A	AACT	1075.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=16;PP=842;SC=GATTCCATCAAACTACACTAT;SOR=3.528;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=16;WE=15447369;WS=15447351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr9	15457853	rs10756669	G	A	1027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=1;PP=789;SC=AAAATTGAAAGTATCTATTTT;SOR=4.680;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=29;WE=15457861;WS=15457843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr9	15458080	rs35960449	A	AT	1393.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=4.216;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.50;ReadPosRankSum=0.118;SOR=1.139;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:5,63:0.93:68
chr9	15468414	rs34331255	CCTT	C	5139.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=7;NR=58;PP=2948;SC=ATGGTTTCTGCCTTAGAAGTC;SOR=1.733;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=7;TCR=59;TR=65;WE=15468424;WS=15468404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr9	15468480	rs4741507	T	C	1398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=30;PP=1068;SC=AGTCCTTCAATAGGCCCATCA;SOR=2.007;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=12;TCR=30;TR=42;WE=15468488;WS=15468470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr9	15486958	rs2737828	A	T	1110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=24;PP=666;SC=ATTAATTTCAAAAAATAAGTT;SOR=1.501;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=13;TCR=24;TR=37;WE=15486966;WS=15486948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr9	15678995	rs7037893	C	A	925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=10;NR=18;PP=461;SC=TAATAGTATGCAAGTTATTTT;SOR=1.819;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=10;TCR=18;TR=28;WE=15679003;WS=15678985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr9	15695418	rs1355172	G	A	4699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=64;NR=93;PP=2700;SC=GATGCCTCTTGTAGTCCCTCA;SOR=1.294;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=157;TCF=64;TCR=93;TR=157;WE=15695426;WS=15695408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr9	15784496	rs2382540	C	G	2287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.130;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=42;PP=1411;ReadPosRankSum=-1.054;SC=CCCCTCTCCTCCTTTTTACAG;SOR=0.503;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=190;TCF=118;TCR=72;TR=102;WE=15784504;WS=15784486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,110:0.51:214
chr9	15784631	rs1539172	A	G	2596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.628;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=57;PP=1596;ReadPosRankSum=1.214;SC=TTGAATTATAAACTTGAATTG;SOR=0.485;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=266;TCF=127;TCR=139;TR=117;WE=15784639;WS=15784621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,128:0.44:292
chr9	15864506	rs770196	C	G	718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=1;PP=490;SC=TCCACTTCTTCTGTCCAAGTG;SOR=3.816;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=15864514;WS=15864496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr9	15883263	rs809493	G	A	150.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=4;PP=75;SC=TCGCTATGCTGCCCAGACTGG;SOR=1.609;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=15883271;WS=15883253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr9	15922137	rs1328285	A	G	6722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=140;NR=80;PP=2965;SC=TTTAGAAGAGATGGTTCACCC;SOR=1.346;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=221;TCF=140;TCR=81;TR=220;WE=15922145;WS=15922127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr9	15922325	rs2225181	A	T	786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=1.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.09;ReadPosRankSum=-0.049;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,36:0.46:78
chr9	16664871	rs35822374	T	TG	558.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=0;PP=575;SC=ACCTATACCATAAGCATTGTG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=16664879;WS=16664861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	16685539	rs7046068	T	C	9056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=133;NR=156;PP=2965;SC=GTTAAGACTCTAACCTGGACT;SOR=0.990;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=289;TCF=133;TCR=156;TR=289;WE=16685547;WS=16685529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,327:1.00:327
chr9	16699287	rs10738447	C	T	11577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.36;SOR=1.067;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr9	16699292	rs10738448	C	T	11321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.29;SOR=1.129;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr9	16727698	rs1360285	G	A	371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=9;NR=2;PP=197;SC=ATTTTAAAAAGTATTTAGAAA;SOR=1.765;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=16727706;WS=16727688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	16738269	rs7858914	G	T	1183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=32;NR=9;PP=811;SC=GTGGCAGAAAGAAGAGGTGAG;SOR=2.110;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=32;TCR=9;TR=41;WE=16738277;WS=16738259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr9	16738307	rs7858709	A	C	5092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.09;QD=44.67;SOR=1.149;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr9	16738312	rs7858712	A	G	5328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.09;QD=42.97;SOR=1.151;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr9	16738338	rs35475650	GA	G	3538.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.545;HP=10;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.571;NF=26;NR=47;PP=1313;ReadPosRankSum=1.489;SC=CTTAAAGGGGGAAAAAAAAAA;SOR=0.479;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=28;TCR=51;TR=73;WE=16738347;WS=16738328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:6,147:0.96:153
chr9	16738556	rs4007684	C	CTTTT	1830.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=23;PP=1281;SC=TACATCAAAACTTTAAGAAAT;SOR=1.900;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=24;WE=16738564;WS=16738546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr9	17135115	rs41306071	C	T	701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=4;PP=377;SC=AGCGCGACAGCTGGGCCCCAG;SOR=1.697;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=22;WE=17135123;WS=17135105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr9	17135434	rs12003380	G	C	5641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.10;SOR=1.072;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr9	17135443	rs111496959	T	C	5297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.28;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr9	17235642	rs67017076	AT	A	1592.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=21;PP=903;SC=AGTAATTTAAATTTTTTTCCA;SOR=1.047;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=36;TCF=12;TCR=24;TR=33;WE=17235650;WS=17235632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr9	17309336	rs10756860	T	C	500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=11;PP=338;SC=AAAATTTAAATATATTTGCAT;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=17309344;WS=17309326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	17309374	rs6475126	T	A	178.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=143;SC=GTGTGCAGATTGTTTTGCATT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=17309382;WS=17309364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr9	17332484	rs3084508	ATT	A	1018.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.87;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr9	17342383	rs1442527	C	T	5579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=91;PP=2965;SC=AAGATTCTGACGCTGTGTGGA;SOR=0.712;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=191;TCF=100;TCR=91;TR=191;WE=17342391;WS=17342373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr9	17342517	rs10756869	A	G	732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=17;PP=501;SC=AAAAGCTATTAAAGAAACACT;SOR=2.584;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=17342525;WS=17342507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr9	17366568	rs4961548	A	T	456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=1;PP=402;SC=TGATTTTTTTAAATAAAACAA;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=17366576;WS=17366558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr9	17394465	rs7035357	G	A	123.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=1;PP=55;SC=TCATAAGTTAGAAATGGTAAT;SOR=1.981;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=17394473;WS=17394455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr9	17394536	rs7035276	C	T	756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=6;PP=444;SC=CTTTAGGTCACTGAGTTGGAA;SOR=1.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=24;WE=17394544;WS=17394526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr9	17394996	rs3739489	T	C	7696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=129;NR=122;PP=2965;SC=TTCTCAATCATTCCATCAAGG;SOR=0.796;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=253;TCF=129;TCR=124;TR=251;WE=17395004;WS=17394986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,284:1.00:284
chr9	17395108	rs3739488	C	T	2117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=50;PP=1480;SC=GGGGACACTGCGCATATGTAA;SOR=2.368;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=17;TCR=50;TR=67;WE=17395116;WS=17395098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr9	17409366	rs2780211	G	A	6046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=111;NR=97;PP=2965;SC=TAAGTCCTACGGAAGATGGAA;SOR=0.720;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=208;TCF=111;TCR=97;TR=208;WE=17409374;WS=17409356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr9	17409556	rs2584549	C	T	430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=13;PP=348;SC=AATGTTACTACTGATTTAATT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=17409564;WS=17409546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	17457512	rs35399020	TA	T	878.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=9;PP=558;SC=TTTCTTTTTTTAAAAAAAAGA;SOR=1.819;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=34;TCF=23;TCR=11;TR=25;WE=17457520;WS=17457502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr9	17464402	rs1442532	G	C	792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=6;PP=652;SC=CATTTAAAAAGTAACAGTAGG;SOR=3.098;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=28;WE=17464410;WS=17464392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr9	17464479	.	CT	C	63.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=0.000;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=3.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.04;ReadPosRankSum=-0.807;SOR=0.298;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,11:0.18:61
chr9	17579190	rs4961573	C	G	5009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.13;SOR=0.825;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr9	17579198	rs4961574	T	G	5386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.76;SOR=0.876;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr9	17579370	rs3739487	T	C	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=313;ReadPosRankSum=0.761;SC=CGGCGGCAGCTTGGGGAGTTC;SOR=0.882;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=19;WE=17579378;WS=17579360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,20:0.44:45
chr9	17747173	rs3780226	C	A	1686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.089;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=32;PP=841;ReadPosRankSum=1.331;SC=TTGACATAAACATGTCTACCA;SOR=0.908;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=120;TCF=62;TCR=58;TR=65;WE=17747181;WS=17747163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,80:0.55:146
chr9	17747279	rs2031456	G	A	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=246;ReadPosRankSum=1.012;SC=TTTCATGTATGTTTTAAAACA;SOR=0.682;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=18;WE=17747287;WS=17747269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,20:0.54:37
chr9	17761379	rs1886589	C	T	1668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.694;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=23;PP=960;ReadPosRankSum=-0.251;SC=AACCAAAAACCGGTATTCTAA;SOR=0.922;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=153;TCF=97;TCR=56;TR=69;WE=17761387;WS=17761369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,79:0.45:177
chr9	17775367	rs2209429	C	T	897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=23;PP=497;ReadPosRankSum=0.341;SC=AGTGGGAAAACAGAGAAAAAA;SOR=0.622;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=90;TCF=44;TCR=46;TR=45;WE=17775375;WS=17775357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,47:0.49:96
chr9	17781818	rs2224955	C	G	2482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.959;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=57;PP=1683;ReadPosRankSum=-0.194;SC=AAGCCCAGCTCGAGCATCATC;SOR=0.630;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=230;TCF=109;TCR=121;TR=111;WE=17781826;WS=17781808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,117:0.46:254
chr9	17781935	rs2209431	G	C	697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.467;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=392;ReadPosRankSum=-1.953;SC=CTGCCTCACAGCAGTGAGTGA;SOR=0.264;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=22;WE=17781943;WS=17781925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,28:0.64:44
chr9	18657558	rs776776	A	G	970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=5;PP=585;SC=GCACTACCATATACTCTTGTT;SOR=2.448;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=27;WE=18657566;WS=18657548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr9	18661848	rs41268977	T	G	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.615;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=186;ReadPosRankSum=0.568;SC=ATAATTTCCATTGATGTGAGC;SOR=0.368;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=13;WE=18661856;WS=18661838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr9	18680679	rs1412672	C	G	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=109;ReadPosRankSum=0.251;SC=CCAGCATGACCAAAAGTAAAT;SOR=0.332;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=8;WE=18680687;WS=18680669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
chr9	18684836	rs140349388	CTG	C	1860.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.770;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=3.041;NF=1;NR=33;PP=1324;ReadPosRankSum=-0.796;SC=ATATTTGAAACTGTTTTGTTT;SOR=1.082;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=64;TCF=2;TCR=62;TR=34;WE=18684845;WS=18684826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,54:0.51:105
chr9	18717903	rs530120	G	A	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.361;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=135;ReadPosRankSum=-1.655;SC=CAAAGTTGGAGTGTTGGCACT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=7;WE=18717911;WS=18717893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr9	18718114	rs4977339	A	C	2043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=35;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.499;SC=CAGTTGTTCCATTGTCTTGCT;SOR=0.686;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=194;TCF=113;TCR=81;TR=84;WE=18718156;WS=18718104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,93:0.44:212
chr9	18718139	rs532101	C	G	2454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.179;NF=56;NR=45;PP=2962;ReadPosRankSum=0.977;SC=TTTTGACCTTCTTCCTTCCCT;SOR=0.662;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=224;TCF=124;TCR=100;TR=101;WE=18718156;WS=18718104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,113:0.46:246
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chr9	19341045	rs928128	A	G	2470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.463;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=63;PP=1582;ReadPosRankSum=-1.762;SC=AGGATGATGCAGAAATTCATG;SOR=0.737;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=229;TCF=108;TCR=121;TR=116;WE=19341053;WS=19341035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,126:0.51:247
chr9	19347204	rs2666801	T	C	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.297;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=109;ReadPosRankSum=-0.172;SC=GTGGCATGATTTTGGCTGTCT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=6;WE=19347212;WS=19347194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr9	19350926	rs375833706	CT	C	51.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=1.973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.78;ReadPosRankSum=0.977;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,8:0.28:29
chr9	19350980	rs2803125	C	G	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=87;ReadPosRankSum=-1.242;SC=AGGCTGGTCTCGAACTCCTGG;SOR=0.368;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=7;WE=19350988;WS=19350970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr9	19352260	rs10114039	A	T	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-4.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=320;ReadPosRankSum=-0.375;SC=CAGGATTCTAAGATACCCTTG;SOR=1.893;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=16;WE=19352268;WS=19352250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr9	19357230	rs36178701	C	G	672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.058;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.001;NF=4;NR=22;PP=464;ReadPosRankSum=1.360;SC=TAAAGACAACCTGACTCATAT;SOR=1.329;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=50;TCF=10;TCR=40;TR=26;WE=19357238;WS=19357220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,28:0.52:54
chr9	19357276	rs10667709	C	CTTA	445.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=374;SC=TACATCTTAACTTATTACCAC;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=8;WE=19357284;WS=19357266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr9	19360566	rs75572195	GT	AC	610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=1.726;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.54;ReadPosRankSum=0.654;SOR=0.354;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,17:0.40:42
chr9	19360570	rs35304654	C	T	610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=1.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.54;ReadPosRankSum=0.449;SOR=0.354;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,17:0.40:42
chr9	19370108	.	G	T	35	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=35;QD=17.4428031368;SC=AACATCTATTGTTTTAAGTGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=4;WE=19370116;WS=19370098;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr9	19379367	rs957	G	A	3097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FS=1.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.47;ReadPosRankSum=-0.784;SOR=0.807;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:176,151:0.46:327
chr9	19409206	rs11792865	G	C	1447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.626;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=27;PP=740;ReadPosRankSum=-0.177;SC=GGGCGCGGGAGCGGGGAAGGC;SOR=0.722;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=122;TCF=66;TCR=56;TR=60;WE=19409214;WS=19409196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,72:0.52:139
chr9	19435162	rs10964137	T	C	1575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=46;PP=1132;ReadPosRankSum=-0.916;SC=TGCTGTCCTGTAGCAGAAGAG;SOR=0.659;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=160;TCF=52;TCR=108;TR=69;WE=19435170;WS=19435152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,72:0.42:170
chr9	19450728	.	G	C	914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=0.000;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.929;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=26;PP=620;ReadPosRankSum=0.361;SC=AATAGTTGGGGTGTGGGCTAT;SOR=0.295;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=55;TCF=13;TCR=42;TR=36;WE=19450736;WS=19450718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,38:0.66:58
chr9	19550308	rs4977555	A	T	1861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.453;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=41;PP=1091;ReadPosRankSum=-1.945;SC=ACAAAAAAATAAAATGTACAC;SOR=0.549;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=120;TCF=48;TCR=72;TR=71;WE=19550332;WS=19550298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,83:0.61:135
chr9	19573284	rs2148951	G	C	1972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.406;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=27;PP=1289;ReadPosRankSum=1.022;SC=TATAGGGTCTGTGCTGCCACG;SOR=1.018;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=169;TCF=106;TCR=63;TR=82;WE=19573292;WS=19573274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,90:0.49:182
chr9	19573306	rs2148952	G	A	2318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.192;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=40;PP=1343;ReadPosRankSum=1.771;SC=TAGGATATCAGTTAAGAACAA;SOR=0.850;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=223;TCF=129;TCR=94;TR=102;WE=19573314;WS=19573296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,114:0.47:241
chr9	19573483	rs149743267	AACACACACACACACACACACACACAC	A	476.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5051;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=0;NR=4;PP=1977;SC=ATATAATTTAAACACACACAC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=4;WE=19573516;WS=19573473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr9	19576815	rs2247818	C	T	50.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=27;ReadPosRankSum=-0.189;SC=TGTGCTGCAGCGGTGTGTGTG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=3;WE=19576825;WS=19576805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr9	19576816	rs56172301	GGT	G	250.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=7;NR=0;PP=295;SC=GTGCTGCAGCGGTGTGTGTGT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=7;WE=19576825;WS=19576805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr9	19576949	rs2383101	T	G	1516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=22;PP=767;ReadPosRankSum=-0.140;SC=CCATTCTGCCTCTCGTTCTCA;SOR=0.642;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=137;TCF=87;TCR=50;TR=65;WE=19576957;WS=19576939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,77:0.50:154
chr9	20620575	rs2073855	G	A	1431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.458;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=19;PP=928;ReadPosRankSum=2.561;SC=GGCGGGGAGCGGGACAGCGGG;SOR=0.555;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=122;TCF=85;TCR=37;TR=60;WE=20620583;WS=20620565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,66:0.49:136
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chr9	20621901	rs376536186	CGT	C	345.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.06;MQRankSum=2.226;QD=2.30;ReadPosRankSum=-0.108;SOR=0.761;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:127,23:0.15:150
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chr9	20923518	rs7044425	C	G	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=65;ReadPosRankSum=0.084;SC=TGGCCTAACACAACAAACAGA;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=20923526;WS=20923514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
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chr9	20953049	rs3206852	A	G	2674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.466;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=58;PP=1451;ReadPosRankSum=0.958;SC=CTTCTTCATTACAGGAGGAAA;SOR=0.740;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=216;TCF=96;TCR=120;TR=104;WE=20953057;WS=20953039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,125:0.50:249
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chr9	21007935	rs7041474	A	G	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=75;ReadPosRankSum=-0.637;SC=TCCCATGTTTACCAACCTGTA;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=5;WE=21007943;WS=21007925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr9	21026540	rs2275889	G	T	2117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=12;PP=1431;SC=AAGCTTTAAAGAGAAAAAATG;SOR=2.802;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=54;TCR=12;TR=66;WE=21026548;WS=21026530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr9	21026800	rs2275890	G	A	1550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=36;PP=960;SC=GCACTTTGAAGTCAAATGGAG;SOR=2.345;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=13;TCR=36;TR=49;WE=21026808;WS=21026790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr9	21031479	rs10964805	C	T	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.15;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
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chr9	21409036	rs28751295	GA	G	257.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=1.214;NF=11;NR=1;PP=126;ReadPosRankSum=-0.482;SC=AACAGAAGTAGAAAAAAAAAA;SOR=0.709;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=12;WE=21409044;WS=21409026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
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chr9	21816528	rs7023329	A	G	152.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=122;SC=CTGTGAATCTATGCCTGCAGA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=21816536;WS=21816518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr9	21816573	rs7023680	G	A	500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=3;PP=304;SC=TGATTATATTGATAATCAGAT;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=21816581;WS=21816563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
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chr9	21816758	rs7023954	G	A	1995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=37;NR=31;PP=1049;SC=TGTTGATTGCGTCCTCCTTGC;SOR=0.746;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=37;TCR=31;TR=68;WE=21816766;WS=21816748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr9	21818310	rs3928894	C	T	267.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=162;SC=GCCACAGACTCGCTTGCTTTT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=21818318;WS=21818300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
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chr9	21968159	rs3088440	G	A	1027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.794;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=21;PP=604;ReadPosRankSum=2.451;SC=GGGCAGTTGTGGCCCTGTAGG;SOR=0.649;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=46;TCR=36;TR=47;WE=21968167;WS=21968149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,53:0.58:91
chr9	21968199	rs11515	C	G	1983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=38;NR=34;PP=1161;SC=CTAAGTTTCCCGAGGTTTCTC;SOR=0.798;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=39;TCR=35;TR=72;WE=21968207;WS=21968189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr9	21993964	rs2811711	T	C	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=104;ReadPosRankSum=0.045;SC=CCAGGTTCAATGGTACTGCGA;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=7;WE=21993972;WS=21993954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr9	22029547	rs564398	T	C	5976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=108;PP=2917;ReadPosRankSum=-1.211;SC=ACTTTCTTTGTGGTAGTTAGG;SOR=1.038;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=203;TCF=94;TCR=109;TR=201;WE=22029555;WS=22029537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,233:0.99:235
chr9	22447655	rs558612	T	A	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=9;PP=292;ReadPosRankSum=-0.015;SC=TGGGACTGGGTGCCTTGAGAC;SOR=0.773;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=33;TCR=22;TR=22;WE=22447663;WS=22447645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,25:0.39:64
chr9	22452041	rs56665855	GTT	G	234.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.207;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.31;MQRankSum=0.579;QD=14.67;ReadPosRankSum=0.620;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
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chr9	24545957	rs2772578	G	C	1658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=27;PP=905;SC=TCTGTGCAGGGAGATGTCTCA;SOR=1.255;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=23;TCR=27;TR=50;WE=24545965;WS=24545947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr9	25677933	rs35110225	T	C	2199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=48;PP=1089;ReadPosRankSum=0.443;SC=GGACCCGGCGTGCCTCCGCGG;SOR=0.707;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=174;TCF=80;TCR=94;TR=91;WE=25677941;WS=25677923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,104:0.53:196
chr9	25677953	rs34498078	T	C	4470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=73;PP=2445;SC=GGCGTCCCGTTGCCGCCTTCG;SOR=0.892;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=141;TCF=68;TCR=73;TR=141;WE=25677961;WS=25677943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr9	26116016	rs10116592	G	A	2125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=36;PP=1293;ReadPosRankSum=0.649;SC=ATTCCATAATGCTCAGGAGAC;SOR=0.701;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=206;TCF=129;TCR=77;TR=96;WE=26116024;WS=26116006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,106:0.45:234
chr9	26116150	rs7019716	G	T	3249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.291;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=83;PP=2017;ReadPosRankSum=0.149;SC=ATTGCCCAGAGTCAAAGGACA;SOR=0.776;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=297;TCF=131;TCR=166;TR=143;WE=26116158;WS=26116140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,163:0.48:339
chr9	26982270	rs57511456	CT	C	132.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.079;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=17;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=51;ReadPosRankSum=-0.494;SC=AGCTTTTTTTCTTTTTTTTTT;SOR=0.818;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=14;TCF=7;TCR=7;TR=6;WE=26982278;WS=26982260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr9	27028947	rs7390085	A	G	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=150;ReadPosRankSum=-0.266;SC=TGGAAAAGATATCTAACCTCC;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=8;WE=27028955;WS=27028937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr9	27044564	rs72703121	A	T	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.499;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=295;ReadPosRankSum=-0.357;SC=TATTCAAGTTACATGCATATG;SOR=1.877;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=16;WE=27044572;WS=27044554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr9	27044587	rs72703122	G	A	698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=414;ReadPosRankSum=-0.374;SC=TACTTGAAAAGTCTCTATAAG;SOR=0.644;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=60;TCF=43;TCR=17;TR=30;WE=27044595;WS=27044577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,32:0.52:62
chr9	27061142	rs34615635	GGT	G	646.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.438;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.438;NF=0;NR=17;PP=745;ReadPosRankSum=0.477;SC=GTAGTTAAGAGGTGTGTGTGT;SOR=1.161;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=17;WE=27061151;WS=27061132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,24:0.62:39
chr9	27168315	rs10511802	G	A	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=254;ReadPosRankSum=1.796;SC=CAGATTCTTAGAAAGGTACAT;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=13;WE=27168323;WS=27168305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr9	27168425	rs45561035	A	G	1084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.637;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=24;PP=695;ReadPosRankSum=1.482;SC=TCTGAGTCTCAAAGCTCAATT;SOR=0.612;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=124;TCF=71;TCR=53;TR=53;WE=27168433;WS=27168415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,58:0.42:139
chr9	27168704	rs10967753	T	C	32.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.93;ReadPosRankSum=0.431;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr9	27183463	rs682632	A	C	4351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=51;PP=2320;SC=TCAGGCATACAGAGGATGACC;SOR=1.222;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=90;TCR=51;TR=141;WE=27183471;WS=27183453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr9	27192330	rs2252883	G	A	1589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=4;PP=1262;SC=TCCTCATATTGGGAAGGATGA;SOR=4.575;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=47;TCR=4;TR=51;WE=27192338;WS=27192320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr9	27192677	rs55936367	G	A	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.088;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.58;ReadPosRankSum=0.248;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr9	27202870	rs639225	A	G	6092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=129;NR=88;PP=2965;ReadPosRankSum=1.513;SC=CACACTCCTCAGCTGTGATTT;SOR=0.410;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=218;TCF=130;TCR=88;TR=217;WE=27202878;WS=27202860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,238:1.00:239
chr9	27203134	rs638203	A	G	5627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=109;PP=2965;SC=TGAATGGACAAGTATTTACAT;SOR=1.054;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=195;TCF=86;TCR=109;TR=195;WE=27203142;WS=27203124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr9	27205021	rs542913	G	A	3393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=65;NR=43;PP=1775;SC=AATTGAAGAGGGCAAATGTGC;SOR=0.826;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=65;TCR=43;TR=108;WE=27205029;WS=27205011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr9	27205235	rs541065	T	A	163.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=129;SC=GTATGACTTTTTAATTTCTTA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=27205243;WS=27205225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr9	27206825	rs2273722	G	T	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=145;ReadPosRankSum=0.523;SC=AGCATTGCGTGAGGGTGTGGA;SOR=0.430;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=9;WE=27206833;WS=27206815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr9	27217516	rs5897224	CTGTT	C	1334.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=5;PP=975;SC=AGGACTTATACTGTTTGTTTG;SOR=2.303;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=18;WE=27217530;WS=27217506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	27217522	rs5004610	G	A	1344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=5;PP=527;SC=TATACTGTTTGTTTGCATGTT;SOR=2.376;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=24;WE=27217530;WS=27217506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr9	27217791	rs1923331	T	TC	2366.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=39;PP=1742;SC=GGATTTTTTTTCCCTCCCAGA;SOR=1.394;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=48;TCF=2;TCR=46;TR=41;WE=27217799;WS=27217781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr9	27217822	rs681754	G	A	1113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=26;PP=680;SC=TTTGACAGAGGTTTTAAAAAG;SOR=2.191;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=8;TCR=26;TR=34;WE=27217830;WS=27217812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr9	27217851	rs681707	G	C	651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=60;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=17;PP=481;SC=ATGTCCTGTAGCTCTCGGGAA;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=27217859;WS=27217841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	27218726	rs667250	C	T	2632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=22;PP=1560;SC=GGAAAATGAGCGGTGACTCTG;SOR=1.711;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=64;TCR=22;TR=86;WE=27218734;WS=27218716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr9	27296595	rs7044345	C	G	444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=5;PP=325;SC=CATTTCTATTCACTTTAAAGA;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=11;TCR=5;TR=16;WE=27296603;WS=27296585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	27297260	rs7875090	A	T	226.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=8;PP=193;SC=GTTTTTAGTTATTTTTTAAAT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=27297268;WS=27297250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	27330788	rs142161099	A	AT	56.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.21;MQRankSum=2.205;QD=1.38;ReadPosRankSum=0.018;SOR=0.770;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,9:0.22:41
chr9	27524731	rs700785	A	G	7348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=115;NR=135;PP=2965;SC=GGAGGAAGACAAGAATGAAAA;SOR=0.919;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=252;TCF=116;TCR=136;TR=250;WE=27524739;WS=27524721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,272:1.00:272
chr9	27524993	rs116899991	C	T	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.92;ReadPosRankSum=-0.484;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr9	27561465	rs3063748	A	ATGT	1376.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=5;PP=945;SC=CAAATACGTAATGTCCCTAGA;SOR=2.303;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=18;WE=27561473;WS=27561455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	27562352	rs2589050	T	C	1036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=6;PP=774;SC=ACTCATAAAGTGTATAATTGC;SOR=2.649;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=34;WE=27562360;WS=27562342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr9	28863459	rs13285849	A	T	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.345;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=273;ReadPosRankSum=-1.574;SC=TGTTTGACACAGGTTTGATCA;SOR=1.106;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=17;WE=28863467;WS=28863449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr9	28889060	rs7043805	C	G	544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=11;PP=323;SC=CAGCAGCTTGCCTGGTGCTTG;SOR=1.402;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=7;TCR=11;TR=18;WE=28889068;WS=28889050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	32384825	rs882812	G	A	1181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=29;PP=609;ReadPosRankSum=0.825;SC=TTACCGAGGTGCCCGAGGCAG;SOR=0.713;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=106;TCF=51;TCR=55;TR=54;WE=32384833;WS=32384815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,59:0.51:115
chr9	32384843	rs913762	A	C	3241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=35;NR=43;PP=1357;SC=CAGTGGCGGCACGGGGGACAC;SOR=1.191;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=35;TCR=43;TR=78;WE=32384851;WS=32384833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr9	32405639	rs41298178	T	G	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=376;ReadPosRankSum=0.354;SC=GAATCTCATTTGCACAATGAT;SOR=0.782;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=53;TCF=10;TCR=43;TR=23;WE=32405647;WS=32405629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,24:0.43:56
chr9	32407466	rs56127964	A	G	1070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.724;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=32;PP=689;ReadPosRankSum=-1.939;SC=TGCCTCCCTCATTAGCCTTTC;SOR=1.073;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=95;TCF=31;TCR=64;TR=44;WE=32407474;WS=32407456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,51:0.45:114
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chr9	32427592	rs72561746	C	G	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.106;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=6.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=18.49;ReadPosRankSum=-1.557;SOR=0.047;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
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chr9	32525969	rs2777729	C	A	1814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.406;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=26;PP=1005;ReadPosRankSum=-1.379;SC=CTGGCAGGCTCTCTGCATTGA;SOR=0.539;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=125;TCF=84;TCR=41;TR=74;WE=32525977;WS=32525959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,84:0.60:141
chr9	32526233	rs3739674	G	C	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.373;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=47;ReadPosRankSum=-1.501;SC=AGCCGGGTAGGAGGAGGGCGT;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=4;WE=32526241;WS=32526223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr9	32542204	rs10971019	A	G	3554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.610;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=75;PP=2241;ReadPosRankSum=-1.430;SC=ATCTGTTACTAGACAGGCTCC;SOR=0.483;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=277;TCF=131;TCR=146;TR=152;WE=32542212;WS=32542194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,163:0.56:293
chr9	32630472	rs10758145	T	C	2639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.001;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=58;PP=1697;ReadPosRankSum=1.166;SC=GGCACATCTGTTTTTCTGGAG;SOR=0.786;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=210;TCF=96;TCR=114;TR=105;WE=32630480;WS=32630462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,117:0.49:237
chr9	32631369	rs10971047	C	T	2738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=61;PP=1667;ReadPosRankSum=0.534;SC=TGGATGACAGCGTCACCATAG;SOR=0.695;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=265;TCF=135;TCR=130;TR=123;WE=32631377;WS=32631359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,135:0.47:290
chr9	32632532	rs35905429	G	A	3081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=350;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.305;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.564;NF=59;NR=81;PP=2042;ReadPosRankSum=-1.163;SC=AGGGAAAGGCGACGAAGGTCT;SOR=0.829;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=316;TCF=142;TCR=174;TR=140;WE=32632540;WS=32632522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:198,152:0.43:350
chr9	32974372	rs4878522	C	T	1632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=36;NR=21;PP=899;SC=TGAGGTCAGACTGTTATTCAG;SOR=1.010;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=36;TCR=21;TR=57;WE=32974380;WS=32974362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr9	32974570	rs34600530	G	GA	716.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.71;SOR=1.942;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr9	33116238	rs34433922	AT	A	358.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.92;SOR=4.047;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr9	33264540	rs1071545	C	G	1367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=31;PP=958;SC=GGTGGACGCCCAGAGGGAGGC;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=14;TCR=31;TR=45;WE=33264548;WS=33264530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr9	33270479	rs844239	A	G	323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=255;SC=GTTTTTGCCAATTTTTCTGCG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=33270487;WS=33270469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr9	33270748	rs831271	G	T	2181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=31;NR=41;PP=1255;SC=GTTATTTCATGTATTTATTCT;SOR=1.264;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=31;TCR=41;TR=72;WE=33270756;WS=33270738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr9	33290532	rs830576	A	G	10508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=388;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=199;NR=162;PP=2965;SC=GACAGTGCTGACTTGGCTGTA;SOR=0.902;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=361;TCF=199;TCR=162;TR=361;WE=33290540;WS=33290522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,387:1.00:387
chr9	33290688	rs4879682	G	C	5385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=104;PP=2965;SC=CTCATATCGCGAGAGTAGCAC;SOR=1.239;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=179;TCF=75;TCR=104;TR=179;WE=33290696;WS=33290678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr9	33344252	rs642157	T	A	1060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=29;PP=812;SC=CCTGCTGTGTTACTGTCTTCA;SOR=2.712;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=36;WE=33344260;WS=33344242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr9	33354070	rs145934546	TTTTTA	T	2105.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.375;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.718;NF=16;NR=19;PP=1545;ReadPosRankSum=0.558;SC=TTCCCTTTCTTTTTTATATTT;SOR=0.851;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=86;TCF=35;TCR=51;TR=35;WE=33354082;WS=33354060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,58:0.41:142
chr9	33385863	.	G	T	65	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000;HP=3;HapScore=3;MGOF=12;MMLQ=28;MQ=54.57;NF=2;NR=3;PP=65;QD=19.9542425094;SC=GGTCAGCCACGCCTGAGGAGC;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=5;WE=33385871;WS=33385842;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:18,5:0.22:23
chr9	33386144	.	G	A	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.806;ClippingRankSum=0.000;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=23.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.91;MQRankSum=-9.399;QD=3.90;ReadPosRankSum=-1.449;SOR=4.382;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,14:0.14:98
chr9	33386146	rs76608797	C	A	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=29.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.07;MQRankSum=-8.737;QD=3.60;ReadPosRankSum=-2.025;SOR=4.756;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,17:0.16:106
chr9	33386167	rs79172651	G	C	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=19.372;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-7.572;NF=33;NR=14;PP=731;ReadPosRankSum=-2.915;SC=ACCATCAGCTGTCCACCCGAA;SOR=2.244;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=161;TCF=101;TCR=60;TR=47;WE=33386175;WS=33386157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,38:0.23:162
chr9	33386211	rs80148578	G	A	2137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.014;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-6.413;NF=59;NR=47;PP=1340;ReadPosRankSum=0.882;SC=GACACAGACTGTCATGCGAAC;SOR=0.990;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=264;TCF=143;TCR=121;TR=106;WE=33386219;WS=33386201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,102:0.38:270
chr9	33386226	rs78244036	T	C	2269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.678;HP=4;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.981;NF=58;NR=56;PP=1549;ReadPosRankSum=2.928;SC=GCGAACCTGCTCCCAACTAAG;SOR=0.807;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=269;TCF=137;TCR=132;TR=114;WE=33386234;WS=33386216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,109:0.40:273
chr9	33386243	rs76705820	C	T	2044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.756;HP=4;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-4.054;NF=56;NR=59;PP=1404;ReadPosRankSum=3.169;SC=TAAGCCCCACCGGGGTCCCAG;SOR=0.566;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=257;TCF=122;TCR=135;TR=115;WE=33386251;WS=33386233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,111:0.43:259
chr9	33386284	rs73478964	T	G	1751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.905;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.569;NF=33;NR=49;PP=1220;ReadPosRankSum=-0.665;SC=GGGTGGGGGATCTCCAAGGCT;SOR=0.882;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=176;TCF=73;TCR=103;TR=82;WE=33386292;WS=33386274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,84:0.48:176
chr9	33386378	rs74462413	C	T	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=9.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.59;MQRankSum=-2.147;QD=1.83;ReadPosRankSum=0.345;SOR=2.562;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,7:0.13:53
chr9	33386387	rs77429065	G	A	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=3.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.67;MQRankSum=-3.968;QD=0.92;ReadPosRankSum=-0.346;SOR=1.256;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,6:0.11:56
chr9	33386393	rs77837642	G	C	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=3.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.85;MQRankSum=-4.116;QD=0.60;ReadPosRankSum=-0.446;SOR=1.240;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,6:0.09:66
chr9	33386395	rs2484931	T	C	2029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=26;PP=2962;SC=CCGGGCAGGATACTCACTGTA;SOR=0.849;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=37;TCR=26;TR=62;WE=33386408;WS=33386368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr9	33386510	rs77962308	CA	TG	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FS=2.836;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQRankSum=-8.302;QD=4.40;ReadPosRankSum=0.886;SOR=1.000;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:128,26:0.17:154
chr9	33386526	rs79202054	G	A	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.767;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-6.913;NF=19;NR=21;PP=412;ReadPosRankSum=3.307;SC=TCACAGCTGCGTTCATGTGGG;SOR=0.717;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=136;TCF=65;TCR=71;TR=40;WE=33386534;WS=33386516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,28:0.21:134
chr9	33395031	rs72707429	G	A	1175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=5.347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQRankSum=-4.000;QD=10.59;ReadPosRankSum=3.623;SOR=1.431;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,35:0.32:111
chr9	33395039	rs72707431	C	T	1157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=8.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-3.904;QD=9.90;ReadPosRankSum=4.111;SOR=1.738;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,34:0.29:117
chr9	33395196	rs642636	A	G	4199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=85;PP=2705;SC=GGGTGGACCTAAGACAGTGGC;SOR=1.216;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=144;TCF=59;TCR=85;TR=144;WE=33395204;WS=33395186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr9	33441826	rs16919255	C	A	1681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.812;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.805;NF=50;NR=28;PP=1090;ReadPosRankSum=0.304;SC=ACCCAAATTCCGGTTCCACCC;SOR=1.022;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=144;TCF=88;TCR=56;TR=78;WE=33441834;WS=33441816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,80:0.52:154
chr9	33442952	rs2228332	G	A	3779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=84;PP=2439;SC=GGTTGTCGGCGAAGTGCCAGA;SOR=1.851;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=120;TCF=36;TCR=84;TR=120;WE=33442960;WS=33442942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr9	33442986	rs2231231	A	C	1707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=40;PP=1186;SC=CAGATTAGACACACAGTGAGT;SOR=2.917;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=10;TCR=40;TR=50;WE=33442994;WS=33442976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr9	33444000	rs2227285	G	C	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=12;PP=324;SC=AGGACTAGAGGCGCTTCCTGG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=33444008;WS=33443990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	33447306	rs517210	C	G	2411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=31;PP=1441;SC=GTGGGGGTCACAGCTGGGGAG;SOR=1.141;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=48;TCR=31;TR=79;WE=33447314;WS=33447296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr9	33447424	rs591810	C	G	5026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=102;NR=68;PP=2788;SC=CACTCACCACCAGGATGAGGG;SOR=0.826;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=170;TCF=102;TCR=68;TR=170;WE=33447432;WS=33447414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr9	33462312	.	G	A	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.260;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=69;ReadPosRankSum=0.303;SC=CCCCTTCTCTGTTTCTGGAAG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=33462320;WS=33462302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr9	33465182	rs2785210	G	A	3047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=76;NR=31;PP=1963;SC=CTTCTCAGCTGGGGAAAAAGT;SOR=1.761;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=108;TCF=76;TCR=32;TR=107;WE=33465190;WS=33465172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr9	33465651	rs560833	T	C	915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=10;PP=590;SC=ATCTGGCCCCTGGAGAGACAG;SOR=1.542;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=23;TCR=10;TR=33;WE=33465659;WS=33465641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr9	33466034	rs183048929	T	A	964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.564;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=25;PP=592;ReadPosRankSum=0.245;SC=GGTGCCCCCCTTCCCTGGGGA;SOR=1.007;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=96;TCF=48;TCR=48;TR=47;WE=33466042;WS=33466024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,49:0.48:103
chr9	33467226	rs145177147	G	A	2966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.952;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=59;PP=1846;ReadPosRankSum=0.069;SC=CCGAAGCTCCGAGCGGGATCC;SOR=0.608;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=239;TCF=132;TCR=107;TR=130;WE=33467234;WS=33467216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,138:0.53:259
chr9	33467577	rs2275228	T	C	3274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=47;PP=2183;SC=AGAAACCTACTTTCTAGCTAG;SOR=0.820;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=103;TCF=55;TCR=48;TR=102;WE=33467585;WS=33467567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr9	33467983	rs679644	G	A	2244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=27;PP=1487;SC=CTGTAGCCCCGAAGAGACAGG;SOR=1.367;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=49;TCR=27;TR=76;WE=33467991;WS=33467973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr9	33469406	rs2777746	C	T	2816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=44;PP=2206;ReadPosRankSum=0.395;SC=CCCATCCTGTCCCCCCATACT;SOR=1.056;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=65;TCR=45;TR=108;WE=33469414;WS=33469395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,107:0.98:109
chr9	33473893	rs2777744	T	G	5169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=85;NR=88;PP=2842;SC=GGTCTATACCTCATAGCTTCC;SOR=0.914;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=173;TCF=85;TCR=88;TR=173;WE=33473901;WS=33473883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr9	33524684	rs3843933	G	A	1954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=34;PP=1115;SC=GTCCGCGACAGAAAAGACAGG;SOR=1.195;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=27;TCR=34;TR=61;WE=33524692;WS=33524674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr9	33524725	rs3843934	G	T	1395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=20;PP=665;SC=GTGGGAGGGGGCCCCCAGGCC;SOR=1.136;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=21;TCR=20;TR=41;WE=33524733;WS=33524715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr9	33573160	rs1807130	C	T	487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=4;PP=352;SC=ATTTTCTCTGCGGCAACCCTA;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=18;WE=33573168;WS=33573150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	33573212	rs12378940	G	A	1570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=22;PP=955;SC=GAGCCACCGAGGAAGCACAGG;SOR=1.071;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=33;TCR=22;TR=55;WE=33573220;WS=33573202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr9	33573377	rs597219	T	C	245.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=7;PP=151;SC=GATTAGTCTCTCTGCAGCCTC;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=33573385;WS=33573367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr9	33617691	rs147881110	TGGATGTAACACG	T	863.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=2630;SC=GGCAGAGAGATGGATGTAACA;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=9;WE=33617710;WS=33617681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	33618028	rs855511	A	G	1705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=39;PP=1116;SC=GAGAGCCGCCAGTCAGAGGAG;SOR=1.467;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=22;TCR=39;TR=61;WE=33618036;WS=33618018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr9	33618358	rs855512	A	G	8376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=157;NR=133;PP=2965;SC=GCTGATGGCAACTTCCAATGA;SOR=0.812;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=290;TCF=157;TCR=133;TR=290;WE=33618366;WS=33618348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,318:1.00:318
chr9	33618460	rs966447	A	T	3037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=61;PP=1903;SC=GACAGTGACCAGTGCCCATCC;SOR=1.632;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=34;TCR=61;TR=95;WE=33618468;WS=33618450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr9	33618497	rs2380835	G	A	1593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=39;PP=1104;SC=TACATCTGCAGTGCTAGAGAC;SOR=2.107;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=15;TCR=39;TR=54;WE=33618505;WS=33618487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr9	33625185	rs36079164	C	T	10160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=373;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=167;NR=176;PP=2965;SC=AAAATTAGGTCTGAATTCAAG;SOR=0.776;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=345;TCF=168;TCR=177;TR=343;WE=33625193;WS=33625175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,373:1.00:373
chr9	33750453	rs113217588	A	ACACAG	178.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=1.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.952;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=1;PP=67;ReadPosRankSum=1.127;SC=CTCCTGAAGCACACAGCCTAG;SOR=1.329;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=2;WE=33750461;WS=33750443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr9	33750748	rs10971678	G	T	450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.962;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=9;PP=273;ReadPosRankSum=0.423;SC=TACCCGCAGGGGGCTTGAAAC;SOR=0.835;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=60;TCF=37;TCR=23;TR=25;WE=33750756;WS=33750738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,26:0.41:64
chr9	33794797	.	TGA	T	460.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.954;ClippingRankSum=0.000;DP=318;ExcessHet=3.0103;FS=19.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQRankSum=-7.791;QD=1.53;ReadPosRankSum=-2.573;SOR=2.002;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:271,30:0.10:301
chr9	33794809	rs201061108	G	A	1425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FS=36.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQRankSum=-14.669;QD=4.56;ReadPosRankSum=0.403;SOR=2.193;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:261,52:0.17:313
chr9	33794812	rs199873220	G	T	1409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FS=33.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQRankSum=-14.364;QD=4.49;ReadPosRankSum=1.267;SOR=2.117;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:260,54:0.17:314
chr9	33794877	.	C	T	823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.523;ClippingRankSum=0.000;DP=256;ExcessHet=3.0103;FS=0.658;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.42;MQRankSum=-11.574;QD=3.22;ReadPosRankSum=2.119;SOR=0.704;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:219,37:0.14:256
chr9	33794890	.	T	A	873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.001;ClippingRankSum=0.000;DP=224;ExcessHet=3.0103;FS=1.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.47;MQRankSum=-11.292;QD=3.90;ReadPosRankSum=2.276;SOR=0.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:189,35:0.16:224
chr9	33794894	.	T	C	876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.839;ClippingRankSum=0.000;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.696;HP=4;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-11.509;NF=28;NR=46;PP=1235;ReadPosRankSum=2.233;SC=CTAACCTGTGTCCCCTCCTTC;SOR=0.828;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=215;TCF=87;TCR=128;TR=74;WE=33794920;WS=33794867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,34:0.16:219
chr9	33794923	.	CTT	C	509.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.925;ClippingRankSum=0.000;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=3.564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQRankSum=-10.153;QD=4.55;ReadPosRankSum=-0.182;SOR=1.189;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,20:0.18:112
chr9	33794927	.	T	C	518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.134;ClippingRankSum=0.000;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=2.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.03;MQRankSum=-10.058;QD=4.72;ReadPosRankSum=-0.198;SOR=1.106;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,20:0.18:110
chr9	33795579	.	C	T	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.718;ClippingRankSum=0.000;DP=222;ExcessHet=3.0103;FS=29.205;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQRankSum=-13.977;QD=1.22;ReadPosRankSum=-3.466;SOR=3.554;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:203,19:0.09:222
chr9	33795581	.	T	C	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.137;ClippingRankSum=0.000;DP=223;ExcessHet=3.0103;FS=36.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQRankSum=-14.115;QD=1.53;ReadPosRankSum=-3.709;SOR=3.816;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:201,22:0.10:223
chr9	33795583	.	C	T	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.883;ClippingRankSum=0.000;DP=223;ExcessHet=3.0103;FS=39.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQRankSum=-14.168;QD=2.35;ReadPosRankSum=-3.628;SOR=3.954;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:199,24:0.11:223
chr9	33795593	rs201140357	G	A	1333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FS=12.277;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.90;MQRankSum=-14.832;QD=5.63;ReadPosRankSum=-3.588;SOR=1.606;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:195,42:0.18:237
chr9	33795601	.	G	T	1718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.490;ClippingRankSum=0.000;DP=238;ExcessHet=3.0103;FS=9.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.51;MQRankSum=-14.877;QD=7.22;ReadPosRankSum=-3.137;SOR=1.316;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:184,54:0.23:238
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chr9	33795613	.	C	T	2731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.304;ClippingRankSum=0.000;DP=253;ExcessHet=3.0103;FS=7.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.93;MQRankSum=-15.297;QD=10.80;ReadPosRankSum=-1.540;SOR=1.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:180,73:0.29:253
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chr9	33795638	.	C	T	3385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.207;ClippingRankSum=0.000;DP=270;ExcessHet=3.0103;FS=5.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.57;MQRankSum=-15.222;QD=12.54;ReadPosRankSum=3.168;SOR=0.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:177,93:0.34:270
chr9	33795640	.	ACCC	A	3400.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.888;ClippingRankSum=0.000;DP=269;ExcessHet=3.0103;FS=6.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.54;MQRankSum=-15.183;QD=12.64;ReadPosRankSum=3.115;SOR=0.904;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:175,94:0.35:269
chr9	33795646	.	C	CAA	3592.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.840;ClippingRankSum=0.000;DP=264;ExcessHet=3.0103;FS=6.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.43;MQRankSum=-15.008;QD=13.61;ReadPosRankSum=3.229;SOR=0.870;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:169,95:0.36:264
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chr9	33795703	rs370216620	C	T	2767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.92;MQRankSum=-12.320;QD=14.72;ReadPosRankSum=-2.313;SOR=0.486;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,78:0.41:188
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chr9	33795731	.	A	G	1390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.809;ClippingRankSum=0.000;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=3.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.63;MQRankSum=-9.940;QD=13.12;ReadPosRankSum=-1.820;SOR=0.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,37:0.35:106
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chr9	33795739	.	C	T	994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=0.000;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=4.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.04;MQRankSum=-8.979;QD=11.70;ReadPosRankSum=-0.405;SOR=1.338;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,25:0.29:85
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chr9	33796802	.	TAAGTG	T	1118.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.113;ClippingRankSum=0.000;DP=286;ExcessHet=3.0103;FS=9.848;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.67;MQRankSum=-6.952;QD=4.01;ReadPosRankSum=-4.485;SOR=1.373;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:233,46:0.16:279
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chr9	33796827	rs375097863	G	A	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.61;MQRankSum=-9.108;QD=3.17;ReadPosRankSum=2.718;SOR=0.671;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:159,49:0.24:208
chr9	33796858	rs369633136	C	A	679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-3.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.950;HP=2;HapScore=1;MGOF=43;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-8.050;NF=13;NR=33;PP=717;ReadPosRankSum=3.533;SC=GAGAGCTTGGCTTCAGCCCAG;SOR=0.513;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=121;TCF=27;TCR=94;TR=46;WE=33796866;WS=33796848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,36:0.32:113
chr9	33796889	.	A	G	916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.237;ClippingRankSum=0.000;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.73;MQRankSum=-5.554;QD=13.48;ReadPosRankSum=0.419;SOR=0.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,27:0.40:68
chr9	33796896	.	T	C	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.999;ClippingRankSum=0.000;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=1.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.91;MQRankSum=-4.730;QD=14.82;ReadPosRankSum=-0.237;SOR=1.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,23:0.40:58
chr9	33796898	.	G	A	831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=0.000;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=2.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.96;MQRankSum=-4.917;QD=15.40;ReadPosRankSum=-1.251;SOR=1.257;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,23:0.43:54
chr9	33796904	.	G	A	730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.957;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=5.994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.70;MQRankSum=-4.091;QD=16.24;ReadPosRankSum=-2.209;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,19:0.42:45
chr9	33797861	rs151192741	A	G	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FS=22.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.05;MQRankSum=-13.798;QD=0.21;ReadPosRankSum=0.344;SOR=3.476;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:170,22:0.11:192
chr9	33797881	rs372122039	G	A	1458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FS=13.409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.87;MQRankSum=-17.572;QD=4.54;ReadPosRankSum=-6.733;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:253,68:0.21:321
chr9	33797917	.	T	C	6063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=4.922;ClippingRankSum=0.000;DP=540;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.605;HP=3;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-19.474;NF=109;NR=66;PP=2962;ReadPosRankSum=-4.248;SC=TCCGCCACCCTAAATACAACA;SOR=1.216;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=524;TCF=298;TCR=226;TR=175;WE=33797939;WS=33797907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:367,171:0.32:538
chr9	33797928	.	G	GCC	7540.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=2.973;ClippingRankSum=0.000;DP=598;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.357;HP=2;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-20.718;NF=41;NR=67;PP=2971;ReadPosRankSum=-0.738;SC=AAATACAACAGGGACACTCTG;SOR=1.114;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=341;TCF=99;TCR=242;TR=108;WE=33797939;WS=33797907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:394,202:0.34:596
chr9	33797930	.	GAC	G	8283.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.023;ClippingRankSum=0.000;DP=620;ExcessHet=3.0103;FS=6.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.41;MQRankSum=-20.960;QD=13.40;ReadPosRankSum=1.399;SOR=1.115;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:410,208:0.34:618
chr9	33797951	rs150316320	A	C	10077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=2.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=687;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.072;HP=1;HapScore=1;MGOF=53;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-21.760;NF=151;NR=116;PP=2962;ReadPosRankSum=3.638;SC=CAATGACATCATGCTGATCAA;SOR=0.999;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=663;TCF=350;TCR=313;TR=267;WE=33797970;WS=33797941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:417,268:0.39:685
chr9	33797962	rs374178684	A	G	10866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=696;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.072;HP=2;HapScore=1;MGOF=53;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-21.622;NF=154;NR=130;PP=2962;ReadPosRankSum=4.366;SC=TGCTGATCAAACTCTCCTCAC;SOR=0.849;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=669;TCF=340;TCR=329;TR=284;WE=33797970;WS=33797941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:407,287:0.41:694
chr9	33797987	rs137945391	G	T	10894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-2.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=646;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.748;HP=3;HapScore=1;MGOF=70;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-17.637;NF=132;NR=143;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.240;SC=CGTCATCAATGCCCGCGTGTC;SOR=0.566;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=622;TCF=295;TCR=327;TR=275;WE=33798007;WS=33797977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:364,280:0.43:644
chr9	33797999	rs142141488	A	G	10205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-2.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=576;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.527;HP=4;HapScore=1;MGOF=70;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-15.880;NF=110;NR=140;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.993;SC=CCGCGTGTCCACCATCTCTCT;SOR=0.631;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=558;TCF=250;TCR=308;TR=250;WE=33798007;WS=33797977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:319,255:0.44:574
chr9	33798016	.	C	T	7471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.153;ClippingRankSum=0.000;DP=447;ExcessHet=3.0103;FS=3.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.46;MQRankSum=-14.316;QD=16.83;ReadPosRankSum=-0.516;SOR=0.963;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:257,187:0.42:444
chr9	33798016	.	CA	TG	2709	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=67;MMLQ=27;MQ=52.24;NF=63;NR=113;PP=2709;QD=20;SC=CTCTGCCCACCACCCCTCCAG;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=430;TCF=173;TCR=257;TR=176;WE=33798025;WS=33798006;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:254,176:0.41:430
chr9	33798017	rs855581	A	G	13571.85	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=436;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.599;HP=6;HapScore=2;MGOF=72;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=3.505;NF=148;NR=237;PP=2962;ReadPosRankSum=-5.098;SC=TCTGCCCACCACCCCTCCAGC;SOR=1.182;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=421;TCF=169;TCR=252;TR=385;WE=33798025;WS=33798006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,404:0.93:434
chr9	33798037	.	T	C	5410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.243;ClippingRankSum=0.000;DP=333;ExcessHet=3.0103;FS=18.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.83;MQRankSum=-12.676;QD=16.30;ReadPosRankSum=0.689;SOR=1.451;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:193,139:0.42:332
chr9	33798042	rs141382822	G	C	4699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FS=13.295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.18;MQRankSum=-11.540;QD=15.56;ReadPosRankSum=2.037;SOR=1.315;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:181,121:0.40:302
chr9	33798052	rs377380263	C	T	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FS=14.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.59;MQRankSum=-3.503;QD=0.46;ReadPosRankSum=1.212;SOR=0.171;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:219,33:0.13:252
chr9	33798073	.	C	T	3491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.609;ClippingRankSum=0.000;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.41;MQRankSum=-8.176;QD=22.24;ReadPosRankSum=-0.124;SOR=0.741;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,89:0.57:157
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chr9	33798075	.	T	C	3448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.596;ClippingRankSum=0.000;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=0.861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.43;MQRankSum=-7.761;QD=23.30;ReadPosRankSum=-0.453;SOR=0.816;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,84:0.57:148
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chr9	33944596	rs141125550	A	G	1809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.555;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=33;PP=997;ReadPosRankSum=-0.934;SC=CGCTGGCTCAACTGGCTAAGA;SOR=0.612;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=160;TCF=83;TCR=77;TR=75;WE=33944604;WS=33944586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,84:0.48:176
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chr9	33960778	.	CA	C	119.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=0.000;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=9.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.35;ReadPosRankSum=0.228;SOR=0.324;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,17:0.33:51
chr9	33969352	rs307675	T	C	1780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=32;PP=1005;ReadPosRankSum=-0.667;SC=TAAGACCAGCTTCCACAACAA;SOR=0.720;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=198;TCF=114;TCR=84;TR=82;WE=33969360;WS=33969342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,94:0.42:224
chr9	33971740	rs3739690	A	G	2698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.466;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=70;PP=1642;ReadPosRankSum=-1.490;SC=AATAGTCTGCAGGATTAAATG;SOR=0.813;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=243;TCF=95;TCR=148;TR=113;WE=33971748;WS=33971730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,131:0.47:280
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chr9	34011835	rs7029122	C	T	686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=20;PP=522;SC=GGATCTCTTACCCATTCATAT;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=34011843;WS=34011825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
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chr9	34089395	rs2296897	T	C	2031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.221;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=20;PP=1212;ReadPosRankSum=-0.784;SC=TCATCTCAGGTAGGGGCTTAC;SOR=1.121;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=64;TCF=44;TCR=20;TR=63;WE=34089403;WS=34089385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,73:0.99:74
chr9	34093274	rs16935392	G	C	662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=379;ReadPosRankSum=-0.621;SC=GTGCACACAGGGACTCTTACC;SOR=0.693;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=54;TCF=42;TCR=12;TR=27;WE=34093282;WS=34093264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,30:0.50:60
chr9	34096597	rs7857551	G	A	518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=0;PP=431;SC=GCGAGACTCTGCCTCAAAAAT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=34096605;WS=34096587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
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chr9	34106410	rs10971917	C	T	2130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.484;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=46;PP=1165;ReadPosRankSum=-2.324;SC=ATCAAAAGCTCCCTATAAAAG;SOR=0.629;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=203;TCF=110;TCR=93;TR=97;WE=34106418;WS=34106400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,110:0.48:228
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chr9	34220855	rs41313794	G	A	1882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.591;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.868;NF=39;NR=38;PP=1004;ReadPosRankSum=-1.648;SC=AATTTTCTTCGTACTACCTTC;SOR=0.778;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=139;TCF=71;TCR=68;TR=77;WE=34220863;WS=34220845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,89:0.56:158
chr9	34242192	rs10972015	C	T	1056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.844;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=32;PP=791;ReadPosRankSum=-1.026;SC=TGATTTTTTTCGAGACAGGGT;SOR=0.440;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=92;TCF=32;TCR=60;TR=51;WE=34242200;WS=34242181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,52:0.54:96
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chr9	34257095	rs41274041	G	A	1251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=31;PP=855;ReadPosRankSum=1.256;SC=CCTCTGACTAGAGATGTGTGA;SOR=0.664;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=183;TCF=98;TCR=85;TR=65;WE=34257103;WS=34257085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,68:0.34:200
chr9	34269386	rs141274403	ACTT	A	4119.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.261;NF=2;NR=60;PP=2493;ReadPosRankSum=-2.885;SC=AGCAGGAGTGACTTCTGTGAA;SOR=0.654;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=132;TCF=3;TCR=129;TR=62;WE=34269396;WS=34269376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,109:0.50:218
chr9	34272085	rs72731297	T	C	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.57;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.979;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=60;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CACTAAATTATACCTAGTTAG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=34272093;WS=34272075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr9	34286486	rs6476442	G	T	509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=1;PP=366;SC=TTTACAGATGGGAAGTGGTGG;SOR=3.500;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=34286494;WS=34286476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	34310927	rs10972048	T	C	9795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=366;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=166;NR=163;PP=2965;SC=TCTGGTAGCATGTGTTCTAGC;SOR=0.710;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=329;TCF=166;TCR=163;TR=329;WE=34310935;WS=34310917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,365:1.00:365
chr9	34370701	rs58832809	TG	T	1422.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=5;PP=1205;SC=GGTATAGAGGTGGGAGGTTCC;SOR=3.312;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=30;WE=34370709;WS=34370691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr9	34372783	rs4879781	G	C	5751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=104;NR=86;PP=2965;SC=GCGGCTTCAGGTCTTTGGAAG;SOR=0.732;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=190;TCF=104;TCR=86;TR=190;WE=34372791;WS=34372773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr9	34372873	rs4879782	C	G	4272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=73;PP=2611;SC=GGTTCTGACGCTATGCGTAGC;SOR=0.732;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=144;TCF=71;TCR=73;TR=144;WE=34372881;WS=34372863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr9	34372931	rs2297776	T	A	866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.685;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=23;PP=480;ReadPosRankSum=0.437;SC=CTCCTGAGGGTTCTGGAGCAT;SOR=0.620;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=111;TCF=50;TCR=61;TR=42;WE=34372939;WS=34372921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,47:0.38:124
chr9	34373041	rs10972084	C	T	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.993;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=118;ReadPosRankSum=0.664;SC=TGAGCTATCTCATCCCATGAT;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=7;WE=34373049;WS=34373031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr9	34379692	rs3737242	C	T	3352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=376;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.694;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=73;PP=1621;ReadPosRankSum=-0.400;SC=TGTAACAGCACACTGCATTCC;SOR=0.592;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=331;TCF=155;TCR=176;TR=145;WE=34379700;WS=34379682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:204,171:0.46:375
chr9	34382726	rs3808876	A	G	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-2.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.632;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=8;PP=318;ReadPosRankSum=0.311;SC=CAGTCCCCAGACGTCTGTGCT;SOR=0.339;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=63;TCF=47;TCR=16;TR=28;WE=34382734;WS=34382716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,35:0.46:76
chr9	34402173	rs10738926	A	G	876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=8;PP=617;SC=ACAGCAGACAACGCAGGCCCC;SOR=1.839;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=29;WE=34402181;WS=34402163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr9	34402663	rs41274849	C	T	1204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=18;PP=737;ReadPosRankSum=0.317;SC=GAAATAGGTCCTGGCTGGCAG;SOR=0.682;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=66;TCR=36;TR=50;WE=34402671;WS=34402653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,57:0.49:117
chr9	34407041	rs12376650	C	T	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.571;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=260;ReadPosRankSum=-1.375;SC=CCTCATGATCCGCCTGCCTCA;SOR=0.334;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=18;WE=34407049;WS=34407031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,21:0.51:41
chr9	34407204	rs10119711	T	C	3506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=68;PP=1904;SC=CCTGAGACTCTGAGGACCAAA;SOR=0.990;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=58;TCR=68;TR=126;WE=34407212;WS=34407194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr9	34407331	rs10972095	G	A	1652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=17;PP=1348;SC=TTTGGTTGGAGAAAAGGTTCT;SOR=1.654;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=36;TCR=17;TR=53;WE=34407339;WS=34407321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr9	34407423	rs10116555	C	T	2379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-2.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-6.221;NF=66;NR=48;PP=1433;ReadPosRankSum=-1.859;SC=GTAGAGAAAACAGTATAGTGA;SOR=0.677;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=237;TCF=138;TCR=99;TR=114;WE=34407431;WS=34407413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,122:0.47:257
chr9	34407572	rs7847950	G	C	2131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-0.443;NF=17;NR=58;PP=1389;ReadPosRankSum=-0.986;SC=AAAGCATGCAGGGAGGGACAT;SOR=1.225;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=76;TCF=17;TCR=59;TR=75;WE=34407580;WS=34407562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,80:0.99:81
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chr9	34487782	rs4878572	C	T	295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=231;SC=TACCCAACCTCCCAATAGCCT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=34487790;WS=34487772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
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chr9	34614681	rs12352811	G	C	2250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.990;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=43;PP=1522;ReadPosRankSum=2.119;SC=CTCCATCTTCGCTTCTAGTCA;SOR=0.766;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=229;TCF=136;TCR=93;TR=106;WE=34614689;WS=34614671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,115:0.47:244
chr9	34622389	rs3808869	A	C	2202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=15;PP=1644;SC=GGGGGCATGCAAGGTCGAGGT;SOR=2.712;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=56;TCR=15;TR=71;WE=34622397;WS=34622379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr9	34623338	rs10972173	A	G	4756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=96;NR=54;PP=2673;SC=CCAGACCTCAATCCTCACATT;SOR=1.218;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=96;TCR=54;TR=150;WE=34623346;WS=34623328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr9	34624175	rs10972174	C	T	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.684;NF=4;NR=8;PP=163;ReadPosRankSum=-0.746;SC=CCCACAGAACCCCAGGGTCTC;SOR=0.636;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=12;WE=34624183;WS=34624165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr9	34627568	rs74857127	G	T	1222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.039;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=11;PP=758;ReadPosRankSum=0.929;SC=AGGTCTCCGTGTCTCTGTGTC;SOR=0.475;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=78;TCF=59;TCR=19;TR=46;WE=34627576;WS=34627558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,52:0.58:89
chr9	34635598	rs4879809	T	C	2366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=53;NR=27;PP=1682;SC=CGCTCCTGTCTATCCGCAGGT;SOR=1.638;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=53;TCR=27;TR=80;WE=34635606;WS=34635588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr9	34646572	rs142496102	CCAGT	C	401.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.222;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.754;NF=6;NR=1;PP=301;ReadPosRankSum=2.135;SC=GCAGGGCAGCCCAGTCAGTCA;SOR=2.147;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=7;WE=34646583;WS=34646570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr9	34647802	rs41274865	G	C	4399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=417;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=100;NR=93;PP=2842;ReadPosRankSum=1.019;SC=CTACCTCTCGGTTATCTTTTC;SOR=0.721;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=387;TCF=201;TCR=186;TR=193;WE=34647810;WS=34647792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:207,210:0.50:417
chr9	34648020	rs2277202	G	A	1264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.828;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=25;PP=791;ReadPosRankSum=-0.978;SC=TTTGGTTCTGGGGAGTAACAT;SOR=0.644;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=108;TCF=61;TCR=47;TR=50;WE=34648028;WS=34648010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,59:0.48:124
chr9	34648088	rs41274867	G	A	1813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=37;PP=1092;ReadPosRankSum=0.190;SC=TTGGCTAACAGAGCTCCGTAT;SOR=0.689;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=194;TCF=105;TCR=89;TR=82;WE=34648096;WS=34648078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,92:0.42:219
chr9	34648462	rs117998880	G	C	2407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.664;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=41;PP=1408;ReadPosRankSum=0.320;SC=AGGTGGGAGAGAGCCAAGCCC;SOR=0.716;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=185;TCF=100;TCR=85;TR=95;WE=34648470;WS=34648452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,110:0.52:213
chr9	34649442	rs2070074	A	G	2747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.511;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=60;PP=1737;ReadPosRankSum=1.642;SC=GGCCAACTGGAACCATTGGCA;SOR=0.618;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=265;TCF=141;TCR=124;TR=123;WE=34649450;WS=34649432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,138:0.47:295
chr9	34655162	.	T	G	2233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.709;ClippingRankSum=0.000;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=0.592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.38;ReadPosRankSum=2.040;SOR=0.640;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,108:0.65:167
chr9	34655436	rs2812357	T	C	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=76;ReadPosRankSum=0.079;SC=ACCTGGGTCCTCTCTCTACCC;SOR=0.527;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=9;WE=34655444;WS=34655426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr9	34657663	rs1104748	T	C	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=103;ReadPosRankSum=-1.067;SC=ACTCCCAGAGTTCCCAGTTTC;SOR=1.230;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=7;WE=34657671;WS=34657653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr9	34658421	rs1104749	T	A	1857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.414;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=22;PP=1072;ReadPosRankSum=-0.165;SC=CTCAGGAGTGTCTGGCTAAGG;SOR=0.841;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=132;TCF=92;TCR=40;TR=74;WE=34658429;WS=34658411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,83:0.58:142
chr9	34661549	rs56079949	G	GGATGGATGGACA	918.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.028;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=4;PP=2837;ReadPosRankSum=0.078;SC=TTGCTGGTGTGGATAGAAACC;SOR=0.858;SbPval=0.09;Source=Platypus;TC=36;TCF=10;TCR=26;TR=9;WE=34661557;WS=34661539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,20:0.31:65
chr9	34661994	rs11575584	G	A	1891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.495;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=41;PP=992;ReadPosRankSum=-2.682;SC=GTCCCATGGAGCTTTCTCTCT;SOR=0.633;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=199;TCF=105;TCR=94;TR=87;WE=34662002;WS=34661984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,99:0.45:220
chr9	34665274	rs41314592	T	C	1464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=0.604;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.83;ReadPosRankSum=0.297;SOR=0.619;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,74:0.50:149
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chr9	34725047	rs78716275	C	T	2838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.858;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-11.346;NF=66;ReadPosRankSum=0.545;SC=GATGCAGGTCCGGGTCACTTG;SOR=0.906;Source=Platypus;TCF=133;WE=34725055;WS=34725037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,136:0.47:289
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chr9	34726418	rs2937382	T	C	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=13.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.40;MQRankSum=-4.966;QD=0.49;ReadPosRankSum=-0.399;SOR=2.486;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,14:0.11:125
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chr9	34726671	rs1854574	G	A	1088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.943;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.219;NF=33;NR=12;PP=713;ReadPosRankSum=-0.055;SC=ATCTGCATACGTTGACTGGGC;SOR=1.179;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=108;TCF=73;TCR=35;TR=45;WE=34726679;WS=34726661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,49:0.44:112
chr9	34726821	rs117956208	A	C	2718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.018;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=56;PP=1587;ReadPosRankSum=-0.466;SC=CAGCATCTCTAGGCAAGAGGA;SOR=0.685;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=234;TCF=119;TCR=115;TR=122;WE=34726829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,129:0.52:250
chr9	35043291	rs615474	G	T	4909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=66;PP=2938;SC=CCTCTGAAGTGGTCTGTTTGT;SOR=0.890;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=155;TCF=89;TCR=66;TR=155;WE=35043299;WS=35043281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr9	35060302	rs684562	T	C	3008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=41;PP=1824;SC=CAGCCTATTGTAGCTCACCTT;SOR=0.927;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=57;TCR=41;TR=98;WE=35060310;WS=35060292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr9	35060746	rs562381	A	G	2575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=32;PP=1569;SC=GATCACCCAGATCAATTACAA;SOR=1.076;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=55;TCR=32;TR=87;WE=35060754;WS=35060736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr9	35060955	rs2258240	T	C	5271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=84;PP=2965;SC=ATGAGACTTATCAAGGGAGGG;SOR=0.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=183;TCF=99;TCR=84;TR=183;WE=35060963;WS=35060945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr9	35061693	rs11272867	G	GACAGTACACAA	6256.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=35;PP=2900;SC=CGACCTGTGGGACAGTACACA;SOR=1.352;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=65;TCF=6;TCR=59;TR=41;WE=35061701;WS=35061683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr9	35062972	rs514492	C	T	6472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=106;NR=116;PP=2965;SC=CCAAATATCTCACCATTGATC;SOR=0.859;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=222;TCF=106;TCR=116;TR=222;WE=35062980;WS=35062962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr9	35074917	rs587118	T	C	3590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=71;NR=44;PP=2096;SC=CATGCAAGTATACATACCTGG;SOR=0.925;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=71;TCR=44;TR=115;WE=35074925;WS=35074907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr9	35077441	rs554098	T	C	5941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=108;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.639;SC=TACAACCTCCTCGTCTTCTCC;SOR=0.325;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=206;TCF=97;TCR=109;TR=205;WE=35077449;WS=35077431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,222:1.00:223
chr9	35079361	rs504082	G	T	11614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=433;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=219;NR=191;PP=2965;SC=CCTCCCCATCGGTTGGGGTAA;SOR=0.867;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=410;TCF=219;TCR=191;TR=410;WE=35079369;WS=35079351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,433:1.00:433
chr9	35089048	rs556766	A	C	633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=4;PP=461;SC=CACTGTTCTCAAGCACTCTCT;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=35089056;WS=35089038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr9	35090782	rs505297	A	C	645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=16;PP=463;SC=TACACACTCAAATGCCTATCA;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=21;WE=35090790;WS=35090772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr9	35093020	rs568300	T	C	837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=5;PP=495;SC=CCAGCCCGCTTACCTACCTGC;SOR=2.226;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=24;WE=35093028;WS=35093010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr9	35100002	rs664357	T	C	4308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=56;PP=2666;SC=GCTTCCTTGTTCCCAGACTCC;SOR=1.012;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=141;TCF=85;TCR=56;TR=140;WE=35100010;WS=35099992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr9	35100569	rs586017	A	G	280.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=124;SC=CCAGTGCTCTATGCTGGGTCC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=35100577;WS=35100559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	35101383	rs34240345	GCA	G	4768.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=48;PP=2957;SC=TGGTACTGGAGCACCCTGAGG;SOR=1.069;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=66;TCF=18;TCR=48;TR=65;WE=35101392;WS=35101373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr9	35101870	rs693325	C	G	4952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=76;PP=2891;SC=GAGGGCAACTCAAAAGGCTGG;SOR=0.880;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=149;TCF=73;TCR=76;TR=149;WE=35101878;WS=35101860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr9	35107033	.	A	C	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.245;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=20.873;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=125;ReadPosRankSum=-0.563;SC=AGAGTACATGAAGGACAGGCG;SOR=4.534;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=11;TCR=29;TR=11;WE=35107041;WS=35107023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,15:0.33:45
chr9	35107765	rs13287211	C	A	7996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=134;NR=139;PP=2965;ReadPosRankSum=1.234;SC=CCCCCAGGGACCCCTGTCCCC;SOR=0.784;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=274;TCF=135;TCR=139;TR=273;WE=35107773;WS=35107755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,297:0.99:299
chr9	35107858	rs7039828	C	T	7036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=121;NR=113;PP=2965;SC=TCCAGGCCCCCGAAGTCCAAG;SOR=0.732;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=235;TCF=122;TCR=113;TR=234;WE=35107866;WS=35107848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr9	35231047	rs10972390	C	T	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.043;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=241;ReadPosRankSum=0.246;SC=TGCTTAATTCCAAGGGCTTTG;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=12;WE=35231055;WS=35231037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr9	35231332	rs10972391	G	A	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=103;ReadPosRankSum=0.079;SC=AAATGTACTGGCACTGTTAAA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=8;WE=35231340;WS=35231322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,9:0.30:30
chr9	35295984	rs661712	T	C	2557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=53;PP=1712;SC=CATGATGCAATTGGCAAGAAG;SOR=1.216;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=33;TCR=53;TR=86;WE=35295992;WS=35295974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr9	35385575	.	C	T	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=81;ReadPosRankSum=-1.409;SC=AGAAGGAGACCTGTAACTTTA;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=35385583;WS=35385565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr9	35546735	rs1535422	A	G	9816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=359;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=170;NR=163;PP=2965;SC=CCTGCACTCTACTCCAGGAGG;SOR=0.704;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=334;TCF=170;TCR=164;TR=333;WE=35546743;WS=35546725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,358:1.00:358
chr9	35555823	rs946483	T	C	1025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=5;PP=823;SC=CATCCCTCCCTCAGCATCTGT;SOR=3.321;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=34;WE=35555831;WS=35555813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr9	35556250	rs870978	G	C	1269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=13;PP=889;SC=CACTGAACTGGCCTGGAACTC;SOR=1.312;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=27;TCR=13;TR=40;WE=35556258;WS=35556240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr9	35556527	rs150786704	A	ACCTCTAAGTGCTGGCTGGGC	315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.47;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	35559369	rs4879906	G	A	4081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=81;PP=2485;SC=GGTGGGGAGGGGGACCACACA;SOR=1.127;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=140;TCF=59;TCR=81;TR=140;WE=35559377;WS=35559359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr9	35559905	rs12338773	T	C	1699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=1;PP=1291;SC=TACATGCAAGTTGACTAGTGC;SOR=6.518;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=46;TCF=45;TCR=1;TR=46;WE=35559913;WS=35559895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr9	35561912	.	CCCCACCCT	C	424	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=4;HapScore=2;MGOF=26;MMLQ=26;MQ=60.0;NF=1;NR=1;PP=424;QD=219.5;SC=CTTTGTGTTCCCCCACCCTCC;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=2;WE=35561927;WS=35561902;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,2:0.40:5
chr9	35562328	rs5897609	TACAA	T	2461.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=7;NR=20;PP=1357;SC=CCCATACCCATACAAACAAAC;SOR=0.800;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=27;WE=35562339;WS=35562318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr9	35562549	rs755774	G	A	5033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=66;PP=2941;SC=GGAAGCGGGCGCAGGGCACAT;SOR=1.014;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=165;TCF=99;TCR=66;TR=164;WE=35562557;WS=35562539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr9	35610523	rs71940749	CCCCTGCTCTGAGT	C	1538.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=4;PP=2978;SC=GGCCCCTGGGCCCCTGCTCTG;SOR=3.737;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=18;WE=35610543;WS=35610513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr9	35610912	rs4879913	A	G	393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=12;PP=316;SC=ACTAAAACAGACTTTAGAACC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=35610920;WS=35610902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	35616583	rs2095858	A	T	3735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=65;PP=2261;ReadPosRankSum=-0.697;SC=GGAAGTAGGGACAGCCTTACT;SOR=0.842;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=65;TCR=66;TR=129;WE=35616591;WS=35616573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,142:0.99:144
chr9	35650458	rs2297880	G	A	7010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=134;NR=101;PP=2965;SC=CTCGGTAAGAGAGAACTCTCA;SOR=0.876;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=235;TCF=134;TCR=101;TR=235;WE=35650466;WS=35650448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr9	35660990	rs1339374	A	G	6633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=116;NR=105;PP=2965;SC=CGAGGAGGAGATTGGTGACAG;SOR=0.718;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=221;TCF=116;TCR=105;TR=221;WE=35660998;WS=35660980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr9	35661243	rs35234337	C	T	2008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=47;PP=1387;SC=ATACTAGGTGCCTAAGGACAA;SOR=2.372;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=65;TCF=17;TCR=48;TR=64;WE=35661251;WS=35661233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr9	35662251	rs2297879	T	C	6381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=121;NR=108;PP=2965;SC=TAGCTTCTCATGAGGGAAGGA;SOR=0.761;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=229;TCF=121;TCR=108;TR=229;WE=35662259;WS=35662241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr9	35664624	rs1361338	C	A	1003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=19;PP=685;SC=ATGCTAAGGCCCTGGGCCAAG;SOR=1.148;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=13;TCR=19;TR=32;WE=35664632;WS=35664614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr9	35677702	rs2857801	T	A	1099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=7;PP=664;SC=ATGGGAGAGGTCTATGGGAAC;SOR=1.730;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=34;WE=35677710;WS=35677692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr9	35679061	rs2857802	C	T	1208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=9;PP=743;SC=CTGCACTTAGCGAAGAAGTGG;SOR=1.954;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=28;TCR=9;TR=37;WE=35679069;WS=35679051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr9	35682296	rs11998	T	A	345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=8;PP=213;SC=TCAGGGCCCCTTGGCAGGGAC;SOR=1.609;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=12;WE=35682304;WS=35682286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	35683240	rs149115565	T	TG	3307.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.038;HP=8;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.498;NF=6;NR=54;PP=1341;ReadPosRankSum=0.529;SC=AGACTTCATCTGGGGGGGGTC;SOR=0.688;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=84;TCF=8;TCR=76;TR=60;WE=35683248;WS=35683230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,130:0.90:145
chr9	35689949	rs3793538	AAA	TTT	1006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=12;PP=1038;SC=GCGGGCGCCTAAAAGGCGGGG;SOR=4.003;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=35689959;WS=35689939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr9	35704898	rs3215701	GA	G	1804.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=38;PP=1043;SC=TAAGGACATAGAAAAAAACAT;SOR=1.999;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=38;WE=35704906;WS=35704888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr9	35705759	rs11541908	G	A	9053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=145;NR=150;PP=2965;ReadPosRankSum=1.262;SC=TCTCCTGAACGGTCACTGCAA;SOR=0.827;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=297;TCF=146;TCR=151;TR=295;WE=35705767;WS=35705749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,333:0.99:335
chr9	35707338	rs55810625	G	A	6522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=109;NR=105;PP=2965;SC=CCTTCACATCGCCTCACCTCA;SOR=0.718;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=214;TCF=109;TCR=105;TR=214;WE=35707346;WS=35707328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr9	35712003	rs2295795	G	A	1071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=13;PP=755;SC=TCCTCCTACCGAGTCACTCAG;SOR=1.236;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=24;TCR=13;TR=37;WE=35712011;WS=35711993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr9	35712823	rs2249133	G	A	3516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=67;NR=44;PP=1866;SC=CCCTTTCCCAGTATCTGACCT;SOR=0.787;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=68;TCR=44;TR=111;WE=35712831;WS=35712813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr9	35722282	rs2295797	T	C	3853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=72;PP=2422;SC=GGAATTAAGGTTGGATGCTAA;SOR=1.410;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=43;TCR=72;TR=115;WE=35722290;WS=35722272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr9	35724448	rs41277065	G	A	1651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=8;PP=1234;SC=CATGAGTGTAGGACTTTGTTT;SOR=3.056;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=49;TCF=41;TCR=8;TR=48;WE=35724456;WS=35724438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr9	35739115	rs3833700	G	GC	3209.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=44;PP=1992;SC=AGCTGGGGGAGAGACACAGAA;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=46;TCF=1;TCR=45;TR=45;WE=35739123;WS=35739105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr9	35749845	rs2236288	G	C	2765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=56;PP=1657;SC=ACCCCCTTCCGCCCACGGCCA;SOR=1.408;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=35;TCR=56;TR=91;WE=35749853;WS=35749835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr9	35751221	rs1570248	C	T	6426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=132;NR=73;PP=2965;SC=CTCTCATCTCCGTTCCCTCTC;SOR=1.164;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=205;TCF=132;TCR=73;TR=205;WE=35751229;WS=35751211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr9	35752274	rs35406278	GT	G	282.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=238;SC=ACCCGGAACAGTTTCTCAGAC;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=35752282;WS=35752264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr9	35753898	rs34478611	G	A	4561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=89;NR=54;PP=2834;SC=CACAGCTGGAGGAAGCCTGGG;SOR=1.096;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=143;TCF=89;TCR=54;TR=143;WE=35753906;WS=35753888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr9	35792423	rs2228580	T	C	2558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=59;NR=25;PP=1681;SC=TGCCATCACTTCTGCTGTTGG;SOR=1.744;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=85;TCF=60;TCR=25;TR=84;WE=35792431;WS=35792413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr9	35801233	rs1322044	T	C	2283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=45;PP=1099;SC=GTCCCTATAATGTGGGATAGG;SOR=1.244;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=33;TCR=45;TR=78;WE=35801241;WS=35801223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr9	35801856	rs7034957	C	A	8164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=120;NR=156;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.259;SC=TAATGATAGCCCCTGCACTAC;SOR=0.577;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=280;TCF=121;TCR=159;TR=276;WE=35801864;WS=35801846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,305:0.99:308
chr9	35802092	rs2890702	G	C	2939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.468;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=39;PP=2085;ReadPosRankSum=0.982;SC=CCTCATACCCGACTCTCTGTG;SOR=0.587;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=94;TCF=53;TCR=41;TR=92;WE=35802100;WS=35802082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,99:0.99:100
chr9	35802583	rs5812	C	T	7134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=105;NR=117;PP=2965;SC=TCACTGAATACTGTCCTCGTG;SOR=0.990;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=222;TCF=105;TCR=117;TR=222;WE=35802591;WS=35802573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr9	35807401	rs112946422	AGCTGGGGCC	A	8192.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=69;PP=2967;SC=ACAAGGTGAGAGCTGGGGCCG;SOR=0.726;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=95;TCF=18;TCR=77;TR=87;WE=35807417;WS=35807391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr9	35807542	rs13294264	C	T	937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=25;PP=710;SC=GAGTGTACTTCGTAGACAGAT;SOR=3.056;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=30;WE=35807550;WS=35807532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr9	35811485	rs141090907	ACCAGGACCAGAG	A	1970.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=9;PP=2972;SC=CAGAGCCATGACCAGGACCAG;SOR=0.829;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=14;WE=35811504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr9	35826038	rs13294245	T	C	3538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=54;NR=66;PP=2369;SC=GTGGAAGGCTTCAAGAAGCTT;SOR=1.010;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=120;TCF=54;TCR=66;TR=120;WE=35826046;WS=35826028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr9	35826058	rs13294256	T	C	3350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=61;PP=1920;SC=TTCAGAGATATGGTTCTCCTG;SOR=0.937;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=117;TCF=56;TCR=61;TR=117;WE=35826066;WS=35826048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr9	35829390	rs2381409	C	T	525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=10;PP=258;SC=GAGCCGCGGGCCAGCTCTGCG;SOR=1.721;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=15;WE=35829398;WS=35829380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	35841071	rs2236292	C	T	303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=223;SC=TTCTGTTTGCCTTGGTTTAGT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=35841079;WS=35841061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	35842301	rs2236294	G	A	3029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=33;PP=1801;SC=CACTCTTTGCGAAATCCTGTC;SOR=1.262;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=67;TCR=33;TR=100;WE=35842309;WS=35842291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr9	35845929	rs7848557	A	C	1385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=15;PP=959;SC=GTGGGTGGAGATGGAGGATGT;SOR=1.436;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=35;TCR=15;TR=50;WE=35845937;WS=35845919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr9	35852670	rs12346647	T	C	460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=0;PP=388;SC=TTCTCAGGATTTGGGGAGTCA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=35852678;WS=35852663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	35870001	rs7044405	T	C	6835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=132;NR=97;PP=2965;SC=CATGAGCACGTGGTACCTGAG;SOR=0.996;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=229;TCF=132;TCR=97;TR=229;WE=35870009;WS=35869991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr9	35906347	rs370606246	CCTG	C	44.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=1.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.14;MQRankSum=3.071;QD=0.63;ReadPosRankSum=-0.820;SOR=0.259;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,7:0.10:71
chr9	35906471	rs76452347	C	T	5869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=97;NR=102;PP=2965;SC=GCCCTTCCGGCGGCGGGGCCA;SOR=0.865;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=201;TCF=98;TCR=103;TR=199;WE=35906479;WS=35906461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr9	35906519	rs79284865	G	A	1351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.746;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=42;PP=818;ReadPosRankSum=-1.477;SC=TCCTGGCCACGTATCTCATGT;SOR=1.066;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=156;TCF=63;TCR=93;TR=65;WE=35906527;WS=35906509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,69:0.42:165
chr9	35906600	.	C	CA	53.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.025;ClippingRankSum=0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=8.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.58;ReadPosRankSum=2.677;SOR=0.843;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,3:0.20:15
chr9	35906601	.	C	CCA	53.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.371;ClippingRankSum=0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=8.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.58;ReadPosRankSum=2.677;SOR=0.843;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,3:0.20:15
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chr9	36063743	rs942478	C	G	1558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=14;PP=1069;SC=CATGCTATCTCTTTTTATTGC;SOR=2.093;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=36;TCR=14;TR=50;WE=36063751;WS=36063733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
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chr9	36109947	rs10972726	C	A	1796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.516;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.932;NF=47;NR=35;PP=965;ReadPosRankSum=-1.110;SC=CTTTCTGTTTCTGTCAGGTCA;SOR=0.752;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=179;TCF=102;TCR=77;TR=82;WE=36109955;WS=36109937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,95:0.47:202
chr9	36110063	rs10972727	T	A	901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.750;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=24;PP=517;ReadPosRankSum=-0.422;SC=AAGATGACCGTCGTACCTTCA;SOR=0.825;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=95;TCF=40;TCR=55;TR=40;WE=36110071;WS=36110053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,45:0.42:106
chr9	36110137	rs10972728	C	A	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=138;ReadPosRankSum=1.541;SC=CACATTTTTCCCTTCAAGGCA;SOR=0.631;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=11;WE=36110145;WS=36110127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr9	36117210	rs2274521	C	G	1245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.675;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=31;PP=639;ReadPosRankSum=-1.408;SC=AAGTACACTACGGATAAAATT;SOR=0.590;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=128;TCF=45;TCR=83;TR=50;WE=36117218;WS=36117200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,61:0.43:143
chr9	36121780	rs2274522	G	A	710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.227;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=22;PP=449;ReadPosRankSum=1.579;SC=GGAAGGATCCGTGGGTGAGGG;SOR=0.422;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=53;TCF=12;TCR=41;TR=30;WE=36121788;WS=36121770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,32:0.54:59
chr9	36135923	rs7041851	T	C	472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=1;PP=275;SC=TGTGTGCTGCTCCCAGGGTCA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=36135931;WS=36135913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	36136526	rs16932970	A	G	487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.10;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	36136566	rs16932974	A	C	1055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.23;SOR=0.770;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr9	36136587	rs3739614	T	G	1065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.63;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr9	36162831	rs75046131	T	C	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=8;PP=315;ReadPosRankSum=1.294;SC=GTACTTTTCTTACTTCTAATA;SOR=0.693;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=40;TCF=24;TCR=16;TR=18;WE=36162839;WS=36162821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr9	36169598	rs3739609	T	C	1888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.343;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=41;PP=1012;ReadPosRankSum=-0.058;SC=TGGCCCTGAGTGTGGACAACC;SOR=0.668;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=189;TCF=97;TCR=92;TR=87;WE=36169606;WS=36169588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,95:0.45:213
chr9	36216324	.	A	ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	781.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.13;QD=45.98;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	36218377	rs2296817	C	G	779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.278;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=24;PP=566;ReadPosRankSum=0.466;SC=GGAAAGCAAGCCCCTACATGG;SOR=0.507;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=53;TCF=11;TCR=42;TR=31;WE=36218385;WS=36218367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,32:0.58:55
chr9	36263435	rs62541786	T	G	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.273;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=10;PP=367;ReadPosRankSum=0.537;SC=GGGCCCGGATTACAGGTATGA;SOR=0.436;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=47;TCF=29;TCR=18;TR=23;WE=36263443;WS=36263425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,28:0.52:54
chr9	36276857	rs7875447	A	G	4181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=98;NR=45;PP=2766;SC=TGCAATTTCAATAATAAAGCT;SOR=1.533;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=144;TCF=99;TCR=45;TR=143;WE=36276865;WS=36276847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr9	36352913	rs78841557	T	C	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.914;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=24;PP=505;ReadPosRankSum=0.186;SC=AAATAAAGTATCTAATTAAAA;SOR=0.856;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=80;TCF=23;TCR=57;TR=33;WE=36352921;WS=36352903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,34:0.39:87
chr9	36353359	.	G	GTA	23	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;FR=0.4999;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=28;MQ=58.01;NF=0;NR=1;PP=23;QD=34.0;SC=ACACATATATGTATATATATA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=1;WE=36353367;WS=36353349;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:11,1:0.08:12
chr9	36369646	rs59794829	CAA	C,CA	2442.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=7.520;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.71;ReadPosRankSum=0.228;SOR=0.756;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:2,49,44:0.52,0.46:95
chr9	36372737	rs12001805	C	A	262.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=240;SC=TTTCAAAGAACTCAAAGCTAA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=36372745;WS=36372727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr9	36643131	rs9298970	A	G	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.462;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=170;ReadPosRankSum=0.365;SC=TGTAATCCAAACACTTTGGGA;SOR=0.446;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=26;TCF=8;TCR=18;TR=12;WE=36643139;WS=36643121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr9	36657220	rs72733443	C	G	708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=11;PP=493;ReadPosRankSum=-1.379;SC=TTAAGTTCTTCTGTCTTTCAT;SOR=0.616;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=89;TCF=60;TCR=29;TR=32;WE=36657228;WS=36657210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,35:0.36:96
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chr9	36674842	rs2274473	C	T	3240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=33;PP=1752;SC=TTCACTATAACGTGACTACAA;SOR=1.374;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=104;TCF=71;TCR=33;TR=104;WE=36674850;WS=36674832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
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chr9	37426524	rs2736664	C	T	8955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=156;NR=148;PP=2965;SC=CACCAGATGTCTGATTCGTAG;SOR=0.699;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=304;TCF=156;TCR=148;TR=304;WE=37426532;WS=37426514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,337:1.00:337
chr9	37429661	rs309459	A	G	1991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=21;PP=1212;SC=CCGCTGTTCCAGAAATGCTGG;SOR=1.349;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=69;TCF=48;TCR=21;TR=68;WE=37429669;WS=37429651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr9	37429814	rs309458	A	G	3030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=48;PP=1844;SC=AGGAAGCAGCAGAATTCCAGG;SOR=0.766;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=53;TCR=48;TR=101;WE=37429822;WS=37429804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr9	37430610	rs143596402	T	C	2177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=45;PP=1076;ReadPosRankSum=1.441;SC=TTCCAGAAGATGAAGGAAACA;SOR=0.659;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=195;TCF=104;TCR=91;TR=98;WE=37430618;WS=37430600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,109:0.50:220
chr9	37432264	rs309455	T	C	709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=20;PP=573;SC=ACACCAGGGATCGTAAATGTT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=37432272;WS=37432254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
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chr9	37486629	rs192323920	C	G	3211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.868;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=69;PP=2115;ReadPosRankSum=2.219;SC=ACAGTCTAGTCCCACCGTACA;SOR=0.654;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=282;TCF=148;TCR=134;TR=141;WE=37486637;WS=37486619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,151:0.48:312
chr9	37486916	rs913278	G	C	676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=16;PP=464;SC=AGCAAATGGAGCTTTGAAGAA;SOR=3.258;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=37486924;WS=37486906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
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chr9	37489298	rs3758223	T	C	1194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.955;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=12;PP=872;ReadPosRankSum=0.195;SC=TTGTATTATTTCTTCTTTATT;SOR=1.251;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=109;TCF=79;TCR=30;TR=52;WE=37489306;WS=37489288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,56:0.47:119
chr9	37489562	rs7860865	C	T	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=123;ReadPosRankSum=2.076;SC=TTTATATACACACTGTTTTTT;SOR=0.465;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=8;WE=37489570;WS=37489552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr9	37492367	rs10758433	C	T	1582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=35;PP=1027;ReadPosRankSum=0.443;SC=GGTGAACTGACCTGGGGCAAG;SOR=0.729;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=155;TCF=79;TCR=76;TR=69;WE=37492375;WS=37492357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,77:0.45:173
chr9	37492440	rs10814562	C	T	1122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=29;PP=666;ReadPosRankSum=0.664;SC=GCTGGATGACCGCTTGATTTG;SOR=0.727;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=44;TCR=64;TR=49;WE=37492448;WS=37492430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,55:0.46:119
chr9	37492492	rs10814563	G	A	476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.980;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=324;ReadPosRankSum=0.423;SC=TACTAAAGCTGCATATTAAAT;SOR=1.317;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=47;TCF=18;TCR=29;TR=21;WE=37492500;WS=37492482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,23:0.43:53
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chr9	37492866	rs3739574	G	A	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=171;ReadPosRankSum=-1.565;SC=GTTTGTACCTGCAGAAGCCTC;SOR=0.791;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=13;WE=37492874;WS=37492856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
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chr9	37493548	rs10814567	A	G	1597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.056;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=26;PP=906;ReadPosRankSum=0.986;SC=GGTTTATCTCATAAACAGATG;SOR=0.911;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=142;TCF=89;TCR=53;TR=72;WE=37493556;WS=37493538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,79:0.51:156
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chr9	37500895	rs2277161	T	C	855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=22;PP=552;ReadPosRankSum=-0.537;SC=AGCACTTTACTTGCTTGACCT;SOR=0.716;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=72;TCF=32;TCR=40;TR=39;WE=37500903;WS=37500885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,42:0.52:81
chr9	37501844	rs2296777	G	A	3435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=365;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=81;PP=2136;ReadPosRankSum=0.664;SC=GAGAAAAGGTGAGCACAACAG;SOR=0.703;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=323;TCF=150;TCR=173;TR=150;WE=37501852;WS=37501834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:194,171:0.47:365
chr9	37503087	rs10814571	G	A	1088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.770;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=26;PP=638;ReadPosRankSum=0.437;SC=TCCAAAAGAAGGGTGTCTGTG;SOR=1.074;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=82;TCF=40;TCR=42;TR=47;WE=37503095;WS=37503077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,52:0.56:93
chr9	37503124	rs7047823	G	A	1689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=33;PP=876;SC=AAGATCACAAGCTGGGCACCC;SOR=1.341;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=23;TCR=33;TR=56;WE=37503132;WS=37503114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr9	37512734	rs10973387	G	A	763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=24;PP=573;ReadPosRankSum=1.766;SC=GGTGCAAAACGAAAGTCAGTG;SOR=0.735;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=53;TCF=12;TCR=41;TR=31;WE=37512742;WS=37512724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,31:0.54:57
chr9	37521777	rs35979885	G	A	2018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.683;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=48;PP=1122;ReadPosRankSum=0.024;SC=AGCTGACGTGGTTGCTGGTGA;SOR=0.582;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=196;TCF=84;TCR=112;TR=89;WE=37521785;WS=37521767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,100:0.47:212
chr9	37536998	rs927930	C	T	1462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=12;PP=964;SC=GTCAAGCGTGCGTGAATAAGT;SOR=2.215;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=35;TCR=12;TR=47;WE=37537006;WS=37536988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr9	37537557	rs7044153	G	A	2179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.164;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=49;PP=1407;ReadPosRankSum=0.814;SC=GGGAGCTAGAGGCTGGGCTGG;SOR=0.799;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=168;TCF=83;TCR=85;TR=94;WE=37537565;WS=37537547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,101:0.56:180
chr9	37592143	rs73441369	A	T	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=305;ReadPosRankSum=-2.164;SC=GGTGTGAGCCAACGCGCCCGG;SOR=0.332;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=16;WE=37592151;WS=37592135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr9	37592452	rs7021977	G	A	1750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.503;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=42;PP=1124;ReadPosRankSum=2.458;SC=TCCGTATGGAGGAGATCACAT;SOR=0.417;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=116;TCF=42;TCR=74;TR=68;WE=37592460;WS=37592442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,71:0.57:124
chr9	37692654	rs3747539	A	C	2619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.970;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=53;PP=1671;ReadPosRankSum=0.855;SC=AGAGCTGGAGACCAGTTTATT;SOR=0.782;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=231;TCF=131;TCR=100;TR=122;WE=37692662;WS=37692644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,129:0.52:250
chr9	37707392	rs2296557	T	C	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.491;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=6;PP=467;ReadPosRankSum=0.948;SC=TTCTCTTTTTTACATACTCCT;SOR=1.238;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=57;TCF=41;TCR=16;TR=27;WE=37707400;WS=37707382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,26:0.44:59
chr9	37708307	rs2296555	A	C	92.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5103;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=64;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TGGGAACTGGATCAGGGTGCC;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=4;WE=37708315;WS=37708304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr9	37708572	rs2296554	A	G	1649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.047;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=40;PP=950;ReadPosRankSum=-0.477;SC=CAGGAATGGCATAACTGATCC;SOR=0.535;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=141;TCF=60;TCR=81;TR=73;WE=37708580;WS=37708562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,81:0.53:153
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chr9	37715724	rs1952125	T	G	2415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.435;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=56;PP=1423;ReadPosRankSum=0.189;SC=AAGATATTCATGGTAGCAGAG;SOR=0.642;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=261;TCF=131;TCR=130;TR=114;WE=37715732;WS=37715714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,125:0.44:283
chr9	37724195	rs10814609	A	G	1981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.723;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=38;PP=1130;ReadPosRankSum=0.829;SC=AAAGACAGGGATACAACAATA;SOR=0.429;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=210;TCF=134;TCR=76;TR=93;WE=37724203;WS=37724185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,99:0.44:226
chr9	37729786	rs1359590	C	T	2369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.426;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=59;PP=1360;ReadPosRankSum=0.771;SC=TTTGCACTGGCCCTGGAAGAG;SOR=0.790;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=267;TCF=125;TCR=142;TR=109;WE=37729794;WS=37729776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,122:0.42:288
chr9	37731177	rs2274323	T	G	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=197;ReadPosRankSum=0.963;SC=GAACGTGAGCTCGAGGCCATT;SOR=0.671;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=36;TCF=11;TCR=25;TR=14;WE=37731185;WS=37731167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,14:0.37:38
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chr9	37887586	.	A	G	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=1.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=65.41;MQRankSum=5.683;QD=13.12;ReadPosRankSum=1.618;SOR=0.435;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,31:0.62:50
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chr9	38068532	rs3750444	A	G	2804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=49;PP=1812;SC=GGGGCTGCGAAGGCCGCTCGC;SOR=0.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=102;TCF=53;TCR=49;TR=102;WE=38068540;WS=38068522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr9	38395940	rs2228094	T	C	7556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=130;NR=118;PP=2965;SC=GGGAGGTCATTGGGCACGTGG;SOR=0.729;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=249;TCF=130;TCR=119;TR=248;WE=38395948;WS=38395930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,285:1.00:285
chr9	38396065	rs2073478	G	T	8111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=146;NR=131;PP=2965;SC=CTGCTGAACCGCCTGGCAGAC;SOR=0.713;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=278;TCF=146;TCR=132;TR=277;WE=38396073;WS=38396055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,297:1.00:297
chr9	38396502	rs4878199	G	A	5693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=106;NR=85;PP=2965;SC=CGCCCAGCACGTGGATGTTGA;SOR=0.823;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=191;TCF=106;TCR=85;TR=191;WE=38396510;WS=38396492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr9	38397355	rs3043	G	C	749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=17;PP=493;SC=CCACCTTGACGAATGCTTGCC;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=38397363;WS=38397345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr9	38413159	rs7018644	T	G	1239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.778;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=17;PP=860;ReadPosRankSum=-1.898;SC=CTTTGAAACATGTAATGTGTT;SOR=0.543;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=102;TCF=72;TCR=30;TR=53;WE=38413167;WS=38413149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,54:0.50:108
chr9	38414030	rs10545424	TCA	T,TCACACA	1610.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=1.004;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.925;NF=23,23;NR=39,39;PP=503,1785;ReadPosRankSum=-0.383;SC=TCCCTCTTTCTCACACACACA;SOR=0.555;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=92;TCF=36;TCR=56;TR=62,62;WE=38414043;WS=38414017;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.53,0.25:150
chr9	38423826	rs7039990	T	A	885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=2;PP=598;ReadPosRankSum=1.310;SC=AGGAGAGATATGAAATACTGC;SOR=0.970;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=56;TCF=52;TCR=4;TR=29;WE=38423834;WS=38423816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,33:0.56:59
chr9	38424344	rs35134904	A	G	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.33;ReadPosRankSum=-0.810;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,19:0.37:51
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chr9	38615779	rs1765381	T	C	887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.062;NF=21;NR=23;PP=741;ReadPosRankSum=0.182;SC=TAGTGTTAGATAAAAAACTAG;SOR=0.670;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=63;TCF=33;TCR=30;TR=44;WE=38615787;WS=38615769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,39:0.63:62
chr9	38621344	rs1815549	G	A	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.059;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=114;ReadPosRankSum=-1.187;SC=TGCAGCTTGGGTGCCCAGGCG;SOR=0.569;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=7;WE=38621352;WS=38621334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr9	39133168	rs6476772	A	G	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.733;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-5.443;NF=6;NR=10;PP=210;ReadPosRankSum=-0.496;SC=GCATCACTGGACGGCAGAGGC;SOR=1.204;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=43;TCF=20;TCR=23;TR=16;WE=39133176;WS=39133158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,15:0.33:46
chr9	40503085	rs139489532	A	G	348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.75;QD=26.83;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
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chr9	40784183	rs4339693	A	G	673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.981;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.701;NF=8;NR=22;PP=494;ReadPosRankSum=-1.730;SC=AGATCACCTTAGGTTTAGTAA;SOR=0.859;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=66;TCF=19;TCR=47;TR=30;WE=40784191;WS=40784173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,31:0.41:75
chr9	43816656	rs199925161	T	C	932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.94;QD=32.16;SOR=3.334;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
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chr9	43860959	rs145957320	G	C	513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.068;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-6.243;NF=20;NR=15;PP=451;ReadPosRankSum=-1.184;SC=TGCTGCTGGCGTCTGCCGCCC;SOR=0.922;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=58;TCF=32;TCR=26;TR=35;WE=43860967;WS=43860949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,27:0.53:51
chr9	43861081	rs62536501	T	G	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.58;BaseQRankSum=2.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.885;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.127;NF=3;NR=7;PP=183;ReadPosRankSum=0.869;SC=GGGCACCCGCTCTCGGCTGTG;SOR=1.426;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=21;TCF=10;TCR=11;TR=10;WE=43861089;WS=43861071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr9	65602551	rs11265643	C	T	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.401;NF=10;NR=5;PP=117;ReadPosRankSum=0.876;SC=TGCTTTGCCTCTTGCTGCTGG;SOR=0.567;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=59;TCF=39;TCR=20;TR=15;WE=65602559;WS=65602541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,16:0.29:56
chr9	66457003	.	C	T	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.880;ClippingRankSum=0.000;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.45;MQRankSum=0.623;QD=1.37;ReadPosRankSum=-0.461;SOR=0.210;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,6:0.15:40
chr9	66457014	.	C	T	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.286;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=4.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.46;MQRankSum=-3.328;QD=4.84;ReadPosRankSum=0.283;SOR=1.855;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,8:0.18:45
chr9	66457016	rs10436128	C	T	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.17;MQRankSum=-0.571;QD=11.97;ReadPosRankSum=-0.718;SOR=0.502;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,16:0.35:46
chr9	66457019	rs7040398	G	A	1399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=5.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.51;MQRankSum=-3.216;QD=28.00;ReadPosRankSum=0.490;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,34:0.68:50
chr9	66457027	rs76122331	T	A	1566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=2.855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.82;MQRankSum=-4.922;QD=27.98;ReadPosRankSum=0.649;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,37:0.66:56
chr9	66457030	.	T	G	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.074;ClippingRankSum=0.000;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.59;MQRankSum=-1.350;QD=1.44;ReadPosRankSum=0.223;SOR=0.809;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,6:0.10:63
chr9	66457040	.	C	A	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.187;ClippingRankSum=0.000;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.61;MQRankSum=0.736;QD=1.35;ReadPosRankSum=-1.532;SOR=0.848;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,13:0.16:82
chr9	66457051	rs79307166	G	C	2464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=2.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.19;MQRankSum=-6.566;QD=23.25;ReadPosRankSum=2.913;SOR=0.999;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,60:0.57:106
chr9	66457052	.	G	A	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.822;ClippingRankSum=0.000;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=1.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.33;MQRankSum=-2.881;QD=2.90;ReadPosRankSum=2.296;SOR=0.454;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:82,16:0.16:98
chr9	66457076	rs76994164	T	C	2703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=60;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-4.392;NF=52;NR=26;PP=993;ReadPosRankSum=-0.668;SC=AATAAAGCCCTTCCTTCTACA;SOR=0.686;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=201;TCF=133;TCR=68;TR=78;WE=66457085;WS=66457066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,83:0.43:192
chr9	66457092	.	G	T	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.426;ClippingRankSum=0.000;DP=217;ExcessHet=3.0103;FS=4.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQRankSum=-2.338;QD=2.12;ReadPosRankSum=4.666;SOR=1.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:183,33:0.15:216
chr9	66457112	rs113087405	G	A	1163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FS=3.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQRankSum=-8.541;QD=4.51;ReadPosRankSum=-1.022;SOR=0.465;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:215,43:0.17:258
chr9	66457126	.	TGC	T	1342.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=0.000;DP=296;ExcessHet=3.0103;FS=3.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQRankSum=-6.456;QD=4.54;ReadPosRankSum=-0.221;SOR=0.479;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:246,50:0.17:296
chr9	66457127	rs73447819	G	A	494.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.276;HP=1;HapScore=1;MGOF=84;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.982;NF=112;NR=78;PP=2962;ReadPosRankSum=1.304;SC=TCCTCCTGCTGCAGAAGGAGA;SOR=1.140;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=380;TCF=212;TCR=168;TR=190;WE=66457137;WS=66457117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:253,38:0.13:291
chr9	66457129	.	A	ATG	1329.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=0.000;DP=297;ExcessHet=3.0103;FS=3.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.00;MQRankSum=-6.322;QD=4.48;ReadPosRankSum=-0.055;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:246,51:0.17:297
chr9	66457151	rs78939328	G	C	2586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FS=1.575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.83;MQRankSum=-3.953;QD=8.74;ReadPosRankSum=-1.054;SOR=0.821;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:214,82:0.28:296
chr9	66457169	rs138400587	AGAG	A	2253.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.092;HP=2;HapScore=1;MGOF=76;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.954;NF=55;NR=117;PP=2545;ReadPosRankSum=-2.954;SC=AAATAGAACCAGAGGGAGAGA;SOR=0.792;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=229;TCF=63;TCR=166;TR=172;WE=66457242;WS=66457159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:191,68:0.26:259
chr9	66457173	.	GGA	G	1006.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=0.000;DP=253;ExcessHet=3.0103;FS=2.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.80;MQRankSum=-9.398;QD=4.18;ReadPosRankSum=2.796;SOR=0.507;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:201,40:0.17:241
chr9	66457178	.	G	C	1039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.315;ClippingRankSum=0.000;DP=230;ExcessHet=3.0103;FS=2.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.31;MQRankSum=-9.131;QD=4.52;ReadPosRankSum=3.565;SOR=0.489;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:190,40:0.17:230
chr9	66457189	rs2874584	C	T	1451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FS=1.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.53;MQRankSum=-2.188;QD=7.19;ReadPosRankSum=-1.182;SOR=0.810;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:157,45:0.22:202
chr9	66457192	rs148663514	TAGAGAGAG	TAGAGAG,T	1600.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.373;HP=2;HapScore=1;MGOF=76;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=5.491;NF=48;NR=108;PP=2991;ReadPosRankSum=-2.683;SC=GAGACAGCGATAGAGAGAGAG;SOR=0.434;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=192;TCF=57;TCR=135;TR=156;WE=66457242;WS=66457159;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.38:151
chr9	66457204	.	G	C	1255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.079;ClippingRankSum=0.000;DP=178;ExcessHet=3.0103;FS=5.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.37;MQRankSum=-7.879;QD=7.56;ReadPosRankSum=4.308;SOR=1.029;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:127,39:0.23:166
chr9	66457209	.	AG	A	1850.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.843;ClippingRankSum=0.000;DP=228;ExcessHet=3.0103;FS=7.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.60;MQRankSum=-8.132;QD=8.37;ReadPosRankSum=4.754;SOR=0.838;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:166,55:0.25:221
chr9	66457211	.	ACAGAAAAG	A	1907.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=0.000;DP=221;ExcessHet=3.0103;FS=9.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.55;MQRankSum=-7.722;QD=9.08;ReadPosRankSum=3.916;SOR=0.798;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:155,55:0.26:210
chr9	66457216	rs150998016	A	G	320.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.84;MQRankSum=0.037;QD=2.20;ReadPosRankSum=-1.084;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:132,14:0.10:146
chr9	66457228	.	A	C	1697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.308;ClippingRankSum=0.000;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=10.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.70;MQRankSum=-6.440;QD=11.32;ReadPosRankSum=1.821;SOR=0.972;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,49:0.33:150
chr9	66457231	rs140644333	G	GAC	399.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.43;MQRankSum=0.873;QD=2.76;ReadPosRankSum=0.631;SOR=0.734;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:125,20:0.14:145
chr9	66457233	.	G	C	1814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.833;ClippingRankSum=0.000;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=7.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.28;MQRankSum=-6.675;QD=11.71;ReadPosRankSum=1.555;SOR=0.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:105,50:0.32:155
chr9	66457237	.	G	A	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.135;ClippingRankSum=0.000;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.67;MQRankSum=-4.101;QD=0.80;ReadPosRankSum=0.986;SOR=0.724;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:144,25:0.15:169
chr9	66457241	rs113933538	G	A	472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.33;MQRankSum=0.894;QD=2.80;ReadPosRankSum=2.154;SOR=0.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:145,24:0.14:169
chr9	66457253	.	A	C	2291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=0.000;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.587;HP=3;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-6.749;NF=52;NR=63;PP=1473;ReadPosRankSum=-0.050;SC=AAGAGAGAGCACCACAGTAGA;SOR=0.674;Source=Platypus;TCF=165;TR=115;WE=66457275;WS=66457243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,62:0.38:164
chr9	66457265	.	C	A	1997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.962;ClippingRankSum=0.000;DP=221;ExcessHet=3.0103;FS=7.639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.09;MQRankSum=-6.620;QD=9.04;ReadPosRankSum=0.727;SOR=0.816;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:162,59:0.27:221
chr9	66457267	rs2002299	C	A	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FS=9.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.16;MQRankSum=2.432;QD=2.31;ReadPosRankSum=2.553;SOR=1.341;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:169,41:0.20:210
chr9	66457270	.	G	A	1799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.167;ClippingRankSum=0.000;DP=213;ExcessHet=3.0103;FS=6.781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.19;MQRankSum=-5.976;QD=8.45;ReadPosRankSum=1.398;SOR=0.800;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:159,54:0.25:213
chr9	66457278	.	G	T	1614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=0.000;DP=211;ExcessHet=3.0103;FS=10.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.53;MQRankSum=-5.366;QD=7.65;ReadPosRankSum=0.810;SOR=1.040;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:160,51:0.24:211
chr9	66457310	rs75999199	T	G	1743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FS=1.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.46;MQRankSum=-3.343;QD=8.11;ReadPosRankSum=0.989;SOR=0.566;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:159,56:0.26:215
chr9	66457313	rs79959518	G	A	3158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FS=16.257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.41;MQRankSum=-6.897;QD=15.95;ReadPosRankSum=1.896;SOR=0.637;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,100:0.51:198
chr9	66457317	rs77524857	C	T	1737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.23;MQRankSum=-3.735;QD=8.31;ReadPosRankSum=1.056;SOR=0.657;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:158,51:0.24:209
chr9	66457324	rs80001863	G	A	1551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FS=1.277;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.18;MQRankSum=-4.221;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.937;SOR=0.572;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:164,49:0.23:213
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chr9	66457399	rs78461570	T	G	1451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=5.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.233;HP=1;HapScore=1;MGOF=41;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-9.436;NF=44;NR=47;PP=2402;ReadPosRankSum=2.715;SC=GGTGGAGGGTTCTTGGGCCGG;SOR=0.809;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=257;TCF=135;TCR=122;TR=91;WE=66457412;WS=66457378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,55:0.27:207
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chr9	68433564	.	C	A	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.459;ClippingRankSum=0.000;DP=614;ExcessHet=3.0103;FS=2.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.67;MQRankSum=-4.188;QD=0.36;ReadPosRankSum=-5.475;SOR=0.879;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:555,46:0.08:601
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chr9	68433620	rs62543351	C	T	9593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=574;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.060;HP=4;HapScore=1;MGOF=46;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.619;NF=134;NR=159;PP=2962;ReadPosRankSum=2.183;SC=GTAGAAGAAACATTAAGTGTT;SOR=0.386;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=668;TCF=290;TCR=378;TR=293;WE=68433628;WS=68433610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:271,282:0.51:553
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chr9	68433701	rs62543352	A	G	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=5.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=46;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.082;NF=0;NR=30;PP=873;ReadPosRankSum=-0.621;SC=CCTGAAAAATATAATACAAGA;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=96;TCF=1;TCR=95;TR=30;WE=68433715;WS=68433691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,31:0.36:87
chr9	69002200	rs10908046	C	T	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=234;ReadPosRankSum=0.906;SC=GTCTGTCAAACAGGATTCCAG;SOR=0.395;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=37;TCR=2;TR=15;WE=69002208;WS=69002187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,16:0.41:39
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chr9	69002304	rs78546776	C	A	3293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FS=1.490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.344;SOR=0.602;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:207,94:0.31:301
chr9	69002317	rs76266132	T	C	3450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=41;PP=2962;ReadPosRankSum=1.544;SC=AACACTGCCATGAGGGTCTTA;SOR=0.720;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=304;TCF=168;TCR=136;TR=94;WE=69002325;WS=69002284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:228,104:0.31:332
chr9	69002413	rs62555122	T	C	1030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=2.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.21;ReadPosRankSum=1.936;SOR=1.005;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:129,37:0.22:166
chr9	69002423	rs62555123	G	A	1000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=0.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.58;ReadPosRankSum=2.037;SOR=0.532;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,32:0.24:132
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chr9	69256816	rs62557779	G	A	801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.03;MQRankSum=0.132;QD=9.43;ReadPosRankSum=0.072;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,41:0.48:85
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chr9	71114312	rs12685375	C	T	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.692;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=317;ReadPosRankSum=0.463;SC=CAGTGTGTCTCGCAGCTCCTG;SOR=0.368;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=49;TCF=6;TCR=43;TR=20;WE=71114320;WS=71114302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,20:0.41:49
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chr9	71478986	rs10869434	G	T	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.5;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5032;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=34;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TATATGTACAGATGTGAATAT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=71478994;WS=71478976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr9	71538069	rs2027208	A	G	1493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=19;PP=1044;SC=CCTGGGCCCCACGGGCTACAG;SOR=1.493;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=58;TCF=39;TCR=19;TR=57;WE=71538077;WS=71538059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr9	71538318	.	AT	A	94.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.835;ClippingRankSum=0.000;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=7.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.79;ReadPosRankSum=-0.918;SOR=0.072;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,9:0.26:34
chr9	71555492	rs10746973	A	G	2394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=22;PP=1408;SC=GACTCATTTCAATTATTATAG;SOR=1.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=57;TCR=22;TR=79;WE=71555500;WS=71555482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr9	71555522	rs10746974	C	T	3858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=39;PP=2376;SC=CTGCATTTATCCTTGAGATTC;SOR=1.335;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=119;TCF=80;TCR=39;TR=119;WE=71555530;WS=71555512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr9	71629062	.	A	G	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.347;ClippingRankSum=0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=72;ReadPosRankSum=0.663;SC=CGGCGGCGGCAGCGGCGGAGA;SOR=0.573;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=6;WE=71629070;WS=71629052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr9	71650752	rs2481598	A	G	1373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=30;NR=17;PP=710;SC=CACCCAGCCCAGCCCAGGCCC;SOR=1.077;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=30;TCR=17;TR=47;WE=71650760;WS=71650742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr9	71661116	rs1800652	G	A	243.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=199;SC=CCGGGAACCAGGGGAGAGGAG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=71661124;WS=71661106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	71668197	rs3829062	T	C	2976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=50;PP=1839;SC=ACTTCTTTTATTTTTCTGTTT;SOR=0.936;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=96;TCF=46;TCR=50;TR=96;WE=71668205;WS=71668187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr9	71686181	rs9314854	T	C	7098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=126;NR=108;PP=2965;SC=GATGGTTTGGTTCACTCATTT;SOR=0.732;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=234;TCF=126;TCR=108;TR=234;WE=71686189;WS=71686171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,263:1.00:263
chr9	71687400	rs3066313	C	CTG	1440.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=7;PP=1069;SC=CAGATATACACTAGCTCATTT;SOR=2.376;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=26;WE=71687408;WS=71687390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr9	71687440	rs7025834	C	T	2179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=23;PP=1457;SC=TTACTCCAGTCAATTTCTTGG;SOR=1.550;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=49;TCR=23;TR=72;WE=71687448;WS=71687430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr9	71687755	rs146039377	TTTG	T	413.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=369;SC=AGGTCTGTTTTTTGTTGTTGT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=8;WE=71687765;WS=71687745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	71820008	rs2498440	A	G	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.623;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=69;ReadPosRankSum=-0.000;SC=ACGTAACCACATGGAGTGATG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=6;WE=71820016;WS=71819998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr9	71831398	rs2498417	T	C	533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=405;ReadPosRankSum=-0.135;SC=CCTCCCTCGCTCCGCAGCCCC;SOR=0.776;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=44;TCF=13;TCR=31;TR=23;WE=71831406;WS=71831388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,23:0.48:48
chr9	71843023	rs2309428	C	A	6246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=102;PP=2965;SC=ACCAAGAGGACCCCCCAGGTG;SOR=0.950;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=199;TCF=97;TCR=102;TR=198;WE=71843031;WS=71843013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr9	71850853	rs2275431	G	A	540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.444;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=3;PP=429;ReadPosRankSum=0.867;SC=GAAGGTAAAGGGGAGATCAGA;SOR=1.098;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=58;TCF=50;TCR=8;TR=24;WE=71850861;WS=71850843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,23:0.43:54
chr9	71854737	rs72187140	TAAAC	T	355.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=245;ReadPosRankSum=1.314;SC=CCCAAATAAGTAAACAAACAA;SOR=0.793;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=6;WE=71854748;WS=71854727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr9	71854769	rs2993823	C	G	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=3.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=383;ReadPosRankSum=-1.410;SC=ATATCTCATACAGCCTTTACT;SOR=0.368;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=35;TCF=33;TCR=2;TR=19;WE=71854777;WS=71854759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,21:0.51:41
chr9	71865932	rs2282335	G	A	2250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.822;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.101;NF=66;NR=37;PP=1351;ReadPosRankSum=-0.273;SC=GGGTGAAAACGTGTCATTGCT;SOR=0.878;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=229;TCF=139;TCR=90;TR=103;WE=71865940;WS=71865922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,113:0.45:252
chr9	71986315	rs1034239	T	C	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.015;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=369;ReadPosRankSum=-0.228;SC=TTTAAAAAAATGTTCTCTTGG;SOR=0.197;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=47;TCF=42;TCR=5;TR=22;WE=71986323;WS=71986305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,24:0.46:52
chr9	71992199	rs41306153	C	T	922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=11;PP=573;ReadPosRankSum=-0.109;SC=ATGGAGGCAGCGTTATTATTA;SOR=0.719;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=71;TCF=53;TCR=18;TR=41;WE=71992207;WS=71992189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,43:0.57:75
chr9	71998936	rs35386391	C	T	1340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.159;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=34;PP=855;ReadPosRankSum=-0.056;SC=ACACAAGTGACTCAAGGTAAT;SOR=0.910;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=126;TCF=57;TCR=69;TR=58;WE=71998944;WS=71998926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,65:0.46:141
chr9	72000674	.	C	T	87	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=66;MMLQ=27;MQ=56.32;NF=7;NR=0;PP=87;QD=17.3958875067;SC=ATTTATGTTTCGCCTCTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=7;WE=72000682;WS=72000664;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
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chr9	72002911	rs5898077	T	TGTTATA	4953.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.447;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.090;NF=14;NR=35;PP=2800;ReadPosRankSum=0.408;SC=AATAACCTTGTGTTGTTTTCC;SOR=0.589;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=138;TCF=38;TCR=100;TR=49;WE=72002919;WS=72002901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,128:0.46:278
chr9	72006393	rs139462503	C	CT	250.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.853;HP=10;HapScore=3;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=224;ReadPosRankSum=-1.270;SC=GGGAAAATGCCTTTTTTTTTT;SOR=2.655;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=53;TCF=38;TCR=15;TR=20;WE=72006401;WS=72006383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,16:0.35:46
chr9	72047415	rs2991694	G	A	1722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=13;PP=1034;SC=ACCAGACGCGGCCCTCAGCAC;SOR=1.981;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=54;TCF=41;TCR=13;TR=53;WE=72047423;WS=72047405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr9	72047599	rs1217339	G	A	6986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=114;NR=122;PP=2965;SC=AGATCTGCCAGAGTCAAAGGC;SOR=0.867;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=236;TCF=114;TCR=122;TR=236;WE=72047607;WS=72047589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,259:1.00:259
chr9	72047635	rs3737172	C	T	4141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=56;NR=83;PP=2437;SC=GCAGACAGTGCGGTGGGGCTG;SOR=1.334;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=56;TCR=83;TR=139;WE=72047643;WS=72047625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr9	72064749	rs2781532	T	C	2219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=43;PP=1186;SC=CCTCCATCAGTGACCATCTGG;SOR=1.090;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=30;TCR=43;TR=73;WE=72064757;WS=72064739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr9	72086415	rs1761287	T	C	2025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=12;PP=1348;SC=CAGCTATCATTCTTTGAGTCT;SOR=2.517;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=47;TCR=12;TR=59;WE=72086423;WS=72086405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr9	72090806	rs2781542	T	G	2045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=17;PP=1412;SC=GACATGGCTTTAACAGGTGAA;SOR=1.931;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=49;TCR=17;TR=66;WE=72090814;WS=72090796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr9	72091104	rs2777862	G	T	1254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=32;PP=886;SC=TGAGAGACTCGGCAGACACTT;SOR=3.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=6;TCR=32;TR=38;WE=72091112;WS=72091094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr9	72338180	rs11139996	T	C	1048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=5;PP=818;SC=TAACTAACACTTTCTGCAGCT;SOR=2.964;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=33;WE=72338188;WS=72338170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr9	72373624	rs10735564	A	G	7300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=126;NR=132;PP=2965;SC=TCATCACCTTAGAGGAAAAGA;SOR=0.904;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=261;TCF=126;TCR=135;TR=258;WE=72373632;WS=72373600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,279:1.00:279
chr9	72373716	rs10780612	G	C	1923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=46;PP=1361;SC=AAAAAATCATGAGCTCCAGTC;SOR=2.507;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=64;TCF=14;TCR=50;TR=60;WE=72373724;WS=72373706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr9	72373752	rs10780613	A	C	216.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.97;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr9	72374677	rs2274745	T	G	1827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=15;PP=1276;SC=CAGGACCCGCTGTCCGCCCGC;SOR=2.139;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=67;TCF=52;TCR=15;TR=66;WE=72374685;WS=72374667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr9	72374941	rs2274744	C	A	885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.54;SOR=3.334;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr9	72374969	rs2252130	T	C	322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=11;PP=298;SC=CTAGGCCGCGTCCCCGCCGCC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=72374977;WS=72374959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	72459567	rs10780678	G	T	2567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.989;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=53;PP=1439;ReadPosRankSum=-1.857;SC=TACTTCGTTTGAAGTCTGAAA;SOR=0.624;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=212;TCF=108;TCR=104;TR=109;WE=72459575;WS=72459557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,123:0.52:238
chr9	72459640	rs11140621	G	A	1457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.680;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=38;PP=822;ReadPosRankSum=2.831;SC=ACCATCCCTCGTTAACTGTGT;SOR=0.802;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=114;TCF=49;TCR=65;TR=64;WE=72459648;WS=72459630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,70:0.56:126
chr9	72472746	rs35585376	TA	T	833.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.249;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.734;NF=14;NR=4;PP=611;ReadPosRankSum=0.500;SC=GCCCAGCCCCTAAATTAGTTT;SOR=1.981;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=32;TCF=23;TCR=9;TR=18;WE=72472754;WS=72472736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,28:0.68:41
chr9	72473053	rs1133275	T	C	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=170;ReadPosRankSum=-1.024;SC=TCCTTTCACATGCACAACATT;SOR=0.480;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=9;TCR=36;TR=14;WE=72473061;WS=72473043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,15:0.31:49
chr9	72501698	rs4407955	G	T	2358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=25;PP=1487;SC=CAATAAAAATGTAAAATATTT;SOR=1.637;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=55;TCR=25;TR=80;WE=72501706;WS=72501688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr9	72501962	rs4548246	T	C	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.628;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=81;ReadPosRankSum=-0.684;SC=ATTGGAATCATGACAATGTTT;SOR=0.036;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=10;WE=72501970;WS=72501952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr9	72517162	rs12344550	T	C	2799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.177;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=57;PP=1965;ReadPosRankSum=-0.218;SC=CTCACAATTCTCTTGACAGGT;SOR=0.565;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=219;TCF=125;TCR=94;TR=124;WE=72517170;WS=72517152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,131:0.54:242
chr9	72517293	rs11140833	G	T	1445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.207;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=43;PP=977;ReadPosRankSum=0.356;SC=ACATTCTAAAGTCCTCAAAAC;SOR=0.942;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=130;TCF=48;TCR=82;TR=64;WE=72517301;WS=72517283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,68:0.47:145
chr9	72740974	rs1927112	A	G	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.350;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=9;PP=423;ReadPosRankSum=0.736;SC=CACCATTCCCACTGGATTATT;SOR=1.090;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=36;TCR=16;TR=29;WE=72740982;WS=72740964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,31:0.53:58
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chr9	72783608	rs10780871	T	C	1943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=28;PP=1038;ReadPosRankSum=-0.334;SC=TTTATTTTTATGAATTTCAGG;SOR=0.669;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=136;TCF=87;TCR=49;TR=78;WE=72783616;WS=72783598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,89:0.58:153
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chr9	72933958	rs7025228	G	C	2039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=42;PP=1303;SC=AATAACAACAGCATTTCCACA;SOR=1.852;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=20;TCR=42;TR=62;WE=72933966;WS=72933948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr9	72965438	rs1536957	A	G	793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=20;PP=554;SC=ATCTCCTGTGACATAATCATA;SOR=2.147;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=27;WE=72965446;WS=72965428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
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chr9	73150873	rs17535963	T	G	3328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.864;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=71;PP=1979;ReadPosRankSum=0.251;SC=GAAGGTTTAGTTGTGCTTGCT;SOR=0.621;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=289;TCF=156;TCR=133;TR=151;WE=73150881;WS=73150863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,163:0.53:309
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chr9	73150984	rs6560142	C	T	3607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=72;PP=2296;ReadPosRankSum=0.064;SC=GAAGGGATTTCGCAGGCTTGC;SOR=0.671;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=272;TCF=141;TCR=131;TR=149;WE=73150992;WS=73150974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,164:0.54:303
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chr9	73151970	rs3739776	C	T	1988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.211;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=47;PP=1215;ReadPosRankSum=1.174;SC=TCATATTGACCGAATAGAAAG;SOR=0.753;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=220;TCF=116;TCR=104;TR=91;WE=73151978;WS=73151960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,99:0.41:240
chr9	73164611	rs1889914	G	A	1130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.080;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.910;NF=18;NR=39;PP=1047;ReadPosRankSum=1.247;SC=AAAAAAAAAGGAAGTCTTGAG;SOR=1.590;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=140;TCF=57;TCR=83;TR=57;WE=73164619;WS=73164586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,51:0.44:115
chr9	73164712	rs1889915	T	C	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.514;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=347;ReadPosRankSum=-0.175;SC=AGATTCCTTGTTAAGTCTCAA;SOR=1.151;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=61;TCF=17;TCR=44;TR=22;WE=73164720;WS=73164690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,23:0.37:62
chr9	73213610	rs4744605	A	G	1655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=33;PP=985;SC=AGGAGAGCAGAGTTAGGTCTG;SOR=1.392;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=19;TCR=33;TR=52;WE=73213618;WS=73213600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr9	73213644	rs4744606	A	C	722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=17;PP=388;SC=TTTTCAGCCCAGTTGGGAAGT;SOR=1.942;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=24;WE=73213652;WS=73213634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr9	73234066	rs7849400	G	A	1804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=37;PP=1017;SC=GACTTATAAGGTAAAAGTGGA;SOR=1.508;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=23;TCR=37;TR=60;WE=73234074;WS=73234056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr9	73234970	rs3812533	C	A	1788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.671;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=37;PP=1161;ReadPosRankSum=-1.421;SC=CCTGACCAGCCCATTTTGCTG;SOR=0.846;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=204;TCF=118;TCR=86;TR=87;WE=73234978;WS=73234960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,90:0.41:222
chr9	73240312	rs7035025	C	G	2193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=30;NR=50;PP=1592;SC=AGGGATTCTACTTCACGTATT;SOR=1.581;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=30;TCR=50;TR=80;WE=73240320;WS=73240302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr9	73240335	rs113701331	T	TA	427.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=1.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.51;ReadPosRankSum=0.477;SOR=0.481;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,22:0.49:45
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chr9	73240674	rs56697575	C	T	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.260;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=47;ReadPosRankSum=0.475;SC=CTCTTGATATCATTTGGTTTC;SOR=0.223;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=5;WE=73240682;WS=73240664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
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chr9	73408407	rs11142597	T	A	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.944;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.31;ReadPosRankSum=-0.751;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr9	73408518	rs10868890	T	G	2250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.481;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=39;PP=1386;ReadPosRankSum=2.630;SC=TGATCAAACATTCCTCTTCCC;SOR=0.757;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=214;TCF=130;TCR=84;TR=102;WE=73408526;WS=73408508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,112:0.47:239
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chr9	73408735	rs1328159	C	T	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=232;ReadPosRankSum=0.075;SC=GTACTCATACCACCATTCGTC;SOR=1.230;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=12;WE=73408743;WS=73408725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr9	73442635	rs1034539	G	A	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=103;ReadPosRankSum=-0.780;SC=GCTCTGGCCCGGTAGAAATAA;SOR=0.368;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=10;WE=73442643;WS=73442625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,10:0.33:30
chr9	73442724	rs1034538	C	T	6166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=122;NR=80;PP=2965;SC=TTCAGCATACCTCCTACGAGC;SOR=1.115;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=203;TCF=123;TCR=80;TR=202;WE=73442732;WS=73442714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr9	73442843	rs139537011	C	G	2383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.661;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=55;PP=1294;ReadPosRankSum=-2.146;SC=TCCAGTGGTCCCGTTGTCAGC;SOR=0.857;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=229;TCF=117;TCR=112;TR=105;WE=73442851;WS=73442833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,121:0.45:269
chr9	73457832	rs1337031	G	A	933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.153;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=14;PP=503;ReadPosRankSum=0.516;SC=ATACTATAATGTGCACATTTT;SOR=0.438;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=62;TCF=42;TCR=20;TR=37;WE=73457840;WS=73457822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,43:0.61:70
chr9	73457861	rs1337030	A	G	1428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=22;PP=905;ReadPosRankSum=1.533;SC=ATTTTATTATACTTTTCTGAT;SOR=0.758;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=112;TCF=69;TCR=43;TR=59;WE=73457869;WS=73457851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,67:0.55:122
chr9	73458045	rs3833697	T	TA	688.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=241;ReadPosRankSum=-0.367;SC=GAATAACACCTAAAAAAAAAA;SOR=0.751;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=64;TCF=4;TCR=60;TR=22;WE=73458053;WS=73458035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,36:0.46:79
chr9	73461337	rs7862440	T	A	3076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=65;PP=1780;ReadPosRankSum=1.119;SC=CAGTTGTCATTGCTGCTTTGA;SOR=0.667;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=272;TCF=135;TCR=137;TR=130;WE=73461345;WS=73461327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,152:0.50:304
chr9	73461558	rs10868907	G	C	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=115;ReadPosRankSum=0.064;SC=ACTGGCTGAGGCTGGTTATCT;SOR=0.892;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=7;WE=73461566;WS=73461548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr9	73479213	rs10780981	C	T	478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.958;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=274;ReadPosRankSum=1.633;SC=ATAAGATTGCCTCAAAGATGT;SOR=0.148;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=19;WE=73479221;WS=73479203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr9	73735946	rs73647947	T	C	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.123;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=67;ReadPosRankSum=-0.193;SC=GCAGGAGTACTGAGAACCTCT;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=5;WE=73735954;WS=73735937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr9	74300640	rs2310021	A	G	1242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=23;PP=666;ReadPosRankSum=-0.970;SC=GAACTTCATGAAATAATACAA;SOR=0.726;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=101;TCF=53;TCR=48;TR=50;WE=74300648;WS=74300630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,59:0.52:113
chr9	74314210	rs4263836	A	T	93.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.7089;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=4;NR=1;PP=44;SC=TTAAGTCTAAACAAAAATTGA;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=5;WE=74314218;WS=74314200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr9	74326961	rs3739781	A	G	1233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.771;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=17;PP=775;ReadPosRankSum=-1.267;SC=TCCTTTTTTCACCATAGTCAC;SOR=0.465;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=96;TCF=68;TCR=28;TR=54;WE=74326969;WS=74326951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,60:0.58:104
chr9	74331376	rs4745117	A	C	566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.538;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=5;PP=375;ReadPosRankSum=-0.749;SC=CAGAAAAAAAAATCAAGGGTT;SOR=1.828;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=61;TCF=43;TCR=18;TR=26;WE=74331384;WS=74331366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,27:0.43:63
chr9	74349917	.	CA	C	173.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQRankSum=0.000;QD=7.55;ReadPosRankSum=1.705;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,16:0.70:23
chr9	74350002	rs2274698	A	C	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.881;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=86;ReadPosRankSum=-0.503;SC=TTCACAAATCAAAAGTTAAGA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=5;WE=74350010;WS=74349992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
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chr9	74360096	rs25689	C	T	2822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=56;PP=1443;ReadPosRankSum=0.532;SC=GCTCTCATTGCGGTATTCATG;SOR=0.674;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=213;TCF=104;TCR=109;TR=110;WE=74360104;WS=74360086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,133:0.53:252
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chr9	74526540	rs4744647	T	A	2845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=19;PP=1797;SC=AGGCTGCGTTTGTTTCTTCCG;SOR=2.448;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=67;TCR=19;TR=86;WE=74526548;WS=74526530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr9	74526978	rs10580392	GCA	G	187.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=157;SC=TTAACTAATTGCACAGAGTGA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=74526987;WS=74526968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr9	74561883	rs10120169	G	A	1766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=24;PP=1002;SC=GCTGGCTCACGCGTGAAATTC;SOR=0.925;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=32;TCR=24;TR=56;WE=74561891;WS=74561873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr9	74586309	rs7866397	C	T	167.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=132;SC=GAAATTGAAACCTAGGAATTT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=74586317;WS=74586299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr9	74622853	rs10120981	G	A	779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.090;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.663;NF=14;NR=17;PP=400;ReadPosRankSum=-0.774;SC=AGCTGGGCCCGCGACTCGAAG;SOR=0.941;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=48;TCF=23;TCR=25;TR=31;WE=74622861;WS=74622843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,36:0.65:55
chr9	74671719	rs13295099	T	C	952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.736;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-1.155;NF=23;NR=21;PP=559;ReadPosRankSum=-0.051;SC=GGACCTCTTCTTTCCAGTACT;SOR=0.745;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=96;TCF=51;TCR=45;TR=44;WE=74671727;WS=74671709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,48:0.47:103
chr9	74675343	rs10869090	A	G	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=269;ReadPosRankSum=-0.090;SC=GATAGTTAATACTTATTAAAA;SOR=0.711;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=16;WE=74675351;WS=74675333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr9	74825707	rs11143170	T	C	2838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=76;PP=1495;ReadPosRankSum=1.263;SC=AAATGAAGCATGATTTATGGG;SOR=0.666;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=278;TCF=117;TCR=161;TR=133;WE=74825715;WS=74825697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,144:0.48:298
chr9	74828718	rs200145454	CAAAAAAA	C	963.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.712;HP=17;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=431;ReadPosRankSum=2.575;SC=GACTCCGTCTCAAAAAAAAAA;SOR=5.242;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=53;TCF=42;TCR=11;TR=21;WE=74828733;WS=74828708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,27:0.75:36
chr9	74828973	rs17494333	A	G	2408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=61;PP=1369;ReadPosRankSum=-0.746;SC=ATGGAGTTAGAGATGGAAAAA;SOR=0.721;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=201;TCF=76;TCR=125;TR=99;WE=74828981;WS=74828963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,115:0.50:228
chr9	74834384	rs10869148	C	T	1243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=20;PP=710;ReadPosRankSum=0.056;SC=CCATTTGTTGCTTTATTTCAG;SOR=0.678;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=118;TCF=74;TCR=44;TR=56;WE=74834392;WS=74834374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,63:0.49:129
chr9	74842851	rs17579467	C	T	1143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=23;PP=635;ReadPosRankSum=0.850;SC=GGGCACTCTTCTCTCCAGACA;SOR=0.675;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=117;TCF=61;TCR=56;TR=52;WE=74842859;WS=74842841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,58:0.46:127
chr9	74845989	rs10869150	C	A	1260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.345;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=13;PP=760;ReadPosRankSum=2.087;SC=TTTATTGGAACCACATGGATC;SOR=1.036;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=121;TCF=84;TCR=37;TR=54;WE=74845997;WS=74845979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,60:0.45:133
chr9	74846104	rs17057536	A	G	1849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=52;PP=1232;ReadPosRankSum=0.852;SC=ACAGGTTAGTAGTTCACCATT;SOR=0.649;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=175;TCF=69;TCR=106;TR=85;WE=74846112;WS=74846094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,89:0.49:183
chr9	74846187	rs34627726	TA	T	146.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.876;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.992;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr9	74863449	rs3830994	AG	A	185.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=224;ReadPosRankSum=0.812;SC=TCTGGTTGAGAGGGTTCATAA;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=7;WE=74863457;WS=74863439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr9	74974534	rs3012505	C	T	852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=25;PP=532;ReadPosRankSum=-0.436;SC=TAGAATATTTCCAAAATGAGC;SOR=0.616;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=31;TCR=50;TR=41;WE=74974542;WS=74974524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,43:0.52:83
chr9	74975136	rs2809270	T	C	2273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=28;PP=1432;SC=CACTAGCTGTTCCTATTTAAA;SOR=0.934;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=45;TCR=28;TR=73;WE=74975144;WS=74975126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr9	74975711	rs1853276	T	C	5429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=98;PP=2795;SC=CTGCTATAGATGAAACGAAAT;SOR=0.973;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=185;TCF=87;TCR=98;TR=185;WE=74975719;WS=74975701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr9	74975736	rs11143275	T	A	1394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.799;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=43;PP=960;ReadPosRankSum=0.356;SC=GAAATTAGTGTTATCACCAAA;SOR=1.082;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=144;TCF=63;TCR=81;TR=67;WE=74975744;WS=74975726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,69:0.43:162
chr9	74979593	rs2224603	G	C	508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.34;SOR=2.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	74979593	.	GCAGCC	CCAGCC,CCAGCT	131	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000,0.5000;HP=4;HapScore=3;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=2,1;NR=12,6;PP=131,108;QD=11.8408008962;SC=GCTCCCACCCGCAGCCCCGTA;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14,7;WE=74979606;WS=74979583;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:14
chr9	74979598	.	C	T	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.154;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.67;ReadPosRankSum=0.771;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr9	75303653	rs2589615	C	T	2282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.939;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=48;PP=1369;ReadPosRankSum=-1.235;SC=AAAAAGAAGACGAGACTGAGG;SOR=0.891;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=266;TCF=142;TCR=124;TR=111;WE=75303661;WS=75303643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,120:0.41:290
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chr9	75315629	.	CATAT	C	108	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=15;MQ=61.53;NF=0;NR=2;PP=108;QD=55.5;SC=CTGAATATTCCATATATATAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=2;WE=75315640;WS=75315619;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,2:0.29:7
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chr9	75420448	rs111880209	CT	C	74.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.02;MQRankSum=1.657;QD=3.25;ReadPosRankSum=0.522;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
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chr9	75543974	rs8187922	T	TAA	3009.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=44;PP=2213;SC=TAAAATTCCATAAGTTTTAGA;SOR=2.584;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=48;TCF=1;TCR=47;TR=45;WE=75543982;WS=75543964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr9	75544038	rs2288087	A	T	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.087;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.06;ReadPosRankSum=0.657;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr9	75545882	rs13959	G	A	1743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.149;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.99;MQRankSum=0.948;NF=45;NR=29;PP=894;ReadPosRankSum=2.149;SC=TACGCCACGGGGATCCAATCT;SOR=0.589;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=158;TCF=96;TCR=62;TR=74;WE=75545890;WS=75545872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,86:0.47:184
chr9	75554952	rs7027604	A	C	2218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=20;PP=1423;SC=GCTGCCCCAGAAACCATATTT;SOR=1.522;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=72;TCF=50;TCR=22;TR=70;WE=75554960;WS=75554942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr9	75554982	rs348449	G	A	3477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=71;NR=44;PP=2084;SC=GTCTTTTGGAGCTTGCAATGG;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=116;TCF=71;TCR=45;TR=115;WE=75554990;WS=75554972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr9	75769169	.	G	T	1614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.900;ClippingRankSum=0.000;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.205;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=27;PP=953;ReadPosRankSum=-0.505;SC=TATGCACAAGGCCGTGCATTT;SOR=0.841;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=160;TCF=96;TCR=64;TR=69;WE=75769177;WS=75769159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,79:0.45:175
chr9	75782510	rs1342017	G	A	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=13;PP=265;ReadPosRankSum=-0.190;SC=CTTAGAGGAAGAATTATTTGT;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=45;TCF=20;TCR=25;TR=23;WE=75782518;WS=75782500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,27:0.50:54
chr9	75783937	rs3739959	A	G	959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=17;PP=549;ReadPosRankSum=-2.597;SC=ACCCTCATTTATTTTGGCCAG;SOR=0.693;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=108;TCF=69;TCR=39;TR=44;WE=75783945;WS=75783927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,50:0.40:126
chr9	77230423	rs3904059	A	T	2090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=19;PP=1213;SC=GCCTGTTGGGATTGAAGTTGT;SOR=1.493;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=49;TCR=19;TR=68;WE=77230431;WS=77230413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr9	77230477	rs3904058	A	G	3423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=40;PP=2059;SC=AGTGAAAAGTATCATATTTTT;SOR=1.225;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=71;TCR=40;TR=111;WE=77230485;WS=77230467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr9	77245162	rs2146777	A	T	4969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=56;PP=2962;SC=GAAAGAAAACATCTGTATGCT;SOR=1.445;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=161;TCF=105;TCR=56;TR=160;WE=77245170;WS=77245152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr9	77282927	rs1327838	T	C	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=284;ReadPosRankSum=2.193;SC=AACAGAGCTATATTTTCTTTA;SOR=0.399;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=14;WE=77282935;WS=77282917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr9	77286876	rs3818559	A	C	1251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=33;PP=817;ReadPosRankSum=0.392;SC=AGCAAAAAGGACTGCTTATAA;SOR=0.622;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=88;TCF=30;TCR=58;TR=51;WE=77286884;WS=77286866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,55:0.59:94
chr9	77397519	rs12339024	T	C	1973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.996;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=34;PP=1295;ReadPosRankSum=1.630;SC=ATTTAGATGATTGTTTTTCAG;SOR=0.519;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=149;TCF=88;TCR=61;TR=79;WE=77397527;WS=77397509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,87:0.54:160
chr9	77400718	rs55720633	T	C	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=308;ReadPosRankSum=0.532;SC=GGATTACAGGTGTGAGCCACC;SOR=1.270;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=17;WE=77400726;WS=77400708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,19:0.73:26
chr9	77407636	rs4145894	C	T	3132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-3.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=71;PP=1726;ReadPosRankSum=-1.894;SC=AACCAAAATGCTGATTTTCAT;SOR=0.683;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=289;TCF=141;TCR=148;TR=139;WE=77407644;WS=77407626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,157:0.50:317
chr9	77436641	rs7018994	G	A	2531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.987;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=54;PP=1505;ReadPosRankSum=-0.853;SC=CCCTACCTGTGCCCTCACACA;SOR=0.628;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=218;TCF=108;TCR=110;TR=110;WE=77436649;WS=77436631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,120:0.50:238
chr9	77442616	rs7045949	C	T	2057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.836;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=37;PP=1358;ReadPosRankSum=0.065;SC=AGAGTGAGCTCTGATGGTCAG;SOR=0.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=164;TCF=95;TCR=69;TR=89;WE=77442624;WS=77442606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,95:0.52:182
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chr9	77502160	rs1333342	G	A	783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.705;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=20;PP=449;ReadPosRankSum=0.997;SC=AACCGGCGCTGTCATCGCTCC;SOR=0.489;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=84;TCF=37;TCR=47;TR=38;WE=77502168;WS=77502150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,41:0.43:96
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chr9	77669152	rs13294415	G	C	507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=15;PP=336;SC=GAGGCAAAAAGGGAGAATTTG;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=77669160;WS=77669142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
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chr9	77692555	rs60305501	CT	C	297.86	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=2.884;HP=12;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=101;ReadPosRankSum=1.421;SC=TCATTAAACACTTTTTTTTTT;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=8;WE=77692563;WS=77692545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,15:0.88:17
chr9	77697929	rs2273767	C	G	4599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=60;PP=2642;SC=CTCCGTCCCCCACTCCATCCA;SOR=1.017;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=158;TCF=98;TCR=60;TR=158;WE=77697937;WS=77697919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr9	77703431	rs73544571	C	T	771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=5;PP=530;SC=GGGCGGAGCACTCGGCGGAGC;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=26;WE=77703439;WS=77703421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr9	77745424	rs2295861	T	C	2552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=26;PP=1682;SC=CCCTAGGAGCTAGATAATTTG;SOR=1.286;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=50;TCR=26;TR=76;WE=77745432;WS=77745414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
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chr9	77748151	rs7040349	G	A	596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.855;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=379;ReadPosRankSum=1.087;SC=TGATTTAAAAGCAAAATAAAA;SOR=0.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=79;TCF=54;TCR=25;TR=27;WE=77748159;WS=77748141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,30:0.34:88
chr9	77749436	rs10869508	T	C	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=104;ReadPosRankSum=-0.176;SC=AAAATTATAATTGTACTAAAA;SOR=1.002;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=22;TCF=8;TCR=14;TR=9;WE=77749444;WS=77749426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr9	77752675	rs2025159	A	G	1443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=41;PP=1121;SC=GTATCATGGAATAGTTATGAT;SOR=3.657;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=6;TCR=41;TR=47;WE=77752683;WS=77752665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr9	78600898	rs4322070	C	G	1155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.558;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=8;PP=891;ReadPosRankSum=-0.280;SC=TAAGGAATCTCTGAGCACTTA;SOR=1.697;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=71;TCF=55;TCR=16;TR=44;WE=78600906;WS=78600888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,45:0.59:76
chr9	78601268	rs1538843	G	A	569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=14;PP=350;SC=ACCAGGGATTGTTTCCTATTT;SOR=4.514;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=78601276;WS=78601258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr9	78722328	rs2297343	C	T	1743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.776;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=36;PP=1049;ReadPosRankSum=1.702;SC=GGAAAACGTACCCCTTCCCTT;SOR=0.573;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=173;TCF=86;TCR=87;TR=73;WE=78722336;WS=78722318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,83:0.43:192
chr9	78748980	.	CT	C	134.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.014;ClippingRankSum=0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.64;ReadPosRankSum=0.209;SOR=0.262;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,14:0.27:51
chr9	78773953	rs2297342	G	A	3305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=366;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=79;PP=2235;ReadPosRankSum=-0.783;SC=CAGGCTGCTCGGATAACCCCA;SOR=0.675;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=340;TCF=168;TCR=172;TR=155;WE=78773961;WS=78773943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:200,163:0.45:363
chr9	78790148	.	GAATGA	G	244.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.361;ClippingRankSum=0.000;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=8.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=0.559;QD=4.29;ReadPosRankSum=3.177;SOR=2.187;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,12:0.21:57
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chr9	78803931	rs2270571	A	T	2640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=25;PP=1436;SC=CATTTTCTCAAACTGTTAAAG;SOR=1.337;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=59;TCR=25;TR=84;WE=78803939;WS=78803921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr9	78804711	rs139022349	CTACTTTCAGGACTAAT	C	1587.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=2970;ReadPosRankSum=0.340;SC=TATGATCTTTCTACTTTCAGG;SOR=0.690;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=1;TCR=50;TR=18;WE=78804734;WS=78804701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,43:0.43:99
chr9	78808034	rs17776908	A	G	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=4.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.576;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=185;ReadPosRankSum=-0.123;SC=CTACTCCTGAATGATCTCTTC;SOR=3.150;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=9;WE=78808042;WS=78808024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
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chr9	78809646	rs34619779	T	C	1261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=12;PP=719;ReadPosRankSum=-0.442;SC=ATCTTATAGATCTTTTGACAG;SOR=0.612;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=73;TCF=52;TCR=21;TR=44;WE=78809654;WS=78809636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,56:0.63:89
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chr9	78917015	rs11451259	T	TA	786.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=17;NR=9;PP=280;SC=CTTTTTGCATTAAAAAAAAAC;SOR=2.147;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=26;WE=78917023;WS=78917005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
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chr9	78936358	rs1110222	G	A	1879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.770;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=34;PP=1113;ReadPosRankSum=-1.389;SC=GCAGAAGACGGCATATGTGAA;SOR=0.862;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=177;TCF=103;TCR=74;TR=84;WE=78936366;WS=78936348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,91:0.46:196
chr9	78936492	rs1110223	A	G	3832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=391;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.366;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=78;PP=2520;ReadPosRankSum=0.990;SC=CGTGGCTGTGAAGGGGGTATG;SOR=0.658;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=358;TCF=197;TCR=161;TR=169;WE=78936500;WS=78936482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:208,183:0.47:391
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chr9	78937901	rs55903217	T	C	1420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=10.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.29;ReadPosRankSum=1.460;SOR=0.090;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,36:0.59:61
chr9	78937901	.	TAC	CAT	1017	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=23;NR=8;PP=1017;QD=34.5312217697;SC=GGAGCTAGCCTACTGCAGACA;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=61;TCF=47;TCR=14;TR=31;WE=78937911;WS=78937891;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:30,31:0.51:61
chr9	78937903	rs55805812	C	T	1420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=6.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.20;ReadPosRankSum=1.727;SOR=0.199;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,37:0.58:64
chr9	78937929	rs56332566	AC	A	1935.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQ=60.18;MQRankSum=1.132;NF=21;NR=24;PP=1147;ReadPosRankSum=0.132;SC=CCTTTCTCCTACCCCCCGGGG;SOR=0.655;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=85;TCF=42;TCR=43;TR=45;WE=78937938;WS=78937919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,74:0.62:120
chr9	78937974	rs3001772	C	T	6454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=127;NR=86;PP=2965;SC=CCAGAGTGCACGCCTGAGTTC;SOR=1.063;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=213;TCF=127;TCR=86;TR=213;WE=78937982;WS=78937964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr9	78938043	rs2495207	G	A	3389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.445;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.223;NF=72;NR=68;PP=1916;ReadPosRankSum=1.180;SC=GCAGACTCGCGCCACTGTGTC;SOR=0.639;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=241;TCF=124;TCR=117;TR=140;WE=78938051;WS=78938033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,157:0.58:273
chr9	78938186	rs2803429	G	C	1456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.672;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=32;PP=902;ReadPosRankSum=-0.153;SC=TTATGAAAAGGAGACTAAGGA;SOR=0.793;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=111;TCF=53;TCR=58;TR=60;WE=78938194;WS=78938176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,66:0.53:124
chr9	78938236	rs55762660	G	A	1265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=2.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.83;ReadPosRankSum=-1.504;SOR=0.403;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,37:0.52:71
chr9	78938246	rs2803430	T	C	997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=2.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.82;ReadPosRankSum=-1.010;SOR=0.403;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,26:0.46:56
chr9	78938256	rs2259775	C	G	850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=1.330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.72;ReadPosRankSum=-2.364;SOR=0.432;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,23:0.48:48
chr9	78942956	rs2259969	A	G	4707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=105;NR=70;PP=2929;SC=CCTGCTCATCATCTGGGACCT;SOR=1.110;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=175;TCF=105;TCR=70;TR=175;WE=78942964;WS=78942946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr9	78965680	rs74756265	C	T	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.064;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=301;ReadPosRankSum=-0.792;SC=CTAAGTGTTCCGGAACAAAGA;SOR=0.509;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=59;TCF=45;TCR=14;TR=25;WE=78965688;WS=78965670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,27:0.41:66
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chr9	79003324	rs2501926	G	A	925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=22;PP=609;SC=AAAGAAGATAGATTCACGTAA;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=31;WE=79003332;WS=79003314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
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chr9	79253347	rs3739518	T	C	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=3.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=198;ReadPosRankSum=-0.244;SC=ATGTTGACTATAGGTCTGTAG;SOR=1.292;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=9;WE=79253355;WS=79253337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr9	79259850	rs512951	A	G	1879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.545;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=48;PP=1293;ReadPosRankSum=0.841;SC=GCACAGAGCAAGGCTGAAGGA;SOR=0.968;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=156;TCF=70;TCR=86;TR=82;WE=79259858;WS=79259840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,87:0.51:169
chr9	79520956	rs45438993	G	A	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.611;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=78;ReadPosRankSum=-1.242;SC=GACGAGCGGGGTCCCGGGAAA;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=5;WE=79520964;WS=79520946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
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chr9	79827964	rs17723908	G	C	1554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.245;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=36;PP=971;ReadPosRankSum=0.695;SC=TACTGTGTTTGTCAACTCATG;SOR=0.948;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=115;TCF=57;TCR=58;TR=64;WE=79827972;WS=79827954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,72:0.55:131
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chr9	79867082	rs17337881	A	C	1126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-3.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.463;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=8;PP=703;ReadPosRankSum=-0.299;SC=GTGACTATGAAGTATTAATAG;SOR=0.348;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=77;TCF=64;TCR=13;TR=43;WE=79867090;WS=79867072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,48:0.56:85
chr9	79888146	rs17063468	G	A	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.784;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=495;ReadPosRankSum=-1.313;SC=TTGAATAAGCGGTGAATAAAC;SOR=1.324;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=54;TCF=37;TCR=17;TR=30;WE=79888154;WS=79888136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,31:0.52:60
chr9	79888396	rs2050831	A	G	205.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=4;PP=110;SC=TCCTTTTAAAATCTAGGTTCT;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=79888404;WS=79888386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
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chr9	79896655	.	GTA	G	130	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=26;MQ=60.42;NF=4;NR=1;PP=130;QD=27.4;SC=GTGTATATGTGTATATATATA;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=5;WE=79896664;WS=79896645;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr9	79910414	rs1317304	G	T	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.142;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=336;ReadPosRankSum=-0.577;SC=TTAATAAGTCGTATTTATTAA;SOR=0.137;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=43;TCF=36;TCR=7;TR=23;WE=79910422;WS=79910404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,22:0.52:42
chr9	79922839	rs2275549	A	G	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=2.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.91;ReadPosRankSum=0.095;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr9	79946961	rs17424026	C	T	1471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=30;PP=935;ReadPosRankSum=-0.961;SC=TGTCTGTTTACGAAGGGGATA;SOR=0.687;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=113;TCF=63;TCR=50;TR=66;WE=79946969;WS=79946951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,71:0.57:125
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chr9	80915403	rs10121107	A	T	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.352;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=6;PP=188;ReadPosRankSum=-0.645;SC=TGGGGATGGAAGCCTGGGGAC;SOR=0.446;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=30;TCF=18;TCR=12;TR=14;WE=80915411;WS=80915393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,15:0.45:33
chr9	80921446	rs944513	G	T	1135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.230;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=32;PP=764;ReadPosRankSum=1.250;SC=CTGACTCGGTGTCTGCAGGGA;SOR=0.906;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=118;TCF=55;TCR=63;TR=54;WE=80921454;WS=80921436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,58:0.44:132
chr9	80923609	rs2039323	CA	TG	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=470;ReadPosRankSum=1.121;SC=CGGTGGCTCACACCTGTAATC;SOR=0.569;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=10;WE=80923618;WS=80923599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
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chr9	82187750	rs1934610	A	G	11823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=454;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=195;NR=222;PP=2965;ReadPosRankSum=1.103;SC=CCAGACACCCAGTGAGTGCGG;SOR=0.295;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=418;TCF=195;TCR=223;TR=417;WE=82187758;WS=82187740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,452:1.00:453
chr9	82189914	rs2791566	T	C	4128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=77;PP=2164;SC=AACAAGAATATGTTTAAATTG;SOR=1.049;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=143;TCF=65;TCR=78;TR=142;WE=82189922;WS=82189904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr9	82267732	rs2297499	C	G	1651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.704;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=43;PP=1056;ReadPosRankSum=-0.479;SC=CTTGGAATGCCAATCTGAGAT;SOR=0.845;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=195;TCF=97;TCR=98;TR=82;WE=82267740;WS=82267722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,87:0.41:212
chr9	82308390	rs11138336	G	A	567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=337;ReadPosRankSum=-0.096;SC=TTGCTTGTACGCATTAGGTTG;SOR=0.787;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=65;TCF=49;TCR=16;TR=25;WE=82308398;WS=82308380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,28:0.38:73
chr9	82308670	rs7025437	A	G	1145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=34;PP=988;SC=TGTCCTTCGAACCATATTTAG;SOR=4.294;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=3;TCR=34;TR=37;WE=82308678;WS=82308660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr9	82320887	rs4877147	A	T	6308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=121;PP=2965;SC=AATTTTTTGCACTTGCCCAGC;SOR=1.087;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=216;TCF=95;TCR=121;TR=216;WE=82320895;WS=82320877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr9	82333505	rs74917162	A	G	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=3.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=127;ReadPosRankSum=0.478;SC=TTTACACTGTATGGACAAATT;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=7;WE=82333513;WS=82333495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr9	82335290	.	T	TGGGG	595	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MMLQ=27;MQ=67.75;NF=3;NR=11;PP=595;QD=48.3598931695;SC=TATATAGGTATGGGTGTGTGT;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=14;WE=82335298;WS=82335280;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:1,14:0.93:15
chr9	82335294	rs7875032	T	G	872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=68.66;QD=41.56;SOR=1.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr9	82335296	rs7875033	T	G	872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=68.66;QD=41.56;SOR=1.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr9	84202822	.	C	CGTGTGT,CGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCATCCCGCCT	1742.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.416;ClippingRankSum=0.000;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.50;MQRankSum=1.076;QD=30.05;ReadPosRankSum=-0.156;SOR=1.047;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:5,16,37:0.28,0.64:58
chr9	84202884	rs11792087	T	C	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-1.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=43;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.423;NF=0;NR=9;PP=97;ReadPosRankSum=-0.425;SC=TCTGCTGATGTGCAAGATCAA;SOR=0.188;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=9;WE=84202892;WS=84202874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr9	84207898	rs7023704	C	G	1982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=45;PP=1219;ReadPosRankSum=0.419;SC=ATTGAATCTCCAGGGAGAAAT;SOR=0.682;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=211;TCF=108;TCR=103;TR=93;WE=84207906;WS=84207888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,103:0.44:235
chr9	84214974	rs7039820	T	G	2113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=32;PP=1298;ReadPosRankSum=-0.962;SC=GGACCTAACTTCCTCTATCAA;SOR=0.740;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=162;TCF=98;TCR=64;TR=84;WE=84214982;WS=84214964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,95:0.53:178
chr9	84235798	rs11139343	G	A	1986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.566;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=44;PP=1257;ReadPosRankSum=0.757;SC=TTCCCACTGCGACTTCCTGGT;SOR=0.771;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=221;TCF=115;TCR=106;TR=94;WE=84235806;WS=84235788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,101:0.41:245
chr9	84248203	.	CGTGTGTGTGTGTGTGT	C,CGTGT	80.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.006;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=4;PP=318;ReadPosRankSum=0.681;SC=AGAAGGGGACCGTGTGTGTGT;SOR=1.329;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=31;TCF=12;TCR=19;TR=10;WE=84248226;WS=84248193;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.15:33
chr9	84267021	rs3045544	TAC	T	245.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQ=60.32;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=4;PP=254;ReadPosRankSum=1.739;SC=AACGTTAAGATACACACACAC;SOR=0.919;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=27;TCF=14;TCR=13;TR=9;WE=84267032;WS=84267011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
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chr9	84302489	rs2129105	G	A	825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=20;PP=488;ReadPosRankSum=1.906;SC=ACTCGAGTTTGCCCTTCACTA;SOR=0.592;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=43;TCF=19;TCR=24;TR=35;WE=84302497;WS=84302479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,37:0.77:48
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chr9	85905666	rs942283	A	G	2772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=49;PP=1543;SC=CAAGCCAGACAGAGTTGGTTT;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=44;TCR=49;TR=93;WE=85905674;WS=85905656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr9	85905737	rs942282	C	G	646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=18;PP=511;SC=TTTGTGTCTACAGGGAACTAC;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=85905745;WS=85905727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr9	85905786	rs942281	G	A	164.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=129;SC=TAAAGATGACGTAACATTCAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=85905794;WS=85905776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
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chr9	85924600	rs374884095	GT	G	415.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5202;FS=0.000;HP=11;HapScore=4;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=0;NR=8;PP=116;SC=TTTTCCATGGGTTTTTTTTTT;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=8;WE=85924619;WS=85924590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr9	85924611	rs1535749	T	A	449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5203;FS=0.000;HP=10;HapScore=4;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=3;NR=8;PP=204;SC=TTTTTTTTTTTCAGGTGTTTA;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=11;WE=85924619;WS=85924590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr9	85925309	rs11140018	T	C	1296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=3.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=11;PP=788;ReadPosRankSum=-0.080;SC=GTCATGGTCTTTGGCGACTAC;SOR=0.643;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=95;TCF=72;TCR=23;TR=46;WE=85925317;WS=85925299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,52:0.49:106
chr9	85928470	rs12375992	A	G	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=65;ReadPosRankSum=-0.113;SC=CCGTGGGCCAAGCTGTGGGAA;SOR=0.566;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=24;TCF=16;TCR=8;TR=9;WE=85928478;WS=85928460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr9	85958298	rs2277177	T	G	1890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.689;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=50;PP=1130;ReadPosRankSum=-1.132;SC=GACCAGAGCTTTTCCCAGCTC;SOR=0.827;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=198;TCF=92;TCR=106;TR=90;WE=85958306;WS=85958288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,95:0.45:212
chr9	85964450	rs4877253	A	G	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=432;ReadPosRankSum=1.224;SC=GTGTAAGAGAAGCATTCCAAG;SOR=0.527;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=21;WE=85964458;WS=85964440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr9	85987879	rs57558822	GA	G	108.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.10;ReadPosRankSum=1.359;SOR=0.825;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,22:0.22:99
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chr9	86153159	rs4529536	T	G	1256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=30;PP=808;ReadPosRankSum=0.035;SC=ACCGCGGCCGTGGGGAGCGAG;SOR=0.703;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=40;TCR=64;TR=49;WE=86153167;WS=86153149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,57:0.47:122
chr9	86238086	rs2811903	T	C	1158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=9;PP=767;SC=GAGCTTGGGTTATGGCGGCGC;SOR=1.923;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=34;WE=86238094;WS=86238076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
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chr9	86256431	rs2811917	T	A	2864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.428;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=57;PP=1638;ReadPosRankSum=-0.294;SC=GAAGTCACGTTGTGTCTGGGT;SOR=0.599;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=251;TCF=141;TCR=110;TR=124;WE=86256439;WS=86256421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,139:0.50:279
chr9	86258685	rs1052690	A	C	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=314;ReadPosRankSum=0.638;SC=GAAACCCTAAAAATGAAATGA;SOR=0.551;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=42;TCF=11;TCR=31;TR=20;WE=86258693;WS=86258675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,23:0.47:49
chr9	86278817	rs7866234	C	A	1553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.104;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=21;PP=903;ReadPosRankSum=1.284;SC=CAAGAGCCTGCAGCATCTGCT;SOR=1.098;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=122;TCF=74;TCR=48;TR=62;WE=86278825;WS=86278807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,71:0.51:140
chr9	86278913	rs2781004	C	T	1101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.015;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=23;PP=588;ReadPosRankSum=-0.682;SC=CATTAGTTCCCGAAGAGCCTC;SOR=0.454;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=130;TCF=61;TCR=69;TR=49;WE=86278921;WS=86278903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,58:0.39:150
chr9	86279015	rs2781003	C	T	1581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.28;SOR=2.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr9	86279015	.	CGTAAATCAGT	TGTAAATCAGC,TGTAAATCAGT	356	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.3;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=3,13;NR=8,30;PP=141,356;QD=17.6788977147;SC=GAAGCCAGTCCGTAAATCAGT;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=43;TCF=13;TCR=30;TR=11,43;WE=86279033;WS=86279005;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.26:43
chr9	86279025	rs2781002	T	C	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.97;ReadPosRankSum=1.221;SOR=0.746;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,12:0.32:37
chr9	86284178	rs1044175	C	A	6440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=119;NR=94;PP=2965;SC=TGTTTTGCATCAGTTGTGGGT;SOR=0.787;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=213;TCF=119;TCR=94;TR=213;WE=86284186;WS=86284168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr9	86297781	rs72746868	T	C	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.670;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=10;PP=454;ReadPosRankSum=1.754;SC=ACATAATGTTTTATTTTCTCA;SOR=0.307;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=40;TCF=28;TCR=12;TR=26;WE=86297789;WS=86297771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,24:0.73:33
chr9	86327898	rs10119344	C	T	7762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=134;NR=135;PP=2965;SC=GGATTTTATACGACAGCCAGT;SOR=0.824;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=269;TCF=134;TCR=135;TR=269;WE=86327906;WS=86327888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,290:1.00:290
chr9	86354511	rs4750	G	C	463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=4;PP=394;SC=GTTCCTTCAAGAAAAACTGCA;SOR=2.419;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=20;WE=86354519;WS=86354501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr9	86354810	rs2287373	T	C	105.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=79;SC=CTACATACTGTTACATTATTT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=86354818;WS=86354800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr9	86368105	rs10868053	A	G	918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=5;PP=698;SC=ATATTTACATATAAGAAAAAC;SOR=2.910;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=28;WE=86368113;WS=86368095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr9	86395380	.	T	TA	20	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;FR=0.8361;HP=17;HapScore=2;MGOF=24;MMLQ=15;MQ=55.99;NF=0;NR=2;PP=20;QD=11.5;SC=TACAAAAATGTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=2;WE=86395388;WS=86395370;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:4,2:0.33:6
chr9	86399815	rs7021357	C	T	1990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=23;NR=42;PP=1154;SC=AACTCACCAACAGGTAATATG;SOR=1.547;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=23;TCR=42;TR=65;WE=86399823;WS=86399805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr9	86617265	rs1982151	A	G	3344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=55;PP=2301;SC=CAGAAAAGGAATTCACAAATT;SOR=0.874;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=56;TCR=55;TR=111;WE=86617273;WS=86617255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr9	86895089	.	CTT	C	34.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.965;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=9.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.04;ReadPosRankSum=0.624;SOR=3.249;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr9	86920236	rs7867504	T	C	2856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.400;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=53;PP=1570;ReadPosRankSum=-0.220;SC=AACCACATACTGTGTCATACC;SOR=0.789;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=257;TCF=142;TCR=115;TR=123;WE=86920244;WS=86920226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,141:0.49:290
chr9	87285915	rs1187326	C	T	1161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.572;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=33;PP=799;ReadPosRankSum=0.518;SC=CTCCTTGCCCCTAGGGCCCGA;SOR=0.377;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=64;TCF=14;TCR=50;TR=44;WE=87285923;WS=87285905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,48:0.69:70
chr9	87360106	rs144586764	ACACCT	A	1024.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=766;ReadPosRankSum=0.642;SC=TAGGGTGTTAACACCTAGGTT;SOR=0.606;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=16;WE=87360118;WS=87360096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,27:0.53:51
chr9	87475806	rs143811359	GTTTATTTA	G	708.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=2.035;NF=1;NR=7;PP=632;ReadPosRankSum=-0.498;SC=CAAGTGGTTTGTTTATTTATT;SOR=0.848;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=8;WE=87475821;WS=87475796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,21:0.58:36
chr9	87563252	rs1078947	T	C	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=197;ReadPosRankSum=-1.359;SC=TTAGCACAAATGTTATTTCCT;SOR=0.770;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=38;TCR=9;TR=15;WE=87563260;WS=87563242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,16:0.33:48
chr9	88269947	rs675837	C	T	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=144;ReadPosRankSum=0.037;SC=ATGTTTATCACGTTAAGTAAG;SOR=0.602;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=9;WE=88269955;WS=88269937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr9	88275838	rs606606	T	A	1097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.911;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=12;PP=574;ReadPosRankSum=0.478;SC=ATTTCTAGTATTTAAAAACTT;SOR=1.104;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=81;TCF=55;TCR=26;TR=42;WE=88275846;WS=88275828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,50:0.52:97
chr9	88356820	.	A	AGGCGGC	89.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.650;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.93;MQRankSum=2.522;QD=4.72;ReadPosRankSum=-0.650;SOR=0.730;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr9	88618462	rs1328923	C	G	865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=7;PP=596;SC=TTTATTTAATCTATTAATGAC;SOR=1.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=28;WE=88618470;WS=88618452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	88667582	rs10780743	T	G	4217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=79;PP=2510;SC=TACAAACCAATGATGGGGCCT;SOR=1.150;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=60;TCR=79;TR=139;WE=88667590;WS=88667572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr9	88924985	.	CT	C	102.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.977;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.42;ReadPosRankSum=0.088;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,10:0.33:30
chr9	88934624	rs700760	G	T	1199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=19;PP=596;SC=AAAATAAGCCGGTTGACACTC;SOR=1.455;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=15;TCR=19;TR=34;WE=88934632;WS=88934614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr9	88937851	rs58050565	ATTT	A	4787.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=36;PP=1938;SC=CCACAGGTGAATTTTTTTCTT;SOR=0.912;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=22;TCR=40;TR=56;WE=88937861;WS=88937841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr9	88941549	rs791312	C	A	1796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=43;PP=1208;SC=ACAATGTCACCACTGTAAGAT;SOR=3.113;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=9;TCR=43;TR=52;WE=88941557;WS=88941539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr9	88943171	rs791314	T	C	4025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=38;PP=2484;SC=GTAAAGATAGTTAAGGAAAGA;SOR=1.545;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=84;TCR=39;TR=122;WE=88943179;WS=88943161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr9	88952313	rs10512175	A	C	1233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=19;PP=644;ReadPosRankSum=0.596;SC=CAGATATATAAGCAAAAAAAA;SOR=0.651;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=143;TCF=97;TCR=46;TR=58;WE=88952323;WS=88952303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,63:0.41:154
chr9	88959938	rs791323	C	T	5124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=106;NR=67;PP=2944;SC=GTTTAATTTCCAGCCTCTGTT;SOR=1.107;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=173;TCF=106;TCR=67;TR=173;WE=88959946;WS=88959928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
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chr9	90062823	rs12682834	A	G	4584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=100;NR=55;PP=2497;SC=GAAACGCTCCATAGTCCTATT;SOR=1.166;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=155;TCF=100;TCR=55;TR=155;WE=90062831;WS=90062813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
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chr9	90534156	rs202161190	T	TTCTTGTCTCCCAGCGTCA	1788.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FS=2.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQRankSum=-2.102;QD=11.47;ReadPosRankSum=-1.035;SOR=0.589;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,72:0.46:156
chr9	90559129	rs7027067	G	A	299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=4;PP=196;SC=CTGGCAGCCCGGAGAGGAAGG;SOR=1.445;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=12;WE=90559137;WS=90559119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
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chr9	91262597	rs7862585	A	G	566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.972;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=324;ReadPosRankSum=-0.481;SC=AGGAGAGAGAATAAGTGTCTA;SOR=0.317;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=57;TCF=16;TCR=41;TR=23;WE=91262605;WS=91262587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,27:0.44:62
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chr9	91628546	rs944483	A	C	4928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=83;NR=85;PP=2965;SC=AAAAAGAGAAAATGGTTTGCT;SOR=0.831;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=168;TCF=83;TCR=85;TR=168;WE=91628554;WS=91628536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
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chr9	91680531	rs3818668	C	G	1024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.148;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=29;PP=714;ReadPosRankSum=-1.713;SC=TGTCACTAATCACAAGTGAGA;SOR=1.009;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=68;TCF=19;TCR=49;TR=39;WE=91680539;WS=91680521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,42:0.55:76
chr9	91680600	rs9410455	A	G	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.297;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=112;ReadPosRankSum=-2.088;SC=CTCAACCACCAAACAGCTAAA;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=91680608;WS=91680590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr9	91934555	rs41306445	A	G	2376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.456;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.131;NF=62;NR=40;PP=1411;ReadPosRankSum=1.264;SC=AAAACCTCATATTTTTCCTCA;SOR=0.740;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=243;TCF=143;TCR=100;TR=102;WE=91934563;WS=91934545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,115:0.44:260
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chr9	91954848	rs45452691	C	G	1966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=44;PP=1194;ReadPosRankSum=0.233;SC=ACCGAAATTTCAATCTAAGCA;SOR=0.676;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=182;TCF=80;TCR=102;TR=80;WE=91954856;WS=91954838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,93:0.45:208
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chr9	92003749	rs7465881	A	G	1660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.553;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=32;PP=960;ReadPosRankSum=-1.769;SC=TGGCGGCATCAAGGGAGCAAG;SOR=0.642;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=155;TCF=88;TCR=67;TR=72;WE=92003757;WS=92003739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,82:0.47:175
chr9	92017733	rs41287361	G	A	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.889;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=372;ReadPosRankSum=-0.162;SC=GGCCAGGAGAGGCTGCCCACT;SOR=2.267;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=46;TCF=35;TCR=11;TR=21;WE=92017741;WS=92017723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,22:0.47:47
chr9	92020433	rs7856677	G	A	1644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=42;PP=1231;SC=TGGCCGGGCAGGTGTGCTATT;SOR=2.480;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=12;TCR=42;TR=54;WE=92020441;WS=92020423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
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chr9	92219921	rs3138499	A	C	1481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.261;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=9;PP=702;ReadPosRankSum=-0.384;SC=GCAGCGTAGTAGGGGCGCACT;SOR=1.460;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=69;TCF=51;TCR=18;TR=41;WE=92219929;WS=92219911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,44:0.59:75
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chr9	93640120	rs2290886	C	T	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.372;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=99;ReadPosRankSum=1.113;SC=AGGGCCCACCCCTGGATGGGC;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=6;WE=93640128;WS=93640110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
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chr9	94398800	rs67030398	G	C	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-2.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=144;ReadPosRankSum=-0.466;SC=CTCTGGGCAGGGCAGGGCATG;SOR=0.793;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=10;WE=94398808;WS=94398790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
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chr9	94456643	rs923771	G	C	969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.754;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=23;PP=665;ReadPosRankSum=-1.107;SC=CCCAGGGTCTGTCATGCGGTT;SOR=0.384;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=97;TCF=41;TCR=56;TR=44;WE=94456661;WS=94456633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,46:0.44:104
chr9	94456705	rs923770	T	A	1652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.66;ReadPosRankSum=1.979;SOR=0.746;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,44:0.55:80
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chr9	94487066	rs41277837	C	T	3180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.404;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=66;PP=1991;ReadPosRankSum=0.844;SC=CGTCCGAGTGCGGCGAGCGCA;SOR=0.658;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=287;TCF=155;TCR=132;TR=138;WE=94487074;WS=94487056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,152:0.47:322
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chr9	94951819	rs3858097	A	G	3023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.500;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=69;PP=1821;ReadPosRankSum=-2.253;SC=GCTGGGAGGGAAGGAGAGAGA;SOR=0.589;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=235;TCF=108;TCR=127;TR=127;WE=94951827;WS=94951809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,144:0.55:262
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chr9	95147840	rs1053441	T	A	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=369;ReadPosRankSum=0.849;SC=GTTCCTTTACTCATTGTTGAG;SOR=0.880;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=35;TCF=33;TCR=2;TR=19;WE=95147848;WS=95147830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
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chr9	95237024	rs3078372	CTCA	C,CTCATCA	2921.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12,12;NR=29,29;PP=2273,1266;ReadPosRankSum=-0.542;SC=GAGAGTTGTCCTCATCATCAT;SOR=1.014;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=86;TCF=22;TCR=64;TR=41,41;WE=95237037;WS=95237014;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.45,0.48:99
chr9	95237222	rs3739606	G	T	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=26;PP=583;ReadPosRankSum=-0.398;SC=AAACAGACATGGGATATTAAA;SOR=0.784;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=73;TCF=21;TCR=52;TR=36;WE=95237230;WS=95237212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,38:0.49:77
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chr9	95256593	rs11788523	G	A	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.723;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=269;ReadPosRankSum=1.428;SC=TTATGTCAATGTGTTTATATT;SOR=0.399;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=17;WE=95256601;WS=95256583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
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chr9	95580726	rs143411689	TTTTG	T	1362.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.32;MQRankSum=-1.810;QD=13.49;ReadPosRankSum=-1.515;SOR=0.699;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,45:0.45:101
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chr9	95768448	rs3802384	G	A	1684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.970;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=31;PP=800;ReadPosRankSum=-1.715;SC=TAAAGACGTCGTCCACAGCAT;SOR=0.390;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=131;TCF=64;TCR=67;TR=68;WE=95768456;WS=95768438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,82:0.55:148
chr9	95772738	rs36150183	GGAGA	G	991.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=5.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.56;ReadPosRankSum=-1.120;SOR=0.145;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,26:0.57:46
chr9	95772799	rs151317911	A	AAGAGAC	456.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=414;ReadPosRankSum=0.795;SC=ACCAGAGGGAAAGAGACAGAG;SOR=0.892;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=9;WE=95772807;WS=95772789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,12:0.80:15
chr9	95780465	rs7048975	A	G	9303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=354;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=175;NR=144;PP=2965;SC=TCATCATAACAGGAAGAAAAA;SOR=0.775;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=319;TCF=175;TCR=144;TR=319;WE=95780473;WS=95780455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,354:1.00:354
chr9	95780570	rs75300361	A	G	1431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.738;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=43;PP=942;ReadPosRankSum=-0.678;SC=TAACCTTGTAATATATTTTTA;SOR=0.584;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=125;TCF=31;TCR=94;TR=57;WE=95780578;WS=95780560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,65:0.48:136
chr9	95782667	rs11790517	C	T	2490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.684;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=55;PP=1488;ReadPosRankSum=1.253;SC=GTGGCGCCTTCAGCCAGGATG;SOR=0.743;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=242;TCF=126;TCR=116;TR=116;WE=95782675;WS=95782645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,124:0.47:262
chr9	95784485	rs10821054	A	T	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=351;ReadPosRankSum=-0.086;SC=GGCCTGGGAAATCCTGCTCCC;SOR=0.402;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=20;WE=95784493;WS=95784475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,20:0.53:38
chr9	95794946	rs150126405	TCCTCCCGCCCACTCCA	T	676.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.44;MQRankSum=1.751;QD=13.81;ReadPosRankSum=0.509;SOR=0.570;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,20:0.41:49
chr9	95797999	rs4073460	C	T	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.844;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=158;ReadPosRankSum=1.559;SC=GCTCAGGACACTTGGCTTTGG;SOR=1.567;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=47;TCF=19;TCR=28;TR=13;WE=95798007;WS=95797989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,13:0.25:52
chr9	95872744	rs3819011	C	T	959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=1;PP=713;SC=GGTGTCCTGACACCCAACAGG;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=27;WE=95872752;WS=95872737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
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chr9	95874428	rs10821071	G	A	103.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.78;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
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chr9	96015398	rs4744203	A	T	187.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=166;SC=CCCCTTCCCCATCCCCATTAC;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=96015406;WS=96015388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
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chr9	96025052	rs7857220	T	C	535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.028;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=17;PP=303;ReadPosRankSum=1.745;SC=GGCGCAGGCCTGTACAGCCAC;SOR=0.463;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=64;TCF=22;TCR=42;TR=27;WE=96025060;WS=96025042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,28:0.43:65
chr9	96025717	rs10649709	C	CAG	1622.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=8;PP=1105;SC=TCGCACAGGACGGGCTGCCTC;SOR=2.115;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=26;TCF=17;TCR=9;TR=25;WE=96025725;WS=96025707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr9	96025771	rs6479467	G	A	2871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=60;NR=32;PP=1692;SC=GACTGTTCCAGATAAGCTGAC;SOR=1.168;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=60;TCR=32;TR=92;WE=96025779;WS=96025761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr9	96026122	.	T	TG	738	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;FR=1.0000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MMLQ=26;MQ=60.54;NF=17;NR=0;PP=738;QD=44.9411764706;SC=GGGGGAGGGGTACTTGGGGGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=17;WE=96026130;WS=96026112;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,17:0.89:19
chr9	96026243	rs55981123	G	A	4346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=438;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.096;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.02;MQRankSum=-0.986;NF=108;NR=88;PP=2508;ReadPosRankSum=-1.254;SC=AGCTGGAGACGCACAACCACA;SOR=0.753;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=401;TCF=217;TCR=184;TR=196;WE=96026251;WS=96026233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:221,217:0.50:438
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chr9	96031262	rs1936401	T	C	3746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=70;PP=2377;SC=CCCCACCAAGTAGGTGGCTCG;SOR=1.196;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=49;TCR=70;TR=119;WE=96031270;WS=96031252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
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chr9	96052179	rs2306183	G	A	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.573;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=7;PP=239;ReadPosRankSum=2.915;SC=TGAGATGAGGGGAGTGGATTT;SOR=0.346;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=49;TCF=34;TCR=15;TR=20;WE=96052187;WS=96052169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,23:0.45:51
chr9	96080699	rs36081907	C	T	2126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.166;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=48;PP=1313;ReadPosRankSum=-0.486;SC=GGCTGAGAGACGGCGGGACGC;SOR=0.590;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=166;TCF=76;TCR=90;TR=90;WE=96080707;WS=96080689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,99:0.55:181
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chr9	96082919	rs13293217	A	G	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=61;ReadPosRankSum=-0.674;SC=GGGATGTGACAGGGGTGGGGG;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=4;WE=96082927;WS=96082909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
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chr9	96238731	rs10821136	C	T	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=164;ReadPosRankSum=1.158;SC=GTTAGCAATACCATGTTTTCC;SOR=0.430;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=9;WE=96238739;WS=96238721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr9	96259883	.	TA	T	147.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=0.000;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=5.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.18;MQRankSum=3.014;QD=1.36;ReadPosRankSum=0.171;SOR=0.250;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,20:0.18:109
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chr9	96292025	rs10761232	A	T	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.623;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=103;ReadPosRankSum=-0.064;SC=AAAGATGAACATTTATAACTG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=6;WE=96292033;WS=96292015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr9	96392182	rs10992812	G	A	1833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.191;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=35;PP=1039;ReadPosRankSum=-0.745;SC=TCTCCCTAGAGCTTCGCAGAT;SOR=0.595;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=147;TCF=85;TCR=62;TR=80;WE=96392190;WS=96392172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,89:0.52:170
chr9	96398508	rs2398851	A	G	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.844;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=49;ReadPosRankSum=-0.202;SC=AGGTCGAGGTAGGGGGTTGAC;SOR=0.269;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=5;WE=96398516;WS=96398498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr9	96407822	rs6479500	A	G	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=347;ReadPosRankSum=0.406;SC=ACCCAGGCTCACCTCTCCAGC;SOR=0.687;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=46;TCF=33;TCR=13;TR=26;WE=96407830;WS=96407812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,26:0.53:49
chr9	96407848	rs7851271	A	G	804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.947;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=14;PP=493;ReadPosRankSum=-0.932;SC=GGCCCTGTCCACACCTGTCCC;SOR=0.460;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=73;TCF=50;TCR=23;TR=40;WE=96407856;WS=96407838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,41:0.53:78
chr9	96415653	rs3750354	C	T	886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.574;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=28;PP=666;ReadPosRankSum=1.721;SC=TCAAGGTGAGCCACGCCCCTC;SOR=0.346;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=54;TCF=8;TCR=46;TR=35;WE=96415661;WS=96415643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,35:0.62:56
chr9	96420390	rs3763605	A	G	767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=18;PP=566;ReadPosRankSum=-0.847;SC=TGTGGGCAGCAGGCACCCACC;SOR=0.720;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=90;TCF=49;TCR=41;TR=38;WE=96420398;WS=96420380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,40:0.42:96
chr9	96422420	rs10992836	T	C	2411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=42;PP=1548;ReadPosRankSum=-1.152;SC=GTGGACCGTCTTGGGCCACAG;SOR=0.690;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=188;TCF=111;TCR=77;TR=101;WE=96422428;WS=96422410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,109:0.53:204
chr9	96425138	rs3750358	T	C	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.952;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=108;ReadPosRankSum=0.791;SC=TCAAGAGAGTTCCACCAGCCC;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=6;WE=96425146;WS=96425128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr9	96425363	rs3750359	G	A	2127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=48;PP=1201;ReadPosRankSum=0.300;SC=GTGAGTGTGAGCAGAGGTGAA;SOR=0.700;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=215;TCF=105;TCR=110;TR=93;WE=96425371;WS=96425353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,106:0.44:243
chr9	96425777	rs7036592	C	T	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=41;ReadPosRankSum=-0.438;SC=GGCTCAGGGACGGCCCTGGTC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=5;WE=96425785;WS=96425767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr9	96426049	rs112327078	T	TCACA	150.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=176;ReadPosRankSum=0.558;SC=ACTCTGCATCTCACACACACC;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=4;WE=96426057;WS=96426039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr9	96428457	rs10992840	A	G	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=3.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=136;ReadPosRankSum=1.269;SC=ATGAGATGGCAAAGGGGCCCC;SOR=1.828;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=7;WE=96428465;WS=96428447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr9	96439004	rs149736720	C	CCCTGCCTCCACCACA	865.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=4.826;NF=4;NR=10;PP=705;ReadPosRankSum=0.053;SC=CCTCTACCACCCCGGCCTCCA;SOR=0.816;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=14;WE=96439012;WS=96438994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr9	96714491	rs11793856	C	G	6886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=130;NR=108;PP=2965;SC=GCACCTCCGCCGGTTTCTCTG;SOR=0.814;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=239;TCF=131;TCR=108;TR=238;WE=96714499;WS=96714481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr9	96714981	rs12684081	G	A	4140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=41;PP=2595;SC=CCAGGAAGCTGAGGGGTGGGA;SOR=1.739;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=137;TCF=96;TCR=41;TR=137;WE=96714989;WS=96714971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
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chr9	97080944	rs150455117	GAGA	G	930.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.23;MQRankSum=-7.370;QD=13.89;ReadPosRankSum=-0.013;SOR=0.696;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,26:0.39:67
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chr9	97219735	rs112270671	A	ATT	398.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=2.784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.59;MQRankSum=1.964;QD=7.52;ReadPosRankSum=-0.328;SOR=1.238;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,18:0.34:53
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chr9	97321127	rs1048510	T	C	633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=450;ReadPosRankSum=0.849;SC=TTACCTTTTGTATACTCATAG;SOR=0.680;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=57;TCF=41;TCR=16;TR=26;WE=97321135;WS=97321117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,28:0.44:63
chr9	97329737	rs10657369	C	CAG	2558.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.000;NF=3;NR=32;PP=1445;ReadPosRankSum=-1.470;SC=AGCCAGGAAACAAGCCAACCG;SOR=0.676;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=80;TCF=6;TCR=74;TR=35;WE=97329745;WS=97329727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,66:0.51:130
chr9	97329822	rs2987883	A	G	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.326;NF=1;NR=9;PP=155;ReadPosRankSum=0.890;SC=GTCACTCTGAACCTGCTCTTT;SOR=0.307;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=10;WE=97329830;WS=97329812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr9	97349666	rs573212	C	G	3267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=44;PP=1911;SC=GAGGATTGGACCATGTTGATC;SOR=0.850;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=61;TCR=44;TR=105;WE=97349674;WS=97349656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr9	97365642	rs9695	G	A	757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=9;PP=504;ReadPosRankSum=2.141;SC=GCAATTCTCCGGATGCAGGCA;SOR=0.770;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=53;TCF=39;TCR=14;TR=32;WE=97365650;WS=97365632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,34:0.57:60
chr9	97365720	rs1769257	T	C	4619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=83;NR=65;PP=2667;SC=CGTCGGGGGATCCCAAGATCA;SOR=0.827;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=83;TCR=65;TR=148;WE=97365728;WS=97365710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr9	97365985	rs3780554	G	A	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=98;ReadPosRankSum=-0.289;SC=TTTCCTTCCTGTGAGGCTGTA;SOR=0.074;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=7;WE=97365993;WS=97365975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr9	97369083	rs2297084	G	A	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=7;PP=259;ReadPosRankSum=-0.457;SC=CACCCTCCCCGGGCCCTCACT;SOR=0.536;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=43;TCF=30;TCR=13;TR=20;WE=97369091;WS=97369073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,22:0.47:47
chr9	97369149	rs1769259	C	T	5420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.43;SOR=0.937;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr9	97369149	.	CTG	TTA,TTG	856	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=38,77;NR=25,53;PP=835,856;QD=14.1026646804;SC=GTCAAAGTCCCTGGCGTAGCC;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=132;TCF=78;TCR=54;TR=63,130;WE=97369159;WS=97369139;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.48:132
chr9	97369151	rs1042144	G	A	1563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.29;ReadPosRankSum=0.531;SOR=0.704;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,74:0.49:152
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chr9	97380043	rs8192689	G	A	3336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=367;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.802;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=72;PP=1921;ReadPosRankSum=0.864;SC=AAGATATCACGTTTTACCTTT;SOR=0.557;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=327;TCF=176;TCR=151;TR=147;WE=97380051;WS=97380033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:200,166:0.45:366
chr9	97426330	.	TA	T	154.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.553;ClippingRankSum=0.000;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=1.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.22;ReadPosRankSum=0.272;SOR=0.344;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,14:0.29:48
chr9	97427531	rs4743965	C	A	3018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.440;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=68;PP=1983;ReadPosRankSum=0.797;SC=TCGCGGGATGCAGACAGGAGT;SOR=0.809;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=252;TCF=129;TCR=123;TR=135;WE=97427539;WS=97427521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,143:0.52:276
chr9	97555228	rs55826214	GA	G	115.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.31;MQRankSum=1.160;QD=6.09;ReadPosRankSum=0.082;SOR=0.293;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr9	97768286	rs10761364	T	C	2365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=30;PP=1583;SC=ACCTAGACTTTAAATTGGAGT;SOR=1.275;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=49;TCR=30;TR=79;WE=97768294;WS=97768276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr9	97822941	rs1888944	T	C	8047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=150;NR=122;PP=2965;SC=ATCAACTGAATGGCATTTTCA;SOR=0.831;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=272;TCF=150;TCR=122;TR=272;WE=97822949;WS=97822931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,308:1.00:308
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chr9	98209594	rs357564	G	A	1691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=34;PP=873;ReadPosRankSum=-0.926;SC=CGGTCTGTAGGGGGGTGGCCA;SOR=0.697;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=141;TCF=72;TCR=69;TR=69;WE=98209602;WS=98209584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,79:0.49:160
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chr9	98694641	rs10760675	T	C	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQRankSum=0.000;QD=14.95;ReadPosRankSum=1.291;SOR=0.766;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
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chr9	98801296	rs34191478	G	A	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.214;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=174;ReadPosRankSum=0.157;SC=AACCACCTTGGAGACAGCTCC;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=9;WE=98801304;WS=98801286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr9	99003264	rs2066485	C	T	2923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.635;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=63;PP=1870;ReadPosRankSum=2.255;SC=AACACTCAAGCCCCCATCCCA;SOR=1.677;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=33;TCR=65;TR=95;WE=99003272;WS=99003254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,106:0.98:108
chr9	99006578	rs2066486	T	C	4346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=88;NR=64;PP=2162;SC=CTCACCTGGATGATGACAAGG;SOR=0.857;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=152;TCF=88;TCR=64;TR=152;WE=99006586;WS=99006568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr9	99012277	rs407179	C	T	642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=21;PP=536;SC=ATTCTGTACCCACGTCATCTT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=99012285;WS=99012267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr9	99013616	rs8190541	C	T	748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=5;PP=526;SC=TTCCATCACGCCTTCCCAGGC;SOR=2.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=26;WE=99013624;WS=99013606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr9	99013663	rs408876	A	G	2486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=17;PP=1439;SC=CAGAACCTGGATAAGAGGAAT;SOR=1.836;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=58;TCR=17;TR=75;WE=99013671;WS=99013653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr9	99015259	rs2066475	C	T	3630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=72;PP=2283;SC=ATGAAGTTTCCCCCAGTGCTC;SOR=1.366;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=117;TCF=45;TCR=72;TR=117;WE=99015267;WS=99015249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr9	99060612	rs7029101	T	C	4710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=59;PP=2925;SC=TGCTTTTATATTCAAAAATCT;SOR=1.172;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=155;TCF=96;TCR=59;TR=155;WE=99060620;WS=99060602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr9	99060882	rs3925451	G	A	294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=186;SC=TCCAGCCCACGCCCTTGAAGC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=8;WE=99060890;WS=99060872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	99064202	rs8190483	C	CA	4270.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=0.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.849;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.633;NF=28;NR=47;PP=1728;ReadPosRankSum=0.023;SC=ACAACAGCAGCAAAAAAACAT;SOR=0.767;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=184;TCF=63;TCR=121;TR=75;WE=99064210;WS=99064192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,174:0.53:327
chr9	99084181	rs2026002	G	A	1535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=27;PP=826;ReadPosRankSum=1.384;SC=CTGGCTTAACGTGAAAGACTT;SOR=0.738;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=163;TCF=99;TCR=64;TR=70;WE=99084189;WS=99084171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,78:0.43:180
chr9	99086282	rs72621424	C	A	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.06;ReadPosRankSum=0.024;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,11:0.35:31
chr9	99086550	rs7038558	C	T	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=346;ReadPosRankSum=-1.262;SC=GCACTTTAAGCGAAGAAAAAA;SOR=0.928;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=20;WE=99086558;WS=99086540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr9	99180258	.	G	GGGC	3141.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.046;ClippingRankSum=0.000;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.848;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=30;PP=1524;ReadPosRankSum=0.374;SC=AGAAGATGACGGGCGGCGGCG;SOR=0.597;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=99;TCF=15;TCR=84;TR=38;WE=99180268;WS=99180248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,82:0.53:154
chr9	99700710	rs201544487	G	A	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.69;MQRankSum=-0.047;QD=5.25;ReadPosRankSum=-1.190;SOR=0.193;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
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chr9	100041610	rs2255135	C	G	74.84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5130;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=46;ReadPosRankSum=0.524;SC=TCCTACCAGCCTCTCATCTCT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=4;WE=100041618;WS=100041600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
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chr9	100069900	rs3214072	A	G	1855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.565;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=31;PP=1057;ReadPosRankSum=-0.299;SC=CCGGATGCGAATTCTGCGCCG;SOR=0.608;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=152;TCF=95;TCR=57;TR=78;WE=100069908;WS=100069890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,90:0.51:175
chr9	100075702	rs7856924	T	C	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=136;ReadPosRankSum=-0.579;SC=CTCCCAGCCTTCCTCCCCCTC;SOR=0.368;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=9;WE=100075710;WS=100075692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr9	100076896	rs3747502	G	A	2452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=54;PP=1535;ReadPosRankSum=0.288;SC=ACTTCTCTGCGTAGGCCCTGC;SOR=0.706;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=187;TCF=90;TCR=97;TR=104;WE=100076904;WS=100076886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,112:0.55:204
chr9	100190780	rs1381532	A	G	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=14;PP=503;ReadPosRankSum=-1.447;SC=CAAAGATGCTACGAGCTGTTC;SOR=0.693;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=79;TCF=44;TCR=35;TR=30;WE=100190788;WS=100190770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,32:0.36:90
chr9	100193113	rs7874295	T	C	1423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.686;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=15;PP=958;ReadPosRankSum=-0.834;SC=ACCACTTGACTTGGGATATGT;SOR=0.984;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=91;TCF=61;TCR=30;TR=50;WE=100193121;WS=100193103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,58:0.56:104
chr9	100194406	rs2045732	T	C	3033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.402;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=56;PP=1896;ReadPosRankSum=1.146;SC=GGAAACTCTGTTGGAGTTAAG;SOR=0.735;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=295;TCF=160;TCR=135;TR=127;WE=100194414;WS=100194396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,145:0.44:328
chr9	100201503	.	CT	C	90.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.149;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=6.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.36;ReadPosRankSum=-0.849;SOR=0.084;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr9	100227423	rs4743099	G	A	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.337;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=70;ReadPosRankSum=-0.358;SC=ATAATTAAATGTAGTTTTCAA;SOR=0.070;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=7;WE=100227431;WS=100227413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr9	100353801	rs2805792	G	T	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=385;ReadPosRankSum=0.309;SC=AAATTCTGTAGATGCCTCTCC;SOR=0.205;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=21;WE=100353809;WS=100353791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,21:0.50:42
chr9	100361864	rs958346	C	T	5624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=97;NR=83;PP=2965;SC=ACAGTGCTGGCCCCTGGTCTA;SOR=0.732;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=180;TCF=97;TCR=83;TR=180;WE=100361872;WS=100361854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr9	100366953	rs2805779	A	G	5543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=121;NR=64;PP=2965;SC=TTTCTAGAATAGTGAACTGAC;SOR=1.306;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=186;TCF=121;TCR=65;TR=185;WE=100366961;WS=100366943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr9	100388197	rs2773347	C	T	4176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=75;PP=2600;SC=GAATAGCTGCCGACAGCATTT;SOR=1.082;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=136;TCF=61;TCR=75;TR=136;WE=100388205;WS=100388187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr9	100396386	rs2773348	C	T	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.418;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=91;ReadPosRankSum=0.000;SC=TCCCCCGCCCCAGTTCTTTGA;SOR=3.781;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=7;WE=100396394;WS=100396376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr9	100407453	.	G	T	2872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.466;ClippingRankSum=0.000;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.894;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=53;PP=1617;ReadPosRankSum=-1.191;SC=CCCATCAATGGTTGCTATGTT;SOR=0.769;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=264;TCF=143;TCR=121;TR=123;WE=100407461;WS=100407443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,140:0.48:289
chr9	100428977	rs10116536	A	G	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.40;ReadPosRankSum=0.908;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
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chr9	100433233	rs2805837	G	A	1056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=36;NR=1;PP=848;SC=GGGGTCCATTGTTCCTATCAG;SOR=5.031;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=37;WE=100433241;WS=100433223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr9	100459578	rs1800975	T	C	2976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.269;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=52;PP=1433;ReadPosRankSum=-0.102;SC=CCGCCATCTCTGGCCCACTCC;SOR=0.439;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=107;TCF=55;TCR=52;TR=106;WE=100459586;WS=100459568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,120:0.99:121
chr9	100616066	rs1867280	G	C	83.10	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.85;ReadPosRankSum=0.674;SOR=0.707;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr9	100616583	rs3021523	T	C	4491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=448;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=110;PP=2325;ReadPosRankSum=-1.112;SC=ACTGGGCGCTTGACCCCAACG;SOR=0.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=403;TCF=176;TCR=227;TR=195;WE=100616591;WS=100616573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:231,217:0.48:448
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chr9	100617021	rs3021526	C	T	513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=11;PP=368;ReadPosRankSum=-0.377;SC=CCAACCCCTCCGCCTATGCGG;SOR=0.668;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=54;TCF=30;TCR=24;TR=23;WE=100617029;WS=100617011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,25:0.40:63
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chr9	101243021	rs2779547	T	C	519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=15;NR=1;PP=389;SC=TCCTCGATGATGGTATTGTTC;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=101243029;WS=101243012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
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chr9	101304348	rs2184026	C	T	2028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.726;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=51;PP=1115;ReadPosRankSum=-0.861;SC=AAAGAGACAACGCTTTTTACT;SOR=0.490;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=207;TCF=90;TCR=117;TR=95;WE=101304356;WS=101304338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,107:0.46:232
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chr9	101340316	rs3750344	T	C	2825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.431;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=52;PP=1440;ReadPosRankSum=-0.439;SC=CGTATTTTATTGCATCGTAGA;SOR=0.742;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=259;TCF=148;TCR=111;TR=125;WE=101340324;WS=101340306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,139:0.49:285
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chr9	101340440	rs2808537	A	G	2727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.534;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=69;PP=1922;ReadPosRankSum=-0.025;SC=ATCTTTCCTCATGGAAACCTT;SOR=2.278;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=93;TCF=23;TCR=70;TR=91;WE=101340448;WS=101340430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,97:0.98:99
chr9	101470641	rs186943372	A	C	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=1.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.96;ReadPosRankSum=1.362;SOR=0.423;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
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chr9	101533220	rs6415847	C	T	3745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=78;NR=47;PP=2186;SC=CTCACACCTACCCCACTGGAG;SOR=1.131;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=78;TCR=47;TR=125;WE=101533228;WS=101533210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr9	101539601	rs4742741	G	A	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.822;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=146;ReadPosRankSum=0.142;SC=TACAAAGACAGACAAACACCT;SOR=0.352;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=41;TCF=28;TCR=13;TR=13;WE=101539609;WS=101539591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,15:0.33:45
chr9	101539865	rs7035722	G	C	728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=22;PP=459;ReadPosRankSum=-0.806;SC=ATAATAATTGGTATTCGATAT;SOR=0.768;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=77;TCF=26;TCR=51;TR=32;WE=101539873;WS=101539855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,36:0.41:87
chr9	101544627	rs7020056	A	G	647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.433;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=418;ReadPosRankSum=1.339;SC=GACACTTGAGAGTGACTTTCC;SOR=0.446;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=24;WE=101544635;WS=101544617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,27:0.63:43
chr9	101546578	rs12056975	G	C	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=61;ReadPosRankSum=1.000;SC=GGGATACTAAGAGGGCGTCAG;SOR=0.105;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=4;WE=101546586;WS=101546568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr9	101552955	rs7027771	T	C	2538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.538;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=66;PP=1722;ReadPosRankSum=-2.674;SC=TATGTCATCCTTAATTGGCAT;SOR=0.774;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=180;TCF=70;TCR=110;TR=106;WE=101552963;WS=101552945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,114:0.57:200
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chr9	101558609	rs138948716	G	A	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=231;ReadPosRankSum=1.527;SC=CCCCGGGCCCGGCCACCTCGG;SOR=0.495;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=14;WE=101558617;WS=101558599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
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chr9	101602171	rs2277189	C	G	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=10;PP=575;ReadPosRankSum=-0.325;SC=TGGCATGCGACGAATGCTCCA;SOR=0.687;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=48;TCR=21;TR=32;WE=101602179;WS=101602161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,35:0.48:73
chr9	101606549	rs1885608	G	T	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=260;ReadPosRankSum=0.916;SC=AAATTAAATAGTTGAATTTTT;SOR=0.770;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=15;WE=101606557;WS=101606539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr9	101748356	rs2075663	A	G	906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=26;PP=592;ReadPosRankSum=-0.162;SC=TGGAATCTTCATGGGCAATGC;SOR=0.697;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=107;TCF=47;TCR=60;TR=46;WE=101748364;WS=101748346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,45:0.41:111
chr9	101749498	rs2075664	C	A	2461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.487;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=53;PP=1436;ReadPosRankSum=2.147;SC=TCTCCATTGCCAAAACAATCA;SOR=0.581;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=240;TCF=125;TCR=115;TR=108;WE=101749511;WS=101749488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,120:0.46:263
chr9	101767385	rs41305481	A	G	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.955;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=82;ReadPosRankSum=0.759;SC=GCAGCTCCTGACCTTCTCAGA;SOR=0.223;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=6;WE=101767393;WS=101767375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr9	101778265	rs2297603	G	T	1903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.872;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=33;PP=1028;ReadPosRankSum=0.643;SC=CAGGGTCCTGGTGATGAAGAA;SOR=0.879;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=154;TCF=89;TCR=65;TR=80;WE=101778273;WS=101778255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,90:0.51:176
chr9	101785558	rs7848837	T	G	2810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.442;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=57;PP=1681;ReadPosRankSum=-0.591;SC=CATTTCCCCATTTTGGAGAAA;SOR=0.737;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=244;TCF=130;TCR=114;TR=126;WE=101785566;WS=101785548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,136:0.51:269
chr9	101785598	rs7861925	G	T	2668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.475;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=56;PP=1609;ReadPosRankSum=0.429;SC=CTTGGAGTCTGGCAGTTAAAT;SOR=0.598;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=233;TCF=118;TCR=115;TR=118;WE=101785606;WS=101785588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,127:0.48:263
chr9	101785633	rs7851787	T	C	2111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.132;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=46;PP=1465;ReadPosRankSum=-1.850;SC=TTTCTTCTCTTTCCAGGCAGG;SOR=0.596;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=166;TCF=78;TCR=88;TR=88;WE=101785641;WS=101785623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,94:0.50:189
chr9	101787017	rs7028686	T	G	751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.086;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=7;PP=497;ReadPosRankSum=-0.269;SC=CTGAGCCTTATTTTCCGCATC;SOR=0.992;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=83;TCF=62;TCR=21;TR=30;WE=101787025;WS=101787007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,34:0.37:91
chr9	101796906	rs11281933	T	TCTCCCTC	98.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=470;SC=AGAACTTTCTTCTCCCTCCTC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=7;WE=101796914;WS=101796896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr9	101804329	rs7854112	T	C	2226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.113;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=42;PP=1519;ReadPosRankSum=1.174;SC=CCTTCCAGGGTCCTAGAGGAC;SOR=0.597;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=181;TCF=106;TCR=75;TR=95;WE=101804337;WS=101804319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,102:0.52:196
chr9	101804366	rs35901514	T	C	2189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=44;PP=1310;ReadPosRankSum=0.619;SC=TTTACCTGGCTTTCCAGGACT;SOR=0.690;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=212;TCF=117;TCR=95;TR=102;WE=101804374;WS=101804356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,109:0.47:231
chr9	101804416	rs7851079	A	G	2143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.806;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=50;PP=1185;ReadPosRankSum=1.378;SC=TATCTGAGTGAGATTGGGCGC;SOR=0.570;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=167;TCF=72;TCR=95;TR=90;WE=101804424;WS=101804406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,105:0.56:189
chr9	101807112	rs16918154	T	C	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=232;ReadPosRankSum=0.613;SC=TTTCATACTTTGATTTGGTTA;SOR=0.880;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=47;TCF=11;TCR=36;TR=20;WE=101807120;WS=101807102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,23:0.43:54
chr9	101810339	rs869776	T	C	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.73;ReadPosRankSum=0.688;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr9	101812072	rs13296166	G	A	1037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=15;PP=711;ReadPosRankSum=0.734;SC=AGACCTTCCCGATTGGCCTAA;SOR=0.677;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=61;TCR=31;TR=44;WE=101812080;WS=101812062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,47:0.47:100
chr9	101814626	rs4142986	C	G	1686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=8;PP=1054;SC=GCAAACACCACGGCAGAGCTT;SOR=2.221;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=42;TCR=8;TR=50;WE=101814634;WS=101814616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr9	101814852	rs7019613	T	C	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.735;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=361;ReadPosRankSum=-0.279;SC=GGATGGCAGCTGAGCCAAGGC;SOR=1.234;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=66;TCF=20;TCR=46;TR=29;WE=101814860;WS=101814842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,30:0.45:66
chr9	101818716	rs11788317	T	C	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.499;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=51;ReadPosRankSum=-1.934;SC=CCCTTGTTCATGCTGTCCCTA;SOR=0.141;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=6;WE=101818724;WS=101818706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr9	101822220	rs4480177	C	T	1115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=29;PP=765;ReadPosRankSum=-0.728;SC=CAGGGCTTCCCGGATCCAGAA;SOR=0.673;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=83;TCF=37;TCR=46;TR=52;WE=101822228;WS=101822210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,52:0.59:88
chr9	101822302	rs7031588	C	T	661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.891;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=18;PP=457;ReadPosRankSum=-2.300;SC=ACTCTGCCTACGATCTCCTGT;SOR=0.844;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=62;TCF=31;TCR=31;TR=32;WE=101822310;WS=101822292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,33:0.46:72
chr9	101822400	rs7047475	A	G	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.595;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=93;ReadPosRankSum=-1.102;SC=ATCTATTTGGATGACTTATTA;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=6;WE=101822408;WS=101822390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr9	101831113	rs4742758	G	A	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=88;ReadPosRankSum=0.218;SC=CTTGGAGTCAGAAGACCCAGG;SOR=0.293;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=6;WE=101831121;WS=101831103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr9	101867537	rs11466445	TGGCGGCGGC	T	192.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.9990;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=1;PP=442;ReadPosRankSum=-1.803;SC=CTCCTCGTGCTGGCGGCGGCG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=1;WE=101867553;WS=101867527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
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chr9	101910151	rs56020300	ACTTTT	A	370.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.062;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=362;ReadPosRankSum=1.125;SC=TTTAAGGAAAACTTTTCTTTA;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=9;WE=101910163;WS=101910141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr9	101911656	rs868	A	G	1137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.744;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=38;PP=857;ReadPosRankSum=-1.673;SC=TGGGAGGTCAATTGTTCTACC;SOR=0.785;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=109;TCF=35;TCR=74;TR=54;WE=101911664;WS=101911646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,53:0.46:115
chr9	102068344	rs790287	C	G	508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=5;NR=14;PP=397;SC=ATGACCTAAGCCGCACAAAGA;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=19;WE=102068352;WS=102068334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	102068770	rs7871150	T	C	792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=9;PP=480;SC=GCTCCAGCTTTGGCTCTGCCG;SOR=1.255;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=18;TCR=9;TR=27;WE=102068778;WS=102068760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr9	102068832	rs170462	G	A	1873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=36;NR=29;PP=1082;SC=GTGGTTGTGAGGAAGATCGAG;SOR=0.750;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=65;TCF=36;TCR=29;TR=65;WE=102068840;WS=102068822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr9	102068912	rs182704	C	T	1399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=26;PP=725;ReadPosRankSum=-0.933;SC=GGCAGCCCCACCCCGCCTGCC;SOR=0.325;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=51;TCF=24;TCR=27;TR=50;WE=102068920;WS=102068902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,54:0.98:55
chr9	102690883	rs6478987	A	G	237.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=7;NR=2;PP=167;SC=TTTGTATGCAACATTCTTAAT;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=102690891;WS=102690873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr9	102713580	rs1997368	G	A	7541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.556;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=120;NR=153;PP=2965;ReadPosRankSum=0.444;SC=AATGTATTGTGCTAAGTCTTA;SOR=0.630;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=274;TCF=121;TCR=153;TR=273;WE=102713599;WS=102713570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,287:1.00:288
chr9	102713591	rs3739794	T	C	7422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=112;NR=149;PP=2965;SC=CTAAGTCTTATTCTCAGTCAC;SOR=1.027;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=262;TCF=112;TCR=150;TR=261;WE=102713599;WS=102713570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,274:1.00:274
chr9	102730697	rs368650655	AT	A	65.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.46;ReadPosRankSum=-1.990;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr9	102778480	rs10819718	T	C	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.056;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=155;ReadPosRankSum=1.618;SC=AGCTATGATATAGTTATGTTC;SOR=0.154;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=11;WE=102778488;WS=102778470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr9	102780721	rs4743375	T	C	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.598;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.13;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
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chr9	102988234	rs56840267	G	A	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=50;ReadPosRankSum=0.084;SC=AATTTCTCTGGATGTTATTAC;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=102988242;WS=102988229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr9	102988328	rs61147858	CTT	C	1425.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.853;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=702;ReadPosRankSum=1.137;SC=CTTATCATCTCTTGTTTTTTA;SOR=0.300;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=52;TCF=24;TCR=28;TR=19;WE=102988337;WS=102988318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,38:0.46:82
chr9	103002451	rs2491097	C	T	2225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.098;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=51;PP=1160;ReadPosRankSum=-0.076;SC=GTCTTGACCTCATATGAAAGC;SOR=0.918;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=182;TCF=87;TCR=95;TR=93;WE=103002459;WS=103002441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,107:0.50:213
chr9	103015184	rs2245216	T	C	2708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.581;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=45;PP=1741;ReadPosRankSum=0.187;SC=TTTGTGCTTTTCCAGGTGGAG;SOR=0.811;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=218;TCF=132;TCR=86;TR=116;WE=103015192;WS=103015174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,127:0.53:241
chr9	103046916	rs11790431	G	A	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.607;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=338;ReadPosRankSum=-0.703;SC=ATCTTCTGCCGGCCCATGGAC;SOR=1.911;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=15;WE=103046924;WS=103046906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr9	103054951	rs2787374	T	C	5377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=88;PP=2965;SC=GAAGGTGCTCTCCGGCTGGTT;SOR=0.735;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=184;TCF=96;TCR=88;TR=184;WE=103054959;WS=103054941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr9	103059176	rs41274951	C	G	1980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.544;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=34;PP=1073;ReadPosRankSum=-0.417;SC=CTTAAAGCCTCTCCTCTCCTC;SOR=0.744;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=161;TCF=96;TCR=65;TR=85;WE=103059184;WS=103059166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,95:0.52:181
chr9	103059476	rs7864494	A	G	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.706;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=308;ReadPosRankSum=1.261;SC=CCCCCAGAGTACCACATCAGA;SOR=1.762;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=38;TCF=8;TCR=30;TR=17;WE=103059484;WS=103059466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,17:0.44:39
chr9	103060386	rs3813712	T	G	1938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.382;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=47;PP=1188;ReadPosRankSum=-1.317;SC=TTAGAACAGATATGGCCAGGG;SOR=1.042;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=158;TCF=70;TCR=88;TR=79;WE=103060394;WS=103060376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,89:0.49:181
chr9	103065884	rs3923501	C	T	1536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FS=1.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.83;ReadPosRankSum=-0.190;SOR=0.594;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,79:0.45:174
chr9	103090328	rs143830136	TTAAA	T	410.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.486;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=425;ReadPosRankSum=1.132;SC=TTTTTTTAACTTAAATATATC;SOR=2.985;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=13;WE=103090339;WS=103090318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
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chr9	103108941	rs2151131	C	G	1570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.467;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=20;PP=1084;ReadPosRankSum=-0.572;SC=TTCAATACAGCAAAACTGTGT;SOR=0.563;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=126;TCF=89;TCR=37;TR=67;WE=103108949;WS=103108931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,70:0.52:134
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chr9	104133628	rs1572983	C	T	1409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=35;PP=883;ReadPosRankSum=-2.637;SC=GCCTGTAGCTCGGATATGCAC;SOR=0.699;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=132;TCF=59;TCR=73;TR=63;WE=104133636;WS=104133618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,68:0.48:143
chr9	104153155	rs10989486	G	C	1545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=36;PP=937;ReadPosRankSum=-0.114;SC=AAAACAAACAGACAAATCCAT;SOR=0.762;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=37;TCR=68;TR=56;WE=104153165;WS=104153145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,65:0.56:116
chr9	104160891	rs184203531	G	C	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=261;ReadPosRankSum=-2.057;SC=TGAGATCCACGGGCCTGAGCG;SOR=0.278;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=16;WE=104160899;WS=104160881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr9	104306988	rs145182555	TA	T	78.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.51;MQRankSum=1.279;QD=4.14;ReadPosRankSum=-0.045;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr9	104324545	rs10521057	G	A	2140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.166;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=35;PP=1164;ReadPosRankSum=0.312;SC=TGACCTGTCCGTGCTGTAACA;SOR=0.797;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=170;TCF=99;TCR=71;TR=90;WE=104324553;WS=104324535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,100:0.55:181
chr9	104449063	rs2506354	C	T	4392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=74;NR=67;PP=2539;SC=GAGCAATGAGCCCTAAGGGCA;SOR=0.796;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=74;TCR=67;TR=141;WE=104449071;WS=104449053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr9	104499575	rs1337677	T	C	2780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.931;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=51;PP=1572;ReadPosRankSum=0.191;SC=GACTCTCCCGTGGAAACTCGT;SOR=0.763;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=236;TCF=134;TCR=102;TR=116;WE=104499583;WS=104499565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,130:0.49:268
chr9	105405214	rs34690795	A	G	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.689;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=112;ReadPosRankSum=-0.273;SC=TGTCCTAGTCAACAAGACCCC;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=8;WE=105405222;WS=105405204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr9	105405415	rs10820216	G	A	1096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.604;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=36;PP=785;ReadPosRankSum=0.394;SC=TTTGTCAGAGGCTTTTACACC;SOR=0.775;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=160;TCF=66;TCR=94;TR=59;WE=105405423;WS=105405405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,59:0.35:171
chr9	105757558	rs10739861	A	G	1903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=31;PP=1240;ReadPosRankSum=-0.448;SC=CTTTTGTTTTACCCCTTTAAT;SOR=0.657;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=155;TCF=97;TCR=58;TR=81;WE=105757566;WS=105757548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,88:0.51:173
chr9	105757756	rs1341205	A	G	935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=28;PP=764;SC=ATGAAGAGATATTTATTATAT;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=28;WE=105757764;WS=105757746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr9	105765610	rs2066261	T	C	631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=440;ReadPosRankSum=0.317;SC=ATTATAACCATAATAAGTAAT;SOR=0.741;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=57;TCF=11;TCR=46;TR=24;WE=105765618;WS=105765600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,26:0.43:60
chr9	106857908	rs3739736	G	A	1221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=31;PP=705;ReadPosRankSum=-0.678;SC=GAGACGTCCCGATATTCTCTT;SOR=0.752;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=45;TCR=64;TR=53;WE=106857916;WS=106857898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,59:0.49:121
chr9	106860969	rs10991107	T	C	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.744;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=104;ReadPosRankSum=-0.955;SC=ACTATTGTGCTGTGTCCGGCC;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=7;WE=106860977;WS=106860959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr9	106878318	rs35784229	TCTC	T	163.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=178;ReadPosRankSum=-2.369;SC=AATGGCAGCATCTCCTTTTTC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=4;WE=106878328;WS=106878313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr9	106885332	rs7350223	A	G	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=4.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.057;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.639;NF=17;NR=0;PP=312;ReadPosRankSum=-0.656;SC=GTTTGAATGTATTTCTCAAAT;SOR=2.256;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=66;TCF=54;TCR=12;TR=17;WE=106885340;WS=106885322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,19:0.28:68
chr9	106885616	rs10991114	A	G	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.607;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=379;ReadPosRankSum=2.308;SC=TATATATGATAAAGTTTATTT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=16;WE=106885624;WS=106885606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
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chr9	106894211	rs3780535	A	C	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.272;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.06;ReadPosRankSum=-0.369;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
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chr9	107360922	rs1851724	A	G	7132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=122;NR=124;PP=2965;SC=CTTCATGTACATGAGGAAGAT;SOR=0.754;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=246;TCF=122;TCR=124;TR=246;WE=107360930;WS=107360912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,270:1.00:270
chr9	107361312	rs1851723	T	C	8705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=135;NR=143;PP=2965;SC=TCTCAGAGGGTTGCAGATAGC;SOR=0.809;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=278;TCF=135;TCR=143;TR=278;WE=107361320;WS=107361302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,309:1.00:309
chr9	107361439	rs4629933	G	C	7742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=51.82;QD=40.12;SOR=1.301;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
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chr9	107361451	rs201540433	GC	AG	6496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.74;QD=45.75;SOR=1.989;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr9	107361460	rs116283639	G	A	5596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.54;QD=49.53;SOR=2.366;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr9	107361490	rs7042502	A	T	1341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.79;QD=31.20;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
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chr9	107368000	rs13289190	A	G	1452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=37;PP=1033;SC=ATGAATATGTATCATAATCCC;SOR=2.701;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=10;TCR=37;TR=47;WE=107368008;WS=107367990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
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chr9	107380396	rs36091517	T	G	5795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=94;PP=2965;SC=TTATGAAGATTAGCACAAAAA;SOR=0.801;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=204;TCF=108;TCR=96;TR=202;WE=107380404;WS=107380386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr9	107456763	rs10991359	T	C	3379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=57;NR=54;PP=1924;SC=TCATGTCCTTTTCTATACTAC;SOR=0.709;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=57;TCR=54;TR=111;WE=107456771;WS=107456753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr9	107457275	rs10820709	A	C	1645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=21;PP=1101;SC=CCCTATTGCAAACAGTTCTGA;SOR=1.123;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=33;TCR=21;TR=54;WE=107457283;WS=107457265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
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chr9	107515214	rs2274870	G	A	1132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.119;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=12;PP=748;ReadPosRankSum=-0.366;SC=ACTGAAGTTCGGAAAGCCTTG;SOR=1.468;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=108;TCF=74;TCR=34;TR=50;WE=107515222;WS=107515204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,53:0.46:114
chr9	107531127	rs12351524	C	T	802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=7;PP=514;ReadPosRankSum=1.311;SC=ATTTTCTTAACTATTTTCCTC;SOR=0.660;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=62;TCF=48;TCR=14;TR=32;WE=107531135;WS=107531117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,37:0.52:71
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chr9	107547622	rs1331924	C	G	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.736;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=8;PP=300;ReadPosRankSum=0.470;SC=GCGGGAGTGTCGGGGCAGGAA;SOR=0.247;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=41;TCF=30;TCR=11;TR=22;WE=107547630;WS=107547612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,26:0.57:46
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chr9	107556793	.	T	TAAA	157	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;FR=0.8985;HP=18;HapScore=2;MGOF=31;MMLQ=15;MQ=54.41;NF=2;NR=1;PP=157;QD=53.3333333333;SC=ATTCAGCTTCTAAAAAAAAAA;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=18;TCF=10;TCR=8;TR=3;WE=107556801;WS=107556783;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:15,3:0.17:18
chr9	107562804	rs2230808	T	C	6767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=125;NR=89;PP=2965;SC=GACATTATTTTTGGTGTCCAG;SOR=1.037;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=214;TCF=125;TCR=89;TR=214;WE=107562812;WS=107562794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr9	107566877	rs2777801	C	A	4593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=98;NR=61;PP=2965;SC=AGTAATAATACGGCAGGGGCC;SOR=1.139;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=159;TCF=98;TCR=61;TR=159;WE=107566885;WS=107566867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr9	107568705	rs2066716	C	T	1524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.548;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=33;PP=940;ReadPosRankSum=-0.753;SC=CCTGGCAGGGCGTGTCTCTGC;SOR=0.749;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=160;TCF=89;TCR=71;TR=72;WE=107568713;WS=107568695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,79:0.44:180
chr9	107586753	rs2066714	T	C	1138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.284;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=23;PP=752;ReadPosRankSum=0.922;SC=TACTTTCTGATATTCTCTTCT;SOR=0.792;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=113;TCF=61;TCR=52;TR=52;WE=107586761;WS=107586743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,56:0.46:122
chr9	107591082	rs10820737	G	T	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.222;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=133;ReadPosRankSum=0.941;SC=GGAAATGACAGGTATGACCCC;SOR=0.132;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=12;WE=107591090;WS=107591072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr9	107591116	rs10820738	T	C	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.429;HP=7;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=10;PP=262;ReadPosRankSum=-1.319;SC=GCTTGGATTTTTTTTCTTCTT;SOR=0.136;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=46;TCF=30;TCR=16;TR=22;WE=107591124;WS=107591106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,24:0.47:51
chr9	107591272	rs2853579	G	T	1701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=40;PP=938;ReadPosRankSum=1.220;SC=TAAACCAGAGGATGCTGTTGT;SOR=0.698;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=193;TCF=95;TCR=98;TR=80;WE=107591280;WS=107591262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,88:0.43:205
chr9	107593182	rs4743763	A	T	583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.822;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=9;PP=359;ReadPosRankSum=-1.200;SC=ACTGGTTAAAAACAGTGGCTT;SOR=1.001;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=85;TCF=56;TCR=29;TR=30;WE=107593190;WS=107593172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,33:0.35:95
chr9	107599438	rs4149346	G	GC	194.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.854;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=168;ReadPosRankSum=1.319;SC=GACAATGAGCGTTTGGCTCCT;SOR=0.096;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=7;WE=107599446;WS=107599428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr9	107599481	rs2297400	T	C	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.25;ReadPosRankSum=-1.718;SOR=0.086;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr9	107618298	rs72732679	G	A	3913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=385;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.368;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=89;PP=2605;ReadPosRankSum=0.665;SC=TTGCATCTCCGGTTGCTGCTA;SOR=0.726;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=354;TCF=180;TCR=174;TR=176;WE=107618306;WS=107618288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:199,186:0.48:385
chr9	107620867	rs2230806	C	T	1588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.664;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=26;PP=1083;ReadPosRankSum=-2.892;SC=CAGTTTCTCCCTTGGTAGGCC;SOR=0.583;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=128;TCF=83;TCR=45;TR=71;WE=107620875;WS=107620857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,73:0.54:135
chr9	107621140	rs2243313	A	C	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=78;ReadPosRankSum=1.915;SC=CTTTACTGAAACTCAGAATGT;SOR=0.307;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=6;WE=107621148;WS=107621130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr9	107624029	rs2230805	C	T	918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=26;PP=563;ReadPosRankSum=-0.245;SC=GGTTGTGATACAGGAACCCAG;SOR=0.690;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=34;TCR=54;TR=43;WE=107624037;WS=107624019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,47:0.48:97
chr9	108060515	rs2036876	G	A	1505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=27;NR=29;PP=905;SC=CTAGGAACAAGATGAAAATGC;SOR=0.871;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=27;TCR=29;TR=56;WE=108060523;WS=108060505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr9	108120818	rs7024985	C	T	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.638;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=113;ReadPosRankSum=-1.054;SC=AAGCTATATCCTCAAGGAAGA;SOR=0.569;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=7;WE=108120826;WS=108120808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr9	108147627	rs2771034	G	A	593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.020;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=366;ReadPosRankSum=-0.553;SC=CAAAAATGTAGATGTTCTTTA;SOR=1.257;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=53;TCF=44;TCR=9;TR=22;WE=108147635;WS=108147617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,25:0.42:60
chr9	108152199	rs2771040	G	A	2015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=35;PP=1078;ReadPosRankSum=1.378;SC=AGTAATGCTGGGAGGAATAAA;SOR=0.655;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=176;TCF=102;TCR=74;TR=83;WE=108152207;WS=108152189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,98:0.48:205
chr9	108226619	rs41277771	T	C	880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.966;NF=20;NR=20;PP=592;ReadPosRankSum=1.160;SC=TCAGGTATGATTGTTTTATGA;SOR=0.735;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=73;TCF=41;TCR=32;TR=40;WE=108226627;WS=108226609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,45:0.51:89
chr9	108268656	.	CT	C	105.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.897;ClippingRankSum=0.000;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.32;ReadPosRankSum=-1.318;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,19:0.24:80
chr9	108275777	rs10739910	T	C	307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=1;PP=238;SC=CAGTAATGAATCCCCAAAAAT;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=108275785;WS=108275767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	108275968	rs75201658	T	G	542.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.995;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=10;PP=258;ReadPosRankSum=-1.542;SC=CTTGGCTGATTAAAAAAACTT;SOR=0.846;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=54;TCF=29;TCR=25;TR=20;WE=108275976;WS=108275958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,27:0.41:66
chr9	108296915	rs7037104	A	G	1233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.698;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=36;PP=882;ReadPosRankSum=-0.402;SC=CTCAGATTAAAGGCATCACAA;SOR=0.567;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=43;TCR=83;TR=55;WE=108296923;WS=108296905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,58:0.44:131
chr9	108296931	rs7037218	C	T	906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.744;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=29;PP=647;ReadPosRankSum=-0.776;SC=CACAATCACACTGGTGGACTT;SOR=0.498;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=99;TCF=31;TCR=68;TR=43;WE=108296939;WS=108296921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,44:0.43:102
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chr9	108483741	rs7859253	G	A	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=201;ReadPosRankSum=-0.712;SC=CCAAATTGTTGTTGCTGTTAG;SOR=0.352;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=12;WE=108483749;WS=108483731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr9	109687403	rs17723637	A	G	3126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=3.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.535;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=55;PP=1924;ReadPosRankSum=-0.473;SC=TTTAAGTGCTATGGATCACCA;SOR=0.876;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=295;TCF=162;TCR=133;TR=129;WE=109687411;WS=109687393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:190,146:0.43:336
chr9	109689752	rs3814541	C	T	2750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=56;PP=1694;ReadPosRankSum=-1.286;SC=AGATGGCCCTCCTGTGGAGAA;SOR=0.679;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=243;TCF=126;TCR=117;TR=115;WE=109689760;WS=109689742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,128:0.48:267
chr9	109689859	rs3814540	T	C	2330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=57;PP=1310;ReadPosRankSum=-0.649;SC=TCAAGGCCAATGCAGATGTGA;SOR=0.710;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=280;TCF=140;TCR=140;TR=112;WE=109689867;WS=109689849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:184,121:0.40:305
chr9	109691676	rs3814538	A	G	3164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.776;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=69;PP=2014;ReadPosRankSum=-1.293;SC=GAGAGAGGCAACTTTGAGAAA;SOR=0.749;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=250;TCF=129;TCR=121;TR=135;WE=109691684;WS=109691666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,146:0.53:273
chr9	110047132	rs10733562	G	C	5391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=90;PP=2965;SC=GCAAATTACGGTTAGTTTCAT;SOR=0.785;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=178;TCF=88;TCR=90;TR=178;WE=110047140;WS=110047122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr9	110084328	rs1805329	C	T	5522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=96;NR=90;PP=2965;SC=AGTACTGGGGCTCCTCAGTCT;SOR=0.795;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=186;TCF=96;TCR=90;TR=186;WE=110084336;WS=110084318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr9	110093970	.	C	CA	1200.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=0.000;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=5.308;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.96;ReadPosRankSum=-0.149;SOR=1.416;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,59:0.69:86
chr9	111616818	rs3750466	T	C	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.154;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=95;ReadPosRankSum=1.885;SC=GACTCCCCCCTACCCTCTGCT;SOR=0.458;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=8;WE=111616826;WS=111616808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr9	111625913	rs4978370	A	G	3346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.032;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=74;PP=1807;ReadPosRankSum=-0.396;SC=GCTTCTGAACAGCGACGAGGA;SOR=0.542;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=276;TCF=128;TCR=148;TR=141;WE=111625921;WS=111625903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,167:0.53:317
chr9	111631647	rs3763644	C	T	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.496;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=281;ReadPosRankSum=0.318;SC=CTGGAGGCCCCGCCCTGAGAG;SOR=1.883;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=16;WE=111631655;WS=111631637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr9	111637331	rs1981268	CC	AG	2694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.436;HP=4;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=41;PP=2062;ReadPosRankSum=1.178;SC=AATCCCTACCCCCAGAAAACA;SOR=1.558;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=177;TCF=77;TCR=100;TR=62;WE=111637340;WS=111637321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,74:0.38:197
chr9	111642535	rs7874280	T	C	1872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.162;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=52;PP=1317;ReadPosRankSum=1.840;SC=AGGGTTAAAATTCAGCAAAAA;SOR=0.929;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=136;TCF=52;TCR=84;TR=80;WE=111642543;WS=111642525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,83:0.56:148
chr9	111644243	rs7046977	A	G	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.222;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=288;ReadPosRankSum=1.224;SC=CAAGAATGATAAAAATGATTT;SOR=1.371;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=14;WE=111644251;WS=111644233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr9	111661150	rs4978760	G	A	212.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=7;PP=155;SC=ATGCCAAGCTGCTATCACTGG;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=111661158;WS=111661140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	111670707	rs838824	T	C	5332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=102;PP=2965;SC=AATGCAAATATTATCATCGTA;SOR=1.440;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=167;TCF=65;TCR=102;TR=167;WE=111670715;WS=111670697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr9	111673580	rs11791215	T	C	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=185;ReadPosRankSum=-1.390;SC=TAACTTTCAATGTTTTTCTCA;SOR=0.846;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=14;WE=111673588;WS=111673570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr9	111678428	rs1772046	T	A	2432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=17;PP=1472;SC=CCCATACCTGTCTACTTTCAA;SOR=2.066;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=59;TCR=17;TR=76;WE=111678436;WS=111678418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr9	111679747	rs35676797	CA	C	69.27	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.90;ReadPosRankSum=1.465;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr9	111679964	rs56125645	C	CA	2447.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=36;PP=1439;ReadPosRankSum=0.969;SC=AAAGCAAACTCAGAGTGTTAC;SOR=0.710;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=90;TCF=7;TCR=83;TR=38;WE=111679972;WS=111679954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,80:0.48:167
chr9	111693132	rs838818	T	C	39.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr9	111712910	rs2780334	G	C	4362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=75;PP=2754;SC=ACGAGCACAGGATCCCTCACT;SOR=0.853;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=73;TCR=75;TR=148;WE=111712918;WS=111712900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr9	111754288	rs838836	T	C	2586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=44;PP=1701;SC=AATTTTGTAGTTGTGGATAAT;SOR=0.757;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=44;TCR=44;TR=88;WE=111754296;WS=111754278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr9	111775547	rs10538092	AAGG	A	4396.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.965;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=2.696;NF=22;NR=47;PP=2737;ReadPosRankSum=-0.771;SC=CCGCGGCGGGAAGGAGAAGAG;SOR=0.786;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=157;TCF=51;TCR=106;TR=69;WE=111775557;WS=111775537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,119:0.46:260
chr9	111775767	rs7032236	C	T	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.905;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=157;ReadPosRankSum=0.848;SC=CCGCGGCGAGCCTGCCGCCAG;SOR=1.702;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=9;WE=111775775;WS=111775757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr9	111782670	rs10816767	G	A	1419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=21;PP=809;ReadPosRankSum=0.531;SC=GAAGGGCAGAGGGCCACAGCT;SOR=0.684;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=101;TCF=61;TCR=40;TR=55;WE=111782678;WS=111782652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,63:0.54:117
chr9	111782867	rs11791093	G	C	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=190;ReadPosRankSum=1.026;SC=GCCCTAATGAGATTATATAGT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=9;WE=111782875;WS=111782857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr9	111795561	rs7866253	C	T	928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=1.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.65;ReadPosRankSum=0.138;SOR=1.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,24:0.59:41
chr9	111795565	rs7852550	T	C	1036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.16;ReadPosRankSum=-0.317;SOR=0.539;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,29:0.59:49
chr9	111795938	.	TAATATTGAGATGCAAC	T	1021	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;FR=0.5000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=1021;QD=350.666666667;SC=CTGACTGCAATAATATTGAGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=111795961;WS=111795928;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr9	111798751	rs2256253	C	T	890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=26;PP=611;ReadPosRankSum=-0.820;SC=TCCTCAACAACTTCCAACAAA;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=54;TCF=14;TCR=40;TR=35;WE=111798759;WS=111798741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,38:0.67:57
chr9	111800234	rs534286	G	A	706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-4.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=2;PP=464;ReadPosRankSum=0.675;SC=TTTCCTAGATGTATGTAAAAT;SOR=0.523;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=54;TCF=51;TCR=3;TR=29;WE=111800242;WS=111800224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,32:0.52:62
chr9	111800267	rs7029890	G	A	1434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=16;PP=910;ReadPosRankSum=-0.507;SC=CTTAAATAGCGAATAGTGGAA;SOR=0.671;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=125;TCF=90;TCR=35;TR=58;WE=111800275;WS=111800257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,66:0.47:140
chr9	111808432	rs7041715	C	G	2542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FS=5.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.09;ReadPosRankSum=0.217;SOR=1.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,67:0.42:158
chr9	111808437	rs7041716	C	A	2627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FS=4.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.10;ReadPosRankSum=0.560;SOR=1.090;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,73:0.42:174
chr9	111812825	rs614253	C	T	10073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=377;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=180;NR=166;PP=2965;SC=GGAAATATGACGTGTACTTAT;SOR=0.715;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=346;TCF=180;TCR=166;TR=346;WE=111812833;WS=111812815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,376:1.00:376
chr9	111835614	rs11792149	T	C	3173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.437;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=67;PP=1798;ReadPosRankSum=-0.537;SC=ATCTCTCTTCTTTTTCAAAAC;SOR=0.807;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=242;TCF=119;TCR=123;TR=128;WE=111835622;WS=111835604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,149:0.53:279
chr9	111843055	rs497196	A	T	1319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=16;PP=688;SC=GCTAGCTTTTAATCCAGACTA;SOR=1.225;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=27;TCR=16;TR=43;WE=111843063;WS=111843045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr9	111848470	rs7031485	G	A	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=172;ReadPosRankSum=-1.720;SC=TAAAATCAACGGAATGTAGTA;SOR=0.914;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=11;WE=111848478;WS=111848460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr9	111868698	rs7871742	A	G	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=242;ReadPosRankSum=-0.829;SC=TTTTAAATAGATTCAAAGCTG;SOR=0.622;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=12;WE=111868706;WS=111868688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr9	111870894	rs74697586	A	C	1565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=2.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.357;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=42;PP=1090;ReadPosRankSum=-0.981;SC=ATACACGTGAAAATGAACATA;SOR=1.115;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=124;TCF=44;TCR=80;TR=62;WE=111870902;WS=111870884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,68:0.50:137
chr9	111881927	rs6825	T	C	2250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=43;PP=1459;ReadPosRankSum=-0.817;SC=AAGTGCCGCATAGCACGGCCC;SOR=0.730;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=191;TCF=104;TCR=87;TR=98;WE=111881935;WS=111881917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,107:0.50:212
chr9	111882167	rs12001627	G	C	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=461;ReadPosRankSum=-1.559;SC=GGCTTGGCGCGTCCTTAGGGC;SOR=0.862;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=44;TCF=18;TCR=26;TR=26;WE=111882175;WS=111882157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,27:0.59:46
chr9	111882355	rs10710804	GA	G	358.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=304;SC=TCCCGAAGGGGAAATGGGGAA;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=111882363;WS=111882345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr9	111899928	rs10759329	A	G	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=366;ReadPosRankSum=0.506;SC=AAAAGAGAAGAGCAGGGGCAA;SOR=0.610;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=14;TCR=37;TR=25;WE=111899936;WS=111899918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,28:0.52:54
chr9	111911775	rs1533641	G	A	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=258;ReadPosRankSum=1.399;SC=CGGGATGGCCGTTACGAAACT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=13;WE=111911783;WS=111911765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr9	111929420	rs10979723	CG	GC	290.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.35;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	111936732	rs10733569	G	A	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.018;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=377;ReadPosRankSum=1.025;SC=TGGGCGAACAGAGCACACACT;SOR=0.972;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=59;TCF=43;TCR=16;TR=26;WE=111936740;WS=111936722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,27:0.41:66
chr9	111936788	rs10979727	C	T	1182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.013;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=22;PP=639;ReadPosRankSum=0.562;SC=AGAAAGAAGACGGACAGAAGG;SOR=0.996;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=129;TCF=73;TCR=56;TR=54;WE=111936796;WS=111936778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,62:0.43:144
chr9	111945049	rs3750450	T	G	2239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=49;PP=1354;ReadPosRankSum=-0.466;SC=AGGAAACGGGTTCATTGTATC;SOR=0.690;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=251;TCF=134;TCR=117;TR=105;WE=111945057;WS=111945039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,114:0.42:271
chr9	111945166	rs10122682	A	G	3919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=77;PP=2485;SC=AAATGGAACCAAAGGATTCAG;SOR=1.235;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=56;TCR=78;TR=133;WE=111945174;WS=111945156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr9	111956599	rs3750447	G	A	759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=12;PP=372;ReadPosRankSum=0.361;SC=CTTGTGTGGCGGCCGTTGTGG;SOR=0.653;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=67;TCF=37;TCR=30;TR=29;WE=111956607;WS=111956589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,36:0.48:75
chr9	112020668	rs745388	T	C	4116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=75;PP=2504;SC=TGCATCATTATAAAGCACAGC;SOR=1.156;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=59;TCR=75;TR=134;WE=112020676;WS=112020658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr9	112020713	rs893917	A	G	1923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=41;PP=1305;SC=TCCTTTCGGGAAGACTTAACT;SOR=1.875;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=17;TCR=41;TR=58;WE=112020721;WS=112020703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
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chr9	112151349	rs1371787	C	T	359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=1;PP=257;SC=AGGGCTGAGCCTCCCGTCACT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=112151357;WS=112151344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr9	112170701	rs35463120	T	TAAAC	2447.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=39;PP=1725;SC=TTTTTTAAGTTAAACAAACAA;SOR=2.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=1;TCR=52;TR=39;WE=112170709;WS=112170691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr9	112172477	rs2275699	T	G	3735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;SC=GCCCTGGGTGTGTGGATCACC;SOR=1.306;SbPval=0.55;Source=Platypus;TCF=50;WE=112172485;WS=112172467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr9	112199146	rs4978809	A	G	5794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.884;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=122;NR=78;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.641;SC=GAGCCAAGACATAACAAGAAT;SOR=0.864;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=201;TCF=122;TCR=79;TR=200;WE=112199154;WS=112199136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,224:1.00:225
chr9	112273733	rs61358126	A	G	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.780;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=11;PP=364;ReadPosRankSum=-2.286;SC=GAGCATGGCCATAGGACTTCG;SOR=0.938;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=83;TCF=52;TCR=31;TR=33;WE=112273741;WS=112273723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,36:0.40:91
chr9	112625187	rs10816901	A	T	3327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.034;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=74;PP=1902;ReadPosRankSum=-1.352;SC=AGATCAGGAGACTGCAAGTAG;SOR=0.559;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=250;TCF=113;TCR=137;TR=139;WE=112625195;WS=112625177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,159:0.57:279
chr9	112629397	rs7044189	G	A	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.725;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=22;PP=495;ReadPosRankSum=-0.361;SC=GGATTGAGACGTTTTTATTCT;SOR=0.606;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=102;TCF=45;TCR=57;TR=42;WE=112629405;WS=112629387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,45:0.41:109
chr9	112629446	rs13295100	G	C	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.702;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=195;ReadPosRankSum=-1.689;SC=ATGGTTCTCTGTGTGTGTGTG;SOR=0.363;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=11;WE=112629459;WS=112629434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,11:0.35:31
chr9	112629858	rs2769154	A	G	2494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=47;PP=1419;SC=CAAGGTAAGCAGCTGATCCCA;SOR=1.109;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=39;TCR=47;TR=86;WE=112629866;WS=112629848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr9	112811038	rs78923754	C	T	740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.10;ReadPosRankSum=1.781;SOR=0.631;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,34:0.74:46
chr9	112852571	rs7861341	C	T	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.414;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=190;ReadPosRankSum=0.422;SC=GTCCTTACATCGGATGTCCTA;SOR=0.982;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=14;WE=112852579;WS=112852561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,15:0.45:33
chr9	112852637	rs7864246	A	G	1500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=24;PP=876;ReadPosRankSum=-1.747;SC=TGAAGATCAGATATAACTGAG;SOR=0.760;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=114;TCF=68;TCR=46;TR=63;WE=112852645;WS=112852627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,70:0.56:124
chr9	112852717	rs6477737	C	T	1458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=32;PP=881;ReadPosRankSum=-0.325;SC=GTTACTTTTACTGTGGACTTT;SOR=0.720;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=137;TCF=74;TCR=63;TR=65;WE=112852725;WS=112852707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,73:0.47:155
chr9	112898327	rs1475612	A	G	1106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=6;PP=781;SC=CTTCCTCTTAATTATGAGTCA;SOR=2.554;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=36;WE=112898335;WS=112898317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr9	112899361	rs4978872	A	C	3804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=54;PP=2607;SC=GCTGCTGCAGAAGCAGTTACA;SOR=0.822;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=121;TCF=67;TCR=54;TR=121;WE=112899379;WS=112899351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr9	112900341	rs150402481	G	GGAAGCT	3127.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.116;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.697;NF=13;NR=24;PP=2175;ReadPosRankSum=0.411;SC=CGACTGTAGAGGAAGCTGAAG;SOR=0.752;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=126;TCF=33;TCR=93;TR=37;WE=112900352;WS=112900331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,81:0.41:196
chr9	112900785	rs3739456	A	G	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.403;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=164;ReadPosRankSum=1.079;SC=ATGCCCCATCACTGCCCTCCA;SOR=0.242;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=37;TCF=10;TCR=27;TR=14;WE=112900793;WS=112900775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,15:0.38:40
chr9	112918531	rs10759392	A	G	567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.874;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=284;ReadPosRankSum=1.006;SC=TTTATTTGCCAGTTTTCTTTC;SOR=0.357;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=23;WE=112918539;WS=112918521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,28:0.54:52
chr9	112918581	rs7862044	T	C	1474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.263;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=17;PP=851;ReadPosRankSum=-0.217;SC=AAAGGGTATTTTCTTCGTGTT;SOR=0.941;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=118;TCF=76;TCR=42;TR=55;WE=112918589;WS=112918571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,67:0.50:135
chr9	112924558	rs2148989	A	T	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=252;ReadPosRankSum=-1.188;SC=CTGTTCTGAAATATGGGACTG;SOR=0.665;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=16;WE=112924566;WS=112924548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr9	112963504	rs10120707	A	G	9931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=361;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=162;NR=163;PP=2965;SC=GGAGCCTTTGATCAGATCCCA;SOR=0.704;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=325;TCF=162;TCR=163;TR=325;WE=112963512;WS=112963494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,360:1.00:360
chr9	113006420	rs5843	A	G	1420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=2.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=13;PP=899;ReadPosRankSum=0.478;SC=GGCTGGTTATATTTTCAGAAA;SOR=0.671;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=106;TCF=79;TCR=27;TR=52;WE=113006428;WS=113006410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,60:0.50:121
chr9	113006579	.	T	TTATATATATACATATACATATG	423.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.518;ClippingRankSum=0.000;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=3.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.42;ReadPosRankSum=0.905;SOR=1.341;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,12:0.27:45
chr9	113007289	rs4135220	T	G	1310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.120;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.246;NF=12;NR=38;PP=808;ReadPosRankSum=0.323;SC=TATAATGGCATTACAAAAGCC;SOR=0.465;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=92;TCF=19;TCR=73;TR=50;WE=113007297;WS=113007279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,56:0.57:98
chr9	113007319	rs4135219	TGAA	T	919.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.147;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.401;NF=0;NR=21;PP=800;ReadPosRankSum=-0.765;SC=ATATTCTCAATGAAGAAGTTT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=1;TCR=47;TR=21;WE=113007329;WS=113007309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,25:0.52:48
chr9	113091653	rs10980325	A	C	423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=12;PP=286;SC=TCAGTAGAAAAGAAAATTGAA;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=113091661;WS=113091643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	113137562	rs138259328	TTCTGAG	T	10720.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=82;PP=2945;SC=TTGCCACCACTTCTGAGTCTA;SOR=1.241;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=130;TCF=43;TCR=87;TR=122;WE=113137575;WS=113137552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr9	113139489	rs2274485	C	G	1425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=17;PP=905;SC=GGTAACTCCCCTCAGGTGGGA;SOR=1.651;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=38;TCR=17;TR=55;WE=113139497;WS=113139479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr9	113139783	rs2077800	G	A	1220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=29;PP=849;SC=TCGAATCTCAGGAGGGAATTT;SOR=2.948;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=36;WE=113139791;WS=113139773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr9	113141815	rs992883	A	G	6955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=127;PP=2965;SC=ATAACAAAACAACAATTAAGC;SOR=1.004;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=225;TCF=98;TCR=127;TR=225;WE=113141823;WS=113141805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr9	113151713	rs2296779	T	C	3737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=39;PP=2517;SC=ACATTTTAATTACAAAACTAA;SOR=1.539;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=83;TCR=39;TR=122;WE=113151721;WS=113151703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr9	113166697	rs1410049	T	A	6625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=134;NR=88;PP=2965;SC=CGTCCCCATGTACAAGTATAT;SOR=1.127;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=222;TCF=134;TCR=88;TR=222;WE=113166705;WS=113166687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr9	113168344	rs7850488	G	C	1516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=21;PP=1093;ReadPosRankSum=-1.526;SC=GTTCAGAGATGATGTTTTCTT;SOR=0.690;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=136;TCF=92;TCR=44;TR=65;WE=113168352;WS=113168334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,69:0.46:150
chr9	113168501	rs41278435	A	G	3216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.470;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=69;PP=2173;ReadPosRankSum=-1.383;SC=TTGGCGACAGACGGTGGGGAC;SOR=0.718;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=252;TCF=127;TCR=125;TR=138;WE=113168509;WS=113168491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,147:0.55:268
chr9	113169126	rs2281937	G	A	3165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.407;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=60;PP=1870;ReadPosRankSum=0.855;SC=TGTAGCCCTCGTGACAGTGGA;SOR=0.834;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=270;TCF=150;TCR=120;TR=136;WE=113169134;WS=113169116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,153:0.48:316
chr9	113169630	rs7046213	T	C	12451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=352;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.48;SOR=0.807;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,351:1.00:351
chr9	113169630	.	TG	CA,CG	2435	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.35;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=62,143;NR=74,160;PP=1942,2435;QD=14.6725579034;SC=AGTCAGAGCCTGCTAGAATGT;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=305;TCF=144;TCR=161;TR=136,303;WE=113169639;WS=113169620;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.45:305
chr9	113169631	rs7030192	G	A	3518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=354;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.266;SOR=0.691;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:184,169:0.48:353
chr9	113171262	rs16914997	G	A	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.631;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=22;PP=497;ReadPosRankSum=0.870;SC=AAGTGAGTGCGATTTGTATAA;SOR=1.151;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=51;TCF=14;TCR=37;TR=28;WE=113171270;WS=113171252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,31:0.57:54
chr9	113174025	rs41278439	T	C	984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.658;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=28;PP=552;ReadPosRankSum=1.225;SC=GCTGTGAGGTTGGGAAGAAAG;SOR=0.788;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=123;TCF=54;TCR=69;TR=49;WE=113174033;WS=113174015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,53:0.39:135
chr9	113174097	rs41278441	C	G	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.285;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=211;ReadPosRankSum=-0.037;SC=TTTTTTAAATCTTTCCCACAA;SOR=0.458;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=43;TCF=11;TCR=32;TR=18;WE=113174105;WS=113174087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,21:0.45:47
chr9	113189954	rs41279045	T	G	1854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.003;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=42;PP=1162;ReadPosRankSum=0.194;SC=CAGGTGGTTCTCCACAGAAGA;SOR=0.598;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=220;TCF=119;TCR=101;TR=91;WE=113189962;WS=113189944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,100:0.41:242
chr9	113190203	rs76191498	A	T	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.044;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=64;ReadPosRankSum=1.605;SC=AGAGAAATCTAAACAAGCTAT;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=5;WE=113190211;WS=113190193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr9	113191533	rs75212846	C	T	3164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=383;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.373;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=73;PP=1805;ReadPosRankSum=-1.837;SC=CTGGTTCACACACAGGAGGGG;SOR=0.678;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=354;TCF=184;TCR=170;TR=151;WE=113191541;WS=113191523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:217,165:0.43:382
chr9	113191597	rs76469101	G	A	2388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.444;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=64;PP=1397;ReadPosRankSum=-0.598;SC=ACCGGCCAGAGTATATCCTTT;SOR=0.652;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=261;TCF=110;TCR=151;TR=112;WE=113191605;WS=113191587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,122:0.43:282
chr9	113194127	rs17806670	A	G	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.712;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=8;PP=408;ReadPosRankSum=0.980;SC=GAAATAACATACACTTAAAAT;SOR=0.119;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=58;TCF=47;TCR=11;TR=28;WE=113194135;WS=113194117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,31:0.49:63
chr9	113194686	rs4545168	C	T	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.961;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=8;PP=442;ReadPosRankSum=-0.836;SC=TTTGGGATGACTGTCATCTAC;SOR=0.861;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=76;TCF=55;TCR=21;TR=29;WE=113194694;WS=113194676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,30:0.38:79
chr9	113207962	rs7847560	A	C	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=57;ReadPosRankSum=0.315;SC=TACGTTCTTAAAGAACTTGTT;SOR=0.260;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=5;WE=113207970;WS=113207959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr9	113208250	rs7863519	T	G	1048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=27;PP=603;ReadPosRankSum=0.485;SC=GATGGGAGCATGCCATCTAGC;SOR=0.766;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=100;TCF=35;TCR=65;TR=42;WE=113208258;WS=113208240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,49:0.45:110
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chr9	113213726	rs4421419	A	G	3148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=74;PP=2063;ReadPosRankSum=2.189;SC=AACTTGACAGAACTTTAAGAC;SOR=0.669;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=263;TCF=122;TCR=141;TR=134;WE=113213734;WS=113213716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,148:0.49:305
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chr9	113244732	rs41296069	G	T	833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=22;PP=455;ReadPosRankSum=-0.392;SC=GAGGGAAAAGGTCTCCTTGTG;SOR=0.673;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=46;TCR=49;TR=43;WE=113244740;WS=113244722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,47:0.47:101
chr9	113245758	rs10817030	C	T	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=3;PP=429;ReadPosRankSum=1.385;SC=ATTCATTCTCCCTAGACAGTT;SOR=0.834;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=49;TCF=42;TCR=7;TR=23;WE=113245766;WS=113245748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,23:0.47:49
chr9	113261483	rs872665	C	T	1286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.973;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=42;PP=863;ReadPosRankSum=-1.535;SC=GATATGATGACATCTTTGGGC;SOR=1.224;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=119;TCF=39;TCR=80;TR=59;WE=113261491;WS=113261473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,60:0.49:123
chr9	113276356	rs3818764	C	G	1089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.760;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=20;PP=552;ReadPosRankSum=-1.111;SC=TCCTGGTGAGCCTTCAGGTTT;SOR=0.601;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=83;TCF=44;TCR=39;TR=45;WE=113276364;WS=113276346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,53:0.55:96
chr9	113308284	rs2991363	A	T	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=-1.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.100;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=372;ReadPosRankSum=0.260;SC=TGTGCCACTGACCCCACACAC;SOR=1.362;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=49;TCF=40;TCR=9;TR=21;WE=113308292;WS=113308274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,25:0.43:58
chr9	113449271	rs7869057	G	C	271.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=222;SC=TTATTCAGAAGTCACTCAAGT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=113449279;WS=113449269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr9	113449377	rs71501643	T	C	1150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.789;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=17;PP=603;ReadPosRankSum=-1.108;SC=TAATCTGTCATTTTTTTCTGT;SOR=0.565;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=81;TCF=53;TCR=28;TR=46;WE=113449385;WS=113449367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,54:0.57:95
chr9	113457726	rs10980531	G	A	1655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.993;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=33;PP=980;ReadPosRankSum=-1.122;SC=AAATAATAGAGGGATTAAAAG;SOR=0.529;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=140;TCF=76;TCR=64;TR=70;WE=113457734;WS=113457716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,80:0.51:157
chr9	113459768	rs41279053	C	G	907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-0.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=24;PP=516;ReadPosRankSum=0.133;SC=CATTTCTTCCCCTGACTGTGT;SOR=0.726;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=33;TCR=55;TR=38;WE=113459776;WS=113459758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,44:0.42:105
chr9	113490776	rs10817087	C	T	443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=2;PP=269;SC=TGTCATTTAACAGTTTGCTTT;SOR=2.584;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=113490784;WS=113490766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	113490925	rs12551974	G	A	3203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=63;NR=41;PP=1490;SC=TTTTGTTTGCGTGTTTATTGT;SOR=0.759;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=63;TCR=41;TR=104;WE=113490933;WS=113490915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr9	113524511	rs147974075	AT	A	2438.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.544;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=35;PP=1443;ReadPosRankSum=1.554;SC=TATTGTAACAATTGTTTCCAA;SOR=0.768;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=99;TCF=17;TCR=82;TR=42;WE=113524519;WS=113524501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,81:0.44:185
chr9	113547001	rs572189	A	C	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=362;ReadPosRankSum=-1.008;SC=TAAATATATTATTATCATGAA;SOR=0.569;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=36;TCF=33;TCR=3;TR=20;WE=113547009;WS=113546991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr9	113547322	rs484010	T	C	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=231;ReadPosRankSum=0.546;SC=CAGCTAACCATGTGTAGTAAT;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=15;WE=113547330;WS=113547312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr9	113637854	rs3739709	G	A	1307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.614;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=28;PP=698;ReadPosRankSum=-1.407;SC=TTTCTTTGTCGCGGTAGGAGT;SOR=0.611;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=130;TCF=74;TCR=56;TR=61;WE=113637862;WS=113637844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,68:0.47:146
chr9	113761797	.	A	C	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.088;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.309;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=111;ReadPosRankSum=-0.173;SC=GGCTGCTATGAAAGCTACCAC;SOR=3.279;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=12;WE=113761805;WS=113761787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,12:0.34:35
chr9	113800931	rs77865995	C	T	2295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=62;PP=1414;ReadPosRankSum=0.072;SC=GGACCCCTTACCTGGTGTGGC;SOR=0.687;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=265;TCF=117;TCR=148;TR=112;WE=113800939;WS=113800921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,120:0.43:282
chr9	114090210	.	G	C	3522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.587;ClippingRankSum=0.000;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.895;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=69;PP=2398;ReadPosRankSum=0.321;SC=GATTCCCACAGAGGGGTATCT;SOR=0.632;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=259;TCF=131;TCR=128;TR=141;WE=114090218;WS=114090200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,153:0.53:288
chr9	114090279	rs314452	A	G	3651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.681;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=66;PP=2265;ReadPosRankSum=-0.025;SC=AGGAGACCGTAGCCATCCGTG;SOR=0.863;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=284;TCF=157;TCR=127;TR=155;WE=114090287;WS=114090269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,166:0.53:311
chr9	114125835	rs2297524	A	G	940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=11;PP=498;ReadPosRankSum=-0.689;SC=ACATGGCTTTATGGTCCCCCA;SOR=0.729;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=76;TCF=51;TCR=25;TR=36;WE=114125843;WS=114125825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,44:0.51:87
chr9	114134198	rs10980884	C	A	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=182;ReadPosRankSum=0.280;SC=GACCAACAGTCTAAAAGCAGT;SOR=0.793;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=11;WE=114134206;WS=114134188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
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chr9	114178402	rs12338500	T	G	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=26;ReadPosRankSum=0.328;SC=TCCCAATACTTTTTTTTTAAA;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=3;WE=114178410;WS=114178392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr9	114193095	rs12348365	A	T	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=2;PP=21;SC=TATGTTTTTAAACCAAAACAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=114193103;WS=114193085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr9	114202502	rs7860748	G	A	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.276;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=133;ReadPosRankSum=0.159;SC=AAGCAGTGGAGCTGAAGTTTA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=7;WE=114202510;WS=114202499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr9	114235064	.	GA	G	48.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.185;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=6.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.43;ReadPosRankSum=0.850;SOR=1.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,8:0.24:34
chr9	114301585	rs10441737	C	T	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.273;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=338;ReadPosRankSum=-2.494;SC=CTATTTATTACGCATTAAATT;SOR=1.055;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=53;TCF=35;TCR=18;TR=25;WE=114301593;WS=114301575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,28:0.48:58
chr9	114326557	rs138247149	T	TTTA	172.82	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.74;QD=28.80;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr9	114341376	rs17320055	C	T	713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.308;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=22;PP=462;ReadPosRankSum=0.000;SC=CATAATGGGCCAACAGATCCC;SOR=0.124;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=58;TCF=13;TCR=45;TR=32;WE=114341384;WS=114341366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,33:0.56:59
chr9	114356659	rs3739703	C	T	1105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.845;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=27;PP=551;ReadPosRankSum=-0.169;SC=GTTGAGAAACCACCCATGAGG;SOR=0.460;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=86;TCF=27;TCR=59;TR=42;WE=114356667;WS=114356649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,50:0.52:96
chr9	114359624	rs1053959	C	A	1215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.911;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=12;PP=752;ReadPosRankSum=1.867;SC=GGGAGCTCAGCTGTCTTCAAC;SOR=1.182;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=106;TCF=72;TCR=34;TR=50;WE=114359632;WS=114359614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,55:0.49:112
chr9	114366028	rs966626	T	C	2469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.557;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=42;PP=1622;ReadPosRankSum=-0.831;SC=GTAGACAAGATCACATAGCTA;SOR=0.925;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=233;TCF=138;TCR=95;TR=109;WE=114366036;WS=114366018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,119:0.48:249
chr9	114366094	rs966627	G	C	3738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.399;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=83;PP=2188;ReadPosRankSum=1.374;SC=CTACACTTTTGTCTGTTCCAT;SOR=0.655;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=298;TCF=137;TCR=161;TR=158;WE=114366102;WS=114366084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,178:0.53:333
chr9	114371322	rs4978450	T	A	1246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.441;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=19;PP=724;ReadPosRankSum=-0.242;SC=TTTCTGTTCATTCTGGGCTTC;SOR=0.485;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=108;TCF=72;TCR=36;TR=53;WE=114371330;WS=114371312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,59:0.50:119
chr9	114371493	rs12351897	C	T	907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.669;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=20;PP=575;ReadPosRankSum=-0.123;SC=CTTCTCACATCGTTGTTGGGG;SOR=0.532;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=38;TCR=43;TR=38;WE=114371501;WS=114371483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,43:0.46:93
chr9	114393784	rs10980984	G	A	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=146;ReadPosRankSum=-1.647;SC=GCTGCTGCTGGTGCGGCCCGC;SOR=0.675;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=9;WE=114393792;WS=114393774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr9	114394146	rs10980985	G	T	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=130;ReadPosRankSum=0.000;SC=CCACCACCGCGACCTTTAAGA;SOR=0.836;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=9;WE=114394154;WS=114394136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr9	114394177	rs10980986	C	T	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=62;ReadPosRankSum=1.029;SC=TCCCACGTGGCCCTGTGAAAG;SOR=0.582;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=5;WE=114394185;WS=114394167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr9	114409550	rs4978455	A	G	1511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=40;PP=931;ReadPosRankSum=-0.863;SC=GTATGTATCAATGGATATTTT;SOR=0.752;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=131;TCF=53;TCR=78;TR=67;WE=114409558;WS=114409540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,72:0.50:144
chr9	114411945	rs7019332	G	T	1504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.623;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=27;PP=793;ReadPosRankSum=0.114;SC=ATATAAAGGGGGGCTATCAGA;SOR=0.561;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=102;TCF=58;TCR=44;TR=57;WE=114411953;WS=114411935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,67:0.59:114
chr9	114454544	rs7869279	T	C	1022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.685;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=23;PP=656;ReadPosRankSum=0.034;SC=ACTTGAGATTTCTTTTAGTTC;SOR=0.585;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=110;TCF=57;TCR=53;TR=48;WE=114454552;WS=114454534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,52:0.43:120
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chr9	114456322	rs113054343	T	TTAAG	109.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=127;ReadPosRankSum=0.099;SC=AGAAAAGAGTTTAATAGTCAG;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=4;WE=114456330;WS=114456312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
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chr9	114467478	rs28545063	T	C	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=176;ReadPosRankSum=-0.730;SC=CACACACACATATATATATAA;SOR=0.491;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=34;TCF=24;TCR=10;TR=16;WE=114467486;WS=114467468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
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chr9	114480602	rs2418174	C	A	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.438;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=27;PP=567;ReadPosRankSum=1.930;SC=AAAACATAGACTATACATTAC;SOR=1.140;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=61;TCF=15;TCR=46;TR=34;WE=114480610;WS=114480592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,34:0.52:66
chr9	114484682	rs1337581	T	C	841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.870;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=4;PP=670;ReadPosRankSum=0.095;SC=CTTTTATTTGTACTCACCTTG;SOR=1.842;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=63;TCF=51;TCR=12;TR=34;WE=114484690;WS=114484672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,35:0.52:67
chr9	114489887	rs953536	C	T	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.640;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=167;ReadPosRankSum=0.986;SC=ACCATATCTACGGCAAAATAT;SOR=1.110;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=12;WE=114489895;WS=114489877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,12:0.34:35
chr9	114490308	rs7470491	T	C	1057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=30;PP=561;ReadPosRankSum=-1.233;SC=AGGTGAAGAATGACTTTTATG;SOR=0.683;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=93;TCF=36;TCR=57;TR=49;WE=114490316;WS=114490298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,51:0.53:97
chr9	114537978	rs440164	A	T	65.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.11;ReadPosRankSum=1.347;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr9	114543400	rs2786632	A	G	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.460;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=376;ReadPosRankSum=-0.187;SC=ATCTTTATTTATTCACAAATG;SOR=1.688;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=19;WE=114543408;WS=114543390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
chr9	114659643	rs3780520	A	G	785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.936;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=17;PP=389;ReadPosRankSum=0.024;SC=CGGGCCTCGGAGACAGGCGAG;SOR=0.566;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=58;TCF=25;TCR=33;TR=32;WE=114659651;WS=114659633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,37:0.54:69
chr9	114659661	rs3780519	A	T	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.528;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=341;ReadPosRankSum=-0.429;SC=GAGAATGGGAAACGTTTGCGC;SOR=1.140;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=48;TCF=17;TCR=31;TR=24;WE=114659669;WS=114659651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,27:0.51:53
chr9	114677046	rs140717465	TTTTTG	T	1062.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.379;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=625;ReadPosRankSum=-2.159;SC=GTGTTACGGTTTTTTGTTTTG;SOR=0.280;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=62;TCF=3;TCR=59;TR=15;WE=114677058;WS=114677036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,29:0.42:69
chr9	114688807	rs72757814	A	G	1275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.422;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=23;PP=644;ReadPosRankSum=-0.604;SC=TCATGTTCATAGTATCAGACC;SOR=0.381;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=104;TCF=50;TCR=54;TR=50;WE=114688815;WS=114688797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,61:0.48:127
chr9	114694486	rs7850023	A	G	1654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.619;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.121;NF=54;NR=24;PP=1075;ReadPosRankSum=-2.496;SC=TTCCTGCTACAATAATTTGTG;SOR=0.922;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=169;TCF=114;TCR=55;TR=78;WE=114694494;WS=114694476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,86:0.45:192
chr9	114803631	rs2281790	C	A	318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=249;SC=AGGAATGGGGCCCAGCTGGGA;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=114803639;WS=114803621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr9	114803957	rs12553171	A	G	477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=14;PP=390;SC=TTTTCCTGGGAAGGCATCCCC;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=114803965;WS=114803947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	114811154	rs1980739	C	T	3713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=81;NR=42;PP=2164;SC=GAGGAGAAAGCATGGGCCATA;SOR=1.263;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=123;TCF=81;TCR=42;TR=123;WE=114811162;WS=114811144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr9	114814828	rs7034341	C	T	1571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=37;PP=1057;SC=ATCTCTTAATCTGAACTAGAC;SOR=1.692;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=17;TCR=37;TR=54;WE=114814836;WS=114814818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr9	114814899	rs7034671	G	A	452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=14;PP=348;SC=AGGGACCGGCGTGGGTTGCAT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=114814907;WS=114814889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr9	114919707	rs700105	A	G	3474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=32;PP=2345;SC=CCCCAAGGACATCAACTCTTT;SOR=2.075;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=123;TCF=91;TCR=32;TR=122;WE=114919715;WS=114919697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr9	115142507	rs7867831	A	G	1400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.587;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=36;PP=893;ReadPosRankSum=0.923;SC=CGGGCGAAGGACGCGTCTCGG;SOR=0.750;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=147;TCF=71;TCR=76;TR=69;WE=115142515;WS=115142497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,71:0.45:157
chr9	115216222	rs10538330	GATTA	G	1890.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.793;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.566;NF=20;NR=10;PP=1318;ReadPosRankSum=-0.638;SC=CTGTCCTGCTGATTAATTAAT;SOR=1.017;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=78;TCF=48;TCR=30;TR=30;WE=115216233;WS=115216212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,51:0.46:112
chr9	115249262	rs6477940	T	C	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=116;ReadPosRankSum=-1.365;SC=CACTTACCTTTGGTGCCCGGC;SOR=0.752;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=9;WE=115249270;WS=115249252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
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chr9	115567015	rs139599865	A	ATG	1202.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=4;PP=581;SC=ACTCTCCAGTATGTTTTCATT;SOR=1.863;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=14;WE=115567023;WS=115567005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr9	115567184	rs1891402	T	C	4391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=67;PP=2330;SC=TCGTTATAGTTGATGATCCCA;SOR=0.730;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=149;TCF=81;TCR=68;TR=148;WE=115567192;WS=115567174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
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chr9	115598800	rs117078509	G	A	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=226;ReadPosRankSum=-1.146;SC=ACAGAACTAGGCCATCTTTTG;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=13;WE=115598808;WS=115598790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr9	115600848	rs7023478	T	C	3066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=54;PP=1800;SC=GTGAGCTGGCTGAACCCCTGG;SOR=0.728;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=54;TCR=54;TR=108;WE=115600856;WS=115600838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr9	115649520	rs3802493	C	T	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.551;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=244;ReadPosRankSum=-2.256;SC=GGAACTGTCTCAAGTGCCTTC;SOR=1.147;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=46;TCF=31;TCR=15;TR=18;WE=115649528;WS=115649510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,20:0.40:50
chr9	115652836	rs3802492	G	A	1639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.633;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=36;PP=897;ReadPosRankSum=0.803;SC=CCTTCACCACGAGGAGTAGCC;SOR=0.605;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=125;TCF=58;TCR=67;TR=70;WE=115652844;WS=115652826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,79:0.56:141
chr9	115873890	rs80016582	G	C	1541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.729;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.676;NF=41;NR=31;PP=939;ReadPosRankSum=-1.306;SC=AGCGGTGGTCGCTCGCCCCCT;SOR=0.516;SbPval=0.36;Source=Platypus;TCF=98;TR=72;WE=115873898;WS=115873880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,79:0.47:168
chr9	115920099	rs4344146	T	C	1142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.402;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=19;PP=675;ReadPosRankSum=0.754;SC=CTCAGACTTGTAGCTTGGAAA;SOR=0.854;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=121;TCF=73;TCR=48;TR=52;WE=115920107;WS=115920089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,57:0.44:131
chr9	115925104	rs3810906	C	T	1076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.664;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=24;PP=698;ReadPosRankSum=-0.752;SC=TCATGCTGGCCGTAATGTCCT;SOR=0.655;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=89;TCF=46;TCR=43;TR=51;WE=115925112;WS=115925094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,52:0.55:95
chr9	115928275	rs3810908	T	C	686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.294;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=9;PP=455;ReadPosRankSum=1.062;SC=CACCCTGTGGTTCGCCTAGAC;SOR=0.283;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=55;TCF=42;TCR=13;TR=30;WE=115928283;WS=115928265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,31:0.55:56
chr9	115931692	rs3810909	A	G	2908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.452;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=57;PP=1782;ReadPosRankSum=0.544;SC=CGGGGTCTGAAGTCAGGGACA;SOR=0.645;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=236;TCF=124;TCR=112;TR=123;WE=115931700;WS=115931682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,135:0.52:259
chr9	115934022	rs5900041	A	AACCTGGATT	566.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.120;NF=0;NR=12;PP=2897;ReadPosRankSum=-0.916;SC=TGGCCTCAGGAACCAGGTGAA;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=12;WE=115934030;WS=115934012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr9	115936903	rs3827673	A	G	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=21;PP=482;ReadPosRankSum=1.683;SC=TAGCTTGTTAACAGAGAATAA;SOR=0.598;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=26;TCR=51;TR=32;WE=115936911;WS=115936893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,33:0.39:84
chr9	115950114	rs45559933	C	T	2591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.455;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=48;PP=1536;ReadPosRankSum=0.484;SC=GAGTGGGAATCGAGAGATGAC;SOR=0.655;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=231;TCF=130;TCR=101;TR=112;WE=115950122;WS=115950104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,124:0.49:255
chr9	115965339	rs67487726	GA	G	174.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=5.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.57;ReadPosRankSum=2.813;SOR=0.204;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,14:0.29:49
chr9	115968609	rs4281172	C	T	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.429;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=38;ReadPosRankSum=0.329;SC=TTTGTTTTAACGCACAATAGT;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=4;WE=115968617;WS=115968599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr9	115968951	rs3935547	T	C	458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.612;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=307;ReadPosRankSum=-0.642;SC=GGAACAACAGTCATTCAGCCT;SOR=0.250;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=45;TCF=13;TCR=32;TR=22;WE=115968959;WS=115968941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,24:0.52:46
chr9	115969433	rs5900043	T	TAGA	1013.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.154;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.200;NF=22;NR=1;PP=973;ReadPosRankSum=-1.074;SC=CGAGAAAAAGTAGCTTAACTG;SOR=2.621;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=54;TCF=43;TCR=11;TR=23;WE=115969441;WS=115969423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,25:0.42:59
chr9	115983540	rs2233914	G	A	1105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.894;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=18;PP=649;ReadPosRankSum=0.889;SC=GGCTTTCACCGGGTTGCGGGG;SOR=1.043;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=130;TCF=77;TCR=53;TR=50;WE=115983548;WS=115983530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,59:0.38:156
chr9	115985417	rs10981693	T	C	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.458;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=75;ReadPosRankSum=-0.023;SC=TTATCCTGGATGTTTAAGTAG;SOR=1.508;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=5;WE=115985425;WS=115985407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr9	115985499	rs4560868	G	C	1343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.43;SOR=0.729;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr9	116124454	rs10600721	GGT	G	244.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.54;MQRankSum=0.693;QD=14.40;ReadPosRankSum=-0.174;SOR=0.990;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr9	116136198	rs1043836	C	T	9794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=350;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=161;NR=151;PP=2965;SC=GCCAAGGCCCCCCAGGATGCC;SOR=0.716;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=312;TCF=161;TCR=151;TR=312;WE=116136206;WS=116136188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,350:1.00:350
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chr9	116155669	rs72217268	T	TCCCCAA	591.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=625;ReadPosRankSum=-0.269;SC=CAACACTCCCTCCCCAACCCC;SOR=0.543;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=12;WE=116155677;WS=116155659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,17:0.38:45
chr9	116259441	rs76955252	T	C	593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.658;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=453;ReadPosRankSum=-1.123;SC=TTCCTGGAGGTGCAGGCATGG;SOR=3.091;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=35;TCF=31;TCR=4;TR=21;WE=116259449;WS=116259431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,22:0.59:37
chr9	116346287	rs3810927	C	T	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.997;HP=2;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=16;ReadPosRankSum=-1.112;SC=ATAGCACCTACAGCCAGAAGG;SOR=0.625;SbPval=0.76;Source=Platypus;TCF=41;TR=37;WE=116346295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,43:0.48:90
chr9	116356373	rs12350531	G	C	8052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=123;NR=149;PP=2965;SC=GGCTCCTCCTGTCTGAGTCCC;SOR=1.009;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=274;TCF=124;TCR=150;TR=272;WE=116356381;WS=116356363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,302:1.00:302
chr9	116356516	rs12341266	A	G	5762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=109;NR=85;PP=2965;SC=GGTGCCTCCTACAGACCAATC;SOR=0.847;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=194;TCF=109;TCR=85;TR=194;WE=116356537;WS=116356506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr9	116356529	rs10817493	C	G	6318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=118;NR=99;PP=2965;SC=GACCAATCTGCGGCCCCAAGG;SOR=0.812;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=217;TCF=118;TCR=99;TR=217;WE=116356537;WS=116356506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr9	116357408	rs884992	C	T	586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=16;PP=404;SC=GGGCTGAGCCCAAGCTGAGGC;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=116357416;WS=116357398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr9	116359339	rs1051013	T	C	1187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=40;PP=935;SC=CCCCAGAGGCTGTGTCTCTGG;SOR=5.283;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=2;TCR=41;TR=42;WE=116359347;WS=116359329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr9	116764832	rs148995274	TTTTGCAC	T	2497.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.698;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.196;NF=13;NR=29;PP=1814;ReadPosRankSum=-1.071;SC=CCATGTTCTCTTTTGCACTTG;SOR=0.905;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=95;TCF=30;TCR=65;TR=42;WE=116764846;WS=116764822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,69:0.39:178
chr9	116769515	rs4979321	C	T	956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.789;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=10;PP=514;ReadPosRankSum=-0.599;SC=TTCCTCCCTCCGCTAGCCAGA;SOR=0.577;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=93;TCF=67;TCR=26;TR=38;WE=116769523;WS=116769505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,46:0.43:106
chr9	116778269	rs4979324	A	G	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.561;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=11;PP=324;ReadPosRankSum=0.166;SC=AAGAGTGGGGACCAGGGCACC;SOR=0.481;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=45;TCF=26;TCR=19;TR=22;WE=116778277;WS=116778259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
chr9	116791161	rs7030167	T	C	2920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.270;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=70;PP=1661;ReadPosRankSum=-2.227;SC=TGGTCCGATGTGCCACCCTCT;SOR=0.684;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=332;TCF=165;TCR=167;TR=143;WE=116791169;WS=116791151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:203,152:0.43:355
chr9	116794784	rs2116407	A	G	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=122;ReadPosRankSum=-1.178;SC=TCCTGGGGAGATCTGGCTTGA;SOR=0.512;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=9;WE=116794792;WS=116794774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr9	116840204	rs2251680	A	G	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.258;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=315;ReadPosRankSum=0.869;SC=CAGCCAAGAGACCCACGGAAT;SOR=2.998;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=14;WE=116840212;WS=116840194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr9	116856481	rs35719524	C	A	2807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=32;PP=1870;SC=CATTCTCTAGCATGAACTCCT;SOR=1.261;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=60;TCR=32;TR=92;WE=116856489;WS=116856471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr9	116856889	rs1465660	A	G	261.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=7;PP=174;SC=TCTGCCTGGAAGGGGCACCTT;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=116856897;WS=116856879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr9	116858625	rs6478062	T	G	7877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=135;NR=108;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.723;SC=GACCCTTGCTTGGTGGCCCCG;SOR=0.317;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=244;TCF=136;TCR=108;TR=243;WE=116858633;WS=116858615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,280:1.00:281
chr9	116859769	rs3810929	T	C	2498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=39;PP=1892;SC=AGTCCACCCATCCCCAGATCT;SOR=0.843;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=41;TCR=39;TR=80;WE=116859777;WS=116859759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr9	116859852	rs62556540	C	T	5653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=111;NR=77;PP=2965;SC=TCCGTTTCCTCATGGGCTGTC;SOR=1.032;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=188;TCF=111;TCR=77;TR=188;WE=116859860;WS=116859842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr9	116860516	rs57239538	TG	T	2053.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=10;NR=28;PP=1380;SC=CTACCCGGGGTGGGGGCTGGG;SOR=0.693;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=43;TCF=10;TCR=33;TR=38;WE=116860524;WS=116860506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr9	116860731	.	A	AGCGGGGCACTCTGGAGGAGG	817.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.98;QD=35.55;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr9	116930100	rs2567707	G	A	1809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.542;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=44;PP=1116;ReadPosRankSum=1.609;SC=CACGGGCACCGTCATTCCTGC;SOR=0.764;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=167;TCF=83;TCR=84;TR=84;WE=116930108;WS=116930090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,89:0.49:183
chr9	116930194	rs2567706	A	G	1348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=30;PP=853;ReadPosRankSum=-0.976;SC=GTCCGCAGCCAGAAACGCAAG;SOR=0.672;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=150;TCF=78;TCR=72;TR=64;WE=116930202;WS=116930184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,68:0.42:161
chr9	116931099	rs2241671	G	A	11265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=417;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=187;NR=195;PP=2965;SC=CTCCCGTCCCGCAGAGAAGCC;SOR=0.773;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=383;TCF=188;TCR=195;TR=382;WE=116931107;WS=116931089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,416:1.00:416
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chr9	116945454	rs10759688	A	C	296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=204;SC=GCTTCAGGGGAACTGAGGGGG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=116945462;WS=116945444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	116958214	rs2567710	C	T	9939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.18;SOR=0.807;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr9	116958214	.	CAC	TAT	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=98;NR=88;PP=2947;QD=20;SC=TTTCCTGCCTCACCCACCTTG;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=196;TCF=102;TCR=94;TR=186;WE=116958224;WS=116958204;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:10,186:0.95:196
chr9	116958216	rs2567711	C	T	9939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.77;SOR=0.786;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr9	116967405	rs13290696	G	T	4837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=80;PP=2654;SC=ATCCTGGACCGGCAGGGCACC;SOR=1.060;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=150;TCF=70;TCR=80;TR=150;WE=116967413;WS=116967395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr9	116967952	rs2567720	T	C	2442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=49;NR=32;PP=1423;SC=TCTTTATTCATTGTCAGCCCC;SOR=0.982;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=49;TCR=32;TR=81;WE=116967960;WS=116967942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr9	116980052	rs10982110	C	T	3334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=52;PP=1747;ReadPosRankSum=-1.000;SC=CCTACCAGGTCCTTCTACCCC;SOR=0.348;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=53;TCR=53;TR=105;WE=116980060;WS=116980042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,124:0.99:125
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chr9	117002517	rs2014134	C	T	2558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.980;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=48;PP=1307;ReadPosRankSum=-0.811;SC=CAGGAGACATCGGCCCCCCTG;SOR=0.619;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=217;TCF=118;TCR=99;TR=101;WE=117002527;WS=117002507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,117:0.48:243
chr9	117026581	rs4978576	C	G	1395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=16;PP=886;SC=CCTGGTTCTCCGCCCGAGGGA;SOR=1.697;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=36;TCR=16;TR=52;WE=117026589;WS=117026571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr9	117027165	rs41312228	A	G	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=159;ReadPosRankSum=1.207;SC=GGTCCTCCCAAGCACCCTCTC;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=10;WE=117027173;WS=117027155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr9	117033022	rs4143245	T	C	2423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=40;PP=1390;ReadPosRankSum=0.437;SC=AGCCAGGCCTTGAGGGTGACA;SOR=0.738;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=175;TCF=104;TCR=71;TR=101;WE=117033030;WS=117033012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,109:0.58:187
chr9	117033096	rs2636866	C	T	7026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=120;NR=127;PP=2965;SC=CTGGGGACCCCGGCAGGGCAT;SOR=0.771;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=247;TCF=120;TCR=127;TR=247;WE=117033104;WS=117033086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr9	117033219	rs10118121	T	C	850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=25;PP=597;ReadPosRankSum=0.177;SC=GTCAGCAGTGTCCAGCAGCCA;SOR=0.786;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=78;TCF=29;TCR=49;TR=38;WE=117033227;WS=117033209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,40:0.48:83
chr9	117037820	rs10513241	A	G	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=6;PP=518;ReadPosRankSum=0.899;SC=GGAACTATCGAGAATCTAGGG;SOR=0.883;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=43;TCR=11;TR=29;WE=117037828;WS=117037810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,30:0.54:56
chr9	117037915	rs12685514	T	C	2529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.40;ReadPosRankSum=-0.727;SOR=0.726;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,122:0.55:222
chr9	117044458	rs1628968	A	G	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=84;ReadPosRankSum=0.384;SC=GAACCTGGCCATCTGCCTCCA;SOR=0.859;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=7;WE=117044466;WS=117044448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr9	117044484	rs72762668	C	T	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=147;ReadPosRankSum=0.536;SC=GACAGTCTGACCGCCTTGCGG;SOR=0.701;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=44;TCF=32;TCR=12;TR=13;WE=117044492;WS=117044474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,14:0.30:47
chr9	117044538	rs2636879	G	T	889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.608;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=12;PP=582;ReadPosRankSum=-0.264;SC=CTCTTGCTCTGTCCCTCCTCT;SOR=0.908;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=104;TCF=69;TCR=35;TR=42;WE=117044546;WS=117044528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,45:0.40:113
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chr9	117046170	rs1565502	G	A	597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.408;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=417;ReadPosRankSum=-0.015;SC=AAGATGTGGGGTCTCACCTGC;SOR=1.112;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=39;TCF=11;TCR=28;TR=24;WE=117046178;WS=117046160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,25:0.61:41
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chr9	117054195	rs10429546	C	A	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.389;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.553;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=2;PP=47;ReadPosRankSum=1.969;SC=GAGACAGAGACCTTCCTCTTT;SOR=0.016;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=5;WE=117054203;WS=117054185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr9	117062322	rs12237679	G	A	2393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.517;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=39;PP=1210;ReadPosRankSum=-2.091;SC=GAGCTCACTCGCTCCATCACT;SOR=0.750;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=181;TCF=106;TCR=75;TR=98;WE=117062330;WS=117062312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,115:0.56:206
chr9	117064405	rs10817586	C	G	1081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.681;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=31;PP=659;ReadPosRankSum=-0.331;SC=TGGAAACCTTCTCTTTTGCCT;SOR=0.803;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=115;TCF=47;TCR=68;TR=50;WE=117064413;WS=117064395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,55:0.44:126
chr9	117066823	rs10817590	C	T	1088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.260;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=10;PP=768;ReadPosRankSum=-1.057;SC=CCCTGGGGCTCCCACTTGATG;SOR=1.302;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=101;TCF=72;TCR=29;TR=45;WE=117066831;WS=117066813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,48:0.44:109
chr9	117072656	rs1000744	C	A	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=103;ReadPosRankSum=-1.280;SC=TGACAGCATTCCTTACAAGAA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=7;WE=117072664;WS=117072647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr9	117073006	rs1249756	C	T	909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=20;PP=581;SC=CTAGGCCTCACGGAGGAGGGA;SOR=1.751;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=31;TCF=10;TCR=21;TR=30;WE=117073014;WS=117072996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr9	117085526	rs147960186	G	A	648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.55;MQRankSum=-0.990;QD=8.65;ReadPosRankSum=0.083;SOR=1.028;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,32:0.43:75
chr9	117085635	rs74594458	T	C	1397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.682;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.634;NF=29;NR=28;PP=919;ReadPosRankSum=0.765;SC=CGGCTCTGCCTTTTTCTCTTC;SOR=0.813;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=108;TCF=57;TCR=51;TR=57;WE=117085643;WS=117085625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,64:0.53:120
chr9	117086226	rs1111796	A	G	2264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.540;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.791;NF=66;NR=48;PP=1561;ReadPosRankSum=-1.612;SC=CTCTTGCCCCAGGACTGTGAT;SOR=0.924;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=235;TCF=134;TCR=101;TR=114;WE=117086234;WS=117086216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,114:0.46:247
chr9	117086271	rs10982151	T	G	3543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=354;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.384;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=77;PP=2131;ReadPosRankSum=-2.594;SC=TCTTCCTGTTTTCCTTCCGCC;SOR=0.661;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=330;TCF=168;TCR=162;TR=159;WE=117086286;WS=117086261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:180,173:0.49:353
chr9	117093729	rs10759691	A	G	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=297;ReadPosRankSum=-1.206;SC=CCCAAAGGAGACCCGGGCCTT;SOR=1.101;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=14;WE=117093737;WS=117093719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr9	117103973	rs2250242	A	G	1166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=23;PP=693;SC=GGAGTTGAAGATGCTTTTCTC;SOR=1.402;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=15;TCR=23;TR=38;WE=117103981;WS=117103963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr9	117106190	rs3748179	C	T	2901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=72;PP=2060;SC=TTTTAATAGTCTCTGTCTCTC;SOR=2.502;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=22;TCR=72;TR=94;WE=117106198;WS=117106180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr9	117121840	rs2787348	A	C	7112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=133;NR=112;PP=2965;SC=TAGGGTGGAAACAAACATTCT;SOR=0.763;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=245;TCF=133;TCR=112;TR=245;WE=117121848;WS=117121830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr9	117122202	rs3748177	C	T	2404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.004;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=45;PP=1344;ReadPosRankSum=0.942;SC=GGTAAACTTGCTCCATCTGCA;SOR=0.614;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=208;TCF=115;TCR=93;TR=100;WE=117122210;WS=117122192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,115:0.49:233
chr9	117124519	rs2636901	A	T	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=168;ReadPosRankSum=-1.088;SC=GACTCAAATCACAGCTTTTGA;SOR=0.465;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=11;WE=117124527;WS=117124509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr9	117124731	rs3748176	G	A	1623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.586;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=42;PP=1076;ReadPosRankSum=0.666;SC=GCCGGCAAGCGGCTGGGCAGG;SOR=0.787;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=149;TCF=68;TCR=81;TR=75;WE=117124752;WS=117124721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,78:0.48:161
chr9	117127034	rs2787351	C	G	331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=9;PP=233;SC=AGCATGGAGACGTGGGTGCTG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=117127042;WS=117127024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr9	117138278	rs4979371	C	T	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.368;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.75;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
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chr9	117166206	rs2274158	G	T	1349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.236;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=18;PP=882;ReadPosRankSum=-0.442;SC=TGGGCCTCTCGTTCCGAGGCA;SOR=0.900;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=118;TCF=81;TCR=37;TR=59;WE=117166214;WS=117166196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,64:0.48:133
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chr9	117188566	rs10817610	C	T	2153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=45;NR=28;PP=1460;SC=GGTGCGGGCACGGGGCAGCCT;SOR=1.150;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=45;TCR=28;TR=73;WE=117188574;WS=117188556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr9	117188714	rs2274163	T	C	1677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.601;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=36;PP=1015;ReadPosRankSum=-0.555;SC=CACCACACAATACAGTCACCT;SOR=0.778;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=137;TCF=61;TCR=76;TR=63;WE=117188722;WS=117188704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,76:0.50:153
chr9	117241105	rs56168690	G	A	1102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=29;PP=674;ReadPosRankSum=0.336;SC=GGGGTGTGGAGGAACACCCTC;SOR=0.730;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=79;TCF=25;TCR=54;TR=43;WE=117241113;WS=117241095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,48:0.56:85
chr9	117390300	rs7031094	C	A	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.475;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=48;ReadPosRankSum=0.552;SC=TCAGTAGTGTCTGAAAGGTGT;SOR=3.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=6;WE=117390308;WS=117390290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,8:0.28:29
chr9	117428960	rs1055207	T	C	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=10;PP=323;ReadPosRankSum=1.422;SC=GAATGGCCAGTGCTCCTGGCA;SOR=0.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=54;TCF=34;TCR=20;TR=29;WE=117428968;WS=117428950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,32:0.54:59
chr9	117430524	rs2296947	G	A	1324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.682;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=23;PP=729;ReadPosRankSum=0.032;SC=GCTCTTTTTTGTCTGGATCAG;SOR=0.614;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=114;TCF=73;TCR=41;TR=60;WE=117430532;WS=117430514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,65:0.53:123
chr9	117430611	rs1359992	A	T	2272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.044;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=48;PP=1286;ReadPosRankSum=0.149;SC=CTTCTGAAGCAGCAAATCTGG;SOR=0.609;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=205;TCF=111;TCR=94;TR=100;WE=117430619;WS=117430601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,107:0.49:217
chr9	117430743	rs2418316	A	T	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=303;ReadPosRankSum=0.279;SC=GTGGGGGTGTACCTGAAACTA;SOR=0.593;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=39;TCF=5;TCR=34;TR=19;WE=117430751;WS=117430733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,20:0.48:42
chr9	117433685	rs2296948	C	T	1757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.558;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=33;PP=971;ReadPosRankSum=0.423;SC=GCTTGTGCTCCTGGGTTTGAC;SOR=0.627;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=149;TCF=82;TCR=67;TR=71;WE=117433693;WS=117433675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,87:0.50:173
chr9	117433811	rs3215861	C	CA	2114.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.125;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=24;PP=1628;ReadPosRankSum=-2.028;SC=GAATGAGGGGCATGGGTTCCG;SOR=0.458;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=91;TCF=42;TCR=49;TR=41;WE=117433819;WS=117433801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,69:0.50:137
chr9	117552885	rs3810936	T	C	4650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=72;PP=2717;SC=CTACTTCGCATACAGACTTGG;SOR=0.934;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=68;TCR=72;TR=140;WE=117552893;WS=117552875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr9	117553249	rs4246905	T	C	2445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=49;PP=1242;SC=GCTTAAAAAGTGTCTCATATC;SOR=1.514;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=27;TCR=49;TR=76;WE=117553257;WS=117553239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr9	117554504	rs142936750	TACACACACAC	T	583.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=9.294;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=34.34;SOR=4.163;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,16:0.94:17
chr9	117568049	rs7030574	C	A	331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=9;NR=4;PP=246;SC=GAGTCCACTGCTCCTCCCCAA;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=13;WE=117568057;WS=117568039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	117656633	rs3833492	C	CCTG	898.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=1025;ReadPosRankSum=-1.164;SC=TCTAATTTAGCGGAATGGTTC;SOR=0.739;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=21;WE=117656641;WS=117656623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,23:0.70:33
chr9	117666678	rs3181367	G	A	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.367;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.48;ReadPosRankSum=-1.335;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr9	117692344	rs3181357	G	A	725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.357;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=8;PP=556;ReadPosRankSum=0.355;SC=CTTTCTCTCGGGAAAACAACA;SOR=1.127;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=75;TCF=55;TCR=20;TR=32;WE=117692352;WS=117692334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,33:0.42:79
chr9	117792583	rs13321	C	G	5613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.196;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=91;PP=2965;ReadPosRankSum=1.803;SC=TCCAGCGCCTCAGCCTTATCA;SOR=0.374;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=187;TCF=96;TCR=91;TR=186;WE=117792591;WS=117792573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,214:1.00:215
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chr9	117803185	rs35141770	A	AACAC,AAC	908.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;NF=10,10;NR=1,1;PP=102,350;SC=GAAAAATAGTAACACACACAC;SOR=2.833;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=11,11;WE=117803193;WS=117803175;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:18
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chr9	119491277	rs72765708	C	T	1235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.736;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=19;PP=800;ReadPosRankSum=-0.443;SC=TCACCTGCTGCGAGGGTGATG;SOR=0.785;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=71;TCR=35;TR=57;WE=119491285;WS=119491267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,58:0.53:110
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chr9	119582872	rs3765537	T	G	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.360;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=255;ReadPosRankSum=-2.343;SC=ATGGGGCACCTGGGCCTTGGG;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=19;WE=119582880;WS=119582862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
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chr9	119770480	rs3761845	C	T	2577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.302;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=46;PP=1384;ReadPosRankSum=0.867;SC=AAAGCTTGGCCGGGTTTAACC;SOR=1.033;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=250;TCF=136;TCR=114;TR=114;WE=119770488;WS=119770470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,128:0.46:280
chr9	119770551	rs7036098	G	A	5941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=111;PP=2965;SC=ATGGGTGAACGGAGAGACAGA;SOR=1.173;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=191;TCF=79;TCR=112;TR=190;WE=119770559;WS=119770541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr9	119903506	rs10817999	C	T	3604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=39;PP=2254;SC=GTTTTATGAGCACAGGGAAGC;SOR=1.557;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=83;TCR=39;TR=122;WE=119903514;WS=119903496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr9	119903807	rs57782747	A	C	1341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=33;PP=925;SC=CACCCTCAGCACCTAGAGCAC;SOR=2.160;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=11;TCR=33;TR=44;WE=119903815;WS=119903797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr9	119977051	rs7856971	G	T	898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=9;NR=17;PP=470;SC=CACACAAATGGGCCACTGTTC;SOR=1.542;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=9;TCR=17;TR=26;WE=119977059;WS=119977041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr9	119977077	rs4543613	T	C	477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=10;PP=243;SC=AATCGAGGGCTGCAGGGGATT;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=119977085;WS=119977067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	120053776	rs7848630	T	C	2440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=41;PP=1207;SC=AGATGTCCGCTGCTGTGCCAG;SOR=0.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=45;TCR=41;TR=86;WE=120053784;WS=120053766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr9	120466929	rs5900307	CA	C,CAA	728.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=2.612;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.54;MQRankSum=0.563;QD=16.95;ReadPosRankSum=0.154;SOR=0.275;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:3,26,14:0.60,0.33:43
chr9	120471058	rs2770148	G	A	4583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=103;PP=2945;SC=TCATTGTCCTGTCATTTCATT;SOR=1.711;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=153;TCF=50;TCR=103;TR=153;WE=120471066;WS=120471048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr9	122257627	rs10984560	C	T	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=2;PP=41;ReadPosRankSum=-0.875;SC=CACAGAAACGCGGGCTACAGC;SOR=0.527;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=5;WE=122257635;WS=122257617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr9	123151679	rs4836820	A	G	3698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=67;PP=2293;SC=TGCTTTCAAAAACATAGTTTG;SOR=1.187;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=114;TCF=47;TCR=67;TR=114;WE=123151687;WS=123151669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr9	123152099	rs2297457	C	G	3849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=67;PP=2345;SC=ATGATTAGGGCCATGGATATC;SOR=0.960;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=126;TCF=59;TCR=67;TR=126;WE=123152107;WS=123152089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr9	123152241	rs2297456	A	C	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=10;PP=273;SC=ACCCATCACAAACCCCAGGGC;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=123152249;WS=123152231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	123156761	rs4410972	G	C	2423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=31;PP=1448;SC=AAGTGGTCAGGCATAGCGGCC;SOR=1.055;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=81;TCF=49;TCR=32;TR=80;WE=123156769;WS=123156751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr9	123170733	rs4837768	C	G	2987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=50;PP=1721;SC=CTCAACTTCACCTCCTCCTGC;SOR=0.844;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=50;TCR=50;TR=100;WE=123170741;WS=123170723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr9	123223026	.	CT	C	66.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=0.000;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=6.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.97;ReadPosRankSum=2.670;SOR=1.374;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,12:0.17:69
chr9	123280950	rs2095064	T	C	2335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.12;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr9	123291036	rs4836822	C	G	3206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=35;PP=1841;SC=ATCCTCTCTTCAAAGCTGTTT;SOR=1.159;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=64;TCR=35;TR=99;WE=123291044;WS=123291026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr9	123313246	rs954214	T	C	829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=19;PP=612;SC=AGATAGTACATACATTAGTCG;SOR=2.670;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=23;WE=123313254;WS=123313236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr9	123330813	rs4837782	T	C	1410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=32;PP=927;SC=GATTTACTGATTTTGCTCCAG;SOR=2.985;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=8;TCR=32;TR=40;WE=123330821;WS=123330803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr9	123342259	rs932975	C	A	4900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=95;PP=2846;SC=TCCATCATGGCTACAGAGGTG;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=162;TCF=67;TCR=95;TR=162;WE=123342267;WS=123342249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr9	123342275	rs932974	A	G	4103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=81;PP=2494;SC=AGGTGGCGACAGCGTTGGTGT;SOR=1.216;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=138;TCF=57;TCR=81;TR=138;WE=123342283;WS=123342265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr9	123370345	rs991121	C	G	937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=27;PP=810;SC=ATTAAAAATGCAAAACAACTA;SOR=2.985;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=32;WE=123370353;WS=123370335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	123374639	rs2416760	T	C	3154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=23;PP=2139;SC=GATTTTTTTTTCCCTCTAAAA;SOR=2.415;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=99;TCF=76;TCR=23;TR=99;WE=123374647;WS=123374629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr9	123476542	rs369989873	ACGGCGG	A	6497.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=49;PP=2992;SC=GGCTGAGGCGACGGCGGCGGC;SOR=1.460;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=103;TCF=41;TCR=62;TR=84;WE=123476558;WS=123476532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,153:0.99:154
chr9	123550027	rs7026635	G	A	4019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=45;PP=2538;SC=AACCCAAAAAGCAGTTTCAAC;SOR=1.451;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=89;TCR=45;TR=134;WE=123550035;WS=123550017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr9	123583192	rs1060817	A	G	4012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=56;PP=2503;SC=GCTCCAGTGGATCCCGAGATA;SOR=1.061;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=83;TCR=56;TR=139;WE=123583200;WS=123583182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr9	123586737	rs10760117	T	G	9853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=353;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=166;NR=152;PP=2965;SC=TGTCAAAGATTAAGATATCCC;SOR=0.757;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=318;TCF=166;TCR=152;TR=318;WE=123586745;WS=123586727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,351:1.00:351
chr9	123631642	rs3753029	G	C	7532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=133;NR=122;PP=2965;SC=TCAACCACCAGGTCCGGGTGG;SOR=0.749;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=256;TCF=134;TCR=122;TR=255;WE=123631650;WS=123631632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,290:1.00:290
chr9	123632045	rs1056567	A	G	4371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.167;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=64;PP=2576;ReadPosRankSum=0.781;SC=TGGAGCTCAGACTCTGTGATG;SOR=0.507;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=147;TCF=82;TCR=65;TR=145;WE=123632062;WS=123632035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,162:0.98:165
chr9	123632829	rs4836833	G	C	6287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=114;PP=2965;SC=GAAAGAGAGGGCCTCGAGGGT;SOR=1.041;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=205;TCF=91;TCR=114;TR=205;WE=123632837;WS=123632819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr9	123636121	rs10985070	C	A	537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=16;NR=2;PP=392;SC=ATCATCATCACAGGTGGGCTT;SOR=2.948;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=123636129;WS=123636111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr9	123670505	rs7866003	A	T	341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.51;NF=11;NR=0;PP=238;SC=TATCTAAAAAATTTTTTAACT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=123670513;WS=123670495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr9	123671520	rs2239657	G	A	1610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=20;PP=1099;SC=TGTTCCGGAAGGGCCACGGCA;SOR=1.493;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=38;TCR=20;TR=57;WE=123671528;WS=123671510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr9	123675895	rs113495277	A	G	2476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.033;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=53;PP=1484;ReadPosRankSum=0.430;SC=CTCCAGGGCCATGGGCCCAGA;SOR=0.809;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=230;TCF=122;TCR=108;TR=116;WE=123675903;WS=123675885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,130:0.49:268
chr9	123676396	rs2416804	G	C	1669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=16;PP=862;SC=TTAGTACAAAGGACATCCAGA;SOR=1.430;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=39;TCR=16;TR=55;WE=123676404;WS=123676386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr9	123676482	rs2416805	T	C	2546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=45;NR=34;PP=1418;SC=CCATAGTGGATAGATCTCCTT;SOR=0.714;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=45;TCR=34;TR=79;WE=123676490;WS=123676472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr9	123676699	rs758959	C	T	121.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=4;PP=81;SC=ACTTTGCACACTGCTGTTCCC;SOR=1.981;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=5;WE=123676707;WS=123676689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr9	123751800	rs3764912	A	G	525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=1;PP=458;SC=TAAAAATATTAGTTTAGAATC;SOR=4.294;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=123751808;WS=123751790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	123751832	.	CT	C	215.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.962;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=2.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.49;ReadPosRankSum=-1.368;SOR=0.278;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,16:0.33:48
chr9	123758425	rs10760134	T	C	685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=4;PP=458;SC=TTTTAGACAATTCACTTTCTG;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=21;WE=123758433;WS=123758415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr9	123760086	rs34704763	AT	A	158.70	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.9630;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=58;ReadPosRankSum=0.366;SC=ATCAAAATACATTTTTTTTTT;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=6;WE=123760094;WS=123760076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr9	123769200	rs17611	C	T	2826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=44;PP=1600;SC=GAAATGCCAACGCCTTGAATT;SOR=0.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=52;TCR=44;TR=96;WE=123769208;WS=123769190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr9	123779607	.	T	C	431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=0.000;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=1.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.17;ReadPosRankSum=-0.519;SOR=0.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,32:0.24:136
chr9	123780005	rs25681	G	A	7768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=128;NR=134;PP=2965;SC=CTGTGACGATGTAATAGACCA;SOR=0.793;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=262;TCF=128;TCR=134;TR=262;WE=123780013;WS=123779995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,292:1.00:292
chr9	123787697	rs140753263	T	TACACACAC,TACACACACAC	706.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.4997,0.5003;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=15;NF=4,4;NR=3,3;PP=27,174;SC=AAAGAAAGTATACACACACAC;SOR=2.179;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=8;TCR=6;TR=7,7;WE=123787705;WS=123787687;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.47,0.53:17
chr9	123789634	rs2416811	C	T	104.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.6;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=3;PP=50;SC=TTTGAAATTACGTAAAGCACT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=123789642;WS=123789624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr9	123800094	rs10818499	T	A	821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=7;PP=479;SC=AGGACAGGGTTATGAAATGAG;SOR=1.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=28;WE=123800102;WS=123800084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	123850770	rs10818503	G	A	8658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=145;NR=155;PP=2965;SC=GTGTGAGCAAGTTGAGATTGC;SOR=0.829;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=300;TCF=145;TCR=155;TR=300;WE=123850778;WS=123850760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,327:1.00:327
chr9	123857085	rs10760146	C	T	183.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=104;SC=ATCAAACAGACCCTGATGCAC;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=123857093;WS=123857078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr9	123860689	rs10818504	C	T	5506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=117;NR=66;PP=2965;SC=AAGTTGAAACCGCTTCAAGAT;SOR=1.353;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=183;TCF=117;TCR=66;TR=183;WE=123860697;WS=123860679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr9	123888242	rs10760150	G	T	2908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=60;PP=1835;SC=CCTATTTTCCGTAGCTTCATA;SOR=1.458;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=35;TCR=60;TR=95;WE=123888250;WS=123888232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr9	123908345	rs7023214	G	A	1071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=5;PP=781;SC=AAGGAAGTAAGTGATTTCATA;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=31;WE=123908353;WS=123908335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr9	123917020	rs3736855	T	A	1262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=10;PP=858;SC=ATGGAAATGTTGAGAGTCTTA;SOR=1.931;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=32;TCR=10;TR=42;WE=123917028;WS=123917010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr9	123917355	rs10818512	A	G	556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=423;SC=GTGAGAATTTATGCAAGTCAT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=123917363;WS=123917345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr9	123922729	rs35562325	A	ATGT	173.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=63.02;NF=0;NR=5;PP=182;SC=AAGGAATATGATATTTTCTGC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=5;WE=123922737;WS=123922719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr9	123923411	rs139754979	A	AGT	3030.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=1.028;NF=19;NR=22;PP=1782;ReadPosRankSum=-1.189;SC=AATGTGTGAGAGTGTGTGTGT;SOR=0.872;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=56;TCF=24;TCR=32;TR=41;WE=123923419;WS=123923401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:6,87:0.94:93
chr9	123924667	rs10586591	CAT	C	1132.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=23;PP=1118;SC=AACTTGGTATCATAATACATT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=23;WE=123924676;WS=123924657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr9	123927477	rs4836841	T	A	2158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=48;PP=1467;SC=ATGAGCATGGTGTTTCTTTCT;SOR=2.737;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=12;TCR=48;TR=60;WE=123927485;WS=123927467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
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chr9	123928569	rs1535655	G	A	1652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=31;PP=890;SC=AGCAGATACCGTAGGGCCATT;SOR=1.234;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=24;TCR=31;TR=55;WE=123928577;WS=123928559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr9	123929710	rs10818513	A	G	3661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=81;NR=38;PP=2446;SC=ATTGGCACTGACCACCTCTAG;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=119;TCF=81;TCR=38;TR=119;WE=123929718;WS=123929700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr9	123937601	rs3789310	T	C	1030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=25;PP=755;SC=CTGGAGTGCATTGGTACCATC;SOR=3.193;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=31;WE=123937609;WS=123937591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr9	123939336	rs3838267	T	TA	369.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=1;PP=409;SC=TCCAAAGAGGTACTCAAATAT;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=10;WE=123939344;WS=123939326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	123943884	rs2296078	C	T	2379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=50;PP=1407;SC=ATTGGAGAACCACAGTTTTCT;SOR=1.556;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=29;TCR=50;TR=79;WE=123943892;WS=123943874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr9	123945505	rs3215744	C	CA	1028.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.48;MQRankSum=0.395;QD=23.92;ReadPosRankSum=-0.693;SOR=1.501;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,41:0.95:43
chr9	123955756	rs10818516	G	A	2548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.94;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr9	123955765	rs6478504	A	C	2514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.12;SOR=0.800;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr9	124043867	rs10985200	C	T	3928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.049;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=92;PP=2316;ReadPosRankSum=-1.523;SC=AGACACCTGTCGTCCTCTTAA;SOR=0.874;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=301;TCF=142;TCR=159;TR=169;WE=124043875;WS=124043857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,185:0.58:319
chr9	124073176	rs306785	T	C	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.203;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.392;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=103;ReadPosRankSum=-0.016;SC=CCTGGTCTGATCAGGGACTTG;SOR=0.238;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=8;WE=124073184;WS=124073166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr9	124088768	rs306769	T	C	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.056;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=223;ReadPosRankSum=2.003;SC=GTCCCTGACTTGCTCTCCTGT;SOR=0.997;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=55;TCF=38;TCR=17;TR=20;WE=124088776;WS=124088758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,23:0.37:63
chr9	124089173	rs216784	C	T	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.656;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=3;PP=28;ReadPosRankSum=-0.587;SC=ACACTTTGCACAGTGGACAGC;SOR=0.041;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=5;WE=124089181;WS=124089163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr9	124091135	rs306771	G	A	689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=7;PP=534;ReadPosRankSum=0.679;SC=GGGTGATGGCGTCCCTTGGCA;SOR=0.606;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=56;TCF=45;TCR=11;TR=31;WE=124091143;WS=124091125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,30:0.52:58
chr9	124218133	rs3747845	C	T	1390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=17;PP=878;SC=GAAGAAAAAACAGCAACATTA;SOR=1.270;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=29;TCR=17;TR=46;WE=124218141;WS=124218123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr9	124222267	rs2289068	A	G	435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=367;SC=CTAATATGCTAAGGCTCTTTC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=124222275;WS=124222264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	124225598	rs77378583	C	T	1965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=35;PP=1317;ReadPosRankSum=-0.296;SC=CAAGAAAGAGCCTTCTGTGCT;SOR=0.727;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=148;TCF=86;TCR=62;TR=85;WE=124225606;WS=124225588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,91:0.56:162
chr9	124229981	rs10818542	A	G	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.594;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=106;ReadPosRankSum=0.953;SC=AGGGCTTAGGAATTCAGGAAG;SOR=0.836;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=7;WE=124229989;WS=124229971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr9	124241284	rs112301437	T	C	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.723;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.211;NF=11;NR=2;PP=206;ReadPosRankSum=-0.532;SC=AACTCCAGGCTGCAGCTTGGC;SOR=1.112;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=13;WE=124241292;WS=124241274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr9	124241314	rs871671	A	G	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.22;MQRankSum=1.168;QD=9.16;ReadPosRankSum=-0.452;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,22:0.44:50
chr9	124241369	rs871670	T	G	1105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.646;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=16;PP=662;ReadPosRankSum=0.273;SC=CCGGCATCCTTCTTCCAGGTC;SOR=0.446;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=95;TCF=64;TCR=31;TR=48;WE=124241377;WS=124241359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,53:0.50:105
chr9	124241603	rs871672	G	C	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=4.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.517;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=323;ReadPosRankSum=0.291;SC=GAAGGTGCTGGTTTCAACTCC;SOR=1.714;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=38;TCF=9;TCR=29;TR=15;WE=124241611;WS=124241593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,17:0.40:43
chr9	124882474	rs6478557	A	C	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.289;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=195;ReadPosRankSum=1.253;SC=CTAAGCCCAGAGACCCAGCTC;SOR=0.385;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=46;TCF=12;TCR=34;TR=18;WE=124882482;WS=124882464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,20:0.39:51
chr9	124906456	rs6822	C	T	186.18	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=137;ReadPosRankSum=-0.157;SC=CGATGCAAACCGCATGGGCGT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=7;WE=124906464;WS=124906446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
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chr9	124910687	rs3793615	T	C	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=33;ReadPosRankSum=0.601;SC=CATATTCTTATCTCACTTACA;SOR=0.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=4;WE=124910695;WS=124910677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
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chr9	124967119	rs60359238	C	G	1299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=29;PP=710;ReadPosRankSum=1.085;SC=CTGCTGCCCCCCAGAGAACCT;SOR=0.684;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=113;TCF=56;TCR=57;TR=57;WE=124967127;WS=124967109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,65:0.52:124
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chr9	124976475	rs62574050	C	G	878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=12;PP=523;SC=CCGGGTCCGGCCCGAGGGGCG;SOR=0.818;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=27;TCF=15;TCR=12;TR=26;WE=124976483;WS=124976465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr9	124990773	rs113188211	C	CG	657.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=4;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.995;NF=1;NR=15;PP=321;ReadPosRankSum=2.087;SC=CGACCCCCCCCCCCCGCTCGC;SOR=0.986;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=16;WE=124990781;WS=124990755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,21:0.70:30
chr9	125084641	.	CA	C	60.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.20;ReadPosRankSum=1.252;SOR=0.293;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
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chr9	125140696	rs2282169	G	C	1820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.670;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=29;PP=1120;ReadPosRankSum=0.321;SC=CTGAGTGACTGCCATTGCCCC;SOR=0.905;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=158;TCF=95;TCR=63;TR=76;WE=125140704;WS=125140686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,85:0.49:172
chr9	125143792	rs5788	C	A	3026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-2.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.885;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.997;NF=67;NR=55;PP=1697;ReadPosRankSum=-1.130;SC=AAACTTCTGGCAAGATGGGTC;SOR=0.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=254;TCF=139;TCR=115;TR=122;WE=125143800;WS=125143782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,146:0.49:295
chr9	125144039	rs3215925	CA	C	1574.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.499;NF=3;NR=29;PP=1121;ReadPosRankSum=1.657;SC=AGTGCTGGGCCAGGGGGTAGG;SOR=0.653;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=71;TCF=5;TCR=66;TR=32;WE=125144047;WS=125144029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,51:0.46:112
chr9	125144145	rs1238420	A	G	557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=13;PP=393;SC=GGGAGTGGGAAGCTTGTGCCA;SOR=2.419;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=17;WE=125144153;WS=125144135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr9	125145743	rs3842798	T	C	1188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.641;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=16;PP=645;ReadPosRankSum=-2.347;SC=TGGGCAGCTGTGGGTGACCCC;SOR=0.505;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=68;TCR=31;TR=50;WE=125145751;WS=125145733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,54:0.50:107
chr9	125148632	rs6478565	A	G	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.303;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=8;PP=266;ReadPosRankSum=-1.857;SC=AGAGACCAAAAGCAAGCACCT;SOR=0.097;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=37;TCF=27;TCR=10;TR=21;WE=125148640;WS=125148622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,24:0.60:40
chr9	125239253	rs1962091	T	C	781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.942;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=7;PP=454;ReadPosRankSum=0.216;SC=TCCCAAAGTGTTGAGATTACA;SOR=0.927;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=77;TCF=56;TCR=21;TR=30;WE=125239261;WS=125239243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,36:0.43:83
chr9	125240175	rs147391208	C	T	636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.845;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=12;PP=315;ReadPosRankSum=-0.533;SC=AGGAGGAACTCGGACACGCTG;SOR=0.556;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=76;TCF=42;TCR=34;TR=27;WE=125240183;WS=125240165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,32:0.38:84
chr9	125272957	rs71511508	G	A	944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=8;PP=576;ReadPosRankSum=-2.402;SC=GCCCCAGTGTGTGTTGTTCCT;SOR=0.739;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=86;TCF=65;TCR=21;TR=39;WE=125272965;WS=125272947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,45:0.49:92
chr9	125273385	rs145911830	A	AT	1730.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.639;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.390;NF=17;NR=17;PP=720;ReadPosRankSum=0.051;SC=TCTCAGATGTATTTTTTTATA;SOR=0.786;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=91;TCF=44;TCR=47;TR=34;WE=125273393;WS=125273375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,73:0.51:142
chr9	125282393	rs1318392	C	T	837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=22;PP=643;SC=GACATATGTACTGACCTATTT;SOR=3.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=26;WE=125282401;WS=125282383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr9	125289521	rs10818708	G	A	2984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=57;PP=1714;SC=TGCTCTGGAGGCGCTGATATT;SOR=1.138;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=43;TCR=57;TR=100;WE=125289529;WS=125289511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr9	125315376	rs11412445	C	CT	1436.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.23;QD=30.57;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr9	125316028	rs41297203	T	C	2253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.302;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=38;PP=1450;ReadPosRankSum=0.587;SC=CATCCCTCATTTCTATTGTGA;SOR=0.956;SbPval=0.59;Source=Platypus;TCF=103;TR=95;WE=125316036;WS=125316018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,103:0.53:193
chr9	125316179	rs1341044	T	G	4264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=63;PP=2615;SC=GCTGTGTTTGTCATCTCATCT;SOR=0.733;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=68;TCR=64;TR=130;WE=125316187;WS=125316169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr9	125317424	rs10733658	G	T	1031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=20;PP=575;ReadPosRankSum=1.748;SC=AAAAAATGTTGCAGTGATAAC;SOR=0.656;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=122;TCF=77;TCR=45;TR=51;WE=125317432;WS=125317414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,56:0.41:138
chr9	125317485	rs10760239	G	T	1342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=31;PP=754;ReadPosRankSum=-2.905;SC=AAGTTCATCCGGGGCCAAATT;SOR=0.660;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=172;TCF=89;TCR=83;TR=64;WE=125317493;WS=125317475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,70:0.38:186
chr9	125317661	rs1041355	A	G	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.708;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=78;ReadPosRankSum=-0.081;SC=GAGACAACTAAGGAAACCAGA;SOR=1.179;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=6;WE=125317669;WS=125317651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
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chr9	125330678	rs10985704	T	G	1723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=35;PP=991;ReadPosRankSum=0.174;SC=ACAAAGAGTGTCTTTTGGTCC;SOR=0.653;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=105;TCF=46;TCR=59;TR=64;WE=125330686;WS=125330668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,76:0.63:120
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chr9	125391026	rs1476858	A	C	2186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.878;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.951;NF=49;NR=43;PP=1517;ReadPosRankSum=-0.026;SC=GGAAGTAGACACAAATGATGG;SOR=0.473;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=193;TCF=114;TCR=79;TR=92;WE=125391034;WS=125391016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,101:0.47:215
chr9	125391127	rs1476859	C	T	2852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.844;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=62;PP=1761;ReadPosRankSum=0.015;SC=CGTAGAATAGCGGCCCCAATT;SOR=0.689;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=297;TCF=151;TCR=146;TR=131;WE=125391135;WS=125391117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,144:0.45:322
chr9	125391241	rs1476860	G	A	2606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.809;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=59;PP=1592;ReadPosRankSum=1.863;SC=CAAGAGGCTCGCAGAAGTGGC;SOR=0.851;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=220;TCF=109;TCR=111;TR=114;WE=125391249;WS=125391231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,124:0.51:245
chr9	125391369	rs1536929	A	G	1691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=41;PP=1157;ReadPosRankSum=0.606;SC=CACCCAGCTCAAGGCTAGTAA;SOR=0.741;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=144;TCF=71;TCR=73;TR=76;WE=125391377;WS=125391359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,81:0.51:160
chr9	125391677	rs12347681	T	C	1348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.966;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=26;PP=799;ReadPosRankSum=0.496;SC=GCAGCACCAGTGTCACATTCC;SOR=0.945;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=137;TCF=72;TCR=65;TR=62;WE=125391685;WS=125391667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,65:0.43:151
chr9	125391917	rs1329951	A	G	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=196;ReadPosRankSum=-0.430;SC=TTACGTTACTAAAGATCGTTA;SOR=0.495;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=11;WE=125391925;WS=125391907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr9	125391940	rs7037571	C	G	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=51;ReadPosRankSum=0.533;SC=GACCTAGATTCGAACTTGACC;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=4;WE=125391948;WS=125391930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr9	125424507	rs70156	A	C	12200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=444;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=184;NR=206;PP=2965;SC=TCTGTGCCTCAAATGTCATCC;SOR=0.838;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=390;TCF=184;TCR=206;TR=390;WE=125424515;WS=125424497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,442:1.00:442
chr9	125438390	.	GGT	G	53.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=-0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=131;ReadPosRankSum=1.718;SC=CTGATTACAAGGTGTGTGTGT;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=5;WE=125438399;WS=125438380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr9	125486968	rs2215530	G	A	4653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=63;NR=81;PP=2747;SC=CTCTGCAGCCGGGAAGTGGAA;SOR=1.013;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=144;TCF=63;TCR=81;TR=144;WE=125486976;WS=125486958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr9	125512193	rs10760252	C	A	10680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=392;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=183;NR=181;PP=2965;SC=TTCCAACCCTCAGCTGCAGAA;SOR=0.724;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=364;TCF=183;TCR=181;TR=364;WE=125512201;WS=125512183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,392:1.00:392
chr9	125512575	rs4838012	G	A	10737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=407;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=183;NR=202;PP=2965;SC=TTGGGTTCTTGCAGCATCTCC;SOR=0.851;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=386;TCF=183;TCR=203;TR=385;WE=125512583;WS=125512565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,406:1.00:406
chr9	125512770	rs10985760	T	C	531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.83;QD=29.54;SOR=3.500;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	125512788	rs10818740	G	A	1145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.94;QD=45.83;SOR=2.215;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr9	125512795	rs10818741	G	C	1288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.06;QD=40.27;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr9	125512826	rs28670025	G	A	2369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=28;PP=1519;SC=CTCTGCAGCCGGGAAGTGGAA;SOR=1.101;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=48;TCR=28;TR=76;WE=125512834;WS=125512816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr9	125612129	rs3049156	CAA	C	1435.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.844;NF=0;NR=21;PP=723;ReadPosRankSum=-1.786;SC=ACATTAAAAACAAATTAGCTT;SOR=0.803;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=21;WE=125612138;WS=125612119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,38:0.60:63
chr9	125620105	rs5900549	C	CA	1024.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=1;PP=1026;SC=CAAACCACTGCAAATATCCAA;SOR=5.421;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=26;WE=125620113;WS=125620095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	125637471	rs2596699	A	T	5554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=110;NR=69;PP=2965;SC=TTCTCTAGGCACTTCAAGTGG;SOR=1.134;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=179;TCF=110;TCR=69;TR=179;WE=125637479;WS=125637461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr9	125637648	rs2596698	T	C	2948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=65;PP=1937;SC=GGGGTTACACTTATGTAAGAT;SOR=1.655;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=34;TCR=65;TR=99;WE=125637656;WS=125637638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr9	125652429	rs10818758	A	G	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=181;ReadPosRankSum=0.289;SC=CAAACAAAACAAAACAGCAAT;SOR=2.448;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=11;WE=125652437;WS=125652419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr9	125652757	rs10818759	G	A	1615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.296;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=41;PP=914;ReadPosRankSum=-1.021;SC=CCAGTTGACAGTTTACAAGTG;SOR=0.574;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=135;TCF=60;TCR=75;TR=75;WE=125652765;WS=125652747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,81:0.54:151
chr9	125659520	rs2793005	T	C	2219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=16;PP=1479;SC=ATAGTGATTATTTTTGCACCA;SOR=2.185;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=73;TCF=57;TCR=16;TR=72;WE=125659528;WS=125659510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
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chr9	125898643	rs72753292	T	C	2456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.237;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=52;PP=1226;ReadPosRankSum=-1.330;SC=AAGGCTGGCTTGTGTCTGGGT;SOR=0.663;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=198;TCF=107;TCR=91;TR=106;WE=125898651;WS=125898633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,117:0.52:226
chr9	125920376	rs803736	G	A	1621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.621;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=41;PP=924;ReadPosRankSum=-1.002;SC=TGTAAATCTGGCCAAAGGCTG;SOR=0.911;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=160;TCF=70;TCR=90;TR=70;WE=125920384;WS=125920366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,79:0.43:183
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chr9	125932152	rs147443012	C	CAT	588.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.006;HP=2;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=9;PP=543;ReadPosRankSum=1.455;SC=CAAATATATACATATATATAT;SOR=0.283;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=37;TCF=15;TCR=22;TR=16;WE=125932161;WS=125932142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,25:0.45:56
chr9	126028395	rs7863265	C	G	2505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=26;PP=1533;SC=CTGGTCTCTTCCAGTTTCACA;SOR=1.584;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=55;TCR=26;TR=81;WE=126028403;WS=126028385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr9	126118517	rs72433015	AGCAGAGC	A	2970.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=14;NR=18;PP=2111;SC=ACAGCAGCCGAGCAGAGCGCA;SOR=1.751;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=42;TCF=16;TCR=26;TR=32;WE=126118531;WS=126118507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr9	126125318	rs2808415	C	A	5064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=81;PP=2965;SC=CCAGATCCCACCGGCTTCCGC;SOR=0.725;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=176;TCF=95;TCR=81;TR=176;WE=126125326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr9	126128211	rs1105223	T	C	3011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=55;NR=32;PP=1166;SC=ACCTGCGAGATGGAGGTGGAC;SOR=0.818;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=55;TCR=32;TR=87;WE=126128219;WS=126128201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr9	126128253	rs1105222	G	C	3077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=57;NR=44;PP=1670;SC=CTGCACGGGGGCTCGTGCCTG;SOR=0.798;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=102;TCF=58;TCR=44;TR=101;WE=126128261;WS=126128243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr9	126128293	rs146687164	C	T	819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=23;PP=587;ReadPosRankSum=1.062;SC=GCTGTGTGTGCGCGCCAGGCT;SOR=0.704;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=100;TCF=51;TCR=49;TR=49;WE=126128301;WS=126128283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,43:0.45:96
chr9	126128679	rs11790447	G	C	838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=17;PP=529;SC=CTGGCGGGGGGAGGGGTAGGT;SOR=1.214;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=12;TCR=17;TR=29;WE=126128687;WS=126128669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr9	126129351	rs10760281	G	A	3447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=80;NR=41;PP=2150;SC=GGCTTATTCCGAGCTGCGGTC;SOR=1.335;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=121;TCF=80;TCR=41;TR=121;WE=126129359;WS=126129341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr9	126129904	rs10818812	C	T	1540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=15;PP=808;SC=CATGCCTCAACGGAGGCCACT;SOR=1.382;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=34;TCR=15;TR=49;WE=126129912;WS=126129894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr9	126131110	rs2488603	T	C	919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.55;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
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chr9	126133547	rs2488602	T	C	4774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=88;PP=2768;ReadPosRankSum=-1.260;SC=CGGGCTGAGGTGCCGGGCAGT;SOR=0.490;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=169;TCF=79;TCR=90;TR=166;WE=126133555;WS=126133537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,180:0.98:183
chr9	126134542	rs61740213	G	A	5186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=81;NR=94;PP=2838;SC=CGGGGCCTACGTGTGCCCAGC;SOR=0.981;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=175;TCF=81;TCR=94;TR=175;WE=126134550;WS=126134532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr9	126135715	rs2488601	A	G	1762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=12;PP=1007;SC=CCCGGCGGCCACCACCTCGCG;SOR=1.758;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=43;TCR=12;TR=55;WE=126135723;WS=126135705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr9	126135887	.	T	TGGCGCGGCCCCGGCCC	762.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.274;ClippingRankSum=0.000;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=6.552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQRankSum=2.074;QD=7.33;ReadPosRankSum=-3.120;SOR=1.380;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,20:0.19:104
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chr9	126144746	rs2491348	T	C	2578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=51;NR=35;PP=1658;SC=CCAGGGAGTTTCCGAGCAGGG;SOR=1.006;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=51;TCR=35;TR=86;WE=126144766;WS=126144736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr9	126144758	rs2808409	T	C	2810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=46;PP=1579;SC=CGAGCAGGGCTGAGGGCTTCT;SOR=0.827;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=56;TCR=46;TR=102;WE=126144766;WS=126144736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr9	126145907	rs2797946	C	A	2150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=46;NR=24;PP=1341;SC=GGCCCCCGGCCGATACCCTCC;SOR=1.358;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=46;TCR=24;TR=70;WE=126145915;WS=126145897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr9	126146197	rs2808411	C	G	3762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=77;PP=2459;SC=TGCGGCCTGTCGGGGACAGAG;SOR=1.220;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=54;TCR=78;TR=131;WE=126146205;WS=126146187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr9	126202551	rs10739633	A	C	478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=1.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.41;ReadPosRankSum=0.364;SOR=0.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,26:0.57:46
chr9	126220114	rs61736953	C	T	1439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=25;PP=905;ReadPosRankSum=1.042;SC=GCAGGAACTGCCTCATGGCTC;SOR=0.705;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=119;TCF=76;TCR=43;TR=69;WE=126220122;WS=126220104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,71:0.56:127
chr9	126439100	rs12377595	T	G	2016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.505;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=51;PP=1312;ReadPosRankSum=0.254;SC=CATGAAATATTAGTATGCAGG;SOR=0.766;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=195;TCF=90;TCR=105;TR=91;WE=126439108;WS=126439090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,99:0.46:214
chr9	126520068	rs9785285	T	C	1963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=41;PP=941;ReadPosRankSum=-0.412;SC=TGAGCACGAATGTGAAGTTCT;SOR=0.675;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=215;TCF=118;TCR=97;TR=92;WE=126520076;WS=126520058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,105:0.44:238
chr9	126531755	rs1778890	T	C	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.491;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=189;ReadPosRankSum=-0.124;SC=GGTTTATTGATACTTTTTTTC;SOR=0.277;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=19;WE=126531763;WS=126531745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,24:0.53:45
chr9	126794642	rs143803976	C	CG	561.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=467;ReadPosRankSum=0.530;SC=GTGAAGCAGTCGGGGGGATGC;SOR=0.516;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=45;TCF=38;TCR=7;TR=19;WE=126794650;WS=126794632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,25:0.45:55
chr9	127075021	rs2274780	T	C	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.021;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=269;ReadPosRankSum=0.762;SC=CTCTCCCCTCTTCTGTGAACG;SOR=0.327;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=16;WE=127075029;WS=127075011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
chr9	127083725	rs10760352	C	T	2397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=43;PP=1334;ReadPosRankSum=0.920;SC=TCCCTCTTTCCCTCCTCATGC;SOR=0.700;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=198;TCF=114;TCR=84;TR=103;WE=127083733;WS=127083715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,117:0.52:227
chr9	127083933	rs2274781	A	G	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.702;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=179;ReadPosRankSum=0.457;SC=CAGTCCCACAATGCTCTGCCT;SOR=1.981;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=10;WE=127083941;WS=127083923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr9	127088481	rs71903158	TCC	T	484.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.62;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	127088728	rs151018846	CCCGCCAGGAG	C	2615.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=4.998;NF=1;NR=43;PP=2971;ReadPosRankSum=1.254;SC=GTACGTGCCACCCGCCAGGAG;SOR=0.713;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=101;TCF=3;TCR=98;TR=44;WE=127088745;WS=127088718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,74:0.54:138
chr9	127101924	rs10760354	C	T	10430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=392;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=180;NR=171;PP=2965;SC=CATCTGGTCCCTGGGCTGTCT;SOR=0.709;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=351;TCF=180;TCR=171;TR=351;WE=127101932;WS=127101914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,391:1.00:391
chr9	127116169	rs72616651	A	G	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=91;ReadPosRankSum=-0.792;SC=AGTGCTGCAAAATGGGGGTGC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=5;WE=127116177;WS=127116159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr9	127177736	rs2236386	G	C	1294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.765;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=29;PP=635;ReadPosRankSum=-0.773;SC=GGTCGGAGGCGGGTGCAAACA;SOR=0.434;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=140;TCF=66;TCR=74;TR=61;WE=127177744;WS=127177726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,69:0.44:158
chr9	127220952	rs12347840	T	C	3213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.914;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=65;PP=1822;ReadPosRankSum=-1.363;SC=GGGACGTCACTGGAGAGGTCA;SOR=0.579;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=262;TCF=143;TCR=119;TR=139;WE=127220960;WS=127220942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,151:0.53:285
chr9	127228596	rs4838184	A	G	803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.893;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=10;PP=479;ReadPosRankSum=0.140;SC=GGGCCACCACAGGCTGCTCCG;SOR=1.022;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=84;TCF=55;TCR=29;TR=36;WE=127228604;WS=127228586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,40:0.45:88
chr9	127228824	rs4838185	T	C	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=206;ReadPosRankSum=-1.306;SC=CAGGGCTGCATGCAGTAGTTC;SOR=0.941;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=16;WE=127228832;WS=127228814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr9	127230118	rs10818977	C	T	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=142;ReadPosRankSum=-1.662;SC=GGAGAGTTCACCACTGTAGCC;SOR=0.818;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=49;TCF=22;TCR=27;TR=15;WE=127230126;WS=127230108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,18:0.31:58
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chr9	127231774	rs1570580	C	G	1578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.758;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=35;PP=897;ReadPosRankSum=-1.265;SC=CCGCCGTGCCCGCATGTTGAG;SOR=0.927;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=142;TCF=70;TCR=72;TR=66;WE=127231782;WS=127231764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,77:0.48:162
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chr9	127561559	rs2281923	C	T	4425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=95;NR=53;PP=2546;SC=CTGCCCCCTCCGCAGAGCATC;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=95;TCR=53;TR=148;WE=127561567;WS=127561549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr9	127563364	rs913231	G	A	4374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=81;PP=2587;SC=GTGAGCAGGTGGAGGAGGCTG;SOR=1.151;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=145;TCF=63;TCR=82;TR=144;WE=127563372;WS=127563354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr9	127566378	rs7874348	A	G	4459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=78;NR=69;PP=2463;SC=TGCAGACAACACCCTCCAGGG;SOR=0.729;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=78;TCR=69;TR=147;WE=127566386;WS=127566368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr9	127572710	rs7020260	C	G	2935.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.670;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=61;PP=1935;ReadPosRankSum=2.172;SC=CTGTGCTCCCCGGAGAGGGGC;SOR=1.702;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=32;TCR=62;TR=92;WE=127572718;WS=127572695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,104:0.98:106
chr9	127618776	rs2274970	A	G	3461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=73;NR=51;PP=2043;SC=TCCACCGTACACATCTGGGAC;SOR=0.902;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=73;TCR=51;TR=124;WE=127618784;WS=127618766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr9	127618839	rs10760381	C	G	4647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=72;PP=2716;SC=GGACACAGTGCCAACATCAGC;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=158;TCF=86;TCR=72;TR=158;WE=127618847;WS=127618829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr9	127619553	rs10819000	C	G	801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=3;PP=612;SC=GAAGACTCATCTCATATTTTG;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=24;WE=127619561;WS=127619543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr9	127619625	rs35041146	G	GC	839.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.754;HP=6;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.762;NF=32;NR=33;PP=1082;ReadPosRankSum=0.139;SC=TTCCTGACATGCCCCCCTCCT;SOR=0.937;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=67;TCF=34;TCR=33;TR=65;WE=127619639;WS=127619615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,38:0.38:100
chr9	127619630	rs67227054	CCT	C	2590.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.674;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=2.146;NF=30;NR=33;PP=1610;ReadPosRankSum=-0.312;SC=GACATGCCCCCCTCCTTTTCC;SOR=0.485;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=76;TCF=37;TCR=39;TR=63;WE=127619639;WS=127619615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,68:0.62:110
chr9	127619922	rs944952	T	C	4396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=84;PP=2707;SC=CCAACCACCTTAGATGGTGCC;SOR=1.460;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=52;TCR=84;TR=136;WE=127619930;WS=127619912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr9	127620480	rs10593927	CAT	C	547.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=9;PP=497;SC=GCAGGCCACACATGTCACTAA;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=11;WE=127620489;WS=127620470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	127637215	rs581558	T	G	804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=1;PP=566;SC=GGCGGTGCCTTCGCAGCTCTG;SOR=4.174;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=127637223;WS=127637205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr9	127643946	rs2304957	A	G	1408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=3;PP=1165;SC=GGTGACCACAAGGGCGTCAAA;SOR=4.223;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=42;TCR=3;TR=45;WE=127643954;WS=127643936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr9	127644882	rs596231	G	A	7471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=124;NR=138;PP=2965;SC=AAAGCCAATCGTTAGATGCAT;SOR=0.901;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=262;TCF=124;TCR=138;TR=262;WE=127644890;WS=127644872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,283:1.00:283
chr9	127661521	rs750884	T	C	1616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.91;SOR=2.432;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr9	127661526	rs750883	A	C	1665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.71;SOR=2.133;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr9	127674200	rs583134	A	C	6372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=129;NR=90;PP=2965;SC=AGTTCTTGCAAGTGTTCTTCT;SOR=0.950;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=219;TCF=129;TCR=90;TR=219;WE=127674208;WS=127674190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr9	127733926	rs2289631	C	T	4622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=68;PP=2794;SC=TTCTGTTAAACGTGCAGTTAG;SOR=0.779;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=80;TCR=68;TR=148;WE=127733934;WS=127733916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr9	127757310	rs6478690	C	T	4968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=100;PP=2965;SC=AAAACAACAACGAAGAACTGT;SOR=1.287;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=169;TCF=68;TCR=101;TR=167;WE=127757318;WS=127757300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr9	127764305	rs764304	G	A	4804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=70;PP=2909;SC=TCAGAAGCACGCTATTGGCAG;SOR=0.837;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=162;TCF=92;TCR=70;TR=162;WE=127764313;WS=127764295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr9	127765978	rs4837005	T	C	968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=25;PP=776;SC=TTCTCTAATATTTCGTTACAG;SOR=3.477;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=29;WE=127765986;WS=127765968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr9	127975583	rs359588	T	C	1870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=44;NR=26;PP=1285;SC=ATGACCCTCCTCAAGTGTGCC;SOR=1.085;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=44;TCR=26;TR=70;WE=127975591;WS=127975573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr9	127982775	rs35811664	CT	C	10939.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=104;PP=2966;SC=TCAGAAGCCCCTCTACCTGGA;SOR=1.043;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=173;TCF=69;TCR=104;TR=171;WE=127982783;WS=127982765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,283:1.00:283
chr9	128069703	rs13299973	C	A	1451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.528;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=32;PP=827;ReadPosRankSum=0.282;SC=GCTGTGTTGCCGCTTTCCTTG;SOR=0.715;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=182;TCF=96;TCR=86;TR=70;WE=128069711;WS=128069693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,78:0.38:204
chr9	128070227	rs1333055	G	C	782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=22;PP=649;SC=TGTTATTGCTGAGTGTTTTGG;SOR=3.014;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=25;WE=128070235;WS=128070217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr9	128072273	rs568409	G	C	5582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=86;NR=92;PP=2965;SC=TCATATTACAGTAGTAACCCC;SOR=0.957;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=178;TCF=86;TCR=92;TR=178;WE=128072281;WS=128072263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr9	128074807	rs432757	T	C	6855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=117;NR=106;PP=2965;SC=AAGAAACCATTCAGGAGGTGC;SOR=0.717;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=223;TCF=117;TCR=106;TR=223;WE=128074815;WS=128074797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr9	128116817	rs937482	A	G	225.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.64;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=91;SC=CAGACATGCTACTTTGTAAAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=128116825;WS=128116811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr9	128121592	rs2270746	A	G	1531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.868;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=4;PP=1081;ReadPosRankSum=2.014;SC=GCTGTAATCCATATCTAGTCA;SOR=3.690;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=48;TCR=4;TR=52;WE=128121600;WS=128121582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,56:0.97:58
chr9	128124798	rs13291306	A	T	1389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=5;PP=958;SC=TGTCTTTCATAGAAGAACATT;SOR=3.816;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=36;TCR=5;TR=41;WE=128124806;WS=128124788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr9	128201098	rs7864593	A	G	1301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=12;PP=976;SC=CACCGGGTGGACTCTAGGGCA;SOR=2.110;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=34;TCR=12;TR=46;WE=128201106;WS=128201088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr9	128206717	rs907501	C	G	4111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=38;PP=2855;SC=GGCCATGCCGCAAACAGCCTG;SOR=1.819;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=90;TCR=38;TR=128;WE=128206725;WS=128206707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr9	128327891	rs545320	A	C	6108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.22;SOR=0.719;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr9	128711803	.	C	CTG	583.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.751;ClippingRankSum=0.000;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.275;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=553;ReadPosRankSum=-0.024;SC=TGGACCTATACTGTGTATATA;SOR=0.484;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=13;WE=128711817;WS=128711793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,20:0.45:44
chr9	128711809	rs13298715	A	G	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.303;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=23;PP=624;ReadPosRankSum=0.000;SC=TATACTGTGTATATATATATA;SOR=1.022;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=47;TCF=11;TCR=36;TR=32;WE=128711817;WS=128711793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,25:0.56:45
chr9	128724304	rs888230	A	C	3321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=72;NR=29;PP=1799;SC=ACTTTTTCTCATCTCCCTGCC;SOR=1.355;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=102;TCF=72;TCR=30;TR=101;WE=128724312;WS=128724294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr9	129097817	rs1230752	G	A	667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=17;PP=497;SC=CCTTGCTTGCGATTTGCCAGC;SOR=2.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=129097825;WS=129097807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr9	129102840	rs1888156	G	A	2594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.477;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=62;PP=1504;ReadPosRankSum=0.965;SC=TGCCAGAAACGTCAATGGATC;SOR=0.632;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=211;TCF=99;TCR=112;TR=115;WE=129102848;WS=129102830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,126:0.53:238
chr9	129102994	rs10987251	G	A	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=7;PP=135;ReadPosRankSum=0.021;SC=TGGCCCTTGCGTGTAAGATGT;SOR=0.502;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=26;TCF=11;TCR=15;TR=12;WE=129103002;WS=129102984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr9	129143242	rs917778	A	G	894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=1;PP=654;SC=GGAGATCCCAAGCTGGTGTTA;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=24;WE=129143250;WS=129143232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr9	129143315	rs917777	A	G	3081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=43;PP=2013;SC=CCTTACCTGCAATCCTTTTCT;SOR=1.316;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=73;TCR=43;TR=116;WE=129143323;WS=129143305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr9	129158002	rs722538	G	A	747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=26;PP=537;ReadPosRankSum=-0.110;SC=GGTGTCTTGCGTTGTCCTGTG;SOR=0.624;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=16;TCR=53;TR=34;WE=129158010;WS=129157992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,34:0.49:70
chr9	129184309	rs887659	G	A	2389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=63;PP=1722;SC=CTGTCTTCTCGTGGGATCTGT;SOR=3.345;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=12;TCR=63;TR=75;WE=129184317;WS=129184299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr9	129265334	rs28641758	C	T	902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=7;PP=524;ReadPosRankSum=-0.806;SC=CCAGCTGCGCCATGTCAAGAT;SOR=0.569;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=68;TCF=54;TCR=14;TR=32;WE=129265342;WS=129265324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,37:0.51:73
chr9	129265397	rs45520335	G	A	2693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.460;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=46;PP=1586;ReadPosRankSum=-0.308;SC=GGCTGTGGAGGGGTTTCCCTA;SOR=0.753;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=231;TCF=136;TCR=95;TR=114;WE=129265405;WS=129265387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,129:0.50:256
chr9	129377855	rs1336980	G	C	6884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=108;NR=130;PP=2965;SC=AACAGTAAGCGCTTCTCGTCC;SOR=0.943;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=238;TCF=108;TCR=130;TR=238;WE=129377863;WS=129377845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chr9	129453229	rs2277158	A	G	3543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.308;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=70;PP=2043;ReadPosRankSum=0.828;SC=GCGTGTGTGAACGGCAGCTAC;SOR=0.620;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=282;TCF=152;TCR=130;TR=145;WE=129453237;WS=129453219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,167:0.52:324
chr9	129455372	rs34682917	C	T	472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=7;PP=278;ReadPosRankSum=-0.074;SC=AGGCTGAGGCCTGGGCTGCCC;SOR=0.591;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=36;TCF=24;TCR=12;TR=20;WE=129455380;WS=129455362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,22:0.55:40
chr9	129455587	rs13295990	G	C	826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.714;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=17;PP=486;ReadPosRankSum=0.400;SC=AGGTCTCGTCGAAGCCTTGCC;SOR=0.462;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=85;TCF=40;TCR=45;TR=36;WE=129455595;WS=129455577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,41:0.44:94
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chr9	129594890	rs371516295	C	T	3410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.016;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=60;PP=2221;ReadPosRankSum=-0.983;SC=AATTATGTGACGTCTCCATTG;SOR=0.860;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=295;TCF=169;TCR=126;TR=145;WE=129594898;WS=129594880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,157:0.50:316
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chr9	129728336	rs480796	G	A	803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=24;PP=620;SC=TATATGCCCAGCAAGAGGGGA;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=26;WE=129728344;WS=129728326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
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chr9	129752239	rs10819260	C	T	2947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.411;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=63;PP=1616;ReadPosRankSum=2.392;SC=CCACATGACACGTTGCAGTTC;SOR=0.649;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=278;TCF=146;TCR=132;TR=133;WE=129752247;WS=129752229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,148:0.47:312
chr9	129831455	rs3832609	AC	A	489.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=460;ReadPosRankSum=0.926;SC=ACAGTTATCCACTCTTTAGCT;SOR=0.368;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=35;TCF=33;TCR=2;TR=13;WE=129831463;WS=129831445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,16:0.40:40
chr9	129831659	rs1281158	T	A	6463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=123;PP=2965;SC=TTGGCTTATTTTTTTTTAAGA;SOR=1.217;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=205;TCF=82;TCR=123;TR=205;WE=129831667;WS=129831649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr9	129854199	rs2297866	G	A	1652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=34;PP=915;ReadPosRankSum=-1.385;SC=AGTATTCGCCGTCAATGTTCC;SOR=0.662;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=133;TCF=68;TCR=65;TR=69;WE=129854207;WS=129854189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,80:0.52:153
chr9	129928600	rs946430	A	C	897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=18;PP=504;SC=ATTTTAATATATCGAGCATCA;SOR=1.911;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=9;TCR=18;TR=27;WE=129928608;WS=129928590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr9	129930892	rs2297865	A	G	1360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.751;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=26;PP=914;ReadPosRankSum=-0.438;SC=TGATTTCTATACTTCTCATCT;SOR=0.413;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=147;TCF=92;TCR=55;TR=57;WE=129930900;WS=129930882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,65:0.39:168
chr9	129940379	rs3739556	T	C	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.718;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=60;ReadPosRankSum=-0.180;SC=GTGTTACCAATCCCAGGGATG;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=4;WE=129940387;WS=129940369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr9	129961152	rs875382	C	T	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=170;ReadPosRankSum=0.000;SC=AGCAAAAACTCGAGTACGTTG;SOR=0.188;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=10;WE=129961160;WS=129961142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr9	130075672	rs2779714	C	T	635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-4.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.790;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=433;ReadPosRankSum=-1.533;SC=CCATCTGTGGCTGGCAGGATC;SOR=0.365;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=59;TCF=50;TCR=9;TR=27;WE=130075680;WS=130075662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,29:0.45:64
chr9	130100305	rs3802370	G	A	2469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.161;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=42;PP=1520;ReadPosRankSum=0.087;SC=AGCGCTGGTCGAGAATGACTC;SOR=0.840;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=215;TCF=130;TCR=85;TR=110;WE=130100313;WS=130100295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,119:0.48:247
chr9	130106778	rs7863063	C	T	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.581;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=130;ReadPosRankSum=-1.425;SC=TTTTGAGAACCGAGTAGGTGC;SOR=0.250;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=13;WE=130106786;WS=130106768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr9	130117861	rs58473776	C	A	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=150;ReadPosRankSum=-1.031;SC=TGTTTAGTAGCCAACTAGGGA;SOR=1.460;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=9;WE=130117869;WS=130117851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
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chr9	130127691	rs377648325	CT	C	147.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQRankSum=1.933;QD=2.08;ReadPosRankSum=-0.073;SOR=0.635;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,17:0.24:71
chr9	130149403	rs4837149	G	A	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=135;ReadPosRankSum=0.036;SC=TGCAGTGATGGCAGGAGGGCC;SOR=0.593;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=9;WE=130149411;WS=130149393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
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chr9	130155331	rs7864853	A	G	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.707;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=341;ReadPosRankSum=0.032;SC=GTACTCCCAAAGATCCTCTTA;SOR=1.171;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=44;TCF=33;TCR=11;TR=21;WE=130155339;WS=130155321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,21:0.44:48
chr9	130160769	rs10987633	G	A	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.685;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=134;ReadPosRankSum=0.672;SC=TTTCATCCCTGGCTTCGGGTC;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=8;WE=130160777;WS=130160759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr9	130164818	rs3802367	T	C	434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=4;PP=263;SC=GCCAGCCTCCTCCACCCACCC;SOR=1.244;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=15;WE=130164826;WS=130164808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	130164993	rs1138739	C	T	687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.208;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=18;PP=444;ReadPosRankSum=1.964;SC=TGTGGGGCTCCGAGCAGGGCT;SOR=0.619;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=65;TCF=32;TCR=33;TR=37;WE=130165001;WS=130164983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,36:0.53:68
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chr9	130166382	rs10819287	C	G	7178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.35;SOR=0.762;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
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chr9	130191186	rs13292096	C	T	2280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=42;NR=37;PP=1219;SC=GGTCTCCTCACAGCTGGGCCC;SOR=0.786;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=42;TCR=37;TR=79;WE=130191194;WS=130191176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr9	130197225	rs3923308	G	A	500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=390;SC=GTGAGCCACCGCACCTGGCCA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=130197233;WS=130197221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	130197414	rs4504745	A	G	7081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=129;NR=108;PP=2965;SC=TGCACAGGAAAGGTGGAGGTG;SOR=0.780;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=237;TCF=129;TCR=108;TR=237;WE=130197422;WS=130197404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr9	130198100	rs7853047	A	G	865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=5;PP=637;SC=TGAACAGTCCAACTGGCCTAC;SOR=3.126;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=32;WE=130198108;WS=130198090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr9	130198342	rs4500179	G	A	2096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=30;NR=35;PP=1105;SC=TTTAAATCACGCATGAGTGTA;SOR=1.108;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=30;TCR=35;TR=65;WE=130198350;WS=130198332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr9	130206295	rs142661397	AT	A	2488.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=23;PP=959;SC=ACAGCTTTTCATTTTTTTTTC;SOR=1.536;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=56;TCF=30;TCR=26;TR=49;WE=130206303;WS=130206285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr9	130206762	rs2248025	C	T	7415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=135;NR=123;PP=2965;SC=TCAGCCAGAACGCCAACCTCA;SOR=0.745;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=258;TCF=135;TCR=123;TR=258;WE=130206770;WS=130206752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,273:1.00:273
chr9	130210111	rs1139400	T	C	11532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=446;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=206;NR=198;PP=2965;SC=ATACACTGGGTGGCCCCCCTT;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=405;TCF=207;TCR=198;TR=404;WE=130210119;WS=130210101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,446:1.00:446
chr9	130210946	rs2247573	A	G	547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=18;PP=465;SC=CAAATCTGACATGGCAGAAAC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=130210954;WS=130210936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	130212876	rs2247322	T	A	4839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=104;NR=62;PP=2965;SC=ACCTAGTACTTGTTCAGTGGC;SOR=1.262;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=166;TCF=104;TCR=62;TR=166;WE=130212884;WS=130212866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr9	130213508	rs2244624	A	G	3956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.03;SOR=0.719;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr9	130216951	rs2244218	G	T	576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=15;PP=452;SC=CCTCCGCACTGCCCCCAACAA;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=21;WE=130216959;WS=130216941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	130219669	rs2243906	C	T	6825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=107;NR=129;PP=2965;SC=TGGCAACCATCAAGGTACTGG;SOR=0.947;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=236;TCF=107;TCR=129;TR=236;WE=130219691;WS=130219659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,262:1.00:262
chr9	130219743	rs2243903	T	C	1952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=47;PP=1380;SC=CGCCTGCTCCTTTTGGGCTGC;SOR=3.442;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=7;TCR=47;TR=54;WE=130219751;WS=130219733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr9	130221388	rs2243767	T	C	5664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=115;PP=2965;SC=TCGGATGGCCTTAGTGAGACC;SOR=1.408;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=184;TCF=67;TCR=117;TR=182;WE=130221396;WS=130221378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr9	130236243	rs2250267	G	A	3357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=81;PP=2192;SC=ACGCATACATGTGTGTGTGTG;SOR=2.226;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=29;TCR=81;TR=110;WE=130236251;WS=130236233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr9	130241374	rs56957982	G	GCA	4495.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=40;PP=2068;SC=CCTCTTACACGCAGTCTGCTG;SOR=1.292;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=52;TCF=4;TCR=48;TR=43;WE=130241382;WS=130241364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr9	130241822	rs1539569	T	C	1400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=31;PP=978;SC=CCTGGCTGCATCCCCCAGCCA;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=11;TCR=31;TR=42;WE=130241830;WS=130241812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr9	130242051	rs56160932	C	T	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=3;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=72;ReadPosRankSum=0.348;SC=CCTCCTAACCCCAGTCAGTAC;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=5;WE=130242059;WS=130242041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr9	130242109	rs1539568	C	T	1869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=11;PP=1314;SC=CCCCTACCTCCGGCTGCAGGA;SOR=2.722;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=43;TCR=11;TR=54;WE=130242117;WS=130242099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
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chr9	130251512	rs2245677	G	A	638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=1;PP=452;SC=CTCAGGGTGCGATGCCGGAAG;SOR=4.615;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=130251520;WS=130251502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
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chr9	130286150	rs2251409	A	G	2286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=51;PP=1523;SC=CCTGATGAGCAGCTGCCCTCT;SOR=1.923;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=22;TCR=51;TR=73;WE=130286158;WS=130286140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr9	130289615	rs2243558	C	G	4110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=59;NR=79;PP=2498;SC=TGGGCAGGAGCGGGTGGGGAG;SOR=1.112;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=138;TCF=59;TCR=79;TR=138;WE=130289623;WS=130289605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
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chr9	130341253	rs4240420	A	G	1933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.113;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=50;PP=1314;ReadPosRankSum=-1.750;SC=AGGGACCGGAACTGGCCCAGT;SOR=0.423;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=183;TCF=74;TCR=109;TR=89;WE=130341261;WS=130341243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,93:0.48:195
chr9	130423271	rs372510099	CA	C	115.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=1.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.24;MQRankSum=1.733;QD=2.69;ReadPosRankSum=1.501;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,15:0.35:43
chr9	130446493	rs4836575	A	G	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.793;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=160;ReadPosRankSum=0.323;SC=ATGTGTGTTCATGCGCGCTTG;SOR=0.141;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=14;WE=130446501;WS=130446483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr9	130457332	rs138071672	T	TTGA	1668.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.962;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=2.007;NF=1;NR=50;PP=2414;ReadPosRankSum=1.366;SC=GGCTCAGCCATTGATGATGAT;SOR=2.066;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=109;TCF=5;TCR=104;TR=51;WE=130457340;WS=130457322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,62:0.87:71
chr9	130457362	.	A	ATGG	1016	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MMLQ=27;MQ=62.23;NF=1;NR=50;PP=1016;QD=20.0196078431;SC=GATGATGATGATGATGATGAT;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=78;TCF=2;TCR=76;TR=51;WE=130457370;WS=130457352;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:27,51:0.65:78
chr9	130475011	rs522328	T	C	3321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=386;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.250;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=83;PP=1830;ReadPosRankSum=0.254;SC=AAGAGGACAGTGACGTTGACG;SOR=0.859;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=350;TCF=171;TCR=179;TR=151;WE=130475019;WS=130475001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:215,170:0.44:385
chr9	130475442	rs497632	A	C	1725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.251;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=35;PP=1013;ReadPosRankSum=0.737;SC=CTGCTGTCATATATCACCCGT;SOR=0.579;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=141;TCF=66;TCR=75;TR=69;WE=130475450;WS=130475432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,79:0.50:159
chr9	130477160	rs550045	G	A	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=371;ReadPosRankSum=-1.596;SC=AGGTGAACCCGCGGATCTGTC;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=21;WE=130477168;WS=130477150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,22:0.61:36
chr9	130477768	rs504434	G	A	4559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=477;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.518;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=105;NR=108;PP=2743;ReadPosRankSum=1.187;SC=GGACATAATGGCCGAACTGAA;SOR=0.733;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=446;TCF=222;TCR=224;TR=213;WE=130477776;WS=130477758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:249,225:0.47:474
chr9	130485618	rs537881	G	A	3611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.922;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=91;PP=2259;ReadPosRankSum=0.149;SC=TTCCGGTACTGCATGGGAAGG;SOR=0.872;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=307;TCF=141;TCR=166;TR=163;WE=130485626;WS=130485608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,174:0.52:335
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chr9	130486385	rs35761147	G	GC	676.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.970;HP=9;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=399;ReadPosRankSum=-1.641;SC=CGTCTCCCACGCCCCCCCCGA;SOR=1.609;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=19;TCF=12;TCR=7;TR=10;WE=130486393;WS=130486374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,18:0.69:26
chr9	130486915	rs2256139	T	C	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.116;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=9;PP=284;ReadPosRankSum=-0.096;SC=GGACGGAGACTGCGGCGGGGG;SOR=0.257;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=45;TCF=28;TCR=17;TR=21;WE=130486923;WS=130486905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,23:0.45:51
chr9	130488494	rs538927	C	T	1935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-3.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.224;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=30;PP=1074;ReadPosRankSum=1.163;SC=CTCATAGCAGCTTGGGACCCA;SOR=0.298;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=122;TCF=81;TCR=41;TR=77;WE=130488502;WS=130488484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,91:0.65:141
chr9	130489189	rs578997	C	T	1785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.638;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=25;PP=1094;ReadPosRankSum=-1.184;SC=AGGGCAGCATCGTGCTGTCTG;SOR=0.798;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=144;TCF=94;TCR=50;TR=77;WE=130489197;WS=130489179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,80:0.54:147
chr9	130489558	rs472144	A	G	1215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=21;PP=684;ReadPosRankSum=-3.284;SC=GGATGCTTAAACGGCACGAGT;SOR=0.657;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=60;TCR=42;TR=50;WE=130489566;WS=130489548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,57:0.50:113
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chr9	130491726	rs555022	T	C	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=173;ReadPosRankSum=-0.422;SC=CCCACCCCACTCTAACCTGGC;SOR=0.430;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=11;WE=130491734;WS=130491716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
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chr9	130495633	rs564754	C	G	2966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.137;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=55;PP=1779;ReadPosRankSum=0.128;SC=AGTGGCCCCCCCACTGTGCCC;SOR=0.735;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=222;TCF=116;TCR=106;TR=121;WE=130495641;WS=130495617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,138:0.55:249
chr9	130495890	rs3739812	A	C	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=53;ReadPosRankSum=1.383;SC=CTCCCCCAACACCAGACCTCT;SOR=0.120;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=5;WE=130495898;WS=130495880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr9	130496415	rs482712	G	A	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.590;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=100;ReadPosRankSum=-0.534;SC=TCCCTGCCAGGTAGAATGACA;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=6;WE=130496423;WS=130496410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
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chr9	130524817	rs3962613	C	T	3279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=73;PP=2293;SC=GCCAAAAACCCTGTGGTCCTT;SOR=2.259;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=100;TCF=27;TCR=73;TR=100;WE=130524825;WS=130524807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr9	130536717	rs10760500	G	A	2436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.777;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=60;PP=1577;ReadPosRankSum=0.362;SC=AGGTTGGAGAGACTCCCAAAG;SOR=0.870;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=228;TCF=103;TCR=125;TR=104;WE=130536725;WS=130536707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,116:0.45:255
chr9	130548589	rs11403971	G	GC	460.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.049;HP=8;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=291;ReadPosRankSum=0.871;SC=GGATGCCCGGGCCCCCCCCGA;SOR=0.456;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=3;TCR=51;TR=19;WE=130548599;WS=130548579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,28:0.45:62
chr9	130550044	rs3217740	C	T	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.082;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=22;PP=491;ReadPosRankSum=2.320;SC=GGTGCTTCCTCGGGGCCTGCC;SOR=1.796;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=65;TCF=22;TCR=43;TR=28;WE=130550052;WS=130550034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,29:0.41:70
chr9	130578404	rs10760503	A	G	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.738;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=6;PP=98;ReadPosRankSum=0.345;SC=GTGCTGGCCCATGTGGGCTTT;SOR=0.132;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=11;WE=130578412;WS=130578394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr9	130579599	rs1330684	C	T	1023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.643;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=29;PP=657;ReadPosRankSum=-1.486;SC=CCATCTCCACCGCTTCGTAGC;SOR=0.373;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=64;TCF=13;TCR=51;TR=38;WE=130579607;WS=130579589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,43:0.62:69
chr9	130587052	rs148063362	A	AGGGAGG	346.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=1.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.32;MQRankSum=1.447;QD=10.84;ReadPosRankSum=0.338;SOR=1.140;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,11:0.34:32
chr9	130588091	rs41322046	C	T	1762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.557;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=29;PP=906;ReadPosRankSum=-0.187;SC=GAGCGTGCGGCCCATGTCCTG;SOR=0.891;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=164;TCF=93;TCR=71;TR=76;WE=130588099;WS=130588081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,88:0.48:182
chr9	130630233	rs4226	G	T	1825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.72;SOR=1.195;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr9	130630639	rs913986	A	G	2999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=57;NR=44;PP=1666;SC=AGGCGATGACAGGTTCTGTGG;SOR=0.781;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=102;TCF=58;TCR=44;TR=101;WE=130630647;WS=130630629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr9	130630749	rs8192462	C	G	887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=22;PP=540;ReadPosRankSum=-0.083;SC=GTCATGGTCTCAGGGCCTGCG;SOR=0.639;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=90;TCF=40;TCR=50;TR=38;WE=130630757;WS=130630738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,46:0.45:103
chr9	130635540	rs2767398	A	G	2766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=34;PP=1775;ReadPosRankSum=-0.772;SC=GTCAGGGAAGAGAGGGTGCTC;SOR=0.470;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=91;TCF=57;TCR=34;TR=90;WE=130635548;WS=130635530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,100:0.99:101
chr9	130648680	rs913983	G	A	4934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=100;NR=65;PP=2622;SC=CTGATTAACCGCATAGACTCC;SOR=1.033;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=165;TCF=100;TCR=65;TR=165;WE=130648688;WS=130648670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr9	130649111	rs4837202	G	A	1401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=36;PP=1018;SC=GGTGAGCGCTGGCAGGGTCCT;SOR=3.865;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=4;TCR=36;TR=40;WE=130649119;WS=130649101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr9	130657020	rs5900777	GC	G	2080.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=46;PP=1699;SC=CAGGCTCAGCGCCCCCACCTC;SOR=2.267;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=1;TCR=54;TR=47;WE=130657028;WS=130657010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr9	130670652	rs1043012	A	G	585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=16;NR=2;PP=483;SC=CGGCATGGCGACTGGCAGGAC;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=130670660;WS=130670642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	130670903	rs10760511	C	A	2608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=60;PP=1771;SC=AGAACCCACTCGCCTCCGGCC;SOR=1.796;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=27;TCR=60;TR=87;WE=130670911;WS=130670893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr9	130672106	rs7026378	A	G	1069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=9;PP=788;SC=TATCTGTGCTATGGTCACCCA;SOR=2.115;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=34;WE=130672114;WS=130672096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr9	130672221	rs10739700	C	T	7071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=138;NR=102;PP=2965;SC=CCGGCCTGGCCGGTCTGACCT;SOR=0.897;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=240;TCF=138;TCR=102;TR=240;WE=130672229;WS=130672211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr9	130690412	rs10760515	G	C	3844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=63;NR=61;PP=1682;SC=CGGGGCCCAGGGCAGCCTGAT;SOR=0.948;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=124;TCF=63;TCR=61;TR=124;WE=130690420;WS=130690402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr9	130698029	rs7997	G	C	5112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=100;NR=69;PP=2965;SC=CACTCTCTTGGTCTTCAGCAT;SOR=0.991;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=169;TCF=100;TCR=69;TR=169;WE=130698051;WS=130698019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr9	130698043	rs6781	A	G	5824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=115;NR=83;PP=2965;SC=TCAGCATCACATAGGAGATGA;SOR=0.898;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=198;TCF=115;TCR=83;TR=198;WE=130698051;WS=130698019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr9	130699917	rs2274424	G	A	3740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=47;PP=2415;SC=AGATGGTAGAGGGCTGACTAG;SOR=1.119;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=76;TCR=47;TR=123;WE=130699925;WS=130699907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr9	130700251	rs6478802	T	C	728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=19;PP=536;SC=CGCCTCCTCTTCTTTGCATAT;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=130700259;WS=130700241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr9	130707081	rs2274426	A	G	6295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=111;NR=105;PP=2965;SC=CATCTGTGAAATCCTGGCTCT;SOR=0.710;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=216;TCF=111;TCR=105;TR=216;WE=130707089;WS=130707071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr9	130710726	rs4837212	A	G	3910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=80;PP=2337;SC=CTATGCCCTGACCACCCACAG;SOR=1.422;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=50;TCR=80;TR=130;WE=130710734;WS=130710716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr9	130710791	rs4837213	T	C	1048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=31;PP=749;SC=CAGAAGGGCTTGGATTCCAAT;SOR=2.891;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=7;TCR=31;TR=38;WE=130710799;WS=130710781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr9	130715922	rs2417062	A	G	5454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=95;PP=2965;SC=AGTTGACTGCAGAATCCCAGG;SOR=0.920;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=178;TCF=83;TCR=95;TR=178;WE=130715930;WS=130715912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr9	130829039	rs1539350	A	G	4676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=91;NR=64;PP=2699;SC=GGCCACCGCCACCACTGCCAC;SOR=0.890;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=155;TCF=91;TCR=64;TR=155;WE=130829047;WS=130829029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr9	130854127	rs10739712	A	G	425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=0;PP=306;SC=AGTCGCCATCAGAGGCGTTTG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=130854135;WS=130854117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	130854461	rs34182859	TCA	T	234.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.543;NF=0;NR=5;PP=126;ReadPosRankSum=0.146;SC=AAGGGAGAACTCACAACGTTA;SOR=1.048;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=5;WE=130854470;WS=130854451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr9	130860866	rs947624	T	C	7216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=154;NR=100;PP=2965;SC=TGTGCCTGTATGTGCCGGTCA;SOR=1.146;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=255;TCF=154;TCR=101;TR=254;WE=130860874;WS=130860856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,274:1.00:274
chr9	130861039	rs947623	A	G	2731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=62;PP=1732;SC=GGAGAGGCGCATTCAACCGGT;SOR=2.141;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=25;TCR=62;TR=87;WE=130861047;WS=130861029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr9	130863599	.	G	A	1992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.596;ClippingRankSum=0.000;DP=187;ExcessHet=3.0103;FS=3.321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.66;ReadPosRankSum=0.702;SOR=0.769;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,99:0.53:187
chr9	130864676	rs7859709	T	C	8214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=156;NR=130;PP=2965;SC=CGATGACCATTGACTGGAACG;SOR=0.881;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=288;TCF=157;TCR=131;TR=286;WE=130864684;WS=130864666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,311:1.00:311
chr9	130868312	rs7864867	G	C	1545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=21;PP=1251;SC=GGCTCACCACGAGTTCCTTAC;SOR=0.780;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=23;TCR=21;TR=44;WE=130868320;WS=130868302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr9	130868831	rs1418420	T	C	878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=16;PP=531;SC=TTTAGAAACCTCCTCCCAGCA;SOR=1.942;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=8;TCR=16;TR=24;WE=130868842;WS=130868821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr9	130869499	rs4837239	A	T	6755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=129;NR=106;PP=2965;SC=GGTCGGGGGGAGCGGACAGAA;SOR=0.791;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=235;TCF=129;TCR=106;TR=235;WE=130869507;WS=130869489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
chr9	130883511	rs2040004	C	T	4911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=101;NR=69;PP=2786;SC=GGTCATCGAACGCATCCAGCC;SOR=0.982;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=171;TCF=101;TCR=70;TR=170;WE=130883519;WS=130883501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr9	130884753	rs13283456	C	T	3623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.968;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=94;PP=2234;ReadPosRankSum=-1.413;SC=GTCCTGGAGGCGGTGCCTGGG;SOR=0.945;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=266;TCF=112;TCR=154;TR=157;WE=130884761;WS=130884743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,170:0.58:294
chr9	130886906	rs4837241	A	G	2534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=58;PP=1658;SC=TTAACAAGACACTCTGGGCAT;SOR=1.559;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=89;TCF=30;TCR=59;TR=88;WE=130886914;WS=130886896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr9	130889571	rs4837242	A	G	707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=1;PP=620;SC=TTTTACACAAAAGAATACAGA;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=130889579;WS=130889561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr9	130889600	rs4837243	C	T	1325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=18;PP=969;SC=AGACTTCAGACCAAGTCACTC;SOR=1.390;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=33;TCR=18;TR=51;WE=130889608;WS=130889590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr9	130889705	rs4837244	G	A	4120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=68;PP=2258;SC=TCCCCGGCCGGGCCAGGCCTT;SOR=0.814;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=138;TCF=70;TCR=68;TR=138;WE=130889713;WS=130889685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr9	130890449	rs11283643	A	AGGTGCGCGGC	8304.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=34;NR=33;PP=2900;SC=ACCCGGCACCAGGTGTTGCGG;SOR=1.654;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=81;TCF=42;TCR=39;TR=67;WE=130890457;WS=130890439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
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chr9	130914170	rs11794980	C	G	774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=10;PP=474;ReadPosRankSum=0.221;SC=GACCCCTCACCGTCCACGCCT;SOR=0.813;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=60;TCF=44;TCR=16;TR=34;WE=130914178;WS=130914160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,38:0.52:73
chr9	130914434	rs2232629	A	G	4224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=66;PP=2579;SC=GGTGTCTGCCAGCCACTCACT;SOR=0.706;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=146;TCF=80;TCR=66;TR=146;WE=130914442;WS=130914424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr9	130922952	rs1539351	G	C	3124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=61;PP=1844;SC=CCCCGTGAGAGCTGCAGGTCA;SOR=1.322;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=39;TCR=61;TR=100;WE=130922960;WS=130922942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr9	130931586	rs10987905	C	A	708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.121;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=11;PP=577;ReadPosRankSum=0.318;SC=TCCAGACCCGCTGTGAGTTTG;SOR=1.324;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=77;TCF=45;TCR=32;TR=31;WE=130931594;WS=130931576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,31:0.42:73
chr9	130932396	rs144699223	AAC	A	4824.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.370;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.804;NF=15;NR=57;PP=2964;ReadPosRankSum=-0.153;SC=CCTGAATGACAACAGTCAAAG;SOR=0.613;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=152;TCF=30;TCR=122;TR=72;WE=130932405;WS=130932386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,127:0.48:263
chr9	130940121	rs4075428	G	A	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=24;PP=506;ReadPosRankSum=0.450;SC=ATCTGCCAACGTTGTCTCATC;SOR=0.823;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=65;TCF=22;TCR=43;TR=34;WE=130940129;WS=130940111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,34:0.50:68
chr9	130940822	rs3892074	C	T	1181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.054;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=35;PP=772;ReadPosRankSum=0.689;SC=CAAGAGCTGCCTTCTCCGTCC;SOR=1.011;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=83;TCF=19;TCR=64;TR=44;WE=130940830;WS=130940812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,49:0.53:92
chr9	130941741	rs11788797	C	G	888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.718;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=18;PP=413;ReadPosRankSum=-0.525;SC=CAAAGAGGCCCCAGGGGCTCC;SOR=0.306;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=73;TCF=26;TCR=47;TR=33;WE=130941749;WS=130941731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,41:0.51:81
chr9	130942972	rs45585631	T	C	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=7;PP=460;ReadPosRankSum=-1.473;SC=CATGTCCCTCTGAAGGGCCAG;SOR=0.824;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=34;TCR=14;TR=24;WE=130942980;WS=130942962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,25:0.46:54
chr9	130981064	rs3003602	C	T	358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=11;PP=277;SC=TGGCCACGCACCTCTGCGTGC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=130981072;WS=130981054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr9	130982416	rs3003606	C	T	7831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=136;NR=117;PP=2965;SC=CCACCCTTCCCCTCCTCTTGA;SOR=0.795;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=253;TCF=136;TCR=117;TR=253;WE=130982424;WS=130982406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,286:1.00:286
chr9	130984430	rs3003608	C	A	2476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=29;PP=1512;SC=CCCTTCCTGGCCCTGTGACCA;SOR=1.414;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=56;TCR=29;TR=85;WE=130984438;WS=130984420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr9	130984755	rs3003609	C	T	9919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=362;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=189;NR=148;PP=2965;SC=TCCAGCAGTTCGCCGTAGACT;SOR=0.918;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=337;TCF=189;TCR=148;TR=337;WE=130984763;WS=130984745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,361:1.00:361
chr9	130988616	rs3003612	C	T	660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=20;PP=524;SC=CACTCATGACCCCTCCAGGCC;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=130988624;WS=130988606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr9	130994179	rs3003578	C	T	619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=1;PP=508;SC=GCTCCAGGGGCTGTGTCCCTG;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=130994187;WS=130994169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr9	131001846	.	CGTGTGTGTGTGTGT	C	628.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.212;ClippingRankSum=0.000;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.96;ReadPosRankSum=0.478;SOR=0.883;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,20:0.67:30
chr9	131015279	rs2267958	G	A	1544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=36;NR=15;PP=879;SC=CTCACAGCATGTGTGTGCACG;SOR=1.421;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=36;TCR=15;TR=51;WE=131015287;WS=131015269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr9	131039060	rs78375359	C	G	3715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-2.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=367;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.239;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=91;PP=2184;ReadPosRankSum=2.445;SC=CCCACACCCCCTTTCCCATCC;SOR=0.577;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=330;TCF=144;TCR=186;TR=164;WE=131039068;WS=131039037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:179,187:0.51:366
chr9	131085373	rs3003601	G	C	3560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=71;PP=1976;SC=CTGCAGAAAGGGCTGTTGGCC;SOR=1.027;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=128;TCF=57;TCR=71;TR=128;WE=131085381;WS=131085363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr9	131087993	.	G	A	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.339;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.538;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=53;ReadPosRankSum=0.498;SC=CCCTCAGCTCGCTGTAGTTGG;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=6;WE=131088001;WS=131087983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,7:0.24:29
chr9	131117281	rs78484772	G	A	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=229;ReadPosRankSum=0.679;SC=GTGACAGGACGGGTGGGAGAG;SOR=0.752;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=13;WE=131117289;WS=131117271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr9	131185295	rs2072401	G	C	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.317;HP=3;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;ReadPosRankSum=-0.846;SC=GGAAGATGGAGAACAGCTGCA;SOR=0.976;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=29;TCF=12;TCR=17;TR=14;WE=131185303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr9	131185357	rs56988335	C	CTGTCCACTG	1347.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.178;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=2962;ReadPosRankSum=0.697;SC=AGCCAGGGCTCTGTCCACTGC;SOR=1.600;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=54;TCF=35;TCR=19;TR=19;WE=131185365;WS=131185347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,31:0.48:65
chr9	131186328	rs78986616	C	T	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.137;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=142;ReadPosRankSum=1.386;SC=CTAGGAGCCACGCTGGGTCTC;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=8;WE=131186336;WS=131186318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr9	131186401	rs7038316	C	T	766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.097;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=11;PP=413;ReadPosRankSum=-2.560;SC=GAGCCTGTGACGTCCCCTCCT;SOR=0.382;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=70;TCF=48;TCR=22;TR=33;WE=131186409;WS=131186391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,38:0.45:84
chr9	131186581	rs2286813	C	T	1833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.501;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=35;PP=1095;ReadPosRankSum=-0.749;SC=CTTGGGTGGACTGAGGTCCTG;SOR=0.525;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=174;TCF=89;TCR=85;TR=76;WE=131186589;WS=131186571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,86:0.45:192
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chr9	131196695	rs7258	C	T	3221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=3.671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.26;ReadPosRankSum=-0.890;SOR=0.889;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,83:0.52:159
chr9	131196704	rs7259	G	A	3279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FS=4.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.25;ReadPosRankSum=-0.210;SOR=0.925;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,85:0.52:162
chr9	131196905	rs60807982	TGG	T	687.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.427;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.266;NF=2;NR=11;PP=390;ReadPosRankSum=-0.515;SC=GAGGCTCTGATGGGGGCCGGG;SOR=0.418;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=13;WE=131196914;WS=131196895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,20:0.40:50
chr9	131197896	rs7040989	G	A	2800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.945;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=58;PP=1611;ReadPosRankSum=0.839;SC=GTAGGGGCCCGCCTCAATCCC;SOR=0.776;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=240;TCF=134;TCR=106;TR=133;WE=131197907;WS=131197886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,139:0.53:262
chr9	131218213	rs10819384	G	A	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.527;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=119;ReadPosRankSum=0.045;SC=GGCGAGACCCGGCCAGGCCCG;SOR=1.721;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=8;WE=131218221;WS=131218203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr9	131219398	rs12683827	G	C	926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=7;PP=540;ReadPosRankSum=-0.188;SC=TTTCCCTCGCGGTTCTGCCCC;SOR=0.678;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=73;TCF=56;TCR=17;TR=34;WE=131219406;WS=131219388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,40:0.48:84
chr9	131219877	rs4240429	T	C	1208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.249;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=31;PP=580;ReadPosRankSum=-0.033;SC=GGGAACGAAATGTATACACAA;SOR=0.402;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=70;TCF=27;TCR=43;TR=53;WE=131219885;WS=131219854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,58:0.73:79
chr9	131222541	rs6478832	A	G	2684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=61;PP=1888;SC=CAGCCCTAAGAACCCTGGGGC;SOR=1.906;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=26;TCR=61;TR=87;WE=131222549;WS=131222531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
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chr9	131247176	rs4075146	C	T	965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.551;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=27;PP=568;ReadPosRankSum=1.420;SC=GTCGCAGGCCCGCGGTGCCCA;SOR=0.317;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=81;TCF=27;TCR=54;TR=44;WE=131247184;WS=131247166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,46:0.54:85
chr9	131247626	rs3924786	T	A	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.489;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=125;ReadPosRankSum=1.104;SC=AACAGGCCCTTTTGTCCCGTG;SOR=1.022;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=11;WE=131247634;WS=131247616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,12:0.36:33
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chr9	131250111	rs9632915	C	A	2879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=1.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.65;ReadPosRankSum=0.479;SOR=0.570;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,83:0.62:133
chr9	131277769	rs112821508	CTTATTTT	C	2758.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=5.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.08;MQRankSum=0.919;QD=21.39;ReadPosRankSum=1.128;SOR=1.227;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,71:0.55:129
chr9	131285955	rs2275260	A	G	1441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.650;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=33;PP=885;ReadPosRankSum=-0.770;SC=AGAAGGCCAGATCCGCCTGCG;SOR=0.709;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=156;TCF=86;TCR=70;TR=69;WE=131285963;WS=131285945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,74:0.42:178
chr9	131287352	rs10988014	C	T	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.314;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=2;PP=348;ReadPosRankSum=-0.892;SC=AGTATCAATTCGTTGAATGTG;SOR=0.487;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=45;TCF=40;TCR=5;TR=22;WE=131287360;WS=131287342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,23:0.45:51
chr9	131289600	rs869455	G	T	2007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=35;PP=1170;ReadPosRankSum=1.425;SC=CAGTAATTTTGTGGACTTGAT;SOR=0.708;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=153;TCF=88;TCR=65;TR=81;WE=131289608;WS=131289590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,94:0.53:179
chr9	131298590	rs3763600	A	G	842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.648;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=13;PP=605;ReadPosRankSum=-0.272;SC=TGGGATTACAAGCGTGAGCCA;SOR=0.318;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=75;TCF=52;TCR=23;TR=35;WE=131298598;WS=131298580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,37:0.45:82
chr9	131300143	rs7048583	G	A	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.832;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=206;ReadPosRankSum=0.117;SC=CTGCCCTGTGGCAGGTGCTAG;SOR=0.105;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=12;WE=131300151;WS=131300133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,12:0.41:29
chr9	131303522	rs10760563	G	A	2378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.495;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=58;PP=1478;ReadPosRankSum=0.297;SC=AGCTGTATTTGGGAGAAGTCA;SOR=0.737;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=197;TCF=91;TCR=106;TR=105;WE=131303530;WS=131303512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,112:0.51:219
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chr9	131340306	rs4837280	A	G	1090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=5;PP=802;SC=ATTTGAGAACATAGAATTCAG;SOR=3.202;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=37;WE=131340314;WS=131340296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr9	131340639	rs1890103	T	C	1713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=38;PP=1236;SC=TCACAGGTGTTTCTCATCATG;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=14;TCR=38;TR=52;WE=131340647;WS=131340629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr9	131344607	rs5900808	GA	G	342.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=0;PP=348;SC=AAAGTTATGAGAAAAAATGTC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=12;WE=131344615;WS=131344601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	131346218	rs10760566	A	C	5462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.936;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=101;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.946;SC=AGAAACATGCACTGCTAGAGG;SOR=0.901;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=173;TCF=72;TCR=101;TR=172;WE=131346226;WS=131346208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,197:0.99:198
chr9	131346479	rs4240431	A	G	6587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=137;NR=66;PP=2965;SC=TCAGGAATGGAAAAAAGACCT;SOR=1.392;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=203;TCF=137;TCR=66;TR=203;WE=131346487;WS=131346469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr9	131347165	rs4836615	G	A	3217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.48;SOR=1.949;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr9	131347169	rs4837284	C	T	3085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.72;SOR=2.015;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr9	131350112	rs4837286	A	G	1332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=22;PP=689;SC=CAGAGTTTAAAATAAGATTTA;SOR=1.514;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=16;TCR=22;TR=38;WE=131350120;WS=131350102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr9	131360750	rs2227864	C	T	2737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=39;PP=1658;SC=CTGAAGGTCTCATGGCAGAGG;SOR=0.905;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=55;TCR=39;TR=94;WE=131360758;WS=131360740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr9	131374165	rs7024498	C	G	2892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=68;PP=2141;SC=AGGAAGATGACCACCGTCACT;SOR=2.597;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=20;TCR=68;TR=88;WE=131374173;WS=131374155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr9	131375701	rs1415568	A	G	4676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=77;PP=2750;SC=GCAAAGACCTAGCTTCTGTGA;SOR=0.843;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=152;TCF=75;TCR=77;TR=151;WE=131375709;WS=131375691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr9	131379967	rs2227862	C	T	5564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=94;PP=2965;SC=GGGACCTAACCGGCGTGCAGA;SOR=0.837;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=189;TCF=95;TCR=94;TR=189;WE=131379975;WS=131379957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr9	131380149	rs3750332	C	G	1706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=22;PP=996;SC=GTTCATGACCCCTCAGTCCAA;SOR=1.000;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=33;TCR=22;TR=55;WE=131380157;WS=131380139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr9	131380994	rs4837290	T	C	222.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.56;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=4;NR=1;PP=83;SC=GATCTCCTGATCTCGTGATCT;SOR=2.833;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=131381002;WS=131380986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	131388643	rs3737308	C	T	1854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=6;PP=1344;SC=CTGGCGACTCCGCCAACTCAG;SOR=3.767;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=48;TCR=6;TR=54;WE=131388651;WS=131388633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr9	131389060	rs10694437	C	CAA	1412.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=26;PP=1387;SC=CACGACAAGACGAGCAGGATG;SOR=3.611;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=28;WE=131389068;WS=131389050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr9	131392553	rs7866175	G	A	3773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=75;PP=2358;SC=CTGAGCTCTCGGCCAGCTGGG;SOR=1.171;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=51;TCR=75;TR=126;WE=131392561;WS=131392543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr9	131397386	.	G	A	857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=0.000;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=13;PP=473;ReadPosRankSum=0.891;SC=TGAGCTTGGTGCTCCGTGGCA;SOR=0.726;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=93;TCF=62;TCR=31;TR=39;WE=131397394;WS=131397376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,45:0.42:107
chr9	131397479	rs4837291	G	A	5877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=106;NR=91;PP=2965;SC=CCTTCCCGTCGGTGGCCACAC;SOR=0.720;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=197;TCF=106;TCR=91;TR=197;WE=131397487;WS=131397469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr9	131398343	rs947182	T	A	377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=9;NR=4;PP=194;SC=CACAGCCCCCTGTCCTGGCCC;SOR=1.244;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=13;WE=131398351;WS=131398333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	131398636	rs10760570	C	T	2997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=54;NR=46;PP=1740;SC=CGGCCGACGGCTGCTGGGGAC;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=54;TCR=46;TR=100;WE=131398644;WS=131398626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr9	131403096	rs2298045	A	G	6157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=108;PP=2965;SC=TGGGTATGTCATACTGGGACG;SOR=0.859;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=209;TCF=101;TCR=108;TR=209;WE=131403104;WS=131403086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr9	131418828	rs4837292	A	C	1581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=19;PP=851;SC=ACCGTCTCCCAGCGGATGCCC;SOR=1.278;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=33;TCR=19;TR=52;WE=131418836;WS=131418818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr9	131452121	.	C	CG	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=70;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=7;NR=0;PP=212;SC=GCCTGGGTGGCCCGCGCCGCG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=131452129;WS=131452111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	131452126	.	GCC	G	494.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.98;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr9	131452137	.	C	CG	569.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=1;PP=469;SC=CCGCGGCGGCCGCGCTGCGAG;SOR=2.985;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=131452145;WS=131452127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	131453331	rs4837293	G	A	2302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=46;NR=27;PP=1051;SC=TGGAACGCTTGCCTTTGTACT;SOR=0.786;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=46;TCR=27;TR=73;WE=131453339;WS=131453321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr9	131453368	rs41275906	C	T	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.14;ReadPosRankSum=-1.399;SOR=0.572;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,24:0.29:84
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chr9	131456385	rs10637043	G	GTA	2344.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.853;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.657;NF=3;NR=47;PP=2084;ReadPosRankSum=1.742;SC=ATTTTGGGGTGTATATATATA;SOR=0.929;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=92;TCF=3;TCR=89;TR=50;WE=131456394;WS=131456375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,78:0.70:111
chr9	131465167	rs1572915	A	G	1806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.38;SOR=0.886;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr9	131465284	rs3750321	G	T	351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.13;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	131468251	rs1572916	T	C	3665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=78;PP=2370;SC=GAGACACCATTCCAGCCTGCA;SOR=1.505;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=121;TCF=43;TCR=78;TR=121;WE=131468259;WS=131468241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr9	131475951	rs4837297	T	C	2895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=60;PP=1532;SC=TCTGACTTGGTGGGACCCTGG;SOR=1.567;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=36;TCR=60;TR=96;WE=131475959;WS=131475941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr9	131477544	rs7854055	G	A	5017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=81;NR=83;PP=2950;SC=GGTATGGGACGGGATTGGGGG;SOR=0.804;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=164;TCF=81;TCR=83;TR=164;WE=131477552;WS=131477534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr9	131479023	rs10739729	T	C	6225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=119;NR=83;PP=2965;SC=CTCTCTCCTGTAGCCTGTACT;SOR=1.008;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=203;TCF=120;TCR=83;TR=202;WE=131479031;WS=131479013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr9	131482467	rs3750325	T	C	4604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=93;NR=63;PP=2345;SC=AGTGAGCGCCTGTCCTATTGC;SOR=1.083;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=156;TCF=93;TCR=63;TR=156;WE=131482475;WS=131482457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr9	131483749	rs2900268	T	A	2590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=39;NR=39;PP=1485;SC=CCGCAACCACTGACCCCAGGG;SOR=0.901;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=39;TCR=39;TR=78;WE=131483757;WS=131483739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr9	131484526	rs10988105	C	T	1714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=45;PP=1296;SC=GGACTGAGGGCGGCTGTGTAT;SOR=3.219;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=10;TCR=45;TR=55;WE=131484534;WS=131484516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr9	131502112	rs2298044	A	G	653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=1;PP=483;SC=GACCAGAAGGAAGGTGGGAGC;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=131502120;WS=131502111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	131502440	rs3818931	G	C	2847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=45;NR=52;PP=1624;SC=CACTCCCCCAGTTTCTCTTCA;SOR=1.002;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=45;TCR=52;TR=97;WE=131502448;WS=131502430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr9	131502460	rs7027146	G	T	1890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=38;PP=1114;SC=AGATACCAGCGGCAGGACCCC;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=26;TCR=38;TR=64;WE=131502468;WS=131502450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr9	131505092	rs10739731	A	C	2903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=41;NR=57;PP=1781;SC=TCTAGGAACTATCTAGAGGTA;SOR=1.211;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=41;TCR=57;TR=98;WE=131505100;WS=131505082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr9	131515547	rs8507	G	T	4583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=73;PP=2794;SC=TGAGGAAGGCGGCGTCGCTCG;SOR=0.776;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=161;TCF=88;TCR=73;TR=161;WE=131515555;WS=131515537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr9	131550722	rs1891076	C	G	2341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=54;PP=1662;SC=GGTTTCCCTACAGCAGCCCTG;SOR=1.996;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=18;TCR=54;TR=72;WE=131550730;WS=131550712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr9	131553768	rs10760577	A	G	3416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NR=66;PP=2332;SC=TGCATGTGACAGAGCCAGTAC;SOR=0.981;Source=Platypus;TCR=66;WE=131553776;WS=131553758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr9	131568363	rs2417127	A	G	3356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=53;PP=2208;SC=AGACAGGAGGACCCTCCGCCC;SOR=0.778;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=115;TCF=62;TCR=53;TR=115;WE=131568371;WS=131568353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr9	131570178	rs45609236	T	C	9757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.80;SOR=1.154;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr9	131570183	rs7862546	C	G	9345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.81;SOR=1.190;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr9	131580998	rs2293969	C	T	322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=7;NR=4;PP=197;SC=ACCCTGGCGTCGGGCGCGGGG;SOR=1.022;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=11;WE=131581006;WS=131580988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr9	131583170	rs2280845	T	C	1399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=38;PP=932;SC=CCCACTCACCTGAGGCCCCTA;SOR=1.938;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=15;TCR=38;TR=53;WE=131583178;WS=131583160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr9	131585069	rs2280843	A	G	3853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=62;NR=68;PP=2120;SC=ACCCGCCTGGATGAGGCCAGG;SOR=1.017;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=130;TCF=62;TCR=68;TR=130;WE=131585077;WS=131585059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr9	131585205	rs2997919	T	C	406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=10;PP=220;SC=GCCCGAGACCTGGCCCACTGG;SOR=2.049;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=14;WE=131585224;WS=131585195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	131585216	rs2977994	G	T	386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=9;PP=223;SC=GGCCCACTGGGGTCCCCTGTC;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=131585224;WS=131585195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	131585994	rs2997918	T	C	2755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=27;PP=1743;ReadPosRankSum=-0.060;SC=AAGGCCCCAGTGGCTGGCAGT;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=63;TCR=28;TR=89;WE=131586002;WS=131585983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,100:0.98:102
chr9	131586558	.	GGT	G	199.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.560;ClippingRankSum=0.000;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.87;ReadPosRankSum=0.939;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,10:0.24:41
chr9	131586913	rs4836630	A	G	1304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.99;SOR=2.226;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr9	131586918	rs2997917	G	A	1392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.21;SOR=2.235;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr9	131587240	rs2293968	G	A	4428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=96;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.777;SC=CAGGGGTTGGGGAACCTTCCA;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=145;TCF=48;TCR=97;TR=144;WE=131587248;WS=131587230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,157:0.99:158
chr9	131588652	rs2997914	T	C	6184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=130;NR=78;PP=2965;SC=GGCGGGCCCATACAGCGTTAC;SOR=1.315;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=208;TCF=130;TCR=78;TR=208;WE=131588660;WS=131588642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr9	131589234	rs2977991	C	G	2185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=12;PP=1513;SC=GTGGACGGGGCCATGGTGAAG;SOR=2.995;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=54;TCR=12;TR=66;WE=131589242;WS=131589224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
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chr9	131599008	rs2759009	C	T	695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=0;PP=485;SC=ACCAGGCCTGCGCTGACTCTC;SOR=4.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=131599016;WS=131598998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr9	131600111	rs2280841	T	C	4261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=77;PP=2149;SC=GCAGGTGGCATGGGGTGGTAC;SOR=0.924;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=143;TCF=66;TCR=77;TR=143;WE=131600124;WS=131600101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr9	131670919	rs3750319	T	C	9491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=353;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=175;NR=149;PP=2965;SC=CCTTCCTGCGTGAGAACCTGC;SOR=0.813;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=325;TCF=175;TCR=150;TR=324;WE=131670927;WS=131670909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,352:1.00:352
chr9	131689361	rs751340	G	A	3703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=395;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.128;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=92;PP=2538;ReadPosRankSum=-0.374;SC=TCTTGTCTGCGGAAGAGTGTG;SOR=0.808;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=363;TCF=175;TCR=188;TR=171;WE=131689369;WS=131689351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:216,178:0.45:394
chr9	131699847	rs12686860	G	A	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.017;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=100;ReadPosRankSum=-0.978;SC=TTGTTGGGCAGGGGTGGGGGT;SOR=1.532;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=8;WE=131699855;WS=131699837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr9	131700209	rs10113912	C	T	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=141;ReadPosRankSum=1.053;SC=CATTCCTTCCCCTGATAGTGG;SOR=0.760;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=11;WE=131700217;WS=131700199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr9	131702891	rs2273866	A	G	1142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.620;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=32;PP=820;ReadPosRankSum=0.417;SC=GTGTGTCAAGAAGGATGGTCC;SOR=0.793;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=138;TCF=61;TCR=77;TR=56;WE=131702899;WS=131702881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,59:0.38:154
chr9	131735559	rs17452428	T	C	775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.936;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=17;PP=495;ReadPosRankSum=-0.139;SC=AAGCTGTCTCTACTGCCCAGC;SOR=0.851;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=60;TCF=28;TCR=32;TR=32;WE=131735567;WS=131735549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,35:0.54:65
chr9	131743701	.	CT	C	86.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.606;ClippingRankSum=0.000;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=3.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.85;ReadPosRankSum=-0.389;SOR=0.668;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,13:0.28:47
chr9	131745548	rs719703	T	C	3025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.440;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=51;PP=1949;ReadPosRankSum=1.268;SC=CTTTATTGAGTATAGTGTATT;SOR=0.724;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=254;TCF=154;TCR=100;TR=132;WE=131745556;WS=131745528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,142:0.51:279
chr9	131761437	rs2004632	A	G	786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.965;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=9;PP=484;ReadPosRankSum=-0.077;SC=TGGCCCACCCAGTATTCTTTC;SOR=0.510;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=69;TCF=52;TCR=17;TR=35;WE=131761445;WS=131761427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,38:0.51:75
chr9	131761659	rs2302813	A	G	1127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=32;PP=720;ReadPosRankSum=0.360;SC=ACAGCCAGGCAGGGCTTCCTT;SOR=0.686;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=29;TCR=63;TR=47;WE=131761667;WS=131761649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,51:0.53:96
chr9	131761899	rs2302811	A	G	2062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=34;PP=1216;ReadPosRankSum=-0.021;SC=TGTCTATTCTACAGTAAGTGA;SOR=0.685;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=192;TCF=114;TCR=78;TR=88;WE=131761920;WS=131761889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,101:0.45:226
chr9	131764969	rs12683155	A	G	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=378;ReadPosRankSum=1.309;SC=TGGTGGCCAGACAGTGGCTGT;SOR=0.902;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=43;TCF=32;TCR=11;TR=22;WE=131764977;WS=131764959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
chr9	131765987	rs10739740	T	C	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.821;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=241;ReadPosRankSum=0.071;SC=AAGAATACACTTGGGGCCGGG;SOR=1.534;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=40;TCF=14;TCR=26;TR=16;WE=131765995;WS=131765977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,16:0.40:40
chr9	131767668	rs2287363	A	C	1632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.006;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=31;PP=1061;ReadPosRankSum=-0.980;SC=CCTCCTCCTCAAAGCAGCCCG;SOR=0.524;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=145;TCF=71;TCR=74;TR=66;WE=131767676;WS=131767658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,73:0.47:156
chr9	131772389	rs3750340	T	G	4935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=77;PP=2845;ReadPosRankSum=1.603;SC=GGGTGGGCAGTGGGACTCACG;SOR=0.232;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=168;TCF=91;TCR=77;TR=167;WE=131772397;WS=131772379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,190:0.99:191
chr9	131790531	rs11537529	C	T	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.953;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=113;ReadPosRankSum=-0.039;SC=TGCTGCGGGGCACCAGCCCTC;SOR=0.693;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=8;WE=131790539;WS=131790521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr9	131847758	rs148259476	G	T	1997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.353;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=38;PP=1233;ReadPosRankSum=2.765;SC=CCTGGGCTGGGCTGTGGGCTG;SOR=0.847;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=166;TCF=91;TCR=75;TR=91;WE=131847766;WS=131847748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,96:0.54:178
chr9	131848382	rs7859344	T	A	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.625;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=4;PP=513;ReadPosRankSum=0.468;SC=TGTGTCTGACTGGCTCTCACA;SOR=1.557;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=64;TCF=51;TCR=13;TR=28;WE=131848390;WS=131848372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,28:0.39:72
chr9	131857630	rs2229419	C	T	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=130;ReadPosRankSum=-0.299;SC=TGGCCCATCCCAGGGTGGGCT;SOR=0.693;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=9;WE=131857638;WS=131857620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
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chr9	131862073	rs3118638	G	A	3902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=85;NR=41;PP=2217;SC=TTCTCTATAAGCTGGTCTATC;SOR=1.435;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=85;TCR=41;TR=126;WE=131862081;WS=131862063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
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chr9	131865493	rs3124498	C	T	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=238;ReadPosRankSum=0.374;SC=GAGGGGCCTGCGAGTCCCAGC;SOR=0.776;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=12;WE=131865501;WS=131865483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
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chr9	131871144	rs2768629	A	G	3858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=60;NR=64;PP=2050;SC=CTACAAAGTGAGTGAGCAGAA;SOR=0.919;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=124;TCF=60;TCR=64;TR=124;WE=131871152;WS=131871134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr9	131871249	rs2541163	A	C	1234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=25;PP=800;SC=GCTGTGGTGGAATCGGGGGTT;SOR=1.455;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=13;TCR=25;TR=38;WE=131871257;WS=131871239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr9	131871435	rs2541162	A	C	4529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=59;PP=2563;SC=GGGAGTCAGGACAAAAGGTAA;SOR=0.884;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=145;TCF=86;TCR=59;TR=145;WE=131871443;WS=131871425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr9	131872847	rs11278777	GCGCCGC	G	1600.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.471;NF=1;NR=22;PP=1131;ReadPosRankSum=-0.212;SC=GGCAAAGTCCGCGCCGCCGCC;SOR=0.627;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=62;TCF=3;TCR=59;TR=23;WE=131872860;WS=131872837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,43:0.49:88
chr9	131873222	rs3814492	G	A	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=273;ReadPosRankSum=-0.025;SC=AGGGCCGAGGGCGAGTCATTG;SOR=0.612;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=53;TCF=43;TCR=10;TR=21;WE=131873230;WS=131873212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,23:0.39:59
chr9	131873256	rs3118625	A	C	1061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.789;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=15;PP=596;ReadPosRankSum=0.541;SC=AGGAAGGAGGAGGTCACCGTC;SOR=0.585;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=92;TCF=67;TCR=25;TR=46;WE=131873264;WS=131873246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,50:0.50:101
chr9	131873638	rs3124501	T	G	439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=12;NR=1;PP=326;SC=CGTCGCCCGGTTCCGCGCGTC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=131873646;WS=131873635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	131882706	.	G	A	231	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=14;HapScore=2;MGOF=43;MMLQ=19;MQ=56.7;NF=8;NR=1;PP=231;QD=29.5301347275;SC=TCCGTCTCAAGAAAAAAAAAA;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=9;WE=131882714;WS=131882696;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,9:0.82:11
chr9	131882761	rs9409311	T	C	1701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=46;NR=15;PP=1255;SC=ATTCTATTTATCTGTTTGTTT;SOR=1.688;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=64;TCF=47;TCR=17;TR=61;WE=131882769;WS=131882751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr9	131882961	rs3739843	G	A	1037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.817;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=32;PP=780;ReadPosRankSum=0.176;SC=GACGGGCGGTGAGTTCCTGGC;SOR=0.858;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=86;TCF=29;TCR=57;TR=46;WE=131882969;WS=131882951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,47:0.48:98
chr9	131885279	rs3118628	G	A	997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=9;PP=675;ReadPosRankSum=0.716;SC=CAGGTGGGGCGGGGGGGTCTG;SOR=0.633;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=54;TCR=17;TR=38;WE=131885287;WS=131885268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,44:0.56:79
chr9	131891152	rs7023900	C	G	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=271;ReadPosRankSum=0.282;SC=GGGGAGAGTTCCCAGTAGGGG;SOR=1.022;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=16;WE=131891160;WS=131891142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr9	131896999	rs3124509	C	T	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.016;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=10;PP=325;ReadPosRankSum=1.120;SC=ATCAATGATTCGGATTCTGGG;SOR=0.450;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=63;TCF=42;TCR=21;TR=28;WE=131897007;WS=131896989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,34:0.47:72
chr9	131897221	rs7019373	C	T	258.31	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5731;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=146;ReadPosRankSum=-0.903;SC=GAGGGGCCATCTGTTTCCTCC;SOR=0.818;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=10;WE=131897229;WS=131897211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr9	131898880	rs1536548	A	G	3085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=72;PP=2182;SC=GATAGGTACTAGAGCGGGAGG;SOR=1.841;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=31;TCR=72;TR=103;WE=131898888;WS=131898870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr9	131899846	rs3118631	T	C	2904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=63;NR=34;PP=1357;SC=TGGTTCTGAATGCTGGGGCCC;SOR=1.138;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=63;TCR=34;TR=97;WE=131899854;WS=131899836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr9	131900180	rs2297112	G	A	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=163;ReadPosRankSum=0.496;SC=TTCTCCTTCAGTTTCTCCTGA;SOR=0.765;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=27;TCF=10;TCR=17;TR=15;WE=131900188;WS=131900170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr9	131904608	rs3124514	C	T	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.863;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=38;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=111;ReadPosRankSum=0.483;SC=GCATTGTGTGCGTGTGCGTTT;SOR=0.593;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=8;WE=131904626;WS=131904605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr9	131904617	.	TTG	T	61.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.765;ClippingRankSum=0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=5.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.12;ReadPosRankSum=-0.405;SOR=0.027;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr9	131905177	rs2254230	T	G	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.445;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=220;ReadPosRankSum=-0.184;SC=TCGGGCAGTCTGAGTCTGGCT;SOR=1.085;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=14;WE=131905185;WS=131905167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
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chr9	131940019	rs184457	G	A	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.560;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.40;ReadPosRankSum=-0.967;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
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chr9	132396281	rs10819551	G	C	3777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=45;PP=2336;SC=AGGAAGGGCCGCACGTGCGGT;SOR=1.376;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=73;TCR=45;TR=118;WE=132396289;WS=132396271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr9	132396655	rs1558873	A	G	1540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=39;PP=1149;SC=ATAAGGTGTCAGGACCAGGGC;SOR=2.584;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=11;TCR=39;TR=50;WE=132396663;WS=132396645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr9	132400480	rs3739851	G	A	2782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=353;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.282;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=59;PP=1749;ReadPosRankSum=1.831;SC=AGTTGTAGGCGGCTCCGGACT;SOR=0.613;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=321;TCF=160;TCR=161;TR=127;WE=132400488;WS=132400470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:213,140:0.40:353
chr9	132401824	rs2302780	G	A	2251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=33;NR=44;PP=1232;SC=GGTCCTATCTGTCCGCATTCT;SOR=1.218;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=33;TCR=44;TR=77;WE=132401832;WS=132401802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr9	132402908	rs2241247	C	G	4085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=78;NR=55;PP=2280;SC=GGGCGTTGCTCACGCCTTCCT;SOR=0.906;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=78;TCR=55;TR=133;WE=132402916;WS=132402898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr9	132404304	rs4837396	C	G	2258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=44;PP=1349;SC=GCAGCAGGGCCGTCGCGCTTT;SOR=1.367;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=28;TCR=44;TR=72;WE=132404312;WS=132404294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr9	132484643	rs28428946	A	C	2608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.097;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=56;PP=1565;ReadPosRankSum=0.214;SC=GTCCAGTCCCACCAGGACCCA;SOR=0.893;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=219;TCF=116;TCR=103;TR=109;WE=132484651;WS=132484629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,124:0.50:248
chr9	132484782	rs1051445	T	C	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.670;HP=4;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=584;ReadPosRankSum=-0.274;SC=TTGAGGCCCCTGCAGCCGGGC;SOR=0.197;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=38;TCF=7;TCR=31;TR=17;WE=132484801;WS=132484772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr9	132484793	rs28441121	C	G	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.926;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=584;ReadPosRankSum=-0.102;SC=GCAGCCGGGCCCAGCTCTTCT;SOR=0.293;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=4;TCR=28;TR=15;WE=132484801;WS=132484772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr9	132501881	rs2302821	A	C	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=165;ReadPosRankSum=1.020;SC=AGGAGGCATCAGCTGCTGGTC;SOR=0.807;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=40;TCF=31;TCR=9;TR=15;WE=132501889;WS=132501871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,16:0.36:44
chr9	132515081	rs2241271	T	C	2985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=70;NR=27;PP=1734;SC=ACCTTGGCCATGTTTCCCTAT;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=70;TCR=27;TR=97;WE=132515089;WS=132515071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr9	132515247	rs11792431	G	A	1806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.440;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=43;PP=1034;ReadPosRankSum=2.098;SC=AGAGCAGGAAGGCCGGGAGGG;SOR=0.524;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=182;TCF=84;TCR=98;TR=84;WE=132515255;WS=132515237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,93:0.46:204
chr9	132566666	rs7029757	G	A	1132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.592;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=32;PP=713;ReadPosRankSum=0.442;SC=GGACTGGTCCGGGTGACCTGC;SOR=0.904;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=102;TCF=39;TCR=63;TR=49;WE=132566674;WS=132566656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,53:0.47:113
chr9	132569442	rs2302820	G	A	1418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.629;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=17;PP=854;ReadPosRankSum=1.164;SC=TTCGCATCCTGTTTCTTCTTT;SOR=0.976;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=99;TCF=66;TCR=33;TR=56;WE=132569450;WS=132569432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,64:0.59:108
chr9	132572614	.	CTG	C	115	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=32;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=115;QD=31.0;SC=CTGAGCTGACCTGTGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=4;WE=132572637;WS=132572604;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,4:0.40:10
chr9	132572626	.	GT	G	69.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.83;MQRankSum=0.908;QD=6.34;ReadPosRankSum=-0.641;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr9	132572628	.	GT	G	69.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.992;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.90;MQRankSum=0.908;QD=6.34;ReadPosRankSum=-0.728;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr9	132572629	rs1220509	T	G	103.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.98;MQRankSum=-0.842;QD=10.38;ReadPosRankSum=1.255;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr9	132585058	rs2296793	G	A	3684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.881;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=91;PP=2464;ReadPosRankSum=-0.490;SC=AACCAAACACGGCATTTAAGA;SOR=0.869;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=322;TCF=147;TCR=175;TR=161;WE=132585066;WS=132585048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,172:0.50:344
chr9	132586468	rs13300897	C	T	723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=2.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.64;ReadPosRankSum=1.782;SOR=0.454;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,37:0.54:68
chr9	132590352	rs1806988	AG	GT	1107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.187;NF=17;NR=4;PP=593;ReadPosRankSum=1.642;SC=GATTACAGGCAGGAGCCACCA;SOR=0.708;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=44;TCF=35;TCR=9;TR=21;WE=132590361;WS=132590342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,29:0.58:50
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chr9	132591272	rs55962905	T	C	989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=14;PP=712;ReadPosRankSum=0.124;SC=ATTCTCAGAGTAATCCTAACA;SOR=0.758;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=91;TCF=60;TCR=31;TR=46;WE=132591280;WS=132591262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,48:0.51:94
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chr9	132595664	rs72755238	G	A	1365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=17;PP=880;ReadPosRankSum=-0.689;SC=AGCTCTCTGAGGGAACCTAGA;SOR=0.735;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=113;TCF=79;TCR=34;TR=58;WE=132595672;WS=132595654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,61:0.52:117
chr9	132595685	rs45507500	C	G	1965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=35;PP=1254;ReadPosRankSum=-0.643;SC=CCCAGGCAGCCGCTAAAGGTG;SOR=0.675;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=165;TCF=101;TCR=64;TR=89;WE=132595693;WS=132595675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,95:0.55:173
chr9	132596031	rs2274507	T	C	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.364;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=8;PP=140;ReadPosRankSum=-2.429;SC=GAGAGAGAAATGGCATAATTC;SOR=1.085;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=10;WE=132596039;WS=132596021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr9	132596899	rs3814548	G	A	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=1;PP=20;ReadPosRankSum=1.215;SC=AAAAATCTACGTCTGAGGAGA;SOR=0.941;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=4;WE=132596907;WS=132596889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr9	132597021	rs3814547	C	T	880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.689;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=16;PP=588;ReadPosRankSum=0.655;SC=AGTTCTGTACCTCTCTGGTCT;SOR=0.902;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=51;TCR=29;TR=44;WE=132597029;WS=132597011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,44:0.48:92
chr9	132597621	rs11790613	T	C	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.780;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=109;ReadPosRankSum=-0.915;SC=GCACGCACAGTCCGCGTGGCC;SOR=0.105;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=8;WE=132597629;WS=132597611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr9	132615077	rs2296786	C	T	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=167;ReadPosRankSum=-0.616;SC=GGCCGCCTTCCGGAGGCTCTG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=10;WE=132615085;WS=132615067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr9	132618578	rs4836674	T	C	5805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=121;NR=85;PP=2965;ReadPosRankSum=-2.128;SC=TCCTCTCAACTCACACAGGGA;SOR=1.032;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=208;TCF=122;TCR=86;TR=206;WE=132618586;WS=132618566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,223:0.99:225
chr9	132618807	rs7862315	G	A	1096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=30;PP=936;SC=CAAAGTCAGCGAATCCTGGGC;SOR=4.174;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=33;WE=132618815;WS=132618797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr9	132620224	rs2417150	A	G	3983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=80;NR=42;PP=2190;SC=TGTGGCCCCTATTCAGGAGAG;SOR=1.244;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=122;TCF=80;TCR=42;TR=122;WE=132620232;WS=132620214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr9	132620364	rs10819568	T	C	5202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=104;PP=2914;SC=GAGAATCCTTTGCTGACCACA;SOR=1.025;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=188;TCF=84;TCR=104;TR=188;WE=132620372;WS=132620354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr9	132620458	rs10819569	C	A	2010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.78;SOR=2.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr9	132620464	rs10760638	C	T	1886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.92;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr9	132620620	rs2174156	T	C	766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=1;PP=643;SC=AAGCAAAATTTGAGCTTCCGG;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=24;WE=132620628;WS=132620610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr9	132620707	rs2134601	T	C	4969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=64;PP=2965;SC=CTTGTTAGGCTAGAGTGCCCT;SOR=0.998;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=166;TCF=102;TCR=64;TR=166;WE=132620715;WS=132620697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr9	132620990	rs2174157	T	C	1132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=26;PP=781;SC=GGTGTCTGTTTCTGGGTCAGT;SOR=1.923;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=11;TCR=26;TR=37;WE=132620998;WS=132620980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr9	132623293	rs1503375	C	T	7475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=124;NR=133;PP=2965;SC=AGTCAGAGGACGATGACCTGA;SOR=0.826;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=257;TCF=124;TCR=133;TR=257;WE=132623301;WS=132623278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,286:1.00:286
chr9	132623868	rs10115249	T	C	6579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=124;PP=2965;SC=ACATGAACGCTGCCCTGCAGG;SOR=0.958;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=230;TCF=106;TCR=124;TR=230;WE=132623876;WS=132623858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr9	132623917	rs10124224	C	A	3813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=76;PP=2267;SC=GTCCGAGGGCCGAGAGCTGTC;SOR=1.455;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=122;TCF=46;TCR=76;TR=122;WE=132623925;WS=132623907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr9	132625417	rs4837419	CA	TG	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=1;PP=424;SC=TAAACTGCCGCATGCCTCATT;SOR=2.303;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=10;WE=132625426;WS=132625407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	132625452	rs35595055	C	G	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.180;HP=3;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=217;ReadPosRankSum=0.227;SC=GGCTCTCTCTCCCCTGCACCC;SOR=2.215;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=11;WE=132625460;WS=132625442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr9	132625602	rs2900279	T	C	5501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=101;NR=92;PP=2929;SC=TCCCTAGCCTTGGGCGGTGTG;SOR=0.732;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=193;TCF=101;TCR=92;TR=193;WE=132625610;WS=132625592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr9	132627480	rs913319	C	T	1845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=19;PP=1197;SC=TGTCAGGAAACGCCACACTCT;SOR=1.646;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=41;TCR=19;TR=60;WE=132627488;WS=132627470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr9	132627723	rs913320	G	A	2411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=56;PP=1505;SC=TGACTTTGACGCCAAAACCAG;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=18;TCR=56;TR=74;WE=132627731;WS=132627713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr9	132630231	rs913325	A	G	1916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=14;PP=1245;SC=GGCGCTGGAGACTGGTTCCTC;SOR=1.839;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=44;TCR=14;TR=58;WE=132630239;WS=132630221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr9	132630664	rs10602985	TGAC	T	6632.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=76;PP=2967;SC=TGGCTGCCCTTGACGACCAGC;SOR=1.171;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=2;TCR=84;TR=78;WE=132630674;WS=132630654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr9	132631680	rs6478920	T	C	6014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=116;PP=2965;SC=TTCTCAGCCTTGTGCAGTGTC;SOR=1.087;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=208;TCF=92;TCR=116;TR=208;WE=132631688;WS=132631670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr9	132632162	rs5900871	G	GC	496.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=552;SC=CATGGGCTGGGCCTGTCCTGG;SOR=4.047;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=14;WE=132632170;WS=132632152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr9	132635653	rs1809959	A	G	4301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=52;PP=2464;ReadPosRankSum=0.975;SC=ATGAGCCACCATGCCCAGCCA;SOR=0.549;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=147;TCF=95;TCR=52;TR=146;WE=132635661;WS=132635643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,166:0.99:167
chr9	132635944	rs2296787	C	G	7110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=128;NR=118;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.085;SC=GCCCTGATGCCGGACACTGAT;SOR=0.235;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=247;TCF=129;TCR=118;TR=246;WE=132635952;WS=132635934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,269:1.00:270
chr9	132636031	rs4332226	A	G	9466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.43;SOR=1.005;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr9	132636031	.	AGT	GGC	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=85;NR=105;PP=2947;QD=20;SC=GAGGTGAGCCAGTGGCCTCGG;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=197;TCF=89;TCR=108;TR=190;WE=132636041;WS=132636021;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:7,190:0.96:197
chr9	132636033	rs4415421	T	C	9466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.51;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr9	132637712	rs735115	G	A	3549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=379;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.728;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=63;PP=2175;ReadPosRankSum=0.215;SC=ACACCTTCGCGGAGCCAGGCC;SOR=0.846;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=335;TCF=192;TCR=143;TR=153;WE=132637720;WS=132637702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:207,171:0.45:378
chr9	132640726	rs2296788	T	G	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.33;ReadPosRankSum=-1.108;SOR=0.591;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,38:0.40:94
chr9	132652677	rs60841376	G	GGA	531.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=6.043;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.625;NF=10;NR=3;PP=519;ReadPosRankSum=-0.426;SC=GGAGCATGCTGGAGAGAGAGA;SOR=2.584;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=13;WE=132652685;WS=132652667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,16:0.80:20
chr9	132658044	rs2047837	T	C	465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=1;PP=352;SC=GTAACAGTCATGGTTGTGGGG;SOR=5.549;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=17;WE=132658052;WS=132658034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr9	132658078	rs71738364	G	GT	76.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=1.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.53;ReadPosRankSum=-1.080;SOR=1.276;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,10:0.20:50
chr9	132662786	rs1023000	C	T	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.760;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=18;PP=420;ReadPosRankSum=-1.617;SC=CGCCTGCTCGCTGCGTGCTGG;SOR=0.798;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=88;TCF=41;TCR=47;TR=35;WE=132662794;WS=132662776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,42:0.42:100
chr9	132671155	rs75300207	T	C	1886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.675;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=36;PP=1152;ReadPosRankSum=0.217;SC=ATAAGTCATATTGATGCACTA;SOR=0.490;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=159;TCF=93;TCR=66;TR=82;WE=132671163;WS=132671145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,91:0.53:173
chr9	132671359	rs3215850	T	TG	641.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=19;PP=606;SC=CCTGCAGCCATGGGGGGTGCA;SOR=3.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=19;WE=132671367;WS=132671349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr9	132672319	rs7855720	G	A	6427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=136;NR=86;PP=2965;SC=TCCCTTTTCAGAAGCAGCTGC;SOR=1.222;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=222;TCF=136;TCR=86;TR=222;WE=132672327;WS=132672309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr9	132678195	rs7867211	G	A	6296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=124;NR=89;PP=2965;SC=TAAAAGACACGCCAGAAAACC;SOR=0.939;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=213;TCF=124;TCR=89;TR=213;WE=132678203;WS=132678185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr9	132681619	rs1054874	C	T	433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=12;PP=305;SC=CAAAATCTTTCGGTCAACTTT;SOR=3.126;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=132681627;WS=132681609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr9	132686186	rs4836680	A	G	2182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.62;SOR=0.846;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr9	132689671	rs4837429	A	G	2091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=45;PP=1361;SC=ATTATTAAACAAAGTTGTTTT;SOR=2.336;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=14;TCR=45;TR=59;WE=132689679;WS=132689661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr9	132720720	rs11394970	G	GA	3644.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-1.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=18;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=20;PP=1453;ReadPosRankSum=-0.918;SC=CAAAAAAAAAGAAAAAAAAAT;SOR=0.427;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=88;TCF=60;TCR=28;TR=68;WE=132720728;WS=132720710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,132:0.99:134
chr9	132816398	rs5900882	T	TC	5280.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=11;NR=61;PP=2874;SC=CCGAGGCCACTCCCCGGGTTT;SOR=0.848;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=76;TCF=11;TCR=65;TR=72;WE=132816406;WS=132816388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr9	132839747	rs41301535	T	C	1521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.508;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=35;PP=760;ReadPosRankSum=0.054;SC=GTGTCTGCCATGTGCCAGAGA;SOR=0.898;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=103;TCF=52;TCR=51;TR=66;WE=132839755;WS=132839737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,73:0.61:119
chr9	132841808	rs6478942	G	C	214.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=7;NR=0;PP=162;SC=TGTAGAACATGATAAGGACTG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=132841816;WS=132841798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr9	132845723	rs7855078	T	A	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=3.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=235;ReadPosRankSum=0.191;SC=GTCCCCAAGATTATTTTGTTT;SOR=0.765;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=13;WE=132845731;WS=132845713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr9	132845986	rs10819597	T	C	3340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=76;PP=1920;SC=CATACATGCATGCACAGACAC;SOR=1.826;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=38;TCR=76;TR=114;WE=132845994;WS=132845976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr9	132848653	rs11399718	C	CT	3123.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=18;PP=2193;SC=AATTAGCATGCTTCTATGCCG;SOR=1.583;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=54;TCF=34;TCR=20;TR=50;WE=132848661;WS=132848643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr9	132862830	rs10081664	AA	TC	2438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=15;PP=1876;SC=TAATTTCCCAAATGGGTCCAA;SOR=1.791;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=50;TCF=35;TCR=15;TR=49;WE=132862839;WS=132862820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr9	132863035	rs2277196	G	C	1350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=17;NR=25;PP=724;SC=CAAGACAAGGGGGGTGGGCAA;SOR=1.565;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=17;TCR=25;TR=42;WE=132863043;WS=132863025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr9	132866749	rs147261140	G	A	2181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.645;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=48;PP=1205;ReadPosRankSum=-1.157;SC=AGGAGGGCACGACTGAATATG;SOR=0.936;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=204;TCF=105;TCR=99;TR=92;WE=132866757;WS=132866739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,108:0.46:234
chr9	132866883	rs7868997	T	C	1054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=29;PP=858;SC=TCAAGCCCAATAGCTGAACTG;SOR=3.611;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=33;WE=132866891;WS=132866873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr9	132866906	rs887536	C	T	746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=22;PP=606;SC=CATTCCCAAACTGATCTCAGT;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=24;WE=132866914;WS=132866896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr9	132872686	rs4837460	A	G	7614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=139;NR=114;PP=2965;SC=GAGCGAATCTAAGAGCAGGAA;SOR=0.880;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=253;TCF=139;TCR=114;TR=253;WE=132872694;WS=132872676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,278:1.00:278
chr9	132891113	rs2286794	G	A	1431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.39;SOR=2.517;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr9	132891113	.	GGT	AGC	587	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=6;NR=21;PP=587;QD=23.7210324023;SC=GTGTGAATCGGGTCGGCTGCT;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=27;WE=132891123;WS=132891103;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,27:0.93:29
chr9	132891115	rs7853219	T	C	1431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.19;SOR=2.376;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr9	132962801	rs7037407	A	T	1891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=11;PP=1257;SC=AGCTCCCCCCACCCCCCCACA;SOR=2.566;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=59;TCF=47;TCR=12;TR=58;WE=132962809;WS=132962791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr9	132962816	rs7022964	T	C	2405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=21;PP=1497;SC=CCCACATAGGTGGGGCAGCCG;SOR=1.927;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=58;TCR=21;TR=79;WE=132962824;WS=132962806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr9	132963115	rs887534	T	G	1702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=11;PP=729;SC=GAGCAGGCCGTTGCCCGGGGA;SOR=1.329;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=23;TCR=11;TR=34;WE=132963137;WS=132963105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr9	132963129	rs887535	G	A	1946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=16;PP=904;SC=CCGGGGACATGGCCGTGGGGA;SOR=1.270;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=30;TCR=16;TR=46;WE=132963137;WS=132963105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr9	132963350	rs4837482	T	C	1575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=43;PP=1233;SC=GTCCAGCTGCTCAGGATGGGG;SOR=2.522;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=13;TCR=43;TR=56;WE=132963358;WS=132963340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr9	132980035	rs2277198	G	A	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.481;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=66;ReadPosRankSum=-0.330;SC=CCTGGGCCCCGGGCAGGCGAT;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=5;WE=132980043;WS=132980025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr9	132988709	rs2277200	T	G	1124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.702;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=21;PP=733;ReadPosRankSum=-0.226;SC=TCCAGGAGGGTTCCAAGGCAG;SOR=0.593;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=105;TCF=65;TCR=40;TR=51;WE=132988717;WS=132988699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,53:0.46:114
chr9	133028196	rs12336285	G	A	1311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.221;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=5;PP=1842;ReadPosRankSum=-0.397;SC=TGCTGACCGCGGTCTCTGCGG;SOR=1.662;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=71;TCF=57;TCR=14;TR=32;WE=133028217;WS=133028186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,34:0.45:76
chr9	133028204	rs72240442	CGGCAGT	C	1340.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.034;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=1860;ReadPosRankSum=0.324;SC=GCGGTCTCTGCGGCAGTGGCA;SOR=1.942;SbPval=0.05;Source=Platypus;TC=55;TCF=25;TCR=30;TR=18;WE=133028217;WS=133028186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,37:0.43:87
chr9	133028476	rs71387337	A	AC	621.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.210;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=19;PP=671;ReadPosRankSum=-0.397;SC=CACCTGCCTGACCCCCTCAGT;SOR=3.434;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=20;WE=133028484;WS=133028466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,24:0.71:34
chr9	133048501	rs6478957	G	A	3092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=65;NR=42;PP=1649;SC=TGTGGCGACCGCACCCATCCT;SOR=1.085;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=107;TCF=65;TCR=42;TR=107;WE=133048509;WS=133048491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr9	133057105	rs34014907	C	T	1271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=26;PP=753;ReadPosRankSum=-0.074;SC=GGGCACCTGCCGGCATCAGCT;SOR=0.758;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=112;TCF=61;TCR=51;TR=57;WE=133057113;WS=133057095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,62:0.50:124
chr9	133057987	rs10988681	A	G	2227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.999;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=41;PP=1430;ReadPosRankSum=-0.282;SC=GTGCTTCTCAACATCCCTGAC;SOR=0.899;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=195;TCF=109;TCR=86;TR=95;WE=133057995;WS=133057977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,106:0.48:220
chr9	133058082	rs10739777	G	A	6641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=109;NR=109;PP=2965;SC=GAGAAAGGTCGACTAGCTTTA;SOR=0.805;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=218;TCF=109;TCR=109;TR=218;WE=133058090;WS=133058072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr9	133058181	rs12348163	G	A	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.338;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=280;ReadPosRankSum=-3.017;SC=TGATGTGGTCGTATCAATAGA;SOR=0.105;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=40;TCF=10;TCR=30;TR=22;WE=133058189;WS=133058171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,24:0.57:42
chr9	133058197	rs7045548	C	A	944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=26;PP=735;SC=ATAGAAGTAACGGGTCAAGGA;SOR=3.912;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=29;WE=133058205;WS=133058187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	133058892	rs34511011	G	A	812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=12;PP=508;ReadPosRankSum=-0.689;SC=GTCACCTCCTGCCCTAAGCTG;SOR=0.664;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=75;TCF=49;TCR=26;TR=37;WE=133058900;WS=133058882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,39:0.51:76
chr9	133067405	rs77228862	G	A	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.312;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=288;ReadPosRankSum=-0.025;SC=AGCCTTTTCAGTGTTTTTTGA;SOR=1.781;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=15;WE=133067413;WS=133067395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr9	133072102	rs116988271	G	T	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=2.702;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=220;ReadPosRankSum=2.249;SC=TTGTGCAGCCGCAGGAGCCAA;SOR=2.030;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=11;WE=133072110;WS=133072092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr9	133072162	rs117309685	G	A	861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.743;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=12;PP=518;ReadPosRankSum=-0.216;SC=CAGGGACACCGGCCTGATGCT;SOR=0.307;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=55;TCF=37;TCR=18;TR=34;WE=133072170;WS=133072152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,38:0.59:64
chr9	133072426	rs12353455	C	G	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.696;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=307;ReadPosRankSum=0.256;SC=GGGAAGCTCTCTCACACAAGT;SOR=0.139;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=35;TCF=12;TCR=23;TR=24;WE=133072434;WS=133072416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,26:0.67:39
chr9	133233377	.	T	C	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.956;ClippingRankSum=0.000;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=327;ReadPosRankSum=-0.328;SC=AACCTACAGGTATGTGCAGGG;SOR=0.551;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=46;TCF=10;TCR=36;TR=20;WE=133233385;WS=133233367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,23:0.43:53
chr9	133260316	rs7858563	T	G	2033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=47;PP=1406;SC=CCCGCACAGATCAGCTCTGAG;SOR=2.105;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=18;TCR=47;TR=65;WE=133260324;WS=133260306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr9	133260353	rs11244109	G	A	858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=24;PP=673;SC=ACGGGCCCCAGGAGCCTGGCT;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=26;WE=133260361;WS=133260343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr9	133263923	rs7849839	T	C	5084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=96;PP=2757;SC=ACAGGATGCCTGTGGGTGAGC;SOR=1.060;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=175;TCF=79;TCR=96;TR=174;WE=133263931;WS=133263913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr9	133264059	rs35750041	GC	G	635.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=19;PP=304;ReadPosRankSum=-0.416;SC=GTGCCGTGTTGCCCCCCCCCC;SOR=1.044;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=20;WE=133264068;WS=133264049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,26:0.96:27
chr9	133266442	rs45488294	C	T	1358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.927;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.199;NF=33;NR=33;PP=950;ReadPosRankSum=1.034;SC=CAGGCGGGCACCTACACGTGC;SOR=0.538;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=158;TCF=86;TCR=72;TR=66;WE=133266450;WS=133266432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,71:0.42:171
chr9	133270337	rs883982	A	T	573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=353;ReadPosRankSum=-1.518;SC=GGGTCCCTCGATGCATGAGAA;SOR=1.101;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=22;WE=133270345;WS=133270327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,23:0.74:31
chr9	133270740	rs6597641	T	C	2968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=48;PP=1546;SC=TGCAGGTGGGTGCCAGGCAGG;SOR=0.711;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=102;TCF=53;TCR=49;TR=101;WE=133270748;WS=133270730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr9	133274806	rs11244165	G	A	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=10;PP=339;ReadPosRankSum=-0.686;SC=GATACAGGAAGGGGAAATGGG;SOR=0.798;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=35;TCR=20;TR=27;WE=133274814;WS=133274796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,35:0.51:68
chr9	133280580	rs1475732	C	G	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.960;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=190;ReadPosRankSum=-1.698;SC=CGGGTACAGACAGCCAGAACT;SOR=1.562;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=11;WE=133280588;WS=133280570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,11:0.34:32
chr9	133281691	rs11244201	C	T	676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.92;ReadPosRankSum=1.471;SOR=0.540;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,32:0.52:62
chr9	133283255	rs10736862	A	G	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.648;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=136;ReadPosRankSum=-0.478;SC=CTGAAGTCCAAGTTCTACTTC;SOR=0.223;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=8;WE=133283263;WS=133283245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr9	133284310	rs10793975	G	A	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.297;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=308;ReadPosRankSum=0.367;SC=CTGACCATCCGCAGGACTGAG;SOR=0.446;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=42;TCF=11;TCR=31;TR=23;WE=133284318;WS=133284300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,24:0.52:46
chr9	133294244	rs13294886	G	A	2278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.281;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=47;PP=1238;ReadPosRankSum=0.354;SC=CCACTGGAGAGCCCACACCCA;SOR=0.686;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=204;TCF=105;TCR=99;TR=99;WE=133294252;WS=133294234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,112:0.51:221
chr9	133307004	rs11244312	G	A	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.04;ReadPosRankSum=-1.419;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,22:0.50:44
chr9	133308780	rs1006615	C	T	727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.715;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=7;PP=386;ReadPosRankSum=3.051;SC=CGGGCGGCCCCTCTACGCTGC;SOR=0.319;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=60;TCF=46;TCR=14;TR=28;WE=133308788;WS=133308770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,34:0.51:67
chr9	133324502	rs10123082	A	G	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=58;ReadPosRankSum=-0.674;SC=CAGATCGCTTAAGTCCAGGAG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=133324510;WS=133324492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr9	133325472	rs4740158	T	C	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=165;ReadPosRankSum=0.344;SC=GGCTTCCACATATTTCCTGAA;SOR=0.330;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=10;WE=133325480;WS=133325462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,12:0.80:15
chr9	133327439	rs1760275	T	C	898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=6;NR=24;PP=664;SC=AGGTCAGGGTTCCCGGGGGTG;SOR=2.376;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=30;WE=133327447;WS=133327429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr9	133327835	rs1615006	G	A	1271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=43;PP=902;ReadPosRankSum=-0.344;SC=ACTCATTCAAGCCTGGCCTCT;SOR=0.763;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=103;TCF=28;TCR=75;TR=58;WE=133327843;WS=133327825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,58:0.55:106
chr9	133346920	rs652313	A	G	5841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=92;NR=112;PP=2965;SC=CCCAAACCCCATCTCCTCCCA;SOR=0.956;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=206;TCF=93;TCR=113;TR=204;WE=133346928;WS=133346910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr9	133346983	rs641510	A	G	3401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=73;PP=2232;SC=TGATGTATTTATAGCCTAATT;SOR=1.426;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=43;TCR=73;TR=116;WE=133346991;WS=133346973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr9	133347080	rs486889	G	A	316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=10;PP=258;SC=TCTGCCCACCGTCTCCTCGCT;SOR=3.442;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=11;WE=133347088;WS=133347070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
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chr9	133376153	rs2282219	A	G	573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=5.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.214;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=371;ReadPosRankSum=0.902;SC=ATGACAAACAATGTTTTCCCC;SOR=2.750;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=37;TCR=3;TR=17;WE=133376161;WS=133376143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,21:0.46:46
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chr9	133710722	rs11433465	G	GC	681.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=1;PP=473;SC=GGTGAGGGCGGCTGGCGGGGC;SOR=2.985;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=133710730;WS=133710712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	133710740	rs11433464	G	GC	1132.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.76;SOR=2.621;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
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chr9	133779730	rs12552821	G	A	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=199;ReadPosRankSum=0.196;SC=GGTGCACACAGGTGTGGGCAC;SOR=0.760;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=44;TCF=12;TCR=32;TR=17;WE=133779738;WS=133779720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,20:0.43:46
chr9	133779756	rs11244186	A	G	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=82;ReadPosRankSum=0.713;SC=GCACGGGTACACCCACTGGTG;SOR=1.781;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=7;WE=133779764;WS=133779746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
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chr9	133911598	rs2275132	A	G	2135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.930;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=44;PP=1202;ReadPosRankSum=0.935;SC=CCGACGTGGCAGGCCAGTTGG;SOR=0.628;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=254;TCF=145;TCR=109;TR=105;WE=133911606;WS=133911588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,115:0.41:278
chr9	133911821	rs2275130	C	T	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=19;PP=388;ReadPosRankSum=0.805;SC=CTCCTGGGTACGCCCCGGGGG;SOR=1.609;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=20;WE=133911829;WS=133911811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr9	133924451	rs869457	C	T	1141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.758;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=16;PP=768;ReadPosRankSum=1.159;SC=CTCTGAGCACCCCCCACAATG;SOR=0.841;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=92;TCF=61;TCR=31;TR=49;WE=133924459;WS=133924441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,53:0.51:104
chr9	133927878	rs10901333	A	G	1821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.232;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=36;PP=1023;ReadPosRankSum=-1.562;SC=TTGTCTTCAGAGAAGTTCCTG;SOR=0.566;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=145;TCF=81;TCR=64;TR=78;WE=133927886;WS=133927868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,89:0.55:163
chr9	133928345	rs12349966	C	T	1934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.572;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=31;PP=969;ReadPosRankSum=-0.410;SC=CCGGCCCCAGCCCTGCCGGTC;SOR=0.664;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=139;TCF=78;TCR=61;TR=74;WE=133928353;WS=133928335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,93:0.56:167
chr9	133936334	rs11244268	G	A	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=211;ReadPosRankSum=-1.551;SC=ACTTCTGCCCGGGATGTGCTC;SOR=0.631;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=15;WE=133936342;WS=133936324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,19:0.68:28
chr9	133936381	rs3824398	G	A	2443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=19;PP=1345;SC=CCATCTCTGGGCATTCTGGGT;SOR=1.749;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=53;TCR=19;TR=72;WE=133936389;WS=133936371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
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chr9	133942624	rs3765569	A	G	968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=24;PP=699;SC=CCAGGGTGGCACATGGTGGGC;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=30;WE=133942632;WS=133942614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr9	133944169	rs45588631	C	T	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=53;ReadPosRankSum=0.200;SC=TGCCATGCACCGAGAGGAGAT;SOR=0.160;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=5;WE=133944177;WS=133944159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr9	133944522	rs2275142	C	T	178.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.81;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
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chr9	133946849	rs34910694	C	CT	1319.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.658;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=10;PP=730;ReadPosRankSum=-0.848;SC=CCTCATACACCTTTTCTTCCT;SOR=0.802;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=78;TCF=36;TCR=42;TR=24;WE=133946857;WS=133946839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,56:0.39:142
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chr9	133981491	rs2872823	G	T	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=56;ReadPosRankSum=-1.417;SC=GAGTGTCTACGATATGCTGGG;SOR=0.765;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=6;WE=133981499;WS=133981481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
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chr9	133981721	rs2315076	T	C	1432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.662;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=31;PP=670;ReadPosRankSum=-1.031;SC=GTCTGCTATGTGGAACCTACA;SOR=0.656;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=117;TCF=63;TCR=54;TR=64;WE=133981729;WS=133981711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,71:0.56:127
chr9	133986836	rs353528	C	T	366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=374;SC=CTCCAAGGGGCGACAGGAAGC;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=133986856;WS=133986826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
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chr9	133986980	rs353526	T	G	4870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=69;PP=2947;SC=TCTCACCTCTTTAGGAGTTTC;SOR=0.890;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=163;TCF=94;TCR=69;TR=163;WE=133986988;WS=133986970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr9	133987060	rs353525	G	A	3328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=67;PP=2140;SC=GGTAAGCTGGGGCGGGCTGCC;SOR=1.236;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=44;TCR=67;TR=111;WE=133987068;WS=133987050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr9	133996460	rs353511	T	G	2142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=25;PP=1367;SC=CCTGGGGTTTTGGGGGAAAGG;SOR=1.300;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=48;TCR=25;TR=73;WE=133996468;WS=133996450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr9	133996503	rs353510	T	A	3185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=68;NR=38;PP=1925;SC=TTTAGGGAGGTTACTGAGGGG;SOR=1.188;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=107;TCF=69;TCR=38;TR=106;WE=133996511;WS=133996493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr9	134014592	rs62580392	C	A	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.5;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=210;ReadPosRankSum=-0.253;SC=TAGGAGGAACCAATGCAAAGC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=7;WE=134014600;WS=134014582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr9	134020092	rs103612	C	T	2738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.440;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=68;PP=1746;ReadPosRankSum=-1.478;SC=AGCAATGAAGCCCTCCTTCCC;SOR=0.801;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=258;TCF=128;TCR=130;TR=130;WE=134020100;WS=134020082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,135:0.49:275
chr9	134020268	rs41296111	C	G	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.701;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=132;ReadPosRankSum=1.357;SC=GTGATACTTGCAAATGGCAAA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=7;WE=134020276;WS=134020258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr9	134021630	rs2296710	A	G	2053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.459;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=49;PP=1276;ReadPosRankSum=0.640;SC=GCCACCCCACACCTCTCTCAG;SOR=0.801;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=239;TCF=122;TCR=117;TR=93;WE=134021638;WS=134021620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,106:0.40:263
chr9	134025595	rs11244305	A	G	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.188;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=283;ReadPosRankSum=1.126;SC=ATTCGTTACAATGAGTGAAGA;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=13;WE=134025603;WS=134025585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr9	134064345	rs2274427	T	C	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.187;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=177;ReadPosRankSum=-0.079;SC=TTGCTTATTTTAAATTATATT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=10;WE=134064353;WS=134064335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,10:0.29:35
chr9	134067795	rs4602942	G	A	1051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=27;PP=734;SC=AGTTCTTACCGTGGCAGTAAT;SOR=3.737;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=31;WE=134067803;WS=134067785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr9	134103759	rs11244329	G	A	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.566;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=304;ReadPosRankSum=1.237;SC=CCACACGCCAGCCAAAAAGCA;SOR=1.643;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=48;TCF=8;TCR=40;TR=19;WE=134103767;WS=134103749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,22:0.43:51
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chr9	134136677	rs352951	A	G	5501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=103;PP=2965;SC=AGTTCACCCCATCCGAGTCGC;SOR=1.085;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=182;TCF=79;TCR=103;TR=182;WE=134136685;WS=134136667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
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chr9	134183503	rs2986606	T	C	5913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=108;NR=91;PP=2965;SC=TGCCCCTGCGTGTGCTGCTGG;SOR=0.874;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=199;TCF=108;TCR=91;TR=199;WE=134183511;WS=134183493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr9	134322324	rs2966340	G	A	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=225;ReadPosRankSum=0.104;SC=ATGAAATGGGGGAGATGGTGG;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=12;WE=134322332;WS=134322314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr9	134323240	rs2994064	A	C	751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=20;PP=572;SC=CAAAGTCCATATGTACTTACC;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=134323248;WS=134323230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr9	134330349	rs112882060	T	G	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.816;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.447;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=47;ReadPosRankSum=-2.557;SC=GTCCTCATGATCCGCCCACCT;SOR=0.223;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=6;WE=134330357;WS=134330339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr9	134342939	rs17458249	A	G	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.410;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=273;ReadPosRankSum=-0.874;SC=CTCTGCTGGTATATTCTCTAG;SOR=0.165;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=17;WE=134342947;WS=134342929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr9	134346315	rs4310250	T	C	9241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=344;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=173;NR=143;PP=2965;SC=TGGACCCACGTATCACGCCCA;SOR=0.803;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=316;TCF=173;TCR=143;TR=316;WE=134346323;WS=134346305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,344:1.00:344
chr9	134346424	rs77664147	G	C	1837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.053;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=48;PP=1231;ReadPosRankSum=0.177;SC=TAGCGTGGTGGTCAAGGGTGT;SOR=0.337;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=120;TCF=40;TCR=80;TR=76;WE=134346432;WS=134346414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,79:0.64:123
chr9	134348807	rs4276727	G	A	934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=5;PP=668;SC=CAGGGTAACTGTTAACTTCTT;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=31;WE=134348826;WS=134348797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr9	134348818	rs5900941	TG	T	1254.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=5;PP=1139;SC=TTAACTTCTTTGGGCCTTTGG;SOR=2.891;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=29;WE=134348826;WS=134348797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr9	134350323	rs10736851	C	G	2972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.007;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=69;PP=2060;ReadPosRankSum=-1.012;SC=ACGGGCAGGACCCGGAGGTCG;SOR=0.619;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=218;TCF=95;TCR=123;TR=120;WE=134350331;WS=134350313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,130:0.54:239
chr9	134350458	rs10751478	C	T	2689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.769;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=59;PP=1748;ReadPosRankSum=-0.792;SC=GAGCAGAGCCCCACGGCAGAA;SOR=0.597;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=239;TCF=119;TCR=120;TR=121;WE=134350466;WS=134350448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,126:0.50:251
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chr9	134351065	rs7858488	G	T	8553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=146;NR=129;PP=2965;SC=CCAACAAGGGGTGCTCTGAGG;SOR=0.731;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=275;TCF=146;TCR=129;TR=275;WE=134351073;WS=134351055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,318:1.00:318
chr9	134351343	rs11243403	C	T	15770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=585;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=261;NR=278;PP=2965;SC=GACAGCCGCGCGGAGGACAAG;SOR=0.760;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=539;TCF=261;TCR=278;TR=539;WE=134351351;WS=134351333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,585:1.00:585
chr9	134351770	rs78591540	G	A	1618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.179;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=27;PP=850;ReadPosRankSum=-0.376;SC=AGCTGGCCAAGAGGAGCTTCT;SOR=0.814;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=153;TCF=90;TCR=63;TR=71;WE=134351778;WS=134351760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,81:0.46:176
chr9	134357039	rs45536539	G	A	1976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.636;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=26;PP=1107;ReadPosRankSum=-1.436;SC=GCCTGTGCTTGTTCTTTAAGA;SOR=0.819;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=212;TCF=142;TCR=70;TR=89;WE=134357047;WS=134357029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,103:0.43:237
chr9	134357164	rs199736233	C	T	2575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.615;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=70;PP=1641;ReadPosRankSum=-1.183;SC=GCTGTCACTGCCTTCAGCAGC;SOR=0.817;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=221;TCF=87;TCR=134;TR=112;WE=134357185;WS=134357154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,121:0.51:236
chr9	134357289	rs12349131	G	A	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.680;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=108;ReadPosRankSum=-0.273;SC=GCCCACCCAAGCCCCTGCCAC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=7;WE=134357297;WS=134357279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr9	134358657	rs10901061	G	C	1291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=13;PP=699;SC=TTTTGAGTCGGGGAAACTGCA;SOR=1.426;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=30;TCR=13;TR=43;WE=134358665;WS=134358647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr9	134358719	rs41317004	G	A	1079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=22;PP=637;ReadPosRankSum=0.820;SC=ATCTCAGTGGGCTGTGTGGCC;SOR=0.661;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=101;TCF=59;TCR=42;TR=53;WE=134358727;WS=134358709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,55:0.50:111
chr9	134359918	rs10751480	G	C	1542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=14;PP=1018;SC=ACACGGAGCTGTAGGTGCTTT;SOR=1.697;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=37;TCR=14;TR=51;WE=134359926;WS=134359908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr9	134360015	rs10793874	G	T	4555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=61;PP=2352;SC=GGATGGGTTTGGGCAAAGCCA;SOR=0.818;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=83;TCR=61;TR=144;WE=134360023;WS=134360005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr9	134361318	rs3808829	C	A	1745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=35;NR=22;PP=1064;SC=CGTGTGCTTCCGGCACACAGG;SOR=1.366;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=35;TCR=22;TR=57;WE=134361326;WS=134361308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr9	134361581	rs10793875	T	A	5605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=72;NR=112;PP=2965;SC=TGACAGCAGCTAGCCAGGTGG;SOR=1.184;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=184;TCF=72;TCR=112;TR=184;WE=134361589;WS=134361571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr9	134361627	rs10901062	G	A	2534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=61;PP=1745;SC=CCAGTGCAGGGCGGAATTGGC;SOR=2.007;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=23;TCR=61;TR=84;WE=134361635;WS=134361617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr9	134367520	.	C	A	2689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=0.000;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.295;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=32;PP=1642;ReadPosRankSum=0.862;SC=TCTCCAGGGCCTCAAATGACA;SOR=1.026;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=184;TCF=121;TCR=63;TR=107;WE=134367528;WS=134367510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,121:0.60:202
chr9	134381487	rs148086540	G	GT	844.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=0.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQRankSum=1.248;QD=7.82;ReadPosRankSum=1.843;SOR=0.805;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,43:0.40:108
chr9	134382673	rs6597501	C	T	1766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=21;PP=1137;SC=AACATGACGGCGCTATGTGAA;SOR=1.410;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=43;TCR=21;TR=63;WE=134382681;WS=134382663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr9	134384277	rs11243404	T	C	3677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=38;PP=2151;SC=AAAATTGACATGTGTTTCCTC;SOR=1.505;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=120;TCF=82;TCR=38;TR=120;WE=134384285;WS=134384267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr9	134384500	rs11999204	C	T	6426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=101;PP=2965;SC=TTTTTTGTTTCGTTTTGTGAG;SOR=1.780;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=146;TCF=45;TCR=101;TR=146;WE=134384521;WS=134384490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr9	134384513	rs28447664	A	G	5436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=78;PP=2295;SC=TTTGTGAGACAGTACCTTTTC;SOR=1.971;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=30;TCR=78;TR=108;WE=134384521;WS=134384490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr9	134385435	rs3887873	C	T	1571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.08;ReadPosRankSum=1.400;SOR=0.710;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,75:0.48:156
chr9	134385435	.	CA	TG	962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=30;NR=37;PP=962;QD=15.1562369382;SC=GGGGCAGATGCAGATGTCACA;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=139;TCF=65;TCR=74;TR=67;WE=134385444;WS=134385425;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:72,67:0.48:139
chr9	134385436	rs2296949	A	G	5520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.16;SOR=0.962;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr9	134385552	rs5900942	GT	G	2079.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.612;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.420;NF=22;NR=26;PP=1607;ReadPosRankSum=0.309;SC=GGAGGCCAGAGTTTCTGTCAC;SOR=0.913;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=112;TCF=42;TCR=70;TR=48;WE=134385560;WS=134385542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,76:0.41:185
chr9	134385599	rs2018621	A	G	6661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=124;NR=92;PP=2965;SC=AGAGGTGGGTACGCTTTTCCA;SOR=0.919;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=216;TCF=124;TCR=92;TR=216;WE=134385607;WS=134385589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr9	134386675	rs4740163	T	G	2016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=44;NR=19;PP=1166;SC=TGGCTTAGGGTCATTTTTCTT;SOR=1.483;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=44;TCR=19;TR=63;WE=134386683;WS=134386665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr9	134386744	rs10901065	T	C	3664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=52;PP=2312;SC=CTCGGATCACTCAGGGTCAGC;SOR=0.908;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=121;TCF=69;TCR=52;TR=121;WE=134386752;WS=134386734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr9	134386903	rs10901066	G	A	2495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=47;PP=1451;SC=TTATTTGCTCGTAGATTTGCT;SOR=1.216;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=36;TCR=47;TR=83;WE=134386911;WS=134386893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr9	134387315	rs10901068	C	G	1680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=6;PP=1230;SC=CCAGGCTGGTCTCAAACTCCT;SOR=3.486;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=45;TCF=39;TCR=6;TR=44;WE=134387334;WS=134387305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr9	134387326	rs116150532	G	A	635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=408;ReadPosRankSum=0.609;SC=TCAAACTCCTGGGCTCAAGCA;SOR=0.661;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=60;TCF=45;TCR=15;TR=26;WE=134387334;WS=134387305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,30:0.43:69
chr9	134387488	rs3739494	T	C	4953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=72;NR=88;PP=2383;SC=CCTTCAAAGATGTCAATAACT;SOR=0.999;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=160;TCF=72;TCR=88;TR=160;WE=134387496;WS=134387478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr9	134387539	rs59515295	G	A	1234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.178;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=31;PP=679;ReadPosRankSum=-0.011;SC=TGCAGGTCCTGTGACTCCAGA;SOR=1.075;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=69;TCF=24;TCR=45;TR=46;WE=134387547;WS=134387529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,54:0.68:80
chr9	134388562	rs77176471	C	T	842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=15;PP=582;ReadPosRankSum=-0.040;SC=TGTGCCCCTCCGGTGCAGCTG;SOR=0.693;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=73;TCF=46;TCR=27;TR=38;WE=134388570;WS=134388552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,39:0.50:78
chr9	134394163	rs1547768	A	G	6615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=110;NR=109;PP=2965;SC=CTTCCAACCCAAGTGGACACG;SOR=0.726;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=219;TCF=110;TCR=109;TR=219;WE=134394171;WS=134394153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr9	134394646	rs2010635	A	G	2719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=18;PP=1756;SC=GCTAAGTGGAATGATGCGGTT;SOR=2.179;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=84;TCF=66;TCR=18;TR=83;WE=134394654;WS=134394636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr9	134395628	rs2277152	C	G	4612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=85;PP=2670;SC=CATCCTGTTTCTTGAGAATTC;SOR=1.088;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=152;TCF=67;TCR=85;TR=152;WE=134395636;WS=134395618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr9	134395687	rs2277153	C	A	1642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=37;PP=1089;SC=GGGTTTCTCCCAAGCTTTTCC;SOR=2.107;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=15;TCR=37;TR=52;WE=134395695;WS=134395677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr9	134397624	rs4740165	C	T	3411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=73;PP=2122;SC=ACGGGGGCTGCGGAGACAGTG;SOR=1.730;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=110;TCF=36;TCR=74;TR=109;WE=134397632;WS=134397614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr9	134398534	rs3739495	T	C	2218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=36;PP=1066;SC=GGGGTCGGGATGAGGTTGAAG;SOR=0.922;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=36;TCR=36;TR=72;WE=134398542;WS=134398524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
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chr9	134404199	rs4740260	A	G	950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=4;PP=664;SC=GTATGTGGCCATAATGAGCCA;SOR=2.964;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=33;WE=134404207;WS=134404189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
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chr9	134463289	rs68140797	GACAA	G	2339.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.692;NF=4;NR=33;PP=1621;ReadPosRankSum=1.780;SC=CTCATTCAGGGACAAACAGTG;SOR=0.746;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=86;TCF=10;TCR=76;TR=37;WE=134463312;WS=134463279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,64:0.42:154
chr9	134464431	rs3824397	G	C	1240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.727;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=36;PP=855;ReadPosRankSum=-1.233;SC=GGCAGAGTCTGTCTTTGCCTT;SOR=0.980;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=95;TCF=32;TCR=63;TR=51;WE=134464439;WS=134464421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,54:0.53:102
chr9	134465398	rs3818581	T	C	1157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.364;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=29;PP=791;ReadPosRankSum=0.094;SC=AGCCATGTGGTCGGCTGAGGG;SOR=0.857;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=127;TCF=65;TCR=62;TR=56;WE=134465406;WS=134465388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,58:0.42:138
chr9	134467456	rs2296951	A	G	385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.792;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=232;ReadPosRankSum=-0.062;SC=CCCATGGTGCAGGGGCCCTGG;SOR=1.329;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=45;TCF=34;TCR=11;TR=20;WE=134467464;WS=134467446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,22:0.46:48
chr9	134467578	rs3215862	GA	G	2396.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.362;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.411;NF=11;NR=49;PP=1560;ReadPosRankSum=0.372;SC=AATCTAGAGGGAAAAAACAAT;SOR=0.551;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=127;TCF=29;TCR=98;TR=60;WE=134467586;WS=134467568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,104:0.50:206
chr9	134473475	rs78835532	C	T	1033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=11;PP=766;ReadPosRankSum=0.173;SC=AAGACTTGGTCTCTAAGCCTC;SOR=0.672;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=62;TCR=20;TR=45;WE=134473483;WS=134473465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,46:0.52:89
chr9	134477387	rs3842210	AG	A	1031.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.050;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=10;PP=761;ReadPosRankSum=-1.774;SC=CTGCTCAGGCAGGCCTCATGA;SOR=0.512;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=44;TCF=29;TCR=15;TR=23;WE=134477395;WS=134477377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,34:0.52:66
chr9	134479267	rs111703184	CG	C	531.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.066;HP=6;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.953;NF=12;NR=3;PP=424;ReadPosRankSum=0.467;SC=GAAGCAGGTGCGGGGGAAGCG;SOR=0.105;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=36;TCF=31;TCR=5;TR=15;WE=134479275;WS=134479257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr9	134479293	rs7037668	A	G	954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=6;PP=689;ReadPosRankSum=0.000;SC=GGGAGGGCAGAGCCCAAGCCC;SOR=0.725;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=72;TCF=58;TCR=14;TR=37;WE=134479301;WS=134479283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,39:0.51:77
chr9	134480221	rs7045121	T	C	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.732;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5564;FS=11.761;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=117;ReadPosRankSum=0.769;SC=AGGCAGTGTCTTTCAGGAACG;SOR=4.166;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=7;WE=134480229;WS=134480211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
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chr9	134497450	rs7023385	C	G	1666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=43;PP=1289;SC=CCCCTCCCCCCATTCTTCCCA;SOR=3.056;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=9;TCR=43;TR=52;WE=134497458;WS=134497440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr9	134505545	rs11243457	A	C	617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=3;PP=529;SC=TGCCCACCCCACCGGGCCCTA;SOR=3.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=134505553;WS=134505535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	134514011	rs41317002	T	C	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=9.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.73;ReadPosRankSum=-0.469;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,37:0.57:65
chr9	134585181	rs11243480	C	T	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.906;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=138;ReadPosRankSum=0.184;SC=TCCCAAACCACCCAGCGGCAG;SOR=1.270;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=10;WE=134585189;WS=134585171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr9	134615240	rs183326492	G	T	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.433;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=21;PP=465;ReadPosRankSum=1.705;SC=GGGCCGCCGCGGGGCGACAGG;SOR=0.430;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=17;TCR=26;TR=35;WE=134615248;WS=134615230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,35:0.78:45
chr9	135073877	rs3824574	C	T	3270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.180;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=72;PP=2212;ReadPosRankSum=0.585;SC=TCAAGGAGTTCTTCACCCTCA;SOR=0.537;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=307;TCF=166;TCR=141;TR=145;WE=135073885;WS=135073867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:179,157:0.47:336
chr9	135074103	rs3739928	G	A	1038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=29;PP=641;ReadPosRankSum=0.303;SC=GAACATGACCGGGTTCTTGGG;SOR=0.717;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=17;TCR=62;TR=37;WE=135074111;WS=135074093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,42:0.48:88
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chr9	135105964	rs4962173	A	G	3664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=45;PP=2160;SC=CACAGGTGCCACTGCAGGTTC;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=122;TCF=77;TCR=45;TR=122;WE=135105972;WS=135105954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
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chr9	135139901	rs1056899	T	C	4793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=84;PP=2965;SC=GGCTGCTGTATATGGCTCAGG;SOR=0.919;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=161;TCF=77;TCR=84;TR=160;WE=135139909;WS=135139891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr9	135144723	rs2274562	C	T	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.673;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=430;ReadPosRankSum=-0.355;SC=CACTTTACATCTGTGGGTTTA;SOR=2.133;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=33;TCF=30;TCR=3;TR=20;WE=135144731;WS=135144713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,20:0.62:32
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chr9	135150616	rs2296865	T	C	1041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.910;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=19;PP=597;ReadPosRankSum=0.525;SC=AACAAGAAAATTGGAAATATT;SOR=0.431;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=76;TCF=44;TCR=32;TR=41;WE=135150624;WS=135150606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,48:0.56:85
chr9	135150834	rs2296866	A	C	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-3.951;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=93;ReadPosRankSum=0.908;SC=AAGAAAACACAGTGTTATCAA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=7;WE=135150842;WS=135150824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr9	135152543	rs201575546	T	TA	435.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=2.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.52;ReadPosRankSum=-0.685;SOR=1.193;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,28:0.35:79
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chr9	135153668	.	CAGTTT	TAGTTC,TAGTTT	850	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=26,64;NR=29,71;PP=722,850;QD=14.0994159066;SC=AATAAAGCAACAGTTTCCAAG;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=135;TCF=64;TCR=71;TR=55,135;WE=135153681;WS=135153658;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.41:135
chr9	135153673	rs11243705	T	C	1136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=1.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.55;ReadPosRankSum=0.254;SOR=0.563;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,58:0.44:133
chr9	135158619	rs2296873	A	T	1303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.497;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=24;PP=856;ReadPosRankSum=-0.174;SC=TCATAGTAGTAGTCAAAGTTG;SOR=0.855;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=112;TCF=63;TCR=49;TR=56;WE=135158627;WS=135158609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,60:0.53:113
chr9	135161766	rs201395158	GA	G	351.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=16.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.03;ReadPosRankSum=-0.152;SOR=2.469;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,20:0.74:27
chr9	135172163	rs2296868	T	C	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=3.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=171;ReadPosRankSum=2.189;SC=AAAAAATATATACAAATCAAA;SOR=0.446;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=9;WE=135172171;WS=135172153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr9	135172412	rs2296869	A	G	1036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.111;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=24;PP=571;ReadPosRankSum=1.811;SC=CTTTCTTTTGATCTTCATTGA;SOR=0.435;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=66;TCF=25;TCR=41;TR=41;WE=135172420;WS=135172402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,47:0.63:75
chr9	135173454	rs3831154	C	CA	1402.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-1.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.765;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=16;PP=1115;ReadPosRankSum=1.450;SC=TAGTATCATACATCATCACTC;SOR=0.354;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=69;TCF=36;TCR=33;TR=29;WE=135173463;WS=135173444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,65:0.51:128
chr9	135173685	rs2296871	T	C	2790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=58;PP=1592;ReadPosRankSum=-0.220;SC=TAACACTCAGTTTTCCCATTA;SOR=0.672;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=259;TCF=124;TCR=135;TR=115;WE=135173693;WS=135173675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,135:0.45:298
chr9	135173758	rs6597570	G	T	1456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=38;PP=856;ReadPosRankSum=1.374;SC=CTGCCTAGTTGTAAAGGTCAT;SOR=0.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=125;TCF=49;TCR=76;TR=62;WE=135173766;WS=135173748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,70:0.51:138
chr9	135187128	rs2296872	G	A	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.497;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=385;ReadPosRankSum=-2.544;SC=TCCAAGTTGCGTAAGAAAAAA;SOR=1.547;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=40;TCF=28;TCR=12;TR=23;WE=135187136;WS=135187118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,26:0.55:47
chr9	135202829	rs543573	T	C	1562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.118;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=35;PP=788;ReadPosRankSum=-0.542;SC=GGTACAAATATGTCAGAATTC;SOR=0.454;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=127;TCF=55;TCR=72;TR=67;WE=135202837;WS=135202819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,76:0.55:139
chr9	135203231	rs1183768	C	T	3358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=362;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.380;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=79;PP=2305;ReadPosRankSum=-1.280;SC=CTATTCTGTCCTTTTTTGGCA;SOR=0.667;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=328;TCF=162;TCR=166;TR=156;WE=135203239;WS=135203221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:197,164:0.45:361
chr9	135203409	rs1185193	A	C	2592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.579;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=51;PP=1754;ReadPosRankSum=0.175;SC=TTCCCACAAGATCTCTCTTAT;SOR=0.671;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=221;TCF=114;TCR=107;TR=110;WE=135203417;WS=135203399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,117:0.49:239
chr9	135205006	rs882709	G	C	1153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.496;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=23;PP=778;ReadPosRankSum=0.590;SC=AGTGTTATCTGCTTTGATCAA;SOR=0.473;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=97;TCF=56;TCR=41;TR=49;WE=135205014;WS=135204996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,53:0.50:107
chr9	135206460	rs9411449	A	G	1015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.094;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=17;PP=565;ReadPosRankSum=0.438;SC=TTTCAGGATTATAATTGTATA;SOR=0.397;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=71;TCF=44;TCR=27;TR=40;WE=135206468;WS=135206450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,46:0.58:79
chr9	135211609	rs111938515	AAC	A	182.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.532;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=58;ReadPosRankSum=1.955;SC=CAGCCTGGGCAACAGAGTGAG;SOR=0.105;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=3;WE=135211618;WS=135211599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr9	135221597	rs497650	G	A	1333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=9;PP=863;SC=AATTCTTATGGTACTAAAATA;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=34;TCR=9;TR=43;WE=135221605;WS=135221587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr9	135263573	rs556386	G	T	7341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=110;NR=138;PP=2965;SC=TGCCATAGTAGATACGCCGAC;SOR=1.027;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=248;TCF=110;TCR=138;TR=248;WE=135263581;WS=135263563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,274:1.00:274
chr9	135265876	rs471890	T	C	889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=8;PP=568;SC=CTAGACACGATTGTTCTTGAC;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=30;WE=135265884;WS=135265866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
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chr9	135272061	rs5900975	GT	G	72.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.54;QD=14.57;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
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chr9	135273518	rs13298007	C	T	1103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=17;PP=780;ReadPosRankSum=0.709;SC=GTGATTGTTTCTAAACTTACC;SOR=0.746;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=101;TCF=67;TCR=34;TR=51;WE=135273526;WS=135273497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,53:0.50:107
chr9	135273607	rs504525	C	G	7074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=130;NR=107;PP=2965;SC=CCGTGTACAGCAGCTTGTCTG;SOR=0.816;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=237;TCF=130;TCR=107;TR=237;WE=135273615;WS=135273597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chr9	135273759	rs5900976	G	GA	2048.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.19;NF=0;NR=41;PP=1913;SC=TGTTAATAATGACAAAAGCAA;SOR=2.958;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=0;TCR=42;TR=41;WE=135273767;WS=135273749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr9	135276710	rs553323	C	T	164.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=129;SC=CAAATCTCCACCTCAAAAATA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=135276718;WS=135276700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr9	135276784	rs66478129	T	C	917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=14;PP=569;ReadPosRankSum=-1.062;SC=TAAAGAGGTATCGGCAGAATC;SOR=0.747;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=76;TCF=50;TCR=26;TR=41;WE=135276792;WS=135276774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,45:0.52:86
chr9	135277007	rs3739916	C	T	3430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.604;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=59;PP=1910;ReadPosRankSum=-0.433;SC=ACCAGACACTCGTGCCCTTTT;SOR=0.849;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=295;TCF=154;TCR=141;TR=138;WE=135277015;WS=135276997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,161:0.48:334
chr9	135374898	rs562350	T	C	10534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=405;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=182;NR=182;PP=2965;SC=GTCAGCTCAATGACATCCGCA;SOR=0.765;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=366;TCF=183;TCR=183;TR=364;WE=135374906;WS=135374888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,404:1.00:404
chr9	135388799	rs577416	G	A	3397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=74;PP=2180;SC=CACAATCTGAGGCCCCTGTGC;SOR=2.262;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=27;TCR=74;TR=101;WE=135388807;WS=135388789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr9	135412913	rs13286286	G	A	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.923;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=119;ReadPosRankSum=-0.205;SC=GGAGGCTCCCGGGGGCGGGCG;SOR=1.426;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=7;WE=135412921;WS=135412903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr9	135470176	rs306549	C	G	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=63;ReadPosRankSum=0.566;SC=TTTTCACAAGCCTCCTCTGAC;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=4;WE=135470184;WS=135470166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr9	135470414	rs306547	T	C	1469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.577;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=31;PP=866;ReadPosRankSum=1.542;SC=ACCTTGGCGATGTCGGCCTCC;SOR=0.751;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=149;TCF=86;TCR=63;TR=72;WE=135470422;WS=135470404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,75:0.46:163
chr9	135500944	rs17149380	A	G	2247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.495;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.051;NF=56;NR=39;PP=1507;ReadPosRankSum=-0.793;SC=TTCTTAAAATAAATGTATTGC;SOR=0.733;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=202;TCF=122;TCR=80;TR=95;WE=135500952;WS=135500934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,107:0.48:221
chr9	135517304	rs3739907	C	G	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.014;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=9;PP=517;ReadPosRankSum=-0.795;SC=TAGGACTGACCACAGGACAAA;SOR=0.531;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=63;TCF=48;TCR=15;TR=36;WE=135517312;WS=135517294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,39:0.54:72
chr9	135533833	rs11243866	C	T	1589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.561;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=41;PP=1055;ReadPosRankSum=1.496;SC=GAGCATCTTACAAAGCTTCCC;SOR=0.909;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=107;TCF=42;TCR=65;TR=65;WE=135533841;WS=135533823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,71:0.61:117
chr9	135536540	rs4498679	G	A	1976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=39;PP=1152;ReadPosRankSum=-1.442;SC=CACAGGTTTCGTCCGGTTATA;SOR=0.660;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=183;TCF=101;TCR=82;TR=87;WE=135536548;WS=135536530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,98:0.48:204
chr9	135538050	rs35918594	C	T	992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.585;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=27;PP=603;ReadPosRankSum=1.237;SC=CCTCACTGGACGCTTGGTATT;SOR=0.518;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=100;TCF=36;TCR=64;TR=45;WE=135538058;WS=135538040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,49:0.42:117
chr9	135538807	rs2583805	G	C	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.262;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=148;ReadPosRankSum=-0.478;SC=GCCTGATTGCGGATTACAGGC;SOR=0.485;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=11;TCR=39;TR=17;WE=135538815;WS=135538797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,20:0.38:53
chr9	135554566	rs371169	G	A	1712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.331;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=45;PP=1205;ReadPosRankSum=-0.568;SC=CCTTTGAAGAGGCAGCTGCTC;SOR=1.086;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=168;TCF=78;TCR=90;TR=78;WE=135554574;WS=135554556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,80:0.44:181
chr9	135562800	rs456396	G	A	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.53;ReadPosRankSum=-1.085;SOR=0.598;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr9	135601354	rs396819	T	C	448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=13;PP=302;SC=TGGCCTGGCCTGGAAGCAGGG;SOR=1.863;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=18;WE=135601375;WS=135601344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
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chr9	135862632	rs633153	C	T	1722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.656;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=30;PP=958;ReadPosRankSum=0.963;SC=TCCCAGAAACCGTGGCTATTG;SOR=0.846;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=210;TCF=131;TCR=79;TR=82;WE=135862640;WS=135862622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,90:0.38:236
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chr9	135945800	rs138715663	C	T	1093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.89;MQRankSum=-1.718;QD=13.85;ReadPosRankSum=-1.408;SOR=0.718;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,40:0.51:79
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chr9	135961809	rs679779	T	C	5549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=2.684;NF=54;NR=120;PP=2965;ReadPosRankSum=0.093;SC=TCTCTAAGGCTATGACCGCCT;SOR=0.871;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=175;TCF=54;TCR=121;TR=174;WE=135961817;WS=135961777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,186:0.99:187
chr9	135974079	rs1062356	G	C	5520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=102;NR=81;PP=2965;ReadPosRankSum=0.904;SC=TCCGCTTCTTGAGGACAAAGT;SOR=0.243;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=184;TCF=103;TCR=81;TR=183;WE=135974087;WS=135974069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,205:1.00:206
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chr9	135976698	rs35108384	G	A	3816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=43;PP=2376;SC=AGCTCCTGGGGGCTTTGCACG;SOR=1.644;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=127;TCF=84;TCR=43;TR=126;WE=135976706;WS=135976688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr9	135977583	rs2519091	C	T	1784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=24;NR=35;PP=1038;SC=CCCAACCCCACAGCCCCTGCA;SOR=1.376;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=24;TCR=35;TR=59;WE=135977591;WS=135977573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr9	135978153	rs694881	G	C	2776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=57;NR=35;PP=1766;SC=CCCATTTGCTGCCCCGGCCTC;SOR=1.167;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=57;TCR=35;TR=92;WE=135978161;WS=135978143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
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chr9	135985796	rs3761824	C	T	4449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=78;NR=74;PP=2556;SC=CCAGGTGCTCCACCAGCTTCT;SOR=0.793;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=78;TCR=74;TR=152;WE=135985804;WS=135985786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
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chr9	136081191	.	T	G	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.404;ClippingRankSum=0.000;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=1.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.97;MQRankSum=-5.171;QD=12.91;ReadPosRankSum=1.054;SOR=1.151;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,20:0.35:57
chr9	136081193	.	G	GCA	753.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=0.000;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=3.849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.13;MQRankSum=-5.025;QD=12.56;ReadPosRankSum=1.093;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,21:0.35:60
chr9	136081196	rs150469509	G	A	759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=3.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.59;MQRankSum=-4.778;QD=12.06;ReadPosRankSum=1.241;SOR=1.718;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,22:0.35:63
chr9	136081261	rs137892402	AG	A	1868.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.355;NF=16;NR=26;PP=1246;ReadPosRankSum=1.449;SC=CCGGGAACCCAGGACTCTGGG;SOR=0.669;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=148;TCF=56;TCR=92;TR=42;WE=136081269;WS=136081251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,71:0.29:241
chr9	136081283	rs147134232	C	T	3616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FS=1.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.31;MQRankSum=-6.509;QD=10.76;ReadPosRankSum=-0.841;SOR=0.590;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:233,103:0.31:336
chr9	136081289	rs146582704	T	C	3676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FS=0.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.54;MQRankSum=-6.824;QD=10.48;ReadPosRankSum=-1.167;SOR=0.621;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:244,107:0.30:351
chr9	136081391	rs6597608	G	A	3456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.435;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=4.393;NF=57;NR=107;PP=2854;ReadPosRankSum=1.078;SC=AGACCCCATCGCAGCCCAGAG;SOR=1.277;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=167;TCF=59;TCR=108;TR=164;WE=136081399;WS=136081381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:5,124:0.96:129
chr9	136081416	.	G	C	411	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=35;MMLQ=19;MQ=53.8;NF=7;NR=24;PP=411;QD=14.3797165338;SC=GAGCCCCAGAGCCCATCGCAG;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=108;TCF=30;TCR=78;TR=31;WE=136081424;WS=136081406;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:77,31:0.29:108
chr9	136081466	rs6597609	C	T	708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=17;PP=733;SC=CAGCCCAGAGCGCGGAGCCCC;SOR=3.056;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=20;WE=136081477;WS=136081456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	136081469	.	G	A	206	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;FR=0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=38;MMLQ=24;MQ=50.27;NF=0;NR=6;PP=206;QD=40.1285354245;SC=CCCAGAGCGCGGAGCCCCAGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=6;WE=136081477;WS=136081456;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:20,6:0.23:26
chr9	136081598	rs28507496	C	T	1780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=22;PP=1088;ReadPosRankSum=0.808;SC=TCGGGGCACACGGGGAATGCG;SOR=0.765;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=122;TCF=84;TCR=38;TR=74;WE=136081606;WS=136081588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,80:0.60:134
chr9	136081829	rs11244037	C	T	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.123;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=18;PP=344;ReadPosRankSum=1.128;SC=CCAGGTGAGCCGACGTGGGGA;SOR=1.402;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=56;TCF=16;TCR=40;TR=22;WE=136081837;WS=136081819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,25:0.40:62
chr9	136083580	rs2073870	T	G	146.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.97;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr9	136083801	rs4310274	A	G	1888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=19;PP=1296;SC=CACCAGGTGGATCTGGGGAGG;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=46;TCR=19;TR=65;WE=136083809;WS=136083791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr9	136132908	rs8176719	T	TC	829.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.277;NF=0;NR=19;PP=675;ReadPosRankSum=0.234;SC=AGCCAAGGGGTACCACGAGGA;SOR=0.625;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=0;TCR=48;TR=19;WE=136132916;WS=136132898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,27:0.39:69
chr9	136133380	.	CGGG	C	4710.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=29;NR=33;PP=2769;SC=GAGGAGAGAACGGGGAAGCAG;SOR=1.300;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=67;TCF=30;TCR=37;TR=62;WE=136133390;WS=136133370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr9	136133506	rs512770	A	G	4721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=77;NR=81;PP=2650;SC=AGCACCTTTGACTGGGGGTAG;SOR=0.938;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=160;TCF=78;TCR=82;TR=158;WE=136133514;WS=136133496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr9	136133531	rs4962040	A	G	1665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.07;MQRankSum=0.931;NF=34;NR=40;PP=955;ReadPosRankSum=-0.288;SC=TCCTGCAAGCACAAAGCGCCG;SOR=0.726;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=130;TCF=63;TCR=67;TR=74;WE=136133539;WS=136133521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,82:0.54:151
chr9	136133582	rs8176712	AG	A	1780.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=28;PP=1120;SC=GCAGGTAAGCAGGGGGTGTGC;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=31;WE=136133590;WS=136133572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr9	136135137	.	GCTTCTGTCCACAC	G	1344.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=3;PP=2957;SC=GCTCCCACATGCTTCTGTCCA;SOR=3.477;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=22;WE=136135157;WS=136135127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr9	136135195	rs549331	G	C	2593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=98;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=27;PP=1787;SC=GACATGGGAGGCACTGAAGGG;SOR=1.584;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=61;TCR=27;TR=88;WE=136135203;WS=136135185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
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chr9	136135365	rs624601	A	G	2338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=49;PP=1598;SC=AGTGGAAGGGACACAGCGTCA;SOR=1.639;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=26;TCR=49;TR=75;WE=136135373;WS=136135355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
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chr9	136150556	rs8176638	C	T	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=2.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.872;SOR=0.566;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,33:0.49:67
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chr9	136185358	rs544622	T	C	211.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=5;PP=178;SC=CTTCCCTTTCTCCACCCAGGA;SOR=1.179;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=9;TCF=4;TCR=5;TR=9;WE=136185366;WS=136185348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	136199466	rs886089	G	A	2361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.858;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=53;PP=1349;ReadPosRankSum=-0.423;SC=CTGGGCCTCCGTGGCCTCCTC;SOR=0.634;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=185;TCF=99;TCR=86;TR=105;WE=136199474;WS=136199456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,115:0.56:204
chr9	136199503	rs886090	G	A	2165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.199;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=52;PP=1236;ReadPosRankSum=0.540;SC=TCTTTCGCCCGCAGCTCCTTT;SOR=1.064;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=172;TCF=83;TCR=89;TR=93;WE=136199511;WS=136199493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,104:0.55:190
chr9	136201470	rs563666	C	A	291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=8;PP=197;SC=GTTAAGTCCCCATCTCATGGC;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=136201478;WS=136201460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	136211248	rs9645009	A	G	545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.694;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=377;ReadPosRankSum=0.330;SC=CTTGCCTACAAGTAGCTGATG;SOR=0.302;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=22;WE=136211256;WS=136211238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,23:0.57:40
chr9	136213521	rs616836	T	C	1138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.599;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=31;PP=592;ReadPosRankSum=0.261;SC=GGGCCATGGCTGAGCCTCAAG;SOR=0.986;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=95;TCF=34;TCR=61;TR=46;WE=136213529;WS=136213511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,56:0.50:111
chr9	136214955	rs553877	A	G	1004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.893;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=10;PP=649;ReadPosRankSum=-0.300;SC=GCAGCCTCTCAGCCCCGCCTC;SOR=1.030;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=95;TCF=73;TCR=22;TR=46;WE=136214963;WS=136214945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,50:0.49:103
chr9	136218590	rs484248	CA	AG	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=88;ReadPosRankSum=-0.241;SC=ATGTAACTTGCATATCAAGTT;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=3;WE=136218599;WS=136218583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr9	136219062	rs183853102	T	A	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=172;ReadPosRankSum=-0.825;SC=CACTTCCTAGTGGCTGTCATT;SOR=0.321;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=9;WE=136219070;WS=136219052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr9	136223043	rs59358281	C	G	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.91;ReadPosRankSum=-1.213;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr9	136223366	rs523304	G	A	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.95;ReadPosRankSum=-0.367;SOR=0.813;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr9	136227260	rs12763	A	G	1346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.365;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=29;PP=812;ReadPosRankSum=0.896;SC=CACTGATGAGAGCAGGAGAGA;SOR=0.494;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=110;TCF=49;TCR=61;TR=56;WE=136227268;WS=136227250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,62:0.52:120
chr9	136232758	rs2269894	T	C	1577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.449;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=16;PP=920;ReadPosRankSum=-1.837;SC=AGCGTCATGTTGGTGCCCAAG;SOR=0.836;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=119;TCF=86;TCR=33;TR=62;WE=136232766;WS=136232748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,69:0.52:132
chr9	136234124	rs1179033	A	G	4695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=63;PP=2587;SC=ACCACCCGCAAAGCCACTCAC;SOR=0.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=148;TCF=85;TCR=63;TR=148;WE=136234132;WS=136234114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr9	136260696	rs41306714	G	C	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.845;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=288;ReadPosRankSum=0.106;SC=TTACTTAAGGGAATACACAGA;SOR=1.214;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=16;WE=136260704;WS=136260686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr9	136268038	rs3124748	C	T	2005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.459;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=41;PP=1082;ReadPosRankSum=0.105;SC=AGCTGCAGAACGCTGGGCTGC;SOR=0.569;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=174;TCF=90;TCR=84;TR=89;WE=136268046;WS=136268028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,97:0.50:195
chr9	136268084	rs3124747	A	G	3449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=70;PP=2319;SC=CAGCTCCCTCAAAAGCAGGGA;SOR=1.262;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=47;TCR=70;TR=117;WE=136268092;WS=136268074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr9	136272787	rs3214115	AT	A	130.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.21;MQRankSum=1.648;QD=2.61;ReadPosRankSum=-0.422;SOR=0.754;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,14:0.28:50
chr9	136274056	.	C	CTT	128	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MMLQ=16;MQ=63.33;NF=0;NR=7;PP=128;QD=18.7142857143;SC=CAAGTAACATCTGTGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=7;WE=136274064;WS=136274046;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr9	136274058	rs7030175	G	T	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.71;MQRankSum=3.053;QD=6.22;ReadPosRankSum=0.761;SOR=0.275;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
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chr9	136277854	rs2285488	G	A	1437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.766;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=25;PP=938;ReadPosRankSum=-0.565;SC=CGCCCTCCACGGCTAAGCATC;SOR=0.927;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=150;TCF=91;TCR=59;TR=67;WE=136277862;WS=136277844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,72:0.43:167
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chr9	136307408	rs602184	A	G	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.580;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=530;ReadPosRankSum=-0.977;SC=TGCTTGCTGAACGAAAGATTA;SOR=0.462;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=42;TCF=35;TCR=7;TR=27;WE=136307416;WS=136307398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,27:0.63:43
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chr9	136310908	rs685523	C	T	1124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.009;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=26;PP=624;ReadPosRankSum=-0.886;SC=TGGACCCCTGCGGCAGGGTCG;SOR=0.799;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=131;TCF=70;TCR=61;TR=52;WE=136310916;WS=136310898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,59:0.41:145
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chr9	136313904	rs2769073	C	T	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.093;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.881;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=45;ReadPosRankSum=-0.094;SC=GTGGGAGACCCGAGCCTTGGC;SOR=1.721;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=4;WE=136313912;WS=136313894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr9	136323248	rs3094374	T	C	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=199;ReadPosRankSum=0.000;SC=TGTGCTGTGATTCTGGACAGC;SOR=0.269;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=10;WE=136323256;WS=136323238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr9	136324239	rs1055432	C	A	1287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=25;PP=681;ReadPosRankSum=0.907;SC=AGTACTGGACCCTCCAATCAT;SOR=0.661;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=110;TCF=57;TCR=53;TR=54;WE=136324247;WS=136324229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,63:0.50:125
chr9	136325160	rs2301614	G	A	535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=14;PP=347;ReadPosRankSum=-0.828;SC=CCTTTGTGAGGGCTGTGAGCT;SOR=0.656;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=82;TCF=45;TCR=37;TR=30;WE=136325168;WS=136325150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,31:0.34:90
chr9	136328657	rs3124765	T	C	5800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=89;NR=110;PP=2965;SC=CTCTGAACATTGCGGCCGGCG;SOR=1.063;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=199;TCF=89;TCR=110;TR=199;WE=136328665;WS=136328647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr9	136333487	rs3094381	G	A	1776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.564;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=40;PP=1053;ReadPosRankSum=-0.559;SC=TGGTTCCTTCGCAGCCCAGCA;SOR=0.672;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=152;TCF=80;TCR=72;TR=79;WE=136333495;WS=136333477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,85:0.50:169
chr9	136337168	rs3094378	G	A	1390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.530;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=25;PP=780;ReadPosRankSum=-0.191;SC=CCTTCTCCCCGTGCGGAAGAA;SOR=0.999;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=168;TCF=97;TCR=71;TR=65;WE=136337176;WS=136337158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,71:0.39:180
chr9	136338187	rs3124762	A	C	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=173;ReadPosRankSum=0.659;SC=GGCCAGTCAGAGAGGGCCTAG;SOR=0.684;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=32;TCF=21;TCR=11;TR=15;WE=136338195;WS=136338177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
chr9	136340200	rs2073935	T	G	1615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=34;PP=847;ReadPosRankSum=0.687;SC=GGCACACGTGTGGGGCCCGTG;SOR=0.643;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=122;TCF=55;TCR=67;TR=65;WE=136340208;WS=136340190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,77:0.54:142
chr9	136342415	rs3124759	A	G	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=16;PP=326;ReadPosRankSum=-0.795;SC=TGGCACCCCAATCTCATCAGA;SOR=0.582;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=24;TCR=31;TR=29;WE=136342423;WS=136342405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,33:0.54:61
chr9	136343647	rs3094326	G	C	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.696;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=52;ReadPosRankSum=-0.790;SC=GTGCTAGGGAGGCCTGGGTCC;SOR=0.136;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=8;WE=136343655;WS=136343637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr9	136379890	rs17758315	A	G	4478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=85;PP=2604;SC=AGCTGTGGACATAAGTGTAGT;SOR=1.085;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=148;TCF=63;TCR=85;TR=148;WE=136379898;WS=136379880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr9	136385437	rs9802272	A	G	6111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=120;PP=2965;ReadPosRankSum=1.706;SC=AGGTGGTCACAGCACAAAGAG;SOR=1.189;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=210;TCF=88;TCR=122;TR=207;WE=136385445;WS=136385427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,229:0.99:231
chr9	136385453	rs9802273	A	G	4954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=106;PP=2965;SC=AAGAGGCCAGAGCTGGTCCCC;SOR=1.389;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=171;TCF=64;TCR=107;TR=170;WE=136385461;WS=136385443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr9	136401606	rs11507717	A	C	1382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.814;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=10;PP=967;ReadPosRankSum=1.742;SC=GTCTTGCCTGAAGCAGGCATT;SOR=0.829;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=113;TCF=91;TCR=22;TR=55;WE=136401614;WS=136401596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,59:0.47:125
chr9	136403562	rs13283227	G	T	718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=25;PP=540;ReadPosRankSum=2.061;SC=GCCCGGCCCGGGCAGGGGCAC;SOR=0.735;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=52;TCF=12;TCR=40;TR=33;WE=136403570;WS=136403552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,31:0.58:53
chr9	136404775	.	A	ACGGCTGTCCCGGCTGTCCCGGCTGTCCCGGCTGTCCCGGCTGTCC	583.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.017;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.19;ReadPosRankSum=-1.310;SOR=0.735;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
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chr9	136409580	rs9802778	T	G	4876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=66;PP=2691;SC=ACTGTCATCCTTTTGCCTCCA;SOR=1.038;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=164;TCF=97;TCR=67;TR=163;WE=136409588;WS=136409570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr9	136412041	rs11507719	C	T	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-2.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=313;ReadPosRankSum=-1.610;SC=TTTCCTGTCTCGGGAGCATTT;SOR=0.693;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=17;WE=136412049;WS=136412031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr9	136412170	rs2073874	C	T	9194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=169;NR=140;PP=2965;SC=CTCTTGCAGACGAAGCTGGCT;SOR=0.796;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=309;TCF=169;TCR=140;TR=309;WE=136412178;WS=136412160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,345:1.00:345
chr9	136412236	rs2073875	A	T	9982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=370;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=166;NR=169;PP=2965;SC=TCAACATCGCAGGCACGGTGG;SOR=0.760;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=335;TCF=166;TCR=169;TR=335;WE=136412244;WS=136412226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,370:1.00:370
chr9	136412255	rs2073876	A	C	8607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=135;NR=161;PP=2965;SC=GGTCAAGTACAGGCGGCCCAT;SOR=0.923;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=296;TCF=135;TCR=161;TR=296;WE=136412263;WS=136412245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,326:1.00:326
chr9	136412346	rs2073878	C	T	2035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=52;PP=1434;SC=GTACGTGTGCCGCAGGCCTTG;SOR=2.867;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=14;TCR=52;TR=66;WE=136412354;WS=136412336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr9	136412382	rs2073879	T	C	897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=23;PP=635;SC=CTGGGCACTGTTTCCCCAGAA;SOR=3.841;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=26;WE=136412390;WS=136412372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr9	136512906	rs3025411	G	A	4587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=104;NR=57;PP=2720;SC=TAATCTGTCCGCAGGGGGAAG;SOR=1.185;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=161;TCF=104;TCR=57;TR=161;WE=136512914;WS=136512896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr9	136518097	rs77905	A	G	6042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=118;NR=102;PP=2965;SC=CGTACAACACAGAAGACCGGG;SOR=0.791;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=220;TCF=118;TCR=102;TR=220;WE=136518105;WS=136518087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr9	136522187	rs1611131	A	G	5539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=120;NR=78;PP=2965;SC=CCTTGTCCCCACCAGGTTCAA;SOR=1.136;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=198;TCF=120;TCR=78;TR=198;WE=136522195;WS=136522177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr9	136532107	rs7854480	G	C	546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=18;PP=405;SC=CGTGGCTCCAGGCAGATAGGG;SOR=4.615;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=19;WE=136532115;WS=136532097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	136536633	rs2797840	G	A	951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=20;PP=796;ReadPosRankSum=-0.870;SC=CCCCCGCCCCGTGCTGTCCAG;SOR=0.260;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=53;TCF=33;TCR=20;TR=47;WE=136536641;WS=136536623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,44:0.98:45
chr9	136536679	rs129932	G	A	2638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.87;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr9	136536793	rs2519123	C	G	4492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=85;NR=69;PP=2406;SC=CCAGCTCCCCCACAAAGGACA;SOR=0.727;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=155;TCF=85;TCR=70;TR=154;WE=136536801;WS=136536783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr9	136555629	rs886016	T	C	5530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=106;NR=82;PP=2853;SC=GCCCCGCCCATGGCCAGGTAG;SOR=0.772;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=190;TCF=106;TCR=84;TR=188;WE=136555637;WS=136555619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr9	136559460	rs2073817	C	T	3083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.048;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=43;PP=1608;ReadPosRankSum=-0.842;SC=GGTGCCCCCACGGTGGTTGAG;SOR=0.278;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=99;TCF=56;TCR=43;TR=98;WE=136559468;WS=136559450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,116:0.99:117
chr9	136561303	rs2502739	A	T	1853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=10;PP=1382;SC=GGCTGTGCCCATGGAGTGACA;SOR=2.584;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=49;TCR=10;TR=59;WE=136561311;WS=136561293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr9	136561567	rs2427998	G	T	1609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=44;PP=1210;SC=CGGGGGCTGTGTCCAACACAC;SOR=2.564;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=11;TCR=44;TR=55;WE=136561575;WS=136561557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr9	136569974	rs2510248	G	A	570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=4;PP=369;SC=CTGGGGAGGCGGGGCACACGG;SOR=1.721;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=17;WE=136569982;WS=136569964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	136570004	rs2502747	GT	AC	1253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=18;NR=4;PP=822;SC=GACGGGGCACGTGGAGGGGCA;SOR=1.382;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=22;WE=136570013;WS=136569994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr9	136573412	rs2073815	G	A	5725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=114;NR=64;PP=2965;SC=GCGTTACCTCGTGCAGCGGGT;SOR=1.281;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=179;TCF=114;TCR=65;TR=178;WE=136573420;WS=136573402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr9	136578271	rs582326	G	C	7154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=107;NR=139;PP=2965;SC=GAGAGGCCTGGAGTCCCTTTT;SOR=1.044;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=249;TCF=109;TCR=140;TR=246;WE=136578279;WS=136578261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,262:1.00:262
chr9	136584196	rs2027963	T	G	4904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=86;PP=2713;SC=CTTGGCATCATCCAGAACTGG;SOR=1.054;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=162;TCF=76;TCR=86;TR=162;WE=136584204;WS=136584186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr9	136590812	rs150689824	A	AAAAC	1225.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.58;QD=42.27;SOR=1.071;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr9	136594864	rs2427988	A	G	4619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=95;NR=65;PP=2623;SC=AGACTGACACAGAACCCGGGG;SOR=0.929;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=160;TCF=95;TCR=65;TR=160;WE=136594872;WS=136594854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr9	136596397	rs916619	G	A	818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=1;PP=706;SC=GCTGGGAACAGGGGACCCAGA;SOR=4.255;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=27;WE=136596405;WS=136596387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr9	136599146	rs573904	C	T	3961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=75;NR=58;PP=2158;SC=CCGAGGTGCCCTGTCCCTCCT;SOR=0.774;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=133;TCF=75;TCR=58;TR=133;WE=136599154;WS=136599136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr9	136599315	rs2488553	G	A	611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=18;PP=521;SC=AGGCCTCAGCGAAACAGGGAG;SOR=3.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=136599323;WS=136599305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	136629256	rs66574029	CTG	C	3600.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.9994;FS=2.476;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=-4.252;NF=3;NR=55;PP=2814;ReadPosRankSum=-1.328;SC=AAGATCGTGTCTGTGTGTGTG;SOR=0.978;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=78;TCF=4;TCR=74;TR=58;WE=136629267;WS=136629246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,114:0.97:117
chr9	136629298	rs2797825	A	G	2387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=31;NR=53;PP=1472;SC=GTGCATGTCTATGTTGGGGTG;SOR=1.508;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=31;TCR=53;TR=84;WE=136629306;WS=136629288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr9	136629399	rs2797826	G	A	289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=7;PP=153;SC=GGGAGTAAGAGCAACCCAGAA;SOR=2.494;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=136629407;WS=136629389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr9	136637177	.	A	ACACACGGCCCCGGCGGTCACTGCGTGAGGGC	5268.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=215;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.44;SOR=1.563;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr9	136637198	.	C	T	1771	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=36;NR=71;PP=1771;QD=16.8763664724;SC=CGGCGGTCACCGCGTGAGGGC;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=123;TCF=37;TCR=86;TR=107;WE=136637206;WS=136637188;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:16,107:0.87:123
chr9	136637242	rs2510244	A	G	692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.61;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=19;PP=503;SC=AGCCAGGCTCATTCTGTGTTT;SOR=3.098;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=23;WE=136637250;WS=136637232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr9	136640226	rs2488559	G	A	888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=24;PP=681;SC=CAGTGTCTGAGGGGTGCCCAG;SOR=2.621;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=29;WE=136640234;WS=136640216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	136641235	rs667183	C	T	4561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=84;NR=63;PP=2782;SC=TTAACGGCCCCCCAGGGCCAC;SOR=0.915;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=84;TCR=63;TR=147;WE=136641243;WS=136641225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr9	136641313	rs2077065	G	C	3992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=63;NR=72;PP=1956;SC=CTGCCCTGGAGGGGACTGTCT;SOR=0.934;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=135;TCF=63;TCR=72;TR=135;WE=136641321;WS=136641303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr9	136643994	rs602990	T	C	7587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=142;NR=117;PP=2965;SC=TAATTCTGCATGGCCACCATC;SOR=0.788;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=260;TCF=142;TCR=118;TR=259;WE=136644002;WS=136643984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,285:1.00:285
chr9	136645079	rs540626	G	C	5848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=112;NR=79;PP=2965;SC=GACAAGGACAGAACACAGAGA;SOR=0.859;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=191;TCF=112;TCR=79;TR=191;WE=136645087;WS=136645069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr9	136648535	rs2488563	T	C	605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=19;NR=0;PP=506;SC=CCGTGGGAGATGGTGCCCGAG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=136648543;WS=136648525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr9	136648611	rs56145872	A	AG	2057.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=23;NR=19;PP=1367;SC=TGGGGGGGTGAGGGGGGTACT;SOR=2.566;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=50;TCF=28;TCR=22;TR=42;WE=136648619;WS=136648601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr9	136651125	rs56072078	GGTGCCT	G	1673.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=19;PP=1118;SC=TATGTGCACAGGTGCCTGTGC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=19;WE=136651138;WS=136651115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr9	136651185	rs2023664	G	A	295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=8;PP=184;SC=TGCCCATGCTGTACGTGCACA;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=136651193;WS=136651175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr9	136652465	rs2258889	A	G	1615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=36;PP=1080;SC=CGCAGTGTGGAGGCGCCAGGA;SOR=1.532;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=21;TCR=36;TR=57;WE=136652473;WS=136652455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr9	136804211	rs2073886	G	A	2604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=24;PP=1840;SC=AGGCTGGAGAGAGTGACTGCT;SOR=1.942;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=63;TCR=24;TR=87;WE=136804219;WS=136804201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr9	136857108	.	CG	C	493.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.789;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=466;ReadPosRankSum=0.660;SC=GCGCCTGGGCCGCCGCCGCTG;SOR=0.257;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=12;WE=136857116;WS=136857098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
chr9	136913355	rs464826	T	C	1721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.554;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=30;PP=957;ReadPosRankSum=0.844;SC=CGCAGTAGCGTAGGTGCTCCG;SOR=0.747;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=156;TCF=88;TCR=68;TR=73;WE=136913363;WS=136913345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,84:0.48:174
chr9	136915508	rs2301576	C	T	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=125;ReadPosRankSum=0.281;SC=TGACGACAGGCGGCGTAGGAG;SOR=0.549;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=13;WE=136915516;WS=136915498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr9	136916969	.	A	ATG	68	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=36;MMLQ=16;MQ=60.9;NF=0;NR=3;PP=68;QD=23.6666666667;SC=AAATGAATATATGTGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=3;WE=136916977;WS=136916959;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,3:0.30:10
chr9	137004907	rs28581991	T	C	1130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=1;PP=793;SC=ATATAGTTTGTTTCTTGGCTC;SOR=4.294;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=31;WE=137004915;WS=137004897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr9	137005023	rs11556390	C	T	2505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.446;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=48;PP=1327;ReadPosRankSum=1.183;SC=AGAAGAAGCCCGAGACCGAGG;SOR=0.647;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=248;TCF=143;TCR=105;TR=111;WE=137005031;WS=137005013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,126:0.47:269
chr9	137007298	rs28648812	G	A	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.626;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=11;PP=226;ReadPosRankSum=1.361;SC=GGCATGGGGCGGGGGTGGGTG;SOR=0.250;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=13;WE=137007306;WS=137007282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
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chr9	137019511	rs28703244	T	C	6062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=128;NR=80;PP=2965;ReadPosRankSum=2.281;SC=ACGTGGGGGATGGGGAGCGGG;SOR=1.240;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=210;TCF=129;TCR=81;TR=208;WE=137019519;WS=137019501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,229:0.99:231
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chr9	137299949	rs1805352	C	A	1307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.027;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=26;PP=837;ReadPosRankSum=-1.172;SC=GACATAGGGACAAACCTGGTG;SOR=0.869;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=143;TCF=86;TCR=57;TR=66;WE=137299957;WS=137299939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,69:0.45:154
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chr9	137320855	rs3118570	G	T	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=270;ReadPosRankSum=0.175;SC=AGGATGGGTCGGTGACATGCT;SOR=0.941;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=38;TCF=30;TCR=8;TR=17;WE=137320863;WS=137320845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,17:0.44:39
chr9	137321156	rs1536475	A	G	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=262;ReadPosRankSum=-0.356;SC=GAGTTCAGCCACCTTGGCCCC;SOR=1.085;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=14;WE=137321164;WS=137321146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr9	137325822	rs3132293	T	C	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.949;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.160;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=135;ReadPosRankSum=-0.221;SC=CCAGCGGCATTCCTCCACCAC;SOR=3.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=7;WE=137325830;WS=137325815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr9	137328286	rs1805343	G	A	1301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=20;PP=867;ReadPosRankSum=0.359;SC=CCCCTTGCCCGGCCCTCACCA;SOR=0.735;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=77;TCR=38;TR=60;WE=137328294;WS=137328276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,63:0.50:127
chr9	137541413	rs12554943	T	C	1950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.519;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=47;PP=903;ReadPosRankSum=-1.135;SC=ATAGGGTTTCTGGTGGCCTCT;SOR=1.058;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=154;TCF=68;TCR=86;TR=82;WE=137541430;WS=137541403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,97:0.55:175
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chr9	137600265	rs35817169	C	CG	290.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5008;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=1;PP=49;SC=GAGCAACTCCCGGGGTGGGGG;SOR=3.056;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=6;WE=137600278;WS=137600255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr9	137600270	rs4841925	T	G	394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=1;PP=347;SC=ACTCCCGGGGTGGGGGCTCTG;SOR=3.611;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=13;WE=137600278;WS=137600255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr9	137600687	rs3128588	C	T	7372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=110;NR=135;PP=2965;SC=TGGGCGGGGCCGTGCTCCCTC;SOR=0.962;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=245;TCF=110;TCR=135;TR=245;WE=137600695;WS=137600677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr9	137619195	rs3124299	C	T	1401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.438;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=18;PP=691;ReadPosRankSum=-0.927;SC=ACTGTGACACCGCAGTACCTG;SOR=1.171;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=114;TCF=70;TCR=44;TR=57;WE=137619203;WS=137619185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,64:0.50:127
chr9	137619425	rs3109683	T	G	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.691;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=103;ReadPosRankSum=0.712;SC=CTGCCCAGAATGATAGGGTCA;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=137619433;WS=137619415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr9	137620474	rs3124302	C	T	1641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.913;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=21;PP=1089;ReadPosRankSum=-1.168;SC=GGTCGCTCTGCGGGCTCCGCT;SOR=1.301;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=189;TCF=124;TCR=65;TR=76;WE=137620482;WS=137620464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,81:0.40:201
chr9	137622033	rs3124308	A	G	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=2.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.30;ReadPosRankSum=-2.277;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr9	137622039	rs3128598	G	A	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=3.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.43;ReadPosRankSum=-2.019;SOR=0.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr9	137622455	rs3128600	A	C	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.528;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=262;ReadPosRankSum=-0.139;SC=GTTCCACCACACCCTGGCCCT;SOR=0.283;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=19;WE=137622463;WS=137622445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,21:0.62:34
chr9	137623555	rs3109675	T	C	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.258;HP=6;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=19;PP=269;ReadPosRankSum=-1.717;SC=GGGGGGCTGGTGGGGCATCAT;SOR=0.276;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=72;TCF=22;TCR=50;TR=30;WE=137623563;WS=137623545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,33:0.44:75
chr9	137623601	rs3124310	C	G	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=221;ReadPosRankSum=-0.765;SC=CAGGGGTGGGCCTCTACGGGC;SOR=0.384;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=12;WE=137623609;WS=137623591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr9	137630568	rs3109677	C	T	1659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.496;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=40;PP=1009;ReadPosRankSum=1.014;SC=CTTCTAACTGCCCCAACTTTA;SOR=0.739;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=211;TCF=107;TCR=104;TR=79;WE=137630576;WS=137630558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,88:0.39:226
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chr9	137645662	rs73558067	C	T	871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.826;HP=1;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=16;PP=1550;ReadPosRankSum=0.902;SC=GTCCCCACCTCGAGCAGACAT;SOR=0.598;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=76;TCF=45;TCR=31;TR=40;WE=137645670;WS=137645638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,42:0.52:80
chr9	137646046	rs11103501	A	G	1467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.559;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=35;PP=940;ReadPosRankSum=1.719;SC=CGATGAGCACAGGGACAAGGC;SOR=0.516;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=176;TCF=99;TCR=77;TR=74;WE=137646054;WS=137646036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,78:0.41:190
chr9	137646217	rs11103502	G	A	1547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=42;PP=914;ReadPosRankSum=-0.475;SC=CAGCTTGGGCGCTGGAGGAGC;SOR=0.669;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=150;TCF=63;TCR=87;TR=71;WE=137646225;WS=137646207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,79:0.48:164
chr9	137655320	rs11103510	G	A	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=176;ReadPosRankSum=-0.333;SC=CTCCTGAGCCGGCATCTCAGA;SOR=0.527;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=9;WE=137655328;WS=137655310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr9	137658722	rs4842158	G	A	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.40;ReadPosRankSum=1.995;SOR=0.702;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,15:0.36:42
chr9	137658730	rs4842159	T	C	565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.30;ReadPosRankSum=0.484;SOR=0.562;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,17:0.37:46
chr9	137658992	rs190613977	G	A	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.523;HP=2;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=10;PP=950;ReadPosRankSum=-0.356;SC=GGGGAGCTCTGTCCCCTCCAA;SOR=0.331;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=59;TCF=40;TCR=19;TR=27;WE=137659013;WS=137658982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,31:0.46:67
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chr9	137660194	rs4842162	G	T	1173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.254;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=24;PP=680;ReadPosRankSum=2.336;SC=CTTGGTGGCCGACGGAGAGGT;SOR=1.071;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=119;TCF=65;TCR=54;TR=58;WE=137660202;WS=137660184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,60:0.48:126
chr9	137660375	rs10776900	A	G	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.193;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=20;PP=445;ReadPosRankSum=1.102;SC=ATAGGGCTGCAGGCCCAGGCT;SOR=1.460;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=57;TCF=22;TCR=35;TR=29;WE=137660383;WS=137660365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,33:0.52:64
chr9	137672012	rs3124932	C	T	1108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.477;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=37;PP=765;ReadPosRankSum=-0.865;SC=TCCTTGCAGCCACGGGGCCCC;SOR=1.021;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=113;TCF=43;TCR=70;TR=57;WE=137672020;WS=137672002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,54:0.47:116
chr9	137686906	rs4072883	C	T	1727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.222;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=23;PP=1009;ReadPosRankSum=-1.576;SC=GAGTGACTGACCAGCCCCTTC;SOR=0.799;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=155;TCF=105;TCR=50;TR=74;WE=137686914;WS=137686896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,83:0.48:174
chr9	137687038	rs4072882	A	G	3581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.283;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=78;PP=2125;ReadPosRankSum=-0.039;SC=AGCACGTGCCAGGGGCTGGGG;SOR=0.624;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=302;TCF=146;TCR=156;TR=156;WE=137687046;WS=137687028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,176:0.52:337
chr9	137688032	.	G	T	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.972;ClippingRankSum=0.000;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=2.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.94;ReadPosRankSum=-1.525;SOR=0.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,9:0.23:39
chr9	137688048	rs10776902	T	C	795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.462;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=8;PP=531;ReadPosRankSum=-0.070;SC=CAGGCTTTGATAGCCACAGAT;SOR=0.362;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=65;TCF=51;TCR=14;TR=34;WE=137688056;WS=137688038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,36:0.54:67
chr9	137688577	rs3811161	A	G	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-2.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=333;ReadPosRankSum=-0.522;SC=AGGAAAGGCCATGGGGGTGGG;SOR=0.570;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=43;TCF=37;TCR=6;TR=23;WE=137688585;WS=137688567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,26:0.53:49
chr9	137688624	rs3811160	A	G	1595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.214;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=21;PP=999;ReadPosRankSum=-0.963;SC=CCACCGGCACAGGCAGGTCAG;SOR=0.511;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=142;TCF=102;TCR=40;TR=71;WE=137688632;WS=137688614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,79:0.51:156
chr9	137688657	rs3811159	A	G	2192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=39;PP=1552;ReadPosRankSum=2.921;SC=CTCGGGAGAGACCTCTTGTCC;SOR=0.697;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=235;TCF=141;TCR=94;TR=98;WE=137688665;WS=137688639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,105:0.42:251
chr9	137688780	rs142676375	GCCTGTCCCCTCCAAAACCCA	G	3146.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.703;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=6.882;NF=5;NR=35;PP=2924;ReadPosRankSum=-0.052;SC=GGCCAGCACTGCCTGTCCCCT;SOR=0.578;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=130;TCF=10;TCR=120;TR=40;WE=137688807;WS=137688770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,91:0.43:210
chr9	137688863	rs72774465	G	A	1226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.003;HP=2;HapScore=2;MGOF=86;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.943;NF=14;NR=32;PP=713;ReadPosRankSum=0.523;SC=CACAGTGGCCGGTGGGTGGAG;SOR=1.181;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=85;TCF=31;TCR=54;TR=46;WE=137688871;WS=137688853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,54:0.54:100
chr9	137690318	rs4240707	A	T	1661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.516;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=42;PP=925;ReadPosRankSum=-0.010;SC=GTGAGTATCGAGGGTGCTGGG;SOR=0.423;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=165;TCF=66;TCR=99;TR=75;WE=137690326;WS=137690308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,81:0.46:177
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chr9	137700999	rs11103535	G	A	2137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.875;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=55;PP=1189;ReadPosRankSum=1.994;SC=TTGGAGCCACGTTTGACCTGA;SOR=0.895;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=223;TCF=110;TCR=113;TR=103;WE=137701007;WS=137700989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,111:0.47:238
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chr9	137702200	rs3827850	G	C	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=2.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.84;ReadPosRankSum=0.748;SOR=1.220;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,20:0.40:50
chr9	137702209	rs3827849	G	A	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=1.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.79;ReadPosRankSum=-0.991;SOR=1.106;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,19:0.44:43
chr9	137703125	rs73664147	C	G	955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=14;PP=560;ReadPosRankSum=2.945;SC=CGGTCCACCCCTCCCTCAGCC;SOR=0.610;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=84;TCF=61;TCR=23;TR=45;WE=137703133;WS=137703115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,49:0.52:95
chr9	137704414	rs45629034	G	A	1797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=39;PP=964;ReadPosRankSum=0.558;SC=AAACATTTGCGTTTCCTCTGG;SOR=0.670;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=186;TCF=96;TCR=90;TR=83;WE=137704422;WS=137704404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,93:0.45:206
chr9	137704433	rs45556931	G	A	1807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.82;ReadPosRankSum=1.454;SOR=0.598;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,94:0.46:205
chr9	137704603	.	GGA	G	124.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=-0.000;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=65.19;MQRankSum=1.282;QD=20.79;ReadPosRankSum=1.834;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr9	137704605	.	A	T	265	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=3;HapScore=4;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=65.19;NF=0;NR=4;PP=265;QD=74.9428031368;SC=TTGTTTGAGGAGTGTGTGTGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=137704627;WS=137704595;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr9	137704610	.	GTGTGTGTGTC	G	867	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MMLQ=27;MQ=65.19;NF=0;NR=4;PP=867;QD=219.5;SC=TGAGGAGTGTGTGTGTGTGTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=137704627;WS=137704595;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr9	137707942	rs4841934	T	C	1139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=31;PP=522;ReadPosRankSum=-0.690;SC=TAGTTGATATTGATTCCTTTA;SOR=0.680;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=34;TCR=61;TR=49;WE=137707950;WS=137707932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,57:0.54:106
chr9	137708803	rs3811149	A	G	1027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.676;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=19;PP=568;ReadPosRankSum=-0.376;SC=TGAAATCGCCATGTGTTTTGC;SOR=0.586;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=111;TCF=70;TCR=41;TR=49;WE=137708811;WS=137708793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,55:0.44:126
chr9	137708884	rs61739195	C	T	1081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.410;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=30;PP=762;ReadPosRankSum=1.053;SC=ATCCCCCGGCCCTACTGGTGA;SOR=0.872;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=119;TCF=56;TCR=63;TR=54;WE=137708892;WS=137708874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,54:0.40:134
chr9	137709529	rs145359576	CCA	C	84.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.63;ReadPosRankSum=1.772;SOR=0.430;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,8:0.15:52
chr9	137709780	rs11792894	T	C	2491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=60;PP=1551;SC=CCATGGAGGCTGAGAGTGGCT;SOR=1.847;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=26;TCR=60;TR=86;WE=137709788;WS=137709770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr9	137709795	rs7847840	C	T	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=22;PP=515;ReadPosRankSum=-1.106;SC=GTGGCTGCCCCAGGGGCACCT;SOR=0.836;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=66;TCF=16;TCR=50;TR=28;WE=137709803;WS=137709785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,27:0.39:70
chr9	137710961	rs10745388	G	A	3083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=61;PP=1710;SC=GTGGCCGTGGGTCTCAAACTC;SOR=1.209;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=44;TCR=61;TR=105;WE=137710969;WS=137710951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr9	137711997	rs2228560	G	C	7442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=126;NR=118;PP=2965;SC=TCGGTCCTCCGGGTGAACAGG;SOR=0.714;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=244;TCF=126;TCR=118;TR=244;WE=137712005;WS=137711987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,283:1.00:283
chr9	137714027	rs9697186	T	C	1593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=32;NR=25;PP=782;SC=TGGTCATTCCTGGGAGGGCAG;SOR=0.756;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=32;TCR=25;TR=57;WE=137714035;WS=137714017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr9	137714191	rs74960017	G	A	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.930;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.332;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=32;ReadPosRankSum=-0.703;SC=GGCGTTGCCCGGCCATGGTTT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=3;WE=137714199;WS=137714181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr9	137715150	rs3128599	AT	TG	2500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.297;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=22;PP=1893;ReadPosRankSum=1.871;SC=GCTGTGGCTGATAGGGCCACC;SOR=0.821;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=130;TCF=82;TCR=48;TR=54;WE=137715159;WS=137715140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,67:0.44:153
chr9	137716422	rs45443491	C	T	1557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.006;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=28;PP=910;ReadPosRankSum=-0.903;SC=CATCACCCACCGCTGCTCCTG;SOR=0.464;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=131;TCF=82;TCR=49;TR=68;WE=137716430;WS=137716412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,74:0.51:145
chr9	137717610	rs7868111	T	C	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.787;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=10;PP=354;ReadPosRankSum=0.375;SC=TGACTCTGCCTGCCTCCCTCC;SOR=0.976;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=78;TCF=53;TCR=25;TR=32;WE=137717618;WS=137717600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,39:0.42:92
chr9	137741585	.	A	G	524	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=15;MQ=46.15;NF=20;NR=19;PP=524;QD=14.3274669884;SC=CAGGAAGCACAGGATCACACC;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=109;TCF=49;TCR=60;TR=39;WE=137741593;WS=137741575;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:70,39:0.36:109
chr9	137741585	.	A	AGGATCACACCTCCCAGGAAGCACG	2141.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.61;QD=50.99;SOR=0.788;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr9	137742018	.	A	ATATCACACCTCCCAGGAAGCACGG	5048.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.752;ClippingRankSum=0.000;DP=295;ExcessHet=3.0103;FS=0.474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.62;MQRankSum=-10.070;QD=20.69;ReadPosRankSum=1.909;SOR=0.640;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:130,114:0.47:244
chr9	137742124	rs62571442	G	A	4247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=465;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-11.452;NF=94;NR=99;PP=2483;ReadPosRankSum=0.155;SC=GGATCACACCGCTCAGGAAGA;SOR=0.695;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=422;TCF=207;TCR=215;TR=193;WE=137742132;WS=137742114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:252,213:0.46:465
chr9	137742496	.	TGGGATCAGACCTCCCAGGGAGCACGGGATCACACCTCCCAGGAAAGCAC	T	1257.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.342;ClippingRankSum=0.000;DP=382;ExcessHet=3.0103;FS=3.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQRankSum=-5.250;QD=4.51;ReadPosRankSum=0.273;SOR=0.948;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:203,76:0.27:279
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chr9	137801416	rs2989735	T	C	8355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=132;NR=142;PP=2965;SC=GAAACACACATTGAAACTGGT;SOR=0.824;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=274;TCF=132;TCR=142;TR=274;WE=137801424;WS=137801406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,307:1.00:307
chr9	137801800	rs1071583	T	C	9480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=353;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=171;NR=137;PP=2965;SC=ACCAGGCTCCTTGGAACTTCT;SOR=0.770;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=308;TCF=171;TCR=137;TR=308;WE=137801808;WS=137801790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,351:1.00:351
chr9	137804360	rs2274845	A	G	4654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.99;NF=101;NR=55;PP=2599;SC=GGATGTTGTCATTCCCCAGCC;SOR=1.147;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=156;TCF=101;TCR=55;TR=156;WE=137804368;WS=137804350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr9	137804830	rs2070622	G	C	571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=0;PP=478;SC=GGGACTCCCAGGCTGACCGCC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=137804838;WS=137804821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
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chr9	137806334	rs2989721	A	G	9663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.15;QD=45.37;SOR=0.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr9	137806344	rs3012788	C	T	8726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.17;QD=45.93;SOR=1.057;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr9	137806487	rs2989722	G	A	349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=4;PP=247;SC=CTCTGTTGCCGTGTCTCTCTG;SOR=1.022;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=11;WE=137806495;WS=137806485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr9	137806783	rs3012789	G	A	4171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=84;PP=2428;SC=GGTTCCAGGAGCTCTCAGAAT;SOR=1.201;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=146;TCF=62;TCR=84;TR=146;WE=137806791;WS=137806773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
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chr9	137968919	rs61043559	G	GAA	7387.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=56;PP=2967;SC=CTCTAGGAGAGGTTTTCTTGG;SOR=0.741;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=90;TCF=30;TCR=60;TR=85;WE=137968927;WS=137968909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
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chr9	137978552	rs4446800	A	G	1901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=43;PP=1054;ReadPosRankSum=0.671;SC=CCTGCGCTTCAGGTGGGACTG;SOR=0.751;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=127;TCF=54;TCR=73;TR=76;WE=137978560;WS=137978542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,87:0.60:144
chr9	137978638	rs695156	T	G	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=7;PP=142;ReadPosRankSum=-1.181;SC=CCTGCCTCTGTGCCTGGGCGC;SOR=0.250;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=9;WE=137978646;WS=137978628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr9	137982127	rs500461	T	C	2019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.973;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=3.532;NF=54;NR=37;PP=1182;ReadPosRankSum=0.679;SC=CAGTGGTCGCTCCACAGCAGA;SOR=1.059;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=172;TCF=98;TCR=74;TR=91;WE=137982135;WS=137982117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,100:0.51:198
chr9	137982232	rs56337838	T	G	643.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=3.354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.85;MQRankSum=0.000;QD=8.70;ReadPosRankSum=-1.235;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,25:0.34:74
chr9	137982234	rs10672761	G	GTT	342.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=24.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.89;MQRankSum=0.000;QD=4.97;ReadPosRankSum=2.897;SOR=3.907;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,17:0.25:69
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chr9	138236212	rs914397	T	G	4539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=100;PP=2965;SC=ACCGCCCCAATGGGGTTGGTT;SOR=1.459;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=155;TCF=55;TCR=100;TR=155;WE=138236220;WS=138236202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
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chr9	138376649	rs3748192	T	C	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.643;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=160;ReadPosRankSum=-0.129;SC=GCGTTGGCTGTCTGTGGTCTC;SOR=1.112;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=22;TCF=8;TCR=14;TR=12;WE=138376657;WS=138376639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
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chr9	138378856	rs2078266	A	G	608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=15;PP=518;SC=AGTGGACAGCAACGACAGCAT;SOR=1.721;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=22;TCF=7;TCR=15;TR=21;WE=138378864;WS=138378846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	138379002	rs1975518	T	G	2591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=38;PP=1641;SC=GGAAGGAGCCTGCCCCACCGC;SOR=1.014;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=53;TCR=38;TR=91;WE=138379010;WS=138378992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr9	138387483	rs2274650	G	A	925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.961;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=28;PP=628;ReadPosRankSum=1.224;SC=AAAGGAACACGGATTAATGAC;SOR=0.836;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=74;TCF=19;TCR=55;TR=37;WE=138387491;WS=138387473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,41:0.53:78
chr9	138391299	rs7037251	T	A	2561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.549;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=56;PP=1409;ReadPosRankSum=-0.172;SC=CCGACACAAATCAGTGGAGCT;SOR=0.627;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=212;TCF=107;TCR=105;TR=111;WE=138391307;WS=138391289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,127:0.53:240
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chr9	138391774	rs2274652	C	T	720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=19;PP=525;SC=GGGGAGCGAGCGGAGGGGCCT;SOR=2.670;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=24;WE=138391782;WS=138391764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr9	138394124	rs80015265	C	T	1807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.554;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=38;PP=899;ReadPosRankSum=0.375;SC=TTGGTCCCCCCGGATCGGGCT;SOR=0.614;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=161;TCF=75;TCR=86;TR=75;WE=138394132;WS=138394114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,89:0.49:180
chr9	138395052	rs75139894	C	T	1279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=17;PP=746;ReadPosRankSum=-1.071;SC=GTGACGGAGGCGGCTGCCCTG;SOR=0.637;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=87;TCF=61;TCR=26;TR=51;WE=138395060;WS=138395042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,57:0.56:101
chr9	138395122	rs79342731	G	A	2313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.497;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=44;PP=1339;ReadPosRankSum=0.314;SC=ACATCCATATGGGGTCAGTTC;SOR=0.632;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=187;TCF=104;TCR=83;TR=96;WE=138395130;WS=138395112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,112:0.52:217
chr9	138395246	rs114368209	G	A	1079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.728;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=27;PP=759;ReadPosRankSum=1.424;SC=CACGGGGAGCGTTGCAAATTG;SOR=0.521;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=88;TCF=35;TCR=53;TR=47;WE=138395254;WS=138395236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,49:0.53:93
chr9	138395969	rs3748199	A	G	1307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.337;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=28;PP=626;ReadPosRankSum=1.124;SC=GACATGAGCCATTCCCTGTGA;SOR=0.862;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=62;TCR=58;TR=57;WE=138395977;WS=138395959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,67:0.48:141
chr9	138413859	rs191919023	C	T	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.503;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.495;NF=14;NR=3;PP=254;ReadPosRankSum=-0.274;SC=CTGGAGCAGTCGGCCTGAGCC;SOR=1.845;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=38;TCF=27;TCR=11;TR=17;WE=138413867;WS=138413849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,14:0.40:35
chr9	138414054	rs112090657	G	A	1120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=1.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.59;MQRankSum=0.271;QD=14.94;ReadPosRankSum=1.736;SOR=0.982;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,31:0.41:75
chr9	138414057	rs113844284	A	G	1120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=2.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.78;MQRankSum=0.313;QD=15.57;ReadPosRankSum=1.583;SOR=1.075;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,30:0.42:72
chr9	138415201	rs56239374	C	G	2974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=50;NR=48;PP=1544;SC=GCTGGATGTGCGGGGGCAGCC;SOR=0.862;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=98;TCF=50;TCR=48;TR=98;WE=138415209;WS=138415191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr9	138415238	rs56120410	C	G	736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=20;PP=422;ReadPosRankSum=-0.857;SC=GGCCTTTTGGCCTGGGAAGCC;SOR=0.616;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=53;TCF=18;TCR=35;TR=31;WE=138415246;WS=138415228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,35:0.58:60
chr9	138415740	rs55884352	G	T	2309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.668;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=39;PP=1511;ReadPosRankSum=0.388;SC=GGGCAAGCACGTGGCATACAT;SOR=0.944;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=215;TCF=129;TCR=86;TR=105;WE=138415748;WS=138415730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,114:0.48:236
chr9	138437869	rs62578292	G	A	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.51;MQRankSum=-1.036;QD=7.95;ReadPosRankSum=1.282;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr9	138438189	rs141004230	G	T	34.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.42;QD=17.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr9	138438976	rs78161279	G	C	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=2.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.23;MQRankSum=-3.624;QD=9.72;ReadPosRankSum=-1.587;SOR=1.781;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr9	138438980	rs4006724	G	T	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.04;MQRankSum=-3.984;QD=10.26;ReadPosRankSum=-2.610;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr9	138438982	rs4006725	T	G	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=2.865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.37;MQRankSum=-4.114;QD=9.72;ReadPosRankSum=-2.099;SOR=2.012;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
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chr9	138439189	rs148884427	G	GC	1335.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.087;HP=2;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=916;ReadPosRankSum=2.088;SC=CTTCTGCCAGGGTCCCAGCCC;SOR=1.148;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=41;TCF=8;TCR=33;TR=16;WE=138439198;WS=138439179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,35:0.45:77
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chr9	138440748	rs3827840	C	T	4500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.88;SOR=2.405;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr9	138440756	rs3827841	G	A	3841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.74;SOR=2.476;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr9	138441081	rs2590502	C	T	562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.70;QD=31.26;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	138441685	rs112851559	G	GC	572.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-2.120;NF=5;NR=8;PP=357;ReadPosRankSum=1.625;SC=CAGCACAGCAGCCCCCGGGTC;SOR=0.771;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=43;TCF=11;TCR=32;TR=13;WE=138441693;WS=138441675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,25:0.36:70
chr9	138453811	rs697448	A	G	1366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=19;NR=22;PP=586;SC=GCGGGCAGGCAGGAAGCCCAG;SOR=1.358;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=19;TCR=22;TR=41;WE=138453819;WS=138453801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr9	138516346	rs34217442	CA	C	4824.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=2.336;NF=15;NR=69;PP=2968;ReadPosRankSum=2.108;SC=GCCATCGAGCCACCACCTCTC;SOR=0.711;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=160;TCF=36;TCR=124;TR=84;WE=138516354;WS=138516336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,146:0.53:276
chr9	138516531	rs7466817	G	C	432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.317;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=218;ReadPosRankSum=0.182;SC=GAAACACACAGTGGGGAAGAA;SOR=0.368;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=48;TCF=12;TCR=36;TR=18;WE=138516539;WS=138516521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,21:0.42:50
chr9	138517853	rs1333241	G	C	1068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=7;PP=581;SC=GAGGTTAAAGGCTCGTGAATG;SOR=1.730;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=29;WE=138517861;WS=138517843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr9	138518010	rs1333240	A	G	2976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=51;NR=54;PP=1714;SC=CCCATAGGACAGGAGCGAGCC;SOR=0.918;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=51;TCR=54;TR=105;WE=138518018;WS=138518000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr9	138518114	rs11103106	G	A	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=6.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.82;ReadPosRankSum=-1.105;SOR=0.117;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,8:0.28:29
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chr9	138523411	rs1333233	C	T	4630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=92;PP=2930;SC=TTTGGTGTTTCGTCAACATGC;SOR=1.234;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=154;TCF=62;TCR=92;TR=154;WE=138523419;WS=138523401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr9	138555161	rs10776838	G	A	1533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.264;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=27;PP=893;ReadPosRankSum=-0.178;SC=AGGCGTCCACGGCAAAGATGG;SOR=0.571;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=149;TCF=93;TCR=56;TR=67;WE=138555169;WS=138555151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,76:0.46:164
chr9	138557256	rs492708	C	T	1447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=34;PP=1020;SC=CTCTGAAGTCCGGCCCAACCC;SOR=2.170;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=14;TCR=34;TR=48;WE=138557264;WS=138557246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr9	138557641	rs138234551	G	A	1950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.559;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=47;PP=1206;ReadPosRankSum=1.026;SC=CCGGGACAGGGTGGGGATGGG;SOR=0.760;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=158;TCF=69;TCR=89;TR=80;WE=138557649;WS=138557631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,89:0.50:177
chr9	138586198	rs572335	G	A	4357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=48;PP=2527;ReadPosRankSum=-1.409;SC=GTGCTTACGCGGGGGGACCAG;SOR=1.358;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=140;TCF=91;TCR=49;TR=137;WE=138586206;WS=138586188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,160:0.99:162
chr9	138586309	rs484524	A	G	8260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=139;NR=140;PP=2965;SC=CAGACCTGGAAGCGACAAGCT;SOR=0.809;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=279;TCF=139;TCR=140;TR=279;WE=138586317;WS=138586299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,309:1.00:309
chr9	138586457	rs548911	T	C	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=162;ReadPosRankSum=-0.206;SC=CGGGGAGAAATGCAGAGGCCA;SOR=0.551;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=12;WE=138586465;WS=138586447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
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chr9	138587203	rs2769033	A	G	578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=15;PP=397;SC=GTCCACTCACACTGACCGAGC;SOR=2.531;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=19;WE=138587211;WS=138587193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	138587220	rs2483364	T	C	472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=12;PP=331;SC=GAGCACCTGCTCTGCTGCCTG;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=138587228;WS=138587210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	138589311	rs7036532	G	A	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=64;ReadPosRankSum=-0.838;SC=CTGCTCCCAGGGTCACCCAGC;SOR=0.693;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=6;WE=138589319;WS=138589301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr9	138590138	rs506498	T	C	3952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=59;PP=2020;SC=ATCACCGTGATGCCGGAGGAC;SOR=0.818;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=132;TCF=73;TCR=59;TR=132;WE=138590146;WS=138590128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr9	138590347	rs529976	C	T	4009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=76;PP=2344;SC=GAAACAAATACCTCTGGGCCC;SOR=1.097;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=58;TCR=76;TR=134;WE=138590355;WS=138590337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr9	138590680	rs474061	G	C	658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=5;PP=496;SC=TTCCCCAACAGGGCTTTTCTG;SOR=2.400;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=24;WE=138590688;WS=138590670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr9	138590928	rs471525	C	T	2295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=36;NR=36;PP=1058;SC=GCCCGAGCCCCGGGCCGAGTC;SOR=0.972;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=36;TCR=36;TR=72;WE=138590936;WS=138590918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr9	138591230	rs558113	C	T	6586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=113;NR=125;PP=2965;SC=ACCCCTTGGCCGCCAGCCCAA;SOR=0.846;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=239;TCF=114;TCR=125;TR=238;WE=138591238;WS=138591220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr9	138591266	rs559326	A	G	6031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=97;NR=116;PP=2965;SC=CCCTGACGGTAGGGATTCTGG;SOR=0.990;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=213;TCF=97;TCR=116;TR=213;WE=138591274;WS=138591256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr9	138594266	rs5901089	A	AC	1765.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=2;NR=25;PP=1008;SC=CTAACCTAAGACCCCCAAGTT;SOR=1.140;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=27;WE=138594274;WS=138594256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr9	138606581	rs141291153	C	CGG	4530.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-2.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.513;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=2.831;NF=1;NR=39;PP=2351;ReadPosRankSum=0.115;SC=GGACCGGGCGCGGGGTGGGGG;SOR=0.817;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=131;TCF=10;TCR=121;TR=40;WE=138606594;WS=138606571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,123:0.48:258
chr9	138606586	rs2385007	T	C	4589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.769;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.886;NF=29;NR=39;PP=2349;ReadPosRankSum=0.475;SC=GGGCGCGGGGTGGGGGCTGGG;SOR=0.870;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=201;TCF=90;TCR=111;TR=68;WE=138606594;WS=138606571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,117:0.46:254
chr9	138642912	rs10122976	C	A	1476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.85;SOR=1.159;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr9	138644203	rs10735239	T	C	6494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=111;NR=105;PP=2965;SC=CTCCTAAGAATGAACCTCCTG;SOR=0.742;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=216;TCF=111;TCR=105;TR=216;WE=138644211;WS=138644193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr9	138645716	rs12378616	C	T	3603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=45;PP=2273;SC=TGGAAGCCCTCGGGCAGCAAG;SOR=1.170;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=75;TCR=45;TR=120;WE=138645724;WS=138645706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr9	138646881	rs4842032	C	T	633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=3;PP=492;SC=CCAGTGGAGGCCAATGGTTAT;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=22;WE=138646889;WS=138646871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr9	138648829	rs13286338	C	G	832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=63.60;QD=41.64;SOR=6.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	138648837	rs59909130	A	C	840.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=64.92;QD=42.04;SOR=6.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	138648838	.	G	A	841.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=65.19;QD=42.09;SOR=6.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	138648847	.	A	AC	837.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.00;QD=41.89;SOR=6.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	138648849	.	C	CCTCTCCCA	1045	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=25;PP=1045;QD=42.56;SC=CCTCCCCCACCTCCCCCACCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=138648876;WS=138648803;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr9	138648851	.	C	CTCCCATCT,CT	884.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.31;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=25;PP=449;SC=TCCCCCACCTCCCCCACCCTC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=138648876;WS=138648803;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:21
chr9	138650121	rs10776842	A	G	724.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=67.04;QD=45.30;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	138650121	.	A	ACAGGCTGCCCCGTGGGCCTCAGCCGAGACACAGGTGTGGCCAGGTGCAGGCTGCCCCATGGGCCTCAGCCGAGACACAGGTGTGGCCAGGTG	167	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=65.8;NF=12;NR=0;PP=167;QD=17.5;SC=GTGGCCAGGTACAGGCTGCCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=12;WE=138650130;WS=138650111;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:15,12:0.44:27
chr9	138650122	rs11103170	C	T	724.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=29;NR=0;PP=293;SC=TGGCCAGGTACAGGCTGCCCC;SOR=3.383;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=29;WE=138650130;WS=138650111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	138656783	rs55816769	T	C	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=312;ReadPosRankSum=0.199;SC=CCCAGGCCCCTAACAGACAGT;SOR=0.582;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=16;WE=138656791;WS=138656773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr9	138656838	rs41298365	A	G	1043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.777;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=13;PP=647;ReadPosRankSum=1.484;SC=CTCGCTCCCCAGGCCTGGTCG;SOR=0.849;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=104;TCF=75;TCR=29;TR=48;WE=138656846;WS=138656828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,51:0.47:109
chr9	138657053	rs58604946	T	G	2197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=55;PP=1454;ReadPosRankSum=-1.077;SC=TGAGGCCCCTTACCGTGGCCC;SOR=0.667;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=161;TCF=58;TCR=103;TR=87;WE=138657061;WS=138657043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,93:0.54:173
chr9	138657635	rs10117578	A	G	690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=0.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.62;ReadPosRankSum=-1.515;SOR=0.612;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,42:0.34:123
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chr9	138657727	rs62583545	A	C	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=72;ReadPosRankSum=0.777;SC=AGCATTATAGACTATCCCCAG;SOR=1.051;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=5;WE=138657735;WS=138657717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
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chr9	138675801	rs10776848	A	C	716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=581;ReadPosRankSum=-1.149;SC=AGTGCCCTCGACCCCGTGGCT;SOR=0.646;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=64;TCF=49;TCR=15;TR=22;WE=138675809;WS=138675780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,25:0.37:67
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chr9	138679895	rs11103190	T	C	1655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.634;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=14;PP=877;ReadPosRankSum=0.614;SC=CGCTTGCTGATATTCTCTCTC;SOR=0.808;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=133;TCF=94;TCR=39;TR=61;WE=138679908;WS=138679885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,73:0.48:152
chr9	138683575	rs41299048	TG	CA	1956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=10;PP=1473;ReadPosRankSum=1.162;SC=CCCACACCTCTGGGCCCCTGC;SOR=0.669;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=79;TCR=24;TR=42;WE=138683584;WS=138683565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,53:0.45:119
chr9	138683790	rs41306389	T	C	2811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FS=2.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.20;ReadPosRankSum=-0.336;SOR=0.903;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:116,82:0.41:198
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chr9	138706844	rs3739465	A	G	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.203;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=147;ReadPosRankSum=1.134;SC=AGTAACTCTCATGCATCAAAG;SOR=2.608;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=10;WE=138706852;WS=138706834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr9	138707727	rs913342	C	G	1659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.592;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=40;PP=999;ReadPosRankSum=-0.919;SC=GGAGGGCGAACGCCGTCACCT;SOR=0.666;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=146;TCF=75;TCR=71;TR=79;WE=138707735;WS=138707717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,83:0.54:155
chr9	138742077	rs35981196	C	G	2068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.782;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.923;NF=41;NR=54;PP=1362;ReadPosRankSum=0.318;SC=CCATAACATTCGGCTAAAAGA;SOR=0.947;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=203;TCF=94;TCR=109;TR=95;WE=138742085;WS=138742067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,102:0.46:224
chr9	138754582	rs2039330	A	C	594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=13;PP=354;SC=CAATTGCAATAATCTAGAAAG;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=138754590;WS=138754572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr9	138757088	rs41306399	A	G	2881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.065;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=56;PP=1877;ReadPosRankSum=0.314;SC=ACAAAAAAACAGTTTTGGGTG;SOR=0.853;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=245;TCF=142;TCR=103;TR=132;WE=138757096;WS=138757078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,138:0.52:267
chr9	138798784	rs191016761	C	T	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5165;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=75;ReadPosRankSum=-0.366;SC=CGGACCCCGGCCGCGTCCCCC;SOR=1.981;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=5;WE=138798792;WS=138798774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr9	138816898	rs4842048	T	C	3096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.92;SOR=1.681;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr9	138816906	rs4842049	T	C	3373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.17;SOR=1.824;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr9	138817142	rs11103226	C	T	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.917;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=285;ReadPosRankSum=0.398;SC=TCCCAGGTGCCCACTTGTTTC;SOR=0.197;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=14;WE=138817150;WS=138817132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr9	138817178	rs10776854	C	A	368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=11;PP=305;SC=GTGAACCTCGCACACACAGCT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=138817186;WS=138817168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
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chr9	138837958	rs2297691	C	T	826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.123;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=25;PP=544;ReadPosRankSum=-0.667;SC=CCCTCAGGCACATCAACAGGA;SOR=0.411;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=79;TCF=20;TCR=59;TR=35;WE=138837966;WS=138837948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,38:0.46:83
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chr9	138899276	rs71759303	TACAC	T	1229.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.398;HP=2;HapScore=2;MGOF=45;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=63;PP=1194;ReadPosRankSum=0.447;SC=CGTGCACACATACACACAGAC;SOR=1.140;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=63;TCF=0;TCR=63;TR=63;WE=138899287;WS=138899266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,37:0.44:84
chr9	138899301	rs56188305	GCA	G	700.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=71;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=36;PP=1068;ReadPosRankSum=-0.228;SC=ACACACACGCGCACACAGACG;SOR=0.749;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=36;WE=138899320;WS=138899291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr9	138899311	rs56102761	GCA	G	700.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=71;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=26;PP=1068;ReadPosRankSum=-0.760;SC=GCACACAGACGCACACACACA;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=138899320;WS=138899291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr9	138903671	rs9626	A	G	6551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=106;PP=2965;SC=GTGCCGCGGCAGGCGGGAACT;SOR=0.786;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=216;TCF=110;TCR=106;TR=215;WE=138903679;WS=138903661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr9	138904997	rs2280485	T	C	1007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.323;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=23;PP=692;ReadPosRankSum=-1.177;SC=GGCTGGGATCTGAACCCAGCC;SOR=0.481;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=115;TCF=67;TCR=48;TR=53;WE=138905005;WS=138904987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,52:0.42:125
chr9	138905136	rs2280486	C	T	1226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.418;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=29;PP=690;ReadPosRankSum=-0.291;SC=TGTTGGCCAGCGTGTTCCTGG;SOR=0.539;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=119;TCF=53;TCR=66;TR=56;WE=138905144;WS=138905126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,62:0.48:128
chr9	138905214	rs2280487	C	G	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=208;ReadPosRankSum=2.103;SC=CCCGCCCGCACGAATGCCCTG;SOR=0.914;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=13;WE=138905222;WS=138905204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr9	138905884	rs11103273	T	C	666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=24;PP=518;SC=GGCGCACAGATGGGTGAGGGG;SOR=2.753;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=29;WE=138905892;WS=138905874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr9	138927183	rs149084098	T	C	3633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=105;NR=59;PP=2690;SC=TGTGACGCACTGAGAAGGTTC;SOR=0.922;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=164;TCF=105;TCR=59;TR=164;WE=138927191;WS=138927173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr9	139008287	rs71508837	C	T	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.593;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=235;ReadPosRankSum=2.154;SC=AGAACACAGCCACAGGCCGGG;SOR=1.668;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=16;WE=139008295;WS=139008277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,15:0.38:39
chr9	139008803	rs3739466	T	G	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.030;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=10;PP=312;ReadPosRankSum=-1.537;SC=TCCAGGCGGCTGTTGGCGTAG;SOR=1.005;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=69;TCF=41;TCR=28;TR=26;WE=139008811;WS=139008793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,26:0.35:74
chr9	139089679	rs7860634	G	A	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.456;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=242;ReadPosRankSum=2.451;SC=CCCCTGGGTCGGAGAAAGAGT;SOR=1.609;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=33;TCF=10;TCR=23;TR=15;WE=139089687;WS=139089669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr9	139089717	rs7850466	T	G	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.195;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=3.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.67;ReadPosRankSum=0.584;SOR=2.215;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr9	139089717	.	TA	GC	156	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=156;QD=52.3669687156;SC=TGACAGGTCATAACAGGCCCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=4;WE=139089726;WS=139089707;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,4:0.33:12
chr9	139089718	rs7847312	A	C	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.195;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=3.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.67;ReadPosRankSum=0.584;SOR=2.215;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr9	139090465	rs3215774	T	TC	227.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.393;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=99;ReadPosRankSum=0.058;SC=CGCGCGCTCGTCCCCCCCCGA;SOR=0.148;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=35;TCF=15;TCR=20;TR=9;WE=139090473;WS=139090455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,14:0.30:47
chr9	139091797	rs1924521	A	C	1533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.625;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=24;PP=861;ReadPosRankSum=-1.412;SC=GGTTGGAGAGAGGCAAGCGGC;SOR=0.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=134;TCF=87;TCR=47;TR=69;WE=139091805;WS=139091787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,73:0.51:143
chr9	139092679	rs4842131	T	C	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.140;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=21;PP=489;ReadPosRankSum=0.564;SC=CGCGAGCCAGTCTCCCCTCCG;SOR=1.418;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=44;TCF=10;TCR=34;TR=25;WE=139092687;WS=139092669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,27:0.53:51
chr9	139094773	rs2274115	A	G	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=14;PP=456;ReadPosRankSum=-0.156;SC=CGGTGCAGCCACTCGGCCCGG;SOR=0.716;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=68;TCF=42;TCR=26;TR=37;WE=139094781;WS=139094763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,43:0.53:81
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chr9	139096622	rs369430724	T	C	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=149;ReadPosRankSum=-1.033;SC=CCCGCCACCCTGGGATCTGGA;SOR=0.375;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=12;WE=139096630;WS=139096612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
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chr9	139118515	rs72773794	C	T	593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=0;PP=427;ReadPosRankSum=0.040;SC=AAAACACAGGCACTATGATGT;SOR=1.751;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=21;WE=139118523;WS=139118507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,23:0.70:33
chr9	139137626	rs79849109	C	T	4163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.19;SOR=0.731;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr9	139142710	rs62579871	G	A	2557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=49;PP=1781;SC=GCTCCCGGGCGAGGGGTGTCT;SOR=1.141;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=36;TCR=49;TR=85;WE=139142718;WS=139142700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr9	139142808	rs66470520	T	C	3971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=78;NR=57;PP=2411;SC=GTAGAGGGCCTTGGCAGCTCC;SOR=0.883;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=135;TCF=78;TCR=57;TR=135;WE=139142816;WS=139142798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr9	139221798	rs76115134	T	C	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=3.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.16;ReadPosRankSum=0.540;SOR=0.290;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr9	139221808	rs144733220	ACCCCCTC	A	226.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.362;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=6;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=1;PP=130;ReadPosRankSum=-0.738;SC=TGGGGCCCACACCCCCTCCCC;SOR=0.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=1;WE=139221822;WS=139221788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr9	139222174	rs28495820	T	C	505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=9;PP=249;SC=GCCCCGCCCGTGGCCGACGAG;SOR=0.892;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=8;TCR=9;TR=17;WE=139222182;WS=139222164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	139222232	rs62579957	G	A	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.18;ReadPosRankSum=-2.543;SOR=1.245;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr9	139222249	.	C	T	26	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=3;NR=3;PP=26;QD=10.1285354245;SC=GGGCCGGGGCCGGGGCTGGGA;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=14;TCF=7;TCR=7;TR=6;WE=139222257;WS=139222239;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr9	139230292	rs28447209	T	G	459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=0;PP=389;SC=ATCACCTCAGTGGTTGCAGGC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=139230300;WS=139230282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	139230585	rs28583929	T	C	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.182;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=15;PP=291;ReadPosRankSum=0.024;SC=GGGCTGGGTGTCTCCCACCCC;SOR=1.161;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=68;TCF=32;TCR=36;TR=26;WE=139230593;WS=139230575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,32:0.42:77
chr9	139235481	rs145729152	TC	T	1781.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.487;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=25;PP=985;ReadPosRankSum=0.926;SC=GGGGTCTTGCTCCCCACAGGC;SOR=0.543;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=66;TCF=17;TCR=49;TR=31;WE=139235489;WS=139235471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,63:0.54:116
chr9	139235526	rs59873903	C	A	1129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.687;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=26;PP=649;ReadPosRankSum=0.354;SC=GGGGTGGGATCGAGGCCAGGC;SOR=0.767;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=102;TCF=50;TCR=52;TR=50;WE=139235534;WS=139235516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,56:0.49:114
chr9	139235606	rs78403475	G	C	679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.780;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=13;PP=392;ReadPosRankSum=-0.128;SC=CTCAGGGACAGCACAGGCCTG;SOR=0.555;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=90;TCF=49;TCR=41;TR=32;WE=139235614;WS=139235596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,36:0.36:101
chr9	139243334	rs28429551	T	A	2146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=47;PP=1326;SC=TGGGAGATAATTGTGCCCTCC;SOR=1.522;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=27;TCR=47;TR=74;WE=139243342;WS=139243324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr9	139249991	rs28603210	T	C	540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=1;PP=384;SC=GGTGACACGTTCTGGGGGAGG;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=139249999;WS=139249987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	139252413	rs3829108	C	T	943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.916;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=9;PP=563;ReadPosRankSum=-1.020;SC=TGACCAGCCCCGGACCACTGG;SOR=0.538;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=82;TCF=63;TCR=19;TR=39;WE=139252435;WS=139252403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,43:0.49:88
chr9	139252495	rs3812547	G	A	7455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=143;NR=123;PP=2965;SC=AGCGCTGCCCGCCACCTGACG;SOR=0.795;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=268;TCF=145;TCR=123;TR=266;WE=139252503;WS=139252485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,286:1.00:286
chr9	139256468	rs3812552	C	G	513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.971;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=9;PP=295;ReadPosRankSum=1.563;SC=CAGGAGTCAGCTCGGCTCCGT;SOR=0.846;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=31;TCR=19;TR=23;WE=139256476;WS=139256458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,26:0.43:60
chr9	139256541	rs3812554	C	T	385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.587;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=7;PP=256;ReadPosRankSum=-0.316;SC=GATGTGGGGGCCCCTGCAGCC;SOR=0.967;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=37;TCF=21;TCR=16;TR=18;WE=139256549;WS=139256531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,19:0.45:42
chr9	139257411	rs10870202	T	C	2924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.773;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=54;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.728;SC=TGGGTGGCCTTCTGGCCCAGC;SOR=0.742;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=228;TCF=121;TCR=107;TR=122;WE=139257430;WS=139257401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,135:0.54:251
chr9	139257422	rs45592338	C	G	2824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.976;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=57;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.147;SC=CTGGCCCAGCCCTGGGGTACA;SOR=0.720;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=223;TCF=117;TCR=106;TR=123;WE=139257430;WS=139257401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,136:0.55:248
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chr9	139261695	rs373303924	T	G	1322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.597;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=24;PP=607;ReadPosRankSum=-0.361;SC=GTGAGCCATCTTCCAGGTCGG;SOR=0.728;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=131;TCF=72;TCR=59;TR=57;WE=139261703;WS=139261685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,70:0.46:153
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chr9	139270975	rs3812562	C	T	1189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.306;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=31;PP=749;ReadPosRankSum=-0.908;SC=GTGACACCCCCGAGCCATGAT;SOR=0.570;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=141;TCF=60;TCR=81;TR=53;WE=139270983;WS=139270965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,59:0.37:161
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chr9	139272058	rs10781507	A	G	3027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.401;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=62;PP=1731;ReadPosRankSum=-1.493;SC=GTTCCAGCTCACTCAGGAGGT;SOR=0.639;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=264;TCF=138;TCR=126;TR=134;WE=139272066;WS=139272048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,147:0.51:286
chr9	139272502	rs3812565	T	C	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.290;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=231;ReadPosRankSum=0.437;SC=CAGGCTGGGGTAGGGGCGGCT;SOR=1.580;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=14;WE=139272510;WS=139272492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,15:0.45:33
chr9	139273288	rs3829112	C	T	810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.770;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=14;PP=502;ReadPosRankSum=-1.494;SC=GGGCTGTGCCCTCGGCCTCTG;SOR=0.940;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=77;TCF=47;TCR=30;TR=37;WE=139273296;WS=139273278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,39:0.45:86
chr9	139273790	rs3812568	C	A	1421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.625;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=38;PP=927;ReadPosRankSum=0.066;SC=AAGCCCCAGGCATCTGGCCCA;SOR=0.881;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=101;TCF=35;TCR=66;TR=56;WE=139273798;WS=139273780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,62:0.57:109
chr9	139275204	rs3812570	A	C	1860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=38;PP=1335;ReadPosRankSum=2.020;SC=GCAGAAGATGAACTGGTGGGT;SOR=0.674;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=207;TCF=126;TCR=81;TR=92;WE=139275212;WS=139275194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,97:0.44:222
chr9	139275294	rs3812571	G	C	2955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.416;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=61;PP=1759;ReadPosRankSum=0.531;SC=CAGTATCGATGTGGAACAGCT;SOR=0.650;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=277;TCF=139;TCR=138;TR=129;WE=139275302;WS=139275284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,145:0.48:304
chr9	139276680	rs3812573	C	T	1211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=16;PP=621;ReadPosRankSum=2.059;SC=GTGGCGTGCGCGTGGGTGTCT;SOR=0.663;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=60;TCR=28;TR=51;WE=139276688;WS=139276670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,57:0.59:96
chr9	139279173	rs10781510	G	A	2233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=39;PP=1297;ReadPosRankSum=0.210;SC=GCAACTTACCGACACCATATT;SOR=0.658;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=170;TCF=95;TCR=75;TR=90;WE=139279181;WS=139279163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,103:0.55:188
chr9	139281847	rs78428995	T	C	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=324;ReadPosRankSum=0.653;SC=CGCTGGCCGCTGTCCCCCAGC;SOR=1.519;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=18;WE=139281855;WS=139281837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
chr9	139288682	rs141530587	C	CT	2226.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.346;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.280;NF=12;NR=13;PP=2787;ReadPosRankSum=-1.460;SC=CCGTTTTTGACTTATGGTTTT;SOR=0.862;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=73;TCF=29;TCR=44;TR=25;WE=139288700;WS=139288672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,58:0.38:151
chr9	139288688	rs76179734	G	T	2466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FS=1.293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.61;ReadPosRankSum=-2.236;SOR=0.840;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,64:0.41:158
chr9	139288692	rs11145863	T	C	2499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FS=2.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.24;ReadPosRankSum=-2.870;SOR=0.936;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,69:0.42:164
chr9	139289825	rs4266763	A	G	2823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=58;PP=1633;ReadPosRankSum=-2.360;SC=GGCTTTTGCCATCTTTCACCT;SOR=0.694;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=280;TCF=158;TCR=122;TR=129;WE=139289833;WS=139289815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,145:0.47:310
chr9	139290011	rs11145874	G	A	919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.978;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=21;PP=657;ReadPosRankSum=2.004;SC=GGGGGCTCTGGGGGTGGGGAG;SOR=0.207;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=75;TCF=27;TCR=48;TR=37;WE=139290019;WS=139290001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,39:0.50:78
chr9	139290251	rs4498662	C	G	722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=22;PP=526;ReadPosRankSum=-0.146;SC=TGGCATGTGACGAGATGAGAC;SOR=0.667;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=70;TCF=28;TCR=42;TR=36;WE=139290259;WS=139290241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,35:0.46:76
chr9	139298580	rs1131992	C	T	1188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.651;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=12;PP=1618;ReadPosRankSum=-0.780;SC=TGCTTCACCACGGTCAGGCTG;SOR=1.114;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=110;TCF=77;TCR=33;TR=47;WE=139298601;WS=139298570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,55:0.46:120
chr9	139298593	rs1051957	A	G	1538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.598;HP=4;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=25;PP=1618;ReadPosRankSum=-1.421;SC=TCAGGCTGGCACCCTGGCCGC;SOR=0.616;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=144;TCF=90;TCR=54;TR=65;WE=139298601;WS=139298570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,78:0.49:160
chr9	139299637	rs3812577	C	T	2143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=35;PP=1215;ReadPosRankSum=1.063;SC=TTCTAACTTCCGCTCAAGCGT;SOR=0.709;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=216;TCF=137;TCR=79;TR=97;WE=139299645;WS=139299627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,107:0.45:240
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chr9	139301583	rs3087886	T	C	696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=2.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.94;ReadPosRankSum=-0.777;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,32:0.64:50
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chr9	139316601	rs10870165	C	T	1877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.322;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=43;PP=1192;ReadPosRankSum=-0.515;SC=GTCGTGGGGTCGCAGACCTGG;SOR=0.448;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=168;TCF=79;TCR=89;TR=85;WE=139316609;WS=139316591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,89:0.50:179
chr9	139324029	rs35873563	C	T	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.178;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=23;ReadPosRankSum=0.536;SC=CACAGTCCCTCGGATCCCCGA;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=3;WE=139324037;WS=139324019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr9	139324737	rs33982662	C	A	1447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=2.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.62;ReadPosRankSum=0.724;SOR=0.479;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,75:0.45:168
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chr9	139326253	rs11146014	T	C	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=179;ReadPosRankSum=-1.720;SC=TCTCCCTCCATGCCCGCCCCC;SOR=0.269;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=10;WE=139326261;WS=139326243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr9	139327034	rs10870194	A	G	2981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.268;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=55;PP=1657;ReadPosRankSum=0.116;SC=CCTTCCCGTCACCTGCTGTGG;SOR=0.788;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=249;TCF=135;TCR=114;TR=130;WE=139327042;WS=139327024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,146:0.53:278
chr9	139327062	rs34936112	G	A	5814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FS=4.575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.91;ReadPosRankSum=1.297;SOR=0.490;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:140,152:0.52:292
chr9	139327062	.	GGA	AGG	2944	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=66;NR=61;PP=2944;QD=20;SC=AATGGGGTAGGGACCACAGGG;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=256;TCF=125;TCR=131;TR=127;WE=139327072;WS=139327052;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:129,127:0.50:256
chr9	139327064	rs34302850	A	G	5814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FS=5.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.40;ReadPosRankSum=0.751;SOR=0.469;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:134,151:0.53:285
chr9	139327143	rs35531907	C	T	1844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=35;PP=1705;ReadPosRankSum=1.027;SC=CCCCGGCAGACGCAACCCCAC;SOR=0.671;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=30;TCR=62;TR=52;WE=139327162;WS=139327133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,53:0.55:97
chr9	139327154	rs34985258	C	T	1644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.663;HP=3;HapScore=3;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=29;PP=1705;ReadPosRankSum=1.117;SC=GCAACCCCACCGGGCATCCGC;SOR=1.232;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=68;TCF=19;TCR=49;TR=38;WE=139327162;WS=139327133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,42:0.56:75
chr9	139327277	rs34619169	G	A	581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.249;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=383;ReadPosRankSum=-0.876;SC=CTTAGCAAGCGTGGTGCCCAC;SOR=0.175;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=23;WE=139327285;WS=139327267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,25:0.61:41
chr9	139327439	rs10781542	A	G	4359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=418;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.740;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=103;PP=2896;ReadPosRankSum=-0.934;SC=AGAGGAAGGAAGTGCCAAAAA;SOR=0.757;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=388;TCF=192;TCR=196;TR=193;WE=139327447;WS=139327429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:209,208:0.50:417
chr9	139327599	rs71269007	G	GCGCCCACCCCTCCAGCCA	2568.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FS=2.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.96;MQRankSum=5.884;QD=13.24;ReadPosRankSum=3.675;SOR=0.923;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:125,69:0.36:194
chr9	139328722	rs7851507	G	T	1169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=31;PP=619;ReadPosRankSum=-1.974;SC=CAAAAAGGGAGCTGCCCGGTC;SOR=0.632;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=116;TCF=43;TCR=73;TR=52;WE=139328730;WS=139328712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,57:0.47:122
chr9	139333049	rs5901103	GCCCT	G	906.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.606;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=762;ReadPosRankSum=0.459;SC=CACCCGCCAGGCCCTCCCTAC;SOR=1.747;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=35;TCF=19;TCR=16;TR=17;WE=139333060;WS=139333039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,25:0.42:60
chr9	139340351	rs36066734	A	G	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=337;ReadPosRankSum=0.740;SC=AACCCTGTTGACTCTAGACCC;SOR=0.892;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=18;WE=139340359;WS=139340341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,19:0.68:28
chr9	139341529	rs3841203	CA	C	1519.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.923;HP=10;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.794;NF=3;NR=43;PP=547;ReadPosRankSum=-0.487;SC=ACAGGCAAATCAAAAAAAAAA;SOR=0.358;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=96;TCF=11;TCR=85;TR=46;WE=139341537;WS=139341519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,73:0.60:122
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chr9	139354097	rs35857370	G	A	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.187;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=281;ReadPosRankSum=0.891;SC=CACCAGAGACGCCAGCCGGAC;SOR=0.260;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=14;WE=139354105;WS=139354087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
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chr9	139418260	rs4489420	A	G	2697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=36;PP=1570;ReadPosRankSum=0.819;SC=TGAGGCAGGCATTGTCCAGGG;SOR=0.342;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=99;TCF=63;TCR=36;TR=98;WE=139418268;WS=139418250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,105:0.99:106
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chr9	139566823	rs1051828	A	G	2387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=54;PP=1627;SC=GGGTCCAGAAACCACCTCGGG;SOR=2.245;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=18;TCR=54;TR=72;WE=139566831;WS=139566813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
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chr9	139572068	rs2236514	C	G	2825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.43;SOR=1.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr9	139612191	rs181849819	C	T	3489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.864;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=83;PP=2148;ReadPosRankSum=-0.119;SC=GGGCTGGGGACTGGGCCGTGC;SOR=0.634;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=287;TCF=124;TCR=163;TR=150;WE=139612199;WS=139612181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,166:0.53:316
chr9	139616742	rs945384	A	G	3857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=74;NR=70;PP=2455;SC=GATGACCCTCAGCTTCCTCAA;SOR=0.734;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=145;TCF=74;TCR=71;TR=144;WE=139616750;WS=139616732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
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chr9	139621168	rs2275160	G	A	846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.889;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=13;PP=530;ReadPosRankSum=1.224;SC=AGATACCAGCGAAGGAAAACA;SOR=0.507;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=78;TCF=54;TCR=24;TR=37;WE=139621176;WS=139621158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,40:0.48:83
chr9	139621326	rs2275159	G	A	2239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=53;PP=1269;ReadPosRankSum=0.652;SC=CGCCTCTAGGGGCAGTGTCCT;SOR=0.685;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=212;TCF=95;TCR=117;TR=99;WE=139621334;WS=139621316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,111:0.48:232
chr9	139634495	rs9886752	G	A	2608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.343;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=73;PP=1683;ReadPosRankSum=1.264;SC=GAAACATTCTGCCTATCTGAG;SOR=0.906;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=256;TCF=112;TCR=144;TR=123;WE=139634503;WS=139634485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,129:0.47:273
chr9	139635199	rs145287279	C	CTCCTGGG	373.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=354;ReadPosRankSum=0.612;SC=CCCGCCTCACCTCCTGCCCGG;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=5;WE=139635207;WS=139635189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr9	139635430	rs7848807	C	T	2189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=56;PP=1316;ReadPosRankSum=1.255;SC=CGCTGGTTCCCGGATGGCGTG;SOR=0.687;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=174;TCF=72;TCR=102;TR=95;WE=139635438;WS=139635420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,102:0.55:184
chr9	139635877	rs12345308	C	T	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=266;ReadPosRankSum=-2.705;SC=TGCCAGCCACCGAGCCCCACC;SOR=0.725;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=72;TCF=17;TCR=55;TR=22;WE=139635885;WS=139635867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,24:0.31:77
chr9	139639004	rs7848644	A	G	1651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.556;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=30;PP=1001;ReadPosRankSum=0.704;SC=GCCAGAATCAACCCCAGGGTC;SOR=0.619;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=169;TCF=104;TCR=65;TR=76;WE=139639012;WS=139638994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,82:0.45:183
chr9	139639532	rs145717467	CGGCCCACGCACCACACAGCTCCCAACGTGGGCCCCGAGT	C	1241.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=1.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.78;ReadPosRankSum=1.962;SOR=0.474;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,40:0.48:84
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chr9	139642961	rs2811728	G	A	2328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.024;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=47;PP=1296;ReadPosRankSum=1.802;SC=CTGCGCCGCAGGCCCAGGATG;SOR=0.610;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=197;TCF=98;TCR=99;TR=98;WE=139642969;WS=139642951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,112:0.50:225
chr9	139643023	rs1360879	G	A	1383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=38;PP=766;ReadPosRankSum=2.246;SC=GAATTTCTCCGTGTGGGTGGC;SOR=0.697;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=143;TCF=62;TCR=81;TR=65;WE=139643031;WS=139643013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,72:0.43:166
chr9	139648918	rs2282261	T	G	1329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.212;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=29;PP=825;ReadPosRankSum=-0.123;SC=GGGCGGGCGCTCCGAACCTTG;SOR=0.390;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=124;TCF=76;TCR=48;TR=63;WE=139648926;WS=139648908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,66:0.49:135
chr9	139649580	rs879467	G	A	877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.024;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=8;PP=472;ReadPosRankSum=1.864;SC=TCGGGGGTCAGGCTCACCTCC;SOR=1.041;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=67;TCF=47;TCR=20;TR=36;WE=139649588;WS=139649570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,42:0.57:74
chr9	139649612	rs2282258	C	A	1134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.395;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=20;PP=716;ReadPosRankSum=-0.504;SC=GGCACACCGCCCTGCAGGATA;SOR=0.565;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=124;TCF=82;TCR=42;TR=51;WE=139649620;WS=139649602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,56:0.41:138
chr9	139650060	rs2784068	C	A	2796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.595;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=57;PP=1721;ReadPosRankSum=-0.020;SC=ATCCTGCCCCCACCCAGTCCC;SOR=0.547;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=265;TCF=146;TCR=119;TR=123;WE=139650068;WS=139650050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,137:0.49:282
chr9	139650167	.	G	GAACAGCATGGGGAACAGTGCAGGGAACCCTGCAGGGAACAGCATGGGGAACGGTGCAGGA	9150.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.926;ClippingRankSum=0.000;DP=403;ExcessHet=3.0103;FS=6.021;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.10;MQRankSum=0.310;QD=111.59;ReadPosRankSum=-0.456;SOR=2.257;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,79:0.96:82
chr9	139650581	.	CA	C	6114.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.488;ClippingRankSum=0.000;DP=289;ExcessHet=3.0103;FS=3.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQRankSum=-1.543;QD=21.61;ReadPosRankSum=1.643;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:134,149:0.53:283
chr9	139650583	.	GGGAACAGCATGTGGAACAGCGCAGGGAACAGCATGAGGAACAGTGCA	G	5955.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=0.000;DP=391;ExcessHet=3.0103;FS=1.201;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQRankSum=0.026;QD=15.27;ReadPosRankSum=1.314;SOR=0.625;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:227,163:0.42:390
chr9	139650595	rs35874639	T	G	4567.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-5.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.314;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.338;NF=88;NR=78;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.975;SC=GAACAGCATGTGGAACAGCGC;SOR=0.971;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=179;TCF=94;TCR=85;TR=166;WE=139650627;WS=139650572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,134:0.45:296
chr9	139650619	rs35341952	A	G	4814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-4.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.736;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.975;NF=98;NR=83;PP=2962;ReadPosRankSum=0.814;SC=GAACAGCATGAGGAACAGTGC;SOR=0.897;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=182;TCF=98;TCR=84;TR=181;WE=139650627;WS=139650572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,143:0.47:305
chr9	139650653	.	CA	C	7145.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.073;ClippingRankSum=0.000;DP=364;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQRankSum=-0.018;QD=19.63;ReadPosRankSum=-1.525;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:182,182:0.50:364
chr9	139650654	.	A	G	1564	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=31;MMLQ=24;MQ=59.07;NF=62;NR=49;PP=1564;QD=14.4033442572;SC=GGAACAGCGCAGGGAACAGCA;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=282;TCF=152;TCR=130;TR=111;WE=139650662;WS=139650644;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:171,111:0.39:282
chr9	139650655	.	GGGAACAGCATGGGGAACAGTGCA	G	6851.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.997;ClippingRankSum=0.000;DP=432;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQRankSum=-0.250;QD=15.86;ReadPosRankSum=-1.918;SOR=0.725;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:246,186:0.43:432
chr9	139651163	rs57411373	A	AG	552.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=466;SC=GGAGTATCCCAGGCCTGGAGC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=13;WE=139651171;WS=139651153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	139652269	rs7045311	G	A	1622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=33;PP=990;ReadPosRankSum=0.064;SC=GCGTCCCCACGAGCTCCCCAC;SOR=0.717;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=181;TCF=96;TCR=85;TR=73;WE=139652277;WS=139652259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,83:0.43:195
chr9	139652329	rs7045416	G	C	1471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.009;HP=1;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=33;PP=1956;ReadPosRankSum=-0.499;SC=GGTGTAGGAGGAGCCCCACCA;SOR=0.888;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=142;TCF=70;TCR=72;TR=62;WE=139652346;WS=139652319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,71:0.46:156
chr9	139652338	rs9411272	C	G	1700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=40;PP=2445;ReadPosRankSum=-1.491;SC=GGAGCCCCACCAACTAAGAAG;SOR=0.642;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=133;TCF=64;TCR=69;TR=77;WE=139652346;WS=139652319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,82:0.56:146
chr9	139653055	rs11145867	C	T	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.922;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=164;ReadPosRankSum=0.051;SC=GCTTGCAGCCCGCCTGGCCTC;SOR=0.307;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=13;WE=139653063;WS=139653045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr9	139656618	rs2484658	T	C	867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.45;SOR=2.012;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr9	139656670	rs2297722	T	C	2905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=35;PP=1628;SC=ATCATGTCCTTGGGGAGCCCC;SOR=1.402;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=101;TCF=66;TCR=35;TR=101;WE=139656678;WS=139656660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr9	139656706	rs2297723	A	C	3963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=83;NR=56;PP=2356;SC=TCCTGGAAGGACTTCAGAGCC;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=83;TCR=56;TR=139;WE=139656714;WS=139656696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr9	139657834	rs9987876	G	C	3523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=74;NR=53;PP=1808;SC=TGGTGCTGAGGGCCCCCTCCA;SOR=0.880;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=127;TCF=74;TCR=53;TR=127;WE=139657842;WS=139657824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr9	139658051	rs4880070	G	T	587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=13;PP=430;SC=GGGAGGGCGGGCAGGGGGCTG;SOR=1.721;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=19;WE=139658059;WS=139658041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	139658576	rs4880140	G	C	588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=17;PP=466;SC=GAGTGGCCATGTCTTGGGTGT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=139658584;WS=139658566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	139690840	rs1055995	G	A	1938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=30;NR=29;PP=978;SC=TGGGGGGCCTGAGAGCAGCCA;SOR=0.898;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=59;TCF=30;TCR=29;TR=59;WE=139690848;WS=139690830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr9	139699964	rs2811793	T	C	1448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=31;PP=983;SC=GCCTCTCACGTCTGGGTAATG;SOR=1.958;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=14;TCR=31;TR=45;WE=139699972;WS=139699954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr9	139700605	rs2811795	T	C	2682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=30;PP=1490;SC=CTGTGAGGAGTGGCGGGTGCA;SOR=1.469;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=56;TCR=30;TR=86;WE=139700613;WS=139700595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr9	139701108	rs2254143	A	C	9191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=135;NR=156;PP=2965;SC=ATGGGCATTAACTTGCCTGCG;SOR=0.944;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=292;TCF=136;TCR=156;TR=291;WE=139701116;WS=139701098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,327:1.00:327
chr9	139701983	rs3739944	C	G	3045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=29;PP=1890;SC=CTGCGCCTAGCTGGGCTAGCC;SOR=1.747;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=65;TCR=29;TR=94;WE=139701991;WS=139701973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr9	139702908	rs7864908	C	T	251.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=7;PP=162;SC=GCCCGCCGGGCGCTCCGGGAG;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=139702916;WS=139702898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr9	139726239	rs2811748	A	G	4343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=73;PP=2677;SC=GCGTGCTGGGAAACTACCGGG;SOR=0.855;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=144;TCF=71;TCR=73;TR=144;WE=139726247;WS=139726229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr9	139730129	rs2811744	T	C	842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=10;PP=434;SC=ATTCAGGGGCTGTGGGGCTGG;SOR=1.214;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=19;TCR=10;TR=29;WE=139730137;WS=139730119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr9	139731531	rs140657278	G	A	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=1.370;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.674;NF=4;NR=1;PP=71;ReadPosRankSum=0.303;SC=GTTTCACTGCGTTAGCCAGGA;SOR=0.693;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=5;WE=139731539;WS=139731521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr9	139731969	rs2811742	C	T	1009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=14;PP=841;SC=CCCTCAATGCCGCCCCACCAT;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=19;TCR=14;TR=33;WE=139731977;WS=139731959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr9	139732331	rs2811741	G	C	934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=23;NR=8;PP=562;SC=CCCGGCCGCAGAGGGCCCAGC;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=31;WE=139732339;WS=139732321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr9	139739643	rs10870132	T	C	569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=15;NR=4;PP=303;SC=GGCCCCTGCCTGGGCCCCGGG;SOR=1.508;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=19;WE=139739651;WS=139739633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr9	139744807	rs872463	A	G	1557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=12;PP=1128;SC=ACACCCCCAGACATGGCCGGC;SOR=2.170;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=36;TCR=12;TR=48;WE=139744815;WS=139744797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr9	139746992	rs10123375	G	A	3340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=63;PP=2050;SC=GGCAGTGACGGACACCAGGGC;SOR=1.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=114;TCF=51;TCR=63;TR=114;WE=139747000;WS=139746982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr9	139749067	rs7869864	C	T	3583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=53;PP=2187;SC=GGAACCACCGCGCTGGTGGTC;SOR=0.945;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=66;TCR=53;TR=118;WE=139749075;WS=139749057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr9	139752899	rs2275156	T	G	8167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.647;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=120;NR=161;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.958;SC=CCACCTGGCCTGGCCCGGCCT;SOR=0.694;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=283;TCF=122;TCR=161;TR=281;WE=139752907;WS=139752889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,307:1.00:308
chr9	139754617	.	A	C	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.208;HP=7;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=129;ReadPosRankSum=0.319;SC=AGGAGCCCCCACCTGTGCAAG;SOR=0.247;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=10;WE=139754625;WS=139754601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
chr9	139760830	rs76229681	CG	C	1455.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=30;PP=933;SC=TGGCTGCACGCGGGGGGCGGG;SOR=2.786;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=30;WE=139760838;WS=139760820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr9	139804274	rs4567138	G	A	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=4.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=330;ReadPosRankSum=0.614;SC=GTGCTCCTGCGGCCCCTCGGC;SOR=0.223;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=17;WE=139804282;WS=139804264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr9	139804346	rs4448378	C	T	1754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.971;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=30;PP=1160;ReadPosRankSum=-0.243;SC=CGTCCACCCTCACACTCCTGA;SOR=0.533;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=160;TCF=105;TCR=55;TR=81;WE=139804354;WS=139804336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,82:0.47:174
chr9	139815053	rs10781522	G	A	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=253;ReadPosRankSum=-1.433;SC=AGCAGGTCCTGGAGCTTTAGA;SOR=2.120;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=14;WE=139815061;WS=139815043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr9	139818169	rs17250631	CTT	C	160.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=146;ReadPosRankSum=2.260;SC=GGAAAAAAAACTTTTCTTTGC;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=5;WE=139818178;WS=139818159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr9	139820048	rs17250673	G	A	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=137;ReadPosRankSum=-0.580;SC=GCCTCCTGCTGGTGGCCCTGC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=9;WE=139820056;WS=139820038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr9	139820421	rs7852970	G	A	1216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=28;PP=689;ReadPosRankSum=-0.382;SC=GGGCCACCACGCTGGGCCAGG;SOR=0.637;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=96;TCF=38;TCR=58;TR=49;WE=139820429;WS=139820411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,57:0.51:111
chr9	139836362	rs7040705	G	A	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.027;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=57;ReadPosRankSum=1.020;SC=CCCAGGTCTGGGCTTGTGACC;SOR=1.329;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=6;WE=139836370;WS=139836352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
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chr9	139837990	rs2271872	G	C	602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=19;PP=370;ReadPosRankSum=1.081;SC=TCCTGGGCCCGGGCCTTCCTC;SOR=0.602;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=42;TCF=12;TCR=30;TR=28;WE=139837998;WS=139837980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,28:0.67:42
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chr9	139848688	rs4880175	C	T	2611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.546;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=41;PP=1568;ReadPosRankSum=-0.937;SC=ATGACAACATCGTCTTCCCAG;SOR=1.044;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=245;TCF=143;TCR=102;TR=113;WE=139848696;WS=139848678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,127:0.47:269
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chr9	139864341	rs2386136	A	G	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=4.260;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=63;ReadPosRankSum=-0.414;SC=CTGCCAGGCCAGCTGCTGCCC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=5;WE=139864349;WS=139864331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr9	139866247	rs11790360	T	G	1406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.671;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=35;PP=802;ReadPosRankSum=0.769;SC=CGGCAGGCCTTGGGGGTGTGG;SOR=0.781;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=48;TCR=70;TR=59;WE=139866255;WS=139866237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,67:0.52:128
chr9	139872048	rs4880179	A	G	4346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=59;PP=2546;SC=CTCATCACACACTGTGGATGG;SOR=1.004;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=149;TCF=90;TCR=59;TR=149;WE=139872056;WS=139872038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr9	139872291	rs71897337	AAGGAGGCTGGGTAGCCGCCCG	A	573.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=2967;ReadPosRankSum=0.563;SC=GGCGCGCAGGAAGGAGGCTGG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=8;WE=139872319;WS=139872281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr9	139875318	rs146717258	C	CCATT,CCATTCATT	1867.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0,0;NR=31,31;PP=732,787;ReadPosRankSum=-0.775;SC=GTGAGCCACTCCATTCATTCA;SOR=1.739;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=72;TCF=2;TCR=70;TR=31,31;WE=139875326;WS=139875308;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.51,0.47:47
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chr9	139878828	rs4880082	T	C	915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.772;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=15;PP=562;ReadPosRankSum=1.557;SC=CCATGTCCTCTAAGGATTGTG;SOR=0.587;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=88;TCF=53;TCR=35;TR=39;WE=139878836;WS=139878818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,44:0.46:96
chr9	139879067	rs2049042	T	C	1556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.616;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=17;PP=1107;ReadPosRankSum=-0.695;SC=GGAGGCTGCATGGACTGCTGG;SOR=1.397;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=52;TCF=34;TCR=18;TR=51;WE=139879075;WS=139879057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,54:0.98:55
chr9	139879113	rs2049041	G	A	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=2.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.14;ReadPosRankSum=1.210;SOR=0.409;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,26:0.27:97
chr9	139879170	rs17578859	G	A	3539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.455;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=73;PP=2000;ReadPosRankSum=0.107;SC=TCCAGCCATGGCCCTGAGTGA;SOR=0.600;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=257;TCF=140;TCR=117;TR=157;WE=139879178;WS=139879160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,169:0.60:282
chr9	139887042	rs10870159	G	C	1898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=41;PP=916;ReadPosRankSum=1.570;SC=GGGAGGTAGGGGTGCAGGGAG;SOR=0.667;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=141;TCF=73;TCR=68;TR=83;WE=139887050;WS=139887032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,93:0.59:158
chr9	139902214	rs10870161	A	G	347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=2;PP=173;SC=CGCAGTGACCACAGGGCATGG;SOR=1.765;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=139902222;WS=139902204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	139902712	rs4880185	A	G	5744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=103;NR=96;PP=2965;SC=CTCCAGGCCTATCTGCAAGTG;SOR=0.731;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=199;TCF=103;TCR=96;TR=199;WE=139902720;WS=139902702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr9	139902786	rs4880186	G	C	5200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=86;NR=75;PP=2938;SC=GTTCTCCCCCGACCCCACCCG;SOR=0.747;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=161;TCF=86;TCR=75;TR=161;WE=139902805;WS=139902776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr9	139902797	rs4880187	C	G	4773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=83;NR=73;PP=2707;SC=ACCCCACCCGCGGCTGGAGCC;SOR=0.738;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=156;TCF=83;TCR=73;TR=156;WE=139902805;WS=139902776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr9	139903352	rs59031144	G	GC	1187.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.130;HP=8;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=24;PP=616;ReadPosRankSum=-0.159;SC=GCCTGGCAGCGCCCCCCCACC;SOR=1.047;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=22;TCR=79;TR=31;WE=139903360;WS=139903342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,53:0.37:143
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chr9	139906359	rs2271862	G	A	3103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.013;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=62;PP=1624;ReadPosRankSum=1.389;SC=CAAACTGCAGGTGCTTGGCCT;SOR=0.623;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=288;TCF=156;TCR=132;TR=133;WE=139906367;WS=139906349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,153:0.49:315
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chr9	139908265	rs10781531	T	C	3366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=70;NR=38;PP=1688;SC=CCAGCACCCCTGTCCAGCCGG;SOR=1.206;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=70;TCR=38;TR=108;WE=139908273;WS=139908255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr9	139910648	rs6560657	T	C	6690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=113;NR=114;PP=2965;SC=GGCGGGGTCATGACCCCACGC;SOR=0.856;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=227;TCF=113;TCR=114;TR=227;WE=139910656;WS=139910638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr9	139912178	rs879854	G	A	4627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=69;PP=2965;SC=GGCAGGCCCCGGGGAGGACGC;SOR=0.848;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=154;TCF=85;TCR=69;TR=154;WE=139912186;WS=139912168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr9	139912484	rs908832	A	G	5978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=106;NR=95;PP=2965;SC=GCTCCACCACATCGTGCCCCA;SOR=0.702;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=201;TCF=106;TCR=95;TR=201;WE=139912492;WS=139912474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr9	139913239	rs908828	T	G	5693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=114;NR=76;PP=2965;SC=CTCCTCGTCGTGGAAGCCCTT;SOR=0.991;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=190;TCF=114;TCR=76;TR=190;WE=139913247;WS=139913229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr9	139916471	rs142576618	A	ATGGCTCAGATGGGGGTG	2791.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.85;QD=41.67;SOR=2.338;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr9	139923265	rs4880189	A	G	4344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=60;PP=2592;SC=GCTCGCCGTGAGCGGAGCAGG;SOR=0.813;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=79;TCR=60;TR=139;WE=139923273;WS=139923255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr9	139926402	rs7469569	T	C	8061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=173;NR=109;PP=2965;SC=TGTCCCCAGCTTGGGCCTCCC;SOR=1.105;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=283;TCF=174;TCR=109;TR=282;WE=139926410;WS=139926392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,303:1.00:303
chr9	139934255	rs143311398	G	A	2573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.712;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=48;PP=1612;ReadPosRankSum=0.108;SC=GCTGGGGGCCGGCAGGGGCGC;SOR=0.557;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=192;TCF=98;TCR=94;TR=103;WE=139934263;WS=139934245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,117:0.55:214
chr9	139937795	rs10781535	T	C	6509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.69;SOR=1.194;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr9	139937799	rs10781536	G	A	6509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.89;SOR=1.210;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr9	139943549	rs7390981	G	A	3075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=44;PP=2022;SC=GCGGGACACCGTCAGGCAGGC;SOR=0.912;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=58;TCR=44;TR=102;WE=139943557;WS=139943539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr9	139944496	.	T	C	855	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=24;MQ=59.42;NF=15;NR=31;PP=855;QD=19.3428524467;SC=GAGCACCTGCTGCCACCCGCC;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=15;TCR=31;TR=46;WE=139944517;WS=139944486;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr9	139944509	.	T	C	452	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=27;MQ=57.56;NF=9;NR=16;PP=452;QD=19.4708485019;SC=CACCCGCCTGTCCCTACTCAC;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=26;TCF=10;TCR=16;TR=25;WE=139944517;WS=139944486;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,25:0.96:26
chr9	139944548	.	T	C	198	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=55;MMLQ=27;MQ=47.26;NF=2;NR=6;PP=198;QD=29.0964015684;SC=CCGCCTGCCCTTACCCACGAC;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=8;WE=139944556;WS=139944538;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,8:0.73:11
chr9	139944689	.	T	C	549	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;FR=0.5358;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MMLQ=18;MQ=43.74;NF=21;NR=10;PP=549;QD=18.831329437;SC=CACCCGCCTGTCCCTACCCAC;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=35;TCF=22;TCR=13;TR=31;WE=139944697;WS=139944679;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:4,31:0.89:35
chr9	139945051	rs7869520	A	G	1103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=25;PP=771;SC=CCAGCCTGACAAACCTCCCAC;SOR=2.964;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=31;WE=139945059;WS=139945041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr9	139946804	rs2271867	C	G	5729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.27;MQRankSum=0.253;QD=25.24;ReadPosRankSum=-0.849;SOR=0.854;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,225:0.99:227
chr9	139946905	rs34679600	C	CA	1118.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=4;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;NF=1;NR=21;PP=486;SC=CTCCCCCCCCCACCCAGTCAT;SOR=3.014;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=22;WE=139946924;WS=139946895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	139946916	rs11145979	G	A	908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=15;PP=404;SC=ACCCAGTCATGTGCCAAGCCT;SOR=2.531;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=139946924;WS=139946895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	139960178	rs2176674	A	G	4835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=78;NR=89;PP=2936;SC=ACACGTCCACACATGCATGAG;SOR=0.953;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=167;TCF=78;TCR=89;TR=167;WE=139960186;WS=139960168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr9	139960894	rs72763246	C	T	1487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=24;NR=27;PP=830;SC=TGAGGTGCAGCGGCCTCCACA;SOR=0.960;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=52;TCF=25;TCR=27;TR=51;WE=139960902;WS=139960884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr9	139973186	rs7390974	T	C	1888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=48;PP=1435;SC=GGGAGCGTAGTTGGGGGTCCA;SOR=3.538;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=8;TCR=48;TR=56;WE=139973194;WS=139973176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
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chr9	139973629	rs7390710	A	C	6164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=90;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.817;SC=GGCGCCCCGCACCCGAGGCTG;SOR=1.213;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=163;TCF=71;TCR=92;TR=160;WE=139973637;WS=139973604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,168:0.99:170
chr9	139973652	rs7390711	A	G	5298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=68;PP=2339;SC=CCCGCCCCTCACGGAGCCCCG;SOR=1.311;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=115;TCF=47;TCR=68;TR=113;WE=139973660;WS=139973642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr9	139973820	rs7037849	C	T	6387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=104;PP=2965;SC=CAGCTACGTGCCTCCGACGGG;SOR=0.727;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=213;TCF=109;TCR=104;TR=213;WE=139973828;WS=139973810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr9	139975108	rs9314874	T	C	5464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=115;NR=76;PP=2965;SC=GCCTCTGTGCTGGGACGTGGG;SOR=1.061;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=193;TCF=115;TCR=78;TR=191;WE=139975116;WS=139975098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr9	139975195	rs41302685	C	T	10035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=378;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=168;NR=171;PP=2965;SC=CACTGAAGAACGCAGAGCCAG;SOR=0.816;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=340;TCF=168;TCR=172;TR=339;WE=139975206;WS=139975185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,376:1.00:376
chr9	139977195	rs4390039	T	C	915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=11;NR=21;PP=563;SC=GCCCAGACTGTCCCCAGACTC;SOR=1.885;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=11;TCR=21;TR=32;WE=139977203;WS=139977185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr9	139981241	rs968732	GT	CG	2636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=43;PP=2344;SC=AGCTACGCTCGTAGCACACCT;SOR=2.546;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=56;TCF=13;TCR=43;TR=53;WE=139981250;WS=139981231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr9	139981627	rs968733	A	G	4333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=72;PP=2765;SC=TTTGGCGAGAACTATGACAAC;SOR=0.813;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=143;TCF=70;TCR=73;TR=142;WE=139981635;WS=139981617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr9	139982868	rs3750518	C	T	4682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=84;PP=2642;SC=CTGATATGTCCAGCCTCCCTT;SOR=0.992;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=157;TCF=73;TCR=84;TR=157;WE=139982876;WS=139982858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr9	139990906	rs4880199	T	C	317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=13;PP=264;SC=AAAACAAGATTGCGGAAACGC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=139990914;WS=139990896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	139994102	rs4880200	G	A	1480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=13;PP=1028;SC=CTGTGCCGACGCCAGGACCAC;SOR=1.893;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=37;TCR=13;TR=50;WE=139994110;WS=139994092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr9	139996641	rs13298199	C	A	11527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=499;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=12.942;NF=205;NR=221;PP=2962;ReadPosRankSum=7.899;SC=GAGTACAGGTCGGTGGTGTTA;SOR=0.604;SbPval=0.54;Source=Platypus;TCF=289;TR=426;WS=139996631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:34,464:0.93:498
chr9	139996653	.	ACG	A	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.54;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MMLQ=26;MQ=50.95;NF=22;NR=116;PP=2962;QD=20;SC=GTGGTGTTACACGTGCTGTTG;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=327;TCF=37;TCR=290;TR=138;WE=139996662;WS=139996631;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:189,138:0.42:327
chr9	139996739	.	A	ACG	2954	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.55;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=39;MMLQ=25;MQ=53.01;NF=10;NR=105;PP=2954;QD=20;SC=ACACACATTCACTGTTGCAGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=236;TCF=51;TCR=185;TR=115;WE=139996757;WS=139996725;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:121,115:0.49:236
chr9	139996749	.	G	A	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.55;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=39;MMLQ=24;MQ=52.87;NF=23;NR=78;PP=2962;QD=20;SC=ACTGTTGCAGGCGTGCAGGTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=347;TCF=170;TCR=177;TR=101;WE=139996757;WS=139996725;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:246,101:0.29:347
chr9	139996768	.	T	TAC	2964	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.55;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=41;MMLQ=26;MQ=53.04;NF=8;NR=77;PP=2964;QD=20;SC=TCGGTGGTGTTACACATTCAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=268;TCF=63;TCR=205;TR=85;WE=139996786;WS=139996754;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:183,85:0.32:268
chr9	139996933	rs10118812	T	G	12355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=456;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=219;NR=195;PP=2965;SC=ACACATTCATTCTGTTGCAGG;SOR=0.804;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=415;TCF=219;TCR=196;TR=414;WE=139996941;WS=139996916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,454:1.00:454
chr9	139997167	.	CATTCAT	C	2968	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MMLQ=24;MQ=47.07;NF=69;NR=103;PP=2968;QD=20;SC=CTGTTACACACATTCATGCTG;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=573;TCF=188;TCR=385;TR=172;WE=139997189;WS=139997116;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:401,172:0.30:573
chr9	139997245	.	CAT	C	2968	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.55;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=58;MMLQ=25;MQ=43.07;NF=126;NR=341;PP=2968;QD=20;SC=GTGTTACACACATTCATGCTG;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=916;TCF=228;TCR=688;TR=467;WE=139997259;WS=139997225;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:449,467:0.51:916
chr9	139997563	.	A	ACATT	2968	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.52;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=36;MMLQ=27;MQ=43.85;NF=36;NR=162;PP=2968;QD=20;SC=GGTGTTACACACATGCTGTTG;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=553;TCF=96;TCR=457;TR=198;WE=139997574;WS=139997553;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:355,198:0.36:553
chr9	140001341	rs5901117	G	GAAC	5352.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=6;NR=53;PP=2924;SC=ATGTCAAAAAGAACGAAATCC;SOR=1.142;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=6;TCR=54;TR=59;WE=140001349;WS=140001331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr9	140002220	rs10117795	A	G	3643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=64;PP=2357;SC=TGTGACCTGGATCCGGGAGGG;SOR=1.057;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=51;TCR=64;TR=115;WE=140002228;WS=140002210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr9	140002501	rs6420280	T	C	335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=4;NR=7;PP=197;SC=AGAGTGTCACTTCCTGGCTCT;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=11;WE=140002509;WS=140002491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	140002989	rs4880091	T	C	7227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=110;NR=135;PP=2965;SC=TCAGCCTGGATGCCTACGTGT;SOR=0.955;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=245;TCF=110;TCR=135;TR=245;WE=140002997;WS=140002979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,272:1.00:272
chr9	140003427	rs4567	A	G	4392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=78;NR=69;PP=2455;SC=GAAGCCTCAGATGTCCCCAAT;SOR=0.767;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=78;TCR=69;TR=147;WE=140003435;WS=140003417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr9	140003529	rs71803786	G	GC	1647.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=27;PP=1214;SC=GATCCTCCTGGCCGCCCCGCA;SOR=1.426;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=29;WE=140003537;WS=140003519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr9	140006202	rs13631	G	A	4911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=85;PP=2673;SC=TGGCGGCTCTGAGATCTGCAA;SOR=0.850;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=170;TCF=85;TCR=85;TR=170;WE=140006210;WS=140006192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr9	140006425	rs10747048	C	G	7356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=136;NR=116;PP=2965;SC=AGGGCAGGTCCGGGAACATAT;SOR=0.757;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=252;TCF=136;TCR=116;TR=252;WE=140006433;WS=140006415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,289:1.00:289
chr9	140008658	.	CCCCGCGACCCCG	C	2974	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MMLQ=17;MQ=58.89;NF=8;NR=8;PP=2974;QD=20;SC=CACCCACGTGCCCCGCGACCC;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=25;TCF=14;TCR=11;TR=16;WE=140008677;WS=140008648;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:9,16:0.64:25
chr9	140008750	rs10747049	G	C	4287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.68;SOR=0.832;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
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chr9	140055876	rs10747050	G	A	4670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FS=2.677;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.69;ReadPosRankSum=1.696;SOR=0.301;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,173:0.99:175
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chr9	140083320	rs11556579	G	C	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-2.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.318;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=118;ReadPosRankSum=1.257;SC=CCGCCTCGCTGCGGGCATCGC;SOR=0.155;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=11;WE=140083328;WS=140083310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr9	140084376	rs11556580	G	A	1417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.442;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=32;PP=890;ReadPosRankSum=-0.578;SC=ACCAGACCACGGGCAGGGCCT;SOR=0.492;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=106;TCF=49;TCR=57;TR=62;WE=140084384;WS=140084366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,67:0.59:114
chr9	140084485	rs3087779	G	A	513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.212;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=364;ReadPosRankSum=-0.407;SC=CTCAGGTGCCGAGAGGGGCAG;SOR=0.180;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=22;WE=140084493;WS=140084475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,22:0.71:31
chr9	140094605	rs9411313	C	A	342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=126;ReadPosRankSum=0.627;SC=CCGGGGCTCGCCCCGCCACCG;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=29;TCF=10;TCR=19;TR=13;WE=140094613;WS=140094595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr9	140108915	rs149701237	CTG	C	2986.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=39;PP=1916;SC=GGCCGTGGGTCTGGGGTTCGG;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=3;TCR=41;TR=42;WE=140108924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr9	140110274	rs7390663	T	C	5119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=75;PP=2965;SC=ACCCAGGGTCTCCGGGCAGGG;SOR=0.704;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=167;TCF=91;TCR=76;TR=165;WE=140110282;WS=140110264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr9	140119997	.	G	T	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.079;ClippingRankSum=0.000;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=5;PP=443;ReadPosRankSum=-0.227;SC=GCTTTCCTGGGCCGCAGGCTC;SOR=0.883;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=60;TCF=49;TCR=11;TR=28;WE=140120005;WS=140119987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,29:0.46:63
chr9	140120396	rs6606566	C	T	2511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.72;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr9	140122977	rs72763301	C	G	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.885;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=154;ReadPosRankSum=-0.375;SC=CCCACAGACCCAGCGCCTGAC;SOR=1.426;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=22;TCF=7;TCR=15;TR=10;WE=140122985;WS=140122967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr9	140123132	rs6606565	C	G	2011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.178;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=30;PP=1131;ReadPosRankSum=-0.620;SC=GAGGAGAGGACAGACTGCATC;SOR=0.386;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=71;TCF=40;TCR=31;TR=70;WE=140123140;WS=140123122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,78:0.99:79
chr9	140123648	rs138184780	G	A	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.913;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=313;ReadPosRankSum=0.508;SC=CATCCTATACGCAGCTTCGTG;SOR=0.296;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=51;TCF=11;TCR=40;TR=23;WE=140123656;WS=140123638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,24:0.47:51
chr9	140126924	rs72763302	C	G	672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=5;PP=430;SC=GGGACCCAGCCCTGTTGGAGA;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=24;WE=140126932;WS=140126914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr9	140128085	rs28407527	T	C	5018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=90;NR=74;PP=2825;SC=TGGCCCCCAGTTGGACTCCGA;SOR=0.747;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=164;TCF=90;TCR=74;TR=164;WE=140128093;WS=140128075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr9	140128118	rs148072630	G	A	2253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FS=3.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.78;ReadPosRankSum=0.786;SOR=0.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,113:0.54:209
chr9	140130606	rs28542318	A	T	5939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=113;NR=87;PP=2965;SC=GGGGGCATGGAGCTGGCCGCT;SOR=0.898;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=200;TCF=113;TCR=87;TR=200;WE=140130614;WS=140130585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr9	140135792	.	CCCG	C	2079.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.778;ClippingRankSum=0.000;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.805;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=48;PP=2134;ReadPosRankSum=-0.384;SC=CTCCTGCTTCCCCGCCGCCGC;SOR=0.596;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=132;TCF=14;TCR=118;TR=52;WE=140135802;WS=140135772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,107:0.49:217
chr9	140139757	rs9775264	G	A	2005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=30;PP=1137;SC=TCCCCTGGCTGCCTGGTGCTG;SOR=0.719;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=35;TCR=30;TR=65;WE=140139765;WS=140139747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr9	140142299	rs9330201	C	T	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.129;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=20;PP=385;ReadPosRankSum=0.335;SC=CAGGCCACCTCGCTAACCCTG;SOR=0.430;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=57;TCF=15;TCR=42;TR=28;WE=140142307;WS=140142289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,30:0.50:60
chr9	140147094	rs71387813	C	CCT	4869.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=46;PP=2930;SC=CCCTGCAGCCCGTCTCCTACC;SOR=1.138;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=70;TCF=22;TCR=48;TR=68;WE=140147102;WS=140147084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr9	140147152	rs28376526	C	G	4851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;MQ=60.28;NF=83;NR=71;PP=2556;SC=TCAGCCGGCCCGCCTTCCCCG;SOR=0.792;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=155;TCF=84;TCR=71;TR=154;WE=140147160;WS=140147142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr9	140148051	rs28631372	A	G	990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=25;PP=748;SC=TGCCCCTGAAAGGTGCTCTCT;SOR=4.047;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=28;WE=140148059;WS=140148041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr9	140157429	rs13294457	G	A	2795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=18;PP=2052;SC=CGGGCGTGACGTCCCTGTGTC;SOR=2.670;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=73;TCR=18;TR=91;WE=140157437;WS=140157419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr9	140157460	rs13296455	T	C	5072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=115;NR=61;PP=2965;SC=CAGGACGGTCTGGGGGCCTGA;SOR=1.337;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=176;TCF=115;TCR=61;TR=176;WE=140157468;WS=140157450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr9	140157701	rs56368095	C	T	2596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=64;PP=1860;SC=TCCTTCCCCCCTACCCTCCTG;SOR=1.683;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=30;TCR=64;TR=94;WE=140157709;WS=140157691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr9	140158650	rs9695897	C	T	3484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=72;NR=43;PP=1829;SC=GGTCTCTGGTCATCCTGGGAG;SOR=1.038;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=72;TCR=43;TR=115;WE=140158658;WS=140158640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr9	140158871	rs13295537	T	C	471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=13;PP=319;SC=GGTCTGCGCTTGCTGTGTTTT;SOR=1.863;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=17;WE=140158879;WS=140158861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	140161334	rs9330192	C	T	730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=19;NR=6;PP=511;SC=GTGTGTGTCACGTCAGGGTGG;SOR=2.670;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=25;WE=140161342;WS=140161324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr9	140161631	.	TGTGGGGCTGAG	T	2990	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=3;NR=8;PP=2990;QD=20;SC=CAGGGGTCGGTGTGGGGCTGA;Source=Platypus;TCF=6;TR=11;WE=140161655;WS=140161621;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:16,11:0.41:27
chr9	140161634	.	GGGGCT	G	1791.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.67;SOR=1.775;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr9	140161641	.	AGGTGGG	A	1792.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.74;SOR=1.662;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr9	140161647	.	G	A	462	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=18;NR=9;PP=462;QD=18.398933798;SC=GCTGAGGTGGGGCTGAGGTGG;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=41;TCF=29;TCR=12;TR=27;WE=140161655;WS=140161621;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:14,27:0.66:41
chr9	140161871	rs9802270	C	T	549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=16;PP=421;SC=GCCCAGGGTGCGGGCCCCAGG;SOR=2.948;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=19;WE=140161879;WS=140161861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr9	140161909	rs9802698	G	T	207.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=6;PP=141;SC=TGTCTCCCCAGCCCACCTCCA;SOR=1.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=8;WE=140161917;WS=140161899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	140166597	rs61751916	G	A	3516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.446;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=69;PP=1993;ReadPosRankSum=0.580;SC=GCAACCTTGCGCTGCTGGCCG;SOR=0.744;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=252;TCF=134;TCR=118;TR=152;WE=140166605;WS=140166587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,163:0.59:275
chr9	140167022	rs3204123	G	A	3942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=59;PP=2156;SC=GGGTGGCCCCGTCTAAGCTGG;SOR=0.734;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=74;TCR=59;TR=133;WE=140167030;WS=140167012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr9	140202194	rs13288421	T	C	940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.749;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=24;PP=553;ReadPosRankSum=1.299;SC=CTGAGCACAGTCACCTCATGG;SOR=0.798;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=89;TCF=41;TCR=48;TR=43;WE=140202202;WS=140202184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,48:0.48:100
chr9	140218025	.	C	T	159	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MMLQ=24;MQ=60.26;NF=10;NR=1;PP=159;QD=17.615564777;SC=GAGGGATGCTCTGCCGACACC;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=11;WE=140218033;WS=140218015;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr9	140242726	rs58941960	C	T	626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.968;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=16;PP=326;ReadPosRankSum=0.220;SC=CCCACGGTCACCCCCCAGCCC;SOR=0.859;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=59;TCF=24;TCR=35;TR=27;WE=140242734;WS=140242716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,31:0.48:64
chr9	140243844	rs28545754	C	T	2597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=44;PP=1339;ReadPosRankSum=-0.039;SC=CTGCTCCTCGCAGAGCGGCCT;SOR=0.730;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=191;TCF=109;TCR=82;TR=106;WE=140243852;WS=140243834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,123:0.57:214
chr9	140243880	rs35097575	G	A	2666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=52;PP=1340;ReadPosRankSum=0.496;SC=CAGCTGCTGCGTCTTGTCCAG;SOR=0.686;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=194;TCF=102;TCR=92;TR=112;WE=140243888;WS=140243870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,127:0.59:214
chr9	140243968	rs79140116	C	T	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.156;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=19;PP=396;ReadPosRankSum=1.429;SC=GGGGCTGGCACGCTCGCCACC;SOR=0.488;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=59;TCF=14;TCR=45;TR=25;WE=140243976;WS=140243958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,29:0.45:64
chr9	140246050	rs11534416	T	G	1800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=45;PP=1346;SC=AGCCTGGAGGTCCTGAGCAGC;SOR=3.729;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=7;TCR=45;TR=52;WE=140246058;WS=140246040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr9	140247143	rs7020732	T	G	2767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=53;NR=35;PP=1392;SC=GCAGCAAGAGTTCCATGGCAC;SOR=0.770;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=53;TCR=35;TR=88;WE=140247151;WS=140247133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr9	140247365	rs28688712	C	T	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.27;ReadPosRankSum=0.454;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr9	140249253	rs11537108	A	C	832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.31;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr9	140249253	.	AG	CA,CG	184	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000,0.5000;HP=4;HapScore=3;MGOF=4;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0,4;NR=8,18;PP=125,184;QD=22.3084843578;SC=CTCAGCACTGAGGGCTCAGGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=8,22;WE=140249262;WS=140249243;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.35:23
chr9	140249254	rs11562624	G	A	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=2.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.29;ReadPosRankSum=0.797;SOR=1.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr9	140250633	rs13293922	G	A	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.855;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.25;ReadPosRankSum=0.076;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr9	140250818	rs7389423	C	T	3528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=61;NR=54;PP=1803;SC=CTCAGGGTACCGTCTGTGGGG;SOR=0.754;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=115;TCF=61;TCR=54;TR=115;WE=140250826;WS=140250808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr9	140262218	rs11533157	T	C	1084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=5;PP=680;SC=GGTCAGCCCATGAGGAGGATG;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=34;WE=140262226;WS=140262208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
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chr9	140322645	rs35406628	G	A	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.076;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=86;ReadPosRankSum=-1.097;SC=GTCCACGGGCGGTGGCACTGT;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=7;WE=140322653;WS=140322635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr9	140327663	rs34155071	C	T	1454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.372;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.031;NF=30;NR=34;PP=921;ReadPosRankSum=-0.743;SC=ACAGGGCTGCCGGCAATGGGG;SOR=0.869;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=122;TCF=61;TCR=61;TR=64;WE=140327671;WS=140327653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,70:0.52:134
chr9	140329618	rs28589413	A	G	2296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=55;PP=1470;ReadPosRankSum=-2.376;SC=CGACCTGCCCACGCCCACGCC;SOR=0.687;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=187;TCF=85;TCR=102;TR=103;WE=140329626;WS=140329608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,108:0.55:198
chr9	140330976	rs13297080	T	C	3143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=39;PP=2119;SC=AGCTGACCTGTACCAGCCCCA;SOR=1.377;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=69;TCR=39;TR=108;WE=140330984;WS=140330966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr9	140331833	rs9414731	A	G	551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=18;PP=467;SC=CCCCAAAGACATGACCACCTC;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=140331841;WS=140331823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	140332478	rs6606582	A	G	12516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=483;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=243;NR=208;PP=2965;SC=CTTGTTCGCCAGCCACTGATA;SOR=0.825;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=452;TCF=243;TCR=209;TR=451;WE=140332486;WS=140332468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,482:1.00:482
chr9	140344204	rs41309970	C	T	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.380;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=234;ReadPosRankSum=0.213;SC=GGAGCAGGGCCCACCCTCTTT;SOR=2.067;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=53;TCF=36;TCR=17;TR=19;WE=140344212;WS=140344194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,20:0.35:57
chr9	140348401	rs9410194	T	C	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.301;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=98;ReadPosRankSum=0.082;SC=CTAAGGCACATGAAGCAGACA;SOR=1.802;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=9;WE=140348409;WS=140348391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
chr9	140356374	rs4962240	C	A	1212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=17;PP=665;ReadPosRankSum=1.413;SC=TCCGGACGCCCGTACTCACCG;SOR=0.665;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=95;TCF=62;TCR=33;TR=50;WE=140356382;WS=140356364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,56:0.53:105
chr9	140356422	rs28452008	G	C	1504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.590;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=24;PP=831;ReadPosRankSum=1.309;SC=GCTGGTCGCGGAGCATCTTCT;SOR=0.639;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=140;TCF=88;TCR=52;TR=62;WE=140356430;WS=140356412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,71:0.45:159
chr9	140356503	rs41307436	C	A	2469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=50;PP=1417;ReadPosRankSum=2.566;SC=CCTGTGCACACCCCCAGGGCC;SOR=0.709;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=237;TCF=127;TCR=110;TR=114;WE=140356511;WS=140356493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,123:0.48:255
chr9	140357972	rs1891627	A	G	4814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=81;PP=2876;SC=CGCACGTACCACCACAGGGAG;SOR=0.929;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=159;TCF=78;TCR=81;TR=159;WE=140357980;WS=140357962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr9	140374861	rs1891630	A	G	4032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=58;PP=2363;SC=CGTGCCATCTACCTGGTAGAG;SOR=0.909;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=138;TCF=80;TCR=58;TR=138;WE=140374869;WS=140374851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr9	140392494	rs4962232	T	C	1684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=13;PP=1082;SC=ACGGTAACCGTGCTTTGCCCA;SOR=2.147;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=42;TCR=13;TR=55;WE=140392502;WS=140392484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr9	140395331	.	G	A	1522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.165;ClippingRankSum=0.000;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.595;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=25;PP=654;ReadPosRankSum=0.343;SC=CCGAGACCACGAACAGGATGC;SOR=0.602;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=144;TCF=74;TCR=70;TR=63;WE=140395339;WS=140395321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,79:0.48:166
chr9	140396212	rs1891629	C	T	3377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.267;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=76;PP=1980;ReadPosRankSum=0.873;SC=GGAACACGGGCGGGAAGCATA;SOR=0.686;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=321;TCF=166;TCR=155;TR=154;WE=140396220;WS=140396202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,169:0.49:345
chr9	140400275	rs3750381	T	C	1151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.817;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=39;PP=687;ReadPosRankSum=-1.412;SC=CGCACAAGGGTGTGGTCAGGT;SOR=1.626;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=127;TCF=54;TCR=73;TR=55;WE=140400283;WS=140400265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,61:0.41:147
chr9	140409726	rs843967	T	C	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=3.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.998;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=240;ReadPosRankSum=0.102;SC=TAGTGGAGGGTGCCCGCCTCG;SOR=1.519;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=14;WE=140409734;WS=140409716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
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chr9	140483344	rs150784463	G	A	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=180;ReadPosRankSum=-0.676;SC=CCACCGTTTGGGGTGGTGCAG;SOR=0.336;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=12;WE=140483352;WS=140483334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
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chr9	140656980	rs4876941	A	G	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.527;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=29;ReadPosRankSum=-1.163;SC=TCCCCGCCCCACGCAGGGCTG;SOR=0.197;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=6;WE=140656988;WS=140656970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr9	140685466	rs149398639	C	T	1246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.512;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=33;PP=732;ReadPosRankSum=-0.112;SC=TGTGTGTAGACGTTTCTCAGA;SOR=0.559;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=38;TCR=72;TR=51;WE=140685474;WS=140685456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,59:0.49:121
chr9	140686373	rs10867072	T	C	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=2.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=199;ReadPosRankSum=-0.406;SC=TTAGTAGAGATGGGGTTTCAC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=11;WE=140686381;WS=140686363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
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chr9	140695576	rs7871917	A	G	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.143;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=217;ReadPosRankSum=-0.702;SC=TCGGCCCGGCACTGTGCTGTG;SOR=0.214;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=13;WE=140695584;WS=140695566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr9	140710603	rs4876902	C	T	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=233;ReadPosRankSum=1.250;SC=AAGAACTTAACGTGTTTGGAT;SOR=0.896;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=38;TCF=6;TCR=32;TR=15;WE=140710611;WS=140710593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,14:0.40:35
chr9	140728787	rs10667884	T	TTC	4196.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.593;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=31;PP=2406;ReadPosRankSum=1.076;SC=CCGTGCCGGCTTCTCGCCCTG;SOR=0.581;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=144;TCF=62;TCR=82;TR=58;WE=140728795;WS=140728777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,114:0.47:245
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chr9	140740886	rs11137260	A	T	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.745;NF=6;NR=3;PP=125;ReadPosRankSum=-0.127;SC=TCCCCCAGGAATCCTCCTAAG;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=29;TCF=19;TCR=10;TR=9;WE=140740894;WS=140740876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
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chr9	140777370	rs1110146	A	C	1083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-4.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.170;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=36;PP=796;ReadPosRankSum=0.332;SC=CCAGCGTGTGAGGCCCGGGCG;SOR=0.402;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=101;TCF=18;TCR=83;TR=47;WE=140777378;WS=140777360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,52:0.48:109
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chr9	141070283	rs7868693	T	C	4184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.947;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-11.768;NF=97;NR=94;PP=2302;ReadPosRankSum=-2.805;SC=CCCTCCTATCTGCCGAGTCGA;SOR=0.727;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=286;TCF=149;TCR=137;TR=191;WE=141070291;WS=141070273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,193:0.67:290
chr9	141070335	rs7868705	T	G	4960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=103;PP=2962;SC=CGGGAGGAAGTCCCGGGTGTC;SOR=1.165;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=181;TCF=78;TCR=103;TR=181;WE=141070355;WS=141070325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr9	141070347	rs189844666	C	G	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=5.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.30;MQRankSum=4.774;QD=2.12;ReadPosRankSum=-1.511;SOR=1.250;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:116,27:0.19:143
chr10	95074	rs6560828	G	A	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=188;ReadPosRankSum=-0.126;SC=CACCTTCCCCGGCCACCCGGC;SOR=1.022;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=15;TCR=8;TR=15;WE=95082;WS=95064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr10	95096	rs11251929	A	G	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=3;PP=78;ReadPosRankSum=1.085;SC=GGCCCGGGCTAGGCCCTCAGA;SOR=0.576;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=32;TCF=20;TCR=12;TR=8;WE=95104;WS=95086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,8:0.24:33
chr10	95226	rs6560829	A	T	2021.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.95;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr10	95229	rs6560830	C	T	2021.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.93;SOR=1.154;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr10	282897	rs4600135	C	T	3536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=52;NR=61;PP=1828;SC=TCCCAAAACACATTTTACTAT;SOR=1.011;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=113;TCF=52;TCR=61;TR=113;WE=282905;WS=282887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr10	285200	rs7919436	T	G	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=2.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.66;ReadPosRankSum=0.324;SOR=1.251;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,5:0.19:27
chr10	285479	rs10655220	G	GTGT	1905.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5178;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=50;PP=600;ReadPosRankSum=-0.015;SC=GAATATTTTTGTTTTTTTTGT;SOR=0.813;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=4;TCR=52;TR=54;WE=285487;WS=285467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,75:0.96:78
chr10	288184	rs34123561	G	GAA	200.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=0.000;QD=3.72;ReadPosRankSum=-0.105;SOR=0.533;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,12:0.22:54
chr10	292927	rs2303990	C	A	782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=16;PP=438;SC=AGTGTGTCTCCGGAAGGAAGT;SOR=2.387;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=21;WE=292935;WS=292917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr10	294165	rs10903752	T	C	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.649;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=30;ReadPosRankSum=-0.285;SC=AACAGCAGTTTATTCTATGGC;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=3;WE=294173;WS=294159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr10	294953	rs1017361	A	G	4020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=67;PP=2321;SC=AGTGTAAGGAAGAATTTGTAG;SOR=0.948;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=129;TCF=62;TCR=67;TR=129;WE=294961;WS=294929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr10	329188	rs45445697	G	T	998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.15;MQRankSum=0.693;QD=35.67;ReadPosRankSum=-0.892;SOR=0.663;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,25:0.89:28
chr10	329191	rs371065533	GC	G	989.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.19;MQRankSum=0.708;QD=36.66;ReadPosRankSum=-1.275;SOR=0.602;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,24:0.89:27
chr10	370977	rs3123241	A	G	476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=14;PP=373;SC=AGGCAAAGGAAGGCGGATCAT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=370985;WS=370967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	375570	rs3832678	GGGAGCTCAGCAAGGCT	G	955.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.178;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.751;NF=0;NR=13;PP=2929;ReadPosRankSum=0.731;SC=CTGTCAGGGCGGGAGCTCAGC;SOR=2.419;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=13;WE=375593;WS=375560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,25:0.68:37
chr10	387060	rs7904155	G	A	1141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=11;PP=706;SC=GCAGTGCTTAGGTTGCCTGGC;SOR=1.666;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=25;TCR=11;TR=36;WE=387068;WS=387050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr10	394714	rs4880610	G	A	5788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=99;NR=98;PP=2965;SC=TACACAAGGAGAGAAACATCA;SOR=0.759;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=197;TCF=99;TCR=98;TR=197;WE=394722;WS=394694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr10	395266	rs4880611	T	C	2361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=55;NR=26;PP=1358;SC=ACCCTGCGCCTGTACCTGGGG;SOR=1.364;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=55;TCR=26;TR=81;WE=395274;WS=395256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr10	395463	rs4242754	G	A	2213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=52;PP=1418;SC=GAGCGCGCACGCGTCATACAA;SOR=1.923;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=23;TCR=52;TR=75;WE=395471;WS=395453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr10	410825	rs10795053	G	A	455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=7;NR=2;PP=109;SC=CCAATCAGCAGTAACTGATTA;SOR=1.371;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=410833;WS=410815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	412449	rs1133113	A	G	1579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=38;PP=981;ReadPosRankSum=1.557;SC=ACCAGTGAACAGGAATGGGGT;SOR=0.604;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=33;TCR=53;TR=62;WE=412457;WS=412439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,69:0.72:96
chr10	428503	rs4881200	A	G	2186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=22;PP=1423;SC=CCTCAGCATCAACTGTTAGGA;SOR=1.582;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=54;TCR=22;TR=76;WE=428511;WS=428493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr10	429903	.	GAAA	GAA,G	36	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5051,0.4949;HP=16;HapScore=3;MGOF=34;MMLQ=18;MQ=60.0;NF=2,2;NR=1,1;PP=36,14;QD=13.0;SC=CCTGCCTCACGAAAAAAAAAA;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=3,3;WE=429913;WS=429893;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.75:4
chr10	435880	rs4881219	G	C	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=49;ReadPosRankSum=-0.374;SC=CTTCGTGTCAGGTGTCCCGGT;SOR=0.859;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=6;WE=435888;WS=435870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr10	436848	rs10904093	A	G	1164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.415;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=34;PP=801;ReadPosRankSum=-0.173;SC=GACCTGCCCCACTCCGCCCAG;SOR=1.193;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=74;TCF=24;TCR=50;TR=48;WE=436856;WS=436838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,49:0.63:78
chr10	444997	rs6560836	C	T	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=0.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.60;ReadPosRankSum=-1.324;SOR=0.812;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,33:0.25:134
chr10	445061	rs6560837	C	T	5386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=93;NR=79;PP=2828;SC=TCCTGGTGAGCGGCACCTCGA;SOR=0.733;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=173;TCF=93;TCR=80;TR=172;WE=445069;WS=445051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr10	459940	rs4881274	G	A	931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=0.672;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.45;ReadPosRankSum=0.168;SOR=0.772;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,50:0.40:125
chr10	461912	rs66682704	TC	T	214.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-1.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.245;HP=9;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.160;NF=0;NR=6;PP=260;ReadPosRankSum=-0.412;SC=CACAGCCCCCTCCCCAGCGCG;SOR=0.155;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=6;WE=461920;WS=461902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr10	468748	rs4881290	C	T	124.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=1;PP=83;SC=AGAAAGACACCGTGAAGCGTG;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=468756;WS=468738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr10	486983	rs61837201	G	A	820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.361;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=24;PP=574;ReadPosRankSum=0.424;SC=TGAGGTCCCAGAGGCCAAGCT;SOR=1.179;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=45;TCF=13;TCR=32;TR=32;WE=486991;WS=486973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,34:0.68:50
chr10	518547	rs10610683	ACT	A	1043.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.808;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=678;ReadPosRankSum=-0.284;SC=GAGTCAGCAGACTCTAACAAA;SOR=1.113;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=82;TCF=13;TCR=69;TR=21;WE=518556;WS=518537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,33:0.25:134
chr10	687569	rs1631975	C	T	1753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=38;NR=23;PP=1077;SC=CACTGCCAGGCTACCCATGAG;SOR=0.966;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=38;TCR=23;TR=61;WE=687577;WS=687559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr10	696237	rs10904535	G	A	663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.768;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=14;PP=384;ReadPosRankSum=-2.152;SC=TCAGGGCCAGGGACCATGGTG;SOR=0.799;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=61;TCR=38;TR=36;WE=696245;WS=696227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,37:0.36:104
chr10	708192	rs3853289	A	G	1913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=46;PP=1322;SC=TCCTGAAGGTACTGTATGAGG;SOR=4.139;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=6;TCR=46;TR=52;WE=708200;WS=708182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr10	859270	rs3763722	C	T	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.86;ReadPosRankSum=-0.534;SOR=0.188;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
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chr10	1042023	rs10665098	A	AAAC	7695.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=47;PP=2375;SC=AGTGGAAAAAATAATATTTTT;SOR=1.083;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=48;TCR=49;TR=93;WE=1042031;WS=1042013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr10	1043058	rs1250887	T	C	961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=6;PP=632;SC=AATATCACCATAGGCCTGGAC;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=29;WE=1043066;WS=1043048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr10	1046712	rs2306409	G	A	1203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.305;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=24;PP=864;ReadPosRankSum=-0.642;SC=TCCGTGCTGCGGTCCTGTATG;SOR=0.583;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=147;TCF=91;TCR=56;TR=60;WE=1046720;WS=1046702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,62:0.40:154
chr10	1052950	rs2306408	G	A	1954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=36;PP=1119;ReadPosRankSum=0.069;SC=TCTTTTTTACGTTATTAGGCT;SOR=0.751;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=135;TCF=77;TCR=58;TR=86;WE=1052958;WS=1052940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,93:0.63:148
chr10	1054276	rs10904595	T	C	357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=0;PP=332;SC=ACCTGGGAGGTGGAGGTTGCA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=1054284;WS=1054266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr10	1056310	rs3765102	G	C	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=328;ReadPosRankSum=-0.045;SC=CGTAGTACTTGAAGATATTAA;SOR=0.368;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=8;WE=1056330;WS=1056300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr10	1056322	rs17293615	A	G	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.808;HP=4;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=282;ReadPosRankSum=-0.079;SC=AGATATTAAAAACTGCTGTAA;SOR=1.162;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=9;WE=1056330;WS=1056300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr10	1061625	.	GCTGAGCA	G	1046	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=39;MMLQ=24;MQ=61.97;NF=17;NR=1;PP=1046;QD=59.5555555556;SC=GGTCCTGAGCGCTGAGCACTG;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=18;WE=1061639;WS=1061615;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,18:0.78:23
chr10	1061862	rs2306406	A	G	1678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=37;PP=858;ReadPosRankSum=0.772;SC=GTGTAATGTAATAAAATGACA;SOR=0.681;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=45;TCR=55;TR=68;WE=1061870;WS=1061852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,79:0.70:113
chr10	1068802	rs3750729	G	A	791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.577;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=23;PP=526;ReadPosRankSum=-0.754;SC=TCTGTTTCTCGTAGAAAAGCC;SOR=0.093;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=39;TCF=9;TCR=30;TR=32;WE=1068810;WS=1068792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,33:0.82:40
chr10	1068849	rs3829163	C	T	351.96	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=292;ReadPosRankSum=2.122;SC=AAGGGGACTGCTGGATGCCCA;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=12;WE=1068857;WS=1068839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr10	1070461	rs3793777	C	T	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=168;ReadPosRankSum=-0.367;SC=CTTAGGTTGCCGTCGGGTGGG;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=9;WE=1070469;WS=1070451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr10	1070710	rs12357207	C	G	3897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.592;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=86;PP=2373;ReadPosRankSum=0.306;SC=ACAAATGCCTCTTTATGTGAA;SOR=0.931;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=236;TCF=103;TCR=133;TR=149;WE=1070718;WS=1070700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,170:0.64:265
chr10	1081882	rs7075695	T	C	3327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FS=1.676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.18;MQRankSum=1.474;QD=14.28;ReadPosRankSum=0.628;SOR=0.560;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,152:0.65:233
chr10	1089616	rs11250238	T	C	3542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=59;NR=61;PP=1801;SC=TGAAGGCACATGCTTCCCTGC;SOR=0.768;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=120;TCF=59;TCR=61;TR=120;WE=1089624;WS=1089606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr10	1093992	rs4880759	A	G	499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=328;SC=GGGTCTTGCTATGTCTGTCGC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=1094000;WS=1093982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr10	1126293	rs7087381	T	C	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.118;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=7;PP=376;ReadPosRankSum=0.965;SC=GACCCATTTGTGAGGCTATAG;SOR=0.972;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=43;TCF=29;TCR=14;TR=24;WE=1126301;WS=1126283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,30:0.59:51
chr10	1126619	rs7084283	A	G	220.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=6;PP=165;SC=GCTGAGGTGGATGGATCACTT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=1126627;WS=1126609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	1132215	rs11250255	C	T	2152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.590;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=36;PP=1229;ReadPosRankSum=-1.076;SC=TTCTTCATTTCCATCTTGCAG;SOR=0.755;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=147;TCF=86;TCR=61;TR=92;WE=1132223;WS=1132205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,101:0.62:164
chr10	1142208	rs10794716	T	C	3858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=63;PP=2147;SC=TCCTTACCTGTGAATGTGTAG;SOR=0.721;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=134;TCF=71;TCR=63;TR=134;WE=1142216;WS=1142198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr10	1149390	rs7915650	C	A	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.481;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=143;ReadPosRankSum=-1.605;SC=ACATACTCATCACTGTGGCCA;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=8;WE=1149398;WS=1149380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr10	1170304	rs7916430	C	G	2295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.888;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=50;PP=1416;ReadPosRankSum=0.042;SC=TAAAGTCAAACTGTTGGTTAA;SOR=0.558;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=159;TCF=71;TCR=88;TR=92;WE=1170312;WS=1170294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,102:0.57:178
chr10	1230968	rs2271275	C	T	1174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.11;SOR=0.829;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
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chr10	1246189	rs78822513	C	T	809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.656;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=16;PP=455;ReadPosRankSum=1.541;SC=TGTCAGTCTTCCCATCGTGCG;SOR=0.604;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=92;TCF=51;TCR=41;TR=34;WE=1246197;WS=1246179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,39:0.39:100
chr10	1421516	rs10794748	A	G	827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.368;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=20;PP=517;ReadPosRankSum=-0.075;SC=AATATCTGACAGCATTTTATC;SOR=0.451;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=114;TCF=61;TCR=53;TR=39;WE=1421524;WS=1421502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,44:0.34:128
chr10	1598718	rs10903484	G	A	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.268;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=183;ReadPosRankSum=0.724;SC=CTGTGCATTCGAATCACCTGG;SOR=0.481;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=35;TCF=25;TCR=10;TR=16;WE=1598726;WS=1598708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,16:0.39:41
chr10	1779349	rs3750684	G	A	2804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=36;NR=56;PP=1670;SC=GGCCATGGCCGAGACCCAGGC;SOR=1.352;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=36;TCR=56;TR=92;WE=1779357;WS=1779339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr10	3124516	rs4881074	G	A	3142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=48;PP=1865;SC=GTCATGGGTAGTTAGTGGCAG;SOR=0.818;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=111;TCF=63;TCR=48;TR=110;WE=3124524;WS=3124506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr10	3143283	rs55882340	T	A	225.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=4;PP=113;SC=GGCTGGTTCCTGCTCCATGTA;SOR=1.179;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=3143291;WS=3143273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	3143643	rs4881080	A	C	2400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=41;NR=40;PP=1202;SC=TGCTGCAGCGAGGCATCACCA;SOR=0.852;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=41;TCR=40;TR=81;WE=3143651;WS=3143633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr10	3145885	rs10903966	T	C	1311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=9;PP=810;SC=TCTCTACCCATGGCCATTCTG;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=32;TCR=9;TR=41;WE=3145893;WS=3145875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr10	3145906	rs11251719	A	C	2113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=20;PP=1158;SC=CCTCACCCCTAGTGGGGCACC;SOR=1.519;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=67;TCF=47;TCR=20;TR=66;WE=3145914;WS=3145896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr10	3146155	rs2306293	C	G	3270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=60;PP=1880;SC=CTCAGAGGAACCGGCGGGAGG;SOR=1.198;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=106;TCF=45;TCR=61;TR=105;WE=3146163;WS=3146145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr10	3146180	rs2306294	C	T	2250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=30;NR=45;PP=1335;SC=TGGGGCCCGACGTGTGCCCAG;SOR=1.320;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=30;TCR=45;TR=75;WE=3146188;WS=3146170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr10	3147508	rs4881082	C	T	364.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.60;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	3147518	rs2388576	G	C	496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.16;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr10	3147519	rs2892549	G	C	496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.40;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr10	3149402	rs10903967	A	G	3703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=59;PP=2309;ReadPosRankSum=-1.354;SC=TTCTGTCTCCACAGAACCGTG;SOR=0.749;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=131;TCF=71;TCR=60;TR=129;WE=3149410;WS=3149389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,146:0.99:148
chr10	3154267	rs2306299	G	A	966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=7;PP=745;SC=GCGGCCGGTCGTCTAGACCAT;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=34;WE=3154275;WS=3154257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr10	3154339	rs2306301	C	T	3678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=42;PP=2080;SC=AGGACCGAGCCAGTCTCTACC;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=119;TCF=77;TCR=42;TR=119;WE=3154347;WS=3154329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr10	3154534	rs2306304	A	G	1678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=36;PP=1078;SC=CCTCAGGCCCAGCCACTGCAA;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=14;TCR=36;TR=50;WE=3154542;WS=3154524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr10	3155173	rs7896691	C	T	1072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=9;PP=729;SC=GCACATGGAACCCTGGGGCCT;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=36;WE=3155181;WS=3155163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr10	3155217	rs6602023	T	C	2836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=21;PP=1538;SC=GCAGACACATTGAGTGCTGGC;SOR=1.808;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=61;TCR=21;TR=82;WE=3155225;WS=3155207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr10	3155237	rs6602024	A	G	3731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=47;PP=2139;SC=CAGATAAGCCACCTTTTCTCC;SOR=1.219;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=77;TCR=47;TR=124;WE=3155245;WS=3155227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr10	3155263	rs7906901	T	C	4931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=62;PP=2504;SC=AGCCCTGAGTTGTGTCCGGTA;SOR=1.058;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=158;TCF=96;TCR=62;TR=158;WE=3155271;WS=3155253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr10	3155408	rs3816700	C	T	3321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=61;PP=2160;SC=CGCGATGCCCCGACCTCTCCT;SOR=1.159;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=108;TCF=47;TCR=61;TR=108;WE=3155416;WS=3155398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr10	3155428	rs3816701	C	T	2657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=46;PP=1851;SC=TGCGGGCCTCCCCTCATGGCC;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=38;TCR=46;TR=84;WE=3155436;WS=3155418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr10	3155540	rs4881085	A	G	6343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=126;NR=96;PP=2965;SC=GTGACCCAGCACTCACCTGCC;SOR=0.897;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=222;TCF=126;TCR=96;TR=222;WE=3155548;WS=3155530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr10	3155620	rs1052309	A	G	6292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=100;NR=108;PP=2965;SC=GGATGAACGCAGCCGTACGCT;SOR=0.932;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=209;TCF=100;TCR=109;TR=208;WE=3155628;WS=3155610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr10	3155753	rs4881087	G	C	546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=15;PP=419;SC=CACCCTGGCTGTGAGCACAGT;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=3155761;WS=3155743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	3158848	rs7086902	C	T	1015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=9;PP=636;SC=CTGTCTCATACGCCTCTCAAA;SOR=1.949;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=31;WE=3158856;WS=3158838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr10	3160917	rs3829913	T	C	1220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=9;PP=716;SC=CGTGGCGTCCTGCGGACCGCG;SOR=1.900;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=36;WE=3160925;WS=3160907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr10	3161131	rs3829914	C	T	3092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=46;NR=57;PP=1797;SC=AAACATTAAGCTACTTGTTGG;SOR=1.074;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=103;TCF=46;TCR=57;TR=103;WE=3161139;WS=3161121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr10	3161216	rs3829916	A	G	774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=44;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=16;PP=460;SC=GCAGGATAGCAGGTGGTAAGA;SOR=2.670;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=3161224;WS=3161206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr10	3161236	rs17285851	C	A	431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=44;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=10;PP=289;SC=ACGTGGCCTACGAGTGGCCCA;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=3161244;WS=3161226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	3161269	rs3829917	G	C	186.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=58;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=120;SC=CAACTTAACCGAGAAGCAAAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=3161277;WS=3161259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	3162033	rs6602025	T	C	643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=18;NR=2;PP=455;SC=AGCGAGACCCTCTCCTCCCCA;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=3162041;WS=3162023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr10	3167465	rs3816703	A	G	5407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=98;PP=2965;SC=GTTTCCTCTCATTGCTTTTCC;SOR=0.993;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=182;TCF=84;TCR=98;TR=182;WE=3167473;WS=3167455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr10	3167591	rs147437896	A	AT	352.82	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.588;NF=1;NR=11;PP=314;ReadPosRankSum=-0.812;SC=ACAGGGTAAAATTTTTTTAGC;SOR=2.584;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=12;WE=3167599;WS=3167581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,14:0.93:15
chr10	3171995	rs2279211	G	T	1534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=10;PP=940;SC=GTGACTGATCGCTTCTCTGTG;SOR=2.170;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=36;TCR=10;TR=46;WE=3172003;WS=3171985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr10	3172121	rs1052333	C	T	6060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=110;NR=92;PP=2965;SC=GGCTCGCGGCCGGAGCTGATG;SOR=0.766;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=202;TCF=110;TCR=92;TR=202;WE=3172129;WS=3172111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr10	3172145	rs1052337	C	T	6105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=111;NR=93;PP=2965;SC=CATACATTTTCGAAGAGCCCT;SOR=0.775;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=204;TCF=111;TCR=93;TR=204;WE=3172153;WS=3172135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr10	3172267	rs4381274	A	G	2696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=60;PP=1802;SC=TTTGCTTTCCAAGGGGCATGG;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=32;TCR=60;TR=92;WE=3172275;WS=3172257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr10	3172299	rs4390256	T	C	1553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=37;PP=860;SC=CTACAGAACATGCCACGCTTG;SOR=1.812;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=17;TCR=37;TR=54;WE=3172307;WS=3172289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr10	3175360	rs66787824	C	G	840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=11;PP=570;SC=GCCCACTGCACGCTAAACAAA;SOR=1.143;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=18;TCR=11;TR=29;WE=3175368;WS=3175350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr10	3175541	rs3740613	C	A	1556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=30;PP=860;SC=CCACAAAGCCCCTGTCATGTG;SOR=1.278;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=22;TCR=30;TR=52;WE=3175549;WS=3175531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr10	3176611	rs200439920	TTTCTATTTA	T	2212.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.65;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=1;PP=2337;SC=GAAATTGTCATTTCTATTTAA;SOR=2.608;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=3176646;WS=3176601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr10	3176625	rs375079219	C	T	2356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.60;QD=45.32;SOR=2.790;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr10	3176627	.	A	AC	2572.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.62;QD=48.54;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr10	3176629	.	G	C	2581.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.74;QD=44.51;SOR=3.037;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr10	3176630	.	TG	T	2572.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.74;QD=44.36;SOR=3.037;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr10	3176634	.	A	G	2581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.74;QD=44.51;SOR=3.037;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr10	3176638	rs147431012	T	TTAAATAGAA	3347.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.65;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=1;PP=1848;SC=AGTGTTACTGTATAACTGGTA;SOR=3.113;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=6;WE=3176646;WS=3176601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr10	3177817	rs2306316	G	A	1099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=7;PP=743;SC=CTTCCAGGCCGGGTTCAGCAT;SOR=2.554;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=35;WE=3177825;WS=3177807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr10	3177876	rs2306317	C	G	5183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.47;SOR=1.651;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr10	3177876	.	CAC	GAT	1463	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;FR=1.0000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=68;NR=26;PP=1463;QD=16.1326369666;SC=TCTGCTCCCCCACCTGCCCAT;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=98;TCF=72;TCR=26;TR=94;WE=3177886;WS=3177866;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,94:0.96:98
chr10	3177878	rs2306318	C	T	5183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.93;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr10	3178802	rs141263930	C	T	1428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=36;PP=901;ReadPosRankSum=0.458;SC=CCTGCAGCCACCGTGGACTGT;SOR=0.737;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=34;TCR=50;TR=61;WE=3178822;WS=3178792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,66:0.73:91
chr10	3178814	rs1052929	T	A	2147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=44;PP=1538;SC=GTGGACTGTCTGTTTTTGTAA;SOR=1.252;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=29;TCR=44;TR=73;WE=3178822;WS=3178792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr10	3178905	rs7673	T	A	391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=10;PP=284;SC=CTGCCCCACCTGCTCCAGTGC;SOR=1.765;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=14;WE=3178913;WS=3178895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	3178964	rs71497863	GAATT	G	232.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=228;SC=CATATGAGCAGAATTAATTAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=3178975;WS=3178954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	3179618	rs138746278	ACT	A	490.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=2;PP=306;SC=CCAAAAACAAACTCTGTTTGG;SOR=1.981;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=7;WE=3179627;WS=3179608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr10	3179703	rs4881107	C	T	3165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.23;SOR=1.418;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr10	3179708	rs4881108	A	G	3329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.15;SOR=1.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr10	3179968	rs9129	G	C	876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=23;PP=698;SC=ATTCTAGAATGAGGTAAAACG;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=28;WE=3179976;WS=3179958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr10	3180175	rs12678	C	T	492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=3;PP=342;SC=ATATTCAGCTCGGAGGTGTAT;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=3180183;WS=3180165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	3180227	rs6901	T	C	1424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=32;NR=12;PP=762;SC=GGCTGCTCATTGGATGATCCA;SOR=1.519;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=32;TCR=12;TR=44;WE=3180235;WS=3180217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr10	3180316	rs11414	T	C	2520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=47;NR=33;PP=1352;SC=TGCCGAGGTATCTGAGAGGAA;SOR=0.799;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=47;TCR=33;TR=80;WE=3180324;WS=3180306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr10	3180343	rs2388559	A	G	2902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=35;PP=1607;SC=CGTGGTCAGCAAGGACTGGCT;SOR=0.912;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=56;TCR=35;TR=91;WE=3180351;WS=3180333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr10	3181003	rs2279217	A	G	2526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=24;PP=1662;SC=ACCAGAAGCTAGTGCTCCTGC;SOR=1.637;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=56;TCR=24;TR=80;WE=3181011;WS=3180993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr10	3181282	rs2279220	G	A	4689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=85;PP=2706;SC=CATTTTACCAGTGGACAAGTT;SOR=0.917;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=161;TCF=76;TCR=85;TR=161;WE=3181290;WS=3181272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr10	3183747	rs7094698	A	G	5087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=73;PP=2965;SC=GAACAGGGCCAATTTCCTCTG;SOR=0.935;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=169;TCF=96;TCR=73;TR=169;WE=3183755;WS=3183737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr10	3185798	rs3736093	T	C	2491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=21;PP=1734;SC=TCCCACGCACTGCCCACGGCA;SOR=2.112;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=59;TCR=21;TR=80;WE=3185806;WS=3185788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr10	3186701	rs150074614	A	AAAAAT	276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=3;PP=160;SC=AACGCTTAAAAAAAATAAAAA;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=3;WE=3186709;WS=3186691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr10	3186723	rs9423496	G	C	90.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.51;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr10	3187749	rs3758632	A	G	58.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=0;PP=37;SC=TCTGGCACCCACCAGGCGCTC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=3187757;WS=3187739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr10	3187924	rs3758631	T	C	404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=7;NR=9;PP=248;SC=TGAAAAATTATGTATACATAA;SOR=0.941;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=7;TCR=9;TR=16;WE=3187932;WS=3187914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr10	3190013	rs10508248	G	C	2078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=30;NR=40;PP=1250;SC=TAAGTTTTCAGAGTACTTTAA;SOR=1.150;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=71;TCF=30;TCR=41;TR=70;WE=3190021;WS=3190003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr10	3190166	rs59486411	C	A	3376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=28;PP=2004;SC=ACAACTCTTGCAAATAAAGTT;SOR=1.863;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=98;TCF=70;TCR=28;TR=97;WE=3190174;WS=3190156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr10	3191823	rs2388556	C	T	1884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=32;PP=1112;SC=TTGGTGAGGACGCTGCAGAAG;SOR=0.750;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=65;TCF=33;TCR=32;TR=65;WE=3191831;WS=3191813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr10	3193292	rs17287235	C	G	258.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=216;SC=GCAGAAGAATCGTGTAGAGCG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=3193300;WS=3193282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	3199555	rs7086470	A	T	423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=295;SC=AATATCAAAAAGCCAGTTAAG;SOR=2.448;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=3199563;WS=3199545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	3200292	rs3182535	G	A	3064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=43;PP=1696;SC=GTCTTTCTCCGCAATCCCTTG;SOR=0.884;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=101;TCF=57;TCR=44;TR=100;WE=3200300;WS=3200282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr10	3201010	rs3814592	C	T	429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=1;PP=306;SC=GTTCCAGACACTGTCAAGTGT;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=3201018;WS=3201000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	3201097	rs3814594	T	C	3686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=79;NR=40;PP=2404;SC=AATCTAATCATAAACTCACCC;SOR=1.540;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=119;TCF=79;TCR=40;TR=119;WE=3201105;WS=3201087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr10	3202065	rs4242746	T	C	4575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=53;PP=2434;SC=CTAACGCTGATGGTTGTTTGT;SOR=1.132;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=91;TCR=53;TR=144;WE=3202073;WS=3202055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr10	3202140	rs4242747	C	T	7279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=135;NR=113;PP=2965;SC=TGTAAAATGACGTGACGTTGT;SOR=0.775;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=249;TCF=136;TCR=113;TR=248;WE=3202148;WS=3202130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,279:1.00:279
chr10	3205851	rs6602034	C	G	1498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=36;NR=11;PP=887;SC=ATGCCATAAACTGTTAAGAAC;SOR=1.791;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=36;TCR=11;TR=47;WE=3205859;WS=3205841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr10	3206027	rs4609511	A	G	1691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=32;PP=957;SC=ACGTGTGGTCAGGAAGAAGTC;SOR=1.341;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=23;TCR=32;TR=55;WE=3206035;WS=3206017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr10	3207632	rs3814596	A	G	5414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=102;NR=80;PP=2965;SC=TAAACATGGGAAAAAGGTGGC;SOR=0.795;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=183;TCF=102;TCR=81;TR=182;WE=3207640;WS=3207622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr10	3208557	rs12359035	A	G	2297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.49;QD=26.11;SOR=0.887;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr10	3208567	.	T	TGCACGCTAGGGAAGAGAGAGGAATG	2957	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MMLQ=25;MQ=60.62;NF=0;NR=10;PP=2957;QD=20;SC=AGTACGGAACTGCACGCTAGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=10;WE=3208575;WS=3208547;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:10,10:0.50:20
chr10	3208581	rs58131139	G	GA	860.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.20;QD=23.26;SOR=2.242;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr10	3208583	.	A	C	166	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.56;FR=0.5072;HP=3;HapScore=2;MGOF=124;MMLQ=30;MQ=59.88;NF=0;NR=14;PP=166;QD=14.3408008962;SC=CTAGGGAAGGAGAATGACCAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=3208591;WS=3208573;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:0,14:1.00:14
chr10	3208583	.	A	AGAGGAATGGCACGCTAGGGAAGGC	874.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.26;QD=23.64;SOR=2.242;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr10	3209015	rs56658860	G	A	1128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=5;PP=731;SC=TATTTTATGCGTGGCCTAAGA;SOR=2.613;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=32;WE=3209023;WS=3209005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr10	3214369	rs4880599	A	G	1345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=28;NR=13;PP=683;SC=GCGCTGAACTATTACCTTATA;SOR=1.157;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=28;TCR=13;TR=41;WE=3214377;WS=3214359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr10	3214516	rs4881118	A	G	2643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=38;NR=54;PP=1528;SC=GACTTTAAGTATGGGCTGTGG;SOR=1.167;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=38;TCR=54;TR=92;WE=3214524;WS=3214506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr10	3214995	rs34460808	AC	A	7830.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=96;PP=2974;SC=CTGGCGAGGAACCCCCTCTTA;SOR=0.701;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=123;TCF=22;TCR=101;TR=113;WE=3215003;WS=3214985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr10	4867313	rs2961562	A	T	721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=16;PP=465;SC=GCTCACATTGAGGAGATGGAT;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=22;WE=4867321;WS=4867303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr10	4868445	rs2924275	G	T	2118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=43;NR=38;PP=1352;SC=CGCCAGCGCCGCAGTAGCTCG;SOR=0.766;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=43;TCR=38;TR=81;WE=4868453;WS=4868435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr10	4877814	rs150127444	T	TTTTTG	2058.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=812;ReadPosRankSum=-0.106;SC=CACATGGTTTTTTTTGTTTTG;SOR=0.510;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=15;WE=4877822;WS=4877804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,48:0.98:49
chr10	4879465	rs2961584	T	C	108.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=82;SC=CCCAGCATCCTCTAGCCAGAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=4879473;WS=4879455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr10	4884784	rs2924269	T	C	3553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=76;PP=1942;SC=GCCTCAGGGTTGCGGAGCTTG;SOR=1.329;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=49;TCR=76;TR=125;WE=4884792;WS=4884774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr10	4889525	rs2961597	T	C	2529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=55;PP=1738;SC=TTAATTAAACTTTCTCATTAT;SOR=2.642;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=16;TCR=55;TR=71;WE=4889533;WS=4889515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr10	4889650	.	CTATTT	C	2154.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.062;ClippingRankSum=0.000;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.879;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.864;NF=15;NR=15;PP=1598;ReadPosRankSum=0.711;SC=TTCTTTGTTCCTATTTTTGAT;SOR=0.435;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=56;TCF=29;TCR=27;TR=30;WE=4889662;WS=4889640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,55:0.59:94
chr10	5009347	rs4445550	A	G	1348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.819;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=30;PP=844;ReadPosRankSum=1.596;SC=ATTATAACATAGAAGAAGAAT;SOR=0.452;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=88;TCF=41;TCR=47;TR=59;WE=5009355;WS=5009337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,62:0.65:95
chr10	5009364	rs2904802	T	C	1132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=28;PP=774;ReadPosRankSum=1.239;SC=GAATCCTAAATCTAACTCCTA;SOR=0.671;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=32;TCR=41;TR=50;WE=5009372;WS=5009354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,51:0.66:77
chr10	5009449	rs7076886	T	C	191.18	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5958;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=149;ReadPosRankSum=0.489;SC=AGTGCAGAACTCTCAAAGCCT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=7;WE=5009457;WS=5009439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr10	5010367	rs12250190	C	T	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.51;BaseQRankSum=-1.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.574;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.740;NF=4;NR=2;PP=35;ReadPosRankSum=-0.550;SC=GTAGTACACTCTGTACATACC;SOR=0.136;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=6;WE=5010375;WS=5010357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,5:0.24:21
chr10	5010572	rs1138600	A	G	35.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=17.87;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr10	5014264	rs6143754	CATTTTTGACAATA	C	565.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.260;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.488;NF=11;NR=0;PP=2954;ReadPosRankSum=-0.961;SC=TGAAAAAGATCATTTTTGACA;SOR=2.613;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=11;WE=5014284;WS=5014254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr10	5014545	rs67671072	T	TA	2586.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.272;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.278;NF=8;NR=42;PP=1005;ReadPosRankSum=-1.355;SC=ACCGGTTTGATAAAAAAAATT;SOR=0.807;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=99;TCF=14;TCR=85;TR=50;WE=5014553;WS=5014535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,109:0.65:167
chr10	5019959	rs8483	G	A	811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=8.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.47;MQRankSum=-0.540;QD=18.04;ReadPosRankSum=1.050;SOR=0.203;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,35:0.78:45
chr10	5041398	rs56259037	T	C	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.25;ReadPosRankSum=-0.712;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr10	5042664	rs2275929	C	T	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=12;PP=248;ReadPosRankSum=-0.004;SC=TAAGAAAAAGCTTAGTTCAAA;SOR=0.681;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=96;TCF=54;TCR=42;TR=28;WE=5042672;WS=5042654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,32:0.30:107
chr10	5120157	rs4881396	G	T	2162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=32;PP=1182;SC=CAAGAAGGATGCAAATATCAC;SOR=0.717;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=39;TCR=32;TR=71;WE=5120165;WS=5120147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr10	5120227	rs11252921	C	T	1570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=27;NR=29;PP=872;SC=AATATGATTACTATATTTTGT;SOR=0.899;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=27;TCR=29;TR=56;WE=5120235;WS=5120217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr10	5136651	rs12529	C	G	2192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=28;PP=1181;SC=ATTCCAAACACCAGTGTGTAA;SOR=0.902;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=41;TCR=28;TR=69;WE=5136659;WS=5136641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr10	5139685	rs12387	G	A	4776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=88;NR=68;PP=2719;SC=ACTCACTGAAGAAAGCTCAAT;SOR=0.811;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=156;TCF=88;TCR=68;TR=156;WE=5139693;WS=5139675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr10	5139815	rs2245191	C	A	2246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=41;PP=1347;SC=GATAGTTGAACAGAGCTTTTT;SOR=1.387;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=29;TCR=41;TR=70;WE=5139823;WS=5139805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr10	5147579	rs17155732	A	G	93.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=0;PP=38;SC=GCAGAGTTGCACAGTTTCAAT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=5147587;WS=5147571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr10	5147909	rs2275928	G	A	1347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=23;PP=751;SC=ATTTATTTCTGGAGAAGGAAT;SOR=1.345;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=18;TCR=23;TR=41;WE=5147917;WS=5147899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr10	5149413	rs11252951	T	C	311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=258;SC=AGGAATATACTTGAATATTTG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=5149435;WS=5149411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	5149427	rs10160019	T	C	379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=295;SC=ATATTTGACTTTGTGTGTTTT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=5149435;WS=5149411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr10	5149703	rs3209896	G	A	1842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=32;NR=29;PP=1025;SC=TAACATGGAGGGCTTTGCCTG;SOR=0.880;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=32;TCR=29;TR=61;WE=5149711;WS=5149693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr10	5196273	rs1781930	A	G	884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=21;NR=6;PP=510;SC=ATCAAATACTAAAATCCTCTC;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=27;WE=5196281;WS=5196263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr10	5197881	rs1781931	A	G	701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=6;PP=453;SC=ATTGTAACTTATCATATCGGA;SOR=1.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=22;WE=5197889;WS=5197871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr10	5199934	rs1781935	G	C	4246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=57;PP=2519;SC=CCTGGGCTTCGACTGTGTTTC;SOR=0.843;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=138;TCF=81;TCR=57;TR=138;WE=5199942;WS=5199924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr10	5200059	rs1761601	T	C	1567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=39;PP=967;SC=ATCTACAGTGTGCTGCTCCTT;SOR=1.903;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=17;TCR=39;TR=56;WE=5200067;WS=5200049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr10	5200638	rs1781937	G	A	304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=250;SC=TGTTGGTGACGTTTAAGCTCA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=5200646;WS=5200628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	5200739	rs5782810	T	TAGG	4282.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=26;PP=2553;SC=TTCGCTTTAATAGTTTTTCAG;SOR=1.132;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=21;TCR=28;TR=46;WE=5200747;WS=5200729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr10	5202060	rs1781940	C	T	284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.45;QD=23.73;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr10	5202104	rs2801889	C	T	272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.40;QD=24.80;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr10	5202221	rs41460145	G	A	3489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.13;QD=42.05;SOR=2.698;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr10	5202241	rs1761599	C	T	3235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.56;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=33;PP=1023;SC=TGGCTTGAGACATGCAATAGT;SOR=2.537;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=24;TCR=33;TR=57;WE=5202249;WS=5202231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr10	5242004	rs55961423	C	T	819.85	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5137;FS=3.117;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=5;PP=564;ReadPosRankSum=-0.629;SC=TGTATGCTCCCCTAGAGGTCT;SOR=2.115;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=29;WE=5242012;WS=5241994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,30:0.88:34
chr10	5242037	rs55695566	C	T	1485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=19;PP=1055;ReadPosRankSum=3.028;SC=CCTGAAGAAGCGAGCCACACC;SOR=0.669;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=70;TCF=49;TCR=21;TR=57;WE=5242045;WS=5242027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,60:0.79:76
chr10	5242164	rs17306779	A	G	2656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.456;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=55;PP=1702;ReadPosRankSum=-2.239;SC=ACAGAGCTGTAGAGGTCACCA;SOR=0.890;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=135;TCF=64;TCR=71;TR=99;WE=5242172;WS=5242154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,109:0.72:151
chr10	5242346	rs7099651	G	A	8806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=153;NR=139;PP=2965;SC=ATGCACATGTGTTTAATGGGA;SOR=0.761;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=292;TCF=153;TCR=139;TR=292;WE=5242354;WS=5242336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,333:1.00:333
chr10	5244295	rs7083869	G	A	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=112;ReadPosRankSum=0.085;SC=GAATAGCAGTGCTACTAATTT;SOR=1.022;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=8;WE=5244303;WS=5244285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr10	5246584	rs11253042	C	A	1392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.774;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=31;PP=712;ReadPosRankSum=-1.234;SC=AAGTATAATGCCTAAGCCATT;SOR=0.563;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=178;TCF=89;TCR=89;TR=64;WE=5246600;WS=5246574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,76:0.37:203
chr10	5246626	rs56015013	G	A	2544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.459;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=54;PP=1427;ReadPosRankSum=-2.651;SC=CTTCTGTAACGTATGATGACA;SOR=0.968;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=157;TCF=76;TCR=81;TR=101;WE=5246634;WS=5246616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,116:0.62:187
chr10	5246670	rs1413781	A	C	1092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.423;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=26;PP=580;ReadPosRankSum=-1.161;SC=AAAGCCTCTGATTCAAAAATT;SOR=0.568;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=110;TCF=47;TCR=63;TR=46;WE=5246678;WS=5246660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,56:0.43:130
chr10	5255025	rs4880718	A	G	2612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.22;SOR=1.190;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr10	5258955	rs2050309	C	G	202.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=6;PP=128;SC=GGGTCAGCATCGGTCAACCTG;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=5258963;WS=5258945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	5260611	rs72003850	TTCAC	T	663.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=361;ReadPosRankSum=1.655;SC=TTCATATAAATTCACTTTGCT;SOR=0.744;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=42;TCF=16;TCR=26;TR=10;WE=5260622;WS=5260601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,21:0.26:81
chr10	5260812	rs2398157	A	G	364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=10;PP=261;SC=CTGGACACACAGCCTCTGGTT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=5260820;WS=5260802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr10	5435918	rs7097775	G	A	4048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=60;PP=2274;SC=ACTCAAAGCAGGCAGTGGTGA;SOR=0.840;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=59;TCR=60;TR=119;WE=5435926;WS=5435908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr10	5436260	rs7910290	A	G	2518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=39;PP=1615;SC=GCTCTACCACAGCAGTGGAGA;SOR=0.826;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=87;TCF=47;TCR=40;TR=86;WE=5436268;WS=5436250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr10	5436487	rs6601957	A	G	1778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=37;PP=1122;SC=TGAATTGGACAGTAGTGGCAG;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=20;TCR=37;TR=57;WE=5436495;WS=5436477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr10	5437365	rs11253156	A	G	4317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=76;NR=65;PP=2508;SC=CGTAATTGTTAGCAGCATCCT;SOR=0.784;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=142;TCF=77;TCR=65;TR=141;WE=5437373;WS=5437355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr10	5446632	rs10904491	G	A	664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=6;PP=351;SC=AGAAACAAATGTTTCTTTACA;SOR=1.270;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=22;WE=5446640;WS=5446622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr10	5446794	rs7477466	C	T	2813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=42;NR=49;PP=1525;SC=GTAGTAATGACTGAGGAGCCT;SOR=1.094;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=42;TCR=49;TR=91;WE=5446802;WS=5446784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr10	5446942	rs4881435	C	T	201.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=162;SC=CTGAACAACCCGGGATAAAGT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=5446950;WS=5446932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr10	5446965	rs4881436	G	A	69.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=3;PP=48;SC=GTACACAGCTGCAGATGAACT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=5446973;WS=5446955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr10	5471200	rs4604777	C	T	1647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=28;PP=939;SC=AAGGTAAGCCCTGCTGCCCTG;SOR=0.976;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=27;TCR=28;TR=55;WE=5471208;WS=5471190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr10	5495218	rs4567355	T	C	3107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=62;NR=40;PP=1797;SC=GACAGGCCTATCATGACCCCA;SOR=0.853;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=102;TCF=62;TCR=40;TR=102;WE=5495226;WS=5495208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr10	5498248	rs4242790	G	T	1353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=29;PP=882;SC=TAAAATGCAGGCCTTCAATAA;SOR=1.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=14;TCR=29;TR=43;WE=5498256;WS=5498238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
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chr10	5558349	rs4072067	G	A	764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=20;PP=551;SC=GAGGCTTGACGGGGAAAGAAG;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=5558357;WS=5558339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr10	5682641	rs7896492	C	T	1993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=23;PP=1140;SC=ACGGGGGCAGCCACGGTCCGG;SOR=1.270;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=46;TCR=23;TR=69;WE=5682649;WS=5682631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr10	5682855	rs4427479	TG	CC	921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=1.798;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.61;ReadPosRankSum=-0.504;SOR=0.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,29:0.27:107
chr10	5684342	rs6602421	C	G	280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=3;PP=202;SC=TCTTGCGGGCCCAGGACGGAG;SOR=1.802;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=11;WE=5684350;WS=5684332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr10	5684534	rs61006671	T	TA	388.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.170;HP=9;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=208;ReadPosRankSum=0.214;SC=AAAGTAAAGGTAAAAAAAAAT;SOR=0.512;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=12;WE=5684551;WS=5684524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,22:0.52:42
chr10	5691135	rs2386647	C	T	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.070;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=282;ReadPosRankSum=-0.193;SC=AGCACACAGACGCGGCAGGGG;SOR=0.533;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=60;TCF=18;TCR=42;TR=21;WE=5691143;WS=5691125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,22:0.34:64
chr10	5693379	rs6602483	A	G	5055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=83;NR=88;PP=2733;SC=CACGCAACCCACTTTCCCATC;SOR=0.916;SbPval=0.52;Source=Platypus;TCF=83;TR=171;WE=5693387;WS=5693369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr10	5708311	rs6602610	G	A	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.97;ReadPosRankSum=0.160;SOR=1.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr10	5708360	rs75474563	G	A	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=128;ReadPosRankSum=-0.296;SC=CCCGCCCACGGAGCCAGCGCG;SOR=0.760;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=18;TCF=11;TCR=7;TR=11;WE=5708368;WS=5708350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr10	5708420	rs6602613	T	C	2907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.26;SOR=0.920;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr10	5708422	rs76394459	A	T	1013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=1.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.00;ReadPosRankSum=1.539;SOR=0.507;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,49:0.63:78
chr10	5708434	rs56178329	C	G	976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.06;ReadPosRankSum=1.833;SOR=0.710;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,50:0.62:81
chr10	5766337	rs10737018	G	A	802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=6;PP=525;SC=CAAATTGACTGTAAGTACATA;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=27;WE=5766345;WS=5766327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr10	5781628	rs2254067	T	G	4040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=87;NR=53;PP=2582;SC=TTCAAGAGGTTGTCAAGAAGA;SOR=1.273;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=141;TCF=87;TCR=54;TR=140;WE=5781636;WS=5781618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr10	5781800	rs61731327	A	T	2388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.785;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=56;PP=1482;ReadPosRankSum=-1.273;SC=GAGGCTAGAAATCTTCACTGT;SOR=0.707;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=275;TCF=146;TCR=129;TR=107;WE=5781808;WS=5781790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:192,122:0.39:314
chr10	5781969	rs2797486	A	T	4972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=80;PP=2965;SC=CAGACTTAACAGTTAGCCAAG;SOR=0.750;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=168;TCF=88;TCR=80;TR=168;WE=5781977;WS=5781959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr10	5784509	rs2797488	G	A	1178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=30;PP=784;SC=GCTGAATACCGTTAAATGTTG;SOR=3.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=37;WE=5784517;WS=5784499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr10	5788608	rs2797491	G	C	7747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=122;NR=127;PP=2965;SC=GCTGATGAACGTACAACCTTT;SOR=0.759;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=249;TCF=122;TCR=127;TR=249;WE=5788616;WS=5788598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,279:1.00:279
chr10	5789966	rs3082216	CCTGCCTCAG	C	1176.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.280;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.268;NF=5;NR=13;PP=2971;ReadPosRankSum=-0.865;SC=GTTAAACCAGCCTGCCTCAGC;SOR=0.692;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=54;TCF=12;TCR=42;TR=18;WE=5789982;WS=5789956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,33:0.39:84
chr10	5790420	rs2669142	T	C	6899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=112;PP=2965;SC=GCAGAGCCAGTGTTTCAAGCA;SOR=0.809;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=213;TCF=101;TCR=112;TR=213;WE=5790428;WS=5790410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr10	5804531	rs2797501	G	A	1291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=30;NR=18;PP=813;SC=TTTGAAAATAGTGGAATCCTT;SOR=1.051;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=30;TCR=18;TR=48;WE=5804539;WS=5804521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr10	5808759	rs77492921	A	G	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=91;ReadPosRankSum=0.655;SC=AGTTGGATGTAAAGTACACAG;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=6;WE=5808767;WS=5808749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr10	5837038	rs10752110	T	C	1119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=29;PP=727;ReadPosRankSum=-0.516;SC=ATAAAGAACATTTACTAATAC;SOR=0.577;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=20;TCR=40;TR=44;WE=5837046;WS=5837028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,47:0.72:65
chr10	5838880	rs11255237	C	T	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=4;PP=37;ReadPosRankSum=1.909;SC=TTTTTTATTACAATATGTACA;SOR=0.446;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=8;TCR=12;TR=7;WE=5838888;WS=5838870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr10	5842509	rs3793714	A	G	1273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=18;PP=705;ReadPosRankSum=1.178;SC=GAGATTCACAAGTGAAATACT;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=131;TCF=86;TCR=45;TR=55;WE=5842517;WS=5842499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,63:0.41:152
chr10	5919947	rs2985043	C	T	687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=1;PP=483;SC=AACTCCTCAGCAGGAGTGGAA;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=5919955;WS=5919937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	5920121	rs1052420	T	C	4749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=75;PP=2280;SC=GCCAGAGCCCTGAAGGACATC;SOR=0.831;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=155;TCF=80;TCR=75;TR=155;WE=5920129;WS=5920111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr10	5922186	rs811561	T	A	358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=1;PP=297;SC=ATTAAAATCATTGTTTTAAAT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=5922194;WS=5922176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr10	5924942	rs617165	C	G	5067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=103;NR=65;PP=2965;SC=CAGGGAAGCTCGGACAACGTT;SOR=1.075;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=168;TCF=103;TCR=65;TR=168;WE=5924950;WS=5924932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr10	5925971	rs631947	C	A	6429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=113;NR=101;PP=2965;SC=CGTCGATGTGCCCACACTGGA;SOR=0.701;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=214;TCF=113;TCR=101;TR=214;WE=5925979;WS=5925961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr10	5932187	rs2253422	C	A	89.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=1;PP=53;SC=AGGAAGTCGGCGGGCGTCTCG;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=5932195;WS=5932177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr10	5932475	.	T	C	69	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=3;NR=3;PP=69;QD=17.2952020912;SC=GGCTCGGCCGTCCGGGCCGTG;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=6;WE=5932483;WS=5932465;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	5932491	.	G	A	49	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=30;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=1;NR=2;PP=49;QD=27.9237375157;SC=CCGTGGGCAGGTGGAGGGCGC;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=5932499;WS=5932481;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr10	5951025	rs595923	T	C	5634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=84;PP=2965;SC=TACGGTGAGCTTTGCCTGTGC;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=175;TCF=91;TCR=84;TR=175;WE=5951033;WS=5951015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr10	5966190	rs2274029	G	A	758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.63;SOR=5.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	5966190	.	GCA	ACG	756	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=15;NR=0;PP=756;QD=53.9645249908;SC=CTGCTCTTGCGCAGCTGCTTA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=5966200;WS=5966180;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	5966192	rs2274030	A	G	758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.15;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	5967158	rs2669126	C	T	142.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=0;PP=112;SC=TTTTCTGTTCCCGACAGTTGT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=5967166;WS=5967152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr10	5978411	rs646406	T	C	2003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=21;PP=1241;SC=TCGCTCTTTCTTTCTCAGGAG;SOR=1.488;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=48;TCR=21;TR=69;WE=5978419;WS=5978401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr10	5990899	rs4367845	C	T	357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=1;PP=236;SC=TTATACAAGGCACAATGTCAA;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=5990907;WS=5990889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	5995052	rs2229135	C	T	1251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.843;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=16;PP=689;ReadPosRankSum=0.626;SC=CTGGTTTCCCCGAGTTTCATA;SOR=0.841;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=78;TCF=47;TCR=31;TR=46;WE=5995060;WS=5995042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,53:0.62:85
chr10	5998285	rs3136627	G	A	1305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=18;PP=779;ReadPosRankSum=-0.090;SC=GCCAGGTGCAGCTCTTTTCTC;SOR=0.775;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=81;TCF=51;TCR=30;TR=50;WE=5998293;WS=5998275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,58:0.61:95
chr10	6005674	rs3136614	G	A	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.97;ReadPosRankSum=-0.857;SOR=0.713;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,26:0.24:107
chr10	6008172	rs2296139	C	T	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.319;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=16;PP=387;ReadPosRankSum=0.808;SC=ACACGCACTCCGTCAGGCTGG;SOR=0.908;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=130;TCF=73;TCR=57;TR=39;WE=6008180;WS=6008162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,41:0.28:145
chr10	6010864	rs8177777	G	A	2699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.768;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=55;PP=1432;ReadPosRankSum=2.306;SC=GCTCCTTCCCGCCAGGACAGC;SOR=0.617;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=158;TCF=85;TCR=73;TR=110;WE=6010872;WS=6010854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,126:0.68:185
chr10	6019698	rs8177628	C	T	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=156;ReadPosRankSum=-1.135;SC=CCCCTGTCCCCGGGACGCATG;SOR=0.446;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=10;WE=6019706;WS=6019688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr10	6042034	rs10795731	C	T	2182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.10;SOR=2.334;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr10	6061277	rs7069976	G	A	237.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=2;PP=166;SC=CAACCTACCAGTCAACCAACT;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=6061285;WS=6061267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr10	6061781	rs10752175	T	C	3871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=64;PP=2519;SC=CCTGGTCACCTCTGCCCTTTT;SOR=0.838;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=137;TCF=73;TCR=64;TR=137;WE=6061789;WS=6061771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr10	6062051	rs9804284	T	A	400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=287;SC=ATGCCACCCCTCATGGTTCCA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=6062059;WS=6062041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	6063674	rs942200	T	C	1757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=41;PP=1060;SC=ATGGAAGGAATGCTCTGAAGG;SOR=1.681;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=19;TCR=41;TR=60;WE=6063682;WS=6063664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr10	6066195	rs12358961	T	A	1641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=13;PP=1020;SC=GGAGGACAGATTCATCTCTCA;SOR=1.823;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=37;TCR=13;TR=50;WE=6066203;WS=6066185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr10	6066461	rs12722575	C	T	771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=18;PP=390;ReadPosRankSum=-0.499;SC=CTTACAAATACGAAACCAGAG;SOR=0.602;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=42;TCF=13;TCR=29;TR=27;WE=6066469;WS=6066451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,33:0.69:48
chr10	6067688	rs2025345	A	G	333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=235;SC=TATCCTGTAGACTGGACTGGC;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=6067696;WS=6067678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr10	6150828	rs374720400	GCTCTGTC	G	279.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=2.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.76;ReadPosRankSum=-0.378;SOR=1.276;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr10	6150837	.	C	T	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.008;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.40;ReadPosRankSum=-0.134;SOR=0.392;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr10	6150843	.	G	A	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.166;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.16;ReadPosRankSum=0.195;SOR=0.425;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr10	6150844	.	C	A	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.328;ClippingRankSum=-0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=17.36;ReadPosRankSum=-0.206;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr10	6150845	.	C	T	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.719;ClippingRankSum=-0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.72;ReadPosRankSum=0.286;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr10	6150848	rs75593307	ACCTG	A	145.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.361;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.21;ReadPosRankSum=0.638;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr10	6152220	rs41295353	C	G	855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.512;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.708;NF=5;NR=28;PP=643;ReadPosRankSum=0.638;SC=CACACGGTACCTGCCTCAATC;SOR=1.236;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=49;TCF=9;TCR=40;TR=33;WE=6152228;WS=6152210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,34:0.64:53
chr10	6156118	rs10795823	T	C	3890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=48;PP=1688;SC=GAAGTAAGAGTGTTTTCTTTT;SOR=0.848;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=120;TCF=72;TCR=48;TR=120;WE=6156126;WS=6156108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr10	6187115	rs11256972	A	G	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=42;ReadPosRankSum=0.452;SC=GCCCGGGGCCAAGCGAGACGC;SOR=0.641;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=6;WE=6187123;WS=6187105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,6:0.21:29
chr10	6188591	rs7074372	A	G	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.03;ReadPosRankSum=-2.104;SOR=0.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,7:0.24:29
chr10	6245317	rs6602514	G	T	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=6.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.54;ReadPosRankSum=0.944;SOR=0.385;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,29:0.37:79
chr10	6258015	rs2148293	T	C	1466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=9;PP=932;SC=TGTCGGGGCGTGTCGGGAGTT;SOR=2.880;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=34;TCR=9;TR=43;WE=6258023;WS=6258005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr10	6258052	rs2148294	G	A	3537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=43;PP=2095;SC=CGGATGCACCGGCGCTGACAT;SOR=1.224;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=73;TCR=44;TR=115;WE=6258060;WS=6258042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr10	6258300	rs2516622	A	C	450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=9;PP=223;SC=CTCAGGAAGGAGGATGTGGGG;SOR=2.494;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=6258319;WS=6258290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr10	6258311	rs2516623	T	C	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=8;PP=190;SC=GGATGTGGGGTGGACTCAGGG;SOR=2.303;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=6258319;WS=6258290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	6258796	rs2182412	T	C	2289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=58;PP=1749;SC=AGGAAAAGGCTTCAGGAAGCG;SOR=2.185;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=20;TCR=58;TR=78;WE=6258804;WS=6258786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr10	6258840	rs5782881	GC	G	640.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=17;PP=666;SC=CCCTCCTGCTGCCCATGTTCC;SOR=4.514;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=6258848;WS=6258830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr10	6258937	rs2765827	A	G	673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=4;PP=499;SC=CTTGGGGGCCATGGGGCGTTC;SOR=3.098;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=25;WE=6258945;WS=6258927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr10	6259239	rs2516624	G	A	583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=16;PP=437;SC=GACCGGGTCCGGCTCGGAAGC;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=6259247;WS=6259229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr10	6261704	rs1557111	T	C	403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=10;PP=308;SC=TGAGGGTTCTTACTGAATTCT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=6261712;WS=6261694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr10	6263272	rs35364998	C	A	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.172;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=170;ReadPosRankSum=1.093;SC=ACGTGGGCTGCCTGCTCCAGC;SOR=0.922;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=47;TCF=38;TCR=9;TR=16;WE=6263280;WS=6263262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,20:0.36:56
chr10	6319702	rs59833671	G	A	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=171;ReadPosRankSum=0.332;SC=CCAGCACCACGCTTTCTGTAC;SOR=0.693;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=10;WE=6319710;WS=6319692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr10	6368707	rs7087657	C	T	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=7;PP=98;ReadPosRankSum=-1.096;SC=AAACAACCCACATTTATAAAG;SOR=0.850;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=16;TCR=24;TR=12;WE=6368732;WS=6368697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,15:0.34:44
chr10	6368721	rs7074209	G	T	1264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.61;SOR=1.460;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr10	6368724	rs7074211	G	T	1264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.17;SOR=1.382;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr10	6368760	rs7087682	C	T	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.72;ReadPosRankSum=1.345;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr10	6472962	rs601150	T	G	1422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=34;PP=972;SC=CATCAGGAGGTCGTGGTGCTT;SOR=2.448;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=11;TCR=34;TR=45;WE=6472970;WS=6472952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr10	6498559	rs112802370	A	C	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=25;ReadPosRankSum=-1.036;SC=AAACCTTCTGATTTTCAGGGG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=3;WE=6498567;WS=6498549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr10	6504126	rs604663	T	C	2701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.58;SOR=1.733;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr10	6504136	rs678304	C	G	3213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.17;SOR=1.468;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr10	6506406	rs141007126	CATTTTT	C	896.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=3.618;NF=0;NR=15;PP=578;ReadPosRankSum=-0.582;SC=TATTTCATTTCATTTTTATTT;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=1;TCR=44;TR=15;WE=6506419;WS=6506396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,27:0.37:73
chr10	6527344	rs661891	A	C	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.697;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=167;ReadPosRankSum=-1.352;SC=CATAGGGTCAACAAAGATCTC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=8;WE=6527352;WS=6527334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr10	6531552	rs4750528	A	G	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=159;ReadPosRankSum=-1.270;SC=AGAGGGCGAGAAGAGTCGAGA;SOR=0.976;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=10;WE=6531560;WS=6531542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr10	6533625	rs527611	T	A	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=28;ReadPosRankSum=0.886;SC=CGGGCCATGCTCATCCCCCAC;SOR=0.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=4;WE=6533633;WS=6533615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,4:0.21:19
chr10	6533877	rs3815975	A	G	1428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=38;PP=907;ReadPosRankSum=-2.000;SC=TAATGAAAACACTGGCATTGT;SOR=0.628;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=75;TCF=26;TCR=49;TR=59;WE=6533885;WS=6533867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,64:0.74:86
chr10	6533900	rs3815974	C	T	893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.895;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=26;PP=590;ReadPosRankSum=-0.689;SC=GCATTTTAAACCATCATTGTC;SOR=1.402;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=46;TCF=12;TCR=34;TR=34;WE=6533908;WS=6533890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,38:0.69:55
chr10	6552852	rs563798	C	T	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=116;ReadPosRankSum=-0.079;SC=CCTGGTGACCCGAGGCCAGTG;SOR=0.610;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=10;WE=6552860;WS=6552842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,12:0.80:15
chr10	7205717	rs2692756	C	G	1791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.604;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=28;PP=903;ReadPosRankSum=-0.060;SC=AATGGGCCACCTCCCGAGGGC;SOR=0.617;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=138;TCF=85;TCR=53;TR=75;WE=7205725;WS=7205707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,87:0.57:153
chr10	7230524	rs2462712	G	T	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=139;ReadPosRankSum=-0.193;SC=AAGTGGCAAGGTTCAAAGTAG;SOR=0.260;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=11;WE=7230532;WS=7230514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
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chr10	7319078	rs4338435	C	G	1003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=1.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.48;ReadPosRankSum=-0.556;SOR=0.394;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,29:0.71:41
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chr10	7390300	rs1751658	A	G	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=1.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.99;ReadPosRankSum=-1.107;SOR=0.867;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,27:0.25:108
chr10	7390444	rs11595496	A	C	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.744;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.07;ReadPosRankSum=-0.023;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr10	7423960	rs2254756	T	C	549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=21;PP=591;SC=ATCATATTGATTATATTCACT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=7423968;WS=7423950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	7423984	rs2254760	G	T	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.18;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	7605067	rs3824658	C	T	2798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=32;PP=1703;SC=GGACATTCCCCGGCCAAGTGT;SOR=1.190;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=59;TCR=32;TR=91;WE=7605085;WS=7605057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr10	7605077	rs61199416	TC	T	4220.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=36;PP=2555;SC=CGGCCAAGTGTCCATCCCTGT;SOR=1.101;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=64;TCF=27;TCR=37;TR=62;WE=7605085;WS=7605057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr10	7605101	rs10795551	A	G	3780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=46;PP=2235;SC=AAATGGATGGAATGCCAGGTA;SOR=1.038;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=122;TCF=76;TCR=46;TR=122;WE=7605109;WS=7605091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr10	7605457	rs10737022	G	A	1001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=24;PP=699;SC=GCCACAGCCCGAGACTGGACT;SOR=1.885;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=34;WE=7605465;WS=7605447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr10	7614936	rs10737023	T	G	403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=308;SC=AGACGAGGTTTCACCATGTTG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=7614944;WS=7614926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr10	7614959	rs12254204	T	C	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=205;ReadPosRankSum=-0.621;SC=CAGGCTGGTCTTGAACTCCTG;SOR=1.493;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=10;WE=7614967;WS=7614949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr10	7615195	rs4747517	C	A	2258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.080;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=51;PP=1198;ReadPosRankSum=-0.985;SC=ATGGTCATTCCTTAAAGAAGA;SOR=0.449;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=105;TCF=40;TCR=65;TR=85;WE=7615203;WS=7615185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,97:0.82:119
chr10	7618380	rs3818783	C	T	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.053;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.880;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=49;ReadPosRankSum=0.922;SC=CTCAGGCCCGCGTCCCCCACA;SOR=2.546;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=4;WE=7618388;WS=7618370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr10	7618501	rs2275068	A	G	720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.533;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=12;PP=344;ReadPosRankSum=-0.865;SC=CCTCCAGGCCATCCATGCGTG;SOR=0.545;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=111;TCF=75;TCR=36;TR=33;WE=7618509;WS=7618491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,42:0.33:129
chr10	7618686	rs2275069	T	G	853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FS=4.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.40;ReadPosRankSum=-1.368;SOR=0.988;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:192,59:0.24:251
chr10	7618993	rs10458802	G	A	981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.83;ReadPosRankSum=0.821;SOR=0.779;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,28:0.34:83
chr10	7618997	rs10458803	G	A	993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.74;ReadPosRankSum=0.494;SOR=0.608;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,28:0.36:78
chr10	7621578	rs11255201	C	A	756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=2;PP=543;SC=CATGGTGACACCTCCCATTGC;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=7621586;WS=7621577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr10	7621771	rs17431370	A	G	5129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.138;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=105;NR=90;PP=2833;ReadPosRankSum=0.536;SC=GTGTGAGGCCACAGTTCTCCA;SOR=0.759;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=270;TCF=142;TCR=128;TR=195;WE=7621779;WS=7621761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,234:0.74:318
chr10	7622047	rs12256183	A	G	176.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=6;PP=148;SC=ACCAACACGGAACAGCTCAAG;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=7622055;WS=7622037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr10	7622075	rs12262854	G	C	77.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr10	7627746	rs12413114	C	T	55.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.43;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr10	7629168	rs945149	C	A	844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=3;PP=603;SC=CAGGGATGCTCAGTGATAACA;SOR=3.334;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=27;WE=7629176;WS=7629158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr10	7629203	rs4747526	C	T	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.901;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=216;ReadPosRankSum=-3.114;SC=TCAGCTGTGACGAATGGAAAG;SOR=1.341;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=40;TCF=34;TCR=6;TR=14;WE=7629211;WS=7629193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,14:0.33:43
chr10	7629411	rs4747527	T	G	432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=2.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.21;ReadPosRankSum=-0.482;SOR=0.370;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,15:0.25:60
chr10	7629417	rs4747528	A	C	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=1.361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.06;ReadPosRankSum=-0.820;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,13:0.26:50
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chr10	7755088	.	GA	G	348.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.102;ClippingRankSum=0.000;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.08;MQRankSum=1.787;QD=2.72;ReadPosRankSum=1.250;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:97,31:0.24:128
chr10	7759510	rs41290277	A	G	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=294;ReadPosRankSum=0.338;SC=AGGAAATTCTACATGCCCTCT;SOR=0.754;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=45;TCF=33;TCR=12;TR=16;WE=7759518;WS=7759500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,18:0.38:48
chr10	7763614	.	G	A	803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.227;ClippingRankSum=0.000;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.133;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=15;PP=377;ReadPosRankSum=-0.391;SC=CTTTCTAGGCGCACGTCTCCT;SOR=0.337;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=102;TCF=67;TCR=35;TR=38;WE=7763622;WS=7763604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,44:0.39:114
chr10	7763661	rs7075296	A	G	5404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=101;NR=75;PP=2965;SC=ATATGCCCTAACTGCCGGGAG;SOR=0.873;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=176;TCF=101;TCR=75;TR=176;WE=7763669;WS=7763651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr10	7769604	rs2277226	A	G	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=166;ReadPosRankSum=-0.888;SC=CTGAATCCAGAATGGGATTTT;SOR=0.631;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=62;TCF=44;TCR=18;TR=17;WE=7769612;WS=7769594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,21:0.28:76
chr10	7773976	rs7098319	A	G	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.784;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=20;PP=384;ReadPosRankSum=-1.518;SC=CCACTTATCCATTTATTCTAT;SOR=0.493;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=94;TCF=32;TCR=62;TR=32;WE=7773984;WS=7773966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,37:0.36:103
chr10	7776831	rs1926937	C	T	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=226;ReadPosRankSum=0.897;SC=AGCTGACTTGCGCTCCCCCTC;SOR=0.567;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=56;TCF=43;TCR=13;TR=19;WE=7776839;WS=7776821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,21:0.32:66
chr10	7785017	rs3736965	T	C	445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=0;PP=343;SC=ATATTTGTTCTGATTAAATTA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=7785025;WS=7785007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	7788495	rs7912419	T	C	1594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=18;PP=963;SC=GAGTCAATAATGAGCCTCTTT;SOR=1.421;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=36;TCR=18;TR=54;WE=7788503;WS=7788485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr10	7795911	rs7342066	A	G	4330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=88;NR=53;PP=2195;SC=GTTTGGCACCATACCTGTGTC;SOR=0.987;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=142;TCF=89;TCR=53;TR=141;WE=7795919;WS=7795901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr10	7797903	rs138937189	C	CAACT	53.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.85;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr10	7804308	rs1980856	C	T	1085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=21;NR=11;PP=517;SC=GCAGTTAATGCCGCCAAGACA;SOR=1.127;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=21;TCR=11;TR=32;WE=7804316;WS=7804298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr10	7811407	rs2296734	G	C	2349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=48;PP=1467;SC=GTGTGACATAGTAATTTACAG;SOR=1.730;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=24;TCR=48;TR=72;WE=7811418;WS=7811397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr10	7829759	rs17553878	C	T	3592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=36;PP=2315;SC=CCTGGGAAGACGGGGCCACTC;SOR=1.743;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=120;TCF=84;TCR=36;TR=120;WE=7829767;WS=7829749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr10	7830319	rs1475406	G	C	1124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=21;PP=700;SC=GGGGGCAGATGTGGGGTCGCA;SOR=1.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=11;TCR=21;TR=32;WE=7830327;WS=7830309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr10	7846152	rs914609	T	C	4841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=83;PP=2411;SC=ACCCACAGAGTGCAGAATACT;SOR=0.878;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=82;TCR=83;TR=165;WE=7846160;WS=7846142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr10	7866268	rs7070208	C	G	5727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=112;NR=83;PP=2965;SC=ATTTGCTTTTCACTTTGTTTC;SOR=0.967;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=196;TCF=112;TCR=84;TR=195;WE=7866276;WS=7866258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr10	8006519	rs17366712	G	C	3431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=65;PP=2153;ReadPosRankSum=-2.707;SC=GCTACACTCAGTGAAAAAATC;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=199;TCF=103;TCR=96;TR=134;WE=8006527;WS=8006509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,148:0.67:221
chr10	8006798	rs4747647	A	G	1375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.391;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=19;PP=689;ReadPosRankSum=0.175;SC=TCCGCGAACAATTTCACAAAG;SOR=0.960;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=177;TCF=102;TCR=75;TR=55;WE=8006806;WS=8006788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,69:0.34:202
chr10	8007559	rs10795583	GT	CC	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.78;ReadPosRankSum=0.085;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,13:0.15:86
chr10	8017033	rs58555368	CAAAAAAAAAAAAA	C	710.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.934;HP=20;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=1758;SC=GACTCTGTCTCAAAAAAAAAA;SOR=2.800;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=26;TCF=18;TCR=8;TR=5;WE=8017053;WS=8017023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,18:0.86:21
chr10	8019124	rs10795584	A	G	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=10;PP=446;ReadPosRankSum=-1.100;SC=TCAGTTTGTGAGAGTGGGAGA;SOR=0.773;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=58;TCF=39;TCR=19;TR=27;WE=8019132;WS=8019114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,28:0.43:65
chr10	8093034	rs501764	G	T	1842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=36;NR=27;PP=990;SC=CCGCGCCTCCGCTCTGCGCCA;SOR=1.002;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=64;TCF=36;TCR=28;TR=63;WE=8093042;WS=8093024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr10	8093185	rs485411	T	C	1032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=18;PP=525;ReadPosRankSum=1.158;SC=CCCTACCGAGTGGAGAAAGTC;SOR=0.771;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=71;TCF=44;TCR=27;TR=48;WE=8093193;WS=8093175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,51:0.65:79
chr10	8111409	rs422628	C	T	2293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.682;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.689;NF=58;NR=33;PP=1379;ReadPosRankSum=-2.076;SC=GTTTTGATTTCACCCTCTCCT;SOR=0.633;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=143;TCF=92;TCR=51;TR=91;WE=8111417;WS=8111399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,99:0.69:144
chr10	8115668	rs373223232	TA	T	259.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=20.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.49;MQRankSum=1.332;QD=6.49;ReadPosRankSum=0.951;SOR=2.700;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,22:0.55:40
chr10	9449465	rs61843465	A	G	10144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=394;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.67;QD=25.88;SOR=0.811;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,392:1.00:392
chr10	9449536	.	G	C	1776	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MMLQ=15;MQ=47.89;NF=63;NR=76;PP=1776;QD=13.0271310255;SC=CGGGGTCCTAGACACAGAGCG;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=316;TCF=147;TCR=169;TR=139;WE=9449544;WS=9449519;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:177,139:0.44:316
chr10	9449563	.	G	C	1819	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=27;MMLQ=25;MQ=47.58;NF=54;NR=59;PP=1819;QD=16.4050549783;SC=CGGGGTCCTAGACACAGAGCG;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=279;TCF=138;TCR=141;TR=113;WE=9449571;WS=9449553;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:166,113:0.41:279
chr10	9449628	.	A	G	717	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MMLQ=19;MQ=52.04;NF=26;NR=34;PP=717;QD=12.5295202091;SC=TGCAGAGCCCATCAGTGGGTT;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=161;TCF=82;TCR=79;TR=60;WE=9449636;WS=9449618;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:101,60:0.37:161
chr10	11047207	rs2773499	C	G	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=2.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.44;ReadPosRankSum=0.480;SOR=1.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr10	11290997	rs2653522	A	C	656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=1;PP=512;SC=TACCTGGAGAAGTCTTGTTGT;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=11291005;WS=11290987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr10	11299607	rs56183744	A	G	1771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=27;PP=1132;SC=TTGGTCTCACATGGCTGGGGC;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=33;TCR=27;TR=60;WE=11299615;WS=11299597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr10	11308790	rs72051267	TTC	T	611.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.15;QD=32.20;SOR=3.383;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr10	11316813	rs67013685	TAGTG	T	614.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=9;NR=1;PP=436;SC=GCAGCAGTGTTAGTGAGTTTC;SOR=3.126;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=10;WE=11316824;WS=11316803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	11316909	rs2244576	G	C	1598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=19;PP=1047;SC=CATCAGTAGGGAGTAGCAACC;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=34;TCR=19;TR=53;WE=11316917;WS=11316899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr10	11316987	rs2244573	G	A	2757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=42;PP=1606;SC=TGCTCTCACCGTCTCCACTTT;SOR=0.773;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=93;TCF=50;TCR=43;TR=92;WE=11316995;WS=11316977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr10	11330525	rs2277214	G	A	3952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=81;PP=2456;SC=GGTGAGTGTGGGGGGTGCTCT;SOR=1.527;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=125;TCF=44;TCR=81;TR=125;WE=11330533;WS=11330515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr10	11356093	rs5783207	T	TTTTG	880.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=2;PP=483;SC=TCTGTTTTCCTTTTTTCAGTG;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=11;WE=11356101;WS=11356083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr10	11361182	rs11596315	A	T	5707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.57;SOR=0.945;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr10	11361186	rs11596316	A	G	5640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.42;SOR=0.993;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr10	11532758	rs882206	C	A	2960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=44;PP=1677;SC=GAAATGTGCCCACAGGGCCCT;SOR=0.730;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=52;TCR=44;TR=96;WE=11532766;WS=11532748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr10	11784633	rs11558855	C	T	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=1.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=74;ReadPosRankSum=1.053;SC=GTGTCTCCGGCGCGGCCCCTG;SOR=1.038;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=19;TCF=9;TCR=10;TR=8;WE=11784641;WS=11784623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr10	11789290	rs4750089	G	C	390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=0;PP=303;SC=GGAATCGCAGGGGTCCTCACT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=11789298;WS=11789280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	11789382	rs4750090	G	A	2882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=33;PP=1634;SC=GAAGAGGAACGCGTTGTCACT;SOR=1.287;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=62;TCR=33;TR=95;WE=11789390;WS=11789372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr10	11789405	rs4750091	G	A	3945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=53;PP=2109;SC=CAATGCTGAAGTCTCTCCAAA;SOR=0.978;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=77;TCR=53;TR=130;WE=11789413;WS=11789395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr10	11789511	rs4750092	C	G	3280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=59;PP=1965;SC=GCAGTGCCCACAAGAGCTTTC;SOR=1.123;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=103;TCF=44;TCR=59;TR=103;WE=11789519;WS=11789501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr10	11791741	rs58243400	CCCAGCAAT	C	584.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=11;PP=1719;SC=GATCCTTTATCCCAGCAATCC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=11;WE=11791756;WS=11791731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	11797436	rs7899215	T	C	8049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=137;NR=137;PP=2965;SC=ACCACCCCGTTCCCGTCATTG;SOR=0.768;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=274;TCF=137;TCR=137;TR=274;WE=11797444;WS=11797426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,303:1.00:303
chr10	11797467	rs7910140	G	A	6698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=110;NR=120;PP=2965;SC=TGGCCTGGCCGCGGCTGCCGG;SOR=0.819;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=230;TCF=110;TCR=120;TR=230;WE=11797475;WS=11797457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr10	11797619	rs902892	C	G	2463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=40;NR=37;PP=1412;SC=TAATTTAACTCCCCCCACCCA;SOR=0.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=77;TCF=40;TCR=37;TR=77;WE=11797627;WS=11797609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr10	11797675	rs3750695	G	A	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=371;ReadPosRankSum=-0.086;SC=CAGTGCATGCGATGATTCAAG;SOR=0.582;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=13;TCR=25;TR=23;WE=11797683;WS=11797665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,23:0.59:39
chr10	11805152	rs61844892	C	T	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.50;ReadPosRankSum=-1.665;SOR=1.007;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,16:0.23:71
chr10	11805204	rs72781916	A	C	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=1.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.15;ReadPosRankSum=0.687;SOR=0.950;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,24:0.22:107
chr10	11805249	rs61739577	T	C	774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=0.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.711;SOR=0.754;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:108,48:0.31:156
chr10	11805354	rs12258196	A	G	1232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FS=1.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.93;ReadPosRankSum=0.161;SOR=0.536;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:138,40:0.22:178
chr10	11805357	rs10906011	G	A	1260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FS=2.250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.08;ReadPosRankSum=-0.020;SOR=0.602;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:137,41:0.23:178
chr10	11911986	.	C	A	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.240;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=344;ReadPosRankSum=0.837;SC=CGGCGCCTTCCCCGCCGCGGG;SOR=0.612;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=27;TCF=9;TCR=18;TR=20;WE=11911994;WS=11911976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,20:0.71:28
chr10	11970709	.	G	GA	40	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;FR=0.5001;HP=13;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=15;MQ=59.21;NF=2;NR=2;PP=40;QD=11.5;SC=CTCCGCCTCAGAAAAAAAAAA;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=4;WE=11970717;WS=11970699;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,4:0.33:12
chr10	11978499	rs7921794	T	G	1350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=21;PP=758;ReadPosRankSum=-0.126;SC=AACCTAACTGTATAACTCACA;SOR=0.758;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=82;TCF=48;TCR=34;TR=54;WE=11978507;WS=11978489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,62:0.67:92
chr10	12046546	rs7079388	T	C	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.169;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=10;PP=376;ReadPosRankSum=-1.738;SC=ATCATCTTTGTTGGACTCTTT;SOR=0.437;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=61;TCF=42;TCR=19;TR=29;WE=12046554;WS=12046536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,30:0.45:67
chr10	12068445	rs72777744	A	C	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.098;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=78;ReadPosRankSum=-1.788;SC=GGAGGTATTTAACATGGAGAC;SOR=0.141;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=6;WE=12068453;WS=12068435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,7:0.28:25
chr10	12071397	rs11257490	G	A	3479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.426;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=57;PP=2305;ReadPosRankSum=1.338;SC=AACTTGAGTCGAGGCGGCTGA;SOR=0.940;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=219;TCF=122;TCR=97;TR=140;WE=12071405;WS=12071387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,152:0.64:239
chr10	12111090	rs1279138	T	C	3379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=55;NR=58;PP=2228;SC=TCTCCCTCTCTTCTGGCGTGG;SOR=0.888;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=55;TCR=58;TR=113;WE=12111098;WS=12111080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr10	12123363	rs1722446	T	A	690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=2;PP=477;SC=AATAAATAAATAAAAAGTAAG;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=12123371;WS=12123353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	12123667	rs1722445	A	C	1096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=23;PP=672;SC=GGAGCTGCACACCAGGCCAGG;SOR=3.383;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=26;WE=12123675;WS=12123657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr10	12148259	rs1701472	A	C	3633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=52;PP=2192;SC=GCAACAGCCCACTGTCAGAAG;SOR=0.917;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=73;TCR=52;TR=125;WE=12148267;WS=12148249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr10	12148286	rs1615510	T	C	3547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=68;NR=54;PP=1842;SC=TCCTGGGATTTGAATATGGGA;SOR=0.802;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=122;TCF=68;TCR=54;TR=122;WE=12148294;WS=12148276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr10	12149939	rs1722462	C	T	3698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=42;PP=2121;SC=AAAGCGGCATCGTCATCCTCC;SOR=1.112;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=75;TCR=42;TR=117;WE=12149947;WS=12149929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr10	12159647	rs2399771	A	G	5437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=102;NR=70;PP=2859;SC=TGCTTGCTGGATGTGTGGCCT;SOR=0.884;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=173;TCF=103;TCR=70;TR=172;WE=12159655;WS=12159637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr10	12159844	.	GATCTCCCCTCTCCT	G	119	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;FR=1.0000;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=7;PP=119;QD=23.1428571429;SC=AGGTGATGCAGATCTCCCCTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=7;WE=12159870;WS=12159834;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,7:0.78:9
chr10	12159845	rs34396265	ATCTCCCCTCTCC	A	760.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.26;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	12159859	rs376672314	ATT	A	759.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.21;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	12159861	.	T	A	127	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;FR=1.0000;HP=4;HapScore=3;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=127;QD=53.9237375157;SC=CCTCTCCTATTTTTATTTATT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=3;WE=12159870;WS=12159834;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,3:0.43:7
chr10	12178142	rs201216126	G	A	983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.270;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=36;PP=650;ReadPosRankSum=0.554;SC=CTGCTATAACGCTCTTCATTT;SOR=0.817;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=165;TCF=69;TCR=96;TR=58;WE=12178150;WS=12178132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,58:0.32:180
chr10	12191526	rs41291291	C	T	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=112;ReadPosRankSum=0.057;SC=TTAGGGAGTGCGACACCTCTA;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=7;WE=12191534;WS=12191516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr10	12191933	rs10466280	C	T	5442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=104;PP=2965;SC=AAATGGGTGCCGGAATCTGTC;SOR=1.196;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=173;TCF=69;TCR=104;TR=173;WE=12191941;WS=12191923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr10	12195881	rs2895501	G	A	1224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=28;PP=875;SC=TTTCATTCACGTGGTTAGTGT;SOR=1.828;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=41;WE=12195889;WS=12195871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr10	12198019	rs3758376	G	A	131.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=129;SC=GCCTAGAGCCGTTCTGGTTTG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=12198027;WS=12198009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr10	12200125	rs4750175	C	T	2032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=40;PP=1121;SC=TGTTTATTTACATTATTTATA;SOR=1.252;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=29;TCR=40;TR=69;WE=12200133;WS=12200115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr10	12202866	rs10906092	A	T	2034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=26;PP=1241;SC=GTTTGAAGTGACATGCAAATG;SOR=1.409;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=48;TCR=26;TR=74;WE=12202874;WS=12202856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr10	12203197	rs2399784	C	G	304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=252;SC=AGCACTTTGGCAGGCTGAGGC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=12203205;WS=12203187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	12209752	rs6686	T	C	6056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=118;NR=91;PP=2965;SC=CATGTTTCAGTGCTAGAGCGT;SOR=0.820;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=209;TCF=118;TCR=91;TR=209;WE=12209760;WS=12209742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr10	12209936	rs71513318	GT	G	1095.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=32;PP=694;SC=TGGTGATAACGTTTTTTTTGG;SOR=3.003;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=32;WE=12209944;WS=12209926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr10	12215870	rs35088067	CT	C	114.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.43;ReadPosRankSum=0.660;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr10	12227067	rs2140660	C	G	594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=18;PP=465;SC=CAATAATCATCTTTCCTTCCC;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=23;WE=12227075;WS=12227057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr10	12288302	rs36042706	A	G	1361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.515;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=30;PP=758;ReadPosRankSum=-0.295;SC=GACAGATACAATGTAAACCTT;SOR=0.642;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=195;TCF=98;TCR=97;TR=62;WE=12288310;WS=12288292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,75:0.33:227
chr10	12292286	rs12779647	C	G	650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.22;ReadPosRankSum=-1.164;SOR=0.681;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:155,47:0.23:202
chr10	12292344	rs10951	A	G	794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FS=1.826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.23;ReadPosRankSum=2.639;SOR=0.856;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:186,60:0.24:246
chr10	12292454	rs1051055	A	G	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=3.571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.00;ReadPosRankSum=1.313;SOR=0.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,9:0.17:54
chr10	12595037	rs2815629	G	C	582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=18;NR=0;PP=492;SC=CCACTGCGCCGGGCTGCCCCT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=12595045;WS=12595028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	12695177	rs7896283	A	G	1370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.06;ReadPosRankSum=0.411;SOR=0.691;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,62:0.68:91
chr10	12856057	rs10795984	G	A	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.308;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=370;ReadPosRankSum=-1.136;SC=CAAATTGCTGGGATTACCTGC;SOR=1.092;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=22;WE=12856065;WS=12856047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,23:0.49:47
chr10	12858045	rs3818675	G	A	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=3;PP=69;ReadPosRankSum=0.569;SC=CCTCCTCACTGCTGGGCCACC;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=7;WE=12858053;WS=12858038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr10	12858372	rs1644417	T	C	487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=320;ReadPosRankSum=0.694;SC=TTTAATGCCATCTGGGGGGGG;SOR=0.722;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=9;TCR=23;TR=21;WE=12858380;WS=12858362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,23:0.66:35
chr10	12858409	rs1644418	A	G	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5033;FS=6.690;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=184;ReadPosRankSum=1.055;SC=GGCCGTTGTCATTTATGAAAT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=10;WE=12858417;WS=12858399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr10	12866356	rs2482023	A	C	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.804;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.802;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=106;ReadPosRankSum=-1.080;SC=CACCCTGTCCACGACTGAGCC;SOR=2.419;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=6;WE=12866364;WS=12866355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr10	12867598	rs1757051	C	G	3313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.245;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=60;PP=2067;ReadPosRankSum=0.614;SC=CGGCCGTCGTCAGACATATGA;SOR=0.823;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=186;TCF=101;TCR=85;TR=134;WE=12867606;WS=12867588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,145:0.73:199
chr10	12870659	.	G	GCC	163	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=7;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=7;NR=0;PP=163;QD=26.7142857143;SC=AAAAAATTGGGCCCCCCCGCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=7;WE=12870667;WS=12870649;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:10,7:0.41:17
chr10	12870714	rs2482075	A	G	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=204;ReadPosRankSum=-0.023;SC=AGTGGGAAGCAGGGTGAGAAT;SOR=0.582;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=49;TCF=33;TCR=16;TR=22;WE=12870722;WS=12870704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,25:0.48:52
chr10	12940377	rs10752280	T	C	278.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=8;NR=0;PP=200;SC=TCAATTACCGTCAGGATTGGC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=12940385;WS=12940367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr10	12940455	rs10906249	A	G	1286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=11;PP=696;SC=GCCCCCGGGCATTGATGTGCG;SOR=1.656;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=43;TCF=32;TCR=11;TR=42;WE=12940463;WS=12940445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr10	13152504	rs34617995	GT	G	242.92	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.86;MQRankSum=0.692;QD=15.18;ReadPosRankSum=1.514;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,14:0.88:16
chr10	13158262	rs2244380	C	T	3577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=68;NR=41;PP=1782;SC=TTTCTGTTTTCACAGGAAGGA;SOR=0.990;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=69;TCR=41;TR=109;WE=13158270;WS=13158252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr10	13164332	rs765884	T	C	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=3.091;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=92;ReadPosRankSum=0.114;SC=ATAATTGCTATTTCTCTTAAA;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=6;WE=13164340;WS=13164322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr10	13164596	rs489040	A	G	1116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=29;PP=687;ReadPosRankSum=-0.446;SC=TATAGAAATCATGTTGATATT;SOR=0.670;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=67;TCF=26;TCR=41;TR=47;WE=13164604;WS=13164586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,50:0.68:73
chr10	13166076	rs523747	A	G	4404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=61;NR=86;PP=2682;SC=AAAACTCAGCAAAGCTGAGCT;SOR=1.273;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=147;TCF=61;TCR=86;TR=147;WE=13166084;WS=13166066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr10	13167860	rs676302	G	T	1137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=13;PP=681;SC=TTTTTCTACTGGAGTGTTCAG;SOR=1.206;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=23;TCR=13;TR=36;WE=13167868;WS=13167850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr10	13175682	rs7086894	A	C	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.48;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=2.769;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=154;ReadPosRankSum=0.000;SC=ATTCCAAATCAAGGCACCAAA;SOR=0.223;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=9;WE=13175690;WS=13175672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,13:0.81:16
chr10	13206233	rs7090944	A	T	1326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.114;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=39;PP=912;ReadPosRankSum=-0.932;SC=GTTTTCTGTTACTCTGTTTCA;SOR=0.577;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=196;TCF=83;TCR=113;TR=68;WE=13206241;WS=13206223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,75:0.33:226
chr10	13212884	rs2147279	C	T	2477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=26;PP=1379;SC=TGGAATTAGCCGTGCTTATTC;SOR=1.280;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=56;TCR=26;TR=82;WE=13212892;WS=13212874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr10	13214753	rs34630110	G	C	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.803;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=134;ReadPosRankSum=-0.977;SC=AACACCAAAGGCTTCACCTCC;SOR=0.245;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=47;TCF=13;TCR=34;TR=15;WE=13214761;WS=13214743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,17:0.35:49
chr10	13214812	rs6602637	A	G	317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=219;SC=GTATGTGTTTATGTGTGTGGG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=13214820;WS=13214802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr10	13224886	rs3765520	G	T	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.968;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=335;ReadPosRankSum=-0.610;SC=AAATGAGGACGGCATAACCTA;SOR=3.407;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=16;WE=13224894;WS=13224876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr10	13225119	rs11258235	G	A	1748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.759;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=38;PP=1041;ReadPosRankSum=-1.422;SC=CTGTTTCTGGGATTTGATTGA;SOR=0.575;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=100;TCF=42;TCR=58;TR=68;WE=13225127;WS=13225109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,77:0.67:115
chr10	13230837	rs6602641	A	G	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=91;ReadPosRankSum=0.316;SC=GCTGTTTCCCAGCCTGTTGCC;SOR=0.714;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=10;WE=13230845;WS=13230827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,8:0.28:29
chr10	13230934	rs7904071	C	T	626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.437;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=17;PP=409;ReadPosRankSum=2.805;SC=AGAAGCTCAGCGCAAAGCGTG;SOR=0.695;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=116;TCF=66;TCR=50;TR=35;WE=13230942;WS=13230924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,38:0.28:134
chr10	13231194	rs2296221	A	G	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=82;ReadPosRankSum=-0.237;SC=TTTATCTTTCATAACTCACTA;SOR=0.979;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=7;WE=13231202;WS=13231184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,7:0.23:31
chr10	13233471	rs7916762	C	T	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=375;ReadPosRankSum=0.000;SC=AAAGACTACACATTGGGTACA;SOR=2.400;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=17;WE=13233479;WS=13233461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,18:0.78:23
chr10	13234356	rs7905784	A	T	717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=1.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.27;ReadPosRankSum=-0.931;SOR=0.837;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:122,46:0.27:168
chr10	13237015	rs10796036	G	A	2982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=35;PP=1830;SC=CCCTGTTTGCGTATTTTGACT;SOR=1.350;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=103;TCF=68;TCR=35;TR=103;WE=13237023;WS=13237005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr10	13275514	rs4750327	A	G	1528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=11;PP=920;SC=TGGACGCGGGATGGGGTCCCT;SOR=2.004;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=34;TCR=11;TR=45;WE=13275522;WS=13275504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr10	13275553	rs3829925	T	G	3188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=43;PP=1826;SC=ACCTCATCTCTGGACTTGGGG;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=68;TCR=43;TR=110;WE=13275561;WS=13275543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr10	13275676	rs3829926	T	C	3609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=54;PP=1913;SC=GTGGGGGTGCTGGGGCTGCTG;SOR=0.769;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=115;TCF=61;TCR=54;TR=115;WE=13275684;WS=13275666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr10	13275691	rs10796042	G	T	3460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=46;PP=1908;SC=CTGCTGCTTCGCTGGCTGCAC;SOR=0.742;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=56;TCR=46;TR=102;WE=13275699;WS=13275681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr10	13276179	rs942418	A	G	3693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=64;NR=63;PP=2079;SC=AACACCCTCCACCTTGACCCT;SOR=0.827;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=64;TCR=64;TR=127;WE=13276187;WS=13276169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr10	13320236	rs11133	C	T	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=1.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.62;ReadPosRankSum=2.420;SOR=0.298;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,11:0.31:35
chr10	13320411	rs825625	A	T	2351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=42;PP=1194;SC=GCCCTCCATTAACCTTCAATT;SOR=1.230;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=31;TCR=42;TR=73;WE=13320419;WS=13320401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr10	13325946	rs648173	C	T	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.657;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=48;ReadPosRankSum=-1.062;SC=AAGCATTTCTCTCTCCCAAGA;SOR=0.307;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=8;WE=13325954;WS=13325936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,11:0.35:31
chr10	13330402	rs473407	T	C	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=10;PP=238;ReadPosRankSum=-1.028;SC=AGCCCTTGTGTGTGCCTGGGA;SOR=0.621;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=69;TCF=43;TCR=26;TR=24;WE=13330410;WS=13330392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,25:0.32:77
chr10	13334058	rs1408364	A	G	107.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=3;PP=83;SC=TTGCAAACAAAGCATGAAAAA;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=13334066;WS=13334048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr10	13337319	rs654536	A	C	211.96	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.593;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.9784;FS=6.532;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=166;ReadPosRankSum=1.593;SC=CAGAGTGAGAACCTTTCTCTA;SOR=2.788;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=8;WE=13337338;WS=13337309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr10	13337330	rs654553	T	C	237.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=394;SC=CCTTTCTCTATAAAAAATAAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=13337338;WS=13337309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	13337588	rs1747682	G	A	1005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=20;PP=520;SC=GGGTTAGAACGTTATTATCCA;SOR=1.236;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=15;TCR=20;TR=35;WE=13337596;WS=13337578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr10	13340236	rs28938169	G	A	2637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=42;PP=1363;SC=CCTGAAGTGGGATGAGCTACC;SOR=0.815;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=46;TCR=42;TR=88;WE=13340244;WS=13340226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr10	13341836	rs511959	G	C	202.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=1;PP=131;SC=AGGCGGGGACGCGGCGCTGAG;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=13341844;WS=13341827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	13341900	rs512109	A	G	683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=7;PP=319;SC=CACCCGGACCAGGGCCACCAC;SOR=1.302;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=22;WE=13341908;WS=13341890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr10	13344169	rs3758423	G	A	208.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=6;PP=151;SC=AGCATCACCAGCCCCTTCCTG;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=13344177;WS=13344159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	13376106	rs11591432	G	T	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.582;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=121;ReadPosRankSum=0.393;SC=AGACAGGGAAGGTTGTTAGGG;SOR=1.179;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=8;WE=13376114;WS=13376096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr10	13481427	rs12415754	T	A	3282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=67;PP=1949;ReadPosRankSum=0.515;SC=TTGTCTGAGGTGAGCTCTGCA;SOR=0.716;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=177;TCF=80;TCR=97;TR=122;WE=13481435;WS=13481417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,143:0.71:202
chr10	13494396	rs3832669	TAA	T	289.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=258;ReadPosRankSum=0.301;SC=AATAAGACTTTAAGAGAGCAA;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=6;WE=13494405;WS=13494395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr10	13494594	rs2277222	T	C	2847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.890;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=54;PP=1658;ReadPosRankSum=0.365;SC=GTAGAATCTGTACCCAATCTC;SOR=0.491;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=189;TCF=95;TCR=94;TR=113;WE=13494602;WS=13494584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,130:0.60:216
chr10	13534851	rs2251555	A	G	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.465;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=22;PP=470;ReadPosRankSum=-0.704;SC=GGGAAATTGGAGGTTGTTGTC;SOR=0.553;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=54;TCR=62;TR=42;WE=13534859;WS=13534841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,44:0.33:135
chr10	13541724	rs113234105	T	TAAAAC	192.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.48;ReadPosRankSum=-0.484;SOR=0.680;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,8:0.19:43
chr10	13570569	.	GGCGGCAGCGGCGGCA	G	233.79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.96;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	13633835	rs10906419	A	G	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.631;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=17;PP=294;ReadPosRankSum=0.488;SC=CTTCAGGAAGACCGCCCTCTT;SOR=1.008;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=112;TCF=57;TCR=55;TR=30;WE=13633843;WS=13633825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,32:0.27:120
chr10	13633929	rs10796097	T	G	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=1.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQRankSum=-1.003;QD=7.14;ReadPosRankSum=-0.649;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr10	13653490	rs2478121	C	A	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.723;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=46;ReadPosRankSum=2.000;SC=AAATTCCATCCGATTTTTAAG;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=13653498;WS=13653480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr10	13658335	rs2253308	G	A	472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FS=3.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.15;ReadPosRankSum=-0.514;SOR=1.134;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:116,34:0.23:150
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chr10	13696570	rs10906442	A	G	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=435;ReadPosRankSum=2.327;SC=CACAGGTGAAAGAGCTTGCGA;SOR=0.540;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=22;WE=13696578;WS=13696560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,24:0.65:37
chr10	13705298	rs10796108	G	T	601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=1;PP=270;SC=CCCAACCAAAGAGGTGAATAC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=13705316;WS=13705288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	13705307	rs55876188	ACT	A	705.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=1;PP=597;SC=AGAGGTGAATACTGGGAAATG;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=13705316;WS=13705288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	13717076	rs3814663	C	G	1657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.534;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=41;PP=980;ReadPosRankSum=-1.756;SC=ACTTGGCCAGCTGACAGGGGA;SOR=0.553;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=107;TCF=44;TCR=63;TR=69;WE=13717084;WS=13717066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,76:0.63:121
chr10	13735587	rs737376	G	A	511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=0;PP=362;SC=TGACATTCCCGACAGCTTGCC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=13735595;WS=13735577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr10	13735603	rs943090	G	C	611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=0;PP=550;SC=TTGCCATGGGGATTGTGAAAC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=13735611;WS=13735593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	13743517	rs1541004	G	A	1890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=42;PP=1105;ReadPosRankSum=0.397;SC=TCCCATTTCTGTTGAGAGAAA;SOR=0.752;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=112;TCF=53;TCR=59;TR=77;WE=13743525;WS=13743507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,87:0.69:127
chr10	13743646	rs1541005	G	C	243.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=8;PP=195;SC=TGCGCACACAGCTTACAGACA;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=13743654;WS=13743636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr10	13782110	rs11258567	A	C	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=5.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.77;ReadPosRankSum=-2.381;SOR=1.429;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,22:0.31:71
chr10	13782124	rs10906462	A	G	2841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=28;PP=1836;SC=AGAAGAAAACATATAACGAGA;SOR=1.536;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=56;TCR=28;TR=84;WE=13782132;WS=13782100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr10	13782605	rs6602679	G	A	864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.620;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=21;PP=530;ReadPosRankSum=-1.037;SC=GAATGCTGTTGTTGGAGTCTC;SOR=0.628;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=142;TCF=78;TCR=64;TR=45;WE=13782613;WS=13782595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,50:0.30:166
chr10	13803866	rs17628770	A	G	192.18	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5210;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=94;ReadPosRankSum=0.887;SC=ATATGAAACTAAACTCTAGAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=5;WE=13803874;WS=13803856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr10	13838340	rs3740122	T	G	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.18;ReadPosRankSum=-1.177;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,3:0.20:15
chr10	13838604	rs3740121	A	G	1781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.001;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=43;PP=1069;ReadPosRankSum=-0.100;SC=GAAAATAGAGACAAATTGGTT;SOR=0.992;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=133;TCF=63;TCR=70;TR=77;WE=13838612;WS=13838594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,83:0.57:146
chr10	13852967	rs77883999	A	T	1903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.394;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=49;PP=1216;ReadPosRankSum=-2.016;SC=TTCCTAAAATATGCAATCTCA;SOR=0.979;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=121;TCF=49;TCR=72;TR=79;WE=13852975;WS=13852957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,85:0.64:132
chr10	14425204	rs12780876	T	A	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=10;PP=147;ReadPosRankSum=1.512;SC=CTTGCTTCAGTCAGGCTGTTC;SOR=0.738;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=63;TCF=31;TCR=32;TR=17;WE=14425212;WS=14425194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,20:0.26:76
chr10	14572644	rs7922221	G	A	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.337;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=186;ReadPosRankSum=0.518;SC=CTGGGGCATCGCTGATAAATA;SOR=2.694;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=10;WE=14572652;WS=14572634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr10	14882060	rs3830599	AT	A	117.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.20;ReadPosRankSum=1.158;SOR=1.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr10	14884509	rs12770830	G	A	2548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.578;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=42;PP=1314;ReadPosRankSum=-1.233;SC=ATATTTAAAGGCCTATGTTGC;SOR=0.616;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=156;TCF=88;TCR=68;TR=96;WE=14884517;WS=14884499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,116:0.65:179
chr10	14920685	rs200159062	T	TG	293.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=1.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=315;ReadPosRankSum=0.685;SC=TCCTCGCGCTTGGGGCCGGGC;SOR=1.244;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=10;WE=14920693;WS=14920675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr10	14941654	rs17353856	C	T	3301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=1.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.493;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=70;PP=1951;ReadPosRankSum=1.530;SC=CGGCTCGATACGGCAATGTGT;SOR=0.643;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=202;TCF=94;TCR=108;TR=130;WE=14941662;WS=14941644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,151:0.63:238
chr10	14974843	rs35927251	G	A	3851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=77;PP=2044;ReadPosRankSum=-2.437;SC=GGAATCACTTGCACACGTACC;SOR=0.675;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=235;TCF=115;TCR=120;TR=153;WE=14974851;WS=14974833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,173:0.65:267
chr10	14974905	rs12768894	T	C	1916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=55;PP=1111;ReadPosRankSum=-1.030;SC=TGTGAGATGATGAAGGATCTC;SOR=0.694;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=139;TCF=49;TCR=90;TR=86;WE=14974913;WS=14974895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,91:0.61:150
chr10	14976414	rs7076862	G	A	6132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=132;NR=72;PP=2965;SC=TTGGTGAACAGATATTCATAG;SOR=1.257;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=204;TCF=132;TCR=72;TR=204;WE=14976422;WS=14976404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr10	14978451	rs12245497	A	G	191.88	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=17.44;ReadPosRankSum=-1.097;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr10	15008493	rs4750568	A	C	1362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=14;PP=702;SC=GTAAAACCAAAATCAGTAAGT;SOR=1.051;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=26;TCR=14;TR=40;WE=15008501;WS=15008483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr10	15014369	rs1935401	C	A	615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=0;PP=404;SC=TTGTGGGTATCATACTTTAAA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=15014377;WS=15014359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
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chr10	15014440	rs1935399	A	G	3143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=28;PP=2068;SC=CTTTTTAACTATTTGATAGTA;SOR=1.893;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=67;TCR=28;TR=95;WE=15014448;WS=15014430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr10	15014698	rs4418687	C	T	761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.32;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	15014702	rs4295952	A	G	793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.10;SOR=5.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	15057310	rs10906795	A	G	1222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.072;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=14;PP=673;ReadPosRankSum=-2.251;SC=CCAGAGCAACACGCAGCCTAG;SOR=1.085;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=80;TCF=53;TCR=27;TR=49;WE=15057318;WS=15057300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,56:0.64:87
chr10	15057496	rs76994393	A	T	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=302;ReadPosRankSum=0.695;SC=TGTACGGGCAAATTATTTGAA;SOR=0.648;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=74;TCF=23;TCR=51;TR=25;WE=15057504;WS=15057486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,30:0.34:88
chr10	15106441	rs10906818	A	G	2186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.770;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=29;PP=1149;ReadPosRankSum=-0.240;SC=CACTAGGTCTAAAAGAAAACA;SOR=0.805;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=107;TCF=65;TCR=42;TR=77;WE=15106449;WS=15106431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,94:0.75:125
chr10	15154974	rs7072269	A	G	2421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=46;PP=1557;SC=TAGGAGCAAAAGTGCTGTCAG;SOR=1.259;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=34;TCR=46;TR=80;WE=15154982;WS=15154964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr10	15177521	rs140435211	T	C	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=245;ReadPosRankSum=1.675;SC=ACCTAAACACTAACAATCCTC;SOR=0.495;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=15;WE=15177529;WS=15177511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr10	15296572	rs3824620	A	T	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=239;SC=ACAGTTTCAAAGCACTTGAAC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=15296580;WS=15296564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	15413071	rs192904368	G	A	1483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.58;SOR=1.278;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr10	15559327	.	ATT	A	30.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=0.000;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=2.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.28;ReadPosRankSum=0.530;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,4:0.17:24
chr10	15573050	rs1041135	A	G	3543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=53;PP=2198;SC=GATACTCACTACTATGCTTCC;SOR=0.856;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=69;TCR=54;TR=121;WE=15573058;WS=15573040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr10	15590372	rs9333229	G	T	330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=1;PP=203;SC=ATTAGAAATCGCTATGAAAAG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=15590380;WS=15590362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr10	15600271	rs2277204	A	G	1028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.743;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=23;PP=573;ReadPosRankSum=1.117;SC=TTTAGCCTTGAACTCTAGGCA;SOR=0.900;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=76;TCF=39;TCR=37;TR=44;WE=15600290;WS=15600261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,51:0.59:87
chr10	15648243	rs2282383	C	T	4959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=68;PP=2584;SC=CCCCAGAGAGCTTGCTTGAGA;SOR=0.760;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=155;TCF=87;TCR=68;TR=154;WE=15648251;WS=15648233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr10	15685983	rs4748191	A	T	912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=9;PP=595;SC=AATGGACTCTATTTCAGGACG;SOR=1.681;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=28;WE=15685991;WS=15685973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr10	15713507	rs7100228	A	G	1719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=9;PP=1093;SC=CCTTTGGTATAGCAAATAAAA;SOR=2.753;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=39;TCR=9;TR=48;WE=15713515;WS=15713497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr10	15713541	rs6602051	T	C	3243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=35;PP=1910;SC=AAAAACTTTATATGCCATTTT;SOR=1.476;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=67;TCR=35;TR=102;WE=15713549;WS=15713531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr10	15713667	rs7100510	C	G	3565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=66;PP=2135;SC=GAAAAAGAAACAAACTAATCA;SOR=1.311;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=111;TCF=44;TCR=67;TR=110;WE=15713675;WS=15713657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr10	15729923	rs1954181	C	T	6709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=117;NR=105;PP=2965;SC=CACAAGCCCACGGCTCATACT;SOR=0.725;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=222;TCF=117;TCR=105;TR=222;WE=15729931;WS=15729913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr10	15761482	rs193294851	G	A	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=148;ReadPosRankSum=-0.489;SC=GCTGCGGGGGGACTCCGCGGC;SOR=0.467;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=44;TCF=33;TCR=11;TR=12;WE=15761490;WS=15761472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,12:0.24:50
chr10	15761527	rs9333070	T	C	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.461;NF=20;NR=7;PP=361;ReadPosRankSum=-2.396;SC=AGCGCCTTCGTCCCCGCGCGC;SOR=0.669;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=83;TCF=60;TCR=23;TR=27;WE=15761549;WS=15761517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,30:0.31:96
chr10	15824258	rs199510240	ATTATAT	A	525.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.717;NF=2;NR=7;PP=408;ReadPosRankSum=0.000;SC=AACACTTTAAATTATATTTAT;SOR=0.368;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=9;WE=15824271;WS=15824248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr10	15883639	.	G	GA	109.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.211;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=9.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.35;MQRankSum=1.417;QD=4.99;ReadPosRankSum=0.855;SOR=0.024;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr10	16526840	rs2275731	G	A	753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=20;PP=505;SC=TTCTTTGACAGTATTTGTTCA;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=16526848;WS=16526830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr10	16547058	rs7904014	A	G	5088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=69;PP=2873;ReadPosRankSum=-0.627;SC=AGTTTGCTCAACTTGGCTGCT;SOR=0.285;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=156;TCF=87;TCR=69;TR=156;WE=16547066;WS=16547048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,187:0.99:188
chr10	16556710	rs7909832	T	C	1071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.55;ReadPosRankSum=0.447;SOR=0.685;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:128,65:0.34:193
chr10	16794623	rs10445	C	T	1882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.976;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=45;PP=1167;ReadPosRankSum=-0.055;SC=CCTTAGGCAGCGAGATCAGGT;SOR=0.831;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=289;TCF=153;TCR=136;TR=99;WE=16794631;WS=16794613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:212,106:0.33:318
chr10	16796919	rs1049632	C	A	914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.802;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=20;PP=512;ReadPosRankSum=-0.583;SC=AGTTGTTGTACGTCAAGTCCA;SOR=0.590;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=83;TCF=37;TCR=46;TR=38;WE=16796927;WS=16796909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,43:0.48:89
chr10	16878204	rs703062	T	C	1270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=10;PP=767;SC=GGCAGCTTTTTTGAATAAAAG;SOR=1.464;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=39;WE=16878212;WS=16878194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr10	16882518	rs703064	T	C	693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=24;PP=554;SC=TTGCATTGTATGTTCCACCAC;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=16882526;WS=16882508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr10	16943371	rs2796835	G	C	4713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=88;PP=2965;SC=CTCCAACAGCGAAGAGCAGTG;SOR=1.151;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=151;TCF=63;TCR=88;TR=151;WE=16943379;WS=16943361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr10	16945905	rs5783520	TG	T	396.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=61.78;NF=11;NR=0;PP=387;SC=GAAATCTTTATGGAAAAAAAT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=11;WE=16945913;WS=16945895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr10	16948177	rs780807	A	G	1726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=43;NR=13;PP=1253;SC=ATAAATGGGAAAACGCATTCT;SOR=2.147;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=43;TCR=13;TR=56;WE=16948185;WS=16948167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr10	16949401	rs780805	G	A	859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=21;NR=8;PP=486;SC=AAGATTTCAAGTATCACTAAA;SOR=1.473;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=29;WE=16949409;WS=16949391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr10	16949447	rs780804	A	C	2262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=22;PP=1313;SC=TTGGCAGTAGATGGGGGCATC;SOR=1.375;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=53;TCR=22;TR=75;WE=16949455;WS=16949437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr10	16967401	rs1276712	C	T	4534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=96;PP=2863;SC=GGGTGGAGAACAGATATCAGG;SOR=1.320;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=156;TCF=60;TCR=96;TR=156;WE=16967409;WS=16967391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr10	16967445	rs1276713	T	G	2427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=60;PP=1812;SC=AATTAAAATTTCATCAACTCC;SOR=2.513;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=17;TCR=60;TR=77;WE=16967453;WS=16967435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr10	16967586	rs62619939	C	G	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=131;ReadPosRankSum=-0.587;SC=GACCTACCACCAAGTAATCCC;SOR=0.593;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=9;WE=16967594;WS=16967576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr10	16975078	rs2271461	G	A	690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=0.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.71;ReadPosRankSum=-0.202;SOR=0.598;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,42:0.35:121
chr10	17007818	rs57634749	C	CT	353.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.643;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=375;ReadPosRankSum=0.167;SC=CTGATAGGTACTTAAATACAT;SOR=1.938;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=12;WE=17007826;WS=17007808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr10	17007847	rs61151602	T	TA	870.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.747;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=698;ReadPosRankSum=0.759;SC=ATTTGATTCTTACAGTTCCAC;SOR=1.347;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=28;TCF=19;TCR=9;TR=18;WE=17007855;WS=17007837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,27:0.56:48
chr10	17008171	rs1687708	A	G	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=1.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.87;ReadPosRankSum=1.597;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,23:0.57:40
chr10	17008174	rs1687707	T	C	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=1.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.43;ReadPosRankSum=1.631;SOR=1.101;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,22:0.56:39
chr10	17008183	rs1687706	C	T	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.11;ReadPosRankSum=-0.326;SOR=0.622;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr10	17024503	rs1801231	G	A	1760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=22;PP=1082;SC=GAGTCTTGTGGTTCAAGATCA;SOR=1.214;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=59;TCF=37;TCR=22;TR=59;WE=17024511;WS=17024493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr10	17024615	rs1801229	A	T	3423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=62;PP=2068;SC=TTGGAGAATGAATCTCTCCAC;SOR=0.822;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=62;TCR=62;TR=124;WE=17024623;WS=17024605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr10	17026010	rs2291523	A	C	991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=5;PP=626;SC=ACTAAGTTATAAGTGTGTAGC;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=27;WE=17026018;WS=17026000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr10	17026384	rs3012494	A	G	246.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=202;SC=TATGATTATTAGAGATTGAAA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=17026392;WS=17026374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	17032281	rs2291521	C	T	1298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.765;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=29;PP=872;ReadPosRankSum=-0.743;SC=GAGTGATTTCCTGTTCTACCC;SOR=0.563;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=196;TCF=114;TCR=82;TR=64;WE=17032289;WS=17032271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,72:0.32:223
chr10	17032559	rs925522	A	C	331.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.47;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	17032559	.	ACA	CCG	357	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=0;NR=7;PP=357;QD=58.6382678375;SC=GGGCAACAGCACATGGAAAAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=17032569;WS=17032549;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr10	17032561	rs925523	A	G	331.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.47;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	17083054	rs370803308	T	C	2257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.292;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=35;PP=1312;ReadPosRankSum=-0.489;SC=TGTGGAGCAGTTTATGTGATG;SOR=0.460;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=126;TCF=77;TCR=49;TR=84;WE=17083062;WS=17083044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,99:0.69:144
chr10	17109974	rs79364985	AAC	A	363.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=6;NR=0;PP=303;SC=TGGTTTTCATAACACAACGTG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=6;WE=17109983;WS=17109964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr10	17110474	rs4747297	C	T	353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=12;NR=1;PP=281;SC=AGAAAATATACATTCTTTGTC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=17110482;WS=17110464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	17110595	rs10795440	G	A	2647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=56;NR=43;PP=1652;SC=AAAGGGAACAGTCTCTTACCC;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=56;TCR=43;TR=99;WE=17110603;WS=17110585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr10	17110722	.	G	A	912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.382;ClippingRankSum=0.000;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=23;PP=536;ReadPosRankSum=0.628;SC=TGTCTGTACCGCAATACTTTT;SOR=0.521;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=45;TCF=15;TCR=30;TR=36;WE=17110730;WS=17110712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,39:0.83:47
chr10	17141952	rs1033765	C	A	228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=7;NR=2;PP=129;SC=TGATTAAGAACACTTAATAAC;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=17141960;WS=17141942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	17146652	rs7068549	C	A	1382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=26;PP=660;SC=TGGATAGACACTAAACTTTAA;SOR=3.737;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=29;WE=17146660;WS=17146642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr10	17146667	rs4748353	C	T	1080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=18;PP=481;SC=CTTTAATCAACCCAAATAATA;SOR=3.442;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=17146675;WS=17146657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr10	17152855	rs12242395	G	A	234.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=162;SC=ACTAGATTCCGTATTCCTATG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=17152863;WS=17152845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	17152994	rs1801223	G	A	4093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=58;PP=2136;SC=AACAGCCGCCGTTATTTATCT;SOR=0.845;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=130;TCF=72;TCR=58;TR=130;WE=17153002;WS=17152984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr10	17156151	rs1801222	A	G	2610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=38;PP=1557;SC=GTTGGGTGAAAACATCCACCC;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=47;TCR=38;TR=85;WE=17156159;WS=17156141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr10	17157630	rs2295813	C	T	2314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=39;NR=35;PP=1145;SC=TGTCAGGGCACGCGCTTTGGG;SOR=0.836;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=39;TCR=35;TR=74;WE=17157638;WS=17157620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr10	17171265	rs2281648	G	C	3920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=78;PP=2621;SC=TAATTCAAACGAGAGAATGCA;SOR=1.228;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=55;TCR=78;TR=133;WE=17171273;WS=17171255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr10	17195428	rs2273736	G	C	3300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=60;PP=2050;ReadPosRankSum=-1.166;SC=GTTTAGGCAAGTCCTAGACAC;SOR=0.714;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=203;TCF=114;TCR=89;TR=135;WE=17195436;WS=17195418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,149:0.66:225
chr10	17199419	rs2295810	C	G	5127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=71;PP=2965;SC=GATACAGGATCAATAGATCTT;SOR=1.061;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=173;TCF=102;TCR=71;TR=173;WE=17199427;WS=17199409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr10	17199830	rs7894268	A	C	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.69;ReadPosRankSum=1.383;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,2:0.50:4
chr10	17203356	rs3752950	G	T	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.19;ReadPosRankSum=-0.589;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr10	17203598	rs151076824	AAAAGT	A	85.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=54;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=187;ReadPosRankSum=-1.150;SC=ACTAAGAAGAAAAAGTAAAGA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=17203610;WS=17203588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr10	17204139	rs33993216	G	A	752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=0.633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.70;ReadPosRankSum=-0.839;SOR=0.612;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,49:0.31:160
chr10	17204187	rs11254413	G	A	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.37;ReadPosRankSum=1.026;SOR=0.749;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,32:0.28:116
chr10	17204246	.	TA	T	473	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;FR=0.5000;HP=15;HapScore=4;MGOF=21;MMLQ=15;MQ=57.05;NF=1;NR=12;PP=473;QD=36.6153846154;SC=CCTAAAGGGGTAAAAAAAAAA;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=13;WE=17204256;WS=17204236;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:22,13:0.37:35
chr10	17204247	rs10904892	A	T	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.64;ReadPosRankSum=-1.331;SOR=0.722;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr10	17210822	rs17464824	A	C	1197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=16;PP=646;ReadPosRankSum=-0.596;SC=ACAACACTGAAATATTTATGA;SOR=0.638;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=72;TCF=47;TCR=25;TR=45;WE=17210830;WS=17210812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,56:0.63:89
chr10	17211383	rs7084476	T	C	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=227;ReadPosRankSum=-1.505;SC=CATCTGTTAATATATTATCAA;SOR=1.493;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=12;WE=17211391;WS=17211377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr10	17216556	rs2273734	C	T	1321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.876;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=23;PP=717;ReadPosRankSum=-0.059;SC=TCACTTCAATCGTCTTGGCAA;SOR=0.848;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=159;TCF=93;TCR=66;TR=61;WE=17216564;WS=17216546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,71:0.39:182
chr10	17243406	rs1885395	C	G	697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=3;PP=481;SC=GGGGTGGACACGGCGGCGCGC;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=17243414;WS=17243396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	17243443	rs11271712	G	GCCGCCCCACAGTGT	326.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=5.917;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.63;ReadPosRankSum=-1.011;SOR=1.877;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,10:0.17:58
chr10	17243480	rs1885394	T	A	3251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.09;QD=25.60;SOR=1.117;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr10	17278171	rs165531	C	G	183.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=178;SC=AATTATTTGGCGAGTAGTACT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=17278179;WS=17278161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	17364962	rs10466289	A	G	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=110;ReadPosRankSum=-1.485;SC=TTCCACCTGTACTGCAAGTCA;SOR=0.941;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=9;WE=17364970;WS=17364952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr10	17365012	rs7085734	TT	AA	829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=473;ReadPosRankSum=1.500;SC=GAGAAACATGTTGAACAATGA;SOR=0.765;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=38;TCF=27;TCR=11;TR=18;WE=17365021;WS=17365002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,22:0.51:43
chr10	17365044	rs7085750	T	G	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.017;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=10;PP=270;ReadPosRankSum=0.917;SC=TGATCAGTTATGTAACTTGCA;SOR=0.502;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=49;TCF=32;TCR=17;TR=23;WE=17365052;WS=17365034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,25:0.43:58
chr10	17365169	rs12354751	A	G	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.702;NF=3;NR=5;PP=60;ReadPosRankSum=-0.649;SC=GAAATTTGAAAAGAAAATCAT;SOR=0.578;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=37;TCF=16;TCR=21;TR=8;WE=17365177;WS=17365159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,9:0.22:40
chr10	17365228	rs112083592	G	GCGCACGCACACA	53.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.812;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.229;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.834;NF=0;NR=3;PP=498;ReadPosRankSum=0.648;SC=ACATATGCGCGCACACACACA;SOR=0.035;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=3;WE=17365236;WS=17365218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr10	17373617	rs2120716	G	A	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=4.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.27;ReadPosRankSum=-1.826;SOR=1.141;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,36:0.26:136
chr10	17496164	rs140398395	C	T	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.30;ReadPosRankSum=1.447;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr10	17496193	.	CGCA	C	53	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=53;QD=31.5;SC=CCAGAGCAGGCGCAGCAGCAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=2;WE=17496203;WS=17496183;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:12,2:0.14:14
chr10	17645790	rs17378371	T	C	1227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.157;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=16;PP=722;ReadPosRankSum=-0.014;SC=TAGAAAACATTAAATAAACCA;SOR=0.908;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=63;TCF=40;TCR=23;TR=46;WE=17645798;WS=17645780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,55:0.72:76
chr10	17645814	rs2252808	C	T	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.06;ReadPosRankSum=-1.247;SOR=0.655;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,16:0.25:65
chr10	17659131	rs11254692	C	A	5354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=56;NR=58;PP=1702;SC=GTGGCCAAGACCCCCAGGCGC;SOR=0.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=114;TCF=56;TCR=58;TR=114;WE=17659139;WS=17659121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr10	17659149	rs7895850	C	T	4581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=42;NR=48;PP=1451;SC=CGCCTCCGCTCGCCGGGAGCC;SOR=0.925;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=42;TCR=48;TR=90;WE=17659157;WS=17659139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr10	17702640	rs10795500	C	T	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=4.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.70;ReadPosRankSum=1.109;SOR=0.117;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr10	17735421	.	T	C	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.792;ClippingRankSum=0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=103;ReadPosRankSum=-2.460;SC=GAAATCTGCTTTGTTGCCCTC;SOR=0.340;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=6;WE=17735429;WS=17735411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr10	17746919	.	A	AT	37.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.308;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=6.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=2.90;ReadPosRankSum=0.514;SOR=0.048;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr10	17747812	rs10904996	A	G	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.630;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=4;PP=60;ReadPosRankSum=1.597;SC=CATGCCTGTAATCTCAGCAAT;SOR=0.307;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=33;TCF=12;TCR=21;TR=8;WE=17747820;WS=17747802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,9:0.26:34
chr10	17891705	rs1926736	A	G	7297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=118;NR=128;PP=2965;SC=GAAGGAAGGCAGTGACCTCGC;SOR=0.947;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=246;TCF=118;TCR=128;TR=246;WE=17891713;WS=17891695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,271:1.00:271
chr10	18122716	rs111490411	A	G	1401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.53;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=24;PP=1046;SC=CGTGGCACCAAGCGAGGAAAA;SOR=1.136;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=33;TCR=24;TR=57;WE=18122724;WS=18122706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr10	18242304	rs691112	T	C	3826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=51;PP=2180;SC=CAGCCCAGGATAGCAGAAGCC;SOR=0.844;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=117;TCF=66;TCR=51;TR=117;WE=18242312;WS=18242294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr10	18254606	rs691513	C	A	513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.50;ReadPosRankSum=0.019;SOR=0.669;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,37:0.25:147
chr10	18266783	rs1926740	G	T	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.395;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=141;ReadPosRankSum=-0.356;SC=GTGACTATTCGGAACTTATCT;SOR=0.233;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=10;WE=18266791;WS=18266773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr10	18266989	rs2478568	G	A	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FS=2.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.89;ReadPosRankSum=0.976;SOR=0.894;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:151,43:0.22:194
chr10	18267096	rs2437260	G	A	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=20;PP=353;ReadPosRankSum=2.397;SC=AACTTAAAGAGTATTGTGTAT;SOR=0.638;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=21;TCR=54;TR=28;WE=18267104;WS=18267086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,28:0.33:85
chr10	18270140	rs2437261	C	G	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=34;ReadPosRankSum=-1.465;SC=TGTGTGTTCTCGCTATTCCAT;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=3;WE=18270148;WS=18270130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr10	18270422	rs1926739	G	A	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.270;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=177;ReadPosRankSum=-0.153;SC=AGTAAGTTCTGGATCTTCCTT;SOR=1.032;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=49;TCF=17;TCR=32;TR=14;WE=18270430;WS=18270412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,15:0.29:52
chr10	18276682	rs10508555	G	C	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.281;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=415;ReadPosRankSum=-0.883;SC=TTCAAAGAGAGAGTATCGTGG;SOR=0.087;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=25;WE=18276690;WS=18276672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,26:0.81:32
chr10	18430167	rs150534429	G	C	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.603;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=116;ReadPosRankSum=1.069;SC=GGGCGGGAGGGGGCCCGCTTC;SOR=0.412;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=25;TCF=16;TCR=9;TR=13;WE=18430175;WS=18430157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr10	18439747	.	C	T	27	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=63;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=4;NR=0;PP=27;QD=15.4428031368;SC=ACTAGGCCTACATTCCTGTTA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=4;WE=18439755;WS=18439737;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr10	18439808	rs74120235	T	G	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=67.00;MQRankSum=4.077;QD=15.63;ReadPosRankSum=-0.026;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr10	18439808	.	T	TTTG	184	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.49;FR=0.5000;HP=21;HapScore=2;MGOF=24;MMLQ=15;MQ=62.6;NF=3;NR=4;PP=184;QD=26.7142857143;SC=TTTTTTTTTTTTAGTCATATG;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=7;WE=18439816;WS=18439798;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr10	18550450	rs951046	G	A	100.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=58;SC=GTTTTTATCTGTCTTTTGTGC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=18550458;WS=18550440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr10	18551154	rs10764369	G	A	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.37;ReadPosRankSum=1.143;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,3:0.23:13
chr10	18795596	rs10741088	G	A	1107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=21;PP=498;ReadPosRankSum=0.562;SC=GATGTTAAAAGGAATCAGAAG;SOR=0.776;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=37;TCF=9;TCR=28;TR=28;WE=18795604;WS=18795586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,32:0.76:42
chr10	18795612	rs200375169	A	AAC	925.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=35.61;ReadPosRankSum=-1.238;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,21:0.81:26
chr10	18795613	.	TGC	ACT	846	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=1;NR=11;PP=846;QD=75.7889895719;SC=GAAGTGAGCATGCCCTTTTGG;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=12;WE=18795623;WS=18795603;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,12:0.67:18
chr10	18795613	.	TGC	T	925.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.398;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=38.57;ReadPosRankSum=-1.105;SOR=1.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,19:0.79:24
chr10	18804094	rs7088091	T	C	2338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=54;PP=1496;ReadPosRankSum=0.821;SC=GCCTTTGCCATTGGCCATCCA;SOR=0.675;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=58;TCR=76;TR=95;WE=18804102;WS=18804084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,102:0.71:144
chr10	18828663	rs4747352	G	T	540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.302;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=17;PP=379;ReadPosRankSum=0.257;SC=AGTTTTGCCCGTTTGTGTTTT;SOR=0.661;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=64;TCF=21;TCR=43;TR=30;WE=18828671;WS=18828653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,26:0.65:40
chr10	18836957	rs4747353	C	T	692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=437;ReadPosRankSum=-0.597;SC=TTTTACTTATCTCTTCGTTAA;SOR=0.788;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=24;WE=18836965;WS=18836947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,28:0.74:38
chr10	18837285	rs3817494	T	C	929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=30;PP=574;ReadPosRankSum=0.944;SC=TGATGTTCTATGTGACAAGGA;SOR=1.051;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=46;TCF=7;TCR=39;TR=35;WE=18837293;WS=18837275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,40:0.77:52
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chr10	18903281	rs11405681	C	CA	685.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.517;HP=11;HapScore=3;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=344;ReadPosRankSum=-1.037;SC=GGATTTATACCAAAAAAAAAA;SOR=0.342;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=31;TCF=20;TCR=11;TR=21;WE=18903289;WS=18903271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,30:0.91:33
chr10	18903605	rs4636555	A	C	145.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=85;SC=CGTGAAAATTATTTGAGCTAG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=18903613;WS=18903595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr10	18931512	rs7907153	T	C	825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.242;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=18;PP=526;ReadPosRankSum=-0.040;SC=GATTATAAAGTAATCCATACA;SOR=0.927;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=45;TCF=22;TCR=23;TR=34;WE=18931520;WS=18931502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,36:0.75:48
chr10	18937579	rs45468894	A	AAAG	693.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=351;ReadPosRankSum=0.334;SC=CACAATCTAAAAAGAAGTTCA;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=8;WE=18937587;WS=18937569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,18:0.69:26
chr10	18940157	rs3740102	C	A	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.23;MQRankSum=0.867;QD=12.40;ReadPosRankSum=1.153;SOR=0.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,28:0.60:47
chr10	18957647	rs10741127	T	G	760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.037;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=21;PP=537;ReadPosRankSum=-1.418;SC=CAAAGGTCCCTAGAGTAAACA;SOR=1.071;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=75;TCF=29;TCR=46;TR=35;WE=18957655;WS=18957637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,35:0.51:68
chr10	18964097	rs12359433	G	A	1833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.973;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=28;PP=1004;ReadPosRankSum=1.528;SC=TTTTGTTTAGGTTATGCCAAG;SOR=0.500;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=89;TCF=56;TCR=33;TR=72;WE=18964105;WS=18964087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,80:0.78:102
chr10	19376734	rs112293611	G	GT	173.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=11.295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.14;MQRankSum=1.910;QD=2.26;ReadPosRankSum=0.203;SOR=2.388;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,17:0.22:77
chr10	19377215	rs11008436	A	G	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.291;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=167;ReadPosRankSum=-0.881;SC=CCAGTTTGCCAGGGACTGAGG;SOR=0.188;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=11;WE=19377223;WS=19377205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr10	19392857	rs10159517	T	C	1971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=46;NR=19;PP=1036;SC=GAGACAGTGATGTTCCTTGCT;SOR=1.402;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=46;TCR=19;TR=65;WE=19392865;WS=19392847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr10	19413368	rs10450317	T	C	1057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=24;NR=14;PP=604;SC=GTATATAAGCTTTTTGGTTGA;SOR=1.005;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=24;TCR=14;TR=38;WE=19413376;WS=19413358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr10	19492566	rs7902704	A	T	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.198;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=370;ReadPosRankSum=0.407;SC=ATACAGAAGCATAATAAGGTG;SOR=3.816;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=16;WE=19492574;WS=19492556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,19:0.76:25
chr10	19492702	rs16918344	C	T	1323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-2.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=30;PP=691;ReadPosRankSum=1.739;SC=TGGTTTGAAGCAATTAGTGGT;SOR=0.671;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=200;TCF=113;TCR=87;TR=69;WE=19492722;WS=19492692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,78:0.34:229
chr10	19492832	rs7476259	A	C	4682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=87;PP=2902;SC=CAGGGACTCTACAACCACTGC;SOR=1.248;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=146;TCF=59;TCR=87;TR=146;WE=19492840;WS=19492822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr10	19493117	rs72786543	T	C	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=35;ReadPosRankSum=0.253;SC=GATTGATTATTGTATAATTTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=3;WE=19493125;WS=19493114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr10	19493215	rs202203955	T	TG	273.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.824;HP=15;HapScore=3;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=136;ReadPosRankSum=-0.835;SC=GAAGCGTTTTTTTTTTTTTTT;SOR=0.252;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=29;TCF=16;TCR=13;TR=10;WE=19493224;WS=19493205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr10	19493216	.	T	G	36.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.303;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=2.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.53;ReadPosRankSum=1.468;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,6:0.25:24
chr10	19493415	rs2358348	C	G	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=319;ReadPosRankSum=1.870;SC=AGGCATACCTCTGCACTTATT;SOR=0.643;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=19;WE=19493423;WS=19493405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,22:0.63:35
chr10	19493993	rs4601653	G	C	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FS=0.615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.19;ReadPosRankSum=1.210;SOR=0.769;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:133,49:0.27:182
chr10	19494310	rs7090927	T	C	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=572;ReadPosRankSum=0.276;SC=CCAAAGCTGATGAATGTTATG;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=11;WE=19494325;WS=19494300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,11:0.32:34
chr10	19494316	rs144770813	TTA	T	649.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=1254;ReadPosRankSum=0.352;SC=CTGATGAATGTTATGTGTGGT;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=17;WE=19494325;WS=19494300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
chr10	19498278	rs2358355	G	A	6266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=116;NR=87;PP=2965;SC=TGGACCAGGAGCCAGGGTCCA;SOR=0.859;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=203;TCF=116;TCR=87;TR=203;WE=19498286;WS=19498268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr10	19546796	rs10763903	T	C	1136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=20;PP=655;SC=AAATTTCCAATATGACCTTGC;SOR=1.730;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=12;TCR=20;TR=32;WE=19546804;WS=19546786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr10	19546877	rs10508582	C	A	75.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=54;SC=AATTAGTTTTCAAGTGTCAAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=19546885;WS=19546867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr10	19571940	rs11009290	CA	TG	1188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=12;PP=976;ReadPosRankSum=0.541;SC=TGTTCTACCCCATCCAAGTTA;SOR=0.749;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=109;TCF=70;TCR=39;TR=34;WE=19571949;WS=19571930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,35:0.28:125
chr10	19572060	rs72796460	C	T	822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.668;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=24;PP=459;ReadPosRankSum=-1.163;SC=GGAACGGGATCAGCATTCATC;SOR=0.767;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=121;TCF=54;TCR=67;TR=41;WE=19572068;WS=19572050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,47:0.34:139
chr10	19572207	rs4748570	C	T	477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=13;PP=376;SC=GCCAATGCTACTGTAAAGACA;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=19572215;WS=19572197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr10	19612835	rs184077778	C	T	1073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=2.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.481;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=5;PP=512;ReadPosRankSum=-0.096;SC=CCACCGTGCCCGGCCTCTTAT;SOR=1.802;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=58;TCF=45;TCR=13;TR=33;WE=19612843;WS=19612825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,42:0.63:67
chr10	19613068	rs72782366	C	G	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.16;ReadPosRankSum=0.602;SOR=0.575;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,25:0.23:108
chr10	19620559	rs7082205	G	A	660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=21;PP=537;SC=AACTCCCACAGCCTTACTCAA;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=19620567;WS=19620549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr10	19637088	rs1577307	G	A	414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=13;PP=347;SC=TATGTGAAGGGGGGAAAAAAT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=19637096;WS=19637078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	19641239	rs10616221	CTG	C	3979.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.226;NF=4;NR=63;PP=2989;ReadPosRankSum=-1.069;SC=ACATTCTAATCTGTGTGTGTG;SOR=0.481;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=87;TCF=7;TCR=80;TR=67;WE=19641248;WS=19641229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,106:0.99:107
chr10	19676553	rs12773592	A	G	6753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.14;SOR=1.003;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr10	19676561	rs12771333	G	A	6985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.94;SOR=1.088;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr10	19678286	rs10763974	C	T	3073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=47;PP=1821;SC=TCAGATCATACGAATTGTAAT;SOR=0.748;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=52;TCR=47;TR=99;WE=19678294;WS=19678276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr10	19678497	rs10763975	G	A	1867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=40;PP=1154;SC=CTGGTATTTCGTATCTGCAAA;SOR=1.716;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=20;TCR=40;TR=60;WE=19678505;WS=19678487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr10	19678602	rs7896087	T	C	242.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=6;PP=146;SC=AGGGTCTTGCTCTGTCACTCA;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=19678610;WS=19678592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr10	19739459	rs6415957	T	G	1569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=36;PP=1076;SC=AAGCACATTTTTAATCTAGCC;SOR=1.453;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=20;TCR=36;TR=56;WE=19739467;WS=19739449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr10	19777907	rs112165212	C	T	680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.796;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=9;PP=399;ReadPosRankSum=-1.181;SC=GAGGAGAAGGCGGGCTCCCAA;SOR=0.842;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=91;TCF=61;TCR=30;TR=31;WE=19777915;WS=19777897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,38:0.35:109
chr10	19777982	rs72788548	G	A	1536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=33;PP=834;ReadPosRankSum=-0.322;SC=AGGGTGGAGGGGCGGCAGCGC;SOR=0.712;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=205;TCF=109;TCR=96;TR=72;WE=19777990;WS=19777972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,86:0.36:236
chr10	19778056	rs2151234	G	A	5185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=69;PP=2242;SC=CTCTGCTGAAGGGGCCGCCAC;SOR=1.252;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=115;TCF=46;TCR=69;TR=114;WE=19778064;WS=19778046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr10	19778072	rs2184035	A	G	4570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=57;PP=1921;SC=GCCACAGGAAAAGCCTAACAG;SOR=1.345;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=34;TCR=57;TR=91;WE=19778080;WS=19778062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr10	19884264	rs10827628	G	A	1941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=29;PP=1104;ReadPosRankSum=-1.668;SC=TGTCCTCTCAGCCCCACCCCT;SOR=0.724;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=93;TCF=52;TCR=41;TR=70;WE=19884272;WS=19884254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,82:0.74:111
chr10	19896830	rs7909976	C	A	2133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=36;NR=32;PP=1166;SC=CCAGCTGCTCCGGTACCCCAT;SOR=0.824;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=68;TCF=36;TCR=32;TR=68;WE=19896838;WS=19896820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr10	19904870	rs10580913	ATT	A	1936.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.67;ReadPosRankSum=-0.163;SOR=0.733;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,49:0.70:70
chr10	19904879	rs62881061	T	G	1959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.60;ReadPosRankSum=0.649;SOR=0.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,50:0.70:71
chr10	20105936	rs989767	T	C	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.737;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=57;ReadPosRankSum=-1.208;SC=GGCCCGGTCGTGCCTATTGCA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=5;WE=20105944;WS=20105926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr10	20290956	rs1409344	T	A	204.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=167;SC=ATTAATGAATTTATTTCATGT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=20290964;WS=20290946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	20336112	rs10740961	G	T	198.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=131;SC=AATTTAGATTGATTACTGCAT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=20336120;WS=20336102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr10	20357050	rs7911756	G	T	1854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=22;PP=1097;ReadPosRankSum=0.621;SC=ATTTCACATTGACTATGCTAC;SOR=0.604;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=90;TCF=61;TCR=29;TR=67;WE=20357058;WS=20357040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,77:0.75:102
chr10	20357183	rs7072650	A	G	755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=1.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.81;ReadPosRankSum=0.139;SOR=0.530;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:113,44:0.28:157
chr10	20357233	rs7912036	G	T	1096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=2.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.554;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=28;PP=668;ReadPosRankSum=-1.253;SC=TTATTTTTAAGTTACTCTATA;SOR=1.581;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=56;TCF=20;TCR=36;TR=40;WE=20357241;WS=20357223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,47:0.67:70
chr10	20436875	rs11815026	G	A	2166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.301;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=45;PP=1241;ReadPosRankSum=-0.205;SC=CCTTGTTCTTGACTGCTGCCT;SOR=0.580;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=140;TCF=67;TCR=73;TR=89;WE=20436883;WS=20436865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,100:0.64:157
chr10	20500592	rs16920092	T	C	1820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=2.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.29;ReadPosRankSum=0.698;SOR=0.497;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,86:0.63:137
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chr10	20500743	rs10827997	T	G	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=1.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.02;ReadPosRankSum=-0.310;SOR=0.469;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,16:0.33:48
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chr10	21104694	rs4748727	A	T	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=234;ReadPosRankSum=-1.177;SC=TCAATTCAACAAAGAGACTTA;SOR=0.929;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=12;TCR=19;TR=18;WE=21104702;WS=21104684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr10	21108247	rs1006362	C	T	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=238;ReadPosRankSum=0.253;SC=TTTGGTTTTACGTTCCTGTGT;SOR=1.112;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=14;WE=21108255;WS=21108237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,16:0.70:23
chr10	21112111	rs11012353	A	T	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.75;ReadPosRankSum=3.195;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr10	21115332	rs1409348	T	C	767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.589;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=15;PP=401;ReadPosRankSum=0.000;SC=TCTATAGTTTTGGTTTGCTTT;SOR=0.269;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=42;TCF=26;TCR=16;TR=33;WE=21115340;WS=21115322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,36:0.73:49
chr10	21120116	rs10491056	A	G	3021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-0.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.849;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=59;PP=1640;ReadPosRankSum=-1.458;SC=ATCTTCATTCATGACCAACCT;SOR=0.527;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=214;TCF=114;TCR=100;TR=122;WE=21120124;WS=21120106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,144:0.58:247
chr10	21141440	rs3831100	AG	A	814.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.452;HP=3;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=7;PP=452;ReadPosRankSum=-0.240;SC=GGTTGCTGGCAGGGAGGGTAG;SOR=1.044;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=23;TCF=10;TCR=13;TR=13;WE=21141448;WS=21141430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,27:0.73:37
chr10	21141469	rs703089	T	C	1563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=18;PP=722;SC=CGGGCAAGTGTGTACCTGACT;SOR=0.986;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=30;TCR=18;TR=48;WE=21141477;WS=21141459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr10	21148584	rs4748729	C	A	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.43;ReadPosRankSum=-1.876;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr10	21157492	rs2296609	T	C	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.465;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=184;ReadPosRankSum=0.395;SC=CTCTGTTTATTCTTGCAATTA;SOR=1.819;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=10;WE=21157500;WS=21157482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr10	21176945	rs703100	G	A	582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=2;PP=389;SC=TGATGAAAACGTTTTATTAAA;SOR=3.056;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=21176953;WS=21176935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	21185821	rs788971	A	C	2532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.022;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=21;PP=1517;ReadPosRankSum=-1.566;SC=CAGCTCTATGACTCTATAACA;SOR=1.942;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=82;TCF=60;TCR=22;TR=80;WE=21185829;WS=21185811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,91:0.98:93
chr10	21188197	rs788976	T	A	1369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.907;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=26;PP=808;ReadPosRankSum=-0.038;SC=TTTCTAGGAGTGTAGGGAGAA;SOR=0.498;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=84;TCF=48;TCR=36;TR=58;WE=21188205;WS=21188187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,63:0.71:89
chr10	21805466	rs112207161	C	CCCTCCT	459.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.228;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=461;ReadPosRankSum=1.819;SC=CCCGCTGCCCCCCTCCTCCTC;SOR=1.981;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=27;TCF=9;TCR=18;TR=10;WE=21805490;WS=21805456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr10	21806832	rs946711	A	C	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.184;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=20;PP=369;ReadPosRankSum=-0.928;SC=GTTAATCCTCAGCCAGATGCT;SOR=2.297;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=51;TCF=16;TCR=35;TR=24;WE=21806840;WS=21806822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,26:0.46:57
chr10	21827796	rs1802669	G	A	3963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.187;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=73;PP=2159;ReadPosRankSum=-0.299;SC=CCACTGGACCGTGGTTTTGCA;SOR=0.874;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=253;TCF=136;TCR=117;TR=164;WE=21827804;WS=21827786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,184:0.65:282
chr10	21884471	rs11592565	A	G	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=25;PP=580;ReadPosRankSum=-1.131;SC=AAATCCAGGGAGATTTGGAAA;SOR=0.990;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=27;WE=21884486;WS=21884461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,28:0.74:38
chr10	22193422	rs792455	T	C	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.015;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=99;ReadPosRankSum=-1.247;SC=TTATATGACATTGTTAAAACA;SOR=0.293;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=8;WE=22193430;WS=22193412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr10	22498749	rs2478476	A	T	6322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=113;PP=2965;SC=TTTTTCAATGACCTTAACATC;SOR=0.816;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=221;TCF=108;TCR=113;TR=221;WE=22498757;WS=22498739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr10	22635359	.	G	GTTC	174.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=5;PP=227;SC=AGAGAAAATGGTTCTTCTTCT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=5;WE=22635367;WS=22635349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr10	22828841	.	GGAGAGA	G	343.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.482;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=7.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.90;MQRankSum=-1.003;QD=13.22;ReadPosRankSum=1.736;SOR=2.448;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr10	22830719	rs943192	G	C	1541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.725;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=35;PP=969;ReadPosRankSum=1.176;SC=AGGGTCCACAGTAATCAAACT;SOR=0.863;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=263;TCF=141;TCR=122;TR=86;WE=22830727;WS=22830709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:199,94:0.32:293
chr10	22839628	rs2230469	T	C	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.806;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=11;PP=252;ReadPosRankSum=-0.354;SC=GACCTTCTTGTTGTTGTCATC;SOR=0.510;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=85;TCF=53;TCR=32;TR=25;WE=22839636;WS=22839618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,30:0.32:95
chr10	22862487	rs11013052	C	A	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.325;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=185;ReadPosRankSum=0.012;SC=AAAGTGAAAACCTCCAGCCAT;SOR=1.534;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=43;TCF=11;TCR=32;TR=14;WE=22862495;WS=22862477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,14:0.29:48
chr10	22896779	rs2765997	C	T	3343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.583;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=45;PP=1899;ReadPosRankSum=-1.244;SC=GACAAAAATACAGATCCCAAT;SOR=0.532;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=196;TCF=129;TCR=67;TR=131;WE=22896787;WS=22896769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,148:0.68:217
chr10	23220883	rs12360508	T	A	909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.026;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=10;PP=442;ReadPosRankSum=-2.073;SC=GAGAAATGTATGTGCAAATGT;SOR=0.935;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=50;TCF=34;TCR=16;TR=34;WE=23220891;WS=23220873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,40:0.65:62
chr10	23290952	rs12259839	C	T	1008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.836;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=20;PP=545;ReadPosRankSum=0.036;SC=GTGCTGGTGACGAGCTGACGG;SOR=0.547;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=72;TCF=35;TCR=37;TR=40;WE=23290960;WS=23290942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,47:0.56:84
chr10	23297252	rs10828395	G	A	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=1.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.71;ReadPosRankSum=0.173;SOR=0.935;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,14:0.19:73
chr10	23297429	rs11013234	A	G	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=2.166;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=49;ReadPosRankSum=-0.406;SC=CAATTGCATAATTGCCTTTTA;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=4;WE=23297437;WS=23297419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr10	23303092	rs72297783	A	AG	1389.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FS=0.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQRankSum=2.372;QD=6.12;ReadPosRankSum=1.205;SOR=0.639;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:167,60:0.26:227
chr10	23322117	rs61079962	CAT	C	32.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=2;PP=69;ReadPosRankSum=0.967;SC=CAAGCATACACATATATATAT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=2;WE=23322126;WS=23322107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr10	23393226	rs1555805	C	G	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.031;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=163;ReadPosRankSum=-0.086;SC=CAGTGAGGGGCCAGTTGGAAT;SOR=1.214;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=10;WE=23393234;WS=23393216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr10	23408139	rs2296468	A	G	1196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=25;PP=969;SC=GAGTGGGAACAGATCCTGCTG;SOR=1.347;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=17;TCR=25;TR=42;WE=23408147;WS=23408129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr10	23482635	rs7918487	T	C	1861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=14;PP=1253;SC=CTGTCCAGGGTCCCCCTCCCC;SOR=2.267;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=44;TCR=14;TR=58;WE=23482643;WS=23482625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr10	23528557	rs7075896	C	A	1942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=31;PP=1001;ReadPosRankSum=1.012;SC=ATCTCTAGAGCCTGTAATGAC;SOR=0.644;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=116;TCF=67;TCR=49;TR=76;WE=23528565;WS=23528547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,89:0.65:136
chr10	23578748	.	T	A	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.706;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=4;PP=93;ReadPosRankSum=1.110;SC=CATAAGACACTCTGGACACAG;SOR=0.743;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=19;TCF=12;TCR=7;TR=9;WE=23578756;WS=23578738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr10	23592468	rs4439422	G	C	521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.859;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=355;ReadPosRankSum=-0.849;SC=TAGACACTCAGCATTAAAAAT;SOR=1.445;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=32;TCF=9;TCR=23;TR=20;WE=23592476;WS=23592458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,21:0.68:31
chr10	23611188	rs5783834	TATTA	T	193.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.393;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=234;ReadPosRankSum=-0.676;SC=AAGCTCTGTGTATTAATTACC;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=6;WE=23611199;WS=23611185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr10	23622202	rs4259746	G	A	280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=6;PP=130;SC=AAATCATATCGTATTTTAAGT;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=23622210;WS=23622192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	23632970	rs11013408	T	G	1182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.71;SOR=1.464;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr10	23633566	rs2036917	C	A	1498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=15;PP=779;SC=CGCAGCAGACCCGCAGCTCGG;SOR=1.278;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=35;TCR=15;TR=50;WE=23633574;WS=23633556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr10	23633660	rs185191255	A	G	1138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=21;PP=610;ReadPosRankSum=-0.875;SC=TCTAATAACTATGCTCATGAC;SOR=0.600;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=64;TCF=33;TCR=31;TR=45;WE=23633668;WS=23633650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,53:0.66:80
chr10	24498403	rs72774807	G	A	224.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=153;SC=TTCTTAAGCAGCAAAAGAGGT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=24498411;WS=24498393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	24544276	rs67303587	GCTGA	G	32.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.60;MQRankSum=2.385;QD=1.82;ReadPosRankSum=-0.967;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,3:0.17:18
chr10	24564831	rs10764458	C	T	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=1.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.51;ReadPosRankSum=-2.311;SOR=1.106;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,9:0.17:53
chr10	24669747	rs41277412	C	T	1159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.911;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=18;PP=664;ReadPosRankSum=-0.429;SC=ATATTTTCCACACGATTAATA;SOR=0.544;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=68;TCF=43;TCR=25;TR=46;WE=24669755;WS=24669737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,53:0.66:80
chr10	24784014	rs71506836	TAA	T	98.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.82;ReadPosRankSum=1.523;SOR=0.697;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,7:0.20:35
chr10	24790393	rs1112284	A	G	1434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.796;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=37;PP=937;ReadPosRankSum=0.953;SC=TGGGCACCTCAGCCATCCACA;SOR=0.861;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=89;TCF=35;TCR=54;TR=57;WE=24790401;WS=24790383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,63:0.62:102
chr10	24790491	rs2366916	GC	TT	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=610;ReadPosRankSum=-0.100;SC=CTCATGCACGGCGGCCTCTGT;SOR=0.693;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=21;TCF=7;TCR=14;TR=16;WE=24790500;WS=24790481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,19:0.83:23
chr10	24810663	rs2297330	C	A	1228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.948;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=13;PP=645;ReadPosRankSum=0.161;SC=TGAGGGTTGTCGTTCTGGCTT;SOR=1.059;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=70;TCF=46;TCR=24;TR=44;WE=24810671;WS=24810653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,54:0.65:83
chr10	24813454	rs10828663	G	A	4542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=67;PP=2604;SC=GGTTCGCCACGCGCAGAGCTC;SOR=0.729;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=150;TCF=83;TCR=67;TR=150;WE=24813462;WS=24813444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr10	24833137	rs2250411	C	T	4649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=81;NR=66;PP=2754;SC=AGCCCAGCATCGAGAGTACAT;SOR=0.859;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=81;TCR=66;TR=147;WE=24833145;WS=24833127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
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chr10	24879281	rs10734053	A	G	5324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=103;NR=68;PP=2965;SC=AGAATCGGGGATTTCTGCAGA;SOR=0.890;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=171;TCF=103;TCR=68;TR=171;WE=24879289;WS=24879271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr10	24884254	rs143446503	A	C	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=125;ReadPosRankSum=-0.563;SC=AATTTCTAAAATGTAAGTTCC;SOR=0.648;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=6;WE=24884262;WS=24884244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr10	25140411	rs1326192	G	C	1517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.19;QD=28.11;SOR=0.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr10	25140413	.	GA	G	73.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.074;ClippingRankSum=0.000;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=1.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.19;MQRankSum=2.001;QD=1.54;ReadPosRankSum=0.697;SOR=0.957;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,10:0.21:48
chr10	25273988	rs2279547	G	A	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=93;ReadPosRankSum=-0.792;SC=ACTTGGCCACGGTAACCAAAA;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=6;WE=25273996;WS=25273978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr10	25313818	rs7086282	C	T	918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.012;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=21;PP=549;ReadPosRankSum=2.308;SC=GGAAAGAAAACTAGCACAAAC;SOR=0.488;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=136;TCF=80;TCR=56;TR=46;WE=25313826;WS=25313808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,52:0.34:154
chr10	25701341	rs2480345	C	G	1344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.029;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=36;PP=906;ReadPosRankSum=-0.524;SC=TCCTTCCAAGCCCTGTGTATG;SOR=0.513;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=70;TCF=21;TCR=49;TR=53;WE=25701349;WS=25701331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,56:0.70:80
chr10	25755734	.	CAT	C	156.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.13;QD=31.37;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr10	25888180	rs10828833	A	G	1970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.339;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=42;PP=1056;ReadPosRankSum=1.083;SC=GAAAGAAGAGATCTGGGATAG;SOR=0.555;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=130;TCF=58;TCR=72;TR=79;WE=25888188;WS=25888170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,92:0.61:150
chr10	26286367	rs7911700	G	A	98.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=72;SC=AGAAGAAAGGGTAACTTCTTT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=26286375;WS=26286357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr10	26310410	rs3737275	T	C	4357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=52;PP=2279;SC=TTTCACCTTTTGATGGTGTGG;SOR=1.244;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=139;TCF=87;TCR=52;TR=138;WE=26310418;WS=26310400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr10	26310679	rs17666079	A	C	694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=18;PP=502;SC=GATATATTCCAACAAGTTGGG;SOR=2.494;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=23;WE=26310687;WS=26310669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr10	26312824	rs1339814	G	A	1255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=6;PP=915;SC=TCTTGGAATTGGGAAAAGATG;SOR=2.935;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=34;TCR=6;TR=40;WE=26312832;WS=26312814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr10	26355771	rs3824703	C	A	198.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=159;SC=ATATATTAGGCTATTTTCTGG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=26355779;WS=26355761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr10	26355862	rs3824702	G	T	4302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.77;SOR=1.796;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr10	26355872	rs3824701	A	G	4806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.08;SOR=1.589;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr10	26355906	rs3824700	G	A	4914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=62;PP=2641;SC=CTCCACAGACGTGAACGTATT;SOR=0.956;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=156;TCF=94;TCR=62;TR=156;WE=26355914;WS=26355896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr10	26355992	rs3824699	A	G	4212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=45;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=78;PP=2410;SC=AACCCTAGAAATTTTGGATGA;SOR=1.294;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=51;TCR=78;TR=129;WE=26356000;WS=26355982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr10	26356014	rs3824698	CA	TG	4736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=55;PP=2947;SC=GTAAGAATTTCAGTTTAATTA;SOR=1.483;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=90;TCF=35;TCR=55;TR=83;WE=26356023;WS=26356004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr10	26356037	rs3824696	C	T	2113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=65;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=49;PP=1420;SC=CTTAGACATTCCAGATGTTTT;SOR=2.271;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=16;TCR=49;TR=65;WE=26356045;WS=26356027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr10	26356066	rs3824695	C	T	1287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=76;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=36;PP=979;SC=ATAGAAGACACGGGTATTGGT;SOR=4.125;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=4;TCR=36;TR=40;WE=26356074;WS=26356056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr10	26357625	rs3817421	T	C	900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=2;PP=707;SC=CTGTTTATTATTGTTTACTTT;SOR=3.841;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=27;WE=26357633;WS=26357615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr10	26357747	rs35379457	CG	TA	8660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=74;PP=2947;ReadPosRankSum=-0.757;SC=ATCAGATCTACGTCTATGTGG;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=174;TCF=90;TCR=84;TR=159;WE=26357756;WS=26357737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,194:0.99:196
chr10	26357820	rs3817419	C	T	3541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=69;PP=2215;ReadPosRankSum=2.055;SC=AAAGGTATGTCGTATGGGGTG;SOR=1.196;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=48;TCR=70;TR=116;WE=26357828;WS=26357810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,129:0.98:131
chr10	26359180	rs3758441	T	G	1382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=22;PP=895;SC=AATTTACCTCTTAGTTACTTA;SOR=0.770;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=25;TCR=22;TR=47;WE=26359188;WS=26359170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr10	26359200	rs3834403	T	TA	1635.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=22;PP=1474;SC=AAATGTCACTTAATTTTGAGG;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=36;TCF=14;TCR=22;TR=35;WE=26359208;WS=26359190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr10	26417531	rs17739425	T	G	76.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=2;PP=55;SC=CTTGTACAAATGAAGCAGGAC;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=26417539;WS=26417521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr10	26436287	rs2368158	G	T	1252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=6;PP=769;SC=TGTTGTTGATGATGATGATGG;SOR=3.056;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=34;WE=26436295;WS=26436277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr10	26443646	rs3818956	G	A	3237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=42;PP=1877;SC=TAGATACCAAGGCATCACTGT;SOR=0.986;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=66;TCR=42;TR=108;WE=26443654;WS=26443636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr10	26446312	rs3758449	G	A	5488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=101;NR=81;PP=2965;SC=AAACCAAATAGTGAGCGTCAG;SOR=0.784;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=182;TCF=101;TCR=81;TR=182;WE=26446320;WS=26446302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr10	26457536	rs1342320	C	T	238.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=1;PP=108;SC=CAGTGATTTCCAAAATCTCAA;SOR=2.093;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=26457544;WS=26457526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr10	26462790	rs3740232	G	A	3692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=56;PP=2208;SC=ATGAGGAAGAGGTTAAGCAAG;SOR=0.754;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=63;TCR=56;TR=119;WE=26462798;WS=26462780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr10	26463043	rs3740231	A	T	6004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=103;PP=2965;SC=CTTTAAAAAAACTTTGGAACC;SOR=0.799;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=198;TCF=95;TCR=103;TR=198;WE=26463051;WS=26463033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr10	26463130	rs1999240	C	A	6310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=111;NR=101;PP=2965;SC=AGTTACCCAGCGTGCACCGAT;SOR=0.710;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=212;TCF=111;TCR=101;TR=212;WE=26463138;WS=26463120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr10	26463569	rs3758448	G	A	142.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=112;SC=ATTAATAACTGGTAGATTGTT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=26463577;WS=26463559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr10	26463587	rs3758447	C	G	72.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=3;PP=52;SC=GTTTTATCTGCGTTGATGGGC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=26463595;WS=26463577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr10	26500658	rs10508715	A	G	542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=2;PP=387;SC=CCTTTCCTAAATGTCCGCGGT;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=26500666;WS=26500648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	26505822	rs2839671	G	A	4004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=68;NR=69;PP=2259;SC=CAGGTAGGAAGGAGAACGGGG;SOR=0.861;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=137;TCF=68;TCR=69;TR=137;WE=26505830;WS=26505812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr10	26507847	rs7071922	C	G	94.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=4;NR=0;PP=68;SC=AATGTTCTGCCTTTCCAAAAG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=26507855;WS=26507844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr10	26512638	rs368592418	ATG	A	64.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.057;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=67;ReadPosRankSum=2.655;SC=GTGTATGTGCATGTGTGTGTG;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=3;WE=26512647;WS=26512628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr10	26569755	rs8190748	A	G	550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=1;PP=453;SC=CGCACTATATACGTGTAATAA;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=26569763;WS=26569745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	26581321	rs3824694	G	C	1345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=14;PP=786;SC=GCAGGATGACGGTCAGTCTCC;SOR=1.436;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=33;TCR=14;TR=47;WE=26581329;WS=26581311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr10	26781355	rs1775245	T	C	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=19;PP=291;ReadPosRankSum=-1.938;SC=ACTGGCAAATTGGAAAACAAA;SOR=0.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=31;TCR=60;TR=29;WE=26781363;WS=26781345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,32:0.31:102
chr10	26781388	rs1775246	G	A	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=116;ReadPosRankSum=0.504;SC=GAATTTCATTGTAATATGACA;SOR=0.465;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=42;TCF=10;TCR=32;TR=12;WE=26781396;WS=26781378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,12:0.27:44
chr10	26851163	rs35016443	A	G	1001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.018;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=7;PP=664;ReadPosRankSum=-1.887;SC=TCTTTGCTTTAGAGATGCAAA;SOR=0.161;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=52;TCF=44;TCR=8;TR=35;WE=26851171;WS=26851153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,39:0.70:56
chr10	26986932	rs2448114	T	C	466.41	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=356;ReadPosRankSum=0.062;SC=TGAGGGGTGCTCGCGGTGGGA;SOR=0.293;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=21;TCF=7;TCR=14;TR=20;WE=26986940;WS=26986922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,20:0.91:22
chr10	26990849	rs1677726	T	G	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=4;PP=75;ReadPosRankSum=-2.209;SC=AGCCACAGAGTCAGAGCCACC;SOR=0.495;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=17;TCF=8;TCR=9;TR=7;WE=26990857;WS=26990839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr10	26991037	rs1677725	A	G	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.73;ReadPosRankSum=1.309;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,8:0.21:38
chr10	26991045	rs1780186	T	C	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.46;ReadPosRankSum=2.384;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,8:0.21:39
chr10	26991067	rs71403882	CG	C	242.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=145;ReadPosRankSum=1.248;SC=TTGGATGTAACGTAACTTGTT;SOR=0.822;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=5;WE=26991075;WS=26991057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,9:0.22:40
chr10	26993597	rs34296355	AT	A	935.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.297;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=699;ReadPosRankSum=1.804;SC=TGACATTTTTATTTTATAGAT;SOR=0.446;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=20;WE=26993605;WS=26993587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,34:0.74:46
chr10	26993725	rs1677730	G	A	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.196;HP=4;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=285;ReadPosRankSum=-1.104;SC=TAAATTTATTGTTGTTTAAAA;SOR=2.391;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=9;WE=26993745;WS=26993715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr10	26993737	rs1780193	A	T	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.128;HP=8;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=285;ReadPosRankSum=-0.083;SC=TGTTTAAAAAATTTTTTTTGT;SOR=1.445;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=6;WE=26993745;WS=26993715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr10	26994150	rs1780192	A	C	1182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.884;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=15;PP=686;ReadPosRankSum=-0.733;SC=ATCTGAGTCTACTAAATATAT;SOR=0.877;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=70;TCF=43;TCR=27;TR=41;WE=26994158;WS=26994140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,51:0.63:81
chr10	26998739	rs2368183	G	C	2707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=61;PP=1774;ReadPosRankSum=1.571;SC=TTATATTTGGGAAGTCTTTCT;SOR=0.679;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=157;TCF=65;TCR=92;TR=104;WE=26998747;WS=26998729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,116:0.66:176
chr10	27009334	rs1780196	A	G	1424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=29;PP=783;ReadPosRankSum=-1.467;SC=TGAATCACACACTTTTCGGAC;SOR=0.643;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=91;TCF=46;TCR=45;TR=60;WE=27009342;WS=27009324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,68:0.67:102
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chr10	27059608	rs1324637	C	T	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.896;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=14;PP=383;ReadPosRankSum=0.651;SC=TGCATGAACACAAACTATAGA;SOR=0.322;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=38;TCF=17;TCR=21;TR=27;WE=27059616;WS=27059598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,31:0.69:45
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chr10	27326014	rs11015469	C	T	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=229;ReadPosRankSum=-1.210;SC=TAAAAATCCTCGACACTTTCC;SOR=0.693;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=5;WE=27326029;WS=27326004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr10	27326021	rs78503631	T	G	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=117;ReadPosRankSum=1.221;SC=CCTCGACACTTTCCAAGATGC;SOR=0.693;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=4;WE=27326029;WS=27326004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr10	27326999	rs7096505	T	C	311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=7;PP=179;SC=GTTAAATATGTTTATCTTAAA;SOR=1.445;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=11;WE=27327007;WS=27326989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr10	27368126	rs3737055	A	C	3506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=74;PP=2340;SC=GAGTGAATTCATTTCTTTAAA;SOR=1.262;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=46;TCR=74;TR=120;WE=27368134;WS=27368116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr10	27371623	rs10829173	G	A	1020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=12;PP=491;SC=CTGTTGGGACGACTATATGGA;SOR=0.743;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=20;TCR=12;TR=32;WE=27371631;WS=27371613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr10	27371647	rs10829174	T	C	982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=13;PP=436;SC=GCACATAATATGGTGTCTACC;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=19;TCR=13;TR=32;WE=27371655;WS=27371637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr10	27375377	rs10443987	A	T	1748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=23;PP=985;SC=ACTGATTTTTAAAACTGCTTT;SOR=1.000;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=35;TCR=23;TR=58;WE=27375385;WS=27375367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr10	27382240	rs2297147	T	C	1166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=31;NR=2;PP=769;SC=AACAAACGCATTTCAAATACT;SOR=3.912;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=33;WE=27382248;WS=27382230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr10	27389197	rs7897309	T	C	1457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=26;PP=709;SC=GCTGCTCCTCTGCCGCCGCGC;SOR=1.047;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=24;TCR=26;TR=50;WE=27389205;WS=27389187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr10	27400861	rs9833	G	A	2475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=39;PP=1346;SC=AATGCTACTTGTATTCTTGCA;SOR=0.829;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=36;TCR=39;TR=75;WE=27400869;WS=27400851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr10	27405310	rs2480718	C	G	1505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=28;PP=880;SC=AAAAAATAAGCAAAGAGGCTG;SOR=1.262;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=20;TCR=28;TR=48;WE=27405318;WS=27405300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr10	27405331	rs7901976	C	T	1072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=23;PP=633;SC=GGTGCGGTGGCTCACGCCTGA;SOR=1.670;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=11;TCR=23;TR=34;WE=27405339;WS=27405321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr10	27409555	rs10829190	G	A	3690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=67;PP=2056;SC=CCCTAATGACGTGACTGGGAA;SOR=1.187;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=115;TCF=48;TCR=67;TR=115;WE=27409563;WS=27409545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr10	27436295	rs3780926	A	C	711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=6;PP=606;SC=ACAAACAAAGAAACTAGACTG;SOR=2.124;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=26;WE=27436303;WS=27436285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr10	27444303	rs3824593	G	A	210.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=81;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=6;NR=0;PP=142;SC=GTTGGCGGGAGTGGCTGCTCG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=27444311;WS=27444301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr10	27444328	rs7919803	CT	AC	734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=0;PP=242;SC=GGGGCAGTGTCTGCGGGGCCG;SOR=4.294;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=12;WE=27444337;WS=27444318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	27444344	rs7907988	T	G	896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=0;PP=660;SC=GGCCGCTGTATGCTGTCCAGC;SOR=5.211;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=27444352;WS=27444334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr10	27454111	rs7068375	A	T	5462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=92;NR=89;PP=2892;SC=TAAGTACTTGAGAAGAAAATT;SOR=0.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=181;TCF=92;TCR=89;TR=181;WE=27454119;WS=27454101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr10	27456003	rs788238	G	A	2432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=51;NR=28;PP=1427;SC=GCTGTAACATGGAATTCAATA;SOR=1.255;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=51;TCR=28;TR=79;WE=27456011;WS=27455993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr10	27459670	rs1981296	C	T	4442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=55;PP=2821;SC=ATAGAAGCATCAAAGAATCCT;SOR=1.290;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=146;TCF=91;TCR=55;TR=146;WE=27459678;WS=27459660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr10	27461953	rs6482600	T	A	1010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=5;PP=751;ReadPosRankSum=-0.769;SC=TAGTAGCCTATGAGCTAGTTA;SOR=1.666;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=33;WE=27461961;WS=27461943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,34:0.97:35
chr10	27475444	rs10741130	T	C	5321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=104;PP=2929;SC=AGCACCTGACTGTATCTGGAT;SOR=1.055;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=183;TCF=79;TCR=104;TR=183;WE=27475452;WS=27475434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr10	27475494	rs10764686	T	C	2497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.314;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=62;PP=1560;ReadPosRankSum=-1.250;SC=AGTCTAGCCTTGTGTTATAGA;SOR=2.135;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=88;TCF=26;TCR=62;TR=87;WE=27475502;WS=27475484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,95:0.98:97
chr10	27497074	rs7919523	C	T	1639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=15;PP=1126;SC=CTAAAAAAATCAGTAAAATAC;SOR=2.147;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=41;TCR=15;TR=56;WE=27497082;WS=27497064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr10	27506854	rs1775355	C	T	3097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=70;NR=38;PP=1913;SC=CCTATAATTACTAAAAGACTA;SOR=1.290;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=70;TCR=38;TR=108;WE=27506862;WS=27506844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr10	27508758	rs10764690	T	C	876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=1.295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.28;ReadPosRankSum=-1.241;SOR=0.575;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,55:0.33:166
chr10	27508837	rs788213	T	C	975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=29;PP=809;SC=TACAATAATGTCATAATTTCC;SOR=3.545;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=34;WE=27508845;WS=27508827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr10	27529549	rs2797078	C	A	7389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=142;NR=109;PP=2965;SC=CCTCCTCCCCCGGGGCGTGAC;SOR=0.897;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=253;TCF=143;TCR=110;TR=251;WE=27529557;WS=27529539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,278:1.00:278
chr10	27529565	rs2489372	T	C	8448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=154;NR=131;PP=2965;SC=GTGACTAAGGTCACGAATCCG;SOR=0.792;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=285;TCF=154;TCR=131;TR=285;WE=27529573;WS=27529555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,317:1.00:317
chr10	27539507	rs7896532	C	T	313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=1;PP=200;SC=GTTCACGCTCCGTAGGATGAC;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=27539515;WS=27539497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	27577568	rs2780686	G	A	2882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=53;NR=38;PP=1355;SC=TCTCCACACTGTAGCTTACAT;SOR=0.844;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=53;TCR=38;TR=91;WE=27577576;WS=27577558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr10	27577615	rs11015640	T	G	2694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.54;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=45;PP=1434;SC=GGAAGAGTGCTGAAAAGATTG;SOR=1.157;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=38;TCR=45;TR=83;WE=27577623;WS=27577605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr10	27577640	rs3818746	G	T	1937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=51.58;QD=27.29;SOR=1.545;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr10	27595356	rs7085523	C	T	1478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=39;PP=1096;SC=GACAAATTTTCGCAGTAAAAA;SOR=2.925;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=9;TCR=39;TR=48;WE=27595364;WS=27595346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr10	27622954	rs200224465	C	CTA	170.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.45;MQRankSum=-2.558;QD=5.17;ReadPosRankSum=0.504;SOR=0.602;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,8:0.24:33
chr10	27687225	rs2505323	A	G	4138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=64;PP=2455;SC=CGTCGTAATTAGAATAACAAT;SOR=0.759;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=146;TCF=81;TCR=65;TR=145;WE=27687233;WS=27687215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr10	27687463	rs61739217	A	G	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.118;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=8;PP=244;ReadPosRankSum=0.462;SC=TTTTATCTACATAGACATTTT;SOR=1.015;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=61;TCF=37;TCR=24;TR=22;WE=27687471;WS=27687453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,23:0.33:70
chr10	27687775	rs1638630	T	C	5933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=115;NR=71;PP=2965;SC=AAAACAAACTTATTGGATGGA;SOR=1.126;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=186;TCF=115;TCR=71;TR=186;WE=27687783;WS=27687765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr10	27687965	rs2505327	A	G	4460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=69;PP=2900;SC=TAACAGGGTCATTCCTGTATA;SOR=0.743;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=150;TCF=81;TCR=69;TR=150;WE=27687973;WS=27687955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr10	27687994	rs2484173	A	G	5069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=79;PP=2965;SC=AACATTGTACAGACCTAAAAG;SOR=0.747;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=172;TCF=92;TCR=80;TR=171;WE=27688002;WS=27687984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr10	27688109	rs2429485	T	C	3964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=78;PP=2522;SC=TCGTATGTCATCTGCAAGGTT;SOR=1.422;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=143;TCF=59;TCR=84;TR=136;WE=27688117;WS=27688099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr10	27692307	rs11599425	A	G	3103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.067;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=64;PP=1668;ReadPosRankSum=-0.913;SC=GGAGGGAAAAATCATGGAATT;SOR=0.917;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=158;TCF=75;TCR=83;TR=116;WE=27692315;WS=27692297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,136:0.72:188
chr10	27700887	rs2429499	G	A	1005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=19;PP=595;SC=CAGATAAATAGCTTTTAATTA;SOR=1.040;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=15;TCR=19;TR=34;WE=27700895;WS=27700877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr10	27702042	.	T	TA	2623.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=15;PP=1440;SC=GTCTTCCTCATCCCTCTCACC;SOR=1.473;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=35;TCF=18;TCR=17;TR=32;WE=27702050;WS=27702032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr10	27702726	rs11015753	G	A	4307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=73;NR=69;PP=2374;SC=CCGGTGCCCAGCGCGGCTGTC;SOR=0.821;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=142;TCF=73;TCR=69;TR=142;WE=27702734;WS=27702716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr10	27702744	rs11015754	A	G	1227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.604;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=28;PP=662;ReadPosRankSum=-0.302;SC=GTCAGCATCAAGGGCGCCAGC;SOR=0.790;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=142;TCF=69;TCR=73;TR=54;WE=27702752;WS=27702734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,63:0.40:158
chr10	27703234	rs7071851	A	G	1586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=21;NR=28;PP=801;SC=GCAGCTGCGGAGATCCCACCA;SOR=1.278;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=50;TCF=21;TCR=29;TR=49;WE=27703242;WS=27703224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr10	27822619	rs72264716	TTC	T	34.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.79;ReadPosRankSum=-0.842;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,2:0.33:6
chr10	28032136	rs2252651	C	T	897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=9;PP=460;SC=GCGGGCAGGGCCCCCAGGGGA;SOR=1.244;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=19;TCR=9;TR=28;WE=28032144;WS=28032126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr10	28151604	rs34181914	AT	A	268.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.305;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=218;ReadPosRankSum=-0.097;SC=ACATTTAGGCATTTTTTAAGA;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=10;WE=28151612;WS=28151594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,14:0.39:36
chr10	28225897	rs2297646	G	T	1371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=29;PP=850;SC=CTAGTAGCTAGGAAACTTCTT;SOR=1.136;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=19;TCR=29;TR=48;WE=28225905;WS=28225887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr10	28228865	rs7893462	A	G	825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=0.669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.26;ReadPosRankSum=0.846;SOR=0.668;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,49:0.37:132
chr10	28233120	rs3824590	A	C	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.782;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=138;ReadPosRankSum=-0.536;SC=GGCTGGCACTAGATGACGATG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=7;WE=28233128;WS=28233110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr10	28233469	rs3802517	T	A	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=2.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.65;ReadPosRankSum=-1.148;SOR=1.781;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr10	28233660	rs147131680	G	A	604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.599;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=378;ReadPosRankSum=2.113;SC=ACCAGGCAACGAGGCATGGCA;SOR=0.197;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=21;WE=28233668;WS=28233650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,24:0.75:32
chr10	28233931	rs34717952	G	A	1769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FS=0.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.27;ReadPosRankSum=0.457;SOR=0.783;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:137,54:0.28:191
chr10	28233931	.	GCA	ACG	1303	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=21;NR=27;PP=1303;QD=28.259747393;SC=AAGGAACACCGCATTCCCATA;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=161;TCF=71;TCR=90;TR=48;WE=28233941;WS=28233921;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:113,48:0.30:161
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chr10	28284140	rs111675655	C	T	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQRankSum=-5.232;QD=1.06;ReadPosRankSum=-1.073;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,5:0.17:29
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chr10	28346584	rs12217744	G	A	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.04;ReadPosRankSum=-0.184;SOR=0.970;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr10	28346629	rs76671899	A	AGT	1650.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=-0.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=10;PP=719;ReadPosRankSum=-3.456;SC=ACAGTGCCCAAGTCAGGAGGC;SOR=0.883;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=24;TCF=9;TCR=15;TR=17;WE=28346637;WS=28346619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,41:0.79:52
chr10	28346796	rs146883805	T	C	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.210;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=12;PP=223;ReadPosRankSum=-1.038;SC=ATGAGGAAAATGCTGTGGGCT;SOR=0.941;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=36;TCF=15;TCR=21;TR=19;WE=28346804;WS=28346786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,22:0.54:41
chr10	28348815	rs1361922	C	T	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=-2.287;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=92;ReadPosRankSum=-0.493;SC=TAATAAAATACAGTAAGCTGT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=6;WE=28348823;WS=28348805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr10	28358659	rs7919895	C	T	1262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=12;PP=725;ReadPosRankSum=1.118;SC=TTAAAATTATCGTAAGTGTAG;SOR=0.749;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=70;TCF=52;TCR=18;TR=45;WE=28358667;WS=28358649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,54:0.66:82
chr10	28378758	rs2997211	T	C	1633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=38;PP=1132;SC=ACGAAAACTTTTTCTAAAACC;SOR=2.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=12;TCR=38;TR=50;WE=28378766;WS=28378748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr10	28408538	rs10047289	C	T	862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.484;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=11;PP=610;ReadPosRankSum=-0.072;SC=CAAAAATAAACATCAGGGTTT;SOR=1.179;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=54;TCF=39;TCR=15;TR=38;WE=28408546;WS=28408528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,38:0.64:59
chr10	28408756	rs11006883	A	C	458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.51;BaseQRankSum=1.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=318;ReadPosRankSum=0.492;SC=GAAAAAAATGAATGTAATGCA;SOR=0.527;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=13;WE=28408764;WS=28408746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,16:0.76:21
chr10	28409614	rs7903192	C	G	1463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.666;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=36;PP=860;ReadPosRankSum=-0.858;SC=ACAGATAAAACAAGGAGTTAT;SOR=0.808;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=118;TCF=52;TCR=66;TR=62;WE=28409622;WS=28409604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,69:0.53:131
chr10	28491313	rs11598304	C	T	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.495;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=35;ReadPosRankSum=0.158;SC=ATTTGTATTCCGGGCCATCAA;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=4;WE=28491321;WS=28491303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr10	28822373	rs12767429	A	C	637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=1;PP=526;SC=CTGGGAGCTGATGAGAGTCGC;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=28822381;WS=28822363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	28899841	rs11371837	A	AT	381.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.29;MQRankSum=0.574;QD=16.60;ReadPosRankSum=1.299;SOR=0.343;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,19:0.83:23
chr10	28903400	rs71391055	G	GTCTTCTTTAAAACA	1131.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=2;PP=2010;SC=GAACTTGACTGCCACATTTTA;SOR=2.200;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=5;WE=28903408;WS=28903390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr10	29136129	rs813935	A	G	2901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=37;PP=1617;SC=CTGAGCTCAAATAGTCCTCCT;SOR=1.008;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=57;TCR=37;TR=94;WE=29136137;WS=29136119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr10	29137085	rs787323	C	T	263.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=214;SC=CTCTTGTGCACGGGATGGGGA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=29137093;WS=29137075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr10	29162164	.	AT	A	75.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.889;ClippingRankSum=0.000;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=2.062;QD=1.17;ReadPosRankSum=0.626;SOR=0.762;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,12:0.18:65
chr10	29162324	rs35236571	TAC	T	328.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.53;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr10	29169046	rs199740171	AT	A	197.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=7.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=1.590;QD=3.04;ReadPosRankSum=-0.794;SOR=0.187;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,19:0.29:65
chr10	29580735	rs2148901	C	T	1359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=5.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.76;MQRankSum=0.488;QD=30.22;ReadPosRankSum=1.434;SOR=0.162;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,34:0.76:45
chr10	29580743	rs2148902	G	A	1356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=7.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.18;MQRankSum=1.178;QD=28.87;ReadPosRankSum=2.234;SOR=0.116;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,34:0.72:47
chr10	29581309	rs1751955	C	T	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.757;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.994;NF=21;NR=0;PP=376;ReadPosRankSum=-0.016;SC=GCCCCCTGGGCGCATGCCCGC;SOR=2.226;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=37;TCR=1;TR=21;WE=29581317;WS=29581299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr10	29581440	rs3818550	C	T	5074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-1.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=342;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.364;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-1.356;NF=106;NR=93;PP=2816;ReadPosRankSum=-0.281;SC=TGGCTTTCCCCCCTCCAGGGA;SOR=0.758;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=294;TCF=152;TCR=142;TR=199;WE=29581448;WS=29581430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,229:0.67:342
chr10	29598896	rs2796293	A	G	4809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=50;PP=2965;SC=TAATGAAAATAAGATTGTGGC;SOR=1.624;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=150;TCF=100;TCR=50;TR=150;WE=29598904;WS=29598886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr10	29747155	rs139380407	GCTC	G	292.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.854;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=306;ReadPosRankSum=0.212;SC=TGACCGTGAGGCTCCTCTGGC;SOR=1.329;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=9;WE=29747165;WS=29747145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,10:0.25:40
chr10	29747221	rs41299212	G	A	648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.086;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=10;PP=436;ReadPosRankSum=0.303;SC=GCTTCCAGGCGGGCAGGGCGT;SOR=1.280;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=125;TCF=83;TCR=42;TR=35;WE=29747229;WS=29747211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,39:0.27:147
chr10	29747618	rs7098527	T	A	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.089;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=189;ReadPosRankSum=0.484;SC=ACCTGCATACTGCCTGAGGAT;SOR=1.000;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=54;TCF=23;TCR=31;TR=16;WE=29747626;WS=29747608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,19:0.29:65
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chr10	29769647	rs10763720	G	A	1269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.117;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=33;PP=779;ReadPosRankSum=-0.364;SC=AGCCACGGCCGACGTTCACTC;SOR=0.698;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=185;TCF=98;TCR=87;TR=63;WE=29769655;WS=29769637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,72:0.33:216
chr10	29770551	rs11007612	A	G	1526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-2.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=46;PP=937;ReadPosRankSum=-0.919;SC=TTCTCATTCGATCTCTTCAGT;SOR=0.711;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=180;TCF=73;TCR=107;TR=75;WE=29770559;WS=29770541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,85:0.42:202
chr10	29776289	rs61192312	T	C	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=114;ReadPosRankSum=0.580;SC=ACGCACCCCATATCGGAAGCA;SOR=1.179;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=8;WE=29776297;WS=29776279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr10	29777558	rs61737742	G	A	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=3.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.81;MQRankSum=-0.824;QD=1.12;ReadPosRankSum=-1.406;SOR=1.349;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,9:0.16:56
chr10	29779847	rs199726033	A	C	999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FS=17.408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.56;MQRankSum=-1.895;QD=3.66;ReadPosRankSum=-0.087;SOR=1.212;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:204,69:0.25:273
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chr10	29782066	rs4749439	A	G	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.695;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-5.251;NF=12;NR=0;PP=225;ReadPosRankSum=-0.182;SC=ACTGGGGGAAAAGCCTCATGG;SOR=1.739;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=12;WE=29782074;WS=29782056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,12:0.32:38
chr10	29783813	rs6481600	G	A	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.296;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=288;ReadPosRankSum=-0.616;SC=GAGATTCTGAGAGCAAAGCCT;SOR=1.631;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=78;TCF=51;TCR=27;TR=22;WE=29783821;WS=29783803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,26:0.30:86
chr10	29783885	rs1056782	A	G	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FS=1.564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.02;MQRankSum=-0.299;QD=1.68;ReadPosRankSum=1.779;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:146,32:0.18:178
chr10	29783908	rs78773460	A	G	1478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.074;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.390;NF=47;NR=29;PP=1010;ReadPosRankSum=-0.498;SC=TTCTAACTGCATATCTGGTCT;SOR=0.704;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=190;TCF=105;TCR=85;TR=76;WE=29783916;WS=29783898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,81:0.40:204
chr10	29783984	rs3031505	GAAACT	G	1560.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=5.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=22.036;HP=4;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-5.951;NF=10;NR=33;PP=1766;ReadPosRankSum=-2.889;SC=CTTCTGATCAGAAACTGCTTG;SOR=2.083;SbPval=0.08;Source=Platypus;TC=111;TCF=15;TCR=96;TR=43;WE=29783996;WS=29783974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,49:0.26:185
chr10	29784004	rs28427082	G	A	2256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-3.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.912;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=4.949;NF=45;NR=49;PP=1320;ReadPosRankSum=4.156;SC=GGCGTGGCCGGGGCCTTGGCG;SOR=0.264;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=138;TCF=62;TCR=76;TR=94;WE=29784012;WS=29783994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,99:0.73:135
chr10	29784072	rs2368406	G	C	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.010;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.681;NF=8;NR=21;PP=509;ReadPosRankSum=-1.868;SC=CCGCAAATGGGTGAGGCTACT;SOR=1.821;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=58;TCF=21;TCR=37;TR=29;WE=29784080;WS=29784062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,27:0.51:53
chr10	29784114	rs6481601	T	C	764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=23;PP=600;SC=GCCAAACCTGTGGAACACACA;SOR=1.402;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=12;TCR=23;TR=35;WE=29784122;WS=29784104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr10	29784188	.	AAA	GAG	43	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MMLQ=15;MQ=50.72;NF=1;NR=2;PP=43;QD=32.1559582874;SC=GGATCTCCAGAAATCCCAGGG;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=3;WE=29784198;WS=29784178;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr10	29785191	rs11007625	G	A	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=130;ReadPosRankSum=-0.059;SC=TTGATTGATGGTGTCAATAAA;SOR=0.793;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=31;TCF=19;TCR=12;TR=12;WE=29785199;WS=29785181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr10	29812602	rs7070678	G	T	708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.808;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=20;PP=420;ReadPosRankSum=0.416;SC=TCCCTGGCTCGGTTCAGGATG;SOR=0.785;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=133;TCF=74;TCR=59;TR=39;WE=29812610;WS=29812592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,43:0.30:145
chr10	29818604	rs913035	A	C	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.501;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=77;ReadPosRankSum=-0.216;SC=GACACTATAGACAAGGCTGAG;SOR=0.323;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=9;WE=29818612;WS=29818594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,11:0.31:35
chr10	29818827	rs3780843	C	T	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.071;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=10;PP=203;ReadPosRankSum=-1.172;SC=GAGCTGGGCACGGTGGCTCAC;SOR=0.448;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=51;TCF=22;TCR=29;TR=20;WE=29818835;WS=29818817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,23:0.41:56
chr10	29820070	rs11819202	G	A	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=9.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.59;ReadPosRankSum=1.357;SOR=0.020;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr10	29821089	rs17756919	C	T	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.250;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=270;ReadPosRankSum=-0.347;SC=CCGACCTCTCCACCCGTGATT;SOR=0.458;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=47;TCF=12;TCR=35;TR=21;WE=29821097;WS=29821079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,21:0.41:51
chr10	29821475	rs41284748	G	A	1359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.954;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=18;PP=906;ReadPosRankSum=-0.533;SC=GTCTCCTGCAGGCGTTGGCAG;SOR=0.957;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=78;TCF=51;TCR=27;TR=55;WE=29821483;WS=29821465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,58:0.71:82
chr10	29821523	rs1328323	T	C	682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.61;ReadPosRankSum=1.085;SOR=0.725;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:107,41:0.28:148
chr10	29822032	rs1247696	C	T	3455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=44;PP=1999;SC=GACTCGCAGACATGGAGAACT;SOR=1.110;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=74;TCR=44;TR=118;WE=29822040;WS=29822022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr10	29822159	rs7076239	T	C	1277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.058;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=25;PP=770;ReadPosRankSum=-0.690;SC=CTGGCGTCACTAGCTTGGCGG;SOR=0.951;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=199;TCF=104;TCR=95;TR=59;WE=29822167;WS=29822149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,69:0.32:218
chr10	29833998	rs2368393	A	G	1416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FS=0.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.14;ReadPosRankSum=1.142;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:112,43:0.28:155
chr10	29834003	rs2368392	G	A	1431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.81;ReadPosRankSum=0.907;SOR=0.656;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,42:0.29:146
chr10	29834095	rs4463752	G	A	403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.06;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	29834095	.	GGTTTTTAGACTAAAATCTC	AGTTTTTAGACTAAAATCTC,AGTTTTTAGATTAAAATCTG	338	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.04;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=6;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=1,0;NR=13,3;PP=338,63;QD=26.6265151819;SC=CTCTGGAGACGGTTTTTAGAC;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14,3;WE=29834122;WS=29834085;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:14
chr10	29834105	rs1410472	C	T	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.68;ReadPosRankSum=-0.115;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr10	29834114	rs1410473	C	G	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.394;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.68;ReadPosRankSum=-0.330;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr10	29839513	rs10159964	A	G	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=2;PP=55;ReadPosRankSum=0.789;SC=CTTAGCGTGGACTGGATGCTT;SOR=0.804;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=5;WE=29839521;WS=29839503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr10	29839787	rs10160013	A	G	1492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.482;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=36;PP=2269;ReadPosRankSum=-2.882;SC=GCCGTCACCCACATGGAGGGC;SOR=0.763;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=237;TCF=128;TCR=109;TR=81;WE=29839806;WS=29839777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,86:0.33:258
chr10	29839798	rs17834991	A	G	3831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=73;PP=2962;ReadPosRankSum=2.816;SC=CATGGAGGGCATAGTCCTTGG;SOR=0.661;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=237;TCF=129;TCR=108;TR=157;WE=29839806;WS=29839777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,173:0.67:260
chr10	29839864	rs1270874	A	C	6434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=113;NR=111;PP=2965;SC=ACAGAGAACTAGCATCTCTGC;SOR=0.701;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=224;TCF=113;TCR=111;TR=224;WE=29839872;WS=29839854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr10	29840038	rs3740003	A	G	775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=16;PP=435;ReadPosRankSum=-1.179;SC=TGTACCTTGCAATTCTTTCGG;SOR=0.639;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=107;TCF=59;TCR=48;TR=37;WE=29840046;WS=29840028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,43:0.36:121
chr10	29840164	rs3740002	A	G	895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=25;PP=569;ReadPosRankSum=-1.999;SC=GAGAAGAATCAGAAGTTTCCT;SOR=0.673;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=138;TCF=67;TCR=71;TR=48;WE=29840172;WS=29840154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,53:0.33:160
chr10	29843833	rs1547169	C	T	745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=13;PP=417;ReadPosRankSum=-0.716;SC=CATTTTCAATCCCTTCCAGGC;SOR=0.658;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=118;TCF=72;TCR=46;TR=34;WE=29843841;WS=29843823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,43:0.30:145
chr10	29844067	rs1547170	T	C	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=196;ReadPosRankSum=0.604;SC=GAACAAAATATAGTATTTAGT;SOR=0.404;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=10;WE=29844075;WS=29844057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr10	29891161	rs11007666	A	G	2466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.579;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=46;PP=1317;ReadPosRankSum=0.047;SC=ATGATGTTTCATGAAGTGCCC;SOR=0.638;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=161;TCF=92;TCR=69;TR=105;WE=29891169;WS=29891151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,116:0.66:177
chr10	29891260	rs12416605	C	T	1493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=41;PP=953;ReadPosRankSum=-1.427;SC=CCTTTAAGGGCACATGGTACA;SOR=0.623;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=91;TCF=30;TCR=61;TR=62;WE=29891268;WS=29891250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,65:0.68:95
chr10	29891321	rs2505901	T	C	509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=14;PP=418;SC=CCCTCCCTTCTCTGCTGTGGG;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=29891329;WS=29891311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	30306804	rs2478839	G	A	1881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.642;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=33;PP=909;ReadPosRankSum=-1.773;SC=AGCTCCACCGGCATTTCATCA;SOR=0.722;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=103;TCF=58;TCR=45;TR=73;WE=30306812;WS=30306794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,85:0.71:119
chr10	30316072	rs3739998	C	G	3229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=56;PP=1887;ReadPosRankSum=-0.180;SC=GATTTTCGGACTTTCCTGGGG;SOR=0.692;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=179;TCF=94;TCR=85;TR=119;WE=30316080;WS=30316062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,138:0.68:203
chr10	30316208	rs2185724	T	C	1728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=40;PP=1106;ReadPosRankSum=0.213;SC=TCCAGGTGTCTCTTCTCTGCA;SOR=0.665;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=234;TCF=122;TCR=112;TR=84;WE=30316216;WS=30316198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,94:0.36:264
chr10	30316872	rs3739996	T	C	1635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FS=4.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.72;ReadPosRankSum=0.161;SOR=0.881;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:188,98:0.34:286
chr10	30317073	rs9337951	G	A	3185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.842;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=59;PP=1857;ReadPosRankSum=2.070;SC=GCTTTGTAAGGTGGATGAAAC;SOR=0.631;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=181;TCF=98;TCR=83;TR=123;WE=30317081;WS=30317063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,139:0.68:205
chr10	30317826	rs7920682	A	G	2119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FS=2.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.48;ReadPosRankSum=0.432;SOR=0.640;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:184,66:0.26:250
chr10	30317838	rs7920686	A	G	2121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FS=1.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.657;SOR=0.669;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:166,66:0.28:232
chr10	30317949	rs2478835	C	T	2908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.640;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=51;PP=1776;ReadPosRankSum=0.939;SC=CCTTCTCGGTCGGAGACTGCT;SOR=0.756;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=174;TCF=92;TCR=82;TR=114;WE=30317957;WS=30317939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,124:0.65:191
chr10	30611614	rs2484284	C	T	520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=15;PP=376;SC=AAATTAAACTCAAACCAAGAA;SOR=2.948;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=30611622;WS=30611604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
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chr10	30615638	rs1029172	A	G	532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=14;PP=366;SC=TTTGTAAAAGAATGCTCTAAA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=30615646;WS=30615628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	30626003	rs12221163	C	T	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=185;ReadPosRankSum=1.062;SC=AAGTACAGGTCGCATAAAAAG;SOR=0.446;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=10;WE=30626011;WS=30625993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr10	30629082	rs2689215	C	T	700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=1;PP=518;SC=GTAGCTTGAACATTTTACAGG;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=30629090;WS=30629072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	30629136	rs1047988	G	A	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.122;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=294;ReadPosRankSum=0.483;SC=TAAAAGTTGAGGTACACCTAA;SOR=0.941;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=61;TCF=45;TCR=16;TR=19;WE=30629144;WS=30629126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,21:0.31:68
chr10	30629226	rs1047991	G	A	1022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.592;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=24;PP=703;ReadPosRankSum=0.071;SC=GACCGTACGCGTGACCGTTCA;SOR=0.750;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=159;TCF=83;TCR=76;TR=53;WE=30629234;WS=30629216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,56:0.32:175
chr10	30629434	rs36002941	CTATTT	C	265.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.908;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=230;ReadPosRankSum=1.234;SC=ATCTAACATACTATTTTAGCT;SOR=0.313;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=7;WE=30629446;WS=30629424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,9:0.26:34
chr10	30637995	rs10826783	C	G	679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=3;PP=463;ReadPosRankSum=-0.228;SC=CCCGTGATCCCAGACTCCTCG;SOR=1.038;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=27;WE=30638003;WS=30637985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,29:0.74:39
chr10	30653561	rs7094285	C	G	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.124;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=7;PP=224;ReadPosRankSum=1.342;SC=TTGGAGAGAGCGGGGCGGGGA;SOR=0.293;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=23;TCF=15;TCR=8;TR=19;WE=30653569;WS=30653551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,24:0.86:28
chr10	30728101	rs1042058	T	C	1495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.666;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=33;PP=931;ReadPosRankSum=2.501;SC=CAGTCAGATATGGAACTGTGG;SOR=0.773;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=214;TCF=113;TCR=101;TR=74;WE=30728109;WS=30728091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,80:0.34:236
chr10	30728250	rs2907	A	G	1280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.459;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=39;PP=816;ReadPosRankSum=0.433;SC=CAGCTTTCCTACTGCAGCTTC;SOR=0.895;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=206;TCF=95;TCR=111;TR=64;WE=30728258;WS=30728240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,72:0.31:232
chr10	30739058	rs303428	A	G	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.799;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=56;ReadPosRankSum=-0.240;SC=TGGGCAGTCCATTTTCACACA;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=5;WE=30739066;WS=30739048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr10	30748498	rs8177029	T	C	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.340;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=88;ReadPosRankSum=0.787;SC=AAACCTCTGATGTAGTTCATG;SOR=1.022;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=8;WE=30748506;WS=30748488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr10	30749895	rs3034	G	A	342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=11;PP=267;SC=CCTGTGACCCGTGAATGTGCC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=30749903;WS=30749885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr10	30901722	rs3832672	GC	G	819.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=1;PP=794;SC=GCCCATGACAGCCCAAGTCTT;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=30901730;WS=30901712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr10	30901756	rs9954	G	A	1644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=6;PP=1181;SC=CTTACCAATAGTTCATTCCTT;SOR=3.651;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=44;TCR=6;TR=50;WE=30901764;WS=30901746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr10	30915618	rs3852488	G	A	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.944;HP=3;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.332;NF=11;NR=0;PP=209;ReadPosRankSum=-1.401;SC=GGTAGTTGGGGAGACACAGCA;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=11;WE=30915626;WS=30915608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr10	30915637	rs3864847	A	G	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.398;NF=15;NR=1;PP=290;ReadPosRankSum=0.475;SC=CAGGGAGTGTAGCCAGGACCT;SOR=0.551;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=44;TCF=39;TCR=5;TR=16;WE=30915645;WS=30915627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,16:0.36:45
chr10	30915708	rs142897252	T	G	2042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.483;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.240;NF=63;NR=38;PP=1400;ReadPosRankSum=-0.157;SC=AATCTCACAGTTTCCAAGGCT;SOR=0.635;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=233;TCF=144;TCR=89;TR=101;WE=30915716;WS=30915698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,104:0.42:246
chr10	30978164	rs28363791	A	G	911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=9;PP=580;SC=TGTGTGTTCCACAGGTTTGGC;SOR=1.675;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=28;TCR=9;TR=37;WE=30978172;WS=30978154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr10	30978206	rs61844348	G	C	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=13.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.08;MQRankSum=-3.469;QD=0.60;ReadPosRankSum=-3.123;SOR=3.477;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,7:0.12:56
chr10	30978274	rs4988769	T	C	1524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=2.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.37;MQRankSum=0.422;QD=17.53;ReadPosRankSum=4.040;SOR=0.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,73:0.84:87
chr10	30978288	rs71023602	C	CAGTTT	176.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=1.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.39;MQRankSum=-2.231;QD=2.01;ReadPosRankSum=-2.421;SOR=0.897;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,10:0.11:88
chr10	30982453	rs7068641	T	C	64.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=21.43;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr10	30982475	rs7084628	A	G	354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.73;QD=27.29;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	30982526	rs7068784	T	G	2264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=46;PP=1969;SC=AGAGAAGATCTCCTTCAGGAA;SOR=1.364;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=108;TCF=60;TCR=48;TR=106;WE=30982534;WS=30982516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr10	30985070	rs11008186	G	A	350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=8;PP=223;SC=CACGTAAGGAGTCCTGACTGT;SOR=1.609;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=12;WE=30985089;WS=30985060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	30985081	rs10826846	G	A	328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=4;NR=8;PP=167;SC=TCCTGACTGTGTAATTCATCC;SOR=1.609;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=12;WE=30985089;WS=30985060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	30986240	rs138927815	C	T	736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.80;QD=49.12;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	30986242	rs11008188	A	G	860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.83;QD=50.63;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	30986244	rs11007616	A	G	893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.85;QD=44.69;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	30986253	rs4747726	G	A	1065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.89;QD=39.47;SOR=2.066;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr10	30986296	rs4749587	C	T	1397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=15;PP=889;SC=GTGTCTGCCTCGTGTTCAGGA;SOR=1.519;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=33;TCR=15;TR=48;WE=30986304;WS=30986286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr10	30986364	rs7078530	G	A	2825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=44;PP=1692;SC=CAATAGTGGGGACTGCTTCCT;SOR=0.872;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=56;TCR=44;TR=100;WE=30986372;WS=30986354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr10	30989188	rs10740829	G	C	7101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=107;NR=125;PP=2965;SC=CCGCTTATCCGCAGGTACTAC;SOR=0.991;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=233;TCF=107;TCR=126;TR=232;WE=30989196;WS=30989178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr10	30993404	rs11008192	G	A	5150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=73;PP=2885;SC=TGCCCCAGACGACAGCAGGTG;SOR=0.779;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=168;TCF=95;TCR=73;TR=168;WE=30993412;WS=30993394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr10	30993448	rs10826848	G	A	5048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=82;NR=85;PP=2667;SC=GGCTGTGGCTGTGGCCTGGTG;SOR=0.850;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=167;TCF=82;TCR=85;TR=167;WE=30993456;WS=30993438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr10	31001494	rs1826619	A	C	7867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQ=59.99;NF=126;NR=125;PP=2965;SC=CAGGAAAAAAATCTCAAGAAG;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=251;TCF=126;TCR=125;TR=251;WE=31001505;WS=31001484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,296:1.00:296
chr10	31134557	rs17229657	T	C	606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=453;ReadPosRankSum=0.687;SC=GCAATTGGAATCTTTCCTCTC;SOR=0.340;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=21;WE=31134565;WS=31134547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,22:0.69:32
chr10	31138817	rs10160116	G	A	1571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.738;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=19;PP=986;ReadPosRankSum=0.717;SC=AATGGACTGGGTTTGTACAGG;SOR=0.596;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=67;TCR=32;TR=58;WE=31138825;WS=31138807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,68:0.60:113
chr10	31146643	rs4237394	T	C	2347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=35;PP=1293;ReadPosRankSum=1.131;SC=AGAAAGGCTGTTGGATATTTG;SOR=0.678;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=135;TCF=80;TCR=55;TR=88;WE=31146651;WS=31146633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,103:0.66:155
chr10	31166088	rs10763848	G	A	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.46;ReadPosRankSum=-0.842;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr10	31791501	rs2839664	A	G	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=19;PP=396;ReadPosRankSum=0.277;SC=CTACCATTCTACTATGGGAAC;SOR=0.668;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=62;TCF=20;TCR=42;TR=28;WE=31791509;WS=31791491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,29:0.43:68
chr10	31803516	rs220060	G	A	1840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=32;NR=25;PP=837;SC=TAAAATACCAGTTCTTTTCTT;SOR=0.721;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=32;TCR=25;TR=57;WE=31803524;WS=31803506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr10	31803723	.	A	C	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=-0.000;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.29;ReadPosRankSum=-0.598;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr10	32097806	rs1029077	A	T	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.287;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=4.228;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=161;ReadPosRankSum=-0.493;SC=AAATGTTTGGAGTAAAACAAT;SOR=2.833;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=8;WE=32097814;WS=32097796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr10	32097851	rs1029078	A	G	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.309;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5081;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=68;ReadPosRankSum=-0.000;SC=AAGATAAAAAAAATTGGGTGG;SOR=1.022;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=4;WE=32097859;WS=32097850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr10	32099547	rs3840745	TA	T	75.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.41;ReadPosRankSum=1.559;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr10	32103077	rs2799012	C	T	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=143;ReadPosRankSum=0.398;SC=CTGCACAGCCCTTTTGTAACA;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=9;WE=32103085;WS=32103067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr10	32106851	rs2778650	A	G	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=217;ReadPosRankSum=-1.577;SC=GAGTATGGTCAGTTTGTGCTT;SOR=0.760;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=39;TCF=18;TCR=21;TR=18;WE=32106859;WS=32106841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,19:0.43:44
chr10	32115133	rs2255544	A	G	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=3.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=243;ReadPosRankSum=-1.572;SC=CACACTAGCTATAACTATAAG;SOR=1.508;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=11;WE=32115141;WS=32115129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr10	32120678	rs2808100	C	T	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.558;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=11;PP=388;ReadPosRankSum=1.106;SC=GAACCTTTTTCCCATTTTCAG;SOR=0.558;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=47;TCF=27;TCR=20;TR=29;WE=32120686;WS=32120668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,34:0.56:61
chr10	32128611	rs2808096	A	G	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.44;ReadPosRankSum=-0.147;SOR=0.826;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,30:0.58:52
chr10	32141460	rs2799021	T	C	2838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.470;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=52;PP=1613;ReadPosRankSum=0.695;SC=GCAATTCCCATTCTGACCGAG;SOR=0.503;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=166;TCF=91;TCR=75;TR=108;WE=32141468;WS=32141450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,129:0.66:195
chr10	32143208	rs2808090	A	C	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=2.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=276;ReadPosRankSum=-0.935;SC=TCTAATAAATAAATTTTACTT;SOR=1.022;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=13;WE=32143216;WS=32143198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,16:0.76:21
chr10	32307534	rs11428920	T	TA	1469.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=20;PP=876;SC=TTTTATTCTGTATATTGTACT;SOR=1.819;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=32307544;WS=32307524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr10	32307536	rs55938482	T	A	1478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=20;PP=589;SC=TTATTCTGTATATTGTACTTA;SOR=1.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=26;WE=32307544;WS=32307524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr10	32309005	rs1775715	A	G	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.697;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=82;ReadPosRankSum=1.407;SC=CTGTTATCCTATACCCTATGG;SOR=1.230;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=6;WE=32309013;WS=32308995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr10	32311969	rs176924	A	G	4024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=77;PP=2427;SC=AGGCTGCTGTAAGGAAAAAGT;SOR=1.202;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=131;TCF=53;TCR=78;TR=130;WE=32311977;WS=32311959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr10	32329482	.	TA	T	129	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=10;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=129;QD=35.25;SC=GAGAAAAGGTTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=4;WE=32329490;WS=32329472;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:16,4:0.20:20
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chr10	32667234	rs11443059	G	GA	102.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=0;PP=72;SC=CTTTAACAATGAAAAAAAAAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=4;WE=32667242;WS=32667229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
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chr10	32742256	rs2490505	T	G	1062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.30;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr10	32745396	rs2244153	A	G	546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=17;PP=464;SC=GCATTGGAAAACATTATTTAT;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=32745404;WS=32745386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	32751901	rs2505380	G	A	1492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=22;NR=24;PP=846;SC=TGCAATTTAAGTAGTCACTAT;SOR=1.101;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=22;TCR=24;TR=46;WE=32751909;WS=32751891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr10	32759918	rs2460710	G	A	159.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.64;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	32833290	.	T	G	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.909;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=13;PP=292;ReadPosRankSum=-0.755;SC=GATAGTCATATATAGAGAAAC;SOR=0.527;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=33;TCF=12;TCR=21;TR=21;WE=32833298;WS=32833280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,22:0.63:35
chr10	32856937	rs12783494	T	G	36.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr10	32974969	rs1762526	A	G	2753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=41;NR=46;PP=1486;SC=CAAATTACAAATAAAGAAACA;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=41;TCR=46;TR=87;WE=32974977;WS=32974959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr10	32978136	rs1763784	G	A	386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=13;PP=305;SC=TTAAAAGTAAGTTCATCCGAA;SOR=2.985;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=32978144;WS=32978126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	33015782	rs928701	G	A	385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.11;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr10	33018351	rs1414548	G	C	1189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=22;PP=752;SC=AATCTCAAACGAAGAAACTTC;SOR=1.259;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=16;TCR=22;TR=38;WE=33018359;WS=33018341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr10	33093858	rs35054696	TAC	T	760.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.39;QD=30.43;SOR=2.400;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr10	33123774	rs11009107	T	C	1708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=19;PP=1024;SC=AAGGTGTTAATGGAAAAGATA;SOR=1.306;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=39;TCR=19;TR=58;WE=33123782;WS=33123764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr10	33123824	rs4448627	G	C	2695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=50;NR=36;PP=1670;SC=AAGAGTCATGGAGGTAAGAAC;SOR=0.845;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=86;TCF=50;TCR=36;TR=86;WE=33123832;WS=33123814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr10	33137515	rs2488294	T	G	1197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.62;SOR=0.829;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr10	33137551	rs2504011	T	C	1454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=27;NR=21;PP=631;SC=AACAAAGATATGTCCGTACAA;SOR=0.728;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=27;TCR=21;TR=48;WE=33137559;WS=33137541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr10	33143396	rs1418538	G	A	1648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=17;PP=936;SC=GACCAATACAGTTGGAAAACC;SOR=1.217;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=35;TCR=17;TR=52;WE=33143404;WS=33143386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr10	33165226	rs2488305	G	A	701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=2;PP=408;SC=TATATCAACTGGAGTAAAATT;SOR=2.584;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=33165234;WS=33165216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr10	33190567	rs2153875	C	A	1897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.47;QD=28.75;SOR=0.886;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr10	33201128	rs2504020	C	G	1467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=37;PP=1120;SC=CAAACAGGAACAGCTCTAGTC;SOR=3.865;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=43;TCF=5;TCR=38;TR=42;WE=33201136;WS=33201118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr10	33209266	rs2230396	G	T	4262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=75;NR=62;PP=2462;SC=TTATTGTTACGCCTTCTGACA;SOR=0.800;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=137;TCF=75;TCR=62;TR=137;WE=33209274;WS=33209256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr10	33211440	rs2252752	T	C	885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=12;PP=655;SC=TAAAAATTAATATAAACCACT;SOR=0.976;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=17;TCR=12;TR=29;WE=33211448;WS=33211430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr10	33219008	rs2256455	T	G	517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=15;PP=391;SC=TAAATGAAAATTGTAATGGTC;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=33219016;WS=33218998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	33471761	.	GCA	G	73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=73;QD=25.3333333333;SC=TTAGGTACATGCACACACACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=3;WE=33471770;WS=33471751;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr10	33495306	rs2474715	A	G	794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.654;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=22;PP=491;ReadPosRankSum=-0.302;SC=GGTTTGGGACATGACTACAGA;SOR=0.758;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=117;TCF=64;TCR=53;TR=42;WE=33495314;WS=33495296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,48:0.33:145
chr10	33496681	rs74656391	A	AAG	85.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=3;PP=86;ReadPosRankSum=1.604;SC=TTAAGGAAAAAAAAAAACAGA;SOR=1.085;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=4;WE=33496689;WS=33496671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,4:0.21:19
chr10	33552696	rs7079053	A	G	5504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=87;PP=2965;SC=CATCTTTGGCACAAAGACAAT;SOR=0.846;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=194;TCF=107;TCR=87;TR=194;WE=33552704;WS=33552686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr10	33619562	rs1411924	C	T	246.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=203;SC=TTGTACACACCGACTTCCCCC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=33619570;WS=33619552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	34408636	rs11009651	T	C	1869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=35;PP=1111;ReadPosRankSum=0.057;SC=ACACCGAGTGTCGCCCGCTCT;SOR=0.671;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=101;TCF=54;TCR=47;TR=71;WE=34408644;WS=34408626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,83:0.68:122
chr10	34408745	rs3004928	A	C	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=11;PP=215;ReadPosRankSum=0.387;SC=CTCCATTTCGATTCTTATGAA;SOR=0.602;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=61;TCF=27;TCR=34;TR=21;WE=34408753;WS=34408735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,23:0.33:69
chr10	34619946	rs10740885	A	C	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=446;ReadPosRankSum=-0.020;SC=CTCAGAGATTACCCTGAAGAA;SOR=1.284;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=35;TCF=33;TCR=2;TR=21;WE=34619954;WS=34619936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,21:0.62:34
chr10	34620220	rs3781128	C	T	1609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.366;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=37;PP=817;ReadPosRankSum=-0.196;SC=GACTCTCCAACGAGCTTGACT;SOR=1.035;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=110;TCF=51;TCR=59;TR=66;WE=34620228;WS=34620210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,76:0.61:125
chr10	34661555	rs10763987	G	C	1246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=28;PP=716;ReadPosRankSum=-0.925;SC=AGAAAATTTTGTTGATTCTTA;SOR=0.659;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=90;TCF=36;TCR=54;TR=48;WE=34661563;WS=34661545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,56:0.55:102
chr10	34663981	.	A	AAC	43.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=-0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=162;ReadPosRankSum=-0.700;SC=ACAACAGGAAAACACACACAC;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=6;WE=34663989;WS=34663971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr10	34666864	rs10740890	C	T	1095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=15;PP=550;ReadPosRankSum=-1.424;SC=TTTCAAGAATCAGGGAACATC;SOR=0.637;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=63;TCF=40;TCR=23;TR=43;WE=34666872;WS=34666854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,50:0.71:70
chr10	34688287	rs2796011	G	A	5962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=104;PP=2965;SC=AAGGCACTACGTGGATTCCCA;SOR=0.757;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=204;TCF=100;TCR=104;TR=204;WE=34688295;WS=34688277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr10	34985197	rs5784425	C	CA	1403.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-0.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5055;FS=0.993;HP=12;HapScore=4;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=1.220;NF=16;NR=26;PP=496;ReadPosRankSum=0.575;SC=CCCTAGTCCTCAAAAAAAAAA;SOR=0.854;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=65;TCF=23;TCR=42;TR=42;WE=34985205;WS=34985187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,65:0.78:83
chr10	35302705	rs12830	C	T	745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5005;FS=7.054;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=20;PP=460;ReadPosRankSum=-2.675;SC=TTAATGAAAACGAAGATTCTG;SOR=2.288;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=26;WE=35302713;WS=35302695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,30:0.77:39
chr10	35320383	rs3740083	C	T	2295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.390;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=31;PP=1580;ReadPosRankSum=1.504;SC=TAAAGTTGACCAAAATACAAA;SOR=0.992;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=131;TCF=84;TCR=47;TR=89;WE=35320391;WS=35320373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,94:0.67:140
chr10	35321414	rs16935840	C	T	3384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.065;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=67;PP=2122;ReadPosRankSum=0.311;SC=TTACAACTGACGTAAGGGCCT;SOR=0.800;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=216;TCF=118;TCR=98;TR=146;WE=35321422;WS=35321404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,156:0.66:235
chr10	35322024	rs12261654	G	A	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=223;ReadPosRankSum=0.334;SC=CTAGAATTCTGATCTTGAAAC;SOR=1.061;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=11;WE=35322032;WS=35322014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr10	35324076	rs2244174	A	G	1956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=16;PP=1218;SC=GGAGGAAAACATTGCAGTTTC;SOR=1.997;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=48;TCR=16;TR=64;WE=35324084;WS=35324066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr10	35328088	rs11010077	A	G	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=34;ReadPosRankSum=0.674;SC=CAAGTAACTCAGCCAAATTTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=35328096;WS=35328078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr10	35338699	rs7900480	G	A	2206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=48;PP=1292;ReadPosRankSum=-0.981;SC=GCTAGCTGCCGGGAAAAACGA;SOR=0.654;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=68;TCR=84;TR=88;WE=35338707;WS=35338689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,102:0.59:174
chr10	35343525	rs2384289	G	A	151.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=59;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GAAAGCAAATGACTTGCAACT;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=35343533;WS=35343515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr10	35360310	rs4934711	G	A	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=288;ReadPosRankSum=0.145;SC=ATAATTCCATGAGCTTAGTTT;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=17;WE=35360318;WS=35360300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,18:0.75:24
chr10	35426614	rs35808464	T	C	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=94;ReadPosRankSum=-0.319;SC=TTCCTGGCCTTGTTTTGAGAG;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=6;WE=35426622;WS=35426604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr10	35426755	rs17499247	A	G	1331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=22;PP=672;ReadPosRankSum=1.529;SC=GATTACAAATATCTTAACAAT;SOR=0.687;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=108;TCF=64;TCR=44;TR=55;WE=35426763;WS=35426745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,65:0.52:126
chr10	35437239	rs34879823	A	AT	741.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=8;PP=565;ReadPosRankSum=0.057;SC=TTCAACCTGTATTTCCAAATA;SOR=0.601;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=39;TCF=24;TCR=15;TR=18;WE=35437247;WS=35437229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,28:0.55:51
chr10	35464778	rs1531550	C	T	2510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.585;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=45;PP=1410;ReadPosRankSum=-2.156;SC=ATCATTTTGGCAGGTTTCTGT;SOR=0.636;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=153;TCF=86;TCR=67;TR=100;WE=35464786;WS=35464768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,112:0.65:172
chr10	35467671	rs12260130	C	T	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=187;ReadPosRankSum=-1.272;SC=CAGACTCCTTCAGTGCAGATT;SOR=1.781;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=11;WE=35467679;WS=35467661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr10	35484949	rs1057108	T	G	1984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.713;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.724;NF=48;NR=29;PP=1302;ReadPosRankSum=0.000;SC=TTTGAAGTGGTTGTCTGCTTG;SOR=0.611;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=111;TCF=71;TCR=40;TR=77;WE=35484957;WS=35484927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,84:0.67:126
chr10	35625845	rs59114674	C	G	646.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=0;PP=260;SC=GGCCGGCCGCCGTTCCGCCCC;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=12;WE=35625854;WS=35625838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	35625846	.	G	GC	637.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.11;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=0;PP=492;SC=GCCGGCCGCCGTTCCGCCCCC;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=11;WE=35625854;WS=35625838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	35772402	rs3802509	G	A	1524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.738;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=30;PP=891;ReadPosRankSum=-1.253;SC=AATCTCAGACGGACGGTAGGT;SOR=0.811;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=99;TCF=51;TCR=48;TR=63;WE=35772410;WS=35772392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,70:0.64:110
chr10	35894666	rs627267	A	G	2389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=50;PP=1462;SC=TCAGTGTGCAAGCACCAAGCT;SOR=1.725;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=23;TCR=50;TR=73;WE=35894674;WS=35894656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr10	35894761	rs637881	G	A	396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.57;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=9;PP=206;SC=GAATGGTTCCGCGGTTCCTCC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=35894769;WS=35894751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	35897125	rs75803523	G	C	707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=0.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.13;ReadPosRankSum=-0.717;SOR=0.820;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:97,41:0.30:138
chr10	35928224	rs625858	C	G	1617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=28;NR=26;PP=874;SC=CTGCACTTGGCTCTCCTCGCC;SOR=0.790;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=54;TCF=28;TCR=26;TR=54;WE=35928232;WS=35928214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr10	35929140	rs73270586	G	A	3608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.491;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=72;PP=1977;ReadPosRankSum=-0.157;SC=TGGCCATGCCGAAGAAGTAGA;SOR=0.647;SbPval=0.47;Source=Platypus;TCF=113;TR=147;WE=35929148;WS=35929130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,166:0.67:248
chr10	35930412	rs142623421	C	CG	103.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.53;ReadPosRankSum=-0.751;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr10	36812362	rs2503084	C	T	6600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=3.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=1.888;NF=120;NR=105;PP=2965;ReadPosRankSum=3.719;SC=TTTTCTCACACGCATTATAAA;SOR=0.766;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=265;TCF=142;TCR=123;TR=225;WE=36812370;WS=36812352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:22,255:0.92:277
chr10	36813180	rs2503083	T	A	4562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=50;NR=67;PP=2144;SC=GCCAGGGGCGTGCGCGCCGGG;SOR=1.133;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=117;TCF=50;TCR=67;TR=117;WE=36813188;WS=36813170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr10	36813198	rs2503082	A	G	3416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=43;PP=1335;SC=GGGCTGGCCCAGCAGGGAAAG;SOR=1.308;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=27;TCR=43;TR=70;WE=36813206;WS=36813188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr10	36813218	rs2505569	C	G	1906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=30;PP=847;SC=GCCCCGCTCACTCTCCACTGC;SOR=2.476;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=40;TCF=9;TCR=31;TR=39;WE=36813226;WS=36813208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr10	36813298	rs10764092	G	A	164.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=7;PP=157;SC=GGAAGGGCATGCGCTCGCCGG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=36813306;WS=36813288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	37425759	.	G	GTGTATA	108	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=27;MQ=64.19;NF=0;NR=3;PP=108;QD=38.0;SC=GTGTGTGTGTGTATATATATA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=37425767;WS=37425749;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr10	37433853	.	T	C	87	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MMLQ=18;MQ=56.18;NF=10;NR=1;PP=87;QD=11.0701102316;SC=TGAAAATAGATTTGTATATGT;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=41;TCF=30;TCR=11;TR=11;WE=37433861;WS=37433843;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:30,11:0.27:41
chr10	37441072	rs1148257	T	G	2534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FS=1.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.32;ReadPosRankSum=1.138;SOR=0.550;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,112:0.63:177
chr10	37488689	rs1209750	G	C	1967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.274;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=36;PP=1044;ReadPosRankSum=0.966;SC=AACAAAAGAAGGTTGAAGAAA;SOR=0.906;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=124;TCF=70;TCR=54;TR=84;WE=37488697;WS=37488679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,91:0.66:137
chr10	37505141	rs1200876	G	A	766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.125;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=13;PP=436;ReadPosRankSum=0.315;SC=CTTGGATACAGTTCATTCTTG;SOR=1.067;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=68;TCF=39;TCR=29;TR=36;WE=37505149;WS=37505131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,38:0.51:74
chr10	37505192	rs1200875	C	T	1148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.854;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=23;PP=686;ReadPosRankSum=2.721;SC=CTGTGAACAACGTACAGGAAA;SOR=0.586;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=87;TCF=46;TCR=41;TR=50;WE=37505200;WS=37505182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,55:0.54:102
chr10	37507982	rs35138017	A	C	1624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.250;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=39;PP=1105;ReadPosRankSum=-1.545;SC=TTGCCATGCTAAAACTGGAAA;SOR=0.731;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=218;TCF=113;TCR=105;TR=82;WE=37507990;WS=37507972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,88:0.36:245
chr10	37508450	rs1148259	A	C	1099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.583;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=23;PP=593;ReadPosRankSum=1.221;SC=TCAATTATGCAGGAGATGCTC;SOR=0.667;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=155;TCF=81;TCR=74;TR=49;WE=37508458;WS=37508440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,59:0.32:183
chr10	38246545	rs2799499	A	G	264.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=7;PP=205;SC=AGACATGTGAACTAGCTCTTA;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=38246553;WS=38246535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr10	38260558	rs67120012	AAC	A,AACAC	342.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.42;ReadPosRankSum=0.487;SOR=1.038;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:6,11,13:0.37,0.43:30
chr10	38306128	rs2738208	A	G	624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=2;PP=451;SC=TTCCACTGGCAACTCGAAGCA;SOR=3.352;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=38306136;WS=38306118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	38385316	rs2474572	A	G	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=176;ReadPosRankSum=-1.371;SC=TACAGCATAAATTGTTTTTAA;SOR=0.169;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=10;WE=38385324;WS=38385307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr10	38385441	rs2474573	G	A	2071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.312;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=39;PP=1309;ReadPosRankSum=-0.273;SC=ATGTTTTGCCGGCTGCGAAGT;SOR=0.848;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=139;TCF=77;TCR=62;TR=89;WE=38385449;WS=38385431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,95:0.62:153
chr10	38407519	rs176889	A	G	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.363;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-1.333;NF=4;NR=4;PP=111;ReadPosRankSum=1.739;SC=GTCAGAAGTCAGCCCTAATTG;SOR=0.223;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=11;TCF=5;TCR=6;TR=8;WE=38407527;WS=38407509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr10	38536882	rs111396337	G	A	807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.504;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.047;NF=26;NR=14;PP=524;ReadPosRankSum=0.112;SC=TGTTTGCCCTGGTGTGCTGCT;SOR=1.111;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=118;TCF=72;TCR=46;TR=40;WE=38536890;WS=38536872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,44:0.33:132
chr10	38537070	rs1780145	A	G	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=263;ReadPosRankSum=-0.697;SC=AAGAGAATATATAAACACACA;SOR=0.430;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=12;WE=38537078;WS=38537060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr10	38599101	rs34686283	C	CT	1532.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.5;BaseQRankSum=1.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.991;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.310;NF=8;NR=21;PP=1078;ReadPosRankSum=-0.403;SC=GACATAGTGTCTTCCCATTGG;SOR=0.979;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=46;TCF=10;TCR=36;TR=29;WE=38599109;WS=38599091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,51:0.70:73
chr10	38645343	rs75687299	C	T	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FS=4.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.02;MQRankSum=-5.190;QD=0.21;ReadPosRankSum=4.182;SOR=0.374;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:152,24:0.14:176
chr10	38645403	rs72639552	T	C	3059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.067;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-8.756;NF=68;NR=69;PP=2116;ReadPosRankSum=-1.266;SC=TGGTTTTGATTACCGGGGCTA;SOR=0.656;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=212;TCF=105;TCR=107;TR=137;WE=38645411;WS=38645393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,140:0.63:223
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chr10	42379801	rs111137627	C	G	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.56;MQRankSum=-1.834;QD=29.29;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr10	42379824	rs62637384	A	C	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.56;MQRankSum=-1.834;QD=22.63;ReadPosRankSum=1.834;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr10	42905431	rs3004228	A	T	313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=0;PP=260;SC=TTTCTTCTTTAGAAAATACCA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=42905439;WS=42905421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	42905510	rs2419684	A	C	2086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=22;PP=1195;SC=TCAGATGTTAAATTACTCCTC;SOR=1.207;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=47;TCR=22;TR=69;WE=42905518;WS=42905500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr10	42907201	rs2505860	G	A	1460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.815;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=32;PP=914;ReadPosRankSum=0.284;SC=AATACAGGCCGTTGTTGTGTG;SOR=0.878;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=259;TCF=143;TCR=116;TR=77;WE=42907209;WS=42907191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:204,87:0.30:291
chr10	42907260	rs2505861	T	C	1164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FS=1.787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.44;ReadPosRankSum=-0.122;SOR=0.558;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:142,72:0.34:214
chr10	42920832	rs2505872	G	A	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.28;ReadPosRankSum=-0.387;SOR=0.644;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,24:0.24:102
chr10	42920884	rs2489720	C	T	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=3.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.15;ReadPosRankSum=-2.469;SOR=0.556;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,21:0.24:87
chr10	42924560	rs6143878	TCACCTTTGCTTGATATGATAATATAGTGCCAAGG	T	1331.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FS=0.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=-1.878;QD=6.14;ReadPosRankSum=2.731;SOR=0.771;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:172,45:0.21:217
chr10	42926170	rs66977053	TGG	T	455.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.911;NF=0;NR=5;PP=149;ReadPosRankSum=0.057;SC=GTGATTGAGTTGGGGTGAAAA;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=42926179;WS=42926160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr10	42928605	rs2000380	T	G	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-5.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.955;HP=3;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=323;ReadPosRankSum=-1.690;SC=TATAGTTGACTCCAATTTCTT;SOR=0.075;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=37;TCF=29;TCR=8;TR=23;WE=42928613;WS=42928595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,29:0.69:42
chr10	42928668	rs67090148	GGAGTCTATC	G	2118.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.144;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=22;PP=2938;ReadPosRankSum=-0.138;SC=TTTGAATGAAGGAGTCTATCC;SOR=1.030;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=69;TCF=17;TCR=52;TR=30;WE=42928684;WS=42928658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,57:0.42:136
chr10	42928759	rs75794730	G	T	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=8.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQRankSum=-10.743;QD=1.90;ReadPosRankSum=1.174;SOR=1.325;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:121,20:0.14:141
chr10	42928764	rs113163067	A	G	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=4.292;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQRankSum=-10.193;QD=2.59;ReadPosRankSum=0.327;SOR=0.973;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,24:0.17:139
chr10	42928814	rs112881188	G	A	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.693;HP=2;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-10.207;NF=10;NR=16;PP=999;ReadPosRankSum=0.270;SC=TGAAGGGGAAGGGAAGTATAA;SOR=0.976;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=97;TCF=46;TCR=51;TR=26;WE=42928834;WS=42928780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,32:0.27:118
chr10	42928826	.	A	T	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.069;ClippingRankSum=0.000;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=0.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.22;MQRankSum=-9.211;QD=3.65;ReadPosRankSum=0.681;SOR=0.890;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,25:0.26:98
chr10	42928842	rs4570532	A	T	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=7.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.56;MQRankSum=-8.033;QD=7.33;ReadPosRankSum=-0.064;SOR=1.578;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,20:0.26:77
chr10	42928845	.	C	T	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.719;ClippingRankSum=0.000;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=10.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.57;MQRankSum=-8.201;QD=8.07;ReadPosRankSum=0.391;SOR=2.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,17:0.24:70
chr10	42928851	.	CA	C	390.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.929;ClippingRankSum=0.000;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=4.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.10;MQRankSum=-7.921;QD=6.01;ReadPosRankSum=1.183;SOR=1.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,14:0.22:65
chr10	42928858	rs371544593	T	G	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=1.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQRankSum=-7.062;QD=7.51;ReadPosRankSum=0.892;SOR=1.075;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,12:0.23:52
chr10	42928869	.	ATTTT	A	226.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=1.927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.94;MQRankSum=-5.474;QD=7.09;ReadPosRankSum=-0.653;SOR=1.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,8:0.25:32
chr10	42928874	.	T	TGA	226.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.644;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=1.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.74;MQRankSum=-5.282;QD=7.56;ReadPosRankSum=-0.751;SOR=1.312;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,8:0.27:30
chr10	42928879	.	G	A	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.703;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.46;MQRankSum=-4.801;QD=8.11;ReadPosRankSum=-1.114;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,6:0.24:25
chr10	42928885	.	G	A	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=2.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.11;MQRankSum=-4.367;QD=8.08;ReadPosRankSum=-1.776;SOR=1.845;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,5:0.24:21
chr10	42941685	rs11455507	T	TA	94.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=1.494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.37;ReadPosRankSum=-1.557;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,8:0.20:40
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chr10	42947215	rs370951841	T	C	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQRankSum=-6.026;QD=0.99;ReadPosRankSum=0.691;SOR=0.209;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,4:0.11:38
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chr10	42965636	rs1255411	C	T	1596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.744;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=24;PP=912;ReadPosRankSum=0.535;SC=TAAATCTCTCCGGGCTCTGGG;SOR=0.580;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=59;TCR=39;TR=61;WE=42965644;WS=42965626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,70:0.64:110
chr10	43088979	rs148668463	C	G	3299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.852;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=60;PP=1871;ReadPosRankSum=0.757;SC=ATTTCCCACACTCAAGACATT;SOR=0.551;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=183;TCF=97;TCR=86;TR=130;WE=43088987;WS=43088969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,148:0.70:211
chr10	43089965	rs210280	G	A	2091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=34;PP=1249;SC=CTCATTCCACGTGAGTCATAC;SOR=0.859;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=67;TCF=33;TCR=34;TR=67;WE=43089973;WS=43089955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr10	43119123	rs158377	G	T	2051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=35;PP=1002;SC=CTGTTGGGAGGGGGGAATGAG;SOR=0.968;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=69;TCF=34;TCR=35;TR=69;WE=43119131;WS=43119113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr10	43119159	rs158378	T	C	1588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=32;PP=941;SC=GGCAATACAGTTTCTGTTTGA;SOR=1.739;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=16;TCR=32;TR=48;WE=43119167;WS=43119149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr10	43128395	rs209391	C	G	794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=22;PP=594;SC=AAATGGCCTGCTGCTGTCTTG;SOR=3.690;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=25;WE=43128403;WS=43128385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr10	43132232	rs209387	A	G	1352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.990;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=6;PP=944;ReadPosRankSum=0.124;SC=ACAGAGATGGAGACACTGCGC;SOR=2.842;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=40;TCF=33;TCR=7;TR=39;WE=43132240;WS=43132222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,44:0.98:45
chr10	43232450	rs702370	G	A	2297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.945;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.918;NF=53;NR=38;PP=1385;ReadPosRankSum=0.700;SC=ACCTTTTAATGTGAAAATGTG;SOR=0.412;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=145;TCF=88;TCR=57;TR=91;WE=43232458;WS=43232440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,105:0.64:163
chr10	43280057	rs55869085	CTT	C	7311.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=88;PP=2979;SC=TCCATTGATTCTTTTTTTAAA;SOR=0.865;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=107;TCF=14;TCR=93;TR=102;WE=43280066;WS=43280047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr10	43288626	rs9422671	T	G	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.73;ReadPosRankSum=0.365;SOR=0.657;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,25:0.29:85
chr10	43572950	rs12246855	AA	GC	474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=5;PP=323;SC=GCGGCGGGCGAAGGGCAGGAC;SOR=1.445;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=9;TCF=4;TCR=5;TR=9;WE=43572959;WS=43572940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr10	43595781	rs2565206	G	T	390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=12;NR=0;PP=202;SC=GAGTGTTCATGTTCTCAGGAA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=12;WE=43595789;WS=43595771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	43595968	rs1800858	A	G	4027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=85;NR=48;PP=2114;SC=TGGACCAGGCAGCCGGCACGC;SOR=1.085;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=85;TCR=48;TR=133;WE=43595976;WS=43595958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr10	43604390	rs1864404	A	T	654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=6;PP=411;SC=CACCAGTGTGAGTGCAGGGCT;SOR=2.124;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=24;WE=43604398;WS=43604380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr10	43606687	rs1800860	A	G	1246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FS=5.790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.40;ReadPosRankSum=-1.323;SOR=0.428;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:154,77:0.33:231
chr10	43607756	rs3026750	G	A	858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=16;PP=410;SC=CCAGCCTGGGGTGGCTCTCCC;SOR=2.093;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=43607767;WS=43607746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	43607759	rs34827976	GC	G	849.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=15;PP=644;SC=GCCTGGGGTGGCTCTCCCTGC;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=15;WE=43607767;WS=43607746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	43612226	rs760466	C	T	86.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.51;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr10	43613843	rs1800861	G	T	3752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=46;PP=2198;SC=CGAGTGAGCTGCGAGACCTGC;SOR=1.059;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=123;TCF=77;TCR=46;TR=123;WE=43613851;WS=43613833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr10	43620551	rs2742236	G	A	482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=13;PP=347;SC=GGATTGTGCAGAGAGAGAGAG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=43620559;WS=43620541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	43622217	rs2075912	T	C	5551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=91;PP=2965;SC=GCTGTCCCCTTTGCACTATCC;SOR=0.842;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=177;TCF=86;TCR=91;TR=177;WE=43622225;WS=43622207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr10	43657811	rs2257767	T	G	514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=16;PP=436;SC=ATGGCCAGGTTGGGTGGGGGT;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=43657819;WS=43657801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	43659536	rs2503865	C	T	2443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=52;PP=1492;SC=GAATTTAGAACGTTGTCAGCA;SOR=1.508;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=30;TCR=52;TR=82;WE=43659544;WS=43659526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr10	43671378	rs61579799	GT	G	102.14	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=46;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=5;PP=113;ReadPosRankSum=-1.465;SC=ATTGTTTTCTGTTTTTTTTTT;SOR=1.179;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=12;TCF=5;TCR=7;TR=10;WE=43671386;WS=43671368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,6:0.86:7
chr10	43932479	rs2244396	A	G	521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=9;PP=262;SC=GGGAGCAGCAAGGCTTCCGGA;SOR=1.127;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=7;TCR=9;TR=16;WE=43932487;WS=43932469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	43978087	rs3750890	A	G	3157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=53;PP=1982;SC=TACATCAGAGAATACATACTG;SOR=0.800;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=53;TCR=53;TR=106;WE=43978095;WS=43978077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr10	43991255	rs9422519	C	T	50.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=16.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr10	44052903	rs2230661	A	C	4607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=76;PP=2867;SC=CACTGACTACATTCGTATTGT;SOR=0.834;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=148;TCF=72;TCR=76;TR=148;WE=44052911;WS=44052893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr10	44053013	rs2230660	G	C	5446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=110;NR=73;PP=2965;ReadPosRankSum=1.890;SC=CTCTGTATGAGCTCTCTGCTG;SOR=0.357;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=184;TCF=111;TCR=73;TR=183;WE=44053021;WS=44053003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,199:1.00:200
chr10	44053585	rs2999278	C	T	3003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=54;PP=1876;SC=GTGTTTTCTGCTGAAGATTCT;SOR=1.042;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=99;TCF=45;TCR=54;TR=99;WE=44053593;WS=44053575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr10	44103923	rs3128239	G	C	676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=3;PP=521;SC=CACATCCCCTGAGCCCTCAGC;SOR=2.636;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=44103931;WS=44103913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr10	44104173	.	A	T	1166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=0.000;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.952;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=27;PP=667;ReadPosRankSum=-1.320;SC=GAACTATGGGAATCTGGTGTC;SOR=0.938;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=66;TCF=30;TCR=36;TR=47;WE=44104181;WS=44104163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,52:0.68:76
chr10	44793299	rs2505734	C	T	5333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=81;PP=2965;SC=TGTCCACTCTCGCTCAGCGTG;SOR=0.734;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=176;TCF=95;TCR=81;TR=176;WE=44793307;WS=44793289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr10	44868856	rs266091	A	C	2210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.715;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=55;PP=1476;ReadPosRankSum=0.267;SC=CCAGCTCCAGAAGGACAGCGG;SOR=1.028;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=148;TCF=60;TCR=88;TR=85;WE=44868864;WS=44868846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,96:0.57:169
chr10	44870015	rs266088	C	T	2111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.328;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=38;PP=1216;ReadPosRankSum=-0.303;SC=GAGATAGCAGCGGGAAACAAA;SOR=0.848;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=133;TCF=72;TCR=61;TR=85;WE=44870023;WS=44870005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,95:0.63:151
chr10	44870240	rs197452	C	T	1003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.312;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=24;PP=601;ReadPosRankSum=0.130;SC=ACCCAGGATCCGGGTGCAGGG;SOR=0.443;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=57;TCF=20;TCR=37;TR=40;WE=44870248;WS=44870230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,44:0.68:65
chr10	44874253	rs266085	C	T	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.823;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=181;ReadPosRankSum=-1.396;SC=CCCCCAACACCCATCTAGGGC;SOR=0.191;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=12;WE=44874261;WS=44874243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr10	44876455	rs17880358	T	A	638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=-3.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.890;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=307;ReadPosRankSum=0.362;SC=AAGTTCCAGGTTACTGGTGTA;SOR=0.333;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=21;WE=44876463;WS=44876445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,27:0.73:37
chr10	44880260	rs72790862	T	C	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.812;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=87;ReadPosRankSum=0.210;SC=AGCGCCCAGCTAAGCGAGCTG;SOR=0.569;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=6;WE=44880268;WS=44880250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr10	44880281	rs78453259	C	T	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=180;ReadPosRankSum=-0.648;SC=CCTCCACCCCCACTGTGTCGG;SOR=0.430;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=11;WE=44880289;WS=44880271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr10	44880494	rs74393923	G	A	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.502;NF=3;NR=5;PP=86;ReadPosRankSum=1.900;SC=AGCGCGGGTCGGGGGCCGGAC;SOR=0.818;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=12;TCF=5;TCR=7;TR=8;WE=44880502;WS=44880484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr10	45423282	rs10900131	C	G	337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=268;SC=AGGAAGAAGACTCACTCCACA;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=45423290;WS=45423272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr10	45427548	rs12414447	G	T	754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=15;PP=438;SC=CCCCTCCATTGTCCACCCCAG;SOR=1.255;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=10;TCR=15;TR=25;WE=45427556;WS=45427538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr10	45473317	rs3740094	C	T	1165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FS=0.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.59;ReadPosRankSum=-0.071;SOR=0.744;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:178,76:0.30:254
chr10	45478092	rs870957	A	G	1106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.384;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=28;PP=676;ReadPosRankSum=0.900;SC=ATGGATGCCCAGACGGCCTAG;SOR=0.191;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=62;TCF=21;TCR=41;TR=45;WE=45478100;WS=45478082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,49:0.73:67
chr10	45479434	rs871043	G	A	1397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.793;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=21;PP=806;ReadPosRankSum=0.388;SC=TTTCTCTGCCGGCAGCCATCT;SOR=0.836;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=80;TCF=48;TCR=32;TR=54;WE=45479442;WS=45479424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,62:0.64:97
chr10	45496120	rs12269028	A	T	5228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=69;PP=2965;ReadPosRankSum=0.202;SC=AAATCTCAAAATTTGTGGAAA;SOR=0.908;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=168;TCF=98;TCR=70;TR=166;WE=45496128;WS=45496110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,193:0.99:195
chr10	45924023	rs1565096	G	A	1111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=11;PP=601;ReadPosRankSum=0.334;SC=TTTTTGGTCCGTCTGCTGAGC;SOR=0.905;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=51;TCF=38;TCR=13;TR=42;WE=45924031;WS=45924013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,48:0.81:59
chr10	45924256	rs1565097	T	C	182.85	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.8059;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=8;PP=121;ReadPosRankSum=1.335;SC=CTCAGTCCTCTGCGATCCAGG;SOR=1.426;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=10;WE=45924264;WS=45924246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr10	45935744	rs3780914	C	T	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=213;ReadPosRankSum=-0.621;SC=TTACCCCCTCCAGGCTCTTCT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=10;WE=45935752;WS=45935734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr10	45936698	rs41502051	A	G	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.589;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.233;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=99;ReadPosRankSum=-1.378;SC=GCATCATCCTATAGGGCAGGC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=6;WE=45936706;WS=45936691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr10	45938791	.	GA	G	908.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=0.000;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.062;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=683;ReadPosRankSum=1.964;SC=CAGCGTCCGTGAGGGGGTTGC;SOR=0.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=27;TCF=10;TCR=17;TR=18;WE=45938799;WS=45938781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,27:0.69:39
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chr10	46135971	rs12354709	C	T	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=86;ReadPosRankSum=1.465;SC=GACAGTCTCACTCTTGTCGCC;SOR=0.527;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=5;WE=46135979;WS=46135961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
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chr10	46965727	rs1889849	G	A	2503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.453;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=46;PP=1685;ReadPosRankSum=0.207;SC=CCAGGCTCTCGGCCTCCAGGT;SOR=0.654;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=252;TCF=149;TCR=103;TR=113;WE=46965735;WS=46965717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,120:0.45:264
chr10	46965887	rs112965082	T	TG	1751.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.066;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.830;NF=6;NR=39;PP=1008;ReadPosRankSum=0.754;SC=GCTGGACACCTGGGGGGGACA;SOR=0.519;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=103;TCF=9;TCR=94;TR=45;WE=46965895;WS=46965877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,75:0.48:157
chr10	46967672	rs2152530	C	T	3688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=357;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.384;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=87;PP=2219;ReadPosRankSum=0.015;SC=TTTTGTCCTCCGGGAACTTGT;SOR=0.661;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=316;TCF=148;TCR=168;TR=159;WE=46967680;WS=46967662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:179,178:0.50:357
chr10	46968762	rs3127790	C	G	1607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=38;PP=985;ReadPosRankSum=-2.730;SC=GGTGGCAAGTCAATGGTGTGG;SOR=0.690;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=163;TCF=73;TCR=90;TR=71;WE=46968770;WS=46968752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,79:0.44:179
chr10	46969496	rs3127792	A	G	1574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.646;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=44;PP=1045;ReadPosRankSum=1.305;SC=TGCCTGGGAAAGCCACTCTCC;SOR=1.002;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=162;TCF=63;TCR=99;TR=68;WE=46969504;WS=46969486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,76:0.44:174
chr10	46970654	rs915449	C	A	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=9;PP=256;ReadPosRankSum=-0.038;SC=CGCCCCAGCCCGTCCCTGGCC;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=19;TCR=14;TR=21;WE=46970662;WS=46970644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,25:0.68:37
chr10	46970792	rs915450	G	C	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.71;ReadPosRankSum=0.981;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr10	46998719	rs201733825	GTCAC	G	847.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.115;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=1;PP=993;ReadPosRankSum=-1.440;SC=CTGGTGTCTTGTCACTCACTG;SOR=1.478;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=46;TCF=41;TCR=5;TR=22;WE=46998730;WS=46998711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,23:0.46:50
chr10	46998795	rs3127677	A	G	2117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.735;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.948;NF=58;NR=43;PP=1287;ReadPosRankSum=1.448;SC=TGAACCTAGCACTGTGGGAGT;SOR=0.561;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=189;TCF=113;TCR=76;TR=101;WE=46998803;WS=46998785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,109:0.53:205
chr10	46998894	rs3127817	G	A	2666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.430;HP=6;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=60;PP=1633;ReadPosRankSum=-0.442;SC=AGCTCCAGCCGCCCCGAGCCG;SOR=0.658;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=268;TCF=137;TCR=131;TR=123;WE=46998902;WS=46998884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,131:0.46:285
chr10	46998995	rs4926045	C	G	3288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=63;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.083;SC=GAGGCCAGAGCTCCGCAAGAC;SOR=0.698;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=268;TCF=148;TCR=120;TR=144;WE=46999007;WS=46998985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,151:0.53:287
chr10	46998999	rs3127818	G	A	5002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.376;HP=3;HapScore=4;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=58;PP=2962;ReadPosRankSum=0.137;SC=CCAGAGCTCCGCAAGACTGCC;SOR=0.780;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=276;TCF=151;TCR=125;TR=130;WE=46999007;WS=46998985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,144:0.49:296
chr10	46999019	rs3127819	G	A	3230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.850;HP=2;HapScore=4;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=60;PP=2962;ReadPosRankSum=0.238;SC=CAGCAGCACCGTGTGGCAGGC;SOR=0.748;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=288;TCF=157;TCR=131;TR=135;WE=46999038;WS=46999009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,152:0.48:314
chr10	46999030	rs4925989	C	T	3552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.401;HP=2;HapScore=4;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=71;PP=2962;ReadPosRankSum=0.163;SC=TGTGGCAGGCCCAGCTGGGCG;SOR=0.741;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=298;TCF=162;TCR=136;TR=157;WE=46999038;WS=46999009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,166:0.51:326
chr10	46999151	rs3127820	T	C	2629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.489;HP=4;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=56;PP=1533;ReadPosRankSum=0.134;SC=AGGCCACTGGTGGAGCAGCAC;SOR=0.628;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=205;TCF=100;TCR=105;TR=109;WE=46999159;WS=46999141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,123:0.55:225
chr10	46999178	rs7090312	A	C	1996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=4.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=45;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.161;SC=CAATGTGTCCACCATGGGCGG;SOR=0.665;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=198;TCF=93;TCR=105;TR=84;WE=46999206;WS=46999168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,92:0.42:218
chr10	46999189	rs3127678	C	T	5147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.28;ReadPosRankSum=-1.663;SOR=0.646;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,132:0.62:212
chr10	46999190	rs3127679	A	G	8457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.34;SOR=0.740;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr10	46999198	rs3127680	G	T	4976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FS=1.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.62;ReadPosRankSum=0.250;SOR=0.771;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,132:0.60:220
chr10	46999465	rs3127682	A	G	2180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.508;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=53;PP=1407;ReadPosRankSum=1.565;SC=GTCAGTTGTCAGTGCCACCAC;SOR=0.631;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=199;TCF=89;TCR=110;TR=98;WE=46999473;WS=46999455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,104:0.49:212
chr10	46999484	rs11204658	G	T	1953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.556;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.735;NF=39;NR=42;PP=1304;ReadPosRankSum=-1.882;SC=ACTAGACCTGGGGGACACAAC;SOR=0.608;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=163;TCF=78;TCR=85;TR=81;WE=46999492;WS=46999474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,88:0.50:176
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chr10	46999591	rs112620425	C	CATGAGGGAG	3075.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FS=1.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.97;MQRankSum=5.696;QD=15.46;ReadPosRankSum=0.247;SOR=0.572;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:121,78:0.39:199
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chr10	46999732	rs4579877	G	A	4692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=389;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=100;PP=2962;ReadPosRankSum=0.072;SC=GGTTGTCTGGGGGGCTCCCTG;SOR=0.710;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=364;TCF=179;TCR=185;TR=197;WE=46999740;WS=46999722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,213:0.55:389
chr10	46999747	rs3127821	T	C	3409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=379;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.374;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=81;PP=2132;ReadPosRankSum=0.407;SC=TCCCTGGGCATTCCCATTGCT;SOR=0.666;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=347;TCF=161;TCR=186;TR=154;WE=46999755;WS=46999737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:211,168:0.44:379
chr10	46999863	rs4445576	C	G	2400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.377;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=54;PP=1586;ReadPosRankSum=0.592;SC=GCAGAGGCATCCCCGCTGTCA;SOR=0.940;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=177;TCF=82;TCR=95;TR=95;WE=46999871;WS=46999853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,104:0.56:185
chr10	47000004	rs3127822	T	C	4809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=84;NR=68;PP=2412;SC=CTGGAGGAGGTGCCGTCCCCT;SOR=0.738;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=152;TCF=84;TCR=68;TR=152;WE=47000012;WS=46999994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr10	47000071	rs4244614	G	A	2587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=51;PP=2962;ReadPosRankSum=1.216;SC=ACGGAGCTGCGGTGGACCTGG;SOR=0.727;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=200;TCF=103;TCR=97;TR=105;WE=47000087;WS=47000061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,118:0.52:226
chr10	47000079	rs3127823	T	C	2290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.585;HP=2;HapScore=4;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=52;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.787;SC=GCGGTGGACCTGGAGGTGCTC;SOR=0.825;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=207;TCF=103;TCR=104;TR=99;WE=47000087;WS=47000061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,112:0.48:233
chr10	47000146	rs3127684	C	T	1927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.320;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=49;PP=1226;ReadPosRankSum=0.192;SC=AGCGGGCGCCCGCCAGCGAGG;SOR=0.939;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=178;TCF=81;TCR=97;TR=86;WE=47000154;WS=47000136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,92:0.49:188
chr10	47000188	rs3127824	A	G	3080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=68;PP=2113;SC=GGAGGGGGCCACTGCGGGCTG;SOR=1.445;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=40;TCR=68;TR=108;WE=47000196;WS=47000178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr10	47000239	rs7912299	C	T	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.319;HP=2;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=304;ReadPosRankSum=1.798;SC=GCGGCTGCTCCGGCGCGGCCC;SOR=0.201;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=42;TCF=10;TCR=32;TR=22;WE=47000247;WS=47000229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,23:0.53:43
chr10	47087078	rs2229967	G	T	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=503;ExcessHet=3.0103;FS=1.667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.82;ReadPosRankSum=0.617;SOR=0.633;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:433,70:0.14:503
chr10	47087160	rs149694580	C	T	817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=514;ExcessHet=3.0103;FS=0.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.59;ReadPosRankSum=0.723;SOR=0.779;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:423,90:0.18:513
chr10	47087474	rs1129838	C	T	12084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=448;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=197;NR=220;PP=2965;SC=GGGCTTCATCCTGGTCTGTTA;SOR=0.841;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=418;TCF=197;TCR=221;TR=417;WE=47087482;WS=47087464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,447:1.00:447
chr10	47087501	rs3824733	C	T	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=387;ExcessHet=3.0103;FS=1.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.24;ReadPosRankSum=0.603;SOR=0.574;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:312,75:0.19:387
chr10	47087608	rs1936339	T	C	10800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.23;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,325:1.00:325
chr10	47087608	.	TG	CA,CG	2624	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=53,157;NR=49,138;PP=1265,2624;QD=12.9261556359;SC=TGGCCTTTGCTGTGCTCTGGC;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=299;TCF=159;TCR=140;TR=102,295;WE=47087617;WS=47087598;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.34:299
chr10	47087609	rs79871698	G	A	2138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.60;ReadPosRankSum=0.753;SOR=0.687;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:210,114:0.35:324
chr10	47087680	rs1048157	C	T	10083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=357;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=190;NR=144;PP=2965;SC=CCATCTGCCACGGGAACCTCA;SOR=0.936;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=336;TCF=191;TCR=145;TR=334;WE=47087688;WS=47087670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,355:1.00:355
chr10	47087731	rs1048158	C	T	12579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=460;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=238;NR=200;PP=2965;SC=CCTCCACCTGCGTCAACCCAT;SOR=0.817;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=438;TCF=238;TCR=200;TR=438;WE=47087739;WS=47087721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,459:1.00:459
chr10	47087830	rs1129839	G	A	10621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=392;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=165;NR=211;PP=2965;SC=TGGAGGAGTCGGAGCATCTGC;SOR=1.027;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=376;TCF=165;TCR=211;TR=376;WE=47087838;WS=47087820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,391:1.00:391
chr10	47405767	rs199589563	T	A	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.638;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.58;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr10	47667164	rs4076960	C	T	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=100;ReadPosRankSum=-0.447;SC=GGAGGACTGGCGCAAAGAACA;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=6;WE=47667172;WS=47667160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr10	47667380	rs4076959	C	T	1817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=35;PP=976;ReadPosRankSum=0.031;SC=AACCCTAACCCTAACCTACAA;SOR=0.681;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=175;TCF=89;TCR=86;TR=73;WE=47667388;WS=47667370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,89:0.44:202
chr10	47668707	rs4409768	T	C	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=254;ReadPosRankSum=0.134;SC=ATAATCTGGATCAGGTAATTC;SOR=0.804;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=8;WE=47668729;WS=47668697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,8:0.28:29
chr10	47668721	rs4570521	G	A	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=254;ReadPosRankSum=0.470;SC=GTAATTCCAAGCAGGTAACCA;SOR=0.616;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=5;WE=47668729;WS=47668697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr10	47669277	rs61845226	C	G	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.566;NF=1;NR=6;PP=88;ReadPosRankSum=-0.726;SC=ATCGGTGGAGCCTTCCTCTGA;SOR=0.527;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=7;WE=47669285;WS=47669267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
chr10	47669320	rs113650392	G	A	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.68;MQRankSum=-1.611;QD=10.35;ReadPosRankSum=1.150;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
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chr10	47677955	rs6602879	A	G	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.186;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=239;ReadPosRankSum=-0.672;SC=CCACAGGGTCAGCCCTGCATG;SOR=1.670;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=71;TCF=52;TCR=19;TR=20;WE=47677963;WS=47677945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,20:0.27:75
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chr10	47756004	rs3013885	T	C	1396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.48;QD=26.86;SOR=1.036;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
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chr10	47915811	.	A	G	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.931;NF=7;NR=5;PP=96;ReadPosRankSum=0.420;SC=TGGGTATCTTACGTGTTAATG;SOR=0.760;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=37;TCF=24;TCR=13;TR=12;WE=47915819;WS=47915801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr10	47915891	.	C	A	88	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=8;MMLQ=27;MQ=40.29;NF=2;NR=10;PP=88;QD=10.2309343789;SC=ACCTTATCTTCCAGCAAAAAT;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=51;TCF=17;TCR=34;TR=12;WE=47915906;WS=47915881;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:39,12:0.24:51
chr10	47915898	rs183064568	A	G	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.41;MQRankSum=-0.809;QD=3.06;ReadPosRankSum=-1.006;SOR=0.619;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,12:0.26:47
chr10	48386110	rs2070706	T	C	1150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=30;PP=738;SC=GCAGGCGCCATGGGAAATATT;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=8;TCR=30;TR=38;WE=48386118;WS=48386100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr10	48414570	rs7923671	A	G	1429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=32;PP=880;SC=GTCTGTTTCCATGACACTGAA;SOR=1.747;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=17;TCR=32;TR=49;WE=48414578;WS=48414560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr10	48426798	rs743509	C	T	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=293;ReadPosRankSum=-0.481;SC=ACCTCAGCTCCGCCCTCACCC;SOR=1.828;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=14;WE=48426806;WS=48426788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr10	48429650	rs2236723	G	A	585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=15;PP=375;SC=AGGAGCAAACGCCCACCGATC;SOR=2.636;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=48429658;WS=48429640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr10	48438734	rs1126827	C	T	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.991;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=43;ReadPosRankSum=-0.437;SC=CGGCAAAGGGCCGAAGTCCAG;SOR=0.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=6;WE=48438742;WS=48438724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr10	49450443	rs280612	A	G	858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=27;PP=738;SC=CAGAGCTGCCACTACGAGGCC;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=49450451;WS=49450433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr10	49609578	rs3730154	C	A	536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=7;PP=436;SC=ACTATCAGTACGTAAACAGTA;SOR=1.402;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=14;TCR=7;TR=21;WE=49609586;WS=49609568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	49609830	.	G	A	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.701;ClippingRankSum=0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.484;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=13;PP=275;ReadPosRankSum=-0.299;SC=AGTATGGTAAGTGTTTACTTC;SOR=0.386;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=30;TCF=11;TCR=19;TR=21;WE=49609838;WS=49609820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,26:0.70:37
chr10	49612844	rs3730156	A	C	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.405;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=167;ReadPosRankSum=-0.444;SC=AATTCAGTTTACAGATTTTTG;SOR=1.179;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=43;TCF=31;TCR=12;TR=13;WE=49612852;WS=49612834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,14:0.31:45
chr10	49618017	rs3730158	A	G	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=4.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.65;ReadPosRankSum=0.383;SOR=1.338;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,21:0.22:97
chr10	49634179	rs113214129	G	A	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.497;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=117;ReadPosRankSum=0.902;SC=ATGGGTTTGTGTGTTTATATG;SOR=1.414;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=33;TCF=10;TCR=23;TR=10;WE=49634187;WS=49634169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,11:0.31:35
chr10	49635277	rs3730161	T	G	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.923;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=23;PP=392;ReadPosRankSum=0.453;SC=AATTTGTGACTTTAATATGCA;SOR=0.525;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=88;TCF=23;TCR=65;TR=29;WE=49635285;WS=49635267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,32:0.32:100
chr10	49658248	rs1867585	G	A	872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.394;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=10;PP=571;ReadPosRankSum=0.561;SC=CCAAGAGCACGGCTCTCCCTG;SOR=1.071;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=52;TCF=35;TCR=17;TR=34;WE=49658256;WS=49658238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,37:0.65:57
chr10	49659351	rs1867587	C	T	772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.231;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=27;PP=532;ReadPosRankSum=-1.186;SC=CACACACCCTCCAACTCCAGG;SOR=1.179;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=159;TCF=80;TCR=79;TR=45;WE=49659359;WS=49659341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,48:0.28:174
chr10	49659559	rs10776601	C	T	2600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.426;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=45;PP=1547;ReadPosRankSum=0.567;SC=GGCTGCCCCACGTCACCCCTC;SOR=0.871;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=183;TCF=103;TCR=80;TR=108;WE=49659567;WS=49659549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,120:0.59:204
chr10	49661341	rs7092959	A	G	2179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=22;PP=1375;SC=TACACCTCCCACTTACCTTCC;SOR=1.816;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=53;TCR=22;TR=75;WE=49661349;WS=49661331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr10	49662854	rs12355719	G	A	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.129;HP=1;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=196;ReadPosRankSum=-0.772;SC=TCCCCGACCTGAGCAGGATGC;SOR=3.442;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=12;WE=49662862;WS=49662848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr10	49662879	rs12356940	C	G	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=11.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.38;ReadPosRankSum=2.846;SOR=2.969;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr10	49662884	rs11101327	A	G	791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.99;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr10	49667713	rs1867575	G	A	4628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.86;SOR=0.953;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr10	49667795	rs3853761	T	C	4588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=79;PP=2137;SC=TGGCCTGGCCTGGCATGCGGA;SOR=0.950;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=153;TCF=74;TCR=79;TR=153;WE=49667803;WS=49667785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr10	49687556	rs4240511	A	C	1081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=10;PP=700;SC=CTGCTGTGAGAAGCACAGGAT;SOR=1.730;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=36;WE=49687564;WS=49687546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr10	49687594	rs4838601	G	A	1794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=37;NR=21;PP=897;SC=AGTGAGCAGGGTCTTTGGGGC;SOR=0.980;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=37;TCR=21;TR=58;WE=49687602;WS=49687584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr10	49687800	rs4080665	G	A	1196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=22;PP=931;SC=CCCGCTCCCCGGCACCACCTG;SOR=0.902;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=18;TCR=22;TR=40;WE=49687808;WS=49687790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr10	49687925	rs4575219	C	G	2188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.803;HP=1;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=35;PP=1359;ReadPosRankSum=2.250;SC=CCAGCAACAGCTGAGCTTTGC;SOR=0.547;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=106;TCF=61;TCR=45;TR=80;WE=49687933;WS=49687915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,94:0.76:123
chr10	49687964	rs4240513	A	C	7026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.47;SOR=0.771;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr10	49687971	rs4240514	T	C	7081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.54;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr10	49688014	rs4838602	C	A	4211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=60;PP=2533;SC=TTTTTCCCTTCGTCTCACTTT;SOR=0.785;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=138;TCF=78;TCR=60;TR=136;WE=49688022;WS=49688004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr10	49690351	rs1445157	T	C	4619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=62;PP=2649;SC=GTTCATTCTTTTGCATATGCA;SOR=0.938;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=86;TCR=62;TR=148;WE=49690359;WS=49690341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr10	49701445	rs9663545	C	T	908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.479;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=19;PP=470;ReadPosRankSum=1.191;SC=CCAGCCTGGTCCTCACAGCCT;SOR=0.857;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=105;TCF=56;TCR=49;TR=39;WE=49701453;WS=49701435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,47:0.39:121
chr10	49701652	rs10735226	G	T	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=132;ReadPosRankSum=0.177;SC=CCACTCGGCTGCCTGTGTGCT;SOR=1.179;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=9;WE=49701660;WS=49701642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr10	49791572	rs11593803	C	T	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=113;ReadPosRankSum=0.609;SC=ATTTGTTCAACGATTCATTTA;SOR=0.904;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=9;WE=49791580;WS=49791562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr10	49791865	rs73300277	C	G	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.773;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=129;ReadPosRankSum=-1.590;SC=GTTTGCTGTGCCTTGTTGGTG;SOR=0.269;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=40;TCF=8;TCR=32;TR=12;WE=49791873;WS=49791855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,12:0.28:43
chr10	49804554	rs10776627	A	G	667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=8;PP=621;SC=CCTCACTGAGAGGTGGAGTGT;SOR=1.329;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=16;TCR=8;TR=24;WE=49804562;WS=49804544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr10	49804785	rs10745280	T	G	3957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=82;PP=2442;SC=CCCATTCTGGTGTCTCTCTCG;SOR=1.528;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=45;TCR=82;TR=127;WE=49804793;WS=49804775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr10	49860130	rs2377612	G	C	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5006;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=233;ReadPosRankSum=1.757;SC=CCATTTCCAGGAGCTGAAGGA;SOR=0.657;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=17;TCF=11;TCR=6;TR=13;WE=49860138;WS=49860120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr10	49860153	rs2377613	G	A	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=296;ReadPosRankSum=1.778;SC=TCAGAACCCTGACCACAGATG;SOR=0.883;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=19;WE=49860161;WS=49860143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,22:0.69:32
chr10	49860258	rs2377614	A	G	1580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.916;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=24;PP=1001;ReadPosRankSum=1.283;SC=TTTCCCACATAGAACATAAAA;SOR=0.446;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=86;TCF=55;TCR=31;TR=63;WE=49860272;WS=49860248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,68:0.71:96
chr10	49944315	rs1871600	A	T	404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=12;PP=312;SC=TTTCTTTGCAACATACAGTCC;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=49944323;WS=49944305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	49983890	rs1871604	G	T	2499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=23;NR=54;PP=1620;SC=TTAATGGGAAGTAAAAGATGA;SOR=1.863;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=23;TCR=55;TR=77;WE=49983898;WS=49983880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr10	50025243	rs41283277	G	A	733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=9;PP=443;ReadPosRankSum=-2.922;SC=TAGGGAGGCAGCGCCCATCAT;SOR=0.623;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=39;TCF=28;TCR=11;TR=30;WE=50025251;WS=50025233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,32:0.74:43
chr10	50031212	rs113439641	CT	C	321.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.37;ReadPosRankSum=1.042;SOR=0.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,32:0.24:136
chr10	50098792	.	C	G	1872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.403;ClippingRankSum=0.000;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.029;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=40;PP=1045;ReadPosRankSum=-0.427;SC=CCACTTCTCCCAGCAGATTCT;SOR=1.300;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=102;TCF=44;TCR=58;TR=64;WE=50098800;WS=50098782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,78:0.63:123
chr10	50108145	rs2671693	G	C	402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=3;PP=260;SC=TCAAAAGGACGACCCAGGAAG;SOR=1.911;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=14;WE=50108153;WS=50108135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	50109902	rs2663046	G	A	2873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=53;PP=1515;SC=GACACCCTCAGTCTAAGGTAA;SOR=1.300;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=39;TCR=53;TR=92;WE=50109910;WS=50109892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr10	50149674	rs2671717	A	G	367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=4;PP=296;SC=GGGTGGGGCAAGAAGAGCTGG;SOR=2.147;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=14;WE=50149682;WS=50149664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	50154768	rs2663066	A	T	934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=7;PP=699;SC=TGAATGTTTTACTTTAGGTCT;SOR=2.448;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=32;WE=50154776;WS=50154758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr10	50155036	.	T	TAC	86	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=22;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=86;QD=44.5;SC=CCACTCTCTGTACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=2;WE=50155044;WS=50155026;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,2:0.22:9
chr10	50165128	rs3829206	G	A	638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.236;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=420;ReadPosRankSum=-1.366;SC=GCCAGCAGGAGGGTGCCAGTG;SOR=1.012;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=47;TCF=34;TCR=13;TR=24;WE=50165136;WS=50165118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,27:0.52:52
chr10	50165411	rs3750867	T	C	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.121;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=115;ReadPosRankSum=-1.562;SC=CAACATCATCTGGACCTTTGC;SOR=0.519;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=43;TCF=14;TCR=29;TR=13;WE=50165419;WS=50165401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,21:0.38:55
chr10	50167621	rs10776660	A	G	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=327;ReadPosRankSum=0.533;SC=GGCAGAGAAGATTGAAAGCAG;SOR=0.544;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=21;WE=50167629;WS=50167611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,23:0.55:42
chr10	50167952	rs4317902	C	G	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.356;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.150;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.502;NF=0;NR=7;PP=136;ReadPosRankSum=-0.640;SC=GGGCCAGTGACCAGCACTGTG;SOR=2.636;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=7;WE=50167960;WS=50167942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr10	50184949	rs2271565	C	T	2137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.720;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=36;PP=1279;ReadPosRankSum=-0.075;SC=CCATAACCTGCTGCTGCCTGA;SOR=0.615;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=75;TCR=49;TR=90;WE=50184957;WS=50184939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,98:0.73:135
chr10	50186317	rs2292585	G	A	1272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.192;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=27;PP=666;ReadPosRankSum=0.254;SC=AGACAGGATCGTCTTCCCCGC;SOR=0.811;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=157;TCF=83;TCR=74;TR=60;WE=50186325;WS=50186307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,70:0.39:178
chr10	50186415	rs2292584	C	T	1833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.162;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=37;PP=1059;ReadPosRankSum=1.547;SC=GAGGAGCCCCCGGCTCAGCCT;SOR=0.418;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=122;TCF=52;TCR=70;TR=69;WE=50186423;WS=50186405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,80:0.58:139
chr10	50190923	.	G	GA	181	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5007;HP=11;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=17;MQ=60.89;NF=0;NR=13;PP=181;QD=14.6153846154;SC=CTATTGCACTGAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=13;WE=50190931;WS=50190913;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:13,13:0.50:26
chr10	50227583	rs150796986	C	T	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=2.632;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=5;PP=117;ReadPosRankSum=2.166;SC=AAAGGGGCTCCCCACCACTCA;SOR=0.916;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=11;TCF=6;TCR=5;TR=8;WE=50227591;WS=50227573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr10	50227785	rs1913525	T	C	1691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.73;SOR=0.725;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr10	50227870	rs1913524	C	T	681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=13;PP=405;SC=ACCACAGGAGCTCTACATCAC;SOR=1.022;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=25;TCF=11;TCR=14;TR=24;WE=50227878;WS=50227860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr10	50227927	rs1913523	C	A	175.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=6;PP=124;SC=TGGGATTCAGCGAGGGATAAG;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=50227935;WS=50227917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr10	50315893	rs13088	A	G	3155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.008;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=65;PP=1831;ReadPosRankSum=0.659;SC=CTGGGAGTCGAAGGAGTGTGC;SOR=0.613;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=219;TCF=111;TCR=108;TR=133;WE=50315901;WS=50315883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,147:0.60:243
chr10	50339664	.	C	A	2232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.315;ClippingRankSum=0.000;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=26;PP=1296;ReadPosRankSum=0.208;SC=TGGCTCACTGCTTCTCCTGCT;SOR=0.709;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=131;TCF=90;TCR=41;TR=86;WE=50339672;WS=50339654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,95:0.67:141
chr10	50339925	rs12765281	G	A	2048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.658;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=34;PP=1342;ReadPosRankSum=0.003;SC=TGACCAGCCAGTCCGGCGGCT;SOR=0.788;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=123;TCF=68;TCR=55;TR=76;WE=50339933;WS=50339915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,86:0.63:136
chr10	50340304	rs17773851	C	A	2756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.317;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=63;PP=1746;ReadPosRankSum=1.914;SC=GCTCCAGTCCCGCATCCCCCG;SOR=0.842;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=157;TCF=67;TCR=90;TR=107;WE=50340312;WS=50340294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,117:0.68:171
chr10	50341954	rs34110351	A	G	2272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.620;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=41;PP=1309;ReadPosRankSum=0.855;SC=TCTGTGAAGTAGCATTTCATG;SOR=0.752;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=135;TCF=73;TCR=62;TR=89;WE=50341962;WS=50341944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,103:0.66:155
chr10	50373738	rs77059741	G	T	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.356;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=185;ReadPosRankSum=-1.000;SC=GGGGATGACAGGCAAGGGAGT;SOR=0.425;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=41;TCF=32;TCR=9;TR=16;WE=50373746;WS=50373728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,16:0.36:44
chr10	50374930	rs45563932	C	T	1944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.810;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=34;PP=1110;ReadPosRankSum=0.644;SC=GGCCCCCAGGCGTGCTTTTCA;SOR=0.761;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=138;TCF=74;TCR=64;TR=81;WE=50374938;WS=50374920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,92:0.59:155
chr10	50531604	rs7093235	T	C	2983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=48;PP=1535;SC=AGAACAGACTTGCAGCAGGGG;SOR=0.995;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=44;TCR=48;TR=92;WE=50531612;WS=50531594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr10	50531931	rs75053680	G	A	3540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=72;PP=2155;ReadPosRankSum=0.881;SC=GTAAGCTCCTGACCCCCATCA;SOR=0.687;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=200;TCF=99;TCR=101;TR=142;WE=50531939;WS=50531921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,164:0.72:229
chr10	50532683	rs7921186	T	C	3145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=61;NR=45;PP=1913;SC=CAGAAATTCTTCCCAGGGCCC;SOR=0.859;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=107;TCF=61;TCR=46;TR=106;WE=50532691;WS=50532673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr10	50533617	rs2377940	T	C	5483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=83;PP=2965;SC=TACCCGAGGGTGACATAGAAG;SOR=0.783;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=191;TCF=106;TCR=85;TR=189;WE=50533625;WS=50533607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr10	50533776	rs10857471	C	G	3482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=61;PP=2060;SC=CCGGCTCCCCCGGGGAGAGCA;SOR=1.117;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=49;TCR=61;TR=110;WE=50533784;WS=50533766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr10	50534599	rs10857472	G	A	4765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=79;PP=2846;SC=GCTGTACCCCGGCTTCCAGCC;SOR=0.907;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=154;TCF=75;TCR=79;TR=154;WE=50534607;WS=50534584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr10	50534969	.	A	AACACACACAC	691.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;QD=53.21;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,11:0.85:13
chr10	50724016	rs4253072	C	T	5757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=105;PP=2965;SC=CAGTGGAACTCTGTCAATGTG;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=190;TCF=85;TCR=105;TR=190;WE=50724024;WS=50724006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr10	50818762	rs1880675	C	T	1113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=7;PP=608;SC=CGGAGGCGTCCTCGGAAGAGC;SOR=1.552;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=34;WE=50818770;WS=50818752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr10	50820345	rs8187730	C	A	6984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=122;PP=2965;SC=CCTTTTGATGCGTGCGAGGAC;SOR=0.815;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=230;TCF=107;TCR=123;TR=229;WE=50820353;WS=50820335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,259:1.00:259
chr10	50822226	rs7923716	T	G	279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.43;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr10	50828506	rs1880677	G	A	3612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=45;PP=2145;SC=GACTGTTTGGGGGGATGTGAC;SOR=0.925;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=69;TCR=46;TR=113;WE=50828514;WS=50828496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr10	50830171	rs8178990	C	T	1427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.489;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=28;PP=849;ReadPosRankSum=-1.127;SC=CTCTGGTGTACTCAGCTACAA;SOR=0.534;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=106;TCF=60;TCR=46;TR=61;WE=50830179;WS=50830161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,68:0.58:118
chr10	50856652	rs4838544	G	A	3134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=51;NR=51;PP=1485;SC=GCTCAAGCACGTGTGAGTCTG;SOR=0.945;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=51;TCR=51;TR=102;WE=50856660;WS=50856642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr10	50856772	rs10580502	TAC	T	140.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;QD=28.15;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr10	50857835	rs1917813	T	C	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=210;ReadPosRankSum=0.407;SC=TGTAGTCAAATTAAAGGAGAG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=11;WE=50857843;WS=50857825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr10	50863083	rs12264845	A	C	1018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.933;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=25;PP=562;ReadPosRankSum=0.437;SC=TTTCTTTCCGAGTTTATGATT;SOR=0.554;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=171;TCF=100;TCR=71;TR=55;WE=50863091;WS=50863073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,60:0.31:193
chr10	50863147	rs8178992	T	C	7419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=126;NR=116;PP=2965;SC=GCAGGCTCCATCGAAGACTGG;SOR=0.753;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=243;TCF=126;TCR=117;TR=242;WE=50863155;WS=50863137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,274:1.00:274
chr10	50863565	rs7076926	C	T	1170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=25;PP=697;SC=ATGGGCACCACGGCATAAGAC;SOR=1.721;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=12;TCR=25;TR=37;WE=50863573;WS=50863555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr10	50863623	rs7094421	A	G	316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=9;PP=233;SC=TGGCAAGGCCACTTCACCACT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=50863631;WS=50863613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	50887651	rs1153781	G	C	1541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=20;PP=842;SC=GGCCCCGCCCGGCGCGTAGCG;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=33;TCR=20;TR=53;WE=50887659;WS=50887641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr10	50901809	rs1153797	T	G	1215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=8;PP=685;SC=CTCCTTTTCTTTCCTTCCCAG;SOR=1.721;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=34;WE=50901817;WS=50901799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr10	50901938	rs1133837	C	T	1599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.834;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=31;PP=854;ReadPosRankSum=-0.976;SC=ACTTGGAGTTCGGTAAGCCCT;SOR=0.499;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=76;TCF=40;TCR=36;TR=60;WE=50901946;WS=50901928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,70:0.81:86
chr10	50902469	rs2278561	T	G	1965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.786;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=26;PP=1153;ReadPosRankSum=0.962;SC=TAGTTAACATTTTACCAGCCC;SOR=0.557;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=108;TCF=71;TCR=37;TR=74;WE=50902477;WS=50902459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,81:0.70:116
chr10	50902684	rs1055421	C	T	998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.281;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=27;PP=586;ReadPosRankSum=-1.124;SC=GTCGGCACAACAGCAGCTGCC;SOR=1.071;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=53;TCF=15;TCR=38;TR=38;WE=50902692;WS=50902674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,42:0.71:59
chr10	50916484	rs1258236	A	G	2705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=47;NR=32;PP=1661;SC=CAGCCCGTGTAGGATGAAAGT;SOR=1.166;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=47;TCR=32;TR=79;WE=50916492;WS=50916474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr10	50916542	rs4838554	C	T	2697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=44;PP=1635;ReadPosRankSum=-1.777;SC=CTGACTTGTACTGTATTGGCC;SOR=0.702;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=141;TCF=84;TCR=57;TR=106;WE=50916558;WS=50916532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,119:0.74:161
chr10	50916834	rs6537550	G	A	100.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=74;SC=CAAACCCAACGTGATTCTCCC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=50916842;WS=50916824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr10	50943186	rs1258256	C	T	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=266;ReadPosRankSum=-1.413;SC=AGCCCCTCTCCTGGGCAGGAG;SOR=0.693;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=63;TCF=45;TCR=18;TR=21;WE=50943194;WS=50943176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,25:0.35:71
chr10	50944009	rs1258257	T	C	646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=6;PP=455;SC=ATGGGACAGATGGAGCCAGGA;SOR=2.030;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=23;WE=50944017;WS=50943999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	50944613	rs1258258	C	T	733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.739;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=21;PP=449;ReadPosRankSum=-0.221;SC=CCCAGAGGGGCTGGGGCAGCT;SOR=0.564;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=110;TCF=45;TCR=65;TR=37;WE=50944621;WS=50944603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,40:0.34:119
chr10	50947918	rs1258259	A	G	1375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=25;PP=727;SC=CTTGCTGCACACAGTCACCAA;SOR=1.436;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=44;TCF=18;TCR=26;TR=43;WE=50947926;WS=50947908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr10	50948987	rs3750757	C	T	487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=426;ReadPosRankSum=0.237;SC=GCCTCCGTCACTGTCCCAGGA;SOR=0.407;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=21;WE=50948995;WS=50948977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr10	50950848	rs79347484	C	T	1437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.235;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=25;PP=657;ReadPosRankSum=0.362;SC=GTCTCCTGTGCGGATGCTGAG;SOR=0.438;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=91;TCF=53;TCR=38;TR=57;WE=50950856;WS=50950838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,66:0.65:102
chr10	50950976	rs11101224	G	A	1401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=2.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.74;ReadPosRankSum=-1.225;SOR=0.452;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,68:0.67:102
chr10	50952101	rs36032010	C	G	1019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.693;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=16;PP=527;ReadPosRankSum=-1.046;SC=TGTGGGTGAGCATGTCCTCAG;SOR=0.413;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=84;TCF=55;TCR=29;TR=41;WE=50952109;WS=50952091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,49:0.49:101
chr10	50952851	rs1268723	C	T	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.328;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=11;PP=201;ReadPosRankSum=-0.242;SC=CGCAGCCAGACGCCCAGTCCA;SOR=0.382;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=51;TCF=21;TCR=30;TR=21;WE=50952859;WS=50952841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,25:0.44:57
chr10	50953830	rs7910114	G	A	828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=8;PP=536;ReadPosRankSum=2.798;SC=CTTGGCCTCAGTCCCCAGACC;SOR=0.789;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=57;TCF=42;TCR=15;TR=31;WE=50953838;WS=50953820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,35:0.56:62
chr10	50960166	rs2304635	C	T	3224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.501;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=57;PP=1839;ReadPosRankSum=1.284;SC=CCCACACACCCGCCTGTGCTC;SOR=0.749;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=207;TCF=114;TCR=93;TR=129;WE=50960174;WS=50960156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,144:0.63:228
chr10	50960209	rs1258184	G	A	1157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=26;PP=676;ReadPosRankSum=-0.708;SC=CCCGCAGAGAGAGGGTGTTTT;SOR=0.721;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=163;TCF=83;TCR=80;TR=54;WE=50960217;WS=50960199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,61:0.34:181
chr10	50960354	rs2304636	C	T	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=309;ReadPosRankSum=-0.988;SC=AGGTCAGGCCCAGGTGGAGCC;SOR=0.965;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=19;WE=50960362;WS=50960344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr10	50960581	rs2304637	A	G	979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.977;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=5;PP=778;ReadPosRankSum=1.750;SC=CTGCTCCCCGAGCTCCATGGA;SOR=1.282;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=54;TCF=47;TCR=7;TR=37;WE=50960589;WS=50960571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,37:0.64:58
chr10	50964761	rs2889728	T	C	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=201;ReadPosRankSum=-1.022;SC=TTCCCTTCAGTGCCTGGCCAC;SOR=1.022;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=13;WE=50964769;WS=50964751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr10	51124153	rs2664655	T	G	1985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=47;PP=1455;SC=ACAAGCTTCCTACTACCTCCC;SOR=2.448;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=13;TCR=47;TR=60;WE=51124161;WS=51124143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr10	51537292	rs4131357	C	A	1796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=45;PP=1232;SC=ACAATAGAGTCTTTTAATCTA;SOR=2.231;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=14;TCR=45;TR=59;WE=51537300;WS=51537282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr10	51539745	rs35494443	AC	A	711.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=0;PP=701;SC=TGAACTTGCTACCCCCAATAG;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=20;WE=51539753;WS=51539735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	51539762	rs10763588	G	T	1241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=4;PP=957;SC=ATAGAGAATTGACTCCCTCAT;SOR=3.664;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=35;TCR=4;TR=39;WE=51539770;WS=51539752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr10	51540291	rs11006274	T	C	1571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=33;PP=999;SC=CTGTGGGATCTCCCGCATGAA;SOR=1.567;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=17;TCR=33;TR=50;WE=51540299;WS=51540281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr10	51549496	rs10993994	T	C	6318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=112;NR=100;PP=2965;SC=TTCCCAATGATGTCGAATGCG;SOR=0.710;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=212;TCF=112;TCR=100;TR=212;WE=51549504;WS=51549486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr10	51549545	rs4935176	G	T	5014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=81;PP=2896;SC=ATGCAGCTTTGCCTGGATGTA;SOR=0.831;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=160;TCF=79;TCR=81;TR=160;WE=51549553;WS=51549535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr10	51568378	rs10761581	T	G	915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.671;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=25;PP=529;ReadPosRankSum=-0.532;SC=GTTGACCACTTTTGCTCTAGC;SOR=0.790;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=114;TCF=53;TCR=61;TR=45;WE=51568386;WS=51568368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,50:0.38:131
chr10	51583018	rs34542065	CATT	C	583.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.500;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=311;ReadPosRankSum=0.613;SC=TACTATGTGTCATTGTTAACT;SOR=1.194;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=8;WE=51583028;WS=51583008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr10	51592744	rs10995796	T	G	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=120;ReadPosRankSum=1.432;SC=TCCCAGCACTTCGGGAGGCCG;SOR=0.922;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=7;WE=51592752;WS=51592734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr10	51623004	rs201547968	T	C	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=1.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.54;MQRankSum=-5.068;QD=15.51;ReadPosRankSum=-0.972;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,24:0.73:33
chr10	51623014	.	GA	G	1604	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5000;HP=10;HapScore=4;MGOF=17;MMLQ=27;MQ=40.33;NF=27;NR=23;PP=1604;QD=32.32;SC=TGCCAGCAAGGAAAAAAAAAA;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=91;TCF=52;TCR=39;TR=50;WE=51623032;WS=51622994;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:41,50:0.55:91
chr10	51623024	rs146205287	A	C	1147.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.75;MQRankSum=-7.105;QD=13.50;ReadPosRankSum=3.180;SOR=0.720;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,54:0.64:85
chr10	51623024	.	A	AC	1709	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5000;HP=9;HapScore=4;MGOF=17;MMLQ=27;MQ=40.43;NF=27;NR=24;PP=1709;QD=33.7450980392;SC=GAAAAAAAAAACAACAACATA;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=93;TCF=53;TCR=40;TR=51;WE=51623032;WS=51622994;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:42,51:0.55:93
chr10	51623052	rs143647852	C	CT	3378.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.772;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-9.291;NF=19;NR=37;PP=2933;ReadPosRankSum=3.549;SC=GGACGCGCAACTTAGTGTAGA;SOR=0.505;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=144;TCF=59;TCR=85;TR=56;WE=51623069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,83:0.52:160
chr10	51623061	rs115719811	G	A	3462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-9.940;NF=55;NR=44;PP=2962;ReadPosRankSum=3.211;SC=ACTTAGTGTAGACGCAAGAAC;SOR=0.672;SbPval=0.43;Source=Platypus;TCR=98;TR=99;WE=51623069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,94:0.50:187
chr10	51623147	rs373071373	C	T	636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=3.022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.52;MQRankSum=-5.936;QD=6.92;ReadPosRankSum=-0.529;SOR=1.100;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,33:0.36:92
chr10	51623174	rs141118546	C	A	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=1.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.42;MQRankSum=-2.755;QD=6.52;ReadPosRankSum=-1.826;SOR=0.360;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr10	51623866	rs374725846	A	G	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=1.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.99;MQRankSum=-2.429;QD=8.75;ReadPosRankSum=-0.075;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr10	51631812	rs200391397	A	G	2615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.28;MQRankSum=-8.252;QD=12.70;ReadPosRankSum=0.287;SOR=0.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,119:0.58:206
chr10	51632906	rs146420399	G	A	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.354;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.72;MQRankSum=-0.831;QD=14.98;ReadPosRankSum=-1.177;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr10	51632971	rs200644678	A	G	1148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.95;MQRankSum=-7.885;QD=7.09;ReadPosRankSum=0.981;SOR=0.677;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,63:0.39:162
chr10	51633027	rs115081809	T	C	1959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-8.122;NF=68;NR=64;PP=1314;ReadPosRankSum=-0.276;SC=AGTAACTATTTGGGTAGGTAG;SOR=0.711;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=319;TCF=157;TCR=162;TR=132;WE=51633035;WS=51633017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,113:0.44:255
chr10	51827839	rs113882441	T	C	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.17;MQRankSum=-1.821;QD=6.75;ReadPosRankSum=1.189;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr10	51827896	rs11552619	C	T	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=6.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.62;MQRankSum=-3.295;QD=1.51;ReadPosRankSum=-2.013;SOR=2.814;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,3:0.14:21
chr10	51827900	rs2805112	A	G	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=6.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.88;MQRankSum=-3.566;QD=1.56;ReadPosRankSum=-2.364;SOR=2.814;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,3:0.14:21
chr10	51827934	rs55875820	G	A	287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.89;MQRankSum=1.800;QD=19.18;ReadPosRankSum=-0.856;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,14:0.93:15
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chr10	51974685	rs201931325	C	T	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=10.577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.13;MQRankSum=-4.408;QD=3.22;ReadPosRankSum=1.866;SOR=0.040;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,9:0.25:36
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chr10	52002852	rs1436217	A	G	565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.033;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=457;ReadPosRankSum=-0.391;SC=ATTGAAGGTAATAGAATTTCA;SOR=1.981;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=20;WE=52002860;WS=52002842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,20:0.71:28
chr10	52002980	rs3739979	T	G	2756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=2.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.552;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=48;PP=1627;ReadPosRankSum=1.063;SC=TGAGCCTTTGTGATACCATGC;SOR=0.778;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=165;TCF=90;TCR=75;TR=108;WE=52002988;WS=52002970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,121:0.63:191
chr10	52004877	rs7096899	A	G	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.706;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=281;ReadPosRankSum=-0.880;SC=TAAAAAGCTAAAAGAAGATAA;SOR=0.269;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=15;WE=52004885;WS=52004867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr10	52005153	rs7097319	A	G	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=8;PP=269;ReadPosRankSum=-0.535;SC=AGCGTTGGGCAGCTGTGGAGC;SOR=0.770;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=31;TCF=20;TCR=11;TR=22;WE=52005161;WS=52005143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,25:0.68:37
chr10	52005271	rs7067773	T	G	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=155;ReadPosRankSum=0.182;SC=TTTGTCAACATCAATTAGAAC;SOR=0.941;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=11;WE=52005279;WS=52005261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr10	52005293	rs7077415	G	A	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=24.82;ReadPosRankSum=1.068;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr10	52005303	rs7097483	A	G	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=18.68;ReadPosRankSum=0.652;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr10	52008140	rs7071083	C	T	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=192;ReadPosRankSum=0.345;SC=CTTAAGTACACGTAGAACTAT;SOR=0.593;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=51;TCF=41;TCR=10;TR=17;WE=52008148;WS=52008130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,18:0.33:55
chr10	52070947	rs2251601	T	C	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.97;ReadPosRankSum=-0.566;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
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chr10	52088004	rs12358176	C	T	689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=15;PP=341;ReadPosRankSum=0.187;SC=ACATTCTTTCCCTCTCTACCT;SOR=0.719;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=41;TCF=18;TCR=23;TR=26;WE=52088012;WS=52087994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,31:0.63:49
chr10	52103707	rs10763354	A	G	1194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=13;PP=683;SC=GCCGCTGCCCATTGTCAGAGG;SOR=0.990;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=23;TCR=13;TR=36;WE=52103715;WS=52103697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr10	52502788	rs78203725	G	A	1292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=0.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.12;MQRankSum=-1.792;QD=10.96;ReadPosRankSum=-1.359;SOR=0.608;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,66:0.56:118
chr10	52502803	rs112405752	C	CGT	1133.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.805;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.765;NF=1;NR=18;PP=869;ReadPosRankSum=-0.238;SC=TGCGTGCGTGCGTGTGTGTGT;SOR=0.455;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=51;TCF=3;TCR=48;TR=19;WE=52502812;WS=52502793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,39:0.45:86
chr10	52573698	rs41274048	G	A	1938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.653;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=44;PP=1144;ReadPosRankSum=-2.757;SC=AAATGTCATAGAGTTTGTCTT;SOR=1.161;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=111;TCF=47;TCR=64;TR=72;WE=52573706;WS=52573688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,83:0.65:128
chr10	52576068	rs4245008	G	A	1347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=30;PP=800;SC=AAATATCAACGCGAGATGATA;SOR=1.911;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=14;TCR=30;TR=44;WE=52576076;WS=52576058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr10	52751070	rs79957958	A	AGCC,AGCCGCCGCCGCC	1025.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5,5;NR=4,4;PP=430,124;ReadPosRankSum=-0.241;SC=CTGCCGTCCCAGCCGCCGCCG;SOR=1.519;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=12;TCF=6;TCR=6;TR=9,9;WE=52751078;WS=52751060;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.62,0.31:26
chr10	53458047	rs3740228	A	G	1408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.508;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=37;PP=886;ReadPosRankSum=-0.085;SC=TTTCCATGGCACGAGTCTCCA;SOR=0.756;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=208;TCF=104;TCR=104;TR=69;WE=53458055;WS=53458037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,78:0.33:233
chr10	53458998	rs2292828	A	G	1020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.712;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=23;PP=649;ReadPosRankSum=0.718;SC=CTGCAGGCCCAAGGCTCTTTA;SOR=1.071;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=167;TCF=91;TCR=76;TR=57;WE=53459006;WS=53458988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,60:0.35:172
chr10	53667443	rs10823860	C	T	946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.510;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=26;PP=621;ReadPosRankSum=-0.296;SC=TAAAAAATTTCTAAGCTCTGG;SOR=0.446;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=47;TCF=11;TCR=36;TR=35;WE=53667451;WS=53667433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,38:0.75:51
chr10	53667462	rs11000040	A	G	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=649;ReadPosRankSum=-1.404;SC=GGGATGAGCTATATATTTGGC;SOR=0.749;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=20;WE=53667484;WS=53667452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,21:0.70:30
chr10	53667476	rs7081919	G	A	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=577;ReadPosRankSum=-0.852;SC=ATTTGGCTTCGTATAGAAAGC;SOR=1.061;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=10;WE=53667484;WS=53667452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr10	53814229	rs1904010	G	T	955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.561;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=14;PP=593;ReadPosRankSum=1.170;SC=TTTTCTTATTGTTTCTACTTT;SOR=0.440;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=105;TCF=73;TCR=32;TR=40;WE=53814237;WS=53814219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,47:0.39:120
chr10	53814383	rs12778630	C	T	1033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.266;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=26;PP=536;ReadPosRankSum=-0.392;SC=TTAGTAACTCCAGTAGGAACA;SOR=0.394;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=122;TCF=48;TCR=74;TR=48;WE=53814391;WS=53814373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,56:0.40:141
chr10	53841337	rs1904024	A	G	1866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=44;NR=17;PP=1080;SC=AATACTTACCATATGCCATGT;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=44;TCR=17;TR=61;WE=53841345;WS=53841327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
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chr10	53893539	rs17642863	A	T	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.551;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=276;ReadPosRankSum=-0.869;SC=ATTAATCACAATGGACACTGT;SOR=0.384;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=44;TCF=30;TCR=14;TR=23;WE=53893547;WS=53893529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,25:0.52:48
chr10	53921754	rs10824173	C	A	405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=9;PP=227;SC=ATTTTGATTGCAAAATGATTT;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=14;WE=53921762;WS=53921744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr10	54050079	rs10762675	G	A	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=9;PP=173;ReadPosRankSum=-0.434;SC=TTATAATTGTGTGACATAATT;SOR=0.892;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=10;TCR=13;TR=16;WE=54050087;WS=54050069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,18:0.72:25
chr10	54074660	rs41281546	C	T	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.900;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=10;PP=381;ReadPosRankSum=-0.447;SC=GTGCCTCACCCTCTCCCCGAA;SOR=0.042;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=28;TCF=18;TCR=10;TR=23;WE=54074668;WS=54074650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,25:0.83:30
chr10	54074757	rs2241529	A	G	1559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=26;PP=907;ReadPosRankSum=-0.460;SC=GAGGGGACGCAGGCGTGCAAA;SOR=0.766;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=98;TCF=57;TCR=41;TR=63;WE=54074765;WS=54074747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,71:0.63:112
chr10	54076649	rs74711339	A	G	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.511;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=289;ReadPosRankSum=0.761;SC=ACTCAATCCTAAGGATATACA;SOR=0.136;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=19;WE=54076657;WS=54076639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,21:0.64:33
chr10	54528266	rs930507	G	C	2971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=54;PP=1846;SC=GAGAGAAGGTGAGCCCTAAAA;SOR=0.956;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=99;TCF=45;TCR=54;TR=99;WE=54528274;WS=54528256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr10	54528298	rs930508	G	C	2116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=46;PP=1427;SC=GGGTGAAACTGACTCATCCTT;SOR=1.488;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=25;TCR=46;TR=71;WE=54528306;WS=54528288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr10	54528353	rs930509	C	G	706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=20;PP=569;SC=TTCTAGAGTACAGTTGCCGGA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=54528361;WS=54528343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr10	54530694	rs1982267	G	T	203.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=6;PP=164;SC=CTGTATGGTGGGCACCTGAGA;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=54530702;WS=54530684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr10	54531461	rs7095891	G	A	1514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=33;PP=995;SC=CATATTTACCGAGCATGCCCT;SOR=1.791;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=16;TCR=33;TR=49;WE=54531469;WS=54531451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr10	54531534	rs11003123	G	A	193.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=114;SC=CCTCTAGCTGGGGATTTGGAA;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=54531542;WS=54531524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr10	55582728	.	C	A	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=0.000;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.694;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=19;PP=439;ReadPosRankSum=0.603;SC=TTGGAACTTTCCTCATCAGCC;SOR=0.624;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=131;TCF=65;TCR=66;TR=38;WE=55582736;WS=55582718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,39:0.28:137
chr10	55585030	rs11331853	CA	C	58.87	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.5;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5040;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=37;ReadPosRankSum=-1.282;SC=GTACGTATATCAAAAAAAAGG;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=55585038;WS=55585020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr10	55588137	rs4570494	G	A	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.971;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=137;ReadPosRankSum=1.890;SC=TTTCACATTTGTGCAAGTTAC;SOR=0.818;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=9;WE=55588145;WS=55588127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr10	55617042	rs75248212	G	T	1521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=31;PP=801;ReadPosRankSum=-0.393;SC=AGAAAAAACAGAATTCATTTA;SOR=0.677;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=107;TCF=57;TCR=50;TR=66;WE=55617050;WS=55617032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,73:0.62:118
chr10	55617177	rs7083307	T	C	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.569;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.802;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=97;ReadPosRankSum=0.889;SC=TTTAATTATATGATCTACACA;SOR=2.419;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=7;WE=55617185;WS=55617167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr10	55663198	rs10740559	A	C	971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=5.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.70;ReadPosRankSum=-0.100;SOR=1.781;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,26:0.63:41
chr10	55663202	rs2593124	T	C	944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=1.409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.24;ReadPosRankSum=0.619;SOR=1.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,22:0.61:36
chr10	55719652	rs2593107	C	T	1574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=2.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.891;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=39;PP=944;ReadPosRankSum=-0.888;SC=GTAAGAACAGCGTAACAGCAC;SOR=0.874;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=85;TCF=26;TCR=59;TR=55;WE=55719660;WS=55719642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,66:0.67:99
chr10	55755491	rs2135720	C	T	1614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.404;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=38;PP=884;ReadPosRankSum=-0.177;SC=TTTGTATATTCGTTTACTAAA;SOR=0.542;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=120;TCF=49;TCR=71;TR=66;WE=55755499;WS=55755481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,76:0.56:136
chr10	55892600	.	T	TAC	97	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=3;NR=2;PP=97;QD=20.4;SC=TTAGAATTTATACACACACAC;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=23;TCF=11;TCR=12;TR=5;WE=55892609;WS=55892590;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:18,5:0.22:23
chr10	55943184	rs7093302	T	C	1077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.924;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=15;PP=685;ReadPosRankSum=0.370;SC=AGTGTACACTTATATTATGTG;SOR=0.856;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=49;TCR=27;TR=42;WE=55943192;WS=55943174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,45:0.58:77
chr10	55949264	rs5785045	AT	A	413.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=260;ReadPosRankSum=-1.363;SC=AGAGTATACAATTTTTTTATT;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=13;WE=55949273;WS=55949254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,20:0.71:28
chr10	55955485	rs7921598	A	G	2876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.471;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=42;PP=1590;ReadPosRankSum=0.310;SC=TTAAAGGTGAAGTCAAATTGA;SOR=0.433;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=158;TCF=98;TCR=60;TR=103;WE=55955493;WS=55955475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,125:0.65:191
chr10	55955610	rs10825269	C	T	1729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.415;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=44;PP=1039;ReadPosRankSum=-1.718;SC=ATGTGTAGACCGGCAAAGGCA;SOR=0.865;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=124;TCF=47;TCR=77;TR=68;WE=55955618;WS=55955600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,78:0.57:138
chr10	55973889	rs10763086	G	A	933.90	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=2.481;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=27;PP=595;ReadPosRankSum=0.355;SC=CCCTTCATCAGCTGAGGAACA;SOR=0.285;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=40;TCF=8;TCR=32;TR=35;WE=55973897;WS=55973879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,38:0.88:43
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chr10	56077209	rs10740579	G	A	1360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.450;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=27;PP=696;ReadPosRankSum=-1.217;SC=GTCCTGTTAGGGAGAAAAACA;SOR=0.498;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=99;TCF=49;TCR=50;TR=57;WE=56077217;WS=56077199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,66:0.59:112
chr10	56089223	rs11004240	A	G	201.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=1;PP=153;SC=TATTATATATAAACACCAAGG;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=56089231;WS=56089213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr10	56089263	rs857395	G	A	479.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5005;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=320;ReadPosRankSum=0.955;SC=GAAGTGAGTGGCACAGAGCTC;SOR=0.330;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=17;WE=56089271;WS=56089253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,19:0.86:22
chr10	56129066	rs11594958	A	G	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.018;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=17;PP=358;ReadPosRankSum=0.015;SC=CTTTTAAAATACTAATTAAAA;SOR=0.892;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=52;TCF=19;TCR=33;TR=26;WE=56129074;WS=56129056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,31:0.51:61
chr10	56287689	rs10825347	A	C	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=14;PP=225;ReadPosRankSum=1.275;SC=GGCACACACAATGAGAAAAAA;SOR=0.784;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=75;TCF=31;TCR=44;TR=23;WE=56287697;WS=56287679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,27:0.30:90
chr10	56335031	rs7070334	A	G	154.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=124;SC=TGCACAATGTACACATGTACC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=56335039;WS=56335021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr10	56335067	rs7070440	A	G	248.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=150;SC=TAATAAAAAAAAAAACTGAAA;SOR=2.093;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=56335075;WS=56335057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr10	56335099	rs10825362	C	T	539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=5;PP=285;SC=TATTATTTCTCGTCAGTTCTT;SOR=1.127;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=17;WE=56335107;WS=56335089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	56335273	rs7086121	G	A	36.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr10	56345303	rs4570492	T	C	1605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=42;NR=14;PP=869;SC=ACTTCATAGCTGTAGGCTAAC;SOR=1.727;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=60;TCF=42;TCR=18;TR=56;WE=56345311;WS=56345293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr10	56345335	rs2026413	T	C	747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=2.031;NF=17;NR=9;PP=350;ReadPosRankSum=-0.036;SC=AAATAATTCATTCATTTCATT;SOR=0.610;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=73;TCF=45;TCR=28;TR=26;WE=56345343;WS=56345325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,35:0.51:69
chr10	56345374	rs71901521	GT	G	89.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=2.985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.72;MQRankSum=-1.152;QD=1.83;ReadPosRankSum=-0.209;SOR=1.236;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,12:0.24:49
chr10	56345378	rs11396767	T	TG	903.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.77;MQRankSum=1.624;QD=17.05;ReadPosRankSum=1.276;SOR=0.660;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,33:0.62:53
chr10	56345425	rs2026412	G	A	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.41;ReadPosRankSum=-0.558;SOR=0.560;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,29:0.52:56
chr10	56345491	rs2026411	C	G	1114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.85;SOR=1.308;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr10	56345511	rs2026410	A	G	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.771;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=188;ReadPosRankSum=0.487;SC=CAACTTCAGCAGGTTCCCAGA;SOR=1.718;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=26;TCF=9;TCR=17;TR=13;WE=56345519;WS=56345501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr10	56424125	.	C	A	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.471;ClippingRankSum=-0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=66;ReadPosRankSum=-1.431;SC=ATTGTCACAGCACAGAAAAGC;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=5;WE=56424133;WS=56424115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr10	58118630	rs2241666	T	C	1943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FS=2.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.259;QD=6.73;ReadPosRankSum=1.237;SOR=0.687;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:178,111:0.38:289
chr10	58119418	rs74876352	C	T	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=174;ReadPosRankSum=-1.531;SC=ACTGCCCTTCCCTCCCTGTAC;SOR=0.656;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=12;WE=58119426;WS=58119408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,14:0.40:35
chr10	58119976	rs3861049	G	A	3654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=45;PP=2208;SC=CTCTCTGCCAGTGCTGCCCTG;SOR=1.179;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=63;TCR=45;TR=108;WE=58119984;WS=58119966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr10	59064371	rs1275284	C	G	88.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=3;PP=51;SC=ACATGTATCTCTCTGTGTGTA;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=59064379;WS=59064361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr10	59956556	rs2790149	C	T	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=200;ReadPosRankSum=0.968;SC=TTTTCCCCATCATCCCTTAGA;SOR=1.127;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=13;WE=59956564;WS=59956546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr10	59958956	rs1769044	C	A	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.674;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=63;ReadPosRankSum=0.206;SC=CTTTAGAAGTCTTTTAACTGT;SOR=0.942;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=23;TCF=12;TCR=11;TR=9;WE=59958964;WS=59958946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr10	59975743	rs2790146	A	T	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.004;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.89;ReadPosRankSum=0.481;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr10	59987071	rs11398218	G	GT	47.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=68;ReadPosRankSum=1.094;SC=GAGTAACTATGTATTTAGAGT;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=3;WE=59987079;WS=59987061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr10	59997644	rs2790217	A	T	1015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=24;PP=560;ReadPosRankSum=0.259;SC=TAAATAGATTAGTTCCTGAAG;SOR=0.619;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=64;TCF=26;TCR=38;TR=41;WE=59997652;WS=59997634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,46:0.64:72
chr10	60027122	rs1339580	C	T	1285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.863;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=18;PP=745;ReadPosRankSum=-0.444;SC=GCTGCCTCCGCTGACAGGGGG;SOR=0.591;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=81;TCF=53;TCR=28;TR=54;WE=60027130;WS=60027112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,59:0.68:87
chr10	60029163	rs1416763	C	T	1092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=24;PP=640;ReadPosRankSum=0.265;SC=ACGCGCCCGCCGGTCCTATAA;SOR=0.688;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=71;TCF=36;TCR=35;TR=47;WE=60029171;WS=60029153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,51:0.64:80
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chr10	60047177	rs3758567	G	C	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.5;BaseQRankSum=0.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.113;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=185;ReadPosRankSum=0.055;SC=AGCATATGTAGTTTACATATG;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=9;WE=60047185;WS=60047167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr10	60094925	.	C	T	1203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=0.000;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.81;ReadPosRankSum=0.497;SOR=0.841;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,56:0.60:94
chr10	60095105	rs112660736	G	T	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.345;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=12;PP=330;ReadPosRankSum=0.244;SC=GCCGGGGTGCGGGCAGGGAGC;SOR=0.703;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=35;TCF=19;TCR=16;TR=25;WE=60095113;WS=60095095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,30:0.73:41
chr10	60095143	rs1905456	T	C	586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=13;PP=361;SC=CCAGCGGGCATCGGACAGGTG;SOR=1.828;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=18;WE=60095151;WS=60095133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr10	60273121	rs7100474	T	C	6459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=99;NR=113;PP=2965;SC=TCTCGGACTCTCCGACTGAGC;SOR=0.890;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=212;TCF=99;TCR=113;TR=212;WE=60273129;WS=60273111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr10	60273155	rs7079648	C	A	3873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=75;PP=2211;SC=TCGGACATCCCCACCGCGCGC;SOR=1.210;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=126;TCF=50;TCR=76;TR=125;WE=60273163;WS=60273145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr10	60273189	rs10571555	ACGGC	A	2295.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=38;PP=1971;SC=ACTCCAGCCTACGGCCGGCCG;SOR=3.056;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=46;TCF=2;TCR=44;TR=39;WE=60273200;WS=60273179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr10	60548276	rs11812567	G	A	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.927;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=95;ReadPosRankSum=-0.057;SC=TTTTATAACCGAATCATGTTC;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=6;WE=60548284;WS=60548266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr10	60558125	rs2393503	A	T	3969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=45;PP=2812;SC=TCTTAAATTTATGTGAATTGA;SOR=1.678;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=135;TCF=90;TCR=45;TR=135;WE=60558133;WS=60558115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr10	60559047	rs2893789	G	C	584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=15;PP=453;SC=TGTGTGATCTGTACTGTTTGT;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=60559055;WS=60559037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	60563062	rs4245600	G	C	1035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=22;PP=655;SC=CTGGTATGGAGAATTCAGTGA;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=11;TCR=22;TR=33;WE=60563070;WS=60563052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr10	60566137	rs3740451	G	A	837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=4;PP=616;SC=CAGAAGTGGTGATTTATTATT;SOR=3.334;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=28;WE=60566145;WS=60566127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr10	60573753	rs9416746	G	T	8583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=150;NR=138;PP=2965;SC=TCAAGTGAGCGTTGTGTTTTA;SOR=0.706;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=288;TCF=150;TCR=138;TR=288;WE=60573761;WS=60573743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,314:1.00:314
chr10	60577393	rs4344442	T	C	3970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=53;PP=2542;SC=TGGCTGTAACTTAAATAGCTC;SOR=0.910;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=121;TCF=68;TCR=53;TR=121;WE=60577401;WS=60577383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr10	60588553	rs4948550	T	C	4278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=66;PP=2458;SC=GCTTTTTGAATCGCCAAATGC;SOR=0.705;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=143;TCF=77;TCR=66;TR=143;WE=60588561;WS=60588543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr10	60966706	rs10509097	G	A	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.461;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=7;PP=126;ReadPosRankSum=0.096;SC=TTACAAATAGGAAAAGATGGG;SOR=0.336;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=35;TCF=11;TCR=24;TR=12;WE=60966714;WS=60966696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,13:0.34:38
chr10	60996453	rs10763600	G	A	1184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=35;PP=926;SC=AAAAGCTTTAGTTGTTCTGGG;SOR=4.461;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=38;WE=60996461;WS=60996443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr10	61005244	rs2452505	G	C	2866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=56;PP=1750;ReadPosRankSum=0.358;SC=GGATCTTTCTGTGGGCACCGT;SOR=0.676;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=176;TCF=89;TCR=87;TR=110;WE=61005252;WS=61005234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,126:0.63:199
chr10	61007534	rs1459996	A	G	1042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.101;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=26;PP=626;ReadPosRankSum=-0.966;SC=TTCACAATGAATCAAGTCATT;SOR=0.960;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=59;TCF=19;TCR=40;TR=38;WE=61007542;WS=61007524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,44:0.67:66
chr10	61007592	rs2446724	G	A	533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=15;PP=406;SC=ATACTGTAACGGCCTCCACTT;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=61007600;WS=61007582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	61014056	rs1903252	C	A	960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.039;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=16;PP=487;ReadPosRankSum=-1.647;SC=ATGTGACATCCTGTTAACTAC;SOR=0.424;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=70;TCF=45;TCR=25;TR=41;WE=61014064;WS=61014046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,46:0.57:80
chr10	61111975	rs284606	G	C	280.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=9;NR=1;PP=260;SC=GAACCGTGTGGCCTAGCCTAA;SOR=3.056;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=61111983;WS=61111965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr10	61122268	rs3078330	T	TTA	2847.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=35;PP=1743;SC=TCTCCGGGAGTGAGCACATAC;SOR=1.828;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=3;TCR=36;TR=38;WE=61122276;WS=61122257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr10	61443751	rs7071865	T	C	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=235;ReadPosRankSum=-0.065;SC=AGATATGTTATACTTTGAAAA;SOR=0.330;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=15;WE=61443759;WS=61443741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr10	61444091	rs34715719	C	T	192.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=153;SC=AGGTCCTAAACAAAAACAAAC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=61444099;WS=61444081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr10	61552692	rs1053266	G	T	3445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=74;PP=2193;SC=TGGGAGGAGGGGTGCGCCGAA;SOR=1.812;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=35;TCR=74;TR=109;WE=61552700;WS=61552682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr10	61552774	rs1053265	C	T	1294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=20;NR=24;PP=695;SC=GAGGTGGAGGCGGAGGTGGCT;SOR=1.157;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=20;TCR=24;TR=44;WE=61552782;WS=61552764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr10	61574357	.	AAC	A	162.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=0.000;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.29;MQRankSum=3.041;QD=2.50;ReadPosRankSum=0.229;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,12:0.18:65
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chr10	61802342	rs2393603	C	A	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=2.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.106;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=614;ReadPosRankSum=-0.500;SC=AAGGAAAGGACGGGGAAAATC;SOR=0.520;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=61;TCF=46;TCR=15;TR=18;WE=61802361;WS=61802332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,21:0.31:68
chr10	61802353	rs2393604	A	T	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=2.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=614;ReadPosRankSum=1.503;SC=GGGGAAAATCAGAATCACTTA;SOR=0.643;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=81;TCF=62;TCR=19;TR=22;WE=61802361;WS=61802332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,25:0.27:93
chr10	61802374	rs2393605	AA	TT	1553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FS=0.698;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.178;SOR=0.581;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:109,44:0.29:153
chr10	61802550	rs9888033	A	T	769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-1.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.557;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=28;PP=1250;ReadPosRankSum=-0.344;SC=AAGATTTCACAGTGAAACAGT;SOR=0.903;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=126;TCF=43;TCR=83;TR=40;WE=61802569;WS=61802540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,43:0.31:140
chr10	61802561	rs2393607	G	T	701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=2.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.566;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=26;PP=1250;ReadPosRankSum=0.044;SC=GTGAAACAGTGTTAGTTATAA;SOR=1.358;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=106;TCF=32;TCR=74;TR=33;WE=61802569;WS=61802540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,36:0.31:118
chr10	61802577	rs5785427	T	TC	2699.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=50;PP=2211;SC=TATAAAGCAGTCCATTCTGAT;SOR=2.365;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=1;TCR=60;TR=51;WE=61802585;WS=61802567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr10	61819024	rs34010158	TA	T	1783.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-2.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.897;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.772;NF=16;NR=21;PP=1170;ReadPosRankSum=0.062;SC=AAGTCACCACTAAAAAGCATG;SOR=0.342;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=60;TCF=30;TCR=30;TR=37;WE=61819032;WS=61819014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,68:0.78:87
chr10	61819049	rs10733757	T	G	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.570;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.895;NF=24;NR=12;PP=395;ReadPosRankSum=-1.026;SC=TAAGATAAACTATTAACAAGT;SOR=0.917;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=119;TCF=74;TCR=45;TR=36;WE=61819057;WS=61819039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,40:0.29:138
chr10	61823109	rs4568956	A	G	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.413;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=129;ReadPosRankSum=-1.710;SC=AGCCCTGCTGACATTTTAGCT;SOR=0.341;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=41;TCF=12;TCR=29;TR=14;WE=61823117;WS=61823099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,15:0.34:44
chr10	61827580	.	GT	G	825.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.173;ClippingRankSum=0.000;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.979;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.644;NF=9;NR=8;PP=438;ReadPosRankSum=0.093;SC=TGATAAAAATGTTTTTTACTA;SOR=0.172;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=38;TCF=26;TCR=12;TR=17;WE=61827588;WS=61827570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,34:0.74:46
chr10	61831271	rs10821668	T	C	2233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.903;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=44;PP=1523;ReadPosRankSum=-1.504;SC=TTGTACTGTCTTACATTCCTG;SOR=0.742;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=138;TCF=72;TCR=66;TR=86;WE=61831279;WS=61831261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,96:0.62:155
chr10	61831744	rs10740006	A	G	4104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.062;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=82;PP=2498;ReadPosRankSum=-1.480;SC=TCCTCTCATCAGCAACTCTGA;SOR=0.606;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=231;TCF=113;TCR=118;TR=163;WE=61831752;WS=61831734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,186:0.72:259
chr10	61840460	rs2241540	G	A	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=329;ReadPosRankSum=0.000;SC=AGGATGGCATGTTGATAACTT;SOR=0.368;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=18;WE=61840468;WS=61840450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,21:0.70:30
chr10	61868716	rs3750800	C	A	2557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.414;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=51;PP=1489;ReadPosRankSum=0.023;SC=GAGTGGGGGCCGTACACTTGC;SOR=0.563;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=142;TCF=67;TCR=75;TR=99;WE=61868724;WS=61868706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,112:0.72:156
chr10	61871430	rs10821675	C	G	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.317;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=180;ReadPosRankSum=1.041;SC=CTAACTATGGCAAAAATTCAC;SOR=0.964;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=42;TCF=28;TCR=14;TR=14;WE=61871438;WS=61871420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,14:0.33:42
chr10	61871598	rs4369346	A	G	716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=20;PP=469;ReadPosRankSum=-0.401;SC=GAAAATGTCAATGACAAGCAA;SOR=0.730;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=91;TCF=44;TCR=47;TR=37;WE=61871606;WS=61871588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,38:0.39:97
chr10	61893898	rs3213829	T	G	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.087;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.48;ReadPosRankSum=3.087;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr10	61900356	rs6479694	A	C	313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=333;SC=TCAGGCCCCCAAAAAAATCTT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=61900364;WS=61900346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr10	61926728	rs11814723	A	G	513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.310;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=377;ReadPosRankSum=0.253;SC=TTATCTCTGAATTAATCAGTT;SOR=1.734;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=21;WE=61926736;WS=61926718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,21:0.78:27
chr10	62021593	rs16914671	T	C	803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.883;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=13;PP=514;ReadPosRankSum=0.231;SC=GCTTTAAAGGTATTACACATT;SOR=0.840;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=39;TCR=25;TR=33;WE=62021601;WS=62021583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,35:0.47:74
chr10	62038397	rs1031689	C	A	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.909;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.590;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=10;NR=0;PP=210;ReadPosRankSum=-1.005;SC=CCAAAGTGTGCCAAATATAAC;SOR=2.215;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=10;WE=62038405;WS=62038387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr10	62038544	rs1031688	A	G	3202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=57;PP=1834;ReadPosRankSum=0.859;SC=GAGATTGTGCATTGACATTGG;SOR=0.685;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=204;TCF=114;TCR=90;TR=129;WE=62038552;WS=62038534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,149:0.64:234
chr10	62038941	rs17807133	G	C	708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.922;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=22;PP=439;ReadPosRankSum=0.354;SC=CTACTCAGCAGGTTGAAAATA;SOR=1.329;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=52;TCF=19;TCR=33;TR=32;WE=62038949;WS=62038931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,34:0.59:58
chr10	62039015	rs72822210	C	G	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=215;ReadPosRankSum=1.251;SC=TGATCACTTGCATGTATGCTG;SOR=1.061;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=11;WE=62039023;WS=62039005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr10	62039708	rs72822211	T	C	2019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.547;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=32;PP=1204;ReadPosRankSum=-0.179;SC=CTATAACTTATTGATAATTAC;SOR=0.530;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=118;TCF=71;TCR=47;TR=79;WE=62039716;WS=62039698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,90:0.69:130
chr10	62039800	rs72822212	C	A	2215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.329;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=49;PP=1243;ReadPosRankSum=-1.542;SC=CAATTTTTTCCATTAATGGAT;SOR=0.865;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=138;TCF=60;TCR=78;TR=86;WE=62039808;WS=62039790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,100:0.64:157
chr10	62493085	.	GGCT	G	37.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.473;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=2;PP=64;ReadPosRankSum=0.530;SC=CATGTTGTGGGGCTGCTGCTG;SOR=1.022;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=2;WE=62493095;WS=62493075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,3:0.15:20
chr10	62539788	rs2260179	C	G	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.697;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=160;ReadPosRankSum=-1.488;SC=TTATGGAATACTTATGCTGCA;SOR=1.402;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=10;WE=62539796;WS=62539778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr10	62544705	rs60202499	A	G	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.852;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=103;ReadPosRankSum=1.814;SC=CATTTGCTCAATTTCTTGGTC;SOR=0.399;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=7;WE=62544713;WS=62544695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr10	62548098	rs2456772	G	C	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=2.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.89;ReadPosRankSum=-1.057;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,5:0.17:30
chr10	62551889	rs2456777	A	G	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.39;ReadPosRankSum=1.334;SOR=0.700;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:108,21:0.16:129
chr10	62551890	rs2456778	A	T	3968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=47;PP=1392;SC=GAAATTTTTAATTTCCTGTTT;SOR=1.022;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=72;TCR=47;TR=118;WE=62551898;WS=62551879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr10	62553763	rs1871446	A	G	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=29;ReadPosRankSum=0.222;SC=CATATGTTATATCAACAGATA;SOR=0.760;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=24;TCF=8;TCR=16;TR=6;WE=62553771;WS=62553753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,7:0.25:28
chr10	62652863	rs11304357	TA	T	80.70	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.53;ReadPosRankSum=-1.465;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr10	63422754	rs151189963	G	GGGGCCGACCCCGGCA	4907.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=6;NR=19;PP=761;SC=CGACTCCCTGGGGGCCGACCC;SOR=1.065;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=25;WE=63422762;WS=63422744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr10	63422803	.	T	C	2860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=0.000;DP=192;ExcessHet=3.0103;FS=2.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.34;MQRankSum=1.698;QD=14.90;ReadPosRankSum=-2.782;SOR=0.637;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,131:0.68:192
chr10	63520698	rs1992625	T	C	2580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=46;NR=36;PP=1450;SC=TAGTTGGTTTTACCATTGAAG;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=46;TCR=36;TR=82;WE=63520706;WS=63520688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr10	63661340	rs4509706	T	C	385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.871;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=2;PP=351;ReadPosRankSum=-0.279;SC=AGGCAAGAGCTCAGTTTTATA;SOR=2.320;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=79;TCF=60;TCR=19;TR=23;WE=63661348;WS=63661330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,23:0.27:86
chr10	63699895	rs7073837	A	C	3306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=32;PP=2135;SC=CATTTCCCTCAAACCTATAAA;SOR=1.589;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=104;TCF=72;TCR=32;TR=104;WE=63699903;WS=63699885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr10	63700228	rs4360655	A	T	1156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=31;PP=823;ReadPosRankSum=-0.663;SC=TTTTCGGTTGAAGATTTTTCT;SOR=1.358;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=40;TCF=8;TCR=32;TR=39;WE=63700236;WS=63700218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,42:0.98:43
chr10	63700245	rs4562771	A	G	931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=23;PP=666;SC=TTCTGGAAACACTATCATTTA;SOR=2.694;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=29;WE=63700253;WS=63700235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr10	63817096	rs34466257	G	A	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.773;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=237;ReadPosRankSum=0.343;SC=ACTTGTTTTCGTTTCTGAATT;SOR=1.230;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=15;WE=63817104;WS=63817086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,15:0.45:33
chr10	63944176	rs3125730	A	C	3312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=56;NR=48;PP=1956;SC=ACCTTTAGTCACCCACAGAGG;SOR=0.726;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=56;TCR=48;TR=104;WE=63944184;WS=63944166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr10	63958112	rs3125734	T	C	930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FS=0.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.29;ReadPosRankSum=2.103;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:116,60:0.34:176
chr10	63977011	rs148142088	GAAAAA	G	1120.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=2.001;QD=28.74;ReadPosRankSum=1.639;SOR=0.741;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,32:0.82:39
chr10	63977069	rs1432414	A	T	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=0.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=241;ReadPosRankSum=-0.351;SC=CACTTTAAATACATCAAAATA;SOR=0.622;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=16;WE=63977077;WS=63977059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr10	63978077	rs11355398	GA	G	76.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.49;ReadPosRankSum=0.459;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr10	63982984	rs10740069	A	G	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.737;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=91;ReadPosRankSum=0.376;SC=AGTAAAATATATACTGTACTT;SOR=1.200;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=48;TCF=34;TCR=14;TR=11;WE=63982992;WS=63982974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,14:0.25:56
chr10	63995983	rs3852448	C	T	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.982;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=12;PP=226;ReadPosRankSum=-0.805;SC=AGCAACTATACACTTCCACCT;SOR=0.870;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=55;TCF=27;TCR=28;TR=22;WE=63995991;WS=63995973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,24:0.38:63
chr10	64000878	rs1368158	T	G	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.92;ReadPosRankSum=0.687;SOR=0.631;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,16:0.29:56
chr10	64005582	rs34205992	T	TA	101.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=70;ReadPosRankSum=0.738;SC=TCTTAAACTCTAAAGTTCTAT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=3;WE=64005590;WS=64005572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr10	64005711	rs3815999	C	T	713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.93;ReadPosRankSum=-0.407;SOR=0.563;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,39:0.43:90
chr10	64019037	rs10675790	A	ATAAAT	228.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=2;PP=172;ReadPosRankSum=-0.582;SC=CTTTTTCTTAATACTCAGTCT;SOR=0.909;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=26;TCF=10;TCR=16;TR=5;WE=64019045;WS=64019027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,9:0.20:46
chr10	64136710	rs149800343	CAG	C	538.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5033;FS=5.740;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.535;NF=1;NR=9;PP=382;ReadPosRankSum=-0.116;SC=GTGTTGCTGACAGGGGATGCT;SOR=2.225;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=10;WE=64136719;WS=64136700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,14:0.93:15
chr10	64136751	rs1873686	G	C	273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=8;PP=221;SC=CACCCCAATCGCCTTACAAGC;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=64136759;WS=64136741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	64148125	rs3852424	C	A	4327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=66;PP=2567;SC=TTATATTTCCCTTTTGTGTTC;SOR=0.731;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=142;TCF=76;TCR=66;TR=142;WE=64148133;WS=64148115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr10	64148369	rs2893897	A	G	170.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=135;SC=CGAGTGTAAGATCCCTGTGGT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=64148377;WS=64148359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	64159333	rs3758490	G	T	1015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FS=2.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.56;ReadPosRankSum=1.468;SOR=0.709;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:162,61:0.27:223
chr10	64415184	rs7076156	A	G	3488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.623;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=59;PP=2013;ReadPosRankSum=0.145;SC=AGACCATCTCACCTTCCAACC;SOR=0.831;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=226;TCF=129;TCR=97;TR=145;WE=64415192;WS=64415174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,162:0.65:248
chr10	64573771	rs224083	C	T	2659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=46;NR=46;PP=1559;SC=GCTTGGGGGACGGATAGGAAG;SOR=0.775;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=46;TCR=46;TR=92;WE=64573779;WS=64573761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr10	64893433	rs2175197	T	C	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.99;ReadPosRankSum=-0.704;SOR=0.457;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,5:0.15:33
chr10	64912097	rs7910827	C	T	1166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=3.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.695;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=37;PP=869;ReadPosRankSum=0.042;SC=CACTTCACAACGGAAATTAAA;SOR=1.781;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=59;TCF=8;TCR=51;TR=42;WE=64912105;WS=64912087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,44:0.71:62
chr10	64914016	rs35751397	T	TA	3861.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=-0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.555;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.108;NF=10;NR=42;PP=2145;ReadPosRankSum=0.380;SC=GAGGAAATAATACAGTAATCG;SOR=0.628;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=89;TCF=14;TCR=75;TR=52;WE=64914024;WS=64914006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,121:0.63:191
chr10	64927823	rs1935	C	G	1658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=34;PP=964;ReadPosRankSum=0.597;SC=CTTCCATATCCTCTACTTCAT;SOR=0.669;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=56;TCR=49;TR=71;WE=64927831;WS=64927813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,81:0.68:120
chr10	64944317	rs10740107	T	A	3523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=45;PP=2223;SC=GCAAAAATTTTAAAAAATCCA;SOR=1.152;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=117;TCF=72;TCR=45;TR=117;WE=64944325;WS=64944307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr10	64945364	rs3211105	G	A	2498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=52;PP=1443;SC=CTGAAGGCCAGTCTTTCAATT;SOR=1.511;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=30;TCR=52;TR=82;WE=64945372;WS=64945354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr10	64950569	rs111971590	C	G	534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.864;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=408;ReadPosRankSum=-0.748;SC=CATCAGCATACTGGGTAGTTC;SOR=1.338;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=43;TCF=32;TCR=11;TR=23;WE=64950577;WS=64950559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,23:0.49:47
chr10	64953311	rs4747098	G	A	442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=10;PP=240;SC=ACAATATTTTGTATTATAATT;SOR=1.739;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=64953319;WS=64953301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	64953959	rs2306264	C	G	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=114;ReadPosRankSum=-1.036;SC=TCTCTCCACCCTGTTATATTT;SOR=0.540;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=11;WE=64953967;WS=64953949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr10	64960536	rs10465990	G	A	529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=15;PP=403;SC=GTGATGATACGGTAAGACTTT;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=64960544;WS=64960526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	64967445	rs1904294	A	T	6254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=98;PP=2965;SC=TTTCACTAACACGATCTTTAG;SOR=0.720;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=199;TCF=101;TCR=98;TR=199;WE=64967453;WS=64967435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr10	64974537	rs10761725	A	T	2185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=30;PP=1235;SC=TGTTCTGACGAATGAATAATC;SOR=1.058;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=43;TCR=30;TR=73;WE=64974545;WS=64974527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr10	65139945	rs7477425	T	C	469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=12;NR=3;PP=256;SC=TTCAAGCAATTGTCCTGCTTC;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=65139953;WS=65139935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	65225244	rs1061259	GA	CG	3309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=19;PP=2219;SC=GGGGGGCGCTGACTCTCTTAC;SOR=1.402;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=46;TCR=21;TR=60;WE=65225253;WS=65225234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr10	65225450	rs1054693	C	T	1553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.976;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=40;PP=798;ReadPosRankSum=-0.479;SC=CGGCCGCTGCCTCCTCCAGTG;SOR=0.769;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=243;TCF=118;TCR=125;TR=80;WE=65225458;WS=65225440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:181,92:0.34:273
chr10	65281137	rs377532429	T	C	286.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.97;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr10	65322464	rs36027145	A	ATCAG	493.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=1.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.06;MQRankSum=5.655;QD=5.88;ReadPosRankSum=-0.194;SOR=0.916;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,20:0.24:84
chr10	65379304	rs35995927	G	A	834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.873;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=11;PP=463;ReadPosRankSum=-0.661;SC=TGCAAAAAGAGTAACTGGGGG;SOR=0.538;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=77;TCF=53;TCR=24;TR=36;WE=65379312;WS=65379294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,40:0.47:85
chr10	65383515	.	A	ATGTG	81.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=167;ReadPosRankSum=-0.126;SC=CACAATATATATGTGTGTGTG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=4;WE=65383523;WS=65383505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr10	65928826	rs10740151	T	C	5845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=58.96;NF=106;NR=82;PP=2965;SC=CACTCTTTTCTGTATAGCTTG;SOR=0.882;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=188;TCF=106;TCR=82;TR=188;WE=65928834;WS=65928816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr10	67726514	rs2105702	A	C	988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=22;PP=562;ReadPosRankSum=0.458;SC=ACTAAATATGAATCAAAGATA;SOR=0.823;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=18;TCR=31;TR=35;WE=67726522;WS=67726504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,41:0.73:56
chr10	68040325	rs4548513	C	T	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.50;ReadPosRankSum=-0.620;SOR=0.626;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,33:0.41:81
chr10	68139142	rs12761828	G	A	786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.084;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=20;PP=449;ReadPosRankSum=-1.349;SC=TAGTTTTTGCGTGTGTCTGTG;SOR=1.096;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=63;TCF=28;TCR=35;TR=34;WE=68139150;WS=68139132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,37:0.55:67
chr10	68381592	rs150747678	T	C	707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=1.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.61;ReadPosRankSum=0.199;SOR=0.786;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,35:0.67:52
chr10	68535082	rs5785786	C	CT	2093.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-1.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=11;PP=1209;ReadPosRankSum=-0.757;SC=TATATTTACTCTTTTTTTCCT;SOR=1.402;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=51;TCF=35;TCR=16;TR=40;WE=68535090;WS=68535072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,70:0.99:71
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chr10	68979343	rs4745933	C	G	509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=254;ReadPosRankSum=-0.972;SC=TCAGATCACACTTTATCTTTC;SOR=0.784;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=73;TCF=49;TCR=24;TR=25;WE=68979351;WS=68979333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,27:0.30:90
chr10	69366602	rs3750863	T	C	2156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=32;PP=1354;ReadPosRankSum=-0.777;SC=CTGACCAGGATTGGAGTACTC;SOR=0.757;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=81;TCR=47;TR=87;WE=69366610;WS=69366592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,99:0.67:148
chr10	69556814	rs41307567	T	C	1511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.772;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=18;PP=855;ReadPosRankSum=0.007;SC=AAACAAAGACTGCATGTTGGC;SOR=0.481;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=70;TCR=29;TR=61;WE=69556822;WS=69556804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,66:0.63:104
chr10	69571336	rs3740049	G	A	1093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FS=1.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.43;ReadPosRankSum=0.607;SOR=0.815;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:180,67:0.27:247
chr10	69583206	rs962608	G	A	906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.428;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=24;PP=502;ReadPosRankSum=-0.349;SC=AGTGACTCACGCCTATAATCT;SOR=1.112;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=49;TCF=10;TCR=39;TR=30;WE=69583214;WS=69583196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,37:0.66:56
chr10	69647332	rs932657	G	T	761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=20;PP=550;SC=TAAATGTACGGTTTTTGGTTT;SOR=3.528;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=69647340;WS=69647322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr10	69648569	rs2236318	T	A	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=210;ReadPosRankSum=-2.201;SC=GCTAACTCATTACTTCAGAAA;SOR=0.776;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=13;WE=69648577;WS=69648559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr10	69651125	rs7896005	A	G	2096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.792;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=29;PP=1398;ReadPosRankSum=0.195;SC=AAGGTAGAAGATTTAATTTTA;SOR=0.572;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=112;TCF=74;TCR=38;TR=83;WE=69651133;WS=69651115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,89:0.72:123
chr10	69668014	rs10997870	G	T	87.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5103;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=61;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GTTAGCATTTGGGAATTTTGG;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=4;WE=69668022;WS=69668004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr10	69692330	rs3758392	T	C	1471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=16;PP=1069;ReadPosRankSum=1.056;SC=CATTTAACAATATCAGAGATT;SOR=0.728;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=78;TCF=57;TCR=21;TR=55;WE=69692338;WS=69692320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,58:0.67:87
chr10	69719074	rs7907843	C	T	108.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.01;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr10	69750788	rs5785841	GA	G	2318.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=2.464;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.26;MQRankSum=0.347;QD=23.19;ReadPosRankSum=0.782;SOR=0.948;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,97:0.97:100
chr10	69755112	rs2308195	C	CCTAT	457.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=390;SC=TTAGTTTCTCCCTATTATATA;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=69755120;WS=69755102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr10	69773841	rs866255	G	A	738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FS=2.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.69;ReadPosRankSum=-2.465;SOR=0.887;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:150,50:0.25:200
chr10	69902549	rs3814180	T	C	348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=290;SC=CTTCTCACTGTTACAAAAAAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=69902557;WS=69902541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr10	69905300	rs2817760	G	A	1190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.786;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=22;PP=604;ReadPosRankSum=-1.077;SC=CTGATTTTCTGTCTTATAGCT;SOR=0.762;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=78;TCF=42;TCR=36;TR=44;WE=69905308;WS=69905290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,55:0.59:94
chr10	69905415	rs2635993	C	T	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5008;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=11;PP=222;ReadPosRankSum=0.398;SC=AATAAATAAACAAACAAACAA;SOR=1.402;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=13;WE=69905423;WS=69905405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr10	69908241	rs2200897	G	A	2206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.661;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=42;PP=1230;ReadPosRankSum=0.274;SC=GAATCCAAGCGAAACACAAGT;SOR=0.797;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=122;TCF=62;TCR=60;TR=85;WE=69908249;WS=69908231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,99:0.68:145
chr10	69925176	rs10823147	T	C	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=157;ReadPosRankSum=-1.565;SC=GCCACTGCGCTCCAGCCTGGG;SOR=0.569;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=50;TCF=34;TCR=16;TR=17;WE=69925184;WS=69925166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,22:0.37:59
chr10	69926097	rs2673794	T	C	2561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=47;NR=30;PP=1355;SC=CAGCCAACTCTACCACCAACC;SOR=0.823;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=47;TCR=30;TR=77;WE=69926105;WS=69926087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr10	69926319	rs61854624	C	A	5162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FS=2.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.32;ReadPosRankSum=0.368;SOR=0.945;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,131:0.69:189
chr10	69926325	rs2673793	C	T	5103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FS=1.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.44;ReadPosRankSum=1.208;SOR=0.899;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,126:0.68:186
chr10	69926334	rs10823148	C	G	1014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.003;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=25;PP=2580;ReadPosRankSum=-0.481;SC=CCGATTCTTTCCAGGAGAGGT;SOR=0.522;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=161;TCF=78;TCR=83;TR=52;WE=69926342;WS=69926309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,57:0.31:181
chr10	69933921	rs10997975	G	A	1486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FS=2.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.99;ReadPosRankSum=1.529;SOR=0.778;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:215,83:0.28:298
chr10	69933969	rs7916821	G	A	1229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.41;ReadPosRankSum=-1.174;SOR=0.660;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:202,77:0.28:279
chr10	69934258	rs3814182	C	G	8329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=137;NR=148;PP=2965;SC=CCATCCCCAGCGGAAACCAGT;SOR=0.834;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=286;TCF=138;TCR=148;TR=285;WE=69934266;WS=69934248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,317:1.00:317
chr10	69934467	rs3814183	A	G	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.183;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=328;ReadPosRankSum=1.325;SC=GTCGATGTGCACATTGAATAG;SOR=1.453;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=66;TCF=28;TCR=38;TR=23;WE=69934475;WS=69934457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,23:0.32:71
chr10	69935059	rs7097776	A	G	3378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=41;PP=1920;ReadPosRankSum=-0.344;SC=TGGGTGTGTCAGGTGTGGATT;SOR=1.224;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=113;TCF=71;TCR=42;TR=111;WE=69935067;WS=69935049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,128:0.98:130
chr10	69935235	rs6480306	T	C	3329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=56;PP=1881;SC=TTGTTGGATTTAGAAGGTTTA;SOR=1.453;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=40;TCR=56;TR=96;WE=69935243;WS=69935225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr10	69948844	rs10733838	T	C	3452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=67;PP=2244;SC=GCTCTCCAGTTACATTCACCT;SOR=1.125;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=49;TCR=67;TR=116;WE=69948852;WS=69948834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr10	69954290	rs7081213	G	A	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=471;ReadPosRankSum=-1.412;SC=AGGGTTCTGCGCTGTGCTGCA;SOR=0.732;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=15;TCR=29;TR=17;WE=69954309;WS=69954280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,21:0.41:51
chr10	69954301	rs11815154	C	T	581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.219;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=18;PP=995;ReadPosRankSum=2.800;SC=CTGTGCTGCACTCTGAGGAAG;SOR=1.341;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=37;TCF=9;TCR=28;TR=22;WE=69954309;WS=69954280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,24:0.56:43
chr10	69955140	rs7069569	T	A	1559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=36;NR=16;PP=878;SC=GGTCCAGAAATTTTTATGTAA;SOR=1.382;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=53;TCF=36;TCR=17;TR=52;WE=69955148;WS=69955130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr10	69956999	.	C	A	31	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=12;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=27;MQ=61.34;NF=2;NR=0;PP=31;QD=32.8856062736;SC=TTTCCCCCTTCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=2;WE=69957007;WS=69956989;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,2:0.25:8
chr10	69959097	rs7079549	G	T	562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=1;PP=463;SC=CATCAGTCATGTGCCTCAGCT;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=69959105;WS=69959087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	69959242	rs7079481	C	A	959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FS=0.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQRankSum=2.314;QD=4.17;ReadPosRankSum=0.454;SOR=0.742;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:167,63:0.27:230
chr10	69959345	rs11279655	GCTGGGA	G	752.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=4.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQRankSum=2.889;QD=5.26;ReadPosRankSum=0.297;SOR=1.172;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,28:0.20:143
chr10	69959397	rs7079974	G	A	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=3.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.20;ReadPosRankSum=-0.660;SOR=1.322;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,13:0.19:69
chr10	69961501	rs7913146	A	G	197.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.88;QD=24.72;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	69966392	rs3814185	T	G	200.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=89;SC=CTGCTCTTCTTTGACGTCTTC;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=69966400;WS=69966391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr10	70045157	rs35708572	G	A	2833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.986;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=57;PP=1655;ReadPosRankSum=-0.746;SC=TGAGAACAGCGTGTGCAGACC;SOR=0.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=193;TCF=96;TCR=97;TR=108;WE=70045165;WS=70045147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,129:0.57:227
chr10	70045201	rs7909365	C	A	4284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=80;PP=2753;SC=AGACAATCCCCAAGAAAACAG;SOR=1.085;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=139;TCF=59;TCR=80;TR=139;WE=70045209;WS=70045191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr10	70045264	rs3816299	A	C	1861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=42;PP=1295;SC=TCCAGTTTGAATAAACTCTAG;SOR=1.839;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=18;TCR=42;TR=60;WE=70045272;WS=70045254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr10	70051810	rs3835100	A	G	2764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=33;PP=1612;SC=GATGGGGGGAAAAAAAACAAA;SOR=1.029;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=56;TCR=33;TR=89;WE=70051818;WS=70051800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr10	70051928	rs10823171	A	G	4115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=63;PP=2330;SC=GGACGATGCCATCCTCTGCTC;SOR=0.824;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=144;TCF=81;TCR=63;TR=144;WE=70051936;WS=70051918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr10	70055967	.	TA	T	70.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=0.000;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=3.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.77;ReadPosRankSum=0.357;SOR=1.312;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,9:0.22:40
chr10	70056600	rs2394470	C	T	1000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=31;NR=11;PP=850;SC=CACTCCAGCCCGTGCGACAGA;SOR=1.547;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=44;TCF=31;TCR=13;TR=42;WE=70056608;WS=70056590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr10	70105560	rs1162753	G	A	7090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=127;NR=105;PP=2965;SC=TGAATGAGCAGTGCATGACAG;SOR=0.882;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=232;TCF=127;TCR=105;TR=232;WE=70105568;WS=70105550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,263:1.00:263
chr10	70143774	rs7899885	C	T	1909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=29;PP=935;SC=ATTTCTGACACGAGATTGTCT;SOR=1.054;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=27;TCR=29;TR=56;WE=70143782;WS=70143764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr10	70166913	rs59831114	T	G	1263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.28;SOR=0.773;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr10	70266546	rs2275716	G	T	163.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=128;SC=GACAATCACAGATAAAGATTA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=70266554;WS=70266536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	70276728	rs2664412	G	A	864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=20;PP=573;SC=TGCCCACAGCGTATAGATATG;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=26;WE=70276736;WS=70276718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr10	70332066	rs3814177	C	T	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.48;BaseQRankSum=-3.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=170;ReadPosRankSum=-0.902;SC=CTGTTTCCTGCGCCCTTTCAT;SOR=0.420;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=11;WE=70332074;WS=70332056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr10	70332477	rs142008363	G	T	1402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.490;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=37;PP=894;ReadPosRankSum=1.242;SC=ATCCAAAAAGGTTCCACTTTC;SOR=0.649;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=223;TCF=118;TCR=105;TR=74;WE=70332485;WS=70332467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,80:0.31:256
chr10	70332580	rs10823229	A	G	3499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.940;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=61;PP=2042;ReadPosRankSum=1.300;SC=CCAATGCAAGACACCCAAGTC;SOR=0.676;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=215;TCF=114;TCR=101;TR=134;WE=70332588;WS=70332570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,156:0.64:245
chr10	70392319	rs10733844	G	A	1446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=11;PP=1019;SC=TTGGAGTAGGGGGGTTTATCT;SOR=2.256;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=35;TCR=11;TR=46;WE=70392327;WS=70392309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr10	70392375	rs1747	G	A	1286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.849;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-4.357;NF=30;NR=20;PP=669;ReadPosRankSum=1.803;SC=AATTATGCAAGGCAAAGAATC;SOR=0.268;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=95;TCF=62;TCR=33;TR=50;WE=70392383;WS=70392365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,59:0.55:107
chr10	70405855	rs3998860	A	G	7294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=130;NR=98;PP=2965;SC=AGGGCACAATACAACAGAAAC;SOR=0.847;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=228;TCF=130;TCR=98;TR=228;WE=70405863;WS=70405845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,263:1.00:263
chr10	70442868	rs11284778	GA	G	183.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=144;SC=AAAATAAAGTGAAAAAAAAGA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=70442876;WS=70442858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	70481547	rs1616158	C	T	857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=24;PP=672;SC=CGAGCTCTGGCCCTTGAGGGT;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=26;WE=70481555;WS=70481537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr10	70497799	rs1149679	C	T	269.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=6;PP=163;SC=AAAAAAGGAACGTCTCCAAGG;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=70497807;WS=70497789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr10	70502288	rs1300253	G	A	3954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=75;PP=2296;SC=TACATGATACGTTTGGATTTG;SOR=1.125;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=131;TCF=56;TCR=75;TR=131;WE=70502296;WS=70502278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr10	70502426	rs1300252	T	C	228.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=8;PP=165;SC=TGGACACAGTTGTGCAATCTC;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=70502434;WS=70502416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr10	70525591	rs1149688	G	A	2031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=45;NR=24;PP=1163;SC=TCTTGCACATGTATATACATC;SOR=1.493;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=70;TCF=46;TCR=24;TR=69;WE=70525599;WS=70525581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr10	70531217	rs10823258	C	T	3263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=63;PP=1922;SC=GTAATAACAACCTGCTTTAGA;SOR=1.362;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=105;TCF=42;TCR=63;TR=105;WE=70531225;WS=70531207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr10	70532672	rs2133151	A	C	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=1;PP=31;ReadPosRankSum=0.842;SC=GTTGGAGACCAGCGTGGGCAA;SOR=0.223;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=3;WE=70532680;WS=70532662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr10	70534744	rs1782323	A	C	450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=12;NR=5;PP=272;SC=TTTACGGTATATTTTGTTTGC;SOR=0.914;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=17;WE=70534752;WS=70534734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	70549579	rs11594683	G	A	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.035;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=203;ReadPosRankSum=0.408;SC=TAAAGATTTCGGAAAACATGA;SOR=0.859;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=45;TCF=28;TCR=17;TR=19;WE=70549587;WS=70549569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,25:0.48:52
chr10	70641860	rs1341667	T	C	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=28;PP=588;ReadPosRankSum=-3.772;SC=GATGAAACATTACCCAGGTAG;SOR=0.697;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=165;TCF=70;TCR=95;TR=47;WE=70641868;WS=70641850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,51:0.28:185
chr10	70645874	rs117563383	G	A	2971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.171;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=62;PP=1849;ReadPosRankSum=2.461;SC=AACAAAAAGTGATTGAGAGAT;SOR=0.823;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=174;TCF=84;TCR=90;TR=117;WE=70645882;WS=70645864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,132:0.66:199
chr10	70652272	rs4472827	G	A	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=136;ReadPosRankSum=0.023;SC=GTAGCAAATGGAAGTATAATG;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=7;WE=70652280;WS=70652262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr10	70666271	rs72371573	AGGAAGGG	A	253.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=336;ReadPosRankSum=-0.157;SC=TGAGAATGCTAGGAAGGGGAT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=7;WE=70666285;WS=70666270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr10	70673430	rs5030891	G	A	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.444;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=89;ReadPosRankSum=-1.017;SC=TGTCCCCTGCGTTCTAACAAA;SOR=2.187;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=7;WE=70673438;WS=70673420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr10	70695972	rs12260649	A	G	954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.091;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=23;PP=533;ReadPosRankSum=-1.717;SC=AATATAAAACAGTGGCTCATG;SOR=0.532;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=57;TCF=22;TCR=35;TR=39;WE=70695980;WS=70695962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,44:0.71:62
chr10	70696009	rs7084726	T	C	741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=4;NR=23;PP=563;SC=TTTGGGAGGCTGAGGCGGGCA;SOR=3.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=27;WE=70696017;WS=70695999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr10	70696039	rs7084742	T	C	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.623;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=92;ReadPosRankSum=-0.478;SC=GTCAGGAGATTGAGACCATCC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=7;WE=70696047;WS=70696029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr10	70696713	rs5030895	C	T	200.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=132;SC=CCGTTTCTTACGCTGCTGTTG;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=8;WE=70696721;WS=70696703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	70696908	rs1539166	G	T	1243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=25;PP=758;SC=TTGAACATAGGAAATATTGTA;SOR=1.132;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=19;TCR=25;TR=44;WE=70696916;WS=70696898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr10	70700944	rs5030900	A	G	676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.768;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.326;NF=20;NR=14;PP=389;ReadPosRankSum=2.132;SC=TCCTGAAAGGAAATATGGTAG;SOR=0.799;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=58;TCR=40;TR=34;WE=70700952;WS=70700934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,37:0.36:104
chr10	70716106	rs5030896	A	G	4219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=85;PP=2440;SC=GGGACGCTGAATGGAGCGGAA;SOR=1.406;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=137;TCF=52;TCR=85;TR=137;WE=70716114;WS=70716096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr10	70722939	rs5030897	T	C	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=87;ReadPosRankSum=0.580;SC=GAAGGTAGAATTCCTTAATTC;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=6;WE=70722947;WS=70722929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr10	70722989	rs10998504	A	C	759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.008;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=4;PP=516;ReadPosRankSum=0.105;SC=TCAGTATGTCAGTATGGCTAA;SOR=1.445;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=48;TCF=39;TCR=9;TR=30;WE=70722997;WS=70722979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,32:0.62:52
chr10	70725128	rs3898314	A	G	1315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=25;PP=715;ReadPosRankSum=0.796;SC=ATTTTTCTTTATCAGGTACTG;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=141;TCF=82;TCR=59;TR=60;WE=70725136;WS=70725118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,70:0.44:158
chr10	70733266	rs5030899	T	G	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.299;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=90;ReadPosRankSum=0.884;SC=CTCTCTTTTTTGGTTTAGTGT;SOR=1.077;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=46;TCF=31;TCR=15;TR=11;WE=70733274;WS=70733256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,13:0.26:50
chr10	70734589	rs3740595	T	A	1275.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=6.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.23;ReadPosRankSum=2.063;SOR=1.945;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,61:0.87:70
chr10	70734599	rs5030902	A	T	3051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.39;SOR=2.115;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr10	70742192	rs2251911	T	G	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.350;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=132;ReadPosRankSum=-0.950;SC=TAAGCACTTATGTTATCACCT;SOR=0.180;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=10;WE=70742200;WS=70742182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
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chr10	70856852	rs2229498	G	A	3094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=39;PP=1810;SC=TATCCTACGCGGAGAGCCAGG;SOR=0.990;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=61;TCR=39;TR=100;WE=70856860;WS=70856842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr10	70884013	rs5030909	G	A	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=9;PP=171;ReadPosRankSum=-2.305;SC=GAGTAGGGGGGACGCGGCGGC;SOR=0.756;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=49;TCF=22;TCR=27;TR=16;WE=70884021;WS=70884003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,16:0.31:51
chr10	70892791	rs5030932	C	T	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.531;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=355;ReadPosRankSum=1.966;SC=ACGGAGAATCCGTTTCAGGAA;SOR=1.685;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=47;TCF=20;TCR=27;TR=23;WE=70892799;WS=70892781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,25:0.45:55
chr10	70922159	rs61871361	T	C	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.37;ReadPosRankSum=0.272;SOR=0.564;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,13:0.27:48
chr10	70931199	rs34811737	G	A	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.296;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.590;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=82;ReadPosRankSum=0.440;SC=TGAAATGTTCGTTCATGTATA;SOR=0.116;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=7;WE=70931207;WS=70931189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr10	70945840	rs5030910	C	T	927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.410;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=20;PP=465;ReadPosRankSum=-0.708;SC=AAAACATCTTCATAGAGGTAT;SOR=0.529;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=113;TCF=55;TCR=58;TR=43;WE=70945848;WS=70945830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,51:0.37:138
chr10	70945865	rs41279648	C	G	1726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.314;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=34;PP=877;ReadPosRankSum=-0.345;SC=TTACCTCTTACGGTACAGCTT;SOR=0.933;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=102;TCF=47;TCR=55;TR=60;WE=70945873;WS=70945855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,78:0.60:129
chr10	70951565	rs370229180	AT	A	82.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.27;MQRankSum=1.543;QD=3.31;ReadPosRankSum=2.857;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr10	70955056	rs5018859	A	G	1562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.120;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=39;PP=823;ReadPosRankSum=0.236;SC=CCCGTGCTTTATGACATCTGC;SOR=0.759;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=247;TCF=129;TCR=118;TR=79;WE=70955064;WS=70955046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:193,93:0.33:286
chr10	70958327	rs5030911	C	T	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.066;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=16;PP=227;ReadPosRankSum=-1.080;SC=TGACTTTCCTCGTGACAAGAT;SOR=0.455;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=86;TCF=28;TCR=58;TR=25;WE=70958335;WS=70958317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,25:0.27:91
chr10	70962381	rs2279928	C	G	1593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=40;PP=925;ReadPosRankSum=1.897;SC=TGAGAAGTTGCTATTTATAAA;SOR=0.742;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=101;TCF=31;TCR=70;TR=59;WE=70962389;WS=70962371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,68:0.62:110
chr10	70992413	rs874557	G	A	191.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=112;SC=ATGATACCTAGTGGCTGTGAT;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=70992421;WS=70992403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr10	70992634	rs35746503	C	T	1122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.330;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=27;PP=530;ReadPosRankSum=1.516;SC=TTCTACCCAACGCCCAATGAA;SOR=0.724;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=194;TCF=102;TCR=92;TR=55;WE=70992642;WS=70992624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,66:0.30:223
chr10	70992664	rs874556	C	T	5263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=87;PP=2965;SC=GGGAACGGCACAGAGGTACCT;SOR=0.734;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=175;TCF=88;TCR=87;TR=175;WE=70992672;WS=70992654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr10	70992912	rs5030970	A	T	2512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=49;PP=1495;SC=GGGAAGCAGCAGTGCAGGAAT;SOR=1.053;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=38;TCR=49;TR=87;WE=70992920;WS=70992902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr10	70992949	rs5030971	T	A	1544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=26;PP=792;SC=TGGGCACGGGTGGGAGTCAGG;SOR=1.508;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=14;TCR=26;TR=40;WE=70992957;WS=70992939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr10	70992970	rs5030972	G	A	920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=15;PP=440;SC=CTGCACGCAGGAGAGAACAGC;SOR=3.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=70992978;WS=70992960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	70998738	rs4145930	G	A	3081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=44;PP=1771;SC=AAGTTTCTGCGGCTCAGTTGC;SOR=0.899;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=105;TCF=60;TCR=45;TR=104;WE=70998746;WS=70998728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr10	71005807	rs41279650	G	A	752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.807;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=15;PP=434;ReadPosRankSum=0.701;SC=AAGGGGCTGCGTCCACAGATC;SOR=0.585;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=83;TCF=52;TCR=31;TR=36;WE=71005815;WS=71005797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,40:0.44:91
chr10	71010026	rs4745978	T	C	616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=4;PP=377;SC=GGAATGCAGCTGCTGCTTTCT;SOR=1.708;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=21;WE=71010034;WS=71010016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	71018660	rs1111335	T	C	1341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=32;PP=794;SC=AGATGACATCTGGACCCGATA;SOR=1.747;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=15;TCR=32;TR=47;WE=71018668;WS=71018650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr10	71027231	rs2611	G	C	742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=7;PP=438;SC=TGTGTTGCAGGTGTTGATAGT;SOR=1.445;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=13;TCR=7;TR=20;WE=71027239;WS=71027221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr10	71055459	rs4746837	T	C	1746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.87;SOR=1.000;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr10	71060610	rs906220	A	G	4222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=71;NR=69;PP=2288;SC=AGAGCCCTGCATGATTTTGTA;SOR=0.836;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=140;TCF=71;TCR=69;TR=140;WE=71060618;WS=71060600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr10	71060634	rs906221	G	A	3842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=59;NR=65;PP=2193;SC=AGAAAATCCTGGAATACCCAC;SOR=1.011;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=125;TCF=60;TCR=65;TR=124;WE=71060642;WS=71060624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr10	71060696	rs906222	G	A	1275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=28;PP=854;SC=AGGATACAAGGTTAATATACA;SOR=2.007;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=40;WE=71060715;WS=71060686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr10	71060707	rs906223	T	A	1079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=22;PP=724;SC=TTAATATACATAAATCAATTG;SOR=1.949;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=34;TCF=11;TCR=23;TR=33;WE=71060715;WS=71060686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr10	71098195	rs906216	G	T	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.640;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=181;ReadPosRankSum=0.867;SC=GGTTTGAGAGGGAGCATTTGA;SOR=1.473;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=12;WE=71098203;WS=71098185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr10	71098295	rs7912524	T	A	759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.831;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=15;PP=367;ReadPosRankSum=0.714;SC=CAGCTGGAAGTGGTGCTGTGC;SOR=0.859;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=71;TCF=37;TCR=34;TR=32;WE=71098303;WS=71098285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,37:0.45:83
chr10	71098436	rs10578071	AGT	A	96	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.8370;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=3;PP=180;SC=TGGAGATGTGAGTGTGTGTGT;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=5;WE=71098445;WS=71098426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr10	71103597	rs1133189	C	G	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.190;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=209;ReadPosRankSum=0.429;SC=ACAAGTATCTCTATGCCATGC;SOR=1.048;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=34;TCR=14;TR=17;WE=71103605;WS=71103587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,18:0.33:54
chr10	71142420	rs748235	G	A	3809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=61;NR=67;PP=2275;SC=ACCTCACCAAGGACATGCTGC;SOR=0.926;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=128;TCF=61;TCR=67;TR=128;WE=71142428;WS=71142410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr10	71144702	rs749105	G	A	398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=291;SC=CTCAGTGATCGGGCAGCACTG;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=71144710;WS=71144692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	71152091	rs2278745	T	C	2129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=39;PP=1214;SC=GAGAGGACACTCACAGTCAGG;SOR=1.022;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=73;TCF=34;TCR=39;TR=73;WE=71152099;WS=71152081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr10	71158268	rs1227938	C	T	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=3.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.68;ReadPosRankSum=-1.153;SOR=0.216;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,12:0.32:38
chr10	71167119	rs10998762	G	A	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=225;ReadPosRankSum=-0.289;SC=AGGACCCCTTGCACCCACCTG;SOR=0.884;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=42;TCF=15;TCR=27;TR=16;WE=71167127;WS=71167109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,17:0.37:46
chr10	71168685	rs55953810	A	T	1381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=9;PP=758;SC=CACCTTCTTCATGGCCTGCAG;SOR=1.656;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=34;TCR=9;TR=43;WE=71168693;WS=71168675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr10	71174636	rs150956058	TAC	T	102.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=2.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.19;MQRankSum=3.871;QD=0.93;ReadPosRankSum=-1.762;SOR=1.123;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:97,14:0.13:111
chr10	71176012	rs5030920	A	G	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.66;ReadPosRankSum=0.716;SOR=0.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,34:0.26:133
chr10	71243323	rs10823396	C	G	258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=0;PP=205;SC=CTAACAGGGCCCTTTCTGTGC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=71243331;WS=71243313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	71244832	rs2305201	C	A	2219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=46;NR=25;PP=1204;SC=CAGATGGTGCCTCCCCTGTAC;SOR=1.112;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=46;TCR=25;TR=71;WE=71244840;WS=71244822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr10	71265826	rs114494478	G	A	1061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.476;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=15;PP=650;ReadPosRankSum=-2.554;SC=TCGGGGCTGTGGCTCCTGCCA;SOR=0.378;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=71;TCF=49;TCR=22;TR=44;WE=71265834;WS=71265816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,48:0.64:75
chr10	71267191	rs77297872	C	T	996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.889;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=8;PP=756;ReadPosRankSum=0.817;SC=CAGCCACGCCCATGGCCAGGT;SOR=1.426;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=56;TCF=43;TCR=13;TR=39;WE=71267199;WS=71267181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,39:0.67:58
chr10	71267412	rs1665583	T	G	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=4.493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.35;ReadPosRankSum=1.221;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,18:0.72:25
chr10	71390392	rs1947741	C	T	3743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=75;NR=50;PP=1992;SC=TTTCGGCATACATGTCACCAG;SOR=0.956;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=126;TCF=76;TCR=50;TR=125;WE=71390400;WS=71390382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr10	71390455	rs2306141	C	G	2498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=49;PP=1342;ReadPosRankSum=-0.114;SC=GAATGAATGGCCTTTACCCAG;SOR=0.654;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=150;TCF=74;TCR=76;TR=99;WE=71390463;WS=71390445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,116:0.68:171
chr10	71391621	rs2306139	G	A	1660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.206;NF=32;NR=31;PP=811;ReadPosRankSum=-0.698;SC=CTGTGGAGTGGGACAGATGGC;SOR=0.684;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=120;TCF=58;TCR=62;TR=63;WE=71391629;WS=71391611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,79:0.55:143
chr10	71391707	rs2262274	C	T	1735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=26;PP=761;SC=CTGAAGCCCTCTTTGCAGAGA;SOR=1.765;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=38;TCF=11;TCR=27;TR=37;WE=71391727;WS=71391697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr10	71391719	rs144716370	C	CTGGGTAAGACT	1424.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=14;PP=2957;SC=TTGCAGAGAGCTGGGGAAGAT;SOR=2.649;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=15;WE=71391727;WS=71391697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr10	71392495	rs2616089	T	A	3835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.13;SOR=1.528;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr10	71392501	rs2616088	G	C	3926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.63;SOR=1.434;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr10	71392557	rs12020	C	T	3973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=73;NR=58;PP=2141;SC=GCTTCTTCAACAGGGGCCATG;SOR=0.720;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=131;TCF=73;TCR=58;TR=131;WE=71392565;WS=71392547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr10	71392692	rs1052152	T	C	3680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=59;PP=2029;SC=AGTGGCATCTTGGCAACCATG;SOR=0.737;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=123;TCF=64;TCR=59;TR=123;WE=71392700;WS=71392682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr10	71562437	rs10998973	G	A	3448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=57;NR=59;PP=1827;SC=AAATGGAGACGGCTATTTTGG;SOR=0.966;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=117;TCF=57;TCR=60;TR=116;WE=71562445;WS=71562427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr10	71583757	rs11598684	C	T	2050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.477;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=27;PP=1039;ReadPosRankSum=-1.317;SC=CAATGACAACCGATTTTTGCT;SOR=0.434;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=112;TCF=75;TCR=37;TR=77;WE=71583765;WS=71583747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,92:0.68:135
chr10	71620388	rs10762320	G	A	604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.52;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=10;NR=3;PP=266;SC=TCGGGTTGTCGTTCCTCTTGC;SOR=1.426;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=71620396;WS=71620378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	71620436	rs67173564	A	AC	1594.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=11;PP=654;SC=CCTGGGCAGAACCTGCAGCCA;SOR=0.874;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=21;TCF=9;TCR=12;TR=18;WE=71620444;WS=71620426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
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chr10	71620671	rs4341432	C	G	189.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=4;NR=4;PP=115;SC=GCTAGGCTGGCGAACGGCTTC;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=8;WE=71620679;WS=71620661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	71634969	rs59942449	G	A	853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.149;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=25;PP=482;ReadPosRankSum=-0.559;SC=TTGCTTCTCCGTGCTGGCCTG;SOR=0.358;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=103;TCF=31;TCR=72;TR=39;WE=71634977;WS=71634959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,42:0.38:111
chr10	71634986	rs59126631	A	T	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.414;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=19;PP=306;ReadPosRankSum=-1.642;SC=CCTGTCCTCTAAACCATGGCA;SOR=0.276;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=76;TCF=19;TCR=57;TR=28;WE=71634994;WS=71634976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,29:0.37:79
chr10	71637905	rs10823446	C	T	260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5004;FS=0.000;HP=6;HapScore=3;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=143;SC=AGCCCTCCCCCCCATGAAAGC;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=8;WE=71637913;WS=71637895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	71640255	rs2395272	G	A	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.584;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=150;ReadPosRankSum=0.804;SC=CTCTCTCCCCGCAGGGGTCCC;SOR=1.453;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=39;TCF=20;TCR=19;TR=14;WE=71640263;WS=71640245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,13:0.25:51
chr10	71640491	rs1227783	C	T	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=34;ReadPosRankSum=-1.150;SC=AGGAAAGTGGCCTGGCTAAAT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=3;WE=71640499;WS=71640481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr10	71647196	rs113746607	G	GT	44.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=2.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.86;ReadPosRankSum=-1.654;SOR=0.250;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr10	71649046	rs10999015	G	A	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=38;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.163;NF=6;NR=0;PP=84;ReadPosRankSum=-1.161;SC=ATGGAGCACAGGGGACAGGGA;SOR=0.730;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=6;WE=71649054;WS=71649036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr10	71649064	rs143450012	GGGGGGCAGGGAGGAGCACA	G	443.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=3.362;NF=4;NR=4;PP=779;ReadPosRankSum=-0.351;SC=GGAGGAGCACGGGGGGCAGGG;SOR=0.610;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=8;WE=71649090;WS=71649054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr10	71649309	rs2683572	A	G	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=2.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.44;ReadPosRankSum=0.934;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,20:0.27:74
chr10	71655443	rs1227744	G	A	2262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=48;PP=1385;SC=TCATGGGGGAGCAGGAGCACC;SOR=1.582;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=27;TCR=48;TR=75;WE=71655451;WS=71655433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr10	71657272	rs1227746	A	G	5931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=84;PP=2965;SC=GCTCCAGCCAAATAATTGCCC;SOR=0.749;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=184;TCF=100;TCR=84;TR=184;WE=71657280;WS=71657262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr10	71658512	rs1227747	G	A	6753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=116;NR=108;PP=2965;SC=AAAGGCGGACGTTCCAGGTAG;SOR=0.701;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=224;TCF=116;TCR=108;TR=224;WE=71658520;WS=71658502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr10	71665421	rs10999022	T	C	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=1.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.81;ReadPosRankSum=1.603;SOR=0.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,15:0.31:48
chr10	71665676	rs2683575	G	C	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.539;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=147;ReadPosRankSum=0.152;SC=TTCCAACCTAGGTGGCTGTGC;SOR=1.911;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=11;WE=71665684;WS=71665666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr10	71678058	rs2274181	C	G	959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=25;NR=11;PP=506;SC=CCGGAATTGCCGTGGCTGGGA;SOR=1.022;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=25;TCR=12;TR=36;WE=71678066;WS=71678048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr10	71681530	rs2274180	C	A	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=277;ReadPosRankSum=1.875;SC=GCAGGGGCACCGAGGCAGGAG;SOR=0.519;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=14;WE=71681538;WS=71681520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr10	71681766	rs4237324	A	G	1620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.785;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=32;PP=901;ReadPosRankSum=-0.675;SC=ACATCCACACAGGCCCCAGCA;SOR=0.497;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=45;TCR=47;TR=64;WE=71681774;WS=71681756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,74:0.72:103
chr10	71689966	rs59283631	TG	T	274.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.622;HP=9;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=152;ReadPosRankSum=0.547;SC=GAAGGGGAGATGGGGGGGGGC;SOR=1.981;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=21;TCF=7;TCR=14;TR=11;WE=71689974;WS=71689956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr10	71696413	rs12571041	C	T	1985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.700;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=32;PP=945;ReadPosRankSum=-0.953;SC=CCATACTCTGCACCCAAAACC;SOR=0.593;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=112;TCF=66;TCR=46;TR=76;WE=71696421;WS=71696403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,92:0.69:133
chr10	71697229	rs3750782	A	G	246.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=0;PP=205;SC=AACTGAGGCGAGAGTAGGCTA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=71697237;WS=71697225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	71697516	rs3750781	G	C	2399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=45;PP=1216;SC=TGATGGGCCAGGGGTGTGGGC;SOR=0.852;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=41;TCR=45;TR=86;WE=71697524;WS=71697506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr10	71703995	rs3750780	A	G	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.180;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=81;ReadPosRankSum=-0.047;SC=CTGGGACCCAACACCAGGGGT;SOR=0.092;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=9;WE=71704003;WS=71703985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr10	71849772	rs16927265	A	G	1981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.453;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=36;PP=1078;ReadPosRankSum=0.269;SC=TTTAGCTCAGACCCCATTCTG;SOR=0.740;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=252;TCF=144;TCR=108;TR=89;WE=71849780;WS=71849762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,103:0.37:279
chr10	71868763	rs2271698	G	A	3395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=60;NR=50;PP=1695;SC=GAAATAACCCGCGGCATTTTC;SOR=0.772;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=60;TCR=50;TR=110;WE=71868771;WS=71868753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr10	71876382	rs2394656	C	T	850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=6;PP=577;SC=GCTCACCAAACGCTTTGCGGT;SOR=2.019;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=28;WE=71876390;WS=71876372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
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chr10	71905569	rs3750774	C	A	2798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=41;PP=1737;SC=CGGTGCCGGGCAGGCAGCGTG;SOR=0.946;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=55;TCR=41;TR=95;WE=71905577;WS=71905559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
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chr10	72014863	rs60225321	G	A	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.63;ReadPosRankSum=-0.185;SOR=0.617;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,35:0.38:93
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chr10	72026279	rs3812697	G	C	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.385;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=94;ReadPosRankSum=-0.393;SC=CCCAGCTCCAGTTGCAACTTG;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=7;WE=72026287;WS=72026269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
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chr10	72043460	rs10999239	T	G	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=17;PP=407;ReadPosRankSum=-0.038;SC=GCTCCGGCGGTCTCCGATGGC;SOR=0.569;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=50;TCF=19;TCR=31;TR=29;WE=72043468;WS=72043450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,31:0.55:56
chr10	72061017	rs3750765	C	T	137.18	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5384;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=91;ReadPosRankSum=0.157;SC=CCGCCCCCAGCCCCCAGGCTT;SOR=1.402;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=7;WE=72061025;WS=72061009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr10	72061079	rs10740336	C	T	961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=23;NR=7;PP=508;SC=GTGGCCTCTGCCCCTTGCTGG;SOR=1.675;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=30;WE=72061087;WS=72061069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr10	72061420	rs4746997	A	G	908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=22;PP=621;SC=AGCCCTGTGCAAAGGGCCATC;SOR=3.334;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=26;WE=72061428;WS=72061410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr10	72083888	rs3833735	GCA	G	645.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.569;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.107;NF=1;NR=16;PP=668;ReadPosRankSum=0.907;SC=GGCCAGGAAGGCACAGAGGAA;SOR=1.179;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=17;WE=72083897;WS=72083878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr10	72136000	rs10999304	C	T	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=54;ReadPosRankSum=0.697;SC=GGCGCCATCACTCAGTGGTTT;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=4;WE=72136008;WS=72135990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr10	72179746	rs1043098	C	T	6032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=105;PP=2965;SC=CACCCTGCCACCTGCCCAATA;SOR=0.796;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=205;TCF=100;TCR=105;TR=205;WE=72179754;WS=72179736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr10	72181460	rs3793809	G	T	1509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=30;PP=885;SC=TCATTTTATTGGTCCTAACTA;SOR=1.238;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=22;TCR=30;TR=52;WE=72181468;WS=72181450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr10	72195439	rs1904589	T	C	4916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=73;PP=2900;SC=GGCCCCAGGGTGCTTCAGCCA;SOR=0.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=166;TCF=93;TCR=73;TR=166;WE=72195447;WS=72195429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr10	72201219	rs10999338	G	A	1192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=13;PP=578;SC=CGCGGCACGCGGCACTGCCTA;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=24;TCR=13;TR=37;WE=72201227;WS=72201209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr10	72207517	rs34717077	AC	A	1161.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=5;PP=1010;SC=CCACCAGCCTACCAGATTGTG;SOR=2.765;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=25;WE=72207525;WS=72207507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr10	72289539	rs12785079	C	T	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.545;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=66;ReadPosRankSum=0.118;SC=GTTCTTTTTGCCCCTATTTCC;SOR=0.240;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=8;WE=72289547;WS=72289529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr10	72289778	rs2275060	C	T	2133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.220;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=40;PP=1264;ReadPosRankSum=-0.532;SC=CCCAGCCTCTCAGGGTTCAGG;SOR=0.700;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=138;TCF=73;TCR=65;TR=90;WE=72289786;WS=72289768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,97:0.66:146
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chr10	72292258	rs10999378	G	C	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.23;ReadPosRankSum=1.054;SOR=0.346;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,5:0.15:34
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chr10	72300743	rs12776085	C	G	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-4.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=0;PP=411;ReadPosRankSum=-0.020;SC=GCTTGGGAGCCTGACAATTTC;SOR=1.038;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=24;WE=72300751;WS=72300740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,27:0.75:36
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chr10	72306978	rs3824763	C	A	871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.989;HP=4;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=14;PP=1073;ReadPosRankSum=0.622;SC=CTGGTGTGGCCTTTTGGTGAG;SOR=0.511;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=63;TCF=40;TCR=23;TR=37;WE=72306986;WS=72306957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,40:0.61:66
chr10	72307053	rs67684173	T	C	796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.679;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=22;PP=454;ReadPosRankSum=0.664;SC=CCCCCTTCTCTGGCCCCAGGT;SOR=0.759;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=119;TCF=64;TCR=55;TR=44;WE=72307061;WS=72307043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,46:0.35:131
chr10	72307214	rs7478096	C	A	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.872;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=87;ReadPosRankSum=-0.210;SC=TGAGCCCCCACCCCACCCCAC;SOR=1.863;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=8;WE=72307222;WS=72307204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr10	72324143	rs7093516	A	G	2444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=28;PP=1484;SC=AAGAGGCGCAAGAAATGCGGA;SOR=1.286;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=49;TCR=28;TR=77;WE=72324151;WS=72324133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr10	72358577	rs885822	G	A	8131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=143;NR=139;PP=2965;SC=CCACTTCCGAGTGGCGCTCCC;SOR=0.706;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=282;TCF=143;TCR=139;TR=282;WE=72358585;WS=72358567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,310:1.00:310
chr10	72358655	rs885821	G	A	3054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.540;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=69;PP=1902;ReadPosRankSum=0.918;SC=CCTTGGCTTCGGCAGAGATGC;SOR=0.640;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=190;TCF=87;TCR=103;TR=126;WE=72358663;WS=72358645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,135:0.66:206
chr10	72358722	rs28933375	T	C	863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.210;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=21;PP=482;ReadPosRankSum=-1.827;SC=CTCCACCTCGTTGTCCGTGAG;SOR=0.466;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=116;TCF=55;TCR=61;TR=43;WE=72358730;WS=72358712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,49:0.36:138
chr10	72360197	rs116554195	T	C	999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FS=2.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.75;ReadPosRankSum=0.099;SOR=0.829;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,59:0.34:174
chr10	72360224	rs115281140	C	T	858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FS=2.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.96;ReadPosRankSum=-1.363;SOR=0.826;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,56:0.32:173
chr10	72432498	rs12762780	C	A	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.01;ReadPosRankSum=0.467;SOR=0.597;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,10:0.17:59
chr10	72432521	rs12762616	A	C	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=1.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.50;ReadPosRankSum=-1.372;SOR=0.898;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,16:0.18:90
chr10	72434194	rs614201	G	A	989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.069;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=10;PP=572;ReadPosRankSum=-1.728;SC=TCAGGCTAAGGGGCCCACCTA;SOR=0.238;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=48;TCF=36;TCR=12;TR=36;WE=72434202;WS=72434184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,41:0.76:54
chr10	72462283	rs12775317	G	A	913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=18;PP=518;ReadPosRankSum=-0.459;SC=AGTGTTTCCCGGTCACTTCTG;SOR=0.582;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=25;TCR=26;TR=36;WE=72462291;WS=72462273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,40:0.69:58
chr10	72468584	rs117280157	C	G	679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.866;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=18;PP=432;ReadPosRankSum=-0.568;SC=TGGGGTGGGCCCCACCCCACC;SOR=0.430;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=88;TCF=30;TCR=58;TR=30;WE=72468600;WS=72468574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,36:0.35:102
chr10	72490102	rs7895554	C	T	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.616;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=153;ReadPosRankSum=0.221;SC=TTCTGGGGCCCACCACATGGA;SOR=1.270;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=34;TCF=8;TCR=26;TR=11;WE=72490110;WS=72490092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,13:0.33:39
chr10	72492155	rs41277996	G	C	1319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.943;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=32;PP=833;ReadPosRankSum=0.964;SC=TGGCAGCTGTGCCGTGAGCTC;SOR=0.549;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=78;TCF=27;TCR=51;TR=51;WE=72492163;WS=72492145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,56:0.67:83
chr10	72492212	rs2587478	T	C	911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=23;PP=687;SC=TTGGCCTGGTTCCAGTGTCCT;SOR=2.621;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=29;WE=72492220;WS=72492202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr10	72492244	rs10740357	A	C	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=297;ReadPosRankSum=-0.857;SC=GAGGAGCTGGACTGCCACTGC;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=14;WE=72492252;WS=72492234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
chr10	72493876	rs10740358	T	C	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=288;ReadPosRankSum=-0.993;SC=TTCCCCACGTTGCCCCTGGCT;SOR=1.085;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=21;WE=72493884;WS=72493866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,24:0.80:30
chr10	72494778	rs12765664	G	A	654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=3;PP=507;SC=AAGGCAGCCCGTCCTCCCTGG;SOR=2.737;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=22;WE=72494786;WS=72494768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr10	72496375	rs1861517	A	G	576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=0;PP=444;SC=CTCCATCACTACCCTTTGTTC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=72496383;WS=72496365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	72500763	rs10823607	T	C	3776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=52;PP=1874;SC=GGAGGCCGCCTGTGCTTAGGG;SOR=0.842;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=68;TCR=52;TR=120;WE=72500771;WS=72500753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr10	72504920	rs10999505	C	T	37.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=0;PP=20;SC=GAGTGGGGGACGCTGGGCAGT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=72504928;WS=72504910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr10	72505208	rs7907248	A	G	1916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.90;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr10	72505243	rs7923892	T	C	1373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=25;NR=25;PP=638;SC=ACCCATTCCATGGTTTACATT;SOR=0.914;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=25;TCR=25;TR=50;WE=72505251;WS=72505233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr10	72513635	rs12774070	C	A	4392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=84;NR=64;PP=2311;SC=ACAGTGCCTGCTGCCCCTCTC;SOR=0.717;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=148;TCF=84;TCR=64;TR=148;WE=72513643;WS=72513625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr10	72513682	rs2587475	C	T	3799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=68;PP=2260;SC=CCAAAGCCTGCGCCGGGGACC;SOR=0.945;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=130;TCF=62;TCR=68;TR=130;WE=72513690;WS=72513672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr10	72517837	rs6480463	C	T	833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.849;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=10;PP=378;ReadPosRankSum=0.565;SC=GCAGCCTGCCCGCCTGTGGAG;SOR=0.904;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=67;TCF=44;TCR=23;TR=32;WE=72517845;WS=72517827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,40:0.50:80
chr10	72520259	rs61573157	C	T	1432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.894;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=31;PP=931;ReadPosRankSum=0.704;SC=AGACCCTGGCCCAACCTCACT;SOR=0.750;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=152;TCF=80;TCR=72;TR=63;WE=72520267;WS=72520249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,70:0.39:180
chr10	72532037	rs2253793	C	T	5349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=89;PP=2965;SC=ATGTAAGTTCCGTGACAGCAG;SOR=0.764;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=184;TCF=94;TCR=90;TR=183;WE=72532045;WS=72532027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr10	72532238	rs2253801	T	C	3041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=40;PP=1822;SC=CCTTGGTGAGTCCCCCAAATG;SOR=0.888;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=57;TCR=40;TR=96;WE=72532246;WS=72532228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr10	72533910	rs7077672	C	T	567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=16;NR=3;PP=318;SC=CCAGGTCCCACTGGCCTCACC;SOR=2.636;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=72533918;WS=72533900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr10	72535007	rs2254174	C	T	6205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=106;NR=88;PP=2965;SC=TTCCAGGATCCGACACAGGAG;SOR=0.784;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=194;TCF=106;TCR=88;TR=194;WE=72535015;WS=72534997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr10	72536288	rs7897034	T	C	410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=13;PP=295;SC=TTTGCTGCATTGTGGTAAGGT;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=72536296;WS=72536278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	72536779	rs2254422	A	C	1179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=3;PP=811;SC=TGCTGACTCCACAGGGCTGGA;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=30;TCR=3;TR=33;WE=72536787;WS=72536769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr10	72537450	rs2254445	T	C	579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=2;PP=369;SC=TAGGTCCTCCTTGCTGCTCCT;SOR=2.531;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=72537458;WS=72537440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	72619205	rs827255	C	T	6201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=99;NR=107;PP=2965;SC=AGGCAGAAATCGTGAGGATAG;SOR=0.896;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=206;TCF=99;TCR=107;TR=206;WE=72619213;WS=72619195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr10	72635143	rs3998628	ATT	A	2256.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=10;PP=1052;SC=TCCTTCATTTATTTTTTTGTT;SOR=2.041;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=41;TCF=27;TCR=14;TR=34;WE=72635152;WS=72635133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr10	72636450	rs923177	T	G	6401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.536;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=115;PP=2965;ReadPosRankSum=1.659;SC=TTTCTTCTCTTGGAAATTTAG;SOR=0.618;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=213;TCF=98;TCR=115;TR=212;WE=72636458;WS=72636440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,236:1.00:237
chr10	72643671	rs9712	C	T	1657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=35;NR=17;PP=897;SC=TCAGTCACCCCTTCCCCCGGA;SOR=1.234;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=35;TCR=17;TR=52;WE=72643679;WS=72643661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr10	72648086	rs827239	A	G	796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.56;SOR=1.143;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr10	72648134	rs827238	A	G	1765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.23;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr10	73039860	rs4415677	C	T	545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.6764;FS=6.608;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=364;ReadPosRankSum=1.923;SC=GAGGCACAGGCCTAGCTCCAT;SOR=2.737;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=18;WE=73039868;WS=73039850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,20:0.77:26
chr10	73044382	rs10823716	T	A	521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=6;PP=290;SC=TGGGCAAGAGTGCCAGCAGGA;SOR=1.127;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=18;WE=73044390;WS=73044372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	73044413	rs10762434	G	C	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.452;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=272;ReadPosRankSum=0.518;SC=AAGGCCGGGGGTGTCCTGTGC;SOR=1.139;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=21;WE=73044421;WS=73044403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,25:0.69:36
chr10	73044580	rs12770025	G	A	2686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=49;PP=1504;ReadPosRankSum=1.778;SC=GGAGCTCCGCGGGCACCACCA;SOR=0.726;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=149;TCF=83;TCR=66;TR=110;WE=73044588;WS=73044570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,122:0.73:166
chr10	73044674	rs10999762	G	A	1452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=35;PP=936;ReadPosRankSum=-2.413;SC=CCATCCCTGAGGATGCTGGAG;SOR=0.728;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=115;TCF=54;TCR=61;TR=66;WE=73044682;WS=73044664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,70:0.58:121
chr10	73044924	rs7350453	A	G	589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.13;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	73044930	rs7350455	C	T	651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.45;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	73044954	rs6480503	A	G	1052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=9;PP=784;SC=GAAATTTCCCAGGCAAAGGCC;SOR=2.362;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=39;WE=73044962;WS=73044944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr10	73046617	rs34957097	A	G	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=1.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.65;ReadPosRankSum=-0.863;SOR=0.483;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,22:0.32:69
chr10	73046625	rs7069294	C	T	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=1.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.04;ReadPosRankSum=0.614;SOR=0.430;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,18:0.29:62
chr10	73047555	rs7074042	C	T	527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=3.351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.30;ReadPosRankSum=1.835;SOR=0.539;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:121,39:0.24:160
chr10	73047593	rs7074280	G	A	2629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=49;PP=1508;SC=TGCCAGAGCCGGGACAGCCAT;SOR=1.536;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=82;TCF=32;TCR=50;TR=81;WE=73047601;WS=73047583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr10	73050637	rs3842239	C	CTG	207.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=169;ReadPosRankSum=0.573;SC=GGCCTGGTCTCTGCTGCCCCT;SOR=0.200;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=5;WE=73050645;WS=73050627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr10	73050983	rs3740462	C	T	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=417;ReadPosRankSum=-0.807;SC=CCAGAGTTTGCTCTAGAGATA;SOR=0.446;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=19;WE=73050991;WS=73050973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,20:0.80:25
chr10	73051388	rs3740460	T	C	1472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.736;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=36;PP=808;ReadPosRankSum=0.165;SC=GCCTGGCAGATGGGGCTGACC;SOR=0.824;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=182;TCF=94;TCR=88;TR=73;WE=73051396;WS=73051378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,79:0.38:207
chr10	73056484	rs12783269	T	C	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=1.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.34;ReadPosRankSum=0.161;SOR=0.354;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,7:0.17:40
chr10	73078862	rs7924115	C	G	930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=10;PP=508;SC=AATGGGCGCACGCAGGCCCCA;SOR=1.148;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=19;TCR=10;TR=29;WE=73078870;WS=73078852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr10	73079004	rs72542481	C	T	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=6;PP=85;ReadPosRankSum=-0.466;SC=CCGCCTGCCGCCTGCCAAGCC;SOR=0.859;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=22;TCF=11;TCR=11;TR=11;WE=73079012;WS=73078994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr10	73079147	rs17525188	G	A	210.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=5;PP=149;SC=TCCCTCCCGGGCCCTGGGGGC;SOR=0.892;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=9;TCF=4;TCR=5;TR=9;WE=73079155;WS=73079137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr10	73082563	rs2277257	A	G	4227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=74;NR=65;PP=2307;SC=CTCCACCTACAGAACCACAAG;SOR=0.705;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=139;TCF=74;TCR=65;TR=139;WE=73082571;WS=73082553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr10	73104056	rs2243540	A	G	5297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=88;PP=2965;SC=CAGGTAGGCGACTCTCTTCCC;SOR=0.745;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=178;TCF=89;TCR=89;TR=177;WE=73104064;WS=73104046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr10	73104178	rs883764	G	A	1600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=34;PP=1018;SC=CAGCAGCTCAGATTTATGCAT;SOR=2.393;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=12;TCR=34;TR=46;WE=73104186;WS=73104168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr10	73111258	rs780667	G	T	1384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=10;PP=910;SC=TGGCTCACCAGCCCCAGCCCA;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=34;TCR=10;TR=44;WE=73111266;WS=73111248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr10	73111408	rs780668	C	T	7240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=128;NR=119;PP=2965;SC=GTGGACACTTCCTCCTGGACC;SOR=0.731;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=247;TCF=128;TCR=119;TR=247;WE=73111416;WS=73111398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,269:1.00:269
chr10	73115941	rs2252997	TG	CA	5690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=59;NR=47;PP=1875;SC=TGACGGCCACTGTCTTCCTCG;SOR=0.790;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=111;TCF=60;TCR=51;TR=106;WE=73115950;WS=73115931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr10	73121645	rs2487067	C	A	178.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=0;PP=114;SC=TGAGTGCCCACCCCTGGCTGT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=73121653;WS=73121635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	73121913	rs2487068	A	G	6799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=132;NR=108;PP=2965;SC=CTACCCCGCCATCTGCACCAA;SOR=0.839;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=240;TCF=132;TCR=108;TR=240;WE=73121921;WS=73121903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,262:1.00:262
chr10	73121945	rs1084004	T	C	7661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=141;NR=115;PP=2965;SC=TCAACAAGGGTTCGGGCTCAC;SOR=0.828;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=257;TCF=141;TCR=116;TR=256;WE=73121953;WS=73121935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,282:1.00:282
chr10	73199501	rs4747153	C	A	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.671;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=15;PP=370;ReadPosRankSum=0.066;SC=CTCTCTGGAGCTGCAGAGGTG;SOR=0.427;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=96;TCF=59;TCR=37;TR=32;WE=73199509;WS=73199491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,39:0.35:112
chr10	73269714	rs2297953	T	C	934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=22;NR=5;PP=593;SC=TGTGATGATCTGTGGCCTGCT;SOR=2.694;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=27;WE=73269722;WS=73269704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr10	73270906	rs3802720	T	C	8772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=159;NR=149;PP=2965;SC=ACATCCAGGTTGGGGATGTGA;SOR=0.723;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=309;TCF=160;TCR=149;TR=308;WE=73270914;WS=73270896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,339:1.00:339
chr10	73270982	rs3802719	G	A	7956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=97;PP=2937;SC=AGGAGCCACTGGGGTTACCCT;SOR=1.167;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=170;TCF=73;TCR=97;TR=169;WE=73271003;WS=73270972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr10	73270995	rs3802718	A	G	7128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=86;PP=2502;SC=GTTACCCTTGAGGGTATCAGA;SOR=1.319;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=54;TCR=86;TR=140;WE=73271003;WS=73270972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr10	73326757	rs7087735	C	T	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5006;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=308;ReadPosRankSum=-1.160;SC=AAGAGAGTGACGGGGCATTCC;SOR=0.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=15;WE=73326765;WS=73326747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr10	73330454	rs736717	G	A	341.41	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5960;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=150;ReadPosRankSum=-0.961;SC=CTTATGTGCTGCACGGTGCAG;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=11;WE=73330462;WS=73330444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,14:0.93:15
chr10	73337850	rs6480531	G	A	1997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=43;PP=1289;SC=AGAGGTCTGCGGGCATGTGGG;SOR=2.602;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=13;TCR=43;TR=56;WE=73337858;WS=73337840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr10	73377314	rs7903772	C	G	998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=28;PP=763;SC=AATCACTAGTCTCTACTTTTG;SOR=2.368;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=36;WE=73377322;WS=73377304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr10	73403490	rs10823810	A	G	1347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=8;PP=940;SC=CTAGGGTGTGATCCTGGGGTC;SOR=2.636;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=33;TCR=8;TR=41;WE=73403498;WS=73403480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr10	73405214	.	TCTC	T	37.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.046;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=3.941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.89;ReadPosRankSum=-0.339;SOR=0.076;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,3:0.15:20
chr10	73406636	rs11598249	C	T	404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=308;SC=TGCCTTTCCCCGAGAGAGACT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=73406644;WS=73406626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	73439066	rs3802717	A	T	3116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=26;PP=1986;SC=AGTCTTCCCCACCCTCCCAGC;SOR=1.915;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=68;TCR=26;TR=94;WE=73439074;WS=73439056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr10	73439101	rs1227042	T	C	6348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=120;NR=72;PP=2965;SC=TGGCCCCCAGTCTCCTGCAGG;SOR=1.139;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=194;TCF=121;TCR=73;TR=192;WE=73439109;WS=73439083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr10	73455201	rs3752752	T	C	5382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=375;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.813;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=119;NR=105;PP=2570;ReadPosRankSum=-1.338;SC=TGGACATCAATGACAACCACC;SOR=0.586;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=337;TCF=181;TCR=156;TR=224;WE=73455211;WS=73455191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,254:0.68:375
chr10	73455273	rs3752751	T	C	3044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.526;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=73;PP=1514;ReadPosRankSum=0.984;SC=CAGACTCTGATGTGACCACGG;SOR=0.645;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=199;TCF=88;TCR=111;TR=131;WE=73455293;WS=73455263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,143:0.66:218
chr10	73455308	rs3752750	T	C	1553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=50;PP=996;ReadPosRankSum=-2.008;SC=GCAGCAGAACTGCCAGGCGGC;SOR=0.721;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=103;TCF=29;TCR=74;TR=69;WE=73455316;WS=73455298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,72:0.67:108
chr10	73492079	rs1227065	A	G	7384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=125;NR=115;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.829;SC=GTACCGCTTCAACGCCTACAC;SOR=0.247;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=240;TCF=125;TCR=115;TR=240;WE=73492087;WS=73492069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,278:1.00:279
chr10	73494159	rs1227062	T	A	974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=23;PP=816;SC=TGACACTTCCTAACCCATGTC;SOR=1.751;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=11;TCR=23;TR=34;WE=73494167;WS=73494149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr10	73494229	rs1227061	T	C	879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=9;PP=673;SC=AGCCTGAGGCTTCGCCATGTC;SOR=1.329;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=19;TCR=9;TR=28;WE=73494237;WS=73494219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr10	73499561	rs10762474	C	G	1691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.387;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=30;PP=813;ReadPosRankSum=0.304;SC=ACTGAGAGACCACTGGCTAAG;SOR=0.567;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=112;TCF=60;TCR=52;TR=66;WE=73499569;WS=73499551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,82:0.61:135
chr10	73501374	rs1227052	C	T	2366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=17;PP=1661;SC=GGGGAGCCTTCGGGCTACAGG;SOR=2.484;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=58;TCR=17;TR=75;WE=73501382;WS=73501364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr10	73501556	rs1227051	G	A	7359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=122;NR=130;PP=2965;SC=CAAGGACATGGCCTTCCGCAT;SOR=0.829;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=253;TCF=122;TCR=131;TR=252;WE=73501564;WS=73501546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr10	73514911	rs9415993	G	C	829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.265;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=24;PP=552;ReadPosRankSum=2.874;SC=AAAGGGGCTGGTGGGCACTTG;SOR=1.119;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=65;TCF=19;TCR=46;TR=32;WE=73514919;WS=73514901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,35:0.49:71
chr10	73515103	rs3747858	G	T	790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.404;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=11;PP=470;ReadPosRankSum=-0.462;SC=CCCAGGCAGGGAGGAATACTC;SOR=1.151;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=61;TCF=39;TCR=22;TR=35;WE=73515111;WS=73515093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,37:0.56:66
chr10	73520632	rs3747869	A	C	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=163;ReadPosRankSum=-1.511;SC=TACTTTCACTATCCTGGGAGG;SOR=0.693;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=69;TCF=28;TCR=41;TR=18;WE=73520640;WS=73520622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,20:0.24:84
chr10	73537358	rs41281328	G	A	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.15;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr10	73538109	rs10740390	C	G	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.475;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=198;ReadPosRankSum=-0.490;SC=TGGAGGTTGGCGAAGGATGGG;SOR=0.412;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=27;TCF=9;TCR=18;TR=13;WE=73538117;WS=73538099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
chr10	73538138	rs10823843	C	T	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=97;ReadPosRankSum=-0.857;SC=AGCTCCGATGCGGGAAGGGGT;SOR=0.368;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=6;WE=73538146;WS=73538128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr10	73544638	rs2394839	A	G	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=2.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.07;ReadPosRankSum=0.537;SOR=0.274;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,15:0.29:52
chr10	73550969	rs10466026	G	A	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=17;PP=405;ReadPosRankSum=-0.544;SC=GCTGCTGGCTGAGGACATCGG;SOR=0.731;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=128;TCF=73;TCR=55;TR=40;WE=73550977;WS=73550959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,43:0.31:138
chr10	73558030	rs7068357	G	A	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.151;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=184;ReadPosRankSum=-0.443;SC=ATGCTCACCCGGCTTGGCTGA;SOR=0.138;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=13;WE=73558038;WS=73558020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr10	73558128	rs41281334	G	A	1074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=21;PP=568;ReadPosRankSum=0.332;SC=GACTGTCAACGTCCTGGACGT;SOR=0.699;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=162;TCF=99;TCR=63;TR=57;WE=73558136;WS=73558118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,63:0.35:179
chr10	73558852	rs4747193	A	G	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=4.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.53;ReadPosRankSum=-1.003;SOR=1.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,19:0.26:73
chr10	73558886	rs4747194	G	A	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=1.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.10;ReadPosRankSum=1.788;SOR=0.961;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,32:0.30:108
chr10	73558952	rs4747195	C	T	1564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.191;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=31;PP=833;ReadPosRankSum=-0.280;SC=AACGGGTCCCCGCCCCGGGCA;SOR=0.860;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=233;TCF=128;TCR=105;TR=72;WE=73558960;WS=73558942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:180,89:0.33:269
chr10	73559227	rs3802708	C	T	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=181;ReadPosRankSum=1.589;SC=CCTACTCTCTCTCCCTGCCCC;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=14;WE=73559235;WS=73559217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr10	73562744	rs10823849	G	A	1392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.285;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=30;PP=648;ReadPosRankSum=-0.409;SC=ATGAGCCGGCGGGCACCTCGG;SOR=0.738;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=226;TCF=112;TCR=114;TR=65;WE=73562752;WS=73562734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,80:0.31:258
chr10	73566203	rs4747197	T	A	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=150;ReadPosRankSum=-0.935;SC=AGCAGCTGTGTTACACTATAT;SOR=0.836;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=12;WE=73566211;WS=73566193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,12:0.34:35
chr10	73571581	rs140848302	C	CCT	460.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=411;ReadPosRankSum=0.263;SC=CCCACCGGAGCCACAAGCCTG;SOR=0.836;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=30;TCF=15;TCR=15;TR=10;WE=73571589;WS=73571571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr10	73571619	rs41281340	C	G	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.520;HP=1;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=9;PP=321;ReadPosRankSum=-1.201;SC=GGCCCAGGACCATGCCCCGCA;SOR=0.394;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=49;TCF=32;TCR=17;TR=23;WE=73571627;WS=73571609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr10	73571881	rs11000014	G	A	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=4.351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.27;ReadPosRankSum=0.773;SOR=0.273;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,18:0.35:51
chr10	73571881	.	GGC	AGT	707	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=7;NR=9;PP=707;QD=47.5292421789;SC=CCAGGCTGTGGGCGCCCCCTG;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=49;TCF=17;TCR=32;TR=16;WE=73571891;WS=73571871;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:33,16:0.33:49
chr10	73571883	rs11000015	C	T	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=4.254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.52;ReadPosRankSum=0.338;SOR=0.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,18:0.36:50
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chr10	73577267	rs4747202	G	A	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=7;PP=101;ReadPosRankSum=2.324;SC=TTTAGTCTTCGGATGAAAAAC;SOR=0.553;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=19;TCR=30;TR=12;WE=73577275;WS=73577257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,17:0.31:54
chr10	73578503	rs885828	G	A	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.46;ReadPosRankSum=-0.815;SOR=0.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:116,39:0.25:155
chr10	73578882	rs4747203	T	C	1429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.15;ReadPosRankSum=-0.559;SOR=0.661;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:120,80:0.40:200
chr10	73579979	rs55829339	G	A	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.458;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=256;ReadPosRankSum=-0.297;SC=CCCTCCCTCTGCCAGGAGGAC;SOR=1.686;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=53;TCF=43;TCR=10;TR=17;WE=73579987;WS=73579969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,22:0.34:64
chr10	73583520	.	G	C	101	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MMLQ=15;MQ=59.08;NF=11;NR=2;PP=101;QD=10.4439394267;SC=CAGAGAGGGAGCCTGCCTCTC;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=43;TCF=34;TCR=9;TR=13;WE=73583528;WS=73583510;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:30,13:0.30:43
chr10	73585526	rs2593163	A	G	1130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.722;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=26;PP=739;ReadPosRankSum=0.081;SC=TAATTTTCAAAATTCCTAGAA;SOR=0.469;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=147;TCF=87;TCR=60;TR=55;WE=73585534;WS=73585516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,61:0.36:168
chr10	73591794	rs11000020	G	A	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=11;PP=196;ReadPosRankSum=0.773;SC=GATCATGACCGCGCTCCTGTC;SOR=0.598;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=33;TCR=39;TR=21;WE=73591802;WS=73591784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,23:0.27:86
chr10	73765773	rs11000129	T	G	4086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=64;NR=76;PP=2445;SC=TTCATCTTCCTTTCAAGGTGG;SOR=0.984;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=140;TCF=64;TCR=76;TR=140;WE=73765781;WS=73765763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr10	73767859	rs3740129	G	A	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=60;ReadPosRankSum=1.257;SC=CTGGGGCTGCGGCAGCCCGCC;SOR=0.947;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=22;TCF=8;TCR=14;TR=7;WE=73767867;WS=73767849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr10	73822507	rs1530803	C	T	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=234;ReadPosRankSum=-1.438;SC=GCAGCCGGCTCCTGAGGGCGT;SOR=0.610;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=12;WE=73822515;WS=73822497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr10	73822957	rs1530802	G	A	906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=20;PP=443;ReadPosRankSum=0.000;SC=CAGAGCAGGGGCCCAGGCTGT;SOR=0.859;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=47;TCF=18;TCR=29;TR=32;WE=73822965;WS=73822947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,40:0.70:57
chr10	73823019	rs1668172	A	G	292.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.6268;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=145;ReadPosRankSum=1.145;SC=AGAAGTCTATACACCCCCAGA;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=9;WE=73823027;WS=73823009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr10	73824170	rs2242250	G	A	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.127;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=276;ReadPosRankSum=1.434;SC=TCTATGGCACGAAAACGCTCA;SOR=0.892;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=8;WE=73824189;WS=73824160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr10	73824181	rs2242251	C	G	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.012;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=265;ReadPosRankSum=1.255;SC=AAAACGCTCACTCTCTATTTA;SOR=0.527;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=6;WE=73824189;WS=73824160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr10	73824203	rs2242252	T	C	111.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=66;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=3;PP=85;SC=GGGAGCTCATTCCACAGCTGT;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=73824211;WS=73824193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr10	73827292	rs1530804	A	G	336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=2;PP=268;SC=ACAAGGGCAGACTGGCCCAGC;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=73827300;WS=73827285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr10	73832859	rs896074	C	T	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.923;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.233;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=100;ReadPosRankSum=1.544;SC=AGTATTCTTACGTCTTCATCA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=6;WE=73832867;WS=73832849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr10	73846826	rs1245546	C	T	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=177;ReadPosRankSum=-1.791;SC=CACCAGGTCGCCAGGAGCAGC;SOR=0.317;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=11;WE=73846834;WS=73846816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr10	73848105	rs10713496	TG	T	235.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=115;ReadPosRankSum=0.085;SC=GGGTTCGACCTGGGGGGGTCT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=6;WE=73848113;WS=73848095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr10	73856984	rs3312	A	G	952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.028;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=12;PP=579;ReadPosRankSum=-0.187;SC=ACCACCCAGGAAAGTCACCAT;SOR=0.553;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=57;TCF=39;TCR=18;TR=36;WE=73856992;WS=73856974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,42:0.64:66
chr10	73862032	rs1668154	C	T	2909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=51;PP=1600;ReadPosRankSum=-0.991;SC=TGAAAGGGAGCTACTTCATGG;SOR=0.715;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=200;TCF=111;TCR=89;TR=116;WE=73862040;WS=73862022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,137:0.60:228
chr10	73964004	rs4237336	C	T	308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=1;PP=222;SC=CGAGACTCTGCCTCAAAAAAT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=73964012;WS=73963994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr10	73970451	rs7069703	G	T	5810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=80;PP=2965;SC=GAGTTTCCTGGAAGTGTCTTC;SOR=0.768;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=184;TCF=104;TCR=80;TR=184;WE=73970459;WS=73970441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr10	74100642	rs9416018	G	A	1942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=25;PP=1207;SC=GGTCAGAGGGGCTGAGTCAGG;SOR=1.134;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=43;TCR=26;TR=68;WE=74100650;WS=74100632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr10	74139200	rs11000276	T	G	2009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=22;PP=1218;SC=TAACCATTCCTTTTTCTGCAT;SOR=1.640;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=49;TCR=22;TR=71;WE=74139208;WS=74139190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr10	74182917	rs10823922	T	C	2683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=28;PP=1490;SC=CTCATCATTATGTTAATACCT;SOR=1.449;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=59;TCR=28;TR=87;WE=74182925;WS=74182907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr10	74183251	rs7069357	G	A	166.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=131;SC=TATTTTTGAGGTACAATTCTC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=74183259;WS=74183241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	74234817	rs915432	T	C	1627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=20;PP=1023;SC=TGCCCATCAGTTCCACATGTG;SOR=1.355;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=36;TCR=20;TR=56;WE=74234825;WS=74234807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr10	74235771	rs11000322	G	A	759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=22;PP=673;SC=GATCACCTGCGGTCAGGAGTT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=74235779;WS=74235761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	74268031	rs3793927	T	C	1365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=27;PP=861;SC=AAATTTTCTATAGAATGTATG;SOR=1.298;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=19;TCR=27;TR=46;WE=74268039;WS=74268021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr10	74293584	rs10509343	A	T	2826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=25;PP=872;SC=AGCTACTGATAATAACTCAAG;SOR=0.784;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=59;TCF=33;TCR=26;TR=58;WE=74293592;WS=74293574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr10	74293601	rs11818304	T	A	2685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=28;NR=25;PP=836;SC=CAAGTGAAATTTATAAAATGA;SOR=0.906;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=28;TCR=25;TR=53;WE=74293609;WS=74293591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr10	74452931	rs112298026	AGT	A	63.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=3.385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.48;MQRankSum=2.499;QD=2.36;ReadPosRankSum=-2.270;SOR=0.116;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
chr10	74671352	rs148311247	A	C	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=135;ReadPosRankSum=0.251;SC=CCGAATGTCCAGTCACTAGGT;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=10;WE=74671360;WS=74671342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr10	74695287	rs2461917	T	C	313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=1;PP=179;SC=GTTGGAAGAATGAATGAGTCA;SOR=2.670;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=74695295;WS=74695277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr10	75135833	.	TA	T	212.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.580;ClippingRankSum=0.000;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=2.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.19;ReadPosRankSum=-0.263;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,24:0.25:97
chr10	75305531	.	A	C	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.216;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.410;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=202;ReadPosRankSum=-1.066;SC=GATAGCTATGAAACCAAATGT;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=17;WE=75305539;WS=75305521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chr10	75490217	rs11814282	T	C	275.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=0;PP=199;SC=GGCACCGAACTTGCTCACAAC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=75490225;WS=75490207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr10	75519322	rs10740418	T	C	3879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=49;PP=2506;SC=GACACTTCTGTAGACTTCAAA;SOR=1.147;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=80;TCR=49;TR=129;WE=75519330;WS=75519312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr10	75525999	rs3849969	A	G	2915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=53;NR=32;PP=1426;SC=GTGTTTCCTGAGGTTAATGAT;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=87;TCF=54;TCR=33;TR=85;WE=75526007;WS=75525989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr10	75532848	rs145929404	GCCAGGACTCCAGGTGTCCAGGACTCCAGGTGT	G	1205.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=12;PP=2670;SC=GCGGGTTGAGGCCAGGACTCC;SOR=1.044;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=13;WE=75532887;WS=75532838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr10	75545251	rs12256103	A	G	1064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=25;NR=7;PP=681;SC=TTAAATAAAAATGTCCCCTAC;SOR=2.012;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=32;WE=75545259;WS=75545241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr10	75556108	rs144915982	TA	T	50.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.18;MQRankSum=2.259;QD=0.86;ReadPosRankSum=0.666;SOR=0.525;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,10:0.17:59
chr10	75558867	rs2271271	G	A	3956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=61;PP=2314;SC=GGTTCTGGCTGTATGAGCAAA;SOR=0.776;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=77;TCR=61;TR=138;WE=75558875;WS=75558857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr10	75559662	rs141230821	C	CTCTA	2694.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=6;PP=1668;SC=CAGAGCGAGACTCTATCTCAA;SOR=2.876;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=42;TCF=25;TCR=17;TR=27;WE=75559670;WS=75559652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr10	75562161	rs13013	C	A	141.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=1;PP=111;SC=TCTGGACCTGCCCCTTAGGGA;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=75562169;WS=75562151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr10	75607696	rs67135801	CA	C	749.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=6;PP=623;SC=GCCCGAGGAGCAAGGACATCT;SOR=1.828;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=10;TCR=6;TR=16;WE=75607704;WS=75607686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr10	75612881	rs2250140	T	C	3100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=37;PP=1926;SC=TGTTTAGGCCTCTTCCTGAGC;SOR=1.322;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=68;TCR=37;TR=105;WE=75612889;WS=75612871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr10	75620757	rs2664282	T	C	1652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=41;PP=1247;SC=TTGTGATGATTTGCTGAAGTA;SOR=3.258;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=8;TCR=41;TR=49;WE=75620765;WS=75620747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr10	75632760	rs2675671	C	T	3641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=77;NR=51;PP=1994;SC=GGGCAGACAACTTCTTGGTAT;SOR=0.945;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=129;TCF=77;TCR=52;TR=128;WE=75632768;WS=75632750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr10	75672607	rs61567551	C	CA	296.50	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.53;ReadPosRankSum=1.362;SOR=1.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,14:0.88:16
chr10	75673101	rs2227564	T	C	5350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=88;PP=2613;SC=GGCCTAAAGCTGCTTGTCCAA;SOR=0.773;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=178;TCF=89;TCR=89;TR=177;WE=75673109;WS=75673091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr10	75673731	rs2227566	C	T	4392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=62;PP=2374;SC=GGTATCTTCTCCCACAGTGAT;SOR=0.859;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=146;TCF=84;TCR=62;TR=146;WE=75673739;WS=75673721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr10	75674740	rs2227571	C	T	3790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=76;PP=2438;SC=ATGAGCCCAGCGTGATCAAGG;SOR=1.574;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=120;TCF=44;TCR=76;TR=120;WE=75674748;WS=75674730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr10	75842152	rs2270548	G	A	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.02;ReadPosRankSum=-0.188;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,26:0.34:77
chr10	75843100	rs1908339	T	A	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.762;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=306;ReadPosRankSum=-1.310;SC=AACAATGTAGTTATTGAATAT;SOR=1.312;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=90;TCF=59;TCR=31;TR=25;WE=75843108;WS=75843090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,29:0.28:104
chr10	75863750	rs2270552	C	T	762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=19;PP=528;SC=GAAATTGGAGCGGGACTGGTT;SOR=2.670;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=24;WE=75863758;WS=75863740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
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chr10	75874166	rs142879319	CGTGTGTGT	C	411.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.72;ReadPosRankSum=1.301;SOR=0.430;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
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chr10	75885817	rs1908331	G	A	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.371;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=316;ReadPosRankSum=2.070;SC=TTTTAAACAAGGTGCCAAACC;SOR=1.155;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=50;TCF=40;TCR=10;TR=18;WE=75885825;WS=75885807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,21:0.37:57
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chr10	75896601	rs10762576	A	C	1313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=18;NR=28;PP=805;SC=ATGGAAGGCAAAAAGAAAGGC;SOR=1.270;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=18;TCR=28;TR=46;WE=75896609;WS=75896591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr10	75936611	rs10824095	C	T	3115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=42;PP=1758;SC=CGCCGTGGCGCTGGGCAGGAG;SOR=0.836;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=58;TCR=42;TR=100;WE=75936619;WS=75936601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr10	76158177	rs2126763	C	T	670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=20;NR=3;PP=445;SC=TCTATTGAAACATATGCTAAG;SOR=2.494;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=76158185;WS=76158167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr10	76285223	rs147013045	TTTTG	T	211.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=251;ReadPosRankSum=1.465;SC=CCTGGGGGTTTTTTGTTTGTT;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=76285234;WS=76285213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr10	76429870	rs10740443	T	C	3476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=39;PP=2021;SC=GAGCTTCAGATGTTACTGGGT;SOR=1.353;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=76;TCR=39;TR=114;WE=76429878;WS=76429860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr10	76854564	rs3088142	C	T	3898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.271;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=70;PP=2100;ReadPosRankSum=-0.573;SC=CATGTTCTCACAGATCATGAG;SOR=0.825;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=234;TCF=131;TCR=103;TR=163;WE=76854572;WS=76854554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,181:0.69:262
chr10	76855326	rs3740318	A	G	683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.263;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=448;ReadPosRankSum=0.100;SC=CTGATCCAGAAGTGCACCTTG;SOR=0.451;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=37;TCF=26;TCR=11;TR=22;WE=76855334;WS=76855316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,27:0.61:44
chr10	76855412	rs3740317	G	A	2683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.334;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=41;PP=1508;ReadPosRankSum=-1.823;SC=AGGGGTTGTCGTCCGCCTCGA;SOR=0.865;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=149;TCF=87;TCR=62;TR=102;WE=76855420;WS=76855402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,116:0.69:167
chr10	76861680	rs6480771	T	C	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=165;ReadPosRankSum=-0.159;SC=TTCGTGCTGCTGGCTTTCAGC;SOR=0.580;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=17;WE=76861688;WS=76861670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr10	76861844	rs7093541	T	C	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.755;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=8;PP=196;ReadPosRankSum=1.377;SC=GTCAGGCACCTTTCCCTCCAG;SOR=0.223;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=24;TCF=11;TCR=13;TR=16;WE=76861852;WS=76861834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr10	76867899	rs7912300	T	C	602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.419;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=11;PP=280;ReadPosRankSum=-2.147;SC=GTAGAGGCCCTTGTGGGCGGC;SOR=0.383;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=43;TCF=21;TCR=22;TR=24;WE=76867907;WS=76867889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,29:0.56:52
chr10	76928186	rs57250768	A	T	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=2.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.203;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=226;ReadPosRankSum=0.913;SC=TGTCCTCTTCAAAGAGTCTAG;SOR=2.608;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=11;WE=76928194;WS=76928176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr10	77160682	rs10824306	C	T	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.893;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=202;ReadPosRankSum=-0.334;SC=ATGCACGCCCCATTCCACTTC;SOR=1.387;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=14;WE=77160690;WS=77160672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr10	77161100	.	G	GCCGCCTCCGCCT	674.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.504;ClippingRankSum=0.000;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=4.828;NF=2;NR=7;PP=1499;ReadPosRankSum=-1.301;SC=GGTCTGCACCGCCGCCTCCGC;SOR=0.555;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=9;WE=77161108;WS=77161090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,21:0.40:53
chr10	77191441	rs55922628	C	A	453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=11;NR=8;PP=256;SC=TGCCGCCGCGCCCCCGCGCTC;SOR=1.022;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=11;TCR=8;TR=19;WE=77191449;WS=77191431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr10	77312183	rs56910833	TC	T	345.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.54;QD=23.05;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	77542558	rs2133705	C	T	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.758;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=45;ReadPosRankSum=1.640;SC=CCGCAACTTTCACTTGTTGAG;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=4;WE=77542566;WS=77542549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr10	77807027	rs1898071	T	C	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.425;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=16;PP=337;ReadPosRankSum=-0.984;SC=GCTGGTCAGCTTGGAAAAGGA;SOR=1.118;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=71;TCF=34;TCR=37;TR=28;WE=77807035;WS=77807017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,30:0.39:77
chr10	77807092	rs1898070	A	C	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.957;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=11;PP=278;ReadPosRankSum=-0.362;SC=CCATGGTGGGAAAAGGGAAAA;SOR=0.546;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=58;TCF=29;TCR=29;TR=23;WE=77807100;WS=77807082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,25:0.38:66
chr10	77818594	rs7924288	C	T	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=49;ReadPosRankSum=-1.310;SC=CATGGCAGTGCTTACACCCCA;SOR=1.508;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=4;WE=77818602;WS=77818584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
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chr10	78649399	rs2288840	C	T	4982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=101;PP=2965;SC=AGCAGGGAAACGGGTCTTTTC;SOR=1.364;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=64;TCR=101;TR=165;WE=78649407;WS=78649389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr10	78729669	rs2288837	A	G	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.952;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=290;ReadPosRankSum=0.920;SC=GGGTGAGGAGAGGGCGAGGGG;SOR=2.925;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=14;WE=78729677;WS=78729659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr10	78737295	rs11001956	G	A	4751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.990;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=106;NR=94;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.623;SC=ATATTAACTCGCTGACCTTTG;SOR=0.682;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=284;TCF=145;TCR=139;TR=200;WE=78737303;WS=78737285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,212:0.67:316
chr10	78778734	rs16934182	G	A	2766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=34;PP=1299;SC=GTCTACAGCCGGGCCAGAAAG;SOR=0.751;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=46;TCR=34;TR=80;WE=78778742;WS=78778724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr10	78782876	rs7078109	T	C	1242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=32;PP=952;SC=TCACATTTCATTGGGTATCTC;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=9;TCR=32;TR=41;WE=78782884;WS=78782866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr10	78839127	.	A	AGTGT	82	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;FR=0.9998;HP=2;HapScore=2;MGOF=33;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=1;NR=0;PP=82;QD=85.0;SC=GGCATGTGAGAGTGTGTGTGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=1;TCR=1;TR=1;WE=78839135;WS=78839117;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,1:0.50:2
chr10	78844579	rs34592624	G	GA	250.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=9.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.03;ReadPosRankSum=2.109;SOR=3.391;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr10	78868165	rs138226779	CAAA	C,CA	3366.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.31;QD=36.20;SOR=0.867;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,76,17:0.82,0.18:93
chr10	79163884	rs11002158	T	C	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.406;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=141;ReadPosRankSum=-2.634;SC=CCAGCTGAGATGGAAACTAGC;SOR=1.585;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=39;TCF=10;TCR=29;TR=13;WE=79163892;WS=79163874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,14:0.32:44
chr10	79397495	.	T	TGCTGCC	160.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=-0.000;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.808;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=0;PP=97;ReadPosRankSum=0.486;SC=TTGCTGCTACTGCTGCCGCCG;SOR=1.981;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=2;WE=79397503;WS=79397485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr10	79552107	rs1058203	G	A	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=330;ReadPosRankSum=0.307;SC=GTTCATAGACGGACAGACTTC;SOR=0.693;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=18;WE=79552115;WS=79552097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,18:0.69:26
chr10	79552151	rs1058202	T	C	1079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.290;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=13;PP=572;ReadPosRankSum=-0.761;SC=CTGAGTCTGGTGTCCCCTCAG;SOR=0.429;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=62;TCF=44;TCR=18;TR=41;WE=79552159;WS=79552141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,47:0.67:70
chr10	79553673	rs2812425	T	C	1537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.516;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=18;PP=827;ReadPosRankSum=0.517;SC=ATGTAGAAAGTGCGGGCTTCT;SOR=0.275;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=76;TCF=55;TCR=21;TR=57;WE=79553681;WS=79553663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,65:0.76:85
chr10	79553688	rs2579150	G	A	2029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.290;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=27;PP=1169;ReadPosRankSum=1.126;SC=GCTTCTCCACGGCTAAGAAAA;SOR=0.348;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=110;TCF=76;TCR=34;TR=78;WE=79553696;WS=79553678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,89:0.72:123
chr10	79571893	rs1248625	C	G	904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.326;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=9;PP=586;ReadPosRankSum=0.336;SC=CTTGGGAGCACTGCTGTTCCC;SOR=1.739;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=50;TCF=33;TCR=17;TR=33;WE=79571901;WS=79571883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,36:0.67:54
chr10	79575879	rs1248638	A	G	1758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.359;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=37;PP=983;ReadPosRankSum=-0.079;SC=GGTGCCAGCCACTAACCACGT;SOR=0.562;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=125;TCF=60;TCR=65;TR=74;WE=79575887;WS=79575869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,86:0.61:142
chr10	79579047	rs1248635	A	G	2583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=50;PP=1497;ReadPosRankSum=0.909;SC=GGGCAGCTGGAGTACAGAGAA;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=162;TCF=89;TCR=73;TR=111;WE=79579068;WS=79579037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,118:0.67:175
chr10	79579222	rs1248634	G	A	792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=21;PP=550;ReadPosRankSum=0.498;SC=GGGGAACAGTGCCTAGAAATG;SOR=0.685;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=57;TCF=24;TCR=33;TR=35;WE=79579230;WS=79579212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,36:0.58:62
chr10	79584178	rs1248629	G	C	1355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.945;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=16;PP=848;ReadPosRankSum=0.551;SC=CCTGGCAGCTGCGCAGCAGAG;SOR=0.853;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=50;TCR=23;TR=51;WE=79584186;WS=79584168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,58:0.71:82
chr10	79588534	rs2801822	C	G	1148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.119;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.162;NF=31;NR=9;PP=713;ReadPosRankSum=-0.747;SC=ACAATGCCCACAACAAGGAAA;SOR=1.096;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=64;TCF=48;TCR=16;TR=40;WE=79588542;WS=79588524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,51:0.61:84
chr10	79588620	rs66642452	GCTCCAGC	G	4667.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.881;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.471;NF=13;NR=41;PP=2940;ReadPosRankSum=-0.630;SC=GATGACCCTGGCTCCAGCCTT;SOR=0.781;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=98;TCF=19;TCR=79;TR=54;WE=79588634;WS=79588610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,120:0.59:205
chr10	79590726	rs1248663	C	G	146.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=117;SC=CCATTTGAAACAGCTAAAATG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=79590734;WS=79590716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr10	79595417	rs1248661	C	T	71.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=1;PP=77;SC=TAAATGATTCCGACCCTCCCA;SOR=1.179;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=79595425;WS=79595414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr10	79595473	rs1781797	G	A	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5167;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=209;ReadPosRankSum=2.426;SC=GCAAGCCCACGCCAGCTTGAG;SOR=1.314;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=13;WE=79595481;WS=79595463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr10	79606441	rs1248676	A	C	1696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.235;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.657;NF=37;NR=24;PP=957;ReadPosRankSum=1.741;SC=GGCGACAGAGAAATATTCTGT;SOR=0.361;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=54;TCR=34;TR=61;WE=79606462;WS=79606431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,65:0.71:91
chr10	79614189	rs1248692	A	G	2103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.519;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=51;PP=1353;ReadPosRankSum=-0.036;SC=GGATAGAGGAACCAGGTCCTG;SOR=0.903;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=122;TCF=50;TCR=72;TR=84;WE=79614197;WS=79614179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,91:0.68:134
chr10	79616605	rs1248696	T	C	715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=10;PP=272;SC=ATTCACTTGCTGGTCAGTGAG;SOR=0.906;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=11;TCR=10;TR=21;WE=79616613;WS=79616595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr10	79628875	rs1248655	A	G	1035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.80;ReadPosRankSum=0.118;SOR=0.829;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,50:0.71:70
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chr10	79629127	rs1248657	T	C	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=178;ReadPosRankSum=-0.946;SC=TGGACTTCGGTGTTTCTGCCA;SOR=0.582;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=18;WE=79629135;WS=79629117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,22:0.67:33
chr10	79777204	rs57076507	CA	C	32.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=4.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.93;ReadPosRankSum=0.529;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr10	79779150	rs1863898	G	A	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-2.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=167;ReadPosRankSum=0.303;SC=ATCCTGGGCAGCCTGCTGCCT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=9;WE=79779158;WS=79779140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr10	79793688	rs3740253	C	T	3831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=79;PP=2150;ReadPosRankSum=-1.902;SC=CCCGTGCAGTCATCTGCCGCG;SOR=0.694;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=248;TCF=127;TCR=121;TR=162;WE=79793696;WS=79793678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,179:0.64:281
chr10	80288406	rs1865706	T	G	2040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=24;PP=1307;SC=TGAATATTTGTGTTGTTTCCA;SOR=1.300;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=48;TCR=24;TR=72;WE=80288414;WS=80288396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr10	80310465	rs2670191	T	C	3886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=59;PP=2063;ReadPosRankSum=-0.532;SC=TGGGTGTTGTTGGAACCTACT;SOR=0.245;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=130;TCF=71;TCR=59;TR=129;WE=80310473;WS=80310455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,148:0.99:149
chr10	80310636	rs7090749	G	A	793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.54;ReadPosRankSum=0.101;SOR=0.717;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:126,49:0.28:175
chr10	80763382	rs10762828	C	T	3806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=59;PP=2039;SC=GTGATGTCTGCGGCACTGAGC;SOR=0.721;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=69;TCR=59;TR=128;WE=80763390;WS=80763372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr10	80763534	rs10762829	A	G	1598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=32;PP=986;SC=AAATTGGCCTAGCTTCCTAAC;SOR=1.278;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=21;TCR=32;TR=53;WE=80763542;WS=80763524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr10	80968367	rs35380943	TC	T	531.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.939;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=353;ReadPosRankSum=-0.535;SC=ATTTGGTGTGTCCCCCACGTG;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=11;WE=80968375;WS=80968357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,20:0.71:28
chr10	81037112	rs79407124	A	G	1058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=26;PP=652;ReadPosRankSum=-0.510;SC=GGGTGCAGGTACTGAGCAGAC;SOR=0.705;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=155;TCF=79;TCR=76;TR=52;WE=81037120;WS=81037102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,58:0.34:171
chr10	81037229	rs1250539	G	A	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=91;ReadPosRankSum=-0.727;SC=TTACATCTTCGTGGGTGAGCC;SOR=0.791;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=9;WE=81037237;WS=81037219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,9:0.29:31
chr10	81045207	rs1250569	T	C	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.518;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=38;ReadPosRankSum=-0.441;SC=CCCCATTTCATAGATGAGGTT;SOR=1.302;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=5;WE=81045215;WS=81045197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,5:0.16:31
chr10	81045280	rs1250568	T	C	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.642;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=12;PP=438;ReadPosRankSum=-1.996;SC=TCTCTCACTTTCTGGGCCCCA;SOR=0.521;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=111;TCF=76;TCR=35;TR=33;WE=81045288;WS=81045270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,37:0.29:126
chr10	81049687	rs12263204	C	T	1250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=34;PP=682;ReadPosRankSum=0.616;SC=TCTTTCTAGGCGGGAGTGTCC;SOR=0.721;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=216;TCF=103;TCR=113;TR=67;WE=81049695;WS=81049677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,76:0.31:243
chr10	81050610	rs80309312	C	G	1639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=46;PP=1052;ReadPosRankSum=0.836;SC=CCCTGTTGTCCTGCCTCCACT;SOR=0.664;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=247;TCF=124;TCR=123;TR=89;WE=81050618;WS=81050600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,94:0.35:270
chr10	81053094	.	C	CT	211.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.241;ClippingRankSum=0.000;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=6.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.90;ReadPosRankSum=0.368;SOR=1.657;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,18:0.25:73
chr10	81058027	rs1250552	A	G	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=326;ReadPosRankSum=0.097;SC=GAGAGAGAAGAGTTTCCCTGG;SOR=0.610;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=64;TCF=50;TCR=14;TR=24;WE=81058035;WS=81058017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,28:0.40:70
chr10	81064719	.	G	A	48	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=4;NR=1;PP=48;QD=16.5542425094;SC=GGGAGGTGGTGTGAGGGATGC;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=5;WE=81064727;WS=81064717;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:4,5:0.56:9
chr10	81064755	rs2296424	G	A	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.438;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.447;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=3;PP=89;ReadPosRankSum=0.329;SC=AGGACTCTGCGTGGCAGAAAG;SOR=0.132;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=8;WE=81064763;WS=81064745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr10	81065774	rs1250557	G	T	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=61;ReadPosRankSum=0.000;SC=AAGGTCACCTGGGTGTCTGTC;SOR=0.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=5;WE=81065782;WS=81065764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr10	81072523	rs2802359	G	C	1579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.093;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=38;PP=983;ReadPosRankSum=0.252;SC=CCCGGTCGGGGCCATCCCTCC;SOR=0.305;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=84;TCF=25;TCR=59;TR=57;WE=81072531;WS=81072513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,65:0.71:91
chr10	81073763	rs2997468	G	C	1179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.13;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr10	81073763	.	GG	CA,CG	399	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000,0.5000;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=19,24;NR=1,1;PP=399,13;QD=22.6233937431;SC=CTGCAGGCATGGGGGGGAGGG;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=20,25;WE=81073772;WS=81073757;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.74:27
chr10	81073764	rs2985841	G	A	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.37;ReadPosRankSum=-1.756;SOR=0.968;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,24:0.83:29
chr10	81074125	rs1782652	T	A	480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=14;PP=331;SC=GGTCCCCAGCTCTCCTCTGTG;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=81074133;WS=81074115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	81108956	rs2233718	A	G	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=161;ReadPosRankSum=-0.721;SC=GTCGGGGCTCAGAGACCCCTG;SOR=0.728;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=48;TCF=11;TCR=37;TR=15;WE=81108964;WS=81108946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,18:0.33:55
chr10	81318545	rs2217231	A	T	305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=3;PP=206;SC=GCCCTTGGGGAACCTGCAGGG;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=12;WE=81318553;WS=81318535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr10	81318565	rs17882088	C	T	364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=5;PP=246;SC=GTTTGTCTGACCCCCATCACC;SOR=1.329;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=9;TCR=5;TR=14;WE=81318573;WS=81318555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	81318820	rs17880349	G	A	536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=15;PP=372;SC=GTTGGAGCTAGTGAGACTCGA;SOR=2.948;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=81318828;WS=81318810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr10	81319214	rs1059046	G	T	461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.46;QD=28.86;SOR=2.049;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr10	81319267	rs1650232	C	T	206.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=37.83;QD=29.54;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr10	81319423	rs1975008	C	T	1746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=36;NR=26;PP=986;SC=CCAAGCATCACCTGGCACCTG;SOR=0.880;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=36;TCR=26;TR=62;WE=81319431;WS=81319413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr10	81319483	rs1975007	A	G	1433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=25;NR=26;PP=823;SC=GGGTCTCAAGACTGCTGAGGA;SOR=0.804;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=51;TCF=25;TCR=26;TR=51;WE=81319491;WS=81319473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr10	81342369	rs34032311	G	T	2901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=53;PP=1701;SC=TCCGCTCACCGTTGGTCATGA;SOR=0.990;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=104;TCF=51;TCR=53;TR=104;WE=81342377;WS=81342359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr10	81342469	rs2678654	A	G	174.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.58;QD=29.14;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	81343036	rs3855862	G	A	214.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=30.69;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr10	81343060	.	G	GCCAAGAACACATTATGGGCAGAGAGAAAGCTCACACTT	300.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.75;QD=75.19;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr10	81371729	rs1136450	C	G	839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.32;QD=31.10;SOR=5.211;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr10	81373182	rs4253524	G	C	81.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=3;PP=63;SC=GAATGGCCCAGAGGAGACAGA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=81373190;WS=81373172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr10	81667323	rs2250135	A	G	435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=9;NR=7;PP=204;SC=TATAAAATATACGAAAGTACT;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=9;TCR=7;TR=16;WE=81667331;WS=81667313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	81680976	rs2819107	A	G	354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=9;PP=217;SC=GGCCCTCTCAACTTTACTTGG;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=81680984;WS=81680966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	81681454	rs2257414	A	G	381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=10;PP=274;SC=TATGCAAGCCATATGTGGAGA;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=81681462;WS=81681444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	81682645	rs1054053	A	G	5103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=79;PP=2965;SC=CTTGACGGGCAGGAGGCTGAC;SOR=0.823;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=176;TCF=96;TCR=80;TR=175;WE=81682653;WS=81682635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr10	81698097	rs2819098	G	A	651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=19;PP=510;SC=AACAGGCACCGCATCAGGATG;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=81698105;WS=81698087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr10	81701722	rs2243639	T	C	1344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=12;PP=854;SC=GCTGCCCCTGTGTTTCCAGGG;SOR=1.708;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=33;TCR=12;TR=45;WE=81701730;WS=81701712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr10	81706324	rs721917	A	G	3230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=62;NR=50;PP=1743;SC=AGCACTGGGCATTGTTCTGTG;SOR=0.742;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=113;TCF=62;TCR=51;TR=112;WE=81706332;WS=81706314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr10	81841692	rs1932574	G	T	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.324;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=135;ReadPosRankSum=-1.954;SC=ACACCCTCCTGTGCAATGGGT;SOR=0.394;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=45;TCF=15;TCR=30;TR=13;WE=81841700;WS=81841682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,15:0.28:53
chr10	81901722	rs745182	C	T	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=93;ReadPosRankSum=-1.034;SC=GGCCGTCCTCCGCTTGCTCCT;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=6;WE=81901730;WS=81901720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr10	81904638	rs2819874	G	A	684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.317;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=6;PP=537;ReadPosRankSum=-0.422;SC=CTCACTGGGGGCCTCTGCTTT;SOR=1.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=50;TCF=40;TCR=10;TR=31;WE=81904646;WS=81904628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,29:0.58:50
chr10	81904863	rs41291394	T	G	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=17;PP=307;ReadPosRankSum=0.156;SC=GGAGGAAGCCTGCAACCCCCT;SOR=0.774;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=80;TCF=36;TCR=44;TR=30;WE=81904871;WS=81904853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,35:0.36:96
chr10	81915790	rs2789687	T	C	818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=23;PP=648;SC=GGGAATTTTCTCCCACTGCAG;SOR=3.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=27;WE=81915798;WS=81915780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr10	81916367	rs61860017	T	A	203.41	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.593;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.6715;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=156;ReadPosRankSum=-0.282;SC=TCTCCCGGGTTCAAGCAATTC;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=8;WE=81916375;WS=81916357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr10	81917708	rs1079242	A	G	1678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=17;PP=1040;SC=CAACCTGCACATGGAAGTTAC;SOR=1.802;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=40;TCR=17;TR=57;WE=81917716;WS=81917698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr10	81921918	rs2245168	T	C	927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=25;PP=508;ReadPosRankSum=1.875;SC=CTGAACTAGATGGCCTCTAAA;SOR=0.916;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=45;TCF=15;TCR=30;TR=37;WE=81921926;WS=81921908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,42:0.82:51
chr10	81923205	rs2236558	T	G	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=2.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.30;ReadPosRankSum=-0.905;SOR=0.780;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,33:0.35:93
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chr10	81925785	rs2573348	C	T	1261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=7.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=32.35;ReadPosRankSum=0.888;SOR=2.376;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,31:0.79:39
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chr10	81925796	rs138741116	GCGCACACACACA	G	1131.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=11.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.35;ReadPosRankSum=0.359;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,40:0.75:53
chr10	81926702	rs1049550	G	A	1593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.464;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=30;PP=925;ReadPosRankSum=-0.510;SC=TTGTTGGAGCGACTCCCCAGG;SOR=0.555;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=109;TCF=59;TCR=50;TR=63;WE=81926710;WS=81926692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,71:0.59:121
chr10	81995058	rs2678622	G	A	3955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=91;NR=64;PP=2630;SC=CGGAGCTGCCGAAAACTGTCA;SOR=0.830;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=156;TCF=92;TCR=64;TR=155;WE=81995066;WS=81995048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
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chr10	82264423	rs2343550	G	A	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=274;ReadPosRankSum=-0.487;SC=GCTCTGTGAAGCATGTTCACA;SOR=0.650;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=44;TCF=35;TCR=9;TR=19;WE=82264431;WS=82264413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,19:0.37:51
chr10	82269238	rs10785897	C	T	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.399;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=16;PP=376;ReadPosRankSum=0.447;SC=GTAAGCACCTCCCCAGCGGGC;SOR=0.495;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=35;TCF=12;TCR=23;TR=25;WE=82269246;WS=82269228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,28:0.70:40
chr10	82331347	rs59617064	A	G	841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.700;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=23;PP=475;ReadPosRankSum=0.045;SC=GGGCCAGCGCATGGGGCCCCT;SOR=0.214;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=54;TCF=14;TCR=40;TR=35;WE=82331355;WS=82331337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,38:0.67:57
chr10	82363371	.	G	A	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=0.000;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.39;ReadPosRankSum=-0.216;SOR=0.573;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,19:0.36:53
chr10	84118322	rs17099846	T	A	298.31	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.9784;FS=7.782;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=199;ReadPosRankSum=1.394;SC=AATATAGTGGTTACAGCCAGC;SOR=3.418;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=10;WE=84118330;WS=84118312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr10	84625107	rs478010	C	T	5160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=97;NR=68;PP=2903;SC=ATGTATAGAGCTTTTTCTAAC;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=97;TCR=68;TR=165;WE=84625115;WS=84625097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr10	84711147	rs4933861	C	T	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.06;ReadPosRankSum=-1.965;SOR=0.722;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,19:0.24:79
chr10	84738832	.	C	T	957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.124;ClippingRankSum=0.000;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.637;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=22;PP=503;ReadPosRankSum=-1.772;SC=ATCAGCAACTCGAAGAATCAA;SOR=0.671;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=129;TCF=66;TCR=63;TR=47;WE=84738840;WS=84738822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,53:0.36:146
chr10	84745256	rs2295933	C	T	1461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=31;PP=1027;ReadPosRankSum=1.292;SC=ACAGTGCAAGCGAAAACACAG;SOR=0.722;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=189;TCF=107;TCR=82;TR=72;WE=84745264;WS=84745246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,74:0.36:208
chr10	85902394	rs3816716	G	C	4072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=54;PP=2337;SC=ACGTGTCTTTGTTTGCATGTG;SOR=0.927;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=74;TCR=54;TR=128;WE=85902402;WS=85902384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr10	85908688	rs7069909	G	A	1339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=31;PP=871;SC=TGGAATTTAAGCCTCATGTTT;SOR=1.911;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=14;TCR=31;TR=45;WE=85908696;WS=85908678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr10	85909911	.	T	C	863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.294;ClippingRankSum=0.000;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.108;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=20;PP=435;ReadPosRankSum=1.451;SC=GCCTCTCCACTGTGGCCATGT;SOR=0.518;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=51;TCF=21;TCR=30;TR=35;WE=85909919;WS=85909901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,41:0.69:59
chr10	85936160	rs4348833	T	C	1037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=14;PP=647;ReadPosRankSum=0.155;SC=TCCTGAGCCCTGTGCCTTGGA;SOR=0.674;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=64;TCF=45;TCR=19;TR=43;WE=85936168;WS=85936150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,45:0.63:71
chr10	85944313	rs12250279	A	T	2113.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.81;ReadPosRankSum=-1.117;SOR=1.483;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,74:0.97:76
chr10	85944313	.	ATTTTTTTTT	TTTTTTTTTA,TTTTTTTTTT	649	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000,0.5000;HP=9;HapScore=3;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=27,44;NR=6,16;PP=649,224;QD=21.2869052989;SC=TTGCTTTGAAATTTTTTTTTA;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=66;TCF=49;TCR=17;TR=33,60;WE=85944330;WS=85944300;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.50:66
chr10	85944322	rs35568118	T	A	1152.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=6.159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.95;ReadPosRankSum=0.806;SOR=1.436;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,55:0.62:89
chr10	85955440	rs11592361	C	T	1081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.183;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=30;PP=681;ReadPosRankSum=-1.365;SC=CAAGTTGCTGCGCGCGCCCGG;SOR=0.552;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=61;TCF=16;TCR=45;TR=42;WE=85955448;WS=85955430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,45:0.69:65
chr10	85957681	rs11200915	A	C	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=6;PP=171;ReadPosRankSum=0.354;SC=CCAAGCCTTCATGGGGGCTTT;SOR=0.446;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=15;TCF=7;TCR=8;TR=11;WE=85957689;WS=85957671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr10	85958658	rs113539611	AAGAG	A	959.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.85;ReadPosRankSum=0.240;SOR=0.538;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,30:0.71:42
chr10	85958739	rs11200917	T	C	1882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=33;PP=1190;ReadPosRankSum=-0.824;SC=CCATTCATCCTTCAGAAGGTC;SOR=0.636;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=107;TCF=60;TCR=47;TR=73;WE=85958747;WS=85958729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,82:0.69:119
chr10	85960274	rs11200920	A	C	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.414;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=221;ReadPosRankSum=2.380;SC=CCCCGACCCCACTGCTGCATG;SOR=0.982;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=23;TCR=9;TR=14;WE=85960282;WS=85960264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,15:0.45:33
chr10	85960296	rs10788334	C	T	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.84;ReadPosRankSum=-2.467;SOR=0.583;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,30:0.60:50
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chr10	85961758	rs11200922	A	G	1377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=37;PP=896;ReadPosRankSum=-0.956;SC=GGGGAGTGGGAGCAGTTTGGA;SOR=0.721;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=113;TCF=45;TCR=68;TR=61;WE=85961766;WS=85961748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,66:0.56:118
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chr10	85965819	rs10788335	A	G	279.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=9;PP=231;SC=GAGCACCTGCACCAGACATGA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=85965827;WS=85965809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
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chr10	85974236	rs3814213	T	C	3349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.549;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=83;PP=1968;ReadPosRankSum=0.112;SC=CCGTGCCTACTGTCTCTGGCT;SOR=0.767;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=202;TCF=86;TCR=116;TR=144;WE=85974244;WS=85974226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,152:0.70:218
chr10	85974381	rs3814212	A	G	2497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.443;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=41;PP=1300;ReadPosRankSum=0.954;SC=CTTCTAGTGTATGCCCTATGA;SOR=0.571;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=81;TCF=40;TCR=41;TR=80;WE=85974389;WS=85974371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,94:0.99:95
chr10	85978809	rs4562752	T	G	684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=465;ReadPosRankSum=-0.651;SC=AGAACACTAATGTACTATTAT;SOR=1.209;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=21;WE=85978817;WS=85978799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,24:0.86:28
chr10	85978939	rs4244947	G	A	3789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.813;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=76;PP=2159;ReadPosRankSum=0.441;SC=GCCAGGGTCTGTTCTTGCATC;SOR=0.553;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=240;TCF=126;TCR=114;TR=153;WE=85978947;WS=85978922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,175:0.65:269
chr10	85981801	rs6585847	T	G	2093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.495;HP=5;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NR=38;PP=1265;ReadPosRankSum=-0.506;SC=GCTGCAGGGGTGCAGCTGGGG;SOR=0.559;Source=Platypus;TCR=57;WE=85981809;WS=85981791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,88:0.68:129
chr10	85981842	rs12217769	A	G	1937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=33;PP=1191;ReadPosRankSum=-0.922;SC=GCCGCGCAGGACCCACTTGCT;SOR=0.657;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=87;TCF=44;TCR=43;TR=67;WE=85981850;WS=85981832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,75:0.77:97
chr10	85981889	rs12218853	G	A	1942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.015;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=41;PP=1046;ReadPosRankSum=1.280;SC=AGGCATAGGCGCCCACAGGCA;SOR=0.863;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=96;TCF=48;TCR=48;TR=81;WE=85981897;WS=85981879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,87:0.84:103
chr10	85984323	rs11200925	G	A	3682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=76;PP=2373;ReadPosRankSum=1.872;SC=ATGACTGGGAGGGTAATGGAC;SOR=0.675;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=204;TCF=95;TCR=109;TR=144;WE=85984331;WS=85984313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,155:0.72:216
chr10	85984423	rs11200926	C	T	2974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.619;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=56;PP=1889;ReadPosRankSum=2.376;SC=GAATCTCAGCCCCACAGTCAG;SOR=0.670;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=178;TCF=94;TCR=84;TR=117;WE=85984431;WS=85984413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,129:0.66:195
chr10	85984723	rs11200928	G	A	2278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-2.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.726;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=32;PP=1309;ReadPosRankSum=-0.453;SC=TGTTAAAATTGAGCCAGAGGT;SOR=0.588;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=109;TCF=66;TCR=43;TR=78;WE=85984731;WS=85984713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,94:0.71:132
chr10	85991631	rs41314473	G	A	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=10;PP=364;ReadPosRankSum=0.436;SC=AGGTGTCAGAGCTAAAGAAGG;SOR=0.601;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=80;TCF=55;TCR=25;TR=30;WE=85991639;WS=85991621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,33:0.38:87
chr10	85992478	rs3814210	T	C	1305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=30;PP=755;ReadPosRankSum=0.843;SC=CCCATAGTGCTCCTGGGCTCC;SOR=0.732;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=184;TCF=96;TCR=88;TR=63;WE=85992486;WS=85992468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,71:0.34:206
chr10	85992511	rs3814209	T	C	1064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FS=3.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.19;ReadPosRankSum=0.337;SOR=0.979;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:139,66:0.32:205
chr10	85993836	rs4933986	A	G	355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=10;NR=3;PP=174;SC=TACCTGTACCATTAAGGGGCC;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=85993844;WS=85993826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	85993910	rs3814206	G	A	1864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=11;PP=967;SC=CAGCGTAGCAGTGCTGTGCCA;SOR=1.828;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=41;TCR=11;TR=52;WE=85993918;WS=85993900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr10	85994142	rs3829858	A	G	3091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=59;PP=1802;SC=GCCCTGCAGGAGTAAAAAAGA;SOR=1.466;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=35;TCR=59;TR=94;WE=85994150;WS=85994132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr10	85996968	rs4933988	A	C	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.596;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=42;ReadPosRankSum=0.184;SC=AAGGTTGCCGACCCTTACCTA;SOR=0.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=6;WE=85996976;WS=85996958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr10	85997105	rs11200933	G	T	1354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=27;PP=727;ReadPosRankSum=-0.474;SC=AGGTTCTCCAGGAAGCGCGCG;SOR=0.772;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=84;TCF=45;TCR=39;TR=55;WE=85997113;WS=85997095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,60:0.65:92
chr10	85997250	rs10887259	G	A	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=2.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.67;ReadPosRankSum=2.605;SOR=0.600;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,19:0.33:58
chr10	85997508	rs74145777	C	T	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.716;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=152;ReadPosRankSum=-1.370;SC=CCACCGCTACCTCCCTTCGCG;SOR=1.627;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=42;TCF=17;TCR=25;TR=13;WE=85997516;WS=85997498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,16:0.35:46
chr10	86004736	rs2279228	A	G	862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=20;NR=9;PP=643;SC=CCAAGGTCCAACATAATAACC;SOR=1.536;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=29;WE=86004744;WS=86004726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr10	86004873	rs2279227	T	C	1204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=20;NR=16;PP=522;SC=CCCTGCCCACTGGCTTCGGGG;SOR=0.976;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=20;TCR=16;TR=36;WE=86004881;WS=86004863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr10	86012713	rs1042454	C	T	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=3.152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.13;ReadPosRankSum=0.210;SOR=0.384;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,27:0.28:95
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chr10	86018460	rs3526	A	G	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=58;ReadPosRankSum=-1.274;SC=CAGCAGCCTCAGTGGCCAAGC;SOR=0.495;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=6;WE=86018468;WS=86018450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
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chr10	86237574	rs149077419	ATG	A	104.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.431;NF=0;NR=3;PP=82;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TTAGGTGTTTATGTGTTTTCC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=3;WE=86237583;WS=86237564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr10	87362579	rs60453921	T	A	325.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=266;ReadPosRankSum=-0.609;SC=TGGGCGAGTATCCCTTTCATG;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=12;WE=87362587;WS=87362569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr10	87966028	rs56757884	T	C	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5731;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=142;ReadPosRankSum=0.319;SC=AGACCACCCCTGACCGGTCCA;SOR=1.863;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=7;WE=87966036;WS=87966018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr10	88024443	rs2607863	T	C	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.910;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=10;PP=291;ReadPosRankSum=-0.741;SC=CCATGTCCCATGCAGGAGCCG;SOR=0.515;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=75;TCF=50;TCR=25;TR=25;WE=88024451;WS=88024433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,26:0.30:87
chr10	88126056	rs11202000	T	G	3253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.42;SOR=0.790;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr10	88203068	rs7094132	T	C	5315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=82;PP=2402;SC=GAAGTAGTGCTGTGTAGGAGG;SOR=0.703;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=171;TCF=89;TCR=82;TR=171;WE=88203076;WS=88203058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr10	88203208	rs7094269	T	C	827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=16;PP=464;SC=ATCTTTACTTTAAAACTGCTA;SOR=2.753;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=21;WE=88203216;WS=88203198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr10	88213604	rs6586011	A	G	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=250;ReadPosRankSum=-1.102;SC=AAGGAAATAAAATATAGACTA;SOR=0.709;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=60;TCF=18;TCR=42;TR=20;WE=88213612;WS=88213594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,24:0.36:67
chr10	88220866	rs7922658	C	T	819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=4;PP=550;SC=TTTTGAAGTACGTCAATGGAG;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=25;WE=88220874;WS=88220856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr10	88230874	rs2288362	G	A	3943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=74;PP=2368;SC=CAAGAAAATAGAGCAGGTTAG;SOR=1.088;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=59;TCR=74;TR=133;WE=88230882;WS=88230864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr10	88233628	rs3758520	C	G	1895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=22;PP=1249;ReadPosRankSum=-0.519;SC=AAGTACAGTTCACTTACTGTG;SOR=0.689;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=109;TCF=78;TCR=31;TR=75;WE=88233636;WS=88233618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,79:0.62:127
chr10	88256943	rs4934215	C	T	2479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=26;PP=1363;SC=AAATCACTGACAGTGCTTTAC;SOR=1.396;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=58;TCR=26;TR=84;WE=88256951;WS=88256933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr10	88277457	rs10887621	C	T	1280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FS=1.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.36;ReadPosRankSum=-0.190;SOR=0.816;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:215,79:0.27:294
chr10	88281344	rs2289738	C	G	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=2.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.67;ReadPosRankSum=0.682;SOR=0.625;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,23:0.35:65
chr10	88281344	.	CCA	GCG	196	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=10;NR=7;PP=196;QD=14.6745808742;SC=CCGGCCGGGCCCAGGCCTAGC;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=53;TCF=28;TCR=25;TR=17;WE=88281354;WS=88281334;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:36,17:0.32:53
chr10	88281346	rs4934218	A	G	2058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=23;PP=480;SC=GGCCGGGCCCAGGCCTAGCTC;SOR=0.758;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=50;TCF=27;TCR=23;TR=48;WE=88281354;WS=88281334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr10	88414569	rs2675703	C	T	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.217;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=12;PP=374;ReadPosRankSum=0.285;SC=CCAAGAGTCCCGCCCAGCCCA;SOR=1.116;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=95;TCF=50;TCR=45;TR=33;WE=88414577;WS=88414559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,36:0.35:102
chr10	88414758	rs2254051	G	A	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.288;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=73;ReadPosRankSum=0.869;SC=GCCACACACAGGGGCTTTGAC;SOR=0.368;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=7;WE=88414766;WS=88414748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr10	88419290	rs2254548	C	A	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=2.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.78;ReadPosRankSum=1.908;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,5:0.18:28
chr10	88420871	.	CA	C	75.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.892;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.31;ReadPosRankSum=0.269;SOR=2.925;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr10	88422116	rs1079610	C	T	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.013;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=9;PP=216;ReadPosRankSum=0.255;SC=TCCACGCTGACCAGCCACACC;SOR=0.968;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=61;TCF=35;TCR=26;TR=22;WE=88422124;WS=88422106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,22:0.34:64
chr10	88422307	rs2803550	G	A	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.294;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.123;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=77;ReadPosRankSum=-1.394;SC=GGGACACTGAGGACGCTGGCA;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=5;WE=88422315;WS=88422297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr10	88423773	rs141974957	ATG	A	114.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.55;ReadPosRankSum=1.503;SOR=0.790;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,10:0.14:74
chr10	88425555	rs2803554	C	A	1192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.12;ReadPosRankSum=0.503;SOR=0.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:127,68:0.35:195
chr10	88428303	rs2803556	G	A	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=101;ReadPosRankSum=-0.570;SC=CACGCAGCCCGGCTGGGCAGC;SOR=0.619;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=40;TCF=30;TCR=10;TR=10;WE=88428311;WS=88428293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,12:0.26:47
chr10	88428335	rs2803558	T	C	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.124;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=300;ReadPosRankSum=-1.628;SC=CAGGCAAGGCTGGGGGTCAGG;SOR=0.927;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=59;TCF=43;TCR=16;TR=20;WE=88428343;WS=88428325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,22:0.32:68
chr10	88440018	rs45598635	G	A	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.256;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=109;ReadPosRankSum=-0.660;SC=GGATGAGGCCGTGGGATCAGC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=7;WE=88440026;WS=88440008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr10	88445385	rs3740345	G	C	1276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.862;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=23;PP=828;ReadPosRankSum=0.119;SC=ACTGCCCCTGGTGGAGCCTCT;SOR=0.840;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=177;TCF=111;TCR=66;TR=65;WE=88445393;WS=88445375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,70:0.35:198
chr10	88458996	rs201580455	TTC	T	611.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=399;ReadPosRankSum=0.719;SC=CTGTCTCTGTTTCTCTCTCTC;SOR=0.575;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=13;WE=88459009;WS=88458986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,28:0.54:52
chr10	88702350	rs4934281	G	C	1550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=26;PP=915;SC=TGGAGGCCGTGAAGGGAGGCG;SOR=1.358;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=44;TCF=18;TCR=26;TR=44;WE=88702358;WS=88702340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr10	88702390	rs10887673	G	A	1525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=23;PP=870;SC=CCCCGGCCTCGGCCTCGCAGC;SOR=0.804;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=49;TCF=25;TCR=24;TR=48;WE=88702398;WS=88702380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr10	88705306	rs3750822	T	G	6618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=121;NR=110;PP=2965;SC=TGGCCCACCCTCCCCTACTCA;SOR=0.741;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=233;TCF=122;TCR=111;TR=231;WE=88705314;WS=88705282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
chr10	88717140	rs4244973	T	A	783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.49;SOR=0.957;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr10	88719569	rs760112	G	A	404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=9;PP=280;SC=TGCAGACCATGAGGCTAAACT;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=88719577;WS=88719559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	88719789	rs760113	C	G	3699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=54;PP=2058;SC=AGGCCAACGCCGTGAGCGAGG;SOR=0.796;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=72;TCR=54;TR=126;WE=88719797;WS=88719779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr10	88722398	rs9864	A	T	4868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=78;NR=80;PP=2615;SC=CAGGAGGGTGAGGCATCCAAA;SOR=0.977;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=158;TCF=78;TCR=80;TR=158;WE=88722406;WS=88722388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr10	88930249	rs11202365	A	T	4120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;MQ=59.96;NF=88;NR=63;PP=2533;SC=CAGTGTAGTTAGTGAAGTTGT;SOR=0.826;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=152;TCF=88;TCR=64;TR=151;WE=88930257;WS=88930239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr10	88935590	rs11202370	C	G	1113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=10;PP=824;SC=TAATCTGATACTAAGCCTAGA;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=39;WE=88935598;WS=88935580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr10	88939962	rs7081609	T	C	2941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=65;PP=2097;SC=TATATACTGGTTGTGCAAAAT;SOR=1.542;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=35;TCR=65;TR=100;WE=88939970;WS=88939952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr10	89267957	rs3843597	C	T	1842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=35;NR=26;PP=1062;SC=AGTTTCCTGACCAATATGTGC;SOR=0.910;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=62;TCF=35;TCR=27;TR=61;WE=89267965;WS=89267947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr10	89269267	rs3843598	G	A	241.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=229;SC=AGGCTAATGTGGTGAACATCC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=89269275;WS=89269257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr10	89273012	rs41299159	T	A	211.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=154;ReadPosRankSum=-0.571;SC=TTTGCTTTTTTAAAAAAATTT;SOR=0.481;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=12;WE=89273020;WS=89273002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr10	89419638	.	C	CGCT	353.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=0.000;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=3.769;NF=3;NR=5;PP=189;ReadPosRankSum=0.035;SC=GTCCGGCAGCCGCTGCTGCTG;SOR=0.644;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=35;TCF=13;TCR=22;TR=8;WE=89419648;WS=89419628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,15:0.25:59
chr10	89419873	rs2255682	C	G	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=142;ReadPosRankSum=0.909;SC=GAGGGGGCGTCGGGAGGAGGA;SOR=0.919;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=10;WE=89419881;WS=89419863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,10:0.26:39
chr10	89420561	.	GAAAAAAAAAAAAAA	G	525	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5000;HP=20;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=17;MQ=50.17;NF=2;NR=0;PP=525;QD=264.0;SC=CCAATAAACTGAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=2;WE=89420582;WS=89420554;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:7,2:0.22:9
chr10	89420789	rs2762528	A	G	1303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.790;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=28;PP=612;ReadPosRankSum=-1.265;SC=TCTCTAGTAGATAGACGTGCA;SOR=0.463;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=129;TCF=59;TCR=70;TR=57;WE=89420797;WS=89420779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,69:0.45:155
chr10	89420898	rs10595979	TAA	T	88.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.68;ReadPosRankSum=-1.718;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr10	89463460	rs7923151	G	C	1900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.406;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=28;PP=1067;ReadPosRankSum=-0.033;SC=CTCCAAAATCGATACTCATGC;SOR=0.832;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=116;TCF=70;TCR=46;TR=73;WE=89463468;WS=89463450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,87:0.64:136
chr10	89463480	rs7923162	G	A	2177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=33;PP=1092;ReadPosRankSum=1.720;SC=CTACTCCGATGCATGCTACAG;SOR=0.647;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=126;TCF=74;TCR=52;TR=81;WE=89463488;WS=89463470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,97:0.66:148
chr10	89469083	rs72025574	CATAT	C	578.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=570;ReadPosRankSum=0.138;SC=ATGTCATGTTCATATATATAT;SOR=0.807;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=15;WE=89469094;WS=89469073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr10	89475640	rs3214322	GA	G	292.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=114;ReadPosRankSum=0.458;SC=TGTTGTTAAGGAAAAAAAAAA;SOR=0.704;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=11;WE=89475648;WS=89475630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,17:0.46:37
chr10	89527300	rs1819163	A	G	192.31	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.48;ReadPosRankSum=0.000;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,10:0.91:11
chr10	89552283	rs11202557	T	C	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=308;ReadPosRankSum=0.803;SC=GGAATACAACTATATGCCGAG;SOR=0.546;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=20;WE=89552291;WS=89552273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,21:0.60:35
chr10	89725293	.	CT	C	55.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.178;ClippingRankSum=0.000;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQRankSum=-2.910;QD=0.88;ReadPosRankSum=2.460;SOR=0.715;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,12:0.19:63
chr10	90034899	rs45585838	C	T	3182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=66;PP=2092;SC=ATATATAGACCTGGAATGGGG;SOR=1.547;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=103;TCF=37;TCR=66;TR=103;WE=90034907;WS=90034889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr10	90034982	rs112956101	AT	A	599.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=17;PP=665;SC=CCCATTTTACATTCTTTATCC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=17;WE=90034990;WS=90034972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
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chr10	90429652	rs814628	A	G	1306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=26;PP=852;ReadPosRankSum=-0.814;SC=TGTAAAGAAAACTGGACAGAA;SOR=0.683;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=160;TCF=96;TCR=64;TR=62;WE=90429660;WS=90429642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,69:0.38:183
chr10	90438207	rs1228187	A	G	1414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.675;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=38;PP=1002;ReadPosRankSum=0.100;SC=TCTAGTCCCAACCTCCCTACT;SOR=0.615;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=214;TCF=115;TCR=99;TR=74;WE=90438215;WS=90438197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,79:0.33:238
chr10	90484243	rs376036	C	T	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.020;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=40;ReadPosRankSum=-0.823;SC=AATTTCACTTCGTAGAATTTA;SOR=1.629;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=6;WE=90484251;WS=90484233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,9:0.25:36
chr10	90484420	rs56390975	C	A	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=10;PP=426;ReadPosRankSum=-0.821;SC=GTCATTTATTCAGAAAAAAAT;SOR=0.648;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=59;TCF=21;TCR=38;TR=17;WE=90484430;WS=90484410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,20:0.29:69
chr10	90484422	rs11358016	GA	G	614.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.123;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=440;ReadPosRankSum=-0.231;SC=CATTTATTCAGAAAAAAATGC;SOR=0.894;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=10;WE=90484430;WS=90484410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,18:0.27:66
chr10	90486793	rs407433	T	G	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.112;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=22;ReadPosRankSum=1.860;SC=GGAGAAAAATTATCGCCCCCC;SOR=0.084;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=4;WE=90486801;WS=90486783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr10	90490728	rs392430	T	C	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=1;PP=32;ReadPosRankSum=-0.729;SC=TCTTGTTGCCTGTGTTTTGCA;SOR=0.425;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=4;WE=90490736;WS=90490718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr10	90490921	rs412227	G	A	764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.672;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=22;PP=441;ReadPosRankSum=0.173;SC=CGAAATCACCGGAATACTGGG;SOR=0.798;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=125;TCF=55;TCR=70;TR=37;WE=90490929;WS=90490911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,45:0.30:148
chr10	90497588	rs444764	A	G	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.106;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=313;ReadPosRankSum=1.631;SC=GTTGCACAGAAGTGATGAAAG;SOR=0.979;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=63;TCF=16;TCR=47;TR=21;WE=90497596;WS=90497578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,25:0.33:75
chr10	90499894	rs443886	G	A	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=182;ReadPosRankSum=0.090;SC=CTCTCAGAGAGCTCACTGCAG;SOR=0.850;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=38;TCF=12;TCR=26;TR=14;WE=90499902;WS=90499884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,14:0.34:41
chr10	90499928	rs419014	C	T	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=113;ReadPosRankSum=-0.738;SC=CCTGCCACTGCCACATTGATG;SOR=0.663;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=9;WE=90499936;WS=90499918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr10	90503075	rs390152	T	C	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=10;PP=229;ReadPosRankSum=0.354;SC=TGCACTTCCATCAGGTACAAA;SOR=0.768;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=96;TCF=56;TCR=40;TR=26;WE=90503083;WS=90503065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,28:0.26:108
chr10	90512306	rs1214464	G	C	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=1.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.91;ReadPosRankSum=0.452;SOR=0.507;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,16:0.22:72
chr10	90522182	rs843782	T	C	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=69;ReadPosRankSum=-0.465;SC=ATTGGATTAGTCTTTAAATAG;SOR=0.260;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=5;WE=90522190;WS=90522172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr10	90524237	rs430517	T	C	1564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.551;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=32;PP=1087;ReadPosRankSum=1.151;SC=AGAATTATGCTAATGGAAGCC;SOR=0.636;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=162;TCF=95;TCR=67;TR=72;WE=90524245;WS=90524227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,79:0.44:181
chr10	90524412	rs398126	A	T	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=33;PP=645;ReadPosRankSum=1.166;SC=GAGGCAATTTAAAAAAAATAA;SOR=0.732;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=116;TCF=39;TCR=77;TR=48;WE=90524420;WS=90524402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,38:0.34:111
chr10	90526260	rs151107451	TCTG	T	457.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.810;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=366;ReadPosRankSum=0.454;SC=TTCCCTGTCCTCTGCTGGGAA;SOR=0.086;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=10;WE=90526270;WS=90526250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,14:0.31:45
chr10	90528499	rs450011	C	T	618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=13;PP=422;ReadPosRankSum=-1.060;SC=GTTAGAAACACTGCGTAAGTA;SOR=0.720;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=135;TCF=87;TCR=48;TR=38;WE=90528507;WS=90528489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,41:0.27:151
chr10	90534698	rs303471	G	A	135.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=0;PP=105;SC=GTTGAGCCCCGTTTGTCATAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=90534706;WS=90534688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr10	90534787	rs303472	T	G	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.441;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=153;ReadPosRankSum=-1.750;SC=TTTCTAAAATTTGCTGTTAGC;SOR=0.430;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=14;WE=90534795;WS=90534777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr10	90535040	rs303473	T	C	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=2;PP=25;SC=GAACTTTTTTTTAAAAAAATT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=90535048;WS=90535030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr10	90537732	rs303484	C	T	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.256;NF=18;NR=9;PP=292;ReadPosRankSum=0.164;SC=TGAGGAGCTTCCTCTCATGAA;SOR=0.671;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=71;TCF=47;TCR=24;TR=27;WE=90537740;WS=90537722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,33:0.40:83
chr10	90538020	rs303485	A	G	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.507;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=238;ReadPosRankSum=0.168;SC=TTTACTTTTCAATTAAAAGTT;SOR=0.332;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=48;TCF=10;TCR=38;TR=16;WE=90538028;WS=90538010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,16:0.32:50
chr10	90565671	rs303534	A	G	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=1.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.77;ReadPosRankSum=-0.782;SOR=0.538;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,14:0.20:71
chr10	90565864	rs303533	T	A	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.450;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=173;ReadPosRankSum=-1.494;SC=GGTGATCTGTTGACAGCACTT;SOR=1.137;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=65;TCF=30;TCR=35;TR=16;WE=90565872;WS=90565854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,16:0.24:66
chr10	90574222	rs303524	C	G	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.032;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=352;ReadPosRankSum=-0.179;SC=AACCTGGTGTCGGGGGGAGCT;SOR=0.278;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=20;WE=90574230;WS=90574212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,20:0.62:32
chr10	90588154	rs1977537	A	G	1557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.51;SOR=3.321;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr10	90588161	rs1029025	C	T	1633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.89;SOR=2.891;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr10	90665355	rs17114071	G	A	1406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.998;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=34;PP=871;ReadPosRankSum=0.819;SC=AGAGGATGGCGTCTGTGTATT;SOR=0.478;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=80;TCF=30;TCR=50;TR=56;WE=90665363;WS=90665345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,61:0.69:88
chr10	90668699	rs147823993	T	C	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.937;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=18;PP=364;ReadPosRankSum=0.954;SC=CATTTAATGATCATCACTGAG;SOR=0.856;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=71;TCF=23;TCR=48;TR=26;WE=90668707;WS=90668689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,32:0.41:79
chr10	90674434	.	AAT	A	173.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.793;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=7.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.79;ReadPosRankSum=-1.813;SOR=0.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,8:0.27:30
chr10	90683124	rs1530281	T	C	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.22;ReadPosRankSum=-0.120;SOR=0.465;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr10	90767395	rs2031611	G	C	667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=1;PP=437;SC=TCCCTCTATAGTTCCCACCCT;SOR=3.912;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=90767403;WS=90767385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr10	90770439	rs2296600	C	G	2779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.141;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=56;PP=1886;ReadPosRankSum=0.338;SC=CTCTTGATTACTAGAAAGTCC;SOR=0.400;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=154;TCF=73;TCR=81;TR=110;WE=90770447;WS=90770429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,115:0.71:163
chr10	90771829	rs2234978	T	C	3555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=51;NR=71;PP=2250;SC=AATCTCCAACTTTAAATCCTG;SOR=1.187;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=122;TCF=51;TCR=71;TR=122;WE=90771837;WS=90771819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr10	90773303	rs1571019	A	G	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.769;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=182;ReadPosRankSum=0.319;SC=TTTATAATGAATACTCATAGT;SOR=0.223;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=11;WE=90773311;WS=90773293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr10	90982081	rs6586175	A	G	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.247;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=474;ReadPosRankSum=0.565;SC=CCCACGTATAACACAGTGTGC;SOR=0.186;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=23;WE=90982089;WS=90982071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,23:0.62:37
chr10	90988250	rs2071509	C	G	285.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=236;SC=GATCCATAAGCAAATAATGAA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=90988258;WS=90988240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr10	91007360	rs1051338	T	G	2574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.108;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=46;PP=1438;ReadPosRankSum=0.956;SC=GAATGCAGGGTCCAGAGAACC;SOR=0.779;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=178;TCF=101;TCR=77;TR=108;WE=91007368;WS=91007350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,120:0.60:200
chr10	91007470	rs2250781	C	A	599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.548;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=21;PP=421;ReadPosRankSum=0.868;SC=ATTCTGGTAACTTAATGCTCC;SOR=1.609;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=43;TCF=7;TCR=36;TR=23;WE=91007478;WS=91007460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,26:0.54:48
chr10	91066460	rs954439	T	A	2344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.705;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=38;PP=1283;ReadPosRankSum=-1.199;SC=TAACAGATGTTCTTCGCAGTG;SOR=0.490;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=155;TCF=91;TCR=64;TR=89;WE=91066468;WS=91066450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,105:0.60:176
chr10	91066769	rs1727	C	A	4813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=84;NR=72;PP=2965;SC=AGTATGAAGACGCAGAGTATT;SOR=0.829;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=156;TCF=84;TCR=72;TR=156;WE=91066777;WS=91066759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr10	91099943	rs10749607	C	G	185.53	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5562;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=4;PP=96;ReadPosRankSum=-0.431;SC=ACGGGTAGGACGATAGGAAGA;SOR=0.446;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=7;WE=91099951;WS=91099933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr10	91137826	rs304504	T	C	3039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.995;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=57;PP=1475;ReadPosRankSum=1.076;SC=ACTCTGTGGATGAACCTTGAA;SOR=0.621;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=217;TCF=118;TCR=99;TR=126;WE=91137834;WS=91137816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,144:0.59:244
chr10	91143529	rs304494	T	A	2791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.548;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=44;PP=1623;ReadPosRankSum=0.718;SC=CGAAGTGTGGTGGAAAGAATT;SOR=0.775;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=168;TCF=95;TCR=73;TR=104;WE=91143537;WS=91143519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,123:0.63:195
chr10	91152227	.	CA	C	68	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=62;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=68;QD=34.0;SC=TTTCATTCCCCACCCCCCCCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=3;WE=91152235;WS=91152221;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr10	91152321	rs74945792	C	CTTA	1057.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.48;BaseQRankSum=0.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.130;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=302;ReadPosRankSum=-1.571;SC=ACACCCACAGCTTACACCATT;SOR=1.402;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=22;TCF=13;TCR=9;TR=8;WE=91152329;WS=91152311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,25:0.66:38
chr10	91152593	rs303218	G	A	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.876;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=100;ReadPosRankSum=-0.660;SC=CTCGATTTGAGTATCTGCTTA;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=7;WE=91152601;WS=91152583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr10	91162497	rs303211	A	G	4714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=78;PP=2852;SC=GTGGAGGAAAAAATTATGAAC;SOR=0.704;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=162;TCF=84;TCR=78;TR=162;WE=91162505;WS=91162487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr10	91162677	rs303210	C	T	1413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.817;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=25;PP=868;ReadPosRankSum=0.624;SC=TAAATCCAGACAATGGATATA;SOR=0.493;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=82;TCF=50;TCR=32;TR=57;WE=91162685;WS=91162667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,63:0.68:93
chr10	91172556	rs79242890	AG	A	412.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.685;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.930;NF=5;NR=5;PP=327;ReadPosRankSum=0.102;SC=ACCAGAAGGAAGAAACTCCAG;SOR=1.329;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=17;TCF=8;TCR=9;TR=10;WE=91172564;WS=91172546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
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chr10	91352650	rs17481096	C	T	696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.728;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=21;PP=402;ReadPosRankSum=-0.517;SC=AGACCTTTTCCTCACATTTCA;SOR=0.790;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=107;TCF=47;TCR=60;TR=36;WE=91352658;WS=91352640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,41:0.35:118
chr10	91352850	rs10160034	C	A	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=2.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.00;ReadPosRankSum=-1.278;SOR=0.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,24:0.36:67
chr10	91352966	rs2296616	G	A	645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.636;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=14;PP=304;ReadPosRankSum=1.428;SC=CATTCAACGCGCACATCCGAG;SOR=0.531;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=92;TCF=56;TCR=36;TR=32;WE=91352974;WS=91352956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,37:0.35:105
chr10	91358943	rs62620049	C	A	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=42;ReadPosRankSum=1.037;SC=ATATAAATAACCTTTTACTAT;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=4;WE=91358951;WS=91358942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr10	91371329	rs41297163	A	G	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=81;ReadPosRankSum=0.751;SC=AAACTGAGGCACAGAGCGGTG;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=6;WE=91371337;WS=91371319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr10	91371445	rs7896079	C	A	2113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=26;PP=1233;SC=AAGACAAACCCGACCTACCAT;SOR=1.096;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=43;TCR=26;TR=69;WE=91371453;WS=91371435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr10	91371844	rs3802655	C	T	699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=21;PP=574;SC=GAATGCTATGCGTGCAAAGAA;SOR=2.925;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=24;WE=91371852;WS=91371834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr10	91373511	rs7079690	T	C	211.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=142;SC=CTGGTCATCCTCATTTGTTGA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=91373519;WS=91373509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr10	91373624	rs7091626	G	A	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=159;ReadPosRankSum=0.804;SC=GCCCCAGACTGGGATTCGGAA;SOR=0.706;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=69;TCF=45;TCR=24;TR=18;WE=91373632;WS=91373614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,24:0.29:83
chr10	91373847	rs7076397	A	G	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.450;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=4;PP=46;ReadPosRankSum=0.000;SC=AGTCTTTTTCAGTGGAGTTTT;SOR=0.409;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=11;TCR=12;TR=8;WE=91373855;WS=91373837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,12:0.36:33
chr10	91404448	rs11185826	C	G	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=3;PP=54;ReadPosRankSum=1.074;SC=GCTGCGGCTGCAGCTCCGGCA;SOR=0.616;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=23;TCF=14;TCR=9;TR=6;WE=91404456;WS=91404438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,6:0.21:29
chr10	91404832	rs12769113	T	C	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.984;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=15;PP=233;ReadPosRankSum=0.658;SC=CCACCTCCTCTGCGCCCTGCC;SOR=0.480;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=72;TCF=25;TCR=47;TR=24;WE=91404840;WS=91404822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,26:0.32:80
chr10	91469576	rs10881631	T	C	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=2.260;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=28;ReadPosRankSum=1.559;SC=GTGGCACCTATTTTAAGAATG;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=3;WE=91469584;WS=91469570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr10	91470660	rs7089473	T	G	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.98;ReadPosRankSum=-0.221;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr10	91470834	rs1048057	A	C	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.15;ReadPosRankSum=-1.813;SOR=0.762;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,28:0.33:86
chr10	91470953	rs10881632	A	G	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.902;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=30;ReadPosRankSum=-0.210;SC=GACTTCTTATAAACCCTTTAG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=3;WE=91470961;WS=91470943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr10	91473887	rs11185853	G	A	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.88;ReadPosRankSum=1.012;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,25:0.40:62
chr10	91474699	rs57304303	C	CT	131.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.630;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.98;ReadPosRankSum=0.183;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr10	91483908	rs7079174	G	C	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=6.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.12;ReadPosRankSum=-0.933;SOR=0.681;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr10	91484780	rs8181361	G	A	1040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.35;ReadPosRankSum=-1.085;SOR=0.680;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,61:0.37:164
chr10	91485950	rs10881639	A	G	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.447;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=80;ReadPosRankSum=-0.623;SC=TCAAGTGATGAATTTTTTGCT;SOR=0.223;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=7;WE=91485958;WS=91485940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr10	91497631	rs1062465	T	A	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.702;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=19;PP=456;ReadPosRankSum=-0.207;SC=ATCTCAGGGATCTGTCAAATG;SOR=0.761;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=88;TCF=47;TCR=41;TR=35;WE=91497639;WS=91497621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,37:0.37:99
chr10	91497902	rs144593231	C	CTAAAAG	1243.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.444;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.212;NF=3;NR=10;PP=665;ReadPosRankSum=-0.889;SC=AAACAATAGACTAAAGGAGAA;SOR=0.814;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=44;TCF=13;TCR=31;TR=13;WE=91497910;WS=91497892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,32:0.42:77
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chr10	91503750	rs10881648	G	T	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=46;ReadPosRankSum=0.409;SC=TGTACAAAAAGGTACAAATTT;SOR=0.634;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=28;TCF=9;TCR=19;TR=7;WE=91503758;WS=91503740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,7:0.23:30
chr10	91510982	rs1326201	T	C	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=51;ReadPosRankSum=-0.366;SC=AAAGTTTCTGTCTATATGGAA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=4;WE=91510990;WS=91510977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr10	91518388	rs2026549	A	G	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.711;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=126;ReadPosRankSum=1.903;SC=GGTGTTACATATAATAATTTC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=10;WE=91518396;WS=91518378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr10	91522605	rs3740038	G	C	601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=3.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.83;ReadPosRankSum=1.503;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,42:0.27:157
chr10	91522707	rs12767644	C	G	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.26;ReadPosRankSum=1.536;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,4:0.22:18
chr10	91532432	rs3758389	A	T	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.906;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=169;ReadPosRankSum=-0.462;SC=CTAATTAACAATTTTATTTTA;SOR=0.260;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=15;WE=91532440;WS=91532422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr10	92503619	rs3740048	T	C	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=0.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.52;ReadPosRankSum=2.647;SOR=0.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:108,38:0.26:146
chr10	92638707	rs75192201	C	CAGT	584.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=431;ReadPosRankSum=-0.942;SC=GCAGAAATGTCAGTATATTAG;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=9;WE=92638715;WS=92638697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,13:0.81:16
chr10	92662860	rs4568910	A	G	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5010;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=169;ReadPosRankSum=-0.930;SC=CAAATTAGATATGAGAAGGAT;SOR=1.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=9;WE=92662868;WS=92662850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr10	92663108	rs7089472	C	T	638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=16;PP=413;ReadPosRankSum=0.433;SC=TTTTTTGCGACGTCCCACCTT;SOR=0.752;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=52;TCF=26;TCR=26;TR=29;WE=92663116;WS=92663098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,30:0.51:59
chr10	92675322	rs35550482	G	A	2617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.593;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=49;PP=1470;ReadPosRankSum=-0.375;SC=GTTGAGATCCGCGCCATACAT;SOR=0.641;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=150;TCF=76;TCR=74;TR=101;WE=92675330;WS=92675312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,117:0.68:173
chr10	92676127	rs4933200	T	C	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=17;PP=428;ReadPosRankSum=-0.011;SC=GTTGTCCCCATCTAGATTGAC;SOR=0.784;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=46;TCF=17;TCR=29;TR=26;WE=92676135;WS=92676117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,29:0.57:51
chr10	92678738	.	AAAATAAAT	A	239.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=0.000;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.94;MQRankSum=0.000;QD=7.73;ReadPosRankSum=1.861;SOR=0.665;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,11:0.35:31
chr10	92678742	rs201258369	TAAATAA	T	169.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=1.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.05;MQRankSum=0.000;QD=5.48;ReadPosRankSum=0.632;SOR=0.668;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,9:0.29:31
chr10	92680929	rs10881855	A	G	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5008;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=150;ReadPosRankSum=0.000;SC=TAACACTCCCACCCCCATTAG;SOR=1.329;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=8;WE=92680937;WS=92680919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,10:0.83:12
chr10	93170250	rs7081569	C	G	3186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=56;NR=47;PP=1662;SC=GGTGGCGGCGCCCGCGCCTGA;SOR=0.709;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=104;TCF=56;TCR=48;TR=103;WE=93170258;WS=93170240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr10	93170365	rs71025355	CG	C	1701.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=26;PP=1027;SC=TCTGGCGCCCCGGACGGCGGG;SOR=1.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=26;WE=93170373;WS=93170355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr10	93390680	rs3781228	G	A	592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=19;PP=405;ReadPosRankSum=0.215;SC=CTTCCCCAGTGCCAAATACAT;SOR=0.787;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=75;TCF=27;TCR=48;TR=29;WE=93390688;WS=93390670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,31:0.38:81
chr10	93577103	rs1539040	A	T	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=1.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.254;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=294;ReadPosRankSum=0.909;SC=GTGTCAGTTCAGTAGCTATCC;SOR=1.743;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=16;WE=93577111;WS=93577093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,22:0.52:42
chr10	93577141	rs1539041	T	G	545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.54;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=13;PP=360;SC=GCTGACATTTTATTCTCCTCT;SOR=4.294;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=93577149;WS=93577131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	93579003	.	C	CT	149	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;FR=1.0000;HP=12;HapScore=2;MGOF=60;MMLQ=16;MQ=60.63;NF=2;NR=2;PP=149;QD=38.75;SC=AATTTCTATACTTTTTTTTTT;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=4;WE=93579011;WS=93578993;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,4:0.50:8
chr10	93586715	rs2275646	C	T	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=234;ReadPosRankSum=0.440;SC=TTACACAGTACGAATAATTCT;SOR=0.667;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=41;TCF=33;TCR=8;TR=17;WE=93586723;WS=93586705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,19:0.40:47
chr10	93588201	rs1572933	G	C	2770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.98;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr10	93588208	rs1572934	G	A	2561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.94;SOR=1.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr10	93600480	rs17107140	G	A	353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.922;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=199;ReadPosRankSum=0.866;SC=GCCAATGATTGTTATGGACTC;SOR=0.860;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=79;TCF=33;TCR=46;TR=22;WE=93600488;WS=93600470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,24:0.28:86
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chr10	93609210	rs41286940	G	A	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=136;ReadPosRankSum=0.559;SC=CTGTTATAGTGATGAAATACA;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=10;WE=93609218;WS=93609200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr10	93610896	rs3758501	C	T	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.50;ReadPosRankSum=0.979;SOR=0.752;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,12:0.18:68
chr10	93611176	rs112177544	A	ATATG	534.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=555;SC=TAATTTAAAAATATGAGAGAA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=10;WE=93611184;WS=93611166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	93617306	rs1340420	A	G	5247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=85;NR=92;PP=2965;SC=CCTCCCCACCAACTCTACCAC;SOR=0.898;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=177;TCF=85;TCR=92;TR=177;WE=93617314;WS=93617296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr10	93702405	rs3814640	C	T	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=19;PP=395;ReadPosRankSum=-0.788;SC=GTTCATTAGTCACACGTAAAC;SOR=0.779;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=25;WE=93702413;WS=93702395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,29:0.73:40
chr10	93702443	rs3814639	G	A	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=217;ReadPosRankSum=0.000;SC=TAAATTAACTGAAGTTTGCAG;SOR=1.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=11;WE=93702451;WS=93702433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,14:0.78:18
chr10	93713405	rs12571564	T	G	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=212;ReadPosRankSum=0.000;SC=ATACTGAAATTTATAGACTTG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=9;WE=93713413;WS=93713395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr10	93713758	rs11186768	T	G	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.049;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=298;ReadPosRankSum=-0.029;SC=ATTCTCTTACTCAATTGTCAG;SOR=3.296;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=14;WE=93713766;WS=93713748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr10	93716899	rs7894570	G	C	180.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=151;SC=ACTAGACCTAGAAATAAAATT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=93716907;WS=93716889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr10	93740429	rs2792022	T	C	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=146;ReadPosRankSum=0.356;SC=TTGAAAAGTCTGGAGATCTGC;SOR=1.112;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=10;WE=93740437;WS=93740419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr10	93767797	rs1711842	G	A	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.087;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=123;ReadPosRankSum=1.030;SC=TCTTTTTTCTGTGTGTTTGTT;SOR=0.495;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=8;WE=93767805;WS=93767787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr10	93771192	rs2676802	T	A	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.19;ReadPosRankSum=-0.117;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,16:0.80:20
chr10	93812334	rs1711841	G	A	649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=18;PP=482;SC=ACTGGATGGTGGTTGAGAGCA;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=93812342;WS=93812324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr10	93841227	rs2676811	A	G	2447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.31;ReadPosRankSum=0.246;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,103:0.98:105
chr10	93851714	rs1229578	T	C	1312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FS=1.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.98;ReadPosRankSum=0.446;SOR=0.581;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:114,74:0.39:188
chr10	93999562	rs3740302	T	A	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=223;ReadPosRankSum=-0.399;SC=GCTGCGCCTGTGGTGGCTGCG;SOR=0.446;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=43;TCF=36;TCR=7;TR=15;WE=93999570;WS=93999552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,17:0.38:45
chr10	93999850	rs3824734	A	G	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=1.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.36;ReadPosRankSum=-2.704;SOR=0.955;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,32:0.29:112
chr10	94229912	rs4646957	C	T	592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.967;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=7;PP=433;ReadPosRankSum=-0.888;SC=CTAATGTGTTCCTTATCACAC;SOR=0.914;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=71;TCF=52;TCR=19;TR=28;WE=94229920;WS=94229902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,29:0.37:78
chr10	94238929	rs35864975	T	TA	334.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=10;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.945;NF=9;NR=4;PP=177;ReadPosRankSum=1.711;SC=CCATAAAGATTAAAAAAAAAA;SOR=0.693;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=27;TCF=15;TCR=12;TR=13;WE=94238937;WS=94238919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr10	94333827	rs4646954	G	A	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.97;ReadPosRankSum=0.790;SOR=0.736;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,20:0.41:49
chr10	94366347	.	A	AT	92	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.9990;HP=13;HapScore=2;MGOF=18;MMLQ=16;MQ=59.01;NF=5;NR=2;PP=92;QD=13.8571428571;SC=TTTGAGGTTGATTTTTTTTTT;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=7;WE=94366355;WS=94366337;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr10	94369023	rs367612060	CAGAGAGAGAG	C	143.94	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.99;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr10	94372942	rs2275219	T	C	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.128;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=9;PP=224;ReadPosRankSum=1.287;SC=ATAGAGCAGCTTGAAATTTTG;SOR=0.941;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=51;TCF=27;TCR=24;TR=16;WE=94372950;WS=94372932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,16:0.29:56
chr10	94409800	rs6583833	C	T	975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.740;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=27;PP=677;ReadPosRankSum=-0.248;SC=CTTGATGTGGCTGACTTCATG;SOR=1.426;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=43;TCF=8;TCR=35;TR=32;WE=94409808;WS=94409790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,36:0.72:50
chr10	94413572	rs138267534	A	G	1422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.603;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=38;PP=919;ReadPosRankSum=-0.919;SC=GGGGTTGGCAATTTTATTTTT;SOR=1.272;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=85;TCF=28;TCR=57;TR=54;WE=94413580;WS=94413562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,59:0.65:91
chr10	94507612	rs2488066	A	G	2041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.691;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=38;PP=1214;ReadPosRankSum=1.435;SC=CACCACTACCACTGTCAGCCC;SOR=0.834;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=129;TCF=73;TCR=56;TR=90;WE=94507620;WS=94507602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,97:0.70:139
chr10	94511683	rs2096177	G	T	6804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=117;NR=108;PP=2965;SC=ATATTTGTATGAAGGCTGCAG;SOR=0.757;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=226;TCF=118;TCR=108;TR=225;WE=94511691;WS=94511673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
chr10	94594416	rs11408607	A	AT	97.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=1.426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.14;MQRankSum=1.880;QD=1.36;ReadPosRankSum=-1.557;SOR=0.333;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,15:0.21:72
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chr10	94695555	rs1326330	G	A	871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.095;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=21;PP=429;ReadPosRankSum=0.235;SC=TTTTGTTTGTGTGTTTCCACC;SOR=0.610;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=118;TCF=68;TCR=50;TR=43;WE=94695563;WS=94695545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,50:0.37:136
chr10	94695617	rs1326331	C	T	3395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=63;PP=1954;SC=AAGAATCTTACTGTAATATTT;SOR=1.117;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=48;TCR=63;TR=111;WE=94695625;WS=94695607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr10	94816807	rs60582805	G	GA	2231.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=42;PP=1770;SC=AGTATATTCTGAAACTTTTTT;SOR=2.338;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=47;TCF=1;TCR=46;TR=43;WE=94816815;WS=94816797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr10	94816859	rs12783274	G	C	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=8.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.47;MQRankSum=-0.495;QD=3.03;ReadPosRankSum=-1.891;SOR=0.038;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr10	94820860	rs1538648	A	G	642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.436;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=19;PP=425;ReadPosRankSum=-0.442;SC=GTCTGTTTTTAGAACAGAGTT;SOR=0.401;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=130;TCF=79;TCR=51;TR=41;WE=94820868;WS=94820850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,43:0.30:143
chr10	94822686	rs55843714	C	T	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.24;ReadPosRankSum=-0.335;SOR=0.735;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,32:0.24:131
chr10	94822895	rs12263200	G	T	1031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.79;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr10	95070037	rs2761286	A	G	1664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=38;PP=1190;SC=GTCAAGAAAAAATACTGTTCC;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=17;TCR=38;TR=55;WE=95070045;WS=95070027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr10	95070076	rs117078251	C	G	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=2.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.03;ReadPosRankSum=-0.037;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,19:0.79:24
chr10	95070080	rs2797581	C	T	960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.77;SOR=4.003;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	95070526	rs787661	G	A	417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=13;PP=319;SC=ATTGCCTTCAGTTTTCCTCAA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=95070534;WS=95070516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	95072906	rs787666	T	C	4346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=82;NR=65;PP=2543;SC=TCATGTCCAATCTGCATTTCT;SOR=0.807;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=147;TCF=82;TCR=65;TR=147;WE=95072914;WS=95072896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr10	95083204	rs148815470	ATTTC	A	572.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=377;SC=AGATGAAACTATTTCTTTCTT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=95083215;WS=95083194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	95089762	rs17477816	T	C	634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=14;PP=401;SC=TAGTACATACTAGAAATAAGA;SOR=2.636;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=18;WE=95089770;WS=95089752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr10	95095600	rs787689	G	C	2056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.677;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=25;PP=1393;ReadPosRankSum=0.017;SC=CCTCCCTAGAGCCTGGTTGTC;SOR=0.814;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=130;TCF=89;TCR=41;TR=81;WE=95095608;WS=95095590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,91:0.64:143
chr10	95097537	rs1614065	T	C	2331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.650;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=34;PP=1154;ReadPosRankSum=-0.986;SC=CAAAGGATGTTGATTCTCCAC;SOR=0.787;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=135;TCF=85;TCR=50;TR=90;WE=95097545;WS=95097527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,103:0.68:152
chr10	95099822	rs2761330	G	C	178.03	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5565;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=136;ReadPosRankSum=-0.887;SC=GGGTGAAAGAGCGAGACTCCT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=8;WE=95099830;WS=95099812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr10	95099849	rs2761329	G	A	592.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=465;ReadPosRankSum=3.743;SC=AAAAAGAAAAGAAAAATTCTG;SOR=0.804;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=22;WE=95099857;WS=95099834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,22:0.71:31
chr10	95111716	rs787624	C	A	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=295;ReadPosRankSum=-0.478;SC=GGGCTCTGACCACCTGCCTGG;SOR=0.941;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=16;WE=95111724;WS=95111706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr10	95113491	rs787625	A	G	171.18	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5210;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=95;ReadPosRankSum=-1.150;SC=AAATGACAAAAAGCATTCACT;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=6;WE=95113499;WS=95113481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr10	95115339	rs5787054	A	AAAAAT	1348.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=4;PP=375;ReadPosRankSum=-0.993;SC=TCAGTCTTGAAAAAATAAAAT;SOR=0.623;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=29;TCF=13;TCR=16;TR=9;WE=95115347;WS=95115329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,30:0.70:43
chr10	95119919	rs787634	T	C	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.044;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=78;ReadPosRankSum=0.088;SC=TCATTCCCATTCAGCTCCTCA;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=5;WE=95119927;WS=95119909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr10	95121135	rs151121728	CCA	C	415.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.117;NF=7;NR=2;PP=330;ReadPosRankSum=0.390;SC=CCCCTCCCTCCCAAGGAAACT;SOR=0.914;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=9;WE=95121144;WS=95121125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr10	95132905	rs787647	C	T	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=150;ReadPosRankSum=1.172;SC=GGAGAGGGACCGAAGACCCTG;SOR=1.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=9;WE=95132913;WS=95132895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr10	95136950	rs787622	A	T	917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=4;PP=602;SC=AGGACTTTTTACGAAGTTTGA;SOR=3.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=26;WE=95136958;WS=95136940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr10	95152624	rs788084	T	C	807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.389;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=8;PP=533;ReadPosRankSum=-0.722;SC=CTTAATAAGATAATATTAGCT;SOR=1.432;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=39;TCF=27;TCR=12;TR=29;WE=95152632;WS=95152614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,33:0.77:43
chr10	95159025	rs701862	T	G	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.304;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=100;ReadPosRankSum=-0.708;SC=CTGTGTTCCCTCAGAGTGCCT;SOR=1.609;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=8;WE=95159033;WS=95159015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr10	95162496	rs701875	A	T	271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=1;PP=167;SC=AATATTTTTTAAAAAATTCCT;SOR=2.494;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=95162504;WS=95162486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr10	95162525	rs3841653	TC	T	1144.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=9;PP=455;SC=AATTCTTTGATCCCCCCCAAA;SOR=1.493;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=22;TCF=11;TCR=11;TR=17;WE=95162533;WS=95162515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr10	95164040	rs788088	A	G	697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=18;PP=501;SC=GGAATCTGATACTATAATTTT;SOR=1.893;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=25;WE=95164048;WS=95164030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr10	95216590	rs17481945	C	T	899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.748;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=19;PP=393;ReadPosRankSum=1.288;SC=ATAGGACAATCAGAAATAGCT;SOR=1.169;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=59;TCF=28;TCR=31;TR=34;WE=95216598;WS=95216580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,41:0.59:70
chr10	95216623	rs701882	A	G	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.038;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=316;ReadPosRankSum=-0.673;SC=CAAAGTTGAAAAAACAATGAA;SOR=0.546;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=47;TCF=20;TCR=27;TR=20;WE=95216631;WS=95216613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,22:0.39:57
chr10	95237861	rs2096181	C	T	376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=2;PP=288;SC=GGTTGTTTATCTTATGTCTAC;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=95237869;WS=95237851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	95237899	rs58873758	ATAT	A	1717.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.04;SOR=1.236;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr10	95237963	rs3938769	A	G	2868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=57;NR=32;PP=1501;SC=ACTGTTTGGAAGAATCATCAA;SOR=1.064;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=57;TCR=32;TR=89;WE=95237971;WS=95237953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr10	95238050	rs6583893	C	T	1780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=29;PP=976;SC=CCTGGCTGTCCGCATGGAACT;SOR=0.849;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=28;TCR=29;TR=57;WE=95238058;WS=95238040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr10	95241999	rs947597	A	C	1986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=49;PP=1256;SC=AGTGGAGACTAGGGCGCTGGA;SOR=1.771;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=23;TCR=49;TR=72;WE=95242007;WS=95241989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr10	95262981	rs7080916	A	G	4619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=66;PP=2701;SC=TAGTACTACCACATTGCTTGA;SOR=0.776;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=155;TCF=89;TCR=66;TR=155;WE=95262989;WS=95262971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr10	95266683	rs947599	A	G	4848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=88;NR=69;PP=2723;SC=ATTATGGTGAATGTAATGAGG;SOR=0.750;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=157;TCF=88;TCR=69;TR=157;WE=95266691;WS=95266673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr10	95276673	rs4919224	G	A	697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=8;PP=388;SC=GAGTTGTGCCGTAATGTTGTT;SOR=1.220;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=15;TCR=8;TR=23;WE=95276681;WS=95276663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr10	95278829	rs2280605	A	G	699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=14;PP=368;SC=AAAGACTTCAATAAAAGTCTT;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=95278849;WS=95278819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	95278841	rs2280606	C	T	634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=11;PP=289;SC=AAAAGTCTTTCTTCTTCAATA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=95278849;WS=95278819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	95279506	rs2293277	A	T	4604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=76;PP=2537;SC=CATCAATTGCATGTAATTCTT;SOR=1.085;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=140;TCF=64;TCR=76;TR=140;WE=95279514;WS=95279496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr10	95279653	rs7068719	A	G	141.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=6;PP=142;SC=ACAGCTTAACACACAGCTAGC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=95279661;WS=95279643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr10	95287643	rs34668129	G	GA	563.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.779;HP=18;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=416;ReadPosRankSum=0.060;SC=CTCAAAAAAAGAAAAAAAAAA;SOR=2.143;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=41;TCF=26;TCR=15;TR=25;WE=95287651;WS=95287633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,29:0.81:36
chr10	95347041	rs116454156	G	A	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=354;ReadPosRankSum=0.233;SC=CACCAGATCCGCGTGTCCCAG;SOR=0.797;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=81;TCF=57;TCR=24;TR=27;WE=95347049;WS=95347031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,30:0.33:91
chr10	95380790	rs1223306	G	A	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=110;ReadPosRankSum=0.296;SC=TGACAAAGCCGCCCAGAGACA;SOR=0.495;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=12;WE=95380798;WS=95380780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr10	95381773	rs701865	T	A	3092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=52;PP=1766;ReadPosRankSum=0.276;SC=CACGGTTAGATCATATCTGAA;SOR=0.729;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=198;TCF=110;TCR=88;TR=120;WE=95381781;WS=95381763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,139:0.60:230
chr10	95388891	rs57732332	G	A	789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.281;HP=4;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=5;PP=520;ReadPosRankSum=0.736;SC=CCATTTGCCCGCAAGCAGTCA;SOR=1.532;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=56;TCF=44;TCR=12;TR=30;WE=95388899;WS=95388881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,33:0.53:62
chr10	95388914	rs2857300	A	G	1277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.665;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=15;PP=800;ReadPosRankSum=-0.620;SC=AGCCGTGTAGAAAATCCTCAC;SOR=0.941;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=97;TCF=66;TCR=31;TR=52;WE=95388922;WS=95388904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,57:0.54:106
chr10	95389041	rs714550	G	A	2830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.883;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=57;PP=1689;ReadPosRankSum=0.940;SC=ATGCCCCTGCGGATGAATACT;SOR=0.559;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=169;TCF=80;TCR=89;TR=111;WE=95389049;WS=95389031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,126:0.66:191
chr10	95389083	rs714549	A	G	1968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.539;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=43;PP=1139;ReadPosRankSum=0.433;SC=TCTGGGTCAGACCTCACCTCT;SOR=0.406;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=111;TCF=46;TCR=65;TR=78;WE=95389091;WS=95389073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,88:0.68:130
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chr10	95394455	rs1856563	T	C	1230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=3;PP=928;SC=TCCTGTGAATTTATGATTATT;SOR=3.611;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=37;WE=95394463;WS=95394445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
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chr10	95459817	rs726817	C	T	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=8.645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.69;ReadPosRankSum=-1.541;SOR=1.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,39:0.25:157
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chr10	95658258	rs11187724	C	G	1334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=11;PP=861;ReadPosRankSum=0.593;SC=CCATTTTTCTCAGTTTCTAAG;SOR=0.836;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=51;TCR=17;TR=45;WE=95658266;WS=95658248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,52:0.67:78
chr10	95718474	rs829225	A	G	2171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=51;NR=27;PP=1497;SC=TATTTAGGCTATAATGATTAC;SOR=1.580;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=79;TCF=52;TCR=27;TR=78;WE=95718482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr10	95931087	rs17417407	G	T	2360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=36;PP=1548;ReadPosRankSum=1.277;SC=ACTATTTACCGCAGGGTCTTG;SOR=0.745;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=143;TCF=85;TCR=58;TR=90;WE=95931095;WS=95931077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,101:0.60:168
chr10	95987313	rs11187825	C	T	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=163;ReadPosRankSum=-0.605;SC=AGCCAGGTAACTGGAAATGAT;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=8;WE=95987321;WS=95987303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr10	96044734	rs3736901	C	A	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=216;ReadPosRankSum=0.535;SC=TAAGATTAGGCAATATCATCT;SOR=0.446;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=15;WE=96044742;WS=96044724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr10	96076542	rs182337388	G	A	552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.581;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=16;PP=353;ReadPosRankSum=1.572;SC=AGCCTACACAGTAACGACTCA;SOR=0.533;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=113;TCF=54;TCR=59;TR=33;WE=96076550;WS=96076532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,36:0.28:127
chr10	96100094	rs140939496	C	A	873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.31;ReadPosRankSum=0.852;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,44:0.62:71
chr10	96104665	rs3758526	T	G	2546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=53;PP=1348;ReadPosRankSum=0.509;SC=AAGCTCTCGCTCTAGTTTCTC;SOR=0.700;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=147;TCF=67;TCR=80;TR=99;WE=96104673;WS=96104655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,117:0.68:172
chr10	96114835	rs12572897	G	A	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=20;PP=471;ReadPosRankSum=-1.867;SC=CTCTTGAATAGGATCTTCAAT;SOR=0.990;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=35;TCF=11;TCR=24;TR=29;WE=96114843;WS=96114825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,36:0.86:42
chr10	96271298	rs2860761	A	C	998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=6;PP=664;SC=AACTTAGAGAAAATTATTTGT;SOR=2.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=32;WE=96271306;WS=96271288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr10	96343623	rs962234	T	C	239.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=199;SC=TCCCATTGTCTTGTTCTACTA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=96343631;WS=96343613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	96348254	rs11188036	G	A	163.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=156;SC=AGGCTGTGGTGCAGTGGCACA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=96348262;WS=96348244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	96454797	rs137908489	A	G	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=198;ReadPosRankSum=1.040;SC=GAAAAATTCAATGAAAACCTC;SOR=0.631;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=39;TCF=16;TCR=23;TR=15;WE=96454805;WS=96454787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,16:0.38:42
chr10	96466824	rs7904929	C	T	143.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=84;SC=TATGTACTTACCATGTGTATA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=96466832;WS=96466814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr10	96495232	rs2860840	C	T	2366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=50;PP=1527;SC=TGCTCCTGTGCTGTCACCTGC;SOR=1.582;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=25;TCR=50;TR=75;WE=96495240;WS=96495222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr10	96522463	rs28399504	A	G	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.697;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=264;ReadPosRankSum=-0.979;SC=GAAGGCTTCAATGGATCCTTT;SOR=0.399;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=16;WE=96522471;WS=96522453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr10	96701601	rs9332119	G	C	8151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.232;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=146;NR=118;PP=2965;ReadPosRankSum=1.525;SC=TGTTATCTCTGTCTACTTTCC;SOR=0.396;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=265;TCF=146;TCR=119;TR=264;WE=96701609;WS=96701591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,300:1.00:301
chr10	96702047	rs1799853	C	T	3456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=67;NR=46;PP=1919;SC=CATTGAGGACCGTGTTCAAGA;SOR=0.929;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=67;TCR=46;TR=113;WE=96702055;WS=96702037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr10	96731788	rs9332172	A	G	2343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=15;PP=1676;SC=AACTATGTGAATAATTTTGAA;SOR=2.630;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=69;TCF=54;TCR=15;TR=69;WE=96731796;WS=96731778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr10	96748893	rs9332242	C	G	229.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=7;PP=176;SC=CCTGTCATCTCACATTTTCCC;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=96748901;WS=96748883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	96798749	rs10509681	T	C	5029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=94;NR=77;PP=2794;SC=AGGAAATTCTTTGTCATCATG;SOR=0.724;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=171;TCF=94;TCR=77;TR=171;WE=96798757;WS=96798739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr10	96802598	rs2275620	A	T	2095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=20;PP=1444;SC=AACCAGCACTATGGAAATTTC;SOR=1.771;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=69;TCF=49;TCR=20;TR=69;WE=96802606;WS=96802588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr10	96827030	rs11572080	C	T	2759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=50;NR=45;PP=1726;SC=CTCAATGCTCCTCTTCCCCAT;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=50;TCR=45;TR=95;WE=96827038;WS=96827020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr10	96827178	rs2275622	T	C	3985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=59;PP=1984;SC=CTGCAACACTTGGCAGCCATG;SOR=0.747;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=74;TCR=59;TR=133;WE=96827186;WS=96827168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr10	96954298	rs591157	A	G	2728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=24;PP=1733;SC=CTGGGATTTGAAGCCTGCTGC;SOR=1.561;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=62;TCR=24;TR=86;WE=96954306;WS=96954288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr10	96954473	rs592041	A	T	3541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.16;SOR=1.666;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr10	96954479	rs592055	G	A	3294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.76;SOR=1.997;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr10	96954511	rs681838	T	A	1188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=28;PP=823;SC=ATGAGATTCATATCCCATCTA;SOR=2.419;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=9;TCR=28;TR=37;WE=96954519;WS=96954501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr10	96961184	rs602941	G	A	663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=7;PP=469;SC=CTGTTTCTGAGTTATTTCCCA;SOR=1.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=24;WE=96961192;WS=96961174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr10	96966954	rs58102963	GT	G	5022.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.12;NF=22;NR=64;PP=2387;SC=TTCTTTTGTGGTTTTTTTCAG;SOR=0.836;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=97;TCF=26;TCR=71;TR=86;WE=96966962;WS=96966944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr10	96970361	rs16872	A	C	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=1.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.97;ReadPosRankSum=-0.579;SOR=0.636;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:123,45:0.27:168
chr10	96972889	rs17524438	G	A	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.825;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=123;ReadPosRankSum=2.611;SC=TCCATATCTTGACCCAGAACA;SOR=2.387;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=8;WE=96972897;WS=96972879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr10	96974518	rs595478	A	T	390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=307;SC=TATTGGAATAACTGCATCATT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=96974526;WS=96974508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	96974552	rs595420	C	T	788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=5;PP=586;SC=TTCTAACAGACCTGTTATTGG;SOR=2.387;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=25;WE=96974560;WS=96974542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr10	96974803	rs594448	A	G	3329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=68;PP=2099;SC=CACACTGTCAAAGCACTAAGC;SOR=1.188;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=42;TCR=68;TR=110;WE=96974811;WS=96974793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr10	96979504	rs11188228	T	C	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=32;ReadPosRankSum=-0.920;SC=CACTCCTGCTTGATTTTTTTT;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=4;WE=96979512;WS=96979494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,4:0.22:18
chr10	96979775	rs11188229	C	G	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=201;ReadPosRankSum=1.967;SC=TAAGTGAGCTCTTACAGTTGT;SOR=0.846;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=41;TCF=7;TCR=34;TR=14;WE=96979783;WS=96979765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,16:0.35:46
chr10	96985198	rs489807	G	A	798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=18;PP=459;SC=GCTACTAATCGTAGTGCCATT;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=96985206;WS=96985188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr10	96988377	rs17452714	T	C	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=270;ReadPosRankSum=-0.616;SC=TAAATGTAGGTTTCTGGATTC;SOR=1.714;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=14;WE=96988385;WS=96988367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,17:0.77:22
chr10	96997589	rs1049961	A	G	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=416;ReadPosRankSum=-1.617;SC=AACCAAAGTAAGCAGAGAACT;SOR=0.941;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=39;TCF=31;TCR=8;TR=23;WE=96997597;WS=96997579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,25:0.60:42
chr10	96998458	rs2901832	C	T	2188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FS=4.426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.30;ReadPosRankSum=-0.156;SOR=0.448;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,107:0.60:178
chr10	96998519	rs2860998	T	C	1914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.403;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=40;PP=1076;ReadPosRankSum=0.780;SC=CAGAACCACTTATAAATATAT;SOR=0.848;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=121;TCF=55;TCR=66;TR=73;WE=96998527;WS=96998509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,86:0.62:138
chr10	96998591	rs2901833	G	A	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.641;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=224;ReadPosRankSum=-1.156;SC=AAGTAACTTAGCCTCTCTGGT;SOR=0.216;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=38;TCF=8;TCR=30;TR=17;WE=96998599;WS=96998581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
chr10	96998625	rs12778613	T	C	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.77;ReadPosRankSum=0.358;SOR=0.033;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr10	96998648	rs2860999	G	A	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=24;ReadPosRankSum=0.022;SC=CCTGGCCAAAGAAAAGCCCAA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=3;WE=96998656;WS=96998638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr10	97006855	rs17525659	T	G	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=203;ReadPosRankSum=2.778;SC=TTCAGCATTTTAAAAGCCCAT;SOR=1.473;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=12;WE=97006863;WS=97006845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr10	97023552	rs4917682	G	A	810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=8;PP=954;SC=ACCTGCCTGGGCAGCCCTGGT;SOR=1.942;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=31;WE=97023560;WS=97023531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr10	97023630	rs2296961	T	C	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.55;ReadPosRankSum=-0.300;SOR=0.766;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,19:0.19:98
chr10	97023895	rs2296962	C	T	401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=4;NR=9;PP=220;SC=GCAGGCTGAGCGCCAGGGAGA;SOR=1.911;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=13;WE=97023903;WS=97023885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
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chr10	97106165	rs726176	T	C	533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=8;PP=236;ReadPosRankSum=2.552;SC=GCACTTACTTTAGTGTCTGAG;SOR=0.696;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=39;TCR=24;TR=20;WE=97106173;WS=97106155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,28:0.35:79
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chr10	97156908	rs17110707	T	C	939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.70;ReadPosRankSum=-1.749;SOR=0.738;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:143,57:0.28:200
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chr10	97174164	rs3818539	A	G	680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.239;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=9;PP=488;ReadPosRankSum=0.070;SC=CTGTCCTCAGAGCTCAGTGCT;SOR=1.302;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=101;TCF=65;TCR=36;TR=34;WE=97174172;WS=97174154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,37:0.33:111
chr10	97181855	rs17849163	T	C	1228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.902;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=21;PP=781;ReadPosRankSum=1.074;SC=GGAAAAAATCTCTCACTCACA;SOR=0.748;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=79;TCF=46;TCR=33;TR=52;WE=97181863;WS=97181845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,57:0.63:90
chr10	97192324	rs943542	A	G	5842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=106;NR=87;PP=2965;SC=GATTTTTGTAAGATCCATGTC;SOR=0.778;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=194;TCF=107;TCR=87;TR=193;WE=97192332;WS=97192314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr10	97192452	rs732101	A	C	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=278;ReadPosRankSum=-0.734;SC=CAGCCATGCGAAGTCTTTGAA;SOR=0.582;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=47;TCF=11;TCR=36;TR=17;WE=97192460;WS=97192442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,18:0.35:51
chr10	97366746	rs7099284	C	T	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=33;ReadPosRankSum=-0.120;SC=CCAGCCTCTGCTTCCTGTCCA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=3;WE=97366754;WS=97366736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr10	97369939	rs10882640	C	T	2043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.564;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=32;PP=999;ReadPosRankSum=-1.167;SC=TCTTCCCAACCAGAGTCTTTC;SOR=0.642;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=152;TCF=90;TCR=62;TR=83;WE=97369947;WS=97369929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,97:0.56:172
chr10	97371317	rs11188399	A	G	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=158;ReadPosRankSum=0.000;SC=CTGTAGCCTCAACAACTGAAC;SOR=0.582;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=12;WE=97371325;WS=97371307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr10	97373966	rs2296692	A	C	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=305;ReadPosRankSum=-0.248;SC=TGACCACACAAAATATAAAAA;SOR=0.368;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=14;WE=97373974;WS=97373956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,17:0.71:24
chr10	97385014	rs57670810	T	C	1646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.620;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=18;PP=1042;ReadPosRankSum=0.024;SC=ATTTCTTTTATAAAAATCCTT;SOR=0.331;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=83;TCF=60;TCR=23;TR=60;WE=97385022;WS=97385004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,69:0.74:93
chr10	97385242	rs10509688	A	G	750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.917;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=19;PP=437;ReadPosRankSum=1.125;SC=TTAAAAAAACAGAGATGTTAA;SOR=0.496;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=73;TCF=25;TCR=48;TR=31;WE=97385250;WS=97385232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,36:0.42:85
chr10	97388162	rs2275272	G	A	4226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.932;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=82;PP=2459;ReadPosRankSum=-0.727;SC=TCTAGACTTGGTTCCAAATGT;SOR=0.758;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=267;TCF=142;TCR=125;TR=177;WE=97388170;WS=97388152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,192:0.66:293
chr10	97392969	rs3750701	G	A	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.197;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=299;ReadPosRankSum=1.067;SC=TCTGTCTGCAGAACACACTGT;SOR=0.459;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=58;TCF=14;TCR=44;TR=22;WE=97392977;WS=97392959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,24:0.38:63
chr10	97392993	rs3750700	T	C	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=263;ReadPosRankSum=0.608;SC=CTGGCAATCCTTTTTCCAAAC;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=15;WE=97393001;WS=97392983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,16:0.42:38
chr10	97393475	rs11188409	C	T	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.18;ReadPosRankSum=0.348;SOR=0.653;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,6:0.16:37
chr10	97397227	rs2275273	T	C	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.811;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=15;PP=295;ReadPosRankSum=-0.476;SC=GACTGTAAGTTACCGTACTGT;SOR=0.837;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=94;TCF=45;TCR=49;TR=25;WE=97397235;WS=97397217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,30:0.27:110
chr10	97412921	rs9787589	T	G	634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=2;PP=420;SC=CTCCAGCCTGTGTGACAAAAT;SOR=2.636;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=97412929;WS=97412911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr10	97440097	.	TCA	T	354	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=11;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=354;QD=132.333333333;SC=TTATGTCAGCTCACTTTAAAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=3;WE=97440116;WS=97440094;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr10	97440098	.	CACT	C	163.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=-0.000;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=20.47;ReadPosRankSum=-1.345;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr10	97440103	.	T	TGG	163.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=-0.000;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=20.47;ReadPosRankSum=-2.369;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr10	97440106	.	A	G	169.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.157;ClippingRankSum=-0.000;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=21.22;ReadPosRankSum=-2.369;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr10	97440107	.	CA	C	160.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=17.86;ReadPosRankSum=-2.369;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr10	97440159	rs11595248	G	A	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=245;ReadPosRankSum=-1.304;SC=AAATTATTTGGTTAACAAATG;SOR=1.022;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=17;WE=97440167;WS=97440149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
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chr10	97440493	rs143448527	GA	G	53.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.368;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=2;PP=30;ReadPosRankSum=-1.006;SC=CTTAGTGGAAGAACACAAAAG;SOR=0.086;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=2;WE=97440501;WS=97440483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr10	97446206	rs2297788	G	A	660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.480;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=14;PP=516;ReadPosRankSum=1.210;SC=AGATGCAGAGGAGCCAAATAT;SOR=1.073;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=134;TCF=79;TCR=55;TR=38;WE=97446214;WS=97446196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,39:0.27:145
chr10	97447373	rs10786229	A	T	1142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.189;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=24;PP=524;ReadPosRankSum=-0.132;SC=GTGGTGATTGAGTTTGGAATG;SOR=0.598;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=153;TCF=80;TCR=73;TR=52;WE=97447381;WS=97447363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,66:0.36:184
chr10	97471925	rs12244559	T	C	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.42;ReadPosRankSum=-0.497;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
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chr10	97964154	rs10748665	C	T	422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=2;PP=322;SC=CCTTTTAACACGTAACTGCAA;SOR=3.126;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=97964162;WS=97964144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	97975167	rs3835127	GTA	G	36.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=6.608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.41;ReadPosRankSum=-0.225;SOR=0.067;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,4:0.15:26
chr10	97975184	rs116962796	T	C	858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.81;SOR=2.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr10	97983526	rs10882746	C	T	365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=6;PP=229;SC=CTGTCCTGGTCGCTTGCCCCA;SOR=0.976;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=8;TCR=6;TR=14;WE=97983534;WS=97983516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	97987144	rs2305846	C	G	762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=7;PP=469;SC=GGCCGAGTGCCCAGGTCTGCG;SOR=1.942;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=26;WE=97987152;WS=97987134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr10	97990583	rs727852	A	G	687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=18;PP=410;ReadPosRankSum=0.189;SC=CTTCGTCAGCAGGGCTCTCTG;SOR=0.737;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=50;TCR=48;TR=36;WE=97990591;WS=97990573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,40:0.35:114
chr10	98006857	rs2168732	A	T	1167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=24;PP=693;SC=CTGACTTTTTAAAAAAAGTCT;SOR=1.132;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=20;TCR=24;TR=44;WE=98006865;WS=98006847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr10	98007727	rs10882762	A	G	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.799;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=70;ReadPosRankSum=0.012;SC=CAGTAAATCTATGCTTTCATT;SOR=0.141;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=6;WE=98007735;WS=98007717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr10	98007933	rs9663433	G	A	1784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.51;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr10	98007943	rs9664029	T	A	1569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.17;SOR=2.049;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr10	98078127	rs7081385	C	T	1611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=9;PP=1053;SC=TCACCCACATCGTAGCAGAGA;SOR=2.670;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=39;TCR=9;TR=48;WE=98078135;WS=98078117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr10	98078239	rs6584066	A	G	6837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=125;NR=94;PP=2965;SC=CGAATGCATAAGAGCAGGGAA;SOR=0.885;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=219;TCF=125;TCR=94;TR=219;WE=98078247;WS=98078229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr10	98080595	rs139029808	G	A	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.314;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=185;ReadPosRankSum=-0.924;SC=AGGTGGGAACGGGGGAGAGAG;SOR=1.802;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=12;WE=98080603;WS=98080585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr10	98082517	rs7097016	T	G	1073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=20;PP=570;SC=TATTGAAAATTGTTTTTCAGT;SOR=1.292;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=14;TCR=20;TR=34;WE=98082525;WS=98082507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr10	98084231	rs2181320	A	G	1096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=29;PP=815;SC=TGCAACTCCAATCTGGGAGAG;SOR=2.133;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=10;TCR=29;TR=39;WE=98084239;WS=98084221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr10	98088387	rs10882773	A	C	136.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=107;SC=CTATGTTGCAAATCTTAAGCA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=98088395;WS=98088377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr10	98095794	rs10736102	T	C	3958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=79;PP=2542;SC=CCCCCGAGCTTTTTTCATGGA;SOR=1.235;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=54;TCR=79;TR=133;WE=98095802;WS=98095784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr10	98116076	rs2861575	C	T	409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=1;PP=341;SC=ACAATGCATTCATTAAGTTTT;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=98116084;WS=98116066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	98144312	rs7085022	G	A	662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=2;PP=413;SC=CCTCACTCGCGCTGCATCAGC;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=98144320;WS=98144302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	98180613	rs3789951	A	G	359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=270;SC=GCCGTGCTAGAAGCATGCAGA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=98180621;WS=98180603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr10	98180644	rs3789952	C	T	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=110;ReadPosRankSum=-1.543;SC=CCGCAGACCTCCAGGAATCCA;SOR=1.179;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=8;WE=98180652;WS=98180634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr10	98180958	rs3789954	T	C	712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=21;PP=606;SC=CTTGTAGTGGTTCTTGTTGTT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=98180966;WS=98180948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr10	98282160	rs17391197	A	G	285.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5033;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=217;ReadPosRankSum=-0.102;SC=AACACTAAATACTCTATGCTC;SOR=1.473;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=11;WE=98282168;WS=98282150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,11:0.85:13
chr10	98287094	rs10786298	T	A	1952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=39;NR=28;PP=1287;SC=TACTTTCAACTTAAGGCCTTA;SOR=0.869;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=67;TCF=39;TCR=28;TR=67;WE=98287102;WS=98287084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
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chr10	98287792	rs12779720	G	T	850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FS=2.667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.64;ReadPosRankSum=0.745;SOR=0.901;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:177,57:0.24:234
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chr10	98321928	rs7094142	A	T	604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=5;NR=15;PP=332;SC=TACAAGGTAAAACCACTTAAT;SOR=1.931;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=20;WE=98321936;WS=98321918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr10	98336341	rs61858555	C	A	302.89	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.9997;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=218;ReadPosRankSum=0.602;SC=AATATGAAACCCTTGTCTACA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=10;WE=98336349;WS=98336331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr10	98346411	rs11188836	A	C	247.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=1;PP=203;SC=GCCGCCGGGCACTCCAGGCTG;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=98346419;WS=98346401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	98346636	.	TC	T	142	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;FR=0.5000;HP=5;HapScore=4;MGOF=4;MMLQ=24;MQ=60.83;NF=0;NR=4;PP=142;QD=42.0;SC=CGACTCCTCCTCCCGCCGCCG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=4;WE=98346657;WS=98346626;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr10	98346649	rs1062176	T	G	56.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.054;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=131;ReadPosRankSum=0.330;SC=CGCCGCCGCCTCCTCCGCCGC;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=3;WE=98346657;WS=98346626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr10	98369536	rs3748236	A	G	755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.673;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=18;PP=486;ReadPosRankSum=-0.145;SC=GGGGAATGACACTTTTCCTGG;SOR=0.618;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=128;TCF=81;TCR=47;TR=44;WE=98369544;WS=98369526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,47:0.34:140
chr10	98380137	rs12784975	T	C	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.791;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=13;PP=347;ReadPosRankSum=1.469;SC=CTCCGATCGTTTCTTCTGGTT;SOR=1.044;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=99;TCF=56;TCR=43;TR=31;WE=98380145;WS=98380127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,31:0.28:109
chr10	98380363	rs7910630	A	G	159.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=5;PP=114;SC=ACTGGGGACCACTCACCAGAA;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=98380371;WS=98380353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	98383329	rs4917745	G	T	1194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=26;PP=752;SC=TACTGAAAAAGTATCAAAATC;SOR=1.954;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=12;TCR=26;TR=38;WE=98383337;WS=98383319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr10	98386433	rs1469847	C	A	580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=2;PP=421;SC=GCTCCAAAGACCCAGTTGGAC;SOR=2.948;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=98386441;WS=98386423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr10	98386558	rs4344416	G	A	4899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=72;PP=2952;SC=CTGCTGGCCAGGTCCACAGAA;SOR=0.929;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=164;TCF=92;TCR=72;TR=164;WE=98386574;WS=98386548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr10	98392872	rs6584092	A	C	260.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=221;SC=TTCCAGGGTCACCATGAGAGG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=98392880;WS=98392862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr10	98408714	rs912483	A	G	1280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=30;PP=882;SC=GGCAACAGAAAGCACTCAGCC;SOR=2.059;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=11;TCR=30;TR=41;WE=98408722;WS=98408704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr10	98410901	rs3748232	A	G	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=264;ReadPosRankSum=-1.529;SC=GAAGGGACCCAGAAGAGTTAC;SOR=0.844;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=20;WE=98410909;WS=98410891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,26:0.63:41
chr10	98742021	rs7098255	C	T	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=4.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.88;ReadPosRankSum=-1.723;SOR=0.917;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,35:0.27:129
chr10	98742605	rs3814163	C	T	1387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.529;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=30;PP=824;ReadPosRankSum=-1.630;SC=TTGACTCACTCGAAGAGAATT;SOR=0.624;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=189;TCF=97;TCR=92;TR=65;WE=98742613;WS=98742595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,74:0.35:211
chr10	98762051	rs3740528	T	G	889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.602;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=22;PP=560;ReadPosRankSum=1.398;SC=GGTTGCACAGTGCCCCCGAGT;SOR=0.752;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=154;TCF=84;TCR=70;TR=46;WE=98762059;WS=98762041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,54:0.31:177
chr10	98778477	rs3740527	C	T	791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.645;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=16;PP=455;ReadPosRankSum=-0.328;SC=CCCAGGGAGACCCAGGAGTTA;SOR=0.795;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=114;TCF=59;TCR=55;TR=41;WE=98778485;WS=98778467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,45:0.35:127
chr10	98778574	rs113945804	C	CTTCA	203.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.275;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=319;ReadPosRankSum=-0.366;SC=CATTCGTCCACTTCATTCATT;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=6;WE=98778582;WS=98778564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr10	98790674	rs41284248	G	C	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.25;ReadPosRankSum=0.438;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr10	98797351	rs2805586	A	G	3665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=45;PP=2080;SC=GAAAAGAAGCAGGATCTGCCC;SOR=1.105;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=74;TCR=45;TR=119;WE=98797359;WS=98797339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr10	98808866	rs2805588	C	G	6158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=110;PP=2965;SC=AAGGGTTCTGCGCCAGGTGCC;SOR=1.018;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=202;TCF=92;TCR=110;TR=202;WE=98808874;WS=98808856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr10	98816786	rs2817675	T	C	531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=2;PP=437;SC=CTCTACCTCCTTCTCTAGCCT;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=98816794;WS=98816776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	98817662	rs59428103	G	A	611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.711;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=15;PP=367;ReadPosRankSum=1.527;SC=GGGGAGGGGGGTTGTATGCCA;SOR=0.606;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=123;TCF=75;TCR=48;TR=37;WE=98817670;WS=98817652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,39:0.29:133
chr10	98819317	rs2817676	A	G	4326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=79;PP=2742;ReadPosRankSum=0.240;SC=GAGAGGGGGCATCTGAATCCC;SOR=0.705;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=159;TCF=80;TCR=79;TR=158;WE=98819325;WS=98819300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,167:0.99:169
chr10	98825940	rs1106375	G	A	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.941;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=16;PP=314;ReadPosRankSum=-0.854;SC=AGGTGGGCTGGAGGGCACTGA;SOR=0.873;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=79;TCF=30;TCR=49;TR=24;WE=98825948;WS=98825930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,24:0.28:87
chr10	98923361	rs2636772	T	C	546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=19;PP=430;SC=CACAGGCCTATGCCTGGCCTG;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=98923369;WS=98923351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	98979009	rs139750444	A	G	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=1.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.64;ReadPosRankSum=0.777;SOR=0.457;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr10	98979111	rs10714841	AT	A	207.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=6;PP=191;SC=TTATATGTGGATTTTTCGACT;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=6;WE=98979119;WS=98979101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	98988759	rs1468069	A	C	522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=1;PP=440;SC=CTGGTGAATGAACTCAAGGGC;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=98988767;WS=98988753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr10	98989454	rs2297987	A	G	2303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=16;PP=1473;SC=AGATGACAGTATATCAATTTT;SOR=2.242;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=51;TCR=16;TR=67;WE=98989462;WS=98989444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr10	99003613	rs793528	A	C	357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=0;PP=305;SC=GACAAGCCTGATTTCTCAGCT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=99003621;WS=99003603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr10	99019144	rs3740522	C	T	3992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=47;PP=2579;SC=CTTTACTCTTCCCGTCAACAC;SOR=1.286;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=84;TCR=47;TR=131;WE=99019152;WS=99019134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr10	99019177	rs2253301	A	G	4878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=64;PP=2860;SC=GCCACAGGACATGGGGTGCAA;SOR=1.117;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=164;TCF=100;TCR=64;TR=164;WE=99019185;WS=99019167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr10	99025611	rs10882884	T	A	1270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=7;PP=915;SC=CAAACACATCTCCTACCCTTT;SOR=3.109;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=41;WE=99025619;WS=99025601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr10	99079023	rs11189127	G	A	104.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=2;PP=54;SC=GAGCCGGCAGGATTCCGGCTC;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=5;WE=99079031;WS=99079017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr10	99117120	rs10882905	G	A	277.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=228;SC=GCTTCCACACGGCTCATGTCC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=99117128;WS=99117110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr10	99125949	rs2275580	C	T	3984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=73;PP=2295;SC=ACCTTGAAGCCGTGGTCCTTC;SOR=0.959;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=135;TCF=62;TCR=73;TR=135;WE=99125957;WS=99125939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr10	99130161	rs149757559	CCCCA	C	1800.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.202;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.087;NF=25;NR=19;PP=2011;ReadPosRankSum=0.507;SC=GGGTGCTTCCCCCCACCCAGT;SOR=1.220;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=81;TCF=37;TCR=44;TR=44;WE=99130172;WS=99130150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,70:0.64:110
chr10	99145090	rs78355705	T	C	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=1.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.84;ReadPosRankSum=0.059;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,12:0.16:75
chr10	99160965	rs2275091	A	G	6540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=101;NR=104;PP=2965;SC=AGACACCAGAAGGCAACTTTC;SOR=0.815;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=206;TCF=101;TCR=105;TR=205;WE=99160973;WS=99160955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr10	99205686	rs2297666	A	G	3390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.025;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=68;PP=2122;ReadPosRankSum=-1.315;SC=CCTATCCAGGACTCTGTACGG;SOR=0.780;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=214;TCF=106;TCR=108;TR=132;WE=99205694;WS=99205676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,150:0.63:239
chr10	99213463	rs186590512	C	T	1473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=33;PP=838;ReadPosRankSum=0.654;SC=TGCAGAACTTCGGGATGTAGA;SOR=0.720;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=155;TCF=77;TCR=78;TR=66;WE=99213471;WS=99213453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,73:0.43:171
chr10	99215953	rs3818909	G	C	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.816;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=155;ReadPosRankSum=0.320;SC=ATTTGAACCAGAAAGGCTTGA;SOR=0.307;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=12;WE=99215961;WS=99215943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,14:0.39:36
chr10	99219885	rs2152092	G	A	1613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.154;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=33;PP=991;ReadPosRankSum=1.356;SC=TCCGCACTTCGGCATGGCCAG;SOR=0.492;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=189;TCF=108;TCR=81;TR=72;WE=99219893;WS=99219875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,84:0.39:215
chr10	99220707	rs3740526	C	T	2376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.607;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=47;PP=1421;ReadPosRankSum=-0.305;SC=GGGCCCAGAGCCCAGGCCAGC;SOR=0.638;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=145;TCF=71;TCR=74;TR=93;WE=99220715;WS=99220697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,104:0.65:160
chr10	99225738	rs2236575	T	A	4097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=85;PP=2437;ReadPosRankSum=0.883;SC=AGACAAAGGTTTACTGTGTGA;SOR=0.702;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=235;TCF=114;TCR=121;TR=165;WE=99225746;WS=99225728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,182:0.70:260
chr10	99226370	rs29001315	A	C	1186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.584;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=28;PP=753;ReadPosRankSum=1.721;SC=CATGAATCTCATCTTTCTTCC;SOR=0.779;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=148;TCF=73;TCR=75;TR=54;WE=99226378;WS=99226360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,62:0.36:174
chr10	99229489	rs11592973	G	A	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=5.338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.87;ReadPosRankSum=0.625;SOR=0.271;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,22:0.30:73
chr10	99230330	rs11593116	G	A	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.195;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=144;ReadPosRankSum=1.150;SC=ATAGGTGTGTGCCACTGAATC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=8;WE=99230338;WS=99230320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr10	99240048	rs7897727	C	T	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=1.496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.19;ReadPosRankSum=-0.726;SOR=1.002;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,8:0.22:36
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chr10	99258223	rs3750558	T	G	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.496;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=27;PP=564;ReadPosRankSum=-0.011;SC=CGAGCCAATCTCCGGGGAAGC;SOR=0.892;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=120;TCF=49;TCR=71;TR=43;WE=99258231;WS=99258213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,46:0.35:130
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chr10	99358511	rs11817730	A	G	1213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.800;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=21;PP=593;ReadPosRankSum=2.050;SC=GGAAGGAGTTAGTCAGCTGTG;SOR=0.497;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=144;TCF=88;TCR=56;TR=51;WE=99358519;WS=99358501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,65:0.39:167
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chr10	99359739	rs2297644	T	C	1512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.288;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=20;PP=784;ReadPosRankSum=-0.338;SC=CTTTGAGCACTGGGCTTTCAT;SOR=0.926;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=199;TCF=128;TCR=71;TR=67;WE=99359747;WS=99359729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,78:0.35:221
chr10	99371147	rs1124116	A	G	576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.895;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=420;ReadPosRankSum=-0.488;SC=TAGAGTTGGCAGTTACTTTCC;SOR=0.379;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=25;WE=99371155;WS=99371137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,25:0.78:32
chr10	99371344	rs12261752	C	A	5788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=99;PP=2965;SC=CCTGCCGCGCCCCCTTGCAGG;SOR=0.888;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=191;TCF=92;TCR=99;TR=191;WE=99371352;WS=99371334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr10	99376843	rs4919121	A	C	1804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=8;PP=1346;SC=ACTACTTATTACTCATCTGTG;SOR=2.872;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=44;TCR=8;TR=52;WE=99376851;WS=99376833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr10	99439556	rs11556392	A	C	1459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.91;ReadPosRankSum=-1.002;SOR=0.727;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:161,86:0.35:247
chr10	99498234	rs3818876	G	A	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.416;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=362;ReadPosRankSum=-0.320;SC=ATGGTTACAGGATGCAGACAT;SOR=0.122;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=21;WE=99498242;WS=99498224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,21:0.70:30
chr10	99504630	rs10882993	G	T	788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.27;ReadPosRankSum=0.873;SOR=0.687;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,39:0.56:70
chr10	99504725	rs10882994	A	G	677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=14;PP=413;SC=AGCAGCCATGACACTAAGTGC;SOR=1.358;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=9;TCR=14;TR=23;WE=99504733;WS=99504715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr10	99504780	.	AC	GT	60	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9885;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=60;QD=56.7339374311;SC=CACAGCTGTTACTTCATTTAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=2;WE=99504789;WS=99504770;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,2:0.25:8
chr10	99507869	rs11189352	T	C	1692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-1.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.836;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=20;PP=995;ReadPosRankSum=-1.339;SC=TAGCCAGGCCTGTTTCTCCCA;SOR=0.575;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=91;TCF=63;TCR=28;TR=64;WE=99507877;WS=99507859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,74:0.69:107
chr10	99509457	rs946778	T	G	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.375;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=184;ReadPosRankSum=0.830;SC=CTTCCACAAGTGCAACACCAC;SOR=3.145;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=9;WE=99509465;WS=99509447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr10	99509969	rs3750615	T	C	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=349;ReadPosRankSum=-0.316;SC=GTTAGGAGGGTGACTCTTTCC;SOR=1.022;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=18;WE=99509977;WS=99509959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,19:0.68:28
chr10	99510068	rs3750614	G	T	2360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=39;PP=1317;ReadPosRankSum=0.213;SC=CTCCTACCTTGTTCTCCATTC;SOR=0.651;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=129;TCF=74;TCR=55;TR=92;WE=99510076;WS=99510058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,106:0.73:146
chr10	99510284	rs3829137	T	C	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.979;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=127;ReadPosRankSum=-0.615;SC=CCCCCTGTTATCAGCTTGTTT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=7;WE=99510292;WS=99510274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr10	99512472	rs1538723	T	C	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.917;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=268;ReadPosRankSum=-0.750;SC=CGTCTGTCAATGTCACCATTT;SOR=1.230;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=36;TCF=23;TCR=13;TR=19;WE=99512480;WS=99512462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr10	99514645	rs7922907	A	G	445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.582;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=294;ReadPosRankSum=-0.604;SC=TTACAGATGAATAACCTGAGG;SOR=1.091;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=18;WE=99514653;WS=99514635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr10	99516955	rs10882995	G	A	654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.885;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=6;PP=465;ReadPosRankSum=-1.242;SC=ATTTAGAAGCGCCAGGAGCAG;SOR=0.358;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=27;WE=99516963;WS=99516945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,27:0.77:35
chr10	99517355	rs3750612	A	G	2026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.633;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQ=59.97;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=34;PP=1099;ReadPosRankSum=-2.032;SC=AACTCCAGGTACCTGAGGGTG;SOR=0.617;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=76;TCR=53;TR=82;WE=99517363;WS=99517345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,95:0.64:148
chr10	99518810	rs1981238	C	T	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=238;ReadPosRankSum=-0.139;SC=GGCATCATCACCCCCAGGATC;SOR=0.283;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=13;WE=99518818;WS=99518802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
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chr10	99518901	rs12412543	G	C	1766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.490;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=19;PP=999;ReadPosRankSum=1.676;SC=TGGGGGGTCTGTGTGGGGCAT;SOR=0.904;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=119;TCF=83;TCR=36;TR=68;WE=99518909;WS=99518891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,78:0.60:131
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chr10	99531571	rs11815012	C	G	272.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.45;ReadPosRankSum=-1.429;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,12:0.86:14
chr10	99610018	rs148818830	C	T	513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.27;ReadPosRankSum=-0.331;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,24:0.67:36
chr10	99640255	rs10883009	G	A	1574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=40;PP=1119;SC=TGCCTTCCTCGCAGAGCCTCA;SOR=3.056;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=8;TCR=40;TR=48;WE=99640263;WS=99640245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr10	99682981	rs894375	T	C	1331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=8;PP=757;SC=CTGGCTCTCATGTGGCTTCTC;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=36;WE=99682989;WS=99682971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr10	99969568	rs11189513	A	G	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.31;ReadPosRankSum=0.024;SOR=0.667;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:141,54:0.28:195
chr10	99991408	rs1952061	A	G	2301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=48;PP=1549;SC=CAAGAATTTCATACTGAAGAC;SOR=1.139;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=32;TCR=48;TR=80;WE=99991416;WS=99991398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr10	100003785	rs1359508	T	C	1319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.217;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=21;PP=937;ReadPosRankSum=1.293;SC=GTAATTTGGATTAAGGGAAAG;SOR=0.374;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=90;TCF=60;TCR=30;TR=58;WE=100003793;WS=100003775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,59:0.62:95
chr10	100011077	rs11189523	T	A	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=188;ReadPosRankSum=-0.780;SC=ATGTTCCCATTTTACAGATAG;SOR=0.465;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=40;TCF=6;TCR=34;TR=13;WE=100011085;WS=100011067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,13:0.31:42
chr10	100011970	rs3750598	G	A	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.877;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=282;ReadPosRankSum=0.110;SC=GTAAGAAATTGCCTTGAATGC;SOR=2.066;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=31;TCF=21;TCR=10;TR=18;WE=100011978;WS=100011960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,22:0.63:35
chr10	100012011	rs10748722	C	T	1704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=20;PP=1068;SC=TCCAGGTGCCCTGGGCTGCTG;SOR=1.197;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=35;TCR=20;TR=55;WE=100012019;WS=100012001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr10	100013244	rs3750599	A	C	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=343;ReadPosRankSum=-0.410;SC=GGAAGGGCCAAACTGCTCCCT;SOR=0.795;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=24;WE=100013252;WS=100013234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,23:0.56:41
chr10	100017453	rs1983864	T	G	2398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=406;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=62;PP=1578;ReadPosRankSum=0.519;SC=GACAGCAGCATCATTCTCATG;SOR=0.715;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=356;TCF=183;TCR=173;TR=125;WE=100017461;WS=100017443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:271,135:0.33:406
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chr10	100022446	rs10736125	A	G	771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.73;SOR=1.536;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr10	100022917	rs112780536	A	ATG	467.14	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5313;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.57;MQRankSum=0.516;NF=0;NR=12;PP=507;ReadPosRankSum=-1.089;SC=CCCCCCTCAAATGTGTGTGTG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=12;WE=100022925;WS=100022907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,15:0.94:16
chr10	100143416	rs190095053	G	A	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=1.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.86;ReadPosRankSum=-0.504;SOR=0.453;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,21:0.28:74
chr10	100183774	rs10883093	A	G	214.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=7;PP=179;SC=GGACCACCCCACTCTTGTACC;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=100183782;WS=100183764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	100190264	rs2296431	T	C	4037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=74;NR=60;PP=2285;SC=CCCACCATCTTCAGGCAGGTT;SOR=0.719;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=134;TCF=74;TCR=60;TR=134;WE=100190272;WS=100190254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr10	100193557	rs11593787	T	C	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.241;NF=19;NR=0;PP=377;ReadPosRankSum=0.981;SC=TGTTTTACCATGGGAAAGCCC;SOR=0.430;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=19;WE=100193565;WS=100193547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,22:0.61:36
chr10	100193679	rs1886728	G	C	8130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.169;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=-0.040;NF=149;NR=127;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.624;SC=GGTCTTAAAGGTGGACGCCCC;SOR=0.350;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=278;TCF=149;TCR=129;TR=276;WE=100193687;WS=100193669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,306:1.00:307
chr10	100194909	rs11594443	T	C	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.019;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=132;ReadPosRankSum=-0.150;SC=TTCTCTGACCTAGGGACCCAG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=7;WE=100194917;WS=100194899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr10	100195583	rs2296430	T	A	2291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=32;NR=46;PP=1419;SC=CACCAAGAACTAAGGAAGGGA;SOR=1.233;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=32;TCR=46;TR=78;WE=100195591;WS=100195573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr10	100219262	rs35712968	G	T	836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=6;PP=499;SC=GAAAACAGAGGATACTACTGG;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=29;WE=100219270;WS=100219252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr10	100219314	rs10883099	G	A	2236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=47;NR=26;PP=1151;SC=ACTGGTAGCCGTGAGTGTGAG;SOR=1.112;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=47;TCR=26;TR=73;WE=100219322;WS=100219304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr10	100219374	rs10883100	T	A	3131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=46;PP=1830;SC=CTTGACCACATAAAAGCCCAT;SOR=0.744;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=56;TCR=46;TR=102;WE=100219382;WS=100219364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr10	100219519	rs11189618	G	A	2006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=33;NR=33;PP=1073;SC=AAAACAGTATGGGACTCATTA;SOR=0.955;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=33;TCR=33;TR=66;WE=100219527;WS=100219509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr10	100250019	rs59184373	GACACACACACAC	GAC,G	726.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.485;NF=3,3;NR=10,10;PP=668,45;ReadPosRankSum=1.351;SC=GAGTAAACATGACACACACAC;SOR=0.387;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=13,13;WE=100250038;WS=100250009;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:0.95:20
chr10	100991971	.	TACACAC	T,TAC	1518.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;ALERT;AN=2;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=7.347;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=36.16;SOR=3.052;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:1,17,24:0.40,0.57:42
chr10	100991976	.	A	G	568.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.687;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=6.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.23;ReadPosRankSum=-0.441;SOR=2.342;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,24:0.56:43
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chr10	101137063	rs3829211	G	A	827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=20;PP=577;SC=CCATTCCTAGGAGGGATGTGT;SOR=2.468;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=26;WE=101137071;WS=101137053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr10	101150256	rs3793931	A	G	238.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=7;PP=166;SC=GGGAGGAGCCATGGACTCCTC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=101150264;WS=101150246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	101163194	rs2275952	C	T	920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.401;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=14;PP=459;ReadPosRankSum=0.695;SC=GCACTCCCCACCCCCCGGCCC;SOR=0.881;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=124;TCF=74;TCR=50;TR=39;WE=101163202;WS=101163184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,49:0.34:144
chr10	101293035	rs41290504	C	A	5243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=95;PP=2965;SC=TGCTGGCCGCCGCTGAGGGGA;SOR=1.078;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=173;TCF=78;TCR=95;TR=171;WE=101293043;WS=101293025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr10	101372411	rs880568	T	C	1805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=38;PP=1238;SC=GACCAACTCATTGAGGTCCCC;SOR=1.503;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=22;TCR=38;TR=60;WE=101372419;WS=101372401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr10	101379795	rs12252561	G	C	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=184;ReadPosRankSum=-1.762;SC=CCGGGTGCAGGTCTCACCTTG;SOR=0.495;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=25;TCF=16;TCR=9;TR=14;WE=101379803;WS=101379785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr10	101420283	rs71933840	GCACACACA	G	694.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;QD=17.81;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,16:0.41:39
chr10	101420293	.	A	G	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.384;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=8.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.15;ReadPosRankSum=-0.610;SOR=0.474;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,9:0.20:45
chr10	101420316	rs7093631	C	G	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.57;ReadPosRankSum=-0.861;SOR=0.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr10	101420316	.	CAC	GAG	381	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=38;MMLQ=27;MQ=58.36;NF=0;NR=7;PP=381;QD=62.066839266;SC=CACACACACACACAGAGATAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=7;WE=101420326;WS=101420306;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
chr10	101420318	rs28529459	C	G	472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=1.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.88;ReadPosRankSum=-1.636;SOR=0.298;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr10	101439252	rs3740079	G	A	1274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=32;PP=875;SC=TTTGTTGTCAGTCTCTTTTAA;SOR=2.636;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=8;TCR=32;TR=40;WE=101439260;WS=101439242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr10	101445591	rs3740078	A	C	1015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=20;PP=531;ReadPosRankSum=2.295;SC=AAGATTTACCACTGGAGTTTG;SOR=0.671;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=137;TCF=78;TCR=59;TR=47;WE=101445599;WS=101445581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,57:0.35:162
chr10	101451194	rs72832512	A	C	1225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.197;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=21;PP=599;ReadPosRankSum=0.079;SC=GAAGGACAGTAGGGATACTGG;SOR=0.415;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=69;TCF=41;TCR=28;TR=49;WE=101451202;WS=101451184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,55:0.73:75
chr10	101451259	rs11190245	T	C	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.280;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=260;ReadPosRankSum=-0.352;SC=TCAACCTCTGTCCTTCCTGCA;SOR=0.382;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=61;TCF=23;TCR=38;TR=24;WE=101451267;WS=101451249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,24:0.38:64
chr10	101458254	.	G	GTGTT	1897.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.855;ClippingRankSum=0.000;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.822;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.938;NF=15;NR=13;PP=1306;ReadPosRankSum=0.931;SC=CAGGCATGACGTGTTTGTTTG;SOR=0.881;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=55;TCF=23;TCR=32;TR=28;WE=101458262;WS=101458244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,50:0.54:92
chr10	101462193	rs10748790	C	T	1024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=5;PP=740;SC=TGTGGGAATACGGAGTGGCTT;SOR=2.964;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=33;WE=101462201;WS=101462183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr10	101473218	rs2231687	A	G	2688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=51;PP=1623;SC=TTAAAAGTAAAGTTGAATAAG;SOR=1.190;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=36;TCR=51;TR=87;WE=101473226;WS=101473208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr10	101480549	rs56288771	T	TG	139.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.222;HP=4;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=76;ReadPosRankSum=0.589;SC=TGTTCAATATTTTTGTTCAAT;SOR=0.124;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=8;WE=101480558;WS=101480539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr10	101480550	rs3740077	T	G	148.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=0;PP=72;ReadPosRankSum=-0.170;SC=GTTCAATATTTTTGTTCAATT;SOR=0.188;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=2;WE=101480558;WS=101480539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr10	101480604	rs3832650	C	CAG	2029.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=10;PP=954;SC=GAACAGGAAACAGGGTGAAGA;SOR=1.455;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=22;TCF=11;TCR=11;TR=21;WE=101480612;WS=101480594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr10	101492241	rs2231675	G	A	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=244;ReadPosRankSum=-0.105;SC=CGTAGTCAGTGGTGATTTCTT;SOR=0.776;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=14;WE=101492249;WS=101492231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr10	101502968	rs3740076	A	G	3465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.585;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=60;PP=2092;ReadPosRankSum=-1.484;SC=TGATTCGGCCACGGGGAGGTG;SOR=0.772;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=185;TCF=107;TCR=78;TR=139;WE=101502976;WS=101502958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,157:0.74:211
chr10	101514219	rs17112219	G	A	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.608;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=145;ReadPosRankSum=-1.615;SC=GTAAGCAGTCGTTACTATTCC;SOR=0.256;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=55;TCF=44;TCR=11;TR=15;WE=101514227;WS=101514209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,19:0.30:64
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chr10	101571528	rs3740074	C	T	315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=9;PP=231;SC=AGCAAAGGTTCTCAGCCCCTT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=101571536;WS=101571518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	101576960	rs3740073	T	C	642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=0;PP=515;SC=CACAGTTATTTAAATTTAAGC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=101576968;WS=101576950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
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chr10	101591944	rs4148396	T	C	858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=21;PP=618;SC=ATCTTTCTGATAGGGAGGAAT;SOR=4.255;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=101591952;WS=101591934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr10	101606683	rs3740064	G	A	1052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=12;PP=539;ReadPosRankSum=0.184;SC=TTTCTGGCATGAGCCCCAACA;SOR=0.686;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=71;TCF=49;TCR=22;TR=41;WE=101606691;WS=101606673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,50:0.62:81
chr10	101637161	rs2256276	G	A	875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=7.824;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=25;PP=590;ReadPosRankSum=1.044;SC=TTCGTGCGGTGTTGGGGAGGG;SOR=2.484;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=38;TCF=8;TCR=30;TR=30;WE=101637169;WS=101637151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,34:0.83:41
chr10	101639796	rs2255901	G	A	3001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=60;PP=1799;ReadPosRankSum=-0.443;SC=GCTGGGAGGTGGAGTCTGGGT;SOR=0.709;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=178;TCF=90;TCR=88;TR=118;WE=101639804;WS=101639786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,135:0.67:202
chr10	101643675	rs144327645	G	GT	1140.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.164;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=748;ReadPosRankSum=-0.917;SC=GATACTTTTTGCTTTTTTTTC;SOR=0.120;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=19;WE=101643684;WS=101643665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,30:0.77:39
chr10	101643676	rs78615379	C	T	1149.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.164;HP=8;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=774;ReadPosRankSum=-0.884;SC=ATACTTTTTGCTTTTTTTTCC;SOR=0.120;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=39;TCF=31;TCR=8;TR=23;WE=101643684;WS=101643665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,30:0.77:39
chr10	101645498	rs2490763	T	C	942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=0.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=13;PP=495;ReadPosRankSum=-0.958;SC=TCCTCTCAAATGGCTTCTTGG;SOR=0.827;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=52;TCF=35;TCR=17;TR=37;WE=101645506;WS=101645488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,42:0.66:64
chr10	101654696	rs3758394	T	C	6090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=105;NR=109;PP=2965;SC=GTGATGTTGATGCTCACCCGG;SOR=0.789;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=214;TCF=105;TCR=109;TR=214;WE=101654704;WS=101654686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr10	101658585	rs3740057	T	C	1624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.702;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=39;PP=1025;ReadPosRankSum=-0.206;SC=GTTTCACATTTTTCTCAGAAC;SOR=0.892;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=95;TCF=36;TCR=59;TR=62;WE=101658593;WS=101658575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,69:0.66:105
chr10	101689378	rs7077718	G	C	684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=6;PP=515;ReadPosRankSum=-0.039;SC=GGGTTTTCTTGCTGTTTTGCA;SOR=0.632;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=28;WE=101689386;WS=101689368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,28:0.64:44
chr10	101690050	rs10786578	C	T	4806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-2.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=102;NR=95;PP=2859;ReadPosRankSum=-0.432;SC=AGTCAGTCAACTGTTCAGCTT;SOR=0.705;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=270;TCF=140;TCR=130;TR=197;WE=101690058;WS=101690040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,218:0.73:297
chr10	101690379	rs10883428	A	G	2206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.281;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=40;PP=1296;ReadPosRankSum=-1.292;SC=CTGGGATCCAAGTCATTTTCT;SOR=0.771;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=134;TCF=74;TCR=60;TR=84;WE=101690387;WS=101690369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,97:0.61:158
chr10	101690637	rs7085955	C	G	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=86;ReadPosRankSum=0.903;SC=TGTCTCCCAACCATTCCAGAC;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=5;WE=101690645;WS=101690627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr10	101715899	rs2862923	G	A	1843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.608;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=30;PP=1130;ReadPosRankSum=-0.606;SC=GAAGAAGGTCGGGGTACTGTT;SOR=0.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=102;TCF=56;TCR=46;TR=70;WE=101715907;WS=101715889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,78:0.68:115
chr10	101716112	rs35924554	G	C	2024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.667;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=34;PP=1130;ReadPosRankSum=-0.802;SC=CCTGATAAGAGTTTCTGTCTG;SOR=0.615;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=119;TCF=66;TCR=53;TR=78;WE=101716120;WS=101716102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,92:0.67:138
chr10	101802262	rs61733667	G	A	1359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=23;PP=885;ReadPosRankSum=0.768;SC=CTCTGACTCCGTGCCTTCTGC;SOR=0.779;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=77;TCF=49;TCR=28;TR=60;WE=101802270;WS=101802252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,61:0.73:83
chr10	101829514	rs61751507	C	T	1724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.475;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=24;PP=1003;ReadPosRankSum=-1.756;SC=GTGGTTGGGGCCTCCGTACTT;SOR=0.853;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=107;TCF=65;TCR=42;TR=66;WE=101829522;WS=101829504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,78:0.62:125
chr10	101841153	rs10883439	A	G	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.856;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=62;ReadPosRankSum=-0.819;SC=AGCTGTTCAGAACTTACAGGG;SOR=0.495;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=4;WE=101841161;WS=101841143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
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chr10	101912194	rs1408579	C	T	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.89;ReadPosRankSum=1.248;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
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chr10	101953705	rs11597086	A	C	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.021;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=249;ReadPosRankSum=0.581;SC=ATAGCAACTCAATGTCACATT;SOR=2.522;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=12;WE=101953713;WS=101953695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr10	101954347	rs17878999	C	T	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.259;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=159;ReadPosRankSum=1.465;SC=ACAAAAAATTCCTCAAAAATC;SOR=1.071;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=50;TCF=19;TCR=31;TR=13;WE=101954355;WS=101954337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,15:0.28:54
chr10	101964312	rs17880383	G	A	3154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=66;PP=1750;ReadPosRankSum=-1.884;SC=CAAGCTGAATGCTTTTGTGAA;SOR=0.678;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=203;TCF=95;TCR=108;TR=125;WE=101964320;WS=101964302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,146:0.62:234
chr10	101967212	rs7909855	C	G	776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=16;PP=465;SC=ATGTGTATTACCATATCTCTT;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=8;TCR=16;TR=24;WE=101967220;WS=101967202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr10	101977883	rs2230804	C	T	3027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=39;NR=66;PP=1965;SC=GGTTCTACTACTAAACTAGAA;SOR=1.428;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=39;TCR=66;TR=105;WE=101977891;WS=101977873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr10	101980459	rs986266	A	G	1057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=24;PP=714;SC=AATATACTTTAAAGTAACAGA;SOR=2.649;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=30;WE=101980467;WS=101980449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr10	101995285	rs12771909	T	A	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=93;ReadPosRankSum=1.625;SC=GTCATATATGTAAACATCTGC;SOR=0.602;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=9;WE=101995293;WS=101995275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr10	102003579	rs35616070	C	G	1085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.559;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=26;PP=602;ReadPosRankSum=2.095;SC=CCAAGCACTACAGCATATAAT;SOR=0.628;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=185;TCF=88;TCR=97;TR=52;WE=102003587;WS=102003569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,62:0.30:206
chr10	102006429	rs4919438	T	C	388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=255;SC=TTTCTAAACATCATCATGATT;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=102006437;WS=102006419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	102006625	rs7073610	G	A	1409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.526;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=36;PP=850;ReadPosRankSum=-0.210;SC=AGTGACATCCGGAGGCTGTTT;SOR=0.753;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=190;TCF=95;TCR=95;TR=68;WE=102006633;WS=102006615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,76:0.36:209
chr10	102009980	rs7072367	T	C	705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FS=5.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.33;ReadPosRankSum=-0.587;SOR=0.564;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:119,44:0.27:163
chr10	102016044	rs2270962	C	T	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.178;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=237;ReadPosRankSum=0.627;SC=GTTCCCCACACACTTGGGCCA;SOR=0.490;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=42;TCF=30;TCR=12;TR=19;WE=102016052;WS=102016034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,24:0.49:49
chr10	102016268	rs2270961	G	A	2183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=46;PP=1396;SC=ATTTTAGTCAGAATTGCAGAA;SOR=1.734;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=23;TCR=46;TR=69;WE=102016276;WS=102016258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr10	102027407	rs12784396	C	T	1771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=39;PP=1203;ReadPosRankSum=-0.460;SC=CGAATCCGCGCTCCCCGGAAA;SOR=0.752;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=115;TCF=58;TCR=57;TR=75;WE=102027422;WS=102027397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,80:0.63:127
chr10	102046380	rs33965491	T	G	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=2.753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.15;ReadPosRankSum=-0.199;SOR=1.034;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,31:0.26:119
chr10	102048208	rs12782963	G	T	596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=14;PP=316;ReadPosRankSum=-0.154;SC=CTCCTCTAAGGCTTCCTCTTC;SOR=0.732;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=102;TCF=61;TCR=41;TR=32;WE=102048216;WS=102048198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,36:0.31:115
chr10	102048269	rs2305386	G	A	886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.392;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=19;PP=456;ReadPosRankSum=-2.943;SC=ATGGGTGCTAGCAACAAATCT;SOR=0.554;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=120;TCF=62;TCR=58;TR=41;WE=102048277;WS=102048259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,50:0.35:141
chr10	102050242	rs6584356	C	A	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.817;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=15;PP=288;ReadPosRankSum=-0.353;SC=CACAATAGATCGGCCTAGTTT;SOR=0.552;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=89;TCF=38;TCR=51;TR=30;WE=102050250;WS=102050232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,35:0.36:98
chr10	102050344	rs6584357	A	T	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.816;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.40;ReadPosRankSum=-1.529;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr10	102050347	rs2242053	T	C	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.224;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.40;ReadPosRankSum=-2.000;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr10	102050971	rs5787377	A	AG	136.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.036;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=149;ReadPosRankSum=0.273;SC=GAGAGTTTTCAGGTGGGTTTG;SOR=1.516;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=6;WE=102050979;WS=102050961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,7:0.28:25
chr10	102051244	rs35423189	G	T	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=245;ReadPosRankSum=-1.695;SC=CTCAGTTATGGACTTCCTCAC;SOR=0.770;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=17;WE=102051252;WS=102051234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr10	102052884	rs35662118	C	T	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.65;ReadPosRankSum=-2.763;SOR=0.573;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,12:0.21:57
chr10	102056745	rs2278842	C	T	3530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=44;PP=1775;SC=ACCAAGATGACCACCAGGTCC;SOR=0.889;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=63;TCR=44;TR=107;WE=102056753;WS=102056735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr10	102059329	rs2242050	G	C	2144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=24;PP=1378;SC=GGGAGGGGTAGAAAAGATCTT;SOR=1.468;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=50;TCR=24;TR=74;WE=102059337;WS=102059319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
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chr10	102088906	rs3829159	C	T	2916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=33;PP=1590;SC=AATGTTTATACATATAGTGCA;SOR=1.222;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=56;TCR=33;TR=89;WE=102088914;WS=102088896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
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chr10	102112075	rs11190480	A	G	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=191;ReadPosRankSum=-0.955;SC=CCTTTCCCAGATGGAACTCAC;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=10;WE=102112083;WS=102112065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr10	102116208	rs111712956	ATCCCC	A	1698.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.707;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.556;NF=12;NR=18;PP=1227;ReadPosRankSum=0.943;SC=AAGACAGCCCATCCCCTCCCA;SOR=0.607;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=83;TCF=40;TCR=43;TR=30;WE=102116220;WS=102116198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,48:0.39:124
chr10	102116311	rs2234970	A	C	1154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.982;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.624;NF=24;NR=31;PP=731;ReadPosRankSum=0.699;SC=TGGCTTGCTGATGATGTGCTT;SOR=0.875;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=149;TCF=70;TCR=79;TR=55;WE=102116319;WS=102116301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,63:0.37:169
chr10	102257348	rs77000964	C	T	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.16;ReadPosRankSum=-1.139;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr10	102265056	rs140191147	AAC	A	56.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.169;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=95;ReadPosRankSum=0.088;SC=AGGCTTCACAAACACACACAC;SOR=1.688;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=25;TCF=11;TCR=14;TR=5;WE=102265065;WS=102265046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,7:0.18:39
chr10	102304595	rs144335682	T	A	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=8;PP=292;ReadPosRankSum=-0.804;SC=AATTTTGATTTGGAACTTTTA;SOR=0.892;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=26;TCF=16;TCR=10;TR=20;WE=102304603;WS=102304585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,23:0.77:30
chr10	102506070	rs4472867	G	C	5373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=103;PP=2842;SC=CGTGAGTACCGGCGCCCGGCT;SOR=0.993;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=185;TCF=82;TCR=103;TR=185;WE=102506078;WS=102506060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr10	102539429	rs7901210	C	G	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.741;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=312;ReadPosRankSum=0.000;SC=TGCCTGCCCGCTTGAGGTCCA;SOR=0.139;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=17;WE=102539437;WS=102539419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
chr10	102568983	rs1800898	A	C	3091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.111;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=64;PP=1480;ReadPosRankSum=-1.613;SC=AGACATACCCAGTTGTGACTG;SOR=0.800;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=186;TCF=91;TCR=95;TR=124;WE=102568991;WS=102568973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,141:0.66:215
chr10	102584597	rs11190717	G	A	4068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.391;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=75;PP=2486;ReadPosRankSum=-1.944;SC=AGGCTGGGGTGGGGGGAGACA;SOR=0.780;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=247;TCF=134;TCR=113;TR=167;WE=102584605;WS=102584587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,186:0.68:272
chr10	102673063	rs3802725	G	T	1307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=16;NR=29;PP=736;SC=GGTATGAGGGGAGGGCTGCAG;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=16;TCR=29;TR=45;WE=102673071;WS=102673053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr10	102684380	rs10883563	C	A	6322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=106;NR=100;PP=2965;SC=GGGAAAATTTCTGGGGGACCT;SOR=0.763;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=206;TCF=106;TCR=100;TR=206;WE=102684388;WS=102684370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr10	102689217	rs2273654	T	C	3413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=68;PP=2229;SC=TTTCATAATGTATTTTACCTT;SOR=1.713;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=33;TCR=68;TR=101;WE=102689226;WS=102689207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr10	102689504	rs10786614	G	A	228.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=157;SC=CTTAAAAAATGGTTTTCTTTG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=102689512;WS=102689494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	102707526	rs12780429	A	G	755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.457;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=10;PP=477;ReadPosRankSum=1.634;SC=GGCAACTGAGACAGTGCCTCA;SOR=1.155;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=50;TCF=33;TCR=17;TR=32;WE=102707534;WS=102707516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,34:0.63:54
chr10	102744331	rs11591349	A	T	2868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=38;PP=1664;SC=ACCAGACAAGACCTCTGCCAG;SOR=1.098;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=61;TCR=38;TR=99;WE=102744339;WS=102744321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr10	102746231	rs7184	C	T	1526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=13;PP=1143;SC=AAAACAAGGGCCCTGTAAAAC;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=41;TCR=13;TR=54;WE=102746239;WS=102746221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr10	102762256	rs752974	C	T	903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=5;PP=541;SC=GCTTACAGGTCGCCTGCGAGG;SOR=2.019;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=26;WE=102762264;WS=102762246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr10	102770082	rs807023	T	G	3615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=59;PP=2164;SC=GCCACTGGGGTTCTTCATGGC;SOR=0.753;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=65;TCR=59;TR=124;WE=102770090;WS=102770072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr10	102770293	rs200896335	T	TGCTGCG	1717.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=17;PP=1177;SC=TGACCCCGGCTGCTGCGGCTG;SOR=1.075;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=20;WE=102770301;WS=102770283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr10	102770327	rs807022	A	G	1064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=14;PP=691;SC=GGCTGCGGCTACGGCTCTGAG;SOR=0.798;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=18;TCR=14;TR=32;WE=102770335;WS=102770317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr10	102775221	.	ATG	A	42.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=126;ReadPosRankSum=1.465;SC=GAGCTGGCAGATGTGTGTGTG;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=3;WE=102775230;WS=102775217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr10	102775349	rs34125357	CT	C	1621.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=-5.655;NF=5;NR=25;PP=1307;ReadPosRankSum=-0.163;SC=GGCTGGGTGACTGAAGGACCG;SOR=0.754;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=30;WE=102775357;WS=102775339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,66:0.97:68
chr10	102777461	rs10786615	T	C	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.808;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=62;ReadPosRankSum=-0.967;SC=GAGGATCGCTTGAGCGTGGGA;SOR=1.179;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=6;WE=102777469;WS=102777451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr10	102777768	rs11190793	C	G	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.157;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=211;ReadPosRankSum=1.125;SC=GCTGGTAAGACGCGGTGTGGG;SOR=0.902;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=54;TCF=36;TCR=18;TR=17;WE=102777776;WS=102777758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,18:0.32:57
chr10	102780265	rs7075659	G	A	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=72;ReadPosRankSum=-0.369;SC=AAAATGCTGGGATTACAGGTG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=5;WE=102780273;WS=102780255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr10	102780312	rs7075685	G	T	1325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=13;PP=685;SC=TCTTCAGAGAGCCGGGCCCCA;SOR=1.225;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=28;TCR=13;TR=41;WE=102780320;WS=102780302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr10	102780354	rs77484072	TG	T	644.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.845;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.264;NF=6;NR=11;PP=515;ReadPosRankSum=0.742;SC=CCTCCAACCTTGGGAGATCTG;SOR=0.862;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=48;TCF=13;TCR=35;TR=17;WE=102780362;WS=102780344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,28:0.29:98
chr10	102783678	rs6584410	T	C	4799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=79;PP=2609;SC=CTGGGGGTTCTGCTTACCTGC;SOR=0.727;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=167;TCF=88;TCR=79;TR=167;WE=102783686;WS=102783668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr10	102792295	rs807014	G	A	3210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=58;NR=42;PP=1722;SC=CAGAGAAGGAGGCCTGCCTTG;SOR=0.761;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=101;TCF=58;TCR=43;TR=100;WE=102792303;WS=102792285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr10	102798346	rs807049	T	C	2892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=37;PP=1637;SC=TGAAATGGGGTGACAGTGAGG;SOR=1.127;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=62;TCR=37;TR=99;WE=102798354;WS=102798336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr10	102824349	rs807037	G	C	1220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=24;PP=735;SC=CGCTGCCTTGGCCGCAATGCC;SOR=1.559;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=15;TCR=24;TR=39;WE=102824357;WS=102824339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr10	102826914	rs807031	G	C	452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.83;SOR=2.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr10	102895312	rs1416361	G	A	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.13;ReadPosRankSum=0.726;SOR=0.280;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,5:0.17:30
chr10	102988345	rs941909	G	A	1063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.315;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=23;PP=693;ReadPosRankSum=-0.247;SC=AGAGCAGCGCGCGGCCCGCCA;SOR=0.567;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=145;TCF=86;TCR=59;TR=53;WE=102988353;WS=102988335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,56:0.35:160
chr10	102997667	.	C	CTTTTTA	1257.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.305;ClippingRankSum=0.000;DP=185;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.56;ReadPosRankSum=-0.840;SOR=0.669;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,37:0.25:147
chr10	103221870	rs5787432	CAGG	C	4625.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=45;PP=2666;SC=AAACAAAAGACAGGAGGAAAC;SOR=0.856;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=59;TCF=11;TCR=48;TR=56;WE=103221880;WS=103221860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr10	103281308	rs9419923	A	G	905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.298;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=8;PP=634;ReadPosRankSum=-0.705;SC=ATGTAGACATAATATAGCATG;SOR=0.273;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=47;TCF=37;TCR=10;TR=33;WE=103281316;WS=103281298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,36:0.69:52
chr10	103281722	rs9420854	C	G	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=79;ReadPosRankSum=-0.812;SC=TCTTTATTGGCTTGATTTTTA;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=5;WE=103281730;WS=103281712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr10	103291249	rs9420859	T	C	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.684;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=22;PP=531;ReadPosRankSum=-0.291;SC=AATCCCAGCATTTTTGGAGGC;SOR=1.148;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=39;TCF=6;TCR=33;TR=25;WE=103291257;WS=103291239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,24:0.59:41
chr10	103542959	rs935445	CC	GG	1618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=16;PP=1255;ReadPosRankSum=-0.096;SC=TTGAAACCCTCCGCATTCCCG;SOR=0.749;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=149;TCF=91;TCR=58;TR=42;WE=103542968;WS=103542949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,48:0.29:166
chr10	103550604	rs1124714	T	C	871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.29;ReadPosRankSum=1.424;SOR=0.781;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,37:0.65:57
chr10	103560186	rs2305194	A	C	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.522;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=114;ReadPosRankSum=-1.990;SC=AAAAGCACAAAAATAGTTTTG;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=103560194;WS=103560176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr10	103573222	rs11191118	C	T	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=4.244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.87;ReadPosRankSum=1.026;SOR=0.978;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,15:0.24:63
chr10	103587552	rs2305189	G	A	1917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.339;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=37;PP=1211;ReadPosRankSum=1.499;SC=GGGATGGCAAGAGAGAGGCAG;SOR=0.570;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=125;TCF=69;TCR=56;TR=76;WE=103587560;WS=103587542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,85:0.59:143
chr10	103588734	rs1562364	A	G	1154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.995;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=15;PP=667;ReadPosRankSum=0.663;SC=CCTTCCGCCCACACCTCAAGC;SOR=0.536;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=69;TCF=50;TCR=19;TR=49;WE=103588743;WS=103588724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,53:0.69:77
chr10	103599325	rs874885	A	T	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.902;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=2;PP=57;ReadPosRankSum=1.718;SC=CCTCCTGCTCAGTAAGGAGGC;SOR=0.039;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=5;WE=103599333;WS=103599315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr10	103609704	rs7918620	G	T	602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=280;ReadPosRankSum=-2.110;SC=CCACAACCCTGAGCCCCATTC;SOR=0.569;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=21;WE=103609712;WS=103609694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,27:0.73:37
chr10	103771457	.	GA	G	136.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.384;ClippingRankSum=0.000;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=13.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.67;ReadPosRankSum=1.504;SOR=1.000;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,18:0.22:82
chr10	103799758	rs11191190	C	T	2130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=40;PP=1242;ReadPosRankSum=1.419;SC=ACAACAAGGCCGCAGGCCTTA;SOR=0.732;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=145;TCF=81;TCR=64;TR=91;WE=103799766;WS=103799748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,99:0.61:163
chr10	103870379	.	C	T	1270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.287;ClippingRankSum=0.000;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.525;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=30;PP=820;ReadPosRankSum=-0.028;SC=CCTTGGGGTGCTTAAGAACAT;SOR=0.633;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=203;TCF=117;TCR=86;TR=69;WE=103870387;WS=103870369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,74:0.34:218
chr10	103904763	rs11357964	TC	T	653.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=0.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.08;MQRankSum=1.642;QD=4.99;ReadPosRankSum=1.218;SOR=0.559;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,36:0.27:131
chr10	103908080	rs3740405	G	A	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5341;FS=4.771;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=104;ReadPosRankSum=-0.447;SC=GATAAGCAGAGTATACCTGAA;SOR=3.126;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=6;WE=103908088;WS=103908070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr10	103991381	rs2281983	G	A	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.955;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=9;PP=363;ReadPosRankSum=-2.815;SC=TCCACACGGCGATCTCCTCGC;SOR=0.557;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=61;TCF=45;TCR=16;TR=27;WE=103991389;WS=103991371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,28:0.39:71
chr10	104111540	rs144741702	T	TACC	2390.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.832;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=11;PP=1297;ReadPosRankSum=0.328;SC=CCCTCTCTCTTACCCTTGAGT;SOR=0.841;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=54;TCF=30;TCR=24;TR=30;WE=104111548;WS=104111530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,59:0.61:96
chr10	104127171	rs2273555	G	A	968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.600;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=19;PP=704;ReadPosRankSum=0.626;SC=TGAAAACCCAGGAGTTCCTTA;SOR=0.777;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=173;TCF=112;TCR=61;TR=53;WE=104127179;WS=104127161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,56:0.29:192
chr10	104128954	rs7902882	T	A	3419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=48;PP=2002;SC=GTCTGTTCTCTTCCTCTTTTC;SOR=1.010;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=69;TCR=48;TR=117;WE=104128962;WS=104128944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr10	104136457	.	G	A	2987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=61;PP=1762;ReadPosRankSum=-0.510;SC=GTGTGGAATCGCTGTCCTTCA;SOR=0.694;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=169;TCF=81;TCR=88;TR=117;WE=104136477;WS=104136447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,128:0.70:182
chr10	104136469	rs2180707	T	C	4907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=86;PP=2962;SC=TGTCCTTCATTGTGCGTGATG;SOR=0.871;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=169;TCF=83;TCR=86;TR=169;WE=104136477;WS=104136447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr10	104156390	rs138364110	G	GT	2004.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.394;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=13;PP=1508;ReadPosRankSum=0.449;SC=GAGTGCTGTAGTTTGGTTCAG;SOR=1.140;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=61;TCF=39;TCR=22;TR=40;WE=104156398;WS=104156380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,68:0.74:92
chr10	104157711	rs7897947	T	G	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=1.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.79;ReadPosRankSum=-0.434;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,15:0.23:64
chr10	104157727	rs4919632	C	T	1951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=24;PP=1260;SC=AATCCATATCCCACTCCATAG;SOR=1.244;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=42;TCR=24;TR=66;WE=104157735;WS=104157717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr10	104159196	rs4919633	A	G	1914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=37;NR=29;PP=1242;SC=CCGCGGAGCCAAGCGCCCCCT;SOR=0.874;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=37;TCR=29;TR=66;WE=104159204;WS=104159186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr10	104160434	rs4919634	A	G	3152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=57;PP=1781;SC=TACACCTGGCAGTCCGAGCCC;SOR=0.991;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=48;TCR=57;TR=105;WE=104160442;WS=104160424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr10	104161168	rs72845693	G	A	1123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.596;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=28;PP=559;ReadPosRankSum=0.551;SC=GCTTAAGGACGAGGTGGGAGG;SOR=0.527;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=170;TCF=80;TCR=90;TR=58;WE=104161176;WS=104161158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,67:0.34:199
chr10	104161967	rs7077329	T	C	902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FS=0.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.68;ReadPosRankSum=-0.217;SOR=0.748;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:183,62:0.25:245
chr10	104163489	rs7068416	G	A	1016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=11;PP=448;SC=TGAGGCTTAGGTTAAGCAACC;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=23;TCR=11;TR=34;WE=104163497;WS=104163479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr10	104163569	rs11191283	G	A	1314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.548;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=25;PP=693;ReadPosRankSum=-0.105;SC=GCCTGCGTGTGTGGACAGAGG;SOR=0.609;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=94;TCF=55;TCR=39;TR=56;WE=104163577;WS=104163559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,63:0.58:108
chr10	104168611	rs148440547	G	T	662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.231;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=10;PP=395;ReadPosRankSum=-0.128;SC=CCCCTCGGTCGCCCCGCAACC;SOR=0.408;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=45;TCF=31;TCR=14;TR=29;WE=104168619;WS=104168601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,31:0.65:48
chr10	104184081	rs1044476	G	A	3661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=75;PP=2434;ReadPosRankSum=-0.274;SC=TGAGCATTTCGGGCCGCTGCA;SOR=0.501;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=222;TCF=105;TCR=117;TR=147;WE=104184089;WS=104184071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,159:0.64:249
chr10	104184953	rs11597439	C	G	1346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.091;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=26;PP=682;ReadPosRankSum=-0.687;SC=CATGCTCTCTCTTCTGAAGGG;SOR=0.432;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=70;TCF=30;TCR=40;TR=49;WE=104184961;WS=104184943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,58:0.72:81
chr10	104184981	rs11593146	A	G	876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.561;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=19;PP=437;ReadPosRankSum=1.046;SC=CAGGATGGCCAGGCCTTCTTC;SOR=0.392;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=49;TCF=19;TCR=30;TR=33;WE=104184989;WS=104184971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,38:0.69:55
chr10	104196465	rs2224374	T	C	91.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.76;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr10	104210735	rs2281878	C	A	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=1.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.75;ReadPosRankSum=-0.596;SOR=1.025;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,10:0.34:29
chr10	104211354	rs187362907	C	A	674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FS=2.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.48;ReadPosRankSum=1.204;SOR=0.541;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:147,47:0.24:194
chr10	104214048	rs1571003	A	T	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=3.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.22;MQRankSum=-1.029;QD=3.65;ReadPosRankSum=1.696;SOR=0.435;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,39:0.26:149
chr10	104214080	rs148334455	CT	C	984.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.43;MQRankSum=0.520;QD=21.41;ReadPosRankSum=0.290;SOR=1.157;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,43:0.93:46
chr10	104215075	rs151146512	CTCTT	C	2402.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.149;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.688;NF=9;NR=15;PP=1032;ReadPosRankSum=0.671;SC=AATCTGATCTCTCTTTCTTTT;SOR=0.903;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=33;TCF=11;TCR=22;TR=24;WE=104215086;WS=104215065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,60:0.82:73
chr10	104229057	rs35597970	C	CA	235.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=325;ReadPosRankSum=0.462;SC=CCCACCCAGTCAGAGGCCTGG;SOR=0.465;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=9;WE=104229065;WS=104229047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr10	104229785	rs41306870	C	T	2947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.541;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=48;PP=1724;ReadPosRankSum=-0.643;SC=TCAATGACCCCCTCTTCGGTT;SOR=0.633;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=187;TCF=114;TCR=73;TR=118;WE=104229793;WS=104229775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,131:0.64:204
chr10	104230930	rs68007409	TTCGGTGCTGGG	T	1835.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.655;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=2935;ReadPosRankSum=0.919;SC=TAAGTCTGATTTCGGTGCTGG;SOR=0.853;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=38;TCF=11;TCR=27;TR=23;WE=104230948;WS=104230920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,46:0.70:66
chr10	104231054	rs11191295	A	G	710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=15;PP=447;ReadPosRankSum=0.628;SC=AGCTGCTTGTAGGCAGTGAGG;SOR=0.703;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=63;TCF=31;TCR=32;TR=31;WE=104231062;WS=104231044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,33:0.49:68
chr10	104231234	rs913028	T	C	116.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=5;PP=86;SC=GCTGGGAACTTGGCCACGCAT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=104231242;WS=104231224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
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chr10	104232809	rs3740414	T	G	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.251;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=255;ReadPosRankSum=0.607;SC=GGTCTCCATTTCCCGACCCAG;SOR=1.402;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=13;WE=104232817;WS=104232799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr10	104240974	rs2296578	C	G	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=7;PP=108;ReadPosRankSum=1.367;SC=CCAGCCCTCCCGCTCCCTTTC;SOR=0.576;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=35;TCF=15;TCR=20;TR=13;WE=104240982;WS=104240964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,18:0.42:43
chr10	104241983	rs12763720	T	C	1300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=25;PP=626;ReadPosRankSum=-0.996;SC=CCAAGGTCCCTTTGGGAGTGG;SOR=0.838;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=63;TCF=32;TCR=31;TR=49;WE=104241991;WS=104241973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,58:0.76:76
chr10	104242886	rs2296581	G	A	1065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.906;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=29;PP=610;ReadPosRankSum=-0.670;SC=AGACAGTCAGGCTGGCAGGAA;SOR=0.985;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=149;TCF=71;TCR=78;TR=51;WE=104242894;WS=104242876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,59:0.37:161
chr10	104243883	rs7079810	C	T	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.95;ReadPosRankSum=-1.066;SOR=0.684;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,17:0.26:66
chr10	104244139	rs2296582	G	T	599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=0.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.75;ReadPosRankSum=1.152;SOR=0.619;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:120,40:0.25:160
chr10	104245549	rs2296585	C	T	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.85;ReadPosRankSum=1.676;SOR=0.631;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,6:0.21:29
chr10	104245575	rs2296586	G	A	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=3;PP=74;ReadPosRankSum=-1.194;SC=CTGCCTTGCTGGTTTGAGAGC;SOR=0.368;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=5;WE=104245596;WS=104245565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr10	104245588	.	G	A	74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=3;HapScore=4;MGOF=6;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=74;QD=54.3856062736;SC=TTGAGAGCCCGGGGACTTCAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=2;WE=104245596;WS=104245565;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:9,2:0.18:11
chr10	104248087	rs2296588	T	C	1085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.281;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=28;PP=588;ReadPosRankSum=-0.973;SC=CAGGACCCTGTTCTCCCAAGA;SOR=1.167;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=121;TCF=52;TCR=69;TR=44;WE=104248095;WS=104248077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,55:0.38:145
chr10	104248106	rs2296589	T	A	790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.834;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=21;PP=427;ReadPosRankSum=-0.096;SC=GACTAAGCAGTGCAAGCTGAA;SOR=1.213;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=100;TCF=43;TCR=57;TR=32;WE=104248114;WS=104248096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,42:0.35:119
chr10	104250209	rs111446950	CT	C	475.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.996;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.841;NF=4;NR=8;PP=284;ReadPosRankSum=0.761;SC=AACTGTTTTCCTTTGTTGACT;SOR=0.469;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=50;TCF=23;TCR=27;TR=12;WE=104250217;WS=104250199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,22:0.28:79
chr10	104264107	rs2274351	C	T	2769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=2.299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.69;ReadPosRankSum=0.565;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,125:0.75:166
chr10	104268877	rs2281879	G	C	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.694;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=2;PP=46;ReadPosRankSum=-0.494;SC=GCTTGACATTGTCTGATTTCC;SOR=0.124;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=5;WE=104268885;WS=104268867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr10	104269217	rs2281880	G	A	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=5.643;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=127;ReadPosRankSum=-1.248;SC=GGTGGTCCTCGTTAACACCTG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=7;WE=104269225;WS=104269207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr10	104356822	rs10786690	A	G	1385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=8;PP=867;SC=CTGTAAGAGCAGTGGCTGAAA;SOR=2.393;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=39;TCR=8;TR=47;WE=104356830;WS=104356812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr10	104375258	rs2001389	G	A	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.730;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=94;ReadPosRankSum=-1.708;SC=CCCAGCAGGCGTCCTCCAGGG;SOR=1.483;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=7;WE=104375266;WS=104375248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr10	104378750	rs10786698	G	A	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=3.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.24;ReadPosRankSum=0.674;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr10	104387019	rs12414407	T	C	2206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.447;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=51;PP=1378;ReadPosRankSum=-1.021;SC=GTTTGACTTTTCCTGACAACA;SOR=0.854;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=125;TCF=51;TCR=74;TR=83;WE=104387027;WS=104387009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,94:0.66:142
chr10	104389932	rs4917980	T	G	2538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=56;PP=1643;SC=GGCCCTGCAGTGGCCAGCAGG;SOR=1.688;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=29;TCR=56;TR=85;WE=104389940;WS=104389922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr10	104414221	rs3850699	A	G	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.317;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.881;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=111;ReadPosRankSum=-0.084;SC=ATAAATATGCATGGGAAGCTA;SOR=0.197;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=7;WE=104414229;WS=104414211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr10	104415093	rs34032774	CT	C	2308.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.987;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.974;NF=2;NR=41;PP=1686;ReadPosRankSum=-0.308;SC=CAGGACCAGGCTGGTGGCACC;SOR=1.109;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=63;TCF=3;TCR=60;TR=43;WE=104415101;WS=104415083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,66:0.69:96
chr10	104415720	rs4274160	T	C	609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=1;PP=410;SC=TGGCCACCCCTACCCCTGCCA;SOR=3.716;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=104415728;WS=104415719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	104415810	rs3217079	GCTCTCCCTGGA	G	5534.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.046;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=5.537;NF=22;NR=42;PP=2974;ReadPosRankSum=0.736;SC=CTCTCCCCGGGCTCTCCCTGG;SOR=0.598;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=125;TCF=44;TCR=81;TR=64;WE=104415828;WS=104415800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,144:0.61:236
chr10	104445545	rs3832710	AG	A	132.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.775;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.792;NF=4;NR=1;PP=113;ReadPosRankSum=-1.751;SC=TCATGTTGCCAGGTGGCCAAG;SOR=0.976;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=5;WE=104445553;WS=104445535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr10	104449836	rs61869211	A	G	400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=11;PP=304;SC=GGTGAGTCTCATCTCATTTAT;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=104449844;WS=104449826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	104459079	rs59504153	TAA	T	1968.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=10;PP=1124;SC=TCCATGTTTCTAACACATGGC;SOR=2.511;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=30;TCF=17;TCR=13;TR=27;WE=104459088;WS=104459069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr10	104473813	rs2248684	C	A	613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=18;NR=3;PP=512;SC=GCCTCGGACCCGCTGCAAGCC;SOR=3.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=104473821;WS=104473803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	104474107	rs2248679	G	A	981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=21;PP=601;SC=CTGCGGCGCCGCCCCCGACGT;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=11;TCR=21;TR=32;WE=104474115;WS=104474097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr10	104486304	rs2244647	G	C	1175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=6;PP=830;SC=ACAGTGGGACGTGCTCAGGTC;SOR=2.613;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=36;WE=104486312;WS=104486294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr10	104486974	rs2244524	C	T	888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=25;PP=579;ReadPosRankSum=-0.273;SC=GGTCAGGGAGCCATACTATGA;SOR=0.821;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=56;TCF=15;TCR=41;TR=34;WE=104486982;WS=104486964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,37:0.62:60
chr10	104487072	rs2244518	G	T	102.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.58;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr10	104489011	rs2244254	G	C	1069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=9;PP=605;SC=CTTTCTCCCTGAAGCCCGTGG;SOR=1.552;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=35;WE=104489019;WS=104489001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr10	104492707	rs2778037	G	C	3442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=59;PP=1983;SC=CCCAGAGTGCGTCCAGCCACA;SOR=1.010;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=112;TCF=53;TCR=59;TR=111;WE=104492715;WS=104492697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr10	104536365	rs2254563	C	G	219.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=5;PP=106;SC=CCACCGTGTTCTTAACCCTCT;SOR=2.833;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=104536373;WS=104536355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	104572276	rs284861	A	G	1875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=19;PP=1160;SC=CAATGCAAATATTCAGTGGGA;SOR=1.473;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=39;TCR=19;TR=58;WE=104572284;WS=104572266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr10	104572963	rs284860	T	C	3679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=60;PP=2163;SC=CCTCTGTCAGTCCTCTGAGGA;SOR=0.784;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=121;TCF=61;TCR=60;TR=121;WE=104572971;WS=104572953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr10	104573017	rs284859	G	T	2492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=41;NR=36;PP=1471;SC=ACGGCCGCCCGCATGCCTGCT;SOR=0.715;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=78;TCF=41;TCR=37;TR=77;WE=104573025;WS=104573007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr10	104591182	rs284849	G	T	1078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=4;PP=741;SC=CAGCAAGCTTGGCAGAGGTGA;SOR=3.026;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=34;WE=104591190;WS=104591172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr10	104828498	rs371887491	C	T	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=177;ReadPosRankSum=-0.171;SC=GGTTCCCAGCCGCATAGGGCA;SOR=0.549;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=53;TCF=14;TCR=39;TR=16;WE=104828506;WS=104828488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,18:0.32:57
chr10	104854004	.	TA	T	35.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.980;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.81;ReadPosRankSum=0.711;SOR=0.809;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,8:0.18:44
chr10	104860395	rs2863727	T	G	560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=5;PP=359;SC=AAATCTTGCCTGGCCTGGGAA;SOR=1.931;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=19;WE=104860403;WS=104860385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr10	105039579	rs1163086	A	G	880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=5;PP=596;SC=TATCATTCAAATAAGTACTTC;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=28;WE=105039587;WS=105039569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr10	105046689	rs3740381	G	C	417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=3;PP=309;SC=AAGTTCATTAGATGATTTTAA;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=105046697;WS=105046679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	105108455	rs4917387	T	C	173.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=138;SC=ACAATTGTAATTTATATATTC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=105108463;WS=105108445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	105110740	rs113359610	A	AGGAGGC	1924.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.49;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=10;PP=718;SC=GCGGGGAGACAGGAGGCGGAG;SOR=1.179;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=12;WE=105110748;WS=105110730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr10	105127708	rs10883858	G	A	70.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=17.51;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr10	105144986	rs7069667	A	G	899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=20;NR=9;PP=529;SC=ATAGTCAAATATATATAAAAT;SOR=1.839;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=29;WE=105144994;WS=105144976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr10	105154089	rs7911488	A	G	6028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=98;NR=103;PP=2965;SC=TCGATTGGCAACACAGACGAG;SOR=0.900;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=201;TCF=98;TCR=103;TR=201;WE=105154097;WS=105154079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr10	105165615	rs7919031	G	A	1341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=31;NR=15;PP=824;SC=TGTGGCTTAAGGTTTAATGTG;SOR=1.345;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=47;TCF=32;TCR=15;TR=46;WE=105165623;WS=105165605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr10	105179214	rs3740382	C	T	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=65;ReadPosRankSum=-1.777;SC=CAGTTCTGTCCTTCTCTGTGG;SOR=0.784;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=8;WE=105179222;WS=105179204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr10	105191755	rs80307802	C	CAA	67.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=53;ReadPosRankSum=1.213;SC=AGGAGAGAAACGGCCTTGGAG;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=3;WE=105191763;WS=105191745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr10	105194086	rs2986014	C	T	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=1.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.36;ReadPosRankSum=-0.601;SOR=0.452;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,26:0.22:118
chr10	105201565	rs2281861	G	A	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=415;ReadPosRankSum=-0.718;SC=TTTCTTTAGCGCCTCTGTGTT;SOR=0.509;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=10;WE=105201585;WS=105201555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,13:0.28:46
chr10	105201577	rs2281860	C	T	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.219;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=415;ReadPosRankSum=0.270;SC=CTCTGTGTTCCTCCAGGAGAA;SOR=1.042;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=54;TCF=39;TCR=15;TR=14;WE=105201585;WS=105201555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,18:0.30:61
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chr10	105233110	rs2986035	C	T	1337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.324;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=28;PP=826;ReadPosRankSum=0.650;SC=AGGAGGCGGTCCACCTGCTCC;SOR=0.820;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=174;TCF=95;TCR=79;TR=64;WE=105233118;WS=105233100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,72:0.36:202
chr10	105254090	rs2986041	G	T	2162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=19;PP=1555;SC=GCACCTCAGCGCCTGCCCGGC;SOR=2.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=71;TCF=51;TCR=20;TR=70;WE=105254098;WS=105254080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr10	105330947	rs12253987	T	A	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=66;ReadPosRankSum=-0.931;SC=CTCTGGACTCTGCCCCTCAGC;SOR=0.368;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=6;WE=105330955;WS=105330937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr10	105344756	rs2236209	T	C	2181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=32;PP=1139;ReadPosRankSum=0.344;SC=CCGACCTGCCTTTCAGCCCTG;SOR=0.734;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=121;TCF=72;TCR=49;TR=80;WE=105344764;WS=105344746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,98:0.67:146
chr10	105361816	rs4918031	T	G	2208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.239;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=38;PP=1134;ReadPosRankSum=0.625;SC=GGGACACGGGTATGCTGTTGC;SOR=0.828;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=140;TCF=70;TCR=70;TR=77;WE=105361824;WS=105361806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,98:0.59:166
chr10	105362209	rs4917396	T	C	2964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.574;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=55;PP=1911;ReadPosRankSum=-0.084;SC=GGCTGTCTGATTTGCCTTCGT;SOR=0.802;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=216;TCF=118;TCR=98;TR=127;WE=105362217;WS=105362199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,138:0.58:239
chr10	105363289	rs3740471	T	C	3392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.504;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=66;PP=1522;ReadPosRankSum=1.140;SC=CAAAGCCGAATGCAGGGATGT;SOR=0.634;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=205;TCF=105;TCR=100;TR=137;WE=105363297;WS=105363279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,159:0.67:238
chr10	105365386	rs7088714	A	G	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=252;ReadPosRankSum=0.000;SC=AGTTTAGGCCATGGCACTGGC;SOR=1.101;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=17;WE=105365394;WS=105365376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
chr10	105428453	rs10533306	CAG	C	8037.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=11;NR=100;PP=2982;SC=AGAGGAGAACCAGAGAGAGAG;SOR=1.070;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=133;TCF=13;TCR=120;TR=111;WE=105428462;WS=105428443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr10	105614884	rs4918064	A	G	1198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=36;NR=5;PP=902;SC=TGGGAGGGGCAAGGGGCCATC;SOR=3.767;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=36;TCR=5;TR=41;WE=105614892;WS=105614874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr10	105615105	rs10883929	G	C	4701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=102;PP=2648;SC=TCCAGCTGCCGGGGTCCCGGG;SOR=1.295;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=167;TCF=65;TCR=102;TR=167;WE=105615113;WS=105615095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr10	105657316	rs10786775	G	C	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=6;PP=460;ReadPosRankSum=-2.262;SC=TTGGTCGGAGGAGGCACTGTG;SOR=0.648;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=27;WE=105657324;WS=105657306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,27:0.68:40
chr10	105658588	rs2902639	G	C	794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=497;ReadPosRankSum=-0.708;SC=AGCTGCTTCAGTTTTCTGCCG;SOR=0.901;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=37;TCF=25;TCR=12;TR=27;WE=105658596;WS=105658578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,33:0.77:43
chr10	105659826	rs2487999	T	C	1245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.21;ReadPosRankSum=1.716;SOR=0.641;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,60:0.59:102
chr10	105727656	rs67597452	AAG	A	1297.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.141;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.612;NF=1;NR=23;PP=923;ReadPosRankSum=-0.313;SC=TGTACAAGGTAAGAGGGGGAA;SOR=0.951;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=42;TCF=2;TCR=40;TR=24;WE=105727665;WS=105727646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,35:0.62:56
chr10	105758670	rs10883960	A	G	730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=22;PP=524;ReadPosRankSum=0.062;SC=ATTTTGGAGTATCAGCTAAAA;SOR=0.731;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=106;TCF=54;TCR=52;TR=41;WE=105758678;WS=105758660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,41:0.35:117
chr10	105763026	rs3740469	C	T	769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.697;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=19;PP=462;ReadPosRankSum=1.089;SC=CCTGAAGTTACTGTAGTTTCA;SOR=0.789;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=116;TCF=58;TCR=58;TR=38;WE=105763034;WS=105763016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,42:0.33:128
chr10	105768158	rs805664	A	T	704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.707;HP=9;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=28;PP=695;ReadPosRankSum=2.684;SC=CTTTTTTTTTAAAAAAATTGT;SOR=0.151;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=46;TCF=14;TCR=32;TR=42;WE=105768166;WS=105768138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,32:0.91:35
chr10	105781532	rs10883961	C	T	3069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.559;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-1.414;NF=54;NR=55;PP=1698;ReadPosRankSum=0.849;SC=TGTGTGTACTCGTCCGTCTAC;SOR=0.787;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=169;TCF=84;TCR=85;TR=109;WE=105781540;WS=105781522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,132:0.67:197
chr10	105781596	rs68117222	CAT	C	1465.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.690;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.517;NF=2;NR=23;PP=922;ReadPosRankSum=1.629;SC=GGGCAGGAAACATAGAGATGA;SOR=0.764;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=78;TCF=5;TCR=73;TR=25;WE=105781605;WS=105781586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,43:0.31:140
chr10	105792205	rs813943	A	C	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.661;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=393;ReadPosRankSum=0.222;SC=GCCCCATTTCAACACCAGCTT;SOR=0.247;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=22;WE=105792213;WS=105792195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,23:0.52:44
chr10	105793173	rs1747675	T	G	179.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=4;PP=85;SC=AGCAGGGATCTCCCAGTACCC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=105793181;WS=105793163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	105793587	rs11596192	C	A	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.13;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr10	105793750	rs17116350	T	C	793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.788;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=26;PP=518;ReadPosRankSum=0.009;SC=GTAATCCAGATCTCCAGCAAA;SOR=0.709;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=171;TCF=95;TCR=76;TR=50;WE=105793758;WS=105793740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,55:0.28:195
chr10	105796399	rs2274098	G	C	826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=19;PP=592;SC=CCCTGGAGAGGAGAGGATGCA;SOR=2.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=25;WE=105796407;WS=105796389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr10	105796449	rs2476957	A	G	352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=10;PP=250;SC=CGCAGCCATGATCCAGCCACA;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=105796457;WS=105796439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	105796738	rs805714	A	C	206.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=1;PP=114;SC=CAAGGTTTGCATGACGAGTGA;SOR=1.863;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=105796746;WS=105796728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	105796819	rs2476958	A	G	1174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=8;PP=668;SC=GCACAGCCAGAATGTCTTCAG;SOR=1.721;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=35;WE=105796827;WS=105796809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr10	105797378	rs2282437	G	A	947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=7;PP=635;SC=GGTGCAGGGCGTGGGGAAGGG;SOR=2.165;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=28;WE=105797386;WS=105797368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr10	105797693	rs61382109	TA	T	699.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=16;PP=584;SC=GTCCTTCCCCTAAATTACAGA;SOR=3.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=16;WE=105797701;WS=105797683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr10	105797989	rs200030951	TACACACACACACACACACAC	T	833.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=6.232;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.883;NF=9;NR=4;PP=1742;ReadPosRankSum=1.590;SC=TAGACACACATACACACACAC;SOR=2.469;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=15;TCF=9;TCR=6;TR=13;WE=105798016;WS=105797979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,20:0.95:21
chr10	105798872	rs2274100	T	C	3765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=80;PP=2193;SC=CTGGAACACCTGGATCACCTG;SOR=1.302;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=131;TCF=51;TCR=80;TR=131;WE=105798880;WS=105798862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr10	105799216	rs2296219	G	T	1258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=15;PP=748;SC=TGTCACCTTTGGGTCCCTGGG;SOR=1.203;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=26;TCR=15;TR=41;WE=105799224;WS=105799206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr10	105799550	.	ACACG	A	154	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;FR=0.5000;HP=2;MMLQ=24;NF=10;NR=2;PP=154;QD=13.0833333333;SC=ACACACACACACACGCACACG;Source=Platypus;TCR=7;TR=12;WS=105799540;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr10	105799552	rs67083195	ACG	A	118.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.335;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.404;HP=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.748;NF=10;NR=2;PP=358;ReadPosRankSum=0.814;SC=ACACACACACACGCACACGCA;SOR=3.352;Source=Platypus;TCR=7;TR=12;WS=105799540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr10	105799599	rs11191905	C	A	2055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=17;PP=1298;SC=TCAACCATTCCTAGAGAAACA;SOR=1.708;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=48;TCR=17;TR=65;WE=105799607;WS=105799589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr10	105800321	rs12763538	C	T	1334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=38;PP=998;SC=GATGAATGGGCGGGTGGGTGG;SOR=2.737;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=49;TCF=10;TCR=39;TR=48;WE=105800329;WS=105800311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr10	105800344	.	ATGGATGGATGGATAGG	A	80.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.799;ClippingRankSum=-0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.799;NF=0;NR=16;PP=247;ReadPosRankSum=0.079;SC=GGATGGATGGATGGATGGATG;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=16;WE=105800367;WS=105800334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr10	105800348	rs139480552	ATGGATGGATAGG	A	155.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.017;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=16;PP=460;ReadPosRankSum=2.655;SC=GGATGGATGGATGGATGGATA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=16;WE=105800367;WS=105800334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr10	105801253	rs4918079	G	A	2559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=39;PP=1446;SC=CTGGTGGCCCGCGTGGGCCGG;SOR=0.901;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=39;TCR=39;TR=78;WE=105801261;WS=105801243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr10	105803080	rs2147269	A	G	112.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.01;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr10	105805310	rs805719	G	A	189.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.11;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr10	105805436	rs805720	G	A	2447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=29;PP=1409;SC=TGGCCAGAGAGAGGCCTCCTC;SOR=1.191;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=49;TCR=29;TR=78;WE=105805444;WS=105805426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr10	105805497	rs813944	C	T	1996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-0.783;NF=46;NR=38;PP=1118;ReadPosRankSum=0.469;SC=AAAGAAATCTCATTTGGAAAT;SOR=0.700;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=135;TCF=75;TCR=60;TR=84;WE=105805505;WS=105805487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,93:0.61:152
chr10	105806310	rs805721	C	A	827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=5;PP=508;ReadPosRankSum=-0.131;SC=CATTTCTACTCGAATGGTGTT;SOR=0.743;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=29;WE=105806318;WS=105806300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,34:0.76:45
chr10	105809727	rs34422866	A	G	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.458;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=4;PP=115;ReadPosRankSum=-0.280;SC=CTAGATCACAAGTTCCCTGAA;SOR=0.362;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=10;WE=105809735;WS=105809717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,12:0.24:51
chr10	105810400	rs805722	T	C	1211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=14;PP=761;SC=GGTGGTCCCATTGGTCCTTTG;SOR=1.280;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=28;TCR=14;TR=42;WE=105810408;WS=105810390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr10	105810879	rs805723	C	A	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.093;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=82;ReadPosRankSum=0.038;SC=AACACATTGTCGAGTCTTGGC;SOR=0.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=3;WE=105810888;WS=105810869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr10	105810880	.	G	A	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.200;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=295;ReadPosRankSum=-0.812;SC=ACACATTGTCGAGTCTTGGCA;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=6;WE=105810888;WS=105810869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr10	105811218	rs12260615	T	A	3180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.645;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=58;PP=1717;ReadPosRankSum=-1.238;SC=AGAACCTATTTACAAGAAGCA;SOR=0.586;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=210;TCF=115;TCR=95;TR=131;WE=105811226;WS=105811208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,150:0.64:234
chr10	105814826	rs805691	C	A	1145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FS=1.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.40;ReadPosRankSum=0.610;SOR=0.884;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:114,65:0.36:179
chr10	105814937	rs805692	C	T	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=8;ReadPosRankSum=1.064;SC=CATTGCTGGGCTTCTCTTAGA;SOR=0.623;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=51;TCF=22;TCR=29;TR=15;WE=105814945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,15:0.27:55
chr10	105815116	rs17821926	A	G	873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FS=0.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.72;ReadPosRankSum=0.207;SOR=0.746;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:176,59:0.25:235
chr10	105815204	rs1747676	A	T	898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.09;ReadPosRankSum=-0.977;SOR=0.843;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,31:0.97:32
chr10	105815241	rs1747677	A	C	250.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=85;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=18;PP=501;SC=CACACACACAATAAGGGGATC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=105815249;WS=105815231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr10	105816916	rs805698	C	T	1597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=32;NR=24;PP=846;SC=CCACTGCTGCCGTAGCTGTGG;SOR=0.826;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=32;TCR=24;TR=56;WE=105816924;WS=105816906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr10	105817043	rs805699	C	T	403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=9;PP=203;SC=TGGGGGCTTTCAAGTTCCTGT;SOR=1.911;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=13;WE=105817051;WS=105817033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	105819956	rs805701	G	A	781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=17;PP=419;ReadPosRankSum=0.367;SC=TCTCCTTCTTGGCAGGTGTGT;SOR=0.706;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=68;TCR=49;TR=40;WE=105819964;WS=105819946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,47:0.35:136
chr10	105821136	rs805704	A	T	2374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=39;PP=1413;SC=ACCAGCCTGAACCCTGGCAGC;SOR=0.763;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=38;TCR=39;TR=77;WE=105821144;WS=105821126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr10	105821294	rs805705	A	G	1083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=23;PP=654;SC=GAGAAGCCTGATCAGCCCTGG;SOR=1.206;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=15;TCR=23;TR=38;WE=105821302;WS=105821284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr10	105821836	rs805706	C	T	698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=3;PP=494;SC=ACAGCCTTCCCTGTGTGCTTG;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=105821844;WS=105821826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	105824333	rs805708	G	A	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.799;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=14;PP=385;ReadPosRankSum=0.674;SC=ATCCAGGATCGTTGCATCGTA;SOR=0.820;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=79;TCF=51;TCR=28;TR=36;WE=105824341;WS=105824323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,38:0.42:91
chr10	105831714	.	G	GCA	70	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MMLQ=24;MQ=59.25;NF=5;NR=1;PP=70;QD=12.6666666667;SC=ACACACGCATGCACACACACA;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=31;TCF=21;TCR=10;TR=6;WE=105831723;WS=105831704;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:25,6:0.19:31
chr10	105837000	rs2274106	A	G	585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=3;PP=422;SC=GCTGCCCAATAGCTGTGTGTT;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=105837008;WS=105836990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr10	105882055	rs7901021	A	C	126.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=4;PP=87;SC=GGGGAACTCAACCTCACCTTA;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=105882063;WS=105882045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr10	105882765	rs10786783	A	G	742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=14;PP=577;ReadPosRankSum=-0.257;SC=AGTCCGTCAGACTCAGCTGTG;SOR=0.709;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=28;TCR=22;TR=31;WE=105882773;WS=105882755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,31:0.58:53
chr10	105883395	rs1338777	A	C	618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=15;NR=8;PP=355;SC=AAATGGAAGGACTTTATTTCT;SOR=1.270;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=15;TCR=8;TR=23;WE=105883403;WS=105883385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr10	105885525	rs201504294	CT	C	137.50	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.612;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-0.000;QD=8.59;ReadPosRankSum=-2.649;SOR=0.916;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr10	105901936	rs637022	G	A	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.017;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=293;ReadPosRankSum=1.270;SC=GAAGGGAGATGGCTGTAAAGC;SOR=3.383;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=16;WE=105901944;WS=105901926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr10	105905380	rs141870801	TGAC	T	1237.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.985;NF=6;NR=14;PP=897;ReadPosRankSum=1.584;SC=TTTTATTTGTTGACAATACTC;SOR=0.752;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=20;WE=105905390;WS=105905370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,33:0.52:63
chr10	105920990	rs36092125	G	GT	1346.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.055;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.880;NF=2;NR=28;PP=596;ReadPosRankSum=-1.139;SC=AAAGCTCAGAGTTTTTTTTAA;SOR=0.297;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=57;TCF=2;TCR=55;TR=30;WE=105920998;WS=105920980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,56:0.74:76
chr10	105921085	rs605712	A	G	160.10	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5341;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=111;ReadPosRankSum=0.674;SC=AAAATTTTACAACAGTTCTTC;SOR=1.402;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=7;WE=105921093;WS=105921075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr10	105922056	rs35188172	GT	G	4838.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.500;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.706;NF=30;NR=60;PP=2964;ReadPosRankSum=-2.131;SC=TAGGACCTGTGTTAAGCAAAG;SOR=0.630;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=151;TCF=52;TCR=99;TR=90;WE=105922064;WS=105922046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,151:0.64:237
chr10	105932074	rs626708	C	T	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.88;ReadPosRankSum=-1.117;SOR=0.846;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,4:0.22:18
chr10	105932157	rs35761606	CT	C	1618.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.935;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.419;NF=14;NR=23;PP=1184;ReadPosRankSum=1.967;SC=TTAAATTATACTTTTTCATAC;SOR=0.920;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=52;TCF=18;TCR=34;TR=37;WE=105932165;WS=105932147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,74:0.77:96
chr10	105938913	rs200538630	CAGAG	C,CAG	1262.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.06;ReadPosRankSum=0.956;SOR=0.656;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:3,11,31:0.24,0.69:45
chr10	105939451	rs624159	C	A	1214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=5;PP=910;SC=ATTTGCTTTCCGAAAAGTTAC;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=33;TCR=5;TR=38;WE=105939459;WS=105939441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr10	105942304	rs569856	T	C	1331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=29;PP=880;SC=ACAGAGGCTATAAAAATCATA;SOR=1.659;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=15;TCR=29;TR=44;WE=105942312;WS=105942294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr10	105942337	rs569967	G	C	858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=22;PP=622;SC=ACATTTAGCTGTATTATTTTC;SOR=3.258;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=26;WE=105942345;WS=105942327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr10	105945985	rs479879	A	C	220.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=4;PP=76;SC=TGTAAATAAAATGATATGGCA;SOR=2.833;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=105945993;WS=105945975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	105956776	rs584309	A	G	1562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=25;NR=27;PP=818;SC=CCAGTGTGCCAATGATTTAGT;SOR=0.986;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=25;TCR=27;TR=52;WE=105956784;WS=105956766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr10	105957561	rs678292	G	A	295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=0;PP=214;SC=TCTGCCTCCTGTTCGCATTGC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=105957569;WS=105957551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	105957613	rs677904	G	A	886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=8;PP=454;SC=ACATATAAATGGGGATTTAAA;SOR=1.244;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=28;TCF=19;TCR=9;TR=27;WE=105957621;WS=105957603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr10	105967413	rs17824653	A	C	944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.350;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=4;PP=625;ReadPosRankSum=-0.079;SC=GAAGTAGGACAGTTTCTTACC;SOR=1.846;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=56;TCF=47;TCR=9;TR=32;WE=105967421;WS=105967403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,36:0.59:61
chr10	105967624	rs11191948	C	T	1091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.570;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=29;PP=583;ReadPosRankSum=0.333;SC=AAAACAATCACGGCTAAAAGC;SOR=0.449;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=110;TCF=37;TCR=73;TR=47;WE=105967632;WS=105967614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,51:0.44:116
chr10	105973981	rs584082	C	G	814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FS=2.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.96;ReadPosRankSum=1.461;SOR=0.862;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:153,53:0.26:206
chr10	105978690	rs606697	A	T	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=3;PP=34;ReadPosRankSum=0.960;SC=CACCACACCAACCACAGCTGC;SOR=0.412;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=16;TCF=7;TCR=9;TR=6;WE=105978698;WS=105978680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr10	105991884	rs789577	T	G	1913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.86;SOR=0.992;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr10	106014764	rs144343542	CCGG	C	654.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.331;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.597;NF=4;NR=10;PP=505;ReadPosRankSum=0.993;SC=TCGGCGACCCCCGGCGGCATG;SOR=1.179;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=47;TCF=8;TCR=39;TR=14;WE=106014774;WS=106014754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,20:0.29:69
chr10	106022789	rs4925	C	A	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.021;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=9;PP=180;ReadPosRankSum=-2.042;SC=GAAGACTATGCTGGCCTAAAA;SOR=0.877;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=55;TCF=28;TCR=27;TR=16;WE=106022797;WS=106022779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,19:0.28:68
chr10	106028154	rs45596840	G	A	4076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FS=0.985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.37;ReadPosRankSum=0.370;SOR=0.612;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:139,110:0.44:249
chr10	106028157	rs641071	G	T	4097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FS=0.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.52;ReadPosRankSum=0.337;SOR=0.604;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:139,109:0.44:248
chr10	106037894	rs157077	T	C	355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=297;SC=ATTTAAAAAGTCACTCACACT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=106037902;WS=106037884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr10	106039185	rs156697	A	G	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.858;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=14;PP=312;ReadPosRankSum=-0.120;SC=AGAATGCACTAATCTGAAGGC;SOR=0.896;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=87;TCF=43;TCR=44;TR=25;WE=106039193;WS=106039175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,27:0.27:99
chr10	106039303	rs276203	A	G	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=34;ReadPosRankSum=1.087;SC=TGGTCACTCTAACACCAGCTT;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=4;WE=106039311;WS=106039293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,4:0.20:20
chr10	106116606	rs17754804	T	A	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.837;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=13;PP=259;ReadPosRankSum=0.417;SC=ACTCATCTTGTGGATAAGCTG;SOR=0.659;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=89;TCF=50;TCR=39;TR=27;WE=106116614;WS=106116596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,29:0.30:97
chr10	106124660	rs12769756	G	T	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=108;ReadPosRankSum=-0.378;SC=CTGCCATGGAGGGCAAGAAGA;SOR=0.650;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=11;WE=106124668;WS=106124650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,13:0.31:42
chr10	106159305	rs10509772	G	A	1445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=34;PP=965;SC=AACAGACACGGGTATTTAATT;SOR=2.004;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=14;TCR=34;TR=48;WE=106159313;WS=106159295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr10	106160731	rs41317250	T	C	725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=17;PP=482;SC=CACTTCGTAGTCATGCTTGTT;SOR=2.215;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=23;WE=106160739;WS=106160721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr10	106163753	rs7087640	T	C	826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=24;PP=669;SC=AAATTGAGTTTTCTCAGAACC;SOR=2.546;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=30;WE=106163761;WS=106163743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr10	106207269	rs1411711	G	C	243.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=6;NR=0;PP=141;SC=AAATGTTGGGGACATTCCCAG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=106207277;WS=106207265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	106602496	rs5787553	C	CT	2502.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=19;PP=1505;SC=AGTAAGCTTCCTTTTTTCCCT;SOR=1.264;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=51;TCF=28;TCR=23;TR=45;WE=106602504;WS=106602486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr10	106675585	rs6584635	C	T	3273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=2.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.260;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=46;PP=1856;ReadPosRankSum=-0.231;SC=TCTCTTTTACCTGCAGGTCGA;SOR=0.941;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=188;TCF=112;TCR=76;TR=122;WE=106675593;WS=106675568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,141:0.65:216
chr10	106907440	rs791125	C	T	1398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=21;PP=761;ReadPosRankSum=0.765;SC=GGAACCAGAACGACACGTACA;SOR=0.692;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=88;TCF=54;TCR=34;TR=57;WE=106907448;WS=106907430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,65:0.65:100
chr10	106907586	rs791126	C	G	1019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=22;PP=572;ReadPosRankSum=-0.890;SC=TCCCTTGGGTCTGTCTCTCTT;SOR=0.599;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=25;TCR=33;TR=39;WE=106907594;WS=106907576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,46:0.64:72
chr10	106916819	rs2297500	G	A	886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.366;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=10;PP=611;ReadPosRankSum=1.109;SC=GAAATTCTGCGGCTTCTCTAA;SOR=0.451;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=48;TCF=35;TCR=13;TR=34;WE=106916827;WS=106916809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,36:0.71:51
chr10	106961109	rs2306652	G	C	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=151;ReadPosRankSum=-0.967;SC=GAAGCATGACGCAGAGATAGG;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=8;WE=106961117;WS=106961099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr10	106970848	rs3214966	AG	A	1417.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.361;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.321;NF=8;NR=15;PP=832;ReadPosRankSum=-0.735;SC=CGGTTATTTTAGCGTTTGTAC;SOR=0.167;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=40;TCF=19;TCR=21;TR=23;WE=106970856;WS=106970838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,42:0.65:65
chr10	106974123	rs113804925	A	AACACAC	2422.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=-1.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=12;PP=1295;ReadPosRankSum=-0.376;SC=TTCCCTTTATAACACACACAC;SOR=0.721;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=60;TCF=31;TCR=29;TR=27;WE=106974132;WS=106974113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,70:0.68:103
chr10	106982993	rs75947816	G	A	3802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.691;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=71;PP=2315;ReadPosRankSum=0.771;SC=CTGGTGGTTCGGCAATAGCAC;SOR=0.572;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=215;TCF=115;TCR=100;TR=148;WE=106983001;WS=106982983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,166:0.69:241
chr10	107023264	rs41291856	C	G	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.034;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=62;ReadPosRankSum=-0.991;SC=AAATAGCAGGCAAATGCCTAG;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=5;WE=107023272;WS=107023254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr10	108371571	rs137930414	A	AGTTT	2965.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=15;PP=1330;SC=CTGCTGGGTTAGTTTGTTTGT;SOR=1.574;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=15;TCR=19;TR=27;WE=108371579;WS=108371561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr10	108389249	rs1322004	T	C	429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=15;PP=332;SC=TCAGGCATGATGGCAGCCCTG;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=108389257;WS=108389239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr10	108432828	rs11193010	C	T	658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=19;PP=530;SC=GGGGCGTTCACCCTGAGCTAA;SOR=3.258;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=21;WE=108432836;WS=108432818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr10	108439103	rs821929	A	C	3243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=65;PP=1757;SC=AGAAAGAGAAAGGTGCCATTA;SOR=1.323;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=43;TCR=65;TR=108;WE=108439111;WS=108439093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr10	108447836	rs821935	C	T	1705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=18;PP=946;SC=CCCTTCCCCACTCCCTTTTGT;SOR=1.284;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=37;TCR=18;TR=55;WE=108447844;WS=108447826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr10	108466412	rs2756231	C	T	2619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=38;NR=48;PP=1431;SC=AAAAACAAGACTGTAAGAAGC;SOR=1.202;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=38;TCR=48;TR=86;WE=108466420;WS=108466402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr10	108469161	rs2756232	C	G	1522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=18;NR=32;PP=914;SC=CAGAGATTTACAGTCAGGGTG;SOR=1.524;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=53;TCF=18;TCR=35;TR=50;WE=108469169;WS=108469151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr10	108923704	rs2993097	A	G	3665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.960;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=65;PP=2207;ReadPosRankSum=1.272;SC=CCACCCCTTTACCCTCAGTCC;SOR=0.776;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=239;TCF=131;TCR=108;TR=145;WE=108923712;WS=108923694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,164:0.61:268
chr10	111440605	rs7898586	A	G	883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.469;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=15;PP=582;ReadPosRankSum=-2.197;SC=TTCATTACAGAAAGAGATTAG;SOR=1.024;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=113;TCF=67;TCR=46;TR=42;WE=111440613;WS=111440595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,45:0.38:118
chr10	111440719	rs7915504	T	A	1175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.551;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.784;NF=24;NR=33;PP=706;ReadPosRankSum=0.228;SC=TCTAGTCACTTGTAAACAATG;SOR=0.783;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=175;TCF=82;TCR=93;TR=57;WE=111440727;WS=111440709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,67:0.33:201
chr10	111625108	rs483072	T	C	561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=15;PP=436;SC=TATTCACCACTACATCTTTAA;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=111625116;WS=111625098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	111630731	rs612155	G	C	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.031;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=293;ReadPosRankSum=-0.039;SC=ATTATGTGTGGCTCCAGAACG;SOR=0.504;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=22;TCR=43;TR=23;WE=111630739;WS=111630721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,24:0.33:72
chr10	111633025	rs642938	A	C	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=154;ReadPosRankSum=0.279;SC=TTACTACCCCACATGTAATTT;SOR=1.022;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=11;WE=111633033;WS=111633015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr10	111635212	rs3818285	T	C	658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=361;ReadPosRankSum=-1.200;SC=TGCTCTCAGCTGGAGCTCAGC;SOR=0.627;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=37;TCF=28;TCR=9;TR=26;WE=111635220;WS=111635202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,29:0.73:40
chr10	111646147	rs623980	A	G	963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.348;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=23;PP=530;ReadPosRankSum=-0.053;SC=CCCAGAAAGCAGTAGGAACCC;SOR=0.862;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=130;TCF=64;TCR=66;TR=43;WE=111646155;WS=111646137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,53:0.35:152
chr10	111647738	rs472049	C	T	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=1.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.72;ReadPosRankSum=-1.311;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr10	111648006	rs2273739	G	C	114.98	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5103;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=43;ReadPosRankSum=-0.792;SC=CAGCAGGGCAGGGAGCAGGGC;SOR=1.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=5;WE=111648014;WS=111647996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr10	111651541	rs111607977	G	A	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=9;PP=194;ReadPosRankSum=-0.430;SC=AGTAGCGCCCGTCAGTCCACA;SOR=0.610;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=32;TCR=25;TR=20;WE=111651549;WS=111651531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,19:0.38:50
chr10	111652610	rs3737153	A	G	1122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=9;PP=829;SC=CTTGGGGAGCAGGGAAAGACT;SOR=2.531;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=42;WE=111652618;WS=111652600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr10	111667664	rs944969	T	C	989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=20;PP=583;SC=AAGTGCCTTCTACGTTCTGCC;SOR=3.477;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=111667672;WS=111667654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr10	111667702	rs686155	T	C	382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.61;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=177;SC=TTCAAATTGATCACTCCACCA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=111667710;WS=111667692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	111683280	rs145751207	CGGCG	C	921.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=1;NR=5;PP=285;SC=GCGCGAGAGCCGGCGGGCGGG;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=6;WE=111683291;WS=111683270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr10	111702481	rs181555168	G	A	2020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=37;PP=1132;ReadPosRankSum=-0.437;SC=TCTTTGTATGGCGTTTGAAGG;SOR=0.700;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=126;TCF=71;TCR=55;TR=80;WE=111702489;WS=111702471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,92:0.59:156
chr10	111706856	rs12569906	A	T	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.587;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=241;ReadPosRankSum=-1.575;SC=TGTATTTCCTAAAGCATTCCT;SOR=1.609;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=58;TCF=41;TCR=17;TR=16;WE=111706864;WS=111706846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,17:0.28:61
chr10	111711658	rs12257668	C	T	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=62;ReadPosRankSum=-1.428;SC=ACCTGGGAGGCGGAGGTTGCA;SOR=0.986;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=7;WE=111711666;WS=111711648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
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chr10	111878510	rs12268910	T	G	1032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.942;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=26;PP=592;ReadPosRankSum=-1.079;SC=TCAATGAAAGTCCAAAACTGA;SOR=0.525;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=168;TCF=78;TCR=90;TR=52;WE=111878518;WS=111878500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,61:0.31:194
chr10	111886089	rs3731566	G	A	816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=4;PP=635;SC=GAAATGTCAAGTAGTAAGCTT;SOR=3.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=27;WE=111886097;WS=111886079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr10	111890362	rs13306109	C	A	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-3.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=46;ReadPosRankSum=-0.434;SC=ACCTGTAATCCCAGCACTTTG;SOR=0.616;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=5;WE=111890370;WS=111890352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr10	111985946	rs35741140	G	C	902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=10;PP=553;ReadPosRankSum=-1.170;SC=GCGGAGAGGCGCCGGTCGCCA;SOR=0.672;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=35;TCR=14;TR=35;WE=111985954;WS=111985936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,39:0.74:53
chr10	112044553	rs5787843	G	GTTC	417.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.57;MQRankSum=0.000;QD=11.94;ReadPosRankSum=-1.059;SOR=0.577;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,22:0.63:35
chr10	112044560	rs33957950	T	TTC	93.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=3.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.53;MQRankSum=0.000;QD=2.47;ReadPosRankSum=1.417;SOR=1.406;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,11:0.29:38
chr10	112044842	rs16448	TAAAAC	T	133.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=2;PP=93;ReadPosRankSum=-0.099;SC=GTCTCCTCTTTAAAACAAAAC;SOR=0.330;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=3;WE=112044854;WS=112044832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr10	112054908	rs7074311	C	A	717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=5;PP=454;SC=CAAAAAATCTCCATCTCTTTT;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=23;WE=112054916;WS=112054898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr10	112266822	rs1889566	GC	AT	9654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=96;PP=2947;SC=CGAGGCCTGCGCGACCCACCT;SOR=0.861;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=192;TCF=94;TCR=98;TR=189;WE=112266831;WS=112266812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr10	112327678	rs55750861	C	CA	2105.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=22;PP=901;SC=CGCAGCCTCTCCCCTGTCTCC;SOR=1.220;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=23;WE=112327686;WS=112327668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr10	112328838	rs4917577	C	G	636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=17;PP=452;SC=CTGTCCATTTCTATATTGGCT;SOR=2.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=112328846;WS=112328828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr10	112349204	rs2419572	A	G	143.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.97;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	112356331	rs7075340	G	A	953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=24;PP=660;SC=TTTGTGCATAGTGATAGATAT;SOR=2.517;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=31;WE=112356339;WS=112356321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr10	112361870	rs2419565	A	G	3283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=57;NR=54;PP=1874;SC=GTTACAAATCAATCATGGAAC;SOR=0.774;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=57;TCR=54;TR=111;WE=112361878;WS=112361860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr10	112362019	rs2039874	G	T	395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=11;PP=321;SC=TTTTAAAGCTGTTTTCCTCAT;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=112362027;WS=112362009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	112543217	rs6585012	G	A	914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.391;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=12;PP=425;ReadPosRankSum=-1.409;SC=AGGCTCATGCGTAGGCTCAAC;SOR=0.583;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=40;TCF=24;TCR=16;TR=33;WE=112543225;WS=112543207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,40:0.82:49
chr10	112544063	rs7898438	A	C	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=194;ReadPosRankSum=0.936;SC=TGTTTAACTTATTAAGGAGCC;SOR=0.551;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=12;WE=112544071;WS=112544053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr10	112570243	rs11195338	T	C	1079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=28;PP=735;ReadPosRankSum=0.007;SC=GCCCCAAGTCTCCAGGCAGGT;SOR=0.582;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=56;TCF=15;TCR=41;TR=38;WE=112570251;WS=112570233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,44:0.66:67
chr10	112572458	rs1417635	G	C	7368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=117;NR=116;PP=2965;SC=AAAGCCAAGTGGGACAAGTAT;SOR=0.760;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=234;TCF=117;TCR=117;TR=233;WE=112572466;WS=112572448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,275:1.00:275
chr10	112579663	rs11195343	C	T	392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=2;PP=297;SC=ATCTATAAAACGAAGATGCTG;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=112579671;WS=112579657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	112590810	rs7070640	G	C	4930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=95;NR=71;PP=2965;SC=ATCCCCCATCGTTTCCCAGGG;SOR=0.986;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=166;TCF=95;TCR=71;TR=166;WE=112590818;WS=112590800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr10	112595719	rs942077	G	C	1632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=27;PP=952;ReadPosRankSum=2.654;SC=GCCACGCTTCGAAAGGAAAAA;SOR=1.217;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=50;TCF=23;TCR=27;TR=49;WE=112595727;WS=112595709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,59:0.97:61
chr10	112641053	rs7081726	A	G	2717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=24;PP=1672;SC=GACTGAGGAAATAAAGAATGA;SOR=1.609;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=84;TCF=60;TCR=24;TR=83;WE=112641061;WS=112641043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr10	112650209	rs2295992	A	G	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.860;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=89;ReadPosRankSum=0.563;SC=CTTTTATGTTATGTGAAAGAT;SOR=0.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=6;WE=112650217;WS=112650199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr10	112697017	.	CT	C	38.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.302;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.76;ReadPosRankSum=-0.671;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr10	112764594	rs1980869	T	C	397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=12;PP=332;SC=ATTGCTTTAATTGGTACTTCC;SOR=2.985;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=14;WE=112764602;WS=112764584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	112837637	.	C	G	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.18;ReadPosRankSum=0.967;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,2:0.20:10
chr10	113913222	rs2297991	T	C	1233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=15;PP=766;SC=GACCCTGCGATGGCACCTTCA;SOR=1.414;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=29;TCR=15;TR=44;WE=113913230;WS=113913212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr10	113917085	rs2254537	T	A	5665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=102;PP=2965;SC=ACAAAGGTTCTGGAAGCTTCT;SOR=0.910;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=190;TCF=88;TCR=102;TR=190;WE=113917093;WS=113917075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr10	113917982	rs6585140	C	G	1621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=17;PP=999;SC=TGCCACCATGCCTGGCCAATT;SOR=1.493;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=54;TCF=36;TCR=18;TR=53;WE=113917990;WS=113917972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr10	113920465	rs2277207	G	A	7114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=129;NR=108;PP=2965;SC=AAAACTCATCGTTCCTGCTAG;SOR=0.821;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=237;TCF=129;TCR=108;TR=237;WE=113920473;WS=113920455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
chr10	113920652	rs3824626	T	C	2071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=54;PP=1366;SC=AACGGTATCATGATGGTGGAA;SOR=2.494;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=17;TCR=54;TR=71;WE=113920660;WS=113920642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr10	113921354	rs2250802	G	A	1185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=15;PP=768;SC=CTGCCCCTGAGTATGTATCTG;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=24;TCR=15;TR=39;WE=113921362;WS=113921344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr10	113923595	rs10736219	C	G	8374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=135;NR=139;PP=2965;SC=TTTCAAAAATCAACACACAAC;SOR=0.831;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=274;TCF=135;TCR=139;TR=274;WE=113923603;WS=113923585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,308:1.00:308
chr10	113926012	rs10749108	G	A	347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=289;SC=AAAAATTTAGGCAACACCACC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=113926020;WS=113926002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr10	113928487	rs2251579	A	C	523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=3;PP=286;SC=TACCAAACTCAAGCAATAATC;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=14;WE=113928495;WS=113928477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	113935379	rs10787428	T	C	3025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=37;PP=1639;SC=CAGCACATTTTCAGTCACATT;SOR=0.970;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=57;TCR=37;TR=94;WE=113935387;WS=113935369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr10	113937941	rs2487294	G	T	89.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.6;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=3;PP=51;SC=AAAATCTTAGGGAAGAAAAAA;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=113937949;WS=113937931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr10	113940329	rs2792751	T	C	5132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=97;PP=2691;SC=GATCTGAAGATGGTGGGTCTA;SOR=1.029;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=174;TCF=77;TCR=97;TR=174;WE=113940337;WS=113940319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr10	114053546	rs726009	C	G	1741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.354;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=31;PP=928;ReadPosRankSum=0.730;SC=TGGAGGCATCCGAAATCGGTT;SOR=0.675;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=123;TCF=69;TCR=54;TR=73;WE=114053554;WS=114053536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,85:0.60:142
chr10	114053870	rs41298239	C	T	676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=19;PP=451;ReadPosRankSum=-0.185;SC=AGGCATTTATCGGGCTACTTT;SOR=0.570;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=40;TCF=10;TCR=30;TR=26;WE=114053878;WS=114053860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,28:0.62:45
chr10	114059330	rs11279253	TCTCTGTTTTC	T	3575.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.252;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.611;NF=3;NR=44;PP=2979;ReadPosRankSum=1.814;SC=GGAGTAAGCGTCTCTGTTTTC;SOR=0.383;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=97;TCF=7;TCR=90;TR=47;WE=114059347;WS=114059320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,92:0.61:150
chr10	114061979	rs10749114	G	A	2467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=48;PP=1440;SC=CTTTGGCCCCGGCAAAACTTT;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=24;TCR=48;TR=72;WE=114061987;WS=114061969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr10	114136349	rs2277208	G	C	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.638;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=26;ReadPosRankSum=-0.431;SC=ACATCATGCTGTCTCCCTCCT;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=3;WE=114136357;WS=114136339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr10	114154815	rs11195943	C	T	2029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.624;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=44;PP=1164;ReadPosRankSum=-0.601;SC=GACCTCAACCCGTCTTACCTC;SOR=0.606;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=134;TCF=66;TCR=68;TR=85;WE=114154823;WS=114154805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,93:0.62:150
chr10	114169276	rs3736946	A	G	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=166;ReadPosRankSum=1.200;SC=TGATATCGCCATGGTGATCTG;SOR=1.179;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=13;WE=114169284;WS=114169266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr10	114181683	rs2255740	A	G	4399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=66;PP=2652;SC=TTTCTCAGCTAATTCAGCACG;SOR=0.718;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=74;TCR=66;TR=140;WE=114181691;WS=114181673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr10	114185856	rs34341101	T	TG	860.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=1;PP=832;SC=TACAGTTCCATGGTGTTGAAA;SOR=5.136;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=21;WE=114185864;WS=114185846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr10	114186157	rs11195955	C	T	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=306;ReadPosRankSum=-1.375;SC=CACCCATGGGCCCATCGTGGA;SOR=1.101;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=16;WE=114186165;WS=114186147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,18:0.69:26
chr10	114186425	.	CAT	C	922.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.655;ClippingRankSum=0.000;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=6;PP=559;ReadPosRankSum=-1.763;SC=TGTGCTTGTGCATAGTTTTAT;SOR=0.894;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=24;TCF=12;TCR=12;TR=13;WE=114186434;WS=114186415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,24:0.60:40
chr10	114186624	rs2256368	G	A	3495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=56;PP=1891;SC=ACAGGTGTGTGCTACCACTGA;SOR=0.836;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=61;TCR=56;TR=116;WE=114186632;WS=114186614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr10	114192285	rs2306158	G	A	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=11;PP=179;ReadPosRankSum=0.640;SC=CGAACCTGTCGTCAGTGATCA;SOR=0.693;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=67;TCF=31;TCR=36;TR=19;WE=114192293;WS=114192275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,23:0.28:81
chr10	114200355	rs2306159	G	A	1216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.139;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=30;PP=776;ReadPosRankSum=1.001;SC=AGGCAAACAAGGTGGTAGCAA;SOR=0.721;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=209;TCF=109;TCR=100;TR=69;WE=114200363;WS=114200345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,74:0.31:236
chr10	114202219	rs11195961	C	T	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=95;ReadPosRankSum=-0.366;SC=CCATGAGCTACGAGAGAATTA;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=6;WE=114202227;WS=114202209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr10	114224502	rs3740143	C	G	982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=25;PP=678;SC=AATGCACAGTCTTTTGGGCTC;SOR=3.193;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=30;WE=114224510;WS=114224492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr10	114297930	rs34676462	AT	A	75.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=1.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.11;ReadPosRankSum=1.422;SOR=0.453;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,12:0.18:68
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chr10	114889837	rs34096467	TC	T	115.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=74;ReadPosRankSum=-1.192;SC=CTATGCTTTTTCCCCCCCCTT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=114889845;WS=114889827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
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chr10	115312811	rs2240879	T	C	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=11;PP=465;ReadPosRankSum=0.989;SC=CTGACATTTTTCCCCCCTAAA;SOR=0.774;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=56;TCR=28;TR=32;WE=115312819;WS=115312801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,31:0.36:86
chr10	115327071	rs11575667	G	A	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.037;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=82;ReadPosRankSum=0.385;SC=GTGGTGGAGGGGGTGTATCTT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=3;WE=115327092;WS=115327061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr10	115327084	rs11575668	A	G	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=0;PP=82;ReadPosRankSum=1.549;SC=TGTATCTTCAAATAGACCCCA;SOR=0.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=3;WE=115327092;WS=115327061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,3:0.20:15
chr10	115327193	rs2286745	A	G	1252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.889;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=21;PP=651;ReadPosRankSum=0.256;SC=GCTAAGGAGCACGCCCGGCAG;SOR=0.871;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=76;TCF=44;TCR=32;TR=52;WE=115327201;WS=115327183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,59:0.69:85
chr10	115334124	rs3740530	C	T	4026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=60;NR=65;PP=2108;SC=CACTTACCCACGCTGAGAATC;SOR=0.974;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=125;TCF=60;TCR=65;TR=125;WE=115334132;WS=115334114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr10	115335843	rs911709	A	G	1955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=40;PP=1242;SC=AGCACTGCGCAATGCCATGGA;SOR=1.678;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=20;TCR=40;TR=60;WE=115335851;WS=115335833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr10	115338615	rs11575684	A	G	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=218;ReadPosRankSum=0.403;SC=AAAACAGATCATTGAAATTCA;SOR=0.533;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=13;TCR=42;TR=16;WE=115338623;WS=115338605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,16:0.29:55
chr10	115340492	rs2286742	G	A	1969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=49;PP=1426;ReadPosRankSum=1.689;SC=GGGTGGGGGGGATGGAGATTT;SOR=1.233;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=66;TCF=16;TCR=50;TR=65;WE=115340500;WS=115340482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,68:0.99:69
chr10	115341545	rs2181082	G	C	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=80;ReadPosRankSum=0.633;SC=CTGCTCAGCTGTTGGGCTCAG;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=7;WE=115341553;WS=115341535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,8:0.24:33
chr10	115341753	rs2245056	G	A	2629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.720;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=62;PP=1625;ReadPosRankSum=1.021;SC=GAGGCTTTAAGAGCACGGCGG;SOR=0.827;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=192;TCF=88;TCR=104;TR=114;WE=115341761;WS=115341743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,123:0.59:208
chr10	115341846	rs2245058	G	A	786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=21;PP=425;ReadPosRankSum=0.987;SC=GTGGTGGGGCGCTGATCCACC;SOR=0.641;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=54;TCF=18;TCR=36;TR=33;WE=115341854;WS=115341836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,37:0.59:63
chr10	115343803	rs911703	C	T	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=54;ReadPosRankSum=-0.745;SC=ATGGTGGGGGCAGGTGGGGCT;SOR=0.770;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=6;WE=115343811;WS=115343793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr10	115343831	rs911701	A	T	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=76;ReadPosRankSum=0.485;SC=GGCCACCTTCATGAGCAAGTT;SOR=0.929;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=32;TCF=23;TCR=9;TR=9;WE=115343839;WS=115343821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,11:0.28:40
chr10	115343852	rs911700	C	G	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=215;ReadPosRankSum=-0.836;SC=GGAGCTGGTGCTTCTCTGACA;SOR=0.770;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=47;TCF=33;TCR=14;TR=17;WE=115343860;WS=115343842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,19:0.33:57
chr10	115349397	rs11196388	AG	A	889.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=3;PP=775;SC=CTTGCAAGCCAGGGGTGGCTT;SOR=3.180;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=21;WE=115349405;WS=115349387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr10	115357078	rs12241995	G	A	1998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=47;PP=1435;SC=CTTCTTGGTAGGTACCTAACA;SOR=2.448;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=15;TCR=47;TR=62;WE=115357086;WS=115357068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr10	115357131	rs113389465	CA	C	657.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=15;PP=616;SC=TGATATGGAACATTTTACAGG;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=115357139;WS=115357121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	115370254	rs12243176	A	G	7886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=91;NR=78;PP=2965;SC=TCCTCCCTTCAATCTCTAACG;SOR=0.815;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=170;TCF=92;TCR=78;TR=169;WE=115370262;WS=115370244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr10	115370274	rs10749138	T	C	7915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=86;PP=2753;SC=GTGCCTGGAATGACACATGCA;SOR=0.769;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=171;TCF=85;TCR=86;TR=171;WE=115370282;WS=115370264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr10	115371873	rs1539588	G	T	133.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=5;NR=1;PP=117;SC=TTCAAAATAAGACTTGGGTTT;SOR=3.611;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=115371881;WS=115371868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr10	115373851	rs2419850	T	C	306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=10;NR=0;PP=240;SC=CCAATACCCATGTCCAGAAGG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=10;WE=115373859;WS=115373841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	115375528	rs11196397	C	A	2319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=28;PP=1291;ReadPosRankSum=-1.003;SC=GGTCAGCAGTCGGTGTGTAAT;SOR=0.421;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=80;TCF=52;TCR=28;TR=79;WE=115375536;WS=115375518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,91:0.99:92
chr10	115393929	rs3189030	G	A	3466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=37;PP=1921;SC=GTCAGTCACCGAGCTGTACTT;SOR=1.161;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=65;TCR=37;TR=102;WE=115393937;WS=115393919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr10	115400958	rs1539592	C	T	545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=17;NR=2;PP=368;SC=TCTTACCTAGCCTTGGTTGTA;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=115400980;WS=115400948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	115400972	rs1539593	G	A	812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=24;NR=5;PP=627;SC=GGTTGTATCCGCTAACATTTA;SOR=2.910;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=29;WE=115400980;WS=115400948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr10	115401031	rs5788038	AT	A	2525.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.34;NF=21;NR=33;PP=1059;SC=TAGAAGACAGATTTTTTTTTA;SOR=1.289;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=63;TCF=28;TCR=35;TR=54;WE=115401039;WS=115401021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr10	115401081	rs3127105	T	C	3951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=76;NR=58;PP=2099;SC=CTTCATGCCCTGCCCCACTCC;SOR=0.838;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=76;TCR=58;TR=134;WE=115401089;WS=115401071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr10	115401264	rs3121465	A	G	2124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=49;PP=1341;SC=CAACCAAAGCATTCCCTTCAC;SOR=1.497;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=27;TCR=49;TR=76;WE=115401272;WS=115401254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr10	115405615	rs3127106	T	C	1715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.51;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr10	115405664	rs3121478	C	T	1469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.25;SOR=1.781;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr10	115405703	rs35741231	G	GAA,GA	577.50	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=0.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5008,0.4992;FS=5.229;HP=10;HapScore=3;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.532;NF=1,1;NR=15,15;PP=182,11;ReadPosRankSum=-1.517;SC=TATTTTATCTGAAAAAAAAAA;SOR=3.352;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=16,16;WE=115405711;WS=115405693;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.92:25
chr10	115405791	rs3121479	A	T	493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=5;NR=14;PP=468;SC=CTTAATGTCAACATTTACTTA;SOR=2.419;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=19;WE=115405799;WS=115405781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr10	115406485	rs3121483	C	T	180.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=101;SC=GCTATGCTGGCTGTCCGTGTC;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=115406493;WS=115406479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr10	115410234	rs2185913	T	C	3507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=75;NR=37;PP=2192;SC=GGCTATCTGATAGGCGGGTGT;SOR=1.311;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=75;TCR=37;TR=112;WE=115410242;WS=115410224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr10	115411614	rs2154028	A	G	2967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=43;PP=1585;SC=AGGAGTATCCACCACCGTGGA;SOR=0.747;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=98;TCF=55;TCR=43;TR=98;WE=115411622;WS=115411604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr10	115412686	rs3121488	G	A	1516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=19;PP=873;SC=AAGCACCCAGGCACTCACTTG;SOR=1.238;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=31;TCR=19;TR=50;WE=115412694;WS=115412676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr10	115417289	rs1891762	G	A	5920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=102;PP=2965;SC=TCATGTCCCAGTGAAAAACTG;SOR=0.865;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=201;TCF=99;TCR=102;TR=201;WE=115417297;WS=115417279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr10	115423094	rs12770981	G	C	7707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=141;NR=111;PP=2965;SC=GTAGTGGTGGGGGCATCAAAC;SOR=0.871;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=253;TCF=142;TCR=111;TR=252;WE=115423102;WS=115423079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,290:1.00:290
chr10	115439530	rs28411397	G	C	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=34;ReadPosRankSum=-0.126;SC=GCGGGGACACGGGTCGCTTTG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=3;WE=115439538;WS=115439520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr10	115439569	rs7921977	C	T	798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=9;PP=549;SC=GAGCGCACTACCCCGAGCCAG;SOR=1.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=30;WE=115439577;WS=115439559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr10	115451781	rs12358524	C	T	599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=2.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.00;ReadPosRankSum=1.104;SOR=0.460;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,32:0.53:60
chr10	115457114	rs78849490	G	A	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=4.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.393;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=300;ReadPosRankSum=1.451;SC=TTAATGGGGCGGTAACCCTGA;SOR=2.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=14;WE=115457122;WS=115457104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr10	115457450	rs77120019	G	A	30.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr10	115481018	rs3814231	C	T	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.775;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=203;ReadPosRankSum=-0.236;SC=CTGCACCTACCTACTGTGGCA;SOR=0.336;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=14;WE=115481026;WS=115481008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,14:0.40:35
chr10	115489152	rs2227310	C	G	2172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.454;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=21;PP=601;ReadPosRankSum=0.598;SC=ACGGAAAAGACCTGGAAATCA;SOR=0.944;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=169;TCF=99;TCR=70;TR=56;WE=115489160;WS=115489142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,65:0.33:196
chr10	115489167	rs2227309	G	A	2182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-2.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=26;PP=658;ReadPosRankSum=0.316;SC=AAATCATGCAGATCCTCACCA;SOR=0.676;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=174;TCF=99;TCR=75;TR=59;WE=115489175;WS=115489157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,68:0.33:203
chr10	115515120	rs3981351	G	A	1316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.879;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=33;PP=779;ReadPosRankSum=0.037;SC=AATGCCCCACGGTTTCCTTCA;SOR=0.996;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=82;TCF=32;TCR=50;TR=52;WE=115515128;WS=115515110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,59:0.66:90
chr10	115525175	rs4631835	T	C	4956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=93;NR=63;PP=2356;SC=TCTGAATCTCTGATGTATTTT;SOR=0.805;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=156;TCF=93;TCR=63;TR=156;WE=115525183;WS=115525165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr10	115533975	rs3750903	T	C	1566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=12;PP=1119;SC=ATCTATTCCTTTTATCTGCAG;SOR=2.215;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=38;TCR=12;TR=50;WE=115533983;WS=115533965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr10	115534200	rs3750902	G	T	1197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=30;PP=812;SC=AACATTACCAGAGACCAGTTT;SOR=3.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=37;WE=115534208;WS=115534190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr10	115535426	rs7899829	G	A	579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=1;PP=446;SC=CCTGGACAATGTCATCTCAGA;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=115535434;WS=115535416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr10	115537960	rs2900990	C	T	3328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=71;PP=2110;SC=AAGTGAGAGGCTGGTTTTCAA;SOR=1.441;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=113;TCF=42;TCR=71;TR=113;WE=115537968;WS=115537950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr10	115540311	rs11196482	T	G	1467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=11;PP=1101;SC=GAAGCAACAATCTTAAAGATA;SOR=2.494;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=52;TCF=40;TCR=12;TR=51;WE=115540319;WS=115540301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr10	115540411	rs11196483	T	C	5656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=98;NR=93;PP=2748;SC=CATTCCATGCTGCATCCTGTA;SOR=0.748;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=191;TCF=98;TCR=93;TR=191;WE=115540419;WS=115540401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr10	115609915	rs3750898	C	G	1063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=25;PP=737;ReadPosRankSum=0.284;SC=TGTGAATCATCCGGTTTTTCA;SOR=0.725;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=186;TCF=101;TCR=85;TR=55;WE=115609923;WS=115609905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,61:0.28:219
chr10	115618246	rs2301180	T	C	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=81;ReadPosRankSum=0.743;SC=AAATTTTATCTTTCTCTTTAA;SOR=0.368;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=8;WE=115618254;WS=115618236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,10:0.24:41
chr10	115644040	rs7913176	G	A	935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=24;PP=500;ReadPosRankSum=-0.142;SC=GGTGAGCACTGTAGCTGGTAT;SOR=0.718;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=162;TCF=89;TCR=73;TR=52;WE=115644048;WS=115644030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,58:0.31:185
chr10	115674736	rs373697341	A	G	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=182;ReadPosRankSum=1.976;SC=GGCTGCCCCAATCACAGAGCC;SOR=0.688;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=54;TCF=39;TCR=15;TR=15;WE=115674744;WS=115674726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,18:0.31:59
chr10	115675025	rs7895609	G	A	708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.783;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=20;PP=461;ReadPosRankSum=1.566;SC=TTCCCTACCTGTACAAGCAGC;SOR=0.583;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=93;TCF=38;TCR=55;TR=35;WE=115675033;WS=115675015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,37:0.36:103
chr10	115805056	rs1801253	G	C	5949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=94;NR=99;PP=2880;SC=GGCCTTCCAGGGACTGCTCTG;SOR=0.841;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=193;TCF=94;TCR=99;TR=193;WE=115805064;WS=115805046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr10	116058933	rs1889450	G	A	172.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=117;SC=TTGAGAAGGTGTGGTGACAGC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=116058941;WS=116058923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr10	116060194	rs3214266	A	AG	4899.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=57;PP=2936;SC=CCTGCAGGGGAGGCCTGTACC;SOR=0.814;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=79;TCF=22;TCR=57;TR=76;WE=116060202;WS=116060184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr10	116060387	rs2286396	T	C	6328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=110;NR=90;PP=2965;SC=CCAGGTACACTCGGTCAGATT;SOR=0.763;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=200;TCF=110;TCR=90;TR=200;WE=116060395;WS=116060377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr10	116068176	rs581327	A	G	1328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=16;PP=875;SC=TTCCCCTCCCAACCACATGAT;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=34;TCR=16;TR=50;WE=116068184;WS=116068166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr10	116073696	rs3813722	C	T	5856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=116;NR=81;PP=2965;SC=CATTCATCGGCGTGATCTTCA;SOR=1.132;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=199;TCF=118;TCR=81;TR=197;WE=116073704;WS=116073686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr10	116075228	rs694883	A	G	315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=2;PP=236;SC=GAAACCTCTGAGGTCAGGGAC;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=116075236;WS=116075218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr10	116075271	rs377755078	T	TCC	1043.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=10;NR=7;PP=748;SC=CCCTGCCCCTTCCCCAAGGAG;SOR=1.697;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=20;TCF=13;TCR=7;TR=17;WE=116075279;WS=116075261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr10	116079505	rs10885547	G	A	1188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=17;NR=26;PP=720;SC=AGACCCAGATGTGGCAACTCG;SOR=1.329;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=17;TCR=26;TR=43;WE=116079513;WS=116079495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr10	116085639	rs75926928	G	A	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.908;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=138;ReadPosRankSum=1.406;SC=GGGTCCTCTCGCCTCTGTGGC;SOR=1.247;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=10;WE=116085647;WS=116085629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,9:0.26:34
chr10	116085784	rs74928179	C	CCCG	9688.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=31;NR=58;PP=2924;SC=GAGATCTGGCCCAAGGTCAGG;SOR=0.789;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=100;TCF=34;TCR=66;TR=89;WE=116085792;WS=116085774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr10	116091555	rs10787524	T	C	1176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=21;PP=571;SC=CCTGAACTGATGCTTACCATC;SOR=0.976;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=20;TCR=21;TR=41;WE=116091563;WS=116091545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr10	116100320	rs4752395	T	G	1645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=18;PP=1103;SC=AACCATCTCTTTTGGCGTGGA;SOR=1.453;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=35;TCR=18;TR=53;WE=116100328;WS=116100310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr10	116203906	rs72826956	A	C	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=2.886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQRankSum=1.763;QD=8.87;ReadPosRankSum=-0.551;SOR=0.327;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr10	116203974	rs10160093	A	G	137.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5006;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=192;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GTTTCTTTGTAGCAGATCCCA;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=9;WE=116203982;WS=116203964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr10	116205267	rs6585279	C	T	682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=23;PP=492;ReadPosRankSum=3.106;SC=AGGTCAGCAACGGTCTTTAAC;SOR=0.929;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=3;TCR=36;TR=25;WE=116205275;WS=116205257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,27:0.66:41
chr10	116211246	rs2145895	A	G	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.361;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=169;ReadPosRankSum=1.540;SC=ATCTTAGTAGACCAGAAAGGC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=8;WE=116211254;WS=116211236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr10	116222749	rs7920878	G	A	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=6;PP=196;ReadPosRankSum=-0.911;SC=CCTTCCCAGGGTGCTAATAAA;SOR=0.549;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=26;TCF=17;TCR=9;TR=15;WE=116222757;WS=116222739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr10	116225365	rs7899255	G	A	827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.127;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=9;PP=410;ReadPosRankSum=1.485;SC=ATGTTTAGTCGTTGATTTTTC;SOR=1.027;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=46;TCF=31;TCR=15;TR=30;WE=116225373;WS=116225355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,37:0.66:56
chr10	116228048	rs1815248	G	T	771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=3.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.205;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=19;PP=454;ReadPosRankSum=-0.326;SC=TTGTTTGTTTGTTTGAGATGG;SOR=1.552;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=20;WE=116228056;WS=116228038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,28:0.65:43
chr10	116233824	rs11814528	C	T	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=20;PP=498;ReadPosRankSum=1.395;SC=AAAAGAAACACTTATCACCTT;SOR=0.561;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=40;TCF=13;TCR=27;TR=30;WE=116233832;WS=116233814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,30:0.68:44
chr10	116251686	rs12784116	T	A	1496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.830;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=33;PP=818;ReadPosRankSum=2.013;SC=TGTCATGGATTCCAGAATCTT;SOR=1.054;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=92;TCF=46;TCR=46;TR=63;WE=116251694;WS=116251676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,69:0.68:101
chr10	116251753	rs34507585	G	T	766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=17;PP=398;ReadPosRankSum=-0.279;SC=AAAAATAATTGTCTAATTGAC;SOR=0.675;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=41;TCF=17;TCR=24;TR=30;WE=116251761;WS=116251743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,34:0.76:45
chr10	116304958	rs10885579	C	T	490.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=252;ReadPosRankSum=1.343;SC=AAGGGCAGGACATATTTCTCC;SOR=0.307;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=15;WE=116304979;WS=116304948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,15:0.83:18
chr10	116304971	rs2483595	T	C	471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=366;ReadPosRankSum=-0.223;SC=ATTTCTCCCCTGCCCAGTGTT;SOR=0.818;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=116304979;WS=116304948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr10	116307504	rs2247528	A	G	4207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=67;PP=2481;SC=GCGCCTGCCCATTCTTGATAT;SOR=0.732;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=142;TCF=74;TCR=68;TR=141;WE=116307512;WS=116307494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr10	116335246	rs985273	G	A	1146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FS=2.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.30;ReadPosRankSum=-0.546;SOR=0.600;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,62:0.39:157
chr10	116593175	rs11196939	C	T	1561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.805;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=45;PP=1062;ReadPosRankSum=1.798;SC=AGTTCCTGATCCACACCATGT;SOR=0.845;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=187;TCF=81;TCR=106;TR=75;WE=116593183;WS=116593165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,78:0.39:198
chr10	116596071	rs17095662	A	C	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=3.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=332;ReadPosRankSum=0.521;SC=AAATTGAATTATGTGAATAAT;SOR=0.746;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=55;TCF=18;TCR=37;TR=20;WE=116596079;WS=116596061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,22:0.35:63
chr10	116605103	rs2420069	A	G	929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=17;PP=576;ReadPosRankSum=-0.782;SC=CTTTGGACTTAGCAATTCTTC;SOR=0.644;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=59;TCR=39;TR=42;WE=116605111;WS=116605093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,47:0.41:116
chr10	116606173	rs3834423	C	CT	247.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=4.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.607;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=243;ReadPosRankSum=-0.324;SC=CTTTGAAATACGGTTTTAATG;SOR=0.061;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=8;WE=116606181;WS=116606163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr10	116608350	.	CT	C	63.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.108;ClippingRankSum=0.000;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=4.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.66;ReadPosRankSum=2.396;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:82,15:0.15:97
chr10	116615045	rs3180654	T	C	1477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=38;PP=777;ReadPosRankSum=-1.894;SC=CTGCTTTCTTTGAAGGTCATT;SOR=0.663;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=227;TCF=106;TCR=121;TR=72;WE=116615053;WS=116615035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,87:0.34:257
chr10	116621154	rs34064819	C	A	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=0.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.01;ReadPosRankSum=-0.087;SOR=0.846;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,26:0.22:116
chr10	116659253	rs10885629	A	G	635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=15;PP=399;ReadPosRankSum=-1.027;SC=CCTCAGGCAGACGTTGCCTTC;SOR=0.641;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=96;TCF=49;TCR=47;TR=33;WE=116659261;WS=116659243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,36:0.33:108
chr10	116697960	rs17092618	G	C	707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=3.355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.85;ReadPosRankSum=1.887;SOR=0.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:102,44:0.30:146
chr10	116730337	rs6585309	G	A	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=4;PP=49;ReadPosRankSum=0.693;SC=ATGTTAAAGTGAAGGTGAGAC;SOR=0.368;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=17;TCF=6;TCR=11;TR=7;WE=116730345;WS=116730327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr10	116734069	rs6585312	G	C	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.09;ReadPosRankSum=-1.206;SOR=0.651;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,22:0.42:52
chr10	116853177	rs2484265	C	G	44.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=0;PP=27;SC=CCCTCCTCCTCCCGGTCAGGT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=116853185;WS=116853169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr10	116856543	rs1264777	T	C	433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=12;PP=330;SC=TCTTCTGTTTTCATTTGAAAA;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=116856551;WS=116856533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	116931101	rs3086141	C	CTT	2121.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=27;PP=1475;SC=ATGTTTTTCTCTAATAAAATC;SOR=2.030;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=29;WE=116931109;WS=116931091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr10	117075175	rs1953758	G	A	2106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=39;PP=1176;SC=ATGCACCACAGTGAGATGGTT;SOR=1.031;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=31;TCR=39;TR=70;WE=117075183;WS=117075165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr10	117228794	rs10885721	A	G	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=1.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.18;ReadPosRankSum=0.348;SOR=0.844;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,17:0.18:94
chr10	117278891	rs41310290	C	T	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=130;ReadPosRankSum=-1.323;SC=TGATATATGTCCTGTCAATCT;SOR=0.699;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=57;TCF=18;TCR=39;TR=14;WE=117278899;WS=117278881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,14:0.22:63
chr10	117278988	rs6421370	G	C	76.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.43;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr10	117309098	rs1336108	G	A	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=37;ReadPosRankSum=1.834;SC=CAAATATATGGATCTCTATTG;SOR=0.368;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=4;WE=117309106;WS=117309088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr10	117357169	rs11197326	G	A	258.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.43;ReadPosRankSum=-0.579;SOR=0.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
chr10	117357264	rs11197327	G	A	298.18	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.88;ReadPosRankSum=-0.196;SOR=0.346;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,14:0.93:15
chr10	117486763	rs2254619	G	T	2023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.784;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=35;PP=1205;ReadPosRankSum=-0.303;SC=TCCAGCAACTGCTTCGAGAAC;SOR=0.923;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=197;TCF=108;TCR=89;TR=88;WE=117486771;WS=117486753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,99:0.45:222
chr10	117486910	rs2286631	T	G	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.306;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=23;PP=534;ReadPosRankSum=0.926;SC=CTTTGCATATTTATTATATTG;SOR=0.392;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=65;TCF=19;TCR=46;TR=35;WE=117486918;WS=117486900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,38:0.56:68
chr10	117849353	rs2072276	T	C	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=1.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.54;ReadPosRankSum=-3.102;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,16:0.21:78
chr10	117856379	rs66851912	TGCACAC	T	495.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.111;NF=0;NR=24;PP=842;ReadPosRankSum=1.146;SC=TGCCTTTTTCTGCACACGCAC;SOR=1.201;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=24;WE=117856401;WS=117856369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,17:0.71:24
chr10	117856386	rs376047022	GCACACGCA	G	126.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.65;MQRankSum=0.269;QD=5.07;ReadPosRankSum=-1.575;SOR=0.323;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,7:0.28:25
chr10	117884950	rs2245020	G	A	4446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=77;PP=2663;SC=TGCAGACATCGTTGGACACGC;SOR=0.729;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=162;TCF=85;TCR=77;TR=162;WE=117884958;WS=117884940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr10	117986207	rs7094346	G	T	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.204;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=102;ReadPosRankSum=-0.255;SC=ATTTCTATTAGTACTACATTG;SOR=0.643;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=19;TCF=12;TCR=7;TR=10;WE=117986215;WS=117986197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr10	118031376	rs2532691	C	A	3487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=72;NR=44;PP=2011;SC=CCCAAAAAGACACTTCTTCCT;SOR=1.144;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=72;TCR=44;TR=116;WE=118031384;WS=118031366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr10	118031619	rs2577360	G	A	195.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=156;SC=GGAGCTCAGCGTGCAGCGATC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=118031627;WS=118031609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr10	118187399	rs10787669	T	G	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=22.29;ReadPosRankSum=0.084;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr10	118187405	rs10787670	T	C	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.242;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.97;ReadPosRankSum=1.068;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr10	118187528	rs10885929	C	T	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.65;ReadPosRankSum=-0.275;SOR=0.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,35:0.52:67
chr10	118196141	rs11197681	T	G	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=5;PP=510;ReadPosRankSum=-1.079;SC=CAAAATTAAATTCTACTTTAA;SOR=0.473;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=26;WE=118196149;WS=118196131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,25:0.74:34
chr10	118202761	rs7896568	T	C	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.703;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=370;ReadPosRankSum=-0.184;SC=TTGCAAGGTATTGATGTATAT;SOR=0.099;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=22;WE=118202769;WS=118202751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,23:0.68:34
chr10	118204039	rs5788162	AT	A	685.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.016;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=19;PP=281;ReadPosRankSum=-0.603;SC=AGAAGAGTTGATTTTTTTTTA;SOR=0.940;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=41;TCF=1;TCR=40;TR=20;WE=118204047;WS=118204029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,34:0.56:61
chr10	118231360	rs10736251	G	A	5213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.56;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr10	118231363	rs1897519	A	G	5180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.05;SOR=0.782;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr10	118231406	rs10749217	A	C	593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=15;PP=399;ReadPosRankSum=0.916;SC=GCAGAGTGAGAAACTGACGCT;SOR=0.691;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=77;TCF=35;TCR=42;TR=27;WE=118231414;WS=118231396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,31:0.35:88
chr10	118236575	.	CT	C	151.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.054;ClippingRankSum=0.000;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=5.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.60;ReadPosRankSum=0.277;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,18:0.19:95
chr10	118313116	rs2915749	T	C	2831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=32;PP=1928;SC=TATGTAAATATACTTTATGAT;SOR=1.477;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=66;TCR=32;TR=98;WE=118313124;WS=118313106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr10	118313265	rs2915748	T	C	5625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=96;NR=95;PP=2777;SC=CACCTTCCAATGTGCATGTCA;SOR=0.817;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=191;TCF=96;TCR=95;TR=191;WE=118313273;WS=118313255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr10	118351905	rs1867991	A	C	1775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=22;PP=1163;SC=CGAAAACATGAAGCACTTCTG;SOR=1.249;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=59;TCF=37;TCR=22;TR=59;WE=118351913;WS=118351895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr10	118355695	rs2915765	A	T	8296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=149;NR=116;PP=2965;SC=ACAGCAAAAAATGTCCTGAAA;SOR=0.865;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=265;TCF=149;TCR=116;TR=265;WE=118355703;WS=118355685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,313:1.00:313
chr10	118357490	rs2915764	C	T	6387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=117;NR=105;PP=2965;SC=GCTGTGAGCACGCACAACTGT;SOR=0.736;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=222;TCF=117;TCR=105;TR=222;WE=118357498;WS=118357480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr10	118359461	rs17735613	A	G	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.648;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=337;ReadPosRankSum=-0.533;SC=TTCTGAAAATACGGTCCTACT;SOR=1.981;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=14;WE=118359469;WS=118359451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr10	118359548	rs3816355	T	C	1411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.549;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=21;PP=777;ReadPosRankSum=2.143;SC=TCTCCTTATTTGTTTTCCCAG;SOR=0.980;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=93;TCF=55;TCR=38;TR=55;WE=118359556;WS=118359538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,63:0.59:107
chr10	118363642	rs3010501	T	C	3017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=51;PP=1698;SC=ACCAGTACAGTATCTTCAGGT;SOR=1.089;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=44;TCR=51;TR=95;WE=118363650;WS=118363632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr10	118364818	rs2915754	G	T	396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=328;SC=TAATCTAGAAGAGAAAACAGC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=118364826;WS=118364814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	118364842	rs2915753	A	G	672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=4;PP=486;SC=CTGGCATTGTATGGTAATTAG;SOR=2.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=21;WE=118364850;WS=118364832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr10	118380511	rs3010502	A	G	1758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=33;NR=31;PP=908;SC=GCCCCATGTGAGCAGGGGATT;SOR=0.840;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=33;TCR=31;TR=64;WE=118380519;WS=118380501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr10	118383463	rs56189579	A	AG	6375.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=55;PP=2957;SC=CTAGGAAAAGAGTCTGCTACG;SOR=0.882;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=85;TCF=26;TCR=59;TR=80;WE=118383471;WS=118383453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
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chr10	118436068	rs2166634	G	T	1227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.842;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=29;PP=792;ReadPosRankSum=-0.692;SC=ACGATACCCAGGCTTATCTGC;SOR=0.929;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=78;TCF=33;TCR=45;TR=48;WE=118436076;WS=118436058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,51:0.61:84
chr10	118452044	rs2240711	G	T	1439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=34;PP=899;ReadPosRankSum=0.528;SC=GCCTCCTGTGGCTTCACTGAA;SOR=0.648;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=30;TCR=43;TR=58;WE=118452052;WS=118452034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,63:0.80:79
chr10	118452099	rs2240710	C	G	383.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=292;ReadPosRankSum=-0.578;SC=GTTTCAGGGTCCCCCAAACTT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=12;WE=118452107;WS=118452089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
chr10	118458305	rs1017088	C	T	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.551;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=11;PP=191;ReadPosRankSum=1.365;SC=AAACATGTCTCCTGGCTTTGG;SOR=0.247;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=60;TCF=22;TCR=38;TR=21;WE=118458313;WS=118458295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,25:0.37:68
chr10	118460747	rs1008308	C	T	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=83;ReadPosRankSum=2.926;SC=AATGTGGGTGCCCAGAGGCAC;SOR=1.179;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=6;WE=118460755;WS=118460737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr10	118466662	.	GCGCA	G	161.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.219;ClippingRankSum=0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.28;MQRankSum=1.290;QD=11.55;ReadPosRankSum=-0.085;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr10	118501765	rs3095121	A	C	351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.13;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	118620459	rs11197835	A	C	5231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=70;PP=2965;SC=ATATCGCTCTACTGAAGCACA;SOR=0.906;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=163;TCF=93;TCR=70;TR=162;WE=118620467;WS=118620449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr10	118628036	rs1637571	G	A	578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=1;PP=413;SC=GTGTGTGTGCGTGTATGTGTG;SOR=4.514;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=118628044;WS=118628026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr10	118633548	rs1637574	A	G	2279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=17;PP=1470;SC=TGAATTCATTATTTATCCCTT;SOR=2.093;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=48;TCR=17;TR=65;WE=118633556;WS=118633538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr10	118643670	rs2257791	G	A	3433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=43;PP=1952;SC=TAAGCAGGACGTATGTAAGTT;SOR=1.196;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=72;TCR=43;TR=115;WE=118643678;WS=118643660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr10	118646129	rs2531685	G	C	1618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=38;PP=1185;SC=AGAGAAAATAGTTGTCTCTGA;SOR=2.480;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=11;TCR=38;TR=49;WE=118646137;WS=118646119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr10	118667346	rs2531690	A	C	6138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=120;NR=77;PP=2965;SC=TTGTCCACCAAGGCTAATAAT;SOR=1.064;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=197;TCF=120;TCR=77;TR=197;WE=118667354;WS=118667336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr10	118708315	rs10595325	GAGA	G	2192.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=13;PP=1339;SC=CACAATATAGGAGAAGATTTT;SOR=1.656;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=33;TCF=19;TCR=14;TR=29;WE=118708325;WS=118708305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr10	118960774	rs140325655	T	C	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.580;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=71;ReadPosRankSum=1.166;SC=GCTCTTTTTCTGCTGCACGGT;SOR=1.473;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=32;TCF=12;TCR=20;TR=9;WE=118960782;WS=118960764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,9:0.26:34
chr10	119001151	rs2619094	A	C	304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=1;PP=280;SC=TGGGGGGTCCACGGCCGCCTT;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=119001159;WS=119001141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	119013080	rs2256299	T	G	67.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=16.76;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr10	119014023	rs2072362	C	T	1390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=25;PP=743;SC=GTAAGGCCCCCGTGTAGGCAA;SOR=1.136;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=47;TCF=21;TCR=26;TR=46;WE=119014031;WS=119014013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr10	119014931	rs363420	C	T	5810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=67;PP=2324;SC=TGCTGGCACGCGCTTGGGCCA;SOR=1.105;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=121;TCF=54;TCR=67;TR=120;WE=119014939;WS=119014921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr10	119014948	rs363343	C	A	5748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=64;PP=2260;SC=GCCACACCTGCTTTCTGAAGA;SOR=1.196;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=49;TCR=64;TR=113;WE=119014956;WS=119014938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr10	119026186	rs11568725	T	G	1109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.724;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=26;PP=679;ReadPosRankSum=0.862;SC=AGTTATTACTTTTTCTAACAT;SOR=0.411;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=154;TCF=91;TCR=63;TR=56;WE=119026194;WS=119026176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,61:0.35:174
chr10	119026401	rs363266	T	C	946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=21;PP=719;SC=TTTCTGCCTTTGCTGTTACAA;SOR=1.148;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=14;TCR=21;TR=35;WE=119026409;WS=119026391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr10	119026566	rs363227	T	C	1724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=37;PP=849;ReadPosRankSum=-1.673;SC=AGATGGCATTTGACAAGTGGG;SOR=0.664;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=107;TCF=54;TCR=53;TR=75;WE=119026574;WS=119026556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,79:0.71:112
chr10	119027123	rs363228	C	A	154.03	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=19.25;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr10	119027411	rs363271	G	T	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.066;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=220;ReadPosRankSum=-0.460;SC=TCCGTGTAAAGACACCTGCTT;SOR=1.402;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=14;WE=119027419;WS=119027401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,16:0.70:23
chr10	119029744	rs363272	G	A	3083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.276;NF=61;NR=69;PP=1878;ReadPosRankSum=-1.926;SC=ACCTCAATACGTAATGGATAA;SOR=0.683;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=207;TCF=97;TCR=110;TR=130;WE=119029752;WS=119029734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,138:0.62:224
chr10	119036625	rs363279	T	C	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.808;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=79;ReadPosRankSum=-0.234;SC=AACCATCTTATCTTTATGAAA;SOR=0.293;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=8;WE=119036633;WS=119036615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,9:0.29:31
chr10	119042761	rs363293	C	T	4877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=90;NR=72;PP=2605;SC=CATTTGAAAGCTTAAATAGAC;SOR=0.747;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=163;TCF=90;TCR=73;TR=162;WE=119042769;WS=119042751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr10	119078593	rs10082507	T	C	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=100;ReadPosRankSum=-0.056;SC=ATTACTATTATAGCTTTAGTA;SOR=1.071;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=6;WE=119078601;WS=119078583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr10	119133968	rs3814230	G	C	1534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=41;PP=967;ReadPosRankSum=0.622;SC=CTTCAAACTGGGAGCGCACCT;SOR=0.700;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=274;TCF=148;TCR=126;TR=90;WE=119133976;WS=119133958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:202,93:0.32:295
chr10	119134058	rs3814229	T	C	1890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.719;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=40;PP=1123;ReadPosRankSum=0.607;SC=AGCGCAGCCTTCCCACCACGC;SOR=0.733;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=247;TCF=130;TCR=117;TR=91;WE=119134066;WS=119134048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,103:0.37:275
chr10	119307524	rs2240776	T	A	653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=2;PP=522;SC=AGGCACTTGATAGAAGGGTGC;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=119307532;WS=119307514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr10	119768551	rs7923321	C	T	5705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=105;NR=74;PP=2965;SC=ATGGTTCATACGGCACTCTGA;SOR=0.928;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=181;TCF=106;TCR=75;TR=179;WE=119768559;WS=119768541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr10	119768838	rs143170621	A	C	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.195;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=126;ReadPosRankSum=-1.050;SC=ACCCTGATGAAGTTTTTCGCT;SOR=0.593;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=9;WE=119768846;WS=119768828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr10	119774577	rs141500760	G	A	3222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.098;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=63;PP=1782;ReadPosRankSum=0.601;SC=GCAACTTACCGGGATTTTCCT;SOR=0.423;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=165;TCF=80;TCR=85;TR=127;WE=119774585;WS=119774567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,147:0.77:191
chr10	119793629	rs2928118	C	T	631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=12;PP=305;SC=ACGCTACCACCGTACACAATT;SOR=2.030;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=17;WE=119793637;WS=119793619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	120070427	rs4751651	G	T	566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.18;ReadPosRankSum=-1.242;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,32:0.74:43
chr10	120070709	rs3213691	G	A	141.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=4;NR=1;PP=112;SC=AAAATCTTAAGTAAACTCACC;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=120070717;WS=120070699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr10	120070843	rs34120011	G	GA	1229.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=3;NR=20;PP=284;SC=TTACAAAGGAGAAAAAAAAAG;SOR=1.055;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=23;WE=120070851;WS=120070833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr10	120081948	rs853911	C	T	3836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=76;PP=2268;SC=TAACCTAAAACTAATCATGAG;SOR=1.431;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=48;TCR=76;TR=124;WE=120081956;WS=120081938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr10	120353910	rs1613448	T	C	3728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=51;PP=2179;SC=ACCACCACGATCACCACCAGC;SOR=0.738;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=117;TCF=65;TCR=52;TR=115;WE=120353918;WS=120353900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr10	120354818	rs3740551	C	T	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.997;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=237;ReadPosRankSum=-1.444;SC=ATCCGACCTCCTACACCAGCC;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=13;WE=120354826;WS=120354808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr10	120445794	rs752483	G	A	1047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=29;PP=689;ReadPosRankSum=1.556;SC=CCCAAAAAAGGCTTAAAAAAA;SOR=0.663;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=52;TCF=13;TCR=39;TR=39;WE=120445802;WS=120445776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,41:0.75:55
chr10	120460715	rs2274314	G	T	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.67;ReadPosRankSum=1.126;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr10	120796572	rs11336519	TC	T	315.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=5.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.73;ReadPosRankSum=-1.930;SOR=1.727;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr10	120796583	rs200178082	C	A	527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=5.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.99;ReadPosRankSum=-0.281;SOR=1.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,21:0.64:33
chr10	120803746	rs3740553	T	C	1041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=23;PP=714;SC=TTTGTACTTATAACAATATGA;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=29;WE=120803754;WS=120803736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr10	120817450	rs10886375	A	G	3198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=33;PP=2093;SC=ATTTTTTAATAACTAAGATGC;SOR=1.609;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=104;TCF=71;TCR=33;TR=104;WE=120817458;WS=120817440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr10	120818609	rs6585524	C	T	623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=6;PP=436;SC=CTATAGGAAACATATCATAAA;SOR=2.030;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=23;WE=120818617;WS=120818599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	120819453	rs10787901	A	G	331.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.47;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	120819458	rs10787902	T	C	331.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.47;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	120820224	rs3740555	C	A	1087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=24;NR=12;PP=669;SC=GAGCACATAACATCACAAAAC;SOR=1.670;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=24;TCR=12;TR=36;WE=120820232;WS=120820214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr10	120828969	rs7908387	A	G	1438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=13;PP=671;SC=TTTGCATCTCATCTTGTGTGA;SOR=1.453;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=33;TCR=13;TR=46;WE=120828977;WS=120828959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr10	120832872	rs1397616	T	C	202.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=158;SC=AAACATCTACTTCAAAAGGAA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=120832880;WS=120832862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	120864868	rs1511033	T	C	214.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=7;NR=1;PP=153;SC=AGCGCAATCATCGCTCTCTGC;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=120864876;WS=120864858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	120883117	.	CTTT	C	104.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.231;ClippingRankSum=-0.000;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=5.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.55;ReadPosRankSum=0.941;SOR=0.074;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr10	120896027	rs11198799	G	A	3635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.6;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=70;PP=2241;SC=ACCTAGCACCGTTTTCAGAAG;SOR=0.883;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=129;TCF=59;TCR=70;TR=129;WE=120896035;WS=120896017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr10	120905940	rs138059828	CGTGT	C	326.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=7.496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.14;MQRankSum=-0.629;QD=8.60;ReadPosRankSum=0.258;SOR=0.089;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,15:0.39:38
chr10	120905972	rs7075068	T	C,TGTGC	1345.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=61.34;QD=37.38;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,15,21:0.42,0.58:36
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chr10	120914692	rs17668734	G	A	3506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=75;PP=1950;ReadPosRankSum=0.010;SC=GGCTTGCACTGTAGATGTAAA;SOR=0.675;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=207;TCF=92;TCR=115;TR=134;WE=120914700;WS=120914682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,158:0.66:238
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chr10	120917269	rs2420494	A	T	2085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=21;PP=1380;SC=AAAGTACTTAATTAGCAAATA;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=45;TCR=21;TR=65;WE=120917277;WS=120917259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr10	120917445	rs2275111	G	A	1506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=352;ExcessHet=3.0103;FS=2.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.28;ReadPosRankSum=1.173;SOR=0.787;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:258,94:0.27:352
chr10	120917616	rs2275112	G	A	2949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=66;PP=1819;ReadPosRankSum=-0.441;SC=GTGTTGCTGTGGAAGGAGAAC;SOR=0.711;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=171;TCF=67;TCR=104;TR=109;WE=120917624;WS=120917606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,127:0.64:199
chr10	120919179	rs3740558	G	A	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=9;PP=271;ReadPosRankSum=-0.943;SC=CTGAGGTTAGGAGGAGAGTGG;SOR=0.663;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=52;TCR=29;TR=24;WE=120919187;WS=120919169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,25:0.28:88
chr10	120919246	rs2181118	T	C	3769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=67;NR=62;PP=2025;SC=TCACCGTGGGTGCCATGAAAG;SOR=0.749;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=129;TCF=67;TCR=62;TR=129;WE=120919254;WS=120919236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr10	120920588	rs10749291	T	C	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=1.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.85;ReadPosRankSum=-0.879;SOR=0.915;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,33:0.25:134
chr10	120922017	rs12413842	T	C	3249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=74;PP=1808;ReadPosRankSum=0.002;SC=CTCACCAGCATGCACTGGACT;SOR=0.667;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=196;TCF=89;TCR=107;TR=135;WE=120922025;WS=120922007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,149:0.68:219
chr10	120922075	rs35233430	T	C	1823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=4.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.048;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=46;PP=1321;ReadPosRankSum=0.087;SC=AGGCTCTCTATCCATTAGGAT;SOR=1.118;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=96;TCF=31;TCR=65;TR=66;WE=120922083;WS=120922065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,70:0.68:103
chr10	120924874	rs933092	G	C	4133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=72;NR=65;PP=2387;SC=TGCGTCCCCTGCCGCGCCCTA;SOR=0.760;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=138;TCF=72;TCR=66;TR=137;WE=120924882;WS=120924864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr10	120933324	rs3758609	G	A	989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=25;NR=5;PP=609;SC=CACAGTTCACGTCGTGAAATT;SOR=2.115;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=30;WE=120933332;WS=120933314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr10	121093160	rs10886461	A	C	928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=19;NR=15;PP=581;SC=CAGGGAGACTACTTAGGTGCT;SOR=0.804;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=19;TCR=15;TR=34;WE=121093168;WS=121093150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr10	121140511	rs4751714	A	G	2490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=34;PP=1020;SC=CAAAGGAAAAAATAGATCTCA;SOR=1.341;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=21;TCR=34;TR=55;WE=121140519;WS=121140501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr10	121140534	rs2275037	C	G	1945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=25;PP=686;SC=GGTTAGAAGACTGAGGAATAA;SOR=1.880;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=11;TCR=25;TR=36;WE=121140542;WS=121140524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr10	121190040	rs10787967	C	G	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=74;ReadPosRankSum=0.844;SC=GGTTGGCCCACGGGTCCCCCG;SOR=1.222;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=41;TCF=15;TCR=26;TR=10;WE=121190048;WS=121190030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,12:0.27:44
chr10	121190113	rs915120	T	C	253.22	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.9988;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=157;ReadPosRankSum=1.769;SC=TCAGTGGCCTTGGGGCTATCA;SOR=2.147;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=10;WE=121190121;WS=121190103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr10	121196062	rs2275040	C	T	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=23;ReadPosRankSum=-1.180;SC=GGTGAGGCTCCTCTGTTCCCT;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=3;WE=121196070;WS=121196052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr10	121199189	rs2245364	T	C	5015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=97;NR=64;PP=2965;SC=GATGCCAGTGTATCCTACCTG;SOR=1.100;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=161;TCF=97;TCR=64;TR=161;WE=121199197;WS=121199179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr10	121199310	rs1109490	T	C	1525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.473;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=47;PP=844;ReadPosRankSum=1.372;SC=GTAGCTGAGGTGAGCATTGCA;SOR=0.745;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=243;TCF=112;TCR=131;TR=83;WE=121199318;WS=121199300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:177,90:0.34:267
chr10	121199365	rs1109489	T	C	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.686;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=28;PP=418;ReadPosRankSum=0.807;SC=CAGAGAGGGCTGGGGAAGCTG;SOR=1.091;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=128;TCF=45;TCR=83;TR=38;WE=121199373;WS=121199355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,40:0.29:138
chr10	121199437	rs915116	T	C	462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=16;PP=351;SC=AAGCTGTGAGTGTGAACAGAG;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=121199445;WS=121199427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	121201626	rs2275044	T	C	2415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=48;PP=1311;ReadPosRankSum=2.799;SC=CCTGTGTCAATGCACCTTGAG;SOR=1.203;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=85;TCF=37;TCR=48;TR=84;WE=121201634;WS=121201616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,94:0.98:96
chr10	121287019	rs3009921	G	A	977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=25;PP=668;SC=CAGCACTGCCGTCACCATCAC;SOR=1.802;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=12;TCR=25;TR=37;WE=121287027;WS=121287009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr10	121302244	rs77190301	G	A	317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.44;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	121338401	rs4752334	T	A	3256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=63;PP=1924;SC=AATAAGACTCTGTAAGATGAA;SOR=1.781;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=33;TCR=63;TR=96;WE=121338409;WS=121338391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr10	121435955	rs196294	A	C	1546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=23;PP=1090;ReadPosRankSum=-0.335;SC=TTAAAAATATATTTTTGTGTC;SOR=0.712;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=102;TCF=68;TCR=34;TR=65;WE=121435963;WS=121435945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,67:0.59:113
chr10	121436362	rs196295	A	G	2119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.324;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=32;PP=1200;ReadPosRankSum=1.183;SC=TGGAGAAGGTACAGGGGCTGG;SOR=0.757;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=119;TCF=68;TCR=51;TR=79;WE=121436370;WS=121436352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,92:0.68:136
chr10	121551581	rs2289306	A	C	3086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=62;PP=1861;ReadPosRankSum=0.446;SC=CAGGGTTTGCACTTGGGAAGA;SOR=0.678;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=184;TCF=85;TCR=99;TR=117;WE=121551589;WS=121551571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,135:0.65:209
chr10	121557940	rs35547475	CTT	C	493.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.096;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=355;ReadPosRankSum=-0.395;SC=TTTAGACAATCTTAGTTCATT;SOR=2.049;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=10;WE=121557949;WS=121557930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr10	121564859	rs2273748	A	G	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=1.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=1;PP=31;ReadPosRankSum=-0.126;SC=CTATGATTAAATTAAAGATTT;SOR=0.859;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=4;WE=121564867;WS=121564849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr10	121565015	rs2273749	C	G	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.79;ReadPosRankSum=0.374;SOR=0.789;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,23:0.26:88
chr10	121571507	rs3781503	T	C	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=280;ReadPosRankSum=-0.405;SC=CTTGCTTAACTGATGTTGGGA;SOR=1.109;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=18;WE=121571515;WS=121571497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,22:0.71:31
chr10	121579226	rs117995151	T	C	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=4.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=151;ReadPosRankSum=0.731;SC=TCATTTGCTGTATTTTTTGAT;SOR=0.465;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=8;WE=121579234;WS=121579216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr10	121582556	rs2289307	T	C	2792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.621;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=39;PP=1773;ReadPosRankSum=1.433;SC=AACATTTAACTTTATACGTAT;SOR=0.771;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=153;TCF=95;TCR=58;TR=104;WE=121582564;WS=121582546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,121:0.70:174
chr10	121586882	rs3188055	A	G	5195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=342;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.095;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=114;NR=92;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.199;SC=TCAAGTTTCAAATGAAACCCA;SOR=0.720;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=305;TCF=162;TCR=143;TR=206;WE=121586890;WS=121586872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,223:0.65:342
chr10	121598173	rs12772291	A	G	888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.144;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=19;PP=601;ReadPosRankSum=1.624;SC=ATGAATTTCAAATGGTTCATG;SOR=0.518;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=22;TCR=27;TR=35;WE=121598181;WS=121598163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,37:0.70:53
chr10	121663483	rs2475304	C	T	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=41;ReadPosRankSum=0.470;SC=CCACCTCTCTCGGCCTCCCAG;SOR=0.434;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=7;WE=121663491;WS=121663473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,8:0.26:31
chr10	121678896	rs2475300	C	G	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=1.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.953;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=115;ReadPosRankSum=-0.754;SC=CGTAGATCAGCAGTCATTATA;SOR=1.222;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=9;WE=121678904;WS=121678886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,13:0.35:37
chr10	121679013	rs2475298	A	G	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FS=2.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.34;ReadPosRankSum=0.787;SOR=0.755;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:155,45:0.22:200
chr10	121685448	rs6585564	A	T	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=62;ReadPosRankSum=-1.585;SC=CCTAAGAAGTAGCTAATCATT;SOR=0.193;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=5;WE=121685456;WS=121685438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr10	121717932	rs11199132	G	A	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.23;MQRankSum=1.109;QD=8.76;ReadPosRankSum=-0.629;SOR=0.639;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,22:0.47:47
chr10	121717956	rs34665773	GT	G	930.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.779;HP=11;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.611;NF=8;NR=20;PP=406;ReadPosRankSum=1.836;SC=GCAAGTGATGGTTTTTTTTTT;SOR=0.365;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=11;TCR=28;TR=28;WE=121717964;WS=121717946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,44:0.86:51
chr10	121718112	rs11199134	C	T	3216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=57;NR=50;PP=1730;SC=GCAGAAGTCACGAGCAGGGTG;SOR=0.742;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=107;TCF=57;TCR=50;TR=107;WE=121718120;WS=121718102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr10	122216790	rs10886691	A	T	2117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=22;PP=1282;SC=GCACCAGCTGACGCCGCGGGA;SOR=1.409;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=72;TCF=49;TCR=23;TR=71;WE=122216798;WS=122216780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr10	122263201	rs713088	C	A	825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=22;PP=562;ReadPosRankSum=-1.224;SC=GACAGCAGGGCCTGTCTCTTT;SOR=0.713;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=106;TCF=50;TCR=56;TR=40;WE=122263209;WS=122263191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,42:0.37:114
chr10	122263555	rs2478418	A	T	716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=20;PP=533;SC=AAAGAGAAGGAGAGCAGCCCA;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=122263563;WS=122263545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	122273276	rs5788426	CT	C	461.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=246;SC=ATACATCATCCTTTTTTTTTT;SOR=4.712;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=15;WE=122273284;WS=122273266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,20:0.95:21
chr10	122334561	rs4751791	C	T	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=920;ReadPosRankSum=-0.453;SC=GTGTGCAAGACGGCAGACGGA;SOR=0.941;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=24;TCR=11;TR=26;WE=122334570;WS=122334551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,28:0.72:39
chr10	122334562	rs77673052	G	A	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=326;ReadPosRankSum=0.183;SC=TGTGCAAGACGGCAGACGGAA;SOR=0.551;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=37;TCF=26;TCR=11;TR=10;WE=122334570;WS=122334551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,12:0.29:41
chr10	122348682	rs76105841	T	C	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=225;ReadPosRankSum=-0.043;SC=GTTTCTTTCCTTTAGTCTTTC;SOR=0.299;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=11;WE=122348690;WS=122348672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr10	122618148	rs2241846	G	C	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=1.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.10;ReadPosRankSum=-0.823;SOR=0.955;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,28:0.23:123
chr10	122619466	rs10563638	TACAC	T,TAC	752.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.43;QD=32.73;SOR=3.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,6,17:0.26,0.74:23
chr10	122622121	rs3816173	A	C	236.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=192;SC=TATGTTATGAATGCATAACAT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=122622129;WS=122622116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	122624679	rs10886789	G	A	776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FS=1.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.34;ReadPosRankSum=0.562;SOR=0.575;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:130,49:0.27:179
chr10	122626038	rs2289335	C	T	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.855;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=9;PP=322;ReadPosRankSum=-0.891;SC=GTAGTGGTATCGATATGGCTG;SOR=0.520;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=61;TCR=27;TR=29;WE=122626046;WS=122626028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,34:0.35:98
chr10	122630587	rs4281410	A	G	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=312;ReadPosRankSum=-0.752;SC=TTATACTTTTAGACCTGAAGA;SOR=0.407;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=15;WE=122630595;WS=122630577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,18:0.72:25
chr10	122637996	rs7923412	G	A	1199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.926;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=29;PP=630;ReadPosRankSum=-0.216;SC=ATCCAAATAGGTTTGTCATAT;SOR=0.552;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=74;TCF=31;TCR=43;TR=51;WE=122638004;WS=122637986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,57:0.70:82
chr10	122638073	rs1992274	T	A	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.41;ReadPosRankSum=0.499;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,3:0.21:14
chr10	122640243	rs4751805	T	A	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.838;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.932;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=50;ReadPosRankSum=-0.057;SC=GAGGGTAGGATGGGTAGGACT;SOR=1.828;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=4;WE=122640251;WS=122640233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr10	122643597	rs4752469	C	A	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.082;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=285;ReadPosRankSum=2.436;SC=CATATTAGTGCAATTCCAATT;SOR=0.914;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=50;TCF=34;TCR=16;TR=20;WE=122643605;WS=122643587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,21:0.37:57
chr10	122643699	rs4752470	G	C	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.546;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=18;PP=433;ReadPosRankSum=-1.082;SC=AGTCATCCTTGAATAAAGAGG;SOR=0.726;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=120;TCF=67;TCR=53;TR=34;WE=122643707;WS=122643689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,36:0.25:143
chr10	122645376	rs7899928	A	T	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.834;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=14;PP=245;ReadPosRankSum=-0.831;SC=AGCAACTTGCAACTCGAGAGG;SOR=0.829;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=88;TCF=42;TCR=46;TR=26;WE=122645384;WS=122645366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,29:0.30:98
chr10	122645524	rs114590334	G	A	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=134;ReadPosRankSum=0.305;SC=AAGTATCATCGGAAGGTGTCT;SOR=1.179;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=9;WE=122645532;WS=122645514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr10	122646113	.	C	T	124	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=8;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=124;QD=52.9237375157;SC=CCTCTTAATGCGTCTGTACTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=3;WE=122646134;WS=122646103;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:12,3:0.20:15
chr10	122646126	rs7079781	G	A	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=124;ReadPosRankSum=-0.372;SC=CTGTACTTTGGGCAAGTTAAT;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=5;WE=122646134;WS=122646103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,5:0.24:21
chr10	122646160	rs11395714	G	GA	166.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.25;MQRankSum=1.706;QD=3.88;ReadPosRankSum=-0.295;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,13:0.30:43
chr10	122646379	rs7079830	A	G	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.124;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=15;PP=227;ReadPosRankSum=1.513;SC=ATCTTCATCAAGAAGATTTTG;SOR=0.371;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=89;TCF=30;TCR=59;TR=25;WE=122646387;WS=122646369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,30:0.31:98
chr10	122648750	rs141904743	T	TTTTTGTTTTG	263.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=9.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.23;MQRankSum=1.455;QD=10.14;ReadPosRankSum=-1.258;SOR=0.042;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr10	122659490	rs2289336	C	T	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.961;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=351;ReadPosRankSum=-0.508;SC=TGAAGCTTCACTGTAGTATAA;SOR=0.939;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=85;TCF=59;TCR=26;TR=27;WE=122659498;WS=122659480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,28:0.30:92
chr10	122660701	rs11199635	C	T	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.185;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=41;ReadPosRankSum=-0.577;SC=AAATAAGTTACGTTTTAGAAA;SOR=1.609;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=5;WE=122660709;WS=122660691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr10	122663585	rs1652727	G	A	2511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=50;NR=35;PP=1385;SC=GGGTTAATCTGCAGGAAGTGA;SOR=0.870;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=50;TCR=35;TR=85;WE=122663593;WS=122663575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr10	122664388	rs10886798	C	T	1227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.001;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=31;PP=631;ReadPosRankSum=0.334;SC=AGCAAAGTATCTGATTAGTAG;SOR=0.518;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=154;TCF=61;TCR=93;TR=57;WE=122664396;WS=122664378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,67:0.39:172
chr10	122664694	rs10788127	G	A	75.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=83;SC=TTATGTTTCAGAATTTAAATC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=122664702;WS=122664684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr10	122664967	rs1866516	C	T	2272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=36;PP=1233;SC=CCTCAACATTCGGGATAGAAA;SOR=0.765;Source=Platypus;TCF=39;TR=75;WE=122664975;WS=122664957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr10	122665285	rs1652726	A	C	890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=5;PP=595;SC=CAAGCAGAGCATAGCCTGTAT;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=27;WE=122665293;WS=122665275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr10	122665310	rs3740306	T	A	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.38;ReadPosRankSum=1.234;SOR=0.586;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,14:0.25:55
chr10	122665459	rs3740307	C	G	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.28;ReadPosRankSum=1.793;SOR=0.602;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,22:0.25:89
chr10	123239112	rs1047057	G	A	4009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=70;PP=2238;SC=TCCACAGCCAGTACGCACGGC;SOR=1.012;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=60;TCR=70;TR=130;WE=123239120;WS=123239102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr10	123243197	rs2278202	G	A	1865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=16;PP=826;SC=GGGGCTTCTAGAAGGAAGTTC;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=40;TCR=16;TR=56;WE=123243205;WS=123243187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr10	123246732	rs148450955	TTTCTAAGGCCAGCTCCTGCACC	T	593.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=4;NR=1;PP=2444;SC=AAATCTGTCCTTTCTAAGGCC;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=5;WE=123246761;WS=123246722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	123247037	rs2981461	C	T	1405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.35;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr10	123247044	rs2981460	T	C	1305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.63;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr10	123277742	rs2420942	C	T	224.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=153;SC=AAGGATCAACCATGCAACCAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=123277750;WS=123277732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	123279745	rs2981448	C	T	239.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=5;PP=110;SC=AATAAATAAGCTGTGTTGTCC;SOR=2.093;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=123279753;WS=123279735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
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chr10	123549691	rs35350755	T	G	1339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.026;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=17;PP=798;ReadPosRankSum=-0.107;SC=TACCTGCTTCTGGGTCCTGGT;SOR=0.194;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=66;TCF=47;TCR=19;TR=54;WE=123549699;WS=123549681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,60:0.83:72
chr10	123596254	rs4237536	T	C	1073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=9;PP=659;SC=TCTTGGGACATGAATGAATGT;SOR=1.730;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=36;WE=123596262;WS=123596244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr10	123600590	rs10886994	A	G	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.851;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=108;ReadPosRankSum=-0.131;SC=GCAAAAAGCAATCTTACCGTA;SOR=0.283;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=56;TCF=41;TCR=15;TR=14;WE=123600598;WS=123600580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,16:0.27:59
chr10	123658595	rs3750837	C	T	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.057;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=16.68;ReadPosRankSum=0.520;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr10	123658602	rs3750836	G	A	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.19;MQRankSum=0.431;QD=22.53;ReadPosRankSum=-1.180;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr10	123673206	rs11200251	C	T	1299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.037;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=12;PP=783;ReadPosRankSum=-0.680;SC=AGTAGCAGTACATGACTGTAT;SOR=0.997;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=80;TCF=58;TCR=22;TR=50;WE=123673219;WS=123673196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,54:0.63:86
chr10	123673339	rs10749435	T	C	6422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=101;NR=106;PP=2965;SC=CCCCTTTAGCTAGAAATTTCA;SOR=0.883;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=208;TCF=101;TCR=107;TR=207;WE=123673347;WS=123673329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr10	123681962	rs10887023	T	C	1398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=27;PP=881;ReadPosRankSum=0.860;SC=ATGTCTTATATATTTTTCACT;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=76;TCF=40;TCR=36;TR=58;WE=123681970;WS=123681952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,62:0.76:82
chr10	123719026	rs11548140	C	T	1141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.540;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=26;PP=742;ReadPosRankSum=-0.305;SC=CTCCCAGTCACGGTAACTCAA;SOR=0.651;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=173;TCF=89;TCR=84;TR=59;WE=123719034;WS=123719016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,63:0.33:192
chr10	123721071	rs12247367	G	A	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=8;PP=169;ReadPosRankSum=-0.364;SC=ATTTTTGCTTGTCATTAATAT;SOR=0.679;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=45;TCF=20;TCR=25;TR=16;WE=123721079;WS=123721061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,19:0.33:57
chr10	123722906	rs12240306	C	T	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=245;ReadPosRankSum=-0.819;SC=TTTCTTCTCTCTTGCACACCC;SOR=0.730;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=48;TCF=18;TCR=30;TR=20;WE=123722914;WS=123722896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,21:0.43:49
chr10	123722922	rs12240308	C	A	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.999;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=125;ReadPosRankSum=1.599;SC=CACCCAAACTCCTTTTCTTCT;SOR=1.244;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=39;TCF=13;TCR=26;TR=14;WE=123722930;WS=123722912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,13:0.36:36
chr10	123722951	rs59415272	CT	C	43.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.25;ReadPosRankSum=2.189;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr10	123724701	rs34074742	AC	A	565.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=468;ReadPosRankSum=0.541;SC=CTGGCTCCAGACCCGCACACT;SOR=1.044;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=14;WE=123724709;WS=123724691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,19:0.76:25
chr10	123724767	rs4752626	T	G	4153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=42;PP=2697;SC=TTAACTTTAATGTGTTTTTTT;SOR=1.626;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=131;TCF=89;TCR=42;TR=131;WE=123724778;WS=123724757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr10	123724925	rs76497370	AT	A	812.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=28;PP=383;ReadPosRankSum=0.883;SC=GCTTTCATTTATTTTTTTTGC;SOR=0.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=89;TCF=3;TCR=86;TR=28;WE=123724933;WS=123724915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,44:0.35:124
chr10	123724948	rs12259144	A	G	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=23;PP=460;ReadPosRankSum=1.638;SC=GTTGTTTGTTAAACAAACTAA;SOR=0.706;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=89;TCF=26;TCR=63;TR=33;WE=123724956;WS=123724938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,35:0.38:93
chr10	123733511	rs10887034	C	G	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.472;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=215;ReadPosRankSum=0.663;SC=TATAAAATAACAAATTACCTT;SOR=1.154;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=14;WE=123733519;WS=123733501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,16:0.39:41
chr10	123781339	rs2461221	A	G	880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=2;PP=584;SC=ATGTGACCGTAGAGATAAACA;SOR=4.332;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=23;WE=123781347;WS=123781329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr10	123792487	rs5788528	A	AAAC	162.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=23.25;ReadPosRankSum=1.981;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr10	123792527	rs11361502	AC	A	403.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.26;MQRankSum=0.667;QD=23.75;ReadPosRankSum=-0.522;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,15:0.88:17
chr10	123842065	rs2459103	A	G	497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=1;PP=286;SC=AGGGCACTTGATGCCCTTTTG;SOR=2.303;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=123842073;WS=123842055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	123842523	rs11200385	G	A	1639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.611;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=37;PP=887;ReadPosRankSum=0.478;SC=GATTGCTGCCGTCCCCAGTGC;SOR=0.589;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=209;TCF=112;TCR=97;TR=79;WE=123842531;WS=123842513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,89:0.37:239
chr10	123844503	rs10887063	C	T	1074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.970;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=26;PP=713;ReadPosRankSum=-0.593;SC=TGAGAAGCATCTCCAGCCATC;SOR=0.608;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=157;TCF=86;TCR=71;TR=54;WE=123844511;WS=123844493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,59:0.33:179
chr10	123845211	rs11200387	G	A	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=13;PP=285;ReadPosRankSum=-0.703;SC=CCTGGCGCCCGCCAGCCCCGG;SOR=0.646;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=97;TCF=50;TCR=47;TR=29;WE=123845219;WS=123845201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,34:0.30:114
chr10	123845322	rs7073433	T	C	2672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=36;PP=1312;SC=AATGGAGTGCTGGGCCACTTC;SOR=0.839;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=51;TCR=36;TR=87;WE=123845330;WS=123845312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr10	123845897	rs1106992	G	C	831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.648;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=18;PP=515;ReadPosRankSum=-1.393;SC=TCGCCCCCCTGTTGCAACCAG;SOR=0.749;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=142;TCF=75;TCR=67;TR=41;WE=123845905;WS=123845887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,46:0.29:160
chr10	123846288	rs4752642	G	A	955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.599;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=28;PP=569;ReadPosRankSum=-0.419;SC=CGGAGCCCTGGCCACACCTGG;SOR=0.749;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=159;TCF=81;TCR=78;TR=53;WE=123846296;WS=123846278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,56:0.32:173
chr10	123846485	rs4751871	A	G	826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.543;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=21;ReadPosRankSum=-0.426;SC=TGGCTCTGCAAGATCCAGCTT;SOR=0.870;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=105;TCF=44;TCR=61;TR=35;WE=123846493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,42:0.33:127
chr10	123846860	rs11599291	C	T	1234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FS=2.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.14;ReadPosRankSum=-0.677;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:220,78:0.26:298
chr10	123847355	rs10788237	G	A	680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.499;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=16;PP=398;ReadPosRankSum=-0.141;SC=AGCAGCCAGGGCCTGAGCGCC;SOR=0.708;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=124;TCF=65;TCR=59;TR=37;WE=123847363;WS=123847345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,40:0.29:139
chr10	123903133	rs12765679	G	A	3429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=61;NR=53;PP=2039;SC=CTCGGCTGCAGAACACATAGT;SOR=0.709;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=61;TCR=53;TR=114;WE=123903141;WS=123903123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr10	123976391	rs10444046	C	A	3768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=79;PP=2306;SC=CTCGGAGAATCCTGCCCCTAG;SOR=1.324;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=50;TCR=79;TR=129;WE=123976399;WS=123976381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr10	123984442	rs2281671	G	A	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=55;ReadPosRankSum=0.566;SC=GTGCACAGCAGTGATGGACTG;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=123984450;WS=123984432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr10	123986116	rs201070235	CAT	C	160.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.36;MQRankSum=4.005;QD=5.36;ReadPosRankSum=-1.211;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr10	123996976	rs2295879	G	A	2113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.607;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=42;PP=1244;ReadPosRankSum=-1.282;SC=CATCGGGACCGCTGAGGTGGA;SOR=0.629;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=146;TCF=77;TCR=69;TR=91;WE=123996984;WS=123996966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,98:0.63:156
chr10	124001539	rs11200496	G	C	1529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.354;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=31;PP=795;ReadPosRankSum=-0.287;SC=ACCTGCGGGGGCTCAGGCCGG;SOR=1.136;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=72;TCF=33;TCR=39;TR=56;WE=124001547;WS=124001529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,66:0.80:83
chr10	124008927	rs2273794	T	C	723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=8;PP=557;ReadPosRankSum=0.764;SC=TCTCATGGGCTCCTGTGCTCC;SOR=0.582;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=42;TCF=32;TCR=10;TR=29;WE=124008935;WS=124008917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,29:0.69:42
chr10	124008959	rs2273795	G	T	1350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.989;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=18;PP=786;ReadPosRankSum=-1.409;SC=GTGGCAGCTGGGGCCAGACCA;SOR=0.574;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=72;TCF=49;TCR=23;TR=54;WE=124008967;WS=124008949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,59:0.75:79
chr10	124009261	rs10887111	G	C	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=43;ReadPosRankSum=0.652;SC=GACAGGCTGGGCTTCCCTGGC;SOR=0.765;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=5;WE=124009269;WS=124009251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr10	124013604	rs3763763	C	A	2745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.171;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=54;PP=1638;ReadPosRankSum=-1.330;SC=TTAACTGTTGCGTGCAATATG;SOR=0.802;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=166;TCF=82;TCR=84;TR=104;WE=124013612;WS=124013594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,120:0.63:189
chr10	124034528	rs7096744	G	T	633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=3.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.07;ReadPosRankSum=-1.827;SOR=1.115;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,37:0.30:125
chr10	124034703	rs7080859	T	C	853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.494;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=24;PP=535;ReadPosRankSum=0.352;SC=GGGGCTGGGTTCTGCACCACC;SOR=0.518;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=127;TCF=50;TCR=77;TR=41;WE=124034711;WS=124034693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,46:0.33:141
chr10	124036141	rs6585808	T	C	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.923;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=120;ReadPosRankSum=0.889;SC=TGGAATACAGTGTCTTTGCCT;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=7;WE=124036149;WS=124036131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr10	124036190	rs7086389	T	C	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.223;HP=5;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=362;ReadPosRankSum=0.166;SC=TGTTCAAAAATTAACCAGCAC;SOR=1.063;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=52;TCF=39;TCR=13;TR=23;WE=124036198;WS=124036180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,23:0.43:54
chr10	124036226	rs7086403	T	C	2730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=31;PP=1691;SC=GATTTCCTTCTTGCTATACAA;SOR=1.408;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=60;TCR=31;TR=91;WE=124036234;WS=124036216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr10	124036494	rs7090214	T	C	958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=13;NR=20;PP=557;SC=AATGGCCCATTATTCCTGGGA;SOR=1.371;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=13;TCR=20;TR=33;WE=124036502;WS=124036484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr10	124043629	rs7098436	T	C	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.900;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=363;ReadPosRankSum=1.103;SC=GTGAGTGAAGTCAAGCTTGGT;SOR=1.893;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=17;WE=124043637;WS=124043619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,19:0.70:27
chr10	124045488	rs2181161	C	T	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.374;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.48;ReadPosRankSum=0.812;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr10	124050575	rs11592545	G	A	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.46;ReadPosRankSum=0.955;SOR=0.829;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr10	124066652	rs7082865	G	A	1588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=17;PP=881;SC=TACAAGCAGCGTGATTTTGTG;SOR=1.421;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=32;TCR=17;TR=49;WE=124066660;WS=124066642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr10	124089036	rs2421013	G	A	4010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=67;PP=2062;ReadPosRankSum=-1.553;SC=GACATAGGACGGAGCTTGAGG;SOR=1.056;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=58;TCR=68;TR=124;WE=124089044;WS=124089026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,152:0.99:154
chr10	124091855	rs5788544	A	AG	397.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=313;SC=AAACCTGGTGAGGGGGGCAGG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=10;WE=124091863;WS=124091845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	124091921	rs4627016	C	T	1913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=18;PP=1167;SC=AGGATCCCACCGTGGTCAGCT;SOR=1.678;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=44;TCR=18;TR=62;WE=124091929;WS=124091911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr10	124094283	rs10788282	C	T	1939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=14;PP=1292;SC=ATGATCTGCCCGCCTCAGCCT;SOR=2.035;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=46;TCR=14;TR=60;WE=124094291;WS=124094273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr10	124095982	rs3817280	A	G	2039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=44;NR=26;PP=1137;SC=TTGCAGTTCCACCTAAGGTGA;SOR=1.207;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=44;TCR=26;TR=70;WE=124095990;WS=124095972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr10	124096035	rs3817281	T	C	5909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.78;SOR=0.937;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr10	124096041	rs1129973	T	C	6059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.60;SOR=0.965;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr10	124096061	rs1048347	A	C	4290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=87;NR=56;PP=2579;SC=GAGCACAACCACGTCAGCCTG;SOR=1.017;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=143;TCF=87;TCR=56;TR=143;WE=124096069;WS=124096051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr10	124096209	rs3817284	C	T	3611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=70;PP=2174;SC=CAAGTGTTCACGTTGTCTTTT;SOR=1.153;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=51;TCR=70;TR=121;WE=124096217;WS=124096199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr10	124096306	rs3817285	T	C	443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=16;PP=363;SC=TGAAGATCCCTGGAAAATCTG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=124096314;WS=124096296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr10	124152936	rs3838776	G	GA	336.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=427;SC=ACAGGCTTTAGATTTGTCTTC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=10;WE=124152944;WS=124152926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	124175273	rs4751892	G	A	248.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=162;SC=ATCTGTTTCTGACTAATCTAA;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=124175281;WS=124175263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr10	124176452	rs4612730	G	A	1621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=19;PP=1065;SC=TGAGGGCAGGGGTTTCTTACT;SOR=1.085;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=34;TCR=19;TR=53;WE=124176460;WS=124176442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr10	124183732	rs4405249	T	C	1231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=13;PP=746;SC=AACCTCTTCGTGTAATACCAC;SOR=1.559;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=40;TCF=27;TCR=13;TR=39;WE=124183740;WS=124183722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr10	124186714	rs2292626	C	T	295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=260;SC=TTTAATGCTTCCTTGTAGTAT;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=124186722;WS=124186704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	124189010	rs10591719	TTGTGTGTG	TTG,T	725.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=5,5;NR=3,3;PP=351,60;SC=GCTGCTGCCTTTGTGTGTGTG;SOR=2.712;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=8,8;WE=124189025;WS=124189000;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:17
chr10	124189197	rs1045216	A	G	3173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=47;PP=1827;ReadPosRankSum=-0.622;SC=CAACGCAGCCACCGCCACCTC;SOR=0.304;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=63;TCR=47;TR=109;WE=124189205;WS=124189187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,123:0.99:124
chr10	124214448	rs10490924	G	T	4068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=67;PP=2330;SC=GATCCCAGCTGCTAAAATCCA;SOR=0.850;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=66;TCR=67;TR=133;WE=124214456;WS=124214438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr10	124214600	rs144224550	G	GGT	1023.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=11;PP=604;SC=ATTCTGGAGTGGTGCCCTGCA;SOR=1.519;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=13;WE=124214608;WS=124214590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr10	124216384	rs72511653	C	CTA	1672.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=8;PP=986;SC=CGTCATGTGTCTTTAAAAATG;SOR=1.670;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=24;TCF=16;TCR=8;TR=22;WE=124216392;WS=124216374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr10	124221270	rs1049331	C	T	152.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.01;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr10	124221276	rs2293870	G	T	152.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.01;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr10	124271589	rs2672586	G	A	2360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=41;PP=1357;SC=AGCGTGAGTTGGAGTCGTTTT;SOR=0.997;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=77;TCF=36;TCR=41;TR=77;WE=124271597;WS=124271579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr10	124320194	rs2981745	T	C	2301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=18;PP=1381;SC=ATAGCAGCAGTAGAAATATAC;SOR=1.639;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=53;TCR=18;TR=71;WE=124320202;WS=124320184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr10	124325409	rs3019515	T	G	5660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=93;PP=2965;SC=ACGGTGAAGCTAAAGCCAATT;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=199;TCF=106;TCR=93;TR=199;WE=124325417;WS=124325399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr10	124325569	rs3019516	A	G	1549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=33;PP=1047;SC=CTCCTCTGCTACTGTTGGCTA;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=18;TCR=33;TR=51;WE=124325577;WS=124325559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr10	124325631	rs2981768	T	C	320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=12;PP=257;SC=CCTTGTCGAATGCAGGAATGC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=124325639;WS=124325621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr10	124329580	rs11524819	C	A	1452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.02;SOR=1.751;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr10	124329583	rs11524820	G	A	1477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.46;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr10	124329672	rs3740220	TC	CT	4866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=48;NR=39;PP=2907;SC=CTTTTCCACCTCGCAGCTTCA;SOR=0.806;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=92;TCF=52;TCR=40;TR=87;WE=124329681;WS=124329662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr10	124329710	rs11523871	C	A	3023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=55;NR=45;PP=1470;SC=GCCCTTGGATCCAACTGTAGC;SOR=0.727;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=55;TCR=45;TR=100;WE=124329718;WS=124329700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr10	124329746	rs3740222	A	T	2195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=34;NR=40;PP=1256;SC=TTATGGGGGAACCCTGTGGGC;SOR=0.987;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=34;TCR=40;TR=74;WE=124329754;WS=124329736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr10	124329801	rs3740223	G	A	1037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=24;PP=667;SC=ATCCAGAAGAGATGCAGAAGC;SOR=1.670;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=12;TCR=24;TR=36;WE=124329809;WS=124329791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr10	124330240	rs2981790	A	G	1495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=7;PP=1159;SC=CCCAGCCTGGAGCCAGTACGG;SOR=3.126;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=41;TCR=7;TR=48;WE=124330260;WS=124330230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr10	124330252	rs2981791	A	G	2071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=19;PP=1471;SC=CCAGTACGGTAACACAGTGAT;SOR=1.897;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=49;TCR=19;TR=68;WE=124330260;WS=124330230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr10	124330427	rs3013236	C	T	4062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=71;PP=2513;SC=CCCTCGGAGTCGACCCTGGAG;SOR=0.992;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=128;TCF=57;TCR=71;TR=127;WE=124330435;WS=124330417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr10	124331867	rs7084792	C	T	3933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=78;NR=47;PP=2176;SC=TGGAGTCAACCGTAGCAGAAG;SOR=1.027;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=78;TCR=47;TR=125;WE=124331875;WS=124331857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr10	124331944	rs2277229	C	T	5843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=63;NR=58;PP=1994;SC=TCATCTCTGACCCAGATGAGG;SOR=0.816;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=122;TCF=64;TCR=58;TR=121;WE=124331971;WS=124331934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr10	124331957	rs2277230	T	C	3369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.53;ReadPosRankSum=-0.165;SOR=0.920;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,125:0.98:127
chr10	124331963	rs2277231	A	G	5085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.23;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr10	124332035	rs2277232	T	C	1098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=51;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=28;PP=809;SC=TATGTGCAACTCTGAGTCCAT;SOR=2.774;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=35;WE=124332043;WS=124332025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr10	124333308	rs2277235	G	A	3067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=46;PP=1529;SC=ATCCCTGTAGGCTCATTACCC;SOR=0.745;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=101;TCF=55;TCR=46;TR=101;WE=124333316;WS=124333298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr10	124335866	rs1985025	C	T	2836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=35;PP=1570;SC=GCCCTGAGACCTTGTGCCTCA;SOR=1.028;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=60;TCR=35;TR=95;WE=124335874;WS=124335856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr10	124389296	rs3013177	C	G	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.437;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=221;ReadPosRankSum=-0.190;SC=ACAGATGATTCCTTGTCACAA;SOR=0.173;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=13;WE=124389304;WS=124389286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr10	124395814	rs55888207	C	T	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.682;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=24;ReadPosRankSum=0.120;SC=AATGAAGGAACCCTTTCAGGT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=3;WE=124395822;WS=124395804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr10	124399467	rs2261655	C	T	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.166;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=34;ReadPosRankSum=1.120;SC=TGTTGAGTCACGTCCCTCTCA;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=4;WE=124399475;WS=124399457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr10	124399985	rs2261660	G	T	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.03;ReadPosRankSum=-1.018;SOR=0.795;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,22:0.23:96
chr10	124402677	rs1052715	A	G	1327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.478;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=32;PP=805;ReadPosRankSum=-1.108;SC=ACTCCTCGCCATCTCTTCGCA;SOR=0.755;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=253;TCF=145;TCR=108;TR=75;WE=124402685;WS=124402667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:198,84:0.30:282
chr10	124402944	rs8441	G	A	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.96;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr10	124436287	rs28700010	G	C	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.715;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=376;ReadPosRankSum=0.418;SC=AGTGACTGTGGGGGCCACTAC;SOR=1.765;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=43;TCF=29;TCR=14;TR=26;WE=124436295;WS=124436277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,29:0.63:46
chr10	124436530	rs3019500	G	T	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.133;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=346;ReadPosRankSum=-0.989;SC=ACAATTTGACGACATTTTCAC;SOR=1.528;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=20;WE=124436538;WS=124436520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,23:0.79:29
chr10	124457452	rs2947594	C	T	5376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=89;PP=2965;SC=GGTTTCTTTGCGGGGAGGAAT;SOR=0.806;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=181;TCF=92;TCR=89;TR=180;WE=124457460;WS=124457442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr10	124457906	rs2901343	C	T	1195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.706;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=33;PP=719;ReadPosRankSum=1.752;SC=GTTTGTAGTCCGGAGACAGCA;SOR=0.826;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=200;TCF=106;TCR=94;TR=65;WE=124457914;WS=124457896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,73:0.30:244
chr10	124459139	rs11813597	T	C	656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.482;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=13;PP=299;ReadPosRankSum=-1.629;SC=ACCGCAACGGTGAAGCAGAAC;SOR=0.332;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=73;TCF=48;TCR=25;TR=32;WE=124459147;WS=124459129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,35:0.44:79
chr10	124594153	rs11248321	A	G	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.836;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=249;ReadPosRankSum=1.419;SC=AACACAAAAAATTACTTTATT;SOR=4.487;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=12;WE=124594161;WS=124594143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr10	124610027	rs1891110	G	A	2355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.157;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=54;PP=1366;ReadPosRankSum=0.487;SC=AGCGATGACAGGCATAATCAC;SOR=0.985;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=135;TCF=54;TCR=81;TR=86;WE=124610035;WS=124610017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,101:0.66:154
chr10	124648150	rs10902838	A	G	4100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=76;PP=2267;ReadPosRankSum=1.545;SC=TCCAGAATTTATGTAGTCAAG;SOR=0.726;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=224;TCF=118;TCR=106;TR=158;WE=124648158;WS=124648140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,183:0.71:257
chr10	124648285	rs10902839	G	A	1413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.030;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=36;PP=916;ReadPosRankSum=0.677;SC=TGGTAGGTGGGAGAATTAGAT;SOR=0.518;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=77;TCF=24;TCR=53;TR=54;WE=124648293;WS=124648275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,58:0.73:80
chr10	124653996	rs12255784	T	C	987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.247;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=15;PP=566;ReadPosRankSum=-2.320;SC=TCAGCCCAGCTGAAGGGGCAG;SOR=0.527;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=52;TCF=33;TCR=19;TR=40;WE=124654004;WS=124653986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,43:0.78:55
chr10	124654345	rs35248586	CT	C	410.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=2.175;HP=11;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.879;NF=0;NR=17;PP=185;ReadPosRankSum=-1.698;SC=TGTAACTACACTTTTTTTTTT;SOR=1.545;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=17;WE=124654354;WS=124654335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,23:0.79:29
chr10	124697198	rs10794580	G	A	2531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.153;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=46;PP=1395;ReadPosRankSum=0.269;SC=ATCGAAACTCGTATGTCTTAA;SOR=0.526;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=146;TCF=81;TCR=65;TR=101;WE=124697206;WS=124697188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,114:0.70:163
chr10	124711563	rs199979287	A	AT	172.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.832;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.187;HP=8;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.524;NF=0;NR=7;PP=97;ReadPosRankSum=1.098;SC=AAAAGAATTAATTTTTTTTAC;SOR=0.293;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=7;WE=124711571;WS=124711553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr10	124711632	rs9804347	T	A	99.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.76;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
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chr10	124746801	rs7096614	T	G	1719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.797;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=16;PP=1159;ReadPosRankSum=0.333;SC=TGAAGAAAATTTAAGTAAGGT;SOR=0.989;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=94;TCF=67;TCR=27;TR=62;WE=124746809;WS=124746791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,69:0.66:105
chr10	124749740	rs11190	A	C	998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=19;PP=562;ReadPosRankSum=1.692;SC=AGAACTTAACAAGCTCAAAGC;SOR=0.751;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=34;TCR=32;TR=39;WE=124749748;WS=124749730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,46:0.57:80
chr10	124768583	rs12263012	G	A	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=13;PP=428;ReadPosRankSum=-2.076;SC=CGCGGCAGCAGGCTGGTGAGT;SOR=0.922;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=31;TCF=15;TCR=16;TR=26;WE=124768591;WS=124768573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,27:0.77:35
chr10	124787047	rs10794584	T	C	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=1.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQRankSum=-0.874;QD=10.12;ReadPosRankSum=0.479;SOR=0.990;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,21:0.54:39
chr10	124787118	rs10902863	G	A	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.238;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.42;ReadPosRankSum=-1.947;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr10	124800853	rs1140591	C	T	856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FS=3.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.98;ReadPosRankSum=0.373;SOR=0.950;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:156,59:0.27:215
chr10	124806770	rs1131430	A	G	1009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=0.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=11;PP=500;ReadPosRankSum=-0.259;SC=TATTCCATATATTAAAGAAAG;SOR=0.746;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=63;TCF=40;TCR=23;TR=33;WE=124806778;WS=124806760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,45:0.57:79
chr10	124812487	rs2421166	A	G	1411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=4;PP=1028;SC=CACTAACAGTAAATCCATGTT;SOR=4.021;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=36;WE=124812495;WS=124812477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr10	124812685	rs11307362	AT	A	929.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=2.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.26;MQRankSum=1.762;QD=9.21;ReadPosRankSum=-0.596;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,52:0.51:101
chr10	124924484	rs34736387	CT	C	497.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.10;ReadPosRankSum=0.385;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,25:0.66:38
chr10	125426412	rs12263344	A	G	2520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=31;PP=1529;SC=GCCGGCGGCCAGACGAGCGCC;SOR=1.053;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=57;TCR=31;TR=88;WE=125426420;WS=125426402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr10	125426565	rs4980313	G	C	4066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=68;NR=78;PP=2032;SC=TGCAGACGCTGGTGCTGCTGG;SOR=0.924;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=148;TCF=69;TCR=79;TR=146;WE=125426573;WS=125426555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr10	125426627	rs3808964	G	T	1468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=30;PP=831;SC=GGGAACAGCCGCGCGGGATCT;SOR=1.791;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=15;TCR=30;TR=45;WE=125426635;WS=125426617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr10	125473208	rs12256385	G	A	56.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=2;PP=25;SC=TACAATTCAAGATGGGATTTG;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=125473216;WS=125473198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr10	125506302	rs7088479	T	C	2291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=13;PP=1565;SC=TCGTCTCTTCTGCCCCCGCAG;SOR=2.774;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=58;TCR=13;TR=71;WE=125506310;WS=125506292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr10	125521533	rs10794566	G	A	4638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=91;NR=71;PP=2483;SC=ACACGTGGTCGTCGGGGGTGG;SOR=0.834;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=163;TCF=91;TCR=72;TR=162;WE=125521541;WS=125521523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr10	125521590	rs10794567	G	A	5567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=96;PP=2965;SC=GGTCGTAGGGGTACGCCACCA;SOR=0.753;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=191;TCF=95;TCR=96;TR=191;WE=125521598;WS=125521580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr10	125521721	rs10751743	G	A	2249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=41;PP=1265;SC=AAAATAAGCAGGAAGTCATTT;SOR=1.416;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=28;TCR=41;TR=69;WE=125521729;WS=125521711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr10	125521751	rs10794568	C	G	1122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=22;PP=656;SC=AGCTGTCAAACAGGGACATAG;SOR=1.788;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=12;TCR=22;TR=34;WE=125521759;WS=125521741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr10	125526689	rs1896392	G	A	558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=16;PP=443;SC=GTGAGAGTGTGAAGAATGCAC;SOR=2.419;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=125526697;WS=125526679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr10	125622250	rs11299200	CA	C	6993.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.22;NF=15;NR=95;PP=2951;SC=CTGGAAAGGACAAATGCTTGT;SOR=1.040;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=114;TCF=15;TCR=99;TR=110;WE=125622258;WS=125622240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr10	125650793	rs28513406	A	C	676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.523;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=433;ReadPosRankSum=-0.437;SC=GACACACACAATGGGAGAAGC;SOR=1.204;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=37;TCF=27;TCR=10;TR=26;WE=125650801;WS=125650783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,29:0.73:40
chr10	125673492	rs7893288	A	G	1732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.540;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=30;PP=902;ReadPosRankSum=0.504;SC=AGTGAGCACCAGAGTCAGGCC;SOR=0.505;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=105;TCF=55;TCR=50;TR=67;WE=125673500;WS=125673482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,81:0.66:122
chr10	125673547	rs4329614	T	G	1665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.757;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=34;PP=992;ReadPosRankSum=1.549;SC=AATCCAACCTTAAAGGCAGGA;SOR=0.798;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=50;TCR=49;TR=68;WE=125673555;WS=125673537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,76:0.68:111
chr10	125780752	rs5788645	CG	C	593.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=5.557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.84;ReadPosRankSum=0.841;SOR=0.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,19:0.73:26
chr10	125780759	rs4072194	G	C	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=1.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.06;ReadPosRankSum=2.762;SOR=0.346;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
chr10	125780958	rs9422312	C	T	1064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.579;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=32;PP=616;ReadPosRankSum=-1.313;SC=ATATTTTTACCACCCATGAAC;SOR=0.771;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=179;TCF=77;TCR=102;TR=56;WE=125780966;WS=125780948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,61:0.31:194
chr10	125801761	rs28698985	A	T	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=92;ReadPosRankSum=-0.367;SC=GCCTGGAGCCAGAGCCAGGAC;SOR=0.551;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=9;WE=125801769;WS=125801751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr10	125801809	rs28716482	C	A	827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=9;PP=465;ReadPosRankSum=0.011;SC=GTGACACAGACGCCTTACCGA;SOR=0.651;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=47;TCF=33;TCR=14;TR=31;WE=125801817;WS=125801799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,35:0.67:52
chr10	126086730	rs2459217	G	A	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=297;ReadPosRankSum=-1.008;SC=ATCCCTTGCCGTATGTATGGG;SOR=0.627;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=20;WE=126086738;WS=126086720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr10	126089656	rs2459215	T	G	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=271;ReadPosRankSum=1.678;SC=CTAGATAAAATACCAGAGGAA;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=13;TCR=17;TR=18;WE=126089664;WS=126089646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,22:0.65:34
chr10	126089703	rs2491158	G	A	343.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.8387;FS=5.740;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=182;ReadPosRankSum=0.916;SC=GCCTGTATTAGTTTCTAATTA;SOR=2.225;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=12;WE=126089711;WS=126089693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,14:0.93:15
chr10	126091814	rs2240882	A	C	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=492;ReadPosRankSum=-1.236;SC=CTCACCAACTATTTCCTTTGT;SOR=0.651;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=22;WE=126091822;WS=126091804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,23:0.68:34
chr10	126093991	rs9422807	T	C	1086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=17;PP=614;ReadPosRankSum=-1.306;SC=AGCACTATGATGCTAGTGAAA;SOR=0.618;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=43;TCR=24;TR=47;WE=126093999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,50:0.68:74
chr10	126097716	rs7923012	G	A	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.309;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=88;ReadPosRankSum=-0.303;SC=GAATTACTAAGAATTGTATTT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=5;WE=126097724;WS=126097706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr10	126100523	rs10794058	G	A	1675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.576;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=28;PP=1005;ReadPosRankSum=-1.283;SC=GGGAAAAGACGGATTAATTTG;SOR=0.546;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=111;TCF=70;TCR=41;TR=71;WE=126100531;WS=126100513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,76:0.65:117
chr10	126150388	rs2491156	C	A	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.287;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=60;ReadPosRankSum=-1.834;SC=GCGCCGGCGCCGGCGTCGGTT;SOR=0.223;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=7;WE=126150396;WS=126150378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr10	126172863	rs6597801	A	G	3661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=56;NR=67;PP=2095;SC=CTGAAGGAGCAAGGCCTGCGA;SOR=1.038;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=123;TCF=56;TCR=67;TR=123;WE=126172871;WS=126172853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr10	126185618	rs3824810	A	G	955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.991;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=27;PP=668;ReadPosRankSum=0.279;SC=TCTGTCCCAAACTCTCTTCAG;SOR=0.858;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=142;TCF=72;TCR=70;TR=52;WE=126185626;WS=126185608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,57:0.33:174
chr10	126185707	rs3824809	C	T	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.070;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=257;ReadPosRankSum=-0.373;SC=GCCTTTTGGGCTTCCACAAAG;SOR=0.533;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=60;TCF=20;TCR=40;TR=19;WE=126185715;WS=126185697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,19:0.30:64
chr10	126186771	rs17620824	A	G	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=200;ReadPosRankSum=1.578;SC=GGAATGGATTACAGGACTCAG;SOR=0.620;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=37;TCF=13;TCR=24;TR=12;WE=126186779;WS=126186761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,11:0.28:39
chr10	126384610	rs10901807	G	A	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=130;ReadPosRankSum=-0.389;SC=GAAGAGTCCCGGGGCTGCTCT;SOR=0.495;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=8;WE=126384618;WS=126384600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr10	126395123	rs7897256	T	C	2919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=32;PP=1610;SC=TTTGCTAAGCTTAGGTGCTCA;SOR=1.015;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=54;TCR=32;TR=86;WE=126395131;WS=126395113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr10	126505045	rs77845805	T	C	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=11;NR=1;PP=195;ReadPosRankSum=1.876;SC=GCTGTCTTTGTTGTCAGAGAT;SOR=0.693;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=12;WE=126505053;WS=126505035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr10	126505062	rs11451694	T	TA	600.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.471;NF=18;NR=6;PP=427;ReadPosRankSum=-0.657;SC=AGATTTTGATTAAAAAAAAAA;SOR=0.527;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=24;WE=126505070;WS=126505052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,24:0.89:27
chr10	126517989	rs2303611	G	A	1011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FS=3.374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.46;ReadPosRankSum=1.367;SOR=0.942;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:163,64:0.28:227
chr10	126518142	rs41300560	A	G	245.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=203;SC=TGACAAATAGAGTTAGGATCC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=126518150;WS=126518132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	126519852	rs75786278	C	T	3062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.523;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=49;PP=1718;ReadPosRankSum=1.273;SC=TTGTAATCAGCGCTGAATTTA;SOR=0.776;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=185;TCF=108;TCR=77;TR=123;WE=126519860;WS=126519842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,141:0.65:217
chr10	126629204	rs7074163	G	A	363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=11;PP=290;SC=CACTATAAATGGTGTATGGAC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=126629212;WS=126629194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr10	126660781	rs3802700	A	T	535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=17;PP=433;SC=GAAAGCACATAACATAGCTAC;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=126660789;WS=126660771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	126662451	rs3740534	C	T	214.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=158;SC=TTCACTGTTACAGAGTGAACA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=126662459;WS=126662441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	126678122	rs140913543	GT	G	93.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=12.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.09;MQRankSum=-2.737;QD=2.47;ReadPosRankSum=-0.926;SOR=0.011;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,6:0.16:38
chr10	126678128	.	T	A	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.791;ClippingRankSum=0.000;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.491;HP=4;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-2.732;NF=7;NR=4;PP=213;ReadPosRankSum=-1.470;SC=CCGTGTTTTGTGGGCTGGTTG;SOR=0.010;SbPval=0.04;Source=Platypus;TC=42;TCF=37;TCR=5;TR=11;WE=126678136;WS=126678112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,6:0.15:39
chr10	126686827	rs1982225	T	A	2383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=26;NR=54;PP=1547;SC=CTCCTGAGACTCGGTTGTTGG;SOR=1.781;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=26;TCR=54;TR=80;WE=126686835;WS=126686817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr10	126714714	rs2946994	G	C	1513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=18;PP=914;SC=GCCACCTTCTGGTACGGTGAG;SOR=1.199;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=34;TCR=18;TR=52;WE=126714722;WS=126714704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr10	126714966	rs3012075	A	G	2222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=33;PP=1270;SC=TGCAGGGGGTACGTGGGGCTC;SOR=0.876;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=37;TCR=33;TR=70;WE=126714974;WS=126714956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr10	126716346	rs2938006	C	T	2440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=42;PP=1256;SC=AAAATGACTGCGGATGAGGCA;SOR=1.095;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=37;TCR=42;TR=79;WE=126716354;WS=126716336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr10	126721441	rs2839737	C	A	2997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=46;NR=63;PP=1916;SC=AAAGCCCAAACAGCCCCATTT;SOR=1.149;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=46;TCR=63;TR=109;WE=126721449;WS=126721431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr10	127426430	rs3740181	A	G	2074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=16;PP=1307;SC=AACAAAAACAATATGTTGACC;SOR=2.049;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=46;TCR=16;TR=62;WE=127426438;WS=127426420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr10	127426588	rs3740180	C	A	2484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=51;PP=1537;SC=TCACTTTTTTCGTAAAGTTTG;SOR=1.460;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=30;TCR=51;TR=81;WE=127426596;WS=127426578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr10	127426835	rs3943225	G	T	2010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=16;PP=1252;SC=AAGTTAGATAGATAGTGAATG;SOR=1.917;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=49;TCR=16;TR=65;WE=127426843;WS=127426825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr10	127429604	rs17153494	C	T	3669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.935;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=66;PP=2098;ReadPosRankSum=0.492;SC=ATATGCTTTCCGAAGTGCTGT;SOR=0.530;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=220;TCF=119;TCR=101;TR=140;WE=127429612;WS=127429594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,162:0.65:249
chr10	127436048	rs2296833	C	T	2455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=58;NR=25;PP=1444;SC=TATTTTAATGCAGTATTGGTA;SOR=1.688;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=58;TCR=25;TR=83;WE=127436056;WS=127436038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr10	127436411	rs2296832	T	C	5049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=92;NR=68;PP=2851;SC=ATTTTTTTCTTCCCCCTCAAA;SOR=0.890;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=162;TCF=93;TCR=69;TR=160;WE=127436419;WS=127436401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr10	127441573	rs10751530	G	T	1700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=40;PP=1124;SC=TATGTGTGTGGGTATATATAC;SOR=2.342;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=13;TCR=40;TR=53;WE=127441581;WS=127441563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr10	127445408	rs4962313	G	T	1924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=37;PP=1120;SC=TTGAGACAAGGTCTCACTCTG;SOR=1.134;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=28;TCR=37;TR=65;WE=127445416;WS=127445398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr10	127460753	rs7922546	G	A	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.072;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=7;PP=192;ReadPosRankSum=0.345;SC=AGTGTCCTCCGCTAGCTCAGG;SOR=0.446;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=49;TCF=35;TCR=14;TR=18;WE=127460761;WS=127460743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,21:0.35:60
chr10	127462525	rs10901425	A	G	5953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=94;PP=2965;SC=CTGGTCGGCCACGGACAGTTG;SOR=0.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=198;TCF=103;TCR=95;TR=196;WE=127462533;WS=127462515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr10	127478064	rs35711389	C	G	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.146;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=275;ReadPosRankSum=1.984;SC=GACCTTGGCCCGTGGCCCATC;SOR=0.455;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=58;TCF=18;TCR=40;TR=21;WE=127478072;WS=127478054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,22:0.37:60
chr10	127483573	rs3740179	G	A	2371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.509;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=51;PP=1306;ReadPosRankSum=-0.320;SC=AACAAGATCAGTCCTTGCCAT;SOR=0.564;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=128;TCF=53;TCR=75;TR=90;WE=127483581;WS=127483563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,103:0.72:144
chr10	127484617	rs2281955	C	G	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.260;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=93;ReadPosRankSum=0.508;SC=CCTTCACCCTCTGCTTCCCCA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=5;WE=127484625;WS=127484607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr10	127484653	rs2281954	G	A	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=6;PP=189;ReadPosRankSum=-1.401;SC=TGCCAGAACCGCCCCCAAACG;SOR=0.489;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=24;TCF=16;TCR=8;TR=15;WE=127484661;WS=127484643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr10	127491732	rs74366862	CT	C	1197.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.165;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.779;NF=2;NR=23;PP=867;ReadPosRankSum=0.547;SC=AGCTCTGTTCCTTATGGACAA;SOR=0.430;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=41;TCF=2;TCR=39;TR=25;WE=127491740;WS=127491722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,38:0.64:59
chr10	127500718	rs10901444	C	G	1073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.514;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=10;PP=700;ReadPosRankSum=0.597;SC=CTGAGTTAAACTGTTTTTTAA;SOR=0.276;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=56;TCF=45;TCR=11;TR=40;WE=127500726;WS=127500708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,44:0.69:64
chr10	127504660	rs2366044	A	G	3040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=33;PP=1801;SC=ATAAAATAAGAAGACAGTAAA;SOR=1.211;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=64;TCR=33;TR=97;WE=127504668;WS=127504650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr10	127515069	rs10159992	C	T	368.81	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5026;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=250;ReadPosRankSum=1.667;SC=TTGTATTCTTCACAGATGGCA;SOR=1.127;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=13;WE=127515077;WS=127515059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,14:0.88:16
chr10	127522572	rs3740206	T	G	342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=248;ReadPosRankSum=1.008;SC=TGAAAATGATTTATCAAGATT;SOR=1.127;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=15;WE=127522580;WS=127522562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr10	127524612	rs4075326	C	T	1238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.931;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=12;PP=712;ReadPosRankSum=-1.673;SC=TGCCGTAGATCAAATGGGTTT;SOR=0.164;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=65;TCF=51;TCR=14;TR=45;WE=127524620;WS=127524602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,51:0.73:70
chr10	127529756	rs146907010	T	TTG	1939.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQRankSum=2.174;QD=8.18;ReadPosRankSum=-0.258;SOR=0.687;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:166,71:0.30:237
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chr10	127541603	rs41305020	T	C	718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=15;PP=384;ReadPosRankSum=0.386;SC=AGGATCTTGGTGGTCTCACCT;SOR=0.676;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=129;TCF=79;TCR=50;TR=41;WE=127541611;WS=127541593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,45:0.31:143
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chr10	127585112	rs72832617	T	C	3065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FS=2.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.28;MQRankSum=-14.567;QD=11.66;ReadPosRankSum=0.425;SOR=0.744;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:180,83:0.32:263
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chr10	127585150	rs74162870	C	A	2637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.444;HP=2;HapScore=2;MGOF=40;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-9.865;NF=80;NR=61;PP=2010;ReadPosRankSum=-2.071;SC=GCGACGCCGGCCCTGGCTGAG;SOR=0.881;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=306;TCF=169;TCR=137;TR=141;WE=127585158;WS=127585140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,125:0.44:285
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chr10	127585237	rs5013589	C	T	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FS=2.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQRankSum=-1.315;QD=3.07;ReadPosRankSum=4.493;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:128,30:0.19:158
chr10	127585260	rs4986789	G	T	768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=4.908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQRankSum=-0.626;QD=7.77;ReadPosRankSum=4.062;SOR=0.308;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,34:0.34:99
chr10	127585288	rs5013590	C	A	1085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.675;HP=2;HapScore=2;MGOF=58;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.129;NF=10;NR=26;PP=520;ReadPosRankSum=0.697;SC=TCCCCGGGAACGAGTGTGGGC;SOR=0.219;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=91;TCF=21;TCR=70;TR=36;WE=127585296;WS=127585278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,38:0.50:76
chr10	127585307	rs74579856	C	T	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.49;MQRankSum=-2.005;QD=12.27;ReadPosRankSum=0.493;SOR=0.713;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,19:0.40:48
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chr10	127585360	rs78190003	C	A	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=3.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.89;MQRankSum=-3.388;QD=16.94;ReadPosRankSum=-2.461;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr10	127585363	rs74162872	G	A	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=3.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.29;MQRankSum=-3.880;QD=17.10;ReadPosRankSum=-2.000;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr10	127668317	rs11244744	G	A	1538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.691;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=23;PP=881;ReadPosRankSum=0.322;SC=TACAGCATAGGTGTCAACCCT;SOR=0.779;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=109;TCF=65;TCR=44;TR=63;WE=127668325;WS=127668307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,70:0.59:119
chr10	127668431	rs11244745	A	G	2947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.711;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=61;PP=1733;ReadPosRankSum=-2.078;SC=AGCAGGTCAAATACAACCTTA;SOR=0.617;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=201;TCF=106;TCR=95;TR=123;WE=127668439;WS=127668421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,138:0.61:225
chr10	127668487	rs2176097	G	A	1962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.689;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=46;PP=1145;ReadPosRankSum=0.736;SC=CAGTGGGGGTGGTATGATATT;SOR=1.053;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=142;TCF=62;TCR=80;TR=77;WE=127668495;WS=127668477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,88:0.54:163
chr10	127668610	rs2138275	C	T	487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.307;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=8;PP=334;ReadPosRankSum=-0.338;SC=GAGGTATGCTCATATGTGTGC;SOR=0.974;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=31;TCF=16;TCR=15;TR=19;WE=127668618;WS=127668600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,20:0.62:32
chr10	127677374	rs2280173	A	G	657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.163;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=23;PP=490;ReadPosRankSum=-0.677;SC=AAACACTGCAATAATATTTGC;SOR=0.508;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=13;TCR=43;TR=30;WE=127677382;WS=127677364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,30:0.53:57
chr10	127685091	rs3736477	T	C	3151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.451;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=62;PP=2162;ReadPosRankSum=-0.095;SC=ACTGAGCATGTTTATCTCTTT;SOR=0.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=193;TCF=101;TCR=92;TR=131;WE=127685099;WS=127685081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,140:0.65:214
chr10	127693432	rs2138283	C	T	2521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=52;NR=35;PP=1460;SC=TGTCAAATGCCGCTTCTTCCA;SOR=0.848;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=52;TCR=35;TR=87;WE=127693440;WS=127693422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr10	127697165	rs2292690	T	G	825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.173;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=20;PP=444;ReadPosRankSum=-0.573;SC=GTGGAATTAATGTCAGAGCTT;SOR=0.491;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=50;TCF=19;TCR=31;TR=33;WE=127697173;WS=127697155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,38:0.68:56
chr10	127697562	rs118160645	C	T	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.55;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=0;PP=64;ReadPosRankSum=0.385;SC=GCTCATGCCCCCTGCTGTGTG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=2;WE=127697570;WS=127697552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr10	127706028	rs3781001	C	T	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=48;ReadPosRankSum=-0.262;SC=TGTCAGATACCACTGCCCCTC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=4;WE=127706036;WS=127706018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
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chr10	127708428	rs2138280	A	T	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.814;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=18;PP=402;ReadPosRankSum=-0.693;SC=AGGGTCACTTACCAGGAGCCA;SOR=1.324;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=54;TCF=20;TCR=34;TR=26;WE=127708436;WS=127708418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,30:0.49:61
chr10	127708468	rs35835884	G	A	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.820;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=129;ReadPosRankSum=-0.468;SC=AGGGCCTGCCGCTTGGCACAG;SOR=1.460;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=9;WE=127708476;WS=127708458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr10	127708503	rs2292694	G	C	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.343;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=23;ReadPosRankSum=1.074;SC=ATATCATCCTGTCACCATACA;SOR=0.223;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=3;WE=127708511;WS=127708493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr10	127730972	rs150225509	CTGTG	C	184.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.96;ReadPosRankSum=-0.071;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,7:0.23:31
chr10	127730991	rs45535336	A	G	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.75;ReadPosRankSum=-1.080;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr10	127731012	rs11244780	T	A	532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=16;PP=403;SC=ATTAGGCAAATTACTTAACTT;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=127731020;WS=127731002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	127731535	rs7911793	T	C	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=3.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.65;ReadPosRankSum=0.369;SOR=0.124;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr10	127731536	rs7922601	G	A	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=3.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.65;ReadPosRankSum=0.369;SOR=0.124;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr10	127731740	rs78012616	C	T	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.78;ReadPosRankSum=-0.338;SOR=0.947;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,28:0.22:126
chr10	127731811	rs7923954	C	G	830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=21;PP=499;ReadPosRankSum=1.211;SC=GAGCCCCCCCCCAACACTGAC;SOR=0.990;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=30;WE=127731819;WS=127731801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,34:0.77:44
chr10	127734486	rs1710312	C	T	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=96;ReadPosRankSum=-1.757;SC=GAAATGAATACCTTTAGAAGA;SOR=0.336;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=10;WE=127734494;WS=127734476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
chr10	127734513	rs1710313	A	C	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.155;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=229;ReadPosRankSum=0.451;SC=TTCAAACACAATAACTGCTCT;SOR=1.316;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=57;TCF=41;TCR=16;TR=19;WE=127734521;WS=127734503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,19:0.30:64
chr10	127753361	rs2279090	T	C	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.548;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=72;ReadPosRankSum=1.043;SC=GCCGAGCTTGTGGCGGCCACG;SOR=0.473;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=7;WE=127753369;WS=127753351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr10	127753478	rs1278279	G	A	790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.731;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=18;PP=470;ReadPosRankSum=1.142;SC=GCAGGTACACGTTGGCTGGGC;SOR=0.600;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=95;TCF=59;TCR=36;TR=40;WE=127753486;WS=127753468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,43:0.39:110
chr10	127755522	rs7084322	T	C	1075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.06;ReadPosRankSum=0.477;SOR=0.651;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,29:0.43:67
chr10	127755522	.	TTA	CTG	1098	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=4;NR=20;PP=1098;QD=47.9778281193;SC=TTTCCGTCTGTTAGGAAAGCA;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=62;TCF=13;TCR=49;TR=24;WE=127755532;WS=127755512;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:38,24:0.39:62
chr10	127755524	rs7080721	A	G	1075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.55;ReadPosRankSum=0.200;SOR=0.586;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,29:0.45:65
chr10	127755544	rs1278280	T	G	1313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=36;PP=1014;SC=AGCTTCTGCTTTTTATGAACC;SOR=3.767;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=5;TCR=36;TR=41;WE=127755552;WS=127755534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr10	127759943	rs7903316	T	A	325.41	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=237;ReadPosRankSum=1.060;SC=CTTCCTGAGTTCTAGTACTTT;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=13;WE=127759951;WS=127759933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
chr10	127786969	rs2290842	A	G	1470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=24;PP=768;ReadPosRankSum=-1.356;SC=ACCAGCTCCCAATGCCCTTGG;SOR=0.692;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=115;TCF=65;TCR=50;TR=58;WE=127786977;WS=127786959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,69:0.51:136
chr10	127829012	rs1551678	C	G	493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=7;PP=316;SC=CAACAACTCACTTGAAGTATT;SOR=1.292;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=12;TCR=7;TR=19;WE=127829020;WS=127829002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr10	127829043	rs71490760	G	A	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=161;ReadPosRankSum=-0.288;SC=GAGGAGGGGGGTGGATTTCAG;SOR=0.665;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=13;WE=127829051;WS=127829033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr10	127829304	rs17154306	G	A	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.409;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=73;ReadPosRankSum=1.915;SC=GTCTCATTAAGTGTTTAAACA;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=127829312;WS=127829294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr10	127843641	rs1466358	T	C	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=98;ReadPosRankSum=-0.032;SC=GGATTTATAATAGAACGCCTA;SOR=0.458;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=7;WE=127843649;WS=127843631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,7:0.25:28
chr10	127843740	rs1466359	G	T	900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.23;ReadPosRankSum=1.211;SOR=0.667;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:155,58:0.27:213
chr10	127843756	rs1466360	G	A	1245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.386;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=27;PP=753;ReadPosRankSum=-0.890;SC=CACAGATCCAGTGGTGTAAGA;SOR=0.891;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=222;TCF=126;TCR=96;TR=67;WE=127843764;WS=127843746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,74:0.30:248
chr10	127843921	rs1466361	T	C	886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.224;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=28;PP=618;ReadPosRankSum=0.250;SC=CAGAATTGCATTGATACATTG;SOR=1.014;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=148;TCF=58;TCR=90;TR=45;WE=127843929;WS=127843911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,48:0.32:149
chr10	127967660	rs17154652	C	T	1888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.696;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=40;PP=1122;ReadPosRankSum=0.645;SC=ATAAACGATGCGGTCAACCTA;SOR=0.611;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=115;TCF=52;TCR=63;TR=74;WE=127967668;WS=127967650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,86:0.67:129
chr10	128019025	rs3740199	C	G	3948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=65;PP=2316;SC=TCCCCACTCCCAACAGAGGCA;SOR=0.747;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=135;TCF=70;TCR=65;TR=135;WE=128019033;WS=128019015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr10	128153623	rs7079392	G	A	488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=15;PP=405;SC=GACTTCTACCGCACATGGTGC;SOR=3.383;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=128153631;WS=128153613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	128202435	rs1436803	T	C	4681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=73;PP=2436;SC=AGTCAGATTTTGCCTCTGTGA;SOR=0.822;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=164;TCF=91;TCR=73;TR=164;WE=128202443;WS=128202425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr10	128209769	rs2099552	T	C	1201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=26;NR=14;PP=678;SC=TGGGGCCTCATACAGTACTGG;SOR=1.038;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=26;TCR=14;TR=40;WE=128209777;WS=128209759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr10	128209797	rs2099553	C	T	1381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=17;PP=703;SC=AGATACTCAGCGTGGACAGAA;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=27;TCR=17;TR=44;WE=128209805;WS=128209787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr10	128209959	rs4962342	G	T	1030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=20;PP=544;SC=TGTATTTGGCGACATGAAAGA;SOR=1.670;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=11;TCR=20;TR=31;WE=128209967;WS=128209949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr10	128335225	rs2842149	T	C	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.24;ReadPosRankSum=-1.231;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,11:0.25:44
chr10	128797717	rs2275540	T	C	2785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-2.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=57;PP=1235;ReadPosRankSum=0.176;SC=CACCCAAAGATGCTTAGTTGA;SOR=0.726;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=172;TCF=86;TCR=86;TR=112;WE=128797725;WS=128797707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,135:0.65:209
chr10	128797809	rs41282888	T	C	742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=19;PP=336;ReadPosRankSum=1.047;SC=CTGGGATGCCTGTATACAGGT;SOR=0.748;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=49;TCF=19;TCR=30;TR=31;WE=128797817;WS=128797799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,36:0.65:55
chr10	128806888	rs9418761	G	C	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.859;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=174;ReadPosRankSum=0.603;SC=TGAGAAAACAGCTTTTGCTGT;SOR=1.350;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=40;TCF=28;TCR=12;TR=14;WE=128806896;WS=128806878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,16:0.34:47
chr10	128810642	rs9418773	C	T	814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FS=0.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.50;ReadPosRankSum=1.159;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:176,57:0.24:233
chr10	128810669	rs9418691	C	T	630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.58;ReadPosRankSum=-2.503;SOR=0.688;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:132,44:0.25:176
chr10	128821415	rs2050812	G	A	1176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.342;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=11;PP=663;ReadPosRankSum=-0.332;SC=TCACAATTACGCTATTAATAA;SOR=0.087;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=67;TCF=53;TCR=14;TR=44;WE=128821423;WS=128821405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,51:0.68:75
chr10	128822842	rs9418706	G	A	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.04;ReadPosRankSum=0.258;SOR=1.071;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr10	128830336	rs2275534	G	A	805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=6;PP=515;ReadPosRankSum=-0.621;SC=ATAACAAAGGGTGGCAAAAAT;SOR=0.639;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=43;TCF=35;TCR=8;TR=31;WE=128830344;WS=128830326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,34:0.72:47
chr10	128830592	rs9418802	C	T	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=83;ReadPosRankSum=1.457;SC=ACGGTGCGTTCGAGAGGAGAA;SOR=0.770;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=42;TCF=13;TCR=29;TR=11;WE=128830600;WS=128830582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,10:0.21:48
chr10	128836214	rs7085407	G	C	81.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.26;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr10	128840842	rs880272	A	G	1568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=11;PP=1035;SC=TGTGTGGGGGAAGTCCGGTGG;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=38;TCR=11;TR=49;WE=128840850;WS=128840832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr10	128841570	rs882052	T	C	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=26;ReadPosRankSum=-0.566;SC=TTTTTAGTATTGTTTCCCTCT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=128841578;WS=128841560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr10	128850789	.	CAA	C	63	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;FR=0.9966;HP=18;HapScore=2;MGOF=30;MMLQ=18;MQ=57.57;NF=4;NR=1;PP=63;QD=13.2;SC=CTGTCTCAAACAAAAAAAAAA;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=5;WE=128850798;WS=128850787;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr10	128850841	rs9418817	T	C	716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=5;PP=541;SC=TACTGATAGATGGAAACCAAA;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=26;WE=128850849;WS=128850831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr10	128859743	rs4751523	C	T	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=30;ReadPosRankSum=-1.179;SC=TGTGGAGGCACGCTGCCTTGG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=4;WE=128859751;WS=128859733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr10	128923954	rs1186355	A	C	3098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=58;PP=1546;SC=TAAAAATGAAAGGTCTTGATT;SOR=1.085;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=44;TCR=58;TR=102;WE=128923962;WS=128923944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr10	128925761	rs1153016	A	T	727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=5;PP=472;SC=ATTAATAAAAACCCCTGAGTT;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=26;WE=128925769;WS=128925751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr10	128926013	rs1060561	A	G	3959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=66;PP=2221;SC=CCATGGGACGAGATTCTGAAC;SOR=1.012;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=62;TCR=67;TR=128;WE=128926021;WS=128926003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr10	128952219	rs34225417	C	T	1157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=32;PP=627;ReadPosRankSum=-0.368;SC=GCATTACAAGCGGTGGCTGGG;SOR=0.674;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=188;TCF=91;TCR=97;TR=59;WE=128952234;WS=128952209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,69:0.32:215
chr10	128952265	rs7068954	A	G	3881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=70;PP=2219;SC=CCTCAAATCAAATGCCTTCCC;SOR=1.368;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=49;TCR=70;TR=119;WE=128952273;WS=128952255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr10	128974220	rs11594560	G	A	1706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.943;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=43;PP=890;ReadPosRankSum=1.126;SC=CTTCTCTTTCGCATCTGTTAG;SOR=0.765;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=254;TCF=126;TCR=128;TR=84;WE=128974228;WS=128974210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:193,98:0.34:291
chr10	128974621	rs2489386	C	T	3575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.352;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=73;PP=2031;ReadPosRankSum=-0.449;SC=CACTCTCCGACGTTGTGAGTA;SOR=0.629;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=220;TCF=115;TCR=105;TR=151;WE=128974629;WS=128974611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,166:0.68:243
chr10	128974713	rs2489385	C	T	2439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=1.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.18;ReadPosRankSum=-2.753;SOR=0.938;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,68:0.62:110
chr10	128974716	rs2489384	A	G	2417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.19;ReadPosRankSum=-0.965;SOR=0.829;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,55:0.57:96
chr10	129046407	rs3740013	T	C	686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.810;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=23;PP=355;ReadPosRankSum=-0.665;SC=CACATAACCATGTTTTAGGGC;SOR=0.557;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=90;TCF=34;TCR=56;TR=38;WE=129046415;WS=129046397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,39:0.41:96
chr10	129160313	rs2296636	C	T	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.750;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=9;PP=357;ReadPosRankSum=-0.298;SC=GAATATTGTACCTCTTTTTTC;SOR=0.976;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=99;TCF=67;TCR=32;TR=29;WE=129160321;WS=129160303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,31:0.27:114
chr10	129178159	.	C	CA	27	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=10;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=18;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=27;QD=13.0;SC=GTTTGACTAGCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=3;WE=129178167;WS=129178149;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,3:0.33:9
chr10	129179426	rs7099958	T	C	676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=0;PP=605;SC=TTATGAACATTGTAAAAAGGA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=129179434;WS=129179416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	129179653	rs6482833	C	T	1752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.467;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=42;PP=1035;ReadPosRankSum=-0.422;SC=TTACCAGTCACCTTGATGATT;SOR=1.003;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=109;TCF=42;TCR=67;TR=66;WE=129179661;WS=129179643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,76:0.62:122
chr10	129183015	rs878562	T	G	920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=3;PP=671;SC=CCCTGGGTGTTTCCGCCTCGG;SOR=3.334;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=27;WE=129183023;WS=129183005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr10	129237572	rs1926427	G	A	647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.784;HP=1;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=22;PP=949;ReadPosRankSum=-0.190;SC=CAGGGCTGACGGTGGGCTCTT;SOR=2.468;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=23;WE=129237588;WS=129237562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,23:0.77:30
chr10	129237580	rs2275052	C	T	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=215;ReadPosRankSum=0.172;SC=ACGGTGGGCTCTTATTGAACT;SOR=0.116;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=6;WE=129237588;WS=129237562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,6:0.24:25
chr10	129242515	rs11371	G	A	2910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.533;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=66;PP=1806;ReadPosRankSum=1.418;SC=TTACACCAAGGGCCAAGCTCA;SOR=0.760;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=189;TCF=89;TCR=100;TR=124;WE=129242523;WS=129242505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,133:0.64:207
chr10	129242555	rs2275053	G	A	1674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.433;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=41;PP=969;ReadPosRankSum=0.340;SC=TAAGTGGAACGCTCCCCACAT;SOR=0.500;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=114;TCF=47;TCR=67;TR=72;WE=129242563;WS=129242545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,77:0.63:123
chr10	129249662	rs2229603	G	A	2023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=32;NR=29;PP=1586;SC=TCGCAAGCAGGCATCGGTGGA;SOR=0.721;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=32;TCR=29;TR=61;WE=129249684;WS=129249652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr10	129249676	rs2229604	C	T	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.947;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=7;PP=185;ReadPosRankSum=-1.256;SC=CGGTGGACTCCGGGATCGTGC;SOR=0.835;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=70;TCF=40;TCR=30;TR=19;WE=129249684;WS=129249652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,21:0.26:81
chr10	129249693	rs2229605	G	A	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=2.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.29;ReadPosRankSum=-1.663;SOR=0.430;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,30:0.28:106
chr10	129249701	rs2229606	C	G	3502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=37;PP=958;SC=ACGTCGCAAGCCTCTCTGGAA;SOR=0.951;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=54;TCR=37;TR=91;WE=129249709;WS=129249683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr10	129249914	rs3824814	T	C	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.046;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=258;ReadPosRankSum=1.303;SC=CGGGATGTGCTATCGTAGTTA;SOR=1.262;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=7;WE=129249933;WS=129249904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr10	129249925	rs10765104	T	C	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=258;ReadPosRankSum=1.122;SC=ATCGTAGTTATCAGAGTTGGG;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=6;WE=129249933;WS=129249904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr10	129534478	rs147236104	A	AGCGCGGC	143	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.9990;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=0;PP=51;SC=TACCCAGCCCAGCGTCAGCCT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=1;WE=129534486;WS=129534468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr10	129534679	rs4751501	T	C	2949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.34;SOR=0.970;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr10	129534739	rs4751502	C	G	4579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=93;NR=60;PP=2448;SC=CCGGACTCCCCGGCTTGGGAA;SOR=1.026;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=153;TCF=93;TCR=60;TR=153;WE=129534747;WS=129534729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr10	129534864	rs4751503	A	C	5914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=110;NR=96;PP=2965;SC=GGGTTGAGGGAGCGAGGACTC;SOR=0.739;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=206;TCF=110;TCR=96;TR=206;WE=129534872;WS=129534854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr10	129536642	rs7085541	G	A	665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.55;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	129536648	rs7085544	G	T	695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.93;SOR=5.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	129690774	rs201802645	C	T	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.010;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=196;ReadPosRankSum=-0.351;SC=TGACATAAACCTTAATTCAAT;SOR=0.206;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=47;TCF=40;TCR=7;TR=15;WE=129690782;WS=129690764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,15:0.29:52
chr10	129834390	rs138694141	G	GT	534.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=444;ReadPosRankSum=-0.314;SC=CCTACCCTGGGTGTGTACCTC;SOR=0.387;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=11;WE=129834398;WS=129834380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,17:0.81:21
chr10	129845547	rs4262642	A	C	1493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=14;PP=832;SC=ACTTTACAAAATATAGTTTGG;SOR=1.342;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=35;TCR=14;TR=49;WE=129845555;WS=129845537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr10	129845902	rs71474240	G	A	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=2.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.24;ReadPosRankSum=-1.318;SOR=0.425;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,25:0.28:89
chr10	129846010	rs7911904	G	A	6197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=103;NR=96;PP=2965;SC=GAAACCTAACGCATCCTGTGT;SOR=0.719;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=200;TCF=104;TCR=96;TR=199;WE=129846018;WS=129846000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr10	129854369	rs4424589	T	C	3998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=66;PP=2165;SC=TTCATACTAATGCTACATTTT;SOR=0.719;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=74;TCR=67;TR=139;WE=129854377;WS=129854359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr10	129859061	rs28411949	T	C	1329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.49;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr10	129859065	rs11016046	T	C	1363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.62;SOR=4.680;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr10	129859769	rs9943332	G	A	157.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=0;PP=53;SC=GACGTATGAAGTAGGATTTGT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=129859777;WS=129859760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	129866449	rs7100666	C	G	1471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FS=0.494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.32;ReadPosRankSum=-0.424;SOR=0.644;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:146,87:0.37:233
chr10	129866558	rs41282864	G	A	1985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.729;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=45;PP=1206;ReadPosRankSum=2.270;SC=TAGGTACGCTGTGGGGGCCAC;SOR=0.582;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=115;TCF=48;TCR=67;TR=79;WE=129866566;WS=129866548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,86:0.68:126
chr10	129866592	rs41282866	C	T	1202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.585;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=30;PP=810;ReadPosRankSum=-0.178;SC=CAAGGGCAGGCCACAGTGGGA;SOR=0.404;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=62;TCF=21;TCR=41;TR=47;WE=129866600;WS=129866582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,49:0.75:65
chr10	129869247	rs41282870	G	A	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=78;ReadPosRankSum=0.264;SC=GCCATTGACCGCTTACCCCTG;SOR=1.863;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=6;WE=129869255;WS=129869237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr10	129870293	rs11016049	G	C	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=199;ReadPosRankSum=1.458;SC=TTGGCTTTACGTAGTGATTTT;SOR=0.793;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=10;WE=129870301;WS=129870283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr10	129870622	rs34882498	TA	T	190.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=1.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.22;MQRankSum=1.469;QD=4.89;ReadPosRankSum=-0.194;SOR=1.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,13:0.33:39
chr10	129871690	rs2275803	A	G	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=2.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.97;ReadPosRankSum=0.404;SOR=0.338;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,15:0.20:74
chr10	129871747	rs2275802	C	T	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.798;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=73;ReadPosRankSum=2.769;SC=TGAGGAGTGCCGCCCAGCCCG;SOR=0.204;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=9;WE=129871755;WS=129871737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr10	129871766	rs3216057	A	AG	356.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.808;HP=3;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=118;ReadPosRankSum=1.227;SC=CGGTCCCTCCAGGGCAGCCTG;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=5;WE=129871774;WS=129871756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr10	129871795	rs11016053	C	T	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=43;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=34;ReadPosRankSum=-0.439;SC=AGGCACTGTCCCCGTTCATTA;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=3;WE=129871803;WS=129871785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr10	129883291	rs4750684	G	T	1242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.60;ReadPosRankSum=0.075;SOR=0.647;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:147,75:0.34:222
chr10	129883370	rs1129205	A	G	9438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.06;SOR=0.904;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr10	129883370	.	AGACTCTC	GGACTCTA,GGACTCTC	1898	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MMLQ=20;MQ=60.0;NF=65,107;NR=74,112;PP=1898,717;QD=14.0393372292;SC=CCAGGACGCAAGACTCTCCCC;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=219;TCF=107;TCR=112;TR=139,219;WE=129883385;WS=129883360;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.63:219
chr10	129883377	rs7898794	C	A	3377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.62;ReadPosRankSum=0.554;SOR=0.713;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,156:0.68:231
chr10	129897565	rs3781301	C	T	552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.858;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=14;PP=314;ReadPosRankSum=0.234;SC=ATTTAAACACCCATTTTTAGA;SOR=0.888;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=75;TCF=36;TCR=39;TR=25;WE=129897573;WS=129897555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,30:0.34:88
chr10	129899543	rs10082504	C	T	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=187;ReadPosRankSum=-0.913;SC=TTTCTGCACACCTCTTGACAC;SOR=0.693;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=13;WE=129899551;WS=129899533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr10	129899578	rs8473	T	C	1799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=17;PP=954;SC=TGCACAGATTTGCTCTCCAAA;SOR=1.249;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=36;TCR=17;TR=53;WE=129899586;WS=129899568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr10	129899778	rs11106	G	C	3804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=55;PP=2369;SC=TTTGTTCTCAGTGACTTTGTC;SOR=0.783;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=123;TCF=68;TCR=55;TR=123;WE=129899786;WS=129899768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr10	129900858	rs3191122	C	T	1971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.864;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=37;PP=1185;ReadPosRankSum=1.852;SC=TTTCAGGGACCGAGTCTTGTA;SOR=0.737;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=134;TCF=68;TCR=66;TR=78;WE=129900866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,90:0.58:156
chr10	129901393	rs11016071	T	C	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=3.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.54;ReadPosRankSum=1.099;SOR=0.860;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,23:0.31:75
chr10	129901501	rs2071496	G	C	2173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=39;PP=1346;ReadPosRankSum=-1.023;SC=GGTGTGCGTGGTCTCCCCTGA;SOR=0.745;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=131;TCF=76;TCR=55;TR=93;WE=129901509;WS=129901491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,99:0.69:144
chr10	129901722	rs10082432	G	A	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.39;ReadPosRankSum=-0.520;SOR=0.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,19:0.23:81
chr10	129901726	rs10082533	C	T	601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.25;ReadPosRankSum=-1.135;SOR=0.500;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,20:0.24:83
chr10	129901747	rs10764749	C	T	1479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=19;PP=966;ReadPosRankSum=1.899;SC=TGCTCTTGGCCGTCTCCTGCT;SOR=0.668;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=73;TCF=47;TCR=26;TR=55;WE=129901755;WS=129901737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,61:0.73:83
chr10	129901825	rs10082391	T	C	1053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FS=1.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.83;ReadPosRankSum=-0.053;SOR=0.805;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:152,66:0.30:218
chr10	129901946	rs1050767	T	G	1274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.778;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=24;PP=678;ReadPosRankSum=1.265;SC=TGCCTCTTTGTGCTTGCTGTG;SOR=0.554;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=148;TCF=72;TCR=76;TR=56;WE=129901954;WS=129901929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,65:0.38:169
chr10	129902158	rs12777740	C	T	1172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=25;PP=596;ReadPosRankSum=-0.835;SC=CTTCTTTGCACGTTGCTTCAA;SOR=0.646;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=153;TCF=84;TCR=69;TR=55;WE=129902166;WS=129902148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,64:0.37:172
chr10	129902281	rs1063535	G	A	4000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=63;PP=2402;ReadPosRankSum=0.085;SC=TTCTTTCCTGGGACGTGTCTT;SOR=0.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=128;TCF=65;TCR=63;TR=128;WE=129902289;WS=129902271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,146:0.99:147
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chr10	129905429	rs7918199	C	T	1371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.124;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=25;PP=795;ReadPosRankSum=-2.141;SC=AGTTTCTGCACTGGAGTTCCC;SOR=0.508;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=129;TCF=79;TCR=50;TR=59;WE=129905437;WS=129905419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,65:0.45:146
chr10	129906364	rs4750685	G	A	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=0.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.63;ReadPosRankSum=0.838;SOR=0.531;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,24:0.24:101
chr10	129906468	rs4750936	C	T	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.406;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=9;PP=179;ReadPosRankSum=1.194;SC=CCTTAGGAGTCTGTAGCTGTC;SOR=0.537;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=67;TCF=39;TCR=28;TR=19;WE=129906476;WS=129906458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,23:0.32:73
chr10	129906980	rs2152143	C	T	4436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=80;PP=2434;ReadPosRankSum=-0.439;SC=GTGAACTTGCCGACTGCTAGG;SOR=0.688;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=261;TCF=135;TCR=126;TR=168;WE=129906988;WS=129906970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,197:0.64:307
chr10	129907544	rs2240	G	C	1790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.997;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=41;PP=1134;ReadPosRankSum=-0.948;SC=TTTGTCTCCAGAGAAGTCATT;SOR=0.626;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=225;TCF=110;TCR=115;TR=80;WE=129907552;WS=129907534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,92:0.37:251
chr10	129907741	rs2065718	G	A	663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.291;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=19;PP=427;ReadPosRankSum=1.095;SC=CATGTCAATCGAGTATTACAG;SOR=0.960;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=43;TCF=12;TCR=31;TR=26;WE=129907749;WS=129907731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,28:0.62:45
chr10	129910475	rs997983	T	G	1429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=31;PP=875;ReadPosRankSum=-0.756;SC=CTTCGGCTGATAGACACTCTC;SOR=0.658;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=219;TCF=116;TCR=103;TR=67;WE=129910483;WS=129910465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,78:0.32:243
chr10	129911856	rs11016076	C	G	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.302;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=302;ReadPosRankSum=1.187;SC=AAGGTATTCCCTCACTCTCAT;SOR=1.135;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=81;TCF=28;TCR=53;TR=23;WE=129911864;WS=129911846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,26:0.28:92
chr10	129911919	rs12255393	T	A	579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=460;ReadPosRankSum=0.642;SC=ATACCAAGACTAGTGATTTAT;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=21;WE=129911927;WS=129911909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,21:0.78:27
chr10	129913960	rs7095325	A	T	599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.040;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=11;PP=399;ReadPosRankSum=-0.128;SC=TAAAGCTTCCAAAAGGGAGAT;SOR=1.139;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=92;TCF=52;TCR=40;TR=29;WE=129913968;WS=129913950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,31:0.30:103
chr10	129917560	rs2071498	T	C	2472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=37;PP=1532;SC=CTTCCTTCCATTCTGAAGACT;SOR=0.738;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=43;TCR=37;TR=80;WE=129917568;WS=129917550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr10	129921195	rs1063536	A	T	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=5.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.35;ReadPosRankSum=0.237;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,19:0.26:74
chr10	131265665	rs16906255	T	G	2026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=40;PP=1201;SC=CCGTCGGGTGTGGGGCCGCCC;SOR=1.349;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=27;TCR=40;TR=67;WE=131265673;WS=131265655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr10	131334789	rs10734087	T	C	653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=22;PP=524;SC=CTCAAAACAGTGTGCTGCGAC;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=24;WE=131334797;WS=131334779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr10	131639306	.	T	TCC	65	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;FR=0.5029;HP=9;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=17;MQ=60.83;NF=1;NR=4;PP=65;QD=15.8;SC=ACTGTTGAAATCCCCCCCCCG;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=5;WE=131639314;WS=131639296;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:5,5:0.50:10
chr10	131641361	rs35210769	T	TG	1088.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.153;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=10;PP=760;ReadPosRankSum=1.304;SC=GGTTCTGGCATGGGGGGGAGG;SOR=0.960;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=51;TCF=32;TCR=19;TR=31;WE=131641369;WS=131641351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,44:0.70:63
chr10	131760352	rs573370	A	G	950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.967;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=8;PP=562;ReadPosRankSum=-0.068;SC=CACGAGATCCATTTGTCAGTG;SOR=1.552;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=56;TCF=41;TCR=15;TR=36;WE=131760360;WS=131760342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,42:0.67:63
chr10	131904286	rs61749960	G	A	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.263;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=125;ReadPosRankSum=0.518;SC=TTACTGCGGCGACCGCCAGAG;SOR=0.165;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=11;WE=131904294;WS=131904276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,15:0.45:33
chr10	131905056	rs149953039	C	T	2195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=27;PP=1313;ReadPosRankSum=1.339;SC=TTGAAGACTCCAAAGTACATG;SOR=0.698;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=116;TCF=77;TCR=39;TR=81;WE=131905064;WS=131905046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,90:0.69:131
chr10	131906096	rs55975328	C	T	2846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=53;PP=1613;ReadPosRankSum=3.934;SC=CTGTCACTTCCGAGGGAACAG;SOR=0.704;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=184;TCF=98;TCR=86;TR=113;WE=131906104;WS=131906086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,130:0.62:208
chr10	131934552	rs2274221	T	C	90.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.51;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr10	131943423	rs7073590	G	T	705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=7;PP=322;SC=CAGTATTTGTGTATTTCCAAA;SOR=1.101;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=22;WE=131943431;WS=131943413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr10	131943719	rs7922450	T	G	109.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=4;PP=86;SC=CTGAGTTCAGTAGTTTGAGAC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=131943727;WS=131943709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr10	131965026	rs3736899	A	G	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=13;PP=364;ReadPosRankSum=1.870;SC=TCTAAGATACAAATTTCTTAT;SOR=0.542;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=34;TCF=12;TCR=22;TR=21;WE=131965034;WS=131965016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,21:0.58:36
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chr10	132915202	rs2298193	A	G	1069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.562;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=18;PP=575;ReadPosRankSum=0.423;SC=TCGGTCCTTCAGGAACACAAG;SOR=0.745;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=90;TCF=49;TCR=41;TR=45;WE=132915210;WS=132915192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,53:0.50:105
chr10	132961555	rs11416735	C	CA	887.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.850;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=498;ReadPosRankSum=-0.887;SC=GAGGAATAAACAAATCTCCTG;SOR=0.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=3;TCR=42;TR=16;WE=132961563;WS=132961545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,35:0.43:81
chr10	133109602	rs148913526	G	A	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.097;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.43;ReadPosRankSum=0.718;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr10	133109785	.	GGGC	G	46	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=1;NR=1;PP=46;QD=30.0;SC=TCCAGACCCAGGGCGGCGGCG;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=2;WE=133109795;WS=133109775;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:9,2:0.18:11
chr10	133608210	rs4897741	A	G	811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.509;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=20;PP=430;ReadPosRankSum=-2.104;SC=GGCCCAGGGCACAGGCTGCAT;SOR=0.866;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=111;TCF=54;TCR=57;TR=39;WE=133608218;WS=133608200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,44:0.37:120
chr10	133608355	rs72847043	G	A	782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=17;PP=399;ReadPosRankSum=-0.686;SC=GGAGCCTCCCGTTCCTGCCTC;SOR=0.672;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=108;TCF=62;TCR=46;TR=40;WE=133608363;WS=133608345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,44:0.38:116
chr10	133754334	rs10870270	G	A	581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=21;PP=428;ReadPosRankSum=0.819;SC=CCTGAAAGTCGTTTGCACTCA;SOR=1.209;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=23;WE=133754342;WS=133754324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,24:0.71:34
chr10	133761285	rs34473884	G	A	1705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.944;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=49;PP=1086;ReadPosRankSum=-0.761;SC=TTGCTGGAACGGTTCGGATAG;SOR=0.764;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=271;TCF=128;TCR=143;TR=92;WE=133761293;WS=133761275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:195,98:0.33:293
chr10	133769482	rs7894	G	C	1651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=2.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.55;ReadPosRankSum=0.384;SOR=0.533;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,82:0.57:143
chr10	133795202	rs142589527	T	TTGGCCTCCCTC	1712.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-0.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=2972;ReadPosRankSum=1.474;SC=TGGCGCCCTCTTGGCCTTCCC;SOR=0.793;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=13;WE=133795210;WS=133795192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,40:0.74:54
chr10	133918372	rs10870252	G	A	950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.146;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=19;PP=439;ReadPosRankSum=0.228;SC=CCCTCGCGGCGCTGCAGGCGG;SOR=0.531;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=130;TCF=79;TCR=51;TR=44;WE=133918380;WS=133918362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,53:0.36:149
chr10	133918466	rs10870253	T	C	707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.482;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=23;PP=471;ReadPosRankSum=1.514;SC=TCCCCAGACCTCCACCCTTGA;SOR=1.044;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=115;TCF=52;TCR=63;TR=38;WE=133918474;WS=133918456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,41:0.31:131
chr10	133948439	rs11146206	C	T	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=97;ReadPosRankSum=0.176;SC=GAGGTAAAGGCGCGCGTCCCA;SOR=0.392;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=8;WE=133948447;WS=133948429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr10	133948456	rs2637643	C	T	1160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=9;PP=733;SC=CCCACGGCAGCGTTTTTGTTC;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=32;TCR=9;TR=41;WE=133948464;WS=133948446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr10	133948634	rs2814182	T	C	1732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=23;NR=34;PP=855;SC=AGGACCGCAATGCATTGCTGT;SOR=1.263;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=23;TCR=34;TR=57;WE=133948642;WS=133948624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr10	133948689	rs2637644	C	T	588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=9;NR=12;PP=332;SC=GGGCTTCTGGCTCCTGGGGGT;SOR=1.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=9;TCR=12;TR=21;WE=133948697;WS=133948679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	133950516	.	G	A	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.145;ClippingRankSum=0.000;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=7.691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.28;ReadPosRankSum=-1.867;SOR=0.388;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,27:0.30:91
chr10	133951501	rs57086821	CA	C	1873.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=9;PP=1379;SC=GGTGTGGGGACAAGCCAGCCC;SOR=2.348;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=39;TCF=28;TCR=11;TR=34;WE=133951509;WS=133951491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr10	133951707	rs2814179	G	A	2391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.886;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=38;PP=1872;ReadPosRankSum=-0.548;SC=ACCGGCACGTGCGGAGAGTAC;SOR=0.887;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=86;TCF=33;TCR=53;TR=60;WE=133951726;WS=133951697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,65:0.70:93
chr10	133951718	rs2637646	G	A	2135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=32;PP=1862;ReadPosRankSum=-2.705;SC=CGGAGAGTACGCCGGGTGTGT;SOR=0.732;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=24;TCR=45;TR=49;WE=133951726;WS=133951697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,54:0.72:75
chr10	133954011	rs2818387	C	T	2298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=49;PP=1288;ReadPosRankSum=-1.804;SC=TGGAATCCGACGGCTCCTCCG;SOR=0.678;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=60;TCR=74;TR=90;WE=133954019;WS=133954001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,106:0.68:155
chr10	133955569	rs5789117	C	CCG	2593.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=35;PP=1721;SC=GTGACTTCCACCGCGCGTTCC;SOR=1.721;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=44;TCF=2;TCR=42;TR=37;WE=133955577;WS=133955559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr10	133958541	rs2637627	C	T	4326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=58;PP=2590;SC=TTCTGACGTCCCACGAGTGTG;SOR=0.944;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=143;TCF=85;TCR=58;TR=143;WE=133958549;WS=133958531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
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chr10	133961494	rs2818384	C	T	3238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=55;NR=46;PP=1573;SC=GGCTCAGACACGAGGTGCAGG;SOR=0.742;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=101;TCF=55;TCR=46;TR=101;WE=133961502;WS=133961484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr10	133961564	rs2818383	T	C	1429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=30;PP=745;SC=GGTAGCTGAGTGGATGGCCAG;SOR=1.140;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=23;TCR=30;TR=53;WE=133961572;WS=133961554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr10	133961636	rs111344225	C	CTGAACA	231.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=2;PP=193;SC=ACACAAAGCCCTGAACATGAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=2;WE=133961644;WS=133961626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
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chr10	133963466	rs9419380	A	G	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.44;ReadPosRankSum=1.928;SOR=0.663;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,25:0.37:68
chr10	133963499	rs117391524	C	T	1283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=23;PP=719;ReadPosRankSum=1.615;SC=ATTGTGGTTGCGGAGCTGATG;SOR=0.690;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=89;TCF=56;TCR=33;TR=57;WE=133963507;WS=133963489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,63:0.62:102
chr10	133967593	rs7906747	C	T	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.05;ReadPosRankSum=-0.583;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,3:0.20:15
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chr10	133976769	.	T	C	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=0.000;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.61;ReadPosRankSum=-0.517;SOR=0.740;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,11:0.13:83
chr10	133976772	.	G	A	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.190;ClippingRankSum=0.000;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.67;ReadPosRankSum=-0.832;SOR=0.706;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,11:0.14:80
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chr10	133976793	.	G	A	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=0.000;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=-2.739;QD=3.44;ReadPosRankSum=0.332;SOR=0.523;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,8:0.11:70
chr10	133976796	.	G	A	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.078;ClippingRankSum=0.000;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=1.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=-2.539;QD=2.32;ReadPosRankSum=-0.285;SOR=0.711;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,9:0.13:69
chr10	133976799	.	G	A	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=0.000;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=1.416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQRankSum=-2.450;QD=2.52;ReadPosRankSum=-0.152;SOR=0.742;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,9:0.13:67
chr10	133976802	rs372743812	C	T	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=1.426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQRankSum=-2.427;QD=2.82;ReadPosRankSum=-0.271;SOR=0.718;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,9:0.14:64
chr10	133976850	.	T	C	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.264;ClippingRankSum=0.000;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=5.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQRankSum=-2.740;QD=4.90;ReadPosRankSum=0.553;SOR=0.525;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,9:0.21:43
chr10	133976857	.	C	A	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.747;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=4.061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQRankSum=-2.715;QD=6.75;ReadPosRankSum=1.102;SOR=0.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,7:0.21:33
chr10	133976859	.	C	A	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.566;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=4.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQRankSum=-2.661;QD=5.87;ReadPosRankSum=0.935;SOR=0.595;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,7:0.22:32
chr10	133976862	.	G	A	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=7.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQRankSum=-2.876;QD=6.15;ReadPosRankSum=1.652;SOR=1.108;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,6:0.19:31
chr10	133976865	.	G	C	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=7.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQRankSum=-2.876;QD=4.80;ReadPosRankSum=1.602;SOR=1.108;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,6:0.19:31
chr10	133976868	rs138755886	C	T	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=7.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQRankSum=-2.695;QD=5.21;ReadPosRankSum=1.177;SOR=1.108;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,6:0.21:28
chr10	133976871	.	C	A	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.092;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=7.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQRankSum=-2.695;QD=5.31;ReadPosRankSum=1.009;SOR=1.108;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,6:0.21:28
chr10	133976881	.	C	A	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.561;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=7.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQRankSum=-2.757;QD=5.34;ReadPosRankSum=1.078;SOR=1.130;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,6:0.21:29
chr10	133976883	.	G	A	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.965;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=7.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQRankSum=-2.757;QD=5.34;ReadPosRankSum=0.890;SOR=1.130;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,6:0.21:29
chr10	133976895	.	G	A	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=4.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQRankSum=-2.215;QD=4.94;ReadPosRankSum=-2.650;SOR=1.123;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr10	133980657	rs141430338	C	T	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=337;ReadPosRankSum=0.337;SC=ACCTGCCATTCGATCAACTGG;SOR=0.756;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=19;WE=133980665;WS=133980647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,19:0.70:27
chr10	133981414	rs2637651	C	T	1602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=3.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.03;MQRankSum=-3.117;QD=21.96;ReadPosRankSum=0.520;SOR=1.154;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,41:0.56:73
chr10	133981422	rs2637650	C	T	1642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=5.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.84;MQRankSum=-2.671;QD=18.25;ReadPosRankSum=2.125;SOR=1.276;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,44:0.49:90
chr10	133981682	rs4880338	G	A	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.72;ReadPosRankSum=0.199;SOR=0.651;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,29:0.24:120
chr10	133981983	rs2814172	T	C	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.724;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=262;ReadPosRankSum=-0.291;SC=CCCCGACGCCTCAGGGGCCCC;SOR=0.086;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=15;WE=133981991;WS=133981973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
chr10	134000498	.	TCCCCCCGCCCGC	T	930	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5072;HP=6;HapScore=1;MGOF=14;MMLQ=25;MQ=55.55;NF=0;NR=3;PP=930;QD=318.333333333;SC=GGCTCACGCGTCCCCCCGCCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=134000517;WS=134000488;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:0,3:1.00:3
chr10	134010224	rs1552681	C	G	311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=1;PP=263;SC=GGGACTGCTCCCAGGGCTGGC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=134010232;WS=134010214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
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chr10	134013856	rs871883	G	T	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.266;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=8;PP=420;ReadPosRankSum=0.005;SC=GCCTCGTGCTGCAGGGGTGGT;SOR=1.316;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=118;TCF=78;TCR=40;TR=34;WE=134013864;WS=134013846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,40:0.31:131
chr10	134013990	rs2247705	G	A	5987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=110;PP=2965;SC=CCACCACGGCGGACCACCTCA;SOR=0.973;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=202;TCF=92;TCR=110;TR=202;WE=134013998;WS=134013980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr10	134016115	rs2637629	G	A	344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=11;NR=1;PP=236;SC=GGGCCCCAGCGTGGAGGCACT;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=134016123;WS=134016105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	134016396	rs3736258	G	A	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.024;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=19;PP=362;ReadPosRankSum=1.947;SC=GGCCCAGAACGCACCCCTGGT;SOR=1.118;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=92;TCF=37;TCR=55;TR=26;WE=134016404;WS=134016386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,28:0.27:105
chr10	134017295	rs12313	A	G	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.296;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=271;ReadPosRankSum=0.125;SC=TGCCCCGTGGACTGTATGACG;SOR=0.415;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=56;TCF=43;TCR=13;TR=21;WE=134017303;WS=134017285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,24:0.38:64
chr10	134021740	rs923659	G	A	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=4.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.63;ReadPosRankSum=-0.807;SOR=0.242;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,14:0.32:44
chr10	134021810	rs923660	T	C	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=4;PP=69;ReadPosRankSum=-0.917;SC=ATGCTCCCGATACACTGGCAG;SOR=0.446;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=12;TCF=6;TCR=6;TR=8;WE=134021818;WS=134021800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr10	134036193	rs2818401	A	G	900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FS=1.299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.09;ReadPosRankSum=-1.887;SOR=0.842;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:124,53:0.30:177
chr10	134038715	rs902629	A	G	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.02;ReadPosRankSum=0.021;SOR=0.783;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,21:0.23:91
chr10	134039132	rs2130893	G	C	1738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.950;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=42;PP=891;ReadPosRankSum=0.845;SC=TGTGCAGAGAGGGGTCAGGTG;SOR=0.782;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=245;TCF=128;TCR=117;TR=86;WE=134039140;WS=134039122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,100:0.35:283
chr10	134039242	rs2130894	C	T	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=1.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.52;ReadPosRankSum=1.401;SOR=0.511;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,39:0.33:117
chr10	134040290	rs2306982	C	A	1030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.016;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=23;PP=610;ReadPosRankSum=0.219;SC=CCGTCTGCCACGCACACACCT;SOR=0.537;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=160;TCF=93;TCR=67;TR=52;WE=134040298;WS=134040280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,58:0.33:176
chr10	134062574	rs4880361	G	A	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=17;PP=290;ReadPosRankSum=-0.881;SC=CGGCGGCTCCGGCAGAGGCTC;SOR=0.717;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=81;TCF=32;TCR=49;TR=28;WE=134062582;WS=134062564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,33:0.36:92
chr10	134143942	rs1052281	C	T	3049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.454;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=62;PP=1779;ReadPosRankSum=0.859;SC=GCCCGGGTGGCTGGCCTCCCC;SOR=0.662;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=229;TCF=124;TCR=105;TR=133;WE=134143950;WS=134143932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,149:0.58:259
chr10	134143985	rs1132165	GC	TT	5523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.945;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=63;PP=2944;ReadPosRankSum=0.219;SC=TGTGCTTTCAGCTTCCTGATT;SOR=0.631;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=224;TCF=109;TCR=115;TR=123;WE=134143994;WS=134143975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,143:0.55:262
chr10	134144005	rs7085852	T	C	2528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=57;PP=1442;ReadPosRankSum=0.565;SC=TGGTAGATAGTTGGGTATGTA;SOR=0.692;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=195;TCF=92;TCR=103;TR=108;WE=134144013;WS=134143995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,122:0.54:228
chr10	134145136	rs7086691	A	G	2720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.96;ReadPosRankSum=-1.086;SOR=0.768;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,70:0.64:109
chr10	134145136	.	ACC	GCG	1899	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=32;NR=26;PP=1899;QD=33.6632392218;SC=GGCAGCGAGGACCGCTCCAAA;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=98;TCF=53;TCR=45;TR=58;WE=134145146;WS=134145126;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:40,58:0.59:98
chr10	134145138	rs7080014	C	G	2720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.19;ReadPosRankSum=-1.077;SOR=0.675;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,69:0.64:108
chr10	134145153	rs7100410	G	A	1531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.742;HP=2;HapScore=3;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=30;PP=2076;ReadPosRankSum=-1.616;SC=CAAAGGTGGTGCCTCAGCAGC;SOR=0.665;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=101;TCF=55;TCR=46;TR=67;WE=134145174;WS=134145143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,70:0.64:110
chr10	134145166	rs13882	T	C	1562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=26;PP=2076;ReadPosRankSum=-2.086;SC=TCAGCAGCAATTCTTTTCTGC;SOR=0.716;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=97;TCF=59;TCR=38;TR=65;WE=134145174;WS=134145143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,70:0.65:108
chr10	134145293	rs12784130	G	T	2082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.676;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=49;PP=2351;ReadPosRankSum=-0.062;SC=CCAGACCCTCGCGGTCTCTAC;SOR=0.487;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=121;TCF=54;TCR=67;TR=91;WE=134145322;WS=134145283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,96:0.75:128
chr10	134145314	rs11146335	A	G	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=0.855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.15;ReadPosRankSum=0.110;SOR=0.867;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,26:0.23:112
chr10	134145336	rs12784321	G	T	1444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=36;PP=874;ReadPosRankSum=1.089;SC=TCAAGGCCGCGGGCGCGGAAA;SOR=0.589;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=31;TCR=48;TR=60;WE=134145344;WS=134145326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,65:0.76:86
chr10	134147172	rs12414718	G	A	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.448;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=12;PP=349;ReadPosRankSum=-0.196;SC=CCTCCTCACCGATTTTAGACT;SOR=0.500;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=33;TCF=19;TCR=14;TR=26;WE=134147180;WS=134147162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,29:0.74:39
chr10	134147341	rs12416634	T	A	69.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=3;PP=48;SC=CTCTTTGGAATTGATGAATTC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=134147349;WS=134147331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr10	134150426	rs7085610	A	C	183.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=148;SC=TGAATGTTATATGCATTTTAC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=134150434;WS=134150416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	134151034	rs2259594	A	G	1446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=17;PP=811;ReadPosRankSum=-0.111;SC=TTAGTTGGTTAACAAAACATT;SOR=0.643;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=87;TCF=61;TCR=26;TR=55;WE=134151042;WS=134151024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,63:0.64:99
chr10	134151288	rs2259600	A	G	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=288;ReadPosRankSum=-1.031;SC=ACTCTTGATTAAATTTTTACC;SOR=0.446;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=14;WE=134151296;WS=134151278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
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chr10	134165291	rs2261222	C	G	1684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=44;PP=1262;SC=CCGCACAGCCCGCCCAGTGCA;SOR=2.753;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=10;TCR=44;TR=54;WE=134165299;WS=134165281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr10	134166205	rs148192749	C	T	192.88	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.619;NF=5;NR=1;PP=80;ReadPosRankSum=0.854;SC=GCAGGTGCAGCGCTCGTGGTC;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=6;WE=134166213;WS=134166199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr10	134166273	rs72479351	A	G	774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.347;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.629;NF=24;NR=8;PP=523;ReadPosRankSum=0.194;SC=TCCCTGTGGGACAGGCCGGTT;SOR=0.198;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=47;TCF=37;TCR=10;TR=32;WE=134166281;WS=134166263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,33:0.69:48
chr10	134180354	rs45513097	G	A	1928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=25;PP=1146;ReadPosRankSum=1.235;SC=TCCTAGAGCCGGAGATGGGAG;SOR=0.762;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=119;TCF=79;TCR=40;TR=76;WE=134180362;WS=134180344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,87:0.65:133
chr10	134188874	rs1054038	G	A	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=214;ReadPosRankSum=0.697;SC=CTGATTTCGCGCAGCCTGTTG;SOR=0.495;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=13;WE=134188882;WS=134188864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr10	134218269	rs11146363	C	T	1993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=36;NR=47;PP=1462;SC=CCCTCCTGCCCGCGGGGTTCA;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=36;TCR=47;TR=83;WE=134218277;WS=134218259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr10	134218296	rs10747057	C	G	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.983;NF=8;NR=17;PP=396;ReadPosRankSum=1.668;SC=CGAGACCACCCGCCCCGAGCC;SOR=0.698;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=56;TCF=20;TCR=36;TR=25;WE=134218304;WS=134218286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,26:0.47:55
chr10	134237425	rs1574448	A	G	1350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.795;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=39;PP=952;ReadPosRankSum=-0.906;SC=TGCCAGCTTCAGCCTGAAGAG;SOR=1.032;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=98;TCF=38;TCR=60;TR=61;WE=134237433;WS=134237415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,61:0.62:98
chr10	134239228	rs12775406	T	C	1966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-1.278;NF=41;NR=43;PP=1028;ReadPosRankSum=-0.272;SC=TGTACCCACGTGTGCGCGTGC;SOR=0.623;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=51;TCR=56;TR=84;WE=134239236;WS=134239218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,91:0.79:115
chr10	134521802	rs41301113	G	C	2472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.459;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=35;PP=1573;ReadPosRankSum=-0.438;SC=TTTGTGTGACGTGTTTATTTT;SOR=0.901;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=139;TCF=86;TCR=53;TR=95;WE=134521810;WS=134521792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,106:0.71:150
chr10	134563122	rs3829130	C	T	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.082;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=15;PP=307;ReadPosRankSum=-0.930;SC=GGAAGGTGAGCGGGGCCTGTG;SOR=1.071;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=72;TCF=38;TCR=34;TR=28;WE=134563130;WS=134563112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,29:0.37:79
chr10	134563366	rs3750578	A	G	647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.675;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=18;PP=284;ReadPosRankSum=-0.196;SC=TTGTGGTCCAATGTGGCAGCT;SOR=1.092;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=103;TCF=49;TCR=54;TR=31;WE=134563374;WS=134563356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,38:0.32:119
chr10	134591389	rs4880427	T	C	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.560;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=45;ReadPosRankSum=-1.083;SC=GGGCACCCAGTCTGGGGAATG;SOR=1.536;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=6;WE=134591397;WS=134591379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,6:0.19:32
chr10	134594316	rs3793687	A	G	1299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.490;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=26;PP=868;ReadPosRankSum=-1.077;SC=AGGGTGCCCCACCTCCCCACA;SOR=0.959;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=158;TCF=90;TCR=68;TR=65;WE=134594324;WS=134594306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,69:0.38:182
chr10	134598628	rs2804003	A	G	2225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=41;PP=1314;SC=CGCCATCTCCACCGCGTGCCG;SOR=1.264;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=29;TCR=41;TR=70;WE=134598636;WS=134598618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr10	134622408	rs2767434	T	C	1450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.805;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=32;PP=857;ReadPosRankSum=1.874;SC=AGAAGCCTCGTCTGTGGAGAA;SOR=0.819;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=86;TCF=36;TCR=50;TR=54;WE=134622416;WS=134622398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,65:0.66:99
chr10	134622507	rs2767431	A	G	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5436;FS=4.771;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=125;ReadPosRankSum=-0.531;SC=CAGCTGCTCCAACTGAGGGCG;SOR=3.126;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=6;WE=134622515;WS=134622497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr10	134623959	rs2254419	T	C	3209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.679;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=66;PP=1656;ReadPosRankSum=1.958;SC=GGAGACGCACTGTTTCTCCAA;SOR=0.683;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=180;TCF=96;TCR=84;TR=131;WE=134623967;WS=134623949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,146:0.71:206
chr10	134624225	rs12416624	G	A	793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=2.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.20;ReadPosRankSum=0.680;SOR=0.327;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,22:0.45:49
chr10	134624232	rs12416631	G	C	772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=1.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.10;ReadPosRankSum=0.908;SOR=0.489;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,21:0.44:48
chr10	134626453	rs3750586	C	T	940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=25;PP=595;ReadPosRankSum=-0.191;SC=CTGTACCAGACCCCACCGTGC;SOR=0.715;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=44;TCF=8;TCR=36;TR=31;WE=134626461;WS=134626443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,36:0.72:50
chr10	134627593	rs11146529	G	A	710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=449;ReadPosRankSum=-0.956;SC=GGGGGCAGTGGCTCCCCGCTG;SOR=0.610;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=41;TCF=32;TCR=9;TR=26;WE=134627601;WS=134627583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,28:0.67:42
chr10	134627882	rs7070307	G	T	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5004;FS=3.278;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=359;ReadPosRankSum=-0.912;SC=TGCCATGCCCGGGTGGGGTGA;SOR=2.200;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=19;WE=134627890;WS=134627872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,19:0.86:22
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chr10	134647453	rs3750583	C	T	411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=2;PP=288;SC=CTGACCCCCCCTGGCGTTCCC;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=134647461;WS=134647443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
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chr10	134659766	rs12260141	G	C	789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.300;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=21;PP=565;ReadPosRankSum=3.518;SC=CCAGGGGCCCGAGGCCTGGGC;SOR=0.412;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=44;TCF=15;TCR=29;TR=33;WE=134659774;WS=134659756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,34:0.71:48
chr10	134660951	rs2892211	A	C	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.579;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=44;ReadPosRankSum=1.068;SC=GGGGTACCGCAGGCCACAGCA;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=134660959;WS=134660941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr10	134664875	rs7913626	A	G	2717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=40;NR=45;PP=1478;SC=ACATCCCCACAACTTGGATGA;SOR=1.000;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=40;TCR=45;TR=85;WE=134664883;WS=134664865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr10	134672798	rs2001324	G	T	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.197;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=29;ReadPosRankSum=-1.310;SC=CCCCAGGGCCGCGTCAGGGCT;SOR=0.067;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=5;WE=134672806;WS=134672788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,5:0.21:24
chr10	134681093	rs4880454	C	T	916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=24;PP=470;ReadPosRankSum=-0.635;SC=GAAACGCAAACGAAAACAGCC;SOR=0.701;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=98;TCF=40;TCR=58;TR=41;WE=134681101;WS=134681083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,47:0.43:110
chr10	134682855	rs7908950	C	T	739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=13;PP=388;ReadPosRankSum=-1.322;SC=TCAGCTTCAGCTCGGAGCACG;SOR=0.724;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=90;TCF=57;TCR=33;TR=37;WE=134682863;WS=134682845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,42:0.40:106
chr10	134699301	rs45547444	A	T	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.710;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=167;ReadPosRankSum=0.240;SC=GGGAGCACTCACAGGCGGTGG;SOR=1.267;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=41;TCF=28;TCR=13;TR=16;WE=134699309;WS=134699291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,17:0.35:48
chr10	134706077	rs7076681	C	T	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.205;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=292;ReadPosRankSum=0.629;SC=AATGTTGTACCGGCCACTATT;SOR=1.044;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=82;TCF=24;TCR=58;TR=24;WE=134706085;WS=134706055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,25:0.30:82
chr10	134722022	rs7075277	A	G	4254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=70;PP=2250;SC=CCCTGTGAGCACAGGCCATGG;SOR=0.834;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=70;TCR=70;TR=140;WE=134722030;WS=134722012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr10	134723390	rs10870353	A	G	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=30.71;ReadPosRankSum=0.230;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr10	134723394	rs11146582	A	G	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.362;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=30.71;ReadPosRankSum=0.068;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr10	134726108	rs72401137	CCTCTCTCTCT	C	737.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=1.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.63;MQRankSum=3.291;QD=12.72;ReadPosRankSum=0.118;SOR=0.990;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,26:0.45:58
chr10	134726335	rs12254100	T	C	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=99;ReadPosRankSum=-0.259;SC=CTGGGAGACATGCTTGTCAGA;SOR=0.502;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=45;TCF=9;TCR=36;TR=13;WE=134726343;WS=134726325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,14:0.31:45
chr10	134726369	rs56300950	T	A	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.754;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=47;ReadPosRankSum=1.176;SC=CCCGCAGGCCTCGCCCCGATC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=5;WE=134726377;WS=134726359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr10	134726621	rs4880467	G	C	1183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=22;PP=674;ReadPosRankSum=-1.572;SC=TCTGCCGCCCGGCCAGGATCA;SOR=0.741;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=151;TCF=93;TCR=58;TR=58;WE=134726629;WS=134726611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,63:0.38:168
chr10	134726841	rs61863089	G	T	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=2.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.11;ReadPosRankSum=3.334;SOR=0.422;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,21:0.20:104
chr10	134733109	rs34347971	A	G	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=33;ReadPosRankSum=-2.584;SC=TGGCGGGTGCATGTCCCAGGG;SOR=0.188;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=4;WE=134733117;WS=134733099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr10	134733131	rs35970466	T	C	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.160;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.31;ReadPosRankSum=-2.000;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr10	134735672	rs7915371	A	G	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.716;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=15;PP=358;ReadPosRankSum=1.545;SC=CCAGGCCTGCATTCACCAGGA;SOR=0.562;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=104;TCF=65;TCR=39;TR=36;WE=134735680;WS=134735662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,41:0.33:125
chr10	134736026	rs4880286	G	A	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=1.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.74;ReadPosRankSum=0.174;SOR=0.894;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,16:0.22:74
chr10	134736052	rs4880287	G	T	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.59;ReadPosRankSum=0.635;SOR=0.785;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,15:0.21:73
chr10	134736076	rs4880288	T	G	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.942;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=7;PP=206;ReadPosRankSum=-1.198;SC=GCCATCTGGATCCTGTCCCGG;SOR=0.563;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=39;TCR=22;TR=19;WE=134736084;WS=134736066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,22:0.28:79
chr10	134738232	rs4075501	A	G	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.24;ReadPosRankSum=0.208;SOR=0.811;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,25:0.29:86
chr10	134740393	rs4295969	C	T	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.526;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=283;ReadPosRankSum=0.943;SC=CACCTGAGAGCGGCACGGGAG;SOR=2.792;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=37;TCR=4;TR=15;WE=134740401;WS=134740383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,17:0.40:43
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chr10	134741099	rs11146048	A	G	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=59;ReadPosRankSum=0.888;SC=CCATGCCACTAAGGAAGCCAT;SOR=0.148;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=6;WE=134741107;WS=134741089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr10	134748331	rs12781609	C	T	737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.666;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=17;PP=362;ReadPosRankSum=-0.277;SC=CAGAATGACACTGATGTCACC;SOR=0.876;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=86;TCF=42;TCR=44;TR=33;WE=134748339;WS=134748321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,38:0.40:96
chr10	134750604	rs10870211	C	A	843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=20;PP=554;SC=TCAAACAATTCGGTAGAGGTT;SOR=1.839;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=28;WE=134750612;WS=134750594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr10	134755298	rs4880292	C	G	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=170;ReadPosRankSum=1.455;SC=GCACCACGGGCCCGCTTTCAG;SOR=0.758;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=56;TCF=18;TCR=38;TR=14;WE=134755306;WS=134755288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,14:0.24:58
chr10	134756013	rs7898115	T	C	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.76;ReadPosRankSum=-1.579;SOR=0.824;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,14:0.24:59
chr10	134884516	rs4271312	G	A	1621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.756;QD=13.19;ReadPosRankSum=-0.770;SOR=0.719;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,77:0.63:123
chr10	134884546	rs4576736	A	G	1349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=0.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.73;ReadPosRankSum=-0.147;SOR=0.602;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,66:0.62:106
chr10	134884595	rs4271313	G	A	1249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=19;PP=2142;ReadPosRankSum=-0.378;SC=CCACACCCGGGGCAGATGGAC;SOR=0.743;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=64;TCF=34;TCR=30;TR=41;WE=134884618;WS=134884585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,53:0.65:81
chr10	134884606	.	G	A	2122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.977;ClippingRankSum=0.000;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.85;ReadPosRankSum=-0.372;SOR=0.677;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,57:0.64:89
chr10	134884610	rs4486541	C	G	2082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.09;ReadPosRankSum=0.028;SOR=0.660;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,52:0.63:83
chr10	134884755	rs11101751	C	A	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=12;PP=303;ReadPosRankSum=-2.094;SC=GCCTCGCAGCCAGGGAGGAGA;SOR=0.685;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=17;TCR=21;TR=22;WE=134884763;WS=134884745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,24:0.59:41
chr10	134885677	rs7069085	A	C	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=162;ReadPosRankSum=0.056;SC=GGGGAGAGTGAGGCCCAGACA;SOR=0.941;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=11;WE=134885685;WS=134885667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr10	134885700	rs7094939	T	C	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.286;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=119;ReadPosRankSum=-0.459;SC=ACCATGGGCCTGAGAACGTCC;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=8;WE=134885708;WS=134885690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr10	134886618	rs4838684	G	C	1769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=48;PP=1190;ReadPosRankSum=-0.427;SC=GGAGCTGGGTGCCCAGGGCTG;SOR=0.638;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=105;TCF=35;TCR=70;TR=73;WE=134886626;WS=134886608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,76:0.69:110
chr10	134895530	rs34883766	C	T	612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.270;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=15;PP=406;ReadPosRankSum=-0.951;SC=ATCCGCTCCCCTCCCCCACTC;SOR=0.468;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=41;TCF=16;TCR=25;TR=26;WE=134895538;WS=134895520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,27:0.64:42
chr10	134898594	rs4838694	A	G	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=10;PP=213;ReadPosRankSum=-0.707;SC=ACCTGCCTCCAAGGGGCAAGC;SOR=0.700;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=17;TCR=25;TR=17;WE=134898602;WS=134898584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,21:0.45:47
chr10	134902314	rs10745302	A	G	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.40;ReadPosRankSum=-0.180;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr10	134902396	rs10776692	C	G	1897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=2.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.50;ReadPosRankSum=-0.857;SOR=1.154;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,47:0.68:69
chr10	134902396	.	CGC	GGT	1090	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=28;NR=9;PP=1090;QD=30.9045371584;SC=CTCACGCTTCCGCAACTTTGC;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=59;TCF=41;TCR=18;TR=37;WE=134902406;WS=134902386;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:22,37:0.63:59
chr10	134902398	rs10776693	C	T	1897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=2.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.36;ReadPosRankSum=-0.969;SOR=1.123;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,49:0.68:72
chr10	134912314	rs11101916	G	A	2314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=51;PP=1326;ReadPosRankSum=1.046;SC=GGGGAACTGCGTGAGCGTCGT;SOR=0.702;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=72;TCR=80;TR=98;WE=134912322;WS=134912304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,107:0.65:165
chr10	134915993	rs7905581	G	C	755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.367;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=21;PP=549;ReadPosRankSum=0.125;SC=AGAAGGGGAGGAAAGCTGAGC;SOR=1.911;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=25;WE=134916001;WS=134915983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,27:0.79:34
chr10	134916121	rs7918862	T	A	614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.970;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=2;PP=413;ReadPosRankSum=-0.196;SC=ATTCTTGAAGTTGCAAGCCCG;SOR=1.380;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=23;WE=134916129;WS=134916111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,26:0.74:35
chr10	134974187	rs56406605	A	T	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=2.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.67;ReadPosRankSum=-2.835;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr10	134980855	rs41299175	C	T	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=7;PP=216;ReadPosRankSum=0.775;SC=GGGGTCCTGCCGGGCTCACGG;SOR=0.848;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=51;TCF=31;TCR=20;TR=19;WE=134980863;WS=134980845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,20:0.37:54
chr10	134981690	rs2998152	T	C	751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.788;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=11;PP=475;ReadPosRankSum=0.351;SC=CAGGCCCTTCTCAGCTGGCGG;SOR=0.814;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=94;TCF=63;TCR=31;TR=34;WE=134981698;WS=134981680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,39:0.37:105
chr10	134981837	rs2998151	T	C	1491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.669;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=45;PP=880;ReadPosRankSum=0.463;SC=GTGGGGGTAATGTGCCACACC;SOR=0.845;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=209;TCF=102;TCR=107;TR=80;WE=134981859;WS=134981827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,81:0.34:239
chr10	134997480	rs57510763	C	T	852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FS=1.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.42;MQRankSum=3.635;QD=5.57;ReadPosRankSum=0.702;SOR=0.631;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,49:0.32:153
chr10	134997514	rs67800134	A	G	836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=5.065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.48;MQRankSum=4.580;QD=6.20;ReadPosRankSum=-1.290;SOR=1.183;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,31:0.23:135
chr10	134997524	rs138319019	T	TCTTG	685.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=3.056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.52;MQRankSum=5.064;QD=5.53;ReadPosRankSum=0.255;SOR=1.103;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,24:0.19:124
chr10	134999602	rs3008393	G	C	4065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=66;NR=61;PP=2273;SC=AGTCTGAGACGAGCCGGGGCC;SOR=0.834;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=127;TCF=66;TCR=61;TR=127;WE=134999610;WS=134999592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
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chr10	135000159	rs3810964	A	G	1463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.846;HP=2;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=35;PP=2103;ReadPosRankSum=0.967;SC=AGGCAGCTGGAAAGTGCAGCC;SOR=0.547;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=166;TCF=79;TCR=87;TR=71;WE=135000167;WS=135000138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,79:0.43:184
chr10	135010662	rs6537590	C	T	630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=375;ReadPosRankSum=-0.510;SC=AGCCAGGCCGCCGCCTCCTCC;SOR=0.703;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=40;TCF=11;TCR=29;TR=24;WE=135010670;WS=135010652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,27:0.63:43
chr10	135012162	rs2998139	T	C	792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.796;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=18;PP=386;ReadPosRankSum=1.573;SC=AAGCTCTCCCTGGAGGCCCAC;SOR=0.461;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=74;TCF=36;TCR=38;TR=36;WE=135012170;WS=135012152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,41:0.49:84
chr10	135012429	rs3008390	TT	AC	1101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=15;PP=785;ReadPosRankSum=0.089;SC=CCACCTGGAGTTGCTTCCGGG;SOR=0.633;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=107;TCF=59;TCR=48;TR=30;WE=135012438;WS=135012419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,34:0.26:129
chr10	135012569	.	G	A	1452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.346;ClippingRankSum=0.000;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=33;PP=917;ReadPosRankSum=0.604;SC=CACCCCTGCCGGGGAACGTGA;SOR=0.733;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=177;TCF=96;TCR=81;TR=72;WE=135012577;WS=135012559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,78:0.39:200
chr10	135012652	rs3008388	T	C	1195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FS=6.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.36;ReadPosRankSum=0.371;SOR=0.938;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:151,72:0.32:223
chr10	135015427	rs9418941	C	A	1012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.653;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=20;PP=670;ReadPosRankSum=-0.417;SC=TTGGCACTGCCGGGTGGGGCA;SOR=0.780;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=123;TCF=73;TCR=50;TR=48;WE=135015435;WS=135015417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,52:0.38:136
chr10	135015667	rs9419023	C	T	922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FS=6.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.42;ReadPosRankSum=0.733;SOR=0.963;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:207,63:0.23:270
chr10	135016089	rs3008386	T	C	1166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=27;PP=739;ReadPosRankSum=0.920;SC=GAACCTCTCCTACCACCGTCT;SOR=0.681;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=171;TCF=93;TCR=78;TR=59;WE=135016097;WS=135016079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,64:0.32:199
chr10	135016175	rs3008385	T	G	759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=20;PP=426;ReadPosRankSum=0.170;SC=TCCTCCTTGCTCCTCTCCTGC;SOR=0.718;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=153;TCF=82;TCR=71;TR=44;WE=135016183;WS=135016165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,49:0.28:172
chr10	135020315	rs3008375	T	C	4788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=74;PP=2830;SC=TCCGAGACCCTGGCTGCAGGC;SOR=0.813;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=165;TCF=91;TCR=74;TR=165;WE=135020323;WS=135020305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr10	135032376	rs3008370	A	G	1299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.570;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.762;NF=34;NR=26;PP=744;ReadPosRankSum=0.927;SC=TGATTGCAAAATCTTGCTATG;SOR=0.608;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=157;TCF=92;TCR=65;TR=60;WE=135032384;WS=135032366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,67:0.37:179
chr10	135038088	rs11597218	C	T	1759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=16;PP=1167;SC=CCTAAGAACGCGGGGGGACTC;SOR=1.963;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=61;TCF=45;TCR=16;TR=60;WE=135038096;WS=135038078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr10	135051562	rs2998143	A	G	723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=7;PP=259;ReadPosRankSum=-0.621;SC=TCCCTGGCCCAGGCCAGACAT;SOR=0.646;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=25;TCR=10;TR=24;WE=135051570;WS=135051552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,32:0.71:45
chr10	135061112	rs12355840	C	T	2958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.51;SOR=0.960;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr10	135076523	rs2995300	C	A	1020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=5;PP=661;SC=TAGATGCATTCCTGAGGTTAG;SOR=2.964;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=33;WE=135076531;WS=135076513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr10	135076596	rs2230576	T	C	3155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.66;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr10	135076758	rs3008318	T	C	1709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=26;NR=30;PP=993;SC=GAAAAGATAATTGATGTTGAA;SOR=1.010;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=26;TCR=30;TR=56;WE=135076766;WS=135076748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr10	135076903	rs3121298	A	G	204.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=136;SC=GGCAGTCACAATATATACAGC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=135076911;WS=135076893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr10	135077121	.	C	T	84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=7;NR=1;PP=84;QD=14.8464015684;SC=GCAGTGCCACCGTCAGCCCCG;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=8;WE=135077129;WS=135077111;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr10	135077121	rs3216041	C	CGTCAGCCCCGTGGGGAGGCCGTGCCACT	505.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=63.22;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	135077311	rs2995301	C	G	3263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=59;NR=52;PP=1809;SC=CCCCCAGGCACTCCCGGCTCT;SOR=0.775;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=113;TCF=60;TCR=53;TR=111;WE=135077319;WS=135077301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr10	135081684	rs2995309	T	C	1400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=24;NR=21;PP=564;SC=CACCACACCCTGAGTCTCTCC;SOR=1.009;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=24;TCR=21;TR=45;WE=135081692;WS=135081674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr10	135081754	rs11101672	G	C	312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=6;PP=153;SC=ATGAGAGACAGACAGGCCCAG;SOR=1.445;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=10;WE=135081762;WS=135081744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr10	135082346	rs2275720	A	G	4298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.90;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr10	135082810	rs2995310	C	T	1158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=26;NR=12;PP=531;SC=TCTGCCTATACCTGTGTGTCG;SOR=1.203;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=26;TCR=12;TR=38;WE=135082818;WS=135082800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr10	135082874	rs2995311	G	A	2755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=54;NR=37;PP=1390;SC=CCGGGCCCGCGGCTTCTGCCT;SOR=0.789;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=54;TCR=37;TR=91;WE=135082882;WS=135082864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr10	135083164	rs2275719	C	T	468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=14;PP=364;SC=CCACATGCGCCGACGGCGAGG;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=135083172;WS=135083154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr10	135083812	rs885023	C	A	1190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.34;SOR=1.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr10	135084232	rs5789159	C	CAGA	3503.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.49;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=11;NR=16;PP=1417;SC=AGGGCGGTCTCAGCTCACCTG;SOR=1.079;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=12;TCR=17;TR=27;WE=135084240;WS=135084222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr10	135084322	rs3008321	A	G	2855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=45;NR=35;PP=1702;SC=GTGGGACCAGAAGCGGGTTAG;SOR=0.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=80;TCF=45;TCR=35;TR=80;WE=135084330;WS=135084312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr10	135084601	rs2995314	T	C	5492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=87;NR=101;PP=2858;SC=CAGCTCACCATGGGGACAGGT;SOR=1.004;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=189;TCF=87;TCR=102;TR=188;WE=135084609;WS=135084591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr10	135085321	rs1131720	C	T	3121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=45;PP=1713;SC=CAATGCTGCCCGCCATGATGC;SOR=0.745;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=100;TCF=55;TCR=45;TR=98;WE=135085329;WS=135085311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr10	135085426	rs1131719	A	G	5208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=72;PP=2965;SC=GGGCCATGGTACAGGCCACGC;SOR=0.901;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=171;TCF=99;TCR=72;TR=171;WE=135085434;WS=135085416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr10	135085754	rs1131718	G	A	6196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=89;NR=99;PP=2965;SC=CAAACCCCACGGTAGTCCCGG;SOR=1.057;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=188;TCF=89;TCR=99;TR=188;WE=135085762;WS=135085744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr10	135086380	rs3008324	C	T	2480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=58;NR=28;PP=1554;SC=ACTGGGGACACGAGACCCTCA;SOR=1.661;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=58;TCR=28;TR=86;WE=135086388;WS=135086370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr10	135086427	rs61869862	G	A	2190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.650;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=38;PP=1348;ReadPosRankSum=-0.543;SC=CCCCGCCGCCGGCTGCTCTCC;SOR=0.611;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=83;TCR=56;TR=94;WE=135086435;WS=135086417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,102:0.68:151
chr10	135087521	rs3008326	G	A	5993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=112;NR=91;PP=2965;SC=TGTAGCCGGAGCCCAGCAGGT;SOR=0.719;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=203;TCF=112;TCR=91;TR=203;WE=135087529;WS=135087511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr10	135089035	rs2275725	A	G	3770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.65;SOR=0.852;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr10	135090183	rs2995317	A	G	650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=4;PP=437;SC=GCGGGGTGCGAGCAGGCCAGG;SOR=2.124;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=22;WE=135090191;WS=135090173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr10	135096784	rs2995325	A	G	966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=23;PP=626;SC=CGGGCCCTGCATGCGCACGTG;SOR=3.193;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=28;WE=135096792;WS=135096774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr10	135097224	rs56403249	T	G	245.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.11;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr10	135097227	.	CGCA	C	236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.82;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr10	135097232	.	T	TCG	187.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.57;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr10	135097434	rs2995326	A	G	3159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=46;PP=1696;SC=CCATCACTTCAAACATCATGT;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=103;TCF=57;TCR=46;TR=103;WE=135097442;WS=135097424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr10	135098672	rs3008334	G	A	5445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=106;NR=73;PP=2965;SC=CGTGCTTGCAGTAGAACATGT;SOR=0.976;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=179;TCF=106;TCR=73;TR=179;WE=135098680;WS=135098662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr10	135098830	rs3008335	T	C	5844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=84;PP=2965;SC=CGTGAATCTCTCGGACACTGA;SOR=0.803;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=187;TCF=102;TCR=85;TR=185;WE=135098838;WS=135098820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr10	135098845	rs2995327	C	T	5717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=99;NR=80;PP=2965;SC=CACTGAAGGCCGGGGAGAGCC;SOR=0.793;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=180;TCF=100;TCR=80;TR=179;WE=135098853;WS=135098835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr10	135103311	.	C	T	721	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=26;NR=14;PP=721;QD=18.8942803137;SC=CCCAAGTCCCCGCCCGCTGCG;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=47;TCF=33;TCR=14;TR=40;WE=135103319;WS=135103301;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:7,40:0.85:47
chr10	135103311	rs141370078	C	CGCCCGCTGCGCCGCGGACGCCAAGTCCCT	2235.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=124.21;SOR=3.500;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	135105955	.	TCCGTGTCC	T	2385	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000;HP=5;HapScore=1;MGOF=31;MMLQ=25;MQ=57.6;NF=11;NR=11;PP=2385;QD=109.409090909;SC=CCCATGTCCCTCCGTGTCCCC;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=43;TCF=19;TCR=24;TR=22;WE=135105974;WS=135105945;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:21,22:0.51:43
chr10	135105961	.	T	TC	925	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000;HP=4;HapScore=1;MGOF=50;MMLQ=25;MQ=56.79;NF=13;NR=11;PP=925;QD=39.4583333333;SC=TCCCTCCGTGTCCCCGTGTCC;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=32;TCF=15;TCR=17;TR=24;WE=135105974;WS=135105945;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,24:0.75:32
chr10	135105966	.	G	A	868	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000;HP=4;HapScore=1;MGOF=31;MMLQ=26;MQ=57.75;NF=10;NR=6;PP=868;QD=56.4232007842;SC=CCGTGTCCCCGTGTCCCTCCG;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=56;TCF=37;TCR=19;TR=16;WE=135105974;WS=135105945;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:40,16:0.29:56
chr10	135105983	rs2864768	C	T	2142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=60;NR=32;PP=1697;SC=TCCGTGTCCCCGTGTCCCGGG;SOR=1.165;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=93;TCF=60;TCR=33;TR=92;WE=135105991;WS=135105973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr10	135106173	rs147567537	G	A	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.616;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=125;ReadPosRankSum=-0.816;SC=CAAGACATTCGCCTTTGTCCA;SOR=1.085;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=11;WE=135106181;WS=135106163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,13:0.34:38
chr10	135141572	rs2298122	G	T	1773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=38;PP=1075;SC=GGACCCAAGAGAGCCCTGAAC;SOR=1.098;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=28;TCR=38;TR=66;WE=135141580;WS=135141562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr10	135160950	rs4838721	C	T	4545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=79;NR=77;PP=2448;SC=CATCCCTGAGCCCCAATCCCC;SOR=0.851;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=157;TCF=79;TCR=78;TR=156;WE=135160958;WS=135160940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr10	135165790	rs4369319	A	G	5907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=115;NR=87;PP=2965;SC=ACCCTGGGCCATGTCCTGAGT;SOR=0.826;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=203;TCF=116;TCR=87;TR=202;WE=135165798;WS=135165780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr10	135171364	rs1891372	T	C	138.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=1;PP=20;SC=GGGGTCCCCGTGCAAGCCTCG;SOR=1.329;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=135171372;WS=135171354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	135178087	rs10745294	A	C	2311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=27;PP=1451;SC=TTAATGATAAAATTTAAAAGG;SOR=1.402;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=51;TCR=27;TR=78;WE=135178095;WS=135178077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr10	135179458	rs6537598	G	C	2538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=26;PP=1580;SC=CCTCTCCAGTGTCTTCCTGGC;SOR=1.533;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=58;TCR=26;TR=84;WE=135179466;WS=135179448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr10	135180430	rs2230261	A	G	2543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.69;SOR=0.754;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr10	135184126	rs1049951	G	A	3396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=30;PP=2124;SC=CTCCTCGAAGGTCTTCAGGGC;SOR=1.749;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=78;TCR=30;TR=108;WE=135184134;WS=135184116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr10	135184342	rs74164169	C	T	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=3.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.217;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=131;ReadPosRankSum=-0.217;SC=GTGGCCCCATCGGTGGATACA;SOR=1.375;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=45;TCF=9;TCR=36;TR=11;WE=135184350;WS=135184332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,16:0.28:57
chr10	135186806	rs10466126	A	G	1394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=23;NR=23;PP=768;SC=CGGGCCGCGGACGCAGGACAG;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=23;TCR=23;TR=46;WE=135186814;WS=135186796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr10	135192762	rs12250188	C	G	119.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.97;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	135194890	rs10745295	A	G	1533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=12;PP=1018;SC=GTGGGAACTCAGAGCACGTAT;SOR=2.221;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=55;TCF=42;TCR=13;TR=53;WE=135194898;WS=135194880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr10	135197419	rs4240520	G	A	1518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=12;PP=1006;SC=GGACTTCCGTGGAGGGCTTTA;SOR=2.024;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=37;TCR=12;TR=49;WE=135197427;WS=135197409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr10	135202594	rs10776679	T	C	3940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=81;PP=2145;SC=CCACACACGCTGGTTCCTGCC;SOR=1.106;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=144;TCF=63;TCR=81;TR=144;WE=135202602;WS=135202584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr10	135204799	rs6537600	C	T	5069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=93;NR=73;PP=2965;SC=CATTCTAACCCTGGCTCTTCT;SOR=0.865;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=166;TCF=93;TCR=73;TR=166;WE=135204807;WS=135204789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr10	135204950	rs1046175	C	G	3141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=56;PP=2166;SC=AGCCCAGGCCCAGGCTCTAGC;SOR=0.970;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=48;TCR=56;TR=104;WE=135204958;WS=135204940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr10	135205009	rs1046178	C	G	3365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=53;PP=1960;SC=GGCTGGGACCCTCATTTCTTC;SOR=0.812;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=56;TCR=53;TR=109;WE=135205017;WS=135204999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr10	135207936	rs10160083	T	C	960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=17;PP=548;SC=TCCCGGTCGTTCTGGGCTGGC;SOR=1.085;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=13;TCR=17;TR=30;WE=135207944;WS=135207926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr10	135209105	rs4838742	A	G	506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=4;PP=300;SC=TCCCTCAGATATAGTCTTTTT;SOR=1.863;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=16;WE=135209113;WS=135209095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	135211892	rs2252852	A	G	1077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=8;PP=648;SC=TGACAGAGCCAAGACTCCAGT;SOR=2.247;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=36;WE=135211900;WS=135211882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr10	135213263	rs2814206	T	C	1094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=27;PP=761;SC=CCAGAGCACATCTTGTCTCGT;SOR=2.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=33;WE=135213271;WS=135213253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr10	135232934	rs2243619	C	T	669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=4;PP=519;SC=TGGCTGGCCGCGCGGTGTCAG;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=135232942;WS=135232924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr10	135233541	rs2255246	A	G	6481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=121;NR=100;PP=2965;SC=TAACGTGAACATTATTCAGCC;SOR=0.741;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=221;TCF=121;TCR=100;TR=221;WE=135233549;WS=135233531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr10	135237060	rs2480253	A	G	705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=12;PP=396;SC=CCCCGCGCGCACCCCCGCGGA;SOR=0.760;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=14;TCR=12;TR=26;WE=135237068;WS=135237050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr10	135237166	rs2492666	G	A	978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.10;SOR=0.743;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr10	135237196	rs4838682	C	T	506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.13;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr10	135267445	rs2253522	T	C	751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=19;NR=3;PP=544;SC=CTGTGACCTCTGCCATTGCCC;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=22;WE=135267453;WS=135267435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr10	135267738	rs2253529	T	C	351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=13;PP=283;SC=TCCACATGGCTGGATCCCTGT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=135267746;WS=135267728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	135271789	rs2480245	C	T	4311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=79;NR=67;PP=2295;SC=TGAAGCCTTCCGCAGTCTGAG;SOR=0.742;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=146;TCF=79;TCR=67;TR=146;WE=135271797;WS=135271779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr10	135272947	rs2257044	CC	AG	626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=2;PP=475;SC=GGTCCTGGGTCCCTCCCGCTG;SOR=1.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=11;WE=135272956;WS=135272937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	135273463	rs731947	C	G	882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=18;NR=9;PP=461;SC=ATGCCTGGGACCTGCGGGACG;SOR=0.957;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=18;TCR=9;TR=27;WE=135273471;WS=135273453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr10	135278193	rs2492654	A	G	2296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=45;NR=28;PP=1041;SC=CTGGGGCGCCATGTGCAGCAA;SOR=0.738;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=45;TCR=28;TR=73;WE=135278201;WS=135278183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr10	135279283	rs2243812	T	C	1940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=43;NR=18;PP=1121;SC=TTTTTGGGAATTCCCTTTTGT;SOR=1.394;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=43;TCR=18;TR=61;WE=135279291;WS=135279273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr10	135279810	rs2243909	T	G	3866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=77;NR=49;PP=2140;SC=CGTCCTGGGATCCCTTCTTGG;SOR=0.971;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=77;TCR=49;TR=126;WE=135279818;WS=135279800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr10	135280765	rs2246634	C	T	3464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=50;PP=1875;SC=GAAATGCCGCCAGCAGGACTG;SOR=0.756;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=64;TCR=50;TR=114;WE=135280773;WS=135280755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr10	135340866	rs11445593	T	TC	261.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=1;PP=276;SC=CACAGGATTGTCTCCCGGGCT;SOR=4.407;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=135340874;WS=135340856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	135347397	rs915909	T	C	4181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=80;PP=2216;SC=ACCCTGAGATTGAAGGTAGGC;SOR=1.049;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=144;TCF=63;TCR=81;TR=143;WE=135347405;WS=135347387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr10	135347533	rs943976	A	G	305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=192;SC=TGAGATGGCTAGATGCACTGC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=135347541;WS=135347523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	135350490	rs147973606	A	AGATGGGTGGAT	264.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.57;ReadPosRankSum=-1.009;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr10	135351137	rs2070676	G	C	353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=1;PP=264;SC=TCCTTCAACTGGAAATATACT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=135351145;WS=135351127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr10	135351174	rs2070677	T	A	1221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=8;PP=877;SC=TATTCAAAACTACATTCTTCA;SOR=2.531;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=31;TCR=8;TR=39;WE=135351182;WS=135351164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr10	135351362	rs2515641	T	C	5120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=82;PP=2965;SC=ATGGAAAGTTTAAGTACAGTG;SOR=0.878;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=160;TCF=78;TCR=82;TR=160;WE=135351370;WS=135351352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr10	135352153	rs2249694	A	G	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.315;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=92;ReadPosRankSum=-0.465;SC=TAGGCAGAGAAGGGTGAGTCC;SOR=0.223;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=7;WE=135352161;WS=135352149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr10	135352168	rs2249695	T	C	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.813;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=88;ReadPosRankSum=-0.517;SC=GAGTCCTGCCTTGTGATGGCC;SOR=0.105;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=7;WE=135352176;WS=135352158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr10	135352509	rs2480257	T	A	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=2.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.88;ReadPosRankSum=-2.067;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,9:0.25:36
chr10	135352514	rs2480256	A	G	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.18;ReadPosRankSum=-2.616;SOR=0.241;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,8:0.25:32
chr10	135367655	rs11101821	A	G	2031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=28;PP=1308;ReadPosRankSum=1.915;SC=GTTTGATAGTATATTGCCAGT;SOR=0.797;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=105;TCF=69;TCR=36;TR=80;WE=135367663;WS=135367645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,85:0.76:112
chr10	135368163	rs2149616	A	G	1190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.883;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=20;PP=738;ReadPosRankSum=-0.694;SC=TTTTAATTTCAGGGAGTCTGT;SOR=0.588;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=72;TCF=40;TCR=32;TR=46;WE=135368171;WS=135368153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,52:0.60:86
chr10	135368325	rs2149617	A	C	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=275;ReadPosRankSum=0.128;SC=GCTGGCAGGTACCAGAGATGA;SOR=0.534;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=17;WE=135368333;WS=135368315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr10	135368452	rs3737029	A	G	1268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=1.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.21;MQRankSum=0.799;QD=24.40;ReadPosRankSum=-1.103;SOR=1.051;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,33:0.63:52
chr10	135368462	rs2183163	T	C	1315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.19;MQRankSum=0.811;QD=23.50;ReadPosRankSum=-0.169;SOR=0.703;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,35:0.62:56
chr10	135368489	rs71228758	A	AGCTGAGACGG	1218.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.037;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.949;NF=6;NR=8;PP=2954;ReadPosRankSum=2.588;SC=CAGTAGACTTAGCTGTATCAA;SOR=0.495;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=14;WE=135368497;WS=135368479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,30:0.55:55
chr10	135368590	rs3737031	T	C	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.182;NF=8;NR=10;PP=205;ReadPosRankSum=2.454;SC=CCCTGCTTGGTGTGCAGCTCC;SOR=0.856;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=15;TCR=18;TR=18;WE=135368598;WS=135368580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,25:0.61:41
chr10	135368709	rs3737032	C	A	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.930;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.85;ReadPosRankSum=-1.345;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr10	135368835	rs3737034	C	T	822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=8;PP=505;ReadPosRankSum=-0.440;SC=TGTTCCCTGACGCCCACTTCT;SOR=0.716;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=49;TCF=37;TCR=12;TR=33;WE=135368843;WS=135368825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,36:0.71:51
chr10	135368967	rs11592461	G	A	1228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=27;PP=759;ReadPosRankSum=0.685;SC=GTAGGATGGGGGAAGGAAGAG;SOR=0.634;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=72;TCF=30;TCR=42;TR=47;WE=135368975;WS=135368957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,52:0.67:78
chr10	135369054	rs3020514	A	G	1773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=24;PP=1145;SC=ATACAACATCAGTCATCTTCC;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=35;TCR=24;TR=59;WE=135369076;WS=135369044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr10	135369258	rs3827688	C	T	1562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=3.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.99;ReadPosRankSum=0.042;SOR=0.873;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,64:0.70:92
chr10	135369532	rs3747881	T	C	1021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.333;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=27;PP=660;ReadPosRankSum=-1.086;SC=ACAAATCTCCTTTGCCAGCCG;SOR=1.201;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=61;TCF=21;TCR=40;TR=39;WE=135369540;WS=135369522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,44:0.66:67
chr10	135370060	rs2987791	G	C	78.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=4;NR=0;PP=87;SC=ACTTGACCTTGGTCTCATCAG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=135370068;WS=135370051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr10	135370343	rs8181464	G	A	1857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.657;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=1.110;NF=38;NR=35;PP=1099;ReadPosRankSum=0.753;SC=ACCAACCACAGGCATGAGGGG;SOR=0.730;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=114;TCF=61;TCR=53;TR=73;WE=135370351;WS=135370333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,85:0.62:136
chr10	135370370	rs8181332	C	T	1595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.706;HP=1;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.128;NF=32;NR=30;PP=939;ReadPosRankSum=-1.984;SC=GCTGAAATCACCACCTTCACA;SOR=0.738;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=100;TCF=53;TCR=47;TR=62;WE=135370378;WS=135370360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,73:0.62:118
chr10	135370407	rs11473038	G	GCA	1403.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.613;HP=1;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.386;NF=10;NR=16;PP=1089;ReadPosRankSum=-0.345;SC=GGTTCTTCAGGCAGATTTTGG;SOR=0.839;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=54;TCF=21;TCR=33;TR=26;WE=135370415;WS=135370397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,37:0.52:71
chr10	135370470	rs8181425	T	C	1208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.893;NF=28;NR=19;PP=720;ReadPosRankSum=0.864;SC=CCACCTTGAATCTCCATGGCT;SOR=0.627;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=50;TCR=34;TR=47;WE=135370478;WS=135370460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,54:0.57:95
chr10	135370633	rs8181356	C	T	2008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=0.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.50;ReadPosRankSum=0.158;SOR=0.599;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,54:0.55:98
chr10	135370639	rs8181357	C	A	1882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.92;ReadPosRankSum=0.088;SOR=0.720;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,48:0.53:90
chr10	135371135	rs11101824	C	T	167.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=1;PP=78;SC=AAAATAAAAACCAGCTGAAGA;SOR=1.609;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=135371143;WS=135371134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr10	135371194	rs8181437	T	A	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.006;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=119;ReadPosRankSum=-0.112;SC=TGAGAGAGTTTCCCTTAACAC;SOR=0.859;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=8;WE=135371202;WS=135371184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
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chr10	135371466	rs2987792	T	C	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.544;HP=1;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=254;ReadPosRankSum=1.273;SC=TGTCAAGGTATTGGGTTTTGG;SOR=2.093;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=7;WE=135371475;WS=135371456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,8:0.26:31
chr10	135371467	rs8181456	T	C	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.544;HP=3;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=14;PP=723;ReadPosRankSum=-1.281;SC=GTCAAGGTATTGGGTTTTGGC;SOR=0.132;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=23;WE=135371475;WS=135371456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,23:0.74:31
chr10	135371566	rs8181309	G	A	450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.090;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=313;ReadPosRankSum=-1.701;SC=CCACAGGAGAGAGGCAAGCTG;SOR=1.445;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=16;WE=135371574;WS=135371556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,18:0.75:24
chr10	135371606	rs8181458	T	C	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.359;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=6;PP=545;ReadPosRankSum=0.708;SC=TCAGCTGCCATAGGGAGAGTG;SOR=1.002;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=31;WE=135371614;WS=135371596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,35:0.74:47
chr10	135371835	rs35408926	A	AC	851.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.153;NF=0;NR=24;PP=841;ReadPosRankSum=-0.422;SC=CCAAATGTGAACCCTTGAGGT;SOR=1.078;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=24;WE=135371843;WS=135371825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,31:0.77:40
chr10	135372310	rs10857748	T	C	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.328;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=302;ReadPosRankSum=0.410;SC=GGATGCTGATTATCTGGAATA;SOR=3.126;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=14;WE=135372318;WS=135372300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr10	135372597	rs10857749	C	T	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.758;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=24;PP=529;ReadPosRankSum=0.270;SC=CTCTCCTTGCCAGGCTCTGCT;SOR=2.222;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=63;TCF=21;TCR=42;TR=31;WE=135372605;WS=135372587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,33:0.49:68
chr10	135372659	rs10857750	A	G	1195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=20;PP=744;ReadPosRankSum=-1.428;SC=GCATGCTGAAATGCCCTGTAC;SOR=0.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=80;TCF=45;TCR=35;TR=48;WE=135372667;WS=135372649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,53:0.61:87
chr10	135372870	rs11101825	C	G	1830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.128;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=38;PP=1099;ReadPosRankSum=0.064;SC=TCCCACTGCACGGAGGAAAGG;SOR=1.022;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=122;TCF=61;TCR=61;TR=73;WE=135372878;WS=135372860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,82:0.59:138
chr10	135373435	rs3813872	A	T	787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.579;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=13;PP=503;ReadPosRankSum=-1.692;SC=TAATTTTGAAACATGGGGCCC;SOR=0.346;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=55;TCF=37;TCR=18;TR=35;WE=135373443;WS=135373425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,36:0.64:56
chr10	135373591	rs3813873	C	T	1655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.141;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=35;PP=985;ReadPosRankSum=-0.566;SC=AGGAGACACACGACCTTTCTG;SOR=0.521;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=127;TCF=59;TCR=68;TR=69;WE=135373599;WS=135373581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,77:0.55:141
chr10	135373694	rs10857752	G	A	987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.172;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=24;PP=676;ReadPosRankSum=0.091;SC=GAATCAAGCAGGGCGAGAGGC;SOR=0.409;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=66;TCF=25;TCR=41;TR=41;WE=135373702;WS=135373684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,43:0.62:69
chr10	135373768	rs10857753	T	C	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.484;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=88;ReadPosRankSum=-0.096;SC=TGCCCCTTCTTCTTGTCCTGA;SOR=0.307;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=6;WE=135373776;WS=135373758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr10	135378802	rs34776401	C	T	1274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.960;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=19;PP=698;ReadPosRankSum=0.213;SC=CGGGCAAGCACTCCCTCATCT;SOR=0.504;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=78;TCF=51;TCR=27;TR=53;WE=135378810;WS=135378792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,59:0.72:82
chr10	135381215	rs3020499	A	G	209.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=6;NR=2;PP=98;SC=CTGGGCAGGCATGGGGAGCTG;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=135381223;WS=135381205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr10	135381276	rs3020500	T	C	514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.40;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr10	135381592	rs3020501	C	G	704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=16;PP=494;ReadPosRankSum=0.046;SC=CGAGCCCAGCCAGGCCTAGGG;SOR=0.692;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=103;TCF=62;TCR=41;TR=40;WE=135381600;WS=135381582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,41:0.34:120
chr10	135381623	rs3020502	T	C	4777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=67;PP=2605;SC=CCCAGGGCACTGAGGGCGCCA;SOR=1.080;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=163;TCF=96;TCR=67;TR=163;WE=135381631;WS=135381613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr10	135381766	rs3020503	C	T	4004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=58;NR=74;PP=2199;SC=CCGCGTTCCCCGGGTCCCGCG;SOR=1.134;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=132;TCF=58;TCR=74;TR=132;WE=135381774;WS=135381756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr10	135381927	rs2987800	T	G	822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=18;PP=496;SC=AGAGGAAGGCTGCCTCCTGTA;SOR=1.402;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=11;TCR=18;TR=29;WE=135381935;WS=135381917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr10	135438810	.	G	A	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.143;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.26;MQRankSum=-1.890;QD=3.10;ReadPosRankSum=-0.507;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,3:0.18:17
chr10	135438834	rs374581917	A	C	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.23;MQRankSum=-3.082;QD=3.29;ReadPosRankSum=-1.038;SOR=0.798;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,6:0.20:30
chr10	135438888	rs150376644	C	T	2825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=-0.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.533;HP=1;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-8.517;NF=100;NR=53;PP=2367;ReadPosRankSum=-1.456;SC=GATAAACAGCCTCTGACATAG;SOR=0.747;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=236;TCF=148;TCR=88;TR=153;WE=135438896;WS=135438878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,126:0.59:212
chr10	135438929	rs201901202	T	G	8193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-2.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.405;HP=2;HapScore=1;MGOF=42;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-12.536;NF=126;NR=103;PP=2962;ReadPosRankSum=1.707;SC=CTTTTTCGAATTGACGGTGTT;SOR=0.605;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=329;TCF=182;TCR=147;TR=229;WE=135438937;WS=135438919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,203:0.64:316
chr10	135438951	rs200483318	G	A	9356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=360;ExcessHet=3.0103;FS=2.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.27;MQRankSum=-14.124;QD=25.99;ReadPosRankSum=1.891;SOR=0.597;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:128,232:0.64:360
chr10	135438955	rs201563622	C	T	9351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=360;ExcessHet=3.0103;FS=1.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.51;MQRankSum=-14.363;QD=25.98;ReadPosRankSum=2.049;SOR=0.653;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:130,230:0.64:360
chr10	135438959	.	AC	A	50.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.510;ClippingRankSum=0.000;DP=358;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.78;MQRankSum=-5.765;QD=0.14;ReadPosRankSum=4.069;SOR=0.750;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:323,31:0.09:354
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chr11	193112	rs7951297	C	T	855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.63;ReadPosRankSum=-0.756;SOR=0.659;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:174,62:0.26:236
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chr11	193863	rs2294081	T	C	6503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FS=1.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.92;ReadPosRankSum=-0.301;SOR=0.876;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,198:0.76:261
chr11	193865	rs2686894	T	G	2292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FS=2.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.82;ReadPosRankSum=0.959;SOR=0.843;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:147,113:0.43:260
chr11	194332	.	C	CA	248.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.971;ClippingRankSum=0.000;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=6;PP=254;ReadPosRankSum=-1.606;SC=GACCCCCCCCCACTGAGGGCC;SOR=0.623;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=54;TCF=35;TCR=19;TR=14;WE=194340;WS=194313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,19:0.24:80
chr11	194598	rs79601819	C	T	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=285;ReadPosRankSum=0.031;SC=GTCTCTGCCCCCACAGAGGGG;SOR=0.582;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=87;TCF=28;TCR=59;TR=23;WE=194606;WS=194588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,25:0.28:88
chr11	194640	rs2979429	G	A	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=278;ReadPosRankSum=1.432;SC=AACACACTCGGGGCCACAGCC;SOR=0.458;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=39;TCF=6;TCR=33;TR=16;WE=194648;WS=194630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,17:0.44:39
chr11	197557	rs7103852	A	G	2724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=32;PP=1996;SC=CATTGCGTCCACAGGCTTCAT;SOR=1.361;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=60;TCR=32;TR=92;WE=197565;WS=197547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr11	198062	rs11605246	C	G	2586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.438;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=58;PP=1649;ReadPosRankSum=-2.160;SC=TGGACACCCCCTGACCCGACT;SOR=0.603;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=252;TCF=130;TCR=122;TR=122;WE=198070;WS=198052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,131:0.48:275
chr11	206089	rs3782120	G	A	696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.868;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=20;PP=420;ReadPosRankSum=-0.133;SC=CGGTGAGCACGGCCCCTGACC;SOR=0.319;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=60;TCF=18;TCR=42;TR=31;WE=206097;WS=206079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,33:0.52:64
chr11	207254	rs143657869	CG	C	1566.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=2.047;NF=8;NR=15;PP=654;ReadPosRankSum=-0.094;SC=GCAGCGGCGTCGGTTTCGGCC;SOR=0.684;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=49;TCF=15;TCR=34;TR=23;WE=207262;WS=207244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,45:0.42:106
chr11	207275	rs6598075	C	G	1459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.31;ReadPosRankSum=0.622;SOR=0.714;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,44:0.43:102
chr11	207359	rs375304678	C	CGGCCACAGCCGCCTCAGACGT	2523.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.54;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=2965;SC=GACACCGACGCGGCCACAGCC;SOR=1.480;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=8;WE=207367;WS=207349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr11	207400	rs71487219	A	G	1754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.10;SOR=1.157;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr11	207400	.	AGCTTCCGGCC	GGCTTCCGGCC,GGCTTCCGGCT	214	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.62;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=127;MMLQ=22;MQ=60.0;NF=13,9;NR=16,8;PP=176,214;QD=7.26797284646;SC=GCGGGGAAAGAGCTTCCGGCC;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=13;TCR=16;TR=29,17;WE=207418;WS=207390;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:29
chr11	207410	rs58692051	C	T	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=1.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.670;SOR=0.469;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,23:0.51:45
chr11	207462	rs11245998	A	G	438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.49;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=8;PP=202;SC=GCCCCTAGATAGCCCAGCCCC;SOR=1.244;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=207470;WS=207452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	209002	rs2177173	A	G	1321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.80;QD=29.37;SOR=1.559;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr11	209894	rs3832797	ACCC	A	2523.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.928;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQ=60.04;MQRankSum=0.647;NF=1;NR=35;PP=1093;ReadPosRankSum=2.998;SC=CCTGAAGGGAACCCCCCACCC;SOR=1.065;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=86;TCF=10;TCR=76;TR=36;WE=209904;WS=209884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,67:0.45:148
chr11	214163	rs1533825	G	A	897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=1.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.75;ReadPosRankSum=-0.989;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,24:0.42:57
chr11	214169	rs1533824	T	C	960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.25;ReadPosRankSum=-1.101;SOR=0.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,28:0.44:63
chr11	214421	rs3216	G	C	2693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.396;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=54;PP=1602;ReadPosRankSum=0.862;SC=GTTGCAACCTGGGGAAGCCAC;SOR=0.779;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=272;TCF=146;TCR=126;TR=119;WE=214429;WS=214411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,129:0.44:291
chr11	219089	rs511744	T	C	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.207;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=131;ReadPosRankSum=-1.097;SC=CTTTACAAGCTCCTCAGGATG;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=7;WE=219097;WS=219079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr11	223832	.	C	A	199	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=6;NR=11;PP=199;QD=13.7512477969;SC=TGCCCTCCAGCCTCCTCCCTG;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=38;TCF=10;TCR=28;TR=17;WE=223840;WS=223822;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:21,17:0.45:38
chr11	233067	rs11246020	C	T	2293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.496;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=37;PP=1340;ReadPosRankSum=0.682;SC=TAGTGAGTGACGTTGGGCTTG;SOR=0.757;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=201;TCF=123;TCR=78;TR=100;WE=233075;WS=233057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,109:0.49:221
chr11	233212	rs11555236	C	A	1682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.502;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=39;PP=1097;ReadPosRankSum=1.201;SC=CACTCCCCGGCGATCTGCAGG;SOR=0.623;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=207;TCF=106;TCR=101;TR=81;WE=233220;WS=233202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,88:0.40:222
chr11	233298	rs12365010	T	G	1244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.263;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=27;PP=895;ReadPosRankSum=-0.856;SC=AGGGCAGGAGTCAGGGGAGGG;SOR=0.760;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=153;TCF=80;TCR=73;TR=58;WE=233306;WS=233288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,61:0.37:165
chr11	235894	rs9795476	T	G	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=291;ReadPosRankSum=-0.111;SC=CCCCCATAAGTGACGTCCACA;SOR=1.112;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=14;WE=235902;WS=235884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,16:0.70:23
chr11	236343	rs7118852	A	G	478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=14;PP=392;SC=CGCGCAGTCCAAGGAGTCCTC;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=236351;WS=236333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	236871	rs2272563	T	C	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=0.983;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=30;ReadPosRankSum=-0.944;SC=GAGAGTTTTGTCCGGAGCGCA;SOR=0.693;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=4;WE=236879;WS=236867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr11	237087	rs1045288	A	G	2131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=44;PP=1126;ReadPosRankSum=0.864;SC=CAGAGCCAGAACTCCGGGCCC;SOR=0.685;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=189;TCF=96;TCR=93;TR=87;WE=237095;WS=237077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,106:0.48:221
chr11	243987	rs6598060	G	A	906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.752;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=12;PP=511;ReadPosRankSum=-0.507;SC=TGGGGTCTTCGTTTTGCAGAA;SOR=0.187;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=67;TCF=49;TCR=18;TR=35;WE=243995;WS=243977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,42:0.55:76
chr11	244106	rs10902112	A	G	2816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FS=4.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.75;ReadPosRankSum=1.430;SOR=0.930;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:116,75:0.39:191
chr11	244108	rs7107362	A	G	2810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FS=2.571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.79;ReadPosRankSum=1.691;SOR=0.878;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,75:0.39:190
chr11	244115	rs7128044	G	A	2663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FS=3.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.87;ReadPosRankSum=1.785;SOR=0.951;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:119,73:0.38:192
chr11	244129	rs7116130	C	T	1391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=40;PP=2962;ReadPosRankSum=0.211;SC=TGATGCTCGGCGGTGCTCAAA;SOR=0.713;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=167;TCF=77;TCR=90;TR=74;WE=244149;WS=244096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,72:0.40:182
chr11	244141	rs7128029	G	A	1284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=38;PP=2962;ReadPosRankSum=0.054;SC=GTGCTCAAAGGCTGGTGGCTT;SOR=0.727;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=163;TCF=76;TCR=87;TR=70;WE=244149;WS=244096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,68:0.37:182
chr11	244167	rs1128320	C	T	1978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=0.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.74;ReadPosRankSum=-1.311;SOR=0.790;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,55:0.38:144
chr11	244171	rs1128321	T	C	1953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.57;ReadPosRankSum=-0.547;SOR=0.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,53:0.37:144
chr11	244197	rs1128322	T	C	814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.859;HP=1;HapScore=2;MGOF=39;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=27;PP=463;ReadPosRankSum=0.346;SC=TCATTCTTCATGTAGTTAGAC;SOR=1.214;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=99;TCF=40;TCR=59;TR=42;WE=244205;WS=244187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,46:0.41:113
chr11	244414	rs2272565	C	T	1439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.616;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=24;PP=983;ReadPosRankSum=1.341;SC=CTGATTGTTCCTTCTTTTCCA;SOR=0.769;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=128;TCF=79;TCR=49;TR=60;WE=244422;WS=244404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,68:0.46:147
chr11	244490	rs3830667	ATACCTTTTAG	A	3610.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.104;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.894;NF=10;NR=35;PP=2978;ReadPosRankSum=-0.705;SC=CATGTGGGCAATACCTTTTAG;SOR=0.674;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=118;TCF=31;TCR=87;TR=45;WE=244507;WS=244480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,96:0.46:209
chr11	244552	rs2272566	A	G	1770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.200;HP=2;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.836;NF=38;NR=38;PP=953;ReadPosRankSum=-1.121;SC=CTCACTGTCCAGACCTTTAGA;SOR=0.650;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=166;TCF=88;TCR=78;TR=76;WE=244560;WS=244542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,87:0.48:183
chr11	247200	rs3830001	G	T	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-4.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=233;ReadPosRankSum=-1.074;SC=CTAGGCAACAGAGTGAGACCC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=12;WE=247208;WS=247193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr11	250877	rs12793187	C	T	1610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=44;PP=1042;ReadPosRankSum=-0.699;SC=TAAGCGAACACCCAGGAGCCA;SOR=0.689;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=175;TCF=79;TCR=96;TR=80;WE=250885;WS=250867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,83:0.42:197
chr11	252318	rs6598055	C	T	383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=1;PP=306;SC=TTTTTTCTAACGTTCCTGTGA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=252326;WS=252308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	279798	rs4758626	G	A	764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.42;ReadPosRankSum=-1.948;SOR=0.710;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,48:0.34:141
chr11	280000	rs4758627	G	A	593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.551;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=7;PP=405;ReadPosRankSum=-0.532;SC=GCCTGAGCAGGGCCGGGGAGG;SOR=0.861;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=40;TCF=23;TCR=17;TR=24;WE=280008;WS=279990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,25:0.61:41
chr11	280221	rs6421985	A	C	4497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=80;PP=2905;SC=GGAGGAGGCGATGGGGCCCGC;SOR=0.955;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=147;TCF=67;TCR=80;TR=147;WE=280229;WS=280211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr11	280464	rs77447196	C	G	2133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=44;PP=1189;ReadPosRankSum=-0.242;SC=GCTGGAGAGGCCGGGCACGCG;SOR=0.650;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=69;TCR=75;TR=86;WE=280472;WS=280454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,98:0.62:157
chr11	280673	rs12807092	C	T	1672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=14;PP=1270;SC=GGCTGCTGAGCAAGGCGCTGC;SOR=1.919;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=38;TCR=14;TR=52;WE=280681;WS=280663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr11	280816	rs7482965	AT	TC	16719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=373;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=178;NR=133;PP=2947;SC=TTCTACAAGTATTTCCGGGAT;SOR=1.018;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=320;TCF=180;TCR=140;TR=311;WE=280825;WS=280806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,373:1.00:373
chr11	284093	rs9734280	A	G	1187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=7;PP=866;SC=AGGCTCTGCGAGGTCCAGGGA;SOR=2.613;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=38;WE=284101;WS=284083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	284341	rs7108246	G	A	1353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.582;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=31;ReadPosRankSum=-0.564;SC=TCAGTGAGGCGGGACTGCGTA;SOR=0.784;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=143;TCF=71;TCR=72;TR=60;WE=284349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,71:0.43:164
chr11	284538	rs6598047	T	C	4114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.40;SOR=0.769;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr11	284716	rs760059	C	T	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=3;PP=55;ReadPosRankSum=-2.000;SC=CCTGGGGGCTCCCCCTGGACC;SOR=0.368;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=6;WE=284724;WS=284706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr11	290816	rs10902120	A	G	2971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=58;NR=44;PP=1605;SC=TCCTGACAGCAGTGGGCGGCA;SOR=0.728;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=58;TCR=44;TR=102;WE=290824;WS=290806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr11	292798	rs11602423	A	G	667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=10;PP=521;SC=AGGTGTCTCAATGCCAGGCCT;SOR=0.784;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=10;TCR=10;TR=20;WE=292806;WS=292788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	293001	rs35259273	A	AG	2148.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.765;NF=16;NR=26;PP=1531;ReadPosRankSum=0.433;SC=CTGAGGGGTGAGGCCATGGTG;SOR=0.722;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=28;TCR=46;TR=42;WE=293009;WS=292991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,73:0.57:128
chr11	293188	rs12801980	T	C	2646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.482;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=59;PP=1618;ReadPosRankSum=-0.449;SC=ACGAGTACCATTCAGGGGTCA;SOR=0.737;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=207;TCF=99;TCR=108;TR=112;WE=293196;WS=293178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,124:0.54:230
chr11	293785	rs12418165	C	T	2142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.035;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=47;PP=1227;ReadPosRankSum=0.041;SC=TCTCTGCCCACGCAGTGGGCC;SOR=0.541;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=223;TCF=104;TCR=119;TR=97;WE=293793;WS=293775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,110:0.43:254
chr11	294512	rs149098966	A	ACCCCAGGCTGTCCCTCACCCCCAGACTGCCCTCTCAC	2716.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.28;SOR=1.460;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr11	294523	.	C	T	913	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=26;MQ=59.9;NF=14;NR=26;PP=913;QD=23.6942803137;SC=CCCCAGGCTGCCCCTCACCCC;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=70;TCF=34;TCR=36;TR=40;WE=294545;WS=294513;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:30,40:0.57:70
chr11	294537	.	G	A	913	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=26;MQ=59.9;NF=7;NR=13;PP=913;QD=47.3885606274;SC=TCACCCCCAGGCTGCCTCTCT;SbPval=0.04;Source=Platypus;TC=71;TCF=43;TCR=28;TR=20;WE=294545;WS=294513;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:51,20:0.28:71
chr11	299219	.	C	A	156	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=5;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=9;NR=1;PP=156;QD=19.0771212547;SC=AAGGACCCCCCACGGAGCTCC;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=10;WE=299227;WS=299209;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,10:0.59:17
chr11	308065	rs9704108	T	C	1060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=3;PP=842;SC=GTTCTGCCCTTATCTGGCCCT;SOR=4.112;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=32;WE=308073;WS=308055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	308178	rs1058873	T	C	4812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FS=3.910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.77;ReadPosRankSum=0.288;SOR=0.910;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:160,127:0.44:287
chr11	308178	.	TCA	CCG	2944	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=64;NR=43;PP=2944;QD=20;SC=GGTAACCCGATCACCGCTGGT;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=256;TCF=143;TCR=113;TR=107;WE=308188;WS=308168;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:149,107:0.42:256
chr11	308180	rs10398	A	G	4812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FS=4.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.71;ReadPosRankSum=0.327;SOR=0.956;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:161,127:0.44:288
chr11	308290	rs1058900	T	C	3127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.528;HP=6;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.616;NF=40;NR=49;PP=1153;ReadPosRankSum=1.696;SC=ATGCTGGGGGTGCCCCACAAC;SOR=0.636;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=178;TCF=79;TCR=99;TR=89;WE=308298;WS=308280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,94:0.48:196
chr11	308314	rs14408	T	C	2756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.619;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-5.411;NF=28;NR=44;PP=985;ReadPosRankSum=0.029;SC=GCTCCCCCGATGTCCACCGTG;SOR=0.796;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=139;TCF=57;TCR=82;TR=72;WE=308322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,73:0.49:149
chr11	308363	rs1058935	G	C	999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.551;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-7.824;NF=15;NR=29;PP=576;ReadPosRankSum=0.040;SC=CTGACCATGTGGTCTGGTCCC;SOR=0.964;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=100;TCF=40;TCR=60;TR=44;WE=308371;WS=308353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,49:0.45:108
chr11	308426	rs1058964	G	C	960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.612;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.086;NF=16;NR=24;PP=680;ReadPosRankSum=-0.114;SC=TAGCATTCGCGTACTCCGTGA;SOR=0.911;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=91;TCF=43;TCR=48;TR=40;WE=308434;WS=308416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,45:0.44:102
chr11	309127	rs1059091	A	G	2092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.532;NF=66;NR=36;PP=1391;ReadPosRankSum=3.180;SC=CATTCTGCTCATCATCATCCC;SOR=0.695;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=204;TCF=131;TCR=73;TR=102;WE=309135;WS=309117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,104:0.48:216
chr11	314207	rs9667990	C	G	10856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=398;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=168;NR=196;PP=2965;SC=TGTGCTGGGGCCACCCCCCAG;SOR=0.873;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=364;TCF=168;TCR=196;TR=364;WE=314215;WS=314197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,397:1.00:397
chr11	314517	.	CTG	C	122.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.081;ClippingRankSum=0.000;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=1.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.32;ReadPosRankSum=-1.587;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,7:0.19:37
chr11	320166	rs28655829	T	C	181.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.47;QD=30.31;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr11	320237	rs28688930	C	G	273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.36;QD=27.38;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	320394	rs6421983	C	T	980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.984;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.895;NF=12;NR=31;PP=704;ReadPosRankSum=-1.363;SC=CCAAGCCACACACACACACAG;SOR=0.858;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=77;TCF=21;TCR=56;TR=43;WE=320402;WS=320384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,43:0.61:70
chr11	369844	.	AGCT	A	250.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.081;ClippingRankSum=0.000;DP=153;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.94;ReadPosRankSum=0.595;SOR=0.707;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:114,15:0.12:129
chr11	373408	.	ACC	A,AC	1147.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=0.000;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.9977;FS=3.096;HP=11;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=19;PP=741;ReadPosRankSum=0.336;SC=GAGAGAGTGAACCCCCCCCCC;SOR=0.105;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=58;TCF=28;TCR=30;TR=42;WE=373427;WS=373396;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.29,0.67:48
chr11	379598	rs1134699	A	G	2435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.518;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=49;PP=1430;ReadPosRankSum=0.552;SC=AAAGTCCCGAACCCGCTCCCG;SOR=0.722;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=234;TCF=124;TCR=110;TR=110;WE=379606;WS=379588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,118:0.47:251
chr11	380774	rs35355019	A	AC	3395.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.591;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.004;NF=32;NR=40;PP=2590;ReadPosRankSum=-0.978;SC=TGCCGGGGGGACCTTGCAGGA;SOR=0.993;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=148;TCF=56;TCR=92;TR=72;WE=380782;WS=380764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,113:0.50:225
chr11	381560	.	C	T	53	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.56;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=24;MQ=46.55;NF=4;NR=0;PP=53;QD=21.9428031368;SC=CACCTCTCCGCCCCCGGCCCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=4;WE=381568;WS=381550;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr11	392634	rs111447834	T	C	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=1.496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.276;SOR=0.379;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr11	396546	rs7105848	G	A	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.358;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.136;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=2;PP=146;ReadPosRankSum=-0.963;SC=TGGTGGAGAGGAGGCAGGAGG;SOR=0.136;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=10;WE=396554;WS=396536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr11	396701	rs11246147	C	T	1963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.545;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=31;PP=1064;ReadPosRankSum=0.227;SC=AGCGATGGGCCCAGCCCGAGG;SOR=0.743;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=161;TCF=96;TCR=65;TR=79;WE=396709;WS=396691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,94:0.52:181
chr11	396915	rs12419281	C	T	1355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.616;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=29;PP=889;ReadPosRankSum=1.684;SC=CAGCCCACAACGGGGGCAGCG;SOR=0.456;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=94;TCF=46;TCR=48;TR=57;WE=396923;WS=396905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,60:0.59:102
chr11	397331	rs200371913	G	C	1246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=27;PP=926;ReadPosRankSum=0.186;SC=CCAGTGGCTCGAGCGCCATCT;SOR=0.667;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=163;TCF=93;TCR=70;TR=62;WE=397339;WS=397321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,62:0.38:163
chr11	397706	rs9795298	T	C	1012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=9;NR=25;PP=858;SC=GGTGACCTCCTTCGTGGGCCC;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=34;WE=397714;WS=397696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	397732	rs9795299	T	G	624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=17;PP=480;SC=CCTCCCACTGTCCTCTGCTCA;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=22;WE=397740;WS=397722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr11	400109	rs8858	A	G	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=137;ReadPosRankSum=1.844;SC=CCTCGGAGGCAGAGATCTTCT;SOR=0.765;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=11;WE=400117;WS=400099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr11	403046	rs76360685	C	T	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.32;ReadPosRankSum=0.608;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr11	403939	rs7479832	A	G	1265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.436;HP=4;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=22;PP=919;ReadPosRankSum=0.585;SC=CCGGCCTCCCACAGCCACGAA;SOR=0.895;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=98;TCF=54;TCR=44;TR=51;WE=403947;WS=403929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,56:0.50:111
chr11	403980	rs11748	G	A	1503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=23;PP=1021;ReadPosRankSum=1.095;SC=AGAAGCTGCCGGGCAGCGTGG;SOR=0.665;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=146;TCF=96;TCR=50;TR=64;WE=403988;WS=403970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,70:0.45:157
chr11	404317	rs1134578	C	T	1843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.679;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=51;PP=1377;ReadPosRankSum=0.369;SC=ACCGTGACTTCCGGGCGGTAC;SOR=0.829;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=202;TCF=95;TCR=107;TR=92;WE=404325;WS=404307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,91:0.42:216
chr11	406043	rs7947	G	A	1805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=33;PP=930;ReadPosRankSum=-1.500;SC=GCTCTCCAAAGACAGGCCCCC;SOR=0.683;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=125;TCF=67;TCR=58;TR=74;WE=406051;WS=406033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,87:0.60:144
chr11	406473	rs3087588	A	C	3231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FS=1.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.32;ReadPosRankSum=0.948;SOR=0.617;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:120,91:0.43:211
chr11	406483	rs3210908	T	C	3007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FS=1.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.50;ReadPosRankSum=1.471;SOR=0.595;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:114,80:0.41:194
chr11	407708	rs6421977	A	C	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.084;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=270;ReadPosRankSum=-1.345;SC=CGCACAGAGCACCCGGGGGCT;SOR=0.042;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=13;WE=407716;WS=407698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr11	409385	rs6421976	C	G	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=164;ReadPosRankSum=-0.458;SC=TGGATGGGCACAGCTGGGAGC;SOR=0.693;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=9;WE=409393;WS=409375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr11	409720	rs6598024	T	G	1116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.357;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=17;PP=636;ReadPosRankSum=-0.817;SC=AAGGGCCCAGTGGGAGGGGTG;SOR=0.916;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=102;TCF=61;TCR=41;TR=49;WE=409728;WS=409710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,55:0.47:117
chr11	428385	rs10794323	A	G	2041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=18;PP=1484;SC=AGGGCCACGCACCTGTTGATC;SOR=2.211;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=55;TCR=18;TR=73;WE=428393;WS=428375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr11	428489	rs10794324	T	C	6733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=130;NR=109;PP=2965;SC=GTCATGATGATGATGGTCACA;SOR=0.724;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=240;TCF=131;TCR=109;TR=239;WE=428497;WS=428479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr11	429659	rs7111432	C	T	8231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=139;NR=147;PP=2965;SC=GTGGCTGCGGCGGGGGCAAGG;SOR=0.780;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=286;TCF=139;TCR=147;TR=286;WE=429667;WS=429649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,309:1.00:309
chr11	430339	rs113926353	C	G	2588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.896;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=68;PP=1608;ReadPosRankSum=2.166;SC=GCGGCCGGCACCAGCATGTAG;SOR=0.639;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=267;TCF=118;TCR=149;TR=127;WE=430347;WS=430329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,135:0.47:288
chr11	430456	rs11603743	A	G	499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=9;PP=264;SC=GGGGAGGGACAGGAAAGGGAT;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=14;WE=430464;WS=430446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	431577	.	T	A	190	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;FR=1.0000;HP=4;HapScore=2;MGOF=89;MMLQ=25;MQ=51.51;NF=8;NR=0;PP=190;QD=28.0964015684;SC=GTGTGGGGGCTCCCGCGGGTA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=431585;WS=431573;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	431622	.	C	T	490	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;FR=1.0000;HP=4;HapScore=1;MGOF=32;MMLQ=18;MQ=59.6;NF=21;NR=9;PP=490;QD=17.4923737516;SC=GGGGCGTCCGCGGGTATCTGG;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=30;WE=431630;WS=431612;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr11	431834	rs55914928	A	G	3983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=69;NR=64;PP=2242;SC=TCTCCAGGCCAGCCCACCCCT;SOR=0.789;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=133;TCF=69;TCR=64;TR=133;WE=431842;WS=431824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr11	433387	rs7395065	A	G	8829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=165;NR=143;PP=2965;SC=TCCAGGAGGAAAGTGCGGTAC;SOR=0.761;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=308;TCF=165;TCR=143;TR=308;WE=433395;WS=433377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,331:1.00:331
chr11	433554	rs12576389	C	T	1092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=11;NR=21;PP=595;SC=TCAGAACCCTCCCCCCTCTAT;SOR=2.019;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=34;TCF=12;TCR=22;TR=32;WE=433576;WS=433544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr11	433568	rs7396813	G	A	1013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=7;NR=20;PP=584;SC=CCTCTATTCCGCCTCAGAACC;SOR=2.694;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=29;TCF=9;TCR=20;TR=27;WE=433576;WS=433544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr11	433867	rs12575508	G	A	5992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=118;NR=85;PP=2965;SC=TTGCTGCCGCGCCTGCCGGGG;SOR=0.883;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=204;TCF=119;TCR=85;TR=203;WE=433875;WS=433857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr11	433965	rs7396778	G	A	3775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=76;PP=2378;SC=GGGGCCAGGCGCAGGTGAAGG;SOR=1.138;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=50;TCR=76;TR=126;WE=433973;WS=433955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr11	433995	rs7396776	G	A	3835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=70;PP=2530;SC=GGGCCAGGTGGGGCCCGGGAG;SOR=1.027;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=55;TCR=70;TR=125;WE=434003;WS=433985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
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chr11	474033	rs72851118	C	T	3675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=82;PP=2231;SC=TCTGAGCGGCCACTCTGTGTC;SOR=1.476;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=44;TCR=82;TR=126;WE=474041;WS=474023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr11	479240	rs3216784	GC	G	641.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.767;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=1042;ReadPosRankSum=-0.345;SC=TGCCCACACAGCCCTCGAGTG;SOR=1.578;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=12;WE=479254;WS=479230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,19:0.35:55
chr11	479245	rs2301169	C	T	650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=4.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.28;ReadPosRankSum=-0.761;SOR=1.503;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,19:0.36:53
chr11	479245	.	CG	TT	1037	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=1;NR=12;PP=1037;QD=83.8821442202;SC=ACACAGCCCTCGAGTGATGGG;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=47;TCF=11;TCR=36;TR=13;WE=479254;WS=479230;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:34,13:0.28:47
chr11	479246	rs2301170	G	T	656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=2.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.63;ReadPosRankSum=-0.491;SOR=1.410;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,18:0.35:52
chr11	486826	rs55653405	C	T	1624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.69;QD=45.13;SOR=1.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr11	486835	rs55976759	G	A	1984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.41;QD=46.16;SOR=1.455;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr11	486843	rs56352613	A	G	2896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.41;QD=49.10;SOR=1.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr11	486855	rs55961417	T	A	1447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=7.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQRankSum=-1.102;QD=20.39;ReadPosRankSum=-3.168;SOR=1.263;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,61:0.86:71
chr11	486874	rs55830538	T	C	4985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.61;QD=38.35;SOR=0.856;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr11	487666	rs112145905	C	T	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.732;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=126;ReadPosRankSum=0.127;SC=GTCGGGTCCCCGCTCCGTCCT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=8;WE=487674;WS=487656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr11	488135	rs11820122	G	A	3350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.29;QD=45.28;SOR=1.641;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr11	488140	rs11821959	C	T	3498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.27;QD=43.19;SOR=1.668;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr11	488389	rs11822000	C	A	1272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=24;SC=CCAGCGCGGCCCCTGGACCCC;SOR=1.347;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=40;TCF=16;TCR=24;TR=39;WE=488397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr11	489386	rs67492572	T	C	2249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=26;PP=1304;SC=GGCTGCCGGCTCTGTGGTTCC;SOR=1.112;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=42;TCR=26;TR=68;WE=489394;WS=489376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr11	489829	rs56005321	C	A	1988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=46;SC=TGGGCAAGTCCGCCTGGAGGA;SOR=1.875;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=18;TCR=46;TR=64;WE=489837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr11	494942	rs7983	G	C	3102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=53;NR=44;PP=1433;SC=GCAGGATGCCGGCGTCCCCCA;SOR=0.800;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=53;TCR=44;TR=97;WE=494950;WS=494932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr11	495103	rs11246165	A	G	658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=494;ReadPosRankSum=-0.705;SC=CTGGCACCGCACTGACCGGCA;SOR=1.044;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=24;WE=495111;WS=495093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,24:0.96:25
chr11	498383	rs11825121	C	T	700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=5;PP=470;SC=GAGTCGCTCACTCCTCCCCTG;SOR=2.584;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=25;WE=498391;WS=498373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	499059	rs17584	C	T	6275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=114;NR=103;PP=2965;SC=GGCCCTGGCACAGCACACGGA;SOR=0.762;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=217;TCF=114;TCR=103;TR=217;WE=499067;WS=499049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr11	499547	rs61876345	A	C	3420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=58;NR=54;PP=1670;SC=ACTCACGGCCAGGCATCTGTT;SOR=0.787;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=113;TCF=59;TCR=54;TR=112;WE=499555;WS=499537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr11	499583	rs61876346	G	A	3776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=63;NR=59;PP=1965;SC=TGGGGCAGCTGTGCCTTGCAA;SOR=0.807;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=63;TCR=59;TR=122;WE=499591;WS=499573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr11	500056	rs12417451	G	A	496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=8;NR=9;PP=208;SC=CACGCCCTTCGCCTGCCAGAG;SOR=1.127;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=8;TCR=9;TR=17;WE=500064;WS=500046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	502013	rs7930593	G	A	880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=10;PP=464;SC=GCCGCCACCCGCCAGCCTGCC;SOR=1.352;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=20;TCR=11;TR=30;WE=502021;WS=502003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	502217	rs7944548	C	T	4191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=68;NR=77;PP=2417;SC=ACGTCTTGGCCGAATCCCCTC;SOR=1.031;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=145;TCF=68;TCR=77;TR=145;WE=502225;WS=502207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr11	534242	rs12628	A	G	3537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.295;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=79;PP=2103;ReadPosRankSum=-1.142;SC=CGTCCACAAAATGGTTCTGGA;SOR=0.621;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=297;TCF=147;TCR=150;TR=157;WE=534250;WS=534232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,168:0.51:330
chr11	534403	rs146677294	GCCCAGGCCCAGC	G	703.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-1.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.755;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.765;NF=0;NR=6;PP=1829;ReadPosRankSum=-2.009;SC=GCTCAGCCAGGCCCAGGCCCA;SOR=0.166;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=6;WE=534422;WS=534393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,19:0.68:28
chr11	549959	rs7942030	C	T	5118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=67;PP=2740;SC=GCTGTGGCCTCGCTGACCTGG;SOR=0.890;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=161;TCF=94;TCR=67;TR=161;WE=549967;WS=549949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr11	550028	rs11246180	C	G	6877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=123;NR=107;PP=2965;SC=GCTGGGGAGGCCTGGGCTGGG;SOR=0.779;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=231;TCF=123;TCR=108;TR=230;WE=550036;WS=550018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr11	551235	rs35537971	G	A	1775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.893;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=29;PP=1006;ReadPosRankSum=0.184;SC=CGGCCCCCCCGCGGCTGAGCC;SOR=0.870;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=155;TCF=96;TCR=59;TR=79;WE=551243;WS=551225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,86:0.50:173
chr11	551405	rs7396875	G	A	6146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=101;NR=114;PP=2965;SC=CATCTCATGCGCTTCTCCAGC;SOR=0.964;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=216;TCF=102;TCR=114;TR=215;WE=551413;WS=551395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr11	551753	rs4963198	G	A	2991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.426;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=63;PP=1788;ReadPosRankSum=-0.384;SC=CTGCTGGTCCGTGGGGGCCCC;SOR=0.655;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=270;TCF=135;TCR=135;TR=129;WE=551761;WS=551743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,141:0.49:289
chr11	552547	rs3740652	T	C	458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=5;PP=359;SC=GGCTGGAGCTTCTCCTCCTCT;SOR=2.049;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=18;WE=552555;WS=552537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	552756	rs12361381	T	C	2269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=37;NR=37;PP=1233;SC=AACACCCCACTTCTATAGGGG;SOR=0.867;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=37;TCR=37;TR=74;WE=552764;WS=552746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr11	552787	rs12361383	T	C	2265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.33;SOR=0.886;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr11	552787	.	TG	CC,CG	356	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=14,29;NR=12,29;PP=260,356;QD=12.0564567255;SC=CCAGATCAGATGTGTCAACCT;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=58;TCF=29;TCR=29;TR=26,58;WE=552796;WS=552777;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.45:58
chr11	552788	rs11246182	G	C	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.68;ReadPosRankSum=-2.534;SOR=0.826;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,31:0.48:64
chr11	552875	rs28575794	A	G	449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=5;NR=10;PP=256;SC=GCTCACGACCAAGGGAGGCCC;SOR=1.739;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=15;WE=552883;WS=552865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	553866	rs12792519	G	A	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.9988;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=171;ReadPosRankSum=-1.019;SC=CCACTGCCTCGGGGCTGCAGG;SOR=0.330;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=11;WE=553874;WS=553856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,12:0.80:15
chr11	554047	rs12793222	G	A	1845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=36;PP=882;ReadPosRankSum=-2.550;SC=AGCTCCCCGCGGTGGTCGACA;SOR=0.722;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=188;TCF=99;TCR=89;TR=79;WE=554055;WS=554037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,93:0.45:207
chr11	554166	rs10902170	C	G	2250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=31;PP=1288;SC=GGTGGCCTCACGCCTGAGCCC;SOR=0.768;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=37;TCR=31;TR=68;WE=554174;WS=554156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr11	554214	rs10902171	G	C	2731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=54;NR=31;PP=1484;SC=GCCAGCACCAGATGCAGCAGC;SOR=0.930;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=54;TCR=31;TR=85;WE=554222;WS=554204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr11	554299	rs10902172	C	G	2074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=36;PP=1197;SC=TGCCAGGCTTCCCTGTGCTGG;SOR=1.051;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=68;TCF=32;TCR=36;TR=68;WE=554307;WS=554289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr11	555182	.	G	GGGAGGGGCGGGGAGGAGAGC	207.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=103.90;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr11	555223	rs55731724	AC	A	1094.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=4;PP=967;SC=GGACGAGGAGACAGAGGGGAG;SOR=3.258;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=21;WE=555231;WS=555213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	556121	rs936467	G	A	809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=12;PP=467;SC=CAGACCTGGAGGGGCGTGGAG;SOR=0.906;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=12;TCR=12;TR=24;WE=556129;WS=556111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr11	556457	rs28407128	T	C	4412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=58;PP=2918;SC=CCAGCTCCAGTCCGGCGCCGG;SOR=0.875;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=139;TCF=81;TCR=58;TR=139;WE=556465;WS=556447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr11	556521	rs28406183	C	G	5941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=117;NR=90;PP=2965;SC=TCCAGTGGTCCGGGTCTGTGC;SOR=1.032;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=207;TCF=117;TCR=90;TR=207;WE=556529;WS=556511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr11	556857	rs7938269	G	C	3586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=59;NR=54;PP=1878;SC=TGCTGTAGCTGCCGGCCTGCA;SOR=0.818;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=113;TCF=59;TCR=54;TR=113;WE=556865;WS=556847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr11	557342	rs936466	T	C	2910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=67;NR=33;PP=1708;SC=GCGTCTTCACTTGCCAAGGTG;SOR=1.168;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=67;TCR=33;TR=100;WE=557350;WS=557332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr11	557989	rs7129811	C	T	1054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=17;PP=530;ReadPosRankSum=-0.776;SC=CCTCCATCTCCTGGAGCGTGC;SOR=0.682;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=102;TCF=58;TCR=44;TR=44;WE=557997;WS=557979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,51:0.47:109
chr11	558884	rs2061586	C	T	4030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=91;NR=38;PP=2511;SC=ACCACCGGTGCGGGGTGGGGC;SOR=1.561;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=91;TCR=38;TR=129;WE=558892;WS=558874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr11	559016	rs3943356	C	T	7690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=128;NR=145;PP=2965;SC=TCGGTTTCTTCAACCTCCTGG;SOR=0.939;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=273;TCF=128;TCR=145;TR=273;WE=559024;WS=559006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,297:1.00:297
chr11	559466	rs117460484	C	A	673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.904;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=21;PP=467;ReadPosRankSum=0.344;SC=GACCCCAGACCAGGCCCCTAG;SOR=0.882;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=73;TCF=28;TCR=45;TR=32;WE=559474;WS=559456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,33:0.42:78
chr11	560801	rs71462097	C	CG	65.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=25;ReadPosRankSum=1.109;SC=CCTGTAGTCTCGGGGGGGGCG;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=3;WE=560809;WS=560791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr11	562219	rs2242183	C	G	2404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.284;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=50;PP=1449;ReadPosRankSum=-1.437;SC=GCGCACAGGGCCCAGCCTAGC;SOR=0.736;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=209;TCF=110;TCR=99;TR=108;WE=562227;WS=562209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,116:0.52:222
chr11	562437	rs11246189	G	A	2093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=45;PP=1227;ReadPosRankSum=-1.008;SC=TGGAGCTCAGGGTGCAGAGGA;SOR=0.684;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=157;TCF=76;TCR=81;TR=88;WE=562445;WS=562427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,99:0.58:171
chr11	568211	rs7395206	G	A	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=0.605;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=33;ReadPosRankSum=-1.383;SC=GCGGGCGGAGGGATTGACCCC;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=5;WE=568219;WS=568201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr11	587425	rs12800061	C	A	1031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.692;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.049;NF=16;NR=26;PP=516;ReadPosRankSum=1.304;SC=AGAACTGTGCCCATTACTTCT;SOR=1.059;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=89;TCF=36;TCR=53;TR=42;WE=587433;WS=587415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,50:0.49:103
chr11	601785	rs2396545	T	C	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-5.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=227;ReadPosRankSum=0.703;SC=AGCCTCCCGCTGGCCTTGGCA;SOR=0.588;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=15;WE=601793;WS=601775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr11	606656	rs936470	G	C	2171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=46;PP=1386;SC=CAGGCTGTTCGCAAGCACTCA;SOR=1.552;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=73;TCF=26;TCR=47;TR=72;WE=606664;WS=606646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr11	606749	rs936469	G	A	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=77;ReadPosRankSum=0.138;SC=TTCCCTTCTTGAGCAGTTTCT;SOR=0.693;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=6;WE=606757;WS=606739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr11	607175	rs936468	G	A	1020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=20;PP=575;ReadPosRankSum=-2.464;SC=CCCAAGGCCCGTCAGGAAACA;SOR=0.739;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=107;TCF=58;TCR=49;TR=46;WE=607183;WS=607165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,52:0.44:119
chr11	609068	rs7928902	G	A	1713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.169;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=36;PP=943;ReadPosRankSum=-0.128;SC=CTTCCCCAGCGCCCCTTGCAC;SOR=0.576;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=159;TCF=87;TCR=72;TR=75;WE=609076;WS=609058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,85:0.48:178
chr11	609353	rs11539530	G	A	5331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=550;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.090;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=116;NR=125;PP=2962;ReadPosRankSum=0.225;SC=ACTCTTCCCCGGAGCGAGACT;SOR=0.734;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=511;TCF=252;TCR=259;TR=241;WE=609361;WS=609343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:286,263:0.48:549
chr11	610277	rs11246212	T	C	4667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=94;PP=2574;SC=GTCAGGCAGGTGTTCTCCGAG;SOR=1.244;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=162;TCF=68;TCR=94;TR=162;WE=610285;WS=610267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr11	611503	rs7941547	G	A	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.469;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=4;PP=484;ReadPosRankSum=1.472;SC=CTCTGCCGCCGTCTGTCTGCG;SOR=1.209;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=47;TCF=39;TCR=8;TR=26;WE=611511;WS=611493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,26:0.54:48
chr11	611531	rs12419618	G	A	1081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.724;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=11;PP=592;ReadPosRankSum=1.038;SC=CCTAGGGCCTGCTCCTGAGCA;SOR=0.916;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=87;TCF=62;TCR=25;TR=43;WE=611539;WS=611521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,51:0.50:101
chr11	611802	rs17155933	C	G	669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.076;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=25;PP=548;ReadPosRankSum=-0.434;SC=GGGCTATGCCCGGGGAGCTGT;SOR=1.981;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=61;TCF=12;TCR=49;TR=28;WE=611810;WS=611792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,28:0.45:62
chr11	612843	rs10902178	T	G	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.462;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=209;ReadPosRankSum=-1.127;SC=CCGGCGTGTGTCCTCCCCTCC;SOR=1.022;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=26;TCF=10;TCR=16;TR=14;WE=612851;WS=612833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr11	612967	rs11246213	A	G	908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.751;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=14;PP=531;ReadPosRankSum=0.720;SC=GCCTGAGCACATGGCCTCCCC;SOR=0.815;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=68;TCR=32;TR=44;WE=612975;WS=612957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,49:0.44:111
chr11	613165	rs1051390	G	C	3165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.359;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=74;PP=1613;ReadPosRankSum=0.412;SC=GTGCTCCCAAGGACCCCTGGA;SOR=0.794;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=291;TCF=148;TCR=143;TR=148;WE=613173;WS=613155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,159:0.52:306
chr11	613192	rs12422022	A	G	3285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.190;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=71;PP=1997;ReadPosRankSum=0.935;SC=CCCCCAGGCAAGGGCCTCACT;SOR=0.881;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=272;TCF=137;TCR=135;TR=137;WE=613200;WS=613170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,149:0.52:287
chr11	613208	rs1131665	T	C	2835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.931;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=61;PP=1428;ReadPosRankSum=0.824;SC=TCACTGACCTTGGAAGAAGAC;SOR=0.769;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=250;TCF=127;TCR=123;TR=121;WE=613216;WS=613198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,134:0.50:267
chr11	613297	rs1061505	T	G	2060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.012;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=42;PP=1203;ReadPosRankSum=0.181;SC=AGCCTGGGGGTCCGCCCACCT;SOR=0.677;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=215;TCF=108;TCR=107;TR=88;WE=613305;WS=613287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,102:0.44:234
chr11	613742	.	G	A	128	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=10;NR=1;PP=128;QD=14.7973829588;SC=GTGAGTGACGGGGGTGGGCGG;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=11;WE=613750;WS=613732;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:10,11:0.52:21
chr11	613757	.	A	G	266	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=16;NR=3;PP=266;QD=15.8300638183;SC=GGGCGGGGACAGGCTGCCCCT;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=19;WE=613765;WS=613747;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr11	614318	rs1061502	T	C	1703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=33;PP=892;ReadPosRankSum=-0.103;SC=AGGTCCCCCTTGTCACCAGCT;SOR=0.678;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=139;TCF=79;TCR=60;TR=73;WE=614326;WS=614308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,82:0.53:156
chr11	614864	rs1061501	C	T	13643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=514;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=258;NR=217;PP=2965;SC=CCGAGTTATCCCGCAGCATCA;SOR=0.808;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=476;TCF=258;TCR=218;TR=475;WE=614872;WS=614854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,514:1.00:514
chr11	615010	rs12290989	GA	TT	3197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=37;PP=2128;ReadPosRankSum=0.008;SC=GCCCAGGCCTGAAGAGGGGGA;SOR=0.747;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=119;TCF=45;TCR=74;TR=61;WE=615019;WS=615000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,81:0.57:142
chr11	616970	rs1610161	A	T	2257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=46;PP=1416;SC=GAGGTCTGAGATGAGCCGGGT;SOR=1.347;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=78;TCF=31;TCR=47;TR=77;WE=616978;WS=616960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr11	617214	rs35600572	A	G	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=9.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.04;ReadPosRankSum=-1.326;SOR=0.033;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr11	617221	rs34449380	T	G	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=9.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.62;ReadPosRankSum=-0.672;SOR=0.027;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr11	617228	rs112006329	G	A	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=11.364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.47;ReadPosRankSum=0.542;SOR=0.041;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr11	617378	rs61877856	C	T	1362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.70;ReadPosRankSum=0.045;SOR=0.681;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:102,75:0.42:177
chr11	617420	rs61877857	A	G	1035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=23;PP=573;ReadPosRankSum=0.683;SC=CCTCGCCCTCATCGCCGCTGC;SOR=0.725;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=152;TCF=83;TCR=69;TR=53;WE=617428;WS=617410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,61:0.37:167
chr11	617519	rs34889521	A	G	1193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.56;ReadPosRankSum=1.520;SOR=0.726;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,66:0.42:158
chr11	617537	rs2740380	C	T	1522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=31;PP=882;ReadPosRankSum=0.809;SC=ACCCGCCCTCCGGCCGCCGCT;SOR=0.650;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=116;TCF=63;TCR=53;TR=66;WE=617545;WS=617527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,72:0.55:131
chr11	617967	rs2740379	C	G	2636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=19;PP=1935;SC=AGCTTTGCCACAGCAGCACTT;SOR=2.168;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=59;TCR=19;TR=78;WE=617975;WS=617957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr11	618013	rs7108757	C	T	2590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=42;PP=1697;ReadPosRankSum=-0.622;SC=ACAAGGACGGCGAGGCCAAGG;SOR=0.734;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=198;TCF=123;TCR=75;TR=112;WE=618021;WS=618003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,119:0.56:213
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chr11	618998	rs2740375	G	A	1838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.987;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=36;PP=942;ReadPosRankSum=-2.328;SC=GCACCCGGGGGCCCCCCGGGT;SOR=0.785;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=151;TCF=83;TCR=68;TR=83;WE=619006;WS=618988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,90:0.56:160
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chr11	626220	rs12280580	C	G	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.930;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=65;ReadPosRankSum=1.501;SC=GTCAGTCCCTCCTGGGTGGAT;SOR=0.527;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=5;WE=626228;WS=626217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr11	636496	rs936461	A	G	1025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=7;PP=606;SC=AGCCGAACCTACTGTCCGGTC;SOR=1.819;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=30;WE=636504;WS=636486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr11	636689	rs747302	G	C	1654.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.40;MQRankSum=0.795;QD=30.64;ReadPosRankSum=1.312;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,42:0.78:54
chr11	636690	rs936462	G	A	1654.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.40;MQRankSum=0.795;QD=30.64;ReadPosRankSum=1.332;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,42:0.78:54
chr11	636701	rs3842250	CG	C	1165.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.53;MQRankSum=0.545;QD=29.89;ReadPosRankSum=2.571;SOR=0.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,35:0.90:39
chr11	636703	rs2396543	G	T	1173.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.57;MQRankSum=0.490;QD=30.89;ReadPosRankSum=2.222;SOR=0.479;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,35:0.92:38
chr11	639372	rs146876215	GGC	G	851.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=281;ReadPosRankSum=1.428;SC=TAAGAGTGGGGGCGGGTCACA;SOR=0.839;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=45;TCF=36;TCR=9;TR=21;WE=639382;WS=639362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,26:0.58:45
chr11	639374	rs28540443	C	G	367.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=333;ReadPosRankSum=-0.989;SC=AGAGTGGGGGCGGGTCACAAG;SOR=0.566;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=54;TCF=45;TCR=9;TR=27;WE=639382;WS=639362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,19:0.42:45
chr11	640349	rs1870723	G	A	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.509;HP=8;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=12;PP=502;ReadPosRankSum=1.204;SC=GGAGGGGGGGGGTACGAGGCC;SOR=0.280;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=43;TCF=26;TCR=17;TR=29;WE=640357;WS=640339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,34:0.71:48
chr11	640369	rs7482904	G	C	976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.369;HP=5;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=14;PP=606;ReadPosRankSum=0.539;SC=CGGCTGGGCGGGGGGCGCTAA;SOR=0.088;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=59;TCF=40;TCR=19;TR=38;WE=640377;WS=640359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,42:0.67:63
chr11	640742	rs372134586	TG	T	218.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=164;ReadPosRankSum=1.224;SC=TGATGGGGAGTGGGGAAGAGG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=640750;WS=640732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr11	654091	rs7112962	G	A	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.312;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=13;PP=268;ReadPosRankSum=2.432;SC=TGACGTGGCCGTGGAGAGCCC;SOR=0.409;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=39;TCF=13;TCR=26;TR=21;WE=654099;WS=654081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,23:0.55:42
chr11	674454	rs11246258	G	T	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.46;ReadPosRankSum=0.492;SOR=0.425;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr11	674458	rs6597997	G	A	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.46;ReadPosRankSum=0.670;SOR=0.425;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr11	674499	rs6597996	G	A	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.855;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=312;ReadPosRankSum=0.796;SC=GGGGTTACTCGGCACAGGTCG;SOR=2.194;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=36;TCF=31;TCR=5;TR=16;WE=674507;WS=674489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr11	678561	rs10902190	C	T	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.525;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=4;PP=531;ReadPosRankSum=-0.780;SC=CACACTTTACCAGCCACTGAT;SOR=1.426;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=56;TCF=45;TCR=11;TR=29;WE=678569;WS=678551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,32:0.54:59
chr11	679915	rs28392994	G	A	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=275;ReadPosRankSum=1.167;SC=GGGGGCCTGGGCTGAAGGGCG;SOR=1.051;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=15;WE=679923;WS=679905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr11	680866	rs7483337	A	G	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.034;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=395;ReadPosRankSum=-0.409;SC=TGTGCTTTAGAAGTGAGAATC;SOR=0.292;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=19;WE=680874;WS=680856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr11	686714	rs10794330	G	A	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=109;ReadPosRankSum=0.489;SC=TAAATCACTCGCCCAAGGCCA;SOR=0.512;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=8;WE=686722;WS=686704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr11	688091	rs12277188	C	T	919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.270;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=33;PP=723;ReadPosRankSum=-0.346;SC=GGTGAGAGGCCGGACACCGGG;SOR=2.531;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=67;TCF=18;TCR=49;TR=39;WE=688099;WS=688081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,39:0.55:71
chr11	691636	rs11246268	G	A	3214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.880;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=67;PP=1864;ReadPosRankSum=0.271;SC=AGCAACAAAAGCCAGAATGGA;SOR=0.770;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=262;TCF=134;TCR=128;TR=137;WE=691644;WS=691626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,153:0.51:298
chr11	698807	rs4963166	C	T	2395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.500;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=46;PP=1415;ReadPosRankSum=-0.273;SC=CAGTGTGGAGCGAGACCCGGG;SOR=0.634;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=200;TCF=115;TCR=85;TR=108;WE=698815;WS=698797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,116:0.54:216
chr11	700247	rs7482162	A	C	2031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=49;PP=1286;ReadPosRankSum=2.183;SC=TAAGTCAGGGACGGGCACAGT;SOR=0.663;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=137;TCF=55;TCR=82;TR=81;WE=700255;WS=700237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,91:0.59:153
chr11	702923	rs5789195	T	TC	86.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=2.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.67;ReadPosRankSum=-0.711;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr11	704583	rs10902201	A	G	4570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=2.332;NF=57;NR=52;PP=1559;ReadPosRankSum=0.952;SC=CCCAGCCCACAAACCATGCAG;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=228;TCF=118;TCR=110;TR=109;WE=704591;WS=704573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,120:0.48:248
chr11	704604	rs35782494	GA	G	4773.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.024;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=2.748;NF=15;NR=53;PP=2490;ReadPosRankSum=0.128;SC=ACCAGGGAAGGACCCCCTCCC;SOR=0.749;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=146;TCF=26;TCR=120;TR=68;WE=704612;WS=704594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,132:0.49:271
chr11	704753	rs7941896	G	A	1576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=35;PP=954;SC=GGCCCGAGAGGCCAGCCTGGA;SOR=1.733;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=17;TCR=35;TR=52;WE=704761;WS=704743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr11	709680	rs11605783	T	C	1001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.726;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=26;PP=468;ReadPosRankSum=-0.628;SC=GGGGGACAGCTGCTCCTGCCC;SOR=0.829;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=95;TCF=42;TCR=53;TR=46;WE=709688;WS=709670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,53:0.49:109
chr11	710558	rs7395822	G	A	1353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=1.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.21;ReadPosRankSum=-0.490;SOR=0.849;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,39:0.44:89
chr11	710567	rs7396652	A	C	1231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=1.293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.38;ReadPosRankSum=-1.368;SOR=0.395;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,31:0.46:67
chr11	720197	rs3087546	C	T	1612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.184;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=48;PP=1056;ReadPosRankSum=-0.383;SC=CGACCAGTCGCTGCGGCTGCT;SOR=1.040;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=131;TCF=42;TCR=89;TR=67;WE=720205;WS=720187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,74:0.51:145
chr11	720978	.	G	GCCGGCAGGGGAGGGGAGGAGC,GC	235.77	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=8;NR=6;PP=426;SC=GAGGGGAGGAGCCGGCAGGGG;SOR=2.303;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=25;TCF=9;TCR=16;TR=14;WE=720992;WS=720968;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:2
chr11	721570	rs7635	C	T	4664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=504;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.522;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=122;NR=97;PP=2962;ReadPosRankSum=0.459;SC=CCCAGCAAATCCTCAACTGCG;SOR=0.780;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=473;TCF=256;TCR=217;TR=219;WE=721578;WS=721560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:273,231:0.46:504
chr11	723429	rs4078520	C	T	1113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.300;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=31;PP=714;ReadPosRankSum=0.550;SC=CATATGGGTACGCTGCCACCA;SOR=0.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=133;TCF=60;TCR=73;TR=55;WE=723437;WS=723419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,60:0.39:154
chr11	725877	rs66512023	G	GC	98.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.294;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.43;MQRankSum=1.304;QD=7.59;ReadPosRankSum=-0.839;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr11	726178	rs28498399	G	C	8410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=146;NR=148;PP=2965;SC=ACGGTGAGAGGTGCTGCTTCG;SOR=0.719;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=294;TCF=146;TCR=148;TR=294;WE=726186;WS=726168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,314:1.00:314
chr11	763299	rs57332668	TCCCCGCCCTCACCTG	T	337.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.899;NF=10;NR=0;PP=561;ReadPosRankSum=2.400;SC=CCCTCACCTGTCCCCGCCCTC;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=10;WE=763321;WS=763289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr11	771034	rs7930569	A	G	1309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.572;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=25;PP=918;ReadPosRankSum=-0.161;SC=CGGCCGGGACAGTGGAGCTGG;SOR=1.033;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=150;TCF=83;TCR=67;TR=62;WE=771042;WS=771024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,66:0.39:170
chr11	772490	rs12224894	G	A	3838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=389;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.762;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=83;PP=2510;ReadPosRankSum=0.389;SC=AGCACAGGGCGGCGACACCGT;SOR=0.645;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=342;TCF=176;TCR=166;TR=170;WE=772498;WS=772480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:200,187:0.48:387
chr11	774982	rs7952095	C	A	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=203;ReadPosRankSum=0.259;SC=CCTCCCAGGCCGCGGCGGCAG;SOR=0.699;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=51;TCF=38;TCR=13;TR=18;WE=774990;WS=774972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,21:0.38:55
chr11	775275	rs7942564	A	G	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=171;ReadPosRankSum=-0.643;SC=TACACCCAAGAACGACTACTT;SOR=0.368;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=10;WE=775283;WS=775265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr11	799670	rs28649421	G	C	1313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=32;PP=1058;SC=CTGGGGCCAGGTGCGGCCAGA;SOR=2.948;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=7;TCR=32;TR=39;WE=799678;WS=799660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr11	800485	rs7121646	TC	AT	13251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=134;NR=127;PP=2947;SC=CAAGGAGGGCTCGGGGAGGAC;SOR=0.700;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=267;TCF=139;TCR=128;TR=261;WE=800494;WS=800475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,297:1.00:297
chr11	801631	rs55974235	T	TG	2867.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=46;PP=1960;SC=GCCGCTGGGATGGGGGAGAGA;SOR=1.321;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=62;TCF=5;TCR=57;TR=51;WE=801639;WS=801621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr11	801776	rs7479183	T	G	791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.47;QD=28.28;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	802115	rs7479101	A	G	6943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.08;SOR=0.807;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr11	802125	rs28498421	T	C	6696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.94;SOR=0.881;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr11	802379	rs10902221	T	C	1621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=27;NR=25;PP=813;SC=TGAGCAGCCTTGAGGGGTCAC;SOR=0.831;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=27;TCR=25;TR=52;WE=802387;WS=802369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr11	802902	rs28360884	T	G	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=11;PP=280;SC=CTGCGGGCAGTTGCTGGCTTA;SOR=1.493;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=6;TCR=11;TR=17;WE=802910;WS=802892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	804212	rs7104785	C	A	6314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=112;NR=90;PP=2965;SC=GCAGCAGCTGCAGAGGCTGCT;SOR=0.812;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=202;TCF=112;TCR=90;TR=202;WE=804220;WS=804202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr11	821504	.	C	G	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.077;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.74;ReadPosRankSum=-0.060;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,10:0.29:35
chr11	822622	rs7942159	A	G	1815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=47;PP=1390;SC=CTCTGCTCCGAGGACTGTGGC;SOR=2.722;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=12;TCR=47;TR=59;WE=822630;WS=822612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr11	824789	rs1138693	T	C	4376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=57;PP=2569;SC=CAGCACCAGCTGGCCGGGCCT;SOR=1.045;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=142;TCF=85;TCR=57;TR=142;WE=824797;WS=824779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr11	824987	rs66460720	CTGCA	C	6972.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=80;PP=2974;SC=CACTCACCAGCTGCATGCACT;SOR=1.329;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=91;TCF=5;TCR=86;TR=85;WE=824998;WS=824977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr11	825110	rs1138714	A	G	303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=8;PP=186;SC=TTTACTCCTGAGAACTTTGCA;SOR=3.442;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=825118;WS=825100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	828784	rs28507876	A	G	5045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=77;PP=2965;SC=TGAGTCCCCCACCCCAAGAGA;SOR=0.859;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=174;TCF=97;TCR=77;TR=174;WE=828792;WS=828774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr11	828916	rs7126805	G	A	5497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=103;NR=80;PP=2965;SC=AGTCTGGACCGGGCTCACACT;SOR=0.852;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=183;TCF=103;TCR=80;TR=183;WE=828924;WS=828906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr11	829539	rs28558789	A	G	1438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=34;PP=977;SC=GGTCCTGGGCAAGTGAGTCGG;SOR=1.524;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=17;TCR=34;TR=51;WE=829547;WS=829529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr11	830487	rs4075290	C	T	11609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=444;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=207;NR=201;PP=2965;SC=CTGGGCCTCACGTATCACCCC;SOR=0.698;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=410;TCF=207;TCR=203;TR=408;WE=830495;WS=830477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,443:1.00:443
chr11	830670	rs4075289	G	T	2790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=41;NR=53;PP=1612;SC=GAGCTGCAGAGCCGCGAGCAG;SOR=1.168;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=41;TCR=53;TR=94;WE=830678;WS=830660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr11	831122	rs7114218	C	T	4403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=92;NR=48;PP=2516;SC=TCATCCCCATCTCAAGTCCCA;SOR=1.214;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=92;TCR=48;TR=140;WE=831130;WS=831112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr11	836008	rs5030778	T	C	2297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=24;PP=1390;SC=CCTATCCGTCTCCCAGTCAGG;SOR=1.501;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=47;TCR=24;TR=71;WE=836016;WS=835998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr11	836023	rs28475448	C	T	2894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=32;PP=1624;SC=GTCAGGGGCCCGGTGCTGTGG;SOR=1.336;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=58;TCR=32;TR=90;WE=836031;WS=836013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr11	836227	rs28434354	A	G	2229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=46;PP=1830;SC=GGCAGATGCGATGACCTTTGT;SOR=1.416;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=33;TCR=46;TR=79;WE=836235;WS=836217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr11	836539	rs56063221	TG	T	3096.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=10;NR=50;PP=1157;SC=TGTGCTCACCTGGGGGGGGGG;SOR=0.730;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=63;TCF=11;TCR=52;TR=60;WE=836557;WS=836528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr11	836971	rs28620453	G	C	682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=7;NR=17;PP=478;SC=ATGTGCCACTGGGCCCTGGAG;SOR=1.893;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=24;WE=836979;WS=836961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	837121	rs28655651	G	C	1068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=6;PP=812;SC=ATGCCGAGGTGTGACCTCAGC;SOR=2.584;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=33;WE=837129;WS=837111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr11	837582	rs1130663	G	A	2770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=57;PP=1596;SC=CTCTTTGTGGGCAGCGAGACC;SOR=1.542;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=34;TCR=57;TR=91;WE=837590;WS=837572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr11	837661	rs56265615	GT	G	527.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=533;SC=CTACGAGGTGGTGGGGGGGCA;SOR=2.448;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=11;WE=837669;WS=837651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	838110	rs5030780	C	T	8540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=159;NR=128;PP=2965;SC=CGTCTGCTTACGCCCACCCGG;SOR=0.811;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=289;TCF=159;TCR=130;TR=287;WE=838118;WS=838100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,322:1.00:322
chr11	840319	rs3059	C	T	2683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=62;NR=30;PP=1628;SC=GAATTCGGGGCAGGACGCTCA;SOR=1.732;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=62;TCR=30;TR=92;WE=840327;WS=840309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr11	840363	rs6591	C	T	5785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=113;NR=86;PP=2965;SC=TGGGTGGGTTCCAGCGTGGTC;SOR=0.888;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=199;TCF=113;TCR=86;TR=199;WE=840371;WS=840339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr11	840477	rs4895	A	G	6485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;MQ=60.04;NF=115;NR=110;PP=2965;SC=CATCCAGCGCATCCCTGTGTC;SOR=0.742;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=225;TCF=115;TCR=110;TR=225;WE=840485;WS=840467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr11	840578	rs34627090	AC	A	2709.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=52;PP=1231;SC=TGCTGGCCTCACCCCCCCCGC;SOR=1.166;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=68;TCF=3;TCR=65;TR=55;WE=840586;WS=840568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr11	840604	rs28677123	C	G	1925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=44;PP=1345;SC=GCAAGGCGAACAGATTCACCC;SOR=1.644;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=65;TCF=21;TCR=44;TR=65;WE=840612;WS=840594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr11	840639	rs28636471	T	A	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=329;ReadPosRankSum=1.102;SC=GATCTAGCAGTATGATCCTGG;SOR=0.468;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=18;WE=840647;WS=840629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr11	842543	rs28372895	C	G	7469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.21;SOR=0.986;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,285:1.00:285
chr11	842627	rs9705236	T	C	1999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.55;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr11	842630	rs9704020	C	T	1941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.13;SOR=3.816;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr11	842653	rs35249369	C	G	906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=56;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=16;PP=463;SC=ACCGGCCCCGCCACCGCTGGC;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=842661;WS=842643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	849090	rs28402197	C	G	700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=17;PP=531;SC=GGTGGGTGCGCGCGACTGCCC;SOR=2.124;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=23;WE=849098;WS=849080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	850170	rs28704105	T	G	4833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=116;NR=51;PP=2965;SC=CGCCGGGGGCTCCTTCTTCGG;SOR=1.885;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=167;TCF=116;TCR=51;TR=167;WE=850178;WS=850160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr11	862652	rs28505621	T	C	5425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=102;NR=86;PP=2965;SC=GGCTGCCAACTTGCTCATCAT;SOR=0.861;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=188;TCF=102;TCR=86;TR=188;WE=862660;WS=862642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr11	864626	rs28377158	A	G	1064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=25;PP=717;SC=CCTCACGGGCAGCCAGGACAG;SOR=2.242;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=33;WE=864634;WS=864616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr11	865447	rs28423070	G	A	533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=13;NR=3;PP=406;SC=GGGCCGGCGAGGGGGTCTGGA;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=865455;WS=865437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	865503	rs28581489	G	A	1391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=20;PP=810;SC=GACCCCCCCCGCACCCCCAGA;SOR=0.941;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=26;TCR=20;TR=46;WE=865511;WS=865493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr11	866044	rs28457111	A	G	1743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=32;PP=1070;SC=CCACTTTGTTAGGACCTTCTG;SOR=1.092;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=25;TCR=32;TR=57;WE=866052;WS=866034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr11	866133	rs11246335	G	A	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.719;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=164;ReadPosRankSum=-1.198;SC=GCAGGAGGGCGAGTTCAGGGG;SOR=1.179;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=20;TCF=9;TCR=11;TR=13;WE=866141;WS=866123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr11	866183	rs28439203	T	C	112.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=86;SC=GGGCTCCCTCTTAGTGGACAG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=866191;WS=866173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr11	866498	rs28663055	T	C	3416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=33;PP=1956;SC=GGACAGGGACTGCTCTGGGCT;SOR=1.498;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=107;TCF=73;TCR=34;TR=106;WE=866506;WS=866488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr11	870524	rs10466744	G	A	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.317;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=9;PP=217;ReadPosRankSum=-0.829;SC=ATATGGATTTGGGAGCCCACC;SOR=0.473;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=29;TCF=14;TCR=15;TR=17;WE=870532;WS=870514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr11	900894	rs28454252	T	G	1794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=45;NR=15;PP=1238;SC=ACCCCCGCAGTTTGAGCCATC;SOR=2.157;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=45;TCR=15;TR=60;WE=900902;WS=900884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr11	902939	rs12799186	G	A	3449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=42;PP=2126;SC=ACCTCCCTCTGCACTGTGAGG;SOR=1.311;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=72;TCR=42;TR=114;WE=902947;WS=902929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr11	903070	rs28380110	G	C	8478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=149;NR=136;PP=2965;SC=GGTCCGTCACGACCAAACCCC;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=287;TCF=149;TCR=138;TR=285;WE=903078;WS=903060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,316:1.00:316
chr11	904911	rs28634117	T	C	896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=26;PP=585;SC=ATGCAGCACATGGGCAACCCC;SOR=2.432;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=8;TCR=26;TR=34;WE=904919;WS=904901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr11	959601	rs188777133	A	G	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.183;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=137;ReadPosRankSum=-0.373;SC=CTCCCACACTAAAGTGAAGTT;SOR=0.976;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=8;WE=959609;WS=959591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr11	970029	rs7396107	C	T	313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=2;PP=245;SC=AGCGTCTGCACTGCACCTGCC;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=970037;WS=970019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	970373	rs7394436	G	C	1889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=51;PP=1221;SC=ACTGAGGCCCGGTGCCCGTGT;SOR=3.226;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=10;TCR=51;TR=61;WE=970381;WS=970363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr11	970405	rs7394427	G	A	836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=24;PP=617;SC=TTCCTTCTCTGCCCACAGCTG;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=26;WE=970413;WS=970395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	972270	rs7933889	C	T	3095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=62;PP=1835;SC=GTGCCGGGCTCGTGCCGGGCT;SOR=1.149;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=41;TCR=62;TR=103;WE=972278;WS=972260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr11	977036	rs6597960	C	T	4024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=42;PP=2511;SC=GGGGGTGCTCCGTGCAGCTCT;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=92;TCR=42;TR=134;WE=977044;WS=977026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr11	985547	rs10794358	C	T	7897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=139;NR=118;PP=2965;SC=ATGCCGTGCTCTTCGAGGCCA;SOR=0.795;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=257;TCF=139;TCR=118;TR=257;WE=985555;WS=985537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,286:1.00:286
chr11	992691	rs10902263	G	T	2376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=49;PP=1509;SC=TCGAGGTATGGCCCGCAGGAT;SOR=1.582;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=77;TCF=27;TCR=50;TR=76;WE=992699;WS=992681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr11	993684	rs112511283	C	A	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=2.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.61;ReadPosRankSum=0.621;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
chr11	993694	rs36081583	G	A	679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.99;ReadPosRankSum=1.371;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr11	1003523	rs10902264	G	A	505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=15;NR=2;PP=406;SC=CTGTGTCCGCGTCCCTGCGTC;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=1003531;WS=1003520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	1003642	rs10902265	G	A	4886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=71;PP=2827;SC=TCCTCGTGCTGTGAGTTTTTT;SOR=1.006;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=169;TCF=98;TCR=71;TR=169;WE=1003650;WS=1003632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr11	1007831	rs10902267	T	C	650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=1;PP=465;SC=GCAGACAGTGTTTTGAGGATT;SOR=3.816;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=1007839;WS=1007821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	1009416	rs7126709	C	T	1648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=42;PP=1156;SC=TCTGGAGGGACGGCCCCGGGG;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=16;TCR=42;TR=58;WE=1009424;WS=1009406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr11	1009589	rs28612764	A	G	545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=2;PP=206;SC=CACGCAGCCCACGACCCAGCG;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=1009597;WS=1009579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	1009622	rs28464902	C	T	1266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=11;PP=687;SC=GGGGCGGCCCCGGGGGACACG;SOR=1.788;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=24;TCR=11;TR=35;WE=1009630;WS=1009612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr11	1009890	rs11246380	T	C	3043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=58;PP=1544;ReadPosRankSum=1.265;SC=TGGTGAGATGTGTAGCTCTTT;SOR=1.140;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=103;TCF=44;TCR=59;TR=101;WE=1009898;WS=1009880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,116:0.98:118
chr11	1010694	rs1128413	C	T	2314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=54;PP=1483;SC=TCTTCGTGGCCATCCTGCAGA;SOR=1.872;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=24;TCR=54;TR=78;WE=1010702;WS=1010684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
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chr11	1011490	rs7950955	G	A	6948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=132;NR=110;PP=2965;SC=CTGTGGAGGAGGGACGCCTCT;SOR=0.841;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=242;TCF=132;TCR=110;TR=242;WE=1011498;WS=1011480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
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chr11	1016928	rs34053383	C	G	16402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=5.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.49;MQRankSum=-7.120;QD=31.01;ReadPosRankSum=0.253;SOR=1.062;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:139,390:0.74:529
chr11	1016928	.	CTGGCC	GTGGCC,GTGGCT	2962	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=74;MMLQ=27;MQ=52.61;NF=286,90;NR=383,157;PP=2962,2944;QD=20;SC=CCTGCTGCTGCTGGCCGAGGT;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=809;TCF=357;TCR=452;TR=669,247;WE=1016941;WS=1016900;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.83:809
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chr11	1016984	rs78839362	G	A	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=493;ExcessHet=3.0103;FS=14.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQRankSum=-16.202;QD=0.56;ReadPosRankSum=0.837;SOR=2.014;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:450,41:0.08:491
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chr11	1017113	rs74202058	T	C	8370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=628;ExcessHet=3.0103;FS=7.286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQRankSum=-10.386;QD=13.33;ReadPosRankSum=1.741;SOR=1.175;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:379,249:0.40:628
chr11	1017135	.	G	A	1870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=0.000;DP=583;ExcessHet=3.0103;FS=6.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQRankSum=-5.714;QD=3.23;ReadPosRankSum=1.651;SOR=1.215;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:488,92:0.16:580
chr11	1017154	rs112965257	T	G	1512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=494;ExcessHet=3.0103;FS=10.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQRankSum=-6.495;QD=3.08;ReadPosRankSum=0.217;SOR=1.596;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:427,64:0.13:491
chr11	1017158	rs36143620	G	T	1415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=479;ExcessHet=3.0103;FS=8.704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQRankSum=-6.456;QD=2.97;ReadPosRankSum=-1.880;SOR=1.488;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:411,65:0.14:476
chr11	1017161	rs374837441	C	T	1421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=478;ExcessHet=3.0103;FS=7.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.92;MQRankSum=-6.686;QD=2.99;ReadPosRankSum=-1.838;SOR=1.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:414,61:0.13:475
chr11	1017169	rs200932890	G	A	1034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=439;ExcessHet=3.0103;FS=9.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.62;MQRankSum=-7.718;QD=2.36;ReadPosRankSum=-2.970;SOR=1.759;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:390,49:0.11:439
chr11	1017173	rs61869004	G	A	1610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=432;ExcessHet=3.0103;FS=1.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.53;MQRankSum=-2.791;QD=3.73;ReadPosRankSum=1.965;SOR=0.579;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:326,106:0.25:432
chr11	1017183	rs34844844	G	T	1979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=381;ExcessHet=3.0103;FS=3.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.95;MQRankSum=0.071;QD=5.20;ReadPosRankSum=0.426;SOR=0.517;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:264,117:0.31:381
chr11	1017186	rs74579726	A	G	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=368;ExcessHet=3.0103;FS=10.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.90;MQRankSum=-10.019;QD=0.94;ReadPosRankSum=-4.630;SOR=1.643;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:338,30:0.08:368
chr11	1017220	rs56238842	T	C	5866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.022;HP=2;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-9.253;NF=96;NR=98;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.006;SC=GCCATCTGTGTGTGGGTAGGG;SOR=0.582;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=315;TCF=148;TCR=167;TR=194;WE=1017248;WS=1017210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,161:0.58:277
chr11	1017231	rs35840539	A	G	5772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FS=5.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.74;MQRankSum=-10.572;QD=22.64;ReadPosRankSum=-1.508;SOR=0.555;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:112,143:0.56:255
chr11	1017239	rs56386804	C	T	5616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.26;MQRankSum=-11.092;QD=23.02;ReadPosRankSum=-0.788;SOR=0.675;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,134:0.55:244
chr11	1017240	rs62891761	G	A	5581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FS=5.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.18;MQRankSum=-10.830;QD=23.07;ReadPosRankSum=-1.462;SOR=0.732;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:106,136:0.56:242
chr11	1017280	rs199539548	G	T	569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FS=10.914;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.35;MQRankSum=-4.125;QD=1.78;ReadPosRankSum=-2.344;SOR=1.435;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:273,47:0.15:320
chr11	1017294	rs200241162	A	T	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FS=10.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.94;MQRankSum=-4.477;QD=1.21;ReadPosRankSum=-0.294;SOR=1.433;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:302,47:0.13:349
chr11	1017302	rs35330958	G	C	7140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=397;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.366;HP=2;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-10.447;NF=120;NR=92;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.062;SC=GAAGTGTGGTGTGAGGGTGTG;SOR=0.725;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=501;TCF=279;TCR=222;TR=212;WS=1017270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:222,175:0.44:397
chr11	1017317	rs33943903	G	T	9435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=505;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.520;HP=3;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-10.988;NF=142;NR=126;PP=2962;ReadPosRankSum=0.132;SC=GGTGTGATGGGGTTGGATAGG;SOR=0.748;SbPval=0.48;Source=Platypus;TCR=292;TR=268;WS=1017270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:265,240:0.48:505
chr11	1017325	rs55903826	A	C	1860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=544;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.54;MQRankSum=4.714;QD=3.43;ReadPosRankSum=-0.274;SOR=0.691;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:410,133:0.24:543
chr11	1017337	rs76686156	TC	CA	11089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=595;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=39;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-13.014;NF=154;NR=143;PP=2944;ReadPosRankSum=3.153;SC=GTAGTGGTGGTCTGGAAGGAT;SOR=0.652;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=748;TCF=396;TCR=352;TR=297;WE=1017346;WS=1017270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:305,290:0.49:595
chr11	1017384	rs34095361	G	C	3223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=604;ExcessHet=3.0103;FS=3.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.32;MQRankSum=-16.995;QD=5.40;ReadPosRankSum=4.562;SOR=1.001;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:423,174:0.29:597
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chr11	1017440	rs78729877	C	T	5224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=363;ExcessHet=3.0103;FS=1.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.89;MQRankSum=-10.925;QD=14.43;ReadPosRankSum=-0.299;SOR=0.742;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:223,139:0.38:362
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chr11	1017495	rs67507057	ATGC	A	1814.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=13.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.10;MQRankSum=-9.729;QD=3.44;ReadPosRankSum=-3.091;SOR=1.816;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:450,77:0.15:527
chr11	1017498	rs76707565	C	T,G	1499.77	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-2.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=521;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=68;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-12.198;NF=113;NR=112;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.275;SC=GGGGGTGATGCTGGTGGTAGA;SOR=0.645;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=686;TCF=339;TCR=347;TR=225;WE=1017537;WS=1017485;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.13:519
chr11	1017502	.	T	C	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=0.000;DP=542;ExcessHet=3.0103;FS=5.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.10;MQRankSum=-3.251;QD=0.93;ReadPosRankSum=-1.195;SOR=1.388;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:492,48:0.09:540
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chr11	1017746	rs78848170	T	G	5399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=834;ExcessHet=3.0103;FS=2.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.17;MQRankSum=-15.525;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.251;SOR=0.755;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:629,196:0.24:825
chr11	1017755	.	C	T	539.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.149;ClippingRankSum=0.000;DP=778;ExcessHet=3.0103;FS=2.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQRankSum=-20.421;QD=0.70;ReadPosRankSum=-2.638;SOR=0.988;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:709,65:0.08:774
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chr11	1017757	rs79198757	G	A	533.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=773;ExcessHet=3.0103;FS=2.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQRankSum=-20.449;QD=0.69;ReadPosRankSum=-2.413;SOR=0.990;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:706,63:0.08:769
chr11	1017767	rs75637734	G	C	1699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=720;ExcessHet=3.0103;FS=0.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQRankSum=1.853;QD=2.39;ReadPosRankSum=0.809;SOR=0.810;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:625,87:0.12:712
chr11	1017773	rs57384288	G	A	900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=686;ExcessHet=3.0103;FS=2.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQRankSum=-21.652;QD=1.32;ReadPosRankSum=1.583;SOR=0.731;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:616,64:0.09:680
chr11	1017783	rs36101709	A	G	3699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=632;ExcessHet=3.0103;FS=1.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQRankSum=-11.020;QD=6.07;ReadPosRankSum=-0.328;SOR=0.559;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:492,118:0.19:610
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chr11	1017793	rs77940304	T	G	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=576;ExcessHet=3.0103;FS=0.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQRankSum=-19.050;QD=0.57;ReadPosRankSum=-0.320;SOR=0.541;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:528,46:0.08:574
chr11	1017797	rs76800954	C	G	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=552;ExcessHet=3.0103;FS=2.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQRankSum=-18.607;QD=0.36;ReadPosRankSum=-1.412;SOR=0.597;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:505,43:0.08:548
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chr11	1017858	rs79583615	A	G	2152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=354;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.224;HP=2;HapScore=1;MGOF=58;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-6.858;NF=109;NR=133;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.810;SC=GCCTGTTGGCATTGAGTGGAT;SOR=0.543;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=536;TCF=240;TCR=296;TR=242;WE=1017866;WS=1017824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:276,74:0.21:350
chr11	1017883	rs79644784	C	A	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FS=3.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQRankSum=-3.646;QD=1.44;ReadPosRankSum=5.365;SOR=0.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:281,32:0.10:313
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chr11	1017921	.	C	T	476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.027;ClippingRankSum=0.000;DP=274;ExcessHet=3.0103;FS=3.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.51;MQRankSum=-1.182;QD=1.86;ReadPosRankSum=-4.566;SOR=0.529;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:227,29:0.11:256
chr11	1017932	.	CA	TG	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.336;ClippingRankSum=0.000;DP=250;ExcessHet=3.0103;FS=11.702;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.23;MQRankSum=-3.280;QD=0.62;ReadPosRankSum=0.211;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:229,21:0.08:250
chr11	1017935	rs138784536	A	G	1491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=18.958;HP=2;HapScore=1;MGOF=67;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-7.184;NF=24;NR=88;PP=1096;ReadPosRankSum=2.017;SC=GAGTCACCAAAGAGGTGGAGA;SOR=1.891;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=344;TCF=136;TCR=208;TR=112;WE=1017996;WS=1017922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,48:0.22:222
chr11	1017939	.	G	C	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.717;ClippingRankSum=0.000;DP=239;ExcessHet=3.0103;FS=11.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.17;MQRankSum=-3.484;QD=0.95;ReadPosRankSum=0.968;SOR=1.201;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:217,22:0.09:239
chr11	1017941	rs61869007	G	T	1121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FS=26.667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.13;MQRankSum=4.710;QD=4.79;ReadPosRankSum=-3.757;SOR=1.563;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:196,38:0.16:234
chr11	1017955	rs113926343	C	T	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FS=12.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.34;MQRankSum=-5.653;QD=3.43;ReadPosRankSum=0.836;SOR=1.716;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:189,33:0.15:222
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chr11	1017968	rs61869009	T	A	2653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FS=23.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.22;MQRankSum=7.721;QD=12.23;ReadPosRankSum=-0.262;SOR=0.876;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:144,73:0.34:217
chr11	1017981	rs61869010	T	A	3024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.348;HP=4;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=8.893;NF=51;NR=36;ReadPosRankSum=2.277;SC=GGTCTGAGGGTGTGATGGGGT;SOR=0.759;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=236;TCF=109;TCR=127;TR=87;WE=1017996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,88:0.42:209
chr11	1017988	rs112579249	G	T	736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FS=5.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.24;MQRankSum=-7.420;QD=3.46;ReadPosRankSum=0.579;SOR=1.009;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:170,43:0.20:213
chr11	1018012	rs10751676	T	G	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FS=42.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.36;MQRankSum=-5.565;QD=1.96;ReadPosRankSum=-3.729;SOR=3.245;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:175,28:0.14:203
chr11	1018024	.	C	G	1723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=0.000;DP=195;ExcessHet=3.0103;FS=0.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.08;MQRankSum=-8.061;QD=8.84;ReadPosRankSum=-1.956;SOR=0.623;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:145,50:0.26:195
chr11	1018025	rs10751677	C	A	2749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FS=17.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.33;MQRankSum=-10.577;QD=14.17;ReadPosRankSum=-2.755;SOR=0.885;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:124,70:0.36:194
chr11	1018031	rs10751678	G	A	2738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FS=16.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.61;MQRankSum=-10.323;QD=14.04;ReadPosRankSum=-2.115;SOR=0.788;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:125,70:0.36:195
chr11	1018042	rs200364398	A	G	1832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FS=0.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.08;MQRankSum=-7.139;QD=9.16;ReadPosRankSum=0.118;SOR=0.624;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:145,55:0.28:200
chr11	1018048	rs12787400	A	G	2192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FS=2.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.77;MQRankSum=-7.631;QD=11.30;ReadPosRankSum=1.584;SOR=0.504;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:132,62:0.32:194
chr11	1018059	rs78336072	C	T	1971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.512;HP=2;HapScore=1;MGOF=48;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-7.945;NF=30;NR=28;PP=2817;ReadPosRankSum=1.480;SC=GGGACTGCTCCCTGTAGGTGG;SOR=0.591;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=187;TCF=103;TCR=84;TR=58;WE=1018067;WS=1018002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,62:0.31:202
chr11	1018116	rs10902269	T	G	2081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.528;HP=1;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-4.615;NF=30;NR=29;PP=580;ReadPosRankSum=1.471;SC=GGTGGCTGAGTTGGTGTGGGC;SOR=0.783;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=174;TCF=94;TCR=80;TR=59;WE=1018124;WS=1018106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,62:0.33:188
chr11	1018138	rs71454075	T	C	2220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQRankSum=-6.001;QD=10.48;ReadPosRankSum=-0.235;SOR=0.667;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:150,62:0.29:212
chr11	1018144	rs12807084	G	C	2294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FS=1.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQRankSum=-6.164;QD=10.29;ReadPosRankSum=-1.584;SOR=0.696;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:157,66:0.30:223
chr11	1018169	rs77647814	C	G	1721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FS=1.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQRankSum=-9.183;QD=7.36;ReadPosRankSum=-0.900;SOR=0.570;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:180,54:0.23:234
chr11	1018175	rs12418172	A	G	1615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FS=1.941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQRankSum=-10.026;QD=6.70;ReadPosRankSum=-0.466;SOR=0.687;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:189,52:0.22:241
chr11	1018182	.	G	T	1397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.173;ClippingRankSum=0.000;DP=238;ExcessHet=3.0103;FS=4.712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQRankSum=-10.610;QD=5.87;ReadPosRankSum=-0.345;SOR=0.754;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:190,48:0.20:238
chr11	1018186	.	G	T	1522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.450;ClippingRankSum=0.000;DP=242;ExcessHet=3.0103;FS=3.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQRankSum=-10.884;QD=6.29;ReadPosRankSum=-0.769;SOR=0.762;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:192,50:0.21:242
chr11	1018192	.	C	T	1400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=0.000;DP=238;ExcessHet=3.0103;FS=5.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQRankSum=-11.288;QD=5.89;ReadPosRankSum=-0.769;SOR=0.875;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:190,48:0.20:238
chr11	1018196	.	A	T	1412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.635;ClippingRankSum=0.000;DP=235;ExcessHet=3.0103;FS=5.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQRankSum=-11.205;QD=6.01;ReadPosRankSum=-1.176;SOR=0.867;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:187,48:0.20:235
chr11	1018215	.	G	GCA	1448.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.427;ClippingRankSum=0.000;DP=220;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQRankSum=-11.902;QD=6.59;ReadPosRankSum=-1.592;SOR=0.652;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:175,45:0.20:220
chr11	1018218	.	T	G	899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.073;ClippingRankSum=0.000;DP=212;ExcessHet=3.0103;FS=7.292;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQRankSum=-11.445;QD=4.24;ReadPosRankSum=1.329;SOR=1.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:178,34:0.16:212
chr11	1018220	.	T	A	1014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.229;ClippingRankSum=0.000;DP=212;ExcessHet=3.0103;FS=3.257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQRankSum=-11.947;QD=4.79;ReadPosRankSum=0.711;SOR=0.980;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:175,37:0.17:212
chr11	1018222	.	AAT	A	879.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.943;ClippingRankSum=0.000;DP=214;ExcessHet=3.0103;FS=7.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQRankSum=-12.065;QD=4.17;ReadPosRankSum=1.023;SOR=1.325;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:176,35:0.17:211
chr11	1018226	.	T	G	945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.029;ClippingRankSum=0.000;DP=210;ExcessHet=3.0103;FS=7.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQRankSum=-11.459;QD=4.50;ReadPosRankSum=1.135;SOR=1.340;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:175,35:0.17:210
chr11	1018229	rs77630889	C	G	1085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FS=9.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQRankSum=-12.012;QD=5.27;ReadPosRankSum=1.112;SOR=1.481;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:169,37:0.18:206
chr11	1018232	rs113063572	G	T	1280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FS=4.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQRankSum=-11.996;QD=6.47;ReadPosRankSum=0.332;SOR=1.049;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:157,41:0.21:198
chr11	1018237	rs79892432	GT	AG	1355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FS=3.123;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQRankSum=-11.716;QD=6.95;ReadPosRankSum=-0.014;SOR=0.965;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:153,42:0.22:195
chr11	1018245	rs76423553	TT	GC	1628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FS=3.957;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.75;MQRankSum=-11.538;QD=8.57;ReadPosRankSum=-0.158;SOR=1.030;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:142,48:0.25:190
chr11	1018256	.	T	G	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.560;ClippingRankSum=0.000;DP=185;ExcessHet=3.0103;FS=11.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.19;MQRankSum=-8.332;QD=4.68;ReadPosRankSum=2.057;SOR=1.671;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:152,33:0.18:185
chr11	1018266	.	G	A	779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=0.000;DP=189;ExcessHet=3.0103;FS=13.973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.66;MQRankSum=-7.637;QD=4.13;ReadPosRankSum=3.128;SOR=1.966;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:160,29:0.15:189
chr11	1018279	rs201852389	C	T	683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FS=12.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.20;MQRankSum=-8.213;QD=4.25;ReadPosRankSum=1.639;SOR=1.968;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:134,27:0.17:161
chr11	1018290	.	G	A	464.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.377;ClippingRankSum=0.000;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=10.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.35;MQRankSum=-6.697;QD=3.18;ReadPosRankSum=1.696;SOR=1.791;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:125,21:0.14:146
chr11	1018291	.	G	C	1052.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.881;ClippingRankSum=0.000;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=2.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.20;MQRankSum=-7.811;QD=6.62;ReadPosRankSum=2.023;SOR=1.003;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:124,35:0.22:159
chr11	1018292	.	C	T	428.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.188;ClippingRankSum=0.000;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=10.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.15;MQRankSum=-5.542;QD=2.73;ReadPosRankSum=1.091;SOR=1.847;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:136,21:0.13:157
chr11	1018295	rs73403297	T	C	1014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=0.689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.19;MQRankSum=-6.527;QD=6.59;ReadPosRankSum=2.248;SOR=0.614;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,39:0.25:154
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chr11	1018303	.	G	A	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.539;ClippingRankSum=0.000;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=0.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.07;MQRankSum=-5.259;QD=2.07;ReadPosRankSum=0.313;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:129,18:0.12:147
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chr11	1018483	rs78265558	C	G	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FS=1.943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.05;MQRankSum=-11.704;QD=2.50;ReadPosRankSum=-0.830;SOR=0.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:139,21:0.13:160
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chr11	1019375	rs9704308	C	T	5121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=94;PP=2965;SC=TGGCGGTCGACGCCGTGGCCC;SOR=0.950;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=174;TCF=80;TCR=94;TR=174;WE=1019383;WS=1019365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr11	1027811	rs7481521	C	T	3864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=69;NR=66;PP=2280;SC=GCCTGGTACACGCACCTCTGC;SOR=0.778;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=135;TCF=69;TCR=66;TR=135;WE=1027819;WS=1027801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr11	1028379	rs116256283	C	T	6183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=591;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.090;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=136;NR=135;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.582;SC=TTGAAGTTGCCGCAGAGCCCT;SOR=0.613;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=528;TCF=263;TCR=265;TR=271;WE=1028387;WS=1028369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:288,300:0.51:588
chr11	1033240	rs61869016	T	C	469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=12;PP=319;SC=GCCAAGCGCTTGGCCTCCCAT;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=1033248;WS=1033230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	1036454	rs116996199	G	A	1494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.807;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=19;PP=899;ReadPosRankSum=1.999;SC=CCTGGCAGCGGGGGCTGGTCA;SOR=0.589;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=87;TCF=60;TCR=27;TR=59;WE=1036462;WS=1036444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,67:0.66:102
chr11	1075092	rs41369349	G	A	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.449;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=6;PP=169;ReadPosRankSum=-0.025;SC=CAGCCTGCGCGGCTCTGCTGA;SOR=0.425;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=27;TCF=11;TCR=16;TR=11;WE=1075100;WS=1075082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr11	1075850	rs11825969	G	A	2931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.421;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=70;PP=1726;ReadPosRankSum=-0.908;SC=CCGGGGTGGAGTCCATCCTGC;SOR=0.648;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=278;TCF=128;TCR=150;TR=134;WE=1075858;WS=1075840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,143:0.48:301
chr11	1075920	rs11825977	G	A	1666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.314;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=44;PP=1028;ReadPosRankSum=0.477;SC=TAACGGGGCCGTGTGAGTGTG;SOR=1.100;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=124;TCF=50;TCR=74;TR=69;WE=1075928;WS=1075910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,75:0.56:133
chr11	1077493	rs34367348	C	T	552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-4.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.703;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=298;ReadPosRankSum=0.169;SC=CCACCCCAGGCGCCCAGCTTC;SOR=0.184;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=40;TCF=33;TCR=7;TR=22;WE=1077501;WS=1077483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,26:0.55:47
chr11	1078393	rs7104590	T	C	3407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=89;PP=1862;ReadPosRankSum=-2.571;SC=CCCCTCGGTCTGGGGTGGGGG;SOR=0.690;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=328;TCF=149;TCR=179;TR=162;WE=1078401;WS=1078383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,173:0.50:344
chr11	1078752	.	C	T	153	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=10;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=1;NR=4;PP=153;QD=37.5542425094;SC=GCTGTGTCTGCGCCGGGCACC;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=5;WE=1078772;WS=1078742;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr11	1079532	.	C	CT	487	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=49;MMLQ=27;MQ=54.44;NF=7;NR=0;PP=487;QD=74.2857142857;SC=GGGACACTCACCACGCCGGGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=7;WE=1079545;WS=1079524;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr11	1079534	.	ACGCC	A	492	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=3;HapScore=4;MGOF=49;MMLQ=24;MQ=56.15;NF=7;NR=0;PP=492;QD=75.0;SC=GACACTCACCACGCCGGGCAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=7;WE=1079545;WS=1079524;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr11	1079809	rs10902081	C	T	2666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=54;PP=1473;SC=GGCCCCGCCCCGGCACTGCCC;SOR=1.384;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=33;TCR=54;TR=87;WE=1079817;WS=1079799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr11	1079879	rs7127117	T	C	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=96;ReadPosRankSum=0.524;SC=ACGGCTCCGCTGGGTGGTGGG;SOR=0.593;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=9;WE=1079887;WS=1079869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr11	1082582	rs7952257	G	A	3421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.432;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=71;PP=2050;ReadPosRankSum=-1.771;SC=TTGCTCTGTCGCCCAGAGGTG;SOR=0.605;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=257;TCF=135;TCR=122;TR=147;WE=1082590;WS=1082572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,159:0.57:281
chr11	1086163	rs7926689	C	A	1670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.883;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=32;PP=1014;ReadPosRankSum=-0.690;SC=CAGCCCCCCACCCCCTGCCCT;SOR=0.658;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=135;TCF=68;TCR=67;TR=71;WE=1086171;WS=1086153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,77:0.55:140
chr11	1090501	rs35179278	C	A	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5006;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=8;PP=195;ReadPosRankSum=-0.660;SC=GGTCCCCCCCCAGCTCAGACC;SOR=1.179;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=10;WE=1090509;WS=1090491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr11	1093430	rs199573018	C	A	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=398;ExcessHet=3.0103;FS=8.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.89;MQRankSum=5.278;QD=0.66;ReadPosRankSum=1.298;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:332,63:0.16:395
chr11	1093512	.	C	A	1154	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MMLQ=25;MQ=58.91;NF=45;NR=50;PP=1154;QD=12.5133811847;SC=CTACGATGACCCCAACCCCAA;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=238;TCF=118;TCR=120;TR=95;WE=1093520;WS=1093502;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:143,95:0.40:238
chr11	1093710	rs7944723	C	G	9881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=376;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=181;NR=156;PP=2965;SC=GCACAGCACCCATTGCTGAGT;SOR=0.817;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=338;TCF=182;TCR=156;TR=337;WE=1093718;WS=1093700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,374:1.00:374
chr11	1093945	rs7934606	T	C	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.103;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=355;ReadPosRankSum=-0.888;SC=TAAGCAGAGCTGCTTGGTTCC;SOR=0.988;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=60;TCF=16;TCR=44;TR=29;WE=1093953;WS=1093935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,33:0.49:67
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chr11	1094753	rs10794292	A	C	2981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FS=1.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.92;ReadPosRankSum=1.039;SOR=0.788;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:132,141:0.52:273
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chr11	1098637	rs12418069	A	G	1178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.597;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=26;PP=718;ReadPosRankSum=0.258;SC=CTCTCCCTGCACAGCCTGTTT;SOR=0.613;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=146;TCF=86;TCR=60;TR=57;WE=1098645;WS=1098627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,64:0.40:160
chr11	1101649	rs7480563	T	C	1976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=46;PP=1056;ReadPosRankSum=-1.212;SC=GGTGCTGTCCTTTCTACTGGT;SOR=0.684;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=236;TCF=113;TCR=123;TR=91;WE=1101657;WS=1101639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,107:0.42:257
chr11	1103137	rs11245955	G	A	1305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.944;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=11;PP=839;ReadPosRankSum=-0.905;SC=CTTCCTGGCCGGGCTGGGGCT;SOR=0.500;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=91;TCF=72;TCR=19;TR=51;WE=1103145;WS=1103127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,56:0.54:103
chr11	1103477	rs11245956	C	T	1687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.366;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=27;PP=986;ReadPosRankSum=0.371;SC=CAGCTACCCCCGCCCACGGCA;SOR=0.442;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=115;TCF=73;TCR=42;TR=70;WE=1103485;WS=1103467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,75:0.60:126
chr11	1103786	rs9988872	A	G	1836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=19;PP=1207;SC=GCCCTGCCCTAAGCCGCTGCC;SOR=1.078;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=40;TCR=19;TR=59;WE=1103794;WS=1103776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr11	1151695	rs28737416	C	T	945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.485;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=21;PP=466;ReadPosRankSum=-0.690;SC=GCACCCGGCACACAGGTACGG;SOR=0.882;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=93;TCF=50;TCR=43;TR=43;WE=1151703;WS=1151685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,49:0.46:106
chr11	1154073	rs33962059	A	AC	96.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.309;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=1;PP=28;ReadPosRankSum=1.981;SC=GCCTCCTAGGACCCCCCAACC;SOR=0.180;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=2;WE=1154081;WS=1154068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr11	1155289	rs28468624	A	G	782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.842;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=24;PP=512;ReadPosRankSum=-0.018;SC=GGGTGGAGAGAGGCCCCAGCT;SOR=0.506;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=82;TCF=25;TCR=57;TR=36;WE=1155297;WS=1155279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,39:0.43:91
chr11	1157476	rs28707071	C	G	1999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.571;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=30;PP=1292;ReadPosRankSum=-0.120;SC=TGCAGGCAGACCCCGCCTCTG;SOR=0.641;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=161;TCF=103;TCR=58;TR=83;WE=1157484;WS=1157466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,90:0.51:175
chr11	1158073	rs28691231	T	C	5300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=90;PP=2465;SC=GCTCCCCCTGTGCAGACACCT;SOR=0.902;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=182;TCF=92;TCR=90;TR=181;WE=1158081;WS=1158063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr11	1158092	rs55863018	C	G	1693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.568;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=38;PP=991;ReadPosRankSum=-1.681;SC=CTGCTCCAACCAGGAGCACTC;SOR=0.642;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=145;TCF=68;TCR=77;TR=71;WE=1158100;WS=1158082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,82:0.49:169
chr11	1158834	rs28433367	C	T	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=-2.037;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.229;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=1;PP=26;ReadPosRankSum=-0.648;SC=GCCCCCGTCCCGGGCCCCTGG;SOR=0.035;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=3;WE=1158842;WS=1158824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr11	1159133	rs35917282	G	A	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=18;PP=449;ReadPosRankSum=-0.275;SC=TGGGGGTTGCGACCCAGGCCG;SOR=0.693;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=52;TCF=16;TCR=36;TR=27;WE=1159141;WS=1159123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,28:0.53:53
chr11	1159150	rs28542750	A	T	1631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=25;PP=953;SC=GCCGGCAGGCACCCTCGTCTG;SOR=1.230;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=15;TCR=25;TR=40;WE=1159158;WS=1159140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr11	1159210	rs56002968	C	T	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=373;ReadPosRankSum=-0.515;SC=CCTCCTGACGCGGAGGCTGGA;SOR=0.524;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=55;TCF=44;TCR=11;TR=21;WE=1159218;WS=1159200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,23:0.37:62
chr11	1161201	rs28653550	G	A	891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=11;PP=631;ReadPosRankSum=1.087;SC=CTGGTGTGTCGTGTTCCGCAG;SOR=0.751;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=70;TCF=53;TCR=17;TR=40;WE=1161209;WS=1161191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,41:0.55:74
chr11	1161315	rs28403537	T	C	6197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=111;NR=100;PP=2965;SC=CTGGATGGGGTGCAGACGGTG;SOR=0.763;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=212;TCF=111;TCR=101;TR=211;WE=1161323;WS=1161305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr11	1161335	rs28663568	T	G	2442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.769;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=56;PP=1404;ReadPosRankSum=0.390;SC=GAGTGGAGCCTGGCAGGGCAA;SOR=0.717;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=228;TCF=115;TCR=113;TR=111;WE=1161343;WS=1161325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,122:0.48:252
chr11	1161477	rs28464760	G	C	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.097;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=16;PP=357;ReadPosRankSum=-0.355;SC=ATGGGTCCACGTGACTGTCCC;SOR=0.478;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=55;TCF=18;TCR=37;TR=25;WE=1161485;WS=1161467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,26:0.46:57
chr11	1161713	rs28404876	G	C	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=146;ReadPosRankSum=0.683;SC=GCCGCAGCTGGAGGGAAAGGC;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=9;WE=1161721;WS=1161703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr11	1213204	rs72479396	C	G	6095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.000;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.105;SOR=0.707;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:292,292:0.50:584
chr11	1213204	.	CTTTCTG	GTTTCCA,GTTTCTG	2962	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.37;FR=0.5000,0.5000;HP=4;HapScore=1;MGOF=79;MMLQ=27;MQ=59.67;NF=124,623;NR=89,505;PP=2934,2962;QD=20;SC=CACAAGCCATCTTTCTGTATC;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=1443;TCF=802;TCR=641;TR=213,1128;WE=1213218;WS=1213194;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.15:1443
chr11	1213245	.	T	A	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=43;MMLQ=27;MQ=59.96;NF=565;NR=450;PP=2962;QD=20;SC=CAGTCACCAGTGACTGTCATC;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=1537;TCF=837;TCR=700;TR=1015;WE=1213325;WS=1213235;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:522,1015:0.66:1537
chr11	1213293	.	C	T	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=43;MMLQ=27;MQ=59.99;NF=367;NR=359;PP=2962;QD=20;SC=ACGTGGACTTCCCATCCCCTG;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=1944;TCF=1031;TCR=913;TR=726;WE=1213325;WS=1213235;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:1218,726:0.37:1944
chr11	1213314	.	C	T	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;FR=0.5000;HP=6;HapScore=1;MGOF=43;MMLQ=24;MQ=59.99;NF=672;NR=554;PP=2962;QD=20;SC=GACCCCACGGCGGGGACAAGG;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=2148;TCF=1125;TCR=1023;TR=1226;WE=1213325;WS=1213235;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:922,1226:0.57:2148
chr11	1213405	rs67262263	G	A	17762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1780;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.091;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=385;NR=428;PP=2962;ReadPosRankSum=1.526;SC=GTGCCGAGCCGAGAGCCACCC;SOR=0.623;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=1748;TCF=814;TCR=934;TR=813;WE=1213448;WS=1213395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:946,829:0.47:1775
chr11	1213416	rs78511643	G	A	12782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1664;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.71;ReadPosRankSum=-0.285;SOR=0.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1018,641:0.39:1659
chr11	1213424	rs61867531	A	G	53294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1575;ExcessHet=3.0103;FS=0.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=33.86;ReadPosRankSum=-1.694;SOR=0.753;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:318,1256:0.80:1574
chr11	1213428	rs61867532	T	C	36880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1541;ExcessHet=3.0103;FS=0.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.96;ReadPosRankSum=-1.267;SOR=0.764;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:452,1087:0.71:1539
chr11	1213440	rs61867533	T	C	47155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1422;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.648;HP=3;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=475;NR=638;PP=2962;ReadPosRankSum=0.343;SC=AACACCTGGGTCAGGTGGTGC;SOR=0.770;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=1420;TCF=615;TCR=805;TR=1113;WE=1213448;WS=1213395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:307,1114:0.78:1421
chr11	1213461	rs61867534	T	G	13045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=53;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=246;NR=334;PP=2962;ReadPosRankSum=1.089;SC=AGTGCAGCCGTGAAGAGGGCC;SOR=0.641;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=1280;TCF=550;TCR=730;TR=580;WE=1213469;WS=1213451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:486,576:0.54:1062
chr11	1213533	rs73395699	C	T	8483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=812;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.452;HP=2;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=162;NR=337;PP=2962;ReadPosRankSum=-5.636;SC=ACGAGGTGCGCGTGCTCTGCT;SOR=0.901;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=885;TCF=359;TCR=526;TR=499;WE=1213541;WS=1213523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:392,407:0.51:799
chr11	1214924	rs2075841	C	T	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=254;ReadPosRankSum=-0.168;SC=GCAGCCGGGGCAGCCACTCCC;SOR=0.906;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=18;WE=1214932;WS=1214914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr11	1215271	rs71025716	GA	G	663.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=2;PP=669;SC=CTGTTGGGAGGAAAGCCCCAG;SOR=3.716;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=18;WE=1215279;WS=1215261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	1215580	rs1132433	A	G	2084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FS=6.277;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.02;ReadPosRankSum=-1.609;SOR=0.886;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:122,109:0.47:231
chr11	1215698	rs28452143	A	G	6106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=123;NR=86;PP=2965;SC=CCCGTCGACCACGCCCTGCGT;SOR=0.974;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=209;TCF=123;TCR=86;TR=209;WE=1215706;WS=1215688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr11	1216316	rs58550179	G	GC	8475.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=20;NR=91;PP=2965;SC=GAGATGTCCGGCTCTGGAACG;SOR=0.790;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=115;TCF=20;TCR=95;TR=111;WE=1216324;WS=1216304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr11	1216333	rs60138698	TA	T	8421.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=93;PP=2957;SC=AACGTGAGCATACCCTGACCA;SOR=0.814;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=16;TCR=93;TR=109;WE=1216341;WS=1216323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr11	1216440	rs28415193	G	C	2714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.497;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=36;PP=816;ReadPosRankSum=1.266;SC=GGTCTACCACGGTCGGGCCCA;SOR=0.752;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=200;TCF=110;TCR=90;TR=80;WE=1216448;WS=1216430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,90:0.40:224
chr11	1216491	rs1132434	G	C	2396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=34;PP=837;ReadPosRankSum=0.114;SC=CCATCTGCCAGCTGATTCTGA;SOR=0.694;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=172;TCF=90;TCR=82;TR=69;WE=1216499;WS=1216481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,74:0.39:189
chr11	1217084	rs28652890	T	C	1704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.189;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=29;PP=1015;ReadPosRankSum=-0.468;SC=CCCAGCACCCTGCCCATCCCT;SOR=0.790;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=170;TCF=107;TCR=63;TR=82;WE=1217092;WS=1217074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,83:0.47:176
chr11	1217228	rs28592983	T	C	5216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=86;NR=94;PP=2578;SC=CGGCACTCTGTGCGTCCCACG;SOR=0.949;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=180;TCF=86;TCR=94;TR=180;WE=1217236;WS=1217218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr11	1218128	rs28503875	G	A	1576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.577;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=27;PP=677;ReadPosRankSum=0.631;SC=ACGGAGAGCCGGTGAAGGTGA;SOR=0.608;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=132;TCF=70;TCR=62;TR=60;WE=1218136;WS=1218118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,80:0.49:164
chr11	1218143	rs28515631	A	C	1555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.342;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=35;PP=910;ReadPosRankSum=0.353;SC=AGGTGAGTGGAAGGCATGGCC;SOR=0.866;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=117;TCF=57;TCR=60;TR=65;WE=1218151;WS=1218133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,72:0.51:142
chr11	1218613	rs28668687	A	G	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.243;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=3;PP=53;ReadPosRankSum=-1.545;SC=TGGCTGCCCCAGCACTGCATG;SOR=0.941;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=12;TCF=6;TCR=6;TR=6;WE=1218621;WS=1218603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr11	1218631	rs28429550	C	G	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.016;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=4;PP=76;ReadPosRankSum=0.118;SC=ATGAGCCGGGCTGGCTGCTGC;SOR=0.892;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=16;TCF=8;TCR=8;TR=8;WE=1218639;WS=1218621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr11	1219118	rs28742281	T	C	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=134;ReadPosRankSum=0.394;SC=GCCTCACTCCTGCCCCCGCAG;SOR=0.446;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=24;TCF=16;TCR=8;TR=13;WE=1219126;WS=1219108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr11	1219632	rs2075843	G	A	2787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.010;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=57;PP=1456;ReadPosRankSum=-2.834;SC=ACTCCGGCCGGGGCCAGGGAC;SOR=0.785;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=206;TCF=99;TCR=107;TR=110;WE=1219640;WS=1219622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,131:0.56:236
chr11	1220599	rs28633254	T	C	956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.798;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=13;PP=579;ReadPosRankSum=-1.350;SC=CCCTCCAGCCTGGCGAGACCT;SOR=0.832;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=92;TCF=62;TCR=30;TR=44;WE=1220607;WS=1220589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,45:0.46:97
chr11	1220760	rs28514396	T	C	1318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.642;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=27;PP=726;ReadPosRankSum=-0.375;SC=GGCTTCACCCTTAGATGGGTT;SOR=0.802;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=111;TCF=59;TCR=52;TR=55;WE=1220768;WS=1220750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,65:0.48:135
chr11	1220796	rs28502687	T	C	620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=20;PP=326;ReadPosRankSum=0.728;SC=ATCCCTGCAGTGCCAGCAGAC;SOR=0.979;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=55;TCF=21;TCR=34;TR=30;WE=1220804;WS=1220786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,33:0.50:66
chr11	1220923	rs1132435	C	T	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.858;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=327;ReadPosRankSum=0.923;SC=CGGCACAGGACGAGGCCCGCA;SOR=1.229;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=48;TCF=37;TCR=11;TR=20;WE=1220931;WS=1220913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,22:0.43:51
chr11	1220967	rs1132436	C	T	1846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=21;PP=1215;ReadPosRankSum=-0.043;SC=TTCTGCCCGCCGCCCCCGCCC;SOR=0.674;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=133;TCF=94;TCR=39;TR=74;WE=1220975;WS=1220957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,79:0.56:142
chr11	1220997	rs28457780	G	A	2238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-3.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.499;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=46;PP=1268;ReadPosRankSum=0.597;SC=AACCGTGAGTGCCCAGCCTGC;SOR=0.496;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=242;TCF=146;TCR=96;TR=107;WE=1221005;WS=1220987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,115:0.44:262
chr11	1221038	rs28439383	C	T	3697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=431;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.527;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=78;PP=2121;ReadPosRankSum=-0.780;SC=CTCAGAGGTCCAGGAGCAGCT;SOR=0.772;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=402;TCF=216;TCR=186;TR=175;WE=1221046;WS=1221028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:241,189:0.44:430
chr11	1221305	rs2075844	A	G	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.131;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.447;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=108;ReadPosRankSum=-1.280;SC=GAGGGGCCAGACAAAGGGCTC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=6;WE=1221313;WS=1221295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr11	1221592	rs28728088	T	C	616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=2;PP=375;SC=GCCCAGAGCTTGGCACGGCGC;SOR=2.200;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=1221600;WS=1221582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	1221817	rs1132440	G	C	1938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.561;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=44;PP=1293;ReadPosRankSum=-0.448;SC=TGGGCCGGCGGTGCCCTGCGC;SOR=0.760;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=161;TCF=81;TCR=80;TR=87;WE=1221825;WS=1221807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,91:0.53:171
chr11	1246941	rs2672785	A	G	1839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FS=1.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.39;ReadPosRankSum=0.072;SOR=0.590;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,92:0.47:196
chr11	1248197	rs908224	G	T	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.769;HP=8;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=249;ReadPosRankSum=1.178;SC=AGGGCTGGGGGGGGGTTGGGT;SOR=0.242;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=27;TCF=18;TCR=9;TR=16;WE=1248205;WS=1248187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr11	1248491	rs908223	T	G	2187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.149;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=40;PP=1452;ReadPosRankSum=-0.662;SC=GTTGCCAGTGTGGGGATCAGA;SOR=0.829;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=170;TCF=93;TCR=77;TR=91;WE=1248499;WS=1248481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,99:0.54:185
chr11	1248960	rs2075855	G	A	3727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=364;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=90;PP=2370;ReadPosRankSum=2.121;SC=ATGGGCCCACGGAGCAGTGCC;SOR=0.687;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=329;TCF=144;TCR=185;TR=163;WE=1248968;WS=1248950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:187,177:0.49:364
chr11	1249952	rs145446448	C	T	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=13;PP=286;ReadPosRankSum=-0.234;SC=AGTGCGCCCACGCGGGGGGCC;SOR=0.826;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=29;TCR=26;TR=27;WE=1249960;WS=1249942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,30:0.50:60
chr11	1250384	rs2471912	A	G	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=9;PP=307;ReadPosRankSum=-1.359;SC=GCCCAGCCCCACCTCCTTTTG;SOR=0.758;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=46;TCF=29;TCR=17;TR=26;WE=1250392;WS=1250374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,29:0.58:50
chr11	1250603	rs2075860	G	C	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=20;PP=499;ReadPosRankSum=0.416;SC=CTCATCAGGCGTGGAAGCAGA;SOR=0.612;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=74;TCF=31;TCR=43;TR=37;WE=1250611;WS=1250593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,40:0.52:77
chr11	1250679	rs2735706	C	T	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=168;ReadPosRankSum=0.419;SC=GGGAGGGTGCCGGAAGACCTG;SOR=0.941;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=21;TCF=7;TCR=14;TR=10;WE=1250687;WS=1250669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr11	1252047	rs2672807	T	C	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.361;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.150;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=77;ReadPosRankSum=0.032;SC=CAGGTCCAGGTCTGAGCTTCT;SOR=0.074;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=5;WE=1252055;WS=1252037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr11	1252708	rs2735709	G	C	3401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.03;ReadPosRankSum=0.261;SOR=0.680;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:168,171:0.50:339
chr11	1253136	rs2735711	C	T	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=146;ReadPosRankSum=0.083;SC=CCAGCCGTTCCACCCTGTGTG;SOR=0.245;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=9;WE=1253144;WS=1253135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr11	1253856	rs1318321	T	C	2515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.51;BaseQRankSum=-0.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=62;PP=1312;ReadPosRankSum=0.896;SC=GACGCCCCGATGCCTCCCACC;SOR=0.713;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=236;TCF=117;TCR=119;TR=112;WE=1253864;WS=1253846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,125:0.51:244
chr11	1253942	rs908229	T	C	3954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FS=1.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.45;ReadPosRankSum=2.940;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,183:0.71:256
chr11	1253969	rs72846370	A	G	2519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FS=9.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.33;ReadPosRankSum=-1.623;SOR=0.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,74:0.39:189
chr11	1253976	rs76956995	A	G	2383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=12.642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.27;ReadPosRankSum=-2.171;SOR=0.628;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:105,62:0.37:167
chr11	1253980	rs202127660	A	G	2063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=14.354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.14;ReadPosRankSum=-2.811;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,52:0.36:146
chr11	1254599	rs2672806	T	C	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=2.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.55;ReadPosRankSum=1.895;SOR=0.197;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr11	1254940	rs2735719	G	A	740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=9;PP=465;ReadPosRankSum=0.442;SC=GAGGCCCAGCGTTCGGCGGGG;SOR=0.850;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=56;TCF=41;TCR=15;TR=32;WE=1254948;WS=1254930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,34:0.55:62
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chr11	1257867	rs2672803	T	C	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.093;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=131;ReadPosRankSum=-0.377;SC=CCAGGTGGGGTCTGTGGGACT;SOR=0.223;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=9;WE=1257875;WS=1257857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
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chr11	1260193	rs74763753	T	C	608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FS=19.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.000;QD=2.58;ReadPosRankSum=0.611;SOR=1.978;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:191,45:0.19:236
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chr11	1260219	rs75935363	CG	TA	971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FS=15.023;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-2.151;QD=5.34;ReadPosRankSum=-1.651;SOR=1.891;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:150,32:0.18:182
chr11	1260632	rs34074919	TG	T	1789.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.313;NF=23;NR=15;PP=1285;ReadPosRankSum=-1.150;SC=TGAGGGCTGGTGGGCGCCTCC;SOR=0.730;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=41;TCR=26;TR=38;WE=1260640;WS=1260622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,62:0.54:114
chr11	1261640	rs2735733	C	T	1660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=39;PP=1031;ReadPosRankSum=-1.527;SC=GGCCCAGTACCGTCTGGGTGA;SOR=0.676;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=121;TCF=56;TCR=65;TR=71;WE=1261648;WS=1261630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,77:0.57:136
chr11	1262189	rs12363494	C	T	1910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.836;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=36;PP=1062;ReadPosRankSum=0.521;SC=GACTTTGAGACGTTTGAAAAC;SOR=0.878;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=228;TCF=124;TCR=104;TR=87;WE=1262197;WS=1262179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,100:0.40:250
chr11	1262907	rs2037089	T	C	3323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.915;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=86;PP=1842;ReadPosRankSum=-1.364;SC=TCTGCTGCAGTGACGACCACT;SOR=0.963;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=326;TCF=160;TCR=166;TR=158;WE=1262915;WS=1262897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:184,172:0.48:356
chr11	1263523	rs1541314	G	A	3363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.297;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=76;PP=2078;ReadPosRankSum=-1.563;SC=AGGGGTTGCAGGCGGGGACAT;SOR=0.777;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=305;TCF=147;TCR=158;TR=146;WE=1263531;WS=1263513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,161:0.48:332
chr11	1263776	rs2943510	C	T	2610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.550;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=57;PP=1425;ReadPosRankSum=-0.794;SC=CCCAGTACCCCAGCCACCAGC;SOR=0.429;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=199;TCF=91;TCR=108;TR=111;WE=1263789;WS=1263766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,125:0.56:224
chr11	1267193	rs2943492	C	G	2595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.299;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-1.941;NF=69;NR=47;PP=1545;ReadPosRankSum=1.829;SC=CTGACCAGCACGGCCACCACA;SOR=0.518;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=262;TCF=152;TCR=110;TR=116;WE=1267201;WS=1267183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,125:0.45:278
chr11	1267325	rs55813014	T	C	1643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=3.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.461;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-16.320;NF=66;NR=67;PP=1931;ReadPosRankSum=3.531;SC=ATCCCCTCCTTCACCCTTGGG;SOR=0.731;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=319;TCF=158;TCR=161;TR=133;WE=1267333;WS=1267315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:197,90:0.31:287
chr11	1271218	rs199629887	GCCA	G	5978.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.262;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.650;NF=15;NR=76;PP=2966;ReadPosRankSum=0.118;SC=GACCACGAAGGCCACCACGAC;SOR=0.885;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=185;TCF=32;TCR=153;TR=91;WE=1271228;WS=1271208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,157:0.56:281
chr11	1271321	rs2943517	C	G	1401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.493;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.139;NF=26;NR=35;PP=1069;ReadPosRankSum=-0.667;SC=ACAACTGCAGCCACTGGCCCC;SOR=0.555;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=118;TCF=48;TCR=70;TR=61;WE=1271329;WS=1271311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,62:0.53:117
chr11	1272226	rs2943512	A	C	2953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.171;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-2.914;NF=45;NR=26;PP=967;ReadPosRankSum=-0.236;SC=AACACCCATCACCCCAGTGCT;SOR=0.493;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=135;TCF=86;TCR=49;TR=71;WE=1272234;WS=1272216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,76:0.53:144
chr11	1272245	rs2943511	C	T	3169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.168;NF=52;NR=32;PP=1140;ReadPosRankSum=-0.493;SC=CTGACCAGCACGGCCACCACA;SOR=0.690;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=159;TCF=98;TCR=61;TR=84;WE=1272253;WS=1272235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,91:0.52:175
chr11	1272709	rs3021155	G	A	1013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.671;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=24;PP=567;ReadPosRankSum=1.913;SC=CACGGCCACCGCCTCCTCCAC;SOR=0.801;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=110;TCF=56;TCR=54;TR=46;WE=1272717;WS=1272699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,53:0.42:126
chr11	1272754	rs3021156	A	G	1171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=2.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.51;ReadPosRankSum=-2.493;SOR=0.516;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,64:0.41:156
chr11	1279486	rs2249550	A	G	1369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.387;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=21;PP=755;ReadPosRankSum=-1.604;SC=GGGGTGGGGGAGTGCAGGATG;SOR=0.556;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=129;TCF=87;TCR=42;TR=63;WE=1279494;WS=1279476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,68:0.49:140
chr11	1280301	rs2249686	G	A	1882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=46;PP=982;ReadPosRankSum=0.080;SC=GGTGAGACCCGAGGCACCTGC;SOR=0.732;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=174;TCF=76;TCR=98;TR=83;WE=1280309;WS=1280291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,91:0.49:187
chr11	1281134	rs2857476	T	C	3760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.833;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=71;PP=1970;ReadPosRankSum=-0.099;SC=TCACCCCCAATGGGGCTCTGC;SOR=0.640;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=299;TCF=167;TCR=132;TR=163;WE=1281142;WS=1281124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,180:0.54:332
chr11	1284227	rs12417955	A	G	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=10;PP=251;ReadPosRankSum=-0.371;SC=TAGGCATAGCAGGATGCAGGG;SOR=0.776;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=38;TCR=26;TR=24;WE=1284235;WS=1284217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,27:0.38:72
chr11	1304706	rs3838783	TG	T	285.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=173;ReadPosRankSum=-0.532;SC=TGCCTGGGCATGGGGGCTGGG;SOR=0.895;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=7;WE=1304714;WS=1304696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr11	1309956	rs3750920	C	T	1856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=37;PP=944;ReadPosRankSum=0.464;SC=TCAGGGACTCCGGGATGGTGA;SOR=0.714;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=154;TCF=82;TCR=72;TR=77;WE=1309964;WS=1309946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,92:0.50:183
chr11	1411501	rs112066837	C	T	1718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=36;NR=25;PP=920;SC=TGGCCGGCGCCGGGCCCCAGA;SOR=0.886;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=36;TCR=25;TR=61;WE=1411509;WS=1411491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr11	1471154	rs11028332	C	T	1241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=31;PP=917;SC=GGCAGCCTCGCGGACCCTGGG;SOR=2.007;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=12;TCR=31;TR=43;WE=1471162;WS=1471144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr11	1472050	rs61869028	A	G	727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.312;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=20;PP=551;ReadPosRankSum=1.619;SC=GAGGCGCCAGAGTGGGGCTGG;SOR=0.375;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=56;TCF=22;TCR=34;TR=34;WE=1472058;WS=1472040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,33:0.55:60
chr11	1472475	rs3838784	TG	T	905.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.083;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.166;NF=11;NR=8;PP=367;ReadPosRankSum=2.006;SC=CCAGTGCCCCTGGGGGGGCTG;SOR=0.384;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=59;TCF=39;TCR=20;TR=19;WE=1472483;WS=1472465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,39:0.43:90
chr11	1475628	rs66529968	C	T	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=133;ReadPosRankSum=0.769;SC=TGGAAGATTCCGCCGTTCCAA;SOR=0.941;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=11;WE=1475636;WS=1475618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr11	1477768	rs67861777	C	T	2634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.029;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=67;PP=1725;ReadPosRankSum=-0.031;SC=GGTGAGCTGGCGCCCCCAGGG;SOR=0.824;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=256;TCF=114;TCR=142;TR=117;WE=1477776;WS=1477758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,124:0.45:275
chr11	1481610	rs28555282	T	C	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.893;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.021;HP=3;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.524;NF=6;NR=2;PP=103;ReadPosRankSum=0.550;SC=CGTCGAGGCCTCTTCGTTCAT;SOR=1.230;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=14;TCF=8;TCR=6;TR=8;WE=1481618;WS=1481600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr11	1481691	rs112514854	C	T	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.391;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.24;MQRankSum=0.898;QD=10.78;ReadPosRankSum=-0.210;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr11	1481930	rs4963048	A	G	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.28;ReadPosRankSum=-1.394;SOR=1.075;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr11	1490643	rs71025733	TG	T	562.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=193;ReadPosRankSum=-2.051;SC=GCCCACAGTGTGGGGGGGGGG;SOR=0.586;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=37;TCF=25;TCR=12;TR=19;WE=1490652;WS=1490633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,28:0.60:47
chr11	1491096	rs9440	G	A	2692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=51;PP=1651;ReadPosRankSum=-2.381;SC=GGGGCTGCACGGAGACCAGAG;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=238;TCF=134;TCR=104;TR=117;WE=1491104;WS=1491086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,130:0.50:260
chr11	1492445	rs4881724	A	G	1822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=10;PP=1353;SC=CCGGCACAGGAGCTTGGTCAC;SOR=3.113;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=47;TCR=10;TR=57;WE=1492453;WS=1492435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr11	1501670	rs10742185	G	C	6266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=112;NR=108;PP=2965;SC=TGCAGAACTCGGAGATGGTGC;SOR=0.770;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=220;TCF=112;TCR=108;TR=220;WE=1501678;WS=1501660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr11	1502097	rs10767696	A	G	3301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=58;PP=1971;SC=TCTTGCCATTAGGCTTGGCTT;SOR=0.906;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=54;TCR=58;TR=112;WE=1502105;WS=1502087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr11	1502338	rs11030218	A	G	695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=408;ReadPosRankSum=1.724;SC=TCCTGGGAAGAAGGGCTGGCG;SOR=0.699;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=46;TCF=36;TCR=10;TR=27;WE=1502346;WS=1502328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,31:0.60:52
chr11	1502401	rs4881735	A	C	3700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=76;NR=45;PP=1906;SC=CCCCTCACCAAGTCCTCCAAC;SOR=1.154;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=121;TCF=76;TCR=45;TR=121;WE=1502409;WS=1502391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr11	1502638	rs11030226	C	T	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.754;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=146;ReadPosRankSum=0.098;SC=CATCAGGCGGCAGCCTGGCCT;SOR=0.148;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=13;WE=1502646;WS=1502628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,16:0.80:20
chr11	1507512	rs1881502	T	C	430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=1;PP=319;SC=CCTGGACAGCTTGCGTGTGGC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=1507520;WS=1507508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	1507731	rs1881503	A	G	7103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=128;NR=132;PP=2965;SC=TCCACTTTGCAGGGACTGGCC;SOR=0.807;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=262;TCF=129;TCR=133;TR=260;WE=1507739;WS=1507721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,277:1.00:277
chr11	1507795	rs1110206	G	A	1636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.748;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=47;PP=1077;ReadPosRankSum=-0.850;SC=ATGAGTGGGCGACGGGAAGGT;SOR=0.835;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=113;TCF=37;TCR=76;TR=69;WE=1507803;WS=1507785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,72:0.60:120
chr11	1509143	rs1105871	T	C	917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=1.883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.56;ReadPosRankSum=0.059;SOR=0.471;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,47:0.49:96
chr11	1509238	rs2334554	T	C	9280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=361;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=177;NR=154;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.948;SC=CCCTAAGCCATGCTCTGAGCA;SOR=0.750;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=333;TCF=178;TCR=155;TR=331;WE=1509246;WS=1509228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,358:0.99:360
chr11	1509421	rs2334553	G	A	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.713;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=129;ReadPosRankSum=0.460;SC=CCAACAGCAGGGACACAGGTG;SOR=1.981;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=7;WE=1509429;WS=1509411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr11	1576005	rs59483236	T	C	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=89;ReadPosRankSum=-1.180;SC=AACAGACATATGGGAGGCAAA;SOR=0.446;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=6;WE=1576013;WS=1575995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr11	1576137	rs11604635	C	T	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=1;PP=42;ReadPosRankSum=1.107;SC=ACAGAGGGAACGGGAACAGGA;SOR=0.941;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=4;WE=1576145;WS=1576127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr11	1576235	rs6578504	T	C	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=6;PP=113;ReadPosRankSum=1.355;SC=GGCGGCTGGCTGGGGCGGGAT;SOR=0.732;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=28;TCF=15;TCR=13;TR=12;WE=1576243;WS=1576225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr11	1576283	rs11603496	G	A	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.484;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=204;ReadPosRankSum=-0.761;SC=CTCAGGACTGGGTCCTGCCCT;SOR=1.179;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=25;TCF=11;TCR=14;TR=14;WE=1576291;WS=1576273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr11	1576863	rs12576976	A	G	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.842;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr11	1585277	rs3740620	C	T	1639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=38;PP=876;ReadPosRankSum=-0.661;SC=GCCCTGGCCCCGTCCCAGATA;SOR=0.681;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=156;TCF=76;TCR=80;TR=74;WE=1585285;WS=1585267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,84:0.47:180
chr11	1606120	.	ACCACAGCCACCCTTGGATCCCCCACAAGAG	A	281.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.492;ClippingRankSum=0.000;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=4.288;NF=0;NR=11;PP=883;ReadPosRankSum=-0.571;SC=CACAGCCGGAACCACAGCCAC;SOR=0.776;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=11;WE=1606157;WS=1606110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr11	1619172	.	ACCCCCACAGGAGCCACAGCCCCCCTTGGAG	A	343.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.000;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=2.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.22;ReadPosRankSum=-2.090;SOR=0.250;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr11	1619202	.	G	A	142	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000;HP=5;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=23;MQ=52.92;NF=5;NR=5;PP=142;QD=17.6771212547;SC=CCCCCTTGGAGCCCCCACAGG;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=24;TCF=8;TCR=16;TR=10;WE=1619210;WS=1619192;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:14,10:0.42:24
chr11	1628844	rs1989592	A	G	4072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=41;PP=2418;SC=CACAGCTGCAATCATTCCTGG;SOR=1.350;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=125;TCF=84;TCR=41;TR=125;WE=1628852;WS=1628834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr11	1628965	rs57186801	G	A	3774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.618;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.000;NF=47;NR=55;PP=1275;ReadPosRankSum=0.848;SC=GCTTGCAGCAGCTGGACTGGC;SOR=0.567;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=202;TCF=91;TCR=111;TR=102;WE=1628973;WS=1628955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,114:0.50:230
chr11	1628992	rs60210378	G	A	3454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.938;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=1.122;NF=35;NR=48;PP=990;ReadPosRankSum=-1.366;SC=ATGACCCACAGCCTGAGGAGC;SOR=0.556;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=156;TCF=63;TCR=93;TR=83;WE=1629000;WS=1628982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,95:0.55:172
chr11	1630342	rs10837527	T	A	1654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=26;PP=1028;SC=AGTTTTCCTCTATTAATTCTT;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=31;TCR=26;TR=57;WE=1630350;WS=1630332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr11	1651352	rs75391124	C	T	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.01;ReadPosRankSum=-0.764;SOR=0.709;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,25:0.48:52
chr11	1651585	.	CCTGCTGCCAGTCCAGCTGCTGTAAGCCTTA	C	1128.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.144;ClippingRankSum=0.000;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.63;MQRankSum=-3.956;QD=9.10;ReadPosRankSum=2.410;SOR=0.671;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,55:0.44:124
chr11	1651613	.	TTACTGCTGCCAGTCCAGCTGCTGTAAGCCC	T	1034.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.460;ClippingRankSum=0.000;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.640;HP=2;HapScore=4;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=5.629;NF=4;NR=17;PP=1113;ReadPosRankSum=-1.963;SC=GCTGTAAGCCTTACTGCTGCC;SOR=0.773;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=60;TCF=12;TCR=48;TR=21;WE=1651650;WS=1651575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,57:0.42:136
chr11	1651830	rs4752770	G	T	1359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.726;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=35;PP=812;ReadPosRankSum=0.014;SC=GAAGGGCCCGGCTGCCCAGCT;SOR=0.533;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=29;TCR=64;TR=51;WE=1651838;WS=1651820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,61:0.59:103
chr11	1651917	rs4752769	C	T	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=135;ReadPosRankSum=1.712;SC=CACCAGTGCTCCCGAAACTGA;SOR=1.445;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=8;WE=1651925;WS=1651907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr11	1756681	rs7943617	G	A	766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.093;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=19;PP=419;ReadPosRankSum=-1.210;SC=AGGAGGACAGGAAATGGGCAG;SOR=0.454;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=57;TCF=17;TCR=40;TR=29;WE=1756689;WS=1756671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,34:0.53:64
chr11	1770224	rs111693235	C	G	1097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.051;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=20;PP=659;ReadPosRankSum=-0.840;SC=TGCCGCAGCCCCCCGGACGGC;SOR=0.877;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=123;TCF=68;TCR=55;TR=50;WE=1770232;WS=1770214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,58:0.41:140
chr11	1771797	rs3740621	T	C	1229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=42;PP=809;ReadPosRankSum=0.146;SC=CCTGTCTGCCTGCCTGTGCCT;SOR=0.640;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=106;TCF=29;TCR=77;TR=57;WE=1771805;WS=1771787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,59:0.52:113
chr11	1776024	rs55725229	TC	T	887.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=4;PP=917;SC=CTTGCCCAGCTCCCACTACTC;SOR=3.098;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=23;WE=1776032;WS=1776014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	1853107	rs616594	C	T	4880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;MQ=59.99;NF=85;NR=75;PP=2574;SC=TGGCCGGCCACAGGAAGTGGT;SOR=0.771;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=161;TCF=85;TCR=76;TR=160;WE=1853115;WS=1853097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr11	1855854	rs2063551	G	C	2201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.099;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=42;PP=1307;ReadPosRankSum=0.860;SC=TGTGGTGCGTGCTGGGGTAGA;SOR=0.747;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=190;TCF=101;TCR=89;TR=97;WE=1855862;WS=1855844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,109:0.52:210
chr11	1857042	rs907605	G	T	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=152;ReadPosRankSum=-1.099;SC=GTCATGCAAGGGCTGCCCGGG;SOR=0.722;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=41;TCF=31;TCR=10;TR=14;WE=1857050;WS=1857032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,15:0.35:43
chr11	1857112	rs907606	C	A	956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=16;PP=534;ReadPosRankSum=0.610;SC=CCAACTCACTCCAGGTGCAAC;SOR=0.737;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=109;TCF=69;TCR=40;TR=46;WE=1857120;WS=1857102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,50:0.42:118
chr11	1857173	rs564271	T	C	5080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=81;PP=2642;SC=GCAATGGGGGTGCCTGCAGCT;SOR=0.755;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=177;TCF=96;TCR=81;TR=177;WE=1857181;WS=1857163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr11	1858262	rs484955	C	T	3420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.800;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=74;PP=1964;ReadPosRankSum=0.035;SC=AAAAAGGGCACGGCGGCCCCC;SOR=0.759;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=306;TCF=156;TCR=150;TR=148;WE=1858270;WS=1858252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,165:0.50:331
chr11	1861225	rs1877444	C	A	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=8;PP=192;ReadPosRankSum=-0.012;SC=GCCCCACCCACCCACCAAGAC;SOR=0.869;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=47;TCF=23;TCR=24;TR=16;WE=1861233;WS=1861215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,16:0.34:47
chr11	1861760	rs907610	T	C	3427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=52;PP=1913;SC=CACCGCAGAGTGTGATGCTGC;SOR=0.790;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=115;TCF=62;TCR=53;TR=113;WE=1861768;WS=1861750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr11	1862168	rs2271442	C	T	1894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.326;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=26;PP=1230;ReadPosRankSum=0.774;SC=CGGCGGCAGGCGGGTAGGCGG;SOR=0.846;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=152;TCF=101;TCR=51;TR=80;WE=1862176;WS=1862158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,85:0.52:162
chr11	1874266	rs2089909	C	T	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=9;PP=381;ReadPosRankSum=0.412;SC=AAGTGAAACTCGGCTGGGGGT;SOR=0.811;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=45;TCF=29;TCR=16;TR=29;WE=1874274;WS=1874256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,33:0.66:50
chr11	1874404	rs2089910	C	T	1342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=22;PP=716;ReadPosRankSum=0.168;SC=ACCCGGGTGCCGAGGAGCGGG;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=108;TCF=61;TCR=47;TR=50;WE=1874412;WS=1874394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,64:0.48:132
chr11	1880811	rs571122	G	A	1003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.653;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=24;PP=490;ReadPosRankSum=-0.138;SC=TAGCCAATTCGTTCCAGATGA;SOR=0.586;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=108;TCF=53;TCR=55;TR=47;WE=1880819;WS=1880801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,56:0.42:134
chr11	1890810	rs501124	G	A	951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=7;PP=592;ReadPosRankSum=0.812;SC=GGGAGGAGGGGTCTCTCCCAC;SOR=0.602;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=68;TCF=53;TCR=15;TR=35;WE=1890818;WS=1890800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,39:0.53:73
chr11	1890971	rs76102571	C	A	1760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.235;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.860;NF=33;NR=48;PP=1111;ReadPosRankSum=-0.559;SC=CGAGGGCTGGCGAGCTTGCCA;SOR=0.926;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=185;TCF=82;TCR=103;TR=81;WE=1890979;WS=1890961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,87:0.43:202
chr11	1891035	rs61278563	G	GA	1893.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=41;PP=1614;SC=GGGCGTGGGGGGGGCTGGTTT;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=45;TCF=1;TCR=44;TR=42;WE=1891043;WS=1891025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr11	1891284	rs688601	T	A	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.103;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=139;ReadPosRankSum=1.204;SC=GTAATGGGGATGATAGGACTG;SOR=1.302;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=9;WE=1891292;WS=1891274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr11	1891319	rs61868778	C	T	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.560;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=168;ReadPosRankSum=1.865;SC=ATTGTGAGGACGGAGGCGCTG;SOR=1.179;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=12;WE=1891327;WS=1891309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr11	1891587	rs61868779	C	T	1972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.968;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=40;PP=1215;ReadPosRankSum=0.118;SC=ACCGGGGAGTCTCCTGGGAAA;SOR=0.533;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=142;TCF=71;TCR=71;TR=80;WE=1891595;WS=1891577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,89:0.55:162
chr11	1901467	rs2271439	A	C	940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=23;PP=636;SC=GAGCAGCCCCATAACGCGTGC;SOR=1.819;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=9;TCR=23;TR=32;WE=1901475;WS=1901457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr11	1902635	rs536462	G	T	1412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=33;NR=16;PP=771;SC=AGCCGCCCAGGCCTAAGCTCC;SOR=1.220;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=33;TCR=16;TR=49;WE=1902643;WS=1902625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr11	1902793	rs11545725	A	T	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=11;PP=213;ReadPosRankSum=0.048;SC=GAGCCCCCCCAGTGCAGGAGT;SOR=0.799;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=61;TCF=32;TCR=29;TR=22;WE=1902801;WS=1902775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,26:0.37:71
chr11	1905146	rs370517012	GT	G	193.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=7.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.17;MQRankSum=1.696;QD=3.23;ReadPosRankSum=0.033;SOR=0.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,16:0.27:60
chr11	1910707	rs613638	T	C	1813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=30;PP=1076;SC=TCTGTGGGGGTGGGCACCTCT;SOR=0.722;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=31;TCR=30;TR=61;WE=1910715;WS=1910697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr11	1911115	rs11041692	T	C	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.329;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=18;PP=410;ReadPosRankSum=0.352;SC=GCCTGGACTGTGGTGGGCAGT;SOR=1.244;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=72;TCF=34;TCR=38;TR=29;WE=1911123;WS=1911105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,34:0.41:82
chr11	1911439	rs17173834	G	T	1928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.536;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=45;PP=1135;ReadPosRankSum=-1.585;SC=TTCTGCAGGGGTGATGCCACG;SOR=0.613;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=170;TCF=82;TCR=88;TR=86;WE=1911447;WS=1911429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,95:0.50:190
chr11	1944050	rs370860604	CCT	C	36.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FS=0.950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.20;ReadPosRankSum=-1.109;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:168,20:0.11:188
chr11	1950302	rs629990	A	G	2926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.426;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=57;PP=1724;ReadPosRankSum=-0.074;SC=CCGCAGCCGCACTGGCTTTTC;SOR=0.744;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=265;TCF=150;TCR=115;TR=134;WE=1950310;WS=1950292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,148:0.51:292
chr11	1950906	rs2292473	T	G	1284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=15;PP=455;ReadPosRankSum=-1.625;SC=TTGGGGGTACTCCCAGCTGAA;SOR=0.654;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=85;TCF=50;TCR=35;TR=34;WE=1950914;WS=1950896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,37:0.38:97
chr11	1950925	rs2292471	T	C	1387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=16;PP=482;ReadPosRankSum=0.283;SC=AAAAGGACGGTGGCCTTCAGT;SOR=0.735;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=101;TCF=61;TCR=40;TR=39;WE=1950933;WS=1950915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,42:0.38:111
chr11	1956212	rs513735	T	C	1844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.801;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=45;PP=1035;ReadPosRankSum=-0.747;SC=AGAGCAGCCATCTCCCTGCGT;SOR=0.504;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=150;TCF=55;TCR=95;TR=77;WE=1956220;WS=1956202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,88:0.51:171
chr11	1961701	rs375322681	TCTCACA	TCA,T	201.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;NF=10,10;NR=0,0;PP=123,110;SC=TCTCTCTCTCTCTCACACACA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=10,10;WE=1961716;WS=1961695;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:0.67:9
chr11	1961869	rs11041941	T	C	5851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=105;NR=88;PP=2965;SC=CATGGCTGTCTATGTAGATTA;SOR=0.760;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=193;TCF=105;TCR=88;TR=193;WE=1961877;WS=1961859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr11	1968455	rs907601	C	G	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=1.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.9970;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=191;ReadPosRankSum=-1.083;SC=GGCACGGGCGCGCGGCACGGG;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=10;WE=1968463;WS=1968447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,10:0.83:12
chr11	1973205	rs217205	T	C	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.393;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=48;ReadPosRankSum=-0.908;SC=CTGCCTGGCCTCACTAGTGCC;SOR=0.061;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=4;WE=1973213;WS=1973195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr11	1976988	rs177720	A	G	3364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=59;PP=1895;SC=TGATTTATCAACTGCCGCACG;SOR=1.316;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=42;TCR=59;TR=101;WE=1976996;WS=1976978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr11	1983444	rs217240	G	A	908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=16;PP=563;ReadPosRankSum=-0.171;SC=TGCCATCTTCGTGTCTCTGTC;SOR=0.660;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=78;TCF=49;TCR=29;TR=41;WE=1983462;WS=1983434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,45:0.49:91
chr11	1993975	rs190063	C	A	4172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=78;PP=2492;SC=TCAGGATGGACGTCTTCTACT;SOR=0.911;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=149;TCF=71;TCR=78;TR=149;WE=1993983;WS=1993965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr11	2016619	rs3741219	A	G	1471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=26;PP=913;ReadPosRankSum=0.394;SC=CGGGCCCTGCACAGGCACTTG;SOR=0.752;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=117;TCF=66;TCR=51;TR=61;WE=2016627;WS=2016609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,67:0.51:132
chr11	2016924	rs10840159	A	G	760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.996;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=9;PP=236;ReadPosRankSum=-0.895;SC=GGGGGTGGCCATGAAGATGGA;SOR=0.587;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=66;TCF=35;TCR=31;TR=26;WE=2016932;WS=2016914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,38:0.47:80
chr11	2017017	rs2839702	A	C	998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.725;HP=1;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=16;ReadPosRankSum=1.571;SC=TGGTTCCTCTAGCTTCACCTA;SOR=1.051;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=99;TCF=56;TCR=43;TR=45;WE=2017025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,51:0.47:109
chr11	2017110	rs2839701	C	G	1787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.013;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=29;PP=986;ReadPosRankSum=0.656;SC=GCTCACCTTCCAGAGCCGATT;SOR=0.403;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=133;TCF=84;TCR=49;TR=73;WE=2017118;WS=2017100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,84:0.56:149
chr11	2017439	rs3024270	C	G	1453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.733;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.97;MQRankSum=-0.862;NF=24;NR=32;PP=924;ReadPosRankSum=2.653;SC=AGACAGAGGTCGGGGCAGTGA;SOR=0.589;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=103;TCF=42;TCR=61;TR=56;WE=2017447;WS=2017429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,62:0.56:110
chr11	2018168	rs2067051	C	T	2411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=47;PP=1417;ReadPosRankSum=-0.586;SC=CTCCTGGTGACGTCCTGCTGC;SOR=0.681;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=258;TCF=143;TCR=115;TR=111;WE=2018176;WS=2018158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,121:0.44:276
chr11	2018336	rs2075745	A	T	1719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.894;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=34;PP=947;ReadPosRankSum=-0.056;SC=GTCCCCTGCCATGTCCCTGTC;SOR=0.866;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=146;TCF=76;TCR=70;TR=69;WE=2018344;WS=2018326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,80:0.47:172
chr11	2018449	rs2075744	A	G	1888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=42;PP=1223;ReadPosRankSum=0.130;SC=CGGGCCCATAACCCCCCAGCC;SOR=0.695;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=180;TCF=94;TCR=86;TR=87;WE=2018457;WS=2018439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,97:0.48:204
chr11	2018853	rs2839698	G	A	3031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=68;PP=1739;ReadPosRankSum=1.651;SC=ATGCCTGGGCGCCTACTCCAC;SOR=0.690;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=260;TCF=137;TCR=123;TR=140;WE=2018861;WS=2018843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,149:0.52:288
chr11	2156536	rs3213225	G	A	1032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=16;PP=570;ReadPosRankSum=0.849;SC=GAGGTTGGGCGTCCTCACCGG;SOR=0.621;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=50;TCR=30;TR=42;WE=2156544;WS=2156526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,47:0.55:86
chr11	2161858	rs3741212	A	G	1150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=1.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.92;ReadPosRankSum=-0.049;SOR=0.684;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,60:0.47:129
chr11	2167543	rs1003483	T	G	2381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=61;PP=1349;ReadPosRankSum=-0.459;SC=CCCAGCTCCTTTCTCCAAGGG;SOR=0.688;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=287;TCF=138;TCR=149;TR=118;WE=2167551;WS=2167533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:189,130:0.41:319
chr11	2167618	rs1003484	A	G	852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=2.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.88;ReadPosRankSum=-1.075;SOR=0.467;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,49:0.40:124
chr11	2169014	rs10770125	A	G	534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.113;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=171;ReadPosRankSum=0.013;SC=CTCCCACACAAGCTCGGTGGT;SOR=0.914;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=38;TCF=25;TCR=13;TR=18;WE=2169022;WS=2169004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,26:0.55:47
chr11	2181060	rs3842753	T	G	3028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=45;PP=1887;SC=GCGGCGGGTGTGGGGCTGCCT;SOR=0.946;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=60;TCR=45;TR=105;WE=2181068;WS=2181050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr11	2182004	rs5506	A	G	3841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=56;PP=2406;SC=AGCAATGGGCAGTTGGCTCAC;SOR=0.930;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=135;TCF=79;TCR=56;TR=135;WE=2182012;WS=2181994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr11	2182224	rs689	A	T	1270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=31;PP=874;SC=GTGATCTGGGAGACAGGCAGG;SOR=2.584;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=8;TCR=31;TR=39;WE=2182232;WS=2182214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr11	2185404	.	G	A	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=113;ReadPosRankSum=0.494;SC=CAGGGCCTGAGCTCCGGGACA;SOR=1.179;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=8;WE=2185412;WS=2185394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr11	2187071	rs6578990	T	C	2184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=33;PP=1599;SC=GTGACCAGGATACCACCCCCA;SOR=0.720;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=36;TCR=33;TR=69;WE=2187079;WS=2187061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr11	2187398	rs4072823	T	G	1054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=27;PP=800;SC=GACACTTCCCTGGCGGCAGAG;SOR=2.012;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=10;TCR=27;TR=37;WE=2187406;WS=2187388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr11	2187855	rs12419447	G	C	2686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=54;NR=35;PP=1568;SC=GCCAGGGCGCGCACTCACGGC;SOR=0.936;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=54;TCR=35;TR=89;WE=2187863;WS=2187845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr11	2188238	rs6357	C	T	3424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=58;NR=56;PP=2021;SC=CGTAGAGGCCCTTCAGCGTGG;SOR=0.808;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=114;TCF=58;TCR=56;TR=114;WE=2188246;WS=2188228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr11	2188566	rs7925924	C	T	530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=1;PP=287;SC=TTAGTCTCTCCTGTTGTGCCA;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=2188574;WS=2188556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	2189983	rs4930043	C	T	660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=26;PP=731;SC=GGAGGCACATCTGGCTGGCTG;SOR=0.859;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=11;TCR=26;TR=37;WE=2189991;WS=2189973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	2193001	rs74555599	C	T	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.822;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=15;PP=354;ReadPosRankSum=-1.472;SC=GGCGTGGTGGCGTCGGGGGTG;SOR=0.560;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=85;TCF=47;TCR=38;TR=32;WE=2193009;WS=2192991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,34:0.39:88
chr11	2194175	rs10743149	T	C	2481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=31;PP=1565;SC=GGCCAGAGCCTGCCTTGACAA;SOR=1.346;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=59;TCR=31;TR=90;WE=2194183;WS=2194165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr11	2321650	rs2651823	A	G	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=47;ReadPosRankSum=-0.878;SC=TTGCAGAGGGAATGTTGGGGT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=5;WE=2321658;WS=2321640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr11	2323029	rs756924	T	C	2159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.713;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=51;PP=1453;ReadPosRankSum=-0.800;SC=CCACACCAGGTCCTGCCCATG;SOR=1.052;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=185;TCF=87;TCR=98;TR=89;WE=2323037;WS=2323019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,98:0.47:209
chr11	2323220	rs734094	G	A	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.512;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=158;ReadPosRankSum=0.216;SC=CCCTTCTTCCGGGGCACCCAG;SOR=2.910;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=10;WE=2323228;WS=2323210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr11	2324041	rs2074022	A	G	965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.357;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=15;PP=594;ReadPosRankSum=-0.791;SC=CAGCAGTCCCATGCCCCACAC;SOR=0.941;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=118;TCF=76;TCR=42;TR=47;WE=2324049;WS=2324031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,53:0.41:129
chr11	2324852	rs2651824	A	C	423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=11;PP=330;SC=GAGGTCAGGGATACTGCCTTA;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=2324860;WS=2324842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	2325581	rs2074023	C	T	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=31;ReadPosRankSum=-0.189;SC=GAGACCCCCACGTCAACCCCA;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=3;WE=2325589;WS=2325571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr11	2329995	rs11554947	C	T	3148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.27;QD=26.24;SOR=0.991;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr11	2330077	rs2234297	C	G	2924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=50;NR=52;PP=1745;SC=AGTGGAGGGTCCCCCAGTAAG;SOR=0.844;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=103;TCF=50;TCR=53;TR=102;WE=2330085;WS=2330067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr11	2330400	rs2521273	G	A	3025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=64;NR=37;PP=1806;SC=CTTGGCCTTAGGGGTTGACTA;SOR=1.230;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=64;TCR=37;TR=101;WE=2330408;WS=2330390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr11	2330479	rs2521274	G	A	4117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=59;PP=2358;SC=TGGGGCAGACGGTACCAGTGG;SOR=0.774;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=132;TCF=72;TCR=60;TR=131;WE=2330487;WS=2330469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr11	2330563	rs2521275	C	T	3967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=62;NR=69;PP=2139;SC=CCCATCCTTCCGTCCTGGATG;SOR=0.992;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=62;TCR=69;TR=131;WE=2330571;WS=2330553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr11	2334740	rs739546	G	A	377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=1;PP=284;SC=TCCGCTTTGGGGAGATCCACC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=2334748;WS=2334730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	2337012	rs11022252	G	C	690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=2;PP=495;SC=GAACCAGGAAGCTGGGACTGT;SOR=3.442;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=2337020;WS=2337002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	2356603	rs2651795	T	C	3306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=28;PP=1931;SC=TCCAACTTGTTGAGACTTGGC;SOR=1.971;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=105;TCF=76;TCR=29;TR=104;WE=2356611;WS=2356593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr11	2356769	rs2651794	T	C	6483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=98;PP=2965;SC=TACACCTGGATTACCTTGCCA;SOR=0.719;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=206;TCF=108;TCR=98;TR=206;WE=2356777;WS=2356759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr11	2356908	rs189628771	G	A	4516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=415;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.014;NF=107;NR=95;PP=2739;ReadPosRankSum=1.067;SC=TCCTGCGCACGTGTGAGGGGG;SOR=0.720;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=388;TCF=205;TCR=183;TR=202;WE=2356916;WS=2356898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:202,213:0.51:415
chr11	2357108	rs2173888	C	G	1251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=34;PP=1024;SC=TGTTGGACATCCTCACCAACA;SOR=5.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=35;WE=2357116;WS=2357098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr11	2400338	rs2651796	C	G	4026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=82;NR=67;PP=2485;SC=GGACCTCAGCCGTTGCTTAGT;SOR=0.813;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=83;TCR=67;TR=149;WE=2400346;WS=2400328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr11	2406893	.	G	T	84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=25;MQ=58.66;NF=4;NR=0;PP=84;QD=29.6928031368;SC=TGGTGTGCCCGTCGTCTGTGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=4;WE=2406901;WS=2406883;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:12,4:0.25:16
chr11	2407084	rs71029143	G	GT	9202.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.52;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=362;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.217;NF=20;NR=120;PP=2957;ReadPosRankSum=-0.924;SC=TACAAGAAACGTGCTAGAACA;SOR=0.908;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=144;TCF=20;TCR=124;TR=140;WE=2407093;WS=2407074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,346:0.99:348
chr11	2424684	rs2234283	A	C	3109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=45;PP=2070;SC=TGGGGCAGCCACCATGGAGGC;SOR=0.884;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=60;TCR=45;TR=105;WE=2424692;WS=2424674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr11	2426984	rs2301696	G	C	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=151;ReadPosRankSum=0.655;SC=AGGCTCCCGTGAGGCGTGTAG;SOR=0.892;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=8;WE=2426992;WS=2426974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr11	2427291	rs800342	A	C	10093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=387;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=192;NR=160;PP=2965;ReadPosRankSum=0.395;SC=GCTCTCTCAGACCCCCGAGGT;SOR=0.266;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=354;TCF=194;TCR=160;TR=352;WE=2427299;WS=2427281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,385:1.00:386
chr11	2427364	rs61873460	T	C	3014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.861;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=75;PP=1574;ReadPosRankSum=0.334;SC=GGCCACGCGGTGCTCTGCGTG;SOR=0.533;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=238;TCF=102;TCR=136;TR=138;WE=2427372;WS=2427354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,148:0.59:250
chr11	2428307	rs138931856	CCTCGGCCTCACCCAGGTGCTCCCGCTTGTG	C	172.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=2.068;NF=2;NR=0;PP=418;ReadPosRankSum=1.944;SC=GGACCCGCCACCTCGGCCTCA;SOR=1.688;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=2;WE=2428344;WS=2428297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr11	2432104	rs140820492	G	GC	133.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=155;ReadPosRankSum=0.511;SC=TCTGGTGGGTGCCCTAGGCCA;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=5;WE=2432112;WS=2432094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr11	2432820	rs2651822	A	G	6988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.152;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=122;NR=108;PP=2965;ReadPosRankSum=1.579;SC=CAGGCAGGGGATTGCTGTCCC;SOR=0.340;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=230;TCF=122;TCR=108;TR=230;WE=2432828;WS=2432810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,249:1.00:250
chr11	2435910	rs76270811	G	GC	1627.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=45;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=21;NR=4;PP=1130;SC=ATCCTCCCCCGCGCGCGGGCC;SOR=3.258;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=25;WE=2435918;WS=2435900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr11	2435931	rs4929980	C	T	2536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=56;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=14;PP=1031;SC=CGGCCCCAGCCGCCGGTCACT;SOR=1.919;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=38;TCR=14;TR=52;WE=2435939;WS=2435921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr11	2435946	rs4929981	A	G	2795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.09;SOR=1.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr11	2435956	rs4929982	C	T	3083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.67;SOR=1.547;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr11	2439542	rs3986599	A	G	2445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=50;PP=1552;SC=CCCCGAGCCTACCAGGATCAG;SOR=1.637;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=28;TCR=50;TR=78;WE=2439550;WS=2439532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr11	2439621	rs2074236	A	T	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.227;HP=4;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.146;NF=6;NR=8;PP=290;ReadPosRankSum=-1.484;SC=AGCGGACCCCAGATTAGCCCG;SOR=1.112;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=28;TCF=13;TCR=15;TR=14;WE=2439629;WS=2439611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr11	2439651	rs886276	G	T	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.211;NF=10;NR=4;PP=258;ReadPosRankSum=-0.510;SC=GGATGCAGGTGTCAGGGGTGC;SOR=0.859;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=14;WE=2439659;WS=2439641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr11	2439672	rs147746598	T	TC	670.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.022;NF=13;NR=4;PP=551;ReadPosRankSum=-0.563;SC=CCCCATCCCTTCAGCCCTGTC;SOR=0.653;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=40;TCF=29;TCR=11;TR=17;WE=2439680;WS=2439662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,19:0.44:43
chr11	2439767	rs886277	T	C	1853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.081;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.529;NF=47;NR=34;PP=1175;ReadPosRankSum=0.926;SC=CTCCAAGGTGTTGGGATCACC;SOR=0.791;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=181;TCF=104;TCR=77;TR=81;WE=2439775;WS=2439757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,92:0.44:207
chr11	2439876	rs886278	G	A	1518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.160;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=36;PP=1013;ReadPosRankSum=0.075;SC=GTGACCACCCGGATCTCAGGC;SOR=0.794;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=161;TCF=83;TCR=78;TR=69;WE=2439884;WS=2439866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,76:0.41:184
chr11	2440041	rs4244810	T	C	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.53;ReadPosRankSum=-0.256;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr11	2441646	rs11607968	G	T	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=16;PP=329;ReadPosRankSum=0.275;SC=CTGCGCCCATGCAGGGAGACG;SOR=0.630;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=76;TCF=35;TCR=41;TR=31;WE=2441654;WS=2441636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,41:0.44:93
chr11	2441686	rs35998237	T	TG	1263.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=19;PP=904;SC=CAGCTTGGGCTGGTCCCGCTG;SOR=1.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=21;WE=2441694;WS=2441676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr11	2444094	rs2301699	C	G	1024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.723;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=18;PP=687;ReadPosRankSum=1.609;SC=GGAAATGGGGCCTCATGGGTT;SOR=0.616;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=97;TCF=65;TCR=32;TR=49;WE=2444102;WS=2444084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,51:0.46:110
chr11	2542605	rs10400376	TA	GG	6780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=79;NR=43;PP=2230;SC=CACTGTGTGTTATCCGGTGTC;SOR=1.240;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=127;TCF=80;TCR=47;TR=122;WE=2542614;WS=2542595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr11	2549329	rs145292450	TGG	T	1738.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=30;PP=1060;SC=CCCCATAAGGTGGGGGGCAGA;SOR=2.531;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=31;WE=2549338;WS=2549319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr11	2592373	rs73404679	T	G	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.806;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=57;ReadPosRankSum=-1.393;SC=GGACAGAGGTTGGGTCTCTCC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=5;WE=2592381;WS=2592371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr11	2593977	rs4930127	A	G	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=246;ReadPosRankSum=0.468;SC=GCGGCGTAGGACGCCCAGTGA;SOR=0.257;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=12;WE=2593985;WS=2593967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr11	2683357	rs760419	A	G	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=290;ReadPosRankSum=0.663;SC=AGGGGACTGGAGCTCAAGGAG;SOR=0.760;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=16;WE=2683365;WS=2683347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr11	2789856	rs163161	A	G	572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=5;PP=426;SC=CCACTCACAGATGAGGTGAAA;SOR=1.721;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=20;WE=2789864;WS=2789850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	2789955	rs163160	A	G	1153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.466;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=15;PP=769;ReadPosRankSum=-0.434;SC=ATGGAGTTGAACACTCTCCTT;SOR=0.861;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=119;TCF=82;TCR=37;TR=49;WE=2789963;WS=2789945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,54:0.41:132
chr11	2797320	rs163150	A	G	902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=25;PP=688;SC=GAGGGTGCCCAGGTCCTGCCC;SOR=2.985;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=30;WE=2797328;WS=2797310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
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chr11	2798448	rs163148	A	G	890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=21;PP=549;SC=TCCAAAGTACATTTTACAAAG;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=30;WE=2798456;WS=2798438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	2868878	rs3852520	T	C	827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.987;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=10;PP=469;ReadPosRankSum=-0.690;SC=GCATACAGCATGCACTTGCAG;SOR=0.495;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=75;TCF=55;TCR=20;TR=35;WE=2868886;WS=2868868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,37:0.46:81
chr11	2905204	rs34289096	G	GC	1551.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.265;NF=4;NR=29;PP=680;ReadPosRankSum=-0.605;SC=GGCCCTCCGCGCCCCCCCAGG;SOR=0.649;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=104;TCF=11;TCR=93;TR=33;WE=2905212;WS=2905194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,70:0.39:180
chr11	2909393	rs72850017	G	T	1771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.184;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=32;PP=1078;ReadPosRankSum=-1.972;SC=AGAAACAAAAGGAACAATATT;SOR=0.794;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=90;TCR=62;TR=78;WE=2909401;WS=2909383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,85:0.49:172
chr11	2920666	rs365605	C	T	1281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.873;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=23;PP=657;ReadPosRankSum=2.275;SC=TGAGAAGCCACCTCTCCCAAA;SOR=0.874;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=154;TCF=90;TCR=64;TR=59;WE=2920674;WS=2920656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,72:0.39:184
chr11	2920953	rs75027200	CA	C	1696.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.582;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.905;NF=4;NR=49;PP=712;ReadPosRankSum=-1.797;SC=CTGTTCATGACAAAAAAAAAG;SOR=1.188;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=122;TCF=11;TCR=111;TR=53;WE=2920961;WS=2920943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,87:0.46:188
chr11	2924610	rs1048047	G	A	2035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.555;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=34;PP=1216;ReadPosRankSum=0.240;SC=GACCAGGGCCGGTCCCCCGGC;SOR=0.620;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=171;TCF=107;TCR=64;TR=90;WE=2924618;WS=2924600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,98:0.53:185
chr11	2924850	rs34816459	T	TC	403.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=484;ReadPosRankSum=1.584;SC=CAGTTGGGACTCATGCCACGC;SOR=0.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=13;WE=2924858;WS=2924840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr11	2929552	rs429886	A	G	1064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.693;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=31;PP=672;ReadPosRankSum=-0.400;SC=GCGGGCCGGTATTTGGCAGGT;SOR=0.813;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=110;TCF=47;TCR=63;TR=53;WE=2929560;WS=2929542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,54:0.45:121
chr11	2929659	rs424663	G	A	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.507;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.16;ReadPosRankSum=1.097;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr11	2930395	rs10832891	G	C	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.872;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=13;PP=301;ReadPosRankSum=0.833;SC=GACCGCCTCCGTGAGGGTCCG;SOR=0.892;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=69;TCF=37;TCR=32;TR=27;WE=2930403;WS=2930385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,31:0.39:79
chr11	2930594	rs67769451	CG	C	562.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=12;PP=359;SC=CAGGTAGGGCCGGGGGGACTG;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=12;WE=2930602;WS=2930584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	2930656	rs2286660	T	G	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=3;PP=60;ReadPosRankSum=-1.532;SC=CCGGGACACCTCCAGGGAGGT;SOR=0.446;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=11;TCF=5;TCR=6;TR=6;WE=2930664;WS=2930646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr11	2937775	rs12363784	G	T	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-3.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.366;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=184;ReadPosRankSum=-0.609;SC=GCAACCAAAGGTGCAGGTTGG;SOR=0.238;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=16;WE=2937783;WS=2937765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,21:0.60:35
chr11	2939392	rs445679	G	A	4786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=71;NR=100;PP=2965;SC=GCCAGGGCCCGGCCCTTCCTC;SOR=1.147;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=171;TCF=71;TCR=100;TR=171;WE=2939400;WS=2939382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr11	2940492	rs450244	T	C	2852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=28;PP=1792;SC=GGCGCCAAGGTCGGGGTGTGG;SOR=1.413;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=61;TCR=28;TR=89;WE=2940500;WS=2940482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr11	2940707	rs61871184	G	C	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=286;ReadPosRankSum=-0.983;SC=TCTGAGAGTAGAGGCTCCTCC;SOR=0.608;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=38;TCF=11;TCR=27;TR=19;WE=2940715;WS=2940697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,21:0.52:40
chr11	2950558	rs13390	A	G	1655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.611;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=34;PP=977;ReadPosRankSum=1.367;SC=CGCTTCTCCAACTCGCCCTCG;SOR=0.624;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=131;TCF=66;TCR=65;TR=70;WE=2950566;WS=2950548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,78:0.53:146
chr11	2950683	.	TGCCCCTCCCCGCCCC	T	182.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=-0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=22.84;ReadPosRankSum=-1.068;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr11	2979798	rs7940694	G	T	2123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=49;PP=1276;ReadPosRankSum=0.785;SC=ACAGCTGTCAGGAACACACAA;SOR=0.723;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=211;TCF=99;TCR=112;TR=95;WE=2979806;WS=2979788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,106:0.46:232
chr11	2990985	rs61871241	G	A	710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.970;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=11;PP=430;ReadPosRankSum=-0.370;SC=GATAAGTAATGTTAGAAGACT;SOR=1.103;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=80;TCF=53;TCR=27;TR=35;WE=2990993;WS=2990975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,37:0.42:88
chr11	3026692	rs4758458	T	G	1443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=25;PP=534;ReadPosRankSum=1.287;SC=GTGAGAAGAGTCTGGGCTCTG;SOR=0.620;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=38;TCR=60;TR=41;WE=3026700;WS=3026682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,45:0.42:106
chr11	3026712	rs7931504	C	T	1248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.017;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=22;PP=484;ReadPosRankSum=1.352;SC=GTGGGCCGTCCCCACTGCGGG;SOR=0.988;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=69;TCF=23;TCR=46;TR=31;WE=3026720;WS=3026702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,34:0.45:76
chr11	3028270	rs7950766	A	G	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=176;ReadPosRankSum=0.000;SC=GTGCTGGGGAAGGAGGGGCCG;SOR=0.512;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=9;WE=3028278;WS=3028260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr11	3036933	rs2071104	G	T	562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.947;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=2;PP=366;ReadPosRankSum=1.022;SC=ACAGAGGAGGGGCAGTTCAGA;SOR=1.969;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=63;TCF=48;TCR=15;TR=24;WE=3036941;WS=3036923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,27:0.39:69
chr11	3048140	rs494427	A	G	1044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.168;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=31;PP=726;ReadPosRankSum=0.495;SC=TCTGTGGCCTATCTACTCTCT;SOR=1.135;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=83;TCF=25;TCR=58;TR=43;WE=3048148;WS=3048130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,45:0.53:85
chr11	3050210	rs434114	A	G	800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.148;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=13;PP=501;ReadPosRankSum=0.006;SC=TCCCTAGGGAAGGCCCTTGTG;SOR=0.422;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=67;TCF=45;TCR=22;TR=36;WE=3050229;WS=3050200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,38:0.55:69
chr11	3061780	rs399565	C	T	1191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.663;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=19;PP=689;ReadPosRankSum=0.091;SC=CTGAGTGTCACGGGAACTCAG;SOR=0.812;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=114;TCF=71;TCR=43;TR=53;WE=3061788;WS=3061770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,60:0.46:130
chr11	3061949	rs2285390	C	A	2644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=56;PP=1686;SC=TTACTTATGGCATTAAAATTT;SOR=1.880;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=26;TCR=56;TR=82;WE=3061957;WS=3061939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr11	3061992	rs369461	T	C	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.027;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=7;PP=144;ReadPosRankSum=-0.960;SC=AATTCAGTCTTGATTCCTCAA;SOR=0.068;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=12;WE=3062000;WS=3061982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr11	3076018	rs7934892	T	C	484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=14;NR=0;PP=377;SC=GAGCAGTGCCTGGCACAGACT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=3076026;WS=3076008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	3076257	rs7945933	C	T	3555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=54;NR=64;PP=2086;SC=CCTTCAAGACCGCAAAGGAAA;SOR=1.000;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=119;TCF=54;TCR=65;TR=118;WE=3076265;WS=3076247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr11	3076285	rs406598	G	A	912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.784;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=24;PP=564;ReadPosRankSum=-0.443;SC=CACCCAGTGAGATCAGGAAAG;SOR=0.564;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=85;TCF=33;TCR=52;TR=40;WE=3076293;WS=3076275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,45:0.45:100
chr11	3109279	rs11553374	G	A	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.938;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.98;ReadPosRankSum=-0.494;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr11	3109284	rs3217567	G	GC	172.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.80;ReadPosRankSum=-0.327;SOR=0.883;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr11	3109403	rs2289999	A	G	4757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.88;SOR=1.300;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr11	3109408	rs2289998	C	T	4871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.50;SOR=1.315;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr11	3109426	rs10160757	T	C	3416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=32;PP=1833;SC=AGCTCTGCCCTCAGGGCTCCT;SOR=1.071;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=100;TCF=68;TCR=32;TR=99;WE=3109434;WS=3109416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr11	3110956	rs895564	C	T	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=5;PP=120;ReadPosRankSum=1.470;SC=CTTGTGGGTTCCAGCTCCGAT;SOR=0.141;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=17;TCF=11;TCR=6;TR=11;WE=3110964;WS=3110946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr11	3110976	rs895563	A	G	575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=7;PP=354;SC=TGACAACCCCAGCCGCGGCCT;SOR=1.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=14;TCR=7;TR=21;WE=3110984;WS=3110966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr11	3114080	.	GCTTTGTCGGCA	G	937.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.755;ClippingRankSum=0.000;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=2935;ReadPosRankSum=0.663;SC=GGCCCCCAGGGCTTTGTCGGC;SOR=0.711;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=51;TCF=16;TCR=35;TR=16;WE=3114098;WS=3114070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,27:0.34:80
chr11	3114307	rs12362578	G	C	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=27;ReadPosRankSum=-0.833;SC=CCCATCCTGAGCCAGTGGCCC;SOR=0.048;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=4;WE=3114315;WS=3114297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr11	3114670	rs75015961	G	C	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.239;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=162;ReadPosRankSum=-1.683;SC=CTGGGGCCATGCTCACAGCAC;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=8;WE=3114678;WS=3114662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr11	3115100	rs113189224	C	T	1271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.635;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=35;PP=830;ReadPosRankSum=-0.269;SC=GCCCAGTGAGCGGGGGCTGGG;SOR=1.217;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=114;TCF=49;TCR=65;TR=55;WE=3115108;WS=3115090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,60:0.48:126
chr11	3115354	rs9795009	T	C	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=274;ReadPosRankSum=1.185;SC=CTGCTCCCCTTATGTGCACTG;SOR=0.551;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=17;WE=3115362;WS=3115344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr11	3122817	rs7106225	A	G	1665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.277;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=25;PP=970;ReadPosRankSum=-2.566;SC=GGGAGCGCCCAGGGTGACCCC;SOR=0.994;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=163;TCF=102;TCR=61;TR=78;WE=3122825;WS=3122807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,88:0.48:183
chr11	3123001	rs7121251	C	T	1693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.299;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=33;PP=812;ReadPosRankSum=0.808;SC=GCCCAGCTTCCCCCAAAAAAC;SOR=0.461;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=158;TCF=73;TCR=85;TR=70;WE=3123009;WS=3122991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,85:0.47:179
chr11	3123047	rs67090912	A	G	1049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.938;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=24;PP=581;ReadPosRankSum=0.625;SC=TTCTCCCCCGATCCCAGGATT;SOR=0.354;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=94;TCF=37;TCR=57;TR=44;WE=3123055;WS=3123037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,53:0.50:105
chr11	3123381	rs58467529	A	G	1148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=306;ReadPosRankSum=1.236;SC=AGAGCCCAGCACCCAGGCCGG;SOR=0.563;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=39;TCR=17;TR=26;WE=3123389;WS=3123371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,29:0.48:61
chr11	3123399	rs58090999	A	G	1498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=16;PP=590;ReadPosRankSum=-0.443;SC=CGGTTGCAGCAGAGGTGCTCT;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=63;TCR=32;TR=47;WE=3123407;WS=3123389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,50:0.50:100
chr11	3123540	rs56062540	G	A	2619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.008;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=54;PP=1263;ReadPosRankSum=1.479;SC=TGTGTGAGGAGCCAGGTGGGT;SOR=0.785;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=200;TCF=97;TCR=103;TR=106;WE=3123548;WS=3123530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,127:0.54:235
chr11	3128774	rs3741353	T	C	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.444;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=242;ReadPosRankSum=-0.330;SC=TGCTCCGCACTTCACATACGT;SOR=0.247;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=54;TCF=9;TCR=45;TR=15;WE=3128782;WS=3128764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,17:0.29:59
chr11	3128915	rs3741351	TG	CA	960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.316;HP=3;HapScore=2;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=634;ReadPosRankSum=-0.961;SC=ACCAGAGCAGTGGCTGGGGCT;SOR=1.059;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=51;TCF=37;TCR=14;TR=21;WE=3128924;WS=3128905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,26:0.46:57
chr11	3129027	rs3741350	G	A	1297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.351;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=27;PP=666;ReadPosRankSum=-0.926;SC=CTGGGTGGACGGTGGCTGAGG;SOR=0.822;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=122;TCF=64;TCR=58;TR=58;WE=3129035;WS=3129017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,65:0.49:134
chr11	3129200	rs113370820	GCCCCAC	G	205.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=180;ReadPosRankSum=0.317;SC=GGATGAGCATGCCCCACCCCC;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=5;WE=3129213;WS=3129190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr11	3140627	rs11025457	C	T	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.695;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=290;ReadPosRankSum=-0.055;SC=GGCCTGACTCCGAGCCGGGCT;SOR=0.239;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=16;WE=3140635;WS=3140617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,16:0.80:20
chr11	3141530	rs34752531	C	G	1262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.43;ReadPosRankSum=-0.477;SOR=0.813;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,31:0.48:65
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chr11	3141744	rs34950527	C	T	2705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.484;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=60;PP=1515;ReadPosRankSum=0.133;SC=CGCAGCAGTGCAGCAGCACCG;SOR=0.658;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=205;TCF=101;TCR=104;TR=118;WE=3141752;WS=3141734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,127:0.56:228
chr11	3143030	rs6578322	T	C	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.063;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=129;ReadPosRankSum=0.207;SC=TTCCTACCACTGGTGTCCTTA;SOR=0.368;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=8;WE=3143038;WS=3143028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr11	3147589	rs11603057	C	G	1460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.548;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=18;PP=942;ReadPosRankSum=0.457;SC=TTCCCCCGAACAGGCTGGAAT;SOR=0.532;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=114;TCF=80;TCR=34;TR=62;WE=3147597;WS=3147579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,66:0.53:124
chr11	3150391	rs2277300	C	T	445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=3.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.69;ReadPosRankSum=1.251;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,25:0.43:58
chr11	3150482	rs11025526	A	G	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=98;ReadPosRankSum=-0.639;SC=GCCCCTGGCTAAGAAGTCCCC;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=6;WE=3150490;WS=3150472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr11	3187772	rs72848215	A	G	1724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.773;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=27;PP=1088;ReadPosRankSum=0.492;SC=GATCACAGGAACCCACGGCTT;SOR=0.863;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=187;TCF=114;TCR=73;TR=77;WE=3187780;WS=3187762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,86:0.43:201
chr11	3240107	rs61870496	A	C	689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-4.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.661;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=23;PP=356;ReadPosRankSum=0.550;SC=GGTCCTCAGGAGTCTTTTGTG;SOR=0.330;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=77;TCF=22;TCR=55;TR=35;WE=3240115;WS=3240097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,39:0.45:86
chr11	3242833	rs7929163	G	C	1738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=12;PP=1264;SC=TGATAAGAGAGTTTTTCCTTC;SOR=2.683;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=45;TCR=12;TR=57;WE=3242841;WS=3242823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr11	3242907	rs11602794	G	A	1917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.449;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=37;PP=1199;ReadPosRankSum=-0.437;SC=CCAGAAATTCGGTCGTAAAGA;SOR=0.878;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=181;TCF=98;TCR=83;TR=83;WE=3242915;WS=3242897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,94:0.48:196
chr11	3242933	rs10833491	C	T	7216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NR=112;PP=2965;SC=TTTCTCTTCACGTTTCTCAAA;SOR=0.810;Source=Platypus;TCR=113;WE=3242941;WS=3242923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,269:1.00:269
chr11	3243346	rs11026004	C	T	2160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=34;PP=1010;SC=CTGGGTCCCTCCTGGCTGCCT;SOR=1.316;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=22;TCR=34;TR=56;WE=3243354;WS=3243336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr11	3243367	rs12280457	G	T	1444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=25;PP=667;SC=CACCATCAGGGGCGGGATGAG;SOR=2.235;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=33;WE=3243375;WS=3243357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	3243427	rs12275900	T	C	363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=11;PP=305;SC=TGATCCCTCGTACATCCTCGA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=3243435;WS=3243417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	3249829	rs11026040	G	A	2451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=59;PP=1547;ReadPosRankSum=1.441;SC=TGAGATCCGCGCAGGCCACGT;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=282;TCF=144;TCR=138;TR=119;WE=3249837;WS=3249819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,124:0.41:302
chr11	3361087	rs2073805	T	C	6370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=109;PP=2965;SC=TTGAAACATATTAATATGAGG;SOR=0.879;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=208;TCF=99;TCR=109;TR=208;WE=3361095;WS=3361077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr11	3381369	rs62619253	G	C	1046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.708;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=29;PP=482;ReadPosRankSum=0.477;SC=AATGTTCTCAGGTTCAGTAAA;SOR=0.804;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=102;TCF=42;TCR=60;TR=46;WE=3381377;WS=3381359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,54:0.46:117
chr11	3381843	rs2157763	A	G	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.694;HP=1;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;ReadPosRankSum=-1.214;SC=ACAGATGAATACACTTTATGA;SOR=0.124;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=25;TCF=14;TCR=11;TR=8;WE=3381851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr11	3382069	rs6578335	C	G	3380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=67;PP=2117;SC=CCCACTGCAGCCCCCGCTCCT;SOR=1.355;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=109;TCF=42;TCR=67;TR=109;WE=3382077;WS=3382059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr11	3382215	rs6578336	T	C	169.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=5;PP=115;SC=TTCTGCCCCCTGTGACACGGA;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=3382223;WS=3382205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr11	3383962	rs10734319	T	C	1127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=24;PP=694;SC=CTAAAGTACATCTTTTCATTT;SOR=1.556;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=13;TCR=24;TR=37;WE=3383970;WS=3383952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr11	3388118	rs11026762	A	G	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=50;ReadPosRankSum=-2.985;SC=AACATGGCAAAACCCTGTCTC;SOR=1.022;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=21;TCF=12;TCR=9;TR=8;WE=3388126;WS=3388108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr11	3389840	.	A	T	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.761;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.914;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=112;ReadPosRankSum=-0.154;SC=GACTTGGCATAGCCAAAGCAA;SOR=0.050;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=9;WE=3389848;WS=3389830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
chr11	3390006	rs7943767	T	C	1836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.786;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=47;PP=1027;ReadPosRankSum=-0.289;SC=ATTAAACTCATGCATATCCAC;SOR=0.860;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=175;TCF=83;TCR=92;TR=87;WE=3390014;WS=3389996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,93:0.49:191
chr11	3390173	rs1989786	A	T	703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.200;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=20;PP=422;ReadPosRankSum=-1.147;SC=AATCAAGCCTAAAATGTAAAA;SOR=0.154;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=39;TCF=12;TCR=27;TR=31;WE=3390181;WS=3390163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,32:0.78:41
chr11	3390547	rs7925972	G	C	518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=14;NR=2;PP=436;SC=AAACCAGGGTGGGGGGGCGTT;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=3390555;WS=3390537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	3390911	rs4758575	G	C	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=2.697;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=179;ReadPosRankSum=-0.708;SC=GGAATCTGTCGTGGCTGAACT;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=9;WE=3390919;WS=3390901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr11	3392351	rs2269735	T	C	3546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.77;ReadPosRankSum=-0.012;SOR=0.550;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,95:0.50:189
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chr11	3392972	rs2269732	G	A	3704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=367;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.334;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=87;PP=2396;ReadPosRankSum=-1.653;SC=TACTTGATTCGAGGTGAAATG;SOR=0.867;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=330;TCF=158;TCR=172;TR=162;WE=3392980;WS=3392962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:190,176:0.48:366
chr11	3394894	rs10833820	G	A	1821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.277;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=49;PP=1125;ReadPosRankSum=0.529;SC=CACCTGCATCGTGAGAATATG;SOR=0.552;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=156;TCF=53;TCR=103;TR=77;WE=3394902;WS=3394884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,85:0.49:173
chr11	3394960	rs10833821	A	G	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.649;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=13;PP=260;ReadPosRankSum=-0.683;SC=CCATCAACAGAAAGACCAAGA;SOR=0.334;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=47;TCF=15;TCR=32;TR=21;WE=3394968;WS=3394950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,24:0.44:54
chr11	3398760	rs7932709	G	T	2731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=61;NR=26;PP=1628;SC=CCTCTGACAGGGGCATGTGAT;SOR=1.634;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=61;TCR=26;TR=87;WE=3398768;WS=3398750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr11	3398795	rs7932797	G	A	3879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=82;NR=47;PP=2363;SC=TGTGTCTCCAGGGATTGAAAG;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=129;TCF=82;TCR=47;TR=129;WE=3398803;WS=3398785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr11	3400237	rs2301567	G	T	1166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.640;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=25;PP=723;ReadPosRankSum=-0.199;SC=GCCCCTCCCTGTCTCTCAGGA;SOR=0.598;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=133;TCF=78;TCR=55;TR=59;WE=3400245;WS=3400227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,62:0.45:137
chr11	3400334	rs7931660	A	G	3394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=60;PP=1983;SC=GGGTCACACGACCTACGGCTA;SOR=1.016;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=50;TCR=60;TR=110;WE=3400342;WS=3400324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr11	3400422	rs6578342	C	T	526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=15;PP=434;SC=GGAAGCCGTCCTCTCCTCTCC;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=3400430;WS=3400412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	3661140	rs4910876	T	C	6241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=111;NR=97;PP=2965;SC=GGACAGAGTCTCCCAGCCTCT;SOR=0.719;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=210;TCF=113;TCR=97;TR=208;WE=3661148;WS=3661130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr11	3661585	rs3062849	A	ATGG	6799.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.04;MQRankSum=0.133;NF=17;NR=91;PP=2957;ReadPosRankSum=-0.931;SC=CAGGGGCAGGATGGGAACAGC;SOR=0.965;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=117;TCF=18;TCR=99;TR=108;WE=3661594;WS=3661575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,255:0.99:257
chr11	3662892	rs72844325	G	T	1542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.042;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=32;PP=916;ReadPosRankSum=0.912;SC=AGAGATGGAGGTTCCTGAGAG;SOR=0.435;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=125;TCF=73;TCR=52;TR=70;WE=3662900;WS=3662882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,77:0.55:139
chr11	3663011	rs932097	G	A	2039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=45;PP=1312;ReadPosRankSum=0.364;SC=CCCCCTTGGGGCTAGGAGATG;SOR=0.654;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=149;TCF=77;TCR=72;TR=93;WE=3663019;WS=3663001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,95:0.60:159
chr11	3663170	rs7111519	G	C	492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=5;NR=13;PP=348;SC=TCGAGGGGCTGGAGGCAGATC;SOR=1.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=18;WE=3663178;WS=3663160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	3663201	rs7128137	A	G	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.136;HP=2;HapScore=2;MGOF=50;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=99;ReadPosRankSum=0.480;SC=CTCCAGGCGCACGGGATCCCG;SOR=0.136;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=7;WE=3663209;WS=3663191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr11	3714311	rs694102	T	A	368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=1;PP=309;SC=TCATGATATTTAATAAAATAA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=3714319;WS=3714310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	3714489	rs1875	C	T	4299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=56;PP=2576;SC=ACATGCTGAGCGCCCTAGAAA;SOR=0.994;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=143;TCF=87;TCR=56;TR=143;WE=3714497;WS=3714479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr11	3740588	rs612785	G	T	1210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=11;PP=778;SC=TATGTTTACAGAAAAAAAAAT;SOR=1.880;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=45;TCF=33;TCR=12;TR=43;WE=3740596;WS=3740578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr11	3746465	rs276901	C	G	2469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=39;PP=1394;SC=AACAAGAAACCAAAAGAAGAA;SOR=0.878;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=44;TCR=39;TR=83;WE=3746473;WS=3746455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr11	3789982	rs146552084	GAAAAAGAAAAA	G	1316.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=14;PP=2983;SC=TACCTTTTAGGAAAAAGAAAA;SOR=1.536;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=14;WE=3790000;WS=3789972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr11	3799985	rs188044	G	A	918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=8;PP=665;SC=CTCTTCCCTTGTTTTTGCCAT;SOR=2.235;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=32;WE=3799993;WS=3799975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	3829419	rs2278845	G	C	1097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=27;NR=9;PP=692;SC=TTTCAGAAGGGCGAGGCTGGA;SOR=1.923;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=36;WE=3829427;WS=3829409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	3838910	rs7946577	G	C	2828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=44;NR=48;PP=1740;SC=GTCAGAGTCAGAGATAATTCA;SOR=0.952;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=44;TCR=48;TR=92;WE=3838918;WS=3838900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr11	3838953	rs10835147	T	C	1439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=31;PP=1010;SC=AGAATCACAGTCCTCCCTGAG;SOR=1.118;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=54;TCF=22;TCR=32;TR=53;WE=3838961;WS=3838943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr11	3839292	rs1975669	T	A	57.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.09;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr11	4045360	rs10835508	A	T	457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=13;PP=319;SC=AGTCACTAAAAAAGACTGAAT;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=17;WE=4045368;WS=4045350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	4104060	rs2898950	A	C	1707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=16;PP=1214;SC=TTTCTCATTTATTCCATTCTC;SOR=1.903;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=41;TCR=16;TR=57;WE=4104068;WS=4104050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr11	4104087	rs10767828	T	C	2483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=28;PP=1459;SC=CTGCTCTTTTTGAGCTGGGGG;SOR=1.434;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=82;TCF=53;TCR=29;TR=80;WE=4104095;WS=4104077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr11	4104355	rs894455	T	C	1505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=35;PP=1091;SC=ATTTATCTCCTGCCTTGCTCT;SOR=1.445;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=18;TCR=35;TR=53;WE=4104363;WS=4104345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr11	4104745	rs2289570	C	G	3962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=70;PP=2372;SC=GACCTCTTTGCGGGGATGAAG;SOR=0.952;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=129;TCF=59;TCR=70;TR=129;WE=4104753;WS=4104735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr11	4109709	rs10835604	A	T	376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=225;SC=CAGCAGAGCCACTCATATCCA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=4109717;WS=4109702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	4116335	rs12801088	A	C	629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=14;PP=381;SC=TGATGCCCAGACCGCCCGCCC;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=7;TCR=14;TR=21;WE=4116343;WS=4116325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	4123345	rs1348310	C	G	3221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=53;PP=1858;SC=TGGGTTCCTTCTTTCATGTGT;SOR=0.853;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=53;TCR=53;TR=106;WE=4123353;WS=4123335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr11	4123427	rs232054	C	G	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=277;ReadPosRankSum=-0.152;SC=CTATGCCCTTCGATATAAAAT;SOR=0.787;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=64;TCF=22;TCR=42;TR=23;WE=4123435;WS=4123417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,28:0.38:73
chr11	4128845	rs725518	G	A	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.552;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=10;PP=180;ReadPosRankSum=-0.350;SC=TTTAAACACTGCAAAAGATAC;SOR=0.275;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=28;TCF=9;TCR=19;TR=17;WE=4128853;WS=4128835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,21:0.66:32
chr11	4133317	rs56336381	C	A	4138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=71;PP=2305;SC=TAGGGAAATACGCCTTGACCT;SOR=1.218;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=123;TCF=52;TCR=71;TR=123;WE=4133325;WS=4133307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr11	4141132	rs183484	C	A	2149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.149;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=41;PP=1286;ReadPosRankSum=-0.882;SC=CAACACAGCTCGATATGTGGA;SOR=0.685;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=167;TCF=95;TCR=72;TR=96;WE=4141140;WS=4141122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,105:0.56:186
chr11	4153767	rs10835662	A	G	1819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=44;PP=1297;SC=AACTTTGATAAAGACAGTCAT;SOR=3.729;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=7;TCR=44;TR=51;WE=4153775;WS=4153757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr11	4159457	rs9937	A	G	1206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=0.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.68;ReadPosRankSum=-0.991;SOR=0.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,59:0.52:113
chr11	4159466	rs1042858	G	A	4426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=34.58;ReadPosRankSum=0.681;SOR=0.415;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,127:0.99:128
chr11	4159764	rs1042919	A	T	479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=17;PP=479;SC=GTTAATGATGATAATGATTTT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=4159778;WS=4159754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	4159770	rs866902	AT	A	169.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.9995;FS=0.000;HP=10;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;NF=0;NR=9;PP=101;SC=GATGATAATGATTTTTTTTTT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=9;WE=4159778;WS=4159754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	4185463	rs979941	T	C	739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.525;HP=1;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=7;PP=1301;ReadPosRankSum=0.915;SC=TGCTCAGCACTAGGGCAGATG;SOR=1.247;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=88;TCF=63;TCR=25;TR=32;WE=4185489;WS=4185453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,34:0.37:93
chr11	4185467	rs142322348	G	T	1427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.837;HP=2;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=21;PP=1881;ReadPosRankSum=-0.239;SC=CAGCACTAGGGCAGATGGGCT;SOR=0.446;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=96;TCF=65;TCR=31;TR=61;WE=4185489;WS=4185453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,64:0.63:102
chr11	4185595	rs979942	T	G	2263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.310;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=51;PP=1501;ReadPosRankSum=0.295;SC=TCTGTAGAGGTCACCTTGCTC;SOR=0.542;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=202;TCF=99;TCR=103;TR=102;WE=4185603;WS=4185585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,109:0.50:217
chr11	4388905	rs11031960	C	T	2581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=56;PP=1549;ReadPosRankSum=-0.839;SC=AGACCACCGTCGACATTAGAA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=220;TCF=106;TCR=114;TR=108;WE=4388913;WS=4388895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,121:0.50:242
chr11	4389587	rs7929171	G	C	527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.029;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=213;ReadPosRankSum=0.139;SC=GATAAAATCTGCAACATTCTT;SOR=0.862;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=46;TCF=18;TCR=28;TR=18;WE=4389595;WS=4389577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,26:0.46:57
chr11	4389639	rs4910623	G	A	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.278;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=106;ReadPosRankSum=-0.200;SC=CATAATCTTCGTCTTCTTTGA;SOR=3.426;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=7;WE=4389647;WS=4389629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr11	4406479	rs4144331	G	T	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.356;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=83;ReadPosRankSum=1.098;SC=GAGAAGCGGTGCCAATGGGGA;SOR=0.976;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=6;WE=4406487;WS=4406469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr11	4409386	rs2554933	C	T	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-3.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=113;ReadPosRankSum=-0.350;SC=GTCTTGAACGCGAACCTTTCA;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=7;WE=4409394;WS=4409379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr11	4409511	rs12805578	A	G	1416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=22;PP=935;ReadPosRankSum=2.479;SC=TTGTAGAAGGAAACCCCTCCC;SOR=0.736;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=75;TCR=44;TR=60;WE=4409519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,64:0.52:124
chr11	4411002	rs926100	C	A	1078.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=33;PP=738;ReadPosRankSum=1.581;SC=ACAGCTTATTCGTCCCCCATG;SOR=0.671;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=102;TCF=33;TCR=69;TR=48;WE=4411010;WS=4410992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,50:0.47:107
chr11	4496613	rs9633905	C	A	2102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=53;PP=1422;ReadPosRankSum=0.175;SC=GCTGTGGGAACACTAGCTTCA;SOR=0.708;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=159;TCF=60;TCR=99;TR=85;WE=4496621;WS=4496603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,91:0.53:173
chr11	4510285	rs96489	A	G	1876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.174;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=34;PP=1169;ReadPosRankSum=0.614;SC=TTCATTATCCAGGCTGATGCA;SOR=0.747;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=153;TCF=81;TCR=72;TR=77;WE=4510293;WS=4510275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,88:0.50:176
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chr11	4562831	rs2657172	A	G	853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.59;ReadPosRankSum=0.653;SOR=0.538;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,42:0.47:89
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chr11	4562970	rs67163911	A	ATTT	1688.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.829;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.171;NF=2;NR=16;PP=742;ReadPosRankSum=0.308;SC=TGTTCTTTAAATTTTATTTTA;SOR=0.536;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=47;TCF=6;TCR=41;TR=18;WE=4562978;WS=4562960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,45:0.53:85
chr11	4566377	rs2657168	C	T	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=316;ReadPosRankSum=0.159;SC=AAACATCCTGCTGCGTTTAGT;SOR=0.723;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=49;TCF=33;TCR=16;TR=22;WE=4566385;WS=4566367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,24:0.43:56
chr11	4566711	rs2709182	C	T	1863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.244;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=49;PP=1154;ReadPosRankSum=1.445;SC=TTGGCCTGGACGCCTGCTTGG;SOR=1.031;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=172;TCF=78;TCR=94;TR=83;WE=4566719;WS=4566701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,90:0.48:187
chr11	4567335	rs2657167	C	G	1049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.246;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=29;PP=730;ReadPosRankSum=0.037;SC=TCCGAGAGAGCCTTCTCCAAA;SOR=1.125;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=123;TCF=61;TCR=62;TR=50;WE=4567343;WS=4567325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,54:0.39:139
chr11	4592706	rs141600462	T	TAC	10723.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=71;PP=2957;SC=ACACGATCCATACAGTTTTTC;SOR=0.880;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=38;TCR=77;TR=106;WE=4592714;WS=4592696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr11	4593334	rs34520159	T	A	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.598;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=26;ReadPosRankSum=1.960;SC=GGTAAGACATTCCCCATAGAT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=3;WE=4593342;WS=4593324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr11	4593411	rs34097396	G	A	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=6;PP=414;ReadPosRankSum=-0.457;SC=GAAAGAAAGCGTGATAAGATC;SOR=0.582;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=49;TCR=12;TR=30;WE=4593419;WS=4593401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,34:0.51:67
chr11	4594471	rs12793041	G	A	1040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=18;PP=556;ReadPosRankSum=-0.496;SC=AGGTTGGGTAGTACTTCCTTA;SOR=0.670;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=99;TCF=60;TCR=39;TR=47;WE=4594479;WS=4594461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,52:0.49:107
chr11	4594545	rs12795289	A	G	1047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.162;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=25;PP=653;ReadPosRankSum=1.778;SC=CAGTACCCTAAAGCAAGGTCT;SOR=0.932;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=124;TCF=67;TCR=57;TR=49;WE=4594553;WS=4594535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,53:0.38:138
chr11	4594739	rs919519	C	T	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.468;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=214;ReadPosRankSum=-0.069;SC=GCACAGGAGTCTTTTTTACCC;SOR=2.152;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=13;WE=4594747;WS=4594729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr11	4608542	rs1847632	C	T	2763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-0.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.625;NF=68;NR=56;PP=1751;ReadPosRankSum=-1.616;SC=AGAATTCTCACGCCTCAAGTG;SOR=0.721;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=271;TCF=149;TCR=122;TR=124;WE=4608550;WS=4608532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,133:0.46:288
chr11	4615234	rs4910511	A	G	3913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=458;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=98;PP=2447;ReadPosRankSum=2.484;SC=CTCTTACATCATCTATACATT;SOR=0.656;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=423;TCF=195;TCR=228;TR=185;WE=4615242;WS=4615224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:259,199:0.43:458
chr11	4615390	rs2010722	C	T	2160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.67;QD=30.87;SOR=1.819;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr11	4615508	rs2010719	C	G	1926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=-2.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.352;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-14.197;NF=73;NR=60;PP=1707;ReadPosRankSum=1.168;SC=TGGCCTCCTCCGTGGTACCCA;SOR=0.904;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=284;TCF=149;TCR=135;TR=133;WE=4615516;WS=4615498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,110:0.39:279
chr11	4621485	rs2231978	C	G	501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=6;PP=324;SC=CCAAGCCTCTCTGGTTAGGGT;SOR=1.493;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=11;TCR=6;TR=17;WE=4621493;WS=4621475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	4622159	rs2231972	T	C	2240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=32;PP=1464;SC=GATGAAGGGGTGAGGCTGGAT;SOR=0.887;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=40;TCR=32;TR=72;WE=4622167;WS=4622149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr11	4623106	rs999818	T	C	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=173;ReadPosRankSum=1.345;SC=AACTGGCCAATTTCAGGCTCC;SOR=0.446;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=12;WE=4623114;WS=4623096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr11	4623788	rs931811	T	C	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=99;ReadPosRankSum=0.792;SC=CTATTTTTCCTAGCTTCCTGT;SOR=0.527;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=5;WE=4623796;WS=4623778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr11	4624394	rs7943486	T	C	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.318;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=137;ReadPosRankSum=-0.139;SC=TGCCTCACAGTGATGAGAATG;SOR=1.302;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=40;TCF=32;TCR=8;TR=12;WE=4624402;WS=4624384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,13:0.31:42
chr11	4624432	rs17314159	C	A	821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.667;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=10;PP=469;ReadPosRankSum=-0.151;SC=CAGGACCACACAGGACGACTG;SOR=1.126;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=97;TCF=62;TCR=35;TR=35;WE=4624440;WS=4624422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,42:0.37:113
chr11	4661243	rs61740347	T	C	2038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.526;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=43;PP=1381;ReadPosRankSum=-0.418;SC=CATGTACCTCTTCCTGGCCAT;SOR=0.658;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=179;TCF=96;TCR=83;TR=90;WE=4661251;WS=4661233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,95:0.49:194
chr11	4661568	rs61746547	A	G	3135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.716;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=59;PP=1739;ReadPosRankSum=-0.693;SC=TCCTACTGCCAAACACATACT;SOR=0.512;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=276;TCF=155;TCR=121;TR=129;WE=4661576;WS=4661558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,153:0.49:310
chr11	4661826	rs79020081	T	C	3064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.357;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=63;PP=2021;ReadPosRankSum=0.814;SC=GTACCCCTCATTGGGCTCTCG;SOR=0.611;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=276;TCF=139;TCR=137;TR=132;WE=4661834;WS=4661816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,144:0.47:305
chr11	4661863	rs117132486	C	T	2832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.912;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=65;PP=1770;ReadPosRankSum=0.667;SC=GTGGTCCCACCTCCCTCCTCC;SOR=0.850;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=243;TCF=121;TCR=122;TR=118;WE=4661871;WS=4661853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,131:0.50:262
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chr11	4703165	rs1123991	C	A	2523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.989;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=52;PP=1672;ReadPosRankSum=-1.329;SC=AGCGGTGTACCACTGAGAGGC;SOR=0.729;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=217;TCF=114;TCR=103;TR=111;WE=4703173;WS=4703155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,117:0.50:236
chr11	4703321	rs1123990	G	A	2996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.596;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=54;PP=1728;ReadPosRankSum=-1.063;SC=TTACGTCCACGCCCATGACCA;SOR=0.794;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=254;TCF=134;TCR=120;TR=122;WE=4703329;WS=4703311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,141:0.49:289
chr11	4703420	rs7939559	C	T	1571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.610;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=42;PP=988;ReadPosRankSum=0.701;SC=AATAGGAGTGCGAGAGGACAT;SOR=0.633;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=144;TCF=57;TCR=87;TR=71;WE=4703428;WS=4703410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,75:0.49:153
chr11	4703654	rs12575331	A	G	1404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.550;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=29;PP=936;ReadPosRankSum=0.299;SC=TCTGGGTAAGACAGGCCTCAA;SOR=0.639;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=175;TCF=102;TCR=73;TR=70;WE=4703662;WS=4703644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,73:0.39:187
chr11	4703762	rs12576387	G	T	1840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.559;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=40;PP=915;ReadPosRankSum=-0.616;SC=TGCAGAGAAAGAGGTACATCG;SOR=0.584;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=223;TCF=112;TCR=111;TR=84;WE=4703770;WS=4703752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,98:0.39:251
chr11	4711986	rs11033350	T	C	1486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.638;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=26;PP=873;ReadPosRankSum=1.415;SC=AATTCTACAATTTTATGTTTC;SOR=0.793;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=119;TCF=67;TCR=52;TR=63;WE=4711994;WS=4711976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,72:0.53:136
chr11	4712353	rs11033352	T	C	2884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.691;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=60;PP=1528;ReadPosRankSum=0.064;SC=TTGATTCTGGTGTCTGTGCAT;SOR=0.593;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=224;TCF=125;TCR=99;TR=120;WE=4712361;WS=4712343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,139:0.54:259
chr11	4730985	rs4619142	C	T	9479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=165;NR=148;PP=2965;SC=ACCCATGTATCATTTTCTCTC;SOR=0.740;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=313;TCF=165;TCR=148;TR=313;WE=4730993;WS=4730975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,350:1.00:350
chr11	4731180	rs4432013	G	A	8189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=136;NR=136;PP=2965;SC=CTTTATTGCCGTCTGTAACCC;SOR=0.767;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=272;TCF=136;TCR=136;TR=272;WE=4731188;WS=4731170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,307:1.00:307
chr11	4731468	rs4436535	G	A	6045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=104;NR=92;PP=2965;SC=TGTTCTGATCGTCCGCTCTGT;SOR=0.711;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=196;TCF=104;TCR=92;TR=196;WE=4731476;WS=4731458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr11	4731583	rs4471413	C	T	7197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=133;NR=101;PP=2965;SC=AGTTTGTCACCAGTGCACAGA;SOR=0.900;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=235;TCF=134;TCR=101;TR=234;WE=4731591;WS=4731573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,263:1.00:263
chr11	4791111	rs17324812	T	C	2327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=53;PP=1546;ReadPosRankSum=1.545;SC=AACAAGAAGGTTGGAAATTTA;SOR=0.686;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=207;TCF=95;TCR=112;TR=99;WE=4791119;WS=4791101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,109:0.49:223
chr11	4869906	rs7117260	A	C	1411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.678;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=31;PP=729;ReadPosRankSum=1.355;SC=GACCTGTGGGAGGCAGTAGGG;SOR=0.598;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=109;TCF=53;TCR=56;TR=63;WE=4869914;WS=4869896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,68:0.56:122
chr11	4870269	rs12417164	A	T	1929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.538;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=37;PP=1095;ReadPosRankSum=0.515;SC=CTGCAGGGCAATGATCCAGAG;SOR=0.758;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=168;TCF=91;TCR=77;TR=84;WE=4870277;WS=4870259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,93:0.50:185
chr11	4880767	rs191425614	T	C	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=146;ReadPosRankSum=-0.164;SC=TGATGCACCATAACTGTGGAA;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=9;WE=4880775;WS=4880763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr11	4880992	rs7947547	C	G	2824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=63;PP=1706;ReadPosRankSum=-0.391;SC=TAAATGCTCCCAAAATCTGTG;SOR=0.671;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=223;TCF=105;TCR=118;TR=120;WE=4881000;WS=4880982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,133:0.52:254
chr11	4928841	rs7108225	T	C	2180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.872;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=38;PP=1064;ReadPosRankSum=0.042;SC=CTTCCTACCATGTTGAGGGTC;SOR=0.474;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=193;TCF=116;TCR=77;TR=90;WE=4928849;WS=4928831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,106:0.49:216
chr11	4936608	rs12419598	C	G	3121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.056;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.97;MQRankSum=-0.937;NF=63;NR=65;PP=1999;ReadPosRankSum=-0.733;SC=TGGCTAATTTCTCGTGCTCCA;SOR=0.621;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=239;TCF=123;TCR=116;TR=128;WE=4936616;WS=4936598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,140:0.53:265
chr11	4945196	rs1378739	T	G	5706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=103;NR=84;PP=2965;SC=GACGGCCACGTAGCGGTCAAT;SOR=0.742;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=189;TCF=104;TCR=85;TR=187;WE=4945204;WS=4945186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr11	4964627	rs2595993	C	A	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.205;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=81;ReadPosRankSum=0.075;SC=TATCAGATTGCCCCTAGGTGC;SOR=0.255;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=8;WE=4964635;WS=4964617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr11	4964649	rs2595992	G	T	1098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=8;PP=787;SC=GTGTAGGTGAGCTCAAGGTAA;SOR=2.613;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=29;TCR=8;TR=37;WE=4964657;WS=4964639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	4964753	rs2605301	A	G	4422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=84;NR=66;PP=2412;SC=ATTTTGTGCTAGATAATTCTT;SOR=0.766;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=84;TCR=66;TR=150;WE=4964761;WS=4964743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr11	4964784	rs2605302	A	T	4685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=78;NR=78;PP=2516;SC=GCTATCCTGTACATTAAAGAA;SOR=0.837;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=156;TCF=78;TCR=78;TR=156;WE=4964792;WS=4964774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr11	4965239	rs2570581	G	T	2679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=37;PP=1527;SC=CTGCCTATCCGCACACTGGGA;SOR=0.714;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=45;TCR=37;TR=82;WE=4965247;WS=4965229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr11	4965301	rs2605303	G	T	2381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=36;PP=1468;SC=ACTACTGCTTGGTTGTACTAC;SOR=0.859;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=47;TCR=36;TR=83;WE=4965309;WS=4965291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr11	4965398	rs72858196	C	A	636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.830;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=18;PP=350;ReadPosRankSum=0.736;SC=ACAGTTCTTGCCCTGATCTGA;SOR=0.864;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=75;TCF=36;TCR=39;TR=32;WE=4965406;WS=4965388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,35:0.41:86
chr11	4967468	rs28698374	G	A	17226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=642;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=310;NR=265;PP=2965;SC=AATTGGGTTCGTCAGTGGAGG;SOR=0.825;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=575;TCF=310;TCR=265;TR=575;WE=4967476;WS=4967458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,642:1.00:642
chr11	4967651	rs76895759	A	G	385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FS=71.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.42;MQRankSum=-9.960;QD=1.68;ReadPosRankSum=-1.173;SOR=5.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:195,34:0.15:229
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chr11	4976145	rs56066301	C	G	432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.54;QD=27.05;SOR=5.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	4976291	rs55889636	G	A	5432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.55;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=129;NR=116;PP=2965;SC=CAGGGTGTAAGACACAGCAAT;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=245;TCF=129;TCR=116;TR=245;WE=4976299;WS=4976281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr11	4976447	rs77497717	C	G	5940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.49;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=115;NR=110;PP=2965;SC=TCTCAAGCTTCTTAAAGTGAA;SOR=1.102;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=228;TCF=115;TCR=113;TR=225;WE=4976455;WS=4976437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr11	4976768	rs112749434	C	T	2019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;BaseQRankSum=1.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.847;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=-0.952;NF=20;NR=40;PP=1461;ReadPosRankSum=-0.954;SC=GTACATGGGCCCATGCAAGGA;SOR=1.828;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=61;TCF=21;TCR=40;TR=60;WE=4976776;WS=4976758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,67:0.97:69
chr11	4976811	rs28482315	C	A	1390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.27;MQRankSum=-4.794;QD=30.23;ReadPosRankSum=-1.116;SOR=1.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,44:0.96:46
chr11	5013421	rs5789346	G	GT	359.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-2.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.178;HP=12;HapScore=3;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=64;PP=832;ReadPosRankSum=-1.698;SC=ATTTACTGTTGTTTTTTTTTT;SOR=0.361;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=81;TCF=3;TCR=78;TR=66;WE=5013431;WS=5013408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,31:0.28:112
chr11	5013423	rs60905583	T	TG	1174.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.635;HP=9;HapScore=3;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=64;PP=821;ReadPosRankSum=4.094;SC=TTACTGTTGTTTTTTTTTTCT;SOR=1.094;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=80;TCF=3;TCR=77;TR=66;WE=5013431;WS=5013408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,56:0.52:108
chr11	5020117	rs10837108	C	G	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.374;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=242;ReadPosRankSum=-0.637;SC=TTTTTGTCCTCATTCCATTAT;SOR=1.162;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=16;WE=5020125;WS=5020107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,17:0.41:41
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chr11	5020416	rs2445290	A	G	4308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=65;PP=2596;SC=TTTCCATCTTAGCAGTGAATG;SOR=0.786;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=139;TCF=74;TCR=65;TR=139;WE=5020424;WS=5020406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr11	5020509	rs11035066	C	T	1328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=22;PP=941;ReadPosRankSum=-0.330;SC=CAAGTGCTTGCTATGCTCAGC;SOR=0.732;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=78;TCR=46;TR=58;WE=5020517;WS=5020499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,60:0.44:135
chr11	5020799	rs10768448	C	T	3745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=397;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.363;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=92;PP=2386;ReadPosRankSum=-1.571;SC=GATGCCAGGACCAACAGTATT;SOR=0.670;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=373;TCF=176;TCR=197;TR=175;WE=5020807;WS=5020789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:210,186:0.47:396
chr11	5020832	rs10768450	C	T	2879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.425;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=71;PP=1796;ReadPosRankSum=0.036;SC=GTAGTCATTGCCACACTAGGT;SOR=0.647;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=274;TCF=121;TCR=153;TR=128;WE=5020840;WS=5020822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,140:0.47:298
chr11	5021055	rs61734126	C	G	1561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.565;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=35;PP=918;ReadPosRankSum=-0.214;SC=TGGCAGACATCTACCTTCTTC;SOR=0.772;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=154;TCF=79;TCR=75;TR=69;WE=5021063;WS=5021045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,78:0.45:172
chr11	5067984	rs2500016	A	G	1223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.047;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=16;PP=673;ReadPosRankSum=0.706;SC=GGCCCTTTCTACAACCTCTGT;SOR=0.670;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=101;TCF=53;TCR=48;TR=46;WE=5067992;WS=5067974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,55:0.47:117
chr11	5068137	rs2500017	G	A	1696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.188;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=35;PP=1039;ReadPosRankSum=0.849;SC=TTATGTGGCCGTCTGTGCTCC;SOR=0.600;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=160;TCF=90;TCR=70;TR=76;WE=5068145;WS=5068127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,81:0.47:171
chr11	5068177	rs2500018	A	T	1822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.983;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=37;PP=1127;ReadPosRankSum=-0.396;SC=TTGACATCCCAAGTGTTGGTG;SOR=0.896;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=204;TCF=111;TCR=93;TR=87;WE=5068185;WS=5068167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,95:0.42:227
chr11	5068661	rs2500019	A	G	2129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.572;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=54;PP=1342;ReadPosRankSum=-0.918;SC=AGATTCGAGAACGAGTGCTCT;SOR=0.908;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=168;TCF=71;TCR=97;TR=89;WE=5068669;WS=5068651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,98:0.51:192
chr11	5079946	rs2445332	C	T	1097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.226;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=30;PP=675;ReadPosRankSum=2.556;SC=ATATTTTCTTCACACATTTAT;SOR=0.951;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=115;TCF=55;TCR=60;TR=53;WE=5079954;WS=5079936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,57:0.43:134
chr11	5080068	rs2500052	G	A	1221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.589;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.812;NF=36;NR=15;PP=795;ReadPosRankSum=1.089;SC=CGGCCAAAGCGATGAGTCATA;SOR=0.984;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=108;TCF=72;TCR=36;TR=51;WE=5080076;WS=5080058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,54:0.48:113
chr11	5080234	rs2445333	T	C	3387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.881;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=76;PP=2437;ReadPosRankSum=0.290;SC=TGTCAAACACTAGATTACAAA;SOR=0.803;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=280;TCF=138;TCR=142;TR=144;WE=5080242;WS=5080224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,155:0.50:308
chr11	5141902	rs10837374	T	C	2178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=48;NR=25;PP=1270;SC=CTCTAATGTGTTTGGTCTTTA;SOR=1.151;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=48;TCR=25;TR=73;WE=5141910;WS=5141892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr11	5141980	rs4426129	A	G	3579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.69;SOR=0.854;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr11	5142270	rs10837375	T	G	9220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=143;NR=152;PP=2965;SC=GTAAGTGTGGTATATTAACTT;SOR=0.768;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=295;TCF=143;TCR=152;TR=295;WE=5142278;WS=5142260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,330:1.00:330
chr11	5152920	rs12289086	G	A	757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=440;ReadPosRankSum=1.357;SC=AGTCACTAACGATCAAGTTAC;SOR=0.541;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=45;TCF=33;TCR=12;TR=27;WE=5152928;WS=5152910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,32:0.60:53
chr11	5172786	rs10768611	A	G	7926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=138;NR=116;PP=2965;SC=ATATAAGGGGAGATGTGAGAC;SOR=0.780;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=255;TCF=139;TCR=116;TR=254;WE=5172803;WS=5172776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,286:1.00:286
chr11	5173229	rs147169118	C	T	1762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.171;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=33;PP=1142;ReadPosRankSum=-0.610;SC=GGCCACATAACGGTCCAGGGC;SOR=0.800;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=161;TCF=89;TCR=72;TR=76;WE=5173237;WS=5173219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,83:0.47:176
chr11	5199222	rs7924390	A	C	383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=0;PP=320;SC=TGAAACACTGAGTGAAGGATC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=5199230;WS=5199215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	5199340	rs113029548	A	AATGCCC	8365.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.51;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=48;PP=2906;SC=CCAATCTGGCAATGTGCTCAC;SOR=1.051;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=81;TCF=31;TCR=50;TR=76;WE=5199348;WS=5199330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr11	5199645	rs6578560	T	C	5982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=108;PP=2965;SC=GCCAGCACCTTAGGGGCTGCA;SOR=0.904;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=197;TCF=89;TCR=108;TR=197;WE=5199653;WS=5199635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr11	5199660	rs6578561	T	C	5095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=99;PP=2795;SC=GCTGCAGCAGTGGCGAGCAGG;SOR=1.033;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=175;TCF=75;TCR=100;TR=174;WE=5199668;WS=5199650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr11	5199675	rs6578562	C	T	4738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=87;PP=2893;SC=AGCAGGAAGTCGGCTGAGGCC;SOR=1.001;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=159;TCF=72;TCR=87;TR=159;WE=5199683;WS=5199665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr11	5199708	rs6578563	T	A	3834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=66;PP=2418;SC=AAGAGATACATGGGCTCATGG;SOR=1.066;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=121;TCF=55;TCR=66;TR=121;WE=5199716;WS=5199698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr11	5199817	rs5789371	GC	G	1543.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=31;PP=1232;SC=AGGTATGCAAGCCTTCCAGCC;SOR=2.200;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=31;WE=5199825;WS=5199807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr11	5221132	rs61736992	G	A	2180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.610;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=43;PP=1312;ReadPosRankSum=1.948;SC=ACCATTGTGAGGCTAATGATA;SOR=0.574;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=200;TCF=110;TCR=90;TR=91;WE=5221140;WS=5221122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,104:0.46:228
chr11	5221645	rs11512276	C	A,G	7200.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;NF=71,72;NR=69,63;PP=1855,1652;SC=CGAATGATCCCCCACAGGATC;SOR=0.767;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=275;TCF=143;TCR=132;TR=140,135;WE=5221653;WS=5221635;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.50,0.50:307
chr11	5221825	rs11036212	G	A	5489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=81;PP=2965;SC=GGGATGGAAAGCCAGGGGTAT;SOR=0.854;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=181;TCF=100;TCR=81;TR=181;WE=5221833;WS=5221815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr11	5247141	rs1609812	G	A	142.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=112;SC=TATATGCAGAGATATTGCTAT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=5247149;WS=5247131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	5247733	rs7480526	A	C	926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.793;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=8;PP=484;ReadPosRankSum=0.350;SC=CCTGTTACTTATCCCCTTCCT;SOR=0.340;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=56;TCF=45;TCR=11;TR=33;WE=5247741;WS=5247723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,40:0.60:67
chr11	5247791	rs10768683	C	G	3863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=75;NR=49;PP=2187;SC=AAACATCAAGCGTCCCATAGA;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=75;TCR=49;TR=124;WE=5247799;WS=5247781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr11	5248243	rs713040	A	G	1505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=36;PP=985;SC=CAGGAGTCAGATGCACCATGG;SOR=2.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=10;TCR=36;TR=46;WE=5248251;WS=5248233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr11	5255582	rs35152987	C	A	2651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.628;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=62;PP=1477;ReadPosRankSum=0.572;SC=CTGCCCAGGGCCTCACCACCA;SOR=0.813;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=208;TCF=100;TCR=108;TR=118;WE=5255590;WS=5255572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,127:0.56:225
chr11	5263577	rs10128555	C	G	553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=426;SC=CATCCTTTTTCACCAGAGTTT;SOR=4.294;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=5263585;WS=5263567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	5269582	rs371855998	AG	A	11774.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.69;MQRankSum=8.140;QD=41.46;ReadPosRankSum=2.229;SOR=0.684;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:13,271:0.95:284
chr11	5269584	rs1065686	T	A	11857.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.55;MQRankSum=8.035;QD=41.32;ReadPosRankSum=2.477;SOR=0.662;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:13,274:0.95:287
chr11	5269586	rs371890964	A	AG	11873.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.43;MQRankSum=7.897;QD=40.94;ReadPosRankSum=2.843;SOR=0.654;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:13,277:0.96:290
chr11	5269799	rs28440105	A	C	277.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.91;QD=30.86;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	5274452	rs34879481	G	GT	5292.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=38;PP=2957;SC=TTTATTATTTGATTGCTTGCA;SOR=1.488;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=83;TCF=42;TCR=41;TR=80;WE=5274460;WS=5274442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr11	5289896	rs3061750	A	AAAAC	3574.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.319;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.316;NF=3;NR=53;PP=2849;ReadPosRankSum=-1.233;SC=ACTTGATGAAAAAACAAACAA;SOR=2.140;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=76;TCF=4;TCR=72;TR=56;WE=5289904;WS=5289886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,84:0.98:86
chr11	5322520	rs12283334	G	A	7896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=116;NR=137;PP=2965;SC=TCACTGTCTTGAGGATTAGTA;SOR=0.844;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=253;TCF=116;TCR=137;TR=253;WE=5322528;WS=5322510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,282:1.00:282
chr11	5323071	rs7118113	C	T	4668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=91;PP=2834;SC=CCAAAAAGGACGGAGAAGTAG;SOR=0.985;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=166;TCF=75;TCR=91;TR=166;WE=5323079;WS=5323061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr11	5344552	rs7934105	C	T	286.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.97;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr11	5344561	rs7933257	G	A	352.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.20;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	5344681	rs11036815	G	A	1680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=23;PP=960;ReadPosRankSum=0.728;SC=TTCATTAAAGGAGGAAAGAGG;SOR=0.729;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=155;TCF=101;TCR=54;TR=69;WE=5344689;WS=5344671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,81:0.46:178
chr11	5344772	rs10742622	T	C	6005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=113;NR=82;PP=2965;SC=AACCCATCACTGTAACATAGA;SOR=0.854;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=195;TCF=113;TCR=82;TR=195;WE=5344780;WS=5344762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr11	5344847	rs10768793	A	G	5655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=93;PP=2965;SC=CTTCACCAGAAGCAATGCCTA;SOR=0.936;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=178;TCF=85;TCR=93;TR=178;WE=5344855;WS=5344837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr11	5344902	rs7937237	C	G	4333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=69;PP=2934;SC=GATGATCAGACAGTCTAGGAA;SOR=0.776;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=136;TCF=67;TCR=69;TR=136;WE=5344910;WS=5344892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr11	5345128	rs10837814	G	A	2795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=63;PP=1866;ReadPosRankSum=-0.597;SC=GTATTGGTGAGAATGGAAGCA;SOR=0.687;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=275;TCF=137;TCR=138;TR=128;WE=5345136;WS=5345118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,138:0.44:311
chr11	5345170	rs7952293	A	G	7694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=115;NR=136;PP=2965;SC=GCAATGAAACAATCATATGCC;SOR=0.939;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=251;TCF=115;TCR=136;TR=251;WE=5345178;WS=5345160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,279:1.00:279
chr11	5345486	rs4910750	G	A	3093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=50;NR=56;PP=1805;SC=GCCCTGGAAAGCCAGTCAGCA;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=50;TCR=56;TR=106;WE=5345494;WS=5345476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr11	5364276	rs4910551	G	A	2492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.780;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=54;ReadPosRankSum=1.210;SC=AAAATAGAGGGGCCTGATTGG;SOR=0.531;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=239;TCF=115;TCR=124;TR=109;WE=5364284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,116:0.46:253
chr11	5364450	rs11036912	A	G	3543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.755;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=82;ReadPosRankSum=-1.763;SC=AAGTGAGTGTATAAAGTAGGC;SOR=0.832;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=284;TCF=143;TCR=141;TR=154;WE=5364458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,161:0.53:304
chr11	5364742	rs11036913	C	T	1564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.777;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.406;NF=20;NR=40;PP=980;ReadPosRankSum=-0.436;SC=TGGGAGCTGCCGCTGGACGAC;SOR=0.550;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=33;TCR=67;TR=60;WE=5364750;WS=5364732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,69:0.61:113
chr11	5364776	rs78253695	T	TGTC	1020.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.173;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.286;NF=1;NR=17;PP=879;ReadPosRankSum=0.494;SC=ATAGAAGAAATGTCTTTCTGT;SOR=1.739;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=18;WE=5364784;WS=5364766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,28:0.67:42
chr11	5373114	rs5006888	G	A	2280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.829;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=38;PP=1252;ReadPosRankSum=-0.056;SC=ACCATCCGCAGCCCCTTAAGA;SOR=0.872;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=158;TCF=87;TCR=71;TR=89;WE=5373122;WS=5373104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,104:0.56:185
chr11	5373646	rs5024041	T	C	3471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.409;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=81;PP=2376;ReadPosRankSum=1.562;SC=GCATACTTCGTTTATTCTCTC;SOR=0.724;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=285;TCF=139;TCR=146;TR=157;WE=5373654;WS=5373636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,163:0.52:313
chr11	5373713	rs12802177	A	T	2110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.538;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=49;PP=1212;ReadPosRankSum=0.066;SC=AATTCAGGGGACCTGGACAGG;SOR=0.636;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=170;TCF=72;TCR=98;TR=84;WE=5373721;WS=5373703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,98:0.51:192
chr11	5410934	rs1498467	T	G	6738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=107;NR=102;PP=2965;SC=TTAACTCCCATAGTATCTACT;SOR=0.763;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=210;TCF=107;TCR=103;TR=209;WE=5410942;WS=5410924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr11	5411031	rs1498468	C	T	5774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=97;PP=2965;SC=CTTTGACCGCCTTGTGGCCAT;SOR=0.772;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=189;TCF=92;TCR=97;TR=189;WE=5411039;WS=5411021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr11	5411239	rs1498469	T	C	4848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=72;PP=2815;SC=TGCACAGATATCACCTTCAAT;SOR=0.749;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=157;TCF=85;TCR=72;TR=157;WE=5411247;WS=5411229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr11	5411395	rs9783355	C	A	4077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=52;PP=2161;SC=TGCACCGCTCCTCTCTGTGCT;SOR=0.895;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=74;TCR=52;TR=126;WE=5411403;WS=5411385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr11	5411579	rs10768906	GT	AC	5105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=52;PP=2947;SC=CCATTATCAAGTTCCTAGGTC;SOR=1.169;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=41;TCR=54;TR=92;WE=5411588;WS=5411569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr11	5423775	rs7481498	G	A	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=166;ReadPosRankSum=-1.477;SC=CATCTCACTAGTTTGTTTCTA;SOR=0.460;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=12;WE=5423783;WS=5423765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr11	5423868	rs2647583	T	A	2246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.425;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=37;PP=1260;ReadPosRankSum=0.764;SC=TACCTACGACTTTCATTTTGG;SOR=0.528;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=196;TCF=126;TCR=70;TR=96;WE=5423880;WS=5423858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,108:0.50:215
chr11	5423931	rs2736526	C	T	3644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.735;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=63;PP=2013;ReadPosRankSum=-1.489;SC=TCCCCTTCTCCCTGATATACA;SOR=0.801;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=315;TCF=177;TCR=138;TR=147;WE=5423939;WS=5423921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,171:0.48:356
chr11	5424087	rs201058453	A	T	2352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.471;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=52;PP=1527;ReadPosRankSum=1.513;SC=TGTTAGGCATATTCCTTTTTG;SOR=0.755;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=218;TCF=99;TCR=119;TR=96;WE=5424095;WS=5424077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,108:0.44:245
chr11	5424125	rs1909261	G	A	2059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.314;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=47;PP=1247;ReadPosRankSum=0.457;SC=CTTGAAGCTTGTCTTTTTCCA;SOR=0.794;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=217;TCF=109;TCR=108;TR=90;WE=5424133;WS=5424115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,102:0.41:250
chr11	5424170	rs2647582	C	T	1741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=40;PP=1110;ReadPosRankSum=-1.284;SC=CATGATGGAGCCAGCTGTGCT;SOR=0.662;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=212;TCF=114;TCR=98;TR=84;WE=5424178;WS=5424160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,91:0.38:241
chr11	5424232	rs1909260	C	T	1966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.713;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=42;PP=1199;ReadPosRankSum=1.800;SC=CACTGAGCTACACAGCTATCC;SOR=0.691;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=181;TCF=94;TCR=87;TR=86;WE=5424240;WS=5424222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,95:0.47:203
chr11	5424387	rs113047337	T	TTATC	6119.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=368;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.336;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.521;NF=12;NR=54;PP=2971;ReadPosRankSum=-1.005;SC=CACCCCAATCTTATCTATCTT;SOR=0.818;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=192;TCF=41;TCR=151;TR=66;WE=5424395;WS=5424377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:179,156:0.47:335
chr11	5424504	rs872163	T	C	5028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FS=0.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQRankSum=1.406;QD=19.88;ReadPosRankSum=-1.610;SOR=0.614;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:125,128:0.51:253
chr11	5424507	rs872164	A	G	5025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FS=1.490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.08;MQRankSum=1.406;QD=19.26;ReadPosRankSum=-1.418;SOR=0.589;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:129,132:0.51:261
chr11	5424532	rs872165	A	C	2205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=57;PP=1261;ReadPosRankSum=0.313;SC=TGGAGAAGGGAGGAAGAAGGC;SOR=0.727;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=210;TCF=101;TCR=109;TR=106;WE=5424540;WS=5424522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,111:0.48:233
chr11	5424552	rs872166	A	G	1886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=47;PP=1246;ReadPosRankSum=0.904;SC=CACTCAACACATGTGGCTCAC;SOR=0.682;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=181;TCF=86;TCR=95;TR=88;WE=5424560;WS=5424542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,91:0.46:200
chr11	5424861	rs2647581	G	A	661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=22;PP=482;ReadPosRankSum=-0.643;SC=CATGTTATGCGATTGATATCA;SOR=0.760;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=23;WE=5424869;WS=5424851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,25:0.62:40
chr11	5451875	rs1498474	G	A	1625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.139;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=21;PP=1049;ReadPosRankSum=-0.003;SC=CTGACTCCTTGCAGTGATTCA;SOR=1.172;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=152;TCF=102;TCR=50;TR=75;WE=5451883;WS=5451865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,78:0.49:158
chr11	5452418	rs1566278	G	A	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.395;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=7;PP=275;ReadPosRankSum=1.515;SC=ACGGGGCAGGGTCAGGATGGC;SOR=0.281;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=27;TCF=11;TCR=16;TR=16;WE=5452426;WS=5452408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr11	5461991	rs1498486	C	A	2576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.487;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=59;PP=1521;ReadPosRankSum=1.686;SC=ACATAAAAGGCCAGCACTGCA;SOR=0.636;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=207;TCF=95;TCR=112;TR=109;WE=5461999;WS=5461981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,120:0.53:228
chr11	5462085	rs11037444	G	A	1766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.670;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=35;PP=1013;ReadPosRankSum=0.925;SC=GGATCAATGCGTAGGAAAGCA;SOR=0.747;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=199;TCF=108;TCR=91;TR=80;WE=5462093;WS=5462075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,88:0.40:221
chr11	5462255	rs11037445	C	G	1784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=36;PP=1169;ReadPosRankSum=-1.091;SC=CGTTTCACCACAAAAGGGAAA;SOR=0.658;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=153;TCF=75;TCR=78;TR=70;WE=5462263;WS=5462245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,79:0.45:176
chr11	5462374	rs16930982	C	T	2247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.471;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=44;PP=1311;ReadPosRankSum=1.011;SC=AGCCACAAAGCGATCCAAGCT;SOR=0.737;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=213;TCF=121;TCR=92;TR=98;WE=5462382;WS=5462364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,109:0.45:241
chr11	5462702	rs16930998	G	A	1027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.574;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=28;PP=725;ReadPosRankSum=0.466;SC=CCTGTCAGCTGGAGTGTTGCT;SOR=0.965;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=95;TCF=40;TCR=55;TR=46;WE=5462710;WS=5462692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,48:0.47:103
chr11	5474838	rs2030094	G	T	4049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=48;PP=2362;SC=TGGCCCTTGGGGGAAATACAG;SOR=1.101;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=127;TCF=78;TCR=49;TR=126;WE=5474846;WS=5474828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr11	5475431	rs35301588	T	TCA	9639.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=90;PP=2974;SC=CTCAAAGCTCTCAACACATGT;SOR=1.039;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=128;TCF=24;TCR=104;TR=112;WE=5475439;WS=5475421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr11	5475597	rs11037503	C	T	7656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=134;NR=124;PP=2965;SC=TCATTTATAGCGCCAAGACAA;SOR=0.750;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=258;TCF=134;TCR=124;TR=258;WE=5475605;WS=5475587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,286:1.00:286
chr11	5510284	rs417425	A	G	5920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=113;NR=84;PP=2965;SC=TGGAGTCCTCAATTCTACTTG;SOR=0.931;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=198;TCF=113;TCR=85;TR=197;WE=5510292;WS=5510274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr11	5510341	rs404280	C	T	7788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=138;NR=119;PP=2965;SC=CATTAAGGTACACAACCATTC;SOR=0.749;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=258;TCF=138;TCR=120;TR=257;WE=5510349;WS=5510331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,294:1.00:294
chr11	5510497	rs2467219	T	C	4176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=66;PP=2496;SC=ATATGGGCATTGCCCGACTGG;SOR=0.734;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=137;TCF=71;TCR=66;TR=135;WE=5510505;WS=5510487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr11	5510626	rs444878	T	C	5078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=85;PP=2965;SC=CAGTCTTTCATCTTCCATCTC;SOR=0.842;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=80;TCR=85;TR=165;WE=5510634;WS=5510616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr11	5510688	rs7101919	T	C	5098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=77;PP=2965;SC=ATTGGCATCATCCTGGTTTTC;SOR=0.802;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=173;TCF=96;TCR=77;TR=173;WE=5510696;WS=5510678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr11	5510928	rs392296	G	A	1966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=44;PP=1206;SC=AAAAAAAAGTGTAGGATGGCT;SOR=1.819;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=19;TCR=44;TR=63;WE=5510936;WS=5510907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr11	5511003	rs426886	G	A	326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=240;SC=ATGGCAGGAAGCTCTGGAAGG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=5511011;WS=5510993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	5528918	rs2227271	C	T	3508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=62;PP=2036;SC=GCCCATGGACCGCAGTTGCTC;SOR=1.057;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=111;TCF=48;TCR=63;TR=110;WE=5528926;WS=5528908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr11	5529139	rs2234456	T	C	8523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=154;NR=145;PP=2965;SC=TACCCGTCCCTGCTAGGCAAG;SOR=0.705;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=299;TCF=154;TCR=145;TR=299;WE=5529147;WS=5529129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,326:1.00:326
chr11	5529865	rs186434	G	A	3134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=49;PP=1842;SC=CTCCATGTGTGGAAGTCCAGG;SOR=0.728;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=102;TCF=52;TCR=50;TR=101;WE=5529873;WS=5529855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr11	5536537	rs393044	A	C	3766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.99;NF=68;NR=52;PP=2358;SC=GCTGGTATCCAAGCTGGCTGC;SOR=0.889;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=68;TCR=52;TR=120;WE=5536545;WS=5536527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr11	5536848	rs2017433	G	A	4904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=66;PP=2965;SC=ATTGATATCAGCATAGTTCTG;SOR=0.950;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=154;TCF=87;TCR=67;TR=153;WE=5536856;WS=5536838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr11	5549254	rs1498480	T	C	638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.856;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=332;ReadPosRankSum=-0.626;SC=GCCTTGTCAGTGACCACCAGC;SOR=0.289;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=46;TCF=38;TCR=8;TR=24;WE=5549262;WS=5549244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,30:0.58:52
chr11	5549316	rs1846317	A	G	1552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=24;PP=891;ReadPosRankSum=-0.641;SC=CAGGCACACAAGCACAGAGAG;SOR=0.686;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=74;TCR=43;TR=65;WE=5549324;WS=5549306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,74:0.55:134
chr11	5549531	rs1560811	T	C	741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.813;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=17;PP=398;ReadPosRankSum=-1.510;SC=GTGAGGGTGATGCTAGGGCTT;SOR=0.509;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=72;TCF=33;TCR=39;TR=34;WE=5549539;WS=5549521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,38:0.47:81
chr11	5566030	rs1995158	A	G	5089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=88;PP=2965;SC=GCTTTCTGGCAGGCATCTTGG;SOR=0.780;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=174;TCF=86;TCR=88;TR=174;WE=5566038;WS=5566020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr11	5566051	rs1995157	C	A	1596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.951;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=40;PP=936;ReadPosRankSum=-1.725;SC=GAGGGAAGGCCAAAGACAGCA;SOR=0.925;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=186;TCF=95;TCR=91;TR=72;WE=5566059;WS=5566041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,82:0.40:203
chr11	5566112	rs1995156	C	T	1466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.211;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=29;PP=746;ReadPosRankSum=-0.683;SC=CTGAGATGACCGTCATGATGG;SOR=0.564;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=154;TCF=76;TCR=78;TR=59;WE=5566120;WS=5566102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,72:0.42:171
chr11	5566365	rs1566275	T	C	5684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=106;PP=2965;SC=AGCTACATAGTGATCAAATGC;SOR=0.931;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=194;TCF=88;TCR=106;TR=194;WE=5566373;WS=5566355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr11	5566489	rs10769054	C	T	1766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.137;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=30;PP=976;ReadPosRankSum=0.591;SC=ATACTGAGTGCTTTAGGCACA;SOR=0.746;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=162;TCF=89;TCR=73;TR=73;WE=5566497;WS=5566479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,85:0.46:184
chr11	5566830	rs10838299	A	C	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=57;ReadPosRankSum=1.000;SC=AACTAATTATAATTATTGCCT;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=4;WE=5566838;WS=5566820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr11	5572816	rs401426	T	C	597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.253;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=422;ReadPosRankSum=0.076;SC=TTCTCTTGGGTGTCTGAACAC;SOR=0.283;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=46;TCF=37;TCR=9;TR=26;WE=5572824;WS=5572806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,27:0.53:51
chr11	5572836	rs11360659	CT	C	936.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.068;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=749;ReadPosRankSum=1.234;SC=CAGGTTCAGTCTTTGACCTAA;SOR=0.498;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=33;TCR=17;TR=23;WE=5572844;WS=5572826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,33:0.49:68
chr11	5572966	rs423501	A	G	2251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=49;PP=1542;ReadPosRankSum=-0.920;SC=TAGACAATAGAGTTGAGAGCA;SOR=0.668;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=208;TCF=111;TCR=97;TR=100;WE=5572974;WS=5572956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,108:0.47:228
chr11	5573024	rs60009475	A	G	1834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.073;HP=4;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=41;PP=1323;ReadPosRankSum=-0.149;SC=GAAAGGTATGAGGGACATTAT;SOR=0.811;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=200;TCF=104;TCR=96;TR=89;WE=5573032;WS=5573013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,93:0.43:214
chr11	5573044	rs9666981	A	G	3834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FS=0.496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.030;SOR=0.663;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,103:0.47:218
chr11	5573054	rs9666982	A	G	3826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.05;ReadPosRankSum=0.446;SOR=0.663;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,102:0.48:212
chr11	5573073	rs1694674	A	G	2247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.506;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=48;PP=1282;ReadPosRankSum=0.558;SC=GAATGCTGGTATATAGAATAT;SOR=0.625;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=189;TCF=87;TCR=102;TR=90;WE=5573081;WS=5573063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,105:0.50:212
chr11	5573160	rs401835	G	C	1191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.381;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=25;PP=668;ReadPosRankSum=-0.066;SC=GCAAAAGACAGCACAGAGGAT;SOR=0.507;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=104;TCF=44;TCR=60;TR=48;WE=5573168;WS=5573150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,56:0.48:117
chr11	5602275	rs1077126	A	G	1863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=43;PP=1249;ReadPosRankSum=0.946;SC=CATGTACATCACTGCCCTGGA;SOR=0.714;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=189;TCF=97;TCR=92;TR=89;WE=5602283;WS=5602265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,93:0.45:207
chr11	5602438	rs2341432	T	A	1556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.120;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=39;PP=888;ReadPosRankSum=1.836;SC=GGTTATAGCCTCATTTCCTTT;SOR=0.909;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=135;TCF=62;TCR=73;TR=68;WE=5602446;WS=5602428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,75:0.52:144
chr11	5602605	rs2341433	G	A	5563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FS=4.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.01;ReadPosRankSum=0.108;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:162,147:0.48:309
chr11	5602615	rs2341434	A	G	5665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.54;ReadPosRankSum=0.590;SOR=0.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:169,154:0.48:323
chr11	5602679	rs892336	T	C	4568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=427;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.516;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=103;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.765;SC=GCCAGATCAATATCATTGCAC;SOR=0.723;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=391;TCF=191;TCR=200;TR=198;WE=5602687;WS=5602665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:217,210:0.49:427
chr11	5602790	rs2163946	A	G	2633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=54;PP=1698;ReadPosRankSum=-0.411;SC=CCACAGGCCTAGACATCATGC;SOR=0.726;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=197;TCF=95;TCR=102;TR=104;WE=5602810;WS=5602780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,116:0.53:219
chr11	5602928	rs10838375	G	C	1606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.258;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=28;PP=887;ReadPosRankSum=-0.564;SC=ATGTCCCTGCGCTTTTTTCTG;SOR=0.804;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=124;TCF=68;TCR=56;TR=60;WE=5602936;WS=5602918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,74:0.49:152
chr11	5602968	rs10769086	G	A	4298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=63;PP=2257;SC=TGGGAGAAGCGTCCCATGCTA;SOR=0.785;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=135;TCF=71;TCR=64;TR=133;WE=5602976;WS=5602958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr11	5603136	rs10838376	C	A	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=230;ReadPosRankSum=0.975;SC=TTAGTCTCAACCCTTTTCTAT;SOR=1.230;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=14;WE=5603144;WS=5603126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr11	5603163	rs10838377	G	A	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.596;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=121;ReadPosRankSum=0.760;SC=CAATTGTCCCGTATTTAGCCC;SOR=1.445;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=8;WE=5603171;WS=5603153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr11	5617987	rs12272467	G	A	1528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=10;PP=1070;SC=GAGCAGAGTCGTGCGTGGTTG;SOR=2.437;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=40;TCR=10;TR=50;WE=5617995;WS=5617977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr11	5618298	rs146384026	A	ATTTTAT	456.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=494;SC=GGTTAGAGACATTTTAATCAG;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=8;WE=5618306;WS=5618288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	5625847	rs3751006	A	G	1859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.364;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=46;PP=1192;ReadPosRankSum=-0.876;SC=GAGAGAAGAAAACATCCTGGA;SOR=0.873;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=127;TCF=48;TCR=79;TR=71;WE=5625855;WS=5625837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,79:0.54:145
chr11	5625988	rs17304278	T	C	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.11;ReadPosRankSum=-1.579;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr11	5631479	rs3740999	A	C	2290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.982;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=44;PP=1084;ReadPosRankSum=-0.515;SC=TGTAGAGGTAAGGAGATTCAG;SOR=0.611;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=218;TCF=121;TCR=97;TR=99;WE=5631487;WS=5631469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,115:0.47:244
chr11	5631622	rs7125403	G	T	3943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=63;PP=2649;SC=AGAAGATGCGGTTTGTATTTA;SOR=0.722;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=67;TCR=63;TR=129;WE=5631630;WS=5631612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr11	5631972	rs3824950	G	A	1676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=27;PP=1017;ReadPosRankSum=1.252;SC=CCATGTCCCCGTTCTCATCTG;SOR=0.723;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=141;TCF=85;TCR=56;TR=67;WE=5631980;WS=5631962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,78:0.48:162
chr11	5632212	rs10769124	G	A	6042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=110;NR=89;PP=2965;SC=CCTGGATCCTGGGGGTATGCA;SOR=0.918;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=199;TCF=110;TCR=89;TR=199;WE=5632220;WS=5632202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr11	5653417	rs4287358	AT	GA	1231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=2;PP=393;SC=GCCAGTCTTTATTGTCTGTGC;SOR=2.468;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=22;WE=5653426;WS=5653407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	5655150	rs7941976	T	A	4598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.036;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=77;PP=2791;ReadPosRankSum=1.563;SC=ATTCTGAAGGTTTTCTGAGAC;SOR=0.261;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=160;TCF=83;TCR=77;TR=159;WE=5655158;WS=5655140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,170:0.99:171
chr11	5655233	rs3824951	G	A	562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.268;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=19;PP=361;ReadPosRankSum=0.924;SC=GAGTCCTGAAGCCATTTGATT;SOR=0.215;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=70;TCF=19;TCR=51;TR=30;WE=5655241;WS=5655223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,30:0.42:72
chr11	5655722	rs3060967	TAC	T	315	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.6307;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.516;NF=8;NR=3;PP=267;ReadPosRankSum=-0.653;SC=ATAATATAAATACACACACAC;SOR=1.863;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=18;TCF=11;TCR=7;TR=11;WE=5655731;WS=5655712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,15:0.94:16
chr11	5662319	rs7108834	C	T	1720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=46;NR=11;PP=1387;SC=CATTTTTTTTCCTACTGTTCT;SOR=2.468;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=58;TCF=47;TCR=11;TR=57;WE=5662327;WS=5662300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr11	5662611	rs7128128	T	G	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.260;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=74;ReadPosRankSum=-0.241;SC=CGATCCTATGTTAGTAAATTC;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=5662619;WS=5662601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr11	5663920	rs66637086	CT	C	2721.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=27;PP=2098;SC=TCTGGTTTATCTTTTTAATTC;SOR=1.508;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=69;TCF=36;TCR=33;TR=57;WE=5663928;WS=5663910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr11	5664356	rs59472811	T	TATATATA	488.27	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.78;MQRankSum=0.696;QD=27.13;ReadPosRankSum=1.873;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,15:0.83:18
chr11	5664831	rs3740998	C	A	2180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.058;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=37;PP=1290;ReadPosRankSum=-0.247;SC=CAAGCCATGGCTCCCTCATTT;SOR=0.795;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=197;TCF=113;TCR=84;TR=89;WE=5664839;WS=5664821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,100:0.46:217
chr11	5664974	rs7109861	T	C	7313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=135;PP=2965;SC=CCCTTTGTCTTGACTTATCTC;SOR=1.024;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=242;TCF=107;TCR=135;TR=242;WE=5664982;WS=5664964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,276:1.00:276
chr11	5691191	rs4309185	C	T	655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=6;PP=468;SC=GGCAACAGAGCGAGACTTCAT;SOR=2.124;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=24;WE=5691199;WS=5691181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	5700340	rs3740995	T	C	1639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.286;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=24;PP=988;ReadPosRankSum=0.127;SC=TGTCAGCTTCTAACTCTTCAG;SOR=0.518;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=118;TCF=77;TCR=41;TR=66;WE=5700348;WS=5700330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,74:0.57:130
chr11	5701001	rs10838525	C	T	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.23;ReadPosRankSum=0.933;SOR=0.606;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,26:0.46:56
chr11	5717762	rs10838543	T	C	2792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.021;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=57;PP=1428;ReadPosRankSum=-1.101;SC=GTGAGCACCATGGAAAAAAAC;SOR=0.579;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=246;TCF=132;TCR=114;TR=121;WE=5717770;WS=5717752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,138:0.51:270
chr11	5718517	rs7935564	G	A	1342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=30;PP=837;ReadPosRankSum=0.978;SC=GATAAAGGAGGATCAAGAGGC;SOR=0.704;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=115;TCF=58;TCR=57;TR=57;WE=5718525;WS=5718507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,62:0.48:130
chr11	5719667	rs2291842	T	C	708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.872;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=16;PP=526;ReadPosRankSum=0.840;SC=ATGTGCTGGATAACCTGGCAG;SOR=0.941;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=72;TCF=38;TCR=34;TR=35;WE=5719675;WS=5719657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,34:0.45:76
chr11	5719750	rs1063303	G	C	873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=25;PP=432;ReadPosRankSum=1.403;SC=CGGAGGTTGAGGGGATCGTCA;SOR=0.726;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=103;TCF=50;TCR=53;TR=46;WE=5719758;WS=5719740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,49:0.43:113
chr11	5719835	rs2291844	T	C	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=263;ReadPosRankSum=0.540;SC=GAGGCCGATTTTCCTTCCCTT;SOR=0.874;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=15;WE=5719856;WS=5719825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr11	5719848	rs7950912	C	T	459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=16;PP=509;SC=CTTCCCTTCCCAGTCTCTAGG;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=5719856;WS=5719825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	5730248	rs999295	A	G	1522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-3.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.318;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=25;PP=976;ReadPosRankSum=-1.807;SC=CACCTATCCCATATCCTTCAC;SOR=0.419;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=125;TCF=86;TCR=39;TR=71;WE=5730256;WS=5730238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,76:0.54:140
chr11	5730294	rs61735276	C	T	2817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.490;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=56;PP=1746;ReadPosRankSum=0.570;SC=GGACGTGATGCTGAATCCAGG;SOR=0.585;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=241;TCF=140;TCR=101;TR=129;WE=5730302;WS=5730284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,138:0.52:264
chr11	5730914	rs73404243	C	T	1294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.437;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=40;PP=869;ReadPosRankSum=-0.912;SC=TGCATAGTAGCCCTTGTGCTG;SOR=0.990;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=125;TCF=41;TCR=84;TR=56;WE=5730922;WS=5730904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,60:0.46:130
chr11	5755605	rs1498552	A	G	928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=22;PP=610;SC=ATAGAGGATTAGAGGGCCTTT;SOR=3.912;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=25;WE=5755613;WS=5755595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
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chr11	5758118	rs7396766	A	C	3081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.817;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=61;PP=1720;ReadPosRankSum=-2.101;SC=CTGGTATCCTACTCTGCATGG;SOR=0.657;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=313;TCF=165;TCR=148;TR=129;WE=5758126;WS=5758108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:195,151:0.44:346
chr11	5776287	rs7936512	C	T	9052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=151;NR=153;PP=2965;SC=ATGTTCTTCACCCACACCTTC;SOR=0.736;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=304;TCF=151;TCR=153;TR=304;WE=5776295;WS=5776277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,331:1.00:331
chr11	5776470	rs7394584	T	G	5624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=89;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.099;SC=CTCACCAAGCTCCTGCCCTAC;SOR=0.703;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=186;TCF=96;TCR=90;TR=184;WE=5776492;WS=5776460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,209:0.99:211
chr11	5776484	rs4910844	A	T	2262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.729;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=35;PP=1368;ReadPosRankSum=-0.042;SC=GCCCTACTGCAGAGGCAATAT;SOR=0.745;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=184;TCF=96;TCR=88;TR=86;WE=5776492;WS=5776460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,102:0.47:215
chr11	5776623	rs7396938	A	T	6213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=107;PP=2965;SC=TGTATCACCAACTCCTATACC;SOR=0.856;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=203;TCF=96;TCR=107;TR=203;WE=5776631;WS=5776613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr11	5776926	rs190757899	A	G	2163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.827;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=55;PP=1394;ReadPosRankSum=0.426;SC=ACCAAATCCTACAGCATGTGA;SOR=1.007;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=183;TCF=81;TCR=102;TR=93;WE=5776934;WS=5776916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,102:0.50:206
chr11	5777023	rs10742782	C	T	875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=26;PP=706;SC=TTTCTGGAAGCACTGTATTGA;SOR=3.841;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=29;WE=5777031;WS=5777013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr11	5777053	rs10742783	A	G	356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=299;SC=GGAGTTTGTTAACTGGTGCAT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=5777061;WS=5777043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	5809308	rs7934670	A	T	4364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=63;PP=2818;SC=ATGGCACAGAAGTGGGCAGTG;SOR=0.756;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=143;TCF=80;TCR=63;TR=143;WE=5809316;WS=5809298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr11	5809477	rs10838637	A	G	2057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=44;PP=1259;ReadPosRankSum=0.816;SC=CATTACCACAAGATATCTTGG;SOR=0.698;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=202;TCF=106;TCR=96;TR=92;WE=5809485;WS=5809467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,103:0.44:232
chr11	5809548	rs7948009	G	A	3161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.737;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=57;PP=1847;ReadPosRankSum=1.239;SC=TATGGAAGGCGCTTGGTGAGG;SOR=0.532;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=233;TCF=128;TCR=105;TR=127;WE=5809556;WS=5809538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,144:0.55:260
chr11	5809673	rs10769224	C	T	2395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.467;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=51;PP=1324;ReadPosRankSum=-1.452;SC=GATGGCCACACAGTGGTCCAG;SOR=0.665;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=226;TCF=115;TCR=111;TR=106;WE=5809681;WS=5809663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,117:0.48:244
chr11	5809746	rs10742787	C	T	2242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.819;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=46;PP=1310;ReadPosRankSum=-0.337;SC=AACATCTGGGCGAGGCAGGCT;SOR=0.702;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=223;TCF=114;TCR=109;TR=97;WE=5809754;WS=5809736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,109:0.44:248
chr11	5810080	rs10742788	T	C	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.023;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=204;ReadPosRankSum=-0.049;SC=ATAGCAGTTATAGCATTGCCT;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=11;WE=5810088;WS=5810070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr11	5810103	rs68146349	AAT	A	175.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=122;ReadPosRankSum=1.253;SC=GTGAGCAGGAAATAAAAAAAA;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=8;WE=5810113;WS=5810093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr11	5810105	rs61619938	TA	T	94.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=4;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=97;ReadPosRankSum=-0.621;SC=GAGCAGGAAATAAAAAAAAGA;SOR=0.169;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=8;WE=5810113;WS=5810093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr11	5817841	rs1453423	C	T	3690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=377;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.778;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=85;PP=2582;ReadPosRankSum=-0.532;SC=GAAAAAAGGACCTACATTTGT;SOR=0.749;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=347;TCF=174;TCR=173;TR=165;WE=5817849;WS=5817831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:206,170:0.45:376
chr11	5817896	rs1453422	G	A	3205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=80;PP=2047;ReadPosRankSum=1.139;SC=AGAAAGATGTGCCATTACATC;SOR=0.700;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=308;TCF=149;TCR=159;TR=153;WE=5817904;WS=5817886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,159:0.47:335
chr11	5841856	rs4758435	C	T	4711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=69;PP=2766;SC=TTGACTTTAACGCCTGCCTGG;SOR=0.728;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=153;TCF=84;TCR=69;TR=153;WE=5841864;WS=5841846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr11	5842310	rs8181529	T	G	2669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.977;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=49;PP=1806;ReadPosRankSum=-1.081;SC=TCACATGTGTTCCATTGTGAT;SOR=0.779;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=223;TCF=120;TCR=103;TR=108;WE=5842318;WS=5842300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,119:0.49:245
chr11	5842356	rs8181512	A	G	3502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=352;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.719;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=64;PP=2014;ReadPosRankSum=0.640;SC=TTTTTCACTCATCGTTTTGTA;SOR=0.924;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=321;TCF=180;TCR=141;TR=156;WE=5842364;WS=5842346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:179,173:0.49:352
chr11	5862339	rs185269636	G	C	1731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.886;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=28;ReadPosRankSum=0.727;SC=GGCCAAAGCAGTGTGTAAAGA;SOR=0.448;SbPval=0.44;Source=Platypus;TCF=73;TR=64;WE=5862347;WS=5862329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,76:0.52:146
chr11	5862731	rs10838719	A	G	1556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.865;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.634;NF=32;NR=33;PP=1008;ReadPosRankSum=-1.278;SC=ATGGTGTACCAAAGAGGTTTG;SOR=0.771;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=156;TCF=80;TCR=76;TR=65;WE=5862739;WS=5862721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,74:0.42:178
chr11	5877909	rs12417880	C	T	1456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=7;PP=854;SC=ATGTTATTGGCTGCAGCATTC;SOR=2.746;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=41;WE=5877917;WS=5877899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr11	5877979	rs12419602	T	A	5703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=116;NR=71;PP=2965;SC=CTCCAACTGGTTAGTGATTGG;SOR=1.157;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=187;TCF=116;TCR=71;TR=187;WE=5877987;WS=5877969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr11	5905412	rs17233457	C	T	705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=1;PP=496;SC=ATACCATTACCTCTAGCACAC;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=5905420;WS=5905402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr11	5906048	rs4758168	G	A	6321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=103;NR=104;PP=2965;SC=GCATAACATCGTACCTCACAC;SOR=0.791;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=207;TCF=103;TCR=104;TR=207;WE=5906056;WS=5906038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr11	5906073	rs4757986	G	T	5509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=81;PP=2965;SC=TGTGAGCACAGGGGTCTGGCC;SOR=0.714;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=168;TCF=87;TCR=81;TR=168;WE=5906081;WS=5906063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr11	5906143	rs11823809	T	C	8333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=171;NR=105;PP=2965;SC=TGATTTCTTATATTATTGTGG;SOR=1.222;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=278;TCF=172;TCR=106;TR=276;WE=5906151;WS=5906133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,296:1.00:296
chr11	5906192	rs1453435	A	C	12433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=460;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=233;NR=196;PP=2965;SC=GCTTATCCTTAGAGCTGTTTT;SOR=0.872;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=429;TCF=233;TCR=196;TR=429;WE=5906211;WS=5906182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,458:1.00:458
chr11	5906203	rs11823828	T	G	12997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=473;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=231;NR=210;PP=2965;SC=GAGCTGTTTTTCGCCTTCCCT;SOR=0.786;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=442;TCF=231;TCR=211;TR=441;WE=5906211;WS=5906182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,471:1.00:471
chr11	5906291	rs11823842	T	C	11224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=405;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=175;NR=200;PP=2965;SC=CACACCAGCATTTTTTTCTTT;SOR=0.876;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=375;TCF=175;TCR=200;TR=375;WE=5906299;WS=5906281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,402:1.00:402
chr11	5922222	rs10160336	T	C	6382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=113;NR=96;PP=2965;ReadPosRankSum=0.539;SC=CCGGCACTGATCTGGGCTTGT;SOR=0.702;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=211;TCF=114;TCR=97;TR=209;WE=5922230;WS=5922211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,237:0.99:239
chr11	5922707	rs7106300	C	T	6021.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=103;PP=2965;SC=GATGCCCGGCCTAAGGCACTC;SOR=0.797;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=204;TCF=101;TCR=103;TR=204;WE=5922715;WS=5922697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr11	5923297	rs4601752	A	G	3170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=63;PP=2282;ReadPosRankSum=-0.585;SC=TTACATATCCAAAGCTGAAGT;SOR=0.950;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=51;TCR=64;TR=113;WE=5923305;WS=5923286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,120:0.98:122
chr11	5968728	rs1840178	T	C	2939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=66;PP=1694;SC=ACCCTCCTGATGACCATCTGG;SOR=1.674;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=34;TCR=66;TR=100;WE=5968736;WS=5968718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr11	5969185	rs10769378	A	G	3793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=365;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.952;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=88;PP=2506;ReadPosRankSum=-1.170;SC=ACCTTTACCAATTTGCTGGAG;SOR=0.799;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=340;TCF=169;TCR=171;TR=169;WE=5969193;WS=5969175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:184,178:0.49:362
chr11	5969579	rs369068476	A	G	868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.869;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=20;PP=451;ReadPosRankSum=0.059;SC=TAATCACTTAATGAGTGAGTG;SOR=0.121;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=60;TCF=22;TCR=38;TR=37;WE=5969587;WS=5969569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,42:0.62:68
chr11	5989415	rs7114672	C	A	970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.595;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=21;PP=493;ReadPosRankSum=-0.027;SC=ATGATGAACACCTGAAGGAAG;SOR=0.862;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=88;TCF=41;TCR=47;TR=38;WE=5989423;WS=5989405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,47:0.47:101
chr11	6007272	rs4237768	A	G	1462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.819;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.97;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=33;PP=836;ReadPosRankSum=0.134;SC=AGGAGATACCATGTGGCCAGA;SOR=0.691;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=176;TCF=90;TCR=86;TR=71;WE=6007280;WS=6007262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,79:0.42:188
chr11	6007396	rs61732631	C	T	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.924;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=16;PP=397;ReadPosRankSum=-0.878;SC=ATGTGCTAAACGCCTTAAGTC;SOR=0.560;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=65;TCF=26;TCR=39;TR=28;WE=6007404;WS=6007386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,30:0.42:71
chr11	6007613	rs4354673	T	G	3353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=1.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.338;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.245;NF=82;NR=59;PP=2076;ReadPosRankSum=1.012;SC=GAAGATAAGTTTTCCCAACAA;SOR=0.775;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=269;TCF=156;TCR=113;TR=141;WE=6007621;WS=6007603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,156:0.50:314
chr11	6007680	rs4436524	A	G	3207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.409;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-6.412;NF=77;NR=66;PP=2026;ReadPosRankSum=-1.610;SC=ATTCCGATGCACCCTATGACC;SOR=0.667;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=272;TCF=151;TCR=121;TR=143;WE=6007688;WS=6007670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,156:0.50:310
chr11	6007743	rs4436525	A	G	2688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.933;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-8.504;NF=58;NR=60;PP=1886;ReadPosRankSum=-0.511;SC=GCTACATAGCAATCCAGAGCC;SOR=0.745;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=248;TCF=127;TCR=121;TR=118;WE=6007751;WS=6007733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,126:0.47:267
chr11	6007772	rs61750896	G	A	3159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.940;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=7.354;NF=76;NR=61;PP=1992;ReadPosRankSum=0.925;SC=AAGTACCCCTGACTCCATGGA;SOR=0.821;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=275;TCF=147;TCR=128;TR=137;WE=6007780;WS=6007762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,147:0.51:291
chr11	6007899	rs4501959	C	T	2083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.501;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.928;NF=37;NR=46;PP=1310;ReadPosRankSum=0.190;SC=AGAACCAGGTCGATGGCAGCT;SOR=0.429;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=164;TCF=64;TCR=100;TR=83;WE=6007907;WS=6007889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,94:0.53:177
chr11	6023581	rs11040248	A	G	3514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.975;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=79;PP=2292;ReadPosRankSum=0.232;SC=CAATAAGGATAAGATCAGAGC;SOR=0.501;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=313;TCF=167;TCR=146;TR=155;WE=6023595;WS=6023571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,167:0.49:341
chr11	6023640	rs11040249	T	C	3048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.399;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=70;PP=1558;ReadPosRankSum=-1.456;SC=TTGAAAGTGATGTCATCACAA;SOR=0.684;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=306;TCF=155;TCR=151;TR=141;WE=6023648;WS=6023630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,155:0.47:329
chr11	6023818	rs10839221	G	A	2504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.422;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=50;PP=1404;ReadPosRankSum=-0.278;SC=TGATAGACGGGTATCTCAATG;SOR=0.452;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=209;TCF=99;TCR=110;TR=103;WE=6023826;WS=6023808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,116:0.52:225
chr11	6079001	rs4448669	G	A	3113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=369;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.792;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=70;PP=1828;ReadPosRankSum=-0.909;SC=AGTAATCCCCGCACCAGCACC;SOR=0.639;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=335;TCF=167;TCR=168;TR=144;WE=6079009;WS=6078991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:212,157:0.43:369
chr11	6129837	rs1462983	C	T	2096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.511;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=37;PP=1271;ReadPosRankSum=0.125;SC=TCCCCTTATTCCTGTGTTCCT;SOR=0.756;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=177;TCF=98;TCR=79;TR=85;WE=6129845;WS=6129827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,97:0.47:205
chr11	6150738	rs325637	A	G	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.525;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=65;ReadPosRankSum=-0.746;SC=AGCTGAGAGCAGGCTTCCAGA;SOR=0.836;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=6;WE=6150746;WS=6150728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr11	6173131	rs145027520	T	C	3024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.910;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=61;PP=1471;ReadPosRankSum=0.683;SC=AGGATCAAAGTGTAGGAAAAA;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=244;TCF=129;TCR=115;TR=127;WE=6173139;WS=6173121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,147:0.52:280
chr11	6173346	rs11826453	G	T	2514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.989;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=48;PP=1507;ReadPosRankSum=-0.157;SC=TCCCCAGATTGTCAGGGTCAT;SOR=0.740;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=246;TCF=133;TCR=113;TR=113;WE=6173354;WS=6173336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,126:0.45:278
chr11	6173364	rs325695	T	A	2744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.084;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=54;PP=1605;ReadPosRankSum=1.321;SC=CATTTTTCCATTTACCATAGA;SOR=0.877;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=276;TCF=153;TCR=123;TR=128;WE=6173372;WS=6173354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,140:0.46:306
chr11	6220376	rs325610	G	C	1835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=42;NR=14;PP=1081;SC=GCCACTGTGAGACCCCCAAAA;SOR=1.793;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=42;TCR=14;TR=56;WE=6220384;WS=6220366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr11	6221169	rs10839531	A	G	4579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=66;PP=2561;SC=CGGGAGGCCCATGCCAAGGCC;SOR=0.837;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=161;TCF=95;TCR=66;TR=160;WE=6221177;WS=6221159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr11	6221214	rs11040799	T	A	5468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=97;NR=78;PP=2965;SC=TGTGTCATTCTGGCCTTCTAC;SOR=0.703;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=175;TCF=97;TCR=78;TR=175;WE=6221222;WS=6221204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr11	6227083	rs10742968	C	T	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=298;ReadPosRankSum=2.826;SC=TGGCACGAACCGCCCCATTTA;SOR=0.892;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=19;WE=6227091;WS=6227073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,22:0.54:41
chr11	6231731	rs10769671	C	T	4661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=84;PP=2800;SC=CACATCAGCACCTGCTGATAC;SOR=0.950;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=153;TCF=69;TCR=84;TR=153;WE=6231739;WS=6231721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr11	6232087	.	A	AG	20	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=27;MQ=60.9;NF=2;NR=0;PP=20;QD=20.5;SC=GGGAAAAGCTAGGGGGGGAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=2;WE=6232095;WS=6232077;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,2:0.25:8
chr11	6232653	rs9659	C	T	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.928;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=337;ReadPosRankSum=0.089;SC=AGTCCTTTTGCCACTGCCTCC;SOR=1.609;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=36;TCF=31;TCR=5;TR=19;WE=6232661;WS=6232643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr11	6239139	rs11040809	A	G	2312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.910;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=53;PP=1373;ReadPosRankSum=0.621;SC=CCACACCACGACGTGCCTCAC;SOR=0.757;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=251;TCF=124;TCR=127;TR=102;WE=6239147;WS=6239129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,118:0.41:287
chr11	6239344	rs3750944	G	A	4095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=73;NR=69;PP=2301;SC=GGGTACTGTCGTCACAGAAGA;SOR=0.800;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=142;TCF=73;TCR=69;TR=142;WE=6239352;WS=6239334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr11	6240358	rs73392995	A	C	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.871;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=170;ReadPosRankSum=-0.645;SC=CGGGAACCCCACCAGCCCCAA;SOR=1.329;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=18;TCF=8;TCR=10;TR=11;WE=6240366;WS=6240348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr11	6243804	rs3750945	A	G	3950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=71;PP=2425;SC=AAAGTTCCAGATAGGCGGTAC;SOR=0.807;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=141;TCF=70;TCR=71;TR=140;WE=6243812;WS=6243794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr11	6243843	rs3750946	C	G	3256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=60;PP=2160;SC=CAGAGGTCTGCACAAAAAGAA;SOR=0.853;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=114;TCF=54;TCR=60;TR=114;WE=6243851;WS=6243833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr11	6243963	rs3750947	G	A	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.526;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=9;PP=272;ReadPosRankSum=-2.256;SC=TCTACCCACCGCCTCCTACGT;SOR=0.368;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=48;TCF=28;TCR=20;TR=19;WE=6243971;WS=6243953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,18:0.35:51
chr11	6243982	rs325606	T	G	2040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=27;PP=1396;SC=GTTAGTCCTGTCACTGAGGTT;SOR=1.042;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=40;TCR=27;TR=67;WE=6243990;WS=6243972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr11	6281108	rs2929180	T	G	786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=16;NR=7;PP=469;SC=TGGAGCCGCGTTGGGAGCCCG;SOR=1.382;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=16;TCR=7;TR=23;WE=6281116;WS=6281098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	6281400	rs11040819	T	C	3860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=65;NR=78;PP=2444;SC=CACACTACCTTCTCAAACGTC;SOR=1.257;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=146;TCF=67;TCR=79;TR=143;WE=6281408;WS=6281390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr11	6290756	rs3901667	A	C	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.375;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=77;ReadPosRankSum=-0.253;SC=AAAGGATTCAAGTTCACCATT;SOR=0.044;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=7;WE=6290764;WS=6290746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr11	6291120	rs1805002	G	A	2013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.495;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=57;PP=1356;ReadPosRankSum=-0.044;SC=CTTTGGCACCGTCATCTGCAA;SOR=0.743;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=210;TCF=96;TCR=114;TR=103;WE=6291128;WS=6291110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,101:0.45:222
chr11	6292837	rs10839535	C	G	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.46;ReadPosRankSum=-0.824;SOR=0.910;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr11	6292837	.	CG	GA	200	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=1;NR=10;PP=200;QD=23.0425340784;SC=TCCAGACATACGAAACACAAA;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=11;WE=6292846;WS=6292827;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr11	6292838	rs10839536	G	A	1089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=24;PP=329;SC=CCAGACATACGAAACACAAAC;SOR=3.912;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=27;WE=6292846;WS=6292827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
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chr11	6411935	rs3838786	TGCTGGC	T,CGCTGGC	5098.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=24;NF=57,10;NR=58,39;PP=2962,2987;SC=ATGGGCCTGGTGCTGGCGCTG;SOR=0.758;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=233;TCF=122;TCR=111;TR=115,49;WE=6411948;WS=6411925;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.46,0.53:223
chr11	6415463	rs1050239	G	A	3595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=360;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.242;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=68;PP=2233;ReadPosRankSum=-2.013;SC=AAACTACTCCGGGAGCTCTCA;SOR=0.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=330;TCF=180;TCR=150;TR=153;WE=6415471;WS=6415453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:190,169:0.47:359
chr11	6416959	rs1800606	C	T	6070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=130;NR=74;PP=2965;SC=GCAGTCACTCCCCAGCCTACC;SOR=1.163;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=205;TCF=130;TCR=75;TR=204;WE=6416967;WS=6416949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr11	6425710	.	G	A	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=26;ReadPosRankSum=1.068;SC=ACACACAGGCGGACCCACACT;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=3;WE=6425718;WS=6425704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr11	6453332	rs17242666	T	C	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.375;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=151;ReadPosRankSum=1.323;SC=AAATGAGTCATGAGAGGGAGA;SOR=3.145;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=10;WE=6453340;WS=6453322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr11	6459838	rs10500670	C	T	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=21;PP=499;ReadPosRankSum=-0.334;SC=ACGATATCCTCCTGTGGCCCT;SOR=0.679;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=67;TCF=21;TCR=46;TR=30;WE=6459846;WS=6459828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,30:0.43:70
chr11	6462087	rs35862450	G	A	1311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.564;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=27;PP=791;ReadPosRankSum=0.605;SC=TCAATCCTTCGCTTCTAGTCC;SOR=0.747;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=161;TCF=91;TCR=70;TR=62;WE=6462103;WS=6462077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,69:0.39:177
chr11	6471722	rs17821052	T	G	2261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.003;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=49;PP=1580;ReadPosRankSum=1.295;SC=TAGAGAGGAGTCTTGTGGAAG;SOR=0.626;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=214;TCF=108;TCR=106;TR=99;WE=6471730;WS=6471712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,104:0.45:233
chr11	6477176	rs139873545	TTAAGGAACGGTACTATCTG	T	571.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.518;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=2962;ReadPosRankSum=1.073;SC=TTCACTGCTCTTAAGGAACGG;SOR=0.111;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=7;WE=6477202;WS=6477166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr11	6477455	rs13343175	C	T	3381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.966;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=61;PP=2149;ReadPosRankSum=-0.342;SC=CAGAGGTCATCTTGAACCTCC;SOR=0.627;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=233;TCF=134;TCR=99;TR=138;WE=6477463;WS=6477445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,152:0.59:259
chr11	6477831	rs10606	C	T	2276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.962;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=53;PP=1324;ReadPosRankSum=0.903;SC=CCACTGGCACCGGAAGGCGCG;SOR=0.673;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=270;TCF=144;TCR=126;TR=108;WE=6477839;WS=6477821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:179,119:0.40:298
chr11	6478384	rs11605141	C	T	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=351;ReadPosRankSum=0.996;SC=ACACAGATGCCCACAGCACCT;SOR=0.616;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=38;TCF=27;TCR=11;TR=21;WE=6478392;WS=6478374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,22:0.56:39
chr11	6478619	rs16913748	G	A	906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.866;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=23;PP=535;ReadPosRankSum=0.289;SC=ACGCTGCACTGATCTGGGCCA;SOR=0.906;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=78;TCF=28;TCR=50;TR=34;WE=6478627;WS=6478609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,41:0.48:85
chr11	6499215	rs2303493	A	G	612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.998;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=15;PP=325;ReadPosRankSum=1.007;SC=CTAATGCCCAAATTTCCACCC;SOR=0.529;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=53;TCF=22;TCR=31;TR=27;WE=6499223;WS=6499205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,30:0.49:61
chr11	6500309	rs2253104	A	G	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=6;PP=252;ReadPosRankSum=-0.422;SC=ACGATCACGAAGAAAAGGGAA;SOR=0.586;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=37;TCF=23;TCR=14;TR=14;WE=6500317;WS=6500299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,15:0.38:39
chr11	6503127	rs2303492	G	A	1334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.150;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=35;PP=760;ReadPosRankSum=1.307;SC=AGAGTTTAGCGGTAGACTGCT;SOR=1.022;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=120;TCF=50;TCR=70;TR=54;WE=6503135;WS=6503117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,64:0.45:142
chr11	6519642	rs11604149	G	A	1978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=43;PP=1186;ReadPosRankSum=-1.161;SC=GCTGAGCTCCGAACTCTGTTC;SOR=0.720;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=178;TCF=89;TCR=89;TR=85;WE=6519650;WS=6519632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,94:0.48:197
chr11	6520015	rs11040899	G	T	1555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.277;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=23;PP=786;ReadPosRankSum=-0.288;SC=CATTGACACTGCCTGAGCTAC;SOR=0.430;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=114;TCF=58;TCR=56;TR=55;WE=6520023;WS=6520005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,69:0.52:133
chr11	6520164	rs2555158	T	A	1499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.590;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=33;PP=808;ReadPosRankSum=-1.548;SC=AATGCAGAGGTGGAGCCTGTT;SOR=0.612;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=139;TCF=67;TCR=72;TR=66;WE=6520172;WS=6520154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,76:0.48:158
chr11	6520346	rs10769693	C	G	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.97;ReadPosRankSum=-0.090;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr11	6524240	rs11040900	C	T	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=221;ReadPosRankSum=-0.177;SC=TCTCCACGTGCGCACCCTTCT;SOR=0.646;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=32;TCF=12;TCR=20;TR=14;WE=6524248;WS=6524230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr11	6530278	rs10839568	C	T	2276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.029;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=45;PP=1535;ReadPosRankSum=-0.342;SC=TCATTCCATTCTTTAAGTATT;SOR=0.824;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=256;TCF=147;TCR=109;TR=106;WE=6530286;WS=6530268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,114:0.41:281
chr11	6532519	rs4758423	C	T	1154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=12;PP=717;ReadPosRankSum=0.215;SC=GCAGGAGCTACACTCTGTGTC;SOR=0.745;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=93;TCF=66;TCR=27;TR=48;WE=6532527;WS=6532509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,53:0.52:101
chr11	6541225	rs11603869	C	G	2682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=53;PP=1584;ReadPosRankSum=-1.290;SC=TCTCTCATCACAGCTGGTCTT;SOR=0.706;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=209;TCF=111;TCR=98;TR=111;WE=6541233;WS=6541215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,128:0.54:237
chr11	6541580	rs2555143	T	G	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.286;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=247;ReadPosRankSum=-0.086;SC=GCACAAGTACTAATGGCATGG;SOR=1.638;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=50;TCF=19;TCR=31;TR=16;WE=6541588;WS=6541570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,17:0.32:53
chr11	6549634	rs55919773	G	GGTGT	157.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.76;ReadPosRankSum=-0.897;SOR=0.382;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
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chr11	6549995	rs7480644	A	G	4809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.19;SOR=0.881;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
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chr11	6555365	rs7103810	A	G	10496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=387;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=170;NR=174;PP=2965;ReadPosRankSum=0.443;SC=ACAGTCAGCGACCTCAGTGAA;SOR=0.746;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=346;TCF=171;TCR=175;TR=344;WE=6555373;WS=6555355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,384:0.99:386
chr11	6560141	rs11040914	A	C	1025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=20;PP=643;SC=AACACCTTTCATCCCCAAGTT;SOR=1.432;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=12;TCR=20;TR=32;WE=6560149;WS=6560131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr11	6561007	rs138266368	C	G	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.971;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=257;ReadPosRankSum=0.138;SC=TGAGCCCTGGCCCTTGAGTTC;SOR=1.828;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=12;WE=6561015;WS=6561002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr11	6567895	rs11270441	C	CTGCCCTACTGCA	6145.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=38;PP=2957;SC=ATTGAGGAGGCTGCCCTACTG;SOR=1.057;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=77;TCF=10;TCR=67;TR=44;WE=6567903;WS=6567885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr11	6569896	rs11606889	G	A	972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.229;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=13;PP=569;ReadPosRankSum=-0.044;SC=CTTGTATGTGGTGGACCTGCT;SOR=0.376;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=70;TCF=50;TCR=20;TR=41;WE=6569904;WS=6569886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,45:0.58:78
chr11	6578004	rs11600179	G	A	1732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.187;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=39;PP=1179;ReadPosRankSum=-0.472;SC=AACTGCAGACGCTGCAGCCTA;SOR=0.678;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=192;TCF=101;TCR=91;TR=80;WE=6578012;WS=6577994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,82:0.39:211
chr11	6579106	rs11040920	C	A	2775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=56;PP=1753;ReadPosRankSum=0.264;SC=GTTGAGCCCCCACCTGGCCCG;SOR=0.655;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=184;TCF=92;TCR=92;TR=113;WE=6579114;WS=6579096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,121:0.60:202
chr11	6579354	rs16915382	G	C	1821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=4.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.573;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=42;PP=1187;ReadPosRankSum=0.433;SC=CAGTGGCTCTGTTGGTACCCA;SOR=1.047;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=152;TCF=62;TCR=90;TR=67;WE=6579362;WS=6579344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,78:0.45:173
chr11	6579539	rs10839583	A	G	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.477;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=259;ReadPosRankSum=-0.580;SC=TGAGGCCAAGAACCCCATATG;SOR=1.078;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=10;TCR=18;TR=17;WE=6579547;WS=6579529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr11	6580495	rs72901756	G	A	2309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.102;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=59;PP=1294;ReadPosRankSum=-0.467;SC=TGGAACAGCAGCTGAAAGACT;SOR=0.815;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=190;TCF=80;TCR=110;TR=100;WE=6580503;WS=6580485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,112:0.55:205
chr11	6585007	rs11040923	G	A	2887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=62;PP=1749;ReadPosRankSum=0.087;SC=AGGTATGGACGATGCAGCCCT;SOR=0.670;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=245;TCF=120;TCR=125;TR=121;WE=6585015;WS=6584997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,135:0.49:278
chr11	6585502	rs7107072	T	C	742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=1;PP=577;SC=CCCTCTGCCATATCTCTGCCT;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=6585510;WS=6585492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	6587252	rs12292436	C	G	815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.089;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=25;PP=548;ReadPosRankSum=-1.270;SC=ACCCTGGCCCCTTTTTGACTT;SOR=0.909;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=67;TCF=19;TCR=48;TR=33;WE=6587260;WS=6587242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,35:0.54:65
chr11	6588228	rs10769699	G	A	2578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.452;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=53;PP=1514;ReadPosRankSum=0.089;SC=TGCCAGCTGCGTGCTCATTGT;SOR=0.667;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=235;TCF=122;TCR=113;TR=109;WE=6588236;WS=6588218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,125:0.48:260
chr11	6591157	rs10839585	A	G	2044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=18;PP=1238;SC=CTCAGGAGAGAGGTTTGAACT;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=64;TCF=45;TCR=19;TR=63;WE=6591165;WS=6591147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr11	6621516	rs11040933	G	A	2212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.011;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=46;PP=1315;ReadPosRankSum=-2.699;SC=AAAAGACCCAGTGAGAACCAA;SOR=0.769;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=207;TCF=109;TCR=98;TR=98;WE=6621524;WS=6621506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,108:0.47:228
chr11	6622714	rs2288283	G	A	3245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=48;PP=1946;SC=ATCTTCTCTTGTTCTTTTGCC;SOR=0.743;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=107;TCF=58;TCR=49;TR=106;WE=6622722;WS=6622704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr11	6622857	rs11826421	G	A	1184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.770;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=33;PP=697;ReadPosRankSum=1.249;SC=ATGGGAAGGTGCACATGAGGC;SOR=0.857;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=95;TCF=37;TCR=58;TR=52;WE=6622865;WS=6622847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,56:0.54:104
chr11	6624617	rs12420389	T	C	1049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.554;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=17;PP=626;ReadPosRankSum=0.492;SC=CTCCCATTGCTCCCGCGAGTC;SOR=0.988;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=90;TCF=52;TCR=38;TR=44;WE=6624625;WS=6624607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,52:0.50:103
chr11	6626049	rs55802517	G	A	918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.785;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=13;PP=537;ReadPosRankSum=0.042;SC=TTTTAAAGCTGTATAGTGACA;SOR=0.816;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=85;TCF=57;TCR=28;TR=40;WE=6626057;WS=6626039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,45:0.46:97
chr11	6626072	rs12272856	C	A	1382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.629;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=24;PP=761;ReadPosRankSum=-1.061;SC=ATGAGATTGTCCATTTTTCAG;SOR=0.793;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=127;TCF=76;TCR=51;TR=62;WE=6626080;WS=6626062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,69:0.49:141
chr11	6629530	rs2048092	G	A	1126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.466;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=28;PP=672;ReadPosRankSum=1.215;SC=AAGCATGTGTGCTCTTCCCCC;SOR=0.884;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=105;TCF=49;TCR=56;TR=51;WE=6629538;WS=6629520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,57:0.48:119
chr11	6629665	rs1043388	C	T	1258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.125;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=26;PP=733;ReadPosRankSum=-0.927;SC=TGAATGAACACGGGAATGTGC;SOR=0.626;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=124;TCF=67;TCR=57;TR=58;WE=6629673;WS=6629655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,64:0.45:142
chr11	6630028	rs11314683	TC	T	12154.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=379;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=153;PP=2974;SC=GAGGTCCATCTCCCCCATCCC;SOR=0.842;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=222;TCF=60;TCR=162;TR=210;WE=6630036;WS=6630018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,372:1.00:372
chr11	6630833	rs1043390	G	A	1234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.698;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=28;PP=759;ReadPosRankSum=-0.868;SC=ACTGGATGCCGTATGGATCCC;SOR=0.790;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=101;TCF=52;TCR=49;TR=54;WE=6630841;WS=6630823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,59:0.52:113
chr11	6632349	rs2555174	C	G	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.075;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=210;ReadPosRankSum=-0.165;SC=TCAGTTTCCCCAAAGGGGTGG;SOR=0.188;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=14;WE=6632357;WS=6632346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr11	6632857	rs1876300	A	T	1270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.653;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=24;PP=930;ReadPosRankSum=-1.654;SC=GAAAGTTTTGACAGCAGGCTA;SOR=0.616;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=125;TCF=77;TCR=48;TR=59;WE=6632865;WS=6632847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,60:0.45:133
chr11	6637518	rs7943955	A	G	929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=16;PP=697;SC=AGGTGTAAGCATTGTCTAAGT;SOR=0.811;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=19;TCR=16;TR=35;WE=6637526;WS=6637508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr11	6638506	rs1800738	A	T	2303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=51;PP=1670;SC=GTGTGCCCCAACCCCCATTCA;SOR=1.445;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=30;TCR=51;TR=81;WE=6638514;WS=6638496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr11	6644427	rs35599968	C	G	1829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.491;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=43;PP=1165;ReadPosRankSum=1.030;SC=GTGGCCACGCCGGGCACCTTC;SOR=0.640;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=212;TCF=114;TCR=98;TR=89;WE=6644435;WS=6644417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,95:0.42:226
chr11	6703892	rs1567135	T	G	3373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=66;NR=44;PP=1940;SC=AGTACCCAAGTTTAATTCTGC;SOR=0.958;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=110;TCF=66;TCR=44;TR=110;WE=6703900;WS=6703882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr11	6739109	rs7112561	G	A	4020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=359;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.382;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=82;PP=2426;ReadPosRankSum=-0.369;SC=AATGCTCTTGGAGAAACTGAA;SOR=0.721;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=321;TCF=158;TCR=163;TR=163;WE=6739117;WS=6739094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,186:0.52:357
chr11	6739407	rs12284429	A	G	1548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.378;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=24;PP=935;ReadPosRankSum=-0.668;SC=TTCATCGATAAGAAATCCTTG;SOR=1.069;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=134;TCF=72;TCR=62;TR=59;WE=6739415;WS=6739397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,69:0.48:145
chr11	6739814	rs7114441	C	T	5522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FS=0.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.18;ReadPosRankSum=-0.172;SOR=0.668;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:145,143:0.50:288
chr11	6739822	rs7102825	T	C	5551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FS=0.417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.44;ReadPosRankSum=0.676;SOR=0.656;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:154,147:0.49:301
chr11	6740308	rs12223353	C	T	2895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.356;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=61;PP=1852;ReadPosRankSum=-1.459;SC=TCTTCCTGATCTGAAGCATTT;SOR=0.604;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=273;TCF=134;TCR=139;TR=121;WE=6740316;WS=6740298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,137:0.44:311
chr11	6789294	rs7924459	G	C	1327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.272;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.154;NF=18;NR=36;PP=872;ReadPosRankSum=0.531;SC=CTCAAGGCCCGCATGACCTCC;SOR=1.106;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=126;TCF=48;TCR=78;TR=54;WE=6789302;WS=6789284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,61:0.45:136
chr11	6789929	rs11828782	C	A	997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.433;NF=26;NR=12;PP=670;ReadPosRankSum=0.446;SC=GTTTTCTCTGCGCAGAAAGTC;SOR=0.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=47;TCR=22;TR=38;WE=6789937;WS=6789919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,43:0.54:79
chr11	6790028	rs10839616	C	G	1938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.511;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.008;NF=47;NR=39;PP=1081;ReadPosRankSum=-0.465;SC=CATGTGGAGCCGGGCTTCTAT;SOR=0.742;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=187;TCF=103;TCR=84;TR=86;WE=6790036;WS=6790018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,99:0.49:204
chr11	6790106	rs7102536	T	C	5542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=102;PP=2965;SC=AAATGTAGCATAGAGCAGTTC;SOR=0.968;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=190;TCF=88;TCR=102;TR=190;WE=6790114;WS=6790096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr11	6806181	rs17264523	A	G	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=81;ReadPosRankSum=1.142;SC=ATGTCCTAAGAAGCCTCTGAT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=5;WE=6806189;WS=6806171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr11	6806496	rs11041022	T	C	788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.528;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.175;NF=20;NR=21;PP=469;ReadPosRankSum=-0.874;SC=TCACATCTGTTGTCACTCCCA;SOR=0.555;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=105;TCF=49;TCR=56;TR=41;WE=6806504;WS=6806486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,42:0.35:119
chr11	6806827	rs2659880	G	T	2989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.879;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=65;PP=1746;ReadPosRankSum=1.147;SC=CTTGCTGAAGGTGGCCTGTGC;SOR=0.753;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=253;TCF=126;TCR=127;TR=124;WE=6806835;WS=6806817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,144:0.49:296
chr11	6807163	rs2659879	C	G	2351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.940;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.690;NF=54;NR=46;PP=1361;ReadPosRankSum=1.396;SC=GGAGGTCATGCGGGCCTTGAG;SOR=0.476;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=152;TCF=83;TCR=69;TR=100;WE=6807171;WS=6807153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,108:0.66:163
chr11	6807243	rs497681	G	A	1912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.746;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=43;PP=1112;ReadPosRankSum=-2.538;SC=CTAGCTTCCAGAATTCCTTCT;SOR=0.916;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=147;TCF=68;TCR=79;TR=79;WE=6807251;WS=6807233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,89:0.54:164
chr11	6816778	rs866347	A	G	9582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=350;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=167;NR=159;PP=2965;SC=TGTGGAGGGTAGAATGGTTCC;SOR=0.716;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=326;TCF=167;TCR=159;TR=326;WE=6816786;WS=6816768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,350:1.00:350
chr11	6816875	rs7122644	G	A	2105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.834;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=56;PP=1268;ReadPosRankSum=-2.557;SC=CTGTAGTGGCGCAGGAGCAGG;SOR=0.967;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=157;TCF=61;TCR=96;TR=87;WE=6816883;WS=6816865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,95:0.57:167
chr11	6866815	rs2741801	C	T	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.263;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=2;PP=401;ReadPosRankSum=0.424;SC=TTGCCTCTATCCCTGACATTA;SOR=0.930;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=58;TCF=50;TCR=8;TR=23;WE=6866823;WS=6866805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,27:0.42:64
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chr11	6867894	rs7105094	T	C	1272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.428;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=32;PP=799;ReadPosRankSum=0.544;SC=CTAAATTCTATTGAATGACAA;SOR=0.556;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=115;TCF=44;TCR=71;TR=53;WE=6867902;WS=6867884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,61:0.46:134
chr11	6891704	rs10839632	T	C	12387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=457;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=208;NR=204;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.963;SC=CTTTTCTATATATCATTAAGC;SOR=0.702;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=413;TCF=208;TCR=205;TR=412;WE=6891712;WS=6891694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,454:1.00:456
chr11	6898663	rs10839635	G	A	5429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=81;PP=2965;SC=ACGTATTTCCGACCCCAATCC;SOR=0.768;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=167;TCF=86;TCR=81;TR=167;WE=6898671;WS=6898653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr11	6913244	rs1965208	A	G	5979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=86;PP=2965;SC=TAGCCTCAGTATGAAGGTGGT;SOR=0.731;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=180;TCF=94;TCR=86;TR=180;WE=6913252;WS=6913234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr11	6942476	rs10839658	C	A	7100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=119;NR=123;PP=2965;SC=TCTTAGAAATCTCTCCTTTGC;SOR=0.762;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=243;TCF=120;TCR=123;TR=242;WE=6942484;WS=6942466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,269:1.00:269
chr11	6942726	rs10839659	G	C	1622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.765;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=29;PP=844;ReadPosRankSum=-1.606;SC=TTCAGGTCCTGGGCCAGTGGG;SOR=0.782;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=138;TCF=71;TCR=67;TR=65;WE=6942734;WS=6942716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,74:0.49:150
chr11	6953858	rs11041108	A	G	2670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.911;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=59;PP=1534;ReadPosRankSum=1.595;SC=CAGTAAAGATATGGTGACCCT;SOR=0.774;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=247;TCF=124;TCR=123;TR=113;WE=6953866;WS=6953848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,129:0.46:282
chr11	6962957	rs2857891	C	T	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.074;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=315;ReadPosRankSum=-1.105;SC=ATTTTTTGATCTTTGAACTTG;SOR=0.487;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=68;TCF=18;TCR=50;TR=24;WE=6962965;WS=6962947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,25:0.33:75
chr11	6964926	rs79180154	T	G	1902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.142;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=42;PP=1228;ReadPosRankSum=0.234;SC=TTCCTAAACATACAGACAATG;SOR=0.414;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=128;TCF=56;TCR=72;TR=79;WE=6964934;WS=6964916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,84:0.60:141
chr11	6965012	rs2515947	C	G	811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=22;PP=588;SC=AGACATTATTCGCTTTTGTTC;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=26;WE=6965020;WS=6965002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	6976988	rs2239731	A	T	2031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.941;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=43;PP=1328;ReadPosRankSum=2.190;SC=CCGAAAGTGGACACCCTTCTT;SOR=0.932;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=254;TCF=139;TCR=115;TR=102;WE=6976996;WS=6976978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:189,112:0.37:301
chr11	6977175	rs2239730	G	C	739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=15;PP=395;ReadPosRankSum=-0.233;SC=TGCTATACAAGTGGGAATTCC;SOR=0.687;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=38;TCR=34;TR=31;WE=6977183;WS=6977165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,37:0.44:85
chr11	7022160	rs2857919	A	G	6161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=111;PP=2965;SC=CATGCTTTACAGATGGAGCAT;SOR=0.992;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=203;TCF=92;TCR=111;TR=203;WE=7022168;WS=7022150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr11	7022531	rs1156525	A	C	1978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.354;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=39;PP=1205;ReadPosRankSum=1.179;SC=TAAGTTCCTGAGACTTTTGCT;SOR=0.617;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=171;TCF=83;TCR=88;TR=84;WE=7022539;WS=7022521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,90:0.49:184
chr11	7059960	rs12801277	A	C	3301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=49;PP=2186;SC=ACACCCTGGAATGAAGTGAAG;SOR=0.728;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=57;TCR=49;TR=106;WE=7059968;WS=7059950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr11	7059981	rs61063081	G	A	1291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=26;PP=871;ReadPosRankSum=1.828;SC=AAGGCCAGGCGGGAGGACCTG;SOR=0.713;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=125;TCF=71;TCR=54;TR=58;WE=7059989;WS=7059971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,61:0.44:138
chr11	7060092	rs16921697	A	G	2768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=60;PP=1676;ReadPosRankSum=-0.707;SC=GAGAGAGCGAAAGAAGAGATC;SOR=0.690;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=214;TCF=109;TCR=105;TR=122;WE=7060100;WS=7060082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,133:0.57:235
chr11	7061062	rs17194742	T	G	1403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=33;PP=868;ReadPosRankSum=-0.879;SC=ATTCAAAGTTTTGATACAGGA;SOR=0.681;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=143;TCF=69;TCR=74;TR=63;WE=7061070;WS=7061052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,71:0.43:167
chr11	7063755	rs7123944	C	T	3221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=44;PP=1940;SC=AACACTTGTTCGATGTGGATG;SOR=0.877;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=103;TCF=59;TCR=44;TR=103;WE=7063763;WS=7063745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr11	7065289	rs6578821	C	A	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=100;ReadPosRankSum=-0.468;SC=AGGGAGGAGGCGTTTAGCTGA;SOR=0.400;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=7;WE=7065297;WS=7065279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,9:0.29:31
chr11	7070866	rs1552727	G	A	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.637;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=422;ReadPosRankSum=-1.165;SC=GAGAGAAATGGTTTTGTAATA;SOR=2.465;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=20;WE=7070874;WS=7070856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,21:0.52:40
chr11	7071031	rs1552726	G	A	7644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=117;NR=133;PP=2965;SC=CATTGTGTGAGGCCTTGAAAC;SOR=0.920;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=250;TCF=117;TCR=133;TR=250;WE=7071039;WS=7071021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,281:1.00:281
chr11	7078804	rs16921939	A	C	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=174;ReadPosRankSum=0.637;SC=TTTTCAGGCAAGATTCCAAAG;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=38;TCF=33;TCR=5;TR=13;WE=7078812;WS=7078794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,16:0.36:44
chr11	7091569	rs17280682	C	T	958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=14;PP=593;ReadPosRankSum=-1.530;SC=CTCCTCTGCTCTTATCTGCAA;SOR=0.771;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=85;TCF=52;TCR=33;TR=39;WE=7091577;WS=7091559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,44:0.47:93
chr11	7091772	rs10769763	C	A	1064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-3.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.242;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=22;PP=494;ReadPosRankSum=0.528;SC=CCTCAGAATCCACCTAATTGT;SOR=0.258;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=62;TCF=24;TCR=38;TR=40;WE=7091780;WS=7091762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,49:0.66:74
chr11	7110237	rs11041169	C	G	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=7.827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.91;ReadPosRankSum=-0.762;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,15:0.33:45
chr11	7110243	rs7119420	G	C	1807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.64;SOR=1.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
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chr11	7110751	rs11041171	A	G	2244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.22;SOR=0.809;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr11	7260054	rs10839747	A	G	2240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.676;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=37;PP=1352;ReadPosRankSum=-1.525;SC=TGAGACTTCAATTTGGGAAAG;SOR=0.996;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=194;TCF=108;TCR=86;TR=96;WE=7260062;WS=7260044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,107:0.50:214
chr11	7324475	rs4412741	T	C	7488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=114;NR=135;PP=2965;SC=ACTTCCTAGATCCTCCCACGC;SOR=0.984;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=250;TCF=114;TCR=136;TR=249;WE=7324483;WS=7324465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,271:1.00:271
chr11	7335424	rs2035639	C	G	2654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.994;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=45;PP=1648;ReadPosRankSum=2.734;SC=AGATTCTTAGCTAGCCCCTAA;SOR=0.792;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=222;TCF=133;TCR=89;TR=116;WE=7335432;WS=7335414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,127:0.51:247
chr11	7586738	rs6578874	G	T	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=197;ReadPosRankSum=1.137;SC=ACCTTGCTCAGGGTGTCCACC;SOR=0.653;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=41;TCF=30;TCR=11;TR=20;WE=7586746;WS=7586728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,24:0.44:54
chr11	7614282	rs7939893	T	C	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=2;PP=432;ReadPosRankSum=2.202;SC=ACAAATTACATGCATCCCTTA;SOR=0.751;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=55;TCF=51;TCR=4;TR=24;WE=7614290;WS=7614272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,24:0.44:55
chr11	7614492	rs7115173	A	G	1715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=41;PP=1086;ReadPosRankSum=0.539;SC=TTATCCTGTTACCTCCTACTA;SOR=0.650;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=131;TCF=56;TCR=75;TR=73;WE=7614500;WS=7614482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,79:0.55:143
chr11	7614531	rs7129888	C	A	1239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.739;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=31;PP=701;ReadPosRankSum=0.692;SC=GAAGGGAAGCCCAAGAGATTT;SOR=0.600;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=41;TCR=55;TR=55;WE=7614539;WS=7614521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,60:0.57:106
chr11	7619518	rs4758206	T	C	2349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=45;PP=1537;SC=CTTAATATTATATTTTTCCCA;SOR=1.320;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=29;TCR=45;TR=74;WE=7619526;WS=7619508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr11	7619643	rs11604700	T	C	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=38;ReadPosRankSum=1.282;SC=TACTGTATTATAAATAATGAG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=7619651;WS=7619633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr11	7627097	rs74448370	A	T	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=173;ReadPosRankSum=2.066;SC=GTGAGATCCAAGTGGTGACTG;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=10;WE=7627105;WS=7627087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr11	7642407	rs10839822	T	C	550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=16;PP=497;SC=GATGGTGCAGTAGACAGACTT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=7642415;WS=7642397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	7650564	rs56298316	C	T	1201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=22;PP=800;ReadPosRankSum=0.027;SC=GGCCTGGACACTCTTTTCCTT;SOR=0.737;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=75;TCR=45;TR=58;WE=7650572;WS=7650554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,60:0.46:131
chr11	7650607	rs6578887	A	C	1934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.346;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=36;PP=1411;ReadPosRankSum=1.641;SC=TCCTTGTGCCAAGAACATAGC;SOR=0.865;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=192;TCF=107;TCR=85;TR=85;WE=7650615;WS=7650597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,91:0.42:216
chr11	7652096	rs72851307	C	T	1118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.885;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=13;PP=738;ReadPosRankSum=0.500;SC=TTTTGTGGTACGATTATAGGT;SOR=0.466;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=91;TCF=69;TCR=22;TR=49;WE=7652104;WS=7652086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,51:0.53:97
chr11	7652385	rs4130354	T	A	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.826;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=101;ReadPosRankSum=0.057;SC=TAAATTAATATAGTGCCCCTC;SOR=1.371;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=7;WE=7652393;WS=7652375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr11	7656809	rs11041490	G	A	2093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.467;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=51;PP=1333;ReadPosRankSum=-0.131;SC=AGCCCTTCCCGGTGTTAGAAC;SOR=0.654;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=227;TCF=105;TCR=122;TR=94;WE=7656817;WS=7656799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,104:0.41:251
chr11	7662732	rs4643071	C	T	4683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=72;PP=2635;SC=GTGGCTGGGACGACACTGCTG;SOR=0.775;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=155;TCF=83;TCR=72;TR=155;WE=7662740;WS=7662722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr11	7663726	rs4402283	T	C	2366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=43;PP=1186;SC=CAAACCTGCATGGGTGAATCT;SOR=1.255;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=34;TCR=43;TR=77;WE=7663734;WS=7663716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr11	7670249	rs4237757	A	G	1936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=40;PP=1482;SC=CCTTGTAAAAAGCAGAGGAAT;SOR=1.850;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=17;TCR=40;TR=57;WE=7670257;WS=7670239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr11	7670353	rs4758009	A	C	3970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.027;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=39;PP=2557;ReadPosRankSum=0.683;SC=GAATCCTGACACATCTGGGGT;SOR=1.631;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=125;TCF=85;TCR=40;TR=124;WE=7670361;WS=7670343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,139:0.99:140
chr11	7670440	rs4758209	A	G	8580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=149;NR=144;PP=2965;SC=TAGAGTTGACAGACGAATGCT;SOR=0.743;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=293;TCF=149;TCR=144;TR=293;WE=7670448;WS=7670430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,328:1.00:328
chr11	7670943	rs10839831	G	A	2256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=58;PP=1638;SC=CTGAAACATCGAGCATGAGCA;SOR=3.383;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=10;TCR=58;TR=68;WE=7670951;WS=7670933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr11	7672272	rs3923491	G	A	1547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=29;PP=788;SC=TAAGGACAAGGCACAAAAGCT;SOR=1.919;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=15;TCR=29;TR=44;WE=7672280;WS=7672262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr11	7673015	rs5864	G	A	5198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=106;PP=2965;SC=CTGAACAGGAGAAGCGAGAGA;SOR=1.430;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=172;TCF=66;TCR=106;TR=172;WE=7673023;WS=7673005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr11	7673099	rs11041498	T	C	1298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.90;SOR=3.477;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr11	7673106	rs11041499	T	C	1215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.03;SOR=3.690;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	7686584	rs1128627	A	T	5599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=91;NR=65;PP=2708;SC=GACATGCAAAATTGCTGAGCA;SOR=0.882;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=156;TCF=91;TCR=65;TR=156;WE=7686610;WS=7686574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr11	7686596	rs13172	G	A	5589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=71;PP=2393;SC=TGCTGAGCACGTGGAGGTGTT;SOR=0.702;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=167;TCF=80;TCR=87;TR=147;WE=7686610;WS=7686574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr11	7686602	rs16411	G	GTGTT	9556.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=62;PP=2974;SC=GCACGTGGAGGTGTTAGTAGG;SOR=0.759;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=84;TCF=14;TCR=70;TR=75;WE=7686610;WS=7686574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr11	7686674	rs13854	T	C	3390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=38;NR=71;PP=2374;SC=CCGTCTGGATTAGTGGTGGCG;SOR=1.368;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=38;TCR=71;TR=109;WE=7686682;WS=7686664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr11	7686810	rs55826178	C	G	438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=5;PP=235;SC=GCAAGCTGAGCGATGCCAGGT;SOR=0.818;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=13;WE=7686818;WS=7686800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	7686915	rs11041521	T	A	1089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=1;PP=861;SC=GTACTACTGCTCCCTGCAAAA;SOR=4.863;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=33;WE=7686923;WS=7686905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr11	7686959	rs11041522	A	G	2550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=22;PP=1705;SC=CTCTGCAGCAATCACCCCAGG;SOR=1.775;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=60;TCR=22;TR=82;WE=7686978;WS=7686949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr11	7686970	rs55635523	T	C	2978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=30;PP=1892;SC=TCACCCCAGGTCCCAGGCTCA;SOR=1.524;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=68;TCR=30;TR=98;WE=7686978;WS=7686949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr11	7687181	rs144589101	A	G	1189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=29;PP=696;ReadPosRankSum=1.112;SC=CTGTATGACAAGCAGGTACAG;SOR=0.663;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=91;TCF=33;TCR=58;TR=46;WE=7687189;WS=7687171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,54:0.51:106
chr11	7687669	rs12796110	A	C	1160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=13;PP=740;SC=AGTGAGGGCAATGGATGTCGT;SOR=1.455;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=28;TCR=13;TR=41;WE=7687677;WS=7687659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr11	7687715	rs12801394	T	C	2477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=30;PP=1378;SC=TACCACAGGTTGAACTGGTCT;SOR=1.130;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=54;TCR=30;TR=84;WE=7687723;WS=7687705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr11	7687863	rs62620008	C	A	2445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=48;PP=1354;SC=CAGCATACTCCTGGCCAAAGC;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=36;TCR=48;TR=84;WE=7687871;WS=7687853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr11	7687913	rs72851388	C	T	1063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=28;PP=760;SC=CCAACTCCCACGGCAAACAAG;SOR=3.026;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=33;WE=7687921;WS=7687903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr11	7689633	rs10743030	A	C	823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=3;PP=621;SC=GTTGTCCCTTAGAGGATCAAA;SOR=3.180;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=27;WE=7689641;WS=7689623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	7690685	rs4631871	T	C	675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=18;PP=604;SC=CTCTGAATTGTTGTACGCAAT;SOR=3.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=7690693;WS=7690675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	7693853	rs144823333	G	GCACACA	776.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.215;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=683;ReadPosRankSum=-0.766;SC=CGCTATTCCAGCACACACACA;SOR=1.085;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=67;TCF=16;TCR=51;TR=24;WE=7693864;WS=7693843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,28:0.35:81
chr11	7710729	rs4505055	C	G	1331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=6;PP=979;SC=CCAAGATCAACGTGTCAGCAG;SOR=3.365;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=32;TCR=6;TR=38;WE=7710758;WS=7710719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr11	7710742	rs4365041	A	T	2384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.00;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr11	7710750	rs4277100	G	A	2624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.66;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr11	7710877	rs4503519	C	T	5515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=91;NR=97;PP=2965;SC=CATCATTACACGATATTCTCC;SOR=0.882;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=188;TCF=91;TCR=97;TR=188;WE=7710885;WS=7710867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr11	7712471	rs4509745	C	T	6769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=118;NR=113;PP=2965;SC=GAACTGGGAACCAAAGAGTTG;SOR=0.773;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=231;TCF=118;TCR=113;TR=231;WE=7712479;WS=7712461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr11	7716549	rs4287332	C	G	2244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=48;PP=1506;SC=CAAGAAAAGACGTAGTGCATG;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=18;TCR=48;TR=66;WE=7716557;WS=7716539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr11	7716855	rs4528317	T	A	3017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=50;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=23;NR=49;PP=2055;SC=CCAGCTGCATTATCTGTGGCA;SOR=0.961;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=23;TCR=49;TR=72;WE=7716863;WS=7716845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr11	7717219	rs111491832	A	T	64.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.43;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr11	7720426	rs4367936	C	A	2403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=54;PP=1642;SC=AGTCAATATGCAACTAATAAA;SOR=1.911;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=20;TCR=54;TR=74;WE=7720434;WS=7720416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr11	7720453	rs35619418	A	AGG	1759.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=29;PP=1478;SC=ATCTGTGGAAAGAAGGGAAGG;SOR=2.726;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=30;WE=7720461;WS=7720443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr11	7721743	rs12279973	C	A	919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=5;PP=720;SC=AGAGGTAGAGCCTGTTGGTTC;SOR=2.985;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=30;WE=7721751;WS=7721733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr11	7721870	rs10839849	G	A	5903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=107;NR=90;PP=2965;ReadPosRankSum=2.277;SC=TGGATCCAGGGAAGCACTTTA;SOR=0.776;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=200;TCF=109;TCR=91;TR=197;WE=7721878;WS=7721860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,223:0.99:225
chr11	7723171	rs5789540	GA	G	3519.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=22;NR=35;PP=2439;SC=ATGCACAATCGATTTTTAAAA;SOR=0.953;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=24;TCR=38;TR=57;WE=7723179;WS=7723161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr11	7723683	rs4373911	G	A	6397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=122;NR=84;PP=2965;SC=AGACAATTCAGTATGATCCTC;SOR=1.057;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=206;TCF=122;TCR=84;TR=206;WE=7723691;WS=7723673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr11	7725092	rs3924747	C	T	1765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=42;NR=12;PP=1171;SC=CAATGTCACCCAGCCCCATTT;SOR=2.546;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=42;TCR=12;TR=54;WE=7725100;WS=7725082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr11	7725173	rs3924748	G	A	5379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=100;NR=73;PP=2965;SC=GTTTTAATAGGGTTATTGCTG;SOR=0.852;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=173;TCF=100;TCR=73;TR=173;WE=7725181;WS=7725163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr11	7725454	rs11041539	C	T	369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=306;SC=TGTCAAGAATCGTGGACTGTG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=7725462;WS=7725444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
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chr11	7794545	rs1482784	C	A	6868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=114;NR=102;PP=2965;SC=TGTAGGACAGCGATATCAATC;SOR=0.701;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=216;TCF=114;TCR=102;TR=216;WE=7794553;WS=7794535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr11	7794650	rs371799	G	C	6790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=126;NR=99;PP=2965;SC=GGGAGGTACAGGTGGAGAAGG;SOR=0.836;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=227;TCF=126;TCR=101;TR=225;WE=7794658;WS=7794640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr11	7794976	rs980145	T	A	6763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=116;NR=111;PP=2965;SC=TGGGTGGAGTTCACCAGGGGT;SOR=0.734;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=228;TCF=117;TCR=111;TR=227;WE=7794984;WS=7794966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr11	7847208	rs1482791	T	C	8498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=148;NR=131;PP=2965;SC=CAAACGTCACTACAGAACAGA;SOR=0.732;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=279;TCF=148;TCR=131;TR=279;WE=7847216;WS=7847198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,310:1.00:310
chr11	7847466	rs1482792	A	G	5769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.04;SOR=0.945;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr11	7847472	rs1482793	C	T	5713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.64;SOR=1.092;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr11	7847523	rs1482794	T	A	1924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=24;NR=39;PP=1202;SC=TCCCCATCTATATTGGGAATG;SOR=1.418;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=24;TCR=39;TR=63;WE=7847531;WS=7847513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr11	7871011	rs4758022	A	G	10077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=368;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=177;NR=155;PP=2965;SC=ATGGCACACTATTTTTCATGT;SOR=0.790;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=332;TCF=177;TCR=155;TR=332;WE=7871019;WS=7871001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,367:1.00:367
chr11	7949134	rs12273639	T	A	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=3.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=206;ReadPosRankSum=1.527;SC=TGATATACAATCAAACTTGGA;SOR=1.127;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=10;WE=7949142;WS=7949124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr11	7949192	rs11041669	G	A	784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=11;PP=522;ReadPosRankSum=1.226;SC=CAAACTTAATGAATCTAAATT;SOR=0.655;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=78;TCF=55;TCR=23;TR=36;WE=7949200;WS=7949182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,40:0.43:92
chr11	7949350	rs4758258	A	G	6645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=113;PP=2965;SC=GTAGATAAGCAGATTCAGCAG;SOR=0.882;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=220;TCF=107;TCR=113;TR=220;WE=7949358;WS=7949340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr11	7949791	rs7933807	A	C	1895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.164;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=27;PP=1266;ReadPosRankSum=0.159;SC=TTTCATAAAAACTCCTTTATT;SOR=0.810;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=169;TCF=103;TCR=66;TR=75;WE=7949803;WS=7949781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,85:0.46:186
chr11	7949860	rs7928451	G	A	3137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=390;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.772;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=65;PP=1867;ReadPosRankSum=-0.157;SC=ATAAGCCATTGCTCCCAGAAG;SOR=0.757;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=354;TCF=190;TCR=164;TR=148;WE=7949868;WS=7949850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:227,163:0.42:390
chr11	7950024	rs12272735	A	G	3399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.828;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=65;PP=2170;ReadPosRankSum=-0.073;SC=AGTTCAGGAGAAACAGGTACA;SOR=0.412;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=271;TCF=128;TCR=143;TR=138;WE=7950044;WS=7950014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,153:0.51:301
chr11	7960045	rs6578915	G	A	1115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=1;PP=701;SC=AAAAAATGCAGTCTGTTTTCA;SOR=5.670;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=26;WE=7960053;WS=7960035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr11	7961130	rs4758259	C	T	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.036;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=21;PP=470;ReadPosRankSum=0.046;SC=AGTCGTAATCCCATAGCTGTG;SOR=1.024;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=75;TCF=26;TCR=49;TR=30;WE=7961138;WS=7961120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,31:0.40:78
chr11	7961146	rs9787855	A	G	764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=22;PP=552;ReadPosRankSum=-0.282;SC=CTGTGAGTTCAAGTCTGGAAT;SOR=0.634;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=57;TCF=18;TCR=39;TR=33;WE=7961154;WS=7961136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,34:0.60:57
chr11	8009241	rs12421289	C	T	624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.839;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.108;NF=19;NR=10;PP=380;ReadPosRankSum=-0.461;SC=AGGGTGCTGCCCGAGTTATCG;SOR=0.941;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=80;TCF=49;TCR=31;TR=29;WE=8009249;WS=8009231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,31:0.36:87
chr11	8009420	rs12278319	G	A	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.364;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=169;ReadPosRankSum=1.068;SC=ACCTTTTGCTGTGACTTATCT;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=9;WE=8009428;WS=8009410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr11	8014479	rs4758267	C	T	1911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=19;PP=1272;SC=TGCTGATCCACGAGTACTACA;SOR=1.785;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=44;TCR=19;TR=63;WE=8014487;WS=8014469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr11	8061100	rs10769865	C	T	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=246;ReadPosRankSum=0.498;SC=CTGAAGGAGGCCTTGAGTGAC;SOR=0.724;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=43;TCF=32;TCR=11;TR=19;WE=8061108;WS=8061090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,21:0.42:50
chr11	8103104	rs11041733	G	T	2022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.126;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=50;PP=1300;ReadPosRankSum=-1.406;SC=AGGTACGCGGGCGCCGGGCCG;SOR=0.551;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=233;TCF=112;TCR=121;TR=99;WE=8103112;WS=8103094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,107:0.41:259
chr11	8111103	rs10584611	GTA	G	3975.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.512;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.198;NF=11;NR=35;PP=1835;ReadPosRankSum=0.400;SC=GCTCTGGGCTGTATATCCTGG;SOR=0.761;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=102;TCF=28;TCR=74;TR=46;WE=8111112;WS=8111093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,106:0.51:206
chr11	8111540	rs2272382	T	C	770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=3;PP=523;SC=CAAGGTGGGCTGTGGACCCCC;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=24;WE=8111548;WS=8111532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	8111853	rs11041737	G	A	1284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.860;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=34;PP=746;ReadPosRankSum=0.125;SC=CTAGGCAGGTGCGGACTGGTC;SOR=1.170;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=95;TCF=37;TCR=58;TR=52;WE=8111861;WS=8111843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,60:0.54:111
chr11	8115762	rs7396690	C	G	759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.019;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=23;PP=494;ReadPosRankSum=1.324;SC=CTACAGCCCTCCCCAGCAGGC;SOR=0.990;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=66;TCF=23;TCR=43;TR=33;WE=8115770;WS=8115752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,36:0.49:74
chr11	8117228	rs11041739	A	G	5371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=82;PP=2965;SC=CCCCATGGGGACCCAGTGATA;SOR=0.734;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=174;TCF=92;TCR=82;TR=174;WE=8117236;WS=8117218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr11	8118103	rs2242501	A	G	931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=831;ReadPosRankSum=0.360;SC=GATATGGCTAAGAGTGTGTGC;SOR=0.711;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=57;TCF=36;TCR=21;TR=23;WE=8118124;WS=8118093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,24:0.41:58
chr11	8118116	rs2242502	A	G	1149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.889;HP=1;HapScore=4;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=11;PP=831;ReadPosRankSum=-0.865;SC=GTGTGTGCATAAGTTTGTGGG;SOR=0.875;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=72;TCF=45;TCR=27;TR=32;WE=8118124;WS=8118093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,35:0.46:76
chr11	8118185	rs10160258	C	G	6059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=63;PP=2344;SC=TCAGGGGCAGCGTAGACTTCT;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=67;TCR=63;TR=130;WE=8118193;WS=8118175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr11	8118200	rs7931842	C	A	6189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=63;PP=2288;SC=ACTTCTCCTCCTTCATCCCTT;SOR=0.707;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=131;TCF=68;TCR=63;TR=131;WE=8118208;WS=8118190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr11	8119063	rs7950355	A	G	878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=7;NR=21;PP=637;SC=CATATCTACCACTGACCTCTC;SOR=2.019;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=28;WE=8119071;WS=8119053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr11	8119298	rs55892969	A	G	2016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=39;PP=1218;ReadPosRankSum=-1.309;SC=AAGAAGAGTAAAACTTCCAAT;SOR=0.660;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=178;TCF=97;TCR=81;TR=88;WE=8119306;WS=8119288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,97:0.47:206
chr11	8122234	rs7394561	G	A	2060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=31;PP=1090;SC=GCTGATGTGTGTATGTGGAGG;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=25;TCR=31;TR=56;WS=8122224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr11	8122242	rs138755629	A	AG	2230.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=29;PP=1419;SC=GTGTATGTGGAGGGGTACCAT;SOR=1.054;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=38;TCF=7;TCR=31;TR=36;WE=8122250;WS=8122224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr11	8123005	rs72093838	CTCTG	C	3301.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.212;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.984;NF=14;NR=33;PP=2197;ReadPosRankSum=0.306;SC=CTGTCCTTTTCTCTGTCTGTG;SOR=0.942;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=115;TCF=34;TCR=81;TR=47;WE=8123016;WS=8122995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,89:0.44:204
chr11	8132728	rs56271449	CA	C	101.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.765;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.30;ReadPosRankSum=-0.967;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,7:0.78:9
chr11	8159892	rs10839976	G	T	2066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.937;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=53;PP=1321;ReadPosRankSum=0.516;SC=TCCCCTTTGAGAGCTGAGAAT;SOR=0.902;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=220;TCF=104;TCR=116;TR=98;WE=8159900;WS=8159882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,104:0.44:234
chr11	8161878	rs6578932	C	T	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.362;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=38;ReadPosRankSum=1.550;SC=TAAAAGGATACAGAGGTATCA;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=4;WE=8161886;WS=8161868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr11	8174966	rs10743052	G	A	1086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=23;PP=589;ReadPosRankSum=0.394;SC=CTCACTCTTAGTTTTCTGCAA;SOR=0.771;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=84;TCF=40;TCR=44;TR=45;WE=8174974;WS=8174956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,51:0.56:91
chr11	8248440	rs2290451	C	G	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.245;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=169;ReadPosRankSum=-0.519;SC=GCGTGCACGCCTCCGCCGTGC;SOR=1.942;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=9;WE=8248448;WS=8248430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr11	8248482	rs2290450	C	T	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.850;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=382;ReadPosRankSum=0.317;SC=CTCAGGCTGGCGTCTGGGGAG;SOR=1.781;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=39;TCF=35;TCR=4;TR=20;WE=8248490;WS=8248472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,21:0.49:43
chr11	8251921	rs3750952	G	C	2282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.510;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=39;PP=1050;ReadPosRankSum=1.155;SC=AGTCACAGCAGGCACACTTGA;SOR=0.625;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=183;TCF=109;TCR=74;TR=97;WE=8251929;WS=8251911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,112:0.53:210
chr11	8284838	rs204931	A	G	2570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=62;NR=33;PP=1567;SC=GCGCCGCGGCAGGGGGCGAGG;SOR=1.225;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=62;TCR=33;TR=95;WE=8284846;WS=8284828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr11	8284981	rs176083	A	C	3333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=57;PP=1684;SC=CGCGCTTTGGAGGGGCGGCCG;SOR=0.806;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=115;TCF=58;TCR=57;TR=115;WE=8285003;WS=8284971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr11	8284995	rs204929	T	C	3454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=55;PP=2032;SC=GCGGCCGGTCTTCGGGCAGCT;SOR=0.824;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=112;TCF=57;TCR=55;TR=112;WE=8285003;WS=8284971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr11	8285124	rs2071458	A	C	814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=9;NR=21;PP=515;SC=TTTGTGCCTCAGAATTGGAAG;SOR=1.839;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=30;WE=8285132;WS=8285114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr11	8289880	rs147803664	C	T	957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.540;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=7;PP=677;ReadPosRankSum=0.227;SC=GCTCTGCCGCCGCTAGCGGGG;SOR=1.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=48;TCF=38;TCR=10;TR=36;WE=8289888;WS=8289870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,38:0.75:51
chr11	8434972	rs3833784	CA	C	765.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=8;PP=275;ReadPosRankSum=-1.954;SC=GACAGATTTGCAAAAAAAATG;SOR=0.601;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=62;TCF=36;TCR=26;TR=19;WE=8434980;WS=8434962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,38:0.44:86
chr11	8435077	rs3751095	CA	TC	7175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-2.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=373;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=71;PP=2944;ReadPosRankSum=0.232;SC=GTGTAATTGGCATCAGGGACA;SOR=0.693;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=323;TCF=164;TCR=159;TR=150;WE=8435086;WS=8435067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:187,185:0.50:372
chr11	8455722	rs142244696	G	T	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.394;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.75;ReadPosRankSum=0.460;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr11	8483335	rs1900273	G	A	1222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=22;PP=708;ReadPosRankSum=-0.263;SC=AAAATGCAGCGCCTAATAGAG;SOR=0.720;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=114;TCF=68;TCR=46;TR=54;WE=8483343;WS=8483325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,59:0.48:124
chr11	8496516	rs2289923	G	A	846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=23;PP=596;SC=AGAAAACCAGGCCAAAAAGGA;SOR=3.334;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=27;WE=8496524;WS=8496506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr11	8639325	rs4929924	G	A	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.544;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=296;ReadPosRankSum=1.112;SC=GATGTACTACGGCTCCCAAAT;SOR=1.469;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=45;TCF=32;TCR=13;TR=18;WE=8639333;WS=8639315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,19:0.38:50
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chr11	8642218	rs7950166	C	T	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=2.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.086;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=117;ReadPosRankSum=0.536;SC=ACTGAGTCTCCGGCTTTGCCG;SOR=1.270;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=9;WE=8642226;WS=8642208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr11	8644530	rs4929948	T	G	1759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=44;PP=914;ReadPosRankSum=-1.092;SC=GCCACACATCTGTCATACAGT;SOR=0.654;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=192;TCF=73;TCR=119;TR=74;WE=8644538;WS=8644520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,89:0.41:216
chr11	8644562	rs10533257	TCATA	T	1425.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=28;PP=1295;ReadPosRankSum=-0.398;SC=CTATAGTCATTCATACATAGT;SOR=0.722;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=83;TCF=1;TCR=82;TR=29;WE=8644573;WS=8644552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,40:0.36:112
chr11	8646237	rs12803166	G	T	1724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.524;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=33;PP=924;ReadPosRankSum=-0.184;SC=AGGAAGTTTGGATAGCATTTC;SOR=0.618;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=181;TCF=105;TCR=76;TR=77;WE=8646245;WS=8646227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,88:0.44:200
chr11	8646763	rs7935453	G	C	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=24;PP=537;ReadPosRankSum=0.850;SC=ATGATGCTCAGCGAGGTGGAG;SOR=0.770;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=74;TCF=30;TCR=44;TR=39;WE=8646771;WS=8646753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,42:0.51:82
chr11	8661751	rs77450953	C	T	1525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.611;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=16;PP=896;ReadPosRankSum=1.063;SC=AGAATATGCACGCCAAGCCAC;SOR=0.485;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=105;TCF=77;TCR=28;TR=58;WE=8661759;WS=8661741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,69:0.58:118
chr11	8662090	rs11042022	T	C	330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.67;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	8662516	rs11042023	T	C	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=8;PP=243;ReadPosRankSum=1.425;SC=TGGGGAGCAGTGGGAGCAGCA;SOR=0.656;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=47;TCF=29;TCR=18;TR=21;WE=8662524;WS=8662506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,24:0.47:51
chr11	8662649	rs61743935	A	G	1731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=34;PP=1096;ReadPosRankSum=0.539;SC=AAGCCTCCATAAGCAGGAGCA;SOR=0.727;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=152;TCF=85;TCR=67;TR=73;WE=8662657;WS=8662639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,80:0.47:171
chr11	8668082	rs61741649	C	T	3033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.886;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=66;PP=1966;ReadPosRankSum=1.164;SC=TTCCACCTTCCTATGCTGATG;SOR=0.721;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=275;TCF=142;TCR=133;TR=129;WE=8668090;WS=8668072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,143:0.47:307
chr11	8669437	rs10840100	A	G	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.740;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=217;ReadPosRankSum=1.845;SC=CAGGCACTACATCTGACGGCC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=14;WE=8669445;WS=8669427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,14:0.39:36
chr11	8670172	rs7950801	T	C	1274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=30;PP=876;SC=GCTGCACAGCTCTCAGCCTTC;SOR=2.200;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=11;TCR=30;TR=41;WE=8670180;WS=8670162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr11	8693405	rs11517718	G	A	1654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=38;PP=1012;ReadPosRankSum=0.325;SC=CAGTCCTTACGGAGCAAATGC;SOR=0.736;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=164;TCF=82;TCR=82;TR=76;WE=8693413;WS=8693395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,82:0.46:179
chr11	8704965	rs2073684	C	T	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=321;ReadPosRankSum=-0.272;SC=CTCTAGTATTCCAGTTCTAAG;SOR=0.760;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=18;WE=8704973;WS=8704955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr11	8717003	rs2270956	C	T	4010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=398;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.616;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=91;PP=2356;ReadPosRankSum=-2.465;SC=GTAACAAGGCCACTTACCCAA;SOR=0.685;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=359;TCF=183;TCR=176;TR=178;WE=8717011;WS=8716993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:202,196:0.49:398
chr11	8719615	rs10840113	C	G	478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=363;ReadPosRankSum=1.409;SC=TGAGCCCAGGCAGGTCGAGGC;SOR=1.071;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=16;WE=8719623;WS=8719605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
chr11	8735662	rs931756	G	A	1544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.549;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=39;PP=941;ReadPosRankSum=1.159;SC=CACCACCCCAGCTTTTCTCAC;SOR=0.743;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=166;TCF=82;TCR=84;TR=74;WE=8735670;WS=8735652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,80:0.44:180
chr11	8736046	rs931757	C	T	771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=5;PP=610;SC=CTCCCTCCTACGTGGCCATTT;SOR=2.387;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=28;WE=8736054;WS=8736036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	8747822	rs7128811	T	A	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.790;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=18;PP=406;ReadPosRankSum=-1.074;SC=CTGGGGAATGTCCATGGCAAC;SOR=0.379;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=46;TCF=12;TCR=34;TR=26;WE=8747830;WS=8747812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,29:0.58:50
chr11	8751889	rs3794153	C	G	1893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=43;PP=1126;ReadPosRankSum=0.972;SC=AGGTTCCAGTCTTCCTTTTCC;SOR=0.711;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=187;TCF=94;TCR=93;TR=84;WE=8751897;WS=8751879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,92:0.44:208
chr11	8772325	.	C	T	716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.997;ClippingRankSum=0.000;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.992;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=21;PP=480;ReadPosRankSum=0.662;SC=GCCAAAAGCACCTTGAACATC;SOR=0.474;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=64;TCF=22;TCR=42;TR=33;WE=8772333;WS=8772315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,34:0.50:68
chr11	8788168	rs10743089	A	T	1810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=40;NR=24;PP=1056;SC=CTGGGTGAAGATCTGCACGAA;SOR=1.163;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=40;TCR=24;TR=64;WE=8788176;WS=8788158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr11	8788225	rs10734637	A	C	2808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=45;PP=1676;SC=TATGCGCCCCACCTCCATTCT;SOR=0.772;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=50;TCR=45;TR=95;WE=8788233;WS=8788215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr11	8797707	.	G	GCACACACACACACACACA,GCACACACA	366.74	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.57;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=0;PP=198;SC=GCGCGCGCGCGCACACACACA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=8797715;WS=8797697;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:3
chr11	8933853	rs2742519	T	G	1079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=2;PP=685;SC=TCTTTTAGAGTTGGAATTCTT;SOR=4.112;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=26;WE=8933861;WS=8933843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	8934101	rs2742518	A	G	6654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=125;PP=2965;SC=GTGAACCAAAACTATGCCCCA;SOR=1.272;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=214;TCF=89;TCR=125;TR=213;WE=8934109;WS=8934091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr11	8938787	rs2016942	A	G	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=132;ReadPosRankSum=-0.152;SC=TTTACAATCCAAAAGTGAAAG;SOR=0.914;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=9;WE=8938795;WS=8938778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr11	8938819	rs1883097	T	C	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.675;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=255;ReadPosRankSum=0.557;SC=ATCAGTGTTCTACTTGTCTCT;SOR=0.327;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=17;WE=8938827;WS=8938809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,17:0.46:37
chr11	8940703	rs3763914	G	T	43.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr11	8942999	rs2568023	G	A	7590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=124;NR=125;PP=2965;SC=CCCCACTACTGCAGTTTGTGC;SOR=0.859;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=249;TCF=124;TCR=125;TR=249;WE=8943007;WS=8942989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,284:1.00:284
chr11	8946950	rs3751068	G	T	1116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=6;PP=729;SC=ACATGTGGGAGGGAAGGGAGG;SOR=2.554;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=36;WE=8946958;WS=8946940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr11	8947021	rs2653588	A	G	5396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=114;NR=69;PP=2965;SC=TGGCTTCCCAAGGCATGGCTC;SOR=1.244;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=183;TCF=114;TCR=69;TR=183;WE=8947029;WS=8947011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr11	8947283	rs3751066	G	C	5471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=88;PP=2965;SC=TGTGCTGTGGGCTCCAACTCT;SOR=0.883;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=169;TCF=81;TCR=88;TR=169;WE=8947291;WS=8947273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr11	8947586	rs11042127	C	G	1104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.450;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=30;PP=759;ReadPosRankSum=0.200;SC=ACCGACTGGACCCCACCTAGG;SOR=1.039;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=107;TCF=53;TCR=54;TR=52;WE=8947594;WS=8947576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,53:0.44:121
chr11	8948680	rs3751065	A	T	3581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=60;PP=2087;SC=CTGCGACAAGAGGAGCCTCGA;SOR=0.889;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=117;TCF=57;TCR=60;TR=117;WE=8948688;WS=8948670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr11	8951230	rs3763913	C	T	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.090;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=38;ReadPosRankSum=-0.349;SC=CTATGACTTCCGGAAGGATAA;SOR=0.941;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=5;WE=8951238;WS=8951220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr11	8959511	rs4910179	T	G	3040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=30;PP=1940;SC=CACTGTAATTTCCCAGGATAA;SOR=1.522;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=65;TCR=30;TR=95;WE=8959519;WS=8959501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr11	8959545	rs4909951	C	A	3554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=39;PP=2188;SC=AAAAGGCAGCCGTGGCAGCTC;SOR=1.215;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=73;TCR=39;TR=112;WE=8959553;WS=8959535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr11	8970083	rs2653604	C	A	1120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=22;PP=620;SC=CATAGACACACAACAGTGACC;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=16;TCR=22;TR=38;WE=8970091;WS=8970073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr11	8977691	rs2742488	C	G	4575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=31;PP=1648;SC=GCAGAAAAGACGTAGACAGAC;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=61;TCR=31;TR=92;WE=8977699;WS=8977681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr11	8977707	rs2568069	G	A	5274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=76;NR=39;PP=2071;SC=CAGACAGACAGACAGGTAGAT;SOR=1.288;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=115;TCF=76;TCR=39;TR=115;WE=8977715;WS=8977697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr11	8977830	rs2568068	A	G	2257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=46;PP=1402;ReadPosRankSum=-2.746;SC=TGGGCTCCACAACATGAAGGC;SOR=0.665;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=210;TCF=110;TCR=100;TR=98;WE=8977838;WS=8977820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,111:0.47:238
chr11	8983547	rs2163626	A	G	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.533;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=186;ReadPosRankSum=0.414;SC=AAATACTTAAAAAGAAAACTA;SOR=0.399;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=16;WE=8983555;WS=8983537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,20:0.62:32
chr11	8985916	rs3833778	G	GGGCTCA	766.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.138;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=2.309;NF=0;NR=14;PP=713;ReadPosRankSum=-0.141;SC=CTCCCGGCTCGGGCTCAGGCT;SOR=0.914;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=2;TCR=41;TR=14;WE=8985924;WS=8985906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,22:0.45:49
chr11	9001450	.	T	TC	36	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5001;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=27;MQ=64.4;NF=0;NR=4;PP=36;QD=24.9614401178;SC=ACTAAATATTTCCTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=9001458;WS=9001440;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:3,4:0.57:7
chr11	9001453	rs74235492	T	C	100.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=68.12;QD=25.01;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr11	9005036	rs2568046	T	A	3626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=46;PP=1996;SC=CAGTTTTCTCTATCTGTCAAC;SOR=0.889;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=114;TCF=68;TCR=46;TR=112;WE=9005044;WS=9005026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr11	9051385	rs7479998	C	A	3959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=42;PP=2050;SC=ACCCAGACACCTATCTTCTTA;SOR=1.242;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=124;TCF=82;TCR=42;TR=124;WE=9051393;WS=9051375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr11	9052170	rs10769983	G	A	273.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=167;SC=CTGCTGGGGCGAGTGGAGCTG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=8;WE=9052178;WS=9052160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	9052423	rs7395988	A	C	5006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=71;PP=2798;SC=GGGCACAGAGATGGCAAGGTG;SOR=0.784;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=154;TCF=83;TCR=71;TR=154;WE=9052431;WS=9052413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr11	9055438	rs181624537	C	T	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.170;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=241;ReadPosRankSum=-0.449;SC=ATGGCACTGACCACACCACCC;SOR=1.501;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=12;WE=9055446;WS=9055428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr11	9072140	rs3751052	C	T	2648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=21;PP=1703;SC=ACACCAACCACCTGATTCCAT;SOR=2.044;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=66;TCR=21;TR=87;WE=9072148;WS=9072130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr11	9081926	rs7112378	C	T	1017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=7;PP=539;SC=TAACAGGGCACCCAGTCTCCC;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=29;WE=9081934;WS=9081916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr11	9096189	rs7930311	G	C	3398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=59;PP=1834;SC=ATTAGCCTTTGCTTTGGTGAC;SOR=1.206;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=47;TCR=60;TR=106;WE=9096197;WS=9096179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
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chr11	9164437	rs74643810	G	A	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=273;ReadPosRankSum=-0.549;SC=TCTCAGCCGAGCTGCCCTCCC;SOR=0.382;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=17;WE=9164445;WS=9164427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr11	9167399	rs10732517	T	C	2934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=53;PP=1703;SC=TGAGGAGAATTAGGAATCTTT;SOR=1.300;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=90;TCF=37;TCR=53;TR=90;WE=9167407;WS=9167389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr11	9171775	rs7123970	A	G	1268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.746;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=28;PP=815;ReadPosRankSum=-0.169;SC=AGAATGTAAAAAGGAAGTGGA;SOR=0.605;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=94;TCF=43;TCR=51;TR=53;WE=9171783;WS=9171765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,57:0.56:101
chr11	9198276	rs7394878	T	C	2194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=13;PP=1470;SC=GAGAAGGAAATGTATCTGCTA;SOR=2.494;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=58;TCR=13;TR=71;WE=9198284;WS=9198266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr11	9199650	rs60693427	C	T	4694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=64;PP=2815;SC=TCCAAGAGGCCTGAATGTACA;SOR=0.932;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=160;TCF=96;TCR=64;TR=160;WE=9199658;WS=9199640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr11	9228785	rs7396439	G	A	2706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=47;PP=1459;SC=ATGAAAAGATGTAAGAACATT;SOR=0.900;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=46;TCR=47;TR=93;WE=9228793;WS=9228775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr11	9304939	rs1136330	T	C	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=68;ReadPosRankSum=-1.121;SC=GAGATGGTGATGACAGCAAAA;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=5;WE=9304947;WS=9304929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr11	9305177	rs72861351	C	T	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.061;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=19;PP=423;ReadPosRankSum=-0.942;SC=TAAAAACCACCGCAATTGTTT;SOR=0.527;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=54;TCF=16;TCR=38;TR=27;WE=9305185;WS=9305167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,28:0.47:60
chr11	9307951	rs76581517	G	A	1599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=27;PP=887;ReadPosRankSum=0.793;SC=GCTGGACACTGTTAGATATGT;SOR=0.739;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=121;TCF=70;TCR=51;TR=67;WE=9307959;WS=9307941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,77:0.56:138
chr11	9309405	rs5014247	A	G	1281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.040;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=39;PP=855;ReadPosRankSum=0.134;SC=TCTTACTCACATTGATTTATT;SOR=0.434;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=90;TCF=25;TCR=65;TR=57;WE=9309413;WS=9309395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,59:0.61:97
chr11	9310114	rs75446893	A	T	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.399;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=1.029;NF=7;NR=9;PP=142;ReadPosRankSum=0.761;SC=ATTAGAATATAATTAAGTAGA;SOR=0.392;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=29;TCF=12;TCR=17;TR=16;WE=9310122;WS=9310104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr11	9310153	rs144571752	G	GA	38.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5130;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.524;NF=0;NR=4;PP=93;ReadPosRankSum=-1.645;SC=AACATTTCAGGAAAAAAGTAT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=4;WE=9310161;WS=9310143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr11	9316937	rs4601780	G	A	1428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=23;PP=786;SC=TTTCTTCTCTGAAGAAATAAA;SOR=0.846;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=47;TCF=24;TCR=23;TR=47;WE=9316945;WS=9316927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr11	9321399	rs10743101	A	G	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5064;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=39;ReadPosRankSum=0.967;SC=GGGCACAGTGACTCACGCCTG;SOR=1.609;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=4;WE=9321407;WS=9321389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr11	9321415	rs11042272	C	T	73.81	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5040;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=38;ReadPosRankSum=-0.842;SC=GCCTGTAATCCCAGCACTTTG;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=4;WE=9321423;WS=9321405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr11	9336093	rs72850544	C	T	1385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.941;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=34;PP=871;ReadPosRankSum=0.864;SC=AGAGCCACTTCCGGCGCGACC;SOR=0.389;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=96;TCF=37;TCR=59;TR=59;WE=9336101;WS=9336083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,64:0.62:104
chr11	9336140	rs116886507	C	T	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.939;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=181;ReadPosRankSum=0.569;SC=GCGAGTACTGCAACCTCCTGC;SOR=1.179;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=12;WE=9336148;WS=9336130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,12:0.34:35
chr11	9406349	rs4606477	T	C	5488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=83;PP=2965;SC=TGCGGGGCACTATGGACCCAG;SOR=0.743;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=174;TCF=91;TCR=83;TR=174;WE=9406357;WS=9406331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr11	9450377	rs2290423	T	G	1690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.582;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=32;PP=1078;ReadPosRankSum=0.178;SC=TCTGTGTTTTTCATTCAGATC;SOR=0.779;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=151;TCF=89;TCR=62;TR=76;WE=9450385;WS=9450367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,80:0.49:163
chr11	9455374	rs4910052	T	C	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.40;ReadPosRankSum=-0.712;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr11	9459912	rs149988366	G	C	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=183;ReadPosRankSum=-0.085;SC=AGTGGCTCAGGCCTGTAATCC;SOR=0.793;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=12;WE=9459920;WS=9459902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr11	9516186	rs12293264	T	C	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.867;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=11;PP=359;ReadPosRankSum=-2.236;SC=CTATTTGTTTTATTTAGATTG;SOR=0.545;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=47;TCR=27;TR=29;WE=9516194;WS=9516176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,31:0.38:82
chr11	9537904	rs10743108	G	C	2860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=49;PP=1757;SC=TACAGAAGGGGAACAGGTAAT;SOR=1.134;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=42;TCR=49;TR=91;WE=9537912;WS=9537894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr11	9549142	rs11607631	G	A	1646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.625;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=40;PP=916;ReadPosRankSum=0.247;SC=AAGGAGAAACGCCAGGGTTGG;SOR=1.053;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=202;TCF=95;TCR=107;TR=72;WE=9549150;WS=9549132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,86:0.38:228
chr11	9595732	rs11042428	C	G	642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.61;SOR=1.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	9715628	rs360049	C	T	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.006;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=23;ReadPosRankSum=-0.180;SC=GCATGTTGTACTCATGGTGAA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=3;WE=9715636;WS=9715620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr11	9715646	rs3763865	T	C	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=98;ReadPosRankSum=-0.449;SC=GAAGGTGTCATGTGCTGGTTA;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=6;WE=9715654;WS=9715636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr11	9734945	rs1390679	A	G	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.938;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=192;ReadPosRankSum=-2.341;SC=TTGTCTTTCTATTTTACTTGC;SOR=2.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=9;WE=9734953;WS=9734935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr11	9746137	rs419412	A	G	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=77;ReadPosRankSum=-0.628;SC=AGTGTTTATAACATAAATACA;SOR=0.148;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=7;WE=9746145;WS=9746127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr11	9746201	rs1695613	G	A	610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.353;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=449;ReadPosRankSum=-1.359;SC=CATTCTTTATGTAGATTGAAT;SOR=0.280;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=56;TCF=49;TCR=7;TR=27;WE=9746209;WS=9746191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,27:0.48:56
chr11	9746552	rs1960386	A	G	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=180;ReadPosRankSum=-0.202;SC=TCGTTTTTTTATTTTTTGTTT;SOR=0.941;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=11;WE=9746560;WS=9746542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr11	9748483	rs2453831	T	C	1237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.075;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=31;PP=835;ReadPosRankSum=1.313;SC=CTTCAGAATATTGAGAGGTCA;SOR=0.517;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=135;TCF=63;TCR=72;TR=58;WE=9748491;WS=9748473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,63:0.41:152
chr11	9748620	rs2453832	G	T	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.81;ReadPosRankSum=0.513;SOR=0.430;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
chr11	9748624	rs2454612	C	T	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.41;ReadPosRankSum=0.021;SOR=0.481;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr11	9749552	rs67364105	CT	C	734.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.644;HP=3;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=689;ReadPosRankSum=1.139;SC=GATGTCAGCTCTTACAAATAA;SOR=0.250;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=11;WE=9749562;WS=9749542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,19:0.79:24
chr11	9749554	rs56116109	T	G	743.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-3.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=2.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.61;ReadPosRankSum=1.401;SOR=0.212;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,20:0.77:26
chr11	9749645	rs397686	A	C	1178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.659;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=21;PP=619;ReadPosRankSum=-2.251;SC=CTGGACTGAAAGATGGTTTGT;SOR=0.435;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=90;TCF=56;TCR=34;TR=50;WE=9749653;WS=9749635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,56:0.56:100
chr11	9751051	rs34125178	C	CT	217.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.203;HP=13;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=1.615;NF=1;NR=7;PP=99;ReadPosRankSum=-0.284;SC=CTCTGACTTTCTTTTTTTTTT;SOR=0.090;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=8;WE=9751059;WS=9751041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr11	9769562	rs415895	C	G	1815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.205;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=46;PP=1176;ReadPosRankSum=1.933;SC=GCAGCTGGAGCAGCTTGAGTT;SOR=0.830;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=168;TCF=84;TCR=84;TR=86;WE=9769570;WS=9769552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,89:0.49:180
chr11	9771687	rs6483656	G	C	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.076;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=108;ReadPosRankSum=0.923;SC=GAGTTCAAGAGCAGCCTGGCC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=6;WE=9771695;WS=9771677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr11	9802228	rs360124	G	C	873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=23;PP=660;SC=CTTTACTTTTGTGGTCTCTAG;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=9802236;WS=9802218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	9802952	rs3763862	A	C	246.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=228;SC=TCTGTCATCCATCTGTAGTCA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=9802960;WS=9802942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	9806914	rs71453928	T	TACTG	1747.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.226;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=1124;ReadPosRankSum=0.106;SC=ACACTTAAACTACTGACTGGA;SOR=1.228;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=58;TCF=4;TCR=54;TR=22;WE=9806922;WS=9806904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,46:0.49:94
chr11	9811039	rs11042496	C	A	791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.280;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=23;PP=471;ReadPosRankSum=-0.761;SC=AAAAATCATACATCAAGATAA;SOR=2.750;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=58;TCF=11;TCR=47;TR=25;WE=9811047;WS=9811029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,32:0.48:67
chr11	9812236	rs2645029	G	A	2161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=29;NR=45;PP=1350;SC=AGTTCCTGTAGATTAAAAAAA;SOR=1.310;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=29;TCR=45;TR=74;WE=9812244;WS=9812226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr11	9830595	rs11042500	G	A	2321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=52;PP=1190;ReadPosRankSum=-0.001;SC=CGCTTTCTGAGTGCAGAAGTC;SOR=0.657;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=197;TCF=85;TCR=112;TR=95;WE=9830603;WS=9830585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,112:0.50:224
chr11	9830732	rs10770066	A	T	468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=14;PP=366;SC=GACACTTTTGACTGGATGCAA;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=9830740;WS=9830722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	9853777	rs12574508	G	C	1418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.588;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=18;PP=935;ReadPosRankSum=1.562;SC=TTACCGGCCTGAGGGGAGTTC;SOR=1.073;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=103;TCF=66;TCR=37;TR=56;WE=9853785;WS=9853767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,63:0.55:114
chr11	9861009	rs7483882	G	A	2403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=15;PP=1611;SC=AAGAAAGGAAGGAAGACCTCT;SOR=2.391;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=59;TCR=15;TR=74;WE=9861017;WS=9860999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr11	9875353	rs375686	G	T	1268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=37;PP=1081;SC=AGAAACATGAGCAAAGTGATG;SOR=5.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=38;TCF=1;TCR=37;TR=38;WE=9875361;WS=9875343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr11	9878332	rs11322743	AT	A	126.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.28;QD=14.08;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	9917620	rs4910073	G	C	1826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.591;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=44;PP=1246;ReadPosRankSum=-1.016;SC=AAATACATGCGAACTAACATC;SOR=0.769;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=140;TCF=65;TCR=75;TR=77;WE=9917628;WS=9917610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,83:0.53:158
chr11	9983737	rs2403226	C	T	612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=19;PP=369;ReadPosRankSum=0.408;SC=AAAATTCAAACGCATCCTATA;SOR=0.582;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=75;TCF=23;TCR=52;TR=28;WE=9983745;WS=9983727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,31:0.38:81
chr11	9983810	rs35824679	A	AC	374.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=380;SC=TATTATTAAGACAATTATAAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=10;WE=9983818;WS=9983800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	10022585	rs7128234	A	T	509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.966;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=361;ReadPosRankSum=-1.439;SC=AATAATAAAAATATGCGTCAA;SOR=1.292;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=49;TCF=19;TCR=30;TR=22;WE=10022593;WS=10022575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,24:0.45:53
chr11	10024311	rs10500716	A	G	518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=369;ReadPosRankSum=-1.358;SC=GACAGTATACACGGAAAGAAA;SOR=0.467;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=20;WE=10024319;WS=10024301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,21:0.58:36
chr11	10050157	rs10840344	T	A	2936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-2.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.420;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=75;PP=1830;ReadPosRankSum=0.131;SC=AGCCATTTTTTAAAAAATAAA;SOR=0.461;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=268;TCF=115;TCR=153;TR=137;WE=10050165;WS=10050147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,145:0.49:294
chr11	10472492	rs35417007	GC	G	915.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=604;ReadPosRankSum=-0.577;SC=TGGCCTCAGTGCCCAGCAGCC;SOR=0.683;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=18;WE=10472500;WS=10472482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,33:0.44:75
chr11	10518289	rs1466426	T	C	778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=5;PP=574;SC=AGGAAGTGACTGGGGCTGGTC;SOR=2.670;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=26;WE=10518297;WS=10518279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	10518521	rs2071016	C	T	1321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.823;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=36;PP=776;ReadPosRankSum=-1.088;SC=GGGCTCATAGCGGCAGAGGCA;SOR=0.380;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=106;TCF=33;TCR=73;TR=54;WE=10518529;WS=10518511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,63:0.52:120
chr11	10521764	rs3741041	T	C	7185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=122;NR=133;PP=2965;SC=ACTACATGTATGCCAACATCA;SOR=0.838;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=256;TCF=123;TCR=133;TR=255;WE=10521772;WS=10521754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,279:1.00:279
chr11	10521850	rs3741039	G	A	1764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=41;PP=1098;SC=GTACATGCACGCATGCACACA;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=13;TCR=41;TR=54;WE=10521858;WS=10521840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr11	10522983	rs1870951	G	T	841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=5;PP=544;SC=AACTGGGGGGGGCCTTCCTGA;SOR=2.621;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=25;WE=10522991;WS=10522973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr11	10526060	rs7943804	C	T	7154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=131;NR=103;PP=2965;SC=ATGGATATCCCCCCTTCTAAT;SOR=0.879;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=234;TCF=131;TCR=103;TR=234;WE=10526068;WS=10526050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr11	10553355	rs4910153	C	T	1120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=7;PP=735;SC=ATGAGGCCATCGAAAGTTAAG;SOR=2.833;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=39;TCF=31;TCR=8;TR=38;WE=10553363;WS=10553345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr11	10553672	rs4910154	C	T	646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.12;SOR=2.448;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	10553675	rs4910155	C	T	646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.12;SOR=2.448;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	10555589	rs1065052	A	G	6190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=106;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.743;SC=CTACTCTCCCAAGAAATTCTT;SOR=0.263;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=208;TCF=101;TCR=107;TR=207;WE=10555597;WS=10555579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,237:1.00:238
chr11	10581623	rs746164	C	G	339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=11;PP=254;SC=ATTGGCCTTGCTTCTCACACT;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=10581631;WS=10581613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	10603648	rs2288236	A	G	1856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=41;PP=1187;SC=AGGCTTTTTCAGTAACTTTCA;SOR=1.839;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=19;TCR=41;TR=60;WE=10603656;WS=10603638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr11	10614911	rs3741033	C	G	258.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=169;SC=CACTCAGATTCTATTCTGGAA;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=10614919;WS=10614901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	10615473	rs7126245	C	T	185.94	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=140;ReadPosRankSum=0.157;SC=CTTATGATCACTTCATGTTCA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=7;WE=10615481;WS=10615467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,7:0.88:8
chr11	10631247	rs3741042	C	T	3494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=37;PP=2213;SC=CGGTACAGGGCCTTCTGTAAC;SOR=1.519;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=79;TCR=37;TR=116;WE=10631255;WS=10631237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr11	10645289	rs61892975	A	G	1875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=16;PP=1207;SC=ACAAATCAGCACTCGCTGAGA;SOR=2.015;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=48;TCR=16;TR=64;WE=10645297;WS=10645279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr11	10645569	rs2303402	A	G	686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=565;ReadPosRankSum=1.198;SC=AAGCACCAGGAAATAGTTCCT;SOR=2.584;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=22;WE=10645577;WS=10645559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,22:0.96:23
chr11	10647702	rs2241489	G	A	5234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=91;PP=2965;SC=TGTCCCAGGAGAGCCCTCGCA;SOR=0.987;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=171;TCF=80;TCR=91;TR=171;WE=10647710;WS=10647692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr11	10649161	rs1425152	C	A	4605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=102;NR=44;PP=2965;SC=CATACGTGTGCATGCACACAC;SOR=1.684;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=146;TCF=102;TCR=44;TR=146;WE=10649169;WS=10649151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr11	10650329	rs2278125	C	T	4060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=86;NR=54;PP=2497;SC=GTGAGTTGCTCCGAGAGGATG;SOR=1.149;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=86;TCR=54;TR=140;WE=10650337;WS=10650319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr11	10653729	rs3741032	C	G	110.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.18;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	10655609	rs2162044	C	T	3750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=67;PP=2151;SC=ACTCCTGCGGCAGGAGGACCC;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=129;TCF=62;TCR=67;TR=129;WE=10655631;WS=10655599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr11	10655623	rs11042902	C	T	1288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.706;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=32;PP=749;ReadPosRankSum=-1.044;SC=AGGACCCTGCCGGTTTAGAAC;SOR=0.779;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=104;TCF=43;TCR=61;TR=53;WE=10655631;WS=10655599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,59:0.51:115
chr11	10673739	rs4909945	T	C	6070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=117;NR=94;PP=2965;SC=GCTGGGGAGATGCCAAAAGGA;SOR=0.830;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=211;TCF=117;TCR=94;TR=211;WE=10673747;WS=10673729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr11	10709194	rs1035694	C	T	819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=5;PP=518;SC=CTTCACCAGACACAGATGCCC;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=27;WE=10709202;WS=10709184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr11	10711918	.	TA	T	366.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.841;ClippingRankSum=0.000;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=1.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.47;ReadPosRankSum=-0.559;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,28:0.34:82
chr11	10715124	rs10770136	T	C	1462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=25;PP=926;SC=GGCCAGCCTCTCTTCACTCTG;SOR=0.931;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=49;TCF=24;TCR=25;TR=49;WE=10715132;WS=10715114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr11	10773049	rs2279697	G	A	3906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=65;PP=2176;SC=GAACTTGTACGATCGCCCCCA;SOR=0.852;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=127;TCF=62;TCR=65;TR=127;WE=10773057;WS=10773039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr11	10783362	rs151043482	A	G	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.951;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=168;ReadPosRankSum=1.279;SC=TTAAAATCATAAGAAGCTTCT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=8;WE=10783370;WS=10783352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr11	10783382	rs181977235	T	C	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.969;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=221;ReadPosRankSum=-1.890;SC=TAATCCGTTTTAGTGTCTGAT;SOR=0.180;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=12;WE=10783390;WS=10783372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr11	10786023	rs3830388	A	AAGTTG	2994.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=25;PP=2336;SC=ATACTGAATCAAGTTGCATGC;SOR=1.000;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=48;TCF=15;TCR=33;TR=38;WE=10786031;WS=10786013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr11	10786142	rs3736326	C	T	5683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=109;NR=84;PP=2965;SC=AAGCGGAACACGATGAGCATT;SOR=0.910;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=193;TCF=109;TCR=84;TR=193;WE=10786150;WS=10786132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr11	10797276	rs72259410	CTTTCTT	C	85.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=0;NR=3;PP=108;SC=ATATACTTTTCTTTCTTTTTC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=10797289;WS=10797266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr11	10821055	rs3736327	C	T	3820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=52;PP=2014;SC=GCTTCTTTTCCAGTACATGAA;SOR=0.722;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=114;TCF=62;TCR=52;TR=114;WE=10821063;WS=10821045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr11	10822202	rs4910190	G	A	4806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=70;PP=2965;SC=TTCCTGTGAAGAACACAAGTA;SOR=0.815;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=154;TCF=84;TCR=70;TR=153;WE=10822210;WS=10822192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr11	10822350	rs7951708	C	T	7662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=130;NR=134;PP=2965;SC=CCTGGATAAGCGGTGGATTAG;SOR=0.779;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=265;TCF=131;TCR=134;TR=264;WE=10822358;WS=10822340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,290:1.00:290
chr11	10823079	rs10840492	T	C	1732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=15;PP=1211;SC=AAAAGAAGTATAGAAAAGAGA;SOR=1.850;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=43;TCR=15;TR=58;WE=10823087;WS=10823069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr11	10823576	.	C	CACACTCCTAAAATAGTTTCATGTTTTAATAGCAAATGAAATCACATATATTGCATAATTTAACATTTGTTGCCTAA	3249.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=649.95;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	10823815	rs7105210	C	T	6640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=116;NR=98;PP=2965;SC=TTCAGCTTAACGCAACCATTG;SOR=0.752;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=214;TCF=116;TCR=98;TR=214;WE=10823823;WS=10823805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr11	10824540	rs10743150	G	A	158.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=1;PP=109;SC=TACACACACAGAGTCTATGTG;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=10824548;WS=10824530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr11	10824731	rs2270620	C	T	6974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=147;NR=93;PP=2965;SC=CTCAGCTTACCAACAAATTTA;SOR=1.239;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=240;TCF=147;TCR=93;TR=240;WE=10824739;WS=10824721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr11	10826341	rs2242360	A	G	889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=5;PP=580;SC=TCAAAAATACATACCTATCTA;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=30;WE=10826349;WS=10826331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	10827418	rs11042964	T	C	5840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=119;NR=66;PP=2965;SC=TAATCCACACTTCCCATCTTT;SOR=1.360;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=185;TCF=119;TCR=66;TR=185;WE=10827440;WS=10827408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr11	10828333	rs61874162	T	C	1478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=28;PP=984;ReadPosRankSum=-0.783;SC=ATCTGTTAAATAAAGCTCACT;SOR=0.728;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=77;TCR=56;TR=66;WE=10828341;WS=10828323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,72:0.49:147
chr11	10828361	rs10743151	C	A	4265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=77;NR=67;PP=2301;SC=TACATGTTTACCACACCTGTT;SOR=0.730;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=144;TCF=77;TCR=67;TR=144;WE=10828369;WS=10828351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr11	10828490	rs11373962	T	TA	1593.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=24;PP=1066;SC=TCAAAAAGAATAAGCATCTAT;SOR=1.765;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=26;WE=10828498;WS=10828480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr11	10830106	rs7127279	A	G	3590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=73;PP=2099;SC=CTTTCCAGGTATCTGAAGCGC;SOR=1.105;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=53;TCR=73;TR=126;WE=10830114;WS=10830096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr11	11292635	rs12282251	C	T	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=22;ReadPosRankSum=1.150;SC=CAGCAGGCAACGTTGCAGCAG;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=3;WE=11292643;WS=11292625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr11	11292700	rs10831567	G	C	567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=305;ReadPosRankSum=0.350;SC=GTCAGGACGCGAGGCTCCTCA;SOR=0.866;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=48;TCF=40;TCR=8;TR=20;WE=11292708;WS=11292690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,26:0.46:56
chr11	11292859	rs12282460	G	T	2328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.38;ReadPosRankSum=0.350;SOR=0.709;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,64:0.48:134
chr11	11292864	rs12282401	C	T	2304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.87;ReadPosRankSum=1.556;SOR=0.689;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,60:0.47:129
chr11	11314538	rs10437598	C	T	884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.458;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=8;PP=562;ReadPosRankSum=0.768;SC=TGGTTTTCCACGATGGCTGCC;SOR=1.273;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=77;TCF=55;TCR=22;TR=37;WE=11314546;WS=11314528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,41:0.48:86
chr11	11348669	rs17435705	G	A	1797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.185;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=26;PP=931;ReadPosRankSum=-1.545;SC=ACATGATGGGGACATTCTCTG;SOR=0.798;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=150;TCF=88;TCR=62;TR=69;WE=11348677;WS=11348659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,84:0.49:172
chr11	11348828	rs745181	A	G	1019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.933;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=24;PP=542;ReadPosRankSum=0.110;SC=GACAGATTTCATGTCCATAAT;SOR=0.291;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=62;TCF=21;TCR=41;TR=39;WE=11348836;WS=11348818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,45:0.65:69
chr11	11354346	rs901553	T	C	1333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=32;PP=679;ReadPosRankSum=-2.476;SC=GAGCCTTCCTTGCAGTGATGT;SOR=0.766;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=102;TCF=46;TCR=56;TR=58;WE=11354354;WS=11354336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,65:0.58:113
chr11	11354393	rs901554	A	G	743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.210;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=18;PP=417;ReadPosRankSum=2.395;SC=ACAGGGACGCAGAAGCAGAGA;SOR=0.476;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=46;TCF=18;TCR=28;TR=30;WE=11354401;WS=11354383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,33:0.66:50
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chr11	11373635	rs1056963	C	T	10495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=405;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=188;NR=172;PP=2965;SC=TGCTGACGGGCGTACTGCCCC;SOR=0.708;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=361;TCF=188;TCR=173;TR=360;WE=11373643;WS=11373625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,403:1.00:403
chr11	11373808	rs1056951	T	G	6027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=113;NR=90;PP=2965;SC=TGATTTTCACTGTGGACAAAG;SOR=0.907;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=203;TCF=113;TCR=90;TR=203;WE=11373816;WS=11373798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr11	11373925	rs4243927	A	C	10763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=400;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=190;NR=165;PP=2965;SC=GTCCCCAGAAACTTGGCTATC;SOR=0.744;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=355;TCF=190;TCR=165;TR=355;WE=11373933;WS=11373915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,400:1.00:400
chr11	11373960	rs2071461	C	T	10451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=393;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=176;NR=183;PP=2965;SC=ATAATTGTCACGTCCATGGAA;SOR=0.811;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=360;TCF=177;TCR=183;TR=359;WE=11373968;WS=11373950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,392:1.00:392
chr11	11374016	rs2896586	T	A	6105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=132;PP=2965;SC=TACAACCCAATCTCCACATAT;SOR=1.278;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=217;TCF=84;TCR=133;TR=216;WE=11374024;WS=11374006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr11	11374269	rs2071460	A	G	4076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=75;PP=2344;ReadPosRankSum=0.094;SC=GTAAAATCGAATATCATAGTC;SOR=0.695;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=304;TCF=162;TCR=142;TR=165;WE=11374291;WS=11374259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,191:0.55:349
chr11	11374283	rs2896585	T	G	9997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=366;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=166;NR=152;PP=2965;SC=CATAGTCTGTTAACGTCTGGT;SOR=0.699;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=318;TCF=166;TCR=152;TR=318;WE=11374291;WS=11374259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,365:1.00:365
chr11	11398698	rs10444245	G	A	353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=1;PP=250;SC=AGGTCAAAGCGGAGAGACCCA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=11398706;WS=11398688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	11905993	rs10765894	C	T	1380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=12;PP=764;ReadPosRankSum=-1.595;SC=TAATCTGAAACATTATGTTTT;SOR=0.729;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=104;TCF=78;TCR=26;TR=56;WE=11906001;WS=11905983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,62:0.55:112
chr11	11913585	rs11022079	G	T	2243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.374;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=48;PP=1250;ReadPosRankSum=-0.435;SC=GAAGGTTCTGGGGGTTCTACC;SOR=0.508;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=217;TCF=106;TCR=111;TR=101;WE=11913593;WS=11913575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,113:0.47:240
chr11	11954786	rs10741562	G	A	878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=25;PP=653;SC=TCATTGAACAGTGTAACCAAC;SOR=3.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=29;WE=11954794;WS=11954776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr11	11972054	rs11022090	A	G	1343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=25;PP=768;SC=TTTGGGGGGAAGTATCAGTTA;SOR=1.094;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=19;TCR=25;TR=44;WE=11972062;WS=11972044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr11	11976628	rs7933089	G	A	4067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=69;PP=2306;ReadPosRankSum=-0.858;SC=ATATTCATCAGGATTTAGACT;SOR=0.988;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=135;TCF=64;TCR=71;TR=132;WE=11976636;WS=11976618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,152:0.99:154
chr11	11986061	rs3206824	T	C	4347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=62;PP=2702;SC=GCAGGCTCCCTCAGCGCCATC;SOR=0.824;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=147;TCF=85;TCR=62;TR=146;WE=11986069;WS=11986051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr11	11989899	rs2291599	T	C	3136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=28;PP=2040;SC=CCCAGGTGCCTGAGACCCTGG;SOR=2.071;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=73;TCR=28;TR=101;WE=11989907;WS=11989889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr11	12225946	rs3763823	T	G	3042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.406;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=75;PP=2002;ReadPosRankSum=1.666;SC=ATGACCTTCGTGGCCTGGGAG;SOR=0.738;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=301;TCF=150;TCR=151;TR=147;WE=12225954;WS=12225936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,150:0.47:319
chr11	12229437	rs16910765	C	T	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=423;ReadPosRankSum=0.333;SC=TGCATAATCCCGCTCAGTAAT;SOR=0.612;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=40;TCF=30;TCR=10;TR=23;WE=12229445;WS=12229427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,23:0.57:40
chr11	12229655	rs2279390	T	G	1565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=39;PP=999;ReadPosRankSum=1.373;SC=TCGTGAAGGTTCTAGAGCCTC;SOR=0.645;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=152;TCF=61;TCR=91;TR=65;WE=12229663;WS=12229645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,73:0.44:167
chr11	12237843	.	C	T	3570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.054;ClippingRankSum=0.000;DP=355;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=90;PP=2219;ReadPosRankSum=-2.172;SC=GCAGAGCCTGCTCGACAAAGG;SOR=0.699;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=323;TCF=136;TCR=187;TR=158;WE=12237851;WS=12237833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,173:0.49:355
chr11	12241626	rs7101833	A	G	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=199;ReadPosRankSum=-0.612;SC=CCTGGTTTTTATATGTCTTTT;SOR=1.061;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=11;WE=12241634;WS=12241616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr11	12242030	rs4237704	A	G	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=61;ReadPosRankSum=-2.053;SC=CGGAGCCCCCATGTTTCTCTG;SOR=0.892;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=6;WE=12242038;WS=12242020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr11	12247665	rs2270507	C	T	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.645;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=6;PP=132;ReadPosRankSum=0.031;SC=GCTCAGCTCGCCACACCTCTG;SOR=0.362;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=45;TCF=32;TCR=13;TR=15;WE=12247673;WS=12247655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,17:0.33:52
chr11	12262476	rs2641936	C	A	3502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=78;NR=41;PP=2205;SC=GCACTTGCAACCTTCGTCTCC;SOR=1.501;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=119;TCF=78;TCR=41;TR=119;WE=12262484;WS=12262466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr11	12263714	rs77070968	G	T	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.220;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=78;ReadPosRankSum=-1.140;SC=GAGGGTGTATGAAAGGGCCGC;SOR=1.445;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=31;TCF=19;TCR=12;TR=10;WE=12263722;WS=12263704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr11	12264140	rs880963	A	C	628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.915;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=9;PP=441;ReadPosRankSum=-1.348;SC=TGCCTCCCTCACCCACTTCTT;SOR=0.826;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=70;TCF=48;TCR=22;TR=30;WE=12264148;WS=12264130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,31:0.41:76
chr11	12270793	rs146412715	GGT	G	4960.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.476;NF=5;NR=62;PP=2688;ReadPosRankSum=-0.900;SC=TGCATCCTCAGGTGAGTTAGA;SOR=0.664;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=146;TCF=9;TCR=137;TR=67;WE=12270802;WS=12270783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,130:0.48:270
chr11	12279937	rs2270513	T	C	1304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=22;PP=779;ReadPosRankSum=0.680;SC=TGGACAGTGGTGGGCACTTGG;SOR=0.696;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=117;TCF=76;TCR=41;TR=59;WE=12279945;WS=12279927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,62:0.48:129
chr11	12313887	rs1874043	C	G	597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=322;ReadPosRankSum=0.377;SC=AGGAAGCTAACCTACCTGTAC;SOR=0.593;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=19;WE=12313895;WS=12313877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,24:0.62:39
chr11	12315407	rs10741579	G	C	2553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.937;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=52;PP=1623;ReadPosRankSum=0.582;SC=GCTGGACAGGGCAAGAGCTAT;SOR=0.767;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=244;TCF=122;TCR=122;TR=108;WE=12315415;WS=12315397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,120:0.45:266
chr11	12315716	rs1493951	C	T	1860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.710;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=37;PP=1120;ReadPosRankSum=-1.075;SC=AGAGAGGGGCCCAGGAGAAGA;SOR=0.569;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=184;TCF=105;TCR=79;TR=80;WE=12315724;WS=12315706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,91:0.44:206
chr11	12315891	rs1493953	G	A	2546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.207;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=54;PP=1480;ReadPosRankSum=-0.956;SC=AACTTTGCCCGCACAGGCCTG;SOR=0.551;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=217;TCF=104;TCR=113;TR=109;WE=12315899;WS=12315881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,119:0.51:235
chr11	12316389	.	A	C	46	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MMLQ=24;MQ=58.95;NF=1;NR=4;PP=46;QD=16.1542425094;SC=TCCTCCTCCTACAGCGGGAGG;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=5;WE=12316397;WS=12316379;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr11	12345459	rs903213	C	T	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.856;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=194;ReadPosRankSum=-1.218;SC=AAGCCTATAACGATATTTTGT;SOR=0.307;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=14;WE=12345467;WS=12345449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr11	12379792	rs10741583	G	C	980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.192;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=10;PP=755;ReadPosRankSum=-0.895;SC=CAAGAACTCTGCCGGGGCCCA;SOR=1.184;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=88;TCF=64;TCR=24;TR=45;WE=12379800;WS=12379782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,45:0.47:95
chr11	12495607	rs2288291	T	C	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.503;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=277;ReadPosRankSum=-0.206;SC=TCTGTGCAGGTACCCCACGAG;SOR=0.217;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=40;TCF=9;TCR=31;TR=18;WE=12495615;WS=12495597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,17:0.40:42
chr11	12495623	rs7109678	G	C	963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=20;PP=656;SC=ACGAGCCCCTGAGAGAAGGTA;SOR=3.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=24;WE=12495631;WS=12495613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr11	12517935	rs11406960	G	GT	746.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=3;PP=615;SC=GAATAACTGAGTAAGTGCATG;SOR=2.636;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=15;WE=12517943;WS=12517925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	12532912	rs12283539	A	C	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.76;ReadPosRankSum=0.909;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,4:0.18:22
chr11	12534707	rs2243707	G	A	3050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.890;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=52;PP=1773;ReadPosRankSum=-0.716;SC=CAGAGTTCCCGGCACAGTCTA;SOR=0.620;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=254;TCF=144;TCR=110;TR=123;WE=12534715;WS=12534697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,145:0.49:294
chr11	12534808	rs2403631	A	G	8743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=146;NR=148;PP=2965;SC=GCCAGGGATCAGCTCTTGTGC;SOR=0.790;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=294;TCF=146;TCR=148;TR=294;WE=12534816;WS=12534798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,323:1.00:323
chr11	12535209	rs2288293	C	T	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=4.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.039;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=327;ReadPosRankSum=1.041;SC=GCACCTGTGCCGAAGAAGGGA;SOR=1.284;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=44;TCF=4;TCR=40;TR=18;WE=12535217;WS=12535199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,21:0.43:49
chr11	12535415	rs11022380	A	G	961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=4;PP=700;SC=TCCTGGGCCCAGGGCTCTTGG;SOR=3.026;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=33;WE=12535423;WS=12535405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr11	12535485	rs56043920	CACAGGCTCCTGCACTA	C	2396.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.070;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=2962;ReadPosRankSum=1.683;SC=ACGGAGCAGCCACAGGCTCCT;SOR=1.096;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=78;TCF=34;TCR=44;TR=26;WE=12535508;WS=12535475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,64:0.43:149
chr11	12902459	.	C	T	766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.769;ClippingRankSum=0.000;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=12;PP=444;ReadPosRankSum=-3.003;SC=ATCGAACCTGCTGTCTTTTAG;SOR=0.690;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=100;TCF=65;TCR=35;TR=37;WE=12902467;WS=12902449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,40:0.37:109
chr11	12923434	rs2289436	T	C	713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=4;PP=462;ReadPosRankSum=0.600;SC=ATGGATGAGTTCCAGGTTGAT;SOR=0.883;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=52;TCF=42;TCR=10;TR=26;WE=12923442;WS=12923424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,30:0.54:56
chr11	12951623	rs2245140	A	C	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.898;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=327;ReadPosRankSum=0.462;SC=AAGATGATTCATGTTGAAAAA;SOR=0.296;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=42;TCF=37;TCR=5;TR=19;WE=12951631;WS=12951613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,20:0.45:44
chr11	12951926	rs2727360	A	G	2998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=56;PP=1786;SC=GAGGCTTGACAGAAGTGAGGA;SOR=1.253;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=40;TCR=56;TR=96;WE=12951934;WS=12951916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr11	12952015	rs2727361	C	T	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=53;ReadPosRankSum=-0.195;SC=GGTCAGTCAGCAGTTGAATTT;SOR=0.293;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=5;WE=12952023;WS=12952005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr11	13398129	rs10741617	T	A	7144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=126;NR=114;PP=2965;SC=CCAAGTTGAATGGTGCACAGT;SOR=0.708;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=242;TCF=127;TCR=115;TR=240;WE=13398137;WS=13398119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
chr11	13399791	rs10832030	A	G	671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=6;PP=476;SC=TGAACTGCAAATGGATCATGG;SOR=1.802;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=24;WE=13399799;WS=13399781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	13514263	rs6254	C	T	4641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=85;PP=2799;SC=CTCCCCACTTCGAAATGATAA;SOR=1.213;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=145;TCF=60;TCR=85;TR=145;WE=13514284;WS=13514253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr11	13514417	rs694	C	T	272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=229;SC=ACTAAAAGGACAAGCAAAATG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=13514425;WS=13514407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	13716530	rs7130943	A	G	1307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=23;PP=697;SC=CACTCAGAACAAAGAAAAAAG;SOR=1.225;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=40;TCF=16;TCR=24;TR=39;WE=13716538;WS=13716520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr11	13716614	.	T	TA	34	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5002;HP=4;HapScore=4;MGOF=33;MMLQ=20;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=34;QD=30.5;SC=AAAAAATTAGTAAAACAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=2;WE=13716627;WS=13716604;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:2,2:0.50:4
chr11	13716619	.	C	A	67	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5002;HP=11;HapScore=4;MGOF=33;MMLQ=20;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=67;QD=33.9237375157;SC=ATTAGTAAAACAAAAAAACTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=13716627;WS=13716604;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:1,3:0.75:4
chr11	13729639	rs183124096	GA	AT	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;JOINED;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=426;ReadPosRankSum=0.442;SC=ATGTTTGTTTGAAATTTATAT;SOR=0.481;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=12;WE=13729648;WS=13729629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr11	13733401	rs7934570	C	T	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=8;PP=332;ReadPosRankSum=-1.087;SC=CATTTTTCTGCTTTTTGTATA;SOR=0.751;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=46;TCF=29;TCR=17;TR=24;WE=13733409;WS=13733391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,26:0.46:56
chr11	13744935	rs12421421	A	C	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.56;ReadPosRankSum=-0.751;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr11	13744958	rs12420123	T	G	728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.053;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=12;PP=523;ReadPosRankSum=1.343;SC=TTTATTTATATTCTGTCTTAC;SOR=0.514;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=53;TCF=35;TCR=18;TR=28;WE=13744966;WS=13744948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,27:0.49:55
chr11	13749317	.	A	C	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.020;ClippingRankSum=0.000;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=19.639;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=106;ReadPosRankSum=-1.227;SC=TATTTGCTATATCTGTCATTC;SOR=4.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=12;TCR=38;TR=13;WE=13749325;WS=13749307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,14:0.26:53
chr11	13984720	rs10741631	A	C	2686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=52;PP=1414;SC=GCATTAGGAGAGCGGGACCCG;SOR=1.329;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=37;TCR=52;TR=89;WE=13984728;WS=13984710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr11	14101493	rs5789820	G	GC	9125.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=30;NR=77;PP=2971;SC=AGACTGCTGTGCTGCGGAACT;SOR=0.726;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=109;TCF=30;TCR=79;TR=107;WE=14101501;WS=14101483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr11	14246336	rs2163463	G	A	1388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.571;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=36;PP=872;ReadPosRankSum=-0.027;SC=GGGCCAAAGGGTGAGCCCTTG;SOR=0.889;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=103;TCF=44;TCR=59;TR=60;WE=14246344;WS=14246320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,64:0.58:110
chr11	14264916	rs2303973	A	G	1771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=29;PP=1140;ReadPosRankSum=1.597;SC=CCAAAGCCCAATGGCCAGCCT;SOR=0.741;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=144;TCF=89;TCR=55;TR=79;WE=14264924;WS=14264906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,82:0.54:153
chr11	14279220	rs116877548	C	T	1250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.810;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=12;PP=627;ReadPosRankSum=0.537;SC=AGTGGCAGCTCCCATAGGTTC;SOR=0.574;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=90;TCF=65;TCR=25;TR=47;WE=14279228;WS=14279210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,57:0.57:100
chr11	14284206	rs3217362	CAT	C	2523.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.309;NF=11;NR=27;PP=1500;ReadPosRankSum=0.849;SC=AGAGCGTGACCATATCTTGTT;SOR=0.646;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=74;TCF=26;TCR=48;TR=38;WE=14284215;WS=14284196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,68:0.49:138
chr11	14316128	.	TA	T	123.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.785;ClippingRankSum=0.000;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=6.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.93;ReadPosRankSum=1.159;SOR=0.472;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,15:0.23:64
chr11	14329984	rs2915408	C	G	540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.389;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=403;ReadPosRankSum=-0.396;SC=CTGGCTCTCACCTATAAATGA;SOR=0.407;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=39;TCF=11;TCR=28;TR=23;WE=14329992;WS=14329974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,23:0.56:41
chr11	14486608	.	TACACACACACACAC	TACAC,T	84	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.39;FR=0.5000,0.4925;HP=6;HapScore=3;MGOF=10;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=0,0;NR=6,6;PP=84,13;QD=14.5;SC=TGGTTAAAAATACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=6,6;WE=14486629;WS=14486598;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.46:13
chr11	14497269	rs2597194	C	T	2656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=26;PP=1916;SC=ATTTGACTGTCTTACATACAA;SOR=2.019;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=66;TCR=26;TR=92;WE=14497277;WS=14497259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr11	14501296	rs2575857	C	T	951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=44;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=27;PP=779;SC=ATGGAACTAACAATTTTCGAA;SOR=6.932;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=29;WE=14501304;WS=14501286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr11	14504463	rs7121538	A	C	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.451;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=248;ReadPosRankSum=0.176;SC=GCTGATCAAAATATAAACTGC;SOR=1.262;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=34;TCF=24;TCR=10;TR=17;WE=14504471;WS=14504453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr11	14504774	rs72419983	CCACA	C	43.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.58;ReadPosRankSum=0.967;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr11	14512060	rs2597189	C	T	965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=10;PP=655;SC=GTAATACTTTCAATTGTCACT;SOR=1.483;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=25;TCR=10;TR=35;WE=14512068;WS=14512050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr11	14515997	.	ATT	A	43.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.19;ReadPosRankSum=-0.044;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
chr11	14516003	rs10832279	TT	AA	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.94;ReadPosRankSum=-0.350;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
chr11	14532338	rs2597218	C	T	905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=6;PP=647;SC=CAGAATGTTGCATATATACTC;SOR=2.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=32;WE=14532346;WS=14532328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	14539639	rs2575849	T	A	252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.98;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	14540671	rs1823466	A	G	4435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=44;PP=2490;SC=ATATGCTTGTATTTCCATTCA;SOR=1.223;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=128;TCF=84;TCR=44;TR=128;WE=14540679;WS=14540661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr11	14632570	rs1403247	A	C	1241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.657;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=24;PP=605;ReadPosRankSum=-2.903;SC=AGACCAACATACAACATAGGT;SOR=0.619;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=110;TCF=54;TCR=56;TR=51;WE=14632578;WS=14632560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,61:0.48:127
chr11	14810762	rs4757268	A	G	1518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=37;PP=985;ReadPosRankSum=-1.290;SC=ATGGCAAAAGACCTCACCAAG;SOR=0.689;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=164;TCF=78;TCR=86;TR=72;WE=14810770;WS=14810752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,77:0.42:185
chr11	14825704	rs3740823	A	G	749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.007;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=24;PP=501;ReadPosRankSum=2.709;SC=AATTTCATGTATTATAAGTTA;SOR=1.300;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=56;TCF=9;TCR=47;TR=27;WE=14825712;WS=14825694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,31:0.52:60
chr11	14852490	rs1037378	G	A	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.057;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=23;ReadPosRankSum=-0.221;SC=TTTTAATATAGTAGTATTTTT;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=3;WE=14852498;WS=14852480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr11	14865666	rs2167453	T	G	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=237;ReadPosRankSum=1.464;SC=GAATCATATGTCCAATCCATC;SOR=0.560;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=12;WE=14865674;WS=14865656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr11	14991511	rs145837941	A	G	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.641;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.705;NF=14;NR=3;PP=200;ReadPosRankSum=-1.803;SC=CTCCTGCTCCAGCTCACTGGC;SOR=1.489;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=45;TCF=32;TCR=13;TR=17;WE=14991519;WS=14991501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,19:0.40:47
chr11	14991539	rs5239	T	C	2145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=48;NR=24;PP=1307;SC=TGCACATAGTTCTGCACCAGT;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=48;TCR=24;TR=72;WE=14991547;WS=14991529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr11	15096419	rs1540139	C	T	1079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=19;PP=857;SC=CTCTGTGCCTCTGAAGTCACG;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=14;TCR=19;TR=33;WE=15096427;WS=15096409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr11	15170644	rs1714354	T	C	1551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=36;PP=977;ReadPosRankSum=0.479;SC=TCTTTTAGGATCTCGTTGTGC;SOR=0.720;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=149;TCF=72;TCR=77;TR=69;WE=15170652;WS=15170634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,77:0.46:168
chr11	15199957	rs1714376	T	C	1797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=40;PP=1111;ReadPosRankSum=-0.772;SC=AGCACTTTGGTCAGCTGCTGG;SOR=0.715;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=105;TCF=49;TCR=56;TR=72;WE=15199965;WS=15199947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,80:0.65:123
chr11	16205323	rs7926424	T	C	960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=2;PP=686;SC=GAAAACAGCCTTATTGGTGCT;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=27;WE=16205331;WS=16205313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr11	16205595	rs1455111	C	T	355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=2;NR=9;PP=252;SC=AATCTTTTACCGCACCTCTAT;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=16205603;WS=16205585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	16305351	rs12277740	G	A	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.939;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=280;ReadPosRankSum=-0.859;SC=TGCTGCTAATGTTCGATAATT;SOR=0.542;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=54;TCF=38;TCR=16;TR=26;WE=16305359;WS=16305341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,33:0.49:67
chr11	16339873	rs72869972	C	A	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=251;ReadPosRankSum=0.359;SC=ATAACTTTTTCCTAGCTAGTG;SOR=0.195;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=42;TCF=37;TCR=5;TR=18;WE=16339881;WS=16339863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr11	16339918	.	CTT	C	43.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=0.000;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.37;ReadPosRankSum=0.349;SOR=0.354;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,5:0.16:32
chr11	16760244	rs1846936	T	G	849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=7;PP=481;SC=GCTTGGGCCCTTGGCGGATTG;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=29;WE=16760252;WS=16760234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	16805226	rs739936	C	T	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=7;PP=435;ReadPosRankSum=-1.178;SC=CCTGCCAACACTTGAGCAAGC;SOR=0.784;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=55;TCF=40;TCR=15;TR=30;WE=16805234;WS=16805216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,33:0.57:58
chr11	16815883	rs78875781	A	G	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.410;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=192;ReadPosRankSum=-0.315;SC=GCAGGGAAATACTACTTTTTA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=9;WE=16815891;WS=16815873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr11	16863130	rs369819	T	C	690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=11;PP=422;ReadPosRankSum=0.358;SC=CTGTGCAGCCTGGTTCATGGC;SOR=0.611;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=81;TCF=55;TCR=26;TR=33;WE=16863138;WS=16863120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,35:0.41:86
chr11	16872653	rs35098462	G	A	2323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.939;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=45;PP=1335;ReadPosRankSum=-0.678;SC=TCCCCCTCCCGACAAAAGCAA;SOR=0.624;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=236;TCF=132;TCR=104;TR=101;WE=16872661;WS=16872643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,119:0.45:267
chr11	16874067	rs418113	C	T	750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.314;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=22;PP=472;ReadPosRankSum=-0.234;SC=GACATTAGAACTTGGATTAAA;SOR=1.115;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=54;TCF=11;TCR=43;TR=27;WE=16874075;WS=16874057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,31:0.53:58
chr11	17035493	rs71047521	C	CA	2511.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=10;PP=1571;SC=AGGGACCCCCCCCCCGCGGCA;SOR=2.165;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=43;WE=17035501;WS=17035483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr11	17035718	rs61881311	A	G	5972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=115;PP=2965;SC=CGGTGCGCGGATGCAGCCAGG;SOR=1.032;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=204;TCF=89;TCR=115;TR=204;WE=17035726;WS=17035708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr11	17096211	rs1541533	A	G	3081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=72;PP=1874;ReadPosRankSum=-0.400;SC=TCACTCAGACATCCAAGGAAG;SOR=0.689;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=309;TCF=153;TCR=156;TR=142;WE=17096226;WS=17096201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:179,156:0.47:335
chr11	17113483	rs7113396	C	T	208.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=114;SC=CCACATTCATCGAGAAGTTAC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=17113491;WS=17113473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr11	17126670	rs2052188	C	T	958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=1;PP=766;SC=ACCTCTGTAACACATTTTTGA;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=30;WE=17126678;WS=17126660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr11	17172133	rs2302511	T	C	7911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=125;NR=145;PP=2965;SC=TGTTTCTTTGTGCTGTGACTG;SOR=1.017;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=271;TCF=125;TCR=146;TR=270;WE=17172141;WS=17172123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,303:1.00:303
chr11	17190127	rs144948079	TAAAAAC	T	463.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.965;NF=7;NR=0;PP=321;ReadPosRankSum=0.236;SC=GACTCCTTCTTAAAAACAAAA;SOR=0.990;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=7;WE=17190140;WS=17190121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr11	17191019	rs214936	A	G	7054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=119;NR=112;PP=2965;SC=TTTCTACATCAATATCTAATG;SOR=0.749;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=231;TCF=119;TCR=112;TR=231;WE=17191027;WS=17191009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr11	17333663	rs2521998	G	A	2865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.59;SOR=0.766;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr11	17352901	rs72863694	A	G	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.706;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=107;ReadPosRankSum=1.913;SC=ATATGAAGGAACATTTAGAAT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=6;WE=17352909;WS=17352891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr11	17373438	rs34000454	G	C	6636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=122;NR=105;PP=2965;SC=ACGCAACAGAGGTCTCCCCCT;SOR=0.791;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=227;TCF=122;TCR=105;TR=227;WE=17373446;WS=17373428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr11	17393644	rs12791318	A	G	1124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=16;PP=566;SC=AAGAAAGAGCACCTCATATTC;SOR=0.784;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=21;TCR=16;TR=37;WE=17393652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr11	17394073	rs10832778	C	G	4592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=96;PP=2907;SC=CCTGATGGACCTGGTGCCACT;SOR=1.311;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=157;TCF=61;TCR=96;TR=156;WE=17394081;WS=17394063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr11	17408404	rs5213	C	T	1543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=32;NR=19;PP=901;SC=AGGCCCTGGCCGGGCTACATA;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=32;TCR=19;TR=51;WE=17408412;WS=17408394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr11	17408630	rs5215	C	T	6482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=127;NR=92;PP=2965;SC=GGCACTTTGACGGTGTTGCCA;SOR=0.915;SbPval=0.53;Source=Platypus;TCF=127;TR=219;WE=17408638;WS=17408620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr11	17409572	rs5219	T	C	8838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=158;NR=148;PP=2965;SC=TACCTGGGCTTGGCAGGGTCC;SOR=0.711;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=306;TCF=158;TCR=148;TR=306;WE=17409580;WS=17409562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,335:1.00:335
chr11	17414715	rs1109591	T	C	2708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=31;NR=59;PP=1849;SC=ATGGTGGGAATACCACCCGCG;SOR=1.561;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=31;TCR=59;TR=90;WE=17414723;WS=17414705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr11	17415190	rs4148646	C	G	3932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=83;NR=38;PP=2245;SC=ACGGCCACAACAGGCCAGTCC;SOR=1.385;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=83;TCR=38;TR=121;WE=17415198;WS=17415180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr11	17417504	rs739689	A	G	3581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=60;PP=2045;SC=AGGCACCGCCACTGGGACTCT;SOR=1.057;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=50;TCR=60;TR=110;WE=17417512;WS=17417494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr11	17418477	rs757110	C	A	3648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=36;PP=2181;SC=TGTCCAGGGGCGATGAGGGCA;SOR=1.557;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=80;TCR=36;TR=116;WE=17418485;WS=17418467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr11	17419279	rs1799859	C	T	5488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=83;PP=2965;SC=CAGAGAGCTCCCTGTGCAGGG;SOR=0.713;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=178;TCF=95;TCR=83;TR=178;WE=17419287;WS=17419269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr11	17425937	rs4148637	GTTTT	G	1020.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.810;NF=10;NR=10;PP=603;ReadPosRankSum=0.507;SC=CTTCATTTCTGTTTTTTGTTT;SOR=0.614;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=35;TCF=20;TCR=15;TR=20;WE=17425948;WS=17425927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,28:0.57:49
chr11	17429922	rs2106865	T	C	2103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=36;NR=32;PP=1082;SC=TGCTTGGCCATCCCTGGATAT;SOR=0.855;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=68;TCF=36;TCR=32;TR=68;WE=17429930;WS=17429912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr11	17435936	rs4148631	G	A	661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=1;PP=374;SC=TGGAGTGCAGGTAAGCACCTG;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=17435944;WS=17435926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr11	17435966	rs4148630	G	A	1306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=6;PP=858;SC=ATGGCTGGGTGTGGGTGATCG;SOR=2.985;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=35;TCR=6;TR=41;WE=17435974;WS=17435956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr11	17436936	rs4148626	A	G	5210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=65;PP=2734;SC=AGTGAACCATATCCTCCAGGA;SOR=0.825;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=164;TCF=98;TCR=66;TR=163;WE=17436944;WS=17436926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr11	17448704	rs1799854	G	A	2536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=61;PP=1668;SC=CAGCTGGCCTGCAGGGAGGGA;SOR=1.942;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=25;TCR=61;TR=86;WE=17448712;WS=17448694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr11	17452603	rs8192694	T	G	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=176;ReadPosRankSum=-0.203;SC=GAGAGGGCTGTCAGGGAGCAG;SOR=0.919;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=9;WE=17452611;WS=17452593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr11	17464534	rs2073587	T	C	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.439;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=11;PP=284;ReadPosRankSum=-0.911;SC=CCTCCTGTCCTCACCGGGAGG;SOR=0.187;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=44;TCF=17;TCR=27;TR=22;WE=17464542;WS=17464524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,24:0.51:47
chr11	17481948	rs886291	T	C	832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.985;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=14;PP=534;ReadPosRankSum=1.335;SC=AGTGTGGCCATGGCTCACACA;SOR=0.483;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=63;TCF=44;TCR=19;TR=39;WE=17481956;WS=17481938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,39:0.57:69
chr11	17484971	rs2301703	G	A	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.692;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=379;ReadPosRankSum=1.572;SC=CCCTGGCCCAGGTGGCCTGCT;SOR=0.186;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=40;TCF=33;TCR=7;TR=24;WE=17484979;WS=17484961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,24:0.56:43
chr11	17491571	rs10400389	C	T	1181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.679;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=16;PP=648;ReadPosRankSum=-0.625;SC=CAATAGCTGGCACATAATGAG;SOR=0.765;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=114;TCF=78;TCR=36;TR=53;WE=17491579;WS=17491561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,59:0.47:126
chr11	17496516	rs1048099	A	G	2563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=64;PP=1566;ReadPosRankSum=-2.464;SC=GGTTGTGCCCAGGGAAATGAA;SOR=0.709;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=249;TCF=115;TCR=134;TR=118;WE=17496524;WS=17496506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,129:0.47:277
chr11	17498057	rs77889556	G	A	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=325;ReadPosRankSum=2.086;SC=GGGACCCCGGGAACGAGGCGG;SOR=0.746;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=34;TCR=2;TR=18;WE=17498065;WS=17498047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,21:0.51:41
chr11	17517235	rs10832795	A	G	4539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=81;PP=2641;SC=CTATATATACAGAGCAGAGCA;SOR=0.983;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=149;TCF=68;TCR=81;TR=149;WE=17517243;WS=17517225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr11	17517381	rs10530940	CAT	C	512.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=11;PP=427;SC=TTCTCCAAGACATGTGTAGAG;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=17517390;WS=17517371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	17517407	rs1859824	G	C	193.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=4;PP=115;SC=ATTCTGCTGGGCACGGGGAGC;SOR=1.609;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=17517415;WS=17517397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr11	17519742	rs1064074	C	G	3631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=382;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.678;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=67;PP=1835;ReadPosRankSum=-0.116;SC=GCAGGGCAGCCTCAGCCTCAG;SOR=0.594;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=347;TCF=201;TCR=146;TR=156;WE=17519750;WS=17519732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:199,183:0.48:382
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chr11	17523474	rs17703528	G	A	2106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.045;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=42;PP=1271;ReadPosRankSum=-1.810;SC=GGAGAGAAGCGTCATCTCTTA;SOR=0.684;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=197;TCF=104;TCR=93;TR=92;WE=17523482;WS=17523464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,102:0.47:217
chr11	17531146	rs17776775	G	A	527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=3.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.19;MQRankSum=-0.932;QD=9.10;ReadPosRankSum=-0.785;SOR=0.839;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,28:0.48:58
chr11	17531449	rs2237965	G	T	1632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=31;PP=916;SC=TCACAATACAGCGAGCACTAT;SOR=1.460;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=20;TCR=31;TR=51;WE=17531457;WS=17531439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr11	17531831	rs733874	A	T	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.108;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.82;ReadPosRankSum=2.189;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr11	17532102	rs2237964	C	T	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.828;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=15;PP=285;ReadPosRankSum=-1.112;SC=AAGGAGAGGACAAAGGGCACA;SOR=0.922;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=73;TCF=36;TCR=37;TR=29;WE=17532110;WS=17532092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,33:0.41:81
chr11	17533397	rs2190453	G	A	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=243;ReadPosRankSum=0.266;SC=CATGGAGAACGACCACATTGT;SOR=0.614;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=38;TCF=34;TCR=4;TR=16;WE=17533405;WS=17533387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,16:0.42:38
chr11	17533635	rs2190454	G	A	5556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=93;PP=2965;SC=TATGACAAAGGTTAGAAATAG;SOR=0.915;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=181;TCF=88;TCR=93;TR=181;WE=17533643;WS=17533625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr11	17539212	rs10766408	T	C	629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=18;PP=539;SC=GCATACAGTGTTTTCAACCTT;SOR=3.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=17539220;WS=17539202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	17542439	rs2240487	T	C	1163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.461;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=19;PP=623;ReadPosRankSum=1.490;SC=GAAGGGGTACTGGGTGTACCT;SOR=0.471;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=114;TCF=77;TCR=37;TR=50;WE=17542447;WS=17542429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,56:0.44:126
chr11	17542583	rs2108332	C	T	7681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.40;SOR=1.052;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr11	17542586	rs2041031	T	C	7648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.53;SOR=1.048;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr11	17542649	rs2041032	T	C	1804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=42;PP=1228;ReadPosRankSum=1.070;SC=ATGGTTCTAGTCATGATGAAT;SOR=1.300;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=57;TCF=14;TCR=43;TR=56;WE=17542657;WS=17542639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,62:0.98:63
chr11	17542872	rs2240488	G	C	857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.837;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=11;PP=574;ReadPosRankSum=-0.440;SC=GCACAGACACGCGTGGAGCCG;SOR=0.874;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=78;TCF=53;TCR=25;TR=38;WE=17542880;WS=17542862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,41:0.47:88
chr11	17545091	rs4757539	A	G	3070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=56;PP=1697;SC=TCTGCAGGACAGGCTCCCCCA;SOR=1.028;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=101;TCF=45;TCR=56;TR=101;WE=17545103;WS=17545081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr11	17548239	rs72870320	C	T	1356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.814;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=21;PP=891;ReadPosRankSum=-0.205;SC=CCTTCAGGACCGGCCACCCCT;SOR=0.396;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=90;TCF=57;TCR=33;TR=51;WE=17548247;WS=17548229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,58:0.57:102
chr11	17548507	rs41282940	T	C	1216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.128;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=30;PP=793;ReadPosRankSum=-0.746;SC=CCCAGGGCTGTACCAGGATCC;SOR=1.040;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=120;TCF=54;TCR=66;TR=49;WE=17548515;WS=17548497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,57:0.41:138
chr11	17548737	rs12795083	T	C	1099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=10;PP=823;SC=CTCCCACCGTTATGGAGTACT;SOR=1.552;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=40;TCF=30;TCR=10;TR=39;WE=17548745;WS=17548727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	17554914	rs2240489	G	C	2351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=0.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.60;ReadPosRankSum=1.165;SOR=0.599;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,63:0.52:120
chr11	17554914	.	GCC	CCA	1806	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=24;NR=32;PP=1806;QD=33.2047834797;SC=CTCAGCACCCGCCCCCATAGC;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=110;TCF=49;TCR=61;TR=56;WE=17554924;WS=17554904;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:54,56:0.51:110
chr11	17554916	rs2355022	C	A	2351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.10;ReadPosRankSum=1.055;SOR=0.698;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,61:0.52:117
chr11	17569885	rs58569858	A	G	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=239;ReadPosRankSum=-1.063;SC=GAACAAGCAGATTCCTGGTAT;SOR=0.848;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=34;TCF=11;TCR=23;TR=17;WE=17569893;WS=17569875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr11	17574588	rs4757543	T	C	2090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=37;PP=1164;ReadPosRankSum=0.475;SC=CTGGATCCTGTGAAGCCTGAG;SOR=0.656;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=174;TCF=104;TCR=70;TR=93;WE=17574596;WS=17574578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,99:0.53:188
chr11	17582470	rs1990180	T	C	2569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=27;PP=1976;SC=GGCACTCACTTAGTACCTTTG;SOR=1.554;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=52;TCR=27;TR=79;WE=17582478;WS=17582460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr11	17615586	rs12792504	C	G	1296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.697;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=24;PP=795;ReadPosRankSum=1.828;SC=TGTCCTCTCTCCTTTCAGGGC;SOR=0.576;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=105;TCF=61;TCR=44;TR=55;WE=17615594;WS=17615576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,61:0.52:117
chr11	17627613	rs7934079	G	C	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.985;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=19;PP=462;ReadPosRankSum=-0.272;SC=TGTGTCGGGCGCGGTGCTGGC;SOR=0.963;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=63;TCF=24;TCR=39;TR=30;WE=17627621;WS=17627603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,32:0.48:67
chr11	17742681	rs10832853	G	C	4071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=89;PP=2300;SC=CCTGTCTTTTGGATTGTCCCG;SOR=1.285;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=51;TCR=89;TR=140;WE=17742689;WS=17742671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr11	17899795	rs35473390	TA	T	161.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.436;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr11	17940172	.	GAC	G	212.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.444;ClippingRankSum=0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.20;ReadPosRankSum=-0.623;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr11	17940200	rs74865487	T	C	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.67;ReadPosRankSum=2.204;SOR=0.634;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,3:0.14:22
chr11	17940204	.	C	CACAT	840	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MMLQ=26;MQ=57.86;NF=22;NR=1;PP=840;QD=37.4347826087;SC=CACACATACACACACACTCTC;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=23;WE=17940221;WS=17940188;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:13,23:0.64:36
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chr11	17948311	rs1468291	T	C	1812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=34;PP=815;ReadPosRankSum=-0.981;SC=AAGACTATCTTGATGCAGAAT;SOR=0.672;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=156;TCF=83;TCR=73;TR=75;WE=17948319;WS=17948301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,88:0.49:179
chr11	17948537	rs728639	A	G	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.021;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=40;ReadPosRankSum=1.224;SC=GCCTGTCACCATGTTCTTTGG;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=4;WE=17948545;WS=17948527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr11	17981047	rs211146	C	T	1762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.852;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=31;PP=1023;ReadPosRankSum=1.300;SC=AATGCGGAGACGAAGGCATGC;SOR=0.448;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=132;TCF=81;TCR=51;TR=73;WE=17981055;WS=17981037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,82:0.54:151
chr11	18023414	rs211134	C	T	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=493;ReadPosRankSum=-0.071;SC=TTAAGGCTTACCACATTTGTT;SOR=0.892;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=46;TCF=37;TCR=9;TR=27;WE=18023422;WS=18023404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,28:0.54:52
chr11	18034592	rs3741202	G	C	459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=4;NR=8;PP=164;SC=CGGGAGGGACGGCACGGGGGC;SOR=1.609;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=12;WE=18034613;WS=18034582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	18034605	rs3741201	C	G	447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=8;PP=235;SC=ACGGGGGCGGCGCCTGCCGGG;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=18034613;WS=18034582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	18044304	rs211101	C	T	3171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=62;NR=39;PP=1682;SC=GGGCTGATCTCTCCCTGAAGA;SOR=0.874;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=101;TCF=62;TCR=39;TR=101;WE=18044312;WS=18044294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr11	18047255	rs1799913	G	T	1822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=48;PP=1084;ReadPosRankSum=-0.223;SC=ATCTCTGAAAGAGAGGTACAA;SOR=0.722;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=166;TCF=63;TCR=103;TR=77;WE=18047263;WS=18047245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,87:0.48:183
chr11	18054777	rs10832874	A	G	708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=7;PP=444;ReadPosRankSum=-0.817;SC=TCCAGTCTGGACAGCAGAGCA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=42;TCR=14;TR=28;WE=18054785;WS=18054767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,31:0.50:62
chr11	18063977	rs623580	A	T	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.875;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=19;PP=383;ReadPosRankSum=0.899;SC=CGTTGTCCTAAAGCGTGAAAA;SOR=0.883;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=71;TCF=30;TCR=41;TR=33;WE=18063985;WS=18063967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,37:0.46:80
chr11	18105302	rs3741199	T	C	1614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.502;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=46;PP=852;ReadPosRankSum=1.213;SC=TCAAGAAGCATGGAATTGGCC;SOR=0.636;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=212;TCF=83;TCR=129;TR=78;WE=18105310;WS=18105292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,89:0.37:239
chr11	18108512	rs35525096	T	C	3149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.973;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=77;PP=1743;ReadPosRankSum=1.606;SC=TCTTGAAGAATGATGGGTGGA;SOR=0.855;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=294;TCF=143;TCR=151;TR=146;WE=18108520;WS=18108502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,158:0.49:320
chr11	18111692	rs11424886	A	AT	928.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=540;ReadPosRankSum=0.734;SC=AATTTAAAACATTTTTTTTCT;SOR=0.610;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=73;TCF=46;TCR=27;TR=30;WE=18111700;WS=18111682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,42:0.51:83
chr11	18118538	rs4757613	A	T	93.85	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5164;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=65;ReadPosRankSum=0.524;SC=ATCCTAGCACATTGGGAGGCC;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=4;WE=18118546;WS=18118528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr11	18127679	rs871699	T	C	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.438;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.98;ReadPosRankSum=0.448;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr11	18158993	rs12291017	T	C	2505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.446;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=50;PP=1303;ReadPosRankSum=1.324;SC=CCACATTATATGTTCGCCGTT;SOR=0.742;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=246;TCF=139;TCR=107;TR=118;WE=18159001;WS=18158983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,127:0.47:268
chr11	18159169	rs2468839	A	G	4413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=63;PP=2965;SC=ACCTGTCATCAGTCATGTGTG;SOR=0.976;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=84;TCR=63;TR=147;WE=18159177;WS=18159159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr11	18159254	rs4274188	A	G	10157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=378;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=186;NR=156;PP=2965;SC=TAGTGGTGCTAATTCTGTTTG;SOR=0.799;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=343;TCF=187;TCR=156;TR=342;WE=18159262;WS=18159244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,377:1.00:377
chr11	18159455	rs72863191	T	C	2106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.185;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=37;PP=1177;ReadPosRankSum=-0.900;SC=TGGCATTCAGTGGGCCCTGTT;SOR=0.824;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=163;TCF=88;TCR=75;TR=86;WE=18159463;WS=18159445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,97:0.52:187
chr11	18194793	rs11024530	G	A	8843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=162;NR=119;PP=2965;SC=ACCAGACTAGGGTTTCTGAGC;SOR=0.970;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=281;TCF=162;TCR=119;TR=281;WE=18194801;WS=18194783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,324:1.00:324
chr11	18194944	rs11024531	T	A	6536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=103;PP=2965;SC=GAAACGCGGTTGTGCTCTGGC;SOR=0.859;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=201;TCF=98;TCR=103;TR=201;WE=18194952;WS=18194934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr11	18195051	rs2445179	T	C	7770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=145;NR=131;PP=2965;SC=ATTATACGTTTGCCATTACGC;SOR=0.707;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=277;TCF=146;TCR=131;TR=276;WE=18195059;WS=18195041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,296:1.00:296
chr11	18210480	rs2445150	T	C	3412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=55;PP=1928;SC=CTGACGGCGGTGGCGGGGGGT;SOR=0.790;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=56;TCR=55;TR=111;WE=18210491;WS=18210470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr11	18210580	rs2124372	C	T	2223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=33;PP=1574;SC=GCTGAAGCCGCTGCCCGCGGA;SOR=0.908;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=76;TCF=43;TCR=33;TR=75;WE=18210588;WS=18210570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr11	18231289	rs4757627	C	A	1017.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.994;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.477;NF=27;NR=23;PP=562;ReadPosRankSum=0.870;SC=CTAACATCTTCGAAACAAGAT;SOR=0.540;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=150;TCF=88;TCR=62;TR=50;WE=18231297;WS=18231279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,60:0.35:171
chr11	18231749	rs2468789	T	G	657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=19;PP=495;SC=TTTATCGAGGTTTGGTGCCCA;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=18231757;WS=18231739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr11	18253176	rs2460827	C	T	5943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=107;NR=98;PP=2965;SC=AAATAAATAGCAGTCTATTAA;SOR=0.720;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=205;TCF=107;TCR=98;TR=205;WE=18253184;WS=18253166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr11	18267027	rs2468844	C	T	8337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=159;NR=124;PP=2965;SC=CTCCGCACCACGGCCTGTGAG;SOR=0.887;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=284;TCF=159;TCR=125;TR=283;WE=18267035;WS=18267017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,314:1.00:314
chr11	18267112	rs2445173	A	G	2454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=61;PP=1690;ReadPosRankSum=1.985;SC=CCAGTGAGCAACAGCTCACCC;SOR=0.701;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=224;TCF=99;TCR=125;TR=108;WE=18267120;WS=18267102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,118:0.47:249
chr11	18267135	rs56373142	C	T	1850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.868;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=47;PP=1140;ReadPosRankSum=0.452;SC=CCATTCTCCCCGTTCCAAGGG;SOR=0.840;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=158;TCF=62;TCR=96;TR=75;WE=18267143;WS=18267125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,87:0.49:179
chr11	18267188	rs58546509	GA	G	581.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.652;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=566;ReadPosRankSum=-0.629;SC=AAGGAGGAGTGAAAACACTGA;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=2;TCR=49;TR=19;WE=18267196;WS=18267178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,24:0.44:55
chr11	18267353	rs2445172	A	G	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=9.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQRankSum=-1.643;QD=5.06;ReadPosRankSum=1.542;SOR=0.829;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,3:0.23:13
chr11	18267356	rs2445171	A	G	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=6.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.74;MQRankSum=-1.788;QD=7.74;ReadPosRankSum=-0.989;SOR=0.057;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr11	18267373	rs1671927	C	T	638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.598;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=3.653;NF=21;NR=4;PP=490;ReadPosRankSum=2.218;SC=CTAACTTCTCCACAAGGAGCT;SOR=0.096;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=42;TCF=38;TCR=4;TR=25;WE=18267381;WS=18267363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,22:0.67:33
chr11	18267431	rs76546965	C	T	3065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FS=2.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.12;MQRankSum=-10.195;QD=17.32;ReadPosRankSum=1.893;SOR=0.898;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,77:0.44:177
chr11	18267434	rs78891342	AA	GG	3211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FS=3.410;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.08;MQRankSum=-9.720;QD=17.36;ReadPosRankSum=1.245;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:102,83:0.45:185
chr11	18267463	rs74872559	A	G	4799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FS=0.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.72;MQRankSum=-5.117;QD=17.84;ReadPosRankSum=0.251;SOR=0.652;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:141,128:0.48:269
chr11	18267471	rs1136766	A	G	2770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.54;MQRankSum=4.570;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.005;SOR=0.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:128,142:0.53:270
chr11	18267478	rs79620496	G	A	4771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.51;MQRankSum=-4.221;QD=17.61;ReadPosRankSum=0.573;SOR=0.709;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:144,127:0.47:271
chr11	18267651	rs80208174	A	C	1141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.55;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=35;PP=945;SC=GACTCCAACAACACCTTAGAG;SOR=2.833;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=45;TCF=7;TCR=38;TR=42;WE=18267659;WS=18267641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr11	18267702	rs4757631	T	A	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=2.81;ReadPosRankSum=1.408;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr11	18290737	rs145097411	T	G	1391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.95;QD=26.26;SOR=0.808;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr11	18290859	rs1136743	C	T	733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.95;QD=40.76;SOR=1.493;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	18290874	rs1136747	T	C	646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.60;QD=43.12;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	18290880	rs28720026	C	G	646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.21;QD=43.12;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	18290902	rs34068567	TT	CC	916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.24;QD=43.66;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	18290906	rs35474820	G	A	896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.03;QD=42.70;SOR=0.990;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	18291312	rs15790	C	T	2491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FS=6.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQRankSum=-2.012;QD=10.98;ReadPosRankSum=-1.541;SOR=0.424;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:107,120:0.53:227
chr11	18291321	rs12218	T	C	7367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.61;QD=36.66;SOR=0.996;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr11	18301605	rs11024601	T	C	1451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=41;PP=1200;SC=TTCTGTGCATTAAAAGACACA;SOR=4.712;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=44;TCF=3;TCR=41;TR=44;WE=18301613;WS=18301595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr11	18303404	rs2271997	C	T	1579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=11;PP=936;SC=AGTGATGGGTCGGGACTAAAT;SOR=1.919;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=39;TCR=11;TR=50;WE=18303412;WS=18303394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr11	18312953	rs4757638	G	A	1129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=7;PP=823;SC=TTTTTAATACGAATTTCTATC;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=36;WE=18312961;WS=18312943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr11	18314359	rs76929453	G	A	934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.039;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=9;PP=601;ReadPosRankSum=-1.405;SC=TTCATACAAGGCCCATAAAAA;SOR=1.009;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=79;TCF=59;TCR=20;TR=36;WE=18314367;WS=18314349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,41:0.47:88
chr11	18314579	rs10665418	C	CTT	1878.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.01;NF=0;NR=42;PP=947;SC=GGGATCAGAGCTTTTTTTGAG;SOR=5.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=0;TCR=59;TR=42;WE=18314587;WS=18314569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr11	18317458	rs2305564	T	A	1495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=2;PP=1128;SC=TTCCTTTTTCTCATTTTCCAT;SOR=5.464;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=42;TCF=40;TCR=2;TR=42;WE=18317466;WS=18317448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr11	18317699	rs2305565	C	T	3076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=72;PP=1959;SC=AAAAAAGAAACAAAATCTAAT;SOR=2.100;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=28;TCR=72;TR=100;WE=18317707;WS=18317689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr11	18327684	rs1140047	G	T	1229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=28;NR=12;PP=744;SC=ATCGTTACCTGAGAGTAATCA;SOR=1.508;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=28;TCR=12;TR=40;WE=18327692;WS=18327674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr11	18330385	rs35952141	G	GA	2163.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=15;PP=983;SC=AAAAGAAAAAGAAAAAAAATC;SOR=1.874;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=55;TCF=30;TCR=25;TR=41;WE=18330393;WS=18330375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr11	18333042	rs59102347	C	CATT	254.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.16;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	18354877	rs4150561	T	C	560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=14;PP=429;SC=AAAAATCAACTATGTAGAAAT;SOR=2.419;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=18;WE=18354885;WS=18354867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	18357180	rs4150579	A	G	667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=3;PP=546;SC=AAGCATCAGTATTGGAATAGG;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=22;WE=18357188;WS=18357170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	18357270	rs4150581	A	G	4372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=54;PP=2674;SC=TGTGAGTGTCATCATCTAACT;SOR=1.264;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=151;TCF=97;TCR=54;TR=151;WE=18357278;WS=18357260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr11	18359983	.	ATGTT	A	44	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;FR=0.9998;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=61.94;NF=0;NR=2;PP=44;QD=28.5;SC=TATTATTATTATGTTTGTTTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=2;WE=18359994;WS=18359973;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,2:0.29:7
chr11	18379446	rs202243676	CA	C	46.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=1.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.82;ReadPosRankSum=-0.175;SOR=0.951;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,13:0.23:57
chr11	18379629	rs4150661	C	A	6315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=115;PP=2965;SC=CTGCCTAAATCAGCTTTAAAA;SOR=0.844;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=223;TCF=108;TCR=115;TR=223;WE=18379637;WS=18379619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr11	18422113	rs5790035	C	CA	243.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=281;SC=GCTTGGGGATCAAAAATTTGA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=18422121;WS=18422104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	18424451	rs5030621	C	T	4800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;PP=2965;SC=TTATTGGAAGCGGTTGCAATC;SOR=0.753;Source=Platypus;TCF=79;WE=18424459;WS=18424441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr11	18424487	rs4820	A	G	4417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=68;PP=2724;SC=TCCGTTACCTAATGGGGGAAA;SOR=0.816;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=135;TCF=67;TCR=68;TR=135;WE=18424495;WS=18424477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr11	18424590	rs3758680	T	A	3381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=64;PP=1970;SC=TTTTTGTTTTTGAAAAGATTA;SOR=1.092;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=50;TCR=64;TR=114;WE=18424598;WS=18424580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr11	18426656	rs6486424	A	T	592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.23;SOR=2.200;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	18426796	rs6486425	T	G	3303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=51;PP=1825;SC=GATTGTCATGTTTTTGCTGTT;SOR=0.709;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=109;TCF=58;TCR=51;TR=109;WE=18426804;WS=18426786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr11	18428552	rs56345574	C	CA	130.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=0.000;HP=9;HapScore=3;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=0;PP=345;SC=GACTCTGCCTCAAAAAAAAAT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=21;WE=18428572;WS=18428542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr11	18428637	rs113340412	A	ATT	313.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.76;QD=22.41;SOR=2.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	18434536	rs10766477	T	C	180.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.83;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr11	18456235	rs4757664	A	T	493.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=396;ReadPosRankSum=-1.023;SC=GAAAAAAAAAATTTTTTTAAG;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=19;WE=18456243;WS=18456225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,20:0.95:21
chr11	18467821	rs2658565	T	C	6861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=119;NR=110;PP=2965;SC=TGTGATGGATTTGGTAGGATC;SOR=0.733;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=229;TCF=119;TCR=110;TR=229;WE=18467829;WS=18467811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr11	18487425	rs2658563	A	G	1766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=41;PP=1180;SC=TCATTACATGAGTATACTGTG;SOR=3.037;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=10;TCR=41;TR=51;WE=18487433;WS=18487415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr11	18490890	rs75031057	G	T	1479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.384;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=35;PP=848;ReadPosRankSum=0.599;SC=TAACAAATTAGGAAAAACAAA;SOR=0.473;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=114;TCF=47;TCR=67;TR=62;WE=18490898;WS=18490880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,70:0.56:124
chr11	18503159	rs2279900	C	T	1888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.679;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=33;PP=978;ReadPosRankSum=-1.961;SC=AATCTTGGAACGTAAAATGAA;SOR=0.834;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=194;TCF=111;TCR=83;TR=82;WE=18503167;WS=18503149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,96:0.44:216
chr11	18505632	rs2279902	G	A	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=398;ReadPosRankSum=1.463;SC=GCAGGAAACAGAGGCAAAAAA;SOR=0.538;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=20;WE=18505640;WS=18505622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr11	18524208	rs2658552	C	T	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=23;PP=464;ReadPosRankSum=-0.706;SC=GGAAGTTAAGCTTGACATATG;SOR=0.818;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=64;TCF=11;TCR=53;TR=27;WE=18524216;WS=18524198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,31:0.45:69
chr11	18536215	rs12574333	G	T	782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=9;PP=374;ReadPosRankSum=0.771;SC=AGAACACTATGAATACTTACG;SOR=0.570;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=32;TCR=16;TR=27;WE=18536223;WS=18536205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,35:0.62:56
chr11	18537800	rs7942548	CA	TG	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=263;ReadPosRankSum=0.063;SC=TAAAATTCATCATTATCCTTG;SOR=0.793;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=8;WE=18537809;WS=18537790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr11	18548546	rs2292179	A	G	777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.636;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=21;PP=449;ReadPosRankSum=-0.065;SC=GCAAGGGTGGACACCGTGTGG;SOR=1.609;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=60;TCF=16;TCR=44;TR=26;WE=18548554;WS=18548536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,33:0.47:70
chr11	18548574	rs1857908	T	C	915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=29;PP=672;SC=AGGGGCCTGGTGGGGTGGGTT;SOR=4.743;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=31;WE=18548582;WS=18548564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	18555901	rs56151250	C	G	869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=11;PP=573;ReadPosRankSum=0.174;SC=ATACAGAATGCACTTTCTTCT;SOR=0.774;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=78;TCF=57;TCR=21;TR=37;WE=18555909;WS=18555891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,43:0.44:98
chr11	18555949	rs55999230	T	C	1301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.70;ReadPosRankSum=-0.162;SOR=0.677;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,69:0.41:169
chr11	18586344	rs3832729	C	CAT	1586.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.848;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=5;PP=1288;ReadPosRankSum=-0.085;SC=GGTTTTCCCACGACAAAATGA;SOR=1.246;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=53;TCF=41;TCR=12;TR=29;WE=18586352;WS=18586334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,40:0.53:75
chr11	18591645	.	A	G	21	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=23;MQ=60.98;NF=4;NR=0;PP=21;QD=13.9428031368;SC=CAAAGACTACATGAAGAATAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=4;WE=18591653;WS=18591639;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr11	18591715	rs11445836	T	TA	88.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=4.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.37;MQRankSum=1.529;QD=3.17;ReadPosRankSum=-0.961;SOR=0.157;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
chr11	18600322	rs10500835	T	G	1231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.627;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=30;PP=639;ReadPosRankSum=0.110;SC=TTTACATTCCTTAGTTCTTCC;SOR=0.806;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=120;TCF=59;TCR=61;TR=56;WE=18600330;WS=18600312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,65:0.46:141
chr11	18610041	rs61884724	C	T	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=101;ReadPosRankSum=-1.081;SC=AGACCAGCCGCCCCGGCTCCA;SOR=0.435;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=10;WE=18610049;WS=18610031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr11	18632984	rs10128711	T	C	6814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=124;NR=102;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.690;SC=AAGGAATTTTTAGGACATTTT;SOR=0.246;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=229;TCF=125;TCR=104;TR=226;WE=18632992;WS=18632974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,249:1.00:250
chr11	18633971	rs11605097	G	A	7559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=128;NR=132;PP=2965;SC=CATCATCATCGTCATCTTCCT;SOR=0.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=261;TCF=129;TCR=132;TR=260;WE=18633979;WS=18633961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,287:1.00:287
chr11	18720304	rs7946446	C	G	1102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=26;NR=10;PP=552;SC=GACAGAACCCCGGCGCCGGGC;SOR=1.455;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=26;TCR=11;TR=36;WE=18720312;WS=18720294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr11	18728650	rs2289965	T	C	6556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=114;NR=113;PP=2965;SC=TTCATGATGATGTAGTGAGCC;SOR=0.784;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=227;TCF=114;TCR=113;TR=227;WE=18728658;WS=18728640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr11	18730895	rs11024768	A	G	475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=0;PP=389;SC=TGGAGGTACAATGTTGGGCAT;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=18730903;WS=18730890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	18732426	rs4237728	T	G	2762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=60;PP=1725;SC=CATGTAGATATTTGCCCACCT;SOR=1.808;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=29;TCR=60;TR=89;WE=18732434;WS=18732416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr11	18733521	rs7128042	C	T	395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=1;PP=315;SC=ATGAGACAGCCAGAGAGATGT;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=18733529;WS=18733515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	18733579	rs10832972	T	C	1570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=12;PP=938;SC=GCTTAAGGTCTCCATGCTGAC;SOR=1.877;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=34;TCR=12;TR=46;WE=18733587;WS=18733569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr11	18735321	rs10766493	A	C	605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=3;PP=478;SC=CTGGCCTCCTACTCAGCCTGC;SOR=3.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=18735329;WS=18735311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	18735396	rs10741752	G	T	2347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=22;PP=1393;SC=GCCCTGCCCTGACCCAGCACA;SOR=1.725;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=54;TCR=22;TR=76;WE=18735404;WS=18735386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr11	18735753	rs7106673	G	A	4577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=95;NR=55;PP=2756;SC=CCCATGGGGCGGGGGAGAAGC;SOR=1.234;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=95;TCR=55;TR=150;WE=18735761;WS=18735743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr11	18735947	rs7125943	T	C	6370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=110;NR=101;PP=2965;SC=ACAATCTGCATGCCTGGCAAG;SOR=0.702;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=212;TCF=111;TCR=101;TR=211;WE=18735955;WS=18735937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr11	18736247	rs4265581	G	A	1017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=28;PP=810;SC=GGCTGGTAGCGATGGTCATGG;SOR=4.047;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=31;WE=18736255;WS=18736237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	18736942	rs3887900	G	A	913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=5;PP=708;SC=CAGGGTCAGGGGGATTGGTCA;SOR=2.910;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=28;WE=18736950;WS=18736932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr11	18737095	rs4424652	C	T	4223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=55;PP=2120;SC=CAGCTCTGCTCGCTTGCCCTC;SOR=0.719;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=70;TCR=55;TR=125;WE=18737103;WS=18737085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr11	18738281	rs10766494	C	T	1280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=5;PP=925;SC=TCACGGTCAACAGTGAGCTGG;SOR=3.467;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=36;TCR=5;TR=41;WE=18738289;WS=18738271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr11	18738339	.	A	T	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.423;ClippingRankSum=0.000;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.93;ReadPosRankSum=0.134;SOR=0.602;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,31:0.21:149
chr11	18738603	rs10766495	G	A	2702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=62;PP=1780;SC=GAGGGGTGGAGTGGTGAAGAG;SOR=1.657;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=34;TCR=62;TR=96;WE=18738611;WS=18738593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr11	18743180	rs10832975	C	G	2642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.377;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=67;PP=1625;ReadPosRankSum=0.185;SC=TGGGGTTTGGCGTTCCCCTGC;SOR=0.924;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=250;TCF=105;TCR=145;TR=113;WE=18743188;WS=18743170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,126:0.46:274
chr11	18750948	rs186378636	C	T	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=98;ReadPosRankSum=0.138;SC=TCCCTCTACCCGCTCGGGGCT;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=9;WE=18750956;WS=18750938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr11	18751041	rs1550870	C	T	924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.75;ReadPosRankSum=1.643;SOR=0.755;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,48:0.56:86
chr11	18754679	rs6483524	A	G	661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=8;PP=485;ReadPosRankSum=-2.265;SC=CGGAGTGAACACCGCCGACCT;SOR=0.639;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=73;TCF=55;TCR=18;TR=33;WE=18754687;WS=18754669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,34:0.44:77
chr11	18763698	rs4757706	A	G	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=1;PP=341;SC=GCTAAGCTATAAGGCCAGCTC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=18763706;WS=18763688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	18764026	rs4757707	G	C	1752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=37;PP=943;SC=GGTGGCTCTGGGGGTGTCCTC;SOR=1.963;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=16;TCR=37;TR=53;WE=18764034;WS=18764016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr11	18764113	rs2278732	G	A	448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=12;PP=295;SC=TGTTCCTGGAGTGCCCATGGG;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=18764121;WS=18764103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	18771041	rs2028897	G	C	2833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=78;PP=2510;SC=AGGGTGGGGGGCAGAACCTTG;SOR=1.115;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=121;TCF=43;TCR=78;TR=120;WE=18771049;WS=18771031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr11	18793399	rs4075663	G	A	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=347;ReadPosRankSum=1.419;SC=CATGAGAATGGGTCACGTGTC;SOR=1.012;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=39;TCF=33;TCR=6;TR=20;WE=18793407;WS=18793389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr11	18793685	rs77383503	C	T	724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.738;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=18;PP=394;ReadPosRankSum=-0.395;SC=CAACAATTTGCTTTCAGGTAG;SOR=0.354;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=53;TCF=21;TCR=32;TR=32;WE=18793693;WS=18793675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,35:0.59:59
chr11	18955861	rs72890000	C	T	3813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=387;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.657;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=90;ReadPosRankSum=0.494;SC=ATAACATCCACTCCAGGATGC;SOR=0.603;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=350;TCF=159;TCR=191;TR=167;WE=18955869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:203,184:0.48:387
chr11	18956194	rs2014931	T	C	1542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=26;PP=922;ReadPosRankSum=-0.344;SC=AGAGCACAACTGCGTTTCCTG;SOR=0.718;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=73;TCR=51;TR=63;WE=18956202;WS=18956184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,69:0.53:130
chr11	18978456	rs7106147	G	A	1071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.703;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=16;PP=593;ReadPosRankSum=-1.277;SC=GGGAAACGATGCACGTCAGCC;SOR=0.772;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=104;TCF=67;TCR=37;TR=46;WE=18978464;WS=18978446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,53:0.46:116
chr11	18978501	rs12363322	C	A	2122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.315;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=31;PP=1178;ReadPosRankSum=-0.723;SC=AGCAAGGAGTCTCCTCACGTC;SOR=0.852;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=200;TCF=123;TCR=77;TR=92;WE=18978509;WS=18978471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,104:0.47:220
chr11	18994005	rs7114481	T	C	4801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=85;PP=2793;SC=TGAGGCGGAATGTATAACGTG;SOR=0.811;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=80;TCR=85;TR=165;WE=18994013;WS=18993995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr11	19167850	rs2271001	A	G	2302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.142;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=53;PP=1455;ReadPosRankSum=-1.143;SC=GATCTTGTAAAGTAAGATGGG;SOR=0.490;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=183;TCF=74;TCR=109;TR=97;WE=19167858;WS=19167840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,109:0.51:213
chr11	19169319	.	TC	T	260.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=0.000;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.42;MQRankSum=2.525;QD=5.11;ReadPosRankSum=-2.665;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,17:0.33:51
chr11	19186826	rs2042687	A	T	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.223;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=56;ReadPosRankSum=0.309;SC=GGGCCCATGCATCGTTATTAT;SOR=0.399;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=5;WE=19186834;WS=19186816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr11	19191851	rs7114038	A	G	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=21;ReadPosRankSum=0.598;SC=GATCTGTGCCATACTTTCTCT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=3;WE=19191859;WS=19191841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr11	19194141	rs7111850	T	C	340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=0;PP=282;SC=TTTTTCTTTGTCCCTTTTCAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=19194149;WS=19194131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	19204403	rs45549043	A	G	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=147;ReadPosRankSum=0.157;SC=CATCCTTTTGATAGATTTATG;SOR=0.495;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=9;WE=19204411;WS=19204393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr11	19252427	rs793252	G	T	1319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=38;PP=868;ReadPosRankSum=0.943;SC=TGGCTCAGTTGGCTTTTGGGA;SOR=1.167;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=86;TCF=18;TCR=68;TR=45;WE=19252435;WS=19252417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,54:0.56:97
chr11	19256250	rs793269	C	T	1044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=8;PP=653;SC=AGACAGAGGACAAATGCCATG;SOR=1.802;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=31;WE=19256258;WS=19256240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr11	19372616	rs10655705	G	GGA	4351.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=57;PP=2957;SC=TTATGGTGCTGATTGCTAAGT;SOR=1.808;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=5;TCR=59;TR=62;WE=19372624;WS=19372606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr11	19735987	rs2278132	A	G	1974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.052;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=49;PP=1160;ReadPosRankSum=1.415;SC=AGAAAAGGGGATCGCGGGTGG;SOR=0.789;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=205;TCF=92;TCR=113;TR=86;WE=19735995;WS=19735977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,97:0.43:224
chr11	19798951	.	CT	C	68.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=4.191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.27;ReadPosRankSum=0.580;SOR=0.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr11	19854088	rs6483617	G	A	2023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.078;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=44;PP=1168;ReadPosRankSum=1.299;SC=CGTCTCATCAGGGATCTCCAG;SOR=0.628;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=185;TCF=102;TCR=83;TR=91;WE=19854096;WS=19854078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,101:0.48:211
chr11	19901632	rs11025310	G	A	2468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=43;PP=1294;SC=ACCAGCCAGCGCCACATCAGC;SOR=1.085;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=39;TCR=43;TR=82;WE=19901640;WS=19901622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr11	19955500	rs1372989	A	G	6833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=113;NR=109;PP=2965;SC=CAGGAATGAAAAGCATGCCCG;SOR=0.760;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=223;TCF=114;TCR=109;TR=222;WE=19955508;WS=19955490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr11	19961457	.	C	CT	64	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;FR=0.9991;HP=14;HapScore=3;MGOF=23;MMLQ=17;MQ=60.72;NF=0;NR=7;PP=64;QD=10.4285714286;SC=AACTTTCTTTCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=7;WE=19961465;WS=19961447;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,7:0.58:12
chr11	19970501	rs11025335	T	C	2693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=72;PP=1471;ReadPosRankSum=-3.021;SC=GTGTCTGCCATGTGGACGTCT;SOR=0.717;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=268;TCF=121;TCR=147;TR=131;WE=19970509;WS=19970491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,137:0.49:279
chr11	19970558	rs2585773	T	C	6837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=103;PP=2698;SC=TCAGCATGGATGCCCCCGGCT;SOR=1.402;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=166;TCF=63;TCR=103;TR=166;WE=19970566;WS=19970548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr11	19970579	rs2707084	C	T	5688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=78;PP=2284;SC=ACATGAGCGACGGGGATGTTC;SOR=1.501;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=44;TCR=78;TR=122;WE=19970587;WS=19970569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr11	20005845	rs35295670	GC	G	87.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.518;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.687;NF=0;NR=5;PP=109;ReadPosRankSum=-0.741;SC=TCCCAGGGGGGCCCTGAGAAA;SOR=2.252;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=5;WE=20005853;WS=20005835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr11	20005870	rs2568116	T	C	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=2.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.72;MQRankSum=1.809;QD=3.72;ReadPosRankSum=-0.516;SOR=1.781;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr11	20057371	rs6483634	T	G	3506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=39;PP=2128;SC=CACATCTGAGTCAAGAGAGCT;SOR=1.379;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=77;TCR=39;TR=116;WE=20057379;WS=20057361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr11	20065673	rs3802799	G	T	2955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=63;PP=1833;ReadPosRankSum=-0.973;SC=TGTCTGACGAGTCCGACAAAA;SOR=0.689;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=220;TCF=114;TCR=106;TR=129;WE=20065681;WS=20065663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,141:0.58:244
chr11	20065779	rs3802800	C	G	2987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=67;PP=1936;SC=AAGGACGAAGCCTTCAGCCCC;SOR=1.336;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=41;TCR=67;TR=108;WE=20065787;WS=20065769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr11	20067064	rs7125647	C	T	10408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=393;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=191;NR=167;PP=2965;SC=ACCAAACAGACAAGGAGAAAG;SOR=0.783;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=358;TCF=191;TCR=167;TR=358;WE=20067072;WS=20067054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,393:1.00:393
chr11	20070225	rs12283929	C	G	893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=13;PP=601;ReadPosRankSum=0.020;SC=CAGTCCGGTGCCCCTTGGCAC;SOR=0.660;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=69;TCF=49;TCR=20;TR=41;WE=20070233;WS=20070215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,42:0.53:79
chr11	20072779	rs6483635	C	T	5304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.34;SOR=1.220;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr11	20099112	rs4757028	A	T	5587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=116;NR=72;PP=2965;SC=ACCTTGTGGCAGCCTTTGAAC;SOR=1.118;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=188;TCF=116;TCR=72;TR=188;WE=20099120;WS=20099102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr11	20099399	rs6483641	G	T	636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=4;PP=406;SC=TTATGTGTTTGTTCATGCCTG;SOR=2.093;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=16;WE=20099407;WS=20099391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	20099541	rs6483642	C	T	6576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=127;NR=96;PP=2965;SC=TTCCCTAGGACTCAGAACTGA;SOR=0.887;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=223;TCF=127;TCR=96;TR=223;WE=20099549;WS=20099531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr11	20099767	rs7121301	A	C	650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.38;SOR=4.047;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	20101704	rs1867114	C	T	4135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=79;NR=63;PP=2266;SC=GCCACTCCAGCGTGGGCAGCA;SOR=0.744;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=142;TCF=79;TCR=63;TR=142;WE=20101712;WS=20101694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr11	20101744	rs1867115	C	A	4438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=80;NR=73;PP=2486;SC=GAAGAAGAAGCGGAAGAACTG;SOR=0.752;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=153;TCF=80;TCR=73;TR=153;WE=20101752;WS=20101734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr11	20101769	rs3758695	C	T	3941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=70;PP=2227;SC=AGTGCACATCCACTCTCCTGG;SOR=0.895;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=135;TCF=64;TCR=71;TR=134;WE=20101777;WS=20101759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr11	20104847	rs10657903	A	AGG	157.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=145;ReadPosRankSum=0.231;SC=TTGCTTTAATAGGACTGTGCA;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=20104855;WS=20104837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr11	20112373	rs2289560	A	G	1099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=24;PP=791;ReadPosRankSum=0.228;SC=GGGGACTAAAAGGAGCTGCTT;SOR=0.693;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=96;TCF=55;TCR=41;TR=52;WE=20112381;WS=20112363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,52:0.50:104
chr11	20112417	rs2243624	A	C	1291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.132;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=32;PP=616;ReadPosRankSum=0.053;SC=CTAGAATTTCAGAATGCATGG;SOR=0.798;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=126;TCF=68;TCR=58;TR=64;WE=20112425;WS=20112407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,69:0.50:139
chr11	20119373	rs10833241	C	T	1927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=40;PP=1130;SC=CTTGTGGCCCCAGTTTTGTTT;SOR=2.015;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=18;TCR=40;TR=58;WE=20119381;WS=20119363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr11	20122392	rs2245314	C	A	1358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=4;PP=842;SC=GGAGAGGAATCACCTCAGGTC;SOR=3.306;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=34;TCR=4;TR=38;WE=20122400;WS=20122382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr11	20124914	rs2243411	A	C	5081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=81;PP=2536;ReadPosRankSum=-0.928;SC=GCTCTCTGGGAGAGATCTTCA;SOR=0.249;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=171;TCF=89;TCR=82;TR=170;WE=20124922;WS=20124904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,196:0.99:197
chr11	20127046	rs11025385	C	A	2571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=32;PP=1637;SC=TCACCATCATCAGCTTGAAAA;SOR=1.167;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=56;TCR=32;TR=88;WE=20127054;WS=20127036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr11	20129075	rs4757890	G	A	87.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=1;PP=49;SC=GTATACCTGCGTTCAGGCCTC;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=20129083;WS=20129072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr11	20178551	rs10717537	CG	C	3546.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.891;HP=13;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.369;NF=36;NR=42;PP=1395;ReadPosRankSum=2.080;SC=AGGGCGGGGGCGGGGGGGGTG;SOR=1.850;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=102;TCF=44;TCR=58;TR=78;WE=20178567;WS=20178540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,124:0.98:126
chr11	20385228	rs3808991	T	C	104.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.98;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	20385606	.	G	A	65	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MMLQ=22;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=65;QD=49.8856062736;SC=GCTGGCTCAGGTGCGGGCGAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=2;WE=20385628;WS=20385596;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:2,2:0.50:4
chr11	20385620	.	C	T	65	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=4;HapScore=4;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=65;QD=49.8856062736;SC=GGGCGATGGCCGGGGAGCCGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=2;WE=20385628;WS=20385596;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:2,2:0.50:4
chr11	20398034	rs10741834	T	C	4394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=88;NR=57;PP=2815;SC=TCCATCCTTCTAGGCCTCCCA;SOR=1.157;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=145;TCF=88;TCR=57;TR=145;WE=20398042;WS=20398024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr11	20403825	rs7926967	A	T	2155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=43;PP=1318;SC=TATGCCACTGATGGTTAATCC;SOR=1.493;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=25;TCR=43;TR=68;WE=20403833;WS=20403815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr11	20403904	rs10766664	G	C	558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=16;PP=463;SC=ACATTGGCTAGAGGTAGATTG;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=20403912;WS=20403894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	20404506	rs2403587	T	C	406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.42;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	20404613	rs3824886	T	G	3301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=74;NR=32;PP=1944;SC=CTTGGGCCAGTGGGCATTCTG;SOR=1.362;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=74;TCR=32;TR=106;WE=20404621;WS=20404603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr11	20404757	rs3781679	T	C	6445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.139;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=122;NR=99;PP=2965;ReadPosRankSum=1.496;SC=CATGACCACATTGGAGAAATG;SOR=0.331;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=223;TCF=123;TCR=100;TR=221;WE=20404765;WS=20404747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,238:1.00:239
chr11	20411199	rs56308542	TAAAA	T	1975.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.39;QD=37.28;SOR=2.613;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr11	20411418	rs7937501	G	C	1158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.96;SOR=2.546;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr11	20411424	rs7937204	A	G	1025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.74;SOR=2.925;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	20419028	rs7934372	T	C	569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.598;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=414;ReadPosRankSum=-0.370;SC=CATCACACTGTACTCCCTCCC;SOR=0.096;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=20;WE=20419036;WS=20419018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,22:0.67:33
chr11	20424326	rs10833319	A	G	928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=6;PP=771;SC=TTTCTTAGGAAAAAAATAAGC;SOR=2.694;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=32;WE=20424334;WS=20424316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr11	20429454	rs10741836	T	C	4178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=87;NR=43;PP=2469;SC=TTAATTACCCTAGGTAGTTTT;SOR=1.171;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=87;TCR=43;TR=130;WE=20429462;WS=20429444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr11	20448531	rs12797994	G	A	278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=6;PP=161;SC=TATTTTTTAAGTAGCTACATT;SOR=1.802;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=20448539;WS=20448521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	20473655	rs1001669	T	G	1019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=10;PP=534;SC=TAAACTCTTTTTTTCCCCTTT;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=22;TCR=10;TR=32;WE=20473663;WS=20473645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr11	20515555	rs6483697	G	A	2370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=34;PP=1493;SC=TAATTATTACGGAAGTACATT;SOR=0.815;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=76;TCF=42;TCR=34;TR=76;WE=20515563;WS=20515545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr11	20529886	rs6483700	G	A	4549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=56;PP=2662;SC=GTTCACAAGAGTAAGAAAGAT;SOR=1.165;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=94;TCR=56;TR=150;WE=20529894;WS=20529876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr11	20623007	rs7109418	C	T	5954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=115;NR=80;PP=2965;SC=CCGGGAGCTCCGGGCCCGGCA;SOR=1.064;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=195;TCF=115;TCR=80;TR=195;WE=20623015;WS=20622997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr11	20623023	rs2241941	C	T	6588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=129;NR=102;PP=2965;SC=CGGCAACGCGCTGCACTGTAA;SOR=0.926;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=231;TCF=129;TCR=102;TR=231;WE=20623031;WS=20623013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr11	20623042	rs1443548	T	C	7842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=137;NR=118;PP=2965;SC=AAGATCCCTTTTCTGCGAGGC;SOR=0.862;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=255;TCF=137;TCR=118;TR=255;WE=20623050;WS=20623032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr11	20623156	rs1443549	C	G	5881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=124;PP=2965;SC=GTGGTGCTGGCCACGGATGGA;SOR=1.148;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=211;TCF=87;TCR=124;TR=211;WE=20623164;WS=20623146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr11	20628407	rs72927519	C	G	303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=1;PP=209;SC=GTTGCTGAAACAGGACATCAA;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=20628415;WS=20628397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	20628479	rs2278649	T	C	2120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=14;PP=1364;SC=GCTCAGCCCCTAGCCCAGAGG;SOR=2.115;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=45;TCR=14;TR=59;WE=20628487;WS=20628469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr11	20639400	rs7925597	A	G	3064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=60;NR=44;PP=1493;SC=TGTATGCATCATTGGCTAAAG;SOR=0.743;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=60;TCR=44;TR=104;WE=20639408;WS=20639390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr11	20639457	rs11025653	A	G	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=18;PP=463;ReadPosRankSum=-1.737;SC=ATCTAAGAGAAAGCTGTGAGA;SOR=0.772;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=69;TCF=33;TCR=36;TR=33;WE=20639465;WS=20639447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,37:0.47:79
chr11	20639479	rs11827415	G	A	690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.151;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=380;ReadPosRankSum=1.257;SC=ACCCAGGGGCGGTTGCTTTGG;SOR=0.511;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=42;TCF=15;TCR=27;TR=26;WE=20639487;WS=20639469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,31:0.61:51
chr11	20648418	rs4923548	C	T	1472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=34;PP=1045;SC=TATAACCAGCCCTGGGGGAGT;SOR=1.958;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=13;TCR=34;TR=47;WE=20648426;WS=20648408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr11	20652148	rs111750026	CAT	C	562.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.031;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=377;ReadPosRankSum=-0.416;SC=TGCAGACAAACATGTGGGCAC;SOR=0.352;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=10;WE=20652157;WS=20652138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr11	20658679	rs2000959	C	A	1730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=23;PP=1081;ReadPosRankSum=0.034;SC=CTGGGTGGTACAATTTGACTC;SOR=0.681;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=132;TCF=92;TCR=40;TR=73;WE=20658687;WS=20658669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,82:0.55:149
chr11	20660149	rs72932948	C	T	1015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.307;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=25;PP=606;ReadPosRankSum=1.410;SC=GCTTGAGTGTCGGTAAGGCAT;SOR=1.025;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=114;TCF=55;TCR=59;TR=44;WE=20660157;WS=20660139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,51:0.41:125
chr11	20673832	rs72932998	C	A	1611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.110;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=32;PP=853;ReadPosRankSum=-2.000;SC=TTTCTCTTTCCAGTTTATCCT;SOR=0.519;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=128;TCF=74;TCR=54;TR=72;WE=20673840;WS=20673822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,81:0.56:144
chr11	20673867	rs2276433	G	A	1218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.352;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=22;PP=707;ReadPosRankSum=-0.340;SC=ACCAGTGGGAGCCCATGACCT;SOR=0.809;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=125;TCF=69;TCR=56;TR=53;WE=20673875;WS=20673857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,60:0.43:139
chr11	20676417	rs1401793	C	T	2427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.461;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=59;PP=1395;ReadPosRankSum=0.541;SC=AGTGCTAGTCCAGTGGTGTGG;SOR=0.634;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=230;TCF=102;TCR=128;TR=107;WE=20676425;WS=20676407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,118:0.46:257
chr11	20699394	rs1793003	C	G	2541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=21;PP=1541;SC=TCCTTGTATTCCCTGCCACTC;SOR=1.637;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=54;TCR=21;TR=75;WE=20699402;WS=20699384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr11	20805286	rs8176785	G	A	7350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=140;NR=106;PP=2965;SC=CAGCTGTTCCGGAACAAGAGT;SOR=0.909;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=246;TCF=140;TCR=106;TR=246;WE=20805294;WS=20805276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,273:1.00:273
chr11	20949115	rs2293241	C	T	826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=25;PP=679;SC=TACCTAGCACCCACTAGCCAT;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=20949123;WS=20949105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	20949763	rs4363596	C	T	384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=12;NR=0;PP=321;SC=TCATTCGGGCCGGAGAAAACA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=20949771;WS=20949753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	20959185	rs1880088	A	T	773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=2;PP=593;SC=CCTCCACACAATTCCTTTCAC;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=26;WE=20959193;WS=20959177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	20959429	rs1880087	T	C	5812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=97;PP=2965;SC=TTATGGTCCCTATCACTTCTG;SOR=0.967;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=188;TCF=91;TCR=97;TR=188;WE=20959437;WS=20959419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr11	20959482	rs1880086	G	C	3858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=74;PP=2494;SC=TGAGGTTCTTGAGTGGGGCAT;SOR=1.490;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=47;TCR=74;TR=121;WE=20959490;WS=20959472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr11	20959533	rs1880085	G	A	1418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.021;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=34;PP=986;ReadPosRankSum=-0.779;SC=ACTCTCTGCGGTGGGTTGGAT;SOR=2.274;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=47;TCF=13;TCR=34;TR=46;WE=20959541;WS=20959523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,51:0.98:52
chr11	21305927	rs4151053	T	C	6201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=105;PP=2965;SC=CAAGTCTTTGTGCATTGCTGA;SOR=0.859;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=203;TCF=98;TCR=105;TR=203;WE=21305935;WS=21305917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr11	21306113	rs4151054	A	C	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.640;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=254;ReadPosRankSum=1.130;SC=CAATGCAGTGAGTATCCCAGC;SOR=1.734;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=56;TCF=22;TCR=34;TR=20;WE=21306121;WS=21306103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,22:0.35:63
chr11	21555780	rs61194030	C	G	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=285;ReadPosRankSum=1.523;SC=ATGGGATTTGCTTCTTCCAGT;SOR=0.473;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=15;WE=21555788;WS=21555770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
chr11	21581665	rs7119475	C	T	1549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=15;PP=1009;SC=AATGCTACTGCAAATGATGGT;SOR=1.781;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=37;TCR=15;TR=52;WE=21581673;WS=21581655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr11	21581805	rs8176789	C	T	1803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.297;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=38;PP=1222;ReadPosRankSum=-0.584;SC=TGGCAGGGGGCTTTGACTGTC;SOR=0.659;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=130;TCF=67;TCR=63;TR=77;WE=21581813;WS=21581795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,84:0.56:149
chr11	21581997	rs8176790	C	T	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.533;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=130;ReadPosRankSum=0.007;SC=TTCTACCTCCCCAGCTCTCTC;SOR=0.223;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=8;WE=21582005;WS=21581987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr11	21592228	rs4922847	C	A	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.271;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=175;ReadPosRankSum=0.069;SC=GGTGACCAAACATCCAAGAAG;SOR=0.445;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=39;TCF=28;TCR=11;TR=14;WE=21592236;WS=21592218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,16:0.36:45
chr11	22214877	rs139514865	A	AAGGAGGAGGGGAATGAGGAGGAGG	1248.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=9.546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.95;MQRankSum=5.743;QD=21.16;ReadPosRankSum=-1.155;SOR=2.331;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,17:0.29:59
chr11	22214903	rs12792259	G	C	1354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.705;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=6.395;NF=38;NR=28;PP=1089;ReadPosRankSum=1.035;SC=GGAAGAGCAGGCCCTTAGAAG;SOR=0.569;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=117;TCF=77;TCR=40;TR=66;WE=22214911;WS=22214893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,63:0.51:123
chr11	22233029	rs4922980	G	A	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=195;ReadPosRankSum=0.816;SC=TTAGGTGGGGGGAAAACACAT;SOR=0.616;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=10;WE=22233037;WS=22233019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr11	22242729	rs4312063	T	C	936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=21;PP=449;ReadPosRankSum=1.243;SC=ACGTTGATGATGTAAAGAAAG;SOR=0.675;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=92;TCF=49;TCR=43;TR=43;WE=22242737;WS=22242719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,50:0.45:111
chr11	22271870	rs7481951	A	T	765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.448;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=13;PP=407;ReadPosRankSum=1.150;SC=TAGTTGGCTTAGCTTGTTTTA;SOR=0.379;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=54;TCF=33;TCR=21;TR=31;WE=22271878;WS=22271860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,36:0.57:63
chr11	22276869	rs150412089	T	A	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=9;PP=432;ReadPosRankSum=1.030;SC=GTTGAAAAAGTTTTTAACTTT;SOR=0.557;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=57;TCF=40;TCR=17;TR=28;WE=22276877;WS=22276859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,27:0.47:57
chr11	22296094	rs374045760	CT	C	37.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.45;ReadPosRankSum=-1.581;SOR=0.481;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,13:0.16:83
chr11	22297606	rs5790245	AT	A	514.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.35;MQRankSum=0.504;QD=17.75;ReadPosRankSum=-1.049;SOR=1.201;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,26:0.90:29
chr11	22297770	rs11026488	G	C	1794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.544;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=36;PP=1096;ReadPosRankSum=1.257;SC=ACTTTCATTCGAGTTACTCTC;SOR=0.772;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=165;TCF=84;TCR=81;TR=74;WE=22297778;WS=22297760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,86:0.47:183
chr11	22364758	rs2278751	C	T	6541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=115;NR=90;PP=2965;SC=TGACTCTACTCTTTCCCTTCA;SOR=0.861;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=205;TCF=115;TCR=90;TR=205;WE=22364779;WS=22364748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr11	22384176	rs117931713	T	C	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=205;ReadPosRankSum=-1.728;SC=GTGAGGCCCATGTACCTGAGT;SOR=0.506;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=14;WE=22384184;WS=22384166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,15:0.38:40
chr11	22391534	rs2665677	G	A	775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=4;PP=547;SC=TTCCCACTTAGGTTTGAAAAT;SOR=2.670;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=25;WE=22391542;WS=22391524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	22397739	rs2248436	A	C	228.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=244;SC=TCATATATATATTCTATATGT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=22397747;WS=22397729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	22398830	rs1374718	A	G	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=90;ReadPosRankSum=0.514;SC=CATAATCAGGATATGGATTTT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=5;WE=22398838;WS=22398820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr11	22696451	rs922571	A	G	3411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.146;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=49;PP=1933;ReadPosRankSum=0.344;SC=TACGCAGTGGACCTGGCCTCT;SOR=0.347;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=115;TCF=64;TCR=51;TR=113;WE=22696459;WS=22696441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,129:0.99:130
chr11	22747745	rs337448	A	C	606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=0;PP=453;SC=GGCATGAGGTAATTCCGAAGC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=22747753;WS=22747735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	22851172	rs2286811	C	T	2670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=22;PP=1681;SC=AATGGCTCGGCCCGCCCCGCA;SOR=2.229;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=67;TCR=22;TR=88;WE=22851180;WS=22851162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr11	22868937	rs2302423	G	A	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=356;ReadPosRankSum=0.570;SC=TTATTTTTCCGAAATGGTGGA;SOR=0.752;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=31;TCR=14;TR=22;WE=22868945;WS=22868927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,22:0.48:46
chr11	22880918	rs3213707	T	G	985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.812;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=18;PP=503;ReadPosRankSum=-0.380;SC=TTCTATTATGTTAGGGACCAC;SOR=0.808;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=77;TCF=44;TCR=33;TR=43;WE=22880926;WS=22880908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,48:0.56:85
chr11	22881002	rs3213706	C	T	726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.782;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=13;PP=323;ReadPosRankSum=0.849;SC=CATTACCTGCCGCTCAGTGAC;SOR=0.794;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=73;TCF=41;TCR=32;TR=31;WE=22881010;WS=22880992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,37:0.44:85
chr11	24750842	rs7128434	G	A	1638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.792;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=39;PP=994;ReadPosRankSum=-0.474;SC=GGTGAGATGAGAACTCATTTT;SOR=0.552;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=174;TCF=83;TCR=91;TR=79;WE=24750850;WS=24750832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,86:0.45:191
chr11	24784862	rs2716532	A	T	1854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=31;NR=34;PP=1035;SC=GAGGTAAGATATATTTCATCT;SOR=0.963;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=65;TCF=31;TCR=34;TR=65;WE=24784870;WS=24784852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr11	24784922	rs10500990	G	T	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=138;ReadPosRankSum=-0.696;SC=CACATATAAAGTTGCCACTAG;SOR=0.815;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=15;TCR=19;TR=14;WE=24784930;WS=24784912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,16:0.42:38
chr11	24998335	rs11028314	A	G	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=2.433;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=156;ReadPosRankSum=1.254;SC=TGCTGTGTATATAAGATAGTT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=8;WE=24998343;WS=24998325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr11	25098938	rs7930185	G	C	2799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.347;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=71;PP=1731;ReadPosRankSum=0.530;SC=TGCAGAAACCGAGCCTATCCC;SOR=0.614;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=283;TCF=126;TCR=157;TR=132;WE=25098946;WS=25098928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,145:0.46:313
chr11	25099056	.	A	T	78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;FR=0.5000;HP=10;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=5;PP=78;QD=22.5542425094;SC=TTATTTATTTATTTTTTTGAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=5;WE=25099064;WS=25099046;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr11	25100229	rs10500994	G	A	746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.866;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=21;PP=468;ReadPosRankSum=0.106;SC=TGTTAAAAACGTCCATTTGCT;SOR=0.518;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=78;TCF=30;TCR=48;TR=35;WE=25100237;WS=25100219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,37:0.44:85
chr11	26465231	rs138185345	TTGTC	T	338.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.100;NF=8;NR=0;PP=323;ReadPosRankSum=-1.266;SC=TGGCCATCATTTGTCCATCTA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=8;WE=26465242;WS=26465221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr11	26465500	rs4032918	G	A	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.481;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=228;ReadPosRankSum=0.843;SC=GGTTTTTAACGTAATAGGTGA;SOR=1.048;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=16;WE=26465508;WS=26465490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,16:0.41:39
chr11	26481497	rs12277506	A	G	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.475;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=9;PP=350;ReadPosRankSum=0.741;SC=CTTTTAGATTATAATTTTAGA;SOR=0.207;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=63;TCF=50;TCR=13;TR=29;WE=26481505;WS=26481487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,33:0.46:71
chr11	26481611	rs2047099	G	A	5845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=99;PP=2965;SC=TTAGAGATCAGATTTCAACAT;SOR=0.801;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=198;TCF=99;TCR=99;TR=198;WE=26481619;WS=26481601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr11	26484496	rs7942432	G	C	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=72;ReadPosRankSum=-1.102;SC=GGGAAAACATGAAAGAGGAGA;SOR=0.307;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=6;WE=26484504;WS=26484486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr11	26547348	rs430563	G	A	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.75;ReadPosRankSum=-0.106;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr11	26547353	rs410617	T	G	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.92;ReadPosRankSum=-0.399;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr11	26552679	rs9988806	T	A	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=293;ReadPosRankSum=0.590;SC=AGTACTTAAGTGAATTGTAGT;SOR=0.520;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=42;TCF=37;TCR=5;TR=18;WE=26552687;WS=26552669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,21:0.46:46
chr11	26552696	rs2131696	T	A	680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=6.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.98;ReadPosRankSum=-1.281;SOR=0.177;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,30:0.48:62
chr11	26552702	rs293937	T	C	2531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.66;SOR=2.206;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr11	26558841	rs386635	G	A	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.703;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=227;ReadPosRankSum=-0.230;SC=GAAGTCATTTGGGTTATCTTA;SOR=0.368;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=16;WE=26558849;WS=26558831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr11	26559172	rs396863	G	A	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-3.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.695;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=189;ReadPosRankSum=0.533;SC=CTGTGCACTGGCTCCTCTGCC;SOR=1.936;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=4;TCR=31;TR=12;WE=26559180;WS=26559162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,13:0.34:38
chr11	26563464	rs410036	A	T	645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.017;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=9;PP=370;ReadPosRankSum=2.252;SC=AAAAAATAGAACCAAATGTAT;SOR=0.453;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=69;TCF=49;TCR=20;TR=28;WE=26563472;WS=26563454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,32:0.42:77
chr11	26563652	rs420143	T	G	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.487;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=16;PP=366;ReadPosRankSum=1.076;SC=AGCAAAGTATTCTGTTTTGTG;SOR=0.311;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=72;TCF=30;TCR=42;TR=32;WE=26563660;WS=26563642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,37:0.47:79
chr11	26568966	rs2663168	A	G	2468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.671;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=50;PP=1538;ReadPosRankSum=1.467;SC=CATGCAGGCTATACTTTGGTG;SOR=0.569;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=194;TCF=105;TCR=89;TR=106;WE=26568974;WS=26568956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,116:0.54:214
chr11	26574740	rs395770	T	C	476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=86;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=12;NR=3;PP=248;SC=AAGTGAATTCTTAGTCACAGT;SOR=3.500;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=15;WE=26574748;WS=26574730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	26574782	rs59938249	TG	T	861.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=50;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=8;PP=370;SC=TTTTTGTTTTTGTTTTTTCTC;SOR=2.387;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=30;TCF=17;TCR=13;TR=19;WE=26574791;WS=26574767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	26581382	.	TACAC	T	263	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MMLQ=17;MQ=60.9;NF=0;NR=5;PP=263;QD=53.2;SC=GTTTCTGTGTTACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=26581393;WS=26581372;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,5:0.56:9
chr11	26584625	rs444178	C	A	1028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.542;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=14;PP=560;ReadPosRankSum=1.099;SC=TTAATTAAAACCACTGTGCCC;SOR=0.479;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=109;TCF=77;TCR=32;TR=45;WE=26584633;WS=26584615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,50:0.41:123
chr11	26586801	rs15783	G	A	2848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-2.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=42;PP=1621;ReadPosRankSum=-1.013;SC=TTGATAAGGGGTAAACCCAGT;SOR=0.665;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=183;TCF=116;TCR=67;TR=111;WE=26586809;WS=26586791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,128:0.59:216
chr11	26587133	rs293980	T	C	3520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=349;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.266;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=79;PP=1842;ReadPosRankSum=0.412;SC=GCTCTGCTGATGAGTTACTGG;SOR=0.779;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=316;TCF=152;TCR=164;TR=150;WE=26587141;WS=26587123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,172:0.50:347
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chr11	26588804	.	CC	TA,TC	365	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000,0.5000;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=6,10;NR=11,27;PP=228,365;QD=16.5569338154;SC=ACTTTTTTTTCCTCAAGCAAT;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=40;TCF=10;TCR=30;TR=17,37;WE=26588813;WS=26588793;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.43:40
chr11	26588805	rs10466440	C	A	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=3.254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.74;ReadPosRankSum=-1.670;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
chr11	26619872	rs7112022	T	C	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=6;PP=490;ReadPosRankSum=2.379;SC=AGCAATATGATGTGATTTGGG;SOR=0.605;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=70;TCF=56;TCR=14;TR=32;WE=26619880;WS=26619862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,33:0.42:78
chr11	26620101	rs10835009	T	C	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=343;ReadPosRankSum=-1.515;SC=ATTAGATTTTTCCCTTGATCT;SOR=0.557;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=47;TCF=15;TCR=32;TR=23;WE=26620109;WS=26620091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,26:0.47:55
chr11	26645894	rs1012552	A	T	299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=198;SC=TTCTATTTAAAGTAAAATGTA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=26645902;WS=26645884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	26655624	.	T	C	93	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=29;MMLQ=17;MQ=54.39;NF=7;NR=0;PP=93;QD=18.2530303639;SC=GAGACTCCATTTCCAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=7;WE=26655632;WS=26655614;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:9,7:0.44:16
chr11	26655658	rs7943086	G	A	650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.212;HP=6;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=9;PP=703;ReadPosRankSum=-3.180;SC=AAATTAAAAAGACAAACTTGA;SOR=1.050;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=68;TCF=51;TCR=17;TR=43;WE=26655666;WS=26655648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,30:0.59:51
chr11	26656370	rs7933233	T	C	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=163;ReadPosRankSum=0.607;SC=TCTTGACCCATTAGTTCACGC;SOR=0.798;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=12;WE=26656378;WS=26656360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr11	26656563	rs7946841	C	T	1949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.841;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=39;PP=1257;ReadPosRankSum=0.172;SC=CTTACAGATTCGTAGGCCACC;SOR=0.575;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=191;TCF=94;TCR=97;TR=86;WE=26656571;WS=26656553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,92:0.45:205
chr11	26656714	rs10835033	C	G	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=372;ReadPosRankSum=2.560;SC=GTTCAGGGAACTTTATGGATA;SOR=1.092;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=22;WE=26656722;WS=26656704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,23:0.68:34
chr11	26663284	rs10835039	T	C	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.712;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.05;ReadPosRankSum=1.310;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr11	26663298	rs11603910	T	A	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.12;ReadPosRankSum=1.030;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr11	26663304	rs57264690	A	T	452.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.11;ReadPosRankSum=0.968;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr11	26663394	rs10835040	A	G	1631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=27;PP=953;ReadPosRankSum=-1.618;SC=ATTGTTAACCAGATGCTTGAA;SOR=0.689;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=161;TCF=105;TCR=56;TR=74;WE=26663402;WS=26663384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,83:0.46:180
chr11	26677867	rs10835050	T	C	1565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.233;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=34;PP=930;ReadPosRankSum=1.119;SC=CAAGAAAATTTGGGCCTCCAC;SOR=0.714;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=145;TCF=75;TCR=70;TR=68;WE=26677875;WS=26677857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,75:0.46:162
chr11	26677947	rs10835051	C	T	1332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=28;PP=787;ReadPosRankSum=1.044;SC=GAGGCCCGCCCTGGAGTTCCA;SOR=0.703;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=147;TCF=78;TCR=69;TR=58;WE=26677955;WS=26677937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,69:0.41:170
chr11	26681862	rs150506041	A	G	1140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=16;PP=644;ReadPosRankSum=-1.176;SC=CAGACGTACCAAAGGGTCTAC;SOR=0.648;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=139;TCF=96;TCR=43;TR=52;WE=26681870;WS=26681852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,63:0.39:160
chr11	26694812	rs4278475	C	T	812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=2;PP=547;SC=AACTCTGAAGCTGAAACTCAA;SOR=4.332;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=24;WE=26694820;WS=26694802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	26694842	rs4551716	C	T	2005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=16;PP=1388;SC=AGTTCTCACACTCACTGCTTT;SOR=2.206;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=50;TCR=16;TR=66;WE=26694850;WS=26694832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr11	26694979	rs4369354	A	G	7693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=136;NR=139;PP=2965;ReadPosRankSum=0.025;SC=GCTGAACTCCACACCAGCATA;SOR=0.806;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=277;TCF=137;TCR=140;TR=275;WE=26695000;WS=26694969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,296:0.99:298
chr11	26700099	rs12793773	G	A	937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-2.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=8;PP=1797;ReadPosRankSum=-0.565;SC=AATAATGAAGGGTGCCTTTGT;SOR=0.599;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=96;TCF=78;TCR=18;TR=40;WE=26700120;WS=26700089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,43:0.41:106
chr11	26700112	rs12793784	G	A	1417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.331;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=16;PP=1797;ReadPosRankSum=-1.574;SC=GCCTTTGTATGTCAGCGTTGA;SOR=0.936;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=133;TCF=94;TCR=39;TR=60;WE=26700120;WS=26700089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,66:0.45:148
chr11	26702482	rs10767569	T	A	578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=4;PP=445;SC=GGTACTTCCCTGAGTGAGTCT;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=21;WE=26702490;WS=26702472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	26702664	rs10734383	C	T	2443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=42;PP=1545;SC=GGTCTGTTGACAGAGGCAAAG;SOR=0.738;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=42;TCR=42;TR=84;WE=26702672;WS=26702654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr11	26705124	rs3924552	C	G	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.718;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=42;ReadPosRankSum=0.108;SC=TCTTTCATTTCTGTACCCAGA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=3;WE=26705132;WS=26705114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr11	26705310	rs3924551	A	G	950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.765;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=18;PP=632;ReadPosRankSum=-1.459;SC=TTACCTTCCAATTCACAAAAG;SOR=0.841;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=88;TCF=51;TCR=37;TR=41;WE=26705318;WS=26705300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,44:0.45:97
chr11	26732923	rs4322349	A	G	2014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.507;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=46;PP=1068;ReadPosRankSum=1.418;SC=AGAAACAAGAATCAGATTGGC;SOR=0.630;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=188;TCF=89;TCR=99;TR=88;WE=26732931;WS=26732913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,102:0.49:210
chr11	26733085	rs12576268	G	A	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.53;ReadPosRankSum=0.531;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
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chr11	27114788	rs3183973	C	T	2098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.464;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=40;PP=1209;ReadPosRankSum=0.610;SC=ATGATGAACACGCATACAAGT;SOR=0.927;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=241;TCF=131;TCR=110;TR=95;WE=27114796;WS=27114778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,106:0.40:265
chr11	27147270	rs1044273	G	A	1811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.507;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=38;PP=971;ReadPosRankSum=-0.052;SC=TATTTGATGTGCCTGTTGAAA;SOR=0.640;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=191;TCF=101;TCR=90;TR=83;WE=27147278;WS=27147260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,93:0.44:210
chr11	27362257	rs80317617	T	C	2956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.412;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=65;PP=1870;ReadPosRankSum=1.276;SC=AAGTTTTCCATTGGCATAACC;SOR=0.648;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=281;TCF=144;TCR=137;TR=132;WE=27362265;WS=27362247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,145:0.47:310
chr11	27379127	rs3741407	C	G	929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.589;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=24;PP=491;ReadPosRankSum=-1.077;SC=GTACAAGAACCTCTTTTGCTT;SOR=0.915;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=97;TCF=40;TCR=57;TR=40;WE=27379135;WS=27379117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,47:0.43:110
chr11	27384585	rs11549824	G	A	3497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.408;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=74;PP=2267;ReadPosRankSum=0.913;SC=GGCAGCGGCGGCGACGGCGAG;SOR=0.731;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=291;TCF=146;TCR=145;TR=151;WE=27384593;WS=27384575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,159:0.50:315
chr11	27390089	rs2447997	T	C	5873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=92;PP=2965;SC=TGCAGTATAGTTTAGTGTAGA;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=188;TCF=95;TCR=93;TR=186;WE=27390097;WS=27390079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr11	27393813	rs2448001	G	A	7100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=146;NR=100;PP=2965;ReadPosRankSum=0.257;SC=TCTATTTTTTGAAACTCATGC;SOR=1.102;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=248;TCF=148;TCR=100;TR=246;WE=27393821;WS=27393796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,276:0.99:278
chr11	27395377	rs2448003	G	A	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.338;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.88;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr11	27395447	rs77328098	C	T	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-1.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=162;ReadPosRankSum=-0.779;SC=TATTTTGATTCGACAATGTTA;SOR=0.711;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=13;WE=27395455;WS=27395437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr11	27401703	rs78698326	G	A	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=361;ReadPosRankSum=0.753;SC=TATATACAAAGGGAAACCGGA;SOR=0.643;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=44;TCF=35;TCR=9;TR=22;WE=27401711;WS=27401693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,24:0.49:49
chr11	27401743	rs2472623	A	T	2948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=26;PP=1685;SC=CATTGTCACTAAAAGACCCTG;SOR=1.702;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=67;TCR=26;TR=93;WE=27401751;WS=27401733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr11	27401927	rs2448005	T	G	776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.40;ReadPosRankSum=0.081;SOR=0.565;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,41:0.39:105
chr11	27401940	rs2472622	T	A	2246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=50;PP=1882;SC=TCATATTTTATGTTTTAAACA;SOR=1.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=22;TCR=50;TR=72;WE=27401948;WS=27401917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr11	27406844	rs6484295	G	A	1647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.152;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=27;PP=826;ReadPosRankSum=-0.890;SC=AGTCAGGGATGCTTGAGATCT;SOR=0.762;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=163;TCF=86;TCR=77;TR=68;WE=27406852;WS=27406834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,84:0.44:190
chr11	27412535	rs12273521	C	T	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=339;ReadPosRankSum=-0.501;SC=CTGTTTTTATCTCAGATGAAA;SOR=0.994;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=40;TCF=34;TCR=6;TR=19;WE=27412543;WS=27412525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,19:0.42:45
chr11	27413855	rs1871251	T	C	366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=1;PP=321;SC=CTCTGGCCTCTCATACTACTC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=27413863;WS=27413845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	27493879	rs11541599	C	G	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.62;ReadPosRankSum=-1.616;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr11	27523164	rs151336878	T	TGAAGTTAAAATTTCAGGC	865.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=3.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.24;MQRankSum=7.458;QD=10.43;ReadPosRankSum=-0.066;SOR=1.158;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,30:0.36:83
chr11	27523186	rs10835188	G	T	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=14.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.28;MQRankSum=5.354;QD=4.06;ReadPosRankSum=0.272;SOR=2.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,16:0.24:67
chr11	27679662	rs2353512	T	C	8058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=142;NR=129;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.988;SC=TTTTGTCTGCTGCCGTTACCC;SOR=0.226;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=272;TCF=143;TCR=129;TR=271;WE=27679670;WS=27679652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,299:1.00:300
chr11	27679916	rs6265	C	T	3172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.830;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=68;PP=1898;ReadPosRankSum=-0.235;SC=TCTTCTATCACGTGTTCGAAA;SOR=0.757;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=299;TCF=159;TCR=140;TR=146;WE=27679924;WS=27679906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,159:0.48:331
chr11	27681596	rs11030102	C	G	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=361;ReadPosRankSum=-0.214;SC=GAGGCATGGACTTACAAAAAG;SOR=0.512;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=38;TCR=4;TR=19;WE=27681604;WS=27681586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,19:0.45:42
chr11	27681915	rs117314519	T	C	533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.268;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=298;ReadPosRankSum=-1.142;SC=GTTCTCAGATTAGGAAGGGAA;SOR=1.536;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=33;TCF=11;TCR=22;TR=18;WE=27681923;WS=27681905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr11	27720937	rs66866077	C	T	2868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=61;PP=1814;ReadPosRankSum=-1.724;SC=ACCCATTCCTCTTCCCGGCTC;SOR=0.722;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=254;TCF=133;TCR=121;TR=129;WE=27720945;WS=27720927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,140:0.50:280
chr11	27910923	rs6484341	T	A	5181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=113;NR=56;PP=2965;SC=CTTTTCTTCATCCTCTGGAAG;SOR=1.547;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=170;TCF=114;TCR=56;TR=169;WE=27910931;WS=27910913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr11	28045260	rs33937991	A	G	875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=14;PP=467;ReadPosRankSum=0.249;SC=TCATACCATTAAATATCAAAT;SOR=0.613;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=84;TCF=54;TCR=30;TR=38;WE=28045268;WS=28045250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,44:0.45:98
chr11	28045430	rs34088899	AT	A	374.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.062;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.177;NF=0;NR=14;PP=239;ReadPosRankSum=0.225;SC=TTAGTTAAGCATTTTTTTTAT;SOR=1.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=14;WE=28045438;WS=28045420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr11	28057957	rs10458896	T	C	1699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=32;PP=1019;ReadPosRankSum=0.805;SC=TTTGAGCTGATAGCCTGAAAA;SOR=0.740;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=141;TCF=78;TCR=63;TR=73;WE=28057965;WS=28057947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,81:0.51:160
chr11	28104605	rs7937778	C	T	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-2.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.210;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=154;ReadPosRankSum=2.049;SC=CTGAATTAACCAGATTTTAAT;SOR=0.603;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=36;TCF=19;TCR=17;TR=14;WE=28104613;WS=28104595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,19:0.45:42
chr11	28106058	rs997555	C	G	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=1.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=181;ReadPosRankSum=0.845;SC=AAAGACCCTTCTAACCCTCAG;SOR=0.481;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=10;WE=28106066;WS=28106048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr11	28113094	.	TA	T	180.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.953;ClippingRankSum=0.000;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=4.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.41;ReadPosRankSum=-0.436;SOR=1.396;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,18:0.24:75
chr11	28134974	rs60970073	C	A	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.921;NF=1;NR=5;PP=84;ReadPosRankSum=0.634;SC=TCTGGCCAAACAGAATACATA;SOR=0.446;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=6;WE=28134982;WS=28134964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr11	28143882	.	G	A	33	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5064;HP=2;HapScore=2;MGOF=94;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=33;QD=22.5904041824;SC=GTGTGTATATGTGTGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=28143890;WS=28143872;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:1,3:0.75:4
chr11	30253318	rs611246	A	T	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.150;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=203;ReadPosRankSum=-0.340;SC=AGGAAAAAAAACTTTTGAAGC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=12;WE=30253326;WS=30253308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr11	30253641	rs609896	T	C	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=86;ReadPosRankSum=-0.593;SC=AGCAAGGGTGTTGAAGGTCTG;SOR=0.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=6;WE=30253649;WS=30253631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr11	30255185	rs6169	C	T	1942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.414;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=42;PP=1374;ReadPosRankSum=-0.631;SC=AACTGGTATACGAAACAGTGA;SOR=0.532;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=186;TCF=108;TCR=78;TR=89;WE=30255193;WS=30255175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,93:0.45:205
chr11	30352473	rs35824273	C	CAG	706.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.928;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=494;ReadPosRankSum=0.513;SC=CAAAATAAAACGGAAAATTTG;SOR=1.678;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=42;TCF=18;TCR=24;TR=14;WE=30352481;WS=30352463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,20:0.34:59
chr11	30353024	rs3858431	A	G	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.776;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=102;ReadPosRankSum=0.976;SC=ATTTGTTAGCATACAGTGAAT;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=6;WE=30353032;WS=30353014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr11	30358032	rs149772521	CCT	C	243.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=3;PP=268;ReadPosRankSum=-0.627;SC=TATTTTATCTCCTTTTTTTTT;SOR=0.283;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=12;WE=30358042;WS=30358022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr11	30410299	rs148498876	T	A	965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.609;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=9;PP=500;ReadPosRankSum=0.507;SC=CATGCCTTCTTTGTCTTCACC;SOR=0.871;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=96;TCF=69;TCR=27;TR=38;WE=30410307;WS=30410289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,47:0.42:111
chr11	30438948	rs492604	C	T	437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.80;QD=31.27;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	30601733	rs66528013	CT	C	612.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.577;HP=12;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=361;ReadPosRankSum=-0.827;SC=GAATGCTTTTCTTTTTTTTCT;SOR=1.179;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=55;TCF=41;TCR=14;TR=24;WE=30601741;WS=30601723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,31:0.45:69
chr11	30900263	.	TA	T	88	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;FR=1.0000;HP=16;HapScore=2;MGOF=16;MMLQ=15;MQ=57.66;NF=0;NR=9;PP=88;QD=10.1111111111;SC=TTAACTCTGTTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=9;WE=30900271;WS=30900253;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:7,9:0.56:16
chr11	30902893	rs273613	T	C	3569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=65;PP=1943;SC=GAATACGGAATGGCACAATAT;SOR=0.831;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=127;TCF=61;TCR=66;TR=125;WE=30902901;WS=30902883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr11	30922081	rs273560	C	T	710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=20;PP=521;SC=CATTGTTCAACGAATAATGAA;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=30922089;WS=30922071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr11	30930393	rs175398	T	G	250.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=176;SC=TCAACTTGTATGAACATAAAG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=30930401;WS=30930383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	30953608	rs163877	A	G	309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=226;SC=CATTCATTCAACAAAAATGTA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=30953616;WS=30953598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	30965855	rs273605	A	T	6885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=116;NR=110;PP=2965;SC=TTAGGAACCAAGTCTATCTCC;SOR=0.755;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=226;TCF=116;TCR=110;TR=226;WE=30965863;WS=30965845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr11	30974203	rs10767883	T	A	286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=9;PP=210;SC=GTACTTACTATACACTAGGCA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=30974211;WS=30974193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	31326332	rs3847588	G	A	685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.772;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=19;PP=455;ReadPosRankSum=-0.086;SC=AAAAAGCATAGGAAAGTACAG;SOR=0.968;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=80;TCF=37;TCR=43;TR=32;WE=31326340;WS=31326322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,35:0.38:91
chr11	31327316	rs2616815	C	T	1774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.058;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=43;PP=969;ReadPosRankSum=-0.037;SC=CTGTGCACTCCTCCAGCAGCT;SOR=0.779;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=195;TCF=87;TCR=108;TR=79;WE=31327324;WS=31327306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,92:0.42:221
chr11	31327342	rs182715635	G	A	1287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.594;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=31;PP=687;ReadPosRankSum=2.302;SC=AAAGCAAGAGGTAAGTCAAAG;SOR=0.770;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=143;TCF=60;TCR=83;TR=55;WE=31327350;WS=31327332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,66:0.39:169
chr11	31451026	rs7119246	A	C	1414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=20;PP=945;ReadPosRankSum=1.725;SC=TTTTCCTTTGACAGTTACTTC;SOR=0.734;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=157;TCF=107;TCR=50;TR=65;WE=31451034;WS=31451016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,69:0.42:165
chr11	31458730	rs7479413	T	G	1014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=26;PP=781;SC=TCAGGTTTCATATATTTAGAT;SOR=3.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=29;WE=31458738;WS=31458720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr11	31648529	rs2273943	G	A	134.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=104;SC=ATATAATACTGTTTTGACATT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=31648537;WS=31648519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	31653956	rs4922872	C	A	6593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=117;PP=2965;SC=GATCCAGGTACGAAATTTCCA;SOR=1.100;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=211;TCF=94;TCR=117;TR=211;WE=31653964;WS=31653946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr11	31812215	rs3026393	A	C	703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.014;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=357;ReadPosRankSum=-1.156;SC=CTTCTAGTGAAGAGAGATCGC;SOR=0.856;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=48;TCF=32;TCR=16;TR=27;WE=31812223;WS=31812205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,33:0.57:58
chr11	31812582	rs2071754	C	T	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=344;ReadPosRankSum=-0.183;SC=GCTAGTCCTTCCACTGGCCAC;SOR=0.836;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=21;WE=31812590;WS=31812572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,23:0.49:47
chr11	31837949	rs1540318	C	T	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.151;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=204;ReadPosRankSum=1.057;SC=GTCCTCGGCTCGCCCTGGGCG;SOR=1.911;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=12;WE=31837957;WS=31837939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr11	31838128	rs4440995	G	A	2143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.515;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=44;PP=1163;ReadPosRankSum=0.698;SC=CGAAGCAGGCGACCTGCTCGC;SOR=0.900;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=161;TCF=86;TCR=75;TR=89;WE=31838136;WS=31838118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,104:0.55:190
chr11	31838252	rs5790869	C	CG	741.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=19;PP=880;SC=GAGCAGGGGGCGCCACCGCTC;SOR=3.160;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=20;WE=31838260;WS=31838242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	32113057	rs223045	A	G	957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=21;PP=573;SC=CGCCTGGGCGAGAGCCACGCG;SOR=1.885;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=30;WE=32113065;WS=32113047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr11	32118665	.	CTTT	C	126.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.302;ClippingRankSum=0.000;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.67;ReadPosRankSum=1.895;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr11	32118925	rs223073	A	G	4427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=88;PP=2684;SC=GGGGGCCCAGATCACAAGCTT;SOR=1.124;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=153;TCF=65;TCR=88;TR=153;WE=32118933;WS=32118915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr11	32119030	rs223072	T	C	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=2.881;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=30;ReadPosRankSum=-1.611;SC=CCCTCCTCTGTAAACTCAGAA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=3;WE=32119038;WS=32119020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr11	32122003	rs2281411	C	A	2104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=43;PP=1409;ReadPosRankSum=-0.247;SC=AGCATTCAGCCGTAAAAGCTG;SOR=0.722;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=230;TCF=131;TCR=99;TR=102;WE=32122011;WS=32121993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,106:0.42:251
chr11	32122020	rs2073223	T	G	2709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.874;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=57;PP=1818;ReadPosRankSum=-1.119;SC=GCTGGACAAATGAGGACAATA;SOR=0.771;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=280;TCF=153;TCR=127;TR=128;WE=32122028;WS=32122010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,135:0.44:307
chr11	32122268	rs223065	C	A	327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=8;PP=200;SC=CAAGTCTATACGTCACTCCTG;SOR=3.442;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=32122276;WS=32122258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	32124579	rs223060	C	T	3210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.378;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=65;PP=1937;ReadPosRankSum=0.625;SC=AGTCACTGAACTAAGTCAAAA;SOR=0.607;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=265;TCF=149;TCR=116;TR=138;WE=32124587;WS=32124569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,154:0.52:298
chr11	32124685	rs223059	G	A	9497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=357;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=156;NR=177;PP=2965;SC=TCCCCAAGAAGCTGCCTACCA;SOR=0.915;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=334;TCF=157;TCR=177;TR=333;WE=32124693;WS=32124675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,356:1.00:356
chr11	32124978	rs4876	T	C	2120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.745;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.899;NF=54;NR=35;PP=1068;ReadPosRankSum=0.169;SC=ATTATGATCATGCACAGGCTG;SOR=0.549;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=178;TCF=107;TCR=71;TR=89;WE=32124986;WS=32124968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,104:0.51:203
chr11	32125855	rs223058	A	G	2454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=42;NR=39;PP=1336;SC=AACATCATACAGAACTAGTAC;SOR=0.780;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=42;TCR=39;TR=81;WE=32125863;WS=32125845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr11	32125961	rs11529889	C	T	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.629;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.763;NF=1;NR=9;PP=174;ReadPosRankSum=0.267;SC=ACATGTTTGTCGGAAGCCAAG;SOR=1.880;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=10;WE=32125969;WS=32125951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr11	32608473	rs201881	G	A	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.194;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=391;ReadPosRankSum=-0.826;SC=CAGTATTTCCGTTTTAGTTTT;SOR=0.437;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=56;TCF=43;TCR=13;TR=24;WE=32608481;WS=32608463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,26:0.44:59
chr11	32610388	rs201877	A	T	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.993;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=220;ReadPosRankSum=-0.140;SC=GCTGTGGCTCATATTAGCTGT;SOR=0.102;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=11;WE=32610396;WS=32610378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr11	32610968	rs201876	T	C	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQ=52.61;MQRankSum=-2.638;NF=6;NR=0;PP=86;ReadPosRankSum=1.780;SC=TTGATCCTCCTGCCTTGGCCT;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=6;WE=32610976;WS=32610958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr11	32615352	rs66536432	A	AT	1944.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=8;PP=1343;SC=TCTTAAAAATATTTTAAATGA;SOR=2.621;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=42;TCF=32;TCR=10;TR=35;WE=32615360;WS=32615342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr11	32622213	rs11031888	G	C	758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.730;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=11;PP=480;ReadPosRankSum=-0.419;SC=CACTCATCAGGCTTCACTATT;SOR=0.904;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=77;TCF=50;TCR=27;TR=32;WE=32622221;WS=32622203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,37:0.40:93
chr11	32623419	rs77379922	C	T	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.080;HP=1;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=12;ReadPosRankSum=-0.042;SC=TAGTTTGTTCCGATTATTTCA;SOR=0.503;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=49;TCF=21;TCR=28;TR=22;WE=32623427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,22:0.42:52
chr11	32624405	rs201893	C	T	819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.905;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=7;PP=529;ReadPosRankSum=0.607;SC=CTTTTCTTTTCTTTGGCTGGT;SOR=0.892;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=72;TCF=53;TCR=19;TR=33;WE=32624413;WS=32624395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,37:0.46:81
chr11	32657266	rs201854	T	C	2537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=46;PP=1405;SC=CTTCCTCAAATGTTTTTTGAT;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=38;TCR=47;TR=84;WE=32657274;WS=32657256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr11	32674627	rs172101	A	G	1154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.724;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=13;PP=857;ReadPosRankSum=0.215;SC=AATATACTAAAACACAGATAG;SOR=0.988;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=89;TCF=62;TCR=27;TR=50;WE=32674635;WS=32674617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,51:0.52:99
chr11	32676632	rs61176333	A	T	1051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.64;QD=40.45;SOR=3.098;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	32676635	rs58867287	C	CATATAT	1068.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=48.58;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr11	32676636	rs58870509	C	CAAGATAATA	1021.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=56.76;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	32676638	rs58027589	T	TAC	817.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=54.52;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	32676640	.	G	GGT	637.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=53.14;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	32676641	.	C	CCATTA	547.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=68.47;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	32676644	.	G	GTGTATTTTCCCTAC	366.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.84;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	32697291	rs7116464	A	G	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.544;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=265;ReadPosRankSum=-0.469;SC=TGCAATATATATGTTATTTAA;SOR=1.230;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=17;WE=32697299;WS=32697281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr11	32704946	rs1396995	C	A	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.800;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=10;PP=285;ReadPosRankSum=1.209;SC=TATCCCCTTTCATATTACTGG;SOR=0.029;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=23;WE=32704954;WS=32704936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,24:0.77:31
chr11	32724611	rs4756174	C	G	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.095;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=26;ReadPosRankSum=-0.433;SC=ATTTTGTGTTCCTGGAATGCA;SOR=0.527;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=5;WE=32724619;WS=32724601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr11	32781829	rs11442361	G	GA	42.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=47;ReadPosRankSum=1.517;SC=GGTCTTAACTGAAAAAAAATT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=4;WE=32781837;WS=32781819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr11	32874926	rs11032025	G	A	4902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=69;PP=2965;SC=CTCCATTGCCGCCTTCTGTGG;SOR=0.849;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=162;TCF=92;TCR=70;TR=161;WE=32874934;WS=32874916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr11	32949463	rs146740108	A	AT	268.70	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.93;ReadPosRankSum=-0.415;SOR=1.508;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,15:0.83:18
chr11	32954344	rs1022586	G	A	6020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=109;PP=2965;SC=ATCTCAGACTGTAACTCCTGA;SOR=1.096;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=193;TCF=84;TCR=109;TR=193;WE=32954352;WS=32954334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr11	32956244	rs7940077	A	G	7044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=129;NR=97;PP=2965;SC=AGTGGAGAGAATGCTACATCA;SOR=0.878;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=226;TCF=129;TCR=97;TR=226;WE=32956252;WS=32956234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr11	32956620	rs7481878	A	G	7253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.108;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=114;NR=118;PP=2965;ReadPosRankSum=0.725;SC=AAAAACAACCAGAAGTCAAAA;SOR=0.307;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=233;TCF=115;TCR=118;TR=232;WE=32956628;WS=32956610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,269:1.00:270
chr11	32975333	rs7395190	T	G	2101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=15;PP=1414;SC=TTAAACTGTTTTGAGTTTTAC;SOR=2.049;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=50;TCR=15;TR=65;WE=32975341;WS=32975323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr11	32990842	rs6416072	G	T	144.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=114;SC=TAGTTTGTCTGCTTAGTGTTA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=32990850;WS=32990832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	33014668	rs7941237	G	A	777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=6;PP=589;SC=TCACAGACTGGGTAGCTTATA;SOR=2.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=27;WE=33014676;WS=33014658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	33050100	rs3802790	A	G	384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=3;PP=296;SC=TGGTGAGCATATAGTAACTAT;SOR=1.765;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=14;WE=33050108;WS=33050090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	33053107	rs966191	C	T	3644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=75;PP=2177;SC=ACTTATCTGACGTTCATAATG;SOR=1.557;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=118;TCF=43;TCR=75;TR=118;WE=33053115;WS=33053097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr11	33053737	rs4511261	C	T	212.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=173;SC=ATTCACCATTCATTGTTAATT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=33053745;WS=33053727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr11	33054562	rs2273536	G	A	855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=20;PP=518;SC=CAAATTTCAGGTGTTTTTTGA;SOR=1.839;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=29;WE=33054570;WS=33054552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr11	33054596	rs2273537	G	A	243.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=203;SC=TAAGTAGTTGGACTTTAATTT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=33054604;WS=33054586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	33054754	rs2273539	C	G	490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=0;PP=387;SC=GATTTTTCTGCTTAAATATGA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=33054762;WS=33054744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	33054794	rs2273540	T	G	1042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=8;PP=716;SC=AACTTTTTACTTTTAAACTTT;SOR=2.613;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=38;WE=33054802;WS=33054784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	33055078	rs1059432	C	T	600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=18;PP=477;SC=CATTTGTAAGCGTGGAAGCTC;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=33055086;WS=33055068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	33065394	rs1064005	C	T	6828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=129;NR=97;PP=2965;SC=AGGAAGGCCTCGAAGATGCTG;SOR=0.907;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=226;TCF=129;TCR=97;TR=226;WE=33065402;WS=33065384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr11	33065547	rs7926030	G	A	2106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=51;PP=1353;SC=GTTTTATGAGGCCTCCTTGTG;SOR=2.124;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=16;TCR=51;TR=67;WE=33065555;WS=33065537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr11	33076191	rs2273544	T	C	5251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=104;NR=82;PP=2965;SC=CAGCGAGAGGTGTCACCAACA;SOR=0.856;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=186;TCF=104;TCR=82;TR=186;WE=33076199;WS=33076181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr11	33078251	rs4471389	A	T	2216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=42;NR=28;PP=1055;SC=CGGCCTCCAAAAGTGCTGGGA;SOR=0.836;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=42;TCR=28;TR=70;WE=33078259;WS=33078241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr11	33078643	rs2273546	T	C	4936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.04;SOR=1.501;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr11	33079445	rs2273548	G	T	1291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=7;PP=909;SC=TTGATTAAACGTAGCTGTGTT;SOR=2.584;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=41;WE=33079453;WS=33079435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr11	33079752	rs7395859	C	T	71.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr11	33080496	rs11032133	T	C	4552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=97;NR=46;PP=2728;SC=AAATCCTTTTTTCTTTCAGAG;SOR=1.565;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=143;TCF=97;TCR=46;TR=143;WE=33080504;WS=33080486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr11	33106616	rs3758741	C	T	7551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=126;NR=125;PP=2965;SC=GAGTTTTCTGCAGAGGCGTTT;SOR=0.743;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=251;TCF=126;TCR=125;TR=251;WE=33106624;WS=33106606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,283:1.00:283
chr11	33106908	rs3834432	C	CTTTATAG	3732.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=35;PP=2459;SC=ACTGTGGATACTTTATTTCAT;SOR=1.967;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=49;TCF=2;TCR=47;TR=37;WE=33106916;WS=33106898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr11	33113653	rs7950763	T	C	1740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=4;PP=1226;SC=TAAAAATAATTTTAAACAGGT;SOR=4.615;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=44;TCR=4;TR=48;WE=33113661;WS=33113643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr11	33113910	rs113144162	A	AT	3359.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.23;MQRankSum=0.312;QD=28.23;ReadPosRankSum=1.484;SOR=1.312;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,116:0.97:119
chr11	33117987	rs75467356	A	G	696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=19;PP=393;ReadPosRankSum=-1.036;SC=ACAGATTTCCATGAAATGTCA;SOR=0.613;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=26;TCR=39;TR=32;WE=33117995;WS=33117977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,35:0.49:72
chr11	33118274	rs7103953	A	G	304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=2;PP=199;SC=CTGCCTTTACAAAATGGAGCA;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=33118282;WS=33118264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	33118529	rs11363325	GC	G	1562.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=30;PP=1284;SC=ATATACCTATGCAAAAGAAAG;SOR=2.584;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=31;WE=33118537;WS=33118519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr11	33129997	rs11605353	C	T	1851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=28;NR=34;PP=1075;SC=AGAATTAATACTATTTTTTTA;SOR=1.054;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=28;TCR=34;TR=62;WE=33130005;WS=33129987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr11	33183017	rs3736213	A	G	2455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=52;PP=1546;SC=CGCCCACTCAAATATGAATTA;SOR=1.967;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=23;TCR=52;TR=75;WE=33183025;WS=33183007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr11	33183073	rs3808985	G	A	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=110;ReadPosRankSum=-1.238;SC=TGTGGCTTCCGCATTAACTTC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=7;WE=33183081;WS=33183063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr11	33360783	rs3847592	A	G	903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=4;PP=668;SC=AGATAATTGTAGTTCCCTCTC;SOR=2.910;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=28;WE=33360791;WS=33360773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr11	33360886	rs5790925	AT	A	5236.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=55;PP=2973;SC=TGAAATTTTGATTTTCTTAGG;SOR=0.879;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=83;TCF=26;TCR=57;TR=79;WE=33360894;WS=33360876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr11	33362723	rs266470	G	T	1336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=26;PP=777;SC=TAATGATTGCGCATTTTACTT;SOR=1.345;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=44;TCF=18;TCR=26;TR=44;WE=33362731;WS=33362713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr11	33370884	rs4756641	G	A	1526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=36;PP=963;SC=CTACTAAAAAGCCTACGATTT;SOR=2.345;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=12;TCR=36;TR=48;WE=33370892;WS=33370874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr11	33564123	rs2076623	T	C	3238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.912;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=71;PP=2209;ReadPosRankSum=-1.047;SC=ATTCAGCAGGTTCATCCACAC;SOR=0.626;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=252;TCF=118;TCR=134;TR=135;WE=33564131;WS=33564113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,145:0.52:280
chr11	33566507	rs117590358	G	A	3488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.576;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=71;PP=2267;ReadPosRankSum=0.564;SC=AAACAAGGCCGCATCTGGCCC;SOR=0.550;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=267;TCF=145;TCR=122;TR=149;WE=33566515;WS=33566497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,158:0.55:287
chr11	33573887	.	A	G	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;BaseQRankSum=2.446;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=125;ReadPosRankSum=-2.230;SC=GCTACCATGTATAAATGTAAC;SOR=1.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=7;WE=33573895;WS=33573877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr11	33581153	rs2076627	T	C	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.81;ReadPosRankSum=-1.032;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr11	33581359	rs201351687	C	T	2350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.460;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=49;PP=1293;ReadPosRankSum=-1.641;SC=AATCAGAGCACATTCCTCAAC;SOR=0.748;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=225;TCF=121;TCR=104;TR=106;WE=33581367;WS=33581349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,121:0.48:251
chr11	33604885	rs2273117	C	T	662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.129;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=6;PP=510;ReadPosRankSum=0.961;SC=TTCCCACAGCCGTGGTGAAGA;SOR=0.971;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=67;TCF=53;TCR=14;TR=31;WE=33604893;WS=33604875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,31:0.46:68
chr11	33604960	rs2273115	C	T	2239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.480;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=47;PP=1337;ReadPosRankSum=-0.542;SC=TCACGGTCATCATCATCATCA;SOR=0.649;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=220;TCF=128;TCR=92;TR=107;WE=33604968;WS=33604945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,112:0.48:234
chr11	33628103	rs2076626	T	G	951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=10;PP=1589;ReadPosRankSum=-0.092;SC=GTAATGTCCTTAGGCTGTGAG;SOR=0.770;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=60;TCF=43;TCR=17;TR=36;WE=33628125;WS=33628093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,39:0.61:64
chr11	33628117	rs2076625	A	C	1164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.853;HP=1;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=15;PP=1589;ReadPosRankSum=1.197;SC=CTGTGAGTCTAACATAAATTC;SOR=0.873;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=82;TCF=55;TCR=27;TR=47;WE=33628125;WS=33628093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,50:0.57:87
chr11	33640104	rs768474	A	C	2530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.389;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=67;PP=1341;ReadPosRankSum=-1.186;SC=CTCTGTCTACAGAAGCCGGCA;SOR=0.803;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=268;TCF=124;TCR=144;TR=123;WE=33640112;WS=33640094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,134:0.45:299
chr11	33667333	rs1033543	A	G	2439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.916;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=57;PP=1317;ReadPosRankSum=-1.685;SC=AGACCTCCACACTGAGCTCCC;SOR=0.624;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=248;TCF=114;TCR=134;TR=109;WE=33667341;WS=33667323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,126:0.45:283
chr11	33667596	rs1033542	T	C	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.939;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.447;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=89;ReadPosRankSum=0.643;SC=AGTCATTCATTCCACCCACCT;SOR=1.863;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=6;WE=33667604;WS=33667586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr11	33719821	rs831611	T	C	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.146;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=289;ReadPosRankSum=1.247;SC=CCACACAAAGTGGGCACTGTA;SOR=0.425;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=52;TCF=38;TCR=14;TR=25;WE=33719829;WS=33719811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,28:0.50:56
chr11	33721175	rs4755893	G	C	1242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=36;PP=836;ReadPosRankSum=-0.332;SC=GACTTCAGACGTAAGACCAGA;SOR=0.704;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=137;TCF=54;TCR=83;TR=59;WE=33721183;WS=33721165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,62:0.42:149
chr11	33721261	rs4755894	T	G	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.696;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=125;ReadPosRankSum=1.969;SC=CCCCCAGCATTGAGAAGTGGA;SOR=0.136;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=10;WE=33721269;WS=33721251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr11	33773161	rs7479064	G	C	1707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=31;PP=943;SC=CACCTATAAAGCAGGAAAGGG;SOR=1.329;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=20;TCR=31;TR=51;WE=33773169;WS=33773151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr11	33775982	rs2272065	A	G	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.291;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=14;PP=385;ReadPosRankSum=-0.698;SC=GGGGGAAAAAAGACTTTTTTC;SOR=0.382;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=62;TCF=40;TCR=22;TR=33;WE=33775990;WS=33775972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,35:0.49:71
chr11	33777334	rs1402954	C	T	701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.984;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=8;PP=413;ReadPosRankSum=0.515;SC=TGGTAGAAAACTTCATTTTTG;SOR=0.540;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=59;TCF=44;TCR=15;TR=29;WE=33777342;WS=33777324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,34:0.49:69
chr11	33778729	rs12224154	T	C	1231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.780;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=32;PP=779;ReadPosRankSum=0.394;SC=CAGTGCAAAGTTCTCCTTAAA;SOR=0.102;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=74;TCF=15;TCR=59;TR=44;WE=33778737;WS=33778719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,51:0.61:84
chr11	33881016	rs3740617	T	C	4734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=73;PP=2919;SC=AGGCGGCGCATTTGAAACATT;SOR=0.705;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=157;TCF=84;TCR=73;TR=157;WE=33881024;WS=33881006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr11	33886547	rs3824848	C	T	1796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.536;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.112;NF=31;NR=48;PP=1074;ReadPosRankSum=-1.231;SC=TGGGTTAAGACGGGAAAGAGC;SOR=0.618;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=179;TCF=71;TCR=108;TR=79;WE=33886555;WS=33886537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,89:0.44:201
chr11	34093121	rs60037622	A	T	89.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=17.95;ReadPosRankSum=1.036;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr11	34093121	.	AA	TT	41	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=11;HapScore=2;MGOF=16;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=41;QD=47.2339374311;SC=AAAAAAAAAAAATTTATGTAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=2;WE=34093130;WS=34093111;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,2:0.29:7
chr11	34093122	rs59978955	A	T	89.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=17.95;ReadPosRankSum=1.036;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr11	34093269	rs191903758	A	G	818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=17;PP=490;ReadPosRankSum=1.167;SC=TTCTTTTAACATAGGGTAAGC;SOR=0.660;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=89;TCF=52;TCR=37;TR=40;WE=34093277;WS=34093259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,44:0.44:100
chr11	34093349	rs10718447	AT	A	2612.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=39;PP=1700;SC=AAGATGTTATATTTTTTATTT;SOR=0.738;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=57;TCF=17;TCR=40;TR=54;WE=34093357;WS=34093339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr11	34107489	rs16925147	C	T	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=-0.492;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=55;ReadPosRankSum=-0.355;SC=TGGGTAACTGCATTAAAGCCC;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=34107497;WS=34107479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr11	34107523	rs60700110	T	A	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-1.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=82;ReadPosRankSum=0.650;SC=TATAGATGGTTTATGTAGTGT;SOR=0.892;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=9;WE=34107531;WS=34107513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,11:0.34:32
chr11	34107785	rs4755360	G	A	3569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=47;PP=2266;SC=ATTTTAGTCAGACTCTGTAAC;SOR=0.899;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=64;TCR=47;TR=111;WE=34107793;WS=34107775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr11	34111038	rs138654211	GT	G	2677.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.616;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=40;PP=1540;ReadPosRankSum=-0.525;SC=TCAGGGCCAGGTTAGGTGGCT;SOR=0.618;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=88;TCF=5;TCR=83;TR=43;WE=34111046;WS=34111028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,85:0.55:155
chr11	34113717	rs2982592	C	T	3114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=76;PP=2095;SC=GTTTTAGTAGCAGACCATATG;SOR=2.411;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=25;TCR=76;TR=101;WE=34113725;WS=34113707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr11	34120705	rs17700132	A	G	803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=7;PP=543;ReadPosRankSum=-0.329;SC=GACAGGGGAAACTTGAACACT;SOR=0.653;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=62;TCF=48;TCR=14;TR=32;WE=34120713;WS=34120695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,34:0.52:65
chr11	34130164	rs73501064	A	G	699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=8;PP=480;ReadPosRankSum=-1.018;SC=CTCGCCTTAGAACCTTGGGCA;SOR=0.742;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=72;TCF=53;TCR=19;TR=31;WE=34130172;WS=34130154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,33:0.44:75
chr11	34130195	rs73501065	G	A	1258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=22;PP=793;ReadPosRankSum=0.873;SC=CTGGCCCTCAGTTTAGTTTCC;SOR=0.701;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=94;TCR=53;TR=61;WE=34130203;WS=34130185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,65:0.41:159
chr11	34130342	rs11552143	A	G	1574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.601;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=35;PP=846;ReadPosRankSum=-0.663;SC=CTCGGCCTTCAGTGCTGTGGT;SOR=0.457;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=147;TCF=64;TCR=83;TR=65;WE=34130350;WS=34130332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,78:0.44:176
chr11	34130406	rs17700360	A	G	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.090;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=14;PP=269;ReadPosRankSum=0.940;SC=CATGTGTTTTATCCAACTTAC;SOR=0.271;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=47;TCF=17;TCR=30;TR=25;WE=34130414;WS=34130396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,32:0.53:60
chr11	34133552	rs73501073	T	C	1226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.733;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=13;PP=636;ReadPosRankSum=-1.037;SC=GCTCTTTAGCTGCTCTGGTTA;SOR=0.776;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=74;TCR=29;TR=46;WE=34133560;WS=34133542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,55:0.47:116
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chr11	34137524	rs79996353	G	A	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=269;ReadPosRankSum=1.817;SC=TTTATATTGGGGAAAGTAGTA;SOR=0.627;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=15;WE=34137532;WS=34137514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr11	34149199	rs2957512	T	C	520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=16;PP=467;SC=CTTGCAGATTTAGGGGCATGT;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=34149207;WS=34149189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	34152939	rs2957516	T	C	6692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=132;NR=102;PP=2965;SC=GCGGACACTGTATGAGGTTTC;SOR=0.865;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=234;TCF=132;TCR=102;TR=234;WE=34152947;WS=34152929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr11	34154641	rs2957518	C	T	2034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.730;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=44;PP=1032;ReadPosRankSum=-0.465;SC=TTCTGCCTCCCGTGCCCCCCA;SOR=0.718;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=195;TCF=102;TCR=93;TR=88;WE=34154649;WS=34154631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,104:0.46:225
chr11	34158411	rs2982615	A	G	1889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=28;NR=28;PP=1400;SC=GGTAGCTGGTATCGGTGCTAG;SOR=0.826;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=28;TCR=28;TR=56;WE=34158419;WS=34158401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr11	34158431	rs2957521	T	C	1983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=24;PP=1363;SC=GCCTGCTATTTGTGGCGTGCT;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=39;TCR=24;TR=63;WE=34158439;WS=34158421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr11	34163705	rs2982612	T	C	4470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=51;PP=2464;SC=TGCAGGTAGATGGAAGAGAAG;SOR=1.278;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=145;TCF=94;TCR=51;TR=145;WE=34163713;WS=34163695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr11	34176214	rs2957525	A	G	2334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=14;PP=1799;SC=TGGGCACCCTAGCCCAGGCCC;SOR=2.599;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=60;TCR=14;TR=74;WE=34176222;WS=34176204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr11	34181383	rs79718145	G	C	610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.599;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=9;PP=353;ReadPosRankSum=-2.011;SC=GTCACTCTCTGTCACCTGGAA;SOR=0.182;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=36;TCF=24;TCR=12;TR=25;WE=34181391;WS=34181373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,27:0.69:39
chr11	34188982	rs7120749	A	G	1416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.319;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=35;PP=811;ReadPosRankSum=0.302;SC=ATGGTGAACCAGAGTTAACAA;SOR=0.417;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=170;TCF=77;TCR=93;TR=70;WE=34188990;WS=34188972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,77:0.42:185
chr11	34189564	rs4756111	A	G	1970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=46;PP=1248;ReadPosRankSum=0.199;SC=TGCACGTGCTAAACTGTTTGC;SOR=0.722;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=200;TCF=98;TCR=102;TR=90;WE=34189572;WS=34189554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,99:0.44:224
chr11	34189648	rs2473919	C	T	1092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=27;PP=590;ReadPosRankSum=-0.055;SC=GCCACCCCAGCCGAGCATCCT;SOR=0.693;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=73;TCF=23;TCR=50;TR=42;WE=34189656;WS=34189638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,49:0.61:80
chr11	34226041	rs2955944	A	G	4074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=56;PP=2436;SC=CCCAGCCCTGAGACCTCGCCG;SOR=0.823;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=74;TCR=56;TR=130;WE=34226049;WS=34226018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr11	34460472	rs7943316	A	T	4431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=44;PP=2824;SC=GTCGCCACGGACTCGGGGCAA;SOR=1.565;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=100;TCR=44;TR=144;WE=34460482;WS=34460462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr11	34460541	rs1049982	T	C	9327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=360;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=173;NR=155;PP=2965;SC=TGCAGTGTTCTGCACAGCAAA;SOR=0.816;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=329;TCF=174;TCR=155;TR=328;WE=34460549;WS=34460531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,359:1.00:359
chr11	34502345	rs2231828	T	C	6904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=140;NR=89;PP=2965;SC=ACTTTTCATATGTCATTCTGT;SOR=1.229;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=229;TCF=140;TCR=89;TR=229;WE=34502353;WS=34502335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
chr11	34511541	rs2231825	C	A	5638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=99;NR=85;PP=2965;SC=GGGTGGCTTGCGCTTGGTTAC;SOR=0.753;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=184;TCF=99;TCR=85;TR=184;WE=34511549;WS=34511531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr11	34514941	rs737254	T	G	807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=3;PP=556;SC=TGCTGTGCAATTCACACGATG;SOR=3.098;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=34514949;WS=34514931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	34527152	rs2231821	A	G	2514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=22;PP=1485;SC=CTGCACTCAGATGGGCTCCTT;SOR=1.688;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=57;TCR=22;TR=78;WE=34527160;WS=34527142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr11	34643780	rs286920	A	G	581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.219;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=3;PP=315;ReadPosRankSum=0.308;SC=CTGATTTACCATGCTCCCAGG;SOR=1.413;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=54;TCF=44;TCR=10;TR=24;WE=34643788;WS=34643770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,29:0.45:64
chr11	34678435	rs435537	C	G	6612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=136;NR=84;PP=2965;SC=CAATTAAACGCCTCTCATTTT;SOR=1.096;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=220;TCF=136;TCR=84;TR=220;WE=34678443;WS=34678425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr11	34680053	rs3818514	G	A	5973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=126;NR=76;PP=2965;SC=TAGATCATTAGTAACCTGCCT;SOR=1.163;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=202;TCF=126;TCR=76;TR=202;WE=34680061;WS=34680043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr11	34680598	rs11032804	C	A	829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=24;PP=695;SC=ATGAGGGGAACAAGAAACTAC;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=34680606;WS=34680588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	34904399	rs2288667	C	T	1587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.247;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=35;PP=931;ReadPosRankSum=0.044;SC=CAGTGTTTATCGAAACAGAGT;SOR=0.674;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=143;TCF=77;TCR=66;TR=73;WE=34904407;WS=34904389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,80:0.51:157
chr11	34904509	rs2288668	T	G	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=288;ReadPosRankSum=0.388;SC=ATTCTATTTTTCCCTCAACAT;SOR=0.627;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=17;WE=34904517;WS=34904499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr11	34905145	rs2303957	T	C	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=132;ReadPosRankSum=-1.099;SC=CAGTTAGACATGCTGTTTGTG;SOR=1.096;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=11;WE=34905153;WS=34905135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr11	34909827	rs35393135	GA	G	445.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=1.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.039;HP=9;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.302;NF=9;NR=0;PP=533;ReadPosRankSum=0.982;SC=TAAGAAAAAGGAAAAAAAAAT;SOR=1.538;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=9;WE=34909841;WS=34909817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr11	34909833	rs61752923	A	C	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.812;HP=8;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.238;NF=12;NR=1;PP=512;ReadPosRankSum=0.106;SC=AAAGGAAAAAAAAATACCTAT;SOR=1.890;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=13;WE=34909841;WS=34909817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,17:0.41:41
chr11	34909926	rs1571133	T	G	1293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.576;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.98;MQRankSum=-0.682;NF=33;NR=28;PP=844;ReadPosRankSum=1.390;SC=GAAAGAGAAGTGTGGCCATCA;SOR=0.638;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=144;TCF=82;TCR=62;TR=61;WE=34909934;WS=34909904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,69:0.42:166
chr11	34910077	rs1571134	G	A	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=2.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.20;ReadPosRankSum=-0.903;SOR=0.250;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr11	34910397	rs1977420	C	T	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.925;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=355;ReadPosRankSum=-0.563;SC=ATTTATATCACAAACAAACAT;SOR=0.973;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=79;TCF=51;TCR=28;TR=27;WE=34910405;WS=34910387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,29:0.34:85
chr11	34910433	rs1977421	A	G	881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.11;ReadPosRankSum=-1.982;SOR=0.741;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,47:0.38:124
chr11	34912013	rs2303959	A	G	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.361;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.136;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=86;ReadPosRankSum=0.367;SC=GTAATTAAGAAGAAAAGACAC;SOR=2.066;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=6;WE=34912021;WS=34912003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr11	34912289	rs2915224	T	A	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=189;ReadPosRankSum=1.856;SC=CTGGTGGCATTGTAGAATATT;SOR=0.804;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=9;WE=34912297;WS=34912279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr11	34916484	rs1326940	A	G	974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.876;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=12;PP=507;ReadPosRankSum=-1.011;SC=TGTTCTTTGGATATAACACAT;SOR=0.856;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=72;TCF=48;TCR=24;TR=39;WE=34916492;WS=34916474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,44:0.56:79
chr11	34916710	rs1326941	A	G	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.326;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=12;PP=325;ReadPosRankSum=-1.501;SC=TCAAGTAACTATTCCAGCTGG;SOR=0.412;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=34;TCF=12;TCR=22;TR=19;WE=34916718;WS=34916700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,22:0.55:40
chr11	34916785	rs1326942	A	G	157.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5341;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=119;ReadPosRankSum=-0.180;SC=AGTACAGTGAAGGAAAAAACT;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=6;WE=34916793;WS=34916775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr11	34918273	rs34774694	G	GCAA	1028.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=4.566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.62;ReadPosRankSum=-0.440;SOR=1.111;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,51:0.38:135
chr11	34918375	rs2986429	A	G	2782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.618;NF=70;NR=66;PP=1842;ReadPosRankSum=-0.655;SC=GTGACCTTGAACTTCAATTTT;SOR=0.695;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=310;TCF=161;TCR=149;TR=136;WE=34918383;WS=34918365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:187,144:0.44:331
chr11	34937813	rs2956114	G	A	1835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.520;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=39;PP=1177;ReadPosRankSum=0.924;SC=TCTCCCTCCCGAGCATCACAG;SOR=0.651;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=178;TCF=103;TCR=75;TR=89;WE=34937821;WS=34937803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,94:0.48:197
chr11	34937884	rs2956113	G	A	1614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.566;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=41;PP=992;ReadPosRankSum=0.254;SC=CTTTGCGCGCGGCGCTTAGCC;SOR=0.784;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=156;TCF=75;TCR=81;TR=75;WE=34937892;WS=34937874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,81:0.47:171
chr11	34937901	rs2956112	A	G	1296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.628;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=35;PP=866;ReadPosRankSum=0.315;SC=AGCCTGGGATACGGCAGCGAG;SOR=0.769;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=131;TCF=57;TCR=74;TR=62;WE=34937909;WS=34937891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,65:0.46:141
chr11	34937931	rs2956111	G	A	1004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.629;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=27;PP=577;ReadPosRankSum=0.204;SC=GCAATCAGGCGGCGCTGAGGG;SOR=0.534;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=90;TCF=35;TCR=55;TR=45;WE=34937939;WS=34937921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,49:0.49:101
chr11	34938115	rs2956110	C	A	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=1.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.27;ReadPosRankSum=0.946;SOR=1.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr11	34938265	rs2956109	C	T	1038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.545;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=14;PP=562;ReadPosRankSum=-0.717;SC=TGGGCTTCCCCGGCCGCCGAA;SOR=0.903;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=101;TCF=65;TCR=36;TR=43;WE=34938273;WS=34938255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,50:0.44:113
chr11	34963224	rs2915190	C	T	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.710;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=226;ReadPosRankSum=0.971;SC=TTGTGAAAGCCTCAGGACTTA;SOR=1.262;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=14;WE=34963232;WS=34963214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr11	34963416	rs2986407	T	C	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=13;PP=284;ReadPosRankSum=-0.703;SC=GGCCCCCGGGTGGGCCTCTGC;SOR=0.662;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=73;TCF=38;TCR=35;TR=27;WE=34963424;WS=34963397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,34:0.39:88
chr11	34969271	rs3215780	A	AT	322.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=395;ReadPosRankSum=0.955;SC=TGTCTACTACATAATACATTT;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=10;WE=34969279;WS=34969261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr11	34999484	rs733567	G	T	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.771;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=34;ReadPosRankSum=0.432;SC=TAATATTATTGATCCAGGACC;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=4;WE=34999492;WS=34999474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr11	35198032	rs4756195	A	G	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.049;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=198;ReadPosRankSum=0.228;SC=GCCTTATTTGACTTTTTAAGG;SOR=1.244;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=11;WE=35198040;WS=35198022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr11	35208251	rs3736812	A	G	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=134;ReadPosRankSum=-0.137;SC=CCAACTTAGGAGTTTCGGAAA;SOR=0.297;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=8;WE=35208259;WS=35208242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr11	35223158	rs11033025	T	C	2737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=29;PP=1756;SC=AATGGAAGAATAGAATCATTA;SOR=1.496;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=63;TCR=29;TR=92;WE=35223166;WS=35223148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr11	35226083	rs11607491	C	T	3651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=352;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.742;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=71;PP=2170;ReadPosRankSum=0.648;SC=AGTAGTACAACGGAAGAAACA;SOR=0.796;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=322;TCF=178;TCR=144;TR=164;WE=35226091;WS=35226073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,178:0.51:351
chr11	35226155	rs9666607	A	G	8172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=125;NR=130;PP=2965;SC=CAAACACCCAAAGAAGACTCC;SOR=0.854;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=255;TCF=125;TCR=130;TR=255;WE=35226163;WS=35226145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,292:1.00:292
chr11	35229673	rs1467558	T	C	8728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=171;NR=129;PP=2965;SC=AGTCATAGTATAACGCTTCAG;SOR=0.958;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=301;TCF=171;TCR=130;TR=300;WE=35229681;WS=35229663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,329:1.00:329
chr11	35244044	rs7116739	G	C	5338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=48;NR=63;PP=2069;SC=CAGTCACCTCGCTAGAACTGA;SOR=1.170;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=48;TCR=63;TR=111;WE=35244066;WS=35244034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr11	35244058	rs7116432	A	G	4828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=60;PP=1736;SC=GAACTGACACATGGGCTGTTT;SOR=1.544;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=96;TCF=35;TCR=61;TR=94;WE=35244066;WS=35244034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr11	35244145	.	AAT	A	58.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.75;ReadPosRankSum=-1.036;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr11	35287000	.	G	GT	114	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5949;HP=13;HapScore=2;MGOF=32;MMLQ=17;MQ=60.63;NF=11;NR=0;PP=114;QD=10.8181818182;SC=GGGCTTTACGGTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=11;WE=35287008;WS=35286990;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr11	35302668	rs2236273	A	G	511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=11;PP=302;SC=CCCCCACCCCATACTCTCCAC;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=16;WE=35302676;WS=35302658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	35323200	rs2273689	A	G	2803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=65;PP=1815;SC=GACCTGTTGGATGAATCACAT;SOR=1.632;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=30;TCR=65;TR=95;WE=35323208;WS=35323190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr11	35327841	rs370271591	GA	G	143.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=9.662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.61;ReadPosRankSum=-0.150;SOR=0.568;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,18:0.20:89
chr11	35344345	rs7115450	A	G	1545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=31;PP=970;SC=AGAACCAGGAAGCAGAGATTT;SOR=1.302;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=19;TCR=31;TR=50;WE=35344353;WS=35344335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr11	35453796	rs11344760	GC	G	569.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=3;PP=507;SC=CCCTGGCACAGCCCAAGTTCA;SOR=2.712;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=35453804;WS=35453786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	35456453	rs675227	G	C	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.333;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=331;ReadPosRankSum=-0.191;SC=AAGGTGAACTGTATGGGCATG;SOR=1.402;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=38;TCF=9;TCR=29;TR=18;WE=35456461;WS=35456443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
chr11	35641312	rs3740799	G	A	1614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.631;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=30;PP=1021;ReadPosRankSum=-1.977;SC=GGCGCGTCCTGGAGCTGCACC;SOR=0.771;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=125;TCF=67;TCR=58;TR=68;WE=35641320;WS=35641302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,74:0.54:137
chr11	35706780	rs3740798	G	C	3412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=369;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.227;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=66;PP=2062;ReadPosRankSum=-0.227;SC=ATGCTGTCTAGTGACCCCTCA;SOR=0.623;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=333;TCF=185;TCR=148;TR=154;WE=35706788;WS=35706770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:198,171:0.46:369
chr11	35827958	rs61881297	A	G	1751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=36;PP=984;ReadPosRankSum=-2.779;SC=CCCAGTGGAAAATCATCCCCT;SOR=0.654;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=135;TCF=64;TCR=71;TR=70;WE=35827966;WS=35827948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,82:0.54:152
chr11	36031593	rs262404	G	A	937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=14;PP=569;ReadPosRankSum=0.382;SC=GGACTGAAGAGTATAACCTAC;SOR=0.691;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=89;TCF=56;TCR=33;TR=41;WE=36031601;WS=36031583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,45:0.47:95
chr11	36103381	rs3740962	A	G	2182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=50;PP=1583;SC=CCGCCAGCCAAACTTGTCCAC;SOR=2.271;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=18;TCR=50;TR=68;WE=36103389;WS=36103371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr11	36251046	rs4755444	G	A	1533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.635;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=38;PP=913;ReadPosRankSum=-0.832;SC=ACCTGTAAGGGTGTCTCAAGT;SOR=0.783;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=133;TCF=59;TCR=74;TR=68;WE=36251054;WS=36251036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,73:0.53:138
chr11	36293048	rs7107433	G	A	2953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=40;PP=1742;SC=AAAAGCCCCAGAGAGATGGTC;SOR=0.808;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=52;TCR=40;TR=92;WE=36293056;WS=36293038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr11	36298555	rs2289986	C	T	1220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=10;PP=843;SC=TTGGTTTCTGCCAAAATCTCT;SOR=2.200;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=43;WE=36298563;WS=36298545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr11	36298878	rs2289985	G	C	357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=299;SC=CCTAAGTGTTGTCAGTTTTCA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=36298886;WS=36298868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	36300211	rs12293902	G	A	746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=17;PP=469;SC=AGAAGCAGCAGGCAGGGGGCA;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=23;WE=36300219;WS=36300201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	36302410	rs368958974	GA	G	1263.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.337;NF=2;NR=34;PP=541;ReadPosRankSum=-1.584;SC=TCACAGATAGGAAAAAAAAAA;SOR=0.869;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=45;TCF=3;TCR=42;TR=36;WE=36302418;WS=36302400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,55:0.93:59
chr11	36422532	rs59943655	T	G	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.473;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=403;ReadPosRankSum=-0.744;SC=AATAAAAGCTTCCCTCTCTTT;SOR=2.461;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=18;WE=36422540;WS=36422522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr11	36422792	rs330261	G	A	4109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=67;NR=70;PP=2277;SC=ATTCCAAGCAGCTCGGCAGGC;SOR=0.889;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=137;TCF=67;TCR=70;TR=137;WE=36422800;WS=36422782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr11	36424729	rs7120381	G	A	746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=294;ReadPosRankSum=-3.159;SC=GATGGAGAGTGTGGCCAGGTT;SOR=0.829;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=58;TCF=39;TCR=19;TR=25;WE=36424737;WS=36424719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,35:0.52:67
chr11	36424967	rs12279091	A	G	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=353;ReadPosRankSum=1.106;SC=TTTCCCCTATAAACCTGAGCA;SOR=0.906;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=39;TCF=10;TCR=29;TR=21;WE=36424975;WS=36424957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,21:0.54:39
chr11	36424988	rs12292430	G	A	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=248;ReadPosRankSum=-0.719;SC=GGGGCATAGGGGCTACCGCCT;SOR=1.127;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=13;WE=36424996;WS=36424978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr11	36425013	.	G	GT	28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=16;HapScore=2;MGOF=15;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=28;QD=15.5;SC=AGCCTTAAGGGTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=2;WE=36425021;WS=36425003;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,2:0.50:4
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chr11	36453506	rs746761	T	C	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.995;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=427;ReadPosRankSum=0.096;SC=TGTGACTCAGTCTTTGATGTC;SOR=1.001;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=85;TCF=28;TCR=57;TR=29;WE=36453514;WS=36453496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,29:0.32:90
chr11	36459130	rs4756316	T	C	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.887;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=136;ReadPosRankSum=0.283;SC=AACTTGGAGATTGGGCGCTTG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=7;WE=36459138;WS=36459120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr11	36484208	rs514352	T	C	3118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=59;NR=48;PP=1407;SC=CCAACATCACTGACAACCCTG;SOR=0.725;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=59;TCR=49;TR=107;WE=36484216;WS=36484198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr11	36514290	rs2303439	T	C	585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=14;PP=388;SC=ACATTGGCAGTTGAATAGGTG;SOR=2.200;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=19;WE=36514298;WS=36514280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	36518824	rs3830511	T	TA	3851.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.815;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=56;PP=1870;ReadPosRankSum=0.307;SC=ATCCTATAATTAAAAAAATAA;SOR=0.826;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=79;TCF=9;TCR=70;TR=64;WE=36518832;WS=36518814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,129:0.99:130
chr11	36595600	rs3740955	A	G	2347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.097;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=50;PP=1417;ReadPosRankSum=0.331;SC=GCCCGTCAGCACAAGAGAAGA;SOR=0.756;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=215;TCF=112;TCR=103;TR=108;WE=36595608;WS=36595590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,119:0.48:247
chr11	36669778	rs1566245	C	T	1180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.852;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=36;PP=751;ReadPosRankSum=0.294;SC=AGAAATGCTGCATGCTTCTGT;SOR=1.150;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=108;TCF=36;TCR=72;TR=50;WE=36669786;WS=36669768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,54:0.43:125
chr11	42209105	rs11416548	G	GA	815.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=12;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=7;PP=412;ReadPosRankSum=0.283;SC=TACTGAAAGAGAAAAAAAAAA;SOR=0.800;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=63;TCF=46;TCR=17;TR=33;WE=42209124;WS=42209095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,40:0.73:55
chr11	42209292	rs901894	T	G	2160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.084;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=63;PP=1518;ReadPosRankSum=1.037;SC=GATAGCAAATTCTATTGTGTC;SOR=0.805;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=207;TCF=78;TCR=129;TR=97;WE=42209300;WS=42209282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,101:0.45:222
chr11	42262449	rs10837795	G	C	630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=0;PP=452;SC=CTTTATGAAGGAAAAAAACCT;SOR=3.816;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=42262457;WS=42262446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	43357020	rs5743252	A	G	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=21;PP=487;ReadPosRankSum=0.152;SC=AAATATGACTATTAGAAATAT;SOR=0.660;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=44;TCF=10;TCR=34;TR=27;WE=43357028;WS=43357010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,28:0.58:48
chr11	43357037	rs5743253	A	G	1131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=24;PP=687;SC=ATATGACTTAAAATGTAAAAT;SOR=3.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=27;WE=43357045;WS=43357027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	43413157	rs202071795	TTTGCG	T	487.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.60;QD=37.52;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	43472895	rs6485426	G	C	4098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=93;PP=2965;SC=CTAAGTGTCTGTAACCTCTTC;SOR=1.964;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=39;TCR=93;TR=132;WE=43472903;WS=43472885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr11	43702530	rs56168061	A	G	1034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=23;PP=652;SC=GGCTCGGAGAATGGGCAGGTG;SOR=1.802;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=10;TCR=23;TR=33;WE=43702538;WS=43702520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr11	43702615	rs4573668	G	C	140.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=2;PP=26;SC=TAGTTCTGGGGTCTGCTCCTG;SOR=1.329;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=4;WE=43702623;WS=43702605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr11	43775734	rs4643069	A	G	401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=11;PP=277;SC=CAGTTATCCGATACTGACATA;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=43775742;WS=43775724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	43776481	rs7115919	C	T	6505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=113;NR=108;PP=2965;SC=AACTTCTACTCAATCAACCAG;SOR=0.709;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=221;TCF=113;TCR=108;TR=221;WE=43776489;WS=43776471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr11	43861748	rs10734518	G	A	881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=19;PP=547;SC=CATTAAAAACGTGGTTTCTTT;SOR=1.681;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=10;TCR=19;TR=29;WE=43861756;WS=43861738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	43905484	rs2271817	T	G	3052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=37;PP=1842;SC=GTCAGTATCCTTGAGGATTAA;SOR=1.432;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=103;TCF=66;TCR=37;TR=103;WE=43905492;WS=43905474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr11	43908104	rs3740983	T	G	6925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=133;NR=84;PP=2965;SC=CCACTGGGTATAGCATATTGT;SOR=1.206;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=217;TCF=133;TCR=84;TR=217;WE=43908112;WS=43908094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr11	43911365	rs2434478	T	C	3208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=43;PP=1591;SC=AACAGAGGACTGGCATCAGAG;SOR=0.709;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=101;TCF=58;TCR=43;TR=101;WE=43911373;WS=43911355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr11	43940566	rs7926534	T	C	1027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=7;PP=823;SC=AAACATTTATTACAACAAATG;SOR=2.517;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=33;WE=43940574;WS=43940556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	43940644	rs1048928	G	T	3569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=41;PP=1872;SC=TGGATCATGGGACCTTGTTAA;SOR=1.033;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=73;TCR=41;TR=113;WE=43940652;WS=43940634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr11	43946967	rs1973717	A	G	3552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=49;NR=66;PP=2018;SC=GATCGTCTCCACGCTGCACCA;SOR=1.232;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=115;TCF=49;TCR=66;TR=115;WE=43946975;WS=43946954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr11	43947990	rs12797684	T	C	3291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=37;PP=2095;SC=CAGGCCACTTTCAAACTCTGT;SOR=1.336;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=73;TCR=37;TR=110;WE=43947998;WS=43947980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr11	43954812	rs2434476	T	C	1346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=32;PP=831;SC=TACTAGCTGGTGGATGTCCCT;SOR=1.480;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=18;TCR=32;TR=50;WE=43954820;WS=43954802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr11	43963843	rs12796438	C	A	868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.398;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=18;PP=431;ReadPosRankSum=1.158;SC=CCTGCGGCCCCGCGGCCAACC;SOR=0.499;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=62;TCR=45;TR=42;WE=43963851;WS=43963833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,46:0.39:118
chr11	43963923	rs12798163	T	C	703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=16;PP=330;ReadPosRankSum=-1.200;SC=AGGGTCCCTGTCCGGGCGCAG;SOR=0.675;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=76;TCF=36;TCR=40;TR=32;WE=43963931;WS=43963913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,37:0.43:86
chr11	43963945	rs12796667	C	T	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.096;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=13;PP=229;ReadPosRankSum=1.108;SC=TCGGGCCAGCCGCGTGCTCCG;SOR=0.451;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=60;TCF=25;TCR=35;TR=25;WE=43963953;WS=43963935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,28:0.42:67
chr11	43963967	rs12798337	T	C	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.131;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=9;PP=190;ReadPosRankSum=0.910;SC=GGCCGCGGCTTCTCCCGGAAC;SOR=0.283;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=45;TCF=19;TCR=26;TR=18;WE=43963975;WS=43963957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,21:0.41:51
chr11	43964246	rs182618474	C	T	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=159;ReadPosRankSum=-0.837;SC=GCCCCCCGAGCCCCGTGCCCC;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=10;WE=43964254;WS=43964236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr11	43964268	rs187843330	G	T	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.385;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=32;ReadPosRankSum=0.598;SC=CGACGGGTCCGCCCGCCCGCC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=43964276;WS=43964258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr11	43964569	rs2434483	C	T	1616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.477;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=28;PP=925;ReadPosRankSum=-1.022;SC=CGCCAAGCTGCCCAAGGGCCG;SOR=0.849;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=165;TCF=86;TCR=79;TR=70;WE=43964577;WS=43964559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,80:0.44:181
chr11	43964842	rs7077	G	C	1016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=0.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.07;ReadPosRankSum=-1.293;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,53:0.52:101
chr11	43964898	rs7524	C	T	1104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.505;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=20;PP=705;ReadPosRankSum=0.996;SC=CGAGAGTGCCCGCGCCCTGCT;SOR=0.994;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=56;TCR=39;TR=48;WE=43964906;WS=43964888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,51:0.48:107
chr11	44071743	rs80110507	T	C	1902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=56;PP=1038;ReadPosRankSum=0.244;SC=TCCTGAGCTATGGTAGATACA;SOR=0.735;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=178;TCF=64;TCR=114;TR=87;WE=44071751;WS=44071733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,95:0.49:193
chr11	44080210	rs2074051	T	C	770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.693;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=22;PP=397;ReadPosRankSum=-1.359;SC=AGGCTGGTTCTGCCTCATCTT;SOR=0.885;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=88;TCF=36;TCR=52;TR=36;WE=44080218;WS=44080200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,41:0.42:98
chr11	44089161	rs178514	G	A	1722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.187;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=25;PP=927;ReadPosRankSum=-0.624;SC=AGGCCTGTGCGTTTTGTCTTT;SOR=0.454;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=117;TCF=76;TCR=41;TR=65;WE=44089169;WS=44089151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,81:0.59:138
chr11	44096238	rs178521	G	A	826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.780;NF=18;NR=25;PP=641;ReadPosRankSum=-0.253;SC=GAATGTGAGTGGCCCCCTCCA;SOR=0.619;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=103;TCF=44;TCR=59;TR=43;WE=44096246;WS=44096228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,44:0.39:113
chr11	44096284	rs202091203	CTCTTTCTT	C,CTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTT	471.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.23;QD=33.70;SOR=2.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,10,4:0.71,0.29:14
chr11	44097226	rs178523	A	G	826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.921;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=21;PP=512;ReadPosRankSum=1.092;SC=AAGGGCTGCAATAGTATGCTT;SOR=0.454;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=75;TCF=28;TCR=47;TR=36;WE=44097234;WS=44097216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,40:0.49:82
chr11	44104701	rs79395013	C	CCT	3148.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.215;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=20;PP=1390;ReadPosRankSum=0.435;SC=GATCTTCTGGCCTCTTTCACC;SOR=0.561;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=90;TCF=33;TCR=57;TR=35;WE=44104709;WS=44104691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,85:0.50:170
chr11	44117898	rs11037860	T	G	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.07;ReadPosRankSum=-0.015;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,10:0.24:42
chr11	44146257	rs10769018	A	G	2771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=32;PP=1653;SC=ACTTACTGTCATAAGTTTAAT;SOR=1.544;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=65;TCR=32;TR=97;WE=44146265;WS=44146247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr11	44151457	rs7125352	T	C	4074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=42;PP=2962;SC=GGGAAAGAGATAATACTTACC;SOR=1.675;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=133;TCF=91;TCR=42;TR=132;WE=44151488;WS=44151447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr11	44151480	rs11037881	G	T	2293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-3.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.526;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=35;PP=1283;ReadPosRankSum=-1.054;SC=AAGGGATGTGGGGCTGAAGGA;SOR=0.637;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=189;TCF=119;TCR=70;TR=97;WE=44151488;WS=44151447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,108:0.52:209
chr11	44151577	rs11037882	T	A	3704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=370;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.554;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=82;PP=2082;ReadPosRankSum=0.358;SC=ATGTAAACTGTTTTGCTGTTG;SOR=0.758;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=331;TCF=168;TCR=163;TR=160;WE=44151585;WS=44151567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:187,181:0.49:368
chr11	44257708	rs151110171	GGT	G	170.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.43;MQRankSum=2.691;QD=3.48;ReadPosRankSum=-0.839;SOR=0.547;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,11:0.22:49
chr11	44258034	rs148995335	A	G	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.629;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=161;ReadPosRankSum=1.610;SC=GCTGGTAGCCATAGTCACCTC;SOR=1.880;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=10;WE=44258042;WS=44258024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr11	44289071	rs12419361	G	A	1775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=23;PP=1108;ReadPosRankSum=0.567;SC=CTCGGGTGAGGAGGGGCAGCT;SOR=0.732;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=95;TCR=46;TR=70;WE=44289079;WS=44289061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,78:0.52:151
chr11	44289289	rs10742699	A	G	2168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=61;PP=1736;SC=CGTTTGGGAAACGGTGCGGCC;SOR=4.743;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=5;TCR=61;TR=66;WE=44289297;WS=44289279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr11	44289312	rs10769024	C	G	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=455;ReadPosRankSum=0.641;SC=ACATAAATATCAACCTTGGTC;SOR=1.148;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=21;WE=44289320;WS=44289302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,22:0.59:37
chr11	44296828	rs11037927	C	T	979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.910;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=8;PP=476;ReadPosRankSum=0.917;SC=TCAGGAGACCCCAACTGCAGC;SOR=0.531;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=67;TCF=50;TCR=17;TR=35;WE=44296836;WS=44296818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,43:0.54:79
chr11	44296946	rs11037928	C	T	1799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=34;PP=1017;ReadPosRankSum=0.473;SC=GCTGTTCCCGCGCATACACGT;SOR=0.705;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=185;TCF=110;TCR=75;TR=83;WE=44296954;WS=44296936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,90:0.45:199
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chr11	44297343	rs11037930	C	A	545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=17;PP=493;SC=ATGCGAGGTCCGGAGACTTGG;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=44297351;WS=44297333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
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chr11	44331509	rs3824915	C	G	3839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.902;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=85;PP=2227;ReadPosRankSum=0.854;SC=GGGAAATGCCCTAAAAGGCGA;SOR=0.794;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=280;TCF=140;TCR=140;TR=168;WE=44331517;WS=44331499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,182:0.59:311
chr11	44585933	rs934178	T	C	1425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.065;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=22;PP=847;ReadPosRankSum=-0.297;SC=CTTACTCCACTCGTACAAAGC;SOR=0.989;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=129;TCF=78;TCR=51;TR=62;WE=44585941;WS=44585923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,69:0.50:139
chr11	44608866	rs7930303	T	C	1278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=5;PP=839;SC=GGAAAGAGGCTACATGAGCCT;SOR=2.356;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=37;WE=44608874;WS=44608856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr11	44609129	rs7118753	T	A	837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.914;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=23;PP=532;ReadPosRankSum=-1.028;SC=CTGAGAGGAGTGGTGGGTTGG;SOR=0.848;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=69;TCF=27;TCR=42;TR=37;WE=44609137;WS=44609119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,39:0.54:72
chr11	44609198	rs7102843	G	A	456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=14;PP=374;SC=GCCCTCAGGTGTTCAGTCTGA;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=44609206;WS=44609188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	44626461	rs4755851	C	G	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.351;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=271;ReadPosRankSum=1.062;SC=ACCTGGTTCCCTGTTGGGCAG;SOR=1.528;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=33;TCF=30;TCR=3;TR=17;WE=44626469;WS=44626451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr11	44626480	rs116871136	C	A	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=5;PP=493;ReadPosRankSum=-1.908;SC=AGTGAGAAGCCAGCAGGGGAA;SOR=0.507;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=45;TCF=38;TCR=7;TR=28;WE=44626488;WS=44626470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,30:0.64:47
chr11	44627168	rs11604994	G	A	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=36;ReadPosRankSum=0.180;SC=CGGCAGGTGTGGGCAGTCCCC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=3;WE=44627176;WS=44627158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr11	44636684	rs12788360	G	T	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=336;ReadPosRankSum=-0.876;SC=CCCTGGGAGCGCCAGGAAAGT;SOR=0.892;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=20;WE=44636692;WS=44636674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,21:0.68:31
chr11	44636833	rs2303865	G	A	1330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.878;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=26;PP=1646;ReadPosRankSum=-0.684;SC=TGAAGCAGGAGATGGGCGGCA;SOR=0.765;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=157;TCF=86;TCR=71;TR=60;WE=44636847;WS=44636823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,70:0.38:183
chr11	44636839	rs883752	C	T	2357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.649;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=44;PP=2962;ReadPosRankSum=0.716;SC=AGGAGATGGGCGGCATCGTGA;SOR=0.649;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=155;TCF=85;TCR=70;TR=94;WE=44636847;WS=44636823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,110:0.61:181
chr11	44639921	rs2303863	C	T	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.258;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=231;ReadPosRankSum=-1.986;SC=AGGAGGTGTGCGGGGGGCTGC;SOR=0.278;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=15;WE=44639929;WS=44639911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr11	44640268	rs1139971	A	G	3872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=69;PP=2238;SC=TGTGGCCATCATCGAGGTCTG;SOR=0.790;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=136;TCF=67;TCR=69;TR=136;WE=44640276;WS=44640258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr11	44925359	rs11456363	C	CT	7499.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=76;PP=2936;SC=GCTGGATTGCCTGGGTTCCAA;SOR=0.713;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=104;TCF=24;TCR=80;TR=100;WE=44925367;WS=44925349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr11	44948052	rs835988	G	T	414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=2;PP=291;SC=CTGCCAAGTCGCTGTTTCTGG;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=44948060;WS=44948043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	44950784	rs835990	G	A	1048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=28;PP=727;SC=CCAGCACCCAGTGTCCTCCCG;SOR=2.554;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=36;WE=44950792;WS=44950774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr11	44959083	rs12792390	C	G	2496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=43;PP=1580;SC=TCCCCTCCCCCAAAAAGTCAG;SOR=0.758;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=44;TCR=43;TR=87;WE=44959091;WS=44959073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr11	44968756	rs4755920	G	A	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=101;ReadPosRankSum=-0.247;SC=CTGTCTCGACGGTCATTCACA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=6;WE=44968764;WS=44968746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr11	45203848	rs1078931	G	A	2412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.762;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=55;PP=1511;ReadPosRankSum=-1.329;SC=AGAAACTGAAGGGGAAGCGCG;SOR=0.724;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=235;TCF=123;TCR=112;TR=110;WE=45203856;WS=45203838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,118:0.46:254
chr11	45204071	rs1078930	A	G	548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=14;PP=381;SC=GGCTATTGTTAGCCCCATTTT;SOR=2.419;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=19;WE=45204079;WS=45204061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	45230443	rs12226640	T	C	3192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.863;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=61;PP=1783;ReadPosRankSum=2.431;SC=CACACCTGGCTGAGCGTAAGA;SOR=0.641;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=274;TCF=155;TCR=119;TR=141;WE=45230451;WS=45230433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,154:0.50:306
chr11	45230862	rs3781705	C	A	2395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.815;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=53;PP=1225;ReadPosRankSum=3.719;SC=TATCACCAGTCCCCCCCGCCA;SOR=0.462;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=166;TCF=76;TCR=90;TR=97;WE=45230870;WS=45230851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,112:0.65:173
chr11	45233984	rs74816811	G	A	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=258;ReadPosRankSum=0.339;SC=TCTCCCTTTTGTAACCACTTT;SOR=0.846;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=33;TCF=23;TCR=10;TR=18;WE=45233992;WS=45233974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,20:0.53:38
chr11	45234877	rs11038356	T	C	6736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=112;NR=121;PP=2965;SC=TGTCCCGTGGTGGCAGGCCTT;SOR=0.880;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=234;TCF=112;TCR=122;TR=233;WE=45234885;WS=45234867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr11	45235433	rs3781704	G	C	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.350;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=119;ReadPosRankSum=-1.000;SC=GGGAAGAGGAGGCAGGGGGCA;SOR=1.802;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=9;WE=45235441;WS=45235423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr11	45672261	rs3802762	A	G	5820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=100;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.975;SC=AGGAGGAGCCACTGCGCGTGG;SOR=0.829;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=197;TCF=95;TCR=102;TR=194;WE=45672269;WS=45672251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,218:0.99:220
chr11	45832935	rs1139266	G	A	324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=9;PP=231;SC=GTACACAGGCGGGGCCAGCAC;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=45832943;WS=45832925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	45834044	rs4756027	C	T	2656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=20;PP=1679;SC=GGCTGGGACGCCCAAGATCAA;SOR=2.229;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=63;TCR=20;TR=83;WE=45834052;WS=45834034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr11	45834198	rs7943306	T	C	9852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.19;SOR=1.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr11	45834198	.	TTCC	CTCC,CTCT	1635	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=112,44;NR=150,68;PP=1635,1528;QD=6.37317256697;SC=TTCATGAGGGTTCCGCCCCCA;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=262;TCF=112;TCR=150;TR=262,112;WE=45834209;WS=45834188;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:262
chr11	45834201	rs55758172	C	T	2863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FS=4.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.65;ReadPosRankSum=1.518;SOR=0.955;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:136,133:0.49:269
chr11	45868850	rs11394694	C	CG	6427.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=20;NR=65;PP=2970;SC=CGTGAGGGGGCGGGCCTGTTC;SOR=0.780;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=88;TCF=20;TCR=68;TR=85;WE=45868858;WS=45868840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr11	45877529	rs2292913	A	G	5795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=116;NR=85;PP=2965;SC=TGTGGACTCCACAGGTTCCTA;SOR=0.848;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=203;TCF=117;TCR=86;TR=201;WE=45877537;WS=45877519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr11	45877688	rs2292912	C	G	1031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=27;PP=734;SC=CTGTCCCTGACGGTTTCCCCA;SOR=2.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=34;WE=45877696;WS=45877678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr11	45883914	rs4755343	T	C	512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=12;PP=359;SC=CTCAGCATTTTTGGGTTAAGC;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=45883922;WS=45883904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	45891418	rs7123390	G	A	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=118;ReadPosRankSum=0.316;SC=GGTCAGGCCCGTCAAAGGGCA;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=8;WE=45891426;WS=45891408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr11	45891508	rs4755345	A	G	357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=2;PP=254;SC=CTTGCCTTCAATGGAAGGGTT;SOR=1.981;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=45891516;WS=45891498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	45907367	rs111751468	C	G	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=178;ReadPosRankSum=0.512;SC=GGGCTGTGCCCGAGAATGGCG;SOR=0.836;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=35;TCR=15;TR=16;WE=45907375;WS=45907357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,18:0.31:58
chr11	45926445	rs2271847	T	C	7361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=121;NR=137;PP=2965;SC=CCAAGACTTGTGATGAAGAGG;SOR=0.859;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=258;TCF=121;TCR=137;TR=258;WE=45926453;WS=45926435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,284:1.00:284
chr11	45932246	rs1533613	G	A	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.827;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=154;ReadPosRankSum=-0.170;SC=CCCCCCACCAGTGGACACCCT;SOR=1.828;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=7;WE=45932254;WS=45932236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr11	45935253	rs2271845	C	T	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=265;ReadPosRankSum=-0.601;SC=CCGGACAACACACAGTGCTTG;SOR=0.760;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=16;WE=45935261;WS=45935243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr11	45935384	rs1132349	A	G	8233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=162;NR=133;PP=2965;SC=AGAAGCGGTCATAGAAAGGAG;SOR=0.861;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=295;TCF=162;TCR=133;TR=295;WE=45935392;WS=45935374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,319:1.00:319
chr11	45936035	rs3802758	G	A	3631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=51;PP=2358;SC=ACACAAGGGCGGCAGATGAGC;SOR=0.929;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=70;TCR=51;TR=121;WE=45936043;WS=45936025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr11	45937267	rs10742772	C	T	11068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=423;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=198;NR=184;PP=2965;SC=GCCAGCTGGACGAGGGCGATG;SOR=0.727;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=383;TCF=198;TCR=185;TR=382;WE=45937277;WS=45937257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,423:1.00:423
chr11	45937306	rs11553094	C	T	4545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=453;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.519;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=107;PP=2626;ReadPosRankSum=-0.616;SC=TCACCCCACACCTTGGCAGCT;SOR=0.759;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=418;TCF=203;TCR=215;TR=203;WE=45937314;WS=45937296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:229,224:0.49:453
chr11	45937968	rs3215273	CTA	C	316.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.660;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=217;ReadPosRankSum=-2.752;SC=CACCCACAGACTATGTGGAAA;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=5;WE=45937977;WS=45937958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr11	45944985	rs113938769	A	G	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=283;ReadPosRankSum=0.802;SC=CGCCTAGCGGAGAAGGGGGGC;SOR=0.713;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=41;TCF=35;TCR=6;TR=17;WE=45945002;WS=45944975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,19:0.40:48
chr11	45944994	rs33927614	G	GC	2017.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=8;PP=1701;SC=GAGAAGGGGGGCTGCTGCCGA;SOR=2.437;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=38;TCF=30;TCR=8;TR=37;WE=45945002;WS=45944975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr11	45945969	rs72902492	C	T	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.181;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=194;ReadPosRankSum=-0.933;SC=GGGGGTTTACCCCCTCTCCTC;SOR=2.424;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=11;WE=45945977;WS=45945959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr11	45949201	rs884668	C	T	2051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.230;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=51;PP=1350;ReadPosRankSum=-1.327;SC=ACGGGGCATGCGTGGGACCCC;SOR=1.235;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=164;TCF=77;TCR=87;TR=86;WE=45949209;WS=45949191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,93:0.53:175
chr11	45949534	rs939105	C	T	5219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=67;PP=2965;SC=TGCCGGCATTCGAGACCCTGC;SOR=1.042;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=166;TCF=99;TCR=67;TR=166;WE=45949542;WS=45949524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
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chr11	45959669	rs10742773	C	T	1610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=6;PP=1138;SC=GTGTCTTTGTCCTCCTCGGCC;SOR=3.486;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=46;TCF=40;TCR=6;TR=45;WE=45959677;WS=45959659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr11	46105688	rs2932515	G	A	4972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=105;NR=61;PP=2965;SC=CTTAACAACAGTGTGGGAGAA;SOR=1.283;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=166;TCF=105;TCR=61;TR=166;WE=46105696;WS=46105678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr11	46334239	rs2288249	G	A	2669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.963;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=71;PP=1764;ReadPosRankSum=2.688;SC=GCTTGGGAGGGGTGGGCAATC;SOR=0.787;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=247;TCF=99;TCR=148;TR=118;WE=46334247;WS=46334229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,126:0.48:265
chr11	46339011	rs35652107	G	A	1616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.579;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=38;PP=882;ReadPosRankSum=0.196;SC=CCCCCTGGCCGCAGACGGCGT;SOR=0.623;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=141;TCF=67;TCR=74;TR=70;WE=46339019;WS=46339001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,80:0.48:166
chr11	46342081	rs67946579	TG	T	2194.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=42;PP=1622;SC=CCACGACAGGTGGGGTGTGTG;SOR=1.793;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=45;TCF=1;TCR=44;TR=43;WE=46342089;WS=46342071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr11	46342259	rs79068197	A	AG	6700.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=54;PP=2936;SC=TTCTCTCTCCAGGATCTGGGC;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=38;TCR=58;TR=89;WE=46342267;WS=46342249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr11	46369238	rs76656670	C	A	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.545;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.276;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-1.121;NF=3;NR=3;PP=53;ReadPosRankSum=0.349;SC=AGCCCCGAGGCCCGGAGCAGC;SOR=0.223;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=6;WE=46369246;WS=46369228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr11	46369267	rs114974750	G	A	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.003;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.598;NF=3;NR=4;PP=42;ReadPosRankSum=1.265;SC=GTCGGCTTCCGCCTCGTCCAG;SOR=0.669;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=16;TCF=10;TCR=6;TR=7;WE=46369275;WS=46369257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr11	46387868	rs1317826	A	G	763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=16;PP=421;ReadPosRankSum=-1.297;SC=GAGGGGCAGCAGCGGCCCAGC;SOR=0.650;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=72;TCF=37;TCR=35;TR=34;WE=46387876;WS=46387858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,40:0.48:83
chr11	46391602	rs12575519	T	G	1232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.529;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=40;PP=857;ReadPosRankSum=-1.529;SC=GCACCTGCGGTCCTGAGCCCA;SOR=1.067;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=178;TCF=76;TCR=102;TR=63;WE=46391610;WS=46391592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,66:0.34:192
chr11	46392825	rs10838601	C	G	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.742;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=7;PP=243;ReadPosRankSum=-0.830;SC=TGCTGCTCCACGCCTGCCCTG;SOR=0.098;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=18;WE=46392833;WS=46392815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr11	46393958	rs7936413	T	C	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=10;PP=324;ReadPosRankSum=-0.234;SC=GACTGTCTCTTGGCTCCCCAT;SOR=0.806;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=37;TCR=24;TR=25;WE=46393966;WS=46393948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,27:0.40:67
chr11	46396479	rs2046768	T	C	1864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.94;MQRankSum=1.410;NF=44;NR=36;PP=1078;ReadPosRankSum=-0.013;SC=CGCCCGCCTTTGCAGGTACTG;SOR=0.695;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=154;TCF=84;TCR=70;TR=80;WE=46396487;WS=46396469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,87:0.49:176
chr11	46397323	rs3740974	A	C	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=176;ReadPosRankSum=1.095;SC=TCTCTCGGCAAGTGGTTTGGT;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=14;WE=46397331;WS=46397313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr11	46398916	rs34406563	T	C	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.536;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=200;ReadPosRankSum=-0.843;SC=TTCAGCCCTGTGGTTCTGTGG;SOR=0.270;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=41;TCF=7;TCR=34;TR=17;WE=46398924;WS=46398906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,19:0.43:44
chr11	46399538	rs2279465	T	C	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.798;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=290;ReadPosRankSum=-0.242;SC=GACTTGTTTGTATCCCTGAAC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=13;WE=46399546;WS=46399528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr11	46406767	rs2067482	G	A	4418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=382;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.215;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=107;NR=78;PP=2698;ReadPosRankSum=0.863;SC=CAGGGTTGATGGTGCTGTTGA;SOR=0.630;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=348;TCF=202;TCR=146;TR=185;WE=46406775;WS=46406757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,207:0.54:381
chr11	46515902	rs3802888	A	G	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.605;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=84;ReadPosRankSum=1.890;SC=CTAATTAGGCAGCACATTAAT;SOR=0.086;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=7;WE=46515910;WS=46515892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr11	46534546	rs3802890	A	G	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=207;ReadPosRankSum=0.425;SC=AAGAGCTGCAAAACTCCCACA;SOR=0.793;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=10;WE=46534554;WS=46534536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr11	46567475	rs61882746	C	T	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.812;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=81;ReadPosRankSum=0.812;SC=AGAAGATCAGCGATCTGGTAG;SOR=0.446;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=6;WE=46567483;WS=46567465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr11	46569434	.	CAAAA	C	141.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.074;ClippingRankSum=0.000;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=1.945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.94;ReadPosRankSum=2.519;SOR=0.293;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,8:0.22:36
chr11	46678462	rs150786219	C	CACACAT	511.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=585;ReadPosRankSum=-0.494;SC=TATATATACACACACATACAC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=16;WE=46678470;WS=46678452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr11	46678478	.	TAC	T	112	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=9;NR=1;PP=112;QD=11.8;SC=TACACGCACATACACACACAC;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=36;TCF=22;TCR=14;TR=10;WE=46678487;WS=46678468;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:26,10:0.28:36
chr11	46686260	rs10838610	G	A	906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.049;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=11;PP=553;ReadPosRankSum=-2.105;SC=CCCCTATCACGTCAGGCCCCC;SOR=0.104;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=65;TCF=52;TCR=13;TR=38;WE=46686268;WS=46686250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,41:0.60:68
chr11	46694313	rs67065551	GTC	G	6226.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=60;PP=2957;SC=TTGGTGTGGAGTCGCAGAAAG;SOR=0.796;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=11;TCR=60;TR=71;WE=46694327;WS=46694303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr11	46702691	rs4319473	G	A	1998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=40;PP=1039;ReadPosRankSum=0.254;SC=TGGGTTGTGGGGGCCCGCTTC;SOR=0.729;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=177;TCF=85;TCR=92;TR=79;WE=46702699;WS=46702681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,95:0.47:203
chr11	46702920	rs4268467	T	C	5297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=93;NR=90;PP=2965;SC=CCTTGATGTTTTTCTTGTACC;SOR=0.744;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=184;TCF=93;TCR=91;TR=183;WE=46702928;WS=46702910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr11	46722731	rs4752928	T	C	3288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=61;PP=1949;SC=TCCTCAGTCTTCTCTCCTCCG;SOR=0.976;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=113;TCF=52;TCR=61;TR=113;WE=46722739;WS=46722721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr11	46742426	rs3136435	G	A	1321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.684;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=32;PP=765;ReadPosRankSum=-1.717;SC=AGCAGGACATGGAGGGGAGCC;SOR=0.777;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=115;TCF=45;TCR=70;TR=54;WE=46742434;WS=46742416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,61:0.48:127
chr11	46744925	rs2070852	G	C	4599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=468;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.521;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=99;NR=105;PP=2955;ReadPosRankSum=0.736;SC=GCAATTTCCTGTTCCAGAATC;SOR=0.748;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=425;TCF=211;TCR=214;TR=204;WE=46744933;WS=46744915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:239,227:0.49:466
chr11	46750819	rs3136474	T	C	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=121;ReadPosRankSum=0.547;SC=CGTGAACGTCTGTGCCCAGCC;SOR=0.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=7;WE=46750827;WS=46750809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr11	46760466	rs3136515	G	T	280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=2;PP=215;SC=GGATTGGATGGGTAGGGTGAG;SOR=2.303;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=46760474;WS=46760456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	46760756	rs3136516	G	A	1763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=2.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.611;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=30;PP=1002;ReadPosRankSum=0.223;SC=TGCCTGGCAGGGGAATACTGA;SOR=0.662;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=121;TCF=63;TCR=58;TR=68;WE=46760764;WS=46760746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,81:0.55:147
chr11	46776697	rs4237546	A	G	65.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=2;PP=44;SC=AAACTTCTCCATAAGAATATT;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=46776705;WS=46776687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr11	46783435	rs61884328	T	C	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=2.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=143;ReadPosRankSum=1.409;SC=ATAGGTTGAGTTGACTAAAAA;SOR=0.765;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=9;WE=46783443;WS=46783425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr11	46802094	rs6485691	C	A	891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=25;PP=704;SC=TACTCAATAACGTTTTATAAA;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=27;WE=46802102;WS=46802084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	46812227	rs7940578	T	C	773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=6;NR=17;PP=498;SC=GTGTCTCATATTGTTGTCGAG;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=23;WE=46812235;WS=46812217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	46822686	rs10734549	C	A	1958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=11;PP=1267;SC=AAGCAAACAGCAAACTAGGCC;SOR=2.338;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=61;TCF=50;TCR=11;TR=60;WE=46822694;WS=46822676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr11	46837625	rs59649961	AC	A	955.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.54;QD=47.79;SOR=3.716;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	46837631	.	CCA	C	424	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;FR=1.0000;HP=6;HapScore=3;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.4;NF=15;NR=3;PP=424;QD=24.9444444444;SC=AACGACCCCCCCATTCCCCCC;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=46837642;WS=46837621;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	46837633	rs58152993	AT	A	992.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.45;QD=41.36;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	46837634	.	T	A	414	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;FR=1.0000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.36;NF=16;NR=2;PP=414;QD=24.9317340304;SC=GACCCCCCCATTCCCCCCAAC;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=18;WE=46837642;WS=46837621;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,18:0.86:21
chr11	46840119	rs67178247	TG	T	475.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=249;ReadPosRankSum=0.827;SC=ACTATTAATCTGGGGGGGGAG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=1;TCR=38;TR=16;WE=46840127;WS=46840109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,21:0.49:43
chr11	46889607	rs111426027	C	T	1543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.648;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=36;PP=895;ReadPosRankSum=0.779;SC=TGTTGGGTAGCACTGGGCTCT;SOR=0.774;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=119;TCF=59;TCR=60;TR=69;WE=46889615;WS=46889597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,74:0.56:132
chr11	46889713	rs2306026	T	C	1039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=23;PP=738;SC=CATAAACATCTACATATGGCC;SOR=2.115;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=9;TCR=23;TR=32;WE=46889721;WS=46889703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr11	46890165	rs3816614	C	T	3950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=45;PP=2554;SC=GGAGCAGGGCCGGCTATCAGG;SOR=1.373;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=87;TCR=45;TR=132;WE=46890173;WS=46890155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr11	46890388	rs2290884	C	G	3219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=76;PP=2326;SC=AGGAGAGATACAACCGCGAGG;SOR=2.371;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=99;TCF=23;TCR=76;TR=99;WE=46890396;WS=46890378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr11	46893108	rs2306029	T	C	2039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=43;PP=1123;ReadPosRankSum=-1.617;SC=GACACATGGCTGACCAAGACC;SOR=0.692;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=175;TCF=93;TCR=82;TR=90;WE=46893116;WS=46893098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,100:0.51:196
chr11	46897253	rs2306032	G	C	2801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.047;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=65;PP=1421;ReadPosRankSum=0.034;SC=AGGAGAGGGTGGGGGGTGGTG;SOR=0.844;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=238;TCF=113;TCR=125;TR=119;WE=46897261;WS=46897243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,137:0.51:270
chr11	46897995	rs964551	G	T	3052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=33;PP=1846;SC=ACACTACCCAGTGCGATACAG;SOR=1.547;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=70;TCR=33;TR=103;WE=46898003;WS=46897985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr11	46898771	rs6485702	T	C	918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.20;ReadPosRankSum=1.437;SOR=0.626;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,50:0.45:112
chr11	46907827	rs2306027	C	T	3124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=60;PP=2093;SC=GAAGCCCTTCCCTGGAGAGGG;SOR=1.287;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=39;TCR=60;TR=99;WE=46907835;WS=46907817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr11	46911457	rs2306035	T	C	1538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=38;NR=13;PP=889;SC=ACCTCAACCATGAGGCTACTT;SOR=1.823;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=52;TCF=39;TCR=13;TR=51;WE=46911465;WS=46911447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr11	46911704	rs2306036	C	T	926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=18;PP=698;SC=TCAGTCTGGACGTGGTCTGCC;SOR=1.112;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=14;TCR=18;TR=32;WE=46911712;WS=46911694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	46914583	rs10838631	T	C	4840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=60;NR=33;PP=1621;SC=ACAGCAACACTTTCCGGTGGG;SOR=1.232;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=60;TCR=33;TR=93;WE=46914591;WS=46914573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr11	46914598	rs10769215	A	G	5188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=68;NR=38;PP=1672;SC=GGTGGGCCCCATCCAGATTGG;SOR=1.225;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=68;TCR=38;TR=106;WE=46914606;WS=46914588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr11	46917983	rs898604	G	A	3865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=56;NR=80;PP=2467;SC=AGACAGATGAGACTCAAGGTG;SOR=1.195;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=56;TCR=80;TR=136;WE=46917991;WS=46917973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr11	46969616	rs2867207	T	C	5081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=70;PP=2701;SC=GTAAGATATATGAAAGGCCAC;SOR=1.092;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=176;TCF=106;TCR=70;TR=176;WE=46969624;WS=46969606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr11	47009041	.	G	GT	196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=5;PP=194;SC=GGTGCAGCTAGTTTGTCCAGT;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=47009049;WS=47009031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr11	47188314	rs4752820	T	C	3646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=44;PP=2208;SC=CACTTACCTCTGCATCCACCT;SOR=1.249;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=80;TCR=44;TR=124;WE=47188322;WS=47188304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr11	47188592	rs3740690	T	C	945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=27;PP=607;SC=TCTCCCCTGGTGAGGAGTCAC;SOR=2.432;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=35;WE=47188600;WS=47188582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr11	47204175	rs2279438	A	T	3378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=67;NR=46;PP=1910;SC=GGGCTGTCAGATGGGCTCCTC;SOR=0.895;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=67;TCR=46;TR=113;WE=47204183;WS=47204165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr11	47237680	rs2291120	T	C	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=122;ReadPosRankSum=0.350;SC=ACTTACTGTTTGTGGGAGTGT;SOR=0.941;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=9;WE=47237688;WS=47237673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr11	47238522	rs326212	T	C	5067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=90;PP=2892;SC=ACCCCAGCACTGTGGCTGTGG;SOR=0.885;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=173;TCF=83;TCR=90;TR=173;WE=47238530;WS=47238512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr11	47238665	rs326211	A	G	543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=16;PP=423;SC=AGTGGTTCGCACCTGTAATCC;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=47238673;WS=47238655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	47251199	rs830085	G	A	1480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=24;PP=885;SC=AGAGAAACTCGAATCAACTCT;SOR=0.800;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=29;TCR=24;TR=53;WE=47251207;WS=47251189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr11	47259668	rs326222	T	C	8658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=132;NR=155;PP=2965;SC=TCTCCTCATGTTGACACTCTT;SOR=0.868;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=287;TCF=132;TCR=155;TR=287;WE=47259676;WS=47259658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,320:1.00:320
chr11	47267408	rs71949967	CGT	C	112.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.22;ReadPosRankSum=1.451;SOR=0.909;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,10:0.29:35
chr11	47298201	rs2291119	C	T	3547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=33;PP=2290;SC=GAAGTGGAAACCAAGTTGTAA;SOR=1.863;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=83;TCR=33;TR=116;WE=47298209;WS=47298191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr11	47298360	rs326214	G	A	8192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=116;NR=164;PP=2965;SC=ACCCACTGGAGTATATGTTTC;SOR=1.160;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=280;TCF=116;TCR=164;TR=280;WE=47298368;WS=47298350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,308:1.00:308
chr11	47303275	rs326217	T	C	4430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.06;SOR=0.741;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr11	47307332	rs148495681	G	GTCATTA	219.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=331;SC=GGACAGATTAGTCATTATGCC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=6;WE=47307340;WS=47307322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr11	47331116	rs1017594	T	C	4033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=70;PP=2510;SC=AGATCGCTTGTTGGCCACACT;SOR=1.027;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=129;TCF=59;TCR=70;TR=129;WE=47331124;WS=47331106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr11	47350534	.	TC	T	2035.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.822;ClippingRankSum=0.000;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.657;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=25;PP=1293;ReadPosRankSum=1.551;SC=CATTGGCAGATCCTTCACATA;SOR=0.601;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=81;TCF=35;TCR=46;TR=38;WE=47350542;WS=47350524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,66:0.50:131
chr11	47361084	rs2856653	T	C	677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=9;PP=466;SC=GTCTCTCCCATGGGGTAGCCA;SOR=0.859;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=12;TCR=9;TR=21;WE=47361092;WS=47361074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	47362431	rs2697926	A	G	1325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=9;PP=1016;ReadPosRankSum=0.957;SC=GGCAAAGCTGAAGCTGGGCCC;SOR=1.445;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=42;WE=47362439;WS=47362421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,44:0.98:45
chr11	47364762	rs896818	A	G	6078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=104;PP=2965;SC=AGTGCGCCCCATGATAATCCC;SOR=0.786;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=204;TCF=100;TCR=104;TR=204;WE=47364770;WS=47364752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr11	47365199	rs2856650	G	A	2090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=26;NR=43;PP=1118;SC=CTCAGCCCCGGCCACCCCACC;SOR=1.468;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=26;TCR=43;TR=69;WE=47365207;WS=47365189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr11	47369600	rs138461443	CTTCCCAGCCT	C	964.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.033;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.553;NF=1;NR=12;PP=2973;ReadPosRankSum=-0.257;SC=AGGATCTCACCTTCCCAGCCT;SOR=0.504;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=13;WE=47369617;WS=47369590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,27:0.47:58
chr11	47371484	rs11570050	AG	A	4408.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=65;PP=2858;SC=CTGCAAAGGCAGGGGCGACAG;SOR=1.214;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=80;TCF=8;TCR=72;TR=72;WE=47371492;WS=47371474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr11	47380061	rs10734557	A	C	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.523;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=297;ReadPosRankSum=-0.263;SC=ACACCCACTCACACAGCCACT;SOR=0.350;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=37;TCF=28;TCR=9;TR=20;WE=47380069;WS=47380051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,22:0.56:39
chr11	47380340	rs3740688	G	T	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.435;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=15;PP=415;ReadPosRankSum=0.922;SC=CTGGGTGGGGGCAGGGCACAG;SOR=0.354;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=73;TCF=33;TCR=40;TR=30;WE=47380348;WS=47380330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,31:0.39:79
chr11	47380593	rs3740689	G	A	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=11;PP=296;ReadPosRankSum=1.148;SC=AGTCAGGAAGGGCCAGCTTAC;SOR=0.605;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=44;TCF=21;TCR=23;TR=22;WE=47380601;WS=47380583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,25:0.53:47
chr11	47380688	rs35284836	GGAA	G	682.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=7;PP=307;SC=GGAGACTGGAGGAAGAAGACC;SOR=1.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=47380698;WS=47380678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	47397353	rs56030824	G	A	752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.959;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=26;PP=514;ReadPosRankSum=1.344;SC=ACCCCCGCACGCTGGGTCCCC;SOR=0.825;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=80;TCF=19;TCR=61;TR=34;WE=47397361;WS=47397343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,36:0.43:84
chr11	47431703	rs61897432	A	G	879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=13;PP=493;ReadPosRankSum=2.380;SC=CCTCTTCCTCACTGCCCTTGC;SOR=0.763;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=111;TCF=75;TCR=36;TR=43;WE=47431711;WS=47431693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,49:0.40:123
chr11	47431728	rs2010519	A	G	4711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=58;PP=2932;SC=GAGCTCTTGGAAAGGGCTGGG;SOR=1.093;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=94;TCR=58;TR=152;WE=47431736;WS=47431718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr11	47431966	rs755555	C	T	1880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.603;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=49;PP=1162;ReadPosRankSum=0.034;SC=TCTCCGGTGGCGCCCAGGGCT;SOR=0.471;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=161;TCF=62;TCR=99;TR=84;WE=47431974;WS=47431956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,90:0.52:173
chr11	47432034	rs755554	G	C	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.486;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=391;ReadPosRankSum=-0.194;SC=GTCACAGAGTGTCTGAGATGG;SOR=0.418;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=46;TCF=8;TCR=38;TR=20;WE=47432042;WS=47432024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,21:0.43:49
chr11	47436531	rs11039228	G	T	2437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=29;PP=1467;SC=TGTGGCTACCGCACTGCTGGT;SOR=0.911;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=49;TCR=29;TR=78;WE=47436539;WS=47436521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr11	47446292	rs55927797	A	T	782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.967;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=21;PP=497;ReadPosRankSum=0.188;SC=CAGCTCCTTGAACTCCCCAAG;SOR=0.551;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=22;TCR=39;TR=33;WE=47446300;WS=47446282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,36:0.54:67
chr11	47447955	rs7948705	C	G	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.702;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=63;ReadPosRankSum=1.268;SC=ACTCTTGACCCGACCAGCTCC;SOR=0.141;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=7;WE=47447963;WS=47447945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr11	47459469	rs45617144	G	A	1168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=20;PP=633;ReadPosRankSum=-0.875;SC=GGCCTCTGGCGTGCAGTGGAG;SOR=0.711;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=123;TCF=73;TCR=50;TR=48;WE=47459477;WS=47459459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,59:0.42:142
chr11	47460098	rs10769267	C	T	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=92;ReadPosRankSum=1.106;SC=GATCTTGAACCCCGGGGCTCA;SOR=0.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=7;WE=47460106;WS=47460088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr11	47460306	rs7126210	A	G	1320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.666;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=26;PP=819;ReadPosRankSum=1.638;SC=TGTGGGAGCAAGGTAGGGCCT;SOR=0.624;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=107;TCF=63;TCR=44;TR=60;WE=47460314;WS=47460296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,63:0.52:122
chr11	47462837	rs10716680	AG	A	847.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=511;SC=AGCACAGGGTAGGGGGGGCAG;SOR=3.841;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=19;WE=47462845;WS=47462827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr11	47463220	rs45603036	C	T	2825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=66;PP=1649;ReadPosRankSum=1.035;SC=GCGCCTGCACCTGCCCCAGGC;SOR=0.708;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=245;TCF=121;TCR=124;TR=127;WE=47463228;WS=47463210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,140:0.50:281
chr11	47463483	rs34729771	AG	A	140.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.995;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.792;NF=0;NR=5;PP=141;ReadPosRankSum=0.757;SC=CCTGCGAGGGAGGCCAGTGGC;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=47463491;WS=47463473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr11	47469439	rs7111873	A	G	3259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.855;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=75;PP=2108;ReadPosRankSum=-1.207;SC=TGTTGTGGGCATAGCGCAGGG;SOR=0.585;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=294;TCF=155;TCR=139;TR=154;WE=47469447;WS=47469429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,159:0.50:315
chr11	47469717	rs45547231	G	A	1056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=31;PP=685;ReadPosRankSum=-1.969;SC=ACACAGCGACGGTGGGCAGGT;SOR=0.690;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=97;TCF=33;TCR=64;TR=47;WE=47469725;WS=47469707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,50:0.49:103
chr11	47496827	rs7102372	C	T	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.559;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.233;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=2;PP=122;ReadPosRankSum=0.721;SC=TCTGCCTTTCCGTTCTGGTAT;SOR=0.105;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=9;WE=47496835;WS=47496817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr11	47587577	rs58926533	TC	T	4809.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=84;PP=2969;SC=GGGGGCCCGCTCCCCCTCGCC;SOR=1.674;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=91;TCF=4;TCR=87;TR=87;WE=47587585;WS=47587567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr11	47609867	rs4486587	G	A	6533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=114;NR=109;PP=2965;SC=GGGCCGCTGGGCCCAGGTCTT;SOR=0.710;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=224;TCF=114;TCR=110;TR=223;WE=47609875;WS=47609857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr11	47611316	rs10769279	C	G	783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=24;NR=3;PP=600;SC=TTCGAGCCTCCGGCCCGGCCT;SOR=3.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=27;WE=47611324;WS=47611306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	47640429	rs1064608	G	C	1852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=0.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.802;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=37;PP=1158;ReadPosRankSum=-1.232;SC=TTCCCAAAGGGGACCTTCCGG;SOR=0.889;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=245;TCF=137;TCR=108;TR=89;WE=47640447;WS=47640419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,97:0.36:270
chr11	47684450	rs6485766	C	A	498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=1;PP=315;SC=TGTTCACCTGCGCAGAACGAA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=47684458;WS=47684440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	47689343	rs10742817	C	T	1594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.729;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=41;PP=922;ReadPosRankSum=-1.034;SC=GACACAAAGGCTAACTCGGTA;SOR=0.821;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=187;TCF=82;TCR=105;TR=70;WE=47689351;WS=47689333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,82:0.39:210
chr11	47701528	rs12286721	C	A	1458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.88;ReadPosRankSum=0.080;SOR=0.707;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:126,86:0.41:212
chr11	47701629	.	GA	G	39.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.000;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.21;MQRankSum=-0.445;QD=1.20;ReadPosRankSum=-0.661;SOR=0.457;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,7:0.21:33
chr11	47736314	rs4752863	C	G	822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=23;PP=652;SC=TACAAAGCCACAAGAGGACAA;SOR=3.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=27;WE=47736322;WS=47736304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	47758449	rs34910028	T	C	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.362;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.616;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=116;ReadPosRankSum=-0.660;SC=GTCAGCCTACTGTCTATATAA;SOR=3.056;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=9;WE=47758457;WS=47758439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr11	47772401	rs11039366	C	T	471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=3;PP=354;SC=AAGGCTTCCACTCCTGTGCTC;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=47772409;WS=47772391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
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chr11	47776283	rs7929014	C	T	628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.725;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=20;PP=420;ReadPosRankSum=-2.047;SC=GCATCTAAAGCGGAAGTATAA;SOR=0.104;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=44;TCF=7;TCR=37;TR=26;WE=47776291;WS=47776273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,27:0.59:46
chr11	47786926	rs148666719	A	AAAAAGAAAAG	481.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=3.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.60;ReadPosRankSum=-1.518;SOR=0.116;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr11	47788663	rs67450550	CGGTGGT	C	1258.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.273;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=9;PP=926;ReadPosRankSum=1.183;SC=GCAGTCACCGCGGTGGTGGTG;SOR=0.499;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=33;TCF=21;TCR=12;TR=19;WE=47788676;WS=47788653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,32:0.67:48
chr11	47801101	rs7114813	A	G	976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.646;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=20;PP=599;ReadPosRankSum=-0.119;SC=AATATTTTAGATAGGCTCAGG;SOR=0.790;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=121;TCF=73;TCR=48;TR=46;WE=47801109;WS=47801091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,52:0.37:142
chr11	47802091	.	C	A	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.649;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=6.934;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQRankSum=-1.055;QD=5.59;ReadPosRankSum=1.918;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr11	47813436	rs10742821	C	T	2980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=28;PP=1761;SC=ACAATAACAACATTACTACTG;SOR=1.654;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=98;TCF=70;TCR=28;TR=98;WE=47813444;WS=47813426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr11	47814280	rs754434	A	G	755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.059;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=494;ReadPosRankSum=1.455;SC=GACCAAAACAAGTAGATTTAC;SOR=0.990;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=70;TCF=49;TCR=21;TR=30;WE=47814288;WS=47814270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,34:0.44:77
chr11	47826090	rs11039402	A	C	1578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.282;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=25;PP=985;ReadPosRankSum=2.158;SC=GAAATGTTCAAAGGAACTCAC;SOR=0.828;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=135;TCF=83;TCR=52;TR=68;WE=47826098;WS=47826080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,77:0.50:153
chr11	47828558	rs77201654	A	G	1271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.270;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=21;PP=728;ReadPosRankSum=0.934;SC=GCAAAAGACCACTTTAATGAA;SOR=0.477;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=110;TCF=68;TCR=42;TR=50;WE=47828566;WS=47828548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,61:0.47:129
chr11	47834346	rs10838773	G	A	1317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=13;PP=850;ReadPosRankSum=-2.165;SC=TATTCTGTACGCTCTGGAACA;SOR=0.816;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=52;TCR=19;TR=48;WE=47834354;WS=47834336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,53:0.68:78
chr11	47834592	rs7110289	G	A	2287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=59;PP=1648;SC=CCCGAGCGATGTCCACATCTA;SOR=2.274;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=21;TCR=59;TR=80;WE=47834600;WS=47834582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr11	47837333	rs17727140	T	C	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.802;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=113;ReadPosRankSum=1.503;SC=TTAAAGGCCATAGACTATGCA;SOR=0.020;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=9;WE=47837341;WS=47837323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,8:0.28:29
chr11	47837408	rs6485786	G	C	1533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=23;PP=935;ReadPosRankSum=-2.071;SC=ACAAGGTCAAGTGAAGAATTC;SOR=0.643;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=145;TCF=92;TCR=53;TR=64;WE=47837416;WS=47837398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,74:0.45:163
chr11	47837638	rs7130715	G	A	1920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=51;PP=1398;SC=AATGGAAAACGTTTCAGTTTA;SOR=2.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=13;TCR=51;TR=64;WE=47837646;WS=47837628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr11	47843133	rs7122182	A	C	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=192;ReadPosRankSum=0.000;SC=CCTGGTCTCGAACTCCTGAGC;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=10;WE=47843141;WS=47843123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr11	47857253	rs3816605	T	C	3002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=61;PP=1639;ReadPosRankSum=1.070;SC=AGTCCCATGGTGGGGGAATAA;SOR=0.681;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=290;TCF=167;TCR=123;TR=138;WE=47857261;WS=47857243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,152:0.47:323
chr11	47869200	rs56283744	TGG	T	241.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.98;MQRankSum=0.349;QD=21.98;ReadPosRankSum=-0.370;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr11	48002671	.	T	TCCGGATCC	121.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=-0.000;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=17.39;ReadPosRankSum=1.368;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr11	48118199	rs4752806	G	C	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=127;ReadPosRankSum=-0.442;SC=CAGAGCTGTTGAGGCCCTTCC;SOR=0.368;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=9;WE=48118207;WS=48118189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr11	48118347	rs11382316	T	TA	2202.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.551;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=29;PP=1453;ReadPosRankSum=1.252;SC=CGAGAGCTGATAAGAACAGAG;SOR=0.648;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=94;TCF=29;TCR=65;TR=41;WE=48118355;WS=48118337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,78:0.44:178
chr11	48142528	rs34681195	AT	A	296.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.49;ReadPosRankSum=-1.151;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,18:0.82:22
chr11	48145247	rs2270992	T	C	1045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.169;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=16;PP=602;ReadPosRankSum=-1.285;SC=GCAATGGCACTGCCTCCTGCC;SOR=1.235;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=90;TCF=55;TCR=35;TR=46;WE=48145255;WS=48145237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,49:0.51:97
chr11	48157869	rs2270994	T	C	2717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.036;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=57;PP=1664;ReadPosRankSum=-1.115;SC=TAGGATGCCCTTCTAAGGAAC;SOR=0.784;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=204;TCF=96;TCR=108;TR=105;WE=48157877;WS=48157859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,120:0.53:225
chr11	48166267	rs4752904	G	C	2514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.515;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=48;PP=1408;ReadPosRankSum=0.145;SC=ACACGTATGAGGATTTCAAAA;SOR=0.807;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=228;TCF=127;TCR=101;TR=112;WE=48166275;WS=48166257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,123:0.48:254
chr11	48168287	rs372716237	CTG	C	80.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.500;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=3;PP=136;ReadPosRankSum=0.821;SC=GTGTGTGCGCCTGTGTGTGTG;SOR=0.143;SbPval=0.07;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=4;WE=48168296;WS=48168277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,5:0.20:25
chr11	48170870	rs4752908	T	G	3849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=49;PP=2487;SC=TGGTGTCAGCTGTGAACTAAT;SOR=1.334;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=136;TCF=87;TCR=49;TR=135;WE=48170878;WS=48170860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr11	48171793	rs10734565	T	C	2887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=68;PP=1655;SC=AGCTGGGATCTGAGGGGAGTT;SOR=1.588;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=34;TCR=68;TR=102;WE=48171801;WS=48171783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr11	48175608	.	A	C	186	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=19;MQ=60.0;NF=0;NR=18;PP=186;QD=12.2650673637;SC=TAAGCACTATATTTAGGTGCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=8;TCR=40;TR=18;WE=48175616;WS=48175598;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:30,18:0.38:48
chr11	48184971	rs3830431	CCTTT	C	7344.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=40;PP=2947;SC=TGTTAGGCAGCCTTTCTGTCT;SOR=1.470;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=96;TCF=53;TCR=43;TR=89;WE=48184991;WS=48184961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr11	48184983	rs2270990	G	T	7702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=107;NR=55;PP=2965;SC=TTTCTGTCTGGATCTAAATCA;SOR=1.351;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=163;TCF=107;TCR=56;TR=162;WE=48184991;WS=48184961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr11	48238302	rs1566737	G	T	774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=7;PP=516;SC=TTAGCGTTATGATTGCATGTG;SOR=1.781;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=25;WE=48238310;WS=48238292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	48238421	rs10769329	T	G	2172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=29;PP=1174;SC=AGGATCCAGCTGTGCAGAGTG;SOR=0.902;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=42;TCR=29;TR=71;WE=48238429;WS=48238411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr11	48266582	rs7120549	A	C	3574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=45;PP=2374;SC=GTGAAGAAGTATTTTGTATCA;SOR=1.270;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=121;TCF=76;TCR=45;TR=121;WE=48266590;WS=48266572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr11	48267589	rs1503180	A	G	2514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=51;PP=1559;SC=TTGTATTGATACTTGGGTTTA;SOR=1.508;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=29;TCR=51;TR=80;WE=48267597;WS=48267579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr11	48285301	rs713325	A	G	774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=23;NR=2;PP=545;SC=GAACAAACTCAAGAGGGAGCA;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=25;WE=48285309;WS=48285291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	48285842	rs1503193	A	G	8084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=152;NR=107;PP=2965;SC=TCTCCTCGTGAGGATAGCATG;SOR=0.915;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=262;TCF=153;TCR=109;TR=259;WE=48285864;WS=48285832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,296:1.00:296
chr11	48285856	rs10838850	C	T	7467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;MQ=59.99;MQRankSum=0.000;NF=146;NR=108;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.447;SC=TAGCATGGGGCGGGGGCCTGC;SOR=0.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=257;TCF=147;TCR=110;TR=254;WE=48285864;WS=48285832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,284:0.99:286
chr11	48285981	rs76884411	CCTT	C	12951.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=129;PP=2969;SC=TGCGCAGACACCTTCTTCATT;SOR=0.778;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=177;TCF=35;TCR=142;TR=159;WE=48285991;WS=48285971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,292:1.00:292
chr11	48286231	rs10838851	T	A	8665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.90;SOR=1.037;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr11	48286234	rs61732322	A	G	8697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.83;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr11	48286256	rs10838852	C	T	4442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=66;NR=80;PP=2517;SC=TCTCTTAAACCCTGTGATTTA;SOR=1.040;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=146;TCF=66;TCR=80;TR=146;WE=48286264;WS=48286246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr11	48346487	rs33950768	TC	T	126.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=2.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.34;MQRankSum=3.998;QD=2.08;ReadPosRankSum=-1.501;SOR=1.392;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,7:0.11:61
chr11	48346513	rs78206553	T	C	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=3.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.20;MQRankSum=2.705;QD=6.47;ReadPosRankSum=-1.923;SOR=1.156;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,24:0.22:110
chr11	48346523	rs72911451	C	T	866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=3.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQRankSum=2.979;QD=5.98;ReadPosRankSum=0.770;SOR=1.049;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,27:0.19:145
chr11	48346535	rs76964780	G	C	1667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FS=3.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQRankSum=2.519;QD=8.97;ReadPosRankSum=-1.292;SOR=0.984;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:141,45:0.24:186
chr11	48346541	rs75498992	A	T	2090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FS=1.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQRankSum=2.278;QD=9.77;ReadPosRankSum=-2.361;SOR=0.829;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:154,60:0.28:214
chr11	48346547	rs79042268	C	T	2372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FS=1.826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQRankSum=2.231;QD=10.23;ReadPosRankSum=-1.837;SOR=0.843;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:165,67:0.29:232
chr11	48346551	rs77470587	C	A	2489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQRankSum=2.126;QD=10.12;ReadPosRankSum=-2.396;SOR=0.714;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:170,76:0.31:246
chr11	48346579	rs72911452	C	A	3722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FS=3.257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.14;MQRankSum=2.845;QD=11.82;ReadPosRankSum=0.339;SOR=0.899;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:210,105:0.33:315
chr11	48346588	rs75900655	A	C	4516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FS=4.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.13;MQRankSum=2.674;QD=13.60;ReadPosRankSum=0.123;SOR=0.927;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:212,120:0.36:332
chr11	48346604	rs75647397	T	G	5253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.586;HP=4;HapScore=1;MGOF=66;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.522;NF=68;NR=50;PP=2962;ReadPosRankSum=0.379;SC=CACAGAATTTTTCATGCTGGG;SOR=0.815;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=318;TCF=166;TCR=152;TR=118;WE=48346623;WS=48346594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:217,138:0.39:355
chr11	48346615	rs73463988	G	A	5366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=370;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.016;HP=3;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.715;NF=71;NR=54;ReadPosRankSum=-0.369;SC=TCATGCTGGGGCTCTCACAGA;SOR=0.780;SbPval=0.7;Source=Platypus;TCF=170;TR=125;WE=48346623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:219,150:0.41:369
chr11	48346660	rs138704181	TTTGCTGATC	T	4838.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=366;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.843;HP=4;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.227;NF=17;NR=52;PP=2971;ReadPosRankSum=1.107;SC=TTGTGGTCTTTTTGCTGATCT;SOR=0.628;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=207;TCF=43;TCR=164;TR=69;WE=48346689;WS=48346650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:213,130:0.38:343
chr11	48346681	rs78490540	G	A	4612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.377;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.514;NF=55;NR=57;PP=2962;ReadPosRankSum=2.407;SC=ATGTGGTCACGGTTTGTGGCA;SOR=0.593;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=284;TCF=136;TCR=148;TR=112;WE=48346689;WS=48346650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:192,123:0.39:315
chr11	48346729	rs73463990	G	C	2945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.451;HP=2;HapScore=2;MGOF=49;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.052;NF=62;NR=55;PP=1911;ReadPosRankSum=-0.820;SC=CCAGCCCCACGCTGGCTTCCC;SOR=0.599;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=245;TCF=132;TCR=113;TR=117;WE=48346737;WS=48346719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,133:0.49:271
chr11	48346791	rs73463994	C	T	3338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=343;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.392;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.082;NF=79;NR=65;PP=2013;ReadPosRankSum=-1.254;SC=TTTTATTCTTCTTCTATGGCT;SOR=0.738;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=320;TCF=169;TCR=151;TR=144;WE=48346799;WS=48346781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:184,159:0.46:343
chr11	48346822	rs73463997	A	C	3457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=395;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.135;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=69;PP=2372;ReadPosRankSum=-2.191;SC=TTGCTGACTCATTGTATGAGG;SOR=0.808;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=371;TCF=198;TCR=173;TR=157;WE=48346830;WS=48346812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:227,168:0.43:395
chr11	48346843	rs73463998	C	T	3193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=395;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.196;HP=2;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=70;ReadPosRankSum=-1.248;SC=GGAGAACCATCTCTTATGAGT;SOR=0.678;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=366;TCF=187;TCR=179;TR=149;WE=48346851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:235,160:0.41:395
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chr11	48346961	rs75493089	AA	TG	4298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.930;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=51;PP=2944;ReadPosRankSum=-1.177;SC=GCCCCTGCACAATACTACCAT;SOR=0.712;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=250;TCF=130;TCR=120;TR=102;WE=48346970;WS=48346951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,115:0.42:276
chr11	48346999	rs72473367	T	G	3159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.898;HP=1;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=50;PP=1503;ReadPosRankSum=1.200;SC=GTGCCATGCTTGTAGGGGTGG;SOR=0.629;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=270;TCF=146;TCR=124;TR=110;WE=48347007;WS=48346989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,123:0.42:292
chr11	48347014	rs72473368	G	A	5024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FS=0.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.58;ReadPosRankSum=0.937;SOR=0.654;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:175,128:0.42:303
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chr11	48347067	rs73464001	C	T	2940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=61;PP=1912;ReadPosRankSum=0.893;SC=CTTTGGTTGCCCTTCTGTGGG;SOR=0.704;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=307;TCF=156;TCR=151;TR=127;WE=48347075;WS=48347057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:189,141:0.43:330
chr11	48347100	rs73465905	C	T	2488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.430;HP=1;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=49;PP=1511;ReadPosRankSum=0.418;SC=AATCACTTTGCCTGTGACTTG;SOR=0.641;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=264;TCF=135;TCR=129;TR=107;WE=48347108;WS=48347090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,123:0.42:293
chr11	48347124	rs79019124	A	G	4914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FS=5.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.01;ReadPosRankSum=-0.153;SOR=0.612;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:162,127:0.44:289
chr11	48347130	rs77395846	C	G	5123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FS=4.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.49;ReadPosRankSum=-0.798;SOR=0.566;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:158,135:0.46:293
chr11	48347140	rs10838874	T	C	5045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FS=3.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.83;ReadPosRankSum=0.469;SOR=0.587;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:156,127:0.45:283
chr11	48347142	rs79891698	C	T	4965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FS=3.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.42;ReadPosRankSum=0.755;SOR=0.531;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:158,127:0.45:285
chr11	48347144	rs79124801	T	C	4884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FS=2.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.57;ReadPosRankSum=0.570;SOR=0.579;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:153,125:0.45:278
chr11	48347267	rs73465910	T	C	2669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=344;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.457;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=65;PP=1511;ReadPosRankSum=-0.173;SC=AGATGGGAGATGCAAAGCCCT;SOR=0.483;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=330;TCF=178;TCR=152;TR=131;WE=48347275;WS=48347257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:205,139:0.40:344
chr11	48347306	rs73465911	G	T	2651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=402;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.582;HP=4;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.98;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=68;PP=1906;ReadPosRankSum=-0.770;SC=CTTCATTGTTGTTGCCTTGTT;SOR=0.722;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=379;TCF=195;TCR=184;TR=131;WE=48347314;WS=48347296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:264,137:0.34:401
chr11	48347342	rs76958755	G	A	3958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=373;ExcessHet=3.0103;FS=1.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.000;QD=10.64;ReadPosRankSum=0.271;SOR=0.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:256,116:0.31:372
chr11	48347346	rs74590631	A	T	3906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=363;ExcessHet=3.0103;FS=1.355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.000;QD=10.79;ReadPosRankSum=0.502;SOR=0.604;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:251,111:0.31:362
chr11	48347358	rs76274696	C	T	3560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FS=1.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.000;QD=10.60;ReadPosRankSum=-0.158;SOR=0.605;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:232,104:0.31:336
chr11	48347363	rs77814753	C	T	3514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FS=0.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.000;QD=10.75;ReadPosRankSum=-0.308;SOR=0.658;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:226,101:0.31:327
chr11	48347392	rs79127479	T	C	1457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.285;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=46;PP=910;ReadPosRankSum=-1.524;SC=CATTATTTTATGGTATTCTGA;SOR=0.877;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=240;TCF=108;TCR=132;TR=81;WE=48347400;WS=48347382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:177,83:0.32:260
chr11	48347419	rs73465913	A	G	1262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=39;PP=931;ReadPosRankSum=0.827;SC=TGTTGAATCCACTCATTTATA;SOR=0.718;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=206;TCF=87;TCR=119;TR=67;WE=48347427;WS=48347409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,70:0.31:227
chr11	48347492	rs79775762	G	A	2143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=1.396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.78;ReadPosRankSum=-0.056;SOR=0.553;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,58:0.40:145
chr11	48347498	rs78309417	A	T	2114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=3.191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.89;ReadPosRankSum=-0.140;SOR=0.472;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,58:0.41:142
chr11	48347539	rs79172951	G	A	561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.017;HP=6;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=21;PP=394;ReadPosRankSum=-1.218;SC=CTTTATTTTTGTAAGTGAAAC;SOR=0.968;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=73;TCF=25;TCR=48;TR=30;WE=48347547;WS=48347529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,30:0.39:77
chr11	48347563	.	CT	C	207	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=7;HapScore=2;MGOF=28;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=12;PP=207;QD=19.0;SC=CCAAGCCTTACTTTTTTTGTA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=1;TCR=37;TR=12;WE=48347571;WS=48347553;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:26,12:0.32:38
chr11	48347583	.	G	A	146	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=32;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=10;PP=146;QD=18.0771212547;SC=ATCATGTATAGTTGTATTCCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=4;TCR=28;TR=10;WE=48347591;WS=48347573;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:22,10:0.31:32
chr11	48349128	rs76530627	G	A	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.92;ReadPosRankSum=0.535;SOR=0.138;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr11	48349128	.	GTA	ATG	135	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=4;NR=0;PP=135;QD=47.1169687156;SC=TGTCTTTAAAGTAAAAGTAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=4;WE=48349138;WS=48349118;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:11,4:0.27:15
chr11	48349130	rs75661263	A	G	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.99;ReadPosRankSum=1.059;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,4:0.21:19
chr11	48349152	rs73465924	A	C	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.636;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=194;ReadPosRankSum=-1.250;SC=ATTTTAGATTACAAGTATAAG;SOR=1.483;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=11;WE=48349160;WS=48349142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,11:0.28:39
chr11	48349171	rs73465926	T	C	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=209;ReadPosRankSum=-1.059;SC=AGTGAGGTCATGCAGTATTTG;SOR=0.876;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=57;TCF=49;TCR=8;TR=16;WE=48349179;WS=48349161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,16:0.26:61
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chr11	48349377	rs72911466	A	T	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=727;ReadPosRankSum=-0.420;SC=AAGTTCTTAAAGCAGTTTCTG;SOR=0.567;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=12;WE=48349415;WS=48349367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,12:0.33:36
chr11	48349389	rs79223613	A	C	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.56;ReadPosRankSum=0.181;SOR=0.641;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,9:0.30:30
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chr11	48349394	rs78755709	G	A	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.84;ReadPosRankSum=0.292;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr11	48349407	rs72911467	T	C	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=3.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=436;ReadPosRankSum=1.031;SC=GAACTCCCAATATGCTTATTT;SOR=0.175;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=5;WE=48349415;WS=48349367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr11	48349425	rs79941850	T	C	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=58;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=43;ReadPosRankSum=1.506;SC=TTTGATATTATCATGTCTACC;SOR=0.188;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=4;WE=48349433;WS=48349415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr11	48366895	rs72473369	A	C	834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=9;PP=655;ReadPosRankSum=-0.537;SC=TTTGTGTCACAAGACTTATTT;SOR=0.598;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=112;TCF=89;TCR=23;TR=41;WE=48366903;WS=48366885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,41:0.35:118
chr11	48366958	rs76319939	T	G	2823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=358;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=48;PP=2962;ReadPosRankSum=0.343;SC=ATTTTTCACTTCTTTATTTTT;SOR=0.685;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=330;TCF=201;TCR=129;TR=126;WE=48366980;WS=48366948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:216,141:0.39:357
chr11	48366971	rs75689989	GG	CA	6321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=423;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=55;PP=2944;ReadPosRankSum=-0.234;SC=TTATTTTTGAGGGTGTAGATT;SOR=0.703;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=384;TCF=233;TCR=151;TR=135;WE=48366980;WS=48366948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:252,170:0.40:422
chr11	48367050	rs113897236	T	TAG	8703.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=640;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.538;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=77;PP=2927;ReadPosRankSum=-0.347;SC=GGAAGGAGGTTAGGTCTTAGA;SOR=0.759;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=373;TCF=95;TCR=278;TR=113;WE=48367058;WS=48367040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:382,235:0.38:617
chr11	48367073	rs7941588	A	C	22966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=660;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=292;NR=295;PP=2965;SC=CAGGTATGAAAAAGGGACAAA;SOR=0.711;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=587;TCF=292;TCR=295;TR=587;WE=48367081;WS=48367063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,660:1.00:660
chr11	48367097	rs73453179	A	G	4621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=667;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.137;HP=1;HapScore=1;MGOF=40;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.307;NF=105;NR=109;PP=2710;ReadPosRankSum=0.594;SC=TAAGATGACAATGAAGATATG;SOR=0.751;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=605;TCF=298;TCR=307;TR=214;WE=48367105;WS=48367087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:420,247:0.37:667
chr11	48367133	rs79453749	C	A	7540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=623;ExcessHet=3.0103;FS=1.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.02;MQRankSum=1.394;QD=12.12;ReadPosRankSum=1.227;SOR=0.774;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:410,212:0.34:622
chr11	48367136	rs78927905	C	T	7590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=611;ExcessHet=3.0103;FS=1.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.02;MQRankSum=1.399;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.106;SOR=0.735;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:403,207:0.34:610
chr11	48367155	rs75315666	T	A	6670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=542;ExcessHet=3.0103;FS=2.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.02;MQRankSum=1.420;QD=12.33;ReadPosRankSum=-0.736;SOR=0.932;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:361,180:0.33:541
chr11	48367159	rs75667244	C	T	6541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=537;ExcessHet=3.0103;FS=2.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.02;MQRankSum=1.434;QD=12.20;ReadPosRankSum=-0.704;SOR=0.918;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:360,176:0.33:536
chr11	48367163	rs74650698	A	G	6257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=516;ExcessHet=3.0103;FS=1.878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.02;MQRankSum=1.441;QD=12.15;ReadPosRankSum=-0.915;SOR=0.855;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:347,168:0.33:515
chr11	48367170	rs77876442	G	A	6050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=491;ExcessHet=3.0103;FS=1.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.02;MQRankSum=1.421;QD=12.35;ReadPosRankSum=-1.960;SOR=0.788;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:327,163:0.33:490
chr11	48367190	rs78661795	A	T	4947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=424;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.70;ReadPosRankSum=-1.799;SOR=0.732;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:288,135:0.32:423
chr11	48367195	rs79063955	C	T	4526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=407;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.15;ReadPosRankSum=-0.910;SOR=0.686;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:281,125:0.31:406
chr11	48367249	rs74815769	C	T	4374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FS=7.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.93;ReadPosRankSum=1.799;SOR=0.428;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:196,118:0.38:314
chr11	48367252	rs76287086	G	A	4377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FS=6.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.68;ReadPosRankSum=1.986;SOR=0.459;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:199,121:0.38:320
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chr11	48367363	rs73453183	C	T	3176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.660;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=59;PP=1458;ReadPosRankSum=-0.697;SC=AAGTCTGGATCCCTCCATGCA;SOR=0.968;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=278;TCF=132;TCR=146;TR=104;WE=48367371;WS=48367353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:192,114:0.37:306
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chr11	48367499	rs72896822	A	G	818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=31.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQRankSum=-2.171;QD=14.62;ReadPosRankSum=2.720;SOR=1.406;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,22:0.39:56
chr11	48367511	rs72896823	T	G	791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=28.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQRankSum=-2.053;QD=15.84;ReadPosRankSum=1.072;SOR=1.676;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,21:0.42:50
chr11	48367528	.	G	GAAGAGCTGAGTCATGCAGCCATTGAAGGATAT	627.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.466;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=29.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQRankSum=-1.751;QD=19.62;ReadPosRankSum=-2.402;SOR=2.512;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr11	48373632	rs4882248	T	A	258.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=160;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=1;PP=171;SC=TATAAGTATGTAACAAACCTG;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=48373640;WS=48373622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	48373748	rs73453188	C	G	2787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=0.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.569;HP=6;HapScore=1;MGOF=64;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=15;PP=1303;ReadPosRankSum=-0.684;SC=ATATGGTGTTCTTTTCAGAGA;SOR=0.346;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=178;TCF=127;TCR=51;TR=63;WE=48373756;WS=48373738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,76:0.37:205
chr11	48373770	rs73453191	T	A	3141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=2.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.072;HP=1;HapScore=1;MGOF=44;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.366;NF=53;NR=22;PP=1280;ReadPosRankSum=2.338;SC=CAAGTCAAAGTTCATTTTAGG;SOR=0.464;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=238;TCF=154;TCR=84;TR=75;WE=48373778;WS=48373760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,97:0.35:280
chr11	48373797	rs72896825	C	T	5226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=387;ExcessHet=3.0103;FS=4.677;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.298;QD=13.54;ReadPosRankSum=-0.613;SOR=0.511;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:243,143:0.37:386
chr11	48373805	rs75618010	G	A	5457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=395;ExcessHet=3.0103;FS=7.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.298;QD=13.85;ReadPosRankSum=-1.213;SOR=0.444;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:248,146:0.37:394
chr11	48373815	rs74350365	A	G	5544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=412;ExcessHet=3.0103;FS=3.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.342;QD=13.49;ReadPosRankSum=-0.756;SOR=0.503;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:265,146:0.36:411
chr11	48373817	rs75951679	C	T	5565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=413;ExcessHet=3.0103;FS=2.588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.331;QD=13.51;ReadPosRankSum=-1.207;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:264,148:0.36:412
chr11	48373820	rs3898634	A	C	5814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=421;ExcessHet=3.0103;FS=2.579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.344;QD=13.84;ReadPosRankSum=-0.986;SOR=0.532;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:271,149:0.35:420
chr11	48373827	rs80081241	G	A	5948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=439;ExcessHet=3.0103;FS=1.159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.340;QD=13.58;ReadPosRankSum=-0.815;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:282,156:0.36:438
chr11	48373833	rs75965588	GA	AG	5905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=437;ExcessHet=3.0103;FS=1.806;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.322;QD=13.55;ReadPosRankSum=-0.849;SOR=0.566;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:278,158:0.36:436
chr11	48373885	rs76292854	A	G	3458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=496;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.818;HP=1;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.911;NF=71;NR=83;PP=1980;ReadPosRankSum=0.814;SC=ACTGAGATGAACAGGTTACCT;SOR=0.834;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=454;TCF=221;TCR=233;TR=154;WE=48373893;WS=48373875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:318,175:0.35:493
chr11	48373900	rs77877396	A	G	3398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=461;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.546;HP=1;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.05;MQRankSum=1.861;NF=66;NR=85;PP=1956;ReadPosRankSum=-0.822;SC=TTACCTGCCAATGTGATCAAG;SOR=0.891;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=428;TCF=202;TCR=226;TR=151;WE=48373908;WS=48373890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:291,169:0.37:460
chr11	48373936	rs76304554	A	G	2549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=377;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.874;NF=48;NR=68;PP=1424;ReadPosRankSum=-0.522;SC=ATAACAAACAAGAATTTCTGC;SOR=0.671;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=343;TCF=145;TCR=198;TR=116;WE=48373944;WS=48373926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:239,137:0.36:376
chr11	48373976	rs80225178	T	G	2717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FS=0.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQRankSum=1.862;QD=12.52;ReadPosRankSum=0.607;SOR=0.637;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:137,80:0.37:217
chr11	48373986	rs12420054	A	G	2549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.11;MQRankSum=1.857;QD=13.49;ReadPosRankSum=0.165;SOR=0.656;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:119,70:0.37:189
chr11	48374000	rs112772888	C	CT	1014.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.876;HP=6;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.854;NF=1;NR=28;PP=2971;ReadPosRankSum=-1.910;SC=CATTGTTCATCTTTTTCATAG;SOR=0.542;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=100;TCF=1;TCR=99;TR=29;WE=48374008;WS=48373966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,44:0.37:118
chr11	48374031	rs72896827	G	A	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=1.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.98;ReadPosRankSum=-0.350;SOR=0.395;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,18:0.26:70
chr11	48374041	rs72896828	T	C	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=5.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.22;ReadPosRankSum=-0.488;SOR=0.111;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,13:0.27:49
chr11	48386956	.	C	CA	434.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.218;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=437;ReadPosRankSum=1.000;SC=CTTAAACTCACTATTCTGACC;SOR=0.157;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=12;WE=48386964;WS=48386954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr11	48387098	rs77594589	A	C	5094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=359;ExcessHet=3.0103;FS=2.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.19;ReadPosRankSum=0.394;SOR=0.546;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:221,138:0.38:359
chr11	48387107	rs77606603	T	C	5467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=378;ExcessHet=3.0103;FS=2.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.46;ReadPosRankSum=0.540;SOR=0.587;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:235,143:0.38:378
chr11	48387115	rs75003399	G	A	5639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=401;ExcessHet=3.0103;FS=1.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.06;ReadPosRankSum=0.373;SOR=0.603;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:250,151:0.38:401
chr11	48387118	rs79339252	G	A	5670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=402;ExcessHet=3.0103;FS=1.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.11;ReadPosRankSum=-0.050;SOR=0.652;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:249,153:0.38:402
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chr11	48387155	rs10839483	T	C	831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=389;ExcessHet=3.0103;FS=4.374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.14;ReadPosRankSum=1.005;SOR=0.989;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:315,74:0.19:389
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chr11	48387278	rs139139147	C	CACTGTCCTTCTGT	1945.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FS=8.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.34;ReadPosRankSum=-1.664;SOR=1.228;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:250,57:0.19:307
chr11	48387285	.	A	AGTCTTTAGTAG	2755.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.323;ClippingRankSum=0.000;DP=306;ExcessHet=3.0103;FS=15.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.04;ReadPosRankSum=0.159;SOR=1.589;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:248,57:0.19:305
chr11	48387301	rs76220342	G	A	2912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=383;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.63;ReadPosRankSum=-3.033;SOR=0.675;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:269,113:0.30:382
chr11	48387335	rs73460769	C	A	2624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=431;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=53;PP=1508;ReadPosRankSum=1.416;SC=AATGAGCATACACATCAGCCC;SOR=0.653;SbPval=0.54;Source=Platypus;TCR=179;TR=115;WE=48387343;WS=48387325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:288,143:0.33:431
chr11	48387370	rs73460772	A	G	3938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=470;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.756;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=69;PP=2152;ReadPosRankSum=-1.286;SC=CAAAGAGTCCAAAGACGTGAG;SOR=0.761;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=422;TCF=224;TCR=198;TR=165;WE=48387378;WS=48387360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:274,196:0.42:470
chr11	48387424	rs61917478	G	T	3432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=439;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.281;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=71;PP=2148;ReadPosRankSum=2.443;SC=GGTCACAGATGAAATGGTCAA;SOR=0.841;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=411;TCF=213;TCR=198;TR=162;WE=48387432;WS=48387414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:264,175:0.40:439
chr11	48387490	rs77144540	G	A	6214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=479;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.238;HP=1;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=93;ReadPosRankSum=0.087;SC=GAATCAGAGCGTGAAGAAATC;SOR=0.939;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=444;TCF=217;TCR=227;TR=167;WE=48387498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:300,178:0.37:478
chr11	48387506	rs72898882	A	G	5992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=448;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.222;HP=3;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=81;PP=2156;ReadPosRankSum=0.895;SC=AAATCCCCCGACCCATGCCAT;SOR=0.797;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=413;TCF=210;TCR=203;TR=149;WE=48387514;WS=48387496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:285,162:0.36:447
chr11	48387526	rs78378263	G	T	5520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=412;ExcessHet=3.0103;FS=7.305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.43;ReadPosRankSum=0.632;SOR=0.758;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:260,151:0.37:411
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chr11	48387580	rs78299098	G	T	4326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=359;ExcessHet=3.0103;FS=0.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.05;ReadPosRankSum=0.048;SOR=0.766;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:237,122:0.34:359
chr11	48387582	rs75027745	C	T	4392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=349;ExcessHet=3.0103;FS=1.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.59;ReadPosRankSum=-0.161;SOR=0.814;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:230,119:0.34:349
chr11	48387584	rs75821991	A	T	4622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=349;ExcessHet=3.0103;FS=0.857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.25;ReadPosRankSum=-0.079;SOR=0.770;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:231,118:0.34:349
chr11	48387591	rs75297075	A	G	4709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=358;ExcessHet=3.0103;FS=0.838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.16;ReadPosRankSum=-1.038;SOR=0.766;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:233,125:0.35:358
chr11	48387604	rs72898886	C	T	4402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=381;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.819;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=56;PP=2962;ReadPosRankSum=0.236;SC=CATAGGCCATCACCACGAGCA;SOR=0.664;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=354;TCF=177;TCR=177;TR=115;WE=48387612;WS=48387570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:254,127:0.33:381
chr11	48387630	rs73460777	C	T	4808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=398;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.789;HP=4;HapScore=1;MGOF=44;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=59;PP=1614;ReadPosRankSum=-0.127;SC=ATCTCAACTCCCCCAAAGAAA;SOR=0.671;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=369;TCF=184;TCR=185;TR=125;WE=48387638;WS=48387620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:262,136:0.34:398
chr11	48387647	rs75615667	A	G	4878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=424;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.833;HP=1;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=70;PP=1897;ReadPosRankSum=0.498;SC=GAAATGTTCTACAAAGAGCTG;SOR=0.607;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=398;TCF=196;TCR=202;TR=141;WE=48387655;WS=48387637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:279,145:0.34:424
chr11	48387679	rs76209049	A	G	5217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=408;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.838;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=64;PP=2962;ReadPosRankSum=1.182;SC=CACTGAAGGAAATAGTTTTCT;SOR=0.671;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=382;TCF=190;TCR=192;TR=135;WE=48387697;WS=48387669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:268,140:0.34:408
chr11	48387683	rs67755516	GT	G	5274.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=417;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.577;HP=4;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=59;PP=2968;ReadPosRankSum=0.643;SC=GAAGGAAATAGTTTTCTTTTC;SOR=0.715;SbPval=0.07;Source=Platypus;TC=245;TCF=47;TCR=198;TR=83;WE=48387697;WS=48387669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:271,146:0.35:417
chr11	48387689	rs75371569	T	C	5310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=409;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.596;HP=3;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=59;PP=2962;ReadPosRankSum=0.952;SC=AATAGTTTTCTTTTCAGTGAG;SOR=0.729;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=379;TCF=192;TCR=187;TR=127;WE=48387697;WS=48387669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:267,142:0.35:409
chr11	48387705	rs34926479	C	T	4827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=394;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.458;HP=3;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=61;PP=1828;ReadPosRankSum=0.363;SC=GTGAGTAAGTCAAATATCATT;SOR=0.909;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=364;TCF=190;TCR=174;TR=140;WE=48387713;WS=48387695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:253,141:0.36:394
chr11	48387737	rs73460780	G	C	3684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=392;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.752;HP=1;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=64;PP=2149;ReadPosRankSum=0.604;SC=GGTAGAAGAGGAGCAGCCATC;SOR=0.834;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=358;TCF=190;TCR=168;TR=140;WE=48387745;WS=48387727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:246,144:0.37:390
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chr11	48387833	rs79515387	T	C	7059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=490;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.41;ReadPosRankSum=0.247;SOR=0.707;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:301,189:0.39:490
chr11	48387850	rs73460781	G	T	6125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=488;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.533;HP=3;HapScore=1;MGOF=43;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=87;PP=2426;ReadPosRankSum=0.243;SC=TGGTGAGAAAGTAGATGAGTG;SOR=0.688;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=441;TCF=222;TCR=219;TR=171;WE=48387858;WS=48387840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:296,192:0.39:488
chr11	48387890	rs74623688	T	C	6632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=476;ExcessHet=3.0103;FS=1.790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.93;ReadPosRankSum=1.220;SOR=0.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:295,181:0.38:476
chr11	48387894	rs75065468	C	T	6764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=475;ExcessHet=3.0103;FS=0.538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.24;ReadPosRankSum=1.185;SOR=0.771;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:295,180:0.38:475
chr11	48387900	rs74338058	G	A	6665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=464;ExcessHet=3.0103;FS=1.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.37;ReadPosRankSum=1.070;SOR=0.838;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:289,175:0.38:464
chr11	48387917	rs66829866	AT	A	6023.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=413;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.361;HP=1;HapScore=1;MGOF=47;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=70;PP=2954;ReadPosRankSum=-0.107;SC=GCCAAGCAAGATGAATTCCGT;SOR=0.986;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=229;TCF=34;TCR=195;TR=80;WE=48387938;WS=48387907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:254,159:0.38:413
chr11	48387919	rs114441034	G	A	6051.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=409;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.159;HP=2;HapScore=1;MGOF=47;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=69;PP=2962;ReadPosRankSum=0.397;SC=CAAGCAAGATGAATTCCGTTA;SOR=1.056;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=350;TCF=157;TCR=193;TR=117;WE=48387938;WS=48387907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:253,156:0.38:409
chr11	48387930	rs75939575	T	C	5113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.527;HP=1;HapScore=1;MGOF=47;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=69;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.517;SC=AATTCCGTTATGTTGTTCACT;SOR=1.024;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=310;TCF=131;TCR=179;TR=111;WE=48387938;WS=48387907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:218,137:0.39:355
chr11	48387945	rs139770813	C	CCA	4468.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=3.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.166;HP=1;HapScore=1;MGOF=49;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=57;PP=2954;ReadPosRankSum=-0.718;SC=TTCACTTGCTCGAAATCCAGT;SOR=1.140;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=173;TCF=22;TCR=151;TR=62;WE=48387968;WS=48387935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:189,118:0.38:307
chr11	48387946	rs114053360	G	T	4435.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.364;HP=3;HapScore=1;MGOF=49;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=52;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.013;SC=TCACTTGCTCGAAATCCAGTT;SOR=1.138;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=265;TCF=108;TCR=157;TR=79;WE=48387968;WS=48387935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:191,112:0.37:303
chr11	48387960	rs79688019	T	C	3692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=3.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.982;HP=2;HapScore=1;MGOF=49;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=56;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.442;SC=TCCAGTTTGGTATTTGGATAA;SOR=1.090;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=236;TCF=96;TCR=140;TR=83;WE=48387968;WS=48387935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,101:0.37:271
chr11	48387978	rs78160589	T	A	2740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FS=2.627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.93;ReadPosRankSum=0.285;SOR=0.896;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:140,72:0.34:212
chr11	48387983	rs75819836	T	C	2524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.62;ReadPosRankSum=0.278;SOR=0.726;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:134,66:0.33:200
chr11	48388047	rs75982328	T	C	610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.54;ReadPosRankSum=-0.537;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,19:0.30:64
chr11	48388047	.	TTA	CTG	654	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=33;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=3;NR=14;PP=654;QD=41.6157573448;SC=TTGGTCAGGATTATTTTCTGT;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=58;TCF=15;TCR=43;TR=17;WE=48388057;WS=48388037;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:41,17:0.29:58
chr11	48388049	rs77697332	A	G	610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.54;ReadPosRankSum=-0.090;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,18:0.28:64
chr11	48388067	rs73460782	G	A	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=87;ReadPosRankSum=0.520;SC=TAACACTGATGGAATCCCTAA;SOR=0.616;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=9;WE=48388075;WS=48388057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,8:0.21:38
chr11	48388094	rs148627403	C	CTT	96.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.740;HP=1;HapScore=4;MGOF=39;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.754;NF=0;NR=4;PP=384;ReadPosRankSum=-1.518;SC=AAACCCAAGACTAAGTTGAGC;SOR=0.027;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=4;WE=48388123;WS=48388084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr11	48388105	rs373593427	T	C	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.838;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQRankSum=-1.150;QD=5.90;ReadPosRankSum=-1.408;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr11	48388108	rs74747286	G	A	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.379;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQRankSum=-1.150;QD=5.90;ReadPosRankSum=-1.017;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr11	48388487	rs78414756	C	A	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=67;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=92;ReadPosRankSum=-0.896;SC=GGTGAGTTCACTTTGAAATTA;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=6;WE=48388495;WS=48388477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr11	48388524	rs76789954	C	T	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.62;ReadPosRankSum=-0.031;SOR=0.458;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr11	48388524	.	CAA	TAG	571	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=58;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=12;NR=0;PP=571;QD=52.0389895719;SC=ATTTCAGAATCAACTGAACTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=12;WE=48388534;WS=48388514;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr11	48388526	rs77473022	A	G	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.53;ReadPosRankSum=-0.092;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr11	48388542	rs77282201	G	A	696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=1.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.875;SOR=1.382;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,19:0.34:56
chr11	48388544	rs74346885	T	C	813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=1.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.28;ReadPosRankSum=1.050;SOR=1.338;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,19:0.33:57
chr11	48388553	rs80082776	C	G	939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=4.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.90;ReadPosRankSum=0.460;SOR=1.432;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,27:0.34:79
chr11	48388563	rs77148147	CT	AG	1269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=7.238;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.70;ReadPosRankSum=-0.174;SOR=1.747;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,35:0.35:100
chr11	48388567	rs79767657	A	C	1413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=10.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.29;ReadPosRankSum=0.440;SOR=2.005;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,38:0.33:115
chr11	48388571	rs79079495	C	T	1567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=16.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.96;ReadPosRankSum=-0.118;SOR=2.388;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,41:0.34:121
chr11	48388583	rs77992774	A	T	1782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.244;HP=2;HapScore=1;MGOF=42;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=14;PP=2760;ReadPosRankSum=-0.757;SC=GTTAGATTTGAGAATTTATGC;SOR=1.115;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=154;TCF=106;TCR=48;TR=54;WE=48388591;WS=48388532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,58:0.35:167
chr11	48388610	rs79108820	T	G	3092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FS=0.514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.22;ReadPosRankSum=-0.717;SOR=0.762;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:151,83:0.35:234
chr11	48388612	rs76366705	T	C	3185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.27;ReadPosRankSum=-0.629;SOR=0.710;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:155,85:0.35:240
chr11	48388614	rs146852809	T	C	3232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FS=1.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.78;ReadPosRankSum=-0.187;SOR=0.769;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:165,88:0.35:253
chr11	48388621	rs75849499	ACA	GTC	3520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FS=4.358;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.80;ReadPosRankSum=0.098;SOR=0.957;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:181,94:0.34:275
chr11	48388641	rs80267937	G	A	4905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=374;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.393;HP=2;HapScore=1;MGOF=45;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=48;PP=1356;ReadPosRankSum=0.600;SC=ACTTCTGGAAGCATATCCTGG;SOR=0.737;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=327;TCF=184;TCR=143;TR=109;WE=48388649;WS=48388631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:242,132:0.35:374
chr11	48388657	rs80000751	G	A	5825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=449;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=40;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=62;PP=1833;ReadPosRankSum=1.743;SC=CCTGGAAGAGGATAAAACAGC;SOR=0.715;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=400;TCF=218;TCR=182;TR=135;WE=48388665;WS=48388647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:293,156:0.35:449
chr11	48388681	rs76712816	G	A	6335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=469;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.543;HP=1;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=73;PP=1758;ReadPosRankSum=1.019;SC=ATGCAAGGCAGCATTCCCCAG;SOR=0.779;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=417;TCF=210;TCR=207;TR=144;WE=48388689;WS=48388671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:302,167:0.36:469
chr11	48388698	rs77483743	C	T	5721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=432;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.809;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=75;PP=1937;ReadPosRankSum=-0.423;SC=CCAGATGTATCTGAAACTTTA;SOR=0.837;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=387;TCF=185;TCR=202;TR=137;WE=48388706;WS=48388688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:275,157:0.36:432
chr11	48388717	rs78132200	T	C	5156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=397;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.379;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=68;PP=1733;ReadPosRankSum=-0.418;SC=TAGAATTCACTTGGAGAACTG;SOR=0.666;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=355;TCF=160;TCR=195;TR=125;WE=48388725;WS=48388707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:254,143:0.36:397
chr11	48388782	rs76039310	A	G	1068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.789;NF=13;NR=35;PP=735;ReadPosRankSum=-0.907;SC=AAGGATGACTATGAAAAATTA;SOR=0.652;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=126;TCF=33;TCR=93;TR=48;WE=48388790;WS=48388772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,51:0.39:131
chr11	48388833	rs73460789	A	C	432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.682;NF=1;NR=14;PP=327;ReadPosRankSum=1.222;SC=GGTGAGGGAAAAAAAGCACCA;SOR=0.458;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=35;TCF=2;TCR=33;TR=15;WE=48388841;WS=48388823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr11	48453787	rs4882063	G	A	7057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.986;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=5.356;NF=136;NR=122;PP=2962;ReadPosRankSum=5.488;SC=TACCTGAAATGTCCTTTCTAC;SOR=0.304;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=304;TCF=168;TCR=136;TR=258;WE=48453795;WS=48453767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:9,278:0.97:287
chr11	48510654	rs7103557	A	C	7223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=117;NR=125;PP=2965;SC=TATCGAGCACATTTTCGGTGG;SOR=0.840;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=244;TCF=118;TCR=126;TR=242;WE=48510662;WS=48510644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr11	48510777	rs7103992	G	A	4699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=72;PP=2953;SC=GCTGCTGGTAGTGTCCTGGGT;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=158;TCF=86;TCR=72;TR=158;WE=48510785;WS=48510767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr11	48997592	rs1813231	C	T	1546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=43;PP=1134;SC=ATGTAATTAACAGAAATTAGA;SOR=2.221;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=14;TCR=43;TR=57;WE=48997600;WS=48997582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr11	49000423	rs1965370	C	G	744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=18;NR=1;PP=572;SC=TCAGTCCGTACCTGGAATAGC;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=49000431;WS=49000414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr11	49000522	rs1963629	C	T	4656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=58;PP=2409;SC=GCTTTGCTTTCATTGAGTTGC;SOR=1.026;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=142;TCF=83;TCR=59;TR=141;WE=49000530;WS=49000512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr11	49002343	rs9783302	T	G	1262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=2;PP=981;SC=CAAGTGTTTTTTCCTTGTTTG;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=36;TCF=34;TCR=2;TR=36;WE=49002351;WS=49002333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr11	49059362	rs2696914	C	A	5978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=118;PP=2965;SC=CTCCCCACTTCTGCTGCAATA;SOR=1.301;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=196;TCF=78;TCR=118;TR=196;WE=49059370;WS=49059352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr11	49075605	rs2851535	G	A	4114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=54;PP=2426;SC=AATGCTTGCCGGAGGTGAATG;SOR=0.778;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=71;TCR=54;TR=125;WE=49075613;WS=49075595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr11	49076963	rs34650085	C	CA,CAA	3038.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-0.307;QD=25.54;ReadPosRankSum=0.305;SOR=0.808;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:6,66,47:0.55,0.39:119
chr11	49077012	rs2773242	C	T	3302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=64;PP=2062;SC=GCTAATCACACAGTCATATGA;SOR=1.205;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=117;TCF=53;TCR=64;TR=117;WE=49077020;WS=49076988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr11	49077889	rs36015501	AT	A	7255.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=13.392;NF=24;NR=108;PP=2983;ReadPosRankSum=0.911;SC=CAGAAATAGCATTTTTTTTAG;SOR=0.755;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=143;TCF=28;TCR=115;TR=132;WE=49077897;WS=49077879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,266:0.99:268
chr11	49080616	rs60452246	T	C	3799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.98;MQRankSum=0.171;QD=24.51;ReadPosRankSum=-0.828;SOR=0.906;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,153:0.99:155
chr11	49138552	rs11040259	C	A	4207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=43;PP=2531;SC=GGTTTGTGACCTGTCCCTGAT;SOR=1.547;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=95;TCR=44;TR=138;WE=49138560;WS=49138542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr11	49170334	rs202694	T	C	2886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=60;PP=1860;SC=ATGTTTCTACTCAGAAAATAA;SOR=1.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=27;TCR=60;TR=87;WE=49170342;WS=49170324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr11	49175475	rs137991256	T	C	2929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.141;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.493;NF=65;NR=73;PP=1643;ReadPosRankSum=0.716;SC=CAGAAAAAAGTGAATCTGAAA;SOR=0.537;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=269;TCF=124;TCR=145;TR=138;WE=49175483;WS=49175465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,147:0.49:297
chr11	49176057	rs2988340	C	T	645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.73;QD=26.91;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	49192667	rs10839236	C	T	1354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=6;PP=933;SC=ATATTCACTTCTTATTTTTAT;SOR=3.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=34;TCR=6;TR=40;WE=49192675;WS=49192657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr11	49195090	rs202718	T	C	2162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.00;QD=24.86;SOR=0.716;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr11	49195129	rs67031328	G	A	358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.80;QD=27.60;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	49196332	rs4929893	CG	TC	821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=1;PP=739;SC=CGATTTTCTTCGTTTGTTTGT;SOR=4.514;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=19;WE=49196341;WS=49196328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	49196652	rs202715	C	T	494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=15;PP=404;SC=AAACTGAAAACTGATTAACAG;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=49196660;WS=49196642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	49329552	rs1164670	G	A	6627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=1.081;NF=111;NR=128;PP=2965;ReadPosRankSum=-2.062;SC=TGGAAATCCGGATGGTCAAAG;SOR=0.908;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=242;TCF=113;TCR=129;TR=239;WE=49329560;WS=49329542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,244:0.99:246
chr11	49356338	.	G	C	604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.000;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.746;NF=10;NR=17;PP=382;ReadPosRankSum=0.603;SC=GTAATAATTTGAATGTGTTTT;SOR=0.659;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=74;TCF=24;TCR=50;TR=27;WE=49356346;WS=49356328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,28:0.41:69
chr11	49372872	rs3915110	G	A	4610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=79;PP=2965;SC=TGATGAGGCAGTGGGCATAGT;SOR=0.779;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=158;TCF=79;TCR=79;TR=158;WE=49372880;WS=49372862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr11	49400965	rs3974576	T	C	6046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=94;PP=2965;SC=ATTCACTATCTAAGACTCTTC;SOR=0.739;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=189;TCF=95;TCR=94;TR=189;WE=49400973;WS=49400955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr11	49401125	rs7102702	T	G	1361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=34;PP=977;SC=ATCAGACAGCTGTGTTATGCC;SOR=3.209;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=7;TCR=34;TR=41;WE=49401133;WS=49401115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr11	49597799	rs7131345	C	T	5817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=116;NR=88;PP=2965;SC=TGTCCTAAAACGGTCCTTCTG;SOR=0.984;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=204;TCF=116;TCR=88;TR=204;WE=49597807;WS=49597789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr11	49598178	rs7101761	G	A	8435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=160;NR=133;PP=2965;SC=AGGGCTTGGTGTGCTCTGTGG;SOR=0.830;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=293;TCF=160;TCR=133;TR=293;WE=49598186;WS=49598168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,310:1.00:310
chr11	49598207	rs3750925	T	C	12729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.42;QD=44.82;SOR=0.722;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,284:1.00:284
chr11	49598207	.	TCT	CCC	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MMLQ=24;MQ=54.68;NF=137;NR=125;PP=2947;QD=20;SC=TCCTCTTCCTTCTGCTCCAAG;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=271;TCF=142;TCR=129;TR=262;WE=49598217;WS=49598197;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:9,262:0.97:271
chr11	49598209	rs7939515	T	C	12729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.40;QD=44.82;SOR=0.722;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,284:1.00:284
chr11	49637416	rs7125677	A	G	382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.73;QD=31.90;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	49655814	rs144145381	T	C	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.50;QD=20.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr11	49729299	rs67084465	AC	A	8635.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=8.530;NF=23;NR=113;PP=2966;ReadPosRankSum=0.698;SC=TCTCATCAACACCCCAACTGG;SOR=0.732;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=146;TCF=26;TCR=120;TR=136;WE=49729307;WS=49729289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:6,259:0.98:265
chr11	49813442	rs7943083	A	G	180.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=6;NR=0;PP=115;SC=GGACCCTGCGACCTTCCGCAG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=6;WE=49813450;WS=49813432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr11	49829193	rs35198519	AT	A	6795.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.282;NF=26;NR=102;PP=2491;ReadPosRankSum=-0.583;SC=ACGTATTTCTATTTTTTTTTA;SOR=0.382;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=146;TCF=29;TCR=117;TR=128;WE=49829210;WS=49829183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,257:0.99:260
chr11	49973979	rs28378220	C	T	1269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.629;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.901;NF=38;NR=21;PP=748;ReadPosRankSum=1.178;SC=AAATACATGGCGAATAGAAAC;SOR=0.787;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=130;TCF=83;TCR=47;TR=59;WE=49973987;WS=49973969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,65:0.45:146
chr11	49974371	rs28662375	G	A	7158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=133;NR=114;PP=2965;SC=CTATACCACCGTCATGAAGCA;SOR=0.803;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=247;TCF=133;TCR=114;TR=247;WE=49974379;WS=49974361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr11	50003191	rs4598671	C	A	7305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=132;NR=115;PP=2965;SC=GTGTAGACCACGGGATTTAAC;SOR=0.715;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=248;TCF=132;TCR=116;TR=247;WE=50003199;WS=50003181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,271:1.00:271
chr11	51516000	rs11246607	C	T	4103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=85;PP=2805;SC=ACCTGTGTCTCCCACATCACG;SOR=1.470;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=143;TCF=57;TCR=86;TR=142;WE=51516008;WS=51515990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr11	51516036	rs11246608	G	A	1929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=44;SC=TTTGTGCCCTGCATATTTGTG;SOR=2.139;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=24;TCR=44;TR=68;WE=51516044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr11	51516144	rs11246609	A	G	1554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.49;MQRankSum=-1.579;QD=29.90;ReadPosRankSum=-0.977;SOR=1.536;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,51:0.98:52
chr11	51527612	rs111311507	G	A	1450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.648;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.862;NF=31;NR=30;PP=846;ReadPosRankSum=-0.608;SC=TCAAAGAAAGGTGGGTCAGGA;SOR=0.690;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=147;TCF=78;TCR=69;TR=61;WE=51527620;WS=51527602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,70:0.43:163
chr11	55111238	rs11229158	C	A	3128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=55;PP=1911;SC=ACTGTTGTGCCTTGACACCTA;SOR=0.965;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=50;TCR=55;TR=105;WE=55111246;WS=55111228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr11	55111584	rs10896659	A	T	1606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=25;NR=29;PP=879;SC=TGGTGTGAAAAGTTAAGTATA;SOR=1.071;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=25;TCR=29;TR=54;WE=55111592;WS=55111574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr11	55135435	rs1425193	C	T	930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.478;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=14;PP=519;ReadPosRankSum=0.711;SC=GAGTCCAACACCTTCAGAAGA;SOR=1.153;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=119;TCF=74;TCR=45;TR=43;WE=55135443;WS=55135425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,50:0.38:133
chr11	55322211	rs9804659	A	G	1781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.528;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=41;PP=1136;ReadPosRankSum=1.247;SC=ATGTGACAAAAACCATCTCTT;SOR=0.631;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=173;TCF=81;TCR=92;TR=76;WE=55322219;WS=55322201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,86:0.43:198
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chr11	55339462	rs71488974	G	A	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.832;HP=4;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=343;ReadPosRankSum=1.053;SC=TTAAGAAACCGCCACCAGAAT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=16;WE=55339470;WS=55339452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
chr11	55339502	rs75292949	T	A	843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.681;HP=5;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=8;PP=591;ReadPosRankSum=-1.084;SC=TAATTTTGCATAAAATATTCC;SOR=0.366;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=76;TCF=61;TCR=15;TR=37;WE=55339510;WS=55339492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,37:0.49:76
chr11	55339652	rs1459101	C	T	3074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.440;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=66;PP=1810;ReadPosRankSum=0.682;SC=TGGATTGACACAGGATCCTTT;SOR=0.690;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=242;TCF=121;TCR=121;TR=136;WE=55339660;WS=55339642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,148:0.54:274
chr11	55339676	rs12800642	G	T	2689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=54;PP=1644;ReadPosRankSum=-0.423;SC=GAAGAAAATAGTGTTTGTTAT;SOR=0.666;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=242;TCF=127;TCR=115;TR=110;WE=55339684;WS=55339666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,127:0.46:277
chr11	55339702	rs34100491	C	T	2763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.410;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=47;PP=1751;ReadPosRankSum=-0.247;SC=TGCGTCTCTACTTGGGAACAC;SOR=0.909;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=231;TCF=129;TCR=102;TR=110;WE=55339710;WS=55339692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,125:0.48:260
chr11	55339798	rs557667	C	T	4346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=387;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=89;PP=2857;ReadPosRankSum=-0.772;SC=TCTACTTATCCTTATCTGATA;SOR=0.713;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=352;TCF=184;TCR=168;TR=185;WE=55339806;WS=55339788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:187,199:0.52:386
chr11	55339829	rs557590	A	G	11212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=408;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=186;NR=187;PP=2965;SC=TACTTCCATAACCCCTAGAAT;SOR=0.769;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=374;TCF=186;TCR=188;TR=373;WE=55339837;WS=55339819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,407:1.00:407
chr11	55340379	rs559449	T	C	7312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.175;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=117;NR=121;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.092;SC=TACACATGCCTTGCAACCGTA;SOR=0.356;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=239;TCF=118;TCR=121;TR=238;WE=55340387;WS=55340369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,267:1.00:268
chr11	55371807	rs11230346	A	T	2492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=46;PP=1453;SC=TCCTGTGTTAATCCTAACAGT;SOR=1.240;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=33;TCR=46;TR=79;WE=55371815;WS=55371797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr11	55433040	rs11230600	T	C	894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=22;PP=662;ReadPosRankSum=1.267;SC=TACACGATCATCATGAGTCCA;SOR=0.780;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=62;TCF=21;TCR=41;TR=32;WE=55433048;WS=55433030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,35:0.51:68
chr11	55541098	rs297118	G	A	6511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=105;NR=118;PP=2965;ReadPosRankSum=1.853;SC=ACAATCATGTGCTTTTTCCTT;SOR=0.286;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=225;TCF=105;TCR=120;TR=223;WE=55541106;WS=55541088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,241:1.00:242
chr11	55563776	rs297054	T	G	7372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=127;NR=112;PP=2965;SC=CCACCTGACTTCTATCACCAT;SOR=0.762;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=239;TCF=127;TCR=112;TR=239;WE=55563784;WS=55563766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr11	55587117	rs297082	T	A	3057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=23;PP=2191;SC=TGCTGCTGACTGATAGAAATA;SOR=2.303;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=99;TCF=76;TCR=23;TR=99;WE=55587125;WS=55587107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr11	55587511	rs297081	A	G	6694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=124;NR=95;PP=2965;SC=CTACACAGTTAACATGTCCCA;SOR=0.895;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=219;TCF=124;TCR=95;TR=219;WE=55587519;WS=55587501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr11	55587914	rs55832853	A	G	3190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=50;PP=1926;SC=AACTCCAGGCACACAGTCAAA;SOR=0.856;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=103;TCF=51;TCR=52;TR=101;WE=55587922;WS=55587904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr11	55595291	rs112845939	G	C	1682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.359;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.169;NF=36;NR=24;PP=1139;ReadPosRankSum=-0.875;SC=AGACACTGCTGTTCCTGGTGG;SOR=1.054;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=105;TCF=60;TCR=45;TR=60;WE=55595299;WS=55595281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,69:0.57:121
chr11	55606302	rs6591699	G	T	6190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=115;NR=89;PP=2965;SC=ACCTGGAACTGCAAATTCCCC;SOR=0.821;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=204;TCF=115;TCR=89;TR=204;WE=55606310;WS=55606292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr11	55606818	rs11231253	C	T	10265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=386;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=187;NR=168;PP=2965;SC=CTTATCTCAGCCAGTTGCTTC;SOR=0.714;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=356;TCF=187;TCR=169;TR=355;WE=55606826;WS=55606798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,386:1.00:386
chr11	55656483	rs7483200	T	A	1373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.38;QD=24.10;SOR=0.800;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr11	55681494	rs2457239	G	A	6676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=123;NR=99;PP=2965;SC=GTATCTGAGCGAGAGAGTAAT;SOR=0.861;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=222;TCF=123;TCR=99;TR=222;WE=55681502;WS=55681484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr11	55682111	rs2940752	T	G	675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=17;PP=482;SC=AGAATGACAGTCTAGAACTTG;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=55682119;WS=55682101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr11	55746891	rs7481466	G	A	4316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=43;PP=2579;SC=AATGGGGAAGGCAACTGTATA;SOR=1.564;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=137;TCF=94;TCR=43;TR=136;WE=55746899;WS=55746881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr11	55761221	rs2449134	C	T	2419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=25;PP=1472;SC=TACTTCCTTACTCCTGAGGCT;SOR=1.434;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=54;TCR=25;TR=79;WE=55761229;WS=55761211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr11	55761738	rs2128152	T	G	3982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=82;NR=56;PP=2286;SC=GCCGCATACCTGTCATAGGCC;SOR=0.937;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=82;TCR=56;TR=138;WE=55761746;WS=55761728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr11	55798152	rs1482011	G	A	8218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=139;NR=131;PP=2965;SC=CAAACTTCTTGGCATCCAGGA;SOR=0.739;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=270;TCF=139;TCR=131;TR=270;WE=55798160;WS=55798142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,309:1.00:309
chr11	55860780	rs1842700	G	A	7342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=-0.089;NF=146;NR=120;PP=2965;ReadPosRankSum=0.764;SC=CTGAGTTGATGTAAATGGCTG;SOR=0.865;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=268;TCF=147;TCR=121;TR=266;WE=55860788;WS=55860768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,287:0.99:289
chr11	55872876	rs2512961	C	T	8268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=130;NR=143;PP=2965;SC=CTCAATGGCCCATGATCGCTA;SOR=0.830;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=273;TCF=130;TCR=143;TR=273;WE=55872884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,293:1.00:293
chr11	55873024	rs2449148	A	G	14055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=518;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=237;NR=229;PP=2965;SC=TTGCATTTCTACGACTCAAAC;SOR=0.732;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=466;TCF=237;TCR=229;TR=466;WE=55873032;WS=55873014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,518:1.00:518
chr11	55873368	rs1842696	G	A	6485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=111;NR=110;PP=2965;SC=TGTGATTCCCGTGCTGAATCC;SOR=0.710;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=222;TCF=112;TCR=110;TR=221;WE=55873376;WS=55873358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr11	55873475	rs2170447	C	T	4715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=94;PP=2965;SC=AGCAGGAATGCTGAACATTTA;SOR=1.101;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=161;TCF=67;TCR=94;TR=161;WE=55873483;WS=55873465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr11	55889790	rs2035408	G	T	1567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=7;PP=1147;SC=GTAGCTGGGAGTACAGGCGCC;SOR=3.056;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=45;TCR=7;TR=52;WE=55889798;WS=55889780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr11	55890257	rs1842691	C	T	7042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=116;NR=107;PP=2965;SC=AGTTATTATGCCCAAAAGGCT;SOR=0.760;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=223;TCF=116;TCR=107;TR=223;WE=55890265;WS=55890247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr11	55944048	rs10896103	G	C	679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=0;PP=578;SC=CAAATTATGAGTCTATCTTTT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=55944056;WS=55944038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr11	56000403	rs10791893	C	G	6259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=111;NR=95;PP=2965;SC=CTAATGACCACTAAAATCAGT;SOR=0.792;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=206;TCF=111;TCR=95;TR=206;WE=56000411;WS=56000393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr11	56000600	rs3919907	G	T	4299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=74;PP=2562;SC=ATGACAAAAAGAATGAACAAC;SOR=0.868;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=142;TCF=67;TCR=75;TR=141;WE=56000608;WS=56000590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr11	56015479	rs1531757	A	G	2432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=50;PP=1484;SC=ATGAGCAGACAACGAAGATTG;SOR=1.531;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=28;TCR=50;TR=78;WE=56015487;WS=56015469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr11	56043604	rs12360890	A	G	13420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=475;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NR=214;PP=2965;SC=CTATGTTGCTAGCATTTTACA;SOR=0.758;Source=Platypus;TCR=215;WE=56043612;WS=56043594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,473:1.00:473
chr11	56043702	rs7125697	G	C	13632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=488;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=224;NR=215;PP=2965;SC=TGCCTCCTCTGCTTGCTATTT;SOR=0.718;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=440;TCF=224;TCR=216;TR=439;WE=56043710;WS=56043692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,488:1.00:488
chr11	56057419	rs17150286	A	G	1573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=15;PP=1045;SC=ATTTCTAATTACAATCTGGAT;SOR=1.835;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=33;TCR=15;TR=48;WE=56057427;WS=56057409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr11	56058197	rs1842674	G	A	10265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=364;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=166;NR=168;PP=2965;SC=CCATTGATGAGAGAAGAAAAC;SOR=0.710;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=334;TCF=166;TCR=168;TR=334;WE=56058205;WS=56058187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,363:1.00:363
chr11	56086147	rs960193	T	G	6845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=118;NR=108;PP=2965;SC=TCCTACGACCTCTATGTGGCC;SOR=0.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=226;TCF=118;TCR=108;TR=226;WE=56086155;WS=56086137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chr11	56113516	rs1905055	T	C	5567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=121;NR=74;PP=2965;SC=GTTACCAAGATGAATCATGTG;SOR=1.094;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=196;TCF=122;TCR=74;TR=195;WE=56113524;WS=56113506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr11	56113575	rs10896271	A	G	7473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=149;NR=105;PP=2965;SC=ATTTATTCTCATGGGGATTAC;SOR=0.967;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=255;TCF=149;TCR=106;TR=254;WE=56113583;WS=56113565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,278:1.00:278
chr11	56113593	rs10896272	C	A	8232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=153;NR=129;PP=2965;SC=TACAGACAACCCTGGGCTGCA;SOR=0.811;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=282;TCF=153;TCR=129;TR=282;WE=56113601;WS=56113583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,303:1.00:303
chr11	56127746	rs7942390	A	G	3691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=38;PP=2279;SC=ATTTCACCAGAGTCACTGAGT;SOR=1.434;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=76;TCR=38;TR=114;WE=56127754;WS=56127736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr11	56128173	rs111941251	T	C	709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.371;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=14;PP=443;ReadPosRankSum=-0.141;SC=CACATACCTCTATGGCTTTTC;SOR=1.143;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=56;TCF=28;TCR=28;TR=25;WE=56128181;WS=56128163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,30:0.47:64
chr11	56128524	rs7928704	C	T	7502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=129;NR=113;PP=2965;SC=TAACCATTCACTGGATACTGA;SOR=0.761;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=242;TCF=129;TCR=113;TR=242;WE=56128532;WS=56128514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,273:1.00:273
chr11	56128772	rs7938038	G	T	319.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.97;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	56128775	rs7938865	C	G	319.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.68;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr11	56143125	rs74467122	C	T	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FS=1.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.62;ReadPosRankSum=-4.657;SOR=0.729;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:226,48:0.18:274
chr11	56143156	rs11228165	C	T	13575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.10;SOR=0.783;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,301:1.00:301
chr11	56143156	.	CCA	TCG	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=141;NR=102;PP=2947;QD=20;SC=GCCTCACAGACCATCAGGAGT;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=256;TCF=148;TCR=108;TR=243;WE=56143166;WS=56143146;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:13,243:0.95:256
chr11	56143158	rs11228166	A	G	13576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.96;SOR=0.761;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,302:1.00:302
chr11	56143198	rs80034856	C	T	4739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=382;ExcessHet=3.0103;FS=9.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.41;ReadPosRankSum=-1.355;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:251,131:0.34:382
chr11	56143204	rs79445223	C	T	5004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=387;ExcessHet=3.0103;FS=8.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.93;ReadPosRankSum=-0.879;SOR=1.044;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:254,133:0.34:387
chr11	56143207	rs75547926	C	T	5304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=393;ExcessHet=3.0103;FS=8.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.50;ReadPosRankSum=-1.252;SOR=1.055;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:254,139:0.35:393
chr11	56143216	rs76044076	G	A	6024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=430;ExcessHet=3.0103;FS=5.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.01;ReadPosRankSum=-0.874;SOR=1.011;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:273,157:0.37:430
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chr11	56143250	rs76390346	G	A	7461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=488;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.29;ReadPosRankSum=1.769;SOR=0.729;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:291,197:0.40:488
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chr11	56143891	rs112265664	T	A	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=2.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-3.275;QD=0.42;ReadPosRankSum=1.598;SOR=1.177;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:120,11:0.08:131
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chr11	56185345	rs6591324	A	G	6264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=118;NR=105;PP=2965;SC=GCGACATAGCAATCGTAGGCC;SOR=0.710;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=223;TCF=118;TCR=105;TR=223;WE=56185353;WS=56185335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr11	56310222	rs628524	C	T	6052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=111;NR=89;PP=2965;SC=GTTGATGACACTGGATCTACA;SOR=0.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=200;TCF=111;TCR=89;TR=200;WE=56310230;WS=56310212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr11	56310877	rs66945922	C	CTT	668.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=14;PP=685;SC=CTACCATAAACTGGTTTTGGT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=14;WE=56310885;WS=56310867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
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chr11	56380134	rs4939078	C	G	4940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=79;PP=2965;SC=CAGCATTGGGCTCAAAAAAGT;SOR=0.859;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=175;TCF=96;TCR=79;TR=174;WE=56380142;WS=56380124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr11	56431216	rs11228710	C	T	5384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=105;NR=73;PP=2965;SC=GGGCATCACCCAGGACCCTCA;SOR=0.985;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=178;TCF=105;TCR=73;TR=178;WE=56431224;WS=56431206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr11	56467757	.	CACG	C	112.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.718;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.27;ReadPosRankSum=1.693;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr11	56467763	.	A	AGAT	154.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.501;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.47;ReadPosRankSum=1.242;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr11	56467764	rs78916686	C	T	163.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.596;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.89;ReadPosRankSum=0.352;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr11	56467787	rs74218731	A	G	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.104;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=70;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=105;ReadPosRankSum=0.055;SC=ATCTTATGTAACATAATTCTA;SOR=0.818;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=7;WE=56467795;WS=56467777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr11	56467810	rs76085479	A	T	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.62;ReadPosRankSum=-0.101;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr11	56467813	rs77180330	A	G	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.17;ReadPosRankSum=-0.730;SOR=0.498;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr11	56467816	rs78119960	G	T	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.12;ReadPosRankSum=-1.985;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr11	56467819	rs78036340	A	G	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.85;ReadPosRankSum=-1.163;SOR=0.460;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr11	56467833	rs73474897	T	C	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.255;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=889;ReadPosRankSum=-0.651;SC=GAGCTCATTTTCTTTCCCCAT;SOR=0.414;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=17;WE=56467841;WS=56467800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,24:0.47:51
chr11	56467881	rs73474900	T	C	1111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.773;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=14;PP=655;ReadPosRankSum=-1.349;SC=GGAGCAATCATACAGTGACTG;SOR=0.544;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=91;TCF=64;TCR=27;TR=44;WE=56467889;WS=56467871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,52:0.50:104
chr11	56467926	rs1704284	A	G	1603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.282;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.987;NF=39;NR=29;PP=941;ReadPosRankSum=1.988;SC=CAGACCCAGGAATGCAGCTGG;SOR=0.550;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=141;TCF=84;TCR=57;TR=68;WE=56467934;WS=56467916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,77:0.50:154
chr11	56467945	rs36184181	G	T	1749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.560;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.338;NF=44;NR=31;PP=1025;ReadPosRankSum=2.193;SC=GGGCCTCTTCGTGGTGTTCCT;SOR=0.753;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=160;TCF=91;TCR=69;TR=75;WE=56467953;WS=56467935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,83:0.48:172
chr11	56468020	rs532637	TG	CA	1941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.448;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=44;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.808;NF=20;NR=32;PP=1669;ReadPosRankSum=-0.526;SC=TAATGACTCCTGCCTCCACAC;SOR=1.283;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=156;TCF=70;TCR=86;TR=52;WE=56468029;WS=56468010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,56:0.33:169
chr11	56468044	rs3975155	T	G	5561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.41;QD=45.22;SOR=1.089;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr11	56468047	rs2865519	AC	GT	5471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.33;QD=45.22;SOR=1.052;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr11	56468111	rs602224	C	T	832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.124;HP=1;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.844;NF=22;NR=11;PP=485;ReadPosRankSum=1.326;SC=ATCCTAGTGACCTGCATCTCT;SOR=1.196;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=86;TCF=51;TCR=35;TR=33;WE=56468119;WS=56468101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,41:0.43:96
chr11	56468198	rs4990194	A	G	4055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.48;ReadPosRankSum=-0.475;SOR=0.662;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:125,107:0.46:232
chr11	56468200	rs4990195	C	T	4331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FS=1.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.51;ReadPosRankSum=0.182;SOR=0.583;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:128,106:0.45:234
chr11	56468202	rs4990196	G	A	4434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FS=3.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.33;ReadPosRankSum=0.253;SOR=0.502;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:132,110:0.45:242
chr11	56468212	rs591369	G	A	4223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FS=0.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.256;QD=15.94;ReadPosRankSum=1.652;SOR=0.635;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:149,116:0.44:265
chr11	56468259	rs503776	C	T	4493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=367;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.237;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.286;NF=104;NR=81;PP=2769;ReadPosRankSum=0.371;SC=TGCTTTATGCCCAGGCCATGT;SOR=0.772;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=329;TCF=183;TCR=146;TR=185;WE=56468267;WS=56468249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,200:0.55:366
chr11	56468368	rs11228733	C	T	3697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=446;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.526;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=93;PP=2523;ReadPosRankSum=0.615;SC=TAACTTCTGCCGTGAAAACAT;SOR=0.776;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=421;TCF=213;TCR=208;TR=181;WE=56468376;WS=56468358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:256,187:0.42:443
chr11	56468403	rs11228734	G	A	5509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=414;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.321;HP=3;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=86;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.520;SC=TCTGTGATTTGCTTCCCTTGG;SOR=0.957;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=384;TCF=184;TCR=200;TR=153;WE=56468424;WS=56468393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:253,159:0.39:412
chr11	56468416	rs11228735	G	A	5835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=397;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.102;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=87;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.187;SC=TCCCTTGGTGGAGCTGGCCTG;SOR=1.174;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=366;TCF=173;TCR=193;TR=146;WE=56468424;WS=56468393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:243,153:0.39:396
chr11	56468440	rs12421330	G	T	5001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=338;ExcessHet=3.0103;FS=4.339;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.80;ReadPosRankSum=-1.057;SOR=0.931;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:208,130:0.38:338
chr11	56468448	rs80194264	AA	GT	4660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FS=4.640;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.08;ReadPosRankSum=0.019;SOR=0.945;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:195,114:0.37:309
chr11	56468452	rs79970235	A	C	4181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FS=3.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.45;ReadPosRankSum=0.606;SOR=0.876;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:198,113:0.36:311
chr11	56468493	rs10792053	A	G	1886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.556;HP=1;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=47;PP=1260;ReadPosRankSum=0.193;SC=TCTGCCCCGCAGTGCTCATCC;SOR=0.582;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=231;TCF=111;TCR=120;TR=91;WE=56468501;WS=56468483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,99:0.39:254
chr11	56468554	rs12420076	A	C	4664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FS=0.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.22;ReadPosRankSum=-0.196;SOR=0.639;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:137,119:0.46:256
chr11	56468560	rs10896516	TA	CG	4828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FS=0.451;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.95;ReadPosRankSum=0.432;SOR=0.639;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:145,124:0.46:269
chr11	56468637	rs76884192	C	T	8882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=538;ExcessHet=3.0103;FS=0.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.51;ReadPosRankSum=0.177;SOR=0.634;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:304,234:0.43:538
chr11	56468646	rs78493274	C	T	9118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=563;ExcessHet=3.0103;FS=1.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.20;ReadPosRankSum=-1.049;SOR=0.554;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:314,249:0.44:563
chr11	56468694	rs79060400	C	T	9369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=593;ExcessHet=3.0103;FS=2.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.83;ReadPosRankSum=-0.823;SOR=0.865;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:339,253:0.43:592
chr11	56468699	rs79251113	T	A	9610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=582;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.54;ReadPosRankSum=-0.975;SOR=0.792;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:332,249:0.43:581
chr11	56468704	rs79288825	T	C	9063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=581;ExcessHet=3.0103;FS=2.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.63;ReadPosRankSum=0.029;SOR=0.774;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:338,242:0.42:580
chr11	56468720	rs66943455	T	C	5206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=583;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.099;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=118;NR=113;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.571;SC=ATGTTGAATCTCATGATCTAC;SOR=0.745;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=532;TCF=268;TCR=264;TR=231;WE=56468728;WS=56468710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:324,258:0.44:582
chr11	56468817	rs74605930	G	T	4391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FS=8.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.27;ReadPosRankSum=1.212;SOR=1.166;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:152,118:0.44:270
chr11	56468819	rs78460796	CC	TT	4391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FS=7.388;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.76;ReadPosRankSum=1.522;SOR=1.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:149,113:0.43:262
chr11	56468828	rs530142	G	C	3944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FS=5.033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.30;ReadPosRankSum=0.694;SOR=1.027;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:127,101:0.44:228
chr11	56468832	rs79579174	G	T	3764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.01;ReadPosRankSum=0.333;SOR=1.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,94:0.45:209
chr11	56468835	rs588308	G	T	3491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FS=5.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.82;ReadPosRankSum=1.142;SOR=1.150;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,85:0.43:196
chr11	56468870	.	GTG	ACA	1506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.708;ClippingRankSum=0.000;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=2.818;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.15;ReadPosRankSum=-1.541;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,40:0.48:83
chr11	56468877	.	G	A	1446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.987;ClippingRankSum=0.000;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=2.847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.82;ReadPosRankSum=-1.513;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,35:0.48:73
chr11	56468881	.	C	T	1200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.995;ClippingRankSum=0.000;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=1.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.92;ReadPosRankSum=0.032;SOR=0.990;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,29:0.43:67
chr11	56468883	.	T	C	1074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.178;ClippingRankSum=0.000;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=1.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.04;ReadPosRankSum=0.171;SOR=0.990;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,29:0.43:67
chr11	56468893	rs79757227	G	A	846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=3.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.28;ReadPosRankSum=0.489;SOR=1.410;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,23:0.44:52
chr11	56468897	.	G	C	897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.143;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=2.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.70;ReadPosRankSum=0.167;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,22:0.46:48
chr11	56468909	rs79696743	TG	CA	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=4.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.106;HP=1;HapScore=4;JOINED;MGOF=55;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=2263;ReadPosRankSum=0.828;SC=GTTACAGACATGTACAATAAG;SOR=2.200;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=13;WE=56468918;WS=56468860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr11	56508476	rs11228758	T	C	1232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=8;PP=834;SC=TTCTACCTTTTATACTATGCT;SOR=2.362;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=35;WE=56508484;WS=56508466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	56508525	rs556056	A	G	2710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=28;PP=1511;SC=AGTCTGAGGAATAAAGACATG;SOR=1.167;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=56;TCR=28;TR=84;WE=56508533;WS=56508515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr11	56508619	rs545772	G	A	3872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.07;NF=63;NR=66;PP=2235;SC=GCTAAGTGATGACAAACTGCT;SOR=0.886;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=129;TCF=63;TCR=66;TR=129;WE=56508627;WS=56508609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr11	56508727	rs59062115	GA	G	586.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=16;PP=660;SC=TGTTTGTTATGATTTTGAGAT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=16;WE=56508735;WS=56508717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	56510243	rs11228762	A	G	763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=4;PP=601;SC=ATGCAAATGAACACATTTATA;SOR=3.014;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=25;WE=56510251;WS=56510233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	56510672	rs577576	T	C	8431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=152;NR=124;PP=2965;SC=ACCCTGGTGTTTGTACAGGAC;SOR=0.783;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=277;TCF=153;TCR=124;TR=276;WE=56510680;WS=56510662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,301:1.00:301
chr11	56756664	rs2853083	G	A	2334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.235;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.145;NF=52;NR=49;PP=1474;ReadPosRankSum=0.077;SC=AGAATTTGATGTTATTTCAGG;SOR=0.574;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=177;TCF=90;TCR=87;TR=101;WE=56756672;WS=56756654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,108:0.55:196
chr11	57003639	.	G	C	3847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=0.000;DP=359;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.235;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=87;PP=2003;ReadPosRankSum=0.589;SC=CAAAGTCACAGGGCCAGTGCA;SOR=0.704;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=337;TCF=173;TCR=164;TR=175;WE=57003647;WS=57003629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,190:0.53:359
chr11	57004344	rs948847	G	T	5613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=90;PP=2965;SC=CCAGACCGTTGCCCGTGGTGC;SOR=0.764;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=179;TCF=89;TCR=90;TR=179;WE=57004352;WS=57004334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr11	57076820	rs78489201	T	G	3202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.740;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=74;PP=2077;ReadPosRankSum=3.315;SC=GCCAAACTGATAGCTCCTCTC;SOR=0.780;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=296;TCF=154;TCR=142;TR=142;WE=57076828;WS=57076810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,152:0.47:325
chr11	57081197	rs4939134	G	C	3433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=58;PP=2271;SC=AGCTTCAGGAGTCTGGGCTTC;SOR=0.724;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=65;TCR=58;TR=123;WE=57081205;WS=57081187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr11	57081475	rs4939135	C	A	412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=11;PP=318;SC=TGGGAGGAGGCAACTGGAACC;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=57081483;WS=57081465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	57094842	.	TA	T	99.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.860;ClippingRankSum=0.000;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=2.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQRankSum=2.188;QD=1.23;ReadPosRankSum=0.052;SOR=0.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,16:0.20:81
chr11	57117385	rs2276042	C	T	2372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=57;PP=1694;SC=GAGGACCTAGCCATTCTTCCG;SOR=2.010;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=22;TCR=57;TR=79;WE=57117393;WS=57117375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr11	57118467	rs3741090	A	C	2034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=28;NR=43;PP=1171;SC=CCATCCACCCACCCCTGGCCC;SOR=1.310;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=29;TCR=44;TR=71;WE=57118475;WS=57118456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr11	57135663	rs55655702	A	AG	969.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=18;PP=968;SC=TCTGGGGGGCAGGGTCTGCTG;SOR=2.019;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=24;WE=57135671;WS=57135653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr11	57137371	rs2276039	G	A	10997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=415;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=201;NR=177;PP=2965;SC=ATGAGACTACGCTGAAAATCG;SOR=0.763;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=378;TCF=201;TCR=177;TR=378;WE=57137379;WS=57137361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,414:1.00:414
chr11	57137424	rs2276038	C	T	9941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=370;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=158;NR=174;PP=2965;SC=CAGACCACAGCGGAGAAGCAG;SOR=0.900;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=334;TCF=158;TCR=176;TR=332;WE=57137432;WS=57137414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,369:1.00:369
chr11	57137538	rs67821929	A	AG	1330.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=31;PP=1319;SC=TGCCTGAGCAAGGGGCATGGG;SOR=4.125;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=1;TCR=37;TR=32;WE=57137546;WS=57137528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr11	57144152	rs1867126	G	C	1042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=7;PP=703;SC=ACTCGGCCATGGCTCACTTTC;SOR=2.649;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=33;WE=57144160;WS=57144142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr11	57146225	rs34108746	A	G	3095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.449;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=61;PP=1953;ReadPosRankSum=0.707;SC=TGAATGCGATAGTTGAAGTTG;SOR=0.813;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=258;TCF=139;TCR=119;TR=140;WE=57146242;WS=57146215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,148:0.54:275
chr11	57147016	rs540687	A	G	5884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=110;NR=89;PP=2965;SC=GTAGCGGCAGATCTTGCACCT;SOR=0.800;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=199;TCF=110;TCR=89;TR=199;WE=57147024;WS=57147006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr11	57147353	rs544079	G	C	1001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=27;PP=772;SC=CTCCAGCAACGTCGCTCGAGC;SOR=4.047;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=30;WE=57147361;WS=57147343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	57148053	rs571651	G	T	823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=5;PP=587;SC=AAATAAAAGCGGGGGGAGGGG;SOR=2.546;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=29;WE=57148061;WS=57148043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr11	57148175	rs669661	A	G	3066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=48;PP=1882;SC=AGCAAGAGGCATTGCATATCT;SOR=0.836;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=61;TCR=48;TR=108;WE=57148183;WS=57148165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr11	57155001	rs536455	G	A	6453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=112;NR=103;PP=2965;SC=CGACGCCAGTGGCCTCCTGTG;SOR=0.701;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=215;TCF=112;TCR=103;TR=215;WE=57155009;WS=57154991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr11	57155288	rs630396	T	C	2581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=39;PP=1364;SC=CAGCCCAGTATGCAAAGTTCC;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=45;TCR=39;TR=84;WE=57155296;WS=57155278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr11	57157405	rs490358	A	G	7392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=126;NR=128;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.087;SC=GCCAGAAGTAAGGGGAGTTTC;SOR=0.789;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=259;TCF=130;TCR=129;TR=254;WE=57157413;WS=57157393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,281:0.99:283
chr11	57184159	rs76902697	C	T	1122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.742;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=29;PP=675;ReadPosRankSum=-1.054;SC=GAAACAAAAGCCCCACCAGCA;SOR=0.589;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=97;TCF=41;TCR=56;TR=51;WE=57184167;WS=57184149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,55:0.52:106
chr11	57184218	rs4938865	C	T	861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=27;PP=667;SC=GAGGGAATAGCATGGTGAATC;SOR=4.615;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=30;WE=57184226;WS=57184208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr11	57243588	rs2258835	A	G	7053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=139;NR=99;PP=2965;SC=TCTGCACCCTACCTCAGGCCC;SOR=1.056;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=240;TCF=140;TCR=100;TR=238;WE=57243596;WS=57243578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr11	57256530	rs36069501	G	A	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.001;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=16;PP=345;ReadPosRankSum=-1.554;SC=GAGGGGTAGGGCGAAGAGGCC;SOR=0.906;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=62;TCF=23;TCR=39;TR=24;WE=57256538;WS=57256520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,25:0.37:68
chr11	57258617	rs2729384	T	C	3799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=79;NR=50;PP=2284;SC=AAGCAACAAGTTGCTGGATGT;SOR=1.092;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=79;TCR=50;TR=129;WE=57258625;WS=57258607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr11	57265400	rs2581922	C	T	425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=13;PP=326;SC=ATACAATAGCCCCAGGAGACG;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=57265408;WS=57265390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	57268170	rs2250673	T	C	177.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=1;PP=129;SC=CCCCAGCCCATTCATACTGCC;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=57268178;WS=57268160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr11	57313469	rs12223229	C	G	5478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=95;NR=88;PP=2965;SC=CCGGGGGCCCCGGGCACAGAA;SOR=0.722;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=183;TCF=95;TCR=88;TR=183;WE=57313477;WS=57313459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr11	57313659	rs2649658	G	A	1105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=12;PP=789;SC=GGCCCTTCATGGCCTCCTGCC;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=23;TCR=12;TR=35;WE=57313667;WS=57313649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr11	57320044	rs2234412	T	C	1693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=48;PP=1453;SC=TGGCTGCCCGTTCCCAATGTC;SOR=4.174;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=5;TCR=48;TR=53;WE=57320052;WS=57320034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr11	57367222	rs1005510	C	T	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.160;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=143;ReadPosRankSum=-0.648;SC=GCTCATCTGCCGCACTGTCAG;SOR=3.647;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=8;WE=57367230;WS=57367212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr11	57369730	rs11229063	G	A	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=193;ReadPosRankSum=1.498;SC=AGAAAGGACAGAGGGAATGTT;SOR=0.465;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=10;WE=57369738;WS=57369720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr11	57374332	rs11603020	T	C	2676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.186;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=61;PP=1731;ReadPosRankSum=-0.324;SC=ATCAGAAGACTCTGGTGGCTT;SOR=0.509;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=186;TCF=83;TCR=103;TR=113;WE=57374340;WS=57374322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,124:0.59:209
chr11	57379170	rs2511988	A	G	853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.817;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=11;PP=491;ReadPosRankSum=1.477;SC=GACTGTTAAGATGCATCTCTT;SOR=0.799;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=73;TCF=49;TCR=24;TR=35;WE=57379178;WS=57379160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,41:0.47:87
chr11	57381989	rs4926	G	A	1751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=44;PP=1120;ReadPosRankSum=1.184;SC=CTTCCTCTTCGTGCTCTGGGA;SOR=0.674;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=127;TCF=57;TCR=70;TR=78;WE=57381997;WS=57381979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,82:0.59:139
chr11	57413943	rs12793139	C	G	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.983;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=269;ReadPosRankSum=1.874;SC=AGTCCCCAGACAGCCCAAGGG;SOR=0.330;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=16;WE=57413951;WS=57413933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,19:0.70:27
chr11	57414387	rs7947357	A	G	3383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=53;PP=2119;SC=GGTGATGTTCAGGCTAGCCTG;SOR=0.742;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=116;TCF=63;TCR=53;TR=116;WE=57414395;WS=57414377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr11	57424389	rs55969690	GA	G	397.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.91;ReadPosRankSum=0.817;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,21:0.84:25
chr11	57456244	rs549022	C	T	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.829;NF=6;NR=13;PP=283;ReadPosRankSum=-0.497;SC=TGTCTAACTACGTTGGCCACA;SOR=0.784;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=19;WE=57456252;WS=57456234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr11	57461225	rs141993890	GTC	G	101.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.133;HP=2;HapScore=3;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=1.853;NF=5;NR=1;PP=108;ReadPosRankSum=0.179;SC=CTCTCGCTGTGTCTCTCTCTC;SOR=0.245;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=6;WE=57461234;WS=57461215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,7:0.20:35
chr11	57463500	rs1783978	T	C	2889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=44;PP=1828;SC=ACACCTCGGCTTGGCTACTAA;SOR=0.795;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=47;TCR=44;TR=91;WE=57463508;WS=57463490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr11	57467035	rs11604333	C	G	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.101;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=116;ReadPosRankSum=-1.065;SC=TTGACTCTACCTGCCTTCATG;SOR=0.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=7;WE=57467043;WS=57467025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr11	57507983	rs4827	C	T	748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=24;PP=488;ReadPosRankSum=-0.092;SC=AAGCTTGGGTCAGTGTGTTAA;SOR=0.986;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=50;TCF=8;TCR=42;TR=28;WE=57507991;WS=57507973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,32:0.60:53
chr11	57509429	rs635663	A	G	3414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=65;PP=2486;SC=CGGCAGCAGTAAGTGGGGACC;SOR=1.302;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=40;TCR=65;TR=105;WE=57509437;WS=57509419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr11	57571232	rs11229137	C	T	6116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.14;SOR=0.745;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr11	57581613	rs623541	C	A	403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=3;PP=290;SC=ATAGTGAGACCTCATCTCTAC;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=57581621;WS=57581603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	57798723	rs921135	A	G	5418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=82;PP=2965;SC=TCTTATGCTGATTGCCTATCC;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=172;TCF=90;TCR=82;TR=172;WE=57798731;WS=57798713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr11	57798942	rs2513726	A	G	9966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=377;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=173;NR=160;PP=2965;SC=CTAACATTTTATGGCCCAAAT;SOR=0.731;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=335;TCF=174;TCR=161;TR=333;WE=57798950;WS=57798932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,375:1.00:375
chr11	57947264	rs11229273	C	G	1570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.297;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=31;PP=1118;ReadPosRankSum=0.052;SC=ACCTCTTGGCCCTCATGGCCT;SOR=1.071;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=168;TCF=93;TCR=75;TR=76;WE=57947272;WS=57947254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,80:0.44:181
chr11	57970980	rs11229277	AC	GT	8247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=421;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.180;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-8.021;NF=101;NR=90;PP=2944;ReadPosRankSum=0.370;SC=GAAGATGAGTACAAAGGGGAA;SOR=0.519;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=392;TCF=191;TCR=201;TR=191;WE=57970989;WS=57970962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:207,211:0.50:418
chr11	57971201	rs11229280	G	A	4170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=386;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.443;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.449;NF=92;NR=76;PP=2337;ReadPosRankSum=-1.382;SC=TGCCGAACCTGGCCCGCATGA;SOR=0.730;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=339;TCF=174;TCR=165;TR=168;WE=57971209;WS=57971191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:189,197:0.51:386
chr11	57971478	rs11229281	A	G	2798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.424;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=53;PP=1874;ReadPosRankSum=0.749;SC=GATAGCCACAATGATGAGCCC;SOR=0.643;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=276;TCF=162;TCR=114;TR=121;WE=57971486;WS=57971468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,132:0.44:303
chr11	57982229	rs1966836	A	G	2763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.008;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=47;PP=1775;ReadPosRankSum=2.226;SC=GAAGACTTTTAGTTCCTTTCT;SOR=0.786;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=213;TCF=126;TCR=87;TR=117;WE=57982237;WS=57982219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,126:0.54:235
chr11	57982584	rs1966835	T	C	2246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.039;NF=56;NR=36;PP=1256;ReadPosRankSum=-0.327;SC=TTTGTCGTCATTGACAATTTG;SOR=0.665;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=218;TCF=127;TCR=91;TR=92;WE=57982592;WS=57982574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,110:0.44:252
chr11	57982620	rs1966834	A	G	3075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.323;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-1.013;NF=74;NR=64;PP=1704;ReadPosRankSum=1.077;SC=GCCTATGACCACTTTGTGGCG;SOR=0.675;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=283;TCF=144;TCR=139;TR=138;WE=57982628;WS=57982610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,157:0.49:320
chr11	57982726	rs1993089	G	T	1413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-3.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.627;HP=1;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.049;NF=25;NR=41;PP=911;ReadPosRankSum=0.367;SC=TTATTGCTCTGACACACACCC;SOR=0.753;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=133;TCF=55;TCR=78;TR=66;WE=57982734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,69:0.47:146
chr11	57982763	rs1993088	A	G	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.445;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-6.744;NF=15;NR=18;PP=521;ReadPosRankSum=0.055;SC=GCTCTTCTGTAACCACAACAC;SOR=1.364;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=89;TCF=48;TCR=41;TR=33;WE=57982771;WS=57982753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,29:0.32:91
chr11	57982832	rs2867400	T	A	1571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=3.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.292;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-9.352;NF=48;NR=20;PP=999;ReadPosRankSum=-0.778;SC=TTCAGATACATTGATCAATGA;SOR=1.014;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=183;TCF=119;TCR=64;TR=68;WE=57982840;WS=57982822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,76:0.37:207
chr11	57982896	rs2903566	G	T	3650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-2.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=402;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-8.061;NF=87;NR=64;PP=1858;ReadPosRankSum=1.087;SC=TTTACACTCAGCTTCTTTTCC;SOR=0.708;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=346;TCF=198;TCR=148;TR=151;WE=57982904;WS=57982886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:217,185:0.46:402
chr11	57995330	rs17555381	C	T	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=134;ReadPosRankSum=-2.036;SC=AGTTCTGTGTCATTTAGAGTT;SOR=0.392;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=9;WE=57995338;WS=57995320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr11	57995777	rs11229301	G	A	948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.21;ReadPosRankSum=-0.150;SOR=0.601;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,49:0.48:103
chr11	57996084	rs61902844	G	A	1949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.112;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=39;PP=1287;ReadPosRankSum=0.141;SC=CCCCCAAAATGTTGGAAAGCA;SOR=0.784;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=179;TCF=104;TCR=75;TR=92;WE=57996092;WS=57996074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,96:0.49:194
chr11	57996312	rs4245219	C	G	3844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=77;PP=2300;SC=ACTCAGTGGGCTCAGACTGGT;SOR=1.171;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=134;TCF=57;TCR=77;TR=134;WE=57996320;WS=57996302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr11	58125620	rs4127353	T	C	1538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=24;PP=968;ReadPosRankSum=2.072;SC=ATCTAGAGAATATTTTGCCTT;SOR=0.674;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=153;TCF=98;TCR=55;TR=67;WE=58125628;WS=58125610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,76:0.44:172
chr11	58126305	rs4939208	A	T	1914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.489;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=44;PP=1096;ReadPosRankSum=1.286;SC=AACCCAGTTAAAACCTTTGGA;SOR=0.759;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=209;TCF=101;TCR=108;TR=85;WE=58126313;WS=58126295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,96:0.42:230
chr11	58169996	rs12279895	T	C	2383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=50;PP=1392;ReadPosRankSum=-1.050;SC=GAATGCACTCTTCACTTCCTT;SOR=0.669;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=196;TCF=97;TCR=99;TR=99;WE=58170004;WS=58169986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,114:0.51:223
chr11	58170025	rs12271646	C	G	2069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.740;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=37;PP=1183;ReadPosRankSum=0.096;SC=GACTATAGACCAGAGGGTTCA;SOR=0.682;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=171;TCF=91;TCR=80;TR=82;WE=58170033;WS=58170015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,99:0.50:197
chr11	58170143	rs11229409	C	G	1379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.149;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=26;PP=751;ReadPosRankSum=-0.185;SC=ATAGAAGATGCCGACTGCAAT;SOR=0.634;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=118;TCF=64;TCR=54;TR=55;WE=58170151;WS=58170133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,66:0.48:137
chr11	58170291	rs11229410	T	C	1128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.646;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=21;PP=686;ReadPosRankSum=-0.435;SC=ACAACATAAATAAGAACAAGC;SOR=0.626;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=121;TCF=71;TCR=50;TR=49;WE=58170299;WS=58170281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,55:0.41:135
chr11	58170342	rs11229411	C	T	1539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=37;PP=1007;ReadPosRankSum=-2.117;SC=ACCATGACTGCTGGAATATCA;SOR=0.662;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=189;TCF=104;TCR=85;TR=77;WE=58170350;WS=58170332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,78:0.40:197
chr11	58170374	rs12280114	T	C	1698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.656;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=39;PP=1055;ReadPosRankSum=1.549;SC=ATGGACTTCATTGGACTTACA;SOR=0.780;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=205;TCF=107;TCR=98;TR=84;WE=58170382;WS=58170364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,91:0.41:223
chr11	58170469	rs11229412	C	A	986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.309;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=20;PP=553;ReadPosRankSum=-0.748;SC=GACGAGCACACACAGTTGTTG;SOR=0.514;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=113;TCF=51;TCR=62;TR=40;WE=58170477;WS=58170459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,49:0.38:129
chr11	58170738	rs11229413	A	G	3065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.444;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=60;PP=1789;ReadPosRankSum=-0.127;SC=CAGGAATCCCAGAATATCAAT;SOR=0.705;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=233;TCF=120;TCR=113;TR=125;WE=58170746;WS=58170728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,146:0.54:269
chr11	58170927	rs12278966	A	G	707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.519;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=22;PP=481;ReadPosRankSum=-0.270;SC=AATACAAAAAAGAACAGTGTG;SOR=0.252;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=46;TCF=8;TCR=38;TR=28;WE=58170935;WS=58170917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,30:0.59:51
chr11	58190112	rs10466659	A	G	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.757;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=17;PP=583;ReadPosRankSum=1.428;SC=AACTAGAAGAACAAAAAAGAT;SOR=0.409;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=90;TCF=52;TCR=38;TR=36;WE=58190120;WS=58190102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,40:0.39:103
chr11	58190136	rs4298923	A	G	2949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=32;PP=1866;SC=AAAGCTTGACATAAAAACCAG;SOR=1.380;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=60;TCR=32;TR=92;WE=58190144;WS=58190126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr11	58190747	rs1893902	A	G	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.960;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=325;ReadPosRankSum=-2.466;SC=GTATTATCTGAGAAACTTAAG;SOR=1.628;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=17;WE=58190755;WS=58190737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr11	58207203	rs11229457	C	T	2313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.26;ReadPosRankSum=-0.224;SOR=0.680;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:142,108:0.43:250
chr11	58207203	.	CA	TG	1443	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=40;NR=49;PP=1443;QD=16.814245785;SC=TATGGCCAGGCAAGCACATAC;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=221;TCF=103;TCR=118;TR=89;WE=58207212;WS=58207193;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:132,89:0.40:221
chr11	58207204	rs4938895	A	G	8785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.57;SOR=0.895;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr11	58378382	rs2245938	G	C	951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=3;PP=671;SC=AGACATGTTCGCTACAACCAG;SOR=3.912;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=26;WE=58378390;WS=58378372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr11	58378424	rs8373	A	G	869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.915;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=11;PP=590;ReadPosRankSum=1.663;SC=TATTTTTAGTAGTGAAGAGGA;SOR=0.489;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=75;TCF=55;TCR=20;TR=35;WE=58378432;WS=58378414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,39:0.46:85
chr11	58379663	rs139680226	CGT	C	251.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=1.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.13;MQRankSum=0.000;QD=3.19;ReadPosRankSum=0.071;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,15:0.19:79
chr11	58381686	rs1938596	A	G	4888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=120;NR=74;PP=2965;SC=CGCCCCTTTCACTTTCTCTGT;SOR=1.411;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=196;TCF=122;TCR=74;TR=194;WE=58381694;WS=58381676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr11	58386049	rs11426880	A	AT	256.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.94;ReadPosRankSum=-0.798;SOR=0.746;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr11	58386177	rs3168135	G	A	3025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.889;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=69;PP=1642;ReadPosRankSum=1.111;SC=AAGAAGCACAGCCAGCCTCTG;SOR=0.721;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=264;TCF=136;TCR=128;TR=137;WE=58386185;WS=58386167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,150:0.51:292
chr11	58391501	rs1800169	G	A	777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=10;PP=498;ReadPosRankSum=1.589;SC=CTGTATCCTCGGCCAGGTGAA;SOR=0.742;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=43;TCR=19;TR=33;WE=58391509;WS=58391491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,36:0.53:68
chr11	58478084	rs675815	T	C	6287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=107;NR=93;PP=2965;SC=TTTGCCACCATTGGGAGATAA;SOR=0.764;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=201;TCF=108;TCR=93;TR=200;WE=58478092;WS=58478074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr11	58491921	rs10896818	A	T	4543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=67;PP=2779;SC=TTCCTCAAGGATTTCTCCAGC;SOR=0.843;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=154;TCF=87;TCR=67;TR=154;WE=58491929;WS=58491911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr11	58492073	rs58778620	GTT	G	985.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=0;NR=25;PP=366;SC=TAATGACCAGGTTTTTTTTTT;SOR=2.147;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=25;WE=58492083;WS=58492063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr11	58602309	rs11229651	C	T	3984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=48;PP=2201;SC=AAGTTTCCTTCCCTGTGAAGA;SOR=1.017;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=82;TCR=48;TR=130;WE=58602317;WS=58602299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr11	58604712	rs11229653	T	C	5026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=82;PP=2657;SC=GAATAAACCATGGATCTTTTT;SOR=0.714;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=170;TCF=88;TCR=82;TR=169;WE=58604720;WS=58604702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr11	58605673	rs11229655	T	C	1365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=13;PP=937;SC=AGTTCCCTCATTGCCATGCAG;SOR=2.030;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=32;TCR=13;TR=45;WE=58605681;WS=58605663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr11	58605922	rs10896850	A	G	2142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=48;PP=1468;SC=ATAAGACATGACATGAGAAAT;SOR=1.609;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=74;TCF=25;TCR=49;TR=73;WE=58605930;WS=58605912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr11	58674948	rs150638642	TTTTG	T	1008.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=14;PP=666;SC=TTTCGCTCTTTTTTGTTTGTT;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=15;WE=58674959;WS=58674938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	58892376	.	CA	C	52.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.726;ClippingRankSum=0.000;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=5.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.08;MQRankSum=2.376;QD=0.44;ReadPosRankSum=1.311;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,17:0.14:120
chr11	58919813	rs10896928	A	G	8709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=140;NR=146;PP=2965;SC=TCAAGGATGCACTGTGCAAGG;SOR=0.881;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=286;TCF=140;TCR=146;TR=286;WE=58919821;WS=58919803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,322:1.00:322
chr11	58940278	rs12796683	G	T	336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=7;PP=195;SC=GCCAAGACACGGGTGAGCCAG;SOR=1.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=12;TCF=5;TCR=7;TR=12;WE=58940286;WS=58940268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	58978940	rs544864	C	T	3554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-3.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=65;PP=1942;ReadPosRankSum=2.627;SC=TGGCTGCTGGCCACACACCAA;SOR=0.700;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=281;TCF=156;TCR=125;TR=150;WE=58978956;WS=58978930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,170:0.55:309
chr11	59056153	rs1894123	C	T	4509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=64;PP=2869;SC=GGAGTTGGTTCGGTTTGAGAG;SOR=1.035;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=94;TCR=64;TR=158;WE=59056161;WS=59056143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr11	59056250	.	C	T	1996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.245;ClippingRankSum=0.000;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.546;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=43;PP=1104;ReadPosRankSum=0.580;SC=CCAGCAGAGGCGGTCACAGCA;SOR=0.629;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=169;TCF=81;TCR=88;TR=86;WE=59056258;WS=59056240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,97:0.53:182
chr11	59189405	rs9988824	T	C	1736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=17;PP=1044;ReadPosRankSum=1.448;SC=TTTAAAATTATGTAAATGTCT;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=60;TCF=43;TCR=17;TR=59;WE=59189413;WS=59189395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,64:0.98:65
chr11	59189912	rs1453547	G	A	3004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=51;PP=1685;ReadPosRankSum=1.702;SC=GATCATATAGGGCCCACAGAA;SOR=0.720;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=238;TCF=130;TCR=108;TR=117;WE=59189920;WS=59189902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,138:0.51:272
chr11	59190120	rs17153691	A	G	1598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.850;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=37;PP=1087;ReadPosRankSum=0.755;SC=CAGAAGACAAAGTACTGAGTG;SOR=0.543;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=164;TCF=80;TCR=84;TR=73;WE=59190128;WS=59190110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,77:0.42:184
chr11	59190499	rs11602535	T	C	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=22;PP=529;ReadPosRankSum=0.023;SC=TTGTTTGTTATTGTAAGAGTG;SOR=0.775;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=41;TCF=6;TCR=35;TR=26;WE=59190507;WS=59190489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,26:0.58:45
chr11	59190529	rs34222593	TACAA	T	400.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=309;ReadPosRankSum=-2.044;SC=TAGAAGATCATACAAACAGTC;SOR=0.317;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=8;WE=59190540;WS=59190519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr11	59210550	rs7947825	G	A	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.09;ReadPosRankSum=-0.566;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr11	59210761	rs11605572	C	G	2443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=47;PP=1638;ReadPosRankSum=0.035;SC=TCTATCTTACCACCCTGGCCT;SOR=0.701;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=190;TCF=110;TCR=80;TR=110;WE=59210769;WS=59210751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,120:0.55:217
chr11	59211421	rs17591107	C	T	1798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.032;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=29;PP=1132;ReadPosRankSum=0.033;SC=CAGCCCTTTTCGTGTACTTGC;SOR=1.168;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=139;TCF=79;TCR=60;TR=76;WE=59211429;WS=59211411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,83:0.55:151
chr11	59224608	rs1453544	A	G	2568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.988;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=46;PP=1691;ReadPosRankSum=-1.388;SC=ACACACTCCTATGTACTTTCT;SOR=1.033;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=271;TCF=148;TCR=123;TR=115;WE=59224616;WS=59224598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,124:0.42:296
chr11	59224720	rs1453543	A	G	8518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=140;NR=146;PP=2965;ReadPosRankSum=1.160;SC=TCCTACAATGACTGCATGGCA;SOR=0.253;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=288;TCF=141;TCR=147;TR=286;WE=59224728;WS=59224710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,307:1.00:308
chr11	59224885	rs1453542	G	C	5284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=87;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.102;SC=TCTTGGGTGAGTGGTGGTTTG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=181;TCF=94;TCR=87;TR=180;WE=59224893;WS=59224875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,188:0.99:190
chr11	59225221	rs1453541	T	C	6998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=138;NR=99;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.157;SC=CGGCCCTTCATGACGCTGCCC;SOR=0.882;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=239;TCF=139;TCR=100;TR=237;WE=59225229;WS=59225211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,263:0.99:265
chr11	59345898	rs495564	G	A	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=19;PP=403;ReadPosRankSum=0.929;SC=TAATGGTTAGGTCCTGTTATA;SOR=0.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=54;TCF=17;TCR=37;TR=27;WE=59345906;WS=59345888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,27:0.49:55
chr11	59361787	rs3216084	AT	A	370.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.559;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=229;ReadPosRankSum=1.030;SC=AGACAGTTTAATTTTTTTTGC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=15;WE=59361795;WS=59361777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
chr11	59368213	rs80049069	C	T	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.747;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr11	59368218	rs367608218	CA	C	48.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=12.490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.57;ReadPosRankSum=1.262;SOR=0.993;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,11:0.35:31
chr11	59368691	rs55667192	C	G	1312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=12;PP=890;ReadPosRankSum=-0.426;SC=AAATATGATGCTAAAATACCA;SOR=0.695;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=81;TCF=62;TCR=19;TR=49;WE=59368699;WS=59368681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,54:0.58:93
chr11	59369401	rs7106463	A	G	1707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=38;PP=1216;SC=CTTATTCTGGAAACTTTTAAC;SOR=2.001;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=16;TCR=38;TR=54;WE=59369409;WS=59369391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr11	59427010	.	GT	G	121.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.681;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=6.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.07;ReadPosRankSum=1.126;SOR=0.916;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr11	59480951	rs499033	T	C	5795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=108;NR=81;PP=2965;SC=CGCTATAAACTGGTCATAAGC;SOR=0.844;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=189;TCF=108;TCR=81;TR=189;WE=59480959;WS=59480941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr11	59558128	rs370918929	AT	A	82.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=1.413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.41;MQRankSum=2.516;QD=1.88;ReadPosRankSum=0.190;SOR=1.018;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,11:0.25:44
chr11	59623378	rs34324219	C	A	1835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.147;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=39;PP=1003;ReadPosRankSum=-1.496;SC=TTGTTAATATCCAAGAAGGTC;SOR=0.678;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=196;TCF=107;TCR=89;TR=83;WE=59623386;WS=59623368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,92:0.45:205
chr11	59626477	rs370252349	TA	T	489.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=9.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.14;MQRankSum=1.196;QD=7.00;ReadPosRankSum=-0.075;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,32:0.46:70
chr11	59829804	rs506053	C	T	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=31;ReadPosRankSum=-0.135;SC=GATAAGCTCTCGTTCTGTTAA;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=4;WE=59829812;WS=59829795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr11	59830103	rs481950	A	G	1755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.867;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=39;PP=1000;ReadPosRankSum=0.701;SC=TCCCCTGGCTATATGTTATTT;SOR=0.855;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=146;TCF=70;TCR=76;TR=73;WE=59830111;WS=59830093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,85:0.48:176
chr11	59830198	rs533855	T	C	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.939;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=144;ReadPosRankSum=-0.758;SC=GGTTTTGATTTGCAATTCTTG;SOR=1.179;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=12;WE=59830206;WS=59830188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,12:0.34:35
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chr11	59940407	rs592346	A	G	2931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.73;QD=42.49;SOR=2.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr11	59940599	rs7232	T	A	2314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.017;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=58;PP=1513;ReadPosRankSum=-0.721;SC=AGAGAGAGAGTTCCCTGAAAG;SOR=0.603;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=209;TCF=94;TCR=115;TR=106;WE=59940607;WS=59940589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,111:0.48:233
chr11	59942757	rs662196	C	T	231.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=187;SC=ATAAACCTGGCTTTCCCCCAG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=59942765;WS=59942747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	59946302	rs598862	C	T	5110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.94;SOR=1.256;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr11	59946466	rs587634	T	A	483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=10;PP=261;SC=TGTAGTGTAATGTAGTAGCTT;SOR=2.584;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=59946474;WS=59946456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	59947252	rs583791	C	T	4450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=97;NR=44;PP=2712;SC=AAGCTATTGGCATCTTCCTCC;SOR=1.580;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=141;TCF=97;TCR=44;TR=141;WE=59947260;WS=59947242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr11	59997223	rs11230202	A	G	610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.794;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=339;ReadPosRankSum=0.121;SC=GTGATAGAATATTATATATTT;SOR=0.189;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=42;TCF=37;TCR=5;TR=22;WE=59997231;WS=59997213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,25:0.51:49
chr11	59997296	rs11230203	G	A	1584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.573;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=23;PP=812;ReadPosRankSum=-0.056;SC=GTATTATGAGGCTAGCGGGAC;SOR=0.636;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=155;TCF=100;TCR=55;TR=66;WE=59997304;WS=59997286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,78:0.45:175
chr11	59997335	rs608659	T	C	7014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=133;NR=104;PP=2965;SC=TCTGATCAAATGTGAGTTTAC;SOR=0.821;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=237;TCF=133;TCR=104;TR=237;WE=59997343;WS=59997325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
chr11	60050125	rs10792260	A	G	3739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=58;PP=2116;SC=CAGATGTCTCAATATAGGAAT;SOR=0.895;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=120;TCF=62;TCR=58;TR=120;WE=60050133;WS=60050115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr11	60057715	rs4939331	A	G	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=156;ReadPosRankSum=-1.379;SC=GATTATAAACAGTAATTTATG;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=8;WE=60057723;WS=60057705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr11	60060016	rs2044981	T	C	615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=15;PP=431;SC=AACTATATAGTATTCTGTCAC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=60060024;WS=60060006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	60070176	rs6591561	A	G	2498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.938;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=61;PP=1626;ReadPosRankSum=1.084;SC=TCATGGGACTATGTCCATCTT;SOR=1.119;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=234;TCF=112;TCR=122;TR=107;WE=60070184;WS=60070166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,112:0.45:248
chr11	60073597	rs4644658	C	T	4216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=48;PP=2528;SC=GGTGCTCCTCCTAAGTGTGCT;SOR=1.445;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=88;TCR=48;TR=136;WE=60073605;WS=60073587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr11	60073702	rs3018806	A	T	5555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=108;PP=2965;SC=TTTGAAGATGACTGTATTAGT;SOR=1.066;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=187;TCF=79;TCR=108;TR=187;WE=60073710;WS=60073692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr11	60102384	rs2304935	A	G	1731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.652;HP=4;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.311;NF=39;NR=27;PP=2102;ReadPosRankSum=2.023;SC=ATCACAACCTATTTCCAATGA;SOR=0.796;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=114;TCF=66;TCR=48;TR=66;WE=60102404;WS=60102374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,81:0.60:135
chr11	60102396	rs2304934	A	G	1741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.367;HP=2;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.306;NF=37;NR=32;PP=2102;ReadPosRankSum=0.950;SC=TTCCAATGAGACCATCATAAT;SOR=0.573;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=117;TCF=66;TCR=51;TR=69;WE=60102404;WS=60102374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,82:0.60:137
chr11	60102507	rs2304933	G	T	1804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=26;PP=974;ReadPosRankSum=-0.566;SC=AAAAGTCAAAGTTATTGGGGT;SOR=0.718;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=141;TCF=81;TCR=60;TR=67;WE=60102515;WS=60102497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,84:0.50:169
chr11	60102631	rs10792268	A	G	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=22;PP=514;ReadPosRankSum=0.622;SC=TGCTGGAGGGACTTTGGGGTA;SOR=0.569;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=55;TCF=14;TCR=41;TR=31;WE=60102639;WS=60102621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,33:0.57:58
chr11	60102790	rs1443250	G	A	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=181;ReadPosRankSum=0.195;SC=TTTCTTTTACGAAAGTAATGG;SOR=1.022;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=9;WE=60102798;WS=60102785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
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chr11	60105199	rs2289614	G	C	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=365;ReadPosRankSum=-0.633;SC=TTCTTACCCAGCATGTCTCTT;SOR=0.683;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=39;TCF=31;TCR=8;TR=22;WE=60105207;WS=60105189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,23:0.55:42
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chr11	60152482	rs2233243	A	G	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.957;NF=12;NR=6;PP=556;ReadPosRankSum=-0.902;SC=TATACTCTTTATACTTTACCG;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=41;TCF=27;TCR=14;TR=18;WE=60152490;WS=60152458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
chr11	60152531	rs2233244	A	C	1426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.918;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.904;NF=37;NR=28;PP=669;ReadPosRankSum=-1.010;SC=TTTGAAGTGCAGTCTAGATTT;SOR=0.311;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=112;TCF=70;TCR=42;TR=65;WE=60152539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,71:0.56:127
chr11	60152563	rs950803	T	A	1755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.843;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.945;NF=45;NR=30;PP=1068;ReadPosRankSum=-0.821;SC=TCTTGTAGACTGTCCAGATCC;SOR=0.854;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=157;TCF=92;TCR=65;TR=75;WE=60152571;WS=60152553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,86:0.48:180
chr11	60152584	rs950802	G	A	1632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.548;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.920;NF=42;NR=32;PP=934;ReadPosRankSum=0.509;SC=TGTGTTGCCTGTTGATTTCAA;SOR=0.775;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=160;TCF=90;TCR=70;TR=74;WE=60152592;WS=60152574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,84:0.46:181
chr11	60157107	rs2233252	T	G	2891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.417;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=61;PP=1849;ReadPosRankSum=-0.678;SC=TCATGTGAAATCTCTGTGTCT;SOR=0.592;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=267;TCF=145;TCR=122;TR=129;WE=60157115;WS=60157097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,139:0.49:284
chr11	60157166	rs2233253	C	T	1506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.552;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=42;PP=983;ReadPosRankSum=0.430;SC=TTGGTCGGTCCGAATGCCTGG;SOR=0.630;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=175;TCF=76;TCR=99;TR=73;WE=60157174;WS=60157156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,77:0.41:186
chr11	60163958	rs6591579	G	A	1302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=0;PP=1030;SC=GCTCATCTCTGAGGGCTCCAT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=40;WE=60163966;WS=60163948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr11	60164204	rs2241920	G	A	1378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.701;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=42;PP=997;ReadPosRankSum=-1.122;SC=GTCCTCTCCAGTCAATAGGTC;SOR=0.610;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=118;TCF=37;TCR=81;TR=62;WE=60164212;WS=60164194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,63:0.48:130
chr11	60164302	rs2241921	C	T	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.375;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=189;ReadPosRankSum=0.886;SC=GTTAATTCTACTTTTCCCCCT;SOR=3.145;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=10;WE=60164310;WS=60164292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr11	60165352	rs3217518	ATT	A	6370.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=3.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=379;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.777;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.118;NF=23;NR=66;PP=2947;ReadPosRankSum=1.512;SC=TGCTCTAATCATTGTGGGCTT;SOR=0.741;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=206;TCF=43;TCR=163;TR=89;WE=60165361;WS=60165342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:208,168:0.45:376
chr11	60172087	rs10750937	C	T	2252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.938;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=60;PP=1418;ReadPosRankSum=-0.415;SC=CAAGTATCCACGGCCCCAAGA;SOR=0.918;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=263;TCF=131;TCR=132;TR=113;WE=60172095;WS=60172077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,119:0.41:288
chr11	60172273	rs10897057	A	T	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=239;ReadPosRankSum=1.213;SC=CATAGCTCCCAATCCTTCTTC;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=13;WE=60172281;WS=60172263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr11	60173360	rs4938941	A	G	1073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=17;PP=599;ReadPosRankSum=-0.819;SC=CATTATTTGCAGGGAATTTTG;SOR=0.685;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=131;TCF=87;TCR=44;TR=51;WE=60173368;WS=60173350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,58:0.41:141
chr11	60173554	rs4939353	A	G	658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.062;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=16;PP=378;ReadPosRankSum=-0.132;SC=TTAGTAGGAAAAGCAGCATGC;SOR=0.296;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=56;TCF=15;TCR=41;TR=24;WE=60173562;WS=60173544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,30:0.45:66
chr11	60182970	rs7131283	A	T	1251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.676;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=19;PP=747;ReadPosRankSum=0.730;SC=CCCAGAAGAAAATGATCAATT;SOR=0.813;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=111;TCF=68;TCR=43;TR=55;WE=60182978;WS=60182960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,61:0.49:125
chr11	60183372	.	A	C	2295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.712;ClippingRankSum=0.000;DP=455;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=65;PP=1609;ReadPosRankSum=0.577;SC=TTCTGCACTAAAACTCGAAGA;SOR=0.690;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=413;TCF=202;TCR=211;TR=128;WE=60183380;WS=60183362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:316,137:0.30:453
chr11	60184191	rs3825020	G	A	3595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.840;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=72;PP=2199;ReadPosRankSum=-0.594;SC=ATCTAAAGATGGACAAGTTAA;SOR=0.767;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=293;TCF=153;TCR=140;TR=151;WE=60184199;WS=60184181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,166:0.51:324
chr11	60198328	rs708229	C	T	1442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.319;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=18;PP=826;ReadPosRankSum=-0.795;SC=TCCTTTTCACCTTGTTAAAAC;SOR=0.268;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=82;TCF=56;TCR=26;TR=50;WE=60198336;WS=60198318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,60:0.65:93
chr11	60202747	rs894590	C	A	1516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=30;NR=21;PP=833;SC=CAAAAGAGGCCTAAAAAGAAA;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=53;TCF=30;TCR=23;TR=51;WE=60202755;WS=60202737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr11	60202798	rs11377519	C	CA	1202.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=3;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=21;PP=299;ReadPosRankSum=-1.782;SC=CAGAACATAGCAAAAAAAAAA;SOR=1.203;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=28;WE=60202806;WS=60202788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,48:0.92:52
chr11	60230722	rs10792278	G	T	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=346;ReadPosRankSum=-0.734;SC=TTGGGTTAAAGTAATTAAGAA;SOR=0.569;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=46;TCF=13;TCR=33;TR=25;WE=60230730;WS=60230712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,28:0.58:48
chr11	60264755	rs2298551	G	A	1594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.273;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-1.050;NF=47;NR=25;PP=968;ReadPosRankSum=-0.845;SC=CTGGATAAACGTATCACTTTT;SOR=0.569;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=147;TCF=98;TCR=49;TR=72;WE=60264763;WS=60264745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,78:0.47:166
chr11	60264947	rs2298552	C	T	2400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=51;PP=1412;ReadPosRankSum=0.936;SC=CTCAGCCCTACGGCATCACAT;SOR=0.713;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=215;TCF=103;TCR=112;TR=95;WE=60264955;WS=60264937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,114:0.45:251
chr11	60265002	rs2298553	C	T	2204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.066;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=48;PP=1188;ReadPosRankSum=-1.306;SC=AGGAAATATACAAATGATAAA;SOR=0.800;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=182;TCF=85;TCR=97;TR=87;WE=60265010;WS=60264992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,105:0.49:213
chr11	60265164	rs2298554	G	A	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.771;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=91;ReadPosRankSum=-1.359;SC=AGTTCTGAACGTTATTCTGAA;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=6;WE=60265172;WS=60265154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr11	60268679	rs2186918	G	C	5954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=101;PP=2965;SC=TAGAACACCAGTCCTTCTTGG;SOR=0.959;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=187;TCF=86;TCR=101;TR=187;WE=60268687;WS=60268669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr11	60268736	rs2298555	C	A	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.194;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=20;PP=483;ReadPosRankSum=1.523;SC=CTATCTCCAGCCAATTCACAA;SOR=0.287;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=65;TCF=19;TCR=46;TR=32;WE=60268744;WS=60268726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,36:0.49:73
chr11	60271325	rs2298556	A	T	961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.811;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=22;PP=520;ReadPosRankSum=0.090;SC=TGCCTGCTCTATTTTCAGTCC;SOR=0.544;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=80;TCF=33;TCR=47;TR=39;WE=60271333;WS=60271315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,47:0.52:91
chr11	60274393	rs2298558	G	A	1603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.830;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;ReadPosRankSum=1.865;SC=TCCTACTATCGGCTTACCAGA;SOR=0.456;Source=Platypus;TCF=65;WE=60274401;WS=60274383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,73:0.48:152
chr11	60274640	rs2298559	T	C	1873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=3.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.827;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=52;PP=1362;ReadPosRankSum=-1.287;SC=GGAGAAAAACTACTTGCAAAA;SOR=1.013;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=148;TCF=52;TCR=96;TR=76;WE=60274648;WS=60274630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,82:0.50:163
chr11	60285575	rs10736706	A	G	4284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=68;PP=2319;SC=CATCTTTCACATTTTCATGTG;SOR=0.791;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=150;TCF=82;TCR=68;TR=150;WE=60285583;WS=60285565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr11	60291413	rs6591595	C	T	2395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.04;SOR=0.829;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr11	60291504	rs150439352	G	A	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.023;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=12;PP=228;ReadPosRankSum=0.721;SC=AAAATATAACGTCTAAACAAT;SOR=0.520;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=49;TCF=21;TCR=28;TR=22;WE=60291512;WS=60291494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,28:0.49:57
chr11	60309947	rs4939400	A	T	984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=4;PP=637;SC=GTTGTATAATATTAAGAAACA;SOR=3.545;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=29;WE=60309955;WS=60309937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	60310083	rs11230378	A	T	1850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.138;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=41;PP=1152;ReadPosRankSum=-0.066;SC=GCTGTTGCTGATGCCTGGTGT;SOR=0.790;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=159;TCF=82;TCR=77;TR=81;WE=60310091;WS=60310073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,89:0.48:184
chr11	60531346	rs1032939	T	G	1228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=23;NR=22;PP=740;SC=GAGCCACCGCTGGGGGCACAG;SOR=0.776;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=45;TCF=23;TCR=22;TR=45;WE=60531354;WS=60531336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr11	60534901	rs4939450	G	C	791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=0;PP=584;SC=CTTTCCCAGTGGCCAACAAGC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=60534909;WS=60534891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	60559805	rs931861	A	G	8290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=143;NR=142;PP=2965;SC=GTGAGTGGGCACACTGAGATC;SOR=0.752;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=285;TCF=143;TCR=142;TR=285;WE=60559813;WS=60559795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,313:1.00:313
chr11	60561613	rs751026	C	T	1546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=38;PP=1086;SC=CTGACTTCAGCGAAGGTGCTG;SOR=2.137;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=14;TCR=38;TR=52;WE=60561621;WS=60561603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr11	60563235	rs4938980	G	C	2936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=54;PP=1634;SC=TACAAGAGGAGCGTGTTTCAT;SOR=1.200;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=93;TCF=39;TCR=54;TR=93;WE=60563243;WS=60563225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr11	60567230	rs11230483	C	T	4995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=106;NR=68;PP=2965;SC=TATTTAATCTCAATGTCATTT;SOR=1.204;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=174;TCF=106;TCR=68;TR=174;WE=60567238;WS=60567220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr11	60567275	rs579967	G	A	7738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=143;NR=119;PP=2965;SC=AGCTGCTGTTGCTATTAATAT;SOR=0.823;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=262;TCF=143;TCR=119;TR=262;WE=60567283;WS=60567265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,292:1.00:292
chr11	60610065	rs2074420	G	A	10650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=397;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=197;NR=168;PP=2965;SC=AGCTACCGCCGGTCCCAGGAT;SOR=0.793;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=365;TCF=197;TCR=168;TR=365;WE=60610073;WS=60610055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,397:1.00:397
chr11	60617646	rs495949	T	C	10696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=406;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=208;NR=160;PP=2965;SC=AGGCTGCAGCTGCACTAATGT;SOR=0.869;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=369;TCF=208;TCR=161;TR=368;WE=60617654;WS=60617636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,405:1.00:405
chr11	60620585	rs2467642	A	G	7367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.65;SOR=1.172;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr11	60620590	rs2428461	C	G	7471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.21;SOR=1.192;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr11	60635091	rs550479	T	C	2554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=57;NR=34;PP=1454;SC=TACTGCTGGTTGCCACCCTGG;SOR=1.190;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=57;TCR=34;TR=91;WE=60635099;WS=60635081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr11	60635248	rs150743574	C	G	866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.761;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=21;PP=525;ReadPosRankSum=-0.962;SC=CTGGCAGAGTCCTGGCCCCTG;SOR=0.511;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=80;TCF=33;TCR=47;TR=37;WE=60635256;WS=60635238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,42:0.48:87
chr11	60637164	rs489172	C	T	3845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=385;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.819;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=73;PP=2204;ReadPosRankSum=-0.505;SC=TCTGTCTCAACCCCACAAACC;SOR=0.686;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=344;TCF=178;TCR=166;TR=160;WE=60637172;WS=60637154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:202,183:0.48:385
chr11	60638461	rs10897122	C	T	13694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.46;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,308:1.00:308
chr11	60638470	rs566411	A	G	14703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=347;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.37;SOR=1.139;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,347:1.00:347
chr11	60689445	rs555835	T	C	3681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=63;NR=70;PP=2047;SC=GGTCGGTGCCTGACCCTTCCA;SOR=0.877;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=64;TCR=72;TR=133;WE=60689453;WS=60689435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr11	60695301	rs575123	C	A	1443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=29;PP=898;SC=CACACCCTGCCGGCACTGCTC;SOR=1.358;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=18;TCR=29;TR=47;WE=60695309;WS=60695291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr11	60696399	rs61751216	G	A	3001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.896;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=60;PP=1757;ReadPosRankSum=1.058;SC=CTCCTGCTTCGGCACAACTTC;SOR=0.638;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=262;TCF=139;TCR=123;TR=130;WE=60696407;WS=60696389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,144:0.51:284
chr11	60703076	rs11230522	C	T	206.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=202;SC=TGGAGGTGATCAAGCAGTGGC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=60703084;WS=60703066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	60703777	rs55920775	G	A	2785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=57;NR=38;PP=1757;SC=GGAGGAGACCGAAGCCAGGGA;SOR=1.190;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=57;TCR=38;TR=95;WE=60703794;WS=60703767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr11	60705454	rs2905692	A	G	3446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=67;PP=1972;SC=CCATGATGGCACCCTGCATGG;SOR=1.397;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=44;TCR=67;TR=111;WE=60705462;WS=60705444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr11	60750048	rs2905506	T	C	888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=13;PP=584;ReadPosRankSum=2.006;SC=CCCCACTCCATTTGGTGTGCT;SOR=0.687;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=82;TCF=56;TCR=26;TR=39;WE=60750056;WS=60750038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,43:0.48:89
chr11	60750240	rs3019541	G	A	1162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.417;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=30;PP=657;ReadPosRankSum=-1.894;SC=GGAGGAAAGCGAGGTGCGAAG;SOR=0.992;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=115;TCF=44;TCR=71;TR=48;WE=60750248;WS=60750230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,55:0.44:124
chr11	60750298	rs72195127	GTCTGCAGGGAC	G	460.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=2954;ReadPosRankSum=1.035;SC=GAGAAGCCCAGTCTGCAGGGA;SOR=0.990;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=10;WE=60750316;WS=60750288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr11	60775007	rs4939485	C	T	1469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.811;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=25;PP=763;ReadPosRankSum=0.548;SC=CCACCGGTCTCAGCTCTCTGG;SOR=0.547;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=92;TCF=56;TCR=36;TR=62;WE=60775015;WS=60774997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,69:0.68:101
chr11	60776209	rs11230563	C	T	2103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=53;PP=1485;ReadPosRankSum=0.114;SC=GCCTATCCACCGGGACCAGGT;SOR=0.665;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=186;TCF=84;TCR=102;TR=95;WE=60776217;WS=60776199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,99:0.47:209
chr11	60776306	rs2074225	C	T	2297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.626;HP=3;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=48;PP=1357;ReadPosRankSum=-0.418;SC=GACGCGGGCGCGGTGTGCTCA;SOR=0.588;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=202;TCF=109;TCR=93;TR=102;WE=60776314;WS=60776296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,113:0.51:220
chr11	60776333	rs72926536	C	T	2244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FS=2.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.55;ReadPosRankSum=1.853;SOR=0.695;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:123,112:0.48:235
chr11	60776333	.	CA	TG	1200	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=49;NR=49;PP=1200;QD=12.790488519;SC=TGGGCGGAGTCACTGAAGCCC;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=214;TCF=109;TCR=105;TR=98;WE=60776342;WS=60776323;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:116,98:0.46:214
chr11	60776334	rs2905518	A	G	8202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.21;SOR=0.702;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr11	60776484	rs2074226	T	C	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=393;ReadPosRankSum=-0.242;SC=GAGAAAGTGGTAAATGCCCCC;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=16;WE=60776492;WS=60776474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,17:0.71:24
chr11	60777073	rs12360861	G	A	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=190;ReadPosRankSum=0.588;SC=GACAGGGGGCGCTGACCGCTG;SOR=0.941;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=23;TCF=16;TCR=7;TR=14;WE=60777081;WS=60777063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr11	60783108	rs2074229	C	T	9419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=115;NR=64;PP=2965;SC=TCACCTCTGCCGTTCATACTC;SOR=1.252;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=179;TCF=115;TCR=64;TR=179;WE=60783116;WS=60783098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr11	60783126	rs3019556	C	T	11593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.29;SOR=1.013;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
chr11	60783135	rs3019557	A	G	11979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.40;SOR=0.933;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,276:1.00:276
chr11	60784934	rs2074231	A	G	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=156;ReadPosRankSum=-1.370;SC=CCTCCCCACCACCGCCTCTGC;SOR=0.795;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=51;TCF=35;TCR=16;TR=14;WE=60784942;WS=60784924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,17:0.28:61
chr11	60785038	rs2074232	A	G	1334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.325;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=19;PP=843;ReadPosRankSum=-0.246;SC=TCAGGATGGGAAGGGGTGTGA;SOR=1.191;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=115;TCF=69;TCR=46;TR=56;WE=60785046;WS=60785028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,63:0.47:133
chr11	60785352	rs1050922	A	G	1417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.611;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=34;PP=851;ReadPosRankSum=-0.622;SC=GCACCTCTTCAGGGGAGGATT;SOR=0.756;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=138;TCF=63;TCR=75;TR=63;WE=60785360;WS=60785341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,69:0.47:147
chr11	60785463	rs12417503	C	T	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.822;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=11;PP=218;ReadPosRankSum=-1.269;SC=TGGAGCTGGCCGGCACCCAGC;SOR=0.172;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=29;TCF=10;TCR=19;TR=19;WE=60785471;WS=60785453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
chr11	60886519	rs79811054	T	C	2185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.433;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=55;PP=1438;ReadPosRankSum=-0.375;SC=CCCAGTTACATTGGAATTTCT;SOR=0.743;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=265;TCF=128;TCR=137;TR=103;WE=60886527;WS=60886509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:187,114:0.38:301
chr11	60890563	rs4245224	C	T	1318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.403;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=30;PP=719;ReadPosRankSum=-0.287;SC=AGGGGCTGCACTAGAGTCCTC;SOR=0.565;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=117;TCF=55;TCR=62;TR=59;WE=60890571;WS=60890553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,66:0.52:128
chr11	60891283	rs7103357	A	G	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.321;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=4;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=8;PP=204;ReadPosRankSum=0.775;SC=GCCCAGCCCCATCCCCACCCC;SOR=2.303;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=28;TCF=14;TCR=14;TR=13;WE=60891291;WS=60891273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr11	60891310	rs7106643	T	C	1876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=34;NR=26;PP=1403;SC=CCCCCACCCATACCTGCCCCC;SOR=0.917;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=34;TCR=26;TR=60;WE=60891318;WS=60891300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr11	60891421	rs12364279	C	T	3557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.399;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=76;PP=2040;ReadPosRankSum=1.502;SC=TAAGTGTCCCCGGAGGCAGGA;SOR=0.722;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=294;TCF=158;TCR=136;TR=161;WE=60891429;WS=60891411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,173:0.53:327
chr11	60892606	rs637186	A	G	6647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=123;PP=2965;SC=AGGAACTCCCACCTGTCAGCT;SOR=1.010;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=219;TCF=96;TCR=123;TR=219;WE=60892614;WS=60892596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr11	60893235	rs2229177	C	T	3436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.419;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=68;PP=1793;ReadPosRankSum=-2.790;SC=CTGGAAGGGGCTCTGCATCGC;SOR=0.740;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=272;TCF=138;TCR=134;TR=139;WE=60893243;WS=60893225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,165:0.54:303
chr11	60899767	rs754382	A	G	2675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=48;NR=40;PP=1606;SC=AGGCATGGCTAATGGTGGCTG;SOR=0.714;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=90;TCF=48;TCR=42;TR=88;WE=60899775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr11	60906450	rs508970	A	G	709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=495;ReadPosRankSum=1.093;SC=GAGAGGCAGAAATCTCTGAGA;SOR=0.737;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=58;TCF=14;TCR=44;TR=29;WE=60906458;WS=60906440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,31:0.51:61
chr11	61100308	rs2512810	G	C	898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.99;SOR=4.479;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr11	61106525	rs2512809	C	T	555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=9;PP=381;SC=CACTCCACTCCTTCCACCTCC;SOR=0.990;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=12;TCR=9;TR=21;WE=61106533;WS=61106515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	61106892	rs2513329	G	C	4216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=89;PP=2442;SC=TGTGCGGCACGGTGCTTATAC;SOR=1.244;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=149;TCF=60;TCR=89;TR=149;WE=61106900;WS=61106882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr11	61108974	rs2260655	G	A	1339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=19;NR=21;PP=687;SC=GAACGTGGTCGCCAAGGCCAT;SOR=1.067;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=19;TCR=21;TR=40;WE=61108982;WS=61108964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr11	61110169	rs4939514	A	C	8719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=152;NR=133;PP=2965;SC=ACCCCTCCTAAACCTCTGGGG;SOR=0.772;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=285;TCF=152;TCR=133;TR=285;WE=61110177;WS=61110159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,314:1.00:314
chr11	61112802	rs2305465	C	T	3196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=38;PP=1924;SC=AGTTGTCTGTCCTGCTCCTGG;SOR=1.112;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=64;TCR=38;TR=101;WE=61112810;WS=61112792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr11	61123965	rs76030461	A	G	1316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=12;PP=888;SC=GTCCAGCCTGAGCCCTATCCC;SOR=1.659;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=33;TCR=12;TR=45;WE=61123973;WS=61123955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr11	61165280	rs3741265	G	A	1423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=14;PP=752;SC=GAAAGATGCCGCTCAGTATTA;SOR=1.287;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=33;TCR=14;TR=47;WE=61165288;WS=61165270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr11	61165731	rs11382548	C	CA	10804.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=80;PP=2957;SC=TTTCTGCCATCGTATGGACAG;SOR=0.839;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=45;TCR=85;TR=123;WE=61165749;WS=61165721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr11	61165741	rs10897158	G	C	11045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=93;PP=2965;SC=CGTATGGACAGGATTTGAAGT;SOR=0.749;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=194;TCF=101;TCR=93;TR=194;WE=61165749;WS=61165721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr11	61179285	rs3019198	G	A	2066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=44;NR=22;PP=1097;SC=ACTTGGCTTCGATGCCATGAA;SOR=1.150;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=44;TCR=22;TR=66;WE=61179293;WS=61179275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr11	61197460	rs34378918	GC	G	300.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=6;PP=174;SC=CCCAGGTCCCGCCCCCCCCGC;SOR=0.859;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=9;WE=61197468;WS=61197450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	61204361	rs896831	A	C	2547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.478;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=37;PP=1671;ReadPosRankSum=-0.760;SC=ATAAGTTGTCAACTTCTCTGG;SOR=0.595;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=94;TCF=55;TCR=39;TR=92;WE=61204369;WS=61204351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,97:0.99:98
chr11	61205434	rs879647	G	A	1023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=6;PP=764;SC=ATTAGACACAGCCTTCTCAAC;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=31;WE=61205442;WS=61205424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr11	61249383	rs3019200	C	A	7986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=131;NR=133;PP=2965;SC=GCTACTGCACCGCCTACGGTG;SOR=0.799;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=264;TCF=131;TCR=133;TR=264;WE=61249399;WS=61249373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,297:1.00:297
chr11	61253200	rs3019187	G	A	679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=7;PP=497;SC=CACCTGCTGGGACACTGAGCC;SOR=1.893;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=26;WE=61253208;WS=61253190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	61253973	rs2957858	A	G	3798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=58;PP=2496;SC=TCCTGGTGCCAGTGGCTGCTT;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=135;TCF=77;TCR=58;TR=135;WE=61253981;WS=61253963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr11	61254376	rs3019188	G	C	597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=3;PP=380;SC=GCTGCCTCAGGCTGGCCACCT;SOR=3.056;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=61254384;WS=61254373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	61487690	rs198430	G	A	4594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=76;PP=2656;SC=TCGTCCTACCGGCCATCTTCC;SOR=0.841;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=155;TCF=79;TCR=76;TR=155;WE=61487698;WS=61487680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr11	61491097	rs566009	A	G	742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=18;PP=547;SC=CTGTCTGGTGAGCAGAGGTCT;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=25;WE=61491105;WS=61491087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	61496657	rs198417	C	T	405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=14;PP=347;SC=ACGAGAACCACCCACTTCACA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=61496665;WS=61496647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	61505168	rs198444	G	A	5802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=112;NR=92;PP=2965;SC=GTGAGGATGCGATGGAGTATT;SOR=0.769;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=204;TCF=112;TCR=92;TR=204;WE=61505176;WS=61505158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr11	61505696	rs198443	G	T	8832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=154;NR=146;PP=2965;SC=CCCCACCTGGGCACCCTGCCT;SOR=0.699;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=300;TCF=154;TCR=146;TR=300;WE=61505704;WS=61505686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,337:1.00:337
chr11	61508522	rs198440	A	G	369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=335;SC=GACCCAAGTGACTCCATGAGG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=61508530;WS=61508515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	61511262	rs150806850	C	A	4001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=394;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.762;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=78;PP=2710;ReadPosRankSum=1.269;SC=CCAGCCTCCACGCTGTGCTGG;SOR=0.748;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=356;TCF=193;TCR=163;TR=175;WE=61511270;WS=61511252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:202,190:0.48:392
chr11	61534872	rs547589	A	C	8150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=134;NR=145;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.393;SC=GGCCACTGCTACCGTCAGGAT;SOR=0.874;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=283;TCF=136;TCR=147;TR=279;WE=61534880;WS=61534862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,310:0.99:314
chr11	61536583	rs579383	G	A	2511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=34;PP=1515;SC=TGGGTGGTGCGGAGAAATGCC;SOR=1.085;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=54;TCR=34;TR=88;WE=61536591;WS=61536573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr11	61543499	rs174528	T	C	4962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=68;PP=2789;SC=AGCCCCATCCTGAGGTGCCAC;SOR=1.030;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=166;TCF=98;TCR=68;TR=166;WE=61543507;WS=61543489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr11	61543961	rs174529	T	C	3579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=78;PP=1986;SC=AGGAAGACACTGCCCTGGGTG;SOR=1.381;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=123;TCF=45;TCR=78;TR=123;WE=61543969;WS=61543951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr11	61547068	rs7943728	G	A	1278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=22;PP=824;SC=GATGGCAGGCGGGTTGGAAAG;SOR=1.038;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=19;TCR=22;TR=41;WE=61547076;WS=61547058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr11	61547237	rs108499	C	T	4926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=96;NR=64;PP=2965;SC=ACCGCTCCTCCGACCTCCAGC;SOR=1.090;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=160;TCF=96;TCR=64;TR=160;WE=61547245;WS=61547227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr11	61548559	rs509360	A	G	5069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=104;NR=63;PP=2916;SC=GGAGGTTGCTATGTTCTGTCT;SOR=1.095;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=167;TCF=104;TCR=63;TR=167;WE=61548567;WS=61548549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr11	61549025	rs174533	G	A	4809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=51;PP=2605;SC=TTCTTAGCCTGTGCCTGGTTC;SOR=1.338;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=147;TCF=96;TCR=51;TR=147;WE=61549033;WS=61549015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr11	61551356	rs174535	T	C	2588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=32;PP=1573;SC=TCCCTGTCAGTAGTGGCACCC;SOR=0.901;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=49;TCR=32;TR=81;WE=61551364;WS=61551346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr11	61551927	rs174536	A	C	1137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=31;PP=908;SC=ACTGGGCCCCAAAATGGGCAA;SOR=3.383;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=36;WE=61551935;WS=61551917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr11	61557422	rs117110139	G	A	2013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.524;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=41;PP=1133;ReadPosRankSum=0.771;SC=GCAAAGCGAAGGGGTGGACTG;SOR=0.635;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=176;TCF=88;TCR=88;TR=86;WE=61557430;WS=61557412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,97:0.50:195
chr11	61557803	rs102275	T	C	482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=2;PP=383;SC=GAAATAAGGCTATAACCTGCC;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=61557811;WS=61557793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	61557826	rs102274	T	C	747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=3;PP=560;SC=TGGGCATCACTAGCCCTCCTC;SOR=3.014;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=61557834;WS=61557816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	61560081	rs174538	G	A	3481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=66;PP=1919;SC=GAACACGTCGGCAGGAGCAGG;SOR=1.501;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=38;TCR=66;TR=104;WE=61560089;WS=61560071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr11	61569830	rs174546	C	T	2801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=53;NR=41;PP=1539;SC=TCCCCTCTGCCTTGGCTCCAG;SOR=0.770;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=53;TCR=41;TR=94;WE=61569838;WS=61569820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr11	61570783	rs174547	T	C	7913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=145;NR=118;PP=2965;SC=CACCTACGCATCCTTTTCAAT;SOR=0.801;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=263;TCF=145;TCR=118;TR=263;WE=61570791;WS=61570773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,291:1.00:291
chr11	61571348	rs174548	C	G	1446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=36;PP=992;SC=TCCAGACTCACTCATCTTCAG;SOR=2.494;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=10;TCR=36;TR=46;WE=61571356;WS=61571338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr11	61571382	rs174549	G	A	645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=19;PP=484;SC=CAATCCTGCAGTATCTAGTGC;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=61571390;WS=61571372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr11	61579463	rs174554	A	G	806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=16;PP=443;SC=AGGATTACAGACATGAGTCAC;SOR=1.214;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=11;TCR=16;TR=27;WE=61579471;WS=61579453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr11	61580635	rs174556	C	T	4467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=88;NR=48;PP=2529;SC=TGACTGTGATCCCATCTAGAC;SOR=1.296;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=88;TCR=48;TR=136;WE=61580643;WS=61580625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr11	61582708	rs174561	T	C	5622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=99;NR=89;PP=2965;SC=GCCGCGGCATTCCCGGCCCCA;SOR=0.712;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=188;TCF=99;TCR=89;TR=188;WE=61582716;WS=61582698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr11	61593816	rs174568	C	T	5094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=84;NR=81;PP=2854;SC=GGCCGGTCCACGCTTCTCAGC;SOR=0.815;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=166;TCF=84;TCR=82;TR=165;WE=61593824;WS=61593806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr11	61615803	rs174589	C	G	1512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=41;PP=1137;SC=TTGTCCTGGGCGAATGGCAGA;SOR=3.745;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=6;TCR=41;TR=47;WE=61615811;WS=61615793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr11	61624414	rs174602	T	C	1036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=16;PP=619;ReadPosRankSum=-0.229;SC=GGCTGCAGGATGGGTTGGGGA;SOR=0.638;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=67;TCR=34;TR=47;WE=61624422;WS=61624404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,50:0.46:108
chr11	61624705	rs498793	T	C	1206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.589;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=39;PP=701;ReadPosRankSum=-0.243;SC=CCTCAGCCTGTGTTACAGGCC;SOR=1.090;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=110;TCF=37;TCR=73;TR=55;WE=61624713;WS=61624695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,60:0.50:121
chr11	61641211	rs6591665	A	G	706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=8;PP=496;SC=TGGAGGGGTGAGGGTATCGAT;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=25;WE=61641219;WS=61641201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	61645967	rs174453	C	G	2314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=22;PP=1564;SC=AGGTTGTCCACGTCCCTCCCC;SOR=1.730;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=54;TCR=22;TR=76;WE=61645975;WS=61645957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr11	61671956	rs174472	A	G	3651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=45;PP=2388;SC=TCGGCACAGTAAACACACGGC;SOR=1.270;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=73;TCR=45;TR=118;WE=61671964;WS=61671946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr11	61672235	rs174473	T	C	2353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=42;PP=1452;SC=CCTCCTGCATTGTGAAGTCCA;SOR=0.947;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=37;TCR=42;TR=79;WE=61672243;WS=61672225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr11	61672265	rs174474	T	C	2758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=45;PP=1762;SC=CCACGTCCTCTCGGTACACCC;SOR=0.845;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=43;TCR=45;TR=88;WE=61672273;WS=61672255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr11	61675644	rs174477	T	C	2780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=62;PP=1624;SC=CTCCTGGCCTTGGGCCTCCTC;SOR=1.702;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=34;TCR=62;TR=96;WE=61675652;WS=61675634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr11	61687674	rs2524290	G	A	527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-4.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.830;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=16;PP=305;ReadPosRankSum=-0.655;SC=TGCTTGCAAGGCCAGACTGAG;SOR=0.202;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=44;TCF=12;TCR=32;TR=24;WE=61687682;WS=61687664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,26:0.54:48
chr11	61719387	rs1800007	T	C	1357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.968;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=31;PP=866;ReadPosRankSum=-0.437;SC=TGGCGAGTTCTTAATCTTCCT;SOR=0.725;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=121;TCF=64;TCR=57;TR=60;WE=61719395;WS=61719377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,67:0.48:141
chr11	61722645	rs1109748	C	A	2114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.061;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=56;PP=1385;ReadPosRankSum=-1.160;SC=ACAGCTACATCCAGCTCATCC;SOR=0.922;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=210;TCF=99;TCR=111;TR=102;WE=61722653;WS=61722635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,104:0.47:221
chr11	61724292	rs760306	C	T	2506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.281;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=43;PP=1547;ReadPosRankSum=-1.187;SC=TCCCACCCACCGCCTTCTTCA;SOR=0.974;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=280;TCF=160;TCR=120;TR=114;WE=61724300;WS=61724282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,126:0.41:309
chr11	61724514	rs195162	C	T	679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=18;PP=509;SC=GTGGGAAGGGCTGTGGTCCAC;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=61724522;WS=61724504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr11	61725599	rs113492158	A	ATCCTCCTCC	2503.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=8;PP=1513;SC=TTGCTACCACATCCTCCTCCT;SOR=2.400;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=33;TCF=18;TCR=15;TR=24;WE=61725607;WS=61725589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr11	61726871	rs195158	G	T	1009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=0;PP=757;SC=CAGGAAGGGCGTCATGGGGTG;SOR=5.486;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=28;WE=61726879;WS=61726861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr11	61730183	rs1800008	C	T	1786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.633;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=21;PP=1148;ReadPosRankSum=1.516;SC=TCTCAGAGAGCGATGGGGCCT;SOR=0.622;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=142;TCF=95;TCR=47;TR=70;WE=61730191;WS=61730173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,78:0.52:151
chr11	61730234	rs1800009	T	C	8796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=179;NR=116;PP=2965;SC=GGAGGAAAACTGTGGAGTTTA;SOR=1.204;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=295;TCF=179;TCR=116;TR=295;WE=61730242;WS=61730224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,324:1.00:324
chr11	61730553	rs17185413	T	C	2924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.896;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=63;PP=1714;ReadPosRankSum=-0.652;SC=AGGGAAGTGTTCGGGACCTTT;SOR=0.627;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=244;TCF=123;TCR=121;TR=124;WE=61730561;WS=61730543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,143:0.50:287
chr11	61731534	rs195155	G	T	2831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=39;PP=1910;SC=GAAATGAAGGGACCTTCCATA;SOR=1.136;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=67;TCR=39;TR=106;WE=61731542;WS=61731524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr11	61735553	rs11271453	T	TGCTGCAGATTGGGAA	5980.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=22;PP=2974;SC=TGTGACACCTTGCTGCAGATT;SOR=0.793;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=56;TCF=21;TCR=35;TR=35;WE=61735561;WS=61735543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr11	61736135	rs77709427	GT	TG	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.648;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=446;ReadPosRankSum=2.068;SC=CAGGGTGGATGTGAATTTATG;SOR=0.148;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=10;WE=61736144;WS=61736125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr11	61895541	rs1675130	A	G	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.203;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=112;ReadPosRankSum=-0.469;SC=GTTGTGGGTCAGGTGGGTATT;SOR=0.089;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=9;WE=61895549;WS=61895531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr11	61895741	rs1675131	A	G	2729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.978;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=57;PP=1481;ReadPosRankSum=0.116;SC=GGCTTGAGGAAATCCAAGAGG;SOR=0.792;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=211;TCF=95;TCR=116;TR=103;WE=61895749;WS=61895731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,129:0.52:249
chr11	61896215	rs1792946	G	A	1818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.150;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=28;PP=1261;ReadPosRankSum=-0.335;SC=AGGCAGCCTCGAGTGACACCC;SOR=0.505;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=150;TCF=103;TCR=47;TR=83;WE=61896223;WS=61896205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,84:0.53:158
chr11	61897197	rs1792944	C	T	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.967;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=90;ReadPosRankSum=0.500;SC=CTTGGAGAGACTGGGTGCCAC;SOR=0.200;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=11;WE=61897205;WS=61897187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr11	61897359	rs1675133	C	T	3988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=376;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.192;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=102;NR=77;PP=2505;ReadPosRankSum=-0.573;SC=ACGGCTCCGTCCTGCGGCGTG;SOR=0.825;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=353;TCF=195;TCR=158;TR=179;WE=61897367;WS=61897349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,189:0.51:374
chr11	61906299	rs1614060	A	G	7120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=131;NR=99;PP=2965;SC=GCTCTGCACTACGGCCATCCT;SOR=1.016;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=230;TCF=131;TCR=99;TR=230;WE=61906307;WS=61906289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr11	61906374	rs1675126	T	C	9847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=380;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=163;NR=186;PP=2965;SC=CTGAGAACAATGGAAATAACT;SOR=0.845;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=349;TCF=163;TCR=186;TR=349;WE=61906382;WS=61906364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,379:1.00:379
chr11	61906538	rs11230922	G	A	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=175;ReadPosRankSum=0.917;SC=TGGCGGCCTCGGCCTGACCTT;SOR=0.223;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=10;WE=61906546;WS=61906528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr11	61907631	rs3741246	T	A	1102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.072;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=8;PP=648;ReadPosRankSum=0.409;SC=CAAGGACCCCTTCCCCCTACA;SOR=1.444;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=72;TCF=53;TCR=19;TR=40;WE=61907639;WS=61907621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,49:0.55:89
chr11	61907909	rs1675124	A	G	1376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.407;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=35;PP=1030;ReadPosRankSum=-0.721;SC=CCAAGGAGGCAGCTCCATGCT;SOR=2.208;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=49;TCF=13;TCR=36;TR=47;WE=61907917;WS=61907899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,48:0.96:50
chr11	61908440	rs2277283	T	C	1949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FS=1.588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.44;ReadPosRankSum=1.692;SOR=0.592;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:126,105:0.45:231
chr11	61908672	rs1675123	G	A	481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=405;SC=TGTGGCCACCGGCTGTCTTGA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=61908680;WS=61908662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	61913196	rs7129085	G	T	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.498;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=139;ReadPosRankSum=0.164;SC=AGGAAGAGGAGGCACGTAGGC;SOR=0.451;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=38;TCF=19;TCR=19;TR=16;WE=61913204;WS=61913186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,19:0.46:41
chr11	61914056	rs11230931	G	A	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=290;ReadPosRankSum=1.399;SC=CCTGGGCTTCGGGGGAGTAGG;SOR=0.861;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=33;TCF=23;TCR=10;TR=19;WE=61914064;WS=61914046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr11	61914230	.	AGCGGGAGCAGGAGCG	A	701.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.387;ClippingRankSum=0.000;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=2.265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.55;MQRankSum=4.944;QD=12.10;ReadPosRankSum=-0.449;SOR=0.425;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,22:0.38:58
chr11	61915823	rs3890102	A	G	661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=9;PP=367;ReadPosRankSum=-0.829;SC=CTGGTTGCCCATTCAGCAATC;SOR=0.821;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=53;TCF=35;TCR=18;TR=28;WE=61915831;WS=61915813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,33:0.54:61
chr11	61959725	rs3831484	GTC	G	897.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=600;ReadPosRankSum=0.822;SC=GGTAATTTCTGTCTCTTTCAT;SOR=0.801;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=3;TCR=48;TR=16;WE=61959734;WS=61959715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,27:0.35:77
chr11	61960763	rs11441356	T	TC	1409.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.642;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=10;PP=1072;ReadPosRankSum=1.645;SC=CCTCTACCCTTCAATTGTCTT;SOR=0.875;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=59;TCF=30;TCR=29;TR=26;WE=61960771;WS=61960753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,47:0.46:102
chr11	61960809	rs7951859	C	A	1576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.449;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=23;PP=943;ReadPosRankSum=-1.543;SC=TGGATGTTAACCTGTTGTCTC;SOR=0.954;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=165;TCF=97;TCR=68;TR=64;WE=61960817;WS=61960799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,78:0.43:181
chr11	61960827	rs2232941	T	C	1518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.559;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=28;PP=950;ReadPosRankSum=-0.749;SC=CTCCAGGAGCTGCATGACCGA;SOR=0.780;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=171;TCF=96;TCR=75;TR=68;WE=61960835;WS=61960817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,75:0.42:179
chr11	62009611	rs2232946	C	T	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=206;ReadPosRankSum=0.375;SC=AGATGGATGGCAACAGCCCTG;SOR=0.352;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=12;WE=62009619;WS=62009601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr11	62010863	rs2232950	C	T	3079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.118;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=64;PP=1744;ReadPosRankSum=1.385;SC=GATGCCCCTCCGGAAGCTGTT;SOR=0.571;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=234;TCF=110;TCR=124;TR=128;WE=62010871;WS=62010853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,142:0.56:255
chr11	62037583	rs11603383	G	A	1597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=26;PP=1019;ReadPosRankSum=0.083;SC=GTGGAATTAAGATGCCTACCT;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=136;TCF=85;TCR=51;TR=71;WE=62037591;WS=62037573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,76:0.50:152
chr11	62040694	rs59964144	T	TACAC	159.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=221;ReadPosRankSum=1.803;SC=ATATTTTACATACACACACAC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=4;WE=62040702;WS=62040684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr11	62105391	rs2513749	C	T	530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=1;PP=430;SC=ACCCGCGCGGCTTCCTTGGGC;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=62105399;WS=62105386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	62105441	rs3741245	T	C	611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=11;PP=416;ReadPosRankSum=-0.623;SC=CTGCCTAGGATCCGCCGACAT;SOR=0.671;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=74;TCF=49;TCR=25;TR=31;WE=62105449;WS=62105431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,32:0.42:76
chr11	62123717	rs2463837	G	A	518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.482;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=370;ReadPosRankSum=0.056;SC=CTGGCCGGGCGGGGGGCTGAC;SOR=2.494;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=18;WE=62123725;WS=62123707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr11	62123989	rs67821209	T	A	719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=18;PP=433;ReadPosRankSum=0.524;SC=ATTGTTATACTGCAGTGATAA;SOR=0.728;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=53;TCF=17;TCR=36;TR=27;WE=62123997;WS=62123979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,31:0.53:58
chr11	62124696	rs143687152	C	CTTTTG	261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=204;SC=ATCTACAGTTCTTTTGTTTTG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=4;WE=62124704;WS=62124686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr11	62158886	rs2958531	G	T	724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.143;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=9;PP=380;ReadPosRankSum=2.821;SC=GACCTTTGTCGGTACTTGAGC;SOR=0.312;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=51;TCF=38;TCR=13;TR=29;WE=62158894;WS=62158876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,33:0.59:56
chr11	62158924	rs2958532	C	T	951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.124;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=10;PP=643;ReadPosRankSum=0.886;SC=TTTCATGTAGCGTCCGACTTC;SOR=1.264;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=101;TCF=70;TCR=31;TR=42;WE=62158932;WS=62158914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,44:0.39:112
chr11	62159187	rs3832779	G	GA	674.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.119;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=617;ReadPosRankSum=0.511;SC=ATGGAGAAGTGTAGGAAACCC;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=16;WE=62159195;WS=62159177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,21:0.49:43
chr11	62186542	rs3741240	G	A	7018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=126;NR=116;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.579;SC=AACCAGAGACGGGCCAGAGCA;SOR=0.236;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=244;TCF=127;TCR=117;TR=242;WE=62186550;WS=62186532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,262:1.00:263
chr11	62190700	rs2302364	T	C	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=112;ReadPosRankSum=1.444;SC=TTGGTCTCCTTGTTATGGTGG;SOR=0.602;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=8;WE=62190708;WS=62190690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr11	62201131	rs2259606	A	G	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.268;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=87;ReadPosRankSum=0.389;SC=CCTTGCAAGTAAAGAAATGCA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=5;WE=62201139;WS=62201128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr11	62201458	rs4084164	A	G	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=23;PP=532;ReadPosRankSum=0.735;SC=ACCAACTGAAAGAAGGTCCCC;SOR=0.619;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=46;TCF=9;TCR=37;TR=30;WE=62201466;WS=62201448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,32:0.64:50
chr11	62287277	.	A	C	2215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.994;ClippingRankSum=0.000;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.618;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=46;PP=1461;ReadPosRankSum=0.041;SC=AACCTTAGGGACAGACACATC;SOR=0.563;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=208;TCF=105;TCR=103;TR=94;WE=62287285;WS=62287267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,103:0.45:227
chr11	62292882	rs566144	G	T	9985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=367;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.394;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=190;NR=150;PP=2965;ReadPosRankSum=1.518;SC=ATGTCCACTTGGGGACCCCTG;SOR=0.511;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=341;TCF=190;TCR=151;TR=340;WE=62292890;WS=62292872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,366:1.00:367
chr11	62293948	rs486903	G	A	5477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=83;PP=2965;SC=AGCCAGGCATGCTGAACTTTG;SOR=0.776;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=182;TCF=99;TCR=83;TR=182;WE=62293956;WS=62293938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr11	62328038	rs11231144	T	C	2070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=52;PP=1276;SC=ATGGTCATTGTGCTGGCAGAT;SOR=1.824;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=24;TCR=52;TR=76;WE=62328046;WS=62328028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
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chr11	62365619	rs11231155	A	G	2253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=50;PP=1409;SC=CAGTCCTGGAATTGGGGAGAG;SOR=1.697;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=26;TCR=50;TR=76;WE=62365627;WS=62365609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr11	62369018	rs12226821	C	G	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.688;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=316;ReadPosRankSum=0.758;SC=CGGTGGGCTGCCGCTTCGAGG;SOR=0.119;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=18;WE=62369026;WS=62369008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr11	62369881	rs35156678	G	A	11833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.67;SOR=0.826;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,271:1.00:271
chr11	62369884	rs35880596	C	G	11751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.53;SOR=0.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,270:1.00:270
chr11	62370155	rs71490394	G	A	7486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=144;NR=115;PP=2965;SC=CGGCGCCTGGGCCGGAGGGAA;SOR=0.900;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=259;TCF=144;TCR=115;TR=259;WE=62370163;WS=62370145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,274:1.00:274
chr11	62370490	rs71458425	C	CGAGGGCCG	8572.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=42;NR=39;PP=2973;SC=TTCCCGGTCCCGAGGGGCCTC;SOR=1.307;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=104;TCF=52;TCR=52;TR=81;WE=62370498;WS=62370480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr11	62371773	rs2516633	A	C	895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=26;PP=637;ReadPosRankSum=0.618;SC=GATGGCAAATAAGAGAAGCTC;SOR=0.693;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=63;TCF=9;TCR=54;TR=31;WE=62371781;WS=62371763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,34:0.50:68
chr11	62378660	rs12808829	G	A	2024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=33;PP=1148;SC=ATTGGGTCCCGCTAGGCTCTT;SOR=0.892;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=33;TCR=33;TR=66;WE=62378668;WS=62378650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr11	62378801	rs11553576	T	C	3468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=59;PP=1899;ReadPosRankSum=1.389;SC=GTGGCAGTCCTGGGGGGGCTG;SOR=0.377;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=73;TCR=60;TR=130;WE=62378809;WS=62378782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,137:0.98:140
chr11	62380027	rs113222038	C	T	40.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.20;ReadPosRankSum=1.150;SOR=0.916;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr11	62380732	rs4387351	T	C	327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=147;SC=CACCTCTGCATTCCCTTGGGC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=62380740;WS=62380722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	62381106	rs1799959	G	C	3226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=63;NR=45;PP=2017;SC=CTGGTCGTCGGCCTCGGGCTA;SOR=0.950;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=109;TCF=63;TCR=46;TR=108;WE=62381114;WS=62381096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr11	62381483	rs72927237	T	C	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.718;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=60;ReadPosRankSum=1.068;SC=CTGCCATTTATTAGCTGTGAA;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=4;WE=62381491;WS=62381473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr11	62381703	rs35904570	C	CT	2215.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.658;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.935;NF=15;NR=23;PP=1400;ReadPosRankSum=-0.580;SC=TCCAGACATCCTAACCCCTCT;SOR=0.609;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=77;TCF=29;TCR=48;TR=38;WE=62381711;WS=62381693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,71:0.54:131
chr11	62381808	rs1801144	G	C	5590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=94;NR=96;PP=2965;SC=ACTCACCCCGGCCTTGCCTGC;SOR=0.792;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=191;TCF=95;TCR=96;TR=190;WE=62381816;WS=62381798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr11	62384869	rs4963224	T	C	5191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=107;PP=2832;SC=ACCATTTGCCTGCTCCAGCCA;SOR=1.004;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=189;TCF=82;TCR=107;TR=189;WE=62384877;WS=62384859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr11	62394881	rs7949030	A	G	4065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=87;PP=2726;SC=ACAAGTCAGAAATGCTCCTCC;SOR=1.678;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=131;TCF=43;TCR=88;TR=130;WE=62394889;WS=62394861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr11	62397177	rs948683	C	G	3308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=69;NR=42;PP=2065;SC=AGAGAAGAGACGGGTAGTGAG;SOR=1.236;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=69;TCR=42;TR=111;WE=62397185;WS=62397167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr11	62398626	rs147084598	C	A	1633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.342;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=48;PP=1131;ReadPosRankSum=0.362;SC=CAGAGCCCTGCAGGTAGTCCA;SOR=0.816;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=143;TCF=48;TCR=95;TR=69;WE=62398634;WS=62398616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,74:0.48:154
chr11	62400016	rs10897289	T	C	2827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=42;PP=1789;SC=CCCTCCTTTTTCCCCGTGCCT;SOR=0.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=51;TCR=42;TR=93;WE=62400024;WS=62400006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr11	62401716	rs2957121	A	G	1454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=35;NR=19;PP=924;SC=ACCTCCCCCCAAAGGCTAGAG;SOR=1.412;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=35;TCR=19;TR=54;WE=62401724;WS=62401706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr11	62414165	.	T	C	1675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.174;ClippingRankSum=0.000;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=40;PP=998;ReadPosRankSum=-0.700;SC=GGCCTTATGATTGGTTCGACC;SOR=0.688;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=154;TCF=61;TCR=93;TR=67;WE=62414173;WS=62414155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,78:0.45:175
chr11	62417595	.	A	AT	84.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.940;ClippingRankSum=0.000;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.82;ReadPosRankSum=0.282;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,8:0.27:30
chr11	62430659	rs597259	T	A	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.933;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=18;PP=515;ReadPosRankSum=1.628;SC=GGAAGTATTATCCCAAATAAA;SOR=0.360;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=86;TCF=52;TCR=34;TR=37;WE=62430667;WS=62430649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,41:0.43:96
chr11	62433781	.	CA	C	348.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.595;ClippingRankSum=0.000;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=6.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQRankSum=1.761;QD=2.88;ReadPosRankSum=0.784;SOR=0.543;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,30:0.25:121
chr11	62434173	rs11231181	G	A	2745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.606;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=54;PP=1770;ReadPosRankSum=0.361;SC=GGGTGGCCCAGGCCAAACACC;SOR=0.539;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=180;TCF=96;TCR=84;TR=113;WE=62434181;WS=62434163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,119:0.63:190
chr11	62438750	rs17637597	T	C	1247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.921;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=28;PP=713;ReadPosRankSum=1.622;SC=TGAGTGTTTGTTCCAGAGTTG;SOR=0.991;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=127;TCF=68;TCR=59;TR=52;WE=62438758;WS=62438740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,61:0.41:149
chr11	62438819	rs693698	G	T	852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.302;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=24;PP=530;ReadPosRankSum=0.400;SC=TGTTGAAAACGCGCGGGTGAC;SOR=1.051;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=56;TCF=19;TCR=37;TR=34;WE=62438827;WS=62438809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,36:0.58:62
chr11	62438846	rs3809079	G	A	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.568;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=91;ReadPosRankSum=-0.990;SC=AAACCACAGAGCACAGCTCGG;SOR=1.022;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=38;TCF=9;TCR=29;TR=10;WE=62438854;WS=62438836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,12:0.30:40
chr11	62439569	rs13941	G	A	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=245;ReadPosRankSum=1.176;SC=AGGCGGCGCCGGCGGGAGGTC;SOR=0.826;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=21;TCR=31;TR=22;WE=62439577;WS=62439559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,25:0.43:58
chr11	62458275	rs6856	T	C	3310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.809;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=67;PP=1989;ReadPosRankSum=0.703;SC=CTGAGGGATCTTCAGGGCTCT;SOR=0.763;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=305;TCF=161;TCR=144;TR=146;WE=62458284;WS=62458265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,159:0.48:329
chr11	62460024	rs74388071	C	A	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.675;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=9;PP=466;ReadPosRankSum=2.068;SC=CTGAGCCCCACTTCCAGTCTC;SOR=0.819;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=38;TCF=20;TCR=18;TR=24;WE=62460032;WS=62460014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,26:0.63:41
chr11	62469929	rs72929434	C	A	2086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.578;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=43;PP=1046;ReadPosRankSum=-0.874;SC=CTCTCTAGTTCCCATACTCAC;SOR=0.577;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=203;TCF=110;TCR=93;TR=93;WE=62469937;WS=62469919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,108:0.46:236
chr11	62487378	rs12291015	T	C	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.799;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=38;ReadPosRankSum=-0.916;SC=CAGATGCTAATGCTATGCTCT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=4;WE=62487386;WS=62487372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr11	62488917	.	GA	G	84.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.194;ClippingRankSum=0.000;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=4.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.03;ReadPosRankSum=0.636;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,8:0.29:28
chr11	62490219	rs576251	G	A	11110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=401;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=167;NR=187;PP=2965;SC=ACCTACAACCGGACTTCCCAT;SOR=0.837;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=354;TCF=167;TCR=187;TR=354;WE=62490227;WS=62490209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,399:1.00:399
chr11	62496519	rs584845	T	C	6981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=101;NR=133;PP=2965;SC=AGAAAACATATTGCATACCAC;SOR=1.075;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=234;TCF=101;TCR=133;TR=234;WE=62496527;WS=62496509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
chr11	62502790	rs80148909	G	T	779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.967;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=9;PP=487;ReadPosRankSum=-0.011;SC=GTCTTGAGCTGGCCAGTGGAA;SOR=0.565;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=74;TCF=56;TCR=18;TR=35;WE=62502798;WS=62502780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,36:0.47:76
chr11	62505764	rs6675	C	T	1818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.221;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=28;PP=1121;ReadPosRankSum=1.540;SC=TCCAAGATGCCAACGTCCGGC;SOR=0.824;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=152;TCF=92;TCR=60;TR=75;WE=62505772;WS=62505754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,83:0.50:167
chr11	62519565	rs544641	G	C	919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=14;PP=661;ReadPosRankSum=-0.459;SC=TGCTCCCTTAGATGTTAGTTT;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=85;TCF=56;TCR=29;TR=43;WE=62519573;WS=62519555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,44:0.50:88
chr11	62521408	rs72929469	A	T	1121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.727;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=15;PP=745;ReadPosRankSum=0.697;SC=CCCGCCCCTTAGCCACCCTCC;SOR=0.844;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=115;TCF=80;TCR=35;TR=55;WE=62521416;WS=62521398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,56:0.47:118
chr11	62521475	rs72929471	T	C	3346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=371;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.379;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=70;PP=2207;ReadPosRankSum=-1.288;SC=GAGATCTTTTTCGCTCCCAGG;SOR=0.662;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=341;TCF=187;TCR=154;TR=153;WE=62521483;WS=62521465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:199,168:0.46:367
chr11	62521663	rs3829248	C	T	788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.944;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=21;PP=481;ReadPosRankSum=-0.255;SC=CTTTAATTGGCTTAAGATTGC;SOR=1.638;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=50;TCF=11;TCR=39;TR=25;WE=62521671;WS=62521653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,31:0.53:59
chr11	62539412	rs78063688	T	C	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=242;ReadPosRankSum=-0.787;SC=AAGGGGTGGGTCTCCAATCCA;SOR=0.352;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=12;WE=62539420;WS=62539405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr11	62541989	rs3017668	A	G	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=241;ReadPosRankSum=0.404;SC=AGTGGGGGCAATGCCTGGGTG;SOR=0.542;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=13;WE=62541997;WS=62541979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr11	62543180	rs11231210	A	G	74.81	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.96;ReadPosRankSum=-0.842;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr11	62543960	rs567791	T	C	1463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.855;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=41;PP=1052;ReadPosRankSum=-0.585;SC=GGGTGCAGGCTACAGAGGGCT;SOR=0.922;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=159;TCF=59;TCR=100;TR=62;WE=62543968;WS=62543950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,67:0.39:170
chr11	62545346	rs633742	T	C	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=73;ReadPosRankSum=-0.521;SC=CTGGACTTCCTTCAAACGTGG;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=5;WE=62545354;WS=62545336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr11	62554814	rs2584916	A	G	2179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.511;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=54;PP=1348;ReadPosRankSum=-1.428;SC=GCCCCCGGAAATGACGTCTCC;SOR=0.758;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=192;TCF=88;TCR=104;TR=98;WE=62554822;WS=62554804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,102:0.49:207
chr11	62555059	rs3087924	G	A	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.68;ReadPosRankSum=0.697;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr11	62555222	rs185978383	G	A	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=151;ReadPosRankSum=-2.563;SC=CAAAGGGACGGGTCAGTAGCG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=9;WE=62555230;WS=62555212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr11	62556703	rs12418135	G	T	2875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.447;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=56;PP=1798;ReadPosRankSum=1.186;SC=AACCCTGAGGGCCAGGGGCTG;SOR=0.662;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=241;TCF=130;TCR=111;TR=121;WE=62556711;WS=62556693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,133:0.51:262
chr11	62559385	rs2584918	T	C	1065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.658;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=27;PP=485;ReadPosRankSum=1.243;SC=TGCAGCGTCGTGCCTTGCAGG;SOR=0.627;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=118;TCF=52;TCR=66;TR=51;WE=62559393;WS=62559375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,58:0.45:128
chr11	62560251	rs1815870	C	G	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=93;ReadPosRankSum=0.361;SC=ATAAAAGCACCCAAGTTTGCC;SOR=0.473;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=21;TCF=8;TCR=13;TR=9;WE=62560259;WS=62560241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr11	62563353	rs539465	G	A	4643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=95;NR=64;PP=2810;SC=CTACAAACTCGGGACTCTAAA;SOR=1.052;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=159;TCF=95;TCR=64;TR=159;WE=62563361;WS=62563343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr11	62564009	rs4693	T	C	1785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=37;PP=1171;SC=GGAGCCCTTGTCGGTCTCCAG;SOR=1.402;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=59;TCF=21;TCR=38;TR=58;WE=62564017;WS=62563999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr11	62569105	rs146787397	T	TAC	3553.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.170;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.175;NF=13;NR=43;PP=2403;ReadPosRankSum=0.481;SC=CATGATCAGCTAGAGGAAAAA;SOR=0.830;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=136;TCF=37;TCR=99;TR=56;WE=62569113;WS=62569095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,94:0.46:203
chr11	62575025	rs2228626	A	T	1088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=18;PP=668;ReadPosRankSum=1.550;SC=TGGAGGTGACAGACTGGAAGT;SOR=0.775;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=73;TCF=43;TCR=30;TR=44;WE=62575033;WS=62575015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,48:0.58:83
chr11	62592961	rs2228627	T	C	842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=19;PP=525;ReadPosRankSum=-0.369;SC=TGCCCTTGGCTCTCACGAAAT;SOR=0.658;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=82;TCF=42;TCR=40;TR=40;WE=62592969;WS=62592951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,43:0.47:91
chr11	62598144	rs10431142	G	T	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.75;ReadPosRankSum=-1.645;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr11	62599260	rs79429455	A	T	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.704;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=200;ReadPosRankSum=0.155;SC=CTCTCTCAACAGAGGCTTTCC;SOR=0.051;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=15;WE=62599268;WS=62599250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr11	62600648	rs12146562	G	A	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.114;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=83;ReadPosRankSum=0.130;SC=GGCCGGGCACGGTGGCTCCCA;SOR=0.283;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=8;WE=62600656;WS=62600638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr11	62602854	rs374731833	A	G	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.192;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=317;ReadPosRankSum=1.169;SC=CCATTTCTCCAGGAGGCTGCT;SOR=0.434;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=49;TCF=36;TCR=13;TR=26;WE=62602862;WS=62602844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,28:0.54:52
chr11	62602983	rs2298636	A	G	2122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.567;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=38;PP=1338;ReadPosRankSum=-0.096;SC=GGAACCCGCAAGTCCAGCCAG;SOR=0.753;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=86;TCR=66;TR=87;WE=62602991;WS=62602973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,96:0.56:170
chr11	62603047	rs2298635	G	T	2720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.037;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=51;PP=1726;ReadPosRankSum=0.347;SC=TGGGGGGCTCGATGTGCCCCT;SOR=0.621;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=199;TCF=108;TCR=91;TR=108;WE=62603055;WS=62603027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,119:0.54:219
chr11	62607068	rs7102434	A	G	1590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.871;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=34;PP=914;ReadPosRankSum=1.587;SC=CAGACAGTTCACACTTCCGGC;SOR=0.665;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=191;TCF=95;TCR=96;TR=76;WE=62607076;WS=62607058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,85:0.40:211
chr11	62620636	rs76076511	T	C	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.251;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.447;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=83;ReadPosRankSum=-0.120;SC=TTTCATTCTATGTCACATTTT;SOR=2.093;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=6;WE=62620644;WS=62620626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr11	62623017	rs2071035	C	A	3382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FS=1.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.83;ReadPosRankSum=-1.247;SOR=0.729;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:112,89:0.44:201
chr11	62623017	.	CAA	AAG	2148	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=39;NR=33;PP=2148;QD=30.5759427064;SC=GACGGCTAAGCAAGAGGCTTG;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=182;TCF=97;TCR=85;TR=72;WE=62623027;WS=62623007;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:110,72:0.40:182
chr11	62623019	rs2071034	A	G	3382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.91;ReadPosRankSum=-1.650;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,90:0.45:200
chr11	62623051	rs1059292	T	C	1271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.247;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=32;PP=816;ReadPosRankSum=1.166;SC=CTCAGAGTTATTTATCCTCAC;SOR=0.813;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=156;TCF=75;TCR=81;TR=59;WE=62623059;WS=62623041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,65:0.39:165
chr11	62638317	rs376940338	TAA	T	434.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=2.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQRankSum=1.532;QD=24.15;ReadPosRankSum=-1.735;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr11	62638320	.	TAATA	T	434.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.614;ClippingRankSum=0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=2.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQRankSum=1.532;QD=24.15;ReadPosRankSum=-1.969;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr11	62638327	rs7106901	A	T	434.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQRankSum=1.477;QD=25.57;ReadPosRankSum=-1.409;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr11	62638330	rs11231260	T	A	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQRankSum=-1.423;QD=4.55;ReadPosRankSum=1.984;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr11	62638333	rs55725256	T	A	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQRankSum=-1.423;QD=4.55;ReadPosRankSum=1.911;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr11	62652063	rs489381	A	G	2017.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.096;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=40;PP=950;ReadPosRankSum=0.982;SC=CTAGAGCCTCATAATATTCTC;SOR=0.582;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=175;TCF=87;TCR=88;TR=85;WE=62652071;WS=62652053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,101:0.50:202
chr11	62677529	rs2067478	C	T	4011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=377;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.208;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=77;PP=2596;ReadPosRankSum=0.723;SC=GCTTGGCCAGCTGCTCCTTTC;SOR=0.770;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=343;TCF=184;TCR=159;TR=172;WE=62677537;WS=62677519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:189,188:0.50:377
chr11	62744899	rs3017670	A	G	589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=12;PP=313;SC=TTAGAGTTCCAGCATGAATGC;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=18;WE=62744907;WS=62744889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr11	62747145	rs3017671	A	G	3652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=65;PP=2240;SC=CTTCTGAGATATTGGGTTATG;SOR=0.921;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=59;TCR=65;TR=124;WE=62747153;WS=62747135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr11	62847453	rs7945121	T	C	3286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=73;PP=1828;SC=TCCTGCTTTATGTTTCTTGAA;SOR=1.397;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=43;TCR=73;TR=116;WE=62847461;WS=62847443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr11	62847562	rs7926818	G	T	257.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=8;PP=209;SC=TGTGCCTGAGGACAAGCTGCC;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=62847570;WS=62847552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	62848367	rs10897341	A	C	468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.04;SOR=1.493;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	62848445	rs11231340	A	G	1519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=32;NR=16;PP=872;SC=TGGTTTCTGGAAGGAGGAGGA;SOR=1.159;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=49;TCF=33;TCR=16;TR=48;WE=62848453;WS=62848435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr11	62848487	rs11231341	A	C	2143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=47;NR=27;PP=1365;SC=GGAAGACTCCATAGGAAATCC;SOR=1.085;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=47;TCR=27;TR=74;WE=62848495;WS=62848477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr11	62848568	rs11231342	C	G	2978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=52;PP=1782;SC=TCCTACCGGACACTGCATTGA;SOR=0.865;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=102;TCF=50;TCR=52;TR=102;WE=62848576;WS=62848558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr11	62848995	rs6591733	G	C	4178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=88;NR=48;PP=2507;SC=TCAGAAATTTGTGTTTTGAAA;SOR=1.255;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=88;TCR=48;TR=136;WE=62849003;WS=62848985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr11	62850684	rs4963356	C	T	638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=1;PP=480;SC=GGGGTAACTACTTTCTTTCCT;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=62850692;WS=62850678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	62863518	rs7113279	A	G	8309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=141;NR=137;PP=2965;SC=CGGAACAGGGAAAAAATGGAT;SOR=0.746;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=278;TCF=141;TCR=137;TR=278;WE=62863526;WS=62863508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,308:1.00:308
chr11	62871460	rs12283166	C	T	585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=0;PP=463;SC=ATCCACTTCTCCCAGTATATT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=62871468;WS=62871450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	62886319	rs948060	G	C	3707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=78;NR=42;PP=2230;SC=CCAGGTGTCAGAATTTTCCTT;SOR=1.187;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=120;TCF=78;TCR=42;TR=120;WE=62886327;WS=62886309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr11	62886800	.	G	A	1510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=0.000;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.239;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=35;PP=783;ReadPosRankSum=0.821;SC=ATGATCTTCCGTCCAACCCTA;SOR=0.415;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=120;TCF=48;TCR=72;TR=62;WE=62886808;WS=62886790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,72:0.53:137
chr11	62902172	rs1939782	A	C	5839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=109;NR=90;PP=2965;SC=GACCTCCCAGAAGTGACCCAG;SOR=0.888;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=199;TCF=109;TCR=90;TR=199;WE=62902180;WS=62902162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr11	62910849	rs1939749	T	C	4824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=92;NR=68;PP=2743;SC=GGGCCTCTTATCTCAGTCACG;SOR=0.918;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=161;TCF=92;TCR=69;TR=160;WE=62910857;WS=62910839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr11	62911079	rs1939748	G	C	6880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=125;NR=102;PP=2965;SC=GTCAGACACAGTGTCATTGTC;SOR=0.902;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=227;TCF=125;TCR=102;TR=227;WE=62911087;WS=62911069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr11	62931484	rs6591771	T	C	1752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.701;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=44;PP=981;ReadPosRankSum=-0.233;SC=AGGATCATCATGAGGGAAGCC;SOR=0.754;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=185;TCF=95;TCR=90;TR=84;WE=62931492;WS=62931474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,90:0.44:206
chr11	62933774	rs2226866	C	G	1457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.679;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=42;PP=955;ReadPosRankSum=-0.967;SC=ATCTGTGGAACCTAAATCCTA;SOR=1.179;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=120;TCF=42;TCR=78;TR=60;WE=62933782;WS=62933764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,66:0.51:129
chr11	62951064	rs1525072	C	A	3508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=79;NR=31;PP=2074;SC=ACCCATAACTCTACCTGTGTT;SOR=1.724;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=79;TCR=31;TR=110;WE=62951072;WS=62951054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr11	62951221	rs11231397	C	G	3304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.414;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=81;PP=2206;ReadPosRankSum=0.248;SC=TGCAGCTTTTCTAAGTTCCTT;SOR=0.746;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=291;TCF=135;TCR=156;TR=151;WE=62951229;WS=62951211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,154:0.50:308
chr11	62984697	rs7949840	T	C	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.007;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=202;ReadPosRankSum=1.232;SC=CAAGGCTAGATAGAGGATCAA;SOR=1.368;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=12;WE=62984705;WS=62984687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,13:0.37:35
chr11	62984868	rs11231409	T	C	2574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.512;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=46;PP=1589;ReadPosRankSum=-0.380;SC=AAAGCCAGGCTTCCCAGGGTT;SOR=0.914;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=222;TCF=120;TCR=102;TR=106;WE=62984876;WS=62984858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,118:0.48:246
chr11	62985088	rs148704171	G	A	1554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-2.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.479;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=37;PP=857;ReadPosRankSum=0.194;SC=GCTAAATGTAGCAGCCCCAGC;SOR=0.873;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=169;TCF=84;TCR=85;TR=69;WE=62985096;WS=62985078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,81:0.41:196
chr11	62985544	rs12417255	C	T	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=282;ReadPosRankSum=0.380;SC=AAAAGATACACGCACTCACAT;SOR=0.608;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=44;TCF=12;TCR=32;TR=21;WE=62985552;WS=62985534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,21:0.45:47
chr11	62987638	rs11336277	CA	C	110.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.784;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=9;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=76;ReadPosRankSum=-0.113;SC=TTTGCAAAGACAAAAAAAATC;SOR=0.141;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=5;WE=62987646;WS=62987628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr11	62995875	rs7106186	G	A	2628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=24;PP=1577;SC=TAGATGAAAAGTGTTTCATGA;SOR=1.561;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=61;TCR=24;TR=85;WE=62995883;WS=62995865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr11	62996162	rs7126435	T	C	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.666;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=290;ReadPosRankSum=-1.701;SC=CTGCATTACCTGATATTCACT;SOR=0.074;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=32;TCF=4;TCR=28;TR=21;WE=62996170;WS=62996152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,21:0.64:33
chr11	63057925	rs1790218	G	A	2719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.412;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=58;PP=1533;ReadPosRankSum=-0.072;SC=ATCCCCAGTGGCAGCTTCTTC;SOR=0.604;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=258;TCF=126;TCR=132;TR=118;WE=63057933;WS=63057915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,134:0.47:286
chr11	63064823	rs576641	T	C	2712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.546;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=52;PP=1690;ReadPosRankSum=-1.488;SC=AGCTTGCCATTACTGACACCT;SOR=0.796;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=263;TCF=141;TCR=122;TR=120;WE=63064831;WS=63064813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,134:0.47:288
chr11	63064970	rs575009	T	G	2778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.617;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=56;PP=1741;ReadPosRankSum=-0.214;SC=TATGACCCTTTAATTTGACCT;SOR=0.776;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=207;TCF=107;TCR=100;TR=115;WE=63064978;WS=63064960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,124:0.55:225
chr11	63066903	rs515213	T	C	763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.292;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=5;PP=579;ReadPosRankSum=-1.523;SC=AAAGGGAACATATTTCTCTTG;SOR=1.048;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=61;TCF=50;TCR=11;TR=32;WE=63066911;WS=63066893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,32:0.52:61
chr11	63067138	rs513338	T	G	1569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.100;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=43;PP=1024;ReadPosRankSum=-0.684;SC=CATTAAAAGTTTGGTGACATG;SOR=0.438;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=135;TCF=48;TCR=87;TR=68;WE=63067146;WS=63067128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,71:0.49:145
chr11	63069715	rs557658	A	G	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.923;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=133;ReadPosRankSum=-0.269;SC=ACTGACCAATAACTGCCTGGG;SOR=1.426;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=7;WE=63069723;WS=63069705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr11	63072310	rs1201559	C	T	2830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.955;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=67;PP=1638;ReadPosRankSum=-0.422;SC=TTCCTCCTACCAGAAACCAAG;SOR=0.825;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=260;TCF=123;TCR=137;TR=122;WE=63072318;WS=63072293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,139:0.48:290
chr11	63129782	rs517655	A	G	1165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=22;PP=791;ReadPosRankSum=0.137;SC=GAAAGGCATCACAGTATAAAG;SOR=0.707;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=125;TCF=78;TCR=47;TR=57;WE=63129790;WS=63129772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,58:0.44:131
chr11	63129876	rs516763	T	G	8125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=147;NR=129;PP=2965;SC=CTGCTCAATGTCTGCTCATCA;SOR=0.740;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=277;TCF=147;TCR=130;TR=276;WE=63129884;WS=63129866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,301:1.00:301
chr11	63138482	rs566456	G	A	595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.213;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=329;ReadPosRankSum=-0.407;SC=GTAATGCTGAGAAAGGAAGCC;SOR=0.286;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=51;TCF=38;TCR=13;TR=25;WE=63138490;WS=63138472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,28:0.52:54
chr11	63149670	.	C	CA	714.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=0.000;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=0.683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.41;MQRankSum=2.831;QD=5.58;ReadPosRankSum=-0.495;SOR=0.618;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,48:0.38:128
chr11	63258416	rs10897424	T	C	3098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=51;NR=64;PP=1636;SC=GGCCCGGTACTGGCGGTTCGC;SOR=1.107;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=51;TCR=64;TR=115;WE=63258424;WS=63258406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr11	63313644	rs584905	T	C	3682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=75;NR=39;PP=1821;SC=AGGTTGAAGTTGGTGTGGCCA;SOR=1.082;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=76;TCR=39;TR=114;WE=63313652;WS=63313634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr11	63357919	rs593759	C	T	3409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=82;PP=2262;SC=CCCAGCCGGGCATCTGCCCTT;SOR=2.133;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=31;TCR=82;TR=113;WE=63357927;WS=63357909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr11	63402869	rs3832716	T	TA	701.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=6;PP=232;ReadPosRankSum=0.620;SC=CAAAATGTGCTAAAAAAAAAT;SOR=0.670;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=42;TCF=25;TCR=17;TR=15;WE=63402877;WS=63402859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,31:0.62:50
chr11	63413962	rs147319344	AAAAT	A	2940.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.62;QD=43.25;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr11	63487386	rs542998	T	C	7009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=135;NR=103;PP=2965;SC=GTGAAAGTGGTTTTACCTGAT;SOR=0.924;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=238;TCF=135;TCR=103;TR=238;WE=63487394;WS=63487376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chr11	63581372	rs149262563	G	C	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=131;ReadPosRankSum=-0.569;SC=CGGGACCCGGGCACCTTCTCA;SOR=0.446;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=8;WE=63581380;WS=63581362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr11	63636181	rs12792726	G	T	1309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=13;PP=809;SC=GTCTGCCTGCGTTGTTGCTCC;SOR=1.562;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=32;TCR=13;TR=45;WE=63636189;WS=63636171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr11	63668557	rs224174	C	T	2935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.772;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=60;PP=1786;ReadPosRankSum=1.872;SC=TGCTCCCCGCCCCATTCTCTG;SOR=2.101;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=26;TCR=60;TR=86;WE=63668565;WS=63668547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,101:0.99:102
chr11	63673603	rs10625190	C	CTG	195.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.248;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=362;ReadPosRankSum=-1.083;SC=GTTGAGCCCGCTGTGTGTGTG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=9;WE=63673611;WS=63673593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr11	63679369	.	T	C	82	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=18;MQ=60.0;NF=3;NR=2;PP=82;QD=23.3542425094;SC=TCCAGAGGGGTTCCAATCAGG;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=5;WE=63679377;WS=63679359;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,5:0.83:6
chr11	63680045	rs320109	C	A	9991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=369;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=170;NR=171;PP=2965;SC=AATACCCCTTCGAACTAGTTA;SOR=0.777;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=341;TCF=170;TCR=171;TR=341;WE=63680053;WS=63680035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,369:1.00:369
chr11	63680297	rs320110	A	G	12043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=463;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=220;NR=198;PP=2965;SC=CTCTGCCTCCAGAGAGAAACC;SOR=0.765;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=420;TCF=221;TCR=199;TR=418;WE=63680305;WS=63680287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,460:1.00:460
chr11	63681513	rs10897461	T	C	4802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=80;PP=2837;SC=CCGTGAGGCCTTCAGGGCTCA;SOR=0.976;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=72;TCR=80;TR=152;WE=63681521;WS=63681503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr11	63682312	rs4375445	G	C	15738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=350;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.10;SOR=0.899;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,349:1.00:349
chr11	63682315	rs34212439	C	G	15757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=350;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.15;SOR=0.886;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,349:1.00:349
chr11	63682317	rs113350066	TG	T	15717.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=347;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=21;NR=148;PP=2974;SC=CAGCTGAGCCTGAGCTGCCCC;SOR=0.867;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=171;TCF=21;TCR=150;TR=169;WE=63682331;WS=63682292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,346:1.00:346
chr11	63682319	rs57942405	A	C	15591.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=348;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=134;NR=150;PP=2965;SC=GCTGAGCCTGAGCTGCCCCGG;SOR=0.887;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=304;TCF=139;TCR=165;TR=284;WE=63682331;WS=63682292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,347:1.00:347
chr11	63713317	rs3740637	G	A	2480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=33;PP=1369;SC=TGCAGAGAAAGTCAAGCAAAG;SOR=0.953;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=47;TCR=33;TR=80;WE=63713325;WS=63713307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr11	63714319	rs4980500	T	C	5250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=72;PP=2909;SC=AGTCTCCCGTTGTGGGTCCCC;SOR=1.037;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=182;TCF=109;TCR=73;TR=181;WE=63714327;WS=63714309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr11	63720086	rs4980513	T	G	4388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=99;PP=2953;SC=CCTGGCGATGTTCCAGGCACT;SOR=1.702;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=148;TCF=49;TCR=99;TR=148;WE=63720094;WS=63720076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr11	63767186	rs709594	A	G	2764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=47;NR=45;PP=1431;SC=CGGCAGCCTGACTGGCGCTGG;SOR=0.967;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=92;TCF=47;TCR=45;TR=92;WE=63767194;WS=63767176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr11	63767249	rs11600062	C	T	1302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=29;PP=804;SC=CGGGGGGCGACGGGGTCAGAC;SOR=1.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=15;TCR=29;TR=44;WE=63767257;WS=63767239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr11	63769144	rs539432	C	G	4537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=76;PP=2685;SC=ACGCTGAGAACGGCTCAGGCC;SOR=0.995;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=145;TCF=69;TCR=76;TR=145;WE=63769152;WS=63769134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr11	63883985	rs614397	T	C	11795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=451;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=212;NR=186;PP=2965;SC=TCCCTGATGATGCCACCACCC;SOR=0.800;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=399;TCF=212;TCR=187;TR=398;WE=63883993;WS=63883975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,449:1.00:449
chr11	63884027	rs614035	C	T	10883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=407;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=190;NR=174;PP=2965;SC=TCAACAACGCCGGCATCCCCC;SOR=0.703;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=365;TCF=190;TCR=175;TR=364;WE=63884035;WS=63884017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,406:1.00:406
chr11	63885632	rs4379854	A	G	8827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=158;NR=138;PP=2965;SC=GCGCCAAAGAAGAGTACGTGG;SOR=0.789;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=298;TCF=158;TCR=140;TR=296;WE=63885640;WS=63885622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,325:1.00:325
chr11	63885704	rs677447	C	T	8726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=132;NR=170;PP=2965;SC=CCATTGGCTACGGCACCACGC;SOR=1.057;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=302;TCF=132;TCR=170;TR=302;WE=63885712;WS=63885694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,337:1.00:337
chr11	63970226	rs145620093	ATGT	A	1466.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.868;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.790;NF=10;NR=13;PP=877;ReadPosRankSum=0.491;SC=GTCTTTCCTGATGTTGTCCCC;SOR=0.869;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=49;TCF=23;TCR=26;TR=23;WE=63970236;WS=63970216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,40:0.49:81
chr11	63994692	rs1860368	T	C	9304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.89;SOR=0.731;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr11	63994696	rs2429456	T	C	9293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.90;SOR=0.783;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr11	63995302	rs2429455	C	G	408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=13;PP=318;SC=AATTCTAGCCCTCAGTACCCT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=13;WE=63995310;WS=63995292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	63997329	rs633561	A	G	3727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.46;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr11	63997338	rs633557	T	C	3900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.94;SOR=0.953;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr11	63997566	rs10708923	GA	G	262.14	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.097;QD=11.40;ReadPosRankSum=0.638;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,19:0.83:23
chr11	63997882	.	ATT	A,AT	2128.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=0.000;DP=154;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.21;MQRankSum=0.561;QD=17.03;ReadPosRankSum=1.299;SOR=0.616;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:16,23,86:0.18,0.69:125
chr11	63999529	rs3741403	C	T	3571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=81;PP=2431;SC=GCATCTCTGGCGGGTGCCACA;SOR=1.783;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=119;TCF=38;TCR=81;TR=119;WE=63999537;WS=63999519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr11	64002238	rs7482791	T	C	203.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=3;PP=87;SC=GCTCTGGCTGTCGCCGCCCCC;SOR=0.892;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=8;WE=64002246;WS=64002228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	64004692	rs12366035	C	T	3270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=72;NR=45;PP=1739;SC=TGAAGCCAGACAGGTGAGTCT;SOR=1.027;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=117;TCF=72;TCR=45;TR=117;WE=64004700;WS=64004682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr11	64011441	rs654573	T	C	3679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=70;PP=1819;SC=CCCCTACAGGTGGTGCAACCC;SOR=1.244;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=124;TCF=54;TCR=70;TR=124;WE=64011449;WS=64011431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr11	64012225	rs605187	G	C	1706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=3;PP=1261;SC=GTCGGGGACCGTCACTTCTTC;SOR=4.654;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=47;TCR=3;TR=50;WE=64012233;WS=64012215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr11	64012949	rs57467371	TG	T	472.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=10;PP=226;SC=CAAAGCGGGGTGGGGGGGGGA;SOR=2.712;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=12;WE=64012957;WS=64012939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	64022459	rs632439	A	G	5655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=102;NR=96;PP=2965;SC=GGCCAGACCCAGTGAACACAG;SOR=0.721;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=199;TCF=102;TCR=97;TR=198;WE=64022467;WS=64022449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr11	64023971	rs7943988	G	A	9050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=342;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=160;NR=154;PP=2965;SC=AGGCCCGGCTGCTCATCGAAA;SOR=0.699;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=314;TCF=160;TCR=154;TR=314;WE=64023979;WS=64023961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,341:1.00:341
chr11	64024056	rs588177	C	A	6127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=112;NR=95;PP=2965;SC=CAGGTGGGACCCCAGCTGACC;SOR=0.778;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=208;TCF=113;TCR=95;TR=207;WE=64024064;WS=64024046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr11	64026144	rs2244625	G	A	10118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=383;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=179;NR=177;PP=2965;ReadPosRankSum=0.105;SC=TCAAGACCTCGCCCTACCCCG;SOR=0.232;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=357;TCF=179;TCR=178;TR=356;WE=64026152;WS=64026134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,382:1.00:383
chr11	64026685	rs28395882	C	T	1934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=44;PP=1302;SC=GCGAGAGCTCCGCGGCCACCG;SOR=2.200;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=17;TCR=44;TR=61;WE=64026693;WS=64026675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr11	64030944	rs2510067	T	C	1160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=14;PP=518;SC=GTCAGCCCTGTGGCTCAGCTC;SOR=0.929;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=22;TCR=14;TR=36;WE=64030952;WS=64030934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr11	64033555	rs3815362	C	T	5519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=115;NR=68;PP=2965;SC=TGGATAGACCCGTCGTCAGCC;SOR=1.249;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=184;TCF=116;TCR=68;TR=183;WE=64033563;WS=64033545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr11	64044284	rs72922077	C	A	463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=304;SC=CCTGCCCACTCTTGCCATCCG;SOR=3.383;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=64044292;WS=64044277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	64052306	rs652611	T	G	6779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=105;NR=129;PP=2965;SC=CTCGTCCGCATCCTTTTTCCT;SOR=1.010;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=235;TCF=106;TCR=129;TR=234;WE=64052314;WS=64052296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr11	64054602	rs144121146	T	C	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.325;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.233;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=96;ReadPosRankSum=1.093;SC=GGAATGTCTGTGGAAGATCTT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=7;WE=64054610;WS=64054592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr11	64066859	rs2232417	G	A	805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=3;PP=641;SC=GGACTGGCACGGTGACAGCGC;SOR=3.690;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=27;WE=64066867;WS=64066849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	64070940	rs11231746	T	C	6369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=121;NR=95;PP=2965;SC=TAACCCTTTTTTCTCTTCTCC;SOR=0.888;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=216;TCF=121;TCR=95;TR=216;WE=64070948;WS=64070930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr11	64082437	rs650008	C	T	2642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=47;PP=1541;SC=CTCTGGTGCGCTTGCTCAGCC;SOR=1.067;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=38;TCR=47;TR=85;WE=64082445;WS=64082427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
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chr11	64083328	rs79204587	C	T	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.01;MQRankSum=-4.613;QD=3.47;ReadPosRankSum=0.366;SOR=1.236;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,4:0.17:23
chr11	64083331	rs80310817	C	T	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=2.567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.87;MQRankSum=-4.124;QD=3.76;ReadPosRankSum=0.256;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,4:0.18:22
chr11	64085074	rs550819	T	A	6276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=129;PP=2965;SC=GGGATGCTCCTCTCGATGCTA;SOR=1.219;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=215;TCF=86;TCR=129;TR=215;WE=64085082;WS=64085064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr11	64085148	rs28364831	A	C	1042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=33;PP=820;SC=GTGGGAGCTGAGGTAGGTAGG;SOR=4.977;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=2;TCR=33;TR=35;WE=64085156;WS=64085138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr11	64085785	rs7938623	A	G	2961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=38;PP=1597;SC=GCAAGACGGTACAGTGAAGGA;SOR=0.808;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=55;TCR=38;TR=92;WE=64085793;WS=64085775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr11	64085938	rs7941847	T	C	1487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=27;PP=938;SC=AGAGTATCGCTTTATTTCCTG;SOR=1.402;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=18;TCR=27;TR=45;WE=64085946;WS=64085928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr11	64088435	rs566049	A	G	4958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=87;PP=2965;SC=GGGGGCCCTTAGCCTCTTCAA;SOR=0.902;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=162;TCF=75;TCR=87;TR=162;WE=64088443;WS=64088425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr11	64108539	rs66493355	C	T	4510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQ=59.97;NF=79;NR=76;PP=2692;SC=AGAGGAGCCCCTTCGGGAAGG;SOR=0.816;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=155;TCF=79;TCR=76;TR=155;WE=64108547;WS=64108529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr11	64110348	rs11602301	T	G	557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.89;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	64111928	rs685870	T	C	4720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=83;PP=2572;SC=GCCTGAGGCCTGGGGGTTGAG;SOR=0.821;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=163;TCF=79;TCR=84;TR=162;WE=64111936;WS=64111918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr11	64116843	rs1318165	A	C	1579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=33;NR=23;PP=864;SC=GAGTTGGGGGACCGGCTGGAG;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=33;TCR=23;TR=56;WE=64116859;WS=64116833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr11	64117284	rs4930155	G	A	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=114;ReadPosRankSum=0.130;SC=GGGCCTGTTGGAGAGAGCACT;SOR=0.836;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=27;TCF=9;TCR=18;TR=10;WE=64117292;WS=64117274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr11	64118422	rs614047	G	C	867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=2;PP=677;SC=CTGCCGCAGAGAGACAGAAGT;SOR=4.479;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=28;WE=64118430;WS=64118420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr11	64120435	rs489419	T	C	1563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=25;PP=953;ReadPosRankSum=0.392;SC=TGGGGTCCTGTCTGGCCTCCC;SOR=0.251;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=31;TCR=26;TR=55;WE=64120450;WS=64120425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,58:0.98:59
chr11	64124515	rs612448	T	C	1609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.206;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=26;PP=843;ReadPosRankSum=-0.388;SC=CTCTAGGCCCTGAGGTACAGG;SOR=0.813;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=150;TCF=94;TCR=56;TR=73;WE=64124523;WS=64124505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,82:0.48:170
chr11	64124823	rs519763	C	T	1396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=22;PP=739;ReadPosRankSum=-1.525;SC=GTGGCTCCCGCTGAGGCAGCG;SOR=0.739;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=98;TCF=56;TCR=42;TR=56;WE=64124831;WS=64124813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,64:0.56:114
chr11	64124940	rs600377	T	G	1657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.918;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=33;PP=905;ReadPosRankSum=0.101;SC=GACTGTGGCCTGGGCTGATCT;SOR=0.526;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=147;TCF=75;TCR=72;TR=72;WE=64124948;WS=64124930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,83:0.49:168
chr11	64124980	rs542907	G	A	1400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.319;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=23;PP=633;ReadPosRankSum=0.759;SC=AGGGGCATGAGAATAAAGCTG;SOR=0.554;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=119;TCF=64;TCR=55;TR=54;WE=64124988;WS=64124970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,69:0.48:144
chr11	64127744	rs521950	A	G	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=7;PP=324;ReadPosRankSum=-0.149;SC=CCAAGACGCAAGAGCACACGC;SOR=0.725;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=42;TCF=30;TCR=12;TR=20;WE=64127752;WS=64127734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,22:0.42:53
chr11	64127881	rs564687	T	G	4500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.528;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=60;PP=2726;ReadPosRankSum=1.587;SC=CCCAACGGGGTTGGGGTGGCT;SOR=0.618;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=155;TCF=94;TCR=61;TR=154;WE=64127889;WS=64127871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,168:0.99:169
chr11	64128423	rs516124	G	T	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=100;ReadPosRankSum=0.903;SC=GATCCACGGGGCCCTCCTTCT;SOR=2.584;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=7;WE=64128431;WS=64128422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr11	64135435	rs508168	G	A	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.649;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=94;ReadPosRankSum=-0.574;SC=ATAAAACCAGGTGGAATAAAA;SOR=0.495;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=7;WE=64135443;WS=64135427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr11	64135541	rs3217512	GTC	G	2843.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.635;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.851;NF=26;NR=23;PP=1949;ReadPosRankSum=0.284;SC=CCCCACCAGAGTCTCCTCACC;SOR=0.597;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=107;TCF=63;TCR=44;TR=49;WE=64135550;WS=64135531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,76:0.47:161
chr11	64136877	rs11606015	C	G	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=155;ReadPosRankSum=-1.202;SC=GGCTTGCCGCCGTGGGTGGGT;SOR=0.922;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=12;WE=64136885;WS=64136867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr11	64137875	rs11606081	T	C	1097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.473;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=20;ReadPosRankSum=0.265;SC=CTGGAGGTCATAGACCATGGT;SOR=0.523;SbPval=0.68;Source=Platypus;TCF=56;TR=48;WE=64137883;WS=64137865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,56:0.47:118
chr11	64138805	rs11542299	T	C	2702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.891;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=69;PP=1348;ReadPosRankSum=-0.444;SC=GCGTGGAGAATGCACCCCTGG;SOR=0.824;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=279;TCF=138;TCR=141;TR=131;WE=64138813;WS=64138795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,142:0.46:308
chr11	64138905	rs17857342	T	G	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=189;ReadPosRankSum=2.221;SC=CCCCGTCGCCTCCAAAGGGGC;SOR=0.656;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=49;TCF=11;TCR=38;TR=15;WE=64138913;WS=64138895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,15:0.31:48
chr11	64329448	rs369401248	G	A	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=191;ReadPosRankSum=-0.714;SC=CCCCTCTCCAGGCCCCGTGTG;SOR=0.922;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=13;WE=64329456;WS=64329438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr11	64367325	rs1630320	A	G	2446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=52;PP=1514;SC=TGTTGCTGGCAGGGCTCTGCA;SOR=1.321;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=33;TCR=52;TR=85;WE=64367333;WS=64367315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr11	64367651	rs2022050	G	A	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=313;ReadPosRankSum=-1.421;SC=CTGGCTCTGGGTGTCTGAGCG;SOR=1.931;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=15;WE=64367659;WS=64367641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr11	64367736	rs7929627	A	G	1504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.304;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=27;PP=882;ReadPosRankSum=0.095;SC=CCAAACATTTACAAAGAGGCC;SOR=0.814;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=131;TCF=75;TCR=56;TR=62;WE=64367744;WS=64367726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,71:0.49:144
chr11	64367862	rs7932775	T	C	1816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.143;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=40;PP=1040;ReadPosRankSum=-0.742;SC=GCGCTCAGCCTTGGCCGTGCT;SOR=0.786;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=157;TCF=79;TCR=78;TR=76;WE=64367870;WS=64367852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,90:0.49:182
chr11	64368428	rs11231837	C	T	1063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=26;PP=664;ReadPosRankSum=-0.044;SC=GACCCAGCCTCGGGACCACCC;SOR=0.678;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=95;TCF=47;TCR=48;TR=48;WE=64368436;WS=64368418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,52:0.48:109
chr11	64402695	rs61884406	T	C	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.579;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.54;ReadPosRankSum=-1.068;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr11	64415767	rs3825074	G	A	1616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=35;PP=850;ReadPosRankSum=-1.297;SC=GCAAGCAGACGCCCTGGTTGG;SOR=0.657;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=122;TCF=56;TCR=66;TR=67;WE=64415775;WS=64415757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,78:0.56:139
chr11	64415903	rs59739006	C	T	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=108;ReadPosRankSum=0.699;SC=GCAGAGAGGTCCTACTCTGAG;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=6;WE=64415911;WS=64415893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr11	64419217	rs502571	TT	GC	527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=413;ReadPosRankSum=-0.618;SC=AGTGACATCTTTAGAGATGTC;SOR=1.127;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=10;WE=64419226;WS=64419207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr11	64465282	rs17189800	C	T	2340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.583;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=60;PP=1407;ReadPosRankSum=0.664;SC=CAGCGAGGTTCGGAGAAGACG;SOR=0.944;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=226;TCF=101;TCR=125;TR=105;WE=64465290;WS=64465272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,115:0.47:244
chr11	64465403	rs471618	T	C	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.228;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=117;ReadPosRankSum=-1.192;SC=AGTCACCCAATGTGGAAGGCC;SOR=0.095;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=9;WE=64465411;WS=64465393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,10:0.33:30
chr11	64480308	rs2666560	C	T	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=145;ReadPosRankSum=0.764;SC=AGCCCTGGAGCGCTCGCACCC;SOR=0.582;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=9;WE=64480316;WS=64480298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr11	64480930	rs12273892	A	T	1491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.384;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=24;PP=657;ReadPosRankSum=0.538;SC=GTCCACCAGCAGCAGCTCCAG;SOR=0.665;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=110;TCF=61;TCR=49;TR=58;WE=64480938;WS=64480920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,70:0.53:131
chr11	64496357	rs2230414	G	T	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.182;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=177;ReadPosRankSum=-1.152;SC=AGCCTCGCCTGCCAGGGCGGG;SOR=0.914;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=41;TCF=30;TCR=11;TR=16;WE=64496365;WS=64496347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,19:0.41:46
chr11	64496587	rs559977	T	C	2406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=49;PP=1249;SC=CGCAGGCTTGTGCCCCCCTAC;SOR=1.240;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=36;TCR=49;TR=85;WE=64496595;WS=64496577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr11	64497161	rs534221	C	T	2806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.99;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr11	64497189	rs533515	A	C	2464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=9.495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.11;ReadPosRankSum=2.169;SOR=0.508;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,106:0.82:129
chr11	64503179	rs553618	A	G	943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=21;PP=761;SC=GAGGCAGGGGAAGCCCAGAGC;SOR=1.473;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=11;TCR=21;TR=32;WE=64503187;WS=64503169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	64503363	rs10897524	G	A	1119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.578;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=18;PP=542;ReadPosRankSum=0.696;SC=AGAGGAGGGAGTACCCCCTCA;SOR=0.502;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=63;TCR=36;TR=49;WE=64503371;WS=64503353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,56:0.52:107
chr11	64503496	rs556356	A	G	1930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=37;PP=1082;SC=CCCTGCCCACAGCCACAGAGC;SOR=1.678;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=20;TCR=37;TR=57;WE=64503504;WS=64503486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr11	64503543	rs33956572	CT	C	161.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.482;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.111;NF=0;NR=7;PP=252;ReadPosRankSum=-0.056;SC=CACAGCTCAGCTCAGAGCTCG;SOR=2.546;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=7;WE=64503551;WS=64503533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr11	64507315	rs550930	T	C	4482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=102;PP=2707;SC=AGCACCTTGCTGGCCTCTCCC;SOR=1.325;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=164;TCF=62;TCR=102;TR=164;WE=64507323;WS=64507305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr11	64507680	rs547280	A	C	11849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=450;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=215;NR=217;PP=2965;SC=CATGCGCATGACTCGTGGCCC;SOR=0.711;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=432;TCF=215;TCR=217;TR=432;WE=64507688;WS=64507670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,450:1.00:450
chr11	64507799	rs546323	G	C	3969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=49;NR=83;PP=2765;SC=CATCTCCCCCGACCCCGTCAT;SOR=1.478;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=132;TCF=49;TCR=83;TR=132;WE=64507807;WS=64507789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr11	64510898	rs2904961	C	T	2745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=50;NR=45;PP=1703;SC=GGCGTCCTGCCCGCCTCGCCC;SOR=0.797;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=50;TCR=45;TR=95;WE=64510906;WS=64510888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr11	64511050	rs2073797	G	C	1304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.352;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=21;PP=733;ReadPosRankSum=1.756;SC=CGGGAAGCCTGAGCCTGGGAA;SOR=0.544;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=81;TCR=49;TR=55;WE=64511058;WS=64511040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,64:0.45:142
chr11	64514506	rs569602	A	G	1358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.404;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=43;PP=952;ReadPosRankSum=-0.128;SC=GGGGGCTAGGATAAGTTCTAT;SOR=1.135;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=135;TCF=45;TCR=90;TR=60;WE=64514514;WS=64514496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,62:0.44:140
chr11	64519062	rs532747	T	C	2694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=54;PP=1670;ReadPosRankSum=0.371;SC=GGAGCCTGGCTTCTCACCTTC;SOR=0.694;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=234;TCF=121;TCR=113;TR=112;WE=64519070;WS=64519052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,129:0.49:264
chr11	64519345	rs686171	G	A	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=4;PP=151;ReadPosRankSum=-0.986;SC=GTACTATGCCGCAGGAACACG;SOR=0.490;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=10;WE=64519353;WS=64519335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr11	64520942	rs2959652	G	T	1225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=18;PP=722;ReadPosRankSum=-0.261;SC=ACAGAGGCGTGGAGTGGGTGG;SOR=0.744;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=109;TCF=70;TCR=39;TR=50;WE=64520950;WS=64520932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,57:0.47:120
chr11	64522066	rs625172	A	G	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=157;ReadPosRankSum=2.320;SC=CCCAGTCTCCACTCCCTTATC;SOR=0.631;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=14;WE=64522074;WS=64522056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr11	64525216	rs589691	C	T	1483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.259;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=28;PP=756;ReadPosRankSum=0.789;SC=CCCTCCCCTTCTCTGGGCTCC;SOR=0.369;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=128;TCF=78;TCR=50;TR=66;WE=64525224;WS=64525206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,74:0.53:139
chr11	64525464	rs490980	C	T	1090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=26;PP=644;ReadPosRankSum=0.635;SC=GGGTGGGGGCCGTGGGCCGGT;SOR=0.726;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=41;TCR=54;TR=46;WE=64525472;WS=64525454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,52:0.48:108
chr11	64525644	rs489192	G	T	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.920;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=72;ReadPosRankSum=0.507;SC=TTCGGACCTTGCCAGAGATGA;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=6;WE=64525652;WS=64525634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr11	64527080	rs477549	T	C	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.629;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=87;ReadPosRankSum=-1.584;SC=GCCAGCTCCCTGGCAGCGCCT;SOR=0.165;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=8;WE=64527088;WS=64527070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr11	64535357	rs575375	T	C	6180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=113;PP=2965;SC=TGCCTGCGCCTCCTAGTGGCA;SOR=1.105;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=198;TCF=85;TCR=113;TR=198;WE=64535365;WS=64535347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr11	64535849	rs561158	C	T	2418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=54;PP=1613;SC=ATGGAAAGTTCTGAAGAATTC;SOR=2.140;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=75;TCF=21;TCR=54;TR=74;WE=64535857;WS=64535839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr11	64536866	rs484886	T	C	4667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=70;PP=2940;SC=AGGTTTCTGCTAGGAGGCTTC;SOR=0.836;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=145;TCF=74;TCR=71;TR=143;WE=64536874;WS=64536856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr11	64543927	rs34514973	G	GT	1444.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.422;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.979;NF=25;NR=8;PP=1301;ReadPosRankSum=-1.511;SC=AGAATAAATCGTAACAATCTC;SOR=1.256;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=66;TCF=45;TCR=21;TR=33;WE=64543935;WS=64543917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,47:0.52:90
chr11	64544135	rs474707	C	T	1800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.213;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=50;PP=1137;ReadPosRankSum=-1.164;SC=GATGTAAATACAAGTAGTTAT;SOR=0.596;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=158;TCF=65;TCR=93;TR=86;WE=64544143;WS=64544125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,88:0.52:169
chr11	64559898	rs10897526	T	C	6686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=132;PP=2965;ReadPosRankSum=0.890;SC=AAAGCGCCTGTAGGGGTGATA;SOR=0.459;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=227;TCF=95;TCR=132;TR=227;WE=64559906;WS=64559888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,243:1.00:244
chr11	64563934	rs483544	A	G	8620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=160;NR=137;PP=2965;SC=GCCCCTGCGGACCCTGCCTCC;SOR=0.818;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=300;TCF=162;TCR=138;TR=297;WE=64563942;WS=64563924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,321:1.00:321
chr11	64564208	rs677298	A	G	2601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.523;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=50;PP=1531;ReadPosRankSum=0.035;SC=GCATGGGGTCAGAGGTCAGAC;SOR=0.652;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=181;TCF=99;TCR=82;TR=109;WE=64564216;WS=64564198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,124:0.61:203
chr11	64567047	rs3832792	GCA	G	5247.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=406;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.230;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.629;NF=20;NR=69;PP=2976;ReadPosRankSum=1.108;SC=CCCAAAATCTGCACACACACA;SOR=0.781;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=233;TCF=40;TCR=193;TR=89;WE=64567056;WS=64567037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:208,158:0.43:366
chr11	64569000	rs1143937	C	T	707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=6;PP=363;ReadPosRankSum=0.253;SC=CCAGGGTAGCCGGGGAGGGTC;SOR=0.742;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=62;TCF=45;TCR=17;TR=28;WE=64569008;WS=64568990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,34:0.49:70
chr11	64572018	rs2959656	T	C	5419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=107;PP=2965;SC=GGTGATGCTGTGGGTGCTGGC;SOR=1.072;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=188;TCF=81;TCR=107;TR=188;WE=64572026;WS=64572008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr11	64572557	rs540012	A	G	3660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=67;NR=59;PP=1999;SC=CCCAGCCCACATGCAGCACAG;SOR=0.796;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=126;TCF=67;TCR=59;TR=126;WE=64572565;WS=64572547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr11	64572602	rs2071313	G	A	1182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.601;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=30;PP=673;ReadPosRankSum=0.372;SC=TGCAGATGCCGTCGTAGAATC;SOR=0.519;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=98;TCF=44;TCR=54;TR=56;WE=64572610;WS=64572592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,59:0.56:105
chr11	64573589	rs669976	T	C	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=152;ReadPosRankSum=0.361;SC=GCCTAGGGACTGGATGGAAAG;SOR=0.818;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=9;WE=64573597;WS=64573584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr11	64577620	rs509606	G	C	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=66;ReadPosRankSum=0.555;SC=AGGCAAGCCGGGGGAGGGAGG;SOR=0.693;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=9;WE=64577628;WS=64577610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr11	64591972	rs10792447	T	C	2088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.666;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=45;PP=1297;ReadPosRankSum=-0.145;SC=ATTCAGGGGATAGGGGGAGGC;SOR=0.459;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=200;TCF=113;TCR=87;TR=92;WE=64591980;WS=64591962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,103:0.47:218
chr11	64594490	rs646709	A	G	682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=4;PP=427;SC=AGCCTCACCAAAGTGGCTTGT;SOR=2.494;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=21;WE=64594498;WS=64594480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	64596916	rs10897529	C	T	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=383;ReadPosRankSum=0.037;SC=TGCCTGGCCCCCCTGCCAAGC;SOR=0.569;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=20;WE=64596924;WS=64596906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,23:0.66:35
chr11	64597205	rs7936466	G	T	2147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.574;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=45;PP=1239;ReadPosRankSum=0.854;SC=ATAGCCGGTCGCCCAGCAGCC;SOR=0.748;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=149;TCF=69;TCR=80;TR=83;WE=64597213;WS=64597195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,96:0.57:167
chr11	64597506	rs3741395	T	C	2615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.947;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=66;PP=1534;ReadPosRankSum=-1.050;SC=CAAGGTCAGCTGCTGCACGCG;SOR=0.614;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=249;TCF=115;TCR=134;TR=123;WE=64597514;WS=64597496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,128:0.49:262
chr11	64597574	rs12790925	G	A	2212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.234;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=49;PP=1413;ReadPosRankSum=1.034;SC=AGTGTCACTGGCAGGTGGTTG;SOR=0.703;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=218;TCF=115;TCR=103;TR=100;WE=64597582;WS=64597564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,104:0.45:231
chr11	64598944	rs684071	A	G	3623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=36;PP=2269;SC=CGCAGGCCTGAACTGCTTCCT;SOR=1.306;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=120;TCF=83;TCR=37;TR=119;WE=64598952;WS=64598934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr11	64601933	rs7933683	T	C	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.494;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=380;ReadPosRankSum=-1.075;SC=CCTGCACCTGTGTCAGCCGCT;SOR=0.978;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=52;TCF=29;TCR=23;TR=23;WE=64601941;WS=64601923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,25:0.45:56
chr11	64602757	rs561895	T	C	2310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.260;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=34;PP=1284;ReadPosRankSum=0.499;SC=TGCCCACCCCTCAACTGGCTC;SOR=0.570;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=147;TCF=90;TCR=57;TR=89;WE=64602765;WS=64602747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,106:0.62:170
chr11	64602782	rs11605623	C	T	2013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.207;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=44;PP=1326;ReadPosRankSum=-1.625;SC=TTGCCTTGTCCGTCTGTTGTA;SOR=0.551;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=216;TCF=126;TCR=90;TR=96;WE=64602790;WS=64602772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,102:0.42:244
chr11	64603844	rs138577794	A	ACTCACCCAC	1433.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.76;MQRankSum=3.285;QD=17.92;ReadPosRankSum=-1.016;SOR=0.731;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,36:0.45:80
chr11	64604178	.	T	C	46	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=16;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=24;MQ=57.15;NF=3;NR=2;PP=46;QD=16.1542425094;SC=GACTCAGCCCTGGGGGGGGGG;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=5;WE=64604186;WS=64604168;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:7,5:0.42:12
chr11	64605689	rs541525	A	G	740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=11;NR=17;PP=509;SC=CCCGAGGCCCAAGGCCCAGGA;SOR=1.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=11;TCR=17;TR=28;WE=64605697;WS=64605679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	64606765	rs676977	T	C	1428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=34;PP=1092;SC=GACTGCTGGCTCCTCGCGATG;SOR=2.352;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=9;TCR=34;TR=43;WE=64606773;WS=64606755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr11	64606910	rs142726755	C	CCTGCTCCCA	570.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.51;ReadPosRankSum=0.892;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,14:0.23:60
chr11	64608282	rs71541906	G	A	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=214;ReadPosRankSum=0.355;SC=CCAAGCCCACGCTCTACAGCT;SOR=1.244;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=13;WE=64608290;WS=64608272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr11	64621856	rs3897618	A	G	4508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=56;PP=2736;SC=GCAGGTCGGCAGGCAGCTCGT;SOR=1.294;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=157;TCF=101;TCR=56;TR=157;WE=64621864;WS=64621846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr11	64622869	rs10897533	G	C	3954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=70;NR=56;PP=2170;SC=AGATCTCTCCGAGGTTGTTCA;SOR=0.761;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=126;TCF=70;TCR=56;TR=126;WE=64622877;WS=64622859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr11	64645871	rs1211284	A	G	6318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=110;PP=2965;SC=GCAGCCCCTCAGCCACCGTCT;SOR=0.752;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=217;TCF=107;TCR=110;TR=217;WE=64645879;WS=64645861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr11	64664774	rs658006	C	T	982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=17;PP=639;ReadPosRankSum=-0.139;SC=AGAGGAGAAACTGAGGCCCTG;SOR=0.704;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=50;TCR=30;TR=45;WE=64664782;WS=64664764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,47:0.55:86
chr11	64668654	.	AT	A	93.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.734;ClippingRankSum=-0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.25;ReadPosRankSum=1.023;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr11	64669417	rs682673	T	C	2860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=24;PP=2001;SC=AACTGGTCCATCCCTCCCACC;SOR=2.078;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=69;TCR=24;TR=93;WE=64669425;WS=64669407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr11	64677293	rs656195	G	C	3194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=49;PP=1785;SC=CCAGGGGTCCGGCTCAGGCCG;SOR=0.744;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=111;TCF=62;TCR=49;TR=110;WE=64677301;WS=64677283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr11	64678920	rs638583	T	C	79.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.76;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr11	64680407	rs594820	G	C	526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=1;PP=433;SC=AGTAAATCCCGCACTTGACAT;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=64680415;WS=64680397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	64680819	rs618006	G	A	671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=16;PP=406;SC=GCTGATGCACGTCCACCGGCG;SOR=2.124;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=22;WE=64680827;WS=64680809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	64695185	.	GAA	G	82.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=0.000;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=9.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.42;MQRankSum=-0.520;QD=2.07;ReadPosRankSum=1.341;SOR=2.542;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,10:0.25:40
chr11	64700767	rs675090	G	A	1338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=35;PP=989;SC=GCAGGGAGGAGTCAGACCCCC;SOR=2.687;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=9;TCR=35;TR=44;WE=64700775;WS=64700757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr11	64702200	rs673995	C	T	1993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.592;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.855;NF=48;NR=41;PP=1239;ReadPosRankSum=-0.717;SC=CCCACCAGAACGTCAAGCCCT;SOR=0.807;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=211;TCF=112;TCR=99;TR=89;WE=64702208;WS=64702190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,100:0.43:234
chr11	64702765	rs2307669	C	CTCTG	727.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=4;NR=6;PP=577;SC=CCACCGTCCACTCAGCTCTTT;SOR=0.804;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=10;WE=64702773;WS=64702755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	64707978	rs586616	A	G	2519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=54;NR=29;PP=1318;SC=GCTGCTCTACATATCAGAGAA;SOR=1.099;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=54;TCR=29;TR=83;WE=64707986;WS=64707968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr11	64713485	rs596321	T	G	1475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=35;NR=17;PP=812;SC=ACCGGAATCCTGACTTGTAAC;SOR=1.278;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=53;TCF=35;TCR=18;TR=52;WE=64713493;WS=64713475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr11	64718050	rs138174447	TTTTC	T	1047.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.34;QD=41.91;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	64721908	rs495330	G	A	852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=4;PP=521;SC=GTTTCCCAGAGCCCTGGAAGG;SOR=2.546;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=25;WE=64721916;WS=64721898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr11	64726701	rs602404	A	C	1566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=10;PP=963;SC=GGTGAAGGTAAAGAAGAGGTG;SOR=1.739;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=36;TCR=10;TR=46;WE=64726709;WS=64726691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr11	64757504	rs574381	G	C	9424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=136;NR=170;PP=2965;SC=TCCGCCTGCTGTCATCCCACC;SOR=0.976;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=306;TCF=136;TCR=170;TR=306;WE=64757512;WS=64757494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,334:1.00:334
chr11	64761779	rs626670	T	C	618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=3;PP=470;SC=AGCCACAGGATCCTTTTCTCA;SOR=2.636;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=64761787;WS=64761769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	64789194	rs664226	T	C	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=386;ReadPosRankSum=-0.293;SC=TCCTCCCAGGTCCTGGAGCTG;SOR=0.850;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=41;TCF=37;TCR=4;TR=21;WE=64789202;WS=64789184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,23:0.53:43
chr11	64794918	rs3832791	T	TG	1134.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=5;PP=978;SC=AGCGCAGGCCTGGCGAGGCGG;SOR=2.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=25;WE=64794926;WS=64794908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	64799789	rs532373	C	T	1707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=27;PP=1205;SC=TGTCCCTGGGCGAGGGGCTGC;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=27;TCR=27;TR=54;WE=64799797;WS=64799779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr11	64799894	rs678614	A	C	6593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=127;NR=94;PP=2965;SC=AGTCTCATGTACCTCATAGGT;SOR=0.959;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=221;TCF=127;TCR=94;TR=221;WE=64799902;WS=64799884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr11	64799998	rs534236	T	C	7044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=114;NR=122;PP=2965;SC=AGGAGTTCCCTGCTTTCCCCC;SOR=0.868;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=236;TCF=114;TCR=122;TR=236;WE=64800011;WS=64799988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,270:1.00:270
chr11	64802267	rs6591869	G	A	859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=8;PP=585;SC=TGGGGCAGAAGCCCCTGTGGG;SOR=1.911;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=31;WE=64802275;WS=64802257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	64807294	rs653111	G	A	1707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=22;NR=37;PP=1012;SC=TGGGACTCTCGCTCCTGCACT;SOR=1.402;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=59;TCF=22;TCR=37;TR=59;WE=64807302;WS=64807284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr11	64808647	rs10160811	A	C	518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=5;PP=305;SC=GCGGGCCCAGACAGGTTCAGC;SOR=1.061;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=17;WE=64808655;WS=64808637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	64808681	rs34998502	AC	A	687.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=10;HapScore=3;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=7;NR=7;PP=471;SC=GCCGCTCCCCACCCCCCGGCC;SOR=1.085;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=7;TCR=7;TR=14;WE=64808690;WS=64808671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	64809090	rs12271134	T	G	1540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=27;NR=24;PP=756;SC=CGAGCTGTGCTCCTGGACCTG;SOR=0.793;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=27;TCR=24;TR=51;WE=64809098;WS=64809080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr11	64809133	rs10792455	T	G	607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.63;SOR=0.874;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr11	64809167	rs10792456	A	G	392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=7;NR=8;PP=248;SC=CACGCTGCTGACCGTAGTGGC;SOR=0.941;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=7;TCR=8;TR=15;WE=64809175;WS=64809157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	64809441	rs3862374	C	T	567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=15;PP=399;SC=TCACCATTAGCCCCCTCCCAG;SOR=2.531;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=19;WE=64809449;WS=64809431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	64810771	rs11231929	A	G	930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.02;SOR=3.477;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr11	64820654	rs477539	C	T	422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=12;NR=3;PP=267;SC=CCTCCGGGGGCGAAGGTCCCT;SOR=2.049;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=64820662;WS=64820644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	64833935	rs548150	G	A	3690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=54;PP=1958;SC=GCCTTCCGGGGGTTTGGGTCA;SOR=0.737;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=122;TCF=68;TCR=54;TR=121;WE=64833943;WS=64833925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr11	64834432	rs573957	T	A	920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=20;PP=603;SC=CACCTCCTGCTTCAGCCACCT;SOR=1.542;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=11;TCR=20;TR=31;WE=64834440;WS=64834422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	64835306	rs492799	C	A	1675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=34;PP=1049;SC=GGGTGCCCAGCCAAAGGCCCC;SOR=1.460;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=20;TCR=34;TR=54;WE=64835314;WS=64835296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr11	64835463	rs149675910	ACT	A	79.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=1.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.11;MQRankSum=2.848;QD=0.90;ReadPosRankSum=0.175;SOR=1.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,14:0.16:89
chr11	64836032	rs117696128	G	A	2659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.596;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=47;PP=1399;ReadPosRankSum=-0.140;SC=CCACTGGCTTGTTGGCCAGCT;SOR=0.839;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=210;TCF=119;TCR=91;TR=113;WE=64836040;WS=64836022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,128:0.55:234
chr11	64851305	rs947799	C	T	6622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=124;NR=94;PP=2965;SC=TTTAAGGGCGCCTCCTCCGGC;SOR=0.897;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=218;TCF=124;TCR=94;TR=218;WE=64851313;WS=64851295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr11	64851453	rs35819335	CT	C	10419.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=137;PP=2951;SC=CCAGACATAACTTAGGCTCCG;SOR=1.048;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=161;TCF=19;TCR=142;TR=156;WE=64851461;WS=64851443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,279:1.00:279
chr11	64856500	rs525781	A	G	2735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=65;PP=1857;SC=TCTTGCAGCCACATCTTGCCC;SOR=2.160;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=90;TCF=25;TCR=65;TR=90;WE=64856508;WS=64856490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr11	64878661	rs625004	T	C	8198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=146;NR=129;PP=2965;SC=TATCCCTCCCTTCTTATCTGG;SOR=0.767;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=275;TCF=146;TCR=129;TR=275;WE=64878669;WS=64878651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,307:1.00:307
chr11	64880090	rs4930284	G	C	1299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=21;PP=708;SC=CGTCCCTGCCGGGGCTGGAGG;SOR=0.859;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=26;TCR=21;TR=47;WE=64880098;WS=64880080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr11	64883864	rs1706937	A	G	5595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=79;PP=2965;SC=CTCAGAAACAAGCAACAGGGC;SOR=0.917;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=187;TCF=108;TCR=79;TR=187;WE=64883872;WS=64883854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr11	64884052	rs1546532	G	A	4638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=71;PP=2892;SC=CGCAGTCTAGGGCCAGGGGTG;SOR=0.753;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=152;TCF=81;TCR=71;TR=152;WE=64884060;WS=64884042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr11	64889416	rs769440	G	C	1299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=34;PP=792;SC=GGCTCACGTGGGGAAGGCCAG;SOR=2.655;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=9;TCR=34;TR=43;WE=64889424;WS=64889406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr11	64897453	rs1206196	C	T	4893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=90;NR=75;PP=2855;SC=CAAGAAGAACCCAGAGAGTGG;SOR=0.726;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=165;TCF=90;TCR=75;TR=165;WE=64897461;WS=64897443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr11	64898357	rs11369296	G	GC	7989.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=86;PP=2974;SC=TGGGGCCTGTGCCTGCTGTGC;SOR=0.806;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=125;TCF=37;TCR=88;TR=120;WE=64898365;WS=64898347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr11	64948277	rs3953797	A	C	2444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.629;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=43;PP=1557;ReadPosRankSum=-1.878;SC=CATCCACAACATGCAAGACTG;SOR=0.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=201;TCF=115;TCR=86;TR=104;WE=64948285;WS=64948267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,115:0.51:224
chr11	64948555	rs12422027	A	G	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.405;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=367;ReadPosRankSum=-0.917;SC=TGGGGGAGAGAACAGGGATGT;SOR=2.617;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=18;WE=64948563;WS=64948545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr11	64950970	rs17583	C	T	1862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.141;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=29;PP=1085;ReadPosRankSum=0.301;SC=TGGCGGCCATCGCCTCCCTCA;SOR=0.601;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=164;TCF=106;TCR=58;TR=80;WE=64950978;WS=64950960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,91:0.48:190
chr11	64972354	rs2271450	A	T	1101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.595;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=31;PP=659;ReadPosRankSum=-1.674;SC=TCACCGGTGGATCTCACTGAG;SOR=1.271;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=116;TCF=55;TCR=61;TR=50;WE=64972362;WS=64972344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,58:0.43:135
chr11	64977424	rs2271448	C	T	2331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.062;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=55;PP=1487;ReadPosRankSum=0.827;SC=CATGCAGGTGCGGGCCGGGCA;SOR=0.766;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=199;TCF=102;TCR=97;TR=109;WE=64977432;WS=64977414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,113:0.53:212
chr11	64977644	rs625750	C	T	513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-1.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.174;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=339;ReadPosRankSum=-0.865;SC=AGGCCCTTGTCCCTGGGGTGC;SOR=0.483;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=15;TCR=23;TR=20;WE=64977652;WS=64977634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,22:0.49:45
chr11	64977937	rs542380	A	G	5534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=109;PP=2965;SC=AGTGTCCCCAACTGCCTCCCA;SOR=1.321;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=180;TCF=71;TCR=109;TR=180;WE=64977945;WS=64977927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr11	64981472	rs239258	G	C	2396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FS=0.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.18;ReadPosRankSum=1.740;SOR=0.748;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:140,121:0.46:261
chr11	64981522	rs11605576	C	A	2992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=63;PP=1745;ReadPosRankSum=1.713;SC=CACACTGAGGCCTCCACCAAC;SOR=0.708;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=258;TCF=131;TCR=127;TR=129;WE=64981530;WS=64981512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,141:0.49:285
chr11	64981587	rs11605632	G	A	1749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.507;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=43;PP=1140;ReadPosRankSum=1.428;SC=TGGGGCCCCTGAGCCCTGCCG;SOR=0.629;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=188;TCF=92;TCR=96;TR=86;WE=64981595;WS=64981577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,92:0.43:214
chr11	64981837	rs12420456	C	T	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=1.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.27;ReadPosRankSum=-0.416;SOR=0.489;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,34:0.37:93
chr11	64981853	rs239259	G	T	959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=20;PP=548;ReadPosRankSum=2.116;SC=CCGTCTACATGGCCGGGGTGC;SOR=0.631;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=70;TCF=37;TCR=33;TR=43;WE=64981861;WS=64981843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,44:0.60:73
chr11	64985220	.	C	G	232	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=11;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=15;MQ=56.52;NF=0;NR=15;PP=232;QD=17.7847475031;SC=AGGGCGGGGGCGGGGGGACAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=15;WE=64985228;WS=64985210;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr11	64990041	rs514076	G	C	3472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.51;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr11	64993195	rs10633296	C	CAGTA	4588.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=46;PP=2161;SC=CTTCTGGAAACAGCAAAAGCC;SOR=1.586;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=57;TCF=2;TCR=55;TR=48;WE=64993203;WS=64993185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr11	65000478	rs2904978	C	T	569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=1;PP=466;SC=CTTAGGAGACCGTGAAGGGGT;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=65000486;WS=65000468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	65000719	rs2904979	C	T	6891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=103;NR=125;PP=2965;SC=ATCATCAACACCCCGGCCATG;SOR=1.016;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=228;TCF=103;TCR=125;TR=228;WE=65000727;WS=65000709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr11	65003812	rs625427	T	C	639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=6;PP=501;SC=GGCTCCACCCTTCTCCACTAC;SOR=1.931;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=21;WE=65003820;WS=65003802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr11	65004301	rs2904982	G	T	8267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=146;NR=135;PP=2965;SC=GGCCGTCTGCGTCCTGACCGA;SOR=0.732;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=281;TCF=146;TCR=135;TR=281;WE=65004309;WS=65004291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,314:1.00:314
chr11	65004386	rs56657874	C	T	1501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.109;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=39;PP=895;ReadPosRankSum=0.490;SC=ACCAAGAGGCCGAAAGTTACA;SOR=0.520;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=133;TCF=52;TCR=81;TR=66;WE=65004394;WS=65004374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,74:0.49:152
chr11	65043321	rs79688041	G	A	1318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.664;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=17;PP=628;ReadPosRankSum=3.474;SC=TTAGTATTGGGTCTAGTAGGA;SOR=0.593;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=117;TCF=77;TCR=40;TR=50;WE=65043329;WS=65043311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,62:0.45:137
chr11	65118971	rs620888	T	C	700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=1;PP=509;SC=TGATATTTCATAATATTTGAA;SOR=4.003;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=65118979;WS=65118961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr11	65143701	rs80042162	CT	C	1108.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.036;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.812;NF=8;NR=11;PP=631;ReadPosRankSum=-0.828;SC=CACAGGCCCCCTGGCTTCCGG;SOR=0.169;SbPval=0.06;Source=Platypus;TC=46;TCF=30;TCR=16;TR=19;WE=65143709;WS=65143691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,34:0.57:60
chr11	65144075	rs624307	T	C	9853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=373;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=173;NR=167;PP=2965;SC=GACTTGATCATGTCTAAGGGC;SOR=0.754;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=340;TCF=173;TCR=167;TR=340;WE=65144083;WS=65144065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,373:1.00:373
chr11	65147294	rs547221	G	A	1689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.084;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=34;PP=892;ReadPosRankSum=1.396;SC=AGCCCCAGATGCCTCCCCGAA;SOR=0.612;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=187;TCF=105;TCR=82;TR=77;WE=65147302;WS=65147284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,87:0.42:207
chr11	65147862	rs573864	C	G	566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=4;PP=408;SC=GGACAAGGGACTAAGACCCCA;SOR=1.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=18;WE=65147870;WS=65147852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	65161129	rs2073800	C	T	2058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.043;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=42;PP=1107;ReadPosRankSum=0.098;SC=GTGCCCCAGACGATGACGTGG;SOR=0.610;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=185;TCF=102;TCR=83;TR=88;WE=65161137;WS=65161119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,105:0.48:217
chr11	65161328	rs4930154	T	C	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.787;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=4;PP=184;ReadPosRankSum=0.081;SC=TGAAGCCCCATTGGGGGATGG;SOR=0.477;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=25;TCF=11;TCR=14;TR=10;WE=65161336;WS=65161318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr11	65164114	rs7940559	G	A	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.103;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=167;ReadPosRankSum=1.321;SC=CCCTCTGTCTGGTGCCTGGGT;SOR=0.317;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=12;WE=65164122;WS=65164104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr11	65164357	rs12417665	C	T	812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=1.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.45;ReadPosRankSum=-0.165;SOR=0.903;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,35:0.41:86
chr11	65178620	rs2957274	G	A	664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=15;NR=9;PP=302;SC=GGAAGGAGCCGTCGCGCTGGA;SOR=0.922;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=15;TCR=9;TR=24;WE=65178628;WS=65178610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	65211979	rs12803915	G	A	2387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.100;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=53;PP=1471;ReadPosRankSum=0.986;SC=AGCACTAGCAGGAGGGGCTCC;SOR=0.807;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=180;TCF=85;TCR=95;TR=99;WE=65211987;WS=65211969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,108:0.54:201
chr11	65212122	rs3825071	C	T	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=158;ReadPosRankSum=0.469;SC=TGCTGTGGACCGTGGATCCTG;SOR=0.941;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=10;WE=65212130;WS=65212112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr11	65222952	rs1784858	T	C	1731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.480;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=52;PP=1046;ReadPosRankSum=0.859;SC=AAGATAAGGTTGTGCTTCTGG;SOR=0.905;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=254;TCF=123;TCR=131;TR=93;WE=65222960;WS=65222942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,96:0.35:271
chr11	65268479	rs72004824	GT	G	68.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.30;ReadPosRankSum=0.571;SOR=0.637;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,11:0.21:53
chr11	65270090	.	C	CT	43.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.000;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=2.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.38;ReadPosRankSum=0.176;SOR=1.045;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,16:0.14:116
chr11	65271779	rs36002528	CT	C	300.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.13;MQRankSum=1.456;QD=5.01;ReadPosRankSum=0.980;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,26:0.43:60
chr11	65273568	rs11367099	TA	T	337.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.24;ReadPosRankSum=-0.807;SOR=1.101;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,23:0.56:41
chr11	65314814	rs66973976	CG	C	86.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.732;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.84;ReadPosRankSum=0.272;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr11	65320780	rs4244811	G	A	751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=14;PP=403;ReadPosRankSum=1.134;SC=ACTGGGGAGGGGCACAGCAGA;SOR=0.806;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=58;TCF=26;TCR=32;TR=28;WE=65320788;WS=65320770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,33:0.53:62
chr11	65325325	.	CCAG	C	236.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.693;ClippingRankSum=0.000;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=2.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.23;ReadPosRankSum=0.604;SOR=1.547;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,9:0.24:38
chr11	65338944	rs2236684	T	G	1804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.748;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=35;PP=1127;ReadPosRankSum=-1.232;SC=GCTCTCGACCTGCGCCCCAGC;SOR=1.005;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=146;TCF=78;TCR=68;TR=81;WE=65338952;WS=65338934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,86:0.55:156
chr11	65340135	rs10896017	C	T	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.691;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=3;PP=147;ReadPosRankSum=-0.432;SC=CGCGCCGGCCCCGGCCATGAA;SOR=1.402;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=9;WE=65340143;WS=65340125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr11	65347636	rs1194100	G	C	4036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=49;PP=2456;SC=CCAAGTCCCAGTGAGGCTGCG;SOR=0.934;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=80;TCR=49;TR=129;WE=65347644;WS=65347626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr11	65349063	rs3741380	G	A	1161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.743;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=19;PP=728;ReadPosRankSum=0.132;SC=CCTCGGCTCCGGAAAGGCTCT;SOR=0.602;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=52;TCR=33;TR=48;WE=65349071;WS=65349053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,54:0.54:100
chr11	65349756	rs6591182	T	G	750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.938;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=12;PP=365;ReadPosRankSum=0.963;SC=AGGCCCCAGGTGAGCAGCTGG;SOR=0.869;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=54;TCF=30;TCR=24;TR=28;WE=65349764;WS=65349746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,35:0.54:65
chr11	65349849	rs1194099	A	T	2045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=25;PP=1275;SC=GGTTCAGGGGACCTGGAAACA;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=72;TCF=46;TCR=26;TR=71;WE=65349857;WS=65349839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr11	65351074	rs10896018	G	A	1795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.106;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=46;PP=1185;ReadPosRankSum=0.722;SC=CCCAGGAAGCGGAGGCTGGGG;SOR=0.798;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=181;TCF=85;TCR=96;TR=83;WE=65351082;WS=65351064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,89:0.45:199
chr11	65357697	rs1151503	A	G	667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=15;PP=440;SC=GCATACATCTAGGGATCCCTT;SOR=2.400;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=20;WE=65357705;WS=65357687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr11	65359625	rs4261292	C	G	3755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=67;PP=2129;SC=CAGAGGGCTGCGTGTGGACCC;SOR=1.204;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=119;TCF=52;TCR=67;TR=119;WE=65359633;WS=65359615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr11	65373621	rs1151527	A	G	2021.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=42;PP=1182;SC=CAGGCTTCAGAGATAAACTTT;SOR=1.488;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=26;TCR=42;TR=68;WE=65373629;WS=65373611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr11	65380916	rs2004649	G	A	6375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=120;PP=2965;SC=GGGGCGGGCCGCCACCCCGAG;SOR=0.960;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=220;TCF=100;TCR=120;TR=220;WE=65380927;WS=65380906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr11	65383896	rs7947140	G	C	9372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=165;NR=146;PP=2965;SC=ACCTCTATGTGTGGATCTTCC;SOR=0.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=311;TCF=165;TCR=146;TR=311;WE=65383904;WS=65383886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,344:1.00:344
chr11	65385606	rs1151489	A	G	3960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=54;PP=2387;ReadPosRankSum=-1.271;SC=ACCCTGACCCAGCCTGACCGG;SOR=0.948;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=132;TCF=77;TCR=55;TR=130;WE=65385614;WS=65385596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,147:0.99:149
chr11	65386640	rs150440459	C	G	39.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.95;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr11	65387378	rs61744384	T	A	8538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=126;NR=159;PP=2965;ReadPosRankSum=0.343;SC=CTGAGGGTGCTGTGCACTATT;SOR=1.026;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=287;TCF=127;TCR=160;TR=285;WE=65387386;WS=65387368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,316:0.99:318
chr11	65389890	rs11227241	G	C	2421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=44;PP=1404;SC=CTGGACCTTGGCTCCCCAGAC;SOR=1.270;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=33;TCR=45;TR=76;WE=65389898;WS=65389880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr11	65394322	rs10896024	A	G	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.239;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=269;ReadPosRankSum=0.582;SC=GGACTTCCTCAGGGAAGGCAG;SOR=0.446;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=20;WE=65394330;WS=65394312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,21:0.45:47
chr11	65402966	rs117032417	G	A	1899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.129;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=39;PP=1130;ReadPosRankSum=-0.758;SC=AACCCCCTTGGGCCGGCCCCC;SOR=0.817;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=176;TCF=82;TCR=94;TR=76;WE=65402974;WS=65402956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,87:0.45:192
chr11	65404018	rs77200859	G	A	1391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.614;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=27;PP=865;ReadPosRankSum=-0.518;SC=GAGGGTCCCCGGACCTCACGG;SOR=0.763;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=71;TCR=59;TR=59;WE=65404026;WS=65404008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,66:0.46:144
chr11	65412467	rs2306364	G	A	2405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.858;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=46;PP=1714;ReadPosRankSum=0.854;SC=ACTGCCGGGCGGGCCAGGGCT;SOR=1.007;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=194;TCF=109;TCR=85;TR=111;WE=65412475;WS=65412457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,113:0.55:204
chr11	65415028	rs4930157	T	G	2846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=55;PP=1720;SC=GCGGCCAGACTCTGCCCAGCC;SOR=1.008;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=45;TCR=55;TR=100;WE=65415036;WS=65415018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr11	65417434	rs746429	G	A	3145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.305;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=69;PP=2128;ReadPosRankSum=-0.042;SC=TGTCGGAGGCGGGCAGTGGGA;SOR=0.614;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=300;TCF=145;TCR=155;TR=141;WE=65417442;WS=65417424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,150:0.47:319
chr11	65423082	rs1144792	G	A	2020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=39;NR=24;PP=1110;SC=ATGGGGCCCAGGAGTCTTCAT;SOR=0.920;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=39;TCR=24;TR=63;WE=65423090;WS=65423072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr11	65480090	rs2236682	G	T	1311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=25;ReadPosRankSum=0.268;SC=GGCCTGGAAAGGGGTGGCACT;SOR=0.767;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=90;TCF=46;TCR=44;TR=50;WE=65480098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,60:0.56:107
chr11	65480768	rs4244812	A	G	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=255;ReadPosRankSum=0.000;SC=CCCCTTCCCCATCCCACTGCC;SOR=0.547;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=18;WE=65480776;WS=65480758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr11	65480791	rs551115	A	G	2084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=21;PP=1260;SC=CCCCGCCCCAAAGGAAGACCC;SOR=1.641;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=46;TCR=21;TR=67;WE=65480799;WS=65480781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr11	65481166	rs1151500	T	C	2031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FS=1.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.23;ReadPosRankSum=-2.429;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,95:0.52:181
chr11	65481465	rs487264	T	G	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=141;ReadPosRankSum=0.385;SC=GGCAGAACATTGTTCAAATGA;SOR=0.631;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=10;WE=65481473;WS=65481455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr11	65484569	rs563427	A	G	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=4.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.188;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=222;ReadPosRankSum=0.127;SC=CTCTAGGGGAACCAGCCAGAA;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=11;WE=65484577;WS=65484559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr11	65548108	rs76925283	C	T	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=122;ReadPosRankSum=0.676;SC=ACCCTCAGGCCGCAGCCACCG;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=7;WE=65548116;WS=65548098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr11	65554680	rs10896044	C	G	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=162;ReadPosRankSum=-0.142;SC=GGTGGAACCGCCGCGCGCCGT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=8;WE=65554688;WS=65554678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr11	65554996	.	TGCGG	T	132.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=0.000;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.99;ReadPosRankSum=0.093;SOR=0.287;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr11	65561468	rs644740	C	T	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=176;ReadPosRankSum=1.024;SC=CTCTCTTCTCCACCAAGCCTC;SOR=0.914;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=9;WE=65561476;WS=65561458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr11	65562257	rs2276133	G	A	958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=31;PP=665;ReadPosRankSum=1.829;SC=GCGGCCGTGCGGGAAAAGTCC;SOR=0.605;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=90;TCF=23;TCR=67;TR=42;WE=65562265;WS=65562247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,44:0.46:95
chr11	65562852	rs72922786	G	C	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=131;ReadPosRankSum=-1.088;SC=AGCCCCAAGAGCATCCAGGAT;SOR=0.724;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=11;WE=65562860;WS=65562842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr11	65601466	rs59416249	C	T	730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=6;PP=475;ReadPosRankSum=1.585;SC=CGGTCAGTTCCTCGGGCGAGT;SOR=0.829;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=53;TCF=42;TCR=11;TR=27;WE=65601474;WS=65601456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,30:0.53:57
chr11	65601644	rs150700040	GGTGGTGTGTGTGTGTCTGTGTGTGT	G	2939.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.424;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=3.405;NF=3;NR=35;PP=2966;ReadPosRankSum=1.825;SC=CCAATCATGCGGTGGTGTGTG;SOR=1.031;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=104;TCF=5;TCR=99;TR=38;WE=65601676;WS=65601634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,79:0.42:189
chr11	65617113	rs11327250	AG	A	6008.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=84;PP=2969;SC=GGCCTCCCCCAGGGGGTGGTA;SOR=0.758;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=127;TCF=37;TCR=90;TR=117;WE=65617121;WS=65617103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr11	65623347	rs652021	G	A	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=13;PP=507;ReadPosRankSum=0.202;SC=AGGAGCCACAGAAGTTCCCAT;SOR=0.756;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=51;TCF=27;TCR=24;TR=26;WE=65623355;WS=65623337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,28:0.51:55
chr11	65623519	rs4621	G	A	4144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=405;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=98;PP=2411;ReadPosRankSum=2.206;SC=TGGCGTAGGGGTCGTCGACAG;SOR=0.679;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=368;TCF=180;TCR=188;TR=192;WE=65623527;WS=65623509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:197,208:0.51:405
chr11	65624934	rs7125986	A	C	2166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=43;PP=1134;ReadPosRankSum=0.023;SC=TGCGCTCCCGAACGGGCCGCG;SOR=0.730;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=152;TCF=72;TCR=80;TR=83;WE=65624942;WS=65624924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,102:0.58:177
chr11	65628334	rs13817	G	A	2726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=41;PP=1605;ReadPosRankSum=-1.564;SC=CGCAGCAGGCGCCGCACGCGC;SOR=0.664;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=198;TCF=129;TCR=69;TR=113;WE=65628342;WS=65628324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,125:0.57:218
chr11	65629932	rs659857	T	C	3076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.65;ReadPosRankSum=-0.164;SOR=0.716;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,78:0.52:149
chr11	65629932	.	TCG	CCC	2598	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=36;NR=32;PP=2598;QD=20;SC=CTGGGAGTGCTCGACCCTGGC;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=136;TCF=72;TCR=64;TR=68;WE=65629942;WS=65629922;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:68,68:0.50:136
chr11	65629934	rs545500	G	C	3076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.51;ReadPosRankSum=-0.782;SOR=0.686;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,80:0.53:150
chr11	65630098	rs3216088	T	TG	1117.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.573;HP=8;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=26;PP=1808;ReadPosRankSum=0.182;SC=CTGTTGAGATTGGGGGGGGTG;SOR=1.438;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=79;TCF=10;TCR=69;TR=28;WE=65630109;WS=65630088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,53:0.43:124
chr11	65630101	rs633877	G	C	1465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.009;HP=7;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=33;PP=1558;ReadPosRankSum=0.852;SC=TTGAGATTGGGGGGGGTGGGC;SOR=0.296;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=116;TCF=50;TCR=66;TR=66;WE=65630109;WS=65630088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,71:0.53:134
chr11	65630436	rs78668370	G	A	870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.628;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=8;PP=553;ReadPosRankSum=0.202;SC=TGTGCAGGGCGCCAAGGGGGT;SOR=1.532;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=77;TCF=54;TCR=23;TR=36;WE=65630448;WS=65630426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,37:0.47:79
chr11	65630698	rs538394	T	G	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.721;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=232;ReadPosRankSum=-1.865;SC=GGCAGAGGAGTGGGGAAAACA;SOR=1.165;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=24;TCF=8;TCR=16;TR=14;WE=65630706;WS=65630688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr11	65631167	rs648732	C	T	3388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.842;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=66;PP=2290;ReadPosRankSum=-0.960;SC=TGTGGGTGGCCCAGGAGACCA;SOR=0.767;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=287;TCF=157;TCR=130;TR=144;WE=65631175;WS=65631157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,157:0.48:325
chr11	65631879	rs630758	C	A	886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=1.784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.34;ReadPosRankSum=0.458;SOR=1.284;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,23:0.61:38
chr11	65631879	.	CCG	ACA	767	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=16;NR=3;PP=767;QD=43.1825197296;SC=GAACAGGGTCCCGGCACCATT;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=19;WE=65631889;WS=65631869;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:16,19:0.54:35
chr11	65631881	rs630755	G	A	886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=3.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.17;ReadPosRankSum=0.687;SOR=1.508;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,23:0.57:40
chr11	65631973	rs630303	G	A	2335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.092;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=44;PP=1342;ReadPosRankSum=2.013;SC=CCTAGTTCCGGCTGAAGCGCT;SOR=0.610;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=177;TCF=99;TCR=78;TR=96;WE=65631981;WS=65631963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,110:0.55:201
chr11	65632262	rs558114	G	T	3030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=72;PP=1902;ReadPosRankSum=-0.879;SC=CCCTCTTGACGCGGGGCCTGC;SOR=0.669;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=290;TCF=133;TCR=157;TR=134;WE=65632270;WS=65632252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,146:0.46:319
chr11	65635559	rs594689	G	A	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-3.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=402;ReadPosRankSum=0.554;SC=ACACAAATGAGCTCCTTGCCC;SOR=0.598;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=21;WE=65635567;WS=65635549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,20:0.77:26
chr11	65636053	rs601314	T	C	4207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=78;PP=2294;SC=GGCTCGTTGATGCAGCGGTAC;SOR=0.924;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=146;TCF=68;TCR=78;TR=146;WE=65636061;WS=65636043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr11	65637273	rs501630	A	G	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.901;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=11;PP=342;ReadPosRankSum=-0.182;SC=GAGGCACGGCATAGCTAGGGC;SOR=0.233;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=62;TCF=43;TCR=19;TR=29;WE=65637281;WS=65637263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,33:0.49:67
chr11	65637984	rs630394	C	G	779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=13;PP=504;ReadPosRankSum=0.552;SC=GCCGGGACTACAGAAGCTGCT;SOR=0.785;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=53;TCR=30;TR=36;WE=65637992;WS=65637974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,38:0.45:84
chr11	65638719	rs633800	G	A	1888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.521;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=40;PP=1037;ReadPosRankSum=1.141;SC=GTCCCTCGCCGTGTAGGTCGT;SOR=0.640;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=171;TCF=88;TCR=83;TR=80;WE=65638727;WS=65638709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,93:0.47:197
chr11	65639374	rs2234458	C	T	2880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=26;PP=1622;SC=TGGGGCTGTCCCTTGGAAAGC;SOR=1.454;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=62;TCR=26;TR=88;WE=65639382;WS=65639364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr11	65647260	rs658524	A	G	371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=12;NR=4;PP=280;SC=CTCCAGCCCCACCCTCACACC;SOR=2.049;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=16;WE=65647268;WS=65647250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	65647796	rs201535604	CT	C	528.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=5.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.31;MQRankSum=1.845;QD=8.13;ReadPosRankSum=1.589;SOR=1.108;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,35:0.54:65
chr11	65649774	rs604630	A	G	8884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=164;NR=148;PP=2965;SC=GAAGGTGGCCAGCGCCATCTC;SOR=0.766;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=312;TCF=164;TCR=148;TR=312;WE=65649782;WS=65649764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,340:1.00:340
chr11	65649984	rs687672	T	C	8063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=151;NR=133;PP=2965;SC=ATTTTGTGGATGTCTCCGTGC;SOR=0.775;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=284;TCF=151;TCR=133;TR=284;WE=65649992;WS=65649974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,302:1.00:302
chr11	65650515	rs35461885	G	T	1340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.990;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=19;PP=774;ReadPosRankSum=-0.427;SC=ACATGCCAAGGGTCTGATGAT;SOR=0.970;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=131;TCF=78;TCR=53;TR=55;WE=65650523;WS=65650505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,65:0.45:145
chr11	65651830	rs658938	A	G	1648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=14;PP=1131;SC=GCTGGGGCAAAGCCAAGCTGG;SOR=1.692;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=39;TCR=14;TR=53;WE=65651838;WS=65651820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr11	65655259	rs2308217	G	GCC	8511.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=27;NR=65;PP=2977;SC=GTCTGGCGGGGCCTAGCAGGG;SOR=0.910;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=32;TCR=77;TR=92;WE=65655267;WS=65655249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr11	65664346	rs637571	T	C	738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=7;PP=497;ReadPosRankSum=0.982;SC=CTGGCCGGGGTTGTGGGGGGC;SOR=0.776;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=79;TCF=61;TCR=18;TR=33;WE=65664354;WS=65664336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,34:0.42:81
chr11	65684929	rs9667389	C	T	1397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=35;NR=11;PP=945;SC=ATTTGGCCCCCCTAGGTCAGT;SOR=2.078;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=35;TCR=11;TR=46;WE=65684937;WS=65684919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr11	65685225	rs7947504	T	C	2212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.461;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=56;PP=1164;ReadPosRankSum=0.797;SC=CACCTGAAGCTGGCCTTCAAC;SOR=0.739;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=230;TCF=109;TCR=121;TR=105;WE=65685233;WS=65685215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,113:0.44:254
chr11	65686473	.	C	A	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.790;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.29;ReadPosRankSum=1.119;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr11	65689090	rs72926844	A	G	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5130;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=62;ReadPosRankSum=-0.712;SC=CCTTCCCCACATGAAACTGGG;SOR=1.981;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=5;WE=65689098;WS=65689080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr11	65713207	rs9795469	T	C	5978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=112;NR=95;PP=2965;SC=CCCGTCGGTGTGACCAGGGCA;SOR=0.756;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=208;TCF=112;TCR=96;TR=207;WE=65713215;WS=65713197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr11	65714925	rs565921	C	T	1365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.181;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=34;PP=848;ReadPosRankSum=0.393;SC=TCAGGATCGGCGTCCGACAAG;SOR=0.815;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=161;TCF=81;TCR=80;TR=67;WE=65714933;WS=65714915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,73:0.41:180
chr11	65715747	.	T	TCATC	127.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.268;ClippingRankSum=-0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.24;MQRankSum=1.691;QD=10.64;ReadPosRankSum=-2.021;SOR=0.055;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr11	65727339	rs67530871	A	G	732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=11;PP=342;ReadPosRankSum=1.389;SC=AGAGGCCCCCAAGGACAGAAC;SOR=0.687;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=72;TCF=46;TCR=26;TR=31;WE=65727347;WS=65727329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,39:0.46:85
chr11	65732800	rs552130	T	C	2020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.020;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=45;PP=1256;ReadPosRankSum=0.379;SC=GCATCACTTTTTCCCCTCTTC;SOR=0.617;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=210;TCF=114;TCR=96;TR=97;WE=65732808;WS=65732790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,102:0.45:227
chr11	65733393	rs688862	C	T	2791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.938;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=59;PP=1892;ReadPosRankSum=-2.817;SC=AGGGCCTCACCGTGGAGCATG;SOR=0.814;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=276;TCF=145;TCR=131;TR=129;WE=65733401;WS=65733383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,133:0.45:293
chr11	65734539	rs1151505	C	T	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=35;ReadPosRankSum=-0.507;SC=ACTTAACCTCCCTGTGCCCCA;SOR=0.465;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=4;WE=65734547;WS=65734529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr11	65744247	rs622779	G	A	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=14;PP=246;ReadPosRankSum=0.608;SC=TGTGAGGGCCGCGCCGCTGGG;SOR=0.573;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=51;TCF=21;TCR=30;TR=26;WE=65744255;WS=65744237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,29:0.53:55
chr11	65744275	rs543952	T	C	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.237;HP=6;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;ReadPosRankSum=-1.119;SC=CGTTTGGGGGTGCTCAAGCTG;SOR=0.926;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=37;TCF=17;TCR=20;TR=16;WE=65744283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,16:0.41:39
chr11	65746136	rs11545221	G	T	781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.77;ReadPosRankSum=-1.776;SOR=0.517;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,40:0.50:80
chr11	65746213	rs138981987	C	T	1242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=19;PP=738;ReadPosRankSum=-0.419;SC=GCAGGGGTGGCTGGTGTGTGG;SOR=0.632;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=109;TCF=68;TCR=41;TR=53;WE=65746221;WS=65746203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,57:0.51:111
chr11	65766092	rs2276017	C	T	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.62;ReadPosRankSum=0.865;SOR=0.743;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,20:0.40:50
chr11	65766266	rs80186982	T	G	1089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.922;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=21;PP=545;ReadPosRankSum=-1.837;SC=GGGAAAATAATATCTACAATC;SOR=0.521;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=67;TCF=30;TCR=37;TR=41;WE=65766274;WS=65766256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,49:0.64:77
chr11	65766360	rs72930951	G	A	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.254;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=74;ReadPosRankSum=0.591;SC=GGACACAGGAGAGCAAACAGT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=5;WE=65766368;WS=65766350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr11	65766671	rs72930952	A	G	1618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.055;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=22;PP=960;ReadPosRankSum=2.142;SC=TGACCTTCAAACCCCATTCAT;SOR=0.913;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=142;TCF=92;TCR=50;TR=67;WE=65766679;WS=65766661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,74:0.47:159
chr11	65767153	rs507672	A	G	1161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=26;PP=650;ReadPosRankSum=0.806;SC=TCCCCTGTAGATAAGAAGAGA;SOR=0.659;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=98;TCF=47;TCR=51;TR=49;WE=65767161;WS=65767143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,58:0.50:115
chr11	65767215	rs506873	G	T	901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=23;PP=510;ReadPosRankSum=1.129;SC=CCATAGGAAGGGGTTCTATCT;SOR=0.700;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=84;TCF=33;TCR=51;TR=37;WE=65767223;WS=65767205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,44:0.45:98
chr11	65767499	rs72930956	A	G	856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.478;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=12;PP=565;ReadPosRankSum=-0.705;SC=TCAAAGTGCCAGGATTACAGG;SOR=0.209;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=56;TCF=40;TCR=16;TR=37;WE=65767507;WS=65767489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,39:0.68:57
chr11	65770953	rs72930967	G	A	803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.868;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-0.950;NF=17;NR=20;PP=500;ReadPosRankSum=1.418;SC=GCCAGAGCCTGGGCACCTGGT;SOR=0.531;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=75;TCF=32;TCR=43;TR=37;WE=65770961;WS=65770943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,39:0.49:80
chr11	65779590	rs1131544	C	T	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=335;ReadPosRankSum=1.489;SC=TGCCACGCGACGCCCGGGCCC;SOR=0.557;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=51;TCF=38;TCR=13;TR=25;WE=65779598;WS=65779580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,26:0.47:55
chr11	65780243	rs72930985	G	A	2135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=29;PP=1381;ReadPosRankSum=0.061;SC=CAAGAGGTGAGAAGTGAGGAT;SOR=0.664;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=144;TCF=101;TCR=43;TR=89;WE=65780251;WS=65780233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,95:0.61:157
chr11	65780702	rs9667817	A	G	994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=11;PP=751;ReadPosRankSum=0.529;SC=GGCCTGGAGCAGCCTGGCAGG;SOR=0.616;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=34;TCF=23;TCR=11;TR=33;WE=65780710;WS=65780692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,35:0.97:36
chr11	65788072	rs3814747	C	T	10075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=384;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=181;NR=169;PP=2965;SC=ATGTAAATTACGAGGATGGGA;SOR=0.714;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=350;TCF=181;TCR=169;TR=350;WE=65788080;WS=65788062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,382:1.00:382
chr11	65790527	rs2845570	G	T	1184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.882;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=30;PP=659;ReadPosRankSum=0.413;SC=CGCTGGAGCCGGCCGGCTGAA;SOR=0.406;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=90;TCF=30;TCR=60;TR=49;WE=65790535;WS=65790517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,55:0.55:100
chr11	65793454	rs1203998	C	T	1457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.578;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=37;PP=917;ReadPosRankSum=-1.281;SC=TGGAACCCACCGTATTGGGAC;SOR=1.118;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=152;TCF=73;TCR=79;TR=65;WE=65793462;WS=65793444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,72:0.42:172
chr11	65810209	rs61895584	C	T	4601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=93;PP=2815;SC=TGGGCTGCCACGGCTGCAGCT;SOR=1.391;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=55;TCR=93;TR=148;WE=65810217;WS=65810199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr11	65810749	rs7937692	T	C	9188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=158;NR=156;PP=2965;SC=AGGCGTTGGGTACGCGCCGGA;SOR=0.761;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=314;TCF=158;TCR=156;TR=314;WE=65810757;WS=65810739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,335:1.00:335
chr11	65811208	rs4930170	G	T	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.655;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=370;ReadPosRankSum=0.263;SC=CTTGACCCCTGCCCTTACCCA;SOR=1.574;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=55;TCF=18;TCR=37;TR=23;WE=65811216;WS=65811198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,26:0.42:62
chr11	65824472	rs547404	C	T	1201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.337;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=29;PP=668;ReadPosRankSum=-1.322;SC=GTGATTTAGACATTTTTAAAA;SOR=0.856;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=110;TCF=57;TCR=53;TR=56;WE=65824480;WS=65824462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,60:0.50:120
chr11	65825951	rs491618	T	A	595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.572;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=309;ReadPosRankSum=0.058;SC=AATTTGTAAGTGTTCAGTAAG;SOR=1.501;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=51;TCF=22;TCR=29;TR=23;WE=65825959;WS=65825941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,28:0.51:55
chr11	65836403	rs72932698	T	G	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=32;ReadPosRankSum=0.828;SC=CCTCATCTCCTTTTAGCCCCT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=4;WE=65836411;WS=65836393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr11	65868310	rs475817	T	A	8663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=152;NR=150;PP=2965;SC=GAACACCTGTTATGGCCTTTC;SOR=0.741;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=302;TCF=152;TCR=150;TR=302;WE=65868318;WS=65868300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,338:1.00:338
chr11	65983522	rs548858	A	G	481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=2;PP=368;SC=GGTCTTGTGCATTCCTTGGCT;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=65983530;WS=65983519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	65985000	rs557082	A	C	3803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=44;PP=2290;SC=TAGGGACCAAACCCCTGAGAG;SOR=1.253;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=81;TCR=45;TR=125;WE=65985008;WS=65984990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr11	65997898	rs561948	A	G	430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=0;PP=309;SC=ACTTGCTTTCAGGAAAAGAAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=65997906;WS=65997888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	66010633	rs524268	T	C	3807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=64;NR=62;PP=2394;SC=CTGTCACCCCTAGTGTCCATC;SOR=0.783;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=126;TCF=64;TCR=62;TR=126;WE=66010641;WS=66010623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr11	66031450	rs525698	T	C	3601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=63;PP=2203;SC=CTGGGCAGGCTGGGGGTCTGG;SOR=1.044;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=50;TCR=63;TR=113;WE=66031458;WS=66031440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr11	66031660	rs1151539	C	T	2677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=59;PP=1758;ReadPosRankSum=0.258;SC=GGCCCGATGACCCCAATGTGG;SOR=0.713;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=257;TCF=134;TCR=123;TR=124;WE=66031668;WS=66031650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,132:0.47:279
chr11	66033301	rs474005	C	T	2663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.401;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=46;PP=1439;ReadPosRankSum=-0.953;SC=CATTCACTGCCTGATGCCCCT;SOR=0.520;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=182;TCF=93;TCR=89;TR=101;WE=66033309;WS=66033291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,122:0.58:210
chr11	66036293	rs150627444	A	AC,ACC	1589.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=61.48;QD=33.12;SOR=2.400;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,13,35:0.27,0.73:48
chr11	66040049	rs555853	G	C	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=1.490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.31;ReadPosRankSum=-1.816;SOR=1.038;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,20:0.45:44
chr11	66040053	rs555826	A	G	1551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=32;PP=432;SC=TTGTCTGCTTACAGGAACTAA;SOR=3.056;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=40;TCF=7;TCR=33;TR=39;WE=66040061;WS=66040039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr11	66043253	rs55931871	T	C	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=245;ReadPosRankSum=0.336;SC=GCAAAATAACTTTGGCCCCTG;SOR=0.859;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=14;WE=66043261;WS=66043243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,15:0.45:33
chr11	66049894	.	T	G	380	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5000;HP=10;HapScore=4;MGOF=7;MMLQ=15;MQ=58.92;NF=0;NR=14;PP=380;QD=29.6265151819;SC=GGGGGTGGGGTGGGGGGCCTA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=13;TCR=23;TR=14;WE=66049902;WS=66049879;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:22,14:0.39:36
chr11	66050712	rs4073582	G	A	1848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.198;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=40;PP=1101;ReadPosRankSum=0.637;SC=GCCCCTGTCTGCCCCAGGTAC;SOR=0.582;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=159;TCF=78;TCR=81;TR=79;WE=66050720;WS=66050702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,86:0.51:169
chr11	66050948	rs3016315	C	T	1528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=22;PP=1038;SC=CCTTTTGCCCCTGAGGACTGA;SOR=0.770;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=27;TCR=22;TR=49;WE=66050956;WS=66050938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr11	66054823	rs510398	C	T	1829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=3;PP=1372;SC=GGGAGGGATACAGTCCAAATC;SOR=5.318;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=52;TCR=3;TR=55;WE=66054831;WS=66054813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr11	66059642	rs150934757	G	A	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=1.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.536;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=4;PP=42;ReadPosRankSum=-1.789;SC=GAGAGGGGCTGAGGAGGGAAG;SOR=1.314;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=26;TCF=16;TCR=10;TR=7;WE=66059650;WS=66059632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,9:0.25:36
chr11	66059782	rs6591210	T	C	90.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.51;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr11	66063126	rs35383623	AC	A	805.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=433;ReadPosRankSum=0.847;SC=GCTCTCTGAGACCCCCCACGG;SOR=0.739;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=1;TCR=38;TR=17;WE=66063134;WS=66063116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,32:0.48:66
chr11	66099987	rs1784029	C	T	1508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.657;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=31;PP=959;ReadPosRankSum=-0.770;SC=CAGGCCACTCCGCCCGGCGGT;SOR=0.781;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=110;TCF=53;TCR=57;TR=57;WE=66099995;WS=66099977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,65:0.51:127
chr11	66100152	rs1784030	T	C	4121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=66;PP=2609;SC=CAATCGAGGCTTCTGGGGGCA;SOR=0.706;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=141;TCF=74;TCR=67;TR=140;WE=66100160;WS=66100142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr11	66101974	rs3016317	C	T	5834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.92;SOR=0.841;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr11	66101974	.	CGGAG	TGGAA,TGGAG	1170	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=34,88;NR=29,68;PP=805,1170;QD=13.6264742042;SC=TATGGAGAGACGGAGCCTCAC;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=156;TCF=88;TCR=68;TR=63,156;WE=66101986;WS=66101964;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.40:156
chr11	66101978	rs10896110	G	A	1381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FS=2.658;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.81;ReadPosRankSum=-1.403;SOR=0.505;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,74:0.42:177
chr11	66102807	rs10444359	G	A	1294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.362;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=31;PP=723;ReadPosRankSum=-1.365;SC=TTCGGGCGGTGTGCTGCGAGC;SOR=1.171;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=118;TCF=57;TCR=61;TR=54;WE=66102815;WS=66102797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,62:0.47:132
chr11	66103046	rs3016763	C	T	4830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=63;PP=2890;SC=AGGAGCAGGGCCCGTGGACAC;SOR=1.038;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=157;TCF=94;TCR=63;TR=157;WE=66103054;WS=66103036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr11	66104057	rs3016316	T	A	682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=17;PP=482;SC=GGGTCAGGGGTCCCCTCCATG;SOR=1.220;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=27;TCF=10;TCR=17;TR=27;WE=66104065;WS=66104047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	66104993	rs3116068	C	T	1099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.689;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=32;PP=742;ReadPosRankSum=-2.166;SC=GCCCTGAGGCCGGACAGCCTG;SOR=0.818;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=111;TCF=47;TCR=64;TR=52;WE=66105001;WS=66104983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,55:0.45:123
chr11	66105194	rs1052566	G	A	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.322;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=23;ReadPosRankSum=0.770;SC=AGGAGTCCAGGCCAGTGCCAG;SOR=0.120;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=66105202;WS=66105184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr11	66105817	rs2276106	C	T	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.041;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=9;PP=232;ReadPosRankSum=-0.479;SC=CCCTGCCCCACCCCCCACCTC;SOR=0.214;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=35;TCF=13;TCR=22;TR=17;WE=66105825;WS=66105807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr11	66107527	rs1785633	C	A	2332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.065;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=47;PP=1456;ReadPosRankSum=1.876;SC=CCAACCCCCTCCCCTGGGTCT;SOR=0.825;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=250;TCF=144;TCR=106;TR=114;WE=66107535;WS=66107517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,119:0.44:268
chr11	66107674	rs1784035	A	G	2879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=66;PP=1865;SC=GCAGTTTGTCATCCCACCATT;SOR=1.848;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=97;TCF=30;TCR=67;TR=96;WE=66107682;WS=66107664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr11	66108660	rs947978	C	T	1042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.714;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=17;PP=600;ReadPosRankSum=-1.015;SC=GAAGAGGGTACAGAACCACCC;SOR=0.820;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=107;TCF=64;TCR=43;TR=45;WE=66108668;WS=66108650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,51:0.46:112
chr11	66108894	rs2236679	G	C	3412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.291;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=73;PP=1564;ReadPosRankSum=-0.131;SC=CAGCAAGCCCGGTGTTAGGCG;SOR=0.774;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=295;TCF=146;TCR=149;TR=143;WE=66108902;WS=66108884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,172:0.52:333
chr11	66109527	rs112182142	C	CTGTGTG	570.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.773;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=560;ReadPosRankSum=0.524;SC=TGTAGGGGCTCTGTGTGTGTG;SOR=1.469;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=56;TCF=32;TCR=24;TR=15;WE=66109536;WS=66109517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,21:0.32:65
chr11	66109779	rs1784037	AT	GA	1131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=15;PP=813;SC=AGGCAGCAGGATGCTGAACAC;SOR=4.255;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=17;WE=66109788;WS=66109769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	66130736	rs1039593	A	G	236.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=7;NR=1;PP=147;SC=TTTCTTCCCCACAGCACTCCA;SOR=2.093;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=66130744;WS=66130726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	66131149	rs1039594	C	T	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=350;ReadPosRankSum=-1.375;SC=CCCTTCTTTCCGGGCCTCAGT;SOR=0.487;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=21;WE=66131157;WS=66131139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,23:0.56:41
chr11	66131880	.	G	A	753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.721;ClippingRankSum=0.000;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=24;PP=550;ReadPosRankSum=-0.499;SC=GGCAGCAGCCGGCTGTCCTCG;SOR=0.714;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=72;TCF=15;TCR=57;TR=31;WE=66131888;WS=66131870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,32:0.44:73
chr11	66131906	rs7125100	A	G	1138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=31;PP=882;SC=CTGTGGTAGAAGCTGAAGTCA;SOR=3.145;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=37;WE=66131914;WS=66131896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr11	66133311	rs4930358	T	C	1185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=5;PP=829;SC=TACCAGGCCATTTGGACTACC;SOR=3.312;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=33;TCR=5;TR=38;WE=66133319;WS=66133301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr11	66133336	rs2279861	A	G	960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=9;PP=615;ReadPosRankSum=0.543;SC=AATCACCTCCATGCTCTTTCA;SOR=0.772;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=66;TCF=51;TCR=15;TR=41;WE=66133344;WS=66133326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,44:0.62:71
chr11	66134085	rs8187658	C	T	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.46;ReadPosRankSum=0.524;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr11	66135179	rs2279862	C	T	1306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.257;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=26;PP=935;ReadPosRankSum=-2.752;SC=CTCTCAGGGCCTCAGGCTCAG;SOR=0.496;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=116;TCF=65;TCR=51;TR=57;WE=66135187;WS=66135169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,59:0.46:128
chr11	66135898	rs2292123	T	C	1337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=31;NR=17;PP=807;SC=CCATATCACCTGCTTACCTCC;SOR=1.314;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=31;TCR=17;TR=48;WE=66135906;WS=66135888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
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chr11	66192145	.	G	A	2793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.596;ClippingRankSum=0.000;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.448;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=58;PP=1673;ReadPosRankSum=1.218;SC=GCCCAGCTCCGGGGCCCCCTC;SOR=0.657;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=234;TCF=113;TCR=121;TR=113;WE=66192153;WS=66192135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,127:0.48:263
chr11	66192527	.	C	T	3182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.013;ClippingRankSum=0.000;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.961;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;ReadPosRankSum=-1.902;SC=CCCCAGATCCCAGTGAGGAAT;SOR=0.788;Source=Platypus;WE=66192535;WS=66192517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,145:0.56:258
chr11	66206169	rs11110	C	T	831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=13;PP=413;ReadPosRankSum=0.840;SC=TCGCCCGGATCACACCGCCGA;SOR=0.678;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=46;TCR=24;TR=38;WE=66206177;WS=66206159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,42:0.55:77
chr11	66258916	rs75546553	G	A	1293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.493;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=25;PP=741;ReadPosRankSum=-1.222;SC=CAGAGCGGGTGTGGAGGTGGG;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=102;TCF=59;TCR=43;TR=60;WE=66258924;WS=66258906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,64:0.55:116
chr11	66262806	rs10791878	T	C	3455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=65;NR=46;PP=1845;SC=AGTGGCCACCTTAAGCCCGAC;SOR=0.838;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=65;TCR=46;TR=111;WE=66262814;WS=66262796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr11	66272142	rs1671063	A	G	1640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.725;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=33;PP=1095;ReadPosRankSum=0.638;SC=GGTATGCAACAGTCACTGATG;SOR=0.902;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=137;TCF=74;TCR=63;TR=77;WE=66272150;WS=66272132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,82:0.53:155
chr11	66278059	rs1791688	C	G	474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=3;PP=320;SC=TTGTACTCGCCCTTCCCTGTG;SOR=2.419;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=66278067;WS=66278049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	66299515	rs8432	A	G	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.804;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=18;PP=374;ReadPosRankSum=-1.671;SC=CTGAGACCTGAGCTGCTGTGA;SOR=0.802;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=76;TCF=37;TCR=39;TR=32;WE=66299523;WS=66299505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,36:0.40:90
chr11	66318972	rs490998	G	A	1369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.718;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=22;PP=660;ReadPosRankSum=2.921;SC=ATGACCTTTGGCCCTTGGCCT;SOR=0.597;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=59;TCR=37;TR=57;WE=66318980;WS=66318962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,65:0.59:111
chr11	66358126	rs486584	C	T	5350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=99;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.393;SC=CTATCTCCTCCAGGAGGGAAA;SOR=0.901;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=192;TCF=91;TCR=101;TR=189;WE=66358134;WS=66358114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,199:0.99:201
chr11	66358274	rs62000969	A	C	1777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.391;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=32;PP=984;ReadPosRankSum=-1.041;SC=AAACCACTCTAGTCTCGCCAG;SOR=0.906;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=159;TCF=87;TCR=72;TR=75;WE=66358282;WS=66358264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,85:0.47:180
chr11	66384143	rs76192789	C	A	862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.206;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=14;PP=535;ReadPosRankSum=1.436;SC=TCTTGCCTGTCGCTGGAGGAG;SOR=0.256;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=68;TCF=47;TCR=21;TR=38;WE=66384151;WS=66384133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,41:0.57:72
chr11	66406070	rs670900	A	C	5812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=112;PP=2965;SC=AGAGGATCTGAGGGAACGCCG;SOR=0.825;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=215;TCF=103;TCR=112;TR=214;WE=66406078;WS=66406060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr11	66456387	rs2276138	T	C	2535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=61;SC=ACAGTGGCCATGGCAACCTCA;SOR=1.968;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=26;TCR=61;TR=87;WE=66456395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr11	66458696	rs12804382	C	T	622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=3;PP=453;SC=GAACTCTCCCCGGCATTTCCC;SOR=3.716;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=66458704;WS=66458686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	66469032	rs532439	T	C	3454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=43;PP=1917;SC=GTCAGTTTCCTGGTCCTGCCC;SOR=1.135;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=73;TCR=43;TR=116;WE=66469040;WS=66469022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr11	66472274	rs4930388	T	C	2247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=30;PP=1468;SC=GGCACCCGGCTCTGCACCTCG;SOR=0.774;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=38;TCR=30;TR=68;WE=66472282;WS=66472264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr11	66481264	rs615536	C	T	1833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=38;PP=1128;SC=TGTGAGATCTCGAAGAGGAAG;SOR=1.437;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=23;TCR=38;TR=61;WE=66481272;WS=66481254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr11	66483265	rs12805133	A	G	2442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.55;SOR=1.095;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr11	66512290	.	G	GGGC	1908.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.607;ClippingRankSum=0.000;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.6748;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.585;NF=6;NR=9;PP=677;ReadPosRankSum=0.413;SC=GCTGAGGAGGGGGCGGCGGCG;SOR=1.203;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=24;TCF=9;TCR=15;TR=15;WE=66512298;WS=66512280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,46:0.96:48
chr11	66581543	rs144880764	TGAAAG	T	572.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.793;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.026;NF=0;NR=13;PP=552;ReadPosRankSum=-0.502;SC=ATTAGATAAATGAAAGGAAAT;SOR=0.175;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=13;WE=66581555;WS=66581533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,16:0.70:23
chr11	66626234	rs3741194	T	C	1917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.492;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=46;PP=976;ReadPosRankSum=-1.261;SC=GAGATTGGGGTGACCGGCGCT;SOR=0.746;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=201;TCF=104;TCR=97;TR=93;WE=66626242;WS=66626224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,99:0.45:222
chr11	66812338	rs11227668	A	G	830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=22;PP=580;SC=ATGCAGATGGATAGGGGGTGG;SOR=3.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=25;WE=66812346;WS=66812328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	66833265	rs12803688	G	A	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.996;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=222;ReadPosRankSum=0.309;SC=AAACAACTACGCTCCACTGAC;SOR=0.306;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=16;WE=66833273;WS=66833255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,16:0.37:43
chr11	66833327	rs12287978	G	A	2119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.717;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=39;PP=1312;ReadPosRankSum=1.539;SC=GTGCCTCTCCGAAGCCTCCTC;SOR=0.571;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=192;TCF=118;TCR=74;TR=97;WE=66833335;WS=66833317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,106:0.51:208
chr11	66834252	rs2282502	C	T	2078.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.198;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=40;PP=1250;ReadPosRankSum=0.591;SC=TCTACCCTGACGCCAGCGTCC;SOR=0.871;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=224;TCF=132;TCR=92;TR=102;WE=66834260;WS=66834242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,107:0.44:244
chr11	66837965	rs4930409	T	C	5028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=80;PP=2655;SC=GACTGACCTGTGCAAGGACAA;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=176;TCF=96;TCR=80;TR=176;WE=66837973;WS=66837955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr11	66995603	rs3741189	T	C	7409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=122;NR=127;PP=2965;SC=CCCACCTAACTAAGGAATTTC;SOR=0.792;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=250;TCF=122;TCR=128;TR=249;WE=66995611;WS=66995593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,273:1.00:273
chr11	66995723	rs35247976	T	C	896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=25;PP=572;ReadPosRankSum=1.125;SC=ACTCAATATGTTCTTGGTTTT;SOR=0.687;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=86;TCF=30;TCR=56;TR=39;WE=66995731;WS=66995713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,42:0.45:93
chr11	67016038	rs144067451	A	G	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=261;ReadPosRankSum=-0.182;SC=TGTGTTTTGTATTACTAAATG;SOR=0.255;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=14;WE=67016046;WS=67016028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr11	67017445	rs34463980	C	CA	2357.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=5;PP=1894;SC=CCCTCTCCAACGTGACCTTTC;SOR=3.461;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=46;TCF=41;TCR=5;TR=43;WE=67017453;WS=67017435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr11	67034266	rs2228418	C	A	970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.516;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=20;PP=481;ReadPosRankSum=0.767;SC=GCAAGAAGATCCTGCTGCCCG;SOR=0.616;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=98;TCF=52;TCR=46;TR=45;WE=67034274;WS=67034256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,51:0.46:111
chr11	67050292	rs2071007	G	A	2688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.143;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=68;PP=1703;ReadPosRankSum=0.102;SC=TGACGATGGTGGGTGCAGGTC;SOR=0.558;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=233;TCF=102;TCR=131;TR=123;WE=67050300;WS=67050282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,133:0.53:253
chr11	67051857	rs3730147	G	A	1631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.428;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=46;PP=1129;ReadPosRankSum=0.835;SC=GAGGGTCGCCGGCTGCTGCGG;SOR=1.088;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=120;TCF=40;TCR=80;TR=65;WE=67051865;WS=67051847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,71:0.55:130
chr11	67052466	rs10896164	G	A	1616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.945;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=21;PP=1026;ReadPosRankSum=0.114;SC=TAAGGAGCCCGTGCGGGGGTC;SOR=0.881;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=172;TCF=120;TCR=52;TR=71;WE=67052474;WS=67052456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,78:0.41:190
chr11	67057092	.	GC	G	97	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;FR=0.5000;HP=16;HapScore=4;MMLQ=16;MQ=55.61;NF=0;NR=7;PP=97;QD=14.2857142857;SC=CCGTCCTGGAGCCCCCCCCCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=7;WE=67057112;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr11	67068859	rs2298815	T	C	2851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.281;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=68;PP=1598;ReadPosRankSum=0.210;SC=GCTCTGCTGTTGCCGCATCAG;SOR=0.883;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=251;TCF=124;TCR=127;TR=126;WE=67068867;WS=67068849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,139:0.50:276
chr11	67071584	rs4244822	C	G	1563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.746;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=39;PP=863;ReadPosRankSum=-0.109;SC=CTGCTCTCTCCGCAGGACCAG;SOR=0.920;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=150;TCF=68;TCR=82;TR=69;WE=67071592;WS=67071574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,77:0.47:165
chr11	67076810	rs3737460	T	G	1327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.682;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=18;PP=907;ReadPosRankSum=-0.615;SC=CAGGTCCGATTGCCAGTGGGC;SOR=0.586;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=128;TCF=90;TCR=38;TR=57;WE=67076818;WS=67076800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,61:0.44:140
chr11	67135006	rs867193	A	T	1510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.058;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=27;PP=695;ReadPosRankSum=-1.323;SC=TGGAGGGGCCAGGCCCTGGGT;SOR=0.649;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=121;TCF=62;TCR=59;TR=62;WE=67135014;WS=67134996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,71:0.53:134
chr11	67141148	.	AT	A	199.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=0.000;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=1.385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=1.388;QD=4.99;ReadPosRankSum=0.594;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
chr11	67160933	rs2066490	G	A	1152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=16;PP=715;ReadPosRankSum=0.571;SC=TTGCAGAGATGTGATGCTAGG;SOR=0.761;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=90;TCF=62;TCR=28;TR=50;WE=67160941;WS=67160923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,54:0.54:100
chr11	67160961	rs2066496	A	G	1377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.587;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=26;PP=727;ReadPosRankSum=0.484;SC=GTCTTATCCCATGCAGTCTTT;SOR=0.634;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=146;TCF=88;TCR=58;TR=65;WE=67160969;WS=67160951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,75:0.47:160
chr11	67164791	rs872110	T	C	834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.451;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=29;PP=704;ReadPosRankSum=-2.767;SC=AGAGCCCCGGTCCCCACTCCG;SOR=0.345;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=105;TCF=31;TCR=74;TR=40;WE=67164799;WS=67164781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,39:0.39:100
chr11	67166337	rs2286619	G	A	2516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.140;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=48;PP=1607;ReadPosRankSum=-1.351;SC=CCTGGGCGAGGATGGGAGCAG;SOR=0.534;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=221;TCF=110;TCR=111;TR=107;WE=67166345;WS=67166327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,115:0.48:242
chr11	67166984	rs2286620	T	C	795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=7;PP=572;ReadPosRankSum=-0.886;SC=TGCCGGGTGCTGAGGGATGCG;SOR=0.655;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=83;TCF=68;TCR=15;TR=37;WE=67166992;WS=67166974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,36:0.43:83
chr11	67167144	rs2286621	G	C	2159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=57;PP=1164;ReadPosRankSum=1.064;SC=TGCCTGCCCAGGGGGAGGTGG;SOR=0.720;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=280;TCF=130;TCR=150;TR=108;WE=67167152;WS=67167134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,118:0.39:300
chr11	67171736	rs2514256	C	T	1321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.980;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=26;PP=646;ReadPosRankSum=0.579;SC=ACTCCAGCTCCTTGGGGTCCG;SOR=0.550;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=133;TCF=77;TCR=56;TR=57;WE=67171744;WS=67171726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,71:0.45:157
chr11	67172911	rs61734600	C	T	1113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.280;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=22;PP=694;ReadPosRankSum=0.956;SC=CTGCCCTGCGCGCCCGATGCT;SOR=0.497;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=123;TCF=74;TCR=49;TR=52;WE=67172919;WS=67172901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,56:0.43:130
chr11	67173240	rs12805811	T	C	719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.326;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=16;PP=433;ReadPosRankSum=0.645;SC=CCACTTTCCCTAGCCCAGCTC;SOR=1.082;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=51;TCF=17;TCR=34;TR=24;WE=67173248;WS=67173230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,29:0.48:60
chr11	67176898	rs11227788	A	G	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.746;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=2;PP=271;ReadPosRankSum=0.537;SC=TGGTGCTGTCAGAGCGGGACC;SOR=2.066;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=68;TCF=51;TCR=17;TR=22;WE=67176906;WS=67176888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,23:0.31:74
chr11	67177278	rs7122299	G	A	4894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=88;PP=2868;SC=GGCTGATGCCGGCCCGGCAAA;SOR=1.043;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=157;TCF=69;TCR=88;TR=157;WE=67177286;WS=67177268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr11	67183492	rs34596169	T	C	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=179;ReadPosRankSum=0.524;SC=AATCCCTCCCTACCTTCGGGG;SOR=1.061;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=10;WE=67183500;WS=67183482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr11	67186000	rs1790733	A	G	2403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.08;ReadPosRankSum=-0.130;SOR=0.704;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,117:0.54:217
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chr11	67188466	rs77472930	C	T	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=276;ReadPosRankSum=0.875;SC=GGCCCTGGAGCTGAACGGCGG;SOR=0.776;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=27;TCF=17;TCR=10;TR=17;WE=67188474;WS=67188456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,23:0.59:39
chr11	67191346	rs3741180	C	T	3776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.850;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=77;PP=2427;ReadPosRankSum=-0.024;SC=AGGGCGAGGCCGACCACCCAG;SOR=0.849;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=329;TCF=177;TCR=152;TR=171;WE=67191354;WS=67191336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,176:0.51:345
chr11	67191449	rs1790747	T	C	2833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=65;PP=1838;ReadPosRankSum=0.009;SC=TGGTGGGCGGTTGCTGGCTGC;SOR=0.706;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=237;TCF=109;TCR=128;TR=119;WE=67191457;WS=67191439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,132:0.50:263
chr11	67192332	.	C	CCACACACACA,CCACACACACACA	82.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=-0.000;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=967;ReadPosRankSum=1.645;SC=ATGACAATGGCCACACACACA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=67192340;WS=67192330;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.60:5
chr11	67192555	rs1626067	G	A	2428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=57;PP=1473;ReadPosRankSum=-0.149;SC=GGATAGCTCTGAAGCCTGCTG;SOR=0.675;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=234;TCF=110;TCR=124;TR=105;WE=67192563;WS=67192545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,122:0.46:265
chr11	67196237	rs1476792	T	C	604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.754;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=401;ReadPosRankSum=-2.150;SC=CTCTATTAAGTTCTGATCCCA;SOR=0.249;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=23;WE=67196245;WS=67196227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,25:0.57:44
chr11	67196544	rs917570	C	G	2064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.168;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=45;PP=1270;ReadPosRankSum=1.556;SC=GGAAGGGGAACTGGGGAGCAC;SOR=0.759;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=167;TCF=86;TCR=81;TR=86;WE=67196552;WS=67196534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,94:0.53:177
chr11	67199706	rs1638588	C	A	948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=16;PP=535;ReadPosRankSum=-1.514;SC=CTGTTCTGTTCTGTTGGGATT;SOR=0.647;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=96;TCF=60;TCR=36;TR=44;WE=67199714;WS=67199696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,47:0.44:108
chr11	67200812	rs55987642	C	T	5252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FS=1.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.39;ReadPosRankSum=0.007;SOR=0.614;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:163,139:0.46:302
chr11	67200819	rs4930427	C	T	5454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FS=0.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.89;ReadPosRankSum=-0.487;SOR=0.629;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:173,150:0.46:323
chr11	67201008	rs1790753	C	T	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=235;ReadPosRankSum=1.021;SC=GCCAGGGCCACCCCGGCCTGT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=13;WE=67201016;WS=67200998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr11	67202044	rs1790752	G	A	1953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.315;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=42;PP=979;ReadPosRankSum=-0.440;SC=CCCTGCCTCCGCCCCCCAGGG;SOR=0.559;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=137;TCF=61;TCR=76;TR=80;WE=67202052;WS=67202034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,91:0.59:154
chr11	67202156	rs13859	C	T	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.974;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=198;ReadPosRankSum=-0.531;SC=AGCCCCCGGGCCCCCGTCAGG;SOR=1.387;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=10;WE=67202164;WS=67202146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr11	67205978	rs872375	G	A	1536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.590;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=39;PP=1013;ReadPosRankSum=0.695;SC=GCCTCCTGTGGGGACATGAAG;SOR=0.996;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=152;TCF=72;TCR=80;TR=66;WE=67205986;WS=67205968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,74:0.43:172
chr11	67207426	rs2302264	G	A	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.882;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=118;ReadPosRankSum=0.438;SC=TCCGCAGGCCGACCCCTAAGG;SOR=0.098;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=8;WE=67207434;WS=67207416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr11	67223920	rs1638564	CA	GC	2598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=34;PP=1736;ReadPosRankSum=-0.892;SC=CGCAGTCAGTCAGGGAGCCCG;SOR=0.640;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=122;TCF=46;TCR=76;TR=52;WE=67223929;WS=67223910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,69:0.46:149
chr11	67257037	rs4084113	C	T	2788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.311;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=55;PP=1636;ReadPosRankSum=2.475;SC=GCTGGGGGAGCGGACAGAGAC;SOR=0.528;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=247;TCF=143;TCR=104;TR=122;WE=67257045;WS=67257027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,138:0.51:272
chr11	67257273	rs611697	G	T	879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=26;PP=713;SC=CATGATCTCTGCGAGGGCAGG;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=27;WE=67257281;WS=67257263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	67257823	rs641081	C	A	5789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=105;NR=94;PP=2965;SC=CCAGCTGGACCAGCAGATCAC;SOR=0.760;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=199;TCF=105;TCR=94;TR=199;WE=67257831;WS=67257813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr11	67258391	rs4930199	A	G	5109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=103;NR=74;PP=2893;SC=CGAGAGCTGCAGGCCCTGGAG;SOR=0.857;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=177;TCF=103;TCR=74;TR=177;WE=67258399;WS=67258381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr11	67259609	rs61755427	C	T	2370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.730;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=51;PP=1259;ReadPosRankSum=-0.301;SC=TGGGGCCCCTCGAGCGAAGCA;SOR=0.655;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=220;TCF=120;TCR=100;TR=104;WE=67259617;WS=67259599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,124:0.48:258
chr11	67262264	.	T	TGAGTGGGCGA	1380	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MMLQ=23;MQ=62.32;NF=19;NR=5;PP=1380;QD=58.25;SC=GCCTCTCTGGTGAGTGGGCGA;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=35;TCF=21;TCR=14;TR=24;WE=67262272;WS=67262254;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:11,24:0.69:35
chr11	67262282	rs202207490	C	CGA	3095.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=5;PP=2316;SC=CGAGAGTGGGCGAGTGGGCGA;SOR=2.265;SbPval=0.01;Source=Platypus;TC=65;TCF=30;TCR=35;TR=24;WE=67262297;WS=67262272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr11	67262289	.	GC	AC	2407	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MMLQ=24;MQ=60.79;NF=19,50;NR=5,36;PP=2407,231;QD=101.166666667;SC=GGGCGAGTGGGCGAGGGGGCG;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=84;TCF=43;TCR=41;TR=24,86;WE=67262297;WS=67262272;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:20,86:0.81:106
chr11	67262289	.	GC	GCGAGAGGAC,GCGAGTGGAC	3601.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.25;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=24;NF=19,50;NR=5,36;PP=2407,231;SC=GGGCGAGTGGGCGAGGGGGCG;SOR=1.802;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=84;TCF=43;TCR=41;TR=24,86;WE=67262297;WS=67262272;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.46,0.54:76
chr11	67263767	rs618633	A	G	1503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=28;PP=837;SC=CGCAGGGGTCAGCCGCGTGGA;SOR=1.101;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=22;TCR=28;TR=50;WE=67263775;WS=67263757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr11	67264679	rs2276120	C	T	783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=1.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.56;ReadPosRankSum=0.081;SOR=1.011;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,37:0.45:82
chr11	67267043	.	T	TCCAA	284	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=63.9;NF=6;NR=0;PP=284;QD=48.3333333333;SC=CATCCATCCATCCATCCATCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=67267051;WS=67267033;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr11	67288594	rs2276118	C	T	1881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=34;PP=1110;ReadPosRankSum=0.241;SC=GTAGCCGTCCCGGTCTCGGTC;SOR=0.733;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=86;TCR=66;TR=78;WE=67288602;WS=67288584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,89:0.52:172
chr11	67289349	.	A	C	96	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=7;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=15;MQ=57.19;NF=9;NR=1;PP=96;QD=13.0771212547;SC=ATGCCCCCCCAACCCTGTGTC;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=10;WE=67289357;WS=67289339;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr11	67351529	rs145589007	A	AG	878.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.643;HP=11;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=949;ReadPosRankSum=-0.390;SC=GGGGGCGGGGAGGGGGGGCAG;SOR=0.111;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=47;TCF=36;TCR=11;TR=19;WE=67351548;WS=67351519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,21:0.50:42
chr11	67351540	rs1871041	A	G	998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.171;HP=1;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.645;NF=22;NR=4;PP=941;ReadPosRankSum=1.278;SC=GGGGGGGCAGACTGCGCTCAC;SOR=0.425;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=65;TCF=54;TCR=11;TR=26;WE=67351548;WS=67351519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,30:0.43:69
chr11	67351585	rs4147581	C	G	1602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.303;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.419;NF=43;NR=26;PP=889;ReadPosRankSum=0.082;SC=CTCCAGCAAACTTTTCTTTGT;SOR=0.564;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=138;TCF=88;TCR=50;TR=69;WE=67351593;WS=67351575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,76:0.50:151
chr11	67375162	rs1382089	T	C	284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=8;PP=162;SC=AGGGCCAAGCTGCCACACTCG;SOR=3.442;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=67375170;WS=67375152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	67395634	rs35181012	C	T	2144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.297;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=54;PP=1377;ReadPosRankSum=1.295;SC=TAGTGTGTAGCGGAAGTGGCC;SOR=0.785;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=225;TCF=112;TCR=113;TR=99;WE=67395642;WS=67395624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,106:0.43:248
chr11	67395714	rs7124513	C	T	2079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.076;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=45;PP=1267;ReadPosRankSum=-0.658;SC=GTGCAAACACCTCATCTACCT;SOR=0.664;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=242;TCF=126;TCR=116;TR=97;WE=67395722;WS=67395704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,107:0.39:273
chr11	67399735	rs2514021	T	C	5078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=96;NR=66;PP=2917;SC=CCCTTTGCCTTCCGCCCACTG;SOR=1.022;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=162;TCF=96;TCR=66;TR=162;WE=67399743;WS=67399725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr11	67399970	rs3765088	C	T	791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=18;PP=456;ReadPosRankSum=-1.154;SC=GGTGGGGCCCCAGGATGGGTC;SOR=0.656;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=88;TCF=46;TCR=42;TR=38;WE=67399978;WS=67399960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,40:0.44:91
chr11	67401635	rs12787511	G	C	837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=12;PP=460;ReadPosRankSum=-0.740;SC=AGGCCCTTCCGTCCCCACCGT;SOR=0.676;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=73;TCF=49;TCR=24;TR=33;WE=67401643;WS=67401625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,41:0.48:85
chr11	67402362	rs3758938	T	G	1606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.548;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=35;PP=796;ReadPosRankSum=0.564;SC=GCCCAGGATCTTCACCTGGAA;SOR=0.774;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=158;TCF=81;TCR=77;TR=72;WE=67402370;WS=67402352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,83:0.46:181
chr11	67407146	rs2447591	T	C	492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=12;PP=370;SC=GTGGTCTTCCTACTCGAGCTG;SOR=1.739;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=17;WE=67407154;WS=67407136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	67412203	rs143278298	C	CCA	578.87	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=2.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.12;ReadPosRankSum=0.481;SOR=0.758;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,21:0.88:24
chr11	67412229	.	A	ACC	151	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=26;MQ=60.0;NF=0;NR=10;PP=151;QD=15.4;SC=ACACACACACACCTGCAGCTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=10;WE=67412237;WS=67412219;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,10:0.59:17
chr11	67414492	rs948445	C	T	2152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=44;PP=1383;SC=CAGGGGCTCCCGGGGCACAGG;SOR=1.058;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=78;TCF=34;TCR=44;TR=78;WE=67414500;WS=67414482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr11	67430589	rs78402723	A	G	1553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=18;PP=921;SC=GGCTGGGGGAACCTGCGGTCT;SOR=1.238;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=33;TCR=18;TR=51;WE=67430597;WS=67430579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr11	67430762	rs1551886	T	C	4030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=72;PP=1989;SC=GGGTGGGTAGTGGATCTCCTT;SOR=1.017;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=133;TCF=61;TCR=72;TR=133;WE=67430770;WS=67430752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr11	67431038	rs1979375	G	A	3039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=35;PP=1841;SC=GAGGCCCAGGGTGTGGATCAA;SOR=1.350;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=66;TCR=35;TR=100;WE=67431046;WS=67431028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr11	67431110	rs1979376	G	A	6423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=120;NR=100;PP=2965;SC=CTTCCCTAGGGGTGGAAATGG;SOR=0.846;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=220;TCF=120;TCR=100;TR=220;WE=67431118;WS=67431100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr11	67432050	rs182885648	C	T	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=1.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.96;ReadPosRankSum=-0.697;SOR=0.515;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,27:0.49:55
chr11	67432804	rs2447571	T	C	8273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=144;NR=147;PP=2965;SC=GCCACGCGGCTGCAGCCCAGC;SOR=0.770;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=291;TCF=144;TCR=147;TR=291;WE=67432812;WS=67432794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,320:1.00:320
chr11	67432854	rs6591270	T	C	5368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=109;PP=2965;SC=GTTGATGATGTGGCCCAGGTT;SOR=1.145;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=191;TCF=82;TCR=109;TR=191;WE=67432862;WS=67432844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr11	67433708	rs5792424	C	CG	5253.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=51;PP=2981;SC=GGGGCGGGCTCGGGGCCAGCC;SOR=0.850;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=95;TCF=40;TCR=55;TR=85;WE=67433716;WS=67433698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr11	67433758	rs1551887	G	A	5546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=66;PP=2965;SC=TGGGGACGTCGGGCACTGCTG;SOR=0.963;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=159;TCF=93;TCR=66;TR=159;WE=67433766;WS=67433748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr11	67433869	rs1551888	C	T	4864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=90;PP=2965;SC=CACCACGCAACTCCCTGCAGG;SOR=1.110;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=160;TCF=70;TCR=90;TR=160;WE=67433877;WS=67433859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr11	67434010	rs1871032	C	T	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.243;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=8;PP=575;ReadPosRankSum=-0.509;SC=GGCTACTGGGCGGGGAGAGCA;SOR=1.523;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=52;TCF=35;TCR=17;TR=32;WE=67434018;WS=67434000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,35:0.65:54
chr11	67434416	rs4646823	C	A	4992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=79;PP=2875;SC=TCCAGGCCTGCAGGTTCTTGA;SOR=0.704;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=170;TCF=91;TCR=79;TR=170;WE=67434424;WS=67434406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr11	67434475	rs145359673	C	T	1413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.298;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=31;PP=812;ReadPosRankSum=-1.962;SC=GATATGTCTGCCTCGAAAGCT;SOR=0.564;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=132;TCF=66;TCR=66;TR=63;WE=67434483;WS=67434465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,69:0.47:148
chr11	67564034	rs79787139	A	G	100.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.05;QD=20.18;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	67564056	rs74682508	T	A	323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=267;SC=AGTGTGGGGCTTCCTAGCTTT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=67564076;WS=67564046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	67564068	rs77439896	C	A	361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.11;QD=30.15;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	67564135	rs77521350	G	C	1774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=38;NR=20;PP=881;SC=ATGCAGGCCCGGGTGGGCGTG;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=38;TCR=20;TR=58;WE=67564143;WS=67564125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr11	67564162	rs75324740	A	G	882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.632;HP=1;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-7.072;NF=27;NR=14;PP=451;ReadPosRankSum=-1.657;SC=CACATAGCTCAGTGGTGAACA;SOR=0.877;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=82;TCF=51;TCR=31;TR=41;WE=67564170;WS=67564152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,47:0.49:96
chr11	67564197	rs72657419	T	C	3438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=62;NR=45;PP=1526;SC=GGGTTGCAGATGGTAAGGGCC;SOR=0.804;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=62;TCR=45;TR=107;WE=67564205;WS=67564187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr11	67564238	rs77785393	C	T	1779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.65;MQRankSum=-4.576;QD=17.45;ReadPosRankSum=1.831;SOR=0.711;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,47:0.46:102
chr11	67564241	rs80309804	C	T	1788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=0.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.47;MQRankSum=-4.302;QD=18.44;ReadPosRankSum=0.852;SOR=0.823;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,47:0.48:97
chr11	67765163	rs5792426	A	AG	3049.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=24;PP=2189;SC=ATGGCCAGGAAGCCACTGCCA;SOR=1.395;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=50;TCF=25;TCR=25;TR=49;WE=67765171;WS=67765153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr11	67786064	rs11433668	A	AC	5498.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=6;NR=61;PP=2936;SC=GCCCTCAGGAACTCCGGGCCT;SOR=0.912;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=69;TCF=7;TCR=62;TR=67;WE=67786072;WS=67786054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr11	67787366	rs4646811	CCT	C	154.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.09;ReadPosRankSum=-1.454;SOR=0.454;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,9:0.18:50
chr11	67789293	rs58160034	G	GC	9438.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=31;NR=70;PP=2967;SC=CTGGGCTGCGGCGTGTGGCCA;SOR=0.776;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=35;TCR=77;TR=101;WE=67789301;WS=67789283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr11	67795378	rs11436139	G	GC	5785.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=67;PP=2974;SC=GGCCATGGAGGCCAAGGCTGC;SOR=0.834;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=94;TCF=23;TCR=71;TR=88;WE=67795386;WS=67795368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr11	67799731	rs3133266	C	G	4357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=73;NR=67;PP=2365;SC=CCTGGTATGACGTCACGCCCT;SOR=0.807;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=140;TCF=73;TCR=67;TR=140;WE=67799739;WS=67799721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr11	67800494	rs3115545	T	G	4647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=92;NR=51;PP=2965;SC=GTCCTGGGCATGAGGGGACAG;SOR=1.186;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=143;TCF=92;TCR=51;TR=143;WE=67800502;WS=67800484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr11	67801282	rs3133267	C	T	712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=2;PP=544;SC=GCAGCCGCCGCCGCTACTTTC;SOR=4.091;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=23;WE=67801290;WS=67801272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	67801517	rs3115546	G	T	5584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=92;NR=102;PP=2965;SC=GACAGACCCGGTGCTGTGCCA;SOR=0.964;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=194;TCF=92;TCR=102;TR=194;WE=67801525;WS=67801507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr11	67814979	rs2471829	G	C	8064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=152;NR=120;PP=2965;SC=TCATGTTCCTGTTCGCCCTGG;SOR=0.813;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=273;TCF=152;TCR=121;TR=272;WE=67814987;WS=67814969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,299:1.00:299
chr11	67815086	rs12418239	G	A	3350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.352;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=70;PP=1892;ReadPosRankSum=-0.189;SC=GGGCCAGGCAGCCCCTCACCA;SOR=0.563;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=313;TCF=170;TCR=143;TR=150;WE=67815094;WS=67815076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,164:0.49:332
chr11	67837771	rs3819255	A	T	2557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=35;PP=1394;SC=CTATTAAAAAATTTTCAAAAA;SOR=0.735;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=46;TCR=35;TR=81;WE=67837779;WS=67837761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr11	67957518	rs2512606	A	T	7879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=123;NR=142;PP=2965;SC=CACCACCATGATCTTGGATTC;SOR=0.999;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=266;TCF=124;TCR=142;TR=265;WE=67957526;WS=67957508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,296:1.00:296
chr11	68030015	rs901827	C	T	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.335;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=264;ReadPosRankSum=-0.717;SC=CTGGAGGCTGCAGTCGTGGGA;SOR=0.491;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=46;TCF=21;TCR=25;TR=17;WE=68030023;WS=68030005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,17:0.37:46
chr11	68030173	rs3802746	C	A	1453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.597;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=25;PP=837;ReadPosRankSum=0.784;SC=ATCAGCTGCACCTCCTGAAGT;SOR=0.597;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=93;TCR=54;TR=68;WE=68030181;WS=68030163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,73:0.45:161
chr11	68131167	rs10791978	A	T	806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=4;PP=644;SC=GCAATGACTGACGGGGGACCC;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=28;WE=68131175;WS=68131157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	68170825	rs687482	A	G	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.43;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	68170833	rs686921	G	T	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.43;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	68171013	rs545382	T	C	7525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=139;NR=120;PP=2965;SC=CGCACATTTTTGGGTTCACGC;SOR=0.728;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=260;TCF=140;TCR=120;TR=259;WE=68171035;WS=68171003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,291:1.00:291
chr11	68173861	rs471966	C	T	243.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=200;SC=GGACCTGACCCGGGGGTGAGT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=68173869;WS=68173851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	68177318	rs371789773	CA	C	97.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.72;MQRankSum=0.623;QD=6.52;ReadPosRankSum=1.737;SOR=2.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr11	68179166	rs689179	A	G	1428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=37;PP=1012;SC=CTCGCCGCACATACCCTGTGG;SOR=2.348;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=12;TCR=37;TR=49;WE=68179174;WS=68179156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr11	68192690	rs556442	G	A	4379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=78;NR=75;PP=2591;SC=CCCTGGTGGTGGACAACACAC;SOR=0.741;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=153;TCF=78;TCR=75;TR=153;WE=68192698;WS=68192680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr11	68305521	rs11403965	G	GT	1002.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=25;PP=1160;SC=CATTCTAGCAGTAAGTCCAGG;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=68305529;WS=68305511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	68312645	rs10896340	A	G	565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=17;PP=445;SC=AAGCACTCACATACTATTTGT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=68312653;WS=68312635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	68315798	rs10736668	C	A	418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=13;PP=350;SC=TCTGGGGAGCCGGTAACAGGG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=68315806;WS=68315788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	68331715	rs10501398	C	G	2099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=53;NR=9;PP=1625;SC=TGGTCGATAACCTTGAATGAT;SOR=3.293;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=53;TCR=9;TR=62;WE=68331723;WS=68331705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr11	68341671	rs139199854	T	C	2998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.507;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=72;PP=1963;ReadPosRankSum=1.081;SC=CAACAGTGCATTAGTGCAGCA;SOR=0.565;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=275;TCF=122;TCR=153;TR=133;WE=68341679;WS=68341661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,145:0.49:297
chr11	68456410	rs3136540	T	C	3241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.822;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=73;PP=1996;ReadPosRankSum=0.483;SC=TGAAATATCATCAACTTAACA;SOR=0.798;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=318;TCF=158;TCR=160;TR=139;WE=68456418;WS=68456400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:195,160:0.45:355
chr11	68458592	.	AT	A	91.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.336;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.40;ReadPosRankSum=-2.099;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr11	68476011	rs4930597	A	G	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.042;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=155;ReadPosRankSum=0.749;SC=ACAGTGCACCATTTCTACCTA;SOR=0.275;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=9;WE=68476019;WS=68476001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr11	68522216	rs75022915	T	C	2877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=49;PP=1315;ReadPosRankSum=0.708;SC=GCCCAGCACATGAACTTGGTG;SOR=0.698;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=210;TCF=120;TCR=90;TR=115;WE=68522224;WS=68522206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,134:0.57:236
chr11	68530257	rs2924699	C	T	2248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.021;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=56;PP=1573;ReadPosRankSum=-0.728;SC=CTTCAGTGCACGGCAGGGCAT;SOR=0.608;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=213;TCF=100;TCR=113;TR=105;WE=68530265;WS=68530247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,109:0.48:228
chr11	68530318	rs7112615	C	A	1453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.199;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=39;PP=920;ReadPosRankSum=-0.836;SC=GGCAAGGAGACGTGGACTTCA;SOR=0.992;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=126;TCF=49;TCR=77;TR=61;WE=68530326;WS=68530308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,67:0.49:136
chr11	68548260	rs3019576	C	A	1957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.686;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=48;PP=1141;ReadPosRankSum=-1.074;SC=AAAGAGGCAACAATGAGGAGA;SOR=0.568;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=200;TCF=87;TCR=113;TR=88;WE=68548268;WS=68548250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,97:0.45:217
chr11	68549340	rs2228502	A	G	2300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.006;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=54;PP=1453;ReadPosRankSum=1.222;SC=CTAACGTCACAAAGAACGCTG;SOR=0.634;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=270;TCF=139;TCR=131;TR=115;WE=68549348;WS=68549330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,122:0.44:280
chr11	68552486	rs2305507	G	A	3583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.407;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=84;PP=2095;ReadPosRankSum=-2.030;SC=TGTCTGAGCCGGCCGCAGGTT;SOR=0.728;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=288;TCF=126;TCR=162;TR=149;WE=68552494;WS=68552476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,169:0.52:323
chr11	68566647	.	GAAA	G	2929.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=52.32;SOR=3.690;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr11	68566648	.	A	AC	1097	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;FR=1.0000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=20;NR=4;PP=1097;QD=47.0;SC=CTTCATACGGAAAAATTTCAT;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=24;WE=68566659;WS=68566638;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,24:0.92:26
chr11	68566649	.	AAA	GCT	1984	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;FR=1.0000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=29;NR=4;PP=1984;QD=62.0444810564;SC=TTCATACGGAAAAATTTCATC;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=58;TCF=48;TCR=10;TR=33;WE=68566659;WS=68566638;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:25,33:0.57:58
chr11	68566651	.	A	ACGCT	2929.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=51.40;SOR=3.461;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr11	68566839	rs3019603	G	A	4093.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.136;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=118;PP=2355;ReadPosRankSum=-0.857;SC=ATTATTGGGGGAAAAAAAAAT;SOR=1.342;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=190;TCF=68;TCR=122;TR=182;WE=68566847;WS=68566824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:9,168:0.95:177
chr11	68658686	rs61887147	C	A	1784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.398;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=27;PP=1031;ReadPosRankSum=0.820;SC=ACATGCTGCTCCAGTTAAACT;SOR=1.033;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=163;TCF=102;TCR=61;TR=80;WE=68658694;WS=68658676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,87:0.48:180
chr11	68671477	rs1249463	T	C	1783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.174;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=43;PP=905;ReadPosRankSum=-0.911;SC=TGCTGGAGCTTGAGAGAGACG;SOR=0.803;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=161;TCF=80;TCR=81;TR=85;WE=68671485;WS=68671467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,91:0.52:175
chr11	68678962	rs560096	T	C	2522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.546;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=42;PP=1595;ReadPosRankSum=-0.227;SC=GAAGCGGTTTTATTTGCGCTG;SOR=0.770;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=166;TCF=99;TCR=67;TR=104;WE=68678970;WS=68678952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,116:0.61:191
chr11	68700701	rs645436	G	C	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.196;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=26;ReadPosRankSum=0.389;SC=CTCCTCACTTGCTGTGGTTCA;SOR=0.120;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=68700709;WS=68700691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr11	68703009	rs598255	C	G	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.207;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=86;ReadPosRankSum=0.811;SC=TCATGGTGCACCTTCTGTCCT;SOR=0.250;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=8;WE=68703017;WS=68702999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr11	68705674	rs17612126	C	A	1624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.575;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=32;PP=916;ReadPosRankSum=0.017;SC=GATCTGCCCACGGAGGAGGAC;SOR=0.627;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=143;TCF=75;TCR=68;TR=70;WE=68705682;WS=68705664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,79:0.48:163
chr11	68705876	rs4378405	G	A	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.518;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=4;PP=52;ReadPosRankSum=1.400;SC=GGTGGGTTCCGTCTCCAGGAA;SOR=0.307;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=7;WE=68705884;WS=68705866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr11	68747485	rs1939734	G	A	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.079;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=300;ReadPosRankSum=0.592;SC=ACCTGTGGGCGGCTCTCAAGC;SOR=1.668;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=15;WE=68747493;WS=68747475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr11	68748003	rs34847539	T	C	9807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=369;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=182;NR=160;PP=2965;SC=GGAGACAGAGTGTCCACAGCA;SOR=0.766;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=342;TCF=182;TCR=160;TR=342;WE=68748011;WS=68747993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,369:1.00:369
chr11	68773810	rs371172006	AGG	A	125	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.9983;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=45;SC=AGCGTGGGGGAGGGGGGGGGT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=68773819;WS=68773800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr11	68816370	rs4930642	A	G	2499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.77;SOR=0.992;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr11	68816420	.	C	T	909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=0.000;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.485;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=22;PP=510;ReadPosRankSum=0.961;SC=TGGGCGCCTTCGGGGCTTGAG;SOR=0.762;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=103;TCF=57;TCR=46;TR=45;WE=68816428;WS=68816410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,51:0.44:117
chr11	68822739	rs1470892	T	C	12588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=473;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=201;NR=222;PP=2965;SC=ACCGCGCTGCTCCCTGGGAGC;SOR=0.832;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=423;TCF=201;TCR=222;TR=423;WE=68822747;WS=68822729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,473:1.00:473
chr11	68825037	rs3750973	A	C	3035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=38;PP=1973;SC=CCGCCCGTCTATCTTGCAGGG;SOR=1.230;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=68;TCR=38;TR=106;WE=68825045;WS=68825027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr11	68830226	rs10792015	G	A	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=290;ReadPosRankSum=0.138;SC=CTCCACTTTGGGCTCAGTGAC;SOR=0.954;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=33;TCF=30;TCR=3;TR=15;WE=68830234;WS=68830216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr11	68831293	rs11228472	C	G	1244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=9;PP=926;SC=GTCACCGAGCCCTGCAGGCAG;SOR=2.560;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=38;TCR=9;TR=47;WE=68831301;WS=68831283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr11	68834831	rs7950657	G	A	130.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5165;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=79;ReadPosRankSum=0.566;SC=CTGGCCATGAGCTCAGCCTGC;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=5;WE=68834839;WS=68834821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr11	68834968	rs6591368	T	C	2890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=56;NR=42;PP=1670;SC=CTTCTGCTCTTAGCAGGATGA;SOR=0.846;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=56;TCR=42;TR=98;WE=68834976;WS=68834958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr11	68835182	rs10750840	T	A	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.744;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.23;ReadPosRankSum=0.682;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr11	68837794	rs61881024	A	G	1896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.731;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=25;PP=1075;ReadPosRankSum=1.319;SC=ACGCTCAGCAATGGAGACCTC;SOR=0.854;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=110;TCF=68;TCR=42;TR=67;WE=68837802;WS=68837784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,81:0.66:123
chr11	68838028	rs3829236	C	T	1286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.828;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=37;PP=864;ReadPosRankSum=-0.042;SC=ACCGATACACCCTGCTGCCTC;SOR=0.888;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=91;TCF=28;TCR=63;TR=53;WE=68838036;WS=68838018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,57:0.56:101
chr11	68839949	rs896969	C	T	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=341;ReadPosRankSum=-1.372;SC=GCAGGATGCTCGTTACAGGGG;SOR=0.660;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=61;TCF=45;TCR=16;TR=27;WE=68839957;WS=68839939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,33:0.44:75
chr11	68840014	rs3750963	G	A	1393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.368;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=24;PP=717;ReadPosRankSum=0.288;SC=CAAGCCAGACGCCAGGGCAGG;SOR=0.592;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=110;TCF=63;TCR=47;TR=57;WE=68840022;WS=68840004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,67:0.50:134
chr11	68840160	rs3750965	A	G	638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=16;PP=383;ReadPosRankSum=-0.290;SC=AGCTCCCACAAACAGGCCATG;SOR=0.698;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=40;TCR=47;TR=30;WE=68840168;WS=68840150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,34:0.34:99
chr11	68840397	rs1466221	T	C	2328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.130;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=18;PP=591;ReadPosRankSum=-0.004;SC=TGCGTTCCTATGGCAGTGTTC;SOR=0.925;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=140;TCF=87;TCR=53;TR=53;WE=68840405;WS=68840387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,61:0.40:153
chr11	68840412	rs1466220	C	G	2785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.177;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=27;PP=913;ReadPosRankSum=-2.448;SC=GTGTTCTGCTCTCAGCTGAGG;SOR=0.810;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=159;TCF=94;TCR=65;TR=71;WE=68840420;WS=68840402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,83:0.46:179
chr11	68840617	rs3750966	T	A	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.234;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=180;ReadPosRankSum=0.098;SC=GGGAATGGAGTTCTCTTTGGC;SOR=1.274;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=47;TCF=11;TCR=36;TR=14;WE=68840625;WS=68840607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,14:0.29:49
chr11	68845867	rs7945151	G	A	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=183;ReadPosRankSum=-1.312;SC=TCAAATCCCAGAATAAGAGGG;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=10;WE=68845875;WS=68845864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr11	68846098	rs4930649	A	G	9822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=371;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=165;NR=168;PP=2965;SC=CAGAGCTGGCACGGAAGTGCC;SOR=0.812;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=333;TCF=165;TCR=168;TR=333;WE=68846106;WS=68846088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,371:1.00:371
chr11	68846519	rs7124310	A	C	2278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=48;PP=1428;SC=GCCGGCCTCTACTGGGCGGGT;SOR=2.494;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=16;TCR=48;TR=64;WE=68846527;WS=68846509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr11	68847138	rs12804893	T	C	944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=4;PP=444;SC=AAAGAAGTCCTGACATCTGGA;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=22;WE=68847146;WS=68847128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr11	68847156	rs731974	C	T	877.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5013;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=9;PP=552;ReadPosRankSum=1.008;SC=GGAACCAACCCGTGGGGTCCA;SOR=0.990;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=39;TCF=28;TCR=11;TR=33;WE=68847164;WS=68847146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,36:0.86:42
chr11	68849073	rs3829240	G	A	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.314;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=401;ReadPosRankSum=0.135;SC=GACTGTGCCCGTCACCCTGGG;SOR=2.799;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=36;TCF=4;TCR=32;TR=21;WE=68849081;WS=68849063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,22:0.56:39
chr11	68851414	rs2376558	T	C	2871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=50;NR=49;PP=1388;SC=TGTCCTCAGCTGATGGCCGTG;SOR=0.786;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=50;TCR=49;TR=99;WE=68851422;WS=68851404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr11	68851466	rs896973	G	T	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.675;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=16;PP=409;ReadPosRankSum=-0.720;SC=ACATGCGTGCGTTTGGCGGGA;SOR=0.521;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=80;TCF=39;TCR=41;TR=33;WE=68851474;WS=68851456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,39:0.40:97
chr11	68853504	rs2290421	C	T	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=19;PP=413;ReadPosRankSum=0.100;SC=GTGGCTGGGACGGGGACTCGG;SOR=0.610;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=20;WE=68853512;WS=68853494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,22:0.67:33
chr11	68855197	rs1123665	T	G	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=90;ReadPosRankSum=-1.193;SC=ACATCCATCCTGAGGCTCATC;SOR=1.022;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=9;WE=68855205;WS=68855187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr11	68855233	rs1551305	G	A	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=133;ReadPosRankSum=-0.071;SC=CTGTGTCCCTGTGACACTCAC;SOR=0.627;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=14;WE=68855241;WS=68855223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr11	68855363	rs3829241	G	A	579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=17;PP=373;ReadPosRankSum=0.206;SC=GAGGAGCCCGGGGAGGATGAG;SOR=0.584;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=50;TCF=18;TCR=32;TR=28;WE=68855371;WS=68855353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,29:0.56:52
chr11	69063136	rs7117236	C	T	2018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.410;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=38;PP=1226;ReadPosRankSum=1.016;SC=GCTCCAAAGCCGGCAGATCCC;SOR=0.855;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=189;TCF=104;TCR=85;TR=88;WE=69063144;WS=69063126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,96:0.47:203
chr11	69063393	rs7103126	T	C	3248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.338;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=75;PP=1795;ReadPosRankSum=-0.408;SC=TCTGCAAGGGTGGTGGGCGTT;SOR=0.798;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=290;TCF=144;TCR=146;TR=146;WE=69063401;WS=69063383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,158:0.50:314
chr11	69063510	rs11539762	G	A	2403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.962;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=47;PP=1499;ReadPosRankSum=-1.516;SC=ATGTGGGCGCGAATGGATGTG;SOR=0.791;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=237;TCF=126;TCR=111;TR=108;WE=69063518;WS=69063500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,116:0.45:255
chr11	69063728	rs11228610	G	C	1581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.654;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=35;PP=815;ReadPosRankSum=-1.154;SC=GGCCCTGGGGGGGTGGCGCAT;SOR=0.760;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=111;TCF=53;TCR=58;TR=63;WE=69063736;WS=69063718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,74:0.56:131
chr11	69462910	rs9344	G	A	3632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.375;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=87;PP=2197;ReadPosRankSum=-0.394;SC=AGTGTGACCCGGTAAGTGAGG;SOR=0.898;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=252;TCF=100;TCR=152;TR=138;WE=69462926;WS=69462900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,160:0.57:279
chr11	69466115	rs7177	C	A	340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=8;PP=180;SC=CAGGTGCTCCCCTGACAGTCC;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=69466123;WS=69466105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	69486324	rs72938090	C	T	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.201;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=72;ReadPosRankSum=1.408;SC=CACCAAACACCTAAAATGTGC;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=5;WE=69486332;WS=69486314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr11	69588729	rs2073464	G	A	6069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=122;NR=85;PP=2965;SC=GAGAAGCCACGAGCCTGCTAG;SOR=1.018;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=208;TCF=122;TCR=86;TR=207;WE=69588737;WS=69588719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr11	69589959	rs9666584	A	G	158.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=4;PP=83;SC=GACCTCGGGCAGGAGTGCGCA;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=69589967;WS=69589949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr11	69924226	rs2509134	C	T	420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=11;NR=2;PP=215;SC=CCCCCTTTCACACCCGGTATG;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=69924234;WS=69924216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	69924352	rs11233117	C	G	718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.778;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=13;PP=358;ReadPosRankSum=0.406;SC=AAAATCTGACCGGCGCGGCCA;SOR=0.839;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=84;TCF=49;TCR=35;TR=33;WE=69924360;WS=69924342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,38:0.39:98
chr11	69924476	rs11233122	T	G	450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.223;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=9;PP=158;ReadPosRankSum=-0.743;SC=AGCAGCCGGGTGGCGGCGCGA;SOR=0.473;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=38;TCF=15;TCR=23;TR=17;WE=69924484;WS=69924466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,21:0.49:43
chr11	69931876	rs2509128	C	G	415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=8;PP=193;SC=CCCTCCCCCTCTCCCCCACTG;SOR=2.448;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=69931884;WS=69931866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	69949135	rs55698329	GCC	G	1057.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.061;HP=9;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQ=60.68;MQRankSum=1.937;NF=9;NR=6;PP=313;ReadPosRankSum=-1.317;SC=GAGATGCACCGCCCCCCCTCA;SOR=0.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=20;TCR=14;TR=15;WE=69949144;WS=69949125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,32:0.53:60
chr11	69954412	rs2509182	A	G	3672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=44;PP=2257;SC=CTGCTCGTGGAAGGTGCCTTA;SOR=1.196;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=74;TCR=44;TR=118;WE=69954420;WS=69954402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr11	69957917	rs9666157	A	G	1275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.320;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=32;PP=757;ReadPosRankSum=-0.025;SC=TGACTCCCCAAATCCCGCCGG;SOR=1.156;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=116;TCF=55;TCR=61;TR=55;WE=69957925;WS=69957894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,62:0.47:132
chr11	69957940	rs2515251	C	A	2441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=33;NR=47;PP=1366;SC=CACACCCCCCCGGGAGCTGCA;SOR=1.280;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=33;TCR=47;TR=80;WE=69957948;WS=69957930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr11	69962432	rs9666084	A	T	807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.857;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=6;PP=410;ReadPosRankSum=-0.864;SC=TCTGTGTGAAATGTTGCCCCA;SOR=0.803;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=83;TCF=63;TCR=20;TR=32;WE=69962440;WS=69962422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,39:0.43:91
chr11	69962642	rs2515245	A	G	1702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=33;PP=961;SC=TGGCTCTGTCAGAGCCTGGAG;SOR=1.903;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=16;TCR=33;TR=49;WE=69962650;WS=69962632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr11	69970412	rs2509160	G	A	4815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=101;NR=59;PP=2956;SC=GAGCAACCTCGGAGTGCCACA;SOR=1.185;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=160;TCF=101;TCR=59;TR=160;WE=69970420;WS=69970402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr11	69970637	rs2515258	A	G	565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=14;PP=404;SC=GTTTGAACTCAAAGAGCTTGT;SOR=2.948;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=18;WE=69970645;WS=69970627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	69978265	rs2509174	C	T	997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=28;PP=645;ReadPosRankSum=1.108;SC=TCTGTCTTTGCGAAATCATCC;SOR=0.762;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=85;TCF=32;TCR=53;TR=43;WE=69978273;WS=69978255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,48:0.51:94
chr11	69978358	rs2515264	G	C	180.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=4;PP=118;SC=TTACTGGGGTGCGCAGTGCAT;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=69978366;WS=69978348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
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chr11	69999122	rs10160639	A	C	1085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=4;PP=694;SC=CTCAGACTCAAAATTAACAAG;SOR=2.774;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=32;WE=69999130;WS=69999112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr11	69999252	rs3781663	G	A	4590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=78;PP=2728;SC=GGCCACTGTGGGTTAACTTTC;SOR=0.816;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=154;TCF=76;TCR=78;TR=154;WE=69999260;WS=69999242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr11	70001976	rs10751195	A	G	1438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=14;PP=818;SC=GCCGCCTCCCACTTCACCGCA;SOR=1.651;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=35;TCR=14;TR=49;WE=70001984;WS=70001966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
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chr11	70002185	rs34657087	AT	A	969.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.831;HP=10;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.866;NF=4;NR=50;PP=627;ReadPosRankSum=-0.158;SC=TGTTGTATATATTTTTTTTTA;SOR=0.481;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=60;TCF=4;TCR=56;TR=54;WE=70002193;WS=70002169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,52:0.55:95
chr11	70002987	rs3781658	G	A	1200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=11;PP=840;ReadPosRankSum=1.235;SC=ATGCACCCACGCTGACACACA;SOR=0.801;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=82;TCF=62;TCR=20;TR=49;WE=70002995;WS=70002977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,51:0.61:83
chr11	70007311	rs2276066	A	G	1234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=18;PP=746;ReadPosRankSum=0.019;SC=TCATCTACAGAATCTCCATGG;SOR=0.687;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=118;TCF=74;TCR=44;TR=51;WE=70007319;WS=70007301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,57:0.44:129
chr11	70007392	rs2276067	A	G	1735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.474;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=41;PP=1017;ReadPosRankSum=0.653;SC=CAGCCACCGCAGTCATCATCA;SOR=0.742;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=216;TCF=114;TCR=102;TR=89;WE=70007400;WS=70007382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,97:0.39:246
chr11	70007484	rs2276068	C	G	890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.733;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=26;PP=544;ReadPosRankSum=0.434;SC=TGCCCATGTTCCAGGTACTGT;SOR=0.827;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=98;TCF=39;TCR=59;TR=41;WE=70007492;WS=70007474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,46:0.39:117
chr11	70007865	rs2155461	A	C	3211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=48;NR=60;PP=1955;SC=GCCTTTCCCCAACCTCGCTTC;SOR=1.066;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=48;TCR=60;TR=108;WE=70007873;WS=70007855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr11	70009720	rs11235460	G	A	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.227;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=126;ReadPosRankSum=-0.286;SC=CTTTTTTTGTGAGACTGAATA;SOR=0.446;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=8;WE=70009728;WS=70009710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr11	70013186	rs3781654	G	T	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=285;ReadPosRankSum=-0.345;SC=CAAGGAGGCAGAGGTTGCAGT;SOR=1.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=15;WE=70013194;WS=70013176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr11	70015951	rs56751551	C	T	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.970;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=249;ReadPosRankSum=-0.979;SC=GCCAGGCACACGGTGACATTC;SOR=1.358;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=38;TCF=35;TCR=3;TR=15;WE=70015959;WS=70015941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,17:0.38:45
chr11	70016058	rs17333013	A	C	2518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.911;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=54;PP=1661;ReadPosRankSum=-0.320;SC=TTCCACTCAGAAACCTTTTCC;SOR=0.807;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=280;TCF=152;TCR=128;TR=121;WE=70016066;WS=70016048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,131:0.43:302
chr11	70016247	rs35843284	T	TG	1537.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=17;PP=911;SC=AGGGGAAGTTTGGGCTCTGGA;SOR=1.251;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=22;WE=70016255;WS=70016237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr11	70016345	rs57900749	T	C	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.837;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.447;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=4;PP=39;ReadPosRankSum=0.569;SC=CTTCCCAGCATGGGCAGGGGG;SOR=0.132;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=7;WE=70016353;WS=70016335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr11	70016922	rs7127005	C	T	1524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-2.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.960;NF=30;NR=5;PP=574;ReadPosRankSum=-1.084;SC=GCTCGGCACACGGGGTGGTGG;SOR=0.555;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=66;TCF=56;TCR=10;TR=35;WE=70016930;WS=70016912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,38:0.54:71
chr11	70016944	rs3842255	AT	A	1907.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.695;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.608;NF=21;NR=13;PP=1191;ReadPosRankSum=-0.437;SC=GTCCCCCCTTATGGGCTGTGG;SOR=0.526;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=77;TCF=47;TCR=30;TR=34;WE=70016952;WS=70016934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,53:0.48:110
chr11	70031909	rs7937532	C	T	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.210;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=214;ReadPosRankSum=-0.014;SC=GGTTCAGAGACTCCTCCAGAG;SOR=0.951;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=39;TCF=15;TCR=24;TR=17;WE=70031917;WS=70031899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,20:0.44:45
chr11	70049523	rs1131677	A	G	1844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=45;NR=19;PP=1090;SC=CAGAGGGCGCACGGAGGGCCG;SOR=1.512;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=45;TCR=19;TR=64;WE=70049531;WS=70049513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr11	70118251	rs670012	T	G	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=140;ReadPosRankSum=1.210;SC=TGAGCTTAATTACTGTAGCCT;SOR=1.022;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=7;WE=70118259;WS=70118241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr11	70118489	rs546502	G	A	1311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.657;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=29;PP=684;ReadPosRankSum=0.377;SC=GTTACACGAGGTTGGTCATGA;SOR=0.602;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=111;TCF=55;TCR=56;TR=57;WE=70118497;WS=70118479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,65:0.50:129
chr11	70179672	rs2282481	C	T	1573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=41;PP=922;ReadPosRankSum=-0.909;SC=GAGCATGCAGCCCTGAGGGTG;SOR=0.691;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=137;TCF=56;TCR=81;TR=70;WE=70179680;WS=70179662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,77:0.52:149
chr11	70192247	rs35455860	A	G	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=45;ReadPosRankSum=1.255;SC=ATTTATGAAGAGACCGGTAAA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=4;WE=70192255;WS=70192237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
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chr11	70208311	rs7130178	G	A	1678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.586;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=29;PP=1128;ReadPosRankSum=0.431;SC=ATGCAGTTGCGTGGGTTACAG;SOR=0.751;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=140;TCF=81;TCR=59;TR=70;WE=70208319;WS=70208301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,76:0.49:156
chr11	70208350	rs10751231	G	A	5276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=72;PP=2965;SC=TACTTTGTAGGCTGTACCTCA;SOR=0.885;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=170;TCF=97;TCR=73;TR=168;WE=70208358;WS=70208340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr11	70211574	rs670310	A	G	2546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.506;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=64;PP=1576;ReadPosRankSum=-1.246;SC=CACTCCTCCCAGCGCGTTTTC;SOR=0.809;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=231;TCF=110;TCR=121;TR=117;WE=70211582;WS=70211564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,127:0.50:255
chr11	70213585	rs34887852	G	C	1204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.530;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=23;PP=615;ReadPosRankSum=2.521;SC=ATTTTATGGAGTTCATAAGAC;SOR=0.446;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=96;TCF=57;TCR=39;TR=52;WE=70213593;WS=70213575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,57:0.53:107
chr11	70222604	rs664130	G	A	749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.057;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=393;ReadPosRankSum=-0.106;SC=TAGATTTGATGAAAGTTTTAT;SOR=1.070;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=58;TCF=38;TCR=20;TR=30;WE=70222612;WS=70222594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,35:0.51:68
chr11	70229171	rs552282	G	A	1984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.517;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=49;PP=1314;ReadPosRankSum=0.197;SC=ACTACATTTTGGAATCCAGTG;SOR=0.646;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=181;TCF=84;TCR=97;TR=91;WE=70229179;WS=70229161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,98:0.49:201
chr11	70253475	rs2298397	C	T	650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=347;ReadPosRankSum=1.651;SC=ACTGGGAGACCGACCCTGATT;SOR=0.843;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=24;WE=70253483;WS=70253465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,29:0.56:52
chr11	70253586	rs569732	T	C	2395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.023;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.944;NF=60;NR=50;PP=1506;ReadPosRankSum=0.519;SC=TGTGTCACAATCCAGGCTGTG;SOR=0.776;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=206;TCF=114;TCR=92;TR=110;WE=70253594;WS=70253576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,120:0.53:225
chr11	70260598	rs34053053	C	T	798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=15;PP=1173;ReadPosRankSum=-0.357;SC=GGAAGTGAAGCGCCGCAGTGT;SOR=0.730;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=101;TCF=65;TCR=36;TR=40;WE=70260617;WS=70260588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,44:0.39:112
chr11	70260609	rs7932550	T	C	915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.469;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=17;PP=1173;ReadPosRankSum=-0.051;SC=GCCGCAGTGTTGTTGGTGTCT;SOR=0.540;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=117;TCF=76;TCR=41;TR=43;WE=70260617;WS=70260588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,49:0.37:133
chr11	70268910	rs12802851	C	T	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.711;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.282;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=78;ReadPosRankSum=-0.143;SC=CAAGTGAAGCCTCGCTTGGCC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=5;WE=70268918;WS=70268900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr11	70281007	rs7131282	T	C	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.921;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=3;PP=430;ReadPosRankSum=0.035;SC=TCCGCGGTGGTCCGCATCTCT;SOR=0.317;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=24;WE=70281015;WS=70280997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,26:0.68:38
chr11	70282629	rs6894	A	C	733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.920;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=20;PP=420;ReadPosRankSum=-0.831;SC=AGCACACCTCATAGGTATGAT;SOR=0.850;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=69;TCF=25;TCR=44;TR=31;WE=70282637;WS=70282619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,35:0.47:75
chr11	70349061	rs7110158	A	G	2988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=53;PP=1883;SC=AGAGGATGGCATCAGTGAGAG;SOR=0.784;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=54;TCR=53;TR=106;WE=70349069;WS=70349051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr11	70506206	rs525304	G	T	104.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=78;SC=CCCCAGGAAGGGCTTGAGATT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=70506214;WS=70506196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr11	70507605	.	TACACACACACACACACACACACACACACACACAC	T,TAC	2752.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.45;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5274;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=17;NF=7;NR=4;PP=2997;SC=TGCAGGCGTATACACACACAC;SOR=2.867;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=21;TCF=12;TCR=9;TR=11;WE=70507644;WS=70507595;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.16,0.84:69
chr11	70544937	rs7117514	A	G	764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=15;PP=419;SC=CCCACAGCACATGAGGCTGGT;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=8;TCR=15;TR=23;WE=70544945;WS=70544927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	70644839	rs11237534	C	T	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.048;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=127;ReadPosRankSum=1.205;SC=CTAAGAGGCACCGGGGCATCA;SOR=0.346;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=8;WE=70644847;WS=70644829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr11	70666765	rs11237599	C	T	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.749;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=20;PP=382;ReadPosRankSum=1.572;SC=GGTTGGAGTACGCCGGGGCCT;SOR=0.774;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=95;TCF=41;TCR=54;TR=34;WE=70666773;WS=70666755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,38:0.35:110
chr11	70672399	rs3019835	G	A	467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=0;PP=408;SC=GTTATATTCCGGACCAACTCA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=70672407;WS=70672397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	70753878	rs79477765	C	T	1120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.652;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=22;PP=738;ReadPosRankSum=0.583;SC=TTTATCAAGACACATCGGATA;SOR=0.599;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=126;TCF=80;TCR=46;TR=54;WE=70753886;WS=70753868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,58:0.41:141
chr11	70754130	rs76897545	C	T	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.158;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=100;ReadPosRankSum=1.000;SC=CGCTTGAACCCGGGAAGTGGA;SOR=1.501;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=7;WE=70754138;WS=70754120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr11	70757620	rs4409861	T	C	2344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.769;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=53;PP=1628;ReadPosRankSum=0.374;SC=GTGTGTGAAGTAGGTGGTTTT;SOR=0.415;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=238;TCF=132;TCR=106;TR=108;WE=70757628;WS=70757610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,116:0.45:260
chr11	70757705	rs4246962	C	T	1657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.053;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=35;PP=923;ReadPosRankSum=-0.175;SC=ATTAATTATCCGTTTTCCCAG;SOR=0.598;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=206;TCF=104;TCR=102;TR=76;WE=70757713;WS=70757695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,85:0.37:230
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chr11	70766664	rs4495913	A	G	893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=24;PP=709;SC=AAGTCATTAAAAATCAAAAAT;SOR=5.283;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=25;WE=70766672;WS=70766654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	70777553	rs10899691	A	C	8425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=126;NR=158;PP=2965;SC=TACCCCTCCGAACAGCCCTCA;SOR=0.972;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=284;TCF=126;TCR=158;TR=284;WE=70777574;WS=70777543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,306:1.00:306
chr11	70777566	rs12287441	A	G	6760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=87;NR=137;PP=2965;SC=AGCCCTCAGAAGGTGGCAGCG;SOR=1.291;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=224;TCF=87;TCR=137;TR=224;WE=70777574;WS=70777543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr11	70777723	rs10793403	C	T	3053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=41;PP=2038;SC=GCCAGCCCTTCGTAGGTCATC;SOR=1.189;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=65;TCR=41;TR=106;WE=70777731;WS=70777713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr11	70790191	rs79427538	C	T	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.652;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=307;ReadPosRankSum=0.235;SC=GGTAGGCAGTCGACTGCAATT;SOR=1.063;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=44;TCF=6;TCR=38;TR=18;WE=70790199;WS=70790181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,20:0.43:46
chr11	70794485	rs67223333	C	G	1620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.593;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=39;PP=1062;ReadPosRankSum=2.983;SC=GTGGCTCTTACGAGAAACTCC;SOR=0.777;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=139;TCF=62;TCR=77;TR=69;WE=70794493;WS=70794475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,75:0.47:158
chr11	70796256	.	C	T	909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.009;ClippingRankSum=0.000;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.083;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=25;PP=584;ReadPosRankSum=-1.379;SC=CTCTGTCTCCCGGGTTCAAGT;SOR=0.959;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=64;TCF=16;TCR=48;TR=33;WE=70796264;WS=70796246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,39:0.57:68
chr11	71146577	rs909217	G	A	2348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.060;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=49;PP=1434;ReadPosRankSum=-1.414;SC=GCAGGTGGCCGCCGCCACAGG;SOR=0.694;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=201;TCF=104;TCR=97;TR=106;WE=71146585;WS=71146567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,111:0.52:212
chr11	71146691	rs760241	A	G	2297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.263;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=52;PP=1516;ReadPosRankSum=0.708;SC=GCCTCTGCCCATCGGCGGATG;SOR=0.560;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=210;TCF=113;TCR=97;TR=107;WE=71146699;WS=71146681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,112:0.50:222
chr11	71146952	rs1792268	G	A	1178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.051;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=28;PP=690;ReadPosRankSum=0.076;SC=TGTGGGCTCGGGGGCCCAGCG;SOR=1.220;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=104;TCF=50;TCR=54;TR=49;WE=71146960;WS=71146942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,57:0.49:116
chr11	71149069	rs949176	A	G	810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.090;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=22;PP=454;ReadPosRankSum=-0.448;SC=CACTCCACGCAGATGCAGCAG;SOR=0.416;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=67;TCF=19;TCR=48;TR=34;WE=71149077;WS=71149059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,39:0.48:81
chr11	71150217	rs2852853	C	T	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=191;ReadPosRankSum=-0.157;SC=CCAGCACTGGCCCAGGGTCCT;SOR=1.739;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=10;WE=71150225;WS=71150207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr11	71152461	rs949177	A	G	1678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.854;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=37;PP=968;ReadPosRankSum=1.145;SC=CTTGCAGGCCATTGATCTGAT;SOR=0.479;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=141;TCF=59;TCR=82;TR=67;WE=71152469;WS=71152451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,80:0.49:162
chr11	71153459	rs11603330	C	A	2573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.440;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=69;PP=1715;ReadPosRankSum=-0.879;SC=AAGGGGGACGCATAGCAGGAA;SOR=0.804;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=268;TCF=118;TCR=150;TR=119;WE=71153467;WS=71153449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,127:0.45:282
chr11	71155153	rs1790334	A	G	4344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=440;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=106;NR=94;PP=2621;ReadPosRankSum=0.421;SC=CCACAGGGCCAGTCAGGGCGC;SOR=0.658;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=397;TCF=214;TCR=183;TR=200;WE=71155161;WS=71155143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:220,220:0.50:440
chr11	71155171	rs1044482	C	T	4671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=456;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.518;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=105;NR=104;PP=2800;ReadPosRankSum=-1.814;SC=CGCAGCTGTACTGGTCACAAG;SOR=0.694;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=412;TCF=209;TCR=203;TR=209;WE=71155180;WS=71155161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:224,232:0.51:456
chr11	71164471	rs12789751	G	A	729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.513;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=22;PP=444;ReadPosRankSum=0.708;SC=GTGGCGCACGGGCACCGTGGC;SOR=1.217;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=73;TCF=27;TCR=46;TR=32;WE=71164479;WS=71164461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,34:0.43:79
chr11	71164544	rs12791871	A	C	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=105;ReadPosRankSum=0.872;SC=GGCCCTGGGCATGGGATCAGG;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=6;WE=71164552;WS=71164534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr11	71166060	rs2276359	T	TG	1512.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.660;HP=10;HapScore=4;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.930;NF=15;NR=15;PP=664;ReadPosRankSum=-0.374;SC=GTTTGTTTTTTTTTTTATCCT;SOR=0.105;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=23;TCR=24;TR=30;WE=71166068;WS=71166044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,46:0.68:68
chr11	71166337	rs1790373	A	G	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=49;ReadPosRankSum=1.205;SC=CGCCACACCCACTGTTGGGCC;SOR=0.297;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=5;WE=71166345;WS=71166327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,5:0.21:24
chr11	71169547	rs2276360	G	C	1925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.560;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=43;PP=1206;ReadPosRankSum=0.677;SC=AGCGGCCCTTGTGGAGTCTCC;SOR=0.748;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=151;TCF=74;TCR=77;TR=82;WE=71169555;WS=71169537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,90:0.53:171
chr11	71169648	rs2276361	A	G	552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=11.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.94;ReadPosRankSum=2.327;SOR=0.059;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,27:0.73:37
chr11	71174452	rs2276362	A	G	2489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.728;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=55;PP=1561;ReadPosRankSum=-0.112;SC=GGGCAGACACACATGTACCTC;SOR=0.694;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=230;TCF=119;TCR=111;TR=116;WE=71174460;WS=71174442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,127:0.49:257
chr11	71174589	rs1629304	T	C	830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=23;PP=438;ReadPosRankSum=-0.902;SC=GGCTCTCAGCTGAGGGCTGCC;SOR=0.792;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=21;TCR=41;TR=35;WE=71174597;WS=71174579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,41:0.59:70
chr11	71183474	rs2282621	C	T	1722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=0.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.12;ReadPosRankSum=0.721;SOR=0.780;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,48:0.39:122
chr11	71183477	rs2282620	C	T	1722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.36;ReadPosRankSum=0.600;SOR=0.718;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,48:0.40:120
chr11	71183645	rs2282619	T	C	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=46;ReadPosRankSum=-0.303;SC=ATCCAGGTAATGGAAGGCACC;SOR=0.180;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=5;WE=71183653;WS=71183635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr11	71184190	rs7935125	C	A	1161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.596;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=7;PP=899;ReadPosRankSum=-0.166;SC=AGGGCACCCACCTCTTCGGAA;SOR=1.277;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=69;TCF=56;TCR=13;TR=44;WE=71184198;WS=71184180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,45:0.62:72
chr11	71184678	rs7950441	A	C	3743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=51;PP=1822;SC=GCAGCCACCAAGTGCTGCGCA;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=75;TCR=51;TR=126;WE=71184686;WS=71184668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr11	71185479	rs2276354	T	C	4198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=389;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.192;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=80;PP=2295;ReadPosRankSum=-0.163;SC=AGAAGGGTTGTGACGGGGACC;SOR=0.759;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=345;TCF=192;TCR=153;TR=178;WE=71185487;WS=71185456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:186,202:0.52:388
chr11	71185518	rs2186778	T	C	5306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=497;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.092;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=115;NR=116;PP=2776;ReadPosRankSum=-0.002;SC=GTGCCATGATTGCCATGAACG;SOR=0.612;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=446;TCF=230;TCR=216;TR=231;WE=71185526;WS=71185508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:238,258:0.52:496
chr11	71188502	rs3794065	G	A	1201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.652;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=34;PP=700;ReadPosRankSum=-0.711;SC=CCCCTGTTACGGCGGTAGGAG;SOR=0.783;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=136;TCF=52;TCR=84;TR=57;WE=71188521;WS=71188492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,61:0.43:143
chr11	71189436	rs2276353	T	C	1516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.433;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=29;PP=917;ReadPosRankSum=-0.830;SC=AATTTCCTTCTCCAGGAAGTC;SOR=0.926;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=167;TCF=91;TCR=76;TR=72;WE=71189444;WS=71189426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,79:0.44:180
chr11	71192602	rs3814731	T	C	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.767;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=46;ReadPosRankSum=0.544;SC=GCTTAGTCTGTGCTAGCCAGA;SOR=0.057;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=8;WE=71192610;WS=71192592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr11	71192851	rs3814734	A	G	630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.928;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=3;PP=356;ReadPosRankSum=-1.704;SC=GGAAAGTGCTAACACCCACGT;SOR=0.921;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=67;TCF=51;TCR=16;TR=23;WE=71192859;WS=71192841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,30:0.37:81
chr11	71279936	rs72475645	A	C	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FS=13.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQRankSum=-9.775;QD=2.70;ReadPosRankSum=3.147;SOR=1.084;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:170,46:0.21:216
chr11	71279995	rs200834593	C	T	808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FS=10.408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.23;MQRankSum=-5.086;QD=3.93;ReadPosRankSum=-3.470;SOR=1.562;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:171,35:0.17:206
chr11	71280000	.	T	G	742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.780;ClippingRankSum=0.000;DP=197;ExcessHet=3.0103;FS=11.903;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.87;MQRankSum=-5.709;QD=3.77;ReadPosRankSum=-3.011;SOR=1.817;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:168,29:0.15:197
chr11	71290603	rs116567102	C	T	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.054;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=106;ReadPosRankSum=0.210;SC=GGCTGTGCCCCGCACAGGGCC;SOR=0.569;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=6;WE=71290611;WS=71290599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr11	71290670	rs2015464	C	G	1624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=13;PP=922;SC=AAAACAGTCACCCCAGGGCTG;SOR=1.775;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=32;TCR=13;TR=45;WE=71290678;WS=71290660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr11	71290689	rs141497880	G	A	774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-1.096;NF=19;NR=14;PP=440;ReadPosRankSum=-0.893;SC=TGTGATTCACGGCTTTATGCT;SOR=0.712;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=38;TCR=27;TR=33;WE=71290697;WS=71290679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,38:0.55:69
chr11	71290740	rs4081429	A	C	2458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.77;QD=26.44;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr11	71290790	.	A	ACAGCAGCTGGACTGGGAGCAGCAGGACCTG	1168.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.03;QD=64.93;SOR=1.493;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	71290816	.	GCT	ACC	520	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.56;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=27;MQ=40.94;NF=4;NR=9;PP=520;QD=44.1129134509;SC=GAGCAGCAGGGCTTGCAGCAG;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=32;TCF=12;TCR=20;TR=13;WE=71290826;WS=71290806;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:19,13:0.41:32
chr11	71293892	rs75907819	C	A	566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.756;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=10;PP=450;ReadPosRankSum=-1.360;SC=ATGATTCTGGCGGATTGAGAG;SOR=0.611;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=62;TCF=33;TCR=29;TR=24;WE=71293900;WS=71293882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,26:0.36:72
chr11	71498562	rs12786239	G	C	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQRankSum=-2.623;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.587;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr11	71498567	rs12788471	A	C	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQRankSum=-2.260;QD=14.27;ReadPosRankSum=-1.137;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr11	71498591	rs12270466	C	G	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQRankSum=-1.981;QD=10.95;ReadPosRankSum=2.509;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr11	71498601	rs12283300	G	T	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQRankSum=-1.790;QD=11.68;ReadPosRankSum=1.759;SOR=0.648;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr11	71498648	rs12277291	A	G	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.848;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.804;NF=4;NR=4;PP=63;ReadPosRankSum=-0.838;SC=GCTTCCTGGCAGCGCGCGCCC;SOR=1.180;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=16;TCF=9;TCR=7;TR=8;WE=71498656;WS=71498638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr11	71498671	rs12283346	G	C	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.081;HP=3;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=3;PP=33;ReadPosRankSum=0.922;SC=CGCTCCTTCCGCTGGCAGGTG;SOR=0.697;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=6;WE=71498679;WS=71498661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr11	71498694	rs11234942	A	G	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.748;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=22.80;ReadPosRankSum=-0.852;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr11	71507261	rs111708284	A	G	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.317;NF=9;NR=17;PP=391;ReadPosRankSum=1.050;SC=AGCTGTCCCTACAGGACTCCA;SOR=0.627;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=20;TCR=40;TR=26;WE=71507269;WS=71507251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,28:0.41:68
chr11	71576817	rs112808966	GTTT	G	954.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=16.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.29;MQRankSum=-5.739;QD=16.18;ReadPosRankSum=-1.178;SOR=0.642;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,26:0.44:59
chr11	71576840	rs3018297	T	G	723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=16.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.67;MQRankSum=-8.362;QD=9.28;ReadPosRankSum=2.472;SOR=1.104;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,22:0.28:78
chr11	71576841	rs61031502	G	C	723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=19.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.63;MQRankSum=-8.302;QD=9.40;ReadPosRankSum=2.364;SOR=1.096;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,22:0.29:77
chr11	71576918	rs60461859	G	A	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.75;MQRankSum=-7.471;QD=1.91;ReadPosRankSum=-2.264;SOR=0.600;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,12:0.17:71
chr11	71576923	rs138059322	T	TAAAC	107.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.96;MQRankSum=-7.297;QD=1.56;ReadPosRankSum=-2.313;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,11:0.16:69
chr11	71627159	rs80164817	C	A	1194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=24;PP=709;ReadPosRankSum=2.328;SC=AGGGACCCACCACAGAGTCAT;SOR=0.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=50;TCR=44;TR=51;WE=71627167;WS=71627149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,56:0.54:104
chr11	71630226	rs3763797	C	A	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-3.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=69;ReadPosRankSum=0.424;SC=ATACTGTTATCATGTGCCAAG;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=6;WE=71630234;WS=71630216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr11	71668362	rs3216157	CT	C	4922.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=67;PP=2951;SC=GTTAACCCAGCTTAATTGAGT;SOR=1.205;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=77;TCF=8;TCR=69;TR=75;WE=71668370;WS=71668352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr11	71671692	rs78708286	G	C	687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=6;PP=504;ReadPosRankSum=-1.290;SC=ATGAAGCAGGGAATGTGTTCT;SOR=0.748;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=42;TCF=34;TCR=8;TR=28;WE=71671700;WS=71671682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,29:0.66:44
chr11	71701502	rs2276385	G	C	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.113;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=44;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=145;ReadPosRankSum=0.626;SC=ACAGCAGACTGGATTTGGTCA;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=9;WE=71701510;WS=71701492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr11	71701523	rs2276384	G	A	910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.95;SOR=4.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	71701523	.	GCACTTGCTC	ACACTTGCTC,ACACTTGCTT	337	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.03;FR=0.5000,0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=22,11;NR=2,1;PP=337,214;QD=15.4904671895;SC=TAGTTTGCCCGCACTTGCTCT;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=24,12;WE=71701540;WS=71701513;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:24
chr11	71701532	rs2276383	C	T	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=4.781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.32;ReadPosRankSum=-0.320;SOR=0.113;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr11	71701763	rs35844388	G	A	1299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=29;PP=840;ReadPosRankSum=1.476;SC=CTACCATAGGGGTAAGTTCAT;SOR=0.648;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=109;TCF=49;TCR=60;TR=54;WE=71701771;WS=71701753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,60:0.48:124
chr11	71706455	rs76950159	C	T	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.359;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=377;ReadPosRankSum=2.734;SC=GCTGGAGTGCCGCCCTGGCTC;SOR=2.655;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=46;TCF=38;TCR=8;TR=19;WE=71706463;WS=71706445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,20:0.42:48
chr11	71706544	rs34075366	A	G	1578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.837;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=33;PP=958;ReadPosRankSum=1.320;SC=GAAAGAAGCAAACGTGTCCCT;SOR=0.541;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=164;TCF=88;TCR=76;TR=67;WE=71706552;WS=71706534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,78:0.42:185
chr11	71706746	rs78736687	G	A	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.896;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=118;ReadPosRankSum=1.381;SC=TGCTAGTCCTGCCCCCATGAT;SOR=0.818;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=8;WE=71706754;WS=71706736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr11	71707102	rs79664808	C	T	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=234;ReadPosRankSum=0.373;SC=TGAGGCTGGGCCCTTCCAGAA;SOR=0.324;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=13;WE=71707110;WS=71707092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr11	71707465	rs1055452	T	C	530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.17;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	71707465	.	TG	CG,CT	186	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000,0.5000;HP=5;HapScore=3;MGOF=14;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=1,1;NR=13,4;PP=186,20;QD=15.7693723248;SC=CTCAAAGGGGTGCTTGGGCCA;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14,5;WE=71707474;WS=71707455;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:14
chr11	71707466	rs185304890	G	T	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.74;ReadPosRankSum=0.398;SOR=0.072;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr11	71712175	rs1892919	G	A	609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=414;ReadPosRankSum=-1.982;SC=GAGCTGGCAGGGAGGGCACAG;SOR=0.877;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=51;TCF=43;TCR=8;TR=23;WE=71712183;WS=71712165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,25:0.45:56
chr11	71714526	rs949324	G	C	7957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.27;SOR=1.489;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr11	71714526	.	GGT	CGG	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=97;NR=37;PP=2947;QD=20;SC=GACCAGGTGAGGTCAGCATCG;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=144;TCF=100;TCR=44;TR=134;WE=71714536;WS=71714516;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:10,134:0.93:144
chr11	71714528	rs949323	T	G	7957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.25;SOR=1.533;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr11	71715215	rs2845857	C	G	2068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FS=2.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.85;ReadPosRankSum=0.989;SOR=0.617;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,91:0.57:161
chr11	71715218	rs2852365	T	C	5893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.30;SOR=0.718;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr11	71717106	rs61745941	G	A	1134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.617;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=15;PP=816;ReadPosRankSum=2.746;SC=TGGACACCCCGGCCTGGGAAC;SOR=0.887;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=100;TCF=71;TCR=29;TR=50;WE=71717114;WS=71717096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,51:0.46:110
chr11	71719328	rs111494297	C	CT	30.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.598;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=31;ReadPosRankSum=-0.842;SC=TCCAAGGTTCCTTTTTTTTTC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=3;WE=71719336;WS=71719318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr11	71719619	rs2155145	G	T	1169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=8;PP=794;SC=CCCGTTTTTCGTTATTCTTCT;SOR=2.191;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=29;TCR=8;TR=37;WE=71719627;WS=71719609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr11	71720244	.	AGGGT	A	52	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=1;NR=1;PP=52;QD=35.0;SC=GTGGGCAGAGAGGGTGGGTGG;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=14;TCF=6;TCR=8;TR=2;WE=71720255;WS=71720234;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:12,2:0.14:14
chr11	71721757	rs78266495	C	G	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=4;PP=78;ReadPosRankSum=-1.858;SC=CCCGACACCCCCCACGGCCCC;SOR=0.141;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=10;WE=71721765;WS=71721747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr11	71726168	rs3750913	G	C	2402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.608;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=49;PP=1629;ReadPosRankSum=-0.235;SC=GTGCTGGGCAGCCATGGCCTC;SOR=0.495;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=203;TCF=96;TCR=107;TR=102;WE=71726176;WS=71726158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,109:0.51:214
chr11	71727422	rs1057992	A	C	768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=6;PP=584;SC=CACACCAACCAGCAGCACACA;SOR=2.215;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=24;WE=71727430;WS=71727412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	71728543	rs34393610	G	GA	787.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=1.804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.59;MQRankSum=3.279;QD=7.29;ReadPosRankSum=-1.003;SOR=0.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,40:0.37:108
chr11	71728908	rs11278712	AGTCAAC	A	377.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=391;ReadPosRankSum=-0.219;SC=CATCACCCAGAGTCAACGCTG;SOR=0.716;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=8;WE=71728922;WS=71728898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
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chr11	71730715	rs2298456	T	A	720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=20;PP=405;ReadPosRankSum=2.409;SC=TAAGAAGGTGTAAAGATTTGC;SOR=0.582;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=19;TCR=42;TR=29;WE=71730723;WS=71730705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,34:0.48:71
chr11	71733519	rs10128658	C	T	754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.604;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=19;PP=406;ReadPosRankSum=1.289;SC=CTTCTCAGTGCCCCCATTCTG;SOR=0.255;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=66;TCF=25;TCR=41;TR=35;WE=71733527;WS=71733509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,37:0.54:69
chr11	71734211	rs2298457	T	C	1252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.157;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=22;PP=690;ReadPosRankSum=0.699;SC=GACAACAACGTAGAAAACAGG;SOR=0.672;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=112;TCF=61;TCR=51;TR=53;WE=71734219;WS=71734201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,62:0.47:131
chr11	71740378	rs35948003	A	AAC	3484.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.664;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.158;NF=11;NR=34;PP=1794;ReadPosRankSum=-1.788;SC=CGTTAGAAGCAACATGGTTTG;SOR=0.724;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=116;TCF=26;TCR=90;TR=45;WE=71740386;WS=71740368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,94:0.43:218
chr11	71740521	rs1939247	A	T	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-2.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=261;ReadPosRankSum=1.041;SC=AGCCACCTGAAATGCAACCAT;SOR=0.631;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=16;WE=71740529;WS=71740511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr11	71797422	rs597513	T	A	3555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.908;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=73;PP=1982;ReadPosRankSum=0.345;SC=CAGCAAGCACTCAACAAATGT;SOR=0.595;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=280;TCF=139;TCR=141;TR=152;WE=71797430;WS=71797412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,171:0.56:305
chr11	71804513	rs2250866	G	A	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=40;ReadPosRankSum=0.656;SC=AAGCAAAGATGATACCCAAGT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=4;WE=71804521;WS=71804503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr11	71805732	rs34329029	T	TGA	703.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.736;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=467;ReadPosRankSum=0.643;SC=CAACTAAGGCTGAGAGAGGCA;SOR=1.519;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=34;TCF=20;TCR=14;TR=14;WE=71805740;WS=71805722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,20:0.43:46
chr11	71816092	rs12293885	T	A	1613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=39;PP=980;ReadPosRankSum=0.172;SC=GTTCCCAAGCTCACCAGTTCA;SOR=0.732;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=172;TCF=86;TCR=86;TR=75;WE=71816100;WS=71816074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,82:0.42:194
chr11	71816219	rs12272213	G	A	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.176;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=216;ReadPosRankSum=-0.615;SC=TGGATGAGGAGGAGAATGGTC;SOR=0.255;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=13;WE=71816227;WS=71816209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr11	71821236	rs17161980	A	G	1481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=36;PP=922;ReadPosRankSum=-0.135;SC=TATCCTCATCATCTTCATCAT;SOR=0.718;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=151;TCF=74;TCR=77;TR=71;WE=71821244;WS=71821226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,75:0.45:168
chr11	71822165	rs144948522	G	GTGCTGGGGTCTCTGTCTA,GGGTCTCTGTCTA	200.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.882;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.830;NF=2;NR=0;PP=47;ReadPosRankSum=-0.973;SC=GTCTCTGTCTGTGCTGAGGTC;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=2;WE=71822173;WS=71822155;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.46:13
chr11	71822401	rs3750908	A	G	1597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=32;PP=842;ReadPosRankSum=0.870;SC=AATTTGATTTAGGGATAGGGT;SOR=0.689;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=47;TCR=51;TR=62;WE=71822409;WS=71822391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,73:0.65:112
chr11	71847080	rs1802609	C	A	1397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.393;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.693;NF=37;NR=25;PP=962;ReadPosRankSum=2.522;SC=CAGGAGTGCGCGGGCCAGGAC;SOR=0.861;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=75;TCR=50;TR=62;WE=71847088;WS=71847070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,66:0.50:133
chr11	71847285	rs74710964	C	T	1351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=36;PP=783;ReadPosRankSum=-0.213;SC=AGGGGAGGGGCGGCCAGGGCC;SOR=0.623;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=114;TCF=36;TCR=78;TR=54;WE=71847293;WS=71847275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,63:0.50:126
chr11	71849741	rs652197	C	T	135.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=36;ReadPosRankSum=-0.319;SC=TTATTTGAGCCCAGGATGTTG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=71849749;WS=71849731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr11	71850156	rs139130389	C	CTA	8783.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=1.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=491;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.437;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.865;NF=15;NR=82;PP=2964;ReadPosRankSum=0.225;SC=ACAGCTGTCTCTGAGTGCTCA;SOR=0.848;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=234;TCF=32;TCR=202;TR=97;WE=71850164;WS=71850146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:252,228:0.47:480
chr11	71850722	rs1802608	C	T	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.580;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=486;ReadPosRankSum=-0.182;SC=TCTGGAGCCACTCCTTCAAGG;SOR=0.934;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=22;TCF=13;TCR=9;TR=11;WE=71850742;WS=71850712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr11	71850734	rs193208888	C	T	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=499;ReadPosRankSum=0.225;SC=CCTTCAAGGTCAGCAACTATA;SOR=0.760;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=32;TCF=20;TCR=12;TR=17;WE=71850742;WS=71850712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr11	71883525	rs112742485	C	G	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=10.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.91;MQRankSum=-5.047;QD=0.92;ReadPosRankSum=-1.159;SOR=1.835;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,19:0.14:134
chr11	71883540	rs633738	G	A	2441.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.934;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=5.860;NF=49;NR=49;PP=1507;ReadPosRankSum=1.022;SC=TGGCTTTGGTGACTGCTGCGG;SOR=0.089;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=111;TCF=51;TCR=60;TR=98;WE=71883548;WS=71883530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,104:0.90:116
chr11	71929526	rs651646	T	A	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=56;ReadPosRankSum=-0.508;SC=CACCGTAGGGTTGGGGAGACT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=4;WE=71929534;WS=71929516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr11	71932120	rs2508202	G	C	1278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.946;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=40;PP=1265;ReadPosRankSum=0.688;SC=GTCTCCCCCCGACCCACCCCA;SOR=2.019;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=50;TCF=7;TCR=43;TR=46;WE=71932128;WS=71932109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,53:0.93:57
chr11	71936225	rs144989913	GGCTCCTTGCGGGCTGGCGTGGACCGGGA	G	136.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=1734;ReadPosRankSum=1.057;SC=GTGGGGCGGGGGCTCCTTGCG;SOR=1.075;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=4;WE=71936260;WS=71936215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr11	72281818	rs380126	A	G	2421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.144;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=41;PP=1305;ReadPosRankSum=-0.784;SC=GAATCCCAACACTCATCCTGC;SOR=0.873;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=230;TCF=124;TCR=106;TR=103;WE=72281826;WS=72281808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,122:0.47:261
chr11	72281884	rs433640	C	T	3032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.846;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=62;PP=1931;ReadPosRankSum=-0.241;SC=AGCAGGGATTCGCTGTATGGG;SOR=0.810;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=270;TCF=142;TCR=128;TR=140;WE=72281892;WS=72281874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,145:0.50:291
chr11	72281941	rs79982683	A	G	2238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.468;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=52;PP=1300;ReadPosRankSum=2.159;SC=AGGAGTGCAAACCTCAGTCAG;SOR=0.759;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=225;TCF=108;TCR=117;TR=99;WE=72281949;WS=72281931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,111:0.45:246
chr11	72282039	rs409512	T	C	4896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=77;PP=2957;SC=CCTTCATTCCTGCCCCAACCC;SOR=0.821;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=172;TCF=95;TCR=77;TR=172;WE=72282047;WS=72282029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr11	72288599	rs1980091	G	A	1295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.676;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.529;NF=20;NR=33;PP=682;ReadPosRankSum=-0.063;SC=CCACGCGCTCGTACAGCTCTG;SOR=0.485;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=97;TCF=34;TCR=63;TR=53;WE=72288607;WS=72288589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,61:0.57:107
chr11	72288650	rs3842266	TG	T	456.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=4;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.519;NF=0;NR=15;PP=674;ReadPosRankSum=-0.557;SC=TGCGGGTGCATGGGGGGCAGA;SOR=0.856;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=15;WE=72288672;WS=72288640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr11	72288664	rs1980090	C	T	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=664;ReadPosRankSum=-0.066;SC=GGGCAGAGGGCGAGAGGCCAG;SOR=0.527;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=14;WE=72288672;WS=72288640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr11	72289176	rs379276	C	G	313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=3;PP=236;SC=ATCAGTTGGACCTGGGCCAGG;SOR=1.802;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=11;WE=72289184;WS=72289166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	72289291	rs1135029	T	C	1585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=25;PP=835;ReadPosRankSum=0.958;SC=AGATGGGCATTGCAATGTGCT;SOR=0.659;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=134;TCF=85;TCR=49;TR=69;WE=72289299;WS=72289281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,73:0.50:145
chr11	72290199	rs11605051	G	A	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.616;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=482;ReadPosRankSum=0.000;SC=TCTGCCTGGGGGGGGCCGTGC;SOR=1.609;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=55;TCF=34;TCR=21;TR=23;WE=72290207;WS=72290189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,25:0.43:58
chr11	72290629	rs392565	G	A	995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.28;ReadPosRankSum=-0.624;SOR=0.574;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,48:0.64:75
chr11	72291477	rs56350365	G	A	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=104;ReadPosRankSum=-1.172;SC=CCAGGAAAATGAGCCAGACAT;SOR=0.512;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=8;WE=72291485;WS=72291467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr11	72291883	rs644698	C	A	807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=3;PP=565;SC=ATGAGACTCCCAGACACCCCA;SOR=3.098;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=23;WE=72291891;WS=72291873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	72291927	rs577536	T	C	1960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=13;PP=1332;SC=GGCAGGGTCTTACCGAGGCCA;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=46;TCR=13;TR=59;WE=72291935;WS=72291917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr11	72292167	rs3781939	G	T	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=4.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.14;ReadPosRankSum=-0.801;SOR=0.172;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr11	72292176	rs7108477	C	T	729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.49;SOR=1.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	72292185	rs3781938	C	A	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.78;ReadPosRankSum=1.664;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr11	72292353	rs57803658	G	GA	5332.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=33;PP=2970;SC=CTGTCCCAGGGAGGGGACCCC;SOR=1.500;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=52;TCR=36;TR=79;WE=72292361;WS=72292343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr11	72292860	rs376724	C	T	1142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=11;PP=663;SC=CCGGGGGCAACGGATGTGACA;SOR=2.093;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=27;TCR=11;TR=38;WE=72292868;WS=72292850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr11	72293039	rs379638	G	A	2438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.22;SOR=0.953;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr11	72293079	rs414178	A	G	1728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=36;PP=1118;SC=CCACACTCAAAATCTGGAGTC;SOR=1.727;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=21;TCR=36;TR=57;WE=72293087;WS=72293069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr11	72293602	rs4944557	A	G	3726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=69;PP=2123;SC=TATACTCATCATCGGAGACCT;SOR=1.032;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=125;TCF=56;TCR=69;TR=125;WE=72293610;WS=72293592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr11	72294440	rs426907	G	A	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=120;ReadPosRankSum=-0.558;SC=CTGGGTCCCCGGGGAATCTGG;SOR=0.892;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=24;TCF=16;TCR=8;TR=10;WE=72294448;WS=72294430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr11	72294714	rs408269	C	T	257.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=7;PP=168;SC=AGTAAAGACCCCACCCCCACT;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=72294722;WS=72294704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	72294734	rs56267207	A	AC	58.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=3;PP=77;SC=TTTCATCCAGACCCCGCGCCG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=3;WE=72294742;WS=72294724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr11	72295502	rs366711	T	C	8071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=135;NR=152;PP=2965;SC=TCCGGGACGCTGGAGGCGGTG;SOR=0.912;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=287;TCF=135;TCR=152;TR=287;WE=72295510;WS=72295492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,311:1.00:311
chr11	72295906	rs452228	A	G	6273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=116;PP=2965;SC=CTCCCTCCACACCCTCTCACC;SOR=0.927;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=220;TCF=102;TCR=118;TR=218;WE=72295914;WS=72295896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr11	72296039	rs907850	G	T	827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.049;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=24;PP=549;ReadPosRankSum=1.214;SC=CCCTCTGATCGCCCTCACGTC;SOR=0.941;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=58;TCF=20;TCR=38;TR=35;WE=72296047;WS=72296029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,37:0.59:63
chr11	72296700	rs424234	C	T	2099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=46;PP=1393;SC=TATCCAACCTCCTGCCTCCAA;SOR=1.810;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=22;TCR=46;TR=68;WE=72296708;WS=72296690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr11	72301503	rs341047	G	A	2745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.816;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=53;PP=1402;ReadPosRankSum=-1.805;SC=GTCGCGGTCGGTGTACGCCGC;SOR=0.533;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=218;TCF=112;TCR=106;TR=114;WE=72301511;WS=72301493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,134:0.54:246
chr11	72302191	rs429075	C	G	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=3.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=334;ReadPosRankSum=0.379;SC=GGCCCAGAGACGTTTAGTGAC;SOR=0.997;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=15;WE=72302199;WS=72302181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr11	72307501	rs66461485	ATCTCTCTCTCTCTC	A	234.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=18.06;ReadPosRankSum=-0.792;SOR=1.108;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr11	72307528	rs57087192	T	A	149.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.501;HP=2;HapScore=3;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=4;PP=99;ReadPosRankSum=2.590;SC=TCTCTCTCTCTCACACACACA;SOR=1.108;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=8;WE=72307536;WS=72307491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr11	72307742	rs1877652	G	A	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.232;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=440;ReadPosRankSum=0.327;SC=GCGAGGCTCAGAGATACCGAG;SOR=1.049;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=54;TCF=19;TCR=35;TR=24;WE=72307750;WS=72307732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,30:0.48:62
chr11	72308511	rs142826924	TCCCTGC	T	608.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=485;ReadPosRankSum=-0.067;SC=CCACAGTCCCTCCCTGCCCCT;SOR=0.990;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=9;WE=72308524;WS=72308501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,16:0.70:23
chr11	72309540	rs4943939	C	T	2296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=39;PP=1488;ReadPosRankSum=-0.721;SC=GCTCATCCCGCTTAATTAAGC;SOR=0.698;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=188;TCF=117;TCR=71;TR=101;WE=72309548;WS=72309530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,108:0.52:208
chr11	72326210	rs572421	A	G	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.052;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=11;PP=196;ReadPosRankSum=1.912;SC=GGGTGTCCCCATCCACAGGAG;SOR=0.965;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=64;TCF=29;TCR=35;TR=22;WE=72326218;WS=72326200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,25:0.35:72
chr11	72361893	rs72349218	TCCCTGAC	T	1537.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=125;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=25;NR=4;PP=1125;SC=TTAGAGTCAGTCCCTGACCCC;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=29;WE=72361907;WS=72361883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	72361920	.	TACACACACACACACACACAC	T,TAC	2175.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;ClippingRankSum=0.000;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=4.206;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=38.17;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:2,16,39:0.28,0.68:57
chr11	72399451	rs7944294	A	G	2564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=55;NR=33;PP=1507;SC=ATCAGTTCTGAGCCCCCATAA;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=57;TCR=34;TR=88;WE=72399459;WS=72399441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr11	72404003	rs11235567	A	G	883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=20;PP=624;SC=AATGAGGGAGAAGGGTGGCCC;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=25;WE=72404011;WS=72403993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	72404958	rs12276972	A	C	1915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=23;NR=38;PP=1115;SC=CTCCAACCATATGCAAGTGCC;SOR=1.418;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=23;TCR=38;TR=61;WE=72404966;WS=72404948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr11	72405868	rs2306608	C	T	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=244;ReadPosRankSum=0.602;SC=TGCCAGCACCCTATCACCACC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=12;WE=72405876;WS=72405858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr11	72407770	rs2306612	G	C	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.965;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=18;PP=394;ReadPosRankSum=-0.651;SC=CTGGGCTGCTGTGCCTCTCAT;SOR=0.560;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=25;TCR=42;TR=29;WE=72407778;WS=72407760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,30:0.45:66
chr11	72407977	rs11602233	C	A	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.361;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=404;ReadPosRankSum=1.154;SC=CGCAGGAGTCCGGAGGGATGG;SOR=1.002;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=35;TCR=9;TR=24;WE=72407985;WS=72407967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,25:0.56:45
chr11	72408055	rs56200889	G	C	1393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.66;ReadPosRankSum=-0.509;SOR=0.648;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,72:0.45:161
chr11	72408657	rs2291289	C	T	1300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=24;PP=615;ReadPosRankSum=1.071;SC=TTCGCTCCACCAGCACCAGCA;SOR=0.758;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=100;TCF=51;TCR=49;TR=49;WE=72408665;WS=72408647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,61:0.51:120
chr11	72409189	rs12575364	C	T	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.490;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=321;ReadPosRankSum=-0.838;SC=CATCAGCCAACGGCACTGCCT;SOR=0.339;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=41;TCF=9;TCR=32;TR=22;WE=72409197;WS=72409179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,25:0.56:45
chr11	72411082	rs7110501	T	C	1520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.584;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=21;PP=845;ReadPosRankSum=0.202;SC=CAGAAGCATCTATCACTCTGT;SOR=0.784;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=144;TCF=91;TCR=53;TR=62;WE=72411090;WS=72411072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,75:0.45:168
chr11	72411099	rs10898866	C	T	1668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=29;PP=793;ReadPosRankSum=0.809;SC=CTGTACTCTGCCTCCTGCTAC;SOR=0.656;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=164;TCF=96;TCR=68;TR=72;WE=72411107;WS=72411089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,86:0.45:190
chr11	72412675	rs11235574	A	G	595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.830;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=2;PP=421;ReadPosRankSum=-1.540;SC=GCTAAAGCAGAGTCTGGGGTG;SOR=1.850;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=44;TCF=37;TCR=7;TR=22;WE=72412683;WS=72412665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
chr11	72414189	rs3765105	G	A	1137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.897;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=30;PP=799;ReadPosRankSum=-1.078;SC=AAGGGGCTACGGGGGAGGAGA;SOR=0.464;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=82;TCF=30;TCR=52;TR=49;WE=72414197;WS=72414179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,50:0.59:85
chr11	72416732	rs4598696	GG	CT	1181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;JOINED;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=3;PP=1084;ReadPosRankSum=0.609;SC=TTATCACAAAGGGTCTCTTCC;SOR=0.678;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=52;TCF=47;TCR=5;TR=27;WE=72416741;WS=72416722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,30:0.55:55
chr11	72438259	rs113714856	G	A	1283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=30;PP=754;ReadPosRankSum=0.795;SC=CAGGGCTGCCGAGGATTGGTC;SOR=0.736;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=112;TCF=50;TCR=62;TR=54;WE=72438267;WS=72438249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,63:0.49:129
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chr11	72528973	rs891655	C	T	833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=23;PP=619;SC=ACGGGTACTCCTGTGTTTGCT;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=29;WE=72528981;WS=72528963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr11	72532569	rs1864651	G	T	3683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=74;NR=56;PP=2060;SC=CCTGTGCAAGGTCCCAAACCT;SOR=0.794;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=74;TCR=56;TR=130;WE=72532577;WS=72532559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr11	72532621	rs1864652	T	G	3678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=63;PP=2150;ReadPosRankSum=-0.749;SC=GGCGGGCAGGTGAGCAGCCGA;SOR=0.317;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=125;TCF=61;TCR=64;TR=124;WE=72532629;WS=72532611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,138:0.99:139
chr11	72532708	rs11235603	C	T	1017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=23;PP=702;SC=CCTGTCCGCCCCCAGATGGCC;SOR=1.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=12;TCR=23;TR=35;WE=72532716;WS=72532698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr11	72533711	rs4944806	A	G	1347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=20;NR=20;PP=1040;SC=ATGTGGTCGGAGCCCACGAGA;SOR=0.836;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=20;TCR=20;TR=40;WE=72533719;WS=72533701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr11	72535083	rs112951181	A	C	2786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.501;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=49;PP=1602;ReadPosRankSum=-0.924;SC=CCCTTAGCATATCTCTCTTGG;SOR=0.740;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=195;TCF=111;TCR=84;TR=114;WE=72535091;WS=72535073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,125:0.58:216
chr11	72536272	rs2303969	G	A	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=189;ReadPosRankSum=-0.787;SC=CACAGGCACCGGTAAGAGGGC;SOR=0.760;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=13;WE=72536280;WS=72536262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr11	72538141	rs3862793	T	C	1018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=4;PP=878;SC=GGGAGGACACTGGGTTCTGGG;SOR=3.611;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=34;WE=72538149;WS=72538131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	72540225	rs891657	G	T	2013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=29;PP=1086;SC=GAGCTAACTTGACAGATGAGG;SOR=0.887;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=41;TCR=29;TR=70;WE=72540233;WS=72540215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr11	72552056	rs111883118	T	A	1073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.781;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=27;PP=614;ReadPosRankSum=1.050;SC=TGAGCAATAATGCTGATGCAA;SOR=0.869;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=89;TCF=32;TCR=57;TR=41;WE=72552064;WS=72552046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,50:0.49:103
chr11	72554407	rs3217361	A	AGGG	6898.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=1.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=396;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.189;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=57;PP=2973;ReadPosRankSum=0.887;SC=ACAAGTTTACACACACAATTT;SOR=0.764;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=198;TCF=40;TCR=158;TR=75;WE=72554415;WS=72554395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:210,179:0.46:389
chr11	72598704	rs7129851	G	A	784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=23;PP=634;SC=ATAATTCAAAGGGCTTTAGTG;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=72598712;WS=72598694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	72788823	rs6592510	C	T	4169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=67;NR=79;PP=2385;SC=ATTATAAGGACACACAGGAAA;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=146;TCF=67;TCR=79;TR=146;WE=72788831;WS=72788813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr11	72945341	rs2511241	C	T	6219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=124;NR=97;PP=2965;SC=GTGTGCGTGCCTGGGCTGTGT;SOR=0.809;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=221;TCF=124;TCR=97;TR=221;WE=72945349;WS=72945331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr11	72946020	rs1783596	C	T	3499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.279;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=80;PP=2087;ReadPosRankSum=-1.306;SC=ACTCCTTCCGCTCGCTGGACC;SOR=0.790;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=304;TCF=149;TCR=155;TR=152;WE=72946028;WS=72946010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,171:0.50:340
chr11	72946140	rs3741156	G	C	2500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.484;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=47;PP=1569;ReadPosRankSum=0.700;SC=CTGGGCAGAGGCTCGTACGCT;SOR=0.746;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=208;TCF=111;TCR=97;TR=102;WE=72946148;WS=72946130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,114:0.50:227
chr11	73007854	rs11235715	C	T	2508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.449;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=63;PP=1603;ReadPosRankSum=-0.231;SC=TTGGCGACTTCGCCTGCCGCC;SOR=0.804;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=263;TCF=121;TCR=142;TR=112;WE=73007862;WS=73007844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,122:0.44:277
chr11	73074548	rs11235726	C	A	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.377;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=196;ReadPosRankSum=0.776;SC=ACTCTGAGCTCCCTGCTCTGG;SOR=1.099;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=32;TCF=14;TCR=18;TR=15;WE=73074556;WS=73074538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr11	73105746	rs147659360	G	C	1536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.614;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=34;PP=915;ReadPosRankSum=-1.117;SC=AAGGCAGGGCGTCAGGGCGAG;SOR=0.593;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=128;TCF=57;TCR=71;TR=62;WE=73105754;WS=73105736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,71:0.48:149
chr11	73362766	rs670811	C	T	2294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.189;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=39;PP=1487;ReadPosRankSum=-0.415;SC=CTATTCCTGTCCCTGCTTTAC;SOR=0.928;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=183;TCF=109;TCR=74;TR=99;WE=73362774;WS=73362756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,106:0.52:204
chr11	73364368	rs6592527	C	G	644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=295;ReadPosRankSum=0.654;SC=TCCAGCTGCTCCTCACAACAG;SOR=0.648;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=53;TCF=40;TCR=13;TR=25;WE=73364376;WS=73364358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,31:0.49:63
chr11	73364629	rs7942217	T	A	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=310;ReadPosRankSum=0.498;SC=ATTTGCAGTGTCTGGCCCTTT;SOR=0.961;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=38;TCF=8;TCR=30;TR=19;WE=73364637;WS=73364619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,21:0.50:42
chr11	73364673	rs7952228	G	A	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=89;ReadPosRankSum=1.769;SC=GGCTTAAACCGAGGACTGAAG;SOR=0.124;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=7;WE=73364681;WS=73364663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr11	73366697	rs2008734	G	A	633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.152;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=6;PP=443;ReadPosRankSum=0.989;SC=GTTACCATGAGCTGAGGAGAA;SOR=1.003;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=61;TCF=46;TCR=15;TR=28;WE=73366705;WS=73366687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,28:0.46:61
chr11	73390772	rs71469461	GAA	G	4353.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.403;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.683;NF=7;NR=60;PP=2460;ReadPosRankSum=-0.155;SC=AGAGCTGTGGGAAAGAGAGAA;SOR=0.487;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=114;TCF=8;TCR=106;TR=67;WE=73390781;WS=73390762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,114:0.59:192
chr11	73441743	rs72976849	T	A	970.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.71;ReadPosRankSum=0.288;SOR=0.743;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,49:0.49:100
chr11	73441772	rs2037709	A	C	3189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=42;PP=2080;SC=ACTTGTAACAAAAAATAGACA;SOR=1.028;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=64;TCR=42;TR=106;WE=73441780;WS=73441762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr11	73441913	rs72976851	T	C	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=70;ReadPosRankSum=0.220;SC=ACACATTACATTGGGTTCTCA;SOR=0.646;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=7;WE=73441921;WS=73441903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,8:0.25:32
chr11	73471036	rs72976884	C	T	1727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=34;PP=1183;ReadPosRankSum=-1.584;SC=ATGGCCCAGACTAATTTCCCA;SOR=0.694;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=180;TCF=108;TCR=72;TR=85;WE=73471044;WS=73471026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,87:0.46:188
chr11	73498933	rs1792174	T	G	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.481;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=200;ReadPosRankSum=2.115;SC=AGGCCGTTCCTTCAGTGTTTT;SOR=1.048;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=15;WE=73498941;WS=73498923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,16:0.41:39
chr11	73499066	.	C	CGGGGAGATGGCGGACGGTGCAGAGA	990.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.008;ClippingRankSum=0.000;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=5.373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.07;MQRankSum=6.502;QD=15.48;ReadPosRankSum=0.395;SOR=1.467;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,27:0.42:64
chr11	73528717	rs1670564	G	C	2911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=38;PP=1930;SC=CTGGAGAATAGTAGTCCCTAG;SOR=1.157;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=98;TCF=59;TCR=39;TR=96;WE=73528725;WS=73528707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr11	73669310	rs10793068	C	A	2153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=46;PP=1439;ReadPosRankSum=-0.529;SC=CTCTGGTCCGCCCTCAGAAAC;SOR=0.675;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=235;TCF=131;TCR=104;TR=98;WE=73669318;WS=73669300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,107:0.40:269
chr11	73669334	rs10793069	A	C	2477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.350;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=58;PP=1433;ReadPosRankSum=-1.423;SC=CCAGCTGATAAGACTTGTATT;SOR=0.631;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=279;TCF=148;TCR=131;TR=118;WE=73669342;WS=73669324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:192,129:0.40:321
chr11	73670645	rs653263	T	C	1430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.614;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=26;PP=906;ReadPosRankSum=-0.191;SC=ACGTCTTCCATGGCAAACCTG;SOR=0.797;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=141;TCF=86;TCR=55;TR=68;WE=73670653;WS=73670635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,70:0.47:150
chr11	73670795	rs148856834	ATTATT	A	1362.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=4.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.29;MQRankSum=1.990;QD=16.22;ReadPosRankSum=1.213;SOR=1.284;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,37:0.44:84
chr11	73675810	.	CTGTGTGTGTG	C	66	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=66;QD=34.5;SC=GATAGGGAGGCTGTGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=2;WE=73675827;WS=73675800;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:1,2:0.67:3
chr11	73679219	rs2306817	G	C	999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.120;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=14;PP=1441;ReadPosRankSum=0.511;SC=TAAGCTTCTCGGGCTTCTAAT;SOR=0.463;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=64;TCF=46;TCR=18;TR=41;WE=73679240;WS=73679209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,44:0.62:71
chr11	73679232	rs2306818	A	G	1138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.873;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=16;PP=1441;ReadPosRankSum=1.043;SC=CTTCTAATCCATCTGGGCTAT;SOR=0.452;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=80;TCF=58;TCR=22;TR=48;WE=73679240;WS=73679209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,52:0.58:89
chr11	73681090	rs2306819	C	T	3180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.732;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=71;PP=1970;ReadPosRankSum=-0.324;SC=TCATCTTCTTCGACATCCAGT;SOR=0.907;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=250;TCF=124;TCR=126;TR=134;WE=73681098;WS=73681080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,148:0.53:278
chr11	73681135	rs72982975	G	A	2296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=54;PP=1296;ReadPosRankSum=0.412;SC=AGAAGCAGATGCTGCGCCAGG;SOR=0.696;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=181;TCF=85;TCR=96;TR=98;WE=73681143;WS=73681125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,111:0.53:208
chr11	73685896	.	A	AGAAAGAGGGAAGGTGGTAGGTAAAGGAGCGGAAGGAAGAGGTGGG	992.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.273;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=3.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=45.12;ReadPosRankSum=1.237;SOR=0.117;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,4:0.18:22
chr11	73686859	rs10535527	ACTT	A	364.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.260;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=306;ReadPosRankSum=0.706;SC=GTAATCCAGGACTTCTTTTGG;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=8;WE=73686869;WS=73686849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr11	73689104	rs660339	G	A	2653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.473;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=53;PP=1534;ReadPosRankSum=-0.896;SC=CTGGGCGCTGGCTGTAGCGCG;SOR=0.709;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=204;TCF=104;TCR=100;TR=109;WE=73689112;WS=73689094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,124:0.52:237
chr11	73715542	rs2075577	G	A	949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.497;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=13;PP=578;ReadPosRankSum=-2.567;SC=TGAGCAGGTGGTAGTCCAGCA;SOR=1.012;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=101;TCF=63;TCR=38;TR=41;WE=73715550;WS=73715532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,47:0.42:113
chr11	73715666	rs2734828	G	A	1970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=43;PP=1121;ReadPosRankSum=0.200;SC=TGTGAAATGGGTGGGGAGGGA;SOR=0.682;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=140;TCF=66;TCR=74;TR=82;WE=73715683;WS=73715656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,92:0.59:156
chr11	73717024	rs1726747	AT	TC	1219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=17;PP=732;SC=ACTAAGCAGCATTCTGGGACA;SOR=1.528;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=26;TCF=9;TCR=17;TR=25;WE=73717033;WS=73717014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	73785326	rs4453265	T	C	3827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=61;PP=2544;SC=TTGCTCTTTCTACTAGGATGC;SOR=0.722;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=127;TCF=66;TCR=61;TR=127;WE=73785334;WS=73785316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr11	73789777	rs1726735	T	G	2907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=57;PP=1781;SC=CGGGAGAAAATAAAGATTCTC;SOR=1.542;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=35;TCR=57;TR=92;WE=73789785;WS=73789767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr11	73796608	rs1095424	T	C	2182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=14;PP=1371;SC=AGGGCTATACTATTCACAATG;SOR=2.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=48;TCR=14;TR=62;WE=73796616;WS=73796598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr11	73796917	rs826058	C	T	1968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=44;PP=1274;SC=AGCGGGTTCCCGTTCAGCCAA;SOR=1.426;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=25;TCR=44;TR=69;WE=73796925;WS=73796907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr11	73803398	rs1790400	C	T	415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=0;PP=290;SC=CCGCACCCGGCTATTTTATAT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=73803406;WS=73803388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	73809278	rs17132707	G	A	1940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.501;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=46;PP=1113;ReadPosRankSum=0.213;SC=GCATCCAGCAGCAGGCGAGAA;SOR=0.752;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=190;TCF=93;TCR=97;TR=84;WE=73809286;WS=73809268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,95:0.44:217
chr11	73833957	rs145193996	C	CTGTCTGGCAAGTGA	637.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=1;PP=1416;SC=AAATGCATAGCTGTCATGCCT;SOR=4.407;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=4;WE=73833965;WS=73833947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
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chr11	74022429	rs7944333	C	T	4334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=65;PP=2389;SC=TGAGGCCCCTCGGTCGCTCCC;SOR=0.730;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=145;TCF=80;TCR=65;TR=145;WE=74022437;WS=74022419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
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chr11	74049569	rs3867270	A	G	2611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.798;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=55;PP=1584;ReadPosRankSum=0.242;SC=GTTCTGTTCCACTTGTCCGAA;SOR=0.523;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=230;TCF=130;TCR=100;TR=120;WE=74049577;WS=74049559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,129:0.51:251
chr11	74053547	rs592644	C	T	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=16;PP=449;ReadPosRankSum=-0.465;SC=CCAGTGGTAACGTCCCGTACA;SOR=0.638;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=41;TCR=30;TR=38;WE=74053555;WS=74053537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,42:0.56:75
chr11	74054346	rs641271	G	T	832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.964;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=8;PP=611;ReadPosRankSum=0.396;SC=AAATTTTGAAGATTTTAATAT;SOR=1.039;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=83;TCF=64;TCR=19;TR=37;WE=74054354;WS=74054336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,39:0.42:93
chr11	74057647	rs519083	T	C	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=1.699;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=62;ReadPosRankSum=0.180;SC=GTGGTTATTTTGGGATAATGG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=4;WE=74057655;WS=74057637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr11	74057931	rs3741130	C	T	1407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.202;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=38;PP=885;ReadPosRankSum=-0.282;SC=TCAATGTTAACGTTCCTGTAT;SOR=0.793;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=154;TCF=71;TCR=83;TR=66;WE=74057939;WS=74057921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,72:0.41:175
chr11	74085420	rs35170680	T	G	803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.209;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=11;PP=546;ReadPosRankSum=0.308;SC=AGCCACCATGTCCAGTCAAAA;SOR=0.289;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=75;TCF=57;TCR=18;TR=36;WE=74085428;WS=74085410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,37:0.47:79
chr11	74109342	rs904155	C	T	606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=21;PP=542;SC=GCAGGGTGTTCGTAACAGCTC;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=74109350;WS=74109332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	74203308	rs586088	T	A	2506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.955;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=58;PP=1421;ReadPosRankSum=-1.300;SC=GTGACGCCTGTCCCAACCAGT;SOR=0.620;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=233;TCF=118;TCR=115;TR=116;WE=74203316;WS=74203298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,126:0.49:255
chr11	74204198	rs10736797	G	A	2861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=34;PP=1451;ReadPosRankSum=-1.686;SC=CCTCACCTCCGTTGGTCCAGC;SOR=0.430;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=97;TCF=63;TCR=34;TR=96;WE=74204206;WS=74204188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,109:0.99:110
chr11	74204269	rs10736798	T	G	4728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=93;NR=74;PP=2651;SC=ACCGCCCTGCTCCGCGGCGCT;SOR=0.738;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=167;TCF=93;TCR=74;TR=167;WE=74204277;WS=74204259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr11	74204591	rs60455691	G	A	730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.145;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=11;PP=300;ReadPosRankSum=-0.090;SC=CACGGGCCCCGCGGGCTCGCA;SOR=0.272;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=42;TCF=21;TCR=21;TR=27;WE=74204599;WS=74204581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,34:0.64:53
chr11	74204727	rs4944895	A	G	1389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.27;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr11	74207856	rs643738	G	A	4862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=104;NR=61;PP=2965;SC=AACATCCCCAGTGGGAAAAAA;SOR=1.257;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=165;TCF=104;TCR=61;TR=165;WE=74207864;WS=74207846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr11	74208029	rs655025	C	T	1724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.249;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=42;PP=1233;ReadPosRankSum=-0.943;SC=GCATTACTCACTGCATTTTTT;SOR=0.827;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=146;TCF=69;TCR=77;TR=77;WE=74208037;WS=74208019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,78:0.50:157
chr11	74208214	rs656506	G	A	1697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.672;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=27;PP=1161;ReadPosRankSum=-0.101;SC=AACATCTTACGGAAGAGTATG;SOR=1.064;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=136;TCF=71;TCR=65;TR=66;WE=74208222;WS=74208204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,73:0.50:145
chr11	74208592	rs657339	G	T	905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.827;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=15;PP=538;ReadPosRankSum=-0.550;SC=TTACTGGCAAGTTCAGTAATG;SOR=0.874;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=77;TCF=46;TCR=31;TR=40;WE=74208600;WS=74208582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,44:0.52:84
chr11	74303841	rs2298572	T	C	4133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=91;PP=2892;SC=GCCTTGACCCTCTGTCTGCTT;SOR=1.765;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=45;TCR=93;TR=135;WE=74303849;WS=74303831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr11	74322417	rs41560822	CAT	C	343.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.94;ReadPosRankSum=-1.904;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr11	74340196	rs2298792	A	G	5190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=70;PP=2965;SC=AAAACCCATAAGAGCATGTGA;SOR=1.026;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=169;TCF=99;TCR=70;TR=169;WE=74340204;WS=74340186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr11	74345550	rs3824999	T	G	1295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=8;PP=899;SC=GACATGTCAATTTAGAGAACC;SOR=2.147;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=32;TCR=8;TR=40;WE=74345558;WS=74345540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr11	74347434	rs4944920	G	C	2977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=73;PP=2293;SC=TGTGAATCATGCCCAAGTGGT;SOR=2.232;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=24;TCR=73;TR=97;WE=74347442;WS=74347424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr11	74407676	rs3819242	C	T	681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=16;PP=448;SC=TGTGTCTGCACGTGCACAACA;SOR=2.124;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=22;WE=74407684;WS=74407666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	74408384	rs10751240	C	T	3813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=64;NR=55;PP=2005;SC=AGGCAAAAACCTACAGTCGGT;SOR=0.796;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=120;TCF=64;TCR=56;TR=119;WE=74408392;WS=74408374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr11	74408619	rs3741124	C	G	9724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=368;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=166;NR=157;PP=2965;SC=AATCCTAGCTCTGGTCATTAG;SOR=0.710;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=328;TCF=168;TCR=160;TR=323;WE=74408641;WS=74408609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,365:1.00:365
chr11	74408633	rs3741123	A	G	9710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=375;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=164;NR=168;PP=2965;SC=TCATTAGAACATGTATACGTC;SOR=0.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=333;TCF=164;TCR=169;TR=332;WE=74408641;WS=74408609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,375:1.00:375
chr11	74408740	rs3741122	C	T	3359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=77;PP=2252;SC=CTGTCACCTGCACCATCCTGC;SOR=1.374;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=41;TCR=77;TR=118;WE=74408748;WS=74408730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr11	74419357	rs1944937	C	T	1334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=8.846;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=4;PP=1015;ReadPosRankSum=-0.633;SC=CTTTGCAGGCCTGGCAGCAGG;SOR=3.849;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=44;TCF=39;TCR=5;TR=43;WE=74419365;WS=74419347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,45:0.98:46
chr11	74419378	rs7948433	C	T	1830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=12;PP=1337;SC=AGTCTGGCAGCGGGAGGGGTG;SOR=2.566;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=50;TCR=12;TR=62;WE=74419386;WS=74419368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr11	74429987	rs12417156	G	A	1979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=43;PP=1184;SC=GGCCACTCAGGCAAAAGAGAA;SOR=1.483;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=24;TCR=43;TR=67;WE=74429995;WS=74429977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr11	74431277	rs4944943	T	C	633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=5;PP=302;SC=GACCCTTAGTTGAATGCTATT;SOR=1.329;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=19;WE=74431285;WS=74431267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr11	74441796	rs11236234	T	G	1332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=34;NR=17;PP=854;SC=GCGCTGTCCCTCACATTCCAG;SOR=1.524;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=34;TCR=17;TR=51;WE=74441804;WS=74441786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr11	74555056	rs3814726	C	T	2058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=39;PP=1321;SC=GCACAGACTTCCCTGGCCTAA;SOR=1.134;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=69;TCF=29;TCR=40;TR=68;WE=74555064;WS=74555046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr11	74555366	rs199654451	CCCT	C	64.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.038;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=2;PP=52;ReadPosRankSum=0.381;SC=AGGCACTTCCCCCTCCTCCTC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=2;WE=74555376;WS=74555356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr11	74559446	rs4944960	G	C	3535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=54;NR=65;PP=2335;SC=CTTGGTTGTCGTCATGCGCGG;SOR=1.016;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=120;TCF=55;TCR=65;TR=119;WE=74559454;WS=74559436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr11	74559481	rs4944961	C	T	2530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=43;PP=1546;SC=GAGGCTGCTTCGGCACCTTTG;SOR=0.874;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=85;TCF=42;TCR=43;TR=84;WE=74559489;WS=74559471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr11	74562378	rs7928381	C	T	105.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=79;SC=GGAGGTAGGTCGAGAATTCCT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=74562386;WS=74562368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr11	74563077	rs2304683	G	A	4736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=95;NR=65;PP=2475;SC=AGACGAACTCGCAGAGAGATG;SOR=0.871;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=160;TCF=95;TCR=65;TR=160;WE=74563085;WS=74563067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr11	74674616	rs562581	A	G	139.89	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=10;NR=0;PP=303;ReadPosRankSum=0.674;SC=TTGTTTGTTTATTTATTTATT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=10;WE=74674624;WS=74674606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr11	74676794	rs514534	G	C	6522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=110;NR=107;PP=2965;SC=TTGATTCCTTGTTTTTCTCAC;SOR=0.701;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=217;TCF=110;TCR=107;TR=217;WE=74676802;WS=74676784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr11	74700896	rs681566	A	G	3248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=69;NR=33;PP=2258;SC=AGAAAGCGGGAAGGACTTGAT;SOR=1.697;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=69;TCR=33;TR=102;WE=74700904;WS=74700886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr11	74705696	rs544115	T	C	8020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=126;NR=131;PP=2965;SC=AGAAGCGTTCTACGAGGAGAG;SOR=0.756;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=258;TCF=127;TCR=131;TR=257;WE=74705704;WS=74705686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,291:1.00:291
chr11	74800829	rs7122948	A	G	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.336;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=48;ReadPosRankSum=0.389;SC=TCTGGAAACCATAGAAACAAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=4;WE=74800837;WS=74800819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr11	74862356	rs2851069	T	C	535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.292;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=9;PP=314;ReadPosRankSum=-1.147;SC=GAAGATTTGCTTCCTCTCCCC;SOR=0.395;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=56;TCF=35;TCR=21;TR=23;WE=74862364;WS=74862346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,26:0.44:59
chr11	74862391	rs1944612	A	G	3053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=41;PP=1938;SC=TCCTGAGATTAAATTAGGGGC;SOR=1.028;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=59;TCR=41;TR=100;WE=74862399;WS=74862381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr11	74876677	rs184162363	C	T	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.032;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=278;ReadPosRankSum=-1.116;SC=GCCGTGCGGCCCTTCCGAGGG;SOR=0.278;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=18;WE=74876685;WS=74876667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,20:0.62:32
chr11	74877004	rs3740839	G	A	1273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.931;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=37;PP=816;ReadPosRankSum=1.134;SC=GGTAAGAGCAGCAGGGGCTGG;SOR=0.481;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=89;TCF=26;TCR=63;TR=54;WE=74877012;WS=74876994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,57:0.61:94
chr11	74904362	rs1621378	T	C	6671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=112;NR=110;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.758;SC=GGCATGGCCATCTTCCTGCCC;SOR=0.733;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=224;TCF=113;TCR=111;TR=222;WE=74904370;WS=74904352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,251:0.99:253
chr11	74988021	rs34053901	G	GTCCCC	2893.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=24;PP=1421;SC=TCTCACAGGCGTCCCCGGGTT;SOR=1.681;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=24;WE=74988029;WS=74988011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr11	74993182	rs526013	A	G	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=23;PP=496;ReadPosRankSum=0.522;SC=GGGACAGGCCATGTCTATCCC;SOR=0.784;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=80;TCF=26;TCR=54;TR=33;WE=74993190;WS=74993172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,33:0.40:82
chr11	74995226	rs480174	G	A	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.808;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=215;ReadPosRankSum=0.568;SC=CTAGAGGTCCGGGGGGAAGAG;SOR=1.961;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=13;WE=74995234;WS=74995216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,15:0.38:39
chr11	74995350	rs647630	C	T	2257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.514;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=42;PP=1254;ReadPosRankSum=0.192;SC=GAGTAAGCGGCCTCTCCCAAC;SOR=0.760;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=179;TCF=102;TCR=77;TR=97;WE=74995358;WS=74995340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,109:0.53:204
chr11	75017436	rs536852	A	G	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.475;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=76;ReadPosRankSum=0.724;SC=CCCCATCTCCACCCCGCACTG;SOR=0.059;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=10;WE=75017444;WS=75017426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
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chr11	75023093	rs546812	A	G	2451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.460;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=47;PP=1481;ReadPosRankSum=0.097;SC=CCCCTCCTCTAAGTGCTGATC;SOR=0.735;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=230;TCF=126;TCR=104;TR=110;WE=75023101;WS=75023083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,119:0.48:250
chr11	75141630	rs11236430	T	C	4498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=64;PP=2871;SC=CGCACGGCGCTTCGCAGCCCG;SOR=0.964;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=152;TCF=88;TCR=64;TR=152;WE=75141638;WS=75141620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr11	75141762	rs3018101	T	C	2563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=33;NR=54;PP=1598;SC=TTATTTCCTCTCTTGACCATT;SOR=1.464;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=33;TCR=54;TR=87;WE=75141770;WS=75141752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr11	75152159	rs117143578	T	C	342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=242;ReadPosRankSum=-0.691;SC=GGGCAGGCTATAGGCAGCTCC;SOR=0.941;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=15;WE=75152167;WS=75152149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr11	75152243	rs571353	C	T	1555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=24;PP=830;ReadPosRankSum=0.569;SC=TGGGACAGGGCGTGGGAGTTG;SOR=0.656;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=125;TCF=80;TCR=45;TR=65;WE=75152251;WS=75152233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,74:0.53:140
chr11	75154067	rs532454	C	T	1259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=19;PP=789;ReadPosRankSum=-0.615;SC=GTGGAGGTCGCGAAAGCTCTG;SOR=0.737;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=74;TCR=38;TR=55;WE=75154075;WS=75154057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,60:0.50:121
chr11	75155743	rs479574	T	C	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.284;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=84;ReadPosRankSum=0.289;SC=GCCTACCTCATTGGTTTTACT;SOR=1.445;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=6;WE=75155751;WS=75155733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr11	75160213	rs473462	G	A	954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.959;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=25;PP=522;ReadPosRankSum=-0.456;SC=CCCTGGGCAGGTTGGGGTGCA;SOR=0.399;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=83;TCF=32;TCR=51;TR=44;WE=75160221;WS=75160203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,47:0.53:88
chr11	75160575	rs518611	G	A	1669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.729;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=22;PP=929;ReadPosRankSum=-0.349;SC=TCCGCTCTGCGCGGGCGAACT;SOR=0.947;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=142;TCF=90;TCR=52;TR=66;WE=75160583;WS=75160565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,80:0.47:170
chr11	75167704	rs1793410	T	C	2546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=55;PP=1298;ReadPosRankSum=-0.423;SC=ATTCTAACGGTGATCCAGGGG;SOR=0.709;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=240;TCF=130;TCR=110;TR=119;WE=75167712;WS=75167694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,131:0.50:263
chr11	75188569	rs1790149	C	T	1027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=14;PP=548;ReadPosRankSum=-0.821;SC=CTGTCCAGAGCGAGTCAGCAG;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=77;TCF=50;TCR=27;TR=39;WE=75188577;WS=75188559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,48:0.50:96
chr11	75277628	rs584961	A	G	1732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=24;PP=1199;SC=CCTCGTCGCTAGGGCTCGTGT;SOR=0.796;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=31;TCR=24;TR=55;WE=75277636;WS=75277618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr11	75277992	rs651581	C	T	8200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.03;NF=119;NR=133;PP=2965;SC=CGGCGCCCTGCTAGTCAACGC;SOR=0.905;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=252;TCF=119;TCR=133;TR=252;WE=75278000;WS=75277982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,310:1.00:310
chr11	75278040	rs35462148	G	GTCC	7058.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-0.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.197;NF=7;NR=59;PP=2983;ReadPosRankSum=0.000;SC=GCGTTCAGGGGTCCTCCTCCT;SOR=0.450;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=92;TCF=10;TCR=82;TR=66;WE=75278048;WS=75278030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,161:0.98:165
chr11	75298917	rs35165133	C	A	1695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=37;PP=1181;ReadPosRankSum=-2.026;SC=TTGCTGGAACCATAGGACTTT;SOR=0.726;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=180;TCF=99;TCR=81;TR=81;WE=75298925;WS=75298907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,84:0.42:199
chr11	75378674	rs12225010	A	C	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=41;ReadPosRankSum=-1.003;SC=CGCGGCGCACAATCCAGGCAG;SOR=0.856;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=20;TCF=11;TCR=9;TR=6;WE=75378682;WS=75378664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr11	75428958	rs554202	A	G	5123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=104;NR=59;PP=2957;SC=GCCCTTGTTTATGCCGTGGGA;SOR=1.124;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=164;TCF=105;TCR=59;TR=163;WE=75428966;WS=75428948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr11	75429157	rs622403	C	T	850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.633;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=25;PP=547;ReadPosRankSum=-0.840;SC=GCTCAGAGCCCCTGCCCAGAG;SOR=0.364;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=65;TCF=18;TCR=47;TR=36;WE=75429165;WS=75429147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,39:0.55:71
chr11	75430950	rs650861	A	G	1218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=6;PP=787;SC=TGCTAGTGCCAGGCCTATGGG;SOR=2.935;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=34;TCR=6;TR=40;WE=75430958;WS=75430940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr11	75501852	rs2510635	A	G	1203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=24;PP=718;SC=ACCCACCCACAGGGAAGCAAG;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=15;TCR=24;TR=39;WE=75501860;WS=75501842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr11	75898329	rs11823833	C	T	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=234;ReadPosRankSum=-1.380;SC=TTGGTCACCACCCCACCAACA;SOR=0.439;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=15;WE=75898337;WS=75898319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr11	75902539	rs11236648	A	G	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.840;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=188;ReadPosRankSum=0.887;SC=TGTGTGCGTGACCCTGAGCTG;SOR=1.329;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=12;WE=75902547;WS=75902529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr11	75902571	rs2508779	A	G	1549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=12;PP=970;SC=GTGCAACACCAGTGACCCTTT;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=41;TCR=12;TR=53;WE=75902579;WS=75902561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr11	75902848	.	G	C	2666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.233;ClippingRankSum=0.000;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.971;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=60;PP=1594;ReadPosRankSum=0.509;SC=GATGGAGCAGGAGCCAGACAC;SOR=0.607;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=225;TCF=100;TCR=125;TR=111;WE=75902856;WS=75902838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,126:0.50:254
chr11	75905800	rs1533767	G	A	342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.884;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=6;PP=142;ReadPosRankSum=-0.686;SC=AGGAGCAGCCGGGCAGGTCGC;SOR=0.129;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=27;TCF=11;TCR=16;TR=13;WE=75905808;WS=75905790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr11	75917189	rs1717626	G	C	775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=4;PP=554;SC=TCGCAAGCCTGCGGGAGGCAG;SOR=3.014;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=23;WE=75917197;WS=75917179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	75917334	rs1879633	T	C	5898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=117;NR=95;PP=2965;SC=CCCCAGTCCCTGGCCTGTGCG;SOR=0.803;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=212;TCF=117;TCR=95;TR=212;WE=75917342;WS=75917324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr11	76115231	rs7113820	G	A	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=413;ReadPosRankSum=-1.338;SC=GGAATAGAACGAGGAGTTCAA;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=19;WE=76115239;WS=76115221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr11	76183924	rs4245443	A	G	320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=222;SC=CACAGTTGCTATATGGAATTT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=76183932;WS=76183914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	76207633	rs10899226	G	A	1310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=24;PP=838;SC=TTTTTCATCAGTGTTTTACAG;SOR=0.818;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=22;TCR=24;TR=46;WE=76207641;WS=76207623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr11	76227182	rs2508740	G	A	6192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=127;NR=86;PP=2965;SC=TTCCCTTTCTGTAGGCACACA;SOR=0.936;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=214;TCF=128;TCR=86;TR=213;WE=76227190;WS=76227172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr11	76237463	.	A	G	1141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.346;ClippingRankSum=0.000;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.781;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=15;PP=845;ReadPosRankSum=2.080;SC=TTTATCATTTATATGCATATA;SOR=0.423;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=107;TCF=78;TCR=29;TR=51;WE=76237471;WS=76237453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,52:0.46:114
chr11	76255815	rs35962163	C	G	1857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FS=2.354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.80;ReadPosRankSum=-1.201;SOR=0.812;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:112,99:0.47:211
chr11	76370792	rs4304809	A	G	5432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=96;PP=2965;SC=CACAGTCCTCAGGACGCACGT;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=197;TCF=101;TCR=96;TR=197;WE=76370800;WS=76370782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr11	76372052	rs3740779	A	G	5176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=108;NR=86;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.861;SC=GGCGGGGCAGACCCTCGAAGG;SOR=0.919;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=196;TCF=109;TCR=87;TR=194;WE=76372060;WS=76372033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,194:0.99:196
chr11	76372418	rs3740778	T	C	6231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=116;NR=100;PP=2965;SC=GACGAAGTGCTGTGTAGAAGC;SOR=0.719;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=216;TCF=116;TCR=100;TR=216;WE=76372426;WS=76372408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr11	76372564	rs10751259	T	C	1917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=47;PP=1342;SC=TGGGGAGGGGTAGGGTGGGGA;SOR=2.412;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=14;TCR=47;TR=61;WE=76372572;WS=76372554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr11	76393990	rs2155850	T	C	1604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.572;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=39;PP=977;ReadPosRankSum=1.985;SC=AGGCACTTCATCCTCCAAGCC;SOR=0.894;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=100;TCF=35;TCR=65;TR=56;WE=76393998;WS=76393980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,69:0.58:119
chr11	76400134	rs10899252	C	T	1591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.315;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=30;PP=956;ReadPosRankSum=-2.802;SC=GGGGTAGGTGCGGAGACGCCA;SOR=1.023;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=179;TCF=102;TCR=77;TR=77;WE=76400142;WS=76400124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,82:0.45:183
chr11	76400343	rs10793181	C	G	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.810;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=203;ReadPosRankSum=-0.072;SC=TCTGGGTAGACAGGGAGGCCC;SOR=1.375;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=12;WE=76400351;WS=76400333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr11	76402532	rs76049815	C	T	933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.018;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=9;PP=656;ReadPosRankSum=0.880;SC=AGTAGAAAGACGGGGATTATT;SOR=1.358;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=85;TCF=61;TCR=24;TR=39;WE=76402540;WS=76402522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,42:0.46:91
chr11	76405062	rs12417222	C	A	1936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=30;PP=1216;ReadPosRankSum=0.666;SC=ACTTTTCCCACAAAGACCACA;SOR=0.675;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=176;TCF=113;TCR=63;TR=82;WE=76405070;WS=76405047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,90:0.47:192
chr11	76405542	rs78808837	G	A	1053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.715;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=23;PP=678;ReadPosRankSum=0.835;SC=CCAGCTATGCGGGATGTATGT;SOR=0.572;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=99;TCF=56;TCR=43;TR=50;WE=76405550;WS=76405532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,53:0.48:110
chr11	76405613	rs12221921	C	T	1222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.945;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=32;PP=660;ReadPosRankSum=1.303;SC=GGGGCTTCAACATCTTAGCTG;SOR=0.840;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=132;TCF=68;TCR=64;TR=61;WE=76405621;WS=76405603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,67:0.47:143
chr11	76405740	rs148326908	T	TA	301.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=-0.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.588;HP=10;HapScore=3;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=117;ReadPosRankSum=-0.879;SC=CGTGACCAATTAAAAAAAAAA;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=32;TCF=10;TCR=22;TR=11;WE=76405748;WS=76405730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,18:0.35:51
chr11	76405872	rs10736809	T	C	393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=299;SC=TTTCCTGCCTTTTGAGTCATT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=76405880;WS=76405862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	76406268	rs117137776	T	A	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.501;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=29;ReadPosRankSum=-0.414;SC=GGCAGGAGAATGGCGTGGTCA;SOR=0.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=4;WE=76406276;WS=76406265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr11	76406341	rs10751260	G	C	2165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=15;PP=1481;SC=TTCCTGAAAAGTAGGGTACGC;SOR=2.211;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=69;TCF=54;TCR=15;TR=68;WE=76406349;WS=76406331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr11	76414249	rs80176488	GT	G	264.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=251;ReadPosRankSum=-0.495;SC=ACCCTATTGAGTTTGGGGGTA;SOR=0.804;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=9;WE=76414257;WS=76414239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr11	76415184	rs11236878	T	C	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=9.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.13;ReadPosRankSum=-0.682;SOR=0.069;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
chr11	76415209	rs10899257	G	A	593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.959;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=422;ReadPosRankSum=-2.328;SC=ACTCACGGGGGAATCATCTGA;SOR=1.295;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=46;TCF=30;TCR=16;TR=26;WE=76415217;WS=76415199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,27:0.53:51
chr11	76415468	rs11236879	C	G	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=246;ReadPosRankSum=-1.182;SC=ACAGAATCCCCGCTTGAAGGA;SOR=0.754;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=17;WE=76415476;WS=76415458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
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chr11	76419633	rs10128693	C	T	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=56;ReadPosRankSum=0.723;SC=TGCTGGAGAGCCAGGGGGAGC;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=4;WE=76419641;WS=76419623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr11	76427731	rs10751261	T	C	7224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=129;NR=110;PP=2965;SC=GATGCCAACGTCCCCTCCCAG;SOR=0.830;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=239;TCF=129;TCR=110;TR=239;WE=76427739;WS=76427721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,263:1.00:263
chr11	76429160	rs10899266	T	A	692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.12;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr11	76430529	rs7122287	C	G	575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=5;PP=460;SC=GTCTGCACGACGAGCATGCCT;SOR=2.419;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=19;WE=76430537;WS=76430519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	76430684	rs35033550	A	C	1607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=2.910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.72;ReadPosRankSum=0.904;SOR=0.484;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,79:0.53:150
chr11	76506572	rs1149620	T	A	647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=12;PP=448;ReadPosRankSum=-0.366;SC=CTTCCAACAGTGTCTAGACTG;SOR=0.655;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=41;TCR=25;TR=31;WE=76506580;WS=76506562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,31:0.46:68
chr11	76506888	rs11546727	G	A	3403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.434;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=69;PP=1937;ReadPosRankSum=-0.532;SC=TGAATGAGTCGGTGTTGGCGG;SOR=0.663;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=250;TCF=127;TCR=123;TR=143;WE=76506896;WS=76506878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,160:0.57:282
chr11	76507692	rs1149621	T	A	1387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=25;NR=24;PP=716;SC=ACACCCGGGATTCTGCTGCCA;SOR=0.931;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=49;TCF=25;TCR=24;TR=49;WE=76507700;WS=76507682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr11	76637651	rs4379869	G	A	8676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=161;NR=133;PP=2965;SC=GTTCGGTGCAGTTCAGAGTGT;SOR=0.888;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=294;TCF=161;TCR=133;TR=294;WE=76637671;WS=76637641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,323:1.00:323
chr11	76637680	rs4479014	G	A	8917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=151;NR=153;PP=2965;SC=GTCTGGAAAAGCGGTACATTG;SOR=0.711;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=304;TCF=151;TCR=153;TR=304;WE=76637688;WS=76637670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,335:1.00:335
chr11	76637730	rs4604914	C	G	6338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=127;PP=2965;SC=AACACTGTATCTGAAGAAATG;SOR=1.282;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=206;TCF=79;TCR=127;TR=206;WE=76637738;WS=76637720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr11	76637785	rs4457775	G	A	2496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=52;PP=1498;SC=TTCTAAAAGCGGTTTTCAATT;SOR=2.419;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=16;TCR=52;TR=68;WE=76637793;WS=76637775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr11	76668478	rs4945125	C	T	940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.788;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=27;PP=895;ReadPosRankSum=0.127;SC=TAATTTTTAACTTTTTGTGTG;SOR=1.802;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=42;TCF=14;TCR=28;TR=40;WE=76668486;WS=76668467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,37:0.95:39
chr11	76669891	rs3740768	A	G	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.480;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=3.010;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=3;PP=62;ReadPosRankSum=0.140;SC=AGAGTCAGCTATATCTTGCCA;SOR=0.160;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=7;WE=76669899;WS=76669881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr11	76687399	rs1517909	A	C	1174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=23;PP=770;SC=AGTACTTTTAAAATTTCATTG;SOR=1.788;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=12;TCR=23;TR=35;WE=76687407;WS=76687389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr11	76687448	rs1517908	A	C	409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=12;PP=332;SC=CTCATAGTGGATTAATATAAC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=76687456;WS=76687438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	76701365	rs3824889	G	T	689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=0;PP=581;SC=TAAAACATTCGACTCACCATA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=76701373;WS=76701355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	76701606	rs3740767	G	A	2742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=59;PP=1716;SC=TAAAAGAGCCGATATTCCATC;SOR=1.863;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=28;TCR=59;TR=87;WE=76701614;WS=76701596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr11	76701657	rs3740766	G	A	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=443;ReadPosRankSum=0.891;SC=GATTGTTTACGATACATGGCT;SOR=0.399;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=22;WE=76701665;WS=76701647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,22:0.71:31
chr11	76709795	rs11237053	G	A	759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.749;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=11;PP=371;ReadPosRankSum=1.694;SC=CTCATTTTCCGTTCCTATTTA;SOR=0.914;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=77;TCF=44;TCR=33;TR=31;WE=76709803;WS=76709785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,38:0.44:86
chr11	76751541	rs11292198	CT	C	13907.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=374;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=50;NR=165;PP=2951;SC=GGGCATGTGTCTTGGAGCGCG;SOR=0.782;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=220;TCF=50;TCR=170;TR=215;WE=76751549;WS=76751531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,372:1.00:372
chr11	76751584	rs11292199	CT	C	15086.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=349;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=32;NR=164;PP=2951;SC=CGAGGGCATCCTGGCCCTTCG;SOR=0.806;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=196;TCF=32;TCR=164;TR=196;WE=76751595;WS=76751574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,334:1.00:334
chr11	76751587	rs34153015	G	A	3546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=73;PP=1878;ReadPosRankSum=0.699;SC=GGGCATCCTGGCCCTTCGGCG;SOR=0.692;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=305;TCF=142;TCR=163;TR=142;WE=76751595;WS=76751574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,169:0.50:336
chr11	76751603	rs11292200	CT	C	14479.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=44;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQ=60.03;NF=23;NR=167;PP=2951;SC=CGGCGTGCAGCTTGCCTGGCG;SOR=0.920;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=193;TCF=24;TCR=169;TR=190;WE=76751611;WS=76751593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,330:1.00:330
chr11	76795839	rs12362168	A	G	1194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=15;PP=642;ReadPosRankSum=-0.266;SC=TCCGCTTCACAGGGCACATCA;SOR=0.771;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=107;TCF=77;TCR=30;TR=52;WE=76795847;WS=76795829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,60:0.50:120
chr11	76799004	rs7121748	T	C	5278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=91;NR=89;PP=2569;SC=GGCCATTCGCTGGCCCCTCAC;SOR=0.754;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=180;TCF=91;TCR=89;TR=180;WE=76799012;WS=76798994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
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chr11	76859069	rs4074664	C	T	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=338;ReadPosRankSum=0.043;SC=CCCACCCCGCCCGACTTGCCT;SOR=0.458;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=17;WE=76859077;WS=76859059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,17:0.74:23
chr11	76866955	rs56023295	G	A	2628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=51;PP=1539;ReadPosRankSum=0.370;SC=GCCCGCAGACGTATACGGGCT;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=253;TCF=144;TCR=109;TR=119;WE=76866963;WS=76866945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,129:0.46:278
chr11	76867991	rs201753022	G	A	2731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.413;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=70;PP=1542;ReadPosRankSum=1.465;SC=CAAGCGGGGCGCCATCGAGGG;SOR=0.652;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=280;TCF=119;TCR=161;TR=122;WE=76867999;WS=76867981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,140:0.43:323
chr11	76868278	rs3737454	C	A	1079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.39;ReadPosRankSum=0.165;SOR=0.729;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,57:0.50:115
chr11	76868372	rs762667	T	C	774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=15;PP=379;ReadPosRankSum=0.530;SC=TGCTGGAGGGTATGAGTGAGG;SOR=0.762;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=48;TCR=41;TR=32;WE=76868380;WS=76868362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,41:0.37:111
chr11	76870458	rs2071151	C	G	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=10;PP=317;ReadPosRankSum=0.000;SC=TGCCCACCCTCCCTCCCCTGA;SOR=0.685;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=43;TCF=25;TCR=18;TR=23;WE=76870466;WS=76870448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,24:0.59:41
chr11	76870634	rs4944145	T	C	3189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.350;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=73;PP=2113;ReadPosRankSum=-1.606;SC=TTTAAGCTCATTGGGGGCTGG;SOR=0.898;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=239;TCF=119;TCR=120;TR=137;WE=76870642;WS=76870624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,148:0.55:268
chr11	76872169	rs2276278	G	A	1666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.138;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=38;PP=863;ReadPosRankSum=0.126;SC=CAGGTACCGCGTGGGGCTCTG;SOR=0.601;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=167;TCF=79;TCR=88;TR=75;WE=76872177;WS=76872159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,85:0.45:189
chr11	76874149	.	C	CATATAT	166	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=5;MMLQ=20;MQ=60.0;NF=0;NR=5;PP=166;QD=35.0;SC=TGTGATTATTCATATATATAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=5;WE=76874157;WS=76874139;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:15,5:0.25:20
chr11	76876976	rs11374303	G	GT	168.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=177;ReadPosRankSum=-0.000;SC=AGGCCTCAGGGCCCCCGTCAT;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=5;WE=76876984;WS=76876970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr11	76885779	rs2276283	G	A	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.837;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=200;ReadPosRankSum=0.147;SC=TGGCCCTGATGCCCTTGGCTG;SOR=0.223;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=16;WE=76885787;WS=76885769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr11	76890242	rs10793239	T	C	471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.366;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.800;NF=1;NR=19;PP=316;ReadPosRankSum=0.188;SC=GCCATGGCAGTGGGACTGGCC;SOR=2.387;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=36;TCF=4;TCR=32;TR=20;WE=76890250;WS=76890232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr11	76891308	rs3831388	T	TCTGCCAAATTATTTGG	419.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=2.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.99;ReadPosRankSum=-1.205;SOR=1.341;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,6:0.17:35
chr11	76891585	rs1109163	G	A	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.203;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=351;ReadPosRankSum=0.018;SC=TCCCCTCCCCGAGGCTGGCTT;SOR=0.173;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=52;TCF=15;TCR=37;TR=26;WE=76891593;WS=76891575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,30:0.53:57
chr11	76891661	rs1109162	A	G	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=84;ReadPosRankSum=1.150;SC=AGACCCACTCAGCCAGCATTG;SOR=0.223;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=7;WE=76891669;WS=76891651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr11	76892943	rs7117606	A	G	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.971;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=102;ReadPosRankSum=0.294;SC=CGATCCTCCCACCTGAGCTTC;SOR=1.508;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=10;WE=76892951;WS=76892933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr11	76893280	rs57741157	A	AG	560.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=17;PP=756;SC=TGGTGGCCGTAGTGATGAGGG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=17;WE=76893288;WS=76893270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	76893401	rs2276287	G	A	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=79;ReadPosRankSum=0.272;SC=TCCCCAAACCGCCAGGTCATT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=5;WE=76893409;WS=76893392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr11	76893731	rs112227803	G	GA	303.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.073;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=399;ReadPosRankSum=-1.640;SC=CTCCTCTGCAGAAAAAGGATC;SOR=3.352;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=13;WE=76893739;WS=76893721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr11	76894235	rs948972	G	C	663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.832;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=19;PP=402;ReadPosRankSum=-1.642;SC=TGGCAGCCCAGGGGTGGCTGC;SOR=0.573;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=34;TCR=47;TR=33;WE=76894243;WS=76894225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,35:0.39:89
chr11	76895770	rs143953991	GGGAGGCGGGGACACCAGGGCCT	G	2502.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.975;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=2.078;NF=11;NR=24;PP=2922;ReadPosRankSum=2.009;SC=GGTCAGTGCCGGGAGGCGGGG;SOR=0.745;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=92;TCF=22;TCR=70;TR=35;WE=76895799;WS=76895760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,68:0.41:164
chr11	76901273	rs2276286	C	T	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=87;ReadPosRankSum=0.032;SC=CTCGAGTGCCCCAGAAACATT;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=8;TCR=13;TR=10;WE=76901281;WS=76901263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr11	76901623	rs55637648	T	TGCTGGGGCCTGGAGC	604.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.583;NF=6;NR=1;PP=977;ReadPosRankSum=0.352;SC=CCCAGTGAGGTACTGGGGCCT;SOR=0.340;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=7;WE=76901631;WS=76901613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr11	76901648	rs7947922	C	G	576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.811;HP=1;HapScore=2;MGOF=53;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=311;ReadPosRankSum=1.214;SC=TGCTGGGGCACCTCCAACCCC;SOR=0.241;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=41;TCF=36;TCR=5;TR=20;WE=76901656;WS=76901638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,23:0.49:47
chr11	76901927	rs2276285	C	T	1504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.426;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=36;PP=907;ReadPosRankSum=-0.096;SC=TATGGCCGCCCGGAAGCACCT;SOR=0.535;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=118;TCF=50;TCR=68;TR=65;WE=76901935;WS=76901917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,69:0.53:130
chr11	76904945	rs10899359	A	G	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=105;ReadPosRankSum=0.519;SC=AACGGTGGTAATGGTGATGGA;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=6;WE=76904953;WS=76904935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr11	76905604	rs1109977	G	T	1214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=28;PP=692;ReadPosRankSum=-0.435;SC=GAGAAGGGATGTGGACCTGAA;SOR=0.721;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=96;TCF=46;TCR=50;TR=53;WE=76905612;WS=76905594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,60:0.55:110
chr11	76905725	rs948958	C	T	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.34;ReadPosRankSum=1.116;SOR=0.425;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr11	76910766	rs7927472	C	T	2514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.624;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=56;PP=1323;ReadPosRankSum=-0.511;SC=TCACCTCCAGCAATGCTGAGG;SOR=0.590;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=197;TCF=95;TCR=102;TR=112;WE=76910774;WS=76910756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,123:0.55:224
chr11	76912636	rs2276288	A	T	1579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.328;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=34;PP=790;ReadPosRankSum=2.452;SC=CCCCACCGACAGTGTGTACGT;SOR=0.542;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=128;TCF=55;TCR=73;TR=63;WE=76912644;WS=76912626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,76:0.52:147
chr11	76917220	rs2276293	A	G	3308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=367;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.209;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=78;PP=2243;ReadPosRankSum=-0.088;SC=TTTTCCACAAAGTCTACTTCC;SOR=0.656;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=339;TCF=179;TCR=160;TR=161;WE=76917228;WS=76917210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:200,167:0.46:367
chr11	76918322	rs2276291	T	C	2377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=52;NR=29;PP=1379;SC=CAGTGCTCACTGCCCCTCCCA;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=52;TCR=29;TR=81;WE=76918330;WS=76918312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr11	76918497	rs2276290	G	A	3709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=51;NR=63;PP=1886;SC=TGGGGCCATAGGAACTTACGG;SOR=1.154;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=114;TCF=51;TCR=63;TR=114;WE=76918505;WS=76918487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr11	76919468	rs1320703	A	T	4767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.06;SOR=1.066;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr11	76919468	.	ACCCCAGGTCC	TCCCCAGGTCA,TCCCCAGGTCC	1108	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000,0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=20;MQ=60.0;NF=33,76;NR=24,49;PP=823,1108;QD=15.3766293835;SC=GATGGCCCTGACCCCAGGTCC;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=126;TCF=77;TCR=49;TR=57,125;WE=76919486;WS=76919458;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.45:126
chr11	76919478	rs948962	C	A	1366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=2.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.17;ReadPosRankSum=-1.366;SOR=0.507;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,70:0.47:149
chr11	76919619	rs948961	G	A	3141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.46;SOR=1.288;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr11	76919629	rs948960	C	T	3119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.57;SOR=1.512;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr11	76919865	rs1320702	T	A	8184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=128;NR=142;PP=2965;SC=ACCTCTGCACTCTAGTTGCCT;SOR=0.859;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=270;TCF=128;TCR=142;TR=270;WE=76919873;WS=76919855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,310:1.00:310
chr11	76920003	rs11237122	T	C	725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=24;PP=542;SC=CCCCAAGGGATGGCCCAACCC;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=26;WE=76920011;WS=76919993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	76923352	rs12418037	A	G	2151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=40;PP=1278;SC=CAGACCCTGGAAAGAGTGCTC;SOR=1.673;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=23;TCR=40;TR=63;WE=76923360;WS=76923342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr11	76924130	rs2276289	A	T	1379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=33;PP=931;SC=TGCCTGAACCACAGACACGGT;SOR=2.078;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=13;TCR=33;TR=46;WE=76924138;WS=76924120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr11	76924766	rs56001117	G	A	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.282;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=290;ReadPosRankSum=-1.222;SC=GCTTCCCACCGCAGCTGGATG;SOR=1.061;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=51;TCF=37;TCR=14;TR=19;WE=76924774;WS=76924756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,18:0.35:51
chr11	76924874	rs883223	G	A	6310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=124;NR=92;PP=2965;SC=GGCCCAGGCCGTGCCTCTCTA;SOR=0.874;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=217;TCF=124;TCR=93;TR=216;WE=76924882;WS=76924864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr11	76925075	rs948959	G	T	1993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=42;PP=1218;SC=TGCCTGCAGCGTAGCCAGCCT;SOR=1.708;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=21;TCR=42;TR=63;WE=76925083;WS=76925065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr11	76928149	rs2282576	A	G	5904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=92;PP=2965;SC=CCAGGCTTCAAAGGTGTGACA;SOR=0.703;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=194;TCF=102;TCR=92;TR=194;WE=76928157;WS=76928139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr11	76944015	rs4945161	G	A	2514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=28;PP=1634;SC=AGGGCTGGGGGGCCTGCACTG;SOR=1.460;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=58;TCR=28;TR=86;WE=76944023;WS=76944005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr11	76944049	rs4945162	C	T	4450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=60;PP=2550;SC=CCTGGAAGAACAATCTGGACA;SOR=1.165;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=156;TCF=96;TCR=60;TR=156;WE=76944057;WS=76944039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr11	76954898	rs7104577	A	G	2691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.938;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=53;PP=1683;ReadPosRankSum=-0.668;SC=AAAAATCTCTAAGGAGAAACA;SOR=0.700;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=213;TCF=108;TCR=105;TR=113;WE=76954906;WS=76954888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,124:0.50:246
chr11	76979465	rs1618188	A	C	4086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=84;NR=47;PP=2506;SC=TTGAACTTATACCCTCCTCCC;SOR=1.257;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=132;TCF=85;TCR=47;TR=131;WE=76979484;WS=76979455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr11	76979889	rs1621624	T	C	229.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=1;PP=142;SC=TCCAGGGGCTTCCATGGTTCT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=76979908;WS=76979881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	76979900	rs1613357	C	G	355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=2;PP=276;SC=CCATGGTTCTCTTTTCTTCTC;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=76979908;WS=76979881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	76980743	rs1620915	T	C	1376.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.99;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr11	77314503	rs2032395	A	G	518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.741;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=352;ReadPosRankSum=0.462;SC=GACTAAGAATACCTAAAATAA;SOR=0.139;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=18;WE=77314511;WS=77314493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
chr11	77335982	rs2013296	C	A	1748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=15;PP=1237;SC=AAACAAAAAACCCACTTTAAA;SOR=2.226;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=42;TCR=15;TR=57;WE=77335990;WS=77335972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
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chr11	77583376	rs588217	G	A	1205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.646;HP=1;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=28;PP=1684;ReadPosRankSum=0.836;SC=GCCTTAAGAGGAGAATAAATC;SOR=0.886;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=91;TCF=46;TCR=45;TR=53;WE=77583387;WS=77583366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,56:0.58:97
chr11	77583379	rs148604757	A	G	850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.672;HP=1;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=17;PP=1228;ReadPosRankSum=0.107;SC=TTAAGAGGAGAATAAATCACT;SOR=0.541;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=92;TCF=46;TCR=46;TR=39;WE=77583387;WS=77583366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,41:0.42:98
chr11	77583476	rs668701	G	A	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=97;ReadPosRankSum=-0.411;SC=GCCAGGTCCTGTGCTAGGCTC;SOR=1.022;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=8;WE=77583484;WS=77583466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr11	77587973	rs616354	T	C	990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.592;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=16;PP=595;ReadPosRankSum=1.062;SC=GCAGCAGCCATGGTTCTTCAT;SOR=0.895;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=100;TCF=63;TCR=37;TR=46;WE=77587981;WS=77587963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,49:0.46:107
chr11	77595642	rs608389	A	G	1052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.933;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=8;PP=698;ReadPosRankSum=-0.834;SC=TGCTCTATGTAAATATACTTA;SOR=0.516;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=82;TCF=65;TCR=17;TR=40;WE=77595650;WS=77595632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,45:0.51:89
chr11	77595717	rs658398	C	T	2587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.446;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=55;PP=1449;ReadPosRankSum=-1.575;SC=GTTGAAACTGCGGAAGGCATG;SOR=0.710;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=241;TCF=127;TCR=114;TR=117;WE=77595725;WS=77595707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,130:0.49:265
chr11	77605501	rs1793336	T	C	1092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=25;PP=740;SC=TAGCATATTATACTATAAAAA;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=35;WE=77605509;WS=77605491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr11	77611597	rs111879239	CT	C	199.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=1.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQRankSum=-1.831;QD=1.96;ReadPosRankSum=-0.307;SOR=0.397;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,23:0.23:102
chr11	77614770	rs2276349	T	G	4154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=92;PP=2757;SC=CCCATGAACATGACTTCTCAA;SOR=1.810;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=131;TCF=39;TCR=92;TR=131;WE=77614778;WS=77614760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr11	77629132	rs60400274	A	AT	4664.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=44;PP=2589;SC=GCACAGTTAGATCTGAATTGT;SOR=0.758;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=12;TCR=44;TR=56;WE=77629140;WS=77629122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr11	77671281	rs12796422	A	G	2808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=30;PP=1892;SC=CGCTGCCACTATTAACTAGCG;SOR=1.586;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=65;TCR=30;TR=95;WE=77671289;WS=77671271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr11	77674414	rs202215249	A	C	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.207;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=4.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.71;ReadPosRankSum=1.707;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr11	77698524	rs7938133	C	T	2777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=68;NR=25;PP=1765;SC=TTATTGGTAACAGATCTTTAA;SOR=1.902;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=68;TCR=25;TR=93;WE=77698532;WS=77698514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr11	77698651	rs6592756	T	C	5962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=108;PP=2965;SC=GTAGCTCACGTCTGTAATCCC;SOR=0.934;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=203;TCF=94;TCR=109;TR=201;WE=77698659;WS=77698641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr11	77702033	rs2276441	T	A	342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=233;SC=TACCTAGCACTTGGAAGACAC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=77702041;WS=77702023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	77734001	rs11237360	G	C	43.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=0.916;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr11	77734209	rs11237362	T	C	4823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=83;NR=83;PP=2387;SC=CACTTACCGTTGGCCGCCTGG;SOR=0.748;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=166;TCF=83;TCR=83;TR=166;WE=77734239;WS=77734199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr11	77734371	rs12420553	G	A	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=287;ReadPosRankSum=-0.507;SC=AAGGCGGGACGGGGCTGAGCC;SOR=0.756;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=12;TCR=23;TR=20;WE=77734379;WS=77734361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,23:0.59:39
chr11	77775466	rs545869	C	G	1168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=32;PP=907;SC=GTGCAACCCACTGGGAGAGGA;SOR=3.500;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=4;TCR=32;TR=36;WE=77775474;WS=77775456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr11	77790653	rs534418	T	C	1602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.09;SOR=2.038;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr11	77790653	.	TAG	CAC,CAG	374	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.1;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=16,30;NR=4,9;PP=208,374;QD=13.0733937431;SC=TCCGCCGGATTAGGTTATCAA;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=20,39;WE=77790663;WS=77790643;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.51:39
chr11	77790655	rs8875	G	C	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=1.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.78;ReadPosRankSum=0.417;SOR=0.365;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,23:0.55:42
chr11	77790863	rs499799	C	G	6476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=101;NR=127;PP=2965;SC=ACCACTACCCCGGCCTAAGCG;SOR=0.987;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=229;TCF=101;TCR=128;TR=228;WE=77790871;WS=77790853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr11	77811990	rs1263505	T	C	2678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=25;PP=1812;SC=GCTTGGCACATATCTAAGCAG;SOR=1.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=62;TCR=25;TR=87;WE=77811998;WS=77811980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
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chr11	77823557	rs624350	G	A	958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=4;PP=744;SC=TGCTCCCCCTGTTCATCCTGA;SOR=3.611;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=33;WE=77823565;WS=77823547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	77825275	rs10899440	A	G	2494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.387;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=49;PP=1445;ReadPosRankSum=0.658;SC=GTAAGGGAAAAATCGAAAATG;SOR=0.557;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=191;TCF=104;TCR=87;TR=105;WE=77825283;WS=77825265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,117:0.56:209
chr11	77825320	rs665278	T	C	2402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.814;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=52;PP=1567;ReadPosRankSum=0.499;SC=GCCTGGTTTATTTGCAGTGAA;SOR=0.777;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=225;TCF=118;TCR=107;TR=111;WE=77825328;WS=77825310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,117:0.48:242
chr11	77825642	rs653721	A	G	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=282;ReadPosRankSum=-1.249;SC=TGGGTGAGGGATATATAGGAA;SOR=0.627;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=16;WE=77825650;WS=77825632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr11	77832076	rs518624	T	A	1719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=17;PP=1094;SC=ACATCAGAATTAGTAAGGGAA;SOR=1.503;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=42;TCR=17;TR=59;WE=77832084;WS=77832066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr11	77838373	rs59662312	TA	T	670.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.817;NF=10;NR=14;PP=236;ReadPosRankSum=0.393;SC=AGATGAATCTTAAAAAAAAAA;SOR=0.613;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=48;TCF=23;TCR=25;TR=24;WE=77838382;WS=77838363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,36:0.62:58
chr11	77849722	rs182850521	C	T	1530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.730;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=16;PP=926;ReadPosRankSum=0.650;SC=GAAGGGAAGGCGGAAGCCAAT;SOR=1.016;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=162;TCF=112;TCR=50;TR=63;WE=77849730;WS=77849712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,75:0.41:181
chr11	77850517	rs10793289	C	A	4958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=441;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=109;NR=101;PP=2764;ReadPosRankSum=0.948;SC=CCCGCCCAGCCCCTGGCCGTG;SOR=0.697;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=398;TCF=205;TCR=193;TR=210;WE=77850525;WS=77850507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:203,238:0.54:441
chr11	77884782	rs230661	C	T	1084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.733;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=16;PP=701;ReadPosRankSum=-0.599;SC=CATGAGCTTCCTGGGACTCCC;SOR=0.517;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=88;TCF=60;TCR=28;TR=49;WE=77884790;WS=77884772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,52:0.54:96
chr11	77921527	rs2512526	G	C	11480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=405;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=192;NR=170;PP=2965;SC=CCGCCCTGCCGCTTCTCTGGG;SOR=0.813;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=362;TCF=192;TCR=170;TR=362;WE=77921535;WS=77921517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,405:1.00:405
chr11	78204073	rs66546995	CACAGAT	C	5688.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=37;PP=2965;SC=ATTTTAATGTCACAGATACCT;SOR=1.537;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=75;TCF=35;TCR=40;TR=67;WE=78204086;WS=78204063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr11	78204299	rs56279811	T	TA	2962.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=53;PP=2294;SC=TTTAAGTATTTAAATATTCAG;SOR=1.662;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=61;TCF=1;TCR=60;TR=54;WE=78204307;WS=78204289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr11	78204380	rs4474465	C	T	183.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=6;PP=132;SC=TTTGCTGCTACATATTTCTCT;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=78204388;WS=78204370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr11	78277277	rs10751296	A	G	3289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=60;PP=1945;SC=ATTGTCGCAGATACTCCAGAG;SOR=1.046;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=50;TCR=60;TR=110;WE=78277285;WS=78277267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr11	78279790	rs10501429	T	G	2404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=49;PP=1503;SC=ACTCCCAAAATTTAATTCTCT;SOR=1.192;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=82;TCF=33;TCR=49;TR=82;WE=78279798;WS=78279780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr11	78372536	rs2277277	G	A	847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=15;PP=508;ReadPosRankSum=-1.387;SC=GTGTGTGGATGAGCTCGTAGG;SOR=0.722;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=94;TCF=61;TCR=33;TR=44;WE=78372544;WS=78372526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,46:0.43:107
chr11	78437182	rs689369	G	A	3170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=60;PP=1998;ReadPosRankSum=1.367;SC=GCTTGGACGCGTCAATTTCAT;SOR=0.671;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=264;TCF=151;TCR=113;TR=138;WE=78437190;WS=78437172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,148:0.52:282
chr11	78440736	rs512004	G	C	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=69;ReadPosRankSum=1.554;SC=TCGACTCACCGAGTGGAGGGA;SOR=0.527;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=7;WE=78440744;WS=78440726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr11	78443235	rs1790557	C	T	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.362;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=121;ReadPosRankSum=1.630;SC=TTTTGCATAACAGGCTGATGG;SOR=0.399;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=8;WE=78443243;WS=78443225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr11	78489793	rs1573527	C	A	1463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=1.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.05;ReadPosRankSum=-0.963;SOR=0.880;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,41:0.56:73
chr11	78489798	rs1573528	C	A	1377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=2.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.53;ReadPosRankSum=0.211;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,33:0.52:64
chr11	78567367	rs505093	T	C	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.902;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=84;ReadPosRankSum=0.257;SC=CTCCCCACCCTGGCCCTCCCC;SOR=2.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=7;WE=78567375;WS=78567357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr11	78602525	rs10736817	C	A	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.179;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=360;ReadPosRankSum=0.576;SC=GGTCAGTGTGCAAGCCACATG;SOR=0.030;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=40;TCF=6;TCR=34;TR=22;WE=78602533;WS=78602515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,23:0.57:40
chr11	78614976	rs72943591	G	T	892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.314;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=30;PP=668;ReadPosRankSum=-0.290;SC=GCCCCAGGCTGACTGAATCAT;SOR=1.103;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=74;TCF=16;TCR=58;TR=37;WE=78614984;WS=78614966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,38:0.49:78
chr11	79133292	.	T	TACAC	156	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=156;QD=53.0;SC=ACATGGTTCTTACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=3;WE=79133300;WS=79133282;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:10,3:0.23:13
chr11	82443417	rs3780	C	T	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.044;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=320;ReadPosRankSum=0.061;SC=CATCGTTCTTCAGATTTAGGA;SOR=0.275;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=61;TCF=47;TCR=14;TR=26;WE=82443425;WS=82443407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,28:0.42:67
chr11	82443672	rs6592081	C	G	825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.645;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=21;PP=566;ReadPosRankSum=-1.125;SC=CAAATGGCCCCGCCCGTCCTC;SOR=0.933;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=98;TCF=42;TCR=56;TR=35;WE=82443680;WS=82443662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,39:0.36:107
chr11	82444216	rs986097	C	G	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.949;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=17;PP=416;ReadPosRankSum=1.049;SC=GGCGCAGCCACCTCACCCCCC;SOR=0.910;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=56;TCF=26;TCR=30;TR=29;WE=82444224;WS=82444206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,30:0.46:65
chr11	82560312	rs10792653	T	G	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.218;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=21;PP=401;ReadPosRankSum=1.920;SC=TCAACAGATGTCTTTACAGAT;SOR=1.155;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=89;TCF=32;TCR=57;TR=31;WE=82560320;WS=82560302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,34:0.37:93
chr11	82560858	rs10736757	A	G	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=194;ReadPosRankSum=0.746;SC=TGTACATTATACTTTAACAAA;SOR=0.307;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=10;WE=82560866;WS=82560848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr11	82561339	rs13306597	G	A	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=10;PP=324;ReadPosRankSum=1.799;SC=ATTAAGAAACGTTCATGTCCA;SOR=0.735;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=78;TCF=50;TCR=28;TR=29;WE=82561347;WS=82561329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,32:0.40:81
chr11	82561661	rs10792655	T	C	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.484;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=116;ReadPosRankSum=2.021;SC=AAATAGAATTTCTAGGCAATT;SOR=0.223;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=6;WE=82561669;WS=82561651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr11	82752734	rs34023989	TA	T	197.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.99;ReadPosRankSum=1.295;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr11	82872529	.	TT	AA	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.733;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;JOINED;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=620;ReadPosRankSum=-0.205;SC=GCGTTTTTTTTTAAAAAATGT;SOR=1.721;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=15;WE=82872538;WS=82872519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr11	82874970	rs10898088	G	A	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-4.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=323;ReadPosRankSum=0.290;SC=GAATTCTTCTGCAGAACTTAC;SOR=0.346;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=18;WE=82874978;WS=82874960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr11	82875359	rs7130527	G	A	2425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.123;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=55;PP=1368;ReadPosRankSum=-0.335;SC=TAATAAGGCAGCAGTTACTGG;SOR=0.626;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=234;TCF=124;TCR=110;TR=110;WE=82875367;WS=82875349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,122:0.47:261
chr11	82878393	rs17144692	G	A	1225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=22;PP=779;ReadPosRankSum=-1.385;SC=ATTATCTATCGTCTATTTTTT;SOR=0.770;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=84;TCF=42;TCR=42;TR=45;WE=82878401;WS=82878383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,52:0.53:98
chr11	82880341	rs12284052	G	A	2393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.041;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=55;PP=1540;ReadPosRankSum=-0.270;SC=CACATGGTCAGCCAGGGGTTG;SOR=0.601;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=183;TCF=94;TCR=89;TR=105;WE=82880349;WS=82880331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,112:0.56:201
chr11	82892837	rs138976866	TAC	T	662.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.022;NF=12;NR=0;PP=441;ReadPosRankSum=-0.151;SC=ATATTGAAGATACACAGTAAA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=12;WE=82892846;WS=82892827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,18:0.69:26
chr11	82893347	rs12049913	T	C	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=91;ReadPosRankSum=1.534;SC=ACTCATAAATTCTTTACTCCA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=5;WE=82893355;WS=82893343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr11	82895657	rs17144746	A	G	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=341;ReadPosRankSum=-0.364;SC=TTACAAGACTAAATGTTATTT;SOR=0.314;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=16;WE=82895665;WS=82895647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr11	82905679	rs11233519	C	T	1844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=44;PP=1188;ReadPosRankSum=-1.458;SC=GGGGCCTGGACTCAACTCCTC;SOR=0.698;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=183;TCF=89;TCR=94;TR=85;WE=82905687;WS=82905669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,91:0.46:199
chr11	82909464	rs150340749	C	CT	490.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=205;ReadPosRankSum=-1.387;SC=CTGTTTTAGTCTTTTTTTTTC;SOR=0.520;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=52;TCF=35;TCR=17;TR=17;WE=82909472;WS=82909454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,24:0.46:52
chr11	82921538	rs553484	C	T	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.961;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=458;ReadPosRankSum=-0.643;SC=GTTATCTCTTCCTGACTTTTT;SOR=0.227;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=52;TCF=11;TCR=41;TR=29;WE=82921546;WS=82921528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,32:0.57:56
chr11	82952108	rs625102	T	C	537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=16;PP=456;SC=TTGGAGGAACTAGAACTAATA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=82952116;WS=82952098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	82968164	rs628223	G	A	898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=8;PP=513;SC=ACTTGCTTACGGACCCTTAGC;SOR=1.542;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=29;WE=82968172;WS=82968154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	82968418	rs657824	G	A	1893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.05;SOR=1.011;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr11	82972855	rs28930683	T	C	1027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.546;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=14;PP=626;ReadPosRankSum=-0.270;SC=AATAATCTTGTGTAGTAAATT;SOR=0.862;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=103;TCF=71;TCR=32;TR=45;WE=82972863;WS=82972845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,50:0.43:116
chr11	82973004	rs8789	C	T	1280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.315;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=38;PP=826;ReadPosRankSum=-0.234;SC=AAGTAAACACCGAAGCTGTGA;SOR=0.934;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=120;TCF=47;TCR=73;TR=58;WE=82973012;WS=82972994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,61:0.47:129
chr11	82973045	rs645954	C	T	2085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=44;PP=1294;SC=GGTCTTGTATCTGTAATTATT;SOR=1.519;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=26;TCR=44;TR=70;WE=82973053;WS=82973035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr11	82984770	rs146002262	T	TA	419.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=4;PP=101;ReadPosRankSum=-1.696;SC=AGCAGGAAGTTAAAAAAAAAG;SOR=0.703;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=39;TCF=18;TCR=21;TR=9;WE=82984778;WS=82984760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,24:0.35:69
chr11	82984985	rs543562	T	A	1782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=32;PP=956;ReadPosRankSum=0.974;SC=AGAAAAAAAATTCACTTACCA;SOR=0.718;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=119;TCF=65;TCR=54;TR=69;WE=82984993;WS=82984975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,79:0.58:137
chr11	82996986	rs494791	A	C	10763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=401;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=195;NR=164;PP=2965;SC=CTTGGGAGAGAAAGAGCCGCC;SOR=0.749;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=359;TCF=195;TCR=164;TR=359;WE=82996994;WS=82996976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,401:1.00:401
chr11	83585289	rs144508115	G	GGGAAGGAAGGAAGGAGAGAGGGAA	1088.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=77.77;SOR=2.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	83585583	rs11447183	T	TA	154.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.223;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.32;ReadPosRankSum=0.983;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr11	83585585	rs112496782	A	T	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.184;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.70;ReadPosRankSum=1.458;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
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chr11	83878075	rs1869472	G	A	3732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=65;PP=2112;SC=TTCCAGTTCTGGCCCTAACTG;SOR=0.976;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=122;TCF=57;TCR=65;TR=122;WE=83878083;WS=83878065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr11	83878183	rs12801364	T	C	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.073;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=211;ReadPosRankSum=-0.488;SC=TTTTCAGTGTTTGAAAAATGT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=10;WE=83878191;WS=83878173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr11	83962251	rs7933566	A	G	597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.375;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=13;PP=365;ReadPosRankSum=-0.655;SC=CACAGTTTTAAAAGAAGGTAG;SOR=0.368;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=50;TCF=29;TCR=21;TR=29;WE=83962259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,30:0.57:53
chr11	84822798	rs601375	T	G	2866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.04;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr11	85418591	rs3069561	AACAG	A	4578.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=59;PP=2947;SC=AGGAGAATTGAACAGACAAAG;SOR=2.280;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=4;TCR=62;TR=63;WE=85418602;WS=85418581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr11	85419193	rs290197	C	T	618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=18;NR=7;PP=410;SC=TGAAACTCCACCTCAAAAAAA;SOR=1.051;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=25;WE=85419205;WS=85419183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	85431755	rs7116742	C	T	1004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.782;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=5;PP=736;ReadPosRankSum=0.241;SC=GCCTCTTCAGCGCACTTTGGA;SOR=3.294;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=33;WE=85431763;WS=85431745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,35:0.97:36
chr11	85435001	rs34653849	T	TA	531.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=13.424;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=346;ReadPosRankSum=1.341;SC=TAATCCCAATTAAAAAAAATC;SOR=6.183;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=16;WE=85435009;WS=85434991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,21:0.95:22
chr11	85435730	rs550404	C	T	8068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=147;NR=132;PP=2965;SC=CAGTTATTAACGGAGCCTCGG;SOR=0.706;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=279;TCF=147;TCR=132;TR=279;WE=85435738;WS=85435720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,304:1.00:304
chr11	85436352	rs641393	G	A	6099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=107;NR=106;PP=2965;SC=CGAAATTTCCGTTTGAGAAGG;SOR=0.782;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=213;TCF=107;TCR=106;TR=213;WE=85436360;WS=85436342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr11	85436394	rs556669	T	C	4175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=76;PP=2581;SC=AAGATGAGCATCCTGGGGAAA;SOR=1.071;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=60;TCR=76;TR=136;WE=85436402;WS=85436384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr11	85436500	rs580459	T	C	3383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=45;PP=2111;SC=TCTGCAGCCATCTGAATCAAA;SOR=0.888;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=62;TCR=45;TR=107;WE=85436508;WS=85436490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr11	85436699	rs598346	A	G	8629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=155;NR=133;PP=2965;SC=CAGTGATAACAGGCGCCAACT;SOR=0.757;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=288;TCF=155;TCR=133;TR=288;WE=85436707;WS=85436689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,322:1.00:322
chr11	85436868	rs597480	G	C	6448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=107;NR=103;PP=2965;SC=CTCAGTATCAGCAAAATCTGT;SOR=0.702;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=210;TCF=107;TCR=103;TR=210;WE=85436876;WS=85436858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr11	85437896	rs491867	A	G	8057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=146;NR=130;PP=2965;SC=TGGATGATACACCCTGTGACT;SOR=0.739;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=276;TCF=146;TCR=130;TR=276;WE=85437904;WS=85437886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,309:1.00:309
chr11	85447611	rs680498	T	C	3232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=51;PP=1769;SC=TTTGTTGTGATGAGTGACCTT;SOR=0.902;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=65;TCR=51;TR=116;WE=85447619;WS=85447601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr11	85456703	rs647912	T	C	1588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=15;PP=1048;SC=GTGCTGCATCTTCTTCTGGCT;SOR=1.823;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=38;TCR=15;TR=53;WE=85456711;WS=85456693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr11	85576113	rs11389838	C	CT	1277.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.829;HP=3;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=11;PP=1695;ReadPosRankSum=1.399;SC=GAATTTTTCACTTTCGTATGT;SOR=0.590;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=77;TCF=47;TCR=30;TR=26;WE=85576135;WS=85576103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,48:0.46:104
chr11	85576127	rs36093844	C	T	1431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.478;HP=3;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.023;NF=35;NR=17;PP=1724;ReadPosRankSum=-0.473;SC=CGTATGTCTCCTTTCTAAACA;SOR=0.550;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=117;TCF=81;TCR=36;TR=52;WE=85576135;WS=85576103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,66:0.50:133
chr11	85584151	rs142446208	G	GT	194.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=171;ReadPosRankSum=-0.695;SC=CCCTAAATGTGTTTTCATAAT;SOR=1.179;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=6;WE=85584159;WS=85584141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr11	85593529	rs17817308	G	A	877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.602;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=8;PP=610;ReadPosRankSum=0.491;SC=TTGATCAAACGTGAATTACTG;SOR=1.596;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=90;TCF=68;TCR=22;TR=38;WE=85593537;WS=85593519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,41:0.41:100
chr11	85597163	rs17744699	C	T	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=63;ReadPosRankSum=1.834;SC=AATATCAGATCTTAACTTCTT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=85597171;WS=85597153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr11	85609806	rs10501601	A	T	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.957;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=61;ReadPosRankSum=0.874;SC=ACAGTGTAAAACAGCAAAAGC;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=5;WE=85609814;WS=85609800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr11	85610109	rs725459	G	C	692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.381;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=21;PP=507;ReadPosRankSum=1.622;SC=ATTTTTTTAAGTGGAAATGAC;SOR=0.389;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=63;TCF=16;TCR=47;TR=30;WE=85610117;WS=85610099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,31:0.46:68
chr11	85626569	rs60185300	G	A	808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=23;PP=576;ReadPosRankSum=-0.482;SC=TAATGATGATGATTTTTTTCA;SOR=0.823;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=64;TCF=20;TCR=44;TR=33;WE=85626577;WS=85626559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,35:0.52:67
chr11	85627039	rs3213934	A	G	1165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.958;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=12;PP=700;ReadPosRankSum=-0.522;SC=TTCAAAATGTATACATAATTA;SOR=0.404;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=91;TCF=68;TCR=23;TR=46;WE=85627047;WS=85627029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,51:0.50:101
chr11	85627108	rs7927222	T	C	2886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.422;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=59;PP=1902;ReadPosRankSum=1.243;SC=AAGTAGAAAGTAGAGACTTGA;SOR=0.594;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=254;TCF=143;TCR=111;TR=129;WE=85627116;WS=85627098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,139:0.49:284
chr11	85630411	rs12805520	C	T	3138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.416;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=65;PP=1930;ReadPosRankSum=2.173;SC=AACTTGGGCCCCCTGGGAGTG;SOR=0.695;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=269;TCF=142;TCR=127;TR=137;WE=85630419;WS=85630401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,150:0.49:304
chr11	85671702	rs618679	A	C	2104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=31;PP=1327;SC=CCATCTCCCAAAACAAGTAGC;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=42;TCR=31;TR=73;WE=85671710;WS=85671692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr11	85685285	rs17817648	T	C	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=4.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=406;ReadPosRankSum=1.142;SC=CAATCCTCAGTGGCAGAAAGT;SOR=1.214;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=19;WE=85685293;WS=85685275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr11	85685970	rs184790466	G	C	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=152;ReadPosRankSum=0.561;SC=GACTCAAAGGGTAACTTCCTC;SOR=0.412;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=9;WE=85685978;WS=85685960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr11	85692077	rs139710547	C	T	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.359;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=7;PP=437;ReadPosRankSum=-0.117;SC=AGTAACAATCCTTCTATTTAT;SOR=1.062;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=56;TCF=40;TCR=16;TR=29;WE=85692085;WS=85692067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,33:0.53:62
chr11	85692181	rs76719109	A	C	7762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=150;NR=128;PP=2965;SC=CCATTGTTGCAGCATTCCAAG;SOR=0.820;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=278;TCF=150;TCR=128;TR=278;WE=85692189;WS=85692171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,300:1.00:300
chr11	85692342	rs2508688	A	C	663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=19;PP=466;SC=ATACTTATATAGAACAGAGTA;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=22;WE=85692350;WS=85692332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	85714288	rs7951988	T	C	2556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=18;PP=1627;SC=TATGATTAAATCCATTTTATA;SOR=2.128;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=61;TCR=18;TR=79;WE=85714296;WS=85714278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr11	85725937	rs592297	C	T	2020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=25;PP=1241;SC=GTGCATCCATCTGATTCTGAA;SOR=1.073;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=65;TCF=40;TCR=25;TR=64;WE=85725945;WS=85725927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr11	85737502	rs541674	A	G	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.555;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.392;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=149;ReadPosRankSum=-0.478;SC=AACACATTCTATTAAGCTTAT;SOR=1.552;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=9;WE=85737510;WS=85737492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr11	85966177	rs7950735	G	T	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=308;ReadPosRankSum=1.170;SC=ATTTAAGATAGGATTGCGATT;SOR=0.781;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=56;TCF=37;TCR=19;TR=22;WE=85966185;WS=85966167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,25:0.39:64
chr11	85968623	rs974144	C	T	984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.48;ReadPosRankSum=2.613;SOR=0.683;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,50:0.53:94
chr11	85975481	rs35685239	A	ATATT	114.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.040;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=169;ReadPosRankSum=2.655;SC=AGTAAAGACTATATTTATTTA;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=5;WE=85975489;WS=85975471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr11	85977117	rs10898460	G	A	624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=5;PP=323;SC=TTTTGGTTTTGCATACAGGAT;SOR=1.519;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=21;WE=85977125;WS=85977107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	85979636	rs72285136	CGT	C,CGTGTGT	537.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=16;NF=0,0;NR=13,13;PP=501,512;SC=GTACTTCCATCGTGTGTGTGT;SOR=2.636;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=1;TCR=40;TR=13,13;WE=85979647;WS=85979626;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.67,0.33:21
chr11	86013380	rs11234604	G	A	1502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FS=1.250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.76;ReadPosRankSum=-0.860;SOR=0.803;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,76:0.49:154
chr11	86017602	rs11822824	T	C	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.059;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=14;PP=332;ReadPosRankSum=0.398;SC=ATATGACTTTTCCCCCTTTAG;SOR=0.465;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=22;TCR=28;TR=25;WE=86017610;WS=86017592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,26:0.48:54
chr11	86017658	rs291247	A	T	420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=16;PP=409;SC=ATTGTTTTTTAAAAAAGACAA;SOR=3.258;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=86017666;WS=86017648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	86037696	rs12295985	T	A	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=219;ReadPosRankSum=-0.854;SC=AAGATTAGACTGGAGCATGAA;SOR=0.765;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=13;WE=86037704;WS=86037686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr11	86037733	rs11419370	G	GC	128.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=121;ReadPosRankSum=0.391;SC=GATTTGGATGGGATGGAAGTG;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=86037741;WS=86037723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr11	86098680	rs292109	T	C	1300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.825;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=35;PP=756;ReadPosRankSum=1.411;SC=TAGTGCAGATTCATGGACTCA;SOR=0.971;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=148;TCF=68;TCR=80;TR=59;WE=86098688;WS=86098670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,66:0.39:168
chr11	86111700	rs12272824	A	T	1044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.954;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=13;PP=690;ReadPosRankSum=1.650;SC=ACTCGTTTTCATTCATTCTTT;SOR=0.297;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=60;TCF=44;TCR=16;TR=42;WE=86111708;WS=86111690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,45:0.67:67
chr11	86119396	rs4412777	G	A	438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=15;PP=376;SC=TTTTATTGGCGCAGGGTCTCA;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=86119404;WS=86119386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	86120280	.	CT	C	380.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.425;ClippingRankSum=0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=2.703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.88;ReadPosRankSum=-0.517;SOR=2.211;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,24:0.69:35
chr11	86123467	rs3741006	G	A	1681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.790;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=26;PP=1086;ReadPosRankSum=0.301;SC=TCAGTCCTGCGCTTAATGCTC;SOR=1.002;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=150;TCF=96;TCR=54;TR=76;WE=86123475;WS=86123457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,79:0.49:160
chr11	86130785	rs7932664	T	C	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.345;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=80;ReadPosRankSum=-0.489;SC=AGACCTTTGATCCATAAATTA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=5;WE=86130793;WS=86130775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr11	86130877	rs112703220	G	GT	405.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.243;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.050;NF=3;NR=10;PP=233;ReadPosRankSum=2.355;SC=AAACCAGAAGGTTTTTTTTGT;SOR=0.392;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=24;TCF=9;TCR=15;TR=13;WE=86130885;WS=86130867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr11	86133784	rs1056194	C	T	5540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=92;PP=2965;SC=CTTCGTTTCCCGGGGAAAGTT;SOR=0.772;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=184;TCF=92;TCR=92;TR=184;WE=86133792;WS=86133774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr11	86133937	rs11234648	A	G	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.767;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=128;ReadPosRankSum=-0.221;SC=CCCACCCCCAATTATTTCCTA;SOR=0.057;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=8;WE=86133945;WS=86133927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr11	86153739	rs2242142	G	T	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.060;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=7;PP=389;ReadPosRankSum=-0.241;SC=CTGGGTTACAGGTAGTGCAGC;SOR=0.966;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=60;TCF=44;TCR=16;TR=28;WE=86153747;WS=86153729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,29:0.47:62
chr11	86153911	rs7548	G	A	1323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=28;PP=759;ReadPosRankSum=1.031;SC=TGAGTGGTGGGTAGAGTCTCC;SOR=0.679;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=111;TCF=53;TCR=58;TR=56;WE=86153919;WS=86153901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,63:0.52:122
chr11	86157998	rs4944580	T	C	774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=6;PP=449;SC=CTTTCTGAAATTCAGTTTGCT;SOR=1.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=24;WE=86158006;WS=86157988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	86161147	rs4944581	A	C	1213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=18;NR=24;PP=863;SC=CCCCCACCTCAATGACTCCCA;SOR=1.230;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=18;TCR=24;TR=42;WE=86161155;WS=86161137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr11	86161388	rs1042780	C	G	2820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=63;PP=1763;ReadPosRankSum=0.653;SC=AAAGCTTGTTCTTGGTGATTC;SOR=0.699;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=280;TCF=141;TCR=139;TR=125;WE=86161396;WS=86161378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,138:0.44:311
chr11	86175193	rs11234662	A	G	2410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=48;PP=1515;ReadPosRankSum=0.280;SC=AAGTTGGCCAACCTTTAGCAA;SOR=0.692;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=187;TCF=99;TCR=88;TR=99;WE=86175201;WS=86175183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,110:0.50:218
chr11	86175300	rs605251	G	A	2627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=56;PP=1568;SC=ATTTGTTAAAGCATCATCAAG;SOR=1.790;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=27;TCR=56;TR=83;WE=86175308;WS=86175290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr11	86176041	rs3824952	G	C	562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.451;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=463;ReadPosRankSum=-1.015;SC=CAACTATGGGGTGACAGCCTT;SOR=1.127;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=62;TCF=49;TCR=13;TR=25;WE=86176049;WS=86176021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,26:0.37:70
chr11	86198529	.	GT	G	115.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.981;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.62;ReadPosRankSum=0.847;SOR=0.763;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,11:0.34:32
chr11	86198596	.	A	G	155	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;FR=0.5000;HP=7;HapScore=2;MGOF=34;MMLQ=19;MQ=60.0;NF=0;NR=10;PP=155;QD=18.9771212547;SC=GAGAGGGGGGAGTAAGAAGGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=10;WE=86198604;WS=86198586;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr11	86208897	rs609848	A	G	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=64;ReadPosRankSum=0.389;SC=ATGCCAAGAAAGAAATGGCCC;SOR=0.412;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=5;WE=86208905;WS=86208893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr11	86267633	rs17211115	C	T	2728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=56;PP=1691;ReadPosRankSum=0.517;SC=GCTGACAGGCCAGCCCCACGG;SOR=0.678;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=229;TCF=127;TCR=102;TR=123;WE=86267641;WS=86267623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,128:0.52:244
chr11	86267714	rs12287767	C	A	2856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.083;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=71;PP=1649;ReadPosRankSum=-1.567;SC=GCTTCTCGTTCCGGTCTTGGA;SOR=0.957;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=250;TCF=117;TCR=133;TR=128;WE=86267722;WS=86267704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,140:0.52:269
chr11	86650282	rs4631906	T	C	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.946;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=133;ReadPosRankSum=-1.578;SC=AACAAAAAATTCTAATTACAG;SOR=0.298;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=11;WE=86650290;WS=86650272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr11	86749027	rs61906171	G	C	1527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.466;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=16;PP=1055;ReadPosRankSum=0.441;SC=CTGGGCTCTCGCGCCCCTCCC;SOR=1.131;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=129;TCF=88;TCR=41;TR=64;WE=86749035;WS=86749017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,69:0.51:136
chr11	86782716	rs111987507	A	AT	294.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=10.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.56;ReadPosRankSum=1.857;SOR=1.114;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,19:0.36:53
chr11	86868278	rs633629	A	T	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=49;ReadPosRankSum=0.579;SC=AAGTTGCTGGATATATAATAG;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=5;WE=86868286;WS=86868268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,5:0.24:21
chr11	86868347	rs556139	C	T	1438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.15;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr11	86868361	rs59532014	GT	G	354.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=7.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.39;ReadPosRankSum=-2.163;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,23:0.48:48
chr11	86947765	rs567403	C	G	1478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.792;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=24;PP=1003;ReadPosRankSum=-0.970;SC=ATACCCCAAACAGTATCTCTT;SOR=0.845;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=177;TCF=106;TCR=71;TR=66;WE=86947773;WS=86947755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,75:0.37:204
chr11	87006776	rs10792935	G	A	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.891;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=12;PP=306;ReadPosRankSum=-2.362;SC=ATAGGTACTTGTATCTCAAAA;SOR=0.477;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=69;TCF=43;TCR=26;TR=32;WE=87006784;WS=87006766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,38:0.49:77
chr11	87013252	rs2276103	G	A	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.600;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=35;ReadPosRankSum=1.221;SC=TTGCCAAAGCGTATTTGTTTA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=4;WE=87013260;WS=87013242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr11	87013438	rs2276102	G	A	3259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=76;PP=2004;ReadPosRankSum=0.602;SC=GGAAAAACCCGGAAGAATGAA;SOR=0.671;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=309;TCF=150;TCR=159;TR=147;WE=87013446;WS=87013428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:179,160:0.47:339
chr11	87016818	rs111653145	A	AAAATAAAT	53.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=1;PP=75;SC=ACTTTATCTCAAAATAAATAA;SOR=0.693;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=2;TCF=1;TCR=1;TR=2;WE=87016826;WS=87016808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr11	87032215	rs7112344	T	C	1815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=11;PP=1252;SC=TATATTAATATTTGTTTACTG;SOR=2.797;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=46;TCR=11;TR=57;WE=87032223;WS=87032205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr11	87846757	rs9144	C	T	1901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=11;PP=1338;SC=AGAGAATATACTGAAATCTGG;SOR=3.126;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=62;TCF=51;TCR=11;TR=61;WE=87846765;WS=87846747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr11	87846803	rs675578	G	A	1859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=28;PP=1158;ReadPosRankSum=1.488;SC=GCCAGTCCTTGACTTGACAGC;SOR=0.730;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=162;TCF=103;TCR=59;TR=82;WE=87846811;WS=87846793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,90:0.51:178
chr11	87847018	rs3740925	C	T	2489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=43;PP=1731;SC=TTCTCTCTCACTGAAAAAACA;SOR=1.139;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=34;TCR=43;TR=77;WE=87847026;WS=87847008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr11	87908346	rs302647	C	G	645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=403;ReadPosRankSum=0.471;SC=TCCCCCCGCGCTCACCTGCGA;SOR=0.843;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=57;TCF=44;TCR=13;TR=25;WE=87908354;WS=87908336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,29:0.47:62
chr11	87908448	rs302646	A	G	6812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=133;NR=104;PP=2965;SC=GGTAGTGCGAAGAGAAGTTCT;SOR=0.867;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=238;TCF=134;TCR=104;TR=237;WE=87908456;WS=87908438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,259:1.00:259
chr11	87909673	rs35854553	T	A	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5081;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=3;PP=57;ReadPosRankSum=-0.812;SC=AGAAGGTAAATTTTTTTGAGG;SOR=0.368;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=6;WE=87909681;WS=87909663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr11	88027209	rs3888798	T	C	1774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.551;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=37;PP=868;ReadPosRankSum=0.532;SC=GCCACTGCTATGCTCTCAATT;SOR=0.628;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=157;TCF=84;TCR=73;TR=77;WE=88027217;WS=88027199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,89:0.50:177
chr11	88027393	rs17594	A	C	1464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.850;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=33;PP=780;ReadPosRankSum=-0.353;SC=CTCTTAGACCAGTGTGGTGGT;SOR=0.968;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=134;TCF=69;TCR=65;TR=63;WE=88027401;WS=88027383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,73:0.47:155
chr11	88033661	rs217116	A	G	2179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=21;PP=1403;SC=AAATAGTTCCAAACAAATTAA;SOR=1.816;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=56;TCR=21;TR=77;WE=88033669;WS=88033651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr11	88045583	rs217086	A	G	4918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=91;NR=69;PP=2674;SC=AAGGTGTGCTATGTTGACATA;SOR=0.808;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=160;TCF=91;TCR=69;TR=160;WE=88045591;WS=88045573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr11	88045815	rs5793312	C	CT	692.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=538;SC=AAATGTGCCCCTTTCAAAACA;SOR=1.931;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=14;WE=88045823;WS=88045805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr11	88059683	rs217060	G	A	395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.27;SOR=2.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	88061405	rs580743	A	C	832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-3.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.233;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=31;PP=529;ReadPosRankSum=-0.554;SC=CATTATGTTGAGATTAAGCAT;SOR=0.392;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=83;TCF=17;TCR=66;TR=41;WE=88061413;WS=88061395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,42:0.48:88
chr11	88068052	rs217076	G	T	896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=5;PP=567;SC=ATCAGAAGAGGTTTCAGATAT;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=31;WE=88068060;WS=88068042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	88068329	rs217077	T	A	316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=13;PP=321;SC=AATTTCAATTTTAATTGTGCT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=88068337;WS=88068319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	88070563	rs580808	C	T	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=198;ReadPosRankSum=-0.613;SC=ATGCTCTGGCCACCCACAAGC;SOR=0.540;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=11;WE=88070571;WS=88070553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr11	88242024	rs2941563	T	G	7701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=152;NR=113;PP=2965;ReadPosRankSum=1.552;SC=GCTGCGCGCCTCCCGTGACTT;SOR=0.300;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=266;TCF=153;TCR=113;TR=265;WE=88242032;WS=88242014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,297:1.00:298
chr11	88258689	rs4753486	C	T	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.854;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=291;ReadPosRankSum=1.075;SC=AATGGGGGTTCCTGCTTCTCA;SOR=1.329;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=16;WE=88258697;WS=88258679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr11	88338165	rs3816649	G	A	1987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=36;PP=1139;SC=TAGCTTTGAGGTACAAATCTA;SOR=1.394;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=25;TCR=36;TR=61;WE=88338173;WS=88338155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr11	88645129	rs626218	T	A	3247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.61;QD=27.76;SOR=1.713;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr11	88925242	rs10765196	G	C	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.710;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=17;PP=419;ReadPosRankSum=-0.072;SC=CAGCACATAGGTAAAGCCTCC;SOR=1.055;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=73;TCF=39;TCR=34;TR=31;WE=88925250;WS=88925232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,43:0.45:95
chr11	88925328	rs10765197	A	C	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.464;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=142;ReadPosRankSum=0.516;SC=CTAAATATTTATCCTACAAAT;SOR=0.438;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=10;TCR=21;TR=12;WE=88925336;WS=88925318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr11	89017961	rs1126809	G	A	2773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.962;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.599;NF=71;NR=52;PP=1632;ReadPosRankSum=0.977;SC=CAGTGGCTCCGAAGGCACCGT;SOR=0.621;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=231;TCF=134;TCR=97;TR=123;WE=89017969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,136:0.53:255
chr11	89133449	rs317139	C	T	10786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=402;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=173;NR=185;PP=2965;SC=AGGGATGACTCATGACCGAAA;SOR=0.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=358;TCF=173;TCR=185;TR=358;WE=89133457;WS=89133439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,402:1.00:402
chr11	89221958	rs597046	G	C	39.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr11	89223616	rs490934	C	G	2369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=24;PP=1524;SC=TCCAAGTTCACCTTACTTACC;SOR=1.638;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=53;TCR=24;TR=77;WE=89223624;WS=89223606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr11	89223931	rs2304500	G	A	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.652;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=513;ReadPosRankSum=0.794;SC=CTGAGACTAAGCATTTGGGTT;SOR=0.424;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=45;TCF=39;TCR=6;TR=25;WE=89223939;WS=89223921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,26:0.57:46
chr11	89224101	rs3816123	G	T	3665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.409;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=1.286;NF=67;NR=71;PP=1874;ReadPosRankSum=-0.193;SC=CTGTATTCACGGAAAATGACC;SOR=0.690;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=271;TCF=137;TCR=134;TR=138;WE=89224109;WS=89224091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,176:0.55:320
chr11	89224131	rs34495256	T	TCTC	5308.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.180;HP=1;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.08;MQRankSum=1.273;NF=8;NR=52;PP=2880;ReadPosRankSum=-1.622;SC=TTCCTCCACATCTCTCCCATC;SOR=0.867;Source=Platypus;TCF=21;TR=60;WE=89224139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,137:0.56:245
chr11	89224229	rs35177439	G	GT	2145.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.274;HP=5;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=26;PP=1545;ReadPosRankSum=0.651;SC=ATAAAGTTTTGTAAGTTGAGA;SOR=0.581;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=104;TCF=47;TCR=57;TR=41;WE=89224237;WS=89224219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,71:0.47:151
chr11	89224326	rs10830279	G	A	2231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.975;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=58;PP=1379;ReadPosRankSum=-0.175;SC=AGGACAGAGAGAACGCAAGGA;SOR=0.840;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=277;TCF=138;TCR=139;TR=110;WE=89224334;WS=89224316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,119:0.40:295
chr11	89224453	rs2289125	A	C	1936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=47;PP=1358;SC=TGCCCGCCGGACCGAGAAGGA;SOR=1.897;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=19;TCR=47;TR=66;WE=89224461;WS=89224443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr11	89370552	rs72971036	G	C	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=2.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.99;ReadPosRankSum=1.281;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr11	89370598	rs12363392	T	C	640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.536;NF=21;NR=7;PP=424;ReadPosRankSum=0.430;SC=CTCACTCTGTTACCAGGCTCC;SOR=0.582;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=66;TCF=48;TCR=18;TR=28;WE=89370606;WS=89370588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,31:0.46:68
chr11	89370719	rs12363079	A	G	2036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.511;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.324;NF=41;NR=45;PP=1135;ReadPosRankSum=0.002;SC=CAGGTCAGCAATCTGGACAGG;SOR=0.635;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=196;TCF=95;TCR=101;TR=86;WE=89370727;WS=89370709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,97:0.46:209
chr11	89372210	rs7924505	C	T	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-2.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.900;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.197;NF=21;NR=13;PP=449;ReadPosRankSum=-0.656;SC=AATTGGTTTGCAACTTAAAAA;SOR=0.337;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=67;TCF=47;TCR=20;TR=34;WE=89372218;WS=89372200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,29:0.53:55
chr11	89372292	rs7942274	T	C	1623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.223;NF=43;NR=37;PP=1299;ReadPosRankSum=0.360;SC=TCACCTAATGTCAGAGGTAAT;SOR=0.681;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=146;TCF=81;TCR=65;TR=80;WE=89372300;WS=89372282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,74:0.55:135
chr11	89372341	rs7942295	T	G	2354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.155;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.513;NF=57;NR=46;PP=1667;ReadPosRankSum=1.414;SC=CATACAACAATAATGAAAAAT;SOR=0.824;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=181;TCF=97;TCR=84;TR=103;WE=89372349;WS=89372331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,105:0.56:186
chr11	89372524	rs7945304	T	C	1047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-8.899;NF=21;NR=38;PP=809;ReadPosRankSum=-0.742;SC=AGCACATTCTTGAAAGTTTAT;SOR=0.725;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=111;TCF=38;TCR=73;TR=59;WE=89372532;WS=89372514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,53:0.49:108
chr11	89378138	rs2072623	C	A	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.136;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-7.274;NF=23;NR=8;PP=528;ReadPosRankSum=0.663;SC=ATTAAACATTCATATCTAACC;SOR=1.293;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=71;TCF=50;TCR=21;TR=31;WE=89378146;WS=89378128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,17:0.27:64
chr11	89378269	rs11018694	C	T	1183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.150;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-13.335;NF=43;NR=43;PP=1184;ReadPosRankSum=-0.434;SC=CTGGATTCTGCTGAGCTAGCT;SOR=0.768;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=203;TCF=102;TCR=101;TR=86;WE=89378277;WS=89378259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,69:0.34:200
chr11	89392653	rs10765230	A	G	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.500;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-2.646;NF=7;NR=2;PP=104;ReadPosRankSum=0.816;SC=TGATATTACCAAATCTGGAAC;SOR=0.143;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=9;WE=89392661;WS=89392643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,6:0.24:25
chr11	89392799	rs10830330	G	A	1581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.940;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.062;NF=38;NR=32;PP=972;ReadPosRankSum=0.478;SC=CTATCCAGACGGTTGGAATCT;SOR=0.548;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=143;TCF=80;TCR=63;TR=70;WE=89392807;WS=89392789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,78:0.48:163
chr11	89402557	rs80292557	G	T	1974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.157;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-11.828;NF=59;NR=37;PP=1444;ReadPosRankSum=-0.806;SC=TAATAATGTTGTTTTGTGTCC;SOR=0.818;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=176;TCF=103;TCR=73;TR=96;WE=89402565;WS=89402546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,94:0.51:184
chr11	89402687	rs11018718	T	C	1200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-2.290;NF=22;NR=35;PP=816;ReadPosRankSum=-0.950;SC=GAGACTATTTTAATTTTAACT;SOR=0.776;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=103;TCF=41;TCR=62;TR=57;WE=89402695;WS=89402677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,53:0.56:95
chr11	89402728	rs11018719	A	G	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=10.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.67;MQRankSum=0.067;QD=13.12;ReadPosRankSum=-0.926;SOR=3.538;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr11	89403414	rs10734120	C	T	311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=1;PP=201;SC=ACGCCTTTTCCCCTGTTAATC;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=89403422;WS=89403404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	89405190	rs10047486	A	G	1250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=2.385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQRankSum=-0.712;QD=10.42;ReadPosRankSum=0.444;SOR=0.497;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,61:0.51:120
chr11	89407164	rs59743058	C	CT	131.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=10.804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQRankSum=-2.988;QD=3.21;ReadPosRankSum=-0.103;SOR=3.138;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,11:0.27:41
chr11	89407391	rs2075536	A	C	1249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.225;NF=16;NR=36;PP=856;ReadPosRankSum=1.692;SC=GTAGCCAGGAATTATTTGCCA;SOR=0.744;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=95;TCF=31;TCR=64;TR=52;WE=89407399;WS=89407381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,55:0.54:102
chr11	89409158	rs4753234	A	G	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.98;MQRankSum=-2.929;QD=6.18;ReadPosRankSum=-2.790;SOR=1.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,6:0.23:26
chr11	89409166	rs4753235	G	C	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=2.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.63;MQRankSum=-2.718;QD=6.36;ReadPosRankSum=-1.876;SOR=1.646;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,8:0.24:33
chr11	89413781	rs10830339	C	G	527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.388;NF=16;NR=4;PP=333;ReadPosRankSum=-0.016;SC=TTTCAGGAAACTACACTCTGA;SOR=0.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=20;WE=89413789;WS=89413771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,22:0.56:39
chr11	89413850	rs10830340	C	T	2022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.772;NF=30;NR=22;PP=655;ReadPosRankSum=-0.028;SC=AAGAGGTATACAATTACATAT;SOR=0.689;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=104;TCF=64;TCR=40;TR=52;WE=89413858;WS=89413840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,56:0.48:117
chr11	89413867	rs7128813	G	A	2034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.402;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.628;NF=25;NR=24;PP=664;ReadPosRankSum=-0.338;SC=ATATAATTTAGGAAAACCCAA;SOR=0.569;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=109;TCF=60;TCR=49;TR=49;WE=89413875;WS=89413857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,57:0.45:127
chr11	89413975	rs10830341	C	T	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.020;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=17;PP=317;ReadPosRankSum=-0.889;SC=TATGACATCACATCTTCACAG;SOR=0.527;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=55;TCF=18;TCR=37;TR=27;WE=89413983;WS=89413965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,33:0.52:64
chr11	89424716	rs2035677	A	G	1989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-6.385;NF=22;NR=42;PP=1048;ReadPosRankSum=1.207;SC=ACATATATGTACATATGTGTA;SOR=0.675;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=99;TCF=33;TCR=66;TR=64;WE=89424724;WS=89424706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,63:0.58:108
chr11	89424736	rs6144434	GTGTGTATATATATATATATATATATA	GTA,G	1097.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=1.364;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-5.466;NF=2,2;NR=16,16;PP=433,125;ReadPosRankSum=5.133;SC=ATATGTGTGTGTGTGTATATA;SOR=0.412;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=18,18;WE=89424769;WS=89424726;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.61:57
chr11	89424740	rs2130024	G	A	169.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=1.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.77;MQRankSum=3.801;QD=3.77;ReadPosRankSum=-3.893;SOR=0.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,12:0.27:45
chr11	89443429	rs10830355	G	A	1019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.233;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=9;PP=743;ReadPosRankSum=0.292;SC=TATGCCATGGGGGAAAGAATG;SOR=1.085;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=86;TCF=66;TCR=20;TR=41;WE=89443437;WS=89443419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,43:0.48:90
chr11	89443808	rs11018745	A	C	1387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=5.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.991;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-12.286;NF=30;NR=44;PP=1221;ReadPosRankSum=-0.939;SC=TGTGTTTTCTATGCTCTCAAT;SOR=0.885;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=180;TCF=74;TCR=106;TR=74;WE=89443816;WS=89443798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,63:0.34:185
chr11	89443939	rs10830356	C	A	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.003;NF=0;NR=12;PP=238;ReadPosRankSum=0.678;SC=ACAGGTAATACGGAAAGATAT;SOR=0.560;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=12;WE=89443947;WS=89443929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr11	89444754	rs7111680	G	A	887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.722;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-7.074;NF=15;NR=28;PP=527;ReadPosRankSum=-0.223;SC=AGTTAACCATGTGTCCCCTGA;SOR=0.588;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=39;TCR=75;TR=43;WE=89444762;WS=89444744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,47:0.38:124
chr11	89447256	rs1967075	A	G	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.361;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=86;ReadPosRankSum=0.480;SC=GCATTAAACTATATTTAGTAG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=5;WE=89447264;WS=89447254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr11	89447313	rs1967074	A	G	611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.963;NF=18;NR=8;PP=427;ReadPosRankSum=1.371;SC=TAAGGAAAGAATAAAACCACT;SOR=0.693;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=47;TCF=34;TCR=13;TR=26;WE=89447321;WS=89447303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,27:0.50:54
chr11	89451057	rs3881253	A	G	2880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-8.584;NF=27;NR=51;PP=2365;ReadPosRankSum=1.590;SC=ACAGGTCACAAACCTGACCAA;SOR=0.660;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=149;TCF=51;TCR=98;TR=78;WE=89451079;WS=89451047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,82:0.52:157
chr11	89451071	rs3881254	C	A	2627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-7.270;NF=19;NR=41;PP=2365;ReadPosRankSum=1.671;SC=TGACCAAGGCCTTGGGAATTC;SOR=0.779;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=106;TCF=34;TCR=72;TR=60;WE=89451079;WS=89451047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,64:0.56:115
chr11	89531540	rs12417980	C	T	3189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=620;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.565;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.313;NF=95;NR=88;PP=2086;ReadPosRankSum=-0.797;SC=CCCGCCTTTCCATCTATCTTC;SOR=0.700;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=565;TCF=283;TCR=282;TR=183;WE=89531548;WS=89531519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:428,192:0.31:620
chr11	89867872	rs1892887	C	T	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.908;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=106;ReadPosRankSum=-0.704;SC=TGTTTCTCTGCAGCCCCGAAG;SOR=0.069;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=12;WE=89867880;WS=89867862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr11	89868582	rs7125969	A	G	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=363;ReadPosRankSum=-0.829;SC=CATTTAATATAAACATTATTT;SOR=0.719;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=8;WE=89868602;WS=89868572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr11	89868594	rs7129238	T	G	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=4;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=363;ReadPosRankSum=-0.438;SC=ACATTATTTTTTAAAGCTCAC;SOR=0.922;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=8;WE=89868602;WS=89868572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr11	89868614	rs7110402	C	T	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.405;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=136;ReadPosRankSum=1.429;SC=CCATGATCTACTTGTCAGATA;SOR=1.398;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=38;TCF=28;TCR=10;TR=10;WE=89868622;WS=89868604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,11:0.27:41
chr11	89868692	rs7109578	G	A	726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.757;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=10;PP=485;ReadPosRankSum=-0.692;SC=GATTTTGTGTGTATGTGTGCA;SOR=1.002;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=100;TCF=69;TCR=31;TR=37;WE=89868700;WS=89868682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,37:0.33:111
chr11	89868755	rs10734123	G	A	1558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.012;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=37;PP=983;ReadPosRankSum=0.360;SC=TCAAAGAAACGACCACTTCTG;SOR=0.622;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=224;TCF=123;TCR=101;TR=82;WE=89868763;WS=89868745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,87:0.35:251
chr11	89880469	rs2186748	T	C	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.569;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=294;ReadPosRankSum=-0.658;SC=TAGTCTTTAATGCCCTCTTAT;SOR=0.197;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=54;TCF=43;TCR=11;TR=26;WE=89880477;WS=89880459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,28:0.45:62
chr11	89883595	rs5793433	GTT	G	149.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.345;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.97;ReadPosRankSum=-1.242;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr11	89883893	rs56341659	C	T	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=48;ReadPosRankSum=0.319;SC=TTCTTTTTTTCTTCCTATTTG;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=89883901;WS=89883883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,1:0.25:4
chr11	89896457	rs489009	C	T	1876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.537;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=27;PP=1146;ReadPosRankSum=0.056;SC=TTGTAGGTTTCTTGAACGTAT;SOR=0.739;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=169;TCF=113;TCR=56;TR=80;WE=89896465;WS=89896447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,91:0.46:198
chr11	89902276	rs10741322	A	G	61.81	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.45;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr11	89903334	rs3758754	C	T	1418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.340;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=33;PP=916;ReadPosRankSum=2.283;SC=TTCATATGTTCTCTTTTGAAT;SOR=0.826;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=124;TCF=58;TCR=66;TR=61;WE=89903342;WS=89903324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,67:0.49:138
chr11	89909096	rs140876943	A	ATGTGTG	817.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.151;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=475;ReadPosRankSum=1.324;SC=TTACTTGTTTATGTGTGTGTG;SOR=1.053;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=33;TCF=18;TCR=15;TR=13;WE=89909105;WS=89909086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,25:0.38:65
chr11	89914886	rs200037090	T	TC	318.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.52;ReadPosRankSum=-1.478;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,12:0.92:13
chr11	89914894	.	TAAAAAA	T	184.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=-0.000;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.55;MQRankSum=1.150;QD=23.09;ReadPosRankSum=-1.465;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr11	89916053	rs9804494	C	G	1120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=10;PP=677;ReadPosRankSum=3.190;SC=CTGCGGTTTGCGTTATAATTA;SOR=0.625;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=55;TCR=18;TR=40;WE=89916061;WS=89916043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,46:0.58:79
chr11	89916080	rs9804632	G	C	1856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.238;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=19;PP=1177;ReadPosRankSum=0.895;SC=TGTTCTTCTCGAAGTCCCATT;SOR=0.936;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=139;TCF=101;TCR=38;TR=73;WE=89916088;WS=89916070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,83:0.54:154
chr11	89935586	rs1045861	G	T	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.560;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.732;NF=5;NR=0;PP=72;ReadPosRankSum=-1.732;SC=ATCTGTTGTGGCATCTTTTTG;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=5;WE=89935594;WS=89935576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr11	89936093	rs3758757	T	C	893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=2.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.41;ReadPosRankSum=-1.647;SOR=0.684;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,49:0.52:95
chr11	89938615	rs36109540	AAG	A	232.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=166;ReadPosRankSum=-1.442;SC=CTATTTTTGGAAGAGTTACTT;SOR=0.141;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=5;WE=89938624;WS=89938609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr11	89939448	rs1943381	G	A	993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=17;PP=504;ReadPosRankSum=-1.485;SC=TGTCTAAAAAGGAAACAAAGA;SOR=0.639;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=106;TCF=65;TCR=41;TR=45;WE=89939456;WS=89939438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,52:0.44:119
chr11	89939569	rs723715	T	C	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=12;PP=247;ReadPosRankSum=0.646;SC=AGAAAATTCATAAATCCATCC;SOR=0.678;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=41;TCF=15;TCR=26;TR=19;WE=89939577;WS=89939559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,20:0.47:43
chr11	89943548	rs3832739	T	TCAGA	830.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.450;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=691;ReadPosRankSum=-0.657;SC=ATGATGCTACTCAGAGTCTCT;SOR=1.022;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=40;TCF=28;TCR=12;TR=14;WE=89943556;WS=89943538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,20:0.43:46
chr11	89951367	rs34787918	GA	G	534.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQRankSum=1.001;QD=9.22;ReadPosRankSum=-0.329;SOR=0.984;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,32:0.55:58
chr11	89955872	rs3740821	A	G	636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=16;PP=409;ReadPosRankSum=0.880;SC=GCGCTCGCCAAGGGAACGCGG;SOR=0.826;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=44;TCF=22;TCR=22;TR=30;WE=89955880;WS=89955862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,30:0.68:44
chr11	91536418	rs4130617	G	A	1579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=18;PP=1104;ReadPosRankSum=-2.365;SC=GGAAAGGTATGAGCCATTATG;SOR=0.714;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=121;TCF=86;TCR=35;TR=64;WE=91536426;WS=91536408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,69:0.54:127
chr11	91545212	rs4753345	C	G	2798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=53;PP=1552;SC=CACAGCAAGACTATTTAACTG;SOR=1.056;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=97;TCF=43;TCR=54;TR=96;WE=91545220;WS=91545202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr11	92497990	rs3847524	C	G	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=59;ReadPosRankSum=1.200;SC=CAGATCCAAACTCTACAACAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=4;WE=92497998;WS=92497987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr11	92531356	rs7949157	A	G	2827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.408;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=61;PP=1913;ReadPosRankSum=-2.141;SC=ATCACCACTCAGAAGGCCCTG;SOR=0.720;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=295;TCF=161;TCR=134;TR=136;WE=92531364;WS=92531346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,143:0.45:316
chr11	92532677	rs12362722	T	C	3561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.967;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=66;PP=2266;ReadPosRankSum=-0.014;SC=GCGGAAAACCTTCTTTGTCTA;SOR=0.646;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=292;TCF=150;TCR=142;TR=141;WE=92532685;WS=92532667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,160:0.50:323
chr11	92534442	rs3847531	A	G	3414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.860;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=68;PP=2035;ReadPosRankSum=-1.958;SC=CAAAGGGGGCATATTCGTCAT;SOR=0.625;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=283;TCF=152;TCR=131;TR=144;WE=92534450;WS=92534432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,162:0.52:311
chr11	92564767	rs6483189	T	G	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=8;PP=596;ReadPosRankSum=-1.883;SC=GCCCACTCATTTTCCTGTGTC;SOR=0.858;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=64;TCF=51;TCR=13;TR=33;WE=92564775;WS=92564757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,35:0.50:70
chr11	92573911	rs10765565	G	T	509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=317;ReadPosRankSum=2.628;SC=TCTGGAATACGTGTTGTGTGT;SOR=0.661;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=57;TCF=19;TCR=38;TR=21;WE=92573919;WS=92573901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,25:0.36:69
chr11	92590448	rs4753069	A	G	1038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=18;PP=607;ReadPosRankSum=1.555;SC=GCAGTGTGTCAGTTATGAAGC;SOR=0.729;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=88;TCF=51;TCR=37;TR=44;WE=92590456;WS=92590438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,49:0.51:97
chr11	92592536	rs35216054	GT	G	542.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.273;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.735;NF=0;NR=17;PP=476;ReadPosRankSum=1.450;SC=TCATGTTAGTGTTTTGGCTCT;SOR=0.487;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=2;TCR=45;TR=17;WE=92592544;WS=92592526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,23:0.41:56
chr11	92599851	rs3847553	G	A	1524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.180;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=28;PP=879;ReadPosRankSum=0.757;SC=CAGGGTGTAGGGAACATATTC;SOR=0.798;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=161;TCF=90;TCR=71;TR=67;WE=92599859;WS=92599841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,76:0.42:179
chr11	92615756	rs77951320	C	G	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=2.609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.23;ReadPosRankSum=0.156;SOR=2.200;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,18:0.72:25
chr11	92620160	rs12421052	A	T	1555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.599;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=29;PP=991;ReadPosRankSum=-1.304;SC=TTCACTGTCCATGAAGACAAA;SOR=0.613;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=139;TCF=83;TCR=56;TR=68;WE=92620168;WS=92620150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,74:0.48:154
chr11	92623608	rs7118363	A	G	197.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=3;PP=102;SC=CCAGCAAAGCACCAACTCCAG;SOR=0.693;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=7;WE=92623616;WS=92623600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	92718127	rs1447350	G	C	3741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=61;NR=73;PP=2350;SC=ATTTGGGGAAGCCTGTCTTCC;SOR=1.011;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=134;TCF=61;TCR=73;TR=134;WE=92718135;WS=92718117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr11	92718163	rs1447351	A	G	2437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=56;PP=1656;SC=AAGTCTGGTCAGAGGTGCCAC;SOR=1.939;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=24;TCR=56;TR=80;WE=92718171;WS=92718153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr11	92915017	rs17631593	C	T	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=299;ReadPosRankSum=-0.573;SC=ATAAAACCACCTCTTGAAATA;SOR=0.922;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=16;WE=92915025;WS=92915007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr11	93085537	rs10831029	T	G	2772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=61;PP=1594;ReadPosRankSum=-1.086;SC=ACCAGCTCCCTGGAGAATGCT;SOR=0.687;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=293;TCF=156;TCR=137;TR=132;WE=93085545;WS=93085527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:177,146:0.45:323
chr11	93118515	rs3020057	G	A	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.564;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=7;PP=267;ReadPosRankSum=0.742;SC=TGCATTGTACGTTATGATAAC;SOR=1.251;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=47;TCF=28;TCR=19;TR=19;WE=93118523;WS=93118505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,19:0.37:51
chr11	93122128	rs72972364	C	T	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=417;ReadPosRankSum=0.146;SC=ACAATATAATCGTTACAATTT;SOR=0.646;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=40;TCF=32;TCR=8;TR=24;WE=93122136;WS=93122118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,24:0.60:40
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chr11	93122446	.	TC	AA	40	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=40;QD=46.7339374311;SC=CCGACATTTTTCTGTGTGAGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=2;WE=93122455;WS=93122436;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:2,2:0.50:4
chr11	93122447	rs3020055	C	A	46.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.524;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,2:0.40:5
chr11	93141580	rs2259633	C	A	908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.622;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=25;PP=594;ReadPosRankSum=0.900;SC=AAAAGTGGAACAAAATGAAGA;SOR=0.467;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=99;TCF=37;TCR=62;TR=42;WE=93141588;WS=93141570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,45:0.42:107
chr11	93170909	rs375443728	T	TC	72.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=9;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=85;ReadPosRankSum=-0.437;SC=TTTATTTGCTTCCCCCCCCCA;SOR=2.636;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=6;WE=93170917;WS=93170899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr11	93170925	rs2605584	G	A	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.693;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=124;ReadPosRankSum=-1.383;SC=CCCCACCCCCGCCAAGAAAAA;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=7;WE=93170933;WS=93170915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr11	93212161	rs2605594	A	G	2550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=55;PP=1625;ReadPosRankSum=0.011;SC=TGGGGTCCGCAGCCGGCTGCG;SOR=0.671;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=261;TCF=149;TCR=112;TR=123;WE=93212169;WS=93212151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,134:0.45:295
chr11	93212254	rs2658797	C	T	4323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=415;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=98;PP=2404;ReadPosRankSum=0.224;SC=GCGTGGGCAGCACCACTGTAG;SOR=0.697;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=368;TCF=172;TCR=196;TR=185;WE=93212262;WS=93212244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:204,211:0.51:415
chr11	93400052	rs7123801	G	A	245.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=8;PP=184;SC=TTACATTAGAGTGTTCTAAAT;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=93400060;WS=93400042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	93400796	rs67112133	C	T	1435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.155;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=25;PP=862;ReadPosRankSum=-0.306;SC=AAAGAGATATCGCCTTACAGA;SOR=0.495;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=127;TCF=82;TCR=45;TR=64;WE=93400804;WS=93400786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,70:0.48:145
chr11	93402006	rs61743303	A	G	861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.97;ReadPosRankSum=-0.329;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,44:0.61:72
chr11	93402096	rs1944101	C	A	787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=17;PP=490;SC=AACAAAAAACCTGGTAAAGTA;SOR=1.688;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=9;TCR=17;TR=26;WE=93402104;WS=93402086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr11	93403067	rs1954994	G	A	323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=240;SC=TTGTACAGGAGTATATCTGGA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=93403075;WS=93403057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	93408831	rs10831088	G	A	5093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=82;PP=2814;SC=GACACAAAACGGGTGATTGAC;SOR=0.826;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=161;TCF=79;TCR=82;TR=161;WE=93408839;WS=93408821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr11	93408958	rs35646565	C	CA	604.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=17;PP=639;SC=TAATAATAATCAAAACCTTTT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=93408966;WS=93408948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	93412774	rs1944100	A	G	2067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=52;PP=1492;SC=ATAGCATTGCAGGACTGATTA;SOR=2.737;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=14;TCR=52;TR=66;WE=93412782;WS=93412764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr11	93425159	rs4753495	C	A	5424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=89;NR=88;PP=2965;SC=CCTCAAGAAGCAGCAGCCAGG;SOR=0.808;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=177;TCF=89;TCR=88;TR=177;WE=93425178;WS=93425149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr11	93454524	rs17651231	T	C	1905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=30;PP=907;ReadPosRankSum=1.352;SC=TGTTAAGTTATGCTGTGGAGG;SOR=0.649;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=153;TCF=92;TCR=61;TR=79;WE=93454532;WS=93454514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,92:0.54:170
chr11	93454831	rs71064775	G	GGT	130.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=1.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.74;ReadPosRankSum=-0.969;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,10:0.29:35
chr11	93460160	rs67879380	A	C	2646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.433;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=55;PP=1803;ReadPosRankSum=-0.856;SC=CAATGTTTTGAACAGCTTCAG;SOR=0.802;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=265;TCF=143;TCR=122;TR=122;WE=93460168;WS=93460150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,130:0.46:280
chr11	93463145	.	AT	A	276.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.138;ClippingRankSum=0.000;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=3.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.39;ReadPosRankSum=-0.128;SOR=0.451;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr11	93463332	rs7101779	A	G	2754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=45;PP=1613;SC=TAACTGAGGGAGAAGGACTTA;SOR=0.859;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=46;TCR=45;TR=91;WE=93463340;WS=93463322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr11	93463666	rs7119918	C	A	2509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=35;PP=1149;SC=GGCAACAATCCTGGATTATTA;SOR=0.778;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=41;TCR=35;TR=75;WE=93463674;WS=93463656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr11	93463726	rs34898352	T	TAG	1349.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.203;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=623;ReadPosRankSum=1.152;SC=AGGAGTGCTATGGCTTCCTAT;SOR=0.454;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=15;WE=93463734;WS=93463716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,35:0.67:52
chr11	93466866	rs2155248	G	T	1940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=48;PP=1364;SC=AGGGGTTCGAGGCTACAGTGA;SOR=2.602;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=14;TCR=48;TR=62;WE=93466874;WS=93466856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr11	93474570	rs11280945	T	TGCGTGA	16222.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.55;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=43;NR=83;PP=2965;SC=ACTGGCCTGGTGTCCTAGAGC;SOR=1.039;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=137;TCF=50;TCR=87;TR=126;WE=93474578;WS=93474560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,346:1.00:346
chr11	93474678	rs630648	G	C	5608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=111;PP=2965;SC=TATTTCCGTGGCCCAAGTAAT;SOR=1.318;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=185;TCF=74;TCR=111;TR=185;WE=93474686;WS=93474668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr11	93474791	rs623510	G	T	572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=16;PP=407;SC=GCGCAGGGAGGACTGACTAAC;SOR=3.056;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=93474799;WS=93474781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	93474827	rs631116	T	C	110.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=4;PP=84;SC=GCTCGCGTATTCTGAGGAGGC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=93474835;WS=93474817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr11	93480708	rs624856	T	C	284.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=6;PP=107;SC=TTACTACTTATGTATATCTAT;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=7;WE=93480716;WS=93480698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	93480717	rs5793654	A	ATATCTTACT	187.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.57;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	93487008	rs623993	G	A	1001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=12;PP=679;SC=CTGTTGATCAGTTGGCAAGGA;SOR=0.818;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=14;TCR=12;TR=26;WE=93487016;WS=93486998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	93490682	rs604414	T	A	3205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.197;NF=35;NR=88;PP=2352;ReadPosRankSum=1.614;SC=GTGTGTGCACTTACTTAAGAT;SOR=0.681;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=134;TCF=35;TCR=99;TR=123;WE=93490690;WS=93490672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,117:0.99:118
chr11	93494878	rs72097212	AAG	A	3882.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=57;PP=2787;SC=TATTTAGAAAAAGAAATAATT;SOR=1.906;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=3;TCR=59;TR=60;WE=93494887;WS=93494868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr11	93517874	rs7116967	C	G	1824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=17;NR=28;PP=814;SC=GGACCGAGGGCGACGCGCAGG;SOR=1.378;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=17;TCR=28;TR=45;WE=93517894;WS=93517864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr11	93517886	rs2848477	G	C	1550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=23;PP=646;SC=ACGCGCAGGAGTGGCCGGGCG;SOR=1.885;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=33;WE=93517894;WS=93517864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr11	93521405	rs676586	C	T	1143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=30;PP=880;SC=GGCTTTGTGCCTGTTGTTCCA;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=37;WE=93521413;WS=93521395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr11	93527219	rs657177	T	C	6358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=87;NR=105;PP=2965;SC=TATGTTCTATTCTCTAATTTC;SOR=1.129;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=192;TCF=87;TCR=105;TR=192;WE=93527227;WS=93527209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr11	93527282	rs5793656	GA	G	1750.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=37;PP=1216;SC=ATATAGGTAGGAAAAAATAGA;SOR=2.760;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=38;WE=93527290;WS=93527272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr11	93534929	.	T	TGA	1717.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.20;SOR=2.554;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr11	93534930	.	TTC	GAT	1789	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=24;NR=3;PP=1789;QD=68.6099212912;SC=TCATAAAATTTTCGAATCATT;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=27;WE=93534940;WS=93534920;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,27:0.87:31
chr11	93534930	.	TTC	T	1717.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.04;SOR=2.362;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	93534990	rs655699	G	A	2576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=53;NR=27;PP=1206;SC=TTAACTTCTTGTATTTAAAAG;SOR=1.081;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=53;TCR=27;TR=80;WE=93534998;WS=93534980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr11	93754508	rs2511403	G	A	1178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=9;PP=896;SC=TGTGCAGGCTGCCTGCCTGCT;SOR=2.419;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=31;TCR=9;TR=40;WE=93754516;WS=93754498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr11	93797619	rs1945783	A	G	6680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=129;NR=97;PP=2965;SC=TTTCTGCACCAACCCTGATTC;SOR=0.870;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=226;TCF=129;TCR=97;TR=226;WE=93797627;WS=93797609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr11	93803717	rs1878799	C	G	3116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=64;PP=1917;SC=AGGTAAGCACCCTTTGTTGGT;SOR=1.282;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=43;TCR=64;TR=107;WE=93803725;WS=93803707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr11	93803771	rs1878800	T	C	1061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=5;NR=33;PP=792;SC=AGGCTTTCTCTGTGATCTAAT;SOR=3.556;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=39;TCF=6;TCR=33;TR=38;WE=93803779;WS=93803761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	93806416	rs1914725	T	C	5137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=76;PP=2965;SC=CTCTTCTGCTTTACTTCTTTC;SOR=0.829;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=154;TCF=78;TCR=76;TR=154;WE=93806424;WS=93806406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr11	93834223	rs7927016	G	A	774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=0;PP=632;SC=CTCTAAAGTGGAGTAGAGTTA;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=93834231;WS=93834213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	93844034	rs7925817	G	T	2771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=28;PP=1871;SC=AGCAAAGAAGGCTACTAGCTG;SOR=1.784;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=62;TCR=28;TR=90;WE=93844042;WS=93844024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr11	93862493	rs1138800	A	C	1459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.217;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=27;PP=982;ReadPosRankSum=0.569;SC=CCATCGCTCAACTGGCCACGG;SOR=0.833;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=154;TCF=93;TCR=61;TR=70;WE=93862501;WS=93862483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,74:0.43:172
chr11	93886838	rs7928030	G	C	842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.798;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=19;PP=452;ReadPosRankSum=0.555;SC=TTGCTTTATAGATAAGGAAAC;SOR=0.843;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=79;TCF=41;TCR=38;TR=38;WE=93886846;WS=93886828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,43:0.48:89
chr11	93913458	rs3020015	T	C	527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=396;ReadPosRankSum=-1.144;SC=TACGGGAGTCTACCGAGAGCC;SOR=0.719;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=71;TCF=20;TCR=51;TR=24;WE=93913466;WS=93913448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,25:0.33:76
chr11	94113466	rs3740868	G	T	1741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.193;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=36;PP=1181;ReadPosRankSum=-0.239;SC=TGGGGAGGGTGGCCTGTCCTC;SOR=0.584;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=151;TCF=82;TCR=69;TR=72;WE=94113474;WS=94113456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,79:0.46:172
chr11	94170484	rs13447714	TTC	T	2161.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.363;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.190;NF=1;NR=24;PP=967;ReadPosRankSum=0.415;SC=GCTAAAGATTTTCTGAGTCCT;SOR=0.856;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=65;TCF=4;TCR=61;TR=25;WE=94170493;WS=94170474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,60:0.42:143
chr11	94179125	rs1014666	T	C	3332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=62;PP=2101;SC=CATACAACACTAAAAAATGAA;SOR=1.123;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=108;TCF=45;TCR=63;TR=107;WE=94179133;WS=94179115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr11	94194303	rs529126	G	T	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=62;ReadPosRankSum=-0.431;SC=CCAAACTTTAGCAACTGCCAG;SOR=0.368;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=4;WE=94194311;WS=94194293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
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chr11	94212048	rs535801	C	T	1122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.670;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=27;PP=693;ReadPosRankSum=-0.136;SC=TCTGCCTATGCAAAATAATTT;SOR=0.588;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=113;TCF=62;TCR=51;TR=54;WE=94212056;WS=94212038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,57:0.46:124
chr11	94212154	rs680695	A	G	614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=20;PP=438;ReadPosRankSum=0.675;SC=AAAAACATAGATGAGGATAGT;SOR=0.646;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=22;TCR=40;TR=31;WE=94212162;WS=94212144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,30:0.49:61
chr11	94223855	rs608452	A	G	118.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=5;NR=0;PP=89;SC=ATACAAAATCAGCTTTGAGCT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=94223863;WS=94223845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	94225807	rs496797	C	T	798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=7;PP=527;SC=ATTCCAAATACCCTTTTTGAT;SOR=1.942;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=26;WE=94225815;WS=94225797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr11	94225920	rs497763	C	T	2422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.77;SOR=0.780;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr11	94229665	rs540199	A	G	324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=270;SC=GAGAAAAACAAGAGTTTAGAC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=94229673;WS=94229658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	94261255	rs647484	C	G	994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=19;PP=630;ReadPosRankSum=0.237;SC=GACAGTGGCCCTGGAAGGGAT;SOR=0.760;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=113;TCF=72;TCR=41;TR=51;WE=94261263;WS=94261245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,54:0.44:123
chr11	94261280	rs11605546	G	A	1317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=26;PP=773;ReadPosRankSum=-1.258;SC=AGCATTAAAAGGAATCTGCCT;SOR=0.719;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=129;TCF=75;TCR=54;TR=62;WE=94261288;WS=94261270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,67:0.47:144
chr11	94320237	rs7110167	T	C	1889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FS=2.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.11;ReadPosRankSum=-0.030;SOR=0.930;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,92:0.49:187
chr11	94322352	rs11020845	AG	TA	6079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=370;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.786;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=69;PP=2944;ReadPosRankSum=0.039;SC=CACACCTTTCAGAAGCGGGAT;SOR=0.649;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=329;TCF=164;TCR=165;TR=140;WE=94322361;WS=94322342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:210,160:0.43:370
chr11	94326627	rs11020851	G	A	838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=5;PP=482;ReadPosRankSum=1.442;SC=ATGTAAGGATGCTCACCTGGC;SOR=0.614;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=44;TCR=9;TR=29;WE=94326635;WS=94326617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,36:0.59:61
chr11	94326765	rs57607909	G	C	2202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.449;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=59;PP=1469;ReadPosRankSum=0.113;SC=CAACAGTGAGGCTCAGCTCGC;SOR=0.730;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=255;TCF=121;TCR=134;TR=109;WE=94326773;WS=94326755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,115:0.43:266
chr11	94337220	rs593690	C	T	864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=18;PP=560;ReadPosRankSum=0.489;SC=TGATGTTCAGCTGGTAAGTAC;SOR=0.675;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=83;TCF=52;TCR=31;TR=43;WE=94337228;WS=94337210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,45:0.47:95
chr11	94354019	rs504010	T	C	1633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.708;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=16;PP=1010;ReadPosRankSum=0.612;SC=TCTTAATTATTATCAATACTT;SOR=0.818;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=121;TCF=88;TCR=33;TR=63;WE=94354027;WS=94354009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,72:0.55:132
chr11	94474044	rs11300560	GT	G	3570.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=30;NR=24;PP=2406;SC=GCTGGTGCTTGTGCGGGTTCG;SOR=1.688;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=56;TCF=31;TCR=25;TR=54;WE=94474052;WS=94474034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr11	94501849	rs2915239	G	A	916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=26;PP=716;SC=TGGGGGCCCGGGGCTGAGATC;SOR=3.912;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=29;WE=94501857;WS=94501839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr11	94528474	rs144547859	C	A	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.782;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=136;ReadPosRankSum=-0.837;SC=TTCATAGATGCCTTATTTTTA;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=8;WE=94528482;WS=94528464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr11	94696474	rs58293261	G	GA	123.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.25;ReadPosRankSum=-1.633;SOR=2.030;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr11	94699507	rs34805065	A	AT	3841.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=31;PP=1595;SC=GGCCAGTGAGATAAGGAGAGG;SOR=0.772;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=38;TCF=6;TCR=32;TR=36;WE=94699515;WS=94699497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr11	94703049	rs7107185	T	C	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.812;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=118;ReadPosRankSum=0.210;SC=TTAGACACGGTAAAGGAGATT;SOR=0.859;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=7;WE=94703057;WS=94703042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr11	94704037	rs3737505	C	G	912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=3;PP=692;SC=ATAACAGTAACTAAACATAAA;SOR=4.407;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=27;WE=94704045;WS=94704027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	94704092	rs4753645	T	A	7041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.43;SOR=1.491;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr11	94704092	.	TAG	AAA	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=93;NR=44;PP=2947;QD=20;SC=TATTTTAGAATAGCATGGTAA;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=140;TCF=94;TCR=46;TR=137;WE=94704102;WS=94704082;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,137:0.98:140
chr11	94704094	rs4753646	G	A	7041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.29;SOR=1.465;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr11	94704689	rs3831469	A	AAC,AACAC	1640.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.313;NF=1,1;NR=22,22;PP=101,559;ReadPosRankSum=0.103;SC=ATGTTACTTAAACACACACAC;SOR=1.085;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=23,23;WE=94704700;WS=94704679;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.62,0.33:55
chr11	94705163	rs72977727	C	T	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=257;ReadPosRankSum=-1.883;SC=CATGACCATGCCATTTAACAG;SOR=0.602;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=39;TCF=32;TCR=7;TR=17;WE=94705171;WS=94705153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,18:0.42:43
chr11	94730403	rs11371511	C	CA	122.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;QD=20.46;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr11	94759059	rs10752685	A	G	2038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FS=2.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.78;MQRankSum=-7.130;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.457;SOR=0.528;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,98:0.54:181
chr11	94782539	rs620838	G	A	703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=3;PP=442;SC=TCAGGCATTTGGAGGACACCG;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=94782547;WS=94782529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	94800902	rs5793709	G	GC	12457.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;BaseQRankSum=-2.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=477;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.148;NF=64;NR=142;PP=2973;ReadPosRankSum=0.274;SC=TCGCGCTACAGCGCTCTCCCT;SOR=0.826;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=221;TCF=69;TCR=152;TR=206;WE=94800910;WS=94800892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,463:1.00:465
chr11	94823448	rs3016947	A	T	510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=14;PP=400;SC=GCCGCTGGACATGCCCCCAGT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=94823456;WS=94823438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	94862288	rs3740862	G	A	2515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.466;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=47;PP=1435;ReadPosRankSum=-0.818;SC=TTATTACCTTGTGGTAGCAAT;SOR=0.750;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=224;TCF=126;TCR=98;TR=108;WE=94862296;WS=94862278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,119:0.49:245
chr11	94862577	rs3740861	G	T	3464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.748;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=73;PP=2342;ReadPosRankSum=-2.754;SC=TACACCATGGGCGCTATTCCA;SOR=0.666;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=280;TCF=142;TCR=138;TR=155;WE=94862585;WS=94862567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,163:0.53:308
chr11	94915241	rs10831316	T	G	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.275;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=248;ReadPosRankSum=1.112;SC=TCCAAGACTTTCTAGTCAAAA;SOR=1.140;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=62;TCF=38;TCR=24;TR=19;WE=94915249;WS=94915231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,21:0.31:67
chr11	95509037	rs3789960	C	G	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=8;PP=267;ReadPosRankSum=-1.092;SC=TGCTATTACTCAAGTTTAGCC;SOR=0.904;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=21;TCR=15;TR=19;WE=95509045;WS=95509027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr11	95512060	rs1150360	A	G	3036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.906;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=65;PP=1973;ReadPosRankSum=0.997;SC=TCTTCTTTCAATTGACTTATA;SOR=0.642;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=259;TCF=130;TCR=129;TR=132;WE=95512068;WS=95512050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,139:0.49:282
chr11	95519195	rs3748252	A	T	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=204;ReadPosRankSum=-0.370;SC=GAATAGATCCAGTCTCAGTAG;SOR=0.914;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=10;WE=95519203;WS=95519185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr11	95519506	rs3748253	G	A	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=22;PP=433;ReadPosRankSum=1.205;SC=TATACCCAGTGTTGTAGACAT;SOR=0.892;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=51;TCF=8;TCR=43;TR=25;WE=95519514;WS=95519496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,27:0.49:55
chr11	95520695	rs1313288	T	C	509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=1.037;NF=15;NR=9;PP=259;ReadPosRankSum=2.851;SC=TGAGCCACTGTGCCCAGCCAG;SOR=0.693;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=45;TCF=30;TCR=15;TR=24;WE=95520703;WS=95520685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,27:0.50:54
chr11	95521648	rs1727165	A	G	867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.712;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=15;PP=567;ReadPosRankSum=-1.448;SC=GTCAAAAACTATTCAGTATAC;SOR=0.961;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=84;TCF=50;TCR=34;TR=39;WE=95521656;WS=95521638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,42:0.45:94
chr11	95521953	rs3748256	A	G	2123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.701;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=25;PP=1357;ReadPosRankSum=1.168;SC=TATATTACAGACAAATTAAGA;SOR=0.807;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=131;TCF=89;TCR=42;TR=81;WE=95521961;WS=95521943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,88:0.64:138
chr11	95524067	rs12272061	G	T	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.594;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=358;ReadPosRankSum=-0.178;SC=CATTCACTGTGGCTGTGTCGA;SOR=1.101;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=20;WE=95524075;WS=95524057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr11	95528714	rs522536	C	T	476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.14;ReadPosRankSum=1.287;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,23:0.49:47
chr11	95551136	rs666398	C	T	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.941;NF=5;NR=19;PP=392;ReadPosRankSum=-0.144;SC=AATTATTTTACATCACTGGAT;SOR=0.859;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=49;TCF=11;TCR=38;TR=24;WE=95551144;WS=95551126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,25:0.49:51
chr11	95555841	rs56284050	G	GTGCCTTTACCAGTGTGTGGATCA	403.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.19;MQRankSum=1.121;QD=16.15;ReadPosRankSum=0.441;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr11	95561265	.	TA	T	72	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=72;QD=26.25;SC=TTGACTTTATTAAATCTTACT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=95561273;WS=95561255;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr11	95562327	rs534488	G	A	1176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.395;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=20;ReadPosRankSum=-1.412;SC=ACTTAACCATGTTCTACTTCT;SOR=0.886;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=127;TCF=79;TCR=48;TR=57;WE=95562335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,61:0.46:134
chr11	95562535	.	G	GA	68	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=12;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=17;MQ=60.51;NF=0;NR=6;PP=68;QD=13.3333333333;SC=TAATGATTAAGAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=6;WE=95562543;WS=95562525;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:9,6:0.40:15
chr11	95564259	rs644799	A	G	1629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.635;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=32;PP=959;ReadPosRankSum=0.269;SC=TGATGAAGAAAGAAACAGCAG;SOR=0.804;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=71;TCR=54;TR=73;WE=95564267;WS=95564249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,78:0.56:139
chr11	95569183	rs499637	G	A	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.752;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=461;ReadPosRankSum=2.014;SC=TCTACTATACGATTGTTAACT;SOR=0.307;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=47;TCF=41;TCR=6;TR=25;WE=95569191;WS=95569173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,25:0.52:48
chr11	95569253	rs627568	A	C	1477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.589;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=32;PP=879;ReadPosRankSum=0.056;SC=GCTGCTTTTAAGGAGACAAAG;SOR=0.607;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=152;TCF=90;TCR=62;TR=74;WE=95569261;WS=95569243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,76:0.47:161
chr11	95574982	rs145538188	G	A	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.393;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=139;ReadPosRankSum=0.349;SC=TTTCAAAGTCGGGTGCTGTGG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=7;WE=95574990;WS=95574972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr11	95580926	rs566204	G	A	2481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.513;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=53;PP=1379;ReadPosRankSum=1.036;SC=ACAACCAGTGGGTTTCCTCAA;SOR=0.748;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=182;TCF=83;TCR=99;TR=97;WE=95580934;WS=95580916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,113:0.55:207
chr11	95598629	rs687559	A	G	1342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.731;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=16;PP=896;ReadPosRankSum=1.098;SC=TAAGATGCTGAGAAGACTGCA;SOR=0.600;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=114;TCF=82;TCR=32;TR=57;WE=95598637;WS=95598619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,60:0.50:121
chr11	95657111	rs3824874	T	G	1452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.182;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=34;PP=774;ReadPosRankSum=-0.315;SC=GCTCGAGCTCTTCTCCATCGC;SOR=1.002;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=117;TCF=53;TCR=64;TR=60;WE=95657119;WS=95657101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,69:0.52:132
chr11	95724658	rs488398	C	G	672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.248;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=364;ReadPosRankSum=-0.856;SC=CAGGTTTGTTCAGTAGAAATT;SOR=1.085;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=23;WE=95724666;WS=95724648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,27:0.56:48
chr11	95824899	.	C	T	138.98	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=-0.000;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5436;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=101;ReadPosRankSum=-0.792;SC=ATGCCCTCAACGAACCAGGCT;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=6;WE=95824907;WS=95824895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr11	95825374	rs10557243	TTGCTGCTGC	T	1102.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=6;PP=1536;SC=GCTGCTGCTGTTGCTGCTGCT;SOR=1.942;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=18;WE=95825390;WS=95825364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr11	99427091	rs2047166	A	G	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=163;ReadPosRankSum=-0.690;SC=ATCCTCAGGTATTAATTTAAA;SOR=0.313;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=11;WE=99427099;WS=99427081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr11	99428929	rs11375374	C	CT	1983.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=1.771;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.13;MQRankSum=-3.488;QD=24.49;ReadPosRankSum=0.352;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:6,75:0.93:81
chr11	99690286	rs10790978	T	G	815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=10;PP=564;ReadPosRankSum=0.947;SC=GTATTCAAAATCTCTTCCTGG;SOR=0.649;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=89;TCF=65;TCR=24;TR=35;WE=99690294;WS=99690276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,39:0.40:97
chr11	99690428	rs7125822	T	G	1033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FS=5.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.58;ReadPosRankSum=-0.752;SOR=0.868;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:219,70:0.24:289
chr11	99690461	rs10893933	A	G	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FS=13.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.13;ReadPosRankSum=-4.532;SOR=1.476;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:176,30:0.15:206
chr11	99932146	rs3758923	A	T	692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.995;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=18;PP=394;ReadPosRankSum=0.189;SC=TCAGCAAAGCATGATTGCTCT;SOR=0.481;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=62;TCF=21;TCR=41;TR=29;WE=99932154;WS=99932136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,34:0.48:71
chr11	99941322	rs2059014	C	T	3799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=66;PP=2160;SC=ACCTGTTCTGCTGTAATTTTA;SOR=0.807;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=67;TCR=66;TR=133;WE=99941330;WS=99941312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr11	100061827	rs3031278	G	GA	850.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.906;HP=10;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.460;NF=13;NR=14;PP=401;ReadPosRankSum=-1.815;SC=CAGTAAAACAGAAAAAAAAAC;SOR=0.558;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=60;TCF=30;TCR=30;TR=27;WE=100061835;WS=100061817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,41:0.51:81
chr11	100061886	.	C	T	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.194;ClippingRankSum=0.000;DP=254;ExcessHet=3.0103;FS=0.588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQRankSum=-0.689;QD=1.96;ReadPosRankSum=1.713;SOR=0.766;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:203,49:0.19:252
chr11	100168289	rs1944178	C	T	5158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=50;PP=2965;SC=TCTGACTTATCTCAGGATTTT;SOR=1.392;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=146;TCF=96;TCR=50;TR=145;WE=100168297;WS=100168279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr11	100168320	rs75986029	T	TC	11174.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=86;PP=2979;SC=GGTTGGGAGTTTTTTTCTCCT;SOR=1.093;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=143;TCF=56;TCR=87;TR=141;WE=100168328;WS=100168310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,287:1.00:287
chr11	100169829	rs1944180	A	G	808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.213;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=3;PP=598;ReadPosRankSum=0.628;SC=TTAATTAAGAATTTGGAGAAA;SOR=3.334;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=27;WE=100169837;WS=100169819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,29:0.94:31
chr11	100641200	rs7944598	A	T	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=4.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.40;ReadPosRankSum=-1.306;SOR=1.229;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,29:0.41:70
chr11	100730087	rs661237	G	A	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-3.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=208;ReadPosRankSum=-0.413;SC=TCACATTGTTGTTAGGATCAA;SOR=1.127;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=11;WE=100730095;WS=100730077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr11	100730213	rs646392	G	A	4652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=70;PP=2459;SC=ACATTGGATAGAGTAGCCATT;SOR=0.800;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=148;TCF=78;TCR=70;TR=148;WE=100730221;WS=100730203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr11	100804088	rs626529	A	G	1947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=25;NR=36;PP=1056;SC=CTAGTGGAAAATACAACCCAC;SOR=1.226;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=25;TCR=36;TR=61;WE=100804096;WS=100804078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr11	100807130	rs581921	T	C	3956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=73;PP=2356;SC=GTGACTTGGTTAGTAGTATTT;SOR=1.195;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=127;TCF=54;TCR=73;TR=127;WE=100807138;WS=100807120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr11	100811574	rs35159175	CAT	C	2370.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=24;PP=1245;SC=ATTAAGAACTCATATTCTAGT;SOR=1.220;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=27;WE=100811583;WS=100811564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr11	100811690	rs661973	G	T	263.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=61.19;NF=0;NR=9;PP=216;SC=TTCAGACAGTGATAACCGCTA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=100811698;WS=100811680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	100812338	rs151209547	A	AAC	765.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=54.70;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	100812340	.	GAC	CAG	483	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=8;NR=1;PP=483;QD=59.6075416514;SC=CTGATTCTAAGACACTCTACC;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=9;WE=100812361;WS=100812330;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,9:0.90:10
chr11	100812342	rs370937549	CACTCTACCCTAT	C	766.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.60;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	100812344	.	CTCTACCCTAT	C	2945	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=6;NR=1;PP=2945;QD=20;SC=TTCTAAGACACTCTACCCTAT;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=100812361;WS=100812330;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr11	100814409	rs619066	G	A	3023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=34;PP=1764;SC=ACATTTTAATGTGGCAACTTG;SOR=1.356;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=67;TCR=34;TR=101;WE=100814417;WS=100814399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr11	100814570	rs543146	A	G	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.129;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=20;PP=408;ReadPosRankSum=1.955;SC=TTGACAAACGATTCTGCTTTG;SOR=0.430;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=57;TCF=16;TCR=41;TR=29;WE=100814578;WS=100814560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,30:0.50:60
chr11	100814609	rs618155	G	T	679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=20;PP=543;SC=GGTTTGAGCTGTTCTTTTCAC;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=100814617;WS=100814599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	100819305	rs633967	T	C	1737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=28;NR=29;PP=980;SC=GGTTTTATTGTCCTAATAATT;SOR=0.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=28;TCR=29;TR=57;WE=100819313;WS=100819295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr11	100819392	rs504081	A	G	345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=10;PP=262;SC=AAAGGAAATCAGGGGAGTAGA;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=100819400;WS=100819382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	100819430	rs482050	A	G	261.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=5;PP=107;SC=AGTCTCACTCATGGCCCATAA;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=100819438;WS=100819420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr11	100819447	rs481991	C	A	229.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=4;PP=103;SC=ATAACTCTACCTTTCTGACTT;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=100819455;WS=100819437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr11	100820555	rs11820715	C	G	3481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.746;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=77;PP=2047;ReadPosRankSum=0.470;SC=TCAAGACACTCTTTTCATCTA;SOR=0.679;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=314;TCF=163;TCR=151;TR=154;WE=100820563;WS=100820545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,172:0.49:350
chr11	100820663	rs17647207	G	A	946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.945;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=30;PP=590;ReadPosRankSum=0.408;SC=TACTCTGCCTGCCATTATAAG;SOR=0.514;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=19;TCR=64;TR=39;WE=100820671;WS=100820653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,44:0.48:91
chr11	100820725	rs694556	A	T	482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=15;PP=363;SC=TTTTATCATGAAGTTATTTTT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=100820733;WS=100820715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	100827326	rs151243237	AAATAT	A	11813.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=114;PP=2965;SC=GGGTGCTGAGAAATATAATCT;SOR=0.731;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=149;TCF=33;TCR=116;TR=144;WE=100827338;WS=100827316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr11	100830440	rs7950832	T	C	1404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.913;NF=40;NR=13;PP=891;ReadPosRankSum=-1.247;SC=GAGGGTGAAGTTCCCTCCTCT;SOR=0.711;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=101;TCF=75;TCR=26;TR=53;WE=100830448;WS=100830430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,60:0.54:112
chr11	100830579	rs6590829	G	A	2730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.004;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=65;PP=1429;ReadPosRankSum=-0.182;SC=TGAGTTCAGCGTAAACACCTA;SOR=0.785;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=217;TCF=86;TCR=131;TR=107;WE=100830587;WS=100830569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,126:0.52:243
chr11	100830693	rs563460	T	C	441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=13;PP=285;SC=GTTGCCTGATTGGTACAGCAT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=100830701;WS=100830683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	100833059	rs540866	A	G	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.090;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=10;PP=357;ReadPosRankSum=2.039;SC=ACAGTCACCTAATTCTTAAAG;SOR=0.265;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=50;TCF=34;TCR=16;TR=25;WE=100833067;WS=100833049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,28:0.53:53
chr11	100847050	rs569270	A	G	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.664;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=9;PP=356;ReadPosRankSum=0.420;SC=GTGTTGCTTCAGTCACTAGCC;SOR=0.323;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=45;TCF=32;TCR=13;TR=27;WE=100847058;WS=100847040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,31:0.60:52
chr11	100847069	rs569336	G	A	861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.927;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.165;NF=24;NR=12;PP=538;ReadPosRankSum=1.247;SC=CCCAGGAGACGTTTCCCCACC;SOR=0.525;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=67;TCF=46;TCR=21;TR=36;WE=100847077;WS=100847059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,40:0.53:76
chr11	100847749	rs575734	A	G	1454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.249;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.117;NF=32;NR=31;PP=792;ReadPosRankSum=-2.816;SC=GGATACAGAGAGGAGTTGAGT;SOR=0.558;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=144;TCF=67;TCR=77;TR=63;WE=100847757;WS=100847739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,73:0.45:162
chr11	100847829	rs3216738	CA	C	837.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.826;NF=0;NR=19;PP=716;ReadPosRankSum=-0.112;SC=AGAGTGGGTACAGTCCACTTC;SOR=0.770;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=19;WE=100847837;WS=100847819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,25:0.62:40
chr11	100849673	rs10791440	A	C	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=270;ReadPosRankSum=1.239;SC=AGCAGAACTGAATGTGATTGA;SOR=0.197;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=14;WE=100849681;WS=100849665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr11	100856632	rs629813	T	C	535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=390;ReadPosRankSum=0.023;SC=GAAATTATAATGTAATGCTGC;SOR=0.836;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=38;TCR=8;TR=23;WE=100856640;WS=100856622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,23:0.48:48
chr11	100856955	rs551632	C	T	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.090;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=47;ReadPosRankSum=0.473;SC=ATGATAGTTCCCTGGGCAGCT;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=4;WE=100856963;WS=100856945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr11	100859439	rs524811	G	A	1362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.275;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=32;PP=740;ReadPosRankSum=0.626;SC=TATTTATTTTGCCAGTGTACC;SOR=0.681;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=129;TCF=71;TCR=58;TR=65;WE=100859447;WS=100859429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,72:0.48:151
chr11	100863096	rs515552	A	G	3266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=377;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.783;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=68;PP=2037;ReadPosRankSum=-0.472;SC=CAGGTCACGAAAAAGAACACA;SOR=0.640;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=336;TCF=171;TCR=165;TR=139;WE=100863104;WS=100863086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:216,160:0.43:376
chr11	100863354	rs471933	C	A	3055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.832;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=69;PP=1827;ReadPosRankSum=0.095;SC=CCCTCATTGTCACCGTTATCC;SOR=0.629;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=302;TCF=141;TCR=161;TR=134;WE=100863362;WS=100863344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,152:0.46:334
chr11	100909809	rs484389	A	G	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.258;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=389;ReadPosRankSum=-0.467;SC=AAAAAGACATACCACAAAATT;SOR=1.066;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=55;TCF=43;TCR=12;TR=21;WE=100909817;WS=100909799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,23:0.38:60
chr11	100909991	rs500760	T	C	2227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.480;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=59;PP=1480;ReadPosRankSum=-0.751;SC=ACAGATGAAGTTGTTTGACAA;SOR=0.747;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=220;TCF=92;TCR=128;TR=98;WE=100909999;WS=100909981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,106:0.43:246
chr11	100921665	rs645213	C	A	673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.554;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=18;PP=373;ReadPosRankSum=-1.072;SC=ACCACTAGAACAATATAAATA;SOR=1.270;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=69;TCF=30;TCR=39;TR=29;WE=100921673;WS=100921655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,34:0.44:77
chr11	100922202	rs1042839	G	A	1093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.738;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=19;PP=633;ReadPosRankSum=2.540;SC=GCCCACTGACGTGTTTGTAGG;SOR=1.056;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=88;TCF=52;TCR=36;TR=50;WE=100922210;WS=100922192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,54:0.57:95
chr11	100922404	rs578029	A	T	98.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.51;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr11	100933412	rs1042838	C	A	1287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.947;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=32;PP=823;ReadPosRankSum=3.463;SC=GGAACGCCCACTGGCTGTGGG;SOR=0.937;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=133;TCF=61;TCR=72;TR=55;WE=100933420;WS=100933402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,61:0.41:150
chr11	100933598	rs11571221	G	GAATGA	187.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=4;PP=164;SC=AGCATCAATCGAATGAAATAG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=4;WE=100933606;WS=100933588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
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chr11	100998076	rs3740752	T	A	353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.788;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=246;ReadPosRankSum=-0.346;SC=AGCGGTGCGCTGGGGCTGGGG;SOR=0.195;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=14;WE=100998084;WS=100998066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr11	100998771	rs3740753	C	G	2147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.426;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=45;PP=1324;ReadPosRankSum=0.370;SC=ACAGGGTGAACTCCGCGGCGG;SOR=0.681;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=170;TCF=91;TCR=79;TR=93;WE=100998779;WS=100998761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,97:0.54:179
chr11	100999245	rs11571145	G	A	2788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.523;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=57;PP=1670;ReadPosRankSum=-0.553;SC=CAGGCCCCGGGGCAGCACTTT;SOR=0.514;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=224;TCF=105;TCR=119;TR=115;WE=100999253;WS=100999235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,129:0.52:247
chr11	100999838	rs11437764	A	AG	2543.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=33;PP=1614;SC=CCCCGTCTCCAGGAGGAGGGA;SOR=1.032;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=36;WE=100999846;WS=100999828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr11	101765654	rs77315074	G	A	1176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FS=0.601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.35;ReadPosRankSum=-1.593;SOR=0.794;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:97,63:0.39:160
chr11	101771248	rs3858418	G	A	6845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=113;NR=119;PP=2965;SC=ATCACAGTCCGTCCACCTCCT;SOR=0.856;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=232;TCF=113;TCR=119;TR=232;WE=101771256;WS=101771238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,262:1.00:262
chr11	101771381	rs3858419	G	A	570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=15;PP=434;SC=AAAAGAGACGGTACTGCCACT;SOR=2.948;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=101771389;WS=101771371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	101775663	rs1661409	G	A	949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=28;PP=622;ReadPosRankSum=1.349;SC=ACACATTTAAGTAAATTTATA;SOR=0.791;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=82;TCF=30;TCR=52;TR=42;WE=101775671;WS=101775653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,45:0.50:90
chr11	101775724	rs56292946	C	T	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=27;ReadPosRankSum=1.058;SC=CTCTGAAATACGTAATGGTGC;SOR=0.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=4;WE=101775732;WS=101775714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,4:0.21:19
chr11	101778710	rs1661410	A	G	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.467;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=180;ReadPosRankSum=-0.182;SC=ACTACAGAGCATAGAGTCTTC;SOR=1.473;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=47;TCF=22;TCR=25;TR=15;WE=101778718;WS=101778700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,15:0.31:49
chr11	101815167	rs77291911	A	G	1199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.664;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=26;PP=701;ReadPosRankSum=-0.325;SC=GAACAGTATGAGAACATAAAG;SOR=0.524;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=82;TCF=39;TCR=43;TR=49;WE=101815175;WS=101815157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,57:0.58:98
chr11	101818728	rs11225080	A	G	1898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.323;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=24;PP=1162;ReadPosRankSum=0.472;SC=AGATAAAGTGATTCTGTACTG;SOR=0.869;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=136;TCF=91;TCR=45;TR=75;WE=101818736;WS=101818718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,85:0.55:154
chr11	101826489	rs12577623	G	A	1384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.290;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=16;PP=814;ReadPosRankSum=0.786;SC=CTGTCTCTCTGCCTGCCTGTC;SOR=0.355;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=87;TCF=66;TCR=21;TR=57;WE=101826497;WS=101826479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,62:0.64:97
chr11	101826949	rs930469	T	C	13120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=498;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=224;NR=222;PP=2965;SC=AGCATTCTACTGCAGCCACTC;SOR=0.697;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=447;TCF=224;TCR=223;TR=446;WE=101826957;WS=101826939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,497:1.00:497
chr11	101829006	rs61743062	G	A	1046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.488;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=25;PP=637;ReadPosRankSum=-0.078;SC=GAAAACATGAGGGCAACCTTG;SOR=0.691;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=102;TCF=55;TCR=47;TR=50;WE=101829014;WS=101828996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,53:0.50:107
chr11	101832478	rs7926728	G	T	1322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=30;NR=11;PP=778;SC=CCAGAAATTTGGTGATGAAGT;SOR=1.514;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=30;TCR=11;TR=41;WE=101832486;WS=101832468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr11	101833644	rs7109233	C	T	2564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=38;PP=1575;SC=TTCCAAAGACCATTAAAAAAC;SOR=0.855;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=45;TCR=38;TR=83;WE=101833652;WS=101833634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr11	101848990	rs3740931	A	G	2501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=20;PP=1447;SC=TTTTCTTGATATTTGAAAGTA;SOR=1.531;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=55;TCR=20;TR=75;WE=101848998;WS=101848980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr11	101857758	rs6590942	G	A	666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=16;PP=461;SC=AATGATCTCAGTGAAAGACTA;SOR=1.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=23;WE=101857766;WS=101857748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	101863706	rs1274901	C	T	1384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=30;PP=882;SC=TTCTCCTCAACTGGCTTTTTA;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=16;TCR=30;TR=46;WE=101863714;WS=101863696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr11	101868415	rs1783742	C	T	8984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=155;NR=134;PP=2965;SC=CATGTACTTCCCTAGGACTAG;SOR=0.711;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=289;TCF=155;TCR=134;TR=289;WE=101868423;WS=101868405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,331:1.00:331
chr11	101918327	rs12804542	A	G	4872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=91;PP=2925;SC=GAACCGAGGCACAGGGAGAGA;SOR=0.920;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=170;TCF=78;TCR=92;TR=169;WE=101918335;WS=101918317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr11	101918686	rs7934495	A	C	1223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.346;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=32;PP=649;ReadPosRankSum=0.134;SC=CTTCCCCCCAAGTTGGCATAG;SOR=0.818;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=126;TCF=59;TCR=67;TR=58;WE=101918694;WS=101918676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,64:0.47:137
chr11	101981962	rs144178719	C	T	2811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.793;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=79;PP=1784;ReadPosRankSum=-1.018;SC=GGGGGGCGCTCGGGAGCCGCG;SOR=0.870;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=246;TCF=98;TCR=148;TR=128;WE=101981970;WS=101981952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,135:0.53:255
chr11	101982041	rs34558896	T	TGGA	664.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=578;ReadPosRankSum=2.670;SC=CGAGGCGAAGTGGAACTGGAG;SOR=0.638;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=14;WE=101982049;WS=101982031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chr11	101984718	rs2033082	A	G	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=26;ReadPosRankSum=-1.896;SC=AAAAGTATCCATTTGAAAACC;SOR=0.117;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=5;WE=101984726;WS=101984708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,5:0.24:21
chr11	102207024	rs7124969	C	T	412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=10;PP=275;SC=TAATTTATGACTACTGAAAAT;SOR=1.911;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=14;WE=102207032;WS=102207014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	102207851	rs1055088	G	A	1305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=27;PP=767;SC=CCAAAACATCGTCTAAACTTT;SOR=1.814;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=13;TCR=27;TR=40;WE=102207859;WS=102207841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr11	102323160	rs2436036	C	T	2823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=36;PP=1867;SC=CAGACACACGCGGAACTTTCT;SOR=1.418;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=104;TCF=67;TCR=37;TR=103;WE=102323168;WS=102323150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr11	102449650	rs7934921	T	A	533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.125;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=7;PP=363;ReadPosRankSum=-0.715;SC=TGAAAGGACCTAAGACCAAAT;SOR=1.493;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=47;TCF=31;TCR=16;TR=24;WE=102449658;WS=102449640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,25:0.50:50
chr11	102449951	rs1940054	A	C	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.019;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=152;ReadPosRankSum=-1.655;SC=CTGGTCAGGCATATGGACACA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=8;WE=102449959;WS=102449941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr11	102465226	rs1711437	C	T	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.862;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=78;ReadPosRankSum=0.873;SC=CATACCCAACCTGAGGACAAA;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=5;WE=102465234;WS=102465220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr11	102477377	rs1784424	G	T	1097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.517;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=22;PP=667;ReadPosRankSum=0.183;SC=ATGGGGCAGAGTGGGCTTCCC;SOR=0.585;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=98;TCF=50;TCR=48;TR=46;WE=102477385;WS=102477367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,53:0.47:112
chr11	102477395	rs1784423	A	G	1237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.456;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=23;PP=800;ReadPosRankSum=-0.540;SC=CCCCAGGAATACTTTCCGAGG;SOR=0.614;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=105;TCF=55;TCR=50;TR=51;WE=102477403;WS=102477385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,57:0.48:119
chr11	102482738	rs1711416	G	A	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.230;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=299;ReadPosRankSum=-0.747;SC=CTACAATTTAGATTTTTCTCT;SOR=1.528;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=42;TCF=10;TCR=32;TR=18;WE=102482746;WS=102482728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,21:0.45:47
chr11	102495745	rs2509023	C	T	129.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=5;NR=0;PP=99;SC=TAACATGGTACACCTAATATG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=102495753;WS=102495744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	102495998	rs2245803	T	G	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.501;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=14;PP=323;ReadPosRankSum=-0.718;SC=AGTGGAAAACTTCAAAGCCAT;SOR=0.344;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=56;TCF=22;TCR=34;TR=26;WE=102496006;WS=102495988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,30:0.47:64
chr11	102562700	rs2509010	C	T	869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.537;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=20;PP=482;ReadPosRankSum=0.776;SC=GTCTTAATGTCGTATTCAAAT;SOR=0.514;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=109;TCF=50;TCR=59;TR=40;WE=102562708;WS=102562690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,45:0.38:117
chr11	102563739	rs1276289	C	T	5479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=98;NR=79;PP=2965;SC=TCTGCGGGAACCCTTTGTCCA;SOR=0.819;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=177;TCF=98;TCR=79;TR=177;WE=102563747;WS=102563729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr11	102565856	rs10895351	A	T	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.254;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=21;PP=457;ReadPosRankSum=-0.833;SC=CACTTTACACATGCAGCCTAT;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=52;TCF=11;TCR=41;TR=26;WE=102565864;WS=102565846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,28:0.48:58
chr11	102567207	rs1276286	T	A	6717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=110;NR=116;PP=2965;SC=CTTAGCAGGTTCCTTAGGCAG;SOR=0.826;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=227;TCF=111;TCR=116;TR=226;WE=102567215;WS=102567197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr11	102567626	rs1940480	C	G	2917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=62;PP=1797;SC=ATGGCTGCATCTGAGATTAGA;SOR=1.725;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=32;TCR=62;TR=94;WE=102567634;WS=102567616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr11	102573396	rs2701994	C	G	1160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=6;PP=819;SC=GGGAACTTTACAGTTAAAAAG;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=35;WE=102573404;WS=102573386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr11	102573451	rs3809017	T	C	1472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=20;PP=965;ReadPosRankSum=0.486;SC=TTTAGAATAATAAGATTTTGT;SOR=0.651;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=115;TCF=81;TCR=34;TR=62;WE=102573459;WS=102573441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,68:0.53:129
chr11	102573569	rs3809018	C	A	3480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=71;PP=2128;ReadPosRankSum=-3.120;SC=CATGGCCAAGCACTCCCAAGG;SOR=0.687;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=293;TCF=158;TCR=135;TR=151;WE=102573577;WS=102573559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,164:0.52:314
chr11	102573912	rs61893941	C	T	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=197;ReadPosRankSum=0.794;SC=ACACACATAACTACAAAAAAC;SOR=1.148;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=12;WE=102573920;WS=102573902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr11	102576358	rs2846707	T	C	1102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.431;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=17;PP=707;ReadPosRankSum=1.142;SC=GCCAGTTGCATATTTTCTTCA;SOR=0.564;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=129;TCF=84;TCR=45;TR=51;WE=102576366;WS=102576348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,55:0.41:135
chr11	102576375	rs1939015	G	A	4372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=60;PP=2791;SC=TTCATTTTCCGTCATCCGGAC;SOR=1.165;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=155;TCF=95;TCR=60;TR=155;WE=102576383;WS=102576365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr11	102576468	rs11225389	C	A	2118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=50;PP=1256;ReadPosRankSum=-0.991;SC=TCAGCTGAAGCCGGTTCTGTT;SOR=0.704;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=189;TCF=89;TCR=100;TR=94;WE=102576476;WS=102576458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,99:0.46:213
chr11	102584023	rs1939018	T	A	5982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=121;NR=73;PP=2965;SC=ACGAAAATGCTTGCTGAACTT;SOR=1.189;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=195;TCF=121;TCR=74;TR=194;WE=102584031;WS=102584013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr11	102584466	rs3832755	G	GT	1434.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=18.225;HP=9;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=1.682;NF=19;NR=19;PP=573;ReadPosRankSum=-0.195;SC=CATTTATTAGGTTTTTTTTTC;SOR=1.806;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=105;TCF=38;TCR=67;TR=38;WE=102584474;WS=102584456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,69:0.42:165
chr11	102584607	rs2509013	T	C	1523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.060;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=46;PP=1042;ReadPosRankSum=2.174;SC=AACAAAATGTTATCCGATTTA;SOR=1.116;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=139;TCF=52;TCR=87;TR=68;WE=102584615;WS=102584597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,72:0.48:151
chr11	102591994	rs1892886	A	T	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=87;ReadPosRankSum=0.751;SC=ATCATGAGGTAGCAAAAATTT;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=5;WE=102592002;WS=102591985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr11	102592049	rs72369292	TTGTG	T,TTGTGTGTG	1526.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;NF=12,12;NR=7,7;PP=744,932;SC=GTTACCTTTATTGTGTGTGTG;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=17;TCR=10;TR=19,19;WE=102592060;WS=102592039;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.59,0.41:39
chr11	102593042	rs948218	T	A	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.989;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=118;ReadPosRankSum=0.494;SC=CTCACACTCTTCAAAGGCAGG;SOR=0.527;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=4;WE=102593061;WS=102593032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr11	102593053	rs1940474	G	T	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=118;ReadPosRankSum=0.895;SC=CAAAGGCAGGGATATTTATCT;SOR=1.112;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=4;WE=102593061;WS=102593032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr11	102593248	rs1940475	T	C	2941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.580;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=53;PP=1756;ReadPosRankSum=-0.993;SC=CGAGGCTTTTTCATCATGTCC;SOR=0.856;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=242;TCF=132;TCR=110;TR=123;WE=102593256;WS=102593238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,143:0.51:283
chr11	102594376	rs6590983	A	C	1411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.877;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=28;PP=803;ReadPosRankSum=0.481;SC=CCATTCTATTAATTACTAATC;SOR=0.841;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=134;TCF=71;TCR=63;TR=57;WE=102594384;WS=102594366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,68:0.45:150
chr11	102594427	rs6590984	T	C	2455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=45;PP=1668;SC=CAAAAATTAATCCAGTCACAC;SOR=1.039;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=80;TCF=35;TCR=45;TR=80;WE=102594435;WS=102594417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr11	102595413	rs11225394	C	T	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.992;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=174;ReadPosRankSum=0.952;SC=TTTTAATTAACAAGAGAAAAC;SOR=0.121;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=18;WE=102595421;WS=102595403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,21:0.60:35
chr11	102595492	rs3765620	G	A	1682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.382;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=20;PP=1005;ReadPosRankSum=-0.274;SC=TACCTGAACAGTTTTTGTATT;SOR=1.004;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=161;TCF=109;TCR=52;TR=72;WE=102595500;WS=102595482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,83:0.44:188
chr11	102595666	rs2155052	C	G	2072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=49;PP=1446;SC=AGCACCCTGACGTTCACAGCA;SOR=2.551;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=15;TCR=49;TR=64;WE=102595674;WS=102595656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr11	102623115	rs531335	A	G	479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=363;SC=TTCTCAAGCTACACAGGTGTG;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=102623128;WS=102623105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	102641452	rs470171	G	C	1407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.643;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=21;PP=925;ReadPosRankSum=-0.334;SC=AACCATTTTGGCTCATAATAC;SOR=0.903;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=98;TCF=63;TCR=35;TR=61;WE=102641460;WS=102641442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,64:0.60:106
chr11	102642716	rs17860997	A	AT	1802.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.726;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=15;PP=1573;ReadPosRankSum=-0.713;SC=AGATTCCTGCATGACAATGAA;SOR=1.207;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=79;TCF=39;TCR=40;TR=38;WE=102642724;WS=102642706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,59:0.49:121
chr11	102643718	rs17359286	G	T	2746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.737;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=75;PP=1751;ReadPosRankSum=-0.652;SC=CATTTCCTCTGATGGCCCAGA;SOR=0.894;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=249;TCF=108;TCR=141;TR=128;WE=102643726;WS=102643708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,131:0.50:262
chr11	102647310	rs470154	T	G	939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.958;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=11;PP=504;ReadPosRankSum=-1.017;SC=TCATTGTAGATCTGCAATGCC;SOR=0.902;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=56;TCF=33;TCR=23;TR=32;WE=102647318;WS=102647300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,40:0.61:66
chr11	102649543	rs470277	T	A	627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=399;ReadPosRankSum=0.090;SC=CTGTTCCAATTAAACAACAGT;SOR=0.631;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=10;TCR=30;TR=24;WE=102649551;WS=102649533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,27:0.61:44
chr11	102650424	rs486055	C	T	1578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.055;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=41;PP=963;ReadPosRankSum=-2.153;SC=ACTGTCCTTTCTTCTAAACTG;SOR=0.885;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=133;TCF=60;TCR=73;TR=69;WE=102650432;WS=102650414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,76:0.51:149
chr11	102661080	rs2239008	G	A	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.18;ReadPosRankSum=-0.878;SOR=0.635;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr11	102661099	rs470215	T	C	545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=8;PP=337;ReadPosRankSum=0.501;SC=GAAAACACCTTCTTTGGACTC;SOR=0.824;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=31;TCF=21;TCR=10;TR=22;WE=102661107;WS=102661089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,25:0.64:39
chr11	102661595	rs470747	A	G	1692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.853;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=42;PP=1017;ReadPosRankSum=2.854;SC=CACTCTGAAAATCATTACAGA;SOR=0.433;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=107;TCF=31;TCR=76;TR=62;WE=102661603;WS=102661585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,71:0.61:117
chr11	102661665	rs1938901	G	A	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=139;ReadPosRankSum=0.775;SC=TGTGAAATGGGGAGTGGATGG;SOR=0.392;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=8;WE=102661673;WS=102661655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr11	102663476	rs17884110	A	AG	4116.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.214;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=3.257;NF=8;NR=44;PP=2971;ReadPosRankSum=-0.008;SC=GAATCTGATTAGAAAAAAAGC;SOR=0.849;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=126;TCF=22;TCR=104;TR=52;WE=102663490;WS=102663466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,110:0.47:235
chr11	102663482	rs1144391	A	T	4109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.020;HP=6;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.081;NF=28;NR=41;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.685;SC=GATTAGAAAAAAAGCAAGAAA;SOR=0.793;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=182;TCF=84;TCR=98;TR=69;WE=102663490;WS=102663466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,107:0.47:230
chr11	102663503	rs7125062	T	C	2414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.735;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=49;PP=1533;ReadPosRankSum=1.929;SC=AGTTTCCATCTAATTTCTGGT;SOR=0.555;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=162;TCF=74;TCR=88;TR=99;WE=102663511;WS=102663493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,109:0.54:202
chr11	102666043	rs491152	A	G	4127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=67;PP=2776;SC=TAAAATACCTAGAGTTAGTTT;SOR=0.945;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=126;TCF=59;TCR=67;TR=126;WE=102666051;WS=102666033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr11	102666316	rs470558	T	C	3959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=81;PP=2279;SC=GTTCATGAGCTGCAACACGAT;SOR=1.294;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=137;TCF=56;TCR=81;TR=137;WE=102666324;WS=102666306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr11	102668702	rs470358	T	C	3704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=58;PP=1878;SC=TATTGTCACATGCAATGCAGC;SOR=0.794;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=127;TCF=69;TCR=58;TR=127;WE=102668710;WS=102668692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr11	102707339	rs639752	C	A	5227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=90;NR=87;PP=2965;SC=TGGAAACTCTCATCACCTATT;SOR=0.845;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=178;TCF=90;TCR=88;TR=177;WE=102707347;WS=102707329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr11	102707914	rs575027	A	G	1231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=6;PP=901;SC=AAATTTTGAGAAGGGAACTGG;SOR=2.948;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=31;TCR=6;TR=37;WE=102707922;WS=102707904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr11	102709425	rs520540	A	G	5302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=97;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.659;SC=TTCCTCTGATAGCCCAGAATT;SOR=0.379;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=172;TCF=74;TCR=98;TR=171;WE=102709433;WS=102709415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,196:0.99:197
chr11	102711338	rs591058	T	C	695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=14;PP=315;SC=TTTAAGAAATTGAGAACAATA;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=11;TCR=14;TR=25;WE=102711346;WS=102711328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	102713465	rs602128	A	G	6212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=116;NR=101;PP=2965;SC=AGTGACCAACATCAGGAACTC;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=217;TCF=116;TCR=101;TR=217;WE=102713473;WS=102713455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr11	102713620	rs679620	T	C	4182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=84;PP=2229;SC=ACATCTTTTTTGAGGTCGTAG;SOR=1.136;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=144;TCF=60;TCR=84;TR=143;WE=102713628;WS=102713610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr11	102713777	rs678815	G	C	112.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=86;SC=TGAAATAATGGCAAATTTTAT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=102713785;WS=102713767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr11	102735103	rs476185	A	G	2767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=51;PP=1618;SC=CTCTGATGAAAAAAACCAAGG;SOR=1.489;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=32;TCR=51;TR=83;WE=102735111;WS=102735093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr11	102738555	.	C	T	496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.014;ClippingRankSum=0.000;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=329;ReadPosRankSum=-1.429;SC=CAGATATTAACGTTTTATCCA;SOR=0.637;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=49;TCF=38;TCR=11;TR=23;WE=102738563;WS=102738545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,24:0.45:53
chr11	102738793	rs5794199	G	GT	9398.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=79;PP=2967;SC=TGAGGAACAAGTGGTGCCTAA;SOR=0.824;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=106;TCF=23;TCR=83;TR=102;WE=102738803;WS=102738783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr11	102738795	rs5003690	G	T	9407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=79;PP=2808;SC=AGGAACAAGTGGTGCCTAAGA;SOR=0.803;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=154;TCF=72;TCR=82;TR=150;WE=102738803;WS=102738783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr11	102822649	rs11225490	T	C	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=82;ReadPosRankSum=0.833;SC=ACCAAAACATTATTATGCAGC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=5;WE=102822657;WS=102822639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr11	102822733	rs3819089	C	T	801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=11;PP=560;ReadPosRankSum=-0.858;SC=TTTCTATAACCGAGTTACCAT;SOR=0.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=60;TCR=29;TR=33;WE=102822741;WS=102822723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,37:0.39:94
chr11	102824826	rs478927	T	C	1093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=7;PP=772;SC=AACTTCATACTAGTGTGTTCA;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=35;WE=102824834;WS=102824816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr11	102825091	rs640198	T	G	3677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=52;NR=61;PP=2019;SC=AGTGTTGAATTCTTTAAAAAG;SOR=1.006;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=113;TCF=52;TCR=61;TR=113;WE=102825099;WS=102825081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr11	102954119	rs11225545	G	A	878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.907;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=19;PP=425;ReadPosRankSum=-0.376;SC=AAATCGTCATGCTAAAGGTAC;SOR=0.425;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=73;TCF=29;TCR=44;TR=35;WE=102954127;WS=102954109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,43:0.48:90
chr11	102960156	.	T	TC	480.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.24;MQRankSum=1.024;QD=10.45;ReadPosRankSum=0.304;SOR=0.749;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,25:0.54:46
chr11	102985018	rs2245404	A	G	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=48;ReadPosRankSum=0.561;SC=TGTCTCATTAATACATTAGTA;SOR=0.412;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=5;WE=102985026;WS=102985008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr11	102988504	rs12146610	A	T	2479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=49;PP=1281;ReadPosRankSum=-0.179;SC=CTAACAGGTCAGGTGTGGCAG;SOR=0.684;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=207;TCF=107;TCR=100;TR=100;WE=102988512;WS=102988494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,119:0.49:245
chr11	103004929	rs2450918	C	G	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=3.251;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=175;ReadPosRankSum=1.072;SC=ATTGATATGTCTTGTATAGAT;SOR=1.781;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=8;WE=103004937;WS=103004919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr11	103005268	rs149703939	CTAATA	C	187.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=2;PP=83;SC=TAATAAATACCTAATATATTT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=2;WE=103005280;WS=103005258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	103013954	rs2514006	G	T	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.307;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=103;ReadPosRankSum=0.127;SC=TTAACATATTGGTTCTGTGTC;SOR=0.030;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=11;WE=103013962;WS=103013944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr11	103019443	rs2514000	C	G	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.450;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=45;ReadPosRankSum=-0.316;SC=AATATATAATCTCAACATTAT;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=4;WE=103019451;WS=103019433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr11	103026040	rs5794210	CT	C	302.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=5.464;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.54;MQRankSum=0.500;QD=15.14;ReadPosRankSum=1.578;SOR=3.500;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,18:0.90:20
chr11	103029373	rs688094	G	A	277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=2;PP=201;SC=AATTGTTAAAGTAGATGTGAA;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=103029381;WS=103029363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	103029516	rs688906	A	G	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=2.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.28;ReadPosRankSum=-0.747;SOR=0.581;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,27:0.52:52
chr11	103033914	rs657936	A	T	2124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.961;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=55;PP=1230;ReadPosRankSum=-1.454;SC=ATAGGCATGGAACGTGGAAAG;SOR=0.759;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=235;TCF=109;TCR=126;TR=102;WE=103033922;WS=103033904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,110:0.43:258
chr11	103047007	rs585692	C	A	3472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=35;PP=2035;SC=GGCTTAATACCATGTCAAAGT;SOR=1.311;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=76;TCR=35;TR=111;WE=103047015;WS=103046997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr11	103050028	rs632672	A	G	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=106;ReadPosRankSum=0.538;SC=TTTCATATTAAGTAAAATAAG;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=7;WE=103050036;WS=103050018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr11	103052558	rs11225584	T	C	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.033;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=9;PP=340;ReadPosRankSum=-1.658;SC=ATAGAAATAATCTTGAAAATT;SOR=0.983;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=31;TCR=19;TR=23;WE=103052566;WS=103052548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,25:0.44:57
chr11	103060309	rs617059	A	G	147.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=0;PP=87;SC=AGAGCAGCACAGTTTCAAAAC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=103060317;WS=103060302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr11	103062371	rs146014868	T	TTGTGTG	924.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=473;ReadPosRankSum=2.297;SC=AGTGTGTATCTTGTGTGTGTG;SOR=0.519;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=13;WE=103062380;WS=103062361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,27:0.59:46
chr11	103074349	rs631712	C	T	1401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=10;PP=833;SC=GAAAAAGCATCATTTATTAAA;SOR=2.078;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=34;TCR=10;TR=44;WE=103074357;WS=103074339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr11	103074639	rs613978	C	A	100.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=103;SC=AAAGTAACACCTAACTAGTGG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=103074647;WS=103074629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr11	103082590	rs589623	G	A	2907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=58;NR=42;PP=1562;SC=ACACCAAGCCGATACATGACC;SOR=0.881;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=58;TCR=42;TR=100;WE=103082598;WS=103082580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr11	103082700	rs11225606	T	C	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=253;ReadPosRankSum=-0.390;SC=TTGAATTATTTTATCTATATA;SOR=0.674;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=35;TCF=11;TCR=24;TR=18;WE=103082708;WS=103082690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,23:0.57:40
chr11	103086381	rs679691	G	T	426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=44;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=0;PP=353;SC=CTTTTCTATAGGGCTTTATTT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=103086389;WS=103086371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	103086399	rs78873690	G	GTA	1071.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=0;PP=1020;SC=TTTACTGTGTGTGTAAAATTC;SOR=4.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=103086407;WS=103086389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr11	103091237	rs636510	A	G	465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=271;SC=TAAGAGAGAGAACATTAGTAA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=103091245;WS=103091227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	103091546	rs670464	G	A	1490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=37;PP=1117;SC=ATATTATTTCGGCAATGAATG;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=12;TCR=37;TR=49;WE=103091554;WS=103091536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr11	103092945	rs654061	A	G	315.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=219;SC=GCTTTTTAAAATGTGGTGCTT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=103092953;WS=103092935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	103092968	rs669940	C	T	152.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.01;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr11	103104930	rs1784259	C	A	3036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=55;PP=1686;SC=TACCTTTAAACTGCAGGAAAT;SOR=1.035;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=45;TCR=55;TR=100;WE=103104938;WS=103104920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr11	103112358	rs58174873	CT	C	936.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.075;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=606;ReadPosRankSum=-0.343;SC=CTATTGAATGCTAGCATAAAA;SOR=0.439;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=39;TCF=8;TCR=31;TR=17;WE=103112366;WS=103112348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,29:0.44:66
chr11	103123999	rs648387	G	T	2094.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=20;PP=1139;ReadPosRankSum=0.208;SC=CCAATTGTGTGTTTTTTTTAA;SOR=1.064;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=69;TCR=21;TR=86;WE=103124007;WS=103123987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,81:0.96:84
chr11	103158278	rs10895391	C	T	2103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.492;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=44;PP=1292;ReadPosRankSum=-0.770;SC=GTAGTACAGGCGCTAAGACCG;SOR=0.740;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=200;TCF=111;TCR=89;TR=97;WE=103158286;WS=103158268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,107:0.49:220
chr11	103174035	rs12362743	T	G	957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.669;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=25;PP=508;ReadPosRankSum=-0.349;SC=GTTCCCACACTTGATGATATT;SOR=0.493;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=89;TCF=35;TCR=54;TR=43;WE=103174043;WS=103174025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,49:0.49:100
chr11	103187169	rs72975657	T	C	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.844;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=117;ReadPosRankSum=1.911;SC=AGGAGTTATATATTTTTAAGT;SOR=0.569;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=8;WE=103187177;WS=103187159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr11	103187438	rs35573672	C	G	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-2.744;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=164;ReadPosRankSum=-0.908;SC=AGTGGCTTAACTTCCTATCAC;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=103187446;WS=103187428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr11	103229027	rs2566913	T	C	2371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.568;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=44;PP=1453;ReadPosRankSum=-1.379;SC=CCAAATTTGATAGAGAAATCT;SOR=0.470;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=205;TCF=124;TCR=81;TR=102;WE=103229035;WS=103229017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,115:0.50:228
chr11	103229110	rs2671333	G	A	3453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.838;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=67;PP=1881;ReadPosRankSum=0.087;SC=ATATTCTTCTGATTCTTTTGC;SOR=0.597;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=278;TCF=140;TCR=138;TR=141;WE=103229118;WS=103229100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,160:0.50:318
chr11	103229173	rs2514408	A	C	1807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.536;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=45;PP=888;ReadPosRankSum=0.404;SC=GAGTCATACAAGTAATCACAT;SOR=0.616;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=177;TCF=75;TCR=102;TR=81;WE=103229181;WS=103229163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,89:0.45:198
chr11	103229188	rs2512128	G	C	1683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.013;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=40;PP=1007;ReadPosRankSum=-0.215;SC=TCACATTGCAGAGGTTCCTAA;SOR=0.520;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=151;TCF=60;TCR=91;TR=70;WE=103229196;WS=103229178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,77:0.46:167
chr11	103229238	rs2512129	G	A	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.310;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=363;ReadPosRankSum=0.558;SC=CTTCATACCAGTGCACATCAA;SOR=1.050;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=52;TCF=11;TCR=41;TR=23;WE=103229246;WS=103229228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,26:0.44:59
chr11	103270607	rs10895417	G	A	1467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.656;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=39;PP=925;ReadPosRankSum=0.592;SC=AAAGGTAAGCGAGTACTAACT;SOR=0.813;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=129;TCF=51;TCR=78;TR=63;WE=103270615;WS=103270597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,67:0.49:137
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chr11	103325908	rs11225812	C	T	2725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.453;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=43;PP=1615;ReadPosRankSum=-0.109;SC=ATTTCCCCCCCTCTAGAACTG;SOR=0.726;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=238;TCF=147;TCR=91;TR=114;WE=103325916;WS=103325898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,128:0.48:266
chr11	103327166	rs7121138	G	T	857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.542;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=25;PP=537;ReadPosRankSum=0.487;SC=ATCTCAAAGTGACCTATCTTT;SOR=0.452;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=46;TCF=8;TCR=38;TR=31;WE=103327174;WS=103327156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,35:0.66:53
chr11	103345030	rs11225822	A	C	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.763;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=91;ReadPosRankSum=-0.866;SC=ATACATTAGAACTCCGATTTC;SOR=0.368;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=8;WE=103345038;WS=103345020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr11	103780455	rs10791649	A	G	4083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=62;PP=2401;SC=AGATACAATCACATCGTTCAT;SOR=0.786;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=79;TCR=62;TR=141;WE=103780463;WS=103780445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr11	103780610	rs4754997	C	T	3127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=54;PP=1642;SC=CAGATGCCACCTACTTATTAC;SOR=1.112;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=98;TCF=44;TCR=54;TR=98;WE=103780618;WS=103780600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr11	103780695	rs4754998	G	A	531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=16;PP=398;SC=TGCACACGTTGCTATTAGAAT;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=103780703;WS=103780685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	103818344	rs11226083	G	C	2292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.445;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=44;PP=1379;ReadPosRankSum=0.683;SC=GACCTTAGCTGTTCCATCCGT;SOR=0.650;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=241;TCF=127;TCR=114;TR=94;WE=103818352;WS=103818334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,113:0.41:274
chr11	103908735	rs1052313	G	A	3072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.880;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=66;PP=1643;ReadPosRankSum=0.692;SC=GACGAAAAGAGCATTAAAGCA;SOR=0.636;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=248;TCF=123;TCR=125;TR=127;WE=103908757;WS=103908725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,151:0.51:296
chr11	104757836	rs5794352	T	TA	881.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=4;PP=802;SC=CAAGATGAATTAGAGCTTTGG;SOR=2.737;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=19;WE=104757844;WS=104757826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr11	104758035	rs484438	G	A	2290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=41;PP=1285;SC=AACATTATCTGCAAATAAAAG;SOR=1.165;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=32;TCR=41;TR=73;WE=104758043;WS=104758025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr11	104761013	rs635846	T	G	907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=24;NR=0;PP=733;SC=GAAATGCTCTTTTCGGTGATA;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=104761021;WS=104761003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	104761100	rs513131	T	C	5489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=111;NR=79;PP=2965;SC=AAATCACTTATGTGGTGTGGA;SOR=0.986;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=190;TCF=111;TCR=79;TR=190;WE=104761108;WS=104761090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr11	104761206	rs647039	C	T	5642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=102;PP=2965;SC=GTATCTGCACCGGCTTTTCCA;SOR=0.921;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=192;TCF=90;TCR=102;TR=192;WE=104761214;WS=104761196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr11	104761271	rs693506	A	C	1677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=40;PP=1260;SC=CATTATGTCTAATTAAAGAAG;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=10;TCR=40;TR=50;WE=104761279;WS=104761261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr11	104762228	rs544216	G	A	695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=16;PP=495;SC=AGCCAGCACTGAGGAATCAGA;SOR=2.124;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=22;WE=104762236;WS=104762218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	104763117	rs497116	G	A	5421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=107;NR=74;PP=2933;SC=AGTAGATCTCGCATCCCCAAA;SOR=0.968;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=181;TCF=107;TCR=74;TR=181;WE=104763125;WS=104763107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr11	104763716	rs617983	A	G	5921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=90;NR=109;PP=2965;SC=ATTTCCAGAAAAGCTGAAAGA;SOR=1.042;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=199;TCF=90;TCR=109;TR=199;WE=104763724;WS=104763706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr11	104768000	rs693001	G	A	9417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=354;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=171;NR=160;PP=2965;SC=TTTGCCTGCAGTTTGAGCTGT;SOR=0.728;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=331;TCF=171;TCR=160;TR=331;WE=104768008;WS=104767990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,352:1.00:352
chr11	104768098	rs555367	T	C	5555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=106;PP=2965;SC=CTGTATTTAATACATTATTTT;SOR=1.139;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=181;TCF=75;TCR=106;TR=181;WE=104768106;WS=104768088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr11	104768909	rs650940	T	C	908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=26;NR=6;PP=661;SC=AGAACAGAAATCCAGGTGTTT;SOR=2.517;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=32;WE=104768917;WS=104768899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	104819327	rs9507	T	C	4411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=83;NR=62;PP=2514;SC=CATCTTCCTCTAGGTTCTCAG;SOR=0.793;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=145;TCF=83;TCR=62;TR=145;WE=104819335;WS=104819317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr11	104819542	rs5794358	G	GAAAC	758.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=64.28;QD=42.15;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	104819544	rs33955446	G	GACAC	758.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=65.52;QD=50.58;SOR=2.448;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	104819546	rs5004914	G	C	646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=65.90;QD=46.20;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	104820163	rs649739	A	C	950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=1;PP=712;SC=AATGTACTTTATTTACACTGG;SOR=4.479;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=27;WE=104820171;WS=104820153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr11	104872981	rs544211	C	T	2594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=51;PP=1540;SC=CTTTTCAACCCCCATATGCCT;SOR=1.251;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=33;TCR=51;TR=84;WE=104872989;WS=104872971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr11	104877717	rs2282658	C	G	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=5.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=362;ReadPosRankSum=1.960;SC=AGAAATGAAACTGTAGGTAGA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=16;WE=104877725;WS=104877707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr11	104877803	rs2282657	A	G	2786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=47;PP=1920;ReadPosRankSum=-0.245;SC=GTTAGATGCAACCTTACGTTT;SOR=0.682;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=215;TCF=132;TCR=83;TR=118;WE=104877811;WS=104877793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,126:0.53:238
chr11	104877927	rs507879	T	C	7879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=118;NR=139;PP=2965;ReadPosRankSum=0.022;SC=TCAATTTTGGTATCATAATAT;SOR=0.892;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=259;TCF=119;TCR=140;TR=257;WE=104877935;WS=104877917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,284:0.99:286
chr11	104878040	rs112680102	G	GT	31.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=4.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.43;ReadPosRankSum=-0.250;SOR=1.188;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,11:0.15:73
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chr11	104893999	rs1699090	A	C	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.496;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=301;ReadPosRankSum=0.078;SC=CTGGGAACCTATAGTTTCATC;SOR=1.002;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=17;WE=104894007;WS=104893989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr11	104896226	rs483345	G	A	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.37;ReadPosRankSum=-1.111;SOR=0.616;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,22:0.49:45
chr11	104896375	rs2509648	G	T	294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=252;SC=GAAAGAATTTGGTTAAAGACA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=104896383;WS=104896365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	104896880	rs534811	A	G	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.213;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=246;ReadPosRankSum=-1.294;SC=CTGTAAACCTAGAGTTCTTGA;SOR=0.368;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=6;WE=104896901;WS=104896870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr11	104896893	rs476889	C	A	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-3.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=246;ReadPosRankSum=0.459;SC=GTTCTTGACTCAAATGGACTT;SOR=0.317;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=8;WE=104896901;WS=104896870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr11	104899817	rs505901	C	A	458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=227;ReadPosRankSum=-0.764;SC=TATTGATAGCCCCAACAAAGA;SOR=0.600;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=16;WE=104899825;WS=104899807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,20:0.54:37
chr11	104900115	rs503153	G	C	812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.066;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=19;PP=484;ReadPosRankSum=0.191;SC=CATGCAAATAGACACATGCAT;SOR=0.033;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=40;TCF=7;TCR=33;TR=26;WE=104900123;WS=104900105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,31:0.66:47
chr11	104900385	rs501192	C	T	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.597;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=430;ReadPosRankSum=0.674;SC=AAGGCATCAGCACTCACCACC;SOR=1.721;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=56;TCF=38;TCR=18;TR=26;WE=104900393;WS=104900375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,26:0.43:60
chr11	104900488	rs580253	G	A	2150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=44;PP=1358;ReadPosRankSum=-0.638;SC=TTGAGTTGTAGTATATCTGGG;SOR=0.697;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=212;TCF=118;TCR=94;TR=100;WE=104900496;WS=104900478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,106:0.47:225
chr11	104901007	rs473549	C	T	1397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=18;PP=741;ReadPosRankSum=0.226;SC=TAATATTATTCAGTTATACGA;SOR=0.713;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=100;TCF=68;TCR=32;TR=55;WE=104901015;WS=104900997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,64:0.57:113
chr11	104903719	rs572687	G	A	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.235;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=211;ReadPosRankSum=-0.862;SC=ATTTACCCACGTTTGATCCTA;SOR=1.521;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=44;TCF=31;TCR=13;TR=17;WE=104903727;WS=104903709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,20:0.40:50
chr11	104904570	rs568910	A	C	1824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.730;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=28;PP=1119;ReadPosRankSum=-0.761;SC=CTTTACAACTACATAAGTGCC;SOR=0.915;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=144;TCF=86;TCR=58;TR=73;WE=104904578;WS=104904560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,85:0.52:165
chr11	104905047	rs539595	G	A	4272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.5;BaseQRankSum=-0.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=387;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.188;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-9.434;NF=101;NR=100;PP=2962;ReadPosRankSum=1.916;SC=TCAAAGCTCGGGTCTTATCCA;SOR=0.626;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=399;TCF=206;TCR=193;TR=201;WE=104905055;WS=104905037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:196,191:0.49:387
chr11	104911939	rs17447587	A	G	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.297;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=84;ReadPosRankSum=-0.759;SC=TAAAAAACTGACTCCAATTCT;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=5;WE=104911947;WS=104911938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr11	104912012	rs17103597	G	T	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.411;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=139;ReadPosRankSum=0.870;SC=TTGCTCAATGGGATGTGCTTT;SOR=0.357;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=15;WE=104912020;WS=104912002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
chr11	104912221	rs542571	T	A	2676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=45;PP=1524;ReadPosRankSum=-0.691;SC=CAGAAGTATGTTCCTCCAGAA;SOR=0.710;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=218;TCF=127;TCR=91;TR=110;WE=104912229;WS=104912211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,124:0.52:240
chr11	104912458	rs1503391	A	C	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=23;PP=556;ReadPosRankSum=0.653;SC=TGCAAGAGACAAGGAATATCA;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=59;TCF=13;TCR=46;TR=30;WE=104912466;WS=104912448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,34:0.50:68
chr11	104914087	rs71037294	AG	A	71.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=125;ReadPosRankSum=0.825;SC=AGATTAAAAAAGAAAATTATA;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=104914095;WS=104914077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr11	104915441	rs545911	C	T	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=3.191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.40;MQRankSum=-7.407;QD=9.12;ReadPosRankSum=-1.792;SOR=1.284;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,17:0.29:58
chr11	104915444	rs473394	C	A	518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=5.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.26;MQRankSum=-7.015;QD=9.98;ReadPosRankSum=-2.421;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,15:0.29:52
chr11	104971210	rs1792771	C	T	4029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=48;PP=2541;SC=AGGCCCTAGGCGAACTTGAGT;SOR=1.378;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=134;TCF=86;TCR=48;TR=134;WE=104971218;WS=104971200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr11	104971257	rs12806837	G	A	2765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.123;NF=70;NR=53;PP=1458;ReadPosRankSum=-0.093;SC=GAGTCCCAGCGTCCCTGCCAG;SOR=0.713;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=274;TCF=153;TCR=121;TR=123;WE=104971265;WS=104971247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,138:0.45:304
chr11	104972190	rs1792773	C	T	8756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=166;NR=139;PP=2965;SC=AAAGCATGCACCACCTTTCTT;SOR=0.827;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=305;TCF=166;TCR=139;TR=305;WE=104972198;WS=104972180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,333:1.00:333
chr11	104972274	rs34077014	CT	C	2263.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.866;NF=2;NR=58;PP=1353;ReadPosRankSum=-0.012;SC=ATATGCATGTCTTTTTTTATT;SOR=0.678;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=128;TCF=5;TCR=123;TR=60;WE=104972282;WS=104972264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,101:0.54:187
chr11	105009425	rs4755080	G	A	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-3.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=198;ReadPosRankSum=-0.696;SC=AATGGAGTCTGAGGCTAAAAT;SOR=1.077;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=13;WE=105009433;WS=105009415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,16:0.39:41
chr11	105782501	.	A	AAT	49	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=0.9990;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=1;NR=0;PP=49;QD=52.0;SC=CTTGAAAAGCAATATATATAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=1;WE=105782509;WS=105782491;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,1:0.33:3
chr11	105836923	rs632549	G	A	1336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=37;PP=986;SC=TACGTATGCAGTTACTGTCAA;SOR=2.985;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=8;TCR=37;TR=45;WE=105836931;WS=105836913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr11	105842916	rs559190	C	T	727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=21;PP=567;SC=GGATGGTCTTCCCAGGAAACT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=105842924;WS=105842906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr11	105844923	rs509512	C	A	1500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=11;PP=1014;SC=ACTTGTAAATCATTTCAGGTT;SOR=2.480;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=38;TCR=11;TR=49;WE=105844931;WS=105844913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr11	105965216	rs1893175	G	T	240.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=198;SC=TATATATATAGAGAGAGAGAG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=9;WE=105965224;WS=105965206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	106408031	rs11279851	TCAAATG	T	5329.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=56;PP=2954;ReadPosRankSum=1.213;SC=CACGGAGAACTCAAATGTGTC;SOR=0.708;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=156;TCF=30;TCR=126;TR=71;WE=106408044;WS=106408021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,140:0.45:310
chr11	106408071	rs1791468	C	T	2505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.908;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=63;PP=1583;ReadPosRankSum=1.011;SC=ACCTCTATTTCCAGCCTTATG;SOR=0.760;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=260;TCF=129;TCR=131;TR=124;WE=106408079;WS=106408061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,130:0.46:280
chr11	106647137	rs139329770	A	ACTCAAACT	1214.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.626;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=7;PP=1002;ReadPosRankSum=1.275;SC=TGCACTTACTACTCAAACTAG;SOR=1.306;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=37;TCF=19;TCR=18;TR=16;WE=106647145;WS=106647127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,27:0.53:51
chr11	106697172	rs61678754	T	C	2879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=41;PP=1442;SC=CTTCTCCATATGATGAAAGAT;SOR=0.844;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=58;TCR=42;TR=97;WE=106697180;WS=106697162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr11	106807443	rs11331245	AT	A	1450.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=9.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.33;MQRankSum=1.790;QD=10.75;ReadPosRankSum=0.568;SOR=0.418;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,80:0.59:135
chr11	106888608	rs3107973	G	A	999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.779;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=20;PP=697;ReadPosRankSum=-0.791;SC=TCGGGGCCGGGGCGGCGGCAG;SOR=0.485;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=83;TCF=52;TCR=31;TR=48;WE=106888616;WS=106888598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,47:0.53:88
chr11	107197536	rs630782	C	T	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=339;ReadPosRankSum=0.833;SC=GCTGCTGTGACTCTCTCTGCC;SOR=1.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=17;WE=107197544;WS=107197526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr11	107197606	rs630693	G	C	1813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=26;PP=1215;ReadPosRankSum=-0.897;SC=AACGGGATCTGAAGAAAAATT;SOR=0.635;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=122;TCF=83;TCR=39;TR=73;WE=107197614;WS=107197596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,79:0.57:138
chr11	107197869	rs12363600	A	G	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=375;ReadPosRankSum=-0.900;SC=GCTATAAAATATAACAAGTTC;SOR=1.893;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=17;WE=107197877;WS=107197859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,18:0.72:25
chr11	107216388	rs474364	C	T	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.68;ReadPosRankSum=0.241;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr11	107286893	rs11439588	T	TG	899.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.347;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.086;NF=10;NR=5;PP=479;ReadPosRankSum=-1.018;SC=CCGGTGGTAGTTTACACAAGG;SOR=1.194;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=32;TCF=18;TCR=14;TR=15;WE=107286901;WS=107286883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,28:0.47:59
chr11	107287139	rs520729	T	A	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=74;ReadPosRankSum=-0.847;SC=TCATGTAGCCTTCATCTAATT;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=107287147;WS=107287129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr11	107299631	rs659040	G	A	2500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.921;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=48;PP=1467;ReadPosRankSum=-0.556;SC=ACATGTTGGTGTTCATCAGTA;SOR=0.618;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=253;TCF=150;TCR=103;TR=117;WE=107299639;WS=107299621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,128:0.46:281
chr11	107304237	rs549909	C	T	746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=6;PP=405;ReadPosRankSum=1.859;SC=CAGAAAATTACTTCAGTAGTA;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=63;TCF=50;TCR=13;TR=31;WE=107304245;WS=107304227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,34:0.53:64
chr11	107304541	rs2432867	C	T	708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=416;ReadPosRankSum=1.026;SC=ATATGTATTGCTTCTATGACT;SOR=0.562;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=40;TCF=4;TCR=36;TR=21;WE=107304549;WS=107304531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,24:0.55:44
chr11	107304572	rs71470848	AT	A	345.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.70;ReadPosRankSum=0.573;SOR=1.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr11	107313608	rs144259680	G	GAGGAAGGA	897.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=1.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.41;MQRankSum=3.305;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.111;SOR=1.284;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,22:0.42:52
chr11	107325376	rs11343583	AT	A	92.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=2.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.595;HP=7;HapScore=3;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=337;ReadPosRankSum=-0.625;SC=GAGAAAAAAAATAAACCACAT;SOR=1.244;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=11;WE=107325385;WS=107325366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,10:0.25:40
chr11	107326340	rs618078	C	A	1616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.150;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=17;PP=1001;ReadPosRankSum=1.021;SC=AACTTGAATACGTGCAAAAAA;SOR=0.899;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=130;TCF=92;TCR=38;TR=65;WE=107326348;WS=107326330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,74:0.49:150
chr11	107396158	rs12574614	T	C	849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.766;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=13;PP=534;ReadPosRankSum=-0.688;SC=GATAAGAGTATATACTTACTA;SOR=1.042;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=79;TCF=50;TCR=29;TR=36;WE=107396166;WS=107396148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,42:0.44:95
chr11	107420530	rs645056	A	G	4040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=404;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.090;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=83;PP=2281;ReadPosRankSum=1.159;SC=CGGAATGTGTATCAATATGAG;SOR=0.757;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=352;TCF=178;TCR=174;TR=169;WE=107420538;WS=107420520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:209,195:0.48:404
chr11	107431637	rs662349	C	A	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=4;PP=83;ReadPosRankSum=2.599;SC=TGTAAAAAAACAAGACAGTAA;SOR=0.327;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=7;WE=107431645;WS=107431626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr11	107462878	rs542650	A	C	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=302;ReadPosRankSum=-0.954;SC=CTCAGTGTTTATGCTCAACCT;SOR=0.846;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=15;WE=107462886;WS=107462868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr11	107462895	rs4085361	G	A	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.132;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=171;ReadPosRankSum=-0.131;SC=ACCTCTAAGCGGCGAGTTCGG;SOR=2.147;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=9;WE=107462903;WS=107462885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr11	107462977	rs5794560	G	GT	172.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=3;PP=143;SC=TAATGAATATGTTGTCAGCCT;SOR=1.329;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=107462985;WS=107462967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr11	107502123	rs10539761	ACCC	A	246.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=27.43;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,8:0.89:9
chr11	107578721	rs583362	C	G	4263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=75;PP=2410;SC=CCTCTGGCTTCTCCTCACCTC;SOR=0.924;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=143;TCF=68;TCR=75;TR=143;WE=107578729;WS=107578711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr11	107643289	rs60511673	T	G	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.78;ReadPosRankSum=-0.345;SOR=0.877;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr11	107729205	rs11603925	C	G	430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=13;NR=0;PP=392;SC=TGCTTCCCGACGCCAGGTGAA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=107729213;WS=107729195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	107729561	rs3741065	T	C	361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=11;PP=235;SC=CGGGAGGCGGTGCCTGTGCGG;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=107729569;WS=107729551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	107925327	rs3847562	C	T	263.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=1;PP=214;SC=ACTCAAAATACTGATTTTGAT;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=107925335;WS=107925317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	107925557	rs2271853	T	C	2765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=41;PP=1820;SC=ATTTGAGCAATTCCCTTGATA;SOR=0.797;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=50;TCR=41;TR=91;WE=107925565;WS=107925547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr11	107943013	rs146753263	A	G	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=312;ReadPosRankSum=0.952;SC=CTAAACTCTTACTCTAGTAAA;SOR=0.559;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=17;WE=107943021;WS=107943003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr11	107943260	rs113786799	TAGTG	T	418.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.044;NF=0;NR=9;PP=354;ReadPosRankSum=-1.203;SC=TTATTGAAAATAGTGAGCGGT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=9;WE=107943271;WS=107943250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr11	107968520	rs73000527	T	A	1577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.822;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=47;PP=1044;ReadPosRankSum=-0.955;SC=AACACCTTGTTTGAATTTTAG;SOR=1.042;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=103;TCF=30;TCR=73;TR=62;WE=107968528;WS=107968510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,68:0.60:113
chr11	107992312	rs3741054	C	G	1936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.575;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=37;PP=964;ReadPosRankSum=1.189;SC=CCTGTGGAGCCGATACTCAGC;SOR=0.636;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=146;TCF=74;TCR=72;TR=78;WE=107992320;WS=107992302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,92:0.56:165
chr11	108004927	rs201199156	CT	C	515.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=4.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.23;MQRankSum=0.751;QD=11.46;ReadPosRankSum=0.550;SOR=2.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,33:0.73:45
chr11	108009660	rs35188041	C	A	2325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-3.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.823;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=51;PP=1326;ReadPosRankSum=-1.699;SC=AGAGCATGTCCAATGTTCCAT;SOR=0.650;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=216;TCF=112;TCR=104;TR=110;WE=108009668;WS=108009650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,120:0.49:244
chr11	108012510	rs34420529	A	AAAGT	322.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=264;SC=GGATTTTGAAAAATTCTAGAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=5;WE=108012518;WS=108012500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	108013006	rs55854804	T	A	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=-3.353;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=83;ReadPosRankSum=0.367;SC=GTCTTGCAGTTAGCTGTGTAC;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=6;WE=108013014;WS=108013003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr11	108043988	rs2070661	C	T	713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.827;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=10;PP=312;ReadPosRankSum=-1.690;SC=CTCTTGTGAACTTCACTAGAA;SOR=0.487;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=71;TCF=38;TCR=33;TR=28;WE=108043996;WS=108043978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,35:0.43:82
chr11	108059000	rs3781869	T	C	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=5.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.57;ReadPosRankSum=0.541;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,19:0.45:42
chr11	108061379	rs659584	C	T	261.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=213;SC=ATTTTTTGGGCAAGCAACTGT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=108061387;WS=108061369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	108064935	rs11212546	A	G	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.119;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=84;ReadPosRankSum=-1.748;SC=GCTTCTAAAGAATCTTGCCTG;SOR=2.252;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=7;WE=108064943;WS=108064925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr11	108068954	rs683312	T	C	1018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=25;PP=613;ReadPosRankSum=-0.716;SC=AAATCTAATCTCAAGAGTTGT;SOR=0.653;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=78;TCF=33;TCR=45;TR=43;WE=108068962;WS=108068944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,48:0.55:87
chr11	108093208	rs228589	A	T	1627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.607;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=27;PP=1055;ReadPosRankSum=0.918;SC=ATAACCCTCCATCCCGCGTCC;SOR=0.639;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=147;TCF=94;TCR=53;TR=70;WE=108093216;WS=108093198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,73:0.47:154
chr11	108128393	.	C	A	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.48;BaseQRankSum=-0.977;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=4;PP=76;ReadPosRankSum=-0.927;SC=GTCACCCAGGCTGGAGTGCAG;SOR=0.593;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=11;TCF=5;TCR=6;TR=8;WE=108128401;WS=108128383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr11	108129657	rs672655	A	G	795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.207;SOR=0.558;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,42:0.51:83
chr11	108137775	rs642496	T	A	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.702;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=263;ReadPosRankSum=-0.214;SC=CACCTGGCTCTGCCTCCCAAA;SOR=0.255;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=18;WE=108137783;WS=108137765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr11	108143182	rs664677	C	T	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=34;ReadPosRankSum=0.784;SC=AAGTAACTTACAATAACCTTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=4;WE=108143190;WS=108143172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
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chr11	108151707	rs3218681	T	TA	514.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=6.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.01;MQRankSum=0.000;QD=8.17;ReadPosRankSum=2.111;SOR=1.585;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,30:0.48:63
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chr11	108183167	rs659243	A	G	2954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=56;NR=40;PP=1424;SC=GGAAGCCAGAATACAACTATT;SOR=0.710;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=56;TCR=40;TR=96;WE=108183175;WS=108183157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr11	108196712	rs3212322	CATT	C	229.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=229;ReadPosRankSum=1.419;SC=TTGCTGCTTTCATTATTATTA;SOR=1.426;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=6;WE=108196722;WS=108196702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr11	108218196	rs227075	T	C	100.88	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5210;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=67;ReadPosRankSum=-0.431;SC=ACAGATAAATTGAAGCAGTAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=5;WE=108218204;WS=108218186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr11	108224697	rs179108	G	A	1305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=35;PP=937;SC=AATCCCAGCTGCTCAAGAGGC;SOR=3.209;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=6;TCR=35;TR=41;WE=108224705;WS=108224687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr11	108225483	rs664982	C	T	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.056;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=270;ReadPosRankSum=-1.230;SC=GATAAAGATACGTTGACAACA;SOR=0.963;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=52;TCF=35;TCR=17;TR=22;WE=108225491;WS=108225473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,25:0.42:59
chr11	108225661	rs664143	A	G	1707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.146;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=36;PP=1069;ReadPosRankSum=-1.111;SC=TGTGTATCTCATCAGGAAGTC;SOR=0.631;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=176;TCF=92;TCR=84;TR=80;WE=108225669;WS=108225651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,88:0.46:192
chr11	108256837	rs113995	A	T	208.56	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.7362;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=162;ReadPosRankSum=0.589;SC=GTAACTCTCAAGACTTTCTCA;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=8;WE=108256845;WS=108256827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr11	108276091	rs9667658	C	G	593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.854;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=9;PP=360;ReadPosRankSum=1.077;SC=AGCAATACCTCATTTCAAATT;SOR=0.325;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=54;TCF=40;TCR=14;TR=27;WE=108276099;WS=108276081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,29:0.49:59
chr11	108352160	rs3901850	C	T	1410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=32;PP=824;SC=TTTAATATGGCAAGCATAATC;SOR=2.049;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=12;TCR=32;TR=44;WE=108352168;WS=108352150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr11	108353018	rs3765632	C	A	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=76;ReadPosRankSum=-1.068;SC=TACAACAGTTCTTTGGTTTTC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=5;WE=108353026;WS=108353008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr11	108380335	rs1943382	T	C	8610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=147;NR=139;PP=2965;SC=GTGTCACAATTTGAGTCCACT;SOR=0.712;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=286;TCF=147;TCR=139;TR=286;WE=108380343;WS=108380325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,313:1.00:313
chr11	108381247	rs2640779	C	T	1944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=39;PP=1162;ReadPosRankSum=-0.974;SC=ACATGCTTTCCGTTCTCACTC;SOR=0.622;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=182;TCF=93;TCR=89;TR=83;WE=108381255;WS=108381237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,92:0.46:198
chr11	108384021	rs76626971	G	C	3153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.320;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=73;PP=2027;ReadPosRankSum=0.038;SC=ATCAGGTAAAGAGTTTGAGAT;SOR=0.752;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=272;TCF=138;TCR=134;TR=138;WE=108384029;WS=108384011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,149:0.51:294
chr11	108384207	rs2846412	C	T	2616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=48;PP=1500;ReadPosRankSum=0.930;SC=TGAATTGCTGCTGGTCACAGT;SOR=0.680;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=201;TCF=109;TCR=92;TR=107;WE=108384215;WS=108384197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,124:0.55:226
chr11	108409784	rs2640785	T	A	3502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.776;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=75;PP=1963;ReadPosRankSum=1.515;SC=CTTTGAAGTCTCCTTTCCAGA;SOR=0.663;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=309;TCF=159;TCR=150;TR=153;WE=108409792;WS=108409774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,171:0.50:339
chr11	108535792	rs2306118	C	T	751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=19;NR=2;PP=525;SC=GCATGCGCCTCTGTGCGTTTG;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=108535800;WS=108535782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	108549186	.	TA	T	61.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.458;ClippingRankSum=0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.58;ReadPosRankSum=-0.549;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,11:0.28:39
chr11	108722851	rs10890899	C	G	2906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=37;PP=1798;SC=TTATATGCTGCTAATTTTTCT;SOR=1.064;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=57;TCR=37;TR=94;WE=108722859;WS=108722841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr11	109964007	rs7116424	A	G	2026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.559;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.956;NF=30;NR=50;PP=1243;ReadPosRankSum=-0.904;SC=TGTGCAACCCAGGGAGGGGGC;SOR=1.010;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=152;TCF=63;TCR=89;TR=80;WE=109964015;WS=109963997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,93:0.53:176
chr11	109964079	rs7116552	C	A	2760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=17;NR=39;PP=1415;SC=GGGAGGGCCGCGGTGGCCGCT;SOR=1.839;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=17;TCR=39;TR=56;WE=109964097;WS=109964069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr11	109964089	rs11395531	T	TG	2785.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=9;NR=37;PP=1944;SC=CGGTGGCCGCTTCTCCGCGGG;SOR=1.430;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=47;TCF=9;TCR=38;TR=46;WE=109964097;WS=109964069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr11	109964257	rs7116683	A	G	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=307;ReadPosRankSum=0.802;SC=CCCGGGCGCCAGGCGGAGGGC;SOR=0.743;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=16;TCR=23;TR=24;WE=109964265;WS=109964247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,26:0.60:43
chr11	110023628	rs665013	C	T	2560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=58;NR=17;PP=1515;SC=TTAAGTGTTCCGTAATAATCT;SOR=2.049;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=58;TCR=17;TR=75;WE=110023636;WS=110023618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr11	110033860	rs11213287	T	C	447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=13;NR=0;PP=345;SC=TTTTTTACTCTGTAAACGTGG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=110033868;WS=110033852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
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chr11	110103924	rs10450619	A	C	183.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=1;PP=178;SC=AATGCAAACTATATTTCAAAT;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=110103932;WS=110103922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr11	110118364	rs17110988	A	C	3561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=42;PP=1407;SC=ACTAAAAAAAATACCACTATC;SOR=1.239;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=120;TCF=77;TCR=43;TR=118;WE=110118372;WS=110118354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr11	110126197	rs2306085	A	G	2659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=52;PP=1582;SC=TGAATGACCAATCTTAAGAGT;SOR=1.321;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=34;TCR=52;TR=86;WE=110126205;WS=110126187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr11	110128994	rs10789756	C	G	1062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.848;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.091;NF=21;NR=34;PP=905;ReadPosRankSum=0.539;SC=AGAATCCTTTCAGTAACTTGA;SOR=0.533;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=37;TCR=60;TR=55;WE=110129002;WS=110128984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,52:0.55:94
chr11	110150486	rs61003001	TA	T	469.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5718;FS=4.309;HP=12;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.321;NF=1;NR=17;PP=263;ReadPosRankSum=0.527;SC=CACTTTCTGTTAAAAAAAAAA;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=18;WE=110150495;WS=110150476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,24:0.89:27
chr11	110333030	rs3831392	A	AAT	3911.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=0.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=34;PP=2111;ReadPosRankSum=1.523;SC=TTGCCTTGTGAATATATATAC;SOR=0.720;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=117;TCF=35;TCR=82;TR=52;WE=110333038;WS=110333020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,117:0.53:219
chr11	110451885	rs10488765	A	G	2149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.484;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=48;PP=1159;ReadPosRankSum=3.359;SC=GTGCATCAACATCCTCATTTA;SOR=0.731;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=198;TCF=101;TCR=97;TR=99;WE=110451893;WS=110451875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,110:0.49:224
chr11	110452999	rs2008772	C	A	1724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.39;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr11	110453009	rs4079590	G	A	1957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.79;SOR=2.608;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr11	110453250	rs4142632	C	G	914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=28;PP=776;SC=TTAACAAAAACCACATCTACC;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=28;WE=110453258;WS=110453240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	110462986	rs10891146	G	C	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.718;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=64;ReadPosRankSum=0.674;SC=AAGAGAAAAAGATGCTAATAG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=110462994;WS=110462976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr11	110479839	rs59458030	ATTT	A	1464.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.17;MQRankSum=0.556;QD=31.16;ReadPosRankSum=-0.099;SOR=0.723;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,38:0.81:47
chr11	110482021	rs149963439	A	G	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=7;PP=216;ReadPosRankSum=1.097;SC=AATGTCTAGCAGAATAACTTA;SOR=0.681;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=26;TCR=16;TR=18;WE=110482029;WS=110482011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,20:0.41:49
chr11	110494724	rs7128425	T	C	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=186;ReadPosRankSum=1.000;SC=TGGTTGGGTGTATGTGTCAAC;SOR=1.473;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=10;WE=110494732;WS=110494721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr11	110561176	rs45502499	C	T	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=191;ReadPosRankSum=0.056;SC=CAAACAACCTCTACACATTAA;SOR=0.914;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=11;WE=110561184;WS=110561166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr11	110582310	rs2305289	T	C	1153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.662;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=22;PP=617;ReadPosRankSum=0.845;SC=CGAAAACTGCTATGGAGCAGC;SOR=0.671;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=106;TCF=63;TCR=43;TR=50;WE=110582318;WS=110582300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,59:0.47:125
chr11	110582814	rs7112658	CG	AA	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;JOINED;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=257;ReadPosRankSum=1.430;SC=GGGGCTGCGGCGGCGGAGGGC;SOR=0.551;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=8;WE=110582823;WS=110582804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr11	110582834	rs7112669	C	A	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.768;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=204;ReadPosRankSum=-2.026;SC=CACGGGCCCCCGCTCAGCGTC;SOR=0.283;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=16;WE=110582842;WS=110582824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr11	110697305	rs120434	C	G	1416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=37;PP=991;ReadPosRankSum=-0.762;SC=GAATGCTGATCCTTAACCATG;SOR=0.660;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=144;TCF=62;TCR=82;TR=65;WE=110697313;WS=110697295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,67:0.44:153
chr11	110697444	rs120436	G	A	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=107;ReadPosRankSum=0.664;SC=TGTATCCACCGGTAGTCACTT;SOR=0.859;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=7;WE=110697452;WS=110697434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr11	111154724	rs7926730	C	A	869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=9;PP=562;ReadPosRankSum=-1.661;SC=GTTTCCCAGGCAGAGACTCAG;SOR=0.627;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=49;TCR=17;TR=34;WE=111154732;WS=111154714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,38:0.54:71
chr11	111156836	rs3087967	T	C	746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=6.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.23;ReadPosRankSum=1.038;SOR=0.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,39:0.53:73
chr11	111179054	rs3087587	A	G	4449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=78;PP=2544;SC=CTCTCCAGGCAGCAGAGTACT;SOR=0.974;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=67;TCR=78;TR=145;WE=111179062;WS=111179044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr11	111229470	rs12282082	T	C	1051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=4;PP=690;SC=CACATTCTCTTTCACACACAC;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=31;WE=111229478;WS=111229460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr11	111249785	rs11213863	C	G	275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=1;PP=202;SC=CCCCCGTGGCCCCATCACCTC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=111249793;WS=111249775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	111249819	rs10789825	A	G	645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=5;PP=359;SC=CCAATTCCAGACCAAGCTGTG;SOR=1.708;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=21;WE=111249827;WS=111249809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr11	111275250	rs4938535	T	C	1080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=21;PP=705;ReadPosRankSum=-0.982;SC=GGGCAGGGAATCATCTGACAT;SOR=0.736;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=97;TCF=59;TCR=38;TR=53;WE=111275258;WS=111275240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,55:0.54:102
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chr11	111326284	rs7925584	T	C	419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=0;PP=351;SC=TCAGCAGCAGTTGAAAGCACA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=111326292;WS=111326280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	111327213	rs11213913	G	A	1971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=18;PP=1290;SC=GCCCAGGGCTGAGCAGGCAAT;SOR=1.739;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=49;TCR=18;TR=67;WE=111327221;WS=111327203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr11	111338478	rs651882	T	C	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=256;ReadPosRankSum=-0.025;SC=TCCTGACATATTTTATTCCCT;SOR=0.560;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=17;WE=111338486;WS=111338468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
chr11	111368047	rs489078	G	T	5791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=94;PP=2965;SC=CTCTACTAACGGCATAACTGA;SOR=0.792;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=187;TCF=93;TCR=94;TR=187;WE=111368055;WS=111368037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr11	111383789	rs11606481	C	T	907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=25;PP=508;ReadPosRankSum=-2.447;SC=CCGGCTCGGGCAGCCCGCAGC;SOR=0.665;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=105;TCF=51;TCR=54;TR=48;WE=111383797;WS=111383779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,50:0.44:114
chr11	111404569	rs117655744	G	A	2317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.029;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=49;PP=1466;ReadPosRankSum=0.123;SC=ATCTATCTGAGTGGATGAATT;SOR=0.599;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=206;TCF=106;TCR=100;TR=100;WE=111404577;WS=111404559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,108:0.48:224
chr11	111420364	rs634679	A	G	2152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=21;PP=1431;SC=TGGATGAGCCATCCTGCGGCA;SOR=1.824;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=76;TCF=55;TCR=21;TR=75;WE=111420372;WS=111420354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr11	111422217	rs663763	C	T	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.695;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=343;ReadPosRankSum=-0.894;SC=CCACCCATGCCCAGAATAGTT;SOR=0.247;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=38;TCF=8;TCR=30;TR=21;WE=111422225;WS=111422207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,22:0.55:40
chr11	111487106	rs571462	C	G	1271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.648;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=30;PP=687;ReadPosRankSum=0.673;SC=CTAACACTATCTCCATTCATT;SOR=0.882;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=37;TCR=52;TR=51;WE=111487114;WS=111487096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,57:0.58:99
chr11	111575634	rs36106790	C	CT	133.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.04;ReadPosRankSum=2.000;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr11	111623088	rs4936675	T	A	3410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.893;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=87;PP=2038;ReadPosRankSum=-2.428;SC=AAGACCACATTTAAAAATCAA;SOR=0.847;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=314;TCF=154;TCR=160;TR=161;WE=111623096;WS=111623078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,169:0.50:338
chr11	111625566	rs3737445	T	C	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=137;ReadPosRankSum=-0.332;SC=TAAGTGACAATGTAACATTTC;SOR=0.602;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=9;WE=111625574;WS=111625556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr11	111635655	rs7106104	T	C	683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=389;ReadPosRankSum=-0.491;SC=ACAGGACTCATCAACATGGAT;SOR=0.610;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=60;TCF=17;TCR=43;TR=25;WE=111635663;WS=111635645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,31:0.43:72
chr11	111636627	rs643506	T	G	1164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.676;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=35;PP=830;ReadPosRankSum=-0.412;SC=CGTCTCGGCCTGGCACCGCGC;SOR=0.335;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=88;TCF=23;TCR=65;TR=50;WE=111636635;WS=111636617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,51:0.56:91
chr11	111637117	rs139691367	T	TCCCGCCCCGCGCCCAGGC	681.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.20;QD=42.61;SOR=5.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	111741106	rs72994380	A	C	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.58;ReadPosRankSum=1.358;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr11	111742145	rs10708475	CG	C	5232.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQ=60.17;NF=38;NR=40;PP=2967;SC=GCAGCCGGGGCGCGTATCCCC;SOR=1.470;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=82;TCF=41;TCR=41;TR=78;WE=111742153;WS=111742135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr11	111747297	rs7124696	A	G	2261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.532;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=51;PP=1347;ReadPosRankSum=-0.791;SC=GAGAACCTTCAAAAGGTAAGC;SOR=0.631;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=172;TCF=85;TCR=87;TR=100;WE=111747305;WS=111747287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,111:0.57:194
chr11	111747427	rs634983	C	T	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=262;ReadPosRankSum=0.439;SC=TTTTAGAGACCGAATCAATTA;SOR=0.892;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=28;TCF=10;TCR=18;TR=16;WE=111747435;WS=111747417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr11	111749349	rs611010	A	T	6220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=104;PP=2965;SC=ATGCGGGAAGATGAAATAAAT;SOR=0.746;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=212;TCF=108;TCR=104;TR=212;WE=111749357;WS=111749339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr11	111750430	rs7107213	A	G	1076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=24;PP=593;ReadPosRankSum=-0.630;SC=GGATGAACAAAATGTGGCCTA;SOR=0.632;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=110;TCF=51;TCR=59;TR=46;WE=111750438;WS=111750420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,55:0.42:131
chr11	111754574	rs1045282	A	C	3291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=397;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.368;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=81;PP=2085;ReadPosRankSum=-1.845;SC=CAGAAAAGTCAACTTACATGA;SOR=0.730;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=363;TCF=171;TCR=192;TR=153;WE=111754586;WS=111754564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:232,165:0.42:397
chr11	111780104	rs68187136	TA	T	64.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.096;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.47;ReadPosRankSum=0.204;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr11	111780837	rs2070894	G	A	658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.424;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=6;PP=463;ReadPosRankSum=0.443;SC=CATCTAAGGCGATCAAATCAA;SOR=0.469;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=44;TCF=37;TCR=7;TR=27;WE=111780845;WS=111780827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,28:0.60:47
chr11	111781047	rs11603779	A	C	4171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=4.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=391;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=99;PP=2765;ReadPosRankSum=-1.146;SC=AACAAGCTACATACCTGGCGC;SOR=0.697;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=355;TCF=154;TCR=201;TR=174;WE=111781055;WS=111781037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:201,190:0.49:391
chr11	111848361	rs11364849	AG	A	960.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=5;PP=653;SC=TAGCTTTGCTAGGCTGGCCTT;SOR=2.066;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=17;WE=111848369;WS=111848351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	111853106	rs11455434	G	GC	5988.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=65;PP=2936;SC=CGGCCAGGGAGCCTGGAACCT;SOR=0.897;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=81;TCF=14;TCR=67;TR=78;WE=111853114;WS=111853096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr11	111889654	rs476581	C	T	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.287;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=273;ReadPosRankSum=-1.001;SC=TGTTTTTTCACTGTGGCTTTT;SOR=1.051;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=63;TCF=49;TCR=14;TR=22;WE=111889662;WS=111889644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,26:0.36:72
chr11	111915765	rs11455845	C	CA	845.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=1.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.62;ReadPosRankSum=-2.447;SOR=0.346;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:7,41:0.85:48
chr11	111916001	rs11335731	AG	A	3207.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=50;PP=2354;SC=GGGCATCTTTAGGTTGTTTAG;SOR=1.609;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=58;TCF=6;TCR=52;TR=56;WE=111916009;WS=111915991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr11	111956989	rs14396	C	A	3982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=58;PP=2477;ReadPosRankSum=-0.659;SC=GTGACGGCGACACCAAAACCC;SOR=0.283;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=81;TCR=58;TR=138;WE=111956997;WS=111956979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,148:0.99:149
chr11	111957143	rs487201	T	C	2611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=61;PP=1827;SC=ATCTTCCCTGTTTTACACCTT;SOR=1.796;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=92;TCF=30;TCR=62;TR=91;WE=111957151;WS=111957133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr11	112025915	rs4988359	T	C	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=59;ReadPosRankSum=-0.241;SC=ATTCAATAAATGCCAGAAGTT;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=112025923;WS=112025905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr11	112041128	rs149903853	TTTTGTCCTG	T	1459.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=2963;ReadPosRankSum=-0.728;SC=GTTTTCTTTATTTTGTCCTGT;SOR=0.693;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=54;TCF=18;TCR=36;TR=22;WE=112041144;WS=112041118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,40:0.40:101
chr11	112064431	rs7105056	T	C	4584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=85;SC=GTGATAGTGATGATTATTTAA;SOR=0.987;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=155;TCF=70;TCR=85;TR=155;WE=112064439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr11	112065434	rs10891338	T	C	7250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=126;NR=125;PP=2965;SC=CATTATGACCTGGATGGAACA;SOR=0.782;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=252;TCF=126;TCR=126;TR=251;WE=112065442;WS=112065424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr11	112065483	rs7123686	A	C	2223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FS=3.704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.995;SOR=0.487;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,118:0.51:233
chr11	112071294	rs12420140	G	A	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-2.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=241;ReadPosRankSum=0.111;SC=GACAACTCTAGTTTGCCAAAT;SOR=0.976;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=14;WE=112071302;WS=112071284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr11	112071570	rs7948124	AA	TT	3100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=48;PP=2759;SC=TTGATTTTTTAAAAATCTTCC;SOR=2.472;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=64;TCF=15;TCR=49;TR=62;WE=112071579;WS=112071560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr11	112072930	rs4935984	G	A	802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.769;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=26;PP=543;ReadPosRankSum=-0.293;SC=ATTAGAATTTGTCAAGAGTCA;SOR=0.949;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=93;TCF=32;TCR=61;TR=38;WE=112072938;WS=112072920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,40:0.40:99
chr11	112087101	rs2676377	T	A	3089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=66;PP=1894;SC=TAGCACTGAGTCATCTGATAA;SOR=1.652;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=34;TCR=66;TR=100;WE=112087109;WS=112087091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr11	112088499	rs2217401	A	C	5400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=119;NR=62;PP=2965;SC=AAGCAATTTTATCCTAGTTTT;SOR=1.317;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=181;TCF=119;TCR=62;TR=181;WE=112088507;WS=112088489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr11	112099410	rs3819331	T	C	638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=6.638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.20;ReadPosRankSum=-0.527;SOR=0.485;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,38:0.37:103
chr11	112123095	rs2564872	A	G	7227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=124;NR=121;PP=2965;SC=TTCAGAGTAGAAAGTATAGGC;SOR=0.777;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=245;TCF=124;TCR=121;TR=245;WE=112123103;WS=112123085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,271:1.00:271
chr11	112130987	rs2518361	G	C	267.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=147;SC=CTCATTCTTTGTCTTCCTTCC;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=112130995;WS=112130977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	112832307	rs11381910	G	GA	5583.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=78;PP=2957;SC=ACCGCGGCAAGACATCCCTCC;SOR=0.761;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=92;TCF=11;TCR=81;TR=89;WE=112832315;WS=112832297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr11	112832339	rs11284059	GC	G	4842.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=71;PP=2967;SC=TTACAATGCTGCCAAACTAAG;SOR=1.148;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=86;TCF=14;TCR=72;TR=84;WE=112832366;WS=112832329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr11	112832353	rs7105734	T	C	4513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.14;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr11	112832358	rs6589347	T	C	4288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.14;SOR=1.227;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr11	112832391	.	AT	A	32.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=0.000;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.73;ReadPosRankSum=-0.383;SOR=0.546;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,10:0.22:45
chr11	112832405	rs73002342	T	A	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.97;ReadPosRankSum=0.601;SOR=0.620;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,26:0.54:48
chr11	112952272	rs5794840	C	CT	884.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=1.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQRankSum=0.785;QD=14.50;ReadPosRankSum=0.541;SOR=0.462;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,39:0.64:61
chr11	112983809	rs10891508	G	A	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=164;ReadPosRankSum=1.213;SC=AGCCGATATCGCACCACACTG;SOR=0.368;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=11;WE=112983817;WS=112983799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr11	112984037	rs1245087	G	A	1214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=30;PP=958;SC=CAAATTAGATGATCAGTAAGT;SOR=2.191;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=10;TCR=30;TR=40;WE=112984045;WS=112984027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr11	113067854	rs973461	T	C	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=136;ReadPosRankSum=2.064;SC=TGGGGGAAACTGCCCCCATGA;SOR=0.446;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=11;WE=113067862;WS=113067852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr11	113073066	rs5794855	T	TTTTTG	905.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.56;MQRankSum=2.939;QD=12.94;ReadPosRankSum=-0.707;SOR=0.643;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,23:0.33:70
chr11	113076982	rs1975259	G	C	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=182;ReadPosRankSum=1.119;SC=ACTTCCTCTTGGGTCTGTAAA;SOR=0.622;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=10;TCR=19;TR=17;WE=113076990;WS=113076972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr11	113085244	rs686050	C	G	1790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.786;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=42;PP=1111;ReadPosRankSum=-0.212;SC=GTATCATGCTCCCCAGGAGTT;SOR=0.500;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=147;TCF=61;TCR=86;TR=74;WE=113085252;WS=113085234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,83:0.50:167
chr11	113103996	rs584427	T	G	1292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.608;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=28;PP=767;ReadPosRankSum=-1.513;SC=GGAGAGCAGTTGGTGAAGAAG;SOR=0.758;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=136;TCF=68;TCR=68;TR=55;WE=113104004;WS=113103986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,63:0.42:149
chr11	113107204	rs652285	G	A	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.105;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=271;ReadPosRankSum=0.829;SC=TGTTGTTAACGTCTGTAGGTT;SOR=0.078;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=17;WE=113107212;WS=113107194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr11	113113515	rs635596	G	A	6295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=120;NR=100;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.603;SC=TCTGTCTGTCGTGTTTCCATA;SOR=0.288;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=221;TCF=121;TCR=100;TR=220;WE=113113523;WS=113113505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,235:1.00:236
chr11	113114313	rs61902540	C	G	2062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.712;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=39;PP=1297;ReadPosRankSum=0.242;SC=ATGTTCCAAGCTGGTCTTCAT;SOR=0.938;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=186;TCF=101;TCR=85;TR=90;WE=113114321;WS=113114303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,98:0.46:214
chr11	113143557	rs2156485	C	T	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.623;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=159;ReadPosRankSum=1.022;SC=ATGCCCCCACCCCCATGGTCC;SOR=0.287;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=28;TCF=19;TCR=9;TR=13;WE=113143565;WS=113143547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr11	113186776	rs2236709	G	A	105.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=1;PP=79;SC=ATTGCCGCACGTAAATGAGTG;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=113186784;WS=113186770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr11	113186879	rs7130072	C	T	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.402;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=115;ReadPosRankSum=-1.264;SC=AATCACTTGGCTCTTAGTTTT;SOR=0.446;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=19;TCR=11;TR=13;WE=113186887;WS=113186869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr11	113193963	rs723078	C	G	445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.995;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=363;ReadPosRankSum=-0.948;SC=TGAATAGAGTCTTTTGAATAT;SOR=1.301;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=50;TCF=39;TCR=11;TR=19;WE=113193971;WS=113193953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,19:0.36:53
chr11	113194168	rs723077	A	C	1372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.652;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=37;PP=928;ReadPosRankSum=-1.241;SC=ACAAACTGCTATGAAGGTTTC;SOR=1.123;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=109;TCF=42;TCR=67;TR=56;WE=113194176;WS=113194158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,60:0.51:117
chr11	113195595	rs948178	A	G	692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=19;PP=506;SC=CAACAAGCAGAGGGTAGGATA;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=113195603;WS=113195585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr11	113200558	rs7928978	A	G	717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=6;PP=520;ReadPosRankSum=0.056;SC=CTGACATTCTACTGTTCGAAT;SOR=0.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=63;TCF=48;TCR=15;TR=27;WE=113200566;WS=113200548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,29:0.43:67
chr11	113200709	rs2303380	G	A	1843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.758;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=45;PP=1227;ReadPosRankSum=-0.852;SC=AAGGTAAGAGGGTATTTCTTT;SOR=0.837;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=179;TCF=83;TCR=96;TR=82;WE=113200717;WS=113200699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,87:0.44:198
chr11	113211329	rs2288159	G	T	970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=15;PP=526;ReadPosRankSum=-1.426;SC=GTGTTGCAGCGAGACACCAGC;SOR=0.695;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=123;TCF=79;TCR=44;TR=42;WE=113211337;WS=113211319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,51:0.37:139
chr11	113212553	rs6589372	T	C	3134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.409;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQ=59.98;MQRankSum=0.981;NF=81;NR=60;PP=1906;ReadPosRankSum=0.074;SC=CCTTTGTCCATTCTAGGTGTT;SOR=0.656;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=297;TCF=170;TCR=127;TR=141;WE=113212561;WS=113212543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,155:0.49:318
chr11	113230600	rs2276070	C	T	841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=19;PP=531;ReadPosRankSum=-0.495;SC=GAAGAAGCTCCGCTGAGAATT;SOR=0.628;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=92;TCF=52;TCR=40;TR=41;WE=113230608;WS=113230590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,41:0.42:97
chr11	113233059	rs2298490	G	A	1014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=16;PP=519;ReadPosRankSum=0.662;SC=CTCCCCGTTAGCTTTTAAAGG;SOR=0.618;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=87;TCF=55;TCR=32;TR=44;WE=113233067;WS=113233049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,50:0.50:100
chr11	113234466	rs713233	G	A	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.838;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=27.15;ReadPosRankSum=0.183;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr11	113234471	rs719803	A	G	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.841;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=22.98;ReadPosRankSum=0.991;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr11	113235419	rs2298489	A	G	538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=2;PP=402;SC=GCTGATGAGTAAGTGAACAAG;SOR=2.712;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=113235427;WS=113235409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	113235864	rs7949242	A	G	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=234;ReadPosRankSum=0.419;SC=CTGGGACTGCATGCCACACAG;SOR=0.425;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=13;WE=113235872;WS=113235854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr11	113239082	rs10891540	G	A	3826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=385;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.157;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=76;PP=2413;ReadPosRankSum=-0.161;SC=CTACCATGCAGACCTTCCAGG;SOR=0.823;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=353;TCF=189;TCR=164;TR=168;WE=113239090;WS=113239072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:198,185:0.48:383
chr11	113239111	rs117852026	C	T	4093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=386;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=92;PP=2404;ReadPosRankSum=0.644;SC=AAAATACCAGCGCCATCTTTC;SOR=0.678;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=355;TCF=175;TCR=180;TR=185;WE=113239119;WS=113239101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:186,199:0.52:385
chr11	113264272	rs17115439	T	C	5703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=88;PP=2965;SC=ACATCGTGTCTATCTACGGGG;SOR=0.780;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=190;TCF=102;TCR=88;TR=189;WE=113264280;WS=113264262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr11	113264470	rs4938013	A	C	3186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.838;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=57;PP=1762;ReadPosRankSum=-0.043;SC=CGGGCAACATACTCCTGGACA;SOR=0.843;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=48;TCR=58;TR=104;WE=113264478;WS=113264460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,120:0.99:121
chr11	113264511	rs11214596	C	G	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.083;HP=2;HapScore=4;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=796;ReadPosRankSum=-0.714;SC=AGGGCTCTGGCCAATCCTCCG;SOR=1.311;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=55;TCF=17;TCR=38;TR=22;WE=113264529;WS=113264501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,23:0.39:59
chr11	113264521	rs4938014	G	A	635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=18;PP=1001;ReadPosRankSum=0.236;SC=CCAATCCTCCGCTCCCTTTCA;SOR=0.610;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=46;TCF=13;TCR=33;TR=26;WE=113264529;WS=113264501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,29:0.59:49
chr11	113265292	rs10891546	T	C	646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=3;PP=499;SC=ATGAATAGCTTACCGAAGGTG;SOR=2.030;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=113265300;WS=113265282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr11	113266679	rs34863235	C	T	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.560;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=360;ReadPosRankSum=-0.173;SC=ATTTGTGGAGCCCCCACTGCG;SOR=2.124;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=19;WE=113266687;WS=113266669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,20:0.71:28
chr11	113266702	rs11214598	T	C	674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=426;ReadPosRankSum=0.241;SC=CATGCCCTGTTGGGATCCTCA;SOR=0.636;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=25;WE=113266710;WS=113266692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,27:0.71:38
chr11	113266821	rs7118900	G	A	2066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.550;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=32;PP=1055;ReadPosRankSum=1.670;SC=TATCCGAGTGGCGGCAGGCAT;SOR=0.745;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=150;TCF=86;TCR=64;TR=77;WE=113266829;WS=113266811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,96:0.54:177
chr11	113270015	rs4938016	G	C	2116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.007;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=57;PP=1281;ReadPosRankSum=0.648;SC=TGGGGATGACGGCACTGCGCG;SOR=0.901;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=197;TCF=93;TCR=104;TR=102;WE=113270023;WS=113270005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,107:0.49:220
chr11	113270374	rs2734848	C	T	5368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=85;NR=90;PP=2965;SC=AGAGCGGCTACGGCCCACTGC;SOR=0.857;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=176;TCF=85;TCR=91;TR=175;WE=113270382;WS=113270364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr11	113270828	rs1800497	G	A	1670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.236;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=44;PP=1195;ReadPosRankSum=1.371;SC=AGTGCTGGTCGAGGCAGGCGC;SOR=0.822;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=157;TCF=64;TCR=93;TR=73;WE=113270836;WS=113270818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,77:0.45:171
chr11	113271065	rs2734847	T	G	75.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=0;NR=3;PP=54;SC=GATCACCTGATATCAAGAGTT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=113271073;WS=113271055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr11	113281397	rs6276	C	T	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.222;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=222;ReadPosRankSum=-0.508;SC=TGAGGCTGGCCGGCCTGGGCA;SOR=0.088;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=11;WE=113281405;WS=113281387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr11	113283459	rs6277	G	A	1247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=30;PP=806;ReadPosRankSum=-1.185;SC=CGGGGCTGTCGGGAGTGCTGT;SOR=0.638;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=96;TCF=38;TCR=58;TR=51;WE=113283467;WS=113283449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,55:0.53:104
chr11	113283477	rs6275	A	G	937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.858;HP=2;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=24;PP=1357;ReadPosRankSum=-0.163;SC=TGTGGAGACCATGGTGGGACG;SOR=0.464;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=81;TCF=30;TCR=51;TR=40;WE=113283492;WS=113283467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,42:0.49:86
chr11	113283484	rs1801028	G	C	776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=21;PP=1183;ReadPosRankSum=1.631;SC=ACCATGGTGGGACGGGTCGGG;SOR=0.783;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=73;TCF=30;TCR=43;TR=35;WE=113283492;WS=113283467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,38:0.48:79
chr11	113285299	rs2511521	G	A	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=2.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.09;ReadPosRankSum=-0.576;SOR=0.274;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,9:0.30:30
chr11	113294976	rs11608185	T	C	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=68;ReadPosRankSum=0.596;SC=AAAAACCACCTGGGGAAGCAC;SOR=0.283;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=6;WE=113294984;WS=113294966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr11	113294998	rs12808482	T	A	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=2;PP=38;ReadPosRankSum=1.345;SC=AGGAAACTCATTGGTAAAAGC;SOR=0.368;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=4;WE=113295006;WS=113294988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr11	113561054	rs7110736	A	G	11228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.02;SOR=1.010;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr11	113561057	rs7110738	A	G	11331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.25;SOR=1.024;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,262:1.00:262
chr11	113561727	rs11607690	G	A	1898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.450;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=39;PP=1211;ReadPosRankSum=-0.256;SC=GAGCCTGGGCGAAGGACCCAG;SOR=0.686;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=179;TCF=92;TCR=87;TR=85;WE=113561735;WS=113561717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,92:0.46:198
chr11	113563688	rs11604602	A	G	243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=1;PP=138;SC=TAAGGTTTACAGTGTTCAGAG;SOR=2.303;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=113563696;WS=113563678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	113564012	rs11600570	G	A	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.831;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=207;ReadPosRankSum=1.597;SC=GGAAGGGGCAGAAGAGGTGTT;SOR=0.223;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=12;WE=113564020;WS=113564002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr11	113566327	rs45503699	C	A	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=196;ReadPosRankSum=1.228;SC=CTTCCTGCCCCCACCCAAACA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=11;WE=113566335;WS=113566317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr11	113569575	rs10891587	T	G	536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=4;PP=356;SC=CCCTCAGCTGTGACAGGTCCC;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=16;WE=113569583;WS=113569565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	113569927	rs72103801	CTGTCTG	C	36.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=70.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.67;ReadPosRankSum=-0.648;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr11	113569929	.	G	C	51	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=18;MMLQ=28;MQ=70.0;NF=1;NR=3;PP=51;QD=21.4428031368;SC=TCCTTTGTCTGTCTGTCTCTC;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=4;WE=113569940;WS=113569919;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,4:0.36:11
chr11	113569931	.	CTG	C	329	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;FR=1.0000;HP=2;HapScore=4;MGOF=18;MMLQ=28;MQ=70.0;NF=1;NR=10;PP=329;QD=32.0;SC=CTTTGTCTGTCTGTCTCTCTC;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=113569940;WS=113569919;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	113569933	rs12797654	G	C	154.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.128;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=70.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.48;ReadPosRankSum=-0.105;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr11	113570208	rs73568808	C	T	1476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=24;PP=868;ReadPosRankSum=2.558;SC=CCCTTGTCTGCACAGAGTAGT;SOR=0.907;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=147;TCF=92;TCR=55;TR=69;WE=113570216;WS=113570198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,74:0.45:163
chr11	113570385	rs11601425	C	T	1802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.920;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=35;PP=898;ReadPosRankSum=-1.434;SC=ACAGCCACGTCGCATGGAACG;SOR=0.477;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=128;TCF=57;TCR=71;TR=67;WE=113570393;WS=113570375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,83:0.54:155
chr11	113570405	rs4936280	T	C	4694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=63;PP=1701;SC=GCCAGCACACTGCCTGAGAAA;SOR=1.249;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=48;TCR=63;TR=111;WE=113570413;WS=113570395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr11	113570490	rs3802856	T	C	963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=21;PP=628;SC=AAGTCACCACTATGGGGCTAG;SOR=1.911;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=30;WE=113570498;WS=113570480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	113570852	rs3802854	C	T	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.666;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=243;ReadPosRankSum=0.112;SC=CCTCTGCATACTGGGCCTCCA;SOR=0.352;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=16;WE=113570860;WS=113570842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr11	113576932	rs7926267	A	G	2330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=35;PP=1575;SC=TGGCACAGAGACGTAACCTTA;SOR=0.947;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=45;TCR=35;TR=79;WE=113576955;WS=113576922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr11	113608450	rs2279996	G	A	1267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.990;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=37;PP=822;ReadPosRankSum=1.502;SC=AGCTATTTACGTGGAAGAAAG;SOR=0.941;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=79;TCF=17;TCR=62;TR=45;WE=113608458;WS=113608440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,53:0.57:93
chr11	113609854	rs4351850	T	A	1690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=11;PP=1175;SC=ATTTCTAATTTTCTCATTCAA;SOR=2.507;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=45;TCR=11;TR=56;WE=113609862;WS=113609844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr11	113618470	rs2459977	T	A	861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=26;PP=677;SC=AAAGAATCATTTACATATATT;SOR=3.841;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=29;WE=113618478;WS=113618460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr11	113618936	rs2271261	A	T	1690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=8;PP=1052;SC=GCAATAAGAAACAACAGTGTC;SOR=3.037;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=42;TCR=8;TR=50;WE=113618944;WS=113618926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr11	113618968	rs2513584	G	C	3307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=27;PP=2024;SC=TGTGCTGTCTGGGCTCTTTAC;SOR=1.898;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=100;TCF=73;TCR=27;TR=100;WE=113618976;WS=113618958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr11	113670052	rs2459971	T	A	7860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=155;NR=117;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.151;SC=TGGGTCGAATTGTTGGAGGCT;SOR=0.914;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=274;TCF=156;TCR=118;TR=272;WE=113670060;WS=113670042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,298:0.99:300
chr11	113674693	rs7116233	G	A	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.006;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=26;ReadPosRankSum=1.006;SC=AATATTTACTGAGCACATCTG;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=3;WE=113674701;WS=113674683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr11	113675542	rs45595543	T	C	2857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.994;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=65;PP=1982;ReadPosRankSum=1.198;SC=GAGGAGTCCATCTAGCCCAAC;SOR=0.787;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=221;TCF=104;TCR=117;TR=118;WE=113675550;WS=113675532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,129:0.54:241
chr11	113678924	rs2513582	G	T	1629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=22;PP=1027;SC=GTTGGTTAAAGGCAGCAGAGA;SOR=0.914;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=32;TCR=22;TR=54;WE=113678932;WS=113678914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr11	113679119	rs2465647	C	T	5199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=80;PP=2965;SC=CATGCTCAGACGACAAGCAGC;SOR=0.714;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=171;TCF=91;TCR=80;TR=171;WE=113679127;WS=113679109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr11	113680018	rs2513581	G	C	1185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=32;PP=1074;SC=CACAAGGAACGAAAACATCCT;SOR=3.442;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=5;TCR=32;TR=37;WE=113680026;WS=113680008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr11	113688357	rs146489349	T	TA	606.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=202;ReadPosRankSum=-1.316;SC=TACATACCATTAAAAAAAAAA;SOR=0.624;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=60;TCF=28;TCR=32;TR=20;WE=113688365;WS=113688347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,37:0.37:99
chr11	113698002	rs17802314	C	T	1276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.734;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.145;NF=33;NR=25;PP=748;ReadPosRankSum=-0.077;SC=TGTGAATTTTCTCTGGCTGCC;SOR=0.582;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=101;TCF=54;TCR=47;TR=58;WE=113698010;WS=113697992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,61:0.58:106
chr11	113712278	rs2513577	G	T	1509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=8;PP=877;SC=TAAAAGAAATGTCATTCAGGT;SOR=2.348;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=31;TCR=8;TR=39;WE=113712286;WS=113712268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr11	113724943	rs2513590	T	C	2393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=34;PP=1427;ReadPosRankSum=0.190;SC=GACAGCTGCTTTAAAGCCTCC;SOR=0.662;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=170;TCF=107;TCR=63;TR=90;WE=113724951;WS=113724933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,106:0.56:190
chr11	113775551	rs145648579	GAGA	G	1261.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.050;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.058;NF=7;NR=9;PP=668;ReadPosRankSum=1.032;SC=CTGGCAAACGGAGAAGGAGGA;SOR=0.994;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=35;TCF=14;TCR=21;TR=16;WE=113775561;WS=113775541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,34:0.49:70
chr11	113802601	rs1176746	A	G	9608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=363;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=175;NR=151;PP=2965;SC=TAAGTGTGCCAGTGTGTATTT;SOR=0.699;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=326;TCF=175;TCR=151;TR=326;WE=113802609;WS=113802591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,363:1.00:363
chr11	113803028	rs1176744	A	C	1960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.469;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=38;PP=1228;ReadPosRankSum=-0.025;SC=ATTGAAAGATACCCTGACCTT;SOR=0.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=242;TCF=140;TCR=102;TR=92;WE=113803036;WS=113803018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,101:0.39:260
chr11	113803887	rs2276307	A	G	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=246;ReadPosRankSum=0.242;SC=GGGCCAAGGAATTTCTGCTCT;SOR=0.874;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=15;WE=113803895;WS=113803877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr11	113846006	rs1062613	T	C	2793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=32;PP=1795;ReadPosRankSum=-0.937;SC=GTGGGCCTCGTCCTGAGCACT;SOR=0.515;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=64;TCR=32;TR=95;WE=113846014;WS=113845996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,101:0.99:102
chr11	113848184	rs4020460	G	GCT	2730.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=32;NR=10;PP=1976;SC=TGGGCCACCTGCTCCGACCTT;SOR=2.584;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=49;TCF=38;TCR=11;TR=42;WE=113848192;WS=113848174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr11	113848273	rs1985242	A	T	2550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.208;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.024;NF=67;NR=49;PP=1685;ReadPosRankSum=0.322;SC=TTTCCTGTCAATGAATGCATA;SOR=0.544;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=216;TCF=127;TCR=89;TR=116;WE=113848281;WS=113848263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,122:0.51:239
chr11	113850006	rs61905785	A	C	1312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.074;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=36;PP=666;ReadPosRankSum=-0.711;SC=GCAGGTGAGCAGACCCGCCCC;SOR=0.511;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=138;TCF=61;TCR=77;TR=67;WE=113850014;WS=113849996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,73:0.48:153
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chr11	113856681	rs10160548	G	T	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.050;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=329;ReadPosRankSum=0.020;SC=TCATCACAGGGTCCAGCAGGC;SOR=1.371;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=55;TCF=36;TCR=19;TR=22;WE=113856689;WS=113856671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,23:0.41:56
chr11	113857886	rs1150220	G	A	658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=22;PP=422;ReadPosRankSum=-1.019;SC=GGCATCCCATGCCCTGCCTTA;SOR=0.496;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=56;TCF=9;TCR=47;TR=27;WE=113857894;WS=113857876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,29:0.50:58
chr11	113860425	rs1176713	A	G	2627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=51;PP=1672;ReadPosRankSum=-0.607;SC=TTTACCTGCTAGCGGTGCTGG;SOR=0.715;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=234;TCF=131;TCR=103;TR=114;WE=113860433;WS=113860415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,128:0.48:267
chr11	114057944	rs682155	A	G	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.740;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=3;PP=44;ReadPosRankSum=-0.810;SC=GGCCCAGCAGAAGTTTACAAG;SOR=0.027;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=4;WE=114057952;WS=114057934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr11	114120999	rs670984	C	T	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.360;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=295;ReadPosRankSum=0.482;SC=GTGCCCTCACCGCCTTCTGTC;SOR=1.022;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=19;WE=114121007;WS=114120989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr11	114270604	rs3741302	C	A	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=11;PP=574;ReadPosRankSum=0.725;SC=TAAAACAACACGATTGCTGCT;SOR=0.619;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=69;TCF=49;TCR=20;TR=36;WE=114270612;WS=114270594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,35:0.49:72
chr11	114273673	rs17547494	A	G	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.675;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=13;PP=264;ReadPosRankSum=-1.436;SC=ATCATTTATCAGGAATTCTTA;SOR=0.239;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=71;TCF=27;TCR=44;TR=26;WE=114273681;WS=114273663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,28:0.38:74
chr11	114284645	rs3897612	CA	AG	1531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=7;PP=967;ReadPosRankSum=-0.658;SC=TATTCCCTCTCATTCTTTTGG;SOR=0.551;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=49;TCF=35;TCR=14;TR=29;WE=114284654;WS=114284635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,38:0.69:55
chr11	114284744	rs11214983	C	T	2199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=39;PP=1241;ReadPosRankSum=-0.080;SC=TGCAGGTCTCCGAGAGTTCTC;SOR=0.669;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=166;TCF=91;TCR=75;TR=88;WE=114284752;WS=114284734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,102:0.55:186
chr11	114393652	rs10891692	C	T	2303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.814;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=36;PP=1406;ReadPosRankSum=2.606;SC=GTAGAGTCTCCCAGGAGGTAA;SOR=0.957;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=195;TCF=111;TCR=84;TR=92;WE=114393660;WS=114393642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,106:0.48:220
chr11	114398627	rs34542949	C	CA	946.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.672;HP=10;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=33;PP=376;ReadPosRankSum=-0.580;SC=TTTGGACCTTCAAAAAAAAAA;SOR=0.584;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=110;TCF=9;TCR=101;TR=38;WE=114398635;WS=114398617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,53:0.35:151
chr11	114401577	rs524911	T	C	5140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-0.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=489;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.100;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=112;PP=2599;ReadPosRankSum=1.889;SC=ATAAGGACTTTGCGGAGTTGT;SOR=0.747;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=417;TCF=209;TCR=208;TR=216;WE=114401585;WS=114401567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:237,251:0.51:488
chr11	114421646	rs79339030	A	G	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=164;ReadPosRankSum=0.635;SC=TGGGAAATGAAGAAATAGAGG;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=9;WE=114421654;WS=114421642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
chr11	114421674	rs75026329	G	A	916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=4.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.68;ReadPosRankSum=-1.032;SOR=0.297;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,25:0.37:67
chr11	114421683	rs79413019	G	A	1006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=5.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.42;ReadPosRankSum=-1.091;SOR=0.273;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,28:0.37:75
chr11	114421698	rs75909356	A	G	1038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=3.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.29;ReadPosRankSum=0.725;SOR=0.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,30:0.33:92
chr11	114421705	rs78231204	A	G	1341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=1.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.54;ReadPosRankSum=0.178;SOR=0.484;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,36:0.34:107
chr11	114421711	rs77069178	C	T	1407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=0.777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.83;ReadPosRankSum=0.132;SOR=0.586;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,40:0.34:119
chr11	114421713	rs112529011	GT	G	1411.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=45;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=2796;ReadPosRankSum=0.317;SC=AGATAGGGCAGTAGTTGAGGT;SOR=0.606;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=76;TCF=41;TCR=35;TR=22;WE=114421729;WS=114421688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,40:0.33:121
chr11	114421721	rs78612878	G	A	1443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=45;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=18;PP=2455;ReadPosRankSum=0.611;SC=CAGTAGTTGAGGTGGGGGAGG;SOR=0.703;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=131;TCF=86;TCR=45;TR=47;WE=114421729;WS=114421688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,43:0.32:136
chr11	114421747	rs78105386	G	A	2042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FS=1.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.87;ReadPosRankSum=0.633;SOR=0.583;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:130,58:0.31:188
chr11	114421754	rs73016111	G	A	2209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FS=0.577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.27;ReadPosRankSum=-0.062;SOR=0.634;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:133,63:0.32:196
chr11	114421768	rs75860289	A	T	2662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FS=1.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.16;ReadPosRankSum=-0.249;SOR=0.837;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:146,73:0.33:219
chr11	114421769	rs76481835	C	G	2662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FS=1.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.05;ReadPosRankSum=-0.592;SOR=0.821;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:146,75:0.34:221
chr11	114421773	rs74572030	A	G	2725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.85;ReadPosRankSum=-0.470;SOR=0.846;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:152,78:0.34:230
chr11	114421789	rs113431368	A	AC	3904.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.306;HP=2;HapScore=1;MGOF=49;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=29;PP=2954;ReadPosRankSum=-1.752;SC=GTGAGGGCTTACTGTGTGATC;SOR=1.235;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=162;TCF=69;TCR=93;TR=64;WE=114421807;WS=114421779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,101:0.39:259
chr11	114421799	rs79701489	C	T	3776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.957;HP=2;HapScore=1;MGOF=49;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.251;NF=62;NR=32;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.835;SC=ACTGTGTGATCTGCATCAAAG;SOR=1.213;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=247;TCF=151;TCR=96;TR=94;WE=114421807;WS=114421779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,108:0.39:275
chr11	114421817	rs73568242	G	T	3786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.594;HP=3;HapScore=1;MGOF=48;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.170;NF=75;NR=39;PP=1868;ReadPosRankSum=-0.018;SC=AAGGTGATTTGCTCCTACCTT;SOR=1.333;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=275;TCF=163;TCR=112;TR=114;WE=114421825;WS=114421807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,130:0.42:306
chr11	114421857	rs78453693	T	C	8876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=464;ExcessHet=3.0103;FS=4.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.02;MQRankSum=1.011;QD=19.17;ReadPosRankSum=0.077;SOR=1.067;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:233,230:0.50:463
chr11	114421861	rs76118887	G	A	9126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=488;ExcessHet=3.0103;FS=4.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.02;MQRankSum=0.998;QD=18.74;ReadPosRankSum=-0.186;SOR=1.007;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:242,245:0.50:487
chr11	114421895	rs78257939	G	A	6153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=557;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.104;HP=6;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.932;NF=140;NR=132;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.384;SC=GATCAGCAGCGTTTTTTGAAG;SOR=0.670;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=505;TCF=256;TCR=249;TR=272;WE=114421920;WS=114421885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:257,298:0.54:555
chr11	114421909	rs79082937	T	C	10938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=541;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.02;MQRankSum=0.951;QD=20.29;ReadPosRankSum=1.771;SOR=0.636;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:255,284:0.53:539
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chr11	114421927	rs78842965	G	A	5702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=510;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=55;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=113;NR=135;PP=2962;ReadPosRankSum=1.958;SC=AGGACATGACGAATGTCCTAG;SOR=0.663;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=464;TCF=212;TCR=252;TR=248;WE=114421935;WS=114421917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:240,269:0.53:509
chr11	114421962	rs75409523	G	A	7512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=364;ExcessHet=3.0103;FS=2.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.64;ReadPosRankSum=-1.103;SOR=0.830;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:166,198:0.54:364
chr11	114421967	rs79109814	A	G	7235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FS=1.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.34;ReadPosRankSum=-0.562;SOR=0.622;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:158,181:0.53:339
chr11	114422003	rs73568250	A	C	1982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FS=0.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.71;ReadPosRankSum=-0.459;SOR=0.623;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,80:0.51:156
chr11	114422016	rs76270589	T	A	2109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=1.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.03;ReadPosRankSum=0.810;SOR=1.015;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,58:0.50:117
chr11	114422025	rs75158214	C	A	1948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.49;ReadPosRankSum=1.280;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,50:0.50:100
chr11	114422029	rs78778953	T	G	1881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.45;ReadPosRankSum=1.516;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,46:0.50:92
chr11	114422036	rs77481744	C	T	1647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.34;ReadPosRankSum=1.419;SOR=0.620;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,42:0.52:81
chr11	114422052	rs10790022	G	C	1205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.972;HP=2;HapScore=2;MGOF=97;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=22;PP=545;ReadPosRankSum=0.160;SC=GTGAGTCACTGTCTTCTTTCC;SOR=0.262;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=42;TCF=5;TCR=37;TR=26;WE=114422060;WS=114422042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,29:0.60:48
chr11	114422068	rs76698432	C	T	940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=2.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=31.36;ReadPosRankSum=-1.553;SOR=0.286;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,20:0.67:30
chr11	114422068	.	CTA	TTC	767	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=121;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=2;NR=14;PP=767;QD=51.2792421789;SC=TTTCCCTCTGCTAACTAACAA;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=16;WE=114422078;WS=114422058;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr11	114422070	rs75429280	A	C	781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=2.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.96;ReadPosRankSum=-1.285;SOR=0.260;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
chr11	114441943	rs10891705	G	A	2758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.448;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=45;PP=1311;ReadPosRankSum=-1.117;SC=GACATTGAGGGCCCTTCGGAT;SOR=0.740;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=234;TCF=128;TCR=106;TR=110;WE=114441951;WS=114441933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,131:0.50:263
chr11	114442103	rs550897	A	G	2403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=3.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.807;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=48;PP=1507;ReadPosRankSum=-0.486;SC=GGATAACAATATTTTTGCCAC;SOR=0.874;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=169;TCF=86;TCR=83;TR=90;WE=114442111;WS=114442093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,104:0.51:203
chr11	114442265	rs481080	G	A	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.990;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=378;ReadPosRankSum=-1.471;SC=ATATAAAGATGGAAGAGATTT;SOR=0.275;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=56;TCF=10;TCR=46;TR=24;WE=114442273;WS=114442255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,26:0.42:62
chr11	114550334	rs1612325	A	G	626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=5;PP=394;SC=GCCATGTCGTACTTATTTGAT;SOR=1.931;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=20;WE=114550342;WS=114550324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr11	114568942	rs11215158	T	C	1925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.053;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=44;ReadPosRankSum=0.952;SC=TTCACCCATGTGAATACCACC;SOR=0.513;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=147;TCF=79;TCR=68;TR=90;WE=114568950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,90:0.58:154
chr11	114569054	rs1712838	A	G	2142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=47;PP=1289;ReadPosRankSum=0.190;SC=ACCACTTGGGACACAGGAAGC;SOR=0.714;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=205;TCF=106;TCR=99;TR=97;WE=114569062;WS=114569044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,108:0.46:233
chr11	115049180	rs17304149	C	T	99.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.67;QD=24.76;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr11	115061533	rs4936322	T	C	6141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=120;NR=87;PP=2965;SC=GCAAACCAAATGGCCATTTTG;SOR=0.909;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=207;TCF=120;TCR=87;TR=207;WE=115061541;WS=115061510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr11	115102224	rs11607928	A	G	2232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=44;PP=1334;SC=CAAATTAAACATATGTGCTTT;SOR=1.206;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=33;TCR=44;TR=77;WE=115102232;WS=115102214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr11	116629949	rs4938310	C	T	2645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.646;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=57;PP=1516;ReadPosRankSum=-0.121;SC=TGACAGTAGGCTCCATGGGTA;SOR=0.821;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=186;TCF=87;TCR=99;TR=103;WE=116629957;WS=116629939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,121:0.55:221
chr11	116631391	rs3741301	T	C	1001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=19;PP=573;ReadPosRankSum=2.173;SC=CTGGGACATATATAAAGCTGA;SOR=0.649;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=86;TCF=48;TCR=38;TR=43;WE=116631399;WS=116631381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,50:0.52:97
chr11	116631690	rs3741300	G	A	817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.125;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=26;PP=576;ReadPosRankSum=-0.602;SC=CAAAGAATCTGTGTGACTCTG;SOR=1.341;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=54;TCF=17;TCR=37;TR=35;WE=116631698;WS=116631680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,36:0.62:58
chr11	116631707	rs3825041	T	C	1480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=29;PP=864;SC=TCTGATGTCCTCTAGGTGAAG;SOR=2.891;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=38;TCF=7;TCR=31;TR=36;WE=116631715;WS=116631697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	116633825	rs918144	C	T	2632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.555;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=36;PP=1468;ReadPosRankSum=0.322;SC=GAGAAGGATCCGGGGTGTCAT;SOR=0.988;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=210;TCF=124;TCR=86;TR=99;WE=116633833;WS=116633815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,111:0.49:228
chr11	116635951	rs79610135	T	C	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.565;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=156;ReadPosRankSum=0.544;SC=TCCTTTTTCCTGCTTTATTTT;SOR=0.126;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=10;WE=116635959;WS=116635941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr11	116641028	rs1263151	C	T	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.047;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=74;ReadPosRankSum=-0.750;SC=AGTTCAAAATCCTACAGGATC;SOR=0.693;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=6;WE=116641036;WS=116641018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr11	116652728	.	CA	CAA,C	46	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.07;FR=0.5004,0.4996;HP=14;HapScore=3;MGOF=15;MMLQ=20;MQ=58.38;NF=3,3;NR=2,2;PP=46,24;QD=10.0;SC=ACTCTGTCTCCAAAAAAAAAA;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=5,5;WE=116652736;WS=116652718;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.50:10
chr11	116654159	rs618923	A	G	1325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.634;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=25;PP=816;ReadPosRankSum=-1.144;SC=GTCCCTGAACATTATTTCTAA;SOR=0.774;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=129;TCF=80;TCR=49;TR=66;WE=116654167;WS=116654149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,68:0.49:140
chr11	116654435	rs603446	C	T	1472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.674;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=42;PP=941;ReadPosRankSum=-1.707;SC=TCAGTTAGGGCCATTAATAGC;SOR=0.607;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=123;TCF=45;TCR=78;TR=67;WE=116654443;WS=116654425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,71:0.54:132
chr11	116660813	rs619054	G	A	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.585;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=343;ReadPosRankSum=2.094;SC=CCCAGACAAGGAGCTGGGAAT;SOR=1.130;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=43;TCF=37;TCR=6;TR=22;WE=116660821;WS=116660803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,24:0.52:46
chr11	116661826	rs2072560	T	C	7109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=129;NR=118;PP=2965;ReadPosRankSum=0.122;SC=ACTGCTAGCCTCCATCATCTC;SOR=0.723;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=249;TCF=130;TCR=119;TR=247;WE=116661834;WS=116661816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,270:0.99:272
chr11	116662033	rs36077557	TG	T	4555.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.434;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.024;NF=7;NR=79;PP=2816;ReadPosRankSum=-0.460;SC=CCTTTGATTCTGGGGACTGCA;SOR=0.652;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=165;TCF=18;TCR=147;TR=86;WE=116662041;WS=116662023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,159:0.55:287
chr11	116662579	rs651821	C	T	3498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=60;NR=67;PP=2141;SC=CTTGCCATTACCTGCTCTGAG;SOR=0.905;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=60;TCR=67;TR=127;WE=116662587;WS=116662569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr11	116691634	rs5110	C	A	1226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.776;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=14;PP=835;ReadPosRankSum=-0.211;SC=GCTGCTCCTGCTGCTGTTCCT;SOR=0.941;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=89;TCF=65;TCR=24;TR=51;WE=116691642;WS=116691624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,54:0.54:100
chr11	116691675	rs675	T	A	1693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.119;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=24;PP=872;ReadPosRankSum=-0.327;SC=AGGGAGAGAGTCTTGTCCTGG;SOR=0.985;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=181;TCF=110;TCR=71;TR=68;WE=116691683;WS=116691665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,82:0.40:204
chr11	116692334	rs5104	C	T	4786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=71;PP=2965;SC=GGCCTGCGTGCTGACCTGGGT;SOR=0.845;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=154;TCF=83;TCR=71;TR=154;WE=116692342;WS=116692324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr11	116692694	rs5100	G	A	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=422;ReadPosRankSum=0.135;SC=ACACGTGCTAGGACAGGTGAG;SOR=0.811;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=43;TCF=12;TCR=31;TR=22;WE=116692702;WS=116692684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,24:0.52:46
chr11	116693353	rs2239013	C	T	2842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.910;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=61;PP=1623;ReadPosRankSum=-0.086;SC=CCGTCACCACCGCACACTGTA;SOR=0.612;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=259;TCF=138;TCR=121;TR=126;WE=116693361;WS=116693343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,140:0.50:280
chr11	116693464	rs5092	C	T	4673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=91;PP=2846;SC=CCCACATCACCGTGGCCACCT;SOR=1.227;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=156;TCF=65;TCR=91;TR=156;WE=116693472;WS=116693454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr11	116701153	rs2070668	T	G	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.862;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=83;ReadPosRankSum=-0.765;SC=GAGCCCGTATTAGCAGGGAGC;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=5;WE=116701161;WS=116701152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr11	116701535	rs4520	T	C	6139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=102;PP=2965;SC=TCATGCAGGGTTACATGAAGC;SOR=0.766;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=205;TCF=103;TCR=102;TR=204;WE=116701543;WS=116701525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr11	116703640	rs5128	G	C	977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=20;PP=576;SC=TCCATCCTGCGAGCTCCTTGG;SOR=2.235;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=28;WE=116703648;WS=116703630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	116703671	rs4225	G	T	523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=12;PP=335;SC=CTCCAGGGCTGCCCCTGTAGG;SOR=2.833;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=116703679;WS=116703661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	116707684	rs2070665	A	G	2635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=24;PP=1895;SC=TCTGCCCCCTACCCCTGCCCT;SOR=1.802;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=63;TCR=24;TR=87;WE=116707692;WS=116707674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr11	116708020	rs5070	A	G	4556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=68;PP=2965;ReadPosRankSum=0.599;SC=TTAGGGAGAAAGCCCCCCGAT;SOR=0.345;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=162;TCF=94;TCR=68;TR=161;WE=116708028;WS=116708010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,167:0.99:168
chr11	116720089	rs2289893	T	C	712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=18;PP=412;SC=CAAGGGACAATGGGCAAGGCT;SOR=2.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=23;WE=116720097;WS=116720079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	116732512	rs2075292	G	T	4767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=78;PP=2956;SC=AAGGGTACCAGGCTATCGAGA;SOR=0.786;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=87;TCR=78;TR=165;WE=116732520;WS=116732502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr11	116732856	rs484646	A	G	1238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=13;PP=724;SC=CAAAATGCACAGGCAAATCAG;SOR=1.464;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=44;TCF=31;TCR=13;TR=43;WE=116732864;WS=116732846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr11	116734545	rs11216164	G	A	2406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.499;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=56;PP=1527;ReadPosRankSum=-0.666;SC=CTGAATATATGGGAAGAGAAG;SOR=0.639;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=204;TCF=97;TCR=107;TR=111;WE=116734553;WS=116734520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,116:0.54:216
chr11	116824884	rs511676	T	G	3942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=81;PP=2584;SC=TACAGGAAGATAAACTAATGA;SOR=1.754;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=123;TCF=42;TCR=81;TR=123;WE=116824892;WS=116824874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr11	117015195	rs2735183	C	T	1568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=27;PP=839;SC=GAAGGGGCTGCGAGGTGTTAT;SOR=1.085;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=25;TCR=27;TR=52;WE=117015203;WS=117015185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr11	117015240	.	T	G	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.605;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=57;ReadPosRankSum=0.140;SC=CCCCCACCCTTGCGGCCCCTC;SOR=0.760;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=27;TCF=9;TCR=18;TR=7;WE=117015248;WS=117015230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,7:0.25:28
chr11	117030581	rs1871757	T	A	368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=3;PP=264;SC=TGTTGAGAGTTCAAGCATGGG;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=117030589;WS=117030571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	117030624	rs35139041	AT	A	1248.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.300;NF=21;NR=11;PP=499;ReadPosRankSum=-1.101;SC=CCAGTTAATAATTTTTTTTTT;SOR=0.957;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=35;TCF=22;TCR=13;TR=32;WE=117030632;WS=117030614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,51:0.98:52
chr11	117032125	rs3736120	G	T	394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=308;SC=TACTGTCATTGCTTGAGAATA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=117032133;WS=117032115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	117034388	rs3057863	CAAAAAA	C	1141.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.437;HP=18;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.408;NF=14;NR=8;PP=279;SC=GACCCCATCTCAAAAAAAAAA;SOR=1.340;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=34;TCF=23;TCR=11;TR=22;WE=117034402;WS=117034378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,30:0.97:31
chr11	117034619	rs7122944	G	T	6647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=106;PP=2965;SC=GTATGTAGTCGTTGGTGGGTA;SOR=0.817;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=214;TCF=108;TCR=106;TR=214;WE=117034627;WS=117034609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr11	117034729	rs10790175	T	C	2222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=53;PP=1608;SC=TATCATACTTTCGTTGACCTC;SOR=2.242;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=19;TCR=53;TR=72;WE=117034737;WS=117034719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr11	117042238	rs10750103	C	T	461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=24;NR=9;PP=625;SC=GGCAACAGAGCGAGACTCTTG;SOR=1.127;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=24;TCR=10;TR=33;WE=117042246;WS=117042228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	117042377	rs4936367	G	A	4878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=86;NR=81;PP=2677;SC=CTCAGAGATAGTGAGACTAGA;SOR=0.816;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=167;TCF=86;TCR=81;TR=167;WE=117042385;WS=117042367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr11	117052069	rs35248926	GTCTCT	G	6916.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=32;NR=49;PP=2967;SC=AGGGCTCATAGTCTCTGGAGC;SOR=1.246;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=83;TCF=34;TCR=49;TR=81;WE=117052081;WS=117052059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr11	117053165	rs7946257	A	G	1559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=3;PP=1092;SC=ATAGGGGACTATTCCCTTCTA;SOR=3.657;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=41;TCF=38;TCR=3;TR=41;WE=117053173;WS=117053155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr11	117059347	rs90192	C	T	1293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=5;PP=951;SC=ATAATTGTTACAATTGCCTCA;SOR=3.109;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=35;TCR=5;TR=40;WE=117059355;WS=117059337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr11	117059552	rs474339	G	A	10274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=394;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=163;NR=184;PP=2965;SC=GGTCTGACCCGTGGGCCTGGC;SOR=0.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=348;TCF=164;TCR=184;TR=347;WE=117059560;WS=117059542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,393:1.00:393
chr11	117064693	rs521171	C	G	5307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=86;PP=2959;SC=AGCACTCACCCTCAGGCTCCT;SOR=0.713;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=178;TCF=92;TCR=86;TR=178;WE=117064701;WS=117064683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr11	117078338	rs199953984	A	T	826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.306;HP=7;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-8.473;NF=41;NR=16;PP=799;ReadPosRankSum=2.355;SC=GGGCCAGTTTAAAAAAAATGG;SOR=1.383;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=152;TCF=102;TCR=50;TR=57;WE=117078346;WS=117078328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,50:0.35:141
chr11	117078378	rs2269396	C	T	2740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.110;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-10.359;NF=89;NR=50;PP=1947;ReadPosRankSum=-0.878;SC=ACCTGCCTACCGGGGCTGGCC;SOR=0.879;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=325;TCF=198;TCR=127;TR=139;WE=117078386;WS=117078368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:188,137:0.42:325
chr11	117078604	rs192640086	C	T	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.67;MQRankSum=-2.579;QD=3.69;ReadPosRankSum=-0.142;SOR=0.275;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr11	117152302	.	CT	C	92.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.086;ClippingRankSum=0.000;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=10.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQRankSum=2.050;QD=1.22;ReadPosRankSum=0.202;SOR=1.856;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,15:0.20:76
chr11	117160347	rs539765	A	G	5504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=87;PP=2965;SC=CGGAGGCAGCACCACTGACAC;SOR=0.813;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=193;TCF=106;TCR=87;TR=193;WE=117160355;WS=117160337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr11	117222647	.	GA	G	65.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=0.000;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.20;ReadPosRankSum=-0.558;SOR=0.631;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,11:0.20:55
chr11	117225982	rs74761525	C	T	1064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.381;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=21;PP=661;ReadPosRankSum=-2.344;SC=CTCCAGAAGGCGACAGAGAAA;SOR=0.490;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=101;TCF=56;TCR=45;TR=43;WE=117225990;WS=117225972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,50:0.42:118
chr11	117241760	rs2305826	T	A	798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.932;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=13;PP=440;ReadPosRankSum=0.859;SC=CACATTCCTTTTGTCTTCCTT;SOR=0.497;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=67;TCF=44;TCR=23;TR=37;WE=117241768;WS=117241750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,40:0.56:72
chr11	117251521	rs2061293	G	C	113.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=87;SC=TCAGTGTACAGTTGCTTGGCA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=117251529;WS=117251511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr11	117252489	rs897836	T	C	2156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=31;PP=1262;ReadPosRankSum=-0.339;SC=AAGAAGAGCCTCCCCAGGGCC;SOR=0.965;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=51;TCR=32;TR=80;WE=117252497;WS=117252478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,89:0.98:91
chr11	117257876	rs2305829	G	T	1394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=24;PP=842;ReadPosRankSum=0.661;SC=GAGGTGGGTGGACATTAACCC;SOR=0.723;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=106;TCF=65;TCR=41;TR=59;WE=117257884;WS=117257866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,64:0.57:113
chr11	117258198	rs501776	T	C	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=158;ReadPosRankSum=-0.251;SC=GACACCCTCTTAGCCTGGGGA;SOR=0.519;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=9;WE=117258206;WS=117258188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,11:0.34:32
chr11	117266312	rs2305830	C	G	729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.68;ReadPosRankSum=-0.925;SOR=0.675;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,41:0.43:95
chr11	117266754	rs693147	A	C	1184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=19;PP=776;ReadPosRankSum=-0.519;SC=CCTCTCACTCATCTTTCCTTC;SOR=0.692;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=64;TCR=36;TR=53;WE=117266762;WS=117266744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,56:0.52:107
chr11	117267884	rs573455	A	G	1801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.455;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=46;PP=1167;ReadPosRankSum=-0.617;SC=TTCCTTGTGCAGCAGACACGC;SOR=0.559;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=52;TCR=72;TR=80;WE=117267892;WS=117267874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,84:0.63:133
chr11	117280724	rs5795079	TC	T	3561.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FS=2.588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.22;MQRankSum=1.641;QD=18.85;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=0.913;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,114:0.60:189
chr11	117282800	rs522885	G	T	10714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=398;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=175;NR=181;PP=2965;SC=CTCTCTTCTCGTCAACACCCA;SOR=0.787;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=356;TCF=175;TCR=181;TR=356;WE=117282808;WS=117282790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,398:1.00:398
chr11	117299617	rs7935468	T	C	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.757;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=56;ReadPosRankSum=-0.820;SC=GTCTTCTCTCTGATTTGGCAT;SOR=1.426;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=26;TCF=9;TCR=17;TR=8;WE=117299625;WS=117299607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr11	117301818	rs4356265	C	T	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=262;ReadPosRankSum=0.459;SC=TGAGCACTTCCCCTGCCCGTA;SOR=0.749;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=46;TCF=17;TCR=29;TR=22;WE=117301826;WS=117301808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,26:0.48:54
chr11	117303242	rs60580523	C	T	1774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.571;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=39;PP=1099;ReadPosRankSum=2.440;SC=AGGACAATTACTGGGAGTCCT;SOR=0.623;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=150;TCF=71;TCR=79;TR=78;WE=117303250;WS=117303232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,84:0.50:167
chr11	117303393	rs880615	C	T	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.49;ReadPosRankSum=-2.391;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr11	117304196	rs2242133	C	T	1965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.868;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=37;PP=1267;ReadPosRankSum=0.594;SC=ATCTGCAAAACAGTAGAGGGA;SOR=0.873;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=162;TCF=90;TCR=72;TR=88;WE=117304204;WS=117304186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,93:0.53:176
chr11	117306291	rs661789	G	T	379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=3;PP=272;SC=TGTGAGCCAGGGAAGGGGGGG;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=12;WE=117306299;WS=117306281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	117308927	rs10892101	C	A	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.951;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=17.05;ReadPosRankSum=-0.438;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr11	117309494	rs74490241	CG	AA	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-2.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.586;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=183;ReadPosRankSum=1.424;SC=GCCCCCAGATCGTTTCTGTCA;SOR=0.111;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=9;WE=117309503;WS=117309484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr11	117309527	rs75808396	G	A	610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-2.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=341;ReadPosRankSum=0.334;SC=TGGCAGAAGTGGGTGAAGCCC;SOR=0.575;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=57;TCF=46;TCR=11;TR=26;WE=117309535;WS=117309517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,30:0.45:67
chr11	117332343	rs2298766	C	T	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.79;ReadPosRankSum=-1.212;SOR=0.631;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr11	117332352	rs588048	A	G	888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=17;PP=241;SC=CCAGTCAGTCATGGATGTGAG;SOR=2.494;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=22;WE=117332360;WS=117332333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	117335722	rs538847	T	C	969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.672;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=17;PP=488;ReadPosRankSum=0.066;SC=GATTGAAGGCTTGGACCACCA;SOR=0.605;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=65;TCR=43;TR=42;WE=117335730;WS=117335712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,51:0.40:127
chr11	117374470	rs2298767	C	T	542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.684;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=3;PP=409;ReadPosRankSum=0.371;SC=GATGAAACGACGGAGACTAAG;SOR=1.402;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=42;TCF=35;TCR=7;TR=25;WE=117374478;WS=117374460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,23:0.56:41
chr11	117395497	rs55642294	C	A	1003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.637;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=14;PP=580;ReadPosRankSum=1.673;SC=ACTGGGGCTGCAGAAGGGGCT;SOR=0.516;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=97;TCF=68;TCR=29;TR=43;WE=117395505;WS=117395474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,49:0.45:108
chr11	117580254	rs2508559	T	C	398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=3;PP=283;SC=TTGCGGGGGTTGGGGGGAGTG;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=14;WE=117580262;WS=117580244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	117580356	rs605500	C	T	1529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.93;SOR=0.726;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr11	117580509	rs655086	A	G	713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=11;NR=13;PP=394;SC=GCGGCTGTGAAAAAGAATGGA;SOR=1.101;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=11;TCR=13;TR=24;WE=117580517;WS=117580499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	117580585	rs604245	A	G	180.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=4;PP=130;SC=AAGACTGGCCATGAGACAGGT;SOR=1.609;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=117580593;WS=117580575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr11	117647461	rs73587457	C	G	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.038;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=376;ReadPosRankSum=-0.896;SC=CCAGTCCCCACAGAGGGAGCA;SOR=0.963;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=55;TCF=37;TCR=18;TR=26;WE=117647469;WS=117647451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,31:0.46:67
chr11	117667688	rs113876980	C	A	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.009;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=8;PP=467;ReadPosRankSum=0.478;SC=CCCGCCTCGCCGCCAGCCGCG;SOR=0.497;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=75;TCF=59;TCR=16;TR=32;WE=117667696;WS=117667678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,35:0.43:81
chr11	117691774	rs7483165	T	C	583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=3.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.78;ReadPosRankSum=0.451;SOR=1.460;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,23:0.62:37
chr11	117693255	rs529623	T	C	1775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.369;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=44;PP=1093;ReadPosRankSum=0.795;SC=GCTGTCTCTCTCCGCAGCCTG;SOR=1.025;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=157;TCF=76;TCR=81;TR=77;WE=117693263;WS=117693245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,85:0.48:178
chr11	117698762	rs7117314	G	A	803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.897;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=22;PP=525;ReadPosRankSum=1.305;SC=AGGAGTGCAGGAGAGCAGGGA;SOR=0.582;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=70;TCF=26;TCR=44;TR=35;WE=117698770;WS=117698752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,36:0.48:75
chr11	117707191	rs10790214	T	C	1121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=10;PP=652;SC=TCTCCTGCTTTAGGCTCCCAA;SOR=1.236;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=34;TCF=24;TCR=10;TR=33;WE=117707199;WS=117707181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	117709028	rs516655	G	A	4229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=70;PP=2570;SC=AAAACACTTCGGCTGCCTCTG;SOR=0.718;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=145;TCF=75;TCR=70;TR=145;WE=117709036;WS=117709018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr11	117711092	rs71482118	G	A	2165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.356;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=47;PP=1244;ReadPosRankSum=-0.261;SC=CCCTGCAGGAGAAAGAGACAC;SOR=0.485;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=216;TCF=104;TCR=112;TR=96;WE=117711100;WS=117711082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,108:0.44:243
chr11	117711232	rs496164	A	G	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=80;ReadPosRankSum=-3.073;SC=TGTGGGATGCATGGGACAGAG;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=8;WE=117711240;WS=117711222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr11	117712887	rs473057	G	A	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=196;ReadPosRankSum=-0.299;SC=AGAGGTGCACGGTAGGGCGGG;SOR=1.179;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=11;WE=117712895;WS=117712877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr11	117713653	.	CT	C	68.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=0.000;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=3.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.45;MQRankSum=1.765;QD=1.96;ReadPosRankSum=0.757;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,9:0.26:35
chr11	117772787	rs71041806	GCA	G	44.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=0;PP=81;ReadPosRankSum=-0.524;SC=GCACACATATGCACACACACA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=2;WE=117772796;WS=117772784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr11	117773110	rs494457	G	C	535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=14;PP=401;SC=CAAGGAGGGAGAGCAAAGGGA;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=117773118;WS=117773100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	117774146	rs2186627	C	G	2029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.919;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=38;PP=1274;ReadPosRankSum=-0.324;SC=GTAGGTCCACCCTTTTTCAAC;SOR=0.540;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=165;TCF=102;TCR=63;TR=96;WE=117774154;WS=117774136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,98:0.55:177
chr11	117774291	rs2845712	A	C	8722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=141;NR=139;PP=2965;SC=TCTGCCTACAACCTGGGTGCT;SOR=0.725;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=280;TCF=141;TCR=139;TR=280;WE=117774299;WS=117774281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,317:1.00:317
chr11	117776471	rs3802873	C	T	854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.777;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=27;PP=584;ReadPosRankSum=-0.516;SC=GACCTCCAGACGTCAGTGAAG;SOR=0.824;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=101;TCF=35;TCR=66;TR=40;WE=117776479;WS=117776461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,43:0.38:112
chr11	117780744	rs12801855	C	T	860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.796;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=18;PP=457;ReadPosRankSum=-1.108;SC=TTCCGAGCTCCTGATCAGGAT;SOR=0.510;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=69;TCF=32;TCR=37;TR=36;WE=117780752;WS=117780734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,42:0.51:82
chr11	117781435	rs2155194	A	G	3480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=71;NR=45;PP=2072;SC=AACACTGGAGAGAGATATACC;SOR=0.988;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=71;TCR=45;TR=116;WE=117781443;WS=117781425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr11	117781618	rs2155195	A	G	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.971;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=131;ReadPosRankSum=0.168;SC=CCCTTTCCCCATGTGACATTG;SOR=1.508;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=9;WE=117781626;WS=117781608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr11	117782638	rs2277288	A	G	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.255;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=319;ReadPosRankSum=0.862;SC=CAAGTCCTCCAGCAGGCTAGA;SOR=1.426;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=39;TCF=11;TCR=28;TR=19;WE=117782646;WS=117782628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,18:0.43:42
chr11	117784434	rs11605749	C	G	1237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.583;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=19;PP=595;ReadPosRankSum=0.771;SC=TTGAGACACCCTATGAAGAGC;SOR=0.765;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=142;TCF=89;TCR=53;TR=58;WE=117784442;WS=117784424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,68:0.41:167
chr11	117784714	rs11216618	T	C	43.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=0.916;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr11	117785260	rs4936410	T	C	2381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.683;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=56;PP=1201;ReadPosRankSum=1.190;SC=AGCTGGGTCATGGCCAGCCCC;SOR=0.495;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=211;TCF=98;TCR=113;TR=110;WE=117785268;WS=117785250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,120:0.52:232
chr11	117789312	rs201746372	CGGGCTGGAGATGCCT	C	4058.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=59;PP=2933;SC=CGGAGATGCCCGGGCTGGAGA;SOR=1.921;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=95;TCF=5;TCR=90;TR=63;WE=117789334;WS=117789302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr11	117790658	rs10790220	C	G	2791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=49;PP=1430;SC=ATGGGGCCCCCTGGCCCTGCA;SOR=1.477;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=82;TCF=33;TCR=49;TR=82;WE=117790666;WS=117790648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr11	117790674	rs12418028	A	G	2030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=37;PP=1109;SC=CTGCAGGGCCAGGAACACCTT;SOR=1.852;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=20;TCR=37;TR=57;WE=117790682;WS=117790664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr11	117799804	rs722729	C	T	672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=7;PP=447;ReadPosRankSum=-0.836;SC=AGCAGCTTCTCCTCCCAGGGG;SOR=0.769;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=52;TCF=38;TCR=14;TR=28;WE=117799812;WS=117799794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,30:0.55:55
chr11	117799923	rs7928668	T	C	3338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.469;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=68;PP=1690;ReadPosRankSum=2.076;SC=CAGAGGTAGCTGTCCCACCTG;SOR=0.795;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=276;TCF=148;TCR=128;TR=152;WE=117799931;WS=117799913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,166:0.54:306
chr11	117800083	rs10892196	T	C	838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.664;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=23;PP=545;ReadPosRankSum=1.032;SC=TCCATCTTGGTCCCTGGCTTC;SOR=0.895;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=84;TCF=37;TCR=47;TR=39;WE=117800091;WS=117800073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,42:0.43:98
chr11	117800169	rs11600129	C	T	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.719;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.136;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=93;ReadPosRankSum=-0.375;SC=CCGGTTGGGACGTGTGAAGTA;SOR=2.066;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=6;WE=117800177;WS=117800159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr11	117863938	rs4252308	C	G	1669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.272;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=27;PP=993;ReadPosRankSum=-1.774;SC=TATTCCCCCCCACCCCAACTC;SOR=1.037;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=168;TCF=101;TCR=67;TR=77;WE=117863946;WS=117863928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,84:0.45:186
chr11	117866311	rs4252311	C	T	1917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.485;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=35;PP=1135;ReadPosRankSum=-1.476;SC=CAGATTTCACCGTGACCAACG;SOR=0.974;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=209;TCF=118;TCR=91;TR=87;WE=117866319;WS=117866301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,97:0.41:236
chr11	117965530	rs2276122	A	G	1955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.521;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=40;PP=1075;ReadPosRankSum=-0.761;SC=TTTTCCTTCAATTACAGGATC;SOR=0.619;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=178;TCF=98;TCR=80;TR=87;WE=117965538;WS=117965520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,96:0.48:198
chr11	117965595	rs2276123	C	T	1769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.318;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=42;PP=1095;ReadPosRankSum=0.008;SC=GGCTTTCATTCGTCCACCTTA;SOR=0.835;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=138;TCF=61;TCR=77;TR=74;WE=117965603;WS=117965585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,80:0.54:147
chr11	117965646	rs2276125	G	A	847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.304;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=24;PP=551;ReadPosRankSum=1.820;SC=TAAGCCACTCGCGCCTGGCCC;SOR=0.350;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=72;TCF=26;TCR=46;TR=40;WE=117965654;WS=117965636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,41:0.54:76
chr11	117979744	rs10892216	C	A	1698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=31;PP=914;SC=TTGGGCTTGTCGGTCAATGCC;SOR=1.727;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=18;TCR=31;TR=49;WE=117979752;WS=117979734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr11	117979814	rs10892217	C	T	109.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=2;PP=53;SC=TTTCCAAGCCCCAGTTTCCCC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=117979822;WS=117979804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr11	117982495	rs1941635	T	G	9229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=173;NR=140;PP=2965;SC=GTGGTGGGTGTGGAGGAGGCC;SOR=0.917;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=313;TCF=173;TCR=140;TR=313;WE=117982503;WS=117982485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,343:1.00:343
chr11	117988082	rs642215	T	C	5877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=113;NR=80;PP=2965;SC=GCATCGTTAGTTGGGGCTATG;SOR=0.951;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=193;TCF=113;TCR=80;TR=193;WE=117988090;WS=117988072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr11	117988223	rs643014	G	A	2916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=59;PP=1741;SC=TCTACCTGGGGGGTGCCAATC;SOR=1.825;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=31;TCR=59;TR=90;WE=117988231;WS=117988213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr11	117988654	rs7123209	G	C	1231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=25;PP=783;SC=GCAGTGCTGGGAGCCGCTTCC;SOR=1.508;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=15;TCR=25;TR=40;WE=117988662;WS=117988644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr11	117996119	rs7944738	C	T	755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=20;PP=549;SC=CATCGCCTGACCACCTGTGTT;SOR=2.066;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=27;WE=117996127;WS=117996109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	118011776	rs668468	G	A	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=36;ReadPosRankSum=0.566;SC=TGAGAGATGGGGAGGGGGTGG;SOR=0.693;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=4;WE=118011784;WS=118011766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr11	118011860	rs12804550	G	A	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-3.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.773;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=7;PP=267;ReadPosRankSum=1.914;SC=GAAAGCTGGTGGGGGTAGATG;SOR=0.208;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=19;WE=118011868;WS=118011850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,20:0.67:30
chr11	118016039	rs955917	G	A	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.343;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=212;ReadPosRankSum=-1.556;SC=TGGCCAGGCAGGTAGGTCTCT;SOR=1.739;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=12;WE=118016047;WS=118016029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr11	118016068	rs1793137	C	T	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=61;ReadPosRankSum=0.760;SC=CAGTGCCAACCTCGGGAGGAT;SOR=0.260;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=5;WE=118016076;WS=118016058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr11	118037813	rs8192613	G	T	1712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.341;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=53;PP=1237;ReadPosRankSum=0.389;SC=TGGAAAGGAAGCAGAGCCACT;SOR=1.127;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=140;TCF=40;TCR=100;TR=72;WE=118037821;WS=118037803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,74:0.49:152
chr11	118067426	rs648947	A	G	565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.191;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=9;PP=375;ReadPosRankSum=-0.138;SC=CACCTGGCTCAGCTGAGGCCA;SOR=0.452;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=45;TCF=32;TCR=13;TR=27;WE=118067434;WS=118067416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,28:0.57:49
chr11	118067621	rs951657	A	G	2523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.468;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=60;PP=1627;ReadPosRankSum=-0.950;SC=CCTATTTGCTAGGCATCGACC;SOR=0.590;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=250;TCF=119;TCR=131;TR=118;WE=118067629;WS=118067611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,124:0.46:269
chr11	118068949	rs1617182	C	T	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.227;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=125;ReadPosRankSum=0.383;SC=GCCAGGGCTACCCGGCTCACC;SOR=0.182;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=40;TCF=7;TCR=33;TR=11;WE=118068957;WS=118068939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,12:0.28:43
chr11	118071097	rs1626649	T	C	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.52;ReadPosRankSum=1.012;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,3:0.23:13
chr11	118074117	rs1793173	A	G	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=3.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.066;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=205;ReadPosRankSum=0.174;SC=AGGTCCCTCAATGCTCCCCAG;SOR=3.287;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=10;WE=118074125;WS=118074107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr11	118074337	rs1793174	A	G	1548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.041;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=37;PP=998;ReadPosRankSum=-0.991;SC=GGAGTACTCCACAGACATCCT;SOR=0.395;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=133;TCF=58;TCR=75;TR=72;WE=118074345;WS=118074327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,76:0.53:144
chr11	118081345	rs17121881	A	T	1842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=36;PP=986;ReadPosRankSum=-1.028;SC=ATTGCATAAGATGTCCCCCAT;SOR=0.673;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=166;TCF=90;TCR=76;TR=81;WE=118081353;WS=118081335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,91:0.49:185
chr11	118081468	rs17121882	C	T	1120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=26;PP=575;ReadPosRankSum=0.463;SC=AAAAGAGGTGCCAGACCGAGG;SOR=0.677;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=102;TCF=44;TCR=58;TR=47;WE=118081476;WS=118081458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,56:0.49:115
chr11	118083664	rs1715429	A	G	3058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=1.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.856;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=65;PP=1824;ReadPosRankSum=0.094;SC=TTGCTCTTAAATCTCCCACTG;SOR=0.762;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=275;TCF=142;TCR=133;TR=132;WE=118083672;WS=118083654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,149:0.48:313
chr11	118107805	rs1793140	A	G	1041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=11;PP=632;ReadPosRankSum=-1.211;SC=GAATATTATGATGCACATCTG;SOR=0.610;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=88;TCF=63;TCR=25;TR=42;WE=118107813;WS=118107795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,48:0.48:99
chr11	118108003	rs1793141	G	A	1200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=36;PP=839;ReadPosRankSum=0.084;SC=TGAGAGAAAAGGTTAACTTGG;SOR=0.657;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=117;TCF=49;TCR=68;TR=61;WE=118108011;WS=118107993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,59:0.48:122
chr11	118110977	rs2853006	T	C	3012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.413;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=58;PP=1727;ReadPosRankSum=0.092;SC=CTATAGTAAGTTTGTCAGTGA;SOR=0.659;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=269;TCF=138;TCR=131;TR=123;WE=118110985;WS=118110967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,145:0.47:307
chr11	118133907	rs200308982	TTAAAG	T	329.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.076;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.144;NF=0;NR=4;PP=139;ReadPosRankSum=-0.317;SC=TGAGTAGGACTTAAAGTAAAG;SOR=0.124;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=4;WE=118133919;WS=118133897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr11	118134597	rs4936426	C	T	324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=253;SC=GTGCCTGAATCACTGGCAGCT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=118134605;WS=118134587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	118134785	rs1624780	T	G	6751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=131;NR=105;PP=2965;SC=AGGAGGAAACTCTGAGAGAAG;SOR=0.832;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=237;TCF=131;TCR=106;TR=236;WE=118134793;WS=118134775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,259:1.00:259
chr11	118179197	rs1599810	A	G	1018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=1.263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.79;ReadPosRankSum=0.747;SOR=0.437;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,27:0.55:49
chr11	118179200	rs1599809	G	A	1024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=1.330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.77;ReadPosRankSum=-0.121;SOR=0.476;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,26:0.58:45
chr11	118182801	rs1945764	G	A	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=63;ReadPosRankSum=-1.414;SC=CACTAGAAAAGTTTTACCTAC;SOR=0.798;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=7;WE=118182809;WS=118182791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,7:0.23:30
chr11	118182829	rs1945765	T	A	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.967;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=2;PP=389;ReadPosRankSum=-2.720;SC=ACTTAAACCATGATATTTTCT;SOR=2.212;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=60;TCF=45;TCR=15;TR=23;WE=118182837;WS=118182819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,24:0.38:63
chr11	118209960	rs2276424	A	C	1873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=34;PP=1160;SC=AGGAGAAGAGAAAACGGTCAG;SOR=1.098;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=26;TCR=34;TR=60;WE=118209968;WS=118209950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr11	118210106	rs2276423	G	C	1260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=9;PP=903;SC=CATTCAGTGTGAGCCTCTCTA;SOR=2.147;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=31;TCR=9;TR=40;WE=118210114;WS=118210096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr11	118210424	rs67065773	TAC	T,TACACAC	2356.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=2.396;HP=2;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=24,24;NR=22,22;PP=1320,561;ReadPosRankSum=1.055;SC=AGCTCACTGGTACACACACAC;SOR=1.965;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=90;TCF=41;TCR=49;TR=46,46;WE=118210435;WS=118210414;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.58,0.38:88
chr11	118359161	rs572126	G	A	141.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=0;PP=111;SC=ATCTCCCGCAGTGTCCAATAC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=118359169;WS=118359154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	118362414	rs562780	T	C	1325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=11;PP=1029;SC=TTCCTCTCTCTCATTCTTCAG;SOR=2.511;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=34;TCR=11;TR=45;WE=118362422;WS=118362404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr11	118391375	rs576950	A	G	331.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=0;PP=326;SC=CAAAAAAAAAAGGGGGGCGCT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=118391383;WS=118391374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	118405343	rs512849	G	A	7761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=137;NR=128;PP=2965;SC=ACACCCTCCCGTTCCTCCAAG;SOR=0.764;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=265;TCF=137;TCR=128;TR=265;WE=118405351;WS=118405333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,290:1.00:290
chr11	118502492	rs517124	C	G	679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=3;PP=563;SC=GTGGGGGTTGCGGGGGGGCAG;SOR=3.160;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=20;WE=118502500;WS=118502482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	118505676	rs58507527	GT	G	1291.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=15;NR=9;PP=1031;SC=GAGGCACCTGGTAGGCCCGCC;SOR=1.751;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=15;TCR=9;TR=24;WE=118505684;WS=118505666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	118509668	rs483598	A	G	4124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=60;PP=2355;SC=CCGTGCAGGAATCAGAACGCC;SOR=0.889;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=80;TCR=60;TR=140;WE=118509676;WS=118509658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr11	118518964	rs11314049	GC	G	407.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=44;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=8;PP=407;SC=CCCCAAAACAGCACCCACCAG;SOR=2.494;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=118518972;WS=118518954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	118529017	rs6589669	T	G	791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=12;PP=391;SC=GCAGGAGGCTTAGCAGGAGGC;SOR=0.756;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=11;TCR=12;TR=23;WE=118529025;WS=118529007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr11	118529044	rs11448549	C	CG	1126.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=9;PP=463;SC=GAAGGGTGGCCCCAGGCAGTG;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=12;WE=118529052;WS=118529034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	118529069	rs6589670	G	C	841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=49.52;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	118529078	rs6589671	G	C	785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.65;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	118529595	rs745663	A	G	7283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=123;NR=122;PP=2965;SC=GGGTGCAGGGAGGGCTTGGGC;SOR=0.724;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=245;TCF=123;TCR=122;TR=245;WE=118529603;WS=118529585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr11	118530434	rs117619140	G	T	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=3;PP=398;ReadPosRankSum=-0.201;SC=CAGTGGACCCGAGCCACCTGC;SOR=0.788;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=46;TCF=41;TCR=5;TR=23;WE=118530442;WS=118530424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,25:0.52:48
chr11	118622744	rs6589689	G	A	3155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=57;NR=50;PP=1676;SC=CACAAAGAGAGGAGCATTCCC;SOR=0.776;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=107;TCF=57;TCR=50;TR=107;WE=118622752;WS=118622734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr11	118625609	rs580079	C	T	1223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=22;PP=676;SC=AAAAAACATGCGTTTAAAAAT;SOR=1.280;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=12;TCR=22;TR=34;WE=118625617;WS=118625599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr11	118651809	rs555649	T	C	6657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=112;NR=114;PP=2965;SC=TTATTCTACTTGTATTTTACA;SOR=0.791;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=227;TCF=112;TCR=115;TR=226;WE=118651817;WS=118651799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
chr11	118757191	rs1790192	G	A	2693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=40.81;ReadPosRankSum=1.746;SOR=0.483;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,65:0.98:66
chr11	118757201	rs3176908	C	G	2529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.00;SOR=1.487;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr11	118757219	rs1623316	C	G	1928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=32;PP=977;SC=TAATTCTCATCAATGAAAGGT;SOR=2.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=9;TCR=32;TR=41;WE=118757227;WS=118757209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr11	118765267	rs598207	G	C	1732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.062;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=43;PP=981;ReadPosRankSum=2.056;SC=GGCTCCTGACGAAGCTGGGCT;SOR=0.603;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=203;TCF=88;TCR=115;TR=79;WE=118765275;WS=118765257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,90:0.40:224
chr11	118768466	rs35636302	C	CT	324.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=1.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.28;MQRankSum=1.493;QD=4.57;ReadPosRankSum=0.264;SOR=0.870;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,24:0.34:71
chr11	118769032	rs11217081	G	A	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=75;ReadPosRankSum=-0.468;SC=ACCCCACCCCGCGACCCAGGC;SOR=0.446;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=6;WE=118769040;WS=118769022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr11	118769442	rs7104819	A	G	1320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.750;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=22;PP=915;ReadPosRankSum=0.456;SC=ACATCTGTCCAGGGTGGCACA;SOR=0.856;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=97;TCF=57;TCR=40;TR=56;WE=118769450;WS=118769432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,59:0.57:104
chr11	118770321	rs11217083	A	G	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.861;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=107;ReadPosRankSum=0.077;SC=GCCAGAGGTCAAAGTCTTCAC;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=7;WE=118770329;WS=118770311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr11	118781601	rs11376918	C	CA	9890.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.49;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=99;PP=2971;SC=GACAGGGAGACAAGACACGCA;SOR=0.970;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=120;TCF=15;TCR=105;TR=114;WE=118781609;WS=118781591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,283:1.00:283
chr11	118781638	rs11376919	C	CG	6184.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.53;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=47;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=4;NR=83;PP=2974;SC=AGAGGCGCGCCGAGGCCAGGG;SOR=1.395;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=87;TCF=4;TCR=83;TR=87;WE=118781646;WS=118781628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr11	118781655	rs11376920	C	CG	4708.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.52;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=57;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=70;PP=2971;SC=AGGGAAGCGCCGCCGGAGCGG;SOR=1.628;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=73;TCF=2;TCR=71;TR=72;WE=118781663;WS=118781645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr11	118828942	rs623500	A	G	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=237;ReadPosRankSum=1.625;SC=TCCCGCAAGTAAGGAGGTCTG;SOR=0.591;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=44;TCF=16;TCR=28;TR=17;WE=118828950;WS=118828932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,17:0.36:47
chr11	118842745	rs36158515	A	AG	3175.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=4;NR=55;PP=2554;SC=GGCGTGGCGGAGGGTGGCCTA;SOR=1.445;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=66;TCF=4;TCR=62;TR=59;WE=118842753;WS=118842735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr11	118842780	.	A	AG	1415.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=34;PP=1367;SC=CCCGGGGCAGACGGCTCCCCA;SOR=2.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=35;WE=118842788;WS=118842770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr11	118851138	rs4456264	C	T	958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=8;PP=667;ReadPosRankSum=-0.145;SC=TAGAACATGCCCCAGAGAAGG;SOR=0.828;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=63;TCF=47;TCR=16;TR=35;WE=118851146;WS=118851128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,37:0.55:67
chr11	118852081	rs4938606	A	G	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.647;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=195;ReadPosRankSum=-0.128;SC=TTGGAGATGGAATGCCTTCAG;SOR=0.086;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=12;WE=118852089;WS=118852071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr11	118867803	rs4938618	G	C	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=232;ReadPosRankSum=0.536;SC=GGCAGACGTTGAATCATTTCC;SOR=0.821;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=15;WE=118867811;WS=118867793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr11	118868842	rs58467585	A	AG	264.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=275;SC=CCGAGGGGTCAGGGTCAGAGG;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=7;WE=118868850;WS=118868832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	118869447	rs12786333	T	C	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=574;ReadPosRankSum=-1.160;SC=CCAGCCTTGTTAGGGTAGGGG;SOR=0.551;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=17;WE=118869468;WS=118869437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr11	118869460	rs3737504	A	G	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.882;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=631;ReadPosRankSum=0.953;SC=GGTAGGGGTCATATGCTGCCA;SOR=1.248;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=14;WE=118869468;WS=118869437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr11	118872404	rs6589713	T	C	1358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.443;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=26;PP=767;ReadPosRankSum=0.757;SC=CAGTTCAAACTTGTGCTGTGC;SOR=0.590;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=98;TCF=55;TCR=43;TR=56;WE=118872412;WS=118872394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,64:0.57:113
chr11	118882138	rs112711662	C	T	56.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5025;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=33;ReadPosRankSum=-0.319;SC=GGCTGGAGTGCAGTGGCACGA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=118882146;WS=118882128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr11	118886117	rs10111	C	T	1429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.922;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=19;PP=755;ReadPosRankSum=-0.755;SC=CTTTTGGCCGCGTCTGGAATA;SOR=0.959;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=125;TCF=75;TCR=50;TR=58;WE=118886125;WS=118886107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,69:0.46:151
chr11	118886656	rs7131534	G	A	2173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.458;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-1.584;NF=55;NR=51;PP=1352;ReadPosRankSum=-1.667;SC=AGTCCTAGGGGGAGAGAATAG;SOR=0.659;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=232;TCF=120;TCR=112;TR=106;WE=118886664;WS=118886646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,112:0.44:253
chr11	118888619	rs11602764	A	G	1507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.024;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=31;PP=825;ReadPosRankSum=-0.228;SC=TTACTAGAGGATTACGAGAGA;SOR=0.517;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=133;TCF=65;TCR=68;TR=64;WE=118888627;WS=118888609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,75:0.49:154
chr11	118888831	rs11820805	T	C	573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=464;ReadPosRankSum=0.641;SC=TACTGCGCCCTCAGCCCCCGC;SOR=0.631;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=22;WE=118888839;WS=118888821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,22:0.56:39
chr11	118889073	rs11545858	G	T	2764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.497;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=65;PP=1648;ReadPosRankSum=-0.268;SC=CTCAGAAACGGGCCCAAAAAC;SOR=0.745;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=201;TCF=94;TCR=107;TR=118;WE=118889085;WS=118889063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,128:0.57:223
chr11	118889114	rs10892321	A	G	4098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=83;PP=2629;SC=TCCGGGGCAAAAGGCGGAGCC;SOR=1.422;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=132;TCF=49;TCR=83;TR=132;WE=118889122;WS=118889104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr11	118889132	rs11217124	A	G	1379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.813;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=39;PP=963;ReadPosRankSum=2.129;SC=GCCAGGCAGAAGAAGTCCCAC;SOR=0.590;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=94;TCF=30;TCR=64;TR=58;WE=118889140;WS=118889122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,61:0.60:101
chr11	118889185	rs11217125	T	C	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=47;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=247;ReadPosRankSum=-2.361;SC=AGACAGGAAGTGGATTCTAGT;SOR=0.997;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=17;WE=118889193;WS=118889175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr11	118889396	rs72350455	G	GAGGAGA	523.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=1.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.13;MQRankSum=3.652;QD=13.09;ReadPosRankSum=-0.848;SOR=1.140;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
chr11	118889810	rs3802884	C	T	3279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FS=1.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.82;ReadPosRankSum=0.334;SOR=0.877;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,85:0.46:184
chr11	118889813	rs3802883	C	G	3284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FS=1.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.57;ReadPosRankSum=0.861;SOR=0.807;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:102,85:0.45:187
chr11	118889822	rs3802882	C	G	3393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.97;ReadPosRankSum=0.640;SOR=0.646;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:109,91:0.46:200
chr11	118890022	rs3802881	C	T	766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.085;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=18;PP=410;ReadPosRankSum=1.022;SC=CCTCCATGTTCCACTCGTAAG;SOR=0.454;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=64;TCF=22;TCR=42;TR=29;WE=118890030;WS=118890012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,34:0.47:72
chr11	118894287	rs569	A	G	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=151;ReadPosRankSum=-0.587;SC=TTCTGTATATACCATGGTCTT;SOR=0.914;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=9;WE=118894295;WS=118894277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr11	118895686	rs8192696	C	T	2686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=50;PP=1497;ReadPosRankSum=0.101;SC=AGAAGGCAGCCGTGCTGGCCG;SOR=0.670;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=203;TCF=111;TCR=92;TR=111;WE=118895694;WS=118895676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,123:0.55:223
chr11	118896115	rs2276072	AA	GC	1142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=16;PP=939;SC=AAGCAAGAAGAAGGCTTGGTC;SOR=1.528;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=23;WE=118896124;WS=118896105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	118898435	rs56966114	AC	A	12481.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=344;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=161;PP=2972;SC=AGACAACCACACCACAGTGCC;SOR=0.785;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=196;TCF=31;TCR=165;TR=190;WE=118898443;WS=118898425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,339:1.00:339
chr11	118915755	rs13929	G	C	1013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.840;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.915;NF=29;NR=10;PP=589;ReadPosRankSum=0.832;SC=AAAGGAGCTGGATGGGGAATG;SOR=0.866;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=74;TCF=52;TCR=22;TR=39;WE=118915765;WS=118915745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,49:0.56:88
chr11	118915757	rs11363127	TG	T	3617.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=21;PP=1686;SC=AGGAGCTGGATGGGGAATGGG;SOR=1.396;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=56;TCF=25;TCR=31;TR=40;WE=118915765;WS=118915745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr11	118915944	rs1043314	A	G	812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=21;PP=503;ReadPosRankSum=1.993;SC=GAAACTCCCCAGCAACCTGAT;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=64;TCF=21;TCR=43;TR=31;WE=118915952;WS=118915934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,36:0.50:72
chr11	118919132	rs2276060	G	A	1141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.379;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=21;PP=781;ReadPosRankSum=0.489;SC=CAGAGGCAAGGCCCACAGAGC;SOR=0.987;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=108;TCF=64;TCR=44;TR=52;WE=118919140;WS=118919122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,53:0.44:120
chr11	118919206	rs568922	T	C	4771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=72;PP=2545;SC=CAAATATGAATGCTTCCAAGC;SOR=0.809;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=165;TCF=92;TCR=73;TR=163;WE=118919214;WS=118919196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr11	118920050	rs35384663	C	G	1030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.119;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=22;PP=658;ReadPosRankSum=1.320;SC=CCTGCTTGGACTGTGGCAATC;SOR=0.813;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=137;TCF=76;TCR=61;TR=50;WE=118920072;WS=118920040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,54:0.36:152
chr11	118920112	rs670192	A	G	2548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=38;NR=46;PP=1436;SC=CCTTGGGAGCACCAGTCAAGA;SOR=1.099;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=85;TCF=39;TCR=46;TR=84;WE=118920120;WS=118920102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr11	118920453	rs673768	T	C	6940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=132;NR=110;PP=2965;SC=CACACAAGTATATTCTCTCCC;SOR=0.805;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=244;TCF=133;TCR=111;TR=242;WE=118920461;WS=118920443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,262:1.00:262
chr11	118922200	rs1804690	G	A	1895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.373;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=27;PP=1059;ReadPosRankSum=-1.836;SC=TGATGTGGAAGTTGAAATCAT;SOR=0.863;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=126;TCF=74;TCR=52;TR=73;WE=118922208;WS=118922190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,85:0.60:142
chr11	118925341	rs538478	G	A	1443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.608;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=38;PP=904;ReadPosRankSum=-0.605;SC=GCTCGGCCTGGTTGAAGAAGA;SOR=0.915;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=146;TCF=72;TCR=74;TR=67;WE=118925349;WS=118925331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,73:0.45:162
chr11	118926720	rs470679	A	C	1969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=32;PP=1529;SC=CCCAAGCTCAATTCCCATCAT;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=63;TCF=31;TCR=32;TR=63;WE=118926728;WS=118926710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr11	118927013	rs57740718	T	TC	4993.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.263;NF=30;NR=74;PP=2977;ReadPosRankSum=1.378;SC=AGCCTACTTCTCCCTTCTCCC;SOR=0.750;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=32;TCR=77;TR=104;WE=118927021;WS=118927003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,183:0.99:185
chr11	118938880	rs584115	A	G	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.53;ReadPosRankSum=0.028;SOR=0.055;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,10:0.33:30
chr11	118938880	.	ATC	GTT	92	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=1;NR=7;PP=92;QD=18.1834843578;SC=AAGGAAGTCCATCTCCTAACT;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=8;WE=118938890;WS=118938870;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr11	118938882	rs670526	C	T	1024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=23;PP=382;SC=GGAAGTCCATCTCCTAACTTG;SOR=5.283;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=24;WE=118938890;WS=118938870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	118939939	rs5795166	T	TC	4360.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=28;NR=37;PP=2708;SC=CTTGCCACGTTCCTACAGCTT;SOR=1.197;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=71;TCF=32;TCR=39;TR=65;WE=118939947;WS=118939929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr11	118940957	rs1784302	C	G	2275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=45;PP=1530;ReadPosRankSum=1.101;SC=TCACAGATGGCAGTGTTACAT;SOR=0.687;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=232;TCF=134;TCR=98;TR=108;WE=118940965;WS=118940947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,116:0.44:262
chr11	118942134	rs45609135	G	A	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=162;ReadPosRankSum=1.180;SC=GTGATCTCTGGTTATATATTT;SOR=0.793;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=9;WE=118942142;WS=118942124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr11	118942638	rs1614264	A	C	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=105;ReadPosRankSum=-0.632;SC=ATGCCTGGATACTGCCAATCT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=6;WE=118942646;WS=118942628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr11	118944675	rs3825061	C	T	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.011;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=120;ReadPosRankSum=0.961;SC=AGTCTGGAGGCACTTTGGGAT;SOR=0.132;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=11;WE=118944683;WS=118944665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr11	118947634	rs540261	C	T	2068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=38;PP=1105;ReadPosRankSum=0.775;SC=AGCCATCCTACGTGATCCGCA;SOR=0.701;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=236;TCF=137;TCR=99;TR=95;WE=118947642;WS=118947624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,108:0.42:258
chr11	118949083	rs1177563	G	A	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-0.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.609;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=278;ReadPosRankSum=0.837;SC=AAGACAGTTCGTGCCGTCTCC;SOR=2.170;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=26;TCF=8;TCR=18;TR=15;WE=118949091;WS=118949073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr11	118949331	rs1177562	C	T	902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.362;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=14;PP=637;ReadPosRankSum=-2.019;SC=GTCGCTTCTGCGACGTCTTTG;SOR=1.162;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=83;TCF=47;TCR=36;TR=39;WE=118949339;WS=118949309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,41:0.45:91
chr11	118949799	rs1168568	G	A	5296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=3.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=423;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.750;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=111;NR=106;PP=2962;ReadPosRankSum=1.400;SC=AGTGCCACACGTGGTTGATTG;SOR=0.562;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=390;TCF=202;TCR=188;TR=217;WE=118949807;WS=118949789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,240:0.57:423
chr11	118952173	rs15818	A	G	2841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.972;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=52;PP=1633;ReadPosRankSum=0.330;SC=CTGCAGCTCAAGTGCTCCAAT;SOR=0.754;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=219;TCF=118;TCR=101;TR=119;WE=118952181;WS=118952161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,138:0.54:257
chr11	118952371	rs4614	A	G	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=86;ReadPosRankSum=-0.712;SC=GTGGAGGACCAAGAGAACAGA;SOR=0.307;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=6;WE=118952379;WS=118952361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr11	118955679	rs589925	C	T	3847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.837;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=67;PP=2150;ReadPosRankSum=-0.323;SC=GGCCGGAGCCCCCGGCTTCCC;SOR=0.631;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=293;TCF=168;TCR=125;TR=153;WE=118955687;WS=118955669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,178:0.53:334
chr11	118958869	rs1006195	G	T	566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=10;PP=344;ReadPosRankSum=0.000;SC=AGGTTCTGAAGTTCCTTTCTT;SOR=0.570;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=36;TCR=20;TR=28;WE=118958877;WS=118958859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,30:0.50:60
chr11	118959331	rs17075	G	A	1269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=11;PP=713;ReadPosRankSum=0.770;SC=ACTAATCCAAGTCTCTACCCG;SOR=0.659;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=85;TCF=63;TCR=22;TR=47;WE=118959339;WS=118959321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,55:0.57:96
chr11	118959732	rs549893	C	T	729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=6;PP=477;ReadPosRankSum=1.202;SC=CGTAGCACAGCGCTAGGCTCA;SOR=0.655;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=43;TCF=35;TCR=8;TR=29;WE=118959740;WS=118959722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,31:0.67:46
chr11	118962816	rs1784304	C	A	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=164;ReadPosRankSum=0.142;SC=CCTTTTGACTCCCTGTTCCGC;SOR=0.610;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=31;TCR=14;TR=19;WE=118962824;WS=118962806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,22:0.43:51
chr11	118967758	rs643788	T	C	1143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.467;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=22;PP=707;ReadPosRankSum=-0.887;SC=GAGAAGGTGATGGCACTGCCC;SOR=0.523;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=111;TCF=72;TCR=39;TR=53;WE=118967766;WS=118967748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,56:0.45:124
chr11	118968959	rs10544271	TAG	T	268.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.568;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=49;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=313;ReadPosRankSum=0.738;SC=TACTACTGGGTAGAGAGAAAT;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=8;WE=118968968;WS=118968949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr11	118970875	rs10892330	T	C	693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.51;SOR=5.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	118970875	.	TGCA	CGCA,CGCC	164	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=17,8;NR=0,0;PP=164,156;QD=11.6924242675;SC=ATAATTACTATGCATATTGCT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17,8;WE=118970886;WS=118970865;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:17
chr11	118970878	rs603826	A	C	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.04;ReadPosRankSum=1.257;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr11	118971251	rs649870	A	G	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=120;ReadPosRankSum=-1.170;SC=CACAGAGACAAAAAAGGAACA;SOR=0.876;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=24;TCR=17;TR=12;WE=118971259;WS=118971241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,13:0.29:45
chr11	118973112	rs3825060	AA	GC	14658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=135;NR=146;PP=2947;SC=TCCCGGAAACAAAGCTACGAT;SOR=0.842;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=286;TCF=137;TCR=149;TR=281;WE=118973121;WS=118973102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,329:1.00:329
chr11	118978411	rs7940073	G	C	356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=4;PP=206;SC=GGGGCAGCGGGTGAGCCCCAG;SOR=1.329;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=13;WE=118978419;WS=118978401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	118983681	rs682795	C	T	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.064;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=99;ReadPosRankSum=-0.685;SC=TTAATTCCAACTCCCCCTGTT;SOR=0.818;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=7;WE=118983689;WS=118983671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr11	118984287	rs4938630	A	C	619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=18;NR=6;PP=436;SC=CTCTGAAGCAACTCCCAGCTC;SOR=2.124;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=24;WE=118984295;WS=118984277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	118985151	rs595782	T	C	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=339;ReadPosRankSum=-0.568;SC=CTCGAGCCAGTGTGCCTTCTC;SOR=0.631;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=23;WE=118985159;WS=118985141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,24:0.62:39
chr11	119003322	rs662069	C	A	6453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=119;NR=99;PP=2965;SC=TCCTGCCCTCCAAGGTTCCAC;SOR=0.899;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=221;TCF=122;TCR=99;TR=218;WE=119003330;WS=119003312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr11	119004009	rs672189	G	T	2179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=48;PP=1332;SC=CCTTAATTTGGGTCGGGCGCG;SOR=1.639;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=25;TCR=48;TR=73;WE=119004017;WS=119003999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr11	119004026	rs537153	C	T	960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=25;PP=664;SC=CGCGGTGGCTCACGCCTGTAA;SOR=2.115;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=34;WE=119004034;WS=119004016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr11	119004686	rs658922	T	A	779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=5;PP=572;SC=GTCACTTGGATTCCAGGACTT;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=25;WE=119004694;WS=119004676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	119005088	rs512703	C	T	9287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=349;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=146;NR=177;PP=2965;SC=AGCAAGAGATCGTCTACTATG;SOR=0.955;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=323;TCF=146;TCR=177;TR=323;WE=119005096;WS=119005078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,349:1.00:349
chr11	119005132	rs100803	C	T	5703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=118;PP=2965;SC=CCTCCCCCAGCCCCTGAGCCA;SOR=1.494;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=186;TCF=68;TCR=118;TR=186;WE=119005140;WS=119005122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr11	119028813	rs626776	C	G	324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=270;SC=CTTAATGGTACAAGATTCTCT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=119028821;WS=119028809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	119031841	rs11383101	G	GC	3794.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=61;PP=2616;SC=CTGTACCCCAGCCCTGCAGCA;SOR=1.490;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=63;TCF=1;TCR=62;TR=62;WE=119031849;WS=119031831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr11	119043500	rs644252	T	G	2096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=20;PP=1265;SC=TGTGGGGCCTTTATCTCAGGA;SOR=1.340;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=43;TCR=20;TR=63;WE=119043508;WS=119043490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr11	119043656	rs643423	C	T	4154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=73;NR=75;PP=2403;SC=CGCTCCCCCACCCGGGAGGCA;SOR=0.868;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=150;TCF=73;TCR=77;TR=148;WE=119043664;WS=119043646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr11	119052826	rs4245191	C	A	5358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=107;NR=77;PP=2965;SC=CCGCTGACGGCGGCAGGTGTT;SOR=0.896;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=184;TCF=107;TCR=77;TR=184;WE=119052834;WS=119052816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr11	119054488	rs10790286	C	T	6143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=111;NR=93;PP=2965;SC=GAGCCTCTGACTGTGTCACCA;SOR=0.836;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=204;TCF=111;TCR=93;TR=204;WE=119054496;WS=119054478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr11	119059404	rs1815811	G	A	4720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=65;PP=2754;SC=GCCTCGCCCCGGGGCAGCAGC;SOR=0.877;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=155;TCF=90;TCR=65;TR=155;WE=119059412;WS=119059394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr11	119059522	rs117468615	C	T	3154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.078;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=67;PP=2005;ReadPosRankSum=0.081;SC=CTGGTGGCAGCTATGGCTTCC;SOR=0.486;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=297;TCF=173;TCR=124;TR=150;WE=119059530;WS=119059512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,158:0.50:319
chr11	119060909	rs139991173	A	G	934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=2.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=32.23;ReadPosRankSum=0.084;SOR=0.186;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,23:0.79:29
chr11	119060933	rs144192308	T	C	1197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.259;HP=2;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=5;PP=514;ReadPosRankSum=1.441;SC=TCCACTTCTCTCTGCCAAACG;SOR=1.136;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=47;TCF=37;TCR=10;TR=30;WE=119060941;WS=119060923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,35:0.66:53
chr11	119060963	rs45535039	T	C	2610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=25;PP=1549;SC=CACAGCTCTATTGAGTTCTAC;SOR=1.420;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=85;TCF=60;TCR=25;TR=84;WE=119060971;WS=119060953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr11	119061045	rs146561918	G	A	1856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.030;HP=6;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=34;PP=1168;ReadPosRankSum=-2.544;SC=AAGATCCAGGGGGGGTGAGTC;SOR=0.524;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=140;TCF=81;TCR=59;TR=77;WE=119061053;WS=119061035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,83:0.54:154
chr11	119065484	rs60630529	A	AC	1648.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=29;NR=4;PP=1288;SC=CTCACTGCCCACCCTCTCTCA;SOR=2.925;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=33;WE=119065492;WS=119065474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr11	119065709	rs10750139	G	C	4078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=75;PP=2101;SC=CTGCACCTGCGGTGGCAAGTG;SOR=1.129;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=135;TCF=60;TCR=75;TR=135;WE=119065717;WS=119065699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr11	119144793	.	T	G	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.458;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.98;ReadPosRankSum=-1.531;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr11	119145705	rs3842642	G	GT	4581.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=4;NR=70;PP=2936;SC=TCTGAATTTCGTTATCTTGAG;SOR=1.521;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=79;TCF=4;TCR=75;TR=74;WE=119145713;WS=119145695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr11	119146659	rs2511854	G	C	1224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=9;PP=938;SC=GCCTTCCACCGTAATACCAGC;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=42;WE=119146667;WS=119146649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr11	119148573	rs2510152	G	T	5895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=111;PP=2965;SC=TGTTTCACATGATAACCATAT;SOR=1.205;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=190;TCF=79;TCR=111;TR=190;WE=119148581;WS=119148563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr11	119155618	rs2298650	G	T	879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=7;PP=557;SC=AGCTTTAGGAGAGTTGAAAGA;SOR=2.448;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=29;WE=119155626;WS=119155608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	119181170	rs2249466	T	C	4305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=76;PP=2606;ReadPosRankSum=1.189;SC=GAGACGGGGGTAGCGTGCTGG;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=71;TCR=76;TR=147;WE=119181178;WS=119181160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,160:0.99:162
chr11	119181674	rs2510146	G	C	9638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=150;NR=179;PP=2965;SC=ACCATCGTTGGCCCAGCCAGT;SOR=0.936;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=331;TCF=151;TCR=180;TR=329;WE=119181682;WS=119181663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,355:1.00:355
chr11	119185133	rs6589731	C	T	1284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=9;PP=815;SC=CCCAAAGCACCGAGATTACAG;SOR=2.007;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=31;TCR=9;TR=40;WE=119185141;WS=119185123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr11	119185347	rs6589732	G	A	2726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.980;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=51;PP=1591;ReadPosRankSum=0.915;SC=CCATCTCAGCGGCTGCGCACC;SOR=0.836;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=250;TCF=134;TCR=116;TR=114;WE=119185355;WS=119185337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,133:0.47:283
chr11	119205735	rs12797083	T	C	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.525;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.98;ReadPosRankSum=-1.691;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr11	119205830	rs12795576	A	G	926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.308;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=12;PP=545;ReadPosRankSum=-0.306;SC=CCATAGCCCTATCATGGAGGC;SOR=0.995;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=128;TCF=83;TCR=45;TR=44;WE=119205838;WS=119205820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,48:0.35:138
chr11	119206375	rs2511841	G	A	5578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=92;PP=2965;SC=GGAGGATGACGGACGTAGTGG;SOR=0.765;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=184;TCF=92;TCR=92;TR=182;WE=119206383;WS=119206365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr11	119209979	rs9640	T	A	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=356;ReadPosRankSum=2.454;SC=CTGGATGACCTGGTTGTCAGC;SOR=0.663;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=23;WE=119209987;WS=119209969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,24:0.59:41
chr11	119210583	rs1135258	G	T	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.276;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=33;ReadPosRankSum=-1.105;SC=GGGCGGCAGGGTGAGAGTAGC;SOR=1.609;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=10;TCF=5;TCR=5;TR=5;WE=119210591;WS=119210573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr11	119213782	rs948411	A	T	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=246;ReadPosRankSum=-0.582;SC=AGCCTCCCACAGGCCTGGCTC;SOR=0.892;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=15;WE=119213790;WS=119213772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr11	119214771	rs948413	A	G	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.563;HP=6;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=258;ReadPosRankSum=0.224;SC=GGCTGGGGGGATGGGGTGGTG;SOR=0.124;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=14;WE=119214779;WS=119214761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr11	119215165	rs10790289	C	T	1052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=24;PP=531;ReadPosRankSum=2.910;SC=ATAGGGCTGGCGGTGATTACA;SOR=0.754;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=67;TCF=28;TCR=39;TR=41;WE=119215173;WS=119215155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,48:0.61:79
chr11	119215253	rs2509388	G	C	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.199;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=20.18;ReadPosRankSum=-0.459;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr11	119215256	rs10892350	C	T	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.57;ReadPosRankSum=-0.400;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr11	119216231	rs2510143	A	G	5312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=89;PP=2965;SC=GCTGTATTGCATGGTCTGTGG;SOR=0.723;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=188;TCF=99;TCR=89;TR=188;WE=119216239;WS=119216221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr11	119216279	rs36015759	G	A	1891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.020;HP=6;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=32;PP=1105;ReadPosRankSum=1.351;SC=TGTTGGGGGGGTAAGGGTCTG;SOR=0.994;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=189;TCF=109;TCR=80;TR=85;WE=119216287;WS=119216269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,92:0.45:205
chr11	119217254	rs883247	C	T	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.191;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=357;ReadPosRankSum=-0.545;SC=TTTCTGGAGTCCCTGTGACAG;SOR=1.017;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=44;TCF=16;TCR=28;TR=23;WE=119217262;WS=119217244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,23:0.49:47
chr11	119217311	rs883245	G	A	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.075;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=73;ReadPosRankSum=0.233;SC=CTCCCTGTCAGAGGGGCAGCC;SOR=0.569;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=6;WE=119217319;WS=119217301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr11	119227844	rs11217253	G	C	1460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=5;PP=1023;SC=TGGAGGAGTGGGGGGAGAGTG;SOR=3.352;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=40;TCR=5;TR=45;WE=119227852;WS=119227834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr11	119229374	rs7937208	T	C	2665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=20;PP=1899;SC=TGTTGAACACTAGGCAGAAAC;SOR=2.059;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=67;TCR=20;TR=87;WE=119229382;WS=119229364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr11	119229964	rs2241646	G	A	4595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=77;NR=74;PP=2624;SC=AGCGCGGTGCGTATCTCTGGA;SOR=0.816;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=151;TCF=77;TCR=74;TR=151;WE=119229972;WS=119229954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr11	119244095	rs587985	C	T	2217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=46;PP=1182;ReadPosRankSum=1.178;SC=CATAGGAGGACGGGGTGTAGG;SOR=0.705;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=175;TCF=90;TCR=85;TR=91;WE=119244103;WS=119244085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,109:0.52:209
chr11	119252151	rs565296	C	T	3463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.001;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=67;PP=2118;ReadPosRankSum=0.099;SC=CCCCGAATCCCCCCTCCCGGA;SOR=0.692;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=286;TCF=149;TCR=137;TR=147;WE=119252159;WS=119252141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,160:0.50:317
chr11	119252199	rs670906	T	G	3382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.428;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=72;PP=2119;ReadPosRankSum=0.355;SC=CTTCTTGGAGTATGGACGAGT;SOR=0.726;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=257;TCF=131;TCR=126;TR=145;WE=119252207;WS=119252189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,157:0.55:287
chr11	119290034	rs1054735	G	C	1609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.609;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=24;PP=823;ReadPosRankSum=-1.916;SC=TGAGGGATTGGGGGGAGGGGG;SOR=0.784;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=136;TCF=84;TCR=52;TR=68;WE=119290042;WS=119290022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,78:0.51:152
chr11	119291480	rs3138091	G	A	1241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.123;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=15;PP=505;ReadPosRankSum=0.938;SC=CCCTCTCTTTGTCACCTGCGC;SOR=0.933;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=127;TCF=77;TCR=50;TR=48;WE=119291488;WS=119291470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,61:0.41:147
chr11	119291688	rs3751026	A	G	785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.262;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=21;PP=501;ReadPosRankSum=-0.521;SC=CACACTTACCACCAGGGCTGG;SOR=1.127;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=69;TCF=26;TCR=43;TR=33;WE=119291696;WS=119291678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,36:0.49:74
chr11	119509625	rs1022080	C	T	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.309;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.251;NF=5;NR=10;PP=182;ReadPosRankSum=1.119;SC=AGAGCAGGCCCGGGAGCTCTG;SOR=1.022;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=35;TCF=13;TCR=22;TR=15;WE=119509633;WS=119509615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,16:0.41:39
chr11	119510644	rs7940667	A	C	3769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=364;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.788;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=83;PP=2410;ReadPosRankSum=1.703;SC=GAGCACAGCAACTAGGATGAG;SOR=0.695;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=330;TCF=169;TCR=161;TR=169;WE=119510652;WS=119510634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:181,183:0.50:364
chr11	119548698	rs2292293	T	G	652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=17;PP=465;SC=TCAGCTGTGCTGCACCAAAGA;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=119548706;WS=119548688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	119584506	rs4245205	T	C	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=12;NR=3;PP=249;SC=GGGCAGCTCCTATCTCTCCTG;SOR=1.493;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=119584514;WS=119584496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	119879255	rs609066	A	G	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.79;ReadPosRankSum=1.282;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr11	119879425	rs648374	T	C	889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=16;PP=530;ReadPosRankSum=1.443;SC=TTCTCCGAGATTGCGAGTGCC;SOR=0.605;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=73;TCF=44;TCR=29;TR=38;WE=119879433;WS=119879415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,42:0.50:84
chr11	119984202	rs506127	A	G	203.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=0;PP=183;SC=CATGCCCTGCAGATCCCAATA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=119984210;WS=119984192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	119984535	rs519672	G	C	370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=280;SC=CTTTGAGGAAGATTGGGTCAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=119984543;WS=119984525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	119986167	rs503559	T	C	7482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=125;NR=125;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.232;SC=GCGCTGGTGGTCAGGGGTGCC;SOR=0.776;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=255;TCF=128;TCR=127;TR=250;WE=119986175;WS=119986157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,275:0.99:277
chr11	119987576	rs488222	C	T	548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=2;PP=405;SC=GAGAAGGGACCGGCACACCCT;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=119987584;WS=119987566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	119989107	rs10466595	C	G	2783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=54;PP=1677;SC=ACAGCCAGGTCTATGACTCTC;SOR=1.306;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=38;TCR=54;TR=92;WE=119989115;WS=119989097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr11	119989123	rs10466596	G	T	2071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=41;PP=1290;SC=CTCTCTAGCCGCTGGCCACAA;SOR=1.319;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=28;TCR=41;TR=69;WE=119989131;WS=119989113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr11	119992839	.	A	AGTGTGT	1045.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.24;QD=38.73;SOR=2.400;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,25:0.93:27
chr11	119993897	rs66674912	CCT	C	13197.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=113;PP=2967;SC=GTTTCCCCAACCTCTCAGAGA;SOR=0.873;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=181;TCF=61;TCR=120;TR=171;WE=119993906;WS=119993887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,299:1.00:299
chr11	119999191	rs569044	A	G	2538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=26;PP=1456;SC=TCCTTTTGCAATGACAGCTCC;SOR=1.230;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=50;TCR=26;TR=76;WE=119999199;WS=119999181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr11	120007889	rs470645	G	T	2123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=12;PP=1473;SC=GAGGGGTGGGGTGAGAGAGGA;SOR=2.743;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=57;TCR=12;TR=69;WE=120007897;WS=120007879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr11	120040442	rs2444240	T	G	1233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=28;NR=6;PP=783;SC=GGCAAAGGCTTGCGGGATGCG;SOR=2.948;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=34;WE=120040450;WS=120040432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr11	120097498	rs873059	T	C	6088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=129;NR=78;PP=2965;SC=TGAAGCCAGGTAGGAGTGACT;SOR=1.209;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=207;TCF=129;TCR=78;TR=207;WE=120097506;WS=120097488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr11	120099658	rs2508489	A	G	6541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=82;NR=52;PP=2107;SC=GTGGGGGACCACGGGAAGCCC;SOR=0.997;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=82;TCR=52;TR=134;WE=120099666;WS=120099648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr11	120099679	rs2508490	G	A	7519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=105;NR=68;PP=2737;SC=TGCGTCTGCCGCTATGGCCTG;SOR=0.991;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=174;TCF=105;TCR=69;TR=173;WE=120099687;WS=120099669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr11	120107411	rs882856	G	A	2630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=40;PP=1616;SC=GCTAAAGGAGGAAGGGGTAAA;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=46;TCR=40;TR=86;WE=120107419;WS=120107401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr11	120292570	rs532006	T	A	1523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=32;PP=932;SC=AGGTAAGGAATAGGCTATTAT;SOR=1.835;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=16;TCR=32;TR=48;WE=120292578;WS=120292560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr11	120355009	rs182499198	A	G	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=224;ReadPosRankSum=0.115;SC=TGAAATTTTTAATGATGAAGT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=10;WE=120355017;WS=120354999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr11	120355230	rs503473	A	G	7079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=114;NR=126;PP=2965;SC=TGTAAAAGTTATGAGTTCCAG;SOR=0.908;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=240;TCF=114;TCR=126;TR=240;WE=120355238;WS=120355220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
chr11	120385841	rs2243746	T	C	836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=18;PP=442;SC=CCCCCTCCCCTGGCCACCCAG;SOR=1.681;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=9;TCR=18;TR=27;WE=120385849;WS=120385831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	120530973	rs6589829	C	T	4228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=78;NR=68;PP=2406;SC=CCCCCTCTCTCGCAGAGTTAT;SOR=0.718;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=146;TCF=78;TCR=68;TR=146;WE=120530981;WS=120530963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr11	120707383	rs10892628	G	A	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.78;ReadPosRankSum=-1.140;SOR=0.193;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr11	120732508	rs3824978	C	T	552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=0;PP=435;SC=TGTTAACTCCCAGAAAAACTG;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=120732516;WS=120732498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	120776001	rs2156634	G	A	4493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=90;NR=63;PP=2838;SC=TGCTGCAGGAGAACCCATATT;SOR=1.035;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=154;TCF=90;TCR=64;TR=153;WE=120776009;WS=120775991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr11	120823528	rs10750178	A	G	4227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=46;PP=2503;SC=TTGACTGAATATGTGCGGTGA;SOR=1.319;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=87;TCR=46;TR=133;WE=120823536;WS=120823518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr11	120837821	rs2276319	G	A	2625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=26;PP=1548;SC=GGGTGGCCAGGAGGTGTGCCG;SOR=1.464;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=57;TCR=27;TR=82;WE=120837829;WS=120837811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr11	120856998	rs371012924	CGGGCGGGGCGGGAG	C	3768.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=41;PP=2974;SC=GCGCAGAGGCCGGGCGGGGCG;SOR=0.997;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=48;TCF=4;TCR=44;TR=45;WE=120857019;WS=120856988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr11	120973507	rs118013075	T	C	2045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.525;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=50;PP=1379;ReadPosRankSum=-2.046;SC=GACACTTTTATTGGAACCACA;SOR=0.741;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=181;TCF=80;TCR=101;TR=89;WE=120973515;WS=120973497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,97:0.49:196
chr11	120984087	rs2298478	C	G	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.441;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=233;ReadPosRankSum=-1.329;SC=CACCCTGACTCGGCTATGAAA;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=10;WE=120984095;WS=120984085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr11	120996292	rs536069	A	G	3313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.426;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=70;PP=2029;ReadPosRankSum=-0.259;SC=TGTACCACGCAGACTGGAAGT;SOR=0.562;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=287;TCF=154;TCR=133;TR=145;WE=120996300;WS=120996282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,158:0.50:313
chr11	120998942	rs10502247	C	T	4174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=381;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.374;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=95;PP=2292;ReadPosRankSum=-0.285;SC=ACTTGGAAATCGACATCAACA;SOR=0.733;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=340;TCF=158;TCR=182;TR=179;WE=120998950;WS=120998932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,204:0.54:378
chr11	121000212	rs643744	T	G	826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.401;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=7;PP=497;ReadPosRankSum=-2.228;SC=GTTGGTATCTTTGTGGGTTCC;SOR=0.394;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=46;TCF=36;TCR=10;TR=29;WE=121000220;WS=121000202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,32:0.64:50
chr11	121000784	rs586473	T	C	3514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.217;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=84;PP=2316;ReadPosRankSum=0.482;SC=TCACTGCCTATTACCGCACCT;SOR=0.985;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=285;TCF=135;TCR=150;TR=152;WE=121000792;WS=121000774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,161:0.53:305
chr11	121032978	rs526433	G	A	5902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=97;NR=100;PP=2965;SC=GGCTGCTACAGCCACAAGAAG;SOR=0.834;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=197;TCF=97;TCR=100;TR=197;WE=121032986;WS=121032968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr11	121037529	rs2186747	C	G	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.006;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=14;PP=292;ReadPosRankSum=-0.044;SC=GCAGAGGCAGCGACAGCTTCG;SOR=0.475;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=59;TCF=23;TCR=36;TR=25;WE=121037537;WS=121037519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,28:0.44:64
chr11	121323277	rs114331262	G	A	1550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.632;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=23;PP=875;ReadPosRankSum=0.338;SC=CGCTCCGGAGGAAACGGAGCG;SOR=0.804;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=116;TCF=70;TCR=46;TR=61;WE=121323285;WS=121323267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,71:0.51:138
chr11	121361015	rs2298525	G	A	573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.971;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=454;ReadPosRankSum=-1.376;SC=GAGAAAGTAAGGTATTTATGA;SOR=0.175;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=22;WE=121361023;WS=121361005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,22:0.59:37
chr11	121367557	rs199875238	CT	C	118.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=2.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.94;ReadPosRankSum=-0.041;SOR=0.211;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr11	121367626	rs12364988	T	C	1312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=0.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.77;ReadPosRankSum=-1.138;SOR=0.591;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,66:0.39:169
chr11	121393212	rs630813	C	G	1124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=27;NR=10;PP=606;SC=CAGCTGCACTCCCCTCACACA;SOR=1.259;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=27;TCR=10;TR=37;WE=121393220;WS=121393202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr11	121403229	rs636588	T	C	7019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=115;NR=121;PP=2965;SC=TCATCACGGCTATTGCCCAGG;SOR=0.781;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=236;TCF=115;TCR=121;TR=236;WE=121403237;WS=121403219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,259:1.00:259
chr11	121403345	rs631232	T	C	1904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=24;NR=45;PP=1353;SC=TATCTCTCTATAGCACTATGT;SOR=1.352;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=70;TCF=24;TCR=46;TR=69;WE=121403353;WS=121403335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr11	121414476	rs2276346	G	T	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=72;ReadPosRankSum=-1.519;SC=ATGGATATGCGTGGACTTCCT;SOR=0.169;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=6;WE=121414484;WS=121414466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr11	121416187	rs11218325	A	C	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-3.195;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=84;ReadPosRankSum=0.221;SC=TTATTCACTCAGCAGTGTTGG;SOR=0.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=7;WE=121416195;WS=121416177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr11	121437819	rs1699107	C	G	5660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=101;PP=2965;SC=CTGTGTCAAACAAGGTACTTC;SOR=1.190;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=177;TCF=76;TCR=101;TR=177;WE=121437827;WS=121437809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr11	121445084	rs1792126	T	C	2696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=56;PP=1775;SC=TAAGGGGACATCACATCCTGA;SOR=1.469;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=32;TCR=56;TR=88;WE=121445092;WS=121445074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr11	121447807	rs1790212	A	G	2281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=49;PP=1531;SC=ACCCATTTGCAGCACACTGAC;SOR=1.639;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=25;TCR=49;TR=74;WE=121447815;WS=121447797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr11	121456962	rs1699102	C	T	2854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=33;PP=1845;SC=GCTGCCCAAACGGCACTTGCA;SOR=1.314;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=66;TCR=33;TR=99;WE=121456970;WS=121456952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr11	121458630	rs183132843	C	T	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=353;ReadPosRankSum=-0.175;SC=ACTGTTGCTTCCTGAAGCCAC;SOR=1.445;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=17;WE=121458638;WS=121458621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr11	121460664	rs1625828	G	A	1924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=17;PP=1412;SC=CTGGAACTTGGGTCTGGAGGA;SOR=2.070;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=50;TCR=17;TR=67;WE=121460672;WS=121460654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr11	121475798	rs1784929	T	A	1865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=19;PP=1167;SC=ACTTTGTTTGTCTTTTTCTCC;SOR=1.402;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=40;TCR=19;TR=59;WE=121475806;WS=121475788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr11	121483401	rs1010159	C	T	5667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=105;NR=82;PP=2965;SC=TTAGTGTGCCCCATGACTAGC;SOR=0.841;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=188;TCF=106;TCR=82;TR=187;WE=121483409;WS=121483391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr11	121483651	rs1010158	G	A	484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=13;PP=349;SC=GGTATTCTCTGGAAGCTGTTC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=121483659;WS=121483641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	121489416	rs1784933	G	A	1099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=4;PP=732;SC=CTTAAATTGGGGATTTCAAGG;SOR=3.797;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=31;WE=121489424;WS=121489406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr11	121491782	rs1792120	G	A	5573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=117;NR=69;PP=2965;SC=GTTGTATGCAGTTGCAGTCAA;SOR=1.196;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=186;TCF=117;TCR=69;TR=186;WE=121491790;WS=121491772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr11	121493001	rs1614735	T	G	2110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=40;NR=32;PP=1147;SC=TCATTCTCAATGACTTTGGAA;SOR=0.796;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=73;TCF=40;TCR=33;TR=72;WE=121493009;WS=121492991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr11	121493072	rs11454566	T	TA	679.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=448;ReadPosRankSum=0.514;SC=ATAGATAGTGTAAAAAAAAAG;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=21;WE=121493080;WS=121493062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,26:0.96:27
chr11	122022927	rs543412	C	T	1276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.272;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=25;PP=750;ReadPosRankSum=-1.165;SC=GCCCCAGGTCCGTGAGATTGC;SOR=0.544;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=108;TCF=63;TCR=45;TR=53;WE=122022935;WS=122022917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,61:0.48:126
chr11	122165766	rs532540	G	A	3429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=71;PP=2184;SC=ATGACAGTATGGACAGCCTCA;SOR=1.360;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=114;TCF=43;TCR=71;TR=114;WE=122165774;WS=122165756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr11	122172113	rs558962	T	C	496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=13;NR=2;PP=305;SC=CCAGCCTGGGTGACAGAGAGA;SOR=2.712;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=122172121;WS=122172103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	122172318	rs615683	C	T	2085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.38;SOR=2.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr11	122172321	rs693194	T	C	2053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.65;SOR=2.110;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr11	122646967	rs12790613	G	A	2634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=53;PP=1469;ReadPosRankSum=1.332;SC=AAGTGTTCAGGCAGCATGTGA;SOR=0.697;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=241;TCF=134;TCR=107;TR=119;WE=122646975;WS=122646957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,132:0.49:268
chr11	122650172	rs4935813	C	G	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.817;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=370;ReadPosRankSum=-1.380;SC=CTCCCCTTGTCTCTGAGTGAA;SOR=1.426;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=17;WE=122650180;WS=122650162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chr11	122709073	rs113585316	TG	T	467.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.041;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=373;ReadPosRankSum=0.062;SC=GTCCCCAAAATGTTCCACCAG;SOR=1.863;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=11;WE=122709081;WS=122709063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr11	122709178	rs3134425	T	C	1254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.020;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=25;PP=766;ReadPosRankSum=0.319;SC=TCTCCCCCTTTAAAAGAAACT;SOR=0.472;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=130;TCF=78;TCR=52;TR=56;WE=122709186;WS=122709168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,62:0.43:143
chr11	122738261	rs2272094	A	G	1357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=26;PP=820;ReadPosRankSum=0.504;SC=ATATGGAAGAAAGGTCAGTGG;SOR=0.711;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=46;TCR=51;TR=50;WE=122738269;WS=122738251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,58:0.51:113
chr11	122738718	rs17126930	T	C	1082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=12;PP=588;ReadPosRankSum=-0.692;SC=TCTTTTTTTGTAGAAAACGAA;SOR=0.634;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=64;TCF=45;TCR=19;TR=43;WE=122738726;WS=122738708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,50:0.67:75
chr11	122742050	rs34242434	T	C	1269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=3.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.85;ReadPosRankSum=1.182;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,62:0.53:117
chr11	122775227	rs3107630	T	C	400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=10;PP=265;SC=TGTCTAGATATCGCTTCCTTT;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=122775235;WS=122775217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	122795688	rs11218891	T	C	1675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=42;PP=1039;ReadPosRankSum=-1.619;SC=ATCCTGAAGATAAATGGCATC;SOR=0.697;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=65;TCR=82;TR=75;WE=122795696;WS=122795678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,82:0.52:159
chr11	122795782	rs11218892	G	A	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=147;ReadPosRankSum=-3.206;SC=AGTAATGATCGTGACTGAGTT;SOR=0.465;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=10;WE=122795790;WS=122795772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr11	122805053	.	TAA	T	131.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.17;ReadPosRankSum=1.033;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr11	122805057	.	TAAATAA	T	119.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.732;ClippingRankSum=-0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.55;ReadPosRankSum=1.016;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr11	122805910	rs4502006	C	A	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=240;ReadPosRankSum=0.396;SC=GTTCACCTAACAACTTCCTTA;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=8;TCR=26;TR=16;WE=122805918;WS=122805897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr11	122827905	rs143794192	ATTAAC	A	439.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.269;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.446;NF=6;NR=2;PP=395;ReadPosRankSum=-0.302;SC=AGGAGAAACAATTAACTTAAC;SOR=0.191;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=8;WE=122827917;WS=122827895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr11	122827977	rs61904391	C	T	788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.352;NF=22;NR=15;PP=526;ReadPosRankSum=0.643;SC=TGATAAGATACGCCCAGTATA;SOR=0.674;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=72;TCF=45;TCR=27;TR=37;WE=122827985;WS=122827967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,38:0.48:79
chr11	122830214	rs7107502	G	A	3240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=79;PP=2121;SC=GAAAAGAAACGCCAACCACCT;SOR=2.474;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=26;TCR=79;TR=105;WE=122830222;WS=122830204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr11	122830251	rs1057703	T	G	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=4.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.974;HP=1;HapScore=2;MGOF=38;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=336;ReadPosRankSum=-0.098;SC=AATGGCCTATTATTATCATCT;SOR=1.528;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=43;TCF=5;TCR=38;TR=17;WE=122830259;WS=122830241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,19:0.40:47
chr11	122830274	rs1057704	T	C	755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=24;PP=543;SC=CTGCCGTCCATGTTTGCTTTC;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=26;WE=122830282;WS=122830264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	122849816	rs7939002	G	A	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.786;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=319;ReadPosRankSum=1.074;SC=CCGGCCAGGTGTAGGTAATTT;SOR=1.488;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=40;TCF=35;TCR=5;TR=18;WE=122849824;WS=122849806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,21:0.50:42
chr11	122929624	rs1461496	A	G	5344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=76;NR=93;PP=2965;SC=TGGTCGCTCAAACATCCAAGG;SOR=1.081;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=170;TCF=76;TCR=94;TR=169;WE=122929632;WS=122929614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr11	123065730	rs11219061	C	A	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=197;ReadPosRankSum=0.745;SC=GGACCTCGGGCGAGCTGGGCG;SOR=0.551;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=16;WE=123065738;WS=123065720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,19:0.40:47
chr11	123154795	rs144580490	TCTTA	T	74.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=2;PP=50;ReadPosRankSum=-0.319;SC=CTTCCTTCCTTCTTACTTACT;SOR=0.446;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=5;WE=123154806;WS=123154785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr11	123154816	rs12289554	A	T	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=27.92;ReadPosRankSum=0.967;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr11	123396674	rs35709687	G	C	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=377;ReadPosRankSum=-1.048;SC=GGGAAGAAGGGGCAGTGGCAG;SOR=0.752;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=42;TCF=34;TCR=8;TR=24;WE=123396682;WS=123396664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,26:0.55:47
chr11	123455101	.	T	TG	684	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.55;FR=0.5000;HP=5;HapScore=4;MGOF=69;MMLQ=28;MQ=59.35;NF=0;NR=8;PP=684;QD=89.375;SC=GAATGGAGGTTGGGGGAAGGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=8;WE=123455117;WS=123455091;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr11	123455109	.	G	A	430	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.55;FR=0.5000;HP=3;HapScore=4;MGOF=69;MMLQ=28;MQ=59.22;NF=0;NR=6;PP=430;QD=77.4618687579;SC=GTTGGGGGAAGGGGTGTGGGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=6;WE=123455117;WS=123455091;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr11	123464637	rs1148101	G	C	902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=7;PP=551;SC=ACACCGAGGCGCCGTTCCTCA;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=29;WE=123464645;WS=123464627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	123464786	rs118067934	G	A	1438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.315;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=28;PP=749;ReadPosRankSum=1.393;SC=CTATTGTCACGCAGGTGTTAA;SOR=0.567;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=124;TCF=68;TCR=56;TR=63;WE=123464794;WS=123464776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,71:0.50:143
chr11	123474090	rs73029849	G	T	1616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=21;PP=954;ReadPosRankSum=-0.291;SC=AGAGTCGGGGGACCTGAGGGA;SOR=0.645;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=125;TCF=89;TCR=36;TR=67;WE=123474098;WS=123474080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,74:0.54:138
chr11	123475982	rs73029853	A	G	683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=12;PP=356;ReadPosRankSum=0.533;SC=ATAGTTGGCCATCTTGAACCA;SOR=0.752;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=91;TCF=59;TCR=32;TR=34;WE=123475990;WS=123475972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,37:0.37:101
chr11	123485324	rs73029866	C	T	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.503;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=376;ReadPosRankSum=0.101;SC=CTCCGCATATCGTTGCTGTCA;SOR=1.270;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=37;TCF=31;TCR=6;TR=21;WE=123485332;WS=123485314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,23:0.55:42
chr11	123524411	rs3851102	G	A	1312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=23;PP=706;ReadPosRankSum=-1.027;SC=TGTTAGCATTGTTACTGTTAC;SOR=0.647;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=79;TCR=48;TR=60;WE=123524419;WS=123524401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,68:0.49:138
chr11	123597804	rs679597	A	G	517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=15;PP=406;SC=AAGACTAAATAGAATGCCTGT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=123597812;WS=123597794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	123600475	rs1144507	A	G	5417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.358;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=98;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.033;SC=CTCAGGCTCCACTCCTAAATG;SOR=0.492;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=187;TCF=89;TCR=98;TR=186;WE=123600483;WS=123600465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,207:1.00:208
chr11	123601143	rs377230991	C	T	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.772;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=235;ReadPosRankSum=-0.923;SC=ATCCAGCCTTCCAGCAAATAG;SOR=0.340;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=20;WE=123601151;WS=123601133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,20:0.42:48
chr11	123676388	rs76301014	G	A	2396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.489;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=51;PP=1374;ReadPosRankSum=2.093;SC=GAGGGGATACGCAGGATGGTA;SOR=0.758;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=210;TCF=112;TCR=98;TR=112;WE=123676396;WS=123676378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,118:0.53:224
chr11	123753803	rs1939928	T	C	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.035;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=309;ReadPosRankSum=-0.390;SC=CAAAGCTTTTTCCATAAAGAT;SOR=0.330;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=19;WE=123753811;WS=123753793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,21:0.54:39
chr11	123753937	rs1939927	A	G	4557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=68;PP=2575;SC=ATTGCAGTGCATTCTGGTAAT;SOR=0.843;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=157;TCF=89;TCR=68;TR=157;WE=123753945;WS=123753927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr11	123754078	rs61908536	A	G	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=12;PP=168;ReadPosRankSum=0.540;SC=AAGAGATTCCAGGGAGTGGGA;SOR=0.572;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=75;TCF=31;TCR=44;TR=19;WE=123754086;WS=123754067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,16:0.21:77
chr11	123754844	rs10893099	T	C	5064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=104;PP=2965;SC=GATCCTATAATTAGAGAAGTG;SOR=1.076;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=185;TCF=79;TCR=106;TR=183;WE=123754852;WS=123754834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr11	123777049	rs10750249	G	T	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=-3.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.998;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=266;ReadPosRankSum=-0.833;SC=TTTTCATAGAGAGAAAACACT;SOR=1.519;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=13;WE=123777057;WS=123777039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr11	123777497	rs10750250	G	A	6809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.47;SOR=0.825;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr11	123777497	.	GCGATC	ACGATC,ACGATT	1232	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=85,41;NR=84,45;PP=889,1232;QD=5.46610184939;SC=GCCATGGCCTGCGATCGCTAC;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=169;TCF=85;TCR=84;TR=169,86;WE=123777510;WS=123777487;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:169
chr11	123777502	rs61907183	C	T	2048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FS=5.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.20;ReadPosRankSum=-1.324;SOR=1.006;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,96:0.52:183
chr11	123777536	rs7926767	G	A	1715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.104;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=32;PP=1121;ReadPosRankSum=-0.662;SC=CTGCTCTACAGGGTCATCATG;SOR=0.567;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=131;TCF=67;TCR=64;TR=69;WE=123777544;WS=123777526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,75:0.52:143
chr11	123777986	rs7942047	T	C	4725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=89;PP=2907;SC=ACTGTGATTCTCATGTTGAAT;SOR=1.275;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=150;TCF=61;TCR=89;TR=150;WE=123777994;WS=123777976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr11	123778031	rs7927385	G	A	1083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.705;HP=5;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=30;PP=664;ReadPosRankSum=-0.720;SC=AATGAAGTAAGAAATGCTCTG;SOR=0.913;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=89;TCF=30;TCR=59;TR=43;WE=123778039;WS=123778021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,50:0.49:102
chr11	123811344	rs11219362	C	T	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=115;ReadPosRankSum=0.983;SC=ATAGGACCCTCGAGGTAGATA;SOR=0.425;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=7;WE=123811352;WS=123811334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr11	123847473	rs55944888	A	G	1567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.569;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=28;PP=840;ReadPosRankSum=-0.536;SC=AGCATGCTTCACCTCCTTGTT;SOR=0.774;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=150;TCF=88;TCR=62;TR=71;WE=123847481;WS=123847463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,83:0.49:169
chr11	123848121	rs17686210	T	C	6398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=113;NR=98;PP=2965;SC=TGCCATGACCTTGGGCACTGT;SOR=0.710;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=211;TCF=113;TCR=98;TR=211;WE=123848129;WS=123848111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr11	123848212	rs17759513	C	T	5471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=91;PP=2965;SC=GAGTCAGAGCCCACAGTTAGG;SOR=0.831;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=182;TCF=90;TCR=92;TR=181;WE=123848220;WS=123848202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr11	123848516	rs35674999	C	A	1683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=46;PP=1037;ReadPosRankSum=-0.631;SC=GAAAGATGTACAAGTTCATCT;SOR=0.700;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=159;TCF=62;TCR=97;TR=75;WE=123848524;WS=123848506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,81:0.44:183
chr11	123886307	rs79057843	CA	TG	6593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=382;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.171;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.914;NF=90;NR=72;PP=2944;ReadPosRankSum=0.641;SC=CTCGTGACAGCATTCATCCTC;SOR=0.904;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=353;TCF=187;TCR=166;TR=162;WE=123886316;WS=123886297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:208,174:0.46:382
chr11	123886681	rs1893766	A	G	4609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=477;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.710;NF=139;NR=130;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.044;SC=GTACACCAGCATGATGAGTGG;SOR=0.692;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=544;TCF=281;TCR=263;TR=269;WE=123886689;WS=123886671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:243,234:0.49:477
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chr11	123886984	rs4936880	A	G	2161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.998;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.311;NF=47;NR=46;PP=1403;ReadPosRankSum=-2.280;SC=TGGGAGGCGCAGAGCCTTTCA;SOR=0.780;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=223;TCF=112;TCR=111;TR=93;WE=123886992;WS=123886974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,101:0.42:242
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chr11	124029541	rs4936896	A	G	2768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.932;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=47;PP=1394;ReadPosRankSum=0.288;SC=GCCACAGAGCATGTATCATCC;SOR=0.915;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=243;TCF=139;TCR=104;TR=118;WE=124029549;WS=124029531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,138:0.49:280
chr11	124086175	rs2508890	T	C	3623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=61;PP=2650;SC=CCAAAGCCTTTAGCACTTGCA;SOR=1.047;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=48;TCR=61;TR=109;WE=124086183;WS=124086165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
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chr11	124095414	rs10893172	C	G	3530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.418;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.105;NF=79;NR=73;PP=2164;ReadPosRankSum=1.334;SC=TTTCTTTCCTCCGTAGAAACT;SOR=0.649;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=273;TCF=146;TCR=127;TR=152;WE=124095422;WS=124095404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,168:0.55:304
chr11	124095525	rs11219508	T	C	1688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.759;NF=35;NR=39;PP=988;ReadPosRankSum=0.435;SC=CTCTTCCTCCTGTTCTTAGGA;SOR=0.709;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=175;TCF=84;TCR=91;TR=74;WE=124095533;WS=124095515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,84:0.43:195
chr11	124095647	rs2466615	A	C	8100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=143;NR=110;PP=2965;SC=CTTCATTGATATCTGCCATTC;SOR=0.867;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=253;TCF=143;TCR=110;TR=253;WE=124095655;WS=124095637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,285:1.00:285
chr11	124095884	rs2466614	A	G	4163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=473;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=3.002;NF=90;NR=102;PP=2596;ReadPosRankSum=1.168;SC=GGGAGTTTACATTTTAGGCAT;SOR=0.755;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=423;TCF=201;TCR=222;TR=192;WE=124095892;WS=124095874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:262,210:0.44:472
chr11	124096122	rs7946182	G	A	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=3.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.556;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-10.949;NF=19;NR=32;PP=761;ReadPosRankSum=-0.328;SC=CTCCGCATTCGCTCCACTGAG;SOR=0.855;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=149;TCF=67;TCR=82;TR=51;WE=124096130;WS=124096112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,34:0.24:142
chr11	124096195	rs7946214	G	A	1186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.398;HP=2;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.693;NF=36;NR=18;PP=862;ReadPosRankSum=0.851;SC=TTTTCTTTGGGTCTGCAGCAT;SOR=1.381;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=127;TCF=78;TCR=49;TR=54;WE=124096203;WS=124096185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,55:0.42:131
chr11	124096247	rs2466613	G	A	6884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=1.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=2.049;NF=124;NR=104;PP=2965;ReadPosRankSum=1.269;SC=CATGGACCAGGGGAAAGTGTC;SOR=0.481;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=230;TCF=126;TCR=104;TR=228;WE=124096255;WS=124096237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,253:0.99:256
chr11	124096275	rs2512268	T	C	6529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FS=0.827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.89;MQRankSum=0.214;QD=19.61;ReadPosRankSum=-0.656;SOR=0.634;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:165,168:0.50:333
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chr11	124096277	rs2466612	G	A	6291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=338;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.97;MQRankSum=0.507;QD=18.61;ReadPosRankSum=-0.224;SOR=0.672;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:172,166:0.49:338
chr11	124120302	rs2512239	A	G	324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=1;PP=239;SC=TACTCAAAGGAGATACCTAAA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=124120310;WS=124120292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	124120338	rs2512240	A	C	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.216;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=129;ReadPosRankSum=-0.565;SC=AACCTTTTCTAAATGAAGAAT;SOR=2.066;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=9;WE=124120346;WS=124120328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr11	124120821	rs12099154	T	C	2326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.612;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=52;PP=1401;ReadPosRankSum=-1.640;SC=TGCTGTACAGTGTCATCATAT;SOR=0.685;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=205;TCF=107;TCR=98;TR=103;WE=124120829;WS=124120811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,111:0.49:225
chr11	124121199	rs4268525	G	C	2189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FS=13.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.109;QD=8.94;ReadPosRankSum=1.956;SOR=1.376;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:136,109:0.44:245
chr11	124134743	rs2466637	G	A	792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.404;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=10;PP=512;ReadPosRankSum=-1.038;SC=ATAAACAAGGGATCACTTTCC;SOR=1.210;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=67;TCF=45;TCR=22;TR=32;WE=124134751;WS=124134733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,36:0.49:73
chr11	124135009	rs2512168	G	A	1326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.330;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.726;NF=28;NR=33;PP=836;ReadPosRankSum=0.618;SC=CCTATGTACTGTTTCCTCAGC;SOR=0.813;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=128;TCF=59;TCR=69;TR=61;WE=124135017;WS=124134999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,64:0.46:139
chr11	124135438	rs2512167	G	A	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.929;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.791;NF=10;NR=16;PP=320;ReadPosRankSum=0.764;SC=ATCTTTAGTGGAATTAACATC;SOR=0.818;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=25;TCR=42;TR=26;WE=124135446;WS=124135428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,28:0.37:76
chr11	124135481	rs2466701	C	T	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=11;PP=264;ReadPosRankSum=-2.461;SC=TCAGCTCTTACATCTTCATCA;SOR=0.560;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=46;TCF=18;TCR=28;TR=19;WE=124135489;WS=124135471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,20:0.40:50
chr11	124135662	rs2512166	A	G	2645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=0.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.401;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.218;NF=62;NR=53;PP=1579;ReadPosRankSum=0.994;SC=TGTGTTTTATACTATTGTTGT;SOR=0.610;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=246;TCF=136;TCR=110;TR=115;WE=124135670;WS=124135652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,131:0.45:290
chr11	124266912	rs28398895	A	G	4350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=411;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.181;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.051;NF=99;NR=89;PP=2928;ReadPosRankSum=1.462;SC=TCAACATGTAACATTCAGAGA;SOR=0.863;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=380;TCF=194;TCR=186;TR=188;WE=124266920;WS=124266902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:209,202:0.49:411
chr11	124267177	rs61910862	T	C	1639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-0.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.051;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-12.699;NF=52;NR=70;PP=2914;ReadPosRankSum=-2.635;SC=GAGGGGTTGCTGGAACTCTGG;SOR=1.084;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=281;TCF=127;TCR=154;TR=122;WE=124267197;WS=124267167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:177,95:0.35:272
chr11	124267189	rs507335	T	C	1032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=0.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.272;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-11.255;NF=35;NR=61;PP=2914;ReadPosRankSum=-0.755;SC=GAACTCTGGATGATCTGTTAA;SOR=1.360;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=247;TCF=100;TCR=147;TR=96;WE=124267197;WS=124267167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,65:0.29:227
chr11	124293767	rs2188707	G	A	1068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=3;PP=820;SC=AAATTCCTCCGCCTATAAATA;SOR=3.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=34;WE=124293775;WS=124293757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr11	124294236	rs4057749	A	G	1420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=33;PP=904;ReadPosRankSum=0.930;SC=AGAACGTCACACAGATAATGG;SOR=0.660;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=118;TCF=58;TCR=60;TR=64;WE=124294244;WS=124294226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,68:0.54:125
chr11	124294349	rs7116575	C	A	1991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.636;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=39;PP=1371;ReadPosRankSum=-2.152;SC=CAGCAGAAAGCAGACCCTTGG;SOR=0.826;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=206;TCF=118;TCR=88;TR=91;WE=124294357;WS=124294339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,96:0.42:226
chr11	124294377	rs4057750	A	G	2068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.478;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=45;PP=1351;ReadPosRankSum=0.219;SC=GTGACCATGTAGAGCAGGGGG;SOR=0.732;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=210;TCF=111;TCR=99;TR=94;WE=124294385;WS=124294367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,102:0.44:234
chr11	124294703	rs10750270	T	C	1244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.870;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=27;PP=645;ReadPosRankSum=0.384;SC=GAGCTGGAGCTCTGGCTGTTC;SOR=0.414;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=86;TCF=32;TCR=54;TR=47;WE=124294711;WS=124294693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,56:0.57:99
chr11	124440362	rs55861866	C	G	1338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=29;PP=857;ReadPosRankSum=-0.292;SC=TACATGCTGACAGTGATGGCC;SOR=0.681;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=147;TCF=79;TCR=68;TR=63;WE=124440370;WS=124440352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,67:0.42:161
chr11	124440617	rs12792184	C	T	2143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.164;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=38;PP=1356;ReadPosRankSum=0.572;SC=GTCTTCTTTTCGGCTGGATTC;SOR=0.931;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=185;TCF=106;TCR=79;TR=94;WE=124440625;WS=124440607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,101:0.50:203
chr11	124494780	rs113773557	A	AT	533.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=1;PP=459;SC=TAATAATGTGATTTTTTTATT;SOR=4.514;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=17;WE=124494788;WS=124494770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	124539236	rs512225	C	T	1320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=28;PP=812;ReadPosRankSum=0.401;SC=AATAGCTGAACGGAAGATGGG;SOR=0.679;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=172;TCF=98;TCR=74;TR=67;WE=124539244;WS=124539226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,71:0.38:188
chr11	124623492	rs12541	T	C	981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.627;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=18;PP=693;ReadPosRankSum=-1.871;SC=GAGGTGACCCTTATAGGAAGG;SOR=0.492;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=101;TCF=64;TCR=37;TR=46;WE=124623500;WS=124623482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,47:0.44:107
chr11	124624150	rs12792040	G	A	3480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.497;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=65;PP=2072;ReadPosRankSum=-0.527;SC=TTGCCCCGGCGGTGGTACAAG;SOR=0.564;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=272;TCF=151;TCR=121;TR=145;WE=124624158;WS=124624140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,161:0.54:299
chr11	124624705	rs72422616	TA	T	118.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=1.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.21;MQRankSum=-0.648;QD=3.30;ReadPosRankSum=0.470;SOR=1.038;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,12:0.33:36
chr11	124626167	rs139265422	G	A	1636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=26;PP=1060;ReadPosRankSum=2.837;SC=ATTGGACAGCGGGCTTACTCC;SOR=0.708;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=156;TCF=99;TCR=57;TR=71;WE=124626187;WS=124626157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,77:0.45:171
chr11	124739988	rs4936957	T	C	8466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=145;NR=128;PP=2965;SC=ATTTTGACATTATGGGAACAG;SOR=0.775;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=273;TCF=145;TCR=128;TR=273;WE=124739996;WS=124739978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,302:1.00:302
chr11	124740410	rs3923890	A	T	1887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=12;PP=1175;SC=CCTGTCTTTAAGTACCTTGAC;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=48;TCR=12;TR=60;WE=124740418;WS=124740400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr11	124740691	rs7925879	A	G	605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=11;PP=380;SC=ATGGTTGGCAAGAGACTGAGG;SOR=2.419;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=15;WE=124740699;WS=124740681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	124747333	rs10790713	A	G	479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=12;PP=402;SC=ACTGTCCTGAAACTCCCGAAT;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=124747341;WS=124747323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	124747837	rs7933204	G	A	9871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=374;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=162;NR=180;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.063;SC=CTGCAGAAGCGGGAATCTCCC;SOR=0.796;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=344;TCF=163;TCR=181;TR=342;WE=124747845;WS=124747824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,366:0.99:368
chr11	124749584	rs3802905	C	G	1108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=24;PP=779;ReadPosRankSum=1.745;SC=CAATCTTGGGCTGTTCATTGG;SOR=0.742;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=109;TCF=61;TCR=48;TR=53;WE=124749592;WS=124749574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,54:0.47:115
chr11	124750232	rs4366494	C	T	483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=1;PP=407;SC=AGAGCTGAGCCTGTGGTCAGG;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=124750240;WS=124750226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	124766591	rs4078483	C	G	5289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=87;NR=84;PP=2839;SC=GAAGGTGACACGGAGCAGGGC;SOR=0.843;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=171;TCF=87;TCR=84;TR=171;WE=124766599;WS=124766581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr11	124789755	rs3802904	T	C	3701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.259;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=61;PP=1769;ReadPosRankSum=-0.654;SC=GAGGAGGGAATGGAATACACA;SOR=0.427;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=63;TCR=61;TR=123;WE=124789763;WS=124789745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,143:0.99:144
chr11	124789828	rs78859654	A	T	894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=19;PP=474;ReadPosRankSum=0.052;SC=GATTACTGCCACTCCTATGAA;SOR=0.765;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=69;TCF=34;TCR=35;TR=37;WE=124789836;WS=124789818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,43:0.54:80
chr11	124792173	rs10893304	C	G	720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.748;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=11;PP=446;ReadPosRankSum=3.250;SC=GTGCCAAAACCGTTGGGGACT;SOR=0.318;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=74;TCF=54;TCR=20;TR=33;WE=124792181;WS=124792163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,37:0.45:82
chr11	124792540	rs78569253	C	A	562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=334;ReadPosRankSum=-1.264;SC=GGGGAAGGGTCCCTGCAGAGC;SOR=0.813;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=20;WE=124792548;WS=124792530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,24:0.59:41
chr11	124792627	rs11826299	G	A	2100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.710;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=33;PP=1280;ReadPosRankSum=-1.194;SC=GTGATTGGGTGGCTGGGAGCT;SOR=0.940;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=205;TCF=125;TCR=80;TR=92;WE=124792635;WS=124792617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,104:0.45:233
chr11	124793682	rs10790715	T	C	6132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=117;NR=96;PP=2965;SC=TTCTCCACCATGCAGCTGTAC;SOR=0.772;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=213;TCF=117;TCR=96;TR=213;WE=124793690;WS=124793672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr11	124793716	rs10790716	G	A	2413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.565;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=51;PP=1481;ReadPosRankSum=-1.602;SC=CCATGAGCACGCGGGTGATGG;SOR=0.618;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=217;TCF=117;TCR=100;TR=109;WE=124793724;WS=124793706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,117:0.49:237
chr11	124794688	rs112686308	C	T	2947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.327;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=61;PP=1806;ReadPosRankSum=-0.910;SC=AGATCTCGACCTCATAGGTGC;SOR=0.658;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=292;TCF=150;TCR=142;TR=131;WE=124794696;WS=124794678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,144:0.45:322
chr11	124824839	rs12272437	T	C	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=230;ReadPosRankSum=0.627;SC=ATGGTGGGGTTCCCCACCACC;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=13;WE=124824847;WS=124824829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,14:0.33:43
chr11	124829914	rs7482800	T	A	791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.297;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=23;PP=523;ReadPosRankSum=0.962;SC=GTACCTGTTCTTTTTATTTTA;SOR=1.095;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=55;TCF=22;TCR=33;TR=36;WE=124829922;WS=124829904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,36:0.60:60
chr11	124856587	rs11219860	T	G	454.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=3.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.00;ReadPosRankSum=-0.853;SOR=0.291;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,20:0.31:65
chr11	124856610	rs11219863	T	C	1269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=8.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.94;ReadPosRankSum=-0.803;SOR=0.298;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,49:0.35:142
chr11	124856951	rs4608089	C	T	738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=5;PP=525;SC=TTTGATATTTCGATTATTTTG;SOR=2.494;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=22;WE=124856959;WS=124856941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	124857708	rs4936966	G	A	6177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-2.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=522;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=128;NR=126;PP=2962;ReadPosRankSum=1.773;SC=AAATATCAAGGCCAGGATTTT;SOR=0.725;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=455;TCF=235;TCR=220;TR=254;WE=124857716;WS=124857698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:232,290:0.56:522
chr11	124862514	rs6590113	A	G	2316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.425;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=44;PP=1393;ReadPosRankSum=0.343;SC=GAGTGAGAGAAGAATTGCCTC;SOR=0.922;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=246;TCF=136;TCR=110;TR=107;WE=124862530;WS=124862504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,114:0.44:262
chr11	124863136	rs7951202	C	A	1428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.622;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=30;PP=884;ReadPosRankSum=-0.975;SC=CTGGAGTGCCCTTGGTATGTT;SOR=0.593;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=129;TCF=67;TCR=62;TR=62;WE=124863144;WS=124863126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,68:0.48:142
chr11	124863249	rs11219864	G	C	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=190;ReadPosRankSum=-0.735;SC=AAGATTGACAGGGCAATGTAA;SOR=1.230;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=14;WE=124863257;WS=124863239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr11	124873610	rs12793774	T	C	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=69;ReadPosRankSum=-0.499;SC=TTCATTCTTTTTTGATTTTAT;SOR=0.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=5;WE=124873618;WS=124873609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr11	124873755	rs72518768	CT	C	3124.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.620;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.203;NF=20;NR=36;PP=1912;ReadPosRankSum=-0.309;SC=ACTGGACCTTCTTAACAGGCT;SOR=0.841;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=131;TCF=40;TCR=91;TR=56;WE=124873763;WS=124873745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,104:0.46:228
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chr11	124875124	rs35971753	T	C	631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=16;PP=259;ReadPosRankSum=-0.120;SC=TTATTCGATCTGCTCTGTGAG;SOR=0.791;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=28;TCR=38;TR=28;WE=124875132;WS=124875114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,34:0.43:79
chr11	124908352	rs7107487	T	C	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.224;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=234;ReadPosRankSum=0.086;SC=AGAGCAAGAATGTTATGCTGC;SOR=1.371;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=43;TCF=30;TCR=13;TR=19;WE=124908360;WS=124908342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,22:0.45:49
chr11	124910335	rs4491235	G	A	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=193;ReadPosRankSum=0.876;SC=CTCACAGAGTGCTTGTCATAT;SOR=0.616;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=11;WE=124910343;WS=124910325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr11	124933223	rs201307672	GCCT	G	5298.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.529;NF=11;NR=59;PP=2827;ReadPosRankSum=0.293;SC=CAGCTCTGTAGCCTCCTCCGT;SOR=0.686;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=172;TCF=44;TCR=128;TR=70;WE=124933233;WS=124933213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,139:0.46:300
chr11	124933351	rs12791554	C	T	930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.729;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=24;PP=535;ReadPosRankSum=-1.288;SC=GGAGGCGTGCCGGGACCTCCT;SOR=0.517;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=89;TCF=28;TCR=61;TR=38;WE=124933359;WS=124933341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,44:0.44:101
chr11	124947396	rs55752830	A	G	2042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.022;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=49;PP=1191;ReadPosRankSum=-1.863;SC=CGCCTTCCTCATCGCCTATGC;SOR=0.618;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=207;TCF=90;TCR=117;TR=90;WE=124947404;WS=124947386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,102:0.44:233
chr11	124950488	rs112513477	C	T	936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.339;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=19;PP=552;ReadPosRankSum=0.035;SC=TATACCTCTTCCCTTCTCTCC;SOR=0.473;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=119;TCF=74;TCR=45;TR=45;WE=124950496;WS=124950478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,52:0.39:132
chr11	124951467	rs4396301	C	G	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=80;ReadPosRankSum=0.344;SC=CTGACCTCACCGACCCAGTGC;SOR=0.340;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=7;WE=124951475;WS=124951457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr11	124954282	rs948270	A	G	2016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.893;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=48;PP=1155;ReadPosRankSum=0.160;SC=CCTCTGGCCTATGTGCACGTC;SOR=0.340;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=159;TCF=65;TCR=94;TR=89;WE=124954290;WS=124954272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,97:0.55:175
chr11	124954652	rs4936976	G	C	1815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.174;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=35;PP=1248;ReadPosRankSum=-1.396;SC=GATGGTTGTTGCAGACCTCAG;SOR=0.798;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=164;TCF=94;TCR=70;TR=83;WE=124954660;WS=124954642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,86:0.49:176
chr11	124955032	rs948268	T	C	1069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.663;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=30;PP=703;ReadPosRankSum=-1.577;SC=TCTCTGCTGATCTGGTGAGTG;SOR=0.775;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=115;TCF=48;TCR=67;TR=50;WE=124955040;WS=124955022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,56:0.43:131
chr11	124955977	rs3808995	C	T	1517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.001;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=33;PP=967;ReadPosRankSum=-0.525;SC=ATCAGCCCAGCGCTCAGTTTC;SOR=0.873;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=141;TCF=68;TCR=73;TR=61;WE=124955985;WS=124955967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,69:0.44:157
chr11	124958122	rs3802808	A	G	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.172;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=284;ReadPosRankSum=-2.665;SC=ACAAGCAGGGAAGGCAAACCC;SOR=0.313;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=43;TCF=9;TCR=34;TR=18;WE=124958130;WS=124958112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,20:0.44:45
chr11	124967774	rs2186888	G	A	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.373;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=146;ReadPosRankSum=0.349;SC=AGTCTCCTCTGTACATGAGAA;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=8;WE=124967782;WS=124967764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr11	124972208	rs14065	A	G	1432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=1.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.02;ReadPosRankSum=-3.018;SOR=0.562;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,72:0.50:143
chr11	124972377	rs2155663	C	T	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.048;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=234;ReadPosRankSum=0.811;SC=AACCCAAAGCCTTTCTCTTTG;SOR=1.473;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=11;WE=124972385;WS=124972367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr11	124972518	rs2155664	A	G	3132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FS=1.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.99;ReadPosRankSum=-0.486;SOR=0.592;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:122,87:0.42:209
chr11	124972522	rs2155665	T	C	3061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.46;ReadPosRankSum=-0.478;SOR=0.650;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:116,82:0.41:198
chr11	125009370	rs56165462	C	A	5322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=83;PP=2965;SC=TCTGGAGAGGCTGTGTGGCCA;SOR=0.775;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=187;TCF=104;TCR=83;TR=187;WE=125009378;WS=125009360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr11	125009529	rs11219919	G	A	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.236;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=276;ReadPosRankSum=0.444;SC=CCCTTCCTCTGTCCGGGACAG;SOR=0.395;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=46;TCF=13;TCR=33;TR=22;WE=125009537;WS=125009519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,22:0.43:51
chr11	125255715	rs3740892	A	G	1386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=33;PP=770;ReadPosRankSum=0.282;SC=ATTTACCAACAAAAGGTTTTG;SOR=0.642;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=31;TCR=61;TR=50;WE=125255723;WS=125255705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,61:0.56:108
chr11	125298871	rs595849	A	G	5127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=107;NR=52;PP=2965;SC=AGATCAGCATATGCCCAGCCC;SOR=1.395;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=159;TCF=107;TCR=52;TR=159;WE=125298879;WS=125298861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr11	125326058	rs679182	G	C	1607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.386;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=41;PP=828;ReadPosRankSum=-0.419;SC=GAGCCCGCTGGGGAGGCTCCT;SOR=0.827;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=120;TCF=48;TCR=72;TR=66;WE=125326066;WS=125326048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,77:0.57:136
chr11	125351472	rs597570	A	T	1067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.829;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=25;PP=743;ReadPosRankSum=1.861;SC=CGATGTTTGGATCCCTCCAGT;SOR=0.541;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=77;TCF=39;TCR=38;TR=48;WE=125351480;WS=125351462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,49:0.57:86
chr11	125365285	rs11220099	T	C	4429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=396;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.690;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=89;PP=2791;ReadPosRankSum=-0.961;SC=CTGTGATACCTCCTCGACGCC;SOR=0.682;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=349;TCF=177;TCR=172;TR=186;WE=125365293;WS=125365275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:184,212:0.54:396
chr11	125442503	rs369141998	CT	C	444.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=0.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.39;ReadPosRankSum=1.061;SOR=0.824;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,39:0.30:131
chr11	125442621	rs7101969	A	G	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=2.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.16;ReadPosRankSum=-1.165;SOR=0.264;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr11	125443429	rs1284351	T	C	2217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.136;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=38;PP=1264;ReadPosRankSum=-1.389;SC=TGCTTGAGTCTGGGAGTATGA;SOR=1.127;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=196;TCF=110;TCR=86;TR=99;WE=125443437;WS=125443419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,108:0.50:217
chr11	125443473	rs1284352	A	C	2710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.744;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=58;PP=1541;ReadPosRankSum=1.245;SC=CCAGTGCACTATAGCAGGGCA;SOR=0.441;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=197;TCF=89;TCR=108;TR=112;WE=125443481;WS=125443463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,126:0.57:221
chr11	125452300	rs55912941	A	AC	3649.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=16;NR=33;PP=2322;SC=TGAAGCAAAGACCCTGGCAAA;SOR=0.999;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=53;TCF=19;TCR=34;TR=49;WE=125452321;WS=125452289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr11	125452313	rs4627097	A	G	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQRankSum=-1.571;QD=7.92;ReadPosRankSum=1.760;SOR=0.631;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,45:0.45:101
chr11	125462162	rs573173	A	G	4097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=48;PP=2455;SC=GCAGTTACCAAGGCACAGTAA;SOR=1.371;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=88;TCR=48;TR=136;WE=125462170;WS=125462152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr11	125467144	rs513209	C	A	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.121;HP=9;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.736;NF=6;NR=24;PP=488;ReadPosRankSum=1.174;SC=GAAAAAAAAACCCTTAAATTC;SOR=0.954;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=77;TCF=17;TCR=60;TR=30;WE=125467152;WS=125467133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,28:0.37:76
chr11	125478209	rs6590153	C	T	567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.511;HP=6;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.696;NF=7;NR=16;PP=344;ReadPosRankSum=0.587;SC=CAGCTTTTTTCCTTTTTTCTT;SOR=1.112;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=34;TCF=11;TCR=23;TR=23;WE=125478225;WS=125478199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,25:0.71:35
chr11	125479363	rs2241502	G	A	1606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.612;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=35;PP=935;ReadPosRankSum=-0.362;SC=GTTTCTACTCGCTGCTGGATC;SOR=0.530;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=141;TCF=80;TCR=61;TR=71;WE=125479371;WS=125479353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,78:0.48:161
chr11	125479496	rs2241501	C	T	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.404;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=19;PP=509;ReadPosRankSum=1.747;SC=TATGTGGCCTCGTGTTCTGAA;SOR=0.466;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=110;TCF=56;TCR=54;TR=41;WE=125479504;WS=125479486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,44:0.35:127
chr11	125489788	rs525186	A	C	534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.386;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=354;ReadPosRankSum=0.734;SC=TCTACTCTCAACAAATTGCAG;SOR=0.358;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=55;TCF=47;TCR=8;TR=23;WE=125489796;WS=125489778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,25:0.41:61
chr11	125497466	rs491528	G	T	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.958;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=5;PP=460;ReadPosRankSum=-0.416;SC=TAGAAGAAATGGAATTCTGTA;SOR=1.284;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=26;WE=125497474;WS=125497456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,26:0.59:44
chr11	125514274	rs541725	T	A	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.702;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=275;ReadPosRankSum=0.245;SC=TCACATGTATTCTTTTTTGGT;SOR=0.846;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=34;TCF=19;TCR=15;TR=15;WE=125514282;WS=125514264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,15:0.45:33
chr11	125525195	rs506504	A	G	7385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=122;NR=120;PP=2965;SC=CAGCCAGAAGATTTGGCTTCC;SOR=0.761;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=242;TCF=122;TCR=120;TR=242;WE=125525203;WS=125525185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,273:1.00:273
chr11	125616379	rs76179820	A	G	1650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.102;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=33;PP=1044;ReadPosRankSum=0.467;SC=TTCTAATGTTATGCCTTCTAC;SOR=0.314;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=106;TCF=60;TCR=46;TR=68;WE=125616387;WS=125616369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,72:0.63:115
chr11	125616483	rs498803	G	T	9398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=107;NR=88;PP=2965;SC=TTGAGTGGATGTTCATAGAAG;SOR=0.786;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=196;TCF=107;TCR=89;TR=195;WE=125616491;WS=125616473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr11	125616502	rs2553829	T	A	9431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=99;NR=93;PP=2965;SC=AGCTTTGAGATGGGGTTTGGA;SOR=0.711;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=194;TCF=100;TCR=94;TR=192;WE=125616510;WS=125616492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr11	125617376	rs5795459	CT	C	992.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=18;PP=738;SC=ATTCCTCCACCTTTCTTTCCC;SOR=2.546;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=19;WE=125617384;WS=125617366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr11	125617610	rs2114084	A	G	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.473;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=346;ReadPosRankSum=-0.117;SC=GAAATTGTTCAGTGTAGGATG;SOR=1.188;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=48;TCF=34;TCR=14;TR=25;WE=125617618;WS=125617600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,28:0.52:54
chr11	125617908	rs2282539	G	A	482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=15;PP=370;SC=GAGGGTGGGGGCCTACAGCTA;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=125617916;WS=125617898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	125618709	.	TCA	T	184	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;FR=0.5000;HP=8;HapScore=2;MGOF=19;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=5;PP=184;QD=38.0;SC=CTAAAAAAAATCACACACACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=5;WE=125618718;WS=125618699;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr11	125618728	rs35822751	CA	C	198.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.896;SOR=0.275;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr11	125618730	rs374899259	CT	C	198.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.569;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.42;ReadPosRankSum=0.613;SOR=0.346;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr11	125618731	rs7939499	T	C	160.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=13;PP=375;ReadPosRankSum=-0.666;SC=ACACACACACTACAGAAGAGG;SOR=1.230;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=19;WE=125618739;WS=125618721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr11	125647712	rs522690	T	C	1915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=17;PP=1187;SC=AAAAGAACACTACTGTTTCTC;SOR=1.576;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=44;TCR=17;TR=61;WE=125647720;WS=125647702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr11	125648216	rs517463	C	T	130.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.18;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	125648503	rs494361	G	A	8516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=153;NR=137;PP=2965;SC=CCATGTTACAGTCTCACATAC;SOR=0.725;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=290;TCF=153;TCR=137;TR=290;WE=125648511;WS=125648493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,321:1.00:321
chr11	125659423	rs495869	A	C	4173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=69;PP=2400;SC=AGGGTCAGGGAAGGTGTTGTA;SOR=0.900;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=65;TCR=69;TR=134;WE=125659431;WS=125659413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr11	125707761	rs11220236	A	C	4333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=55;PP=2260;SC=TCCACCCTGCAGTTATGGGTC;SOR=1.130;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=89;TCR=55;TR=144;WE=125707769;WS=125707751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr11	125708198	rs10160391	C	T	3641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=41;PP=1967;SC=TCTTCATTTTCAGGAGACAAA;SOR=1.095;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=71;TCR=41;TR=112;WE=125708206;WS=125708188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr11	125763746	rs3088241	C	G	9732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=361;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=170;NR=154;PP=2965;SC=AATTAGTATTCTCTTCCTCTA;SOR=0.756;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=324;TCF=170;TCR=154;TR=324;WE=125763754;WS=125763736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,361:1.00:361
chr11	125766044	rs549990	C	A	8957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=148;NR=151;PP=2965;SC=CCAGCTCCTGCTGAATTTTCT;SOR=0.781;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=299;TCF=148;TCR=151;TR=299;WE=125766052;WS=125766034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,330:1.00:330
chr11	125766173	rs622756	A	C	4436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=74;PP=2649;SC=GTGTCATTATAAGCCATGATA;SOR=1.319;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=129;TCF=55;TCR=74;TR=129;WE=125766181;WS=125766163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr11	125766204	rs600761	G	C	5254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.43;SOR=1.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr11	125766207	rs471980	C	T	3084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.82;ReadPosRankSum=-0.977;SOR=1.449;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,113:0.98:115
chr11	125769354	rs667782	T	C	2803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.201;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=68;PP=1501;ReadPosRankSum=-0.380;SC=TACCCACATCTGTGCAGGGCA;SOR=1.080;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=255;TCF=120;TCR=135;TR=120;WE=125769362;WS=125769344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,138:0.48:285
chr11	125776216	rs34692223	A	ATT	1302.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;NF=2;NR=25;PP=394;SC=GATATTCAATATTTTTTTTTG;SOR=1.542;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=27;WE=125776224;WS=125776206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr11	125776259	rs681416	G	C	411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=18;PP=385;SC=CTGTCCCCCAGGCTGGAGTGC;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=125776267;WS=125776249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	125778074	rs5795465	AT	A	3093.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.283;NF=33;NR=38;PP=1110;ReadPosRankSum=0.984;SC=TAAGTGTTTGATTTTTTTTTT;SOR=0.729;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=87;TCF=39;TCR=48;TR=71;WE=125778083;WS=125778064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,127:0.97:131
chr11	125780194	rs2272104	C	T	546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=1;PP=370;SC=ATTTTTATTGCAGTTGAAATT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=125780202;WS=125780184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	125788678	rs683155	T	C	7711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=124;NR=148;PP=2965;SC=CTAATGTTTGTGCCCGAGGTG;SOR=0.962;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=272;TCF=124;TCR=148;TR=272;WE=125788686;WS=125788668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,291:1.00:291
chr11	125810571	rs4937070	T	C	1234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.87;ReadPosRankSum=-0.109;SOR=0.678;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,63:0.61:104
chr11	125810663	.	C	CT	43	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5056;HP=14;HapScore=2;MGOF=18;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=43;QD=11.75;SC=AATTTTCTAACTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=4;WE=125810671;WS=125810653;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr11	125825412	rs73019364	A	C	366.98	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=238;ReadPosRankSum=1.116;SC=GTGAGTGTGGAACCCCAGTCA;SOR=1.292;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=13;WE=125825420;WS=125825402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,15:0.94:16
chr11	125830970	rs684535	A	T	5095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=80;PP=2965;SC=TACAATGTTGATCTCTGTTTC;SOR=0.826;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=176;TCF=96;TCR=80;TR=176;WE=125830978;WS=125830960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr11	125831701	rs2276061	G	A	7540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=133;NR=117;PP=2965;SC=GCTGAGTAGGGACTGGTTCCA;SOR=0.738;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=250;TCF=133;TCR=117;TR=250;WE=125831709;WS=125831691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,272:1.00:272
chr11	125848419	rs636641	A	C	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=302;ReadPosRankSum=0.796;SC=ACCAACTCCCAGAGCAACGTC;SOR=0.760;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=56;TCF=11;TCR=45;TR=23;WE=125848427;WS=125848409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,28:0.44:64
chr11	125850881	rs611548	C	G	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=5;PP=485;ReadPosRankSum=0.353;SC=GCATGCTGTCCCTGTTCTAGT;SOR=0.919;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=55;TCF=45;TCR=10;TR=30;WE=125850889;WS=125850871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,31:0.54:57
chr11	125851055	rs564214	A	G	1781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.601;HP=2;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=37;PP=1067;ReadPosRankSum=0.452;SC=CATTGACTGCATTGGGGACCT;SOR=0.800;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=136;TCF=67;TCR=69;TR=72;WE=125851063;WS=125851045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,84:0.55:153
chr11	125851181	rs684805	G	A	1967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=39;PP=883;ReadPosRankSum=1.978;SC=CCATCTGCCCGTTCATATCTG;SOR=0.721;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=186;TCF=92;TCR=94;TR=80;WE=125851189;WS=125851171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,100:0.48:209
chr11	125851300	rs624070	T	C	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=186;ReadPosRankSum=0.123;SC=CACACACGCATGCACACATGC;SOR=0.553;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=13;WE=125851308;WS=125851290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr11	125864972	rs138741332	AAAC	A	271.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.036;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.98;ReadPosRankSum=0.850;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr11	125867053	rs11220309	G	T	1837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=12;PP=1315;SC=TAAATATATGGATCTAAAGTT;SOR=2.531;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=50;TCR=12;TR=62;WE=125867061;WS=125867043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr11	125873639	rs512761	G	T	139.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=5;NR=0;PP=109;SC=TGCTTGAACCGGGGAGGCGGA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=125873647;WS=125873629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	126045822	rs560813	T	C	1169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.445;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=27;PP=762;ReadPosRankSum=-0.005;SC=GGGTGTCTGTTCACCTTTCTG;SOR=0.376;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=112;TCF=52;TCR=60;TR=54;WE=126045830;WS=126045812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,56:0.43:129
chr11	126045882	rs75462411	C	T	791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.961;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=20;PP=488;ReadPosRankSum=0.895;SC=TTCTGGACTCCCCACGTGTCT;SOR=0.516;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=61;TCF=22;TCR=39;TR=33;WE=126045890;WS=126045872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,35:0.51:69
chr11	126080757	rs608367	T	C	1389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=25;PP=746;ReadPosRankSum=-0.687;SC=AGCTGCAGGTTCCTCCACCTT;SOR=0.727;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=140;TCF=79;TCR=61;TR=60;WE=126080765;WS=126080747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,72:0.44:165
chr11	126081336	rs587891	T	C	1457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.980;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=24;PP=743;ReadPosRankSum=0.124;SC=CTGGTCCCTTTGGACTCACCG;SOR=0.483;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=136;TCF=87;TCR=49;TR=63;WE=126081344;WS=126081326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,69:0.46:149
chr11	126081403	rs2282580	T	C	2649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.923;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=53;PP=1335;ReadPosRankSum=-1.529;SC=CGCTAATCTCTGGGCATTTAT;SOR=0.588;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=270;TCF=156;TCR=114;TR=122;WE=126081411;WS=126081393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,137:0.46:299
chr11	126134698	rs638766	T	C	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=325;ReadPosRankSum=-1.818;SC=ACATCTGTTATCCAAAAGCAG;SOR=0.446;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=18;WE=126134706;WS=126134688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr11	126138453	rs12786155	C	T	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=312;ReadPosRankSum=2.053;SC=AAGCGGAGTCCGGGTTACGCG;SOR=1.259;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=41;TCF=33;TCR=8;TR=21;WE=126138461;WS=126138443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr11	126139100	rs1786702	T	C	812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=4;PP=518;ReadPosRankSum=0.243;SC=CTCAGAGGGGTTATGATTCGG;SOR=0.892;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=53;TCF=44;TCR=9;TR=29;WE=126139108;WS=126139090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,33:0.58:57
chr11	126139313	rs1786703	T	A	1691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.256;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=37;PP=926;ReadPosRankSum=0.623;SC=GGAAGGGGGTTAGCTTACCTA;SOR=0.586;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=142;TCF=64;TCR=78;TR=69;WE=126139321;WS=126139303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,78:0.49:159
chr11	126142984	rs180800246	A	G	1438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.116;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=38;PP=908;ReadPosRankSum=-0.808;SC=TGTAGGTGCAATGATATCCGG;SOR=0.925;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=132;TCF=54;TCR=78;TR=63;WE=126142992;WS=126142974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,68:0.46:149
chr11	126145931	rs2276025	T	C	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.971;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=15;PP=517;ReadPosRankSum=-0.587;SC=GCCTTCCCACTCCTCACCCTC;SOR=0.737;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=94;TCF=47;TCR=47;TR=37;WE=126145939;WS=126145921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,40:0.38:106
chr11	126146244	rs56321210	C	T	1185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=12;PP=1057;SC=GGAGGGTTGCCGGCCATGCTG;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=42;TCR=12;TR=54;WE=126146252;WS=126146234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr11	126160687	rs1893352	A	G	1429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=29;PP=918;ReadPosRankSum=1.070;SC=CTCTCTCTCTACCCTCTGTAG;SOR=0.708;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=159;TCF=94;TCR=65;TR=68;WE=126160695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,72:0.40:179
chr11	126161490	rs614700	T	C	912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.472;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=28;PP=465;ReadPosRankSum=-1.206;SC=CGAAGCTCTCTGCTCCTCAGC;SOR=0.848;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=119;TCF=47;TCR=72;TR=46;WE=126161498;WS=126161480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,51:0.40:128
chr11	126162607	rs3802814	G	A	1936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.140;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=34;PP=1183;ReadPosRankSum=0.492;SC=TGGCCGCCCAGGACCTGGTCT;SOR=0.787;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=161;TCF=93;TCR=68;TR=81;WE=126162615;WS=126162597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,91:0.49:184
chr11	126162843	rs8177374	C	T	3234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=59;PP=1907;ReadPosRankSum=-0.287;SC=CCCCTGCTGTCGGGCCTCAGC;SOR=0.683;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=264;TCF=147;TCR=117;TR=136;WE=126162851;WS=126162833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,151:0.53:285
chr11	126163124	rs609634	C	T	891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=10;PP=609;ReadPosRankSum=-0.074;SC=AGTAACTTGGCCAAGTTACTC;SOR=0.777;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=84;TCF=58;TCR=26;TR=36;WE=126163132;WS=126163114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,40:0.44:90
chr11	126163691	rs611953	A	G	730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.394;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=22;PP=461;ReadPosRankSum=-0.364;SC=GGAGTGAGTCACAGCGCTTTG;SOR=1.242;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=80;TCF=31;TCR=49;TR=33;WE=126163699;WS=126163681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,36:0.43:84
chr11	126164349	rs625413	T	C	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=2.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=241;ReadPosRankSum=0.177;SC=CAGGGTTCAATGCCTTCACCT;SOR=0.404;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=15;WE=126164357;WS=126164339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr11	126176578	rs637462	G	A	1704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.920;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=26;PP=828;ReadPosRankSum=1.200;SC=CTGAGCTCCAGTTGCAGTTCT;SOR=0.898;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=141;TCF=83;TCR=58;TR=69;WE=126176586;WS=126176568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,84:0.50:168
chr11	126213395	rs240536	T	C	2347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.500;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=55;PP=1488;ReadPosRankSum=1.554;SC=TTTCCTCACCTTTCCCAGAGT;SOR=0.753;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=195;TCF=86;TCR=109;TR=96;WE=126213403;WS=126213385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,109:0.50:219
chr11	126228258	rs77137587	A	T	3098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=67;NR=39;PP=1715;SC=GTGTAGGCAGATTTGGGTGAC;SOR=0.997;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=68;TCR=39;TR=106;WE=126228266;WS=126228248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr11	126294817	rs948052	G	A	5630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=97;PP=2965;SC=CACGCTGCTTGCCCGCAGGAC;SOR=0.834;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=191;TCF=94;TCR=97;TR=191;WE=126294825;WS=126294807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr11	126301449	rs3802816	T	C	2348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=55;PP=1355;SC=GCACAGCTGATGACGGATGGG;SOR=2.147;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=22;TCR=56;TR=77;WE=126301457;WS=126301439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr11	126301481	rs3802817	T	A	1250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=35;PP=997;SC=TATCCCCCCATGATCTCACCC;SOR=4.461;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=38;WE=126301489;WS=126301471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	126305279	rs4937132	C	G	3060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=60;PP=1754;SC=GCTGCTTGAGCGGGGCTGGGT;SOR=1.508;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=37;TCR=60;TR=97;WE=126305287;WS=126305269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr11	126310082	rs878830	A	T	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-4.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.900;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=206;ReadPosRankSum=-0.857;SC=TGCCCTTAGGATGCGGAATTT;SOR=0.042;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=15;WE=126310090;WS=126310072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr11	126310299	rs3212313	T	C	5140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=473;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.517;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=116;NR=113;PP=2789;ReadPosRankSum=0.365;SC=AAGTGACTGTTGGGCTGCTGG;SOR=0.632;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=428;TCF=212;TCR=216;TR=229;WE=126310307;WS=126310289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:222,249:0.53:471
chr11	126315024	rs3802819	T	C	6229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=100;NR=111;PP=2965;SC=CAGGCTCAGATGCCAAGAGCA;SOR=0.980;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=211;TCF=100;TCR=111;TR=211;WE=126315032;WS=126315014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr11	126316610	rs1574534	C	T	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.332;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=251;ReadPosRankSum=-1.806;SC=CCACTGTCCCCGCCCCCTGCC;SOR=0.129;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=16;WE=126316618;WS=126316600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr11	126343135	rs12786235	A	C	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.77;ReadPosRankSum=0.908;SOR=1.506;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr11	126396674	rs674537	G	A	1757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=42;PP=1177;SC=CAGGGCTGGCGCAGGAGACTG;SOR=2.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=13;TCR=42;TR=55;WE=126396682;WS=126396664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr11	126858484	rs558276	T	C	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=4;PP=66;ReadPosRankSum=0.000;SC=GGCTCCTGAATGGAGCAGCAG;SOR=0.859;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=13;TCF=7;TCR=6;TR=8;WE=126858492;WS=126858474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr11	126873721	rs11377295	G	GC	2330.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=39;PP=1264;SC=TGAGCCCCTGGCCCGCCCCCC;SOR=1.778;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=53;TCF=3;TCR=50;TR=42;WE=126873731;WS=126873711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr11	126968477	rs10893631	C	T	6302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=114;NR=86;PP=2965;SC=TCACTCCTGCCATCCTGCTCC;SOR=0.890;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=200;TCF=114;TCR=86;TR=200;WE=126968485;WS=126968467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr11	128333503	rs2230004	T	C	3684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=347;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.765;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=61;PP=2179;ReadPosRankSum=-1.191;SC=GAAACTGCCATAGCTGGATTG;SOR=0.808;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=298;TCF=172;TCR=126;TR=149;WE=128333511;WS=128333493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,176:0.51:346
chr11	128391937	rs61907765	C	T	1232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.502;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=32;PP=796;ReadPosRankSum=0.124;SC=TTTGCAGTTACTGTTGTTTTT;SOR=0.551;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=47;TCR=58;TR=59;WE=128391945;WS=128391927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,62:0.54:115
chr11	128396738	rs7117118	A	G	490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=352;ReadPosRankSum=0.260;SC=TTAGAGCTCAATGGGAGTTTA;SOR=1.264;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=17;WE=128396746;WS=128396728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,19:0.68:28
chr11	128443083	rs7935676	G	C	1296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.725;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=28;PP=725;ReadPosRankSum=-0.290;SC=ATGCTCACAGGTTTGTGGATT;SOR=0.829;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=96;TCF=46;TCR=50;TR=53;WE=128443091;WS=128443073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,61:0.56:109
chr11	128443099	rs7935393	A	C	1122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=25;PP=653;ReadPosRankSum=-0.852;SC=GGATTAGAATACACAAGGAAG;SOR=0.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=36;TCR=47;TR=44;WE=128443107;WS=128443089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,51:0.54:95
chr11	128638216	rs35044982	TG	T	4292.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=73;PP=2163;SC=CCCCACTCTCTGGGGGGGCAG;SOR=1.324;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=89;TCF=5;TCR=84;TR=78;WE=128638224;WS=128638206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr11	128652012	rs639336	G	T	4776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=99;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.182;SC=ACCAGCTTGCGTGTTCCACTC;SOR=1.556;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=155;TCF=55;TCR=100;TR=153;WE=128652020;WS=128652001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,174:0.99:176
chr11	128652053	rs3216814	A	AG	1688.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.058;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=37;PP=1360;ReadPosRankSum=-0.856;SC=GACAAGCCAAAATTTTCGCCA;SOR=0.563;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=62;TCF=0;TCR=62;TR=37;WE=128652061;WS=128652043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,49:0.56:87
chr11	128679211	rs630797	G	C	1705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.783;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=45;PP=1189;ReadPosRankSum=0.269;SC=TAACATGCACGTCTTTCCTTG;SOR=0.871;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=173;TCF=82;TCR=91;TR=80;WE=128679219;WS=128679201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,85:0.44:194
chr11	128772420	rs150014706	G	C	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=142;ReadPosRankSum=-1.846;SC=GAGGGGGCTGGGGAGCACAGG;SOR=0.846;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=12;WE=128772428;WS=128772410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,12:0.41:29
chr11	128781339	rs6590357	T	C	2739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.107;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=62;PP=1406;ReadPosRankSum=-0.976;SC=TGGAGAAGAGTGGCAAGTGCA;SOR=0.897;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=241;TCF=124;TCR=117;TR=122;WE=128781347;WS=128781329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,134:0.51:264
chr11	128781978	rs7118824	T	G	4915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.886;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=74;PP=1830;ReadPosRankSum=-0.363;SC=GCCTCTTCCTTGTGTCTCCTC;SOR=0.617;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=284;TCF=129;TCR=155;TR=137;WE=128781986;WS=128781968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,143:0.48:297
chr11	128782002	rs7118833	T	C	4390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FS=0.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.63;ReadPosRankSum=-0.741;SOR=0.618;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:134,115:0.46:249
chr11	128782012	rs7102584	C	G	8146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.52;SOR=0.936;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr11	128786294	rs4937391	G	A	1748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=25;PP=1105;ReadPosRankSum=-1.505;SC=TGTAACTTCCGTTTCCCCAGG;SOR=0.668;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=140;TCF=92;TCR=48;TR=72;WE=128786305;WS=128786284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,77:0.52:147
chr11	128804789	rs2155548	C	A	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=71;ReadPosRankSum=0.424;SC=GTCATGTAGACTATGGCTCAG;SOR=0.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=6;WE=128804797;WS=128804779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr11	128804955	rs2186833	C	T	1636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=1.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.69;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=0.730;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,84:0.50:169
chr11	128805548	rs11601431	G	A	2315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.41;SOR=1.314;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr11	128805557	rs56235610	T	C	2389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.67;SOR=1.101;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr11	128842873	rs581258	T	C	3309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=57;PP=2023;ReadPosRankSum=-1.084;SC=TTCTGGCCTTTTCTGGGTCCC;SOR=0.722;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=241;TCF=133;TCR=108;TR=126;WE=128842881;WS=128842863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,145:0.54:268
chr11	128846547	rs665619	C	A	1771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.276;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=36;PP=972;ReadPosRankSum=-1.110;SC=ATAAAAAACACATAGTGTGAA;SOR=0.544;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=211;TCF=104;TCR=107;TR=76;WE=128846555;WS=128846537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,90:0.38:236
chr11	128855753	.	GTATA	G	106	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=106;QD=36.3333333333;SC=GTGTGTGTGTGTATATATATA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=3;WE=128855764;WS=128855743;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr11	128857882	rs57177179	TAAG	T	2067.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.372;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=3.117;NF=13;NR=15;PP=997;ReadPosRankSum=-1.288;SC=TTTAATTAGTTAAGAAGGAGT;SOR=0.875;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=87;TCF=37;TCR=50;TR=28;WE=128857892;WS=128857872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,59:0.39:151
chr11	128868090	rs669678	G	A	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.48;BaseQRankSum=-2.200;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=77;ReadPosRankSum=-0.282;SC=AGAAAGCTTAGTACATGCATT;SOR=0.859;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=6;WE=128868098;WS=128868089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr11	128868239	rs670440	T	C	2703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.952;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=48;PP=1639;ReadPosRankSum=-1.436;SC=TTAGAAGGTGTTCCCCCAGGT;SOR=0.630;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=231;TCF=136;TCR=95;TR=114;WE=128868247;WS=128868229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,130:0.50:258
chr11	128993224	rs145776868	T	TA	97.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.484;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.88;ReadPosRankSum=-0.352;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr11	129061849	rs2511810	G	T	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.884;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=23;ReadPosRankSum=0.812;SC=CTGCTCCCTTGAGCTCCAAAC;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=3;WE=129061857;WS=129061839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr11	129312603	rs79325083	G	A	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.395;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=156;ReadPosRankSum=-1.682;SC=GGAAGACCTCGTTTAATGGGG;SOR=0.233;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=10;WE=129312611;WS=129312593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr11	129735677	rs3817614	G	T	960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=3;PP=622;SC=GCCCCAGAAAGACCAGCCACT;SOR=3.193;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=30;WE=129735685;WS=129735667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	129743012	rs1650826	A	G	2941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=46;NR=49;PP=1629;SC=GCATGAGGCCAAGAGCTTAAT;SOR=0.907;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=46;TCR=49;TR=95;WE=129743020;WS=129743002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr11	129752991	rs2293664	G	C	1509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=14;PP=942;SC=TCAGATGAAGGCTCCTAGAGG;SOR=1.651;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=33;TCR=14;TR=47;WE=129752999;WS=129752981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr11	129753900	rs2303663	T	C	3241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=29;PP=2100;SC=CGTGTCTTCCTCAGGACAGCC;SOR=1.757;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=106;TCF=77;TCR=29;TR=106;WE=129753908;WS=129753890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr11	129754103	rs3214551	T	TG	4097.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=61;PP=2642;SC=TCTGGTCACTTTCAAAAGTAA;SOR=2.004;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=63;TCF=0;TCR=63;TR=61;WE=129754111;WS=129754093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr11	129754627	rs12574106	G	T	1023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=5;PP=741;SC=GACAGCGGCAGCTTGGTTCTC;SOR=2.649;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=33;WE=129754635;WS=129754617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr11	129754644	rs1131972	A	G	1337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=12;PP=939;SC=TCTCACCTGCAGTTTTCATAT;SOR=1.958;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=36;TCR=12;TR=48;WE=129754652;WS=129754634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr11	129755669	rs1783914	G	A	603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=18;PP=490;SC=CGAAGAATCTGTATTGATTAC;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=129755677;WS=129755659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	129758327	rs1650823	G	A	2935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=28;PP=1976;SC=TTGTTTTTTAGAACACAGCCT;SOR=2.027;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=72;TCR=28;TR=100;WE=129758335;WS=129758317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr11	129784456	rs2241575	G	A	3958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=74;NR=51;PP=2370;SC=AGCCTGAAAGGGGAAGGGGCA;SOR=0.937;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=74;TCR=51;TR=125;WE=129784464;WS=129784446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr11	129785594	rs3734073	G	A	1862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=19;PP=1208;SC=GACAGCAGACGGGAGGGGTGG;SOR=1.751;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=44;TCR=19;TR=63;WE=129785602;WS=129785584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr11	129785816	rs10561615	AAACT	A	2673.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=34;PP=1759;SC=TGCTTAAAGCAAACTAACAAT;SOR=2.584;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=40;TCF=3;TCR=37;TR=37;WE=129785827;WS=129785806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr11	129793305	rs2241573	A	G	2485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=45;PP=1372;SC=TCACCTGGTGATAAGAACCAC;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=80;TCF=35;TCR=45;TR=80;WE=129793313;WS=129793295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr11	129794950	rs2241571	T	C	8739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=158;NR=139;PP=2965;ReadPosRankSum=-2.077;SC=TCCAAGGATGTGCTGCTGATG;SOR=0.718;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=299;TCF=159;TCR=140;TR=297;WE=129794958;WS=129794940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,324:0.99:326
chr11	129801043	rs2277033	C	T	5372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=105;NR=72;PP=2965;SC=ACTGGGTTTCCTGTGGCAGCT;SOR=1.022;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=177;TCF=105;TCR=72;TR=177;WE=129801051;WS=129801033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr11	129940076	.	GTGCGGCGCCGGGGGTCCGGCTC	G	372.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.216;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.42;MQRankSum=1.171;QD=15.53;ReadPosRankSum=0.435;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr11	129940806	rs112826009	A	G	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=189;ReadPosRankSum=-1.642;SC=GCGAAGCGGCAGGGCCGGGGG;SOR=0.368;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=12;WE=129940814;WS=129940796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr11	129991652	rs71750553	TGAAGAG	T	1180.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=4.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.98;MQRankSum=2.489;QD=20.71;ReadPosRankSum=0.008;SOR=0.277;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,32:0.56:57
chr11	129997581	.	T	C	1999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.175;ClippingRankSum=0.000;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.526;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=35;PP=1242;ReadPosRankSum=1.611;SC=AGATTTAGCATCTGACAGTGT;SOR=0.512;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=179;TCF=110;TCR=69;TR=91;WE=129997589;WS=129997571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,99:0.51:195
chr11	129998900	rs651935	T	C	4064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=45;PP=2252;SC=AGGCTTCCTCTGGGTGCCACA;SOR=1.288;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=135;TCF=90;TCR=45;TR=135;WE=129998908;WS=129998890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr11	130060612	rs858704	A	G	680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=20;PP=430;ReadPosRankSum=-2.717;SC=GGGGGCGGGTAGGGCTGTGGG;SOR=0.582;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=54;TCF=14;TCR=40;TR=27;WE=130060620;WS=130060602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,30:0.51:59
chr11	130064223	rs610005	A	G	1837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=43;PP=1223;SC=CCCTCGGGCCACAGAGAAGGG;SOR=2.093;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=17;TCR=43;TR=60;WE=130064231;WS=130064213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr11	130064647	rs597661	G	A	2422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.464;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=59;PP=1275;ReadPosRankSum=0.335;SC=GAGCTATGGGGCGTGTGAACG;SOR=0.799;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=246;TCF=113;TCR=133;TR=106;WE=130064665;WS=130064637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,123:0.45:272
chr11	130064705	rs597576	A	G	2550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=61;PP=1801;SC=CTCCCTGTGCAGATGTGTGTG;SOR=2.250;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=83;TCF=21;TCR=62;TR=82;WE=130064713;WS=130064695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr11	130064746	.	C	CGT	417.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.954;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.47;ReadPosRankSum=-0.850;SOR=0.069;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr11	130064747	rs369392586	ATG	A,GTG	699.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=31.81;ReadPosRankSum=-1.579;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:1,9,12:0.41,0.55:22
chr11	130066261	rs17667603	C	A	899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.717;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=12;PP=444;ReadPosRankSum=0.844;SC=TGTGAAGGTGCGCTTCAAATT;SOR=0.808;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=101;TCF=64;TCR=37;TR=39;WE=130066269;WS=130066251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,47:0.41:114
chr11	130066372	rs858713	G	A	1321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.107;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=35;PP=1058;ReadPosRankSum=0.009;SC=GGGGGCTGCCGGGCCCATGCT;SOR=0.984;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=140;TCF=78;TCR=62;TR=75;WE=130066380;WS=130066362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,68:0.51:133
chr11	130066452	rs11368852	G	GC	1962.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.532;HP=11;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=28;PP=1034;ReadPosRankSum=0.636;SC=CTTGTGCCCCGCCCCCCCTCC;SOR=0.640;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=144;TCF=52;TCR=92;TR=45;WE=130066460;WS=130066437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,84:0.44:191
chr11	130067892	rs858715	C	T	1884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=41;PP=1168;SC=CCACCCTGCCCGCGTCCCATG;SOR=1.508;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=23;TCR=41;TR=64;WE=130067900;WS=130067882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr11	130067987	rs595073	A	C	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.215;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.119;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=108;ReadPosRankSum=-0.535;SC=CTCTGGCCCCACTCCCCACCC;SOR=2.252;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=16;TCF=10;TCR=6;TR=7;WE=130067995;WS=130067977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr11	130069790	rs613501	T	G	4093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=85;NR=54;PP=2294;SC=TGTCCCCTTGTGGTTTGATGT;SOR=1.060;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=85;TCR=54;TR=139;WE=130069798;WS=130069780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr11	130270855	rs59317921	T	C	2214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=20;PP=1279;SC=AACTTGAAATTTCCAGTGTCC;SOR=1.164;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=39;TCR=20;TR=59;WE=130270863;WS=130270845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr11	130271647	rs747249	A	G	2364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=21;PP=1468;SC=GCTGGCTTAGATGGGTGACTT;SOR=1.638;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=52;TCR=21;TR=73;WE=130271655;WS=130271637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr11	130271678	rs747250	T	G	4059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=87;NR=46;PP=2470;SC=ACATTCCACATGCAGCTCTCC;SOR=1.194;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=87;TCR=46;TR=133;WE=130271686;WS=130271668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr11	130278924	rs2291344	T	G	1028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=27;PP=731;SC=AGCACTTTTCTTCTTTCTTTT;SOR=2.964;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=32;WE=130278932;WS=130278914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr11	130281488	rs2131535	G	A	4056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=55;NR=82;PP=2338;SC=GCCTCCATCTGCCACGGGCTG;SOR=1.345;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=137;TCF=55;TCR=82;TR=137;WE=130281496;WS=130281478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr11	130284344	rs7106106	T	C	2706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=25;PP=1744;SC=GTGGTTTCCTTCTGGAGAACA;SOR=1.683;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=64;TCR=25;TR=89;WE=130284352;WS=130284334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr11	130286766	rs2291347	G	A	8278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=162;NR=124;PP=2965;SC=TAGGATCTACGCAACCTTGGA;SOR=0.982;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=286;TCF=162;TCR=124;TR=286;WE=130286774;WS=130286756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,312:1.00:312
chr11	130297948	rs7927048	C	G	6121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.51;SOR=0.871;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr11	130297957	rs7942034	T	C	5855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.03;SOR=0.905;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr11	130298117	rs10548872	GGCA	G	969.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;NF=4;NR=12;PP=767;SC=GCGGGCCAGCGGCAGCAGCAG;SOR=1.270;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=16;WE=130298127;WS=130298107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	130298447	rs903024	C	T	123.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=3;PP=83;SC=TCCTCCGCCCCTGCCCGCGCC;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=5;WE=130298455;WS=130298437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	130332338	rs11604959	A	G	3124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=67;PP=2007;ReadPosRankSum=-1.895;SC=ATTCTGGGCTAGCCAAACCTC;SOR=0.671;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=327;TCF=186;TCR=141;TR=147;WE=130332346;WS=130332328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:193,157:0.45:350
chr11	130339312	rs731446	T	C	769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.823;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-0.931;NF=16;NR=18;PP=363;ReadPosRankSum=-1.273;SC=GATCCTGCAATCTGGAGCCCT;SOR=0.551;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=77;TCF=34;TCR=43;TR=34;WE=130339320;WS=130339302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,41:0.48:86
chr11	130542882	rs7933829	C	T	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.726;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQ=59.98;MQRankSum=-1.164;NF=14;NR=4;PP=296;ReadPosRankSum=0.678;SC=ACATGGTCCTCCTCTGTCTCT;SOR=0.354;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=41;TCF=35;TCR=6;TR=18;WE=130542890;WS=130542872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,17:0.40:42
chr11	130716157	rs7943757	C	T	3050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=65;PP=1927;SC=GATTCTATTGCATAATCTCCA;SOR=1.791;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=32;TCR=65;TR=97;WE=130716165;WS=130716147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr11	130731518	rs202084321	CCTT	C	682.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=499;SC=TGGGGGAAGTCCTTCTTCTGG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=10;WE=130731528;WS=130731508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	130748131	rs3190331	A	G	908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=0;PP=774;SC=AAACGTGCATACAACTGGGAC;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=27;WE=130748139;WS=130748130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	130749715	rs2282528	A	G	3817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=80;PP=2503;SC=TAGGTATTTCAGGCCTACCTC;SOR=1.398;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=127;TCF=47;TCR=80;TR=127;WE=130749723;WS=130749705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr11	130750642	rs2298566	A	C	5432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=82;PP=2965;SC=CTGAAGAAGCAGGAGGTACTG;SOR=0.785;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=181;TCF=99;TCR=82;TR=181;WE=130750650;WS=130750632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr11	130763772	rs3794143	C	T	6431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=105;NR=107;PP=2965;SC=ACCAATTTACCCAACTCCCTC;SOR=0.796;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=213;TCF=105;TCR=108;TR=212;WE=130763780;WS=130763762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr11	130773076	rs3751039	G	A	4128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=60;PP=2485;SC=AGATTCCCTGGACACTATTCA;SOR=0.857;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=143;TCF=83;TCR=60;TR=142;WE=130773084;WS=130773066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr11	130775688	rs3198419	C	T	3264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=27;PP=1975;SC=TACTACTCATCTCTGTGCCCC;SOR=1.672;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=70;TCR=27;TR=97;WE=130775696;WS=130775678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr11	130775782	rs1865298	C	T	8750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=160;NR=135;PP=2965;SC=ACTCCAACTACCCCAAGTACC;SOR=0.814;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=296;TCF=160;TCR=136;TR=295;WE=130775790;WS=130775772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,331:1.00:331
chr11	130776524	rs4414223	T	C	944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=4;PP=652;SC=TCTTACCACATTGCCTTCCTG;SOR=3.126;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=30;WE=130776532;WS=130776514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	130776613	rs4373936	A	G	4809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=96;NR=67;PP=2815;SC=ACCTCAGCCTAGACCTGGTAC;SOR=0.899;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=163;TCF=96;TCR=67;TR=163;WE=130776621;WS=130776603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr11	130776646	rs4586174	T	A	5179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=77;PP=2755;SC=CAGAAACAGGTTGTAATTTAT;SOR=0.745;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=172;TCF=95;TCR=77;TR=172;WE=130776654;WS=130776636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr11	130776690	rs6590536	C	T	3441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=67;PP=2172;SC=CTGGCAAGTACTGATAATAAA;SOR=1.143;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=49;TCR=67;TR=116;WE=130776709;WS=130776680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr11	130776701	rs6590537	A	T	2935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=41;NR=57;PP=1846;SC=TGATAATAAAACACAACAAGA;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=41;TCR=57;TR=98;WE=130776709;WS=130776680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr11	130780015	rs1781	C	T	3892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=48;PP=2292;SC=TAGCGATCTCCGGAATGGCAC;SOR=1.163;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=77;TCR=48;TR=125;WE=130780023;WS=130780005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr11	130780225	rs681982	C	A	1030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=26;PP=725;SC=CCATGTTTCCCAATGGAAGAT;SOR=2.649;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=33;WE=130780233;WS=130780215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr11	130780270	rs1237478	C	A	128.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.47;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr11	130784754	rs3751037	C	G	3177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.99;NF=62;NR=33;PP=2122;SC=GGACCTCGAACATTTGGCTGT;SOR=1.380;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=63;TCR=34;TR=95;WE=130784762;WS=130784744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr11	130784971	rs3751036	C	G	1571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=31;PP=1372;SC=GCAGAGATGTCGGCACTGAGG;SOR=1.051;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=53;TCF=22;TCR=31;TR=52;WE=130784979;WS=130784961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr11	131530083	rs2472253	G	C	832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.983;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=13;PP=444;ReadPosRankSum=0.566;SC=GTAGGACTCGGGTGGGCCAGT;SOR=0.507;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=63;TCF=43;TCR=20;TR=38;WE=131530091;WS=131530073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,40:0.59:68
chr11	131531000	rs2739287	T	C	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.549;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=420;ReadPosRankSum=-0.767;SC=GTCTTCCCCCTAGATTCGGTG;SOR=1.179;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=55;TCF=16;TCR=39;TR=22;WE=131531008;WS=131530990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,22:0.37:59
chr11	131531015	rs2658857	T	G	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.061;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=242;ReadPosRankSum=-0.724;SC=TCGGTGGAGATTCCTTTCCTC;SOR=1.247;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=41;TCF=11;TCR=30;TR=16;WE=131531023;WS=131531005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,16:0.37:43
chr11	131781634	rs11222836	G	A	1202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.990;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=42;PP=991;ReadPosRankSum=1.220;SC=GGCGTGCCTGGGTTGGCGGAG;SOR=1.327;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=96;TCF=18;TCR=78;TR=48;WE=131781642;WS=131781624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,48:0.48:100
chr11	133328729	rs113245202	T	C	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=20;ReadPosRankSum=-0.876;SC=TGTGTGTGTATATACACATAG;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=3;WE=133328737;WS=133328719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr11	133788869	rs10791338	A	G	1256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.443;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=23;PP=762;ReadPosRankSum=-0.209;SC=GACGGCAGGGAAGAAGGATGA;SOR=0.487;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=95;TCF=59;TCR=36;TR=55;WE=133788877;WS=133788859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,62:0.55:113
chr11	133792021	rs596430	T	C	2865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.463;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=60;PP=1591;ReadPosRankSum=2.902;SC=GGTCTACCTATGCGCCCCCTG;SOR=0.646;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=231;TCF=122;TCR=109;TR=128;WE=133792029;WS=133792011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,138:0.55:250
chr11	133794599	rs329670	TG	CT	2281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=15;PP=1786;ReadPosRankSum=-1.413;SC=AACCAGGCACTGCCTTAGTTT;SOR=0.704;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=115;TCF=82;TCR=33;TR=51;WE=133794608;WS=133794589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,60:0.48:126
chr11	133800773	rs12796441	C	A	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.89;ReadPosRankSum=-1.876;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr11	133800775	rs11223628	G	A	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.89;ReadPosRankSum=-1.876;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr11	133805440	rs139927942	AGCCT	A	244.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.758;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=146;ReadPosRankSum=-1.550;SC=GCTACCCTCCAGCCTACAGTC;SOR=0.148;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=4;WE=133805451;WS=133805437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr11	133805585	rs329637	C	T	1206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.331;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=16;PP=515;ReadPosRankSum=-1.862;SC=TGTACTTCCCCGAGTCCTCCG;SOR=0.564;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=132;TCF=87;TCR=45;TR=49;WE=133805593;WS=133805575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,63:0.42:150
chr11	133807819	rs329635	G	A	2417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=59;PP=1434;ReadPosRankSum=0.401;SC=CCTTGGCCTCGATGTACTGGG;SOR=0.690;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=255;TCF=124;TCR=131;TR=114;WE=133807834;WS=133807809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,124:0.44:283
chr11	133814191	rs595986	A	G	1594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.863;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=37;PP=952;ReadPosRankSum=-1.141;SC=CTTTGCACTCATACCAGCCCT;SOR=0.494;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=142;TCF=66;TCR=76;TR=71;WE=133814199;WS=133814181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,75:0.49:153
chr11	134014673	rs3216140	C	CCT	169.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.420;NF=5;NR=0;PP=161;ReadPosRankSum=0.326;SC=AACACCACCCCTTTTTCCCCA;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=5;WE=134014681;WS=134014663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr11	134016011	rs11223714	T	C	730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=17;PP=432;ReadPosRankSum=-1.582;SC=TTTAATATTATACCATCAGCT;SOR=0.680;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=42;TCF=16;TCR=26;TR=27;WE=134016019;WS=134016001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,32:0.64:50
chr11	134018656	rs610382	T	C	2391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.896;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=45;PP=1383;ReadPosRankSum=0.351;SC=CTTCTCCTCATAGTTACAAGA;SOR=0.486;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=215;TCF=110;TCR=105;TR=101;WE=134018664;WS=134018646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,118:0.48:247
chr11	134018849	rs201522031	TAACA	T	30.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=5.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.81;ReadPosRankSum=0.588;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr11	134018850	rs373298428	AACAC	A	145.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-3.195;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=3.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.40;ReadPosRankSum=-0.592;SOR=0.116;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr11	134031836	rs3214800	C	CAA	364.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.021;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=328;ReadPosRankSum=0.380;SC=TTCTGAAAGACAGGCCTCTCC;SOR=0.078;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=8;WE=134031844;WS=134031826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr11	134038538	rs73731	C	T	1472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.661;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=40;PP=893;ReadPosRankSum=2.164;SC=CACATGGGCACGGGTGTAAGG;SOR=0.602;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=121;TCF=43;TCR=78;TR=62;WE=134038546;WS=134038528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,70:0.51:136
chr11	134047243	rs2276265	T	C	2172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=45;PP=1452;ReadPosRankSum=-0.128;SC=GATCGCACATTACAATGATGA;SOR=0.676;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=198;TCF=106;TCR=92;TR=95;WE=134047251;WS=134047233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,102:0.47:217
chr11	134051166	.	A	C	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.117;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=33;ReadPosRankSum=0.042;SC=AGAAACTATGATCTTCAAATG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=6;WE=134051174;WS=134051156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr11	134054705	rs10569940	TACACACAC	T	1873.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.871;HP=2;HapScore=4;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=16;PP=2997;ReadPosRankSum=2.801;SC=CAGGTATATATACACACACAC;SOR=0.563;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=86;TCF=28;TCR=58;TR=27;WE=134054723;WS=134054695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,65:0.59:110
chr11	134054715	rs201518163	C	T	843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=6.572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.96;ReadPosRankSum=1.493;SOR=0.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,34:0.44:77
chr11	134054717	.	C	T	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.021;ClippingRankSum=0.000;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=10.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.51;ReadPosRankSum=1.990;SOR=2.463;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,11:0.13:84
chr11	134055478	rs10894783	C	A	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.41;ReadPosRankSum=0.982;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr11	134064540	rs1125399	T	C	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.606;HP=11;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=30;PP=803;ReadPosRankSum=-2.397;SC=AAAAAAAAAATGTGCAGAGAA;SOR=1.131;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=157;TCF=91;TCR=66;TR=65;WE=134064548;WS=134064518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,54:0.37:146
chr11	134073019	rs2305379	A	T	656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.326;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=10;PP=418;ReadPosRankSum=-0.265;SC=AATATTTGAAAATGTATTGAT;SOR=0.414;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=58;TCF=41;TCR=17;TR=30;WE=134073027;WS=134073009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,31:0.52:60
chr11	134073913	rs896409	C	T	3340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=372;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.228;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=62;PP=1906;ReadPosRankSum=0.454;SC=AAAAAGGACCCAAGGTTTTAT;SOR=0.781;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=323;TCF=168;TCR=155;TR=134;WE=134073921;WS=134073903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:210,162:0.44:372
chr11	134074099	rs10791349	T	C	1632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.562;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=47;PP=1135;ReadPosRankSum=-0.067;SC=GACCAACCAATATCCACCCGC;SOR=0.744;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=164;TCF=65;TCR=99;TR=74;WE=134074107;WS=134074089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,78:0.43:182
chr11	134105030	rs1259022	A	G	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.256;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=265;ReadPosRankSum=0.219;SC=CCACTTTGAGAATCTTCACAG;SOR=1.005;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=43;TCF=14;TCR=29;TR=17;WE=134105038;WS=134105020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,19:0.41:46
chr11	134118382	.	CA	C	77.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.595;ClippingRankSum=0.000;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=2.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.08;MQRankSum=2.236;QD=0.68;ReadPosRankSum=1.124;SOR=0.376;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,18:0.16:114
chr11	134123428	rs112372624	G	A	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.086;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=116;ReadPosRankSum=-1.942;SC=CGCAGGTCCCGCCAGTGCGAG;SOR=0.330;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=11;WE=134123436;WS=134123418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr11	134126612	rs473041	T	C	630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.962;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=18;PP=317;ReadPosRankSum=0.488;SC=CTTTGTCTCCTGATAATGTAA;SOR=0.863;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=61;TCF=21;TCR=40;TR=27;WE=134126620;WS=134126602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,32:0.46:69
chr11	134131509	rs7943666	A	G	2608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.375;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=52;PP=1612;ReadPosRankSum=0.571;SC=AGAAAAAGCAAGAGACTTTGA;SOR=0.510;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=250;TCF=146;TCR=104;TR=120;WE=134131517;WS=134131499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,127:0.48:267
chr11	134132334	rs73603086	G	C	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.902;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.843;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=4;PP=201;ReadPosRankSum=-0.536;SC=CTGCCAGATCGTGGGCTGGGG;SOR=0.018;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=10;WE=134132342;WS=134132324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr11	134132559	rs561945	G	A	2230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.535;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=46;PP=1111;ReadPosRankSum=1.067;SC=CAGAACGGGGGCGGGATCGCT;SOR=0.624;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=170;TCF=80;TCR=90;TR=91;WE=134132567;WS=134132549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,107:0.55:193
chr11	134151975	rs472287	G	C	1965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=48;NR=19;PP=1232;SC=CGTCCAGGCCGCTACATCTGC;SOR=1.708;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=48;TCR=19;TR=67;WE=134151983;WS=134151965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr11	134152030	rs10791352	G	A	5092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=95;NR=83;PP=2762;SC=CGGGGCTACAGTCCCAGAGTC;SOR=0.799;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=179;TCF=96;TCR=83;TR=178;WE=134152038;WS=134152020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr11	134177275	rs2510356	C	T	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.259;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=153;ReadPosRankSum=-1.359;SC=ATAGAAATTACATGGTTCCCA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=9;WE=134177283;WS=134177265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr11	134180695	rs526507	G	C	715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=21;PP=592;SC=GAACCCTGGGGTTAAAATCTG;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=134180703;WS=134180685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr11	134180874	rs11223753	G	A	820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.702;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=4;PP=605;ReadPosRankSum=0.963;SC=GAAAGGAAAAGCCATGCTGGA;SOR=0.346;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=56;TCF=51;TCR=5;TR=32;WE=134180882;WS=134180864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,33:0.53:62
chr11	134181101	rs1144218	T	C	1913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.574;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=48;PP=1195;ReadPosRankSum=-1.989;SC=GGAGTGGCCATTGGAGGGATG;SOR=0.607;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=164;TCF=65;TCR=99;TR=83;WE=134181109;WS=134181091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,91:0.52:174
chr11	134182135	rs751719	T	C	711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=6;PP=438;SC=ATTTCCCATTTGAAGAACCCT;SOR=2.215;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=23;WE=134182143;WS=134182125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	134182375	rs2509062	G	A	1985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=43;PP=1252;SC=CGCTCATGACGTGGCACAGGT;SOR=1.371;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=26;TCR=43;TR=69;WE=134182383;WS=134182365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr11	134182856	rs1144216	A	G	1440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=34;PP=1031;SC=TGAGACAGTCAGCCTCCCTTC;SOR=1.958;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=14;TCR=34;TR=48;WE=134182864;WS=134182846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr11	134183235	rs11223754	C	T	822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.980;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=10;PP=483;ReadPosRankSum=0.748;SC=AACGGGTTGTCGGGTAGACGC;SOR=0.563;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=56;TCF=42;TCR=14;TR=32;WE=134183243;WS=134183225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,37:0.54:68
chr11	134183450	rs1144215	T	C	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.480;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=170;ReadPosRankSum=-1.101;SC=CGGGAGAGGGTGGGGAAACCA;SOR=1.186;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=16;WE=134183458;WS=134183440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chr11	134184141	.	C	T	26	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=2;NR=1;PP=26;QD=20.2570708491;SC=ACCTTAGGCTCGGCCCACGCC;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=3;WE=134184149;WS=134184135;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr11	134188542	rs481252	T	C	2071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.036;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=33;PP=1166;ReadPosRankSum=-0.277;SC=ATTATGGATTTGTGTTCATCA;SOR=1.040;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=184;TCF=111;TCR=73;TR=91;WE=134188550;WS=134188532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,97:0.49:198
chr11	134188851	rs5795879	A	AT	107.75	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.28;MQRankSum=-0.000;QD=7.18;ReadPosRankSum=0.226;SOR=1.170;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr11	134201864	rs3098651	T	C	385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=10;NR=2;PP=222;SC=AGGCGACCAGTGCGCGGCTCC;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=134201872;WS=134201854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	134226244	rs61740182	G	A	1876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=31;PP=1087;ReadPosRankSum=0.351;SC=AATGAATATGGTTCCTATAAT;SOR=0.658;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=179;TCF=116;TCR=63;TR=85;WE=134226252;WS=134226234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,93:0.47:196
chr11	134237113	rs10791357	C	A	1541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=15;PP=881;SC=TTTTGTCTGGCCAGCCTGCTT;SOR=1.453;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=35;TCR=15;TR=50;WE=134237121;WS=134237103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr11	134238389	rs3741100	G	C	338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=3;PP=280;SC=TTCTGTGATTGGGGTTTTATG;SOR=1.802;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=11;WE=134238397;WS=134238383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	134240142	rs10791358	T	C	3719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=41;PP=2085;SC=GAGCAGGCAGTGACATTTGGG;SOR=1.364;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=125;TCF=84;TCR=41;TR=125;WE=134240150;WS=134240132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr11	134241094	rs4937880	A	G	1656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=41;PP=1140;SC=CAGCTCTGCAATAGGCGTCTC;SOR=2.226;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=15;TCR=41;TR=56;WE=134241102;WS=134241084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr11	134251777	rs729687	C	A	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.317;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=240;ReadPosRankSum=1.005;SC=AACCTGGTGCCGCCCTGCCCA;SOR=0.446;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=19;WE=134251785;WS=134251767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,22:0.52:42
chr12	235022	rs12822449	C	T	2630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=56;NR=37;PP=1598;SC=GGCGCTGTGCCCCCACGCCCC;SOR=0.985;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=56;TCR=37;TR=93;WE=235030;WS=235012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr12	235128	rs11608642	T	C	1445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=19;NR=32;PP=943;SC=GGGGCCCTGCTTTGGGGGCTG;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=19;TCR=32;TR=51;WE=235136;WS=235118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr12	248071	rs77474006	G	C	1726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.045;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;ReadPosRankSum=0.090;SC=TGGGCGCTCAGACGGTCCAGG;SOR=0.906;Source=Platypus;TCF=57;WE=248079;WS=248061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,77:0.48:160
chr12	250130	rs12321262	T	C	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.570;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=251;ReadPosRankSum=-0.077;SC=ATCCTCTGCGTGAGGACATTC;SOR=1.802;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=13;WE=250138;WS=250120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr12	250239	rs2291928	A	G	4467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=60;PP=2453;SC=GGAAAGAGTCATGGATGGCTT;SOR=1.052;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=154;TCF=94;TCR=60;TR=154;WE=250247;WS=250229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr12	271373	rs4980805	A	G	373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=4;NR=11;PP=285;SC=ACTGTGTGCCAGACACTGCAT;SOR=1.765;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=15;WE=271381;WS=271363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	274572	rs11061700	G	C	5635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=112;NR=70;PP=2937;SC=TGTTCATCAGGGCATGCCTGT;SOR=1.125;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=182;TCF=112;TCR=70;TR=182;WE=274580;WS=274562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr12	283642	rs2291917	C	T	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=118;ReadPosRankSum=2.799;SC=GGAGAGATGGCGAGAGGGTCA;SOR=0.904;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=9;WE=283650;WS=283632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr12	284058	rs216230	T	C	6104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=88;NR=108;PP=2965;SC=CCCTGGGCGGTCCCGGCTCTC;SOR=1.015;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=196;TCF=88;TCR=108;TR=196;WE=284066;WS=284048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr12	301843	rs646569	A	G	3115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=54;PP=1727;SC=AGCCATGGGTAAGATAGGGGG;SOR=1.315;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=40;TCR=54;TR=94;WE=301851;WS=301833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr12	305254	rs533572	T	C	1861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=22;PP=1048;SC=CTCCCTCCCCTGGAGCCTGGC;SOR=1.352;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=65;TCF=43;TCR=22;TR=64;WE=305262;WS=305244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr12	306124	rs150908861	CTG	C	311.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=377;ReadPosRankSum=0.787;SC=TCTCTAAGCACTGTGTGTGTG;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=9;WE=306133;WS=306114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr12	309753	rs7967868	C	T	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=221;ReadPosRankSum=-0.693;SC=CAGAGGGTCCCCCTCAAGTGT;SOR=0.368;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=13;WE=309761;WS=309743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr12	310113	rs4980863	A	G	355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=11;PP=298;SC=CCCGTAGACCAAACTACTACC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=310121;WS=310103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	310901	rs216248	T	C	5131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=96;NR=81;PP=2965;SC=TTCCTCTTCATATGTGGCAAA;SOR=0.791;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=177;TCF=96;TCR=81;TR=177;WE=310909;WS=310891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr12	311816	rs216249	C	T	348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=4;PP=215;SC=GGTTCTGCTACACTTATACTC;SOR=1.179;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=12;WE=311824;WS=311806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	311949	rs216250	A	G	2017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=23;PP=1205;SC=GCAGCTCAGAAGTGAAGGAGC;SOR=1.340;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=43;TCR=23;TR=66;WE=311957;WS=311939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr12	312200	rs216251	C	T	322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=292;SC=CCATTCATAGCATATTTTTCT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=312208;WS=312190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	347068	rs2289957	T	A	1329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=16;PP=794;SC=CGGCCCACAGTGGGTGGGGAA;SOR=1.067;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=26;TCR=16;TR=42;WE=347076;WS=347058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr12	351711	rs525797	T	G	1641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=9;PP=1249;SC=GGGGATATAGTGACAAGCCCA;SOR=2.670;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=43;TCR=9;TR=52;WE=351719;WS=351701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr12	404987	.	G	C	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.957;ClippingRankSum=0.000;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=2.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.80;ReadPosRankSum=-0.358;SOR=1.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,14:0.17:82
chr12	404994	.	A	C	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.962;ClippingRankSum=0.000;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=4.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.81;ReadPosRankSum=0.310;SOR=1.424;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,12:0.16:75
chr12	427165	.	CA	C	35.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.70;ReadPosRankSum=1.407;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr12	431586	rs74894801	T	A	2245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.667;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=38;PP=1436;ReadPosRankSum=2.157;SC=GGTTTACCTGTGTTTCTGCTT;SOR=0.392;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=164;TCF=102;TCR=62;TR=95;WE=431594;WS=431576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,103:0.59:176
chr12	464254	rs3759371	T	C	4007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=47;PP=2421;SC=CCATGATATATCAGGATAGAA;SOR=1.355;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=84;TCR=47;TR=131;WE=464262;WS=464244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr12	495217	rs10774152	G	T	789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=20;PP=542;SC=TTAAAGGGGGGTTTTGCCACA;SOR=4.255;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=495225;WS=495207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	496439	rs7965303	A	T	1099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=36;PP=1028;SC=AATCTGCCAAAACTAAAATTA;SOR=3.767;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=12;TCR=36;TR=48;WE=496447;WS=496429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr12	496533	rs10848877	C	T	345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=10;PP=262;SC=AGTAAAAAAACTTTTTTTAAT;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=496541;WS=496523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	498267	.	CGGGG	C	370.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.255;ClippingRankSum=0.000;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=1.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.89;ReadPosRankSum=1.146;SOR=0.441;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,19:0.40:47
chr12	498280	rs376841529	GGGT	G	87.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=29.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.11;ReadPosRankSum=2.527;SOR=3.492;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,18:0.23:79
chr12	520947	rs4980895	A	C	3323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=72;NR=33;PP=1882;SC=TGTTGCCGTCAGTGGTCCCAC;SOR=1.441;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=72;TCR=33;TR=105;WE=520955;WS=520937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr12	537841	rs35713455	T	TA	60.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=10;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.477;NF=6;NR=0;PP=59;ReadPosRankSum=0.251;SC=ACAATTGTTTTAAAAAAAAAA;SOR=1.688;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=6;WE=537849;WS=537831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr12	539984	rs55854088	C	T	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-4.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.544;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=375;ReadPosRankSum=-1.647;SC=GTGGCTCACGCCTGTAATCCC;SOR=0.055;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=22;WE=539992;WS=539974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,24:0.65:37
chr12	540994	rs7310504	A	G	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=63;ReadPosRankSum=0.698;SC=AGAAAAGCTGAGTAAAATCTT;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=6;WE=541002;WS=540984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,9:0.24:38
chr12	547683	rs735295	T	C	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=196;ReadPosRankSum=0.721;SC=TTGCCCGTTATGCATGAGAGT;SOR=0.818;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=63;TCF=25;TCR=38;TR=18;WE=547691;WS=547673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,18:0.26:69
chr12	550911	.	CTTT	C	137.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.342;ClippingRankSum=0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.29;MQRankSum=-0.550;QD=5.74;ReadPosRankSum=2.514;SOR=0.616;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr12	619618	.	T	A	76	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.55;FR=1.0000;HP=7;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=19;MQ=60.34;NF=4;NR=1;PP=76;QD=22.1542425094;SC=CATGGGGGGGTTGGACGCTGG;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=5;WE=619626;WS=619608;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:10,5:0.33:15
chr12	619660	.	AGGGAAACG	AGGGCTGGGCTGGGAAACG,A	726.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.46;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=8;PP=1338;SC=CTGGGCTGGGAGGGAAACGGG;SOR=3.442;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=24;TCF=15;TCR=9;TR=23;WE=619675;WS=619650;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:11
chr12	619664	.	A	AGGG	1222.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=76.42;SOR=5.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	619665	.	A	AGTTGGCTGGGCTGGG	1852.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=108.98;SOR=5.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	619667	.	C	G	2484.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=59.16;SOR=1.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr12	619668	.	G	GGAGTTGGCTGGGCTGGGA	2475.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=57.58;SOR=1.775;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr12	619808	rs7306988	G	A	3004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=51;NR=50;PP=1663;SC=GTATGAGAGGGAGGGGCGGGG;SOR=0.903;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=101;TCF=51;TCR=50;TR=101;WE=619816;WS=619798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr12	661458	rs68092327	TAC	T	225.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.52;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	662448	rs758790	T	C	1598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.943;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=28;PP=813;ReadPosRankSum=-2.431;SC=CCAGGATGCTTGAGGGAAGAC;SOR=0.860;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=145;TCF=80;TCR=65;TR=67;WE=662456;WS=662438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,77:0.48:162
chr12	664363	.	GA	G	30.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.655;ClippingRankSum=0.000;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=4.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.34;ReadPosRankSum=1.907;SOR=0.292;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,13:0.14:91
chr12	666943	rs7300933	A	G	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=7;PP=108;ReadPosRankSum=-1.723;SC=GGGGACCACCAGCCAGGGGGT;SOR=0.693;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=29;TCF=10;TCR=19;TR=12;WE=666951;WS=666933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr12	667910	rs12368256	A	G	1177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.72;ReadPosRankSum=-0.430;SOR=0.565;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,35:0.44:80
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chr12	752998	rs9669247	G	A,T	1543.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;NF=11,11;NR=19,12;PP=585,458;SC=CCAGCTCATCGCTCAGGTCTT;SOR=1.118;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=53;TCF=22;TCR=31;TR=30,23;WE=753006;WS=752988;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.57,0.43:54
chr12	772673	rs4980959	C	A	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.945;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=113;ReadPosRankSum=0.327;SC=ATTCATCCCTCTGATGTGGGA;SOR=2.279;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=9;WE=772681;WS=772663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
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chr12	863517	rs3858703	G	A	1128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.659;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=28;PP=657;ReadPosRankSum=1.121;SC=TTTATTTGACGGTCCTTTGGA;SOR=0.610;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=113;TCF=48;TCR=65;TR=50;WE=863525;WS=863507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,57:0.43:132
chr12	936468	rs2158502	C	G	1667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.237;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=38;PP=959;ReadPosRankSum=-0.046;SC=CTGGCTTTCTCACATTCCTTT;SOR=0.570;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=142;TCF=63;TCR=79;TR=69;WE=936476;WS=936458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,80:0.49:164
chr12	939302	rs10774466	A	G	1227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.761;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=31;PP=793;ReadPosRankSum=1.082;SC=AAAATGCTGCACAGATCTACC;SOR=0.376;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=101;TCF=38;TCR=63;TR=52;WE=939310;WS=939292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,57:0.50:115
chr12	966208	rs2240284	G	A	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=198;ReadPosRankSum=0.896;SC=TCCTGCAGGCGAGTCAGAAAA;SOR=1.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=10;WE=966216;WS=966198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr12	971291	rs2286007	C	T	1285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=25;PP=669;ReadPosRankSum=0.430;SC=TCTGTCTTCACAGAATCTCGA;SOR=0.744;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=109;TCF=61;TCR=48;TR=59;WE=971299;WS=971281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,64:0.54:118
chr12	974326	rs11611231	G	C	3061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.613;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.192;NF=56;NR=56;PP=1811;ReadPosRankSum=-0.024;SC=TTCTGCTGTTGCCTCTGTGTC;SOR=0.546;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=209;TCF=112;TCR=97;TR=112;WE=974334;WS=974316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,141:0.51:277
chr12	974355	rs11441897	T	TC	10852.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=102;PP=2965;SC=CTCCCAGTGCTCTTCCACCCC;SOR=0.707;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=149;TCF=43;TCR=106;TR=142;WE=974363;WS=974345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,293:1.00:293
chr12	974404	rs7300829	T	C	2917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=2.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.902;HP=4;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.068;NF=53;NR=60;PP=1892;ReadPosRankSum=-0.992;SC=CCTTCCCTCCTCCGGACTGCC;SOR=0.774;Source=Platypus;TCF=114;TR=113;WE=974412;WS=974394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,137:0.49:282
chr12	987482	rs1012729	G	A	1810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FS=4.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.84;ReadPosRankSum=0.141;SOR=0.614;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,90:0.49:184
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chr12	990912	rs956868	A	C	4697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=69;PP=2965;SC=AGTAGCACAGACCCAAGCTAC;SOR=0.841;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=153;TCF=84;TCR=69;TR=153;WE=990920;WS=990902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr12	991009	rs7953912	C	T	2658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.233;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=46;PP=1632;ReadPosRankSum=0.350;SC=CGGTATGAAACGCCAAACTGT;SOR=1.143;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=258;TCF=144;TCR=114;TR=118;WE=991017;WS=990999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,128:0.45:282
chr12	992229	rs34032084	C	T	1762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.510;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=35;PP=861;ReadPosRankSum=0.385;SC=AATTATGGTACGTCTGCATTT;SOR=0.650;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=175;TCF=91;TCR=84;TR=78;WE=992237;WS=992219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,92:0.45:205
chr12	994487	rs7955371	G	C	7484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=139;NR=104;PP=2965;SC=TCACAGCTGTGCATTCAGCTT;SOR=0.879;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=243;TCF=139;TCR=104;TR=243;WE=994495;WS=994477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr12	995291	rs11450919	G	GT	1158.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=24;PP=583;SC=AATATGATCAGTTTTTTTTCT;SOR=1.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=24;WE=995299;WS=995281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr12	996357	rs56375346	C	T	1403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.866;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=22;PP=928;ReadPosRankSum=-0.217;SC=TAGCGTCTCACGGACTTGATT;SOR=1.181;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=154;TCF=94;TCR=60;TR=67;WE=996365;WS=996347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,70:0.42:166
chr12	998365	rs12828016	G	T	6458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=128;PP=2965;SC=GTCCAGAGATGATCACAGTGA;SOR=1.119;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=221;TCF=93;TCR=128;TR=221;WE=998373;WS=998355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr12	999762	rs2255390	A	G	3107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=65;PP=1950;SC=TTTCAAAGACACATTTCCACG;SOR=1.377;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=40;TCR=65;TR=105;WE=999770;WS=999752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr12	1003837	rs2301880	C	T	2455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.009;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=60;PP=1601;ReadPosRankSum=-2.507;SC=TGATTCCTTCCTTTGGAGGAG;SOR=0.776;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=210;TCF=99;TCR=111;TR=112;WE=1003845;WS=1003827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,118:0.51:233
chr12	1005162	rs35956200	T	C	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=350;ReadPosRankSum=-0.057;SC=ATTCTTTTTTTCCTTTTTTAA;SOR=0.495;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=19;WE=1005170;WS=1005152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,21:0.51:41
chr12	1017197	rs4766334	C	T	3760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=69;PP=2151;SC=ACATGAATTACGAGGTAAGTC;SOR=0.854;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=65;TCR=69;TR=134;WE=1017205;WS=1017187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
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chr12	1035947	rs6489763	C	A	678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=8;PP=413;SC=TGTGTAACTACGTTAACTATG;SOR=1.136;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=15;TCR=8;TR=23;WE=1035955;WS=1035937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
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chr12	1038742	rs4766377	A	G	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=168;ReadPosRankSum=-1.065;SC=CATCCTTTGCAACAATTTTTA;SOR=0.634;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=13;WE=1038750;WS=1038732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr12	1038766	rs11571425	C	G	708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=443;ReadPosRankSum=1.739;SC=ATGGTGAAAACTTTTAGGTGT;SOR=0.667;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=52;TCF=39;TCR=13;TR=27;WE=1038774;WS=1038756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,30:0.53:57
chr12	1038854	rs11571424	C	T	1977.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=39;PP=1193;ReadPosRankSum=-3.535;SC=AATTCCACCACTCTAGGGAAC;SOR=0.697;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=186;TCF=105;TCR=81;TR=88;WE=1038862;WS=1038844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,97:0.46:211
chr12	1038978	rs35278212	C	CT	2838.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.110;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.136;NF=12;NR=33;PP=1533;ReadPosRankSum=0.568;SC=CTACTCCATCCCCTCACCTTC;SOR=0.607;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=110;TCF=31;TCR=79;TR=45;WE=1038986;WS=1038968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,86:0.44:195
chr12	1040297	rs104895071	G	A	1099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.906;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=18;PP=647;ReadPosRankSum=0.352;SC=GCAGACTTCCGAATCCCTGAG;SOR=0.464;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=73;TCF=45;TCR=28;TR=45;WE=1040305;WS=1040287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,51:0.61:83
chr12	1040373	rs7303748	T	C	4425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=63;PP=2422;SC=TCCAGGCACATGAATTCTCCT;SOR=0.905;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=145;TCF=82;TCR=63;TR=145;WE=1040381;WS=1040363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr12	1137048	rs144267759	C	A	1752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.055;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=31;PP=1017;ReadPosRankSum=0.003;SC=TTTCTGCTCACACCTTTCCTG;SOR=0.804;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=189;TCF=110;TCR=79;TR=81;WE=1137056;WS=1137038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,92:0.41:222
chr12	1137823	rs117698549	C	T	833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.225;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=23;PP=609;ReadPosRankSum=0.023;SC=CTAGATTTTTCCCTTCGTAGT;SOR=0.223;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=47;TCF=12;TCR=35;TR=32;WE=1137831;WS=1137813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,33:0.67:49
chr12	1219286	rs7131703	T	C	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=388;ReadPosRankSum=-0.175;SC=GTAACTTCTTTAAATATCATG;SOR=0.665;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=19;WE=1219294;WS=1219276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr12	1221221	rs74679668	T	TAG	616.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=1;PP=458;SC=CCTGTGAACTTAGAAACTACC;SOR=3.912;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=11;WE=1221229;WS=1221211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	1224917	rs7973282	A	G	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=60;ReadPosRankSum=0.054;SC=ATGACCTATCACACAGTTCGT;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=6;WE=1224925;WS=1224907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr12	1224972	rs7973392	A	C	1080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.44;ReadPosRankSum=-1.529;SOR=0.600;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,30:0.43:70
chr12	1224980	rs61912159	G	A	1115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.97;ReadPosRankSum=0.767;SOR=0.826;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,31:0.36:86
chr12	1292399	rs111929784	CTA	C	1382.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.484;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=1049;ReadPosRankSum=0.950;SC=ATTTAAACCTCTATTTTTTTT;SOR=1.170;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=56;TCF=36;TCR=20;TR=25;WE=1292408;WS=1292389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,39:0.48:81
chr12	1313732	rs7977526	T	C	3062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=67;PP=1994;ReadPosRankSum=0.114;SC=TGTTTGCGAATATTGTCTTGA;SOR=0.679;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=271;TCF=138;TCR=133;TR=138;WE=1313740;WS=1313722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,148:0.51:291
chr12	1372114	rs2286031	A	G	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.468;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=93;ReadPosRankSum=-0.749;SC=AGAACATTTAATAAGCAAACA;SOR=0.132;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=7;WE=1372122;WS=1372104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr12	1676039	rs12422360	C	T	966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.801;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=25;PP=510;ReadPosRankSum=1.559;SC=CTCTTCCTAACGAGGTCGCCT;SOR=0.442;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=86;TCF=30;TCR=56;TR=42;WE=1676047;WS=1676029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,48:0.49:97
chr12	1703322	.	AGCC	A	344	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=24;MQ=60.35;NF=0;NR=8;PP=344;QD=44.0;SC=GCTTCTCCCCAGCCGCCGCCG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=8;WE=1703332;WS=1703312;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr12	1748728	rs58317077	C	T	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.097;HP=4;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=9;PP=365;ReadPosRankSum=-0.271;SC=GGAAGCGAAGCCCCCTGCCCC;SOR=0.478;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=55;TCF=37;TCR=18;TR=26;WE=1748736;WS=1748718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,26:0.46:57
chr12	1748766	rs6489313	G	A	2431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=48;NR=37;PP=1429;SC=CGTGGCGTGCGGGTCCGTCGG;SOR=0.906;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=86;TCF=48;TCR=38;TR=85;WE=1748774;WS=1748756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr12	1748834	rs2270036	T	C	3874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=72;NR=62;PP=2010;SC=CTTACCGCCCTGGCCTCATTC;SOR=0.706;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=72;TCR=62;TR=134;WE=1748842;WS=1748824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr12	1889823	rs767870	G	A	581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.006;HP=2;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=18;PP=364;ReadPosRankSum=-0.072;SC=TGTAAAGTCCGTATTTTGGCC;SOR=0.963;Source=Platypus;TCF=29;TR=29;WE=1889831;WS=1889813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,30:0.41:73
chr12	1889920	rs10848575	T	A	464.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;QD=46.47;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	1889921	rs2887630	T	A	500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.52;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	1902766	rs2058111	T	G	6080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=116;NR=93;PP=2965;SC=TGCTGACTTTTTGGGATGGCT;SOR=0.785;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=209;TCF=116;TCR=93;TR=209;WE=1902774;WS=1902756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr12	1904726	rs3078853	G	GAC	262.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=3;PP=237;ReadPosRankSum=-0.394;SC=CCCTGTGGAGGACACGGGCGG;SOR=0.527;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=14;TCF=6;TCR=8;TR=6;WE=1904734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
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chr12	1906764	rs74059368	C	T	1287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=36;PP=828;ReadPosRankSum=1.513;SC=GACCTCGCCTCGGCACTCCCA;SOR=0.950;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=101;TCF=41;TCR=60;TR=57;WE=1906772;WS=1906754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,61:0.56:109
chr12	1919543	rs2286377	C	T	1657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.465;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=44;PP=1119;ReadPosRankSum=1.566;SC=ATGCCAGGGCCCTCACCCACC;SOR=0.982;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=112;TCF=45;TCR=67;TR=69;WE=1919551;WS=1919533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,72:0.60:121
chr12	1937511	rs10437823	T	C	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=9;PP=185;ReadPosRankSum=0.336;SC=CTTCCTGGGGTACCCGAGGCT;SOR=0.502;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=31;TCF=13;TCR=18;TR=16;WE=1937519;WS=1937501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr12	1943730	.	G	T	2640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.229;ClippingRankSum=0.000;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=57;PP=1655;ReadPosRankSum=0.201;SC=GTCGTGTGCGGCGTCGTCTGC;SOR=0.699;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=267;TCF=143;TCR=124;TR=121;WE=1943738;WS=1943720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,132:0.44:300
chr12	1950011	rs58188909	A	AC	6854.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=65;PP=2957;SC=CAACCCAGTCATGGGGAAGAG;SOR=0.867;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=80;TCF=13;TCR=67;TR=76;WE=1950019;WS=1950001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr12	1955664	rs7137553	G	T	867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.39;SOR=2.531;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr12	1955668	rs7138458	C	A	858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.94;SOR=2.531;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr12	1955890	rs7137876	T	C	5835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=108;PP=2946;ReadPosRankSum=-0.575;SC=GGTCACCACATGGCTGTGGCA;SOR=0.934;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=208;TCF=99;TCR=109;TR=206;WE=1955898;WS=1955880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,229:0.99:231
chr12	1967947	rs2286369	C	G	532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=16;PP=403;SC=CCTCATGCCCCCTTCTTTACC;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=1967955;WS=1967937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	1969262	rs10848582	T	C	3562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=357;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.795;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=83;PP=2457;ReadPosRankSum=-1.153;SC=GAGTTGCTGGTATTCATGTTC;SOR=0.742;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=326;TCF=160;TCR=166;TR=161;WE=1969270;WS=1969252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,174:0.49:356
chr12	1969435	rs2370057	G	C	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=16;PP=374;ReadPosRankSum=-0.062;SC=CCCCCACCTCGCCCCCAGGGC;SOR=0.850;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=49;TCF=17;TCR=32;TR=24;WE=1969443;WS=1969425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,28:0.50:56
chr12	1993337	rs2429184	T	C	1124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=4;PP=764;SC=TGCTCAGCACTTCCAGGGCTG;SOR=3.797;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=31;WE=1993345;WS=1993327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	1995042	rs10774003	A	G	644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=0;PP=482;SC=ATAAGCAAAAAGGGCCACAGA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=1995050;WS=1995032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr12	1995403	rs10735005	T	C	3660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=62;PP=2073;SC=ATGATATTAATGAAGTCATTC;SOR=0.799;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=63;TCR=62;TR=125;WE=1995411;WS=1995393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr12	2016550	rs112521420	A	ATTGTC	806.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=1;PP=703;SC=CAGTGCCCCTATTATTTCCAG;SOR=3.383;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=12;WE=2016558;WS=2016540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	2016938	rs113797488	AGCCTGGTGAGTAT	A	1223.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.36;QD=43.70;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr12	2019322	rs8181786	G	A	291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=5;PP=112;SC=ACAGACAAAAGGCACACACAT;SOR=1.802;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=2019330;WS=2019312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	2022411	rs1558142	T	C	1671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=44;PP=1043;SC=TTCCGGCACATGGAGCCTGGT;SOR=2.494;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=13;TCR=44;TR=57;WE=2022419;WS=2022401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr12	2024316	rs758157	A	G	6451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=111;NR=104;PP=2965;ReadPosRankSum=2.141;SC=ATGCATATGCATACACACACG;SOR=0.751;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=217;TCF=113;TCR=104;TR=215;WE=2024324;WS=2024306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,245:0.99:247
chr12	2039022	rs66541354	G	C	198.90	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=6.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.516;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,12:0.80:15
chr12	2039209	.	GAGGAGGAAGAGGGGGAGA	G	520.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.41;MQRankSum=1.746;QD=23.67;ReadPosRankSum=1.870;SOR=1.292;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr12	2039238	rs111237959	G	A	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=1.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.72;MQRankSum=-1.877;QD=6.35;ReadPosRankSum=-1.665;SOR=0.275;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr12	2039690	rs2429172	A	G	833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.660;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=30;PP=647;ReadPosRankSum=-1.180;SC=CAGAGAGCTCACTCTGCCTGG;SOR=1.655;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=69;TCF=12;TCR=57;TR=34;WE=2039698;WS=2039680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,35:0.50:70
chr12	2055266	rs7222	T	C	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=337;ReadPosRankSum=-0.431;SC=ACATACTTTTTTTTTAAAAAA;SOR=0.859;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=44;TCF=38;TCR=6;TR=19;WE=2055274;WS=2055256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,23:0.44:52
chr12	2058245	rs2240612	T	C	2534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=54;NR=29;PP=1334;SC=ATGACGTGCTTGCTTACCTGA;SOR=1.191;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=54;TCR=29;TR=83;WE=2058253;WS=2058235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr12	2059337	rs112215626	T	C	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=134;ReadPosRankSum=-0.426;SC=GAAGTTGCTGTAATTTTATAA;SOR=0.446;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=10;WE=2059345;WS=2059327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr12	2059473	rs112888038	A	G	1615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.559;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=28;PP=1062;ReadPosRankSum=-1.707;SC=AGGTGGAGTCAAGCATTCTGA;SOR=0.519;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=71;TCR=45;TR=72;WE=2059481;WS=2059463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,75:0.63:119
chr12	2059597	rs113447912	G	C	1434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.954;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=36;PP=896;ReadPosRankSum=1.169;SC=TATATTCATCGCATGCTTCTA;SOR=1.016;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=130;TCF=56;TCR=74;TR=60;WE=2059605;WS=2059587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,68:0.48:143
chr12	2061614	rs113839196	G	A	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.217;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=8;PP=534;ReadPosRankSum=0.556;SC=TCTGTGTTGGGTGTCTTGTTG;SOR=1.044;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=64;TCF=48;TCR=16;TR=34;WE=2061622;WS=2061604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,34:0.51:67
chr12	2061982	rs1044950	G	A	1417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.311;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=26;PP=861;ReadPosRankSum=-0.020;SC=GCTGGCAGGTGCTGGTGTACT;SOR=0.545;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=135;TCF=80;TCR=55;TR=63;WE=2061990;WS=2061972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,69:0.47:147
chr12	2062075	rs715146	C	T	2134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=50;PP=1340;ReadPosRankSum=0.961;SC=TTGTACACCACGAGAAGTTCC;SOR=0.714;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=207;TCF=111;TCR=96;TR=101;WE=2062083;WS=2062065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,108:0.46:235
chr12	2062135	rs113147414	G	A	1844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.167;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=39;PP=1046;ReadPosRankSum=-1.948;SC=AAATTCTCCCGCAGAATGGGT;SOR=0.539;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=164;TCF=83;TCR=81;TR=79;WE=2062143;WS=2062125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,90:0.47:190
chr12	2062323	rs149912567	T	TTGC	2001.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FS=0.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.21;MQRankSum=2.624;QD=11.77;ReadPosRankSum=0.957;SOR=0.752;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:107,63:0.37:170
chr12	2064575	rs11062033	A	G	990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.617;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=20;PP=709;ReadPosRankSum=-1.777;SC=CACACTGAATATGACAAGCAG;SOR=0.768;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=153;TCF=92;TCR=61;TR=51;WE=2064583;WS=2064565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,53:0.32:168
chr12	2064602	rs34730825	T	C	1197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=4.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.311;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=25;PP=2313;ReadPosRankSum=-0.306;SC=CCGTACCTGGTTGGGCTGAGG;SOR=1.018;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=196;TCF=115;TCR=81;TR=63;WE=2064624;WS=2064592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,65:0.30:216
chr12	2064616	rs34175323	A	G	1482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=4.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.673;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=29;PP=2313;ReadPosRankSum=-0.909;SC=GCTGAGGTATACGCTGTTGCT;SOR=1.048;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=218;TCF=125;TCR=93;TR=74;WE=2064624;WS=2064592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,78:0.32:240
chr12	2064634	rs35252166	A	G	1886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.966;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=39;PP=1196;ReadPosRankSum=-0.593;SC=GCTGGTTTTCACTGGGTTTCA;SOR=0.984;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=247;TCF=140;TCR=107;TR=95;WE=2064642;WS=2064624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,103:0.37:275
chr12	2064747	rs113460897	C	A	1278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.680;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=37;PP=799;ReadPosRankSum=0.908;SC=AAAGAAAATCCCCTCATTTTT;SOR=0.999;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=108;TCF=32;TCR=76;TR=51;WE=2064755;WS=2064737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,57:0.50:113
chr12	2064820	rs112571799	C	T	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.101;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=142;ReadPosRankSum=-0.803;SC=AATTGGTAGACGGCTGTGTTT;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=8;WE=2064828;WS=2064810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr12	2074543	rs112012351	A	G	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.421;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=154;ReadPosRankSum=-0.491;SC=TAACCCACTTAAAGGCAAACA;SOR=0.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=9;WE=2074551;WS=2074536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr12	2077897	rs2470425	G	C	1777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=30;PP=1138;ReadPosRankSum=-1.119;SC=AAGTTAGGGAGAGGCCACTGG;SOR=0.754;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=62;TCF=32;TCR=30;TR=61;WE=2077905;WS=2077887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,66:0.97:68
chr12	2077931	rs112299955	C	T	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=171;ReadPosRankSum=-0.838;SC=TAATAATAAACTTCTGGCTTC;SOR=0.562;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=41;TCF=17;TCR=24;TR=15;WE=2077939;WS=2077921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,17:0.37:46
chr12	2080373	rs112721107	A	G	1217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.876;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=31;PP=766;ReadPosRankSum=0.062;SC=TGGAGGTAAGAAACCCTAAAG;SOR=0.954;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=78;TCF=30;TCR=48;TR=49;WE=2080381;WS=2080363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,53:0.62:86
chr12	2100509	rs113498916	T	G	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.222;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=206;ReadPosRankSum=1.093;SC=AAACATAAAATAAAATATGAA;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=10;WE=2100517;WS=2100499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr12	2102271	rs112637373	T	G	1204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.737;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=17;PP=729;ReadPosRankSum=-0.730;SC=TATTCCATCATTAGGGCATGC;SOR=0.574;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=72;TCR=36;TR=50;WE=2102279;WS=2102261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,56:0.49:114
chr12	2102403	rs140441717	C	A	2467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.336;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=49;PP=1637;ReadPosRankSum=-0.755;SC=AGAAGTAAAACAACCCACTGT;SOR=0.715;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=202;TCF=105;TCR=97;TR=105;WE=2102411;WS=2102391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,113:0.53:213
chr12	2107036	rs2302098	T	C	471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.041;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=10;PP=334;ReadPosRankSum=-0.054;SC=TGAAGAAGAGTGACACAACGG;SOR=1.017;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=68;TCF=44;TCR=24;TR=29;WE=2107044;WS=2107026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,28:0.39:72
chr12	2113348	rs7298333	A	C	1093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.235;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=22;PP=648;ReadPosRankSum=-0.909;SC=CCAGGGCGTCAACGTCTCCTC;SOR=0.844;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=119;TCF=67;TCR=52;TR=48;WE=2113356;WS=2113338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,55:0.41:133
chr12	2224228	rs2299661	C	G	382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=1;PP=302;SC=GGCCCTCTTCCCTCAGCATCT;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=2224236;WS=2224223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	2613521	rs1008832	A	G	1989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=54;NR=14;PP=1345;SC=GTCCCCTCCCAATCTGCTCAC;SOR=2.472;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=54;TCR=14;TR=68;WE=2613529;WS=2613511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr12	2613716	rs2238087	C	T	1937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.586;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=51;PP=1286;ReadPosRankSum=0.417;SC=GTAAGCTGACCGTTTCTATGT;SOR=0.636;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=153;TCF=58;TCR=95;TR=82;WE=2613724;WS=2613706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,88:0.53:166
chr12	2659044	rs34277236	TG	T	4300.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.864;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.04;MQRankSum=1.083;NF=33;NR=41;PP=2772;ReadPosRankSum=-1.396;SC=TGCAAACTACTGCTCTTCTGT;SOR=0.988;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=158;TCF=58;TCR=100;TR=74;WE=2659052;WS=2659034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,128:0.46:276
chr12	2659082	rs11062272	G	T	3346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=372;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.318;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.111;NF=88;NR=58;PP=1916;ReadPosRankSum=2.128;SC=CTCAATGCCTGGCTCTGCTTC;SOR=0.857;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=337;TCF=193;TCR=144;TR=146;WE=2659090;WS=2659072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:204,167:0.45:371
chr12	2659622	rs12304811	G	A	763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.807;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=13;PP=467;ReadPosRankSum=1.629;SC=TGATAAATGTGACCTGGGAGA;SOR=0.795;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=79;TCF=49;TCR=30;TR=35;WE=2659630;WS=2659612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,37:0.42:88
chr12	2659848	rs10848675	T	C	1358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=22;PP=843;SC=CATTTCTGAATTGCTCCACCT;SOR=0.909;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=22;TCR=22;TR=44;WE=2659856;WS=2659838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr12	2659942	rs79331677	C	T	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.190;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=111;ReadPosRankSum=0.664;SC=CCTTTCACAACGCTGAGCTGT;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=7;WE=2659950;WS=2659932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr12	2665940	rs117791272	A	G	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.905;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=3;PP=346;ReadPosRankSum=1.149;SC=CAGTCTCCACATTCAAATACA;SOR=1.236;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=62;TCF=51;TCR=11;TR=24;WE=2665948;WS=2665930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,22:0.35:62
chr12	2676683	rs2370602	C	T	633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=1;PP=491;SC=CTGCCTCCCTCTCTGCCTCCT;SOR=3.716;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=2676691;WS=2676678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr12	2676781	.	C	T	1241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.536;ClippingRankSum=0.000;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.645;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=13;PP=905;ReadPosRankSum=-0.312;SC=CAGAGATGCTCCTGAAGATGT;SOR=1.721;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=111;TCF=74;TCR=37;TR=51;WE=2676789;WS=2676771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,54:0.46:118
chr12	2690702	rs11832738	G	A	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=2.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.40;ReadPosRankSum=0.119;SOR=0.411;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,33:0.38:87
chr12	2706720	rs215983	G	C	4152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=64;PP=2137;SC=TCTGCTCTGTGTGGCTGGATC;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=126;TCF=62;TCR=64;TR=126;WE=2706728;WS=2706710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr12	2743650	rs59658684	A	AT	229.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=1.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.74;ReadPosRankSum=0.476;SOR=0.951;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,15:0.38:40
chr12	2750893	rs2239124	C	T	1398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=28;PP=686;ReadPosRankSum=-0.818;SC=AGGCGATGCTCAACCTGCAGG;SOR=0.742;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=112;TCF=57;TCR=55;TR=57;WE=2750901;WS=2750883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,66:0.52:126
chr12	2751009	rs2239125	A	G	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=178;ReadPosRankSum=1.546;SC=GCTGTTTTCTACTCTGCTTAA;SOR=0.631;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=11;WE=2751017;WS=2750999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr12	2757756	rs2239127	T	C	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.455;HP=3;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=617;ReadPosRankSum=0.000;SC=AACTCCAGAGTCCCTGGGAGC;SOR=1.706;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=42;TCF=15;TCR=27;TR=13;WE=2757790;WS=2757746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,12:0.30:40
chr12	2757769	rs2239128	T	C	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.580;HP=3;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=583;ReadPosRankSum=0.572;SC=CTGGGAGCCCTGCCTGGCTCT;SOR=1.473;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=34;TCF=11;TCR=23;TR=13;WE=2757790;WS=2757746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr12	2757782	rs2239129	C	T	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.717;HP=1;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=617;ReadPosRankSum=0.195;SC=CTGGCTCTCACTGCATGTGGC;SOR=1.833;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=35;TCF=13;TCR=22;TR=12;WE=2757790;WS=2757746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,12:0.33:36
chr12	2760965	rs34428885	GA	G	1577.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=29;PP=1171;SC=GCGGCCCGGGGAATCGCAGGG;SOR=2.409;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=29;WE=2760973;WS=2760955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr12	2773862	rs4765702	T	G	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=446;ReadPosRankSum=-0.623;SC=CAGGGAATGATGAACATCAAG;SOR=0.793;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=10;WE=2773878;WS=2773852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr12	2773870	rs45555233	A	G	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=154;ReadPosRankSum=0.053;SC=GATGAACATCAAGTTCATTTT;SOR=0.512;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=6;WE=2773878;WS=2773852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr12	2778272	rs35749666	G	GC	3201.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.526;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.542;NF=3;NR=53;PP=2033;ReadPosRankSum=0.100;SC=GAGCTCGGCAGCCTGCAAAGT;SOR=1.069;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=108;TCF=5;TCR=103;TR=56;WE=2778280;WS=2778262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,108:0.56:192
chr12	2783517	rs11062308	G	A	1427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.148;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=21;PP=955;ReadPosRankSum=1.939;SC=AAGGAAGGTGGACAGAGGAAG;SOR=0.929;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=135;TCF=85;TCR=50;TR=62;WE=2783525;WS=2783507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,68:0.46:147
chr12	2786115	rs12818148	C	G	576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=3;PP=406;ReadPosRankSum=-0.122;SC=TTTTTTTTCTCTCTTTTTAAG;SOR=0.540;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=53;TCF=46;TCR=7;TR=24;WE=2786123;WS=2786105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,25:0.46:54
chr12	2787058	rs2302731	C	T	1868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=45;PP=1076;ReadPosRankSum=-1.315;SC=GGCGCACTCTCGACCCCTATA;SOR=0.695;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=183;TCF=88;TCR=95;TR=85;WE=2787066;WS=2787048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,93:0.45:208
chr12	2789401	rs35692616	C	CA	81.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=100;ReadPosRankSum=0.362;SC=GAGGGCATCCCCTGTGGGAGG;SOR=0.188;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=4;WE=2789409;WS=2789391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr12	2789787	rs12299577	A	G	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQRankSum=-0.889;QD=19.29;ReadPosRankSum=0.392;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr12	2789787	.	AGC	GGG	503	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=59.67;NF=3;NR=11;PP=503;QD=39.7477053473;SC=ATAGAGAAGTAGCAGCTTCCC;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=14;WE=2789797;WS=2789777;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr12	2789789	rs12319450	C	G	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQRankSum=-0.849;QD=20.03;ReadPosRankSum=0.029;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr12	2791205	rs10774054	A	G	2623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=59;NR=30;PP=1642;SC=CTGCTCAGGAAAGCAAACCCC;SOR=1.167;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=90;TCF=59;TCR=31;TR=89;WE=2791213;WS=2791195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr12	2794791	rs11062315	T	G	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.187;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=231;ReadPosRankSum=-1.694;SC=GCACAAAGTGTGCGTCCCTTC;SOR=0.260;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=13;WE=2794799;WS=2794783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr12	2795119	.	T	TG	467.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.330;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.833;NF=6;NR=7;PP=433;ReadPosRankSum=-0.942;SC=CCCCACACAGTGGGGCATTTC;SOR=0.294;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=13;WE=2795127;WS=2795109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr12	2795255	rs2270373	C	T	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.748;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.942;NF=23;NR=12;PP=443;ReadPosRankSum=1.741;SC=CTCCTGGCACCCCACCAGGGT;SOR=1.145;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=100;TCF=60;TCR=40;TR=35;WE=2795263;WS=2795245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,38:0.34:113
chr12	2799987	rs55830098	C	T	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=118;ReadPosRankSum=-0.507;SC=TACCCCCTCGCTCTAGCCCTC;SOR=0.556;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=11;WE=2799995;WS=2799977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr12	2851185	rs12319038	A	G	473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.26;QD=27.87;SOR=1.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	2851259	rs12319097	A	G	2152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.35;QD=26.25;SOR=0.961;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr12	2851357	rs10774059	C	T	3186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.26;QD=42.49;SOR=0.832;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr12	2851365	rs4765989	T	C	3000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.88;QD=44.79;SOR=0.849;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr12	2876636	rs4313632	A	G	1029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.430;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=20;PP=657;ReadPosRankSum=-0.117;SC=GGTGAGAAGCAGCTTTGTTCT;SOR=0.892;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=120;TCF=67;TCR=53;TR=49;WE=2876644;WS=2876626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,54:0.42:128
chr12	2907087	rs41456246	G	A	1632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=44;PP=952;ReadPosRankSum=0.032;SC=CCTTATCTCAGCCCAATGCCT;SOR=0.723;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=160;TCF=68;TCR=92;TR=77;WE=2907095;WS=2907077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,82:0.48:172
chr12	2937013	rs4765998	G	C	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.509;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=130;ReadPosRankSum=0.582;SC=GCTGCAGGGAGTGAAAGTCTC;SOR=0.399;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=7;WE=2937021;WS=2937007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr12	2968458	rs2215292	T	C	3490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.879;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=63;PP=2266;ReadPosRankSum=1.467;SC=GATGCTGTTTTCTCCGAGACC;SOR=0.823;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=284;TCF=155;TCR=129;TR=146;WE=2968466;WS=2968448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,158:0.51:310
chr12	3018675	rs11305670	AT	A	42.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=1.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.47;ReadPosRankSum=-0.179;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,7:0.24:29
chr12	3043634	.	G	C	2240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.575;ClippingRankSum=0.000;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.957;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=49;PP=1414;ReadPosRankSum=0.696;SC=TGGGGACCAAGTTTACAGTTT;SOR=0.614;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=214;TCF=111;TCR=103;TR=100;WE=3043642;WS=3043624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,114:0.44:258
chr12	3047466	rs2074987	G	A	743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=23;PP=512;ReadPosRankSum=-1.499;SC=GCCTCCAGGAGGGGTTGGGTG;SOR=0.780;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=61;TCF=20;TCR=41;TR=33;WE=3047474;WS=3047456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,34:0.52:66
chr12	3127652	rs2159411	A	G	2114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=18;PP=1426;SC=CCACCCCCACACCACAGGGCC;SOR=2.103;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=55;TCR=18;TR=73;WE=3127660;WS=3127642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr12	3130938	rs4759380	A	G	913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=1;PP=741;SC=CGTGGTGGGCACGCAGAGCCA;SOR=4.743;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=33;WE=3130946;WS=3130928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr12	3131206	rs3741952	T	C	4355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=86;PP=2732;SC=TAACCCCTTCTTTCCTGCCAC;SOR=1.460;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=53;TCR=86;TR=139;WE=3131214;WS=3131196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr12	3131238	rs4759379	A	G	2326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=47;PP=1485;SC=TGGTAGTGAGAACGGGGCGAG;SOR=1.725;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=25;TCR=47;TR=72;WE=3131246;WS=3131228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr12	3149483	rs7294804	A	G	4098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=75;PP=2574;SC=CAGCCATGGCATGCCCCTTCT;SOR=0.845;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=143;TCF=68;TCR=75;TR=143;WE=3149491;WS=3149473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr12	3310335	rs740777	C	T	2489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=24;PP=1526;SC=CCTTTGTGTTCCTCCTAGAAT;SOR=1.481;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=53;TCR=24;TR=77;WE=3310343;WS=3310325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr12	3315433	rs2058243	A	G	4608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=66;PP=2760;SC=CTGAATGCCCACTCTGTGCAC;SOR=1.046;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=164;TCF=98;TCR=66;TR=164;WE=3315441;WS=3315423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr12	3409277	rs7306401	C	T	4750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=105;PP=2965;SC=CTGCAGGTGCCGGAGAAGGCC;SOR=1.556;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=159;TCF=54;TCR=105;TR=159;WE=3409285;WS=3409267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr12	3490820	rs10848860	T	C	510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=370;SC=TTGTTTCAATTAAACTTTTAA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=3490828;WS=3490810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	3600967	rs757609	T	C	562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=14;PP=381;SC=CTTTCCCCAGTTTCATCCCGC;SOR=3.500;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=16;WE=3600975;WS=3600957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	3647766	rs3741938	C	T	876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.39;ReadPosRankSum=0.244;SOR=0.512;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,42:0.55:77
chr12	3701390	rs3741935	C	T	4198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=358;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.249;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=85;PP=2492;ReadPosRankSum=0.865;SC=GTTCTCTCACCCCTCAGCCCC;SOR=0.625;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=328;TCF=178;TCR=150;TR=183;WE=3701398;WS=3701380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,200:0.56:358
chr12	3702219	rs4765741	A	G	1783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=20;PP=1132;SC=CTGTGGCTTCATACCCAGACG;SOR=1.678;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=43;TCR=20;TR=63;WE=3702227;WS=3702209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr12	3736734	rs10848893	C	T	3285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.422;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=77;PP=1965;ReadPosRankSum=-0.833;SC=AGAAGGGCCACGGGTCAGGCA;SOR=0.738;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=277;TCF=125;TCR=152;TR=141;WE=3736753;WS=3736724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,153:0.51:300
chr12	3736745	rs10848894	T	C	7046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=110;NR=135;PP=2962;SC=GGGTCAGGCATGCACGGCCTT;SOR=0.959;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=246;TCF=110;TCR=136;TR=245;WE=3736753;WS=3736724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,268:1.00:268
chr12	3749874	rs7138453	T	C	6113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.102;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=111;NR=104;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.574;SC=TTTCATTTCATGCTTGCAGTC;SOR=0.304;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=216;TCF=112;TCR=104;TR=215;WE=3749882;WS=3749864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,238:1.00:239
chr12	3750070	rs4766151	T	C	176.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=7;PP=137;SC=CAACAAAATGTGTTATGTTTG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=3750078;WS=3750060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	3751046	rs7297853	T	C	7864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=129;NR=132;PP=2965;SC=GCCTATTTGCTCCGATGTTTG;SOR=0.778;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=262;TCF=129;TCR=133;TR=261;WE=3751054;WS=3751036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,292:1.00:292
chr12	3753975	rs7975304	T	G	1022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=29;PP=762;SC=AGGATAGTTTTTGTGTACAGA;SOR=3.321;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=34;WE=3753983;WS=3753965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr12	3757548	rs887304	T	C	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.297;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=183;ReadPosRankSum=-0.045;SC=AGTGGCTACTTGGTGGTCCAA;SOR=0.385;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=55;TCF=44;TCR=11;TR=17;WE=3757556;WS=3757538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,16:0.26:61
chr12	3757923	rs758530	A	G	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.057;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=81;ReadPosRankSum=0.819;SC=GAGCTCCTACAGTATGCAAGT;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=3757931;WS=3757913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr12	3782456	rs55825408	A	G	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.310;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=118;ReadPosRankSum=1.608;SC=TTAAAAATACATATATCGTGA;SOR=1.833;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=10;WE=3782464;WS=3782446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr12	3782480	rs56040859	T	C	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=228;ReadPosRankSum=0.134;SC=ACACAGGGCCTGGTCCCCACT;SOR=0.465;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=17;WE=3782488;WS=3782470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr12	3782647	rs36030417	A	T	975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=22;PP=492;ReadPosRankSum=-0.042;SC=TCTTCTCCTCATGGGCTTCTT;SOR=0.637;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=119;TCF=56;TCR=63;TR=44;WE=3782655;WS=3782637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,54:0.41:133
chr12	3782701	rs17697920	C	T	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=16;PP=318;ReadPosRankSum=1.644;SC=CAAAGTTGGACAGTAAATGAG;SOR=0.743;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=75;TCF=29;TCR=46;TR=25;WE=3782709;WS=3782691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,31:0.36:85
chr12	3782779	rs61907258	A	G	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.345;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=27;ReadPosRankSum=0.703;SC=AGGGACGCTCATGTGGAAGTG;SOR=0.307;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=3;WE=3782787;WS=3782769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr12	3787956	rs242019	A	C	1342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=9;PP=939;SC=GCGGGCCTTTACCTGCACTGC;SOR=2.409;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=32;TCR=9;TR=41;WE=3787964;WS=3787946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr12	3948550	rs12319851	A	G	1170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.868;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.165;NF=28;NR=15;PP=610;ReadPosRankSum=1.959;SC=ATGGACGCCTATCTGCGGAAA;SOR=0.288;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=83;TCF=57;TCR=26;TR=43;WE=3948558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,51:0.57:89
chr12	3948718	rs3809251	G	A	8237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=138;NR=133;PP=2965;SC=GCGATTATAGGAGGATCATTT;SOR=0.700;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=271;TCF=138;TCR=133;TR=271;WE=3948726;WS=3948708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,305:1.00:305
chr12	3950977	rs7295047	T	C	3342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.474;NF=71;NR=65;PP=2143;ReadPosRankSum=-1.481;SC=AGGCAGAATATTGTCCTGCCC;SOR=0.718;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=235;TCF=127;TCR=108;TR=136;WE=3950985;WS=3950967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,151:0.56:269
chr12	3982657	rs4766179	A	G	1395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=36;PP=1025;SC=ACGCTTATCCATACGCGCGCG;SOR=3.033;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=8;TCR=36;TR=44;WE=3982665;WS=3982647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr12	4388084	rs3217805	C	G	7423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=127;NR=133;PP=2965;SC=TGTGTGCCACCGGTAAGATGA;SOR=0.804;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=260;TCF=127;TCR=133;TR=260;WE=4388092;WS=4388074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,283:1.00:283
chr12	4430547	rs10774222	C	T	4916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=66;NR=95;PP=2706;SC=AAAACGGGTCCACCACCCTCT;SOR=1.235;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=161;TCF=66;TCR=95;TR=161;WE=4430555;WS=4430537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr12	4446116	rs7296163	T	C	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=187;ReadPosRankSum=0.643;SC=AAAATTTAGATAAATGCAGCT;SOR=0.223;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=12;WE=4446124;WS=4446106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
chr12	4461485	rs7133330	G	A	1718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.679;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=34;PP=984;ReadPosRankSum=-2.432;SC=TGAAAGAAGCGGATCAAAAAG;SOR=0.497;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=156;TCF=93;TCR=63;TR=74;WE=4461493;WS=4461475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,83:0.47:175
chr12	4537658	rs2970806	G	A	1726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=29;NR=26;PP=872;SC=TTCAACGTCAGACCCACCTGG;SOR=0.854;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=29;TCR=26;TR=55;WE=4537666;WS=4537648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr12	4554548	rs7358740	G	C	14663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=563;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=255;NR=247;PP=2965;SC=CAGCTAGCCCGGCGCGAGACC;SOR=0.722;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=503;TCF=256;TCR=247;TR=502;WE=4554556;WS=4554538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,562:1.00:562
chr12	4639340	rs139033748	A	G	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=124;ReadPosRankSum=-0.748;SC=TTATATATATATGTGTGTGTA;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=7;WE=4639348;WS=4639330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr12	4645161	rs63144961	TA	T	31.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQRankSum=2.264;QD=0.29;ReadPosRankSum=0.502;SOR=0.699;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,16:0.15:110
chr12	4662210	rs17850028	T	C	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.985;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=345;ReadPosRankSum=0.792;SC=AAGACTTCTCTATGAGAAAAA;SOR=0.502;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=59;TCF=42;TCR=17;TR=27;WE=4662218;WS=4662200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,32:0.48:66
chr12	4671429	rs34206253	G	T	6533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=113;NR=99;PP=2965;SC=TCCTCCCGCCGCCTATCCGCA;SOR=0.727;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=212;TCF=113;TCR=99;TR=212;WE=4671437;WS=4671419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr12	4671490	rs740059	G	A	6333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=105;NR=118;PP=2965;SC=GCAGTCAGGCGCGAGTACGAG;SOR=0.883;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=223;TCF=105;TCR=118;TR=223;WE=4671498;WS=4671480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr12	4677255	rs2240766	T	C	967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=28;PP=727;ReadPosRankSum=-2.154;SC=AGAGGTATCATTGCGAGGTCC;SOR=0.784;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=77;TCF=21;TCR=56;TR=39;WE=4677263;WS=4677245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,40:0.49:81
chr12	4682418	rs3815360	T	G	445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=320;ReadPosRankSum=-0.507;SC=GGCATTTACTTCTATATAATG;SOR=0.765;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=17;WE=4682426;WS=4682408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr12	4689963	.	AT	A	286.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=0.000;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.08;MQRankSum=1.791;QD=2.78;ReadPosRankSum=0.674;SOR=0.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,28:0.27:103
chr12	4697987	rs2041295	A	T	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=1.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.13;ReadPosRankSum=0.689;SOR=0.420;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,17:0.40:43
chr12	4697991	rs2041294	AT	GG	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=1.271;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.97;ReadPosRankSum=0.350;SOR=0.458;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,19:0.41:46
chr12	4700221	rs2302248	G	T	1098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=17;PP=797;ReadPosRankSum=-0.231;SC=GGAGAGGTAGGTAAAGAGCCT;SOR=0.611;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=90;TCF=61;TCR=29;TR=48;WE=4700229;WS=4700211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,50:0.50:100
chr12	4714008	rs2286576	T	G	791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.071;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=6;PP=400;ReadPosRankSum=-0.507;SC=AACTGAGAAGTTGTCCTGGGG;SOR=0.527;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=40;TCR=11;TR=27;WE=4714016;WS=4713998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,35:0.57:61
chr12	4716572	rs997373	C	A	833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.612;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=22;PP=520;ReadPosRankSum=1.563;SC=TAGTGTGTCTCATGAGGTGTC;SOR=1.230;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=63;TCF=20;TCR=43;TR=30;WE=4716580;WS=4716562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,35:0.49:72
chr12	4725134	rs7301885	G	A	2218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=57;PP=1644;SC=TGCCAAGGCTGGAGCAGAGAG;SOR=3.136;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=11;TCR=57;TR=68;WE=4725142;WS=4725124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr12	4735965	rs200178782	T	TC	2850.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.17;ReadPosRankSum=2.498;SOR=0.681;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,75:0.45:166
chr12	4735968	.	AGA	CAG	2934	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=39;NR=32;PP=2934;QD=20;SC=TGGCATCTCCAGACTTGTCAT;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=161;TCF=89;TCR=72;TR=71;WE=4735978;WS=4735958;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:90,71:0.44:161
chr12	4735969	rs67512580	GA	G	2906.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.71;ReadPosRankSum=2.961;SOR=0.668;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:97,77:0.44:174
chr12	4736495	rs1990312	C	T	2473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=33;PP=1710;SC=ATCAGGTCCTCGGCCCAGGAG;SOR=0.821;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=39;TCR=33;TR=72;WE=4736503;WS=4736485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr12	4736569	rs12366671	A	G	2082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.348;HP=1;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=34;PP=1341;ReadPosRankSum=-0.847;SC=GAGGTTGCCAATATCTTCAGG;SOR=1.020;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=160;TCF=94;TCR=66;TR=86;WE=4736577;WS=4736559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,94:0.52:180
chr12	4736631	rs11063265	A	G	6768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=129;NR=99;PP=2965;SC=TGGGAGCTTCAAATGCTGCAT;SOR=0.969;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=228;TCF=129;TCR=99;TR=228;WE=4736639;WS=4736621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr12	4736677	rs11063266	G	C	8619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=144;NR=135;PP=2965;SC=TTTCTGCTGAGTTTTATGCCA;SOR=0.739;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=280;TCF=145;TCR=135;TR=279;WE=4736698;WS=4736667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,311:1.00:311
chr12	4736690	rs10774251	A	G	9040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=155;NR=138;PP=2965;SC=TTATGCCACAAGGTAAGCCCC;SOR=0.756;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=293;TCF=155;TCR=138;TR=293;WE=4736698;WS=4736667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,326:1.00:326
chr12	4737042	rs7972737	G	A	3042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.899;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=67;PP=1724;ReadPosRankSum=0.994;SC=CTGTGACGCTGTGGAGATTCC;SOR=0.633;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=253;TCF=116;TCR=137;TR=127;WE=4737050;WS=4737032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,146:0.51:288
chr12	4737318	rs7960207	A	G	7328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=127;NR=126;PP=2965;SC=CATAATCTCCATTACGAGATT;SOR=0.722;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=253;TCF=127;TCR=126;TR=253;WE=4737326;WS=4737308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr12	4737459	rs2072356	C	T	1954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.746;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=34;PP=1191;ReadPosRankSum=-2.832;SC=GTGATGATCCCGAGACTCTGT;SOR=0.532;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=141;TCF=71;TCR=70;TR=75;WE=4737467;WS=4737449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,85:0.54:158
chr12	4737715	rs2072355	C	T	2500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.491;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=46;PP=1502;ReadPosRankSum=2.368;SC=TACTGAACTCCCGTTGCCAAG;SOR=0.763;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=185;TCF=100;TCR=85;TR=107;WE=4737723;WS=4737705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,113:0.58:196
chr12	4740515	rs11063270	A	T	2337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.722;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=53;PP=1373;ReadPosRankSum=-0.754;SC=TTGTGCTCACATGGAAGGAGA;SOR=0.848;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=236;TCF=120;TCR=116;TR=104;WE=4740523;WS=4740505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,115:0.44:262
chr12	4740588	rs11063271	G	T	976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.403;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=32;PP=659;ReadPosRankSum=0.969;SC=CCACAAAGTGGGGCTGAAAGT;SOR=0.942;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=117;TCF=43;TCR=74;TR=48;WE=4740596;WS=4740566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,50:0.38:130
chr12	4740681	.	C	T	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.259;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.21;ReadPosRankSum=0.464;SOR=0.169;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr12	4740690	rs12227238	C	T	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.92;ReadPosRankSum=0.709;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr12	4758188	rs714621	G	C	1708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.315;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=32;PP=1069;ReadPosRankSum=0.181;SC=CGAAACCGTCGTTTCTTGGTT;SOR=0.514;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=119;TCF=69;TCR=50;TR=74;WE=4758196;WS=4758178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,79:0.62:127
chr12	4763780	rs3217056	GCA	G	344.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=2.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=348;ReadPosRankSum=-1.525;SC=GACATGAAGAGCACACTCATG;SOR=0.582;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=9;WE=4763789;WS=4763770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr12	4768354	rs7972657	A	C	1765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=34;NR=24;PP=902;SC=GTAAGTAACAAATTGATCTGG;SOR=0.722;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=34;TCR=24;TR=58;WE=4768362;WS=4768344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr12	4768437	rs7958182	C	T	836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=16;PP=430;SC=TTATCACAGACATATGTAGAA;SOR=1.473;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=11;TCR=16;TR=27;WE=4768445;WS=4768427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr12	4771682	rs2267549	G	A	1581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.376;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=30;PP=955;ReadPosRankSum=-1.396;SC=AAACAGGTTTGTTTGGTTATT;SOR=0.492;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=112;TCF=67;TCR=45;TR=70;WE=4771690;WS=4771672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,74:0.60:123
chr12	4779087	rs1009633	A	G	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=49;ReadPosRankSum=0.389;SC=TACAATATCAAAATCTCCTCA;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=4;WE=4779095;WS=4779077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr12	4794351	rs2240760	A	G	2027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=36;PP=1362;SC=GTCTTCCTGCAGTTCTCATAG;SOR=0.908;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=38;TCR=36;TR=74;WE=4794359;WS=4794341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr12	4854539	rs34073667	T	TC	381.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=419;ReadPosRankSum=1.588;SC=TTATCTGCTCTCCCCTACTGC;SOR=0.941;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=13;WE=4854547;WS=4854529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr12	4919267	rs758534	A	G	1611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.660;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=40;PP=996;ReadPosRankSum=1.490;SC=GGCCGGAGGGAGAGCAACAGG;SOR=1.058;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=141;TCF=69;TCR=72;TR=72;WE=4919275;WS=4919257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,81:0.51:159
chr12	4959874	rs10774275	T	C	1708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.909;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=25;PP=967;ReadPosRankSum=-2.393;SC=ACTAACTACATGTCCTTTTGT;SOR=0.871;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=158;TCF=102;TCR=56;TR=74;WE=4959882;WS=4959864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,82:0.46:178
chr12	5021228	rs1048500	T	C	8815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=135;NR=146;PP=2965;SC=AAACGCTGTGTATCATCTGGT;SOR=0.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=283;TCF=136;TCR=147;TR=281;WE=5021236;WS=5021218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,319:1.00:319
chr12	5021348	rs2227910	G	C	4681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=75;PP=2965;SC=ATTTCATCACGCTGGGCACCG;SOR=0.830;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=151;TCF=76;TCR=75;TR=151;WE=5021356;WS=5021338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr12	5021984	rs4766309	T	A	8476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=133;NR=140;PP=2965;SC=ATTGCACCACTGCTAACCAAA;SOR=0.824;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=274;TCF=133;TCR=141;TR=273;WE=5021992;WS=5021974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,307:1.00:307
chr12	5022041	rs4766310	G	A	5595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=105;PP=2965;SC=AAAAAACAAAGGCAAGCAAAC;SOR=1.106;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=185;TCF=80;TCR=105;TR=185;WE=5022049;WS=5022031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr12	5154462	rs2359641	T	C	5194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=108;PP=2965;SC=AGCCAGGGGGTGGAGGAGGCG;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=181;TCF=73;TCR=108;TR=181;WE=5154470;WS=5154452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr12	5603632	rs6332	G	A	5042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=491;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=116;NR=108;PP=2962;ReadPosRankSum=0.038;SC=CATTCCAGCCGGTGATTGCAA;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=443;TCF=230;TCR=213;TR=224;WE=5603640;WS=5603622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:244,244:0.50:488
chr12	5674754	rs2277398	G	A	1989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.694;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=36;PP=1228;ReadPosRankSum=-0.420;SC=CCAGACGGGCGGACAGAATAA;SOR=0.850;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=194;TCF=104;TCR=90;TR=87;WE=5674773;WS=5674744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,96:0.46:209
chr12	5721962	rs3741837	A	G	1627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=26;PP=1097;ReadPosRankSum=1.393;SC=TTAGAACAAAAGGGAGCTCTG;SOR=0.223;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=25;TCR=27;TR=51;WE=5721970;WS=5721952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,56:0.98:57
chr12	5756783	rs2277400	C	G	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.761;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=206;ReadPosRankSum=-0.399;SC=TGTGGCTTCCCCTTTACCAGC;SOR=0.346;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=58;TCF=47;TCR=11;TR=21;WE=5756791;WS=5756773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,23:0.38:61
chr12	5756824	rs367978	C	T	1115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.266;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=15;PP=719;ReadPosRankSum=-0.845;SC=GAATATAATACCCACAGTAGT;SOR=0.940;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=144;TCF=99;TCR=45;TR=52;WE=5756832;WS=5756814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,57:0.38:151
chr12	5841841	rs2277401	G	C	3424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.320;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=65;PP=2339;ReadPosRankSum=0.853;SC=AAGGAAGAATGACCTTGGCCT;SOR=0.792;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=297;TCF=163;TCR=134;TR=145;WE=5841849;WS=5841831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,156:0.48:323
chr12	5848953	rs17195410	C	T	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=3;PP=445;ReadPosRankSum=-1.269;SC=CCTCCTTCACCTTCATCAGCA;SOR=0.627;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=61;TCF=52;TCR=9;TR=25;WE=5848961;WS=5848943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,27:0.40:68
chr12	5860179	rs2277402	T	C	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.452;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=206;ReadPosRankSum=-1.866;SC=ATTAAGAACATCATATACTTT;SOR=1.765;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=12;WE=5860187;WS=5860169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr12	5916350	rs2277403	G	A	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.011;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=336;ReadPosRankSum=-1.140;SC=GGTCAGTCAAGGTATTTTAAT;SOR=1.292;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=56;TCF=42;TCR=14;TR=20;WE=5916358;WS=5916340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,25:0.39:64
chr12	5936818	.	C	T	1135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=0.000;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.035;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=24;PP=682;ReadPosRankSum=-1.138;SC=GCAGCCTCTCCGTGGGGGGCA;SOR=0.902;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=146;TCF=82;TCR=64;TR=57;WE=5936836;WS=5936808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,61:0.38:162
chr12	5961048	rs7485945	G	A	8000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=145;NR=125;PP=2965;SC=CACTTTTCCTGTGTCTCTAGG;SOR=0.833;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=270;TCF=145;TCR=125;TR=270;WE=5961056;WS=5961038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,304:1.00:304
chr12	6032129	rs12817045	A	G	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.625;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.80;ReadPosRankSum=-0.461;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr12	6032138	rs12817050	A	G	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.291;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.60;ReadPosRankSum=-1.282;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr12	6054277	rs6416321	G	A	2310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=45;PP=1349;ReadPosRankSum=0.072;SC=AATCCCGAAGGGTGGGAGTTC;SOR=0.684;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=200;TCF=112;TCR=88;TR=100;WE=6054285;WS=6054267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,113:0.48:233
chr12	6054395	rs6489680	A	G	5054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=80;NR=90;PP=2906;SC=ATGTGGACGCAGACCCCGCCG;SOR=0.961;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=170;TCF=80;TCR=90;TR=170;WE=6054403;WS=6054385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr12	6055132	rs6489682	T	G	2893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=27;PP=1981;SC=AGGAGTGCCATCTCCCCGGGA;SOR=1.945;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=65;TCR=27;TR=92;WE=6055140;WS=6055122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr12	6062853	rs3759320	C	T	1227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-3.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.972;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=28;PP=632;ReadPosRankSum=1.580;SC=TCATCTCTCTCATCCAGTAGT;SOR=0.224;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=97;TCF=36;TCR=61;TR=53;WE=6062861;WS=6062843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,58:0.52:111
chr12	6062878	rs3759321	G	A	789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.475;HP=1;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=20;PP=974;ReadPosRankSum=1.469;SC=CCTAGAATTCGGAAAGTCAAC;SOR=0.354;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=50;TCF=15;TCR=35;TR=32;WE=6062897;WS=6062868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,34:0.59:58
chr12	6062889	rs12297442	A	G	692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.911;HP=1;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=17;PP=974;ReadPosRankSum=0.643;SC=GAAAGTCAACATCCAACTCCA;SOR=0.180;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=43;TCF=14;TCR=29;TR=28;WE=6062897;WS=6062868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,30:0.64:47
chr12	6078616	rs2270239	T	G	742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-3.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.560;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=23;PP=490;ReadPosRankSum=-0.727;SC=CAGGGTCCCATTGGGAATGTG;SOR=0.240;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=68;TCF=18;TCR=50;TR=34;WE=6078624;WS=6078606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,35:0.48:73
chr12	6085513	rs216855	A	G	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=12;PP=291;ReadPosRankSum=0.328;SC=AGCCGCTCTAAGTGCTGAGAA;SOR=0.811;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=53;TCF=24;TCR=29;TR=22;WE=6085521;WS=6085503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,27:0.46:59
chr12	6091000	rs216867	A	G	6801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=129;NR=103;PP=2965;SC=CATTGGTGGCAGTTGAGGCCA;SOR=0.877;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=232;TCF=129;TCR=103;TR=232;WE=6091008;WS=6090990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr12	6092442	rs55867239	G	A	1511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.574;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=32;PP=862;ReadPosRankSum=0.458;SC=AAAGAGAGACGTCCATGCAGA;SOR=0.781;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=148;TCF=76;TCR=72;TR=64;WE=6092450;WS=6092432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,74:0.44:167
chr12	6092567	.	G	GGATAGATA	341.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=0;NR=5;PP=539;SC=ACATGGGTTAGGATAGATAGA;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=5;WE=6092575;WS=6092557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	6092629	.	TGATA	T	97	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=39;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=97;QD=30.25;SC=GAGATAGATTTGATAGATAGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=6092640;WS=6092619;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:2,4:0.67:6
chr12	6094124	rs144331815	AAC	A	567.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.803;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.120;NF=9;NR=2;PP=354;ReadPosRankSum=1.056;SC=TGTGCCTGAGAACAGAGACAC;SOR=1.329;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=11;WE=6094133;WS=6094114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr12	6094784	rs1053523	T	C	2065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.378;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=47;PP=1179;ReadPosRankSum=-0.555;SC=CGCTGAGGCATGTGCAGATCT;SOR=0.540;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=195;TCF=111;TCR=84;TR=99;WE=6094792;WS=6094774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,102:0.49:207
chr12	6094845	rs177702	G	A	5447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=91;NR=93;PP=2965;SC=AGGGCAAAGCGAGGTTCAGAA;SOR=0.909;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=184;TCF=91;TCR=93;TR=184;WE=6094853;WS=6094835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr12	6103844	rs17491334	G	A	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=-2.057;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=113;ReadPosRankSum=-0.210;SC=GGAAGTTACCGAGAGTTCCTG;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=6;WE=6103852;WS=6103834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr12	6121078	rs216305	C	T	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.476;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.010;NF=11;NR=2;PP=274;ReadPosRankSum=0.587;SC=CAAGGAGGCCCCCTGTACATG;SOR=2.833;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=39;TCF=23;TCR=16;TR=13;WE=6121086;WS=6121068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,13:0.33:39
chr12	6127943	rs216310	A	G	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=2.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.08;MQRankSum=-5.189;QD=3.00;ReadPosRankSum=-1.624;SOR=1.222;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,17:0.23:74
chr12	6128443	rs216311	T	C	1829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.211;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-7.856;NF=37;NR=47;PP=1054;ReadPosRankSum=-1.038;SC=AGGAGCAGGGTGATGCGGGAG;SOR=0.958;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=187;TCF=88;TCR=99;TR=84;WE=6128451;WS=6128433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,91:0.45:202
chr12	6134679	.	C	G	431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.130;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=3.897;NF=13;NR=4;PP=239;ReadPosRankSum=-1.332;SC=GAAGGTCACACTCTGTGTCCA;SOR=0.586;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=17;WE=6134687;WS=6134669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr12	6134715	rs73051263	G	A	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-1.796;NF=15;NR=7;PP=216;ReadPosRankSum=1.916;SC=CCTTGGGACCGTCTGCTTCCC;SOR=0.547;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=56;TCF=41;TCR=15;TR=22;WE=6134723;WS=6134705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,20:0.38:53
chr12	6134949	rs56121649	C	G	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.477;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.662;NF=5;NR=4;PP=145;ReadPosRankSum=0.273;SC=TCCTTCCCACCCTGCAGCCAC;SOR=0.346;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=9;WE=6134957;WS=6134939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr12	6134987	rs56068059	C	A	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.028;HP=5;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.686;NF=8;NR=6;PP=220;ReadPosRankSum=0.941;SC=CACAACCCCCCTTCCAGCCCC;SOR=0.191;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=14;WE=6134995;WS=6134977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr12	6135265	rs34877178	C	T	1633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=1.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.626;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-10.258;NF=30;NR=35;PP=811;ReadPosRankSum=0.135;SC=GCATGCTCTCCGGCTCAGGGG;SOR=0.971;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=136;TCF=64;TCR=72;TR=65;WE=6135273;WS=6135255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,77:0.47:163
chr12	6135337	rs3858686	G	A	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.349;NF=2;NR=11;PP=210;ReadPosRankSum=-0.748;SC=GAGGAGGAGCGGGACAGAGAC;SOR=0.460;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=13;WE=6135345;WS=6135327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
chr12	6138410	rs11063999	T	C	1141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.200;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.99;MQRankSum=-1.282;NF=35;NR=13;PP=616;ReadPosRankSum=0.391;SC=CAGGAGCACCTGGATTCATAA;SOR=1.022;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=139;TCF=93;TCR=46;TR=48;WE=6138418;WS=6138400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,56:0.37:150
chr12	6138595	rs1800380	C	T	947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.598;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=22;PP=584;ReadPosRankSum=-0.501;SC=GAATGATGTACCGGCCAGACT;SOR=0.409;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=112;TCF=40;TCR=72;TR=37;WE=6138603;WS=6138585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,45:0.36:126
chr12	6143984	rs216321	T	C	8999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=350;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=174;NR=144;PP=2965;ReadPosRankSum=1.042;SC=CTTCCGGTCCTGACAGACACT;SOR=0.268;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=321;TCF=176;TCR=145;TR=318;WE=6143992;WS=6143974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,346:1.00:347
chr12	6144138	rs12810426	G	A	897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.176;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=28;PP=624;ReadPosRankSum=-0.947;SC=GACCTGTAGCGTGGAGTGTGG;SOR=0.441;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=67;TCF=15;TCR=52;TR=38;WE=6144146;WS=6144128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,39:0.57:68
chr12	6144164	rs499648	T	C	1624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.91;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr12	6144169	rs669667	T	G	1591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.22;SOR=3.383;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	6145529	rs216325	G	A	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.222;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=10;PP=317;ReadPosRankSum=1.186;SC=CTGGGTCCCCGGCGCAGCCCC;SOR=0.428;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=55;TCF=37;TCR=18;TR=25;WE=6145537;WS=6145519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,30:0.49:61
chr12	6153514	rs1063857	A	G	2094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.517;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=50;PP=1294;ReadPosRankSum=-0.252;SC=ACTCCAGGTCATAGTTCTGGC;SOR=0.792;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=231;TCF=122;TCR=109;TR=107;WE=6153522;WS=6153504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,112:0.44:255
chr12	6153534	rs1063856	T	C	2507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.051;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=55;PP=1760;ReadPosRankSum=-0.811;SC=CACGTTTTGGTACACTCGAGC;SOR=0.741;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=240;TCF=126;TCR=114;TR=116;WE=6153542;WS=6153524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,121:0.46:264
chr12	6153659	rs216293	G	C,T	3172.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;NF=19,24;NR=35,39;PP=892,901;SC=GTGAAGGAGAGAATGGACCTA;SOR=1.317;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=118;TCF=43;TCR=75;TR=54,63;WE=6153667;WS=6153649;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.45,0.55:128
chr12	6153738	rs1558519	AC	GT	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.378;HP=2;HapScore=3;JOINED;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=176;ReadPosRankSum=-1.972;SC=TTGCCCACTCACGGGGACCAG;SOR=0.197;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=6;WE=6153758;WS=6153728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr12	6153750	rs216294	A	G	584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=16;PP=757;SC=GGGGACCAGCAGCTGCCTGAG;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=6153758;WS=6153728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	6161963	rs10622633	G	GAGA	6278.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.29;QD=44.22;SOR=1.203;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr12	6167196	rs1800379	A	G	2473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FS=0.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.04;MQRankSum=-1.025;QD=10.22;ReadPosRankSum=-1.630;SOR=0.653;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,125:0.52:242
chr12	6172202	rs1800378	T	C	3594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=61;NR=56;PP=1656;SC=CGTCACTGTATGCTGGATGCG;SOR=0.783;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=117;TCF=61;TCR=56;TR=117;WE=6172210;WS=6172192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr12	6204615	rs7980045	T	G	1499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.539;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=26;PP=1002;ReadPosRankSum=1.547;SC=CCCAGGCCAGTCCACACCCAC;SOR=0.739;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=198;TCF=123;TCR=75;TR=74;WE=6204623;WS=6204605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,76:0.36:210
chr12	6204902	rs5796209	CA	C	100.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.025;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=110;ReadPosRankSum=-1.100;SC=GGCTGGAGTGCAGCGGCTATT;SOR=0.148;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=4;WE=6204910;WS=6204892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr12	6230288	rs6489694	A	G	1157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.230;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=6;PP=878;ReadPosRankSum=0.205;SC=CACCAGGGCTAAGCTCAGCCA;SOR=1.371;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=56;TCF=46;TCR=10;TR=39;WE=6230296;WS=6230278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,41:0.69:59
chr12	6232426	rs2286608	G	A	1611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.142;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=45;PP=1028;ReadPosRankSum=0.897;SC=CTGGTGTGGCGACTATCAGGG;SOR=0.799;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=168;TCF=77;TCR=91;TR=78;WE=6232434;WS=6232416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,83:0.43:191
chr12	6309598	rs11539945	C	T	822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=8;PP=476;ReadPosRankSum=2.066;SC=CGCCAGGTCCCGCCAGTCCCA;SOR=0.571;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=52;TCR=16;TR=34;WE=6309606;WS=6309588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,37:0.50:74
chr12	6344600	rs2072372	C	A	2300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.858;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=48;PP=1628;ReadPosRankSum=-1.553;SC=CGTCTTCTTACAATTTGTTTC;SOR=0.907;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=226;TCF=121;TCR=105;TR=108;WE=6344608;WS=6344590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,111:0.46:241
chr12	6345199	rs3181300	C	T	43.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr12	6352292	rs9668222	T	A	1742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=11;PP=1121;SC=TACTTTGAGTTACAGACGTAT;SOR=2.584;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=56;TCF=45;TCR=11;TR=55;WE=6352300;WS=6352282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr12	6421495	rs740842	G	A	1186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.954;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=29;PP=636;ReadPosRankSum=1.083;SC=TCAGAGCACTGCTGGCAGACT;SOR=1.095;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=90;TCF=45;TCR=45;TR=52;WE=6421503;WS=6421485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,59:0.58:102
chr12	6422272	rs10849440	T	C	1454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.585;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=32;PP=942;ReadPosRankSum=-0.695;SC=TGGCTGTGGCTTCAGCCTTTC;SOR=0.632;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=150;TCF=74;TCR=76;TR=65;WE=6422280;WS=6422262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,70:0.44:160
chr12	6424577	rs1003563	A	G	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=8;PP=323;ReadPosRankSum=-0.282;SC=CCTACACATCAGAGCACTGGT;SOR=0.697;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=59;TCF=41;TCR=18;TR=28;WE=6424585;WS=6424567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,29:0.48:61
chr12	6427052	rs1468603	C	T	2656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.238;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=48;PP=1548;ReadPosRankSum=0.726;SC=TCCTGCGACACATCAATGGGC;SOR=0.956;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=229;TCF=126;TCR=103;TR=115;WE=6427060;WS=6427042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,126:0.50:251
chr12	6428116	rs4764497	T	G	1917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.119;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=42;PP=1239;ReadPosRankSum=-0.707;SC=GGGACGGAGATCAAATAAAGG;SOR=0.800;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=178;TCF=84;TCR=94;TR=81;WE=6428124;WS=6428106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,89:0.46:195
chr12	6428621	rs12828469	A	T	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.18;ReadPosRankSum=0.941;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr12	6439255	rs10849443	A	G	4208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=69;PP=2683;SC=AGGTGGCGCAACATTAGTGCG;SOR=0.820;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=136;TCF=67;TCR=69;TR=136;WE=6439263;WS=6439245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr12	6439470	rs12426675	A	G	1726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.570;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=38;PP=1137;ReadPosRankSum=2.077;SC=AACTGAGGAAAAAGAAAGAAA;SOR=0.790;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=152;TCF=75;TCR=77;TR=72;WE=6439478;WS=6439460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,79:0.47:169
chr12	6440009	rs1800693	T	C	1201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=20;PP=688;ReadPosRankSum=-0.950;SC=ACCAGGTCACTTCTCCTCACC;SOR=0.687;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=81;TCF=47;TCR=34;TR=49;WE=6440017;WS=6439999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,55:0.62:89
chr12	6442346	rs1800692	A	G	2142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.027;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=39;PP=1356;ReadPosRankSum=-0.365;SC=GCTAAAGGAGAAGCGCCTGCA;SOR=0.775;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=201;TCF=115;TCR=86;TR=95;WE=6442354;WS=6442336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,106:0.47:225
chr12	6450945	rs767455	T	C	1481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=0.669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.76;ReadPosRankSum=-0.116;SOR=0.781;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,74:0.59:126
chr12	6457062	rs2228576	T	C	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.955;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=54;ReadPosRankSum=1.876;SC=AGAGGACAGGTGGAGGAACTG;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=5;WE=6457070;WS=6457052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr12	6458084	rs3764875	C	T	3811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=64;PP=2443;SC=CAAAGATTCCCTTCTTGTGGC;SOR=0.707;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=65;TCR=64;TR=129;WE=6458092;WS=6458074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr12	6459326	rs61918248	T	C	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.347;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.282;NF=9;NR=9;PP=186;ReadPosRankSum=0.694;SC=AGGCCGGGCGTGGTGGCTCAC;SOR=0.202;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=29;TCF=12;TCR=17;TR=18;WE=6459334;WS=6459316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,22:0.65:34
chr12	6463862	rs11614164	G	A	1436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=16;PP=1081;SC=GCTTTGCAGGGCCAGCCAGGG;SOR=1.426;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=31;TCR=16;TR=47;WE=6463870;WS=6463852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr12	6483463	rs3741914	T	C	1319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=7;PP=925;SC=GCCTGCCCAGTGAGCACCTCA;SOR=2.737;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=37;TCR=7;TR=44;WE=6483471;WS=6483453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr12	6495275	rs2364480	C	A	1945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.330;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=50;PP=1221;ReadPosRankSum=-0.046;SC=CCTGCAAGGCCGGGCACTTCC;SOR=0.546;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=210;TCF=85;TCR=125;TR=89;WE=6495283;WS=6495265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,97:0.43:228
chr12	6495635	rs5796232	C	CGG	877.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.017;HP=8;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQ=60.14;MQRankSum=1.141;NF=5;NR=12;PP=281;ReadPosRankSum=-0.625;SC=CTGAGGGACACGGGGGGGGCG;SOR=0.468;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=47;TCF=10;TCR=37;TR=17;WE=6495643;WS=6495625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,30:0.45:67
chr12	6500105	rs12354	T	G	2012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.811;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=49;PP=1224;ReadPosRankSum=-0.800;SC=CATGACTGACTGAGTCTGAGA;SOR=0.559;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=160;TCF=68;TCR=92;TR=89;WE=6500113;WS=6500095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,97:0.51:190
chr12	6554429	rs2534719	G	C	2036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.559;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=45;PP=1258;ReadPosRankSum=-0.511;SC=GGCCAGGTGAGTGGCGAAAGA;SOR=0.919;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=162;TCF=79;TCR=83;TR=85;WE=6554437;WS=6554419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,96:0.52:184
chr12	6554628	rs25680	G	A	3669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.284;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=82;PP=2111;ReadPosRankSum=2.281;SC=GCATAGAAAGGCTGCTCAGTG;SOR=0.667;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=311;TCF=157;TCR=154;TR=166;WE=6554636;WS=6554618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,180:0.54:336
chr12	6560473	rs2532502	A	G	3767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=67;NR=65;PP=2054;SC=GAGCCTTGTCATTACAGCTGC;SOR=0.854;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=132;TCF=67;TCR=65;TR=132;WE=6560481;WS=6560463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr12	6560573	rs1059501	G	T	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=264;ReadPosRankSum=0.060;SC=GCACCTGCGGGAGCTGCACTA;SOR=1.085;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=15;WE=6560581;WS=6560563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr12	6562538	rs2041386	C	T	1966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=47;PP=1151;ReadPosRankSum=-0.739;SC=CGATTACAGCCACACATACTG;SOR=0.718;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=175;TCF=73;TCR=102;TR=83;WE=6562546;WS=6562528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,93:0.48:192
chr12	6562753	rs2532501	A	G	1638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.580;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=35;PP=842;ReadPosRankSum=-1.169;SC=CATGGCCAACATGCAGGTCTC;SOR=0.601;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=146;TCF=69;TCR=77;TR=70;WE=6562761;WS=6562743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,82:0.50:164
chr12	6562810	rs2532500	A	G	746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.897;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=18;PP=380;ReadPosRankSum=0.181;SC=TCCCAGGGTCACCAAGAATGA;SOR=0.582;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=68;TCF=24;TCR=44;TR=29;WE=6562818;WS=6562800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,36:0.48:75
chr12	6565718	rs12368360	C	T	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.05;ReadPosRankSum=-0.315;SOR=0.509;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,12:0.31:39
chr12	6565750	rs10774432	A	G	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.13;ReadPosRankSum=-1.987;SOR=0.751;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,26:0.37:70
chr12	6567907	rs1045546	C	T	2338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.992;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=53;PP=1388;ReadPosRankSum=1.065;SC=GTGGTGGTGACGTGGACCCGA;SOR=0.785;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=219;TCF=110;TCR=109;TR=107;WE=6567915;WS=6567897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,116:0.49:239
chr12	6570163	rs2534710	C	T	784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.156;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=24;PP=490;ReadPosRankSum=-0.763;SC=TCTAACCACCCCCCCGCCCAG;SOR=0.952;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=60;TCF=14;TCR=46;TR=31;WE=6570171;WS=6570150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,35:0.55:64
chr12	6572048	rs1045452	A	G	2847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.422;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=63;PP=1743;ReadPosRankSum=0.628;SC=CAAGGGCGAAAGGAAAGGAAG;SOR=0.647;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=263;TCF=132;TCR=131;TR=130;WE=6572056;WS=6572038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,143:0.48:296
chr12	6574524	.	G	GTA	148	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5000;HP=6;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=148;QD=39.75;SC=AAAGAAAAAAGTATATATATA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=6574532;WS=6574514;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr12	6575191	rs2534718	A	T	1147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.233;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=25;PP=570;ReadPosRankSum=-0.060;SC=GAAACAAAGCAGCTAAGCTTC;SOR=0.870;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=120;TCF=64;TCR=56;TR=49;WE=6575199;WS=6575181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,57:0.43:134
chr12	6579565	rs2534720	A	G	1600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=7;PP=1223;SC=CCGGTCCGGAAGCGGCGCGCG;SOR=3.300;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=46;TCR=7;TR=52;WE=6579573;WS=6579555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr12	6579757	rs2532489	T	C	5825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=86;NR=113;PP=2911;SC=AGACACCCGGTGAGGGACGCT;SOR=1.138;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=199;TCF=86;TCR=113;TR=199;WE=6579765;WS=6579747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr12	6579812	rs2072376	T	C	1215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.099;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=34;PP=818;ReadPosRankSum=1.281;SC=TCGCGCCGACTACCCCGCGGT;SOR=0.446;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=84;TCF=19;TCR=65;TR=45;WE=6579820;WS=6579802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,50:0.54:93
chr12	6601743	rs1001127	A	C	1305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=32;PP=991;SC=ATAGACAAGGAACATTACAGT;SOR=2.356;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=10;TCR=32;TR=42;WE=6601751;WS=6601733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr12	6601980	rs4764600	C	G	1758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.938;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=37;PP=1179;ReadPosRankSum=0.506;SC=TCGTTACAGCCTAATTGCCAT;SOR=0.895;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=229;TCF=136;TCR=93;TR=94;WE=6601988;WS=6601970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,96:0.40:243
chr12	6604415	rs11064231	T	G	1620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.557;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=41;PP=2490;ReadPosRankSum=-0.358;SC=GCTGTCACTGTACCTAGCTCT;SOR=0.742;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=161;TCF=76;TCR=85;TR=75;WE=6604426;WS=6604405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,80:0.46:173
chr12	6604418	rs6489718	C	T	1838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=44;PP=2531;ReadPosRankSum=0.910;SC=GTCACTGTACCTAGCTCTTTC;SOR=0.672;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=159;TCF=74;TCR=85;TR=84;WE=6604426;WS=6604405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,90:0.53:170
chr12	6619054	rs7298053	T	C	1116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.759;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=34;PP=585;ReadPosRankSum=1.052;SC=ATAGGTTCACTGATAAATGCC;SOR=0.807;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=97;TCF=32;TCR=65;TR=50;WE=6619062;WS=6619044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,56:0.52:108
chr12	6619081	rs144245376	TCTA	T	868.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=751;ReadPosRankSum=1.513;SC=TATTGATATCTCTACTGATGA;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=3;TCR=44;TR=18;WE=6619091;WS=6619071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,24:0.41:58
chr12	6619284	rs714774	C	G	6133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=93;PP=2965;SC=AGATACTCTGCAATTCCTGAT;SOR=0.719;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=202;TCF=109;TCR=93;TR=201;WE=6619292;WS=6619274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr12	6620495	rs7358768	G	T	1304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.65;SOR=3.467;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr12	6623382	rs4764604	A	G	1167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=5.535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.60;ReadPosRankSum=-1.451;SOR=1.534;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,46:0.57:80
chr12	6623389	rs4764605	T	C	3380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.75;SOR=2.354;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr12	6624139	rs9788151	T	C	545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=19;PP=307;ReadPosRankSum=0.596;SC=TTAAGTCCAGTGTTGAAAGGC;SOR=0.859;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=50;TCF=17;TCR=33;TR=27;WE=6624147;WS=6624129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,29:0.53:55
chr12	6626369	rs758739	G	C	393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=2;PP=330;SC=TTTAAGGACTGTAATGTGTCT;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=6626377;WS=6626359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
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chr12	6635274	rs10849482	G	A	2764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.641;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=49;PP=1641;ReadPosRankSum=-0.978;SC=AGACACACTGGTGAGCATAGG;SOR=0.842;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=203;TCF=114;TCR=89;TR=113;WE=6635282;WS=6635264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,126:0.56:224
chr12	6635374	rs10849483	G	A	3333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.510;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=69;PP=2176;ReadPosRankSum=0.465;SC=AAGGTATGTGGGGGTGGTTCC;SOR=0.713;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=265;TCF=137;TCR=128;TR=134;WE=6635382;WS=6635364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,152:0.52:295
chr12	6635567	rs7311174	A	T	9636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=365;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=180;NR=163;PP=2965;SC=CTTGGGCAGAATTGGGCCCTT;SOR=0.699;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=343;TCF=180;TCR=163;TR=343;WE=6635583;WS=6635557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,365:1.00:365
chr12	6637845	rs2072374	T	C	4183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=68;PP=2578;SC=CCATTCCTAGTCTCCGGGACC;SOR=0.811;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=150;TCF=82;TCR=68;TR=150;WE=6637853;WS=6637835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr12	6637941	rs10849484	C	T	1648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.525;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=38;PP=991;ReadPosRankSum=-1.477;SC=GGCAGGTCAGCGAGATGGCGG;SOR=0.683;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=173;TCF=94;TCR=79;TR=77;WE=6637949;WS=6637931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,85:0.43:197
chr12	6638116	rs740850	C	T	1457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=34;PP=869;ReadPosRankSum=0.483;SC=TACAGGGCAACGCAATCTATA;SOR=0.743;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=119;TCF=57;TCR=62;TR=62;WE=6638124;WS=6638106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,69:0.51:136
chr12	6638666	rs7316224	C	T	3225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=350;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.266;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=62;PP=1928;ReadPosRankSum=-0.101;SC=ATCCTCATCTCCCCTTCCTGC;SOR=0.770;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=329;TCF=193;TCR=136;TR=155;WE=6638674;WS=6638656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:186,164:0.47:350
chr12	6639088	rs1043262	A	G	6040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=106;NR=89;PP=2965;SC=TGTCAGTTGTAGGCAAGCTGC;SOR=0.711;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=195;TCF=106;TCR=89;TR=195;WE=6639096;WS=6639078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr12	6640267	rs10849485	G	A	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.712;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=126;ReadPosRankSum=1.259;SC=CCTGTTCCCGGCCGAGAAGGC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=8;WE=6640275;WS=6640257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr12	6640443	rs71579330	C	T	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.536;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=265;ReadPosRankSum=-0.092;SC=TCTATTTTTTCACCATCTTTG;SOR=1.214;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=54;TCF=37;TCR=17;TR=19;WE=6640451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,20:0.34:59
chr12	6643991	rs1136666	C	G	1474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=28;PP=993;ReadPosRankSum=-1.391;SC=CCACATCGCTCAGACACCATG;SOR=0.650;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=162;TCF=95;TCR=67;TR=68;WE=6643999;WS=6643981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,72:0.42:172
chr12	6646622	rs182573972	C	T	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.808;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=54;ReadPosRankSum=1.321;SC=TCCTCCCTGCCGGGGCTGCGT;SOR=1.919;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=5;WE=6646630;WS=6646617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr12	6669257	rs11064255	T	C	2282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.876;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=49;PP=1505;ReadPosRankSum=-2.835;SC=AGAAAAAGATTACTTACCTGT;SOR=0.534;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=223;TCF=128;TCR=95;TR=107;WE=6669265;WS=6669247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,112:0.47:238
chr12	6679949	.	A	C	2726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.789;ClippingRankSum=0.000;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.950;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=58;PP=1832;ReadPosRankSum=-2.054;SC=CCCACCCAGTATGTAAAGCTA;SOR=0.507;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=213;TCF=102;TCR=111;TR=117;WE=6679957;WS=6679939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,123:0.54:229
chr12	6690190	rs55670476	A	C	1395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.723;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=22;PP=967;ReadPosRankSum=-0.246;SC=AACAAACAAAAAAAATGTGGA;SOR=0.575;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=76;TCR=40;TR=63;WE=6690198;WS=6690180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,65:0.56:116
chr12	6691452	rs7316626	G	A	1264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.678;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=30;PP=736;ReadPosRankSum=0.344;SC=TATGCCCTGTGTAAAGAAGTA;SOR=0.791;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=107;TCF=52;TCR=55;TR=55;WE=6691460;WS=6691442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,61:0.50:121
chr12	6707526	rs11539543	G	A	1577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.232;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=41;PP=1086;ReadPosRankSum=-0.958;SC=GCACTGGTGTGGGAGATGGTG;SOR=0.823;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=156;TCF=71;TCR=85;TR=72;WE=6707534;WS=6707516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,75:0.45:165
chr12	6708813	rs7303399	A	T	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=146;ReadPosRankSum=-0.267;SC=CTATAGGATGAAGGAGAATAC;SOR=0.922;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=13;WE=6708821;WS=6708803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr12	6708898	rs7132970	C	T	1048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=19;PP=555;ReadPosRankSum=0.168;SC=GAAAAGACTACACTTTCCCAT;SOR=0.711;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=104;TCF=61;TCR=43;TR=48;WE=6708906;WS=6708888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,54:0.47:116
chr12	6709059	rs11539542	G	A	1939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.536;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=34;PP=1033;ReadPosRankSum=0.468;SC=CATCCTTGCAGACCCGACAGA;SOR=0.648;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=171;TCF=99;TCR=72;TR=81;WE=6709067;WS=6709049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,94:0.51:186
chr12	6709945	rs12816349	G	A	695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.290;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;ReadPosRankSum=0.224;SC=AGCAAGCACCGTTATACAGGG;SOR=2.019;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=47;TCF=19;TCR=28;TR=24;WE=6709953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,27:0.52:52
chr12	6711147	rs1639122	C	A	1268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.200;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=42;PP=1080;ReadPosRankSum=2.745;SC=CATCATCATCCTCCTCCTCCT;SOR=0.597;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=180;TCF=90;TCR=90;TR=87;WE=6711155;WS=6711134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,69:0.39:175
chr12	6715593	rs1734116	A	G	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=206;ReadPosRankSum=0.450;SC=CGGCGGCCTGAGGACCTCTAC;SOR=0.527;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=12;WE=6715601;WS=6715583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr12	6747578	rs1882553	G	C	5271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=76;NR=96;PP=2965;SC=CACCTACACAGAGATTCAGTG;SOR=0.999;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=172;TCF=76;TCR=96;TR=172;WE=6747586;WS=6747568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr12	6749093	rs2365087	A	G	473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=2;PP=296;SC=GAGGCAGGAGATTCAGTGAGG;SOR=2.448;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=6749101;WS=6749087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	6756240	rs3803130	A	G	494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=11;PP=339;SC=CGAGACCAGGACAGACAGACC;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=15;WE=6756248;WS=6756230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	6762026	rs4764506	T	C	2117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=28;PP=1450;SC=GTGCCAAACTTCCCACCAGAT;SOR=0.722;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=33;TCR=28;TR=61;WE=6762034;WS=6762016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr12	6764831	rs4764616	G	A	585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=0;PP=440;SC=TCAGGGAACTGTGTCCAGGGT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=6764839;WS=6764825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr12	6777069	.	TTGCTGC	T,TTGC	994.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.25;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;NF=2,2;NR=14,14;PP=729,43;SC=GTGGTGGCTGTTGCTGCTGCT;SOR=1.528;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=37;TCF=3;TCR=34;TR=16,16;WE=6777082;WS=6777059;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.19,0.81:27
chr12	6804902	rs10849498	A	G	2001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=45;PP=1345;SC=CCCCAGCCTCACCCAGTCACT;SOR=1.516;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=26;TCR=45;TR=71;WE=6804910;WS=6804892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr12	6835068	rs7487866	A	G	2064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=38;PP=1802;ReadPosRankSum=0.526;SC=ATGAAAAAGAAGCACTTGGCT;SOR=0.685;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=120;TCF=38;TCR=82;TR=55;WE=6835089;WS=6835058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,59:0.45:132
chr12	6835081	rs2365100	G	A	1861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=31;PP=1802;ReadPosRankSum=0.032;SC=ACTTGGCTGGGTGCGGTGGCT;SOR=0.657;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=27;TCR=66;TR=44;WE=6835089;WS=6835058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,48:0.48:101
chr12	6836852	rs7138427	A	G	10512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=390;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=171;NR=173;PP=2965;SC=GAATTGGATGACGTATGGAGC;SOR=0.735;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=346;TCF=172;TCR=174;TR=344;WE=6836860;WS=6836842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,388:1.00:388
chr12	6836913	rs2178691	G	T	2790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.520;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=65;PP=1683;ReadPosRankSum=-0.678;SC=CCTGAAGGTGGAAATGAGCCC;SOR=0.577;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=225;TCF=94;TCR=131;TR=115;WE=6836921;WS=6836903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,132:0.51:259
chr12	6839388	rs871366	G	A	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5129;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=36;ReadPosRankSum=-1.036;SC=TTGCCATATCGCTCAGGCTGG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=3;WE=6839396;WS=6839381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr12	6839453	rs871365	G	A	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=197;ReadPosRankSum=-1.061;SC=AAAATGCAGGGATTATGGGGG;SOR=0.955;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=15;WE=6839461;WS=6839443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr12	6839913	rs2286730	C	T	2130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.360;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=42;PP=1095;ReadPosRankSum=-0.220;SC=TGAGCAACACCTGACTGAGCT;SOR=0.550;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=183;TCF=90;TCR=93;TR=88;WE=6839921;WS=6839903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,105:0.50:208
chr12	6840209	rs3168600	G	A	964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=21;PP=567;ReadPosRankSum=-1.696;SC=GAATTGAAAGGACTGTCGTTT;SOR=0.691;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=115;TCF=70;TCR=45;TR=49;WE=6840217;WS=6840199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,51:0.39:131
chr12	6840371	rs11227	G	T	1145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=27;PP=583;ReadPosRankSum=-0.825;SC=TAGGGAGGAGGCAAATGTAGG;SOR=0.739;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=105;TCF=44;TCR=61;TR=48;WE=6840379;WS=6840361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,58:0.48:122
chr12	6861043	rs2302367	T	C	1685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.183;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.929;NF=34;NR=36;PP=1059;ReadPosRankSum=-0.554;SC=CTTTCCTAACTAACCTCCAAC;SOR=0.827;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=154;TCF=77;TCR=77;TR=70;WE=6861051;WS=6861033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,80:0.46:175
chr12	6879202	rs4764622	T	C	1079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.685;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=20;PP=618;ReadPosRankSum=0.647;SC=TGGCAAAGTCTGGGCTCAAAG;SOR=0.608;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=107;TCF=63;TCR=44;TR=45;WE=6879210;WS=6879192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,52:0.43:121
chr12	6879279	rs4764621	A	G	1966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.058;NF=50;NR=44;PP=1232;ReadPosRankSum=-1.343;SC=GGGCTCTGCCAGAGCTTCCTG;SOR=0.700;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=194;TCF=102;TCR=92;TR=94;WE=6879287;WS=6879269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,100:0.48:210
chr12	6883700	rs2365095	C	T	1296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=15;PP=767;ReadPosRankSum=-0.944;SC=GGCTTGGCAGCCCTGCTGTGT;SOR=0.627;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=87;TCF=62;TCR=25;TR=50;WE=6883708;WS=6883690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,58:0.58:100
chr12	6887020	rs870849	T	C	4307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=76;PP=2728;SC=CTGTTTCTCATCCTTGGTGTC;SOR=0.897;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=146;TCF=70;TCR=76;TR=146;WE=6887028;WS=6887010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr12	6909388	rs2365568	A	G	2710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.027;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=48;PP=1608;ReadPosRankSum=-1.481;SC=AATGCAGATGACGTGGGAGGA;SOR=0.618;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=200;TCF=116;TCR=84;TR=110;WE=6909396;WS=6909378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,125:0.56:225
chr12	6924718	rs3782736	C	A	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=418;ReadPosRankSum=-0.373;SC=AACCATGTGACCTTGGGTGAG;SOR=0.486;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=23;WE=6924726;WS=6924708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,23:0.61:38
chr12	6925149	rs10744715	C	T	2422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.916;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=37;PP=1505;ReadPosRankSum=-0.673;SC=CTGCTGCCTCCACATGCCAAC;SOR=0.974;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=194;TCF=117;TCR=77;TR=100;WE=6925157;WS=6925139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,110:0.51:216
chr12	6926363	rs1055141	T	C	1002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.629;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=20;PP=542;ReadPosRankSum=-0.708;SC=TGATGCTGAGTTTGAAACTGG;SOR=0.597;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=104;TCF=59;TCR=45;TR=44;WE=6926371;WS=6926353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,51:0.43:119
chr12	6927470	rs12226953	C	T	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=226;ReadPosRankSum=1.218;SC=CACCCCTCCCCTCTCCCCCAA;SOR=0.260;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=12;WE=6927478;WS=6927466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr12	6928075	rs12821756	T	C	2583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FS=1.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.50;ReadPosRankSum=-1.919;SOR=0.677;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:143,129:0.47:272
chr12	6928135	rs55764611	T	G	2409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.43;SOR=1.163;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr12	6928135	.	TA	GA,GG	555	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MMLQ=11;MQ=59.52;NF=41,14;NR=40,20;PP=497,555;QD=6.56507669811;SC=GGGAGGGAGTTAGAGAGGAGG;SbPval=0.08;Source=Platypus;TC=109;TCF=41;TCR=68;TR=81,34;WE=6928144;WS=6928125;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.74:109
chr12	6928136	rs2071077	A	G	545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=3.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.046;SOR=0.384;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,26:0.39:67
chr12	6928586	rs7136817	CA	AG	1914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=29;PP=1828;SC=AGCAGATCCCCAGCCTCTGGC;SOR=2.200;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=40;TCF=10;TCR=30;TR=39;WE=6928595;WS=6928576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr12	6932967	rs2040353	G	C	1880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=37;PP=1146;ReadPosRankSum=0.234;SC=ACAGGGCGAGGATTGTGGGGA;SOR=0.694;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=163;TCF=88;TCR=75;TR=83;WE=6932975;WS=6932957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,91:0.50:182
chr12	6933223	rs11575110	C	T	2828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=50;PP=1685;ReadPosRankSum=1.671;SC=TGCTGCTCTGCTTCCTAGCGG;SOR=0.692;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=246;TCF=146;TCR=100;TR=123;WE=6933231;WS=6933213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,138:0.51:269
chr12	6933787	rs1051409	A	G	6983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=127;NR=93;PP=2965;SC=CTTTTGAGGTACCAGCCATTG;SOR=0.879;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=220;TCF=127;TCR=93;TR=220;WE=6933795;WS=6933777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
chr12	6935787	rs2071082	A	T	1310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.652;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=22;PP=784;ReadPosRankSum=-0.297;SC=TCCCTGCAGCACCTTCAGGTC;SOR=0.792;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=123;TCF=76;TCR=47;TR=56;WE=6935795;WS=6935777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,62:0.46:135
chr12	6935977	rs11612427	A	G	1646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.574;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=30;PP=1002;ReadPosRankSum=-0.010;SC=CCTGGGACAAAGACACAGGTT;SOR=0.732;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=146;TCF=76;TCR=70;TR=60;WE=6935985;WS=6935967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,70:0.41:169
chr12	6938023	rs57050687	C	CG	2473.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=7;NR=25;PP=1474;SC=GGGCGCGGCGCGCTTCGCGTG;SOR=0.754;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=36;TCF=10;TCR=26;TR=32;WE=6938031;WS=6938013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr12	6939850	rs10744716	A	G	1644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=30;PP=952;ReadPosRankSum=0.508;SC=TGTGGGGGAAACAGCCACACG;SOR=0.658;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=159;TCF=91;TCR=68;TR=70;WE=6939858;WS=6939840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,80:0.45:177
chr12	6940254	rs7305463	A	G	1810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=39;PP=1197;ReadPosRankSum=-0.355;SC=GCCAGTGGGAAGGGGGCTCTT;SOR=0.732;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=163;TCF=79;TCR=84;TR=74;WE=6940262;WS=6940244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,82:0.47:175
chr12	6942672	rs4963513	A	C	846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.723;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=6;PP=433;ReadPosRankSum=0.574;SC=AACAGAAGAAACTTAATGAGA;SOR=1.262;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=60;TCF=44;TCR=16;TR=31;WE=6942680;WS=6942662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,38:0.52:73
chr12	6942823	rs4963512	A	G	2582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=50;PP=1526;ReadPosRankSum=-0.619;SC=GATATGCCCCATGGTGGGAGG;SOR=0.701;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=235;TCF=133;TCR=102;TR=117;WE=6942831;WS=6942813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,129:0.48:266
chr12	6946545	rs4963510	C	A	432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=343;ReadPosRankSum=-1.356;SC=CCACCCTCCCCTTGCCTTCCT;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=18;WE=6946553;WS=6946535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr12	6948028	rs4963516	T	G	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=90;ReadPosRankSum=0.477;SC=AGCTAGTCCCTGAATTAAGGA;SOR=0.752;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=8;WE=6948036;WS=6948018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr12	6954875	rs5443	C	T	2346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.435;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=51;PP=1349;ReadPosRankSum=-0.829;SC=GCATCACGTCCGTGGCCTTCT;SOR=0.659;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=264;TCF=137;TCR=127;TR=109;WE=6954883;WS=6954865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,119:0.42:284
chr12	6955865	rs138991440	C	CCACA	1149.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.15;MQRankSum=2.494;QD=20.53;ReadPosRankSum=0.025;SOR=0.661;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,29:0.52:56
chr12	6959095	rs367917525	AC	A	879.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=22;PP=654;ReadPosRankSum=-0.318;SC=ACATACAGAAACCCAGGACTC;SOR=0.569;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=23;WE=6959103;WS=6959085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,31:0.50:62
chr12	6965194	rs2226955	A	G	2297.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.462;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=50;PP=1513;ReadPosRankSum=-0.121;SC=TTGAAGGCGGATTTGACCTTA;SOR=0.660;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=230;TCF=126;TCR=104;TR=109;WE=6965202;WS=6965184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,115:0.46:252
chr12	6965740	rs2238114	C	A	696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.927;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.218;NF=12;NR=19;PP=538;ReadPosRankSum=0.070;SC=GAAATGAACACGACATGGGGA;SOR=0.515;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=27;TCR=44;TR=31;WE=6965748;WS=6965730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,31:0.41:75
chr12	6965763	rs72181812	AAG	A	565.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.257;NF=6;NR=12;PP=709;ReadPosRankSum=-1.802;SC=GCCAGAGGAGAAGAGAGAGAG;SOR=0.634;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=44;TCF=13;TCR=31;TR=18;WE=6965772;WS=6965753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,19:0.40:47
chr12	6965805	rs66621175	T	C	472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=12;PP=426;ReadPosRankSum=-0.540;SC=TGCAGAGCCCTCTCTCTCTGC;SOR=0.564;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=53;TCF=31;TCR=22;TR=26;WE=6965813;WS=6965795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,23:0.43:53
chr12	6969731	rs2071059	A	G	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=238;ReadPosRankSum=-0.784;SC=TTCTCCCTCTATCAGCCCCAA;SOR=0.446;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=14;WE=6969739;WS=6969721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr12	6979010	rs2071069	G	A	4549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=507;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.104;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.902;NF=99;NR=111;PP=2962;ReadPosRankSum=1.403;SC=GCCCACATGGGGCAACCCCTT;SOR=0.777;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=460;TCF=224;TCR=236;TR=210;WE=6979018;WS=6979000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:280,226:0.45:506
chr12	7014962	rs2071071	A	G	1189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.311;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=26;PP=727;ReadPosRankSum=-2.579;SC=GGGCTGAAGGAGGGGGTTGGG;SOR=0.505;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=124;TCF=59;TCR=65;TR=56;WE=7014970;WS=7014952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,60:0.45:132
chr12	7015915	rs1007924	A	G	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.757;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=182;ReadPosRankSum=1.485;SC=GCTAGGGCACATGGCAGTCTG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=10;WE=7015923;WS=7015905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
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chr12	7018949	rs2301137	C	T	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=178;ReadPosRankSum=0.154;SC=CCACTCCTCCCTCTCTACCTC;SOR=0.693;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=12;WE=7018957;WS=7018939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr12	7022085	rs1057077	T	A	3893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=360;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=81;PP=2244;ReadPosRankSum=-1.190;SC=GAGGCTGATGTGATTCGACAG;SOR=0.694;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=318;TCF=155;TCR=163;TR=161;WE=7022093;WS=7022075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,185:0.52:359
chr12	7023123	rs710415	A	G	2014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.032;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=44;PP=1197;ReadPosRankSum=-0.580;SC=TATGACAGAGAACAGAGGATG;SOR=0.621;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=196;TCF=99;TCR=97;TR=91;WE=7023131;WS=7023113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,100:0.45:221
chr12	7026893	rs376463507	A	AG	1326.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=26;PP=1222;SC=GCAATAAGCCAGCCTGCGGCT;SOR=2.774;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=27;WE=7026901;WS=7026883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr12	7026932	rs2071419	T	C	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=2.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.22;ReadPosRankSum=1.364;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr12	7044647	rs367827860	A	AG	2511.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=13;PP=2062;SC=TATGCAAGAGAGCCCCAAATC;SOR=2.049;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=48;TCF=33;TCR=15;TR=45;WE=7044655;WS=7044637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr12	7045891	rs377147612	ACAGCAGCAGCAGCAG	A	1540.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=3.152;NF=8;NR=11;PP=2650;ReadPosRankSum=0.089;SC=AGCAACAGCAACAGCAGCAGC;SOR=0.700;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=74;TCF=19;TCR=55;TR=19;WE=7045916;WS=7045881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,43:0.48:90
chr12	7047143	rs7969685	C	A	1125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.363;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=28;PP=667;ReadPosRankSum=0.787;SC=CCGAGCAGCGCGCGCGCGAAG;SOR=0.947;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=107;TCF=48;TCR=59;TR=48;WE=7047151;WS=7047133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,55:0.45:121
chr12	7049999	rs2071076	C	T	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=307;ReadPosRankSum=-0.293;SC=TGGTTTGCCCCAAACCTGCCT;SOR=0.527;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=14;WE=7050007;WS=7049989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr12	7053085	rs3087835	A	G	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=328;ReadPosRankSum=0.234;SC=TCACTGTGCAAAAATTATGGG;SOR=1.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=15;WE=7053093;WS=7053075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr12	7053149	rs1044189	A	C	1569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.760;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=17;PP=1089;ReadPosRankSum=0.236;SC=GGTTTGGGCCACGCCTGGGCG;SOR=0.817;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=112;TCF=82;TCR=30;TR=60;WE=7053157;WS=7053139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,66:0.54:123
chr12	7053362	rs915997	A	G	4780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=95;PP=2965;SC=GTCAAGGCATAGGCTGCTGGC;SOR=1.375;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=158;TCF=63;TCR=95;TR=158;WE=7053370;WS=7053352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr12	7054859	rs2019743	G	A	1771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=14;PP=1307;SC=TTCATGCTTAGACTACCACCC;SOR=2.226;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=41;TCR=14;TR=55;WE=7054867;WS=7054849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr12	7055860	rs2301262	T	C	2840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=65;NR=30;PP=1478;SC=TGCGGCCCTCTGCCGTGGCTT;SOR=1.287;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=96;TCF=66;TCR=30;TR=95;WE=7055868;WS=7055850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr12	7065281	rs10744724	C	T	4513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=90;NR=63;PP=2599;SC=CAGACCATCTCGCCTCCTCTC;SOR=1.017;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=153;TCF=90;TCR=63;TR=153;WE=7065289;WS=7065271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr12	7065406	rs7963446	G	A	5400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=99;PP=2965;SC=GGGCCACGTGGGAGGAGAGGC;SOR=0.877;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=188;TCF=89;TCR=99;TR=188;WE=7065414;WS=7065396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr12	7065576	rs2110071	G	A	5386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=76;PP=2965;SC=CCACGCTTGCGTCCAGAACCA;SOR=0.888;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=177;TCF=101;TCR=76;TR=176;WE=7065584;WS=7065566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr12	7065635	rs2110072	T	C	6907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=116;NR=117;PP=2965;SC=CCAGCCAGGGTTGTCTGGAGG;SOR=0.781;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=233;TCF=116;TCR=117;TR=233;WE=7065643;WS=7065625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,259:1.00:259
chr12	7069422	rs35119590	TG	T	195.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=4.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.11;ReadPosRankSum=-0.202;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,15:0.24:63
chr12	7069425	rs28579154	G	C	818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=10.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.79;ReadPosRankSum=0.251;SOR=1.404;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,47:0.73:64
chr12	7069426	.	G	C	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.633;ClippingRankSum=0.000;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=4.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.01;ReadPosRankSum=-0.237;SOR=0.490;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,15:0.23:66
chr12	7069620	rs759052	T	C	4959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=106;PP=2796;SC=TGACTGCCACTGCCCGGCATC;SOR=1.215;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=177;TCF=71;TCR=106;TR=177;WE=7069628;WS=7069610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr12	7069654	rs759053	G	A	2357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=56;PP=1804;SC=TGCCCAGCCCGATCCTCACTT;SOR=2.185;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=20;TCR=56;TR=76;WE=7069662;WS=7069644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr12	7079215	rs7301709	T	G	5346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=84;PP=2965;SC=CTGGAGGTTCTCGCAGCACCC;SOR=0.753;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=185;TCF=101;TCR=84;TR=185;WE=7079223;WS=7079205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr12	7080210	rs60117710	A	AG	9238.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=29;NR=75;PP=2957;SC=CGGAGGCCGTAGTTTATTGTG;SOR=0.763;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=114;TCF=29;TCR=85;TR=104;WE=7080220;WS=7080200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr12	7080212	rs17857448	T	C	9247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=76;PP=2965;SC=GAGGCCGTAGTTTATTGTGGT;SOR=0.773;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=147;TCF=69;TCR=78;TR=144;WE=7080220;WS=7080200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr12	7086586	rs117996263	G	A	1473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.030;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=23;PP=841;ReadPosRankSum=-0.195;SC=AACCCATGAAGAGCCAGTGGA;SOR=0.894;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=137;TCF=84;TCR=53;TR=64;WE=7086594;WS=7086576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,72:0.47:154
chr12	7090659	rs60570787	A	AG	5044.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=23;NR=38;PP=2752;SC=AATGAGGGAGAGCTCCGCTCT;SOR=1.222;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=63;TCF=24;TCR=39;TR=61;WE=7090667;WS=7090649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
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chr12	7244382	rs117830039	C	A	1619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.760;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=43;PP=922;ReadPosRankSum=-0.019;SC=TGGGCATTCTCCTCTCTGCCC;SOR=0.826;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=111;TCF=40;TCR=71;TR=67;WE=7244390;WS=7244372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,73:0.62:117
chr12	7244956	rs12422724	A	T	5152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FS=2.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.68;ReadPosRankSum=0.642;SOR=0.690;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:209,142:0.40:351
chr12	7244962	rs12426834	T	G	5318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FS=1.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.94;ReadPosRankSum=-1.014;SOR=0.711;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:206,150:0.42:356
chr12	7246581	rs56876910	T	TTG	621.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.727;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=489;ReadPosRankSum=-0.308;SC=TAGCAGCAGTTTGTGTGTGTG;SOR=1.697;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=53;TCF=3;TCR=50;TR=17;WE=7246590;WS=7246571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,23:0.44:52
chr12	7248856	rs61917912	G	A	98.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5025;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=31;ReadPosRankSum=-0.674;SC=CAACAGTGATGTGAATAGGAT;SOR=0.368;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=4;WE=7248864;WS=7248852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr12	7249598	rs3742089	T	C	4754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=95;PP=2792;SC=TTGGGGTAGATGGTGTGGGCA;SOR=0.962;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=175;TCF=80;TCR=95;TR=175;WE=7249606;WS=7249588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr12	7261607	.	TG	T	75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;FR=1.0000;HP=9;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=26;MQ=57.57;NF=4;NR=0;PP=75;QD=23.0;SC=GATGTGTGTGTGGGGGGGGTA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=4;WE=7261615;WS=7261597;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,4:0.57:7
chr12	7277236	rs2290237	T	A	4931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.16;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr12	7284301	rs2167285	C	T	295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=8;NR=2;PP=241;SC=TGCCCTTCCACCGCTCTCTCT;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=7284309;WS=7284291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	7284484	rs10772466	A	C	5667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=106;NR=85;PP=2965;SC=GGTTGGAGGAAAGAATGGAAA;SOR=0.760;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=191;TCF=106;TCR=85;TR=191;WE=7284492;WS=7284474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr12	7287886	rs6488452	A	C	5463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=116;NR=63;PP=2965;SC=AGGCTGGCTGACGTGTCTTCA;SOR=1.202;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=179;TCF=116;TCR=63;TR=179;WE=7287894;WS=7287876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr12	7287914	rs2278822	C	T	8033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=160;NR=108;PP=2965;SC=TTCTCTCTGGCATATGCAGGG;SOR=0.925;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=269;TCF=160;TCR=109;TR=268;WE=7287922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,304:1.00:304
chr12	7290352	.	A	ATG	41.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=63.51;QD=13.75;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr12	7294657	rs63110460	GT	G	228.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.94;ReadPosRankSum=1.426;SOR=0.507;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr12	7309199	rs7296261	G	A	5725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=107;NR=88;PP=2965;SC=GGCCTGGCTCGGGTGTGGGGC;SOR=0.869;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=195;TCF=107;TCR=88;TR=195;WE=7309207;WS=7309189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr12	7309471	rs1868799	C	A	4032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.32;SOR=1.533;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr12	7309471	.	CGG	AGC	2748	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=29;NR=41;PP=2748;QD=20;SC=CCAGACGTCCCGGAGCCCCAA;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=30;TCR=43;TR=70;WE=7309481;WS=7309461;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,70:0.96:73
chr12	7309473	rs1868800	G	C	4032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.83;SOR=1.531;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr12	7355898	rs4883087	C	G	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=243;ReadPosRankSum=-0.296;SC=TTTTAAAAAACTTATTCAGAT;SOR=0.871;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=13;WE=7355906;WS=7355888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr12	7360143	rs3825405	C	A	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=123;ReadPosRankSum=-0.350;SC=CAATTAATTCCGGAACCTGTT;SOR=1.302;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=9;WE=7360151;WS=7360133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr12	7362204	.	G	T	1172	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=52;NR=16;PP=1172;QD=17.7466354786;SC=CAGAGTTTGAGCTGAGTCGGT;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=89;TCF=73;TCR=16;TR=68;WE=7362212;WS=7362194;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:21,68:0.76:89
chr12	7362204	rs141721291	G	GCTGAGTCGGTGGAGTAATGTGCAGAGTTTGAT	3384.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=94.02;SOR=4.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	7463491	rs7962994	C	G	368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=10;PP=248;SC=GCTGGGTGCGCTGGCTCACAC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=7463499;WS=7463481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	7470019	rs73057799	G	A	482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=15;PP=371;SC=TGCTGGCCCCGCCCAACCTAG;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=7470027;WS=7470009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	7470534	rs7968312	A	T	574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=17;NR=0;PP=444;SC=CTTAAGATATAGGGGCAAAGT;SOR=4.514;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=7470542;WS=7470524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	7477298	rs10743732	G	A	879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=25;PP=654;SC=ATTAATTCTCGTTATGAAGCA;SOR=3.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=29;WE=7477306;WS=7477288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	7519826	rs7974006	A	G	642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=7;PP=489;ReadPosRankSum=-0.602;SC=CTGGAGTTGCACAGACCTGAG;SOR=0.678;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=73;TCF=59;TCR=14;TR=35;WE=7519834;WS=7519816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,34:0.47:73
chr12	7521563	rs148414953	TGA	T	164.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.276;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=2.109;NF=0;NR=7;PP=171;ReadPosRankSum=-0.194;SC=GCGACTGTCCTGAGAGAGAGA;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=7;WE=7521574;WS=7521553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,13:0.25:51
chr12	7525795	rs10845007	C	T	471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=1;PP=381;SC=TAAATCAGCACTTATTGTCAT;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=7525803;WS=7525785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
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chr12	7551022	rs6488268	A	T	13289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=492;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=222;NR=229;PP=2965;SC=AACACATGCAAAGGCTTTCCA;SOR=0.726;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=451;TCF=222;TCR=229;TR=451;WE=7551030;WS=7551012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,490:1.00:490
chr12	7551050	rs6488269	A	C	13087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=470;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=217;NR=206;PP=2965;SC=ATTGTTTACAAACAACAGCTG;SOR=0.719;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=424;TCF=217;TCR=207;TR=423;WE=7551058;WS=7551040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,468:1.00:468
chr12	7585247	rs58195891	T	C	3864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=425;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.423;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=91;PP=2874;ReadPosRankSum=0.971;SC=CACATATAGTTCCCCACCTTT;SOR=0.793;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=382;TCF=195;TCR=187;TR=188;WE=7585255;WS=7585235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:216,192:0.47:408
chr12	7585443	rs141002179	T	TA	272.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=176;ReadPosRankSum=-0.437;SC=TACCAAAAATTAAAAAAAAAT;SOR=0.576;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=13;WE=7585451;WS=7585433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr12	7591536	rs59581534	T	A	2005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.550;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-6.314;NF=44;NR=36;ReadPosRankSum=1.102;SC=TCTCTAAGAATGCGTTCTTGT;SOR=0.622;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=160;TCF=82;TCR=78;TR=80;WE=7591544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,94:0.53:179
chr12	7591715	rs58992912	T	G	1899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.361;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.116;NF=45;NR=37;PP=1195;ReadPosRankSum=-0.066;SC=GCACTTTTAGTGTTTTGTTTC;SOR=0.534;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=187;TCF=106;TCR=81;TR=82;WE=7591723;WS=7591705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,94:0.44:213
chr12	7592035	rs10772330	G	T	1446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.218;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=-2.440;NF=35;NR=34;PP=856;ReadPosRankSum=1.003;SC=TCCAGGTCTGGTTTGGACTTG;SOR=0.598;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=147;TCF=73;TCR=74;TR=69;WE=7592043;WS=7592025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,75:0.46:163
chr12	7592139	rs10772331	G	A	1063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=22;PP=664;ReadPosRankSum=1.357;SC=CTTCTTTGGGGAAGTATCTTC;SOR=0.662;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=103;TCF=53;TCR=50;TR=47;WE=7592147;WS=7592129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,52:0.46:113
chr12	7592194	rs61748920	T	C	1637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.591;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=28;PP=729;ReadPosRankSum=1.309;SC=GCCTCAAATATGTCGTTATTT;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=133;TCF=73;TCR=60;TR=65;WE=7592202;WS=7592184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,82:0.53:156
chr12	7596855	rs7954905	T	C	3061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=72;PP=2160;SC=GTTCATAGTTTTCCAAAGGGG;SOR=2.170;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=26;TCR=72;TR=98;WE=7596863;WS=7596845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr12	7632376	rs12304718	T	C	2337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=23;PP=1541;SC=CATTCTTTCTTTCTAATGCCA;SOR=1.525;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=54;TCR=23;TR=77;WE=7632384;WS=7632366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr12	7638020	rs10743939	G	A	916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.421;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=21;PP=543;ReadPosRankSum=-1.309;SC=ATTCTGCAGCGAAACATAGAA;SOR=0.487;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=102;TCF=48;TCR=54;TR=43;WE=7638028;WS=7638010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,48:0.41:118
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chr12	7649653	rs4883264	T	C	2806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.426;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=56;PP=1824;ReadPosRankSum=-1.055;SC=TCCCCCATTCTCCTTGGAATC;SOR=0.656;SbPval=0.54;Source=Platypus;TCF=144;TR=122;WE=7649661;WS=7649643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,133:0.46:292
chr12	7655137	rs3210140	A	G	4121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=365;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.232;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=88;PP=2674;ReadPosRankSum=0.978;SC=AAGGGACTCAAGTTGACAAAA;SOR=0.612;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=340;TCF=164;TCR=176;TR=176;WE=7655145;WS=7655127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,189:0.52:365
chr12	7655278	rs11836971	T	A	2530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.639;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=55;PP=1662;ReadPosRankSum=0.878;SC=AAACTCTTCATTCTAAATTGC;SOR=0.506;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=222;TCF=120;TCR=102;TR=114;WE=7655286;WS=7655268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,118:0.51:232
chr12	7803562	rs10431308	C	A	725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=3.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.83;ReadPosRankSum=-0.061;SOR=0.356;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,37:0.55:67
chr12	7805236	rs2302515	C	G	2385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.916;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=49;PP=1399;ReadPosRankSum=1.205;SC=TGGAGCAGCTCATGGATGGGT;SOR=0.531;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=209;TCF=98;TCR=111;TR=98;WE=7805244;WS=7805226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,112:0.48:231
chr12	7805467	rs2080127	C	T	2668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.708;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.485;NF=41;NR=60;PP=1390;ReadPosRankSum=-0.842;SC=TGTCATGCCACATTTAGAGAG;SOR=0.944;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=193;TCF=85;TCR=108;TR=101;WE=7805475;WS=7805457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,126:0.54:234
chr12	7805511	.	TTTTTA	T,TATTTTA	3191.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.35;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=3;MGOF=8;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=7,2;NR=47,47;PP=1556,1734;SC=CCCTCTTCTTTTTTTATTTTA;SOR=1.533;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=76;TCF=8;TCR=68;TR=54,49;WE=7805523;WS=7805501;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.33,0.67:91
chr12	7807138	rs10845624	G	A	1417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=21;PP=817;ReadPosRankSum=-1.541;SC=ACCATGCACAGCTCTTAAATA;SOR=0.703;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=120;TCF=76;TCR=44;TR=60;WE=7807146;WS=7807128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,68:0.51:133
chr12	7818444	rs7294364	C	A	2017.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.058;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-1.021;NF=54;NR=36;PP=1163;ReadPosRankSum=-0.559;SC=GCCCCCGGATCCATTTTACCT;SOR=0.777;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=175;TCF=99;TCR=76;TR=90;WE=7818452;WS=7818434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,99:0.52:192
chr12	7842932	rs12819884	C	T	2575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.035;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=47;PP=1821;ReadPosRankSum=0.452;SC=AAATTCACCCCTGAGTCTCTA;SOR=1.104;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=222;TCF=122;TCR=100;TR=114;WE=7842940;WS=7842922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,119:0.49:243
chr12	7843373	rs3815479	C	T	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.436;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=245;ReadPosRankSum=1.967;SC=AATAGAAATGCCAGACACCCA;SOR=1.688;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=37;TCF=9;TCR=28;TR=14;WE=7843381;WS=7843363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,15:0.36:42
chr12	7847940	rs6488591	C	T	391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=269;SC=TTAAATGAGACAAAATATGAA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=7847948;WS=7847930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	7868777	rs34619457	A	AT	897.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.738;HP=8;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=365;ReadPosRankSum=-1.138;SC=CAATAAACATATTTTTTTCCC;SOR=0.509;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=44;TCF=3;TCR=41;TR=17;WE=7868785;WS=7868767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,40:0.46:87
chr12	7894056	rs73056605	G	A	3033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.932;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.03;MQRankSum=1.105;NF=70;NR=64;PP=1886;ReadPosRankSum=1.288;SC=GTCAGGCTTGGATGATACTGT;SOR=0.659;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=288;TCF=147;TCR=141;TR=134;WE=7894064;WS=7894046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:181,150:0.45:331
chr12	7894132	rs80204298	GA	G	2302.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.927;NF=2;NR=47;PP=1701;ReadPosRankSum=1.247;SC=GAGGCACTGGGAAAGAGAAAT;SOR=0.730;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=86;TCF=3;TCR=83;TR=49;WE=7894140;WS=7894122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,78:0.55:143
chr12	7894188	rs73056607	C	G	674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.646;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=21;PP=514;ReadPosRankSum=-0.833;SC=TTGTACTATACAATCTTATGC;SOR=0.387;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=41;TCF=7;TCR=34;TR=26;WE=7894196;WS=7894178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,26:0.60:43
chr12	7899703	rs117041014	G	A	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=83;ReadPosRankSum=0.305;SC=ACAGGCGTGAGCCACCGCGCC;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=5;WE=7899711;WS=7899698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr12	7945829	rs4242903	G	C	8728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=125;NR=162;PP=2965;SC=TTTGTCCTTGGAATAAGGTGA;SOR=0.987;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=287;TCF=125;TCR=162;TR=287;WE=7945837;WS=7945819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,315:1.00:315
chr12	7966958	rs10845981	C	T	1599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.643;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-14.957;NF=58;NR=37;PP=1508;ReadPosRankSum=-0.234;SC=GCTGTTCATCCCCATGACGCC;SOR=0.828;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=249;TCF=148;TCR=101;TR=95;WE=7966966;WS=7966948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,82:0.33:252
chr12	7967135	rs11055945	T	A	1316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-8.931;NF=23;NR=41;PP=1007;ReadPosRankSum=-0.905;SC=ATAGTACTAGTGAAAGGACAG;SOR=0.636;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=132;TCF=51;TCR=81;TR=64;WE=7967143;WS=7967125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,62:0.45:137
chr12	7970347	.	T	TATAGATAGATAGATAGATAG	579.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.514;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.79;MQRankSum=1.625;QD=17.57;ReadPosRankSum=0.921;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,10:0.30:33
chr12	7970721	rs10845990	T	G	841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=25;PP=691;SC=AAGCTCCTCCTGTCCTGACGT;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=7970729;WS=7970711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	7980035	rs10846003	T	C	5203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=111;NR=66;PP=2965;SC=CCACCATGCCTGGCATTTTAA;SOR=1.396;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=178;TCF=112;TCR=66;TR=177;WE=7980043;WS=7980025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr12	7980306	rs56049529	T	TA	1435.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.28;QD=32.63;SOR=1.662;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr12	7982753	rs202204123	CTT	C	104	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.00;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr12	7984447	rs10772787	G	A	2920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=63;PP=1811;SC=GCTCACGCCTGTAATCCCAGC;SOR=2.101;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=24;TCR=63;TR=87;WE=7984455;WS=7984437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr12	7985460	rs17728008	T	C	2255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=2.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.017;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.155;NF=44;NR=52;PP=1356;ReadPosRankSum=0.129;SC=AAACTTGTAATTGATGACTGT;SOR=0.842;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=238;TCF=116;TCR=122;TR=96;WE=7985468;WS=7985450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,114:0.40:287
chr12	8043688	rs7297809	G	C	2113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=38;PP=1278;SC=TCACACCCAGGAGTACTTCTA;SOR=1.577;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=23;TCR=38;TR=61;WE=8043696;WS=8043678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr12	8074192	rs25684	G	A	1955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.030;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.390;NF=44;NR=47;PP=1164;ReadPosRankSum=-0.810;SC=TGAGGAAGCCGGTGAAGATAA;SOR=0.501;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=205;TCF=90;TCR=115;TR=91;WE=8074200;WS=8074182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,100:0.44:226
chr12	8075685	rs741361	A	G	803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.822;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=27;PP=587;ReadPosRankSum=0.127;SC=CTAGGTTCCCAGAAGCAATTA;SOR=0.798;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=93;TCF=29;TCR=64;TR=37;WE=8075693;WS=8075675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,39:0.41:96
chr12	8082367	rs17847967	T	C	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FS=23.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.80;MQRankSum=-8.618;QD=0.24;ReadPosRankSum=-0.464;SOR=3.181;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:168,18:0.10:186
chr12	8088766	rs2541281	T	C	181.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=147;SC=TCCAAAGTCTTACCATTACAG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=8088774;WS=8088756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	8090361	.	C	T	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.032;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.77;ReadPosRankSum=-0.263;SOR=0.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr12	8090505	rs12321738	C	G	345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=9;PP=233;SC=AAAAGTGTTACATAAGTATCT;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=8090513;WS=8090495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	8090839	rs7309332	T	C	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=4.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.578;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=2;PP=427;ReadPosRankSum=0.083;SC=GGAGAAAGTGTATCTTCCTTT;SOR=1.807;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=50;TCF=43;TCR=7;TR=22;WE=8090847;WS=8090829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,23:0.42:55
chr12	8196445	rs2277414	T	G	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=479;ReadPosRankSum=-1.457;SC=TTCAGTCCTTTCAGAGGCAAA;SOR=0.617;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=53;TCF=13;TCR=40;TR=22;WE=8196453;WS=8196435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,29:0.45:64
chr12	8197424	rs35642012	C	G	1011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.684;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=19;PP=580;ReadPosRankSum=0.674;SC=CTGAGGGTCCCCCTCCCCTCT;SOR=0.829;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=116;TCF=72;TCR=44;TR=51;WE=8197432;WS=8197414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,55:0.44:125
chr12	8235172	rs66928724	GT	G	454.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.436;NF=0;NR=28;PP=353;ReadPosRankSum=-1.581;SC=TATTTCTGCCGTTTTTTTTTT;SOR=3.352;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=28;WE=8235181;WS=8235162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,21:0.95:22
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chr12	8248367	rs2231754	T	C	2146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=49;PP=1340;ReadPosRankSum=0.931;SC=TCAATTGAAATCTTTGATCTG;SOR=0.671;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=236;TCF=114;TCR=122;TR=96;WE=8248375;WS=8248357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,108:0.41:261
chr12	8276432	rs7295783	C	T	3186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=37;PP=2191;SC=TAAGAAAGATCTGAAACAGAT;SOR=1.528;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=74;TCR=37;TR=111;WE=8276440;WS=8276422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr12	8278181	rs2024301	A	T	3450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=369;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.379;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=73;PP=2296;ReadPosRankSum=-2.115;SC=ACTGCCCCTCACAAAAGTAAT;SOR=0.736;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=330;TCF=177;TCR=153;TR=156;WE=8278196;WS=8278171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:200,168:0.46:368
chr12	8286762	rs7315526	G	C	2761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;SC=TTTCTCTTTCGGGCCTGCACG;SOR=0.776;Source=Platypus;TCF=43;WE=8286770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr12	8287048	rs11043498	C	T	2659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=42;PP=1552;SC=TGGGACTCCTCCGGGTTTTGC;SOR=0.778;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=43;TCR=42;TR=85;WE=8287056;WS=8287038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr12	8288098	rs10840746	T	C	279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=0;PP=201;SC=ATGTGCTCTCTCTTGGCTCTT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=8288106;WS=8288094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	8288403	rs17728942	G	A	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=19;PP=416;ReadPosRankSum=1.294;SC=CTAAGAAGGAGGTTTTTGTTA;SOR=0.830;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=54;TCF=18;TCR=36;TR=28;WE=8288411;WS=8288393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,32:0.55:58
chr12	8289226	rs4322490	G	A	390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=309;SC=CGATGTCTTTGATTCTGCCCT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=8289234;WS=8289225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	8289300	rs4573763	T	C	2902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=25;PP=1730;SC=ATCCTCTCCTTTTCTTCTTGT;SOR=1.855;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=63;TCR=25;TR=88;WE=8289308;WS=8289290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr12	8374770	rs9668474	G	A	471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=7;PP=296;SC=CCTCGTGCCTGTCTGGGGTGA;SOR=0.793;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=8;TCR=7;TR=15;WE=8374789;WS=8374760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	8374781	rs71265055	C	CACG	727.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=4;NR=6;PP=599;SC=TCTGGGGTGACGTACGTGGTC;SOR=0.804;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=10;WE=8374789;WS=8374760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	8608482	.	G	GTTT	74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=12;HapScore=2;MGOF=54;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=4;NR=0;PP=74;QD=22.75;SC=TTCCTCTTTTGTTTTTTTTAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=4;WE=8608490;WS=8608475;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,4:0.80:5
chr12	8608502	rs4628756	T	A	119.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.76;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr12	8608583	rs4528410	A	G	1344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=28;NR=9;PP=767;SC=TTAGTCCTATAAGAGTGTGTA;SOR=1.659;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=28;TCR=9;TR=37;WE=8608591;WS=8608573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr12	8612336	rs10770736	G	C	4999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=94;PP=2647;SC=TTTTTTCTCAGGGAGAGATCA;SOR=1.053;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=173;TCF=78;TCR=95;TR=172;WE=8612344;WS=8612326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr12	8612481	rs12300621	A	G	395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.97;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	8617976	rs7302011	A	T	511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.65;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	8617982	rs7315873	G	A	544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.91;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	8692327	rs148901915	GA	G	122.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=3.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.24;MQRankSum=1.785;QD=2.79;ReadPosRankSum=0.387;SOR=1.585;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,11:0.25:44
chr12	8693240	rs5014225	C	A	1270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.82;SOR=4.479;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	8693245	.	A	AC	636.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.260;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.30;ReadPosRankSum=0.930;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,28:0.85:33
chr12	8693333	rs4620776	G	A	3130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.45;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr12	8693419	rs145952293	T	TTCTC,TTC	1289.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;NF=0,0;NR=20,20;PP=676,110;SC=GGTTTTTTGTTTCTCTCTCTC;SOR=2.468;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=20,20;WE=8693427;WS=8693409;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:0.97:30
chr12	8757481	rs2028373	G	A	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.488;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=13;PP=286;ReadPosRankSum=0.072;SC=AAGTTCTTTCGTGGTTTTCTA;SOR=0.824;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=58;TCF=27;TCR=31;TR=26;WE=8757489;WS=8757471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,25:0.53:47
chr12	8757522	.	C	CA	74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;FR=0.5000;HP=13;HapScore=2;MGOF=39;MMLQ=17;MQ=56.98;NF=1;NR=5;PP=74;QD=13.1666666667;SC=AAATAATCTTCAAAAAAAAAA;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=6;WE=8757530;WS=8757512;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,6:0.46:13
chr12	8759445	rs2518144	C	T	1595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.588;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=25;PP=866;ReadPosRankSum=1.229;SC=CTTGCAAAGCCGACTTTAATT;SOR=0.786;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=145;TCF=90;TCR=55;TR=67;WE=8759453;WS=8759435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,76:0.47:162
chr12	8765447	rs1345004	T	C	1610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=34;PP=1039;SC=TTCTCTGTCTTAGTCTGACAG;SOR=1.781;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=52;TCF=17;TCR=35;TR=51;WE=8765455;WS=8765437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr12	8802008	rs2289382	G	A	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.610;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=351;ReadPosRankSum=0.195;SC=CCCTCCTCTAGTACCAGACTT;SOR=1.092;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=50;TCF=43;TCR=7;TR=20;WE=8802016;WS=8801998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,20:0.39:51
chr12	8802962	rs2289385	C	A	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.092;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=319;ReadPosRankSum=-1.514;SC=GTACATTCAGCAATAACTAGG;SOR=1.371;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=40;TCF=36;TCR=4;TR=17;WE=8802970;WS=8802952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,18:0.44:41
chr12	8803202	rs3841565	CA	C	2425.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.618;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=53;PP=1344;ReadPosRankSum=0.125;SC=AAGCCCAATACAAAAAAATAA;SOR=0.514;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=126;TCF=14;TCR=112;TR=61;WE=8803210;WS=8803192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,106:0.57:186
chr12	8807195	rs17802192	T	C	1267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.608;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=36;PP=883;ReadPosRankSum=0.354;SC=TGGCTTTGTGTTTTATGTATA;SOR=1.122;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=105;TCF=40;TCR=65;TR=53;WE=8807203;WS=8807185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,57:0.49:117
chr12	8807982	rs34501309	A	AT	551.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=1.187;QD=8.36;ReadPosRankSum=0.626;SOR=0.669;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,30:0.45:66
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chr12	8808362	rs151087918	CAAACA	C	1925.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.388;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=3.661;NF=10;NR=19;PP=1270;ReadPosRankSum=-0.057;SC=AACAAACAAACAAACAAAAGT;SOR=0.539;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=85;TCF=37;TCR=48;TR=29;WE=8808374;WS=8808352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,56:0.39:145
chr12	8808630	rs35365089	C	T	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=173;ReadPosRankSum=0.762;SC=ATACCAAAGGCATTGTGATTT;SOR=0.425;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=14;WE=8808638;WS=8808620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr12	8813498	rs12833793	T	A	1426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=31;PP=819;ReadPosRankSum=-2.920;SC=ATCCAGTCTATAGCAAAGGAA;SOR=0.711;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=158;TCF=83;TCR=75;TR=67;WE=8813506;WS=8813488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,75:0.44:172
chr12	8813595	rs12809190	T	A	684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-2.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.311;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=347;ReadPosRankSum=0.247;SC=ATGGTTATACTTTATCTTTGT;SOR=0.242;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=50;TCF=13;TCR=37;TR=25;WE=8813603;WS=8813585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,32:0.53:60
chr12	8850706	rs112263725	G	T	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=257;ReadPosRankSum=-0.531;SC=CTGGGCGAGTGTGCGAGGACG;SOR=0.976;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=25;TCF=16;TCR=9;TR=15;WE=8850714;WS=8850696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr12	8850816	rs116782838	G	T	980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=18;PP=514;ReadPosRankSum=0.666;SC=ACTTCCAGCCGCCCGGCGGCC;SOR=0.623;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=77;TCF=46;TCR=31;TR=41;WE=8850824;WS=8850806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,49:0.55:89
chr12	8926011	rs2969089	T	C	4845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=74;PP=2965;SC=GTGGCATTGATCTGCTGATGA;SOR=0.959;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=172;TCF=97;TCR=75;TR=169;WE=8926019;WS=8926001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr12	8988403	rs4883188	A	C	90.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQ=58.79;NF=1;NR=3;PP=55;SC=AGGTCAGGAGATCGAGACCAC;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=8988411;WS=8988393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr12	8988777	rs1894814	A	G	1121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=3;PP=762;SC=CACTGTTTATACCCCTCTGCT;SOR=3.026;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=32;WE=8988785;WS=8988767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	8989916	rs11047510	A	G	976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=33;NR=3;PP=791;SC=GCACTGGCCCAGATTGTCAGA;SOR=4.235;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=33;TCR=3;TR=36;WE=8989924;WS=8989906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr12	8990813	rs10743504	A	G	886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=0;PP=693;SC=GAGTTTTTCTATATTAGAAAC;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=8990821;WS=8990803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	8991562	.	T	C	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.687;ClippingRankSum=0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.25;ReadPosRankSum=-0.542;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr12	8995694	rs7307991	A	G	1959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.673;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=36;PP=1150;ReadPosRankSum=-0.676;SC=TGGTTGGAGCACATGCTAAAA;SOR=0.852;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=182;TCF=106;TCR=76;TR=86;WE=8995714;WS=8995684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,99:0.46:216
chr12	8995966	rs7136813	G	A	2576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.569;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=62;PP=1553;ReadPosRankSum=1.246;SC=ATGTGAGACCGGGAAACGGGG;SOR=0.589;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=228;TCF=103;TCR=125;TR=117;WE=8995974;WS=8995956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,126:0.53:239
chr12	9004512	rs1860927	G	A	6087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=101;NR=94;PP=2965;SC=CTTTCAAGCCGTTCTTTGTTG;SOR=0.776;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=196;TCF=101;TCR=95;TR=195;WE=9004520;WS=9004502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr12	9004892	rs1860926	C	A	5942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=108;PP=2965;SC=GTGCTGATGACGCAAAAACCC;SOR=1.018;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=194;TCF=86;TCR=108;TR=194;WE=9004900;WS=9004882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr12	9009820	rs1558526	G	A	752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.717;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=11;PP=401;ReadPosRankSum=1.053;SC=CCCAGTGGCTGTGGCGAGCAG;SOR=0.898;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=85;TCF=54;TCR=31;TR=35;WE=9009828;WS=9009810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,40:0.43:92
chr12	9009999	rs3079157	T	TAA	1697.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.818;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.358;NF=4;NR=19;PP=1003;ReadPosRankSum=-0.031;SC=GACAGATTGATGATACAGGGA;SOR=0.556;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=45;TCF=9;TCR=36;TR=23;WE=9010007;WS=9009989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,45:0.53:85
chr12	9010671	rs11612600	G	A	1256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.706;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=30;PP=740;ReadPosRankSum=0.134;SC=ATGCCAACGTGGGAAATCTCC;SOR=0.779;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=99;TCF=41;TCR=58;TR=51;WE=9010679;WS=9010661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,59:0.51:115
chr12	9016573	rs10219561	A	G	841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=14;PP=400;SC=GCCAAGCAACACAATGCATAT;SOR=1.214;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=12;TCR=14;TR=26;WE=9016581;WS=9016563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr12	9020489	rs7308811	A	G	4832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=68;PP=2744;SC=TACCGCCTACATGCCATCTGA;SOR=0.971;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=168;TCF=100;TCR=68;TR=168;WE=9020505;WS=9020468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr12	9020912	rs1476910	A	G	7341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=118;NR=119;PP=2965;SC=GATGTGAGCAACCGACTTCAC;SOR=0.810;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=237;TCF=118;TCR=119;TR=237;WE=9020920;WS=9020902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,269:1.00:269
chr12	9021053	.	C	CGTGTGT	1693.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=0.000;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=3.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.71;ReadPosRankSum=-0.331;SOR=0.525;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,41:0.72:57
chr12	9021256	rs12816475	C	T	2800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=56;PP=1682;SC=ATTTATCTAGCTGTGAGGGGA;SOR=1.519;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=30;TCR=56;TR=86;WE=9021264;WS=9021246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr12	9021316	rs10664353	T	TAC	579.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=15;PP=675;SC=ATGGCGTGTATACACACACAC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=15;WE=9021324;WS=9021306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	9068472	rs10771204	G	T	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.191;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=2;PP=368;ReadPosRankSum=-0.010;SC=CAGAATTCAGGTTTGGGAAGA;SOR=1.336;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=47;TCF=41;TCR=6;TR=22;WE=9068480;WS=9068462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,24:0.46:52
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chr12	9090668	rs3026261	C	T	2850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=0.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.519;NF=55;NR=74;PP=1995;ReadPosRankSum=-0.153;SC=TACTGACCCTCTCTTCAACAG;SOR=0.697;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=288;TCF=126;TCR=162;TR=129;WE=9090676;WS=9090658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,137:0.44:309
chr12	9095226	rs1805731	T	C	850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.330;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=24;PP=607;ReadPosRankSum=0.776;SC=TGTCAGCTGTTTCCTAAGATA;SOR=0.299;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=53;TCF=13;TCR=40;TR=33;WE=9095234;WS=9095216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,35:0.60:58
chr12	9095268	rs1805730	A	T	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=354;ReadPosRankSum=0.000;SC=GAGTAGTGATACTAAATGAAA;SOR=2.200;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=16;WE=9095276;WS=9095258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,16:0.76:21
chr12	9095905	rs113829875	T	TAC	2546.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=16;PP=1733;ReadPosRankSum=0.406;SC=CAGCATAATGTACACATACAA;SOR=0.730;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=95;TCF=51;TCR=44;TR=39;WE=9095913;WS=9095895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,68:0.52:131
chr12	9097902	rs1805762	C	G	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.160;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=2;PP=107;ReadPosRankSum=0.663;SC=TGTGCCGAACCACACGTATGA;SOR=0.368;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=9;WE=9097910;WS=9097892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr12	9097933	rs1805725	C	A	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.862;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=5;PP=145;ReadPosRankSum=-0.631;SC=ACACTAGAAACGGCCAAGACA;SOR=0.211;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=24;TCF=16;TCR=8;TR=11;WE=9097941;WS=9097923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr12	9099034	rs4140911	G	A	750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=19;PP=418;ReadPosRankSum=-0.711;SC=GGGAGGGCAGGTAGGATCAGG;SOR=0.603;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=51;TCF=11;TCR=40;TR=26;WE=9099042;WS=9099024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,32:0.52:62
chr12	9161986	rs9888309	C	T	1187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=17;PP=671;ReadPosRankSum=0.447;SC=TCTGTGCATGCGGCCTTAAGT;SOR=0.732;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=96;TCF=62;TCR=34;TR=52;WE=9161994;WS=9161976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,57:0.52:110
chr12	9205540	rs2216143	T	A	433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=10;PP=284;SC=TACATTTTTTTAATCTCCTTA;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=15;WE=9205548;WS=9205530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	9220729	rs7955940	G	A	5512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=101;NR=98;PP=2965;SC=GGTTTGGGGGGCAAGCTGAAG;SOR=0.841;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=200;TCF=102;TCR=98;TR=199;WE=9220737;WS=9220719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr12	9222286	rs1805664	C	T	5481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=112;NR=59;PP=2965;SC=CCCAGATGTTCCCTTAGAGGA;SOR=1.435;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=172;TCF=113;TCR=59;TR=171;WE=9222294;WS=9222276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr12	9227058	rs1805660	T	A	886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=8;PP=701;SC=CAAGTTACTGTCATCTGTATT;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=30;WE=9227066;WS=9227048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr12	9230038	rs2377682	C	T	4787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=85;PP=2926;SC=AGAGAGAGATCTGAATAATTC;SOR=0.902;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=163;TCF=78;TCR=85;TR=163;WE=9230046;WS=9230028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr12	9230131	rs1805653	G	A	1833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=41;PP=1204;SC=TCCCTATAGGGCAAAGTATCA;SOR=1.410;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=66;TCF=24;TCR=42;TR=65;WE=9230139;WS=9230121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr12	9230572	rs1805652	G	T	488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=14;PP=366;SC=TACTTAGAGAGCTTATCTCCT;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=9230580;WS=9230562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	9232268	rs669	T	C	2314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=46;NR=32;PP=1475;SC=TTGGACTTGATCTCTGGAGTA;SOR=1.039;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=46;TCR=32;TR=78;WE=9232276;WS=9232258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr12	9242924	rs2193005	G	C	6713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=137;NR=97;PP=2965;SC=TTTGAGTAGAGAATTATCTCT;SOR=1.028;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=234;TCF=137;TCR=97;TR=234;WE=9242932;WS=9242914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr12	9248233	rs226405	T	C	5433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=100;PP=2890;SC=CAGTCTTCATTGTCCTGGTCA;SOR=0.916;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=187;TCF=86;TCR=101;TR=186;WE=9248241;WS=9248223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr12	9253894	rs226397	C	T	2609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=57;PP=1563;SC=GAGTCCCTGCCGGCAATAATT;SOR=1.790;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=25;TCR=57;TR=82;WE=9253902;WS=9253884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr12	9256708	rs226390	C	T	788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=0;PP=611;SC=AACCTTCAATCGGTTTCTAAT;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=9256716;WS=9256698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	9260280	rs226388	T	C	3836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=64;PP=1877;SC=GAGCAGACACTGAACCTCCCC;SOR=0.898;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=65;TCR=64;TR=129;WE=9260288;WS=9260257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr12	9262727	rs226386	T	G	757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=20;PP=587;SC=TACAAAAAGGTCAAATGGGGT;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=9262735;WS=9262717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	9264946	rs226383	T	G	4383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=76;PP=2820;SC=CTTTTTGAAGTTGTCCTGTCT;SOR=0.826;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=145;TCF=69;TCR=76;TR=145;WE=9264954;WS=9264936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr12	9268473	rs226380	A	C	1440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=23;PP=710;SC=CTGGAGGAGAACAGACTGTAT;SOR=1.480;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=17;TCR=23;TR=40;WE=9268481;WS=9268463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr12	9268585	rs226379	T	C	52.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=17.43;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr12	9302313	rs2303615	A	G	350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=10;PP=270;SC=AGAATTGTCAAAACTTCATGT;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=9302321;WS=9302303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	9303296	rs10842971	A	T	9471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=357;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=171;NR=151;PP=2965;SC=TCCTACTGGGATGTCTTGCAG;SOR=0.733;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=322;TCF=171;TCR=151;TR=322;WE=9303304;WS=9303286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,357:1.00:357
chr12	9307373	rs2377741	T	G	3258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=66;PP=1956;SC=GGAGCCTGGGTTTGGTAAAGA;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=114;TCF=48;TCR=66;TR=113;WE=9307381;WS=9307363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr12	9309995	rs12822596	G	A	314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=259;SC=GGTGAATAGAGGGCAGAGCAA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=9310003;WS=9309985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	9310576	rs10771364	T	G	946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=25;PP=678;SC=TCTCGACAGGTTCTTGCTCTG;SOR=3.477;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=30;WE=9310584;WS=9310566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr12	9310959	rs7298673	C	T	623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=0;PP=528;SC=CTCCCTTCACCCCTGGGGGAT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=9310967;WS=9310949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	9311251	rs7309811	C	G	1347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=22;PP=623;SC=ACAGGCTCCCCCATCACAGTG;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=27;WE=9311273;WS=9311241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr12	9311265	rs3741850	A	C	1145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=18;PP=503;SC=CACAGTGTGCACCCAAGAAAG;SOR=3.014;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=9311273;WS=9311241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr12	9311281	rs7309821	C	T	826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=57;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=15;PP=371;SC=GAAAGTCAATCAGCTGTTACT;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=9311289;WS=9311271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	9313518	rs7972015	T	A	525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.24;QD=29.21;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	9333749	rs919209	G	A	1500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.857;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=30;PP=756;ReadPosRankSum=0.570;SC=TGAAGGAAACGTCAACCAGTG;SOR=0.660;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=155;TCF=85;TCR=70;TR=64;WE=9333757;WS=9333739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,76:0.42:179
chr12	9334728	rs3832849	G	GAGTGAGACAAAATGGTCATA	2742.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FS=1.244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.29;MQRankSum=9.044;QD=17.47;ReadPosRankSum=0.067;SOR=0.596;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,74:0.47:157
chr12	9344878	rs2075394	A	G	2922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.701;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=57;PP=1781;ReadPosRankSum=-0.140;SC=AGTGAAGGAAATTTCTTGAGC;SOR=0.836;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=247;TCF=131;TCR=116;TR=130;WE=9344886;WS=9344868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,141:0.50:280
chr12	9344962	rs12423745	A	G	2301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.984;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=55;ReadPosRankSum=-0.496;SC=GAGAGAATCAACCTCAAGAAA;SOR=0.918;SbPval=0.7;Source=Platypus;TCF=126;TR=101;WE=9344970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,116:0.41:282
chr12	9345273	rs10771407	A	G	5621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=93;PP=2965;SC=TGTGCTGAGCACCCTGGTGGT;SOR=0.702;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=193;TCF=100;TCR=93;TR=193;WE=9345281;WS=9345263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr12	9345408	rs2075395	A	G	1465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=36;PP=1003;SC=CAAAATGAATAGTTACAACGG;SOR=2.701;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=9;TCR=36;TR=45;WE=9345416;WS=9345398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr12	9346792	rs12230214	G	C	3311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=338;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.285;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=73;PP=2094;ReadPosRankSum=-0.667;SC=ATGAAGAAGAGTTTATTGGGG;SOR=0.655;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=308;TCF=156;TCR=152;TR=141;WE=9346800;WS=9346782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,160:0.47:338
chr12	9349370	rs11049396	C	CT	743.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.464;NF=4;NR=21;PP=482;ReadPosRankSum=0.312;SC=GACAAGAAAACTTTTTTTTTG;SOR=1.127;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=25;WE=9349378;WS=9349360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,30:0.94:32
chr12	9352908	rs6487668	C	A	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.564;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=149;ReadPosRankSum=-0.669;SC=CTACATAATCCCTCAAAATTG;SOR=1.073;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=42;TCF=34;TCR=8;TR=12;WE=9352916;WS=9352898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,14:0.31:45
chr12	9356603	rs78952243	T	C	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.299;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=143;ReadPosRankSum=-1.662;SC=AGCGTTTTCATCCATAAATGT;SOR=2.070;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=9;WE=9356611;WS=9356593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,9:0.29:31
chr12	9446977	rs3874129	G	C	4933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=104;NR=72;PP=2658;SC=CCTTAGGAGAGGCCTGGTTTT;SOR=0.874;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=178;TCF=104;TCR=74;TR=176;WE=9446985;WS=9446967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr12	9447484	rs77482466	C	T	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.95;MQRankSum=-5.589;QD=10.04;ReadPosRankSum=0.056;SOR=0.768;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,22:0.31:71
chr12	9447488	rs75114985	C	T	656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=1.033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.82;MQRankSum=-5.262;QD=9.80;ReadPosRankSum=0.457;SOR=0.533;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,20:0.30:67
chr12	9447492	rs75754601	T	C	830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=1.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.78;MQRankSum=4.857;QD=13.85;ReadPosRankSum=0.105;SOR=0.956;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,41:0.68:60
chr12	9451370	rs200995345	T	C	785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.43;MQRankSum=-7.451;QD=5.27;ReadPosRankSum=0.280;SOR=0.674;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,50:0.34:149
chr12	9451397	rs74390404	G	A	1013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.58;MQRankSum=-5.865;QD=5.96;ReadPosRankSum=-1.219;SOR=0.707;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:107,63:0.37:170
chr12	9451473	rs141541321	G	A	298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.71;QD=27.16;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	9452016	.	C	G	77.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.77;QD=25.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr12	9452017	rs149620408	C	A	77.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.77;QD=25.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr12	9452062	rs75887043	A	C	106.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.10;QD=21.38;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	9453743	rs28415351	C	G	459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.81;QD=27.05;SOR=4.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	9453854	rs370590832	TC	T	1860.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=2.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.33;MQRankSum=1.571;QD=17.89;ReadPosRankSum=3.119;SOR=1.044;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,64:0.62:104
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chr12	9455171	rs373750394	A	G	462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.81;QD=30.85;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
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chr12	9459854	rs9971685	G	C	2364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=55;PP=1887;SC=TGTGCACTTTGCCCAAGTGGT;SOR=1.445;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=94;TCF=37;TCR=57;TR=92;WE=9459862;WS=9459844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr12	9459898	rs2911825	G	T	610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.30;QD=30.54;SOR=2.531;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr12	9462709	rs2889720	A	G	739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=4;NR=19;PP=627;SC=CCAGGCACAGAGGCGGAGGAG;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=23;WE=9462717;WS=9462699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	9462984	rs12317441	A	G	3019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.875;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.349;NF=60;NR=83;PP=1843;ReadPosRankSum=-1.562;SC=CTGCAGCGGGATCTCCAACCA;SOR=1.097;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=319;TCF=147;TCR=172;TR=143;WE=9462992;WS=9462974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:198,153:0.44:351
chr12	9463010	rs4883234	C	G	7166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=104;NR=141;PP=2965;SC=TGGAATTCACCTTCCAGAAAA;SOR=1.153;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=245;TCF=104;TCR=141;TR=245;WE=9463018;WS=9463000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr12	9463077	rs10771513	A	C	1904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=-1.573;NF=8;NR=55;PP=1375;ReadPosRankSum=0.930;SC=GCCTGGCCTCAGGCAGCAAAG;SOR=2.524;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=8;TCR=56;TR=63;WE=9463085;WS=9463067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,68:0.99:69
chr12	9463806	rs10771515	T	C	1726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=34;PP=981;SC=CTGTTTCTTCTCCTCCTACGA;SOR=1.685;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=18;TCR=34;TR=52;WE=9463814;WS=9463796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr12	9464060	.	G	C	26	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MMLQ=27;MQ=53.74;NF=4;NR=0;PP=26;QD=15.1928031368;SC=TCTCCAGTCCGCTGGCCAGAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=4;WE=9464068;WS=9464055;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:14,4:0.22:18
chr12	9464109	rs12824979	A	G	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=5.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.415;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-7.418;NF=20;NR=1;PP=385;ReadPosRankSum=-0.167;SC=CTGGCACCCTAAACCTGTCTC;SOR=2.777;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=79;TCF=63;TCR=16;TR=21;WE=9464117;WS=9464099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,22:0.25:89
chr12	9464126	rs201695391	A	G	1106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=4.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.170;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-6.018;NF=35;NR=7;PP=1804;ReadPosRankSum=-0.626;SC=TCTCTGGGAAATGTCCTCTGT;SOR=1.806;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=136;TCF=101;TCR=35;TR=42;WE=9464141;WS=9464116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,42:0.29:147
chr12	9464133	rs10843383	C	G	3009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.312;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=4.872;NF=73;NR=34;PP=2962;ReadPosRankSum=0.989;SC=GAAATGTCCTCTGTCTTTCTC;SOR=0.425;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=159;TCF=111;TCR=48;TR=107;WE=9464141;WS=9464116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,117:0.69:170
chr12	9464178	rs112191067	G	A	2614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-4.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=374;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.471;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-5.620;NF=75;NR=58;PP=1681;ReadPosRankSum=-1.180;SC=CACACCAGGTGGAGCAGGTGC;SOR=0.529;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=341;TCF=201;TCR=140;TR=133;WE=9464186;WS=9464168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:225,148:0.40:373
chr12	9464241	rs61917427	C	A	2356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=526;ExcessHet=3.0103;FS=6.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQRankSum=-12.449;QD=4.50;ReadPosRankSum=2.377;SOR=0.795;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:369,155:0.30:524
chr12	9464271	.	C	CGTT	2045.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.802;ClippingRankSum=0.000;DP=466;ExcessHet=3.0103;FS=16.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQRankSum=-15.463;QD=4.55;ReadPosRankSum=-3.612;SOR=1.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:371,79:0.18:450
chr12	9464748	rs10771516	G	A	1457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=2.716;NF=32;NR=17;PP=926;ReadPosRankSum=0.023;SC=AGGGCTGACGGAAGGGGTAGA;SOR=1.487;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=34;TCR=18;TR=49;WE=9464756;WS=9464738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,55:0.96:57
chr12	9465465	rs11050199	A	G	5167.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=2.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=4.663;NF=87;NR=84;PP=2928;ReadPosRankSum=1.047;SC=CTCTGTTCCTATGCAGGCAGG;SOR=0.640;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=202;TCF=103;TCR=99;TR=171;WE=9465473;WS=9465455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:29,219:0.88:248
chr12	9465495	rs147788242	A	AT	6136.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=4.778;NF=18;NR=83;PP=2963;ReadPosRankSum=-3.969;SC=CACCAGAAGGATTTTGCCAGC;SOR=0.750;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=121;TCF=20;TCR=101;TR=101;WE=9465503;WS=9465485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,215:0.88:244
chr12	9465660	rs200338757	A	C	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.58;MQRankSum=-3.195;QD=18.52;ReadPosRankSum=-0.875;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr12	9549634	rs11308534	AG	A	486.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=1;PP=491;SC=GAGTACTGGAAGAAAAAAAAG;SOR=3.912;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=11;WE=9549642;WS=9549624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	9554954	rs199562811	G	C	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.35;MQRankSum=-0.000;QD=14.46;ReadPosRankSum=-0.253;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr12	9555110	rs12821647	A	G	1373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.82;MQRankSum=-1.607;QD=30.53;ReadPosRankSum=-1.272;SOR=1.893;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,44:0.98:45
chr12	9555185	rs72475431	A	G	3952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.53;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=58;PP=2341;SC=CCTTAGAGAAAAGCCCCTCTT;SOR=0.994;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=101;TCF=42;TCR=59;TR=100;WE=9555209;WS=9555165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr12	9555195	rs58903301	T	TC	1399.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.53;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.547;HP=7;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.017;NF=1;NR=35;PP=861;ReadPosRankSum=4.929;SC=AAGCCCCTCTTCCCCCCCTGG;SOR=1.030;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=67;TCF=2;TCR=65;TR=36;WE=9555209;WS=9555165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,57:0.53:107
chr12	9570971	rs7487238	G	A	206.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=4;PP=125;SC=GAGACCAAGCGGGAGGCCTGG;SOR=0.892;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=9;TCF=5;TCR=4;TR=9;WE=9570979;WS=9570961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	9571547	rs61916776	C	G	4224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.147;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=-0.742;NF=76;NR=78;PP=2720;ReadPosRankSum=-0.553;SC=CAGAGGCTGGCGCTCCGAGCA;SOR=0.343;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=155;TCF=77;TCR=78;TR=154;WE=9571555;WS=9571537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,160:0.99:161
chr12	9571599	rs73242993	C	A	4196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=65;NR=74;PP=2094;SC=GGCGACCCCCCCTCACCTTCC;SOR=1.096;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=139;TCF=65;TCR=74;TR=139;WE=9571607;WS=9571589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr12	9571670	rs77617533	T	C	1055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=22;PP=658;SC=CTTCTCCAGCTCCCATCTGTC;SOR=2.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=31;WE=9571678;WS=9571660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	9572244	rs7305608	A	G	1134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=21;PP=618;SC=CAGCTGCTCCATTCTACCCCT;SOR=1.402;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=15;TCR=21;TR=36;WE=9572252;WS=9572234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr12	9572788	rs145731114	C	CGCACCTGGAT	2879.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.53;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=26;PP=2900;SC=GCATGACGCCCGCACCTGGAA;SOR=6.123;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=73;TCF=4;TCR=69;TR=27;WE=9572796;WS=9572778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr12	9572819	rs10843740	C	T	756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.94;QD=30.27;SOR=3.014;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr12	9572871	rs10843741	T	C	294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.85;QD=26.80;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	9573130	rs7358608	C	T	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.114;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.416;NF=12;NR=2;PP=230;ReadPosRankSum=0.352;SC=GGCAGCCAGACGGCCCAGCAG;SOR=1.739;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=14;WE=9573138;WS=9573120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr12	9573224	rs7358609	C	T	2245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=4.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.78;MQRankSum=5.818;QD=16.51;ReadPosRankSum=-1.968;SOR=0.856;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,103:0.76:136
chr12	9573291	rs67766754	AAGGG	A	2461.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=5.919;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=63.51;MQRankSum=2.570;QD=37.30;ReadPosRankSum=1.664;SOR=0.092;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,63:0.95:66
chr12	9573306	.	GGA	CCC	1198	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MMLQ=15;MQ=66.24;NF=19;NR=20;PP=1198;QD=32.3453301247;SC=AGGGAGGGAGGGAGCCCCCAT;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=53;TCF=22;TCR=31;TR=39;WE=9573317;WS=9573285;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:14,39:0.74:53
chr12	9573308	.	AG	A	1159	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;FR=1.0000;HP=4;HapScore=1;MGOF=25;MMLQ=27;MQ=65.7;NF=2;NR=30;PP=1159;QD=37.03125;SC=GGAGGGAGGGAGCCCCCATGG;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=32;WE=9573317;WS=9573285;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,32:0.97:33
chr12	9573309	.	G	GCCC	2917.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=64.60;QD=41.68;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr12	9573338	rs4763950	G	A	2006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=50;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=27;PP=691;SC=TCAGCCACCCGCAAACCGCGT;SOR=1.508;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=15;TCR=27;TR=42;WE=9573346;WS=9573328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr12	9574002	rs10771709	C	T	6186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=123;NR=88;PP=2965;SC=GCAGGTCTCTCTTCTGGAACG;SOR=0.865;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=211;TCF=123;TCR=88;TR=211;WE=9574010;WS=9573992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr12	9574042	rs7298124	C	A	7536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=9.977;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=6.584;NF=149;NR=125;PP=2965;ReadPosRankSum=2.971;SC=GGAGACCCCGCTGCAGATGAC;SOR=0.237;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=281;TCF=151;TCR=130;TR=274;WE=9574050;WS=9574032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:9,301:0.97:310
chr12	9574119	rs4764050	A	G	6065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=105;NR=107;PP=2965;SC=CCGAAAACTGAAGATGCAGGT;SOR=0.896;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=214;TCF=106;TCR=108;TR=212;WE=9574127;WS=9574109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr12	9574344	rs4237949	T	G	182.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5729;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=1;PP=124;SC=GCAGTATGAGTTATTACCCAC;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=6;WE=9574352;WS=9574334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	9574480	rs7132464	T	C	497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.30;QD=31.11;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	9574520	.	G	T	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=2.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.57;MQRankSum=-0.273;QD=14.49;ReadPosRankSum=0.125;SOR=0.957;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
chr12	9577027	rs3825308	C	G	592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=0;PP=411;SC=TTCTGGCTTGCGGCCCCAGGA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=9577035;WS=9577017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr12	9577310	rs7296629	A	C	3565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=81;PP=2422;SC=AAGGGGGTCCACAGTTGAGTC;SOR=1.284;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=131;TCF=50;TCR=81;TR=131;WE=9577318;WS=9577300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr12	9577992	rs201150453	C	T	451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=1;PP=526;SC=GGAAAGAATCCTTTCATGCTG;SOR=3.912;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=9578000;WS=9577982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	9578197	rs76671194	A	T	9462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=358;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=168;NR=163;PP=2965;SC=GGGCTGCAAGAGCTGCACAGA;SOR=0.716;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=331;TCF=168;TCR=163;TR=331;WE=9578205;WS=9578187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,358:1.00:358
chr12	9580122	rs61914680	A	G	676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-6.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.584;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.129;NF=44;NR=5;PP=765;ReadPosRankSum=-2.715;SC=GTAATTACACATCTGTTTTGC;SOR=0.083;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=122;TCF=114;TCR=8;TR=49;WE=9580130;WS=9580112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,37:0.32:114
chr12	9580203	rs58705479	G	C	7548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=417;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.441;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=5.447;NF=175;NR=132;PP=2962;ReadPosRankSum=-3.789;SC=ATTGGATGTGGAATGTGGAAA;SOR=0.798;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=431;TCF=243;TCR=188;TR=307;WE=9580211;WS=9580193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,325:0.78:415
chr12	9580395	rs61914681	C	G	1257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.77;MQRankSum=1.323;QD=33.99;ReadPosRankSum=-0.092;SOR=4.351;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,34:0.92:37
chr12	9582244	rs201653123	G	A	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.38;MQRankSum=1.383;QD=18.28;ReadPosRankSum=-1.054;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr12	9583216	rs3864916	T	C	586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.29;QD=36.67;SOR=2.049;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	9583221	rs3864915	G	A	487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.48;QD=40.65;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	9583324	rs4012577	G	A	318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.65;QD=24.52;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	9584916	rs3882934	C	T	119.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.26;QD=23.98;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	9585487	rs56309949	G	T	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=2.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.70;MQRankSum=-3.808;QD=6.76;ReadPosRankSum=-2.491;SOR=0.558;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,19:0.44:43
chr12	9585598	rs200479049	T	C	337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.61;QD=25.98;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	9590197	rs61914700	T	C	2034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=48;PP=1536;SC=GCTCTCCTTCTCCAACCAGCA;SOR=1.852;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=25;TCR=48;TR=73;WE=9590205;WS=9590187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr12	9590505	rs201948852	G	A	251.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.53;QD=27.98;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	9633258	rs4015230	A	G	2372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=55;PP=2057;SC=TCCAGAGAGAATGTGGTCTTC;SOR=1.046;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=116;TCF=61;TCR=55;TR=115;WE=9633266;WS=9633248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr12	9633375	rs4015231	A	G	494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.80;QD=30.92;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	9664292	rs10843926	G	A	424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.53;QD=28.32;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	9688883	rs2536903	A	C	2567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=54;PP=2139;SC=AGAAAAATGAAAATGAAATAT;SOR=0.738;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=55;TCR=54;TR=109;WE=9688891;WS=9688873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr12	9693196	rs138943288	G	A	418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=29.91;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	9707098	rs7309655	C	T	1791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.05;QD=32.58;SOR=3.952;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr12	9711954	rs2536846	A	T	383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.85;QD=31.98;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	9712911	rs200418990	G	A	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=51.91;QD=21.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr12	9725847	rs78525383	T	G	321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=12;PP=308;SC=GAGAGCTGGTTTACTTAATTT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=9725855;WS=9725837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	9747744	rs3214342	T	TA	366.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=380;SC=ATAACAGTTGTCAATTCTCAG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=9747752;WS=9747734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	9750669	rs1135816	A	G	2983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=33;PP=1591;SC=AGAGCCGTTTATCCACTTCCA;SOR=1.069;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=61;TCR=33;TR=94;WE=9750677;WS=9750659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr12	9751035	rs3072716	C	CAT	2155.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=6;PP=1308;SC=AATGCACAGACATTAATATGG;SOR=3.080;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=28;WE=9751043;WS=9751025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr12	9754221	rs3072720	A	AAAAC	4642.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.94;QD=43.80;SOR=1.747;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr12	9822387	rs16914640	C	G	2121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.022;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=48;PP=1346;ReadPosRankSum=0.700;SC=TGCCTGCAAACCCAGGTAAGA;SOR=0.672;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=204;TCF=107;TCR=97;TR=95;WE=9822395;WS=9822377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,104:0.46:228
chr12	9832822	rs2114872	C	T	730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.20;SOR=0.906;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	9832882	rs2114873	T	C	218.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=179;SC=CCATGTAGAATTGTGAGTCAG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=9832890;WS=9832872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	9833524	rs3764022	C	G	1139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=12;PP=567;ReadPosRankSum=-0.568;SC=TCCAGGTTGTCTGCATTCAAA;SOR=0.642;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=43;TCR=18;TR=41;WE=9833532;WS=9833514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,50:0.70:71
chr12	9833628	rs3764021	C	T	2420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=36;NR=36;PP=1187;SC=CTGCTTTAAGCGGTAAGTGAA;SOR=0.965;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=36;TCR=36;TR=72;WE=9833636;WS=9833618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr12	9846521	rs7968401	C	G	56.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr12	9869208	rs57357049	T	C	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.53;ReadPosRankSum=-0.630;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr12	9869208	.	TCC	CCG	234	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=8;NR=1;PP=234;QD=31.9408749847;SC=CTTGTCCCATTCCTCTTGCTC;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=9;WE=9869218;WS=9869198;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:12,9:0.43:21
chr12	9869210	rs56751889	C	G	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=1.804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.86;ReadPosRankSum=-0.309;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr12	9869271	rs2268146	A	G	1211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=14;PP=677;SC=GCCTCTTCCTAAGAAGACCCC;SOR=0.990;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=24;TCR=14;TR=38;WE=9869279;WS=9869261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr12	9885526	rs12304510	C	T	4381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=43;PP=2485;SC=TTCTCAAAGGCACCCTAAATC;SOR=1.552;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=138;TCF=95;TCR=43;TR=138;WE=9885534;WS=9885516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr12	9885707	rs71045297	A	ATAAGT	10333.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=72;PP=2957;SC=GAAACTTCTGATAAGTAAATT;SOR=0.747;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=133;TCF=38;TCR=95;TR=102;WE=9885715;WS=9885697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr12	9906067	rs1051065	T	C	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.304;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.136;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=101;ReadPosRankSum=-1.407;SC=TAAGTGAACATGTTTCCTTAT;SOR=0.136;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=8;WE=9906075;WS=9906057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr12	9906350	rs57931161	GA	G	97.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=0;NR=6;PP=106;SC=GACAAGAATTGAAAAAAAAAT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=6;WE=9906358;WS=9906340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	9980243	rs2232543	A	G	2974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=51;PP=1939;SC=ATTTAATTTCATTTTTTCAAT;SOR=0.827;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=51;TCR=51;TR=102;WE=9980251;WS=9980233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr12	9994445	rs33911869	GTGT	G	4087.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=27;PP=2109;SC=ACCAAGGGAAGTGTTGTTATT;SOR=1.179;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=46;TCF=19;TCR=27;TR=45;WE=9994455;WS=9994435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr12	10015082	rs253147	G	A	704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.976;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=10;PP=281;ReadPosRankSum=1.920;SC=AAAATAAAATGAAGGATGTAA;SOR=0.454;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=61;TCF=40;TCR=21;TR=28;WE=10015090;WS=10015072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,36:0.51:71
chr12	10015177	rs253146	A	G	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=8;PP=185;ReadPosRankSum=-0.048;SC=TCATACCTGAAAAATAAAAAT;SOR=0.682;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=56;TCF=30;TCR=26;TR=19;WE=10015185;WS=10015167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,23:0.35:65
chr12	10041364	rs1797517	G	A	2048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=40;PP=1174;ReadPosRankSum=0.589;SC=GAATGTAAACGTCAGCAGTCT;SOR=0.663;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=189;TCF=108;TCR=81;TR=89;WE=10041372;WS=10041354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,98:0.47:209
chr12	10045919	rs577575	G	A	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.132;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=350;ReadPosRankSum=0.902;SC=AAATGCTAATGTATATGAAAA;SOR=1.445;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=37;TCF=11;TCR=26;TR=18;WE=10045927;WS=10045909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr12	10046052	rs576601	C	A	2530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.660;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=42;PP=1451;ReadPosRankSum=1.255;SC=CAGTTTAAAACCTGGACATTT;SOR=0.843;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=207;TCF=124;TCR=83;TR=107;WE=10046060;WS=10046042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,118:0.53:222
chr12	10069302	rs526680	C	T	2763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-1.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.232;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=49;PP=1731;ReadPosRankSum=0.243;SC=AACTCACCAACCATTGAATGT;SOR=0.900;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=250;TCF=149;TCR=101;TR=125;WE=10069310;WS=10069292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,138:0.47:291
chr12	10131684	rs607567	T	G	4043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=82;PP=2598;SC=CCCCTGTTTTTGTCAAGAGGA;SOR=1.292;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=51;TCR=82;TR=133;WE=10131692;WS=10131674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr12	10133478	rs117182256	T	C	816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=23;PP=523;ReadPosRankSum=-1.359;SC=CAAGATATCATAGGCAAGGTA;SOR=0.732;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=28;TCR=56;TR=35;WE=10133486;WS=10133468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,38:0.42:90
chr12	10136672	rs2961544	G	A	924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=24;PP=671;SC=AAAGAAAACTGAAAAAGTATA;SOR=4.479;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=26;WE=10136680;WS=10136662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	10137557	rs479499	A	C	1850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=21;NR=37;PP=1136;SC=CACTTATAAAAAAAGAATGAT;SOR=1.508;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=21;TCR=37;TR=58;WE=10137565;WS=10137547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr12	10137645	rs588272	T	G	143.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=0;NR=5;PP=102;SC=CAAATACATTTAAGGAGTGTA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=10137653;WS=10137635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	10138830	rs576031	C	T	291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=237;SC=TGCGTCAGAACAGAAAAAGGA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=10138838;WS=10138820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	10146005	rs11412323	C	CA	424	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=8.073;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.43;ReadPosRankSum=-1.429;SOR=1.155;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,20:0.87:23
chr12	10149851	rs583903	C	T	5067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=87;NR=84;PP=2755;SC=TTCATTCTCACCTTGTAGGTA;SOR=0.811;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=171;TCF=87;TCR=84;TR=171;WE=10149859;WS=10149841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr12	10150961	rs2273987	G	A	1679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.718;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.340;NF=31;NR=41;PP=921;ReadPosRankSum=1.259;SC=ACGCCACCAGGAGGAGGATGC;SOR=0.854;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=186;TCF=86;TCR=100;TR=72;WE=10150982;WS=10150951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,86:0.40:213
chr12	10150974	rs2273986	A	G	6471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=73;NR=90;PP=2962;SC=GAGGATGCAGAGCCAACTGTA;SOR=0.991;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=163;TCF=73;TCR=90;TR=163;WE=10150982;WS=10150951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr12	10151642	rs612593	T	C	5650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.147;NF=122;NR=60;PP=2965;ReadPosRankSum=2.473;SC=TTACCGGAGATGAGAGCTGGT;SOR=1.509;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=183;TCF=123;TCR=60;TR=182;WE=10151650;WS=10151632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,208:0.99:210
chr12	10151747	rs118077922	A	G	3086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=1.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.861;HP=3;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.99;MQRankSum=-0.916;NF=49;NR=71;PP=1869;ReadPosRankSum=-0.106;SC=GACTTTGCAAAATGTAGTTTC;SOR=0.823;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=257;TCF=109;TCR=148;TR=120;WE=10151755;WS=10151737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,148:0.46:322
chr12	10151762	rs11379994	T	TC	10976.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=136;PP=2936;SC=AGTTTCCAACTTTACAATTTC;SOR=1.243;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=146;TCF=10;TCR=136;TR=146;WE=10151770;WS=10151752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,273:1.00:273
chr12	10163375	rs1359082	C	A	3491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FS=4.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.87;ReadPosRankSum=-0.368;SOR=1.051;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,92:0.44:207
chr12	10163379	rs1359083	C	T	3550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FS=3.910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.21;ReadPosRankSum=0.405;SOR=0.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:123,96:0.44:219
chr12	10165469	rs476474	A	G	3477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.57;SOR=0.753;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr12	10165593	rs620449	T	G	782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=18;PP=459;ReadPosRankSum=-1.131;SC=CGTCTGATACTTTTCTGCTGT;SOR=0.628;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=58;TCF=28;TCR=30;TR=35;WE=10165601;WS=10165583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,38:0.58:66
chr12	10167277	rs637790	G	C	7343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=117;NR=126;PP=2965;SC=GATCTCCAGTGTACTGAAGAG;SOR=0.895;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=243;TCF=117;TCR=126;TR=243;WE=10167285;WS=10167267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,269:1.00:269
chr12	10206925	rs7315231	A	G	2044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.473;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=60;PP=1335;ReadPosRankSum=-0.710;SC=GATTATTAACAGCATCCATTT;SOR=0.751;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=229;TCF=96;TCR=133;TR=99;WE=10206933;WS=10206915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,107:0.43:248
chr12	10215582	rs10772230	G	A	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=223;ReadPosRankSum=-1.184;SC=GTGAGGCAAGGGGCTTTTTGG;SOR=1.493;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=11;WE=10215590;WS=10215572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr12	10217326	rs10622534	C	CTT	5673.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=35;PP=2817;SC=ATTTTTGTCTCATAGGATTTT;SOR=1.179;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=67;TCF=32;TCR=35;TR=65;WE=10217334;WS=10217316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr12	10241541	.	A	AT	99	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=10;HapScore=4;MGOF=4;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=99;QD=55.5;SC=TTGGCAACTGATTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=2;WE=10241561;WS=10241531;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,2:0.33:6
chr12	10241593	rs1352477	A	T	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.854;HP=6;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=208;ReadPosRankSum=1.602;SC=GTTGCCATTTAAAAAAAGATA;SOR=0.223;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=16;WE=10241601;WS=10241583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr12	10241829	rs2277416	G	T	1972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.433;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=57;PP=1260;ReadPosRankSum=-1.375;SC=GCTCTGCAGGGAACAGAAGAG;SOR=0.954;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=176;TCF=66;TCR=110;TR=88;WE=10241837;WS=10241819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,93:0.49:188
chr12	10245158	rs11347002	GA	G	363.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.833;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=116;ReadPosRankSum=1.164;SC=AAGTAGTAATGAAATGAAATG;SOR=0.346;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=4;WE=10245166;WS=10245148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr12	10251256	rs10706436	GA	G	364.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.830;NF=6;NR=6;PP=129;ReadPosRankSum=-0.129;SC=GAATATAACTGAAAAAAAAAA;SOR=0.446;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=25;TCF=14;TCR=11;TR=12;WE=10251264;WS=10251246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr12	10251287	rs6488257	C	T	609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.050;NF=18;NR=10;PP=384;ReadPosRankSum=1.192;SC=TGTCACAGGGCGAGTAATTGG;SOR=0.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=35;TCR=19;TR=28;WE=10251295;WS=10251277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,30:0.53:57
chr12	10251385	rs3816845	T	C	1225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.240;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=26;PP=673;ReadPosRankSum=-0.349;SC=GTGGTCTATTTGGACTCCAGG;SOR=0.438;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=119;TCF=67;TCR=52;TR=55;WE=10251393;WS=10251375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,61:0.48:126
chr12	10251445	rs2306894	C	G	1137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.210;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=29;PP=696;ReadPosRankSum=-0.319;SC=TGTGGCAGAGCCTTGAGAATG;SOR=0.875;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=132;TCF=68;TCR=64;TR=53;WE=10251453;WS=10251435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,55:0.39:141
chr12	10271055	rs7959451	T	C	5013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=64;PP=2965;ReadPosRankSum=1.840;SC=CCACCCTTCCTCTTACATTGA;SOR=0.398;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=162;TCF=98;TCR=64;TR=161;WE=10271063;WS=10271045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,185:0.99:186
chr12	10312648	rs13306593	C	A	1049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=0.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.72;ReadPosRankSum=-0.200;SOR=0.576;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,52:0.48:108
chr12	10312691	rs17174597	T	C	597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=466;ReadPosRankSum=0.125;SC=TTCAGAAACTTAGCTTTTGAA;SOR=0.749;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=45;TCF=12;TCR=33;TR=25;WE=10312699;WS=10312681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,25:0.51:49
chr12	10312878	rs2634156	C	T	3854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=41;PP=2231;SC=AGGCAGTGACCTCACTAGCAG;SOR=1.364;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=121;TCF=80;TCR=41;TR=121;WE=10312886;WS=10312868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr12	10312914	rs3816844	G	A	2337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=43;PP=1398;ReadPosRankSum=-2.818;SC=GGAAACTGACGAGAGAGGCAT;SOR=0.686;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=187;TCF=109;TCR=78;TR=105;WE=10312922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,113:0.54:208
chr12	10313075	rs3736235	T	C	2023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.557;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=52;PP=1194;ReadPosRankSum=1.231;SC=TGGGGAGTAATGTTTCTGAGT;SOR=0.636;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=163;TCF=70;TCR=93;TR=92;WE=10313083;WS=10313065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,97:0.54:180
chr12	10313134	rs3736234	G	A	1168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.847;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=32;PP=773;ReadPosRankSum=0.588;SC=AGTTAGTGTTGGATCCACAAA;SOR=0.560;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=80;TCF=26;TCR=54;TR=48;WE=10313142;WS=10313124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,52:0.56:93
chr12	10313358	rs3736232	C	G	1500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.425;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=19;PP=1027;ReadPosRankSum=-0.864;SC=CAATACTCCACCCCAACAAAT;SOR=1.148;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=121;TCF=81;TCR=40;TR=63;WE=10313366;WS=10313348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,68:0.51:133
chr12	10313448	rs11053646	C	G	2977.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.388;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=62;PP=1691;ReadPosRankSum=-0.530;SC=TCTCTTGGCTCTTTTCCCAGT;SOR=0.604;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=267;TCF=136;TCR=131;TR=129;WE=10313456;WS=10313438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,145:0.49:293
chr12	10373324	rs7301041	T	A	1560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=31;PP=820;SC=ATTAGATACCTCTTGTTTTTT;SOR=1.453;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=19;TCR=31;TR=50;WE=10373332;WS=10373314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr12	10460543	rs2302489	A	T	875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=1.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.965;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=12;PP=568;ReadPosRankSum=0.343;SC=TTCATTCTCTATTTTTGCTAA;SOR=0.563;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=64;TCF=45;TCR=19;TR=38;WE=10460551;WS=10460533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,40:0.56:71
chr12	10461883	rs10734825	A	G	2171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=20;PP=1405;SC=CTCCGTTATCAAATGAAAGAA;SOR=1.996;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=71;TCF=51;TCR=20;TR=71;WE=10461891;WS=10461873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr12	10462052	rs10772256	T	G	3388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=64;PP=2113;SC=TTCGTTGATGTCTACGTTGGG;SOR=1.198;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=44;TCR=64;TR=108;WE=10462060;WS=10462042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr12	10462431	rs7980604	G	A	752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=19;PP=488;SC=ATTTTACATTGCTCAATCTAA;SOR=2.066;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=24;WE=10462439;WS=10462421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	10467533	rs2537752	T	A	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=87;ReadPosRankSum=-1.465;SC=AATTGTCATGTATGTGAAACA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=5;WE=10467541;WS=10467523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr12	10511662	rs10743886	C	T	1940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.100;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=44;PP=918;ReadPosRankSum=0.334;SC=AATTCCAGAGCAGGGAGAAAA;SOR=0.786;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=173;TCF=80;TCR=93;TR=81;WE=10511670;WS=10511652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,97:0.49:198
chr12	10525644	rs1351113	A	G	1552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.132;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=22;PP=979;ReadPosRankSum=1.309;SC=CTTTAGTCTCAGTTGGCAGTG;SOR=0.982;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=126;TCF=82;TCR=44;TR=68;WE=10525652;WS=10525634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,75:0.53:141
chr12	10525740	rs1049172	C	T	3056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.411;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=57;PP=1658;ReadPosRankSum=-0.113;SC=TGCAGATGTACGTATTTGGAG;SOR=0.807;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=270;TCF=144;TCR=126;TR=129;WE=10525748;WS=10525730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,151:0.48:314
chr12	10532111	rs2255353	T	G	743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.579;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=13;PP=381;ReadPosRankSum=3.276;SC=TATTAAAAGTTTGTATTGTTA;SOR=0.399;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=43;TCF=23;TCR=20;TR=30;WE=10532119;WS=10532101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,34:0.69:49
chr12	10532326	rs2255336	T	C	1109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=20;PP=690;ReadPosRankSum=2.013;SC=CTCCATATTGTTACCATAATA;SOR=0.623;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=58;TCR=39;TR=49;WE=10532334;WS=10532316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,54:0.50:108
chr12	10532434	rs2617151	A	G	1031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.817;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=29;PP=728;ReadPosRankSum=-0.370;SC=GAAGCATAAAAGGTTTGGGTA;SOR=0.877;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=81;TCF=33;TCR=48;TR=45;WE=10532442;WS=10532424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,48:0.53:91
chr12	10541251	rs2294147	T	C	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=3.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=179;ReadPosRankSum=-1.040;SC=TCAACATAAATAGAACATGAA;SOR=0.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=11;WE=10541259;WS=10541241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,13:0.35:37
chr12	10560824	rs2617169	T	A	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.808;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=132;ReadPosRankSum=1.263;SC=TTATGGCTCATTGTTATAGTT;SOR=0.223;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=9;WE=10560832;WS=10560814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr12	10560957	rs2617170	T	C	855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.737;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=20;PP=538;ReadPosRankSum=2.075;SC=CAGGGAAAAATTGTTCTGCTC;SOR=0.784;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=92;TCF=49;TCR=43;TR=41;WE=10560965;WS=10560947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,44:0.43:102
chr12	10562025	rs1841957	C	T	3020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=353;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.814;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.99;MQRankSum=-1.655;NF=76;NR=61;PP=1889;ReadPosRankSum=0.512;SC=CTTGATGATCCGAAGAAGCAT;SOR=0.747;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=315;TCF=172;TCR=143;TR=137;WE=10562033;WS=10562015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:203,148:0.42:351
chr12	10562089	rs1841958	A	C	3338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=364;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=81;PP=2200;ReadPosRankSum=1.555;SC=TGAAATGGAGATTTTATTGCC;SOR=0.695;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=325;TCF=157;TCR=168;TR=154;WE=10562097;WS=10562079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:195,167:0.46:362
chr12	10570965	rs2682495	C	G	8797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=147;NR=133;PP=2965;SC=ATTATCTATACAAAGCAGACT;SOR=0.756;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=280;TCF=147;TCR=133;TR=280;WE=10570973;WS=10570955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,326:1.00:326
chr12	10571042	rs2741882	A	G	4461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=81;PP=2914;SC=TACCAATGTAATAACAACTGT;SOR=1.003;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=64;TCR=81;TR=145;WE=10571050;WS=10571032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr12	10571091	rs2682494	T	G	3994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=45;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=56;PP=1886;SC=ATGGCCACAATGACGTGCTAA;SOR=1.661;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=30;TCR=56;TR=86;WE=10571099;WS=10571081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr12	10571106	rs2682493	G	C	3888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=51;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=53;PP=1936;SC=TGCTAATAAAGATATGAATTA;SOR=1.295;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=33;TCR=53;TR=86;WE=10571114;WS=10571096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr12	10571158	rs10743890	C	T	3481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=43;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=38;PP=1573;SC=AAAATTAGTTCACATATTTGC;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=79;TCF=40;TCR=39;TR=78;WE=10571166;WS=10571148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr12	10571177	rs4394921	A	G	3612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=42;PP=1941;SC=GCAACAGTATAAACATATATG;SOR=0.716;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=40;TCR=42;TR=82;WE=10571185;WS=10571167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr12	10571504	rs4579992	C	T	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.84;QD=42.43;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	10571514	rs4275705	C	G	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.84;QD=42.43;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	10571536	rs33947579	A	AT	260.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.39;QD=28.97;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	10571622	rs4093355	G	A	98.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=24.51;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr12	10572687	rs2682492	G	T	56.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.67;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=2;PP=25;SC=AACTCTGGCCGCTAAATCTAC;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=10572695;WS=10572677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr12	10572839	rs2253365	A	T	735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=1;PP=610;SC=ATATTAGAATATTAGATCCCA;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=10572847;WS=10572829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	10572982	rs2741881	A	G	8306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=164;NR=116;PP=2965;SC=CATATATTTTATCAATCCCTT;SOR=0.916;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=280;TCF=164;TCR=116;TR=280;WE=10572990;WS=10572972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,305:1.00:305
chr12	10573094	rs2682491	C	G	1335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.47;MQRankSum=-0.448;QD=13.10;ReadPosRankSum=0.863;SOR=0.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,57:0.56:102
chr12	10573094	.	CA	GG	882	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=24;MQ=47.49;NF=10;NR=40;PP=882;QD=18.7093574972;SC=CCTTTGCTGCCACTTTGGGTC;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=117;TCF=35;TCR=82;TR=50;WE=10573103;WS=10573078;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:67,50:0.43:117
chr12	10573095	rs2682490	A	G	3764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.09;QD=38.81;SOR=2.184;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr12	10573145	rs2682489	C	T	183.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.200;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.08;MQRankSum=-2.200;QD=20.42;ReadPosRankSum=-1.383;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr12	10573211	rs10734829	A	G	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.35;MQRankSum=-1.834;QD=14.13;ReadPosRankSum=0.842;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr12	10583611	rs3003	C	T	343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=285;SC=ATTTTTGTATCAGAGCAAATA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=10583619;WS=10583601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	10583696	rs2981593	C	T	1989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=17;PP=1059;SC=TGATGCACTGCAAACGCAAAT;SOR=1.457;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=44;TCR=17;TR=61;WE=10583704;WS=10583686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr12	10586921	.	C	T	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.5;BaseQRankSum=-2.955;ClippingRankSum=0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.519;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.391;NF=14;NR=0;PP=239;ReadPosRankSum=-1.668;SC=TATTTCTACTCACTGGAGAAA;SOR=1.483;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=38;TCR=6;TR=14;WE=10586929;WS=10586911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,5:0.14:37
chr12	10586946	rs113946028	C	T	849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=16.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.23;MQRankSum=-3.750;QD=13.71;ReadPosRankSum=-2.903;SOR=3.841;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,23:0.37:62
chr12	10586956	rs72475445	C	G	1079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=4.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.91;MQRankSum=-3.639;QD=12.70;ReadPosRankSum=-1.806;SOR=1.373;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,35:0.41:85
chr12	10586961	rs1356930	T	C	1494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=13.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.32;MQRankSum=3.820;QD=14.37;ReadPosRankSum=0.375;SOR=0.118;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,62:0.60:104
chr12	10586978	rs144149096	A	AT	2374.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.48;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.876;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.294;NF=42;NR=24;PP=2280;ReadPosRankSum=-1.844;SC=TTATGGCTGAATTTATGGCTT;SOR=1.181;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=142;TCF=78;TCR=64;TR=66;WE=10586986;WS=10586968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,89:0.50:178
chr12	10587111	rs61917677	A	G	7186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=162;PP=2965;SC=ATTCGGGGAAAAATTGTTCTG;SOR=1.366;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=252;TCF=90;TCR=162;TR=252;WE=10587119;WS=10587101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr12	10587158	rs35801775	A	T	1360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.344;HP=6;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.555;NF=6;NR=45;PP=1068;ReadPosRankSum=-0.606;SC=AATGATTTTTATAAAAACTGA;SOR=0.439;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=83;TCF=9;TCR=74;TR=51;WE=10587166;WS=10587148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,52:0.61:85
chr12	10587631	rs144960284	C	T	2116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=47;PP=1400;SC=AATTGTTCTGCTCCAGGACTG;SOR=1.874;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=21;TCR=47;TR=68;WE=10587639;WS=10587621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr12	10588530	rs75545535	C	G	1016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FS=5.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.29;MQRankSum=0.436;QD=5.08;ReadPosRankSum=2.251;SOR=1.069;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:135,65:0.32:200
chr12	10588581	rs28403159	T	C	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=53.125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.78;MQRankSum=-7.664;QD=2.40;ReadPosRankSum=0.557;SOR=6.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,21:0.16:132
chr12	10588647	rs28730284	A	G	648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=3.034;NF=4;NR=18;PP=427;ReadPosRankSum=-0.345;SC=GAAGCTATAAATGGTGTATAT;SOR=0.495;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=22;WE=10588655;WS=10588637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,25:0.69:36
chr12	10594848	rs78547237	C	A	88.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.75;QD=22.01;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr12	10599270	rs7314384	G	A	1692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.863;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.825;NF=42;NR=54;PP=1323;ReadPosRankSum=2.444;SC=TCCTGTAATGGAGAAAAATCC;SOR=1.128;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=212;TCF=99;TCR=113;TR=96;WE=10599278;WS=10599260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,86:0.41:212
chr12	10599347	rs2682471	T	G	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=5.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.839;HP=6;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.778;NF=4;NR=24;PP=609;ReadPosRankSum=-0.275;SC=TGTAAGAAAATAATTTCATGG;SOR=1.609;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=74;TCF=25;TCR=49;TR=28;WE=10599355;WS=10599337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,18:0.24:76
chr12	10599425	rs144548572	C	G	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.564;NF=0;NR=7;PP=332;ReadPosRankSum=1.688;SC=CAGAGTAGTCCCCCTTCATCC;SOR=0.293;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=7;WE=10599435;WS=10599415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
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chr12	10600282	rs11053804	C	T	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.007;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=179;ReadPosRankSum=0.551;SC=GAAAACATTACAAAAACAATA;SOR=1.368;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=12;WE=10600290;WS=10600272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,13:0.37:35
chr12	10602077	rs2734440	C	T	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=13;PP=335;ReadPosRankSum=0.080;SC=TAAACCTATACGTATGCAACA;SOR=0.684;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=64;TCF=30;TCR=34;TR=26;WE=10602085;WS=10602067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,32:0.45:71
chr12	10602624	rs3216778	TTTTAAG	T	391.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=268;ReadPosRankSum=-0.658;SC=ATCATAATAATTTTAAGTTTT;SOR=1.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=6;WE=10602637;WS=10602614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr12	10603670	rs2253849	T	C	5567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.458;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=109;NR=80;PP=2965;ReadPosRankSum=0.719;SC=TAAAATGGAGTTTTTATTGCC;SOR=0.565;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=190;TCF=109;TCR=81;TR=189;WE=10603678;WS=10603660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,203:1.00:204
chr12	10658507	rs10845152	G	A	2544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.978;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=40;PP=1393;ReadPosRankSum=0.145;SC=GCAACATGGCGGGCGGAGAAG;SOR=0.514;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=199;TCF=123;TCR=76;TR=103;WE=10658515;WS=10658497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,122:0.53:231
chr12	10659228	rs11053826	A	T	4422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-2.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=396;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.754;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.311;NF=94;NR=88;PP=2661;ReadPosRankSum=-1.507;SC=AGTAAAGAAAATTCCAGTACC;SOR=0.646;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=351;TCF=184;TCR=167;TR=182;WE=10659236;WS=10659218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:187,209:0.53:396
chr12	10659438	rs10772299	T	C	5999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=105;PP=2965;SC=CATGTGTAAATCAATCTTTTC;SOR=0.888;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=200;TCF=95;TCR=105;TR=200;WE=10659446;WS=10659428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr12	10659964	rs10772300	C	G	1632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=47;PP=1315;SC=CTGGAAGTTGCAATTTCTCTT;SOR=4.133;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=5;TCR=47;TR=52;WE=10659972;WS=10659954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr12	10675250	rs7980396	G	C	6420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=98;PP=2965;SC=ATGGGGCCCAGTTCTTACCAA;SOR=0.744;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=203;TCF=104;TCR=99;TR=202;WE=10675258;WS=10675240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr12	10675295	rs10845155	G	A	2295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.491;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=50;PP=1269;ReadPosRankSum=0.025;SC=AAACTTCTAGGAAATCATTTC;SOR=0.750;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=190;TCF=91;TCR=99;TR=96;WE=10675303;WS=10675285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,111:0.50:223
chr12	10746385	rs2244387	G	A	1226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=13;PP=677;ReadPosRankSum=1.217;SC=CTCACTCTGGGCTCCAGCCTG;SOR=0.605;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=41;TCF=28;TCR=13;TR=40;WE=10746393;WS=10746375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,46:0.98:47
chr12	10748314	rs2168749	C	T	682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.865;HP=5;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=13;PP=392;ReadPosRankSum=1.166;SC=ACTTTAAAAACGATCTCATTT;SOR=0.466;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=77;TCF=48;TCR=29;TR=32;WE=10748322;WS=10748304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,35:0.43:81
chr12	10748403	rs2682484	A	T	2873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=42;PP=1827;SC=GAGAACGTCAAATTTTAAAGT;SOR=1.049;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=109;TCF=67;TCR=42;TR=109;WE=10748411;WS=10748393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr12	10749664	rs74413095	CAA	C	178.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.792;NF=0;NR=6;PP=182;ReadPosRankSum=-1.846;SC=CCATTTGAAACAAAGAGACAA;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=6;WE=10749673;WS=10749654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr12	10759032	rs10772333	T	C	2183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=40;NR=36;PP=1015;SC=ATTCTTTAAATGCCTAAAACA;SOR=0.812;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=41;TCR=37;TR=76;WE=10759040;WS=10759022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr12	10760305	rs2290718	G	C	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=41;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=331;ReadPosRankSum=1.642;SC=AAGATAATAAGCCTTTAATGA;SOR=0.512;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=21;WE=10760313;WS=10760295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,23:0.59:39
chr12	10760328	rs3947920	G	A	2495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.38;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr12	10760335	rs2125090	T	A	2810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.74;SOR=1.211;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr12	10760380	rs2125089	G	A	2794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=38;PP=1614;SC=ATCTTGGCTAGCAAACTGACT;SOR=0.900;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=93;TCF=55;TCR=38;TR=93;WE=10760388;WS=10760370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr12	10762069	rs7311796	G	A	2034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=45;PP=1249;SC=AGGGATGCAAGTAAGAATTTT;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=24;TCR=45;TR=69;WE=10762077;WS=10762059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr12	10763205	rs11053880	T	C	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=1.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.49;ReadPosRankSum=-1.306;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr12	10763236	rs10845182	G	C	1453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=20;PP=1165;SC=TTCTGATCATGACATCATTTT;SOR=1.179;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=54;TCF=34;TCR=20;TR=51;WE=10763244;WS=10763226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr12	10763419	rs72054859	CTAGACATG	C	593.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=2971;SC=AAGATCATTGCTAGACATGTA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=11;WE=10763448;WS=10763409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	10763440	rs12811247	G	T	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=136;ReadPosRankSum=-0.845;SC=GACAATAAATGTTTGCTGGTT;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=7;WE=10763448;WS=10763409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr12	10766244	rs10772335	A	C	2552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=67;PP=1674;SC=TTCCTCCTGCAGTGCAGCCCT;SOR=2.737;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=16;TCR=67;TR=83;WE=10766252;WS=10766234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr12	10772983	rs1870194	A	G	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.757;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=137;ReadPosRankSum=0.138;SC=CTTCCTTGACAAGGCAAATGT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=7;WE=10772991;WS=10772973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr12	10775195	rs1078437	T	C	4829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=397;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.129;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=99;NR=106;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.592;SC=CACGCTTGCATATTTGCATAC;SOR=0.806;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=355;TCF=174;TCR=181;TR=205;WE=10775203;WS=10775185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,222:0.56:394
chr12	10782115	rs3759259	T	C	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=337;ReadPosRankSum=-0.073;SC=CAGAGAAAGCTGAGCAGGTCC;SOR=0.793;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=51;TCF=37;TCR=14;TR=27;WE=10782123;WS=10782105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,30:0.55:55
chr12	10783729	rs2290717	A	G	904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=15;PP=509;ReadPosRankSum=-1.217;SC=CACAGCTACCACTGCAAATCT;SOR=0.735;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=64;TCF=39;TCR=25;TR=37;WE=10783737;WS=10783719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,43:0.58:74
chr12	10784021	rs2168746	G	C	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=39;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TTTGGCCAATGGGGAGTTGTC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=10784029;WS=10784011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr12	10786757	rs5796407	T	TGAA	6841.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=61;PP=2974;SC=GAGAAGAGAATGAAGAAGCCT;SOR=1.324;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=84;TCF=7;TCR=77;TR=66;WE=10786765;WS=10786747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr12	10786797	rs2252664	C	T	808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.51;BaseQRankSum=3.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=24;PP=559;ReadPosRankSum=0.205;SC=TTCCCCTACCCGCCAGCTCTC;SOR=0.788;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=63;TCF=17;TCR=46;TR=32;WE=10786805;WS=10786787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,37:0.41:90
chr12	10868142	rs112162659	TA	T	43.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=11.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.62;MQRankSum=2.639;QD=1.29;ReadPosRankSum=-0.631;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,8:0.24:34
chr12	10870900	rs11309033	AC	A	248.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=218;SC=TCCACAGGCCACCCACCTTCC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=6;WE=10870908;WS=10870890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	10871667	rs33016	A	G	3903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=63;PP=2421;SC=GCAAATATACACACACACATA;SOR=0.720;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=137;TCF=74;TCR=63;TR=137;WE=10871675;WS=10871657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr12	10958658	rs2537817	T	C	558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=13;NR=6;PP=244;SC=TTTCATATCATGCAGGCAATT;SOR=1.329;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=19;WE=10958666;WS=10958648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr12	10958818	.	C	A	737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.000;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=12;PP=454;ReadPosRankSum=-0.969;SC=AGCTAAAGGTCATCAAAATAG;SOR=0.738;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=70;TCF=44;TCR=26;TR=32;WE=10958826;WS=10958808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,36:0.46:78
chr12	10978402	rs597468	G	A	2498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=35;PP=1435;SC=GTCATTCTTCGTTTTATAATC;SOR=0.809;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=40;TCR=35;TR=75;WE=10978410;WS=10978392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr12	10999708	rs1047699	T	C	4008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=62;PP=2243;SC=TCTGTCCCTCTGGAAGAATGA;SOR=0.706;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=135;TCF=73;TCR=62;TR=135;WE=10999716;WS=10999695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr12	11000934	rs2227296	A	G	1889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.63;SOR=1.574;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr12	11034980	rs61914782	G	A	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.98;MQRankSum=-0.108;QD=12.11;ReadPosRankSum=-1.718;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr12	11083356	rs116998526	A	G	1975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.47;QD=29.49;SOR=0.723;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr12	11083677	rs10772391	T	C	492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=52.68;QD=25.94;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	11091432	rs3741843	C	T	5112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=65;PP=2965;SC=CCTTTTTAACCCTCCACTTTA;SOR=0.923;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=157;TCF=92;TCR=65;TR=157;WE=11091440;WS=11091422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr12	11091693	rs7138535	T	A	8945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=338;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=135;NR=159;PP=2965;SC=AGATCTTTCTTCCCTTGACCC;SOR=0.987;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=294;TCF=135;TCR=159;TR=294;WE=11091701;WS=11091683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,338:1.00:338
chr12	11126111	rs4763232	C	T	616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=1;PP=460;SC=CACACAATAACAATACCCTCC;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=11126119;WS=11126101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr12	11126428	rs7314608	T	G	728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=19;PP=542;SC=AGAGTCTTTATAGGTGAAGAG;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=23;WE=11126436;WS=11126418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	11150240	rs7135018	T	C	3805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=67;PP=2542;SC=ATTATTACTTTTAAATTAGAT;SOR=0.983;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=123;TCF=56;TCR=67;TR=123;WE=11150248;WS=11150230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr12	11150551	rs4388985	G	A	1590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=33;PP=962;SC=AAGACTTTAAGTTAAATATGC;SOR=1.316;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=21;TCR=33;TR=54;WE=11150559;WS=11150541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr12	11150579	rs1463237	C	T	1024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=22;PP=667;SC=TCCTGAATGTCCAATAACATT;SOR=1.547;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=12;TCR=22;TR=34;WE=11150587;WS=11150569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	11174213	rs114463974	G	A	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQRankSum=-11.737;QD=1.56;ReadPosRankSum=-3.936;SOR=0.781;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:137,14:0.09:151
chr12	11174219	rs79407997	C	A	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQRankSum=-9.779;QD=1.69;ReadPosRankSum=-4.469;SOR=0.608;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:151,22:0.13:173
chr12	11174223	rs74363809	G	C	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQRankSum=-9.618;QD=1.54;ReadPosRankSum=-3.877;SOR=0.757;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:160,24:0.13:184
chr12	11174261	rs75441696	C	G	2829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FS=2.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQRankSum=-7.238;QD=7.95;ReadPosRankSum=-1.315;SOR=0.888;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:270,86:0.24:356
chr12	11174264	rs77074409	C	A	2919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=366;ExcessHet=3.0103;FS=6.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQRankSum=-7.097;QD=7.98;ReadPosRankSum=-1.109;SOR=1.050;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:275,91:0.25:366
chr12	11174271	rs79475879	T	C	3324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=402;ExcessHet=3.0103;FS=4.943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQRankSum=-6.989;QD=8.27;ReadPosRankSum=0.152;SOR=1.087;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:300,102:0.25:402
chr12	11174276	rs10772420	G	A	13147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=411;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=-0.189;NF=195;NR=156;PP=2962;ReadPosRankSum=1.589;SC=TTCACTCAGCGTGTCATCTGC;SOR=0.597;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=372;TCF=204;TCR=168;TR=351;WE=11174294;WS=11174251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,410:1.00:411
chr12	11174277	.	T	C	3810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.890;ClippingRankSum=0.000;DP=415;ExcessHet=3.0103;FS=4.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQRankSum=-6.910;QD=9.18;ReadPosRankSum=1.051;SOR=1.070;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:308,107:0.26:415
chr12	11174282	rs74386164	T	C	4091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=438;ExcessHet=3.0103;FS=4.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQRankSum=-6.835;QD=9.34;ReadPosRankSum=0.731;SOR=1.064;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:318,120:0.27:438
chr12	11174286	rs77837442	C	A	4254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=459;ExcessHet=3.0103;FS=4.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQRankSum=-6.674;QD=9.27;ReadPosRankSum=0.750;SOR=1.090;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:329,130:0.28:459
chr12	11174302	rs72475480	A	G	2877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=531;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.885;HP=2;HapScore=1;MGOF=44;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.196;NF=85;NR=65;PP=2037;ReadPosRankSum=-1.146;SC=AACTGAAAGAAAGGTCTGTTT;SOR=0.825;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=477;TCF=254;TCR=223;TR=150;WE=11174310;WS=11174292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:354,164:0.32:518
chr12	11174327	rs72475481	C	T	3509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=592;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.548;HP=2;HapScore=1;MGOF=45;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.376;NF=93;NR=91;PP=2429;ReadPosRankSum=1.128;SC=TTCCTACTTCCCATAATCAGG;SOR=0.638;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=530;TCF=255;TCR=275;TR=184;WE=11174335;WS=11174317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:376,203:0.35:579
chr12	11174372	rs74772077	C	G	6345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=461;ExcessHet=3.0103;FS=1.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQRankSum=-5.149;QD=13.77;ReadPosRankSum=1.669;SOR=0.879;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:284,177:0.38:461
chr12	11174380	rs76970958	C	T	6042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=415;ExcessHet=3.0103;FS=1.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQRankSum=-5.064;QD=14.56;ReadPosRankSum=1.171;SOR=0.773;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:252,163:0.39:415
chr12	11174390	rs74992161	G	A	5619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=367;ExcessHet=3.0103;FS=4.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQRankSum=-5.252;QD=15.31;ReadPosRankSum=-0.132;SOR=0.899;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:218,149:0.41:367
chr12	11174397	rs76455106	T	A	5204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FS=2.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQRankSum=-5.493;QD=15.04;ReadPosRankSum=-0.130;SOR=0.862;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:208,138:0.40:346
chr12	11174416	rs112900131	A	G	2057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.947;HP=1;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.977;NF=38;NR=66;PP=1409;ReadPosRankSum=-0.104;SC=CTGTGTCCTAAGATTCCAAGT;SOR=0.973;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=268;TCF=109;TCR=159;TR=104;WE=11174424;WS=11174406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:177,106:0.37:283
chr12	11174466	rs199592952	GA	AC	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=40.436;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQRankSum=-9.676;QD=3.12;ReadPosRankSum=-0.369;SOR=4.167;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,16:0.14:111
chr12	11174476	rs200081075	G	A	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=43.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQRankSum=-10.463;QD=1.79;ReadPosRankSum=1.168;SOR=4.972;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,11:0.10:111
chr12	11174478	.	C	A	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=0.000;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=36.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQRankSum=-10.514;QD=1.05;ReadPosRankSum=1.988;SOR=4.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,9:0.08:112
chr12	11174753	rs1868769	G	A	6634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=117;PP=2965;SC=TTACAAATCAGAAATACCAAG;SOR=0.883;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=219;TCF=102;TCR=117;TR=219;WE=11174761;WS=11174743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr12	11175087	rs12313469	G	A	7408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=134;NR=99;PP=2965;SC=CATTTACTAGGGCTATGAAGC;SOR=0.982;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=233;TCF=134;TCR=99;TR=233;WE=11175095;WS=11175077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chr12	11182998	rs200315131	CA	TC	9260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-3.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=679;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.537;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-15.870;NF=124;NR=122;PP=2944;ReadPosRankSum=6.520;SC=ATGCCCCTCTCATGAATCTAT;SOR=0.630;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=632;TCF=331;TCR=301;TR=246;WE=11183007;WS=11182976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:425,253:0.37:678
chr12	11183035	rs78820764	C	T	7487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-3.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=621;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.229;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-15.125;NF=98;NR=128;PP=2962;ReadPosRankSum=2.664;SC=CTCCTTTCACCCAGTACCTCA;SOR=0.938;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=578;TCF=274;TCR=304;TR=226;WE=11183074;WS=11183025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:398,222:0.36:620
chr12	11183046	rs201730548	C	T	6931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=572;ExcessHet=3.0103;FS=4.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQRankSum=-15.268;QD=12.14;ReadPosRankSum=0.528;SOR=1.018;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:382,189:0.33:571
chr12	11183052	rs199894662	G	A	6307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=7.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.75;MQRankSum=-13.042;QD=11.95;ReadPosRankSum=-1.603;SOR=1.141;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:359,169:0.32:528
chr12	11183066	rs138895028	A	T	4502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-1.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=482;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.304;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-10.874;NF=48;NR=101;PP=2962;ReadPosRankSum=-5.104;SC=AACTGAAAGAAAAGTCTGCTT;SOR=1.576;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=468;TCF=210;TCR=258;TR=149;WE=11183074;WS=11183025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:349,132:0.27:481
chr12	11183217	rs10772423	C	T	8177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=129;NR=151;PP=2965;SC=AGAAAGTAAACGGCACATAAC;SOR=0.821;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=281;TCF=129;TCR=152;TR=280;WE=11183225;WS=11183207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,296:1.00:296
chr12	11183255	rs10845293	G	A	6979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=107;PP=2965;SC=AGTTTGCAAAGCTTTTATGTG;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=215;TCF=108;TCR=107;TR=215;WE=11183263;WS=11183245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr12	11183451	rs10743938	A	T	9845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=354;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=166;NR=160;PP=2965;SC=TTCCAAGTCAAGTTTCCTTCA;SOR=0.739;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=328;TCF=168;TCR=160;TR=326;WE=11183459;WS=11183441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,354:1.00:354
chr12	11183484	.	CT	GA	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.303;ClippingRankSum=0.000;DP=310;ExcessHet=3.0103;FS=63.994;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQRankSum=-17.574;QD=0.56;ReadPosRankSum=-1.206;SOR=4.974;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:286,24:0.08:310
chr12	11183496	rs199736450	T	C	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FS=86.577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQRankSum=-16.787;QD=1.71;ReadPosRankSum=-0.313;SOR=5.484;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:252,31:0.11:283
chr12	11183506	rs115707514	T	A	760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FS=98.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.72;MQRankSum=-16.390;QD=2.82;ReadPosRankSum=0.824;SOR=5.783;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:234,36:0.13:270
chr12	11183512	rs12370363	A	G	5411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-5.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=91.345;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=16.124;NF=89;NR=112;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.636;SC=AAAGTTGACAAGCCAAAAATA;SOR=0.602;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=241;TCF=125;TCR=116;TR=201;WE=11183532;WS=11183486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,221:0.84:262
chr12	11183524	rs75159539	T	C	1642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FS=91.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.29;MQRankSum=-14.322;QD=6.57;ReadPosRankSum=1.222;SOR=4.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:201,49:0.20:250
chr12	11183541	rs78152338	T	C	2320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=45.409;HP=1;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-10.946;NF=58;NR=23;PP=1254;ReadPosRankSum=-1.049;SC=CCCAACAGCATCACCAGAATG;SOR=2.043;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=239;TCF=132;TCR=107;TR=81;WE=11183549;WS=11183531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:177,82:0.32:259
chr12	11183576	rs72475488	T	C	2627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.634;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-7.565;NF=75;NR=53;PP=1579;ReadPosRankSum=1.098;SC=CCTCTTTAAGTGAAGAAAAAT;SOR=1.071;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=294;TCF=159;TCR=135;TR=128;WE=11183584;WS=11183566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:179,132:0.42:311
chr12	11183642	rs73049067	A	G	5715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=551;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.730;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.734;NF=128;NR=128;PP=2962;ReadPosRankSum=0.540;SC=GCTAGTAGCAAGCCAGTTGCT;SOR=0.620;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=525;TCF=267;TCR=258;TR=256;WE=11183650;WS=11183632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:282,268:0.49:550
chr12	11183676	rs73049072	C	T	5008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=525;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.520;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-4.976;NF=107;NR=122;PP=2950;ReadPosRankSum=1.103;SC=ACTGCCCAGACATTATAAGCA;SOR=0.764;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=499;TCF=233;TCR=266;TR=229;WE=11183684;WS=11183666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:278,245:0.47:523
chr12	11183697	rs73049074	C	A	4486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=451;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.522;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-6.246;NF=90;NR=106;PP=2529;ReadPosRankSum=-0.951;SC=GTAGTTCTTACTTCTACACTA;SOR=0.778;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=426;TCF=197;TCR=229;TR=196;WE=11183705;WS=11183687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:240,211:0.47:451
chr12	11183722	rs78562467	A	C	3216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.348;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-7.555;NF=48;NR=81;PP=2157;ReadPosRankSum=-0.365;SC=AAGCTGGATTAAACACAGTTG;SOR=0.928;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=314;TCF=123;TCR=191;TR=129;WE=11183730;WS=11183712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:195,141:0.42:336
chr12	11183752	rs72475489	T	C	1618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.287;HP=3;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-8.876;NF=18;NR=50;ReadPosRankSum=-1.497;SC=TTAATAATAATACCCAGAGCA;SOR=1.401;SbPval=0.88;Source=Platypus;TCF=72;TR=68;WE=11183760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,76:0.34:222
chr12	11183793	.	G	C	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.209;ClippingRankSum=0.000;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=42.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.15;MQRankSum=-11.280;QD=3.74;ReadPosRankSum=-0.701;SOR=4.711;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:113,21:0.16:134
chr12	11183797	.	C	T	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.329;ClippingRankSum=0.000;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=46.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.19;MQRankSum=-11.365;QD=3.69;ReadPosRankSum=-1.473;SOR=4.710;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,21:0.15:136
chr12	11183809	.	A	G	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.113;ClippingRankSum=0.000;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=30.908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQRankSum=-10.968;QD=0.23;ReadPosRankSum=2.165;SOR=4.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:125,9:0.07:134
chr12	11183832	rs10845295	G	A	4597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=91;NR=59;PP=2965;SC=CTCTTGACCCGCTCAATGGAA;SOR=1.074;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=150;TCF=91;TCR=59;TR=150;WE=11183840;WS=11183822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr12	11199734	rs2597984	T	C	2242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=58;PP=1402;SC=TTTAAAAAGCTGGCGCCTTCT;SOR=1.900;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=23;TCR=58;TR=81;WE=11199742;WS=11199724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr12	11201689	rs2597986	C	T	1386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=9;PP=995;SC=AGTAAACCAACTCTGGACACC;SOR=2.560;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=45;TCF=36;TCR=9;TR=43;WE=11201697;WS=11201679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr12	11201846	rs199838132	A	C	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FS=9.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQRankSum=-11.699;QD=1.09;ReadPosRankSum=-3.844;SOR=1.780;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:154,17:0.10:171
chr12	11201850	.	TATC	T	174.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=0.000;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=7.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQRankSum=-11.664;QD=1.03;ReadPosRankSum=-4.396;SOR=1.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:153,17:0.10:170
chr12	11201889	.	C	G	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MMLQ=27;MQ=56.26;NF=6;NR=28;PP=2962;QD=20;SC=AAAAATGCAGCCTTAATAACA;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=122;TCF=33;TCR=89;TR=34;WE=11201897;WS=11201836;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:88,34:0.28:122
chr12	11201928	rs74318546	C	A	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.90;MQRankSum=-5.911;QD=6.63;ReadPosRankSum=-1.334;SOR=0.722;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,11:0.23:47
chr12	11201933	rs79649094	T	C	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.76;MQRankSum=-6.137;QD=6.37;ReadPosRankSum=-1.216;SOR=0.664;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,10:0.22:45
chr12	11201934	rs75574044	G	T	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.76;MQRankSum=-6.137;QD=6.37;ReadPosRankSum=-1.239;SOR=0.664;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,10:0.22:45
chr12	11201962	rs2597987	T	C	705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=22;PP=1099;SC=TTTAAATGTGTAGTAACATTT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=22;WE=11201970;WS=11201940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr12	11214066	.	T	C	5883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.723;ClippingRankSum=0.000;DP=682;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.13;MQRankSum=-25.580;QD=8.63;ReadPosRankSum=-0.230;SOR=0.740;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:511,171:0.25:682
chr12	11214074	rs200528237	T	C	6072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=703;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.93;MQRankSum=-25.936;QD=8.65;ReadPosRankSum=2.333;SOR=0.692;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:520,182:0.26:702
chr12	11214080	.	G	A	6183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.515;ClippingRankSum=0.000;DP=723;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.88;MQRankSum=-26.309;QD=8.56;ReadPosRankSum=4.336;SOR=0.663;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:535,187:0.26:722
chr12	11214082	.	T	C	6309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.354;ClippingRankSum=0.000;DP=726;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.89;MQRankSum=-26.368;QD=8.70;ReadPosRankSum=4.940;SOR=0.674;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:538,187:0.26:725
chr12	11214091	.	G	C	6434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.322;ClippingRankSum=0.000;DP=752;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.81;MQRankSum=-26.983;QD=8.57;ReadPosRankSum=6.136;SOR=0.707;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:556,195:0.26:751
chr12	11214101	.	C	G	6452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.911;ClippingRankSum=0.000;DP=748;ExcessHet=3.0103;FS=0.600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.74;MQRankSum=-26.901;QD=8.64;ReadPosRankSum=6.191;SOR=0.764;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:551,196:0.26:747
chr12	11214133	rs76020872	C	T	5434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=663;ExcessHet=3.0103;FS=0.600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.73;MQRankSum=-25.315;QD=8.22;ReadPosRankSum=-0.707;SOR=0.756;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:490,171:0.26:661
chr12	11214137	rs76147157	C	T	5371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=634;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.84;MQRankSum=-24.796;QD=8.49;ReadPosRankSum=-1.351;SOR=0.738;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:474,159:0.25:633
chr12	11214145	rs2708381	C	T	10339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=588;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.127;HP=3;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=23.919;NF=197;NR=216;PP=2962;ReadPosRankSum=2.798;SC=CTCAAAACTCCAAACTGACAT;SOR=0.493;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=536;TCF=245;TCR=291;TR=413;WE=11214175;WS=11214123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,448:0.76:587
chr12	11214153	.	C	T	3970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.327;ClippingRankSum=0.000;DP=531;ExcessHet=3.0103;FS=5.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.13;MQRankSum=-22.779;QD=7.49;ReadPosRankSum=-3.477;SOR=1.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:416,114:0.22:530
chr12	11214156	.	G	T	3251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.048;ClippingRankSum=0.000;DP=511;ExcessHet=3.0103;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.14;MQRankSum=-22.369;QD=6.38;ReadPosRankSum=-3.258;SOR=1.164;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:406,104:0.20:510
chr12	11214161	.	TG	CA	2858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.305;ClippingRankSum=0.000;DP=472;ExcessHet=3.0103;FS=10.124;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.21;MQRankSum=-21.520;QD=6.07;ReadPosRankSum=-3.489;SOR=1.468;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:381,90:0.19:471
chr12	11214167	.	G	C	2453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.804;ClippingRankSum=0.000;DP=433;ExcessHet=3.0103;FS=11.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.21;MQRankSum=-20.282;QD=5.69;ReadPosRankSum=-4.194;SOR=1.573;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:349,82:0.19:431
chr12	11214182	rs377226761	A	G	1149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FS=17.627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.77;MQRankSum=-18.615;QD=3.29;ReadPosRankSum=-4.863;SOR=1.797;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:302,48:0.14:350
chr12	11214191	rs370059980	G	A	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FS=38.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQRankSum=-17.359;QD=0.65;ReadPosRankSum=-2.391;SOR=3.881;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:279,24:0.08:303
chr12	11214212	rs2708380	A	T	6210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-4.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=22.246;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=14.260;NR=107;PP=2965;ReadPosRankSum=2.107;SC=ACAGTTTGCAAAGCTTTTATG;SOR=0.029;Source=Platypus;TCR=121;WE=11214220;WS=11214202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:12,235:0.95:247
chr12	11214299	rs376020270	T	C	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=452;ExcessHet=3.0103;FS=14.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQRankSum=-19.985;QD=0.81;ReadPosRankSum=-2.969;SOR=2.362;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:401,50:0.11:451
chr12	11214324	.	C	T	1873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.477;ClippingRankSum=0.000;DP=544;ExcessHet=3.0103;FS=12.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.69;MQRankSum=-22.336;QD=3.45;ReadPosRankSum=-0.146;SOR=1.822;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:468,75:0.14:543
chr12	11214326	.	G	C	1984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.616;ClippingRankSum=0.000;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=8.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.63;MQRankSum=-22.812;QD=3.59;ReadPosRankSum=-0.412;SOR=1.613;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:473,80:0.14:553
chr12	11214330	.	G	A	2118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.078;ClippingRankSum=0.000;DP=566;ExcessHet=3.0103;FS=9.658;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.69;MQRankSum=-23.294;QD=3.75;ReadPosRankSum=-0.101;SOR=1.547;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:480,85:0.15:565
chr12	11214336	rs371367179	A	T	2393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=590;ExcessHet=3.0103;FS=9.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.65;MQRankSum=-23.726;QD=4.06;ReadPosRankSum=-0.534;SOR=1.528;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:490,99:0.17:589
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chr12	11244070	.	TCC	T	772.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.06;QD=42.93;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	11244091	rs199768488	C	T	1006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.67;QD=45.76;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
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chr12	11244102	rs199943442	G	C	1121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.16;QD=43.14;SOR=1.220;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
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chr12	11244126	rs113410031	G	A	1573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.43;QD=44.96;SOR=1.002;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr12	11244149	rs73064964	G	A	822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.54;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=174;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=22;PP=644;SC=AGTTTGCAAAGCTTTTATGTG;SOR=1.402;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=12;TCR=22;TR=34;WE=11244157;WS=11244139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
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chr12	11244225	rs200919222	A	G	286.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.87;QD=35.85;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	11244234	rs78179946	T	C	222.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.22;QD=55.71;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr12	11244299	rs114386807	A	G	62.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.20;QD=31.37;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr12	11244303	rs200422162	T	C	62.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.20;QD=31.37;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr12	11244309	rs113441874	A	G	62.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.20;QD=31.37;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr12	11244321	rs200838689	T	G	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.16;QD=35.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr12	11244323	rs201365712	T	C	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.16;QD=35.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr12	11244356	rs200257456	A	T	1012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.47;QD=25.97;SOR=1.236;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
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chr12	11244378	rs201455884	C	G	3140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.55;QD=39.76;SOR=0.718;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr12	11244390	rs73064966	T	C	2019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.67;QD=24.33;SOR=0.717;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr12	11244432	rs111982292	A	G	1818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.38;MQRankSum=-1.733;QD=23.02;ReadPosRankSum=-0.447;SOR=0.719;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,77:0.97:79
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chr12	11244855	.	T	A	1951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.512;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.02;MQRankSum=-1.345;QD=42.43;ReadPosRankSum=1.735;SOR=0.280;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,45:0.98:46
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chr12	11244918	.	A	AG	799.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.64;QD=42.09;SOR=5.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
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chr12	11244926	.	C	G	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.01;QD=43.24;SOR=5.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
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chr12	11244936	.	T	TTG	547.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.34;QD=42.13;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
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chr12	11244944	.	AG	A	502.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=50.27;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
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chr12	11286088	rs2599404	A	C	11531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=414;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=174;NR=184;PP=2965;SC=CCAGCCTCCCAAAATTACAAA;SOR=0.837;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=358;TCF=174;TCR=184;TR=358;WE=11286096;WS=11286078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,414:1.00:414
chr12	11286141	rs67515177	GA	G	83.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FS=70.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQRankSum=-11.149;QD=0.28;ReadPosRankSum=-4.729;SOR=6.357;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:271,23:0.08:294
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chr12	11286309	.	G	C	372.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.081;ClippingRankSum=0.000;DP=543;ExcessHet=3.0103;FS=17.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQRankSum=-19.171;QD=0.69;ReadPosRankSum=-0.998;SOR=2.557;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:493,47:0.09:540
chr12	11286314	.	A	G	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.551;ClippingRankSum=0.000;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=15.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQRankSum=-18.048;QD=0.53;ReadPosRankSum=-1.378;SOR=2.583;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:492,43:0.08:535
chr12	11286318	.	T	C	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.871;ClippingRankSum=0.000;DP=527;ExcessHet=3.0103;FS=17.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQRankSum=-18.989;QD=0.23;ReadPosRankSum=-1.116;SOR=2.771;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:490,37:0.07:527
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chr12	11286713	rs113799622	A	G	739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FS=36.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.98;MQRankSum=-16.782;QD=2.47;ReadPosRankSum=3.098;SOR=2.476;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:245,54:0.18:299
chr12	11286736	rs112605675	G	C	3034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FS=11.945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.03;MQRankSum=-14.983;QD=8.95;ReadPosRankSum=1.201;SOR=1.177;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:250,89:0.26:339
chr12	11286745	.	AA	GG	3295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.397;ClippingRankSum=0.000;DP=317;ExcessHet=3.0103;FS=8.509;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.03;MQRankSum=-14.123;QD=10.40;ReadPosRankSum=-0.750;SOR=1.005;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:222,95:0.30:317
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chr12	11286790	rs2600355	A	C	4470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FS=1.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQRankSum=9.973;QD=16.56;ReadPosRankSum=-1.980;SOR=0.580;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,183:0.68:270
chr12	11286797	.	A	G	2669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.558;ClippingRankSum=0.000;DP=262;ExcessHet=3.0103;FS=3.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.39;MQRankSum=-9.244;QD=10.19;ReadPosRankSum=2.529;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:178,84:0.32:262
chr12	11286807	rs113282241	T	C	2538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FS=12.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.06;MQRankSum=-8.101;QD=10.71;ReadPosRankSum=3.785;SOR=1.414;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:165,72:0.30:237
chr12	11286820	rs111958076	A	T	1342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FS=7.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.54;MQRankSum=-6.609;QD=6.19;ReadPosRankSum=1.666;SOR=1.235;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:147,70:0.32:217
chr12	11338539	.	C	A	429	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=43;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=17;NR=2;PP=429;QD=24.4090111867;SC=AAACAGTGGACGTGATCCCCA;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=19;WE=11338547;WS=11338529;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,19:0.95:20
chr12	11338589	rs1817104	G	T	2086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=59;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=15;PP=1313;SC=AAAGCTTCTGGAAAGTCTGTC;SOR=0.990;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=72;TCF=55;TCR=17;TR=70;WE=11338597;WS=11338579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr12	11338613	rs1650017	CA	GG	3999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=75;NR=32;PP=2947;SC=AAAGGTAAAGCATTTGGTGTT;SOR=0.809;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=114;TCF=76;TCR=38;TR=107;WE=11338622;WS=11338603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr12	11338669	rs1669412	C	T	6169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=122;NR=88;PP=2965;SC=AGCTGTCTGTCGCAGCTTGCT;SOR=0.806;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=211;TCF=122;TCR=89;TR=210;WE=11338691;WS=11338659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr12	11338750	rs1451772	T	C	5808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=89;PP=2965;SC=AAACTTTATGTACTTGTTGTT;SOR=0.946;Source=Platypus;TCF=89;WE=11338758;WS=11338740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr12	11338781	rs1669413	C	A	4217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=85;PP=2827;SC=AAAAATATCCCATTGGCCACT;SOR=1.142;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=146;TCF=61;TCR=85;TR=146;WE=11338789;WS=11338771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr12	11338983	rs1650019	T	C	3509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=49;PP=2178;SC=TAAAACTGGTTAAGCTGAGAA;SOR=0.725;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=60;TCR=49;TR=109;WE=11338991;WS=11338973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr12	11339553	rs34736072	C	CA	3266.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=72;PP=2457;SC=TCTCCAGAGACAAAAAATCCA;SOR=2.509;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=87;TCF=2;TCR=85;TR=73;WE=11339561;WS=11339543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr12	11418867	rs7294995	A	G	2291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.730;HP=7;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=57;PP=1303;ReadPosRankSum=1.088;SC=TAAGCTGTTTATTTTATTGGT;SOR=0.827;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=176;TCF=77;TCR=99;TR=99;WE=11418875;WS=11418856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,111:0.55:203
chr12	11418954	rs1896551	A	G	1428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=38;PP=1044;SC=TCATCTTCTTATTCACTTCCT;SOR=3.611;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=5;TCR=38;TR=43;WE=11418962;WS=11418944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr12	11421086	rs142192897	G	A	1014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.129;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.486;NF=13;NR=32;PP=730;ReadPosRankSum=1.303;SC=GGCTTTCCTGGAGGAGGTGGA;SOR=1.931;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=85;TCF=33;TCR=52;TR=45;WE=11421101;WS=11421076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,46:0.47:98
chr12	11421093	rs61463237	T	TGGG	3653.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=41;PP=2451;SC=CTGGAGGAGGTGGACACACGG;SOR=1.292;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=51;TCF=5;TCR=46;TR=46;WE=11421101;WS=11421076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr12	11461292	rs1052808	C	G	1294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=26;PP=823;SC=TTGCCTCCTGCTGGGGGTGGG;SOR=1.132;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=44;TCF=18;TCR=26;TR=44;WE=11461300;WS=11461282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr12	11461470	.	A	G	708	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MMLQ=15;MQ=57.45;NF=28;NR=18;PP=708;QD=16.1472002728;SC=GGGACTGGTTACCTCCTTGTG;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=50;TCF=28;TCR=22;TR=46;WE=11461478;WS=11461460;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,46:0.92:50
chr12	11461596	.	T	G	481	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MMLQ=19;MQ=50.18;NF=14;NR=17;PP=481;QD=16.6377810499;SC=GGGACTGGTTTCCTCCTTGTG;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=72;TCF=39;TCR=33;TR=31;WE=11461604;WS=11461586;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:41,31:0.43:72
chr12	11461706	rs12308381	G	T	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=9.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQRankSum=-6.144;QD=2.00;ReadPosRankSum=-0.451;SOR=1.030;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:113,23:0.17:136
chr12	11461836	rs6488386	T	C	3474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=62;PP=2043;SC=GTGGGGGACATACGGCATTCA;SOR=1.075;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=52;TCR=63;TR=113;WE=11461844;WS=11461826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr12	11462275	rs1834857	A	G	4174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=78;NR=61;PP=2504;SC=AAGGGAGTCAAAACAGATTGA;SOR=0.803;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=78;TCR=61;TR=139;WE=11462283;WS=11462265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr12	11506211	rs76504934	A	C	903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=24;NR=9;PP=656;SC=CCTGGAGGAGATCGGGCACTT;SOR=1.352;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=24;TCR=10;TR=33;WE=11506219;WS=11506201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr12	11506749	.	T	C	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=2.265;ClippingRankSum=0.000;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.644;HP=3;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-2.316;NF=5;NR=11;PP=202;ReadPosRankSum=-2.616;SC=GTCCTTGTGGTTTTCCTGGAG;SOR=1.765;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=51;TCF=25;TCR=26;TR=16;WE=11506757;WS=11506739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,14:0.27:52
chr12	11506893	rs10845341	C	T	1081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=24;NR=16;PP=717;SC=GTGGGGGGCCCTGGGGCTTGT;SOR=0.954;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=41;TCF=25;TCR=16;TR=40;WE=11506901;WS=11506883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr12	11546742	rs201044388	T	C	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=3.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.78;MQRankSum=1.368;QD=2.26;ReadPosRankSum=-1.260;SOR=0.543;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,11:0.27:41
chr12	11803220	rs2856305	A	C	152.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.01;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr12	11904983	rs2724600	A	G	281.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=202;SC=AGAAGAGAAAACATGGCTTTA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=11904991;WS=11904973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	12044534	rs372555234	GA	G	132.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=0.883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.08;ReadPosRankSum=0.320;SOR=0.573;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,22:0.18:123
chr12	12230938	rs1641721	C	G	740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.942;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=14;PP=334;ReadPosRankSum=-0.038;SC=GGAAATTGAACAAAATCAGTT;SOR=0.489;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=60;TCF=25;TCR=35;TR=28;WE=12230946;WS=12230928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,35:0.50:70
chr12	12240199	rs879732	C	T	1872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=45;PP=1133;ReadPosRankSum=-0.672;SC=AAATTGTTTACTCCTGGCCAC;SOR=0.716;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=168;TCF=84;TCR=84;TR=86;WE=12240207;WS=12240189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,94:0.50:189
chr12	12247594	rs11054682	A	G	1750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.622;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=32;PP=1184;ReadPosRankSum=-2.235;SC=TCTTTTGTACACAGCTGAAGA;SOR=0.904;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=168;TCF=98;TCR=70;TR=83;WE=12247602;WS=12247584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,87:0.49:178
chr12	12247616	rs11054683	T	C	2508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.506;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=43;PP=1581;ReadPosRankSum=-2.202;SC=AGATAAGGCTTTGATGGGCCA;SOR=0.740;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=193;TCF=111;TCR=82;TR=105;WE=12247624;WS=12247606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,112:0.53:210
chr12	12247921	.	ATT	A	264.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.172;ClippingRankSum=0.000;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=5.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.69;MQRankSum=-1.236;QD=9.80;ReadPosRankSum=1.173;SOR=0.730;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr12	12265118	rs55833207	CA	C	352.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.20;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	12278468	rs2302684	A	T	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=41;ReadPosRankSum=-1.960;SC=ACAGTGAAGTAGTCTGATTTT;SOR=0.818;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=5;WE=12278476;WS=12278458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr12	12301898	rs2302685	C	T	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=331;ReadPosRankSum=2.927;SC=TTTACCACAACGGCTCGAGGT;SOR=0.738;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=38;TCR=17;TR=26;WE=12301906;WS=12301888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,27:0.48:56
chr12	12397668	rs10219768	T	A	1316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.36;QD=43.89;SOR=3.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	12397668	.	TTA	ATT	673	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MMLQ=24;MQ=60.27;NF=4;NR=26;PP=673;QD=24.2155958287;SC=TCAAATCGGTTTAAGTGAGCA;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=30;WE=12397678;WS=12397658;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	12397670	rs10219748	A	T	1316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.36;QD=43.89;SOR=3.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	12483275	rs1861676	G	A	5409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=82;PP=2965;SC=TTCAAAGTTAGGTTGGAGATT;SOR=0.777;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=180;TCF=96;TCR=84;TR=178;WE=12483283;WS=12483265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr12	12483713	rs4763282	A	G	8081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=138;NR=121;PP=2965;SC=AGTTTCTCCAAGTGATCTGAG;SOR=0.767;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=261;TCF=138;TCR=123;TR=259;WE=12483721;WS=12483703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr12	12483927	rs4763818	G	A	2743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=63;PP=1784;SC=GAAGGCTTATGTAACTCCATG;SOR=2.254;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=22;TCR=63;TR=85;WE=12483935;WS=12483917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr12	12510075	.	G	A	1412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=0.000;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=9.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.58;ReadPosRankSum=-0.680;SOR=1.581;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,62:0.51:122
chr12	12510097	rs10772552	C	T	2116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=51;PP=1547;SC=TGCGGCAAAGCCAGTGTCATC;SOR=2.770;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=12;TCR=51;TR=63;WE=12510105;WS=12510087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr12	12618427	rs3751261	C	T	1696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.031;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=20;PP=1036;ReadPosRankSum=1.211;SC=CCCGGCCCTGCGGAGAGGACT;SOR=1.045;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=132;TCF=87;TCR=45;TR=65;WE=12618435;WS=12618417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,78:0.51:152
chr12	12618715	rs967648	T	C	1174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=35;PP=821;SC=CTGTAGCTGCTGCCCGGCCTG;SOR=4.174;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=4;TCR=35;TR=39;WE=12618723;WS=12618705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr12	12790737	rs10845599	G	A	1315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=38;PP=1099;SC=CACTTTGGGAGGCCGAGGTGG;SOR=3.716;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=4;TCR=38;TR=42;WE=12790745;WS=12790727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr12	12814818	rs4763862	C	T	5607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=91;PP=2965;SC=GCATCAAAGACCCACGATGCC;SOR=0.723;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=186;TCF=95;TCR=91;TR=186;WE=12814826;WS=12814808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr12	12967053	rs74063824	C	G	4024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=397;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.364;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=80;PP=2527;ReadPosRankSum=2.143;SC=GTATATTTTTCTGAATTCCAA;SOR=0.732;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=359;TCF=194;TCR=165;TR=174;WE=12967061;WS=12967043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:207,188:0.48:395
chr12	12977400	rs1010878	G	A	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.496;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=238;ReadPosRankSum=-1.196;SC=GTTTGTTCTCGTGTTTGTCTA;SOR=0.360;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=41;TCF=33;TCR=8;TR=18;WE=12977408;WS=12977390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,19:0.46:41
chr12	13028653	rs10845659	A	G	2534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=40;NR=37;PP=1227;SC=TACCCCCTCCAGGCCCCCAGC;SOR=0.845;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=77;TCF=40;TCR=37;TR=77;WE=13028661;WS=13028643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr12	13028696	rs11055120	G	A	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=12;PP=201;ReadPosRankSum=1.562;SC=GAGGTATGCCGCCCCACAAGA;SOR=0.687;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=61;TCF=29;TCR=32;TR=21;WE=13028704;WS=13028686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,22:0.30:73
chr12	13101454	rs7294444	G	T	3277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=56;PP=2002;SC=TATGTGTGCTGTACAATATAT;SOR=0.932;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=105;TCF=49;TCR=56;TR=105;WE=13101462;WS=13101444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr12	13102445	.	C	A	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.494;ClippingRankSum=0.000;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.957;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=11;PP=258;ReadPosRankSum=0.944;SC=TCCTGGTTCTCCACTTGGAAG;SOR=0.394;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=103;TCF=69;TCR=34;TR=29;WE=13102453;WS=13102435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,35:0.30:117
chr12	13102605	rs4630382	G	A	9055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=161;NR=150;PP=2965;SC=CGACCGGGTCGTCCCACTGGG;SOR=0.717;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=311;TCF=161;TCR=150;TR=311;WE=13102613;WS=13102595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,340:1.00:340
chr12	13136623	rs735689	T	C	9953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=365;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=179;NR=164;PP=2965;SC=AACTCCGTGTTAAAAATTCCA;SOR=0.732;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=344;TCF=179;TCR=165;TR=343;WE=13136631;WS=13136613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,365:1.00:365
chr12	13142174	rs850918	C	G	826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=6;PP=626;SC=CAAAGCTGGTCCCCGAGACCA;SOR=2.468;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=28;WE=13142182;WS=13142164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr12	13153126	.	C	CGGCGGCAGGGCGGCAG	952.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.79;QD=38.11;SOR=3.528;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr12	13153388	.	G	GGCAGCAGTCCAGCAGTGCAGCAGT	1029.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=4;PP=542;SC=CGGGCAGCAGGGCAGCAGTGC;SOR=1.244;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=12;TCF=7;TCR=5;TR=7;WE=13153396;WS=13153378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	13153773	rs1291364	T	C	333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=13;PP=283;SC=TCTTGGTAGCTGTCCCTCTAC;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=13153781;WS=13153763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	13154077	rs67498669	C	T	387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.24;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	13154105	rs9919709	A	T	369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.65;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	13154123	rs61912779	G	C	394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.22;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	13154582	rs59113920	CG	C	2062.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=25;PP=1240;SC=ATCTGCTGAGCGGGGGCCCCC;SOR=0.925;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=45;TCF=15;TCR=30;TR=36;WE=13154590;WS=13154572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr12	13154790	rs1291363	G	C	7226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=128;NR=108;PP=2965;SC=CCAACTACCTGATCGTGTCCA;SOR=0.819;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=236;TCF=128;TCR=108;TR=236;WE=13154798;WS=13154780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr12	13154911	rs1291362	A	G	11148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=432;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=203;NR=206;PP=2965;ReadPosRankSum=1.192;SC=CGTCTTCTCCATGAATGTCAT;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=410;TCF=204;TCR=206;TR=409;WE=13154919;WS=13154901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,430:1.00:432
chr12	13155166	rs1291361	G	T	7213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=150;PP=2965;SC=CTCCACCGCAGTGGCATCCTA;SOR=1.236;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=245;TCF=95;TCR=150;TR=245;WE=13155174;WS=13155156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,262:1.00:262
chr12	13211212	rs6488582	G	A	724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=0;PP=563;SC=TTTGTTTTATGTACAGTGTCC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=13211220;WS=13211202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	13214537	rs3741818	A	G	1418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=10;PP=961;SC=CTAATCTTGTATGCCTTTCGG;SOR=2.208;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=45;WE=13214545;WS=13214527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr12	13215685	rs2200498	C	A	1011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=27;NR=8;PP=655;SC=TGTTCAGCCCCTTGCGTCTTT;SOR=2.012;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=35;WE=13215693;WS=13215675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr12	13221606	rs1386005	T	C	7360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=122;NR=125;PP=2965;SC=AGACATTAGATTTCCTTCTGC;SOR=0.784;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=247;TCF=122;TCR=125;TR=247;WE=13221614;WS=13221596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,274:1.00:274
chr12	13248445	rs2291396	C	A	4676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=57;PP=2731;SC=GACAACAGATCGATGAGGCAG;SOR=1.047;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=157;TCF=99;TCR=58;TR=156;WE=13248453;WS=13248435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr12	13294280	rs7978768	C	A	4523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=50;PP=2788;SC=CCTCTGGTGCCTGACCATAAC;SOR=1.430;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=149;TCF=99;TCR=50;TR=149;WE=13294288;WS=13294270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr12	13366599	rs2277395	C	T	2206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.230;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=42;PP=1365;ReadPosRankSum=-0.563;SC=TTGTTCTCCTCGTCCTGTGTC;SOR=0.729;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=152;TCF=80;TCR=72;TR=87;WE=13366607;WS=13366589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,96:0.58:166
chr12	13526328	rs17821405	G	T	1215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.257;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=30;PP=747;ReadPosRankSum=-0.142;SC=GTCTACGAGCGCTCTGACTCT;SOR=1.123;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=121;TCF=59;TCR=62;TR=54;WE=13526336;WS=13526318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,59:0.46:129
chr12	13529401	rs7957232	T	C	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.793;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=128;ReadPosRankSum=1.334;SC=ATAGATATAATACAATGAATA;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=7;WE=13529409;WS=13529391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr12	13716638	rs1806191	G	A	1875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.573;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=40;PP=1149;ReadPosRankSum=0.363;SC=CGTGCTTGATGTGAGACCTGT;SOR=0.617;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=179;TCF=98;TCR=81;TR=77;WE=13716646;WS=13716628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,89:0.44:201
chr12	13717508	rs1806201	G	A	2202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.056;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=52;PP=1459;ReadPosRankSum=-1.374;SC=TCATGGTTGCGGTGGGGGAGT;SOR=0.957;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=233;TCF=114;TCR=119;TR=93;WE=13717516;WS=13717498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,105:0.41:256
chr12	13719859	rs3026159	A	G	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-4.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.463;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=229;ReadPosRankSum=-0.644;SC=CTTGAGCAACATGGGGGTGGA;SOR=0.073;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=12;WE=13719867;WS=13719849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr12	13720264	rs61216234	G	A	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.40;ReadPosRankSum=0.752;SOR=0.604;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr12	13720272	rs4764010	A	G	1164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=25;PP=271;SC=GAGAAAGAGGAGTATTGAGCA;SOR=3.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=29;WE=13720280;WS=13720254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	13761483	rs1805521	A	G	732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=9;PP=339;ReadPosRankSum=-0.180;SC=AACTTTGAGTATGGCTGAGAA;SOR=0.625;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=70;TCF=47;TCR=23;TR=28;WE=13761491;WS=13761473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,36:0.42:86
chr12	13761829	rs56069446	CA	C	1376.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=27;PP=865;ReadPosRankSum=0.276;SC=TTGAAACCTACAAATACACAG;SOR=0.650;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=64;TCF=1;TCR=63;TR=28;WE=13761837;WS=13761819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,48:0.45:106
chr12	13768354	rs1468845	C	T	3896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=97;NR=37;PP=2709;SC=AAAGTGAGCACGTTTTAAACT;SOR=1.880;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=97;TCR=37;TR=134;WE=13768362;WS=13768344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr12	13769664	rs1805199	T	C	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.958;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=25;PP=439;ReadPosRankSum=0.324;SC=CAGTATTGTCTGAACAATCCC;SOR=1.402;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=76;TCF=22;TCR=54;TR=32;WE=13769672;WS=13769654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,34:0.41:83
chr12	14018777	rs7301328	G	C	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=252;ReadPosRankSum=-0.452;SC=TGCCCAGGATGGGGGTGAGAG;SOR=0.773;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=52;TCF=37;TCR=15;TR=23;WE=14018785;WS=14018767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,28:0.43:65
chr12	14019157	rs12818068	C	T	2129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.734;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=55;PP=1425;ReadPosRankSum=-1.206;SC=AACTCGTCGACTCCCTGCAAA;SOR=0.858;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=182;TCF=85;TCR=97;TR=97;WE=14019165;WS=14019147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,102:0.50:202
chr12	14577892	rs2231909	A	T	2218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.570;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=45;PP=1337;ReadPosRankSum=-0.205;SC=ATTGATGCTAATGAAGAAACT;SOR=0.728;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=155;TCF=80;TCR=75;TR=92;WE=14577900;WS=14577882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,101:0.59:172
chr12	14579235	rs11055969	A	C	826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=2;PP=663;SC=GAAACTTTCTAAGCCTGTGGA;SOR=3.611;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=25;WE=14579243;WS=14579225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	14590981	rs10734876	T	C	392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.57;QD=28.05;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	14591220	rs4479040	G	A	822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=19;PP=493;SC=ATTGACTTGAGTTGTATACTC;SOR=2.019;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=27;WE=14591228;WS=14591210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	14628705	rs7298275	A	G	400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=1;PP=293;SC=CAGCCATTTAAGGGTCCAGAT;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=14628713;WS=14628695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	14634392	rs140044044	C	CAGTT	772.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=1;PP=778;SC=ATGCATATGTCAGCTAGATTT;SOR=4.407;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=14;WE=14634400;WS=14634382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	14656768	rs1600	G	C	5190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=72;PP=2965;SC=TAGACCTCTGGCATGCCCTGA;SOR=0.848;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=171;TCF=99;TCR=72;TR=171;WE=14656776;WS=14656758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr12	14688644	rs7957558	C	T	4762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=66;PP=2938;SC=TTATCTATGACGTTGAAGTCC;SOR=1.005;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=159;TCF=93;TCR=66;TR=159;WE=14688652;WS=14688634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr12	14689449	rs35754761	T	G	1619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.190;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=27;PP=995;ReadPosRankSum=2.371;SC=TTGGGCGCTATATAGAAAAAG;SOR=0.359;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=140;TCF=89;TCR=51;TR=69;WE=14689457;WS=14689439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,75:0.50:149
chr12	14694993	rs1862014	G	C	437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=1;PP=364;SC=CATGCCATTAGCAAAAAGTGC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=14695001;WS=14694983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	14720554	rs147342083	GGCA	G,TGCA	1409.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=11;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=24;NF=2,17;NR=10,16;PP=845,1285;SC=TAACAACAGCGGCAGCAGCAG;SOR=0.910;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=12,33;WE=14720567;WS=14720544;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.40,0.52:75
chr12	14720583	rs7954623	T	C	1698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=27;PP=734;SC=GCAGAAGCGGTGGCGGCTGTG;SOR=1.092;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=24;TCR=27;TR=51;WE=14720591;WS=14720573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr12	14769468	rs1558795	G	A	855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=5;PP=648;SC=GAGTACAGAAGAGGATTAGCA;SOR=2.621;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=29;WE=14769476;WS=14769458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	14774849	rs7302418	T	A	1644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=9;PP=1153;SC=ACTAGAGCGGTCAAGAGTAGT;SOR=2.753;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=52;TCF=43;TCR=9;TR=51;WE=14774857;WS=14774839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr12	14781503	rs4764105	A	T	109.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=0;PP=83;SC=TTCTCATTCTAAGGTGCCACT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=14781511;WS=14781493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr12	14781678	rs3217210	G	GA	656.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.595;HP=11;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=266;ReadPosRankSum=-1.050;SC=ACACCTGGAAGAAAAAAAAAC;SOR=0.963;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=67;TCF=10;TCR=57;TR=23;WE=14781686;WS=14781668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,37:0.32:114
chr12	14794062	rs10772800	G	A	2507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.40;SOR=0.757;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr12	14804994	rs7313027	G	C	1297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=34;PP=1017;SC=TTAGGAGACAGTGTTGTGGTG;SOR=2.584;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=9;TCR=34;TR=43;WE=14805002;WS=14804984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr12	14822855	rs7314345	G	A	760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=21;PP=533;SC=ACACAATGACGCTTGATTTCC;SOR=2.753;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=26;WE=14822863;WS=14822845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	14827463	rs3217157	AATC	A	13193.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=106;PP=2967;SC=TTAGCTGTGGAATCATCTATT;SOR=0.990;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=155;TCF=46;TCR=109;TR=146;WE=14827473;WS=14827453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,297:1.00:297
chr12	14829893	rs1420635	A	C	6332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.98;NF=100;NR=111;PP=2965;SC=CATTGTCCTCAAAGTACTGGT;SOR=0.883;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=211;TCF=100;TCR=111;TR=211;WE=14829901;WS=14829883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr12	14832830	rs11336448	CT	C	67	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=16.75;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr12	14834421	rs56944147	GA	G	11946.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=132;PP=2969;SC=CCTGGAATAGGAAAAAGAGAA;SOR=1.153;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=158;TCF=15;TCR=143;TR=145;WE=14834435;WS=14834411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,270:1.00:270
chr12	14834427	rs58911033	G	T	11979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=135;PP=2965;SC=ATAGGAAAAAGAGAAACTAAA;SOR=1.166;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=230;TCF=95;TCR=135;TR=230;WE=14834435;WS=14834411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,274:1.00:274
chr12	14993439	rs11276	C	T	2966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=45;PP=1764;SC=TGCAACCAGTCTCCTCTTGGG;SOR=0.922;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=59;TCR=45;TR=104;WE=14993447;WS=14993429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr12	14993608	rs3088189	G	A	2816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=44;PP=1672;SC=GGGATGTGGAGAGGAATTGGC;SOR=0.732;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=47;TCR=44;TR=91;WE=14993616;WS=14993598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr12	14993854	rs1861698	A	G	8325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=150;NR=118;PP=2965;SC=TGTTCAATGTATAAAACAAAA;SOR=0.812;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=268;TCF=150;TCR=118;TR=268;WE=14993862;WS=14993844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,301:1.00:301
chr12	15034996	rs2430735	T	A	1764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=10;PP=1260;SC=TATGTATTTCTGTAATGCTGC;SOR=2.872;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=46;TCR=10;TR=56;WE=15035004;WS=15034986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr12	15035081	rs4236	T	C	6300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=123;NR=93;PP=2965;SC=TCTCATTTGGTCCCTCGGCGC;SOR=0.888;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=217;TCF=124;TCR=93;TR=216;WE=15035089;WS=15035071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr12	15037187	rs11393307	T	TA	362.50	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.6276;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=124;ReadPosRankSum=0.706;SC=ATTCTGAAATTAAAAAAAAAA;SOR=1.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=8;WE=15037195;WS=15037177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,16:0.89:18
chr12	15038788	rs1800801	C	T	733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=14;PP=394;SC=GAGGCTCCTACGGGATGTTAG;SOR=1.528;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=9;TCR=14;TR=23;WE=15038796;WS=15038778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	15067492	.	CTG	C	57.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.745;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=2;PP=126;ReadPosRankSum=-0.783;SC=AAATGAAGCTCTGTGTGTGTG;SOR=0.527;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=19;TCF=9;TCR=10;TR=5;WE=15067503;WS=15067482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,7:0.24:29
chr12	15081897	rs2445371	AG	CA	9266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=137;NR=168;PP=2947;ReadPosRankSum=2.005;SC=CCAGCTGGCAAGTCTCCTTCA;SOR=1.000;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=313;TCF=140;TCR=173;TR=305;WE=15081906;WS=15081887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,340:0.99:342
chr12	15082004	rs11056244	T	A	1358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=36;PP=1047;SC=GCTTCCTGACTATTTTTCTAG;SOR=3.767;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=4;TCR=36;TR=40;WE=15082012;WS=15081994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr12	15090762	rs3748296	G	C	913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=2;PP=750;SC=AATCAAACTGGGTGGCTGTCT;SOR=4.479;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=29;WE=15090770;WS=15090752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	15090837	rs3748297	A	G	3480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=47;PP=2209;SC=TGGTTCCCTTAAGGTAGAACA;SOR=1.051;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=70;TCR=47;TR=117;WE=15090845;WS=15090827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr12	15091221	rs11432737	A	AT	4708.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=22;PP=2957;SC=GGCAAAATGCACTTATCCAGG;SOR=2.364;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=76;TCF=54;TCR=22;TR=75;WE=15091229;WS=15091211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr12	15095707	rs10772822	T	C	1751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=24;NR=35;PP=1137;SC=AGGAAAAACATACACTGCAAA;SOR=1.270;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=24;TCR=35;TR=59;WE=15095715;WS=15095697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr12	15100683	rs2075265	C	T	246.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=202;SC=CATTCCAGACCCAGCTTGGGG;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=15100691;WS=15100678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	15101034	rs72428197	GCACACACACA	G	917.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=0;NR=15;PP=2997;SC=TTTAGTCCTTGCACACACACA;SOR=3.816;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=15;WE=15101051;WS=15101024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr12	15101072	rs4764142	T	G	943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=229;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=17;PP=245;SC=ACACACACACTTAATGCCTGA;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=15101080;WS=15101062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr12	15102681	rs28683560	G	C	4456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=59;PP=2500;SC=CAGAGACCAAGTTTTCTTTGT;SOR=1.053;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=148;TCF=89;TCR=59;TR=148;WE=15102689;WS=15102671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr12	15103605	rs2430711	A	G	4237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=70;PP=2446;SC=GCTCATCATCATCATCCTCCT;SOR=0.866;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=145;TCF=75;TCR=70;TR=144;WE=15103613;WS=15103595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr12	15131995	rs2233623	C	A	238.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=194;SC=GAGTTTCTCACATACAAACAC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=15132003;WS=15131985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	15652330	rs4764197	T	C	653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=1;PP=444;SC=AAGTGTGTGATGTTTAGAAGA;SOR=3.258;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=15652338;WS=15652320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr12	15656832	rs4764199	T	A	1739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=10;PP=1147;SC=CTTTTTTATATATGATTTAGA;SOR=2.507;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=42;TCR=10;TR=52;WE=15656840;WS=15656822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr12	15661441	rs888163	A	G	1167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=11;PP=702;ReadPosRankSum=-0.935;SC=TTTTTAAACCAGAATCTTTTA;SOR=0.793;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=43;TCF=32;TCR=11;TR=42;WE=15661449;WS=15661431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,46:0.98:47
chr12	15702007	rs7132826	C	T	2183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.481;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=40;PP=1263;ReadPosRankSum=0.704;SC=CTAAAATTTACCTTATTTTCT;SOR=0.741;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=212;TCF=122;TCR=90;TR=96;WE=15702015;WS=15701997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,110:0.47:233
chr12	15702202	rs10541885	AAT	A	168.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=3.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.91;ReadPosRankSum=0.659;SOR=0.260;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,10:0.17:58
chr12	15704425	rs1012674	G	T	1280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.343;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=16;PP=819;ReadPosRankSum=-0.080;SC=AGCAATGAATGGTTCTGTTTG;SOR=0.929;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=117;TCF=81;TCR=36;TR=57;WE=15704433;WS=15704415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,62:0.48:129
chr12	15710270	rs10846209	C	G	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.480;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=89;ReadPosRankSum=-1.611;SC=GGCCTAGCTTCTTCTTTTTTT;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=5;WE=15710278;WS=15710260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr12	15722555	rs10846212	A	G	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=366;ReadPosRankSum=-0.545;SC=TGGCCTGGGGATTGCTGATCT;SOR=0.984;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=41;TCF=6;TCR=35;TR=21;WE=15722563;WS=15722545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,24:0.56:43
chr12	15731724	rs5796639	T	TG	3414.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=12;PP=2092;SC=AATAAACCAGTTGAACAATAA;SOR=2.331;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=56;TCF=43;TCR=13;TR=50;WE=15731732;WS=15731714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr12	15731744	rs1024843	C	T	3622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=28;PP=2029;SC=ATCCAATTCACACCACGTATG;SOR=1.683;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=73;TCR=28;TR=101;WE=15731753;WS=15731734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr12	15748020	rs1558787	C	T	2922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=54;PP=1683;SC=TCCACGAGTGCTCAGTCTTAG;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=40;TCR=54;TR=94;WE=15748028;WS=15748010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr12	15777486	rs4623959	T	C	89.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=3;PP=39;SC=TATCCTCGCCTGGTATAAATG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=15777494;WS=15777476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr12	15803992	rs4237955	T	C	2759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=59;PP=1575;SC=AATGTATCCATGCTCACAGTT;SOR=1.336;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=38;TCR=59;TR=97;WE=15804000;WS=15803982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr12	15818880	rs4363660	T	A	627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=15;PP=391;SC=CTATAACATATCAATTAACTC;SOR=1.519;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=8;TCR=15;TR=23;WE=15818888;WS=15818870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	15822229	rs4237957	A	C	1581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=7;PP=1119;SC=AAATCTAGTAACTAATATGCA;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=42;TCR=7;TR=49;WE=15822237;WS=15822219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr12	15822244	rs4237958	T	C	2428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=15;PP=1669;SC=TATGCAGATATATTATCAAAA;SOR=2.448;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=61;TCR=15;TR=76;WE=15822252;WS=15822234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr12	15834192	rs71532816	T	C	884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.427;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=16;PP=407;ReadPosRankSum=2.086;SC=TTTTGAACCATGTTCTCTGTC;SOR=0.776;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=93;TCF=52;TCR=41;TR=39;WE=15834200;WS=15834182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,48:0.41:116
chr12	16036261	rs10734889	C	G	799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=23;PP=645;SC=TATTCCCAGCCAATTACAGAT;SOR=4.174;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=16036269;WS=16036251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr12	16050808	rs10772879	T	A	294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=240;SC=ACTTAAATTTTTTTTCAGTTT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=16050816;WS=16050798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	16055926	rs71042275	G	GT	897.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=5;PP=550;SC=TCAATCATATGTGCAGTTAGT;SOR=1.358;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=13;TCF=7;TCR=6;TR=12;WE=16055934;WS=16055916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr12	16109673	rs2306181	T	G	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.762;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=165;ReadPosRankSum=-0.823;SC=GGAGTGATTTTGCATGAAGTA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=7;WE=16109681;WS=16109663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr12	16185463	rs57961487	CTT	C	2555.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=10;PP=1614;SC=AGTTTTTCCTCTTTTTGTTTT;SOR=2.621;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=45;TCF=33;TCR=12;TR=42;WE=16185472;WS=16185453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr12	16347308	rs3942536	G	A	3072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.405;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=77;PP=1879;ReadPosRankSum=0.500;SC=ATCCCAGGACGTTCAACAATG;SOR=0.742;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=294;TCF=141;TCR=153;TR=142;WE=16347316;WS=16347298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,153:0.48:321
chr12	16369828	rs1671511	A	T	6962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=136;NR=93;PP=2965;SC=TATTTTTACCATCTGAGATGA;SOR=0.931;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=229;TCF=136;TCR=93;TR=229;WE=16369836;WS=16369818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr12	16392545	rs11056836	C	T	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=211;ReadPosRankSum=-0.471;SC=ATAGCTAGTTCGGATCTTAGC;SOR=0.387;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=12;WE=16392553;WS=16392535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr12	16397677	rs1527014	G	A	3352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=49;PP=1939;SC=GCAGTATTGCGGGTGGCATGT;SOR=0.742;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=61;TCR=49;TR=110;WE=16397685;WS=16397667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr12	16397734	rs1852450	C	A	1192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.569;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=33;PP=763;ReadPosRankSum=1.844;SC=GAGAGAACAACCTGCAAGTAA;SOR=0.892;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=98;TCF=41;TCR=57;TR=53;WE=16397754;WS=16397724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,57:0.53:108
chr12	16397746	rs1852451	C	T	2591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=52;PP=1988;SC=TGCAAGTAATCGGAGATATTA;SOR=1.167;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=35;TCR=52;TR=87;WE=16397754;WS=16397724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr12	16430284	rs1671487	G	A	7035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=132;NR=103;PP=2965;SC=ACAAGCAAATGTACACCAGTT;SOR=0.935;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=236;TCF=132;TCR=104;TR=235;WE=16430292;WS=16430274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr12	16743165	rs2058798	A	G	362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=9;PP=237;SC=TTCTTGAAGCAAAACTAACAT;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=16743173;WS=16743155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	16757863	rs78062402	T	C	7028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=127;PP=2965;SC=CAGCTTCGCATTGAGCACCAA;SOR=1.071;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=228;TCF=101;TCR=127;TR=228;WE=16757871;WS=16757853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr12	17142546	rs7955087	T	C	808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.021;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.886;NF=10;NR=21;PP=376;ReadPosRankSum=-1.031;SC=TTTGGGAGGCTGAGGCAGGCG;SOR=0.538;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=60;TCF=18;TCR=42;TR=31;WE=17142554;WS=17142536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,37:0.54:68
chr12	18234461	rs11043840	T	A	418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.04;ReadPosRankSum=1.377;SOR=0.622;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,18:0.95:19
chr12	18435398	rs35277916	GCCC	G	2541.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.156;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.15;MQRankSum=1.461;NF=7;NR=32;PP=1465;ReadPosRankSum=-0.543;SC=TCCTGGGGAAGCCCCATAGGA;SOR=0.431;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=74;TCF=9;TCR=65;TR=39;WE=18435408;WS=18435388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,67:0.49:137
chr12	18435452	rs11044004	C	T	906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.217;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=15;PP=542;ReadPosRankSum=0.320;SC=ATTTTAGCTCCATCATTCACA;SOR=0.583;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=66;TCF=34;TCR=32;TR=36;WE=18435460;WS=18435442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,40:0.49:82
chr12	18473881	rs34734874	T	G	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=1.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.01;ReadPosRankSum=0.508;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,20:0.37:54
chr12	18478126	rs17475920	A	T	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.838;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=39;ReadPosRankSum=0.998;SC=AAGATGACAAAAATGAATAAA;SOR=0.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=4;WE=18478134;WS=18478116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr12	18499777	rs10770357	C	G	5496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=106;PP=2965;SC=ACAGGTGAGTCGTGGTGAGTT;SOR=1.286;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=179;TCF=73;TCR=106;TR=179;WE=18499785;WS=18499767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr12	18641326	rs7137852	T	C	1074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=6;PP=756;SC=TCCGGCTGGATGTGGTTTAAA;SOR=2.554;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=36;WE=18641334;WS=18641316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr12	18641364	rs149017505	TTC	T	1507.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.852;HP=6;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.023;NF=15;NR=11;PP=962;ReadPosRankSum=1.760;SC=AAGAATTTTTTTCTCTCTCTT;SOR=0.543;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=69;TCF=41;TCR=28;TR=26;WE=18641373;WS=18641354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,47:0.51:93
chr12	18656174	rs11044141	G	C	1411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.612;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=20;PP=897;ReadPosRankSum=1.852;SC=CTCATCTTGTGATGAAGGAAT;SOR=0.801;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=139;TCF=88;TCR=51;TR=60;WE=18656182;WS=18656164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,68:0.43:157
chr12	18656225	rs11044142	G	A	2733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.506;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=46;PP=1708;ReadPosRankSum=-0.816;SC=GATTGGTGCAGATGGTACCTG;SOR=0.954;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=275;TCF=155;TCR=120;TR=120;WE=18656233;WS=18656215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,133:0.43:306
chr12	18801017	rs501379	T	C	561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=20;PP=464;SC=TTTTCACTTCTGGGCCTCTGA;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=18801025;WS=18801007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr12	18848131	rs1487070	T	C	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=34;ReadPosRankSum=-0.703;SC=TATGAGCAAGTATCATTAGCC;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=18848139;WS=18848121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr12	18849071	rs3825081	G	C	803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=13;PP=498;ReadPosRankSum=1.302;SC=ACTCAATATCGTATATAACAT;SOR=0.706;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=87;TCF=57;TCR=30;TR=38;WE=18849079;WS=18849061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,41:0.43:95
chr12	18854540	.	ATCCTCCTCCTCC	A,ATCC	2417.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.23;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=17;NF=6,6;NR=25,25;PP=1078,524;SC=CTTTGAATTTATCCTCCTCCT;SOR=0.871;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=69;TCF=9;TCR=60;TR=31,31;WE=18854562;WS=18854530;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.49,0.51:59
chr12	18872325	rs10841078	G	C	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=199;ReadPosRankSum=1.823;SC=GAACTTCCAAGTATTTTTAAA;SOR=0.569;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=15;WE=18872333;WS=18872315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
chr12	18889149	rs12300257	T	C	977.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.609;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=20;PP=546;ReadPosRankSum=1.884;SC=GTGGATGTCATCTTACCTTAA;SOR=0.704;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=86;TCF=47;TCR=39;TR=40;WE=18889157;WS=18889139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,47:0.47:99
chr12	18889517	rs144525318	A	AAATTTGAG	625.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.970;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=659;ReadPosRankSum=0.566;SC=ATTAAAGTTAAAATTTGAGAA;SOR=1.329;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=12;WE=18889525;WS=18889507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,16:0.37:43
chr12	18889547	rs10841080	C	A	1053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.711;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.173;NF=30;NR=13;PP=687;ReadPosRankSum=0.427;SC=TTACTTAGAACATACATTAAA;SOR=0.334;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=72;TCF=53;TCR=19;TR=43;WE=18889555;WS=18889537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,46:0.59:78
chr12	18889565	rs12306752	A	T	1602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.075;NF=44;NR=19;PP=1007;ReadPosRankSum=1.690;SC=AAAACATTATAACAATCTATT;SOR=0.634;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=116;TCF=82;TCR=34;TR=63;WE=18889573;WS=18889555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,69:0.54:127
chr12	18890472	rs5796766	GT	G	1397.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=37;PP=834;SC=ACACACAGTGGTTTTTTTTGC;SOR=2.393;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=0;TCR=46;TR=37;WE=18890480;WS=18890462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr12	18891079	rs1075421	T	C	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.106;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=321;ReadPosRankSum=-1.057;SC=CCTGCTTTCATGGATAGACAT;SOR=0.117;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=17;WE=18891087;WS=18891069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr12	19282670	rs28512290	C	T	1097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.808;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=15;PP=747;ReadPosRankSum=0.647;SC=CTCGCTCGTTCCCTCCTCCCT;SOR=0.576;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=100;TCF=73;TCR=27;TR=51;WE=19282678;WS=19282660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,53:0.51:104
chr12	19283135	rs61913270	C	A	1496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.067;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=38;PP=1110;ReadPosRankSum=1.055;SC=CCCGGCTCCCCGCAACCTGCC;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=15;TCR=38;TR=53;WE=19283143;WS=19283125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,54:0.96:56
chr12	19406863	rs6486942	C	T	2968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=63;NR=35;PP=1691;SC=TTTCTTTTTTCCTTTTTTCAG;SOR=1.168;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=98;TCF=63;TCR=35;TR=98;WE=19406871;WS=19406853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr12	19410474	rs10706958	AT	A	89.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=1.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.63;ReadPosRankSum=-0.389;SOR=0.418;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,14:0.25:55
chr12	19418588	rs6486945	G	A	115.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=1;PP=72;SC=GTTCATTTATGTACAAGAACC;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=19418596;WS=19418582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	19418874	rs7316780	C	T	441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=11;PP=284;SC=AAAAAAGCTACCTTATAGTGA;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=19418882;WS=19418864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	19428009	rs2279537	T	A	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=262;ReadPosRankSum=-0.317;SC=AATATTGGTTTAAATTGTGTT;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=12;WE=19428017;WS=19427999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr12	19441082	rs7960486	C	A	734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.807;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=14;PP=495;ReadPosRankSum=-0.089;SC=ATTCCCTTATCCTTAAAACAG;SOR=0.572;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=85;TCF=55;TCR=30;TR=37;WE=19441090;WS=19441072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,39:0.44:88
chr12	19512563	rs11044515	G	A	890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=26;PP=677;SC=AAAATAAAGTGTGTTTCTTTC;SOR=3.912;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=29;WE=19512571;WS=19512553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	19522484	rs113006194	A	AAAAG	457.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=0;PP=508;SC=TTTAAAAAGAAAAAATCACAA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=9;WE=19522502;WS=19522474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	19522494	rs57357758	A	G	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.402;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.105;NF=7;NR=0;PP=137;ReadPosRankSum=-0.207;SC=AAAAATCACAATAGAACCAAA;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=7;WE=19522502;WS=19522474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr12	19592600	rs143333997	GGGA	G	897.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5743;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=10;PP=573;SC=GGCGGCGGTGGGGAGGAGGAG;SOR=0.874;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=11;WE=19592613;WS=19592590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr12	19626311	.	AT	A	1906.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.21;QD=41.45;SOR=2.110;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr12	19626315	.	ATTT	A	1905.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.24;QD=41.43;SOR=2.110;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr12	19626322	rs11044583	T	A	1825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.28;QD=46.81;SOR=2.362;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr12	19626326	rs12370241	T	A	1591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.32;QD=46.82;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr12	19646943	rs66556640	CTGGTGTATTTCA	C	1525.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=19;PP=2957;SC=CTGAGAAAATCTGGTGTATTT;SOR=2.649;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=19;WE=19646962;WS=19646933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr12	19873411	rs4301848	G	T	624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=3;PP=419;SC=AATTCTCGCAGGTTGTGGGAG;SOR=2.737;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=19873419;WS=19873401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr12	19873497	rs4369485	A	G	2355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=47;NR=36;PP=1327;SC=TAAGTCCGATAACATCTGATG;SOR=0.878;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=47;TCR=36;TR=83;WE=19873505;WS=19873487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr12	20522114	rs138187101	A	AGCGT	315.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.367;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.7042;FS=10.414;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=348;ReadPosRankSum=-0.745;SC=AATTGGGAAGAGCGTGCGTGC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=9;WE=20522122;WS=20522104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr12	20709733	rs4762972	G	A	4247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=81;PP=2552;SC=AATAAAATGTGGAGCGAGGAA;SOR=1.375;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=135;TCF=54;TCR=81;TR=135;WE=20709741;WS=20709723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr12	20766559	rs10743380	C	T	5612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=101;PP=2965;SC=TGAATCCCGTCACTTCGCTCA;SOR=1.114;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=176;TCF=75;TCR=101;TR=176;WE=20766567;WS=20766549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr12	20766685	rs7308381	G	C	1619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=34;PP=984;SC=TTTTTTAATTGTCTTCTAGGT;SOR=1.823;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=17;TCR=34;TR=51;WE=20766693;WS=20766675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr12	20769026	rs68125264	TTAGA	T	232.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=247;SC=CACTCAAATTTTAGATAGATA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=5;WE=20769037;WS=20769019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	20774464	rs10743381	A	G	3561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=83;PP=2324;SC=TGGTTTGTCTATTCTAATAAC;SOR=1.990;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=119;TCF=36;TCR=83;TR=119;WE=20774472;WS=20774454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr12	20774539	rs10734705	A	G	410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=13;PP=344;SC=CTTATGTGATAATACAGATTC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=20774547;WS=20774529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	20786787	rs4265636	T	C	3107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=62;PP=1947;ReadPosRankSum=-1.180;SC=AAAACAGTGATCTACATTTCT;SOR=0.606;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=97;TCF=34;TCR=63;TR=96;WE=20786795;WS=20786777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,111:0.99:112
chr12	20786807	rs3858661	T	G	1745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=39;PP=1152;SC=TGATATTTTGTGGGGCGCTGG;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=19;TCR=39;TR=58;WE=20786815;WS=20786797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr12	20786822	rs10841580	C	T	1301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=33;PP=887;SC=CGCTGGGAGACGGGGTCTCAT;SOR=2.935;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=7;TCR=33;TR=40;WE=20786830;WS=20786812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr12	20786841	rs10743382	T	C	482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=60;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=422;SC=ATGATGTTGGTCAGGTCGGTC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=20786849;WS=20786831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	20786880	rs10841581	C	T	205.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=61;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=166;SC=GTGATCCTCCCGCCTCAGCCT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=20786888;WS=20786870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	20803323	rs9804769	A	C	180.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=145;SC=TTTCTCTTCTATTCAACTTTT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=20803331;WS=20803313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	20803549	rs10743384	T	C	1968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=27;NR=37;PP=1143;SC=CTGACCACTGTTTAATACAGC;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=27;TCR=37;TR=64;WE=20803557;WS=20803539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr12	20864356	rs7963279	C	T	1968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.218;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=42;PP=1039;ReadPosRankSum=1.983;SC=CCTCCAATTCCACTCTCAGCA;SOR=0.756;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=211;TCF=113;TCR=98;TR=89;WE=20864364;WS=20864346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,101:0.43:234
chr12	20864481	rs142446674	T	TA	336.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.474;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=258;ReadPosRankSum=0.375;SC=AACAAGCTTTTAAAAAAAAGA;SOR=3.500;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=13;WE=20864489;WS=20864471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr12	20893052	rs2037154	C	A	2289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=9;PP=1556;SC=ACATTTTTAACATAACTGTCT;SOR=3.056;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=55;TCR=9;TR=64;WE=20893060;WS=20893042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr12	20893108	rs2271656	C	T	6848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=137;NR=100;PP=2965;SC=TTTTCCCTATCGTGTTACAGA;SOR=1.007;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=237;TCF=137;TCR=100;TR=237;WE=20893116;WS=20893098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr12	20893354	rs12368368	G	C	945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=28;PP=816;SC=CAATCATCTCGAGCAATGATT;SOR=4.479;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=30;WE=20893362;WS=20893344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	20903757	rs10841611	T	C	10013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=372;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=161;NR=174;PP=2965;SC=CCGCATCTCATTGCTACAGCA;SOR=0.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=335;TCF=161;TCR=174;TR=335;WE=20903765;WS=20903747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,371:1.00:371
chr12	20903865	rs10841612	G	A	2294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=53;PP=1455;SC=GTGATCTGTAGTCATAGAATA;SOR=2.720;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=16;TCR=53;TR=69;WE=20903873;WS=20903855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr12	20905250	rs6487138	C	T	1183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=11;PP=809;SC=ACATATATATCTGGGACTAAC;SOR=1.721;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=29;TCR=11;TR=40;WE=20905258;WS=20905240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr12	20968828	rs10734710	C	T	1481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=32;PP=903;SC=AGGCCACTAACTGTCAAAAAG;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=18;TCR=32;TR=50;WE=20968836;WS=20968818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr12	21011480	rs4149117	T	G	5293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.372;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=-0.050;NF=101;NR=75;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.453;SC=TATTTTGACATCTTTACCACA;SOR=0.503;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=176;TCF=101;TCR=75;TR=176;WE=21011488;WS=21011470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,199:1.00:200
chr12	21011581	rs4149118	G	A	2164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=49;PP=1408;SC=TTTTATACTTGTAAGTGGGCA;SOR=1.670;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=24;TCR=49;TR=73;WE=21011589;WS=21011571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr12	21013948	rs3764009	C	T	941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=25;NR=8;PP=555;SC=GTTGCTCTTACAGTTATAGGT;SOR=1.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=33;WE=21013956;WS=21013938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	21014139	rs3764008	C	G	1841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=36;PP=1088;SC=TATAAAGTTTCTGATATTCTT;SOR=1.318;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=25;TCR=36;TR=61;WE=21014147;WS=21014129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr12	21014163	rs3764007	T	A	933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=23;PP=602;SC=CAAAATTGATTTAAGAACAAA;SOR=2.517;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=30;WE=21014171;WS=21014153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr12	21015610	rs1036261	A	G	3452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=49;PP=2332;SC=AGTGTATTGTATAATATTACT;SOR=0.896;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=61;TCR=49;TR=110;WE=21015618;WS=21015600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr12	21015760	rs7311358	G	A	4469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=83;PP=2552;SC=TTGCTAAAATGTACGTGGATA;SOR=1.000;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=155;TCF=72;TCR=83;TR=155;WE=21015768;WS=21015750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr12	21031020	rs2417938	A	G	230.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=7;PP=176;SC=TCCATCTTGTAATATCATCGT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=21031028;WS=21031010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	21032242	rs4149142	T	G	90.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=4;NR=0;PP=64;SC=TCCCAGGTTCTCCACCCTTCT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=21032250;WS=21032232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr12	21036411	rs2053098	A	G	984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=9;PP=503;SC=ATTACTCAGCACACTTGGGTG;SOR=1.329;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=30;WE=21036419;WS=21036401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr12	21051489	rs4149153	C	T	677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=16;PP=442;SC=ATGTTAAATACTAAAGACTGA;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=8;TCR=16;TR=24;WE=21051497;WS=21051479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr12	21054369	rs3764006	G	A	1193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=26;NR=16;PP=621;SC=GAGCACAAGGGGCTTGTAGGA;SOR=0.963;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=43;TCF=27;TCR=16;TR=42;WE=21054377;WS=21054359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr12	21054918	rs2082518	T	C	1983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=40;PP=1315;SC=TTACCTCTTATAGAAGCATTA;SOR=1.576;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=22;TCR=40;TR=62;WE=21054926;WS=21054908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr12	21065235	rs142241896	TTTTATTTATTTATTTA	T	184.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.97;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	21065365	rs10841706	C	A	826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.33;QD=25.05;SOR=0.752;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr12	21168582	rs78646354	A	G	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=101;ReadPosRankSum=0.000;SC=GATCTTCTTGACACTCCTGTC;SOR=0.782;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=22;TCF=14;TCR=8;TR=9;WE=21168590;WS=21168572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr12	21168758	rs34168692	T	TA	437.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=8;PP=219;SC=TTGCATATGTTAAAAAAAAAC;SOR=1.371;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=11;WE=21168766;WS=21168748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	21176135	rs1546308	T	C	7093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=127;NR=107;PP=2965;SC=ACTGTGAATGTAATGGGAATG;SOR=0.838;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=234;TCF=127;TCR=107;TR=234;WE=21176143;WS=21176125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
chr12	21176247	rs1546307	A	G	3483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=67;PP=2033;SC=ACGAGGTACCATGATAGTGCT;SOR=1.430;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=43;TCR=67;TR=110;WE=21176255;WS=21176237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr12	21201572	.	A	ATGTG	46.27	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5337;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=1;PP=53;ReadPosRankSum=-0.967;SC=ACATATTTAAATGTGTGTGTG;SOR=0.223;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=1;WE=21201580;WS=21201562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr12	21201663	rs11045689	G	A	1056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=24;NR=12;PP=515;SC=CGCCCTACCTGCTGTTGCAAT;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=24;TCR=12;TR=36;WE=21201671;WS=21201653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr12	21220349	rs1910163	A	T	2493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=38;PP=1374;SC=GAAATTTAACATGTAAATATT;SOR=0.829;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=44;TCR=38;TR=82;WE=21220357;WS=21220339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr12	21317810	rs4149033	A	G	1430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=28;NR=20;PP=808;SC=GGCAATTATAAAACTCAATAC;SOR=0.808;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=28;TCR=20;TR=48;WE=21317818;WS=21317800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr12	21327652	.	T	TA	138	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;FR=0.5211;HP=14;HapScore=3;MGOF=21;MMLQ=15;MQ=58.98;NF=0;NR=14;PP=138;QD=10.1428571429;SC=TAGTAAGTGTTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=14;WE=21327660;WS=21327642;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:19,14:0.42:33
chr12	21331599	rs4149057	T	C	3590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=54;PP=2224;SC=CATAGTACCATTGGGGCTTTC;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=118;TCF=64;TCR=54;TR=118;WE=21331607;WS=21331589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr12	21331987	rs2291076	C	T	2452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=39;PP=1180;SC=ACCATGATAACGTCTTTCTAA;SOR=1.061;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=36;TCR=39;TR=75;WE=21331995;WS=21331977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr12	21392169	rs71581985	T	G	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=224;ReadPosRankSum=-0.037;SC=CAAACAGCATTGCATTGATTC;SOR=0.588;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=14;WE=21392177;WS=21392159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,21:0.48:44
chr12	21446815	.	C	T	1352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.607;ClippingRankSum=0.000;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.592;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=23;PP=823;ReadPosRankSum=-0.629;SC=TAAATATAGGCCCAGTTCATA;SOR=0.598;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=162;TCF=108;TCR=54;TR=64;WE=21446823;WS=21446805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,70:0.40:176
chr12	21457434	rs11568563	T	G	1850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.072;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-1.168;NF=50;NR=32;PP=1184;ReadPosRankSum=-0.968;SC=GGATGGGAGTTTCACCCATTC;SOR=0.904;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=140;TCF=83;TCR=57;TR=82;WE=21457442;WS=21457424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,88:0.58:151
chr12	21526367	rs138036034	T	C	1792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.200;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=44;PP=1216;ReadPosRankSum=1.672;SC=CATTGAAAGGTTGGTAACTTT;SOR=0.813;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=157;TCF=70;TCR=87;TR=77;WE=21526375;WS=21526357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,83:0.48:172
chr12	21590600	rs113744302	C	T	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.669;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=51;ReadPosRankSum=-0.339;SC=GCTGCTTCCTCTCCTGGAGTC;SOR=0.569;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=6;WE=21590608;WS=21590590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr12	21593404	rs4762702	G	C	2022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=34;NR=34;PP=1110;SC=TGTATAACTTGTTAATATTAA;SOR=0.920;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=34;TCR=34;TR=68;WE=21593426;WS=21593394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr12	21605116	rs147310223	C	CAT	91.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.187;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=2;PP=32;ReadPosRankSum=0.719;SC=AATATGATAACATTTAAATTG;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=2;WE=21605124;WS=21605106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr12	21609127	rs4367993	T	C	1483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=24;PP=806;SC=CAACGAACTGTTAGGTCACTT;SOR=1.061;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=23;TCR=25;TR=47;WE=21609135;WS=21609117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr12	21615207	rs3213210	A	G	209.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=6;PP=140;SC=CTTGATTTACAGTATTTTTTA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=21615215;WS=21615197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	21615894	rs73067231	T	G	1263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.676;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=33;PP=786;ReadPosRankSum=-1.061;SC=TTCCAACTTTTCTGCTTAAGT;SOR=0.600;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=121;TCF=49;TCR=72;TR=58;WE=21615902;WS=21615884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,62:0.48:128
chr12	21623122	rs13035	T	G	1440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.104;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.389;NF=42;NR=28;PP=893;ReadPosRankSum=-1.059;SC=TTTAGTAACATTCATATCAGG;SOR=0.518;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=140;TCF=86;TCR=54;TR=70;WE=21623130;WS=21623112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,72:0.50:143
chr12	21624309	rs11046076	A	T	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.401;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=5;PP=473;ReadPosRankSum=2.071;SC=TGCAATTTTTAAAAAAAAACC;SOR=1.460;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=65;TCF=51;TCR=14;TR=33;WE=21624317;WS=21624299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,28:0.48:58
chr12	21626324	rs917852	A	C	601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.98;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	21626330	rs917853	C	A	633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.25;SOR=4.047;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
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chr12	21628812	rs10160843	G	A	1389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=35;PP=1011;SC=CCTGGAAGATGGTTTTCAACA;SOR=2.985;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=8;TCR=35;TR=43;WE=21628820;WS=21628802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr12	21629769	rs73082666	T	C	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.826;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=259;ReadPosRankSum=-0.085;SC=CAGTTATCAGTATAATTATCA;SOR=1.329;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=14;WE=21629777;WS=21629759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr12	21629987	rs917854	T	C	1791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=35;PP=954;SC=TGGCTGTCTATGTACAACTTT;SOR=1.163;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=26;TCR=35;TR=61;WE=21629995;WS=21629977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr12	21639591	rs7964104	G	C	75.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.09;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr12	21644667	rs10841834	G	A	1401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=41;PP=994;ReadPosRankSum=-0.072;SC=GAGGCAGCGCGGATACAATGA;SOR=0.721;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=116;TCF=40;TCR=76;TR=61;WE=21644675;WS=21644657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,62:0.52:120
chr12	21654831	rs1060126	G	T	2941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.967;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=66;PP=1723;ReadPosRankSum=0.569;SC=CCGAGGTGCTGTCGCCGCTGT;SOR=0.573;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=258;TCF=136;TCR=122;TR=130;WE=21654839;WS=21654821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,146:0.51:285
chr12	21657590	rs67392337	AT	A	7040.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=98;PP=2951;SC=AAGTTACTGAATTACCTCTAG;SOR=1.253;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=6;TCR=100;TR=104;WE=21657598;WS=21657580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr12	21657618	rs11046089	T	A	1341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.834;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=43;PP=958;ReadPosRankSum=1.990;SC=GTTGCACATATGAACCATAGG;SOR=1.148;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=113;TCF=34;TCR=79;TR=57;WE=21657637;WS=21657608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,60:0.47:127
chr12	21668258	rs199678829	GT	G	400.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.611;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=134;ReadPosRankSum=-0.040;SC=TGACATTTCAGTTTTTTTTAT;SOR=0.260;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=37;TCF=1;TCR=36;TR=11;WE=21668266;WS=21668248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,22:0.38:58
chr12	21681819	rs2306178	A	G	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=3.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=206;ReadPosRankSum=-0.633;SC=TCCTTTGTTGAGGGGTCAAAA;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=11;WE=21681827;WS=21681809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,15:0.42:36
chr12	21684029	rs3765093	G	A	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.215;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.80;ReadPosRankSum=1.681;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr12	21692166	rs36023861	CA	C	942.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=10;PP=366;SC=ATATAGCTTTCAAAAAAAAAT;SOR=1.270;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=23;TCF=12;TCR=11;TR=20;WE=21692174;WS=21692156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr12	21699491	rs3765089	C	G	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=189;ReadPosRankSum=-0.486;SC=TTTCAGTACTCTACTATAGAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=10;WE=21699499;WS=21699481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr12	21711009	rs7967170	C	A	468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=0;PP=363;SC=AAACTGAACCCATTTTCCTTT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=21711017;WS=21710999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	21711111	rs7977474	G	C	4120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=51;PP=2788;SC=TTTAAAGTTCGCCACATGAAC;SOR=1.319;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=89;TCR=51;TR=140;WE=21711119;WS=21711101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr12	21711381	rs7977648	C	T	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.08;ReadPosRankSum=1.093;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr12	21711385	rs7977846	G	C	1172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=24;PP=266;SC=TGATGACTAAGTCTTGTGTGT;SOR=2.985;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=28;WE=21711393;WS=21711371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	21712545	rs1871136	A	G	2144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=25;PP=1344;SC=GAATAGTGAAACCTTAAGTGA;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=47;TCR=25;TR=72;WE=21712553;WS=21712535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr12	21712574	rs1871137	C	T	2892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=58;NR=41;PP=1537;SC=GAAAGCATTTCAAGCACCTAC;SOR=0.951;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=58;TCR=41;TR=99;WE=21712582;WS=21712564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr12	21712728	rs111250042	GACATTCTTTGAAATT	G	1140.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=2957;SC=TTGTTTTGTTGACATTCTTTG;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=10;WE=21712750;WS=21712718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	21713308	rs4639981	T	A	6808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=125;NR=86;PP=2965;SC=CATTCACAGGTTGTGAGATTA;SOR=0.996;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=211;TCF=125;TCR=86;TR=211;WE=21713316;WS=21713298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr12	21713402	rs2306180	T	C	6862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=105;NR=119;PP=2965;SC=AAAAACACCATCACTGTGATG;SOR=1.004;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=224;TCF=105;TCR=119;TR=224;WE=21713410;WS=21713392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr12	21715801	rs1473421	A	G	5755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=118;NR=62;PP=2965;SC=CTTCCCACAGAAGAAAGTTCT;SOR=1.390;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=181;TCF=119;TCR=62;TR=180;WE=21715809;WS=21715791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr12	21715989	rs8192697	C	T	1217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.427;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=35;PP=841;ReadPosRankSum=0.176;SC=CAAAACAAAACCAAACAGTTT;SOR=0.962;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=120;TCF=42;TCR=78;TR=52;WE=21715997;WS=21715979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,55:0.44:126
chr12	21716055	rs1473422	A	C	1352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=25;PP=1107;SC=TTAATGTACAAAGGGGGCTGG;SOR=1.259;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=42;TCF=16;TCR=26;TR=41;WE=21716063;WS=21716045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr12	21716098	rs1473423	T	C	1844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=21;PP=1269;ReadPosRankSum=-0.932;SC=CAATTCTGTTTTCTCTCTACC;SOR=0.475;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=60;TCF=39;TCR=21;TR=59;WE=21716106;WS=21716088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,62:0.98:63
chr12	21727315	rs7963756	C	A	2559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=59;PP=1738;SC=CTTGATTGTGCTCATGGTCCA;SOR=2.102;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=25;TCR=59;TR=84;WE=21727323;WS=21727305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr12	21733121	rs2126887	T	G	183.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=148;SC=TGTCTCAAATTCAATCCATTT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=21733129;WS=21733120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	21757272	rs153944	A	G	150.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=120;SC=TAGCCTAAATATATATTCCGT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=21757280;WS=21757263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	21789968	rs1677134	G	T	281.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=203;SC=AATACAATGCGAGAAATCATA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=21789976;WS=21789958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	21791272	rs1650289	T	C	139.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=9;NR=0;PP=166;SC=TAAAATCAAGTTCCCTTTCAC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=21791280;WS=21791262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	21791410	rs71053332	TA	T	365.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.45;QD=19.25;SOR=4.514;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	21791455	rs1427830	A	T	367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.72;QD=26.27;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	21791565	rs1677129	A	C	81.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=0;NR=3;PP=60;SC=ATAGTTCCCCAAAAAGGCTGA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=21791573;WS=21791555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr12	21794865	rs1626023	A	T	1319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=39;NR=6;PP=1163;SC=ACAAGTAATTATTTCTTTTTT;SOR=3.767;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=46;TCF=39;TCR=7;TR=45;WE=21794877;WS=21794855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr12	21796814	rs4762862	G	A	2944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=28;PP=2002;SC=AATAACAACAGAAACACCAAA;SOR=1.679;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=68;TCR=28;TR=96;WE=21796822;WS=21796804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr12	21797029	rs1650294	A	G	4342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=90;PP=2848;SC=TAGAATTGGCAGTCACAGAAT;SOR=1.491;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=142;TCF=51;TCR=91;TR=141;WE=21797037;WS=21797019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr12	21799999	rs1540405	G	C	9035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=135;NR=159;PP=2965;SC=TCTAGGATGCGTCAGCTCACA;SOR=0.928;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=295;TCF=136;TCR=159;TR=294;WE=21800007;WS=21799989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,329:1.00:329
chr12	21807432	rs1677078	T	C	1523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=9;PP=1064;SC=AAACTGTGTATACATGCTGAA;SOR=2.393;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=40;TCR=9;TR=49;WE=21807440;WS=21807422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr12	21807640	rs1650315	G	A	3553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=51;NR=72;PP=2095;SC=AACATTACACGTATATCTGCA;SOR=1.222;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=51;TCR=72;TR=123;WE=21807648;WS=21807630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr12	21807687	rs7953579	C	G	2101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=46;PP=1326;SC=TAAAATGTTACTGTTGCAATT;SOR=1.704;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=23;TCR=46;TR=69;WE=21807695;WS=21807677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr12	21958998	rs4148680	CA	C	233.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FS=6.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.58;ReadPosRankSum=0.455;SOR=0.271;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,33:0.22:148
chr12	21995555	rs1643235	C	A	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=55;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=92;ReadPosRankSum=-1.383;SC=TCTTCACTCACTTCCCATAGT;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=6;WE=21995563;WS=21995545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr12	22005003	rs2307024	T	G	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-3.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.127;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=243;ReadPosRankSum=-1.234;SC=AATTGGGCTCTGAACTCTTCT;SOR=0.283;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=16;WE=22005011;WS=22004993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr12	22005510	rs704183	A	G	1419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=37;PP=1026;SC=CCTCTCGAAAATAGTAATACA;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=9;TCR=37;TR=46;WE=22005518;WS=22005500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr12	22014161	rs2418018	C	A	62.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr12	22014163	rs2418019	C	T	62.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr12	22014165	rs2418020	C	A	62.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr12	22016004	rs4148670	GA	G	406.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=6.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.43;ReadPosRankSum=-0.326;SOR=0.117;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,22:0.56:39
chr12	22017422	rs697250	A	G	2540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=46;NR=37;PP=1360;SC=CTGCAAGTATAGCAAACAATG;SOR=0.736;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=83;TCF=46;TCR=37;TR=83;WE=22017430;WS=22017412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr12	22017486	rs697251	C	G	1738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=32;PP=953;SC=CGTCAGGTAACAGATACAATA;SOR=1.249;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=24;TCR=32;TR=56;WE=22017494;WS=22017476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr12	22035873	rs1356368	C	T	1253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=37;PP=1806;ReadPosRankSum=-1.081;SC=TTACTGAACACTTACTCACAT;SOR=0.617;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=103;TCF=32;TCR=71;TR=55;WE=22035891;WS=22035863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,56:0.50:112
chr12	22035883	rs1283802	T	G	1136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.883;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=30;PP=1766;ReadPosRankSum=0.926;SC=CTTACTCACATTGCTACCTAA;SOR=0.867;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=86;TCF=24;TCR=62;TR=41;WE=22035891;WS=22035863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,47:0.51:92
chr12	22047151	rs704216	G	T	2666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=50;PP=1722;SC=TGGAAAAAGTGTCACACATGC;SOR=1.485;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=31;TCR=50;TR=81;WE=22047159;WS=22047141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr12	22047174	rs704217	C	T	1776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=38;PP=1146;SC=ACATTCAGTCCTAGAAACCTA;SOR=1.850;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=17;TCR=38;TR=55;WE=22047182;WS=22047164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr12	22063115	rs10770865	A	G	7202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=137;NR=107;PP=2965;SC=CCCATAGATTAGGACACAGGA;SOR=0.831;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=245;TCF=138;TCR=107;TR=244;WE=22063123;WS=22063105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,276:1.00:276
chr12	22063337	rs4148656	A	G	506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=395;SC=CAAACATTTAATTTTTTTGAG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=22063345;WS=22063327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	22063737	rs4762719	G	T	3030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=22;PP=1819;SC=AGGAAACAAAGAGTATTCACA;SOR=1.915;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=69;TCR=22;TR=91;WE=22063757;WS=22063727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr12	22063749	rs4762720	T	C	3784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=39;PP=2436;SC=GTATTCACAGTCTTTACATAC;SOR=1.410;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=79;TCR=39;TR=118;WE=22063757;WS=22063727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr12	22063971	rs4148654	A	G	1308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=30;PP=836;SC=GACCAGGTGTACAGTTTGCAT;SOR=2.833;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=39;TCF=8;TCR=31;TR=38;WE=22063979;WS=22063961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr12	22065699	rs3835048	G	GA	262.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=0;PP=249;SC=TCAATTCTCTGAAAAAAAGCC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=9;WE=22065707;WS=22065696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	22068849	rs3759236	G	T	1213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=30;PP=882;SC=ATATCTCTGTGGCAAGAAAAA;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=10;TCR=30;TR=40;WE=22068857;WS=22068839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr12	22078245	rs2900493	G	C	782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=4;PP=491;SC=ATATTTTAGAGAGCCTCTGAT;SOR=2.147;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=22078253;WS=22078235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr12	22078556	rs2277404	T	C	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.412;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=10;PP=199;ReadPosRankSum=0.626;SC=GAGCTCTGATTCTTAAAATAC;SOR=0.197;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=33;TCF=10;TCR=23;TR=17;WE=22078564;WS=22078546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,20:0.54:37
chr12	22078571	rs2176394	T	A	767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=7;NR=17;PP=424;SC=AAATACAACTTCTGCAAGCCA;SOR=2.147;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=24;WE=22078579;WS=22078561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr12	22078838	rs2277405	T	G	905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=6;PP=688;SC=AAAACAAATATCTCTTTAAGG;SOR=2.621;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=29;WE=22078846;WS=22078828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	22086976	rs6487252	A	C	862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=22;PP=655;SC=GAAACCTTAAAACTTTCTAGA;SOR=3.690;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=25;WE=22086984;WS=22086966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	22089348	rs4586220	G	A	171.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=136;SC=TTGCTTGTTCGTTTCTCACAG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=22089356;WS=22089342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	22354921	rs704219	A	G	3035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.703;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=61;PP=1853;ReadPosRankSum=0.675;SC=TGTGGTTATAAATTTTCATGT;SOR=0.288;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=103;TCF=38;TCR=65;TR=99;WE=22354929;WS=22354911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,110:0.98:112
chr12	22401911	rs4762896	C	T	3250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.424;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=62;PP=2142;ReadPosRankSum=0.252;SC=CATCTTCGTTCGTCACAAACA;SOR=0.743;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=274;TCF=157;TCR=117;TR=143;WE=22401919;WS=22401901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,150:0.51:296
chr12	22440281	rs2287166	A	T	1393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.579;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=42;PP=926;ReadPosRankSum=0.460;SC=TGAGGAGCAGATTCATTCACT;SOR=0.761;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=170;TCF=65;TCR=105;TR=68;WE=22440289;WS=22440271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,71:0.40:178
chr12	22440315	rs2072542	A	G	869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.883;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=32;PP=619;ReadPosRankSum=-0.145;SC=GAGATGTGCCACCTTACCTCA;SOR=0.457;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=107;TCF=26;TCR=81;TR=44;WE=22440323;WS=22440305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,44:0.41:107
chr12	22478425	rs4762904	A	G	1317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.305;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=36;PP=763;ReadPosRankSum=-2.016;SC=AGGGATAAAAATCGATTCCTT;SOR=0.847;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=138;TCF=59;TCR=79;TR=62;WE=22478433;WS=22478415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,67:0.43:155
chr12	22478698	rs4762905	C	A	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.388;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=207;ReadPosRankSum=-0.158;SC=ACAATAATAACTAATAATAAA;SOR=0.144;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=12;WE=22478706;WS=22478688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr12	22489150	rs3809202	A	G	5111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=89;PP=2911;ReadPosRankSum=1.240;SC=GGGAAGGGGGAGCTTTTCCTA;SOR=0.257;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=183;TCF=93;TCR=90;TR=182;WE=22489158;WS=22489140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,202:1.00:203
chr12	22602796	rs2063573	A	G	8031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=142;NR=143;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.745;SC=AAACCACTGCATCACCACTTA;SOR=0.271;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=287;TCF=142;TCR=145;TR=285;WE=22602804;WS=22602786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,311:1.00:312
chr12	22606738	rs12424580	G	C	2382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=34;PP=1548;SC=GGGCTCTAAAGAGCAATTCTC;SOR=1.204;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=50;TCR=34;TR=84;WE=22606746;WS=22606728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr12	22612291	rs148077355	CA	C	157.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.86;ReadPosRankSum=-1.930;SOR=0.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr12	22778701	rs2271098	C	G	2757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.866;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=54;PP=1682;ReadPosRankSum=-1.307;SC=CCCTTCCCGTCGCAGTTGCTC;SOR=0.752;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=283;TCF=158;TCR=125;TR=122;WE=22778709;WS=22778691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,137:0.44:311
chr12	22796994	rs11429701	A	AT	3491.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=47;PP=2296;SC=TTTGAAAAATAGGGCATTTAA;SOR=1.636;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=4;TCR=48;TR=51;WE=22797002;WS=22796984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr12	23689301	rs4636755	T	C	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=87;ReadPosRankSum=-0.210;SC=CAAAATGTCTTTTTGCAACTG;SOR=0.223;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=5;WE=23689309;WS=23689292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr12	23696045	rs76722400	C	T	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=108;ReadPosRankSum=-0.306;SC=GCAAATAACACGACCTGTATG;SOR=1.302;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=7;WE=23696053;WS=23696035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr12	23696116	rs7485662	C	T	1125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.189;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=24;PP=639;ReadPosRankSum=1.846;SC=TTATTCCATACGTCACTTAGT;SOR=0.508;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=128;TCF=77;TCR=51;TR=56;WE=23696124;WS=23696106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,60:0.43:141
chr12	23757245	rs1479452	C	T	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.366;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=174;ReadPosRankSum=0.826;SC=TGCTGGCATACAATAGACATT;SOR=1.552;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=32;TCF=23;TCR=9;TR=13;WE=23757253;WS=23757235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,14:0.40:35
chr12	23915547	rs71059921	G	GA	457.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=4.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQRankSum=-0.454;QD=14.30;ReadPosRankSum=-1.963;SOR=0.595;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,25:0.78:32
chr12	23998888	rs7980561	T	C	7013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=135;NR=110;PP=2965;SC=GGACACAGCATCAACTTTGTT;SOR=0.854;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=245;TCF=135;TCR=110;TR=245;WE=23998896;WS=23998878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr12	24102665	rs141363242	CCT	C	432.90	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQRankSum=0.000;QD=25.46;ReadPosRankSum=0.898;SOR=3.383;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,15:0.88:17
chr12	24103911	rs35800209	GCA	G	370.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.567;NF=0;NR=15;PP=557;ReadPosRankSum=0.915;SC=ACACACGCATGCACACACACA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=15;WE=24103922;WS=24103901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,14:0.88:16
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chr12	24985653	rs3736212	G	A	3143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=52;PP=1770;ReadPosRankSum=-1.173;SC=AATACTTGTCGTACCTCGCCT;SOR=0.682;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=273;TCF=167;TCR=106;TR=135;WE=24985661;WS=24985643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,153:0.50:307
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chr12	25054891	rs2291894	G	A	1347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=31;PP=870;SC=CCTACGTGACGCTCACCATGA;SOR=2.352;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=11;TCR=31;TR=42;WE=25054899;WS=25054881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr12	25147300	rs699030	G	C	3263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=58;PP=1951;SC=TTTCTGAAGAGACTGCATTTG;SOR=1.059;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=107;TCF=49;TCR=58;TR=107;WE=25147308;WS=25147290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr12	25147362	rs1846016	G	A	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=166;ReadPosRankSum=-0.724;SC=GGAGGCCGAGGCAGGCAGATC;SOR=0.481;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=12;WE=25147370;WS=25147352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr12	25148755	rs864161	C	G	9697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=371;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=184;NR=139;PP=2965;SC=AGTATATCCCCAACAGGAATC;SOR=0.940;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=325;TCF=185;TCR=140;TR=323;WE=25148763;WS=25148745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,369:1.00:369
chr12	25149982	rs75288396	G	A	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=73;ReadPosRankSum=0.066;SC=AGCTGAGATCGTGCCACTGCA;SOR=0.368;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=7;WE=25149990;WS=25149972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr12	25242595	rs7969931	C	G	1176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=17;PP=570;SC=ATCGGTTAACCTTAGACAAAG;SOR=0.776;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=23;TCR=17;TR=40;WE=25242603;WS=25242585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr12	25242776	rs10743538	C	T	321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=9;PP=232;SC=CCAGACTCACCTGCTACAGTC;SOR=1.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=14;WE=25242784;WS=25242766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	25243671	rs138692844	T	A	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.291;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=112;ReadPosRankSum=-1.562;SC=TAGGAGAGTATCAGCTATAAA;SOR=0.188;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=10;WE=25243679;WS=25243661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr12	25254710	rs12309185	G	C	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=384;ReadPosRankSum=-0.447;SC=AGGCCACGGGGAGTAACATAT;SOR=1.302;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=17;WE=25254718;WS=25254700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr12	25254732	rs118182225	A	G	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.953;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=204;ReadPosRankSum=-2.623;SC=GTTTCTATAAATCTTACAATA;SOR=0.061;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=13;WE=25254740;WS=25254722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr12	25254790	rs7134445	T	C	1967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.681;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=26;PP=1413;ReadPosRankSum=0.352;SC=AGAATTCTTATTTCAAGAATC;SOR=0.822;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=136;TCF=92;TCR=44;TR=83;WE=25254798;WS=25254780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,86:0.60:144
chr12	25254975	rs7303889	A	C	2439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=57;PP=1510;ReadPosRankSum=0.824;SC=TGTTATGAAGAATGAAATGAA;SOR=0.710;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=185;TCF=75;TCR=110;TR=97;WE=25254983;WS=25254965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,109:0.55:199
chr12	25257182	rs34133737	GA	G	384.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.224;NF=15;NR=0;PP=318;ReadPosRankSum=-1.279;SC=AATGTGCCAAGAAAAAAATAA;SOR=2.400;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=15;WE=25257190;WS=25257172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr12	25257429	rs7316187	C	T	2101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.872;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=60;PP=1358;ReadPosRankSum=-0.201;SC=ATTAACCTGACATGAACTGGG;SOR=0.979;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=156;TCF=54;TCR=102;TR=88;WE=25257437;WS=25257419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,96:0.55:174
chr12	25261735	rs859146	G	T	3041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=61;PP=1831;SC=CTCAGTACATGCTTCAGTAAG;SOR=1.567;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=111;TCF=42;TCR=69;TR=102;WE=25261743;WS=25261725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr12	25343516	rs10842501	C	T	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.064;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=227;ReadPosRankSum=0.209;SC=AGTGATTATACAACTATCTAT;SOR=0.504;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=33;TCR=14;TR=20;WE=25343524;WS=25343506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,26:0.46:56
chr12	25343707	rs10842502	C	T	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=14;PP=292;ReadPosRankSum=-0.030;SC=TGTAACTTTCCTTGCAAATCT;SOR=0.690;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=52;TCF=25;TCR=27;TR=26;WE=25343715;WS=25343697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,30:0.46:65
chr12	25347780	rs73071293	G	A	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=185;ReadPosRankSum=-1.090;SC=TGACAGCTTTGACCATCTCCC;SOR=0.914;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=12;WE=25347788;WS=25347770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr12	25362217	rs9266	A	G	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=16;PP=463;ReadPosRankSum=0.728;SC=CTTTACATTCATCAGGGATGA;SOR=0.769;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=81;TCF=47;TCR=34;TR=38;WE=25362225;WS=25362207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,40:0.45:89
chr12	25368462	rs4362222	C	T	5965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=119;NR=86;PP=2965;SC=GTCGGATCTCCCTCACCAATG;SOR=0.963;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=206;TCF=119;TCR=87;TR=205;WE=25368470;WS=25368452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr12	25368593	.	AT	A	92.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.268;ClippingRankSum=0.000;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=3.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.78;ReadPosRankSum=1.288;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,15:0.29:52
chr12	25378456	rs76433096	T	C	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=58;ReadPosRankSum=-0.180;SC=TTTCCTAGTATAGCATAATTG;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=25378464;WS=25378446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr12	25378869	rs61762369	T	G	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.96;ReadPosRankSum=-1.645;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr12	25388290	rs7133635	G	T	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=15;PP=362;ReadPosRankSum=0.749;SC=CATCAAAGACGGTTGTAGACT;SOR=0.758;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=65;TCF=34;TCR=31;TR=30;WE=25388298;WS=25388280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,34:0.47:73
chr12	25398284	rs121913529	C	A	1487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.398;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=32;PP=823;ReadPosRankSum=1.473;SC=GCCTACGCCACCAGCTCCAAC;SOR=0.489;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=172;TCF=99;TCR=73;TR=71;WE=25398292;WS=25398274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,78:0.42:186
chr12	25671759	rs1479500	T	A	3191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=44;PP=1667;SC=GTTGACCGAGTCCTGGGCTGT;SOR=1.010;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=62;TCR=44;TR=106;WE=25671767;WS=25671749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr12	25673073	.	GATATACATAT	G	836	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MMLQ=25;MQ=63.33;NF=0;NR=12;PP=836;QD=71.8333333333;SC=GCTGTTATGAGATATACATAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=12;WE=25673090;WS=25673063;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr12	25673079	rs1382849	C	T	368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=66.33;QD=28.37;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	25679932	rs1705419	G	A	310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=10;PP=256;SC=CTTCAGATAGGAGTGTCTTTG;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=25679940;WS=25679922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	25699523	rs278990	A	G	3193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=59;PP=1933;SC=GTAACCAGGAAAGAAGTAAAT;SOR=1.188;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=43;TCR=59;TR=102;WE=25699531;WS=25699513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr12	26027207	rs41379251	C	T	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=310;ReadPosRankSum=2.065;SC=GCCTTATATGCTAATACTTTT;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=1;TCR=51;TR=17;WE=26027215;WS=26027197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,19:0.35:55
chr12	26231825	rs11048403	G	C	1184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.201;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=16;PP=676;ReadPosRankSum=1.069;SC=TTTCTAGAAGGTTCTCAAAAA;SOR=0.260;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=85;TCF=58;TCR=27;TR=44;WE=26231851;WS=26231815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,52:0.55:94
chr12	26231843	rs7133685	G	T	3361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=44;PP=2241;SC=AAAAAAAGGCGCTAACCGAAA;SOR=1.061;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=115;TCF=71;TCR=44;TR=114;WE=26231851;WS=26231815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr12	26231898	rs4963952	G	A	4544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=79;PP=2578;SC=TCATGATTATGTATACAAAAA;SOR=0.867;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=151;TCF=72;TCR=79;TR=151;WE=26231906;WS=26231888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr12	26377232	rs34624361	T	C	3596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.492;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=62;PP=2118;ReadPosRankSum=0.950;SC=GCAGGTCTGCTTAGTGGCCTA;SOR=0.734;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=275;TCF=143;TCR=132;TR=145;WE=26377240;WS=26377222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,166:0.53:314
chr12	26492555	rs34679762	A	AT	313.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.519;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.200;NF=0;NR=10;PP=192;ReadPosRankSum=0.491;SC=CAAAAAAGGGATTTTTTTAAA;SOR=0.420;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=10;WE=26492563;WS=26492545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr12	26553032	rs12817771	C	G	1396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.812;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=24;PP=810;ReadPosRankSum=-1.542;SC=AGATGTGCTCCTTGAAAAAAT;SOR=0.960;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=144;TCF=84;TCR=60;TR=64;WE=26553040;WS=26553022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,72:0.45:160
chr12	26568456	rs66797056	TAAGAAAAGA	T	1234.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.382;NF=0;NR=22;PP=2968;ReadPosRankSum=0.247;SC=AAAACACTAATAAGAAAAGAA;SOR=0.588;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=0;TCR=51;TR=22;WE=26568472;WS=26568446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,33:0.52:63
chr12	26581306	rs4963995	G	A	3260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=54;NR=45;PP=1673;SC=TCATATGAGGGTGATTTGCTA;SOR=0.760;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=99;TCF=54;TCR=45;TR=99;WE=26581314;WS=26581296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr12	26592288	rs2270960	G	A	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=315;ReadPosRankSum=0.217;SC=TTAGCCTTTCGGACACCTCAG;SOR=0.681;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=3;TCR=39;TR=16;WE=26592296;WS=26592278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,21:0.42:50
chr12	26596618	rs2220406	C	T	4243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=87;PP=2802;SC=TTTAGGTCTTCTTTTCCCCTT;SOR=1.304;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=53;TCR=87;TR=140;WE=26596626;WS=26596608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr12	26703459	rs11048575	T	G	72.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=51;SC=AAATTTTGTATTACAACACAT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=26703467;WS=26703449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr12	26709497	.	T	TTG	40	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;FR=0.5000;HP=10;HapScore=2;MGOF=28;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=40;QD=12.25;SC=CTATTTTTTTTTTTGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=4;WE=26709505;WS=26709487;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,4:0.36:11
chr12	26732987	rs2230376	G	A	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.109;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=21;PP=480;ReadPosRankSum=1.330;SC=TGTCTGAAAAGGGAGAATTAA;SOR=1.209;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=83;TCF=41;TCR=42;TR=35;WE=26732995;WS=26732977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,36:0.40:90
chr12	26733062	rs2230375	T	C	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=12;PP=244;ReadPosRankSum=-1.188;SC=TGTCTGCATGTTTCCTGTCTG;SOR=0.782;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=67;TCF=32;TCR=35;TR=22;WE=26733070;WS=26733052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,27:0.36:74
chr12	26749831	rs2230377	G	A	1725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=33;PP=909;ReadPosRankSum=1.432;SC=GGATGCAGTCGTCATGGGTCA;SOR=0.682;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=138;TCF=78;TCR=60;TR=76;WE=26749839;WS=26749821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,85:0.54:158
chr12	26752897	rs12832680	C	T	649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=4;PP=306;SC=ACTAGAAATACTAGAAGCCAC;SOR=1.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=17;WE=26752905;WS=26752887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	26755486	rs10842758	T	C	2316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=55;PP=1702;ReadPosRankSum=-0.657;SC=AAGTATAATATATAAGCAAAA;SOR=0.664;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=152;TCF=66;TCR=86;TR=95;WE=26755494;WS=26755476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,95:0.60:158
chr12	26755546	rs3736185	C	T	1510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.564;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=29;PP=934;ReadPosRankSum=0.186;SC=TTGTATCTGCCGACCTCCTTT;SOR=0.745;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=155;TCF=88;TCR=67;TR=69;WE=26755554;WS=26755536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,74:0.43:172
chr12	26777379	rs2880875	T	C	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=330;ReadPosRankSum=-0.880;SC=GTGAAAATATTTTTGTCTTCA;SOR=1.022;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=16;WE=26777387;WS=26777369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr12	26784850	rs2230372	G	A	2441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.265;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=61;PP=1575;ReadPosRankSum=1.305;SC=TCACATCCTCGTGCTCGGTGG;SOR=0.881;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=213;TCF=105;TCR=108;TR=111;WE=26784858;WS=26784840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,119:0.51:235
chr12	26809177	rs2880877	C	T	2616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=29;PP=1532;SC=AGACATTTGACGTGGAGTTCA;SOR=1.402;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=60;TCR=29;TR=89;WE=26809185;WS=26809167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr12	26809316	rs2230379	G	A	1615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.264;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=39;PP=995;ReadPosRankSum=2.228;SC=CCCGGTCAACGTGCATGTGGA;SOR=0.719;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=181;TCF=97;TCR=84;TR=77;WE=26809324;WS=26809306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,83:0.42:198
chr12	26810777	rs2291264	T	C	7362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=128;NR=130;PP=2965;SC=CAATGTCATCTGAAAGGATGG;SOR=0.766;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=259;TCF=129;TCR=130;TR=258;WE=26810785;WS=26810767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,282:1.00:282
chr12	26810816	rs2291263	T	G	2341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.043;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=53;PP=1492;ReadPosRankSum=0.426;SC=CTGCTTGCATTGAGACCACCC;SOR=0.803;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=205;TCF=93;TCR=112;TR=94;WE=26810824;WS=26810806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,107:0.48:221
chr12	26812245	rs2306549	G	A	1449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.440;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=39;PP=911;ReadPosRankSum=-0.221;SC=CTGTCAGAATGCACTGCCAAA;SOR=0.841;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=118;TCF=48;TCR=70;TR=63;WE=26812253;WS=26812235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,67:0.53:126
chr12	26816496	rs1375656	T	C	2231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=18;PP=1421;SC=TTGCCCAACATAAAATATTTC;SOR=1.923;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=53;TCR=18;TR=71;WE=26816504;WS=26816486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr12	26816831	rs2306548	C	T	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.90;ReadPosRankSum=-2.119;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr12	26819095	rs34107444	A	ATAGATAGATAGATAGAT	106.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.78;QD=17.81;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	26834804	rs111626763	T	TACTC	5257.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=27;PP=2918;SC=TTTAAAGAGTTACCTCCTTTC;SOR=2.033;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=74;TCF=43;TCR=31;TR=67;WE=26834812;WS=26834794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr12	26835085	rs10842774	T	G	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.48;BaseQRankSum=2.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=74;ReadPosRankSum=-0.095;SC=CCGAACACAGTAACTCCCACA;SOR=0.425;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=6;WE=26835093;WS=26835075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr12	26835427	rs3830262	ATG	A	4528.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=1.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.731;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=36;PP=2820;ReadPosRankSum=-1.087;SC=TATAAGGAACATGTGTCACAC;SOR=0.949;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=153;TCF=63;TCR=90;TR=66;WE=26835436;WS=26835417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,119:0.49:242
chr12	26839591	rs374123712	A	G	1291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.478;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=36;PP=859;ReadPosRankSum=-0.530;SC=AAGTTTATTTACTTTTATCAC;SOR=0.487;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=111;TCF=41;TCR=70;TR=58;WE=26839599;WS=26839568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,61:0.52:117
chr12	26848410	rs1982385	A	C	378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=0;PP=295;SC=TTACCTGTGAACCATAGGCTC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=26848418;WS=26848400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	26848663	rs3830260	A	AT	1738.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=26;PP=1295;SC=AATTCAATTAATATTCTATCC;SOR=1.708;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=29;WE=26848671;WS=26848653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr12	27059149	rs1488053	C	T	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=178;ReadPosRankSum=1.947;SC=TAATAAAAAACTGCTGATTAT;SOR=0.776;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=13;WE=27059157;WS=27059139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr12	27059224	rs1488052	G	A	3269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=71;NR=37;PP=1895;SC=TTGACAATAAGTAACACAAAC;SOR=1.236;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=71;TCR=37;TR=108;WE=27059232;WS=27059214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr12	27059422	rs1488051	T	C	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=134;ReadPosRankSum=-1.689;SC=TAATTTATTATTTCCAAATTT;SOR=0.098;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=10;WE=27059430;WS=27059412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr12	27064232	rs3210635	C	T	1193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.350;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=30;PP=679;ReadPosRankSum=-1.886;SC=CTTTTCCACGCTCTAAGATTC;SOR=0.484;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=117;TCF=44;TCR=73;TR=51;WE=27064240;WS=27064222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,58:0.44:132
chr12	27066350	rs3736227	C	T	1731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=21;PP=1004;ReadPosRankSum=0.614;SC=TGTGATATAACAAAAGGCACC;SOR=0.716;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=127;TCF=87;TCR=40;TR=71;WE=27066358;WS=27066340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,78:0.56:139
chr12	27075705	rs7137176	A	T	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.092;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=91;ReadPosRankSum=-0.484;SC=TTAATTATTCATTTGCTTTTT;SOR=0.293;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=8;WE=27075713;WS=27075695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr12	27081097	rs16931479	T	C	746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=10;PP=410;ReadPosRankSum=-1.278;SC=CATATATCTATCCACATGAAC;SOR=0.765;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=69;TCF=45;TCR=24;TR=33;WE=27081105;WS=27081087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,36:0.49:73
chr12	27081566	rs2029309	C	G	486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=0;PP=427;SC=GCTGTCTCTACTATTCTGAAA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=27081574;WS=27081558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	27081873	rs2029310	G	A	1017.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.490;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=21;PP=434;ReadPosRankSum=-0.829;SC=GTTGACAAGAGTATGTGCAAT;SOR=0.306;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=95;TCF=35;TCR=60;TR=40;WE=27081881;WS=27081863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,51:0.48:106
chr12	27087349	rs140460865	G	A	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.769;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=20;ReadPosRankSum=0.742;SC=CCTAGAATGGGGATAGCTGTT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=3;WE=27087357;WS=27087339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr12	27087703	rs708158	T	C	142.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=4;PP=113;SC=ATGTGTAGTATATGCCAGGTG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=27087711;WS=27087693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	27089806	rs11611563	A	C	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=185;ReadPosRankSum=2.585;SC=CATTTTTTCTAATTTTCTCAA;SOR=1.214;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=9;WE=27089814;WS=27089796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr12	27128594	rs5797208	G	GT	9170.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=92;PP=2979;SC=ATGTTCAGCTGTGGAAGAGTG;SOR=1.025;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=108;TCF=14;TCR=94;TR=106;WE=27128602;WS=27128584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
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chr12	27143632	rs35719635	C	T	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=218;ReadPosRankSum=-0.628;SC=ATCCCACCTACGTGTAATATT;SOR=0.914;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=10;WE=27143640;WS=27143622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr12	27152666	rs7314394	T	C	2963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=45;NR=57;PP=1482;SC=CATAAATTACTGAGCTGATCC;SOR=1.093;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=45;TCR=58;TR=102;WE=27152674;WS=27152656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr12	27175494	rs3963548	T	C	2537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=32;PP=1400;SC=TTTTGGCGTCTGTTTGCTGCG;SOR=1.216;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=85;TCF=53;TCR=32;TR=84;WE=27175502;WS=27175484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr12	27175640	rs1872191	A	G	4684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=75;PP=2965;SC=GCAAAACTTGAAAGTGGGGAG;SOR=0.717;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=154;TCF=78;TCR=76;TR=153;WE=27175648;WS=27175630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr12	27179551	rs145100138	CTTATT	C	237.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=230;ReadPosRankSum=1.615;SC=AGAAATTCAGCTTATTTTATT;SOR=0.859;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=6;WE=27179563;WS=27179541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr12	27181513	rs8628	T	G	561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.715;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=390;ReadPosRankSum=1.287;SC=TATGACACATTACCTTTTTAG;SOR=0.351;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=50;TCF=12;TCR=38;TR=25;WE=27181521;WS=27181503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,26:0.45:58
chr12	27182956	rs111936388	A	T	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.017;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=10;PP=252;ReadPosRankSum=0.452;SC=TGTATAGGGTAAATATAATAG;SOR=0.502;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=52;TCF=31;TCR=21;TR=23;WE=27182964;WS=27182946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,26:0.45:58
chr12	27234200	rs708165	T	C	2544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.046;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=53;PP=1611;ReadPosRankSum=-0.188;SC=GATGGGGACTTTTGGTGGCAT;SOR=0.772;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=189;TCF=90;TCR=99;TR=100;WE=27234208;WS=27234190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,114:0.53:215
chr12	27234505	rs34457591	A	T	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=322;ReadPosRankSum=1.365;SC=AAAATAGCCCAAGTGTCAATG;SOR=0.504;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=19;WE=27234513;WS=27234495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr12	27234999	rs708167	T	C	2177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.064;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=40;PP=1480;ReadPosRankSum=-1.645;SC=TCTAGAAATATCTGAAACTCT;SOR=0.909;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=197;TCF=109;TCR=88;TR=95;WE=27235007;WS=27234989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,104:0.49:214
chr12	27235381	rs708168	G	A	899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.679;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.240;NF=25;NR=22;PP=607;ReadPosRankSum=0.310;SC=TGGAGCTGTCGTCCTCTATGT;SOR=0.614;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=118;TCF=67;TCR=51;TR=47;WE=27235389;WS=27235371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,47:0.37:126
chr12	27300420	rs841618	T	C	1419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=7;PP=960;SC=TATGCTCTCTTAATGTTCCTT;SOR=2.935;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=41;WE=27300428;WS=27300410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr12	27461984	rs6487599	T	C	502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=4;PP=310;SC=TTAAGGGAAGTTACTTTTCTT;SOR=1.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=16;WE=27461992;WS=27461974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	27470682	rs2242185	C	T	932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=8;PP=608;SC=TTATTAGCAACGTGATTGTAA;SOR=2.049;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=31;WE=27470690;WS=27470672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr12	27470788	rs10771336	C	T	1426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.370;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=26;PP=767;ReadPosRankSum=0.491;SC=CTTCACTGCTCACAAAGCTGA;SOR=0.455;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=106;TCF=61;TCR=45;TR=59;WE=27470796;WS=27470778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,66:0.56:118
chr12	27470866	rs6487601	G	A	6046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=111;NR=92;PP=2965;SC=CTCAAGAAACGTACAGAAAAG;SOR=0.785;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=204;TCF=111;TCR=93;TR=203;WE=27470874;WS=27470856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr12	27485974	rs71524338	G	C	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=4;PP=84;ReadPosRankSum=0.937;SC=TGCCAGCCGCGGGGCTGCGGA;SOR=0.777;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=19;TCF=10;TCR=9;TR=9;WE=27485982;WS=27485964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr12	27486168	rs62758860	GA	G	125	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=4;PP=131;SC=TCTCGGGCCGGAGCATCGCCT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=27486176;WS=27486158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr12	27521075	.	CT	C	83	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MMLQ=27;MQ=60.83;NF=3;NR=0;PP=83;QD=44.0102999566;SC=AGCGCCTGGCCTTAGCTGGTA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=3;WE=27521083;WS=27521065;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:3,3:0.50:6
chr12	27529219	rs4964059	A	C	925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.525;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=7;PP=650;ReadPosRankSum=1.072;SC=CTATTTCTCTATCAAGAACTA;SOR=1.194;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=61;TCF=47;TCR=14;TR=35;WE=27529227;WS=27529209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,37:0.55:67
chr12	27533367	rs4964060	A	G	5828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=121;PP=2965;SC=CCACACTTCGATAAGTGAAAT;SOR=1.283;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=199;TCF=78;TCR=121;TR=199;WE=27533375;WS=27533357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr12	27540087	rs140557984	ATG	A	38.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=2.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.02;ReadPosRankSum=0.994;SOR=0.145;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,5:0.13:38
chr12	27553794	rs2927028	C	T	76.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=0;NR=7;PP=181;SC=GCTAGTTTTTCTTTTTCTTTT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=7;WE=27553802;WS=27553784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr12	27569025	rs1256955	G	T	354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=304;SC=TTTAAGTGGCGTTGTGGAATA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=27569033;WS=27569015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	27623433	rs35052632	G	GT	558.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=0;PP=684;SC=TGAACAGCCAGTTGAAAGGGG;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=17;WE=27623441;WS=27623423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	27623490	rs776199	A	G	1982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=13;PP=1220;SC=TCTGGTGTCAATGAAGAGGAT;SOR=2.483;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=47;TCR=13;TR=60;WE=27623498;WS=27623480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr12	27623558	rs395098	C	T	2462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.462;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=40;PP=1393;ReadPosRankSum=-0.027;SC=CTTACAGTGCCGAAGAAATGG;SOR=0.730;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=213;TCF=123;TCR=90;TR=99;WE=27623566;WS=27623548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,119:0.48:249
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chr12	27627805	rs411816	G	A	5909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=108;PP=2965;ReadPosRankSum=0.816;SC=ACCCTCAAGCGTCTACATCTC;SOR=0.441;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=193;TCF=84;TCR=109;TR=192;WE=27627813;WS=27627795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,222:1.00:223
chr12	27647420	.	T	TTTA	91.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=18.35;ReadPosRankSum=-1.282;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr12	27654898	rs61731840	C	T	1576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=12;PP=953;SC=ATGTCCTCACCGTCACTGGAC;SOR=1.919;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=37;TCR=12;TR=49;WE=27654906;WS=27654888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr12	27786115	rs3751231	C	T	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.116;NF=15;NR=2;PP=290;ReadPosRankSum=-0.333;SC=TTAACTGATACAGGTATCGCA;SOR=0.395;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=39;TCF=36;TCR=3;TR=17;WE=27786123;WS=27786105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,16:0.41:39
chr12	27788021	rs2075378	G	A	1919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.519;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=42;PP=1057;ReadPosRankSum=-0.980;SC=CAGCAGAAACGCTTGTTGAAT;SOR=0.771;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=178;TCF=89;TCR=89;TR=84;WE=27788029;WS=27788011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,94:0.47:201
chr12	27800503	rs7959186	T	C	219.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=0;PP=214;SC=AATAGGAATGTGAGGGACCAC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=27800511;WS=27800500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	27800576	rs34792131	C	CT	1028.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.351;HP=7;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=13;PP=703;ReadPosRankSum=-1.627;SC=AGGATCATTCCTTTTTTTGTT;SOR=0.276;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=67;TCF=40;TCR=27;TR=31;WE=27800584;WS=27800566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,44:0.60:73
chr12	27800746	rs2194816	G	T	3271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=78;PP=2247;SC=CAGAGAGAAGGTGAATGCCAC;SOR=1.797;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=114;TCF=35;TCR=79;TR=113;WE=27800754;WS=27800736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr12	27807906	rs7979973	G	A	631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=11;PP=448;SC=TTGAATTTAAGCACCACTGAT;SOR=0.874;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=10;TCR=11;TR=21;WE=27807914;WS=27807896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr12	27811649	rs10771354	G	T	312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=199;SC=TTAGATTTCCGTTATTTTAGG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=27811657;WS=27811639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	27813754	rs7132997	A	G	1272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=14;PP=765;SC=TGGAGAGTAAATAACTTCTTA;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=30;TCR=14;TR=44;WE=27813762;WS=27813744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr12	27813903	rs7133222	C	T	2269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=43;NR=31;PP=1421;SC=TTTAAATATACGTGTGGATGT;SOR=0.818;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=43;TCR=31;TR=74;WE=27813911;WS=27813893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr12	27813961	rs7133231	A	G	2104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=35;PP=1166;SC=GAGCTATGCCATTTTAAAAGA;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=69;TCF=34;TCR=35;TR=69;WE=27813989;WS=27813951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr12	27813973	rs7133328	C	T	3214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.44;SOR=0.992;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr12	27813981	rs7133545	G	C	3076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.59;SOR=0.980;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr12	27814085	rs6487629	C	T	304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=251;SC=CCTGCCCCCACGAATTCAGAA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=27814093;WS=27814075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	27817408	rs34613698	CT	C	3529.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.028;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.888;NF=14;NR=49;PP=2152;ReadPosRankSum=0.636;SC=AGTTTTTCTACTTTGGTTGAC;SOR=0.600;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=127;TCF=23;TCR=104;TR=63;WE=27817416;WS=27817398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,120:0.53:225
chr12	27820302	rs2033024	C	T	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=21;PP=436;ReadPosRankSum=0.757;SC=GACTGTGTTACTGAAAAGTTA;SOR=0.793;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=51;TCF=16;TCR=35;TR=30;WE=27820310;WS=27820292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,30:0.55:55
chr12	27826780	rs2052673	T	G	3530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.35;SOR=0.957;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr12	27832308	rs10743607	G	A	430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=1;PP=317;SC=CTCTTTGTAAGTCACTGATTA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=27832316;WS=27832298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	27845924	rs3764010	C	T	1249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=36;PP=976;SC=TTTGTTGTTCCAACTTCTGCT;SOR=4.565;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=3;TCR=36;TR=39;WE=27845932;WS=27845914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr12	27849795	rs929948	C	T	2161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FS=0.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.26;ReadPosRankSum=1.055;SOR=0.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,91:0.56:163
chr12	27849795	.	CA	TG	1329	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=41;NR=38;PP=1329;QD=17.4995933527;SC=TTTGGGGATCCAACAAGCAAA;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=147;TCF=78;TCR=69;TR=79;WE=27849804;WS=27849785;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:68,79:0.54:147
chr12	27849796	rs929949	A	G	6210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.19;SOR=0.729;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr12	27867706	rs11049106	C	T	1556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.351;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=24;PP=1008;ReadPosRankSum=0.428;SC=TTATCTTTTACGTACAGCGGA;SOR=0.832;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=135;TCF=88;TCR=47;TR=74;WE=27867714;WS=27867696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,75:0.52:144
chr12	27915718	rs10842975	A	T	1711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.554;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=26;PP=1027;ReadPosRankSum=-0.298;SC=ATTTGCAAGGATCCTGATTTT;SOR=0.614;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=172;TCF=117;TCR=55;TR=81;WE=27915726;WS=27915708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,87:0.45:193
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chr12	28724216	rs6487691	T	C	3817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=76;NR=50;PP=2243;SC=TACTACTGTATATCCTTCTTG;SOR=1.011;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=77;TCR=51;TR=126;WE=28724233;WS=28724206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr12	28726042	rs6487692	C	T	1047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=7;PP=692;SC=TAAAAAAAGGCTTTAGCACCG;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=36;WE=28726050;WS=28726032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr12	28732601	rs150882957	A	C	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=3.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=29;ReadPosRankSum=1.892;SC=TAAATTGTCTATAAGTTATTC;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=3;WE=28732609;WS=28732599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr12	29423460	rs2216854	G	A	4381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=80;PP=2621;ReadPosRankSum=1.644;SC=GCAAAGTGCTGATGGAGAAGC;SOR=0.439;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=144;TCF=63;TCR=81;TR=143;WE=29423468;WS=29423450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,157:0.99:158
chr12	29423583	rs2194519	A	G	541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=15;PP=390;SC=TATGCCTTATAGGAAAGCGTG;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=29423591;WS=29423573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	29444284	rs7972032	G	A	4601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=62;PP=2795;SC=TACTGAGCCAGGGTCTCTGAG;SOR=0.902;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=146;TCF=84;TCR=62;TR=146;WE=29444292;WS=29444274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr12	29446477	rs10679359	T	TA	1284.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.636;HP=9;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.481;NF=3;NR=38;PP=802;ReadPosRankSum=0.828;SC=ATAGTTTCTGTAAAAAAAAAG;SOR=1.781;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=53;TCF=3;TCR=50;TR=41;WE=29446485;WS=29446466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,50:0.94:53
chr12	29462224	rs6487807	C	G	3984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=82;PP=2512;SC=TAACAAAATTCTTAGTGCTGG;SOR=1.267;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=49;TCR=82;TR=131;WE=29462232;WS=29462214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr12	29485449	rs10743656	G	A	2080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=13;PP=1115;SC=AAGGTCACTCGTCTATGTAGA;SOR=1.842;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=46;TCR=13;TR=59;WE=29485457;WS=29485439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr12	29486745	rs1052583	T	C	2532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=56;PP=1695;SC=TAGCCATCGCTTTTTATCTGG;SOR=1.662;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=29;TCR=56;TR=85;WE=29486753;WS=29486735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr12	29496224	rs3782511	G	A	4547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=67;NR=87;PP=2956;SC=TCCTAAAAGGGAGGCAAAAGG;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=154;TCF=67;TCR=87;TR=154;WE=29496232;WS=29496214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr12	29502236	rs3764953	T	C	113.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=87;SC=AGGATAATAATACAGTATTTT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=29502244;WS=29502226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr12	29524365	rs3214493	TA	T	3143.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=17;PP=2591;SC=AATTCATTGATAAATTCTTCC;SOR=2.636;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=74;TCF=51;TCR=23;TR=65;WE=29524373;WS=29524355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr12	29586810	.	C	CA	339.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.379;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=2.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.18;ReadPosRankSum=-0.289;SOR=2.066;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,16:0.76:21
chr12	29593768	rs66808023	GA	G	1495.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=34;PP=1493;SC=TTAGCAATTGGATTTTTTACC;SOR=2.670;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=35;WE=29593776;WS=29593758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr12	29604392	rs1347570	C	G	5627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=113;NR=74;PP=2965;SC=ATACTGCTTGCTGAAACTCTG;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=189;TCF=114;TCR=75;TR=187;WE=29604400;WS=29604382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr12	29607931	rs2060570	T	C	1880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=22;NR=40;PP=1194;SC=TAGTGGGCACTAAAGCAGCCA;SOR=1.644;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=63;TCF=22;TCR=41;TR=62;WE=29607939;WS=29607921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr12	29608449	rs1369904	T	C	640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=16;PP=453;SC=TTTAATTCCTTAAAGATTTGT;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=21;WE=29608457;WS=29608439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr12	29617643	rs117893886	G	A	4547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=85;PP=2656;SC=CACCTGTATCGGTGGCAAGTA;SOR=1.264;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=146;TCF=61;TCR=85;TR=146;WE=29617651;WS=29617633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr12	29628016	rs2043623	G	A	2428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=36;PP=1368;SC=TGGTAAATCTGGCCTTGAAGC;SOR=0.784;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=78;TCF=41;TCR=37;TR=77;WE=29628024;WS=29628006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr12	29630081	rs7975356	G	A	7783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=153;NR=107;PP=2965;SC=ATGACACCTTGTGTTACTGGG;SOR=1.001;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=260;TCF=153;TCR=107;TR=260;WE=29630089;WS=29630071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,287:1.00:287
chr12	29639186	rs3847680	T	C	2448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.397;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=52;PP=1527;ReadPosRankSum=0.926;SC=CACATACCCTTTCCTCTCTGG;SOR=0.475;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=212;TCF=119;TCR=93;TR=108;WE=29639194;WS=29639176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,118:0.50:237
chr12	29642542	rs967182	C	T	1143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.746;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=19;PP=499;ReadPosRankSum=0.563;SC=GGCTGGTTTACACTTTTGTAC;SOR=0.763;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=90;TCF=51;TCR=39;TR=48;WE=29642559;WS=29642532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,57:0.56:102
chr12	29642573	rs967181	A	C	1189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.802;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=20;PP=592;ReadPosRankSum=-0.545;SC=TCCATTCCCCAATCAGGGAAG;SOR=0.590;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=88;TCF=46;TCR=42;TR=48;WE=29642581;WS=29642563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,57:0.58:99
chr12	29648191	rs10492374	T	G	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.007;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=225;ReadPosRankSum=-0.863;SC=CCACTGCATTTTTAATATTCT;SOR=1.368;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=12;WE=29648199;WS=29648181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,13:0.37:35
chr12	29648275	rs10843438	G	A	1803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.552;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=27;PP=1148;ReadPosRankSum=0.326;SC=ATATATTCACGGCTGTTGTAT;SOR=0.745;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=159;TCF=105;TCR=54;TR=78;WE=29648283;WS=29648265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,87:0.47:184
chr12	29650361	rs10771544	A	C	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.598;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=114;ReadPosRankSum=-0.218;SC=AATGCAAAAAATTTCAAAAAG;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=7;WE=29650369;WS=29650351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr12	29650702	rs822879	C	T	1562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=43;PP=1200;SC=CGCCCTTTATCCCCTCCTGCG;SOR=3.258;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=8;TCR=43;TR=51;WE=29650710;WS=29650692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr12	29667659	rs299438	G	A	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=-0.594;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=118;ReadPosRankSum=-0.101;SC=GACAATCAAAGTACAATTCTT;SOR=1.445;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=7;WE=29667667;WS=29667649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr12	29667680	rs299437	A	G	31.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.967;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr12	29721945	rs2254945	C	T	742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.056;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=15;PP=299;ReadPosRankSum=-2.523;SC=GTGAGAGCTGCCCCTCACAGC;SOR=0.481;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=49;TCF=19;TCR=30;TR=26;WE=29721953;WS=29721935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,34:0.58:59
chr12	29722008	rs137900546	C	T	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.754;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=33;ReadPosRankSum=0.265;SC=AGGGTTTTGACATTTTTCTTT;SOR=1.675;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=4;WE=29722016;WS=29721998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,4:0.21:19
chr12	29736480	rs2113879	A	G	686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.939;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=21;PP=443;ReadPosRankSum=0.539;SC=TGCTCAGTCCATGCACAAAAA;SOR=0.824;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=67;TCF=21;TCR=46;TR=30;WE=29736488;WS=29736470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,33:0.46:72
chr12	29736523	rs2288230	G	T	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=133;ReadPosRankSum=-0.148;SC=AAACAGGGTGGAAGGAACGGG;SOR=0.646;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=11;WE=29736531;WS=29736513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr12	29813709	.	G	GTA	26	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;FR=0.4998;HP=4;HapScore=3;MGOF=4;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=26;QD=15.5;SC=TATTTCAAAAGTATATATATA;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=10;TCF=5;TCR=5;TR=2;WE=29813718;WS=29813699;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:8,2:0.20:10
chr12	29920745	rs35316467	G	GTA	434.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-1.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.174;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=353;ReadPosRankSum=0.049;SC=ATATTTACATGTATATATATG;SOR=0.091;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=15;WE=29920753;WS=29920735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr12	29920790	rs148049141	C	CACAT	2016.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.773;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=3.193;NF=23;NR=10;PP=1480;ReadPosRankSum=0.735;SC=TACATACACACATTCATATTC;SOR=0.915;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=65;TCF=41;TCR=24;TR=33;WE=29920798;WS=29920780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,52:0.52:100
chr12	29921074	rs302316	A	G	642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=19;PP=521;SC=CACAAGGAACACAGACGGAAT;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=29921082;WS=29921064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr12	29936613	rs184221	T	G	1044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.48;SOR=0.843;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr12	30787228	rs10843797	C	T	1324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.762;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=41;PP=985;ReadPosRankSum=-1.107;SC=CCTCTGTGAACCCATTAATTA;SOR=0.837;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=113;TCF=33;TCR=80;TR=57;WE=30787236;WS=30787218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,58:0.50:117
chr12	30809492	rs7974489	G	A	227.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=183;SC=TCCAAAAATTGAAGTGATTAT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=30809500;WS=30809482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	30814043	rs67741303	CTATTA	C	357.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.316;NF=4;NR=2;PP=209;ReadPosRankSum=-1.151;SC=TTAAATGCTACTATTATATCA;SOR=0.732;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=6;WE=30814055;WS=30814033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr12	30814259	rs10771753	C	T	1035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=23;PP=566;ReadPosRankSum=-0.820;SC=CCCCGCTTTACAAAAGTTAGC;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=96;TCF=48;TCR=48;TR=47;WE=30814267;WS=30814249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,53:0.50:106
chr12	30815157	rs2118780	A	T	745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=0;PP=599;SC=AATGTTGTTAAGCAGCACATG;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=30815165;WS=30815147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	30815503	rs73077877	T	A	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=124;ReadPosRankSum=2.063;SC=CAAGGTCAAGTGACCCAGGGT;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=7;WE=30815511;WS=30815493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr12	30818081	rs10843807	A	G	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.810;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=137;ReadPosRankSum=1.114;SC=AGGTCAATTTATCCAAAAAAC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=7;WE=30818089;WS=30818071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr12	30818406	rs10843808	T	G	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=90;ReadPosRankSum=-1.068;SC=TATTACCTTATATCAGTTTGA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=5;WE=30818414;WS=30818396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr12	30823971	rs1054426	A	G	3966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=91;PP=2374;ReadPosRankSum=2.072;SC=ATGCTTGCTGAAGAACACGGG;SOR=0.670;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=297;TCF=123;TCR=174;TR=158;WE=30823979;WS=30823961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,181:0.55:329
chr12	30827086	rs2289301	G	C	442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=301;SC=AAATATAGTCGCTTATTCAAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=30827094;WS=30827076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	30829377	rs17560141	C	A	1560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=26;PP=914;ReadPosRankSum=-1.533;SC=ATCAGTCTACCGCAAACATTC;SOR=0.671;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=151;TCF=93;TCR=58;TR=68;WE=30829385;WS=30829367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,76:0.46:165
chr12	30841200	rs6487931	C	T	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=193;ReadPosRankSum=-0.521;SC=GCAGACCAAACATTCAAATTT;SOR=0.560;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=15;WE=30841208;WS=30841190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
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chr12	30872178	rs73079962	G	A	816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-5.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.375;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=23;PP=475;ReadPosRankSum=0.761;SC=GAGAAATGCAGCATCAGCCAA;SOR=0.155;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=50;TCF=11;TCR=39;TR=32;WE=30872186;WS=30872168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,36:0.65:55
chr12	30877391	rs7299800	G	T	1157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.664;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=25;PP=577;ReadPosRankSum=1.422;SC=GACTCCTAAAGATATGATTTT;SOR=0.341;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=111;TCF=45;TCR=66;TR=49;WE=30877399;WS=30877381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,58:0.46:126
chr12	30878859	rs7304879	G	C	850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=2;PP=567;SC=CCAGTCAGAAGCCCCATGAAT;SOR=3.767;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=23;WE=30878867;WS=30878849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr12	30879088	rs10843822	T	C	1040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.689;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=29;PP=643;ReadPosRankSum=0.208;SC=TAGGAAACAGTTTATCACTAC;SOR=0.932;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=90;TCF=34;TCR=56;TR=42;WE=30879096;WS=30879078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,46:0.44:105
chr12	30881809	rs2304630	T	C	5603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=100;PP=2965;SC=TCGCTCTGCATGGAAGGTGTC;SOR=0.871;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=190;TCF=90;TCR=100;TR=190;WE=30881817;WS=30881799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr12	30886435	rs11613738	G	A	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=287;ReadPosRankSum=0.294;SC=CATTCTCCCAGTGAATATAGT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=13;WE=30886443;WS=30886430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr12	30906358	rs17688567	G	A	782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.676;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=18;PP=537;ReadPosRankSum=-0.846;SC=GCTTGGGAAGGAGATGCAGCA;SOR=0.388;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=97;TCF=59;TCR=38;TR=39;WE=30906366;WS=30906348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,43:0.39:109
chr12	30948848	rs256653	G	C	3126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=56;NR=42;PP=1744;SC=TCCTTCCCCTGCCCCCATTCC;SOR=0.746;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=56;TCR=42;TR=98;WE=30948856;WS=30948838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr12	30949206	rs256654	A	G	1028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=29;PP=809;SC=CATCCTCTCGATGGCCGCGCC;SOR=2.432;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=8;TCR=29;TR=37;WE=30949214;WS=30949196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	31116745	rs11051187	C	T	2125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=15;PP=1297;SC=TGCTCTAACCCGGTGGTCTCC;SOR=1.949;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=50;TCR=15;TR=65;WE=31116753;WS=31116735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr12	31131712	rs35097	T	C	1285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=31;PP=986;SC=TCCCCCTACATATCTGCATCC;SOR=2.476;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=41;WE=31131720;WS=31131702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr12	31132479	rs35096	A	C	3018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=66;NR=32;PP=2007;SC=GCTGATGGGGACTTCGCTCCT;SOR=1.566;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=66;TCR=32;TR=98;WE=31132487;WS=31132469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr12	31135478	rs35089	T	C	2521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=35;PP=1298;SC=TCAAGTGCTGTGGAAGCAACA;SOR=0.848;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=48;TCR=35;TR=83;WE=31135486;WS=31135468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr12	31135579	rs2075333	T	C	953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=5.691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.95;ReadPosRankSum=-2.791;SOR=1.101;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,52:0.43:120
chr12	31136256	rs35088	C	T	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.303;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=237;ReadPosRankSum=0.629;SC=CTGAATCCCACGGTCAGTCTC;SOR=0.446;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=41;TCF=11;TCR=30;TR=17;WE=31136264;WS=31136246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,20:0.44:45
chr12	31237026	rs28559720	A	G	1145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.153;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-10.055;NF=23;NR=44;PP=990;ReadPosRankSum=-0.595;SC=AAGTGGGAGTACTGGAGGAAA;SOR=0.978;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=142;TCF=53;TCR=89;TR=67;WE=31237034;WS=31237016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,57:0.40:143
chr12	31237372	rs3930906	A	T	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.725;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=331;ReadPosRankSum=-0.369;SC=AGGTCCCGGGAGGGGATGCGG;SOR=0.385;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=20;WE=31237380;WS=31237362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr12	31237700	rs3881296	G	A	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.002;NF=10;NR=7;PP=160;ReadPosRankSum=-1.312;SC=TCTCCCCTCCGTGACCCTCAC;SOR=0.746;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=59;TCF=32;TCR=27;TR=17;WE=31237708;WS=31237690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,21:0.32:66
chr12	31238075	rs4931428	G	A	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.412;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.29;MQRankSum=1.803;QD=10.09;ReadPosRankSum=-2.057;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr12	31240862	rs7308754	A	T	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=5.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.401;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.567;NF=20;NR=4;PP=309;ReadPosRankSum=0.537;SC=GTTCTCTCTCACACACACAGA;SOR=2.612;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=87;TCF=63;TCR=24;TR=24;WE=31240870;WS=31240852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,24:0.29:82
chr12	31240925	rs7308773	A	G	1671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FS=4.022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.09;MQRankSum=-1.121;QD=8.15;ReadPosRankSum=-0.793;SOR=0.991;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,88:0.43:205
chr12	31240960	rs7309189	G	A	1816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.785;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-3.811;NF=39;NR=38;PP=888;ReadPosRankSum=0.781;SC=GGGGGTATAGGCTGGGCTGTG;SOR=0.552;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=165;TCF=79;TCR=86;TR=77;WE=31240968;WS=31240950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,90:0.47:193
chr12	31242271	rs2005896	G	A	1039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.856;HP=1;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.438;NF=31;NR=12;PP=697;ReadPosRankSum=0.372;SC=GCAGGTCCACGTGTGTTGGTA;SOR=0.906;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=90;TCF=63;TCR=27;TR=43;WE=31242279;WS=31242261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,46:0.50:92
chr12	31242314	rs2005897	T	C	1878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FS=1.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQRankSum=-4.067;QD=9.94;ReadPosRankSum=-1.175;SOR=0.875;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:97,92:0.49:189
chr12	31242399	rs3881298	T	C	2332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.590;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-11.860;NF=54;NR=59;PP=1351;ReadPosRankSum=0.497;SC=ACGACCGCTGTGTGGACATGC;SOR=0.840;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=265;TCF=134;TCR=131;TR=113;WE=31242407;WS=31242389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,121:0.42:288
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chr12	31244619	rs61917221	C	T	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.253;NF=8;NR=0;PP=83;ReadPosRankSum=-1.808;SC=AGGGGAGCCCCGCCCTGCTCA;SOR=0.340;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=8;WE=31244627;WS=31244609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,6:0.21:28
chr12	31244703	rs374684190	C	T	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FS=2.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.07;MQRankSum=-9.015;QD=1.06;ReadPosRankSum=-0.151;SOR=0.478;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:228,46:0.17:274
chr12	31244846	rs1808348	C	G	847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.827;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=25;PP=530;ReadPosRankSum=-0.776;SC=CCTGCTGTGACGTAAAGGGAC;SOR=1.007;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=84;TCF=29;TCR=55;TR=36;WE=31244854;WS=31244836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,41:0.44:93
chr12	31245741	rs2075321	A	G	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.331;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-7.112;NF=16;NR=4;PP=204;ReadPosRankSum=-1.535;SC=CTTAGCCCTCAGCTGCTTGCT;SOR=0.941;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=59;TCF=46;TCR=13;TR=20;WE=31245749;WS=31245731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,18:0.31:58
chr12	31245916	rs61273537	C	T	1325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.607;NF=27;NR=34;PP=900;ReadPosRankSum=0.300;SC=TGGTTCCCACCTCTGGCCCGG;SOR=0.662;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=111;TCF=48;TCR=63;TR=61;WE=31245924;WS=31245906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,63:0.56:113
chr12	31246371	rs10843882	C	T	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=22;PP=436;ReadPosRankSum=0.766;SC=AAGGGTCGGCCGGGTGCGGTG;SOR=0.720;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=73;TCF=26;TCR=47;TR=33;WE=31246379;WS=31246361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,33:0.45:74
chr12	31246438	rs7970074	T	C	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQRankSum=-1.626;QD=13.99;ReadPosRankSum=-0.053;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr12	31247682	rs61917225	T	C	2444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.58;BaseQRankSum=-2.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.969;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.728;NF=82;NR=45;PP=1940;ReadPosRankSum=-0.738;SC=CATGTGTTTGTTCTCAGGGAC;SOR=0.435;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=282;TCF=188;TCR=94;TR=127;WE=31247690;WS=31247672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,122:0.43:281
chr12	31249861	rs2075322	C	G	2017.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.479;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.463;NF=44;NR=54;PP=1482;ReadPosRankSum=-0.318;SC=GATGCACATCCAAGGCTTCCT;SOR=0.649;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=221;TCF=101;TCR=120;TR=98;WE=31249869;WS=31249851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,100:0.42:239
chr12	31250768	rs2909388	C	T	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=22.905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.09;MQRankSum=-7.099;QD=0.73;ReadPosRankSum=-4.425;SOR=3.540;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,16:0.13:126
chr12	31253995	rs1046456	C	T	3670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=383;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.154;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.231;NF=91;NR=81;PP=2265;ReadPosRankSum=-0.236;SC=TCCTGCCCCTCGTCATCTGCA;SOR=0.799;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=359;TCF=185;TCR=174;TR=172;WE=31254003;WS=31253985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:201,182:0.48:383
chr12	31254642	rs7952861	T	A	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.858;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.167;NF=9;NR=0;PP=172;ReadPosRankSum=-0.873;SC=CCAAGTCCTCTTCCTTGGCTG;SOR=3.312;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=9;WE=31254650;WS=31254632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr12	31254701	rs7966366	G	T	823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.137;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.728;NF=22;NR=11;PP=535;ReadPosRankSum=1.930;SC=AGGTGAAGACGCGGTTTGTGG;SOR=1.055;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=60;TCF=40;TCR=20;TR=33;WE=31254709;WS=31254691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,37:0.55:67
chr12	31254752	rs7966272	C	T	1595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=1.335;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQRankSum=-1.603;QD=11.48;ReadPosRankSum=-0.759;SOR=0.832;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,75:0.54:139
chr12	31255263	rs10771803	G	A	4017.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.445;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-11.732;NF=62;NR=47;PP=1623;ReadPosRankSum=3.148;SC=CGTCATGCTGGGCTTGGGTCT;SOR=0.660;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=273;TCF=155;TCR=118;TR=109;WE=31255271;WS=31255253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,110:0.39:284
chr12	31255280	rs61918673	G	A	4229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=3.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-11.438;NF=69;NR=54;PP=1689;ReadPosRankSum=2.485;SC=GTCTGAGATCGTGTGGGGGTG;SOR=0.681;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=311;TCF=175;TCR=136;TR=123;WE=31255288;WS=31255270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:201,124:0.38:325
chr12	31255772	rs58740356	A	AG	249.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.197;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-2.044;NF=7;NR=1;PP=268;ReadPosRankSum=0.748;SC=ACAGTCGGAGAGGCTGAGGGA;SOR=1.445;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=8;WE=31255780;WS=31255762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr12	31256075	rs3825318	G	A	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.882;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.071;NF=2;NR=12;PP=244;ReadPosRankSum=-0.235;SC=TGCCCCCTCCGGAAGCTTGGA;SOR=1.585;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=14;WE=31256083;WS=31256065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr12	31256546	rs1046457	G	A	1267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-9.267;NF=31;NR=36;PP=827;ReadPosRankSum=-0.668;SC=TTTTGCCAGCGTAGTGCTCCT;SOR=0.707;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=159;TCF=78;TCR=81;TR=67;WE=31256554;WS=31256536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,65:0.39:166
chr12	31256905	rs1046458	T	C	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.301;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-7.220;NF=12;NR=14;PP=354;ReadPosRankSum=0.536;SC=GAGTCCAGAGTGCTGCCAGGA;SOR=1.038;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=74;TCF=32;TCR=42;TR=26;WE=31256913;WS=31256895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,18:0.25:73
chr12	31264743	rs4930953	C	T	827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.442;NF=15;NR=22;PP=567;ReadPosRankSum=0.866;SC=TGCTTCTCCACCTGGGATTTA;SOR=0.735;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=76;TCF=32;TCR=44;TR=37;WE=31264751;WS=31264733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,39:0.48:82
chr12	31264770	rs1053552	A	G	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.568;NF=12;NR=18;PP=489;ReadPosRankSum=-1.913;SC=CATTTAAACAATAAACACATT;SOR=0.773;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=69;TCF=29;TCR=40;TR=30;WE=31264778;WS=31264760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,33:0.45:74
chr12	31265823	rs2302848	A	G	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-3.723;NF=6;NR=0;PP=56;ReadPosRankSum=0.606;SC=CTGTGAAGACAGAGGTTGATT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=6;WE=31265831;WS=31265813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr12	31265872	rs2302849	C	T	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=12.683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQRankSum=-6.047;QD=2.95;ReadPosRankSum=2.741;SOR=3.227;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,12:0.20:61
chr12	31265925	rs2302850	C	G	736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.499;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-8.273;NF=25;NR=14;PP=465;ReadPosRankSum=-1.814;SC=CTTTTTCGTACTAATCGTAGA;SOR=0.883;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=128;TCF=80;TCR=48;TR=39;WE=31265933;WS=31265915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,42:0.30:138
chr12	31265983	rs1053534	G	A	1375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.547;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=-9.461;NF=33;NR=32;PP=745;ReadPosRankSum=2.359;SC=GCTCTGCTCAGCAGAAAAAGT;SOR=0.741;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=169;TCF=86;TCR=83;TR=65;WE=31265991;WS=31265973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,73:0.39:186
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chr12	31267744	rs7968684	A	C	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-8.707;NF=14;NR=24;PP=554;ReadPosRankSum=-0.296;SC=TGTCTTTGTGATGAAAGATTA;SOR=0.764;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=99;TCF=40;TCR=59;TR=38;WE=31267752;WS=31267734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,40:0.36:111
chr12	31269189	rs25559	C	CATCAT	178.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.560;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.516;NF=8;NR=0;PP=386;ReadPosRankSum=1.088;SC=CATGAGAACTCATTACCATGA;SOR=1.536;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=8;WE=31269197;WS=31269179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,6:0.19:32
chr12	31270076	rs58035829	A	C	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FS=8.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQRankSum=-10.025;QD=1.27;ReadPosRankSum=-4.574;SOR=1.792;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:139,18:0.11:157
chr12	31270080	rs59046327	G	GAAA	136.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FS=12.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQRankSum=-11.622;QD=0.90;ReadPosRankSum=-4.037;SOR=2.415;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:137,15:0.10:152
chr12	31270149	rs7316147	GC	CA	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=6.411;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.48;MQRankSum=-7.461;QD=5.74;ReadPosRankSum=0.293;SOR=0.212;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,14:0.21:67
chr12	31270171	rs7301557	T	C	1607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=31;PP=787;SC=GGATCCCCATTGCAGGGCGGG;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=19;TCR=31;TR=50;WE=31270179;WS=31270161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr12	31282765	rs2536839	A	T	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.780;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.784;NF=19;NR=14;PP=313;ReadPosRankSum=-0.954;SC=AATGAATACAAATTTTTTCAT;SOR=0.806;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=118;TCF=67;TCR=51;TR=33;WE=31282773;WS=31282755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,31:0.26:120
chr12	31282784	rs35666624	A	G	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.449;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-5.312;NF=24;NR=17;PP=464;ReadPosRankSum=-1.351;SC=ATTCTCTCCAATGTCTTAAAA;SOR=0.851;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=127;TCF=66;TCR=61;TR=41;WE=31282792;WS=31282774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,40:0.31:129
chr12	31283446	rs140298932	T	G	1845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-6.708;NF=59;NR=49;PP=1482;ReadPosRankSum=-1.203;SC=TCTCACCATATGCTTCCTTTC;SOR=0.714;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=209;TCF=115;TCR=94;TR=108;WE=31283454;WS=31283436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,95:0.50:189
chr12	31285101	rs2933405	A	G	1723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=12;PP=1177;SC=TCTCTATTCTATTATTTTAAG;SOR=2.262;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=40;TCR=12;TR=52;WE=31285109;WS=31285091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr12	31285169	rs2287449	A	T	5171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=76;PP=2965;SC=ACAAAATTTGATCAACTTACC;SOR=0.938;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=180;TCF=104;TCR=76;TR=180;WE=31285177;WS=31285159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr12	31286189	rs3844571	T	C	1763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=52.29;QD=28.00;SOR=1.092;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr12	31288835	rs200865477	G	GA	1158.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.57;QD=38.62;SOR=4.548;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	31288884	rs4931444	G	T	3829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=45;PP=2611;SC=ACAGAACAACGCACCTCTACA;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=129;TCF=84;TCR=45;TR=129;WE=31288892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr12	31288955	rs11051266	G	A	3297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.388;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.015;NF=80;NR=68;PP=2069;ReadPosRankSum=-1.078;SC=TTGAACAACCGAAAAGGGTGA;SOR=0.593;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=270;TCF=146;TCR=124;TR=148;WE=31288963;WS=31288945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,160:0.54:298
chr12	31289662	.	TA	T	463.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=0.000;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=8.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.43;MQRankSum=-0.605;QD=3.22;ReadPosRankSum=0.566;SOR=0.245;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,40:0.28:144
chr12	31297722	rs55758709	C	T	514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.10;QD=30.28;SOR=5.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	31297871	rs12309295	G	C	6666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=113;NR=111;PP=2965;SC=TCAGATTTCAGTAGAAGGACG;SOR=0.718;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=224;TCF=113;TCR=111;TR=224;WE=31297879;WS=31297861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr12	31300754	rs116358569	T	C	3447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=49;PP=2342;SC=GACTGATGCATGATTTCTAAG;SOR=1.239;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=140;TCF=91;TCR=49;TR=140;WE=31300762;WS=31300744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr12	31300891	rs56144986	C	A	8870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=183;NR=157;PP=2965;SC=GAGTAATGCACAGTAACAACC;SOR=1.047;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=341;TCF=183;TCR=158;TR=340;WE=31300899;WS=31300881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,319:1.00:319
chr12	31301888	rs11051274	T	C	1849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.657;NF=32;NR=41;PP=1049;ReadPosRankSum=0.943;SC=AGGTACATTATTGGGATCCGA;SOR=0.702;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=133;TCF=61;TCR=72;TR=73;WE=31301896;WS=31301878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,86:0.55:155
chr12	31307173	rs4931449	A	T	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.156;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.115;NF=16;NR=6;PP=353;ReadPosRankSum=0.469;SC=TGAAAATAGTATTGTTAAGCT;SOR=0.499;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=47;TCF=34;TCR=13;TR=22;WE=31307181;WS=31307163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,26:0.49:53
chr12	31310983	rs7971718	G	A	3209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.528;NF=64;NR=77;PP=1857;ReadPosRankSum=-0.089;SC=TGCATTGACCGTAACTTCAAA;SOR=0.710;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=267;TCF=125;TCR=142;TR=141;WE=31310991;WS=31310973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,156:0.54:291
chr12	31311973	rs61733843	G	A	1762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=-7.976;NF=32;NR=53;PP=1281;ReadPosRankSum=0.516;SC=TGAAAAATCCGATTGTTTTGA;SOR=0.694;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=171;TCF=63;TCR=108;TR=85;WE=31311981;WS=31311963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,83:0.49:169
chr12	31359159	rs3065666	C	CAATGGTAA	1935.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=23;PP=1780;SC=TCATACCAACCAATGGTAAGC;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=23;WE=31359167;WS=31359149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr12	31359210	rs2164498	A	G	287.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=58;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=208;SC=CTCTTTGTGTAAAGACCCACA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=31359218;WS=31359200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	31539303	rs708200	G	T	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.226;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=202;ReadPosRankSum=0.777;SC=ACAACTTTTGGTCTTTCAAAA;SOR=2.235;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=11;WE=31539311;WS=31539293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr12	31545103	rs708218	T	C	199.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=132;SC=AATATATATATCCTTATCACT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=31545111;WS=31545093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	31545381	rs792874	A	G	4226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=67;PP=2538;SC=CTATGTCTAAAAAAAACACTA;SOR=0.786;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=136;TCF=69;TCR=67;TR=136;WE=31545389;WS=31545371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
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chr12	31551350	rs1798769	C	T	1497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=33;PP=980;SC=GACAGGGTTCCCGCTCAGCCC;SOR=2.170;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=12;TCR=33;TR=45;WE=31551358;WS=31551340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
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chr12	31562177	rs16918627	G	A	1502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.857;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=24;PP=890;ReadPosRankSum=-1.567;SC=AACCCTTAACGGTCAATTCTC;SOR=0.940;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=141;TCF=87;TCR=54;TR=65;WE=31562185;WS=31562167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,72:0.46:158
chr12	31568221	rs793159	C	T	3965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=39;PP=2470;SC=CAGCCATAATCATTTGAGCAA;SOR=1.527;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=87;TCR=39;TR=126;WE=31568229;WS=31568211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr12	31577378	rs34764768	A	AT	1103.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=1.020;NF=17;NR=11;PP=420;ReadPosRankSum=0.914;SC=AAAAGAGCCTATTTTTTTTTA;SOR=0.780;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=69;TCF=34;TCR=35;TR=28;WE=31577386;WS=31577368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,51:0.50:102
chr12	31586007	rs2682695	C	T	690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.33;ReadPosRankSum=-1.054;SOR=0.546;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,35:0.47:74
chr12	31600400	rs7976644	G	A	672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.573;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=6;PP=476;ReadPosRankSum=1.159;SC=TTTGTTGTACGTAAGGCCAGC;SOR=0.187;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=44;TCF=36;TCR=8;TR=28;WE=31600408;WS=31600390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,29:0.59:49
chr12	31604928	rs3205175	G	C	3200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.403;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=58;PP=1687;ReadPosRankSum=-1.827;SC=CCATGTCCTGGGCAGTCTGAA;SOR=0.668;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=281;TCF=156;TCR=125;TR=132;WE=31604936;WS=31604918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,153:0.48:321
chr12	31605044	rs1056320	G	T	2360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.083;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=62;PP=1598;ReadPosRankSum=1.064;SC=TCTTCACAATGCAGTTTTAAA;SOR=0.837;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=242;TCF=113;TCR=129;TR=109;WE=31605052;WS=31605034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,115:0.43:265
chr12	31633258	rs113784337	G	GT	300.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.071;NF=0;NR=12;PP=228;ReadPosRankSum=-0.575;SC=AATAAATGTTGTTTTTTTAAC;SOR=0.197;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=12;WE=31633266;WS=31633248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr12	31648723	rs4931506	G	A	2004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.503;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=36;PP=1142;ReadPosRankSum=-0.013;SC=AAGAGTAAATGAGGGGAAAAA;SOR=0.763;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=194;TCF=113;TCR=81;TR=87;WE=31648736;WS=31648713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,102:0.47:216
chr12	31648948	rs4931507	G	A	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=140;ReadPosRankSum=1.181;SC=GACTGATAATGTTGAGATCTG;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=8;WE=31648956;WS=31648938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr12	31693975	rs34225458	T	TA	850.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-1.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.707;HP=11;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=1.388;NF=1;NR=21;PP=265;ReadPosRankSum=-1.556;SC=TCTTACCATATAAAAAAAAAA;SOR=1.528;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=48;TCF=4;TCR=44;TR=22;WE=31693983;WS=31693965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,40:0.52:77
chr12	31814741	rs7959989	G	C	744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=1;PP=584;SC=CTCTTCCTCAGAATTCTCAGT;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=24;WE=31814749;WS=31814731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	31850220	rs2388926	C	T	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=301;ReadPosRankSum=-0.206;SC=ATTGGTTATCCGCTAGGTTTT;SOR=0.638;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=18;WE=31850228;WS=31850210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,21:0.60:35
chr12	31908050	rs6488005	A	C	10327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=392;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=191;NR=175;PP=2965;SC=CCAAGCCCATAGATAGATCAG;SOR=0.745;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=366;TCF=191;TCR=175;TR=366;WE=31908058;WS=31908040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,392:1.00:392
chr12	31944691	rs3759294	A	C	1630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.602;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.280;NF=44;NR=24;PP=1048;ReadPosRankSum=1.832;SC=AACTGCCTTCACTTAAGCTCT;SOR=0.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=145;TCF=91;TCR=54;TR=68;WE=31944699;WS=31944681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,76:0.48:159
chr12	32134240	rs2388982	C	T	10896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=403;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=183;NR=173;PP=2965;SC=TTACCCAAAACGTATGGTTGA;SOR=0.754;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=356;TCF=183;TCR=173;TR=356;WE=32134248;WS=32134230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,402:1.00:402
chr12	32134638	rs2166807	T	C	8842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=149;NR=132;PP=2965;SC=AGTCAGCTTCTAAATTCTGTA;SOR=0.787;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=281;TCF=149;TCR=132;TR=281;WE=32134646;WS=32134628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,310:1.00:310
chr12	32134943	rs10771894	A	G	5096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=84;PP=2965;SC=GCCTTTTAACAGTCCCATTAG;SOR=0.804;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=167;TCF=82;TCR=85;TR=165;WE=32134951;WS=32134933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr12	32135441	rs3759301	T	C	8343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=147;NR=127;PP=2965;SC=AATGCCAGACTCATCTCATGA;SOR=0.775;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=274;TCF=147;TCR=127;TR=274;WE=32135449;WS=32135431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,302:1.00:302
chr12	32137447	rs3759300	C	T	6542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=109;NR=98;PP=2965;SC=AAGGAGTACCCCAGTGTCAGT;SOR=0.737;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=209;TCF=110;TCR=99;TR=207;WE=32137455;WS=32137437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr12	32137512	rs3759299	C	G	6391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=114;NR=85;PP=2965;SC=GAGCAGTGTTCTCCTTTGGAT;SOR=0.864;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=200;TCF=115;TCR=85;TR=199;WE=32137520;WS=32137502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr12	32138924	rs7302975	T	C	4445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=92;PP=2965;SC=GTGTCTACAATATTGTAAAGA;SOR=1.478;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=145;TCF=52;TCR=93;TR=144;WE=32138932;WS=32138914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr12	32138974	rs35804480	CT	C	1795.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=38;PP=1492;SC=CTCATGCTGTCTTGGGCTGCT;SOR=2.701;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=38;WE=32138982;WS=32138964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr12	32140098	rs3213955	A	G	340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=1;PP=261;SC=TTCAGCTTACATGATTTTCCT;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=32140106;WS=32140088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	32261435	rs1144715	A	G	120.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=102;SC=TGGGTAGCAAATAACCACTTA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=32261443;WS=32261428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	32490369	rs2388987	G	A	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.446;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=237;ReadPosRankSum=0.163;SC=TTACTTTTCAGCTTAACTCCC;SOR=2.093;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=39;TCF=32;TCR=7;TR=14;WE=32490377;WS=32490359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,14:0.34:41
chr12	32490850	rs1057779	C	G	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.45;ReadPosRankSum=0.317;SOR=0.409;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr12	32491626	rs1471909	G	A	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=57;ReadPosRankSum=1.657;SC=TTAAATGCCAGTATAAATAAT;SOR=0.465;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=5;WE=32491634;WS=32491616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr12	32491969	rs2291419	C	T	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=36;ReadPosRankSum=-0.524;SC=AATAGACTCTCCCCTTCCTTC;SOR=0.105;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=4;WE=32491977;WS=32491959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr12	32639156	rs6488061	C	A	1675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=29;PP=994;SC=GCAAAGTATACAATAGATGAG;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=25;TCR=29;TR=54;WE=32639164;WS=32639146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr12	32687352	rs17537634	A	G	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.021;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=12;PP=358;ReadPosRankSum=-0.237;SC=ATGAACTTTAAAAGAGTAAAG;SOR=0.976;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=62;TCF=35;TCR=27;TR=30;WE=32687360;WS=32687342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,31:0.47:66
chr12	32764184	rs10844253	G	A	6989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=105;NR=125;PP=2965;ReadPosRankSum=2.182;SC=TAGCTGCTCGGAACACTTCAG;SOR=0.349;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=231;TCF=105;TCR=126;TR=230;WE=32764192;WS=32764174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,257:1.00:258
chr12	32777362	rs11052110	G	A	728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=9;NR=19;PP=459;SC=TTAGTTCTGCGCAAGACAAAG;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=9;TCR=19;TR=28;WE=32777370;WS=32777352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr12	32778039	rs7970584	A	G	1146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=26;PP=708;SC=AACCTCTTTCATATCTTTGCA;SOR=1.721;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=11;TCR=26;TR=37;WE=32778047;WS=32778029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr12	32854602	rs9737752	G	A	355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=237;SC=CTGTAGCATAGTTAGAAGTCC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=10;WE=32854610;WS=32854592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	32889911	rs2293341	C	T	389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=314;SC=ATAATTATGGCATGAGTCCCA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=32889919;WS=32889901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	32890685	rs2177704	C	T	2101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=17;PP=1378;SC=TTATTTTCATCTTTCATGTTA;SOR=2.336;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=68;TCF=50;TCR=18;TR=67;WE=32890693;WS=32890675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr12	32897647	.	CA	C	190.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=0.000;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=3.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.87;ReadPosRankSum=0.885;SOR=1.196;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,21:0.21:102
chr12	32949029	rs149968852	A	AG	956.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.747;NF=15;NR=4;PP=702;ReadPosRankSum=-2.211;SC=GACGGGCAGAACTGAAGGACT;SOR=0.481;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=19;WE=32949037;WS=32949019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,27:0.68:40
chr12	32955647	rs7975824	C	A	74.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.5025;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=38;SC=GGCTGGAGTGCAGTGGTGTGA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=32955655;WS=32955637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr12	32974218	rs7967264	T	C	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=244;ReadPosRankSum=0.000;SC=CACTGTTTCATCTCTGAATTG;SOR=0.784;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=16;WE=32974226;WS=32974208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr12	32974245	rs10772008	C	T	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=7;PP=475;ReadPosRankSum=-1.182;SC=GGTATGTCTACAATATCATTA;SOR=0.843;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=52;TCF=40;TCR=12;TR=29;WE=32974253;WS=32974235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,29:0.53:55
chr12	33021934	rs1046116	A	G	1068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=19;PP=669;ReadPosRankSum=-3.710;SC=CCTGGATGGCAGCATGTGGTC;SOR=0.644;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=109;TCF=69;TCR=40;TR=50;WE=33021942;WS=33021924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,54:0.47:115
chr12	33049457	rs75909145	C	A	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=5.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQRankSum=0.962;QD=4.62;ReadPosRankSum=1.141;SOR=1.247;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,19:0.30:63
chr12	33529647	rs10844567	A	T	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.831;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=52;ReadPosRankSum=-0.249;SC=AGTGCACATCAAGTTTGTTCA;SOR=0.169;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=6;WE=33529655;WS=33529637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr12	33535289	rs10844571	G	A	1673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.252;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=26;PP=908;ReadPosRankSum=0.113;SC=CATACCTATCGTAATCCATGA;SOR=0.809;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=139;TCF=85;TCR=54;TR=71;WE=33535297;WS=33535279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,81:0.52:157
chr12	33535510	rs74075211	T	G	34.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.60;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr12	33576990	rs7980799	A	C	3990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=82;PP=2596;SC=TGATTGATATAAAAGTTCTAG;SOR=1.527;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=121;TCF=39;TCR=82;TR=121;WE=33576998;WS=33576980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr12	33578997	rs141090671	TCA	T	167.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.473;HP=2;HapScore=3;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=177;ReadPosRankSum=-0.684;SC=TTATGAAATTTCACACACACA;SOR=0.211;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=18;TCF=11;TCR=7;TR=8;WE=33579006;WS=33578987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr12	38710583	rs7296576	C	T	242.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=199;SC=TATGTGGCCCCGTCTGGCTAG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=38710591;WS=38710573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	38712142	rs6582584	C	G	11756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=431;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=194;NR=201;PP=2965;SC=TGGATCTTTGCATGGTCTGAA;SOR=0.745;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=395;TCF=194;TCR=201;TR=395;WE=38712150;WS=38712132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,431:1.00:431
chr12	38717898	rs147846597	G	A	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-1.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.129;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=393;ReadPosRankSum=0.844;SC=GCAATGGCGCGATCTTGGCTC;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=18;WE=38717906;WS=38717888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr12	39087687	rs826877	A	C	2961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=34;NR=52;PP=1689;SC=AGGGTAAATAAATTTAACAAA;SOR=1.499;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=34;TCR=52;TR=86;WE=39087695;WS=39087677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr12	39117384	rs844115	C	A	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=186;ReadPosRankSum=0.000;SC=GTTAAAGTTACAATTTGCCCC;SOR=0.387;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=10;WE=39117392;WS=39117375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
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chr12	40037727	rs10735878	A	G	478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.174;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=12;PP=212;ReadPosRankSum=-1.332;SC=CTGGTAAGTCATTCCAATTGC;SOR=1.122;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=69;TCF=33;TCR=36;TR=22;WE=40037735;WS=40037711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,28:0.35:81
chr12	40077028	rs10047563	A	G	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=126;ReadPosRankSum=1.030;SC=ATACACACACATCTATATATT;SOR=0.293;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=8;WE=40077036;WS=40077018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr12	40224180	rs146729184	G	A	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=52;ReadPosRankSum=-1.068;SC=AGTGACATGCGCTGAGCCAGG;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=4;WE=40224188;WS=40224170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr12	40345185	rs11446411	G	GA	712.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=10.274;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.63;MQRankSum=0.490;QD=18.76;ReadPosRankSum=1.342;SOR=1.814;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,36:0.95:38
chr12	40442111	rs10878036	C	T	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.923;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=7.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.80;ReadPosRankSum=-2.562;SOR=0.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr12	40619082	rs2256408	G	A	3560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=65;PP=1976;SC=TACTCCGAGCGCGGTAATCAC;SOR=0.973;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=120;TCF=55;TCR=65;TR=120;WE=40619090;WS=40619072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr12	40619301	rs2723273	G	A	1210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=7;PP=868;SC=CTAAAAAGGAGAGGGGGTGCT;SOR=2.948;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=38;WE=40619309;WS=40619291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr12	40619542	rs2256286	A	G	2176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=43;PP=1305;SC=GGTTATTCCCAAAATTTGGCT;SOR=1.522;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=23;TCR=43;TR=66;WE=40619550;WS=40619532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr12	40626230	rs1352879	T	C	5037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=87;PP=2954;ReadPosRankSum=-0.620;SC=GAGTATTTATTTGTACACATG;SOR=0.349;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=160;TCF=72;TCR=88;TR=159;WE=40626238;WS=40626220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,186:0.99:187
chr12	40626285	rs1352878	C	T	2520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=51;PP=1482;SC=AAGGCTACTCCTGTGGAATTC;SOR=1.662;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=76;TCF=24;TCR=52;TR=75;WE=40626293;WS=40626275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr12	40631791	rs10878245	T	C	1087.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=21;PP=700;ReadPosRankSum=0.305;SC=CTTGCTGATATTGGATGAAGA;SOR=0.656;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=92;TCF=54;TCR=38;TR=49;WE=40631799;WS=40631781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,52:0.53:98
chr12	40634203	rs11564187	A	G	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.63;ReadPosRankSum=-1.111;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr12	40645257	rs7955902	C	A	751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.673;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=22;PP=498;ReadPosRankSum=0.128;SC=TTTTTTCTCCCCTAATCCAGG;SOR=1.042;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=109;TCF=56;TCR=53;TR=39;WE=40645265;WS=40645247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,41:0.34:121
chr12	40657537	rs10784461	A	G	863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=7;PP=596;SC=CAGTCTGTTCAACTCAAATGT;SOR=2.235;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=30;WE=40657545;WS=40657527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr12	40657771	rs10784462	C	G	1225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=26;PP=749;SC=GAACTAGGGGCGCTTTTTCAG;SOR=1.714;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=12;TCR=26;TR=38;WE=40657779;WS=40657761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr12	40681142	rs138343113	C	CT	3503.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=23;PP=2695;SC=TGGTGTATCTCTTATTTTCAG;SOR=1.855;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=66;TCF=41;TCR=25;TR=62;WE=40681150;WS=40681132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr12	40702846	rs7305344	A	T	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.500;HP=9;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=330;ReadPosRankSum=1.010;SC=ATTTTTTTTTAAAAAAGGATT;SOR=1.194;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=37;TCF=26;TCR=11;TR=21;WE=40702854;WS=40702826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr12	40703087	rs10650388	C	CGT	191.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.279;NF=0;NR=7;PP=249;ReadPosRankSum=-0.455;SC=TGTCTGTGTGCGTGTGTGTGT;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=7;WE=40703095;WS=40703077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr12	40708922	rs1427266	C	T	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-3.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=38;ReadPosRankSum=0.041;SC=TCTTCACCTGCAAAATGAGGA;SOR=0.250;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=6;WE=40708930;WS=40708912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr12	40709185	rs721713	A	G	1871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.659;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=42;PP=1069;ReadPosRankSum=-1.746;SC=GCATTTTAGAATTTGGGTTTA;SOR=0.451;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=146;TCF=62;TCR=84;TR=78;WE=40709193;WS=40709175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,88:0.52:168
chr12	40713759	rs1896252	T	C	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=134;ReadPosRankSum=0.864;SC=AAAATAAATTTTAGTGATTAT;SOR=0.836;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=10;WE=40713767;WS=40713749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr12	40713834	rs1427263	C	A	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=248;ReadPosRankSum=0.664;SC=ACCCTAAGGGCATTATTTCGC;SOR=0.715;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=38;TCF=23;TCR=15;TR=16;WE=40713842;WS=40713824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,19:0.43:44
chr12	40713873	rs11176013	A	G	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.626;HP=7;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=369;ReadPosRankSum=-0.898;SC=TTCTTTCAAAAAAAAGGAAAT;SOR=1.398;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=48;TCF=30;TCR=18;TR=21;WE=40713881;WS=40713863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,23:0.43:54
chr12	40713901	rs11564148	T	A	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=11;PP=335;ReadPosRankSum=0.217;SC=GAACTACATGTCACAGTATTT;SOR=0.770;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=50;TCF=29;TCR=21;TR=24;WE=40713909;WS=40713891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,25:0.44:57
chr12	40714785	rs10878368	A	T	2071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.289;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=35;PP=1221;ReadPosRankSum=-1.895;SC=TTGCTCAACAAGGTTGGGTGT;SOR=1.117;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=212;TCF=122;TCR=90;TR=94;WE=40714793;WS=40714775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,105:0.45:234
chr12	40715013	rs7307276	T	A	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.738;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=259;ReadPosRankSum=1.034;SC=TGAAGACTTATTAGATTTTTA;SOR=2.110;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=15;WE=40715021;WS=40715003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
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chr12	40716260	rs10878371	T	C	1023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.420;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=38;PP=623;ReadPosRankSum=-0.342;SC=TTAATGATGGTGAAGAACATC;SOR=1.991;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=107;TCF=30;TCR=77;TR=47;WE=40716268;WS=40716250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,52:0.45:116
chr12	40742254	rs10878405	G	A	662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.792;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=15;PP=390;ReadPosRankSum=-0.424;SC=CTATGGTTGAGAAATTAATTA;SOR=0.804;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=79;TCF=44;TCR=35;TR=31;WE=40742272;WS=40742244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,36:0.39:92
chr12	40753044	rs111612315	C	CT	180.27	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.335;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.87;ReadPosRankSum=0.230;SOR=0.293;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,11:0.85:13
chr12	40753303	rs3789330	A	G	288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=1;NR=10;PP=251;SC=TTTTTTCCTTATAATCATTAA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=40753311;WS=40753293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	40757114	rs10626458	A	ACATG	412.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=429;SC=TAGTGTTTTTACATTAAGAAC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=40757122;WS=40757104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	40757186	rs11317573	AT	A	2172.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.280;NF=36;NR=17;PP=1018;ReadPosRankSum=0.186;SC=ATGACTTTCTATTTTTTTTTC;SOR=1.201;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=64;TCF=46;TCR=18;TR=53;WE=40757194;WS=40757176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,83:0.99:84
chr12	40758652	rs3761863	T	C	5074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=110;NR=63;PP=2901;SC=AGGGAGGTAATGGTAAAAGAA;SOR=1.272;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=175;TCF=111;TCR=64;TR=173;WE=40758660;WS=40758642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr12	40761007	rs3789328	A	G	270.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=193;SC=TTGGTAGTTTATAGTGTAAAG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=40761015;WS=40760997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	40761358	rs4768238	A	G	310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=256;SC=ATCTAAGTCAACTAAAAATAC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=40761366;WS=40761348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	40761663	rs66737902	T	C	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.69;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,2:0.50:4
chr12	40787120	.	A	G	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=0.000;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.22;ReadPosRankSum=0.354;SOR=0.546;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,15:0.20:76
chr12	40787385	rs7968721	C	A	255.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=7;PP=168;SC=TCTGTAGATCCAACATTTTTC;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=40787393;WS=40787375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	40793993	rs1820544	C	T	561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.116;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=15;PP=349;ReadPosRankSum=-0.157;SC=AAAATATAATCTCTCTTATTA;SOR=0.471;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=49;TCF=18;TCR=31;TR=25;WE=40794001;WS=40793983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,27:0.51:53
chr12	40799969	rs10784595	C	T	4625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FS=2.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.42;ReadPosRankSum=-1.663;SOR=0.874;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,122:0.56:216
chr12	40799975	rs10784596	G	C	4518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.94;ReadPosRankSum=-1.883;SOR=0.845;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,116:0.56:206
chr12	40802150	rs1019709	G	A	5100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=88;PP=2965;SC=GGATGCTGGAGGTTCAAAGTC;SOR=0.918;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=164;TCF=76;TCR=88;TR=164;WE=40802158;WS=40802140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr12	40805948	rs10878538	G	C	1342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.260;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=30;PP=753;ReadPosRankSum=-0.903;SC=AGAACGCTGGGATGCTGGGAA;SOR=0.804;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=144;TCF=65;TCR=79;TR=55;WE=40805956;WS=40805938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,66:0.41:160
chr12	40808832	rs994798	A	G	1715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.649;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=34;PP=1121;ReadPosRankSum=0.101;SC=AGTGACAATTATTTTATATTC;SOR=0.747;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=118;TCF=60;TCR=58;TR=66;WE=40808840;WS=40808822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,73:0.55:132
chr12	40815548	rs6581732	T	A	342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=10;NR=4;PP=205;SC=GATAGAATTGTATTTGAGGAG;SOR=1.329;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=14;WE=40815556;WS=40815538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	40820208	rs11176575	G	A	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.004;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=370;ReadPosRankSum=1.921;SC=TTATTTTGTAGCACTGTAACA;SOR=0.330;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=48;TCF=39;TCR=9;TR=23;WE=40820216;WS=40820198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,26:0.49:53
chr12	40821176	rs7955308	G	A	4183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=99;NR=57;PP=2965;SC=ATTTCTCCAGGAACACAAAGA;SOR=1.076;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=156;TCF=99;TCR=57;TR=156;WE=40821184;WS=40821166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr12	40821867	rs7958987	G	A	2564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.998;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=64;PP=1414;ReadPosRankSum=-0.275;SC=GCCAGGAGAAGTCCGAGAAGG;SOR=0.816;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=254;TCF=120;TCR=134;TR=116;WE=40821875;WS=40821857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,127:0.46:278
chr12	40822012	rs7960062	C	T	521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=403;SC=AAATAAAAAGCAATCTCACTG;SOR=4.294;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=40822020;WS=40822002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	40825487	rs2114567	G	A	2468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=51;PP=1373;ReadPosRankSum=0.643;SC=AGACAGGAACGTGCTTAAATA;SOR=0.726;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=202;TCF=105;TCR=97;TR=105;WE=40825495;WS=40825477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,118:0.50:234
chr12	40827479	rs2162470	T	C	2037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=21;PP=1236;SC=TTCACTTGGGTGAAGAACTGA;SOR=1.675;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=45;TCR=21;TR=66;WE=40827487;WS=40827469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr12	40830599	rs66908734	CGTGTGTGT	C,CGTGTGT	1649.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.60;QD=34.37;SOR=3.467;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,29,19:0.60,0.40:48
chr12	40832126	rs10878584	C	T	2968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.144;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=74;PP=1787;ReadPosRankSum=0.840;SC=GTTACATAAACGACGAGGTCA;SOR=0.881;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=280;TCF=126;TCR=154;TR=129;WE=40832134;WS=40832116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,142:0.47:299
chr12	40832161	rs11176635	T	C	2158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.333;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=55;PP=1352;ReadPosRankSum=-1.284;SC=CTCATCCATATTGATGACAAT;SOR=0.965;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=185;TCF=70;TCR=115;TR=84;WE=40832169;WS=40832151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,97:0.49:200
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chr12	40834955	rs10784618	C	A	2751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.887;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=69;PP=1600;ReadPosRankSum=-0.069;SC=ACTGTCCATGCTCTTTTGGTG;SOR=0.777;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=271;TCF=124;TCR=147;TR=124;WE=40834965;WS=40834945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,134:0.45:299
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chr12	40835734	rs7966110	C	G	3154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.408;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=63;PP=1824;ReadPosRankSum=-0.665;SC=TCTGCCACATCTATGGGGAAG;SOR=0.735;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=289;TCF=153;TCR=136;TR=137;WE=40835742;WS=40835724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,150:0.48:315
chr12	40835749	rs11176655	T	C	3114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.473;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=76;PP=1611;ReadPosRankSum=0.483;SC=GGGAAGGTCATGTTAGAACTT;SOR=0.855;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=278;TCF=138;TCR=140;TR=143;WE=40835757;WS=40835739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,157:0.52:304
chr12	40835817	rs11176659	T	C	1321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=39;PP=893;ReadPosRankSum=-0.220;SC=CTTGAGGTAATTATGAGTATG;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=118;TCF=38;TCR=80;TR=56;WE=40835825;WS=40835807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,61:0.48:128
chr12	40837264	rs11564230	T	C	650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=18;PP=406;ReadPosRankSum=0.496;SC=AACTGGAATGTATGTATATCG;SOR=0.613;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=63;TCF=20;TCR=43;TR=26;WE=40837272;WS=40837247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,27:0.41:66
chr12	40838146	rs10784620	A	T	1872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=47;PP=1234;ReadPosRankSum=-2.367;SC=GCAGTGACTTACACAGGGTTT;SOR=0.670;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=208;TCF=92;TCR=116;TR=83;WE=40838154;WS=40838136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,95:0.40:237
chr12	40838216	rs10784621	T	C	1359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.556;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=30;PP=696;ReadPosRankSum=-0.374;SC=TACCATGATGTGTGCATTGAA;SOR=0.744;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=152;TCF=74;TCR=78;TR=57;WE=40838224;WS=40838206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,71:0.39:181
chr12	40839467	rs7972395	A	G	1626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.089;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=40;PP=992;ReadPosRankSum=0.523;SC=CTTTAAGAATATGCATAAAGT;SOR=0.524;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=140;TCF=55;TCR=85;TR=67;WE=40839475;WS=40839457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,76:0.49:156
chr12	40839521	rs1346307	T	C	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=449;ReadPosRankSum=-0.729;SC=TTGTTTCTCCTAATTTCGTGT;SOR=0.651;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=6;TCR=43;TR=23;WE=40839529;WS=40839511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,25:0.49:51
chr12	40840325	rs10878597	T	C	2726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=62;PP=1721;ReadPosRankSum=-0.326;SC=TGCTCCTTACTTGGATGAGAA;SOR=0.690;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=282;TCF=153;TCR=129;TR=130;WE=40840333;WS=40840315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,140:0.45:310
chr12	40840442	rs118180891	T	C	904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=26;PP=590;ReadPosRankSum=0.718;SC=GTATATTCTCTACTAACTTTT;SOR=0.616;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=30;TCR=60;TR=39;WE=40840450;WS=40840432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,43:0.44:98
chr12	40841938	rs11176682	G	T	994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.736;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=19;PP=559;ReadPosRankSum=1.423;SC=AAAAATTCCTGTCAATAACAG;SOR=0.815;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=94;TCF=55;TCR=39;TR=47;WE=40841946;WS=40841928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,51:0.50:103
chr12	40843504	rs12581232	A	C	802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.798;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=14;PP=407;ReadPosRankSum=0.830;SC=CCACTACAACAGCTACCACCA;SOR=0.502;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=75;TCF=48;TCR=27;TR=35;WE=40843512;WS=40843494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,40:0.48:83
chr12	40844250	rs10878599	G	A	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=52;ReadPosRankSum=0.345;SC=AAAGCTTTTGGGGAAAAAAAG;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=5;WE=40844258;WS=40844240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
chr12	40852398	rs1035811	T	C	783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.03;SOR=2.753;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	40857126	rs144249723	TAAGTA	T	424.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=363;ReadPosRankSum=-0.608;SC=ATAACGAGATTAAGTAAAGAA;SOR=1.493;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=9;WE=40857138;WS=40857116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr12	40857214	rs10878623	T	C	1572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=23;PP=848;ReadPosRankSum=1.501;SC=TATCCATATATATTAAGCACC;SOR=0.716;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=119;TCF=72;TCR=47;TR=62;WE=40857222;WS=40857204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,76:0.55:137
chr12	40857943	rs2933353	A	C	1205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.549;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=21;PP=802;ReadPosRankSum=0.976;SC=GTATCTGGAGAAACCCCTGCA;SOR=0.931;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=96;TCF=54;TCR=42;TR=51;WE=40857951;WS=40857933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,54:0.50:108
chr12	40858122	rs12228358	G	T	1070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=29;PP=669;ReadPosRankSum=-0.891;SC=GCTGAGGAAAGTTGGAGGGAT;SOR=0.636;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=109;TCF=51;TCR=58;TR=55;WE=40858130;WS=40858112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,57:0.49:116
chr12	40859036	rs2131202	C	T	1847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.067;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=34;PP=906;ReadPosRankSum=0.751;SC=GATGTCATTCCGAGGCTGTGG;SOR=0.594;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=190;TCF=98;TCR=92;TR=78;WE=40859044;WS=40859026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,94:0.44:216
chr12	40859551	rs2131203	T	A	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-2.227;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=2;PP=67;ReadPosRankSum=1.086;SC=CATTGTAACCTTTTATGTAGA;SOR=0.693;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=12;TCF=6;TCR=6;TR=5;WE=40859559;WS=40859541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr12	40868767	rs1444222	A	G	1603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.241;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=23;PP=1102;ReadPosRankSum=0.800;SC=AAGTGTCAGAACAAAGGGAAA;SOR=0.948;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=116;TCF=68;TCR=48;TR=60;WE=40868775;WS=40868757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,67:0.52:130
chr12	40894745	rs111256342	A	ACTGAGAATAC	1364.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=2.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.329;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=2954;ReadPosRankSum=-0.421;SC=TGTCCTCCTGACAGGAAGATT;SOR=1.838;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=55;TCF=28;TCR=27;TR=14;WE=40894753;WS=40894735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,32:0.32:100
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chr12	40895026	rs719227	C	T	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-3.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=267;ReadPosRankSum=-0.512;SC=TGCAGGTTGGCAGGGAAGTCT;SOR=0.551;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=16;WE=40895034;WS=40895016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr12	40910157	rs59005564	A	C	803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.838;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=14;PP=493;ReadPosRankSum=0.375;SC=CTTCTGGAGGAAGGTCTTCAG;SOR=0.530;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=70;TCF=44;TCR=26;TR=34;WE=40910165;WS=40910147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,40:0.49:82
chr12	40910545	rs1122863	G	A	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.142;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=394;ReadPosRankSum=0.505;SC=ACACTTTTTGGATTTCCCAGA;SOR=2.054;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=39;TCF=8;TCR=31;TR=19;WE=40910553;WS=40910535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,20:0.48:42
chr12	40911882	rs7300780	G	A	2776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.091;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=69;PP=1660;ReadPosRankSum=0.258;SC=GAGTGGCACTGCTGGAACTGA;SOR=0.830;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=237;TCF=108;TCR=129;TR=121;WE=40911890;WS=40911872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,136:0.52:260
chr12	40912034	rs56036709	T	C	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.002;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=336;ReadPosRankSum=0.280;SC=TATTTGTTTATTTATTTAGAA;SOR=0.819;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=34;TCF=17;TCR=17;TR=16;WE=40912042;WS=40912024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr12	40912162	rs17128391	T	C	2652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=50;PP=1516;ReadPosRankSum=1.200;SC=GTTTTCTGTGTGAACGTGCGT;SOR=0.674;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=265;TCF=153;TCR=112;TR=122;WE=40912170;WS=40912152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,131:0.46:282
chr12	40912684	rs73116206	A	T	1402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.363;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=35;PP=910;ReadPosRankSum=1.464;SC=TGTGGTGGGGAATCCTTTCAT;SOR=0.491;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=50;TCR=62;TR=64;WE=40912692;WS=40912674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,66:0.55:121
chr12	40912953	rs112863400	G	GA	821.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.754;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=314;ReadPosRankSum=-0.505;SC=ATTTTTGTTGGAAAAAAAAAA;SOR=1.297;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=47;TCF=6;TCR=41;TR=23;WE=40912961;WS=40912943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,40:0.53:76
chr12	40913928	rs17599001	T	C	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=61.53;MQRankSum=-0.792;NF=0;NR=4;PP=66;ReadPosRankSum=-1.006;SC=AGTGTGGTTTTAAATTTCCTT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=40913936;WS=40913918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr12	40913955	rs35115017	CA	C	53.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=62.13;MQRankSum=0.524;NF=0;NR=3;PP=45;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TATAGTATTTCAAGGAAACAG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=40913963;WS=40913945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr12	40914127	rs17599042	A	G	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=4.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.200;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=309;ReadPosRankSum=-0.504;SC=CATAGTCTGTATAACATTTGT;SOR=1.802;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=15;WE=40914135;WS=40914117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr12	40915474	rs58079549	CA	C	2532.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.574;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.779;NF=4;NR=29;PP=2123;ReadPosRankSum=1.284;SC=AGCAGGACCACACCGGGGGTG;SOR=0.760;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=86;TCF=13;TCR=73;TR=33;WE=40915488;WS=40915464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,68:0.39:174
chr12	40915480	rs56952712	G	A	2569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.207;NF=30;NR=28;PP=2122;ReadPosRankSum=0.258;SC=ACCACACCGGGGGTGAGCTTG;SOR=0.680;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=138;TCF=69;TCR=69;TR=58;WE=40915488;WS=40915464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,70:0.41:170
chr12	40915786	rs59767957	C	T	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=3.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.37;ReadPosRankSum=0.675;SOR=0.086;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,3:0.23:13
chr12	40916163	rs56211973	T	C	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=143;ReadPosRankSum=-0.970;SC=TAGGGCTACATTGATGCTTCC;SOR=0.446;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=10;WE=40916171;WS=40916161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr12	40916281	rs55642775	A	G	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=11;PP=323;ReadPosRankSum=-1.171;SC=AGAATTGTCTAGAACGAACTT;SOR=0.600;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=46;TCF=28;TCR=18;TR=26;WE=40916289;WS=40916271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,30:0.55:55
chr12	40917312	rs2920820	C	T	830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-4.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.424;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=20;PP=444;ReadPosRankSum=-0.097;SC=GTCTTTCCTTCTGGTGTTTCT;SOR=1.179;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=53;TCF=16;TCR=37;TR=28;WE=40917320;WS=40917302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,35:0.57:61
chr12	40917416	rs11829565	T	C	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.770;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.368;NF=23;NR=5;PP=371;ReadPosRankSum=-1.075;SC=CTGGAGCAAGTGGAATGACTG;SOR=2.031;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=81;TCF=53;TCR=28;TR=28;WE=40917424;WS=40917406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,31:0.34:91
chr12	40917541	.	AAT	A	1247.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=0.000;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=5.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.24;MQRankSum=1.023;QD=9.52;ReadPosRankSum=-0.916;SOR=1.172;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,65:0.50:131
chr12	40917664	rs73119908	T	G	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.854;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=110;ReadPosRankSum=-0.880;SC=CATCAGTTGTTTGATTGGAGA;SOR=0.096;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=7;WE=40917672;WS=40917654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr12	40919119	rs56226314	T	C	3522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=362;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.373;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=62;PP=2107;ReadPosRankSum=-0.533;SC=GTTGGCCACATTTTTCCAAGG;SOR=0.863;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=322;TCF=174;TCR=148;TR=149;WE=40919127;WS=40919109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:193,168:0.47:361
chr12	40919535	rs73119922	A	G	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.632;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=227;ReadPosRankSum=-3.294;SC=CAAAAATTTAACAGATGTTCA;SOR=0.123;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=13;WE=40919543;WS=40919525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr12	40920110	rs2933351	T	C	3300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=51;PP=1993;SC=CGGGGCCACCTGAGCAGGATT;SOR=0.726;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=60;TCR=51;TR=111;WE=40920118;WS=40920100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr12	40920169	rs7302287	T	C	1276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.599;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=28;PP=889;ReadPosRankSum=-1.791;SC=TCATCATCTCTCTATCAGGGT;SOR=0.597;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=142;TCF=79;TCR=63;TR=61;WE=40920177;WS=40920159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,65:0.41:159
chr12	40920332	rs61382395	A	G	1022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.736;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=32;PP=741;ReadPosRankSum=0.702;SC=ATTCTAGTTTATGGAGACATT;SOR=0.562;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=38;TCR=70;TR=50;WE=40920340;WS=40920322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,50:0.43:117
chr12	40921902	rs4768287	C	T	2497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.441;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=45;PP=1632;ReadPosRankSum=-1.394;SC=CCCCTGGAAGCTTCAGCACAG;SOR=0.729;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=254;TCF=152;TCR=102;TR=113;WE=40921910;WS=40921892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,122:0.43:282
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chr12	40922104	rs1444220	A	C	2054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.815;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=51;PP=2962;ReadPosRankSum=1.554;SC=GCTGGCCCCAACTCAGGTAAG;SOR=0.864;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=174;TCF=76;TCR=98;TR=88;WE=40922112;WS=40922081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,96:0.51:188
chr12	40923073	rs73119944	G	T	1216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.603;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=19;PP=603;ReadPosRankSum=-1.083;SC=GTTACAGTTTGATTCCAAGTT;SOR=0.823;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=91;TCF=52;TCR=39;TR=49;WE=40923081;WS=40923063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,58:0.55:105
chr12	40924179	rs73106607	C	G	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.836;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=10;PP=920;ReadPosRankSum=1.527;SC=AGTGAGTTGTCTGCCTGGGTG;SOR=0.509;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=69;TCF=47;TCR=22;TR=30;WE=40924199;WS=40924169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,37:0.45:82
chr12	40924191	rs12813020	T	A	1128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.809;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=15;PP=1451;ReadPosRankSum=-1.103;SC=GCCTGGGTGATCCTACCATAC;SOR=0.880;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=51;TCR=25;TR=45;WE=40924199;WS=40924169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,51:0.55:92
chr12	40925108	rs4768289	A	C	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.665;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=325;ReadPosRankSum=-0.242;SC=TCATCTCTCTATCTGGGTGGC;SOR=1.255;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=45;TCF=14;TCR=31;TR=19;WE=40925116;WS=40925098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,23:0.43:54
chr12	40925691	rs17128416	C	T	938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.850;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=16;PP=551;ReadPosRankSum=-1.044;SC=TACTTGGAGACTGTTCATTTT;SOR=0.563;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=72;TCF=43;TCR=29;TR=38;WE=40925699;WS=40925681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,43:0.54:80
chr12	40925908	rs7139187	A	C	4770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=88;PP=2965;SC=AAGGGAATGCATCTTATTTAA;SOR=0.912;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=160;TCF=72;TCR=88;TR=160;WE=40925916;WS=40925898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr12	40926203	rs11835376	T	A	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.488;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=210;ReadPosRankSum=-1.467;SC=CTCTATAGAGTTAAATTTTTT;SOR=1.445;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=26;TCF=9;TCR=17;TR=14;WE=40926211;WS=40926193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr12	40926454	rs10506166	T	C	1746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=30;PP=937;ReadPosRankSum=-0.792;SC=TAATATTTTGTGCTACATCTA;SOR=0.681;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=143;TCF=90;TCR=53;TR=79;WE=40926462;WS=40926444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,86:0.54:160
chr12	40927890	rs7977973	T	G	602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=322;ReadPosRankSum=-2.293;SC=ATCTCATGTATTGACATCCAC;SOR=0.616;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=28;TCR=13;TR=25;WE=40927898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,28:0.60:47
chr12	40928476	rs113966690	T	TTCC	1071.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.41;MQRankSum=1.300;QD=20.61;ReadPosRankSum=-0.904;SOR=0.678;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,29:0.56:52
chr12	40929241	rs142725558	TG	T	81.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.291;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.68;ReadPosRankSum=1.718;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr12	40929425	rs113734402	TA	T	185.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.29;ReadPosRankSum=1.897;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr12	40930284	rs1873674	C	G	2277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.221;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=45;PP=1429;ReadPosRankSum=-0.136;SC=GGAAGGGAAACAGGTCAGCGT;SOR=0.845;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=212;TCF=118;TCR=94;TR=105;WE=40930292;WS=40930274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,113:0.49:230
chr12	40930709	rs7971316	G	C	9729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=174;NR=143;PP=2965;SC=CTTCCCTACTGTATTTGTTCC;SOR=0.856;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=318;TCF=174;TCR=144;TR=317;WE=40930717;WS=40930699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,355:1.00:355
chr12	40931655	rs76684015	G	A	1349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=33;PP=784;ReadPosRankSum=0.699;SC=TCCTCTGCCAGCAGCCACAAC;SOR=0.680;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=124;TCF=59;TCR=65;TR=61;WE=40931663;WS=40931645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,69:0.48:143
chr12	40932661	rs11177108	G	A	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.886;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=175;ReadPosRankSum=-0.466;SC=TAAATATTTTGCAGTATTCAT;SOR=1.021;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=34;TCF=17;TCR=17;TR=14;WE=40932669;WS=40932651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,15:0.38:39
chr12	40935231	rs11177133	C	G	1587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=12;PP=1040;SC=GAGAAACCCACTAGCAACACA;SOR=2.215;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=33;TCR=12;TR=45;WE=40935239;WS=40935221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr12	40935517	rs56083241	G	A	1761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.684;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=42;PP=1065;ReadPosRankSum=-0.994;SC=AATGTCAAATGTCATGCTATG;SOR=0.815;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=50;TCR=68;TR=73;WE=40935525;WS=40935507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,78:0.60:129
chr12	40935632	rs11177134	T	C	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=120;ReadPosRankSum=1.028;SC=ACAAATTCCATTGAAGAGACT;SOR=0.616;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=9;WE=40935640;WS=40935622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr12	40936512	rs17599666	C	A	2469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.497;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=63;PP=1549;ReadPosRankSum=-0.580;SC=CAGACCATTCCCTTTCTAAAT;SOR=0.800;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=228;TCF=107;TCR=121;TR=113;WE=40936520;WS=40936502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,121:0.47:259
chr12	40938751	rs7304329	A	G	609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.483;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=452;ReadPosRankSum=-0.331;SC=ATCTCCTCTGAAAATCTTTGT;SOR=1.206;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=52;TCF=28;TCR=24;TR=23;WE=40938759;WS=40938741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,24:0.44:54
chr12	40938944	rs7133943	C	T	1191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=31;PP=712;ReadPosRankSum=-1.445;SC=TTTACCAGTACTCAGAGAATA;SOR=0.703;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=134;TCF=55;TCR=79;TR=53;WE=40938952;WS=40938934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,63:0.43:148
chr12	40938975	rs7133098	G	C	686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=19;PP=451;ReadPosRankSum=1.330;SC=TAATATGAGAGCTTAGCCTTT;SOR=0.666;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=87;TCF=32;TCR=55;TR=31;WE=40938983;WS=40938965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,34:0.36:94
chr12	40939066	rs139186904	CA	C	586.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=8;PP=495;ReadPosRankSum=-1.274;SC=TCTGAGTTAACAAAAAACATA;SOR=0.850;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=43;TCF=25;TCR=18;TR=20;WE=40939074;WS=40939056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,26:0.55:47
chr12	40940392	rs7959536	C	T	2635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.398;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=51;PP=1613;ReadPosRankSum=0.379;SC=CATTGCTTCTCTTTTTCTTCC;SOR=0.795;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=265;TCF=143;TCR=122;TR=116;WE=40940400;WS=40940382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,129:0.44:295
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chr12	40942311	rs11177162	C	A	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.511;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=199;ReadPosRankSum=-0.586;SC=TTGCCTCATTCTATTATAGAA;SOR=0.412;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=17;WE=40942319;WS=40942301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,18:0.43:42
chr12	40942463	.	GTT	G,GT	424.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.920;ClippingRankSum=0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.60;MQRankSum=0.654;QD=18.47;ReadPosRankSum=-0.439;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:2,11,10:0.48,0.43:23
chr12	40943329	rs1463738	G	A	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.194;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=405;ReadPosRankSum=-0.007;SC=TTTGGAATTCGGATATTATAA;SOR=0.481;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=60;TCF=49;TCR=11;TR=26;WE=40943337;WS=40943319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,27:0.42:65
chr12	40943970	rs1492316	G	A	1326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.520;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=34;PP=796;ReadPosRankSum=1.770;SC=GGTGGGCACTGGCAATCAAAT;SOR=0.467;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=104;TCF=39;TCR=65;TR=57;WE=40943978;WS=40943960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,63:0.55:114
chr12	40944697	rs11177169	T	C	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=238;ReadPosRankSum=0.968;SC=ATTTTCTCCATACACTAGTCT;SOR=0.368;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=13;WE=40944705;WS=40944687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr12	40950883	rs7487017	A	G	662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.328;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=507;ReadPosRankSum=-0.635;SC=GTAGAAGGGGAAAATCTCTCT;SOR=1.002;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=27;WE=40950891;WS=40950873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,27:0.63:43
chr12	40951596	rs3751167	A	G	1724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=2.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.608;SOR=0.470;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,47:0.42:113
chr12	40951605	rs3751168	G	A	1894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=1.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.79;ReadPosRankSum=-1.799;SOR=0.542;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,54:0.45:120
chr12	40951756	rs3829294	G	A	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.974;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;ReadPosRankSum=-0.714;SC=AATGAATGTGGCTGGAAAGTG;SOR=2.303;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=35;TCF=22;TCR=13;TR=15;WE=40951764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,14:0.37:38
chr12	40951845	rs3751169	G	A	1641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-2.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.344;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=25;PP=1056;ReadPosRankSum=0.917;SC=TTGTAGATGTGTTAATAATTC;SOR=0.554;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=143;TCF=97;TCR=46;TR=74;WE=40951853;WS=40951835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,79:0.50:157
chr12	40951950	rs3751172	G	A	3367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=370;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=78;PP=2186;ReadPosRankSum=-0.732;SC=AGATTACTATGATGGATGCAG;SOR=0.672;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=330;TCF=163;TCR=167;TR=152;WE=40951958;WS=40951940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:201,167:0.45:368
chr12	40952934	rs1352938	A	G	3375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=42;PP=2055;SC=TGCAGCACTGACCCAGAAAGT;SOR=1.244;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=113;TCF=71;TCR=42;TR=113;WE=40952942;WS=40952924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr12	40954482	rs3751175	G	A	1376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.303;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=37;PP=853;ReadPosRankSum=-1.875;SC=TAGAGAGTAGGATGATGGTTA;SOR=1.207;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=135;TCF=58;TCR=77;TR=60;WE=40954490;WS=40954472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,66:0.45:146
chr12	40954998	rs146275060	C	CT	129.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=1.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.49;MQRankSum=2.271;QD=3.60;ReadPosRankSum=-0.530;SOR=0.991;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,10:0.28:36
chr12	40961265	rs11177260	A	G	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=3.481;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=177;ReadPosRankSum=1.211;SC=CTTTTTTACTACTAACCTAAT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=8;WE=40961273;WS=40961255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr12	40964206	rs7979493	A	G	785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=25;NR=2;PP=600;SC=CAGTTTGAGCACTGATGTCAA;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=27;WE=40964214;WS=40964196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr12	41302374	rs35684552	A	C	197.18	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5958;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=156;ReadPosRankSum=0.489;SC=GTATTGTATGAAGTAAAAATT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=7;WE=41302382;WS=41302364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr12	41312365	rs10879356	A	T	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=217;ReadPosRankSum=-0.020;SC=TTTTCAAGTAATTTTTTTTCA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=35;TCR=3;TR=12;WE=41312373;WS=41312354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,11:0.31:35
chr12	41318265	rs7299744	C	T	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=59;ReadPosRankSum=-0.534;SC=CTGTATCTCACGAATGAGTTA;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=5;WE=41318273;WS=41318255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr12	41327427	rs56323985	G	T	1162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.719;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=23;PP=734;ReadPosRankSum=1.845;SC=ATAAATAATTGTTTAGCTATA;SOR=0.846;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=99;TCF=52;TCR=47;TR=47;WE=41327435;WS=41327417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,54:0.50:108
chr12	41330531	rs2289522	T	C	767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.890;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=7;PP=386;ReadPosRankSum=-0.901;SC=CTGGAGATTATGATGGATCTT;SOR=0.338;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=53;TCF=42;TCR=11;TR=28;WE=41330539;WS=41330521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,35:0.56:63
chr12	41330611	rs935105	T	C	1964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=33;PP=990;ReadPosRankSum=0.783;SC=AACACATCAATGACACAGAGG;SOR=0.687;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=193;TCF=118;TCR=75;TR=88;WE=41330619;WS=41330601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,100:0.46:219
chr12	41331612	rs1442193	T	C	323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=238;SC=ATGTTGGTTGTTTACTGATTT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=41331620;WS=41331602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	41333049	rs74449088	T	TA	222.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.857;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=221;ReadPosRankSum=-0.188;SC=CATTAACTATTAAGGAGAATA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=7;WE=41333057;WS=41333039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr12	41333391	rs34686634	AT	A	123.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.140;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=86;ReadPosRankSum=-0.330;SC=TTTGCTCTGAATTTTTTTTTT;SOR=0.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=6;WE=41333399;WS=41333381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr12	41337435	rs1056019	C	T	3801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=47;PP=2008;SC=TGGAAATCAACAACATTACAA;SOR=1.069;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=69;TCR=47;TR=116;WE=41337443;WS=41337425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr12	41365345	.	CT	C	88.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.454;ClippingRankSum=0.000;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=5.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.71;ReadPosRankSum=-0.606;SOR=1.725;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,11:0.21:52
chr12	41374697	rs10784981	C	A	1145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.636;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=20;PP=675;ReadPosRankSum=0.200;SC=TCATTACCCACATTTTCATTT;SOR=0.520;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=92;TCF=55;TCR=37;TR=48;WE=41374705;WS=41374687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,53:0.54:98
chr12	41387106	rs7309797	A	G	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.43;ReadPosRankSum=0.402;SOR=0.252;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,20:0.38:53
chr12	41387110	rs278911	C	G	718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=5.538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.67;ReadPosRankSum=-0.249;SOR=0.157;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,20:0.41:49
chr12	41421642	rs12367345	A	G	1677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.673;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=20;PP=1195;ReadPosRankSum=-1.446;SC=CTGATTGCATATTACTACTTT;SOR=0.780;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=88;TCR=39;TR=65;WE=41421650;WS=41421632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,71:0.51:138
chr12	41582590	rs10879830	G	C	2326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.82;SOR=0.960;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr12	41582603	rs10879831	G	C	2153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=18;NR=20;PP=439;SC=CCGCAGCCGCGGGGGCTGCGC;SOR=1.112;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=18;TCR=20;TR=38;WE=41582611;WS=41582580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr12	41585373	rs78251066	C	G	2785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=41;NR=47;PP=1548;SC=ATGCATTACTCGTTACTTATA;SOR=1.072;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=41;TCR=47;TR=88;WE=41585381;WS=41585363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr12	41588124	rs3847980	A	G	194.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=7;PP=155;SC=AGGCATTATCATTTTTACTTT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=41588132;WS=41588114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	41946453	rs285585	T	C	3175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=60;NR=38;PP=1773;SC=GTGTTGTTCTTTCAGGAGGTC;SOR=0.951;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=98;TCF=60;TCR=38;TR=98;WE=41946461;WS=41946443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr12	41949370	rs285580	T	G	636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=453;ReadPosRankSum=-0.081;SC=AGAGAAATATTATGTATACTG;SOR=1.609;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=21;WE=41949378;WS=41949360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,22:0.67:33
chr12	41949688	rs35738715	CA	C	61.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.719;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.17;ReadPosRankSum=1.778;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr12	41957568	rs157971	C	T	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=269;ReadPosRankSum=0.000;SC=ATCATTATCACGGTTATCTCT;SOR=0.846;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=17;WE=41957576;WS=41957558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr12	41961535	rs12310084	A	G	896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=5;PP=545;ReadPosRankSum=0.059;SC=CTCTATTTTAACATGAGTTCT;SOR=0.555;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=63;TCF=53;TCR=10;TR=32;WE=41961543;WS=41961525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,38:0.54:71
chr12	41966306	rs12298745	G	A	1980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=37;PP=1172;ReadPosRankSum=-0.063;SC=ATGCAGCCGAGGACCCCAATA;SOR=0.697;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=164;TCF=86;TCR=78;TR=78;WE=41966314;WS=41966296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,90:0.48:188
chr12	41967677	rs3747556	G	A	2214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=49;PP=1363;ReadPosRankSum=1.286;SC=CCTTCTTGTCGGTGACCACTG;SOR=0.655;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=187;TCF=87;TCR=100;TR=94;WE=41967685;WS=41967667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,102:0.50:204
chr12	42481732	rs7972986	G	A	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=1.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.51;ReadPosRankSum=0.713;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,15:0.35:43
chr12	42481803	rs824722	G	A	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=69;ReadPosRankSum=1.179;SC=AGGTACATATGTAAGTTCAAT;SOR=0.743;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=21;TCF=10;TCR=11;TR=9;WE=42481811;WS=42481793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr12	42499538	rs61942483	TT	AC	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=365;ReadPosRankSum=0.486;SC=TCAATTTAGTTTTTAATAAAA;SOR=0.954;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=9;WE=42499547;WS=42499533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr12	42499690	rs79044728	T	C	2483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=452;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQRankSum=-9.465;QD=5.52;ReadPosRankSum=-1.635;SOR=0.749;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:365,85:0.19:450
chr12	42499692	rs77044712	A	T	2507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=464;ExcessHet=3.0103;FS=0.669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQRankSum=-9.478;QD=5.43;ReadPosRankSum=-0.662;SOR=0.738;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:375,87:0.19:462
chr12	42499694	.	A	T	2720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=0.000;DP=465;ExcessHet=3.0103;FS=0.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQRankSum=-9.424;QD=5.88;ReadPosRankSum=0.126;SOR=0.714;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:375,88:0.19:463
chr12	42499701	rs74583427	C	A	2978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=475;ExcessHet=3.0103;FS=0.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQRankSum=-8.903;QD=6.32;ReadPosRankSum=1.697;SOR=0.759;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:373,98:0.21:471
chr12	42499711	rs76555438	C	A	3203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=477;ExcessHet=3.0103;FS=0.638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQRankSum=-8.584;QD=6.79;ReadPosRankSum=5.126;SOR=0.777;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:368,104:0.22:472
chr12	42499714	rs78536827	T	C	3227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=471;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQRankSum=-8.516;QD=6.93;ReadPosRankSum=6.000;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:362,104:0.22:466
chr12	42499730	rs77940338	G	T	3566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=444;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQRankSum=-8.050;QD=8.12;ReadPosRankSum=6.177;SOR=0.714;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:332,107:0.24:439
chr12	42499738	.	TC	CT	3656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.691;ClippingRankSum=0.000;DP=430;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQRankSum=-7.940;QD=8.60;ReadPosRankSum=4.645;SOR=0.727;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:315,110:0.26:425
chr12	42499763	rs80202058	T	C	3834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.421;HP=2;HapScore=1;MGOF=59;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-6.408;NF=48;NR=59;PP=1493;ReadPosRankSum=-0.353;SC=ATTGCAGCAATTTGTGTGGAA;SOR=0.740;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=324;TCF=145;TCR=179;TR=107;WE=42499771;WS=42499753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:239,110:0.32:349
chr12	42503505	rs824695	T	A	1540.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.00;ReadPosRankSum=0.618;SOR=1.306;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,65:0.97:67
chr12	42629550	rs7960176	T	C	1796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.46;SOR=1.107;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr12	42632354	rs75085410	C	A	353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.366;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=6;PP=195;ReadPosRankSum=0.103;SC=CCTTGGTACCCCCGGCTGCCG;SOR=0.387;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=31;TCF=21;TCR=10;TR=15;WE=42632362;WS=42632344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr12	42717811	rs17091074	A	T	3561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.325;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=74;PP=2282;ReadPosRankSum=1.179;SC=ACTCGATAAGATTTACTTACC;SOR=0.608;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=289;TCF=160;TCR=129;TR=157;WE=42717819;WS=42717801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,173:0.54:323
chr12	42717961	rs3747557	G	T	883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.939;HP=9;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=35;PP=893;ReadPosRankSum=1.468;SC=TTCTTTTTTTGTTGTTTGAGA;SOR=0.334;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=70;TCF=12;TCR=58;TR=44;WE=42717969;WS=42717950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,41:0.61:67
chr12	42729891	rs7296357	T	G	1435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.833;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=43;PP=992;ReadPosRankSum=-0.145;SC=ACCAGTGTAGTTTACAAAAGA;SOR=0.867;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=26;TCR=74;TR=58;WE=42729899;WS=42729881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,61:0.56:108
chr12	42778922	rs1669906	G	A	2381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=49;PP=1414;SC=ACCACAGTTAGCAGTAGACCT;SOR=1.583;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=29;TCR=49;TR=78;WE=42778930;WS=42778912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr12	42781149	rs2305423	T	G	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=94;ReadPosRankSum=0.040;SC=AATGAAAAGTTTTAGTACTAA;SOR=0.223;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=5;WE=42781157;WS=42781139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr12	42839836	rs1669885	A	C	10575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=388;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=158;NR=191;PP=2965;SC=GGACCCAACCAAGTACCAGAA;SOR=0.920;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=350;TCF=158;TCR=192;TR=349;WE=42839844;WS=42839826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,388:1.00:388
chr12	42853058	rs68074167	GT	G	1772.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=17;HapScore=3;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=13;NR=17;PP=478;SC=AATGTTTTTTGTTTTTTTTTT;SOR=1.981;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=34;TCF=17;TCR=17;TR=30;WE=42853066;WS=42853048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr12	42853084	rs12658	C	A	1160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=3.287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.349;SOR=0.390;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,57:0.69:83
chr12	42853213	rs17091220	C	A	820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.33;ReadPosRankSum=-0.582;SOR=0.732;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,45:0.40:112
chr12	42853520	rs1043652	A	G	304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=2;PP=240;SC=AGCACTTTAAACTATTTTCAC;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=42853528;WS=42853510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	42854205	rs3747562	A	G	1803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.668;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=22;PP=1107;ReadPosRankSum=-1.266;SC=TGACATCATCAGAAAACTTGA;SOR=1.028;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=147;TCF=94;TCR=53;TR=73;WE=42854213;WS=42854195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,84:0.50:168
chr12	42862750	rs2708062	T	G	370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=281;SC=TGCTACCTCTTTTAGTGATTA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=42862758;WS=42862740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	42863516	rs67128387	G	A	897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.351;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=28;PP=642;ReadPosRankSum=-0.777;SC=ACACCCCCACGATTTTAAAAT;SOR=0.284;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=63;TCF=14;TCR=49;TR=38;WE=42863524;WS=42863506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,38:0.59:64
chr12	43769718	rs7972295	A	G	1027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=4;PP=765;SC=AACAACATCTAGTTTAGGTCC;SOR=3.545;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=30;WE=43769726;WS=43769708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr12	43817445	rs6582463	C	T	588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=4;PP=407;SC=AACAGAGACACAGTAAGCAGA;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=43817453;WS=43817435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr12	43819209	rs61925141	C	A	1615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.673;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=16;PP=1082;ReadPosRankSum=-0.619;SC=TGCACATGTACCCCTGAATGT;SOR=0.908;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=109;TCF=79;TCR=30;TR=64;WE=43819217;WS=43819199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,68:0.57:120
chr12	43819298	rs10785430	G	A	3293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=368;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=69;PP=2008;ReadPosRankSum=0.498;SC=CATGTTAACAGACAAGAGTGC;SOR=0.695;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=324;TCF=169;TCR=155;TR=143;WE=43819306;WS=43819288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:207,160:0.44:367
chr12	43821335	.	TA	T	43.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.016;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=2.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.82;ReadPosRankSum=2.969;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,6:0.25:24
chr12	43823316	rs12308771	C	T	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.954;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=338;ReadPosRankSum=-1.068;SC=CATCAAAATACCTGAGAATAA;SOR=1.781;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=22;WE=43823324;WS=43823306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,23:0.66:35
chr12	43824011	rs202030722	A	AT	223.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=210;ReadPosRankSum=-0.087;SC=AACAAATTCTATTTTTTTGCC;SOR=2.147;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=8;WE=43824019;WS=43824009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr12	43824042	rs10880489	G	T	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-1.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=309;ReadPosRankSum=1.861;SC=ACATACACGTGTTTAAGGCAT;SOR=1.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=13;WE=43824050;WS=43824032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr12	43824241	.	G	T	2577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.830;ClippingRankSum=0.000;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.452;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=66;PP=1569;ReadPosRankSum=0.054;SC=TTAACATCTCGCATCTGATAC;SOR=0.806;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=253;TCF=118;TCR=135;TR=122;WE=43824249;WS=43824231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,129:0.47:274
chr12	43824316	rs11182071	A	G	1185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.877;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=30;PP=787;ReadPosRankSum=-0.430;SC=TTGTTTCCCAAAAGTTACACA;SOR=0.886;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=81;TCF=25;TCR=56;TR=42;WE=43824324;WS=43824306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,49:0.53:92
chr12	43827506	.	AACACACACAC	A,AACACAC	93	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.09;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=24;MMLQ=18;MQ=60.0;NF=1,1;NR=0,0;PP=48,93;QD=51.0;SC=TGCACACACAAACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=1,1;WE=43827523;WS=43827496;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.20:5
chr12	43833927	rs61925145	A	G	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.021;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=113;ReadPosRankSum=1.242;SC=AACAATACAGAAAACACTTGT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=6;WE=43833935;WS=43833917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr12	43837403	rs200301712	GT	G	154.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.14;ReadPosRankSum=0.419;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr12	43840370	rs61925148	G	A	2223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=33;PP=1291;ReadPosRankSum=-0.629;SC=AAATAAAAGCGAAATCTAGAA;SOR=0.675;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=189;TCF=118;TCR=71;TR=93;WE=43840378;WS=43840360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,106:0.51:208
chr12	43846272	rs7307955	C	T	4834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=59;PP=2965;SC=TGTGTTCTTACGTCTCAGAAA;SOR=1.052;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=154;TCF=95;TCR=59;TR=154;WE=43846280;WS=43846262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
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chr12	43945603	rs275602	A	C	3289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=40;PP=1954;SC=GCCCCCACTTAGCCGCTGAAG;SOR=1.255;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=69;TCR=40;TR=109;WE=43945611;WS=43945593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr12	44191789	rs144307978	AT	A	517.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.668;NF=0;NR=10;PP=527;ReadPosRankSum=-0.532;SC=TCCTGCTAGCATTTTGTCAAC;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=10;WE=44191803;WS=44191779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,14:0.78:18
chr12	44191795	rs115243912	T	G	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=562;ReadPosRankSum=-0.945;SC=TAGCATTTTGTCAACATGCAG;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=10;WE=44191803;WS=44191779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,13:0.81:16
chr12	44198528	rs7972804	C	T	39.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=2;PP=22;SC=CATAAAATAACGAAGACTGTA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=44198536;WS=44198518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr12	44200087	.	AGCCAGCGGCCCCG	A	1145.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=0.000;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.268;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=3.192;NF=0;NR=18;PP=2967;ReadPosRankSum=0.214;SC=CGCTGAGTGCAGCCAGCGGCC;SOR=1.101;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=18;WE=44200107;WS=44200077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,32:0.46:69
chr12	44338153	rs6582491	T	A	2693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=51;PP=1534;SC=GGGGTAGGTTTTCTTTCCCCT;SOR=1.247;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=36;TCR=51;TR=87;WE=44338161;WS=44338143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr12	45004824	rs2305448	G	A	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=209;ReadPosRankSum=0.104;SC=TACACCTTCAGTCTTGGTTAT;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=11;WE=45004832;WS=45004814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr12	45170006	rs4768572	T	C	5578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=104;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.916;SC=ACTCCGCAGGTATCTTTTTTT;SOR=1.044;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=188;TCF=82;TCR=106;TR=185;WE=45170014;WS=45169996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,203:0.99:205
chr12	45173571	rs1123078	C	A	2079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=53;PP=1382;ReadPosRankSum=-0.661;SC=AAAGAAGGAACGTGAGTAGAC;SOR=0.680;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=229;TCF=113;TCR=116;TR=101;WE=45173579;WS=45173561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,103:0.42:244
chr12	45173858	rs1122352	T	A	1212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.437;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=35;PP=756;ReadPosRankSum=-1.119;SC=TCAAAAACGATTGAAGTGATC;SOR=1.029;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=106;TCF=42;TCR=64;TR=54;WE=45173866;WS=45173848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,58:0.49:118
chr12	45173884	rs1122351	G	A	741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.789;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=23;PP=533;ReadPosRankSum=-0.756;SC=CTACGGGATGGAATAGATGTA;SOR=1.387;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=66;TCF=23;TCR=43;TR=31;WE=45173892;WS=45173874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,34:0.44:77
chr12	45269284	rs7295923	C	T	1766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.558;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=38;PP=1198;ReadPosRankSum=-0.251;SC=CCGCCGAGAGCCTTACCTGAG;SOR=0.764;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=163;TCF=88;TCR=75;TR=83;WE=45269292;WS=45269274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,86:0.50:173
chr12	45269703	rs2272517	A	T	1379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=0.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.61;ReadPosRankSum=0.203;SOR=0.628;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,69:0.53:130
chr12	45270272	rs4415832	G	A	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.670;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=117;ReadPosRankSum=0.414;SC=CCCAGGAGCCGTTGCAGCCTC;SOR=1.329;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=9;WE=45270280;WS=45270262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,11:0.33:33
chr12	45278055	rs56181373	G	A	1317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.108;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=21;PP=721;ReadPosRankSum=-1.922;SC=TCACAATTAAGACACAACAAT;SOR=0.990;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=115;TCF=68;TCR=47;TR=58;WE=45278063;WS=45278045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,67:0.50:133
chr12	45307633	rs374144	T	C	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.49;ReadPosRankSum=-1.456;SOR=0.586;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,16:0.42:38
chr12	45410075	rs1224442	A	G	8151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=144;NR=134;PP=2965;SC=CCATTCAGACAGCCCCAGTAA;SOR=0.719;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=278;TCF=144;TCR=134;TR=278;WE=45410083;WS=45410054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,310:1.00:310
chr12	45417666	rs2731038	T	C	3196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=74;PP=2051;SC=AGAGGCAGCATGCTCTCTTCT;SOR=1.421;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=116;TCF=41;TCR=75;TR=115;WE=45417674;WS=45417656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr12	45444238	rs11182810	T	A	402.96	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.923;HP=4;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=272;ReadPosRankSum=-0.295;SC=CCGCCGGCGCTCCCAGATCCC;SOR=2.584;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=15;WE=45444246;WS=45444228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,16:0.89:18
chr12	45444264	rs11182811	G	C	725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=3;PP=465;SC=CACCCGGCCTGGGGGCGCGGG;SOR=2.494;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=45444272;WS=45444254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	45444529	.	T	C	1253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.679;ClippingRankSum=0.000;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.600;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=19;PP=786;ReadPosRankSum=0.506;SC=GGTCGCCGGGTCGTGGGGCGC;SOR=0.455;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=92;TCF=58;TCR=34;TR=49;WE=45444537;WS=45444519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,58:0.55:105
chr12	45664213	rs10748415	G	A	1396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=13;PP=790;SC=ATATTGGCCTGTTGTATTTAT;SOR=1.480;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=29;TCR=13;TR=42;WE=45664221;WS=45664203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr12	45695735	rs4140756	C	A	4143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=34;PP=2687;SC=TTTAAAAGTACAGAACTACGT;SOR=2.049;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=126;TCF=92;TCR=34;TR=126;WE=45695743;WS=45695725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr12	46215163	rs2059404	G	A	540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.661;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=232;ReadPosRankSum=0.270;SC=AGAATTTATTGCATTTTATTG;SOR=0.363;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=45;TCF=32;TCR=13;TR=22;WE=46215171;WS=46215153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,25:0.52:48
chr12	46287170	rs138252675	TTC	T	64.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=1.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.67;ReadPosRankSum=-0.082;SOR=0.900;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,14:0.14:97
chr12	46317004	rs1062905	T	A	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.383;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=102;ReadPosRankSum=-0.744;SC=TAGTGATGCATTAGAAATAAC;SOR=0.061;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=10;WE=46317012;WS=46316994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
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chr12	46385815	rs11574952	C	T	1747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=36;PP=1006;ReadPosRankSum=0.317;SC=GCCGACCGACCGCTTCACTGC;SOR=0.722;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=130;TCF=69;TCR=61;TR=76;WE=46385823;WS=46385805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,83:0.56:148
chr12	46582540	rs1045278	T	A	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=3.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=104;ReadPosRankSum=-1.103;SC=GAAAAAAAAATTTCACAATCC;SOR=0.200;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=7;WE=46582548;WS=46582530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr12	46590127	rs149687454	C	G	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.832;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=301;ReadPosRankSum=1.009;SC=TGGGTCCAGTCTAACTCCCAG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=15;WE=46590135;WS=46590117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
chr12	46591906	rs7954255	T	C	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.725;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=182;ReadPosRankSum=-0.406;SC=GACATTTCTCTGCAGAGTAAC;SOR=1.140;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=14;WE=46591914;WS=46591896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr12	46601056	rs2289768	C	T	745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.93;ReadPosRankSum=-2.024;SOR=0.598;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,39:0.41:94
chr12	46662485	rs2242355	G	C	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.388;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=210;ReadPosRankSum=0.990;SC=GGCGGATTTCGGAGGAAGGTG;SOR=0.144;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=11;WE=46662493;WS=46662478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr12	46755112	rs7961994	A	T	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=250;ReadPosRankSum=-0.290;SC=ATCTATAGAAAGAATATTTAA;SOR=0.622;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=13;WE=46755120;WS=46755102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr12	46758494	rs2307061	A	G	2856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.976;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=71;PP=1828;ReadPosRankSum=0.609;SC=TCCTATAAGGAGGGGTGGCAG;SOR=0.613;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=230;TCF=101;TCR=129;TR=129;WE=46758502;WS=46758484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,138:0.55:252
chr12	46759017	rs7968173	T	A	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.404;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=20;PP=446;ReadPosRankSum=1.388;SC=AAATATCCTCTGAAAAATATA;SOR=1.200;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=69;TCF=24;TCR=45;TR=28;WE=46759025;WS=46759007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,32:0.41:78
chr12	46761127	rs10880959	G	A	1064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=26;PP=582;ReadPosRankSum=-0.088;SC=GAGAATTCTGGTGAGAGAAGG;SOR=0.726;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=94;TCF=46;TCR=48;TR=49;WE=46761135;WS=46761117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,54:0.50:107
chr12	47159123	rs4768756	A	G	1987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=25;PP=1126;SC=ATACTTTTACAGAGAACCACT;SOR=1.150;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=44;TCR=25;TR=69;WE=47159131;WS=47159113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr12	47159196	rs2430921	A	T	1011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=20;PP=571;ReadPosRankSum=1.828;SC=ACTGAACTAAATCCTATTTTA;SOR=0.683;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=48;TCR=37;TR=45;WE=47159204;WS=47159186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,50:0.53:94
chr12	47162211	rs2465583	C	T	1448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.772;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=36;PP=930;ReadPosRankSum=1.210;SC=AAACACAGGGCAAGGTCAATG;SOR=0.880;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=148;TCF=73;TCR=75;TR=68;WE=47162219;WS=47162201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,73:0.46:160
chr12	47162889	rs2465582	A	G	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=224;ReadPosRankSum=-1.049;SC=GTGGCTCCCAATGTCAGTTAG;SOR=0.616;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=11;WE=47162897;WS=47162887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr12	47162938	rs2216433	T	G	2004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=48;NR=25;PP=1302;SC=CCAGAGCCTCTCAGGGATAAA;SOR=1.550;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=48;TCR=25;TR=73;WE=47162946;WS=47162928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr12	47163306	rs180403	C	T	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.878;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.78;ReadPosRankSum=-0.790;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr12	47168898	rs180414	G	A	5650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=98;NR=88;PP=2965;SC=CCATGAGAAGGGGGATGTCTA;SOR=0.722;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=186;TCF=98;TCR=88;TR=186;WE=47168906;WS=47168888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr12	47170621	rs12316767	C	A	1026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.583;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=13;PP=546;ReadPosRankSum=-2.625;SC=AAAATCATACCTACCCAGGTC;SOR=0.535;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=101;TCF=75;TCR=26;TR=45;WE=47170629;WS=47170611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,52:0.44:117
chr12	47170887	rs180419	C	A	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=21;PP=450;ReadPosRankSum=-0.474;SC=CTATATTGCTCATCATGAAGA;SOR=0.650;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=52;TCF=9;TCR=43;TR=26;WE=47170895;WS=47170877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,26:0.49:53
chr12	47170910	rs2430922	A	G	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=200;ReadPosRankSum=0.512;SC=TATTTAGTACATAAACTTATA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=11;WE=47170918;WS=47170900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr12	47173662	rs180426	A	G	2276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.488;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=45;PP=1288;ReadPosRankSum=0.374;SC=GTGAGAGACAAGGATATTAGA;SOR=0.765;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=204;TCF=110;TCR=94;TR=100;WE=47173670;WS=47173652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,113:0.50:224
chr12	47173830	rs2287471	G	A	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=319;ReadPosRankSum=-0.131;SC=TGGAAAATGTGACAGCTTAAT;SOR=0.856;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=20;WE=47173838;WS=47173820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,24:0.57:42
chr12	47178307	rs180430	A	G	1513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.652;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=20;PP=840;ReadPosRankSum=0.323;SC=GGATCCATTGAAAAGTATATC;SOR=0.806;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=118;TCF=75;TCR=43;TR=58;WE=47178315;WS=47178297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,69:0.51:136
chr12	47471439	rs2269828	G	A	7676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.98;NF=122;NR=121;PP=2965;SC=CATCACTAGCGGGGCCAGGAC;SOR=0.737;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=243;TCF=122;TCR=121;TR=243;WE=47471447;WS=47471429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr12	47581629	rs832733	T	C	1018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.734;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=16;PP=485;ReadPosRankSum=-2.106;SC=CATTTCCACCTAGACGGGCCT;SOR=0.710;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=87;TCF=46;TCR=41;TR=39;WE=47581637;WS=47581619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,50:0.48:104
chr12	47761313	.	AT	A	79.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.681;ClippingRankSum=0.000;DP=173;ExcessHet=3.0103;FS=2.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.60;ReadPosRankSum=1.360;SOR=0.945;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:113,20:0.15:133
chr12	48081539	rs7136422	C	T	1036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=3;PP=809;SC=GCATTTAATTCCCAATTCCTA;SOR=4.112;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=32;WE=48081547;WS=48081529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr12	48081637	rs7136561	C	T	2838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.995;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=52;PP=1870;ReadPosRankSum=-1.486;SC=ATACATTGTACGTTGGAATAG;SOR=0.620;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=228;TCF=138;TCR=90;TR=133;WE=48081645;WS=48081627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,136:0.55:246
chr12	48091522	rs140915397	AACAGGG	A	2301.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.018;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=34;PP=2005;ReadPosRankSum=-0.329;SC=AAAGACGGAAAACAGGGGTCA;SOR=0.882;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=99;TCF=12;TCR=87;TR=39;WE=48091535;WS=48091512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,63:0.38:165
chr12	48104746	rs1235152	G	C	927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=25;PP=728;SC=CCCACTTCACGCTGCCTCTCC;SOR=2.694;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=31;WE=48104754;WS=48104736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr12	48110325	rs1235153	A	G	581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=14;PP=384;SC=CCCCAAACACAGGGCAGCGAC;SOR=1.329;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=9;TCR=14;TR=23;WE=48110333;WS=48110315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr12	48110608	rs2524318	A	G	370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.08;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	48110608	.	ACATCG	GCATCA,GCATCG	35	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.35;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=4,8;NR=0,0;PP=33,35;QD=21.6169687156;SC=AAAAGTCGAGACATCGAAAGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=4,8;WE=48110621;WS=48110598;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.50:8
chr12	48110613	rs2524317	G	A	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.881;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.78;ReadPosRankSum=-1.383;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr12	48131728	rs2072117	G	A	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=117;ReadPosRankSum=0.730;SC=CACATGGCAAGTGCCTAGGAT;SOR=0.892;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=36;TCF=22;TCR=14;TR=11;WE=48131736;WS=48131718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,13:0.34:38
chr12	48132451	rs2072116	T	C	2750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=34;PP=1484;SC=TAGTAGTGAATGCCTGCTCTC;SOR=1.072;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=57;TCR=34;TR=91;WE=48132459;WS=48132441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr12	48134214	rs10875687	G	C	2199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.368;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=59;PP=1123;ReadPosRankSum=-0.357;SC=TCAGGGTAAGGGAAGCAGCCA;SOR=0.940;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=174;TCF=77;TCR=97;TR=100;WE=48134222;WS=48134204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,106:0.56:188
chr12	48134300	rs12828238	G	A	1330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.760;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.851;NF=26;NR=24;PP=799;ReadPosRankSum=-0.560;SC=GAAGGCAGAGGCTCCAGGGGA;SOR=0.602;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=87;TCF=44;TCR=43;TR=50;WE=48134308;WS=48134290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,58:0.59:98
chr12	48134360	rs10875688	G	T	1413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.577;HP=5;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-0.890;NF=39;NR=27;PP=803;ReadPosRankSum=-1.493;SC=AAGCAAAGAGGGGGGCTTAGG;SOR=0.791;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=147;TCF=85;TCR=62;TR=66;WE=48134368;WS=48134350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,74:0.45:165
chr12	48134381	rs35703007	CG	C	5332.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=66;PP=2846;SC=AAAAGGTAGCCGGGGGGACTC;SOR=0.830;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=103;TCF=31;TCR=72;TR=91;WE=48134389;WS=48134371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr12	48134634	rs11168219	C	T	1886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=37;PP=1165;ReadPosRankSum=1.207;SC=GAGAGGTCAGCGAGTGCTGAG;SOR=0.665;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=185;TCF=103;TCR=82;TR=85;WE=48134642;WS=48134624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,91:0.46:197
chr12	48134695	rs2074533	T	C	7735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=147;NR=123;PP=2965;SC=CTGCCTCCCATACCTGGTGGA;SOR=0.802;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=270;TCF=147;TCR=123;TR=270;WE=48134703;WS=48134685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,289:1.00:289
chr12	48141798	rs56199059	T	C	870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.201;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=12;PP=534;ReadPosRankSum=-0.021;SC=AGATTTTCTCTCAACCCCACG;SOR=0.416;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=44;TCF=29;TCR=15;TR=30;WE=48141806;WS=48141788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,37:0.70:53
chr12	48141885	.	C	T	948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.742;ClippingRankSum=0.000;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.186;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=18;PP=589;ReadPosRankSum=1.035;SC=CAGAGTTGGGCGCTGGGCATG;SOR=0.994;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=118;TCF=68;TCR=50;TR=47;WE=48141893;WS=48141875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,51:0.38:135
chr12	48142343	rs12424297	T	C	1251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.484;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=22;PP=712;ReadPosRankSum=-0.028;SC=AAATGGCCAATCTTTGGCACT;SOR=0.865;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=104;TCF=54;TCR=50;TR=51;WE=48142351;WS=48142333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,61:0.53:115
chr12	48142418	rs757281	C	G	1584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=25;PP=875;SC=CATTTTTCTCCATTAGCCAGC;SOR=0.950;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=49;TCF=24;TCR=25;TR=49;WE=48142426;WS=48142408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr12	48142636	rs12422983	C	T	2283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.766;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=32;PP=1322;ReadPosRankSum=0.970;SC=CGGGAAGGGCCGGCGCCCTGA;SOR=1.118;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=186;TCF=111;TCR=75;TR=92;WE=48142644;WS=48142626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,105:0.50:209
chr12	48143095	rs149061709	G	GCTCTGGT	4984.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=19;PP=2704;SC=CAGGCCCTCTGCTCTGGTCCC;SOR=1.585;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=57;TCF=31;TCR=26;TR=39;WE=48143103;WS=48143085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr12	48143360	rs757280	T	C	105.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=4;PP=96;SC=CTGCCGCCCCTGCCGCCCCCA;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=48143368;WS=48143350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	48143978	rs12423645	C	T	1172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=18;PP=579;ReadPosRankSum=1.602;SC=GACAGGGCAGCGCCGGGGGCA;SOR=0.724;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=82;TCF=51;TCR=31;TR=46;WE=48143986;WS=48143968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,55:0.58:95
chr12	48144243	rs757279	A	C	1900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=31;PP=1080;SC=CACACTGTGAACTGTGGGCCC;SOR=1.054;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=58;TCF=27;TCR=31;TR=58;WE=48144251;WS=48144233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
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chr12	48145104	rs1018939	G	A	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.010;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=125;ReadPosRankSum=-1.280;SC=AGTAGTGCCTGCTTCCCAGGA;SOR=0.207;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=9;WE=48145112;WS=48145096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr12	48145153	rs757287	G	A	476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=8;PP=342;ReadPosRankSum=-0.194;SC=AGCCCAGCCCGGGGCACCCCA;SOR=0.782;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=35;TCF=22;TCR=13;TR=22;WE=48145161;WS=48145143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,21:0.58:36
chr12	48145171	rs757286	C	T	636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.731;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=11;PP=397;ReadPosRankSum=0.357;SC=CCACCCTGGGCTCGGGCTCAC;SOR=0.302;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=43;TCF=28;TCR=15;TR=28;WE=48145179;WS=48145161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,30:0.64:47
chr12	48151822	rs11168230	C	G	918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.534;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=19;PP=552;ReadPosRankSum=-0.657;SC=TCCTCCACAGCCAGGCCCACC;SOR=0.324;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=66;TCF=33;TCR=33;TR=40;WE=48151830;WS=48151812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,44:0.58:76
chr12	48164758	rs2544025	G	C	777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=22;PP=529;ReadPosRankSum=-0.038;SC=ATGCACTCCGGACCACGGGGC;SOR=0.606;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=43;TCF=2;TCR=41;TR=24;WE=48164766;WS=48164748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,27:0.59:46
chr12	48178127	rs3192737	A	G	1164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.765;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=28;PP=623;ReadPosRankSum=-1.358;SC=TCCTCCACTTAGGGTCGGCTC;SOR=0.483;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=84;TCF=31;TCR=53;TR=46;WE=48178135;WS=48178117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,54:0.55:98
chr12	48178465	rs3815138	T	C	2084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.549;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=40;PP=1015;ReadPosRankSum=1.508;SC=GAACACAACATGGGAGAACTG;SOR=0.912;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=216;TCF=122;TCR=94;TR=98;WE=48178473;WS=48178455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,109:0.45:244
chr12	48181778	rs6580637	T	C	2571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.674;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=47;PP=1662;ReadPosRankSum=1.602;SC=AGAGTAAGTGTCAGGAGGAGG;SOR=0.889;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=237;TCF=131;TCR=106;TR=115;WE=48181786;WS=48181768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,123:0.48:256
chr12	48185167	rs11832133	G	C	1990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=48;PP=1264;ReadPosRankSum=-0.907;SC=GGAGCCCAGAGAGCAGGGCCG;SOR=0.686;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=177;TCF=81;TCR=96;TR=90;WE=48185175;WS=48185157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,96:0.51:188
chr12	48185399	rs376563167	G	A	1535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.905;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=30;PP=890;ReadPosRankSum=1.519;SC=AGTTTGAGGCGGCTGAGCGGG;SOR=0.560;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=157;TCF=92;TCR=65;TR=71;WE=48185407;WS=48185389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,78:0.46:170
chr12	48185448	rs73107974	C	T	2487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.468;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=52;PP=1351;ReadPosRankSum=1.419;SC=CAGAGTGGACCGACTGCAGCT;SOR=0.656;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=218;TCF=120;TCR=98;TR=112;WE=48185456;WS=48185438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,124:0.52:240
chr12	48186560	.	A	T	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=5.540;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.556;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=245;ReadPosRankSum=-0.505;SC=AAAATGAAATACATTAATGAA;SOR=3.029;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=5;TCR=33;TR=13;WE=48186568;WS=48186550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,16:0.37:43
chr12	48272743	rs10783218	G	A	1870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.561;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=37;PP=1230;ReadPosRankSum=1.271;SC=CCTGGGAGGAGGGCTCACCTG;SOR=0.787;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=162;TCF=86;TCR=76;TR=80;WE=48272751;WS=48272733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,87:0.51:172
chr12	48272895	rs2228570	A	G	909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.841;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=28;PP=550;ReadPosRankSum=-2.069;SC=CATTGCCTCCATCCCTGTAAG;SOR=0.869;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=82;TCF=29;TCR=53;TR=43;WE=48272903;WS=48272885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,45:0.51:88
chr12	48358279	rs11609253	C	A	837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=20;PP=536;SC=GCCCAGACAACTTTTCTTCTA;SOR=2.621;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=27;WE=48358287;WS=48358269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	48397924	rs76609872	G	C	4679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=86;NR=74;PP=2229;SC=GTTTTAGCCCGGAGCCGCGGG;SOR=0.704;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=160;TCF=86;TCR=74;TR=160;WE=48397932;WS=48397914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr12	48413789	rs113940474	A	ATATTGT	8576.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.49;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=46;PP=2957;SC=AATTTGACAGATAAATTCCCT;SOR=1.329;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=87;TCF=38;TCR=49;TR=80;WE=48413797;WS=48413779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr12	48413944	rs7299135	C	T	7244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.91;SOR=1.242;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr12	48413950	rs28459711	A	C	7024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.03;SOR=1.261;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr12	48413979	rs7299364	G	T	2490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=47;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=56;PP=1812;SC=GCTGTCTCAGGGTGGTTTTAA;SOR=1.809;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=89;TCF=26;TCR=63;TR=82;WE=48413987;WS=48413969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr12	48441692	rs1018973	C	G	6519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=135;NR=80;PP=2965;SC=ATCAATCACTCCATTGAAGGT;SOR=1.377;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=215;TCF=135;TCR=80;TR=215;WE=48441700;WS=48441682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr12	48457385	rs3742074	C	T	310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=256;SC=GAGATGATTCCAATGCAGGTC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=48457393;WS=48457378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	48459488	rs17122612	C	G	5402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=98;PP=2965;SC=GGAACGTGACCAAATGTAGAC;SOR=1.052;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=178;TCF=80;TCR=98;TR=178;WE=48459496;WS=48459478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr12	48460563	rs77759793	G	A	526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=13;NR=4;PP=221;SC=CCAAAATGCTGGAATTACAGG;SOR=1.230;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=17;WE=48460571;WS=48460553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr12	48465425	rs72644844	A	C	1197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=11;PP=748;SC=TAATTAATAAAGAACAAGCTT;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=40;TCF=29;TCR=11;TR=39;WE=48465433;WS=48465415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr12	48468652	rs4258439	A	G	723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=20;PP=582;SC=GCATGTAAACAGAATCCTAGC;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=48468660;WS=48468642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr12	48477577	rs11613879	C	T	1656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=39;PP=1063;SC=AAGATAAGAACAGATAATAAG;SOR=2.794;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=11;TCR=39;TR=50;WE=48477585;WS=48477567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr12	48499131	rs2408955	G	T	2343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=51;NR=22;PP=1265;SC=ACGAGGCATAGATCCAGAGAT;SOR=1.312;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=51;TCR=22;TR=73;WE=48499139;WS=48499121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr12	48501161	rs11609399	A	T	3224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=39;PP=1956;SC=GCAGCCATGCATAAAGACGAG;SOR=1.290;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=67;TCR=39;TR=106;WE=48501169;WS=48501151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr12	48501411	rs10492080	A	G	308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=7;PP=170;SC=TGTATTTTCCAGGTAAGATTT;SOR=2.494;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=48501419;WS=48501401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	48512285	rs4760682	C	A	4002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=72;NR=69;PP=2446;SC=GGTAGAGATACAAGTAAGCAA;SOR=0.733;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=141;TCF=72;TCR=69;TR=141;WE=48512293;WS=48512275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr12	48741964	rs78809888	A	G	2911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=54;PP=1684;SC=TAAGGGAGTTATGAAGAACAG;SOR=1.336;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=36;TCR=54;TR=90;WE=48741972;WS=48741954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr12	48866585	rs7956679	A	C	4295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=73;PP=2779;SC=AACTGGAATTATTAAATACAA;SOR=0.850;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=142;TCF=69;TCR=73;TR=141;WE=48866593;WS=48866575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr12	48866792	rs7966826	C	T	7042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=122;NR=109;PP=2965;SC=TAGAAAACCTCGAGAGCTTAG;SOR=0.834;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=231;TCF=122;TCR=109;TR=231;WE=48866800;WS=48866782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr12	48877193	rs11832311	T	C	3961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=73;PP=2602;SC=TGCTATACTCTATGGGAGAAG;SOR=1.063;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=128;TCF=55;TCR=73;TR=128;WE=48877201;WS=48877183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr12	48879908	rs4620769	T	C	2616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=33;PP=1473;SC=AGGAGAAGGCTTTAGCCCACA;SOR=0.866;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=82;TCF=49;TCR=33;TR=82;WE=48879916;WS=48879898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr12	48880090	rs2068293	C	G	300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=253;SC=AAAAAAAAAGCTACCTGACAA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=48880098;WS=48880080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	48880381	rs2731091	A	G	6801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=125;NR=105;PP=2965;SC=TCCAAGAAACATCTTGTCTTC;SOR=0.797;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=230;TCF=125;TCR=105;TR=230;WE=48880389;WS=48880371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr12	48884535	rs2731102	GT	CC	14113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=152;NR=109;PP=2947;SC=AGCTAATACAGTGCAGGTCTG;SOR=0.841;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=272;TCF=154;TCR=118;TR=261;WE=48884544;WS=48884525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,316:1.00:316
chr12	48888763	rs2705132	A	G	1871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=39;PP=1111;SC=CTTCCGCCAGATGCTTTACCC;SOR=1.646;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=20;TCR=39;TR=59;WE=48888771;WS=48888753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr12	48919556	rs2731073	A	G	5856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=112;NR=94;PP=2965;SC=GCTGCTGCTCATGATCAGGGC;SOR=0.746;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=206;TCF=112;TCR=94;TR=206;WE=48919564;WS=48919546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr12	48919659	rs4075258	T	C	4539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=70;NR=77;PP=2238;SC=CCCAAGATGCTGGAGAACCTC;SOR=0.992;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=147;TCF=70;TCR=77;TR=147;WE=48919667;WS=48919649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr12	48919796	rs12425460	C	T	4696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=60;PP=2541;SC=TGCCATCTGCCGCCCACTACT;SOR=0.967;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=147;TCF=87;TCR=60;TR=147;WE=48919804;WS=48919786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr12	48920006	rs12425518	G	A	6706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=120;NR=96;PP=2965;SC=AAGCCTCATCGCCTTGCTCTG;SOR=0.861;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=216;TCF=120;TCR=96;TR=216;WE=48920014;WS=48919996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr12	48921533	rs7299323	C	T	393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=325;SC=TTTACAATTGCCTAACTTACT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=48921541;WS=48921528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	48954040	rs1807757	A	G	4535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=75;PP=2712;SC=GTTTCAGGCCATGTGTCATCC;SOR=0.791;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=155;TCF=80;TCR=75;TR=155;WE=48954048;WS=48954030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr12	49048738	rs3741628	G	T	2388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.490;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=35;PP=1294;ReadPosRankSum=1.572;SC=ATATCCACTGGGTCTTCAGCA;SOR=0.739;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=195;TCF=121;TCR=74;TR=95;WE=49048746;WS=49048728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,115:0.51:227
chr12	49048985	rs6580690	G	A	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-4.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=182;ReadPosRankSum=-0.551;SC=TTTTACAAGAGCGTCCAACAA;SOR=0.416;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=13;WE=49048993;WS=49048975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr12	49054491	rs3741629	G	C	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.52;BaseQRankSum=0.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=114;ReadPosRankSum=-0.897;SC=AACTCAAGGTGTGGACTATAT;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=7;WE=49054499;WS=49054481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,10:0.83:12
chr12	49073358	rs3741630	A	T	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=358;ReadPosRankSum=-1.455;SC=TGCCAAATAGATCAAGGCATT;SOR=0.957;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=38;TCF=30;TCR=8;TR=22;WE=49073366;WS=49073348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,22:0.55:40
chr12	49075811	rs2277365	T	G	1799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.606;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=42;PP=1202;ReadPosRankSum=0.237;SC=CATTTTGTCCTACGGCTCCAG;SOR=0.971;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=149;TCF=70;TCR=79;TR=74;WE=49075819;WS=49075801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,81:0.49:164
chr12	49076036	rs10783277	T	C	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=250;ReadPosRankSum=0.552;SC=CCAGCGGCTCTCAGATCGGCC;SOR=0.610;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=10;WE=49076044;WS=49076026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr12	49086963	rs3741632	G	A	1528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.588;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=33;PP=893;ReadPosRankSum=-0.592;SC=CAAATGCAGTGGGCTGAGTGG;SOR=0.748;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=137;TCF=71;TCR=66;TR=68;WE=49086971;WS=49086953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,75:0.49:154
chr12	49093729	rs7308699	C	T	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.712;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=89;ReadPosRankSum=1.180;SC=GGTTTCCACACTAAAATATTA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=5;WE=49093737;WS=49093719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr12	49108488	rs7138930	C	T	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.078;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=182;ReadPosRankSum=-0.831;SC=TAATCGCCAACTGACACTTAG;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=10;WE=49108496;WS=49108478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
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chr12	49177113	rs2453486	T	G	2799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.086;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=52;PP=1718;ReadPosRankSum=-0.402;SC=AGAAGCCACCTGCCCGAGTGC;SOR=0.500;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=197;TCF=114;TCR=83;TR=116;WE=49177121;WS=49177103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,130:0.59:220
chr12	49218171	rs2070615	A	G	2331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.463;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=52;PP=1347;ReadPosRankSum=0.878;SC=GAGTTGGGCCATGAGTCAGTA;SOR=0.726;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=226;TCF=120;TCR=106;TR=112;WE=49218179;WS=49218161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,120:0.49:244
chr12	49218810	rs11379348	G	GT	1126.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.877;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.137;NF=7;NR=19;PP=948;ReadPosRankSum=-0.652;SC=TGGGGACAGTGTTCTAGGCAG;SOR=0.412;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=63;TCF=15;TCR=48;TR=26;WE=49218818;WS=49218800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,41:0.45:92
chr12	49219569	rs2453469	A	G	1236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.726;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=39;PP=881;ReadPosRankSum=-1.962;SC=AGTCCCCACCACCTGCTTCTG;SOR=0.912;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=106;TCF=31;TCR=75;TR=54;WE=49219577;WS=49219559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,55:0.50:109
chr12	49221622	rs1045340	G	A	8913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=144;NR=175;PP=2965;SC=AGGACTCAGAGCACAACCACA;SOR=0.922;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=319;TCF=144;TCR=175;TR=319;WE=49221630;WS=49221612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,337:1.00:337
chr12	49228077	rs2453473	G	C	769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=12;PP=509;ReadPosRankSum=3.274;SC=CAGACAGCAGGCTGGCTGCTA;SOR=0.669;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=63;TCF=42;TCR=21;TR=34;WE=49228085;WS=49228067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,36:0.51:70
chr12	49230035	rs1057908	T	G	2442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=37;PP=1540;SC=CCTGACGCTGTATAGGTGTTG;SOR=0.715;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=45;TCR=37;TR=82;WE=49230043;WS=49230025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr12	49237652	rs2446993	G	A	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.323;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=171;ReadPosRankSum=-0.439;SC=TTCATAAGAAGCTGAGCAAAC;SOR=0.148;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=14;WE=49237660;WS=49237642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr12	49238024	rs2446994	G	A	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-1.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=187;ReadPosRankSum=0.588;SC=AAATATTAACGGCAATGACAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=9;WE=49238032;WS=49238014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr12	49255798	rs1565933	G	C	1678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.550;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=34;PP=1025;ReadPosRankSum=0.506;SC=TTACCTTCTTGAGTGCGCTGT;SOR=0.661;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=163;TCF=84;TCR=79;TR=74;WE=49255806;WS=49255788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,81:0.45:180
chr12	49259194	rs2453489	T	G	462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=5;PP=366;SC=ATCTGATGGGTCCTCTGGGTG;SOR=1.739;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=18;WE=49259202;WS=49259184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	49298059	rs3809147	G	A	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-1.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=82;ReadPosRankSum=-0.856;SC=TTTCTTCTAAGCTCTGTAACG;SOR=0.591;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=8;WE=49298067;WS=49298049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr12	49298340	rs3825184	C	T	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.531;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=8;PP=160;ReadPosRankSum=-1.008;SC=TCATCCTGACCTCCCCTCCTC;SOR=0.446;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=23;TCF=10;TCR=13;TR=15;WE=49298348;WS=49298330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr12	49308284	rs10747556	A	G	2335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=42;PP=1237;ReadPosRankSum=1.651;SC=CTGCAGAGGCACCGGCTCAGT;SOR=0.686;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=213;TCF=121;TCR=92;TR=100;WE=49308292;WS=49308274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,113:0.48:235
chr12	49310724	rs10875891	GA	AG	2486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=18;PP=1507;ReadPosRankSum=-0.178;SC=GTATCCCTCAGAGCAGGGACA;SOR=0.642;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=129;TCF=85;TCR=44;TR=52;WE=49310733;WS=49310714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,66:0.46:142
chr12	49312593	rs10875893	A	G	1407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.319;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=26;PP=867;ReadPosRankSum=1.643;SC=AGGCCCAAAGAACTCAGGCCC;SOR=1.044;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=167;TCF=96;TCR=71;TR=65;WE=49312601;WS=49312583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,74:0.39:190
chr12	49314862	rs10875894	C	A	1166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=22;PP=725;ReadPosRankSum=-0.101;SC=AGGAGCTCACCAAGGTAAAGC;SOR=0.748;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=90;TCF=49;TCR=41;TR=49;WE=49314870;WS=49314852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,52:0.57:92
chr12	49314994	rs4760600	A	G	2452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.511;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=39;PP=1397;ReadPosRankSum=0.604;SC=TGGAAAAGGTACAACAAAGTG;SOR=0.751;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=182;TCF=106;TCR=76;TR=95;WE=49315002;WS=49314984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,111:0.54:206
chr12	49315200	rs117927481	G	A	2524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=60;PP=1529;ReadPosRankSum=0.395;SC=AGCCCATCCAGGTGATAAACA;SOR=0.722;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=253;TCF=115;TCR=138;TR=109;WE=49315208;WS=49315190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,125:0.44:286
chr12	49319036	rs12829682	A	C	10939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=393;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=168;NR=186;PP=2965;SC=ATTACCACCCAACAAGGCTCG;SOR=0.851;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=354;TCF=168;TCR=186;TR=354;WE=49319044;WS=49319026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,393:1.00:393
chr12	49319270	rs2272312	C	T	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=80;ReadPosRankSum=-0.431;SC=TGGCGGCAGCCAGGACAGCGT;SOR=1.230;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=7;WE=49319278;WS=49319260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr12	49325142	rs11168794	G	A	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=270;ReadPosRankSum=-0.551;SC=AGTAGGAGAAGGTGGTAGTAG;SOR=0.596;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=37;TCF=26;TCR=11;TR=18;WE=49325150;WS=49325132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,19:0.42:45
chr12	49332092	rs1054376	G	A	35.85	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.96;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr12	49332366	rs4760666	C	T	1815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=34;PP=1030;ReadPosRankSum=1.611;SC=CTTGTGGGGACAGGGAAAGGA;SOR=0.662;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=153;TCF=87;TCR=66;TR=78;WE=49332374;WS=49332356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,85:0.51:167
chr12	49332451	rs148694584	T	TGA	2272.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=32;PP=1297;ReadPosRankSum=0.732;SC=ACCCAGAGGGTGAGAGAGAGA;SOR=0.707;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=90;TCF=9;TCR=81;TR=35;WE=49332460;WS=49332441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,73:0.45:164
chr12	49333248	rs833831	T	G	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.183;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=117;ReadPosRankSum=0.648;SC=TCCTGAGGACTGAAATGTTGC;SOR=0.105;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=10;WE=49333256;WS=49333241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
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chr12	49334044	rs708242	G	C	888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=23;PP=667;SC=TAATCGTTAAGCTAGCAGCCT;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=24;WE=49334052;WS=49334034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr12	49334762	rs12122	G	C	2837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=32;PP=1674;SC=CGATCTCCCCGAGTTTCAGCT;SOR=1.189;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=55;TCR=32;TR=87;WE=49334770;WS=49334752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr12	49334982	rs10747557	G	C	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.621;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=319;ReadPosRankSum=-0.514;SC=CTAGACAAAGGAAATGTAAAA;SOR=0.357;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=41;TCF=6;TCR=35;TR=18;WE=49334990;WS=49334972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,21:0.47:45
chr12	49359989	rs1051886	G	A	2579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.045;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=65;PP=1513;ReadPosRankSum=-0.594;SC=GGAGCACGTTGTGCCCACGGC;SOR=0.829;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=247;TCF=109;TCR=138;TR=115;WE=49359997;WS=49359979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,127:0.47:272
chr12	49362779	rs833834	T	G	1664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=36;NR=13;PP=908;SC=GGAGAGAGGTTGGGGAGTGAT;SOR=1.460;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=36;TCR=13;TR=49;WE=49362787;WS=49362769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr12	49364391	rs833843	G	A	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.468;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=95;ReadPosRankSum=-0.984;SC=CAGGAATAGGGCGGCTCGCTT;SOR=0.132;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=8;WE=49364399;WS=49364381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr12	49390677	rs10783299	T	C	2965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=78;PP=1987;ReadPosRankSum=-1.803;SC=GTTTCCAACCTCGGGCAGGGT;SOR=0.694;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=233;TCF=95;TCR=138;TR=129;WE=49390685;WS=49390667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,134:0.54:250
chr12	49397291	.	G	GC	344.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.573;ClippingRankSum=0.000;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=6.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQRankSum=0.000;QD=4.06;ReadPosRankSum=-0.583;SOR=1.559;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,23:0.27:85
chr12	49398862	rs2293445	G	A	2047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=41;PP=1169;ReadPosRankSum=1.478;SC=CCAGAAACCCGCCATCCCTTT;SOR=0.664;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=202;TCF=110;TCR=92;TR=90;WE=49398870;WS=49398852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,102:0.44:231
chr12	49418435	rs55776396	A	C	1582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=26;PP=1122;ReadPosRankSum=0.346;SC=GCAGCTCCATAAGGGGGTGGC;SOR=0.696;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=126;TCF=75;TCR=51;TR=66;WE=49418443;WS=49418425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,69:0.52:133
chr12	49426460	rs80132640	A	G	2210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=53;PP=1310;ReadPosRankSum=1.173;SC=CCAGGGCTAGAAAAGTGTTGA;SOR=0.709;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=182;TCF=73;TCR=109;TR=88;WE=49426468;WS=49426450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,103:0.50:205
chr12	49427652	rs3782357	C	T	1401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=25;PP=885;ReadPosRankSum=3.378;SC=CAGCTGAGTGCTGTTGCTGTT;SOR=0.669;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=121;TCF=75;TCR=46;TR=62;WE=49427674;WS=49427642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,67:0.50:135
chr12	49434074	rs10747559	C	A	1208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.821;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=23;PP=698;ReadPosRankSum=0.675;SC=CTGCTGGGAACCCCCCAGCCC;SOR=0.425;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=80;TCF=40;TCR=40;TR=49;WE=49434082;WS=49434064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,56:0.61:92
chr12	49437399	rs78764337	T	G	793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.064;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=17;PP=496;ReadPosRankSum=0.134;SC=CTCACACCACTCACTCCCACA;SOR=0.420;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=61;TCF=26;TCR=35;TR=31;WE=49437407;WS=49437389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,36:0.54:67
chr12	49438164	rs75566539	C	T	2499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FS=3.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.33;ReadPosRankSum=2.601;SOR=0.509;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:120,122:0.50:242
chr12	49439659	rs833818	C	T	1654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=13;PP=1252;SC=AGATGATGTCCGACGTCTGGT;SOR=2.221;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=57;TCF=43;TCR=14;TR=56;WE=49439667;WS=49439649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr12	49442356	rs5798089	C	CA	2096.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.650;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.285;NF=29;NR=19;PP=1756;ReadPosRankSum=-0.769;SC=TGGGTATCCCCAAAGTAGGTC;SOR=0.784;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=92;TCF=52;TCR=40;TR=48;WE=49442364;WS=49442346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,79:0.54:145
chr12	49442561	rs55776244	CAG	C	1924.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.891;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=35;PP=1552;ReadPosRankSum=0.240;SC=ACCTGATGGGCAGAGAGTTAT;SOR=0.929;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=66;TCF=2;TCR=64;TR=37;WE=49442570;WS=49442551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,52:0.56:93
chr12	49444545	rs2241726	G	A	1956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.567;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=35;PP=1295;ReadPosRankSum=-2.562;SC=CAGCTGTGATGATGGGTGAGA;SOR=0.607;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=156;TCF=97;TCR=59;TR=85;WE=49444553;WS=49444535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,93:0.53:174
chr12	49448463	rs55865069	C	T	2159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.820;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=52;PP=1402;ReadPosRankSum=0.513;SC=CTCAAAGCGCCGTAGCTCCCG;SOR=0.872;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=227;TCF=114;TCR=113;TR=101;WE=49448471;WS=49448453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,107:0.44:245
chr12	49460135	rs77472342	C	T	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=319;ReadPosRankSum=-1.070;SC=CAAGGCTGGACGACTCCTTAT;SOR=0.622;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=25;TCF=9;TCR=16;TR=16;WE=49460143;WS=49460125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr12	49463352	rs71080168	CT	C	8246.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.40;SOR=1.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr12	49463353	.	TC	CT	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MMLQ=26;MQ=60.0;NF=71;NR=40;PP=2947;QD=20;SC=CACCACCAACTCTTCCAATCC;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=126;TCF=78;TCR=48;TR=111;WE=49463381;WS=49463343;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:15,111:0.88:126
chr12	49463356	.	TCCAATCCTCCACTCTTCC	TTCCTCCACTCTTCC,T	8356.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.41;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=21;NR=42;PP=2930;SC=CACCAACTCTTCCAATCCTCC;SOR=1.885;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=68;TCF=23;TCR=45;TR=63;WE=49463381;WS=49463343;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:183
chr12	49463361	rs200055056	TCCTCCACTCTTCC	T	8295.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.23;QD=44.36;SOR=1.850;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr12	49494862	rs35472356	C	CA	276.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.720;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=223;ReadPosRankSum=-0.116;SC=GCCCTCCTTTCAAATTAAGTC;SOR=1.095;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=8;WE=49494870;WS=49494852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr12	49497049	rs80218878	G	A	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=145;ReadPosRankSum=2.111;SC=CAGGGGTTAGGCAATTAATAC;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=10;WE=49497057;WS=49497039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr12	49497464	rs11834849	G	A	1278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.650;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=19;PP=612;ReadPosRankSum=0.471;SC=AAGCTGGGCCGCTCACCATAG;SOR=0.418;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=103;TCF=70;TCR=33;TR=51;WE=49497472;WS=49497454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,60:0.52:115
chr12	49498130	rs10783302	G	T	1297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.800;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=13;PP=822;ReadPosRankSum=1.716;SC=TCAAACTTCCGTTAACTAAAC;SOR=0.555;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=80;TCR=26;TR=53;WE=49498138;WS=49498120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,57:0.50:113
chr12	49582053	.	G	GT	68.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.269;ClippingRankSum=0.000;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=1.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQRankSum=2.330;QD=0.78;ReadPosRankSum=-1.672;SOR=0.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,14:0.16:88
chr12	49667103	rs9668136	A	T	1398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=20;NR=32;PP=883;SC=ATAAAATTGAAGTTTCCATTT;SOR=1.287;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=20;TCR=32;TR=52;WE=49667111;WS=49667093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr12	49689152	.	C	T	2205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=0.000;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.143;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=48;PP=1345;ReadPosRankSum=-1.508;SC=CTCGGTGCGCCTGGGCAGCTT;SOR=0.825;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=174;TCF=83;TCR=91;TR=89;WE=49689160;WS=49689142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,100:0.53:187
chr12	49689917	rs201983319	G	A	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=10;PP=442;ReadPosRankSum=-0.299;SC=GTGCGAGCTGGGCGGCGACCC;SOR=0.839;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=54;TCF=35;TCR=19;TR=30;WE=49689925;WS=49689907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,32:0.57:56
chr12	49937654	rs11337899	GC	G	680.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.432;NF=13;NR=8;PP=374;ReadPosRankSum=0.992;SC=AAGAGTGGCTGCCCCCCCAGC;SOR=0.663;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=69;TCF=42;TCR=27;TR=21;WE=49937662;WS=49937644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,33:0.34:96
chr12	50174307	rs111500583	CA	C	522.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=8.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=2.079;QD=7.47;ReadPosRankSum=1.360;SOR=0.129;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,41:0.59:70
chr12	50290728	rs297935	A	G	947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=5;PP=704;SC=CTACGGGCTCAGATTAGGTCA;SOR=3.193;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=33;WE=50290736;WS=50290718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr12	50297670	rs706795	T	C	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=192;ReadPosRankSum=-0.663;SC=GCGTGGGTTCTAGCAACATCC;SOR=0.646;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=11;WE=50297678;WS=50297660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr12	50304588	rs487165	A	T	5607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=113;NR=86;PP=2965;SC=AGGCATCGGCATTCTGAGTCG;SOR=0.896;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=199;TCF=113;TCR=86;TR=199;WE=50304596;WS=50304578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr12	50304949	rs450798	G	A	2104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=45;PP=1307;SC=TTTCCCCAGGGTCTCACGGGT;SOR=1.673;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=20;TCR=45;TR=65;WE=50304957;WS=50304931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr12	50305007	rs394119	C	T	480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=15;PP=390;SC=TCCGTTTCTCCACCAGATGGA;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=50305015;WS=50304997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	50344976	rs3741559	G	A	1543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=27;PP=797;ReadPosRankSum=-1.016;SC=TCAATGCTGTGAGTAGCCACA;SOR=0.699;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=101;TCF=53;TCR=48;TR=59;WE=50344984;WS=50344966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,73:0.62:118
chr12	50348078	rs426496	T	C	2178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.455;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=34;PP=1337;ReadPosRankSum=-1.322;SC=TAGGCTTCTCTGTGGCCCTGG;SOR=0.905;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=195;TCF=124;TCR=71;TR=99;WE=50348086;WS=50348068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,102:0.49:207
chr12	50348674	rs402813	C	T	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.944;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.42;ReadPosRankSum=-1.180;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr12	50349090	rs410837	A	G	829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=4;PP=581;ReadPosRankSum=-0.669;SC=CGGGGAGGAGAGGTGCGGCCG;SOR=1.675;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=27;WE=50349098;WS=50349080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,29:0.97:30
chr12	50349123	rs371777	C	A	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=161;ReadPosRankSum=0.177;SC=CCGGGGCCTGCGGGCTCCGCG;SOR=0.646;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=47;TCF=33;TCR=14;TR=14;WE=50349131;WS=50349113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,15:0.29:51
chr12	50349143	rs403201	C	G	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=7;PP=178;ReadPosRankSum=-0.685;SC=GTGCCGGTGCCGGCGCGGGTG;SOR=0.789;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=65;TCF=40;TCR=25;TR=19;WE=50349151;WS=50349133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,20:0.29:69
chr12	50349411	rs457487	C	A	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=170;ReadPosRankSum=1.458;SC=GCGGCCTCTACGGCCCCGACG;SOR=0.437;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=10;WE=50349419;WS=50349401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr12	50349765	rs467323	C	T	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=11;PP=275;ReadPosRankSum=0.173;SC=TTGGGGGTTCCGGGAATGATG;SOR=0.804;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=12;TCR=17;TR=19;WE=50349773;WS=50349755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,21:0.68:31
chr12	50356174	rs139560378	TGGG	T,TGG	763.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=0,0;NR=14,14;PP=155,125;SC=GTGAGTGCCCTGGGGGGGGGG;SOR=1.931;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=14,14;WE=50356184;WS=50356164;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.68,0.32:22
chr12	50358054	rs3736309	A	G	821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.889;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=19;PP=420;ReadPosRankSum=-2.526;SC=CTGTGGGTCTAGAGCTTGGGG;SOR=0.560;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=27;TCR=39;TR=33;WE=50358062;WS=50358044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,39:0.49:79
chr12	50358073	rs296753	C	G	1479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=17;NR=31;PP=910;SC=GGGTGGGCCACGGAGTGGTGG;SOR=1.791;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=17;TCR=31;TR=48;WE=50358081;WS=50358063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr12	50368013	rs296748	C	T	936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=14;PP=780;SC=TGTCACCCCCCTCCAGCTGAG;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=15;TCR=14;TR=29;WE=50368021;WS=50368003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	50384171	rs2292720	T	C	654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.73;ReadPosRankSum=-1.617;SOR=0.660;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,36:0.48:75
chr12	50384260	rs73119644	T	C	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=60;ReadPosRankSum=-1.247;SC=TGCTTAAGTATTCTTAGTCAC;SOR=0.065;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=7;WE=50384268;WS=50384250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr12	50386015	rs296737	C	T	1710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.534;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=47;ReadPosRankSum=-0.518;SC=CACACACACACGCACCTGCCT;SOR=0.900;Source=Platypus;TCF=74;TR=78;WE=50386023;WS=50386005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,85:0.43:196
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chr12	50393372	rs378943	G	T	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=344;ReadPosRankSum=-1.549;SC=TTTTACACAGGCCAGTTTAGT;SOR=1.179;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=21;WE=50393380;WS=50393362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,22:0.76:29
chr12	50410533	rs2291612	C	T	990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.446;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=23;PP=532;ReadPosRankSum=-1.625;SC=CATTAGGGGTCCTGCCTTCTC;SOR=0.462;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=106;TCF=47;TCR=59;TR=46;WE=50410541;WS=50410523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,51:0.44:116
chr12	50452708	rs653576	C	G	4412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=68;PP=2656;SC=TCCTGGGCTCCCTGGCTGTGC;SOR=0.857;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=151;TCF=83;TCR=68;TR=151;WE=50452716;WS=50452698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr12	50467644	rs706792	G	T	1736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.579;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=35;PP=1169;ReadPosRankSum=-0.448;SC=GGTGCTGTGGGCGGTGGCCTT;SOR=0.722;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=150;TCF=78;TCR=72;TR=71;WE=50467652;WS=50467634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,78:0.48:161
chr12	50467769	rs706793	G	A	3094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=363;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.248;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.853;NF=73;NR=60;PP=1867;ReadPosRankSum=-0.327;SC=TGGCCTTCCCGGCAGTCACCC;SOR=0.624;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=311;TCF=175;TCR=136;TR=133;WE=50467777;WS=50467759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:209,154:0.42:363
chr12	50471630	rs2272391	A	G	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.605;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=84;ReadPosRankSum=0.520;SC=ACCCAGAAGGAGGCTAGGGGG;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=5;WE=50471638;WS=50471623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,5:0.24:21
chr12	50473660	rs404751	A	G	1090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=5;PP=690;SC=CACTCAACTGAGACCTCTCAC;SOR=2.712;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=30;WE=50473668;WS=50473650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	50482211	rs646782	T	C	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.226;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=432;ReadPosRankSum=0.455;SC=TGAGTTTTTTTCCATTGTTGT;SOR=2.004;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=44;TCF=13;TCR=31;TR=22;WE=50482219;WS=50482201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,22:0.49:45
chr12	50498139	rs836178	T	G	884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=13;PP=557;ReadPosRankSum=-0.966;SC=AGATGAGAAGTGGGGCTCCCT;SOR=0.634;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=75;TCF=47;TCR=28;TR=36;WE=50498147;WS=50498129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,41:0.51:81
chr12	50503269	rs836180	C	T	1758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=42;PP=1110;ReadPosRankSum=0.316;SC=GTGAATTCATCCACTGCCTGC;SOR=0.729;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=180;TCF=89;TCR=91;TR=81;WE=50503277;WS=50503259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,84:0.42:201
chr12	50513687	rs7961065	C	T	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.745;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=100;ReadPosRankSum=0.441;SC=TTTACCTAGACATAGGGGCCA;SOR=0.283;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=8;WE=50513695;WS=50513683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr12	50529314	rs11169281	C	T	1285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=23;PP=806;ReadPosRankSum=0.867;SC=GCTAGAAATACGGTCTGAGGC;SOR=0.681;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=160;TCF=98;TCR=62;TR=62;WE=50529322;WS=50529304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,66:0.38:175
chr12	50529736	rs3741562	G	A	3077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.118;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=65;PP=1672;ReadPosRankSum=0.609;SC=CCAGCAAGAAGTCTGAGACAT;SOR=0.782;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=264;TCF=136;TCR=128;TR=124;WE=50529744;WS=50529726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,143:0.48:299
chr12	50529936	rs7136570	A	G	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=306;ReadPosRankSum=0.339;SC=ATTATTCTCTAAGAATCTTAC;SOR=1.436;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=15;WE=50529944;WS=50529926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr12	50537815	rs7302981	A	G	1331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.178;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=34;PP=885;ReadPosRankSum=-0.688;SC=ATGCCAATACAGAGTGCACAG;SOR=0.463;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=126;TCF=51;TCR=75;TR=61;WE=50537823;WS=50537805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,64:0.48:134
chr12	50599709	rs2302900	T	C	1076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.750;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=18;PP=618;ReadPosRankSum=0.084;SC=GTCCAAAAGATGTTACTACTA;SOR=0.416;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=88;TCF=58;TCR=30;TR=48;WE=50599717;WS=50599699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,53:0.54:98
chr12	50599984	rs1362984	T	A	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.992;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=304;ReadPosRankSum=0.126;SC=GAATTTTTTTTAAATTACAAA;SOR=1.460;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=16;WE=50599992;WS=50599974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr12	50616346	rs3812825	A	G	1929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=48;PP=1284;ReadPosRankSum=-0.231;SC=GTAAAATGAAAGTTAAAACTC;SOR=0.707;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=188;TCF=86;TCR=102;TR=88;WE=50616354;WS=50616336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,93:0.46:201
chr12	50727706	rs6580741	G	C	1152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.804;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=17;PP=722;ReadPosRankSum=0.158;SC=GGTTGAATACGTGTATCATTT;SOR=0.368;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=111;TCF=78;TCR=33;TR=49;WE=50727714;WS=50727696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,54:0.44:122
chr12	50744094	rs7296277	G	A	2683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=28;PP=1603;SC=AAAACTAGACGTAAATAATTA;SOR=1.426;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=60;TCR=28;TR=88;WE=50744102;WS=50744084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr12	50744119	rs7296291	G	A	1633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.297;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=22;PP=894;ReadPosRankSum=0.009;SC=TACCTGGCATGCTGGATCAGC;SOR=0.814;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=139;TCF=95;TCR=44;TR=71;WE=50744127;WS=50744109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,79:0.51:155
chr12	50744171	rs7312252	T	C	2148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.460;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=44;PP=1150;ReadPosRankSum=-1.326;SC=CCAACTGAACTGTGTCCATAT;SOR=0.735;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=226;TCF=128;TCR=98;TR=100;WE=50744179;WS=50744161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,111:0.44:253
chr12	50744753	rs10506292	T	C	3117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=64;PP=1976;ReadPosRankSum=0.248;SC=TTGCCAATCTTTTCTTAGCAA;SOR=0.719;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=221;TCF=100;TCR=121;TR=117;WE=50744761;WS=50744743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,133:0.54:248
chr12	50746348	rs7304951	A	G	3706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=62;PP=2374;SC=TGAGGGGTGAAAGGGATCCCC;SOR=0.912;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=56;TCR=62;TR=118;WE=50746356;WS=50746338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
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chr12	50747005	rs10876024	T	C	1672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.721;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-1.691;NF=41;NR=37;PP=1194;ReadPosRankSum=1.347;SC=AGAGAGACCCTCAGGGCCTGG;SOR=0.516;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=153;TCF=75;TCR=78;TR=78;WE=50747015;WS=50746995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,79:0.51:154
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chr12	50754563	rs12303082	T	G	1214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=15;PP=655;ReadPosRankSum=1.333;SC=TGTTTCTTCTTTTCGTCGAGG;SOR=0.748;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=76;TCR=33;TR=50;WE=50754571;WS=50754553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,60:0.46:131
chr12	50796555	rs368134552	A	T	1613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.544;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=30;PP=976;ReadPosRankSum=0.957;SC=ATGTCAAATCATGGACGGGAT;SOR=0.750;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=160;TCF=95;TCR=65;TR=72;WE=50796563;WS=50796545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,82:0.45:183
chr12	50829263	rs113327207	T	TTATTC	598.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=477;SC=ACTATTTTGTTTTTTCAGAGA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=50829271;WS=50829261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	51019633	rs34609458	TC	T	740.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=1;PP=426;SC=AACCATACATTCCCCCCCCCA;SOR=5.136;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=22;WE=51019641;WS=51019623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	51034721	rs2731436	C	T	1515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=15;NR=31;PP=926;SC=TAATACTTGTCTTTTTTTTCC;SOR=1.747;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=15;TCR=31;TR=46;WE=51034729;WS=51034709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr12	51076844	rs2731447	C	T	648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=5;PP=483;SC=ATAAATATTACATACTTAGAC;SOR=2.400;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=23;WE=51076852;WS=51076834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	51086931	rs2090852	T	C	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=5.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.148;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=425;ReadPosRankSum=0.030;SC=TTCCAGAGGCTATATAACCTT;SOR=4.130;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=4;TCR=33;TR=18;WE=51086939;WS=51086921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr12	51088979	rs34553264	T	G	802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=5.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.496;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=2;PP=466;ReadPosRankSum=0.597;SC=GCTAACAAAATACCAGCTCAA;SOR=1.179;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=53;TCF=46;TCR=7;TR=23;WE=51088987;WS=51088969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,30:0.48:62
chr12	51089287	rs2139930	G	T	1000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=30;PP=732;ReadPosRankSum=0.792;SC=TAGGTACCTTGCCTGTTCATC;SOR=0.591;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=79;TCF=24;TCR=55;TR=44;WE=51089295;WS=51089277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,44:0.54:81
chr12	51089572	rs2684890	G	A	2559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=19;PP=1714;SC=TTATTGTGGTGTATTACATAT;SOR=2.409;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=65;TCR=19;TR=84;WE=51089580;WS=51089562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr12	51089616	rs2684891	T	C	6389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=135;NR=79;PP=2965;SC=AACTTCATCCTTTTTGAATTT;SOR=1.312;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=214;TCF=135;TCR=79;TR=214;WE=51089624;WS=51089606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr12	51089734	rs11169524	T	A	3996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=357;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.385;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=89;PP=2574;ReadPosRankSum=0.086;SC=TAATTGTGACTGATGGAGCTA;SOR=0.734;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=320;TCF=152;TCR=168;TR=167;WE=51089742;WS=51089724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,186:0.52:355
chr12	51121629	rs3832875	CA	C	2103.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.462;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.145;NF=7;NR=47;PP=1352;ReadPosRankSum=-0.360;SC=CCACATCTGCCAAAAAATAGA;SOR=0.906;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=124;TCF=17;TCR=107;TR=54;WE=51121637;WS=51121619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,94:0.47:200
chr12	51128832	rs3742062	A	G	1397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=26;PP=681;ReadPosRankSum=-0.493;SC=AGCCCTATATATAGTAAATAC;SOR=0.693;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=153;TCF=80;TCR=73;TR=59;WE=51128840;WS=51128822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,72:0.42:170
chr12	51130756	rs118022454	C	T	2316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=41;PP=1499;ReadPosRankSum=2.332;SC=ACTAACCGTGCGTTTCCTGGA;SOR=0.712;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=213;TCF=133;TCR=80;TR=107;WE=51130764;WS=51130746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,113:0.49:232
chr12	51135167	rs1975351	A	G	2049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=15;PP=1369;SC=GTATATGTCCAAGCCACATTT;SOR=2.062;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=52;TCR=15;TR=67;WE=51135175;WS=51135157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr12	51135275	rs1866422	T	C	7339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=144;NR=107;PP=2965;SC=ACCACCCAATTGATATTGAGA;SOR=0.905;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=251;TCF=144;TCR=107;TR=251;WE=51135283;WS=51135265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,268:1.00:268
chr12	51138687	rs2280503	A	C	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.663;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=180;ReadPosRankSum=-0.128;SC=CCTCTGGCTAAGAGCAGGCTT;SOR=1.096;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=14;WE=51138695;WS=51138677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr12	51182122	rs10747592	C	T	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.544;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=11;PP=292;ReadPosRankSum=-0.734;SC=TGTGCCATCACATCCGGCTAA;SOR=0.395;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=40;TCF=19;TCR=21;TR=22;WE=51182130;WS=51182112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,23:0.52:44
chr12	51203226	rs4986837	GT	G	514.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=4;PP=397;SC=TAGAGTTCTGGTTTTTTTTAC;SOR=3.056;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=18;WE=51203234;WS=51203216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr12	51203371	rs1129406	C	T	2430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.14;ReadPosRankSum=0.190;SOR=0.709;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,62:0.54:115
chr12	51203376	rs4986838	T	C	2395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=0.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.65;ReadPosRankSum=-0.068;SOR=0.616;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,62:0.53:116
chr12	51207704	rs829112	A	G	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=92;ReadPosRankSum=0.220;SC=TACCTGTTTTAGTAAATAGTG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=6;WE=51207712;WS=51207694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr12	51236931	rs829121	G	A	2713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=60;PP=1821;SC=GGCGCATGCAGAGGGCAGTAC;SOR=1.906;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=25;TCR=60;TR=85;WE=51236939;WS=51236921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr12	51237816	rs861204	G	A	975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.492;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=25;PP=605;ReadPosRankSum=0.379;SC=CACTAAAGACGCTAGGTACGT;SOR=0.543;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=106;TCF=47;TCR=59;TR=48;WE=51237824;WS=51237806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,51:0.43:120
chr12	51279367	rs79213577	G	A	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.769;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=196;ReadPosRankSum=0.991;SC=TCATCAGTAGGCAGAATTTAC;SOR=1.261;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=44;TCF=21;TCR=23;TR=18;WE=51279375;WS=51279357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,24:0.42:57
chr12	51319346	rs2359005	A	G	950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.110;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=23;PP=578;ReadPosRankSum=0.100;SC=GAGGAGGACTAGTTAGTAGCA;SOR=1.007;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=60;TCF=25;TCR=35;TR=39;WE=51319354;WS=51319336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,43:0.63:68
chr12	51364349	rs7306293	A	G	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.797;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.596;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=96;ReadPosRankSum=-0.055;SC=ATTATGAAGAATAAATTTTCA;SOR=0.180;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=8;WE=51364357;WS=51364339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr12	51382232	rs161044	T	C	3748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=61;NR=63;PP=2281;SC=AAAGACAAAATATGGTCATCA;SOR=0.864;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=124;TCF=61;TCR=63;TR=124;WE=51382240;WS=51382222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr12	51386066	rs1048230	A	G	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.297;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=14;PP=363;ReadPosRankSum=0.541;SC=GGATGATGGCAATAGAGCGAG;SOR=0.573;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=70;TCF=34;TCR=36;TR=31;WE=51386074;WS=51386056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,34:0.41:82
chr12	51386527	.	AAAG	A	410.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.16;SOR=1.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	51386839	rs224569	C	G	210.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=171;SC=TGCTGTGCTGCGCACTGTGCC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=51386847;WS=51386829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	51386868	rs224570	T	C	57.89	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=19.30;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,2:0.67:3
chr12	51386872	rs1632791	C	T	57.89	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=19.30;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,2:0.67:3
chr12	51398441	rs12831269	C	T	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=43;ReadPosRankSum=-0.974;SC=CCGTTGGTACCGTCTGTCTTC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=4;WE=51398449;WS=51398431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr12	51399050	rs224589	T	G	1368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.618;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=14;PP=733;ReadPosRankSum=-0.878;SC=GATGTGAGAGTGTATTATGTG;SOR=0.901;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=94;TCF=64;TCR=30;TR=52;WE=51399058;WS=51399040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,62:0.57:109
chr12	51399997	rs224590	A	G	251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=2;PP=148;SC=CAGGAGAATCACTTGAATGCG;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=51400005;WS=51399987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	51400084	rs140582579	AAAAC	A	683.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=342;SC=CTCCGTCTCAAAAACAAACAA;SOR=0.941;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=7;WE=51400095;WS=51400074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	51402905	rs445520	T	G	8554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=165;NR=103;PP=2965;SC=CTTACTCAAATAATCGACCGT;SOR=1.103;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=269;TCF=165;TCR=104;TR=268;WE=51402913;WS=51402895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,310:1.00:310
chr12	51403088	rs11169667	G	A	781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=26;PP=546;ReadPosRankSum=-1.534;SC=CCCTCGTGATGGCAGGGCTCA;SOR=0.597;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=66;TCF=11;TCR=55;TR=30;WE=51403096;WS=51403078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,33:0.48:69
chr12	51404467	rs427020	C	T	1827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.084;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=31;PP=1030;ReadPosRankSum=-0.221;SC=TAACACAAAGCGGTAAATTAC;SOR=0.780;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=187;TCF=116;TCR=71;TR=86;WE=51404475;WS=51404457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,93:0.44:210
chr12	51404679	rs370462	C	T	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.701;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=232;ReadPosRankSum=-1.233;SC=AATTAGGTAACCTTGAAAATA;SOR=0.368;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=43;TCF=6;TCR=37;TR=16;WE=51404687;WS=51404669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,18:0.41:44
chr12	51442944	rs12379	G	A	3659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=374;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.373;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=82;PP=1997;ReadPosRankSum=0.400;SC=CCGCTTCTATGTCCTGTACAC;SOR=0.666;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=338;TCF=168;TCR=170;TR=162;WE=51442952;WS=51442934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:192,181:0.49:373
chr12	51447506	rs7971308	A	G	2218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=4.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.951;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=24;PP=1465;ReadPosRankSum=0.586;SC=TGGATTGTCTATTGTATTAAC;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=152;TCF=106;TCR=46;TR=80;WE=51447514;WS=51447496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,89:0.53:168
chr12	51453366	rs3190077	A	C	659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=15;PP=409;SC=CATGGCACACATGTGGGAACT;SOR=2.400;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=19;WE=51453374;WS=51453356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	51461425	rs4768956	C	G	1112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=10;PP=730;SC=CCCTGGTGTACATATACTATC;SOR=1.552;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=36;WE=51461433;WS=51461415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr12	51461793	rs2029146	G	A	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=13;PP=315;ReadPosRankSum=0.039;SC=AGACATGAGCGGCATGCACCT;SOR=0.566;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=57;TCF=23;TCR=34;TR=23;WE=51461801;WS=51461783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,25:0.40:63
chr12	51467596	rs11169696	A	C	1598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=16;PP=1123;SC=ATCCCAGAACACTTAGGCACC;SOR=1.571;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=39;TCR=16;TR=55;WE=51467604;WS=51467586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr12	51502791	rs7134695	C	T	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=365;ReadPosRankSum=-0.754;SC=AGACTTTTTGCGTGTGTGTGA;SOR=0.804;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=36;TCR=11;TR=25;WE=51502799;WS=51502781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,25:0.52:48
chr12	51504799	rs7978782	T	C	4191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=89;PP=2859;SC=TTGAACAATTTTGAGGGCCAC;SOR=1.914;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=38;TCR=89;TR=127;WE=51504807;WS=51504789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr12	51510234	rs12826153	C	A	1944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.738;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=58;PP=1375;ReadPosRankSum=1.201;SC=CAGATGATAACAAGACCTCTT;SOR=1.064;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=158;TCF=60;TCR=98;TR=89;WE=51510242;WS=51510223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,90:0.54:168
chr12	51511244	rs10876138	G	A	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.481;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=143;ReadPosRankSum=-0.943;SC=TTCTATTTCTGCAGCTCTGAA;SOR=0.446;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=9;WE=51511252;WS=51511234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr12	51511264	rs12810700	T	C	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.246;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=163;ReadPosRankSum=-1.626;SC=AAAATTCATGTGAATACTGGG;SOR=0.223;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=12;WE=51511272;WS=51511254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr12	51512637	rs3839987	CT	C	667.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.836;NF=1;NR=22;PP=776;ReadPosRankSum=0.267;SC=AACTGCAATGCTTTGGAAAGC;SOR=0.462;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=23;WE=51512645;WS=51512627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,23:0.62:37
chr12	51632507	rs7979728	G	A	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=371;ReadPosRankSum=-0.138;SC=GCGGGACCGCGCGGACCCTCC;SOR=0.656;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=56;TCF=47;TCR=9;TR=25;WE=51632515;WS=51632497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,30:0.49:61
chr12	51636259	rs1049467	C	T	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.967;NF=3;NR=6;PP=166;ReadPosRankSum=1.810;SC=AAGGCCACCTCTGTGCCGGGA;SOR=0.735;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=9;WE=51636267;WS=51636249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr12	51663215	rs2114876	T	C	742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.95;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	51675208	rs3759175	C	T	826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.388;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=7;PP=562;ReadPosRankSum=0.778;SC=CTCTTATATCCCTCTGACCTA;SOR=0.209;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=53;TCF=44;TCR=9;TR=32;WE=51675216;WS=51675198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,33:0.60:55
chr12	51681846	rs4611251	C	T	1051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=9;PP=518;SC=TTTTAATGTACAAAAAAATAG;SOR=1.552;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=23;TCR=9;TR=32;WE=51681854;WS=51681836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr12	51681903	rs7954976	T	C	1848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=20;PP=1037;SC=TCCGAGGAGTTAGCTGAGATA;SOR=1.000;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=55;TCF=35;TCR=20;TR=54;WE=51681911;WS=51681893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr12	51685831	rs3210837	T	C	3776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=54;PP=2592;SC=ACTTGGCCCTTTCAGTGGTAG;SOR=0.709;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=57;TCR=54;TR=111;WE=51685839;WS=51685821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr12	51686204	rs7306505	T	C	3316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=48;NR=71;PP=1656;SC=TTACGATGCATGTAATAAAAA;SOR=1.358;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=48;TCR=71;TR=119;WE=51686212;WS=51686194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr12	51686285	rs7135343	A	T	451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=16;PP=405;SC=GTGAAATGAAAAAAGGCCAAA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=51686293;WS=51686275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	51691149	rs3782469	A	G	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.869;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=22;PP=500;ReadPosRankSum=-0.053;SC=TCAGGAGATCAAGACCATCCT;SOR=0.214;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=24;WE=51691157;WS=51691139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,23:0.62:37
chr12	51696842	.	T	C	2132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.302;ClippingRankSum=0.000;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.770;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=48;PP=1445;ReadPosRankSum=1.798;SC=ATAAATGCCCTCTGGATTCTC;SOR=0.611;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=180;TCF=94;TCR=86;TR=96;WE=51696850;WS=51696832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,101:0.53:190
chr12	51722311	rs7138439	C	T	2304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=31;PP=1506;SC=GCAAGTCCTACTGCAGATCTA;SOR=1.206;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=53;TCR=31;TR=84;WE=51722319;WS=51722301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr12	51722409	rs17860373	G	GT	2493.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.722;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.453;NF=10;NR=29;PP=1526;ReadPosRankSum=-0.313;SC=TCCACAGTCAGTAACTCCTGC;SOR=0.505;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=83;TCF=16;TCR=67;TR=39;WE=51722417;WS=51722399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,81:0.49:165
chr12	51723499	rs17860364	T	C	1920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.423;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=31;PP=1113;ReadPosRankSum=-1.400;SC=AGCAGAGACCTGGGTGAAGAC;SOR=0.536;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=125;TCF=80;TCR=45;TR=79;WE=51723507;WS=51723489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,88:0.63:140
chr12	51733734	rs17860317	G	A	1746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.998;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=30;PP=976;ReadPosRankSum=0.514;SC=AGCAGATGGCGTAGTCCACAG;SOR=0.876;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=139;TCF=76;TCR=63;TR=71;WE=51733742;WS=51733724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,81:0.52:155
chr12	51733951	rs12816187	A	C	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=214;ReadPosRankSum=-0.083;SC=TTCTCTCTTTATATGGCCGCA;SOR=0.437;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=9;WE=51733959;WS=51733941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr12	51735022	rs934089	A	T	1858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.580;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=41;PP=1195;ReadPosRankSum=0.725;SC=AATGTAGGCAACTTACTCTTG;SOR=0.816;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=227;TCF=125;TCR=102;TR=93;WE=51735030;WS=51735012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,97:0.40:245
chr12	51737439	rs17860302	G	A	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=44;ReadPosRankSum=-0.398;SC=CCCAGTCCCTGAAGTGCTGTC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=4;WE=51737447;WS=51737429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr12	51737607	rs17860299	G	A	1058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.829;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=20;PP=577;ReadPosRankSum=0.475;SC=GTGTGATACCGGGAACCTCCA;SOR=0.838;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=38;TCR=34;TR=42;WE=51737615;WS=51737597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,48:0.57:84
chr12	51739648	rs17860287	C	G	2427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.626;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=50;PP=1414;ReadPosRankSum=0.268;SC=CCGGAAGGTCCTGGGTGCTGT;SOR=0.583;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=205;TCF=111;TCR=94;TR=107;WE=51739656;WS=51739638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,119:0.54:222
chr12	51739783	rs138733777	C	G	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.409;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=19;PP=388;ReadPosRankSum=-1.532;SC=CAGTTCCTCTCTAACGAATGA;SOR=1.609;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=20;WE=51739791;WS=51739773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr12	51740387	rs57614420	ACTGG	A	2251.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FS=1.906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.85;ReadPosRankSum=0.420;SOR=0.891;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:126,64:0.34:190
chr12	51740388	rs907354	C	A	2708.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-3.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.676;HP=1;HapScore=1;MGOF=54;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=51;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.430;SC=AGGGTTGCGACTGGACCATAT;SOR=0.517;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=135;TCF=67;TCR=68;TR=107;WE=51740407;WS=51740377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,123:0.66:187
chr12	51740393	.	CCATATCCACTT	C	2270.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.958;ClippingRankSum=0.000;DP=200;ExcessHet=3.0103;FS=2.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.35;ReadPosRankSum=1.093;SOR=0.896;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:136,64:0.32:200
chr12	51740407	.	CATAA	C	2342.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.580;ClippingRankSum=0.000;DP=186;ExcessHet=3.0103;FS=0.572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.60;ReadPosRankSum=1.011;SOR=0.613;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:123,63:0.34:186
chr12	51740415	.	A	AAG	2335.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=4.076;ClippingRankSum=0.000;DP=177;ExcessHet=3.0103;FS=2.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.20;ReadPosRankSum=1.689;SOR=0.481;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:116,61:0.34:177
chr12	51740416	.	C	CG	2251.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.149;ClippingRankSum=0.000;DP=175;ExcessHet=3.0103;FS=5.787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.87;ReadPosRankSum=2.004;SOR=0.586;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:116,59:0.34:175
chr12	51748326	rs2288369	G	A	1090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.435;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=25;PP=613;ReadPosRankSum=-0.345;SC=ACCTCTTAACGGTGCTACCAG;SOR=0.533;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=115;TCF=53;TCR=62;TR=49;WE=51748334;WS=51748316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,56:0.44:128
chr12	51748395	rs7971653	G	A	1490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=17;NR=30;PP=847;SC=GGCACAAAGAGGACACTTCCC;SOR=1.697;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=17;TCR=30;TR=47;WE=51748403;WS=51748385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr12	51754629	rs2241545	A	G	916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=23;PP=560;ReadPosRankSum=0.234;SC=GGATCTGGAGAGACAGAGGGA;SOR=0.747;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=104;TCF=48;TCR=56;TR=42;WE=51754637;WS=51754619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,47:0.39:122
chr12	51773557	rs2278216	G	A	810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=19;PP=425;ReadPosRankSum=-0.528;SC=GTCTGCGGAGGAGCCTCATCC;SOR=0.631;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=60;TCF=26;TCR=34;TR=34;WE=51773565;WS=51773547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,39:0.57:69
chr12	51796904	rs907350	T	C	3663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=77;NR=44;PP=2309;SC=GTAATAGGTATAAACTGCTCA;SOR=1.346;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=121;TCF=77;TCR=44;TR=121;WE=51796912;WS=51796894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr12	51863643	rs4491281	T	C	983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=27;PP=646;SC=CCAGGTCCACTGTGGGGGAAA;SOR=2.774;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=34;WE=51863651;WS=51863633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr12	51879826	rs10783445	G	T	347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=288;SC=ACCTTGTCATGTAGAAAAGCA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=51879834;WS=51879816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	52080965	rs4761829	C	T	9177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=348;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=181;NR=133;PP=2965;SC=TTTTACGGGACCCATGGAACT;SOR=0.928;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=314;TCF=181;TCR=133;TR=314;WE=52080973;WS=52080955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,347:1.00:347
chr12	52099153	rs2291265	C	T	4776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=101;NR=62;PP=2965;SC=GTTTTCAGCCCGGTTCATTTG;SOR=1.172;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=163;TCF=101;TCR=62;TR=163;WE=52099161;WS=52099143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr12	52100566	rs10783474	G	A	1052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=32;PP=822;SC=ATGTGTATATGTATATTATAC;SOR=4.235;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=35;WE=52100574;WS=52100556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr12	52156255	rs303767	A	C	4540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=50;PP=2721;SC=TCTACTATTTATTTTTCTTAC;SOR=1.281;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=140;TCF=90;TCR=50;TR=138;WE=52156263;WS=52156245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr12	52159438	rs56879517	G	GT	885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.47;MQRankSum=0.616;QD=20.13;ReadPosRankSum=-0.360;SOR=1.519;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,38:0.86:44
chr12	52163789	rs303808	G	A	1145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=24;PP=675;SC=GATGAGGAGCGGATGGGCTGG;SOR=1.845;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=11;TCR=24;TR=35;WE=52163797;WS=52163779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr12	52173781	rs76315468	G	GTTC	502.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=302;SC=TGGAGCCACAGTTCTTGGGAA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=7;WE=52173789;WS=52173771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	52184271	rs303815	T	C	4505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=78;PP=2965;SC=CACAGAAACCTATTCCCCGCC;SOR=0.810;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=151;TCF=73;TCR=78;TR=151;WE=52184279;WS=52184261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr12	52200028	rs303828	C	A	2636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=25;PP=1700;SC=GGGTGTCTCCCATCTCAATAA;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=62;TCR=25;TR=87;WE=52200036;WS=52200018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr12	52200742	rs60637	C	A	9433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=344;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=160;NR=144;PP=2965;SC=TGCCCAAGCCCAATACCATTG;SOR=0.728;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=304;TCF=160;TCR=144;TR=304;WE=52200750;WS=52200732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,344:1.00:344
chr12	52204246	rs172559	T	C	5597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=109;PP=2965;SC=TAAGTGGCAATGCTTTGCCAA;SOR=1.318;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=184;TCF=75;TCR=109;TR=184;WE=52204254;WS=52204236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr12	52215102	rs303819	T	G	6845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=109;NR=126;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.894;SC=CCTTTGGGAGTCTCCCCCGAC;SOR=0.947;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=237;TCF=110;TCR=127;TR=235;WE=52215110;WS=52215092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,262:0.99:264
chr12	52281920	rs697633	G	A	3092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=34;PP=1887;SC=TGGGGCCCCAGTCCCAGCTGC;SOR=1.392;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=66;TCR=34;TR=100;WE=52281928;WS=52281910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr12	52284233	rs706832	T	C	7720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=155;NR=98;PP=2965;SC=CTGGCCTCCCTGATTCCACCT;SOR=1.270;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=253;TCF=155;TCR=98;TR=253;WE=52284241;WS=52284223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,284:1.00:284
chr12	52285090	rs143960014	G	A	5241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=88;PP=2965;SC=ACAGAAGTAGGGGAAGATGGG;SOR=0.857;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=175;TCF=87;TCR=88;TR=175;WE=52285098;WS=52285080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr12	52307963	rs67833112	TCAGAATTGGAATTCTGCTGGG	T	2170.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=14;PP=2957;SC=CAGGCCTGGGTCAGAATTGGA;SOR=1.345;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=16;WE=52307991;WS=52307953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr12	52312944	rs706815	T	C	3604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=50;PP=1434;SC=TGGTGGCTCATGGCTGGGATT;SOR=1.688;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=27;TCR=50;TR=77;WE=52312952;WS=52312934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr12	52312964	rs706816	A	G	3146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=39;PP=1220;SC=TTCTGGGCCCAGGAACTTGTG;SOR=1.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=19;TCR=39;TR=58;WE=52312972;WS=52312954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr12	52345497	rs10540557	TGCG	T	1062.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=7;PP=545;SC=GCTGCTGGGCTGCGGCGGCGG;SOR=0.770;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=6;TCR=8;TR=12;WE=52345507;WS=52345487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr12	52369300	rs2242106	C	T	2064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.868;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=52;PP=1189;ReadPosRankSum=-2.173;SC=TGAGTGCATGCCCTTGTTGGG;SOR=0.552;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=165;TCF=68;TCR=97;TR=91;WE=52369308;WS=52369290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,101:0.55:183
chr12	52369956	rs3214829	G	GA	204.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=1;PP=249;SC=CATCTAGGCAGCAAGACTAGC;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=52369964;WS=52369946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	52381026	rs2252518	C	A	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-3.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.739;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=18;PP=379;ReadPosRankSum=-0.465;SC=CCCCGGTGCGCATAGCACGGG;SOR=0.223;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=42;TCF=6;TCR=36;TR=22;WE=52381034;WS=52381016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,25:0.53:47
chr12	52404618	rs1298913	T	G	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=251;ReadPosRankSum=1.403;SC=CTATGGGACTTCTACACCTTT;SOR=0.586;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=17;WE=52404626;WS=52404608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,17:0.44:39
chr12	52408422	rs1283166	A	G	37.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.45;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr12	52408888	rs7974426	C	G	2729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.42;ReadPosRankSum=-0.203;SOR=0.724;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:123,139:0.53:262
chr12	52448409	rs61751612	C	T	2331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.521;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=53;PP=1496;ReadPosRankSum=-3.961;SC=CTGCCTCTGCCTCCTTCAAGT;SOR=0.763;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=181;TCF=84;TCR=97;TR=98;WE=52448417;WS=52448399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,107:0.53:201
chr12	52565322	rs3741737	G	T	6498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=117;NR=106;PP=2965;SC=GGGAACATAAGGGGTAGGGGA;SOR=0.751;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=223;TCF=117;TCR=106;TR=223;WE=52565330;WS=52565312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr12	52566047	rs3741736	G	A	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.113;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=11;PP=490;ReadPosRankSum=-2.122;SC=CCAGCTTGACGTTCATCAGCT;SOR=0.420;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=70;TCF=50;TCR=20;TR=34;WE=52566055;WS=52566037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,37:0.46:80
chr12	52566650	rs73103470	A	C	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.25;ReadPosRankSum=1.068;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr12	52574780	rs4762060	A	G	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=326;ReadPosRankSum=-0.662;SC=TCAGCTGGATATGGTGGGGGC;SOR=0.922;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=17;WE=52574788;WS=52574770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr12	52600033	rs10747632	T	C	3347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=50;NR=65;PP=1704;SC=CGAGGGGACGTGAAGTAAGTG;SOR=1.288;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=115;TCF=50;TCR=65;TR=115;WE=52600041;WS=52600023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr12	52602013	rs1902767	C	T	4887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=67;PP=2954;SC=TTGGCGCCTCCGTAATCTCCC;SOR=1.005;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=165;TCF=98;TCR=67;TR=165;WE=52602021;WS=52602003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr12	52627007	rs7308751	C	T	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.102;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=8;PP=299;ReadPosRankSum=-1.558;SC=GGATAAAAGGCGCGGAGTGTC;SOR=0.460;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=73;TCF=54;TCR=19;TR=28;WE=52627015;WS=52626997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,31:0.41:76
chr12	52627215	rs7308888	A	G	989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.565;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=23;PP=521;ReadPosRankSum=0.446;SC=TCGGCGCCTCACGGCCGCGCG;SOR=0.977;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=88;TCF=40;TCR=48;TR=40;WE=52627223;WS=52627205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,47:0.46:102
chr12	52631313	rs6580870	A	G	1594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.056;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=21;PP=829;ReadPosRankSum=-2.392;SC=GAAATTAACCACCGCACAGCT;SOR=1.198;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=187;TCF=114;TCR=73;TR=68;WE=52631321;WS=52631303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,83:0.39:214
chr12	52631394	rs10637094	C	CAT	4742.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.463;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=40;PP=2129;ReadPosRankSum=2.607;SC=TGTCTGAAAACATGGGACAAA;SOR=0.647;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=124;TCF=20;TCR=104;TR=49;WE=52631402;WS=52631384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,123:0.50:247
chr12	52631510	rs10546862	ATGTG	A	334.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.088;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=19.69;ReadPosRankSum=-1.154;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr12	52635241	rs2078201	G	A	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.975;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=9;PP=473;ReadPosRankSum=0.855;SC=CTGATGTCCCGTCTGGTCCCT;SOR=0.319;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=65;TCF=50;TCR=15;TR=33;WE=52635249;WS=52635240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,35:0.52:67
chr12	52635443	rs2243588	T	C	1711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.619;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=41;PP=1075;ReadPosRankSum=2.189;SC=CAGGGGCGTATTTCCTCCTGC;SOR=0.432;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=154;TCF=64;TCR=90;TR=75;WE=52635451;WS=52635433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,82:0.48:170
chr12	52639302	rs2608009	G	C	1319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=32;PP=809;ReadPosRankSum=0.039;SC=CTGCAGCGGGGCAAGCAGGAT;SOR=0.694;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=113;TCF=54;TCR=59;TR=62;WE=52639310;WS=52639292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,66:0.55:121
chr12	52648297	rs9325150	T	G	1120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=29;PP=813;SC=GTATCATGCCTTGGTGAAGCC;SOR=2.419;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=10;TCR=29;TR=39;WE=52648305;WS=52648287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr12	52649887	rs2168762	T	C	5081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=110;PP=2956;ReadPosRankSum=0.145;SC=CTCCCACTGTTGGCTTCCATG;SOR=0.546;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=178;TCF=67;TCR=111;TR=177;WE=52649895;WS=52649877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,190:0.99:191
chr12	52649954	rs2242139	T	C	1769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=39;PP=1045;SC=AGGTTGCTCTTGCAGCACTCA;SOR=2.093;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=15;TCR=39;TR=54;WE=52649962;WS=52649944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr12	52661075	rs748040	C	T	4101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=52;PP=2299;SC=CTGGACATATCCAGGTAATGG;SOR=1.031;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=84;TCR=52;TR=136;WE=52661083;WS=52661065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr12	52661192	rs1870222	A	G	5955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=72;PP=2519;SC=CCTTAGCGATAACCGCTGCAA;SOR=1.017;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=133;TCF=60;TCR=73;TR=132;WE=52661200;WS=52661182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr12	52661209	rs1870223	T	C	5108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=55;PP=1720;SC=GCAAGCTGGTTGAGCTGGAGG;SOR=1.003;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=104;TCF=48;TCR=56;TR=103;WE=52661217;WS=52661199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr12	52661302	rs1870224	C	A	1424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=28;PP=763;SC=CTTCTTGCCACCTTCTAGATG;SOR=1.747;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=15;TCR=28;TR=43;WE=52661310;WS=52661292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr12	52681056	rs4761856	C	T	3710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=29;PP=1154;SC=CACTGAGGGCCGCCTCACCCT;SOR=0.791;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=40;TCR=29;TR=69;WE=52681064;WS=52681046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr12	52681080	rs4761784	G	A	3830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=44;NR=33;PP=1230;SC=GCTCAGACTGGGCCACCGCGG;SOR=0.714;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=78;TCF=45;TCR=33;TR=77;WE=52681088;WS=52681070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr12	52681714	rs6580872	T	C	4281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=49;PP=2499;SC=TTAATAGATATCTCACATCCC;SOR=1.135;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=83;TCR=49;TR=131;WE=52681722;WS=52681704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr12	52681925	rs6580873	A	C	2993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=69;PP=1653;SC=CTGGAGAATGAGGATCTCCTG;SOR=1.672;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=38;TCR=69;TR=107;WE=52681933;WS=52681915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr12	52681968	rs6580874	T	C	1258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.06;QD=34.97;SOR=5.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	52685096	rs2071588	C	G	512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.81;QD=26.99;SOR=4.514;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	52818504	rs298104	T	G	6402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=121;NR=100;PP=2965;SC=CTGCTGCCGCTTCCATAGCCA;SOR=0.833;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=221;TCF=121;TCR=100;TR=221;WE=52818512;WS=52818494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr12	52822258	rs401926	A	G	7888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=129;NR=128;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.662;SC=GCAAGCTGGAACACTGTAAGG;SOR=0.223;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=257;TCF=129;TCR=128;TR=257;WE=52822266;WS=52822248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,290:1.00:291
chr12	52824352	rs395623	G	A	3569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=77;NR=38;PP=1896;SC=ACTCAGCCTCGGCCCGGCTGC;SOR=1.089;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=77;TCR=38;TR=115;WE=52824360;WS=52824342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr12	52824562	rs443084	T	A	3339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=72;PP=2022;SC=TAACTACCCATCTAGGTCAGG;SOR=1.407;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=39;TCR=72;TR=111;WE=52824570;WS=52824552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr12	52825363	rs1798640	G	A	3351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=41;PP=1797;SC=TGATCTCCTCGGGCAGAGATT;SOR=0.941;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=66;TCR=41;TR=107;WE=52825371;WS=52825353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr12	52827534	rs67876	C	T	1888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=17;PP=1107;SC=ATGGGATGGCCCTTCCAAGAG;SOR=1.576;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=45;TCR=17;TR=62;WE=52827542;WS=52827524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr12	52827818	rs298109	T	C	6698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=110;NR=121;PP=2965;SC=ACTCCAAACCTGTTGCTGGCC;SOR=0.850;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=232;TCF=111;TCR=121;TR=231;WE=52827826;WS=52827808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,259:1.00:259
chr12	52841174	rs61746355	C	T	2792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.910;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.344;NF=64;NR=53;PP=1837;ReadPosRankSum=0.321;SC=CCGCTGGCACCGCCATAGCCA;SOR=0.853;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=217;TCF=116;TCR=101;TR=117;WE=52841182;WS=52841164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,122:0.53:231
chr12	52841765	rs388626	G	A	5350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=91;NR=92;PP=2965;SC=CAGCAATGGCGGCCTGTAGGT;SOR=0.809;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=183;TCF=91;TCR=92;TR=183;WE=52841773;WS=52841755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr12	52842736	rs437014	T	C	1514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.39;QD=34.43;SOR=7.614;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr12	52844016	rs4024141	T	C	2421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=61;PP=1892;SC=AAATTTGCCATTTCTTTAATC;SOR=4.892;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=6;TCR=61;TR=67;WE=52844024;WS=52844006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr12	52844265	rs652423	T	C	6529.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=34.790;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=9.837;NF=129;NR=127;PP=2962;ReadPosRankSum=1.406;SC=CCCCACGATGTTGTCCAGCTG;SOR=0.204;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=295;TCF=160;TCR=135;TR=256;WE=52844273;WS=52844255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,270:0.89:302
chr12	52844477	rs5798212	G	GC	2193.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.652;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-2.218;NF=2;NR=33;PP=1336;ReadPosRankSum=0.299;SC=CAGTTTCCTGGAGGTCTGGGA;SOR=0.593;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=87;TCF=4;TCR=83;TR=35;WE=52844485;WS=52844467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,66:0.45:146
chr12	52845801	rs428894	T	C	1375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=36;NR=23;PP=1047;SC=CCTGGCTGAGTTGGCACTGAA;SOR=1.201;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=36;TCR=23;TR=59;WE=52845809;WS=52845791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr12	52862767	rs2567	G	C	1136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.72;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	52862770	rs1053796	T	C	1170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.81;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr12	52862783	rs2568	G	A	1008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=21;NR=10;PP=644;SC=GCAACCTGAGGAGACGGCTCT;SOR=1.371;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=21;TCR=10;TR=31;WE=52862791;WS=52862757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	52863038	rs410562	G	A	5277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=97;NR=89;PP=2965;SC=TGCCGACACCGCTGGCACCGC;SOR=0.837;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=186;TCF=97;TCR=89;TR=186;WE=52863046;WS=52863028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr12	52863213	rs412533	C	T	6670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=120;PP=2965;SC=ACTTGTCCAACGCCTTCGCCA;SOR=0.972;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=223;TCF=102;TCR=121;TR=222;WE=52863221;WS=52863203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr12	52863621	rs382367	T	G	4656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=80;PP=2965;SC=CATCCTTGAGTGCCATCTCCC;SOR=0.717;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=160;TCF=80;TCR=80;TR=159;WE=52863629;WS=52863611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr12	52863709	rs452600	C	T	3010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=58;PP=1928;SC=AACTTCTTGTCTGCTCCTCCG;SOR=1.220;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=42;TCR=58;TR=100;WE=52863717;WS=52863699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr12	52863732	rs434339	C	T	1989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=44;PP=1372;SC=GGAGGCTGGCCCTTGTTTAGT;SOR=1.643;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=22;TCR=44;TR=66;WE=52863740;WS=52863722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr12	52864240	rs415580	G	T	12938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=490;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=227;NR=207;PP=2965;SC=ACTGCCTGATGGGTCTAGCAA;SOR=0.783;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=436;TCF=228;TCR=208;TR=434;WE=52864256;WS=52864230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,485:1.00:485
chr12	52864843	rs604303	G	A	3367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=40;PP=2241;SC=GATGTCCCCAGTGAAGTCTGC;SOR=1.336;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=73;TCR=40;TR=113;WE=52864851;WS=52864833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr12	52865548	rs28759265	G	C	9092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=344;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=166;NR=158;PP=2965;SC=ACACATATGAGCCAGTGGGTA;SOR=0.717;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=325;TCF=167;TCR=158;TR=324;WE=52865556;WS=52865538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,344:1.00:344
chr12	52865592	rs644414	A	T	6198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=133;PP=2965;SC=GGATTCAACAATTTCCTGAAT;SOR=1.174;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=228;TCF=95;TCR=133;TR=228;WE=52865600;WS=52865582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr12	52865687	rs391567	C	T	653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.09;QD=32.69;SOR=3.716;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr12	52865918	rs425073	G	C	613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.68;QD=32.30;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	52865925	rs17099602	C	T	380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.08;QD=47.60;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	52881376	rs1053857	C	T	1006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.77;SOR=2.400;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	52881380	rs1053854	A	C	1006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.77;SOR=2.400;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	52881428	rs28667515	A	C	1395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=12;PP=865;SC=CAGGAGAGGAAAGGCAACCTG;SOR=1.436;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=34;TCR=12;TR=46;WE=52881436;WS=52881418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr12	52882410	rs144849815	T	TGAA	1209.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=16;PP=773;SC=TATTTCCTAGTGAAGGGGCCA;SOR=2.833;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=17;WE=52882418;WS=52882400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr12	52884283	rs298119	A	G	3258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=40;PP=2031;SC=TGTCCCCAGTAAAGTCTGCAG;SOR=1.278;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=110;TCF=70;TCR=40;TR=110;WE=52884291;WS=52884273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr12	52884557	rs298120	T	C	15283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=559;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=265;NR=263;PP=2965;SC=TCACTTCCGATATTTACAGAG;SOR=0.726;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=528;TCF=265;TCR=263;TR=528;WE=52884565;WS=52884547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,559:1.00:559
chr12	52885019	rs298121	C	T	6457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.52;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=114;NR=131;PP=2965;SC=GAAAAGCAGCCTGGGATTCAA;SOR=0.744;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=245;TCF=114;TCR=131;TR=245;WE=52885027;WS=52885009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr12	52885201	rs298122	C	T	2262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=25;PP=1538;SC=TTCATTTCCACGGACATGGGT;SOR=1.439;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=49;TCR=25;TR=74;WE=52885209;WS=52885191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr12	52886478	rs376545	T	C	3101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=54;PP=2061;SC=TCTTGATCTGTTCACGCTCCT;SOR=0.856;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=115;TCF=61;TCR=54;TR=115;WE=52886498;WS=52886468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr12	52886490	rs711317	A	G	3300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=57;PP=2139;SC=CACGCTCCTCAGCCCGCACCC;SOR=0.826;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=66;TCR=57;TR=123;WE=52886498;WS=52886468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr12	52912906	rs641621	G	T	4228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.72;QD=44.51;SOR=0.999;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr12	52912909	rs641615	G	T	4158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.13;QD=44.24;SOR=0.924;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr12	52913029	rs607860	C	T	854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=20;PP=523;SC=CACCTCTTTCCGTCCCTCTAA;SOR=2.621;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=24;WE=52913037;WS=52913019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	52938364	rs2292507	T	C	6625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=126;NR=108;PP=2965;ReadPosRankSum=2.119;SC=AACCCTTCCCTAGGGTGTCTT;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=236;TCF=127;TCR=109;TR=234;WE=52938372;WS=52938354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,256:0.99:258
chr12	52938497	rs10783518	A	C	2265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=41;PP=1355;SC=GAAGCCATAGACACTGCCGCC;SOR=1.468;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=28;TCR=41;TR=69;WE=52938509;WS=52938487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr12	52938535	rs10783519	A	G	865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=20;PP=565;SC=TGGCTGCAGGAGGAGCCGAAG;SOR=2.093;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=28;WE=52938543;WS=52938525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr12	52939407	rs10580903	AGAG	A	5716.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=51;PP=2973;SC=AAATAAAATAAGAGGAGAAGA;SOR=0.818;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=77;TCF=23;TCR=54;TR=70;WE=52939417;WS=52939397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr12	52939994	rs11170171	T	C	3020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=63;NR=38;PP=1689;SC=CTCTTCTGGATTGAGATGTGT;SOR=0.984;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=63;TCR=38;TR=101;WE=52940002;WS=52939984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr12	52941529	rs4761929	T	C	408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=2;PP=320;SC=CTCACTGGCCTTCTCTCTTCT;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=52941537;WS=52941520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	52941784	rs3839975	CAG	C	8206.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=80;PP=2965;SC=CCCCAAAGCACAGAGTCATGA;SOR=0.747;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=107;TCF=24;TCR=83;TR=104;WE=52941793;WS=52941774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr12	52942235	rs12308719	G	T	1052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=23;PP=766;SC=CCAGGGCTGTGTGCTTTGCGG;SOR=3.126;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=28;WE=52942243;WS=52942225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr12	52942998	rs635206	C	T	462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=2;PP=314;SC=TTGAGGGGGGCTAACAGAGCA;SOR=2.712;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=52943006;WS=52942988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	52943144	rs4761930	G	A	3516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=64;NR=48;PP=1845;SC=ATACCTGTGGGAATGGCGAGG;SOR=0.723;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=64;TCR=48;TR=112;WE=52943152;WS=52943134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr12	52944060	rs10747643	T	C	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.873;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=294;ReadPosRankSum=1.805;SC=TGCTGAACCCTTGCAGTAATA;SOR=2.270;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=37;TCF=12;TCR=25;TR=17;WE=52944068;WS=52944050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
chr12	52946498	rs665470	C	T	2062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.766;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=37;PP=1302;ReadPosRankSum=0.429;SC=TTCTGGATCTCGGGGTCCAGC;SOR=1.005;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=203;TCF=119;TCR=84;TR=92;WE=52946506;WS=52946488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,96:0.45:215
chr12	52946543	rs665522	C	T	2642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.434;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=54;PP=1579;ReadPosRankSum=0.188;SC=CTCTCATTGACGGTAACCTGG;SOR=0.749;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=260;TCF=145;TCR=115;TR=121;WE=52946551;WS=52946533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,131:0.46:284
chr12	52946890	rs628819	A	G	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=217;ReadPosRankSum=0.148;SC=GCTCAGATGCAGGAGGGAGGA;SOR=0.922;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=13;WE=52946898;WS=52946880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr12	52961318	rs74095143	C	T	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-3.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=138;ReadPosRankSum=-0.205;SC=TCCTTTGAAGCCCAGAAACCT;SOR=0.446;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=9;WE=52961326;WS=52961308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr12	52964706	rs56182525	A	G	1225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.774;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=39;PP=862;ReadPosRankSum=0.061;SC=CCCTGGCCCAATAGGCTGCTA;SOR=0.825;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=110;TCF=30;TCR=80;TR=53;WE=52964714;WS=52964696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,55:0.46:119
chr12	52964978	rs73107567	C	T	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=20.10;ReadPosRankSum=0.090;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr12	52964981	rs73107568	A	G	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=22.54;ReadPosRankSum=0.566;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr12	52965173	rs670741	T	G	1792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.160;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=39;PP=1213;ReadPosRankSum=2.201;SC=GGAACTTGATTTCTTTGTCCA;SOR=0.595;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=166;TCF=89;TCR=77;TR=79;WE=52965181;WS=52965163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,84:0.47:179
chr12	52965722	rs673363	T	C	1090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.02;ReadPosRankSum=-0.222;SOR=0.680;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,59:0.43:136
chr12	52965761	rs673449	C	T	2148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=25;PP=660;ReadPosRankSum=0.158;SC=TCTCTGCTGTCGTGCGCCGGT;SOR=0.688;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=134;TCF=73;TCR=61;TR=56;WE=52965769;WS=52965751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,62:0.42:149
chr12	52965782	rs673476	T	C	2086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=26;PP=645;ReadPosRankSum=-0.699;SC=TAATCTCCACTTCATATCTGC;SOR=0.641;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=64;TCR=60;TR=53;WE=52965790;WS=52965772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,59:0.42:140
chr12	52966137	rs685720	T	A	956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.773;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=14;PP=582;ReadPosRankSum=-0.591;SC=CTGACCCTGGTGCATACTCCC;SOR=0.783;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=93;TCF=60;TCR=33;TR=42;WE=52966145;WS=52966127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,45:0.46:98
chr12	52967436	rs11836189	G	A	2605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.587;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=59;PP=1626;ReadPosRankSum=-1.218;SC=CAAAGCCAGCGCCAGCCCCTC;SOR=0.574;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=210;TCF=101;TCR=109;TR=115;WE=52967444;WS=52967426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,121:0.52:233
chr12	52986132	rs617820	T	A	1709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.193;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=29;PP=926;ReadPosRankSum=-0.379;SC=GCCAGAAACCTCTTGTTAAAG;SOR=0.469;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=127;TCF=81;TCR=46;TR=75;WE=52986140;WS=52986122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,82:0.59:138
chr12	52994896	rs56207115	A	G	1979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.479;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=37;PP=1118;ReadPosRankSum=0.860;SC=CTCGGGGTCCATCTCCACGTT;SOR=0.651;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=222;TCF=133;TCR=89;TR=92;WE=52994904;WS=52994886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,103:0.43:239
chr12	52995020	rs57242225	C	T	1517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.251;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=39;PP=995;ReadPosRankSum=0.900;SC=CCCACGAAGCCGCCCAGGCGG;SOR=0.512;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=128;TCF=48;TCR=80;TR=65;WE=52995028;WS=52995010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,68:0.51:134
chr12	53002956	rs591636	T	C	1266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.464;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=17;PP=730;ReadPosRankSum=-0.314;SC=CTCAGGGGGCTGGGCGGTGGA;SOR=1.055;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=111;TCF=72;TCR=39;TR=54;WE=53002964;WS=53002946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,58:0.48:120
chr12	53010024	rs61736101	C	T	1091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.918;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.555;NF=28;NR=24;PP=695;ReadPosRankSum=0.469;SC=CCCCAGACAGCGTCTCCAGCT;SOR=0.831;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=146;TCF=75;TCR=71;TR=52;WE=53010032;WS=53010014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,57:0.36:158
chr12	53043636	rs632952	G	T	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.343;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=391;ReadPosRankSum=-0.747;SC=TGGCTGCTTAGACACAATGGG;SOR=1.531;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=65;TCF=49;TCR=16;TR=25;WE=53043644;WS=53043626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,26:0.40:65
chr12	53045623	.	A	AGCC	1145.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=0.000;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.23;MQRankSum=7.520;QD=11.81;ReadPosRankSum=-1.223;SOR=0.586;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,31:0.32:97
chr12	53045626	.	T	C	1543	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=61.95;NF=16;NR=9;PP=1543;QD=63.1108485019;SC=CCTCCAAAGCTGCTGCCGCCT;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=92;TCF=57;TCR=35;TR=25;WE=53045634;WS=53045605;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:67,25:0.27:92
chr12	53045626	.	T	TGCCGCCTCCAAAGCC	1422.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.686;ClippingRankSum=0.000;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.38;MQRankSum=8.072;QD=13.42;ReadPosRankSum=-0.914;SOR=0.702;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,34:0.32:106
chr12	53045777	rs11835758	G	A	1452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=31;PP=820;ReadPosRankSum=0.736;SC=CGAAGCCCCCGCCACCACCAC;SOR=0.672;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=128;TCF=65;TCR=63;TR=64;WE=53045785;WS=53045767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,71:0.49:145
chr12	53069014	rs14024	T	C	1259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.651;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=23;PP=784;ReadPosRankSum=-0.403;SC=AGAAACAAACTTCACGCTGGA;SOR=0.766;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=112;TCF=68;TCR=44;TR=56;WE=53069022;WS=53069004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,62:0.48:128
chr12	53069222	.	CACCTCCGGAGCCGTAGCTGCT	C	766.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.210;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=7.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.19;MQRankSum=3.759;QD=20.18;ReadPosRankSum=1.051;SOR=0.499;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr12	53070121	rs698170	T	G	5749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=113;NR=80;PP=2965;SC=GGGCCAGCTTTGTGTTCATCA;SOR=0.933;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=193;TCF=113;TCR=80;TR=193;WE=53070129;WS=53070111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr12	53070145	rs936958	G	A	2196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.750;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=48;PP=1269;ReadPosRankSum=-0.280;SC=CCTGGTAGTCGCGCAGCAGGC;SOR=0.448;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=192;TCF=108;TCR=84;TR=98;WE=53070153;WS=53070135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,106:0.50:211
chr12	53071338	rs626480	A	G	2608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=35;PP=1808;SC=AAGCAGTCAGAAAATAAAAGA;SOR=0.839;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=41;TCR=35;TR=76;WE=53071346;WS=53071328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr12	53071382	rs2741159	A	C	1506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=24;PP=826;ReadPosRankSum=-0.448;SC=TTGTGGGTTCAGGCTTAAAAA;SOR=0.657;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=128;TCF=82;TCR=46;TR=64;WE=53071390;WS=53071372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,72:0.50:143
chr12	53071560	rs2741158	A	G	1904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.821;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=48;PP=1099;ReadPosRankSum=1.744;SC=ATGAAGGCACATTCTCTCCAG;SOR=0.544;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=172;TCF=74;TCR=98;TR=88;WE=53071568;WS=53071550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,95:0.49:192
chr12	53073471	rs3837476	C	CA	955.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.209;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=672;ReadPosRankSum=0.289;SC=TTCAAACCTACTGTGTTTTGA;SOR=1.329;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=44;TCF=31;TCR=13;TR=18;WE=53073479;WS=53073461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,28:0.47:60
chr12	53084872	rs643027	C	T	1117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.180;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=12;PP=463;ReadPosRankSum=1.218;SC=GAGAGGGGATCAGGAAGGGCG;SOR=0.338;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=90;TCF=67;TCR=23;TR=40;WE=53084880;WS=53084862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,52:0.50:104
chr12	53084928	rs11170236	T	G	2829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.434;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=54;PP=1843;ReadPosRankSum=1.791;SC=GCAGGCGTGATGTGTGGCAGA;SOR=0.645;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=248;TCF=146;TCR=102;TR=128;WE=53084936;WS=53084918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,137:0.48:285
chr12	53085089	rs636127	T	C	1940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=33;PP=1188;SC=CCTCCACTCCTGCCTCGTGCC;SOR=1.011;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=64;TCF=29;TCR=35;TR=62;WE=53085097;WS=53085079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr12	53085262	rs2684339	C	A	1076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.88;ReadPosRankSum=-1.230;SOR=0.800;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,56:0.51:109
chr12	53086645	rs3782489	G	A	2770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=70;PP=1613;ReadPosRankSum=0.588;SC=TCTCCCTGCCGTGATCTGGAG;SOR=0.698;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=238;TCF=102;TCR=136;TR=121;WE=53086653;WS=53086635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,133:0.50:268
chr12	53088484	rs10783528	C	T	1933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.265;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=28;PP=1200;ReadPosRankSum=-1.272;SC=CGCACTGCATCGATGATGCTG;SOR=0.812;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=145;TCF=92;TCR=53;TR=77;WE=53088492;WS=53088474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,86:0.54:159
chr12	53089405	rs10783530	T	C	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.856;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=54;ReadPosRankSum=-0.464;SC=GTGGAGAGGATGGCTGACTCC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=4;WE=53089413;WS=53089395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr12	53089460	rs5798218	GACCC	G	1672.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=7;PP=1058;SC=TCCCTAGTGGGACCCTAGTGT;SOR=1.863;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=12;TCR=7;TR=19;WE=53089471;WS=53089450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr12	53090068	rs588706	G	A	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.169;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=287;ReadPosRankSum=-1.167;SC=CCACCCTGCCGTTGTCACAGA;SOR=2.194;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=39;TCF=31;TCR=8;TR=17;WE=53090076;WS=53090058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,17:0.41:41
chr12	53090190	rs7138818	C	T	1244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.980;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=23;PP=689;ReadPosRankSum=1.926;SC=CGCTGCCAGTCCTCTTGTTGA;SOR=0.862;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=146;TCF=81;TCR=65;TR=56;WE=53090198;WS=53090180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,66:0.41:161
chr12	53091566	rs1567759	C	A	2359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.457;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=52;PP=1445;ReadPosRankSum=-2.442;SC=CGCAGGTCACCGATGTAGTTC;SOR=0.736;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=226;TCF=117;TCR=109;TR=107;WE=53091574;WS=53091556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,118:0.46:254
chr12	53096913	rs1625862	G	A	4789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=80;PP=2963;SC=CACCAGCCCCGGTGCTGCCAA;SOR=0.902;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=77;TCR=81;TR=156;WE=53096921;WS=53096903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr12	53162528	rs2280480	G	A	5690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=103;NR=95;PP=2965;SC=GCTTGAGCTCGTGGTCTGGGA;SOR=0.702;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=198;TCF=103;TCR=95;TR=198;WE=53162536;WS=53162518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr12	53162773	rs1464423	A	G	2796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=43;PP=1642;SC=CTCCATAGCCACTGCTGCTGC;SOR=0.712;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=49;TCR=44;TR=91;WE=53162782;WS=53162762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr12	53164847	rs61730596	C	T	1216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.651;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=22;PP=784;ReadPosRankSum=0.578;SC=GCCAGCTTGACGTTCATCAGC;SOR=0.799;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=134;TCF=83;TCR=51;TR=59;WE=53164855;WS=53164837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,61:0.44:138
chr12	53165621	rs12828901	A	G	1214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=4;PP=978;SC=GGCCCAGAAGACCTCTGGGAT;SOR=3.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=33;TCR=4;TR=37;WE=53165629;WS=53165617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr12	53165940	rs6580904	C	T	7186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=109;NR=111;PP=2965;ReadPosRankSum=2.505;SC=TCATACTGGGCGCGGACCTCG;SOR=0.775;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=222;TCF=110;TCR=112;TR=220;WE=53165948;WS=53165930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,252:0.99:254
chr12	53167313	rs7399317	T	C	1225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=5;PP=912;SC=ACTCTCTCCATGGGGGCAGCT;SOR=3.611;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=33;TCR=5;TR=38;WE=53167321;WS=53167303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr12	53167395	rs11170271	C	T	5776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=111;NR=91;PP=2965;SC=TCATTCTCTGCGGCAGTGCGT;SOR=0.912;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=202;TCF=111;TCR=91;TR=202;WE=53167403;WS=53167385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr12	53184491	rs11170279	A	G	2781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=34;PP=1575;ReadPosRankSum=-1.037;SC=AAAGCCAATCACTTCCCTCTC;SOR=1.200;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=65;TCR=35;TR=98;WE=53184499;WS=53184481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,109:0.98:111
chr12	53185492	rs61929765	C	T	1900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.634;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=29;PP=1181;ReadPosRankSum=0.653;SC=TTGACACCCTCGATCTCTGCC;SOR=0.634;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=137;TCF=88;TCR=49;TR=79;WE=53185500;WS=53185482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,85:0.57:148
chr12	53186122	rs4432093	G	A	1738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.124;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=35;PP=1072;ReadPosRankSum=-0.099;SC=GGTCCAGGGAGCGATTATTGT;SOR=0.769;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=170;TCF=91;TCR=79;TR=78;WE=53186130;WS=53186112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,88:0.46:191
chr12	53187150	rs4919750	C	T	1109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=35;PP=759;ReadPosRankSum=0.260;SC=TCTTTACTATCTCCCTGTTAG;SOR=0.722;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=129;TCF=40;TCR=89;TR=51;WE=53187158;WS=53187140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,54:0.40:136
chr12	53187888	rs368758985	C	G	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=10;PP=404;ReadPosRankSum=1.540;SC=CCTGCCCTGTCACTCACTTCT;SOR=0.679;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=45;TCR=21;TR=31;WE=53187896;WS=53187878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,36:0.45:80
chr12	53189413	.	ACCAAAGCCACCAGCCCCT	A	1311.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.118;ClippingRankSum=0.000;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.14;MQRankSum=4.272;QD=16.19;ReadPosRankSum=-0.889;SOR=0.746;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,37:0.46:81
chr12	53202380	rs2307028	T	C	1034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=11;PP=755;SC=CTGACTTCTATTGGGCTTGAG;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=19;TCR=11;TR=30;WE=53202388;WS=53202370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr12	53204614	rs2307027	C	T	3176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=50;PP=1781;SC=GGGGTGGGCACGGGGAGAAAA;SOR=0.710;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=58;TCR=50;TR=108;WE=53204622;WS=53204604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr12	53204757	rs10783539	T	C	878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=19;PP=577;SC=ATTTAACCTATATTCATTGAA;SOR=2.019;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=27;WE=53204765;WS=53204747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	53207583	rs11267392	C	CCACCAAAGCCACCAGTGCCGAAACCAGCTCCGAAGCCGCCGG	7505.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=78.18;SOR=0.919;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr12	53216184	rs4415849	A	G	2541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=50;PP=1625;SC=CAGAAAGGCCAGGAGAGCAGT;SOR=1.109;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=41;TCR=50;TR=91;WE=53216192;WS=53216174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr12	53216989	rs17688627	G	A	1519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.936;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=43;PP=923;ReadPosRankSum=-1.574;SC=ACGCTGCTCCGCTTCCGCAAT;SOR=0.872;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=160;TCF=70;TCR=90;TR=73;WE=53216997;WS=53216979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,76:0.45:170
chr12	53217056	rs10876353	G	A	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=147;ReadPosRankSum=0.681;SC=AGCACCCTCCGGGGTCATCCC;SOR=0.602;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=11;WE=53217064;WS=53217046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,11:0.30:37
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chr12	53223661	rs7970710	C	T	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.992;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.53;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
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chr12	53241626	rs11170287	A	G	1328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.748;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=17;PP=736;ReadPosRankSum=0.876;SC=CTCCTGGCTGACAGACCCAAA;SOR=0.137;SbPval=0.08;Source=Platypus;TC=113;TCF=89;TCR=24;TR=52;WE=53241634;WS=53241616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,59:0.48:122
chr12	53242440	rs2013335	A	G	3979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=358;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.244;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=93;PP=2614;ReadPosRankSum=-0.706;SC=TGGGGTCAGCAGATTCTGGTT;SOR=0.625;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=335;TCF=160;TCR=175;TR=181;WE=53242448;WS=53242430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,191:0.54:357
chr12	53291239	rs76938494	A	G	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQRankSum=-4.767;QD=1.97;ReadPosRankSum=1.928;SOR=0.588;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,10:0.23:44
chr12	53291266	rs77961911	G	A	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQRankSum=-4.767;QD=1.97;ReadPosRankSum=0.136;SOR=0.588;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,10:0.23:44
chr12	53294381	rs8608	T	C	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.205;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=136;ReadPosRankSum=0.186;SC=CCTCTTCATATAGCTGCCTGA;SOR=0.255;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=8;WE=53294389;WS=53294371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr12	53294742	rs56128482	C	T	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.93;ReadPosRankSum=-0.945;SOR=0.346;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr12	53294747	rs56095813	C	T	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.25;ReadPosRankSum=-0.999;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr12	53294821	rs4351899	T	G	540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.881;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=12;PP=337;ReadPosRankSum=1.857;SC=CCCAAATGTTTACATAAATGA;SOR=0.525;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=71;TCF=44;TCR=27;TR=28;WE=53294829;WS=53294811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,30:0.38:80
chr12	53295917	rs2035875	A	G	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.232;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=282;ReadPosRankSum=0.815;SC=AGTCTGGAGGAAAGCAAGCAG;SOR=0.920;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=45;TCF=14;TCR=31;TR=19;WE=53295925;WS=53295907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,18:0.40:45
chr12	53298769	rs1065306	A	G	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.345;HP=1;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.314;NF=9;NR=15;PP=870;ReadPosRankSum=-2.053;SC=TGGACATGGTAGAGGCAGGAG;SOR=1.007;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=49;TCF=23;TCR=26;TR=24;WE=53298783;WS=53298759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,24:0.45:53
chr12	53298775	rs137898974	A	T	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.345;HP=2;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=3.343;NF=14;NR=11;PP=813;ReadPosRankSum=1.476;SC=TGGTAGAGGCAGGAGTGGAGG;SOR=0.516;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=49;TCF=23;TCR=26;TR=25;WE=53298783;WS=53298759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,29:0.55:53
chr12	53298835	rs2070910	T	G	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.012;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-2.073;NF=12;NR=14;PP=296;ReadPosRankSum=1.536;SC=AGAAGCTGCTTCTTGGTGAGG;SOR=0.520;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=23;TCR=28;TR=26;WE=53298843;WS=53298825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,28:0.49:57
chr12	53343461	rs17120866	A	AC	3484.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.948;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.444;NF=12;NR=55;PP=2396;ReadPosRankSum=-0.291;SC=TTCCATAACCACCCAACCCCT;SOR=0.612;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=149;TCF=20;TCR=129;TR=67;WE=53343469;WS=53343451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,129:0.49:262
chr12	53400440	rs61927957	T	G	4728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=63;NR=99;PP=2965;SC=TTACTGCCTCTGGATGTTTGG;SOR=1.412;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=162;TCF=63;TCR=99;TR=162;WE=53400448;WS=53400430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr12	53416119	rs7975725	T	C	7256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=111;NR=125;PP=2965;SC=CCACCTGGGGTTGAATTGGAG;SOR=0.921;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=236;TCF=111;TCR=125;TR=236;WE=53416127;WS=53416109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,270:1.00:270
chr12	53416251	rs10506315	C	T	738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=17;PP=580;SC=AGATAACTTACGGTTTTTGTT;SOR=2.124;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=23;WE=53416259;WS=53416241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	53421746	rs59856997	CT	C	3335.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.831;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.410;NF=9;NR=64;PP=1331;ReadPosRankSum=2.642;SC=GTAACTTTGCCTTTTTTTTTT;SOR=0.773;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=80;TCF=11;TCR=69;TR=73;WE=53421754;WS=53421736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:5,134:0.96:139
chr12	53432088	rs7968918	T	C	1317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=4;PP=1001;SC=TGTTTCTTGGTTGTTTTCTCC;SOR=4.174;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=37;TCR=4;TR=40;WE=53432096;WS=53432078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr12	53433089	rs1548204	C	A	4657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=51;PP=2937;SC=GTGGTCCAGGCGACGGAGGGA;SOR=1.447;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=149;TCF=98;TCR=51;TR=149;WE=53433097;WS=53433079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr12	53433486	rs8916	C	T	1709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=48;PP=1338;SC=ATCCAGCTTCCGTAAGTGTTG;SOR=5.747;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=49;TCF=1;TCR=48;TR=49;WE=53433494;WS=53433476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr12	53433709	rs1356993	C	G	686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=2;PP=468;SC=GTTCTCATCCCTTCTGCAAGG;SOR=4.174;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=23;WE=53433717;WS=53433703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr12	53433788	rs1356994	A	G	2840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=39;PP=1727;SC=CTCCTCTCCAATGGACAATGC;SOR=1.115;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=58;TCR=39;TR=97;WE=53433796;WS=53433778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr12	53442956	rs12369033	G	C	2877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=51;PP=1570;SC=TGTGTTGGGAGGGGGGACCTC;SOR=0.981;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=97;TCF=45;TCR=52;TR=96;WE=53442964;WS=53442946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr12	53448361	.	C	T	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.145;ClippingRankSum=0.000;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.87;ReadPosRankSum=-0.300;SOR=0.927;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr12	53448863	rs139448854	C	T	1073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.829;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=14;PP=577;ReadPosRankSum=-2.121;SC=TTACTGCGACCGGCCTGCACC;SOR=0.555;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=81;TCF=53;TCR=28;TR=41;WE=53448871;WS=53448853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,49:0.55:89
chr12	53449735	rs2364153	T	C	1336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=36;PP=1140;SC=TGAGAGTCCTTTGCTGTCAGC;SOR=4.073;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=4;TCR=36;TR=40;WE=53449743;WS=53449725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr12	53453810	rs145498347	T	C	1270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.174;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=15;ReadPosRankSum=0.223;SC=GAGGAGCAGTTCCCAGTTACT;SOR=0.905;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=117;TCF=73;TCR=44;TR=47;WE=53453818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,58:0.41:141
chr12	53470825	.	TA	T	43.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.015;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.97;ReadPosRankSum=0.597;SOR=0.603;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,9:0.20:45
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chr12	53572108	.	C	CA	96.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=0.000;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=2.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.11;ReadPosRankSum=0.763;SOR=1.214;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,14:0.16:87
chr12	53647373	rs10876422	T	C	8697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=161;NR=140;PP=2965;SC=CGTGCTGCTGTTGGGCACCAT;SOR=0.804;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=301;TCF=161;TCR=140;TR=301;WE=53647381;WS=53647363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,321:1.00:321
chr12	53662624	rs6580942	C	A	2942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=33;PP=1672;ReadPosRankSum=-0.876;SC=TTGCTGCCCGCCTTGAAGGTG;SOR=0.420;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=95;TCF=62;TCR=33;TR=94;WE=53662632;WS=53662614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,108:0.99:109
chr12	53662735	rs4758965	C	T	7608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=135;NR=104;PP=2965;SC=CTCTGAGTAACCCTATTTCTA;SOR=0.953;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=239;TCF=135;TCR=104;TR=239;WE=53662743;WS=53662725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,274:1.00:274
chr12	53664148	rs4758963	G	A	3814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=54;PP=2268;SC=CCAACCTTCCGCTTCCTTCCT;SOR=1.079;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=138;TCF=84;TCR=54;TR=138;WE=53664156;WS=53664138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr12	53664308	rs146243389	GTTTGGGGTTGCTCCACTGCCCTCAAACAGC	G	2974.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.48;QD=43.75;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr12	53670545	rs1318648	C	A	9805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=364;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=178;NR=148;PP=2965;SC=TGGAGCTGAGCCCCGAGGAGA;SOR=0.773;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=326;TCF=178;TCR=148;TR=326;WE=53670553;WS=53670535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,362:1.00:362
chr12	53671549	rs2272313	A	G	2729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=37;PP=1648;SC=GAGGAAGGGAAGTTCTCTCCA;SOR=0.866;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=47;TCR=37;TR=84;WE=53671557;WS=53671539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr12	53677072	rs1609473	T	G	7039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=117;NR=108;PP=2965;SC=AGGGCCCTCTTGGAATGGACA;SOR=0.726;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=225;TCF=117;TCR=108;TR=225;WE=53677080;WS=53677062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr12	53677089	rs4454760	G	A	6730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=121;NR=105;PP=2965;SC=GACAGGCTATGTGAGAGGGCT;SOR=0.759;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=227;TCF=122;TCR=105;TR=226;WE=53677097;WS=53677079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr12	53681883	rs1110719	A	T	1649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=25;PP=1093;SC=CTGAGCCTAAAGACGGATGCC;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=34;TCR=25;TR=59;WE=53681891;WS=53681873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr12	53682267	rs3080422	CAA	C	11950.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=122;PP=2950;SC=GAAGGAAGAACAAAGAGAATG;SOR=0.701;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=150;TCF=27;TCR=123;TR=149;WE=53682276;WS=53682257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,271:1.00:271
chr12	53682326	rs1110720	G	A	5291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=78;NR=98;PP=2965;SC=CCCCAGGTGGGAAGACTCCAG;SOR=1.056;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=176;TCF=78;TCR=98;TR=176;WE=53682334;WS=53682316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr12	53686703	rs1056685	G	A	2412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=52;PP=1415;SC=CTGGCTGTGCGTGGAAACCTG;SOR=1.691;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=28;TCR=52;TR=80;WE=53686711;WS=53686693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr12	53689190	rs1870240	C	G	417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=318;SC=TGAACTCACACAACAGTCTCT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=12;WE=53689198;WS=53689180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	53690188	rs59765323	CT	C	562.75	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.9994;FS=5.337;HP=11;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.681;NF=1;NR=19;PP=253;ReadPosRankSum=-0.078;SC=TGAGGATACCCTTTTTTTTTT;SOR=2.009;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=20;WE=53690207;WS=53690178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,27:0.84:32
chr12	53691962	rs2694861	C	A	2193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=48;PP=1406;SC=CACCTCTTGACCCTATCTCCA;SOR=1.497;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=28;TCR=48;TR=76;WE=53691970;WS=53691952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr12	53692955	rs1020745	G	A	1943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=29;PP=1554;SC=ACAAACTGTAGTTAGTCGGTC;SOR=1.011;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=43;TCR=29;TR=72;WE=53692963;WS=53692945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr12	53693277	rs56249432	TG	T	570.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=19;PP=583;SC=GGTGATGAGATGGGGGGTGTG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=19;WE=53693285;WS=53693267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	53693532	rs1534284	AA	GC	2482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=8;PP=2010;SC=ATGGGACACCAATTCCTGCGC;SOR=2.958;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=52;TCF=42;TCR=10;TR=48;WE=53693541;WS=53693522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr12	53700848	rs1534282	C	T	6066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=112;PP=2965;SC=AGCGGCTTCACTGGCGGTCAC;SOR=1.085;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=199;TCF=87;TCR=112;TR=199;WE=53700868;WS=53700838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr12	53700860	rs711316	A	G	4929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=92;PP=2899;SC=GGCGGTCACCACACCCGAGAG;SOR=1.124;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=162;TCF=70;TCR=92;TR=162;WE=53700868;WS=53700838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr12	53702371	rs4759287	T	C	3211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=53;PP=1963;SC=ACTGGTCCCCTGCCAGCTCAC;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=57;TCR=53;TR=109;WE=53702379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr12	53703021	rs1546808	G	A	3528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=74;PP=2360;SC=CACCTCCTCGGAACCAGGGAA;SOR=1.590;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=38;TCR=74;TR=112;WE=53703029;WS=53703011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr12	53708011	rs7953255	G	C	2772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=61;NR=33;PP=1664;SC=CCTTTCAGACGTCCTCACCAC;SOR=1.146;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=61;TCR=33;TR=94;WE=53708019;WS=53708001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr12	53709708	rs7960963	G	T	723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=16;PP=443;SC=GCACTCTACGGGCTGTCCTTT;SOR=1.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=23;WE=53709716;WS=53709698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	53714290	rs4759232	T	G	632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=2;PP=416;SC=TAAAGGGGTGTTGACTCATTT;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=53714298;WS=53714280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr12	53714496	rs4759231	A	G	4081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=83;PP=2576;SC=AAAAGTGAGGAGTGTGACGGT;SOR=1.209;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=53;TCR=83;TR=136;WE=53714517;WS=53714486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr12	53714509	rs7298879	T	G	3776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=78;PP=2319;SC=GTGACGGTGATTCAGTCTCTT;SOR=1.410;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=121;TCF=43;TCR=78;TR=121;WE=53714517;WS=53714486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr12	53714993	rs4759020	C	T	379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=2;PP=217;SC=GCCCTTCTAGCCTCCTGCCGG;SOR=2.147;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=53715001;WS=53714989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	53722098	rs7138938	A	G	6359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=132;NR=95;PP=2965;SC=CTGGTTCTCCATGGGTGCGCT;SOR=1.012;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=227;TCF=132;TCR=95;TR=227;WE=53722106;WS=53722088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr12	53722128	rs7139272	G	A	8170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=155;NR=127;PP=2965;SC=TCAGGTGGTCGCTTCGGGTAA;SOR=0.839;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=282;TCF=155;TCR=127;TR=282;WE=53722136;WS=53722118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,307:1.00:307
chr12	53729491	.	T	G	151	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000;HP=14;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=15;MQ=56.17;NF=0;NR=11;PP=151;QD=16.8882920497;SC=AGCCGGGGGGTGGGGGGGGTA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=10;TCR=17;TR=11;WE=53729499;WS=53729481;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:16,11:0.41:27
chr12	53823175	rs373716383	CA	C	91.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=3.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.99;ReadPosRankSum=0.909;SOR=0.560;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,13:0.28:46
chr12	53861636	rs138035823	TA	T	120.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=8.789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.89;ReadPosRankSum=0.317;SOR=1.718;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,14:0.22:64
chr12	53877562	rs784565	C	T	777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=13;PP=597;SC=AGGGCCATAACAGATCTCAGT;SOR=0.770;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=22;TCF=9;TCR=13;TR=22;WE=53877570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr12	53926889	rs12422400	G	A	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=324;ReadPosRankSum=0.941;SC=CCATTCAGGTGGAAGGGAAGG;SOR=1.143;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=19;WE=53926897;WS=53926879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr12	53946595	rs3741652	C	G	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.880;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=5;PP=103;ReadPosRankSum=2.777;SC=GGTGCTAGAACGCAGGGAGAA;SOR=0.082;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=8;WE=53946603;WS=53946585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr12	54066271	rs10876480	C	G	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.197;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=64;ReadPosRankSum=1.082;SC=CTCCTCTCCCCCAGCCTTGCT;SOR=0.283;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=8;WE=54066279;WS=54066261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr12	54067544	rs2857000	A	G	151.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=6;NR=1;PP=107;SC=GGCAGAGGCTACGGTGAGCCA;SOR=2.303;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=54067552;WS=54067534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	54069803	rs916134	A	G	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=179;ReadPosRankSum=0.894;SC=GCGCGTGCGCAGCGCACAGAG;SOR=0.765;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=12;WE=54069811;WS=54069793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr12	54070062	rs4020138	C	CTG	2069.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.298;NF=1;NR=30;PP=1344;ReadPosRankSum=0.032;SC=GGAGCGCCGACTGCAGAAATG;SOR=0.787;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=60;TCF=1;TCR=59;TR=31;WE=54070070;WS=54070052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,54:0.55:98
chr12	54108228	rs2277368	G	C	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=384;ReadPosRankSum=0.326;SC=GAGATCATCCGCTGTCCTGCC;SOR=0.911;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=40;TCF=28;TCR=12;TR=21;WE=54108236;WS=54108218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,21:0.50:42
chr12	54118274	rs77808076	C	T	813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.098;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=6;PP=513;ReadPosRankSum=0.325;SC=ATTCTCTATCCGCTGAGCGCT;SOR=0.986;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=61;TCF=47;TCR=14;TR=31;WE=54118282;WS=54118264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,34:0.49:69
chr12	54339052	rs4759058	C	A	2259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.758;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=49;PP=1321;ReadPosRankSum=-0.184;SC=CACCCACCCGCTGCTTGCCCC;SOR=0.570;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=177;TCF=85;TCR=92;TR=96;WE=54339060;WS=54339042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,106:0.54:195
chr12	54348554	.	CGGGAT	C	53	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=53;QD=26.3333333333;SC=AGTTAGAGTGCGGGATGGGAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=3;WE=54348566;WS=54348550;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr12	54349365	rs10876524	C	T	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=107;ReadPosRankSum=0.845;SC=CAAACCCGACCTCTTACCAGG;SOR=0.784;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=8;WE=54349373;WS=54349355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr12	54367061	rs4759315	T	G	4042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=52;PP=2336;SC=ACTTCTGCTCTCCGTCGCGCA;SOR=1.012;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=137;TCF=85;TCR=52;TR=137;WE=54367069;WS=54367051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr12	54385599	rs11614913	C	T	620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.913;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=11;PP=328;ReadPosRankSum=-0.560;SC=CAAGAAACTGCCTGAGTTACA;SOR=0.512;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=59;TCF=36;TCR=23;TR=26;WE=54385607;WS=54385589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,32:0.46:70
chr12	54394497	rs2241820	C	T	876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.776;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=20;PP=431;ReadPosRankSum=1.482;SC=AGGAGAAGGCCGACCTGGACC;SOR=0.579;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=35;TCR=43;TR=37;WE=54394505;WS=54394487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,45:0.47:96
chr12	54405190	rs4142680	C	T	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.887;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=4;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=128;ReadPosRankSum=-0.136;SC=CCCCCCCCCCCTTAGCAACTC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=8;WE=54405198;WS=54405169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr12	54428011	rs2071449	C	A	722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.251;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=5;PP=507;ReadPosRankSum=-0.099;SC=GACGGGGGAACGCTGCAAGCT;SOR=0.990;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=51;TCF=41;TCR=10;TR=28;WE=54428019;WS=54428001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,31:0.55:56
chr12	54448575	rs144938914	TG	T	279.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.929;HP=9;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=226;ReadPosRankSum=0.192;SC=GGGGTGAGGGTGGGGGGCGGG;SOR=3.477;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=10;WE=54448583;WS=54448565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr12	54575458	rs971	T	C	960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.838;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=25;PP=574;ReadPosRankSum=0.638;SC=CAGCTAAAGGTAACTGTTCTA;SOR=1.167;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=98;TCF=41;TCR=57;TR=40;WE=54575466;WS=54575448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,46:0.41:112
chr12	54575800	rs2233921	C	A	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.875;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=90;ReadPosRankSum=-1.013;SC=TTGCTCCAGTCCAGGAGATGT;SOR=1.457;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=22;TCF=14;TCR=8;TR=8;WE=54575808;WS=54575790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr12	54764618	rs2706248	T	C	827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=6;PP=619;SC=TGGGGAAAACTCTGAAGAAGG;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=24;WE=54764626;WS=54764613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	54764962	rs2244933	G	T	2376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=42;PP=1321;SC=ACATTCCCAGGTACAATATGA;SOR=1.179;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=76;TCF=33;TCR=43;TR=75;WE=54764970;WS=54764952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr12	54765005	rs3830651	TCTAA	T	1476.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=25;PP=1191;SC=GTGGGTTCTTTCTAACTAAGC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=25;WE=54765016;WS=54764995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr12	54767613	rs2706258	C	T	1157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=5;PP=854;SC=ATCACTGTGCCTGGCTCCAGG;SOR=3.500;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=37;TCF=31;TCR=6;TR=36;WE=54767621;WS=54767603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr12	54767981	rs3832831	C	CAG	482.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=537;SC=GATCTCCCCACAGAGCTCCCT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=54767989;WS=54767971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	54772755	rs2706256	C	A	587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.56;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	54796757	rs7306692	C	T	2564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.443;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=49;PP=1556;ReadPosRankSum=-0.449;SC=TTACCGTCAGCCCTACTTACC;SOR=0.729;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=248;TCF=141;TCR=107;TR=115;WE=54796765;WS=54796747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,125:0.46:272
chr12	54799450	rs1249378	A	G	6375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=122;NR=108;PP=2965;SC=CCACTCACCCATCCCCATTGA;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=230;TCF=122;TCR=108;TR=230;WE=54799458;WS=54799440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr12	54805753	rs1922254	G	T	4602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=51;PP=1855;SC=CTGACCCTGTGGGGGGGAAAA;SOR=0.961;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=98;TCF=47;TCR=51;TR=98;WE=54805773;WS=54805743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr12	54805765	rs1249181	C	T	4573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=47;PP=1714;SC=GGGGGAAAAGCGAGGCAGTTG;SOR=0.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=96;TCF=49;TCR=47;TR=96;WE=54805773;WS=54805743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr12	54905815	rs2458409	C	G	3754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=77;PP=2347;SC=AGGGCTCCCTCTACATCACCC;SOR=1.458;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=122;TCF=45;TCR=77;TR=122;WE=54905823;WS=54905805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr12	54910234	rs60294924	C	G	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=5.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.71;ReadPosRankSum=-0.242;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr12	54910837	rs1691630	G	A	6763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=132;PP=2965;SC=GTGTAGCTACGTGGCACTCAC;SOR=1.073;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=234;TCF=102;TCR=132;TR=234;WE=54910845;WS=54910827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr12	54911768	rs1795838	C	T	987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=30;PP=647;ReadPosRankSum=-0.121;SC=AGGATGATCCCTAGTGATTTT;SOR=0.609;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=74;TCF=15;TCR=59;TR=38;WE=54911776;WS=54911758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,41:0.51:80
chr12	54920566	rs12369172	T	C	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.840;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=99;ReadPosRankSum=2.063;SC=TGCCTTACTTTGTGTTGGCAC;SOR=0.223;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=13;WE=54920574;WS=54920556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr12	54920591	rs12367426	G	A	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.874;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=112;ReadPosRankSum=0.832;SC=TCCTTTACACGGTAGGACCTC;SOR=0.283;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=8;WE=54920599;WS=54920581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr12	54925674	rs2271476	T	G	658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=16;PP=322;ReadPosRankSum=1.154;SC=GTTTGTATGATAATTTGTGGA;SOR=0.639;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=70;TCF=31;TCR=39;TR=28;WE=54925682;WS=54925664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,35:0.42:84
chr12	54925750	rs10747697	A	C	797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=10;PP=386;SC=GAAGAGGGAGAGTAATTTGGC;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=14;TCR=10;TR=24;WE=54925758;WS=54925740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	54928781	rs112377731	T	TA	60.06	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5947;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=1;PP=37;ReadPosRankSum=1.282;SC=AAAGCATCTTTAAAAAAAAAA;SOR=0.693;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=3;WE=54928789;WS=54928771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr12	54929838	rs34084680	AG	A	79.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.57;MQRankSum=1.793;QD=4.20;ReadPosRankSum=-0.325;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr12	54932788	rs4758966	T	C	4627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=86;PP=2904;SC=GGTGTGAGAATAGGGAATGGA;SOR=1.085;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=150;TCF=64;TCR=86;TR=150;WE=54932796;WS=54932778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr12	54955324	rs10747699	T	C	1563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=11;PP=957;SC=CTGGGGCTCCTGGGGTCAGGA;SOR=2.024;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=39;TCR=11;TR=50;WE=54955332;WS=54955314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr12	54955461	rs9668037	A	G	3688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=67;PP=2415;SC=GGAGGAGGGAAAGGACAGGTT;SOR=0.921;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=126;TCF=59;TCR=67;TR=126;WE=54955469;WS=54955451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr12	54955545	rs3036634	C	CGT	1043.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.824;NF=1;NR=20;PP=821;ReadPosRankSum=-1.549;SC=ATGTTTTGTGCGTGTGTGTGT;SOR=0.527;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=21;WE=54955553;WS=54955535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,48:0.89:54
chr12	54955647	rs1552957	G	T	227.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=173;SC=CCCCACCTTTGTAAAAATTGC;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=54955655;WS=54955637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	54975837	rs1249958	T	C	2031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=41;NR=26;PP=1050;SC=CTCCTGGGTTTCTGTGCTCTC;SOR=0.798;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=41;TCR=26;TR=67;WE=54975845;WS=54975827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr12	55002014	rs1795819	C	T	800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=0;PP=670;SC=TTGGATGTGGCGTCTCCCACA;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=55002022;WS=55002004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	55002053	rs1795818	C	G	2029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=13;PP=1443;SC=GCACCCTCATCATTAGGGCCT;SOR=2.338;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=50;TCR=13;TR=63;WE=55002073;WS=55002043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr12	55002065	rs1716356	G	A	2297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=21;PP=1533;SC=TTAGGGCCTCGTGACATCATT;SOR=1.911;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=58;TCR=21;TR=79;WE=55002073;WS=55002043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr12	55003931	rs939463	G	A	320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=252;SC=CAGAATTCCCGGGATCATATG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=55003939;WS=55003921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	55004150	rs937308	C	A	2772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.16;SOR=0.853;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr12	55248357	rs1048371	G	T	3524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=57;PP=2144;SC=CTGATCTTCAGGTCACCACCA;SOR=0.804;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=122;TCF=65;TCR=57;TR=122;WE=55248365;WS=55248347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr12	55248739	rs10783684	T	C	801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=23;NR=0;PP=622;SC=TTGGTTTTCATGGGTTTTATC;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=23;WE=55248747;WS=55248737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr12	55250549	rs10783685	T	G	5765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=109;NR=82;PP=2965;SC=TCCTTCTAATTTCAGCTGGTC;SOR=0.952;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=191;TCF=109;TCR=82;TR=191;WE=55250557;WS=55250539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr12	55250612	rs1349910	A	G	11388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=431;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=220;NR=171;PP=2965;SC=CAACCACTGCAACCACTGCTG;SOR=0.853;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=391;TCF=220;TCR=171;TR=391;WE=55250620;WS=55250602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,430:1.00:430
chr12	55250714	rs10876639	G	A	6489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=130;PP=2965;SC=TCCTTTATGTGGCTCCTTGAT;SOR=1.213;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=221;TCF=91;TCR=130;TR=221;WE=55250722;WS=55250704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr12	55354876	rs5798332	TA	T	949.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=1.567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.25;MQRankSum=1.530;QD=7.42;ReadPosRankSum=0.062;SOR=0.923;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,60:0.47:128
chr12	55356258	rs61733025	C	T	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=2.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.352;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=218;ReadPosRankSum=-0.319;SC=GCTTAAAGACCGACGCAGTTC;SOR=1.473;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=28;TCF=17;TCR=11;TR=14;WE=55356266;WS=55356248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr12	55367178	rs3741673	C	T	1730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.507;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=34;PP=996;ReadPosRankSum=0.836;SC=TCCATCTTCCCGTCTCTGAGT;SOR=0.635;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=188;TCF=113;TCR=75;TR=80;WE=55367186;WS=55367168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,90:0.41:218
chr12	55368245	rs4758993	G	A	1448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.763;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=27;PP=800;ReadPosRankSum=0.481;SC=GCAGGGCGGCGGCAGCCTCCT;SOR=0.615;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=132;TCF=68;TCR=64;TR=61;WE=55368253;WS=55368235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,73:0.48:153
chr12	55368368	rs4758994	G	A	1668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.630;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=36;PP=957;ReadPosRankSum=0.204;SC=AGACTTCAGGGCCTCCCGTAA;SOR=0.629;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=126;TCF=65;TCR=61;TR=73;WE=55368376;WS=55368358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,80:0.58:139
chr12	55368441	rs4759131	T	C	768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=18;PP=423;ReadPosRankSum=1.842;SC=TCAGAAACCATCATGATGCTC;SOR=0.662;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=25;TCR=33;TR=32;WE=55368449;WS=55368431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,36:0.55:65
chr12	55368521	rs12810984	G	A	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.622;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=18.21;ReadPosRankSum=-0.212;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr12	55523414	rs11171309	A	C	352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=220;SC=ACTTAAAGAAATAAGAAATGC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=55523422;WS=55523408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	55523586	rs58036029	AT	A	8560.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=105;PP=2967;SC=TCATTTGTATATTTTGCCCTG;SOR=0.953;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=154;TCF=46;TCR=108;TR=148;WE=55523594;WS=55523576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr12	55523685	rs12303066	C	T	8623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=154;NR=130;PP=2965;SC=CTTCAGGGTACGCCCAGAGCT;SOR=0.794;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=284;TCF=154;TCR=130;TR=284;WE=55523693;WS=55523675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,309:1.00:309
chr12	55523860	rs7305779	A	C	7566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=101;NR=121;PP=2965;SC=TCTGTTATTGAACCCAAGGCT;SOR=1.011;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=222;TCF=101;TCR=121;TR=222;WE=55523868;WS=55523850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr12	55524172	rs7306491	G	A	8013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=133;NR=156;PP=2965;ReadPosRankSum=-2.031;SC=TGTGATTCTCGCCCACTTCAG;SOR=0.937;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=291;TCF=134;TCR=157;TR=289;WE=55524180;WS=55524161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,308:0.99:310
chr12	55524314	rs7137261	T	C	2914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=30;PP=1991;SC=TAAAGATACATTCTACTGAGG;SOR=1.496;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=63;TCR=30;TR=93;WE=55524322;WS=55524304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr12	55641031	rs7302063	G	A	1785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=14;PP=1221;SC=TTCCTCTTCTGTTCTAATTTT;SOR=2.093;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=47;TCR=14;TR=61;WE=55641039;WS=55641021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr12	55641075	rs7301705	A	G	4308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.685;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=43;PP=2828;ReadPosRankSum=0.371;SC=ATCAACTATGAGAAACCATAC;SOR=1.410;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=137;TCF=94;TCR=43;TR=137;WE=55641083;WS=55641065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,149:0.99:150
chr12	55641255	rs4522268	C	T	11813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=439;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=199;NR=215;PP=2965;SC=TTTCTTCCTCCGAAATTTCTC;SOR=0.788;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=415;TCF=199;TCR=216;TR=414;WE=55641263;WS=55641245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,438:1.00:438
chr12	55641295	rs4388990	A	G	9292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=144;NR=172;PP=2965;ReadPosRankSum=0.855;SC=ACAACTGTCTACATTCCCAAA;SOR=0.919;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=319;TCF=147;TCR=172;TR=316;WE=55641303;WS=55641285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,341:0.99:343
chr12	55641328	rs6581025	G	A	8376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=120;NR=153;PP=2965;SC=ATGGCAACAGGTGATAAGACC;SOR=1.049;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=273;TCF=120;TCR=153;TR=273;WE=55641336;WS=55641318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,305:1.00:305
chr12	55688267	rs7308594	G	A	7005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=113;NR=115;PP=2965;SC=TACAGCTACCGTATGTCATGG;SOR=0.709;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=229;TCF=114;TCR=115;TR=228;WE=55688275;WS=55688257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr12	55714406	rs5798345	C	CA	6564.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=37;PP=2965;SC=ACAGAAATAACAGAGTTTATT;SOR=1.388;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=86;TCF=45;TCR=41;TR=82;WE=55714414;WS=55714396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr12	55714772	rs7132431	G	A	5464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=98;NR=87;PP=2965;SC=CCTCTGCATTGCTTGAGTATC;SOR=0.784;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=185;TCF=98;TCR=87;TR=185;WE=55714780;WS=55714762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr12	55714876	rs7132347	C	G	5392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=78;PP=2965;SC=TTTAAAGCTTCATTACTGTAG;SOR=0.726;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=166;TCF=88;TCR=78;TR=165;WE=55714884;WS=55714866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr12	55715119	rs7132916	G	A	12065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=448;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=218;NR=194;PP=2965;SC=CATGGTTGTTGTCTCCATCTC;SOR=0.825;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=412;TCF=218;TCR=194;TR=412;WE=55715127;WS=55715109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,448:1.00:448
chr12	55758832	rs7962135	T	C	902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.924;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=4;PP=741;ReadPosRankSum=0.740;SC=GGTGTCATAGTTTTCTGGTTT;SOR=3.381;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=32;WE=55758840;WS=55758822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,30:0.97:31
chr12	55759878	rs10876751	A	G	1026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=27;PP=812;SC=AAGCTGAATGAAAAACTCTCT;SOR=3.545;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=31;WE=55759886;WS=55759868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr12	55794264	rs7967395	A	G	1201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=12;PP=681;SC=ACGTATTGACATTCACTCTTC;SOR=1.464;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=29;TCR=12;TR=41;WE=55794272;WS=55794254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr12	55794976	rs7971073	A	G	8162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=127;NR=134;PP=2965;SC=CATCCTTAAAACAATTCTGAA;SOR=0.837;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=261;TCF=127;TCR=134;TR=261;WE=55794984;WS=55794966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,296:1.00:296
chr12	55805499	rs61956295	G	A	941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=32.47;SOR=6.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	55805787	rs7300096	C	A	4090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.89;QD=30.76;SOR=0.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr12	55806238	rs7300594	A	G	11409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=437;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-0.154;NF=216;NR=175;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.544;SC=GTGGCTTCTCAGACTCCTTCA;SOR=0.614;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=393;TCF=217;TCR=176;TR=391;WE=55806246;WS=55806228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,435:1.00:436
chr12	55807293	rs3887805	A	G	1860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.71;QD=28.63;SOR=8.380;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr12	55808469	rs7132076	C	G	3957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=59;PP=2188;SC=TGCACTGCTTCTCGTTCATAT;SOR=0.749;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=66;TCR=59;TR=125;WE=55808477;WS=55808459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr12	55819933	rs10876774	T	C	839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=2;PP=591;SC=CAATAGTATTTGAAAAAAAAA;SOR=4.255;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=23;WE=55819941;WS=55819923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	55820121	rs6581046	C	T	7630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=125;NR=120;PP=2965;SC=TTTTCTCGTTCCTATTTCTTA;SOR=0.722;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=246;TCF=126;TCR=120;TR=245;WE=55820129;WS=55820111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr12	55863381	rs10747756	A	G	3623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=51;PP=2218;SC=TTGTAGGATAAGAGAAATGTC;SOR=0.788;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=64;TCR=51;TR=115;WE=55863389;WS=55863371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr12	55863398	rs12313730	G	A	3302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=47;PP=2064;SC=TGTCACAAATGAAATGATCAA;SOR=0.762;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=104;TCF=57;TCR=47;TR=103;WE=55863406;WS=55863388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr12	55886294	rs7133698	G	A	5207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=81;PP=2965;SC=GACCATTATCGCCCTCACCAT;SOR=0.735;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=168;TCF=87;TCR=81;TR=168;WE=55886302;WS=55886284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr12	55944926	rs7313959	G	A	889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=2;PP=671;SC=TGTTCATTAAGATAAGCTTTA;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=26;WE=55944934;WS=55944916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr12	55945119	rs7313899	A	G	11554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=413;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=202;NR=174;PP=2965;SC=CATGCTAAGTATCCTAGGAAA;SOR=0.865;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=376;TCF=202;TCR=174;TR=376;WE=55945127;WS=55945109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,413:1.00:413
chr12	56030938	rs10876838	C	T	1802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.832;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=31;PP=1185;ReadPosRankSum=-0.272;SC=CTGGGCTCCCCGCATCCCCAG;SOR=0.889;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=135;TCF=75;TCR=60;TR=72;WE=56030946;WS=56030928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,77:0.51:150
chr12	56031273	rs7970885	G	A	4362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=437;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.521;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=99;NR=95;PP=2721;ReadPosRankSum=2.282;SC=CGAGATCTCCGTGATGACAGC;SOR=0.619;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=392;TCF=195;TCR=197;TR=194;WE=56031281;WS=56031263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:227,210:0.48:437
chr12	56092610	rs148190047	C	T	3361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.881;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=65;PP=2091;ReadPosRankSum=0.745;SC=GCAGGATGACCACAGCACCCT;SOR=0.751;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=270;TCF=149;TCR=121;TR=142;WE=56092618;WS=56092600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,155:0.53:295
chr12	56092682	rs3847675	C	T	3562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.262;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=85;PP=2245;ReadPosRankSum=-1.515;SC=CCAGACCTTTCCCCGAGTCAA;SOR=0.816;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=323;TCF=158;TCR=165;TR=161;WE=56092690;WS=56092672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:177,173:0.49:350
chr12	56182846	rs3741504	G	C	7111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=127;PP=2965;SC=TACTTCCATCGAGCCTACATT;SOR=1.262;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=217;TCF=90;TCR=127;TR=216;WE=56182854;WS=56182836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr12	56236043	rs2291268	G	A	1387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=15;PP=857;SC=ATGGTTTAGGGTCAGGAGGAG;SOR=1.480;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=33;TCR=15;TR=48;WE=56236051;WS=56236033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr12	56236318	rs7310325	T	C	371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=12;PP=289;SC=AGGAGGGACCTGATATGGAAG;SOR=3.912;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=56236326;WS=56236308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	56236531	rs7294345	A	G	3508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=46;PP=2182;SC=GACTTACCACAGGCGCCACCT;SOR=1.239;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=78;TCR=46;TR=124;WE=56236539;WS=56236521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr12	56295544	rs147424544	GAAGT	G	772.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=694;ReadPosRankSum=1.747;SC=GCAGGAGGTGGAAGTAAGCCA;SOR=0.957;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=16;WE=56295555;WS=56295534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,20:0.67:30
chr12	56295734	rs7302270	A	G	4659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=81;NR=65;PP=2808;SC=GCTCTTTGCTAGGCTGGCTGA;SOR=0.755;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=146;TCF=81;TCR=65;TR=146;WE=56295742;WS=56295724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr12	56297625	rs1701698	C	T	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=2.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.623;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=307;ReadPosRankSum=-0.816;SC=ATGACAATAGCGGATGTTGTA;SOR=0.171;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=19;WE=56297633;WS=56297615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,21:0.49:43
chr12	56298115	rs61956424	T	C	1881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.77;SOR=1.364;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr12	56298120	rs61956425	A	G	1771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.29;SOR=1.292;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr12	56330572	rs7297871	G	A	2503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.018;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=57;PP=1545;ReadPosRankSum=-1.222;SC=GCAAGGTCTCGGCTCTCTACC;SOR=0.778;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=211;TCF=108;TCR=103;TR=112;WE=56330580;WS=56330562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,121:0.53:227
chr12	56335107	rs1136082	A	G	2258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.478;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.97;MQRankSum=-1.157;NF=41;NR=65;PP=1746;ReadPosRankSum=0.136;SC=AGCAGGGGCAAAGGTGAGGAG;SOR=0.740;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=238;TCF=95;TCR=143;TR=106;WE=56335115;WS=56335097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,106:0.42:250
chr12	56348028	rs1052206	G	A	1176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=20;PP=546;ReadPosRankSum=1.605;SC=GGAGGGGGCTGTTCTCACCAA;SOR=0.753;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=97;TCF=58;TCR=39;TR=51;WE=56348036;WS=56348018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,60:0.53:114
chr12	56364321	rs2069408	A	G	2040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=22;PP=1355;SC=TTATCCCCCCAGTGCATTACC;SOR=1.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=52;TCR=22;TR=74;WE=56364329;WS=56364311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr12	56374695	rs773109	G	A	4060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=71;PP=2613;SC=AATCAATTCCGATGGTGGAGA;SOR=1.006;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=134;TCF=63;TCR=71;TR=134;WE=56374703;WS=56374685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr12	56379427	rs1873914	G	C	5638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=109;NR=74;PP=2965;SC=CTGATTCAGTGTATTCTTTCA;SOR=0.973;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=183;TCF=109;TCR=74;TR=183;WE=56379435;WS=56379417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr12	56384687	rs705698	T	C	600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=18;PP=510;SC=CAGAGGACATTCATTGTCTCA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=56384695;WS=56384677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	56398454	rs773115	G	C	4915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=98;PP=2697;SC=CTGTCCAGTCGGCCATCACAG;SOR=1.149;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=170;TCF=72;TCR=98;TR=170;WE=56398462;WS=56398444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr12	56417403	rs2658479	T	C	4757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=66;PP=2724;SC=AGGATATGAATGGGAAATGGT;SOR=1.078;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=163;TCF=97;TCR=66;TR=161;WE=56417424;WS=56417393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr12	56426577	rs1619653	A	G	2451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=60;PP=1736;SC=AGTATCTCCCACACTGAGGGA;SOR=1.927;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=25;TCR=60;TR=85;WE=56426585;WS=56426567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr12	56428344	rs2452822	G	C	5316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=103;NR=60;PP=2965;SC=CTGAGTTCCTGTTCTCCACAG;SOR=1.228;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=163;TCF=103;TCR=60;TR=163;WE=56428352;WS=56428334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr12	56436472	rs705706	T	G	1159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=29;PP=872;SC=GGCTCTGTTCTTTGGAGCCTC;SOR=2.191;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=10;TCR=29;TR=39;WE=56436480;WS=56436462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr12	56488913	rs705708	G	A	1407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=12;PP=947;SC=GCCATGTCTTGGGATCAGCTC;SOR=1.893;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=50;TCF=37;TCR=13;TR=49;WE=56488921;WS=56488903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr12	56493822	rs2292238	A	C	9289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=157;NR=140;PP=2965;SC=GGGTAAGACAACTTCTAATTA;SOR=0.766;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=297;TCF=157;TCR=140;TR=297;WE=56493839;WS=56493812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,340:1.00:340
chr12	56494991	rs2271189	G	A	6033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=102;NR=87;PP=2965;SC=CAATGTGTAGGAGCCGGAGCA;SOR=0.749;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=189;TCF=102;TCR=87;TR=189;WE=56494999;WS=56494981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr12	56525230	rs73125289	G	C	1334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=26;PP=780;ReadPosRankSum=1.353;SC=CTTTTCTGGGGAAAGGCTTTG;SOR=0.723;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=141;TCF=75;TCR=66;TR=56;WE=56525238;WS=56525220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,65:0.40:162
chr12	56564056	rs60041436	CTTTT	C	1393.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=44;PP=1920;ReadPosRankSum=-0.467;SC=GTGTCTAACACTTTTCTTTTT;SOR=0.929;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=4;TCR=45;TR=48;WE=56564068;WS=56564046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,58:0.95:61
chr12	56567805	.	C	T	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.744;ClippingRankSum=-0.000;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.16;ReadPosRankSum=-0.406;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr12	56575742	rs773644	T	G	3347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=46;PP=2317;SC=GGGTAGACTGTTCCTGGCATT;SOR=0.922;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=108;TCF=62;TCR=46;TR=108;WE=56575750;WS=56575732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr12	56601237	rs703823	A	G	1390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=34;PP=981;SC=CCACCCAAACACATAAGACAT;SOR=2.078;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=12;TCR=34;TR=46;WE=56601245;WS=56601227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr12	56604416	rs10532115	GAT	G	4233.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=43;PP=2382;SC=GCCTGGATATGATATAACTCT;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=57;TCF=4;TCR=53;TR=46;WE=56604428;WS=56604406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr12	56604420	rs79677444	T	C	4241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=44;PP=1640;SC=GGATATGATATAACTCTACAA;SOR=1.634;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=27;TCR=44;TR=71;WE=56604428;WS=56604406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr12	56607927	rs4759218	C	T	3865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=82;PP=2558;SC=ACACTCATTGCCAAGATCCAT;SOR=1.340;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=51;TCR=82;TR=133;WE=56607935;WS=56607917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr12	56625045	rs1274497	T	C	4406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=54;PP=2833;SC=GCCCCTAAGCTATTCCCCTCA;SOR=1.201;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=91;TCR=54;TR=145;WE=56625053;WS=56625035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr12	56628728	.	A	G	738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.872;ClippingRankSum=0.000;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.844;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=25;PP=508;ReadPosRankSum=-0.812;SC=CCGCGTCTGCATCGGCGCTCC;SOR=1.129;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=100;TCF=42;TCR=58;TR=38;WE=56628736;WS=56628718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,39:0.36:107
chr12	56629276	rs901073	A	C	978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=6;PP=737;SC=GGCTTGCCACAATCCATGCAA;SOR=2.376;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=28;WE=56629284;WS=56629274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr12	56637479	rs75420081	C	T	958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=15;PP=564;ReadPosRankSum=1.203;SC=GGAAGAAAATCCCATGTATAG;SOR=0.714;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=76;TCF=51;TCR=25;TR=40;WE=56637487;WS=56637469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,45:0.49:92
chr12	56647911	rs808919	G	C	4543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=79;NR=63;PP=2060;SC=CGCCATTGGTGGAGACTGCAG;SOR=0.765;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=142;TCF=79;TCR=63;TR=142;WE=56647919;WS=56647901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr12	56649601	rs1274490	A	G	1313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=13;PP=950;SC=CATGGTGCAGAGCACTGCGCC;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=31;TCR=13;TR=44;WE=56649609;WS=56649591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr12	56650742	rs1274491	C	T	797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=7;PP=558;SC=ACCCTTAACCCCCACCTTTAA;SOR=1.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=27;WE=56650750;WS=56650732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr12	56717466	rs773665	C	T	2219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=48;PP=1413;SC=CGTCTTCAAACTGGGATTCCT;SOR=1.416;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=76;TCF=27;TCR=49;TR=75;WE=56717474;WS=56717456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr12	56719015	rs73131007	G	A	1013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=26;PP=665;ReadPosRankSum=1.485;SC=GGTCCAGGGTGGTAGTTGAAG;SOR=0.656;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=87;TCF=34;TCR=53;TR=42;WE=56719023;WS=56719005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,47:0.48:98
chr12	56722060	rs1918496	T	G	5151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=83;PP=2965;SC=TCAATCTCTATTATGTGATTC;SOR=0.748;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=167;TCF=84;TCR=83;TR=166;WE=56722068;WS=56722050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr12	56726518	rs2643626	G	A	2301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=53;NR=20;PP=1276;SC=CTGGCTATCTGCAAAGCAGCT;SOR=1.556;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=53;TCR=20;TR=73;WE=56726526;WS=56726508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr12	56814256	rs10631263	G	GGAT	879.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.683;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.216;NF=11;NR=3;PP=537;ReadPosRankSum=-0.905;SC=ATGACGATAAGGATAAGGAGG;SOR=0.126;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=47;TCF=37;TCR=10;TR=14;WE=56814264;WS=56814246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,23:0.42:55
chr12	56814563	rs66491720	G	A	1849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.255;HP=2;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=36;PP=2730;ReadPosRankSum=0.205;SC=AGCCTCCAGGGCTCTTCTCCT;SOR=0.812;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=146;TCF=81;TCR=65;TR=81;WE=56814578;WS=56814553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,84:0.54:155
chr12	56814570	rs812279	T	G	1299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.909;HP=3;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=30;PP=1961;ReadPosRankSum=1.159;SC=AGGGCTCTTCTCCTAAAAGTG;SOR=0.538;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=143;TCF=79;TCR=64;TR=63;WE=56814578;WS=56814553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,67:0.45:150
chr12	56814653	rs2291739	G	A	1500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.774;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=33;PP=1046;ReadPosRankSum=-0.228;SC=CCATAGGAGCGGGATAGAAAA;SOR=0.499;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=150;TCF=83;TCR=67;TR=68;WE=56814661;WS=56814643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,72:0.44:162
chr12	56815281	rs2291738	T	C	3470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.422;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=72;PP=2183;ReadPosRankSum=0.827;SC=AGGACATCTATAAAAAGCAAG;SOR=0.590;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=257;TCF=125;TCR=132;TR=144;WE=56815289;WS=56815271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,159:0.56:286
chr12	56815922	rs774047	C	T	854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=21;PP=460;ReadPosRankSum=0.483;SC=GTACAGCTCCCGAAGATGAGC;SOR=0.728;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=70;TCF=27;TCR=43;TR=34;WE=56815930;WS=56815912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,40:0.49:82
chr12	56818982	rs12824030	G	C	2029.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=32;PP=1130;SC=GCTAAAGAGGGCTTTCCCCAT;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=11;TCR=32;TR=43;WE=56818991;WS=56818972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr12	56818983	rs35382350	C	CT	787.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.078;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.580;NF=0;NR=17;PP=563;ReadPosRankSum=0.100;SC=CTAAAGAGGGCTTTCCCCATC;SOR=0.296;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=17;WE=56818991;WS=56818972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,30:0.64:47
chr12	56821998	rs774026	A	G	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.377;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=7;PP=207;ReadPosRankSum=0.690;SC=AGCTCTTTCTACATTGTGGGG;SOR=0.392;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=32;TCF=20;TCR=12;TR=15;WE=56822006;WS=56821988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr12	56822378	rs774027	T	A	1189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=24;PP=686;ReadPosRankSum=-0.408;SC=TCTGGAGATATGTCCATCTCA;SOR=0.721;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=124;TCF=66;TCR=58;TR=51;WE=56822386;WS=56822368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,59:0.42:142
chr12	56822641	rs774028	G	C	446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=2;PP=302;SC=CTAGCTCACTGTATCTCCAGT;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=56822649;WS=56822631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	56825311	rs774033	C	T	885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.951;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=17;PP=443;ReadPosRankSum=1.212;SC=GCTGGCGCAACACCTCCAGTT;SOR=0.838;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=146;TCF=80;TCR=66;TR=46;WE=56825319;WS=56825301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,53:0.32:167
chr12	56825981	rs774039	A	G	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.82;ReadPosRankSum=-1.465;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr12	56826061	rs774040	G	A	2038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=47;NR=16;PP=1212;SC=GCCTTCCCCAGATAATGCAGC;SOR=1.810;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=47;TCR=16;TR=63;WE=56826069;WS=56826051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr12	56826293	.	C	T	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.331;ClippingRankSum=0.000;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.724;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=16;PP=299;ReadPosRankSum=0.279;SC=TGGGCACTGGCGTCATCATCA;SOR=0.323;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=68;TCF=20;TCR=48;TR=25;WE=56826301;WS=56826283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,27:0.35:78
chr12	56827694	rs2279665	C	G	458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.567;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=334;ReadPosRankSum=-0.286;SC=AATAGCGGATCAGATCCTTCA;SOR=0.343;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=44;TCF=8;TCR=36;TR=18;WE=56827702;WS=56827684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,19:0.40:47
chr12	56827974	rs2638312	C	T	5233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=88;NR=104;PP=2926;SC=GACCAACCAACAGAGAAGGAA;SOR=0.946;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=192;TCF=88;TCR=104;TR=192;WE=56827982;WS=56827964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr12	56845296	rs2643622	T	C	1174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.55;SOR=1.819;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr12	56845296	.	TAGCAACG	CAGCAACA,CAGCAACG	151	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=3,9;NR=8,21;PP=115,151;QD=15.3152613511;SC=GGGGACAGAGTAGCAACGCTG;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=11,30;WE=56845311;WS=56845286;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.37:30
chr12	56845303	rs2088155	G	A	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.288;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr12	56845358	rs7953824	T	C	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.28;ReadPosRankSum=-1.383;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr12	56862886	rs2657881	T	C	4862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=71;PP=2703;SC=AGAGATGATATGGGTGTCAAA;SOR=0.909;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=168;TCF=97;TCR=71;TR=168;WE=56862894;WS=56862876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr12	56869577	rs5798384	C	CT	1451.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.790;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=22;PP=912;ReadPosRankSum=0.105;SC=GCTTTCCTCTCTGAGGCCAGC;SOR=0.922;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=48;TCF=5;TCR=43;TR=23;WE=56869585;WS=56869567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,47:0.53:88
chr12	56869949	rs34325581	C	CT	309.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=43;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=164;ReadPosRankSum=-1.050;SC=CTTTCTCTTTCTTTTTTTTGA;SOR=0.473;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=16;WE=56869957;WS=56869939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr12	56869971	rs79174190	TTTGTCACCC	T	549.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=11;PP=2436;SC=ACAGTCTTGCTTTGTCACCCT;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=12;WE=56869987;WS=56869961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
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chr12	56915782	rs808929	G	A	619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=10;PP=594;SC=TCTCTCTCTCGCTCGTTCCCT;SOR=1.358;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=41;TCF=30;TCR=11;TR=30;WE=56915790;WS=56915772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr12	56933651	rs2657902	G	A	2020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.040;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=49;PP=1184;ReadPosRankSum=-1.548;SC=CTGAGAGGCCGGATGCTTCAT;SOR=0.799;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=199;TCF=95;TCR=104;TR=93;WE=56933659;WS=56933641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,101:0.45:222
chr12	56933722	rs2657903	G	A	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.174;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=23;PP=444;ReadPosRankSum=-0.643;SC=GCTTTTAACCGTGTGCTCCCT;SOR=0.458;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=71;TCF=19;TCR=52;TR=33;WE=56933730;WS=56933712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,35:0.47:74
chr12	56956213	rs3759091	T	C	784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=2;PP=624;SC=ATATGTGTCATTGGCTCAGCA;SOR=3.611;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=26;WE=56956221;WS=56956203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	56982290	rs2470385	C	T	635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=20;PP=534;SC=ATACGAAGAACGTAGGAAGGA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=56982298;WS=56982280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr12	56992630	rs2242497	C	G	4465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=80;PP=2838;SC=AAAGACCGGGCGGTTCACCCA;SOR=0.921;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=150;TCF=70;TCR=80;TR=148;WE=56992638;WS=56992620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr12	56993714	rs2256341	C	T	5842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=97;NR=80;PP=2965;SC=GCTGGCTGGCCCCTCAGCCTC;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=178;TCF=97;TCR=81;TR=177;WE=56993722;WS=56993704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr12	56999549	rs202234970	CT	C	97.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=1.819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.37;ReadPosRankSum=-1.921;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,10:0.34:29
chr12	57030026	rs2255074	T	C	5320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=100;NR=92;PP=2965;ReadPosRankSum=0.943;SC=TCCTTGGGCCTCCACTTCACG;SOR=0.743;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=194;TCF=101;TCR=93;TR=192;WE=57030034;WS=57030016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,203:0.99:205
chr12	57033680	rs12229457	T	A	919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=25;NR=8;PP=683;SC=AACAAATCACTAAGAAAGATC;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=33;WE=57033688;WS=57033670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr12	57058450	rs146702882	G	A	970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=30;PP=646;ReadPosRankSum=0.969;SC=ATTTATTCAAGGTCATAAAGA;SOR=0.680;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=37;TCR=61;TR=49;WE=57058458;WS=57058440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,49:0.49:101
chr12	57180855	rs4277148	C	T	2004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=11;PP=1242;SC=ACTGCATGATCTTAAAAATAT;SOR=2.799;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=46;TCR=11;TR=57;WE=57180863;WS=57180845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr12	57346828	rs4319546	C	T	1095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.417;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=30;PP=646;ReadPosRankSum=-1.114;SC=GAAGGTAAAACACAAACAATA;SOR=0.333;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=80;TCF=25;TCR=55;TR=47;WE=57346836;WS=57346818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,51:0.54:94
chr12	57350928	rs11172074	G	A	4149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=492;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.525;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=99;NR=101;PP=2826;ReadPosRankSum=-0.392;SC=AAACCTGGGTGGTTACCTTTG;SOR=0.643;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=467;TCF=228;TCR=239;TR=200;WE=57350936;WS=57350918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:285,207:0.42:492
chr12	57486647	rs324019	A	G	821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.895;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=12;PP=522;ReadPosRankSum=-1.114;SC=GTGCTCTGCCAGTCGAGTGGC;SOR=0.423;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=93;TCF=66;TCR=27;TR=39;WE=57486655;WS=57486637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,42:0.43:98
chr12	57492745	rs3024974	G	A	2707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.415;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=60;PP=1664;ReadPosRankSum=-0.381;SC=CCTCCTTCCTGCAGATAAGCA;SOR=0.655;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=278;TCF=148;TCR=130;TR=126;WE=57492753;WS=57492735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,136:0.44:309
chr12	57492996	rs841718	G	A	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-0.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.805;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=57;ReadPosRankSum=-0.811;SC=AGGATGACACGCGGGCAGGGA;SOR=1.499;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=27;TCF=13;TCR=14;TR=7;WE=57493004;WS=57492992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
chr12	57502182	rs324011	C	T	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.52;ReadPosRankSum=0.827;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,3:0.23:13
chr12	57535266	rs1799986	C	T	2232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.679;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=49;PP=1459;ReadPosRankSum=0.347;SC=ACTGCATGGACGGCTCAGATG;SOR=0.862;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=250;TCF=135;TCR=115;TR=109;WE=57535274;WS=57535256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,116:0.43:269
chr12	57543572	rs10876966	C	T	1018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=24;PP=512;ReadPosRankSum=-1.807;SC=AAACAAGGAGCATGAGGCCAC;SOR=0.642;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=34;TCR=46;TR=42;WE=57543580;WS=57543562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,50:0.53:94
chr12	57577280	.	C	T	1202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.983;ClippingRankSum=0.000;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=32;PP=761;ReadPosRankSum=-0.782;SC=CTGTCGGCATCGACTTCCACG;SOR=0.700;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=32;TCR=57;TR=50;WE=57577288;WS=57577270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,54:0.56:96
chr12	57581028	rs6581127	C	G	4182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=97;NR=41;PP=2881;SC=CCTGACAAATCGCTGCTCCTG;SOR=1.675;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=138;TCF=97;TCR=41;TR=138;WE=57581036;WS=57581018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr12	57585144	rs1800139	C	T	4997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=90;PP=2965;SC=TCGGGCTGGCCGTGTATGGGG;SOR=0.826;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=179;TCF=89;TCR=90;TR=179;WE=57585152;WS=57585134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr12	57587839	rs1800187	C	T	1547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=32;PP=939;SC=TCCTCCCCATCGCTCACTGCA;SOR=1.412;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=19;TCR=32;TR=51;WE=57587847;WS=57587829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr12	57589784	rs7397167	A	C	5946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=95;PP=2965;ReadPosRankSum=1.626;SC=TGCACCAGCCAAGGTGGGCCC;SOR=0.251;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=194;TCF=98;TCR=96;TR=193;WE=57589796;WS=57589774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,213:1.00:214
chr12	57589865	rs1800189	C	T	5233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=97;NR=78;PP=2965;SC=TCCGCCCCTCCGCAGAGCACA;SOR=0.815;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=175;TCF=97;TCR=78;TR=175;WE=57589873;WS=57589855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr12	57590735	rs7308552	T	C	1121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=7;PP=869;SC=CCCTGCCACATGCCCAGCCCA;SOR=2.554;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=33;TCR=7;TR=40;WE=57590743;WS=57590725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr12	57590869	rs7308698	T	C	7204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=125;NR=111;PP=2965;ReadPosRankSum=1.376;SC=GCATCAACACTCATGGCAGCT;SOR=0.251;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=237;TCF=126;TCR=111;TR=236;WE=57590877;WS=57590859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,275:1.00:276
chr12	57592557	rs1800168	C	T	2086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=44;PP=1298;SC=ACATAAAAAGCGGAGGATATG;SOR=1.463;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=27;TCR=44;TR=71;WE=57592565;WS=57592547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr12	57593101	rs1140648	G	A	7582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=113;NR=141;PP=2965;SC=ACAAGACCACGGGCACCAACA;SOR=1.022;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=256;TCF=113;TCR=143;TR=254;WE=57593109;WS=57593091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,285:1.00:285
chr12	57593211	rs370186029	G	A	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.150;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=185;ReadPosRankSum=0.451;SC=GGGAGCAGGCGAACGGTGAGC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=10;WE=57593219;WS=57593201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr12	57593894	rs1800159	A	G	318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=8;PP=193;SC=CTCTGTCCTAATGTCCTCATG;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=57593902;WS=57593884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	57602815	rs7956957	C	G	1234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=13;PP=824;SC=CTTTCCACCCCGAGCCTGGGT;SOR=1.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=33;TCR=13;TR=46;WE=57602823;WS=57602805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr12	57604802	rs1800164	A	G	929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=12;PP=713;SC=AGCCAGGCCCAAGCTGCTGGC;SOR=1.418;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=21;TCR=12;TR=33;WE=57604810;WS=57604792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr12	57605168	rs10783814	T	C	4694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=77;PP=2786;SC=TCCACCCAGCTGGGCCCCTGC;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=162;TCF=85;TCR=77;TR=161;WE=57605176;WS=57605158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr12	57606386	rs7304504	A	G	869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=25;PP=682;SC=GCCCCCTGCCAGTGAAGTCCT;SOR=2.621;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=31;WE=57606394;WS=57606376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	57610616	.	GCCGCCGCTC	G	266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.65;QD=38.11;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	57614958	rs7134826	G	T	2544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=56;NR=30;PP=1382;SC=AGGCTGTCCTGTCCACCCCAC;SOR=1.156;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=56;TCR=30;TR=86;WE=57614966;WS=57614948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr12	57619209	rs7979061	C	G	3061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=47;PP=2017;SC=CGGCGGGGCCCGGGCTTGGGG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=50;TCR=47;TR=97;WE=57619217;WS=57619199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr12	57637593	rs3204635	G	A	5252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=94;PP=2965;SC=GCGCCCGCACGCCTAAATTTC;SOR=0.823;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=181;TCF=87;TCR=94;TR=181;WE=57637601;WS=57637583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr12	57639190	rs7139342	C	T	284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=1;NR=10;PP=229;SC=GGTCTCCCTCCGTCACCCAGG;SOR=3.442;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=11;WE=57639198;WS=57639180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	57649840	rs4075325	C	T	6240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.99;MQRankSum=0.000;NF=122;NR=94;PP=2965;ReadPosRankSum=0.520;SC=GGTTTCCATGCTTCAGTCCAC;SOR=0.955;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=218;TCF=124;TCR=94;TR=216;WE=57649848;WS=57649830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,238:0.99:240
chr12	57652963	rs6581131	G	A	168.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=160;SC=CTCAAGCTACGTCTTGCCAGG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=57652971;WS=57652953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	57693060	rs4760126	G	A	3160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=43;PP=1951;SC=CAGTAAGGCTGGCAGGTGCCA;SOR=1.142;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=69;TCR=43;TR=112;WE=57693068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr12	57704005	rs57612216	GA	G	4362.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.811;HP=11;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.345;NF=27;NR=77;PP=1820;ReadPosRankSum=1.745;SC=GTCTCTAAAGGAAAAAAAAAA;SOR=0.595;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=117;TCF=30;TCR=87;TR=104;WE=57704014;WS=57703995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:6,183:0.97:189
chr12	57829129	rs560048	C	T	427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=13;PP=325;SC=CCAGGTGTCCCGACAACCCCC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=57829137;WS=57829119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	57843014	rs776037	C	T	2901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=36;PP=1716;SC=GTTGGTAGAACTGACAGTCAG;SOR=1.098;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=62;TCR=36;TR=98;WE=57843022;WS=57843004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr12	57843711	rs2229357	G	A	1359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=32;PP=844;ReadPosRankSum=0.287;SC=CCCACGGCCCGGCGCCCCCTG;SOR=0.631;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=50;TCR=60;TR=59;WE=57843719;WS=57843701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,64:0.53:121
chr12	57848639	rs3809114	G	A	614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.053;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=10;PP=391;ReadPosRankSum=-0.569;SC=CCTAGCCCCAGTGCTAGAAAT;SOR=0.521;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=57;TCF=40;TCR=17;TR=28;WE=57848647;WS=57848629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,29:0.49:59
chr12	57848708	rs3809113	C	G	1117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.212;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=24;PP=710;ReadPosRankSum=-0.715;SC=CACTGGAACTCACAGCTGCCT;SOR=0.580;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=114;TCF=67;TCR=47;TR=49;WE=57848716;WS=57848698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,54:0.41:131
chr12	57849768	rs507562	C	G	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.398;HP=4;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=6;PP=225;ReadPosRankSum=-1.114;SC=GCAGTCTCTACTTTTCTAGAG;SOR=0.243;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=37;TCF=25;TCR=12;TR=14;WE=57849776;WS=57849758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,13:0.34:38
chr12	57857354	rs10876987	T	C	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.376;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=7;PP=213;ReadPosRankSum=1.305;SC=GGGTGGGGGATACCAGGGATG;SOR=0.143;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=49;TCF=37;TCR=12;TR=18;WE=57857362;WS=57857344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,19:0.36:53
chr12	57858414	rs3817475	A	G	1385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.724;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=22;PP=810;ReadPosRankSum=-0.342;SC=ATGGAGAGACATGCCCCTTTA;SOR=0.842;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=102;TCF=66;TCR=36;TR=61;WE=57858422;WS=57858404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,70:0.60:117
chr12	57858835	rs3817474	G	A	1819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.379;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=27;PP=1082;ReadPosRankSum=-1.424;SC=CCTCCAAATAGCCCAATCCTT;SOR=1.016;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=161;TCF=96;TCR=65;TR=77;WE=57858843;WS=57858825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,85:0.47:179
chr12	57859431	rs2228225	G	A	2764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.442;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=52;PP=1657;ReadPosRankSum=1.214;SC=AGTGCCGGGAGGAACCCTTGG;SOR=0.725;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=243;TCF=133;TCR=110;TR=121;WE=57859439;WS=57859421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,133:0.50:268
chr12	57859932	rs2292657	G	A	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=4.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.666;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=243;ReadPosRankSum=0.735;SC=AGGTGGAGTCGTGGAAGAGGA;SOR=1.282;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=51;TCF=37;TCR=14;TR=16;WE=57859940;WS=57859922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,21:0.34:61
chr12	57865321	rs2228224	G	A	2617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.535;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=53;PP=1639;ReadPosRankSum=3.386;SC=TTTCTGGGGGGTTCCCAGGTT;SOR=0.746;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=181;TCF=91;TCR=90;TR=106;WE=57865329;WS=57865311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,115:0.60:193
chr12	57865821	rs2228226	G	C	1151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.002;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=27;PP=679;ReadPosRankSum=-1.667;SC=TGGGGAAACAGAATTCCTCAA;SOR=0.359;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=98;TCF=38;TCR=60;TR=47;WE=57865829;WS=57865811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,54:0.50:109
chr12	57865928	rs474058	A	C	334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=239;SC=CTGCAGTCCCATGCACAAGAT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=57865936;WS=57865918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	57869241	rs527226	T	C	2814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=53;NR=33;PP=1689;SC=GCTCCCGGACTCTCCCTCCCC;SOR=1.122;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=53;TCR=33;TR=86;WE=57869249;WS=57869231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr12	57869447	rs2277318	T	C	819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.220;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=22;PP=555;ReadPosRankSum=0.426;SC=GAGAAATCTGTATCCCTAGCT;SOR=0.393;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=70;TCF=24;TCR=46;TR=35;WE=57869455;WS=57869437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,37:0.47:78
chr12	57869476	rs2277317	G	A	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=1.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.14;ReadPosRankSum=1.417;SOR=1.030;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,19:0.45:42
chr12	57869486	rs2277316	A	G	633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.81;ReadPosRankSum=0.567;SOR=0.846;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr12	57869500	rs524522	A	C	932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=17;SC=CGGCCCAGGCAAGGGCTCTCC;SOR=1.781;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=9;TCR=17;TR=26;WE=57869508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	57869530	rs3216740	CA	C	428.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.067;NF=6;NR=7;PP=436;ReadPosRankSum=1.992;SC=ACCCTGCCCCCAACTGCTCCT;SOR=0.721;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=10;TCR=11;TR=13;WE=57869538;WS=57869520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr12	57869582	rs2277315	T	C	777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.776;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.198;NF=22;NR=17;PP=537;ReadPosRankSum=1.176;SC=TCCCGGCCGGTCGGAGCCTCC;SOR=0.446;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=89;TCF=54;TCR=35;TR=39;WE=57869590;WS=57869572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,39:0.42:93
chr12	57870121	rs486699	A	C	1874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=13;PP=1326;SC=GCCCGCACCCATCCTGCGCCT;SOR=2.457;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=45;TCR=13;TR=58;WE=57870129;WS=57870111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr12	57870155	rs11544238	A	C	1105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.548;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=16;PP=645;ReadPosRankSum=0.119;SC=ACCCAGCCTGAGGAGGGCGCT;SOR=0.858;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=105;TCF=67;TCR=38;TR=49;WE=57870163;WS=57870145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,53:0.46:114
chr12	57870463	rs10706671	AG	A	2164.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.371;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.601;NF=1;NR=37;PP=1365;ReadPosRankSum=-0.466;SC=GGGATCTGTAAGTCACCCTCG;SOR=0.833;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=87;TCF=4;TCR=83;TR=38;WE=57870471;WS=57870453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,66:0.44:149
chr12	57870648	rs512490	A	G	984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=24;NR=8;PP=691;SC=GAAATGGGAGATTCACATGGG;SOR=1.819;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=32;WE=57870656;WS=57870638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr12	57871555	rs3825080	A	G	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=125;ReadPosRankSum=0.453;SC=TCCCTCCCCCATTGTCTTCTC;SOR=0.591;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=33;TCF=13;TCR=20;TR=14;WE=57871563;WS=57871545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr12	57873042	rs33927108	T	C	2952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.950;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=55;PP=2064;ReadPosRankSum=1.877;SC=AGTAGGAACCTATCCCCTTCA;SOR=0.778;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=231;TCF=129;TCR=102;TR=124;WE=57873050;WS=57873032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,134:0.52:260
chr12	57883801	rs899653	G	A	1125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.378;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=32;PP=682;ReadPosRankSum=-0.613;SC=TGGTGTAGGGGTTACAGAATG;SOR=1.094;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=111;TCF=49;TCR=62;TR=51;WE=57883809;WS=57883791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,56:0.44:126
chr12	57891804	rs537161	T	C	1692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=14;PP=1053;SC=CCTGTGGGTTTGTGTGCAGAA;SOR=2.041;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=41;TCR=14;TR=55;WE=57891812;WS=57891794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr12	57905349	rs747340	G	C	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=71;ReadPosRankSum=1.180;SC=CTGGGCAACAGAGCAAGACTC;SOR=0.105;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=6;WE=57905357;WS=57905339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr12	57905687	rs1284467	A	G	6447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=119;NR=98;PP=2965;SC=ATTCAGCCTTAGTGTTGAAAC;SOR=0.800;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=217;TCF=119;TCR=98;TR=217;WE=57905695;WS=57905677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr12	57911160	rs697221	G	A	1927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.417;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=47;PP=1305;ReadPosRankSum=1.387;SC=ACAGTGTCCCGAAGGAGAAAG;SOR=0.521;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=187;TCF=83;TCR=104;TR=85;WE=57911168;WS=57911150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,91:0.43:210
chr12	57918634	rs1148555	A	G	2489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=54;PP=1638;ReadPosRankSum=-0.396;SC=GCCTGAGAGTACAGAGATAAG;SOR=0.722;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=230;TCF=117;TCR=113;TR=108;WE=57918642;WS=57918624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,116:0.46:251
chr12	57919107	rs1148554	C	T	1352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.291;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=13;PP=915;ReadPosRankSum=1.269;SC=CACAGGCTGACCCTTCATTTT;SOR=1.473;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=103;TCF=71;TCR=32;TR=56;WE=57919115;WS=57919097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,58:0.55:106
chr12	57920262	rs2127318	T	G	703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=422;ReadPosRankSum=1.047;SC=CTTTGAGGGTTTTCTGGGTTG;SOR=0.836;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=23;WE=57920270;WS=57920252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,27:0.68:40
chr12	57921188	rs1284605	C	T	998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.900;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=11;PP=603;ReadPosRankSum=0.331;SC=ATAAGCATGGCCTATCTCACT;SOR=0.885;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=71;TCF=49;TCR=22;TR=39;WE=57921196;WS=57921178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,44:0.56:78
chr12	57922363	rs2620679	A	G	2022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.670;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=34;PP=1208;ReadPosRankSum=-0.479;SC=GAGTGCTGGTAGTCTGGGCTC;SOR=0.750;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=189;TCF=105;TCR=84;TR=82;WE=57922371;WS=57922353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,94:0.44:212
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chr12	57940749	rs775325	C	T	710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=21;NR=7;PP=526;SC=CTGGTTTCTGCTGGGGGTCCT;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=28;WE=57940757;WS=57940739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	57958313	rs775322	A	G	824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.770;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=18;PP=380;ReadPosRankSum=-1.161;SC=GTCCCAGTGGATGAGGGTGTG;SOR=1.120;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=90;TCF=46;TCR=44;TR=34;WE=57958321;WS=57958303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,41:0.40:103
chr12	57974670	rs775245	G	A	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=317;ReadPosRankSum=-1.983;SC=TGTCCCCTACGCTCCTCTGGG;SOR=0.681;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=69;TCF=54;TCR=15;TR=24;WE=57974678;WS=57974660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,27:0.38:71
chr12	57975155	rs775246	A	C	2216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.211;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=29;PP=1357;ReadPosRankSum=-0.703;SC=GGGCAAATGCAGGGTCATAGC;SOR=0.820;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=177;TCF=120;TCR=57;TR=93;WE=57975163;WS=57975145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,101:0.53:191
chr12	57975570	rs775247	A	G	413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=0;PP=211;SC=CAGCTCTATCACTGAGGATGA;SOR=2.049;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=57975578;WS=57975560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	57975910	rs775248	C	G	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.881;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=51;ReadPosRankSum=1.074;SC=ACCTGTAGTCCTAGCTACTTG;SOR=1.721;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=4;WE=57975918;WS=57975900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr12	57977003	rs775249	C	T	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=17;PP=377;ReadPosRankSum=-0.491;SC=TTTCAGGTAGCGTCAGGCTGC;SOR=0.617;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=71;TCF=25;TCR=46;TR=28;WE=57977011;WS=57976993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,30:0.41:74
chr12	57977040	rs775250	C	A	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-2.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=51;ReadPosRankSum=-0.846;SC=CAGGTTGCTTCCCTTCTTGCT;SOR=0.502;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=7;WE=57977048;WS=57977030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr12	57994743	rs775235	T	G	4922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.534;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=90;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.704;SC=CTCCTGCTCTTGTGGGCTCCT;SOR=0.621;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=160;TCF=70;TCR=90;TR=159;WE=57994751;WS=57994733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,175:0.99:176
chr12	57995089	rs812873	T	C	4803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=68;PP=2894;SC=AGTATGATGCTAAGAAGAAAG;SOR=0.787;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=151;TCF=83;TCR=68;TR=151;WE=57995097;WS=57995079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr12	58000378	rs703834	G	A	8110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=143;NR=127;PP=2965;SC=GGAGGGGCAAGTTGTTTCTAT;SOR=0.727;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=270;TCF=143;TCR=127;TR=270;WE=58000386;WS=58000368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,301:1.00:301
chr12	58003922	rs10437954	G	A	1218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=14;PP=819;SC=GCAACTCCCCGGACGCGCGCA;SOR=1.455;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=28;TCR=14;TR=42;WE=58003930;WS=58003912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr12	58004563	rs7314872	C	G	597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.186;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=351;ReadPosRankSum=0.136;SC=AAGTTCGCATCTAATTTGCAT;SOR=1.565;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=35;TCF=13;TCR=22;TR=23;WE=58004571;WS=58004553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,26:0.65:40
chr12	58005682	rs60586224	G	A	1693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=23;PP=1034;ReadPosRankSum=-0.547;SC=GGCGCCATGCGGGGGGGGCAC;SOR=0.712;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=151;TCF=103;TCR=48;TR=72;WE=58005690;WS=58005672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,82:0.50:163
chr12	58007678	rs7305391	G	A	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.583;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=202;ReadPosRankSum=-0.728;SC=TACTCTGGGGGCAGGGCGGCT;SOR=0.382;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=26;TCF=17;TCR=9;TR=12;WE=58007686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr12	58008952	rs703833	C	T	2112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=19;PP=1445;SC=GGCAACTGGCCGAGGAGGCCT;SOR=1.577;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=49;TCR=19;TR=68;WE=58008960;WS=58008942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr12	58009372	rs2277323	G	A	2146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.477;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=45;PP=1207;ReadPosRankSum=-0.161;SC=GAGGGCTGCTGTCTTCCCGAG;SOR=0.732;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=212;TCF=111;TCR=101;TR=99;WE=58009380;WS=58009362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,109:0.47:232
chr12	58010163	rs1564374	A	G	1784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=32;PP=973;ReadPosRankSum=0.917;SC=GGAAGAATTCAGCTTGGAGAT;SOR=0.674;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=147;TCF=87;TCR=60;TR=78;WE=58010171;WS=58010153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,89:0.53:168
chr12	58013175	rs2277324	G	A	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.350;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=149;ReadPosRankSum=-1.054;SC=TCCAAGCCGCGGCTCTCGCCA;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=8;WE=58013183;WS=58013165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr12	58015494	rs923828	G	A	1069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.523;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=21;PP=607;ReadPosRankSum=-0.028;SC=CTTGCTGACTGCGCTGCCTCG;SOR=0.529;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=106;TCF=67;TCR=39;TR=53;WE=58015502;WS=58015484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,56:0.48:116
chr12	58019472	rs774895	T	G	4011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=89;PP=2625;ReadPosRankSum=1.832;SC=GGGGAGCCTGTTAAGGGGCAG;SOR=0.608;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=140;TCF=50;TCR=90;TR=139;WE=58019480;WS=58019462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,148:0.99:149
chr12	58022074	rs12322482	G	A	2040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=47;PP=1169;ReadPosRankSum=-1.002;SC=TGGTTGGGGAGGCTGCAGAAA;SOR=0.666;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=137;TCF=64;TCR=73;TR=86;WE=58022082;WS=58022064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,95:0.62:154
chr12	58023012	rs35287199	CTG	C	986.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.723;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=579;ReadPosRankSum=-1.104;SC=AGTGCCTACTCTGTGTCCCAC;SOR=1.230;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=15;WE=58023021;WS=58023002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,27:0.46:59
chr12	58023981	rs715930	C	A	2452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.886;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=55;PP=1582;ReadPosRankSum=1.740;SC=TGTAAGTGACCAGTTGTAGTT;SOR=0.637;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=269;TCF=137;TCR=132;TR=116;WE=58023989;WS=58023971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,124:0.41:300
chr12	58025813	rs774896	G	C	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.910;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=11;PP=336;ReadPosRankSum=-0.321;SC=GCAAGAGGTAGCCGGAGGCCG;SOR=0.573;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=70;TCF=43;TCR=27;TR=27;WE=58025821;WS=58025803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,27:0.37:73
chr12	58026001	rs2307095	G	A	1511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.556;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=38;PP=1152;ReadPosRankSum=-0.871;SC=CGTCCTCAGAGGCTCCTGCCG;SOR=0.624;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=170;TCF=92;TCR=78;TR=78;WE=58026009;WS=58025991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,76:0.40:190
chr12	58026021	rs2258877	A	G	3080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.077;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=46;PP=1591;ReadPosRankSum=0.850;SC=GGCTCCCAAGAGCGCTCTCCA;SOR=0.808;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=196;TCF=110;TCR=86;TR=112;WE=58026029;WS=58026011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,139:0.63:221
chr12	58026159	rs774897	A	T	2779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=66;PP=1772;ReadPosRankSum=0.302;SC=CGGTTTCCTCACACACCCGAG;SOR=0.679;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=208;TCF=99;TCR=109;TR=123;WE=58026167;WS=58026149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,129:0.57:226
chr12	58089413	rs3825078	A	T	5967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=111;NR=98;PP=2965;SC=CTCCTTACTGAAAGTCTGGAG;SOR=0.738;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=209;TCF=111;TCR=98;TR=209;WE=58089421;WS=58089403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr12	58090232	rs72303843	AGTCGG	A	3734.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.51;QD=41.96;SOR=0.809;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr12	58090241	.	GGGGGC	G	176.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.683;ClippingRankSum=0.000;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=5.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.80;MQRankSum=-1.446;QD=2.56;ReadPosRankSum=1.391;SOR=0.957;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,15:0.22:69
chr12	58090242	.	GGGGC	G	807.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=0.000;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=7.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.84;MQRankSum=0.598;QD=11.71;ReadPosRankSum=-0.740;SOR=0.850;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,53:0.77:69
chr12	58110062	rs141328077	T	TG	260.87	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.9973;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=190;ReadPosRankSum=1.287;SC=ACTGGTGGGGTGGGGGGGGGT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=11;WE=58110070;WS=58110052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,11:0.85:13
chr12	58112189	rs799265	A	G	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=22;PP=519;ReadPosRankSum=-1.814;SC=GGGAACTGGAAAACATCATCC;SOR=0.597;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=71;TCF=21;TCR=50;TR=32;WE=58112197;WS=58112179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,39:0.48:81
chr12	58120276	rs12318065	C	A	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.75;ReadPosRankSum=-1.085;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr12	58124803	rs238523	C	T	1844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=42;PP=1117;SC=AAGCAGTCAACATGGTACAGA;SOR=1.276;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=27;TCR=42;TR=69;WE=58124811;WS=58124793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr12	58125438	rs12307841	T	C	1906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.604;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=49;PP=1264;ReadPosRankSum=-0.562;SC=GGAATGGTTATTGGAATCAGT;SOR=0.928;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=171;TCF=70;TCR=101;TR=79;WE=58125446;WS=58125428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,87:0.47:187
chr12	58126234	rs17852479	C	A	2239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=43;PP=1375;ReadPosRankSum=-0.755;SC=GGGAGCTGGGCAGGGACTTGC;SOR=0.674;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=202;TCF=120;TCR=82;TR=99;WE=58126242;WS=58126220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,108:0.48:224
chr12	58127766	rs238526	T	C	865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=2;PP=685;SC=GTAGCCTCCTTAGGGCCTCCC;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=27;WE=58127774;WS=58127756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	58127967	rs12422249	G	A	2113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=46;PP=1142;ReadPosRankSum=0.320;SC=CTTGCGGGGAGTGAGGGAGCA;SOR=0.707;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=182;TCF=93;TCR=89;TR=93;WE=58127975;WS=58127957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,103:0.52:199
chr12	58129052	.	AAG	A	217.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=0.000;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=2.000;QD=3.46;ReadPosRankSum=0.025;SOR=0.631;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,13:0.21:63
chr12	58135659	rs238530	T	C	3920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=50;PP=2097;SC=TGCTAGTCCCTGATACACCCA;SOR=1.037;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=78;TCR=50;TR=128;WE=58135667;WS=58135649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr12	58139743	rs11172318	G	A	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=163;ReadPosRankSum=2.195;SC=TGGGAGGGCTGTCATCTAAGG;SOR=0.465;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=15;WE=58139751;WS=58139733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr12	58145156	rs2270777	C	T	1361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=32;PP=794;ReadPosRankSum=-0.791;SC=CTTTTCAATCCCCTTTAACCC;SOR=0.643;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=44;TCR=53;TR=59;WE=58145164;WS=58145146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,62:0.62:100
chr12	58149446	rs1689582	C	T	663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=15;PP=456;SC=CCTTCGCTGGCTGCTCCACCC;SOR=1.519;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=7;TCR=15;TR=22;WE=58149454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	58150989	rs35101706	CCA	C	1884.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=28;PP=1385;SC=CCGCCAGTTACCACAGTCTCC;SOR=2.833;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=29;WE=58150998;WS=58150979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr12	58177379	rs5798416	CT	C	108.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=3.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.29;MQRankSum=0.000;QD=2.72;ReadPosRankSum=-0.828;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,12:0.30:40
chr12	58202419	rs2277326	C	A	107.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=81;SC=TATGAAGCCACATGATATAAG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=58202427;WS=58202409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr12	58203264	rs12582311	A	G	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.645;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=184;ReadPosRankSum=0.477;SC=TTTGCAGTCCATGTACGTAAG;SOR=1.341;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=13;WE=58203272;WS=58203254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,13:0.33:39
chr12	58204283	rs2172521	T	C	2466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=50;PP=1648;SC=ACTCCTATTTTAGCACGGCCC;SOR=1.286;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=84;TCF=34;TCR=50;TR=83;WE=58204291;WS=58204273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr12	58335626	rs3751325	A	T	1665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=30;PP=848;ReadPosRankSum=-1.360;SC=CTTCTTCACCAGCAACCAGAA;SOR=0.724;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=158;TCF=91;TCR=67;TR=74;WE=58335634;WS=58335616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,84:0.47:177
chr12	58350631	rs10122	C	T	1301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.066;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=35;PP=691;ReadPosRankSum=-0.563;SC=GATATGCTCACAGAGACTTTG;SOR=1.356;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=119;TCF=53;TCR=66;TR=55;WE=58350639;WS=58350621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,65:0.47:137
chr12	59197223	rs1148531	A	G	569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=10;PP=311;SC=CCTTGGTGCCAGATTTCCATG;SOR=1.230;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=8;TCR=10;TR=18;WE=59197231;WS=59197213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr12	59313151	rs12426955	G	T	1710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.225;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=29;PP=1078;ReadPosRankSum=0.926;SC=ATCGAGTTCCGCCCTTTCCAT;SOR=0.840;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=150;TCF=91;TCR=59;TR=75;WE=59313159;WS=59313141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,81:0.49:167
chr12	60113729	rs1693605	G	A	478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=354;ReadPosRankSum=-1.010;SC=TTATAAACATGCTAATCTTCT;SOR=0.784;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=39;TCR=17;TR=26;WE=60113737;WS=60113719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,25:0.44:57
chr12	60113910	rs1795893	A	G	1385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.243;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.781;NF=24;NR=30;PP=783;ReadPosRankSum=-0.405;SC=TTGACGTGTTATTATGGGATC;SOR=0.488;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=113;TCF=49;TCR=64;TR=54;WE=60113918;WS=60113900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,65:0.49:132
chr12	60113936	rs35527852	C	CAG	1672.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.844;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.297;NF=1;NR=24;PP=978;ReadPosRankSum=-1.039;SC=CTAAAGAACACAATTGGAAAG;SOR=1.020;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=57;TCF=3;TCR=54;TR=25;WE=60113944;WS=60113926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,46:0.50:92
chr12	60127590	rs2706309	A	T	3310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=55;NR=55;PP=1789;SC=CTGAGCAACAAAACAACTCTT;SOR=0.937;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=55;TCR=55;TR=110;WE=60127598;WS=60127580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr12	60127612	rs2711672	G	A	2736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=45;NR=49;PP=1548;SC=GGAGAGCCACGGTGGGCACCT;SOR=0.994;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=45;TCR=49;TR=94;WE=60127620;WS=60127602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr12	60129896	rs2706306	A	T	757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=19;PP=495;SC=AAGGTATCAGAGGTTGGAAAT;SOR=2.147;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=26;WE=60129904;WS=60129886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr12	60129918	rs12824395	G	C	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.458;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=47;ReadPosRankSum=0.463;SC=TGAGAGCAAGGCTCCAGGGAC;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=4;WE=60129926;WS=60129908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr12	60161839	rs139829485	G	A	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=75;ReadPosRankSum=-1.309;SC=AAACCTGCACGTTGTGCACAT;SOR=0.495;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=7;WE=60161847;WS=60161829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,7:0.27:26
chr12	60161941	rs35166468	G	GA	1560.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.248;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.040;NF=7;NR=25;PP=1044;ReadPosRankSum=1.209;SC=ATGAATCTGGGAAAAGGAGAT;SOR=0.416;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=67;TCF=20;TCR=47;TR=32;WE=60161949;WS=60161931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,62:0.49:127
chr12	60169265	rs12718000	G	A	1082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.692;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=28;PP=664;ReadPosRankSum=0.020;SC=AGGTAAGAACGTTTTTCATCA;SOR=0.770;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=105;TCF=46;TCR=59;TR=48;WE=60169273;WS=60169255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,53:0.45:118
chr12	60173356	rs3763980	A	T	2605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.402;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=62;PP=1584;ReadPosRankSum=-0.069;SC=AAGGCAGAAGACCAGAGAATC;SOR=0.650;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=301;TCF=149;TCR=152;TR=123;WE=60173364;WS=60173346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:196,138:0.41:334
chr12	60173406	rs3763979	C	T	2536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.069;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=62;PP=1512;ReadPosRankSum=1.173;SC=AAGATGTTAACGTCAAAGTTT;SOR=0.784;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=195;TCF=82;TCR=113;TR=104;WE=60173414;WS=60173396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,117:0.54:216
chr12	62104219	rs7399207	A	C	1864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.083;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=50;PP=1245;ReadPosRankSum=-0.360;SC=AGGAGAAAATATAGTCAACAT;SOR=0.520;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=149;TCF=55;TCR=94;TR=81;WE=62104227;WS=62104209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,86:0.53:162
chr12	62114671	rs7485027	T	C	2602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=56;PP=1727;ReadPosRankSum=-0.440;SC=TCTTTCTACTTCTCCATTCGA;SOR=0.695;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=249;TCF=130;TCR=119;TR=115;WE=62114679;WS=62114661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,125:0.46:272
chr12	62261077	rs34255534	G	GA	281.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=1.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.47;ReadPosRankSum=0.170;SOR=0.990;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,17:0.27:63
chr12	62705960	rs17120331	A	G	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.324;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=245;ReadPosRankSum=0.457;SC=GAATGAAGCTAGCTCTACAAA;SOR=0.483;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=21;TCR=11;TR=17;WE=62705968;WS=62705950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr12	62708442	rs10877825	G	A	245.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=172;SC=ATATATATTGGCAGGCTTTAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=62708450;WS=62708435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	62717783	rs139681009	CT	C	52.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.63;MQRankSum=2.320;QD=2.20;ReadPosRankSum=-0.234;SOR=0.864;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr12	62778065	rs2044846	A	G	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.225;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=204;ReadPosRankSum=1.033;SC=GAATGGATCCACTTACCAAAC;SOR=0.169;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=20;WE=62778073;WS=62778055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,20:0.54:37
chr12	62783462	rs61760205	A	G	884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.918;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=19;PP=623;ReadPosRankSum=0.929;SC=GTATTATGGAACGGGATGATA;SOR=0.632;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=65;TCF=35;TCR=30;TR=38;WE=62783470;WS=62783452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,39:0.57:69
chr12	62783843	rs17097891	C	T	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=251;ReadPosRankSum=0.584;SC=AAAATAAACACATAAGGTACT;SOR=0.670;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=55;TCF=13;TCR=42;TR=19;WE=62783851;WS=62783833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,21:0.36:58
chr12	62785524	rs1532435	T	C	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=1.668;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5004;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=59;ReadPosRankSum=0.967;SC=CTGGTGTATATCCTAACATTA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=4;WE=62785532;WS=62785514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr12	62785663	rs11174457	T	C	1345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=29;PP=705;ReadPosRankSum=0.614;SC=AAAATGCTGCTGAGGTAAGTC;SOR=0.680;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=120;TCF=71;TCR=49;TR=66;WE=62785671;WS=62785653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,69:0.52:132
chr12	62789933	.	G	GAT	36.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=0;PP=64;ReadPosRankSum=-2.200;SC=TCCTTAGTGAGATATATATAT;SOR=0.132;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=2;WE=62789941;WS=62789923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,2:0.22:9
chr12	62810962	rs10459254	G	A	4537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=80;NR=70;PP=2769;SC=CTGGAGGAAAGAAAAAATGAT;SOR=0.705;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=151;TCF=80;TCR=71;TR=150;WE=62810970;WS=62810948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr12	62861111	rs6581450	T	C	2201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.543;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=53;PP=1220;ReadPosRankSum=-1.012;SC=AAGCTTCAGGTGACGTCAGGA;SOR=0.984;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=205;TCF=99;TCR=106;TR=97;WE=62861119;WS=62861101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,109:0.48:226
chr12	62883990	rs11393430	C	CT	320.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.467;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=328;ReadPosRankSum=0.424;SC=AAGAGTTACACTATTGAGGGA;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=9;WE=62883998;WS=62883980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr12	62887938	rs11174512	C	T	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=3.468;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=170;ReadPosRankSum=1.090;SC=GCAATGTGCTCGGAGAAAATG;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=9;WE=62887946;WS=62887928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr12	62892905	rs4025987	C	G	922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.890;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=26;PP=616;ReadPosRankSum=-0.980;SC=GGCCTTTGCTCAGATGATCAA;SOR=0.560;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=74;TCF=25;TCR=49;TR=40;WE=62892913;WS=62892895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,42:0.51:82
chr12	62928747	rs11364534	TA	T	2797.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=57;PP=1363;SC=CTGTGTCAGTTAAAAAAAACA;SOR=1.454;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=71;TCF=4;TCR=67;TR=60;WE=62928755;WS=62928737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr12	62931083	rs73141045	C	G	1475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.321;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=36;PP=875;ReadPosRankSum=1.470;SC=AATTAGCTATCAAGGAAACTT;SOR=1.090;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=116;TCF=46;TCR=70;TR=58;WE=62931091;WS=62931073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,66:0.50:131
chr12	62940854	.	T	C	1079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=0.000;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=29;PP=653;ReadPosRankSum=1.146;SC=TGATCAAGGGTAAGTATTTAA;SOR=0.722;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=33;TCR=53;TR=47;WE=62940862;WS=62940844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,50:0.55:91
chr12	62943371	rs10877874	G	A	584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=0;PP=405;SC=CAACCTGAGTGGCAGAGTGAG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=62943379;WS=62943361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	62965149	rs2270732	T	C	2112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=50;NR=19;PP=1285;SC=TTAATGCTTATATTAAACTGT;SOR=1.833;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=70;TCF=51;TCR=19;TR=69;WE=62965157;WS=62965139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr12	62979216	rs11174557	G	A	2612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.336;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=58;PP=1522;ReadPosRankSum=0.524;SC=TTTTAAAGAGGTCCCAAGATG;SOR=0.511;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=248;TCF=118;TCR=130;TR=117;WE=62979224;WS=62979206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,128:0.47:271
chr12	62981993	rs150301464	G	A	693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.086;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=17;PP=429;ReadPosRankSum=1.058;SC=TATTTGTGATGGACTTTTGTC;SOR=0.307;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=41;TCF=12;TCR=29;TR=26;WE=62982001;WS=62981983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,29:0.64:45
chr12	62997643	rs7302456	G	T	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.569;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=216;ReadPosRankSum=0.161;SC=AAGCCTCGGCGCCCGGCCGGC;SOR=1.061;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=13;WE=62997651;WS=62997633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr12	63087901	rs2270482	C	T	1310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=34;PP=771;ReadPosRankSum=0.067;SC=CACTGACTACCTCTTCCTTTA;SOR=0.765;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=87;TCF=31;TCR=56;TR=52;WE=63087909;WS=63087891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,58:0.60:97
chr12	63113828	rs342170	T	C	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.579;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.97;ReadPosRankSum=-0.697;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr12	63114156	rs2270484	A	G	654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=19;PP=391;ReadPosRankSum=-0.008;SC=GCAAATTGAGACAGGCCATAT;SOR=0.546;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=54;TCF=15;TCR=39;TR=27;WE=63114164;WS=63114146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,30:0.50:60
chr12	63359011	rs699595	A	T	915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=3;PP=537;SC=TGAAAAAAAAAAATCAAACCT;SOR=3.126;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=26;WE=63359019;WS=63359001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr12	63359168	rs699596	G	A	2408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.491;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.93;MQRankSum=0.301;NF=63;NR=41;PP=1483;ReadPosRankSum=2.483;SC=ACCTCATGCCGGAAAATTGGT;SOR=0.908;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=225;TCF=134;TCR=91;TR=104;WE=63359176;WS=63359158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,117:0.46:252
chr12	63359409	rs699597	C	A	1065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.279;NF=15;NR=28;PP=681;ReadPosRankSum=2.664;SC=GAAAGGAAAGCCAAGATGACA;SOR=0.669;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=81;TCF=29;TCR=52;TR=43;WE=63359417;WS=63359399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,47:0.55:86
chr12	63359549	rs143590555	ACTGCTG	A	5185.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=42;PP=2995;SC=TACTAAGGGTACTGCTGCTGC;SOR=0.816;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=23;TCR=50;TR=61;WE=63359565;WS=63359539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr12	63543551	.	TTC	T	50.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.64;ReadPosRankSum=0.497;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr12	63543576	.	TCTCA	T	232	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=12;MMLQ=28;MQ=59.02;NF=10;NR=0;PP=232;QD=23.5;SC=TCTCTCTCTCTCTCACACACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=32;TCR=6;TR=10;WE=63543587;WS=63543566;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:28,10:0.26:38
chr12	63544209	rs1042615	A	G	3125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.839;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=67;PP=1960;ReadPosRankSum=0.015;SC=AGGCCGACGCAAACATGCCGA;SOR=0.753;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=299;TCF=152;TCR=147;TR=134;WE=63544217;WS=63544199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,148:0.45:326
chr12	63954300	rs12314553	C	T	2325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=-3.398;QD=4.33;ReadPosRankSum=-1.077;SOR=0.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:389,148:0.28:537
chr12	63954304	rs1054891	T	C	10389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=558;ExcessHet=3.0103;FS=0.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=-2.367;QD=18.65;ReadPosRankSum=0.846;SOR=0.759;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:212,345:0.62:557
chr12	63964640	.	GA	G	109.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.541;ClippingRankSum=0.000;DP=210;ExcessHet=3.0103;FS=4.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQRankSum=-1.815;QD=0.69;ReadPosRankSum=0.105;SOR=0.338;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:133,25:0.16:158
chr12	63984999	rs55743108	C	T	450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.839;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.981;NF=1;NR=17;PP=325;ReadPosRankSum=0.802;SC=CTTCTGACAACCATACACAGC;SOR=2.070;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=62;TCF=10;TCR=52;TR=18;WE=63985007;WS=63984989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,20:0.30:66
chr12	64011062	rs4105524	A	G	3246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=557;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.556;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-3.979;NF=93;NR=83;PP=2234;ReadPosRankSum=0.278;SC=AAAAAAACCAACTTTATGAAC;SOR=0.755;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=525;TCF=272;TCR=253;TR=176;WE=64011070;WS=64011040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:373,184:0.33:557
chr12	64041195	.	C	CATAATAATAATAATA	234.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.834;ClippingRankSum=0.000;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=14.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.94;MQRankSum=-4.076;QD=6.52;ReadPosRankSum=-1.446;SOR=3.647;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,9:0.25:36
chr12	64055269	rs55665893	T	A	602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=4.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.29;ReadPosRankSum=-0.230;SOR=1.215;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,33:0.29:114
chr12	64055347	.	G	GA	66	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5569;HP=12;HapScore=2;MGOF=25;MMLQ=18;MQ=60.0;NF=0;NR=6;PP=66;QD=12.0;SC=CTTTTTTTCTGAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=64055355;WS=64055337;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:5,6:0.55:11
chr12	64057447	rs35598493	CAGA	C	3639.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.464;NF=21;NR=31;PP=1964;ReadPosRankSum=0.665;SC=TGCAGTTGACCAGAAGTTCAT;SOR=0.683;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=169;TCF=72;TCR=97;TR=52;WE=64057457;WS=64057437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,103:0.36:288
chr12	64061745	rs11175110	C	G	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.665;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.475;NF=18;NR=1;PP=323;ReadPosRankSum=0.595;SC=TACTAGGCACCCACAAACCCT;SOR=2.400;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=19;WE=64061753;WS=64061735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,19:0.76:25
chr12	64078548	rs61935227	G	A	5287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.60;MQRankSum=-1.379;QD=21.58;ReadPosRankSum=-0.703;SOR=0.705;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,135:0.55:245
chr12	64078557	rs61935228	C	T	5489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FS=0.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.02;MQRankSum=-1.106;QD=21.03;ReadPosRankSum=-0.651;SOR=0.742;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:116,145:0.56:261
chr12	64078612	rs61935229	G	A	3420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.095;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.110;NF=85;NR=71;PP=2313;ReadPosRankSum=0.646;SC=TGGTATCGCGGCATGTGGAAT;SOR=0.723;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=257;TCF=136;TCR=121;TR=156;WE=64078620;WS=64078602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,156:0.59:263
chr12	64118558	rs3864455	A	G	2600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.978;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-10.634;NF=66;NR=34;PP=1812;ReadPosRankSum=1.941;SC=CTCATCAGTTAATTCTGGTAG;SOR=0.988;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=157;TCF=102;TCR=55;TR=100;WE=64118566;WS=64118548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,108:0.64:169
chr12	64174680	rs3791156	G	C	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.526;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=61;ReadPosRankSum=0.751;SC=TTCAGTTGCTGTACCTCTCAG;SOR=0.223;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=5;WE=64174688;WS=64174670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr12	64174904	rs73122634	C	T	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=16;PP=417;ReadPosRankSum=0.568;SC=GATAAATCCACGAAAGGAAAA;SOR=0.723;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=65;TCF=32;TCR=33;TR=31;WE=64174912;WS=64174894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,36:0.46:78
chr12	64472803	rs789710	A	T	6444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=117;PP=2965;SC=CCACAGAATCAGTGAAGTCCA;SOR=0.960;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=212;TCF=95;TCR=117;TR=212;WE=64472811;WS=64472793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr12	64485593	rs5798729	A	ACC	1691.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=2;PP=1234;SC=GAATTGTAAGACTATGATCTA;SOR=3.855;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=31;WE=64485601;WS=64485583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr12	64519806	rs789722	T	C	2678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.588;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=63;PP=1366;ReadPosRankSum=0.377;SC=TTGGGCGGTCTGCCAGAGAAC;SOR=0.514;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=251;TCF=122;TCR=129;TR=130;WE=64519814;WS=64519796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,136:0.50:273
chr12	64521567	rs10878106	C	G	3009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.803;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=64;PP=1916;ReadPosRankSum=0.114;SC=TGAGGAGCCACTGCACCTCAG;SOR=0.598;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=315;TCF=173;TCR=142;TR=138;WE=64521575;WS=64521557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:189,147:0.44:336
chr12	64587633	rs699638	C	A	3422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=42;PP=2101;SC=TAACCTTTGGCTCCAGGTTTC;SOR=1.262;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=115;TCF=73;TCR=42;TR=115;WE=64587641;WS=64587623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr12	64609562	rs2335390	C	T	3262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=51;PP=1777;SC=AGAAGTCTGCCATCTCCATCC;SOR=0.743;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=54;TCR=51;TR=105;WE=64609570;WS=64609552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr12	64661209	rs1657057	AT	CC	452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=0;NR=9;PP=527;SC=GCATTTTCAGATCTCCAATCT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=9;WE=64661218;WS=64661199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	64669018	rs5798743	AT	A	318.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=1;PP=251;SC=ATAATATATAATAGTCATGTA;SOR=2.093;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=64669026;WS=64669008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	64669090	rs1002392	C	A	1266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=10;PP=625;SC=GCTGAAAGACCAGAAGTATCT;SOR=1.251;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=28;TCR=10;TR=38;WE=64669098;WS=64669080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr12	64669270	rs10878132	C	G	1600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=30;PP=977;SC=GAGACAAGGTCTCATGCTGCC;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=22;TCR=30;TR=52;WE=64669278;WS=64669260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr12	64671412	rs10624687	C	CTA	2382.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=27;PP=1568;ReadPosRankSum=-0.296;SC=GCCAGGGCCCCTATATATATA;SOR=0.593;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=59;TCF=21;TCR=38;TR=41;WE=64671421;WS=64671402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,85:0.83:102
chr12	64679694	.	CA	C	311.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.336;ClippingRankSum=0.000;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=2.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.19;MQRankSum=2.387;QD=2.94;ReadPosRankSum=0.189;SOR=1.031;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,28:0.26:106
chr12	64697635	rs10878142	T	G	321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=272;SC=ATGATTACTGTCAGGTTTGTT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=64697643;WS=64697625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	64712511	rs7955105	A	G	7576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=146;NR=113;PP=2965;SC=ACTCATTTCCATTCCCATTGC;SOR=0.855;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=259;TCF=146;TCR=113;TR=259;WE=64712519;WS=64712501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,290:1.00:290
chr12	64746924	rs11434916	G	GT	32.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=6.781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.39;MQRankSum=1.952;QD=1.49;ReadPosRankSum=0.315;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,5:0.23:22
chr12	64833249	rs10878172	A	G	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=18;PP=548;SC=CACCATTTTGAAATTATGAGT;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=64833257;WS=64833239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr12	64838922	rs6581565	G	T	5146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=87;PP=2965;SC=GTAGGTATTTGTGAAGCTCAC;SOR=0.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=78;TCR=87;TR=165;WE=64838930;WS=64838912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr12	64858100	rs57810028	A	AT	1008.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=385;ReadPosRankSum=0.324;SC=CCAATCAATGATTTTTTTTTT;SOR=0.922;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=20;TCR=11;TR=23;WE=64858108;WS=64858090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,43:0.91:47
chr12	64875787	rs7486100	T	A	1464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=29;PP=785;SC=AGATTTATATTCATAGCTATA;SOR=1.938;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=14;TCR=29;TR=43;WE=64875795;WS=64875777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr12	64883761	rs10878177	C	A	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.570;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=109;ReadPosRankSum=-0.376;SC=TATAAAACATCTTTTTAAAAC;SOR=0.180;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=9;WE=64883769;WS=64883751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr12	65004316	rs3741747	T	C	892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=3;PP=726;SC=TGCCCGGGGCTGCGCGCCGGG;SOR=3.841;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=29;WE=65004324;WS=65004306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	65004387	rs3741748	C	T	4450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.31;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr12	65134536	rs1690277	C	G	573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=14;PP=418;SC=TGGATTACTACAGTAGATAAT;SOR=2.419;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=18;WE=65134544;WS=65134526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	65146532	rs1147096	C	T	2064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=28;PP=1220;SC=TTTTCTTTAGCGGTGTCTGTA;SOR=0.976;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=71;TCF=42;TCR=29;TR=70;WE=65146540;WS=65146522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr12	65146676	rs1147095	T	C	2654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=52;PP=1640;SC=AAAGAGAGTCTTGTATGATTC;SOR=1.337;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=33;TCR=52;TR=85;WE=65146684;WS=65146666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr12	65150485	rs2620733	C	T	5316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=86;PP=2965;SC=TGCTCTTGTCCTAGCTCTTCC;SOR=0.714;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=173;TCF=87;TCR=86;TR=173;WE=65150493;WS=65150475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr12	65150577	.	A	G	1191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.053;ClippingRankSum=0.000;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.867;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=32;PP=726;ReadPosRankSum=-0.057;SC=AGTTTGGAACATTAAGTTTGA;SOR=0.905;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=79;TCF=22;TCR=57;TR=42;WE=65150585;WS=65150567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,52:0.55:94
chr12	65222347	rs1144426	C	G	2616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=53;PP=1591;SC=TTCTTTAGAGCCTCTGGAATG;SOR=1.890;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=22;TCR=53;TR=75;WE=65222355;WS=65222337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr12	65270436	rs7311657	A	G	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=147;ReadPosRankSum=1.466;SC=CCAGCTCTAGACTGCAGACGC;SOR=0.602;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=11;WE=65270444;WS=65270426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,13:0.34:38
chr12	65449071	rs1026025	A	G	766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.137;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=25;PP=519;ReadPosRankSum=1.198;SC=TTTCCTTGCAATTCTTTAGAA;SOR=0.483;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=63;TCF=16;TCR=47;TR=34;WE=65449079;WS=65449061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,35:0.55:64
chr12	65460368	rs3782498	A	G	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=4.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.853;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=125;ReadPosRankSum=0.162;SC=AACTTATTCTAATCAAACATT;SOR=1.461;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=31;TCR=4;TR=9;WE=65460376;WS=65460358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,13:0.30:43
chr12	65462429	rs72205564	ATGTGTGTGTG	A,ATGTGTG	1764.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=16;NF=8,8;NR=16,16;PP=374,1079;SC=CCAAAAAACCATGTGTGTGTG;SOR=2.200;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=32;TCF=9;TCR=23;TR=24,24;WE=65462446;WS=65462419;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.41,0.59:49
chr12	65477613	rs150722125	TTTC	T	412.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.48;ReadPosRankSum=2.268;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr12	65514266	rs7301320	T	C	2216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.282;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=51;PP=1111;ReadPosRankSum=1.028;SC=TTCTCTGTTGTGCTTTTCTGA;SOR=0.896;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=248;TCF=129;TCR=119;TR=103;WE=65514274;WS=65514256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,117:0.41:283
chr12	65633880	rs34562240	GTGAT	G	1681.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.804;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.045;NF=12;NR=14;PP=1050;ReadPosRankSum=0.744;SC=ATTATGTCAAGTGATTGATTC;SOR=0.534;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=69;TCF=37;TCR=32;TR=26;WE=65633891;WS=65633870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,46:0.50:92
chr12	65639615	rs3217456	ATTTT	A	1307.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.538;NF=3;NR=19;PP=861;ReadPosRankSum=-0.173;SC=AACTAAGACTATTTTCTTTCT;SOR=0.683;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=6;TCR=38;TR=22;WE=65639626;WS=65639605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,36:0.47:77
chr12	65762703	rs57910895	AC	A	764.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=2.504;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.26;MQRankSum=0.423;QD=19.61;ReadPosRankSum=1.228;SOR=2.115;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,35:0.90:39
chr12	65881710	.	TA	T	193.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.818;ClippingRankSum=0.000;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=1.683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.22;MQRankSum=3.576;QD=1.34;ReadPosRankSum=0.310;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,28:0.19:145
chr12	66232383	rs3834468	T	TG	1501.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.966;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.28;MQRankSum=1.201;NF=0;NR=28;PP=959;ReadPosRankSum=-1.856;SC=CTTCTTTTTTTTAAAGAAAAA;SOR=0.577;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=1;TCR=50;TR=28;WE=66232391;WS=66232373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,45:0.59:76
chr12	66261467	rs139811507	G	T	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.338;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=345;ReadPosRankSum=-1.930;SC=AGTCAGAGCCGTAAGGCTGCC;SOR=0.379;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=50;TCF=11;TCR=39;TR=23;WE=66261475;WS=66261457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,24:0.46:52
chr12	66308644	rs10878345	A	G	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.923;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=135;ReadPosRankSum=-0.159;SC=TAGTAGAGACAGGGTTTCACC;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=9;WE=66308652;WS=66308634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr12	66517828	rs2464304	T	A	3538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=59;NR=65;PP=1891;SC=AACTATTAACTCCATGTATGA;SOR=0.846;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=59;TCR=65;TR=124;WE=66517836;WS=66517818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr12	66531694	rs1185629	A	G	1076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=34;NR=2;PP=798;SC=CTTTTTTCTCATTAAATTTTT;SOR=5.084;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=36;TCF=34;TCR=2;TR=36;WE=66531702;WS=66531684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr12	66533329	rs11176056	A	G	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=188;ReadPosRankSum=0.794;SC=TTTCCAGGCCAGCGTGTAGGG;SOR=0.634;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=39;TCF=28;TCR=11;TR=17;WE=66533337;WS=66533319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,19:0.40:47
chr12	66546100	rs8793	A	G	3216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=352;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=72;PP=2020;ReadPosRankSum=0.786;SC=TCTGTTTAAAATCAACGCAAA;SOR=0.679;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=326;TCF=170;TCR=156;TR=147;WE=66546108;WS=66546090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:193,159:0.45:352
chr12	66597701	rs1882200	C	T	1089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.448;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=32;PP=739;ReadPosRankSum=1.196;SC=TAATGTGGCTCTTAATCTGTA;SOR=0.399;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=69;TCF=14;TCR=55;TR=41;WE=66597709;WS=66597691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,45:0.61:74
chr12	66603399	rs11465955	C	T	1026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.793;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=22;PP=469;ReadPosRankSum=-1.865;SC=CTGGATTTGCCGGCACTTTTT;SOR=0.801;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=77;TCF=34;TCR=43;TR=39;WE=66603407;WS=66603389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,50:0.54:92
chr12	66603856	rs189986321	A	G	1375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.390;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=22;PP=748;ReadPosRankSum=-2.632;SC=GGAGCTTTGGATTTGTGTTGA;SOR=0.830;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=114;TCF=70;TCR=44;TR=61;WE=66603864;WS=66603846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,68:0.53:129
chr12	66605228	rs1152888	A	G	1708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=21;PP=1014;SC=TTCCTAAGGAATACTGCTTAA;SOR=1.270;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=38;TCR=21;TR=59;WE=66605236;WS=66605218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr12	66696255	rs3741605	T	C	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=390;ReadPosRankSum=0.202;SC=TCAGGTTTTATGTACGCTGGC;SOR=0.701;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=50;TCF=43;TCR=7;TR=23;WE=66696263;WS=66696245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,24:0.45:53
chr12	66696410	rs3741604	C	T	4376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=354;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.753;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.194;NF=101;NR=85;PP=2703;ReadPosRankSum=-0.629;SC=CGTACCTGCGCCAACTTCAGG;SOR=0.598;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=331;TCF=170;TCR=161;TR=186;WE=66696418;WS=66696400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,201:0.57:354
chr12	66698438	rs2118139	G	A	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-4.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.876;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=275;ReadPosRankSum=-0.807;SC=TAAGTTTGATGAAACTTTGAG;SOR=0.211;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=15;WE=66698446;WS=66698428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr12	66698461	rs2118140	A	G	794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.119;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=1;PP=523;ReadPosRankSum=0.116;SC=AACGGTTTCTAAATAATCTCC;SOR=1.445;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=40;TCF=37;TCR=3;TR=24;WE=66698469;WS=66698451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,28:0.64:44
chr12	66698736	.	G	T	2007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.470;ClippingRankSum=0.000;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.538;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=47;PP=1307;ReadPosRankSum=-0.528;SC=GAGGTCTCCAGTGATGATGTT;SOR=1.220;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=129;TCF=54;TCR=75;TR=77;WE=66698744;WS=66698726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,84:0.60:140
chr12	66698895	rs4430553	T	C	1522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.683;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=38;PP=934;ReadPosRankSum=-1.153;SC=GAGTTGTTCCTAGACAATGAG;SOR=0.942;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=157;TCF=71;TCR=86;TR=65;WE=66698903;WS=66698885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,76:0.43:175
chr12	66698954	rs1971302	C	G	1911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=44;PP=1239;SC=TTATCATCAACTTTCAGTGTA;SOR=1.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=19;TCR=44;TR=63;WE=66698962;WS=66698944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr12	66716618	.	GT	G	118.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.178;ClippingRankSum=0.000;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=4.351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.86;ReadPosRankSum=0.171;SOR=1.397;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,14:0.22:64
chr12	66717692	rs7969887	T	G	1058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=5;PP=800;SC=GTCTGAGTAGTAGTTAATGTT;SOR=3.258;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=33;WE=66717700;WS=66717682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr12	66717716	rs7957877	C	T	1510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=10;PP=1066;SC=ACAAGTGAAACGGAGACTTTC;SOR=2.480;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=42;TCR=10;TR=52;WE=66717724;WS=66717706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr12	66725160	rs1185244	C	T	3077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.325;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=53;PP=1708;ReadPosRankSum=-0.301;SC=GCAGATTTTCCGTCCCCACGG;SOR=0.548;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=198;TCF=115;TCR=83;TR=120;WE=66725168;WS=66725150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,139:0.61:227
chr12	66731864	rs1168329	C	A	672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.744;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=18;PP=387;ReadPosRankSum=1.259;SC=TCAAGCCCACCGATAATCAAG;SOR=0.819;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=100;TCF=52;TCR=48;TR=35;WE=66731872;WS=66731854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,39:0.35:110
chr12	66771108	rs35635542	AT	A	427.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQRankSum=-0.126;QD=30.55;ReadPosRankSum=0.126;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,13:0.93:14
chr12	66771121	rs148141593	T	C	514.10	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.12;MQRankSum=-0.149;QD=34.27;ReadPosRankSum=-1.274;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,14:0.93:15
chr12	66786073	rs7970076	A	G	3685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=46;PP=2447;SC=TCTGGGGGACAAAGTAAAGAC;SOR=1.448;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=88;TCR=46;TR=134;WE=66786081;WS=66786063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr12	66786091	rs13277	G	C	5276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=107;NR=74;PP=2965;SC=GACATACCTTGAGTTCCATAG;SOR=1.053;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=181;TCF=107;TCR=74;TR=181;WE=66786099;WS=66786081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr12	66786341	rs7970771	G	A	2177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=34;PP=1603;SC=AATATACCAAGATACTCCGTG;SOR=0.747;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=38;TCR=34;TR=72;WE=66786349;WS=66786331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr12	66786644	rs2270594	G	A	1820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=36;PP=1195;SC=TCCCTGTATGGTACTGAATAT;SOR=1.112;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=25;TCR=36;TR=61;WE=66786652;WS=66786634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr12	66814466	rs7397861	C	G	2307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.302;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=56;PP=1383;ReadPosRankSum=-1.264;SC=TTAAGAGAGGCCTTAAAATGA;SOR=0.717;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=246;TCF=128;TCR=118;TR=109;WE=66814474;WS=66814456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,122:0.44:275
chr12	66814487	rs7397862	C	A	2108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.692;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=55;PP=1148;ReadPosRankSum=0.075;SC=ATCAGAAAATCCATTTTCCTT;SOR=0.902;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=238;TCF=118;TCR=120;TR=102;WE=66814495;WS=66814477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,115:0.43:269
chr12	66826527	rs143524823	GAAGT	G	593.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=535;SC=TGTAGGAACTGAAGTAAGATG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=11;WE=66826538;WS=66826517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	66826555	rs6581694	A	G	296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=10;PP=261;SC=TTAAAATCCTAGTAAATTAAG;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=66826563;WS=66826545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	66849408	rs1038923	T	C	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.860;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.48;ReadPosRankSum=-2.346;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr12	66856978	rs3830371	AT	A	656.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=1.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.52;ReadPosRankSum=-0.076;SOR=1.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr12	66856981	rs144154456	AAAG	A	656.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.89;ReadPosRankSum=-0.678;SOR=0.725;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr12	66859110	rs201673783	A	G	2286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.811;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=50;PP=1330;ReadPosRankSum=0.912;SC=TGTTTGTTACAGCACATCGAG;SOR=0.539;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=227;TCF=128;TCR=99;TR=109;WE=66859118;WS=66859100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,119:0.49:245
chr12	66859221	rs12820901	T	C	1146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.306;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=27;PP=691;ReadPosRankSum=0.500;SC=GAACAAATTTTAGAAAACAAA;SOR=0.432;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=120;TCF=46;TCR=74;TR=49;WE=66859229;WS=66859211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,56:0.42:133
chr12	66909389	rs12316942	C	T	3907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=70;NR=61;PP=2284;SC=CCCTCAGGACCCCAACATACC;SOR=0.707;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=131;TCF=70;TCR=61;TR=131;WE=66909397;WS=66909379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr12	66911771	rs11838180	G	T	2098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.469;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=46;PP=1070;ReadPosRankSum=0.711;SC=CAAAGAAAAGGAACAGAGCTT;SOR=0.731;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=216;TCF=111;TCR=105;TR=96;WE=66911779;WS=66911761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,109:0.45:241
chr12	66932832	rs66522623	T	C	614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.709;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=311;ReadPosRankSum=0.190;SC=GTATCCCCTATGGATAAGGGG;SOR=0.146;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=39;TCF=32;TCR=7;TR=24;WE=66932840;WS=66932822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,26:0.60:43
chr12	66933149	rs10219689	C	T	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.918;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=222;ReadPosRankSum=0.000;SC=TCCTAGGAGACGGTGGGCCCT;SOR=1.371;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=14;WE=66933157;WS=66933139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
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chr12	67701103	rs812325	G	A	997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.754;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=15;PP=591;ReadPosRankSum=1.021;SC=GTGTTATTTGGAGTGGTTTAA;SOR=0.788;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=99;TCF=64;TCR=35;TR=43;WE=67701111;WS=67701093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,48:0.45:107
chr12	67706466	rs1060350	G	A	1864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=41;PP=1025;ReadPosRankSum=-1.087;SC=TAGCAGCACTGCTAACCATTC;SOR=0.714;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=185;TCF=100;TCR=85;TR=86;WE=67706474;WS=67706456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,95:0.46:205
chr12	68045455	rs7307918	C	T	1312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=32;PP=910;SC=ATTTGGGTTTCGATGGTGGTT;SOR=2.110;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=13;TCR=32;TR=45;WE=68045463;WS=68045445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr12	68619604	rs11570915	G	A	2147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.651;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=59;PP=1379;ReadPosRankSum=0.134;SC=GGTTAGATGAGAGGATAACCT;SOR=0.813;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=216;TCF=82;TCR=134;TR=91;WE=68619612;WS=68619594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,102:0.43:237
chr12	68646521	rs2227491	T	C	2568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.798;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=57;PP=1523;ReadPosRankSum=3.447;SC=CACACGGCCCTGTTCGTCACA;SOR=0.638;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=226;TCF=117;TCR=109;TR=120;WE=68646529;WS=68646511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,125:0.51:244
chr12	68646729	rs139006537	T	G	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=65;ReadPosRankSum=1.662;SC=AAAGCAGAATTCAGATGTGTG;SOR=0.223;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=6;WE=68646737;WS=68646719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr12	68688939	rs7958232	C	T	1499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=6;PP=1106;SC=AAGTAGAAAACGTTAGGAAAA;SOR=3.745;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=41;TCR=6;TR=47;WE=68688947;WS=68688929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr12	68690765	.	TA	T	30.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.284;ClippingRankSum=0.000;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=3.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.43;ReadPosRankSum=1.098;SOR=0.300;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,11:0.15:72
chr12	68707576	rs4575357	G	A	1391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=34;PP=956;SC=GCATTTCCTCGAGAAAATATG;SOR=2.400;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=11;TCR=34;TR=45;WE=68707584;WS=68707566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr12	68708761	rs2306393	C	T	10166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=386;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=182;NR=150;PP=2965;SC=AGATTTCTCACGTACATCCAA;SOR=0.813;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=332;TCF=182;TCR=150;TR=332;WE=68708769;WS=68708751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,386:1.00:386
chr12	68709892	rs17224810	C	T	1662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.603;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=27;PP=888;ReadPosRankSum=-0.469;SC=TTGCTACTAACGGTTCCTTCT;SOR=0.968;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=145;TCF=82;TCR=63;TR=69;WE=68709900;WS=68709882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,80:0.49:162
chr12	68717038	rs80219525	T	C	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=219;ReadPosRankSum=-0.049;SC=CAAAAATTATTTTAGTTTAGT;SOR=0.929;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=34;TCF=12;TCR=22;TR=16;WE=68717046;WS=68717028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,17:0.46:37
chr12	68719216	rs2870812	G	A	1091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=11;PP=611;ReadPosRankSum=2.308;SC=CATCCATTAAGCTACCTGATT;SOR=1.455;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=40;TCF=28;TCR=12;TR=38;WE=68719224;WS=68719206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,43:0.96:45
chr12	68720335	rs17224845	C	T	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=8;PP=371;ReadPosRankSum=1.594;SC=AAGAAAACAACAATGGAAAAT;SOR=0.659;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=66;TCF=48;TCR=18;TR=28;WE=68720343;WS=68720325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,28:0.42:67
chr12	68720627	rs962976	G	A	6588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=118;NR=100;PP=2965;SC=TCTTTCTTGAGTAACATCCTT;SOR=0.789;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=218;TCF=118;TCR=100;TR=218;WE=68720635;WS=68720617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr12	68721040	rs962977	A	G	625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=2;PP=455;SC=ATTAAAAATCAGGGGGTCACA;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=68721048;WS=68721030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	68724951	rs3741808	G	T	6491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=107;NR=103;PP=2965;SC=TACAAGACTCGGACAAATAAG;SOR=0.744;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=210;TCF=107;TCR=103;TR=210;WE=68724959;WS=68724941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr12	68725582	rs1480050	T	C	592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.514;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=6;PP=462;ReadPosRankSum=1.044;SC=TATTTCTTTATACGCTGTCTT;SOR=0.268;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=43;TCF=35;TCR=8;TR=27;WE=68725590;WS=68725572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,27:0.60:45
chr12	69096398	rs139991082	A	G	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=3.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.92;ReadPosRankSum=1.760;SOR=1.545;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,21:0.50:42
chr12	69096626	.	AT	A	40.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=-0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.82;ReadPosRankSum=1.465;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr12	69141678	rs57821268	T	A	542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=14;NR=5;PP=411;SC=TTGAATTTAATCTGAACAACA;SOR=1.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=19;WE=69141686;WS=69141668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	69207162	rs1470383	G	A	539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=1;PP=402;SC=ATTGGATACTGTCTGTGATCA;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=69207170;WS=69207152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	69218038	rs2291857	T	G	288.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=240;SC=ATTGAAAGGTTAAATTGCATA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=69218046;WS=69218028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	69250481	rs3741599	T	C	2968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.328;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=68;PP=1774;ReadPosRankSum=1.109;SC=CAAGAGACAATTATATGAGTG;SOR=0.499;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=290;TCF=133;TCR=157;TR=132;WE=69250489;WS=69250471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,149:0.46:325
chr12	69250548	rs3741598	C	T	1392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.940;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=40;PP=860;ReadPosRankSum=-0.608;SC=CACTAAAATGCAGCCTTTGTG;SOR=0.986;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=90;TCF=24;TCR=66;TR=54;WE=69250556;WS=69250538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,60:0.61:99
chr12	69252594	rs58495062	G	C	32.31	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.77;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr12	69252715	rs1143653	A	G	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=11;PP=329;ReadPosRankSum=1.439;SC=TTATTATATAAGACCCAGGCA;SOR=0.777;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=65;TCF=41;TCR=24;TR=30;WE=69252723;WS=69252705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,35:0.47:75
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chr12	69645864	rs490872	A	G	2274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=48;PP=1360;SC=TCTTTTTTTCAGGGGGAGACA;SOR=1.582;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=25;TCR=48;TR=73;WE=69645872;WS=69645854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr12	69646914	rs2305641	G	A	1308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=0.610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.73;ReadPosRankSum=1.254;SOR=0.792;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,69:0.46:150
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chr12	69653146	rs2231700	T	C	1462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.834;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=27;PP=643;ReadPosRankSum=-0.638;SC=TGCTATACACTGTTGTGACTA;SOR=0.453;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=131;TCF=80;TCR=51;TR=63;WE=69653154;WS=69653136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,74:0.49:151
chr12	69667075	rs1463335	T	A	1340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.652;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=28;PP=730;ReadPosRankSum=-1.158;SC=AATTTCAGGTTGTGGCATTCA;SOR=0.816;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=111;TCF=56;TCR=55;TR=55;WE=69667083;WS=69667065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,66:0.51:130
chr12	69744104	rs686407	C	T	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=313;ReadPosRankSum=1.889;SC=AGAATTGAGACTCAATACAAA;SOR=0.866;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=45;TCF=8;TCR=37;TR=19;WE=69744112;WS=69744094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,20:0.43:47
chr12	69753595	rs622656	C	T	472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=1;PP=407;SC=GAGGAGTTGACGGTTACTCAC;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=69753603;WS=69753588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	69753830	rs623853	G	A	1286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.588;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=36;PP=850;ReadPosRankSum=-0.292;SC=CCCCTCTTCCGGGGTGGCTCT;SOR=0.747;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=141;TCF=63;TCR=78;TR=62;WE=69753838;WS=69753820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,68:0.42:162
chr12	69753847	rs554591	T	C	997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.491;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=31;PP=742;ReadPosRankSum=1.090;SC=CTCTCCCGCCTCGGTTCCTCC;SOR=1.007;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=107;TCF=42;TCR=65;TR=47;WE=69753855;WS=69753837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,49:0.41:120
chr12	69756762	rs10784775	G	A	532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=20;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=19;PP=536;SC=ACAACCTGTAGTTTTTTTTTT;SOR=2.948;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=22;WE=69756770;WS=69756752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	69759551	rs11286051	AT	A	2555.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=42;PP=1179;SC=ATAATTTACTATTTTTTTTCT;SOR=0.736;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=12;TCR=50;TR=52;WE=69759559;WS=69759541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr12	69764388	rs2291005	A	G	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.468;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=126;ReadPosRankSum=0.900;SC=TTTGACATGTATATACTTATT;SOR=0.132;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=8;WE=69764396;WS=69764378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr12	69967862	rs547497	G	A	6976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=124;NR=97;PP=2965;SC=CATTGGAGGCGAGGGTTTCTA;SOR=0.873;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=221;TCF=124;TCR=97;TR=221;WE=69967870;WS=69967852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr12	69968829	rs61759370	T	C	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.993;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=175;ReadPosRankSum=0.097;SC=TAACTCCTTTTATAGACTGAT;SOR=1.845;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=9;WE=69968837;WS=69968819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr12	69979115	rs2601007	G	C	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=115;ReadPosRankSum=-0.475;SC=GCCCCCTCCAGTGTGAAAGGC;SOR=0.489;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=9;WE=69979123;WS=69979105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr12	69980028	rs485288	G	A	4866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=77;PP=2484;SC=TAAACGGAATGCCTCTTGGTT;SOR=0.758;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=161;TCF=83;TCR=78;TR=160;WE=69980036;WS=69980018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr12	69980141	rs484319	G	C	1492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=30;PP=877;SC=CTTGTTCTAAGCATTGTTTTA;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=18;TCR=30;TR=48;WE=69980149;WS=69980131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr12	69981862	rs530701	G	A	3170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=53;PP=1985;SC=TACTTCCTCTGTCTTTACTAT;SOR=0.800;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=52;TCR=53;TR=105;WE=69981870;WS=69981852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr12	69982129	rs710777	G	C	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=151;ReadPosRankSum=-0.147;SC=ACACTGAAAAGCATACACAAA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=9;WE=69982137;WS=69982119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
chr12	69985771	rs137875319	CTT	C	500.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.127;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=402;ReadPosRankSum=0.416;SC=AAGCAGACAGCTTTTTATAAG;SOR=1.414;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=13;WE=69985780;WS=69985761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr12	69987494	rs710773	G	A	1244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=34;PP=892;SC=TAGAATTTCAGCAGTTATTCT;SOR=3.716;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=5;TCR=34;TR=39;WE=69987502;WS=69987484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr12	69991627	rs710765	C	T	773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=10;PP=636;SC=ATGGTTCTTACAGAAATCTTA;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=15;TCR=10;TR=25;WE=69991635;WS=69991617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr12	69991733	rs56100203	A	G	1733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.595;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=27;PP=1029;ReadPosRankSum=-0.297;SC=ATTTTATTGGAATTTTAATCT;SOR=0.778;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=142;TCF=85;TCR=57;TR=68;WE=69991741;WS=69991723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,79:0.50:159
chr12	69992230	rs143109784	G	GT	3455.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.587;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=54;PP=2099;ReadPosRankSum=2.067;SC=CTTTGTGGCCGTTGTTAAAAG;SOR=0.908;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=113;TCF=7;TCR=106;TR=57;WE=69992238;WS=69992220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,116:0.59:195
chr12	69992301	rs17225328	A	G	611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=20;PP=466;ReadPosRankSum=-2.356;SC=ATAACCGTATAAAAGACTCTT;SOR=0.576;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=49;TCF=12;TCR=37;TR=27;WE=69992309;WS=69992291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,26:0.55:47
chr12	70064146	rs17813545	T	C	1647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.159;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=26;PP=926;ReadPosRankSum=0.536;SC=TTCTCTAAGATGTGCTTTGCG;SOR=0.801;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=175;TCF=111;TCR=64;TR=74;WE=70064154;WS=70064136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,82:0.43:191
chr12	70064295	rs3847772	C	T	1669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.659;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=41;PP=2224;ReadPosRankSum=0.813;SC=AGAAGTGCCACAAACCATCAC;SOR=0.943;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=161;TCF=71;TCR=90;TR=70;WE=70064309;WS=70064285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,81:0.45:179
chr12	70064301	rs142392948	A	G	1826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.226;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=46;PP=2875;ReadPosRankSum=-0.363;SC=GCCACAAACCATCACTGATGG;SOR=0.593;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=153;TCF=65;TCR=88;TR=82;WE=70064309;WS=70064285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,87:0.52:167
chr12	70065072	rs3847773	A	G	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5165;FS=3.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=86;ReadPosRankSum=0.637;SC=AGCCTCCCCAAGTAGCTAGGA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=5;WE=70065080;WS=70065062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr12	70065126	rs200930771	CTT	C,CT	551.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.99;ReadPosRankSum=-0.378;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:1,15,7:0.65,0.30:23
chr12	70070942	rs710718	A	G	6180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=116;NR=103;PP=2965;SC=AAAGAATTCCATGAAAAGTAT;SOR=0.808;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=219;TCF=116;TCR=103;TR=219;WE=70070950;WS=70070932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr12	70072479	rs3741755	C	G	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.090;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=334;ReadPosRankSum=0.935;SC=TTCTTGGTCTCTAATTAGCGT;SOR=0.300;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=55;TCF=39;TCR=16;TR=21;WE=70072487;WS=70072469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,22:0.35:62
chr12	70078172	rs710714	C	T	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.195;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=189;ReadPosRankSum=-1.050;SC=TTATTGCCCTCGAGCCAAAGG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=9;WE=70078180;WS=70078164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr12	70078387	rs11177791	T	C	2262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.920;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=54;PP=1493;ReadPosRankSum=-0.152;SC=TGCCAGTTCTTTCTGAAAGAG;SOR=0.847;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=223;TCF=114;TCR=109;TR=100;WE=70078395;WS=70078377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,110:0.44:248
chr12	70078575	rs12425422	T	G	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=259;ReadPosRankSum=-0.388;SC=TCCCTGTCAATTGGGAAAATC;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=12;WE=70078583;WS=70078565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,16:0.84:19
chr12	70088132	rs1158868	C	T	1764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.144;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=35;PP=1016;ReadPosRankSum=-3.113;SC=CTGCAATCTGCGTGTGACCTA;SOR=0.789;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=163;TCF=89;TCR=74;TR=79;WE=70088140;WS=70088122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,88:0.48:182
chr12	70091432	rs775429	T	C	1331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=12;PP=680;SC=AGTACCTGTATACCAAACTTA;SOR=1.270;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=29;TCR=12;TR=41;WE=70091440;WS=70091422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr12	70149518	rs76006484	A	G	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=3.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.150;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=417;ReadPosRankSum=0.074;SC=AAGTTTTACTATTTTTAGAAA;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=19;WE=70149526;WS=70149508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,24:0.62:39
chr12	70178374	rs1602954	T	C	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.078;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=85;ReadPosRankSum=-1.180;SC=ATAAATACTTTCAATGTGAAC;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=70178382;WS=70178364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr12	70188142	rs17107111	T	C	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.444;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=223;ReadPosRankSum=1.150;SC=TTGCTTCAATTGTAAACATTT;SOR=0.979;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=39;TCF=31;TCR=8;TR=16;WE=70188150;WS=70188132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,16:0.40:40
chr12	70195293	rs10879014	T	G	543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=430;SC=AGTGGAACTTTGGAGAAGAAT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=70195301;WS=70195283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	70195341	rs111879916	A	ATATTTTT	656.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=743;ReadPosRankSum=-0.842;SC=TACAATTTTGATATTTTTCTG;SOR=0.616;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=47;TCF=34;TCR=13;TR=15;WE=70195349;WS=70195331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,18:0.38:48
chr12	70272783	rs75388650	C	T	1783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.769;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=32;PP=1114;ReadPosRankSum=0.345;SC=GAAACAAAAACGCAATGTATG;SOR=0.551;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=184;TCF=115;TCR=69;TR=84;WE=70272791;WS=70272773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,89:0.44:202
chr12	70272919	.	CCTCCTCG	C	3793.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=0.000;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.310;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=2968;ReadPosRankSum=1.130;SC=TGTTGCTCTTCCTCCTCGACT;SOR=0.534;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=108;TCF=20;TCR=88;TR=29;WE=70272938;WS=70272909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,100:0.45:222
chr12	70272928	.	C	CGGCGGG,CGGCGGGTG	4050.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.856;ClippingRankSum=0.000;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.976;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=2962;ReadPosRankSum=2.007;SC=TCCTCCTCGACTCTGGGCCGT;SOR=0.482;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=99;TCF=20;TCR=79;TR=29;WE=70272938;WS=70272909;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.47:211
chr12	70272929	.	T	TG	2281.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.436;ClippingRankSum=0.000;DP=214;ExcessHet=3.0103;FS=6.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.66;ReadPosRankSum=0.879;SOR=0.521;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,99:0.46:214
chr12	70272930	.	C	CA	4129.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.403;ClippingRankSum=0.000;DP=217;ExcessHet=3.0103;FS=6.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.03;ReadPosRankSum=0.864;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,102:0.47:217
chr12	70273171	rs7970982	C	T	3321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=377;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.218;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=74;PP=1881;ReadPosRankSum=1.207;SC=TGGACCAATCCGTGTCCTCCC;SOR=0.616;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=328;TCF=159;TCR=169;TR=147;WE=70273179;WS=70273161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:206,169:0.45:375
chr12	70273276	rs116814265	G	T	635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.198;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=366;ReadPosRankSum=0.642;SC=TTTGCGGAAAGCCTCGGAGCA;SOR=0.516;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=11;TCR=42;TR=23;WE=70273284;WS=70273266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,28:0.46:61
chr12	70273303	rs1240286	C	G	1165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=29;PP=845;SC=CTCTGGCAGGCACCTAGAGAG;SOR=4.294;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=32;WE=70273311;WS=70273293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	70274160	rs1240287	G	A	597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=17;PP=455;SC=GAGCAGCCCTGCAAAAGTTTC;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=70274168;WS=70274150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
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chr12	70280913	rs376613022	TA	T	100.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.253;NF=0;NR=4;PP=135;ReadPosRankSum=-0.253;SC=AACAAATAAATAGTTGGAATA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=70280921;WS=70280903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr12	70289063	rs7964113	A	T	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=264;ReadPosRankSum=0.771;SC=CCAAGCATAGATGAGAGTCTG;SOR=0.399;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=39;TCF=35;TCR=4;TR=17;WE=70289071;WS=70289053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr12	70289112	rs7979309	T	C	757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=3.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.63;ReadPosRankSum=-0.326;SOR=1.668;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,29:0.48:60
chr12	70290875	rs10879038	T	A	2241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.527;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=34;PP=1309;ReadPosRankSum=-0.717;SC=GTGGTATTTGTTTGTACAAAT;SOR=0.617;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=180;TCF=115;TCR=65;TR=93;WE=70290883;WS=70290865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,109:0.53:205
chr12	70291047	rs10879040	T	G	1893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.776;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=53;PP=1209;ReadPosRankSum=-0.421;SC=TTCTCTGACTTTTCTGGATCT;SOR=0.854;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=190;TCF=73;TCR=117;TR=82;WE=70291055;WS=70291037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,91:0.44:207
chr12	70297317	rs10784805	A	G	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=3.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=241;ReadPosRankSum=-0.114;SC=GGATTCTCTTATGAAAGACTT;SOR=0.610;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=11;WE=70297325;WS=70297307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr12	70304510	rs10879052	T	C	487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.272;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=393;ReadPosRankSum=-2.061;SC=TTGCTGCAAATGTATTGTAGA;SOR=2.766;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=46;TCF=37;TCR=9;TR=21;WE=70304518;WS=70304500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,21:0.43:49
chr12	70304763	rs74101388	C	T	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.991;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=14;PP=300;ReadPosRankSum=2.066;SC=AGGGATAAACCCCCTTCTGTG;SOR=0.542;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=57;TCF=23;TCR=34;TR=25;WE=70304771;WS=70304753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,28:0.45:62
chr12	70304860	rs989879	C	A	56.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5032;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=33;ReadPosRankSum=-0.674;SC=GGTATCAACTCTCTTATAATT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=70304868;WS=70304850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr12	70321450	rs1239822	C	T	666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=14;NR=10;PP=382;SC=AACCAATTTTCTCTCTCTTTT;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=14;TCR=10;TR=24;WE=70321458;WS=70321440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	70330087	rs813147	A	G	5872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=100;PP=2965;SC=CACAGGAGCCAGCTCTGCTGC;SOR=0.856;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=201;TCF=100;TCR=101;TR=200;WE=70330095;WS=70330077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr12	70351684	rs10879065	C	A	5102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=83;PP=2950;SC=AACCAAAGGGCTGGAAAGCCA;SOR=0.839;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=164;TCF=80;TCR=84;TR=163;WE=70351692;WS=70351674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr12	70351905	rs2307086	A	G	1193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=3;PP=907;SC=AGCAACACCCATCAAAAGCTG;SOR=4.174;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=40;TCF=37;TCR=3;TR=40;WE=70351913;WS=70351895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr12	70352021	rs2307087	C	T	8109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=146;NR=121;PP=2965;SC=CTTTTATTCACTATTTAGGGA;SOR=0.841;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=267;TCF=146;TCR=121;TR=267;WE=70352029;WS=70352011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,303:1.00:303
chr12	70352198	rs35912210	CT	C	1697.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.967;HP=11;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.255;NF=5;NR=48;PP=808;ReadPosRankSum=1.130;SC=ATTAATCTTCCTTTTTTTTTT;SOR=0.170;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=71;TCF=10;TCR=61;TR=53;WE=70352217;WS=70352188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,72:0.97:74
chr12	70915347	rs369876	A	G	5001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=86;PP=2948;SC=ATAATTGTTTACGCTGTTTAT;SOR=0.840;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=167;TCF=81;TCR=86;TR=167;WE=70915355;WS=70915337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr12	70928724	rs582954	A	G	2961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=52;PP=1752;SC=GCCAGTAATGATCACACTTTA;SOR=1.002;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=47;TCR=52;TR=99;WE=70928732;WS=70928714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr12	70928745	rs3752702	G	A	976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=24;PP=640;ReadPosRankSum=-0.203;SC=CCTAGAACAGGACAGACAGAA;SOR=0.669;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=92;TCF=40;TCR=52;TR=42;WE=70928753;WS=70928735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,46:0.46:100
chr12	70930061	rs2278346	T	G	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=3.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=72;ReadPosRankSum=-0.731;SC=CAGAAAAAGATACTAACACAA;SOR=0.050;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=5;WE=70930069;WS=70930051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr12	70932572	rs17226374	T	C	253.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=307;ReadPosRankSum=-0.945;SC=CTATTTCTTATTAAAGGCATT;SOR=0.202;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=6;WE=70932581;WS=70932564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr12	70932573	rs11332712	TA	T	244.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=309;ReadPosRankSum=-1.059;SC=TATTTCTTATTAAAGGCATTC;SOR=0.202;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=6;WE=70932581;WS=70932564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr12	70933687	rs919595	A	G	7557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=126;NR=121;PP=2965;SC=CCATCTTTCAACAAATTATAC;SOR=0.751;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=247;TCF=126;TCR=121;TR=247;WE=70933695;WS=70933677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,282:1.00:282
chr12	70938176	rs4761221	G	A	1303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=6;PP=1015;SC=CTTCTAGAGAGGTTGTACAAT;SOR=3.417;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=35;TCR=6;TR=41;WE=70938184;WS=70938166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr12	70948833	rs2278342	A	C	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.808;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=8;PP=286;ReadPosRankSum=0.577;SC=TACAAAAATTACATTTTCTAC;SOR=0.129;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=35;TCF=25;TCR=10;TR=20;WE=70948841;WS=70948823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
chr12	70949085	rs75994780	G	A	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=302;ReadPosRankSum=2.610;SC=GTGGAGGAGGGGGGCCTGGAA;SOR=0.806;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=52;TCF=18;TCR=34;TR=21;WE=70949093;WS=70949075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,22:0.40:55
chr12	70949620	rs2278341	G	A	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.318;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=173;ReadPosRankSum=-0.363;SC=AGTGACAGGAGGCTCTGTGCG;SOR=0.260;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=10;WE=70949628;WS=70949610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr12	70949973	.	A	ATT	594.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=0.000;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=2.857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.25;MQRankSum=0.000;QD=9.91;ReadPosRankSum=-1.322;SOR=1.302;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,26:0.43:60
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chr12	70963770	rs17108351	A	C	627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.429;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=382;ReadPosRankSum=0.190;SC=GAACTGTTGAAATTTTCAAAC;SOR=1.069;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=52;TCF=14;TCR=38;TR=23;WE=70963778;WS=70963760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,27:0.44:61
chr12	70964750	rs1431257	G	A	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=297;ReadPosRankSum=-0.455;SC=TGAACTACCCGAAAGTTAAAT;SOR=1.329;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=15;WE=70964758;WS=70964740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr12	70965902	rs61930308	G	T	1342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-3.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.826;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=33;PP=743;ReadPosRankSum=1.562;SC=AAATATTTATGAATTCTGAGT;SOR=0.380;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=98;TCF=38;TCR=60;TR=56;WE=70965910;WS=70965892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,64:0.57:112
chr12	70965955	rs1125122	A	G	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.129;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=336;ReadPosRankSum=0.192;SC=ATAAAAAGAGAGAGTAGATTA;SOR=0.086;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=18;WE=70965963;WS=70965945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr12	71002865	rs2717430	T	A	2592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.561;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=50;PP=1421;ReadPosRankSum=0.077;SC=GCAAGACCACTGTTCTCTCTT;SOR=0.763;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=261;TCF=135;TCR=126;TR=112;WE=71002873;WS=71002855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,129:0.45:289
chr12	71002893	rs2252784	C	T	2672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.402;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=57;PP=1460;ReadPosRankSum=0.532;SC=AGAAATAATCCTGAAGTTATA;SOR=0.601;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=257;TCF=128;TCR=129;TR=116;WE=71002901;WS=71002883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,134:0.46:290
chr12	71003360	rs2717431	T	C	1672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.898;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=14;PP=1057;ReadPosRankSum=-2.498;SC=CTTTGACAGCTGGATAAGCTG;SOR=0.839;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=79;TCR=22;TR=64;WE=71003368;WS=71003350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,69:0.64:107
chr12	71078135	rs7958846	G	C	2128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=50;PP=1502;SC=AAATAGCTGGGCTAGTACAAA;SOR=1.493;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=25;TCR=50;TR=75;WE=71078143;WS=71078125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr12	71139664	rs3803036	T	C	4783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=85;NR=78;PP=2916;SC=GGTGGTAGCTTTGATCTCAGG;SOR=0.716;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=165;TCF=86;TCR=79;TR=163;WE=71139672;WS=71139654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr12	71148592	rs200305919	CT	C	63.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.97;ReadPosRankSum=0.566;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr12	71158270	rs3751287	T	C	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.365;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.30;ReadPosRankSum=0.486;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr12	71314102	rs12830783	C	T	904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.520;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=19;PP=598;ReadPosRankSum=-0.306;SC=CTAAGCCTGGCAACCCCTTAC;SOR=0.869;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=98;TCF=52;TCR=46;TR=45;WE=71314110;WS=71314092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,47:0.44:107
chr12	71509836	rs1796329	C	T	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.667;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=74;ReadPosRankSum=-1.368;SC=AAATAGCTGACGTTTTTCCAT;SOR=0.859;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=5;WE=71509844;WS=71509826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr12	71522953	rs1796330	G	C	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.204;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=32;ReadPosRankSum=-0.792;SC=CGAGGGAGATGATGGGCCTTT;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=3;WE=71522961;WS=71522943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr12	71523043	rs1705263	C	A	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=4.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.03;ReadPosRankSum=-1.193;SOR=1.384;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,28:0.51:55
chr12	71526677	rs1397566	A	G	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=369;ReadPosRankSum=-2.325;SC=TTAAATTATAATCTTCTGAAA;SOR=0.760;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=47;TCF=5;TCR=42;TR=21;WE=71526685;WS=71526667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,21:0.44:48
chr12	71531889	rs1798093	T	C	2390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.682;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=34;PP=1553;ReadPosRankSum=-0.494;SC=AGGTAGTATTTCAATTTTTCA;SOR=0.820;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=211;TCF=134;TCR=77;TR=103;WE=71531897;WS=71531879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,111:0.51:219
chr12	71532922	rs2971392	A	C	3538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=532;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=105;NR=80;PP=2461;ReadPosRankSum=-1.170;SC=TGATTTTACCACAACCCACAC;SOR=0.707;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=499;TCF=287;TCR=212;TR=185;WE=71532930;WS=71532912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:336,195:0.37:531
chr12	71947173	rs1148985	G	A	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=350;ReadPosRankSum=1.467;SC=ACATTTTAAGGGAGGAAAACC;SOR=0.379;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=17;WE=71947181;WS=71947163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr12	71953320	rs201955428	T	A	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.633;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=179;ReadPosRankSum=1.518;SC=AGAGTATATATGAAGTTTTAA;SOR=0.242;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=14;WE=71953328;WS=71953310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,14:0.37:38
chr12	71953540	rs3765015	G	C	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=2.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.10;ReadPosRankSum=-0.571;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr12	71953542	rs3765016	T	G	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.617;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.85;ReadPosRankSum=-0.411;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr12	71955394	rs1280603	T	C	60.10	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=15.02;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr12	71960208	rs1797372	G	A	2105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=27;PP=1222;SC=ATCCCATCCAGTTTGTTGGGA;SOR=1.003;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=44;TCR=27;TR=71;WE=71960216;WS=71960198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr12	71960329	rs1797373	G	A	2633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=42;NR=44;PP=1483;SC=AATATTATAGGTTGAAGTGCT;SOR=0.941;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=42;TCR=44;TR=86;WE=71960337;WS=71960319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr12	71960533	rs1797374	G	A	9316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=169;NR=139;PP=2965;SC=TGCCATTAGAGCTTGATCAGT;SOR=0.862;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=308;TCF=169;TCR=139;TR=308;WE=71960541;WS=71960523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,343:1.00:343
chr12	71960584	rs1726469	T	C	10020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=373;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=183;NR=153;PP=2965;SC=GTGTGATGCCTGAATGAAAGA;SOR=0.794;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=336;TCF=183;TCR=153;TR=336;WE=71960592;WS=71960574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,372:1.00:372
chr12	71966836	rs11178860	G	A	1008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=28;PP=593;ReadPosRankSum=0.561;SC=GAAACATCAAGTATTTTGCTT;SOR=0.756;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=88;TCF=30;TCR=58;TR=41;WE=71966844;WS=71966826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,48:0.48:100
chr12	72007084	rs7305505	G	A	686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.309;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=13;PP=430;ReadPosRankSum=0.501;SC=CCATTAGGCAGAGGACCAAAA;SOR=0.358;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=77;TCF=50;TCR=27;TR=30;WE=72007092;WS=72007074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,35:0.40:87
chr12	72013832	rs1298463	A	G	1486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.109;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=31;PP=860;ReadPosRankSum=-0.865;SC=ATGCAACAAGAGCTTCCAGCA;SOR=0.576;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=123;TCF=69;TCR=54;TR=66;WE=72013840;WS=72013822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,73:0.54:135
chr12	72019989	rs55719302	T	TAC	2172.76	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=1.754;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.82;ReadPosRankSum=0.227;SOR=0.324;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:7,74:0.91:81
chr12	72022556	rs1148996	C	G	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=101;ReadPosRankSum=-0.381;SC=ACTGTATTGTCTAAAAACCCA;SOR=0.627;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=8;WE=72022564;WS=72022546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr12	72022857	.	G	GT	41.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.776;ClippingRankSum=-0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.79;ReadPosRankSum=-1.602;SOR=0.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr12	72023336	.	T	TACAC	330.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=-0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=25.44;ReadPosRankSum=0.431;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr12	72026872	rs1011331	T	C	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-4.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=169;ReadPosRankSum=0.705;SC=TCAAACACCGTGGCTTTTGAG;SOR=2.049;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=11;WE=72026880;WS=72026862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr12	72027927	rs149292687	A	C	1895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=32;PP=1018;ReadPosRankSum=0.877;SC=GAAGATAACAAGGCTCACCTA;SOR=0.670;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=182;TCF=111;TCR=71;TR=84;WE=72027935;WS=72027917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,95:0.45:209
chr12	72028607	rs34399921	TA	T	359.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=1.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.60;ReadPosRankSum=1.354;SOR=0.278;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,21:0.68:31
chr12	72030252	rs1149006	T	C	791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.145;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=9;PP=503;ReadPosRankSum=0.444;SC=AAAAGTAGCATTAAATTTTTG;SOR=1.078;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=62;TCF=43;TCR=19;TR=33;WE=72030260;WS=72030242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,37:0.54:69
chr12	72058416	rs3741691	G	T	1116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.769;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=25;PP=672;ReadPosRankSum=-0.471;SC=TGTGGCTATCGCTTGTGTGGA;SOR=0.576;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=38;TCR=47;TR=46;WE=72058424;WS=72058406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,52:0.53:98
chr12	72067966	rs5799053	A	AT	152.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.66;ReadPosRankSum=-0.519;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr12	72080272	rs2304269	T	C	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=288;ReadPosRankSum=-0.865;SC=CCCATATGAATTGGAGCTCTC;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=14;WE=72080280;WS=72080262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr12	72091025	rs3741690	T	G	644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.057;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=9;PP=468;ReadPosRankSum=0.356;SC=TAAGGAGGAATCATTTGTTTG;SOR=0.553;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=53;TCF=40;TCR=13;TR=30;WE=72091033;WS=72091015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,30:0.53:57
chr12	72248423	rs2468335	T	C	791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.962;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=16;PP=533;ReadPosRankSum=-1.710;SC=TTTGGATAGCTGAAGGTCATC;SOR=0.551;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=56;TCF=30;TCR=26;TR=32;WE=72248431;WS=72248413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,35:0.56:62
chr12	72255388	rs7296729	G	C	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.103;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=74;ReadPosRankSum=-1.085;SC=GTTTGTATAAGTAATGGTTTG;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=72255396;WS=72255378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr12	72287159	rs10467177	T	C	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=6.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.80;ReadPosRankSum=-1.243;SOR=1.084;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,28:0.39:72
chr12	72287220	rs139574467	A	ATG	40.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=2.205;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.85;ReadPosRankSum=-1.450;SOR=0.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,4:0.18:22
chr12	72307616	rs3759171	A	G	856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=23;PP=508;ReadPosRankSum=0.136;SC=GATATGTTCAAGGAATGAGTG;SOR=0.687;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=101;TCF=51;TCR=50;TR=45;WE=72307624;WS=72307606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,47:0.44:107
chr12	72307637	rs11178983	C	G	784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=21;PP=485;ReadPosRankSum=0.013;SC=ATTTACTTTCCCCTCTTTTAT;SOR=0.709;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=100;TCF=49;TCR=51;TR=41;WE=72307645;WS=72307627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,44:0.42:105
chr12	72372601	rs4760816	C	T	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.316;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=182;ReadPosRankSum=-1.820;SC=ATATGTCACTCAGTTGTCAAG;SOR=1.127;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=14;WE=72372609;WS=72372591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
chr12	72372862	rs7305115	A	G	3166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.313;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=75;PP=1899;ReadPosRankSum=1.539;SC=TCTACACCCCAGAACCGTGAG;SOR=0.601;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=287;TCF=135;TCR=152;TR=144;WE=72372870;WS=72372852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,160:0.49:329
chr12	72388374	rs1007023	G	T	4122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=83;PP=2592;SC=TAAAACCAGTGCTATTTATGT;SOR=1.659;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=44;TCR=83;TR=127;WE=72388382;WS=72388364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr12	72416235	rs4290270	A	T	2729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.339;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=52;PP=1578;ReadPosRankSum=-1.050;SC=AACTGCGGGCATATGGAGCAG;SOR=0.719;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=239;TCF=124;TCR=115;TR=113;WE=72416243;WS=72416225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,131:0.49:268
chr12	72666485	rs74594364	A	G	482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.23;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	72666488	rs78720771	G	A	482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.23;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	72666499	rs79761722	A	G	782.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.27;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr12	72893531	rs1444607	T	G	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.203;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=237;ReadPosRankSum=0.032;SC=TAGACTGTGATTTAGAAAACA;SOR=2.608;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=12;WE=72893539;WS=72893521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr12	72935947	rs723867	G	C	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=33;ReadPosRankSum=0.819;SC=TCATGATACTGCTGTTTCTTA;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=3;WE=72935955;WS=72935937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr12	72936221	.	T	C	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.080;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.123;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=53;ReadPosRankSum=-0.365;SC=ACAAAATTGCTGAACTTGGTG;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=5;WE=72936229;WS=72936211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr12	72962547	rs11179252	G	T	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.227;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=225;ReadPosRankSum=0.032;SC=ATTAGAAAGAGAATATAAAGG;SOR=0.316;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=35;TCF=9;TCR=26;TR=19;WE=72962555;WS=72962537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr12	73012599	rs112881013	C	T	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=111;ReadPosRankSum=-0.381;SC=TTTGCTTTTCCGTCTTTTATT;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=8;WE=73012607;WS=73012589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr12	73012649	rs111312234	CT	C	371.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=2.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.77;ReadPosRankSum=-1.159;SOR=0.337;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,22:0.81:27
chr12	73014917	rs7139238	A	G	1286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=23;PP=660;ReadPosRankSum=-0.662;SC=TTGCAACAACATATATCAAGC;SOR=0.692;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=110;TCF=67;TCR=43;TR=58;WE=73014925;WS=73014907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,66:0.53:125
chr12	73015115	rs74105937	G	A	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.218;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=383;ReadPosRankSum=-0.061;SC=TCACTTTCCCGAGAGGACTGC;SOR=0.436;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=49;TCF=14;TCR=35;TR=25;WE=73015123;WS=73015105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,26:0.51:51
chr12	73015662	rs2217678	G	A	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=52;ReadPosRankSum=-1.242;SC=AACATTTTGTGTCAGGTTCAC;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=4;WE=73015670;WS=73015652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr12	74932159	rs590352	G	C	1175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.984;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=37;PP=867;ReadPosRankSum=-1.067;SC=ATCAGCAGCTGCAGCGCTCAC;SOR=0.948;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=85;TCF=17;TCR=68;TR=45;WE=74932167;WS=74932149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,48:0.52:92
chr12	75435986	.	AT	A	133.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.877;ClippingRankSum=0.000;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=8.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.45;ReadPosRankSum=1.156;SOR=0.115;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,20:0.22:92
chr12	75437614	.	G	GA	197.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.510;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=4.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.61;ReadPosRankSum=1.091;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr12	75706720	rs60971359	T	C	1056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=25;PP=657;ReadPosRankSum=0.611;SC=TAAAGACAACTTCACCATCCA;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=35;TCR=53;TR=42;WE=75706728;WS=75706710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,47:0.50:94
chr12	75710004	rs10879900	C	T	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.127;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=245;ReadPosRankSum=1.505;SC=TCAACTGTTGCAATTATTTAT;SOR=0.283;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=16;WE=75710012;WS=75709994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr12	75715330	rs10879901	C	A	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.049;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=11;PP=238;ReadPosRankSum=0.117;SC=TTGGTGCTGGCAAATTTTCAG;SOR=0.904;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=54;TCF=21;TCR=33;TR=19;WE=75715338;WS=75715320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,22:0.38:58
chr12	75719076	.	T	TA	37.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=0.000;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.30;MQRankSum=2.123;QD=1.22;ReadPosRankSum=-1.876;SOR=0.674;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,6:0.19:31
chr12	75760742	rs12366348	G	A	1197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=29;PP=592;ReadPosRankSum=-1.837;SC=CACCCAAGGGGCAGCTTGCAG;SOR=0.708;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=113;TCF=53;TCR=60;TR=55;WE=75760750;WS=75760732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,62:0.48:128
chr12	75784773	rs7978856	C	T	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=13.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.55;ReadPosRankSum=-0.535;SOR=4.271;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr12	75785100	rs11180483	C	T	2687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.124;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=64;PP=1561;ReadPosRankSum=-0.478;SC=GGGGCGACGTCATTCCCCGAG;SOR=0.534;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=285;TCF=136;TCR=149;TR=131;WE=75785108;WS=75785090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,138:0.46:301
chr12	75785468	rs4393363	G	A	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.078;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=196;ReadPosRankSum=-0.686;SC=AATATCAAGGGTAAAGAAAAT;SOR=0.283;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=44;TCF=12;TCR=32;TR=17;WE=75785476;WS=75785458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,17:0.40:43
chr12	75796721	rs7135440	G	T	763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.427;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=4;PP=545;ReadPosRankSum=1.388;SC=TGATAGTCTTGCCACCTACCA;SOR=1.629;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=47;TCF=39;TCR=8;TR=28;WE=75796729;WS=75796711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,30:0.60:50
chr12	75816612	rs1543946	C	G	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=353;ReadPosRankSum=-0.203;SC=AAATTAGTAACTATATTATTT;SOR=0.498;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=37;TCF=29;TCR=8;TR=21;WE=75816620;WS=75816602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,23:0.55:42
chr12	75816814	rs144850646	G	GACA	1034.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.095;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.754;NF=2;NR=14;PP=686;ReadPosRankSum=-0.687;SC=TAATGGATTGGACAAGAAAAA;SOR=0.914;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=16;WE=75816822;WS=75816804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,29:0.51:57
chr12	75874913	rs2242435	G	A	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.771;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=81;ReadPosRankSum=0.128;SC=TAATACCTTCGTAATACTGAA;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=5;WE=75874921;WS=75874903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr12	75875576	rs1909979	C	T	1800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=26;PP=1106;ReadPosRankSum=-0.517;SC=AGTTACATTTCAGATGAACCC;SOR=0.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=125;TCF=81;TCR=44;TR=74;WE=75875584;WS=75875566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,83:0.58:143
chr12	75900702	rs2704766	G	A	1756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.911;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=44;PP=1193;ReadPosRankSum=1.369;SC=ACATGCTACAGAAGGAAAGAG;SOR=0.526;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=160;TCF=70;TCR=90;TR=80;WE=75900710;WS=75900692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,83:0.48:173
chr12	76424937	rs71716769	TTGC	T	4715.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.333;NF=23;NR=50;PP=2985;ReadPosRankSum=1.479;SC=GCTGCTGCTGTTGCTGCTGCT;SOR=0.223;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=106;TCF=37;TCR=69;TR=73;WE=76424950;WS=76424927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,108:0.99:109
chr12	76444510	rs4831914	G	A	2337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=47;PP=1535;SC=AAGACTCTTAGAGGCTGGGTG;SOR=1.065;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=36;TCR=47;TR=83;WE=76444518;WS=76444500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr12	76447792	rs35076461	AT	A	1065.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=24;PP=466;SC=CTAAATGATAATTTTTTTTTC;SOR=1.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=24;WE=76447800;WS=76447782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
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chr12	76450465	rs113043714	TA	T	62.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=1.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.39;ReadPosRankSum=0.609;SOR=0.293;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,12:0.27:45
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chr12	76762923	rs10656017	A	AAAT	535.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=2;PP=284;SC=ACCAAATTTTAGTTGGTTGCT;SOR=1.445;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=76762931;WS=76762913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	76767065	rs71311107	A	AT	1861.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.365;HP=10;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.295;NF=20;NR=20;PP=574;ReadPosRankSum=-1.944;SC=TTTAAATGTGATTTTTTTTTT;SOR=1.885;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=48;TCF=21;TCR=27;TR=40;WE=76767073;WS=76767055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,72:0.95:76
chr12	76769209	rs7299563	G	A	177.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=112;SC=TATGGCTCACGATAAACAGTT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=76769217;WS=76769199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	76786349	rs4761423	G	A	5313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=115;NR=63;PP=2965;SC=CTCAGCGGCAGTATCTACTTA;SOR=1.337;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=178;TCF=115;TCR=63;TR=178;WE=76786357;WS=76786339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr12	76804195	rs77274445	G	A	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=78;ReadPosRankSum=-1.085;SC=TAGCCCCAATGGAACTTCACT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=5;WE=76804203;WS=76804185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr12	77158419	rs1017784	T	C	854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=5;PP=525;SC=GGGCCTGGTGTGGTTTTTGAA;SOR=2.226;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=25;WE=77158427;WS=77158409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	77199250	rs140164197	AACTTG	A	654.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.737;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.682;NF=0;NR=19;PP=857;ReadPosRankSum=0.175;SC=TAATTATTAGAACTTGACTTT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=0;TCR=46;TR=19;WE=77199262;WS=77199240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,28:0.42:66
chr12	77202798	rs10778920	A	G	635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.64;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	77214681	rs1477748	G	A	276.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=169;SC=TGATCAAATAGATATAGACTT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=77214689;WS=77214673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	77214788	rs2306142	G	A	2255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=54;NR=25;PP=1385;SC=TTAGATGACTGGAGGAGTAGT;SOR=1.450;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=54;TCR=25;TR=79;WE=77214796;WS=77214778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr12	77216281	rs17813975	G	A	2591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.956;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=60;PP=1318;ReadPosRankSum=-0.487;SC=ATGACAATCCGTCCTTCCTTA;SOR=0.774;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=246;TCF=110;TCR=136;TR=110;WE=77216289;WS=77216271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,127:0.50:255
chr12	77236968	rs1979743	G	A	618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=521;SC=CTTTTGATTCGGAGGTGCCGT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=77236976;WS=77236958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	77239420	rs143729859	AAAAT	A	3123.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=20;PP=2212;SC=ATATTTTGAGAAAATAAATAG;SOR=1.965;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=54;TCF=29;TCR=25;TR=45;WE=77239431;WS=77239410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr12	77253236	.	CT	C	66.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.838;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=6.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.47;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=0.059;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr12	77254207	rs35557984	GA	G	6834.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.28;MQRankSum=0.345;QD=25.89;ReadPosRankSum=-1.061;SOR=0.773;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,260:0.98:264
chr12	77256477	rs2047226	T	C	833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=0;PP=647;SC=GAATCAAAAATAAGAAGTAAT;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=77256485;WS=77256467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	77256681	rs2047227	T	G	6805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=111;NR=96;PP=2965;SC=GCTGTGAAATTGAAGTAAATA;SOR=0.701;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=207;TCF=111;TCR=96;TR=207;WE=77256689;WS=77256671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr12	77438436	rs2242384	T	C	2617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.047;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=37;PP=1453;ReadPosRankSum=-0.406;SC=TACTATGGTCTGGGGCATCTT;SOR=0.603;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=205;TCF=133;TCR=72;TR=104;WE=77438444;WS=77438426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,123:0.53:234
chr12	77438607	rs2242383	T	C	1026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.023;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=30;PP=756;ReadPosRankSum=-0.740;SC=AGCATCAAAGTATATGATTTT;SOR=1.061;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=87;TCF=25;TCR=62;TR=41;WE=77438615;WS=77438597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,43:0.47:92
chr12	77439720	rs74544237	T	C	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=295;ReadPosRankSum=1.547;SC=CCCTCCAGGGTTGTCAACCTG;SOR=0.804;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=33;TCR=4;TR=17;WE=77439728;WS=77439710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr12	77449514	rs10506725	T	C	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.78;ReadPosRankSum=0.084;SOR=0.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr12	77449790	rs310791	A	G	2077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.601;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=48;PP=1321;ReadPosRankSum=1.117;SC=CTGTCAACAAACTTAACTGGA;SOR=0.566;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=211;TCF=105;TCR=106;TR=99;WE=77449798;WS=77449780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,106:0.46:231
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chr12	78225186	rs17195772	C	A	932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.448;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=15;PP=626;ReadPosRankSum=2.487;SC=TGGAGTCTACCAGACTGAGGT;SOR=0.865;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=122;TCF=80;TCR=42;TR=43;WE=78225194;WS=78225176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,50:0.35:142
chr12	78225374	rs10735309	A	G	7188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=119;NR=110;PP=2965;SC=TTTGGAACTTACTGAAACAGA;SOR=0.725;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=230;TCF=119;TCR=111;TR=229;WE=78225382;WS=78225364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr12	78334053	rs1731740	G	C	6351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=118;NR=79;PP=2965;SC=TATTGTCTCTGTTTTCCCTCA;SOR=1.064;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=198;TCF=119;TCR=79;TR=197;WE=78334061;WS=78334043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr12	78510374	rs2694680	T	C	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.584;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=128;ReadPosRankSum=-0.799;SC=GTTATTCTTATGTAGACCCTC;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=7;WE=78510382;WS=78510364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr12	78511755	rs300442	T	C	2570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=24;PP=1672;SC=CCTTAATTCATACTTTATAAA;SOR=1.796;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=60;TCR=24;TR=84;WE=78511763;WS=78511745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr12	78513833	rs55670442	T	TATATA	235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=250;SC=ATGTATAAGGTATATATATAT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=78513841;WS=78513823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	78530979	rs1852464	G	A	4907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=83;PP=2965;SC=ATTTGTCTCAGTTTAACCTTC;SOR=0.832;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=168;TCF=85;TCR=83;TR=168;WE=78530987;WS=78530969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr12	78531207	rs300462	T	C	534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=19;PP=418;SC=GGGAAACCATTGTGTCACTCA;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=78531215;WS=78531197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr12	78540174	rs34144410	TA	T	1246.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=8;NR=16;PP=485;SC=CATTCAGAGGTAAAAAAAAAA;SOR=1.179;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=24;WE=78540183;WS=78540164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr12	78562687	rs1726431	A	G	2899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=60;PP=1753;SC=AATATAATAGACATCTATTTT;SOR=1.848;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=91;TCF=29;TCR=62;TR=89;WE=78562695;WS=78562677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr12	78569059	rs2442134	G	A	2555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=25;PP=1592;SC=TTCATGAGCCGATGTGATACT;SOR=1.511;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=58;TCR=25;TR=83;WE=78569067;WS=78569049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr12	78570914	rs1020462	G	C	1876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.529;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=31;PP=991;ReadPosRankSum=0.696;SC=TTCTGTCCTTGTTTCAGCTGA;SOR=0.524;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=162;TCF=98;TCR=64;TR=74;WE=78570922;WS=78570904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,91:0.48:190
chr12	78571186	rs1020461	T	C	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.779;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=222;ReadPosRankSum=-0.310;SC=CTGTACCAATTATTTTCAGAT;SOR=1.222;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=13;WE=78571194;WS=78571176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr12	78571490	rs958836	T	C	2263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.574;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=50;PP=1508;ReadPosRankSum=-0.344;SC=GATGCATGAATACTGCAAAGA;SOR=0.822;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=219;TCF=111;TCR=108;TR=100;WE=78571498;WS=78571480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,108:0.45:238
chr12	78582362	rs300513	T	C	1156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=5;PP=876;SC=TCTGTTTTGATTTTATTTTTT;SOR=3.442;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=37;WE=78582370;WS=78582352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr12	78582566	rs400289	A	G	3180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=61;PP=2030;SC=AGGTAAAAGCAATAATGAAAA;SOR=1.140;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=48;TCR=62;TR=109;WE=78582574;WS=78582556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr12	78590946	rs300498	A	C	355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=0;PP=303;SC=GAGGACAAAGAGTGCTATTCC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=78590954;WS=78590936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	78590983	rs300497	A	G	941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=5;PP=708;SC=TCCTATTAGTATAAATTTATC;SOR=2.621;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=29;WE=78590991;WS=78590973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	79611374	rs2037743	C	T	5949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=106;PP=2965;SC=TGCCAAGCAACGCCACAGAGC;SOR=0.730;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=210;TCF=104;TCR=106;TR=210;WE=79611382;WS=79611364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr12	79611536	rs2400390	T	C	1084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=27;PP=802;SC=GGAAAGAAAGTAGAACTCCGT;SOR=4.112;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=30;WE=79611544;WS=79611526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr12	79747487	rs1732664	T	C	645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=19;PP=511;ReadPosRankSum=1.627;SC=ACTCCCCACTTCTTAATTGAT;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=9;TCR=29;TR=25;WE=79747495;WS=79747477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,25:0.61:41
chr12	80014907	rs2307223	A	T	1114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.574;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=27;PP=715;ReadPosRankSum=2.222;SC=CTTCATTCTGAATAGTGTTCT;SOR=0.900;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=96;TCF=45;TCR=51;TR=48;WE=80014915;WS=80014897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,52:0.50:105
chr12	80175764	rs2111687	G	A	389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=10;PP=242;SC=ACAGGTTCGTGAGTAAAGCAA;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=80175772;WS=80175754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	80189344	rs17299883	T	C	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=4.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.70;ReadPosRankSum=0.906;SOR=1.915;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,10:0.21:47
chr12	80201271	rs34190005	TTA	T	441.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=305;SC=AGTACTAAGATTATATACCCT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=7;WE=80201280;WS=80201261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	80216060	rs3849223	C	A	1640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=35;PP=999;SC=TATATAAAGACGTTGGATAAC;SOR=2.387;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=12;TCR=35;TR=47;WE=80216068;WS=80216050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr12	80602001	rs1244908	T	C	2733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=46;PP=1737;SC=GAATTATGGTTATCTAGAGCA;SOR=0.845;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=41;TCR=46;TR=87;WE=80602009;WS=80601991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr12	80613570	.	CT	C	398.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=0.000;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=4.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.54;ReadPosRankSum=0.400;SOR=0.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,31:0.43:72
chr12	80626970	rs1451105	T	G	140.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=81;SC=GTCATAGCTTTGGGAAAATTT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=80626978;WS=80626960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	80632596	rs143126749	TTG	T	60.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=3.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.77;ReadPosRankSum=-1.380;SOR=0.208;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,12:0.15:79
chr12	80645734	rs11438265	A	AT	680.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=5;PP=632;SC=CAAGTATGCAATTTTTTTGCA;SOR=1.802;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=21;WE=80645742;WS=80645724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	80645799	rs2100258	A	T	3130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.20;QD=28.72;SOR=1.959;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr12	80647155	rs10862083	A	G	930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=2;PP=818;SC=ATGCGTAGGTATTCAACAGAA;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=30;WE=80647163;WS=80647145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr12	80648148	rs144548100	ATTTAT	A	187.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.57;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	80648399	rs7295623	C	T	1262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=21;PP=701;SC=TTTCTTTAGACTGGGGAGAAA;SOR=1.132;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=20;TCR=21;TR=41;WE=80648407;WS=80648389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr12	80650276	rs147846753	T	TCAAA	271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=244;SC=TTTCTTTACATCAAACAAACA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=5;WE=80650284;WS=80650266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	80655692	rs10778721	G	A	2261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=20;PP=1554;SC=AATATCTGAAGGTTATGAACA;SOR=1.795;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=50;TCR=20;TR=70;WE=80655700;WS=80655682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr12	80660499	rs7313132	T	C	179.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=159;SC=TATTTCTTATTGTCTTTACTT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=80660507;WS=80660489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	80661187	.	ATT	A	31.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=2.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.22;ReadPosRankSum=-0.036;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,4:0.15:26
chr12	80661189	rs11114377	T	A	522.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.36;ReadPosRankSum=0.593;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,22:0.81:27
chr12	80663825	.	GAA	G	103.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.297;ClippingRankSum=-0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.13;MQRankSum=-0.000;QD=9.43;ReadPosRankSum=2.260;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr12	80664143	rs7310985	C	G	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=62;ReadPosRankSum=0.623;SC=ACATATAAGTCAGCTCAGGGG;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=80664151;WS=80664133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr12	80665397	rs4483657	A	G	2380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=24;PP=1472;SC=ACAAAAAGTTAAGGACATTTT;SOR=1.528;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=53;TCR=24;TR=77;WE=80665405;WS=80665387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr12	80672064	rs1376384	A	G	3117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=57;PP=1733;SC=TGGTAAGGAGATCCATTTATT;SOR=1.140;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=42;TCR=57;TR=99;WE=80672072;WS=80672054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr12	80707153	rs1037335	C	T	129.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=1;PP=99;SC=CAGTGTTAAGCTGATAATATC;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=80707161;WS=80707151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	80712307	rs7963215	A	C	1805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.36;SOR=1.376;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr12	80712420	rs10778725	G	A	2493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=43;PP=1514;SC=TCTGTTTGCCGAGAAGCAGTG;SOR=0.929;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=40;TCR=43;TR=83;WE=80712428;WS=80712410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr12	80722385	rs71094975	C	CT	630.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.52;ReadPosRankSum=-0.597;SOR=1.432;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,29:0.81:36
chr12	80730664	rs10862093	G	A	1343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=26;NR=16;PP=605;SC=GTTTAACTCCGTAAAGTTTTA;SOR=0.892;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=43;TCF=26;TCR=17;TR=42;WE=80730672;WS=80730654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr12	80735771	rs10778727	T	C	1223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=9;PP=786;SC=GGATGCAAAATGGCACAATTA;SOR=2.059;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=32;TCR=9;TR=41;WE=80735779;WS=80735761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr12	80746234	rs147703967	G	GAAT	3229.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=35;PP=2056;SC=ACTGTTAACTGAATATTTTTC;SOR=1.394;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=44;TCF=3;TCR=41;TR=38;WE=80746242;WS=80746224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr12	80747242	rs7297767	A	G	5085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=107;PP=2965;SC=AGTTGGAACTATTCTTCACAG;SOR=1.531;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=168;TCF=61;TCR=107;TR=168;WE=80747250;WS=80747232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr12	80749392	rs6539501	A	T	485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=0;PP=403;SC=TCTGAGAAAAACAATAGACTT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=80749400;WS=80749382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	80750741	rs5799468	G	GA	2389.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=46;PP=1419;SC=AAGGATCTAGGAAAAAAATCT;SOR=1.952;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=60;TCF=2;TCR=58;TR=48;WE=80750749;WS=80750731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr12	80752660	rs2034528	A	G	669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=19;PP=510;SC=TGAAAACCTTATTATGCCAAC;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=23;WE=80752668;WS=80752650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	80760291	rs60847056	T	TTATATATA,TTATATATATA	52.70	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.9983;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=0;PP=217;SC=TATATATAGGTTATATATATA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=1;WE=80760299;WS=80760281;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:1
chr12	80760470	rs34113015	GT	G	1239.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=27;PP=837;SC=ATTAGTATCTGTTTTTTCACT;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=28;WE=80760478;WS=80760460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr12	80761430	rs1551118	G	A	2185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=49;NR=27;PP=1157;SC=CTTTTGTTATGCTATAGAGTG;SOR=1.013;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=49;TCR=27;TR=76;WE=80761438;WS=80761420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr12	80761465	rs2717482	G	A	2607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=52;NR=34;PP=1456;SC=ATAACCATACGGGCTTTCACA;SOR=0.888;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=52;TCR=34;TR=86;WE=80761473;WS=80761455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr12	80762163	rs57527553	T	TCC	5806.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.598;HP=8;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.682;NF=12;NR=96;PP=1604;ReadPosRankSum=1.810;SC=TTGGAAAATGTCCCCCCCCAC;SOR=1.114;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=128;TCF=13;TCR=115;TR=108;WE=80762179;WS=80762153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:8,164:0.95:172
chr12	80762246	rs10778730	G	A	1577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.818;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=52;PP=1468;ReadPosRankSum=1.935;SC=GTTACATTTTGAAGTATCTGA;SOR=4.215;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=61;TCF=9;TCR=52;TR=60;WE=80762254;WS=80762236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,53:0.96:55
chr12	80765683	rs5799469	TGAA	TAA,T	772.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=0;PP=677;SC=TATTTTTCTATGAAGGCTTTG;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=80765695;WS=80765673;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:18
chr12	80765685	rs201680829	AAG	A	772.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.93;SOR=5.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	80765687	.	G	A	356	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=14;NR=0;PP=356;QD=27.9122294677;SC=TTTCTATGAAGGCTTTGTGGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=14;WE=80765695;WS=80765673;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,14:0.82:17
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chr12	80765800	rs1551122	A	G	2902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=49;NR=43;PP=1631;SC=TCTTTCTAGAATGAAGGGATT;SOR=0.712;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=49;TCR=43;TR=92;WE=80765808;WS=80765790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr12	80765933	rs10862100	C	G	1476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=21;PP=565;SC=AATTCAATTCCTATGATGCAA;SOR=2.115;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=30;WE=80765953;WS=80765923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr12	80765945	rs10778734	G	A	1355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=18;PP=493;SC=ATGATGCAAAGAGAGAAACAA;SOR=2.093;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=26;TCF=8;TCR=18;TR=26;WE=80765953;WS=80765923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr12	80771813	rs2717477	G	A	4179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=79;PP=2536;SC=TAGACTGTACGTGCCAGTGGA;SOR=0.966;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=144;TCF=65;TCR=79;TR=144;WE=80771821;WS=80771803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr12	80816492	rs4482093	C	T	1769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.032;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=30;PP=964;ReadPosRankSum=-0.437;SC=TCTCTGGAATCGAGTTGATGG;SOR=0.763;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=175;TCF=94;TCR=81;TR=77;WE=80816500;WS=80816482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,89:0.44:202
chr12	80818876	rs10746164	A	G	922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=24;PP=545;ReadPosRankSum=0.037;SC=GGGACTGAAAAGAAGCCATCC;SOR=0.723;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=106;TCF=50;TCR=56;TR=44;WE=80818884;WS=80818866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,49:0.40:121
chr12	80818964	rs10746165	G	T	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=114;ReadPosRankSum=1.534;SC=AGAGAGAAATGGTTGTATTTA;SOR=0.922;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=22;TCF=7;TCR=15;TR=8;WE=80818972;WS=80818954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr12	80821391	rs61127339	C	CT	1080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5621;FS=7.782;HP=9;HapScore=3;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=30;PP=489;ReadPosRankSum=0.558;SC=TATTTCACTCCTTTTTTTTTG;SOR=0.087;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=60;TCF=1;TCR=59;TR=30;WE=80821399;WS=80821381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:5,46:0.90:51
chr12	80821446	rs7294514	T	C	389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=20;PP=401;SC=TGTGCCACTTTGTTAATGTAG;SOR=2.712;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=80821454;WS=80821436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	80828629	rs4128302	T	C	294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=2;PP=229;SC=CTCTACCTTGTAGTAGTAATT;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=80828637;WS=80828619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	80828679	rs4128303	C	G	868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=2;PP=481;SC=GCTTTTTAAACTTTGGAAAAT;SOR=2.546;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=23;WE=80828687;WS=80828669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	80838012	rs10746166	T	C	616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=5;PP=314;SC=TTGAGTAATATGGGCTCATTA;SOR=1.708;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=20;WE=80838020;WS=80838002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	80849328	rs4482094	G	A	3068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=53;NR=48;PP=1590;SC=TTCAGTTGTAGCAGCTGAAAC;SOR=0.800;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=53;TCR=48;TR=101;WE=80849336;WS=80849318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr12	80855597	rs4499068	T	C	3401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=70;NR=43;PP=1578;SC=TAATCCTAAATGGAGAAAAGT;SOR=1.038;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=70;TCR=43;TR=113;WE=80855605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr12	80855803	rs7137294	G	A	5358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=95;PP=2965;SC=AGGTCAGTGCGTGCAGTGCGC;SOR=0.828;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=184;TCF=89;TCR=95;TR=184;WE=80855811;WS=80855793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr12	80878174	rs7311413	T	A	1751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=8;PP=747;SC=ATATTTTTAATTTCCCCCTTT;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=33;WE=80878189;WS=80878164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr12	80878181	rs56351124	C	CT	1904.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=9;PP=1164;SC=TAATTTCCCCCTTTTCTTTTC;SOR=1.931;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=29;WE=80878189;WS=80878164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr12	80889165	rs145970310	T	TTTG	912.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5082;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=482;ReadPosRankSum=-0.452;SC=AAAACAATGTTTTGTTGTTGT;SOR=1.426;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=10;WE=80889173;WS=80889155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,23:0.92:25
chr12	80889829	rs10778752	T	A	2897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=44;PP=1546;SC=TCAACCCACGTTGGAGAAAGT;SOR=0.730;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=52;TCR=44;TR=96;WE=80889837;WS=80889819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr12	80890325	rs56929349	T	TG	4281.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=57;PP=2818;SC=GCTTTTGTTTTCTTTGTTTGT;SOR=1.402;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=5;TCR=58;TR=62;WE=80890333;WS=80890315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr12	80899901	rs11114486	C	A	3210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.32;SOR=0.795;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr12	80900397	rs12824064	C	G	4305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=64;PP=2529;SC=CTAGTACACTCAAAGGTGAAG;SOR=0.744;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=77;TCR=64;TR=141;WE=80900405;WS=80900387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr12	80933465	rs2222752	G	A	110.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5004;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=154;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=0;PP=63;SC=ATGATAAATAGTAAAATCGAT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=80933473;WS=80933460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr12	80935300	rs11114502	A	T	1499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=11;PP=1062;SC=AGGGTAACTGATGATTTTTGT;SOR=2.393;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=38;TCR=11;TR=49;WE=80935308;WS=80935290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr12	81004543	rs79784645	T	C	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.10;ReadPosRankSum=-1.292;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr12	81009858	rs3994957	TTA	T	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=1;PP=71;ReadPosRankSum=-0.674;SC=ATAATCAGTTTTATATATATA;SOR=0.941;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=2;WE=81009867;WS=81009848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr12	81015822	.	TC	T	134	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=4;HapScore=4;MGOF=8;MMLQ=27;MQ=59.79;NF=6;NR=4;PP=134;QD=16.1;SC=TGTTGATTTTTCTTTTTTTAT;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=26;TCF=14;TCR=12;TR=10;WE=81015831;WS=81015811;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr12	81028838	rs61729309	C	T	2148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.971;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=58;PP=1336;ReadPosRankSum=0.141;SC=AACTGAAGGACGAGAGATTAA;SOR=0.908;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=157;TCF=62;TCR=95;TR=91;WE=81028846;WS=81028828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,99:0.57:174
chr12	81063245	.	TA	T	92.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=0.000;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=1.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.24;MQRankSum=0.000;QD=0.84;ReadPosRankSum=1.680;SOR=0.822;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,19:0.17:110
chr12	81329536	rs2682818	A	C	4820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=76;NR=77;PP=2600;SC=CACAGGGTAAACCTGCTTGTC;SOR=0.938;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=153;TCF=76;TCR=77;TR=153;WE=81329544;WS=81329526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr12	81533078	rs2107415	G	C	1827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=49;PP=1169;SC=TCTTGCTTATGGTAATATGCT;SOR=2.973;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=61;TCF=11;TCR=50;TR=60;WE=81533086;WS=81533068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr12	81552338	rs11835646	C	T	5894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=110;PP=2965;SC=GTGCTTGACTCCTCAGCATTT;SOR=1.132;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=193;TCF=83;TCR=110;TR=193;WE=81552346;WS=81552328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr12	81614070	rs141535831	G	A	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=93;ReadPosRankSum=0.556;SC=CACAAATTTTGCATATTTTTA;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=81614078;WS=81614060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr12	81624964	rs2293651	A	T	885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=20;PP=516;SC=ACTTTTCTATAATTCTTGCCT;SOR=1.751;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=9;TCR=20;TR=29;WE=81624972;WS=81624954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr12	81647065	rs2895868	G	A	4500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=97;NR=52;PP=2748;SC=TATTCTAAATGAATGCCTTTC;SOR=1.447;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=149;TCF=97;TCR=52;TR=149;WE=81647073;WS=81647055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr12	81647471	rs2400895	T	A	795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=24;PP=627;SC=AAGATATTTATTCCTGGGTTC;SOR=3.690;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=27;WE=81647479;WS=81647461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	81655692	.	CT	C	189.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.825;ClippingRankSum=0.000;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=6.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.17;MQRankSum=1.553;QD=3.01;ReadPosRankSum=1.195;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,17:0.27:63
chr12	81655861	rs2272501	G	C	4203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=60;NR=80;PP=2615;SC=TTGGATGATTGAGTACAAGAT;SOR=1.121;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=60;TCR=80;TR=140;WE=81655869;WS=81655851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr12	81660963	rs35647579	C	CA	164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.54;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	81661039	rs12826016	G	A	460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.04;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr12	81661903	.	T	TTTTC	609.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=63.65;QD=24.39;SOR=0.770;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr12	81671191	.	G	T	31	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=18;MMLQ=17;MQ=59.45;NF=0;NR=5;PP=31;QD=13.1542425094;SC=TTGTAAACTTGTTCTTTTTTT;SbPval=0.03;Source=Platypus;TC=27;TCF=14;TCR=13;TR=5;WE=81671199;WS=81671181;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:22,5:0.19:27
chr12	81688958	rs1882188	C	G	218.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=179;SC=CCCTAGAGGACATAGATGCAC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=81688966;WS=81688948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	81695836	rs10862288	G	A	133.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=103;SC=CAGAAGAGGTGCTAAATAAAT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=81695844;WS=81695826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	81696399	rs1921053	G	A	6763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=113;NR=107;PP=2965;SC=GTGGAAAAACGGATCAGATGG;SOR=0.742;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=220;TCF=113;TCR=107;TR=220;WE=81696407;WS=81696389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr12	81696487	rs1921052	G	A	3656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=78;PP=2200;SC=TTTGAGAGAAGTAACAATTAT;SOR=1.318;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=127;TCF=49;TCR=78;TR=127;WE=81696495;WS=81696477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr12	82617279	rs7304928	G	C	822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=2;PP=604;SC=ATGAAAGCTTGTTTGAAGGAA;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=23;WE=82617287;WS=82617269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	82751955	rs6539662	A	G	1436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=2;PP=1089;SC=TTATATCCTAAAACTTAGCAA;SOR=5.283;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=40;TCF=38;TCR=2;TR=40;WE=82751963;WS=82751945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr12	82752633	rs4882530	G	A	2518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=46;PP=1475;SC=GGGCGGGAAGGGAGGCGGAGG;SOR=1.346;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=33;TCR=46;TR=79;WE=82752641;WS=82752623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr12	82780723	rs149436881	G	A	1007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.780;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=27;PP=698;ReadPosRankSum=1.040;SC=GTAGCCCTTCGAGGAAATCAA;SOR=1.195;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=96;TCF=47;TCR=49;TR=45;WE=82780731;WS=82780713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,47:0.46:102
chr12	82783668	rs10778908	C	T	3762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=55;PP=1925;SC=CAGAGCTGATCAGCAGTATTG;SOR=0.737;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=120;TCF=65;TCR=55;TR=120;WE=82783676;WS=82783658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr12	82792787	rs4296098	C	A	3805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=44;PP=2485;SC=AAGGAAAGTGCAAAATAAAGT;SOR=1.239;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=125;TCF=81;TCR=44;TR=125;WE=82792806;WS=82792777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr12	82828426	rs10683876	T	TATAAG	4964.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=28;PP=2974;SC=TTATAAATCTTATAAGACTCA;SOR=1.516;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=67;TCF=38;TCR=29;TR=60;WE=82828434;WS=82828416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr12	82832418	rs2717448	G	A	606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=16;NR=6;PP=435;SC=ACAGTCACGTGTGGTTCCAAC;SOR=1.931;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=22;WE=82832426;WS=82832408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr12	82850427	rs2731290	A	G	286.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.86;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	83324499	rs10746259	G	T	471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=14;PP=365;SC=CTTTGTTTCGGGCCACATCAT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=83324507;WS=83324489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	83358930	rs2403023	A	G	3574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=78;PP=2243;SC=ACCTCTTTCCATATTTGAAAA;SOR=1.521;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=119;TCF=41;TCR=78;TR=119;WE=83358938;WS=83358920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr12	83379977	.	A	G	1121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.942;ClippingRankSum=0.000;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.551;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=30;PP=700;ReadPosRankSum=2.435;SC=CAGAAAATATAGAAAAATGTG;SOR=0.323;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=80;TCF=25;TCR=55;TR=46;WE=83379985;WS=83379967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,51:0.58:88
chr12	83424455	rs11115554	A	T	425.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=1.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.92;ReadPosRankSum=1.298;SOR=0.458;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,21:0.54:39
chr12	85277561	rs17183577	T	A	2065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.540;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=33;PP=1251;ReadPosRankSum=2.102;SC=CCCACAGAAATCTGTAACAGA;SOR=0.781;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=182;TCF=113;TCR=69;TR=91;WE=85277569;WS=85277551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,97:0.50:194
chr12	85277608	rs17183612	C	T	2932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.028;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=49;PP=1587;ReadPosRankSum=-1.142;SC=TGGTGATTAGCAGAATGAGGA;SOR=0.835;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=245;TCF=140;TCR=105;TR=120;WE=85277616;WS=85277598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,137:0.50:275
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chr12	86272378	rs58553548	A	T	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.277;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=331;ReadPosRankSum=-1.821;SC=TAATATGATTATAGTTACACT;SOR=0.428;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=51;TCF=12;TCR=39;TR=23;WE=86272386;WS=86272368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,24:0.44:55
chr12	88177722	rs1796320	G	A	2106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=25;PP=1652;SC=TTGTTTCCACGGCAGTTTGCT;SOR=1.263;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=41;TCR=25;TR=66;WE=88177730;WS=88177712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr12	88177791	rs1675574	C	T	4702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=99;NR=59;PP=2679;SC=TGCAGGAAGGCGCAGTGCGGC;SOR=1.153;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=159;TCF=99;TCR=60;TR=158;WE=88177799;WS=88177781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr12	88178087	.	G	A	2462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=0.000;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.358;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=58;PP=1575;ReadPosRankSum=-0.513;SC=ACATTATACGGACTGTCAGAG;SOR=0.648;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=280;TCF=147;TCR=133;TR=117;WE=88178095;WS=88178077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:186,127:0.41:313
chr12	88178271	rs112316052	TGCC	T	4987.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=53;PP=2824;SC=AGGCCGCTGCTGCCGCCGCCG;SOR=1.003;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=81;TCF=11;TCR=70;TR=61;WE=88178281;WS=88178261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr12	88178418	rs7136026	G	A	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=3;PP=104;ReadPosRankSum=-0.886;SC=TGCTGGGAGAGGACTGAGAGG;SOR=0.120;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=6;WE=88178426;WS=88178408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr12	88379566	rs10858676	A	G	183.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=148;SC=CAAGCTGTCAAGAAATTCCAT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=88379574;WS=88379565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	88381467	rs141375032	GAGTT	G	211.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=283;ReadPosRankSum=1.465;SC=CTCATTGTCAGAGTTAGTTAG;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=6;WE=88381478;WS=88381459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr12	88440676	rs9262	G	C	7285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=140;NR=96;PP=2965;SC=CAATGATCTCGTGTCCTGGTT;SOR=1.070;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=237;TCF=140;TCR=97;TR=236;WE=88440684;WS=88440666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr12	88449379	.	T	C	871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=0.000;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.722;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=13;PP=435;ReadPosRankSum=-1.740;SC=TCATTGTATTTGTTAACTTTT;SOR=0.922;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=81;TCF=49;TCR=32;TR=37;WE=88449387;WS=88449369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,42:0.47:90
chr12	88453608	rs2471512	C	T	457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=0;PP=355;SC=GGATCTACTTCCAGTTTTTCC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=88453616;WS=88453598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	88454594	rs11405846	T	TA	1388.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=12;PP=716;SC=ATGATCACATTAAAAAAAATT;SOR=1.609;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=39;TCF=25;TCR=14;TR=31;WE=88454602;WS=88454584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr12	88470954	rs45477793	C	G	1895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=22;PP=1192;SC=TTAACTTACTCTGTCACTACC;SOR=1.230;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=40;TCR=22;TR=62;WE=88470962;WS=88470944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr12	88473049	rs2468245	C	T	2040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=51;PP=1498;SC=TAAAGGAAAACTGACATTTTA;SOR=1.432;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=27;TCR=51;TR=78;WE=88473057;WS=88473039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr12	88478316	rs11356711	TA	T	247.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=231;SC=AGCATTTGCTTAAAAAAACTA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=9;WE=88478324;WS=88478306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	88483272	rs10717563	TA	T	4290.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.06;NF=4;NR=82;PP=1936;SC=TGCCTGATATTAAAAAAAATA;SOR=1.506;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=97;TCF=4;TCR=93;TR=86;WE=88483280;WS=88483262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr12	88496838	rs2471532	C	G	368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=7;PP=205;SC=TTTTTCTGGTCAAGCACTAGC;SOR=2.670;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=88496846;WS=88496828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	88505078	rs2468255	T	C	2438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=35;PP=1195;SC=AAACAACATTTGATCCTTCTG;SOR=0.780;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=48;TCR=35;TR=82;WE=88505086;WS=88505068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr12	88505633	rs45465996	A	G	4530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=102;PP=2965;SC=TTGATTCTATAGCCTAGCAAA;SOR=1.878;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=145;TCF=43;TCR=102;TR=145;WE=88505641;WS=88505623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr12	88522823	rs71082425	A	AC	5889.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.07;NF=9;NR=65;PP=2936;SC=CTAAAAGACAAAGTTATTTCA;SOR=0.982;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=9;TCR=65;TR=74;WE=88522831;WS=88522813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr12	88522936	rs79458642	C	CTTA	522.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=13;PP=464;SC=CGTATTCATACTTATATACAC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=88522944;WS=88522926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	88525005	.	TA	T	80.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=5.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.04;ReadPosRankSum=0.793;SOR=0.090;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
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chr12	89864432	rs10777167	T	A	159.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=124;SC=ATCACATAGCTCTAAGCTTCC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=89864440;WS=89864422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	89866054	rs59139895	TAGAAAGAAGA	T	3833.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.060;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.741;NF=10;NR=35;PP=2978;ReadPosRankSum=-1.358;SC=GGTGAAAATCTAGAAAGAAGA;SOR=0.994;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=146;TCF=29;TCR=117;TR=45;WE=89866071;WS=89866044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,104:0.40:260
chr12	89885923	rs6538189	C	A	633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.052;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=438;ReadPosRankSum=-0.267;SC=ATTTATAACTCATTTGATTTA;SOR=0.160;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=25;WE=89885931;WS=89885913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,26:0.68:38
chr12	89885942	rs6538190	T	C	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.764;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=336;ReadPosRankSum=-0.449;SC=TAATTATAGTTAATACTTAAT;SOR=0.250;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=16;WE=89885950;WS=89885932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
chr12	89916811	rs2230283	C	T	1563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.031;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=27;PP=980;ReadPosRankSum=1.253;SC=TGCTCAGGTACCTCTGCACAT;SOR=0.824;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=139;TCF=75;TCR=64;TR=63;WE=89916819;WS=89916801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,69:0.46:150
chr12	89917518	rs2230281	A	G	7028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=123;NR=119;PP=2965;SC=GGGCTCCCCTATCTGCATATA;SOR=0.701;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=242;TCF=123;TCR=119;TR=242;WE=89917526;WS=89917508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,259:1.00:259
chr12	89918677	rs11105310	C	A	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=27;ReadPosRankSum=-0.718;SC=AGGCCCAGACCGCTGGATAGG;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=4;WE=89918685;WS=89918676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr12	89919630	rs67346689	ACC	A	220.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.812;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.368;HP=8;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=66;ReadPosRankSum=-0.105;SC=CCAGGGAGGGACCCCCCCCAC;SOR=2.541;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=4;WE=89919639;WS=89919620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr12	90024249	.	C	G	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-4.074;ClippingRankSum=0.000;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.739;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=323;ReadPosRankSum=-1.760;SC=GCCCTATTTCCAAATACCAAT;SOR=0.223;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=40;TCF=35;TCR=5;TR=22;WE=90024257;WS=90024239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,25:0.53:47
chr12	91334194	rs4520662	T	C	870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=22;PP=634;SC=AGTAGACTCCTTGAATAGGAA;SOR=3.258;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=26;WE=91334202;WS=91334184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr12	91366649	rs17784152	G	C	2730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.910;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=55;PP=1641;ReadPosRankSum=-1.393;SC=GTTAAAGCGGGAATAGAAATA;SOR=0.657;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=258;TCF=135;TCR=123;TR=116;WE=91366657;WS=91366639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,131:0.47:279
chr12	91445303	rs2701166	G	A	1148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.701;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=27;PP=628;ReadPosRankSum=-0.926;SC=CACCTACAGTGACAAAGAGAA;SOR=0.834;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=101;TCF=45;TCR=56;TR=49;WE=91445311;WS=91445293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,56:0.48:117
chr12	91449990	rs2735333	C	T	3564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=71;PP=2136;ReadPosRankSum=0.979;SC=AGACCTGCCTCACACTTCTAG;SOR=0.705;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=311;TCF=164;TCR=147;TR=153;WE=91449998;WS=91449980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,170:0.50:339
chr12	91450082	rs28776777	C	A	1922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.478;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=52;PP=1210;ReadPosRankSum=-0.580;SC=GAAAAAGGAACACAACTGTTA;SOR=0.737;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=222;TCF=92;TCR=130;TR=88;WE=91450090;WS=91450072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,99:0.39:252
chr12	91546745	rs190226009	T	C	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=134;ReadPosRankSum=-0.118;SC=TTTGAGATTATAGAAACAACA;SOR=0.446;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=9;WE=91546753;WS=91546735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr12	92539344	rs709223	T	C	1264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=14;NR=37;PP=811;SC=CCGGGGCGGCTGGGGCTCGGC;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=52;TCF=15;TCR=37;TR=51;WE=92539352;WS=92539334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr12	92539378	rs1049979	G	A	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=279;ReadPosRankSum=-0.067;SC=CGGCGGAGCAGCCACCCCGGG;SOR=1.329;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=15;WE=92539386;WS=92539368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr12	92818786	rs1515565	A	G	664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.003;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=15;PP=342;ReadPosRankSum=0.161;SC=TTTTGTCCAAAAATTTTAAAT;SOR=1.018;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=65;TCF=29;TCR=36;TR=26;WE=92818794;WS=92818776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,31:0.42:73
chr12	92821860	rs11284604	CT	C	2538.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.580;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.828;NF=12;NR=26;PP=1450;ReadPosRankSum=0.799;SC=TAATTAACCCCTGTTACTTAC;SOR=0.772;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=84;TCF=23;TCR=61;TR=38;WE=92821868;WS=92821850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,77:0.48:161
chr12	93131203	rs2036553	A	C	2943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=60;PP=1900;ReadPosRankSum=0.171;SC=CTCCCGACCGATCAATTAGAC;SOR=0.674;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=273;TCF=153;TCR=120;TR=132;WE=93131211;WS=93131193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,147:0.48:307
chr12	93139392	rs12305577	T	C	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.436;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=174;ReadPosRankSum=0.706;SC=TCTTTTCTTTTGTATTTTTGC;SOR=1.445;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=14;WE=93139400;WS=93139382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr12	93147901	rs74784157	C	T	1066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=6.299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.16;ReadPosRankSum=-0.211;SOR=0.220;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,45:0.68:66
chr12	93147907	rs9669519	A	T	2886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.01;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr12	93150060	rs7316541	G	A	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.289;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=228;ReadPosRankSum=0.573;SC=TTATTTTCTCGCTTGTTTTAC;SOR=0.452;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=20;WE=93150068;WS=93150050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,24:0.56:43
chr12	93150102	rs924326	T	C	2996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=29;PP=1764;SC=AAAGAACACATGGCAGAAAAC;SOR=1.483;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=71;TCR=29;TR=100;WE=93150110;WS=93150092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr12	93155399	rs200925190	GAAGAAAGAAAGAAAGA	G,GAAGA	830.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=62.82;QD=36.12;SOR=2.030;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,12,11:0.52,0.48:23
chr12	93155519	rs182332035	T	C	901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.606;HP=6;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.858;NF=18;NR=17;PP=424;ReadPosRankSum=1.260;SC=CTTCTCTTTTTTTCCTCAGAA;SOR=0.856;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=88;TCF=46;TCR=42;TR=35;WE=93155527;WS=93155509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,44:0.43:103
chr12	93155535	rs1504907	G	A	3533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=43;NR=44;PP=1486;SC=CAGAAAGCACGAGATTCCTAG;SOR=0.880;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=88;TCF=44;TCR=44;TR=87;WE=93155543;WS=93155525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr12	93196422	rs10745623	T	G	2388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=38;PP=1402;SC=TTCAGGATTTTTTTTTCTTCC;SOR=0.809;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=42;TCR=38;TR=80;WE=93196430;WS=93196412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr12	93202801	rs7970286	C	T	1700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=30;PP=1036;ReadPosRankSum=-1.148;SC=ACATTTCCTTCTCCATTTCAA;SOR=0.654;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=159;TCF=96;TCR=63;TR=75;WE=93202809;WS=93202791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,83:0.47:178
chr12	93206878	rs3925797	G	A	1157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=28;PP=734;SC=ATCTGTAACAGCATTTACAAA;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=11;TCR=28;TR=39;WE=93206886;WS=93206868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr12	93236402	rs7300619	C	T	1381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=16;NR=21;PP=589;SC=ACTAAATTGTCTAAAAGATAA;SOR=1.055;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=16;TCR=21;TR=37;WE=93236410;WS=93236392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr12	93236419	rs7316894	T	G	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=146;ReadPosRankSum=-1.085;SC=ATAAAAAAAATGAAAGTATAT;SOR=0.481;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=27;TCF=9;TCR=18;TR=13;WE=93236427;WS=93236409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr12	93247775	rs3065021	G	GATA	1479.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=18;PP=974;SC=AAAAGGAAAAGATAATACTGT;SOR=1.819;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=19;WE=93247783;WS=93247765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr12	93258498	rs11106721	A	G	603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=2;PP=478;ReadPosRankSum=-0.534;SC=TAGTGGAGGAAGGATATGCTA;SOR=0.399;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=22;WE=93258506;WS=93258488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,22:0.71:31
chr12	93289284	rs78542460	GAA	G	49.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.52;ReadPosRankSum=0.542;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr12	93398302	rs3924467	T	C	2216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.480;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=50;PP=1225;ReadPosRankSum=1.409;SC=TTATCTTGTGTCCTTATGATC;SOR=0.647;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=205;TCF=100;TCR=105;TR=99;WE=93398310;WS=93398292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,114:0.49:231
chr12	93609340	rs7305552	A	C	242.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=170;SC=TTCCCAATTCAACAGTTGGGG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=93609348;WS=93609330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	93721949	rs11380531	A	AC	349.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=1.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=398;ReadPosRankSum=-0.726;SC=TGAAGTCCTAACCCCAGTACT;SOR=1.292;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=12;WE=93721957;WS=93721939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr12	93862989	rs4761720	G	A	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.128;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=249;ReadPosRankSum=-1.097;SC=GGTATGCTTAGAAGCAGATTC;SOR=0.903;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=49;TCF=35;TCR=14;TR=20;WE=93862997;WS=93862979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,20:0.37:54
chr12	93863162	rs4761721	C	G	690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.71;ReadPosRankSum=-0.827;SOR=0.532;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,21:0.54:39
chr12	93863170	rs4761722	C	G	672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=1.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.43;ReadPosRankSum=-2.070;SOR=0.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr12	93864474	rs1552861	A	G	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.677;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=108;ReadPosRankSum=0.048;SC=TCCTACTTGTAAGTTAGAACA;SOR=1.022;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=8;WE=93864482;WS=93864464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr12	93894823	rs6538425	G	C	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=67;ReadPosRankSum=0.492;SC=CTAAGAAATGGCTGATACGTA;SOR=0.368;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=7;WE=93894831;WS=93894813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr12	93898249	rs7971966	A	G	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.75;ReadPosRankSum=0.262;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr12	93965659	.	AGGC	A	40.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.18;ReadPosRankSum=1.383;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,2:0.50:4
chr12	94243853	rs56944668	C	T	2926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.945;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=72;PP=1860;ReadPosRankSum=-1.474;SC=GCCCATGGTGCTGTCTCTGGG;SOR=0.768;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=243;TCF=114;TCR=129;TR=135;WE=94243861;WS=94243843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,140:0.53:262
chr12	94253033	rs10859603	T	A	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.436;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=9;PP=576;ReadPosRankSum=-0.477;SC=AATTGTTTTTTAAAAAGCTAT;SOR=1.485;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=79;TCF=55;TCR=24;TR=36;WE=94253041;WS=94253023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,39:0.44:89
chr12	94543506	rs2230754	C	T	4636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=509;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.15;ReadPosRankSum=1.176;SOR=0.808;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:265,242:0.48:507
chr12	94562802	rs2361358	G	A	817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=0;PP=692;SC=TAGTCTAAGAGAATATATGTG;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=94562810;WS=94562792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr12	94562875	rs2361359	C	G	3578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=30;PP=2363;SC=ATAATGAGAACTATTGTTGTT;SOR=1.915;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=82;TCR=30;TR=112;WE=94562883;WS=94562865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
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chr12	94575157	.	C	T	132	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;FR=0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=19;MMLQ=24;MQ=51.06;NF=5;NR=0;PP=132;QD=33.3542425094;SC=AGCGAGATTCCGTCTCAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=5;WE=94575170;WS=94575147;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr12	94575162	.	C	CA	68	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;FR=0.5000;HP=14;HapScore=4;MGOF=19;MMLQ=19;MQ=55.93;NF=4;NR=0;PP=68;QD=18.0;SC=GATTCCGTCTCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=4;WE=94575170;WS=94575147;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:12,4:0.25:16
chr12	94580286	rs3751189	T	C	853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.718;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=29;PP=541;ReadPosRankSum=0.242;SC=CTCGCATTTTTGAAAAAGTGT;SOR=0.803;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=112;TCF=44;TCR=68;TR=46;WE=94580294;WS=94580276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,47:0.39:119
chr12	94603249	rs2610671	G	A	2216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=18;PP=1508;SC=CACTGTACAAGGTCTGGCATT;SOR=2.043;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=54;TCR=18;TR=72;WE=94603257;WS=94603239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr12	94603300	rs2305971	C	T	4659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=101;NR=59;PP=2858;SC=AACTAATGCACGTATGGGGTC;SOR=1.219;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=160;TCF=101;TCR=59;TR=160;WE=94603308;WS=94603290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr12	94613764	rs3833789	AT	A	635.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.998;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.051;NF=3;NR=13;PP=387;ReadPosRankSum=0.399;SC=AAAAATCATCATTTTTTCCCC;SOR=0.525;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=35;TCF=11;TCR=24;TR=16;WE=94613772;WS=94613754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,29:0.49:59
chr12	94620264	.	AT	A	277.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.817;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=5.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.08;ReadPosRankSum=0.939;SOR=3.477;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,18:0.78:23
chr12	94637557	rs864106	C	T	280.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=231;SC=AAAAGATTCCCAAAATTGTCC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=94637565;WS=94637547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	94645255	rs2230757	A	G	2562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.914;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=57;PP=1611;ReadPosRankSum=-0.330;SC=TTCCTTCCACATGGTATTTTC;SOR=0.632;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=246;TCF=126;TCR=120;TR=116;WE=94645263;WS=94645245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,127:0.46:277
chr12	94648103	rs11107483	C	G	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.245;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=153;ReadPosRankSum=-0.859;SC=GCAGGTTTGGCCCATGTAGCC;SOR=0.086;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=9;WE=94648111;WS=94648093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr12	94648493	rs7980141	A	G	1051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.568;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=16;PP=726;ReadPosRankSum=-2.006;SC=AACTGTAAAGATTGCTATTTG;SOR=1.068;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=113;TCF=72;TCR=41;TR=48;WE=94648501;WS=94648483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,51:0.45:114
chr12	94649103	rs865569	T	C	7761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.626;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=121;NR=144;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.927;SC=TTCCGAAGGTTGAGTCTTGAA;SOR=0.679;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=265;TCF=121;TCR=144;TR=265;WE=94649111;WS=94649093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,294:1.00:295
chr12	94653227	rs2306664	T	C	717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.894;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=20;PP=495;ReadPosRankSum=1.411;SC=CTATCATCTCTATTATTATTA;SOR=0.816;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=67;TCF=23;TCR=44;TR=30;WE=94653235;WS=94653217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,33:0.43:77
chr12	94671565	rs832507	A	G	3388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=83;NR=38;PP=2218;SC=CGATACTATCATCAAGCCTTT;SOR=1.665;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=83;TCR=38;TR=121;WE=94671573;WS=94671555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr12	94671592	rs1880936	C	T	2102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.582;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=32;PP=1440;ReadPosRankSum=0.794;SC=AGCCTGGCCCCGTGCTAAGCC;SOR=0.910;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=176;TCF=110;TCR=66;TR=92;WE=94671600;WS=94671582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,97:0.51:190
chr12	94671743	rs832506	G	C	4543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=109;PP=2880;SC=CTGAGCCCTAGGCAAATCAGA;SOR=1.680;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=162;TCF=53;TCR=109;TR=161;WE=94671751;WS=94671730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr12	94671910	rs1880935	G	A	1930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.475;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.823;NF=55;NR=39;PP=1224;ReadPosRankSum=-2.745;SC=TAGACTCTCCGCTCCTTAAAA;SOR=0.743;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=225;TCF=131;TCR=94;TR=94;WE=94671930;WS=94671900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,101:0.41:247
chr12	94671922	rs11341959	CA	C	7447.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.152;NF=39;NR=106;PP=2980;ReadPosRankSum=1.079;SC=TCCTTAAAACCAAAAAAAACA;SOR=0.304;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=158;TCF=45;TCR=113;TR=145;WE=94671930;WS=94671900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,272:1.00:273
chr12	94672002	rs4761601	G	A	1734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.377;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.571;NF=34;NR=48;PP=1093;ReadPosRankSum=-0.795;SC=TTAAATAATTGTGCATTTCAC;SOR=0.489;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=173;TCF=68;TCR=105;TR=82;WE=94672010;WS=94671992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,87:0.45:193
chr12	94673277	rs2230760	G	A	3920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=3.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=403;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.446;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=73;PP=2536;ReadPosRankSum=0.083;SC=AAAAAATCCCGGAAAACGAGA;SOR=0.908;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=366;TCF=196;TCR=170;TR=170;WE=94673285;WS=94673267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:213,189:0.47:402
chr12	94673509	rs10713724	GC	G	3300.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=40;PP=1665;SC=CCCCCTCCCTGCCCCCACCAG;SOR=0.732;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=67;TCF=21;TCR=46;TR=59;WE=94673522;WS=94673499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr12	94688232	rs1880934	C	A	624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=12;PP=347;ReadPosRankSum=-0.660;SC=AAATTTTGAACACTCATATAT;SOR=0.597;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=48;TCR=31;TR=30;WE=94688240;WS=94688222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,33:0.40:83
chr12	94697525	rs1057977	T	C	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=1.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQRankSum=0.000;QD=11.21;ReadPosRankSum=0.280;SOR=1.292;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr12	94698880	rs3803071	C	T	445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=271;ReadPosRankSum=-0.239;SC=TTACCACTCACAGCATCAGGT;SOR=1.708;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=13;WE=94698888;WS=94698870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,17:0.85:20
chr12	94729577	rs4761605	C	T	921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.244;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=26;PP=565;ReadPosRankSum=1.205;SC=CTTCAAGAAACTAGGTTGTGT;SOR=1.093;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=65;TCF=18;TCR=47;TR=34;WE=94729585;WS=94729567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,40:0.54:74
chr12	94761701	rs12426243	T	C	3476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=3.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.660;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=83;PP=2296;ReadPosRankSum=0.116;SC=AATCTGCTAATCTGTTCTCGA;SOR=0.965;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=300;TCF=134;TCR=166;TR=142;WE=94761709;WS=94761691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,159:0.48:334
chr12	94769758	rs4761611	A	G	1117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.398;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=18;PP=609;ReadPosRankSum=-1.012;SC=CTTTTTCCAAACGTTCTGCCC;SOR=0.904;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=109;TCF=58;TCR=51;TR=46;WE=94769766;WS=94769738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,53:0.43:123
chr12	94972117	.	AT	A	2745.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.434;ClippingRankSum=0.000;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.095;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.552;NF=23;NR=28;PP=1872;ReadPosRankSum=-1.580;SC=TGTTAAATGAATTAAGGCTCG;SOR=0.998;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=114;TCF=39;TCR=75;TR=51;WE=94972125;WS=94972107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,91:0.46:199
chr12	94972290	rs2270893	C	T	4346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=82;PP=2576;SC=GCAGCTGGTCCTCCAGTCGCT;SOR=1.157;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=57;TCR=82;TR=139;WE=94972298;WS=94972280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr12	94975799	rs3747553	G	A	8047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=129;NR=130;PP=2965;SC=TATTGAAAACGAACACAGGTG;SOR=0.763;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=259;TCF=129;TCR=130;TR=259;WE=94975807;WS=94975789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,296:1.00:296
chr12	94976084	rs3747552	T	C	5217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=92;PP=2965;SC=GCTGCTTGTCTGCGTTGTTCA;SOR=0.778;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=180;TCF=88;TCR=92;TR=180;WE=94976092;WS=94976074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr12	94976159	rs3747551	T	C	1807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=39;PP=1236;ReadPosRankSum=-0.995;SC=TCTGCTCTGTTACCTTTAGAA;SOR=0.717;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=165;TCF=86;TCR=79;TR=77;WE=94976167;WS=94976149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,83:0.45:185
chr12	94976383	rs3747550	T	A	1197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=22;PP=678;SC=ACAGAATCTATGCACATACAA;SOR=1.455;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=13;TCR=22;TR=35;WE=94976391;WS=94976373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr12	95044161	rs1274523	A	C	2494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=32;PP=1417;SC=CGGCCGGGGTACGAGTAGGTC;SOR=0.911;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=46;TCR=32;TR=78;WE=95044169;WS=95044151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr12	95228007	rs2289031	T	G	479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=357;SC=CGGCATCCTGTCTGGGTCCAA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=95228015;WS=95227997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	95500635	rs61938198	A	G	413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=50;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=0;PP=301;SC=GTACCACTGCACTCCAGCCTG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=95500643;WS=95500625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	95500700	rs10694512	A	AAACAAAACAAAAC	6589.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=66.73;QD=49.18;SOR=2.683;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr12	95500727	rs7138545	C	G	8763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=114;NR=57;PP=2965;SC=CAGATGCACACACCTTCATTC;SOR=1.266;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=171;TCF=114;TCR=57;TR=171;WE=95500735;WS=95500717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr12	95510811	rs6419371	T	G	463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=11;PP=290;SC=TTGGTCATAGTGAACCACCTA;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=95510819;WS=95510801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	95639261	rs7979908	G	A	1535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.462;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=30;PP=914;ReadPosRankSum=1.324;SC=AAACTCTTTTGGGAAAAACTG;SOR=0.447;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=157;TCF=93;TCR=64;TR=68;WE=95639269;WS=95639251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,77:0.45:173
chr12	95651888	rs6538624	T	C	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=93;ReadPosRankSum=0.074;SC=TATTATTTTTTGGCTGACTAA;SOR=0.293;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=8;WE=95651896;WS=95651878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr12	95771236	rs2727663	T	C	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.037;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=236;ReadPosRankSum=1.744;SC=GACATGTGGATGGAAATTTGG;SOR=0.487;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=17;TCR=31;TR=22;WE=95771244;WS=95771226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,29:0.48:60
chr12	95878552	rs7978914	T	A	2173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.28;SOR=1.192;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr12	95878751	rs301036	T	G	659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=17;PP=528;SC=ATCATTTCTGTAACAAGCCAA;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=95878759;WS=95878741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr12	95897997	rs2769469	T	C	1398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=32;PP=978;SC=TTGTCGAGTGTTTTCTTTGGG;SOR=2.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=10;TCR=32;TR=42;WE=95898005;WS=95897987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr12	95907834	rs3751215	A	G	843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=23;PP=650;SC=GACAAAGGCAAACCGTCTAAT;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=95907842;WS=95907824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	95914687	rs7974596	T	C	402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=0;PP=305;SC=TTGTTTATGATTTAGTAGTCA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=12;WE=95914695;WS=95914677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	95927762	rs3812813	T	C	8314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=124;NR=135;PP=2965;SC=TCTCCAGTTGTGTTATCATTC;SOR=0.849;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=260;TCF=124;TCR=136;TR=259;WE=95927770;WS=95927752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,302:1.00:302
chr12	95966944	rs4762567	A	G	1163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.430;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=22;PP=573;ReadPosRankSum=0.242;SC=GCTGGACTACATCTCTAGTTT;SOR=0.477;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=101;TCF=48;TCR=53;TR=47;WE=95966952;WS=95966934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,57:0.50:113
chr12	96063947	rs3833792	TGTTA	T	1525.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=28;PP=1375;SC=TTAAAAATGGTGTTAGTTATT;SOR=3.321;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=28;WE=96063958;WS=96063937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr12	96077312	rs17851048	C	T	1367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=18;PP=954;SC=CACAGCTCCCCGCACAGTCAC;SOR=1.225;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=31;TCR=18;TR=49;WE=96077320;WS=96077302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr12	96106943	rs4129599	T	C	1966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.184;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=38;PP=1153;ReadPosRankSum=-0.562;SC=CACAGATGCGTTGACTTTACA;SOR=0.578;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=161;TCF=90;TCR=71;TR=87;WE=96106951;WS=96106933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,96:0.55:176
chr12	96184102	rs11108265	G	A	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.043;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=351;ReadPosRankSum=-0.381;SC=GGGAGGAGCCGGGAGCAGCCG;SOR=0.217;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=18;WE=96184110;WS=96184092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr12	96217159	rs10777742	C	T	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.259;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=139;ReadPosRankSum=-0.558;SC=ATATTAAAAACGCCATCTATT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=8;WE=96217167;WS=96217149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr12	96253003	rs66876037	A	AG	313.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=272;SC=CTCTGCTTTTAGGTTTCTGAG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=8;WE=96253011;WS=96252993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
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chr12	96263437	rs10735335	G	A	1051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.82;SOR=4.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
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chr12	96348536	rs11108351	C	A	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.423;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=192;ReadPosRankSum=-2.464;SC=ATCAAGGGAACCAGACAGACA;SOR=1.065;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=15;WE=96348544;WS=96348526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr12	96354455	rs2043608	G	C	828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.971;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=23;PP=564;ReadPosRankSum=2.090;SC=GCACATTCATGCTATGGGAAA;SOR=0.509;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=66;TCF=21;TCR=45;TR=35;WE=96354463;WS=96354445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,37:0.51:73
chr12	96355949	rs3751266	T	C	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.53;MQRankSum=0.792;QD=7.68;ReadPosRankSum=0.842;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr12	96356048	rs112878109	A	AAC	1123.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.912;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.14;MQRankSum=1.245;NF=6;NR=6;PP=923;ReadPosRankSum=-1.268;SC=TCTCAAAAATAAAACAAACAA;SOR=0.569;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=44;TCF=24;TCR=20;TR=12;WE=96356068;WS=96356038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,31:0.40:77
chr12	96356060	rs3751265	G	A	852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=8;PP=912;ReadPosRankSum=-1.245;SC=AACAAACAAAGCAATTTAATG;SOR=0.782;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=74;TCF=51;TCR=23;TR=29;WE=96356068;WS=96356038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,41:0.43:96
chr12	96356280	rs5800239	A	AC	2121.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.804;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.455;NF=0;NR=42;PP=1598;ReadPosRankSum=-1.554;SC=CTCACCCCAGACCAAGAGCTG;SOR=1.082;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=65;TCF=2;TCR=63;TR=42;WE=96356288;WS=96356270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,71:0.66:107
chr12	96359301	rs4762657	T	G	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.793;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=286;ReadPosRankSum=-0.154;SC=CAGGAGTCCTTGGATTATATA;SOR=0.307;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=17;WE=96359309;WS=96359291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr12	96359426	rs4762658	C	G	4001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=445;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=82;PP=2478;ReadPosRankSum=0.943;SC=ACAAAAGCTCCCATTCTAGAG;SOR=0.673;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=402;TCF=228;TCR=174;TR=186;WE=96359434;WS=96359416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:236,207:0.47:443
chr12	96360350	rs1025606	A	T	740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.817;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=24;PP=563;ReadPosRankSum=-2.200;SC=TGAGGCCTAAATCCCTTTTCC;SOR=1.387;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=44;TCF=6;TCR=38;TR=27;WE=96360358;WS=96360340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,28:0.62:45
chr12	96371894	rs4762659	C	T	2814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=40;NR=56;PP=1581;SC=GTGCTCCTCACAGGATGAGCT;SOR=1.253;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=40;TCR=56;TR=96;WE=96371902;WS=96371884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr12	96374554	rs6538693	G	A	9850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.17;SOR=0.816;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr12	96374563	rs6538694	T	C	9829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.88;SOR=0.786;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr12	96374614	rs7297245	C	T	4743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=88;PP=2850;SC=CCTCCAGAAACTGTCTCTCCC;SOR=1.013;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=161;TCF=73;TCR=88;TR=161;WE=96374622;WS=96374604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr12	96374672	rs6538695	T	C	2191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=52;PP=1273;SC=TTGAAGATAATGTTTGCTGGT;SOR=1.582;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=28;TCR=52;TR=80;WE=96374680;WS=96374662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
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chr12	96384345	rs17676826	T	C	985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=22;PP=647;SC=AGTTCAAGAGTACTGCATTCT;SOR=2.049;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=31;WE=96384353;WS=96384335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr12	96386385	rs116031658	T	C	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.194;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=424;ReadPosRankSum=0.032;SC=CCTCAGCATCTGGCCAATCAA;SOR=2.468;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=47;TCF=41;TCR=6;TR=21;WE=96386393;WS=96386375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,23:0.48:48
chr12	96653501	rs4762144	C	T	4804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=86;NR=76;PP=2723;SC=GTTTGCTTTACTTCCCAGACA;SOR=0.749;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=162;TCF=86;TCR=76;TR=162;WE=96653509;WS=96653491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr12	96660711	rs7974921	A	G	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.501;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=171;ReadPosRankSum=-0.589;SC=TCATCTTCCAATTATTCTGTA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=8;WE=96660719;WS=96660701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr12	96676188	rs71460338	T	G	2206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.342;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=34;PP=1394;ReadPosRankSum=1.504;SC=GACTAGAATCTTAGGCTTAAA;SOR=0.573;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=159;TCF=109;TCR=50;TR=101;WE=96676196;WS=96676178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,105:0.63:166
chr12	96688732	rs11835965	C	T	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=76;ReadPosRankSum=-0.030;SC=AACCATTACACTTTAGAACCT;SOR=0.569;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=9;WE=96688740;WS=96688722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
chr12	96691355	rs5800246	T	TA	570.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.205;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=505;ReadPosRankSum=1.250;SC=TCCAATTTACTATGTTTTTCT;SOR=2.207;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=20;TCF=12;TCR=8;TR=13;WE=96691363;WS=96691345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr12	96694162	rs10777781	G	T	331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=11;PP=284;SC=AATGAAAAATGTAGTATTTAC;SOR=3.442;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=12;WE=96694170;WS=96694152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	96704740	rs35036804	G	A	1905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-2.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.218;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=28;PP=1024;ReadPosRankSum=-0.928;SC=CTAAAGTCAAGTATAAAAATT;SOR=0.578;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=148;TCF=98;TCR=50;TR=79;WE=96704748;WS=96704730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,92:0.53:175
chr12	96704979	rs3759366	C	A	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=232;ReadPosRankSum=-1.124;SC=AAAGGTAATCCAAAATAGTAA;SOR=0.859;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=14;WE=96704987;WS=96704969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr12	96718008	rs35383509	T	C	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=233;ReadPosRankSum=-0.279;SC=TTTAGCCTCATTGCTTTGCTT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=11;WE=96718016;WS=96717998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr12	96883245	rs3825265	G	C	305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=181;SC=GAGCATCATTGTTTTCTGGAC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=96883253;WS=96883239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	96894453	rs7959697	A	C	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=193;ReadPosRankSum=1.999;SC=GGAAGCAATAATTTTAACTGT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=10;WE=96894461;WS=96894444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr12	96894774	rs10860047	C	A	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.148;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=406;ReadPosRankSum=-0.252;SC=ATTATTATTACAGTATTTAGT;SOR=1.609;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=20;WE=96894782;WS=96894764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,20:0.45:44
chr12	96900801	rs61730867	G	T	3464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=363;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=80;PP=2161;ReadPosRankSum=-1.517;SC=TCCAGTGTCTGCATATCTTGT;SOR=0.686;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=328;TCF=156;TCR=172;TR=149;WE=96900809;WS=96900791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:192,170:0.47:362
chr12	96912598	rs11108564	G	A	867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=6;PP=641;SC=TTTTTGGTTTGAGTAATCAGC;SOR=2.621;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=29;WE=96912606;WS=96912588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	96927498	rs2160500	T	C	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5081;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=40;ReadPosRankSum=1.960;SC=TGCCTGAAAGTGTCTATAGTG;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=3;WE=96927506;WS=96927488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr12	96927778	rs5800251	GT	G	537.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.747;HP=10;HapScore=3;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.051;NF=8;NR=12;PP=188;ReadPosRankSum=-1.896;SC=TATCCTCCTGGTTTTTTTTTT;SOR=0.334;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=21;TCR=33;TR=20;WE=96927786;WS=96927768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,29:0.47:62
chr12	96927817	rs2111146	C	T	967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.741;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=1.127;NF=28;NR=16;PP=559;ReadPosRankSum=2.137;SC=TACTAATTAACGTGTGGGATA;SOR=0.614;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=106;TCF=61;TCR=45;TR=44;WE=96927825;WS=96927807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,48:0.45:107
chr12	96927972	rs2160501	A	G	879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.733;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=23;PP=1045;ReadPosRankSum=-0.343;SC=AGGACAGTCAACTCAAATTTA;SOR=0.996;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=80;TCF=33;TCR=47;TR=37;WE=96927994;WS=96927962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,43:0.46:93
chr12	96927986	rs2160502	A	T	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=2.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.45;ReadPosRankSum=-1.468;SOR=1.018;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,31:0.42:73
chr12	96929200	rs11453356	A	AT	208.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=196;ReadPosRankSum=-2.404;SC=CATTTGTGTCATTTTTTTAGC;SOR=1.096;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=10;WE=96929208;WS=96929190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr12	96958227	rs3803090	C	T	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.50;ReadPosRankSum=-1.628;SOR=0.675;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,42:0.52:80
chr12	96986190	rs2052293	G	A	658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.520;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=5;PP=299;ReadPosRankSum=0.476;SC=TAGATACTGAGAACAAATCAA;SOR=0.381;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=48;TCF=38;TCR=10;TR=26;WE=96986198;WS=96986180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,31:0.57:54
chr12	96988037	rs815896	C	G	3358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=30;PP=2222;SC=CACCTATGTTCAATCTGAGTA;SOR=1.736;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=102;TCF=72;TCR=30;TR=101;WE=96988045;WS=96988027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr12	96992494	rs815890	C	T	2772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=55;PP=1716;SC=ATACTGCGAGCTTTGAAAGTA;SOR=1.094;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=40;TCR=55;TR=95;WE=96992502;WS=96992484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr12	97020673	rs10507074	T	C	663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.924;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=14;PP=344;ReadPosRankSum=1.897;SC=AAAAATTTCATCTTATGGTAG;SOR=0.644;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=59;TCF=29;TCR=30;TR=30;WE=97020681;WS=97020663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,35:0.52:67
chr12	97023937	rs9919717	A	C	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=13;PP=364;ReadPosRankSum=0.000;SC=ATAAAAAAGCAAACAAATCTT;SOR=0.596;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=56;TCF=26;TCR=30;TR=25;WE=97023945;WS=97023927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,28:0.47:60
chr12	97023991	rs1362949	C	T	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=165;ReadPosRankSum=-0.044;SC=GAGTAAGTTTCCTATGAGTTT;SOR=0.465;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=12;WE=97023999;WS=97023981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr12	97024016	rs35205059	TG	T	231.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=182;ReadPosRankSum=-0.578;SC=TTTTAGGTAATGAAATTAAGA;SOR=0.473;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=6;WE=97024024;WS=97024006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr12	97051632	rs10710617	AT	A	641.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=8;PP=324;ReadPosRankSum=0.125;SC=GAAATTACACATTTTTTTTTT;SOR=0.368;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=24;TCF=15;TCR=9;TR=20;WE=97051640;WS=97051622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,28:0.93:30
chr12	97079041	rs7974435	C	G	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.278;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.48;ReadPosRankSum=1.738;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr12	97079041	.	CCG	GCA	84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=3;HapScore=3;MGOF=4;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=0;NR=6;PP=84;QD=22.911312477;SC=GGAAGGATCCCCGTACTAGCT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=6;WE=97079051;WS=97079031;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr12	97079043	rs7974634	G	A	435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=10;PP=80;SC=AAGGATCCCCGTACTAGCTAA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=97079051;WS=97079031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	97085107	rs4762319	A	C	3122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.32;SOR=2.235;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr12	97098415	rs10860069	C	T	326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=1;PP=232;SC=AATTACTTTTCCAATAAAAAT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=97098423;WS=97098405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	97098549	rs11108643	T	C	1979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=23;PP=1132;SC=TCAGGAAAACTTCTTACCAGT;SOR=0.874;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=35;TCR=23;TR=58;WE=97098557;WS=97098539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr12	97102578	rs7968231	G	A	2527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=44;PP=1507;SC=ACCAAACTTGGAAGGTAATTG;SOR=0.901;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=40;TCR=44;TR=84;WE=97102586;WS=97102568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr12	97102700	rs10581594	TTATA	T	256.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=245;ReadPosRankSum=2.326;SC=TTCTCTATGCTTATATAATGA;SOR=0.382;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=6;WE=97102711;WS=97102690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr12	97114231	rs10860073	G	A	1031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.565;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=18;PP=523;ReadPosRankSum=-0.194;SC=CCTTCTGTCCGAGGTGGAACA;SOR=0.578;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=87;TCF=51;TCR=36;TR=41;WE=97114239;WS=97114221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,51:0.48:106
chr12	97136239	rs1990828	G	A	1094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=7;PP=574;SC=AAAGATGACAGTGAGTTTTTA;SOR=1.730;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=32;WE=97136247;WS=97136229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr12	97147503	rs1420649	G	C	2101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.730;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=35;PP=1422;ReadPosRankSum=0.732;SC=CTTCCCCACCGAACTGTTTTT;SOR=0.860;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=184;TCF=115;TCR=69;TR=95;WE=97147511;WS=97147493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,99:0.48:208
chr12	97151077	rs1019336	C	G	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=41;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=45;ReadPosRankSum=-0.189;SC=AGCTCTCTTCCAGAACTTCCA;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=3;WE=97151085;WS=97151067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr12	97158126	rs10860094	T	C	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=173;ReadPosRankSum=-0.314;SC=AGGAGTTGGGTGTGATACCTC;SOR=1.058;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=12;WE=97158134;WS=97158116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr12	97158772	rs58414715	C	CT	51.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.550;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=80;ReadPosRankSum=0.456;SC=TATGAATTCACTTTTTTCACA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=4;WE=97158780;WS=97158762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr12	97254620	rs1420653	G	A	4767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=77;PP=2768;SC=TCTCACTGCCGTCTATATTCA;SOR=0.795;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=169;TCF=92;TCR=77;TR=169;WE=97254628;WS=97254610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr12	97306603	.	AT	A	103.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.003;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.48;MQRankSum=2.037;QD=3.58;ReadPosRankSum=1.447;SOR=0.922;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,10:0.34:29
chr12	97339388	rs249589	G	C	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.242;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=54;ReadPosRankSum=-0.319;SC=TTTCAAGTTTGCACATGCCAA;SOR=1.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=5;WE=97339396;WS=97339378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr12	97345955	rs2304697	A	G	419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=11;PP=307;SC=GAGTAAAAGGATGATGGGATT;SOR=1.061;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=6;TCR=11;TR=17;WE=97345963;WS=97345945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	97639049	rs1012314	T	C	2591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.977;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=44;PP=1691;ReadPosRankSum=0.718;SC=TAATGCAGTCTCTCCATTTGT;SOR=0.817;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=264;TCF=154;TCR=110;TR=112;WE=97639057;WS=97639039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,127:0.43:295
chr12	97639144	rs1012315	A	G	3647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=403;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.525;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=80;PP=2320;ReadPosRankSum=0.657;SC=AAAAAAACTGATTATAGAAGC;SOR=0.618;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=360;TCF=172;TCR=188;TR=156;WE=97639152;WS=97639134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:228,175:0.43:403
chr12	98332667	rs1349300	C	A	1202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=6;PP=904;SC=TTTTTTAAAACACAACTTATA;SOR=3.202;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=31;TCR=6;TR=37;WE=98332675;WS=98332657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr12	98332704	rs1349299	C	G	2481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=24;PP=1656;SC=AACTCCTTTGCTCAATATTTA;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=55;TCR=24;TR=79;WE=98332712;WS=98332694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr12	98332904	rs3072891	TCA	T	2122.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=32;PP=1541;SC=TTTCTTAGCCTCAGTTTTCTC;SOR=3.352;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=32;WE=98332913;WS=98332894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr12	98389341	rs1477006	A	T	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.338;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=104;ReadPosRankSum=2.875;SC=CAAGACCCAAAGCAAAAGTTT;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=6;WE=98389349;WS=98389331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr12	98896502	rs3825263	G	A	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=322;ReadPosRankSum=2.607;SC=TGAATTGGCCGGGCGCGGTGG;SOR=0.826;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=18;WE=98896510;WS=98896492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr12	98897361	rs56397627	C	G	1198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.98;ReadPosRankSum=0.737;SOR=0.982;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,31:0.52:60
chr12	98897364	rs56118269	C	T	1195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=2.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.85;ReadPosRankSum=1.724;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,32:0.48:67
chr12	98985056	rs934930	T	C	633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.373;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=393;ReadPosRankSum=-0.405;SC=CCATGTCAACTTAGCTAGGCT;SOR=0.412;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=47;TCF=9;TCR=38;TR=24;WE=98985064;WS=98985046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,27:0.52:52
chr12	98993270	.	G	GT	38.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.566;ClippingRankSum=0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.04;ReadPosRankSum=-1.954;SOR=1.302;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr12	99020688	rs148210292	TGACA	T	199.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.297;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=92;ReadPosRankSum=-2.065;SC=AGAATCAGACTGACAAAGATA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=3;WE=99020699;WS=99020678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr12	99056125	rs10745833	T	A	84.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5103;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=56;ReadPosRankSum=1.282;SC=CTATTTGTTTTAAAAAAAATT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=4;WE=99056133;WS=99056121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr12	99116919	rs11109582	A	G	1410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=22;PP=876;ReadPosRankSum=1.111;SC=CACCCCTCCAATGAGATAGGA;SOR=0.658;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=131;TCF=85;TCR=46;TR=62;WE=99116927;WS=99116909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,67:0.46:146
chr12	99129497	rs10860361	G	A	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=362;ReadPosRankSum=0.341;SC=CATGTGCCTGGCATTGTGGTA;SOR=0.701;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=48;TCF=11;TCR=37;TR=23;WE=99129505;WS=99129487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,23:0.46:50
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chr12	99478889	rs7970088	G	A	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.541;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=90;ReadPosRankSum=1.990;SC=GAGAAAACCAGTGAGTGACCT;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=6;WE=99478897;WS=99478879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
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chr12	100173822	rs116442602	C	G	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.971;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=175;ReadPosRankSum=2.105;SC=CACTATCTAACTGCTGTAATT;SOR=1.508;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=10;WE=100173830;WS=100173812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr12	100219207	rs7138513	A	G	3255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=53;PP=1840;SC=CAGTGAAGCCAGATCTTGCCT;SOR=0.793;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=108;TCF=55;TCR=53;TR=108;WE=100219215;WS=100219197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr12	100635627	rs56098115	GAA	G	291.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=5.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQRankSum=1.736;QD=16.21;ReadPosRankSum=1.957;SOR=3.477;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
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chr12	100649967	rs112288452	T	C	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.083;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=12;PP=231;ReadPosRankSum=-0.605;SC=GGTGAATCAATTGAAGAAGAC;SOR=1.051;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=57;TCF=27;TCR=30;TR=21;WE=100649975;WS=100649957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,27:0.39:69
chr12	100655307	rs10860569	G	C	213.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.75;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	100676960	rs7965910	C	A	2625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.057;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=69;PP=1524;ReadPosRankSum=0.483;SC=TGGAAAAAACCCACATGCTAA;SOR=0.793;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=204;TCF=81;TCR=123;TR=111;WE=100676968;WS=100676950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,124:0.55:224
chr12	100709313	rs7968030	T	A	208.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.96;ReadPosRankSum=-0.295;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,12:0.34:35
chr12	100709420	rs10860577	C	T	1512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=38;PP=964;ReadPosRankSum=1.440;SC=GCCCAATGTTCTACTTATTGC;SOR=0.697;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=201;TCF=107;TCR=94;TR=81;WE=100709428;WS=100709410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,84:0.38:223
chr12	100717260	rs11110340	A	T	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.108;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=167;ReadPosRankSum=-1.863;SC=GAGAGAAAAGATGAGTCTTTC;SOR=3.240;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=32;TCR=7;TR=12;WE=100717268;WS=100717250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,12:0.31:39
chr12	100732327	rs10860580	C	T	3849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=72;NR=52;PP=1954;SC=GACAGACACACTGATGGATAA;SOR=0.763;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=72;TCR=52;TR=124;WE=100732335;WS=100732317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr12	100814008	rs75599713	T	C	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.043;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=170;ReadPosRankSum=-1.583;SC=GCCTTTCTTGTAGCCCAGCTT;SOR=0.061;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=12;WE=100814016;WS=100813998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr12	100988773	rs35690	T	A	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.702;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=114;ReadPosRankSum=0.742;SC=TTAGCAAAGATAAAATTATCA;SOR=0.148;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=8;WE=100988781;WS=100988763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr12	101012490	rs7961640	G	A	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=302;ReadPosRankSum=1.059;SC=AATATAAACCGGTACTATTCT;SOR=1.179;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=16;WE=101012498;WS=101012480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr12	101017445	rs1469385	T	C	1695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.305;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=27;PP=1058;ReadPosRankSum=1.140;SC=GTTTGCCACATTAGAACAAAA;SOR=0.843;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=139;TCF=82;TCR=57;TR=72;WE=101017453;WS=101017435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,77:0.52:148
chr12	101127795	rs17030480	C	T	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=7;PP=124;ReadPosRankSum=0.484;SC=TTTTCTGGATCGCCCTCTTGT;SOR=0.180;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=9;WE=101127803;WS=101127785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr12	101133912	rs4764751	G	A	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.794;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=259;ReadPosRankSum=-0.657;SC=TTGGAGATTCGGGACTGGGTG;SOR=0.063;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=14;WE=101133920;WS=101133902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr12	101433990	rs665071	A	G	431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=346;SC=TCTTCACAAGAGGAAACTCAT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=101433998;WS=101433980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
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chr12	101473272	rs651784	G	A	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.49;BaseQRankSum=-2.132;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=108;ReadPosRankSum=0.471;SC=TGATTAAGTGGAGAATTCCAC;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=7;WE=101473280;WS=101473262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
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chr12	101683929	rs703715	C	T	432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.181;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=304;ReadPosRankSum=-0.053;SC=CTGATAAAAACGCACTTTTCA;SOR=1.024;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=49;TCF=34;TCR=15;TR=23;WE=101683937;WS=101683919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,22:0.43:51
chr12	101685691	rs4764641	G	A	2742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.449;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=63;PP=1871;ReadPosRankSum=0.585;SC=TAATATGCTCGAGAGTCTGGT;SOR=0.659;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=240;TCF=129;TCR=111;TR=132;WE=101685699;WS=101685681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,135:0.52:260
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chr12	101687043	rs2290720	C	T	1070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.776;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=24;PP=518;ReadPosRankSum=1.361;SC=TTACTAAGTTCGGAGTATTTT;SOR=0.793;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=82;TCF=34;TCR=48;TR=40;WE=101687051;WS=101687033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,50:0.52:97
chr12	101693534	rs4764643	C	G	3330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.392;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=60;PP=1767;ReadPosRankSum=-1.150;SC=CATCTTTTATCTATAATTAAG;SOR=0.724;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=297;TCF=164;TCR=133;TR=139;WE=101693542;WS=101693524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,165:0.49:340
chr12	101693892	rs36020087	G	A	1773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=50;PP=1056;ReadPosRankSum=0.958;SC=CACACTCAAAGTAATTGTAAA;SOR=0.641;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=152;TCF=52;TCR=100;TR=77;WE=101693900;WS=101693882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,83:0.50:166
chr12	101701930	rs7975348	T	C	751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.166;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=14;PP=388;ReadPosRankSum=-0.134;SC=AAATACTGACTGGTCTTCTCC;SOR=0.375;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=87;TCF=58;TCR=29;TR=36;WE=101701938;WS=101701920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,38:0.40:94
chr12	101705477	rs11110747	T	C	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.17;ReadPosRankSum=1.680;SOR=0.531;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,28:0.37:75
chr12	101732485	rs35164790	TA	T	182.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=202;ReadPosRankSum=-0.105;SC=AAATTTAACTTAAATGTTCAT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=7;WE=101732493;WS=101732475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr12	101750814	rs10082778	T	A	8118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=129;NR=141;PP=2965;SC=CACTTCCTCCTATATGTTTTA;SOR=0.875;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=270;TCF=129;TCR=141;TR=270;WE=101750822;WS=101750804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,297:1.00:297
chr12	101761867	rs1457564	G	T	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.645;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=260;ReadPosRankSum=0.704;SC=TGATTGAGGTGTTTTTGTTTG;SOR=1.981;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=32;TCF=4;TCR=28;TR=14;WE=101761875;WS=101761857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr12	101776996	rs1061436	G	C	2348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.483;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=49;PP=1414;ReadPosRankSum=-0.080;SC=GGTGAAGGAAGAGCTCGGCAG;SOR=0.752;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=205;TCF=101;TCR=104;TR=94;WE=101777004;WS=101776986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,109:0.48:229
chr12	101777489	rs10860719	G	A	1602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.354;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=45;PP=1078;ReadPosRankSum=1.210;SC=TGCACATGAGGATTTCTAACT;SOR=0.853;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=142;TCF=51;TCR=91;TR=68;WE=101777497;WS=101777479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,73:0.49:150
chr12	101779964	rs4764794	T	C	1942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=36;PP=1124;SC=GAAATTACAGTAGGTTGTCTG;SOR=1.196;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=70;TCF=22;TCR=48;TR=58;WE=101779972;WS=101779954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr12	101790024	rs11110777	G	A	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=334;ReadPosRankSum=-0.298;SC=TGCACCTGAAGACCAGTGAGA;SOR=0.749;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=56;TCF=45;TCR=11;TR=21;WE=101790032;WS=101790014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,23:0.38:61
chr12	101790097	rs11110778	G	A	1989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.483;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=40;PP=1142;ReadPosRankSum=-0.336;SC=TCCTCAACACGGGAGAAAAAT;SOR=0.744;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=205;TCF=114;TCR=91;TR=91;WE=101790105;WS=101790087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,100:0.43:234
chr12	101795009	rs17500203	A	C	1779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=40;PP=1178;ReadPosRankSum=1.160;SC=AGAAACTGACATATCAATTGC;SOR=0.687;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=140;TCF=66;TCR=74;TR=73;WE=101795017;WS=101794999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,80:0.51:158
chr12	101796965	rs12370450	G	A	3306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=354;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.265;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=70;PP=1914;ReadPosRankSum=0.778;SC=ACATGTGCAGGTGTGTGCACA;SOR=0.580;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=318;TCF=171;TCR=147;TR=148;WE=101796973;WS=101796955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:188,164:0.47:352
chr12	101870804	rs7979430	G	A	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.087;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=11;PP=202;ReadPosRankSum=-1.736;SC=TATCGATCATGTTAATAAGGA;SOR=1.005;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=49;TCF=21;TCR=28;TR=19;WE=101870812;WS=101870794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,22:0.41:54
chr12	101871237	rs76202035	T	C	1557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.381;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=25;PP=936;ReadPosRankSum=0.625;SC=AGTGTCAAGATTGAGAAACCC;SOR=0.547;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=78;TCR=47;TR=66;WE=101871245;WS=101871227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,72:0.53:136
chr12	101880128	rs61748064	A	G	2403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.089;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=42;PP=1408;ReadPosRankSum=0.475;SC=TTAGGCAGGAAGAAGCTCCGA;SOR=0.600;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=187;TCF=109;TCR=78;TR=99;WE=101880136;WS=101880118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,111:0.54:205
chr12	102008103	.	TGA	T	56.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.809;NF=5;NR=0;PP=135;ReadPosRankSum=-0.458;SC=TGTGTGTGTGTGAGAGAGAGA;SOR=0.602;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=5;WE=102008112;WS=102008093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr12	102046394	rs1997205	C	T	2982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=24;PP=1798;SC=GTCTTTTCAGCTTGGGTCATA;SOR=1.893;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=91;TCF=66;TCR=25;TR=90;WE=102046402;WS=102046384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr12	102046595	rs1997204	T	C	3621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=81;PP=1945;SC=TGCATAGTTGTGTTCTTTTTT;SOR=1.695;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=125;TCF=44;TCR=81;TR=125;WE=102046603;WS=102046585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr12	102057166	rs2254631	T	C	717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=2;PP=505;SC=AGCTGTGTAGTAAATAGTTTA;SOR=3.014;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=23;WE=102057174;WS=102057156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr12	102060672	rs7307993	T	C	75.22	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.07;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr12	102060676	rs7136919	C	T	75.96	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.32;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr12	102061793	rs147564199	GTTAATGCT	G	639.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=2978;SC=TTGATATTTTGTTAATGCTTT;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=12;WE=102061808;WS=102061783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	102063901	rs58177042	C	CCACACA,CCACACACA	664.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=15;NF=2,2;NR=8,8;PP=209,118;SC=TGTGTGGAAACCACACACACA;SOR=2.448;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=10,10;WE=102063909;WS=102063891;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.40,0.60:15
chr12	102064118	rs7139095	T	C	9837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=364;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=170;NR=161;PP=2965;SC=AGATTCGCATTCCAAGACACC;SOR=0.715;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=333;TCF=171;TCR=162;TR=331;WE=102064126;WS=102064108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,362:1.00:362
chr12	102120364	rs222508	A	G	420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=13;PP=322;SC=TGAAGCCCCCATTGTATCATC;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=102120372;WS=102120354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	102433811	rs4237982	T	C	1907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=44;PP=1045;SC=GGGTCTATCATGTTACTTAAA;SOR=1.488;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=26;TCR=44;TR=70;WE=102433819;WS=102433801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr12	102468734	.	TA	T	240.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=1.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.26;MQRankSum=1.283;QD=6.02;ReadPosRankSum=0.253;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
chr12	102512024	.	CT	C	92.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=-0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.80;ReadPosRankSum=0.104;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr12	102514184	rs4764863	A	G	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=208;ReadPosRankSum=-0.607;SC=GTGGGACCGAAGTATTATGGT;SOR=0.892;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=13;WE=102514192;WS=102514174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr12	102517753	rs2036772	T	C	2879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=55;PP=1831;ReadPosRankSum=-0.557;SC=CTGAGAGAACTACTCTATGTG;SOR=0.692;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=260;TCF=147;TCR=113;TR=124;WE=102517761;WS=102517743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,138:0.48:285
chr12	103234479	rs798709	A	G	948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=29;PP=788;SC=AAGCCTCTGTATGTGTGTATG;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=30;WE=103234487;WS=103234469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	103237468	rs772897	G	C	3055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=44;PP=1871;SC=CCACGTAATAGAGGGGCTGGA;SOR=0.767;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=53;TCR=44;TR=97;WE=103237476;WS=103237458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr12	103237958	rs10860930	AA	CG	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-3.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=242;ReadPosRankSum=0.673;SC=GCCATCATCAAATCATAGCTG;SOR=0.275;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=7;WE=103237967;WS=103237957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr12	103238017	rs12580432	C	T	1383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-1.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=14;PP=854;ReadPosRankSum=1.363;SC=CATATCAAAACGGATACAAAT;SOR=0.742;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=99;TCF=75;TCR=24;TR=55;WE=103238025;WS=103238007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,62:0.54:115
chr12	103246700	rs1042503	C	T	2264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=52;PP=1322;ReadPosRankSum=0.817;SC=GCAGGCCAGCCACAGGTCGGA;SOR=0.714;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=173;TCF=80;TCR=93;TR=94;WE=103246708;WS=103246690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,106:0.55:193
chr12	103248924	rs1126758	C	T	1624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.308;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=25;PP=1045;ReadPosRankSum=0.840;SC=TCTGCAGGAACTGAGAAACGT;SOR=0.820;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=135;TCF=84;TCR=51;TR=70;WE=103248932;WS=103248914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,76:0.51:149
chr12	103260273	rs10860933	T	G	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.481;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=127;ReadPosRankSum=-0.281;SC=GGCAGGACTCTTCATGCTGGT;SOR=0.204;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=10;WE=103260281;WS=103260264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr12	103271350	rs2037639	G	A	4026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=75;PP=2396;SC=AGAAGGCAACGTCCTGAGTAC;SOR=1.067;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=137;TCF=62;TCR=75;TR=136;WE=103271358;WS=103271340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr12	103352171	rs71438488	C	CGCA	293.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=3;PP=192;ReadPosRankSum=-0.456;SC=GCGCAGAGCGCGCAGCAGCAG;SOR=0.627;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=21;TCF=9;TCR=12;TR=6;WE=103352179;WS=103352161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
chr12	103561799	rs1401988	C	T	1323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=9;PP=768;SC=TTAATATGTACATGCATCTCT;SOR=2.352;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=39;WE=103561807;WS=103561789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr12	103670917	rs12311525	A	G	3042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.406;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=65;PP=1864;ReadPosRankSum=-0.679;SC=ATCATACCAAACGATACTCAC;SOR=0.656;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=293;TCF=155;TCR=138;TR=136;WE=103670925;WS=103670907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,150:0.47:320
chr12	103696182	rs79387839	T	G	3057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.371;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=63;PP=1806;ReadPosRankSum=-1.299;SC=AGGAGTCTGCTTTGGATGTCG;SOR=0.828;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=283;TCF=155;TCR=128;TR=141;WE=103696190;WS=103696172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,159:0.49:324
chr12	103699685	rs7488867	C	T	1873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.631;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=22;PP=1072;ReadPosRankSum=0.748;SC=TCTGTTTATACTGAAGTTAAA;SOR=0.633;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=92;TCR=38;TR=75;WE=103699693;WS=103699675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,86:0.57:152
chr12	103872172	rs10778257	T	G	3930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=62;PP=2250;SC=AGAATTCTTCTTCCCTTTGTT;SOR=0.746;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=72;TCR=62;TR=134;WE=103872180;WS=103872162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr12	104014402	.	AAC	A	70	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=16;MQ=58.88;NF=0;NR=4;PP=70;QD=18.25;SC=ATCCTCCTTAAACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=4;WE=104014411;WS=104014392;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr12	104015999	rs703612	T	C	2374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=44;PP=1396;SC=AAAAAAGAAATTTCAGCAGAA;SOR=1.882;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=65;TCF=21;TCR=44;TR=65;WE=104016007;WS=104015989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr12	104042736	rs697199	T	C	182.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=9;PP=169;SC=GTCATGCAGGTGAGAGGGAAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=104042744;WS=104042726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	104048592	rs831425	C	T	787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=18;PP=538;SC=GCTAGGATCCCGAGCAGAGAG;SOR=2.670;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=23;WE=104048600;WS=104048582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
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chr12	104067812	rs11614418	C	T	2509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.018;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=48;PP=1313;ReadPosRankSum=-1.528;SC=GTGGGCCCTACGTGCAGTTCT;SOR=0.774;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=207;TCF=112;TCR=95;TR=110;WE=104067820;WS=104067802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,122:0.54:227
chr12	104071158	rs72177976	TTCTC	T	1357.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.827;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.004;NF=10;NR=10;PP=884;ReadPosRankSum=-1.136;SC=TGTCTGGAAATTCTCTCTTAT;SOR=0.990;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=52;TCF=24;TCR=28;TR=20;WE=104071169;WS=104071148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,38:0.44:87
chr12	104081793	rs697206	A	G	1067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=5;PP=755;SC=ACGCATTCACATCAGCATCAG;SOR=3.145;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=37;WE=104081801;WS=104081783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr12	104086631	rs703651	C	T	2175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=45;PP=1239;ReadPosRankSum=0.846;SC=ATGGGGACAACGCAGCCACAA;SOR=0.721;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=216;TCF=114;TCR=102;TR=98;WE=104086639;WS=104086621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,110:0.45:243
chr12	104092996	rs697210	T	C	2113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.342;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=40;PP=1294;ReadPosRankSum=-2.039;SC=TCTTTCTCCATAATGACCAGG;SOR=0.457;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=156;TCF=90;TCR=66;TR=87;WE=104093004;WS=104092986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,98:0.55:177
chr12	104100617	rs697212	C	T	4342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=393;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.759;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=107;NR=87;PP=2674;ReadPosRankSum=0.645;SC=GCCAGCCCTGCCCAGGGAATG;SOR=0.649;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=357;TCF=194;TCR=163;TR=194;WE=104100625;WS=104100607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,209:0.53:391
chr12	104100775	rs66517507	G	A	733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.244;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=25;PP=534;ReadPosRankSum=1.006;SC=GGTGAGCACCGTCCTCTCCAC;SOR=1.643;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=55;TCF=8;TCR=47;TR=28;WE=104100783;WS=104100765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,30:0.51:59
chr12	104111687	rs703653	C	A	1455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=35;PP=994;SC=CCCCACTTCTCGGGGATGCAG;SOR=2.655;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=9;TCR=35;TR=44;WE=104111695;WS=104111677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr12	104124061	rs4981042	A	G	2263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=38;PP=1183;ReadPosRankSum=1.856;SC=TTATGTTTTCAGCCTGGAGTG;SOR=0.344;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=36;TCR=39;TR=74;WE=104124069;WS=104124051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,87:0.99:88
chr12	104131609	rs2271640	G	T	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=211;ReadPosRankSum=-0.911;SC=CCAAAGAATGGCCCTCATGAT;SOR=0.713;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=17;TCR=20;TR=18;WE=104131617;WS=104131599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,19:0.40:47
chr12	104133305	rs151040830	CTGTGTGTGTGTGTG	C	587.92	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.035;HP=1;HapScore=3;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=834;ReadPosRankSum=-1.488;SC=ATTATCAGACCTGTGTGTGTG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=1;TCR=36;TR=12;WE=104133328;WS=104133295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr12	104136289	rs35102665	G	A	1238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.436;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=34;PP=798;ReadPosRankSum=0.470;SC=ATGGGACGGCGTGTGAGATGT;SOR=0.965;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=169;TCF=86;TCR=83;TR=61;WE=104136297;WS=104136279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,67:0.36:185
chr12	104136316	rs2292688	C	T	1090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.007;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=31;PP=667;ReadPosRankSum=-0.453;SC=CGGGGAGATTCGGGCCTGATT;SOR=0.973;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=138;TCF=65;TCR=73;TR=53;WE=104136324;WS=104136306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,58:0.39:148
chr12	104138918	rs2292687	C	T	1518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=31;PP=870;ReadPosRankSum=-1.120;SC=GTCTCAACCCCTGATGACTGA;SOR=0.692;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=140;TCF=77;TCR=63;TR=70;WE=104138926;WS=104138908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,77:0.51:152
chr12	104140517	rs2056128	A	G	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=190;ReadPosRankSum=-1.023;SC=AAATAGCAGCATGGTGTGGGA;SOR=0.653;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=13;WE=104140525;WS=104140507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr12	104146813	rs34738204	A	T	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.82;ReadPosRankSum=0.652;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr12	104146964	rs35756765	C	A	1797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=28;PP=1080;ReadPosRankSum=-0.574;SC=ACCTGGTGGGCTGACCTGGGC;SOR=0.740;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=161;TCF=100;TCR=61;TR=76;WE=104146972;WS=104146954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,84:0.47:178
chr12	104147171	rs3751200	G	A	717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.281;HP=1;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=28;PP=1125;ReadPosRankSum=-0.253;SC=GACAGAGTCTGCAGGGGCGGA;SOR=1.421;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=77;TCF=14;TCR=63;TR=32;WE=104147186;WS=104147161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,32:0.42:77
chr12	104147178	rs3751199	C	A	1029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.785;HP=6;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=29;PP=1785;ReadPosRankSum=-0.026;SC=TCTGCAGGGGCGGAAGTGCAG;SOR=0.220;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=66;TCF=12;TCR=54;TR=38;WE=104147186;WS=104147161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,39:0.59:66
chr12	104149022	rs11111748	G	A	10689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=403;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=200;NR=173;PP=2965;SC=CATTAACCAAGTGATGCCACA;SOR=0.836;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=373;TCF=200;TCR=173;TR=373;WE=104149030;WS=104149012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,403:1.00:403
chr12	104149251	rs7296626	C	T	9277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=344;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=153;NR=149;PP=2965;SC=GAAAGGTAACCGCCCCAGCTA;SOR=0.753;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=302;TCF=153;TCR=149;TR=302;WE=104149259;WS=104149241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,344:1.00:344
chr12	104151931	rs12425537	T	C	912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.939;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=15;PP=668;ReadPosRankSum=0.417;SC=CTCTGATGACTTCCTTCTTCT;SOR=1.022;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=73;TCF=45;TCR=28;TR=42;WE=104151939;WS=104151921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,42:0.55:77
chr12	104155075	rs55724382	T	C	2312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.213;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=48;PP=1320;ReadPosRankSum=0.210;SC=CTCATTTCCCTAGACGGAGAC;SOR=0.680;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=204;TCF=107;TCR=97;TR=97;WE=104155083;WS=104155065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,112:0.48:234
chr12	104157234	rs1057892	G	C	740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=11;PP=449;ReadPosRankSum=1.270;SC=CTGCTTTGGGGATGCTCCTGG;SOR=0.646;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=61;TCF=38;TCR=23;TR=31;WE=104157242;WS=104157224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,35:0.53:66
chr12	104157502	rs3751196	G	A	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.407;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=197;ReadPosRankSum=-1.132;SC=TAGAATGTATGTCAGGTAACA;SOR=1.402;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=28;TCF=9;TCR=19;TR=12;WE=104157510;WS=104157492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
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chr12	104182458	rs2888792	T	C	1062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.741;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=8;PP=720;ReadPosRankSum=-0.638;SC=AATATATTGATTTAAACCTAA;SOR=0.328;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=77;TCF=65;TCR=12;TR=41;WE=104182466;WS=104182448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,44:0.55:80
chr12	104186995	rs61748068	G	A	2448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=45;PP=1619;ReadPosRankSum=-0.120;SC=TGACCACATCGAACAGGTCCC;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=216;TCF=128;TCR=88;TR=111;WE=104187003;WS=104186985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,117:0.50:234
chr12	104187092	rs1866296	G	A	4319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-2.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=387;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.369;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=106;NR=90;PP=2690;ReadPosRankSum=-0.817;SC=GAGATTAACTGTGTCTGTAAC;SOR=0.723;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=357;TCF=189;TCR=168;TR=196;WE=104187100;WS=104187082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,206:0.54:384
chr12	104187440	rs11111781	C	T	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=361;ReadPosRankSum=-0.694;SC=CGGTGGAACACGGGTACATCT;SOR=0.495;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=19;WE=104187448;WS=104187430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr12	104190523	rs12425205	G	A	527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-5.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=363;ReadPosRankSum=-1.228;SC=CATCTTTCTTGTAATGTTCAA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=19;WE=104190531;WS=104190513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,21:0.60:35
chr12	104208868	rs10861107	C	T	790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.016;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=25;PP=524;ReadPosRankSum=1.552;SC=CATCTGGATTCAACAAGTTGC;SOR=0.979;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=71;TCF=19;TCR=52;TR=33;WE=104208876;WS=104208858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,36:0.47:76
chr12	104237882	rs2576974	G	A	5021.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=97;NR=68;PP=2965;SC=TTTCAGCATTGTTTTGTGTCT;SOR=0.944;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=97;TCR=68;TR=165;WE=104237904;WS=104237872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr12	104237896	rs7966100	G	A	5797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=110;NR=80;PP=2965;SC=TGTGTCTTCCGTTGTATCTTT;SOR=0.928;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=190;TCF=110;TCR=80;TR=190;WE=104237904;WS=104237872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr12	104309712	rs2583273	C	T	5357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=98;PP=2965;SC=CAGCCACCGACCCCCACTGCT;SOR=1.196;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=172;TCF=74;TCR=98;TR=171;WE=104309720;WS=104309702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr12	104324148	rs2722187	G	A	823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=10;PP=545;SC=CCCGCCCGCGGGAAGTGGGGG;SOR=1.214;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=31;TCF=21;TCR=10;TR=30;WE=104324156;WS=104324138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr12	104335750	rs58392270	TAA	T	5405.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=60;PP=2668;SC=ATTTGTGGAGTAAAACCAGAT;SOR=1.374;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=69;TCF=5;TCR=64;TR=65;WE=104335759;WS=104335740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr12	104359931	rs4135039	T	A	2482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.08;SOR=1.145;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr12	104359982	rs4135040	C	A	808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=16;PP=496;SC=GTGGCCTGGTCGGCCTTTCCT;SOR=1.688;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=8;TCR=16;TR=24;WE=104359990;WS=104359972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	104461711	.	CT	C	278.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.092;ClippingRankSum=0.000;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=8.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQRankSum=1.826;QD=2.68;ReadPosRankSum=0.371;SOR=0.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,26:0.25:104
chr12	104476264	rs2253274	T	C	6108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.39;SOR=1.032;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr12	104618454	rs6539128	A	G	1136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=1;PP=799;SC=GAGCCACCGCACCTATAGCTG;SOR=5.994;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=35;WE=104618462;WS=104618444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr12	104645363	rs7960443	G	A	6000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=98;NR=97;PP=2965;SC=TCACCAGCACGGCCACTGCAG;SOR=0.806;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=196;TCF=98;TCR=98;TR=195;WE=104645371;WS=104645353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr12	104645384	rs73180108	C	G	1863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.808;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=43;PP=1069;ReadPosRankSum=-0.070;SC=ACTCCAGAGCCCTGCTTCAGG;SOR=0.865;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=169;TCF=79;TCR=90;TR=79;WE=104645392;WS=104645374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,91:0.49:187
chr12	104645405	rs7975161	T	C	4357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=83;PP=2445;SC=CCTATATAGATGGTCACTCTG;SOR=1.053;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=65;TCR=83;TR=148;WE=104645413;WS=104645395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr12	104651594	rs7297584	A	G	163.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=88;SC=TTGACAATTGAATAGAATCAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=104651602;WS=104651586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	104684773	rs11111981	A	C	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=176;ReadPosRankSum=1.244;SC=TTCTTTAGAGATGGAGGTCTC;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=11;WE=104684781;WS=104684763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr12	104698582	rs11111987	A	G	3701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=338;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.287;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=72;PP=2385;ReadPosRankSum=0.751;SC=ATGTTAACCAAATGGGTGAGG;SOR=0.790;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=313;TCF=170;TCR=143;TR=157;WE=104698590;WS=104698572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,170:0.50:338
chr12	104703957	rs35882028	T	A	781.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.43;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	104703957	.	TCT	AGA	737	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=1;NR=9;PP=737;QD=80.0467874862;SC=GGAGTCTCACTCTGTGAGACT;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=10;WE=104703980;WS=104703947;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,10:0.91:11
chr12	104703958	rs34794131	C	G	781.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.43;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	104703959	rs34873076	T	A	781.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.99;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	104703965	rs66665385	ACTCCCAGG	A	707.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=9;PP=2849;SC=ACTCTGTGAGACTCCCAGGCT;SOR=2.049;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=104703980;WS=104703947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
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chr12	104712858	rs369071091	CT	C	108.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.19;ReadPosRankSum=0.798;SOR=0.795;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,18:0.20:91
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chr12	104742310	rs11611385	C	T	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.166;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=126;ReadPosRankSum=-0.473;SC=CCTGCGTGTCCTGTGCTTACC;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=7;WE=104742318;WS=104742300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr12	104985271	rs77877813	G	GTCT	523.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=434;ReadPosRankSum=0.570;SC=TCACTGTTTGGTCACAGCTAG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=10;WE=104985279;WS=104985261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr12	104985289	rs1615960	A	G	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=3.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.590;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=306;ReadPosRankSum=1.406;SC=TAGGGGCATGATGGTGGCATC;SOR=2.124;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=14;WE=104985297;WS=104985279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr12	104985407	rs11112118	T	C	1842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.510;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=35;PP=1123;ReadPosRankSum=0.699;SC=AAATTGAACTTAAAGGAAGAG;SOR=0.621;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=181;TCF=99;TCR=82;TR=76;WE=104985415;WS=104985397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,89:0.42:211
chr12	104985443	rs61938575	G	A	2253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.002;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=44;PP=1288;ReadPosRankSum=-0.616;SC=AGGTCCCACAGCAGGGCTGGA;SOR=0.673;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=202;TCF=108;TCR=94;TR=92;WE=104985451;WS=104985433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,108:0.46:236
chr12	104985540	rs11112119	G	T	2397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.981;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=55;PP=1405;ReadPosRankSum=-1.592;SC=CATGACCCACGGGTGTGTTGT;SOR=0.762;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=219;TCF=114;TCR=105;TR=112;WE=104985548;WS=104985530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,119:0.50:240
chr12	104985580	rs11112120	G	A	1533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.016;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=43;PP=939;ReadPosRankSum=1.463;SC=GTGACTAGTAGTTCATAAAAG;SOR=0.881;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=143;TCF=60;TCR=83;TR=70;WE=104985588;WS=104985570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,75:0.46:162
chr12	104985655	rs313323	C	T	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=225;ReadPosRankSum=-0.788;SC=AAACTTGTCTCGGTTTTCTAT;SOR=0.507;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=12;WE=104985663;WS=104985645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr12	104995800	rs5800627	A	AT	518.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=1.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQRankSum=1.219;QD=5.96;ReadPosRankSum=-0.117;SOR=0.847;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,33:0.38:87
chr12	105199038	rs11112201	G	A	1538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=0.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.981;SOR=0.724;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,76:0.48:159
chr12	105260159	rs149586274	TACACAC	T	289.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.315;HP=1;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.629;NF=10;NR=2;PP=467;ReadPosRankSum=0.423;SC=CAGACAGACGTACACACACAC;SOR=2.303;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=12;WE=105260174;WS=105260149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr12	105370961	rs11112272	G	A	1937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.561;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=38;PP=1088;ReadPosRankSum=0.351;SC=CAACCTCGGCGGACTGCGTGG;SOR=0.592;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=217;TCF=121;TCR=96;TR=85;WE=105370969;WS=105370951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,101:0.41:245
chr12	105371567	rs11112273	C	T	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.901;NF=12;NR=15;PP=410;ReadPosRankSum=0.475;SC=TGGTCTCCTTCTCGTTCTGGA;SOR=0.779;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=60;TCF=30;TCR=30;TR=27;WE=105371575;WS=105371557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,28:0.43:65
chr12	105371660	rs11112274	C	G	1371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=2.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.74;ReadPosRankSum=0.118;SOR=0.560;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,71:0.45:157
chr12	105371678	rs11112275	T	C	1342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=0.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.26;ReadPosRankSum=0.311;SOR=0.621;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,70:0.48:145
chr12	105380152	rs1129593	A	C	2342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=42;PP=1252;ReadPosRankSum=0.403;SC=TGGCAAGCCCAAGGCTAGCCC;SOR=0.677;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=209;TCF=114;TCR=95;TR=97;WE=105380160;WS=105380142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,116:0.49:239
chr12	105388181	rs11112287	C	A	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.021;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=257;ReadPosRankSum=-0.148;SC=AATGTTGGTTCTTCCCAATAT;SOR=0.238;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=18;WE=105388189;WS=105388171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
chr12	105418294	rs7304326	G	A	1768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.273;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=32;PP=1033;ReadPosRankSum=2.659;SC=ACCACATTCAGAGGCAGACAT;SOR=0.664;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=131;TCF=72;TCR=59;TR=74;WE=105418302;WS=105418284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,84:0.55:153
chr12	105425815	rs17036612	A	C	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5004;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=138;ReadPosRankSum=-1.221;SC=ATGTATTGTCATTTAGTCTTT;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=8;WE=105425823;WS=105425805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr12	105431835	rs10861315	T	G	1024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.716;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=13;PP=580;ReadPosRankSum=0.202;SC=GTGAGCCACCTCACCTGGCCC;SOR=0.451;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=106;TCF=80;TCR=26;TR=47;WE=105431843;WS=105431825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,52:0.45:116
chr12	105432019	rs112805543	ATC	A	235.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=1.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.37;ReadPosRankSum=0.990;SOR=0.708;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
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chr12	105432057	rs61938824	A	C	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.48;ReadPosRankSum=1.728;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
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chr12	105433523	rs4964317	T	A	3543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.802;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=74;PP=2164;ReadPosRankSum=-1.504;SC=TAGGAGTGGATCCAGTGAAAC;SOR=0.757;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=331;TCF=179;TCR=152;TR=163;WE=105433531;WS=105433513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:181,174:0.49:355
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chr12	105433702	rs7315784	A	T	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=409;ReadPosRankSum=-0.427;SC=AGGTCAGGAGATCGAGACCCG;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=19;WE=105433710;WS=105433692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr12	105434467	rs11112330	C	T	2073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.705;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=45;PP=1165;ReadPosRankSum=1.477;SC=CAGTCAAGGGCGTGACCTGAG;SOR=0.841;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=187;TCF=96;TCR=91;TR=91;WE=105434475;WS=105434457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,100:0.49:205
chr12	105434533	rs10861316	C	A	1540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=35;PP=789;ReadPosRankSum=0.255;SC=TAGCCCAGAACCCAGTTTTCC;SOR=0.702;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=174;TCF=86;TCR=88;TR=71;WE=105434541;WS=105434523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,80:0.41:194
chr12	105440421	rs10861324	T	G	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.273;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=227;ReadPosRankSum=0.999;SC=ATAAATATATTTCACTTTTTT;SOR=1.075;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=15;WE=105440429;WS=105440411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,19:0.42:45
chr12	105443914	rs11112344	C	T	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.836;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=23;PP=476;ReadPosRankSum=-0.053;SC=ATCCTAAGGACGGAGAATTCA;SOR=0.563;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=79;TCF=28;TCR=51;TR=35;WE=105443922;WS=105443904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,41:0.46:89
chr12	105443940	rs11112345	G	A	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.820;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=338;ReadPosRankSum=-0.704;SC=AAACACATATGGATCAGATCT;SOR=2.484;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=6;TCR=32;TR=16;WE=105443948;WS=105443930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,18:0.43:42
chr12	105443966	rs7485673	T	C	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=3.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=279;ReadPosRankSum=0.322;SC=CTTATAGAGATCATGGTCCAG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=13;WE=105443974;WS=105443956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr12	105445798	rs61938827	C	A	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=221;ReadPosRankSum=0.928;SC=CCAGCCTGGCCAACGTAGTGA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=12;WE=105445806;WS=105445788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr12	105446092	rs140372840	AT	A	712.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.967;NF=0;NR=20;PP=585;ReadPosRankSum=0.827;SC=AGTATTACTGATTTTAAAAAA;SOR=0.651;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=20;WE=105446100;WS=105446082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,29:0.53:55
chr12	105446552	rs56188643	T	C	1793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.610;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=21;PP=931;ReadPosRankSum=-0.315;SC=TAAAAATCCATGACCAGTGAT;SOR=0.627;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=147;TCF=100;TCR=47;TR=71;WE=105446560;WS=105446542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,83:0.52:161
chr12	105446719	rs56118650	G	T	2111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=52;PP=1293;ReadPosRankSum=1.831;SC=TCTGAGAGAAGTATATTAATA;SOR=0.690;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=143;TCF=57;TCR=86;TR=86;WE=105446727;WS=105446709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,94:0.60:157
chr12	105455651	rs6539183	A	G	895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=23;PP=761;SC=GGAAAAATACAGATTAAAAGC;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=105455659;WS=105455641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	105456866	rs12372293	G	A	1001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=31;PP=704;ReadPosRankSum=0.581;SC=GTATGTATAAGCATCATTCTC;SOR=0.783;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=74;TCF=20;TCR=54;TR=42;WE=105456874;WS=105456856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,44:0.56:78
chr12	105477951	rs11112362	C	T	311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=10;NR=0;PP=258;SC=AGACAATGGCCTGCGTGCCAG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=105477959;WS=105477941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	105478327	rs7303961	C	T	75.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=3;PP=54;SC=GACTGCCTGGCTCGCGGCTCG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=105478335;WS=105478317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr12	105504764	rs1196839	G	A	939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=3;PP=584;SC=TTTAACTTTGGAACTTTATTT;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=105504772;WS=105504754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr12	105504787	rs1196838	G	A	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.368;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=189;ReadPosRankSum=2.259;SC=AGGAAGTCCAGACATTCCAGA;SOR=1.449;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=13;WE=105504795;WS=105504777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,14:0.30:46
chr12	105509160	rs1196801	G	T	177.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=142;SC=AGGTAAAAAAGCTGAGGAAGC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=105509168;WS=105509150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	105514480	rs1196837	A	G	1335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=23;PP=641;SC=ACTCTTAAAGAGGCGTGTGTG;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=31;WE=105514491;WS=105514470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr12	105514483	rs57967713	C	CGT	175.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.684;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.336;NF=0;NR=7;PP=264;ReadPosRankSum=-0.253;SC=CTTAAAGAGGCGTGTGTGTGT;SOR=2.115;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=7;WE=105514491;WS=105514470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr12	105514786	rs1196836	G	T	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.683;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=162;ReadPosRankSum=-0.635;SC=TACTAATTCAGTAATCAGCCC;SOR=0.208;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=15;WE=105514794;WS=105514776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,17:0.46:37
chr12	105527385	rs1211276	G	C	349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=320;SC=CAGTACCTGGGATGTTTGTTG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=105527393;WS=105527375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	105534025	rs1196808	G	A	1793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=12;PP=1246;SC=AATTTTGCCTGAAATTTTTAA;SOR=2.376;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=48;TCR=12;TR=60;WE=105534033;WS=105534015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr12	105536430	rs5800652	C	CTA	187.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.57;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	105538417	rs148267591	AGTT	A	226.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=249;ReadPosRankSum=0.636;SC=TTCAAGGACAAGTTGTTGTTT;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=9;WE=105538427;WS=105538407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr12	105538757	rs12425803	T	A	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=67;ReadPosRankSum=0.517;SC=GCTTATTTTTTAAGAAATTAT;SOR=0.260;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=5;WE=105538765;WS=105538747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr12	105540322	rs199922129	A	AT	698.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=1.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQRankSum=1.025;QD=8.03;ReadPosRankSum=-1.199;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,40:0.46:87
chr12	105540668	rs11112389	C	T	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.030;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=20;ReadPosRankSum=1.120;SC=TTCAGATTTTCGGATTAAGGA;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=3;WE=105540676;WS=105540658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr12	105543326	rs1196802	T	G	218.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=166;SC=CAGTAAAATTTATTTGAATTG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=105543334;WS=105543317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	105546172	rs1663564	G	A	8419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.99;NF=147;NR=138;PP=2965;SC=AAAACTTGGAGTAACACCTGA;SOR=0.699;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=286;TCF=148;TCR=138;TR=285;WE=105546180;WS=105546162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,315:1.00:315
chr12	105546332	rs7315964	G	T	648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.198;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=427;ReadPosRankSum=0.124;SC=GAAAGCCTGAGCTCAGCTTTA;SOR=2.275;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=46;TCF=5;TCR=41;TR=22;WE=105546340;WS=105546322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,26:0.51:51
chr12	105550565	rs35149056	C	T	1180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=23;PP=580;ReadPosRankSum=-2.465;SC=GCAGCAATGCCATTAGGTATG;SOR=0.729;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=53;TCR=45;TR=50;WE=105550573;WS=105550555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,58:0.50:117
chr12	105551167	rs10083185	G	A	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=124;ReadPosRankSum=0.869;SC=AGACCAGAGGGTAATATGTAA;SOR=1.270;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=8;WE=105551175;WS=105551157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr12	105553720	.	A	AT	683.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=2.636;ClippingRankSum=0.000;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.728;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=468;ReadPosRankSum=0.231;SC=TGAGAGATGGATTTTTTTCAA;SOR=1.742;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=52;TCF=29;TCR=23;TR=21;WE=105553728;WS=105553710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,32:0.40:80
chr12	105558324	rs146551772	AAAT	A	405.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.640;NF=8;NR=1;PP=354;ReadPosRankSum=-0.901;SC=GAGCTTTTAAAAATAATAATA;SOR=1.473;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=9;WE=105558334;WS=105558314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,11:0.85:13
chr12	105558566	rs117460788	A	G	822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.982;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=24;PP=497;ReadPosRankSum=-0.169;SC=GTCTTTAGTAATAGACAGTAA;SOR=1.112;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=74;TCF=29;TCR=45;TR=35;WE=105558574;WS=105558556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,40:0.47:86
chr12	105568122	rs935241	G	A	4633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=61;PP=2642;SC=CTCTATGTTCGTTTGGATTTC;SOR=0.950;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=150;TCF=89;TCR=61;TR=150;WE=105568130;WS=105568112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr12	105568176	rs935240	G	A	5892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=103;NR=93;PP=2965;SC=CATATTTTCCGTCATTGGTTA;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=196;TCF=103;TCR=93;TR=196;WE=105568184;WS=105568166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr12	105570981	rs73179990	A	G	3204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.405;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=62;PP=1797;ReadPosRankSum=-0.180;SC=AATCACTAACATGAACCTGTA;SOR=0.649;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=283;TCF=147;TCR=136;TR=133;WE=105570989;WS=105570971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,155:0.48:320
chr12	105582245	rs1196852	A	G	2231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=55;PP=1368;ReadPosRankSum=-0.842;SC=AGCATTTTCCACTCAGGATCT;SOR=0.667;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=204;TCF=96;TCR=108;TR=102;WE=105582253;WS=105582235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,113:0.49:230
chr12	105583747	rs73179996	G	A	1962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.892;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=31;PP=1252;ReadPosRankSum=-0.777;SC=TTCTCCCAGAGATAACCTCTC;SOR=0.879;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=162;TCF=95;TCR=67;TR=81;WE=105583755;WS=105583737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,89:0.51:174
chr12	105597672	rs7300130	G	A	769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=19;PP=422;ReadPosRankSum=-3.044;SC=TGGCTGGCCCGCCTCGCACGC;SOR=0.722;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=60;TCF=24;TCR=36;TR=32;WE=105597680;WS=105597662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,36:0.55:66
chr12	105600752	rs12311156	G	A	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=170;ReadPosRankSum=-1.224;SC=TTCTTTCTACGACGATGCTTC;SOR=0.540;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=10;WE=105600760;WS=105600742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr12	105601697	rs7975115	T	C	841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=6;PP=576;ReadPosRankSum=-0.132;SC=GAGGAAGGCATGAAAGGCCTT;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=59;TCF=49;TCR=10;TR=36;WE=105601705;WS=105601687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,37:0.61:61
chr12	105629865	rs1196785	C	G	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.010;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=58;ReadPosRankSum=-1.296;SC=GAGCACTCCCCGGCTCTGGGC;SOR=0.207;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=21;TCF=7;TCR=14;TR=9;WE=105629873;WS=105629855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr12	105742241	.	C	T	31	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=39;MMLQ=29;MQ=57.57;NF=3;NR=0;PP=31;QD=21.9237375157;SC=ATTTTTTTGCCCTCCTTTCTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=3;WE=105742249;WS=105742238;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr12	105789562	rs1534253	C	T	595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-5.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.958;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=409;ReadPosRankSum=1.135;SC=CTGACTTTGGCAAGCAGAATG;SOR=0.089;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=22;WE=105789570;WS=105789552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,24:0.59:41
chr12	106461760	rs3741884	G	A	2383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=50;PP=1440;ReadPosRankSum=2.510;SC=AAAAAGAATCGGGCATTATGT;SOR=0.665;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=221;TCF=110;TCR=111;TR=100;WE=106461768;WS=106461750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,118:0.48:246
chr12	106464785	rs4964437	G	C	612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.738;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=19;PP=433;ReadPosRankSum=0.560;SC=ACCCCCAGCAGCCCCAGGAAC;SOR=1.179;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=48;TCF=13;TCR=35;TR=25;WE=106464793;WS=106464775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,26:0.54:48
chr12	106480450	rs2251027	A	G	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=43;ReadPosRankSum=1.279;SC=TAATAGGAAAAAAATCATGCA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=4;WE=106480458;WS=106480444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr12	106500158	rs35769739	GT	G	291.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.934;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=33;PP=1109;ReadPosRankSum=1.219;SC=TGATATGGGGGTTAAAAAAAA;SOR=1.589;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=71;TCF=17;TCR=54;TR=42;WE=106500170;WS=106500142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,21:0.31:67
chr12	106532072	rs1215597	C	A	449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=2;PP=391;SC=CGGGGCTTCCCAATGAGCCCC;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=106532080;WS=106532062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	106641489	rs368519473	GGGC	G	121.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=17.39;ReadPosRankSum=0.842;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr12	106647783	rs2704898	T	G	2024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.576;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=39;PP=1201;ReadPosRankSum=-0.098;SC=AAATCAGACATCTCAGTCCGA;SOR=0.657;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=169;TCF=93;TCR=76;TR=84;WE=106647791;WS=106647773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,93:0.52:178
chr12	106704974	rs4964460	G	A	2742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=53;PP=1531;ReadPosRankSum=-0.759;SC=GCAGAGCTTTGCAAGTGACTC;SOR=0.441;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=95;TCF=40;TCR=55;TR=93;WE=106704982;WS=106704964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,105:0.99:106
chr12	106708278	rs2253838	T	G	2651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.32;MQRankSum=0.289;QD=26.00;ReadPosRankSum=-1.316;SOR=1.167;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,100:0.98:102
chr12	106708352	.	TGTGAGAGAGA	T	219	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=42;MMLQ=28;MQ=58.74;NF=1;NR=11;PP=219;QD=18.5;SC=TGTGTGTGTGTGTGAGAGAGA;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=12;WE=106708381;WS=106708340;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:10,12:0.55:22
chr12	106708354	rs138352358	TGAGAGAGA	T	193.82	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=64.03;QD=32.30;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	106717224	rs12424952	C	A	939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=0;PP=681;SC=GAACATAGATCATTGTTAGTG;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=106717232;WS=106717214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	106717490	rs200010594	TTTAAA	T	262.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.54;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	106723190	rs11112940	A	G	1709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=33;PP=1016;SC=AGCCTGTGAGAGTGAAGTCTC;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=18;TCR=33;TR=51;WE=106723198;WS=106723180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr12	106751805	rs61943670	G	A	445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=11;PP=301;SC=TGCTCGGGCCGCCAAGGGGGC;SOR=2.049;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=15;WE=106751813;WS=106751795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	106763013	rs7134881	C	T	2367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=23;PP=1504;SC=TTATGATCTTCGAAGAAGTAT;SOR=1.882;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=52;TCR=23;TR=75;WE=106763021;WS=106763003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr12	106763268	rs7135054	A	G	4604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=61;PP=2945;SC=TTCAATGTGGACCATAATTCT;SOR=1.008;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=149;TCF=88;TCR=61;TR=149;WE=106763276;WS=106763258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr12	106773676	rs7310703	A	C	563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=2;PP=483;SC=TTTTTAAAGTACTTATTAGAA;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=106773684;WS=106773666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	106831283	rs11112993	G	A	207.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=113;SC=TATTTCAGCAGTTTGTGGTTA;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=106831291;WS=106831273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	106890059	rs721438	C	T	1332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=26;PP=714;SC=AGCTCTTCTGCCCCTTGCCAG;SOR=2.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=11;TCR=26;TR=37;WE=106890067;WS=106890049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr12	106890135	rs2288270	A	G	87.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.76;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr12	106893863	rs7137638	G	T	2512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=57;NR=29;PP=1369;SC=CCTGTCGGGCGCTCTGTGTCC;SOR=1.265;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=57;TCR=29;TR=86;WE=106893871;WS=106893853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr12	106893930	rs7137444	A	T	4707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=88;NR=65;PP=2555;SC=CGTTGTGTGGATTAAGTAGCA;SOR=0.859;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=153;TCF=88;TCR=65;TR=153;WE=106893938;WS=106893920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr12	106994965	rs7311507	T	C	1073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=13;PP=673;SC=AGGCCACAGCTGCTGGCTTCC;SOR=1.445;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=26;TCR=13;TR=39;WE=106994973;WS=106994955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr12	106995136	rs7295853	G	C	1608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=33;PP=772;SC=TAATGACCAGGGCCCAGGGAC;SOR=1.306;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=58;TCF=24;TCR=34;TR=57;WE=106995144;WS=106995126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr12	107033047	rs10861641	A	G	1939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.074;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=16;PP=1310;ReadPosRankSum=-1.212;SC=GAGAGTCGAGAGGACTTTTAC;SOR=1.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=64;TCF=47;TCR=17;TR=62;WE=107033055;WS=107033037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,68:0.97:70
chr12	107078448	rs10467029	C	T	1356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=11;PP=904;SC=CTGAAGCCACCGGAACCATGC;SOR=2.030;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=34;TCR=11;TR=45;WE=107078456;WS=107078438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr12	107078562	rs5800715	A	AAAG	7827.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=64;PP=2965;SC=CGCTCAGCACAAAGAATTTTC;SOR=0.764;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=94;TCF=21;TCR=73;TR=85;WE=107078570;WS=107078552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr12	107080617	rs56287989	CTTT	C	2191.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=21;NR=24;PP=576;SC=GGGTCTCTCTCTTTTTTTTTT;SOR=1.662;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=21;TCR=24;TR=45;WE=107080648;WS=107080607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr12	107080638	rs55658229	TCC	T	2710.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.17;QD=41.70;SOR=1.539;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr12	107083031	rs9804754	G	A	4321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=47;PP=2588;SC=ATTAATGTATGTCTTTGTTGT;SOR=1.478;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=140;TCF=93;TCR=47;TR=140;WE=107083039;WS=107083021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr12	107090201	rs10778502	T	C	3791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=75;PP=2115;SC=TGATGCCCACTGTGCTGCAGG;SOR=1.195;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=53;TCR=75;TR=128;WE=107090209;WS=107090191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr12	107126065	rs7307472	A	G	5064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=102;PP=2965;SC=ACCACTTGGTAATGTTATTTG;SOR=1.325;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=166;TCF=64;TCR=102;TR=166;WE=107126073;WS=107126055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr12	107144328	rs12424114	A	G	2254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.67;SOR=2.630;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr12	107364873	rs10778520	C	T	2732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=30;PP=1698;SC=ATGATATTTTCTCTCATTAGG;SOR=1.384;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=61;TCR=30;TR=91;WE=107364881;WS=107364863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
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chr12	107395106	rs8192440	A	G	1677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.006;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=43;PP=1071;ReadPosRankSum=-1.002;SC=CAGTTTCTCCACCTGGCCACA;SOR=0.601;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=221;TCF=122;TCR=99;TR=91;WE=107395114;WS=107395096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,98:0.40:242
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chr12	107713542	rs79492704	C	T	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=22;PP=581;ReadPosRankSum=0.399;SC=CAGGCCCGAGCTCGGGCCCTG;SOR=0.894;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=47;TCF=13;TCR=34;TR=30;WE=107713550;WS=107713532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,31:0.66:47
chr12	107714310	rs11383016	T	TC	651.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.620;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.850;NF=17;NR=4;PP=715;ReadPosRankSum=0.682;SC=TGCTCCCACTTCCCCACTCCC;SOR=1.352;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=37;TCF=29;TCR=8;TR=21;WE=107714318;WS=107714300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,25:0.61:41
chr12	107914141	rs1861586	C	T	100.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=0;PP=74;SC=CCTACATTGGCTTTCTTTGCA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=107914149;WS=107914131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr12	108003911	rs4964599	T	C	2565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=25;PP=1655;SC=CGGAGTTTGCTCCTGTGCCCC;SOR=1.511;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=61;TCR=25;TR=86;WE=108003919;WS=108003901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr12	108008772	rs10492158	C	T	525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=330;ReadPosRankSum=0.494;SC=GCCACAGATACGTCAAATTTG;SOR=0.650;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=43;TCF=38;TCR=5;TR=21;WE=108008780;WS=108008762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,24:0.49:49
chr12	108012040	rs150221761	G	A	1526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.204;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=39;PP=851;ReadPosRankSum=-0.805;SC=AGACAGCCCCGCCCCCCTTGT;SOR=0.836;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=154;TCF=73;TCR=81;TR=71;WE=108012048;WS=108012030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,79:0.46:172
chr12	108029186	rs73187339	C	A	683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=16;PP=494;ReadPosRankSum=-2.974;SC=TTCCCCCAGGCCTGTGTTGGC;SOR=0.776;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=22;TCR=33;TR=27;WE=108029194;WS=108029176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,30:0.49:61
chr12	108045336	rs2241185	T	C	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.097;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=344;ReadPosRankSum=-1.211;SC=GTCCCCTACCTGTGACACTGC;SOR=0.449;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=63;TCF=49;TCR=14;TR=25;WE=108045344;WS=108045326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,28:0.42:67
chr12	108086697	rs2287216	T	C	2374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=24;PP=1376;SC=ACATCTTTTTTCTAATTATGC;SOR=1.375;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=46;TCR=24;TR=70;WE=108086705;WS=108086687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr12	108090518	rs2287214	A	G	55.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.43;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr12	108127965	rs17306603	A	G	1375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=13;PP=850;SC=TTTTCATCCAAAATTGCTTGT;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=31;TCR=13;TR=44;WE=108127973;WS=108127955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr12	108136172	rs2302734	A	G	3818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=71;PP=2050;SC=TTTGAAATGCATACTAAGTAC;SOR=1.644;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=113;TCF=42;TCR=71;TR=113;WE=108136180;WS=108136162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr12	108140032	rs3803120	T	C	4779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=101;NR=56;PP=2965;SC=AATAGTGTTTTACAGTTCCAA;SOR=1.227;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=157;TCF=101;TCR=56;TR=157;WE=108140040;WS=108140022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr12	108147982	rs4964617	C	T	207.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=174;SC=GGTTTTTACACATGGGCAAAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=108147990;WS=108147972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	108150758	rs1814335	C	A	2141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=38;PP=1242;SC=AAAGAGCACACACAACTAGTT;SOR=1.068;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=33;TCR=38;TR=71;WE=108150766;WS=108150748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr12	108154199	rs2302733	A	G	10290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=382;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=175;NR=175;PP=2965;SC=AATGGCACCAAAAACAACGGC;SOR=0.736;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=351;TCF=175;TCR=176;TR=350;WE=108154207;WS=108154189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,380:1.00:380
chr12	108600237	rs1106752	A	G	3446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=68;PP=2058;SC=TCAGATTCCCACCTGTGGTAT;SOR=1.252;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=115;TCF=47;TCR=68;TR=115;WE=108600245;WS=108600227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr12	108618630	rs3764002	C	T	5701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=81;NR=116;PP=2965;SC=GACTTCTGCACTGAGAAGGTG;SOR=1.211;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=198;TCF=81;TCR=117;TR=197;WE=108618638;WS=108618620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr12	108686549	rs192034694	A	G	2626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.026;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=54;PP=1488;ReadPosRankSum=0.827;SC=GAAGGTGGCAATGATGATCAC;SOR=0.770;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=195;TCF=96;TCR=99;TR=103;WE=108686557;WS=108686539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,120:0.54:223
chr12	108913380	.	TTA	T	53	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=33;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=1;NR=4;PP=53;QD=16.2;SC=TGTTTTAGTTTTAAAAAAAAA;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=5;WE=108913389;WS=108913370;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,5:0.45:11
chr12	108917520	.	G	GA	203	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5020;HP=11;HapScore=3;MGOF=25;MMLQ=15;MQ=61.07;NF=0;NR=18;PP=203;QD=11.7777777778;SC=GTTAAAAGGTGAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=18;WE=108917528;WS=108917510;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:13,18:0.58:31
chr12	108918146	rs2303633	C	T	1681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=17;PP=995;SC=TCCTGGTCTCCGGCTTCTCTG;SOR=1.392;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=39;TCR=17;TR=56;WE=108918154;WS=108918136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr12	108918330	rs2303632	G	T	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=17;PP=349;ReadPosRankSum=-1.142;SC=GCAGACTAGGGACGCAACCTC;SOR=0.685;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=57;TCF=22;TCR=35;TR=27;WE=108918338;WS=108918320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,29:0.48:61
chr12	108919390	rs7963063	T	C	1666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.365;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=40;PP=1120;ReadPosRankSum=-0.337;SC=TGAACACCTATAGGAAGAAGG;SOR=0.972;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=161;TCF=82;TCR=79;TR=74;WE=108919398;WS=108919380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,81:0.43:188
chr12	108923950	rs1549096	A	G	7643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=130;NR=129;PP=2965;SC=CTTTCTCATCATCCTCATCTG;SOR=0.817;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=259;TCF=130;TCR=129;TR=259;WE=108923958;WS=108923940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,289:1.00:289
chr12	108924904	rs2287549	C	T	2143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-2.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.550;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=34;PP=1301;ReadPosRankSum=2.762;SC=TGTAAAACATCTTGACAAGAA;SOR=0.634;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=161;TCF=104;TCR=57;TR=87;WE=108924912;WS=108924894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,100:0.53:188
chr12	108931779	rs2287550	C	A	1743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.423;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=21;PP=1112;ReadPosRankSum=0.931;SC=GACTTTGTCACCGCTCTCTGT;SOR=1.024;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=184;TCF=125;TCR=59;TR=76;WE=108931787;WS=108931769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,82:0.41:199
chr12	108932053	rs2287551	C	T	704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=20;PP=520;SC=ATTGCCAGCACGACCAAGTGA;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=108932061;WS=108932043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	108932916	rs7133076	C	T	2195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=47;PP=1332;SC=GGAAGCACAACACATCTGCAA;SOR=1.893;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=22;TCR=47;TR=69;WE=108932924;WS=108932906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr12	108936428	rs11113982	T	C	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.525;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.56;ReadPosRankSum=-0.635;SOR=0.086;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr12	108936516	rs888556	T	G	4278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.57;SOR=1.190;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr12	108936519	rs888557	C	T	4311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.45;SOR=1.156;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr12	108943028	rs2052423	G	A	1908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=39;PP=1122;SC=TTAAAACACCGTCATCAAGTA;SOR=1.418;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=25;TCR=39;TR=64;WE=108943036;WS=108943018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr12	108954502	rs1160332	G	A	1444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=11;PP=887;SC=GTCACGAAAAGCGGGTTTGCA;SOR=1.848;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=34;TCR=11;TR=45;WE=108954510;WS=108954492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr12	108954823	rs1063936	C	T	6685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.171;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=113;NR=93;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.672;SC=ATAACACCTTCCTCCTTGTCC;SOR=0.354;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=207;TCF=113;TCR=94;TR=206;WE=108954831;WS=108954813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,246:1.00:247
chr12	108956357	rs2287554	C	T	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=179;ReadPosRankSum=0.131;SC=GCGCCCCGCCCCTCGGCGTCG;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=9;WE=108956365;WS=108956347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr12	108956417	rs10778647	TT	GG	3555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.55;NF=53;NR=14;PP=1469;SC=GGCTGGGGCTTTCCGTCTGAG;SOR=2.185;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=74;TCF=56;TCR=18;TR=67;WE=108956426;WS=108956407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr12	108956433	rs2287555	C	T	4130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=26;PP=1804;SC=CTGAGGCGGGCGGCATCGGCT;SOR=1.779;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=62;TCR=26;TR=88;WE=108956441;WS=108956423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr12	108956526	rs60547936	A	AG	7264.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=14;NR=80;PP=2975;SC=GGGACAAAAGAGGGACGCGCG;SOR=0.904;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=102;TCF=14;TCR=88;TR=94;WE=108956534;WS=108956516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr12	108956610	rs2287556	C	G	1979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=45;PP=1301;SC=TGGGAGCTGTCCCCTCCCACG;SOR=2.139;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=16;TCR=45;TR=61;WE=108956618;WS=108956600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr12	108960906	rs10861945	G	T	526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=3;PP=407;SC=TTTTTTATTGGCTGGCCCTCA;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=108960914;WS=108960896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	108961293	rs888546	C	T	859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=19;PP=633;SC=ATTTCTAAACCTCACAAATAT;SOR=1.536;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=10;TCR=19;TR=29;WE=108961301;WS=108961283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	108961354	rs888547	T	C	1661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=19;PP=1007;SC=ATGAGGAAGCTAAGGCTTGGG;SOR=1.217;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=32;TCR=19;TR=51;WE=108961362;WS=108961344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr12	108961383	rs888548	A	G	2468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=24;PP=1389;SC=CCCACATCACATGGCTAATAA;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=57;TCR=24;TR=81;WE=108961391;WS=108961373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr12	108985945	rs7975237	A	G	2091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=45;PP=1127;ReadPosRankSum=0.623;SC=CCCCAGGGTTATGGGCTGGGG;SOR=0.730;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=75;TCR=90;TR=84;WE=108985953;WS=108985935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,100:0.54:186
chr12	108986031	rs74504010	C	T	768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.097;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=20;PP=552;ReadPosRankSum=-1.128;SC=AGCCCTCGGCCTCCCCACTAC;SOR=0.968;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=55;TCF=18;TCR=37;TR=29;WE=108986039;WS=108986021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,31:0.54:57
chr12	109017650	rs63748999	GGAGTGGTCTGTGCCTCCGTGGGCACTGGTT	G	2663.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FS=4.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.09;MQRankSum=7.248;QD=13.39;ReadPosRankSum=0.262;SOR=1.001;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:125,74:0.37:199
chr12	109025432	rs8179115	T	C	797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.51;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=1;PP=523;SC=CCCCCCTCCCTACCCTCCACC;SOR=3.611;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=109025440;WS=109025431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	109052794	rs374484534	CAG	C	53.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=3.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.28;MQRankSum=-0.344;QD=1.68;ReadPosRankSum=-0.133;SOR=0.080;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,5:0.16:32
chr12	109194449	rs3217206	TC	T	153.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=4;NR=1;PP=135;SC=CCCGTTAGGATCCCCCCTCCC;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=5;WE=109194457;WS=109194439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	109219856	.	TA	T	278.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=0.000;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=6.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.97;ReadPosRankSum=-0.773;SOR=1.519;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,24:0.26:94
chr12	109277492	rs11114083	C	A	1035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.431;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=21;PP=614;ReadPosRankSum=-1.875;SC=AGGGGCTGTCCCCTAAGCCCC;SOR=0.533;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=109;TCF=53;TCR=56;TR=47;WE=109277500;WS=109277482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,52:0.42:123
chr12	109278747	rs2111902	T	G	3111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=53;PP=1883;ReadPosRankSum=0.446;SC=GGTGATGATGTTGTGCCTCAA;SOR=0.727;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=224;TCF=128;TCR=96;TR=126;WE=109278755;WS=109278737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,139:0.57:243
chr12	109281310	rs7980427	G	A	2567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.441;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=66;PP=1666;ReadPosRankSum=-0.596;SC=TCCTAATCTCGGGCTACAACC;SOR=0.724;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=248;TCF=113;TCR=135;TR=119;WE=109281318;WS=109281300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,126:0.46:275
chr12	109288202	rs75607844	A	C	1442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.917;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=28;PP=791;ReadPosRankSum=0.482;SC=CTGCATGCTTATTTCATCCCT;SOR=0.496;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=128;TCF=61;TCR=67;TR=59;WE=109288210;WS=109288192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,70:0.48:147
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chr12	109293320	rs3918347	A	G	490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=298;ReadPosRankSum=-1.048;SC=TTTTCAGGGAACAGTCATGTC;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=16;WE=109293328;WS=109293310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr12	109294397	.	C	A	1239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.746;ClippingRankSum=0.000;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=34;PP=695;ReadPosRankSum=-1.042;SC=TAAGCCATTGCTTCTCCCTCA;SOR=0.725;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=107;TCF=42;TCR=65;TR=55;WE=109294405;WS=109294387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,60:0.52:116
chr12	109309424	rs4964773	T	C	1138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.679;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=22;PP=725;ReadPosRankSum=1.738;SC=ATTTCTTCTGTCCTCGGGTGT;SOR=0.811;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=111;TCF=62;TCR=49;TR=50;WE=109309432;WS=109309414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,55:0.44:125
chr12	109309762	rs11834711	T	C	561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=3.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.980;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=425;ReadPosRankSum=1.970;SC=GGCAAATCCCTCCAGTGCTGG;SOR=1.532;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=20;WE=109309770;WS=109309752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
chr12	109330915	rs10861986	G	A	1161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.403;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=13;PP=673;ReadPosRankSum=-0.527;SC=GATGATGTTCGAACTACTGAA;SOR=0.246;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=92;TCF=73;TCR=19;TR=48;WE=109330923;WS=109330905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,54:0.50:107
chr12	109331162	rs3918305	C	T	1674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.055;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=49;PP=1164;ReadPosRankSum=1.990;SC=TACAGATGCACGGGAGATGGG;SOR=0.901;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=147;TCF=58;TCR=89;TR=77;WE=109331170;WS=109331152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,78:0.50:157
chr12	109334733	rs150503625	C	G	490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=406;ReadPosRankSum=1.940;SC=ATGGTCCATACAGAGAGGAAT;SOR=0.826;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=19;WE=109334741;WS=109334723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr12	109338835	rs36131538	C	T	697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.548;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=5;PP=367;ReadPosRankSum=-0.029;SC=AACCTCCTGCCGGAATCCACA;SOR=0.391;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=57;TCF=47;TCR=10;TR=26;WE=109338843;WS=109338825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,31:0.49:63
chr12	109339023	rs36191519	C	T	2134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=49;PP=1207;ReadPosRankSum=-1.165;SC=AATTTGCAGCCGACATTCCTC;SOR=0.696;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=178;TCF=79;TCR=99;TR=88;WE=109339031;WS=109339013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,101:0.52:195
chr12	109354632	rs36181716	T	C	987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=8;PP=730;SC=TAACTCCTGATCCAGACCATG;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=32;WE=109354640;WS=109354622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr12	109354843	rs36139385	G	A	2385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.583;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=59;PP=1600;ReadPosRankSum=-1.076;SC=AGGAAGACACGGAATCACAAG;SOR=0.807;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=216;TCF=93;TCR=123;TR=101;WE=109354851;WS=109354833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,112:0.47:238
chr12	109371381	rs149284306	C	A	1272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.609;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=32;PP=728;ReadPosRankSum=1.218;SC=CCCTCTCTACCCATTGCCAAG;SOR=0.948;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=103;TCF=39;TCR=64;TR=50;WE=109371389;WS=109371371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,55:0.50:110
chr12	109371442	rs36182807	G	T	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=168;ReadPosRankSum=-0.208;SC=TTAAAACCATGCATTACCATT;SOR=0.430;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=11;WE=109371450;WS=109371432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr12	109458559	rs138861157	A	ACC	272.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.45;ReadPosRankSum=0.000;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,13:0.26:50
chr12	109490401	rs2304266	C	T	472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=269;ReadPosRankSum=0.259;SC=GTTCCGCTGTCTCGGGAACCG;SOR=0.864;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=18;WE=109490409;WS=109490391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,21:0.66:32
chr12	109490601	rs2304267	C	T	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=15;PP=378;ReadPosRankSum=-2.003;SC=CCGAAGAGGCCGGGACCAGGG;SOR=0.792;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=60;TCF=30;TCR=30;TR=27;WE=109490609;WS=109490591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,29:0.43:67
chr12	109510086	rs111762860	G	GT	130.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=1.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.95;ReadPosRankSum=-0.045;SOR=1.049;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,14:0.21:67
chr12	109511144	rs7967182	T	C	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.269;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=262;ReadPosRankSum=-0.043;SC=TATTTTTTCTTAAGAGGTAGT;SOR=0.468;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=32;TCR=11;TR=19;WE=109511152;WS=109511134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,22:0.45:49
chr12	109511256	rs7967322	T	C	2047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=36;PP=1253;ReadPosRankSum=0.270;SC=CACCTCACCCTACATCCAATC;SOR=0.723;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=221;TCF=132;TCR=89;TR=92;WE=109511264;WS=109511246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,103:0.43:241
chr12	109530278	rs145676752	G	GCA	989.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=7.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.08;MQRankSum=1.251;QD=8.76;ReadPosRankSum=-1.543;SOR=1.418;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,39:0.35:113
chr12	109547586	.	A	AAAT	634.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.582;ClippingRankSum=0.000;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.94;MQRankSum=7.902;QD=8.35;ReadPosRankSum=-0.919;SOR=0.581;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,25:0.33:76
chr12	109577952	rs4766494	T	C	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.319;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=257;ReadPosRankSum=-0.999;SC=TTGATCAAGCTGTTTGCTGAT;SOR=0.372;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=44;TCF=12;TCR=32;TR=22;WE=109577960;WS=109577942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
chr12	109605898	rs34285	C	T	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.069;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=15;PP=284;ReadPosRankSum=0.184;SC=CCCTCGCCTCCTTCCCCTGTG;SOR=0.971;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=63;TCF=26;TCR=37;TR=25;WE=109605906;WS=109605888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,27:0.41:66
chr12	109617865	rs11065772	T	C	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.707;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=104;ReadPosRankSum=-0.765;SC=TGATTGCTGATGTTAATCTGC;SOR=0.506;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=22;TCF=10;TCR=12;TR=10;WE=109617873;WS=109617855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr12	109634834	rs17848802	A	G	1245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.427;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=19;PP=630;ReadPosRankSum=-2.323;SC=GTCTCTGACCATGTTCGTTCT;SOR=0.474;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=110;TCF=74;TCR=36;TR=54;WE=109634842;WS=109634824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,61:0.50:121
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chr12	109635076	rs2268392	T	C	472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=259;ReadPosRankSum=-1.097;SC=GGTGCCTTTCTGGTAAATTCT;SOR=0.683;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=57;TCF=16;TCR=41;TR=24;WE=109635084;WS=109635066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,25:0.44:57
chr12	109637188	rs7299171	G	C	2209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.155;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=44;PP=1497;ReadPosRankSum=1.855;SC=CTCCCTACCCGACTCCTCCTC;SOR=0.488;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=186;TCF=107;TCR=79;TR=96;WE=109637196;WS=109637178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,103:0.50:206
chr12	109639521	rs2284691	G	A	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.454;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=350;ReadPosRankSum=0.447;SC=GTGGCTCCACGGCCCAAGTGC;SOR=2.400;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=17;WE=109639529;WS=109639511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr12	109650546	rs2300454	T	C	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=203;ReadPosRankSum=-0.169;SC=GGACCAGTGCTCGTTTGGGTA;SOR=0.493;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=38;TCF=30;TCR=8;TR=15;WE=109650554;WS=109650536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,17:0.41:41
chr12	109658070	rs2300452	G	A	1357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.653;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=31;PP=818;ReadPosRankSum=-0.044;SC=TTATTCTTCTGACTTTCTTGG;SOR=0.603;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=116;TCF=51;TCR=65;TR=59;WE=109658078;WS=109658060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,66:0.50:131
chr12	109660578	rs11065873	C	T	1063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.227;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=13;PP=774;ReadPosRankSum=0.154;SC=TGGCTCACGCCAGCGCCCCCA;SOR=1.185;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=92;TCF=62;TCR=30;TR=47;WE=109660586;WS=109660568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,46:0.51:91
chr12	109670468	rs3742027	T	C	9389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=178;NR=134;PP=2965;SC=TGCCATCACCTTACAGGATGA;SOR=0.872;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=312;TCF=178;TCR=134;TR=312;WE=109670476;WS=109670458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,349:1.00:349
chr12	109671701	rs7974040	C	T	3319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.845;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=75;PP=2022;ReadPosRankSum=-0.320;SC=TGGGCCGTGGCCCCCAGGCTT;SOR=0.770;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=294;TCF=141;TCR=153;TR=143;WE=109671709;WS=109671691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,161:0.50:322
chr12	109671738	rs34708647	C	A	1936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.132;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=47;PP=1077;ReadPosRankSum=-0.221;SC=GCTTCTCCCTCTCAGAGCCTC;SOR=0.597;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=177;TCF=72;TCR=105;TR=83;WE=109671746;WS=109671728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,95:0.48:199
chr12	109675029	rs2241220	T	C	7063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=141;NR=96;PP=2965;ReadPosRankSum=1.302;SC=AGCTGGAACTTAACCGGATGC;SOR=0.379;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=238;TCF=142;TCR=96;TR=237;WE=109675037;WS=109675019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,262:1.00:263
chr12	109683575	rs10744772	A	G	2960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=58;PP=1739;SC=GCGGAGCCTAACCCCTGGCTG;SOR=1.365;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=96;TCF=38;TCR=58;TR=96;WE=109683583;WS=109683565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr12	109685545	rs2284689	A	G	1663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=36;PP=1020;SC=AATTTTGCTCATGGTTAATTT;SOR=1.270;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=24;TCR=36;TR=60;WE=109685553;WS=109685535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr12	109691991	rs2075259	A	G	9311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=338;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=175;NR=134;PP=2965;SC=ACCACAGACTAAGTCAGAGAC;SOR=0.928;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=309;TCF=175;TCR=134;TR=309;WE=109691999;WS=109691981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,338:1.00:338
chr12	109693982	rs3742023	C	T	2739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.257;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=51;PP=1645;ReadPosRankSum=-1.414;SC=TCTTTGACCACGGCAGTTTCA;SOR=0.888;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=256;TCF=142;TCR=114;TR=122;WE=109693990;WS=109693972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,134:0.48:278
chr12	109694230	rs10849967	T	G	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.205;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.596;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=161;ReadPosRankSum=-0.292;SC=TCAGCCAGCCTCCTCCTGAGG;SOR=1.802;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=9;WE=109694238;WS=109694220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr12	109695891	rs11066004	A	G	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.142;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.233;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=89;ReadPosRankSum=-0.639;SC=AAAGGGCACCAATAGGTCTGC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=7;WE=109695899;WS=109695881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr12	109696838	rs2075260	G	A	10774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=406;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=199;NR=183;PP=2965;SC=CGCCCAGGCCGTCAAGGACTT;SOR=0.744;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=382;TCF=199;TCR=183;TR=382;WE=109696846;WS=109696828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,404:1.00:404
chr12	109697796	rs2075261	A	G	4559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=82;NR=71;PP=2779;SC=CCGAGGTAAGAGTCTGATGAG;SOR=0.791;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=153;TCF=82;TCR=71;TR=153;WE=109697804;WS=109697786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr12	109701959	rs35795929	CA	C	466.70	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=2.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.81;ReadPosRankSum=1.403;SOR=1.003;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,37:0.70:53
chr12	109704177	rs2075262	G	A	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=314;ReadPosRankSum=0.105;SC=ACCGTGGCCCGCCCAGCCACT;SOR=0.538;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=51;TCF=14;TCR=37;TR=22;WE=109704185;WS=109704167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,24:0.44:55
chr12	109717697	rs10774641	A	G	1758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.042;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=37;PP=1210;ReadPosRankSum=1.983;SC=AGTGTGTCCAAGCTGAATCCC;SOR=0.593;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=204;TCF=112;TCR=92;TR=79;WE=109717705;WS=109717687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,88:0.38:233
chr12	109723077	rs10774643	T	C	241.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.31;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	109723077	.	TGT	CGC	234	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=5;NR=1;PP=234;QD=47.911312477;SC=TGTGTGTGTGTGTGCGCGCAC;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=6;WE=109723087;WS=109723067;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,6:0.75:8
chr12	109723079	rs10774644	T	C	241.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.31;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	109826634	rs11611277	C	A	5567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=109;PP=2965;SC=AGCGTTTCAGCGAGAACCTCA;SOR=1.081;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=191;TCF=82;TCR=109;TR=191;WE=109826642;WS=109826624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr12	109831344	.	T	TCATCCAACCATTCATCCATCCATCCATC	954	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=68.25;NF=0;NR=27;PP=954;QD=35.5555555556;SC=GTCCATCCATTCATCCATCCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=27;WE=109831364;WS=109831334;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:7,27:0.79:34
chr12	109831348	.	C	CCAACCATT	442.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=68.56;QD=44.27;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	109831356	.	C	T	232	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=65.96;NF=0;NR=9;PP=232;QD=29.6412458386;SC=ATCCATCCATCCATCCATCCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=109831364;WS=109831334;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	109831356	.	C	CCATCCATCCATCCATCCATT	436.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=68.03;QD=39.70;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	109835590	rs11611358	A	G	8945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=148;NR=147;PP=2965;SC=GATTTGGGAAATACATGGATA;SOR=0.730;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=295;TCF=148;TCR=147;TR=295;WE=109835598;WS=109835580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,330:1.00:330
chr12	109843594	rs9888353	G	A	1256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=5;PP=775;SC=TGGTTCTGTGGGCTCAGGTGT;SOR=2.356;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=37;WE=109843602;WS=109843584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr12	109844432	rs11066505	A	G	647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=4;PP=385;SC=TCCAGCCTGGATGACAGAGTG;SOR=2.636;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=17;WE=109844440;WS=109844422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr12	109844702	rs12425103	C	T	1111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=28;PP=790;SC=GCCAGCCCTCCCTGCTGCTGC;SOR=2.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=35;WE=109844710;WS=109844692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	109845660	rs117442521	T	A	3966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=399;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.360;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.289;NF=89;NR=91;PP=2299;ReadPosRankSum=0.606;SC=GCAAAGGCTGTTTATGGACGA;SOR=0.714;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=364;TCF=181;TCR=183;TR=180;WE=109845668;WS=109845650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:202,196:0.49:398
chr12	109845778	rs75978659	C	CATT	6890.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=61.05;NF=6;NR=73;PP=2967;SC=TTATAATCATCGTTTCTTTAA;SOR=1.493;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=84;TCF=6;TCR=78;TR=79;WE=109845786;WS=109845768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr12	109848000	rs7967632	C	G	376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=9;PP=278;SC=AGGCTGGAGTCCAGTGGCACA;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=109848008;WS=109847990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	109848567	rs7315991	T	C	3860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=64;PP=2347;SC=GAATCATATCTATTCTGGTGA;SOR=0.809;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=131;TCF=67;TCR=64;TR=131;WE=109848575;WS=109848557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr12	109849535	rs2196612	A	G	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.24;ReadPosRankSum=-0.059;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr12	109849540	rs7316486	A	G	656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.89;ReadPosRankSum=-1.077;SOR=1.382;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr12	109849552	rs5800859	C	CCT	921.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=4.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.77;MQRankSum=1.493;QD=21.95;ReadPosRankSum=0.064;SOR=0.157;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,25:0.60:42
chr12	109853306	rs4766598	A	G	1433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.490;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=22;PP=807;ReadPosRankSum=0.953;SC=AGAAAGTTCAACTCGTGTCTA;SOR=0.518;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=103;TCF=65;TCR=38;TR=55;WE=109853314;WS=109853296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,65:0.54:120
chr12	109853462	rs4766471	G	A	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=360;ReadPosRankSum=-1.581;SC=AGCCATGTATGTGCCCAGCCT;SOR=0.813;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=21;WE=109853470;WS=109853452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,24:0.59:41
chr12	109858665	rs11066538	G	A	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=30;ReadPosRankSum=0.189;SC=CCAAGGTTGAGAAACTATGAG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=3;WE=109858673;WS=109858655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr12	109859032	rs5800861	G	GC	216.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.09;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	109863721	rs67083809	TTC	T	1536.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=17;PP=1136;ReadPosRankSum=0.726;SC=CTCTGGCTCGTTCTCTCTCTC;SOR=0.695;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=25;TCR=36;TR=29;WE=109863742;WS=109863711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,49:0.54:91
chr12	109873042	.	C	T	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.057;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=70;ReadPosRankSum=-2.200;SC=AAACTAGGAACGAGATATGGG;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=5;WE=109873050;WS=109873032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr12	109874230	rs2075432	A	G	4473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=61;PP=2633;SC=ACCCCTGGAGATCACAACCAC;SOR=1.004;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=149;TCF=88;TCR=61;TR=149;WE=109874238;WS=109874220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr12	109879972	rs78063180	C	T	2172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.780;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=35;PP=1214;ReadPosRankSum=0.341;SC=GACTTTTCCACAGGATTGGTA;SOR=0.544;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=185;TCF=116;TCR=69;TR=95;WE=109879980;WS=109879962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,105:0.52:202
chr12	109883254	rs3742020	T	C	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.073;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=94;ReadPosRankSum=-1.474;SC=ATTTCTTCTGTAGACCAAAGG;SOR=0.036;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=8;WE=109883262;WS=109883244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr12	109883374	rs3825393	T	C	4769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=70;PP=2661;SC=GACACTGGACTGGAAGAACAA;SOR=0.909;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=167;TCF=97;TCR=70;TR=166;WE=109883382;WS=109883364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr12	109883577	rs7969719	C	T	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.821;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=279;ReadPosRankSum=0.562;SC=CAGGAAGAAACTGATATAGAG;SOR=1.981;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=14;WE=109883585;WS=109883567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr12	109889704	rs11282253	A	AATCAGG	768.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=865;ReadPosRankSum=0.764;SC=CGCCAGGCTAAATCAGGCCCC;SOR=0.844;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=13;WE=109889712;WS=109889694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
chr12	109893797	rs2302707	G	A	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.748;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=228;ReadPosRankSum=0.837;SC=TTTTAAGGATGAGCAATCACA;SOR=0.034;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=14;WE=109893805;WS=109893787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr12	109894028	rs2302706	A	G	4645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=422;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.518;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=101;PP=2962;ReadPosRankSum=0.692;SC=CATCCCCAATAACATCCTTTA;SOR=0.669;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=386;TCF=189;TCR=197;TR=202;WE=109894036;WS=109894018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:203,219:0.52:422
chr12	109895636	rs4766605	C	A	682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.537;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=15;ReadPosRankSum=-0.179;SC=CCACATGACCCAATAGCAGGG;SOR=0.101;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=52;TCF=16;TCR=36;TR=26;WE=109895644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,28:0.52:54
chr12	109895958	rs11609019	G	A	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=307;ReadPosRankSum=0.838;SC=CGGCTGGACAGGCTCTGGCGA;SOR=0.760;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=16;WE=109895966;WS=109895948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
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chr12	109907308	rs80095910	G	C	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=9;PP=753;ReadPosRankSum=1.052;SC=GGCACATGGTGGGTGAGCTTA;SOR=0.735;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=32;TCR=16;TR=26;WE=109907316;WS=109907293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,30:0.56:54
chr12	109907670	rs12819658	A	T	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.579;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=229;ReadPosRankSum=1.184;SC=TCCAATGTGGACAACTAAGGA;SOR=0.031;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=37;TCF=3;TCR=34;TR=16;WE=109907678;WS=109907660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,17:0.46:37
chr12	109927827	rs73196268	C	A	2061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.267;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=49;PP=1206;ReadPosRankSum=-1.435;SC=ACTCCTGCCCCCCAGTGTGCA;SOR=0.771;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=205;TCF=106;TCR=99;TR=95;WE=109927835;WS=109927817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,104:0.46:225
chr12	109928013	rs7976796	C	T	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.876;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=4;PP=92;ReadPosRankSum=-0.120;SC=GTGCTGGGATCCCTTGAATGC;SOR=0.132;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=7;WE=109928021;WS=109928003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr12	109935894	rs2270361	G	C	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=475;ReadPosRankSum=-0.032;SC=GCCCAAAGAAGTGGGTTCTTG;SOR=0.602;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=44;TCF=18;TCR=26;TR=22;WE=109935902;WS=109935884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,24:0.51:47
chr12	109936211	rs56244055	G	A	1661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.636;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=44;PP=1070;ReadPosRankSum=-0.196;SC=GGGAAAGCCCGAGTGTTTTGC;SOR=0.591;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=134;TCF=47;TCR=87;TR=69;WE=109936219;WS=109936201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,78:0.52:150
chr12	109936238	rs73196275	G	T	737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=27;PP=507;ReadPosRankSum=-0.545;SC=CTATTCTAGAGATTTGGTTGT;SOR=0.680;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=74;TCF=16;TCR=58;TR=34;WE=109936246;WS=109936228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,36:0.44:82
chr12	109937534	rs7298565	G	A	4002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=80;NR=45;PP=2065;SC=TGCTACTGTCGGAAGTATGTG;SOR=1.012;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=80;TCR=45;TR=125;WE=109937542;WS=109937524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr12	109949134	rs3742018	C	T	774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.398;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=25;PP=552;ReadPosRankSum=0.276;SC=AGCTGGGCCCCGATGTGTCTT;SOR=1.112;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=58;TCF=17;TCR=41;TR=33;WE=109949142;WS=109949124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,34:0.54:63
chr12	109959365	rs200710207	G	GT	3845.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.468;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=2.265;NF=23;NR=84;PP=1928;ReadPosRankSum=-2.122;SC=AGGTAGGAACGTTAAGAAACA;SOR=0.644;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=121;TCF=24;TCR=97;TR=107;WE=109959373;WS=109959355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,133:0.55:244
chr12	109959389	rs67731731	TA	T	2434.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.540;HP=8;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=79;PP=1877;ReadPosRankSum=-0.974;SC=AAATGTAAAATAAAATGTTAA;SOR=0.762;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=103;TCF=20;TCR=83;TR=97;WE=109959397;WS=109959379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,93:0.50:187
chr12	109964102	rs7139198	C	T	2442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.346;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=41;PP=1347;ReadPosRankSum=-1.410;SC=CTCTCATCTCCGGGAAGCTTT;SOR=0.883;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=197;TCF=112;TCR=85;TR=101;WE=109964110;WS=109964092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,115:0.53:215
chr12	109971215	rs4766608	C	T	705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.810;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=7;PP=520;ReadPosRankSum=0.807;SC=TGCAAGGGCCCGTCCTGGAAG;SOR=1.347;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=85;TCF=62;TCR=23;TR=33;WE=109971223;WS=109971205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,33:0.38:88
chr12	109994870	rs9593	A	T	3473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=48;PP=2121;SC=GTCATTTTTCATGTATATTTT;SOR=1.135;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=75;TCR=48;TR=123;WE=109994878;WS=109994860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr12	109995097	rs888192	A	G	738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=17;PP=502;SC=TCTTGCACTTAATGGATGGCA;SOR=1.528;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=25;WE=109995105;WS=109995087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	109999005	rs11610545	G	A	1267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.614;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=31;PP=771;ReadPosRankSum=1.250;SC=CCCCCAAACCGGGCAGTGTTC;SOR=0.799;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=138;TCF=65;TCR=73;TR=56;WE=109999013;WS=109998995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,63:0.42:151
chr12	109999037	rs2287181	G	A	895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=19;PP=602;ReadPosRankSum=-0.623;SC=GCCCTGCCACGGCACACCCAC;SOR=0.613;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=43;TCR=44;TR=38;WE=109999045;WS=109999027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,41:0.44:93
chr12	109999068	rs2287180	G	A	725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.770;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=14;PP=511;ReadPosRankSum=0.672;SC=GCTCCAGAGTGGGCAGGGCTG;SOR=0.959;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=94;TCF=48;TCR=46;TR=34;WE=109999076;WS=109999058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,35:0.35:99
chr12	110002819	rs10850380	A	G	945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=4;PP=681;SC=GAGGGAGAGTAACTAGCCCCA;SOR=2.910;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=26;WE=110002827;WS=110002809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	110004804	rs874171	C	T	1414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=0.604;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.50;ReadPosRankSum=-2.691;SOR=0.779;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,73:0.49:149
chr12	110004960	rs874170	C	T	333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=11;PP=257;SC=GGGCAACAAGCGCGAAACTCC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=110004968;WS=110004950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	110009324	.	C	T	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.913;ClippingRankSum=0.000;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.124;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=11;PP=397;ReadPosRankSum=1.710;SC=CCCAAAGTGCCGGGATTACAG;SOR=0.427;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=72;TCF=52;TCR=20;TR=34;WE=110009332;WS=110009303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,36:0.49:74
chr12	110017759	rs67886029	C	T	566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.395;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=19;PP=395;ReadPosRankSum=-0.771;SC=GAGGTGTGTGCGTGGTCTGGG;SOR=0.380;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=48;TCF=10;TCR=38;TR=25;WE=110017767;WS=110017749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,25:0.51:49
chr12	110019338	rs2287218	C	T	2944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.403;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=63;PP=1666;ReadPosRankSum=0.861;SC=CGCTGAAGGACGGGGATTGCG;SOR=0.665;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=284;TCF=155;TCR=129;TR=134;WE=110019346;WS=110019328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,150:0.47:321
chr12	110024541	rs2270375	A	G	5866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=107;PP=2965;SC=GCTCTGACCCACTGGTTTTTC;SOR=0.853;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=206;TCF=98;TCR=108;TR=204;WE=110024549;WS=110024531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr12	110029008	rs35191208	C	T	1069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.851;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=21;PP=726;ReadPosRankSum=0.508;SC=TCTGCCTGCCCCCAGGCCTCA;SOR=0.320;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=63;TCF=36;TCR=27;TR=45;WE=110029016;WS=110028998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,47:0.71:66
chr12	110029186	rs2270374	G	A	1822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=39;PP=1103;ReadPosRankSum=2.353;SC=TGCAGGAACCGGGGTTACTGA;SOR=0.700;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=128;TCF=63;TCR=65;TR=75;WE=110029194;WS=110029176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,85:0.57:148
chr12	110029279	rs72648031	C	A	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.187;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=218;ReadPosRankSum=0.390;SC=GAGGTCAGGACCTGCCTCTGG;SOR=0.262;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=16;WE=110029287;WS=110029269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr12	110034435	rs36021200	T	TG	331.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.547;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.212;NF=0;NR=10;PP=274;ReadPosRankSum=-0.384;SC=TGGATTATTCTGGGGGCTGCA;SOR=0.404;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=10;WE=110034443;WS=110034425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr12	110221631	rs10774894	G	C	5113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=104;PP=2965;SC=GGTGGAGAGAGAGCGTGCGTA;SOR=1.321;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=173;TCF=68;TCR=105;TR=172;WE=110221639;WS=110221621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr12	110240838	rs3825394	T	G	1888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.588;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=34;PP=1059;ReadPosRankSum=-1.153;SC=ATGAACTCCCTCATGTTGCCG;SOR=0.612;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=148;TCF=90;TCR=58;TR=86;WE=110240846;WS=110240828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,94:0.57:164
chr12	110293678	rs3782893	G	C	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.245;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=77;ReadPosRankSum=-0.228;SC=CAGGAACATGGGCGCCCCAGA;SOR=0.155;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=8;WE=110293686;WS=110293668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr12	110296095	rs4766488	G	C	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.947;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=12;PP=191;ReadPosRankSum=-0.509;SC=CTGGGCCCTAGGTGGATTCTC;SOR=0.091;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=32;TCF=10;TCR=22;TR=21;WE=110296103;WS=110296085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,25:0.69:36
chr12	110354536	rs17680262	C	T	917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.960;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=32;PP=671;ReadPosRankSum=1.144;SC=GGGGCACTGTCAGATGGCTCA;SOR=0.826;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=84;TCF=19;TCR=65;TR=40;WE=110354544;WS=110354526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,41:0.45:91
chr12	110403713	rs77909433	T	C	788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.282;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=24;PP=539;ReadPosRankSum=0.949;SC=AAGCATGATATAAGAAAATAT;SOR=1.128;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=71;TCF=21;TCR=50;TR=31;WE=110403721;WS=110403703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,36:0.44:81
chr12	110418635	rs7960775	A	G	595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=1;PP=487;SC=ATTAAAAGCCATATGTATAGC;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=110418643;WS=110418625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	110418922	rs78613700	G	A	1536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.035;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=44;PP=906;ReadPosRankSum=-0.770;SC=GTACAAAGACGTCTCCTGAGA;SOR=1.242;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=151;TCF=62;TCR=89;TR=68;WE=110418930;WS=110418912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,75:0.46:163
chr12	110573340	rs12300649	G	T	434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=233;SC=AGACGTTCACGTTCCTTTTGC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=110573348;WS=110573330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	110628714	.	TT	AA	545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.028;ClippingRankSum=0.000;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=1.001;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.74;ReadPosRankSum=0.374;SOR=0.828;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,18:0.22:81
chr12	110783241	rs1860561	G	A	1233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=34;PP=998;SC=CCAGGGCACCGGGGAATTGTG;SOR=4.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=3;TCR=34;TR=37;WE=110783249;WS=110783231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr12	111020739	rs151075597	TCGC	T	1425.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.424;NF=3;NR=21;PP=944;ReadPosRankSum=-2.912;SC=CAGTCCGTAGTCGCCGCCGCC;SOR=0.739;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=59;TCF=4;TCR=55;TR=24;WE=111020752;WS=111020729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,39:0.51:77
chr12	111070349	.	GATA	G	5959.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.198;ClippingRankSum=0.000;DP=388;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=75;PP=2966;ReadPosRankSum=1.703;SC=TCTGTGCACTGATAATAACCC;SOR=0.713;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=199;TCF=28;TCR=171;TR=88;WE=111070359;WS=111070339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:212,158:0.43:370
chr12	111160344	.	A	G	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.620;ClippingRankSum=0.000;DP=537;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.48;ReadPosRankSum=1.172;SOR=0.701;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:458,77:0.14:535
chr12	111290871	rs886132	G	C	2518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=33;NR=46;PP=1471;SC=ACAGATCTGTGCTCACCCATT;SOR=1.295;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=33;TCR=46;TR=79;WE=111290879;WS=111290861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr12	111296332	rs4766432	T	C	243.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=0;PP=199;SC=GTGCCTGGAGTGCTCCGTCAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=111296340;WS=111296325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	111317904	rs35762292	T	C	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.873;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=325;ReadPosRankSum=0.934;SC=GGGCTGGGGATAGGTCCAGGG;SOR=0.304;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=47;TCF=13;TCR=34;TR=21;WE=111317912;WS=111317894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,21:0.44:48
chr12	111351963	rs377450331	GAC	G	246.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.36;MQRankSum=6.417;QD=1.40;ReadPosRankSum=-0.500;SOR=0.641;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:153,23:0.13:176
chr12	111375170	rs1056618	A	G	4813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.16;SOR=0.787;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr12	111375170	.	AGC	GGT	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=53;NR=39;PP=2947;QD=20;SC=TCCCCCGCCAAGCCTGCCAGA;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=95;TCF=54;TCR=41;TR=92;WE=111375180;WS=111375160;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,92:0.97:95
chr12	111375172	rs1056620	C	T	4813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.99;SOR=0.789;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr12	111701486	rs56249976	GA	G	1817.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.571;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.000;NF=20;NR=34;PP=638;ReadPosRankSum=0.208;SC=TTTTCTTGTGGAAAAAAAAAA;SOR=0.381;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=120;TCF=54;TCR=66;TR=54;WE=111701495;WS=111701476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,93:0.51:184
chr12	111733077	rs116462643	G	A	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.961;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=9;PP=620;ReadPosRankSum=-0.649;SC=GGCTCGACTCGGGGGCCCCAG;SOR=0.483;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=71;TCF=55;TCR=16;TR=36;WE=111733085;WS=111733067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,36:0.46:79
chr12	111733274	rs2301658	C	T	2502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.985;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=61;PP=1585;ReadPosRankSum=-1.757;SC=ATGCTGTCAACGAGGGGTCAC;SOR=0.777;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=228;TCF=105;TCR=123;TR=111;WE=111733282;WS=111733264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,118:0.48:244
chr12	111742222	rs1362006	T	C	791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.681;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=18;PP=318;ReadPosRankSum=0.406;SC=TGGTTGATTGTGTGCATCCAT;SOR=0.943;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=84;TCF=40;TCR=44;TR=35;WE=111742230;WS=111742212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,42:0.44:96
chr12	111747963	rs3742007	C	T	2012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.254;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=41;PP=1302;ReadPosRankSum=0.017;SC=CTCCCAGCCCCGGGCAGCCCC;SOR=0.859;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=181;TCF=99;TCR=82;TR=95;WE=111747971;WS=111747953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,97:0.50:193
chr12	111757647	rs10849933	A	C	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=161;ReadPosRankSum=-0.143;SC=GTGGCTGCCTAATATTCTGCC;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=8;WE=111757655;WS=111757637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr12	111758620	rs4766505	A	G	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.087;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5004;FS=4.771;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=175;ReadPosRankSum=-1.004;SC=GCTCTGGGAGAAGATGTCGGA;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=8;WE=111758628;WS=111758610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr12	111760251	rs3742006	G	C	885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=16;PP=575;ReadPosRankSum=0.992;SC=AGGGCAGCGTGAGCGACATGC;SOR=0.660;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=107;TCF=67;TCR=40;TR=44;WE=111760259;WS=111760241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,47:0.41:114
chr12	111785586	rs3803167	T	C	1440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.384;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=23;PP=738;ReadPosRankSum=1.777;SC=TGGAGGAGGATGCTGAGGAAG;SOR=1.068;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=154;TCF=93;TCR=61;TR=67;WE=111785594;WS=111785576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,76:0.43:176
chr12	111786082	rs6490073	G	C	7353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=126;NR=118;PP=2965;SC=CATTTACCGAGTAGAGCGGGC;SOR=0.792;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=244;TCF=126;TCR=118;TR=244;WE=111786090;WS=111786072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,273:1.00:273
chr12	111799524	rs11576045	C	CTGT	358.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.214;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=313;ReadPosRankSum=0.445;SC=CGGTGTGCGGCTTTTTCTCCG;SOR=0.105;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=8;WE=111799532;WS=111799514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr12	111799681	rs874286	T	C	2971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.205;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=58;PP=2087;ReadPosRankSum=-0.444;SC=GCCCCAGGCCTAGGGGCCAAG;SOR=0.857;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=216;TCF=119;TCR=97;TR=129;WE=111799689;WS=111799657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,135:0.56:239
chr12	111800258	rs3809272	G	A	1376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.498;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=18;PP=803;ReadPosRankSum=0.342;SC=TGCACGTGACGTTCCCCTCAA;SOR=0.563;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=112;TCF=79;TCR=33;TR=56;WE=111800266;WS=111800248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,64:0.51:125
chr12	111800826	rs139032867	TGCCACCCCC	T	812.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.460;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=1659;ReadPosRankSum=-0.035;SC=GGCAGGGCCATGCCACCCCCG;SOR=1.414;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=30;TCF=16;TCR=14;TR=8;WE=111800842;WS=111800816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,22:0.47:47
chr12	111884608	rs3184504	T	C	7687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=142;NR=114;PP=2965;SC=GGAGGTCCGGTGGTGCACACG;SOR=0.787;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=256;TCF=142;TCR=114;TR=256;WE=111884616;WS=111884598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,287:1.00:287
chr12	111885351	rs111340708	ATGGGG	A	871.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.27;ReadPosRankSum=1.854;SOR=0.523;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,23:0.53:43
chr12	111894072	rs2073950	C	T	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-4.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.457;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=357;ReadPosRankSum=-0.321;SC=TGCAAAGCGACAGGAAAGAAT;SOR=0.039;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=20;WE=111894080;WS=111894062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr12	111895203	rs2301622	C	G	895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=24;PP=587;ReadPosRankSum=-0.434;SC=CAACCGATGTCTGACAACCTC;SOR=0.718;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=41;TCR=50;TR=44;WE=111895211;WS=111895193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,45:0.47:96
chr12	111895272	rs2301621	C	T	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=222;ReadPosRankSum=-0.937;SC=GCATAACTCACGCCACTACCA;SOR=0.551;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=40;TCF=14;TCR=26;TR=17;WE=111895280;WS=111895262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,17:0.40:42
chr12	111926255	rs78209549	T	G	1842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.271;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=26;PP=1124;ReadPosRankSum=-0.438;SC=AGTAACAGGATGGTCTAAGTT;SOR=0.826;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=149;TCF=93;TCR=56;TR=74;WE=111926263;WS=111926245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,82:0.53:154
chr12	112036753	rs10560189	GGCT	G	768.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=10;PP=562;SC=CGCGGGCGGCGGCTGCTGCTG;SOR=0.914;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=12;WE=112036763;WS=112036743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	112036776	.	CTGCTGT	C	197	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=2;NR=10;PP=197;QD=17.0833333333;SC=GCTGCTGCTGCTGCTGTTGCT;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=12;WE=112036789;WS=112036766;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:2,12:0.86:14
chr12	112036797	rs4098854	C	T	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.685;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.45;MQRankSum=0.861;NF=6;NR=6;PP=151;ReadPosRankSum=-1.046;SC=GCTGCTGCTGCTGCTGCTGCT;SOR=0.346;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=21;TCF=9;TCR=12;TR=12;WE=112036805;WS=112036787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr12	112036929	rs695872	G	A	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.174;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=302;ReadPosRankSum=-0.707;SC=GCGGGGACGCGCGGGCGCCGA;SOR=1.082;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=43;TCF=29;TCR=14;TR=22;WE=112036937;WS=112036919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
chr12	112037000	rs695871	G	C	595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=1.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.39;ReadPosRankSum=-0.883;SOR=0.583;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,33:0.46:71
chr12	112098285	rs1419586	T	G	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-4.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=2;PP=391;ReadPosRankSum=-0.034;SC=AAGCCCTGTCTCTTAAAATAA;SOR=0.321;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=23;WE=112098293;WS=112098275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,25:0.68:37
chr12	112148301	rs34767337	AT	A	669.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=5.927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQRankSum=0.736;QD=10.00;ReadPosRankSum=0.656;SOR=1.172;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,40:0.60:67
chr12	112191139	rs7956676	A	G	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.804;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=83;ReadPosRankSum=-0.235;SC=GCTGCAGGGCAGGAAGGGGTG;SOR=1.179;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=9;WE=112191147;WS=112191129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
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chr12	112235783	rs4646778	C	A	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=240;ReadPosRankSum=-0.839;SC=GACCTTGGTCCATTTCCCAGT;SOR=0.576;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=16;WE=112235791;WS=112235773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr12	112241472	rs111627571	G	A	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=143;ReadPosRankSum=0.463;SC=CCCCAGATGTGGAGGTTGCAA;SOR=0.804;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=10;WE=112241480;WS=112241468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr12	112241552	rs2106696	T	A	720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.38;ReadPosRankSum=0.231;SOR=0.751;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,43:0.38:113
chr12	112280773	rs3213628	G	T	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=137;ReadPosRankSum=-1.342;SC=TCCGACTCCCGCCAGCTTCCC;SOR=0.321;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=8;WE=112280781;WS=112280763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr12	112321322	rs75803132	A	G	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.986;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=119;ReadPosRankSum=0.795;SC=TGAGCCTGTCATGGGGTGTTT;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=11;WE=112321330;WS=112321312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,11:0.28:40
chr12	112338539	rs3742000	T	C	3972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=387;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.367;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=87;PP=2197;ReadPosRankSum=-0.637;SC=ATATCCTTGCTGTCCTTCTAG;SOR=0.662;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=340;TCF=170;TCR=170;TR=175;WE=112338547;WS=112338529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:192,193:0.50:385
chr12	112338734	rs3832867	T	TA	6246.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=1.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=428;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.056;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.498;NF=38;NR=63;PP=2933;ReadPosRankSum=-0.231;SC=ACAAGAGTGTTACAATTCAAT;SOR=0.999;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=235;TCF=71;TCR=164;TR=101;WE=112338742;WS=112338724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:224,201:0.47:425
chr12	112338985	rs147114007	C	CACTT	4829.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.967;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.922;NF=22;NR=41;PP=2954;ReadPosRankSum=0.360;SC=TGCACAATGGCACTTACTGTG;SOR=0.795;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=184;TCF=53;TCR=131;TR=63;WE=112338993;WS=112338975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,129:0.45:286
chr12	112339015	rs12321677	G	A	2792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.382;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=57;PP=1645;ReadPosRankSum=-0.534;SC=AAGTCTGCCTGAATTCCGCCT;SOR=0.595;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=259;TCF=125;TCR=134;TR=112;WE=112339023;WS=112339005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,137:0.46:299
chr12	112375990	rs3752630	A	C	1798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=45;PP=1155;ReadPosRankSum=-0.567;SC=GCCATTTGACAAACTCGACAA;SOR=0.638;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=140;TCF=46;TCR=94;TR=69;WE=112375998;WS=112375980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,78:0.50:156
chr12	112416586	rs11066112	C	T	763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=11;PP=442;ReadPosRankSum=0.539;SC=CTTCCAGCCTCCAGAACTGTA;SOR=0.620;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=53;TCF=34;TCR=19;TR=31;WE=112416594;WS=112416576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,35:0.56:62
chr12	112416794	rs111436404	T	C	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=370;ReadPosRankSum=0.599;SC=TAAGACCTTATACCTGTCACA;SOR=1.931;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=15;WE=112416802;WS=112416784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,16:0.73:22
chr12	112429469	rs12423126	C	G	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.762;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=326;ReadPosRankSum=-2.254;SC=TAAACAAATACGTCTCCACTT;SOR=0.349;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=20;WE=112429477;WS=112429459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,23:0.45:51
chr12	112459849	rs80350869	C	T	1309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=18;PP=891;ReadPosRankSum=-1.051;SC=AACCATTACACGGCCAAGAAA;SOR=0.654;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=128;TCF=91;TCR=37;TR=59;WE=112459857;WS=112459839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,61:0.46:134
chr12	112471090	rs12298022	G	T	2259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.527;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=52;PP=1349;ReadPosRankSum=0.278;SC=AGTGCAATTAGATGTGTTTCA;SOR=0.740;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=178;TCF=80;TCR=98;TR=96;WE=112471098;WS=112471080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,107:0.54:197
chr12	112481511	rs79907395	C	T	2371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=54;PP=1426;ReadPosRankSum=1.845;SC=AATATCAATCCGGGAGGATAC;SOR=0.667;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=248;TCF=127;TCR=121;TR=104;WE=112481519;WS=112481501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,116:0.44:266
chr12	112506856	rs7958564	G	C	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=424;ReadPosRankSum=0.192;SC=TTCTATTTAAGTGAGAATTAA;SOR=0.756;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=36;TCF=11;TCR=25;TR=24;WE=112506864;WS=112506846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,23:0.64:36
chr12	112515954	.	GA	G	63.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.719;ClippingRankSum=0.000;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=3.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.45;ReadPosRankSum=-0.407;SOR=1.321;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,9:0.20:44
chr12	112572941	rs148107405	G	A	769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.767;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=21;PP=444;ReadPosRankSum=0.597;SC=AGAGCAGGAAGCCAGTCTGGT;SOR=0.301;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=60;TCF=17;TCR=43;TR=31;WE=112572949;WS=112572931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,37:0.53:70
chr12	112638688	rs35054697	CGT	C	306.86	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.077;HP=2;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=486;ReadPosRankSum=0.050;SC=TGCGTGCGTGCGTGTGTGTGT;SOR=0.543;Source=Platypus;TCF=7;TR=14;WE=112638699;WS=112638678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr12	112667675	rs1005902	T	G	3436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=69;PP=2084;SC=ATCAGTGCTCTAGACAGAACC;SOR=1.397;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=44;TCR=69;TR=113;WE=112667683;WS=112667665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr12	112685781	.	TAC	T	242.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.543;ClippingRankSum=0.000;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=248;ReadPosRankSum=-0.919;SC=TTATTTTACCTACACACACAC;SOR=0.569;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=8;WE=112685792;WS=112685771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,15:0.42:36
chr12	112712771	rs141512931	A	G	1427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.243;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=40;PP=957;ReadPosRankSum=-2.309;SC=AGGACTTTGGAAACAAACATT;SOR=0.811;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=161;TCF=61;TCR=100;TR=62;WE=112712779;WS=112712761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,69:0.40:174
chr12	112843998	rs2233861	A	T	3346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.813;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=75;PP=2109;ReadPosRankSum=-0.436;SC=ACTTGTGGCAATAAGTGTCTA;SOR=0.805;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=295;TCF=147;TCR=148;TR=144;WE=112844006;WS=112843988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,157:0.48:328
chr12	112915434	rs41279090	C	T	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.199;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=149;ReadPosRankSum=0.051;SC=CTTATGTGACCGTGGTCTCTT;SOR=2.517;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=8;WE=112915442;WS=112915430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
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chr12	113325629	rs4141253	T	C	3067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.341;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=66;PP=1786;ReadPosRankSum=-0.360;SC=AGGACAAATTTGGCCACAATG;SOR=0.616;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=285;TCF=153;TCR=132;TR=137;WE=113325637;WS=113325619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,149:0.48:311
chr12	113328981	rs3741982	G	A	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.682;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=131;ReadPosRankSum=0.852;SC=ATGTGGGTCTGGAGTCTCAGG;SOR=0.293;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=7;WE=113328989;WS=113328971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr12	113348870	rs1131454	G	A	7958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=137;NR=131;PP=2965;SC=GTTGACTGGCGGCTATAAACC;SOR=0.720;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=268;TCF=137;TCR=131;TR=268;WE=113348878;WS=113348860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,300:1.00:300
chr12	113357193	rs10774671	G	A	3427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=28;PP=1999;SC=CACCCTTTCAGGCTGAAAGCA;SOR=1.649;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=75;TCR=28;TR=103;WE=113357201;WS=113357183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr12	113357209	rs1131476	G	A	3869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=84;NR=40;PP=2115;SC=AAGCAACAGTGCAGACGATGA;SOR=1.251;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=85;TCR=40;TR=124;WE=113357217;WS=113357199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr12	113357237	rs1051042	G	C	5719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=114;NR=77;PP=2877;SC=GATCCCAGGAGGTATCAGAAA;SOR=0.916;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=192;TCF=115;TCR=77;TR=191;WE=113357245;WS=113357227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr12	113357442	rs2660	G	A	3648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=68;PP=2317;SC=GATCCAGAGAGGACAAAGCTC;SOR=1.016;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=123;TCF=55;TCR=68;TR=123;WE=113357450;WS=113357432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr12	113369644	rs7968145	C	T	3749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=81;NR=49;PP=2273;SC=ACAGGCTCCTCAATATGAGAG;SOR=1.076;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=131;TCF=81;TCR=50;TR=130;WE=113369652;WS=113369634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr12	113369715	rs11352835	TA	T	7710.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=86;PP=2965;SC=GAAGGAACTATACCAATAATT;SOR=0.768;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=104;TCF=16;TCR=88;TR=102;WE=113369723;WS=113369705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr12	113369759	rs7967461	G	C	3174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=63;PP=1806;SC=ACAGACAAGAGGAGCCTCATT;SOR=1.123;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=46;TCR=63;TR=109;WE=113369767;WS=113369749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr12	113376320	rs3815178	C	T	1020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=22;NR=15;PP=533;SC=TCCCCTTGCACCTGCGCCGGG;SOR=0.902;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=38;TCF=23;TCR=15;TR=37;WE=113376339;WS=113376310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr12	113376331	rs1859331	C	A	1370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=27;NR=17;PP=707;SC=CTGCGCCGGGCGGCCATGGAC;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=45;TCF=28;TCR=17;TR=44;WE=113376339;WS=113376310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr12	113376388	rs1859330	G	A	2157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=25;PP=1096;SC=GTGGCCAGAAGGCTGCAGCCG;SOR=0.961;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=44;TCR=25;TR=69;WE=113376396;WS=113376378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr12	113376452	rs1859329	C	T	2428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=29;PP=1296;SC=TGGCCGCTGCCCTGAGGGAGC;SOR=0.965;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=48;TCR=29;TR=77;WE=113376460;WS=113376442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr12	113376543	rs3038120	C	CCAAAGGG	2500.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=29;PP=2259;ReadPosRankSum=-0.590;SC=CTTTATGTGTCCAAAGGGGAG;SOR=0.976;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=41;TCF=6;TCR=35;TR=35;WE=113376551;WS=113376533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,96:0.98:98
chr12	113379509	rs116951660	G	A	2442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.031;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=52;PP=1345;ReadPosRankSum=-0.672;SC=TGCGGGCATCGCTGGAATCCT;SOR=0.609;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=192;TCF=89;TCR=103;TR=101;WE=113379517;WS=113379499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,117:0.52:224
chr12	113385918	rs7961861	C	T	4145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=78;PP=2329;SC=AGTGAGGGGGCCCCAGGACCC;SOR=1.208;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=134;TCF=56;TCR=78;TR=134;WE=113385926;WS=113385908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr12	113386616	rs34647135	T	C	3197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=27;PP=2262;SC=ATTGGGTTGATGCAGAAACCA;SOR=2.240;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=81;TCR=27;TR=108;WE=113386624;WS=113386606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr12	113386950	rs2285932	T	C	4232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=65;PP=2081;SC=AAAAGGCCATTGACATCATCT;SOR=0.810;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=133;TCF=68;TCR=65;TR=133;WE=113386958;WS=113386940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr12	113387034	rs3214199	A	AG	1907.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=24;PP=1029;SC=GTGGAGACACAGGGGGGACCC;SOR=0.933;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=38;TCF=8;TCR=30;TR=32;WE=113387042;WS=113387024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
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chr12	113400824	rs113210418	CA	C	322.75	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=249;SC=TCCCACTCCTCACTCTGCTTC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=113400834;WS=113400814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
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chr12	113405181	rs1557866	A	C	2066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=7;PP=1601;ReadPosRankSum=0.598;SC=CACTGGGACAACATGGGAGCC;SOR=2.584;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=66;TCF=59;TCR=7;TR=64;WE=113405189;WS=113405171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,70:0.99:71
chr12	113416431	rs45562438	C	T	2815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.952;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=52;PP=1730;ReadPosRankSum=0.658;SC=ATGGGGAGTCCCAGCTGTCCT;SOR=0.770;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=241;TCF=139;TCR=102;TR=126;WE=113416439;WS=113416421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,135:0.52:262
chr12	113425154	rs1293767	C	G	2143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=34;PP=1095;SC=GCCAAAGAAGCGGGTGCCAGA;SOR=1.079;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=28;TCR=34;TR=62;WE=113425162;WS=113425144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr12	113435293	rs1293756	C	A	6415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=119;NR=99;PP=2965;SC=CTAGATCCCCCAATGAGCTGC;SOR=0.769;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=220;TCF=119;TCR=101;TR=218;WE=113435301;WS=113435283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr12	113435450	rs1293755	A	T	6070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=104;NR=108;PP=2965;SC=TCAGAACCGTACTGGAGCTGA;SOR=0.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=214;TCF=105;TCR=109;TR=212;WE=113435458;WS=113435440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr12	113444418	rs929291	T	C	4911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=79;PP=2965;SC=AAGGACAGTCTTTGTTCTGAC;SOR=0.726;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=167;TCF=88;TCR=79;TR=167;WE=113444426;WS=113444408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr12	113445768	rs1293746	G	A	4084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=65;NR=74;PP=2198;SC=CCCTAGCCCCGTACTTTTCTT;SOR=1.012;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=139;TCF=65;TCR=74;TR=139;WE=113445776;WS=113445758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr12	113447199	rs34600329	GC	G	779.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=22;PP=790;SC=AGCCCCCTAAGCCCCCACTAC;SOR=3.528;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=22;WE=113447207;WS=113447189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr12	113448288	rs15895	A	G	5426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=101;NR=80;PP=2965;SC=AGAAACTTCTAGAGATCATCT;SOR=0.866;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=181;TCF=101;TCR=80;TR=181;WE=113448296;WS=113448278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr12	113496313	rs1732785	C	T	1753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=32;NR=33;PP=1047;SC=TACCTTGCAGCGTAGGATGCT;SOR=0.880;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=66;TCF=33;TCR=33;TR=65;WE=113496321;WS=113496303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr12	113530845	rs3217697	C	CAG	5207.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=36;PP=2272;SC=CTGCAGTTGGCAGAGAGGTAC;SOR=0.793;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=12;TCR=38;TR=47;WE=113530853;WS=113530835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr12	113530899	rs1628639	A	G	3986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=53;PP=2022;SC=GACAGAAGGCAAGCCAGGTCC;SOR=0.720;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=54;TCR=53;TR=107;WE=113530907;WS=113530889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr12	113531295	rs1625170	T	C	408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.42;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	113531305	rs1674095	A	T	503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.75;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	113533050	rs2243397	C	T	8529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=154;NR=147;PP=2965;SC=GCCCCCACACCCCTCCAACTC;SOR=0.725;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=301;TCF=154;TCR=147;TR=301;WE=113533058;WS=113533040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,315:1.00:315
chr12	113533124	rs2243396	C	T	10663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=397;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=197;NR=175;PP=2965;SC=CTGTCCCTCTCTGCAGGGCCC;SOR=0.804;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=374;TCF=197;TCR=177;TR=372;WE=113533132;WS=113533114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,397:1.00:397
chr12	113539822	rs1674101	A	G	2056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=37;PP=1310;SC=CGGCTGAGGGAACACAGCTTC;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=34;TCR=37;TR=71;WE=113539830;WS=113539812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr12	113541940	rs1613480	C	T	5672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=103;NR=80;PP=2965;SC=GGACGCCCCCCGCTCCCCATC;SOR=0.925;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=183;TCF=103;TCR=80;TR=183;WE=113541948;WS=113541930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr12	113544874	rs2468355	C	T	8128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=162;NR=123;PP=2965;SC=GCTGAGAAGCCAGATGTGGCC;SOR=0.859;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=285;TCF=162;TCR=123;TR=285;WE=113544882;WS=113544864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,310:1.00:310
chr12	113545393	rs736285	A	G	2013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=26;PP=1225;SC=GTGCCACTGCACTCCAGCCTG;SOR=1.252;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=45;TCR=26;TR=71;WE=113545401;WS=113545383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr12	113553251	rs148454620	C	T	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-3.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.043;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=167;ReadPosRankSum=1.101;SC=TCACACAGCCCACAAGTAGCA;SOR=0.061;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=12;WE=113553259;WS=113553241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr12	113553408	rs1284878	C	T	342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=2;PP=296;SC=CCATTGAGGGCGGTGATGTCG;SOR=2.670;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=13;WE=113553416;WS=113553398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	113553481	rs1284879	C	T	2033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=26;PP=1314;SC=GTCCAGAAAGCGCCCAGCCAG;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=42;TCR=26;TR=68;WE=113553489;WS=113553471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr12	113559531	.	AT	A	54.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.000;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=3.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.18;MQRankSum=-0.431;QD=1.27;ReadPosRankSum=1.369;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,10:0.23:43
chr12	113565637	rs146551951	G	A	4010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=342;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=87;PP=2364;ReadPosRankSum=0.779;SC=GGCTGTAATCGCCTCCCTGCT;SOR=0.694;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=307;TCF=143;TCR=164;TR=159;WE=113565645;WS=113565627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,184:0.54:342
chr12	113566050	rs60280118	GAC	G,GACAC	93.74	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=10.792;HP=2;HapScore=3;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.000;NF=0,0;NR=9,9;PP=266,200;ReadPosRankSum=1.042;SC=TGGAGACCCAGACACACACAC;SOR=3.901;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=9,9;WE=113566059;WS=113566040;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.55:11
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chr12	113723632	rs142960105	G	A	727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.386;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=6;PP=477;ReadPosRankSum=0.264;SC=GCCTCAAAGAGGAGACCGAGC;SOR=1.885;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=47;TCF=35;TCR=12;TR=29;WE=113723640;WS=113723622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,31:0.66:47
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chr12	114261237	rs2059598	A	C	723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=17;PP=322;ReadPosRankSum=-1.672;SC=GAGCAGAACAAGGGTGCGGGG;SOR=0.662;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=60;TCF=25;TCR=35;TR=30;WE=114261245;WS=114261227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,36:0.51:70
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chr12	114282496	rs2075387	C	T	2076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.205;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=46;PP=1182;ReadPosRankSum=2.068;SC=GGCCGTCTTCCGCCGCAGGGC;SOR=0.816;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=157;TCF=75;TCR=82;TR=87;WE=114282504;WS=114282486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,96:0.56:171
chr12	114282678	rs2075386	G	A	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=17;PP=336;ReadPosRankSum=0.198;SC=GCCTGCCTGCGTCTCAGATGC;SOR=0.826;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=48;TCF=17;TCR=31;TR=26;WE=114282686;WS=114282668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,25:0.52:48
chr12	114296745	rs10744803	C	T	1978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.951;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=43;PP=1070;ReadPosRankSum=1.267;SC=AATAGAGGCCCGCAAGGGAGG;SOR=0.858;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=147;TCF=73;TCR=74;TR=84;WE=114296753;WS=114296735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,94:0.57:164
chr12	114356357	rs10774721	T	C	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=7;PP=136;ReadPosRankSum=0.872;SC=GGGAGCCTGATTGTTCCCCGG;SOR=0.458;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=9;WE=114356365;WS=114356347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr12	114362483	rs3782456	C	T	2630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=38;PP=1711;ReadPosRankSum=1.359;SC=GAACACTTTCCGAATTTCATG;SOR=0.706;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=213;TCF=141;TCR=72;TR=112;WE=114362491;WS=114362473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,120:0.50:239
chr12	114362621	rs1458713	A	G	8470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=123;NR=159;PP=2965;SC=AGGCAAGGGCACCTGTCAAAC;SOR=1.024;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=282;TCF=123;TCR=159;TR=282;WE=114362640;WS=114362611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,318:1.00:318
chr12	114362632	rs3782458	A	G	2218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.878;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=57;PP=1305;ReadPosRankSum=-0.666;SC=CCTGTCAAACACTATACCCCC;SOR=0.979;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=249;TCF=108;TCR=141;TR=92;WE=114362640;WS=114362611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,112:0.40:282
chr12	114362699	rs10774723	G	T	722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=21;PP=434;ReadPosRankSum=-2.155;SC=GATGAGTGATGACCTCCTTTA;SOR=0.723;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=26;TCR=55;TR=31;WE=114362707;WS=114362689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,35:0.39:89
chr12	114377885	rs2290790	G	C	1300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.638;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=28;PP=664;ReadPosRankSum=0.480;SC=AATGGCCGAAGGTCTCCTGCA;SOR=0.758;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=115;TCF=61;TCR=54;TR=58;WE=114377907;WS=114377875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,65:0.49:132
chr12	114377899	rs7299217	G	C	3817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=60;PP=2067;SC=TCCTGCAGCTGGGCCGCCAGG;SOR=0.840;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=125;TCF=65;TCR=60;TR=125;WE=114377907;WS=114377875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr12	114379991	rs2290791	T	C	1002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.951;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=10;PP=634;ReadPosRankSum=-0.577;SC=ACATTTCTTCTTTTCTTTAGA;SOR=1.035;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=82;TCF=58;TCR=24;TR=41;WE=114379999;WS=114379981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,45:0.48:93
chr12	114383559	rs898081	A	G	581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.686;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=341;ReadPosRankSum=-0.024;SC=CAACAGCAGTACAACGAGCCT;SOR=0.109;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=18;WE=114383567;WS=114383549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,21:0.62:34
chr12	114384426	rs11066842	G	A	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.163;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.392;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=60;ReadPosRankSum=-0.481;SC=CAGGTAGAACGTGGCCACTCT;SOR=0.238;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=7;WE=114384434;WS=114384416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr12	114393028	rs1037747	C	G	997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=18;PP=452;ReadPosRankSum=-0.247;SC=TGAGTGATCACAAAAACAAAC;SOR=0.732;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=76;TCF=42;TCR=34;TR=40;WE=114393036;WS=114393018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,51:0.55:93
chr12	114395571	rs2290786	C	T	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=221;ReadPosRankSum=1.126;SC=TCATCACCTGCGGGATACACA;SOR=1.119;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=14;WE=114395579;WS=114395561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr12	114397192	rs140397506	C	T	1949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=41;PP=1118;ReadPosRankSum=1.336;SC=ACTCCTGGAACTCTGTATCCT;SOR=0.695;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=186;TCF=99;TCR=87;TR=89;WE=114397200;WS=114397182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,100:0.49:204
chr12	114397558	.	C	T	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.827;ClippingRankSum=0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.008;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=69;ReadPosRankSum=-1.085;SC=CCCTCTCCAGCCTCTACGGTC;SOR=0.075;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=8;WE=114397566;WS=114397548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr12	114793240	rs883079	C	T	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=298;ReadPosRankSum=0.630;SC=AAATCTTGTCCGTGGGGTTCT;SOR=0.776;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=17;WE=114793248;WS=114793230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr12	114823187	rs2277377	G	T	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.552;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=3;PP=401;ReadPosRankSum=-0.690;SC=CGGGCAGGAAGGCTGGTGGAG;SOR=1.068;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=45;TCF=38;TCR=7;TR=23;WE=114823195;WS=114823177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,23:0.51:45
chr12	114832510	rs2236017	C	A	1128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.076;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=7;PP=763;ReadPosRankSum=-2.380;SC=AAAGAGCAGACGGCCCCAGGC;SOR=1.061;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=85;TCF=67;TCR=18;TR=41;WE=114832518;WS=114832500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,45:0.49:91
chr12	115118997	rs515746	G	A	1159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=36;PP=941;SC=TAAACCACCCGTAATCTTGGG;SOR=5.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=1;TCR=36;TR=37;WE=115119005;WS=115118987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr12	115801070	rs1920947	G	A	616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=15;PP=428;SC=TTTTGGGCAAGTTACACAGCC;SOR=1.708;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=7;TCR=15;TR=22;WE=115801078;WS=115801060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
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chr12	116408538	rs2304460	A	G	1141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.385;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=25;PP=708;ReadPosRankSum=3.076;SC=TGTTCAGTGCAGTACTTCGGC;SOR=0.554;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=108;TCF=54;TCR=54;TR=54;WE=116408546;WS=116408528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,57:0.50:115
chr12	116412921	rs1992068	AT	TC	4646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=35;PP=2947;SC=GTTAATGACAATAGCTGAGCC;SOR=1.257;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=98;TCF=59;TCR=39;TR=90;WE=116412940;WS=116412911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr12	116420448	rs56159580	T	C	814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.240;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=24;PP=616;ReadPosRankSum=0.183;SC=AAAATAAATATAAATTACACG;SOR=1.154;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=71;TCF=27;TCR=44;TR=35;WE=116420456;WS=116420438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,36:0.47:76
chr12	116429689	rs1865787	A	G	3595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.297;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=71;PP=2128;ReadPosRankSum=-1.460;SC=GCGCTGTTCAACGTCACGGGT;SOR=0.743;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=296;TCF=151;TCR=145;TR=149;WE=116429697;WS=116429679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,170:0.51:332
chr12	116440740	rs75081071	G	A	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=309;ReadPosRankSum=2.654;SC=GCACCACTAAGTATGAGAATA;SOR=0.799;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=55;TCF=41;TCR=14;TR=21;WE=116440748;WS=116440730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,24:0.40:60
chr12	116446445	rs3741768	C	T	1227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.443;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=22;PP=720;ReadPosRankSum=-0.747;SC=GAGTAGACAACTGCTGGAGTT;SOR=0.742;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=102;TCF=55;TCR=47;TR=52;WE=116446453;WS=116446435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,59:0.49:121
chr12	116586414	.	CTATATA	C	438.87	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.117;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.45;MQRankSum=0.667;QD=29.26;ReadPosRankSum=-1.084;SOR=0.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,12:0.80:15
chr12	116714815	.	A	AC	222.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.076;ClippingRankSum=0.000;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=6.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.34;MQRankSum=3.076;QD=2.45;ReadPosRankSum=2.651;SOR=1.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,21:0.23:91
chr12	117013730	rs7303998	G	C	4365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=45;PP=2698;SC=TCGCCGCCGCGGCCCAGATCC;SOR=1.519;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=96;TCR=45;TR=141;WE=117013738;WS=117013720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr12	117014131	rs55717114	G	GA	2659.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=1.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.890;HP=7;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-8.357;NF=8;NR=58;PP=1670;ReadPosRankSum=0.068;SC=TGTAAAACCAGAAAAAATGCA;SOR=0.639;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=156;TCF=14;TCR=142;TR=66;WE=117014140;WS=117014121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,137:0.47:292
chr12	117014174	rs139308338	GA	G	1427.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=0.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.145;HP=9;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-9.545;NF=4;NR=40;PP=549;ReadPosRankSum=0.764;SC=CCTTACCAAGGAAAAAAAAAG;SOR=0.516;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=98;TCF=7;TCR=91;TR=44;WE=117014182;WS=117014164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,72:0.48:151
chr12	117186316	rs1532395	A	G	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=1;PP=328;SC=CCACCCCCAGAAATTCTATTC;SOR=2.985;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=117186324;WS=117186306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	117217141	rs4767452	T	C	3442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=70;PP=1858;SC=TCATCCTGGCTGTCAAGTCCA;SOR=1.049;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=123;TCF=53;TCR=70;TR=123;WE=117217149;WS=117217131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr12	117286981	rs4767461	C	T	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=4.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.36;ReadPosRankSum=-1.388;SOR=0.190;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr12	117287112	rs73220476	C	T	1575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=34;PP=897;ReadPosRankSum=-2.035;SC=GATTGCTGTCCCCGCAGCACG;SOR=0.719;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=195;TCF=108;TCR=87;TR=78;WE=117287120;WS=117287102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,85:0.39:216
chr12	117289599	rs139947917	GGAAA	G	1366.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=0.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.34;MQRankSum=2.465;QD=12.54;ReadPosRankSum=1.129;SOR=0.612;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,47:0.43:109
chr12	117289613	rs903775	G	C	1354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.642;HP=1;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.276;NF=36;NR=24;PP=2442;ReadPosRankSum=1.265;SC=AGAAAGAAAGGTCAGCTTTGG;SOR=0.758;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=121;TCF=72;TCR=49;TR=60;WE=117289621;WS=117289589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,64:0.49:130
chr12	117290601	rs903772	T	C	2953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=42;NR=52;PP=1400;SC=TCAGCCTCCCTGTAGCCATCT;SOR=1.230;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=42;TCR=52;TR=94;WE=117290609;WS=117290591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr12	117348968	rs112339051	C	A	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.664;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=342;ReadPosRankSum=1.442;SC=CGGAGGTGGGCTCCGGGCGCG;SOR=1.508;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=20;WE=117348976;WS=117348958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr12	117349014	rs11068230	C	G	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.619;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=7;PP=182;ReadPosRankSum=1.115;SC=GCTGGCCCAGCGTCTCCTGGA;SOR=0.330;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=23;TCF=10;TCR=13;TR=14;WE=117349022;WS=117349004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr12	117383320	rs4076700	G	A	1001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.479;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=26;PP=590;ReadPosRankSum=-0.901;SC=CACATGTTACGAACCAACTGG;SOR=1.312;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=78;TCF=33;TCR=45;TR=41;WE=117383328;WS=117383310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,47:0.52:90
chr12	117402755	rs6490101	T	C	216.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=6;PP=112;SC=TCCCTCCATATGTACACGTGG;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=117402763;WS=117402745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	117423264	rs7131746	G	A	805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=23;PP=461;ReadPosRankSum=1.328;SC=TGGGTCTAATGTAAGCACGTA;SOR=0.730;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=68;TCF=20;TCR=48;TR=33;WE=117423272;WS=117423254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,37:0.51:73
chr12	117448195	rs371138207	CGT	C	3666.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.454;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=48;PP=2080;ReadPosRankSum=2.048;SC=CGTGACTTCACGTGTGTCAAC;SOR=1.091;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=123;TCF=11;TCR=112;TR=52;WE=117448204;WS=117448185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,101:0.44:229
chr12	117465857	rs4529958	T	C	2910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=32;PP=1615;SC=TCCGCGCCTATGAGTTTGCGG;SOR=1.522;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=96;TCF=64;TCR=32;TR=96;WE=117465865;WS=117465847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr12	117465981	rs2291916	T	C	4932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=85;PP=2445;SC=TGTTTAGGGATGTGCCTCAGT;SOR=0.899;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=164;TCF=79;TCR=85;TR=164;WE=117465989;WS=117465971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr12	117476896	rs9308	C	A	1266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.777;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=14;PP=831;ReadPosRankSum=-2.032;SC=GGGGAGGCGGCCCCATTGCAA;SOR=0.521;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=99;TCF=74;TCR=25;TR=52;WE=117476904;WS=117476886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,55:0.53:103
chr12	117477082	rs118025365	G	A	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.699;HP=6;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=16;PP=319;ReadPosRankSum=1.240;SC=CAGGCCCCCCGGTCCTCGGCC;SOR=0.334;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=63;TCF=27;TCR=36;TR=30;WE=117477090;WS=117477072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,32:0.46:69
chr12	117477104	rs2270794	C	T	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=242;ReadPosRankSum=1.306;SC=TTCCCACCTACCGTCTCCTGC;SOR=0.704;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=36;TCF=12;TCR=24;TR=17;WE=117477112;WS=117477094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,17:0.46:37
chr12	117486478	rs2291911	C	T	10595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=394;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=205;NR=155;PP=2965;SC=CACGCATGATCGGCATACCCA;SOR=0.979;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=360;TCF=205;TCR=155;TR=360;WE=117486486;WS=117486468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,394:1.00:394
chr12	117486642	rs2291910	T	A	3201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.958;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=77;PP=1901;ReadPosRankSum=0.875;SC=AGGATGAAGGTGCCGGGAACG;SOR=0.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=271;TCF=115;TCR=156;TR=130;WE=117486650;WS=117486632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,148:0.49:299
chr12	117494543	rs2173654	A	G	489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=16;NR=2;PP=380;SC=TCTAGGAAACAAGTATCCCGA;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=117494551;WS=117494533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	117593216	rs4767506	C	A	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.560;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=70;ReadPosRankSum=-0.522;SC=CAGCCACAGCCTTGGGAGGCC;SOR=0.976;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=6;WE=117593224;WS=117593206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr12	117593387	rs79478437	G	A	1715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=1.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.50;ReadPosRankSum=0.881;SOR=0.814;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,44:0.50:88
chr12	117593391	rs4767507	A	G	1721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.79;ReadPosRankSum=-0.335;SOR=0.861;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,45:0.52:87
chr12	117595930	rs2279765	G	A	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=13;PP=253;ReadPosRankSum=-0.563;SC=TCTTTTTTGCGGCGAGGGATT;SOR=0.743;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=18;TCR=30;TR=21;WE=117595938;WS=117595920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,24:0.48:50
chr12	117595978	rs2279766	A	C	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.692;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=106;ReadPosRankSum=-1.192;SC=CAAAGGACCAAAAGGGGTGGC;SOR=0.141;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=7;WE=117595986;WS=117595968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr12	117603161	rs2270791	T	C	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.79;ReadPosRankSum=-1.282;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr12	117611934	rs57632063	C	T	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=125;ReadPosRankSum=-0.155;SC=AGAGCGAGACCCTGTCTCTAA;SOR=0.425;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=7;WE=117611942;WS=117611928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr12	117612357	rs3817015	T	C	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=310;ReadPosRankSum=-0.476;SC=TTATCACTTTTTCATGACATA;SOR=0.551;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=33;TCF=22;TCR=11;TR=17;WE=117612365;WS=117612347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr12	117636032	rs11068409	G	A	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.70;ReadPosRankSum=0.274;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr12	117636074	rs112407951	A	AT	894.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.45;ReadPosRankSum=-0.541;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,25:0.54:46
chr12	117636075	rs59514465	A	T	903.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.65;ReadPosRankSum=0.044;SOR=0.540;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,24:0.52:46
chr12	117701714	rs2293054	A	G	8172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=140;NR=145;PP=2965;SC=TCTTGAAGCCAATGGCTCGCC;SOR=0.782;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=285;TCF=140;TCR=145;TR=285;WE=117701722;WS=117701704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,303:1.00:303
chr12	117705774	rs3741480	C	T	257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=7;NR=0;PP=84;SC=TCTCTTGATCCTCTGCATCAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=117705782;WS=117705764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	117718473	rs11282297	G	GGGTAAAA	8691.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=56;PP=2973;SC=AAAAGTCTGTGGTCTGGGGAC;SOR=0.790;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=75;TCF=19;TCR=56;TR=74;WE=117718481;WS=117718463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr12	117718686	rs2293051	G	C	3957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=77;PP=2099;SC=GGTGGAGAGAGGGGAACACCC;SOR=1.304;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=132;TCF=55;TCR=77;TR=132;WE=117718694;WS=117718676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr12	117768105	rs111326073	G	GCACA	445.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.694;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=233;ReadPosRankSum=0.952;SC=ACACAAGCATGCACACACACA;SOR=2.147;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=10;WE=117768118;WS=117768095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr12	117905636	rs36058871	T	TA	300.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.37;MQRankSum=0.645;QD=15.83;ReadPosRankSum=-2.002;SOR=0.275;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,15:0.79:19
chr12	117955801	rs16947663	T	C	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=32;ReadPosRankSum=-1.383;SC=TTTGAAAGCATGGAAAACAGG;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=117955809;WS=117955791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr12	118017201	rs4767569	C	T	891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=27;PP=699;SC=CAGATAATAACAGTATTGACC;SOR=4.548;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=29;WE=118017209;WS=118017191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	118020115	rs11068551	G	A	9472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=352;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=175;NR=134;PP=2965;SC=TGGAGTTGCCGAGATCTCTGC;SOR=0.932;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=309;TCF=175;TCR=134;TR=309;WE=118020123;WS=118020105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,352:1.00:352
chr12	118199286	rs617641	C	G	4245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=78;NR=59;PP=2538;SC=CCGTCTCTGTCGTGGGCCACT;SOR=0.873;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=137;TCF=78;TCR=59;TR=137;WE=118199294;WS=118199276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr12	118406112	rs7309205	A	G	87.94	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=17.59;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	118455759	rs2393374	T	G	10193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=380;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=162;NR=174;PP=2965;SC=TGGAAATCCTTTACCCATTGA;SOR=0.857;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=337;TCF=162;TCR=175;TR=336;WE=118455767;WS=118455749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,379:1.00:379
chr12	118456825	rs5745811	A	G	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.518;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=362;ReadPosRankSum=0.274;SC=TTTTGCACATAAAATATTCTT;SOR=0.400;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=41;TCF=33;TCR=8;TR=22;WE=118456833;WS=118456815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,24:0.53:45
chr12	118464688	rs5745870	A	G	1236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=3;PP=932;SC=CCCTCTGTCTACACAGAGCAC;SOR=4.351;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=34;WE=118464696;WS=118464678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
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chr12	118467369	rs4766894	T	A	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=200;ReadPosRankSum=0.292;SC=TTCCTTTTTGTCTACCCTATA;SOR=0.963;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=10;WE=118467377;WS=118467359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr12	118467457	rs11331177	AG	A	2294.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.617;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.705;NF=16;NR=29;PP=1543;ReadPosRankSum=0.715;SC=TCTAGTGAGCAGGCTGAGGCC;SOR=0.623;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=95;TCF=38;TCR=57;TR=45;WE=118467465;WS=118467447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,75:0.51:146
chr12	118467553	rs4767654	A	G	5420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=89;PP=2965;SC=GACCTAACTCATTTGATTTTG;SOR=0.850;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=177;TCF=87;TCR=90;TR=176;WE=118467561;WS=118467543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr12	118473054	rs9788041	T	C	4870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=96;PP=2555;SC=ACAAGCCTTCTGGAGAGAAGC;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=166;TCF=70;TCR=96;TR=166;WE=118473062;WS=118473044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr12	118475967	rs11068779	T	C	204.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=2;PP=129;SC=GTGGTGGCCATGGCCCACCAG;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=118475975;WS=118475957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	118476079	rs11068780	C	T	972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.514;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=12;PP=417;ReadPosRankSum=-0.982;SC=AAAGCAATAACGCTGGAGACT;SOR=0.357;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=51;TCF=35;TCR=16;TR=33;WE=118476087;WS=118476069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,45:0.65:69
chr12	118506186	rs67405503	A	T	3877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=42;PP=2164;SC=GCTTACCTTGAAGATCCTGGA;SOR=1.244;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=84;TCR=42;TR=126;WE=118506194;WS=118506176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr12	118508796	rs7135008	A	G	2865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=394;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.773;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=65;PP=1831;ReadPosRankSum=0.415;SC=GGAAGGGAACAAAACAGAAGT;SOR=0.645;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=364;TCF=205;TCR=159;TR=145;WE=118508804;WS=118508786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:238,156:0.40:394
chr12	118509086	rs7135400	A	T	702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=4;PP=548;SC=GGTGGGAGCAAGGCAGGGGCC;SOR=2.400;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=22;WE=118509094;WS=118509076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	118509138	rs9669300	A	G	1222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=1.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.72;ReadPosRankSum=0.367;SOR=0.366;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,33:0.48:69
chr12	118509148	rs7308222	C	T	1390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=4.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.28;ReadPosRankSum=1.526;SOR=1.410;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,36:0.40:91
chr12	118509157	rs7296643	T	C	1534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=1.896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.70;ReadPosRankSum=-0.062;SOR=1.015;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,47:0.42:112
chr12	118520240	rs6490164	G	A	673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=20;PP=583;SC=GCCGCCTGGGGATGACAGGGG;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=24;WE=118520248;WS=118520230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	118541188	rs35800761	G	C	457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=2;PP=292;SC=GAGGCTGGGGGTATCTCGCCC;SOR=2.049;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=118541196;WS=118541178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	118589069	rs2249624	G	A	1092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.30;QD=33.11;SOR=2.517;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr12	118589092	rs140297022	GCGCA	G	34.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.51;MQRankSum=-0.000;QD=6.95;ReadPosRankSum=-1.036;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr12	118650917	rs353886	C	T	480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=12;PP=320;SC=TAAAAAAATGCTTTGGAATAT;SOR=2.584;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=118650925;WS=118650907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	118675984	.	GA	G	43.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.972;ClippingRankSum=0.000;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=1.714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.11;MQRankSum=2.199;QD=0.64;ReadPosRankSum=0.330;SOR=1.089;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,12:0.18:68
chr12	118681158	rs708862	T	A	1679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=34;NR=22;PP=1025;SC=AAATAGATAATAGAAAAAAAA;SOR=1.143;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=34;TCR=22;TR=56;WE=118681166;WS=118681148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr12	118682751	rs428073	C	T	3702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=59;NR=68;PP=2107;SC=CACCACCTCACTGGTGTGAGC;SOR=1.092;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=59;TCR=68;TR=127;WE=118682759;WS=118682741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr12	118828755	rs492939	G	A	693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=1;PP=469;SC=CAAAAGTCACGTGGGTCTGAT;SOR=4.003;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=118828763;WS=118828745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	119563084	rs7296134	C	G	911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.833;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=11;PP=476;ReadPosRankSum=-2.971;SC=GGATGGTGACCAGTGCAAAGG;SOR=1.194;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=93;TCF=61;TCR=32;TR=40;WE=119563092;WS=119563074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,48:0.44:109
chr12	119568421	rs7298308	C	G	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.188;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.497;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=82;ReadPosRankSum=0.135;SC=GTTGGTCCTGCATACATCTCC;SOR=2.419;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=6;WE=119568429;WS=119568411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr12	119568596	rs7297606	G	A	1314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.369;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=28;PP=764;ReadPosRankSum=-0.125;SC=CGCCCGCCCAGTCAACCCCTC;SOR=0.596;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=123;TCF=69;TCR=54;TR=60;WE=119568604;WS=119568586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,65:0.49:134
chr12	119568670	rs7298583	C	A	1219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.377;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=25;PP=598;ReadPosRankSum=0.530;SC=CCTCTGCCAGCCTTGGCCACG;SOR=0.498;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=100;TCF=49;TCR=51;TR=51;WE=119568678;WS=119568660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,60:0.52:116
chr12	119568691	rs4298970	A	G	1102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.751;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=26;PP=580;ReadPosRankSum=0.501;SC=ACACTTGGGGAATGTGGAGGC;SOR=0.582;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=92;TCF=41;TCR=51;TR=47;WE=119568699;WS=119568681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,54:0.53:102
chr12	119588962	rs2723880	G	A	3966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=69;NR=63;PP=2257;SC=CACTCGTCCCGATCCCCAAAT;SOR=0.790;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=132;TCF=69;TCR=63;TR=132;WE=119588970;WS=119588952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr12	119591176	rs34002484	A	AC	633.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=0;PP=699;SC=ATTATTAACCACCGGTGGGGA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=17;WE=119591184;WS=119591166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	119871387	rs1716471	A	G	8791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=153;NR=160;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.848;SC=TCCAAGTGGCACAAACTCCCT;SOR=0.785;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=317;TCF=155;TCR=162;TR=313;WE=119871395;WS=119871377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,339:0.99:341
chr12	119871493	rs1716470	G	A	2185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=54;PP=1572;SC=CCCTCCTGTTGGAGACTAGCT;SOR=2.211;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=19;TCR=55;TR=73;WE=119871501;WS=119871483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr12	119871533	rs1727388	T	C	479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=14;PP=393;SC=TTACTGTCTCTTGGATTTTTG;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=119871541;WS=119871523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	119937983	rs482802	A	C	2853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=55;PP=1791;SC=GGTAACCAACAACACGCGACT;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=35;TCR=55;TR=90;WE=119937991;WS=119937973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr12	119957861	rs708884	T	C	2979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.452;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=57;PP=1629;ReadPosRankSum=2.155;SC=TCCTCCCACATGTAGTTACTG;SOR=0.650;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=247;TCF=141;TCR=106;TR=132;WE=119957869;WS=119957851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,145:0.55:264
chr12	119958068	rs573590	T	C	1066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=27;PP=663;SC=ACTGCAGGGATGCTCCTCCCC;SOR=2.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=35;WE=119958076;WS=119958058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr12	119960612	rs708887	G	T	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.988;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=209;ReadPosRankSum=0.675;SC=AGAGTTCTGTGACTGGTGCCT;SOR=1.179;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=14;WE=119960620;WS=119960588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr12	119960838	rs2239904	C	G	1196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.505;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=31;PP=796;ReadPosRankSum=-1.702;SC=AGGAACCACGCAAGAGGGAAT;SOR=0.512;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=114;TCF=44;TCR=70;TR=52;WE=119960846;WS=119960828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,56:0.44:126
chr12	119961587	rs78218795	G	A	2692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.665;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=44;PP=1542;ReadPosRankSum=-0.326;SC=CAGGAGGCTGGCTTCTGCCTG;SOR=0.587;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=191;TCF=117;TCR=74;TR=108;WE=119961595;WS=119961577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,122:0.56:218
chr12	119966250	rs3915269	G	C	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=199;ReadPosRankSum=0.395;SC=CTTGGAGAGAGCTGTATCCTC;SOR=1.314;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=10;WE=119966258;WS=119966240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr12	119978404	rs708889	A	G	1813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=31;PP=985;ReadPosRankSum=1.212;SC=GATTGCCACTATGTCTGCCTC;SOR=0.750;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=174;TCF=99;TCR=75;TR=78;WE=119978412;WS=119978394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,89:0.45:199
chr12	120067561	rs2301653	T	C	1537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=12;PP=882;SC=GCTACAACGATGGAGACTACG;SOR=1.877;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=37;TCR=12;TR=49;WE=120067569;WS=120067551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr12	120067727	rs2301654	C	T	7595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=128;NR=125;PP=2965;SC=CTTTCTCGAACGCCCGTTGGA;SOR=0.707;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=254;TCF=129;TCR=125;TR=253;WE=120067735;WS=120067717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,282:1.00:282
chr12	120067864	rs2893805	G	A	2427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=54;PP=1608;SC=CTTCTAGTGCGGGAGTGGGTG;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=20;TCR=54;TR=74;WE=120067872;WS=120067854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr12	120078473	.	TTC	T	63.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.207;ClippingRankSum=0.000;DP=236;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQRankSum=3.154;QD=0.31;ReadPosRankSum=3.418;SOR=0.759;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:187,19:0.09:206
chr12	120078577	rs2301655	T	C	2831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=38;NR=55;PP=1752;SC=CCAAAGGAGTTTCTAAGGAAT;SOR=1.270;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=96;TCF=38;TCR=58;TR=93;WE=120078585;WS=120078567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr12	120106376	rs6490267	G	T	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=133;ReadPosRankSum=0.557;SC=TCTCTTAGCGGTCCAAGAACC;SOR=1.022;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=9;WE=120106384;WS=120106366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr12	120109284	rs138621699	AGGCACCTCTTCACAGGAC	A	197.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.468;NF=1;NR=2;PP=683;ReadPosRankSum=0.249;SC=TCATGGTAAAAGGCACCTCTT;SOR=0.787;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=3;WE=120109309;WS=120109274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr12	120112099	rs278145	C	T	733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.013;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=7;PP=474;ReadPosRankSum=0.007;SC=AGAATAACTCCGCAGACCTTC;SOR=0.892;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=61;TCF=44;TCR=17;TR=29;WE=120112107;WS=120112089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,32:0.48:66
chr12	120114205	rs10849690	C	G	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.387;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=372;ReadPosRankSum=-0.186;SC=CTCTTGGAACCAGTGCATCCT;SOR=1.085;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=46;TCF=36;TCR=10;TR=22;WE=120114213;WS=120114195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,23:0.48:48
chr12	120114507	rs278149	G	T	924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.741;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=25;PP=537;ReadPosRankSum=-0.463;SC=CGGACCATCCGCCGTGGGTCA;SOR=0.842;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=102;TCF=39;TCR=63;TR=38;WE=120114515;WS=120114497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,46:0.39:118
chr12	120126074	rs10669112	A	AAGG	4000.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.615;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.540;NF=3;NR=35;PP=1678;ReadPosRankSum=0.017;SC=GGAGTGAAATAAGGAGGAGTG;SOR=0.811;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=117;TCF=9;TCR=108;TR=38;WE=120126082;WS=120126064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,105:0.46:228
chr12	120135717	rs278126	G	T	2424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.591;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=46;PP=1599;ReadPosRankSum=-1.072;SC=GAAGGAACATGCGGCCGGCCC;SOR=0.821;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=209;TCF=117;TCR=92;TR=107;WE=120135725;WS=120135707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,115:0.50:231
chr12	120150196	rs804667	C	T	1107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.618;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=23;PP=529;ReadPosRankSum=-1.097;SC=GGATTTCCCCCGTTCCCACTG;SOR=0.971;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=86;TCF=40;TCR=46;TR=43;WE=120150204;WS=120150186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,52:0.53:99
chr12	120152084	rs34105832	G	A	1923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.030;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=44;PP=985;ReadPosRankSum=-0.095;SC=TCAGTCCTACGTTGAATCGGT;SOR=0.792;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=195;TCF=98;TCR=97;TR=84;WE=120152092;WS=120152074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,100:0.44:226
chr12	120156141	rs278102	G	A	1236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=30;PP=717;ReadPosRankSum=0.129;SC=GCACGATGGCGGACATGGCGA;SOR=0.676;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=102;TCF=41;TCR=61;TR=50;WE=120156149;WS=120156131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,58:0.51:114
chr12	120158203	rs7299963	C	T	1316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=23;PP=851;ReadPosRankSum=-0.060;SC=TTCCTATGATCATATATCACA;SOR=0.725;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=121;TCF=77;TCR=44;TR=60;WE=120158211;WS=120158193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,62:0.48:128
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chr12	120172173	rs11064891	G	A	3652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-5.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.419;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=77;PP=1950;ReadPosRankSum=1.751;SC=CTGCAAATCAGTAGCACTGAT;SOR=0.312;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=242;TCF=107;TCR=135;TR=150;WE=120172181;WS=120172163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,166:0.61:272
chr12	120189879	rs904655	A	G	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=1.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.62;ReadPosRankSum=0.117;SOR=0.334;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,8:0.16:50
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chr12	120195354	rs34851548	TG	T	981.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.810;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=553;ReadPosRankSum=-0.171;SC=GCCTTCCTGGTGGGGGTGGTG;SOR=0.850;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=41;TCF=6;TCR=35;TR=19;WE=120195362;WS=120195344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,39:0.45:87
chr12	120220282	rs440299	A	G	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=75;ReadPosRankSum=0.492;SC=AGGTCCAAGCAAGCCGAGATG;SOR=0.399;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=7;WE=120220290;WS=120220272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr12	120220589	rs385959	C	T	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.222;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.049;NF=2;NR=8;PP=166;ReadPosRankSum=1.404;SC=TGGTTGCCGACTCCGGTTTCC;SOR=0.088;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=10;WE=120220597;WS=120220579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr12	120270528	rs4767849	T	C	764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.343;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=7;PP=516;ReadPosRankSum=-0.543;SC=GGACCAAGAATACTTTTTAGT;SOR=1.169;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=69;TCF=51;TCR=18;TR=32;WE=120270536;WS=120270518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,35:0.45:78
chr12	120287990	rs142505542	A	T	3258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.952;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=72;PP=1918;ReadPosRankSum=-1.621;SC=GATAAAGGTGATTTTTGTCCT;SOR=0.868;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=290;TCF=147;TCR=143;TR=140;WE=120287998;WS=120287980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,159:0.49:327
chr12	120527599	rs17841967	T	C	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.113;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.77;ReadPosRankSum=-0.114;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr12	120537042	rs7971249	C	G	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=338;ReadPosRankSum=-0.434;SC=CGTCAGGACACTGACCCGGAA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=16;WE=120537050;WS=120537032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr12	120567406	rs2240312	C	A	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.322;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=314;ReadPosRankSum=1.171;SC=ACACTGACCCCCCCTGCTCCT;SOR=1.044;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=22;WE=120567414;WS=120567396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,24:0.56:43
chr12	120575549	rs3864938	A	C	9729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=353;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=166;NR=163;PP=2965;SC=TCCAGCAGATACTCGATGATG;SOR=0.699;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=330;TCF=166;TCR=164;TR=329;WE=120575557;WS=120575539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,351:1.00:351
chr12	120580393	.	G	T	3079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=0.000;DP=354;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.272;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=76;PP=1946;ReadPosRankSum=-1.596;SC=CAAGGTGCGGGGGGTATTGGA;SOR=0.672;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=333;TCF=173;TCR=160;TR=151;WE=120580401;WS=120580373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:198,156:0.44:354
chr12	120588852	rs4503602	A	G	2134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=21;PP=1402;SC=CGCACAAGCAACGGCCTCCAC;SOR=1.708;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=47;TCR=21;TR=68;WE=120588860;WS=120588842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr12	120589160	rs2286046	A	G	2140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=37;PP=1280;SC=TGGCTGGCACAAGGGGTGGCA;SOR=0.717;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=41;TCR=37;TR=78;WE=120589168;WS=120589150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr12	120591251	rs10735071	C	T	6943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=98;NR=133;PP=2965;SC=GTCAACCCTACAGGCTGCATC;SOR=1.051;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=231;TCF=98;TCR=133;TR=231;WE=120591259;WS=120591241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr12	120595883	rs117191025	G	A	1660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.427;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=42;PP=1115;ReadPosRankSum=0.426;SC=GCAGGGACCCGGGCCACTGCT;SOR=0.464;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=121;TCF=38;TCR=83;TR=65;WE=120595891;WS=120595873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,71:0.54:132
chr12	120606163	rs6490286	T	C	2534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=55;PP=1786;SC=AGAGCTGATCTACTCCATCCT;SOR=2.484;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=17;TCR=56;TR=72;WE=120606171;WS=120606153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr12	120612861	.	C	A	22	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MMLQ=16;MQ=59.88;NF=4;NR=0;PP=22;QD=14.1928031368;SC=ACCTGGGAGGCAGAGGTTGCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=4;WE=120612869;WS=120612852;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:9,4:0.31:13
chr12	120650264	rs25664	G	A	2550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.031;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=60;PP=1555;ReadPosRankSum=0.386;SC=TGCAGCGGCCGGTGATGGGCT;SOR=0.803;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=208;TCF=98;TCR=110;TR=110;WE=120650272;WS=120650254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,119:0.53:225
chr12	120661977	rs4767884	T	C	1548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=8;PP=906;SC=AATCGGGAGCTGCTGGGCTGC;SOR=2.670;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=50;TCF=40;TCR=10;TR=48;WE=120661985;WS=120661967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr12	120720038	rs7960743	T	C	3810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=42;PP=2154;SC=CACTGCCGCCTGGCCCCTCCA;SOR=1.385;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=84;TCR=42;TR=126;WE=120720046;WS=120720028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr12	120750239	rs2261612	A	G	2038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=18;PP=1354;SC=CTGTTCAGTCAGCGTCTTCCT;SOR=1.905;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=52;TCR=18;TR=70;WE=120750247;WS=120750229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr12	120783527	rs1076205	G	A	1760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=38;PP=1093;SC=GAAGTGAGGCGCTGACCTCTC;SOR=1.376;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=25;TCR=38;TR=63;WE=120783535;WS=120783517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr12	120783561	rs1076206	T	C	1075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=10;NR=26;PP=792;SC=ATCGCCCCCCTACTGCAGGTC;SOR=1.923;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=11;TCR=26;TR=36;WE=120783569;WS=120783551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr12	120791042	rs1007469	G	A	677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.21;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr12	120794653	rs1179441	T	C	2017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=5;PP=1568;SC=CCCCTGCTAGTCCTGGGAGCA;SOR=4.014;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=62;TCF=56;TCR=6;TR=61;WE=120794661;WS=120794643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr12	120796703	rs1179445	T	A	705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=0;PP=522;SC=ACGCAGATCCTGGGGGATAGG;SOR=4.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=120796711;WS=120796693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	120800823	rs757123	A	G	3205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=63;NR=39;PP=1758;SC=CCCCAGCAGCAAGCGCCCCCA;SOR=0.888;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=63;TCR=39;TR=102;WE=120800831;WS=120800813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr12	120801064	rs34243955	GC	G	49.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=2;PP=26;SC=CTCTTTAAAGGCCCCCCCCCC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=120801072;WS=120801054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr12	120806129	rs111293994	C	CT	1769.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.66;QD=31.05;SOR=1.835;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,55:0.96:57
chr12	120882835	rs3858722	TAC	T	346.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=284;ReadPosRankSum=-0.416;SC=AATATGACAGTACAAAAGTAA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=8;WE=120882844;WS=120882825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr12	120884328	rs2235217	C	T	2846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.454;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=61;PP=1722;ReadPosRankSum=-1.183;SC=CCCCTCTGGGCGGGCGCCAGG;SOR=0.755;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=292;TCF=150;TCR=142;TR=132;WE=120884336;WS=120884318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,141:0.46:309
chr12	120897652	rs28390349	T	C	983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=2;PP=707;SC=AGCGAGACTCTGTCTCAAAAC;SOR=4.047;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=29;WE=120897660;WS=120897642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr12	120901765	rs145299974	G	A	2896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.884;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=58;PP=1818;ReadPosRankSum=-0.484;SC=CATGAGAGCGGAATTTGGTGT;SOR=0.628;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=270;TCF=147;TCR=123;TR=127;WE=120901773;WS=120901755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,140:0.47:296
chr12	120907271	rs11548262	G	T	2412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=34;PP=1141;ReadPosRankSum=-1.711;SC=AGGCCGTGCCGGTTCTTGAGC;SOR=0.726;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=173;TCF=111;TCR=62;TR=93;WE=120907279;WS=120907261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,114:0.55:206
chr12	120934407	rs1563333	C	T	3516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=386;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.773;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=91;PP=2150;ReadPosRankSum=-0.377;SC=GGGGTTCCTTCCCCCCGATCC;SOR=0.634;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=350;TCF=157;TCR=193;TR=169;WE=120934415;WS=120934397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:205,180:0.47:385
chr12	120941927	rs7136951	C	T	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.412;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=73;ReadPosRankSum=2.011;SC=AGAACATGCCCCTCACTTCTT;SOR=0.293;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=7;WE=120941935;WS=120941917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr12	120942911	rs4766966	G	C	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=215;ReadPosRankSum=1.261;SC=CCTCTTGTTTGTTCTCACTTG;SOR=0.746;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=38;TCF=13;TCR=25;TR=16;WE=120942919;WS=120942901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,16:0.37:43
chr12	120947788	rs4766968	G	C	1588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.451;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=18;PP=1069;ReadPosRankSum=1.649;SC=TTTCCTGAGAGTCATACAAGC;SOR=0.527;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=137;TCF=103;TCR=34;TR=67;WE=120947796;WS=120947778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,73:0.49:149
chr12	120947948	rs500003	G	A	8079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=113;NR=163;PP=2965;SC=AGTGAGTTCCGGGTCTCAGTG;SOR=1.144;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=276;TCF=113;TCR=163;TR=276;WE=120947956;WS=120947938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,296:1.00:296
chr12	120954490	rs3742049	C	T	4251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=449;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.221;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=99;NR=84;PP=2472;ReadPosRankSum=3.201;SC=TACTCTTTGGCAATTTCTTCC;SOR=0.676;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=405;TCF=202;TCR=203;TR=183;WE=120954498;WS=120954480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:241,208:0.46:449
chr12	120966659	rs55848094	G	A	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.188;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=4;PP=454;ReadPosRankSum=-0.052;SC=GAACTAATTGGATGTTAAATC;SOR=1.041;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=74;TCF=59;TCR=15;TR=26;WE=120966667;WS=120966649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,25:0.34:74
chr12	120966921	rs3742052	A	G	1096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=37;PP=803;ReadPosRankSum=-0.593;SC=AGCTCCATAGAGCACAGCTCC;SOR=0.836;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=92;TCF=12;TCR=80;TR=42;WE=120966929;WS=120966911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,45:0.46:97
chr12	120990582	rs12309824	A	C	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=50;ReadPosRankSum=-0.705;SC=GGCTTTTTTTAAGCTATTGTG;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=4;WE=120990590;WS=120990572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr12	120992401	rs3213565	C	T	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=417;ReadPosRankSum=1.587;SC=TGCAGTGCCTCATGAACCAGG;SOR=0.839;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=64;TCF=50;TCR=14;TR=25;WE=120992409;WS=120992391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,26:0.39:66
chr12	120994932	rs7956998	G	A	833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=0;PP=597;SC=ATGTACCTACGTTGTAAACAA;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=24;WE=120994940;WS=120994922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	120995332	rs2292681	G	A	2728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.446;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=56;PP=1625;ReadPosRankSum=-0.879;SC=TGCTACATATGAGTGTCCATG;SOR=0.650;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=235;TCF=121;TCR=114;TR=117;WE=120995350;WS=120995322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,132:0.50:265
chr12	120998443	rs603574	A	G	562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.610;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=302;ReadPosRankSum=-1.243;SC=CCCCAGAGAAAAGGCTGTATT;SOR=1.221;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=58;TCF=39;TCR=19;TR=23;WE=120998451;WS=120998433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,27:0.42:64
chr12	120998481	rs787949	G	A	3261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=42;PP=1954;SC=CTACACCATCGTGAGCTTTGA;SOR=0.973;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=65;TCR=42;TR=106;WE=120998489;WS=120998471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr12	121004564	rs35194242	CAA	C	65.75	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=7.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.22;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr12	121004590	rs546417	C	A	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.846;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=279;ReadPosRankSum=-1.126;SC=AAATTGAATTCTGTAAATGGG;SOR=1.270;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=47;TCF=32;TCR=15;TR=20;WE=121004598;WS=121004580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,16:0.39:41
chr12	121008958	rs2280168	G	A	1694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FS=1.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.159;SOR=0.854;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,85:0.49:172
chr12	121009198	rs651627	C	T	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.987;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=52;ReadPosRankSum=1.846;SC=CATTCTAATACGGCTGGACAA;SOR=1.347;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=6;WE=121009206;WS=121009188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
chr12	121012456	rs11611781	C	T	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5005;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=83;ReadPosRankSum=1.242;SC=TGGCTGGGCACGGTGTCTCAT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=5;WE=121012464;WS=121012446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr12	121014987	.	G	GT	243.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=0.000;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=0.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.90;ReadPosRankSum=1.351;SOR=0.872;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:102,26:0.20:128
chr12	121017171	rs7174	A	G	3092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=29;PP=1674;SC=TCCTCCTCTAATAAGCAGCTT;SOR=1.350;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=61;TCR=29;TR=90;WE=121017179;WS=121017161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr12	121017243	rs509445	A	C	2474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.529;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=39;PP=1334;ReadPosRankSum=-0.080;SC=CAGGGATGAAAGATATCTTTG;SOR=1.004;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=201;TCF=120;TCR=81;TR=104;WE=121017251;WS=121017233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,116:0.50:230
chr12	121017439	rs563920	A	G	3697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=73;PP=2486;SC=CTTGTGAAAGATCTCGACCTT;SOR=1.353;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=48;TCR=73;TR=121;WE=121017447;WS=121017429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr12	121017474	rs3833953	GT	G	1391.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=21;PP=1192;ReadPosRankSum=-1.318;SC=GTAGGGGGAAGTGTCTTGTTA;SOR=0.601;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=62;TCF=22;TCR=40;TR=31;WE=121017482;WS=121017464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,41:0.56:73
chr12	121019323	rs591992	T	C	397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=12;PP=340;SC=CTGTCAGCTCTCTCAAGCCCC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=121019331;WS=121019313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	121093629	rs112935060	CGTGCGTGT	CGT,C	2210.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=1.953;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.428;NF=22,22;NR=27,27;PP=91,1790;ReadPosRankSum=1.552;SC=CCAGTGCGTGCGTGCGTGTGT;SOR=1.371;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=56;TCF=24;TCR=32;TR=49,49;WE=121093644;WS=121093611;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.89:83
chr12	121094110	rs569499	T	C	304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=11;PP=231;SC=CCGCTGAACTTGGCTTCACAG;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=121094118;WS=121094100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	121097622	rs529584	G	A	4235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=57;PP=2528;SC=CCCAGGTTAGGTATTTTGTGA;SOR=1.114;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=144;TCF=87;TCR=57;TR=144;WE=121097630;WS=121097612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr12	121131891	rs2393749	C	T	3296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=43;PP=1924;SC=CTTTTGTCCTCAGCCTCAGAC;SOR=0.991;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=63;TCR=43;TR=106;WE=121131899;WS=121131881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr12	121132100	rs7964786	C	T	782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=20;PP=537;SC=TGCTGCTTGACCAGTAGGACA;SOR=2.753;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=25;WE=121132108;WS=121132090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	121133037	rs504403	G	C	1116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=26;PP=769;SC=TTGAGCTGATGACTATTTTGG;SOR=2.073;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=10;TCR=26;TR=36;WE=121133045;WS=121133027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr12	121151062	rs3833788	CTCTCTTG	C	8453.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=53;PP=2976;SC=GTTGGTTTCTCTCTCTTGTTT;SOR=1.634;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=102;TCF=47;TCR=55;TR=97;WE=121151076;WS=121151052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr12	121157535	rs56179458	GC	AA	372.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=1;PP=280;SC=CAGCTGGGGGGCCTCTGTGGT;SOR=3.056;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=6;WE=121157544;WS=121157525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	121157851	rs3752531	A	G	3332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=35;NR=72;PP=2038;SC=GCAAGAGTAGATAGGGGAGGT;SOR=1.903;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=35;TCR=72;TR=107;WE=121157859;WS=121157841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr12	121163518	rs2239760	C	A	411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=2;PP=333;SC=GCGTCGGTTCCTCGCCTTGGG;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=121163526;WS=121163508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	121174899	rs3914	T	C	6845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=118;NR=114;PP=2965;SC=AGATCAGCCGTGGCTGCGCCT;SOR=0.813;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=232;TCF=118;TCR=114;TR=232;WE=121174907;WS=121174889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,263:1.00:263
chr12	121175984	rs555404	T	C	4002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=64;PP=2344;ReadPosRankSum=0.271;SC=CCTGAGCTTCTGAGGGAGGTG;SOR=0.733;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=140;TCF=76;TCR=64;TR=139;WE=121175992;WS=121175974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,151:0.99:153
chr12	121176083	rs1799958	G	A	7090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=129;NR=113;PP=2965;SC=CTCCTTTCAGGGCATCAGTGC;SOR=0.708;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=242;TCF=129;TCR=113;TR=242;WE=121176091;WS=121176073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
chr12	121176679	rs3915	C	T	6446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=105;NR=113;PP=2965;SC=TGACCTGGCGCGCTGCCATGC;SOR=0.888;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=218;TCF=105;TCR=113;TR=218;WE=121176687;WS=121176669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr12	121177272	rs3916	G	C	575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=21;PP=482;SC=GACTGCCCCAGGACTGCGGGA;SOR=6.273;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=121177280;WS=121177262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr12	121220375	rs2393717	G	C	346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=288;SC=TGTAGTGATGGTTGTACAGCT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=121220383;WS=121220371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	121221628	rs7137504	C	T	1132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=26;PP=766;SC=AACTTCATTCCGCCAAACACT;SOR=2.133;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=9;TCR=26;TR=35;WE=121221636;WS=121221618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr12	121222411	rs3213570	C	G	4456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=76;PP=2662;SC=AAGAGAAAAACAGACAGATTA;SOR=1.108;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=133;TCF=57;TCR=76;TR=133;WE=121222419;WS=121222401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr12	121222556	rs3213567	T	C	219.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=151;SC=CCAACGAGATTATGAGCTCCT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=121222564;WS=121222546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	121248584	rs674021	G	A	5734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=117;NR=82;PP=2965;SC=CCTCCAACTTGTATCAACCCC;SOR=1.121;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=199;TCF=117;TCR=82;TR=199;WE=121248592;WS=121248574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr12	121341762	rs7966446	C	T	530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.08;SOR=0.963;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	121341849	rs2686458	A	G	137.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=3;PP=52;SC=CGGGCTCCGAAGCGGCCCCGC;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=5;WE=121341857;WS=121341839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	121431300	rs1169301	C	T	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.752;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=398;ReadPosRankSum=-0.043;SC=CAGTACCCCACTCACGGCTTT;SOR=1.584;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=41;TCF=33;TCR=8;TR=24;WE=121431308;WS=121431290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,25:0.52:48
chr12	121432302	rs1169302	T	G	772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=19;PP=445;ReadPosRankSum=1.200;SC=CTCTTTGCACTTCAGTTTGGT;SOR=0.616;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=62;TCF=28;TCR=34;TR=34;WE=121432310;WS=121432292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,38:0.52:73
chr12	121434630	rs55853809	C	CTCATTCAT	2751.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=16;PP=1862;SC=GCCACTGGGACTCATTCATTC;SOR=0.914;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=22;WE=121434638;WS=121434620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr12	121434725	rs201039488	C	CA	2060.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.867;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.954;NF=7;NR=25;PP=1138;ReadPosRankSum=-0.748;SC=CCAAACAGACCAAAATCTCAG;SOR=0.744;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=64;TCF=17;TCR=47;TR=32;WE=121434733;WS=121434715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,78:0.53:147
chr12	121434833	rs2259852	G	A	1566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=36;PP=1033;SC=AGGGTAAGGGGGACTGATGTT;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=13;TCR=36;TR=49;WE=121434841;WS=121434823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr12	121435342	rs2259820	C	T	1344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.767;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=21;PP=880;ReadPosRankSum=1.589;SC=CCTGACCACCCTGCAGCCCGT;SOR=0.554;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=100;TCF=70;TCR=30;TR=61;WE=121435350;WS=121435332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,62:0.58:107
chr12	121435427	rs2464196	G	A	2240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.328;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=42;PP=1369;ReadPosRankSum=-0.933;SC=GTGACCCAGAGCCCCTTCATG;SOR=0.547;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=199;TCF=118;TCR=81;TR=98;WE=121435435;WS=121435417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,107:0.49:217
chr12	121435475	rs2464195	G	A	8329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=160;NR=121;PP=2965;SC=CACGGTGAGCGCCCTGTGCCC;SOR=0.888;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=281;TCF=160;TCR=121;TR=281;WE=121435483;WS=121435465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,312:1.00:312
chr12	121435536	rs55919842	A	G	2940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.374;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=71;PP=1914;ReadPosRankSum=0.870;SC=ATGCAGGGGAAAGGGGTGCCT;SOR=0.876;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=295;TCF=148;TCR=147;TR=135;WE=121435544;WS=121435526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,144:0.46:315
chr12	121435587	rs2259816	G	T	6637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=107;NR=122;PP=2965;SC=GGACAAGTGTGTTTCCGTGAT;SOR=0.983;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=230;TCF=107;TCR=123;TR=229;WE=121435595;WS=121435577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr12	121437221	rs1169304	T	C	6127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=109;PP=2965;SC=GGCCCTCCCTTGGCCTGTGAC;SOR=0.948;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=203;TCF=94;TCR=109;TR=203;WE=121437229;WS=121437211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr12	121437382	rs1169305	A	G	1303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=27;PP=765;SC=GGACCCTGCCAGCATCCAGCA;SOR=1.473;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=15;TCR=27;TR=42;WE=121437390;WS=121437372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr12	121438844	rs735396	T	C	4134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=44;PP=2650;SC=GGTGGGTGGCTAGCAGCCTTG;SOR=1.457;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=132;TCF=88;TCR=44;TR=132;WE=121438852;WS=121438834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr12	121439433	rs1169310	G	A	6598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=137;NR=81;PP=2965;SC=GAGAGGCCCTGGATCAGCGTG;SOR=1.245;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=220;TCF=138;TCR=82;TR=218;WE=121439441;WS=121439423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr12	121442241	rs73214128	C	T	900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.682;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=24;PP=500;ReadPosRankSum=-1.533;SC=GGATGTCGGACGCCGACACAG;SOR=0.505;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=88;TCF=35;TCR=53;TR=42;WE=121442249;WS=121442231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,47:0.47:101
chr12	121442883	rs11537856	G	A	1964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FS=2.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.15;ReadPosRankSum=1.355;SOR=0.554;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:133,108:0.45:241
chr12	121444026	rs2708082	G	A	106.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.92;QD=21.38;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	121450165	rs2264750	C	T	1308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.748;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=17;PP=887;ReadPosRankSum=0.767;SC=TGACGTGGGCCAATGGGAGGA;SOR=1.042;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=104;TCF=71;TCR=33;TR=57;WE=121450173;WS=121450155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,58:0.55:105
chr12	121450354	rs2264778	C	A	782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=25;PP=562;ReadPosRankSum=-0.573;SC=CAGATAGATGCACTTTTAAGA;SOR=0.790;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=74;TCF=20;TCR=54;TR=33;WE=121450362;WS=121450344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,35:0.45:78
chr12	121450384	rs2254971	G	C	1163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=33;PP=781;SC=GGCCGGGCGCGGTGGCTCACG;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=8;TCR=33;TR=41;WE=121450392;WS=121450374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr12	121454257	rs2258227	T	A	11637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=423;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=204;NR=184;PP=2965;SC=AATCGCTCACTGTGCCACTGG;SOR=0.788;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=391;TCF=205;TCR=186;TR=388;WE=121454273;WS=121454247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,419:1.00:419
chr12	121454313	rs2258287	C	A	4479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=411;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.520;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=115;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.906;SC=AGAACACCGCCGTTATCAAGC;SOR=0.736;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=381;TCF=173;TCR=208;TR=207;WE=121454321;WS=121454303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:195,213:0.52:408
chr12	121471337	rs3213545	G	A	1984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.200;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=40;PP=1289;ReadPosRankSum=-0.899;SC=TGGTGAAGACGAGAGCATCGG;SOR=0.598;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=150;TCF=83;TCR=67;TR=84;WE=121471345;WS=121471327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,93:0.55:169
chr12	121600253	rs208294	T	C	2511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.457;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=54;PP=1647;ReadPosRankSum=0.942;SC=GTGTGTAGTGTATGAAGGGAA;SOR=0.650;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=232;TCF=119;TCR=113;TR=113;WE=121600261;WS=121600243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,123:0.49:253
chr12	121618278	rs112146943	CT	C	66.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.964;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=5.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.34;ReadPosRankSum=1.047;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr12	121622024	rs28360458	G	A	450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=267;ReadPosRankSum=-1.734;SC=AATATTAAACGTAACTTTATA;SOR=0.495;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=32;TCR=6;TR=18;WE=121622032;WS=121622014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr12	121622304	rs3751143	A	C	2693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.210;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=59;PP=1479;ReadPosRankSum=-0.068;SC=TGCCTGGAGGAGCTGTGCTGC;SOR=0.856;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=213;TCF=106;TCR=107;TR=115;WE=121622312;WS=121622294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,130:0.55:236
chr12	121622520	rs1653624	A	T	6302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=106;NR=95;PP=2965;SC=GACTTTGCCAACCTGCCCAGC;SOR=0.719;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=201;TCF=106;TCR=95;TR=201;WE=121622528;WS=121622510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr12	121648132	rs28360467	G	T	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.820;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=3;PP=45;ReadPosRankSum=-2.264;SC=GGGGCGCGGCGGGTGCTGCCC;SOR=0.330;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=5;WE=121648140;WS=121648122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr12	121682051	rs2686340	T	C	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-3.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.831;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=92;ReadPosRankSum=0.678;SC=CCATGGGCCCTGTGACAGAGC;SOR=0.112;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=10;WE=121682059;WS=121682041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr12	121690548	rs2686344	T	C	2319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=3.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.48;ReadPosRankSum=-0.988;SOR=0.396;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,61:0.56:108
chr12	121690555	rs2686345	T	C	2316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=3.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.71;ReadPosRankSum=-0.445;SOR=0.413;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,59:0.58:102
chr12	121706533	rs1718120	T	G	1020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=2.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.31;ReadPosRankSum=-0.004;SOR=0.439;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,52:0.53:99
chr12	121707321	rs1109453	G	A	1290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.070;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=16;PP=850;ReadPosRankSum=-0.186;SC=AGGAGAATGCGGATACTCACA;SOR=1.088;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=145;TCF=96;TCR=49;TR=56;WE=121707329;WS=121707311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,62:0.40:155
chr12	121712077	rs3817190	T	A	1640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=28;PP=969;ReadPosRankSum=-0.781;SC=GACCCGGAGGTGTCAAGGGGG;SOR=0.671;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=181;TCF=106;TCR=75;TR=67;WE=121712087;WS=121712067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,78:0.39:202
chr12	121764799	rs4980993	A	C	2191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=32;PP=1566;SC=GTCGAGCAGAACTGTCCAACA;SOR=1.193;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=50;TCR=32;TR=82;WE=121764807;WS=121764789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr12	121768248	rs2280067	C	T	881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=3;PP=689;SC=TAATTAAAGTCATATGAAACT;SOR=4.407;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=27;WE=121768256;WS=121768238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr12	121773552	rs3751162	T	C	1305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=30;PP=908;SC=ATCAATGTATTTTAAACGCTG;SOR=1.514;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=16;TCR=30;TR=46;WE=121773560;WS=121773542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr12	121785795	rs1169961	C	A	1192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=30;PP=810;SC=TCACTCCAAACATGCAAATAA;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=10;TCR=30;TR=40;WE=121785803;WS=121785785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr12	121789927	rs1799525	C	A	1423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=5;PP=1058;SC=AGCCAGCGGGCGCCTCTCACC;SOR=3.912;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=39;TCR=5;TR=43;WE=121789935;WS=121789917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr12	121853164	rs11065565	T	C	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.209;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=214;ReadPosRankSum=-0.111;SC=TGGCTCACACTTGTAATCTGA;SOR=0.400;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=43;TCF=17;TCR=26;TR=18;WE=121853172;WS=121853154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,19:0.41:46
chr12	121870922	rs12427382	G	A	916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=16;PP=491;ReadPosRankSum=1.860;SC=CCTCTTTGGAGGCTCATTCAT;SOR=0.776;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=85;TCF=49;TCR=36;TR=41;WE=121870930;WS=121870912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,46:0.51:90
chr12	121871006	rs11065575	A	C	948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=5.691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.91;ReadPosRankSum=-0.603;SOR=1.040;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,51:0.43:120
chr12	121878659	rs1064951	C	T	1661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=30;PP=1053;ReadPosRankSum=-0.912;SC=GATCCCGCATCTGGGCATCCT;SOR=0.671;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=180;TCF=114;TCR=66;TR=79;WE=121878667;WS=121878649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,85:0.42:203
chr12	121879111	rs2288154	G	C	525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=387;ReadPosRankSum=-1.015;SC=GCTCTTAACTGTCCCCACCTA;SOR=0.330;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=40;TCF=10;TCR=30;TR=22;WE=121879119;WS=121879101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,23:0.53:43
chr12	121880520	rs3751131	G	A	917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.545;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=14;PP=475;ReadPosRankSum=0.672;SC=AGCGGGAGTGGTCGCTCTCCC;SOR=0.980;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=102;TCF=56;TCR=46;TR=39;WE=121880528;WS=121880510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,47:0.42:111
chr12	121881848	rs10849885	G	A	1546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.778;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=30;PP=1017;ReadPosRankSum=1.915;SC=GGGGCTTCTCGTATTTCCGCT;SOR=0.425;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=144;TCF=90;TCR=54;TR=71;WE=121881856;WS=121881838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,73:0.47:156
chr12	121882098	rs3817551	T	G	4448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=515;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.115;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=96;PP=2847;ReadPosRankSum=1.587;SC=AAAGAGAGAATGAACAGACCA;SOR=0.619;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=473;TCF=247;TCR=226;TR=197;WE=121882106;WS=121882088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:299,216:0.42:515
chr12	122064773	rs141919534	CCCGCCA	C	4609.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.18;MQRankSum=0.219;QD=26.34;ReadPosRankSum=-0.344;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,173:0.99:175
chr12	122079189	rs3741595	C	T	4483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=362;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.831;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=104;PP=2750;ReadPosRankSum=-1.724;SC=CCACCGTCATCGGCACGCTGC;SOR=0.864;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=334;TCF=157;TCR=177;TR=190;WE=122079197;WS=122079179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,208:0.58:361
chr12	122079441	rs3825175	T	C	5007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=459;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=114;NR=102;PP=2513;ReadPosRankSum=-0.103;SC=GCCATAAGACTGACCGACAGT;SOR=0.700;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=418;TCF=214;TCR=204;TR=216;WE=122079449;WS=122079431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:213,244:0.53:457
chr12	122097043	rs63632160	GCACA	G,GCACACA	1401.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.436;NF=17,17;NR=8,8;PP=75,565;ReadPosRankSum=-1.105;SC=ACACACGCGCGCACACACACA;SOR=1.445;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=40;TCF=27;TCR=13;TR=25,25;WE=122097056;WS=122097031;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.60:53
chr12	122186268	rs28651018	C	T	1714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=31;PP=1011;ReadPosRankSum=-1.582;SC=AGGCGGAGCTCGTTCAGCAGA;SOR=0.667;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=161;TCF=96;TCR=65;TR=77;WE=122186282;WS=122186258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,84:0.48:176
chr12	122186317	rs28655666	G	A	1639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.539;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=31;PP=877;ReadPosRankSum=-0.046;SC=CGTCTTCTTCGACATGGAGGC;SOR=0.770;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=170;TCF=95;TCR=75;TR=73;WE=122186325;WS=122186307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,84:0.45:187
chr12	122209333	rs12299238	G	A	1643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.020;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=26;PP=930;ReadPosRankSum=0.293;SC=GAGTTGGGGCGGGGAGGAATG;SOR=0.531;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=143;TCF=91;TCR=52;TR=67;WE=122209341;WS=122209323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,80:0.49:164
chr12	122212752	rs7314742	G	T	684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.276;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=19;PP=463;ReadPosRankSum=2.108;SC=TCCTGGGGCCGGGGCAGCCTC;SOR=0.422;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=59;TCF=20;TCR=39;TR=30;WE=122212760;WS=122212742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,30:0.49:61
chr12	122217856	rs59641582	G	GGT	3351.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=24;PP=1521;SC=GGTTCCCCCAGGTGTCTCCCA;SOR=0.798;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=9;TCR=26;TR=32;WE=122217864;WS=122217846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr12	122218489	rs7136373	C	G	2242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.072;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=51;PP=1368;ReadPosRankSum=2.300;SC=CTCCACTTCTCGCTAGCTGTG;SOR=0.598;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=189;TCF=88;TCR=101;TR=96;WE=122218497;WS=122218479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,106:0.51:209
chr12	122231368	rs2707067	C	A	1161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.801;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=16;PP=589;ReadPosRankSum=-0.971;SC=AGGGGCGTCCCTCGCCCCCAC;SOR=0.547;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=74;TCF=47;TCR=27;TR=42;WE=122231376;WS=122231358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,54:0.59:92
chr12	122231573	rs2707066	C	T	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=7;PP=179;ReadPosRankSum=1.231;SC=GGCGGCGCGCCGGGCACTAGC;SOR=0.610;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=12;WE=122231581;WS=122231563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr12	122243905	rs1168666	C	T	3263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=386;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.670;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=72;PP=1780;ReadPosRankSum=-2.209;SC=ACCTGGGCATCGCCAAGGTGG;SOR=0.742;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=352;TCF=180;TCR=172;TR=144;WE=122243913;WS=122243888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:219,166:0.43:385
chr12	122248582	rs895952	C	G	3365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=363;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.371;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=72;PP=2135;ReadPosRankSum=1.631;SC=CAACACCCCTCCCAGACTCCG;SOR=0.592;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=327;TCF=176;TCR=151;TR=146;WE=122248590;WS=122248572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:200,162:0.45:362
chr12	122257890	rs11043202	G	A	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.684;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=146;ReadPosRankSum=0.000;SC=GGGGTAGATCGCTGACCGTCC;SOR=2.115;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=10;WE=122257898;WS=122257880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr12	122284715	rs2247291	T	C	1218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=24;PP=780;ReadPosRankSum=-0.890;SC=TTTGCAGAGATCGTCCCTGGC;SOR=0.424;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=123;TCF=76;TCR=47;TR=61;WE=122284723;WS=122284705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,61:0.47:130
chr12	122287132	rs3832816	CT	C	367.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.932;NF=0;NR=12;PP=205;ReadPosRankSum=-1.121;SC=AAGAGAGACTCTTTTTTTTGC;SOR=0.420;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=12;WE=122287140;WS=122287122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,17:0.74:23
chr12	122295335	rs1154510	T	C	3657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.433;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.828;NF=75;NR=97;PP=2015;ReadPosRankSum=-2.444;SC=TAGAATGACGTGGCCTGAATC;SOR=0.601;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=287;TCF=121;TCR=166;TR=172;WE=122295343;WS=122295325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,178:0.60:298
chr12	122326812	rs2230681	T	C	2059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.537;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=38;PP=1204;ReadPosRankSum=0.991;SC=CAGGCCGGCGTCGTGACTGTC;SOR=0.534;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=163;TCF=92;TCR=71;TR=85;WE=122326820;WS=122326802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,98:0.53:185
chr12	122348666	.	CA	C	35.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.023;ClippingRankSum=0.000;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.57;ReadPosRankSum=0.247;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,11:0.17:63
chr12	122353613	.	C	T	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.960;ClippingRankSum=-0.000;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.79;ReadPosRankSum=-1.282;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr12	122359172	rs6486782	T	C	1191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.131;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=18;PP=816;ReadPosRankSum=-1.532;SC=AGCTGGTTATTATGGTCAAAA;SOR=0.360;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=98;TCF=67;TCR=31;TR=52;WE=122359180;WS=122359162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,54:0.51:105
chr12	122359397	rs142042908	G	GGAGGAGGAGGAGAAA	2518.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=4.173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.74;MQRankSum=4.159;QD=17.99;ReadPosRankSum=-0.348;SOR=0.413;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,57:0.41:140
chr12	122361929	rs34885077	CT	C	496.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.356;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.798;NF=2;NR=11;PP=394;ReadPosRankSum=-0.689;SC=TCCCCCAGTGCTTTTGAGAGT;SOR=0.148;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=13;WE=122361937;WS=122361919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
chr12	122389248	rs1185260	A	G	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.900;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=182;ReadPosRankSum=-1.262;SC=ATTTCCCAAGACAGCAAGTTC;SOR=0.018;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=12;WE=122389256;WS=122389238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr12	122391963	rs1154513	A	G	618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.577;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=491;ReadPosRankSum=-0.519;SC=AAAATATCGTATTGATAAATG;SOR=0.252;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=42;TCF=34;TCR=8;TR=25;WE=122391971;WS=122391953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,25:0.60:42
chr12	122394921	rs11043271	A	C	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=94;ReadPosRankSum=1.077;SC=ATTAGGTATTATATAGATGCT;SOR=0.250;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=6;WE=122394929;WS=122394911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr12	122409664	rs658957	T	C	806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.076;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=21;PP=592;ReadPosRankSum=2.719;SC=ATCTTTGTGATATGGTTTGGC;SOR=0.546;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=55;TCF=18;TCR=37;TR=32;WE=122409672;WS=122409654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,33:0.58:57
chr12	122439369	rs1182927	T	C	2022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=31;PP=1176;ReadPosRankSum=0.573;SC=GCCTCAAGAGTTAAACAATCA;SOR=0.715;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=214;TCF=132;TCR=82;TR=85;WE=122439377;WS=122439359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,100:0.42:238
chr12	122492598	rs2280573	A	G	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=146;ReadPosRankSum=-0.730;SC=TGTAGCCTTCAAAGACCACTG;SOR=0.922;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=12;WE=122492606;WS=122492588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr12	122497001	rs28629903	T	C	1722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.113;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=24;PP=1207;ReadPosRankSum=-1.909;SC=CCCCAAGGATTTGGAAGGAGT;SOR=0.927;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=140;TCF=89;TCR=51;TR=70;WE=122497009;WS=122496991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,74:0.49:151
chr12	122611620	rs75503016	A	G	131.03	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5564;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=93;ReadPosRankSum=-0.792;SC=CAGTATCCCCACCATGCCCTG;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=6;WE=122611628;WS=122611619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr12	122611641	rs78324047	C	T	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.740;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=215;ReadPosRankSum=1.457;SC=CCCTGTGTGGCTCTGAAGAAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=11;WE=122611649;WS=122611631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr12	122612325	rs7488393	G	A	850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.278;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=6;PP=605;ReadPosRankSum=-1.100;SC=GAAGGAAAGGGTACCTGGGAA;SOR=0.394;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=72;TCF=62;TCR=10;TR=34;WE=122612333;WS=122612309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,35:0.46:76
chr12	122612350	rs7486198	G	T	1357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.576;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=14;PP=914;ReadPosRankSum=-0.343;SC=GTCTGCCCTAGGGGAGGGGTG;SOR=0.934;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=122;TCF=90;TCR=32;TR=56;WE=122612358;WS=122612340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,61:0.46:133
chr12	122612598	rs7484733	T	C	1304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.453;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=28;PP=745;ReadPosRankSum=-0.550;SC=GCTGGTCCTGTAGGAGAGGCT;SOR=0.351;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=71;TCF=21;TCR=50;TR=42;WE=122612606;WS=122612588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,51:0.63:81
chr12	122612625	rs10847611	C	G	1051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.37;ReadPosRankSum=-0.573;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,29:0.64:45
chr12	122612635	rs6489238	G	A	959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.94;ReadPosRankSum=-1.432;SOR=0.651;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,25:0.68:37
chr12	122613540	rs6489244	T	C	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=216;ReadPosRankSum=-1.540;SC=TGGGACGTACTTTCTGAGTGA;SOR=0.947;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=34;TCF=24;TCR=10;TR=16;WE=122613548;WS=122613530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr12	122613599	rs10847853	A	G	1012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.97;ReadPosRankSum=0.735;SOR=0.536;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,53:0.42:127
chr12	122614060	rs7487608	G	T	2052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.756;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=36;PP=1335;ReadPosRankSum=-0.521;SC=CTCCCTGAGAGTTCTGTATAT;SOR=0.867;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=187;TCF=118;TCR=69;TR=95;WE=122614068;WS=122614050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,101:0.50:202
chr12	122614209	rs5801481	CT	C	2926.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.761;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.452;NF=1;NR=51;PP=1758;ReadPosRankSum=-0.120;SC=AGGACCCCCACTTTGACATGA;SOR=0.845;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=112;TCF=3;TCR=109;TR=52;WE=122614217;WS=122614199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,101:0.49:206
chr12	122614387	rs7487292	T	G	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.280;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=337;ReadPosRankSum=-0.920;SC=TCACTTCCACTGAGCACCCCT;SOR=0.446;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=46;TCF=36;TCR=10;TR=26;WE=122614395;WS=122614377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,26:0.52:50
chr12	122615515	rs4758654	C	G	1145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-2.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.926;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=35;PP=775;ReadPosRankSum=0.563;SC=ACGGTTGCCTCCATCTCCCCC;SOR=1.002;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=82;TCF=23;TCR=59;TR=46;WE=122615523;WS=122615505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,50:0.53:94
chr12	122616759	rs7955571	G	A	3200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=0.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.26;ReadPosRankSum=-1.819;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,83:0.53:158
chr12	122616766	rs7955575	G	A	3315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FS=1.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.06;ReadPosRankSum=-0.673;SOR=0.547;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,90:0.52:174
chr12	122619528	rs11287019	CT	C	190.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.472;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=150;ReadPosRankSum=1.113;SC=GCCTCTCTATCTTTTTTTTAA;SOR=1.381;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=28;TCF=16;TCR=12;TR=10;WE=122619536;WS=122619518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,12:0.34:35
chr12	122622207	rs11307581	CT	C	4281.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.336;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.736;NF=10;NR=72;PP=2963;ReadPosRankSum=0.843;SC=GGATCTGTGTCTTGTCTGGAA;SOR=0.900;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=167;TCF=22;TCR=145;TR=82;WE=122622215;WS=122622197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,138:0.50:275
chr12	122623000	rs4758686	T	C	1168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=1.305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.84;ReadPosRankSum=-1.780;SOR=0.865;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,64:0.43:149
chr12	122625212	rs7488857	A	G	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=7.782;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=62;ReadPosRankSum=-0.475;SC=TTTTGATCGCATGTTTGTGCT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=5;WE=122625220;WS=122625202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr12	122626842	rs4758685	G	A	4054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=400;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=86;PP=2454;ReadPosRankSum=-0.939;SC=GTTGGAAGGCGTCTTTCTTTC;SOR=0.704;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=357;TCF=191;TCR=166;TR=184;WE=122626850;WS=122626832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:200,199:0.50:399
chr12	122657271	rs7974857	G	C	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=300;ReadPosRankSum=-0.541;SC=ACACGAGCACGCCCTTCTCTT;SOR=0.856;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=20;WE=122657279;WS=122657261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,24:0.46:52
chr12	122658379	rs61955584	T	C	3236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.24;ReadPosRankSum=-0.577;SOR=0.694;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:137,151:0.52:288
chr12	122658383	rs6489173	A	G	10720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.10;SOR=0.939;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,297:1.00:297
chr12	122668965	rs10847623	T	C	457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=3;PP=371;SC=CTAAACTCTATCCCTAATCGT;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=122668973;WS=122668955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	122674032	rs10847725	C	T	4799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=77;PP=2762;SC=TTCTCAGAGCCGAGATCAATT;SOR=0.761;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=167;TCF=90;TCR=77;TR=167;WE=122674040;WS=122674022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr12	122674143	rs11060051	G	C	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.893;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=367;ReadPosRankSum=-1.139;SC=CCCCTCCCAGGCCCCTTTCCT;SOR=2.154;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=50;TCF=15;TCR=35;TR=21;WE=122674151;WS=122674133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,26:0.46:56
chr12	122674780	rs11060094	C	A	9305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=163;NR=157;PP=2965;SC=CCTGGTGCTGCAGGGAAACCC;SOR=0.723;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=321;TCF=163;TCR=158;TR=320;WE=122674788;WS=122674770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,339:1.00:339
chr12	122675882	rs67032306	C	T	199.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=6;NR=1;PP=105;SC=TATCTGCCAACTTCCATTCCA;SOR=1.863;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=122675890;WS=122675872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	122684966	rs11060679	G	C	1847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=26;PP=1381;SC=CATGGGAGCCGCACTCCCTGG;SOR=0.726;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=29;TCR=26;TR=55;WE=122684974;WS=122684956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr12	122689109	.	C	CCCG	1241.52	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.269;ClippingRankSum=0.000;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=644;ReadPosRankSum=-1.511;SC=TCGCTTCGACCCCGCCGCCGC;SOR=0.516;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=20;WE=122689117;WS=122689097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,53:0.91:58
chr12	122689126	.	C	CGCG	333	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=25;MQ=60.3;NF=7;NR=13;PP=333;QD=17.4;SC=CCGCCGCCGCCCGGCATCCTG;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=42;TCF=14;TCR=28;TR=20;WE=122689134;WS=122689116;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:22,20:0.48:42
chr12	122691738	rs4758675	C	A	7520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=132;NR=120;PP=2965;SC=GTGCCTGAGGCGGCTGGGGCT;SOR=0.738;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=252;TCF=132;TCR=120;TR=252;WE=122691746;WS=122691728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,272:1.00:272
chr12	122694214	.	C	CA	145.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=0.000;DP=188;ExcessHet=3.0103;FS=2.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.02;MQRankSum=0.012;QD=0.86;ReadPosRankSum=-1.006;SOR=0.579;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:143,27:0.16:170
chr12	122723317	.	T	TAC,TACAC	329.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=0.000;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=2.764;HP=2;HapScore=3;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=1.022;NF=0,0;NR=25,25;PP=400,132;ReadPosRankSum=-1.002;SC=TACATATACATACACACACAC;SOR=0.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=60;TCF=0;TCR=60;TR=25,25;WE=122723326;WS=122723307;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.67:27
chr12	122760929	.	CCA	C	991.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.104;ClippingRankSum=0.000;DP=235;ExcessHet=3.0103;FS=2.152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.77;ReadPosRankSum=-0.514;SOR=0.913;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:157,51:0.25:208
chr12	122804034	rs3825097	A	G	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=27;ReadPosRankSum=0.022;SC=ATCAGTCACAATCCAGTGCTG;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=3;WE=122804042;WS=122804024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr12	122812503	rs1129167	G	C	726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=5;PP=544;ReadPosRankSum=1.733;SC=CTTTGGCTTTGTCGGCTTGCT;SOR=0.495;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=49;TCF=41;TCR=8;TR=28;WE=122812511;WS=122812493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,28:0.56:50
chr12	122817507	rs7956480	A	G	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.17;ReadPosRankSum=-0.713;SOR=0.713;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,38:0.44:86
chr12	122817580	rs17883517	A	G	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=20;PP=427;ReadPosRankSum=-0.733;SC=AGCTGAGAAGAGTTATCTCCT;SOR=0.682;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=87;TCF=40;TCR=47;TR=37;WE=122817588;WS=122817570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,40:0.43:92
chr12	122838956	rs4997380	A	G	630.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=1.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.90;ReadPosRankSum=-1.322;SOR=0.988;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,32:0.60:53
chr12	122862560	rs55834409	C	G	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=234;ReadPosRankSum=1.363;SC=CAGACAACCTCTAACTTAAAG;SOR=0.576;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=14;WE=122862568;WS=122862550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr12	122865029	rs1803290	T	C	3421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.348;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=64;PP=2006;ReadPosRankSum=-1.358;SC=TGTTTCTCCTTTGCCTGTTGC;SOR=0.520;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=240;TCF=117;TCR=123;TR=133;WE=122865037;WS=122865019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,154:0.57:272
chr12	122964708	rs10846978	T	C	608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=335;ReadPosRankSum=2.176;SC=TCACATCACATGATAATTTAA;SOR=0.841;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=42;TCF=34;TCR=8;TR=23;WE=122964716;WS=122964698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,27:0.56:48
chr12	122983460	rs7314638	A	G	1501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.050;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=33;PP=891;ReadPosRankSum=-0.810;SC=TAACAATGCAAATCATAAAAT;SOR=0.869;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=132;TCF=67;TCR=65;TR=63;WE=122983468;WS=122983450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,72:0.49:146
chr12	122991279	rs11058480	C	T	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=100;ReadPosRankSum=-1.002;SC=AACTCAAAAACGCTGACACCT;SOR=0.582;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=9;WE=122991287;WS=122991269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr12	122991478	rs9988963	C	G	525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.085;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=16;PP=274;ReadPosRankSum=-0.349;SC=GTCCTGTTAACAAACACTGAA;SOR=0.970;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=60;TCF=22;TCR=38;TR=24;WE=122991486;WS=122991468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,28:0.38:74
chr12	122995468	rs10709275	GA	G	261.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.160;NF=9;NR=0;PP=282;ReadPosRankSum=1.675;SC=GGTGATGTGGGACCTGCAGTC;SOR=0.602;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=9;WE=122995476;WS=122995458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr12	123003278	rs10847103	C	T	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=54;ReadPosRankSum=0.188;SC=CCCAAACAAACGAACAAGAAA;SOR=0.260;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=5;WE=123003286;WS=123003268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr12	123028096	rs61956128	T	C	1241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.779;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=22;PP=799;ReadPosRankSum=0.684;SC=TGACTTGTATTATTTTGTAGA;SOR=0.581;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=84;TCF=48;TCR=36;TR=49;WE=123028104;WS=123028086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,54:0.57:94
chr12	123071365	rs7311684	A	T	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.63;ReadPosRankSum=-0.159;SOR=0.425;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,3:0.21:14
chr12	123071366	rs7315477	T	A	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.63;ReadPosRankSum=-0.159;SOR=0.425;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,3:0.21:14
chr12	123079020	rs10847242	T	G	545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.675;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=207;ReadPosRankSum=0.615;SC=GATTATTTTATGAGGTCCATA;SOR=0.327;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=14;WE=123079028;WS=123079010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,17:0.46:37
chr12	123079035	rs4319547	A	G	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.690;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=89;ReadPosRankSum=0.790;SC=TCCATAGACCACTATTTTCTT;SOR=0.035;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=8;WE=123079043;WS=123079025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr12	123087442	rs7307735	A	G	2936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.490;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=52;PP=1917;ReadPosRankSum=0.136;SC=AAGGTAATGGATTAAAACATT;SOR=0.905;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=227;TCF=128;TCR=99;TR=125;WE=123087450;WS=123087432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,135:0.54:250
chr12	123097528	rs10744294	C	A	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=102;ReadPosRankSum=1.112;SC=ACACACAGTGCGTTCCGTAAC;SOR=0.512;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=6;WE=123097536;WS=123097518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr12	123105143	rs2270775	C	T	1544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.132;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=35;PP=801;ReadPosRankSum=-1.518;SC=AGAAAAGACACCAGCAAATTA;SOR=0.796;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=168;TCF=82;TCR=86;TR=70;WE=123105151;WS=123105133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,81:0.42:191
chr12	123110654	rs3803005	T	C	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.347;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=79;ReadPosRankSum=0.830;SC=TATGTAGATTTGTATCACTTC;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=5;WE=123110662;WS=123110644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr12	123200247	rs56308926	G	C	1432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.977;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.408;NF=32;NR=43;PP=1012;ReadPosRankSum=0.403;SC=CGGAGTTGGCGATTAACGCCT;SOR=1.055;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=213;TCF=100;TCR=113;TR=75;WE=123200255;WS=123200237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,75:0.34:221
chr12	123265952	rs1798563	A	G	853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=29;PP=636;ReadPosRankSum=1.770;SC=ATTAGATTTGACCGGGCACGG;SOR=0.602;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=88;TCF=22;TCR=66;TR=39;WE=123265960;WS=123265942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,39:0.44:89
chr12	123281967	rs10744394	G	A	2833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.513;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=68;PP=1658;ReadPosRankSum=0.090;SC=ATCCTTCTCTGTCACATAAGA;SOR=0.810;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=229;TCF=99;TCR=130;TR=119;WE=123281975;WS=123281957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,132:0.51:258
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chr12	123307755	rs2604851	A	G	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=4.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.29;ReadPosRankSum=-0.601;SOR=0.074;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
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chr12	123334929	rs7489275	G	T	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.368;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.27;MQRankSum=1.105;QD=6.83;ReadPosRankSum=-1.270;SOR=1.229;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr12	123334946	.	G	A	20	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MMLQ=27;MQ=47.41;NF=0;NR=3;PP=20;QD=18.2570708491;SC=GCCCTGGTTCGGTGGCCGCTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=3;WE=123334954;WS=123334936;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:12,3:0.20:15
chr12	123335287	rs12369846	A	G	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQRankSum=-0.243;QD=7.83;ReadPosRankSum=-0.136;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr12	123335483	rs2271048	A	G	2799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FS=0.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.39;ReadPosRankSum=-0.070;SOR=0.642;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,77:0.48:161
chr12	123335488	rs2271049	G	A	2708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.55;ReadPosRankSum=-0.754;SOR=0.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,69:0.47:146
chr12	123335527	rs2271050	C	T	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.189;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=312;ReadPosRankSum=0.601;SC=CCGCGTCTCACGCCCAGGCGT;SOR=0.432;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=53;TCF=14;TCR=39;TR=23;WE=123335535;WS=123335517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,23:0.41:56
chr12	123339344	rs2292136	A	G	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=221;ReadPosRankSum=-0.851;SC=GCCCGGTCTCAGGTGATCTCT;SOR=0.465;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=14;WE=123339352;WS=123339334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr12	123339712	rs2292138	A	G	2545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.957;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=62;PP=1661;ReadPosRankSum=-0.176;SC=CCCTTTGAGGACCCCAGGCAC;SOR=0.625;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=237;TCF=102;TCR=135;TR=111;WE=123339720;WS=123339702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,121:0.46:262
chr12	123340453	rs11418615	G	GC	1792.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.523;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.713;NF=12;NR=19;PP=1152;ReadPosRankSum=1.478;SC=AGCTGGAGGTGCGGGGTGGGG;SOR=0.717;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=69;TCF=19;TCR=50;TR=31;WE=123340461;WS=123340443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,59:0.51:115
chr12	123341289	rs897386	A	C	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.86;ReadPosRankSum=1.941;SOR=0.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,13:0.81:16
chr12	123341297	rs897385	A	G	431.28	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=35.94;ReadPosRankSum=1.942;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,11:0.92:12
chr12	123341833	rs7138398	G	C	1824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.764;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=40;PP=1035;ReadPosRankSum=0.298;SC=CTGTCTCCGTGATCTGCCTGT;SOR=0.561;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=170;TCF=81;TCR=89;TR=79;WE=123341841;WS=123341823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,91:0.46:197
chr12	123341863	rs2343109	G	C	1145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.636;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=33;PP=578;ReadPosRankSum=0.478;SC=TTCATGTAAAGGGGATCATAC;SOR=0.766;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=127;TCF=56;TCR=71;TR=57;WE=123341871;WS=123341853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,62:0.44:141
chr12	123342628	rs34131980	CCTCTT	C	2690.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.438;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.729;NF=9;NR=32;PP=2026;ReadPosRankSum=0.458;SC=TCTAACCTGTCCTCTTCACCC;SOR=0.485;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=101;TCF=26;TCR=75;TR=41;WE=123342640;WS=123342618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,74:0.40:183
chr12	123343571	rs2343110	T	G	2281.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.124;HP=10;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.585;NF=32;NR=37;PP=2447;ReadPosRankSum=1.610;SC=AGCCTGTCGGTGGGGGGGGCT;SOR=0.749;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=158;TCF=81;TCR=77;TR=69;WE=123343580;WS=123343558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,106:0.52:202
chr12	123343572	rs5801491	G	GGC	4199.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.733;HP=7;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=2.701;NF=11;NR=38;PP=2465;ReadPosRankSum=2.301;SC=GCCTGTCGGTGGGGGGGGCTC;SOR=0.713;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=104;TCF=25;TCR=79;TR=49;WE=123343580;WS=123343558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,108:0.54:201
chr12	123344910	rs937765	A	C	1188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.666;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=18;PP=821;ReadPosRankSum=1.846;SC=CTTGAGGGCCACTTTCCACCT;SOR=0.760;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=115;TCF=73;TCR=42;TR=52;WE=123344918;WS=123344900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,56:0.43:130
chr12	123345347	rs7306948	G	A	1321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.631;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=30;PP=1953;ReadPosRankSum=-0.685;SC=CTTGCACGCCGACAGCAGCAC;SOR=0.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=131;TCF=65;TCR=66;TR=57;WE=123345368;WS=123345337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,60:0.43:141
chr12	123345360	rs7298176	T	C	1143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=25;PP=1953;ReadPosRankSum=-1.812;SC=AGCAGCACACTGGGCTCTGGG;SOR=0.639;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=114;TCF=59;TCR=55;TR=53;WE=123345368;WS=123345337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,54:0.44:124
chr12	123345736	rs10847910	C	G	5772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=368;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.378;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.593;NF=58;NR=68;PP=1723;ReadPosRankSum=0.978;SC=AGATGGAGACCCAGGTAGGCG;SOR=0.661;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=299;TCF=137;TCR=162;TR=126;WE=123345744;WS=123345726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:192,174:0.48:366
chr12	123345756	rs3215148	G	GC	3229.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.396;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=2.828;NF=9;NR=49;PP=1821;ReadPosRankSum=1.382;SC=GCCCATGGCTGCCCCGTGACC;SOR=0.599;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=166;TCF=24;TCR=142;TR=58;WE=123345764;WS=123345746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,130:0.43:300
chr12	123352179	rs3825143	C	T	1042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.620;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=23;PP=539;ReadPosRankSum=1.624;SC=AACCTGGTTACAGGGACAGCC;SOR=0.913;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=42;TCR=49;TR=43;WE=123352187;WS=123352169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,50:0.50:101
chr12	123425575	rs4148866	C	T	1200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.697;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=23;PP=587;ReadPosRankSum=-1.088;SC=CCTGTCCCACCGATACCCGAC;SOR=0.574;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=100;TCF=49;TCR=51;TR=49;WE=123425583;WS=123425565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,57:0.49:116
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chr12	123460962	rs884956	T	C	2204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.661;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=44;PP=1279;ReadPosRankSum=0.659;SC=CATCTAGGGGTTCTCATCCCA;SOR=0.757;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=191;TCF=101;TCR=90;TR=89;WE=123460970;WS=123460952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,103:0.49:212
chr12	123466111	rs55742290	C	T	1341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.073;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=25;PP=708;ReadPosRankSum=0.701;SC=CCCTCCTGGCCTTCCAGCCTC;SOR=0.641;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=121;TCF=64;TCR=57;TR=59;WE=123466119;WS=123466101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,67:0.50:135
chr12	123470586	rs12828755	C	T	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.036;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.67;ReadPosRankSum=-0.907;SOR=0.204;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr12	123471094	rs12811109	G	A	1977.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.189;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=34;PP=1088;ReadPosRankSum=-1.104;SC=CATAGGCCGCGTGCACGCGCA;SOR=0.843;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=171;TCF=94;TCR=77;TR=81;WE=123471102;WS=123471084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,94:0.47:198
chr12	123471402	rs2049506	T	C	1653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=29;PP=991;SC=CGTCTCATGGTCACCCCTTCC;SOR=1.123;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=23;TCR=29;TR=52;WE=123471410;WS=123471392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr12	123473254	rs1463877	T	C	1140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=14;PP=789;ReadPosRankSum=1.535;SC=TCCTGGGAGGTCCCAGGCCCC;SOR=0.588;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=74;TCF=53;TCR=21;TR=47;WE=123473262;WS=123473244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,49:0.63:78
chr12	123476586	rs7135296	G	A	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=23;PP=514;ReadPosRankSum=-1.417;SC=GGCAGGGGTCGGGCCAAGCCT;SOR=0.713;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=13;TCR=37;TR=31;WE=123476594;WS=123476576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,33:0.61:54
chr12	123480996	rs111787219	C	T	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.035;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=205;ReadPosRankSum=0.592;SC=TGGGCCCCCACTTGGGTACCT;SOR=1.010;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=75;TCF=54;TCR=21;TR=21;WE=123481004;WS=123480986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,27:0.32:84
chr12	123485188	rs883263	A	G	603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.951;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=9;PP=456;ReadPosRankSum=0.348;SC=GCCTCTCCCCAGACAGTACCC;SOR=1.002;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=77;TCF=49;TCR=28;TR=30;WE=123485196;WS=123485178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,31:0.38:82
chr12	123488849	.	G	A	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.116;ClippingRankSum=0.000;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.293;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=5;PP=507;ReadPosRankSum=0.151;SC=GGCAACACCCGCATCAGTCCA;SOR=0.446;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=58;TCF=48;TCR=10;TR=31;WE=123488857;WS=123488839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,36:0.56:64
chr12	123492112	rs3897102	C	T	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=202;ReadPosRankSum=1.234;SC=CACTTCCCACCCCTGGCTTTG;SOR=0.793;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=13;WE=123492120;WS=123492102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr12	123645803	rs1051431	G	A	3795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.385;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=79;PP=2274;ReadPosRankSum=-0.401;SC=TACACTGTTCGTAGCTAACTG;SOR=0.724;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=307;TCF=158;TCR=149;TR=161;WE=123645811;WS=123645793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,182:0.52:351
chr12	123647725	rs1727296	G	C	1220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.922;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=37;PP=833;ReadPosRankSum=0.182;SC=CCTTCTATATGTATCAGCATA;SOR=0.879;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=100;TCF=21;TCR=79;TR=46;WE=123647733;WS=123647715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,50:0.47:107
chr12	123651162	rs1716167	A	G	881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=14;PP=595;ReadPosRankSum=0.185;SC=CTAAGAAAACATAACATCCCT;SOR=0.764;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=66;TCR=29;TR=45;WE=123651170;WS=123651152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,45:0.44:102
chr12	123664514	rs1727301	G	A	1258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.450;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=25;PP=668;ReadPosRankSum=-2.191;SC=CAAGCAATTTGTTCTCAGTTG;SOR=0.565;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=104;TCF=53;TCR=51;TR=52;WE=123664522;WS=123664504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,61:0.52:118
chr12	123665695	rs1727306	A	G	1994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.151;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=39;PP=1138;ReadPosRankSum=-0.385;SC=TAGAACATGAACCATTACCCC;SOR=0.584;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=159;TCF=82;TCR=77;TR=82;WE=123665703;WS=123665685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,97:0.53:183
chr12	123694724	rs2682434	C	T	1568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.913;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=38;PP=883;ReadPosRankSum=0.103;SC=TGTGCACAAACACACAGAATA;SOR=0.472;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=138;TCF=56;TCR=82;TR=68;WE=123694732;WS=123694714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,76:0.49:154
chr12	123699200	rs77954523	GTTT	G	346.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=219;ReadPosRankSum=0.035;SC=TAGGCAAGTTGTTTTTTAAAA;SOR=0.540;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=8;WE=123699210;WS=123699191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr12	123699520	rs1727322	A	G	740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.799;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=26;PP=589;ReadPosRankSum=-1.858;SC=GCCAGGCGTGATAGCTCACGC;SOR=0.801;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=98;TCF=35;TCR=63;TR=38;WE=123699528;WS=123699510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,38:0.36:105
chr12	123703103	rs2851451	T	C	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.623;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=10;PP=149;ReadPosRankSum=0.317;SC=GACAGAGTCTTGCTGTGTCGC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=10;WE=123703111;WS=123703093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr12	123707509	.	ATG	A	283	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=10;NR=9;PP=283;QD=15.2631578947;SC=GTATATATATATGTGTGTGTG;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=40;TCF=27;TCR=13;TR=19;WE=123707519;WS=123707499;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:21,19:0.47:40
chr12	123707527	rs34047404	GTA	G	334.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=13;PP=701;ReadPosRankSum=2.428;SC=GTGTGTGTGTGTATATGTACG;SOR=0.517;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=56;TCF=33;TCR=23;TR=26;WE=123707536;WS=123707517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,19:0.31:61
chr12	123707552	rs36043549	TA	T	1369.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.382;HP=8;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.604;NF=17;NR=22;PP=727;ReadPosRankSum=-0.468;SC=TATATGTATATAAAAAAAGGA;SOR=0.534;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=102;TCF=42;TCR=60;TR=39;WE=123707560;WS=123707542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,65:0.44:147
chr12	123710835	rs1626703	A	C	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.179;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=384;ReadPosRankSum=0.390;SC=AAATAATTACACTTAGCAGTT;SOR=0.513;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=46;TCF=35;TCR=11;TR=25;WE=123710843;WS=123710825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,27:0.53:51
chr12	123715113	rs941306	C	T	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=24;ReadPosRankSum=-1.282;SC=AAAAAGCCACCAAAGCTAGCA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=123715121;WS=123715103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr12	123738678	rs1568427	A	G	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=107;ReadPosRankSum=0.549;SC=TCCCTGAGCCATTCCTCCCTA;SOR=0.569;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=6;WE=123738686;WS=123738668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr12	123746357	rs4759416	C	G	4090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.767;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=78;PP=2554;ReadPosRankSum=0.227;SC=ATGCCTGAAACAGAGGCAGAG;SOR=0.599;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=316;TCF=175;TCR=141;TR=168;WE=123746365;WS=123746341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,187:0.54:346
chr12	123746510	rs4759417	C	T	1114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.015;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=35;PP=769;ReadPosRankSum=0.516;SC=CCCTGAAGGACGCTAACAATC;SOR=0.893;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=85;TCF=17;TCR=68;TR=43;WE=123746518;WS=123746500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,47:0.51:92
chr12	123794022	rs6488867	T	C	5526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=103;PP=2965;SC=CTTCACAACATTTTCTAAACT;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=170;TCF=67;TCR=103;TR=170;WE=123794030;WS=123794012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr12	123794450	rs2277343	A	T	279.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.99;ReadPosRankSum=0.175;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr12	123799974	rs6488868	A	G	2614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=52;PP=1569;ReadPosRankSum=-0.095;SC=CCCTTCTATCACCATGTGTAA;SOR=0.712;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=245;TCF=133;TCR=112;TR=112;WE=123799982;WS=123799964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,129:0.46:278
chr12	123801672	rs10846515	T	G	2265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.105;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=34;PP=1228;ReadPosRankSum=-1.368;SC=GGCGTGAGCCTCTGTGCCCGG;SOR=0.613;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=178;TCF=110;TCR=68;TR=91;WE=123801680;WS=123801662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,109:0.54:203
chr12	123806219	rs1060105	C	T	4065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=383;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.765;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=90;PP=2610;ReadPosRankSum=0.721;SC=GTCGTCAGAACTGCTACCAGT;SOR=0.736;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=348;TCF=173;TCR=175;TR=176;WE=123806227;WS=123806208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:192,190:0.50:382
chr12	123810662	rs111400678	A	AC	3387.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.49;MQRankSum=0.263;QD=31.08;ReadPosRankSum=1.510;SOR=0.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,108:0.99:109
chr12	123810873	rs61388686	G	A	3761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.003;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=83;PP=2243;ReadPosRankSum=-0.708;SC=GCTCTCTGGCGATGACCCACT;SOR=0.863;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=289;TCF=129;TCR=160;TR=148;WE=123810881;WS=123810863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,170:0.52:325
chr12	123812207	rs7959415	C	T	6223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=123;NR=78;PP=2965;SC=GAATAACACACTTCTTAGATT;SOR=1.148;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=201;TCF=123;TCR=78;TR=201;WE=123812215;WS=123812197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr12	123812611	rs10846517	A	G	808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=20;PP=629;SC=TCACATTAGTATTAAGTAAGA;SOR=2.387;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=26;WE=123812619;WS=123812601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	123812629	rs28419092	G	C	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=2.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=258;ReadPosRankSum=-0.161;SC=AGAATCTCCAGTCTTTCAAGA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=12;WE=123812637;WS=123812619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr12	123813493	rs7301163	C	A	554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=1;NR=16;PP=422;SC=TTTCTCTCTGCAACATTCATC;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=123813501;WS=123813483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	123815668	rs6488869	A	C	556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=1;PP=508;SC=CACCATGACGACCGGCTGATT;SOR=4.407;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=19;WE=123815676;WS=123815658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	123816007	rs11282939	T	TATGTTG	1614.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=29;PP=1803;SC=GGAGTAGGAATATGTTATGTT;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=29;WE=123816015;WS=123815997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr12	123821234	rs7486223	T	A	440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=12;PP=294;SC=GACAATGAGGTCCTACTCTGT;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=123821242;WS=123821224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	123825339	rs7312145	A	G	78.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=0;PP=57;SC=CACTCCATCAATCTGCAAGTT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=123825347;WS=123825329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr12	123825389	rs7315453	T	C	393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=11;NR=2;PP=263;SC=TCCAGCGAGGTTTAAGCATAT;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=123825397;WS=123825379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	123825559	rs12322888	C	T	614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=14;PP=305;ReadPosRankSum=0.938;SC=AACTCCTCATCTTCATGTCGT;SOR=0.749;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=58;TCF=28;TCR=30;TR=26;WE=123825567;WS=123825549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,32:0.46:70
chr12	123832710	rs11325003	TA	T	8158.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=146;PP=2966;SC=AGACAAAAAATAAAAGGACAG;SOR=1.225;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=157;TCF=7;TCR=150;TR=153;WE=123832718;WS=123832698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr12	123832746	rs10846523	G	A	4438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=99;PP=2843;SC=CAAGGACAAGGTTTGCATTTA;SOR=1.580;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=148;TCF=49;TCR=99;TR=148;WE=123832754;WS=123832736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr12	123875394	rs28660993	C	T	5183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=103;PP=2965;SC=AGCCTCTGTCCTCTGCAAGAA;SOR=1.246;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=175;TCF=71;TCR=104;TR=174;WE=123875402;WS=123875384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr12	123881176	rs28372579	A	G	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=263;ReadPosRankSum=0.599;SC=TGCTGGGGTCACTGCAGGGCT;SOR=0.730;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=14;WE=123881184;WS=123881166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr12	123960474	.	A	G	85	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=33;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=85;QD=29.9428031368;SC=TTTTTGAGACAGAGTCTCACT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=123960482;WS=123960464;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr12	124008073	rs2292500	A	G	6689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=119;NR=112;PP=2965;SC=CCTCTGAGAAATTGACATCCT;SOR=0.725;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=233;TCF=120;TCR=113;TR=231;WE=124008081;WS=124008063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
chr12	124069111	rs71088937	GGGC	G	343.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=1;PP=161;ReadPosRankSum=0.880;SC=GAAGGCAGCGGGGCGGCGGCG;SOR=0.551;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=4;WE=124069121;WS=124069101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr12	124069213	rs786446	T	C	2614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=56;NR=25;PP=1354;SC=TGCTGGTGCTTCTGGCCGCTC;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=56;TCR=25;TR=81;WE=124069221;WS=124069203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr12	124086620	rs786427	G	C	571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=6;PP=377;SC=CTGGAGCTGCGGGAAGCGGAA;SOR=1.828;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=21;WE=124086628;WS=124086610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr12	124086998	rs786428	C	G	281.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=9;PP=261;SC=AGAGGGGCCGCGACCCACCCC;SOR=3.056;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=124087006;WS=124086988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	124090453	rs786436	A	G	2629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=36;PP=1335;SC=TCCTTTAACCAGTGCTTTGCA;SOR=0.859;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=86;TCF=50;TCR=36;TR=86;WE=124090461;WS=124090443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr12	124090605	rs4047521	ACT	A	8083.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=83;PP=2969;SC=GGAAACCAAAACTCTCTGTTT;SOR=0.746;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=114;TCF=25;TCR=89;TR=107;WE=124090614;WS=124090595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr12	124097528	rs884892	A	G	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=65;ReadPosRankSum=-0.712;SC=ATACAAATTAACTTTTACAGG;SOR=0.527;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=5;WE=124097536;WS=124097518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr12	124097824	rs3748268	A	G	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.026;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=10;PP=259;ReadPosRankSum=1.249;SC=TCTGTGGTAGAGGCATCAGGG;SOR=0.490;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=52;TCF=24;TCR=28;TR=21;WE=124097832;WS=124097814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,24:0.41:59
chr12	124099925	rs3748269	T	C	545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.337;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=253;ReadPosRankSum=-0.147;SC=GGTCCCCAAATGCCCCATTCT;SOR=0.430;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=57;TCF=17;TCR=40;TR=25;WE=124099933;WS=124099915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,30:0.47:64
chr12	124101347	rs6488883	G	C	487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.402;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=271;ReadPosRankSum=-1.221;SC=AGGCCTTGCCGTGCTCCATGT;SOR=0.078;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=18;WE=124101355;WS=124101337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,21:0.75:28
chr12	124104460	rs7302183	C	G	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.761;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=130;ReadPosRankSum=0.148;SC=GGTTTCACTACAACACTATTG;SOR=0.180;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=8;WE=124104468;WS=124104453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr12	124104551	rs10773019	A	G	1623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=18;PP=923;ReadPosRankSum=1.263;SC=GAACTTCTTAATGACACAAGA;SOR=0.687;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=84;TCR=35;TR=62;WE=124104559;WS=124104541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,72:0.53:135
chr12	124110934	rs3704	G	T	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.062;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=474;ReadPosRankSum=1.219;SC=AGCATGGGGTGGGGGAGGTGA;SOR=1.051;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=69;TCF=50;TCR=19;TR=30;WE=124110942;WS=124110924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,33:0.39:84
chr12	124111723	rs7298287	T	C	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.203;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=185;ReadPosRankSum=0.199;SC=GAGAAAGCTTTGTCAAAGGGG;SOR=1.885;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=11;WE=124111731;WS=124111713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr12	124116833	rs7300147	G	A	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=1.631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.53;ReadPosRankSum=-1.878;SOR=1.262;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
chr12	124117089	rs10773020	T	G	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.352;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=365;ReadPosRankSum=0.654;SC=AAGCAAACAATTTAAAAAATA;SOR=0.050;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=21;WE=124117097;WS=124117079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,24:0.69:35
chr12	124124445	rs11572934	C	CGTGT	3205.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.719;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=4.169;NF=5;NR=30;PP=1590;ReadPosRankSum=1.086;SC=TGCGTGCGTGCGTGTATGTGT;SOR=0.713;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=100;TCF=20;TCR=80;TR=35;WE=124124453;WS=124124435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,89:0.42:211
chr12	124130128	rs2292702	T	C	1808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=31;PP=857;ReadPosRankSum=-0.135;SC=TTGTGATTGCTTTTGCTCTTC;SOR=0.712;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=136;TCF=65;TCR=71;TR=62;WE=124130136;WS=124130118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,79:0.48:164
chr12	124132610	.	T	G	1082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.634;ClippingRankSum=0.000;DP=224;ExcessHet=3.0103;FS=7.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.635;QD=4.83;ReadPosRankSum=0.865;SOR=1.217;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:161,63:0.28:224
chr12	124140201	.	C	CA	62.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=83;ReadPosRankSum=-0.674;SC=CGTGCAGAGTCACGTTGCATA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=3;WE=124140209;WS=124140199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr12	124171640	rs3748271	A	G	1129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.720;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=39;PP=843;ReadPosRankSum=-0.521;SC=TGGTGGGGCCATACTCTAGTA;SOR=1.312;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=81;TCF=12;TCR=69;TR=44;WE=124171648;WS=124171630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,46:0.53:86
chr12	124172746	rs7302449	T	C	579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.332;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,31:0.50:62
chr12	124174937	rs11057329	A	T	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=168;ReadPosRankSum=-1.077;SC=AAAGCGGGTCAACTAGTCGGT;SOR=0.313;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=11;WE=124174945;WS=124174927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr12	124177289	rs7137946	T	C	921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-5.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.237;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=26;PP=484;ReadPosRankSum=0.185;SC=TGTTACACTTTGACGTCATTT;SOR=0.062;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=60;TCF=15;TCR=45;TR=40;WE=124177297;WS=124177279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,45:0.65:69
chr12	124179417	rs7966867	T	C	1894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=44;PP=1321;ReadPosRankSum=1.523;SC=GATCAACCCCTAGAATTGTGA;SOR=0.684;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=174;TCF=84;TCR=90;TR=84;WE=124179425;WS=124179407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,91:0.48:189
chr12	124207098	rs7301641	T	C	2184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=46;PP=1536;SC=TTCTCAAAACTATGGAAGATG;SOR=1.519;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=25;TCR=46;TR=71;WE=124207106;WS=124207088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr12	124209332	rs1139789	T	C	7271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=92;PP=2485;SC=TGAAACGCAATGTTGAGGTAC;SOR=1.018;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=164;TCF=72;TCR=92;TR=164;WE=124209340;WS=124209322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr12	124209352	rs11837144	C	T	6462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=85;PP=2524;SC=CTGAACAGCTCGTGAGGAAAT;SOR=1.530;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=49;TCR=85;TR=134;WE=124209360;WS=124209342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr12	124210782	rs1399961	T	C	4801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=67;PP=2437;SC=CCTTAGAGAGTGATTCTTTGT;SOR=0.808;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=155;TCF=88;TCR=67;TR=155;WE=124210790;WS=124210772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr12	124218359	rs10744159	T	G	2506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=25;PP=1602;SC=AAATAAGGAGTATTGACTGTA;SOR=1.531;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=53;TCR=25;TR=78;WE=124218367;WS=124218349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr12	124220055	rs2271660	T	C	4229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=80;NR=67;PP=2122;SC=GATGTGAGACTGTGTTCAACT;SOR=0.743;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=147;TCF=80;TCR=67;TR=147;WE=124220063;WS=124220045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr12	124220354	rs2333838	A	C	152.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=122;SC=ACTTGTTAGGAACCTGAGTAG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=124220362;WS=124220344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	124229429	rs7135542	T	C	5871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=106;PP=2965;SC=TTTGTTACAGTGACAGCGTCG;SOR=0.776;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=212;TCF=106;TCR=106;TR=212;WE=124229437;WS=124229419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr12	124258887	rs7131750	T	C	685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=19;PP=552;SC=CACAAATAGGTAGCGGGCAGC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=124258895;WS=124258877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr12	124265687	rs11057353	T	C	8299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=149;NR=127;PP=2965;SC=GGGAGTCACATCTGGAGAAGT;SOR=0.760;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=276;TCF=149;TCR=127;TR=276;WE=124265695;WS=124265677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,308:1.00:308
chr12	124267638	rs11057354	A	G	3497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=50;PP=2078;SC=CTGACTGATCACTTTTATTTT;SOR=0.889;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=68;TCR=50;TR=118;WE=124267646;WS=124267628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr12	124267703	rs11057355	T	C	3826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=69;PP=2003;SC=GAGAGGTGTCTGACCTGGCAG;SOR=0.948;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=59;TCR=69;TR=128;WE=124267711;WS=124267693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr12	124268458	rs7303002	A	G	2472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=17;PP=1776;SC=CCACCCTAATAATGAGAGTTC;SOR=2.455;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=56;TCR=17;TR=73;WE=124268466;WS=124268448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr12	124274474	rs10846559	A	G	4533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=59;PP=2720;SC=GATTGGACAGATTTTGGAGGA;SOR=1.040;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=144;TCF=85;TCR=59;TR=144;WE=124274482;WS=124274464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr12	124274758	rs35056478	C	CT	140.86	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.9988;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=99;ReadPosRankSum=-0.157;SC=GATGCTTAGTCTTTTTTTTTA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=6;WE=124274766;WS=124274748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr12	124297653	rs75275217	G	A	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.01;ReadPosRankSum=0.967;SOR=0.641;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,20:0.22:92
chr12	124325977	rs4930729	T	G	1875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=42;PP=1087;ReadPosRankSum=-0.817;SC=TCGGAAGATCTTGCGGGCTGA;SOR=0.669;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=200;TCF=109;TCR=91;TR=91;WE=124326004;WS=124325967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,99:0.46:216
chr12	124330311	rs34934281	C	T	3157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.397;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=65;PP=1951;ReadPosRankSum=1.519;SC=GAGTTGGTAACGCGCATCACC;SOR=0.728;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=301;TCF=159;TCR=142;TR=139;WE=124330319;WS=124330301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,152:0.46:334
chr12	124332702	rs10846561	A	G	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=128;ReadPosRankSum=-1.467;SC=AAAGCAGGACATGGCATTTCA;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=8;WE=124332710;WS=124332692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr12	124333519	rs7960854	C	T	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.174;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=246;ReadPosRankSum=-1.713;SC=GTTTCTGGGCCGTTGACACTC;SOR=0.091;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=13;WE=124333527;WS=124333509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr12	124350360	rs7313897	G	C	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=77;ReadPosRankSum=0.741;SC=CAGTTAAAAAGCTCATGGAAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=5;WE=124350368;WS=124350350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr12	124350444	rs7314963	C	T	930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.813;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=11;PP=656;ReadPosRankSum=-2.085;SC=CCTTAAACATCTAGTTTATCT;SOR=1.349;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=84;TCF=59;TCR=25;TR=41;WE=124350452;WS=124350434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,42:0.47:89
chr12	124350704	rs10773043	T	C	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=61;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TGTTTGTAGTTGAAGGCGATG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=5;WE=124350712;WS=124350694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr12	124352338	rs10846565	T	G	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.506;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=9;PP=342;ReadPosRankSum=0.204;SC=ACCAACATGTTGGGTCTTATG;SOR=0.617;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=36;TCF=21;TCR=15;TR=17;WE=124352346;WS=124352328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr12	124360117	rs10846567	G	T	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=306;ReadPosRankSum=-0.851;SC=ACTTATCCATGTAGGCACAGC;SOR=0.752;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=18;WE=124360125;WS=124360107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr12	124362256	rs113178558	T	TG	144.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=2.354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.36;ReadPosRankSum=1.623;SOR=0.200;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr12	124363724	rs72053758	GTGTC	G	386.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=196;SC=TGCGCTCTGTGTGTCTGTCTG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=4;WE=124363735;WS=124363714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	124364131	rs1317312	G	C	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.158;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=9;PP=316;ReadPosRankSum=1.547;SC=CAAGTTTCAGGCCGTGTACTG;SOR=0.446;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=56;TCF=39;TCR=17;TR=25;WE=124364139;WS=124364121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,28:0.43:65
chr12	124366150	rs34756279	CT	C	1260.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.20;MQRankSum=1.064;QD=11.89;ReadPosRankSum=0.344;SOR=0.689;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,74:0.70:106
chr12	124366370	.	C	T	734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.719;ClippingRankSum=0.000;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.146;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=22;PP=497;ReadPosRankSum=0.819;SC=GGTCAGTCCACGTACCCTCCC;SOR=0.929;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=61;TCF=14;TCR=47;TR=28;WE=124366378;WS=124366360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,31:0.48:65
chr12	124392843	rs79810037	C	G	1045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.822;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=16;PP=517;ReadPosRankSum=-0.338;SC=GTGTCTCCCCCTCTGTCCCTC;SOR=0.985;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=77;TCF=47;TCR=30;TR=44;WE=124392851;WS=124392833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,51:0.59:86
chr12	124393076	rs74624536	T	G	1404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.476;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=35;PP=835;ReadPosRankSum=-2.911;SC=TGGCTTTCACTGACCTTGCCT;SOR=0.553;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=113;TCF=45;TCR=68;TR=60;WE=124393084;WS=124393066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,67:0.54:124
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chr12	124414098	rs3802999	C	T	722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=14;PP=444;ReadPosRankSum=-0.449;SC=GACTTTCCTCCGGGTTCAACC;SOR=0.684;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=54;TCF=28;TCR=26;TR=28;WE=124414106;WS=124414088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,29:0.54:54
chr12	124417889	rs4930721	C	T	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=243;ReadPosRankSum=-0.214;SC=TGACCGAGAGCGAGCCCAGCG;SOR=0.813;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=15;WE=124417897;WS=124417879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,17:0.77:22
chr12	124418472	rs77020228	C	G	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=121;ReadPosRankSum=0.552;SC=GCCAGAACTTCAGGTCCCTTA;SOR=0.784;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=8;WE=124418480;WS=124418464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr12	124418674	rs12298484	C	T	1751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.532;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=39;PP=1137;ReadPosRankSum=1.398;SC=TCCGGGCCACCACTCTCTCTG;SOR=0.627;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=181;TCF=93;TCR=88;TR=80;WE=124418682;WS=124418664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,85:0.44:192
chr12	124419062	rs11057396	A	C	980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.654;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=21;PP=450;ReadPosRankSum=-1.580;SC=GCTGGGGAGGAGGCCAGCCAG;SOR=0.837;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=89;TCF=46;TCR=43;TR=40;WE=124419070;WS=124419052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,47:0.47:100
chr12	124420076	rs113646068	C	CAGGA	1207.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.447;NF=0;NR=15;PP=781;ReadPosRankSum=1.418;SC=CTGGGGTTGTCAGAGTGATCG;SOR=0.979;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=4;TCR=37;TR=15;WE=124420084;WS=124420066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,33:0.50:66
chr12	124427306	rs11057401	T	A	2646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.151;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=55;PP=1508;ReadPosRankSum=0.255;SC=TGTTCCGAACTTTTGACTGTC;SOR=0.556;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=217;TCF=114;TCR=103;TR=111;WE=124427314;WS=124427296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,125:0.51:245
chr12	124427524	rs35825716	G	C	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=229;ReadPosRankSum=0.745;SC=TGGGGTCAGAGGGCACCCTCT;SOR=0.822;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=57;TCF=15;TCR=42;TR=19;WE=124427532;WS=124427514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,19:0.30:63
chr12	124428162	rs4930725	T	A	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.65;ReadPosRankSum=-0.700;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr12	124780201	rs114786346	T	C	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=5;PP=122;ReadPosRankSum=0.611;SC=GCGCTCTCTCTCCCAAACGGG;SOR=0.769;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=32;TCF=18;TCR=14;TR=11;WE=124780209;WS=124780191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,13:0.36:36
chr12	124798811	rs78753849	G	A	2675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.216;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=56;PP=1578;ReadPosRankSum=0.114;SC=CGTACCCACCGTCACGGCCTA;SOR=0.486;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=238;TCF=135;TCR=103;TR=123;WE=124798819;WS=124798801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,133:0.52:254
chr12	124799387	rs904647	G	A	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.499;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=213;ReadPosRankSum=1.386;SC=ATGGGTCCATGGAGTGCCCTT;SOR=1.855;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=12;WE=124799395;WS=124799377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr12	124810174	rs10846657	G	A	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.402;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=303;ReadPosRankSum=0.733;SC=CTGTGAGCCCGGCAGCCCCTG;SOR=1.197;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=48;TCF=23;TCR=25;TR=24;WE=124810182;WS=124810164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,27:0.52:52
chr12	124810968	rs1006100	C	T	2497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.75;SOR=1.214;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr12	124815504	rs12367963	C	T	1228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.634;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=34;PP=661;ReadPosRankSum=-0.693;SC=CCTGCCCTACCAGTCCCGTGT;SOR=0.764;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=129;TCF=52;TCR=77;TR=57;WE=124815512;WS=124815494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,64:0.45:143
chr12	124820013	rs1106317	A	G	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=14;PP=403;ReadPosRankSum=-1.664;SC=GGGCCTGGGTACTGGGTGGGG;SOR=0.760;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=67;TCF=35;TCR=32;TR=30;WE=124820021;WS=124820003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,29:0.43:67
chr12	124821696	rs2229842	C	T	895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.129;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=10;PP=456;ReadPosRankSum=-0.598;SC=ATGTGGCAGCCGGGCGAACGG;SOR=1.200;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=80;TCF=52;TCR=28;TR=35;WE=124821704;WS=124821686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,44:0.46:95
chr12	124824721	rs143952466	C	CGCCGCTGCT	3060.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=16;PP=2979;SC=CCCCCACCCCCGCCGCTGCTG;SOR=0.760;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=48;TCF=16;TCR=32;TR=25;WE=124824729;WS=124824711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr12	124825447	rs1702334	A	G	366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=4;NR=9;PP=190;SC=TCCCAGCACCAGCCATGGAAC;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=13;WE=124825455;WS=124825437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	124829234	rs1263992	C	T	1716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.83;ReadPosRankSum=0.788;SOR=0.595;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,47:0.46:102
chr12	124829255	rs1244085	A	G	2052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.289;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=23;PP=846;ReadPosRankSum=0.153;SC=GCCGCGGCTTACCCAGCTCAG;SOR=0.490;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=111;TCF=72;TCR=39;TR=56;WE=124829263;WS=124829245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,60:0.47:129
chr12	124831062	rs11370026	C	CG	39.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.021;HP=1;HapScore=4;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=1;PP=101;ReadPosRankSum=0.619;SC=CCACAGCCACCGCCACCCCTC;SOR=0.020;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=2;WE=124831075;WS=124831061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,2:0.25:8
chr12	124831067	rs2272370	C	A	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.393;HP=3;HapScore=4;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQ=60.98;MQRankSum=-0.908;NF=7;NR=0;PP=311;ReadPosRankSum=0.076;SC=GCCACCGCCACCCCTCCTAGA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=7;WE=124831075;WS=124831061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr12	124832474	rs1244065	G	A	1243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=0.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.21;ReadPosRankSum=-0.489;SOR=0.632;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,63:0.47:135
chr12	124832492	rs1244064	C	G	3119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=54;PP=1872;SC=CATTCCGTGGCTCCCTGAGCC;SOR=0.965;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=48;TCR=54;TR=102;WE=124832500;WS=124832482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr12	124832606	rs1244063	A	G	595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.514;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=12;PP=424;ReadPosRankSum=0.334;SC=CGCTACCTCCAGATGGAGCCT;SOR=0.573;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=59;TCF=31;TCR=28;TR=31;WE=124832614;WS=124832596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,30:0.48:62
chr12	124835352	rs4765551	A	C	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.312;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=133;ReadPosRankSum=-0.009;SC=AAATGCAGGCAAAGACGTGCT;SOR=1.230;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=7;WE=124835360;WS=124835342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr12	124838591	rs4765555	C	G	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=142;ReadPosRankSum=0.609;SC=ATGGGCTGGCCCCGTGCTGGT;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=14;WE=124838599;WS=124838581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr12	124838772	rs1244082	C	G	9966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.38;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,274:1.00:274
chr12	124838772	.	CGT	GGA,GGT	1632	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.31;FR=0.5000,0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=70,133;NR=51,101;PP=1632,1540;QD=13.9294865691;SC=GGGCTGAGGGCGTGTCTGTGG;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=236;TCF=133;TCR=103;TR=121,234;WE=124838782;WS=124838762;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.51:236
chr12	124838774	rs3817108	T	A	2899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.28;ReadPosRankSum=2.368;SOR=0.666;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:141,141:0.50:282
chr12	124838897	rs1244081	A	G	3714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=70;PP=2333;SC=TGAGGGAGACAGCTGTGAAGA;SOR=1.129;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=122;TCF=52;TCR=70;TR=122;WE=124838905;WS=124838887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr12	124839150	rs2271142	G	A	2351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.728;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=57;PP=1368;ReadPosRankSum=1.090;SC=TAAGAGGAGCGAGTCACGTGC;SOR=0.549;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=239;TCF=107;TCR=132;TR=108;WE=124839158;WS=124839140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,120:0.46:261
chr12	124839165	rs2271141	G	A	2089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.500;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=54;PP=1254;ReadPosRankSum=0.814;SC=ACGTGCTGCCGGAGCAGGGTC;SOR=0.653;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=203;TCF=86;TCR=117;TR=95;WE=124839173;WS=124839155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,104:0.48:218
chr12	124839540	rs2271139	C	A	1759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=43;PP=1085;ReadPosRankSum=1.140;SC=CCCCCACAGTCCAGAGTGCCT;SOR=0.715;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=135;TCF=60;TCR=75;TR=77;WE=124839548;WS=124839530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,82:0.57:144
chr12	124839867	rs870050	A	G	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5083;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=264;ReadPosRankSum=-0.492;SC=CTGAGTGGAGATGACCCAGGC;SOR=0.871;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=20;TCF=13;TCR=7;TR=16;WE=124839875;WS=124839857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,16:0.76:21
chr12	124839899	rs870051	T	C	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=1.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.00;ReadPosRankSum=-1.005;SOR=0.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,24:0.40:60
chr12	124839945	rs870052	T	C	775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=0.703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.57;ReadPosRankSum=0.444;SOR=0.799;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,45:0.38:118
chr12	124841421	rs4765144	C	T	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.999;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=198;ReadPosRankSum=0.000;SC=GGCCTTCCTGCACCCACAGTA;SOR=1.473;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=12;WE=124841429;WS=124841411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr12	124848137	rs1794956	T	C	1361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=30;NR=19;PP=763;SC=TGCAGGTGCATGCTCCCGCCC;SOR=1.136;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=30;TCR=19;TR=49;WE=124848145;WS=124848127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr12	124856618	rs7961196	A	G	2981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.512;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=68;PP=1928;ReadPosRankSum=0.843;SC=CACTGCAGGTAGCACTGGAGT;SOR=0.549;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=277;TCF=138;TCR=139;TR=137;WE=124856626;WS=124856608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,144:0.49:296
chr12	124856660	rs3741513	T	A	2401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=56;PP=1494;ReadPosRankSum=-0.561;SC=AGCTCTTGGCTGTGGTGGCCC;SOR=0.683;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=218;TCF=103;TCR=115;TR=107;WE=124856668;WS=124856650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,117:0.49:239
chr12	124856830	rs142292731	C	T	1887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.078;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=49;PP=1019;ReadPosRankSum=-0.471;SC=GCCAGCTCCTCAGCCGCGGGG;SOR=0.587;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=187;TCF=84;TCR=103;TR=92;WE=124856838;WS=124856820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,100:0.48:209
chr12	124857033	rs7978237	C	T	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.393;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=198;ReadPosRankSum=0.917;SC=GGTGGGTGGCCCTGGGGGTGG;SOR=2.066;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=44;TCF=30;TCR=14;TR=18;WE=124857041;WS=124857023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr12	124857199	rs1109271	G	T	644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.027;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=18;PP=392;ReadPosRankSum=-0.746;SC=AGGGTCTGGCGGGGCCTCCAG;SOR=0.990;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=56;TCF=20;TCR=36;TR=27;WE=124857207;WS=124857189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,30:0.48:63
chr12	124857234	rs1702329	C	G	740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=18;PP=499;SC=CCTGACCCTCCGGATGAGGCC;SOR=2.215;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=23;WE=124857242;WS=124857224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr12	124859045	rs2695993	A	G	6296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=111;NR=110;PP=2965;SC=GAAGTGAGGCAGCACCAAGTA;SOR=0.796;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=221;TCF=111;TCR=110;TR=221;WE=124859053;WS=124859035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr12	124885249	rs2293514	C	T	5994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=106;NR=98;PP=2965;SC=GATAGGATGGCTTCACCCGAG;SOR=0.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=204;TCF=106;TCR=98;TR=204;WE=124885257;WS=124885239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr12	124885290	rs2293513	T	C	4391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=71;NR=83;PP=2145;SC=TGGAGGAGACTGTTTCTTTAG;SOR=1.039;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=155;TCF=72;TCR=83;TR=154;WE=124885298;WS=124885280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr12	124887058	.	G	GGCTGCTGCTGCT	127.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.724;ClippingRankSum=0.000;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.197;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=432;ReadPosRankSum=0.490;SC=GCGGGGCATGGGCTGCTGCTG;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=5;WE=124887066;WS=124887048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr12	124907154	rs115355225	G	A	1377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.086;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=44;PP=960;ReadPosRankSum=-0.236;SC=GCTTTCCTGCGGGGCAGCCGA;SOR=1.094;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=148;TCF=53;TCR=95;TR=64;WE=124907162;WS=124907144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,66:0.43:152
chr12	124915431	rs59053140	T	C	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=116;ReadPosRankSum=-1.705;SC=CACAGGTGCGTGCGCACACAC;SOR=0.569;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=13;WE=124915439;WS=124915421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr12	124922325	rs1702322	C	T	343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=1;PP=285;SC=TTCCTCCTTTCCTGGCCGGCC;SOR=4.977;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=124922333;WS=124922323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	124934459	rs1147284	C	G	3331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=50;NR=61;PP=1909;SC=GCTGGCCACTCGCCACTACAG;SOR=1.133;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=50;TCR=61;TR=111;WE=124934467;WS=124934449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr12	124941816	rs2277341	T	C	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.113;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=197;ReadPosRankSum=2.739;SC=CAGTCCAGCATGCTGATCCTC;SOR=0.446;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=48;TCF=19;TCR=29;TR=20;WE=124941824;WS=124941806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,23:0.43:54
chr12	124968349	rs747443	T	C	4930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=88;PP=2912;SC=CAACGTCACATAGGAGATTGC;SOR=1.154;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=160;TCF=72;TCR=88;TR=159;WE=124968357;WS=124968339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr12	124979811	rs148141514	G	A	814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=17;PP=446;ReadPosRankSum=2.083;SC=GGTGGGGGTCGGCGGGGAGCT;SOR=0.651;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=59;TCF=26;TCR=33;TR=32;WE=124979819;WS=124979801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,37:0.57:65
chr12	124979833	rs872224	C	G	1511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=31;PP=958;SC=CTCCCAGGCCCCAATAAGCTT;SOR=1.487;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=19;TCR=31;TR=50;WE=124979841;WS=124979823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr12	125263204	rs701104	A	C	67.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=3;PP=57;SC=CCCGCCCACCACAGCCCTGTA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=125263212;WS=125263194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr12	125284748	rs5888	A	G	3284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=66;NR=51;PP=1894;SC=GAACCGGGTCAGCGTTGAGGA;SOR=0.824;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=118;TCF=66;TCR=52;TR=117;WE=125284756;WS=125284738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr12	125296362	rs61932577	G	A	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=4.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.639;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=412;ReadPosRankSum=0.370;SC=AGCCATGGCCGGGCCCACCCT;SOR=2.266;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=47;TCF=40;TCR=7;TR=21;WE=125296370;WS=125296352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,21:0.41:51
chr12	125323593	rs112622075	A	G	866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.130;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=6;PP=643;ReadPosRankSum=-2.450;SC=TACTGGGATTACAGGCATGAG;SOR=0.900;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=61;TCF=50;TCR=11;TR=34;WE=125323601;WS=125323583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,35:0.54:65
chr12	125324553	.	C	T	2163	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MMLQ=24;MQ=44.19;NF=66;NR=46;PP=2163;QD=19.6229572549;SC=TTTCTCCGCACCCTCACCCCA;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=113;TCF=67;TCR=46;TR=112;WE=125324578;WS=125324543;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,112:0.99:113
chr12	125324570	.	C	T	2768	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MMLQ=24;MQ=49.25;NF=87;NR=62;PP=2768;QD=20;SC=CCCAACGGCACACATGGGCCC;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=151;TCF=89;TCR=62;TR=149;WE=125324578;WS=125324543;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,149:0.99:151
chr12	125324731	rs61308172	AT	A	62.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.29;MQRankSum=1.418;QD=3.30;ReadPosRankSum=-0.085;SOR=0.648;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr12	125398039	rs1071862	G	C	6818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=117;NR=112;PP=2965;SC=CACTGGGCTCGACCTCAAGGG;SOR=0.765;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=230;TCF=118;TCR=112;TR=229;WE=125398047;WS=125398029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chr12	125400206	rs6488957	A	G	627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=14;PP=380;SC=TAGAATCCCAACCTTATTTCA;SOR=1.708;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=7;TCR=14;TR=21;WE=125400214;WS=125400196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	125434434	rs4562928	C	G	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=252;ReadPosRankSum=-0.492;SC=ATGTTTTAAGCCTCCCTGTGT;SOR=0.507;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=15;WE=125434442;WS=125434424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr12	125434580	rs4447263	C	T	2697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=48;PP=1563;ReadPosRankSum=-1.394;SC=CAGACAGCTCCGGTATGAGGC;SOR=0.722;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=229;TCF=131;TCR=98;TR=113;WE=125434588;WS=125434570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,128:0.50:254
chr12	125434716	rs4078216	G	A	3176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.396;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=70;PP=2009;ReadPosRankSum=0.455;SC=GCAGGAACCGGGCAAAGTGCT;SOR=0.832;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=284;TCF=141;TCR=143;TR=135;WE=125434724;WS=125434706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,153:0.48:318
chr12	125435388	rs10773125	C	T	1244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.748;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=38;PP=881;ReadPosRankSum=0.635;SC=AGGGAAGAACCCATGCCCAGG;SOR=0.844;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=111;TCF=35;TCR=76;TR=54;WE=125435396;WS=125435378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,56:0.47:119
chr12	125436850	rs4375522	G	A	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=77;ReadPosRankSum=2.508;SC=ACAGCTGAGAGGGAACAAGCC;SOR=0.518;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=7;WE=125436858;WS=125436840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,7:0.27:26
chr12	125436897	rs4502074	A	G	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.995;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=260;ReadPosRankSum=-1.423;SC=CCTGCCCCTCACCAGGTGCCC;SOR=0.487;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=55;TCF=38;TCR=17;TR=23;WE=125436905;WS=125436887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,29:0.44:66
chr12	125437019	rs4429156	T	C	1813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.571;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=33;PP=912;ReadPosRankSum=-1.000;SC=CCCCCAGGCCTGCCGTCACGA;SOR=0.721;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=165;TCF=90;TCR=75;TR=79;WE=125437027;WS=125437009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,89:0.49:182
chr12	125437236	rs6488960	A	G	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=227;ReadPosRankSum=-1.676;SC=GCTTGTCTCAACCCCTCCCCA;SOR=1.739;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=12;WE=125437244;WS=125437226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr12	125438414	rs12367953	A	G	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.275;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=310;ReadPosRankSum=0.841;SC=GCGTGCCGGCACGGGGCCGTA;SOR=0.402;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=48;TCF=36;TCR=12;TR=25;WE=125438422;WS=125438404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,26:0.54:48
chr12	125438516	rs4516060	T	C	3086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.28;ReadPosRankSum=-1.671;SOR=0.744;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:119,83:0.41:202
chr12	125438523	rs4258464	C	T	3032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.09;ReadPosRankSum=-2.402;SOR=0.715;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,84:0.42:201
chr12	125438549	rs4606565	A	G	1952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.165;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=33;PP=1259;ReadPosRankSum=-1.835;SC=GCGCCTGGGGAACGAAGAGGG;SOR=0.918;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=182;TCF=105;TCR=77;TR=84;WE=125438557;WS=125438539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,93:0.46:203
chr12	125438616	rs11831506	A	C	2187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.479;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=37;PP=1033;ReadPosRankSum=-0.487;SC=CCACCCTCCAACGGGCAGGGC;SOR=0.731;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=200;TCF=108;TCR=92;TR=86;WE=125438624;WS=125438606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,106:0.46:230
chr12	125441359	rs10773127	T	C	1278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.629;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=27;PP=714;ReadPosRankSum=1.830;SC=CCACGGGGAATGTGGCCATTG;SOR=0.795;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=124;TCF=69;TCR=55;TR=62;WE=125441367;WS=125441349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,65:0.47:139
chr12	125441856	rs11057932	G	A	223.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=4;PP=111;SC=GGAACCCCAAGGCCTCCTTTA;SOR=2.833;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=125441864;WS=125441846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	125444975	rs4765007	T	C	4566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=80;PP=2393;SC=ACAGCCTGGATGGAGAGAAAC;SOR=0.865;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=159;TCF=79;TCR=80;TR=159;WE=125444983;WS=125444965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr12	125445096	rs4765008	C	G	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.506;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=188;ReadPosRankSum=-0.511;SC=ACTGGATCTTCACCTGACAGC;SOR=3.185;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=10;WE=125445104;WS=125445086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
chr12	125445124	rs73229559	G	T	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=252;ReadPosRankSum=-0.561;SC=GTGCTTTACCGCTTCCTGCCT;SOR=0.776;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=13;WE=125445132;WS=125445114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr12	125448960	rs4076777	C	T	3380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=80;NR=25;PP=2145;SC=GGCCGGGCTCCGTCCGTCCTG;SOR=2.221;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=80;TCR=25;TR=105;WE=125448968;WS=125448950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr12	125449470	rs73229567	G	A	2135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.560;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=46;PP=1234;ReadPosRankSum=-0.594;SC=GGCCCAGCACGGTTACCTGTG;SOR=0.634;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=152;TCF=74;TCR=78;TR=89;WE=125449478;WS=125449460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,100:0.57:176
chr12	125450416	rs73229568	G	T	776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.899;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=19;PP=468;ReadPosRankSum=0.588;SC=TGAGGACGTGGCACGTGCAGG;SOR=0.448;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=71;TCF=31;TCR=40;TR=36;WE=125450424;WS=125450406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,38:0.49:78
chr12	125451162	rs61942952	G	A	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=203;ReadPosRankSum=0.998;SC=CTCCCACCTTGGCCTCCCAAA;SOR=1.493;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=12;WE=125451170;WS=125451152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr12	125451277	rs56213993	T	C	1367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.735;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=22;PP=694;ReadPosRankSum=-1.621;SC=ATGGGGCTGGTAGCTGCCATC;SOR=0.389;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=103;TCF=65;TCR=38;TR=54;WE=125451285;WS=125451267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,64:0.55:116
chr12	125451487	rs35364982	C	T	1156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=32;PP=779;ReadPosRankSum=0.780;SC=AGCACACTGCCCTTTGTTGTT;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=40;TCR=65;TR=52;WE=125451495;WS=125451477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,54:0.50:108
chr12	125451532	rs35177301	G	C	583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.578;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=20;PP=403;ReadPosRankSum=-0.105;SC=CCATTTATTCGGGGGTGAGGT;SOR=1.176;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=55;TCF=15;TCR=40;TR=26;WE=125451540;WS=125451522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,27:0.48:56
chr12	125451561	rs17879868	T	C	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.314;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=207;ReadPosRankSum=-1.496;SC=GCAAAGGTGCTGATGCTTCCA;SOR=1.123;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=38;TCF=17;TCR=21;TR=16;WE=125451569;WS=125451557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr12	125451589	rs35874447	A	G	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.999;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=171;ReadPosRankSum=-1.309;SC=GCTCAGAGGCAGGAGCTGCAC;SOR=1.244;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=37;TCF=23;TCR=14;TR=13;WE=125451597;WS=125451579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,13:0.36:36
chr12	125453232	rs10773130	A	G	3823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.71;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr12	125453235	rs11057940	C	A	6114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.31;SOR=0.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr12	125453542	rs11614657	G	T	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.203;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=256;ReadPosRankSum=-1.393;SC=CAGTGACCGTGGCCCCAGGAC;SOR=1.008;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=49;TCF=17;TCR=32;TR=18;WE=125453550;WS=125453532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,18:0.35:52
chr12	125456004	rs4542508	C	A	1817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=29;NR=35;PP=984;SC=CCAGCCTAAGCCCCAAGGGCC;SOR=1.002;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=29;TCR=35;TR=64;WE=125456012;WS=125455994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr12	125456911	rs6488966	A	G	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.233;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=134;ReadPosRankSum=0.009;SC=TAAGTAACTCACCCAAAGTCA;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=9;WE=125456919;WS=125456910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr12	125465269	rs376470858	ACTC	A	172.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.92;ReadPosRankSum=-0.632;SOR=0.641;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,11:0.12:90
chr12	125466987	rs11057949	C	T	863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=4;PP=602;SC=CAGAGGACCCCATAACCTGTG;SOR=2.910;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=28;WE=125466995;WS=125466977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	125478381	.	C	CCTG	1234.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.338;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=439;ReadPosRankSum=0.392;SC=GGGCCGGGCTCCTGCTGCTGC;SOR=0.527;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=10;WE=125478389;WS=125478371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,30:0.97:31
chr12	125509502	rs7303493	C	T	1684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=31;PP=945;ReadPosRankSum=0.017;SC=CTGGCCCCTGCGTAACGAGCC;SOR=0.724;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=143;TCF=85;TCR=58;TR=77;WE=125509510;WS=125509492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,83:0.53:158
chr12	125562809	rs7303092	G	A	4564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=94;PP=2866;SC=CACATCTTCCGGGGCTGGGGC;SOR=1.284;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=157;TCF=63;TCR=94;TR=157;WE=125562817;WS=125562799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr12	125587706	rs7138557	T	C	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.318;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=221;ReadPosRankSum=1.510;SC=CTGGATCTTCTACTTGGGGTC;SOR=1.942;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=11;WE=125587714;WS=125587696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr12	125591844	rs2297478	C	T	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.836;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=18;PP=422;ReadPosRankSum=-0.319;SC=TCTGCAGGGCCTCCTGTTGTC;SOR=0.801;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=86;TCF=35;TCR=51;TR=30;WE=125591852;WS=125591834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,32:0.36:89
chr12	125619308	rs2291248	C	T	1862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=39;PP=1100;ReadPosRankSum=0.427;SC=TCCAGAGCTGCGGTGTGGCCC;SOR=0.696;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=150;TCF=81;TCR=69;TR=85;WE=125619316;WS=125619298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,90:0.57:159
chr12	125621419	rs41473449	A	G	1888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.787;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=45;PP=1049;ReadPosRankSum=-0.838;SC=CGGTATGGCCATCTCCCGCCA;SOR=0.956;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=139;TCF=68;TCR=71;TR=80;WE=125621427;WS=125621409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,92:0.56:164
chr12	125810958	rs551601	T	C	125.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5164;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=65;ReadPosRankSum=0.210;SC=GTTGAAAAAGTCACTTGCCCT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=4;WE=125810966;WS=125810952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr12	125811056	rs550677	A	G	909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.381;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=9;PP=689;ReadPosRankSum=-1.061;SC=CAACCTGTATAGTAAACATCG;SOR=0.407;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=67;TCR=20;TR=39;WE=125811064;WS=125811046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,38:0.47:81
chr12	125833964	rs7971264	C	T	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.464;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=140;ReadPosRankSum=0.192;SC=TCTCAGAACACGGTTTTATTC;SOR=0.140;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=49;TCF=45;TCR=4;TR=15;WE=125833972;WS=125833954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,18:0.35:51
chr12	125834095	rs1491893	C	A	3090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.328;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=64;PP=1654;ReadPosRankSum=2.553;SC=CAGAGGAGTCCTTTTTCCTTA;SOR=0.722;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=284;TCF=147;TCR=137;TR=139;WE=125834103;WS=125834085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,156:0.50:314
chr12	125834395	rs3803155	T	C	12145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=460;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=189;NR=210;PP=2965;SC=GGGATGACAGTGACCTTACGG;SOR=0.848;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=399;TCF=189;TCR=210;TR=399;WE=125834403;WS=125834385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,457:1.00:457
chr12	126003890	rs964997	G	A	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.689;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=365;ReadPosRankSum=0.523;SC=TCATTCTTTTGGTTGACAAAT;SOR=1.148;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=50;TCF=44;TCR=6;TR=21;WE=126003898;WS=126003880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,23:0.45:51
chr12	126003934	rs964998	T	C	1703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.193;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=21;PP=1127;ReadPosRankSum=-0.441;SC=TCTTGACATTTTGCTGAGTCT;SOR=1.095;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=133;TCF=87;TCR=46;TR=68;WE=126003942;WS=126003924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,74:0.52:143
chr12	126068417	rs6489006	T	C	898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.567;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=4;PP=542;ReadPosRankSum=-1.190;SC=TTTTGAACACTGCCATTCTCA;SOR=0.337;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=53;TCF=47;TCR=6;TR=31;WE=126068425;WS=126068407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,36:0.62:58
chr12	126128476	rs11610291	A	G	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=147;ReadPosRankSum=-0.812;SC=GTGCCTACAAATTACCTTTTG;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=7;WE=126128484;WS=126128470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr12	126128871	rs12305906	T	C	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.659;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=90;ReadPosRankSum=0.551;SC=TGTCCTGGAGTCCAGATCTTT;SOR=0.041;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=8;WE=126128879;WS=126128861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr12	126135195	rs3803152	A	G	837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.840;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=14;PP=391;ReadPosRankSum=0.843;SC=TTAACAATGAAGACTTTGTTC;SOR=0.556;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=69;TCF=44;TCR=25;TR=34;WE=126135203;WS=126135185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,41:0.51:81
chr12	126932624	rs758564	G	A	4867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=78;PP=2800;SC=AGTGGCTATCGGGGCAGACAA;SOR=0.808;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=161;TCF=83;TCR=78;TR=161;WE=126932632;WS=126932614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr12	126932764	rs758565	C	G	565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=18;PP=483;SC=GCATCAGAAACCCACCCTCTT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=126932772;WS=126932754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	126947430	rs1019149	G	T	1858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=40;PP=1248;SC=GCCTAGAAAGGTACAGGCCCT;SOR=1.263;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=25;TCR=40;TR=65;WE=126947438;WS=126947420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr12	127229254	rs10847207	A	G	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-4.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.637;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=286;ReadPosRankSum=0.433;SC=GGTGATGGGCAGCTTACTGTG;SOR=0.269;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=19;WE=127229262;WS=127229244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,22:0.73:30
chr12	127229327	rs10773323	T	A	1447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.989;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=18;PP=914;ReadPosRankSum=-0.420;SC=AAAGGAAGAATCAACACTTTC;SOR=0.955;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=149;TCF=103;TCR=46;TR=64;WE=127229335;WS=127229317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,69:0.42:165
chr12	127229506	rs10847208	T	C	4577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=449;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.100;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=102;PP=2799;ReadPosRankSum=0.040;SC=GTATGCATTGTGTTAATTACT;SOR=0.630;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=413;TCF=212;TCR=201;TR=205;WE=127229514;WS=127229496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:228,220:0.49:448
chr12	128108780	rs3803151	T	C	1464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.92;QD=28.17;SOR=1.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr12	128108934	rs10847418	G	A	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.762;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=303;ReadPosRankSum=0.023;SC=CCTGGTCAGTGGAGATGACTT;SOR=1.402;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=17;WE=128108942;WS=128108924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr12	128899427	rs376257454	C	T	1718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.759;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=35;PP=1152;ReadPosRankSum=0.999;SC=AGCCTGCAGGCGAGGGTGGAG;SOR=0.503;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=144;TCF=74;TCR=70;TR=73;WE=128899435;WS=128899417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,78:0.48:161
chr12	128900005	rs1683723	G	A	8398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=146;NR=134;PP=2965;SC=GATCGGCACCGTCGGCCTTTA;SOR=0.700;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=280;TCF=146;TCR=134;TR=280;WE=128900013;WS=128899995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,309:1.00:309
chr12	129028708	rs11610490	G	C	286.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.97;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	129028712	rs12812251	G	C	286.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.97;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	129153986	rs4272850	G	A	1866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.987;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=40;PP=1195;ReadPosRankSum=1.198;SC=GAACACCGCCGTACTCACAGG;SOR=0.778;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=231;TCF=124;TCR=107;TR=87;WE=129153994;WS=129153976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,98:0.39:253
chr12	129181625	rs902058	A	G	264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=0;PP=238;SC=ATGGGCCAGCATATAGAGTGA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=129181633;WS=129181615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	129181701	rs902059	A	G	2179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=26;PP=1456;SC=AAGAAATATTACTGGTAAAGG;SOR=1.349;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=49;TCR=26;TR=75;WE=129181714;WS=129181691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr12	129181810	rs885546	A	G	4878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=71;PP=2946;SC=CAGAGAAGACAATAACCGTGC;SOR=0.846;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=157;TCF=86;TCR=71;TR=157;WE=129181818;WS=129181800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr12	129181834	rs902060	A	G	6067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=93;PP=2965;SC=ATGACAAAGTATCGGTGACAG;SOR=0.720;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=194;TCF=101;TCR=93;TR=194;WE=129181842;WS=129181824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr12	129189591	rs4533104	A	G	599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.926;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=399;ReadPosRankSum=-1.191;SC=TCTAAGGGAAAAGGCATCCCC;SOR=0.310;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=25;WE=129189605;WS=129189581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,26:0.79:33
chr12	129189702	rs12426596	C	G	627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=0.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.37;ReadPosRankSum=1.091;SOR=0.602;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,37:0.32:117
chr12	129189941	rs12424159	G	A	2923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.424;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=59;PP=1811;ReadPosRankSum=-0.259;SC=CAGCCCCGGCGGGGACTATGA;SOR=0.646;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=271;TCF=145;TCR=126;TR=127;WE=129189949;WS=129189931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,140:0.48:294
chr12	129190021	rs11059841	A	G	7937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=134;NR=136;PP=2965;SC=GCACAGGCCAAGATGGGCACC;SOR=0.802;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=270;TCF=134;TCR=136;TR=270;WE=129190029;WS=129190001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,289:1.00:289
chr12	129190266	rs112818862	G	A	3211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.404;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=70;PP=2112;ReadPosRankSum=0.060;SC=CAGACTCCGCGGGGCCTGAGT;SOR=0.754;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=274;TCF=140;TCR=134;TR=138;WE=129190274;WS=129190256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,144:0.50:288
chr12	129190474	rs3812792	G	A	3580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.395;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=78;PP=1982;ReadPosRankSum=0.277;SC=TGGGGGATGCGCCGCCGCCCC;SOR=0.723;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=297;TCF=150;TCR=147;TR=151;WE=129190482;WS=129190464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,175:0.52:335
chr12	129278864	rs1059312	A	G	1816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=44;PP=1226;ReadPosRankSum=0.278;SC=CAGCCAGAAGAAAAAAGTAAT;SOR=0.731;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=179;TCF=90;TCR=89;TR=85;WE=129278872;WS=129278854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,89:0.45:197
chr12	129283711	rs2291350	G	A	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=250;ReadPosRankSum=-0.106;SC=GGCCATCCACGTGAAAACACC;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=11;WE=129283719;WS=129283701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr12	129293346	rs11059924	C	T	957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=12;PP=580;ReadPosRankSum=1.918;SC=CAGCAAAGGCCGAGCACATGA;SOR=0.707;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=98;TCF=71;TCR=27;TR=45;WE=129293354;WS=129293336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,48:0.43:111
chr12	129298468	rs10688448	C	CAATA	197.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.668;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=21.97;ReadPosRankSum=-0.700;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr12	129298564	rs73149855	G	C	1342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.709;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=24;PP=816;ReadPosRankSum=2.097;SC=ATGAGTCATAGTTGGCCAGTG;SOR=0.573;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=100;TCF=62;TCR=38;TR=58;WE=129298572;WS=129298554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,64:0.56:114
chr12	129298727	.	A	AGACCTGAGCGCCGTATGATG	1808.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.576;ClippingRankSum=0.000;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=1.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQRankSum=-1.098;QD=14.95;ReadPosRankSum=-1.624;SOR=0.747;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,57:0.47:121
chr12	129298775	.	C	CCACCGTATGATGGACCTGACCGCTGTATGATGGACCTGAG	1914.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.003;ClippingRankSum=0.000;DP=148;ExcessHet=3.0103;FS=2.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQRankSum=-1.335;QD=13.30;ReadPosRankSum=-0.464;SOR=0.663;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,50:0.35:144
chr12	129298779	rs111379578	C	T	816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.626;NF=33;NR=27;PP=798;ReadPosRankSum=-0.961;SC=ACCTGACCGCCGTATGATGGA;SOR=0.657;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=174;TCF=98;TCR=76;TR=60;WE=129298787;WS=129298769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,51:0.40:129
chr12	129298819	.	C	T	1124	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MMLQ=24;MQ=57.18;NF=48;NR=35;PP=1124;QD=13.9610989464;SC=ACCTGACCGCCGTATGATGGA;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=198;TCF=113;TCR=85;TR=83;WE=129298827;WS=129298809;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:115,83:0.42:198
chr12	129299675	rs2306683	C	G	802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.643;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=25;PP=528;ReadPosRankSum=1.371;SC=GGATGAAAACCATATACGGTC;SOR=0.305;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=92;TCF=25;TCR=67;TR=38;WE=129299683;WS=129299665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,39:0.42:92
chr12	129348666	rs715805	C	T	1052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=16;PP=657;ReadPosRankSum=-0.819;SC=GATGCCAGCTCGGCTGGGGCA;SOR=0.621;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=93;TCF=61;TCR=32;TR=47;WE=129348674;WS=129348656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,50:0.48:105
chr12	129348899	rs715804	G	A	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.169;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=98;ReadPosRankSum=-2.076;SC=AGAGGGCCCCGGAAATCCAGA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=6;WE=129348907;WS=129348889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr12	129360498	rs482401	G	A	1657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.732;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=37;PP=1072;ReadPosRankSum=-0.888;SC=GCGTTTTGAAGGATGCCTTTG;SOR=0.653;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=190;TCF=95;TCR=95;TR=76;WE=129360506;WS=129360488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,84:0.41:206
chr12	129373073	rs7300146	A	C	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.424;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=322;ReadPosRankSum=0.645;SC=TACAGCAACAAACAGCTCCGG;SOR=1.029;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=40;TCF=32;TCR=8;TR=20;WE=129373081;WS=129373063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,22:0.51:43
chr12	129373100	rs12309809	G	A	1021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.837;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=5;PP=667;ReadPosRankSum=-0.743;SC=GGGAACTTCAGTGTTTAAGAT;SOR=1.931;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=65;TCF=49;TCR=16;TR=35;WE=129373108;WS=129373087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,40:0.56:71
chr12	129410738	rs141839609	CAAT	C	660.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5010;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.471;NF=8;NR=1;PP=377;ReadPosRankSum=1.555;SC=GACTCTGTCTCAATAATAATA;SOR=3.056;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=9;WE=129410748;WS=129410728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,18:0.95:19
chr12	129411117	rs11609238	A	G	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.905;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=256;ReadPosRankSum=-0.561;SC=CGTGAGCAGAACTGTTTCTAG;SOR=2.419;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=14;WE=129411125;WS=129411107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr12	129559557	rs10773594	C	T	5047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=85;PP=2954;SC=TATCCAAGGGCGTGACTGAGC;SOR=0.746;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=173;TCF=88;TCR=85;TR=173;WE=129559565;WS=129559547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr12	129566284	.	ATT	A	80.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.305;ClippingRankSum=-0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=-0.000;QD=6.73;ReadPosRankSum=0.233;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
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chr12	130647709	rs10848026	G	C	2535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.498;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=44;PP=1611;ReadPosRankSum=-0.116;SC=TCGCGCCGCTGGTGGAGTACG;SOR=0.982;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=227;TCF=130;TCR=97;TR=114;WE=130647717;WS=130647699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,117:0.50:233
chr12	130838987	rs2173082	C	T	4030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=48;PP=2527;SC=TTGGCATCAGCTCTTTATTTT;SOR=1.429;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=92;TCR=48;TR=140;WE=130838995;WS=130838977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr12	130839645	rs1874521	A	C	1095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=27;PP=807;SC=GGCAGAAAGTAACTTTCTCCT;SOR=2.432;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=34;WE=130839653;WS=130839635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	130847389	rs2242363	A	G	5390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=86;PP=2965;SC=AAGGTTAGTCACCTGTGGGGT;SOR=0.765;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=185;TCF=99;TCR=86;TR=185;WE=130847397;WS=130847379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr12	130883554	rs79117967	CT	C	113.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=10.300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.92;ReadPosRankSum=-1.225;SOR=0.017;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,12:0.41:29
chr12	130884347	rs756186	A	G	1271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.795;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=38;PP=879;ReadPosRankSum=-0.622;SC=CTTTCTGCCCATTCAGCTCCC;SOR=1.389;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=102;TCF=34;TCR=68;TR=51;WE=130884355;WS=130884337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,56:0.49:115
chr12	130916685	rs7966010	T	C	568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=3;PP=512;SC=GGGTTTGTAATCTGAGCAGAT;SOR=3.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=130916693;WS=130916675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr12	130923089	rs2292666	C	G	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.027;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=226;ReadPosRankSum=1.472;SC=GGAACGGAGGCGTTCAGGGAC;SOR=1.863;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=32;TCF=14;TCR=18;TR=16;WE=130923097;WS=130923079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr12	130929546	rs10848102	C	G	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=309;ReadPosRankSum=0.084;SC=TCAAAGAGGGCAAACCTGGTA;SOR=0.368;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=15;WE=130929554;WS=130929536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr12	130929599	rs7952756	A	G	562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.585;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=329;ReadPosRankSum=0.373;SC=CTGGGTGGCCAGGAGTATGTT;SOR=0.062;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=54;TCF=44;TCR=10;TR=27;WE=130929607;WS=130929589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,29:0.53:55
chr12	130935710	rs2398519	C	G	3950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=47;PP=2452;SC=GCACAGGCAGCCCCGGCAGCC;SOR=1.296;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=132;TCF=85;TCR=47;TR=132;WE=130935718;WS=130935700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr12	130941150	rs2277361	G	C	2454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.516;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=46;PP=1600;ReadPosRankSum=1.226;SC=GGTCAATCTTGCCAGCGTGCT;SOR=0.533;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=183;TCF=106;TCR=77;TR=105;WE=130941158;WS=130941140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,112:0.58:193
chr12	130941338	rs1356081	G	A	1367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.751;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=33;PP=789;ReadPosRankSum=-1.236;SC=GTGTGCACATGTGCACTGTGT;SOR=0.559;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=93;TCF=33;TCR=60;TR=51;WE=130941346;WS=130941328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,62:0.55:112
chr12	131276448	rs4759786	G	T	5788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=103;PP=2965;SC=ATGGTTGCTAGGACAATGTTG;SOR=0.884;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=198;TCF=95;TCR=103;TR=198;WE=131276456;WS=131276438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr12	131280714	rs10848205	T	C	4364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=88;PP=2965;SC=TAATTTCATATTGCCACATTA;SOR=1.965;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=37;TCR=88;TR=125;WE=131280722;WS=131280704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr12	131285663	rs1881060	T	C	2982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=35;PP=1908;SC=ACATGACTGATATCTCTCTTG;SOR=1.295;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=67;TCR=35;TR=102;WE=131285671;WS=131285653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr12	131296908	rs9668291	C	G	1670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=30;NR=24;PP=1037;SC=GGAGCGGGTGCGGGTGGGAGC;SOR=0.831;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=56;TCF=31;TCR=25;TR=54;WE=131296916;WS=131296898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr12	131297348	rs4759794	T	G	296.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=184;SC=TTTTGAATATTAATTAGTACT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=131297356;WS=131297347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	131306314	rs17564	C	G	4337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=80;NR=72;PP=2718;SC=TTTATCAATACTGTTTCTAAT;SOR=0.731;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=153;TCF=80;TCR=73;TR=152;WE=131306322;WS=131306304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr12	131311629	rs112850087	G	A	378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.14;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	131323708	rs10848214	T	G	1142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=24;PP=731;SC=CGGCCGGGCCTCGGGCTCTCC;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=18;TCR=24;TR=42;WE=131323716;WS=131323698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr12	131356645	rs11546491	G	A	2564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.475;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=50;PP=1393;ReadPosRankSum=0.215;SC=AGCCTCAGTCGGACGGGCGCG;SOR=0.597;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=230;TCF=126;TCR=104;TR=108;WE=131356653;WS=131356635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,126:0.48:263
chr12	131438971	rs56090874	G	T	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.606;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=294;ReadPosRankSum=0.517;SC=AGACCCTCAGGAATTTCACTT;SOR=1.244;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=41;TCF=33;TCR=8;TR=19;WE=131438979;WS=131438961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,24:0.46:52
chr12	131439239	rs10848261	T	C	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.544;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=112;ReadPosRankSum=1.569;SC=TGAGCACCGCTCTCCCCCTGC;SOR=0.473;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=6;WE=131439247;WS=131439229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr12	131453378	rs7309920	T	C	417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=11;NR=1;PP=275;SC=GGCTGGGGGATGTGAGGTCCG;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=131453386;WS=131453368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	131466562	rs4759534	T	C	2539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=53;PP=1613;SC=TGGAGCTGTATACGCGGGACA;SOR=1.995;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=22;TCR=53;TR=75;WE=131466570;WS=131466552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr12	131471608	rs1547577	T	C	3119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=32;PP=1764;SC=ATTCCCACAGTACTCAGAATG;SOR=1.392;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=63;TCR=32;TR=95;WE=131471616;WS=131471598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr12	131476665	rs5801945	CAA	C	270.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=19.34;ReadPosRankSum=0.967;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,12:0.86:14
chr12	131485025	rs4759822	A	G	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=50;ReadPosRankSum=-0.449;SC=GGTGGCTCATACCTATAATCC;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=4;WE=131485033;WS=131485015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr12	131488566	rs10773836	C	T	228.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=142;SC=CATTGCTTTACCCTTTTTTTT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=8;WE=131488574;WS=131488556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	131490483	rs35387826	G	A	1930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.095;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=33;PP=1104;ReadPosRankSum=0.960;SC=GGCCTGGAGCGCTGACAGCGC;SOR=0.586;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=196;TCF=121;TCR=75;TR=84;WE=131490491;WS=131490473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,95:0.45:213
chr12	131498946	rs1212936	C	T	2344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=48;PP=1537;SC=CTGAGGAATGCTGGGTTGTCT;SOR=1.473;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=29;TCR=48;TR=77;WE=131498954;WS=131498936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr12	131498995	rs1195923	G	A	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=183;ReadPosRankSum=-0.095;SC=CCTTGGTGCCGGCCCGAACTG;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=12;WE=131499003;WS=131498985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr12	131555329	rs10744491	C	A	2132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=48;NR=26;PP=1237;SC=GCTGATTGGACTGTGGAGTAC;SOR=1.236;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=48;TCR=26;TR=74;WE=131555337;WS=131555319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr12	131555635	.	G	A	28	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=27;MQ=45.47;NF=0;NR=3;PP=28;QD=20.9237375157;SC=GAAAGGAGGTGGAGCCATGTA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=3;WE=131555643;WS=131555625;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:5,3:0.38:8
chr12	131602811	rs7961434	C	T	779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.983;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=8;PP=470;ReadPosRankSum=0.648;SC=CATAGTTCCCCCTCTGTATAC;SOR=0.207;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=59;TCF=49;TCR=10;TR=33;WE=131602819;WS=131602801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,34:0.56:61
chr12	131620578	rs884522	C	T	3581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FS=1.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.97;ReadPosRankSum=-1.279;SOR=0.807;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,92:0.56:163
chr12	131620588	rs868158	A	G	3628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FS=0.543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.72;ReadPosRankSum=1.341;SOR=0.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,99:0.54:184
chr12	131620738	rs2280683	A	G	908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.290;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=30;PP=669;ReadPosRankSum=1.617;SC=GCGGGGAGGCAGGGCCGCCAG;SOR=1.131;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=70;TCF=18;TCR=52;TR=37;WE=131620746;WS=131620728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,39:0.52:75
chr12	131622735	rs7302341	T	C	8768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=147;NR=161;PP=2965;SC=CGAGCAGCTCTGCCCGCACCT;SOR=0.883;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=308;TCF=147;TCR=161;TR=308;WE=131622743;WS=131622725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,331:1.00:331
chr12	131622833	rs2277337	T	C	777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.017;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=25;PP=447;ReadPosRankSum=0.966;SC=CAGGCTCGGTTGTCAGCAGGA;SOR=0.502;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=65;TCF=19;TCR=46;TR=36;WE=131622841;WS=131622823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,39:0.56:70
chr12	131687287	rs7486559	G	C	6115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.86;MQRankSum=-0.186;QD=33.60;ReadPosRankSum=0.398;SOR=0.834;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,180:0.99:182
chr12	131687287	.	GCG	CCC,CCG	1323	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000,0.5000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=14;MQ=59.64;NF=47,97;NR=29,72;PP=1008,1323;QD=13.966682564;SC=CCTCCTCCCCGCGACGTGACG;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=173;TCF=98;TCR=75;TR=76,169;WE=131687297;WS=131687276;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.44:173
chr12	131687289	rs12816480	G	C	1711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FS=1.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=-2.256;QD=8.92;ReadPosRankSum=1.127;SOR=0.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:107,85:0.44:192
chr12	131692116	rs11061381	T	C	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=7.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.29;MQRankSum=-3.927;QD=4.29;ReadPosRankSum=2.628;SOR=2.484;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,13:0.22:58
chr12	132209932	rs138640311	ATG	A	2464.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.861;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=19;PP=1593;ReadPosRankSum=-0.176;SC=TGACGTGAATATGTGTGTTTT;SOR=0.936;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=96;TCF=44;TCR=52;TR=40;WE=132209941;WS=132209922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,71:0.45:159
chr12	132237750	rs1051219	C	T	3424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=350;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.389;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=78;PP=2128;ReadPosRankSum=-1.422;SC=CCGGAATCGACGTGACTACTT;SOR=0.731;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=306;TCF=146;TCR=160;TR=147;WE=132237758;WS=132237740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,165:0.47:348
chr12	132237848	rs1982528	T	C	4205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=58;NR=83;PP=2710;SC=ACCACACCACTACCGCCCCCA;SOR=1.319;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=141;TCF=58;TCR=83;TR=141;WE=132237856;WS=132237838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr12	132240937	rs3217666	C	CAT	856.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.770;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=568;ReadPosRankSum=2.772;SC=TCCAGTGAAACATATACCGTA;SOR=0.250;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=29;TCF=18;TCR=11;TR=14;WE=132240945;WS=132240927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,24:0.57:42
chr12	132241229	rs7136191	A	G	614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=12;PP=305;SC=ACATTCCACCATAAGTTGGCA;SOR=1.270;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=9;TCR=12;TR=21;WE=132241237;WS=132241219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	132250712	rs1051233	G	C	2023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.722;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=42;PP=1026;ReadPosRankSum=0.549;SC=GGGAAAAGCTGGCCCAGGCGT;SOR=0.616;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=150;TCF=78;TCR=72;TR=86;WE=132250720;WS=132250688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,97:0.57:169
chr12	132262713	rs79031981	C	T	2396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.240;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=41;PP=1536;ReadPosRankSum=-0.130;SC=AAAGATCCACCGAGAGAAGAA;SOR=0.870;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=210;TCF=122;TCR=88;TR=98;WE=132262721;WS=132262703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,109:0.46:235
chr12	132262911	rs75324057	A	T	1382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.172;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=41;PP=941;ReadPosRankSum=0.941;SC=TGGTACCCTCATGACCCCCAT;SOR=1.031;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=87;TCF=14;TCR=73;TR=47;WE=132262919;WS=132262901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,55:0.56:98
chr12	132269830	rs66665803	G	GA	4500.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=71;PP=2690;SC=AAAGGTCTGGGAAAAAATCAA;SOR=1.516;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=8;TCR=82;TR=78;WE=132269838;WS=132269820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr12	132271113	rs7136643	T	C	1730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=25;PP=1215;SC=CTGGGGCCAGTAGGAAGCGGA;SOR=1.127;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=38;TCR=25;TR=63;WE=132271121;WS=132271103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr12	132313098	.	G	GGCTGCCGCT	490.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=3;PP=1117;SC=GGACTCTCGCGGCTGCCGCTG;SOR=0.892;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=5;WE=132313106;WS=132313088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	132323082	rs7971187	A	G	515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.67;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	132323089	rs7965611	C	G	515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.67;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	132323294	rs4964884	T	C	690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=12;NR=11;PP=310;SC=GAGGTGGGTGTGTGGCCAGGG;SOR=0.765;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=12;TCR=11;TR=23;WE=132323302;WS=132323284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	132325239	rs6598163	G	A	5335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=546;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=121;NR=125;PP=2962;ReadPosRankSum=1.411;SC=GGCGGGCAGCGCCGCCGACAT;SOR=0.694;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=503;TCF=251;TCR=252;TR=246;WE=132325247;WS=132325229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:282,264:0.48:546
chr12	132326051	rs4964929	C	T	132.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=5;NR=0;PP=102;SC=CCCTCTGGCGCAGCCGGCATC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=132326059;WS=132326041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	132326298	rs35466884	G	A	1376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=35;PP=811;ReadPosRankSum=0.312;SC=GACCCGCTGCGCTACGGGCTC;SOR=0.696;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=41;TCR=56;TR=61;WE=132326306;WS=132326288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,65:0.61:106
chr12	132329553	rs61942397	A	C	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.487;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=10;NR=0;PP=205;ReadPosRankSum=-1.645;SC=TAGGGGCTCCACACAAGGATG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=10;WE=132329561;WS=132329543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr12	132329807	rs11611232	T	C	2119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.982;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=53;PP=1455;ReadPosRankSum=-0.393;SC=GTGCAGACCGTCTCTGCAGCC;SOR=0.778;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=229;TCF=106;TCR=123;TR=94;WE=132329815;WS=132329797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,102:0.40:258
chr12	132395052	rs7295593	G	C	515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=5;PP=414;SC=AGCAGGCTTGGGATGGGGATG;SOR=1.739;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=17;WE=132395060;WS=132395043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	132396343	rs11615995	C	T	599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=1;PP=457;SC=GAGCGGAGCACAGGAAGAAAG;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=132396351;WS=132396333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr12	132396603	rs11616018	C	T	3430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=68;PP=2063;SC=GTGACACAGACGACTTCGTCA;SOR=1.092;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=117;TCF=49;TCR=68;TR=117;WE=132396611;WS=132396593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr12	132398253	.	AAAC	A	85.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=-0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.59;ReadPosRankSum=0.929;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr12	132398256	rs4964880	C	A	117.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.783;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.06;ReadPosRankSum=-0.645;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr12	132399065	rs12303764	T	G	3398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=76;PP=2156;SC=GCTGGGGCCTTGTGTGGCAGG;SOR=1.482;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=120;TCF=44;TCR=76;TR=120;WE=132399073;WS=132399055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr12	132401642	rs7959651	T	C	3597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.85;QD=34.93;SOR=1.125;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr12	132401668	rs140238247	G	C	2222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=47;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=35;PP=880;SC=TGGGATGGGGGTCGGAGGCTG;SOR=1.519;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=52;TCF=15;TCR=37;TR=50;WE=132401676;WS=132401658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr12	132401684	rs7959669	T	C	1455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=55;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=29;PP=644;SC=GGCTGTGGGATGGGGGTCGGA;SOR=2.448;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=35;WE=132401692;WS=132401674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr12	132401712	.	C	CG	199	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=69;MMLQ=24;MQ=55.89;NF=0;NR=5;PP=199;QD=48.4;SC=GGATGGGGCTCGAGGCTGTGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=132401720;WS=132401695;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,5:0.56:9
chr12	132402020	rs4964918	T	C	2489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=49;NR=33;PP=1396;SC=CCAGCAGCCCTTCCCCGGTGG;SOR=0.953;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=82;TCF=49;TCR=33;TR=82;WE=132402028;WS=132402010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr12	132403161	rs11609348	A	G	4697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=81;NR=73;PP=2573;SC=CGACCCCATTACTGCGAACCT;SOR=0.800;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=154;TCF=81;TCR=73;TR=154;WE=132403169;WS=132403151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr12	132403305	.	A	ATAGGGTGTGTGGGGTG	293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.72;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	132404212	rs7299195	A	G	1527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=34;PP=990;SC=GTGACAGGGTAACAGGGAGGC;SOR=1.835;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=14;TCR=34;TR=48;WE=132404220;WS=132404202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr12	132406275	rs7311029	A	C	2700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=17;PP=1956;ReadPosRankSum=0.614;SC=CTGCTTAGGGAAGGTCAGCAG;SOR=1.350;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=86;TCF=69;TCR=17;TR=85;WE=132406283;WS=132406265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,90:0.99:91
chr12	132427909	rs7961398	A	G	341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=3;PP=254;SC=CTTTCCCTGCACAGGTTCCTG;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=14;WE=132427917;WS=132427899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	132465943	.	T	G	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.086;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.881;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=256;ReadPosRankSum=0.164;SC=GCCTCCCTTTTCCAAGATGAT;SOR=0.319;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=45;TCF=33;TCR=12;TR=19;WE=132465951;WS=132465933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,20:0.44:45
chr12	132510288	.	C	T	2250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.879;ClippingRankSum=0.000;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=49;PP=1426;ReadPosRankSum=2.527;SC=GCGCTGTGCACGGCGCCCTGG;SOR=0.700;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=209;TCF=105;TCR=104;TR=98;WE=132510296;WS=132510278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,108:0.47:228
chr12	132512261	rs35569693	T	A	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.031;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=157;ReadPosRankSum=0.057;SC=GCCACAATCTTTTTTTGTATT;SOR=0.352;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=12;WE=132512269;WS=132512251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr12	132514454	rs79985228	C	T	1343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.151;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=25;PP=919;ReadPosRankSum=-0.697;SC=CTCAGGTATGCGGCAGTTGGG;SOR=0.843;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=120;TCF=65;TCR=55;TR=55;WE=132514462;WS=132514444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,60:0.46:131
chr12	132547093	.	A	ACAG	1104.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.543;ClippingRankSum=0.000;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.876;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=2.862;NF=5;NR=11;PP=673;ReadPosRankSum=0.858;SC=AGCAGCAACAACAGCAGCAGC;SOR=1.171;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=37;TCF=8;TCR=29;TR=16;WE=132547101;WS=132547083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,33:0.85:39
chr12	132562126	rs73164912	G	A	1450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.602;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=34;PP=967;ReadPosRankSum=-0.671;SC=CCAGGTGCCCGCCAGCTCCGA;SOR=0.784;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=134;TCF=69;TCR=65;TR=68;WE=132562134;WS=132562116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,70:0.46:151
chr12	132626668	rs1133690	T	C	2107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=21;PP=1152;SC=ACATACCTGCTGGGCCAGCTC;SOR=1.270;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=44;TCR=21;TR=64;WE=132626676;WS=132626658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr12	132630822	rs10794454	C	T	7991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=149;NR=133;PP=2965;SC=TATGTGGCTTCTTCCACTCAT;SOR=0.733;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=282;TCF=149;TCR=133;TR=282;WE=132630830;WS=132630812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,308:1.00:308
chr12	132633505	.	C	A	67	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=48;MMLQ=26;MQ=52.49;NF=3;NR=6;PP=67;QD=11.3079125052;SC=CCGCCTCACTCCTACCACACC;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=9;WE=132633513;WS=132633495;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:13,9:0.41:22
chr12	132635521	rs7397057	T	C	4360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=87;NR=63;PP=2207;SC=TCTGTCTGTCTGCAGGGGGGG;SOR=0.918;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=152;TCF=88;TCR=64;TR=150;WE=132635532;WS=132635511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr12	132635989	rs11246947	A	G	1077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.884;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=24;PP=838;ReadPosRankSum=-0.615;SC=GGTGGGGGCTAGCAGTCCGGG;SOR=0.687;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=103;TCF=56;TCR=47;TR=44;WE=132635997;WS=132635979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,46:0.41:113
chr12	132636400	rs11246948	G	A	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.158;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=366;ReadPosRankSum=0.302;SC=GGGGCCTCCCGAGCCATCCTT;SOR=0.502;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=53;TCF=11;TCR=42;TR=24;WE=132636408;WS=132636390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,27:0.46:59
chr12	132682481	rs12308155	T	G	9729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.44;SOR=0.786;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr12	132682484	rs12306514	A	G	9600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.07;SOR=0.780;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr12	132683632	rs4074045	A	C	409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=3;PP=303;SC=AGCAGGCTGGACCCGTGCCTC;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=14;WE=132683640;WS=132683622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	132683862	rs6598205	G	A	5073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=105;PP=2965;SC=CCGAGGGTGCGGCCCCAGGGA;SOR=1.136;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=180;TCF=75;TCR=105;TR=180;WE=132683870;WS=132683852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr12	132683961	rs6598206	T	C	865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=23;PP=534;SC=CCGGGTGGGCTGCCTGGGAAG;SOR=3.126;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=28;WE=132683969;WS=132683951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr12	132685837	rs10794457	A	G	4218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=83;PP=2452;SC=GAGAGGGTACATGGGTGTCAC;SOR=1.421;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=53;TCR=83;TR=136;WE=132685845;WS=132685827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr12	132688115	rs11246991	C	T	3473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=379;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.509;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=73;PP=2095;ReadPosRankSum=0.667;SC=ACCTCGGCGGCGCGCAGGGCG;SOR=0.863;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=358;TCF=190;TCR=168;TR=169;WE=132688123;WS=132688105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:201,178:0.47:379
chr12	132688279	rs10902510	A	G	1987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=46;PP=1351;SC=TCCCAACGGAAGCGGGCAGCC;SOR=1.897;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=19;TCR=46;TR=65;WE=132688287;WS=132688269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr12	132811399	rs74514445	A	G	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=81;ReadPosRankSum=-0.522;SC=GCGTGGCCCCAGGGCTCAGCT;SOR=0.473;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=8;WE=132811407;WS=132811389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr12	132811498	rs368985675	TC	T	1176.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.755;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=643;ReadPosRankSum=1.616;SC=TCGGACCTGCTCCTCTTCACT;SOR=0.830;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=51;TCF=20;TCR=31;TR=20;WE=132811506;WS=132811488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,41:0.38:107
chr12	132811652	rs73166880	TG	CT	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=392;ReadPosRankSum=0.709;SC=TTTACACACATGCCACACACC;SOR=0.495;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=41;TCF=11;TCR=30;TR=13;WE=132811661;WS=132811642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,16:0.38:42
chr12	132811670	rs111837594	A	G	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.682;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=106;ReadPosRankSum=-0.536;SC=ACCCTTCCCAAGGCCGTCCCT;SOR=0.148;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=10;WE=132811678;WS=132811660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr12	132824197	.	ATGGCCGCACTCGCCCTCACCCCGTCCCCGGATGCCG	A	1428.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.850;ClippingRankSum=0.000;DP=154;ExcessHet=3.0103;FS=1.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.23;MQRankSum=5.016;QD=17.21;ReadPosRankSum=-0.597;SOR=0.979;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,38:0.46:83
chr12	132824450	rs73166888	G	T	3842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=368;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.786;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=81;PP=2222;ReadPosRankSum=1.038;SC=CTGGACACCGGGGCCGCACTC;SOR=0.637;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=336;TCF=186;TCR=150;TR=178;WE=132824458;WS=132824440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,194:0.53:368
chr12	132839265	rs28431148	A	G	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=294;ReadPosRankSum=-0.534;SC=GGGACCCCGGAAGCCATAGCT;SOR=1.101;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=16;WE=132839273;WS=132839255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
chr12	132905487	.	C	T	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.722;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=160;ReadPosRankSum=0.124;SC=CCTGACCCATCGCGCCCGGGG;SOR=0.732;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=12;WE=132905495;WS=132905477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr12	132912099	.	CGTGTGTGCATGCAT	C	142.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.707;ClippingRankSum=0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.832;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=3;PP=590;ReadPosRankSum=-0.257;SC=AGCATGTACCCGTGTGTGCAT;SOR=0.707;SbPval=0.78;Source=Platypus;TCF=5;WE=132912120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr12	132912160	.	ATG	A	611.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.136;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=409;ReadPosRankSum=-0.270;SC=GTGTGCATGCATGTGTGTGCA;SOR=0.693;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=18;TCF=9;TCR=9;TR=11;WE=132912169;WS=132912150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr12	133031898	rs10870487	A	G	2483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=21;PP=1504;SC=CAGTAGCTCCAACCTCACAGC;SOR=1.770;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=62;TCR=21;TR=83;WE=133031906;WS=133031888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr12	133032047	.	T	TGTGTGTGCATGTTGAC	3785.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=27;PP=2974;SC=TGTGGACATATGTGTGTGCAT;SOR=1.375;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=53;TCF=3;TCR=50;TR=28;WE=133032055;WS=133032037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr12	133032110	rs9706362	T	C	364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=168;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=14;PP=198;SC=CTTGTGTGTGTGTGCATGTGT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=133032118;WS=133032100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	133032132	rs113386371	C	CGT	279.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=82;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=10;PP=444;SC=TGCATGTGAACGTGTGTGTGA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=133032140;WS=133032122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	133067343	.	A	G	274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.80;QD=24.98;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	133084973	rs61952075	G	A	290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=3;NR=8;PP=201;SC=GCTCTGCGGCGGGTCAGTGCT;SOR=1.802;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=133084981;WS=133084963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	133146416	rs7312710	A	G	1299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=8;PP=953;SC=GCCCAGACATAGCCTGGGCAC;SOR=2.531;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=32;TCR=8;TR=40;WE=133146424;WS=133146406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr12	133146457	rs3751316	G	A	2809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=33;PP=1692;SC=CTGGGCCACAGGAGGGGCAGG;SOR=1.168;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=63;TCR=33;TR=96;WE=133146465;WS=133146447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr12	133153281	rs10870473	A	T	1090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=4;PP=734;SC=TGCTCCCCTTACTGGACTGGC;SOR=3.026;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=31;WE=133153289;WS=133153271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	133158632	rs3751304	C	T	836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=2;PP=639;SC=TCATGCTCCCCGGCCTCTGCC;SOR=3.690;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=26;WE=133158640;WS=133158622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	133159004	rs7308900	C	G	254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.16;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	133159733	rs11550079	C	T	1877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=40;NR=24;PP=945;SC=AAGGAGGAGGCCGCCAAGATG;SOR=0.927;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=40;TCR=24;TR=64;WE=133159741;WS=133159723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr12	133159870	.	GGCCTGGGCCGCGAGC	G	774.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.938;ClippingRankSum=0.000;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=1783;ReadPosRankSum=-1.461;SC=CCTGCAGCTCGGCCTGGGCCG;SOR=0.586;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=4;WE=133159892;WS=133159860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,21:0.54:39
chr12	133182783	.	CCAG	C	273.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.082;ClippingRankSum=0.000;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.74;ReadPosRankSum=-1.864;SOR=0.491;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,14:0.14:100
chr12	133233705	rs5744889	T	C	1418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=34;NR=16;PP=844;SC=AGCCCAGCCTTGGGGCCCCAC;SOR=1.848;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=34;TCR=16;TR=50;WE=133233713;WS=133233695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr12	133252796	rs4077170	C	G	6461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=113;PP=2965;SC=TAGCCCTAGCCAAGTTCATTA;SOR=0.930;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=212;TCF=99;TCR=113;TR=212;WE=133252804;WS=133252786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr12	133252947	rs5744759	T	C	328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=10;PP=240;SC=AGACGCTCTGTGTGTGGATTC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=133252955;WS=133252937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	133253310	rs5744757	A	G	798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=21;PP=582;SC=ACCCACCCCCAGCCTGCTCTA;SOR=2.753;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=26;WE=133253318;WS=133253300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	133254083	rs5744750	T	C	5882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=89;NR=91;PP=2965;SC=AAGTCTATTCTTCTGTGGATT;SOR=0.906;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=180;TCF=89;TCR=91;TR=180;WE=133254091;WS=133254073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr12	133256904	rs5744738	C	T	1466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=40;PP=1123;SC=CCATGAACAGCCTAGGGCCAG;SOR=2.701;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=10;TCR=40;TR=50;WE=133256912;WS=133256894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr12	133263743	rs111877885	A	C	270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=2;PP=140;SC=GGCTGCGGGAACCGGGCCTCC;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=133263751;WS=133263733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	133263825	rs2075784	G	A	1333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=32;NR=7;PP=736;SC=AGAGCCTCAGGAGGGCGCCCC;SOR=2.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=32;TCR=7;TR=39;WE=133263833;WS=133263815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr12	133264332	rs11538534	C	T	90.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=1;PP=54;SC=CGCCCAGTACCTGCTCTTCCT;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=133264340;WS=133264322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr12	133267164	rs34659814	CT	C	97.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.57;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	133272380	rs10781627	G	C	1099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=4;PP=746;SC=GGAAGCAGGGGTTAGGACCTG;SOR=3.383;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=32;WE=133272388;WS=133272370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	133277983	rs7958567	T	C	1922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=34;NR=28;PP=1016;SC=CAGCCTCTGCTAACATTACTT;SOR=0.874;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=34;TCR=28;TR=62;WE=133277991;WS=133277973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr12	133281462	rs10007	G	A	6264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=103;NR=113;PP=2965;SC=AAAGGCAGTCGCTGCCTTCAG;SOR=0.905;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=216;TCF=103;TCR=113;TR=216;WE=133281470;WS=133281452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr12	133287418	rs117520285	T	C	42.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.70;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr12	133287459	rs7486453	C	T	103.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.78;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	133287721	rs7973452	A	G	893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=18;NR=15;PP=565;SC=GTTGGGATCGAGATCGGGACC;SOR=0.811;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=18;TCR=15;TR=33;WE=133287729;WS=133287711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr12	133294492	rs146140910	C	T	733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.043;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=16;PP=468;ReadPosRankSum=-0.162;SC=CGGGCTTCCCCGGGCGGCGAT;SOR=0.527;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=53;TCF=20;TCR=33;TR=27;WE=133294500;WS=133294482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,30:0.52:58
chr12	133294826	rs149250932	G	GC	774.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=16;PP=593;SC=GGCCTCACCAGCCCCCGGGCG;SOR=2.066;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=16;WE=133294834;WS=133294816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	133295161	.	G	GT	344	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;FR=1.0000;HP=5;HapScore=2;MGOF=17;MMLQ=26;MQ=55.02;NF=11;NR=1;PP=344;QD=31.25;SC=CTGGGTGGGGGGTCCTGGGTG;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=12;WE=133295169;WS=133295151;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr12	133297103	rs10781631	T	C	317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=1;PP=164;SC=CCGTGTTAGCTGGGATGGTCT;SOR=2.494;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=133297111;WS=133297096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	133297182	rs10870498	A	G	1906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=48;NR=19;PP=1018;SC=GTGAGCCACCATGCCCGGCCT;SOR=1.578;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=49;TCR=20;TR=67;WE=133297190;WS=133297172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr12	133297240	rs368555916	TTC	T	54.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FS=4.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQRankSum=2.987;QD=0.39;ReadPosRankSum=-1.488;SOR=0.590;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:123,17:0.12:140
chr12	133304146	rs10437912	C	T	1512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.39;QD=42.02;SOR=3.383;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	133304149	rs10437913	G	C	1480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.37;QD=42.31;SOR=3.321;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr12	133304891	rs10870499	T	C	517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=18;PP=497;SC=TCTCGGCTCATCGCAAGCTCC;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=133304899;WS=133304881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	133306589	rs10781634	C	T	6260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=97;NR=107;PP=2965;SC=TTCCTCCCCACGGGGGGCCTT;SOR=0.894;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=206;TCF=98;TCR=108;TR=204;WE=133306597;WS=133306579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr12	133306920	.	CCCATCCATGACCAACTGCCGTGACCCCAGCAACAGCAACTCTTATACCCAAAACCTCCCCACT	C	956.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.10;QD=25.18;SOR=1.493;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr12	133306927	.	AT	GC	817	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=7;NR=14;PP=817;QD=41.4508511839;SC=CGCCCCATCCATGACCAACTG;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=23;TCF=9;TCR=14;TR=21;WE=133306936;WS=133306917;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,21:0.91:23
chr12	133311888	rs10781636	C	G	2568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=30;PP=1655;SC=CCCAGAAAAGCCTTCTGGAAA;SOR=1.414;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=55;TCR=30;TR=85;WE=133311896;WS=133311878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr12	133311944	rs10747081	T	C	4055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=59;PP=2228;SC=TTAATCAAAATGCAACCAACT;SOR=0.937;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=135;TCF=76;TCR=59;TR=134;WE=133311952;WS=133311934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr12	133312191	rs10781637	T	C	446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=15;PP=365;SC=AGTAGCTGCCTGTCTCCGCAC;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=133312199;WS=133312181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	133327470	rs7304425	A	T	172.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=108;SC=AAATCAGAGAAGAGTGACTGG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=133327478;WS=133327460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	133331537	rs1132375	G	A	5737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=85;PP=2965;ReadPosRankSum=1.408;SC=GCCTCATGGTGGTAGAAAGAA;SOR=0.317;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=190;TCF=105;TCR=85;TR=188;WE=133331545;WS=133331527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,209:1.00:210
chr12	133349620	rs3741483	C	G	3203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=71;NR=34;PP=1627;SC=AAACATCGACCACACAATCAA;SOR=1.133;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=71;TCR=34;TR=105;WE=133349628;WS=133349610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr12	133349893	rs3741484	A	G	445.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.72;SOR=2.448;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	133353168	.	C	T	193	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=26;MQ=50.53;NF=8;NR=1;PP=193;QD=25.3079125052;SC=GCCCCTCCAGCTCCTTCCTCC;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=133353176;WS=133353166;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	133354262	rs143232411	C	T	2362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.723;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=46;PP=1543;ReadPosRankSum=-0.016;SC=TGAAGGTCGTCGGCCTCGGCC;SOR=0.856;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=199;TCF=113;TCR=86;TR=109;WE=133354270;WS=133354252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,112:0.54:206
chr12	133354470	rs900444	T	C	1164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=33;PP=605;ReadPosRankSum=-1.357;SC=AGGGGGTGAATGCACTCCCGG;SOR=0.710;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=127;TCF=49;TCR=78;TR=53;WE=133354478;WS=133354460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,61:0.43:143
chr12	133357412	rs2291260	T	C	1173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=1.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.49;ReadPosRankSum=-1.331;SOR=0.501;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,52:0.60:87
chr12	133360530	rs11147073	T	C	801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=0;PP=647;SC=TCTGTAACCATTCCACCAAAG;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=133360538;WS=133360520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr12	133360964	rs1009320	G	A	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=232;ReadPosRankSum=-0.287;SC=CTGTGGTGCCGGCAGGCATGA;SOR=0.965;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=14;WE=133360972;WS=133360954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr12	133363264	rs2242294	C	T	1636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.263;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=46;PP=1383;ReadPosRankSum=1.564;SC=CTCCCCCGGGCACATGCAGAC;SOR=0.586;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=152;TCF=64;TCR=88;TR=79;WE=133363272;WS=133363234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,83:0.52:159
chr12	133363376	rs7976379	G	T	796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=24;PP=456;ReadPosRankSum=0.217;SC=TGCAACGACTGTGGAAGGGAA;SOR=0.706;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=115;TCF=50;TCR=65;TR=40;WE=133363384;WS=133363366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,45:0.35:127
chr12	133365497	rs968522	A	C	440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=19;NR=5;PP=477;SC=ACAGGCCCCGACCCAGACAGA;SOR=1.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=24;WE=133365505;WS=133365487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	133372395	rs4758905	A	C	5080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=118;NR=60;PP=2965;SC=CATTCCTGCAAGGAGGGTTCT;SOR=1.464;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=179;TCF=119;TCR=60;TR=178;WE=133372403;WS=133372385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr12	133373375	rs2242292	C	T	717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.516;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=26;PP=570;ReadPosRankSum=-0.141;SC=AGAAACCCACCGCCCTGGCAT;SOR=1.802;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=53;TCF=9;TCR=44;TR=29;WE=133373383;WS=133373365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,29:0.53:55
chr12	133374905	rs77330849	C	T	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.447;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=379;ReadPosRankSum=1.593;SC=TAAGCTTCCACGGCCCCGGCC;SOR=2.280;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=42;TCF=35;TCR=7;TR=21;WE=133374913;WS=133374895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,21:0.47:45
chr12	133378244	rs149456851	AC	A	829.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=840;ReadPosRankSum=-0.921;SC=CAGGTTAAAAACAAAAACATG;SOR=0.646;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=73;TCF=41;TCR=32;TR=20;WE=133378252;WS=133378234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,38:0.36:105
chr12	133378440	rs2291258	C	T	1954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.505;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=45;PP=1097;ReadPosRankSum=-1.701;SC=GGACACTCTGCAGGGACGAGA;SOR=0.404;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=156;TCF=66;TCR=90;TR=84;WE=133378448;WS=133378430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,93:0.53:177
chr12	133378610	rs75002364	G	A	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=71;ReadPosRankSum=1.056;SC=GGGGGAGTCCGCAGCTCCGCG;SOR=0.148;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=7;WE=133378618;WS=133378600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr12	133383923	rs10781653	T	C	2075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=38;PP=1250;SC=CCTCATTTTCTTTCACACTCC;SOR=1.288;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=28;TCR=38;TR=66;WE=133383931;WS=133383913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr12	133384864	rs3741486	G	A	2813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.913;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=61;PP=1726;ReadPosRankSum=-1.571;SC=ATCGGGAGCCGGGACATTTCC;SOR=0.565;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=259;TCF=141;TCR=118;TR=128;WE=133384872;WS=133384854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,138:0.49:283
chr12	133385188	rs3741488	A	T	1110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=34;PP=768;ReadPosRankSum=1.447;SC=CAAGCAGCATACTTAAAACTG;SOR=0.608;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=23;TCR=73;TR=45;WE=133385196;WS=133385178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,48:0.46:104
chr12	133418069	rs1045979	C	T	1027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.684;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=21;PP=621;ReadPosRankSum=-1.012;SC=CCTTGACGTGCTTGTCTCTGT;SOR=0.606;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=116;TCF=71;TCR=45;TR=50;WE=133418077;WS=133418059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,54:0.44:124
chr12	133419808	rs4758950	G	A	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.059;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=177;ReadPosRankSum=-1.090;SC=TAGTTTCCTCGGACCGTTCTG;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=9;WE=133419816;WS=133419798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr12	133420533	rs150643970	CA	C	533.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.43;MQRankSum=1.870;QD=7.21;ReadPosRankSum=2.283;SOR=0.709;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,35:0.47:74
chr12	133420743	rs143440255	CCCAGCAACA	C	2168.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.686;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.133;NF=4;NR=22;PP=2938;ReadPosRankSum=-1.048;SC=CAGCCAGTTACCCAGCAACAC;SOR=0.808;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=65;TCF=6;TCR=59;TR=26;WE=133420759;WS=133420733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,59:0.48:124
chr12	133423662	rs2306536	C	T	1132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.439;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=19;PP=561;ReadPosRankSum=-0.655;SC=TGGAGAGCCACGAGGCTCTCG;SOR=0.851;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=110;TCF=65;TCR=45;TR=50;WE=133423670;WS=133423652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,58:0.48:122
chr12	133423695	rs2306537	A	G	1538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.659;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=31;PP=982;ReadPosRankSum=0.357;SC=TTCCATGTCAAACCTCTGGTT;SOR=0.584;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=66;TCR=53;TR=68;WE=133423703;WS=133423685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,72:0.56:129
chr12	133423866	rs10747087	G	A	624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=13;PP=323;SC=AGGGCTGCACGTTCACGGCCT;SOR=1.519;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=8;TCR=13;TR=21;WE=133423874;WS=133423856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	133423884	rs2306538	G	A	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.840;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=141;ReadPosRankSum=2.662;SC=CCTGCAGCACGAGAAGTCTTG;SOR=1.270;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=8;WE=133423892;WS=133423874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr12	133428131	rs2306540	C	T	1714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=44;PP=1051;ReadPosRankSum=-0.931;SC=ACCCTAAGGCCAACACCGCTT;SOR=0.681;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=266;TCF=141;TCR=125;TR=93;WE=133428139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:191,100:0.34:291
chr12	133432992	rs2306539	G	A	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=180;ReadPosRankSum=1.249;SC=GTGAGCTCTCGGTCACGGTTG;SOR=0.269;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=11;WE=133433000;WS=133432982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr12	133433173	rs2062163	T	C	5170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=84;PP=2965;SC=TGATTTTATTTCTGGCATCCA;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=177;TCF=93;TCR=84;TR=177;WE=133433181;WS=133433163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr12	133433237	rs3816759	C	T	1324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.270;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=37;PP=785;ReadPosRankSum=2.314;SC=AAGGACACAGCGCCATTCACC;SOR=0.836;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=141;TCF=64;TCR=77;TR=64;WE=133433245;WS=133433227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,70:0.45:157
chr12	133435595	rs4758955	C	T	1250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.795;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=17;PP=812;ReadPosRankSum=0.218;SC=CCCTGCCCCACACGGGACGAA;SOR=0.856;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=95;TCF=64;TCR=31;TR=53;WE=133435603;WS=133435585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,56:0.55:101
chr12	133435716	rs35011845	T	G	2871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.035;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=63;PP=1666;ReadPosRankSum=-0.911;SC=CCATCTTGTCTGGCTTCCCAG;SOR=0.497;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=244;TCF=121;TCR=123;TR=131;WE=133435724;WS=133435706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,146:0.54:272
chr12	133438277	rs2306543	T	C	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=1.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.27;ReadPosRankSum=-1.192;SOR=0.375;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr12	133439002	rs9943856	G	A	912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.74;ReadPosRankSum=0.729;SOR=0.706;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,47:0.40:118
chr12	133439115	rs9943858	G	A	893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=20;PP=593;SC=ACTTGAGCCCGGGAGTTCGAG;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=27;WE=133439123;WS=133439105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	133447224	rs11147126	T	C	1698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.258;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=24;PP=1058;ReadPosRankSum=-1.221;SC=CCAGCCTGGGTAACAGAGCGA;SOR=0.587;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=151;TCF=99;TCR=52;TR=71;WE=133447232;WS=133447203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,76:0.47:163
chr12	133454294	rs11147137	C	T	2535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.511;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.469;NF=54;NR=60;PP=1667;ReadPosRankSum=-0.847;SC=ACTGTGAACACTACTGCACTT;SOR=0.764;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=239;TCF=118;TCR=121;TR=114;WE=133454302;WS=133454284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,121:0.48:250
chr12	133454354	rs149820641	TA	T	1114.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.777;HP=9;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=1.395;NF=2;NR=42;PP=479;ReadPosRankSum=0.407;SC=TGTACATATGTAAAAAAAAAC;SOR=0.544;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=88;TCF=3;TCR=85;TR=44;WE=133454362;WS=133454344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,54:0.51:105
chr12	133454390	.	AT	A	197.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.262;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=1.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQRankSum=0.920;QD=5.34;ReadPosRankSum=1.367;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,14:0.38:37
chr12	133463969	rs113492159	G	A	2081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FS=1.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.054;QD=9.96;ReadPosRankSum=0.616;SOR=0.579;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,109:0.52:209
chr12	133501827	rs3052642	CTT	C	135.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.917;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.53;MQRankSum=0.869;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.221;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr12	133682655	rs710945	A	G	5454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=79;PP=2965;SC=CTCGACATCAAAGAATTCACA;SOR=0.901;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=182;TCF=102;TCR=80;TR=181;WE=133682663;WS=133682645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr12	133683261	rs905226	T	C	5108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=118;PP=2886;SC=AGAAAAACTATGAATGTATGG;SOR=2.077;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=165;TCF=47;TCR=118;TR=165;WE=133683269;WS=133683251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr12	133683280	rs905225	A	T	2645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=79;PP=2183;SC=GGAATTTTTTAAAAAGAAGTA;SOR=3.564;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=97;TCF=17;TCR=80;TR=96;WE=133683288;WS=133683270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr12	133696743	rs144074942	G	GAAC	1201.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=2;PP=843;SC=AGTATTTACAGAAAATGTTAT;SOR=4.174;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=18;WE=133696751;WS=133696733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr12	133696785	rs11147239	C	G	2081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=23;PP=1417;SC=AACCTTAAATCGTTCTTTTAG;SOR=1.577;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=45;TCR=23;TR=68;WE=133696793;WS=133696775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr12	133697130	rs2173970	CA	GG	9658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=85;PP=2947;ReadPosRankSum=1.534;SC=CATTCATAAACATTCTCTCCG;SOR=0.223;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=192;TCF=101;TCR=91;TR=186;WE=133697139;WS=133697120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,218:1.00:219
chr12	133698537	rs11615248	G	C	2192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=54;PP=1646;SC=CAGTAGAGTAGAGAGATCAGG;SOR=3.816;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=7;TCR=54;TR=61;WE=133698545;WS=133698527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr12	133721452	rs11613951	T	C	7722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=131;NR=126;PP=2965;SC=CAAAAACAGGTATTTACAAAC;SOR=0.778;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=257;TCF=131;TCR=126;TR=257;WE=133721460;WS=133721442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,292:1.00:292
chr12	133764701	.	C	CT	20	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5717;HP=12;HapScore=2;MGOF=30;MMLQ=15;MQ=57.88;NF=0;NR=2;PP=20;QD=13.0;SC=TCTTTATTACCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=2;WE=133764709;WS=133764691;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,2:0.33:6
chr12	133768553	rs61960670	A	T	6838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=106;NR=113;PP=2965;SC=AGAGCTGTGTATGGTGCAGGC;SOR=0.895;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=219;TCF=106;TCR=113;TR=219;WE=133768561;WS=133768543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr12	133770096	rs61960671	G	A	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.059;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=11;PP=255;ReadPosRankSum=0.538;SC=CCAAGATGACGCCTTGTTGCT;SOR=0.465;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=48;TCF=29;TCR=19;TR=23;WE=133770104;WS=133770086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,26:0.48:54
chr12	133780851	rs62644541	G	C	6841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=103;NR=122;PP=2965;SC=ATGCACACAAGAGAGAAACCA;SOR=0.937;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=225;TCF=103;TCR=122;TR=225;WE=133780859;WS=133780841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr12	133787329	rs138369699	A	G	1567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=32;NR=26;PP=953;SC=AAGGCAGCTCAGTCTTTACTG;SOR=0.859;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=58;TCF=32;TCR=26;TR=58;WE=133787337;WS=133787319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr12	133795418	rs142613020	C	G	6439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=113;NR=104;PP=2965;SC=GTTGACCAGGCAGACCATCCA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=219;TCF=114;TCR=105;TR=217;WE=133795426;WS=133795408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr12	133796033	rs36130280	C	T	2461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=45;PP=1492;SC=TGTGCTTTCTCCCTCATCAGG;SOR=0.929;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=39;TCR=45;TR=84;WE=133796041;WS=133796023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr12	133797649	rs147515371	T	G	1664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=12;PP=1111;SC=TGTAGGCTTGTGGGGACTGTT;SOR=2.215;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=35;TCR=12;TR=47;WE=133797657;WS=133797639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr12	133803075	rs146938968	C	A	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.062;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=16;PP=254;ReadPosRankSum=-0.080;SC=TGGTTCCCAACCTCCTTCCCA;SOR=0.296;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=59;TCF=15;TCR=44;TR=24;WE=133803083;WS=133803065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,30:0.45:66
chr12	133803093	rs137878698	T	C	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.817;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=21;PP=384;ReadPosRankSum=0.934;SC=CCATCAGGTATGAGCAGCCCT;SOR=1.839;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=39;TCF=8;TCR=31;TR=24;WE=133803101;WS=133803083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,25:0.57:44
chr12	133803551	rs36146434	G	C	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=555;ReadPosRankSum=2.397;SC=CACAAACCCAGAGTCAACACG;SOR=0.745;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=48;TCF=37;TCR=11;TR=30;WE=133803559;WS=133803541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,30:0.58:52
chr12	133808129	rs147259575	C	T	2526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.902;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=54;PP=1349;ReadPosRankSum=-0.150;SC=ACTTCTGCACCGGGGTGAGCG;SOR=0.638;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=256;TCF=126;TCR=130;TR=113;WE=133808137;WS=133808119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,129:0.46:283
chr12	133808270	rs142638257	C	T	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=7.579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.53;ReadPosRankSum=-0.098;SOR=3.113;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr12	133808275	rs150558535	G	C	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=7.499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.64;ReadPosRankSum=0.034;SOR=3.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr12	133810703	rs141475940	G	C	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=2.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.29;ReadPosRankSum=1.245;SOR=0.427;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,35:0.49:72
chr12	133810926	.	G	A	1659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=0.000;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.983;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=32;PP=957;ReadPosRankSum=-1.466;SC=CTTCAGCAGAGTCAGGAAGCT;SOR=0.713;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=180;TCF=95;TCR=85;TR=77;WE=133810934;WS=133810916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,85:0.43:199
chr13	19600475	rs9511168	C	A	929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FS=3.300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQRankSum=-7.822;QD=3.56;ReadPosRankSum=-0.031;SOR=0.939;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:197,64:0.25:261
chr13	19601129	rs35887366	TA	T	1387.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.825;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.991;NF=0;NR=53;PP=751;ReadPosRankSum=0.294;SC=TCAACACCTGTAAAAAAAATA;SOR=1.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=166;TCF=4;TCR=162;TR=53;WE=19601137;WS=19601119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,76:0.34:225
chr13	19601182	rs2039524	C	T	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.533;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=234;ReadPosRankSum=0.418;SC=TATTTGGCTTCTAGTAAAAAT;SOR=0.383;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=61;TCF=8;TCR=53;TR=17;WE=19601190;WS=19601172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,18:0.28:64
chr13	19606506	rs12865916	C	T	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.81;ReadPosRankSum=0.424;SOR=0.193;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr13	19747991	rs3764135	C	T	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.104;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=297;ReadPosRankSum=0.348;SC=GAGAACCCACCACACCCTCCC;SOR=0.287;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=80;TCF=66;TCR=14;TR=25;WE=19747999;WS=19747981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,26:0.30:88
chr13	19748038	rs1803092	C	T	780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FS=2.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.000;QD=3.58;ReadPosRankSum=-0.443;SOR=0.517;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:163,55:0.25:218
chr13	19748238	.	C	T	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=0.000;DP=244;ExcessHet=3.0103;FS=2.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.91;ReadPosRankSum=0.319;SOR=0.573;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:199,45:0.18:244
chr13	19750964	rs9511916	T	C	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=169;ReadPosRankSum=0.347;SC=GCCCATGGAATAGGGGTAGTA;SOR=0.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=42;TCF=39;TCR=3;TR=12;WE=19750972;WS=19750954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,13:0.30:44
chr13	19751229	rs36216108	T	C	929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.141;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=30;PP=554;ReadPosRankSum=2.765;SC=TCTGATTGGCTGGCTCGAAGC;SOR=0.912;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=146;TCF=65;TCR=81;TR=51;WE=19751237;WS=19751219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,53:0.34:158
chr13	19751657	rs9507566	G	T	950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=2.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQRankSum=-4.809;QD=6.30;ReadPosRankSum=-1.028;SOR=0.860;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,53:0.35:151
chr13	19751694	rs9507567	A	G	614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-6.408;NF=15;NR=18;PP=354;ReadPosRankSum=1.477;SC=AGCCAGTGCCACCCCCAAAAC;SOR=0.749;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=107;TCF=56;TCR=51;TR=33;WE=19751702;WS=19751684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,38:0.31:124
chr13	19752291	rs9507572	A	G	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.840;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=308;ReadPosRankSum=1.879;SC=CAGCCAACGCACTGGTCTAGG;SOR=0.109;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=45;TCF=43;TCR=2;TR=20;WE=19752299;WS=19752281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,19:0.41:46
chr13	19752538	rs146476021	CAA	C	3316.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.909;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=4.121;NF=12;NR=49;PP=1842;ReadPosRankSum=1.149;SC=ACTTCATCTACAAAAGAGACC;SOR=0.765;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=212;TCF=37;TCR=175;TR=61;WE=19752547;WS=19752528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:242,100:0.29:342
chr13	19752575	rs9507573	A	G	1335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.096;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=42;PP=839;ReadPosRankSum=-2.121;SC=TTTAAGGCCTATACTCACCAA;SOR=0.791;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=230;TCF=96;TCR=134;TR=72;WE=19752583;WS=19752565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,75:0.32:238
chr13	19752625	rs605109	A	G	1796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.544;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=55;PP=1317;ReadPosRankSum=-1.361;SC=TACAAAGTACATGCTGTTCAA;SOR=0.313;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=86;TCF=11;TCR=75;TR=64;WE=19752633;WS=19752615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,67:0.75:89
chr13	19753449	rs36215078	A	G	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=241;ReadPosRankSum=-0.266;SC=CACCCTCCTAAGAAAGCTGCC;SOR=0.210;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=45;TCR=0;TR=14;WE=19753457;WS=19753441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,14:0.32:44
chr13	19753554	rs36215076	C	T	895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FS=1.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.96;MQRankSum=-11.094;QD=2.82;ReadPosRankSum=-2.138;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:250,68:0.21:318
chr13	19753575	rs36215075	A	G	1652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=407;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.53;MQRankSum=-9.794;QD=4.06;ReadPosRankSum=-3.301;SOR=0.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:301,106:0.26:407
chr13	19753730	rs9511925	C	T	1642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.83;ReadPosRankSum=1.217;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:240,100:0.29:340
chr13	19753776	rs9511926	A	C	854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=30;PP=554;ReadPosRankSum=-2.745;SC=GCAAAATATTATAATTTAATA;SOR=0.724;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=139;TCF=39;TCR=100;TR=42;WE=19753784;WS=19753766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,46:0.31:148
chr13	19755690	rs36214434	A	G	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.248;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=204;ReadPosRankSum=-0.455;SC=AAAAGCTGCCATCCCTGCCCT;SOR=0.474;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=44;TCF=34;TCR=10;TR=18;WE=19755698;WS=19755680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,20:0.42:48
chr13	19755726	rs17076891	G	C	674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=11;PP=492;ReadPosRankSum=0.859;SC=AGCAGACGATGCCGTGTCCTC;SOR=0.754;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=62;TCR=30;TR=33;WE=19755734;WS=19755716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,36:0.35:102
chr13	19756002	rs3751422	G	A	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=51;ReadPosRankSum=0.000;SC=TGGCCTGCTGGTGCCAGGCCA;SOR=0.627;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=8;WE=19756010;WS=19755992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,8:0.24:34
chr13	19756026	rs783595	C	G	498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=15;PP=406;SC=TTGGTCCGGACGTCCTGGGAG;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=19756034;WS=19756016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr13	19759404	rs142818236	CT	C	1304.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FS=0.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.06;MQRankSum=1.505;QD=7.63;ReadPosRankSum=-0.063;SOR=0.811;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,53:0.31:171
chr13	19761359	rs77809485	T	G	1290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FS=1.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.86;ReadPosRankSum=-0.889;SOR=0.579;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:247,87:0.26:334
chr13	19761398	rs79239276	G	A	1381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=381;ExcessHet=3.0103;FS=0.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.64;ReadPosRankSum=2.024;SOR=0.748;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:284,96:0.25:380
chr13	19761432	rs74996029	T	C	1197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.48;ReadPosRankSum=-1.770;SOR=0.687;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:256,88:0.26:344
chr13	19761496	rs17790638	A	G	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=2.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.64;ReadPosRankSum=0.131;SOR=0.990;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:112,34:0.23:146
chr13	19775652	rs66950030	CA	C	379.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.75;MQRankSum=-3.610;QD=10.55;ReadPosRankSum=-0.261;SOR=1.209;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,22:0.61:36
chr13	19775755	rs115152530	A	G	3705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.447;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.405;NF=87;NR=73;PP=2484;ReadPosRankSum=2.764;SC=TTTTTTCTGGATAGCCAGGAA;SOR=0.597;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=278;TCF=156;TCR=122;TR=160;WE=19775763;WS=19775731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,173:0.60:289
chr13	19775867	rs114445450	G	A	1059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FS=74.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.70;MQRankSum=-10.274;QD=5.95;ReadPosRankSum=0.316;SOR=6.646;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:140,38:0.21:178
chr13	19775873	rs200815536	C	CA	4395.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.51;BaseQRankSum=-8.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=59.369;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=9.947;NF=5;NR=56;PP=2954;ReadPosRankSum=-0.692;SC=CTACGCCACTCATTGGTGCTT;SOR=0.002;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=97;TCF=5;TCR=92;TR=61;WE=19775883;WS=19775857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,134:0.80:167
chr13	19775875	rs138429293	T	C	957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FS=59.645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.40;MQRankSum=-9.965;QD=5.80;ReadPosRankSum=0.344;SOR=6.206;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:132,33:0.20:165
chr13	19778557	rs61946465	T	C	41.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=20.87;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr13	19778601	rs141790008	G	A	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=19.37;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr13	19782646	rs9512066	G	A	5394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=354;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.420;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=-9.711;NF=127;NR=121;PP=2962;ReadPosRankSum=0.325;SC=TGCTCCACAGGGACCCATATC;SOR=0.649;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=346;TCF=175;TCR=171;TR=248;WE=19782654;WS=19782636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,247:0.70:354
chr13	19801344	rs77928908	GA	G	207.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=10.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.64;MQRankSum=-0.874;QD=4.33;ReadPosRankSum=1.684;SOR=3.084;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,16:0.33:48
chr13	19931495	rs113883205	T	C	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=2.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.776;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.392;NF=11;NR=1;PP=157;ReadPosRankSum=-0.756;SC=TGGACTCTTTTGGGATTTCTT;SOR=1.026;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=48;TCF=41;TCR=7;TR=12;WE=19931503;WS=19931485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,13:0.25:52
chr13	19931579	rs61956074	G	A	2083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-1.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.262;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.382;NF=65;NR=30;PP=1441;ReadPosRankSum=1.722;SC=TACAGTAAGAGCCCAGTGGAT;SOR=1.028;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=247;TCF=158;TCR=89;TR=95;WE=19931587;WS=19931569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,101:0.37:270
chr13	19931686	rs17080489	T	C	2740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=456;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.171;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-5.575;NF=64;NR=90;PP=1601;ReadPosRankSum=0.776;SC=TTCTCCTGTATGAAACATCGT;SOR=0.804;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=425;TCF=185;TCR=240;TR=154;WE=19931694;WS=19931676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:297,158:0.35:455
chr13	19931710	rs146638959	C	A	2180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.328;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.442;NF=39;NR=75;PP=1528;ReadPosRankSum=0.056;SC=AATCTTGTGTCGGTAAGAGTA;SOR=0.984;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=325;TCF=125;TCR=200;TR=114;WE=19931718;WS=19931700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:227,118:0.34:345
chr13	19933289	rs145709924	C	T	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=278;ReadPosRankSum=0.371;SC=TACTTGTGTTCCGAGAAACAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=13;WE=19933297;WS=19933280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr13	19933372	rs4771142	G	A	3731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.130;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.464;NF=99;NR=58;PP=2501;ReadPosRankSum=1.167;SC=AGTTCTGAGCGAGGGAGAAAT;SOR=0.799;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=223;TCF=140;TCR=83;TR=157;WE=19933380;WS=19933362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,164:0.70:235
chr13	19933448	rs61956080	G	A	1416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FS=4.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.78;MQRankSum=-0.008;QD=5.02;ReadPosRankSum=1.200;SOR=1.005;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:203,79:0.28:282
chr13	19933518	rs61956081	T	C	1625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.35;MQRankSum=-1.197;QD=5.21;ReadPosRankSum=1.516;SOR=0.702;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:214,98:0.31:312
chr13	19941233	rs3002090	C	A	5856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=93;PP=2965;SC=CCTAGTGATCCTACTGAATTA;SOR=0.730;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=202;TCF=108;TCR=94;TR=201;WE=19941241;WS=19941223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr13	19943770	rs4112696	A	G	1106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.559;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.970;NF=32;NR=31;PP=737;ReadPosRankSum=-1.852;SC=TGTCCACATCAAGGAGAATCA;SOR=0.617;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=173;TCF=90;TCR=83;TR=63;WE=19943778;WS=19943760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,66:0.35:191
chr13	19949111	.	TC	T	155	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000;HP=5;HapScore=1;MGOF=16;MMLQ=26;MQ=54.89;NF=7;NR=0;PP=155;QD=25.7142857143;SC=ATGGATTTTTTCTCTTCTTCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=19;TCR=13;TR=7;WE=19949119;WS=19949106;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:25,7:0.22:32
chr13	19949155	rs34247662	T	G	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.438;HP=1;HapScore=3;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.552;NF=16;NR=5;PP=838;ReadPosRankSum=-0.233;SC=CAAATAAAAGTCATGTGCCCA;SOR=1.859;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=70;TCF=42;TCR=28;TR=21;WE=19949166;WS=19949145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,19:0.26:73
chr13	19949158	rs139492586	T	A	1271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.200;HP=1;HapScore=3;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=3.882;NF=26;NR=23;PP=1678;ReadPosRankSum=-0.408;SC=ATAAAAGTCATGTGCCCATTG;SOR=0.210;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=71;TCF=42;TCR=29;TR=49;WE=19949166;WS=19949145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,55:0.73:75
chr13	19949218	rs35633897	C	T	1387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=11.257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.26;MQRankSum=-5.781;QD=16.72;ReadPosRankSum=-1.297;SOR=1.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,37:0.45:83
chr13	19949227	rs34936230	C	T	1421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=6.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.85;MQRankSum=-5.628;QD=16.16;ReadPosRankSum=-1.010;SOR=0.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,39:0.44:88
chr13	19949262	rs34280326	G	A	792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.894;HP=1;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-7.458;NF=20;NR=23;PP=739;ReadPosRankSum=0.303;SC=GAGGTAAGGCGAGAAGATGCA;SOR=0.518;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=78;TCF=35;TCR=43;TR=43;WE=19949270;WS=19949252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,36:0.49:74
chr13	19949287	rs34088473	G	T	720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.927;HP=1;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-6.761;NF=18;NR=22;PP=628;ReadPosRankSum=1.771;SC=GCCCGCTCTCGGCTTTCAAAG;SOR=0.569;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=31;TCR=39;TR=40;WE=19949295;WS=19949277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,34:0.52:66
chr13	19949338	rs149139495	A	G	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=4.061;NF=5;NR=11;PP=225;ReadPosRankSum=1.382;SC=CGGAGTCCCCATGGCTATAAG;SOR=0.582;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=42;TCF=12;TCR=30;TR=16;WE=19949346;WS=19949328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,16:0.40:40
chr13	19949386	rs118146542	T	C	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.017;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.054;NF=3;NR=6;PP=96;ReadPosRankSum=-0.818;SC=AGAATATTCTTTGAAGAACCA;SOR=0.293;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=9;WE=19949394;WS=19949376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr13	19962045	rs9554181	G	A	729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.747;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.750;NF=12;NR=25;PP=1118;ReadPosRankSum=-1.850;SC=TCGTGCTTTCGTTTGTTCATG;SOR=0.495;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=103;TCF=31;TCR=72;TR=37;WE=19962063;WS=19962035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,39:0.35:112
chr13	19962055	rs9512903	G	A	1538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.882;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.570;NF=18;NR=41;PP=2440;ReadPosRankSum=1.309;SC=GTTTGTTCATGAAGATGAAGG;SOR=0.943;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=90;TCF=29;TCR=61;TR=59;WE=19962063;WS=19962035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,65:0.68:96
chr13	20000630	rs2497218	T	C	11544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=425;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=173;NR=223;PP=2965;SC=TTAATTAATATTTTGTCTGTT;SOR=0.982;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=396;TCF=173;TCR=223;TR=396;WE=20000638;WS=20000620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,422:1.00:422
chr13	20000702	rs4408395	G	C	3282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=78;PP=2475;SC=CCTAGATAACGATAACAAAAG;SOR=2.856;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=18;TCR=78;TR=96;WE=20000710;WS=20000692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr13	20004762	rs7139692	T	C	3113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.845;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.683;NF=54;NR=78;PP=1668;ReadPosRankSum=-0.732;SC=CTTAACATCATGGATTAAAAA;SOR=0.551;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=201;TCF=79;TCR=122;TR=132;WE=20004770;WS=20004752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,144:0.67:214
chr13	20004798	rs2497068	C	T	2836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=74;PP=2087;SC=AAGCTAACAACGTATCAATAG;SOR=2.985;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=17;TCR=74;TR=91;WE=20004806;WS=20004788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr13	20025406	rs2497236	C	T	1359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.434;NF=26;NR=39;PP=803;ReadPosRankSum=0.105;SC=TTACATGGCACCAACACAAGC;SOR=0.664;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=179;TCF=73;TCR=106;TR=65;WE=20025414;WS=20025396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,74:0.37:201
chr13	20038584	rs7339103	A	G	5830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=423;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.318;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=141;NR=106;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.255;SC=TTTGTCAGATAAAGACCCTTA;SOR=0.937;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=392;TCF=218;TCR=174;TR=247;WE=20038592;WS=20038563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,258:0.61:421
chr13	20038714	rs34800894	CA	C	939.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.478;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.304;NF=1;NR=28;PP=372;ReadPosRankSum=-0.981;SC=TCATATAACACAAAAAAAATT;SOR=0.482;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=94;TCF=5;TCR=89;TR=29;WE=20038722;WS=20038704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,50:0.38:133
chr13	20039289	rs2497079	A	T	3728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=22;PP=2379;SC=TATATTCTCAAGAATAAAGAA;SOR=2.907;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=91;TCR=22;TR=113;WE=20039297;WS=20039279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr13	20041323	rs2497251	G	T	486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.10;QD=32.45;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr13	20041323	.	GTAATG	TTAATG,TTAATT	235	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000,0.5000;HP=4;HapScore=3;MGOF=10;MMLQ=27;MQ=44.44;NF=15,6;NR=0,0;PP=235,65;QD=17.9847475031;SC=AATGCTAAAAGTAATGAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15,6;WE=20041336;WS=20041313;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:15
chr13	20041328	rs185409838	G	T	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.25;MQRankSum=-0.900;QD=7.52;ReadPosRankSum=1.235;SOR=0.293;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
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chr13	20067140	rs76824079	T	G	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=4.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.97;MQRankSum=-4.068;QD=4.50;ReadPosRankSum=-2.610;SOR=2.206;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,11:0.20:56
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chr13	20077477	rs199948816	C	G	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=27.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQRankSum=-9.348;QD=0.68;ReadPosRankSum=-3.048;SOR=0.019;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,16:0.15:104
chr13	20224202	rs75390100	G	T	1005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=15;PP=691;ReadPosRankSum=-0.413;SC=AGAAAAAAATGATGTTTCTGA;SOR=0.618;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=134;TCF=97;TCR=37;TR=51;WE=20224210;WS=20224192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,51:0.36:140
chr13	20233804	.	CA	C	153.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.980;ClippingRankSum=0.000;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=6.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.14;MQRankSum=1.716;QD=2.23;ReadPosRankSum=0.554;SOR=1.791;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,18:0.26:69
chr13	20240743	rs9508812	T	C	2024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=50;PP=1518;SC=GACTGTGCCATAGTTAAGTCA;SOR=3.442;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=10;TCR=50;TR=60;WE=20240751;WS=20240733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr13	20247171	rs4769866	A	G	539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=40;NR=2;PP=920;SC=CTCCAGCCTGAGTGACAGAAT;SOR=3.611;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=48;TCF=40;TCR=8;TR=42;WE=20247179;WS=20247161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr13	20247226	rs10706287	CG	C	2362.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=43.75;ReadPosRankSum=1.285;SOR=0.641;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,53:0.98:54
chr13	20247238	rs10531847	GTT	G	2712.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=2.631;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.31;MQRankSum=0.310;QD=39.89;ReadPosRankSum=2.034;SOR=0.317;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,66:0.97:68
chr13	20251791	rs2290810	T	C	1851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=16;PP=1300;SC=TCAGGAAGAATTGACTAGAAA;SOR=2.093;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=44;TCR=16;TR=60;WE=20251799;WS=20251781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr13	20252093	rs9508836	G	A	328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=270;SC=GTAGTGCTGCGTGCTGATTAT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=20252101;WS=20252083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr13	20277188	rs140475170	CA	C	314.14	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.64;MQRankSum=-2.277;QD=14.96;ReadPosRankSum=1.425;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,18:0.86:21
chr13	20277413	rs75085951	T	C	2711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=482;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.445;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-8.690;NF=100;NR=86;PP=2105;ReadPosRankSum=1.015;SC=ACACCACTCATTGGTGCTTGA;SOR=0.376;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=512;TCF=240;TCR=272;TR=186;WE=20277421;WS=20277403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:317,165:0.34:482
chr13	20279879	rs200516102	T	C	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=475;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.24;MQRankSum=-9.427;QD=0.78;ReadPosRankSum=-3.820;SOR=0.699;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:406,69:0.15:475
chr13	20325625	rs2340650	C	G	6377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=132;PP=2965;SC=AACATTAAAACATACAGAAAT;SOR=1.276;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=215;TCF=83;TCR=132;TR=215;WE=20325633;WS=20325615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr13	20356941	rs9508887	T	A	4197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=66;NR=75;PP=2485;SC=CCTAGATTTATAGACAGTGTG;SOR=0.966;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=141;TCF=66;TCR=75;TR=141;WE=20356949;WS=20356931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr13	20398669	rs9508907	T	C	5188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=82;PP=2965;SC=ATATAATCTGTGTTCTGCAGC;SOR=0.746;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=175;TCF=93;TCR=82;TR=175;WE=20398677;WS=20398659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr13	20398742	rs9508908	C	T	4951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=71;PP=2965;SC=CTATTGTTGACGTGCATTTCA;SOR=1.001;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=167;TCF=95;TCR=72;TR=166;WE=20398750;WS=20398732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr13	20426381	rs56100501	C	T	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.24;MQRankSum=1.810;QD=3.35;ReadPosRankSum=-0.847;SOR=0.499;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,11:0.24:45
chr13	20600927	rs138849093	T	TA	367.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.810;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=281;ReadPosRankSum=-0.663;SC=TTTGGACAGTTAAAAAAACTT;SOR=1.333;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=0;TCR=56;TR=15;WE=20600935;WS=20600917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,20:0.30:66
chr13	20601004	rs7981272	T	C	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.450;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=77;ReadPosRankSum=0.697;SC=AACAGCTTTTTATTTTATATT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=20601012;WS=20600994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr13	20601532	rs148238464	G	GCTTTAT	586.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.236;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.154;NF=1;NR=14;PP=777;ReadPosRankSum=-0.008;SC=AATATAATATGCTTTATTTTA;SOR=1.033;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=51;TCF=1;TCR=50;TR=15;WE=20601540;WS=20601522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,18:0.31:58
chr13	20608318	rs259806	T	A	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.20;MQRankSum=-0.804;QD=7.94;ReadPosRankSum=0.262;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,22:0.42:53
chr13	20608354	rs11272380	T	TTTTCTTGAGGTG	4340.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=20;PP=2967;SC=TTCTTAAGCTTGTCGTCATAT;SOR=1.244;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=38;TCF=17;TCR=21;TR=36;WE=20608362;WS=20608344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr13	20608465	rs79833154	T	C	685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=2.579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.39;MQRankSum=-0.457;QD=6.18;ReadPosRankSum=0.452;SOR=0.463;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,40:0.36:111
chr13	20608560	rs1543536	A	G	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.898;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=4;PP=43;ReadPosRankSum=-1.010;SC=TTGCATATACAGTGTTGTTCA;SOR=0.247;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=26;TCF=8;TCR=18;TR=7;WE=20608568;WS=20608550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,8:0.28:29
chr13	20610839	rs144794743	GT	G	366.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQRankSum=1.567;QD=4.96;ReadPosRankSum=-0.463;SOR=0.644;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,22:0.30:74
chr13	20638490	rs259785	T	C	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=350;ReadPosRankSum=1.253;SC=TGTCCCCATGTATGAATGCTG;SOR=0.846;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=36;TCF=25;TCR=11;TR=21;WE=20638498;WS=20638480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,21:0.52:40
chr13	20656138	rs11344087	CT	C	384.50	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.79;ReadPosRankSum=1.766;SOR=2.226;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,23:0.88:26
chr13	20657188	rs9509028	T	G	2447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.876;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=63;PP=1578;ReadPosRankSum=0.987;SC=GTAACAGATTTCTATTTTTAT;SOR=0.411;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=127;TCF=39;TCR=88;TR=94;WE=20657196;WS=20657178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,101:0.74:136
chr13	20716533	rs968566	G	T	5442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=106;PP=2965;ReadPosRankSum=1.314;SC=AGGGCTAGCAGTTTGAAGTCC;SOR=0.317;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=197;TCF=91;TCR=106;TR=197;WE=20716541;WS=20716523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,209:1.00:210
chr13	20762956	rs3751385	A	G	3506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=32;PP=2345;SC=GGGAAATGCTAGCGACTGAGC;SOR=1.911;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=76;TCR=32;TR=108;WE=20762964;WS=20762946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr13	20978504	rs4638418	C	T	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.469;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=149;ReadPosRankSum=-0.175;SC=GCAATAAACCCTCAATGAACA;SOR=0.105;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=10;WE=20978512;WS=20978494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
chr13	20978664	rs3737036	T	C	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.628;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=200;ReadPosRankSum=0.272;SC=AGATCAAGGGTAAAGATTCCA;SOR=0.042;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=12;WE=20978672;WS=20978654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr13	21006475	rs7983215	T	C	6852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=96;NR=136;PP=2965;SC=AAGGAGATGATCCTGGGTTTG;SOR=1.220;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=232;TCF=96;TCR=136;TR=232;WE=21006483;WS=21006465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr13	21100067	.	T	TG	367.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=205;ReadPosRankSum=0.484;SC=GAGGGCCGCTTGGTCCCTGAG;SOR=0.368;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=7;WE=21100075;WS=21100057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr13	21148408	rs4326897	G	A	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.066;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=219;ReadPosRankSum=0.418;SC=ATAGTGAGCCGTGATTGTGCT;SOR=0.307;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=13;WE=21148416;WS=21148398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr13	21156999	rs9509289	G	A	1444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-3.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.284;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=12;PP=910;ReadPosRankSum=-2.009;SC=CAATAGATGAGTTATAGAGGC;SOR=0.310;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=74;TCF=60;TCR=14;TR=52;WE=21157007;WS=21156989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,58:0.69:84
chr13	21157257	rs35700311	GA	G	595.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.081;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=668;ReadPosRankSum=1.367;SC=TAGTGTTAAAGATTATAACCA;SOR=0.133;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=18;WE=21157265;WS=21157247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr13	21170193	rs149283826	G	GTAAAA	398.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=236;SC=GACCTTGTCTGTAAAATAAAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=4;WE=21170201;WS=21170183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr13	21173826	rs2497475	G	A	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.282;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=116;ReadPosRankSum=0.375;SC=AGATTTATACGTGTAGTATTT;SOR=0.223;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=10;WE=21173834;WS=21173816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr13	21189941	rs2442455	G	A	802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.090;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=21;PP=501;ReadPosRankSum=1.042;SC=GGAAAGCCATGGCAGAAAAAT;SOR=0.534;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=163;TCF=94;TCR=69;TR=46;WE=21189949;WS=21189931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,50:0.28:176
chr13	21190027	rs144370036	GAA	G	4153.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.676;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.944;NF=4;NR=58;PP=2338;ReadPosRankSum=-1.255;SC=TGGTAAGAGAGAAAGTCTATA;SOR=0.822;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=89;TCF=7;TCR=82;TR=62;WE=21190036;WS=21190017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,104:0.70:149
chr13	21205046	rs2497489	T	C	1282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FS=2.339;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.24;MQRankSum=-1.591;QD=4.77;ReadPosRankSum=-1.030;SOR=0.547;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:190,79:0.29:269
chr13	21205124	rs35290473	TG	T	8473.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=402;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.766;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.769;NF=27;NR=132;PP=2948;ReadPosRankSum=-1.736;SC=CATATTACAGTGGTAGTAACC;SOR=0.631;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=240;TCF=51;TCR=189;TR=159;WE=21205132;WS=21205114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,261:0.66:395
chr13	21205140	rs1329519	A	T	5322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=363;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.222;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=106;NR=123;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.485;SC=TAACCTTCAGATATTCCATTT;SOR=0.829;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=346;TCF=167;TCR=179;TR=229;WE=21205148;WS=21205130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,235:0.65:362
chr13	21205192	rs9509307	G	A	3104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=78;PP=2054;ReadPosRankSum=0.023;SC=AAAAAGGACAGTAGAGTGAAA;SOR=0.687;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=201;TCF=80;TCR=121;TR=129;WE=21205200;WS=21205182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,135:0.63:215
chr13	21212739	rs34800529	C	CT	147.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=164;ReadPosRankSum=0.922;SC=TTAAAGAGCTCTAACACATTA;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=5;WE=21212747;WS=21212729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr13	21237413	rs17055251	G	A	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=7.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.96;ReadPosRankSum=0.327;SOR=0.195;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,22:0.37:59
chr13	21358061	rs17318617	A	G	2130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.709;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=59;PP=1428;ReadPosRankSum=0.280;SC=TATTCAGCCTATTGAAGAGAT;SOR=0.518;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=125;TCF=38;TCR=87;TR=87;WE=21358069;WS=21358051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,90:0.70:128
chr13	21361513	rs4146442	T	C	1538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.613;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=7;PP=923;ReadPosRankSum=0.568;SC=ATGGTTTCCTTGCCCCCGAAA;SOR=1.233;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=74;TCF=61;TCR=13;TR=49;WE=21361521;WS=21361503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,58:0.70:83
chr13	21370398	.	GA	G	52.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.430;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.29;ReadPosRankSum=-0.127;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr13	21416945	rs2762995	G	A	1520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=3;PP=1185;SC=TATGTTTTATGAAAGCTGCAG;SOR=4.493;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=43;TCR=3;TR=46;WE=21416953;WS=21416935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr13	21442945	rs9509410	G	A	743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-4.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.434;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=24;PP=510;ReadPosRankSum=-0.188;SC=CTTTTGGGGGGCAAGAGGAAC;SOR=0.182;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=30;WE=21442953;WS=21442935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,30:0.81:37
chr13	21476997	rs7326480	A	G	450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=370;ReadPosRankSum=-1.202;SC=CGCTGTCGACACCGGCGTCGC;SOR=1.022;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=17;WE=21477005;WS=21476987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr13	21562832	rs2770928	C	T	5047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=80;PP=2805;SC=GAGGTGCTGCCCAATTCATAC;SOR=0.714;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=170;TCF=90;TCR=80;TR=170;WE=21562840;WS=21562822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr13	21562948	rs558614	G	A	3738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=56;PP=2419;SC=CTGGTGGGCCGCGGGACCGGC;SOR=0.801;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=128;TCF=72;TCR=56;TR=128;WE=21562956;WS=21562938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr13	21620085	rs7317471	T	C	6879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=425;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.572;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=137;NR=136;PP=2962;ReadPosRankSum=1.896;SC=TGGATGGCTGTTTTAACCCCT;SOR=0.631;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=391;TCF=196;TCR=195;TR=273;WE=21620093;WS=21620063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,298:0.70:425
chr13	21714920	rs2281914	G	A	1474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FS=0.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.609;QD=4.54;ReadPosRankSum=1.341;SOR=0.698;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:235,90:0.28:325
chr13	21720956	rs4620	C	T	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.388;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=153;ReadPosRankSum=1.212;SC=TGGATGCAACCTTGAAAGAAC;SOR=0.169;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=40;TCF=34;TCR=6;TR=13;WE=21720964;WS=21720946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,14:0.32:44
chr13	21721220	rs3742222	G	C	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.021;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.06;ReadPosRankSum=-1.420;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr13	21729064	rs9552370	A	G	957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=0;PP=786;SC=AACACTAATAATCCTTAAAGA;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=27;WE=21729072;WS=21729054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr13	21732094	rs4770121	C	T	5955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=119;NR=99;PP=2965;SC=TAGTTACTTCCGGAGGTGTAG;SOR=0.720;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=220;TCF=120;TCR=100;TR=218;WE=21732102;WS=21732084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr13	21736133	rs4561294	C	T	1026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=29;PP=766;SC=CTTTATGGTACAGAAGTCCCA;SOR=3.321;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=34;WE=21736141;WS=21736123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr13	21746453	rs2026600	T	C	3589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=55;PP=2001;SC=CTAAAACAAATGCTATAAAAT;SOR=0.917;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=128;TCF=73;TCR=55;TR=128;WE=21746461;WS=21746443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr13	21751005	rs9550717	G	C	2965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=27;PP=1854;SC=CTCCAGGTCCGGCCGCGCCAG;SOR=1.819;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=100;TCF=72;TCR=28;TR=99;WE=21751013;WS=21750995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr13	21751164	rs117575190	C	T	3229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=631;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=86;PP=2011;ReadPosRankSum=0.522;SC=GAACATGATCCGCCGCCTGGA;SOR=0.716;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=582;TCF=306;TCR=276;TR=181;WE=21751172;WS=21751154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:437,191:0.30:628
chr13	21949267	rs3759473	T	C	817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=21;PP=454;ReadPosRankSum=-0.371;SC=AGCAAAACTCTGTGGAAAAAA;SOR=0.654;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=114;TCF=63;TCR=51;TR=43;WE=21949275;WS=21949257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,46:0.37:125
chr13	21950926	.	CTAA	C	2061.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.756;ClippingRankSum=0.000;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.133;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.700;NF=0;NR=33;PP=1358;ReadPosRankSum=-0.139;SC=CTTAACACTACTAATATTATA;SOR=1.453;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=1;TCR=47;TR=33;WE=21950936;WS=21950916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,54:0.69:78
chr13	21951016	rs9509669	A	G	285.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=238;SC=TTTTAAAAGGAAGAATCTTAC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=21951024;WS=21951006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr13	21974399	rs79578210	C	CT	38.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.748;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=70;ReadPosRankSum=0.605;SC=TTATAAAACTCTAACTTGTAA;SOR=0.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=3;WE=21974407;WS=21974389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr13	22033122	rs57438463	G	C	722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=7;PP=513;ReadPosRankSum=-0.389;SC=GGCGGGTGTGGGGCGCAGAGG;SOR=0.714;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=87;TCR=20;TR=36;WE=22033130;WS=22033112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,35:0.32:111
chr13	22096611	rs1359190	T	G	761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=4;PP=624;SC=CATTATCATTTTGCAGATATA;SOR=3.014;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=27;WE=22096619;WS=22096601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr13	22096843	rs1200028	T	C	1874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=39;PP=1276;SC=TTAGAATATATAGAGACATTA;SOR=1.926;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=16;TCR=39;TR=55;WE=22096851;WS=22096833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr13	22140911	rs66467009	TA	T	177.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.65;ReadPosRankSum=2.040;SOR=0.567;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,18:0.27:67
chr13	22178308	rs2761924	G	A	310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=4;PP=100;SC=GCGCAGCTAGGCGGCGCTTCT;SOR=1.445;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=8;WE=22178316;WS=22178298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr13	22275394	rs9509841	A	G	2305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=426;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.919;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=49;PP=1395;ReadPosRankSum=0.012;SC=ATACGTACTCATCAAACCTAT;SOR=0.852;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=394;TCF=230;TCR=164;TR=128;WE=22275402;WS=22275384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:288,137:0.32:425
chr13	22275583	rs9509842	G	A	13583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=500;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=198;NR=263;PP=2965;SC=GACAAAGACAGTTTCTTCACT;SOR=1.082;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=461;TCF=198;TCR=263;TR=461;WE=22275591;WS=22275573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,499:1.00:499
chr13	23251016	rs35856253	CT	C	1484.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=36;PP=1409;SC=AATCCCAGCACTTTTGGGAGG;SOR=2.511;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=43;TCF=1;TCR=42;TR=37;WE=23251024;WS=23251006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr13	23253313	rs9506904	T	C	7882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=176;NR=96;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.057;SC=GTGAGAAGACTATGCACGGTA;SOR=0.518;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=275;TCF=178;TCR=97;TR=272;WE=23253321;WS=23253303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,284:1.00:285
chr13	23279254	rs314874	G	A	9744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=361;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=175;NR=152;PP=2965;SC=AAGAGAAGTTGTCGACAGATT;SOR=0.816;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=327;TCF=175;TCR=152;TR=327;WE=23279262;WS=23279244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,361:1.00:361
chr13	23279279	rs314873	T	C	11231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=422;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=206;NR=172;PP=2965;SC=CAGAGGCCATTGAAGATTTTA;SOR=0.852;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=380;TCF=207;TCR=173;TR=378;WE=23279287;WS=23279269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,419:1.00:419
chr13	23808623	rs143561165	C	CTATT	385.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=399;ReadPosRankSum=1.708;SC=TTTAAATACACTAGGAGAAAT;SOR=0.941;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=7;WE=23808631;WS=23808613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr13	23808732	.	CT	C	204.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.507;ClippingRankSum=0.000;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.13;MQRankSum=1.718;QD=2.66;ReadPosRankSum=1.604;SOR=0.751;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,20:0.26:77
chr13	23824818	rs17314986	G	A	7025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=513;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.182;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=172;NR=131;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.035;SC=GTAAATGCGCGCAACTCAGAA;SOR=0.872;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=471;TCF=253;TCR=218;TR=303;WE=23824826;WS=23824808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:189,322:0.63:511
chr13	23894744	rs1536725	T	G	3039.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=3.661;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=30.40;ReadPosRankSum=2.486;SOR=0.211;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:8,92:0.92:100
chr13	23894746	rs1536726	T	G	4807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=45.36;ReadPosRankSum=1.537;SOR=0.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,105:0.99:106
chr13	23894748	rs1536727	T	G	4888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=44.44;ReadPosRankSum=1.607;SOR=0.735;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,109:0.99:110
chr13	23894750	rs1536728	T	G	4904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=4.890;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=44.19;ReadPosRankSum=1.718;SOR=1.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,110:0.99:111
chr13	23894752	rs1536729	T	G	4905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=6.164;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=42.66;ReadPosRankSum=2.800;SOR=1.637;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,112:0.97:115
chr13	23898454	rs9510700	C	T	4042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=45;PP=2561;SC=GGATTTGCTGCTGACCAGGGT;SOR=1.410;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=91;TCR=45;TR=136;WE=23898462;WS=23898431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr13	23898509	rs1800353	T	C	5711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=110;NR=91;PP=2870;SC=CCAACCAGCTTGTGCTTGATG;SOR=0.778;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=201;TCF=110;TCR=91;TR=201;WE=23898517;WS=23898499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr13	23898664	rs1800354	A	G	1643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=36;PP=1079;SC=CAGGAGCACAACCACATCTGC;SOR=1.355;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=21;TCR=36;TR=57;WE=23898672;WS=23898654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr13	23905711	rs2737699	A	G	1626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.095;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=36;PP=908;ReadPosRankSum=-1.900;SC=GTCATTGCCAATGCTAACAGG;SOR=0.586;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=193;TCF=89;TCR=104;TR=69;WE=23905719;WS=23905701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,82:0.38:213
chr13	23907677	rs2737701	C	T	8700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=166;NR=129;PP=2965;SC=ATGATGATGACTGTGTCCATT;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=295;TCF=166;TCR=129;TR=295;WE=23907685;WS=23907667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,322:1.00:322
chr13	23907909	rs17078605	A	G	1448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.981;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.645;NF=39;NR=34;PP=977;ReadPosRankSum=-0.174;SC=TGAAGTTTGGACCATATAATG;SOR=0.505;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=251;TCF=140;TCR=111;TR=73;WE=23907917;WS=23907899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:195,79:0.29:274
chr13	23908034	rs2737700	A	G	6238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=416;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.171;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=134;NR=127;PP=2962;ReadPosRankSum=3.112;SC=GAATACAGCCAGCTTTCATTA;SOR=0.616;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=385;TCF=199;TCR=186;TR=261;WE=23908042;WS=23908024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,279:0.67:415
chr13	23909162	rs9552929	A	G	1558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.621;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=34;PP=1025;ReadPosRankSum=-0.721;SC=TGTCCTTTACAACATGAATAG;SOR=0.806;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=222;TCF=120;TCR=102;TR=79;WE=23909170;WS=23909152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,85:0.35:243
chr13	23911820	rs4143768	A	G	1210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.951;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.699;NF=17;NR=35;PP=823;ReadPosRankSum=-0.561;SC=CAATTTCTTGAATATTTGGAA;SOR=0.947;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=164;TCF=57;TCR=107;TR=52;WE=23911836;WS=23911810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,58:0.32:181
chr13	23949252	rs3751368	G	A	2676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=41;PP=1578;ReadPosRankSum=-0.988;SC=CCCGGCCACCGCCTACCTCGC;SOR=0.695;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=179;TCF=116;TCR=63;TR=116;WE=23949260;WS=23949242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,120:0.66:183
chr13	24234369	rs3751366	G	T	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=7.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.65;ReadPosRankSum=0.304;SOR=0.075;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,10:0.31:32
chr13	24234375	rs3751365	A	T	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=9.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.02;ReadPosRankSum=0.058;SOR=0.080;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,13:0.31:42
chr13	24234517	rs3751364	A	G	1072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FS=0.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.42;ReadPosRankSum=-1.271;SOR=0.756;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:233,81:0.26:314
chr13	24242801	rs7329483	A	G	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.789;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=12;PP=362;ReadPosRankSum=-1.250;SC=CCCCATCAAAAACTTTAAGTT;SOR=0.801;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=98;TCF=56;TCR=42;TR=30;WE=24242809;WS=24242787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,32:0.30:105
chr13	24243200	rs3751363	T	C	1181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.624;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=39;PP=652;ReadPosRankSum=-1.109;SC=AGGAGAGTGGTGCTGTCATCC;SOR=0.628;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=153;TCF=53;TCR=100;TR=61;WE=24243208;WS=24243190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,64:0.40:161
chr13	24410278	rs7982516	G	A	7984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=167;NR=93;PP=2965;SC=TACTAACAGAGGGTGAGTTCT;SOR=1.402;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=260;TCF=167;TCR=93;TR=260;WE=24410286;WS=24410268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,284:1.00:284
chr13	24411772	rs7333040	T	C	7115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=140;NR=99;PP=2965;SC=TCCATCATGCTAGGAGTTAGC;SOR=0.908;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=241;TCF=141;TCR=100;TR=239;WE=24411780;WS=24411762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
chr13	24436230	rs1886972	C	T	143.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=113;SC=TAAAATATGTCGACTCCTCAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=24436238;WS=24436220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr13	24449166	.	AACAC	A	108	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5723;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=18;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=108;QD=37.0;SC=GTTTCTTCAAAACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=3;WE=24449177;WS=24449156;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr13	24462173	rs139459675	CT	C	96.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.79;ReadPosRankSum=-0.083;SOR=0.722;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,12:0.22:54
chr13	24465743	rs3864971	A	G	12842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=472;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.88;QD=27.27;SOR=0.986;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,471:1.00:471
chr13	24844994	rs35768526	G	C	3824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.514;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=100;NR=63;PP=2141;ReadPosRankSum=0.237;SC=CCAAACAGAAGGATGGTAGCT;SOR=0.913;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=250;TCF=149;TCR=101;TR=163;WE=24845002;WS=24844984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,175:0.64:273
chr13	24845159	rs10654469	A	ACT	258.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.430;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.416;NF=1;NR=16;PP=445;ReadPosRankSum=0.760;SC=ACTCTCTCTCACTCTCTCTCT;SOR=0.223;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=41;TCF=2;TCR=39;TR=17;WE=24845167;WS=24845149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr13	24853011	rs9580911	T	C	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.51;MQRankSum=0.808;QD=25.66;ReadPosRankSum=0.047;SOR=0.929;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr13	24853015	rs9580912	C	T	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.51;MQRankSum=0.808;QD=25.66;ReadPosRankSum=-0.385;SOR=0.929;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr13	24865057	rs12430530	A	G	4015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=69;PP=2315;SC=AGGTGAGAGCACTGCTGCCAT;SOR=0.895;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=136;TCF=66;TCR=70;TR=135;WE=24865065;WS=24865047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr13	24869025	rs7993660	A	G	1892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=45;PP=1348;SC=AAAGCACCCCACATGATCCCA;SOR=2.494;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=14;TCR=45;TR=59;WE=24869033;WS=24869015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr13	24895559	rs3751357	A	G	7252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.96;MQRankSum=-1.341;QD=28.22;ReadPosRankSum=-0.028;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,256:1.00:257
chr13	24895684	rs2862239	A	G	17618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=645;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=318;NR=314;PP=2965;SC=TTTTCTCCAGAAATGTTCAGG;SOR=0.728;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=633;TCF=318;TCR=315;TR=632;WS=24895674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,645:1.00:645
chr13	25008588	rs1372085	A	G	3108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=28;PP=1747;SC=CCAGTGTTGTATGCACACTAT;SOR=1.423;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=93;TCF=64;TCR=29;TR=92;WE=25008596;WS=25008578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr13	25008630	rs1822135	A	G	4338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=53;PP=2578;SC=CAGAAAGCACAGGATACTGTC;SOR=1.242;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=147;TCF=94;TCR=53;TR=147;WE=25008638;WS=25008620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr13	25008903	rs9318536	G	T	1571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=52.50;QD=30.82;SOR=1.314;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr13	25009099	rs9511259	A	C	4245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=80;PP=2965;SC=CAATAGGGTGAAGAAGGTGGG;SOR=1.032;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=143;TCF=63;TCR=80;TR=143;WE=25009107;WS=25009089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr13	25016230	rs9511267	C	T	987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=10.792;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=3.417;NF=0;NR=31;PP=772;ReadPosRankSum=-0.939;SC=GAGCTTGTGCCGTGGGCCACA;SOR=6.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=31;WE=25016238;WS=25016220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,33:0.92:36
chr13	25016687	rs4770683	C	T	5828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=119;NR=78;PP=2965;SC=TGTGGAAATACAAATAAAATA;SOR=1.126;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=197;TCF=119;TCR=78;TR=197;WE=25016695;WS=25016677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr13	25016870	rs3816221	C	A	777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.446;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-4.156;NF=18;NR=24;PP=402;ReadPosRankSum=1.643;SC=ATTTCTATTTCGCTATGTCAG;SOR=0.188;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=130;TCF=42;TCR=88;TR=42;WE=25016878;WS=25016860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,48:0.33:147
chr13	25016924	rs112553634	C	T	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-4.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.563;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.795;NF=1;NR=9;PP=114;ReadPosRankSum=-0.990;SC=TATTGAATTGCAGGTCCCATC;SOR=0.034;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=10;WE=25016932;WS=25016914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,10:0.28:36
chr13	25020757	rs9511273	T	C	1841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=10;PP=769;SC=GAGCATTATATATGGAAATAT;SOR=1.900;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=39;WE=25020765;WS=25020747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr13	25020782	rs9318553	C	G	2716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=19;PP=1285;SC=TCATAACTTTCAAACAATGGG;SOR=1.516;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=46;TCR=19;TR=65;WE=25020790;WS=25020772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr13	25020863	rs9318554	G	A	4012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=71;NR=68;PP=2230;SC=ACCATTGTACGAAATTCTTTC;SOR=0.801;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=139;TCF=71;TCR=68;TR=139;WE=25020871;WS=25020853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr13	25020910	rs9507346	G	A	2840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=44;NR=56;PP=1794;SC=CTGAAATGGGGAAAAAAATAA;SOR=1.036;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=44;TCR=56;TR=100;WE=25020918;WS=25020900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr13	25021144	rs78060735	GTCT	G	5379.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=35;NR=44;PP=2969;SC=CAAACTCTGCGTCTTCTTACC;SOR=1.456;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=91;TCF=43;TCR=48;TR=79;WE=25021162;WS=25021134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr13	25021154	rs61947037	C	T	5676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=50;PP=2812;SC=GTCTTCTTACCTGTGTGCAGT;SOR=1.371;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=134;TCF=84;TCR=50;TR=131;WE=25021162;WS=25021134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr13	25021200	rs9318558	A	C	5509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=115;NR=80;PP=2962;SC=TCGATCATTGAGAAACAAGGA;SOR=0.977;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=204;TCF=118;TCR=86;TR=195;WE=25021219;WS=25021190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr13	25021211	rs7333856	C	T	4813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5044;FS=1.105;HP=2;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=-2.884;NF=105;NR=86;PP=2962;ReadPosRankSum=4.010;SC=GAAACAAGGACGGCACCTGGG;SOR=0.471;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=217;TCF=122;TCR=95;TR=191;WE=25021219;WS=25021190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:13,197:0.94:210
chr13	25021245	rs7334587	A	G	4682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.346;HP=2;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.145;NF=94;NR=101;PP=2867;ReadPosRankSum=-0.268;SC=GGCCTCGGGCACATCTGGATT;SOR=0.677;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=248;TCF=124;TCR=124;TR=195;WE=25021253;WS=25021235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,204:0.85:240
chr13	25021263	rs77269056	T	C	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FS=4.201;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.31;MQRankSum=1.302;QD=0.68;ReadPosRankSum=4.925;SOR=0.621;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:214,38:0.15:252
chr13	25021323	rs73172125	A	G	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FS=4.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQRankSum=-8.132;QD=1.94;ReadPosRankSum=-1.417;SOR=0.363;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:128,34:0.21:162
chr13	25027744	rs4770684	A	G	15926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=605;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=284;NR=281;PP=2965;SC=CTCTGCTGCCATGGTATTGCT;SOR=0.720;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=566;TCF=284;TCR=282;TR=565;WE=25027752;WS=25027734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,604:1.00:604
chr13	25029218	rs2275660	C	T	5940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=126;NR=85;PP=2965;SC=GCATGCAAGGCGATTTGCTTG;SOR=1.002;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=211;TCF=126;TCR=85;TR=211;WE=25029226;WS=25029208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr13	25043029	rs4770694	C	T	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=3.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.76;ReadPosRankSum=0.587;SOR=2.049;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr13	25043033	rs4770695	C	G	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.76;ReadPosRankSum=1.290;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr13	25049812	rs8001930	T	C	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5013;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.138;NF=0;NR=10;PP=229;ReadPosRankSum=0.772;SC=TATTCCTTCTTCAAGCCTTCA;SOR=2.147;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=10;WE=25049820;WS=25049802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr13	25052261	rs4770696	C	T	3063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.708;NF=77;NR=53;PP=1928;ReadPosRankSum=-0.123;SC=AGGCTGTTTGCGAAACTCCAT;SOR=0.720;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=199;TCF=119;TCR=80;TR=130;WE=25052269;WS=25052251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,139:0.63:219
chr13	25052420	rs17080653	T	A	2626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.257;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=3.983;NF=43;NR=61;PP=1634;ReadPosRankSum=-1.209;SC=TTGTACTACATGCGAAAGGAA;SOR=0.826;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=162;TCF=69;TCR=93;TR=104;WE=25052428;WS=25052410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,116:0.66:177
chr13	25059023	rs4769362	C	T	1037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=29;PP=825;SC=TGGTTGTTTCCGGAAACACAA;SOR=4.743;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=31;WE=25059031;WS=25059013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr13	25065008	rs1361577	A	G	1516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=47;PP=1038;ReadPosRankSum=0.666;SC=ATCACCACATATCAAAATTAA;SOR=0.850;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=84;TCF=14;TCR=70;TR=56;WE=25065016;WS=25064998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,62:0.66:94
chr13	25068620	rs2862906	G	C	131.41	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=18.77;ReadPosRankSum=-0.566;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr13	25068934	rs4770700	G	T	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.399;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=345;ReadPosRankSum=-1.587;SC=AAATAAAGCAGTAGGTCCTTG;SOR=1.802;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=17;WE=25068942;WS=25068924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,17:0.74:23
chr13	25072200	rs1965154	T	C	3564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=78;PP=1857;ReadPosRankSum=0.544;SC=TTCATTGAAATGAGTTATGAA;SOR=0.701;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=254;TCF=129;TCR=125;TR=157;WE=25072208;WS=25072190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,172:0.61:282
chr13	25075859	rs1539096	C	T	4871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.379;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=106;PP=2932;ReadPosRankSum=-0.093;SC=GTCTCTTTTCCCTGATAGATT;SOR=0.788;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=305;TCF=139;TCR=166;TR=194;WE=25075867;WS=25075849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,217:0.66:331
chr13	25170030	.	C	CTAATCTTCAATGTCT	824.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=51.11;QD=41.24;SOR=6.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr13	25255705	rs41288276	C	A	657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=7.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.45;ReadPosRankSum=2.236;SOR=0.280;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,37:0.36:102
chr13	25267017	rs56291145	A	C	3084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=512;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=77;PP=2034;ReadPosRankSum=0.998;SC=AGGACAGGAAAATGTCCCCAT;SOR=0.700;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=479;TCF=242;TCR=237;TR=154;WE=25267025;WS=25267007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:341,170:0.33:511
chr13	25280753	rs2289905	C	T	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.823;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=237;ReadPosRankSum=0.071;SC=TCCAACCTCTCAGGTGGGCTG;SOR=0.191;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=15;WE=25280761;WS=25280743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,15:0.83:18
chr13	25283657	rs2289910	G	C	1559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.213;HP=1;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.613;NF=28;NR=29;PP=1023;ReadPosRankSum=0.483;SC=CCCATCACACGAGGGCCTGCC;SOR=0.386;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=79;TCF=36;TCR=43;TR=57;WE=25283665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,63:0.72:88
chr13	25283744	rs7318859	G	A	1672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=19;PP=1101;ReadPosRankSum=-0.060;SC=GAGGGAGGGGGAACCGAGAGT;SOR=0.705;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=57;TCR=26;TR=60;WE=25283752;WS=25283734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,66:0.73:91
chr13	25338586	rs9578783	A	G	120.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=6;PP=115;SC=TGGTGTCACCAGAAACTGCGT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=25338594;WS=25338576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr13	25341365	rs142005435	A	AATC	2280.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.891;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=14;PP=1369;ReadPosRankSum=1.592;SC=CTGTCTCAATAATCATCATCA;SOR=1.100;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=64;TCF=31;TCR=33;TR=31;WE=25341373;WS=25341355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,59:0.59:100
chr13	25355965	rs5802305	GT	G	793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.46;ReadPosRankSum=0.383;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,39:0.91:43
chr13	25356053	rs9707144	T	C	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.99;ReadPosRankSum=-1.184;SOR=0.745;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:119,37:0.24:156
chr13	25363477	rs11616245	A	T	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FS=0.711;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.08;ReadPosRankSum=3.242;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,46:0.33:141
chr13	25363776	rs6490979	C	T	850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=8;PP=666;SC=TGATTTTTGTCTAGAGAACAT;SOR=1.781;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=26;TCF=18;TCR=8;TR=26;WE=25363784;WS=25363766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr13	25367282	rs1451568	A	C	3738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=650;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=108;NR=94;PP=2520;ReadPosRankSum=-0.779;SC=TAGAAAAGAAAAAGGTTGACA;SOR=0.662;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=615;TCF=335;TCR=280;TR=202;WE=25367296;WS=25367272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:433,215:0.33:648
chr13	25370255	rs1446294	A	G	2256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=19;PP=1442;SC=TATTAATGTGACTTAAACATT;SOR=1.640;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=48;TCR=19;TR=67;WE=25370263;WS=25370245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr13	25399702	rs9553451	C	A	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=150;ReadPosRankSum=0.023;SC=ATTCATTCAACACTTACATTT;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=8;WE=25399710;WS=25399692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr13	25399752	rs2121253	A	G	1587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=6;PP=1220;SC=CCCTTTATTTACTAGATAGAG;SOR=3.702;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=41;TCR=6;TR=47;WE=25399760;WS=25399742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr13	25400338	rs12869348	A	T	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=168;ReadPosRankSum=-0.249;SC=AGTTTTCTCGATATATTTTTT;SOR=0.682;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=9;TCR=28;TR=13;WE=25400346;WS=25400328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,15:0.35:43
chr13	25404743	rs4769382	T	C	1612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=42;PP=1271;SC=AGAAGGTAATTTATTTATTAT;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=13;TCR=42;TR=55;WE=25404751;WS=25404733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr13	25416104	rs148630636	C	CA	73.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=1.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.77;MQRankSum=3.210;QD=1.76;ReadPosRankSum=-2.572;SOR=0.293;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,10:0.24:42
chr13	25417795	rs34260997	TATC	T	367.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=212;ReadPosRankSum=0.377;SC=GTCATATAAGTATCATCACAG;SOR=0.479;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=6;WE=25417805;WS=25417785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr13	25419176	rs6490984	A	G	3403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=57;PP=1936;SC=ATCTAAAGACAATGGGAAGAC;SOR=0.937;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=51;TCR=57;TR=108;WE=25419184;WS=25419166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr13	25442631	rs113369387	A	G	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=20;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.690;NF=10;NR=0;PP=165;ReadPosRankSum=0.050;SC=AAAAAAAAAAACTTGCTTTCT;SOR=0.317;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=10;WE=25442639;WS=25442621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr13	25442921	rs2275938	A	C	3364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=86;PP=2621;ReadPosRankSum=1.375;SC=TAAACACTATAAGTGACTCTT;SOR=2.322;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=101;TCF=14;TCR=87;TR=100;WE=25442929;WS=25442911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,104:0.99:105
chr13	25448120	rs8001764	G	A	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.831;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=57;ReadPosRankSum=2.178;SC=GGTTGATTCCGTATCTTGGCT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=6;WE=25448128;WS=25448110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr13	25453116	rs9553461	T	C	946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=2.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.05;ReadPosRankSum=0.065;SOR=1.751;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,24:0.69:35
chr13	25453116	.	TTG	CTC	1156	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=21;NR=1;PP=1156;QD=54.9758124937;SC=TAGGAAGACCTTGTGAGAAGG;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=22;WE=25453126;WS=25453114;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:12,22:0.65:34
chr13	25453118	rs79933264	G	C	946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=2.941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.85;ReadPosRankSum=-0.469;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,24:0.71:34
chr13	25457207	rs9318911	T	C	1091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=1;PP=886;SC=TTTTAGAATCTAATCTTTTCC;SOR=5.670;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=33;WE=25457215;WS=25457197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr13	25458232	rs34991318	AGTT	A	3021.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FS=2.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.928;SOR=0.870;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:184,86:0.32:270
chr13	25458267	rs3831371	G	GAATT	3570.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FS=8.543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.06;ReadPosRankSum=-0.018;SOR=0.698;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:196,100:0.34:296
chr13	25458650	rs1530876	G	A	855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.773;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=31;PP=584;ReadPosRankSum=1.338;SC=CCTGACGAAAGTATGGCTAAT;SOR=0.826;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=119;TCF=35;TCR=84;TR=42;WE=25458658;WS=25458640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,44:0.36:123
chr13	25460428	rs9511502	A	G	5970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=114;NR=89;PP=2965;SC=AAAGTGTAACAGAGCTGGATG;SOR=0.842;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=203;TCF=114;TCR=89;TR=203;WE=25460436;WS=25460418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr13	25466774	rs9318917	T	C	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.358;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=84;ReadPosRankSum=-2.145;SC=CCCGCCTCCCTGCCTACCGCA;SOR=0.167;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=36;TCF=33;TCR=3;TR=10;WE=25466782;WS=25466764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,9:0.25:36
chr13	25466955	rs3742165	T	C	1117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.33;ReadPosRankSum=-0.475;SOR=0.649;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:190,68:0.26:258
chr13	25517938	rs113483335	C	T	1067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.061;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.746;NF=18;NR=29;PP=682;ReadPosRankSum=-0.055;SC=GAGATATGAACTTCTCTGTTT;SOR=0.477;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=73;TCF=25;TCR=48;TR=47;WE=25517946;WS=25517928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,50:0.65:77
chr13	25525370	rs9511519	C	T	839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=0;PP=624;SC=ATTTAGTAGACTTATGAAGAA;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=25525378;WS=25525364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr13	25525481	rs56247049	G	A	5428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=427;ExcessHet=3.0103;FS=3.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQRankSum=-0.508;QD=12.71;ReadPosRankSum=-0.456;SOR=0.517;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:175,252:0.59:427
chr13	25525488	rs2167398	G	A	16526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=447;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.77;QD=37.06;SOR=1.069;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,446:1.00:446
chr13	25525544	rs41288282	T	C	5770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=467;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.463;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=110;NR=139;PP=2962;ReadPosRankSum=1.140;SC=CCAAAAAGTATCTCCACGGCA;SOR=0.870;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=432;TCF=199;TCR=233;TR=249;WE=25525552;WS=25525534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:195,272:0.58:467
chr13	25525636	rs41288284	G	C	1037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.106;HP=9;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=33;PP=813;ReadPosRankSum=0.298;SC=CCTAAGAATAGAAAAAAAATT;SOR=0.235;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=70;TCF=3;TCR=67;TR=36;WE=25525644;WS=25525626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,38:0.52:73
chr13	25670851	rs75475407	A	G	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=361;ExcessHet=3.0103;FS=5.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQRankSum=-13.379;QD=0.27;ReadPosRankSum=-0.943;SOR=0.501;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:333,27:0.08:360
chr13	25670868	rs200859889	G	A	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=417;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQRankSum=-15.550;QD=0.51;ReadPosRankSum=0.240;SOR=0.513;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:383,33:0.08:416
chr13	25670873	rs77142265	A	G	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=432;ExcessHet=3.0103;FS=1.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQRankSum=-16.029;QD=0.45;ReadPosRankSum=0.668;SOR=0.492;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:397,34:0.08:431
chr13	25670877	rs112107735	G	A	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=432;ExcessHet=3.0103;FS=1.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQRankSum=-16.300;QD=0.56;ReadPosRankSum=0.273;SOR=0.491;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:395,36:0.08:431
chr13	25670907	rs76264750	C	A	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=498;ExcessHet=3.0103;FS=0.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQRankSum=-18.970;QD=0.67;ReadPosRankSum=0.646;SOR=0.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:454,43:0.09:497
chr13	25670919	rs76861216	A	G	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=490;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQRankSum=-20.120;QD=0.79;ReadPosRankSum=0.393;SOR=0.613;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:444,45:0.09:489
chr13	25670953	rs74040928	G	A	534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=476;ExcessHet=3.0103;FS=0.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQRankSum=-21.759;QD=1.12;ReadPosRankSum=0.515;SOR=0.902;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:431,45:0.09:476
chr13	25670955	rs79397892	C	T	534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=476;ExcessHet=3.0103;FS=0.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQRankSum=-21.758;QD=1.12;ReadPosRankSum=0.189;SOR=0.842;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:430,46:0.10:476
chr13	25670978	.	C	T	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.234;ClippingRankSum=0.000;DP=459;ExcessHet=3.0103;FS=0.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQRankSum=-21.363;QD=1.28;ReadPosRankSum=0.117;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:414,45:0.10:459
chr13	25670981	rs77476965	G	C	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=451;ExcessHet=3.0103;FS=1.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQRankSum=-21.174;QD=1.31;ReadPosRankSum=-0.045;SOR=0.906;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:406,45:0.10:451
chr13	25670984	rs11619791	C	T	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=463;ExcessHet=3.0103;FS=0.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQRankSum=-21.433;QD=1.22;ReadPosRankSum=0.204;SOR=0.878;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:417,45:0.10:462
chr13	25670988	rs74564616	T	G	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=462;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQRankSum=-20.489;QD=1.04;ReadPosRankSum=0.820;SOR=0.694;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:419,42:0.09:461
chr13	25671008	rs76447065	C	T	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=488;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQRankSum=-17.936;QD=0.46;ReadPosRankSum=0.179;SOR=0.636;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:439,48:0.10:487
chr13	25671015	rs75314628	A	G	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=497;ExcessHet=3.0103;FS=0.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQRankSum=-17.873;QD=0.43;ReadPosRankSum=0.629;SOR=0.572;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:447,46:0.09:493
chr13	25671080	rs76241879	A	G	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=629;ExcessHet=3.0103;FS=1.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQRankSum=-15.508;QD=0.10;ReadPosRankSum=-0.106;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:578,47:0.08:625
chr13	25671271	rs79246694	A	G	1382.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=659;ExcessHet=3.0103;FS=1.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQRankSum=-14.820;QD=2.11;ReadPosRankSum=0.289;SOR=0.777;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:581,75:0.11:656
chr13	25671272	rs376589131	AG	A	1486.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=664;ExcessHet=3.0103;FS=1.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQRankSum=-15.031;QD=2.25;ReadPosRankSum=0.123;SOR=0.728;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:585,76:0.11:661
chr13	25671274	rs76994938	C	T	1507.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=662;ExcessHet=3.0103;FS=1.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQRankSum=-15.134;QD=2.29;ReadPosRankSum=0.298;SOR=0.750;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:582,76:0.12:658
chr13	25671292	rs80261016	C	T	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=594;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQRankSum=-13.861;QD=0.66;ReadPosRankSum=2.176;SOR=0.805;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:530,60:0.10:590
chr13	25671310	rs371130768	TTATGA	T	1218.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=572;ExcessHet=3.0103;FS=0.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQRankSum=-12.005;QD=2.19;ReadPosRankSum=2.311;SOR=0.936;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:491,66:0.12:557
chr13	25671320	.	A	G	1305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.983;ClippingRankSum=0.000;DP=545;ExcessHet=3.0103;FS=2.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.83;MQRankSum=-9.983;QD=2.41;ReadPosRankSum=2.522;SOR=1.040;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:475,66:0.12:541
chr13	25671332	rs371570689	CA	C	851.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=4.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.82;MQRankSum=-5.669;QD=1.71;ReadPosRankSum=2.030;SOR=1.204;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:439,59:0.12:498
chr13	25802491	rs4770813	A	G	1533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=1;PP=1071;SC=CTTGGTCCCCATCCTCAGGGA;SOR=5.747;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=47;TCF=46;TCR=1;TR=47;WE=25802499;WS=25802481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr13	25825889	rs4312169	T	C	3028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=59;NR=39;PP=1637;SC=TTCGATCAAATTGATGGTACA;SOR=0.907;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=99;TCF=59;TCR=40;TR=98;WE=25825897;WS=25825879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr13	25831888	rs7995033	T	C	12767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=473;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=226;NR=198;PP=2965;SC=GCCAAGAAGATTGCAGCATCC;SOR=0.790;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=424;TCF=226;TCR=198;TR=424;WE=25831896;WS=25831878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,472:1.00:472
chr13	25848404	rs4387458	A	C	648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=18;PP=507;SC=CTTACATGCAACATTCTCAAT;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=25848412;WS=25848394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr13	25876011	rs11556093	G	A	13395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=514;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=230;NR=241;PP=2965;SC=CGGAACGGGAGCGTCTAGGTA;SOR=0.741;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=473;TCF=232;TCR=241;TR=471;WE=25876019;WS=25876001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,512:1.00:512
chr13	25886932	rs4341628	A	G	2277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=7;PP=1706;SC=TGAACTTTTAAGGATCCTTAT;SOR=4.174;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=56;TCR=7;TR=63;WE=25886940;WS=25886922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr13	25887738	rs12866994	C	T	883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.528;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=12;PP=617;ReadPosRankSum=-0.101;SC=AGCTTACTATCTCTCTTTTTA;SOR=1.118;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=129;TCF=86;TCR=43;TR=41;WE=25887746;WS=25887728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,45:0.32:140
chr13	25887811	rs12871608	T	C	1921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.429;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=46;PP=1200;ReadPosRankSum=-1.209;SC=TACAACTGCATCAACAGGCCT;SOR=0.652;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=289;TCF=156;TCR=133;TR=98;WE=25887819;WS=25887801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:204,110:0.35:314
chr13	25893363	rs59567333	GTTTATA	G	2617.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=8;PP=1812;SC=ATGCTTAACAGTTTATATTTA;SOR=2.722;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=40;TCF=29;TCR=11;TR=32;WE=25893376;WS=25893353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr13	25901781	rs7997070	A	C	770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=20;PP=604;SC=GAAAACTACTATAATCCATAA;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=9;TCR=20;TR=29;WE=25901789;WS=25901771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr13	26104547	rs9581376	G	A	1073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=0;PP=907;SC=TGTAAAATACGTAGCTAGTTT;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=33;WE=26104555;WS=26104537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr13	26107591	rs45451496	A	C	5176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.50;SOR=1.297;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr13	26107595	rs7319869	CT	TG	5172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.60;SOR=1.350;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr13	26107606	rs7319993	C	T	4620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.75;SOR=1.563;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr13	26108557	rs4257084	G	A	1213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=36;PP=1048;SC=TATTTCTCTAGGGTTCTTCTT;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=6;TCR=36;TR=42;WE=26108565;WS=26108547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr13	26125651	rs34018109	G	A	3852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=75;PP=2408;SC=GGTAAGTGTCGGGGTGGGTTG;SOR=1.195;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=129;TCF=54;TCR=75;TR=129;WE=26125668;WS=26125641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr13	26125731	rs9581389	T	C	1408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=31;PP=820;SC=GTGTCCCTGCTGTCCTTCTGT;SOR=1.567;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=18;TCR=31;TR=49;WE=26125739;WS=26125721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr13	26127821	rs9740054	G	C	1207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=36;NR=1;PP=1040;SC=TTGAACTCACGGTTCCTGACA;SOR=5.838;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=37;WE=26127829;WS=26127811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr13	26128128	rs7331675	CA	AG	5687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=65;PP=2947;SC=TTTAATTGAGCACTCAAAAAA;SOR=1.802;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=36;TCR=66;TR=101;WE=26128137;WS=26128118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr13	26133009	rs12862551	C	T	701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=0;PP=492;SC=GAAATCTACCCGTTTCATACA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=26133017;WS=26133002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr13	26137989	rs12871941	T	C	899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=0;PP=590;SC=TGAATCCCTATAGGACTTTAG;SOR=4.479;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=26137997;WS=26137979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr13	26144896	rs17729346	C	T	13524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=511;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=259;NR=218;PP=2965;SC=TCCCGCCTCACGTTTGCAGCC;SOR=0.857;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=477;TCF=259;TCR=218;TR=477;WE=26144904;WS=26144886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,511:1.00:511
chr13	26148727	rs12854617	A	G	973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=31;NR=5;PP=716;SC=AAGTGCCTGCACTCCCCAACT;SOR=3.026;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=31;TCR=5;TR=36;WE=26148735;WS=26148717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr13	26148966	rs6491066	C	T	5098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=92;PP=2965;SC=AACAAACATTCGGAATCCTTA;SOR=1.010;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=167;TCF=75;TCR=92;TR=167;WE=26148974;WS=26148956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr13	26151184	rs71752532	C	CT	2215.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FS=11.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQRankSum=2.042;QD=8.62;ReadPosRankSum=0.143;SOR=1.334;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:139,118:0.46:257
chr13	26155953	rs7335339	G	C	5795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=123;NR=61;PP=2965;SC=TTTTTTCAATGTAGAATTTGC;SOR=1.340;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=184;TCF=123;TCR=61;TR=184;WE=26155961;WS=26155932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr13	26273385	rs6491088	G	C	9161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=162;NR=147;PP=2965;SC=ACGTGGCCCTGATCATCGATG;SOR=0.730;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=309;TCF=162;TCR=147;TR=309;WE=26273393;WS=26273375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,332:1.00:332
chr13	26273538	rs2296003	C	T	2089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=51;PP=1472;ReadPosRankSum=1.875;SC=GTATCCCGTGCTTATACAAAA;SOR=1.528;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=65;TCF=13;TCR=52;TR=64;WE=26273546;WS=26273528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,70:0.99:71
chr13	26436641	rs2249800	C	T	3469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=73;PP=2222;SC=CTTACAGCCACGATGAGCTTC;SOR=1.534;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=114;TCF=41;TCR=73;TR=114;WE=26436649;WS=26436631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr13	26501227	rs1185907	C	T	6235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=138;NR=78;PP=2965;SC=TTCATTCATTCACCTTCTTCC;SOR=1.312;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=216;TCF=138;TCR=78;TR=216;WE=26501235;WS=26501217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr13	26535625	rs9511998	G	A	1751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=40;NR=19;PP=933;SC=TTGTTTTTGTGTTGTGAAATA;SOR=1.376;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=40;TCR=19;TR=59;WE=26535633;WS=26535615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr13	26586775	rs2274135	C	T	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=550;ReadPosRankSum=-0.012;SC=GTACCGCGGGCGGGGGCTGAT;SOR=0.743;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=42;TCF=13;TCR=29;TR=17;WE=26586796;WS=26586765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,18:0.40:45
chr13	26586788	rs9553698	A	C	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.764;HP=4;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=567;ReadPosRankSum=0.769;SC=GGGCTGATGGAGGAGTGGGTG;SOR=0.223;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=18;WE=26586796;WS=26586765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr13	26624935	rs111516934	C	T	1967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.511;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=36;PP=1108;ReadPosRankSum=1.202;SC=GGCGTCGCCGCCGTCGAAGCG;SOR=0.531;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=117;TCF=67;TCR=50;TR=79;WE=26624943;WS=26624925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,91:0.69:132
chr13	26974562	rs998692	G	A	6397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=147;NR=63;PP=2965;SC=AAGCAATACCGTCATGTTTGT;SOR=1.771;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=210;TCF=147;TCR=63;TR=210;WE=26974570;WS=26974552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr13	27250945	rs3794413	A	G	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.760;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=107;ReadPosRankSum=-1.618;SC=AAATGCATCAATAGCTTCGGG;SOR=0.126;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=44;TCF=7;TCR=37;TR=12;WE=27250953;WS=27250935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,13:0.29:45
chr13	27643597	rs9512534	C	T	1692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=0.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.11;ReadPosRankSum=0.575;SOR=0.602;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,80:0.67:120
chr13	27745840	.	G	A	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.426;ClippingRankSum=0.000;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.49;ReadPosRankSum=1.734;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,18:0.41:44
chr13	27829310	rs3094293	G	A	4351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=63;PP=2495;SC=AGAATACTTTGCAGTTACTTA;SOR=0.782;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=147;TCF=83;TCR=64;TR=146;WE=27829318;WS=27829300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr13	27997758	rs75326986	C	T	1470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=12;PP=955;ReadPosRankSum=2.626;SC=TTCATAAGCACTGATGTTAAG;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=89;TCF=70;TCR=19;TR=55;WE=27997766;WS=27997748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,61:0.64:95
chr13	27997985	rs33932496	GC	G	12014.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=166;PP=2954;SC=TCTCAAAAGTGCTTCTCAGGT;SOR=1.228;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=177;TCF=8;TCR=169;TR=174;WE=27998007;WS=27997975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,284:1.00:284
chr13	27997999	rs3759433	G	A	3641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.171;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=105;PP=2542;ReadPosRankSum=-1.181;SC=CTCAGGTTTTGATATGCACTG;SOR=1.015;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=234;TCF=82;TCR=152;TR=158;WE=27998007;WS=27997975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,155:0.67:231
chr13	28003997	rs9581848	C	T	1590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=20;PP=900;ReadPosRankSum=0.843;SC=GTTTATATAACTTCTTACAGT;SOR=0.751;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=83;TCF=52;TCR=31;TR=56;WE=28004005;WS=28003987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,67:0.70:96
chr13	28009851	rs7669	G	A	2856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.425;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.011;NF=60;NR=58;PP=1703;ReadPosRankSum=0.670;SC=CATTTCCATGGTCTTTGTTCA;SOR=0.416;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=181;TCF=85;TCR=96;TR=118;WE=28009859;WS=28009841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,126:0.66:191
chr13	28009920	rs1218825	G	C	3002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=60;PP=2022;SC=CATTTTTGCTGAAAGCACGAA;SOR=1.374;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=36;TCR=60;TR=96;WE=28009928;WS=28009910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr13	28011158	rs74811644	G	A	1101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=16;PP=679;ReadPosRankSum=-0.176;SC=AAAATGCTGGGATTACAGGCG;SOR=0.779;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=45;TCR=23;TR=48;WE=28011166;WS=28011148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,50:0.68:74
chr13	28133956	rs373436911	TA	T	397.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=0.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.19;ReadPosRankSum=1.900;SOR=0.838;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,32:0.34:95
chr13	28136989	rs11838661	A	G	902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.786;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=28;PP=574;ReadPosRankSum=1.608;SC=TGTTTATGTGACATTTCCACA;SOR=0.941;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=97;TCF=29;TCR=68;TR=39;WE=28136997;WS=28136979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,43:0.41:105
chr13	28141698	rs35007323	A	G	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.441;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=181;ReadPosRankSum=0.525;SC=TAGGTTCCAAAACAGCACAAT;SOR=0.037;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=42;TCF=41;TCR=1;TR=13;WE=28141706;WS=28141688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,12:0.29:42
chr13	28143229	rs8002697	A	G	2121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=367;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=45;PP=1403;ReadPosRankSum=1.127;SC=CTCCATGTGGAAAGAGACGCT;SOR=0.880;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=331;TCF=175;TCR=156;TR=102;WE=28143237;WS=28143219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:250,116:0.32:366
chr13	28155994	rs9512753	G	C	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.42;ReadPosRankSum=-1.884;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr13	28196033	rs2232679	G	C	2753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=427;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=58;PP=1840;ReadPosRankSum=0.412;SC=GTCGGTCCTTGCTTCCTGCTT;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=400;TCF=231;TCR=169;TR=136;WE=28196041;WS=28196023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:281,143:0.34:424
chr13	28197436	rs7097	C	T	848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.264;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=564;ReadPosRankSum=2.088;SC=TATTCTCTTCCTGATGGTGCA;SOR=0.324;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=44;TCF=9;TCR=35;TR=29;WE=28197444;WS=28197426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,33:0.69:48
chr13	28367061	rs1231058	A	G	1628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=43;PP=1057;ReadPosRankSum=-0.222;SC=CGCTGCCTCTACTCAAGGCTT;SOR=0.715;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=289;TCF=154;TCR=135;TR=91;WE=28367069;WS=28367051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:209,95:0.31:304
chr13	28498323	rs9805632	G	C	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.108;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=31;ReadPosRankSum=1.465;SC=CCCCTTGAAGGGGTTGGGCTG;SOR=1.022;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=4;WE=28498331;WS=28498313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr13	28519354	rs2504220	A	C	4858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=113;NR=52;PP=2951;ReadPosRankSum=-1.317;SC=ACATTGCCAGAGTCTTGGCGA;SOR=1.531;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=167;TCF=114;TCR=53;TR=165;WE=28519362;WS=28519344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,178:0.99:180
chr13	28537242	rs1805108	A	C	573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.999;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=350;ReadPosRankSum=-2.117;SC=CCGCTGCAGAACCCGGTGGGT;SOR=0.955;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=67;TCF=48;TCR=19;TR=27;WE=28537250;WS=28537232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,29:0.41:71
chr13	28537317	rs1805107	G	A	1249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=28;PP=699;ReadPosRankSum=1.933;SC=ACAGAGCCAGGCACTGAGGCT;SOR=0.651;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=164;TCF=97;TCR=67;TR=64;WE=28537325;WS=28537307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,68:0.38:178
chr13	28537537	rs2504212	T	G	2290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=434;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=65;PP=1476;ReadPosRankSum=-1.253;SC=AAAAGCACATTGTGGTGAAGA;SOR=0.710;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=405;TCF=204;TCR=201;TR=130;WE=28537545;WS=28537527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:296,138:0.32:434
chr13	28539185	rs2481953	TG	AA	3408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.906;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=49;PP=2685;ReadPosRankSum=0.812;SC=GGCTGAGAACTGCAAGGCAGC;SOR=0.904;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=230;TCF=104;TCR=126;TR=86;WE=28539194;WS=28539175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,94:0.37:253
chr13	28541583	rs2481967	T	G	699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.980;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=23;PP=418;ReadPosRankSum=-0.494;SC=AATTGGGGCATCAAGGAGCGA;SOR=0.927;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=95;TCF=22;TCR=73;TR=29;WE=28541591;WS=28541573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,34:0.32:106
chr13	28552425	rs9579139	G	T	730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FS=3.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.58;ReadPosRankSum=-0.271;SOR=0.919;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:222,61:0.22:283
chr13	28552614	rs4463949	G	A	885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.301;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=26;PP=573;ReadPosRankSum=-1.055;SC=AGACACCGGCGGGAGCGCGTC;SOR=1.324;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=98;TCF=42;TCR=56;TR=40;WE=28552622;WS=28552604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,44:0.41:108
chr13	28562605	rs3897926	T	G	1466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=32;PP=851;ReadPosRankSum=-2.040;SC=CTTACCTGACTGTGCAAGGGC;SOR=0.718;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=259;TCF=163;TCR=96;TR=83;WE=28562613;WS=28562595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:193,92:0.32:285
chr13	28589495	rs9579142	C	G	3138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=63;PP=1878;SC=GTGCCAGACACTGTTGCAGGC;SOR=1.652;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=33;TCR=63;TR=96;WE=28589517;WS=28589485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr13	28589509	rs9579143	C	T	2635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=58;PP=1649;SC=TGCAGGCACACGGGCTGCGGC;SOR=1.931;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=25;TCR=58;TR=83;WE=28589517;WS=28589485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr13	28589662	rs4497507	C	G	1354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=36;NR=13;PP=1000;SC=AGGGGTGGGGCGGCACCGAGA;SOR=2.160;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=50;TCF=36;TCR=14;TR=49;WE=28589670;WS=28589652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr13	28597447	rs35829721	ATC	A	872.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.573;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=558;ReadPosRankSum=1.181;SC=ATCTTTTCAAATCTTTTTTTT;SOR=0.369;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=45;TCF=33;TCR=12;TR=15;WE=28597456;WS=28597437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,25:0.39:64
chr13	28602226	rs60462219	AAG	A	4259.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.611;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.787;NF=23;NR=51;PP=2997;ReadPosRankSum=-1.892;SC=AAGAATTAAAAAGAGAGAGAG;SOR=1.127;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=88;TCF=26;TCR=62;TR=74;WE=28602237;WS=28602216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:8,134:0.94:142
chr13	28602292	rs75580865	T	C	3141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.515;NF=77;NR=62;PP=1862;ReadPosRankSum=-0.559;SC=TTTGATGAGGTGATTTTCGTG;SOR=0.689;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=220;TCF=122;TCR=98;TR=139;WE=28602300;WS=28602282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,145:0.62:234
chr13	28607916	rs2491222	T	A	1262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=2;PP=968;SC=CCTTGAAACATGGCAAACAGT;SOR=4.565;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=36;TCR=2;TR=38;WE=28607924;WS=28607912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr13	28607989	rs2491223	T	G	5871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=129;NR=61;PP=2965;SC=CCCATTTTTGTGCATCTTTGT;SOR=1.680;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=190;TCF=129;TCR=61;TR=190;WE=28607997;WS=28607979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr13	28609825	rs2491227	A	G	7112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=163;PP=2965;SC=AAAAAAAAATAGCAAAGAATT;SOR=1.899;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=237;TCF=74;TCR=163;TR=237;WE=28609833;WS=28609803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr13	28609846	rs2491228	A	T	4004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=109;PP=2965;SC=TAGACAGGTGAGCTGTCATCA;SOR=3.143;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=134;TCF=25;TCR=109;TR=133;WE=28609854;WS=28609836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr13	28609991	rs2491229	T	C	2695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.48;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr13	28609997	rs2491230	T	C	2854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.25;SOR=2.448;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr13	28610183	rs2491231	A	G	6345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=129;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.552;SC=AGGTTTCCCTATAGAAAAGAA;SOR=1.394;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=210;TCF=80;TCR=130;TR=208;WE=28610191;WS=28610173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,231:0.99:233
chr13	28622356	rs2153000	G	A	2885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.895;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=32;PP=1535;ReadPosRankSum=-0.856;SC=TCTCAAGGGCGACAAGCAAGG;SOR=0.563;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=166;TCF=113;TCR=53;TR=103;WE=28622364;WS=28622346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,128:0.65:197
chr13	28623699	rs9507985	G	T	1889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.585;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=41;PP=1190;ReadPosRankSum=-0.196;SC=AACAGAGTTTGCATTTAATGT;SOR=0.701;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=230;TCF=115;TCR=115;TR=85;WE=28623707;WS=28623689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,93:0.38:248
chr13	28623759	rs9513004	C	T	2046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.132;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=54;PP=1340;ReadPosRankSum=0.928;SC=AGAATACAAACTTGTCCTATT;SOR=0.711;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=294;TCF=155;TCR=139;TR=106;WE=28623767;WS=28623749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:213,113:0.35:326
chr13	28623938	rs67491524	G	GA	337.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.258;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.992;NF=4;NR=14;PP=230;ReadPosRankSum=1.860;SC=TCCCAAGTGAGAAAAAAAAAG;SOR=0.993;SbPval=0.05;Source=Platypus;TC=54;TCF=4;TCR=50;TR=18;WE=28623946;WS=28623928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,19:0.35:55
chr13	28624294	rs1933437	G	A	7062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=526;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=138;NR=156;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.163;SC=CCTTATGTCCGTCCCAAATAA;SOR=0.741;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=472;TCF=225;TCR=247;TR=294;WE=28624302;WS=28624284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:201,324:0.62:525
chr13	28636084	rs7338903	G	A	5984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=115;PP=2965;SC=TCCCTGGGGCGTCGACCAGCA;SOR=1.163;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=199;TCF=84;TCR=115;TR=199;WE=28636092;WS=28636074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr13	28644510	rs2387350	C	A	1108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=6;PP=710;SC=AGATGTGAGGCCATAATATAC;SOR=2.554;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=33;WE=28644518;WS=28644500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr13	28647489	rs35318238	GA	G	499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.49;MQRankSum=0.545;QD=12.81;ReadPosRankSum=1.303;SOR=0.749;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,35:0.90:39
chr13	28834833	.	A	AT	157.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.060;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.32;MQRankSum=-0.735;QD=6.07;ReadPosRankSum=-2.810;SOR=0.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr13	28834854	rs139094014	CT	C	558.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5008;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.548;NF=0;NR=18;PP=415;ReadPosRankSum=-0.277;SC=GGAAACCTGTCTTTTAAAAAA;SOR=3.383;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=28834862;WS=28834844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,15:0.88:17
chr13	28835527	rs5802469	T	TC	4087.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=29;PP=2094;SC=TATACTTATTTTGTTTCATAG;SOR=1.257;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=53;TCF=23;TCR=30;TR=50;WE=28835535;WS=28835517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr13	28877629	rs3029489	AC	A	39.86	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.96;ReadPosRankSum=1.150;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,3:0.75:4
chr13	28882948	rs9579177	G	A	825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FS=0.557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.53;ReadPosRankSum=-0.057;SOR=0.741;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:178,56:0.24:234
chr13	28883061	rs7993418	G	A	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.123;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.658;NF=15;NR=15;PP=319;ReadPosRankSum=0.112;SC=AAGCATTTACGTATCTAATGA;SOR=0.346;SbPval=0.23;Source=Platypus;TCF=40;TR=30;WE=28883069;WS=28883051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,33:0.29:114
chr13	28885672	rs4771238	C	T	378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.56;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr13	28886113	rs7328692	A	G	975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=1;PP=740;SC=TTTTGATGTAAATAAATTTAG;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=27;WE=28886121;WS=28886103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr13	28886388	rs61763562	A	G	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=324;ReadPosRankSum=-2.168;SC=TTGGGTTTATAGCACCAGCAC;SOR=0.604;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=50;TCF=8;TCR=42;TR=19;WE=28886396;WS=28886378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,19:0.37:51
chr13	28893484	rs2296188	T	C	434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=2;PP=323;SC=AAAGGCTGTCTAACCAAAGGA;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=28893492;WS=28893474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr13	28893642	rs2296189	A	G	1561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.967;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=41;PP=975;ReadPosRankSum=-2.069;SC=AGATAGATTCAGGAGCCATCC;SOR=0.608;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=251;TCF=143;TCR=108;TR=89;WE=28893650;WS=28893632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:181,97:0.35:278
chr13	28908385	rs17536165	C	T	1430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.103;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=45;PP=1092;ReadPosRankSum=-1.821;SC=CTCCAGTGAACTAACCCTAAA;SOR=1.556;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=66;TCF=5;TCR=61;TR=48;WE=28908393;WS=28908375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,51:0.72:71
chr13	28958955	rs3751395	C	A	2378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=14;PP=1663;SC=GGTGACGGGACTGTTAAGGGA;SOR=2.513;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=77;TCF=62;TCR=15;TR=76;WE=28958963;WS=28958945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr13	28964325	rs7983774	G	A	1452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.015;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=47;PP=1087;ReadPosRankSum=0.862;SC=AGAATTGTTCGTGCACAAATT;SOR=0.369;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=76;TCF=12;TCR=64;TR=57;WE=28964333;WS=28964315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,58:0.73:79
chr13	28970917	rs7990486	C	T	1476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=6;PP=1141;SC=GAAATAACTCCTTACGAGATC;SOR=4.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=43;TCR=6;TR=49;WE=28970925;WS=28970907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr13	28980150	rs5802481	A	AG	1375.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=30;PP=1379;SC=TTTATGTGTGATCTTCTTTTC;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=30;WE=28980158;WS=28980140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr13	29236489	rs1340815	C	T	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.845;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=9;PP=418;ReadPosRankSum=-0.474;SC=GACACAGCTGCCTGGGTGTGT;SOR=0.800;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=99;TCF=73;TCR=26;TR=36;WE=29236497;WS=29236479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,37:0.37:101
chr13	29238576	rs3737528	T	C	991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FS=2.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.40;ReadPosRankSum=0.026;SOR=0.922;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:97,58:0.37:155
chr13	29275102	rs947027	T	C	3026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=39;PP=1758;SC=CTCTATAAAATAAAGCATTAC;SOR=0.749;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=93;TCF=54;TCR=39;TR=93;WE=29275110;WS=29275092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr13	29275129	rs705423	C	T	1592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=30;PP=904;ReadPosRankSum=1.966;SC=TAGGTAAAATCATACATATTT;SOR=0.675;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=97;TCF=50;TCR=47;TR=63;WE=29275137;WS=29275119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,71:0.65:109
chr13	29278063	rs34444192	T	TA	1272.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FS=5.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.03;ReadPosRankSum=1.683;SOR=0.369;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:122,59:0.33:181
chr13	29278264	rs34310301	G	GA	155.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=2.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.17;MQRankSum=1.634;QD=3.24;ReadPosRankSum=0.515;SOR=1.493;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,12:0.25:48
chr13	29674840	rs1536720	T	C	2029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=5.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.366;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=6;PP=1507;ReadPosRankSum=0.880;SC=TTCGAATTCATAATCTGTAGA;SOR=2.494;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=105;TCF=90;TCR=15;TR=68;WE=29674848;WS=29674830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,75:0.66:113
chr13	29674855	rs1536719	A	G	2243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.242;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=22;PP=1437;ReadPosRankSum=0.579;SC=TGTAGAATTCATTATCTCATT;SOR=1.365;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=143;TCF=104;TCR=39;TR=91;WE=29674863;WS=29674845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,102:0.65:157
chr13	29675131	rs3829381	G	A	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=185;ReadPosRankSum=2.322;SC=GGCAGGGTGGGGTGCCTTCAC;SOR=1.880;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=10;WE=29675139;WS=29675121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr13	29898768	rs928661	A	C	9751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=369;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=204;NR=147;PP=2965;SC=AAAGATGCTCAGAAAGATCAA;SOR=1.065;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=351;TCF=204;TCR=147;TR=351;WE=29898776;WS=29898758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,369:1.00:369
chr13	29898881	rs928660	A	G	7905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.64;SOR=1.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,286:1.00:286
chr13	29898889	rs928659	G	C	11618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.56;SOR=1.338;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr13	30014373	rs7337496	C	T	1122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=31;PP=865;SC=TTCACGTCTCCGTTGTTATAA;SOR=4.921;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=33;WE=30014381;WS=30014363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr13	30071310	rs2258198	G	T	1176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=13;PP=577;SC=GATCACAGCTGCCCAGGCTGT;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=21;TCR=13;TR=34;WE=30071318;WS=30071300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr13	30075114	rs882953	C	T	4991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=52;PP=2965;SC=TAAAGCATTGCGAACTGATGT;SOR=1.623;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=160;TCF=108;TCR=52;TR=160;WE=30075122;WS=30075104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr13	30077088	rs2482096	C	T	4511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=47;PP=2965;SC=GTTCAGTGTCCACTAGCATGA;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=150;TCF=103;TCR=47;TR=149;WE=30077096;WS=30077078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr13	30090404	rs2989592	T	C	4746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=91;PP=2965;SC=AGGAGGTGGCTTCAATCCATG;SOR=1.199;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=155;TCF=64;TCR=91;TR=155;WE=30090412;WS=30090394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr13	30091516	rs2490267	T	C	5973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=121;PP=2965;SC=GCATCCACTGTTCTCCCCTAA;SOR=1.279;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=201;TCF=80;TCR=121;TR=201;WE=30091524;WS=30091506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr13	30091714	rs2482089	G	A	6428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=140;NR=74;PP=2965;SC=TCTTACCTATGAGGCTGGTTG;SOR=1.365;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=214;TCF=140;TCR=74;TR=214;WE=30091722;WS=30091704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr13	30091819	rs2482090	G	C	9112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=135;NR=160;PP=2965;SC=CTGGTAAAAAGCCCAGCTGGG;SOR=0.927;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=295;TCF=135;TCR=160;TR=295;WE=30091827;WS=30091809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,340:1.00:340
chr13	30098215	rs2776957	C	T	784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=4;PP=527;SC=CAAGCATTGGCTTGTTTGCCC;SOR=3.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=26;WE=30098234;WS=30098205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr13	30098226	rs2776958	A	G	1073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=10;PP=740;SC=TTGTTTGCCCAGGGTGCAGGA;SOR=2.247;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=30;TCR=10;TR=40;WE=30098234;WS=30098205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr13	30346392	rs140223719	CTATAT	C	2350.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.890;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.529;NF=0;NR=37;PP=1836;ReadPosRankSum=0.357;SC=TAAGGTACTACTATATTGTTT;SOR=0.521;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=66;TCF=5;TCR=61;TR=37;WE=30346404;WS=30346382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,61:0.64:95
chr13	30351248	rs35681461	T	TA	6206.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=72;PP=2936;ReadPosRankSum=-0.093;SC=AGGTAGGGCATAAGAATCAAC;SOR=1.301;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=143;TCF=62;TCR=81;TR=130;WE=30351257;WS=30351238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,222:0.99:224
chr13	30804797	rs73163470	A	G	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=7.877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.16;ReadPosRankSum=-1.283;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr13	30805627	rs202087	A	G	3776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=58;NR=64;PP=2103;SC=TTCAAAAGACAAATTAAATGA;SOR=0.991;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=122;TCF=58;TCR=64;TR=122;WE=30805635;WS=30805617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr13	31035853	rs202182303	GATC	G	2080.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.591;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.946;NF=3;NR=26;PP=1104;ReadPosRankSum=0.698;SC=AAAAATACAAGATCATTATAA;SOR=0.746;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=96;TCF=16;TCR=80;TR=29;WE=31035863;WS=31035843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,59:0.35:169
chr13	31036642	rs3742305	C	G	2614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=379;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.810;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=70;PP=1795;ReadPosRankSum=-0.025;SC=GCGTACTTGTCATCATTTTAC;SOR=0.743;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=342;TCF=156;TCR=186;TR=128;WE=31036650;WS=31036632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:242,136:0.36:378
chr13	31036681	rs1929606	A	G	7171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=141;PP=2965;SC=TTACCTTTTCATATTTTTCCT;SOR=1.161;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=240;TCF=99;TCR=141;TR=240;WE=31036689;WS=31036671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
chr13	31037903	rs2249825	G	C	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.479;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=96;ReadPosRankSum=1.775;SC=TACTTAGTAAGGGAATGAAAA;SOR=2.080;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=9;WE=31037911;WS=31037893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,10:0.29:34
chr13	31231513	rs7983138	C	T	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=2.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.86;ReadPosRankSum=0.675;SOR=1.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,22:0.24:92
chr13	31231806	rs7984952	T	C	3143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=479;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=67;PP=2081;ReadPosRankSum=-0.342;SC=CCAGTATCTTTAACATCGTGT;SOR=0.694;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=431;TCF=242;TCR=189;TR=150;WE=31231814;WS=31231796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:314,165:0.34:479
chr13	31233063	rs3742302	G	A	3291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=505;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.825;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=77;PP=1809;ReadPosRankSum=-0.173;SC=GATATTGCCAGTGAGTCTGCA;SOR=0.673;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=471;TCF=232;TCR=239;TR=160;WE=31233071;WS=31233053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:326,179:0.35:505
chr13	31287979	rs147763360	G	GTA	6048.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.759;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=1.165;NF=8;NR=118;PP=2990;ReadPosRankSum=-1.944;SC=ATCAGTGCTGGTGTGTGTGTG;SOR=0.407;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=133;TCF=8;TCR=125;TR=126;WE=31287987;WS=31287969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:6,173:0.97:179
chr13	31318020	rs4360791	G	A	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=157;ReadPosRankSum=0.627;SC=ACCAAACACAGTGTTCAGTAG;SOR=0.385;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=43;TCR=1;TR=11;WE=31318028;WS=31318010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,11:0.24:46
chr13	31318068	rs17238738	T	G	3101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.267;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=36;PP=2003;ReadPosRankSum=-0.805;SC=AAATGACAGTTGATGGAGGAC;SOR=0.521;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=161;TCF=112;TCR=49;TR=112;WE=31318076;WS=31318058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,124:0.70:176
chr13	31318308	rs3803277	C	A	540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=5.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.16;ReadPosRankSum=-1.099;SOR=1.264;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,35:0.27:130
chr13	31318401	rs3803278	T	C	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.92;ReadPosRankSum=-1.188;SOR=0.188;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr13	31480827	rs9531945	A	G	4424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=75;PP=2749;SC=CGTGGTGGCCAGGCCCGGGGA;SOR=0.705;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=161;TCF=86;TCR=75;TR=161;WE=31480835;WS=31480817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr13	31495040	rs150471836	A	G	2308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=20;PP=1554;ReadPosRankSum=-0.491;SC=GAAGGTTATAAATGAATAAAA;SOR=0.632;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=103;TCR=33;TR=83;WE=31495048;WS=31495030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,94:0.63:150
chr13	31495179	rs11841583	G	A	9537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=673;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.471;NF=198;NR=196;PP=2962;ReadPosRankSum=2.739;SC=TTGTAAACACGAGGCACCCCA;SOR=0.661;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=613;TCF=302;TCR=311;TR=394;WE=31495192;WS=31495169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:244,427:0.64:671
chr13	31495733	rs6563571	C	T	1170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.131;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=13;PP=737;ReadPosRankSum=0.818;SC=ATTTCTTCCCCCCAGGAAATG;SOR=1.500;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=91;TCF=61;TCR=30;TR=46;WE=31495741;WS=31495723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,52:0.51:102
chr13	31498447	rs368825437	G	C	4147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.558;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=118;NR=55;PP=2656;ReadPosRankSum=-1.359;SC=CTGTTTTTTAGGTTCAATAGA;SOR=0.633;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=236;TCF=163;TCR=73;TR=173;WE=31498455;WS=31498437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,181:0.73:249
chr13	31513900	rs139118056	T	C	7302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=491;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.189;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=139;NR=168;PP=2962;ReadPosRankSum=0.827;SC=ACAGGAGCAGTGCCTGCCTTA;SOR=0.587;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=449;TCF=198;TCR=251;TR=307;WE=31513908;WS=31513890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,333:0.68:489
chr13	31531195	rs6560988	T	C	5385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.569;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=103;PP=2956;ReadPosRankSum=-0.720;SC=CTTTTTTTCCTGGGTCATGTG;SOR=0.643;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=187;TCF=84;TCR=103;TR=186;WE=31531203;WS=31531185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,206:1.00:207
chr13	31543095	rs2274869	C	T	5402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=408;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=107;NR=121;PP=2962;ReadPosRankSum=0.445;SC=AAAGTGACTACGACAAAACCT;SOR=0.690;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=364;TCF=172;TCR=192;TR=228;WE=31543103;WS=31543085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,250:0.61:408
chr13	31715455	rs3761866	A	C	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.171;HP=7;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=23;PP=481;ReadPosRankSum=0.545;SC=GAAAAACACAAAAAAAATGTC;SOR=0.943;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=17;TCR=66;TR=29;WE=31715463;WS=31715445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,27:0.33:83
chr13	31722620	.	TAA	T,TA	950.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.232;ClippingRankSum=0.000;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.67;ReadPosRankSum=-1.303;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:3,25,18:0.54,0.39:46
chr13	31725260	rs11556147	A	G	2274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.687;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=53;PP=1474;ReadPosRankSum=-1.637;SC=ATTCTGCACAAAAATGTTCCA;SOR=0.627;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=129;TCF=50;TCR=79;TR=88;WE=31725268;WS=31725250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,96:0.68:141
chr13	31725374	rs3736861	T	C	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.458;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=78;ReadPosRankSum=-0.599;SC=TTCAATCACATTTGTAACTAG;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=5;WE=31725382;WS=31725364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr13	31725617	rs2146895	C	T	417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=12;NR=0;PP=321;SC=CAACCGTTTCCTGTTAACATC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=31725625;WS=31725607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr13	31725732	rs4941772	A	C	3407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.519;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=49;PP=1917;ReadPosRankSum=0.944;SC=CTGAGTTCCAATGTATGACTT;SOR=0.647;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=204;TCF=127;TCR=77;TR=132;WE=31725740;WS=31725722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,154:0.67:231
chr13	31728657	rs4943165	T	C	889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.70;ReadPosRankSum=1.127;SOR=1.094;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,31:0.76:41
chr13	31728666	rs2274018	G	A	2034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.70;SOR=6.439;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr13	31728703	rs2274019	T	C	685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.904;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=9;PP=518;ReadPosRankSum=0.544;SC=CCACATTTCATACTTAAAAGT;SOR=0.501;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=112;TCF=86;TCR=26;TR=35;WE=31728711;WS=31728693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,36:0.30:119
chr13	31729729	rs1047086	A	G	3403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.488;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=75;PP=2031;ReadPosRankSum=-1.257;SC=TGAAGGGGTCATTGAATGCTC;SOR=0.637;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=231;TCF=113;TCR=118;TR=148;WE=31729737;WS=31729719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,158:0.64:245
chr13	31729889	rs3818350	A	C	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.362;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=23;ReadPosRankSum=0.191;SC=ACTCAAACCAATCCTATGAGT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=3;WE=31729897;WS=31729879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr13	31789169	rs35344913	CT	C	716.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.21;MQRankSum=0.000;QD=17.07;ReadPosRankSum=0.265;SOR=1.075;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,38:0.90:42
chr13	31796969	rs2147515	G	C	6243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=120;NR=78;PP=2965;SC=TCCAAGCTCCGTTTTTCAAAT;SOR=1.130;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=198;TCF=120;TCR=78;TR=198;WE=31796977;WS=31796959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr13	31821240	rs9564692	C	T	1651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=43;PP=996;ReadPosRankSum=-0.178;SC=TACCGCAGTACGTTTGTTTAA;SOR=0.671;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=252;TCF=127;TCR=125;TR=87;WE=31821248;WS=31821230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:184,97:0.35:281
chr13	31821256	rs9542307	C	G	3188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.499;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=72;PP=1775;ReadPosRankSum=0.851;SC=TTTAACTCACCTGTGAATTAC;SOR=0.752;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=206;TCF=93;TCR=113;TR=131;WE=31821264;WS=31821246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,150:0.64:235
chr13	31821992	rs4943266	T	C	1700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=13;PP=1105;SC=TTTTGGTCAGTTTTTCTGTAA;SOR=2.041;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=56;TCF=42;TCR=14;TR=55;WE=31822000;WS=31821982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr13	31835268	rs34409451	AC	A	2035.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.971;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.185;NF=1;NR=38;PP=1493;ReadPosRankSum=-0.168;SC=GTGTGCATCAACTTTAATTTC;SOR=1.121;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=64;TCF=2;TCR=62;TR=39;WE=31835276;WS=31835258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,59:0.60:99
chr13	31835375	rs4943289	G	A	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=33;ReadPosRankSum=-0.566;SC=AGATGCTTGAGGGTTTCTGCT;SOR=0.330;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=4;WE=31835383;WS=31835365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr13	31843598	rs1924817	A	G	1616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=42;PP=1245;SC=AGTTATGTAGATGAAGACAGA;SOR=3.300;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=51;TCF=8;TCR=43;TR=50;WE=31843606;WS=31843588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr13	31848535	rs912600	G	A	1801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=9;PP=1245;SC=ATATGGTTCAGCCTACTCTCT;SOR=3.037;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=43;TCR=9;TR=52;WE=31848543;WS=31848525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr13	31850714	rs1028751	G	C	2099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=43;NR=25;PP=1123;SC=AAAACTTTATGCCGGAAATAT;SOR=1.031;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=43;TCR=25;TR=68;WE=31850722;WS=31850704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr13	31850989	rs4065552	G	A	1095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=28;PP=738;SC=ATTCTTGAGTGTAAATTCAGA;SOR=2.362;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=36;WE=31850997;WS=31850979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr13	31891561	rs1041074	T	C	1414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=3;PP=983;SC=TTTATTTATTTTATAAGTCAC;SOR=4.664;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=37;WE=31891569;WS=31891551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr13	31891746	rs1041073	G	A	6936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=125;PP=2965;SC=TGACTCCGGCGAGCCTGTGTT;SOR=0.950;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=231;TCF=106;TCR=125;TR=231;WE=31891754;WS=31891736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr13	31903834	rs1060709	G	T	721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=18;PP=585;SC=CCTAGCCTGCGCAGGGAATGA;SOR=2.400;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=23;WE=31903842;WS=31903824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
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chr13	32332556	rs61946567	C	T	1890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.134;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=50;PP=1260;ReadPosRankSum=-1.186;SC=GTGCTCCCCTCGGCTCCCCAT;SOR=0.290;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=89;TCF=21;TCR=68;TR=68;WE=32332564;WS=32332546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,76:0.78:98
chr13	32335840	rs9532478	A	T	5699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=350;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.428;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=133;NR=88;PP=2962;ReadPosRankSum=0.572;SC=TAAGTGACACATCTCAATCAC;SOR=0.735;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=324;TCF=195;TCR=129;TR=221;WE=32335848;WS=32335830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,241:0.69:349
chr13	32335880	rs9532479	G	A	2418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=482;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.915;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=62;PP=1641;ReadPosRankSum=-0.533;SC=GTGGATGGGCGACCATATTTG;SOR=0.869;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=443;TCF=231;TCR=212;TR=135;WE=32335888;WS=32335870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:333,144:0.30:477
chr13	32339382	rs12870532	C	T	848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.122;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=22;PP=524;ReadPosRankSum=-0.671;SC=TAATAGAAACCCTGTTTAAAA;SOR=0.487;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=54;TCF=18;TCR=36;TR=34;WE=32339390;WS=32339372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,36:0.62:58
chr13	32340193	rs35564049	T	TA	4113.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.165;NF=12;NR=57;PP=1257;ReadPosRankSum=-0.293;SC=CATATTTATTTAAAAAAAATC;SOR=0.304;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=79;TCF=13;TCR=66;TR=69;WE=32340201;WS=32340183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,147:0.99:148
chr13	32348859	rs9549049	T	C	4754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=81;PP=2965;SC=ATTGTAGGTATAATTTTAAGC;SOR=0.728;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=165;TCF=84;TCR=81;TR=165;WE=32348867;WS=32348849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr13	32348987	rs17076647	C	T	777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.904;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=468;ReadPosRankSum=-2.134;SC=AATTATTAAACGATTCCTACC;SOR=0.069;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=29;WE=32348995;WS=32348977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,32:0.80:40
chr13	32360547	rs7325513	A	G	12648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=475;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=228;NR=222;PP=2965;SC=CGATAACGGAACTATCACCTC;SOR=0.719;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=451;TCF=229;TCR=222;TR=450;WE=32360555;WS=32360537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,474:1.00:474
chr13	32360583	rs9549106	A	G	6202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=415;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.551;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=125;NR=135;PP=2962;ReadPosRankSum=0.340;SC=TGAAGCTTCTACAAAAGCTGT;SOR=0.643;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=395;TCF=187;TCR=208;TR=260;WE=32360591;WS=32360573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,271:0.65:415
chr13	32360691	rs71941366	T	TA	2004.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=4.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=0.000;QD=19.09;ReadPosRankSum=-0.287;SOR=1.416;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,90:0.86:105
chr13	32371361	rs17076657	A	G	4396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.411;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=106;NR=80;PP=2479;ReadPosRankSum=0.881;SC=GGCTTTTCTCATCATTGTGTT;SOR=0.659;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=299;TCF=168;TCR=131;TR=186;WE=32371369;WS=32371343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,207:0.63:331
chr13	32606069	rs424118	A	G	842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQ=60.34;MQRankSum=0.650;NF=8;NR=14;PP=344;ReadPosRankSum=0.436;SC=TGGAGACAGAAAATCTCAACT;SOR=0.950;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=30;TCF=11;TCR=19;TR=22;WE=32606077;WS=32606059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,24:0.75:32
chr13	32606087	rs433551	T	C	713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.45;MQRankSum=0.616;NF=5;NR=11;PP=289;ReadPosRankSum=-1.352;SC=ACTGGACACATATGTTTGTGA;SOR=1.179;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=21;TCF=7;TCR=14;TR=16;WE=32606095;WS=32606077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,19:0.79:24
chr13	32606131	rs200662366	C	CT	195.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.90;MQRankSum=0.431;QD=21.75;ReadPosRankSum=-0.241;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr13	32606136	rs11272632	C	CTT	195.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.19;MQRankSum=0.431;QD=21.75;ReadPosRankSum=-0.241;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr13	32660137	rs423932	T	G	6651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=463;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=133;NR=139;PP=2962;ReadPosRankSum=0.586;SC=AATACTTGAGTCCTACCCAGG;SOR=0.662;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=416;TCF=203;TCR=213;TR=272;WE=32660145;WS=32660127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,302:0.65:463
chr13	32676114	rs364995	A	G	5399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=402;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.548;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=139;NR=108;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.764;SC=AGCCATTGACAAAATCTCTGC;SOR=0.629;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=386;TCF=220;TCR=166;TR=247;WE=32676122;WS=32676104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,256:0.64:402
chr13	32698544	rs629265	T	C	1071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.214;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=26;PP=667;ReadPosRankSum=0.731;SC=TACTTTTAGATAATATTTATT;SOR=0.290;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=67;TCF=22;TCR=45;TR=42;WE=32698552;WS=32698534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,46:0.63:73
chr13	32705785	rs17591851	A	G	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=57;ReadPosRankSum=0.898;SC=AATATTTGATAAACCACTTAT;SOR=1.071;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=5;WE=32705793;WS=32705775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr13	32708993	rs9590780	T	C	885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FS=0.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.04;ReadPosRankSum=-1.906;SOR=0.779;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:163,56:0.26:219
chr13	32721615	rs2285330	C	G	696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=21;PP=405;ReadPosRankSum=0.717;SC=CAACTAGAAGCTATTCAAAGC;SOR=0.810;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=55;TCF=9;TCR=46;TR=25;WE=32721623;WS=32721605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,30:0.48:63
chr13	32723799	rs204558	C	T	955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=1;PP=692;SC=ACCACCTGTTCGCTTGGTGCA;SOR=6.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=32723807;WS=32723789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr13	32731667	rs11409421	T	TA	278.94	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=231;ReadPosRankSum=-1.472;SC=TAAAGATAGTTAAAAAAAAAC;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=12;WE=32731675;WS=32731657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr13	32758834	rs798971	A	G	1641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.245;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=42;PP=1103;ReadPosRankSum=0.007;SC=GACAGGTAGGATCAGAATTCT;SOR=0.492;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=281;TCF=127;TCR=154;TR=84;WE=32758853;WS=32758824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:211,89:0.30:300
chr13	32798235	rs5802638	T	TA	964.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=4;PP=420;ReadPosRankSum=-1.266;SC=ACCCTGTCCCTAAAAAAAATT;SOR=2.093;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=45;TCF=37;TCR=8;TR=26;WE=32798243;WS=32798225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,36:0.97:37
chr13	32798953	rs9595159	G	A	553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=0;PP=436;SC=CCCCGAATAAGAGCCTTATAT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=32798961;WS=32798943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr13	32813497	rs117297533	C	T	1552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FS=2.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.88;ReadPosRankSum=0.789;SOR=0.820;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:223,95:0.30:318
chr13	32813818	rs45467296	T	C	2568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=9;PP=1986;SC=TGGGCTATTTTATTCCTAATT;SOR=3.401;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=68;TCR=9;TR=76;WE=32813838;WS=32813808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr13	32823882	rs2806630	G	A	2711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=65;PP=1813;SC=TTGAGTCCATGTGGCTGGGTC;SOR=2.030;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=27;TCR=65;TR=92;WE=32823890;WS=32823872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr13	32825913	rs2806632	A	G	5652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=127;NR=56;PP=2965;SC=CATTCTGTCTATACGTTAAGT;SOR=1.884;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=184;TCF=128;TCR=56;TR=183;WE=32825921;WS=32825903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr13	32825941	rs2806633	C	A	8326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=175;NR=110;PP=2965;SC=CCCTGTATGGCTAGTGGCTAG;SOR=1.271;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=286;TCF=176;TCR=110;TR=285;WE=32825949;WS=32825931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,305:1.00:305
chr13	32828553	rs2157961	A	G	2959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=62;PP=1924;SC=TCTCTGTAAAAATAATCCCCG;SOR=1.774;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=30;TCR=62;TR=92;WE=32828561;WS=32828543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr13	32832149	rs2520686	T	C	5183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=81;PP=2574;SC=TGCTAGTAGATGTTTTGCATC;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=176;TCF=95;TCR=81;TR=176;WE=32832157;WS=32832139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr13	32832350	rs2806636	A	G	86.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=3;PP=49;SC=AAGTTGCATGATTATATCTCA;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=32832358;WS=32832340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr13	32834538	rs5802640	C	CTATCT	4194.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=53;PP=2459;SC=TCCTTTATTCCTAACAGAAAG;SOR=1.585;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=65;TCF=4;TCR=61;TR=57;WE=32834546;WS=32834527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr13	32848907	rs147812266	TC	T	1136.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.162;HP=9;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=4;PP=900;ReadPosRankSum=-0.306;SC=AAGCTACCCCTCCCCCAAAAT;SOR=1.500;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=48;TCF=37;TCR=11;TR=29;WE=32848915;WS=32848897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,42:0.67:63
chr13	32849345	rs183269	A	C	179.41	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.674;NF=0;NR=9;PP=200;ReadPosRankSum=-1.150;SC=GAAACCCCGTATCTATTAAAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=9;WE=32849368;WS=32849335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr13	32862118	rs45560736	C	T	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.022;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=286;ReadPosRankSum=0.338;SC=AGCATGTTCTCCCTTTCTCAT;SOR=0.846;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=80;TCF=25;TCR=55;TR=23;WE=32862126;WS=32862108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,24:0.30:79
chr13	32882912	rs34528008	G	GT	2821.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.137;HP=10;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.146;NF=23;NR=29;PP=808;ReadPosRankSum=-1.669;SC=AGAGAAATATGTTTTTTTTTA;SOR=1.068;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=124;TCF=47;TCR=77;TR=52;WE=32882920;WS=32882902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,124:0.61:204
chr13	32883052	rs206103	G	A	1497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.964;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=43;PP=1071;ReadPosRankSum=-1.213;SC=TCTACCCTTGGGGTTTCAAGG;SOR=0.556;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=87;TCF=22;TCR=65;TR=58;WE=32883060;WS=32883042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,59:0.66:89
chr13	32884653	rs206110	G	T	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.270;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=290;ReadPosRankSum=2.290;SC=CACCTGGCACGGGGGATGCCA;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=14;WE=32884661;WS=32884643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr13	32884771	rs206111	T	C	3824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.020;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=65;PP=2435;ReadPosRankSum=1.325;SC=ACTCTTTTTATTTACCTTGTT;SOR=0.528;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=237;TCF=142;TCR=95;TR=159;WE=32884779;WS=32884761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,170:0.68:251
chr13	32885654	rs445909	T	C	5012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FS=0.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.39;ReadPosRankSum=1.089;SOR=0.775;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,125:0.68:183
chr13	32885658	rs371193	G	A	5108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.61;ReadPosRankSum=0.738;SOR=0.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,128:0.69:185
chr13	32905219	.	AT	A	79.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=-0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.64;ReadPosRankSum=0.483;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr13	32905265	rs206073	G	A	76.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=62;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=0;NR=6;PP=105;SC=CCGTGATCTCGGTTTACCGCA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=32905273;WS=32905255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr13	32906729	rs144848	A	C	2820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=468;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.556;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=67;PP=1984;ReadPosRankSum=0.162;SC=AAATGTAGCAAATCAGAAGCC;SOR=0.640;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=422;TCF=226;TCR=196;TR=139;WE=32906737;WS=32906719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:313,152:0.33:465
chr13	32912299	rs543304	T	C	1727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=40;PP=1123;ReadPosRankSum=-1.114;SC=ATGATTCTGTTGTTTCAATGT;SOR=0.659;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=125;TCF=62;TCR=63;TR=78;WE=32912307;WS=32912289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,79:0.60:132
chr13	32913055	rs206075	A	G	10016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=362;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=169;NR=161;PP=2965;SC=AACCTACTCTATTGGGTTTTC;SOR=0.756;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=330;TCF=169;TCR=161;TR=330;WE=32913063;WS=32913045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,361:1.00:361
chr13	32915005	rs206076	G	C	4878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=73;PP=2965;SC=GAACCAAAGTGTCACTTGTTG;SOR=0.716;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=155;TCF=82;TCR=73;TR=155;WE=32915013;WS=32914995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr13	32920844	rs206080	T	C	322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=9;NR=0;PP=245;SC=ATTGAGCATCTGTTACATTCA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=32920852;WS=32920834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr13	32929387	rs169547	T	C	5691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=100;PP=2965;SC=AATCAAGCAGTAGCTGTAACT;SOR=1.106;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=176;TCF=76;TCR=100;TR=176;WE=32929395;WS=32929377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr13	33052294	rs380627	C	T	1256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=36;PP=1027;SC=TCAATCTCAACGAAGAACTTG;SOR=4.021;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=4;TCR=36;TR=40;WE=33052302;WS=33052284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr13	33095620	rs621450	G	A	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.721;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=21;PP=414;ReadPosRankSum=1.285;SC=CAAAAACCCAGAGAAGTACTT;SOR=0.789;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=109;TCF=48;TCR=61;TR=36;WE=33095628;WS=33095610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,40:0.33:120
chr13	33101731	rs391612	T	C	1716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=45;PP=1367;SC=AGAAATAAACTATCAGAAATA;SOR=3.570;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=7;TCR=45;TR=52;WE=33101739;WS=33101721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr13	33222831	rs2301389	G	A	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.680;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=219;ReadPosRankSum=-0.851;SC=TACCATTTATGTTTGTTAAGA;SOR=0.257;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=15;WE=33222839;WS=33222821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
chr13	33232334	rs7335546	G	A	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.999;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=158;ReadPosRankSum=-2.623;SC=TTTTCATTTAGCGTTCATAAT;SOR=1.473;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=12;WE=33232342;WS=33232324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr13	33232435	rs2301393	A	G	1096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=16;PP=550;ReadPosRankSum=0.945;SC=AGAGCCCACAATTCAATAGGT;SOR=0.654;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=73;TCF=46;TCR=27;TR=44;WE=33232443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,51:0.62:82
chr13	33253136	rs11355777	GA	G	636.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=24;PP=444;ReadPosRankSum=-0.350;SC=TTCATAGGGGGAAAAAAAACC;SOR=0.655;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=24;WE=33253144;WS=33253126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,29:0.67:43
chr13	33268573	rs561056	T	C	145.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=85;SC=GGATTCCTTGTTTAGAAAACT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=33268581;WS=33268563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr13	33275733	rs34184885	G	GCA	51.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.39;ReadPosRankSum=-0.652;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr13	33309563	rs17516382	C	G	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=58;ReadPosRankSum=-1.068;SC=ATAATACTTCCATTTGACTGC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=33309571;WS=33309553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr13	33315206	rs733487	G	A	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=1.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQRankSum=0.000;QD=11.79;ReadPosRankSum=0.054;SOR=0.898;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,21:0.62:34
chr13	33320054	rs4942867	A	G	1406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.590;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=9;PP=1048;ReadPosRankSum=1.803;SC=AATTAGATGTACAGAAGATTT;SOR=0.354;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=84;TCF=71;TCR=13;TR=50;WE=33320062;WS=33320044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,52:0.61:85
chr13	33332648	rs3752474	G	T	1831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.384;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=15;PP=1264;ReadPosRankSum=0.413;SC=AAGTATCTGTGTTTTTAAAAA;SOR=0.377;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=89;TCF=72;TCR=17;TR=67;WE=33332656;WS=33332638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,72:0.73:98
chr13	33333876	rs7988089	A	C	1277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.812;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=40;PP=777;ReadPosRankSum=-0.214;SC=CTTATTTTAGAGTGATTATTG;SOR=0.864;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=95;TCF=29;TCR=66;TR=57;WE=33333884;WS=33333866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,61:0.58:106
chr13	33344241	rs112309957	AT	A	1549.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.560;HP=10;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.17;MQRankSum=1.159;NF=24;NR=22;PP=605;ReadPosRankSum=-0.925;SC=ATAAATTGTGATTTTTTTTTT;SOR=0.926;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=89;TCF=43;TCR=46;TR=46;WE=33344249;WS=33344231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,75:0.60:124
chr13	33349341	rs3492	A	G	521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=15;PP=330;ReadPosRankSum=-1.448;SC=GACCCCATACATTTGTGGTCA;SOR=0.660;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=45;TCF=21;TCR=24;TR=28;WE=33349349;WS=33349331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,28:0.56:50
chr13	33590851	rs2772364	T	C	12197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=440;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=212;PP=2965;ReadPosRankSum=1.181;SC=CCATCTGGGATACGTTCACCC;SOR=0.227;Source=Platypus;TCF=213;WE=33590859;WS=33590841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,438:1.00:439
chr13	33627760	rs7323281	A	G	680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=0;PP=499;ReadPosRankSum=0.705;SC=GAAATAATGTATTGGTTCTAG;SOR=0.843;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=21;WE=33627768;WS=33627750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,23:0.72:32
chr13	33627829	rs570875	T	G	4098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=46;PP=2691;SC=TATAATCTGATTTGGGGATTC;SOR=1.497;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=135;TCF=89;TCR=46;TR=135;WE=33627837;WS=33627819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr13	33635463	rs648202	T	C	3571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.304;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=61;PP=2327;ReadPosRankSum=1.249;SC=AAGAGGTGGCTGAGAGAGTTT;SOR=0.937;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=224;TCF=126;TCR=98;TR=145;WE=33635471;WS=33635453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,155:0.63:245
chr13	33635835	rs649964	T	C	6654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=134;PP=2965;SC=TAATATCCAATGGAATCGATG;SOR=1.111;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=233;TCF=99;TCR=134;TR=233;WE=33635843;WS=33635825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr13	33635939	rs650439	T	A	2400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.326;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=48;PP=1413;ReadPosRankSum=-0.012;SC=TAGCTGCGGCTATCTCCTGAA;SOR=0.569;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=145;TCF=72;TCR=73;TR=97;WE=33635947;WS=33635929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,109:0.68:161
chr13	33686065	rs17518136	C	T	2200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=481;ExcessHet=3.0103;FS=1.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.58;ReadPosRankSum=0.354;SOR=0.860;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:342,139:0.29:481
chr13	33701347	rs2764617	C	T	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.188;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=248;ReadPosRankSum=-0.380;SC=GTAGGGTCCACTGCATCGAGG;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=13;WE=33701355;WS=33701337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr13	33703656	rs495680	T	C	3765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=604;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=93;PP=2382;ReadPosRankSum=2.635;SC=GGGAGTGAAATTCATGCATAC;SOR=0.647;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=548;TCF=286;TCR=262;TR=190;WE=33703664;WS=33703646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:393,210:0.35:603
chr13	33713038	rs2858805	C	G	1362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.900;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=38;PP=943;ReadPosRankSum=1.421;SC=GGGAGGGTAGCGGTGTTGTCA;SOR=0.613;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=257;TCF=142;TCR=115;TR=76;WE=33713046;WS=33713028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:203,82:0.29:285
chr13	33739629	rs797232	G	A	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=197;ReadPosRankSum=0.857;SC=AGACCTTCAAGGTCTGTAAAA;SOR=0.610;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=13;WE=33739637;WS=33739619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,13:0.37:35
chr13	33741559	rs797229	C	T	654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.761;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=13;PP=448;ReadPosRankSum=1.185;SC=GCAAAAAGGCCGAGGGAAAAA;SOR=0.551;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=133;TCF=92;TCR=41;TR=37;WE=33741567;WS=33741549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,39:0.28:141
chr13	33923314	rs9597272	T	C	833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.38;ReadPosRankSum=-0.164;SOR=0.705;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:183,64:0.26:247
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chr13	35618991	rs7996448	A	G	896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=2;PP=727;SC=AGAGAGAGATAACAATGATAA;SOR=4.174;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=27;WE=35618999;WS=35618981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr13	35619588	rs73491592	C	A	1843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.845;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=54;PP=1285;ReadPosRankSum=0.142;SC=TTTTAGGTCACCTTTAGTAAG;SOR=1.389;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=106;TCF=34;TCR=72;TR=76;WE=35619596;WS=35619578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,78:0.71:110
chr13	35633030	rs17775456	A	T	884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=3.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=26;PP=592;ReadPosRankSum=-1.238;SC=TATAAATTCTATGGAGAGTTT;SOR=0.946;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=42;TCF=2;TCR=40;TR=28;WE=35633038;WS=35633020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,33:0.66:50
chr13	35672679	rs139015501	AGATTT	A	878.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.901;NF=0;NR=17;PP=796;ReadPosRankSum=-0.339;SC=CAAACGTCTTAGATTTAAGTG;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=17;WE=35672691;WS=35672669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,23:0.74:31
chr13	35730381	rs117397794	T	C	705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=16;PP=420;ReadPosRankSum=-1.148;SC=CTTTATTCCATAATTAATATT;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=31;TCF=10;TCR=21;TR=24;WE=35730389;WS=35730371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,28:0.78:36
chr13	35735976	rs17051895	A	G	4141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.638;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=77;PP=2591;ReadPosRankSum=-0.205;SC=AGGAACAGCGACGCCAGTTTA;SOR=0.575;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=236;TCF=130;TCR=106;TR=166;WE=35735984;WS=35735966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,185:0.70:263
chr13	35738430	rs9543506	A	G	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.578;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=97;ReadPosRankSum=-0.544;SC=TTGTTATTCTAATTGTCTAAG;SOR=1.460;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=7;WE=35738438;WS=35738420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,7:0.22:32
chr13	35745239	rs2120822	G	A	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.55;ReadPosRankSum=0.997;SOR=0.748;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,34:0.25:135
chr13	35758287	rs17051909	C	A	1821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.818;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=53;PP=1190;ReadPosRankSum=0.384;SC=TCATGATATACTTGTTTATAA;SOR=0.484;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=113;TCF=27;TCR=86;TR=71;WE=35758295;WS=35758277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,77:0.64:120
chr13	35783077	rs138674996	T	A	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=339;ReadPosRankSum=0.902;SC=AAAATTAAAATACCCTAATCA;SOR=0.749;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=17;WE=35783085;WS=35783067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,20:0.80:25
chr13	35806549	rs9565113	T	G	852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.46;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr13	35806862	rs114146564	G	T	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=124;ReadPosRankSum=-1.383;SC=GAATGTAAAGGCATTACTTCA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=7;WE=35806870;WS=35806852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr13	35864688	rs41292203	A	T	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=199;ReadPosRankSum=-1.297;SC=ATATATTTTTAAAATTTCCAT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=11;WE=35864696;WS=35864678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr13	35926497	rs9565205	A	G	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.336;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=72;ReadPosRankSum=1.180;SC=AATAATTCATAGGTTAATTAT;SOR=0.202;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=8;WE=35926505;WS=35926487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,10:0.33:30
chr13	36141009	rs9544667	G	A	5624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.79;SOR=1.378;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr13	36141009	.	GTA	ATA,ATG	1373	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=85,55;NR=42,27;PP=557,1373;QD=4.65961584683;SC=CATTTTGTGTGTACAAATTTT;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=131;TCF=87;TCR=44;TR=127,82;WE=36141019;WS=36140999;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.97:131
chr13	36141011	rs35877639	A	G	2263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.09;ReadPosRankSum=1.076;SOR=0.728;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,97:0.65:150
chr13	36202176	rs74332217	T	C	2821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.489;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=27;PP=2186;ReadPosRankSum=-0.178;SC=GAAGGTGTACTAAGTTTTGAT;SOR=0.868;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=161;TCF=121;TCR=40;TR=111;WE=36202184;WS=36202166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,117:0.70:168
chr13	36220281	rs3818423	A	C	1091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=12;PP=1445;ReadPosRankSum=0.473;SC=CACCCGTTGAATTTTCTGGAC;SOR=0.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=47;TCF=33;TCR=14;TR=40;WE=36220300;WS=36220271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,41:0.85:48
chr13	36220292	rs3818424	T	C	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.722;HP=6;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=7;PP=306;ReadPosRankSum=-2.481;SC=TTTTCTGGACTTTTTTTCATG;SOR=0.109;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=60;TCF=43;TCR=17;TR=16;WE=36220300;WS=36220271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,17:0.27:62
chr13	36224051	rs200267946	TACTGGG	T	839.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=13;PP=648;SC=TAAAAAAGTGTACTGGGACTG;SOR=2.531;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=13;WE=36224064;WS=36224041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr13	36229636	rs2274551	A	T	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.590;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.758;NF=18;NR=0;PP=361;ReadPosRankSum=-1.561;SC=AAAATTTTTTAAAAAATCTGA;SOR=1.927;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=18;WE=36229644;WS=36229626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,21:0.60:35
chr13	36239095	rs41292205	C	T	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.080;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=438;ReadPosRankSum=0.202;SC=GTAACTGGCTCATGGTCACAC;SOR=1.308;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=40;TCF=32;TCR=8;TR=25;WE=36239103;WS=36239085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,28:0.64:44
chr13	36242513	rs41292209	C	A	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.031;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=316;ReadPosRankSum=-1.096;SC=AGGCCATTCTCCTGAGCAGTG;SOR=1.384;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=83;TCF=59;TCR=24;TR=26;WE=36242521;WS=36242503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,25:0.30:84
chr13	36367641	rs1926459	G	C	990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=2.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.39;ReadPosRankSum=-0.288;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,41:0.55:74
chr13	36382312	rs4421866	C	T	3748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.741;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=54;PP=2317;ReadPosRankSum=-0.115;SC=AAAAATAATTCCGTTAAGACA;SOR=1.032;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=257;TCF=156;TCR=101;TR=146;WE=36382320;WS=36382302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,165:0.58:284
chr13	36401838	rs35734430	A	G	6733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=488;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=139;NR=136;PP=2962;ReadPosRankSum=0.710;SC=GAAGAACGATATTGGGATGCT;SOR=0.668;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=440;TCF=225;TCR=215;TR=275;WE=36401846;WS=36401828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,303:0.62:488
chr13	36401909	rs9574699	T	C	3681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.678;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=87;PP=2355;ReadPosRankSum=-0.085;SC=AAGGAAAAGTTATCTTCATCA;SOR=0.584;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=223;TCF=80;TCR=143;TR=137;WE=36401917;WS=36401899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,156:0.64:245
chr13	36402325	rs2296644	T	A	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.492;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=12;PP=325;ReadPosRankSum=0.149;SC=TTGGGAGTGATCTTTGTGTTT;SOR=0.988;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=125;TCF=71;TCR=54;TR=35;WE=36402333;WS=36402315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,38:0.29:133
chr13	36402426	rs2296645	A	G	1470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.837;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=37;PP=878;ReadPosRankSum=-0.238;SC=TTTTCAGAGCATACTCTCTAG;SOR=1.092;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=95;TCF=40;TCR=55;TR=60;WE=36402434;WS=36402416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,66:0.63:104
chr13	36402475	rs2296646	G	A	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.391;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=324;ReadPosRankSum=0.584;SC=TTTTTAAAATGAAACTTAACT;SOR=1.152;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=48;TCF=11;TCR=37;TR=19;WE=36402483;WS=36402465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,19:0.37:52
chr13	36428595	rs1926466	C	T	1787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=18;PP=1064;ReadPosRankSum=-0.044;SC=TGCACCAAGGCTGAGACAGGT;SOR=0.340;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=93;TCF=71;TCR=22;TR=65;WE=36428603;WS=36428585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,76:0.73:104
chr13	36521433	rs1936004	T	G	6814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=145;NR=82;PP=2965;SC=CTTGGCCTGGTGCAGCTCATT;SOR=1.368;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=228;TCF=145;TCR=83;TR=227;WE=36521441;WS=36521423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr13	36521460	rs1936003	A	G	9501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=192;NR=119;PP=2965;SC=AGCTGCCTCAAATTTCCCCTG;SOR=1.182;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=311;TCF=192;TCR=119;TR=311;WE=36521468;WS=36521450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,336:1.00:336
chr13	36700354	rs74044530	A	T	879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=4.033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.39;ReadPosRankSum=0.757;SOR=1.375;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,39:0.55:71
chr13	36745029	rs1328641	C	T	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.508;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=268;ReadPosRankSum=1.204;SC=CCTCACATTACAAATCTGTAC;SOR=2.655;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=65;TCF=7;TCR=58;TR=18;WE=36745037;WS=36745019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,19:0.28:69
chr13	36747798	rs1410633	C	G	1415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=9;PP=977;SC=AGGTCCCCCTCTAAGTGGCAC;SOR=2.352;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=34;TCR=9;TR=43;WE=36747806;WS=36747788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr13	36748957	rs150925868	C	T	5383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=372;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.826;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=109;NR=114;PP=2962;ReadPosRankSum=0.258;SC=CTCCCTTTTACATACGGCAAG;SOR=0.755;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=339;TCF=167;TCR=172;TR=223;WE=36748965;WS=36748947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,245:0.66:372
chr13	36788758	rs3762117	C	T	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=20;PP=456;ReadPosRankSum=1.065;SC=ACTAATGGCTCCTGGCCGCAG;SOR=0.651;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=8;TCR=32;TR=25;WE=36788766;WS=36788748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,27:0.68:40
chr13	36805549	rs2296532	G	A	1915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.569;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=43;PP=1067;ReadPosRankSum=-0.226;SC=ACCTTCACACGGAAACCTTCC;SOR=0.453;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=108;TCF=43;TCR=65;TR=75;WE=36805557;WS=36805539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,86:0.68:126
chr13	36940028	rs1041140	G	A	4156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=99;PP=2738;SC=TACAGAGCCAGTCACCAAATC;SOR=1.973;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=139;TCF=40;TCR=99;TR=139;WE=36940036;WS=36940018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr13	37007040	rs4245378	A	G	264.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=6;PP=205;SC=CCCAATAATTACTGGGAAGAT;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=37007048;WS=37007030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr13	37007491	.	A	G	468	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=27;MQ=59.79;NF=3;NR=17;PP=468;QD=25.1385606274;SC=GGACTACAGGAAAGTTGATTG;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=37007505;WS=37007481;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr13	37007494	.	GTTGA	G	702	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=27;MQ=58.86;NF=0;NR=15;PP=702;QD=48.6;SC=CTACAGGAAAGTTGATTGATT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=15;WE=37007505;WS=37007481;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,15:0.88:17
chr13	37015242	rs17188012	C	G	1197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FS=4.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.64;ReadPosRankSum=0.496;SOR=0.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:188,70:0.27:258
chr13	37399774	rs141085992	A	G	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.957;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=121;ReadPosRankSum=-0.116;SC=ACATCACACTATACATCAAAA;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=7;WE=37399782;WS=37399764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr13	37401917	rs11285105	GT	G	4915.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=95;PP=2975;SC=CATCTACATGGTTTTTTATCT;SOR=1.227;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=116;TCF=13;TCR=103;TR=108;WE=37401925;WS=37401907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr13	37439964	rs3748305	C	A	1030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.243;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=29;PP=669;ReadPosRankSum=0.370;SC=ATGATTCCACCAGGAAACTTA;SOR=0.919;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=135;TCF=57;TCR=78;TR=48;WE=37439972;WS=37439954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,52:0.36:143
chr13	37446711	rs9576126	G	T	1205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.391;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=24;PP=623;ReadPosRankSum=1.872;SC=CAGTTACAATGACTGTCATTG;SOR=0.545;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=130;TCF=79;TCR=51;TR=57;WE=37446719;WS=37446701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,61:0.45:136
chr13	37453293	rs10658358	C	CCTCT	1043.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=49.70;SOR=3.816;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr13	37524255	rs3818380	A	C	1337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=41;PP=958;SC=AAAACGTATCAGTTTAAAGTC;SOR=3.398;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=7;TCR=41;TR=48;WE=37524263;WS=37524245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr13	37526560	rs6563506	G	A	2937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=62;NR=39;PP=1682;SC=GGCTTGATGAGGGGAGCAAGG;SOR=0.976;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=101;TCF=62;TCR=39;TR=101;WE=37526568;WS=37526550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr13	37563791	rs2243710	C	T	445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=361;SC=CTTGCTTTGGCTCAAACACTG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=37563799;WS=37563781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr13	37569200	rs2323165	A	G	3352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=60;NR=53;PP=1769;SC=ATTAAAAATCACTTTTGAAAA;SOR=0.806;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=113;TCF=60;TCR=53;TR=113;WE=37569208;WS=37569190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr13	37581051	rs9576154	T	G	2936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=17;PP=2042;SC=AAGTCTAAGCTAATAGCATGT;SOR=3.111;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=80;TCR=17;TR=97;WE=37581059;WS=37581041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr13	37582122	.	TA	T	47.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.242;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.30;ReadPosRankSum=2.655;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr13	37584838	rs7317750	G	A	3341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQ=59.95;NF=50;NR=58;PP=1995;SC=AAAGTTTGAAGGCTACCAGGG;SOR=0.945;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=50;TCR=58;TR=108;WE=37584846;WS=37584828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr13	37598113	rs4943441	A	G	2834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=14;PP=2118;SC=AAGCTGTCTTAAGAAACACTA;SOR=3.134;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=71;TCR=14;TR=85;WE=37598121;WS=37598103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr13	37600199	rs4941856	A	G	185.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=0;PP=150;SC=TACAACAGAGACCCATAAATA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=37600207;WS=37600189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr13	37618442	rs34587536	CA	C	408.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=17;PP=374;SC=AAGCAAGGATCAAAAAAAATA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=17;WE=37618450;WS=37618432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr13	37621528	rs1199983	A	G	1890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=23;PP=1200;SC=CAGAGCTCTGAGTCAGCTACA;SOR=1.296;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=41;TCR=23;TR=64;WE=37621536;WS=37621518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr13	37625601	rs1543738	T	C	3302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=67;NR=45;PP=1774;SC=AACACAAATTTGAACATACTG;SOR=1.107;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=67;TCR=45;TR=112;WE=37625609;WS=37625591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr13	37625770	rs5802853	A	AG	1387.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=1;NR=31;PP=1365;SC=GGCTATTAAGAGAAAAAAAAA;SOR=2.303;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=32;WE=37625778;WS=37625760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr13	37804353	rs1408229	A	C	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=29;PP=579;ReadPosRankSum=-0.781;SC=ACCACAAGTAACAGAAGTGGC;SOR=0.694;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=171;TCF=75;TCR=96;TR=50;WE=37804361;WS=37804343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,54:0.27:198
chr13	38138730	rs4390468	C	T	4002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=75;PP=2378;SC=AGAAATACTTCGCAATTATGG;SOR=1.110;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=127;TCF=52;TCR=75;TR=127;WE=38138738;WS=38138720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr13	38143325	rs58863577	CT	C	930.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.9996;FS=0.000;HP=13;HapScore=3;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=9;PP=409;ReadPosRankSum=-0.609;SC=TGGATGTTGTCTTTTTTTTTT;SOR=1.508;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=20;TCR=11;TR=26;WE=38143334;WS=38143315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,42:0.98:43
chr13	38152959	rs7322626	T	G	536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=5;PP=367;SC=AAAAAAGAAATAAATCAAGTA;SOR=1.609;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=19;WE=38152967;WS=38152949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr13	38153130	rs7322993	T	C	5795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=86;PP=2965;SC=AGACTTAGCCTATCAATGAGT;SOR=0.722;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=186;TCF=100;TCR=86;TR=186;WE=38153138;WS=38153120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr13	38153351	rs7323378	T	C	4795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=73;PP=2950;SC=CATAAATTCATTCTAGACAAC;SOR=0.788;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=149;TCF=76;TCR=73;TR=149;WE=38153359;WS=38153341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr13	38154189	rs7986347	G	A	2933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=70;PP=2005;SC=TTCACCTACAGTGCATGTAAT;SOR=1.970;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=29;TCR=70;TR=99;WE=38154197;WS=38154179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr13	38166068	rs9547968	C	G	447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=0;PP=397;SC=GAAATATGCTCTTATATTTTA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=38166076;WS=38166058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr13	38166357	rs9603229	T	G	878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=21;PP=605;SC=GATACATTTTTACATAAATTT;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=28;WE=38166365;WS=38166347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr13	38237756	rs147170623	C	T	5992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=412;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.153;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=120;NR=127;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.873;SC=TTGCAGTAAACAGTGAGATCA;SOR=0.773;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=373;TCF=182;TCR=191;TR=247;WE=38237764;WS=38237746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,268:0.66:409
chr13	38237872	rs2985171	A	G	7265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=141;PP=2965;SC=CTGTACTGGAAAAAACAGAGA;SOR=1.050;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=250;TCF=108;TCR=142;TR=249;WE=38237880;WS=38237862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr13	38266000	rs7329237	G	T	704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=1;PP=552;SC=CTTTGGGGGTGAGGTTCTTGG;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=38266008;WS=38265990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr13	38320594	rs35278654	TA	T	570.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=3;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;NF=1;NR=20;PP=383;SC=AGGAGGCACCTAAAAAAAAAA;SOR=3.500;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=21;WE=38320603;WS=38320584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr13	38357471	rs3904512	G	A	1679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.040;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=45;PP=988;ReadPosRankSum=1.725;SC=ACTGAGCCATGTTTCATGCCA;SOR=0.595;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=220;TCF=89;TCR=131;TR=77;WE=38357479;WS=38357461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,89:0.35:252
chr13	38357494	rs12583681	G	A	2546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.720;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=62;PP=1437;ReadPosRankSum=0.102;SC=CTATTTCTTCGTCTCTGAAAG;SOR=1.157;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=159;TCF=61;TCR=98;TR=96;WE=38357502;WS=38357484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,112:0.61:183
chr13	38924083	rs2231330	A	T	10823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=399;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.508;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=209;NR=156;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.007;SC=ACCGACTGCCATAATTCCTGG;SOR=0.593;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=365;TCF=209;TCR=156;TR=365;WE=38924091;WS=38924073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,396:1.00:397
chr13	38924263	rs2231332	T	C	9863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=367;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=150;NR=185;PP=2965;SC=TGATCCGAGCTTTTCCAACAA;SOR=1.013;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=337;TCF=151;TCR=186;TR=335;WE=38924271;WS=38924253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,363:1.00:363
chr13	38930893	rs2481880	C	T	2566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=33;PP=1674;SC=TCAAAAAATACGAGAAACACT;SOR=1.014;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=51;TCR=33;TR=84;WE=38930901;WS=38930883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr13	38931144	rs9548318	T	C	1248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=28;PP=933;SC=CCACATTTCATTGATTTAAAA;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=14;TCR=28;TR=42;WE=38931152;WS=38931134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr13	38931650	rs34489703	G	GTT,GTTT	1396.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=3.547;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.93;ReadPosRankSum=-0.338;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:3,33,14:0.66,0.28:50
chr13	38932194	rs2150470	G	A	95.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.96;ReadPosRankSum=1.383;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr13	38932207	rs67284300	TA	T	77.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.72;ReadPosRankSum=1.930;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr13	38932648	rs2485786	C	T	363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=1;NR=12;PP=291;SC=AAAATTGTTTCTTGTAGGCTT;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=38932656;WS=38932638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr13	38932681	rs2485785	G	T	203.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=3;NR=6;PP=155;SC=ATTTTATTCCGTTTTAGGTAT;SOR=1.179;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=38932689;WS=38932671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr13	39262057	rs1868464	G	A	11953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=442;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NR=209;PP=2965;ReadPosRankSum=0.157;SC=TCGTGGAAGAGCTGCTGGGGA;SOR=0.309;SbPval=0.55;Source=Platypus;TCR=210;WE=39262065;WS=39262047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,441:1.00:442
chr13	39263714	rs2496423	T	C	20209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=742;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=328;NR=346;PP=2965;SC=AGTGACTCAGTCCCCCACAGA;SOR=0.740;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=675;TCF=329;TCR=346;TR=674;WE=39263722;WS=39263704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,741:1.00:741
chr13	39338612	rs2442370	T	C	1593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=39;PP=1157;SC=TTATTTCTGTTTTAAAATTTT;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=13;TCR=39;TR=52;WE=39338620;WS=39338602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr13	39430314	rs9548509	C	T	2125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=432;ExcessHet=3.0103;FS=1.917;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.829;SOR=0.550;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:300,128:0.30:428
chr13	39448455	rs9548518	A	G	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.12;ReadPosRankSum=-1.384;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,3:0.20:15
chr13	39452235	rs1540131	T	C	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.479;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=9;PP=299;ReadPosRankSum=-1.761;SC=TACCTTATCATATAACAGAAA;SOR=0.361;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=87;TCF=65;TCR=22;TR=26;WE=39452243;WS=39452225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,29:0.31:94
chr13	39452538	.	T	TGGCC	215.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.463;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=4.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.81;ReadPosRankSum=-1.097;SOR=0.069;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr13	39452934	rs9532296	C	T	1838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=362;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.432;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=35;PP=1240;ReadPosRankSum=-0.882;SC=GTGGCATTATCTACAGCAATC;SOR=0.743;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=338;TCF=212;TCR=126;TR=99;WE=39452942;WS=39452924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:254,108:0.30:362
chr13	39454771	rs41306664	G	C	3728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.051;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=82;PP=1905;ReadPosRankSum=1.474;SC=GAGGCACCACGGTAGGGTTAC;SOR=0.775;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=225;TCF=107;TCR=118;TR=155;WE=39454779;WS=39454761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,174:0.69:251
chr13	39546530	rs8000175	C	G	984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=3;PP=727;SC=CAGGTCTCTGCGGGTACTCAG;SOR=3.912;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=27;WE=39546538;WS=39546520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr13	39618366	.	TTG	T	373.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.231;ClippingRankSum=0.000;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=3.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.34;ReadPosRankSum=1.459;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr13	39622075	rs9532318	T	C	1953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=44;PP=1143;SC=GTTTCTTTCCTGGGAATATTT;SOR=1.949;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=20;TCR=44;TR=64;WE=39622090;WS=39622065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr13	40229744	rs9603589	C	T	4055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.570;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=78;PP=2177;ReadPosRankSum=2.087;SC=CAGGGTTACCCGGCGAAGACT;SOR=0.591;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=236;TCF=117;TCR=119;TR=159;WE=40229752;WS=40229734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,185:0.68:271
chr13	40231018	.	G	C	1802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=0.000;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.633;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=51;PP=1165;ReadPosRankSum=0.372;SC=GACTCAGTGAGAGACTCCAGG;SOR=0.935;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=247;TCF=105;TCR=142;TR=84;WE=40231026;WS=40231008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:177,92:0.34:269
chr13	40233691	rs7330016	C	T	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.28;ReadPosRankSum=-0.322;SOR=1.151;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,4:0.17:24
chr13	40238162	rs4636783	C	G	856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=12;PP=623;ReadPosRankSum=-0.862;SC=TTATTGACAGCATACCTAGAA;SOR=0.632;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=105;TCF=75;TCR=30;TR=41;WE=40238170;WS=40238152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,43:0.38:113
chr13	40238387	rs4566029	T	C	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=21;PP=437;ReadPosRankSum=-0.209;SC=AACAGACTGATTCACCTTCTA;SOR=0.806;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=75;TCF=23;TCR=52;TR=30;WE=40238395;WS=40238377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,31:0.41:75
chr13	40239139	rs7991151	G	A	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=81;ReadPosRankSum=-0.819;SC=GATCTCATTTGTTTTAAGTCT;SOR=0.784;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=7;WE=40239147;WS=40239129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr13	40254100	rs11414752	A	AT	935.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=1.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.40;ReadPosRankSum=-1.126;SOR=0.939;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,42:0.65:65
chr13	40254281	rs35468663	TCAAA	T	64.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.49;ReadPosRankSum=-0.214;SOR=1.005;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,4:0.15:26
chr13	40256483	rs4346098	G	A	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.565;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=73;ReadPosRankSum=2.089;SC=TATCAAAAGCGTATATAATAG;SOR=0.020;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=7;WE=40256491;WS=40256473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr13	40261945	rs4129745	A	G	1456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.832;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=37;PP=946;ReadPosRankSum=0.930;SC=AGGTGGGTCCACCAATTGTAT;SOR=1.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=94;TCF=35;TCR=59;TR=57;WE=40261953;WS=40261935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,63:0.63:100
chr13	40263979	rs9548882	T	C	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.167;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=9;PP=177;ReadPosRankSum=-0.176;SC=ATTTTGTTTTTACATATGCTA;SOR=1.061;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=43;TCF=23;TCR=20;TR=16;WE=40263987;WS=40263969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,17:0.35:49
chr13	40264066	rs9603593	T	C	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.501;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=147;ReadPosRankSum=-0.370;SC=AATCTATAATTTTTTCAAATT;SOR=0.473;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=8;WE=40264074;WS=40264056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr13	40268685	rs9603594	T	C	342.96	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=255;ReadPosRankSum=1.310;SC=ATTTTATCTTTGTTATGCTAT;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=11;WE=40268693;WS=40268675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr13	40268930	rs9548886	A	G	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.931;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=268;ReadPosRankSum=-1.100;SC=AGCACAGTATAAGATTTTTTT;SOR=1.584;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=61;TCF=23;TCR=38;TR=17;WE=40268938;WS=40268920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,18:0.26:69
chr13	40293288	rs5803008	AT	A	1697.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=11;PP=846;SC=TAACTTTTACATTTTTTTTTA;SOR=2.765;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=47;TCF=33;TCR=14;TR=42;WE=40293296;WS=40293278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr13	40297684	rs7985075	C	T	733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.501;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=27;PP=516;ReadPosRankSum=0.226;SC=TAGCTGTGTTCTCCTGGGAAA;SOR=1.095;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=139;TCF=53;TCR=86;TR=39;WE=40297692;WS=40297674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,42:0.27:153
chr13	40298805	rs9532421	C	T	541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=17;PP=463;SC=TATCTCTTGACATGCTGTATT;SOR=2.948;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=40298813;WS=40298795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr13	40301763	rs9548899	T	A	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.695;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=188;ReadPosRankSum=0.494;SC=TGGAAAAAAATTTATTTTCAA;SOR=1.936;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=12;WE=40301771;WS=40301753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,13:0.34:38
chr13	41302147	rs9549273	C	G	206.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=6;PP=167;SC=GAGTCTGATTCTGTTCTCGTT;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=41302155;WS=41302137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr13	41323397	rs13508	C	T	3557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=74;NR=48;PP=2091;SC=AATTCCACATCCCAAAGTGAA;SOR=1.055;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=74;TCR=48;TR=122;WE=41323405;WS=41323387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr13	41515286	rs1056820	T	A	17101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=633;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=297;NR=292;PP=2965;SC=TTTAGAACTGTAGTGGCTCCT;SOR=0.706;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=589;TCF=297;TCR=292;TR=589;WE=41515294;WS=41515276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,632:1.00:632
chr13	41517985	rs3764056	A	G	3533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=51;PP=2190;SC=TACCCTTTCCATCTTTGTTTT;SOR=1.146;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=77;TCR=51;TR=128;WE=41517993;WS=41517975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr13	41525586	rs3736953	A	G	4848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=101;PP=2965;SC=CAACACATTTAAAGAGAAAAT;SOR=1.461;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=160;TCF=58;TCR=102;TR=159;WE=41525594;WS=41525576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr13	41533052	rs7799	T	C	15259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=569;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=286;NR=243;PP=2965;SC=AATCATGTCATTGGGCTCTTC;SOR=0.852;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=529;TCF=286;TCR=243;TR=529;WE=41533060;WS=41533042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,566:1.00:566
chr13	41705495	rs584594	A	G	10842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=392;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=203;NR=162;PP=2965;SC=CAGACAGCTAAAGTGGTGACA;SOR=0.857;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=365;TCF=203;TCR=162;TR=365;WE=41705503;WS=41705485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,392:1.00:392
chr13	41706800	rs9566703	A	G	177.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=7;PP=172;SC=ACCCCGCAGAACCGCCTCCCG;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=41706808;WS=41706790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr13	41767338	rs2039134	A	G	7361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.97;QD=43.82;SOR=1.320;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr13	41767341	rs2039135	A	G	7337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.79;QD=45.29;SOR=1.348;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr13	41791440	rs2274903	T	A	2032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=51;PP=1430;SC=ATTTATTTAATTTCTTTGCAG;SOR=2.030;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=71;TCF=20;TCR=51;TR=71;WE=41791448;WS=41791430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr13	41797601	rs2026469	A	T	2306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=53;PP=1552;SC=TTTCTAAAAGACATATATACA;SOR=2.133;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=22;TCR=53;TR=75;WE=41797609;WS=41797591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr13	41807950	rs3751344	T	C	3783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=53;PP=2426;SC=CAGACACTCATATAGGACTAT;SOR=1.032;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=132;TCF=79;TCR=53;TR=132;WE=41807958;WS=41807940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr13	41834578	rs66465270	GT	G	1336.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.387;NF=41;NR=2;PP=758;ReadPosRankSum=-0.131;SC=TAAGTGTGTGGTTTTTTTTTT;SOR=5.136;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=54;TCF=49;TCR=5;TR=43;WE=41834586;WS=41834568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,52:0.98:53
chr13	41834744	rs2297555	C	T	12717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=457;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=230;NR=202;PP=2965;SC=TTCGGTTTTCCTCATTCACAG;SOR=0.798;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=432;TCF=230;TCR=202;TR=432;WE=41834752;WS=41834734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,457:1.00:457
chr13	41835076	rs3215932	T	TA	1584.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.902;HP=9;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=38;PP=622;ReadPosRankSum=-0.310;SC=ACACAGTCTTTAAAAAAAAAT;SOR=0.183;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=54;TCF=2;TCR=52;TR=40;WE=41835097;WS=41835066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:5,63:0.93:68
chr13	41835089	rs1332940	T	G	2736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.296;NF=12;NR=42;PP=1241;ReadPosRankSum=1.300;SC=AAAAAAATCATCTCTAAAGAT;SOR=1.329;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=55;TCF=12;TCR=43;TR=54;WE=41835097;WS=41835066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,63:0.98:64
chr13	41837220	rs3818721	C	T	230.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=186;SC=ATTTCAAGCACGTTAGAGAAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=41837228;WS=41837212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr13	41893105	rs2065498	T	G	1882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=44;PP=1224;SC=CTAATTCAAATTAAATTTGTA;SOR=1.946;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=19;TCR=44;TR=63;WE=41893113;WS=41893095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr13	41902939	rs3812896	T	C	3671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=69;PP=2281;SC=ATGCAGAAAATTGGTGTTATT;SOR=1.129;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=121;TCF=52;TCR=69;TR=121;WE=41902947;WS=41902929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr13	41910692	rs11842833	A	G	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.834;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=261;ReadPosRankSum=-0.394;SC=TAGGAGCATAATTGCTTCTGA;SOR=0.334;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=18;WE=41910700;WS=41910682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,24:0.52:46
chr13	41948051	rs9525478	G	C	1937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=50;PP=1486;SC=ACAAATTTAAGTTATGTTCAA;SOR=2.869;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=64;TCF=13;TCR=51;TR=63;WE=41948059;WS=41948041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr13	41949804	rs6560982	G	T	2398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=60;PP=1761;SC=CTTTTCCAGGGTGCATTTTAA;SOR=4.615;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=6;TCR=60;TR=66;WE=41949812;WS=41949794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr13	42032572	rs7136	T	C	3818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.968;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=80;PP=1937;ReadPosRankSum=-0.173;SC=GCAGCGCCAGTGTCAGCGACA;SOR=0.623;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=248;TCF=126;TCR=122;TR=167;WE=42032580;WS=42032562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,181:0.66:275
chr13	42043086	rs2324791	C	G	695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=19;PP=546;SC=TCATCCTAAGCCTTCTATAGG;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=42043094;WS=42043076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr13	42044508	rs396963	A	G	6359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=143;NR=93;PP=2965;SC=TGGGAAGCCCAGCATTGAGTT;SOR=1.133;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=238;TCF=144;TCR=94;TR=236;WE=42044516;WS=42044498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr13	42185696	rs3814782	T	C	4340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.805;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=86;PP=2369;ReadPosRankSum=-0.494;SC=GGTCTAAATGTGATGGGAGCA;SOR=0.468;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=279;TCF=155;TCR=124;TR=184;WE=42185704;WS=42185686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,199:0.66:302
chr13	42189232	rs3862741	C	G	2242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.189;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=54;PP=1479;ReadPosRankSum=2.313;SC=TAAAAATGAACAATTGAGACA;SOR=0.823;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=158;TCF=73;TCR=85;TR=99;WE=42189240;WS=42189222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,104:0.58:178
chr13	42275473	rs7322461	A	G	2036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=50;NR=20;PP=1107;SC=ATTTTAATCCATCTTTTAAAA;SOR=1.522;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=50;TCR=20;TR=70;WE=42275481;WS=42275463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr13	42277675	rs9315858	A	T	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=30;ReadPosRankSum=-0.718;SC=TGAGTTATACATCATTTTATT;SOR=0.120;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=4;WE=42277683;WS=42277665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr13	42306139	rs9315861	T	A	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=295;ReadPosRankSum=0.679;SC=TCCATGAGAGTTCCATCCTCC;SOR=0.631;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=16;WE=42306147;WS=42306129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,17:0.85:20
chr13	42306411	rs9315862	T	C	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.959;HP=5;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=468;ReadPosRankSum=0.686;SC=TGCTTCCCCTTCCCCCACCAA;SOR=2.179;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=32;TCF=4;TCR=28;TR=22;WE=42306427;WS=42306401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,22:0.65:34
chr13	42335222	rs9566844	T	C	3863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.450;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=63;PP=2476;ReadPosRankSum=-0.247;SC=AAACAAATGATTAAATGAGAT;SOR=0.796;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=271;TCF=162;TCR=109;TR=161;WE=42335230;WS=42335212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,176:0.61:290
chr13	42352285	rs12864636	T	C	944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.57;ReadPosRankSum=-0.255;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,38:0.67:57
chr13	42361743	rs112297676	T	TACAC	552.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.42;ReadPosRankSum=0.621;SOR=1.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr13	42407759	rs9315868	C	T	3780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.348;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=95;PP=2307;ReadPosRankSum=0.777;SC=GAGTCACCTCCGTCTGAACTT;SOR=0.528;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=236;TCF=87;TCR=149;TR=154;WE=42407767;WS=42407749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,167:0.66:254
chr13	42442546	rs3742262	A	G	3801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=83;PP=2241;ReadPosRankSum=-0.640;SC=ATGGTTTTCCATCATCTTCTC;SOR=0.694;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=275;TCF=137;TCR=138;TR=165;WE=42442554;WS=42442536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,180:0.60:300
chr13	42465490	rs7332372	C	T	1217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.025;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=10;PP=758;ReadPosRankSum=0.307;SC=CCATGTCTTACACAATAAAAT;SOR=0.950;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=72;TCF=54;TCR=18;TR=46;WE=42465498;WS=42465480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,51:0.64:80
chr13	42465713	rs9562362	C	T	5915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=434;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.136;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=109;NR=131;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.367;SC=TGTGGCTGCACGAACTGCACA;SOR=0.785;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=384;TCF=177;TCR=207;TR=240;WE=42465721;WS=42465703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,268:0.62:433
chr13	42481712	rs2003064	C	T	4003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.346;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=79;PP=2260;ReadPosRankSum=3.433;SC=TAGAGTGTGACAGAACTTGCC;SOR=0.616;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=290;TCF=159;TCR=131;TR=173;WE=42481720;WS=42481702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,189:0.59:320
chr13	42486383	rs35273694	TTA	T	548.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=508;ReadPosRankSum=-0.382;SC=GTGGACATATTTATATATATA;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=12;WE=42486392;WS=42486373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,17:0.71:24
chr13	42701717	rs605371	A	G	4830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.477;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=107;PP=2962;ReadPosRankSum=0.789;SC=AAGGTAACTCACGAGAATACT;SOR=0.633;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=271;TCF=121;TCR=150;TR=193;WE=42701725;WS=42701707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,210:0.72:293
chr13	42701739	rs670676	A	T	6158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=121;PP=2965;SC=GTTTCAAGCAATTGAGGCTAT;SOR=1.109;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=209;TCF=88;TCR=121;TR=209;WE=42701747;WS=42701729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr13	42701803	rs957255	G	A	1474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=46;PP=1087;ReadPosRankSum=0.033;SC=GAAGCGCACTGTAGCATTATG;SOR=0.778;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=69;TCF=14;TCR=55;TR=58;WE=42701811;WS=42701793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,58:0.84:69
chr13	42703682	rs3742261	T	C	2760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.583;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=40;PP=1854;ReadPosRankSum=2.788;SC=TTTTTTTCATTAACAGTCTCT;SOR=0.641;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=168;TCF=112;TCR=56;TR=115;WE=42703690;WS=42703672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,123:0.66:187
chr13	42748077	rs373481342	ATG	A	99.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=10;PP=282;ReadPosRankSum=0.228;SC=TAGTTCATGAATGTGTGTGTG;SOR=0.610;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=42;TCF=26;TCR=16;TR=27;WE=42748086;WS=42748067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,8:0.16:50
chr13	42748118	rs140630635	T	TGC	1781.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.799;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.968;NF=25;NR=22;PP=1586;ReadPosRankSum=3.129;SC=TGTGTGTGTGTGCGCGTTTAT;SOR=0.606;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=50;TCR=42;TR=47;WE=42748126;WS=42748108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,54:0.52:104
chr13	42748136	rs9590674	T	C	3331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.335;NF=65;NR=33;PP=1746;ReadPosRankSum=0.877;SC=TATGAGATGCTAACAGTTAGT;SOR=0.739;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=162;TCF=108;TCR=54;TR=98;WE=42748144;WS=42748126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,100:0.61:165
chr13	42761399	rs17598471	A	G	2932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.699;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=79;PP=1958;ReadPosRankSum=1.311;SC=TTAAATCGAGAGAAAAATTAC;SOR=0.533;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=149;TCF=45;TCR=104;TR=116;WE=42761407;WS=42761389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,125:0.79:158
chr13	42763533	rs55656510	A	T	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=23;PP=571;ReadPosRankSum=0.354;SC=CAGATTGGACACACTTTTTAA;SOR=1.022;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=4;TCR=31;TR=26;WE=42763541;WS=42763523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,26:0.74:35
chr13	42764439	rs1170119	T	C	1743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=3;PP=1452;SC=TCTGGAATTTTGTTTGGCATA;SOR=5.709;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=53;TCF=50;TCR=3;TR=53;WE=42764447;WS=42764429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr13	42764564	rs7324235	C	G	5830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=439;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.142;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=132;NR=125;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.698;SC=CAGTTCACCCCTGTGAACCAG;SOR=0.594;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=410;TCF=214;TCR=196;TR=257;WE=42764572;WS=42764554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,276:0.63:439
chr13	42772717	rs9533031	G	T	1203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FS=4.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.87;ReadPosRankSum=0.245;SOR=0.468;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:176,71:0.29:247
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chr13	42783012	rs168329	G	A	360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=1;PP=242;SC=TTAAATATATGTAGATATATA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=42783020;WS=42783005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr13	42793298	rs9315899	G	T	1350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.524;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=21;PP=707;ReadPosRankSum=0.584;SC=AAAGTACAATGATTTATTCTA;SOR=0.644;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=211;TCF=137;TCR=74;TR=65;WE=42793306;WS=42793288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,76:0.32:235
chr13	42793479	rs180870	G	A	901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FS=1.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.32;ReadPosRankSum=0.468;SOR=0.571;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:210,62:0.23:272
chr13	42793766	rs11277175	AGGTTTTTC	A	1217.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.205;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.190;NF=15;NR=6;PP=1972;ReadPosRankSum=-0.253;SC=TTATCAGAGTAGGTTTTTCTC;SOR=0.985;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=57;TCF=42;TCR=15;TR=21;WE=42793781;WS=42793756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,35:0.39:89
chr13	42794004	rs347382	G	A	11900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=449;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=187;NR=231;PP=2965;SC=CATGGAGGTCGTGAAAATGTT;SOR=0.952;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=418;TCF=187;TCR=231;TR=418;WE=42794012;WS=42793994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,448:1.00:448
chr13	42803341	rs545602	T	C	1830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.453;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=51;PP=1148;ReadPosRankSum=-1.608;SC=TGGTGCTATTTCTTGGAAGAG;SOR=0.788;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=266;TCF=120;TCR=146;TR=89;WE=42803349;WS=42803331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:202,103:0.34:305
chr13	42869720	rs3835266	A	AG	239.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=193;ReadPosRankSum=-0.977;SC=ATCCTTTTCAAGCAGACAGCA;SOR=0.693;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=7;WE=42869728;WS=42869710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,10:0.31:32
chr13	42876290	rs41288311	A	C	3317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=614;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.567;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=96;PP=2272;ReadPosRankSum=0.270;SC=CACCTGCTACACCACCTTCTA;SOR=0.760;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=584;TCF=282;TCR=302;TR=180;WE=42876298;WS=42876280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:423,191:0.31:614
chr13	42882762	rs238314	A	G	2722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=60;PP=1708;SC=ACACTTTTGCATATAATTGTG;SOR=1.540;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=29;TCR=60;TR=89;WE=42882770;WS=42882752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr13	42888230	rs9566957	A	G	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=75;ReadPosRankSum=-0.049;SC=GTCCACTTTTAGATCCTTTGT;SOR=0.175;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=6;WE=42888238;WS=42888220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr13	43148565	rs2296533	T	C	2689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=50;NR=43;PP=1455;SC=ACCAGCCCCCTGCCGCCTCCC;SOR=0.712;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=50;TCR=43;TR=93;WE=43148573;WS=43148555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr13	43155168	rs2277438	G	A	549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=1;PP=477;SC=AGACTCTTGCGAGTATGAATT;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=43155176;WS=43155158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr13	43155443	rs2277439	G	A	8037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=130;NR=147;PP=2965;SC=AGTCCACATCGAGGCTGATAA;SOR=0.919;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=277;TCF=130;TCR=147;TR=277;WE=43155451;WS=43155433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,301:1.00:301
chr13	43462607	rs11557739	G	A	2642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.188;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=69;PP=1521;ReadPosRankSum=-0.626;SC=GTTGATGAAGGCCAGATAGGA;SOR=0.350;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=167;TCF=54;TCR=113;TR=107;WE=43462615;WS=43462597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,117:0.64:182
chr13	43463299	rs1323864	T	C	8504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=151;NR=156;PP=2965;SC=GCCTCACCTATTGTATCAGAG;SOR=0.756;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=307;TCF=151;TCR=156;TR=307;WE=43463307;WS=43463289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,326:1.00:326
chr13	43474371	rs4942174	C	T	6541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=145;NR=72;PP=2965;SC=TATCGTAATGCTTTCCTAAAA;SOR=1.589;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=217;TCF=145;TCR=72;TR=217;WE=43474379;WS=43474361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr13	43537240	rs1054813	A	G	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.55;ReadPosRankSum=0.811;SOR=0.425;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,3:0.21:14
chr13	43537277	rs34758461	A	AAG	237.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.17;ReadPosRankSum=1.431;SOR=0.926;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,11:0.24:46
chr13	43544819	rs66702221	GA	G	1175.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.17;ReadPosRankSum=0.697;SOR=0.705;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,63:0.38:164
chr13	43566099	rs942311	T	A	6158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=124;NR=87;PP=2965;SC=GAAGCCAGGTTGTTAAAATAC;SOR=1.091;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=211;TCF=124;TCR=87;TR=211;WE=43566107;WS=43566089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr13	43566373	rs3825511	A	C	1456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=35;PP=1115;SC=AGCGAGTCTCAAGATGGGATT;SOR=2.560;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=10;TCR=35;TR=45;WE=43566381;WS=43566363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr13	43788031	rs1044753	C	T	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-4.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.930;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=781;ReadPosRankSum=0.264;SC=ACAAAGGTTGCGTGCTGGACC;SOR=0.263;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=41;TCF=37;TCR=4;TR=20;WE=43788044;WS=43788021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,21:0.44:48
chr13	43788036	rs703206	T	G	698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.590;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=3;PP=981;ReadPosRankSum=0.083;SC=GGTTGCGTGCTGGACCAACCC;SOR=1.746;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=48;TCF=41;TCR=7;TR=25;WE=43788044;WS=43788021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,31:0.56:55
chr13	43788158	rs703207	G	A	2334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=404;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.168;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=64;PP=1521;ReadPosRankSum=-0.113;SC=AAGGCACACAGCTTCCATCTT;SOR=0.588;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=377;TCF=208;TCR=169;TR=133;WE=43788166;WS=43788148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:269,134:0.33:403
chr13	43839494	rs4306408	G	A	12484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=464;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=222;NR=212;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.590;SC=TTCAACCAACGTCAAGCAAGA;SOR=0.234;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=435;TCF=223;TCR=212;TR=434;WE=43839502;WS=43839484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,462:1.00:463
chr13	43843812	rs730210	A	G	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=157;ReadPosRankSum=0.549;SC=GAAGATGTTTACAAGTCTTGA;SOR=0.093;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=9;WE=43843820;WS=43843802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr13	43872419	rs4451860	C	T	623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.51;SOR=2.546;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
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chr13	43930337	rs2281713	A	G	1230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.112;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=43;PP=872;ReadPosRankSum=0.525;SC=CAATGGCCACAGTTTTGGTCC;SOR=0.800;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=222;TCF=93;TCR=129;TR=71;WE=43930345;WS=43930327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,73:0.31:234
chr13	43935405	rs1535580	C	T	1159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.164;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=19;PP=690;ReadPosRankSum=1.502;SC=TTCTCATAGGCGTTACTTACT;SOR=0.785;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=208;TCF=140;TCR=68;TR=64;WE=43935413;WS=43935395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,69:0.30:229
chr13	44433700	rs1562216	G	A	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=50;ReadPosRankSum=-0.901;SC=AAGGTAATAGGACAGCTATGG;SOR=0.515;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=6;WE=44433708;WS=44433690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr13	44434281	rs142300402	TAATG	T	72.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=2;PP=28;ReadPosRankSum=0.157;SC=TTTTAATCCATAATGAATATA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=2;WE=44434292;WS=44434271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr13	44457925	rs3764147	A	G	1397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.490;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=29;PP=804;ReadPosRankSum=0.622;SC=TTCCAATGACATCTGGATTAT;SOR=0.643;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=237;TCF=150;TCR=87;TR=74;WE=44457933;WS=44457915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:180,85:0.32:265
chr13	44734696	rs4942287	A	G	1110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.626;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=21;PP=805;ReadPosRankSum=-0.102;SC=AAGTGGTTCTATTAAAATAGC;SOR=0.806;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=141;TCF=87;TCR=54;TR=55;WE=44734704;WS=44734686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,56:0.36:154
chr13	44948295	rs201663302	T	TG	1509.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.74;SOR=2.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr13	44948302	rs199705926	GA	G	1383.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.71;SOR=2.546;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr13	44964723	rs2281848	C	T	1759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=44;PP=1164;SC=AGGTGACCTGCAGCCTCCTTT;SOR=2.056;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=16;TCR=44;TR=60;WE=44964731;WS=44964713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr13	44969907	rs1467624	G	A	10303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=389;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=207;NR=149;PP=2965;SC=GATTTGACTCGTAATTCTAAC;SOR=1.018;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=356;TCF=207;TCR=149;TR=356;WE=44969915;WS=44969897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,387:1.00:387
chr13	45010283	rs1555781	T	G	4056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=93;PP=2792;SC=TATCTTAAGCTTCCAAGATAA;SOR=1.675;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=45;TCR=93;TR=138;WE=45010291;WS=45010273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr13	45010616	rs7997320	G	A	2408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.599;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=19;PP=1565;ReadPosRankSum=-0.646;SC=TAAATTTAAAGAAACTATCTT;SOR=0.992;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=127;TCF=97;TCR=30;TR=85;WE=45010624;WS=45010606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,97:0.66:146
chr13	45090478	rs1336163	A	C	4066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.802;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=94;PP=2512;ReadPosRankSum=-0.279;SC=ATTCTGAAGAACCTGCTTTTT;SOR=0.517;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=285;TCF=117;TCR=168;TR=167;WE=45090486;WS=45090468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,186:0.59:316
chr13	45090580	rs1336164	C	T	1001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=31;PP=813;SC=GGGACTTCGGCATAAAGGCTT;SOR=4.743;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=33;WE=45090588;WS=45090570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr13	45517486	.	AAC	A	38.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=4.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.92;ReadPosRankSum=-0.436;SOR=1.751;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,6:0.14:42
chr13	45556056	rs148833607	T	TCATGTTTAACATAAAACATAAAA	1079.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=1;PP=625;SC=TTTGCTATATTCATGTTTAAC;SOR=3.500;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=2;WE=45556064;WS=45556046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr13	45563464	rs1140993	G	C	7949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=169;NR=105;PP=2965;SC=AGAACATCCAGCTGTCCCGCG;SOR=1.276;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=274;TCF=169;TCR=105;TR=274;WE=45563472;WS=45563454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,290:1.00:290
chr13	45710748	rs9534041	G	A	1251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=31;NR=13;PP=755;SC=ACATACAGTAGTAACTTGATA;SOR=1.426;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=31;TCR=13;TR=44;WE=45710756;WS=45710738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr13	45723823	rs141823802	G	GT	815.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=2.261;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.05;ReadPosRankSum=-0.156;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,33:0.89:37
chr13	45724053	rs9534044	A	G	1798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=33;NR=30;PP=983;SC=AGAACACATAAAGGTATAAAT;SOR=0.811;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=33;TCR=30;TR=63;WE=45724061;WS=45724043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr13	45725763	rs13378297	A	T	416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.06;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr13	45768759	rs9534059	G	A	920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=26;PP=727;SC=TTTAAAAAGAGACACTACCAC;SOR=4.479;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=28;WE=45768767;WS=45768749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr13	45826876	rs7982845	A	G	356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=1;PP=267;SC=AAAGTATTAAAGCTAGTGTAT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=45826884;WS=45826869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr13	45826994	rs139972349	A	AT	3351.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=37;PP=1172;ReadPosRankSum=-0.235;SC=AATGCCTTATATTTTTTTTCA;SOR=0.714;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=76;TCF=29;TCR=47;TR=64;WE=45827002;WS=45826984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:6,123:0.95:129
chr13	45841502	rs7331090	G	A	4052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.157;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=66;PP=2353;ReadPosRankSum=-0.662;SC=ACATCACAAAGCAACCTGTGG;SOR=0.351;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=136;TCF=70;TCR=66;TR=135;WE=45841510;WS=45841492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,150:0.99:151
chr13	45912634	rs9595305	T	C	2235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=15;PP=1527;SC=CCCTAAGAATTTTTTACATAT;SOR=2.062;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=52;TCR=15;TR=67;WE=45912642;WS=45912624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr13	45914957	rs2234216	T	C	8178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=130;NR=165;PP=2965;ReadPosRankSum=0.824;SC=ACCGTGCGCCTGGCGCCGCCA;SOR=0.998;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=298;TCF=131;TCR=167;TR=295;WE=45914965;WS=45914947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,312:0.99:314
chr13	45970108	rs75330252	G	A	7796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=555;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.541;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=178;NR=155;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.526;SC=GCCTTGGCTTGTCACAAATCC;SOR=0.635;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=522;TCF=282;TCR=240;TR=333;WE=45970116;WS=45970098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:196,358:0.65:554
chr13	45973231	rs11330086	GA	G	47.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.14;MQRankSum=-0.407;QD=0.99;ReadPosRankSum=-0.327;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,11:0.23:48
chr13	45980223	rs35419409	A	AT	423.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.66;ReadPosRankSum=0.772;SOR=2.948;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,21:0.88:24
chr13	45982934	rs6561227	G	A	357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=294;SC=TGAAAAATCTGTCATGCTATT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=45982942;WS=45982928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr13	45985705	rs4941527	G	A	454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=295;SC=TATTTGGAGAGTGCTATCACC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=45985713;WS=45985695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr13	46039407	rs11619408	G	T	891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.891;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=28;PP=601;ReadPosRankSum=-0.545;SC=CGGGCGCCCCGGCAGGACCCC;SOR=1.284;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=62;TCF=17;TCR=45;TR=36;WE=46039415;WS=46039397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,39:0.57:69
chr13	46060459	.	ACGGGAGACGGGAGAC	A	782	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MMLQ=24;MQ=65.21;NF=32;NR=2;PP=782;QD=23.2941176471;SC=GAGACGGGAGACGGGAGACGG;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=35;TCF=33;TCR=2;TR=34;WE=46060482;WS=46060449;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:1,34:0.97:35
chr13	46060474	.	C	CGGGAGA,CGGGAGACGGAGA	1714.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.36;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=25;NF=31;NR=2;PP=2167;SC=AGACGGGAGACGGGAGAGGGA;SOR=4.548;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=43;TCF=39;TCR=4;TR=33;WE=46060482;WS=46060449;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.20,0.80:30
chr13	46065235	rs58083561	G	A	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.215;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=19;PP=343;ReadPosRankSum=-1.182;SC=GGGGAGCAAGGTCACAGACTT;SOR=1.188;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=89;TCF=37;TCR=52;TR=29;WE=46065243;WS=46065225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,33:0.34:97
chr13	46066163	rs3014948	T	C	950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.297;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=3;PP=596;ReadPosRankSum=-0.993;SC=CCAACCATTTTCCGTTCTTCA;SOR=1.857;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=38;TCF=33;TCR=5;TR=29;WE=46066171;WS=46066153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,34:0.79:43
chr13	46066192	rs7139877	G	A	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=6.557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.84;ReadPosRankSum=-0.327;SOR=0.260;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:82,27:0.25:109
chr13	46077301	rs3014959	G	A	903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=9;PP=638;SC=ATATATATATGTACTTTGTAT;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=31;WE=46077309;WS=46077278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr13	46077381	rs3014960	G	A	2986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=39;PP=1663;SC=TTATACAGCAGATTGCACAGA;SOR=0.884;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=60;TCR=39;TR=99;WE=46077389;WS=46077371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr13	46085699	rs2985969	G	A	714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=1;PP=578;SC=ATGTTTCCAGGGATGACTGCA;SOR=4.003;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=46085707;WS=46085689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr13	46085746	rs56260231	T	C	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.700;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=309;ReadPosRankSum=-0.104;SC=AAAGGTTGCATGGGAATAGGA;SOR=1.214;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=64;TCF=47;TCR=17;TR=23;WE=46085754;WS=46085736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,24:0.35:69
chr13	46085864	rs2985970	A	G	6381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=124;NR=101;PP=2965;ReadPosRankSum=0.123;SC=GTTTTGTCAAATGCCACAGGC;SOR=0.308;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=226;TCF=125;TCR=101;TR=225;WE=46085898;WS=46085854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,238:1.00:239
chr13	46093284	rs3818456	C	G	1588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.632;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=43;PP=1020;ReadPosRankSum=0.232;SC=CCTTAGATTTCCTTTTGAATT;SOR=1.155;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=113;TCF=38;TCR=75;TR=60;WE=46093292;WS=46093274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,68:0.53:128
chr13	46098994	rs3014966	T	C	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=341;ReadPosRankSum=1.775;SC=CATTGTGTTTTAATAGGTTTA;SOR=0.593;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=16;WE=46099002;WS=46098984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
chr13	46099243	rs2985984	A	G	2315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.626;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=60;PP=1520;ReadPosRankSum=-0.334;SC=GTTTGCATTTATATAGTCCTT;SOR=0.619;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=152;TCF=55;TCR=97;TR=97;WE=46099251;WS=46099233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,101:0.63:160
chr13	46103935	rs2274285	A	G	4884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.780;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=120;NR=71;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.531;SC=GCAAAGGTCAATGACCTTGCG;SOR=0.545;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=275;TCF=174;TCR=101;TR=191;WE=46103943;WS=46103925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,212:0.70:305
chr13	46104130	rs2274286	G	C	2707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=65;PP=1976;SC=TTTTCCTTTTGCTGTAGACAT;SOR=3.206;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=80;TCF=15;TCR=65;TR=79;WE=46104138;WS=46104120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr13	46105021	rs66498730	AT	A	1518.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.309;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=31;PP=1208;ReadPosRankSum=0.409;SC=AATTTAAAAAATATTACCTTC;SOR=0.096;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=0;TCR=51;TR=31;WE=46105029;WS=46105011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,46:0.66:70
chr13	46108643	rs3014901	T	C	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=188;ReadPosRankSum=-1.596;SC=TTTTTTTTTTTCCATTCTAAT;SOR=0.646;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=11;WE=46108651;WS=46108633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr13	46108679	rs9652191	A	G	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.222;HP=8;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=573;ReadPosRankSum=-1.433;SC=TTCAACTTTTATTTTAGATTC;SOR=0.030;SbPval=0.07;Source=Platypus;TC=44;TCF=36;TCR=8;TR=16;WE=46108699;WS=46108669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,16:0.36:44
chr13	46108691	rs9595339	A	C	778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.995;HP=4;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=573;ReadPosRankSum=-1.658;SC=TTTAGATTCAAGGGGTACATA;SOR=0.184;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=70;TCF=55;TCR=15;TR=27;WE=46108699;WS=46108669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,27:0.38:72
chr13	46108853	rs3014902	TG	CA	12952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=115;NR=135;PP=2947;SC=CTTCTGCTGTTGGTTTCTAAA;SOR=0.920;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=257;TCF=118;TCR=139;TR=250;WE=46108862;WS=46108843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,290:1.00:290
chr13	46124290	rs2860345	T	A	1754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=399;ExcessHet=3.0103;FS=1.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.40;ReadPosRankSum=1.644;SOR=0.587;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:288,111:0.28:399
chr13	46137807	rs79845240	T	C	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.930;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=348;ReadPosRankSum=-1.104;SC=GGAGAGGCGGTGGGATGCAGA;SOR=0.498;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=97;TCF=77;TCR=20;TR=30;WE=46137815;WS=46137797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,34:0.33:104
chr13	46148855	rs747652	A	G	844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=5;PP=635;SC=GGATATATGAAGCAAAAAGAA;SOR=2.546;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=29;WE=46148863;WS=46148845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr13	46148943	rs140782618	TG	T	306.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.53;ReadPosRankSum=-0.933;SOR=0.711;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,26:0.21:121
chr13	46170609	rs3014939	C	T	7115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=446;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.31;MQRankSum=2.292;NF=155;NR=131;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.110;SC=GCCTTTTCCTCTTCTAGATAT;SOR=0.744;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=405;TCF=218;TCR=187;TR=286;WE=46170617;WS=46170596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,316:0.72:440
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chr13	46287153	rs9316154	A	C	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=117;ReadPosRankSum=0.332;SC=TGACAAGGATAGGCCACATTT;SOR=0.346;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=8;WE=46287161;WS=46287148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr13	46287927	.	C	T	1451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=0.000;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.733;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=37;PP=1000;ReadPosRankSum=0.148;SC=GAGAATCGCGCGCTGCAGCAG;SOR=0.549;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=203;TCF=104;TCR=99;TR=76;WE=46287935;WS=46287917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,78:0.36:217
chr13	46288017	rs79707842	C	A	842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=24;PP=592;ReadPosRankSum=-1.302;SC=CCCGCCCCCTCACCCCACGAG;SOR=0.708;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=149;TCF=74;TCR=75;TR=48;WE=46288025;WS=46288007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,48:0.31:156
chr13	46288145	rs7317245	A	G	4812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=68;PP=2743;SC=CGCCCTGCGGAAGATGGTCAG;SOR=0.705;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=152;TCF=84;TCR=68;TR=152;WE=46288153;WS=46288135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr13	46541673	rs9534264	T	A	676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=13;PP=377;ReadPosRankSum=0.455;SC=ATTTATTTGTTTCTTCAAATC;SOR=0.734;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=116;TCF=77;TCR=39;TR=37;WE=46541681;WS=46541663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,41:0.30:136
chr13	46550061	rs11428563	G	GT	406.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=482;SC=TTTTATCTGTGATAGGGTCAC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=11;WE=46550069;WS=46550051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr13	46562935	rs1134071	A	G	2176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=380;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.143;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=52;PP=1406;ReadPosRankSum=-0.687;SC=CCCTCCTTTCATGGCGTCGAT;SOR=1.022;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=352;TCF=190;TCR=162;TR=123;WE=46562943;WS=46562925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:251,129:0.34:380
chr13	46594619	rs41284155	T	C	1102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.075;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=29;PP=642;ReadPosRankSum=1.210;SC=ATTTTCTTCTTCACTTTCTGG;SOR=0.876;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=140;TCF=65;TCR=75;TR=53;WE=46594627;WS=46594609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,58:0.37:158
chr13	46619026	rs962694	T	C	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.251;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=346;ReadPosRankSum=-0.431;SC=CAGATTTTTATACTAGATAAA;SOR=1.071;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=85;TCF=66;TCR=19;TR=25;WE=46619034;WS=46619016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,28:0.29:96
chr13	46619071	rs3736943	T	C	1483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.873;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=24;PP=1067;ReadPosRankSum=1.396;SC=ACATGAACAATACAAAGTTCT;SOR=1.040;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=232;TCF=146;TCR=86;TR=74;WE=46619079;WS=46619061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,79:0.32:248
chr13	46627677	rs1049669	T	C	2909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=7;PP=2152;SC=TAAAAATAATTTGATACAATG;SOR=4.223;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=75;TCR=7;TR=82;WE=46627685;WS=46627667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr13	46629944	rs1926447	A	G	1735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.459;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=45;PP=1104;ReadPosRankSum=-1.925;SC=ATTTTTACTAATTTTCTCAAT;SOR=0.667;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=268;TCF=139;TCR=129;TR=97;WE=46629952;WS=46629934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:197,102:0.34:299
chr13	46629995	rs1926446	C	A	1302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.350;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=37;PP=766;ReadPosRankSum=2.016;SC=CTGGAAGCAACAAGATATAGA;SOR=0.528;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=221;TCF=102;TCR=119;TR=75;WE=46630003;WS=46629984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,81:0.34:239
chr13	46641481	rs7337140	T	C	2479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=475;ExcessHet=3.0103;FS=1.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.24;ReadPosRankSum=-1.607;SOR=0.790;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:323,150:0.32:473
chr13	46656412	rs3818477	T	G	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=174;ReadPosRankSum=1.761;SC=TCAGGGAAGATATCTACCAAA;SOR=0.430;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=9;WE=46656420;WS=46656406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr13	46656669	rs2296642	A	G	982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.084;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=32;PP=634;ReadPosRankSum=1.276;SC=GATCTTCCACATCTGCCAGCA;SOR=0.906;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=167;TCF=68;TCR=99;TR=50;WE=46656677;WS=46656659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,55:0.31:176
chr13	46708291	rs4941543	T	C	10245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=377;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=197;NR=155;PP=2965;SC=GAACTTTTCTTTGCTTCCCTC;SOR=0.908;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=352;TCF=197;TCR=155;TR=352;WE=46708299;WS=46708281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,377:1.00:377
chr13	46728924	rs2296122	C	T	9147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=350;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=154;NR=155;PP=2965;SC=ATTATGGTAACGGTGGGAAGA;SOR=0.795;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=309;TCF=154;TCR=155;TR=309;WE=46728932;WS=46728914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,349:1.00:349
chr13	46733235	rs11841954	A	G	2045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=50;PP=1503;SC=TATCATTCAGACATTAAGGCA;SOR=2.939;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=12;TCR=50;TR=62;WE=46733243;WS=46733225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr13	46836201	rs2764598	A	G	1274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=25;PP=728;SC=AGAGAAAATCAATCCTTTCAT;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=14;TCR=25;TR=39;WE=46836209;WS=46836191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr13	46930372	rs9526171	T	C	1023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=28;NR=4;PP=809;SC=CTGGTCCTGGTGTCCTCGGTC;SOR=3.611;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=32;WE=46930380;WS=46930362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr13	47243357	rs73193018	C	T	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.495;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=138;ReadPosRankSum=-0.297;SC=TCAAGGTATTCAGAAAACCTT;SOR=0.399;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=60;TCF=10;TCR=50;TR=15;WE=47243365;WS=47243347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,16:0.26:62
chr13	47256071	rs151080336	T	TTGTGTGTG,TTG	268.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;NF=0,0;NR=4,4;PP=45,153;SC=GGGTCGATCTTTGTGTGTGTG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=4,4;WE=47256079;WS=47256061;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.75:8
chr13	47260054	rs842381	T	C	7016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.579;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=150;NR=94;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.350;SC=AGTAGATCTTTCCTTGGTAAA;SOR=0.125;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=247;TCF=153;TCR=94;TR=244;WE=47260062;WS=47260044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,259:0.99:262
chr13	47261970	rs842375	T	C	3311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=31;PP=2173;SC=ATATGATTGCTATTAATTTCT;SOR=1.629;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=78;TCR=31;TR=109;WE=47261978;WS=47261960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr13	47273458	rs706621	G	C	6608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=130;NR=90;PP=2965;SC=AACCCTGTGTGTTTTGTCCAC;SOR=0.971;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=221;TCF=130;TCR=91;TR=220;WE=47273466;WS=47273448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr13	47279375	rs11483731	C	CT	2153.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.664;HP=10;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.332;NF=33;NR=28;PP=1296;ReadPosRankSum=1.060;SC=CACTTTGTATCTTTTTTTTTC;SOR=0.303;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=81;TCF=46;TCR=35;TR=61;WE=47279383;WS=47279365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,76:0.97:78
chr13	47279454	rs842387	A	G	5901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=125;NR=91;PP=2965;SC=GGCTGCTGGTAGATTCACCAG;SOR=0.919;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=218;TCF=126;TCR=92;TR=216;WE=47279462;WS=47279444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr13	47279680	rs3832915	A	AT	2405.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=44;PP=1354;SC=GATTCTGTAGATTTTTTTACC;SOR=1.581;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=59;TCF=2;TCR=57;TR=46;WE=47279688;WS=47279670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr13	47297352	rs7319836	G	A	7702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=154;NR=108;PP=2965;SC=CCTTTGTATTGTAGTGTTTCT;SOR=1.014;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=262;TCF=154;TCR=108;TR=262;WE=47297360;WS=47297342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,291:1.00:291
chr13	47302934	rs3742273	T	A	6225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=125;NR=86;PP=2965;SC=TTACTCACAGTTACCTCAGTG;SOR=1.028;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=211;TCF=125;TCR=86;TR=211;WE=47302942;WS=47302924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr13	47308109	rs2298086	A	G	4195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=81;NR=68;PP=2335;SC=TTTTGGAAGCATGCCGAAAAT;SOR=0.705;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=149;TCF=81;TCR=68;TR=149;WE=47308117;WS=47308099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr13	47315984	rs3742274	T	C	1613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=37;PP=910;SC=GTCCGCATAATGTCTGCACGT;SOR=1.850;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=18;TCR=37;TR=55;WE=47315992;WS=47315974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr13	47358540	rs8192889	T	C	2649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.105;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=53;PP=1500;ReadPosRankSum=0.678;SC=ATGTGCACCATTAATACTGGG;SOR=0.484;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=145;TCF=60;TCR=85;TR=96;WE=47358548;WS=47358530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,113:0.70:162
chr13	47408902	rs58145637	A	AT	279.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.18;ReadPosRankSum=0.733;SOR=0.572;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,20:0.30:67
chr13	47470824	rs6312	C	T	5869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=123;NR=73;PP=2965;SC=TCTTCAGGGTCCACACATGAG;SOR=1.200;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=196;TCF=123;TCR=73;TR=196;WE=47470832;WS=47470814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr13	48547467	rs7320366	A	T	1744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.847;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=19;PP=1096;ReadPosRankSum=0.773;SC=GCTTCAGGAGACTCAGCAGCA;SOR=0.939;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=93;TCF=65;TCR=28;TR=66;WE=48547483;WS=48547457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,75:0.71:105
chr13	48563008	rs6561424	G	A	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.674;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=337;ReadPosRankSum=0.170;SC=CTTAAAAAATGTGACTTACGA;SOR=0.286;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=19;WE=48563016;WS=48562998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,20:0.67:30
chr13	48563246	rs6561425	A	G	954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=26;PP=748;SC=GTCCAAAAATAAGGCATTCTC;SOR=3.912;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=28;WE=48563254;WS=48563236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr13	48571213	rs8001509	C	T	6935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=140;PP=2965;SC=GTCACTCTTGCTAACTACTTG;SOR=1.335;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=227;TCF=87;TCR=140;TR=227;WE=48571221;WS=48571203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr13	48575207	rs11316376	GA	G	6863.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=86;PP=2969;SC=AGGGCACCCAGAAAAATGTCA;SOR=1.015;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=131;TCF=40;TCR=91;TR=122;WE=48575215;WS=48575197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr13	48575292	rs9567972	C	T	5761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=374;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.846;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.514;NF=123;NR=111;PP=2962;ReadPosRankSum=1.956;SC=ACCCTCGAGACGACAGCGGAC;SOR=0.595;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=339;TCF=182;TCR=157;TR=234;WE=48575300;WS=48575282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,261:0.70:374
chr13	48653864	rs5803423	CA	C	217.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=1.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.21;MQRankSum=-0.686;QD=4.44;ReadPosRankSum=0.891;SOR=0.475;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,17:0.35:49
chr13	48653957	rs138539860	AAC	A	3492.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.343;NF=22;NR=36;PP=2108;ReadPosRankSum=0.233;SC=TCTGTTTGAAAACACTCTTCG;SOR=0.691;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=177;TCF=72;TCR=105;TR=58;WE=48653966;WS=48653947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,102:0.36:284
chr13	48660380	rs41287449	T	C	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.247;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=74;ReadPosRankSum=-2.037;SC=TTAAACAACATCCTTTTTAAC;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=6;WE=48660388;WS=48660370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr13	48664556	rs3215817	TA	T	275.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FS=19.313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.663;QD=2.01;ReadPosRankSum=0.488;SOR=0.347;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:107,30:0.22:137
chr13	48671081	rs1571256	A	G	10463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=396;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=182;NR=180;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.796;SC=TACTCTAGTCAATCATTTCTT;SOR=0.231;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=363;TCF=182;TCR=181;TR=362;WE=48671089;WS=48671071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,394:1.00:395
chr13	48830601	rs3818455	A	C	2104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.781;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=61;PP=1612;ReadPosRankSum=0.666;SC=AATATTTGCTAATTTATTATA;SOR=1.025;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=124;TCF=32;TCR=92;TR=80;WE=48830609;WS=48830591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,81:0.64:126
chr13	48878271	rs2854351	T	C	871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=24;PP=691;SC=TCGGCGGGGATCCGTCCTCGC;SOR=3.258;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=28;WE=48878279;WS=48878261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr13	48878292	rs2252544	G	A	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=42;ReadPosRankSum=-0.241;SC=CAGGGGCCGGGTCCCGGCGGG;SOR=0.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=5;WE=48878300;WS=48878282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr13	48916895	rs520342	C	T	1207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.266;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=32;PP=770;ReadPosRankSum=-2.484;SC=TAAAAGGAAACGAATTCTGGA;SOR=1.139;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=69;TCF=27;TCR=42;TR=50;WE=48916903;WS=48916885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,53:0.72:74
chr13	48919358	rs198617	T	G	2936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=59;PP=1747;SC=TTTTATTAGGTTTACACTCTG;SOR=1.329;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=38;TCR=59;TR=97;WE=48919366;WS=48919348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr13	48921884	rs198616	A	G	2216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=16;PP=1599;SC=AAAAGAAGATAAATAAAGCAT;SOR=2.062;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=52;TCR=16;TR=68;WE=48921892;WS=48921874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr13	48947469	rs185587	G	T	1972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=19;PP=1169;SC=CTTGGGAGATGGAAAACATTT;SOR=1.418;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=61;TCF=42;TCR=19;TR=60;WE=48947477;WS=48947459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr13	48953655	rs11449461	C	CA	194.19	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.18;ReadPosRankSum=-0.109;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,10:0.83:12
chr13	48955659	rs4151540	C	CAA	232.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=129;ReadPosRankSum=0.169;SC=TGTTTCTTAACATCTACCTCA;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=5;WE=48955667;WS=48955649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr13	48955676	rs2804086	T	A	115.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=90;SC=CTCAAGAACATATAGGGAATT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=48955684;WS=48955666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr13	49033747	rs198580	G	A	2984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=11;PP=2208;SC=TAATTAGAGCGATTTCATGAT;SOR=3.657;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=83;TCR=11;TR=93;WE=49033755;WS=49033737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr13	49034022	rs10648129	A	AT	6294.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.16;QD=34.21;SOR=2.080;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr13	49051012	rs3020646	C	T	10094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=369;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=139;NR=204;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.594;SC=TTCCAGTAGCCGAGATGGTCA;SOR=0.446;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=344;TCF=139;TCR=205;TR=343;WE=49051020;WS=49051002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,368:1.00:369
chr13	49051481	rs3092904	T	A	1011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=15;PP=572;ReadPosRankSum=-0.694;SC=TGCATTTTTTTAATCTGCAGT;SOR=0.717;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=61;TCF=37;TCR=24;TR=39;WE=49051489;WS=49051471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,46:0.64:72
chr13	49077088	rs9332043	C	CA	6505.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.013;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.616;NF=12;NR=87;PP=2963;ReadPosRankSum=-0.632;SC=GCACAGTGACCGGGGCAGAAA;SOR=0.768;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=150;TCF=16;TCR=134;TR=99;WE=49077096;WS=49077078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,192:0.70:275
chr13	49089223	rs9316388	T	C	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.757;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=456;ReadPosRankSum=0.390;SC=TCATGTTTTATGGTATCCAAA;SOR=2.226;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=22;WE=49089231;WS=49089213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr13	49089620	rs3215827	CT	C	519.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.488;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.910;NF=10;NR=11;PP=300;ReadPosRankSum=-0.449;SC=AATTTCCATGCTTTTTTTTTT;SOR=0.396;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=37;TCF=15;TCR=22;TR=21;WE=49089628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,25:0.74:34
chr13	49107241	rs7997110	T	C	11573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=441;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=178;NR=235;PP=2965;SC=GGCGCCGCGATGAGTTGGCGC;SOR=1.027;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=413;TCF=178;TCR=235;TR=413;WE=49107249;WS=49107231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,440:1.00:440
chr13	49684341	rs3834947	C	CT	335.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.480;HP=8;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=241;ReadPosRankSum=-1.801;SC=GGAACGTTTGCTTTTTTTTCC;SOR=1.186;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=37;TCF=24;TCR=13;TR=19;WE=49684349;WS=49684331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chr13	49752915	rs1407826	A	G	506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=14;PP=364;SC=CTGTCACCCAAGCTGCTGCAG;SOR=2.833;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=49752923;WS=49752905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr13	49775997	rs45604939	A	G	3499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.090;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=61;PP=2408;ReadPosRankSum=2.354;SC=TAATGAGTCAACATCCTATAA;SOR=0.855;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=250;TCF=141;TCR=109;TR=146;WE=49776005;WS=49775987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,153:0.58:266
chr13	49794650	rs9568169	C	A	12856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=493;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=249;NR=203;PP=2965;SC=ACGTGGTGACCGTGATGCTGA;SOR=0.895;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=455;TCF=251;TCR=204;TR=452;WE=49794658;WS=49794640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,488:1.00:488
chr13	49840024	rs6561512	A	G	10564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=387;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=205;NR=146;PP=2965;SC=GGATTACTGGAAGCAGCTAAG;SOR=1.031;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=351;TCF=205;TCR=146;TR=351;WE=49840032;WS=49840014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,387:1.00:387
chr13	49852430	rs2274149	T	G	4641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=106;NR=45;PP=2965;SC=AAAAATACATTGCAAAGTGTC;SOR=1.798;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=151;TCF=106;TCR=45;TR=151;WE=49852438;WS=49852420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr13	49865748	rs6561514	A	G	4917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=70;PP=2965;SC=CTCTTACAACATGTAAGGCTG;SOR=1.119;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=179;TCF=109;TCR=70;TR=179;WE=49865756;WS=49865738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr13	49866869	rs3751418	G	C	2480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.359;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=35;PP=1544;ReadPosRankSum=1.323;SC=GAAACATTCAGAAAATTATTC;SOR=0.826;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=145;TCF=91;TCR=54;TR=98;WE=49866877;WS=49866859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,110:0.69:160
chr13	49885216	rs912547	A	G	3841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=87;PP=2561;SC=CCTCACCCACACTACTCGCGT;SOR=2.165;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=35;TCR=87;TR=122;WE=49885224;WS=49885206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr13	49913930	rs114944657	G	A	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.671;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=17;PP=326;ReadPosRankSum=-0.035;SC=TGGATTCTCCGTATTAGGCTG;SOR=0.846;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=91;TCF=49;TCR=42;TR=32;WE=49913938;WS=49913920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,36:0.33:108
chr13	49934045	rs9535208	T	C	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=27;ReadPosRankSum=-0.114;SC=TATATACATATATATATACAC;SOR=0.330;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=5;WE=49934053;WS=49934035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr13	49951027	rs111664849	G	GTAGATAGATAGATAGATAGA,GTAGATAGATAGATAGATAGATAGA	3215.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=25;NF=6;NR=1;PP=76;SC=AAGTTGAATAGTAGATAGATA;SOR=3.160;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=28;TCF=18;TCR=10;TR=7;WE=49951035;WS=49951017;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.59,0.41:44
chr13	49951142	rs8002829	T	C	8617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.066;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.307;NF=154;NR=130;PP=2965;ReadPosRankSum=0.157;SC=TCAGTGTCACTAGCAGGCCAC;SOR=0.394;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=287;TCF=155;TCR=132;TR=284;WE=49951150;WS=49951132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,317:0.99:320
chr13	49951193	rs8002858	T	C	7129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=113;NR=134;PP=2965;ReadPosRankSum=1.319;SC=CTGCTTCTGTTGGGGGTTCTT;SOR=0.351;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=248;TCF=113;TCR=135;TR=247;WE=49951201;WS=49951183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,269:1.00:270
chr13	49951310	rs8002153	G	T	1517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=33;PP=942;SC=GAATAAAAATGTTTAGGCCAT;SOR=1.654;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=16;TCR=33;TR=49;WE=49951318;WS=49951300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr13	50007393	rs7998660	C	T	656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.846;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=12;PP=358;ReadPosRankSum=1.090;SC=GTATGTTGAGCATAGTCTACA;SOR=0.430;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=96;TCF=66;TCR=30;TR=32;WE=50007401;WS=50007383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,37:0.35:105
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chr13	50050620	rs7998427	A	G	913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.196;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=2;PP=544;ReadPosRankSum=-1.175;SC=AGAACAACAGAAAATAAGGAA;SOR=0.241;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=66;TCF=61;TCR=5;TR=30;WE=50050628;WS=50050610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,37:0.50:74
chr13	50054308	rs4142285	G	A	1008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FS=1.130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.00;ReadPosRankSum=0.014;SOR=0.800;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:185,67:0.27:252
chr13	50054346	rs7996852	G	T	1483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=401;ExcessHet=3.0103;FS=0.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.03;MQRankSum=-0.571;QD=3.74;ReadPosRankSum=0.655;SOR=0.658;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:298,99:0.25:397
chr13	50057097	rs2057413	G	A	1067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.698;NF=23;NR=35;PP=627;ReadPosRankSum=-0.479;SC=GGAGCTTACTGTGTAAGTAAC;SOR=0.664;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=170;TCF=66;TCR=104;TR=58;WE=50057105;WS=50057087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,61:0.34:182
chr13	50057633	rs11619265	A	G	1337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=34;PP=762;ReadPosRankSum=-1.626;SC=CAAGAATTCAATATCATTCAG;SOR=0.670;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=197;TCF=105;TCR=92;TR=72;WE=50057641;WS=50057623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,76:0.37:207
chr13	50080847	rs2031532	A	G	2501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=358;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.284;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=65;PP=1470;ReadPosRankSum=-0.889;SC=ATAATGTCCTATACTTTGCAC;SOR=0.771;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=326;TCF=157;TCR=169;TR=122;WE=50080855;WS=50080837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:223,135:0.38:358
chr13	50087142	rs2247119	T	C	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=4.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.72;ReadPosRankSum=0.441;SOR=1.616;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,14:0.19:72
chr13	50092127	rs66480424	TACTC	T	632.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.126;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.808;NF=9;NR=4;PP=491;ReadPosRankSum=-0.971;SC=AACAGGTACTTACTCAGTAAA;SOR=0.476;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=51;TCF=35;TCR=16;TR=13;WE=50092138;WS=50092117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,21:0.28:74
chr13	50095127	rs3765526	A	G	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.836;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=16;PP=364;ReadPosRankSum=-0.803;SC=GTAAACATTTATGTAACATAA;SOR=0.527;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=93;TCF=40;TCR=53;TR=29;WE=50095135;WS=50095117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,31:0.31:100
chr13	50096127	rs2274277	C	G	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=309;ReadPosRankSum=0.507;SC=TGTAGTCAAACAGTAATCTTT;SOR=0.604;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=51;TCF=40;TCR=11;TR=21;WE=50096135;WS=50096117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,21:0.38:56
chr13	50100090	rs7322908	T	A	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.233;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=83;ReadPosRankSum=-1.774;SC=GGATCATCTGTGGTCAGCAGT;SOR=0.195;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=10;WE=50100098;WS=50100080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr13	50100389	rs7323493	T	C	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=144;ReadPosRankSum=0.373;SC=GCTGCTGCTGTTGCCATCTAA;SOR=0.693;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=58;TCF=44;TCR=14;TR=17;WE=50100397;WS=50100379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,23:0.32:71
chr13	50100627	rs10546233	GTT	G	885.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.089;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.662;NF=0;NR=13;PP=1130;ReadPosRankSum=0.068;SC=GAGCAGCATAGTTTTGAGAAA;SOR=0.396;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=1;TCR=48;TR=13;WE=50100655;WS=50100617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,28:0.30:92
chr13	50100637	rs371713260	ATATT	A	811.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.968;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=1129;ReadPosRankSum=-0.553;SC=GTTTTGAGAAATATTTATCAC;SOR=0.530;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=11;WE=50100655;WS=50100617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,24:0.33:72
chr13	50100647	rs61960012	C	T	829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.133;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=10;PP=787;ReadPosRankSum=0.223;SC=ATATTTATCACGATATTGAAA;SOR=0.459;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=60;TCF=24;TCR=36;TR=19;WE=50100655;WS=50100617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,23:0.33:69
chr13	50100667	rs6561533	G	A	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.249;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=145;ReadPosRankSum=0.890;SC=ACAATATACTGTACAGGTGAT;SOR=0.892;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=44;TCF=14;TCR=30;TR=14;WE=50100675;WS=50100657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,15:0.31:49
chr13	50102810	rs1046295	G	A	2001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=372;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.396;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=46;PP=1232;ReadPosRankSum=0.792;SC=AGGGATTACCGTTTCCTAAGC;SOR=0.839;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=343;TCF=189;TCR=154;TR=107;WE=50102818;WS=50102800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:255,117:0.31:372
chr13	50108252	rs7317982	T	C	1231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FS=1.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.07;ReadPosRankSum=0.284;SOR=0.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:133,70:0.34:203
chr13	50115669	rs1536195	C	T	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.208;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=152;ReadPosRankSum=-0.815;SC=CACAATACTACTTTTAAAGAT;SOR=0.242;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=12;WE=50115677;WS=50115659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr13	50121211	rs1570883	G	A	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.51;ReadPosRankSum=0.603;SOR=0.620;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,9:0.27:33
chr13	50121311	.	CA	C	92.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.131;ClippingRankSum=0.000;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=1.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.52;ReadPosRankSum=-2.330;SOR=0.926;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,14:0.23:61
chr13	50121511	rs1570884	A	G	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.253;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=19;PP=342;ReadPosRankSum=-0.704;SC=TTAACCTTCAATATCAATTGC;SOR=1.121;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=90;TCF=28;TCR=62;TR=25;WE=50121519;WS=50121501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,29:0.30:96
chr13	50123622	rs3751384	G	C	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.046;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=275;ReadPosRankSum=-1.149;SC=ACGAGACGGCGGGAGTGGCAA;SOR=0.529;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=87;TCF=66;TCR=21;TR=23;WE=50123630;WS=50123612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,24:0.27:90
chr13	50126382	rs2274278	G	A	1148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=25;PP=646;ReadPosRankSum=1.764;SC=TTGTTTCCCAGGCCCAGCTGA;SOR=0.725;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=79;TCR=68;TR=54;WE=50126390;WS=50126372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,61:0.37:163
chr13	50129615	rs2274284	A	G	1952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.424;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=44;PP=1284;ReadPosRankSum=-0.995;SC=ATTGAAAAAGAAGGTAGAAAG;SOR=0.644;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=304;TCF=176;TCR=128;TR=105;WE=50129623;WS=50129605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:221,112:0.34:333
chr13	50134358	rs12146924	T	C	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-4.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.675;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=197;ReadPosRankSum=-0.945;SC=TAAGTAACCATGGACAGAGTA;SOR=0.330;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=61;TCF=7;TCR=54;TR=20;WE=50134366;WS=50134348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,21:0.34:62
chr13	50141345	rs4942848	G	A	1112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.016;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=23;PP=652;ReadPosRankSum=0.684;SC=GAAGACACACGCCTTCCGAAT;SOR=0.608;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=146;TCF=77;TCR=69;TR=52;WE=50141353;WS=50141335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,59:0.36:164
chr13	50205025	rs3803185	T	C	2808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=470;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.552;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=79;PP=1518;ReadPosRankSum=-0.102;SC=CCAGGACCACTGCTGGGAGCT;SOR=0.636;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=443;TCF=215;TCR=228;TR=153;WE=50205033;WS=50205015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:309,159:0.34:468
chr13	50244041	rs9535292	T	C	1518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.230;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=46;PP=898;ReadPosRankSum=0.456;SC=AGGATGGCACTGTAGACACAT;SOR=0.561;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=250;TCF=101;TCR=149;TR=81;WE=50244049;WS=50244031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:181,88:0.33:269
chr13	50260905	rs6561552	T	C	662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=5.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=23;PP=479;ReadPosRankSum=0.966;SC=CAACTCAATTTACATTTTTCA;SOR=0.697;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=88;TCF=13;TCR=75;TR=26;WE=50260913;WS=50260895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,29:0.31:95
chr13	50296026	rs9535310	T	C	1248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=22;PP=922;ReadPosRankSum=-0.523;SC=GTCCCCTGTATATGAATTCCT;SOR=0.716;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=177;TCF=118;TCR=59;TR=63;WE=50296034;WS=50296016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,63:0.33:192
chr13	50296115	rs1127021	C	T	2218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=403;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.880;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=62;PP=1254;ReadPosRankSum=0.787;SC=CCATAGGCGGCGGGGGATCCT;SOR=0.795;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=364;TCF=186;TCR=178;TR=120;WE=50296123;WS=50296105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:271,131:0.33:402
chr13	50299677	rs2273817	T	C	926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.465;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=28;PP=639;ReadPosRankSum=0.156;SC=GACACATAACTACCACTTAAA;SOR=0.532;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=131;TCF=46;TCR=85;TR=45;WE=50299685;WS=50299667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,49:0.35:141
chr13	50306823	rs11342957	GA	G	1017.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=1.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.22;MQRankSum=1.872;QD=8.21;ReadPosRankSum=2.337;SOR=0.566;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,58:0.47:124
chr13	50464697	.	T	TG	228	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=24;MQ=60.3;NF=7;NR=1;PP=228;QD=33.875;SC=CCTGGGTTACTGCGGCCACCG;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=8;WE=50464705;WS=50464687;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:23,8:0.26:31
chr13	50466990	rs144184696	T	C	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=452;ExcessHet=3.0103;FS=5.370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.57;MQRankSum=-13.262;QD=0.15;ReadPosRankSum=-1.614;SOR=0.809;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:395,57:0.13:452
chr13	50467038	rs375406271	CT	C	3409.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=564;ExcessHet=3.0103;FS=6.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.21;MQRankSum=-21.114;QD=6.06;ReadPosRankSum=3.924;SOR=1.219;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:447,116:0.21:563
chr13	50467044	.	G	C	3412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.953;ClippingRankSum=0.000;DP=553;ExcessHet=3.0103;FS=5.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQRankSum=-20.897;QD=6.17;ReadPosRankSum=4.868;SOR=1.155;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:438,115:0.21:553
chr13	50467124	rs7316930	T	C	1904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.995;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.780;NF=22;NR=57;PP=1015;ReadPosRankSum=-1.182;SC=TCCAGAACCATGGCAAGAAAC;SOR=1.310;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=193;TCF=64;TCR=129;TR=79;WE=50467132;WS=50467114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,85:0.41:206
chr13	50510199	rs9670083	A	C	914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.245;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=9;PP=612;ReadPosRankSum=-1.358;SC=TCTGACCCTGAAGGTCCCCCT;SOR=0.426;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=51;TCF=39;TCR=12;TR=35;WE=50510207;WS=50510189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,38:0.67:57
chr13	50510401	rs1063181	C	G	2629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.211;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=57;PP=1631;ReadPosRankSum=-0.566;SC=CCGCCGCCGTCCCTAGACCGA;SOR=0.825;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=164;TCF=74;TCR=90;TR=103;WE=50510409;WS=50510391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,115:0.63:182
chr13	50590292	rs10675754	T	TCTC	325.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.928;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=284;ReadPosRankSum=-0.908;SC=GCCTGTAACTTCTGGAAAAGA;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=7;WE=50590300;WS=50590282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr13	50656797	rs7325993	C	A	992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.990;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=30;PP=647;ReadPosRankSum=0.964;SC=GTGGATGAATCCACATCTGTC;SOR=0.544;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=18;TCR=55;TR=40;WE=50656805;WS=50656787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,44:0.54:81
chr13	51522081	.	AT	A	56.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.581;ClippingRankSum=0.000;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=1.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.21;MQRankSum=1.978;QD=1.09;ReadPosRankSum=-0.710;SOR=0.325;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,11:0.21:52
chr13	51590433	rs17075173	C	T	2369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=512;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.573;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=80;PP=1498;ReadPosRankSum=1.603;SC=ACACCTCCTACCACCATATAA;SOR=0.661;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=476;TCF=209;TCR=267;TR=143;WE=51590441;WS=51590423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:360,151:0.30:511
chr13	51594741	rs1328361	T	G	3849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.567;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=79;PP=2468;ReadPosRankSum=1.781;SC=GTGGTGTCGTTGGGGGCGATG;SOR=0.808;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=238;TCF=117;TCR=121;TR=152;WE=51594749;WS=51594731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,167:0.65:258
chr13	51603768	rs9568497	T	C	3617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.939;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=65;PP=2478;ReadPosRankSum=0.592;SC=ATCCGAGTAGTAATGGAGAAA;SOR=0.771;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=254;TCF=143;TCR=111;TR=148;WE=51603776;WS=51603758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,160:0.58:274
chr13	51826044	rs17075482	G	C	2066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.336;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=49;PP=1235;ReadPosRankSum=-1.290;SC=CTGTCGCTACGACAACTATGC;SOR=0.605;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=321;TCF=167;TCR=154;TR=102;WE=51826052;WS=51826034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:235,118:0.33:353
chr13	51918558	rs17790811	G	A	4565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=99;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.257;SC=GGAACCAGCCGACCTCAGTGA;SOR=0.677;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=290;TCF=141;TCR=149;TR=192;WE=51918566;WS=51918548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,199:0.65:308
chr13	51922287	rs17194955	G	A	1062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=10;PP=744;ReadPosRankSum=1.170;SC=CTCAGGGTCCGACACTGGTTC;SOR=0.734;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=58;TCF=46;TCR=12;TR=44;WE=51922295;WS=51922277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,46:0.72:64
chr13	51929304	rs4942995	G	T	2125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.847;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=44;PP=1128;ReadPosRankSum=0.363;SC=TCTTCCAAACGTTCTAGCCGT;SOR=0.553;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=162;TCF=72;TCR=90;TR=84;WE=51929312;WS=51929294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,101:0.55:184
chr13	51935649	rs71785351	CAA	C	428.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=287;ReadPosRankSum=-0.911;SC=CTAAAGAAAACAAAAAGTTTT;SOR=0.892;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=9;WE=51935658;WS=51935639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr13	51943057	rs45535533	G	A	732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FS=2.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.29;ReadPosRankSum=0.156;SOR=0.488;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:123,48:0.28:171
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chr13	51956122	rs9526753	T	C	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.197;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=330;ReadPosRankSum=1.681;SC=CAGGCGTGAGTCACTGCGCCC;SOR=2.331;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=16;WE=51956130;WS=51956112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
chr13	51963594	rs368336972	AAAG	A	3575.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.073;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.759;NF=11;NR=80;PP=2987;ReadPosRankSum=0.068;SC=AGATTAAAAAAAAGAAGAAGA;SOR=0.813;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=153;TCF=22;TCR=131;TR=91;WE=51963607;WS=51963583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,144:0.63:227
chr13	51969696	rs3825524	C	T	2246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=62;PP=1566;ReadPosRankSum=-0.639;SC=ATTACACTTACGTTAGAACTG;SOR=0.655;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=137;TCF=39;TCR=98;TR=86;WE=51969704;WS=51969686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,95:0.64:148
chr13	51997076	rs9568592	T	C	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.471;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=189;ReadPosRankSum=-0.473;SC=CCCTCAAAACTTTACTCCTTT;SOR=1.445;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=9;WE=51997084;WS=51997066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr13	51997112	rs116927067	T	C	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=73;ReadPosRankSum=0.449;SC=GAACCTTCTGTTTATTTCTGC;SOR=1.154;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=6;WE=51997120;WS=51997102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,6:0.22:27
chr13	51997199	rs9568593	C	T	2037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=31;PP=1188;ReadPosRankSum=-0.209;SC=TCTAGCCTTGCTTAATTCCAT;SOR=0.646;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=69;TCR=42;TR=81;WE=51997207;WS=51997189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,89:0.72:123
chr13	52293509	rs3803201	C	T	864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=21;PP=581;SC=ACAAAAATCTCTTAGTGGGAA;SOR=2.910;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=26;WE=52293517;WS=52293499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr13	52293532	rs912097	T	C	537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=11;PP=298;SC=TAACTGTTGTTCTCTTTGATT;SOR=2.833;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=52293540;WS=52293522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr13	52332153	rs5803570	AT	A	1120.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=46;NR=0;PP=945;SC=GATTTCTTGTATTTTTTTTTT;SOR=7.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=55;TCR=0;TR=46;WE=52332162;WS=52332143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr13	52343577	.	C	T	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5065;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=189;ReadPosRankSum=0.778;SC=CCAAGCCACTCGGAACCAGTT;SOR=0.818;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=9;WE=52343585;WS=52343567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr13	52346146	.	G	A	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=126;ReadPosRankSum=1.947;SC=ATCTTACACTGGACTCTGCAG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=8;WE=52346154;WS=52346136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr13	52351037	rs2296026	C	T	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.113;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=253;ReadPosRankSum=2.495;SC=TCTTGGCATGCCTCCACTTCC;SOR=0.450;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=57;TCF=44;TCR=13;TR=22;WE=52351045;WS=52351027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,26:0.42:62
chr13	52365185	rs2760303	G	C	883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=5;PP=619;SC=AAGCATAAGAGAGTCTTACTA;SOR=2.621;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=27;WE=52365193;WS=52365175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr13	52365407	.	CAA	C,CA	354.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.041;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.87;ReadPosRankSum=0.511;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:1,8,8:0.47,0.47:17
chr13	52372070	.	G	C	4616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.983;ClippingRankSum=0.000;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=84;PP=2907;ReadPosRankSum=0.290;SC=GAAACCATCTGTGAGTTACAG;SOR=0.696;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=296;TCF=157;TCR=139;TR=180;WE=52372078;WS=52372060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,200:0.61:329
chr13	52425587	rs36141261	A	AT	2696.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FS=8.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.25;ReadPosRankSum=-0.829;SOR=1.463;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,135:0.81:166
chr13	52440130	rs1054515	A	G	11144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=420;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=189;NR=202;PP=2965;SC=CAATGGCCACATTGCCGGAGA;SOR=0.879;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=391;TCF=189;TCR=202;TR=391;WE=52440138;WS=52440120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,420:1.00:420
chr13	52482429	rs6561654	T	C	4159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.23;QD=37.82;SOR=0.888;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr13	52482451	rs201406153	GT	G	2125.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.93;MQRankSum=0.383;QD=25.31;ReadPosRankSum=-1.703;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,82:0.98:84
chr13	52482454	.	GGGGC	G	3471.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.73;QD=43.40;SOR=1.923;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr13	52483545	rs61740022	G	A	1555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=47;PP=941;ReadPosRankSum=0.924;SC=TTCTCTAACCGGTTATTTTCC;SOR=0.722;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=202;TCF=74;TCR=128;TR=73;WE=52483553;WS=52483535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,80:0.37:214
chr13	52492525	rs9596613	A	C	6788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.33;ReadPosRankSum=1.855;SOR=0.837;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,266:0.99:268
chr13	52511362	rs9535795	C	G	4612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=88;NR=65;PP=2965;SC=ACCTGGGAGACAGAAGCCTTT;SOR=1.004;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=153;TCF=88;TCR=65;TR=153;WE=52511370;WS=52511352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr13	52511606	rs2282057	G	A	1449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.983;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NR=43;ReadPosRankSum=0.908;SC=CTGCAGCCACGCTCACTCTGA;SOR=0.434;Source=Platypus;WE=52511614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,82:0.34:241
chr13	52513266	rs7334118	T	C	4963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=112;NR=90;PP=2954;ReadPosRankSum=0.490;SC=CTGCAGCGTGTGCACAGCCAG;SOR=0.671;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=306;TCF=171;TCR=135;TR=202;WE=52513274;WS=52513256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,215:0.66:325
chr13	52515354	rs1801249	A	G	6860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=110;NR=119;PP=2965;SC=GGTCTGGGGGACTGCATCTAT;SOR=0.889;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=230;TCF=111;TCR=119;TR=229;WE=52515362;WS=52515344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr13	52520704	rs2296246	C	A	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=18;PP=344;ReadPosRankSum=0.492;SC=CAGGGGGGCACTGGACACAAC;SOR=0.602;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=54;TCF=18;TCR=36;TR=26;WE=52520712;WS=52520694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,29:0.51:57
chr13	52523808	rs732774	C	T	7168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=158;NR=87;PP=2965;SC=AGGAAAGTATCTCTGAACAAC;SOR=1.381;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=245;TCF=158;TCR=87;TR=245;WE=52523829;WS=52523798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chr13	52524488	rs1061472	T	C	1292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.112;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=38;PP=770;ReadPosRankSum=0.497;SC=AGGGACCACCTTGACGATATC;SOR=0.518;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=164;TCF=54;TCR=110;TR=60;WE=52524496;WS=52524478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,65:0.37:176
chr13	52524560	rs9526811	C	T	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=137;ReadPosRankSum=-0.654;SC=ACTTATCACTCACATGGCCAC;SOR=1.123;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=10;WE=52524568;WS=52524550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,11:0.30:37
chr13	52534157	rs78021873	G	T	819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=6;PP=590;ReadPosRankSum=0.869;SC=CCTGGGTGGGGCAGGAAAGCT;SOR=0.956;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=40;TCF=32;TCR=8;TR=31;WE=52534165;WS=52534147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,33:0.79:42
chr13	52536114	rs9535809	C	T	2925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.262;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=79;PP=1908;ReadPosRankSum=-1.196;SC=TATGCATTGGCAGAAAGCACT;SOR=0.827;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=176;TCF=68;TCR=108;TR=125;WE=52536122;WS=52536104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,130:0.69:188
chr13	52542796	rs2147363	T	G	605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=15;PP=426;SC=GGCCTCTAGGTTGACACAGTC;SOR=3.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=52542804;WS=52542786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr13	52544577	rs151202111	C	T	1489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.331;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=10;PP=863;ReadPosRankSum=-0.213;SC=AGGGAGAATACGAGGTCTATA;SOR=1.159;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=82;TCF=62;TCR=20;TR=53;WE=52544585;WS=52544567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,63:0.68:93
chr13	52544805	rs1801244	C	G	3065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=433;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.541;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=69;PP=1848;ReadPosRankSum=1.041;SC=ACTTCCTGCACAGATGTAGGT;SOR=0.623;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=392;TCF=196;TCR=196;TR=142;WE=52544813;WS=52544795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:271,161:0.37:432
chr13	52544978	rs3742288	T	G	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=149;ReadPosRankSum=0.555;SC=GAGGGTTCATTGTCCCGGCTC;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=9;WE=52544986;WS=52544968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr13	52548140	rs1801243	A	C	1876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=338;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.55;ReadPosRankSum=-0.264;SOR=0.699;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:228,110:0.33:338
chr13	52585548	rs2277448	G	T	7094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=143;PP=2965;SC=GAGGAGAGCGGGGTGTTAAAG;SOR=1.128;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=244;TCF=101;TCR=143;TR=244;WE=52585556;WS=52585538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr13	52585591	rs148013251	T	TCGGCG	870.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=3.679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.43;MQRankSum=3.719;QD=8.54;ReadPosRankSum=-0.582;SOR=0.327;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,28:0.27:102
chr13	52598189	rs17480245	A	G	3537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.985;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=49;PP=2287;ReadPosRankSum=-0.517;SC=GTTAATGTCAACGGTCAACAG;SOR=0.904;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=194;TCF=123;TCR=71;TR=139;WE=52598197;WS=52598179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,149:0.72:207
chr13	52602919	rs3825528	A	C	1141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=18;PP=730;ReadPosRankSum=-0.422;SC=CTTGGTATACATGAGAGAGGC;SOR=0.742;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=172;TCF=116;TCR=56;TR=57;WE=52602927;WS=52602901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,62:0.34:184
chr13	52603194	rs3742289	G	T	9380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=148;NR=162;PP=2965;SC=GAAAAGCTGGGCCTTGCAGAT;SOR=0.821;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=310;TCF=148;TCR=162;TR=310;WE=52603202;WS=52603184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,330:1.00:330
chr13	52603775	rs3742291	C	T	11338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=421;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=207;NR=183;PP=2965;SC=AACTGTGGCACTGGAAGAAAT;SOR=0.722;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=392;TCF=208;TCR=184;TR=390;WE=52603783;WS=52603765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,420:1.00:420
chr13	52639462	rs71437831	T	C	2177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.910;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=16;PP=1396;ReadPosRankSum=2.620;SC=CAAGTCTCTTTAGGCATAGGG;SOR=0.537;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=104;TCF=83;TCR=21;TR=75;WE=52639470;WS=52639452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,84:0.72:116
chr13	52649974	.	CA	C	69.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=-0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQRankSum=-0.000;QD=5.36;ReadPosRankSum=-0.344;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr13	52657287	rs9563091	A	G	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.901;HP=12;HapScore=3;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=115;ReadPosRankSum=-0.412;SC=TCTCATAGAAAAAAAAAAAAA;SOR=0.223;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=49;TCF=43;TCR=6;TR=14;WE=52657295;WS=52657274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,14:0.35:40
chr13	52657689	rs12585654	T	G	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.73;ReadPosRankSum=0.882;SOR=2.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr13	52663491	rs9535861	A	G	4559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=77;PP=2945;SC=AAACTTGAACAAATCTTAGGC;SOR=0.872;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=152;TCF=75;TCR=77;TR=152;WE=52663499;WS=52663481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr13	52673787	rs143521332	A	T	1474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.979;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=17;PP=945;ReadPosRankSum=-0.486;SC=GCCTGGCGACAGAGCGAGACT;SOR=0.469;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=86;TCF=62;TCR=24;TR=57;WE=52673795;WS=52673777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,61:0.66:93
chr13	52678741	rs34326189	A	G	1344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.062;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=37;PP=932;ReadPosRankSum=0.219;SC=TTCTTAATAAAAGCTTTTATC;SOR=1.030;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=81;TCF=24;TCR=57;TR=51;WE=52678749;WS=52678731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,55:0.65:85
chr13	52684801	rs71665641	TAC	T	835.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.588;NF=0;NR=24;PP=993;ReadPosRankSum=-1.937;SC=ATAGAAATTATACACACACAC;SOR=0.842;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=72;TCF=1;TCR=71;TR=24;WE=52684812;WS=52684791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,31:0.47:66
chr13	52684803	rs34283630	C	T	710.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-1.233;NF=9;NR=36;PP=1372;ReadPosRankSum=3.090;SC=AGAAATTATACACACACACAC;SOR=0.843;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=86;TCF=18;TCR=68;TR=45;WE=52684812;WS=52684791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,34:0.44:78
chr13	52701490	rs3076657	A	ACTT	8684.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=38;PP=2971;SC=AGAAATTTGAACTTAACTTTA;SOR=1.898;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=129;TCF=79;TCR=50;TR=105;WE=52701498;WS=52701480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr13	52701637	rs1886544	T	G	11720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=436;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=174;NR=235;PP=2965;SC=ATGGGCTGAGTTTCCTGGAAT;SOR=1.067;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=410;TCF=174;TCR=236;TR=409;WE=52701645;WS=52701627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,436:1.00:436
chr13	52701782	rs1886543	T	C	577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=469;SC=AATAACTTTCTTTGTGGCCAC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=52701790;WS=52701772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr13	52707240	rs3368	C	G	1826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=413;ExcessHet=3.0103;FS=1.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.43;ReadPosRankSum=0.299;SOR=0.829;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:298,114:0.28:412
chr13	52707751	rs3831081	T	TCACACA	985.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=33.99;ReadPosRankSum=-0.660;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,24:0.83:29
chr13	52709742	rs2408611	G	A	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=3.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=67;ReadPosRankSum=-0.685;SC=ACAATGTGACGTACTTAGTGC;SOR=0.616;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=5;WE=52709750;WS=52709740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr13	52710044	rs2296350	T	C	925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.855;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=28;PP=1010;ReadPosRankSum=-1.102;SC=AAAAAAGATTTTTCAGCATGT;SOR=0.276;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=99;TCF=24;TCR=75;TR=40;WE=52710066;WS=52710034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,45:0.41:110
chr13	52710058	rs2296349	T	G	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.213;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=1010;ReadPosRankSum=0.371;SC=AGCATGTACTTTCCAGATCAT;SOR=0.394;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=63;TCF=12;TCR=51;TR=21;WE=52710066;WS=52710034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,25:0.36:69
chr13	52715168	rs55969405	T	A	5123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.981;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.598;NF=118;NR=90;PP=2909;ReadPosRankSum=-0.175;SC=CTGTGCTTGCTTCATTTCCCA;SOR=0.615;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=283;TCF=163;TCR=120;TR=208;WE=52715176;WS=52715158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,229:0.73:313
chr13	52717950	rs3783242	C	T	653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=0;PP=523;SC=GGAGTATCTCCGATAATCATT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=52717958;WS=52717940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr13	52718050	rs3837575	C	CT	3476.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=36;PP=1598;SC=AAAATTCTTACTTTTTTTCTT;SOR=1.093;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=74;TCF=23;TCR=51;TR=53;WE=52718058;WS=52718040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr13	52726707	.	CT	C	728.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.140;ClippingRankSum=0.000;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=4.872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.34;ReadPosRankSum=0.767;SOR=0.295;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,42:0.54:78
chr13	52952928	rs113543720	CA	C	793.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.381;NF=0;NR=27;PP=481;ReadPosRankSum=-0.210;SC=TGGAAAGCTGCAAAAAAAAAC;SOR=2.242;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=27;WE=52952936;WS=52952918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,32:0.97:33
chr13	52971893	rs3803264	G	A	9635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=352;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=155;NR=162;PP=2965;SC=CATCCACTACGATGTTGGGCT;SOR=0.782;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=319;TCF=156;TCR=163;TR=317;WE=52971901;WS=52971883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,351:1.00:351
chr13	52989863	rs1056335	C	T	1253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=1;PP=908;SC=TGTGAAGTTCCAATAAATTCT;SOR=5.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=33;WE=52989871;WS=52989853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr13	53009048	rs11148252	C	T	2615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=55;PP=1658;SC=CTTTAAATGACTCAGTCAGAT;SOR=1.396;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=91;TCF=31;TCR=60;TR=86;WE=53009056;WS=53009038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr13	53029770	rs72440971	CGCGGTGGCGGTGGCGGTG	C,CGCGGTG	4713.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=24;NF=3,3;NR=52,52;PP=593,2987;SC=AGGTGAAGGCCGCGGTGGCGG;SOR=3.066;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=123;TCF=6;TCR=117;TR=55,55;WE=53029795;WS=53029760;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.33,0.67:114
chr13	53030565	rs9536079	G	A	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=54;ReadPosRankSum=0.057;SC=AACCAGCTTTGGAAGTAAACT;SOR=0.223;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=7;WE=53030573;WS=53030555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,7:0.24:29
chr13	53035783	rs7337054	T	C	11888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=438;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=201;NR=206;PP=2965;SC=TCAGTAGAACTTCTGCCAATG;SOR=0.793;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=407;TCF=201;TCR=206;TR=407;WE=53035791;WS=53035773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,437:1.00:437
chr13	53035925	rs7335867	A	G	12454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=444;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=233;NR=183;PP=2965;SC=ATCTGAAGTTATAGCCAGGCC;SOR=0.939;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=416;TCF=233;TCR=183;TR=416;WE=53035933;WS=53035915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,443:1.00:443
chr13	53036398	rs3803262	A	G	1491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=1;PP=1267;SC=TATGCCATTAAAGTAAGATTA;SOR=6.229;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=45;TCF=44;TCR=1;TR=45;WE=53036406;WS=53036388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr13	53049267	rs34494025	T	C	6139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=446;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=106;NR=139;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.565;SC=ATGAGGCTGATACAACATAAG;SOR=0.662;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=402;TCF=172;TCR=230;TR=245;WE=53049275;WS=53049257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,272:0.61:445
chr13	53233194	rs9536223	A	T	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.498;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5005;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=118;ReadPosRankSum=-0.017;SC=AGGTTTATTAACATACACTTA;SOR=1.426;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=8;WE=53233202;WS=53233184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr13	53238148	rs112815564	C	T	1644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.775;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=25;PP=909;ReadPosRankSum=-1.259;SC=TTTCAACTTACCAAAATCAAT;SOR=0.916;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=140;TCF=82;TCR=58;TR=69;WE=53238156;WS=53238138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,78:0.49:158
chr13	53240884	rs9316580	G	C	87.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=104;SC=ATTATTTTGTGTAGGTTTTTT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=53240892;WS=53240874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr13	53254082	rs4539485	T	C	1990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=22;PP=1357;SC=TGTTGATTAATTACTTCTGCC;SOR=1.512;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=45;TCR=22;TR=67;WE=53254090;WS=53254072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr13	53254296	rs7986540	A	G	1237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=12;NR=29;PP=895;SC=CCTTTGTAAGAATATAAACTT;SOR=1.954;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=12;TCR=29;TR=41;WE=53254304;WS=53254286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr13	53286822	rs62637607	A	G	1598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=24;PP=1139;ReadPosRankSum=2.792;SC=GGAAAGTTGTAAACAGCTTAA;SOR=0.793;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=92;TCF=59;TCR=33;TR=65;WE=53286830;WS=53286812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,66:0.69:96
chr13	53419139	rs2236363	T	G	1070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.867;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=27;PP=688;ReadPosRankSum=0.700;SC=GCTTCCATCTTCAGCATGTCA;SOR=0.895;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=77;TCF=32;TCR=45;TR=44;WE=53419147;WS=53419129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,49:0.59:83
chr13	53421432	rs3742300	C	A	4171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.558;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=71;PP=2306;ReadPosRankSum=-0.328;SC=CGTCCGCTCCCCCGAGTGCAG;SOR=0.749;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=212;TCF=115;TCR=97;TR=159;WE=53421451;WS=53421422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,181:0.76:237
chr13	53422553	rs3742301	A	G	7257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=467;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.643;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=136;NR=163;PP=2962;ReadPosRankSum=0.240;SC=GGGCTGCCCCAACGCCTCACA;SOR=0.897;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=443;TCF=208;TCR=235;TR=299;WE=53422561;WS=53422543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,318:0.68:466
chr13	54886105	rs10162244	G	C	822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.448;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=18;PP=565;ReadPosRankSum=1.414;SC=AAAATTAGAAGTGTTTCACTA;SOR=0.834;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=66;TCR=52;TR=40;WE=54886113;WS=54886095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,44:0.33:134
chr13	55748673	rs1572687	T	C	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=10;PP=228;ReadPosRankSum=-0.851;SC=AATTAGTCAATAATTTCTGTT;SOR=0.743;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=30;TCF=14;TCR=16;TR=19;WE=55748681;WS=55748663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,22:0.65:34
chr13	59103355	rs4886083	A	G	1351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.224;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=39;PP=920;ReadPosRankSum=0.048;SC=GAATGAAGAAAGAATGAAGAT;SOR=0.506;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=225;TCF=90;TCR=135;TR=69;WE=59103363;WS=59103345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,74:0.31:239
chr13	60240961	rs9538494	C	T	8069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=122;NR=155;PP=2965;SC=ACCCTTCTGTCAACTGCACTT;SOR=0.990;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=277;TCF=122;TCR=155;TR=277;WE=60240969;WS=60240951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,304:1.00:304
chr13	60385060	rs10665848	A	ATTAC	2733.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=35;PP=1538;SC=ATTGCTTGCTAAAAAAATTTT;SOR=2.265;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=35;WE=60385068;WS=60385050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr13	60582651	rs339540	C	G	899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=4;PP=635;SC=CATTTAAAAACAGATTTTATA;SOR=2.621;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=27;WE=60582659;WS=60582641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr13	60590299	rs2762134	C	T	5506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=113;PP=2965;SC=AGAAAAAAGACAGTTACACAT;SOR=1.318;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=187;TCF=73;TCR=114;TR=186;WE=60590307;WS=60590289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr13	60617060	rs2800294	A	G	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=97;ReadPosRankSum=0.480;SC=ACTATAATTAACACTATTTGG;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=6;WE=60617068;WS=60617050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr13	61986918	rs3812872	C	A	8143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=587;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=163;NR=173;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.272;SC=TCAGATAAACCACACCATCTA;SOR=0.695;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=531;TCF=253;TCR=278;TR=336;WE=61986926;WS=61986908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:225,362:0.62:587
chr13	61988107	rs4281600	T	G	8891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=126;NR=179;PP=2965;SC=ATGCTGGAGTTGGGGGAGGGA;SOR=1.120;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=307;TCF=126;TCR=181;TR=305;WE=61988115;WS=61988097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,327:1.00:327
chr13	61988153	rs3812873	C	G	2691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.296;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=74;PP=1847;ReadPosRankSum=0.255;SC=AATAGGGGTCCGAGAGAGAAA;SOR=0.236;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=147;TCF=38;TCR=109;TR=106;WE=61988161;WS=61988143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,111:0.73:153
chr13	63745832	rs298898	G	A	4822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=74;PP=2897;SC=AAATGGGATAGGATAATGATC;SOR=0.821;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=167;TCF=92;TCR=75;TR=165;WE=63745840;WS=63745822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr13	66540575	rs3843944	C	T	832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.017;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=18;PP=477;ReadPosRankSum=0.657;SC=TGGGGTTTACCACTGAAGCAT;SOR=0.987;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=155;TCF=91;TCR=64;TR=48;WE=66540583;WS=66540565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,52:0.32:165
chr13	66792439	rs76595065	T	C	758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.666;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=13;PP=438;ReadPosRankSum=1.112;SC=CAGTCACATATCTAGTGTCTA;SOR=0.876;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=89;TCF=51;TCR=38;TR=34;WE=66792447;WS=66792429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,38:0.40:96
chr13	67800935	rs9571740	G	A	3213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=442;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.805;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=64;PP=1912;ReadPosRankSum=-1.144;SC=GGGTCCCATTGTCCCTGGCAG;SOR=0.836;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=408;TCF=221;TCR=187;TR=151;WE=67800943;WS=67800925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:276,166:0.38:442
chr13	67802339	rs8000556	A	T	7734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=113;NR=152;PP=2965;SC=TGCTGCTGGAAACTTTCACCA;SOR=1.056;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=265;TCF=113;TCR=152;TR=265;WE=67802347;WS=67802329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,287:1.00:287
chr13	70314433	rs1559465	A	G	222.56	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.7362;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=177;ReadPosRankSum=0.282;SC=TTTTAAAACAATTTTTACCAG;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=8;WE=70314441;WS=70314423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr13	70314807	rs7331253	A	T	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=261;ReadPosRankSum=2.479;SC=ATGAAAAAAAATTAAAAATTG;SOR=1.739;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=12;WE=70314815;WS=70314797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr13	70370853	rs17727950	A	G	1815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=2.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.148;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=9;PP=1252;ReadPosRankSum=-1.324;SC=AGTAATATCAATAAAGTAAGA;SOR=0.487;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=87;TCF=75;TCR=12;TR=57;WE=70370861;WS=70370843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,67:0.67:100
chr13	70535355	rs9592668	T	A	1907.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=5;PP=1480;SC=GAATTTTTTTTAAAAAAGCGT;SOR=4.768;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=56;TCR=5;TR=61;WE=70535363;WS=70535345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr13	70549636	rs71693665	CTTAAAAAAAT	C	1341.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.671;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=3.715;NF=15;NR=10;PP=2937;ReadPosRankSum=-0.059;SC=CAACAAAAAACTTAAAAAAAT;SOR=0.070;SbPval=0.09;Source=Platypus;TC=69;TCF=52;TCR=17;TR=25;WE=70549653;WS=70549626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,39:0.45:87
chr13	70549942	rs144583054	CCA	C	65.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.29;ReadPosRankSum=-1.724;SOR=0.542;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,8:0.16:51
chr13	72038653	rs915052	C	A	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;NF=2;NR=1;PP=83;SC=ATTTCATTAGCTCTTAAATAA;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=72038661;WS=72038643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:0,3:1.00:3
chr13	72440658	.	TGCCGCC	T	671.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;NF=5;NR=5;PP=507;SC=CCGCCTCCGCTGCCGCCGCCG;SOR=1.112;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=6;TCR=6;TR=10;WE=72440671;WS=72440648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr13	73301480	rs9652239	G	A	1897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=15;PP=1264;SC=ACGCAGCGGCGGAGACAACTC;SOR=2.093;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=43;TCR=15;TR=58;WE=73301488;WS=73301470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr13	73301655	rs1465897	A	C	8952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=149;NR=152;PP=2965;SC=GCGCAACGGAAACTCACCGTC;SOR=0.782;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=301;TCF=149;TCR=152;TR=301;WE=73301663;WS=73301645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,326:1.00:326
chr13	73301728	rs1465896	T	C	3951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=61;NR=81;PP=2183;SC=CCAGCACCGCTGCTACTCGCC;SOR=1.085;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=142;TCF=61;TCR=81;TR=142;WE=73301736;WS=73301718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr13	73302157	rs11350390	CT	C	18935.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=543;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=59;NR=246;PP=2965;SC=TAGGTACGCTCTTTGTGGTCC;SOR=0.739;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=331;TCF=64;TCR=267;TR=305;WE=73302165;WS=73302147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,534:1.00:534
chr13	73302261	rs2277417	G	A	10924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=406;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=191;NR=188;PP=2965;SC=CAGTCAGGGAGTAGGTGTGGA;SOR=0.718;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=380;TCF=192;TCR=188;TR=379;WE=73302269;WS=73302251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,405:1.00:405
chr13	73302481	rs4885034	G	A	2450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=52;PP=1614;SC=AGGTCTTGGCGAAAGGAGGAT;SOR=1.694;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=25;TCR=52;TR=77;WE=73302489;WS=73302471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr13	73302997	.	T	G	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.866;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.245;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=95;ReadPosRankSum=-1.578;SC=GAGTACATTTTAATAGTTAAA;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=10;WE=73303005;WS=73302987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr13	73309347	rs9543106	C	T	1773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=45;PP=1265;SC=ATAGCACTTGCATACTGTTGT;SOR=2.910;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=57;TCF=11;TCR=46;TR=56;WE=73309355;WS=73309337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr13	73409508	.	TA	T	160.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.119;ClippingRankSum=0.000;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.98;ReadPosRankSum=1.156;SOR=0.607;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,15:0.28:54
chr13	73410370	rs117674558	T	G	1887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.883;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=50;PP=1076;ReadPosRankSum=-1.620;SC=ATGGCAGATATTTTTATACCG;SOR=0.816;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=237;TCF=123;TCR=114;TR=96;WE=73410378;WS=73410360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,104:0.39:265
chr13	73636910	rs113148226	A	AGTGT,AGT	3687.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.245;NF=1,1;NR=69,69;PP=135,2665;ReadPosRankSum=1.374;SC=CAATAGATGTAGTGTGTGTGT;SOR=1.132;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=105;TCF=1;TCR=104;TR=70,70;WE=73636919;WS=73636900;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:0.97:95
chr13	73638125	rs4885061	G	T	660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=20;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=12;NR=10;PP=585;SC=TGTCAACTTTGTTTTTTTTTT;SOR=0.770;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=30;TCF=14;TCR=16;TR=22;WE=73638133;WS=73638115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr13	73650112	rs9573097	C	A	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.24;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr13	74289799	rs6562780	A	T	1435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=35;PP=1006;SC=TGCTACCACTATCTTGGGCAG;SOR=2.348;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=12;TCR=35;TR=47;WE=74289807;WS=74289789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr13	74339104	rs3764134	G	T	6796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=531;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=141;NR=137;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.930;SC=TCATTCGATTGCCCCGGACCC;SOR=0.710;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=480;TCF=241;TCR=239;TR=278;WE=74339112;WS=74339094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:221,310:0.58:531
chr13	74518210	rs9573330	G	A	1949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=413;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.72;ReadPosRankSum=1.233;SOR=0.653;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:298,115:0.28:413
chr13	74988714	rs1931954	C	T	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=9;PP=282;ReadPosRankSum=2.201;SC=CCCACCCTGCCGCAGCAGCCA;SOR=0.771;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=87;TCF=54;TCR=33;TR=25;WE=74988722;WS=74988704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,25:0.28:90
chr13	75860804	rs534538	C	A	808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=1;PP=655;SC=TGTGACTAGGCGCTCAGCACC;SOR=4.255;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=26;WE=75860812;WS=75860794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr13	75873787	rs2297207	G	A	2161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.266;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=55;PP=1488;ReadPosRankSum=0.645;SC=GCAATTCAGTGACCTCCAAGA;SOR=0.368;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=146;TCF=51;TCR=95;TR=90;WE=75873795;WS=75873777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,96:0.61:158
chr13	75876389	rs2297208	G	A	2681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=4.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.833;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=25;PP=1873;ReadPosRankSum=0.361;SC=CTAAATCCACGAGAATCGCAT;SOR=1.033;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=179;TCF=130;TCR=49;TR=103;WE=75876397;WS=75876379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,111:0.58:191
chr13	75880667	rs2297209	G	A	1618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=36;PP=1017;SC=AACTTTAGACGTTTGATTGTA;SOR=1.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=16;TCR=36;TR=52;WE=75880675;WS=75880657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr13	75884216	rs1062087	C	T	4834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=95;PP=2941;SC=GACAGGAATACAACCAGCGGT;SOR=1.098;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=164;TCF=69;TCR=95;TR=164;WE=75884230;WS=75884206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr13	75887127	rs2274757	T	C	645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=21;PP=479;SC=TCACAAGTTCTGTCACGGGCA;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=24;WE=75887135;WS=75887117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr13	75894015	rs2274758	T	C	1996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=21;PP=1344;SC=TTCCCTACTATATAGCCCTCA;SOR=1.545;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=66;TCF=44;TCR=22;TR=65;WE=75894023;WS=75894005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr13	75898596	rs2297210	C	A	1792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=42;PP=1291;SC=AATCTTCATTCACTATGAAAA;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=15;TCR=42;TR=57;WE=75898604;WS=75898586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr13	75901749	rs2297206	G	T	648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=0;PP=570;SC=AATCTTCTTAGTTAAAATAAT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=75901757;WS=75901739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr13	75910909	rs693134	C	A	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.442;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.615;NF=9;NR=2;PP=148;ReadPosRankSum=-3.111;SC=AAAAAAGATCCTTTTGTTAAA;SOR=0.074;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=40;TCF=35;TCR=5;TR=11;WE=75910917;WS=75910899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,11:0.31:35
chr13	75910950	rs9573525	T	G	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=5.495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQRankSum=-0.689;QD=6.68;ReadPosRankSum=0.992;SOR=0.253;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,29:0.34:86
chr13	75915215	rs80163254	T	C	9237.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.05;QD=45.51;SOR=1.207;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr13	75915215	.	TAT	CCA	2937	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MMLQ=27;MQ=60.08;NF=86;NR=50;PP=2937;QD=20;SC=TTAACAAAATTATTAAACAAC;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=150;TCF=90;TCR=60;TR=136;WE=75915225;WS=75915205;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:14,136:0.91:150
chr13	75915216	rs80143047	A	C	9237.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.05;QD=45.28;SOR=1.190;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr13	75915217	rs76964739	T	A	9237.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.05;QD=44.84;SOR=1.212;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr13	75915250	rs35018625	T	TA	11471.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=90;PP=2965;SC=AAGTAGGAAATATCTTCTCAC;SOR=0.923;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=146;TCF=56;TCR=90;TR=142;WE=75915258;WS=75915240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,306:1.00:306
chr13	75915859	rs9888477	C	A	1468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=35;PP=995;SC=TTCCTGCCTACAAGAAACCTT;SOR=2.348;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=12;TCR=35;TR=47;WE=75915867;WS=75915849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr13	75923536	rs3831188	T	TA	752.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=19;PP=713;SC=GCTGACTAAATAAAAATAATA;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=19;WE=75923544;WS=75923526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr13	75936519	rs7983969	C	G	7488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=156;NR=100;PP=2965;SC=CGCGCTGCTCCCCTTGGATCT;SOR=1.061;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=256;TCF=156;TCR=100;TR=256;WE=75936527;WS=75936509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,283:1.00:283
chr13	76055321	rs144814586	T	C	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=35;ReadPosRankSum=-0.385;SC=AGTCGGTCCTTAAAGTGGGGT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=3;WE=76055329;WS=76055311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr13	76055397	rs9573565	C	T	1923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.966;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.581;NF=59;NR=17;PP=1356;ReadPosRankSum=2.021;SC=CTCCGAGCCCCTGTCTTGCCT;SOR=0.541;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=106;TCF=84;TCR=22;TR=76;WE=76055405;WS=76055387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,80:0.73:109
chr13	76055820	rs7327548	G	C	5259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=382;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.387;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=109;NR=121;PP=2962;ReadPosRankSum=1.957;SC=TTGGCTTCCCGGGGCCGGGCT;SOR=0.657;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=357;TCF=172;TCR=185;TR=230;WE=76055828;WS=76055810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,245:0.64:381
chr13	76101863	rs1408042	T	C	818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=1;PP=595;SC=CTGGAGGACATTGTGCAAAGT;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=76101871;WS=76101853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr13	76102137	rs57959582	GCACA	G	188.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.77;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr13	76124151	rs8192738	C	T	12993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=487;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=199;NR=254;PP=2965;SC=CGCTCGGGACCTCGGAGTCTT;SOR=0.996;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=453;TCF=199;TCR=254;TR=453;WE=76124159;WS=76124141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,487:1.00:487
chr13	76135028	rs4884008	T	A	2149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=27;NR=47;PP=1376;SC=GTAATTGTTATGTAAAATAGA;SOR=1.439;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=27;TCR=47;TR=74;WE=76135036;WS=76135018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr13	76140814	rs56945758	CT	C	1350.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.270;NF=32;NR=10;PP=685;ReadPosRankSum=-0.774;SC=ACACTGTTGACTTTTTTTTTT;SOR=1.681;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=55;TCF=38;TCR=17;TR=42;WE=76140833;WS=76140804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,55:0.98:56
chr13	76169234	rs7330411	G	A	947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=22;PP=625;SC=AAATTAACTGGTTGCCTATAA;SOR=2.049;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=31;WE=76169242;WS=76169224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr13	76210742	rs2224797	A	C	1151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=9;PP=791;SC=CGCGGGGACAACCCCTCCCCT;SOR=1.900;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=38;WE=76210750;WS=76210732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr13	76369670	rs17065050	T	C	566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.816;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=336;ReadPosRankSum=1.162;SC=TCTTTTCTAATTAATTTTTTG;SOR=1.329;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=18;WE=76369678;WS=76369660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,22:0.61:36
chr13	76378459	rs625033	T	C	11030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=388;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=194;NR=162;PP=2965;SC=AATTTACATTTAAGATGCAGG;SOR=0.847;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=356;TCF=194;TCR=162;TR=356;WE=76378467;WS=76378449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,388:1.00:388
chr13	76383353	rs9530469	C	T	9761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=371;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=173;NR=162;PP=2965;SC=AAAATCTGTGCGTGTTGTTTG;SOR=0.726;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=336;TCF=173;TCR=163;TR=335;WE=76383361;WS=76383343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,368:1.00:368
chr13	76395278	rs7334674	G	A	2919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.708;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=42;PP=1776;ReadPosRankSum=1.460;SC=TCAAATGTGTGTCTTTGTGGT;SOR=0.917;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=179;TCF=117;TCR=62;TR=123;WE=76395286;WS=76395268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,130:0.66:196
chr13	76395464	rs41286126	C	T	5991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=390;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.265;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=122;NR=121;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.899;SC=AGCAACTTATCCTTCAGAAAT;SOR=0.581;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=368;TCF=180;TCR=188;TR=243;WE=76395472;WS=76395454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,258:0.66:390
chr13	76409436	rs2273997	A	G	2013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.279;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=57;PP=1318;ReadPosRankSum=-0.669;SC=CTTCAAATCTATCTGTAACAA;SOR=1.349;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=120;TCF=32;TCR=88;TR=75;WE=76409444;WS=76409426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,82:0.61:135
chr13	76410725	rs2273996	A	G	1313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=35;PP=1024;SC=TAAAAGGTTAACACGCAGATC;SOR=4.073;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=4;TCR=35;TR=39;WE=76410733;WS=76410715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr13	76412259	.	A	AT	1942.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.155;ClippingRankSum=0.000;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.777;HP=12;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.807;NF=36;NR=18;PP=799;ReadPosRankSum=-0.128;SC=CATAGTGTTTATTTTTTTTTC;SOR=1.216;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=108;TCF=66;TCR=42;TR=54;WE=76412267;WS=76412249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,86:0.61:140
chr13	76415379	rs3736858	C	G	847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=26;PP=530;ReadPosRankSum=0.787;SC=TTCTCTTTACCTTGTTGGTGA;SOR=0.739;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=121;TCF=45;TCR=76;TR=41;WE=76415387;WS=76415369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,45:0.35:129
chr13	76417101	rs920701	C	T	2622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=42;NR=44;PP=1364;SC=TGGCTTCAGACAATATTCCAG;SOR=1.007;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=42;TCR=44;TR=86;WE=76417109;WS=76417091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr13	76419421	rs3832886	AT	A	1567.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=8;PP=1278;SC=AAAGGAGGTTATTTAATGAGA;SOR=2.511;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=33;WE=76419429;WS=76419411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr13	76423248	rs7986131	T	C	5695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=132;NR=70;PP=2965;ReadPosRankSum=1.825;SC=ATTGGGAACATGACCTCTTCA;SOR=1.407;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=202;TCF=132;TCR=70;TR=202;WE=76423256;WS=76423238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,213:0.99:215
chr13	76429311	rs9573671	G	A	1377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.211;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=28;PP=769;ReadPosRankSum=1.792;SC=ATTATTATCAGTGTTAATAGC;SOR=0.503;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=205;TCF=130;TCR=75;TR=73;WE=76429319;WS=76429301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,79:0.35:224
chr13	76429619	rs4885354	C	A	296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=7;PP=202;SC=TGTATTCGTCCATCTGTGCTG;SOR=2.303;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=76429627;WS=76429609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr13	76445155	rs9544057	G	C	6521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=125;NR=84;PP=2965;SC=TTAAAAACGGGCAGTTTTTAA;SOR=1.081;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=209;TCF=125;TCR=84;TR=209;WE=76445163;WS=76445145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
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chr13	76445316	rs9600567	C	T	3578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.912;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=83;PP=2304;ReadPosRankSum=-0.576;SC=ACTCCTGCTCCTTCTCTGAAT;SOR=0.458;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=185;TCF=67;TCR=118;TR=134;WE=76445324;WS=76445306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,144:0.73:197
chr13	76457148	rs7987971	A	G	1839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=9;PP=1222;SC=GGTATTCAATAATGCTGGTTC;SOR=3.037;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=40;TCR=9;TR=49;WE=76457156;WS=76457138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
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chr13	76457273	rs149329187	T	A	2363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=404;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=57;PP=1485;ReadPosRankSum=-0.220;SC=AAGATCACAGTCCTCATTGTC;SOR=0.701;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=368;TCF=203;TCR=165;TR=123;WE=76457281;WS=76457263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:269,133:0.33:402
chr13	77522725	rs67524409	GACTT	G	4824.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=434;ExcessHet=3.0103;FS=1.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQRankSum=3.186;QD=11.63;ReadPosRankSum=0.954;SOR=0.604;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:277,138:0.33:415
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chr13	77527707	rs9530614	A	G	1569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=379;ExcessHet=3.0103;FS=0.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.15;ReadPosRankSum=0.413;SOR=0.644;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:279,99:0.26:378
chr13	77565972	rs654196	A	G	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=2.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.63;ReadPosRankSum=0.571;SOR=1.109;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,29:0.24:121
chr13	77569901	rs605153	G	A	2612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=26;PP=1879;SC=GGATATGACAGTAGCAGCATG;SOR=1.956;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=68;TCR=26;TR=94;WE=77569909;WS=77569891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr13	77589725	rs599115	A	C	1184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.635;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=35;PP=766;ReadPosRankSum=-0.943;SC=ACTGAAAAGCAAAAAAAATAA;SOR=0.463;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=131;TCF=31;TCR=100;TR=47;WE=77589733;WS=77589714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,55:0.38:146
chr13	77725106	rs9574006	C	A	1070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=38;PP=685;ReadPosRankSum=0.044;SC=ATTATAGAAACCAAATACCAT;SOR=0.736;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=179;TCF=66;TCR=113;TR=58;WE=77725114;WS=77725096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,61:0.32:190
chr13	77732333	rs3861128	G	A	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=114;ReadPosRankSum=1.569;SC=TTTCAGATAGGCCTTTACGGA;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=9;WE=77732341;WS=77732323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,9:0.27:33
chr13	77738664	rs2274547	A	G	6647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=417;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=107;NR=153;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.256;SC=TCTTTTTCCAATTGGATGACT;SOR=0.741;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=381;TCF=159;TCR=222;TR=260;WE=77738672;WS=77738654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,286:0.69:417
chr13	77739291	rs9318468	A	T	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.989;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=8;PP=238;ReadPosRankSum=0.047;SC=CCACTGCACCAGGCCCCAATT;SOR=0.928;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=72;TCF=45;TCR=27;TR=22;WE=77739299;WS=77739281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,22:0.30:74
chr13	77750765	rs71102724	TA	T	32.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=1.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.44;ReadPosRankSum=1.101;SOR=0.341;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,12:0.16:74
chr13	77751892	rs4885445	C	T	1556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FS=4.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.37;ReadPosRankSum=-1.650;SOR=0.936;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:264,92:0.26:356
chr13	77780665	rs17693337	T	C	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.831;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.98;ReadPosRankSum=-1.087;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr13	77792099	rs374242789	TA	T	224.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=4.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=1.302;QD=5.62;ReadPosRankSum=0.000;SOR=1.938;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr13	77835520	.	TA	T	103.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.026;ClippingRankSum=0.000;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=1.502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.50;ReadPosRankSum=0.423;SOR=0.382;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,15:0.22:69
chr13	78142653	rs11325667	GA	G	547.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=17;PP=374;SC=GACTTTTGCAGAAAAAAAAGA;SOR=2.200;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=17;WE=78142661;WS=78142643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr13	78146301	rs678047	C	T	7488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=127;NR=126;PP=2965;SC=ACAATGCCTCCTCGAGCACAG;SOR=0.807;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=253;TCF=127;TCR=126;TR=253;WE=78146309;WS=78146281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,277:1.00:277
chr13	78177082	rs7490669	T	A	488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=0;PP=380;SC=TTTTTATACTTAAAGCCAATT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=78177090;WS=78177072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr13	78178451	rs6563011	C	T	1837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=12;PP=1284;SC=TAGTGCTATACTTTAACATCA;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=46;TCR=12;TR=58;WE=78178459;WS=78178441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr13	78183087	rs9593240	A	C	103.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=78;SC=TTATCTCAAAACTCAGTAGTA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=78183095;WS=78183079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr13	78183167	rs912293	G	C	1454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=13;PP=961;SC=TTTTATTTATGATGTTTTTTG;SOR=1.702;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=48;TCF=35;TCR=13;TR=47;WE=78183175;WS=78183157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr13	78191824	rs4142585	G	T	2959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=40;PP=1773;SC=TAATGTACTTGGGTCAGAAAG;SOR=0.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=59;TCR=40;TR=99;WE=78191832;WS=78191814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr13	78192207	rs9574090	T	C	4348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=98;PP=2533;SC=TAAATGACCTTGACTATCTTG;SOR=1.553;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=54;TCR=98;TR=152;WE=78192215;WS=78192197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr13	78211386	rs72078326	CAT	C	251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5725;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=166;ReadPosRankSum=-0.489;SC=CACACACACACATATATATAT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=4;WE=78211395;WS=78211376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,7:0.88:8
chr13	78216873	rs1053985	A	G	5289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=72;PP=2965;SC=TGGAAAATCTACAAGCGGGTG;SOR=1.010;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=176;TCF=104;TCR=72;TR=174;WE=78216881;WS=78216863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr13	78272267	rs201380414	T	TGG	1176.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=7;NR=15;PP=1010;SC=CGCCCCCCGCTGGCCTGCAGC;SOR=1.101;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=7;TCR=15;TR=22;WE=78272284;WS=78272257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr13	78272276	rs71102772	G	GC	1247.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=15;PP=906;SC=CTGGCCTGCAGCCTTTGGGTC;SOR=0.997;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=8;TCR=15;TR=23;WE=78272284;WS=78272257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr13	78475313	rs5351	T	C	3408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=58;PP=1989;SC=AGAAACTGAATAGCCACCAAT;SOR=0.933;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=111;TCF=53;TCR=58;TR=111;WE=78475321;WS=78475303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr13	78477674	rs5348	A	G	9940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=383;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=175;NR=185;PP=2965;SC=TGATTCCCACAGAGGCTTTCT;SOR=0.763;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=362;TCF=176;TCR=186;TR=360;WE=78477682;WS=78477664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,381:1.00:381
chr13	78477799	rs34576965	T	A	713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=25;PP=584;ReadPosRankSum=0.075;SC=CCCTCTGAATTGTATCACTTA;SOR=1.206;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=26;WE=78477807;WS=78477789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,26:0.60:43
chr13	78492540	rs1801710	C	T	1500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FS=2.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.23;ReadPosRankSum=-0.530;SOR=0.861;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:259,96:0.27:355
chr13	78492582	rs200304077	C	A	1488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=342;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.35;ReadPosRankSum=1.162;SOR=0.669;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:249,93:0.27:342
chr13	79175496	rs36032170	C	T	800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=3;PP=438;ReadPosRankSum=2.111;SC=GAAAGCCCCCCAAAAATGCCT;SOR=0.665;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=58;TCF=51;TCR=7;TR=29;WE=79175504;WS=79175486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,32:0.54:59
chr13	79176483	rs371388366	CTGG	C	145.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FS=1.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.99;ReadPosRankSum=0.508;SOR=0.502;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:132,15:0.10:147
chr13	79177291	rs9601093	G	A	734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=506;ReadPosRankSum=-0.245;SC=TTTCGGAGACGGGGAGGGGCG;SOR=1.432;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=27;WE=79177299;WS=79177281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,29:0.78:37
chr13	79194750	rs35712557	TGA	T	6328.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.023;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.464;NF=30;NR=64;PP=2970;ReadPosRankSum=-0.926;SC=ACATTCTGGATGAGAGAGAAA;SOR=1.102;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=196;TCF=56;TCR=140;TR=94;WE=79194759;WS=79194740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,177:0.59:302
chr13	79209382	rs9805409	A	C	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=21;PP=515;ReadPosRankSum=-0.540;SC=AATAAAAGTGACTTGTAAAAA;SOR=0.839;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=11;TCR=32;TR=28;WE=79209390;WS=79209372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,28:0.65:43
chr13	79216178	rs9601108	G	A	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=115;ReadPosRankSum=-0.921;SC=TTTACTCTAAGAAGTCTGGGG;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=6;WE=79216186;WS=79216168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr13	79216356	.	GA	G	109.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.643;ClippingRankSum=0.000;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=2.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.55;ReadPosRankSum=0.651;SOR=0.323;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,15:0.21:71
chr13	79216418	rs7327732	A	G	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=24;PP=535;ReadPosRankSum=0.479;SC=ATCCTTTTTCATATTGTTTTA;SOR=0.719;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=49;TCF=9;TCR=40;TR=28;WE=79216426;WS=79216408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,21:0.62:34
chr13	79916792	rs374223990	T	TA	3752.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=31;PP=2503;SC=ACAATGAAATTAAATACCTGA;SOR=1.250;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=67;TCF=32;TCR=35;TR=59;WE=79916800;WS=79916782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr13	79918323	rs2274555	T	C	864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=3;PP=643;SC=TAGCATAAGATTAAGTTCACT;SOR=3.334;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=27;WE=79918331;WS=79918313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr13	79928477	rs9574411	A	G	1496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=11;PP=1140;SC=TCATATTTCTATGTAAAATAT;SOR=2.303;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=54;TCF=43;TCR=11;TR=51;WE=79928485;WS=79928467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr13	79932617	rs7994560	A	G	1366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=30;PP=913;SC=TCCTGACCCTAACCAAATACA;SOR=1.473;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=17;TCR=30;TR=47;WE=79932625;WS=79932607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr13	79939606	rs7319252	C	A	948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=1;PP=821;SC=AAATAAATCACCATTCCTTAT;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=31;WE=79939614;WS=79939596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr13	79939921	rs11279869	TAAGAGA	T	1597.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=29;PP=1581;SC=TTAATATTGATAAGAGAAAAA;SOR=3.912;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=30;WE=79939934;WS=79939911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr13	79946163	rs7325232	G	C	338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=10;PP=271;SC=TGCCTGTAATGCCAGCACTTT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=79946171;WS=79946153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr13	80095143	.	CT	C	118.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=0.000;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=3.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.25;MQRankSum=1.551;QD=3.71;ReadPosRankSum=-0.204;SOR=1.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,10:0.31:32
chr13	80910786	rs4728	C	A	3567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.64;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr13	80910786	.	CCTTTCT	ACTTTCG,ACTTTCT	911	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=22,56;NR=18,38;PP=482,911;QD=13.3866968716;SC=GACTATCCCACCTTTCTATTA;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=94;TCF=56;TCR=38;TR=40,94;WE=80910800;WS=80910776;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.43:94
chr13	80910792	rs700397	T	G	743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=3.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.82;ReadPosRankSum=2.007;SOR=0.397;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,41:0.38:109
chr13	80910851	rs11911	A	C	2437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.300;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=38;PP=1607;ReadPosRankSum=0.214;SC=TAAAAAAAGAAAGAAAAAATC;SOR=0.918;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=137;TCF=79;TCR=58;TR=94;WE=80910859;WS=80910841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,103:0.71:146
chr13	80911525	rs504122	G	A	4147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=75;PP=2759;ReadPosRankSum=-1.018;SC=CTGGACAGAGGGGCTCGTGCA;SOR=0.681;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=244;TCF=130;TCR=114;TR=159;WE=80911533;WS=80911515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,176:0.65:270
chr13	83597934	rs2639486	A	T	1078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=17;PP=528;SC=ACTGTGAACTAATTGAAGTAA;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=19;TCR=17;TR=36;WE=83597942;WS=83597924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr13	83598060	rs2807479	C	T	73.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.43;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr13	86368834	rs371704272	C	T	842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=472;ExcessHet=3.0103;FS=0.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.79;ReadPosRankSum=-0.151;SOR=0.624;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:390,82:0.17:472
chr13	86369120	rs3825413	C	T	5579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=392;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.703;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=122;NR=110;PP=2962;ReadPosRankSum=0.284;SC=TCTGGGTTAGCAAATCAAGAT;SOR=0.652;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=369;TCF=188;TCR=181;TR=232;WE=86369128;WS=86369110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,249:0.64:392
chr13	88270840	rs4036976	CTGT	C	2312.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.924;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.708;NF=29;NR=8;PP=1570;ReadPosRankSum=-0.216;SC=AATGTCCTCCCTGTTGTTGTT;SOR=0.233;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=69;TCF=51;TCR=18;TR=37;WE=88270853;WS=88270830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,56:0.68:82
chr13	88270860	rs956960	A	G	1791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.772;NF=55;NR=22;PP=1243;ReadPosRankSum=-1.227;SC=TGTTGTTGTCATTGTTGTTGT;SOR=0.785;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=121;TCF=88;TCR=33;TR=77;WE=88270868;WS=88270850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,79:0.64:124
chr13	88270894	rs150250373	G	T	3272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.562;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.830;NF=87;NR=51;PP=2265;ReadPosRankSum=0.585;SC=TTTAACTCAGGAGACTTTTTG;SOR=0.989;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=225;TCF=139;TCR=86;TR=138;WE=88270902;WS=88270884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,145:0.60:243
chr13	92408505	rs3783054	T	G	654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.490;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=2;PP=466;ReadPosRankSum=-2.088;SC=TGGCCTTTATTGTGGATGTTT;SOR=1.061;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=41;TCF=35;TCR=6;TR=23;WE=92408513;WS=92408495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,25:0.57:44
chr13	92560425	rs1854735	G	T	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=3.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.509;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=487;ReadPosRankSum=0.802;SC=CTAAAATATTGTAACACACTT;SOR=1.882;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=22;WE=92560433;WS=92560415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,24:0.62:39
chr13	92796964	rs12429836	G	A	688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=0;PP=494;SC=ACTTGACTTGGTGTCTACACC;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=92796972;WS=92796954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr13	93142362	rs722178	C	T	606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.05;ReadPosRankSum=-0.086;SOR=0.718;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,40:0.27:150
chr13	94938785	rs1409174	A	G	1432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=37;PP=1024;SC=TACAGGTGCAATAACCTAAAA;SOR=2.655;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=10;TCR=37;TR=47;WE=94938793;WS=94938775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr13	94938808	rs56210803	GAT	G	857.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.492;NF=0;NR=19;PP=808;ReadPosRankSum=-0.209;SC=GAAGTAACTAGATATGTCGGC;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=19;WE=94938817;WS=94938798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,22:0.88:25
chr13	94958100	rs10492630	T	A	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.304;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=147;ReadPosRankSum=-1.876;SC=CTTGTTTACATTTCAAAATTA;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=8;WE=94958108;WS=94958090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr13	95034749	rs1535692	G	A	3696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.039;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=79;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.176;SC=GGACGAGAGCGTGACAGCGGG;SOR=0.786;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=226;TCF=108;TCR=118;TR=149;WE=95034771;WS=95034739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,163:0.66:246
chr13	95034763	rs2274020	G	A	1321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=37;PP=2058;ReadPosRankSum=-0.639;SC=CAGCGGGCACGTCCAACGAGG;SOR=0.723;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=200;TCF=92;TCR=108;TR=69;WE=95034771;WS=95034739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,74:0.34:217
chr13	95090692	rs1540979	T	A	698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=1;PP=542;SC=TAGCAGTCCTTTTGCATGGGG;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=95090700;WS=95090682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr13	95096505	rs7339198	G	A	683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=0;PP=506;SC=CAAGTATTCCGAAATCTGAAA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=95096513;WS=95096495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr13	95097956	rs755684	C	T	9860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=370;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=155;NR=195;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.747;SC=AGTAGAGCCTCCCAGGCTCAT;SOR=0.342;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=351;TCF=155;TCR=196;TR=350;WE=95097964;WS=95097946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,369:1.00:370
chr13	95230877	rs16949940	G	A	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=14;PP=334;ReadPosRankSum=1.024;SC=AATTTAGTGGGGCATTCAATT;SOR=0.718;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=65;TCR=49;TR=32;WE=95230885;WS=95230867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,34:0.28:123
chr13	95243270	rs9301979	G	A	2096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=60;PP=1212;ReadPosRankSum=-0.237;SC=TTTTACTATAGCATCCCCCTA;SOR=0.681;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=305;TCF=144;TCR=161;TR=112;WE=95243286;WS=95243260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:215,118:0.35:333
chr13	95254382	rs9556404	A	G	1642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=18;NR=29;PP=790;SC=CCGCCGGCTGAGTCCGCCGGC;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=18;TCR=29;TR=47;WE=95254390;WS=95254372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr13	95264604	rs9524559	C	T	2694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.603;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=65;PP=1601;ReadPosRankSum=1.731;SC=ACCCAGATGCCGAAGGGAATC;SOR=0.634;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=158;TCF=59;TCR=99;TR=104;WE=95264612;WS=95264594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,115:0.64:180
chr13	95275576	rs4296139	C	G	7108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=156;PP=2965;SC=GAAAGAAAATCGTTTATTCTG;SOR=1.363;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=247;TCF=90;TCR=157;TR=245;WE=95275584;WS=95275566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr13	95279505	rs9524568	T	A	1633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.898;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=44;PP=1029;ReadPosRankSum=-0.918;SC=TTTTTTTTCATACATTTAGTA;SOR=0.576;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=90;TCF=23;TCR=67;TR=61;WE=95279513;WS=95279495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,69:0.68:102
chr13	95363884	rs9556411	G	C	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=7.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.55;ReadPosRankSum=-2.338;SOR=1.110;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,11:0.19:58
chr13	95364046	rs1060474	C	G	3580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.273;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=66;PP=2376;ReadPosRankSum=0.120;SC=CCTTCTTGAGCAGCGTCTTGG;SOR=0.454;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=206;TCF=117;TCR=89;TR=146;WE=95364054;WS=95364036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,153:0.70:218
chr13	95364337	rs2253604	T	G	10414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=410;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=181;NR=191;PP=2965;SC=GCCCGCCGCCTCCCGGGCCCT;SOR=0.822;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=372;TCF=181;TCR=191;TR=372;WE=95364345;WS=95364327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,409:1.00:409
chr13	95673791	rs3742106	A	C	5707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=417;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.124;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=128;NR=105;PP=2962;ReadPosRankSum=1.088;SC=AAACTAGTGGAAAATGCCTTC;SOR=0.612;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=384;TCF=213;TCR=171;TR=233;WE=95673799;WS=95673781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,252:0.61:416
chr13	95673939	rs9524765	A	G	1929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=84;PP=2433;ReadPosRankSum=0.846;SC=AAGTATACCTAGAAAAAAAAA;SOR=1.115;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=123;TCF=35;TCR=88;TR=118;WE=95673948;WS=95673928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:5,85:0.94:90
chr13	95695837	rs9302041	A	T	2448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=24;PP=1582;ReadPosRankSum=0.211;SC=ACAGAAAATTAACTTACTAGG;SOR=0.718;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=139;TCF=100;TCR=39;TR=89;WE=95695845;WS=95695827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,100:0.65:153
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chr13	95715148	rs202097426	AAAAG	A	583.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=6.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.84;ReadPosRankSum=1.114;SOR=1.659;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,24:0.36:66
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chr13	95727861	rs11568672	G	A	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=106;ReadPosRankSum=0.793;SC=AAAAACCTGCGGCCTCCCAAG;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=7;WE=95727869;WS=95727851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
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chr13	95829843	rs2296653	G	A	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=194;ReadPosRankSum=-0.338;SC=GCAGGGGACAGTGTGGGGAGG;SOR=0.836;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=12;WE=95829851;WS=95829833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,12:0.34:35
chr13	95829870	rs1751005	T	C	509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=382;ReadPosRankSum=-1.331;SC=GACACCAGAGTAGGATGAGCT;SOR=0.620;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=65;TCF=53;TCR=12;TR=25;WE=95829878;WS=95829860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,25:0.38:66
chr13	95847020	rs2274403	A	G	4288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=110;NR=40;PP=2839;SC=GTAACACCTCAAAATTCTCTA;SOR=1.944;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=110;TCR=40;TR=150;WE=95847028;WS=95847010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr13	95858686	rs3818493	G	A	964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.240;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=10;PP=645;ReadPosRankSum=-0.756;SC=TTATGAGAGAGTTAAATGTCA;SOR=0.260;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=50;TCF=38;TCR=12;TR=36;WE=95858694;WS=95858676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,39:0.71:55
chr13	95858704	rs3818494	G	C	1343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.703;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=16;PP=803;ReadPosRankSum=1.670;SC=TCATTACACTGGAACATAGTG;SOR=0.240;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=74;TCF=55;TCR=19;TR=52;WE=95858712;WS=95858694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,54:0.68:79
chr13	95858978	rs2274405	T	C	5858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=399;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.388;HP=5;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=131;NR=117;PP=2962;ReadPosRankSum=1.731;SC=CACTGAAAAATGAAGCCAAAT;SOR=0.708;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=362;TCF=192;TCR=170;TR=248;WE=95858986;WS=95858968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,272:0.68:399
chr13	95858996	rs2274406	T	C	5521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=375;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.407;HP=4;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=120;NR=118;PP=2962;ReadPosRankSum=0.224;SC=AATTCATCCCTCTGAGGCAGG;SOR=0.664;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=342;TCF=173;TCR=169;TR=238;WE=95859004;WS=95858985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,253:0.69:367
chr13	95859035	rs2274407	C	A	3973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.597;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=96;PP=2267;ReadPosRankSum=-0.790;SC=AAATCTCCTTCCTGAAAGAGA;SOR=0.983;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=240;TCF=102;TCR=138;TR=161;WE=95859043;WS=95859025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,180:0.68:263
chr13	95859974	rs2274408	T	C	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=326;ReadPosRankSum=1.162;SC=TGTGAAAACATAGTAAAACTT;SOR=1.931;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=15;WE=95859982;WS=95859964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,16:0.73:22
chr13	95860288	rs2274410	C	A	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-4.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.893;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=25;PP=522;ReadPosRankSum=0.474;SC=AGCGCTTTTGCTTCCGACAAC;SOR=0.324;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=44;TCF=6;TCR=38;TR=30;WE=95860296;WS=95860278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,30:0.68:44
chr13	95861804	rs899494	A	G	5767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=118;PP=2965;SC=CAGTCACTGCAATCGCCTGCA;SOR=1.299;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=194;TCF=76;TCR=118;TR=194;WE=95861812;WS=95861794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr13	95861981	rs1678403	C	G	426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=11;PP=289;SC=TGGGTTTACACCTGCTAAAGC;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=95861989;WS=95861971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr13	95862860	rs3046400	AGAGT	A	549.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.25;ReadPosRankSum=0.813;SOR=0.714;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,19:0.22:88
chr13	95862873	rs4148472	G	A	1830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=22;PP=2474;ReadPosRankSum=0.004;SC=GTGAGCCCCTGCCTCCAGAAA;SOR=0.807;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=94;TCF=64;TCR=30;TR=72;WE=95862881;WS=95862850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,80:0.79:101
chr13	95862896	rs899496	A	G	4786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=105;NR=58;PP=2965;SC=ATAAAAGGGGAAAGAGGGGTG;SOR=1.251;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=163;TCF=105;TCR=58;TR=163;WE=95862904;WS=95862886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr13	95863143	rs899497	A	G	3097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=73;PP=2299;SC=GACCAGATCTAAGCACAAGCA;SOR=1.747;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=33;TCR=73;TR=106;WE=95863151;WS=95863133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr13	95899354	rs4148437	A	G	8057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=146;NR=144;PP=2965;SC=CAGAACCTACAATGAGGAAAA;SOR=0.767;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=290;TCF=146;TCR=144;TR=290;WE=95899362;WS=95899344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,307:1.00:307
chr13	95900071	rs9556466	C	T	6539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=130;PP=2965;SC=TAGACTCCTACCTCCATGGGT;SOR=1.266;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=217;TCF=87;TCR=130;TR=217;WE=95900079;WS=95900061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr13	95900172	rs56389126	G	GCACACACACA	157	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=0;NR=4;PP=1252;SC=GTTAACATGTGCACACACACA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=4;WE=95900180;WS=95900162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr13	95921534	rs3047283	TACA	T	7165.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.923;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.139;NF=26;NR=69;PP=2954;ReadPosRankSum=0.166;SC=ATACAGAGCCTACAACCTGTC;SOR=0.923;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=164;TCF=38;TCR=126;TR=95;WE=95921544;WS=95921524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,181:0.61:297
chr13	95921687	rs200078196	AAATATATAT	A	175.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=735;SC=CTCAAAAAAAAAATATATATA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=11;WE=95921703;WS=95921677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr13	95953405	rs61974974	G	A	630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.871;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=9;PP=391;ReadPosRankSum=1.048;SC=CAGCCGCAGAGGGCTTGGGCA;SOR=1.093;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=96;TCF=66;TCR=30;TR=32;WE=95953413;WS=95953395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,35:0.32:108
chr13	96230279	rs1325774	T	G	2034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=379;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.829;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=52;PP=1171;ReadPosRankSum=0.991;SC=AAGAGCTCGCTGGCAAGCTGC;SOR=0.657;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=337;TCF=170;TCR=167;TR=109;WE=96230287;WS=96230269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:255,123:0.33:378
chr13	96239805	rs11070136	G	A	1480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.661;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=30;PP=941;ReadPosRankSum=1.626;SC=GCGGGCTTGGGAGAATCATCA;SOR=0.560;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=241;TCF=159;TCR=82;TR=77;WE=96239813;WS=96239795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:180,85:0.32:265
chr13	96258410	rs7319952	A	G	768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FS=3.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.07;ReadPosRankSum=0.367;SOR=1.011;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:141,48:0.25:189
chr13	96270202	rs17268561	A	T	1851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.602;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=27;PP=1113;ReadPosRankSum=0.188;SC=GAGCATCTGGAGGAACGAGGG;SOR=1.281;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=239;TCF=146;TCR=93;TR=88;WE=96270210;WS=96270192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,95:0.37:256
chr13	96485417	rs3099359	A	G	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=328;ReadPosRankSum=0.223;SC=GCAGAGTCCTACTAAGTACTG;SOR=1.426;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=17;WE=96485425;WS=96485407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,17:0.74:23
chr13	96506664	rs11070154	A	G	2130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=373;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=64;PP=1388;ReadPosRankSum=1.160;SC=CACAAAATGGAGTATACCCAT;SOR=0.700;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=346;TCF=158;TCR=188;TR=116;WE=96506672;WS=96506654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:249,124:0.33:373
chr13	96529376	rs10601193	TCTGC	T	55.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.98;ReadPosRankSum=-0.677;SOR=1.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,3:0.21:14
chr13	96539977	rs11842395	T	G	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.29;ReadPosRankSum=1.282;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,2:0.33:6
chr13	96539979	rs11842396	T	C	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.29;ReadPosRankSum=1.282;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,2:0.33:6
chr13	96540019	rs12871416	C	T	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=124;ReadPosRankSum=-0.689;SC=ATAGTCTGACCTTCTGACTTA;SOR=0.804;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=11;WE=96540027;WS=96540009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr13	96540141	rs9525075	T	C	2830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.93;SOR=0.724;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr13	96540141	.	TTT	CTC	1969	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=19;MQ=60.0;NF=30;NR=21;PP=1969;QD=39.6562328404;SC=TTCACTCAGATTTACCTTTCT;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=53;TCF=30;TCR=23;TR=51;WE=96540151;WS=96540131;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,51:0.96:53
chr13	96540143	rs9525076	T	C	2830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.93;SOR=0.724;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr13	96540204	rs12876018	T	G	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.308;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=12;PP=243;ReadPosRankSum=-1.080;SC=TTTATCTTCATGTTGATAATC;SOR=1.445;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=59;TCF=30;TCR=29;TR=19;WE=96540212;WS=96540194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,21:0.31:68
chr13	96555149	rs33949518	C	T	1013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.616;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=19;PP=613;ReadPosRankSum=1.078;SC=GAGTAAATAGCTGTAGCAATT;SOR=0.750;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=142;TCF=89;TCR=53;TR=49;WE=96555157;WS=96555139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,56:0.36:157
chr13	96578189	rs7985727	G	A	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.393;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=40;ReadPosRankSum=-0.191;SC=ATGCAAGTACGTATATATACA;SOR=0.061;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=4;WE=96578197;WS=96578179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr13	96599271	rs7986005	C	T	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.254;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=188;ReadPosRankSum=1.295;SC=AAACAAATCACATTTAGTGCA;SOR=1.022;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=53;TCF=37;TCR=16;TR=15;WE=96599279;WS=96599261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,15:0.27:55
chr13	96599433	rs9556512	A	C	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.836;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=20;PP=872;ReadPosRankSum=-1.447;SC=AATTCTGGAAAAAGAAGATGA;SOR=0.911;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=86;TCF=29;TCR=57;TR=29;WE=96599453;WS=96599423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,31:0.33:95
chr13	96599445	rs9556513	C	T	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.539;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=872;ReadPosRankSum=0.123;SC=AGAAGATGAACAAGGACTGTT;SOR=1.270;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=77;TCF=25;TCR=52;TR=23;WE=96599453;WS=96599423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,24:0.29:84
chr13	96636170	rs9562008	G	C	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=1.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.69;ReadPosRankSum=1.527;SOR=0.484;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,14:0.21:68
chr13	96638636	rs816142	A	C	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.673;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=18;PP=429;ReadPosRankSum=0.491;SC=AATTTAATGGAATCATAAACT;SOR=0.792;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=123;TCF=65;TCR=58;TR=38;WE=96638644;WS=96638626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,44:0.31:142
chr13	96638651	rs12863903	C	T	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=16;PP=322;ReadPosRankSum=-0.595;SC=TAAACTGGAGCGGACATTATT;SOR=0.733;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=107;TCF=53;TCR=54;TR=33;WE=96638659;WS=96638641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,40:0.31:127
chr13	96641695	rs555120	T	G	3183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=30;PP=2013;SC=AATTGAAAAGTACTTAAAAGT;SOR=1.589;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=71;TCR=30;TR=101;WE=96641703;WS=96641685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr13	97639414	rs9284174	C	T	2590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=478;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.572;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=68;PP=1610;ReadPosRankSum=-1.294;SC=CAGTCAAAATCAGGTTGTACC;SOR=0.781;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=433;TCF=218;TCR=215;TR=130;WE=97639422;WS=97639404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:334,143:0.30:477
chr13	97986448	rs16952071	C	T	1179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=9;PP=831;SC=TGCTTTTGTGCATAAGAAGTG;SOR=2.531;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=35;TCR=9;TR=44;WE=97986456;WS=97986438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr13	98017211	rs3825422	A	G	1534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=1;PP=1260;SC=ATACTGGCTTAAAATAAGTCA;SOR=6.184;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=42;TCF=41;TCR=1;TR=42;WE=98017219;WS=98017201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
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chr13	98632349	rs555647	A	G	658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=21;PP=481;ReadPosRankSum=-0.738;SC=GCCACAACTGATAACATTCAC;SOR=1.096;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=40;TCF=4;TCR=36;TR=23;WE=98632357;WS=98632339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,25:0.58:43
chr13	98634572	rs11620106	T	A	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=76;ReadPosRankSum=-2.376;SC=AGGAACTTGATAAGTAACCCT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=5;WE=98634580;WS=98634564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr13	98634737	rs182994654	AT	A	459.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FS=3.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.04;MQRankSum=2.142;QD=1.74;ReadPosRankSum=-1.141;SOR=0.468;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:209,55:0.21:264
chr13	98637593	rs187179283	G	A	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=2.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.04;ReadPosRankSum=0.134;SOR=1.166;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,10:0.20:50
chr13	98637917	.	CTT	C	338.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.059;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.20;ReadPosRankSum=1.006;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,12:0.86:14
chr13	98637931	rs60936969	T	A	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.67;ReadPosRankSum=0.539;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,12:0.92:13
chr13	98640318	rs592246	C	T	2811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=56;PP=1725;ReadPosRankSum=0.038;SC=GTTCAAATATCGGGGGACGTT;SOR=0.709;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=177;TCF=94;TCR=83;TR=118;WE=98640326;WS=98640308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,125:0.67:187
chr13	98640386	rs588144	A	G	1379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=39;PP=940;ReadPosRankSum=-0.494;SC=GGTCTTTGTGACAATATAACC;SOR=0.760;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=35;TCR=55;TR=64;WE=98640394;WS=98640376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,63:0.69:91
chr13	98642639	rs9513332	G	A	540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.808;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=7;PP=331;ReadPosRankSum=0.182;SC=TTGAATTTGCGTTTATCAAAA;SOR=0.819;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=115;TCF=82;TCR=33;TR=31;WE=98642647;WS=98642629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,33:0.26:125
chr13	98645580	rs56411106	G	A	723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.367;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=25;PP=570;ReadPosRankSum=0.014;SC=AGAATATAATGAATATCCTTT;SOR=2.636;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=25;WE=98645588;WS=98645570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,26:0.63:41
chr13	98650024	rs651241	G	T	980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=28;PP=662;ReadPosRankSum=0.148;SC=TGTGTCACATGTTATAAGTAG;SOR=0.871;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=48;TCF=9;TCR=39;TR=34;WE=98650032;WS=98650014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,39:0.71:55
chr13	98655078	.	G	A	2514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.913;ClippingRankSum=0.000;DP=420;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.172;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=65;PP=1683;ReadPosRankSum=0.524;SC=AAGAAGGGTGGACATTTCAAC;SOR=0.640;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=385;TCF=203;TCR=182;TR=130;WE=98655086;WS=98655068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:280,139:0.33:419
chr13	98658358	rs633161	G	A	2215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.736;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=22;PP=1677;ReadPosRankSum=-0.740;SC=TTTCCTTTGAGGTAATAATTT;SOR=0.587;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=145;TCF=111;TCR=34;TR=89;WE=98658366;WS=98658348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,90:0.60:149
chr13	98666534	rs192955800	TA	T	47.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=3.910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.24;MQRankSum=1.929;QD=1.54;ReadPosRankSum=0.213;SOR=0.082;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,7:0.23:31
chr13	98666549	rs6491395	T	C	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=362;ReadPosRankSum=-1.296;SC=AAAAAAAATTTGAGACAGGGT;SOR=1.445;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=19;WE=98666557;WS=98666539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr13	98670641	rs528546	G	C	850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=2;PP=616;ReadPosRankSum=2.369;SC=TTGCCTGTATGAGGAATATCA;SOR=0.347;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=41;TCF=39;TCR=2;TR=27;WE=98670649;WS=98670636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,30:0.68:44
chr13	98829176	rs628778	T	C	12125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=472;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=209;NR=224;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.908;SC=CCATGTCCTCTGGCCCCACAG;SOR=0.446;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=437;TCF=211;TCR=226;TR=433;WE=98829184;WS=98829166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,470:1.00:471
chr13	98896776	rs7318267	C	T	693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.30;ReadPosRankSum=2.527;SOR=0.637;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,41:0.31:131
chr13	99017533	rs587377	G	A	304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=0;PP=251;SC=AATGGAACAGGCGGCCTCATA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=99017541;WS=99017526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr13	99061556	rs5806061	C	CT	4991.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.646;HP=9;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;MQRankSum=0.204;NF=47;NR=59;PP=1598;ReadPosRankSum=2.551;SC=AAAAAAATTACTTTTTTTTTC;SOR=1.196;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=124;TCF=53;TCR=71;TR=106;WE=99061564;WS=99061546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:8,211:0.96:219
chr13	99076965	rs7984394	A	G	2464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=43;PP=1369;SC=CGGGGCTGCCATGGGCATAGG;SOR=1.191;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=33;TCR=43;TR=76;WE=99076973;WS=99076955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr13	99090166	rs59023150	TG	T	4095.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.65;QD=44.04;SOR=1.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr13	99090168	rs1969794	G	T	4104.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.65;QD=43.67;SOR=1.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr13	99092052	rs4772080	G	T	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=254;ReadPosRankSum=1.920;SC=TTTCCGATTTGGGTTTTTCCA;SOR=0.693;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=14;WE=99092060;WS=99092046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr13	99093094	rs2146998	T	C	3165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=55;PP=1457;SC=AGTGGAGGTATGCAGGGGCAG;SOR=1.004;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=103;TCF=48;TCR=55;TR=103;WE=99093102;WS=99093084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr13	99098318	rs2274053	C	T	1678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=34;PP=1017;ReadPosRankSum=2.807;SC=GGCAGGTGCCCGCTGTGCTTC;SOR=0.669;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=190;TCF=110;TCR=80;TR=83;WE=99098326;WS=99098308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,88:0.43:203
chr13	99098470	rs2274054	C	T	967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=29;PP=635;ReadPosRankSum=0.851;SC=GTAAGTGTCTCGCACAGGGCA;SOR=0.673;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=126;TCF=45;TCR=81;TR=47;WE=99098478;WS=99098460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,49:0.37:134
chr13	99098882	rs2281766	A	C	2274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=372;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.817;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=34;PP=1708;ReadPosRankSum=1.126;SC=GCAGAAGCTGACCCCGAAAAG;SOR=0.915;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=339;TCF=224;TCR=115;TR=114;WE=99098890;WS=99098872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:250,120:0.32:370
chr13	99100547	rs12261	T	C	5953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=113;NR=91;PP=2965;SC=ACGTGTTGAGTCACAAAGAGT;SOR=0.848;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=204;TCF=113;TCR=91;TR=204;WE=99100555;WS=99100537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr13	99109319	rs2031237	C	T	38.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.70;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr13	99112468	rs112280830	T	TGCCTGAC	4853.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=10;PP=2969;SC=CGCAAGGTGGTGCTGACAGCC;SOR=2.808;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=55;TCF=43;TCR=12;TR=43;WE=99112476;WS=99112458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr13	99112680	rs4771305	C	T	5795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=126;PP=2965;SC=AAGGCCTCTTCGGGATGTCTT;SOR=1.776;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=186;TCF=60;TCR=126;TR=186;WE=99112688;WS=99112670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr13	99112754	rs4772083	TT	GC	4098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=48;PP=2947;SC=TGGCAATAATTTAATAAACCT;SOR=1.485;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=76;TCF=26;TCR=50;TR=74;WE=99112763;WS=99112744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr13	99115838	rs56325686	TA	T	285.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=4.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.42;ReadPosRankSum=-1.369;SOR=0.503;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,18:0.78:23
chr13	99115927	rs2296149	A	G	988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FS=0.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.03;MQRankSum=-0.549;QD=3.16;ReadPosRankSum=-0.336;SOR=0.742;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:239,74:0.24:313
chr13	99127052	rs9582232	C	T	846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=8;PP=486;ReadPosRankSum=2.024;SC=TGAGGCACGGCGCCGCCCTCA;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=47;TCF=35;TCR=12;TR=32;WE=99127060;WS=99127042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,37:0.70:53
chr13	99127252	rs9513430	C	G	3490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.305;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=64;PP=2130;ReadPosRankSum=-2.011;SC=AAAGCCAAGGCGGCCCTGGGC;SOR=0.672;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=221;TCF=118;TCR=103;TR=144;WE=99127260;WS=99127242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,159:0.66:241
chr13	99127496	rs2274055	C	T	2889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.443;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=70;PP=1750;ReadPosRankSum=-0.991;SC=AAACGGATGTCCTCTTACCTT;SOR=1.020;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=175;TCF=72;TCR=103;TR=114;WE=99127504;WS=99127486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,127:0.65:194
chr13	99134626	rs9513431	A	T	524.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=4.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=437;ReadPosRankSum=-1.515;SC=ATCCAGGAAAATTTTTTTTAA;SOR=1.781;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=19;WE=99134634;WS=99134616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
chr13	99336919	rs7331216	T	C	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.326;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=172;ReadPosRankSum=0.360;SC=TCCTGCTACCTGGGGGCAGAG;SOR=1.051;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=57;TCF=41;TCR=16;TR=15;WE=99336927;WS=99336909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,14:0.23:60
chr13	99338254	rs78583477	G	A	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.79;ReadPosRankSum=0.095;SOR=0.083;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,4:0.20:20
chr13	99354931	rs1768042	C	T	288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=7;PP=195;SC=CTCTGGAGGCCGGGCACAGTA;SOR=2.303;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=99354939;WS=99354921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr13	99356612	rs1339067	A	G	6801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=121;NR=114;PP=2965;SC=CGTCAGTTACAGCAGTGACTG;SOR=0.764;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=236;TCF=121;TCR=115;TR=235;WE=99356620;WS=99356602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr13	99361959	rs2297319	G	A	6568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=452;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.150;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=150;NR=116;PP=2962;ReadPosRankSum=0.874;SC=TCTCAAAGACGACTCTGATCC;SOR=0.806;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=424;TCF=234;TCR=190;TR=266;WE=99361967;WS=99361949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,287:0.63:452
chr13	99363919	rs6145194	GGTTTT	G	1608.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=5;PP=1218;SC=AATTGCTTTTGGTTTTGTTTT;SOR=3.912;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=26;WE=99363931;WS=99363909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr13	99404743	rs4646208	T	A	965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=308;ReadPosRankSum=0.157;SC=GTCGCCCCGCTTCCCGCCGCC;SOR=0.495;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=23;WE=99404751;WS=99404733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,25:0.68:37
chr13	99404761	rs4646207	C	T	1136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.782;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=9;PP=389;ReadPosRankSum=0.235;SC=GCCGCGTACCCTTCGCGCCTC;SOR=0.336;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=48;TCF=35;TCR=13;TR=30;WE=99404769;WS=99404751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,34:0.67:51
chr13	99447005	rs812808	T	C	6035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=101;NR=113;PP=2965;SC=GGGCAGATCTTGAGGACAGAA;SOR=0.870;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=214;TCF=101;TCR=113;TR=214;WE=99447013;WS=99446995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr13	99448441	rs9554522	T	A	1135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.320;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=22;PP=699;ReadPosRankSum=-2.211;SC=AGAAAAATAATGTTTAAAAAT;SOR=0.566;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=150;TCF=95;TCR=55;TR=52;WE=99448449;WS=99448431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,60:0.36:165
chr13	99448623	rs9554524	A	G	842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.666;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=28;PP=534;ReadPosRankSum=-1.332;SC=CTGAAGGACGATAATGGAGGG;SOR=0.600;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=155;TCF=55;TCR=100;TR=45;WE=99448631;WS=99448613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,48:0.30:158
chr13	99449579	rs1289314	T	C	10319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=377;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=177;NR=168;PP=2965;SC=CAGCATCTCCTTCCCGAATGA;SOR=0.736;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=346;TCF=177;TCR=169;TR=345;WE=99449598;WS=99449569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,376:1.00:376
chr13	99449755	rs1289315	G	A	2512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=67;PP=1605;ReadPosRankSum=-0.020;SC=TAGACAAAGAGCAAAGATTTT;SOR=0.664;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=158;TCF=58;TCR=100;TR=105;WE=99449763;WS=99449745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,111:0.66:168
chr13	99457431	rs2296984	T	G	2356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=464;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.566;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=61;PP=1523;ReadPosRankSum=-0.615;SC=CCTGGATGTATGCATACTTAG;SOR=0.751;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=433;TCF=225;TCR=208;TR=132;WE=99457439;WS=99457421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:324,140:0.30:464
chr13	99457552	rs7990741	T	A	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=25;PP=462;ReadPosRankSum=0.069;SC=ACATTTTATTTGTAAATATAA;SOR=0.749;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=119;TCF=34;TCR=85;TR=34;WE=99457560;WS=99457542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,34:0.28:122
chr13	99459891	rs9557078	A	C	1711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.149;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=25;PP=1115;ReadPosRankSum=0.432;SC=CATTGCTATGAAACTTATCCA;SOR=0.600;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=203;TCF=139;TCR=64;TR=79;WE=99459899;WS=99459881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,85:0.40:213
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chr13	99533649	rs9584961	G	A	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.203;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=232;ReadPosRankSum=0.060;SC=GTCCCTCTTCGTACCTCCCCT;SOR=2.608;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=11;WE=99533657;WS=99533643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
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chr13	99534048	rs6491461	G	A	2642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=35;PP=1658;SC=TTTCTTAAATGTAATGTTCAG;SOR=0.924;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=49;TCR=35;TR=84;WE=99534056;WS=99534038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr13	99536031	rs9517474	G	A	8024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.99;NF=157;NR=115;PP=2965;SC=TTTGTCACAGGGCAGCAACTG;SOR=1.017;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=272;TCF=157;TCR=115;TR=272;WE=99536039;WS=99536021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,296:1.00:296
chr13	99536215	rs2296996	C	T	2488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.91;SOR=4.066;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr13	99536220	rs2296997	A	G	2363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.35;SOR=4.133;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr13	99537202	rs2274641	C	A	3705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=44;PP=2306;SC=ATTGGGATGACCCAATCTTAA;SOR=1.312;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=125;TCF=81;TCR=44;TR=125;WE=99537210;WS=99537192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr13	99537217	rs2274642	G	T	4229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=55;PP=2683;SC=TCTTAAAATGGGACATACCCT;SOR=1.157;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=89;TCR=55;TR=144;WE=99537225;WS=99537207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr13	99537942	rs2296998	G	T	2347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=404;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.558;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQ=59.99;MQRankSum=0.712;NF=73;NR=52;PP=1393;ReadPosRankSum=-0.465;SC=AAAATCAAAGGAATGGTAAGC;SOR=0.785;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=373;TCF=214;TCR=159;TR=125;WE=99537950;WS=99537932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:268,134:0.33:402
chr13	99538711	rs6491465	C	G	2681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=20;PP=1887;SC=CTTGAATTTTCCTTTACCAGG;SOR=2.250;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=61;TCR=20;TR=81;WE=99538719;WS=99538701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr13	99538935	rs6491466	C	G	2770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=73;PP=1908;ReadPosRankSum=-0.195;SC=AGAAATTAAACTTGGATATAT;SOR=0.689;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=193;TCF=75;TCR=118;TR=119;WE=99538943;WS=99538925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,122:0.60:202
chr13	99540394	rs3737021	T	C	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=1.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.84;ReadPosRankSum=0.075;SOR=0.415;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,13:0.29:45
chr13	99540394	.	TA	CG	353	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=5;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=6;NR=5;PP=353;QD=36.9516249875;SC=GGTGAACATATATTAAAAAAA;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=44;TCF=29;TCR=15;TR=11;WE=99540414;WS=99540384;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:33,11:0.25:44
chr13	99540395	rs1928104	A	G	1662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=15;PP=1144;SC=GTGAACATATATTAAAAAAAA;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=44;TCF=29;TCR=15;TR=43;WE=99540414;WS=99540384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr13	99540406	rs3737023	A	C	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.588;HP=8;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=372;ReadPosRankSum=-1.005;SC=TTAAAAAAAAACAAACCTTAA;SOR=0.317;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=51;TCF=34;TCR=17;TR=16;WE=99540414;WS=99540384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,18:0.33:55
chr13	99540500	rs2274643	A	G	4285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.056;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=109;NR=56;PP=2557;ReadPosRankSum=-0.140;SC=ACAAAACAGAATAAGAAAAAA;SOR=0.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=237;TCF=156;TCR=81;TR=165;WE=99540508;WS=99540490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,186:0.69:268
chr13	99550351	rs2296999	T	A	1415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=23;PP=903;ReadPosRankSum=-0.711;SC=TCTTTGTCTCTGAACAACAAA;SOR=0.660;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=176;TCF=117;TCR=59;TR=70;WE=99550359;WS=99550341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,73:0.39:186
chr13	99555187	rs35240640	AT	A	3670.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.352;NF=47;NR=45;PP=1592;ReadPosRankSum=2.674;SC=ACCTCTGCCTATTTTTTTTTT;SOR=0.971;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=109;TCF=55;TCR=54;TR=92;WE=99555196;WS=99555177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:8,154:0.95:162
chr13	99556808	rs111507474	CAAAT	C	139.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.114;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.812;NF=5;NR=0;PP=168;ReadPosRankSum=-0.786;SC=ACAAAGCAAACAAATAAACAA;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=5;WE=99556819;WS=99556798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr13	99566730	rs41279134	C	T	992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.186;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=29;PP=588;ReadPosRankSum=-1.367;SC=GGCCGTTTCTCTTAGGTGCCT;SOR=0.565;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=196;TCF=89;TCR=107;TR=56;WE=99566738;WS=99566720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,62:0.29:215
chr13	99574524	rs7983462	C	T	2163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=53;PP=1383;SC=TTTACTGAAGCACCCATTGAC;SOR=1.893;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=75;TCF=21;TCR=54;TR=74;WE=99574532;WS=99574514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
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chr13	99575775	rs7989935	C	T	1159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.270;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=31;PP=725;ReadPosRankSum=2.048;SC=CATCTATGCCCTTGCTTTTCA;SOR=1.412;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=61;TCF=19;TCR=42;TR=43;WE=99575783;WS=99575765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,49:0.73:67
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chr13	99578265	rs7318788	T	C	807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=21;PP=648;ReadPosRankSum=-0.799;SC=GGCATACCCATAGAAACATCA;SOR=2.226;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=24;WE=99578273;WS=99578255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,25:0.96:26
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chr13	99853443	rs7338947	T	G	2923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=52;NR=55;PP=1700;SC=CCCCAGGTGCTCTGCCCAGGA;SOR=0.965;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=52;TCR=55;TR=107;WE=99853451;WS=99853433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr13	99907341	rs3742130	G	A	6296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=448;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=122;NR=133;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.771;SC=GATTGTAACTGTTCTCCCCCG;SOR=0.684;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=404;TCF=194;TCR=210;TR=255;WE=99907349;WS=99907331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,278:0.62:447
chr13	99947261	rs2230341	C	T	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.198;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=3;PP=424;ReadPosRankSum=0.155;SC=AAGGGAAGTCCTGCAAAGTTT;SOR=1.619;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=67;TCF=53;TCR=14;TR=23;WE=99947269;WS=99947251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,25:0.32:77
chr13	99948178	rs2230342	C	A	4878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-3.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=96;PP=2962;ReadPosRankSum=0.296;SC=TATCAGAAATCACCAAATTTG;SOR=0.701;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=279;TCF=138;TCR=141;TR=188;WE=99948186;WS=99948168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,207:0.67:307
chr13	99966291	rs9517681	A	G	746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.780;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=7;PP=556;ReadPosRankSum=1.253;SC=TCAAAGATACATCTGCCATTT;SOR=0.959;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=144;TCF=113;TCR=31;TR=43;WE=99966299;WS=99966281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,43:0.29:149
chr13	99970429	rs56695114	CT	C	1819.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.305;NF=3;NR=49;PP=1001;ReadPosRankSum=-1.661;SC=TCTCACCATTCTTTTTTTTTG;SOR=1.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=67;TCF=4;TCR=63;TR=52;WE=99970437;WS=99970419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,70:0.99:71
chr13	100004108	rs727263	G	A	1595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=39;PP=1050;ReadPosRankSum=-0.450;SC=GGTGTTAACTGGTTGATTATC;SOR=0.680;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=222;TCF=113;TCR=109;TR=77;WE=100004116;WS=100004098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,87:0.34:258
chr13	100020212	rs7318947	G	A	603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.61;ReadPosRankSum=1.543;SOR=0.672;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:97,34:0.26:131
chr13	100169825	rs9557247	G	A	638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=10;PP=465;ReadPosRankSum=-0.054;SC=AAGGCTTTGTGTCCTGTTGTT;SOR=0.667;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=87;TCF=64;TCR=23;TR=34;WE=100169833;WS=100169815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,34:0.37:92
chr13	100181915	rs4772217	A	G	933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=26;PP=723;SC=TGCTTTGACTATATAAATTAC;SOR=3.056;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=31;WE=100181923;WS=100181905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr13	100199256	.	T	C	3041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.752;ClippingRankSum=0.000;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.494;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=51;PP=2058;ReadPosRankSum=-0.124;SC=TTGCCTGGGATTTTTGTCACC;SOR=0.739;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=212;TCF=128;TCR=84;TR=128;WE=100199264;WS=100199246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,135:0.59:229
chr13	100201640	rs3803255	A	G	220.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=6;PP=167;SC=AACGTTTGCCAAATGATTACC;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=100201648;WS=100201630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr13	100206495	rs1980770	G	T	1622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-0.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.184;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=18;PP=1142;ReadPosRankSum=0.014;SC=ATAATCTCGTGTAGAGAAGAA;SOR=1.207;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=230;TCF=156;TCR=74;TR=76;WE=100206503;WS=100206485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,84:0.33:256
chr13	100515161	rs10648017	A	AGACTT	4985.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=16;PP=2912;SC=CTCAGGTCAAAGACTTAAATA;SOR=2.170;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=70;TCF=47;TCR=23;TR=54;WE=100515169;WS=100515151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr13	100518400	rs2390354	T	A	591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=0;PP=472;SC=CCAGGGAGGTTTAGATATCTG;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=100518408;WS=100518396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr13	100518580	rs3783185	A	G	5946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=108;NR=107;PP=2965;SC=TCTCCAAGCCATAGATCTGGT;SOR=0.747;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=215;TCF=108;TCR=107;TR=215;WE=100518588;WS=100518570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr13	100523386	rs3742254	T	C	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=61;ReadPosRankSum=2.170;SC=GAAACAAATATGTTGTGTGAA;SOR=0.641;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=6;WE=100523394;WS=100523376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr13	100537221	rs912283	T	C	2528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=466;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.177;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=62;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.430;SC=ACTTGTGTCCTTCTATTCAGG;SOR=0.607;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=430;TCF=240;TCR=190;TR=136;WE=100537240;WS=100537211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:315,150:0.32:465
chr13	100537232	rs912284	T	C	2548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=496;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.210;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=66;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.821;SC=TCTATTCAGGTAGGTCGGTAT;SOR=0.574;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=460;TCF=251;TCR=209;TR=139;WE=100537240;WS=100537211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:343,153:0.31:496
chr13	100537376	rs912285	G	A	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=26;PP=354;ReadPosRankSum=1.959;SC=GAGGCCTGGCGCCTCCCCACA;SOR=0.606;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=122;TCF=32;TCR=90;TR=34;WE=100537384;WS=100537366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,35:0.28:124
chr13	100622667	.	TGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGC	T	3315.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.417;ClippingRankSum=0.000;DP=309;ExcessHet=3.0103;FS=1.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.66;MQRankSum=4.449;QD=14.29;ReadPosRankSum=0.310;SOR=0.813;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:140,92:0.40:232
chr13	100807416	rs3215976	T	TA	52.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=4.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.10;ReadPosRankSum=0.568;SOR=2.187;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,8:0.17:48
chr13	100921056	rs4306370	A	G	6902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=136;PP=2965;SC=CCTAAGAAACATTTATAAAGC;SOR=1.126;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=235;TCF=98;TCR=137;TR=234;WE=100921064;WS=100921046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chr13	100945533	rs9300598	G	A	10347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=380;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=151;NR=194;PP=2965;SC=TTGAAATTCTGTGAAGGCTAT;SOR=1.031;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=345;TCF=151;TCR=194;TR=345;WE=100945541;WS=100945523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,380:1.00:380
chr13	100945603	rs8002928	A	G	513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.06;ReadPosRankSum=1.158;SOR=0.682;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:131,37:0.22:168
chr13	101020695	rs9518061	A	G	1891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.844;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=27;PP=1161;ReadPosRankSum=-0.325;SC=ATATAAAATTATTAACTCTTT;SOR=0.404;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=110;TCF=72;TCR=38;TR=73;WE=101020703;WS=101020685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,80:0.68:118
chr13	101143782	rs4772295	A	G	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=242;ReadPosRankSum=-0.539;SC=ATAAAAAGGAAAAGAATGGAA;SOR=0.520;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=41;TCF=29;TCR=12;TR=18;WE=101143790;WS=101143772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,18:0.43:42
chr13	101144031	rs4772296	A	G	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.786;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=17;PP=303;ReadPosRankSum=-0.545;SC=GATTTGTAACACTTTTATTTT;SOR=0.975;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=96;TCF=43;TCR=53;TR=27;WE=101144039;WS=101144021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,30:0.26:115
chr13	101179710	.	AT	A	46.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.048;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=1.804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.03;ReadPosRankSum=0.211;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr13	101182211	rs3059677	CGGTGG	C	529.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.273;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=348;ReadPosRankSum=0.416;SC=CGATGGGCTCCGGTGGGGTGG;SOR=1.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=20;TCR=18;TR=10;WE=101182227;WS=101182201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,16:0.31:51
chr13	101264633	rs1572641	C	T	3799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=34;PP=2586;SC=CAAGAACTCACAGCCTGCGGT;SOR=2.117;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=126;TCF=92;TCR=34;TR=125;WE=101264641;WS=101264623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr13	101264845	rs72661055	T	C	911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.491;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=32;PP=690;ReadPosRankSum=0.821;SC=TAACAGGGTTTATGTGCACAG;SOR=0.881;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=146;TCF=44;TCR=102;TR=44;WE=101264853;WS=101264835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,47:0.28:166
chr13	101286924	rs1890861	T	C	766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=0;PP=617;SC=AAACCATACATAACAAAGAAA;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=101286932;WS=101286914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr13	101287340	rs946837	C	T	8851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=123;NR=170;PP=2965;SC=CAGTACCCAACGCTGGGGAGG;SOR=1.136;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=293;TCF=123;TCR=170;TR=293;WE=101287348;WS=101287330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,322:1.00:322
chr13	101287365	rs946838	T	C	5838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=127;PP=2965;SC=GGACACGCTCTGCGACCACGA;SOR=1.434;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=201;TCF=74;TCR=127;TR=201;WE=101287373;WS=101287355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr13	101288992	rs3803256	C	T	6396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=119;PP=2965;SC=TTACGGCCTGCCAGTCAAAAG;SOR=0.921;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=228;TCF=108;TCR=120;TR=227;WE=101289000;WS=101288982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr13	101289998	rs7985718	C	A	6585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=97;PP=2965;SC=CTGATTTTCACATAAAAGTGT;SOR=0.905;Source=Platypus;TCF=97;WE=101290006;WS=101289988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr13	101294428	rs9585476	C	G	2788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=13;PP=2173;SC=AAAGGACACACAGAAAAAGCA;SOR=3.611;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=74;TCR=13;TR=87;WE=101294436;WS=101294418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr13	101316313	rs1298168	C	T	1371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=5;PP=1093;SC=GCCACGCTGGCCTTCTCTGCA;SOR=3.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=41;TCR=5;TR=46;WE=101316321;WS=101316303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr13	101316378	rs1283208	A	G	3890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=42;PP=2510;SC=CACTGACTAGACTCCTGAATG;SOR=1.402;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=128;TCF=86;TCR=42;TR=128;WE=101316386;WS=101316368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr13	101318136	rs945962	C	T	906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=0;PP=707;SC=ACACTGACCACTCCCCAAGAG;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=27;WE=101318144;WS=101318126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr13	101321067	rs2791680	T	C	2390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=60;PP=1431;SC=AAAACAACACTGTATAAATAT;SOR=1.796;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=28;TCR=60;TR=88;WE=101321075;WS=101321057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr13	101322622	rs1283201	G	C	5848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=113;PP=2965;SC=ACCATTCCATGGTGATGCTGT;SOR=1.002;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=208;TCF=95;TCR=113;TR=208;WE=101322630;WS=101322612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr13	101712426	rs2274085	G	T	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.831;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=247;ReadPosRankSum=-0.121;SC=CCTGCATGACGGGTGACCTCT;SOR=0.132;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=14;WE=101712434;WS=101712416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr13	101717980	rs369621391	GAA	G	705.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=15;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.663;NF=2;NR=21;PP=287;ReadPosRankSum=0.294;SC=TTTCTCAAAAGAAAAAAAAAA;SOR=1.044;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=23;WE=101717989;WS=101717970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,23:0.74:31
chr13	101720300	rs1289556	T	G	9499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=352;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=145;NR=174;PP=2965;SC=TGTTCCATATTATTTGAAAGT;SOR=0.982;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=320;TCF=145;TCR=175;TR=319;WE=101720308;WS=101720290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,351:1.00:351
chr13	101721029	rs11616341	T	C	2122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=13;PP=1576;SC=TAAAAAGTATTCAACTAACAT;SOR=2.737;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=54;TCR=13;TR=67;WE=101721037;WS=101721019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr13	101727043	rs34229756	C	CAG	600.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.756;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=81;PP=2767;ReadPosRankSum=3.553;SC=AGCGGGGAGACAGAGAGAGAG;SOR=2.315;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=142;TCF=7;TCR=135;TR=86;WE=101727055;WS=101727028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,31:0.37:84
chr13	101727071	rs112963196	CAG	C	1603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.16;ReadPosRankSum=-0.259;SOR=1.946;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,51:0.93:55
chr13	101735026	rs12430032	T	A	1479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.454;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=15;PP=881;ReadPosRankSum=-0.659;SC=ACCGCTTAAGTAGGAAATATC;SOR=0.341;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=87;TCF=66;TCR=21;TR=56;WE=101735034;WS=101735016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,62:0.67:93
chr13	101736075	rs686141	A	G	5911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=110;NR=91;PP=2965;SC=GGCGAGGCGGAAGATGAAGAG;SOR=0.778;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=201;TCF=110;TCR=91;TR=201;WE=101736083;WS=101736065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr13	101747878	rs609246	C	T	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.368;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=571;ReadPosRankSum=0.084;SC=AAGCCTTATACTGACAAACAC;SOR=0.061;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=15;WE=101747900;WS=101747868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr13	101747892	rs8000023	A	G	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=571;ReadPosRankSum=0.298;SC=CAAACACACCATTCTTCAGAA;SOR=0.527;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=17;WE=101747900;WS=101747868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr13	101753023	rs113145864	C	CTG	3873.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=13;PP=2354;SC=CCTTGACCTCCAGTTTCAAGT;SOR=2.891;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=51;TCF=36;TCR=15;TR=48;WE=101753033;WS=101753013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr13	101753025	rs57703343	GT	G	3873.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=13;PP=1723;SC=TTGACCTCCAGTTTCAAGTAA;SOR=2.967;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=53;TCF=36;TCR=17;TR=44;WE=101753033;WS=101753013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr13	101755480	rs9300647	G	T	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FS=1.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.56;ReadPosRankSum=0.967;SOR=0.883;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:140,37:0.21:177
chr13	101755813	rs7331375	C	A	951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=27;PP=752;SC=TTGTACGTGCCATCTGTTAAC;SOR=4.548;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=29;WE=101755821;WS=101755803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr13	101769546	rs658424	T	C	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-3.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=71;ReadPosRankSum=1.955;SC=AGAACTTCATTGTAGGCAGAA;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=6;WE=101769554;WS=101769536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr13	101844329	.	C	G	2345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=0.000;DP=388;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.297;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=57;PP=1437;ReadPosRankSum=0.727;SC=CCACATATGTCCCACAGCATT;SOR=0.626;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=364;TCF=195;TCR=169;TR=117;WE=101844337;WS=101844319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:260,128:0.33:388
chr13	101890040	rs9518352	A	G	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=353;SC=TGTTAAAATAATGTGACAGGT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=101890048;WS=101890030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr13	101936108	.	T	G	59	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=22;MQ=58.94;NF=4;NR=0;PP=59;QD=23.4428031368;SC=CTATTGTGTATGTTAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=4;WE=101936116;WS=101936098;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,4:0.40:10
chr13	101944752	rs570252	C	T	1485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=40;PP=1160;SC=TGAGTCACAGCTGACTTTTGA;SOR=3.958;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=5;TCR=41;TR=45;WE=101944760;WS=101944742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr13	102021517	rs145272114	A	ATG	111.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.524;NF=0;NR=6;PP=139;ReadPosRankSum=0.825;SC=GACAAAATAAATGTGTGTGTG;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=6;WE=102021525;WS=102021507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr13	102344867	rs981073	A	G	1262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=10;PP=863;SC=TAGTGTGCTCACCTCCTTGAA;SOR=2.352;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=37;TCR=10;TR=47;WE=102344875;WS=102344857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr13	102366742	rs2281990	C	T	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-5.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.713;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=4;PP=426;ReadPosRankSum=0.337;SC=GAGATGGAAACCTTTAGTTAT;SOR=0.321;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=77;TCF=69;TCR=8;TR=30;WE=102366750;WS=102366732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,33:0.36:91
chr13	102368056	rs1436266	G	T	4201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=94;PP=2686;SC=CATTAGAACAGATAAATGCGA;SOR=2.056;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=132;TCF=38;TCR=94;TR=132;WE=102368064;WS=102368046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr13	102619987	rs7993843	G	C	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.055;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=12;PP=440;ReadPosRankSum=1.719;SC=TCTTTAGATAGCTTACACGTT;SOR=1.123;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=71;TCF=44;TCR=27;TR=32;WE=102619995;WS=102619977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,33:0.41:80
chr13	102620137	rs11069471	T	C	843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.772;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=19;PP=465;ReadPosRankSum=0.683;SC=TTAACCTCTATTGAATCCTCT;SOR=0.809;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=83;TCF=40;TCR=43;TR=36;WE=102620145;WS=102620127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,43:0.46:94
chr13	102698415	rs7337292	A	G	1367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.531;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=36;PP=800;ReadPosRankSum=-0.363;SC=GTCAAGATCTATTCTAACTCC;SOR=0.766;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=187;TCF=92;TCR=95;TR=68;WE=102698423;WS=102698405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,74:0.36:208
chr13	102698459	rs667685	G	A	879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=27;PP=478;ReadPosRankSum=-0.507;SC=GATGCCTTTTGTTCTTGCCTG;SOR=0.648;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=148;TCF=63;TCR=85;TR=49;WE=102698467;WS=102698449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,52:0.32:161
chr13	103257297	.	AT	A	73.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.341;ClippingRankSum=0.000;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.78;ReadPosRankSum=0.209;SOR=0.735;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,18:0.19:94
chr13	103271003	.	G	C	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.917;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=21;ReadPosRankSum=0.646;SC=TTGTATCTTTGGCTGTATGTT;SOR=0.105;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=4;WE=103271011;WS=103270993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,4:0.22:18
chr13	103271206	rs4576935	G	A	1443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=41;PP=746;ReadPosRankSum=1.615;SC=GGTAAACTTCGTGTATTTTAT;SOR=0.711;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=236;TCF=103;TCR=133;TR=72;WE=103271214;WS=103271196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,85:0.33:260
chr13	103275386	rs2230854	T	C	2150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.23;ReadPosRankSum=-2.585;SOR=0.816;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:224,121:0.35:345
chr13	103279589	rs16960258	C	G	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=315;ReadPosRankSum=2.211;SC=TTTATAAGTGCTCCTAGTTTA;SOR=0.346;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=17;WE=103279597;WS=103279579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr13	103282279	rs660832	A	C	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=415;ReadPosRankSum=1.760;SC=AGTAAAATGTATGGTACATAG;SOR=0.601;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=64;TCF=53;TCR=11;TR=24;WE=103282287;WS=103282269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,24:0.36:67
chr13	103282299	rs660811	C	G	727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.919;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=15;PP=435;ReadPosRankSum=0.460;SC=GTAGACTTTCCTTGTTTCCTT;SOR=0.292;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=106;TCF=73;TCR=33;TR=40;WE=103282307;WS=103282284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,40:0.36:110
chr13	103282643	rs72452045	TGTTG	T	576.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=422;ReadPosRankSum=0.508;SC=AGTTTTTTTCTGTTGGTTTTT;SOR=2.419;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=10;WE=103282654;WS=103282633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,15:0.79:19
chr13	103286280	rs2274461	T	A	2787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.555;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=43;PP=1538;ReadPosRankSum=-1.712;SC=CTAAGCAAACTTCAATGGCTT;SOR=0.769;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=177;TCF=108;TCR=69;TR=115;WE=103286288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,127:0.65:196
chr13	103286474	rs58545410	C	T	3066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.077;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=70;PP=1726;ReadPosRankSum=1.075;SC=ATTGTCCTTACATTATTGCAG;SOR=0.605;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=206;TCF=88;TCR=118;TR=126;WE=103286482;WS=103286464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,140:0.62:226
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chr13	103289338	rs2274463	C	T	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=28;ReadPosRankSum=0.045;SC=CCAACCAAACCAAGTCGCTAA;SOR=0.148;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=5;WE=103289346;WS=103289328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr13	103290535	rs613926	G	C	2026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=396;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.330;HP=6;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=45;PP=1343;ReadPosRankSum=-0.607;SC=ACCTTCCCCCGCTCTTTTAAA;SOR=0.617;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=372;TCF=228;TCR=144;TR=112;WE=103290543;WS=103290519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:279,117:0.30:396
chr13	103290574	rs614290	G	A	2924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=577;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=76;PP=1969;ReadPosRankSum=-0.971;SC=GACACTTACCGATTCTTTTTT;SOR=0.738;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=541;TCF=290;TCR=251;TR=163;WE=103290582;WS=103290564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:404,173:0.30:577
chr13	103292580	rs41281652	T	C	973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.874;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=5;PP=632;ReadPosRankSum=-1.166;SC=TGTGGTCTTATAATAAATATA;SOR=0.074;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=46;TCF=41;TCR=5;TR=33;WE=103292588;WS=103292570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,38:0.70:54
chr13	103292810	rs634293	G	A	1216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.290;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=36;PP=751;ReadPosRankSum=0.480;SC=TTTATCTGTAGCATGTATTTC;SOR=0.823;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=154;TCF=62;TCR=92;TR=60;WE=103292818;WS=103292800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,63:0.38:164
chr13	103292875	rs16960293	G	A	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.774;HP=5;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=334;ReadPosRankSum=0.290;SC=AGTTCAAAACGTTTTTAAGAT;SOR=2.256;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=17;WE=103292883;WS=103292865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr13	103295485	rs3831118	A	AT	105.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.961;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=76;ReadPosRankSum=-0.380;SC=CATGGGAATTATCCCTAAGTG;SOR=0.078;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=5;WE=103295493;WS=103295475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,6:0.22:27
chr13	103295551	rs144831383	CTTCT	C	1441.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FS=6.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.06;MQRankSum=1.794;QD=7.51;ReadPosRankSum=0.079;SOR=1.249;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:146,46:0.24:192
chr13	103296819	rs35462812	C	CAT	115.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=148;ReadPosRankSum=-0.678;SC=AGTTTGAAAACAGAATTGCTC;SOR=0.086;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=5;WE=103296827;WS=103296809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,5:0.21:24
chr13	103297435	rs10713633	CT	C	1239.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=1.771;QD=8.98;ReadPosRankSum=1.069;SOR=0.729;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,77:0.56:138
chr13	103299517	rs17507295	A	G	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=298;ReadPosRankSum=-1.386;SC=CAGAAATTATATGCAAATCAT;SOR=0.516;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=60;TCR=10;TR=20;WE=103299525;WS=103299507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,24:0.31:77
chr13	103301537	rs664660	G	T	4050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=84;PP=2498;SC=ACTGCCCATCGTATACACTGT;SOR=1.394;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=135;TCF=51;TCR=84;TR=135;WE=103301545;WS=103301527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr13	103301619	rs3215841	G	GT	211.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.493;NF=2;NR=6;PP=242;ReadPosRankSum=-0.772;SC=TTTGGCTGAAGTATTTCTTCC;SOR=0.635;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=27;TCF=9;TCR=18;TR=8;WE=103301627;WS=103301609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr13	103307218	rs673424	C	T	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=192;ReadPosRankSum=0.164;SC=TCAGATTTTGCGCTTACCTTG;SOR=0.518;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=18;WE=103307226;WS=103307208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,22:0.50:44
chr13	103307322	rs677248	A	G	5127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=97;NR=68;PP=2965;SC=AGCCCAAGCAATAGACCTGTT;SOR=0.967;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=97;TCR=68;TR=165;WE=103307330;WS=103307312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr13	103307360	rs677179	G	A	1587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.024;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=36;PP=1107;ReadPosRankSum=-0.125;SC=TGTTTCACGTGAGGCCTTTGT;SOR=0.769;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=223;TCF=126;TCR=97;TR=83;WE=103307368;WS=103307350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,87:0.36:245
chr13	103307483	rs672129	G	A	6891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=106;NR=132;PP=2965;SC=ATGAGTCAGTGTGGAGATAGG;SOR=1.030;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=238;TCF=106;TCR=132;TR=238;WE=103307491;WS=103307473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr13	103315948	rs9585959	G	C	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=79;ReadPosRankSum=-0.074;SC=AAGACAAATAGTCTTTTTAAA;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=6;WE=103315956;WS=103315938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr13	103316113	rs7334625	G	A	1066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.291;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=28;PP=564;ReadPosRankSum=0.390;SC=TGTTCATTCTGATATATCTTA;SOR=0.805;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=143;TCF=64;TCR=79;TR=50;WE=103316121;WS=103316103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,59:0.37:158
chr13	103328579	rs665479	G	T	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=36;ReadPosRankSum=1.484;SC=TTAATTTTATGGTTAAAGCTA;SOR=0.252;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=5;WE=103328587;WS=103328569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
chr13	103328619	rs584710	C	A	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=3.787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.84;ReadPosRankSum=-0.103;SOR=0.184;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,12:0.27:45
chr13	103328660	rs2230856	A	G	1669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.968;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=21;PP=948;ReadPosRankSum=-1.210;SC=TGACATTTGCATATAAACATG;SOR=0.964;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=81;TCF=54;TCR=27;TR=65;WE=103328668;WS=103328650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,75:0.78:96
chr13	103330718	rs3806	G	A	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=3.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.92;ReadPosRankSum=0.230;SOR=1.659;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,11:0.21:53
chr13	103339365	rs660207	A	G	2405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=477;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=55;PP=1618;ReadPosRankSum=1.129;SC=TGGAAATTCAATTCCTCGGCA;SOR=0.688;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=426;TCF=237;TCR=189;TR=127;WE=103339373;WS=103339355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:339,138:0.29:477
chr13	103343308	rs16960383	T	C	1058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.615;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=35;PP=757;ReadPosRankSum=0.068;SC=TTCTATCTTGTTGGATTCTGT;SOR=0.619;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=174;TCF=64;TCR=110;TR=55;WE=103343316;WS=103343298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,57:0.30:188
chr13	103343333	rs73583332	A	G	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.880;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=21;PP=381;ReadPosRankSum=-0.796;SC=CAGAAAAATAAAATGGAGTTC;SOR=0.315;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=106;TCF=27;TCR=79;TR=30;WE=103343341;WS=103343323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,31:0.27:115
chr13	103346806	rs2390760	C	G	3187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=74;PP=2178;SC=AGTCCTTCCCCCCGGCGCCCA;SOR=0.906;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=123;TCF=49;TCR=74;TR=121;WE=103346814;WS=103346796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr13	103383417	rs9554897	T	C	9098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=154;NR=136;PP=2965;SC=CCTTTTTCTTTTACTGAGTGG;SOR=0.744;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=290;TCF=154;TCR=136;TR=290;WE=103383425;WS=103383407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,320:1.00:320
chr13	103385015	rs6491707	A	G	8862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=156;NR=128;PP=2965;SC=CTTTAGAGATAGAAGATGCGG;SOR=0.827;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=284;TCF=156;TCR=128;TR=284;WE=103385023;WS=103385005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,316:1.00:316
chr13	103385299	rs7335290	A	C	7018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=116;NR=116;PP=2965;SC=ACTTCGGAAGAAATTCCAGAA;SOR=0.794;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=232;TCF=116;TCR=116;TR=232;WE=103385307;WS=103385289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr13	103385534	rs17592438	C	T	6570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=428;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.166;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=128;NR=129;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.304;SC=TTCACACCGTCGGATCACTTG;SOR=0.605;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=391;TCF=201;TCR=190;TR=257;WE=103385542;WS=103385524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,279:0.65:428
chr13	103385798	rs7983175	T	C	8323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.082;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=146;NR=137;PP=2965;ReadPosRankSum=1.475;SC=TCCTTTTGAATTTGCAGGGGT;SOR=0.286;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=285;TCF=147;TCR=138;TR=283;WE=103385806;WS=103385788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,304:1.00:305
chr13	103386116	rs7982465	C	G	11145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=412;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=182;NR=198;PP=2965;SC=TTCTTCTGACCTGACTCGTGA;SOR=0.795;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=381;TCF=182;TCR=199;TR=380;WE=103386124;WS=103386106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,410:1.00:410
chr13	103386283	rs7982670	A	G	12801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=481;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=234;NR=220;PP=2965;SC=TTGAGGGTACATGGAGAGTTC;SOR=0.723;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=454;TCF=234;TCR=220;TR=454;WE=103386291;WS=103386273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,481:1.00:481
chr13	103388220	rs9300758	A	G	7857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=123;NR=142;PP=2965;SC=AATGAAGCAGATTTCCTCGGA;SOR=0.949;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=265;TCF=123;TCR=142;TR=265;WE=103388228;WS=103388210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,287:1.00:287
chr13	103390386	rs74471135	C	A	14764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=547;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=257;NR=257;PP=2965;SC=TCTTGTCCTGCACCTCTTCTG;SOR=0.750;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=515;TCF=258;TCR=257;TR=514;WE=103390394;WS=103390376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,545:1.00:545
chr13	103391605	rs17592480	T	C	4971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=78;PP=2965;SC=ATTTCTTTCCTTTCAAAGTGA;SOR=0.728;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=158;TCF=80;TCR=78;TR=158;WE=103391613;WS=103391595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr13	103391634	rs7322112	C	T	5701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=85;PP=2965;SC=AGGCCCATTACATCTTTCACA;SOR=0.825;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=189;TCF=104;TCR=85;TR=189;WE=103391642;WS=103391624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr13	103392127	rs74435572	T	A	7165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=129;NR=122;PP=2965;SC=CAATTGTTTCTTTATTCAATT;SOR=0.701;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=251;TCF=129;TCR=122;TR=251;WE=103392135;WS=103392117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr13	103392709	rs79592880	A	T	11595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=432;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=215;NR=180;PP=2965;SC=TGCTTAGCTGATCTGCAGAAA;SOR=0.790;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=395;TCF=215;TCR=180;TR=395;WE=103392717;WS=103392699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,432:1.00:432
chr13	103394003	rs1449707	G	A	11618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=425;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=184;NR=204;PP=2965;SC=CTCCTGGCAAGTCTTCTGTTG;SOR=0.877;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=388;TCF=184;TCR=204;TR=388;WE=103394011;WS=103393993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,424:1.00:424
chr13	103394613	rs9585986	T	G	7385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.097;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=148;PP=2965;ReadPosRankSum=1.642;SC=TGGGAAACTGTTATTCTTTTT;SOR=1.008;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=245;TCF=97;TCR=148;TR=244;WE=103394621;WS=103394603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,261:1.00:262
chr13	103394716	rs9585987	T	C	5727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=111;NR=96;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.149;SC=GAGAAATAGATGTGTAGGGAT;SOR=0.788;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=209;TCF=113;TCR=96;TR=207;WE=103394724;WS=103394706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,218:0.99:220
chr13	103395819	rs1375720	C	T	4306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=81;PP=2818;SC=GTAAACTGCCCACTGATTTTA;SOR=1.164;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=142;TCF=61;TCR=81;TR=142;WE=103395827;WS=103395809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr13	103396716	rs6491708	C	G	5186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=90;NR=80;PP=2965;SC=GCAGTTTTCTCAGAAATAGAA;SOR=0.726;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=170;TCF=90;TCR=80;TR=170;WE=103396724;WS=103396706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr13	103397583	rs9582626	C	G	8365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=125;NR=155;PP=2965;SC=TTTAACAATGCCTCCTGTTTC;SOR=0.939;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=280;TCF=125;TCR=155;TR=280;WE=103397591;WS=103397573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,306:1.00:306
chr13	103397890	rs75285783	G	A	17306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=645;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=281;NR=312;PP=2965;SC=TATTGAGCATGTATGAAATTG;SOR=0.843;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=593;TCF=281;TCR=312;TR=593;WE=103397898;WS=103397880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,643:1.00:643
chr13	103399837	rs58265842	C	A	5601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=117;NR=70;PP=2965;SC=TAATTTCCTGCCTTTTAAAAT;SOR=1.236;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=188;TCF=118;TCR=70;TR=187;WE=103399845;WS=103399827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr13	103400033	rs17592564	A	G	14807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=523;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=253;NR=215;PP=2965;SC=TGGCATTGTAAGTGGATTCTT;SOR=0.876;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=470;TCF=255;TCR=215;TR=468;WE=103400041;WS=103400023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,522:1.00:522
chr13	103400729	rs12583104	G	A	8200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=157;NR=126;PP=2965;SC=TTTGCTTCCTGGGGAAATGAG;SOR=0.892;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=284;TCF=158;TCR=126;TR=283;WE=103400737;WS=103400719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,306:1.00:306
chr13	103402522	rs9300760	C	T	11763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=443;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=225;NR=175;PP=2965;SC=GGCTTAGACACGTTTCCTCTA;SOR=0.906;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=400;TCF=225;TCR=175;TR=400;WE=103402530;WS=103402512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,443:1.00:443
chr13	103402772	rs9284197	T	C	182.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=178;SC=CAAATGAATATTAGAATATAT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=103402780;WS=103402762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr13	103410710	rs9585989	A	G	956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=6;PP=604;SC=ATAGAACACAACCAACCTATT;SOR=2.235;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=30;WE=103410718;WS=103410700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr13	103445609	rs11441956	G	GT	2868.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=16;PP=2194;SC=CCCTGATAGTGTATAATTTGT;SOR=1.673;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=35;TCR=17;TR=49;WE=103445617;WS=103445599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
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chr13	103449375	rs12583419	A	G	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=18.68;ReadPosRankSum=-0.140;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
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chr13	103451050	rs7993350	C	A	1931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.741;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=50;PP=1217;ReadPosRankSum=-0.122;SC=AATGATCCACCGATAAATGAA;SOR=0.816;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=119;TCF=42;TCR=77;TR=77;WE=103451058;WS=103451040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,83:0.66:126
chr13	103473497	rs9557936	T	G	867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.391;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=24;PP=524;ReadPosRankSum=1.151;SC=GTATGTCAATTTATCAGTACC;SOR=1.085;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=54;TCF=18;TCR=36;TR=34;WE=103473505;WS=103473487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,38:0.63:60
chr13	103474031	rs2148449	C	T	4588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=114;NR=38;PP=2922;SC=AACATTGAGACAGGCTGTATT;SOR=1.967;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=152;TCF=114;TCR=38;TR=152;WE=103474039;WS=103474021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr13	103474382	rs2274390	G	A	1338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.047;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=16;PP=815;ReadPosRankSum=0.501;SC=TTGTAGAATTGTTGCCATGAA;SOR=0.516;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=68;TCF=47;TCR=21;TR=50;WE=103474390;WS=103474372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,56:0.74:76
chr13	103484060	rs2181676	G	A	5684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=132;PP=2965;SC=AAGCATTGACGTGTTTTAGAA;SOR=1.805;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=194;TCF=62;TCR=132;TR=194;WE=103484070;WS=103484050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr13	103484107	rs3825519	C	T	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.664;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=292;ReadPosRankSum=-0.125;SC=TAGATGGGTGCGGTAGCTCAC;SOR=0.348;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=53;TCF=7;TCR=46;TR=19;WE=103484115;WS=103484097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,18:0.35:52
chr13	103486912	rs76812904	C	T	1199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=32;PP=815;ReadPosRankSum=0.761;SC=AGTATGTTAACTTCCCTTTAT;SOR=0.665;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=26;TCR=47;TR=50;WE=103486920;WS=103486902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,51:0.67:76
chr13	103491172	rs2281886	G	A	4171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=94;PP=2623;SC=TAGGTTGCAAGTAACAGAAAC;SOR=1.806;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=137;TCF=43;TCR=94;TR=137;WE=103491180;WS=103491162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr13	103491223	rs7337774	C	G	1084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=30;PP=818;SC=TAAGGACACACGGCTGTCTTT;SOR=3.675;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=34;WE=103491231;WS=103491213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr13	103498545	rs2296148	C	T	2102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.675;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=33;PP=1130;ReadPosRankSum=-1.298;SC=GGGTCCTAGGCGGCGGTGCAG;SOR=0.582;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=125;TCF=77;TCR=48;TR=84;WE=103498553;WS=103498535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,97:0.68:142
chr13	103504517	rs1047768	T	C	13052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=496;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=228;NR=213;PP=2965;ReadPosRankSum=0.983;SC=GGGATCGCCATGGGAACTCAA;SOR=0.275;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=443;TCF=228;TCR=215;TR=441;WE=103504525;WS=103504507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,494:1.00:495
chr13	103506509	rs1535729	A	C	1499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=5;PP=1141;SC=AGCCCCGCCAAGGTTCCTTCC;SOR=4.047;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=42;TCR=5;TR=47;WE=103506517;WS=103506499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr13	103510896	rs3736865	C	T	521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=17;PP=434;SC=AGCATTTCTACATCTCAGATT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=103510904;WS=103510886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr13	103511301	rs4150299	T	C	8524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=158;NR=144;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.086;SC=TGCCATTGGCTCTCCACATTC;SOR=0.737;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=304;TCF=159;TCR=145;TR=302;WE=103511309;WS=103511290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,325:0.99:327
chr13	103514091	rs7982448	T	C	3611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.60;SOR=1.812;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr13	103515085	rs2227869	G	C	6127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=461;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.129;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=145;NR=122;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.265;SC=TCTCCAACTTGTACAAATTCT;SOR=0.802;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=436;TCF=230;TCR=206;TR=267;WE=103515093;WS=103515075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,278:0.60:461
chr13	103515561	rs4150321	C	T	593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=462;ReadPosRankSum=2.104;SC=AGATAAGGAACGAGAGACGTA;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=22;WE=103515569;WS=103515551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,23:0.64:36
chr13	103518769	rs6491716	T	C	3475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=68;PP=2201;SC=TACCACCTTCTTCAGACCCCT;SOR=1.512;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=39;TCR=68;TR=107;WE=103518777;WS=103518759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr13	103524762	rs4150360	C	T	888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=27;PP=612;ReadPosRankSum=1.503;SC=TCCTTTGCTTCTTAAAAGAGA;SOR=0.644;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=42;TCR=83;TR=41;WE=103524770;WS=103524752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,44:0.33:134
chr13	103527849	rs9514066	G	C	10087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=369;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=155;NR=180;PP=2965;SC=TAAGGCAAAAGGAAAAACCCA;SOR=0.882;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=335;TCF=155;TCR=180;TR=335;WE=103527857;WS=103527839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,368:1.00:368
chr13	103527930	rs9514067	G	C	10259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=380;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=178;NR=167;PP=2965;SC=AGATTCTAAAGGAAAGAATAC;SOR=0.698;SbPval=0.52;Source=Platypus;TCF=178;TR=345;WE=103527938;WS=103527920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,379:1.00:379
chr13	103528002	rs17655	G	C	5835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=387;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=122;NR=112;PP=2962;ReadPosRankSum=0.710;SC=TTCAAGTGAAGATGCTGAAAG;SOR=0.671;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=355;TCF=183;TCR=172;TR=234;WE=103528010;WS=103527992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,255:0.66:387
chr13	103528337	.	G	A	40	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;FR=0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=40;QD=37.3856062736;SC=ATTAACTGGTGGCACGGTCTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=2;WE=103528350;WS=103528327;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:13,2:0.13:15
chr13	103528342	rs4150390	G	A	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=392;ReadPosRankSum=-0.960;SC=CTGGTGGCACGGTCTTTGTAT;SOR=1.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=12;WE=103528350;WS=103528327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,15:0.88:17
chr13	103698363	rs2301157	A	G	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=124;ReadPosRankSum=-0.044;SC=ATGAATTCCAATGAAATTCCA;SOR=1.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=8;WE=103698371;WS=103698353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,10:0.31:32
chr13	103698630	rs279940	C	T	5936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=140;PP=2965;SC=AATACACAGACAGTTAAGTAA;SOR=2.147;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=194;TCF=54;TCR=140;TR=194;WE=103698638;WS=103698620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr13	103703481	rs279938	A	G	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=270;ReadPosRankSum=-0.475;SC=CTCTGAAACCATGAGACAATA;SOR=1.828;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=15;WE=103703489;WS=103703476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr13	103703579	rs8000956	T	C	1385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.084;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=28;PP=903;ReadPosRankSum=-0.485;SC=AGATTAAAATTCCCAATGTGA;SOR=0.592;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=240;TCF=152;TCR=88;TR=75;WE=103703587;WS=103703569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,79:0.32:250
chr13	103705044	rs188096	A	C	14847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=555;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=261;NR=255;PP=2965;SC=ACAACGAGAGAAACCAGAGAT;SOR=0.708;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=517;TCF=261;TCR=256;TR=516;WE=103705052;WS=103705034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,552:1.00:552
chr13	106119446	rs2391191	G	A	2475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.276;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=64;PP=1627;ReadPosRankSum=-0.445;SC=GGTTTTCAAAGGAGCATTCTT;SOR=0.939;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=149;TCF=61;TCR=88;TR=105;WE=106119454;WS=106119436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,110:0.71:156
chr13	106142235	rs778294	C	T	1036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=17;PP=601;ReadPosRankSum=0.068;SC=CAACTGAGACCGGATCTCCTT;SOR=0.737;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=154;TCF=103;TCR=51;TR=50;WE=106142243;WS=106142225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,57:0.33:175
chr13	107145463	rs7995379	G	C	9452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=369;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=186;NR=145;PP=2965;ReadPosRankSum=0.589;SC=GCCCGTAGTCGCCGCTGACCT;SOR=0.526;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=337;TCF=190;TCR=147;TR=331;WE=107145471;WS=107145452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,360:0.99:363
chr13	107165255	rs9520090	C	G	207.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=1;NR=6;PP=168;SC=TAATCCCAAACTACACATTTT;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=107165263;WS=107165245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr13	107209378	rs9587157	T	C	3356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.120;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=45;PP=1905;ReadPosRankSum=-1.362;SC=ACACTTTTCATGTATGCTTTA;SOR=0.910;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=209;TCF=136;TCR=73;TR=132;WE=107209386;WS=107209368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,147:0.63:233
chr13	107862841	rs3751448	T	C	496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=338;ReadPosRankSum=0.152;SC=CAAGGTTATATCAGTGAAAGG;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=18;WE=107862849;WS=107862831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
chr13	108183631	rs912446	A	G	1662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=34;PP=1085;SC=CCTCATGAATAGCTTGGGCCA;SOR=1.255;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=22;TCR=34;TR=56;WE=108183639;WS=108183621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr13	108518444	rs1771137	G	A	1426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=39;PP=777;ReadPosRankSum=-1.156;SC=AAGTCTCCAGGCGCCACACGG;SOR=0.688;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=271;TCF=134;TCR=137;TR=79;WE=108518452;WS=108518434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:214,90:0.30:304
chr13	108518700	.	TGCTGCTGCTGCTGCC	T	2990	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MMLQ=19;MQ=63.47;NF=21;NR=18;PP=2990;QD=20;SC=CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTG;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=59;TCF=29;TCR=30;TR=39;WE=108518722;WS=108518690;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:20,39:0.66:59
chr13	108518715	rs3832903	CGCTGCTGCTGCT	C	2174.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.026;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=5.404;NF=23;NR=20;PP=2976;ReadPosRankSum=0.491;SC=CTGCTGCTGCCGCTGCTGCTG;SOR=1.201;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=70;TCF=36;TCR=34;TR=43;WE=108518734;WS=108518690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,61:0.62:99
chr13	108863591	rs1805388	G	A	1460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.731;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=31;PP=713;ReadPosRankSum=0.175;SC=AGATGCAACAGTTTGTGAAGT;SOR=0.604;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=93;TCF=41;TCR=52;TR=57;WE=108863599;WS=108863581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,69:0.62:112
chr13	108955464	rs1224145	C	G	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.18;ReadPosRankSum=2.253;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr13	108959080	rs11381410	A	AT	109.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.22;ReadPosRankSum=2.341;SOR=1.259;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr13	109282302	rs9284241	T	G	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=190;ReadPosRankSum=0.706;SC=ATTAAGGCAGTTCTCCTGGTA;SOR=0.804;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=57;TCF=9;TCR=48;TR=15;WE=109282310;WS=109282292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,16:0.23:69
chr13	109311665	rs149670466	C	T	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.571;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=119;ReadPosRankSum=1.327;SC=ATATATAATACACATATATAC;SOR=2.397;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=38;TCR=5;TR=10;WE=109311673;WS=109311655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,13:0.27:49
chr13	109311775	rs4378499	G	A	2403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=415;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=58;PP=1235;ReadPosRankSum=0.266;SC=ACAGAGGTACGCACTCGCTGA;SOR=0.656;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=372;TCF=201;TCR=171;TR=123;WE=109311783;WS=109311765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:273,142:0.34:415
chr13	109318212	rs55718090	G	A	776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.504;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=15;PP=494;ReadPosRankSum=-1.059;SC=GTCTGGTGACGCTCCCCTTGC;SOR=0.532;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=142;TCF=97;TCR=45;TR=45;WE=109318220;WS=109318202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,46:0.30:152
chr13	109437923	rs9559411	C	T	600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=430;ReadPosRankSum=1.040;SC=AAGTACAACTCCTAATCTGCT;SOR=3.258;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=20;WE=109437931;WS=109437913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,20:0.95:21
chr13	109458889	rs9514920	A	G	265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=10;NR=0;PP=211;SC=ATAAAATTGCATGTATGTTCT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=109458897;WS=109458880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr13	109459020	rs9301323	G	A	5563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=110;NR=76;PP=2965;SC=ATGTCTCTTCGCTGCAGTTAC;SOR=1.047;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=186;TCF=110;TCR=76;TR=186;WE=109459028;WS=109459010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr13	109472601	rs2146327	G	C	1207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=4;PP=899;SC=CCGGCTGTTAGTTGGACAGCA;SOR=3.312;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=35;TCR=4;TR=39;WE=109472609;WS=109472591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr13	109472849	rs9521065	A	G	3814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=84;PP=2650;SC=CACAGCTACAAAGTGAGAGCT;SOR=1.540;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=46;TCR=84;TR=130;WE=109472857;WS=109472839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr13	109472933	rs9514924	T	C	1085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=31;PP=918;SC=TACGATGATATAGGCGATGTG;SOR=5.549;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=32;WE=109472941;WS=109472923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr13	109496601	rs7989143	C	T	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=2;PP=472;ReadPosRankSum=1.458;SC=ATAAAACCACCGTCATAGTCC;SOR=0.914;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=22;WE=109496609;WS=109496591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,23:0.66:35
chr13	109496928	rs7989802	C	T	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=22;PP=392;ReadPosRankSum=0.384;SC=AAAACAAATGCGCACTAATTT;SOR=0.708;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=17;TCR=66;TR=28;WE=109496936;WS=109496918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,34:0.37:93
chr13	109550561	rs7322768	A	G	697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.793;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=29;PP=491;ReadPosRankSum=-0.561;SC=CGCTATGGACACACTGTGTAT;SOR=0.537;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=140;TCF=37;TCR=103;TR=39;WE=109550569;WS=109550551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,40:0.26:153
chr13	109661359	rs3825491	C	G	11738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=433;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=178;NR=226;PP=2965;SC=AGCATATTCTCCTGGTAACCA;SOR=0.991;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=406;TCF=178;TCR=228;TR=404;WE=109661367;WS=109661349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,433:1.00:433
chr13	109680620	rs10574005	GTATAA	G	143	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.75;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr13	109704892	.	A	T	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.458;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=100;ReadPosRankSum=0.863;SC=CTTTTTTTTTAAAAAAAAGCA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=7;WE=109704900;WS=109704872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr13	109717874	.	GA	G	562.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.178;ClippingRankSum=0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=4.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.80;MQRankSum=1.650;QD=10.82;ReadPosRankSum=0.185;SOR=1.547;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,32:0.62:52
chr13	109717928	rs1431267	A	G	4267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.420;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.873;NF=125;NR=85;PP=2962;ReadPosRankSum=0.983;SC=AAGTCCCTACAGGAGATGTTT;SOR=0.746;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=332;TCF=201;TCR=131;TR=210;WE=109717936;WS=109717918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,209:0.64:329
chr13	109779906	rs3815983	C	T	1094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=31;PP=649;ReadPosRankSum=1.458;SC=AAGGTCAGCCCTGGGGAGGGA;SOR=0.725;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=127;TCF=53;TCR=74;TR=52;WE=109779914;WS=109779896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,58:0.41:143
chr13	109793474	rs28705148	T	C	10896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=421;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=220;NR=172;PP=2965;SC=CGCCCAAGGTTCACCCAAAGC;SOR=0.918;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=392;TCF=220;TCR=172;TR=392;WE=109793482;WS=109793464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,421:1.00:421
chr13	109793720	rs7986595	A	C	11347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=434;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=222;NR=180;PP=2965;SC=TCAGGGAAGCAGAAGGTAAGC;SOR=0.809;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=402;TCF=222;TCR=180;TR=402;WE=109793728;WS=109793710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,434:1.00:434
chr13	109831849	rs2038707	G	C	2379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.230;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=30;PP=1495;ReadPosRankSum=0.382;SC=TTTGGAACAAGGAGACACTGC;SOR=0.462;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=151;TCF=109;TCR=42;TR=98;WE=109831857;WS=109831839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,102:0.63:163
chr13	109832084	rs1033870	G	A	1890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=53;PP=1298;ReadPosRankSum=-0.681;SC=TGGACTGGAGGGCTCAGCTGT;SOR=0.691;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=97;TCF=23;TCR=74;TR=70;WE=109832092;WS=109832074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,75:0.73:103
chr13	110408608	rs1865434	C	T	7537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=134;NR=111;PP=2965;SC=TTTAATGATACTCTCTGACAT;SOR=0.789;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=245;TCF=134;TCR=111;TR=245;WE=110408616;WS=110408598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,281:1.00:281
chr13	110435231	rs1805097	C	T	878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=31;PP=527;ReadPosRankSum=0.492;SC=TGAGGCGGCGCCCGGGCCCTG;SOR=0.652;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=169;TCF=73;TCR=96;TR=52;WE=110435239;WS=110435221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,58:0.31:186
chr13	110435953	rs4773092	A	G	1851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.448;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=44;PP=1099;ReadPosRankSum=-0.358;SC=TGTCCCCGCCACAGGTGTAGG;SOR=0.638;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=264;TCF=141;TCR=123;TR=94;WE=110435961;WS=110435943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,103:0.36:286
chr13	110436232	rs3742210	G	A	1750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.495;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=48;PP=1057;ReadPosRankSum=-2.795;SC=AGCCGCCCCCGCTCGCCGGGA;SOR=0.750;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=211;TCF=96;TCR=115;TR=85;WE=110436240;WS=110436222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,91:0.39:231
chr13	110804527	rs75273185	C	T	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.908;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.23;ReadPosRankSum=0.875;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr13	110807474	rs615742	T	C	1855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.639;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=15;PP=2753;ReadPosRankSum=0.827;SC=GGCCAGGCTTTGAGGCATGCT;SOR=0.187;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=92;TCF=75;TCR=17;TR=66;WE=110807504;WS=110807464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,73:0.72:101
chr13	110807496	rs616089	T	C	2665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.603;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=28;PP=2841;ReadPosRankSum=0.467;SC=TGGAAGGGGATGGTTGGAGGA;SOR=0.400;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=145;TCF=108;TCR=37;TR=102;WE=110807504;WS=110807464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,115:0.71:162
chr13	110807570	rs2275841	C	G	6543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=460;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.542;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=144;NR=119;PP=2962;ReadPosRankSum=0.190;SC=CAGACAGAGGCGACTATGGGG;SOR=0.734;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=422;TCF=227;TCR=195;TR=263;WE=110807578;WS=110807560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,294:0.64:460
chr13	110813709	rs1133219	G	A	5071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.457;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=112;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.377;SC=GGCAGCTGCCGGCCGTGCCTA;SOR=0.853;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=316;TCF=148;TCR=168;TR=206;WE=110813717;WS=110813699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,222:0.65:340
chr13	110817171	rs1816884	G	C	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.156;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=7;PP=256;ReadPosRankSum=-0.269;SC=GCCCCTCTGGGCTCCCCATAC;SOR=0.426;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=55;TCF=41;TCR=14;TR=19;WE=110817179;WS=110817161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,19:0.32:59
chr13	110818598	rs3742207	T	G	11550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=427;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=177;NR=212;PP=2965;SC=CCGGGACGCCTTGATCGCCTT;SOR=0.991;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=390;TCF=178;TCR=212;TR=389;WE=110818606;WS=110818588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,426:1.00:426
chr13	110821834	rs1838557	G	A	925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.889;HP=2;HapScore=4;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=3;PP=779;ReadPosRankSum=1.365;SC=TAGTGGGGATGTGGGAGTGTA;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=44;TCF=39;TCR=5;TR=27;WE=110821852;WS=110821824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,28:0.65:43
chr13	110821844	.	A	AACACAC,AACACACAC	519.27	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=12,12;NR=4,4;PP=315,856;ReadPosRankSum=-0.765;SC=GTGGGAGTGTAACACACACAC;SOR=1.112;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=16,16;WE=110821852;WS=110821824;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.79:42
chr13	110821872	.	C	CACACAT	344	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MMLQ=28;MQ=60.1;NF=13;NR=5;PP=344;QD=19.2777777778;SC=CACACACACACATATATATAC;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=68;TCF=42;TCR=26;TR=18;WE=110821880;WS=110821862;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:50,18:0.26:68
chr13	110823178	rs2275845	G	A	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.562;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=138;ReadPosRankSum=0.215;SC=GCCTCATCCTGTAGGTACCGC;SOR=1.495;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=55;TCF=17;TCR=38;TR=13;WE=110823186;WS=110823168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,16:0.25:63
chr13	110824974	rs2289799	C	G	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.101;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=301;ReadPosRankSum=0.887;SC=GGCCAACAGGCATGGGGCTTC;SOR=1.890;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=47;TCF=41;TCR=6;TR=16;WE=110824982;WS=110824964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,16:0.33:49
chr13	110825264	rs17517598	G	T	1141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.300;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=38;PP=918;ReadPosRankSum=-0.123;SC=GTAATAAAATGATATTCCTAC;SOR=1.823;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=63;TCF=7;TCR=56;TR=41;WE=110825272;WS=110825254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,43:0.68:63
chr13	110827574	rs874203	T	A	1618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=9.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.75;ReadPosRankSum=0.533;SOR=0.242;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,46:0.36:127
chr13	110827580	rs874204	C	T	1683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=5.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.61;ReadPosRankSum=1.453;SOR=0.362;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,49:0.34:145
chr13	110828891	rs1975514	T	C	2605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=441;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.553;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=64;PP=1666;ReadPosRankSum=0.760;SC=GTCTGACAGGTTGACATCTAC;SOR=0.636;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=407;TCF=203;TCR=204;TR=136;WE=110828899;WS=110828881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:293,147:0.33:440
chr13	110828922	rs1562173	G	A	2255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=410;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.560;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=56;PP=1374;ReadPosRankSum=0.295;SC=GGGGAACACAGGCCTCATCCT;SOR=0.690;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=373;TCF=190;TCR=183;TR=118;WE=110828930;WS=110828912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:279,130:0.32:409
chr13	110831451	rs503053	T	C	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=12;PP=192;ReadPosRankSum=0.331;SC=AGGAGACCCATGCACACGAAT;SOR=0.607;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=63;TCF=24;TCR=39;TR=19;WE=110831459;WS=110831441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,19:0.28:67
chr13	110831866	rs10492497	T	C	1213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.743;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=40;PP=611;ReadPosRankSum=0.862;SC=ATACTGCCAATGCATTTAGTA;SOR=0.446;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=193;TCF=62;TCR=131;TR=64;WE=110831874;WS=110831856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,68:0.34:202
chr13	110833564	rs16975491	C	T	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.55;ReadPosRankSum=-0.801;SOR=0.631;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,26:0.22:116
chr13	110833702	rs16975492	C	T	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=6.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.36;MQRankSum=0.430;QD=2.96;ReadPosRankSum=0.744;SOR=0.242;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,21:0.23:90
chr13	110833751	rs112508409	C	CA	49.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=2.486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.65;MQRankSum=3.432;QD=1.16;ReadPosRankSum=-0.332;SOR=1.734;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,8:0.19:43
chr13	110838703	rs2305080	T	C	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=191;ReadPosRankSum=-1.226;SC=TACAACTTCATGCTGCATCAC;SOR=0.892;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=14;WE=110838711;WS=110838693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,15:0.79:19
chr13	110838814	rs61749897	A	G	1908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.799;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=36;PP=1153;ReadPosRankSum=-0.931;SC=CATATCCTGGAGGCCCAGGGG;SOR=0.475;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=220;TCF=142;TCR=78;TR=93;WE=110838822;WS=110838804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,100:0.42:236
chr13	110839428	rs9521638	A	G	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.818;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=18;PP=547;ReadPosRankSum=0.049;SC=CTCATTTCTCAATGCTTTGCA;SOR=0.920;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=176;TCF=106;TCR=70;TR=52;WE=110839440;WS=110839418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,55:0.28:193
chr13	110839550	rs536174	T	G	5163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=93;PP=2965;SC=GCTCTCCCTGTCATGCCGGGC;SOR=1.066;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=174;TCF=80;TCR=94;TR=172;WE=110839558;WS=110839540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr13	110843985	rs1373744	T	C	4028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=83;NR=54;PP=2545;SC=ATTTATGGATTTGAAAAAGCA;SOR=1.088;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=137;TCF=83;TCR=54;TR=137;WE=110843993;WS=110843975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr13	110844188	rs7330851	G	A	1099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=31;PP=793;ReadPosRankSum=0.300;SC=ACAGAAAGACGGCACTTCGGC;SOR=0.724;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=63;TCF=18;TCR=45;TR=43;WE=110844196;WS=110844178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,45:0.68:66
chr13	110845060	rs9521642	G	A	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=142;ReadPosRankSum=-1.891;SC=TTCTGATTATGCTTTAGGATT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=8;WE=110845068;WS=110845055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr13	110845119	rs17591246	A	G	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=7;PP=669;ReadPosRankSum=0.700;SC=TTTCACAGGAAAGATGCCAAC;SOR=0.622;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=51;TCF=41;TCR=10;TR=33;WE=110845127;WS=110845109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,31:0.63:49
chr13	110845314	rs685884	G	A	1548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.084;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=40;PP=822;ReadPosRankSum=0.966;SC=AGAAGTCTCCGCAGTGCACTG;SOR=0.504;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=212;TCF=95;TCR=117;TR=78;WE=110845322;WS=110845304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,86:0.38:229
chr13	110847227	rs505050	G	T	822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=1;PP=476;ReadPosRankSum=0.715;SC=ATTCTAGGAAGAGATTGTGAA;SOR=1.542;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=23;WE=110847235;WS=110847219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,23:0.82:28
chr13	110847566	rs9588112	C	T	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=16;PP=283;ReadPosRankSum=0.638;SC=GGCTATTTGACAAGTGTTAGA;SOR=0.719;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=66;TCF=27;TCR=39;TR=27;WE=110847574;WS=110847556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,31:0.41:75
chr13	110850770	rs683309	T	C	611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=2;PP=444;SC=GGCACCCTGGTGTCTGCTTGC;SOR=3.160;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=110850778;WS=110850760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr13	110850842	rs995224	A	G	2182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.538;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=31;PP=1413;ReadPosRankSum=-0.196;SC=CAGGGGGCCCAGGGGAACCAG;SOR=0.518;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=138;TCF=100;TCR=38;TR=97;WE=110850850;WS=110850832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,100:0.68:146
chr13	110851036	rs995223	T	C	5767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=394;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.385;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.357;NF=101;NR=128;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.399;SC=AACTACAGCATAAACTCATTC;SOR=0.732;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=359;TCF=158;TCR=201;TR=229;WE=110851044;WS=110851026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,256:0.65:394
chr13	110859069	rs9588116	G	C	7542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=118;NR=148;PP=2965;SC=TCCCCTTAAAGGAATAAAAAG;SOR=1.040;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=266;TCF=118;TCR=148;TR=266;WE=110859077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,285:1.00:285
chr13	110859316	rs372683715	GA	G	716.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=1.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.93;ReadPosRankSum=-0.119;SOR=0.370;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,36:0.75:48
chr13	110859622	rs12867220	A	T	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=4.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=351;ReadPosRankSum=2.138;SC=TGAACAGTCTATAAATCTGTT;SOR=0.826;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=16;WE=110859630;WS=110859612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr13	110859690	rs598819	A	G	5568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=117;NR=57;PP=2965;SC=TTTTCTCTTTATCTTTTGGAA;SOR=1.585;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=174;TCF=117;TCR=57;TR=174;WE=110859698;WS=110859680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr13	110861096	rs35092560	CTA	C	9853.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=90;PP=2962;ReadPosRankSum=2.628;SC=AGAAGAGTAACTATACTTGTA;SOR=0.676;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=205;TCF=74;TCR=131;TR=141;WE=110861105;WS=110861086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,244:0.69:355
chr13	110861342	rs12869358	T	C	1142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=5.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=35;PP=897;ReadPosRankSum=-0.508;SC=TTTCAGGCAATAGCTTTGTCC;SOR=0.749;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=51;TCF=1;TCR=50;TR=36;WE=110861350;WS=110861332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,38:0.69:55
chr13	110861620	rs35638294	T	TAAAG	474.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=39;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=507;ReadPosRankSum=-1.242;SC=TATAGTTAGATATAGTGTTAA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=13;WE=110861628;WS=110861610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr13	110861647	rs35906431	T	TAC	1206.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=3;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.521;NF=19;NR=5;PP=1654;ReadPosRankSum=0.262;SC=AACTTTTTTTTAGAGACTGAA;SOR=0.582;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=42;TCF=36;TCR=6;TR=24;WE=110861659;WS=110861637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,28:0.58:48
chr13	110861651	rs61963269	G	A	1310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.385;HP=2;HapScore=3;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.409;NF=30;NR=7;PP=1636;ReadPosRankSum=-0.320;SC=TTTTTTTAGAGACTGAAAGAA;SOR=0.435;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=59;TCF=50;TCR=9;TR=37;WE=110861659;WS=110861637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,37:0.62:60
chr13	110861670	rs7332120	GT	AC	2538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.177;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.301;NF=38;NR=17;PP=1834;ReadPosRankSum=-0.769;SC=AATAAGAAGAGTGAGCTATAG;SOR=0.392;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=86;TCF=62;TCR=24;TR=55;WE=110861679;WS=110861660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,61:0.65:94
chr13	110861785	rs645114	C	G	7551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=127;NR=118;PP=2965;SC=CTGGGAGAGACAGCATTTTAA;SOR=0.708;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=246;TCF=128;TCR=118;TR=245;WE=110861793;WS=110861775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,276:1.00:276
chr13	110861971	rs7332235	A	G	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.487;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=7;PP=159;ReadPosRankSum=-1.085;SC=ATACCAATCCATCTCCCCTGC;SOR=0.368;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=9;WE=110861979;WS=110861961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr13	110862085	rs77370634	C	T	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=5.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.54;ReadPosRankSum=-0.020;SOR=1.874;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,8:0.23:35
chr13	110862161	rs41275098	C	T	726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=12.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.88;ReadPosRankSum=0.043;SOR=1.648;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:109,40:0.27:149
chr13	110862268	rs2166207	A	C	6485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=110;NR=105;PP=2965;SC=TTTATTTTCAAACCTCAATAT;SOR=0.772;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=215;TCF=110;TCR=105;TR=215;WE=110862276;WS=110862258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr13	110862303	rs9521649	G	A	3284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.011;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=57;PP=1956;ReadPosRankSum=-1.540;SC=TGATTGCCTCGGAGAGACAGC;SOR=0.680;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=205;TCF=111;TCR=94;TR=128;WE=110862311;WS=110862293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,146:0.63:233
chr13	110864396	rs626444	T	C	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.779;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=16;PP=333;ReadPosRankSum=-0.683;SC=AAACAGTTTGTCACAAGCTGT;SOR=0.507;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=101;TCF=37;TCR=64;TR=27;WE=110864404;WS=110864386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,31:0.28:110
chr13	110866065	rs3737328	C	T	476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.007;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=287;ReadPosRankSum=-1.165;SC=AAAAGGTGCCCGGCTCTGGAA;SOR=0.334;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=49;TCF=42;TCR=7;TR=18;WE=110866073;WS=110866055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,21:0.40:52
chr13	110959464	.	C	A	21	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;FR=0.9998;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=1;NR=1;PP=21;QD=27.8856062736;SC=ACTTCCAGCGCTACGCACCGT;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=2;WE=110959472;WS=110959454;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,2:0.67:3
chr13	111077197	rs4238272	G	A	9601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=354;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.085;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=168;NR=166;PP=2965;ReadPosRankSum=0.163;SC=CCGGAGTAACGGGACCCAAGG;SOR=0.287;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=335;TCF=169;TCR=166;TR=334;WE=111077205;WS=111077187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,351:1.00:352
chr13	111077400	rs58151684	AT	A	4144.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=71;PP=2966;SC=TAGGCAATACATTTTGTGACT;SOR=1.416;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=83;TCF=7;TCR=76;TR=78;WE=111077408;WS=111077390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr13	111077450	rs7326522	G	A	1381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=33;PP=983;SC=TTTTGTTTATGACATAAAACA;SOR=3.467;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=7;TCR=33;TR=40;WE=111077458;WS=111077440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr13	111082157	rs3929758	C	A	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.699;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=212;ReadPosRankSum=-0.425;SC=CAGTCATCCACATTACCATAG;SOR=0.318;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=69;TCF=53;TCR=16;TR=20;WE=111082165;WS=111082147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,20:0.28:72
chr13	111090854	rs7983487	A	G	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.061;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=164;ReadPosRankSum=-0.804;SC=CGGTCTGGACACCATCGGGGC;SOR=1.575;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=56;TCF=42;TCR=14;TR=15;WE=111090862;WS=111090844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,15:0.26:57
chr13	111090909	rs7984937	T	C	1695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=16;PP=596;ReadPosRankSum=0.310;SC=GTGGGCCCTGTTGGCTGGAGG;SOR=0.682;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=136;TCF=88;TCR=48;TR=46;WE=111090917;WS=111090899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,49:0.33:147
chr13	111090924	rs7984100	G	A	1876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.584;HP=6;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=23;PP=622;ReadPosRankSum=1.169;SC=TGGAGGGGCCGCCCCTGGGTT;SOR=0.629;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=173;TCF=106;TCR=67;TR=58;WE=111090932;WS=111090914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,61:0.33:185
chr13	111091136	rs72657930	G	A	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=182;ReadPosRankSum=2.291;SC=GAGATTTCCCGTTATTACTCC;SOR=0.430;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=41;TCF=5;TCR=36;TR=14;WE=111091144;WS=111091126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr13	111091157	rs9521759	C	A	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;QD=30.68;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:0,7:1.00:7
chr13	111091995	rs7991229	T	G	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=401;ReadPosRankSum=1.098;SC=TTGTTGCTATTCTTCAAAATC;SOR=1.528;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=17;WE=111092003;WS=111091985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
chr13	111098110	rs7489705	C	T	5850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=121;NR=79;PP=2965;SC=ATAATAATGCCATTGCAGTCC;SOR=1.102;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=200;TCF=121;TCR=79;TR=200;WE=111098118;WS=111098100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr13	111098226	rs4103	C	T	3180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.545;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=79;PP=1930;ReadPosRankSum=0.039;SC=CCCGGGGACCCAAGGTGAGCC;SOR=0.616;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=200;TCF=84;TCR=116;TR=137;WE=111098234;WS=111098216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,145:0.67:215
chr13	111098338	rs7988186	A	T	523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=14;PP=369;SC=CCTAAAAAGTACAAGATCCCC;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=111098346;WS=111098328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr13	111099057	rs45612833	G	A	2391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=51;NR=36;PP=1451;SC=GACGGTCCACGCTCGGGTTTC;SOR=1.061;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=51;TCR=36;TR=87;WE=111099065;WS=111099047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr13	111099122	rs7326449	G	A	4507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=68;PP=2675;SC=CTCACATCCTGTTTTTCTCTT;SOR=0.897;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=157;TCF=89;TCR=68;TR=157;WE=111099130;WS=111099112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr13	111099338	rs35275552	T	TA	584.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=5.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.17;MQRankSum=0.963;QD=11.03;ReadPosRankSum=-0.107;SOR=1.809;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,30:0.57:53
chr13	111101931	rs56676181	C	T	945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.196;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=11;PP=512;ReadPosRankSum=-1.242;SC=GCATATGGAGCATTTGGTAAA;SOR=1.157;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=77;TCF=53;TCR=24;TR=40;WE=111101939;WS=111101921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,45:0.52:87
chr13	111101952	rs75082326	A	G	1257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.084;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=13;PP=851;ReadPosRankSum=0.877;SC=TATGTAGTCAATGAAAAAGTG;SOR=1.514;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=100;TCF=68;TCR=32;TR=49;WE=111101960;WS=111101942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,55:0.47:116
chr13	111102042	rs76425569	G	A	3059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.737;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=62;PP=2032;ReadPosRankSum=0.049;SC=GAGGTGACCCGGGATTCCCAG;SOR=0.792;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=192;TCF=101;TCR=91;TR=128;WE=111102050;WS=111102032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,138:0.64:215
chr13	111102126	rs74941798	C	T	3252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=74;PP=2005;ReadPosRankSum=0.614;SC=GCCTCTCCATCGGAGATGGAG;SOR=0.697;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=182;TCF=82;TCR=100;TR=134;WE=111102134;WS=111102116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,145:0.73:198
chr13	111102183	rs34734302	A	G	1850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=45;PP=1139;ReadPosRankSum=-1.431;SC=AAGCACCTGCACTCAGGTCCT;SOR=0.763;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=34;TCR=60;TR=70;WE=111102191;WS=111102173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,77:0.75:103
chr13	111108956	rs192745272	A	C	914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.044;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=13;PP=634;ReadPosRankSum=0.823;SC=AAAATAGTCTAAGTTTTCTTT;SOR=0.538;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=60;TCF=43;TCR=17;TR=40;WE=111108964;WS=111108946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,41:0.65:63
chr13	111109157	rs28502737	G	A	1322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=32;PP=872;SC=CCATGGTGCCGATGCCCTGCG;SOR=1.519;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=18;TCR=32;TR=50;WE=111109165;WS=111109147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr13	111109576	.	G	C	1250	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MMLQ=27;MQ=50.07;NF=45;NR=5;PP=1250;QD=25.6954242509;SC=CCGTGGGGCTGATGCCCTGCG;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=46;TCR=5;TR=50;WE=111109584;WS=111109566;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,50:0.98:51
chr13	111109618	.	G	C	2965	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MMLQ=18;MQ=56.85;NF=111;NR=56;PP=2965;QD=20;SC=CCGTGGGGCTGATGCCCTGCG;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=169;TCF=112;TCR=57;TR=167;WE=111109626;WS=111109608;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,167:0.99:169
chr13	111109670	.	A	C	1899	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MMLQ=28;MQ=59.73;NF=79;NR=61;PP=1899;QD=13.8126515182;SC=CATGCCCTGCATCTGTGGTTG;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=403;TCF=233;TCR=170;TR=140;WE=111109678;WS=111109660;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:263,140:0.35:403
chr13	111109859	rs9515218	A	G	5711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=109;PP=2965;SC=GGTGAAATCCATCCCCCACTC;SOR=0.984;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=201;TCF=92;TCR=109;TR=201;WE=111109867;WS=111109849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr13	111109882	rs9555703	A	G	3053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=64;ReadPosRankSum=-1.235;SC=GTGTTTGGACATGAAAATGAG;SOR=0.654;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=194;TCF=98;TCR=96;TR=130;WE=111109890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,139:0.67:209
chr13	111109960	rs9515219	T	C	4462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=67;PP=2610;SC=ATGGAGCCAGTGGTGCTGTCT;SOR=0.796;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=149;TCF=82;TCR=67;TR=149;WE=111109968;WS=111109950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr13	111110303	rs7319009	T	C	997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=2;PP=758;SC=CCTGACCCTTTCCAGTCACCT;SOR=4.548;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=27;WE=111110311;WS=111110293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr13	111110418	rs7325055	G	C	9102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=338;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=170;NR=135;PP=2965;SC=AGAACATGGGGAGCACTTCCT;SOR=0.886;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=305;TCF=170;TCR=135;TR=305;WE=111110426;WS=111110408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,338:1.00:338
chr13	111110666	rs7326779	T	C	287.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.97;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr13	111110674	rs7325334	C	G	225.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.17;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr13	111111023	rs9521781	T	C	4411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=16;PP=2182;SC=AAGCACCAAGTGTGCCACCCA;SOR=3.118;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=76;TCR=16;TR=92;WE=111111031;WS=111111013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr13	111111043	rs9521782	G	A	5496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.381;HP=5;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=99;NR=40;PP=2734;ReadPosRankSum=1.031;SC=AGCTCTCCCCGCTGCCTGATA;SOR=1.853;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=99;TCR=41;TR=139;WE=111111051;WS=111111033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,144:0.99:145
chr13	111111173	rs7990214	G	A	14106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=530;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=254;NR=254;PP=2965;SC=AAGGTCTTCCGGGACTGCCAG;SOR=0.724;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=508;TCF=254;TCR=254;TR=508;WE=111111181;WS=111111151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,530:1.00:530
chr13	111111235	rs7990383	G	A	7250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=163;PP=2965;SC=AAAGGGGACAGAGGAGACCCC;SOR=1.453;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=256;TCF=92;TCR=164;TR=255;WE=111111243;WS=111111225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr13	111114751	rs7992330	G	A	1055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=33;PP=781;ReadPosRankSum=2.252;SC=CACAAACTGCGGCAGCTCCGT;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=66;TCF=19;TCR=47;TR=46;WE=111114759;WS=111114741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,42:0.68:62
chr13	111115467	rs9521786	G	A	4682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=84;PP=2619;SC=TCACAGCTCTGGAGGCTGAAA;SOR=2.958;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=105;TCF=21;TCR=84;TR=105;WE=111115488;WS=111115457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr13	111115480	rs9515223	C	T	3929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=69;PP=1961;SC=GGCTGAAAGCCGACATCAAGG;SOR=3.742;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=11;TCR=69;TR=80;WE=111115488;WS=111115457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr13	111117745	rs3803236	C	T	2194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=48;NR=25;PP=1227;SC=ACTGAATTTTCACACAGGGTG;SOR=1.193;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=48;TCR=25;TR=73;WE=111117753;WS=111117735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr13	111118221	rs1983932	T	C	407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=1;PP=310;SC=TCCCTGCCCATTTCAAAGCCT;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=111118229;WS=111118211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr13	111118546	rs1927350	T	G	2651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=56;PP=1768;SC=TGGCACAACATAGTGGCCTGG;SOR=1.661;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=30;TCR=56;TR=86;WE=111118554;WS=111118536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr13	111118574	rs1927351	A	G	2106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.14;SOR=1.958;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr13	111118580	rs1927352	G	A	1992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.32;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr13	111118615	rs1927353	A	T	586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=64;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=16;PP=480;SC=ATTTAACCAAACCCCTCTTGT;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=111118623;WS=111118605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr13	111119296	rs3803232	A	G	6668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=148;NR=89;PP=2965;SC=CGGTTTGCACAGCTCGTGCTT;SOR=1.238;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=237;TCF=148;TCR=89;TR=237;WE=111119304;WS=111119286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chr13	111119342	rs3803231	T	C	1917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.388;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=46;PP=1034;ReadPosRankSum=1.254;SC=TGGGACTCAGTGTTTAGGATT;SOR=0.793;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=304;TCF=160;TCR=144;TR=103;WE=111119350;WS=111119332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:217,111:0.34:328
chr13	111119396	rs3803230	G	C	1662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.974;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=51;PP=1138;ReadPosRankSum=1.750;SC=GGTTGCATAGGAGGGCCCAAG;SOR=0.625;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=267;TCF=110;TCR=157;TR=90;WE=111119404;WS=111119386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:196,93:0.32:289
chr13	111120684	rs34167123	AT	A	7097.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.448;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.705;NF=29;NR=109;PP=2948;ReadPosRankSum=-0.666;SC=CCATCCATGGATTTCAACACC;SOR=0.651;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=194;TCF=36;TCR=158;TR=138;WE=111120692;WS=111120674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,229:0.71:322
chr13	111121444	rs9559813	C	A	2549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.657;HP=5;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=28;PP=1335;ReadPosRankSum=-2.034;SC=GGCTGATATTCCCCCCAGCCT;SOR=0.814;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=137;TCF=93;TCR=44;TR=92;WE=111121452;WS=111121434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,113:0.70:162
chr13	111121483	rs9559814	A	G	6608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=132;NR=95;PP=2965;SC=TGAGATCCACATTAAGTCAGA;SOR=0.876;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=227;TCF=132;TCR=95;TR=227;WE=111121491;WS=111121473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr13	111121717	rs9515229	A	G	805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=20;PP=600;SC=TTCCAGCGGGAACCTGTGTGT;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=111121725;WS=111121707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr13	111130226	rs9559818	G	A	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=209;ReadPosRankSum=-0.233;SC=GTGTTTTCCTGATTCTCTAGA;SOR=0.586;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=71;TCF=55;TCR=16;TR=19;WE=111130234;WS=111130216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,19:0.26:74
chr13	111130519	rs2281974	C	T	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.669;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=61;ReadPosRankSum=0.319;SC=AAGGTAAGACCCCAGCCCTCC;SOR=1.188;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=33;TCF=12;TCR=21;TR=8;WE=111130527;WS=111130509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,8:0.24:34
chr13	111132820	rs1475438	G	A	956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.466;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=30;PP=530;ReadPosRankSum=-0.709;SC=TCTGCTGGGCGCCTCTGTGGG;SOR=0.841;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=128;TCF=45;TCR=83;TR=46;WE=111132828;WS=111132810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,51:0.36:140
chr13	111134858	rs3803228	T	C	2139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=40;PP=1091;ReadPosRankSum=-2.264;SC=TCTTTTCCTCTGAAGGAGATA;SOR=0.651;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=160;TCF=92;TCR=68;TR=91;WE=111134866;WS=111134848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,102:0.58:176
chr13	111137167	rs1983930	T	C	1663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=9;PP=1114;SC=CGTGCAGCCCTATGGCTCAGG;SOR=2.604;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=42;TCR=9;TR=51;WE=111137175;WS=111137157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr13	111137465	rs2296852	G	A	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=394;ReadPosRankSum=-0.268;SC=AGAGACGCCCGTGCCCTCCAC;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=10;TCR=26;TR=25;WE=111137473;WS=111137455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,30:0.73:41
chr13	111137488	rs11839527	G	A	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=233;ReadPosRankSum=1.015;SC=GGCTTTCTTCGTGCTTTTCAT;SOR=0.941;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=15;WE=111137496;WS=111137478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr13	111138255	rs2296851	G	A	788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.175;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=19;PP=432;ReadPosRankSum=-0.587;SC=GACATGCTTTGGTCTGGAATT;SOR=0.223;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=49;TCF=18;TCR=31;TR=33;WE=111138263;WS=111138245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,37:0.66:56
chr13	111142009	rs409345	A	C	8122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.87;ReadPosRankSum=0.157;SOR=0.717;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,199:0.63:314
chr13	111142016	rs368115	G	A	8335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FS=1.373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.11;ReadPosRankSum=-1.460;SOR=0.790;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:114,218:0.66:332
chr13	111142227	rs749077	A	T	707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=21;PP=476;ReadPosRankSum=-0.463;SC=TTCAGTAACAACCAGAAAGCA;SOR=0.864;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=5;TCR=36;TR=24;WE=111142235;WS=111142217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,27:0.61:44
chr13	111143755	rs413756	T	C	5033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=84;PP=2965;SC=ACAAAGGCGGTCAACATTGTC;SOR=0.892;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=164;TCF=79;TCR=85;TR=162;WE=111143763;WS=111143745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr13	111143851	rs402661	G	C	1105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.985;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=28;PP=747;ReadPosRankSum=1.187;SC=ATGGCATGGAGAGAAACAACC;SOR=1.463;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=8;TCR=36;TR=34;WE=111143859;WS=111143841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,39:0.81:48
chr13	111144321	rs403839	G	A	1046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.731;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=10;PP=604;ReadPosRankSum=0.884;SC=CCGGCCCTCGGCCCCTCCCAG;SOR=1.225;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=53;TCF=37;TCR=16;TR=37;WE=111144329;WS=111144311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,43:0.74:58
chr13	111145427	.	TG	CA	690	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=27;MQ=56.36;NF=21;NR=5;PP=690;QD=28.5949182639;SC=GACACCCCCATGGGTGAAATA;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=45;TCF=36;TCR=9;TR=26;WE=111145436;WS=111145424;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:19,26:0.58:45
chr13	111145676	rs2391833	G	C	4399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=98;PP=2554;SC=AGGTGTCGAGGGTGGGGACTC;SOR=1.711;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=146;TCF=48;TCR=98;TR=146;WE=111145684;WS=111145661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr13	111145779	rs9559826	C	T	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=4.559;HP=7;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=249;ReadPosRankSum=2.496;SC=CCGTGAGGGGCGGGTCCGGGC;SOR=2.985;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=12;WE=111145787;WS=111145769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,13:0.81:16
chr13	111153934	rs378601	G	A	1869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=17;PP=1159;SC=TCCACCACAGGTGATGGTGTG;SOR=1.793;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=39;TCR=17;TR=56;WE=111153942;WS=111153924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr13	111154058	rs439831	T	A	11197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.97;SOR=0.750;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr13	111154061	rs409858	T	C	11288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.44;SOR=0.758;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr13	111154159	rs388222	C	T	2496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.620;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=62;PP=2962;ReadPosRankSum=0.647;SC=ATCTGTGCTTCGACATCTCTA;SOR=0.617;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=152;TCF=61;TCR=91;TR=104;WE=111154168;WS=111154149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,111:0.66:167
chr13	111154160	rs2281968	G	A	977.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.328;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=29;PP=1493;ReadPosRankSum=-0.546;SC=TCTGTGCTTCGACATCTCTAG;SOR=0.827;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=151;TCF=60;TCR=91;TR=47;WE=111154168;WS=111154149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,55:0.33:166
chr13	111155363	rs406174	G	A	3295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=93;NR=9;PP=2579;SC=CCATGCCACAGACTTGCCAGA;SOR=4.575;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=93;TCR=9;TR=102;WE=111155371;WS=111155353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr13	111155428	rs401316	C	T	9964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=369;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=214;NR=136;PP=2965;SC=GGCCTTGGGGCCCTGTTTAAA;SOR=1.216;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=350;TCF=214;TCR=136;TR=350;WE=111155436;WS=111155418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,369:1.00:369
chr13	111155711	rs4773198	C	T	2216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=404;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=69;PP=1379;ReadPosRankSum=-0.781;SC=GTGTCCCTAACGTCTTGTTTG;SOR=0.699;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=389;TCF=170;TCR=219;TR=124;WE=111155719;WS=111155701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:276,128:0.32:404
chr13	111155773	rs438758	T	C	4709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.04;SOR=2.131;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr13	111155773	.	TGGGGCG	CGGGGCA,CGGGGCG	1355	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000,0.5000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=13,39;NR=33,103;PP=630,1355;QD=14.8579972796;SC=CTGGACCCACTGGGGCGGTGG;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=142;TCF=39;TCR=103;TR=46,142;WE=111155787;WS=111155763;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.32:142
chr13	111155779	rs4773199	G	A	911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=0.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.07;ReadPosRankSum=0.897;SOR=0.815;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,46:0.36:129
chr13	111156021	rs4773200	C	T	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=135;ReadPosRankSum=-0.818;SC=AATATTCAAACGGCAGGCGCT;SOR=0.317;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=39;TCF=36;TCR=3;TR=11;WE=111156029;WS=111156014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,11:0.28:39
chr13	111156047	rs9284254	C	G	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.471;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=258;ReadPosRankSum=-1.037;SC=ACGGCTCAGGCCCGTTAGTGT;SOR=0.400;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=76;TCF=59;TCR=17;TR=21;WE=111156055;WS=111156037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,22:0.28:78
chr13	111156153	rs9301460	G	A	1336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.16;ReadPosRankSum=0.840;SOR=0.667;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:238,83:0.26:321
chr13	111156411	rs414881	G	A	1315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=22;PP=838;ReadPosRankSum=0.161;SC=CTGGCATTGCGTCCTCTTGTG;SOR=0.762;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=88;TCF=52;TCR=36;TR=55;WE=111156419;WS=111156401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,57:0.63:90
chr13	111156499	rs4771683	C	T	6617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=135;NR=83;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.682;SC=TTGCAGGTTTCCGTGGGGCTC;SOR=0.391;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=219;TCF=136;TCR=83;TR=218;WE=111156507;WS=111156489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,241:1.00:242
chr13	111156773	rs4771684	A	G	739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=15;PP=454;SC=CTACACTCCTATGCCCAGCAG;SOR=2.215;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=21;WE=111156781;WS=111156763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr13	111158874	rs445348	A	G	10132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=395;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=194;NR=175;PP=2965;SC=CCATGTGCCCAGTGGGCATGA;SOR=0.729;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=369;TCF=194;TCR=175;TR=369;WE=111158894;WS=111158864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,395:1.00:395
chr13	111176393	rs419244	A	G	9367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=165;NR=169;PP=2965;SC=CCACGATGGCAAAGAGGCAGT;SOR=0.774;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=334;TCF=165;TCR=169;TR=334;WE=111176401;WS=111176383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,356:1.00:356
chr13	111277810	rs330561	C	A	789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=24;PP=666;SC=ACAGAGACGGCGGGGTGGAGA;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=24;WE=111277818;WS=111277800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr13	111293585	rs10709696	TG	T	523.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=5;PP=478;SC=GCTCTTCTGTTGGCTGTGTTG;SOR=0.818;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=12;TCF=7;TCR=5;TR=12;WE=111293593;WS=111293575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr13	111294920	rs11414164	G	GC	9428.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=395;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.290;NF=44;NR=136;PP=2969;ReadPosRankSum=-0.416;SC=GATTGTGGATGCCCCCTCCCC;SOR=0.750;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=201;TCF=46;TCR=155;TR=180;WE=111294931;WS=111294910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,362:0.99:366
chr13	111315249	rs7989346	G	A	4638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=106;NR=48;PP=2965;SC=AGACAGGCCAGAAGACAAAGG;SOR=1.759;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=154;TCF=106;TCR=48;TR=154;WE=111315257;WS=111315239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr13	111315299	rs4622384	T	C	8686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=169;NR=134;PP=2965;SC=TCCGTGGGTGTGCCTGTTTTC;SOR=0.938;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=303;TCF=169;TCR=134;TR=303;WE=111315307;WS=111315289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,326:1.00:326
chr13	111315405	rs7993933	G	A	7804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=110;NR=147;PP=2965;SC=AGCCTATTAAGGGCAAACAGC;SOR=1.111;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=257;TCF=110;TCR=147;TR=257;WE=111315413;WS=111315395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,282:1.00:282
chr13	111315489	rs2296659	A	G	2123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=53;PP=1627;SC=CAGCAGATGCACCAAGAGGGA;SOR=3.360;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=10;TCR=53;TR=63;WE=111315497;WS=111315479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr13	111315506	rs376834	A	C	1825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=44;PP=1432;SC=GGGAGACAACAATTATAAAAG;SOR=3.383;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=8;TCR=44;TR=52;WE=111315514;WS=111315496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr13	111319754	rs4628819	T	C	13156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=481;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=215;NR=230;PP=2965;SC=CAATTTCGTTTTCATGATGTG;SOR=0.784;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=445;TCF=215;TCR=230;TR=445;WE=111319762;WS=111319744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,481:1.00:481
chr13	111319884	rs9521884	G	A	2277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=62;PP=1703;SC=TTCTAACCTCGTCTATTTATT;SOR=3.116;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=13;TCR=62;TR=75;WE=111319892;WS=111319874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr13	111329610	.	AGA	GGG	220	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=24;MQ=57.69;NF=0;NR=10;PP=220;QD=27.3467874862;SC=CCCCCACCACAGAGACCCAGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=10;WE=111329620;WS=111329600;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,10:0.91:11
chr13	111340342	rs2304767	G	A	2672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=58;PP=1852;SC=AAAGACTGGCGAGGGAAGCGG;SOR=1.688;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=29;TCR=58;TR=87;WE=111340350;WS=111340332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr13	111358000	rs9521906	T	G	11843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=423;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=201;NR=191;PP=2965;SC=GATCATATAATTTTTAAAGTA;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=392;TCF=201;TCR=191;TR=392;WE=111358008;WS=111357990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,422:1.00:422
chr13	111368164	rs7338333	T	G	4505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=73;PP=2845;SC=GTGTCGCCCCTGCCCCTCTCC;SOR=0.768;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=147;TCF=74;TCR=73;TR=147;WE=111368172;WS=111368154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr13	111545198	rs10664568	A	AGT	503.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=342;SC=CCTTTTGTTAAGTCCCATCTT;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=11;WE=111545206;WS=111545189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr13	111562803	rs35930208	T	C	882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=3;PP=666;SC=GGAAAGGGCCTACTATCCTCC;SOR=3.841;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=27;WE=111562811;WS=111562800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr13	111566989	rs59070384	A	G	1617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=42;NR=18;PP=1008;SC=GGCACGCCCCACGTCCCCCGC;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=42;TCR=18;TR=60;WE=111566997;WS=111566979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr13	111567039	rs56924528	G	C	3946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=85;NR=52;PP=1973;SC=TGGACAGCCGGGGAAAATGGC;SOR=1.041;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=138;TCF=86;TCR=52;TR=137;WE=111567047;WS=111567029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr13	111806245	rs61966721	A	G	12735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=477;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=236;NR=219;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.101;SC=TGTGCTCTGTATTGCAGGTCT;SOR=0.243;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=455;TCF=236;TCR=219;TR=455;WE=111806253;WS=111806235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,475:1.00:476
chr13	111870037	rs2296354	T	C	7622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=519;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=174;NR=144;PP=2962;ReadPosRankSum=0.655;SC=ACATGACCGATAATAGCAACA;SOR=0.696;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=483;TCF=263;TCR=220;TR=318;WE=111870045;WS=111870027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:179,339:0.65:518
chr13	111893709	rs942655	C	T	2190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.940;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=60;PP=1521;ReadPosRankSum=-0.925;SC=GGCTGCGCCCCGAGGTCAGGA;SOR=0.443;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=117;TCF=37;TCR=80;TR=90;WE=111893717;WS=111893699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,94:0.76:124
chr13	111932586	.	GT	G	156.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.514;ClippingRankSum=0.000;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=3.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.25;ReadPosRankSum=0.777;SOR=0.304;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:106,19:0.15:125
chr13	111933098	rs2296353	C	G	633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=442;ReadPosRankSum=0.315;SC=AGCAAGTGATCAGTTGCTTTA;SOR=0.495;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=20;WE=111933106;WS=111933088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,23:0.85:27
chr13	111953903	rs3742181	T	C	2415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=71;PP=1779;ReadPosRankSum=1.874;SC=CATCTTTAAATCTTTTTTTTC;SOR=0.642;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=148;TCF=36;TCR=112;TR=95;WE=111953911;WS=111953893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,98:0.64:152
chr13	111955465	rs1555751	T	C	1649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=41;PP=1036;SC=CTATAAGGGATGTCCTCAGTT;SOR=1.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=18;TCR=41;TR=59;WE=111955473;WS=111955455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr13	111968432	rs12560420	A	G	2492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=30;PP=1720;ReadPosRankSum=-0.654;SC=CTTTCTAGACAAGGCCATGCT;SOR=0.752;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=162;TCF=119;TCR=43;TR=110;WE=111968440;WS=111968422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,116:0.67:174
chr13	111968680	rs7991693	C	T	892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.138;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=29;PP=649;ReadPosRankSum=-0.101;SC=GGCATGCACACGCCTCCCGCC;SOR=1.435;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=52;TCF=11;TCR=41;TR=35;WE=111968688;WS=111968670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,37:0.69:54
chr13	111980478	rs2479955	A	G	3696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=43;PP=2210;SC=AGCGGAGAGCAGAGTGGCTTT;SOR=1.431;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=85;TCR=43;TR=128;WE=111980486;WS=111980468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr13	111980537	rs1359428	C	T	1513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.837;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=38;PP=792;ReadPosRankSum=0.342;SC=CAGTGTGTGACGTTCCTCTGT;SOR=0.661;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=203;TCF=111;TCR=92;TR=77;WE=111980545;WS=111980527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,86:0.38:229
chr13	112278338	rs7992732	G	A	923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.43;ReadPosRankSum=-1.945;SOR=0.678;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:202,67:0.25:269
chr13	112278521	rs7992659	C	G	1653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.001;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=49;PP=1019;ReadPosRankSum=0.917;SC=GGACCACTTGCCTGAACTTCT;SOR=0.623;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=257;TCF=101;TCR=156;TR=82;WE=112278529;WS=112278511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:184,92:0.33:276
chr13	112297403	rs8000950	C	T	3798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=44;PP=2552;SC=TCGTCCCCTACTGGGGCCAGC;SOR=1.527;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=89;TCR=44;TR=133;WE=112297411;WS=112297393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr13	112324912	rs1105513	T	G	1228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=34;PP=900;ReadPosRankSum=-0.721;SC=GATTTGCACTTTGATAACTTA;SOR=3.767;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=36;WE=112324920;WS=112324902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,40:0.98:41
chr13	112722435	.	ATGGGCG	A	591.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.219;ClippingRankSum=0.000;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.079;NF=0;NR=11;PP=487;ReadPosRankSum=0.566;SC=GGCTGTGGCCATGGGCGTGGG;SOR=0.553;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=0;TCR=46;TR=11;WE=112722448;WS=112722425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,18:0.43:42
chr13	112723111	rs137969745	C	CGGGCGT	564.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=-0.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.579;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=3.179;NF=3;NR=3;PP=212;ReadPosRankSum=1.127;SC=GGCGCGGGCGCGGGCGTGAAC;SOR=0.674;SbPval=0.06;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=6;WE=112723119;WS=112723101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,16:0.36:45
chr13	112723232	rs1056121	G	C	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.748;NF=2;NR=4;PP=67;ReadPosRankSum=0.360;SC=CCGGCGCGGCGTGGCTTTTGT;SOR=0.495;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=6;WE=112723240;WS=112723222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr13	113032915	rs7324712	A	G	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.562;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=164;ReadPosRankSum=0.480;SC=CAGACTTCACATGTGGTACCT;SOR=1.495;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=56;TCF=41;TCR=15;TR=16;WE=113032923;WS=113032905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,16:0.25:63
chr13	113032962	rs9550063	G	C	885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.411;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=17;PP=550;ReadPosRankSum=-1.170;SC=CGAAGGTCTCGAGGTTCCCAA;SOR=0.825;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=117;TCF=70;TCR=47;TR=43;WE=113032970;WS=113032952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,48:0.35:137
chr13	113052388	rs2296895	A	G	3774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=605;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.156;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-8.628;NF=101;NR=92;PP=2371;ReadPosRankSum=-0.046;SC=AGGAGATTTTAGATCTGAATA;SOR=0.603;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=562;TCF=299;TCR=263;TR=193;WE=113052396;WS=113052378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:396,209:0.35:605
chr13	113052562	rs2296894	T	C	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.354;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-7.870;NF=9;NR=25;PP=423;ReadPosRankSum=-0.856;SC=AGACCAGCTATTTCTGGGGCA;SOR=0.154;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=119;TCF=19;TCR=100;TR=34;WE=113052570;WS=113052552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,34:0.27:124
chr13	113053470	rs10816	T	A	1755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.445;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=38;PP=931;ReadPosRankSum=0.874;SC=GGCATTGAGGTCAAAATTTCC;SOR=0.745;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=278;TCF=155;TCR=123;TR=88;WE=113053478;WS=113053460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:203,100:0.33:303
chr13	113055295	rs3742225	A	G	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.476;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=185;ReadPosRankSum=0.333;SC=ATCTCAACTTAGCATGTTTAA;SOR=0.375;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=46;TCF=37;TCR=9;TR=14;WE=113055303;WS=113055285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,16:0.33:48
chr13	113153114	rs9549532	T	C	2962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=12;PP=2381;SC=GGGCAGGAGATTTGTAATTCT;SOR=3.801;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=82;TCR=12;TR=94;WE=113153122;WS=113153104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr13	113158861	.	CAT	C	147.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=0.000;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.84;ReadPosRankSum=-0.148;SOR=0.458;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,9:0.17:52
chr13	113201852	rs75968030	A	G	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.717;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=139;ReadPosRankSum=-0.580;SC=AAAGACGTGCATGGGAAAGTC;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=9;WE=113201860;WS=113201842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr13	113219291	rs78143012	C	T	809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=4;PP=596;ReadPosRankSum=0.379;SC=AAAGCAAATGCTATCTATAAT;SOR=0.979;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=36;TCR=5;TR=32;WE=113219299;WS=113219281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,32:0.78:41
chr13	113333684	rs7338610	C	T	3277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=33;PP=1993;SC=CATCCTGGGACCTTGTTAGGA;SOR=1.290;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=70;TCR=33;TR=103;WE=113333692;WS=113333674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr13	113344803	rs3742227	G	A	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=2.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.01;ReadPosRankSum=0.644;SOR=0.965;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,19:0.29:65
chr13	113439586	rs11616475	G	T	5785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=394;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=115;NR=129;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.207;SC=CTTGGCTTGGGTCTGAGTGTC;SOR=0.681;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=365;TCF=173;TCR=192;TR=244;WE=113439594;WS=113439576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,265:0.67:393
chr13	113459221	rs3742228	A	G	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.479;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=179;ReadPosRankSum=-0.747;SC=GTAACACTACAAGAGTAAAAT;SOR=0.385;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=39;TCR=8;TR=17;WE=113459229;WS=113459211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,19:0.37:51
chr13	113465109	rs9577843	G	T	786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.833;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=26;PP=590;ReadPosRankSum=0.310;SC=TTTTACCCAGGTGCAGTGGCT;SOR=0.816;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=93;TCF=31;TCR=62;TR=38;WE=113465117;WS=113465099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,38:0.41:93
chr13	113470572	rs201099344	G	A	1490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.348;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=47;PP=878;ReadPosRankSum=-0.306;SC=TTCCTGTCCTGCTTCGGACTG;SOR=0.958;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=212;TCF=75;TCR=137;TR=69;WE=113470580;WS=113470562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,76:0.32:235
chr13	113473598	rs34166778	CAT	C	1595.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FS=3.486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.04;MQRankSum=2.000;QD=5.85;ReadPosRankSum=1.432;SOR=0.946;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:218,55:0.20:273
chr13	113474348	rs9603957	C	T	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=4.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.14;ReadPosRankSum=-1.575;SOR=1.232;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,24:0.22:107
chr13	113478654	rs7323586	G	C	5103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.667;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=125;NR=76;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.132;SC=CTTCCTCTCTGTAGGTGTGGC;SOR=0.962;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=305;TCF=183;TCR=122;TR=201;WE=113478662;WS=113478644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,220:0.67:329
chr13	113479813	rs9549564	G	A	3173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.11;ReadPosRankSum=-1.928;SOR=0.687;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,149:0.62:242
chr13	113479820	rs368865	A	G	8820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.35;SOR=0.943;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr13	113487073	rs3215888	AC	A	713.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.812;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=283;ReadPosRankSum=-0.832;SC=GGCCGCGGGGACCCCCCCCAC;SOR=0.563;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=67;TCF=29;TCR=38;TR=22;WE=113487081;WS=113487063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,34:0.32:105
chr13	113508839	rs9549573	G	C	1845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.976;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=49;PP=1306;ReadPosRankSum=0.361;SC=GAGACAACCTGTCCGGGTAGG;SOR=1.035;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=98;TCF=28;TCR=70;TR=67;WE=113508847;WS=113508829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,73:0.71:103
chr13	113512004	rs7325522	C	G	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=178;ReadPosRankSum=-2.077;SC=TCGTAAATTACCTCTAAGTAG;SOR=0.307;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=10;WE=113512012;WS=113511994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr13	113512331	rs9549575	C	T	1565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=40;PP=1245;SC=TCAGGACACCCCCGTCACCAC;SOR=2.925;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=10;TCR=40;TR=50;WE=113512339;WS=113512321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr13	113513682	rs10492684	C	G	7718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=156;NR=103;PP=2965;SC=CGTCACCGAACTAACAGTTAT;SOR=1.095;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=259;TCF=156;TCR=103;TR=259;WE=113513690;WS=113513672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr13	113525952	rs1765767	A	G	2045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=56;NR=15;PP=1387;SC=GTGTTGGCACACAAGAAAAAT;SOR=2.660;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=73;TCF=56;TCR=17;TR=71;WE=113525960;WS=113525942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr13	113527781	.	C	T	2965	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MMLQ=27;MQ=59.93;NF=136;NR=66;PP=2965;QD=20;SC=CTGGGTCTTGCGTTTGGTTTA;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=204;TCF=136;TCR=68;TR=202;WE=113527789;WS=113527771;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,202:0.99:204
chr13	113534907	rs9577174	T	C	5423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=110;NR=73;PP=2965;SC=AGAGCAGCGATGGGCCCCTCC;SOR=1.022;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=184;TCF=111;TCR=73;TR=183;WE=113534915;WS=113534897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr13	113536467	rs36048052	G	A	2066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=60;PP=1630;SC=TTGCCCTCGAGCATGGCACCC;SOR=3.675;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=70;TCF=10;TCR=60;TR=69;WE=113536475;WS=113536457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr13	113634091	rs6577024	G	C	1685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.513;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=33;PP=1062;ReadPosRankSum=0.813;SC=CAATGGGGTCGCAGGGCATGG;SOR=0.652;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=194;TCF=113;TCR=81;TR=80;WE=113634107;WS=113634081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,87:0.42:208
chr13	113639671	rs9577407	G	A	1121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.322;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=15;PP=612;ReadPosRankSum=1.950;SC=GGCAGCGCGCGTCCTCCCCGG;SOR=0.493;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=133;TCF=95;TCR=38;TR=51;WE=113639679;WS=113639661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,59:0.41:145
chr13	113639862	rs2993287	G	A	2705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=2.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.23;ReadPosRankSum=1.880;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,115:0.73:157
chr13	113639869	rs3011543	A	G	6224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.77;SOR=2.200;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr13	113639872	rs3011542	A	G	6008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.58;SOR=2.213;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr13	113656216	rs7986677	C	T	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=3.201;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.04;ReadPosRankSum=2.221;SOR=0.682;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,47:0.32:146
chr13	113681243	rs9549343	C	A	3191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.997;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=42;PP=2072;ReadPosRankSum=0.742;SC=AGGGGTGCCGCGGGGGTCTCT;SOR=0.917;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=222;TCF=142;TCR=80;TR=127;WE=113681251;WS=113681233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,141:0.59:241
chr13	113681400	rs3011512	G	T	1691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.473;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=55;PP=1138;ReadPosRankSum=0.518;SC=TCTGTATCCCGCACATTACAT;SOR=0.647;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=259;TCF=102;TCR=157;TR=92;WE=113681408;WS=113681390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,95:0.34:277
chr13	113699223	rs145185774	T	G	4958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.987;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=116;PP=2962;ReadPosRankSum=0.387;SC=TAAGACTGTTTTGGAGGGTTT;SOR=0.841;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=290;TCF=121;TCR=169;TR=192;WE=113699231;WS=113699213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,208:0.65:319
chr13	113699488	rs3814266	T	C	7503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=525;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.162;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=184;NR=138;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.609;SC=ATCATGAATATGGGGGATCGC;SOR=0.824;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=501;TCF=282;TCR=219;TR=322;WE=113699496;WS=113699478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,338:0.65:523
chr13	113717022	rs7982214	G	A	1101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.56;BaseQRankSum=-1.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.359;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-4.405;NF=34;NR=21;PP=629;ReadPosRankSum=-0.360;SC=CCGTGTGCTGGACTCAGCCAT;SOR=0.919;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=146;TCF=72;TCR=74;TR=55;WE=113717030;WS=113717012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,60:0.38:157
chr13	113718198	rs9549651	C	T	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=1.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.85;MQRankSum=2.371;QD=5.45;ReadPosRankSum=-0.732;SOR=0.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,24:0.29:82
chr13	113718812	rs9549345	C	T	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=4.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.669;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=172;ReadPosRankSum=0.099;SC=CATTACAACACGGCCCTTTCC;SOR=1.532;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=10;WE=113718820;WS=113718802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,9:0.28:32
chr13	113720476	rs2297192	C	T	1729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.956;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=34;PP=998;ReadPosRankSum=-1.510;SC=ACCAGGCCACCGTGCAGAGGT;SOR=0.990;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=194;TCF=102;TCR=92;TR=80;WE=113720484;WS=113720466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,90:0.43:210
chr13	113728781	rs3814264	G	A	3611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=461;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.120;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=90;PP=2137;ReadPosRankSum=0.468;SC=TGGACGCAGCGTCCCAGAAGA;SOR=0.831;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=424;TCF=200;TCR=224;TR=167;WE=113728789;WS=113728771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:270,188:0.41:458
chr13	113728887	rs61966397	G	T	1140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.617;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=39;PP=716;ReadPosRankSum=0.988;SC=CGTAAGGCGGGGTCCCGGCGG;SOR=0.800;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=166;TCF=60;TCR=106;TR=60;WE=113728895;WS=113728877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,62:0.37:169
chr13	113735390	rs494129	T	C	1718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=12;PP=1204;SC=GCGTCCAGCCTGTGGGCTTTG;SOR=2.381;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=43;TCR=12;TR=55;WE=113735398;WS=113735380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr13	113738175	rs491455	G	A	1200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.069;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=15;PP=793;ReadPosRankSum=1.887;SC=GCGTGGCTGCGGCGTCTCCAA;SOR=0.269;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=69;TCF=50;TCR=19;TR=49;WE=113738183;WS=113738165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,52:0.71:73
chr13	113739125	rs2281724	C	T	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=89;ReadPosRankSum=-1.246;SC=TCCCTCACCGCGTAATGCGGT;SOR=0.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=8;WE=113739133;WS=113739115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
chr13	113739518	rs546818	G	A	1031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=31;PP=784;ReadPosRankSum=-1.291;SC=ACCGTGGCCCGGCCTCCCCAG;SOR=0.664;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=56;TCF=9;TCR=47;TR=38;WE=113739526;WS=113739508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,39:0.67:58
chr13	113739553	.	C	T	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.046;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.235;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=189;ReadPosRankSum=1.280;SC=GTGTCTGTGCCGCCCTGGGGC;SOR=1.739;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=4;TCR=28;TR=11;WE=113739561;WS=113739543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,13:0.37:35
chr13	113740706	rs1745949	A	G	1137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=32;PP=914;SC=GTCCCTAGATAAGCCCACTCC;SOR=4.294;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=35;WE=113740714;WS=113740696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr13	113741851	rs514181	C	A	1132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.541;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=29;PP=923;ReadPosRankSum=-0.985;SC=TCTGAGGTGGCCACGCTGACA;SOR=1.251;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=75;TCF=29;TCR=46;TR=43;WE=113741859;WS=113741841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,44:0.57:77
chr13	113742777	rs9549668	C	T	2221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=343;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.876;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=52;PP=1522;ReadPosRankSum=-1.377;SC=GCATTTTTACCTATGTTCAGA;SOR=0.584;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=327;TCF=185;TCR=142;TR=114;WE=113742785;WS=113742767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:224,119:0.35:343
chr13	113742805	rs7986589	C	G	11223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=432;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=223;NR=185;PP=2965;SC=CACAGTCCCCCCATGCGCAAG;SOR=0.868;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=409;TCF=224;TCR=185;TR=408;WE=113742813;WS=113742795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,431:1.00:431
chr13	113743768	.	T	C	1061	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MMLQ=24;MQ=56.63;NF=37;NR=8;PP=1061;QD=24.3504713899;SC=TCTCATCCAGTCCGTCCGGGT;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=37;TCR=8;TR=45;WE=113743776;WS=113743758;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr13	113744139	rs4907483	G	A	10316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=383;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=182;NR=182;PP=2965;SC=TTCCTGCAGTGTGAAGAAGCT;SOR=0.719;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=364;TCF=182;TCR=182;TR=364;WE=113744147;WS=113744129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,383:1.00:383
chr13	113745611	rs4907485	T	G	1141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=35;PP=840;ReadPosRankSum=1.028;SC=GGGGATGCTCTCGTGGGTCTT;SOR=0.598;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=59;TCF=8;TCR=51;TR=42;WE=113745619;WS=113745601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,44:0.66:67
chr13	113748690	rs7327099	C	T	1830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=12;PP=1324;SC=TTTATGAACCCGGGAAGATGA;SOR=2.340;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=49;TCR=12;TR=61;WE=113748698;WS=113748680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr13	113749475	rs2146752	G	A	5571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=125;PP=2965;SC=CATTGTTAATGTCAGAAGCAA;SOR=1.609;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=189;TCF=64;TCR=125;TR=189;WE=113749483;WS=113749465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr13	113750586	rs12855893	G	A	887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.227;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=7;PP=633;ReadPosRankSum=-0.664;SC=AGCTCCCACCGGGGCAGGGCG;SOR=0.941;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=54;TCF=43;TCR=11;TR=36;WE=113750594;WS=113750576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,37:0.65:57
chr13	113776947	rs563964	T	C	1411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=32.83;ReadPosRankSum=1.421;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,32:0.74:43
chr13	113776947	.	TGC	CGA	1347	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=25;NR=0;PP=1347;QD=56.0187149945;SC=GATGAGGTTCTGCGGGGCCTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=25;WE=113776957;WS=113776941;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:15,25:0.62:40
chr13	113776949	rs3211717	C	A	1411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.41;ReadPosRankSum=0.389;SOR=1.217;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,37:0.77:48
chr13	113792754	rs2251102	T	C	1435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=10;PP=844;SC=ATTTTTAAATTTCTTTTTTCC;SOR=1.565;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=43;WE=113792762;WS=113792744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr13	113792893	rs2026160	C	A	1846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=36;PP=1245;SC=CTTTTGTTCTCATTTTACTCA;SOR=1.162;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=26;TCR=36;TR=62;WE=113792901;WS=113792883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr13	113801737	rs5960	C	T	7515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=147;NR=104;PP=2965;SC=GTGGTGGAACCATTCTGAGCG;SOR=0.998;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=251;TCF=147;TCR=104;TR=251;WE=113801745;WS=113801727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,275:1.00:275
chr13	113801843	rs2031184	A	G	6589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=107;NR=127;PP=2965;ReadPosRankSum=0.629;SC=GGCCGTGGTGAGGGGCACCGT;SOR=1.007;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=236;TCF=108;TCR=128;TR=234;WE=113801851;WS=113801832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,246:0.99:248
chr13	113812962	rs2273971	G	A	1491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=35;NR=17;PP=890;SC=CTGTCCCAGCGCTCCGGGTGG;SOR=1.528;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=35;TCR=17;TR=52;WE=113812970;WS=113812952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr13	113815328	rs41286612	G	A	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.54;ReadPosRankSum=-1.687;SOR=0.605;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,26:0.30:86
chr13	113817240	.	ATTCCTGTCACCACCCCCACCCTCCTCCTGCTCAGGTCCCCG	A,GTTCCTGTCACCACCCCCACCCTCCTCCTGCTCAGGTCCCCG	1390.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.3;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=18;NF=8,14;NR=13,6;PP=1616,716;SC=TCAGGTCCCCATTCCTGTCAC;SOR=1.101;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=88;TCF=24;TCR=64;TR=21,20;WE=113817288;WS=113817230;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.70,0.30:56
chr13	113818708	rs3024731	A	T	2667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=23;PP=1607;SC=ACACACCAGAACTCTTGTGTG;SOR=1.896;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=92;TCF=65;TCR=27;TR=88;WE=113818716;WS=113818698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr13	113818817	rs45606038	T	C,TC	4036.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=55;PP=1098;ReadPosRankSum=-1.255;SC=TTTTTTTTTTTCCTTTTCAGC;SOR=1.017;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=148;TCF=47;TCR=101;TR=81;WE=113818827;WS=113818795;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.28,0.71:127
chr13	113818900	rs564081	A	G	4430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=73;NR=109;PP=2965;SC=AATCCTACACATGCAGCTGTG;SOR=0.925;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=183;TCF=73;TCR=110;TR=182;WE=113818908;WS=113818890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr13	113819005	rs45596441	C	T	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=429;ReadPosRankSum=-0.311;SC=TGCCAGCGACCCCGTCCACAT;SOR=0.804;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=22;WE=113819013;WS=113818995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,22:0.71:31
chr13	113833499	rs486407	G	A	712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=20;PP=550;SC=GTGTTCTAAAGGAGTAAAAAA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=113833507;WS=113833489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr13	113839747	rs515863	C	T	9547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=184;NR=137;PP=2965;SC=ATGTGGGAAGCCCAGGACAAT;SOR=0.993;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=322;TCF=184;TCR=138;TR=321;WE=113839755;WS=113839737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,355:1.00:355
chr13	113852425	rs546686	C	T	5828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=122;NR=73;PP=2965;SC=GCTTCAAGCACAAGATAATGC;SOR=1.272;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=195;TCF=122;TCR=73;TR=195;WE=113852433;WS=113852415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr13	113854560	rs3751411	G	A	418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=14;NR=0;PP=345;SC=ACCACAGTGTGCGTACATAGT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=113854568;WS=113854557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr13	113854600	rs3751412	T	C	1662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=7;PP=1270;SC=TGAAATTACATAAATCATAAA;SOR=3.383;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=46;TCR=7;TR=53;WE=113854608;WS=113854590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr13	113854715	rs3751413	C	T	9370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=350;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=183;NR=142;PP=2965;SC=TCTGCAGACACCTGTGTGCAC;SOR=0.935;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=326;TCF=184;TCR=142;TR=325;WE=113854723;WS=113854705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,348:1.00:348
chr13	113854965	rs35769549	T	A	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=114;ReadPosRankSum=2.042;SC=ACAATCAAAATGTAACAGATG;SOR=0.770;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=7;WE=113854973;WS=113854955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr13	113862801	rs9549692	G	A	2454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=29;PP=1444;SC=CCGAACGGAAGAAGGGTGGCG;SOR=1.191;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=49;TCR=29;TR=77;WE=113862809;WS=113862791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr13	113888201	rs2146408	T	C	9169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=166;NR=147;PP=2965;SC=TAACTCTGCTTGTTTCTTAGG;SOR=0.773;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=314;TCF=167;TCR=147;TR=313;WE=113888209;WS=113888191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,337:1.00:337
chr13	113889474	rs2287250	C	T	13827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=511;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=224;NR=242;PP=2965;SC=GTACCGTTTGCTCGCTGAGCG;SOR=0.795;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=466;TCF=224;TCR=242;TR=466;WE=113889482;WS=113889464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,511:1.00:511
chr13	113891075	rs2287253	G	A	4558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=64;PP=2542;SC=CCCATCTTTTGCAGAGAACCA;SOR=0.882;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=151;TCF=87;TCR=64;TR=151;WE=113891083;WS=113891065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr13	113899004	rs3932499	C	A	550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=16;PP=438;SC=AAATACAAAACATTAGCCAGG;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=113899012;WS=113898994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr13	113900197	rs2302756	G	A	1101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=4;PP=783;SC=AAAATTACACGGTTTATTTTG;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=34;WE=113900205;WS=113900187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr13	113917767	rs4907602	T	C	4405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=102;NR=45;PP=2916;ReadPosRankSum=-0.131;SC=TTTAATGCCATTGTAATTAGG;SOR=0.772;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=148;TCF=103;TCR=45;TR=147;WE=113917775;WS=113917757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,159:0.99:160
chr13	113951722	rs7983578	C	T	320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.67;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr13	113965176	rs9577503	C	A	4698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=92;PP=2932;SC=CAGCTTCAGCCGGGGAGGTAG;SOR=1.334;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=154;TCF=62;TCR=92;TR=154;WE=113965184;WS=113965166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr13	113978969	rs912010	G	A	4666.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=88;PP=2720;SC=TGGCAGGCAGGCAGACAGGCC;SOR=0.881;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=164;TCF=76;TCR=88;TR=164;WE=113978977;WS=113978959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr13	113980198	rs117936998	G	A	6924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=486;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=146;NR=149;PP=2962;ReadPosRankSum=0.252;SC=ACTCCCTGGCGGCCCGCCCGC;SOR=0.704;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=455;TCF=225;TCR=230;TR=295;WE=113980206;WS=113980188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,313:0.65:483
chr13	113999051	rs4406954	C	A	1262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=20;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=44;NR=14;PP=1575;SC=AAAAAAAAAACGGTTTGTAAC;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=44;TCR=14;TR=58;WE=113999059;WS=113999041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr13	114157846	rs9805588	G	A	2488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.281;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=34;PP=1515;ReadPosRankSum=0.900;SC=GAGAATTTGGGGTGTTTTTTA;SOR=0.821;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=153;TCF=98;TCR=55;TR=98;WE=114157854;WS=114157836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,112:0.65:173
chr13	114158078	rs9805651	G	T	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=182;ReadPosRankSum=2.836;SC=AAAATATCAGGTTTGAAAGCG;SOR=0.368;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=10;WE=114158086;WS=114158068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr13	114309226	rs11164142	G	A	7557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=567;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=167;NR=156;PP=2962;ReadPosRankSum=1.524;SC=TCATCACCACGTAGAAGGCCA;SOR=0.704;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=528;TCF=270;TCR=258;TR=323;WE=114309234;WS=114309216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:216,351:0.62:567
chr13	114312354	rs9285616	T	G	1582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=16;PP=956;SC=GTACCCCACCTGGACAGGGTG;SOR=1.498;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=56;TCF=39;TCR=17;TR=55;WE=114312362;WS=114312344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr13	114312605	rs58459344	G	GA	730.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=680;ReadPosRankSum=0.830;SC=GGCCAGGGCCGTTTATCAGCG;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=11;WE=114312614;WS=114312595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
chr13	114312606	rs58758822	T	G	739.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=709;ReadPosRankSum=0.620;SC=GCCAGGGCCGTTTATCAGCGC;SOR=0.941;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=13;WE=114312614;WS=114312595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
chr13	114322289	rs9796035	A	G	3090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.629;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=69;PP=2017;ReadPosRankSum=-0.141;SC=TCAGGGTCCTAGGGAAAGGGG;SOR=0.587;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=217;TCF=109;TCR=108;TR=139;WE=114322297;WS=114322279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,143:0.62:232
chr13	114323997	rs9796234	T	C	5116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=344;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.871;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=119;NR=97;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.457;SC=CGTCTCACTTTTCAGGGTGCT;SOR=0.620;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=323;TCF=181;TCR=142;TR=216;WE=114324005;WS=114323987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,229:0.67:344
chr13	114453605	.	C	CTGTGTGCACG	2872.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.190;ClippingRankSum=0.000;DP=298;ExcessHet=3.0103;FS=1.672;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.11;MQRankSum=2.531;QD=11.27;ReadPosRankSum=-1.363;SOR=0.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:173,82:0.32:255
chr13	114462517	rs58074269	CTCTCTG	C	392.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.897;NF=0;NR=6;PP=252;ReadPosRankSum=-0.472;SC=CCCTGTCTCTCTCTCTGTCTC;SOR=0.275;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=6;WE=114462530;WS=114462507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr13	114469434	rs68023809	G	A	1247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.286;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=37;PP=772;ReadPosRankSum=0.331;SC=CCAAGGCAGAGGGGAATTGGG;SOR=1.141;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=186;TCF=89;TCR=97;TR=64;WE=114469442;WS=114469424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,70:0.34:203
chr13	114471900	rs9604527	C	T	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=4;PP=335;ReadPosRankSum=-0.315;SC=GCCTGCCCAACGCCAGCAGAC;SOR=0.561;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=88;TCF=70;TCR=18;TR=26;WE=114471908;WS=114471890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,28:0.30:93
chr13	114498034	rs9577895	G	A	604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.188;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=450;ReadPosRankSum=0.613;SC=AAGAAGCCCCGACCTCGAGCT;SOR=1.584;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=22;WE=114498042;WS=114498024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,23:0.72:32
chr13	114498362	rs28653123	T	C	1299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=30;PP=886;SC=CTCCTCTCAGTAAGTCTCATT;SOR=4.021;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=34;WE=114498370;WS=114498352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr13	114502416	rs7400029	T	C	3847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=59;NR=66;PP=1768;SC=CTGAGATTCATGTGGGTTTTG;SOR=1.061;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=59;TCR=66;TR=125;WE=114502424;WS=114502406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr13	114503875	rs66696122	GCCTGCGGGAGGTGAGGGGCACCGGGGACCCCCATATCTACACCTGCGGGAGGTGAGGGGCGCTGGGGACCCCCGTATCTACA	G	1432.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=3.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FS=12.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.35;ReadPosRankSum=-7.724;SOR=0.595;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:167,101:0.38:268
chr13	114503915	rs9577890	C	T	4282.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-2.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FS=15.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.20;ReadPosRankSum=2.162;SOR=1.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,111:0.52:212
chr13	114503915	.	CA	TG	2944	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MMLQ=18;MQ=59.54;NF=31;NR=54;PP=2944;QD=20;SC=CCCATATCTACACCTGCGGGA;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=140;TCF=56;TCR=84;TR=85;WE=114503929;WS=114503885;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:55,85:0.61:140
chr13	114503916	rs9577889	A	G	4282.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FS=16.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.89;ReadPosRankSum=2.772;SOR=1.328;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,104:0.51:205
chr13	114503921	.	C	A	2233	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MMLQ=27;MQ=59.49;NF=17;NR=21;PP=2233;QD=59.6781898039;SC=TCTACACCTGCGGGAGGTGAG;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=126;TCF=49;TCR=77;TR=38;WE=114503929;WS=114503885;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:88,38:0.30:126
chr13	114507778	rs189379242	C	T	2709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.352;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=17;PP=1175;ReadPosRankSum=1.156;SC=GTCGAGGGTGCTGGGCTTTCT;SOR=1.357;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=113;TCF=84;TCR=29;TR=73;WE=114507786;WS=114507768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,79:0.63:126
chr13	114507836	rs7323732	A	G	11227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.72;SOR=1.098;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,290:1.00:290
chr13	114507836	.	ACCCG	GCCCA,GCCCG	2659	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000,0.5000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=98,156;NR=66,104;PP=2659,988;QD=20;SC=CACGCCGACCACCCGTCTCCT;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=264;TCF=158;TCR=106;TR=164,260;WE=114507848;WS=114507826;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.62:264
chr13	114507840	rs7332019	G	A	5487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FS=1.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.88;ReadPosRankSum=-1.207;SOR=0.815;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:105,202:0.66:307
chr13	114514918	rs34217684	T	A	1029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.20;ReadPosRankSum=2.804;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,54:0.69:78
chr13	114524056	rs7319527	C	T	1224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=18;NR=23;PP=600;SC=CTGGCCCCCCCACCCCCGGCA;SOR=1.251;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=18;TCR=23;TR=41;WE=114524064;WS=114524046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr13	114525261	rs11619074	G	T	1948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=46;PP=1263;SC=TACGCCGCACGCCTGTCTCCG;SOR=2.338;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=16;TCR=46;TR=62;WE=114525269;WS=114525251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr13	114537517	rs8191974	C	T	2561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=26;PP=1480;SC=GGCCAGGGGCCGCCTACCTCA;SOR=1.389;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=54;TCR=26;TR=80;WE=114537525;WS=114537507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr13	114538460	rs7331124	C	T	8750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=172;NR=139;PP=2965;SC=TCAGAGAAAGCGAGGGTGACC;SOR=0.861;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=311;TCF=172;TCR=139;TR=311;WE=114538468;WS=114538450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,332:1.00:332
chr13	114538717	rs373185949	ACT	A	759.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=376;SC=TCGCATCCAGACTCTGTGGGG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=9;WE=114538726;WS=114538707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr13	114542858	rs9604573	G	A	3345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=72;PP=2120;SC=ATCATGTTCAGCTGCCCCACC;SOR=1.688;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=110;TCF=38;TCR=72;TR=110;WE=114542866;WS=114542848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr13	114542942	rs9604490	C	T	900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=24;PP=651;SC=CTCTGAGGGGCGCAGGCTGAG;SOR=4.479;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=26;WE=114542950;WS=114542932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr13	114620051	rs11259844	C	T	1130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=29;PP=845;SC=CAAAATGAGACGTCTAGCGGG;SOR=2.362;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=10;TCR=29;TR=39;WE=114620059;WS=114620041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr13	114623880	rs7399982	G	A	20241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=758;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=368;NR=345;PP=2965;SC=CGTGTATTCAGTGCTGCTTCA;SOR=0.744;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=716;TCF=369;TCR=347;TR=713;WE=114623888;WS=114623870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,757:1.00:757
chr13	114751040	rs71449038	G	A	768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.395;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=4;PP=531;ReadPosRankSum=-0.617;SC=GCAATCTCCCGCCCACTACAC;SOR=1.042;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=44;TCF=36;TCR=8;TR=30;WE=114751048;WS=114751030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,32:0.68:47
chr13	114751359	rs10781677	A	G	529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=15;PP=420;SC=CCCCACCCACAGTACACATCC;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=114751367;WS=114751349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr13	114765199	rs115290344	C	T	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.874;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=21;PP=363;ReadPosRankSum=0.267;SC=GGCTGGGGTCCGGGTGGGGCT;SOR=0.487;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=94;TCF=26;TCR=68;TR=32;WE=114765207;WS=114765189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,35:0.34:102
chr13	114772897	.	T	TCC	108	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;FR=0.5000;HP=5;HapScore=2;MGOF=29;MMLQ=27;MQ=51.81;NF=7;NR=0;PP=108;QD=20.2857142857;SC=CTTACCCTTCTCCCCTCCTGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=7;WE=114772905;WS=114772887;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:18,7:0.28:25
chr13	114772918	.	A	G	252	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=24;MQ=56.51;NF=14;NR=4;PP=252;QD=15.9317340304;SC=CCTGCCGGACACCACCTTACC;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=38;TCF=32;TCR=6;TR=18;WE=114772926;WS=114772908;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr13	114773126	rs9562086	C	T	1655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.102;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=48;PP=1019;ReadPosRankSum=-0.581;SC=AGCCACACATCTGACGTGCAC;SOR=0.790;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=198;TCF=80;TCR=118;TR=80;WE=114773134;WS=114773116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,86:0.40:215
chr13	114774813	rs6560943	C	T	728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.824;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=10;PP=510;ReadPosRankSum=1.511;SC=AAGAGAACTCCGTCTCCTGAG;SOR=1.141;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=108;TCF=74;TCR=34;TR=37;WE=114774821;WS=114774803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,39:0.32:122
chr13	114778593	rs7322518	C	T	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.992;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=7;PP=512;ReadPosRankSum=0.000;SC=CTCAGAAAGCCTCGGTCCCTC;SOR=0.859;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=82;TCF=64;TCR=18;TR=33;WE=114778601;WS=114778583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,32:0.39:83
chr13	114778859	rs146849472	C	CTCTCCCTCTCTCTG	77.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.62;MQRankSum=2.961;QD=3.11;ReadPosRankSum=1.020;SOR=0.432;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,5:0.20:25
chr13	114780638	rs2274720	G	C	1346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FS=1.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.73;ReadPosRankSum=-3.242;SOR=0.832;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:157,43:0.22:200
chr13	114780648	rs2274719	A	C	1436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FS=2.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.41;ReadPosRankSum=-2.885;SOR=0.945;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:173,51:0.23:224
chr13	114780764	rs2274717	A	G	1704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.468;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=42;PP=1007;ReadPosRankSum=-0.270;SC=CCCCAGACTCAGTGATGGCGT;SOR=0.599;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=271;TCF=137;TCR=134;TR=88;WE=114780772;WS=114780754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:200,99:0.33:299
chr13	114782779	rs61749934	G	A	2942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=478;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.155;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=72;PP=1862;ReadPosRankSum=1.147;SC=TGGTCTCGTCGATGCACTTGG;SOR=0.828;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=445;TCF=237;TCR=208;TR=160;WE=114782787;WS=114782769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:310,168:0.35:478
chr13	114784435	rs12875472	C	T	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.516;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=140;ReadPosRankSum=-1.533;SC=CATGAGGCTGCATCTGCCAAG;SOR=1.127;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=50;TCF=10;TCR=40;TR=13;WE=114784443;WS=114784425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,14:0.27:52
chr13	114787031	rs2274713	T	G	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.066;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=272;ReadPosRankSum=-0.777;SC=GGGCAGCCCGTGTGGAGCAAA;SOR=0.866;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=78;TCF=21;TCR=57;TR=21;WE=114787039;WS=114787021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,22:0.26:84
chr13	114792842	rs3829340	C	T	2129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=396;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.397;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=43;PP=1210;ReadPosRankSum=2.054;SC=TTCCACTTAACGTTGACCCAT;SOR=0.660;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=362;TCF=217;TCR=145;TR=110;WE=114792850;WS=114792832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:272,124:0.31:396
chr13	114795094	.	T	C	330	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=24;MQ=57.57;NF=5;NR=0;PP=330;QD=72.9542425094;SC=ACCTCTAAAATGGCGTCATCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=5;WE=114795115;WS=114795084;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:15,5:0.25:20
chr13	114795107	.	GT	G	335	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=27;MQ=58.77;NF=8;NR=0;PP=335;QD=46.0;SC=CGTCATCCTGGTGGGCCAGGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=8;WE=114795115;WS=114795084;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:21,8:0.28:29
chr13	115000449	rs201328050	G	GGGCGGC	886.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=3;PP=563;SC=TCGAGTCCTGGGGCGGCGGCG;SOR=1.721;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=9;WE=115000457;WS=115000439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr13	115000465	rs61973461	T	C	1061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=5;PP=350;SC=CGGCGGCGGCTGCAGGCACGG;SOR=1.302;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=19;WE=115000473;WS=115000455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr13	115000650	rs7331680	G	T	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.629;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=126;ReadPosRankSum=-0.435;SC=GGCCTCGCCGGGTCTTTTTCC;SOR=0.825;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=53;TCF=29;TCR=24;TR=13;WE=115000658;WS=115000640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,14:0.22:64
chr13	115000719	rs7331882	G	A	1047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=20;PP=645;SC=GGACTGGGCCGGCCCTGGGCC;SOR=1.432;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=12;TCR=20;TR=32;WE=115000727;WS=115000709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr13	115002305	rs8002514	G	A	4483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=78;PP=2639;SC=GGTTGGCTCAGTGTCTTTACC;SOR=0.740;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=161;TCF=82;TCR=79;TR=160;WE=115002313;WS=115002295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr13	115004524	rs17337828	AT	A	2658.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=100;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=42;PP=1188;SC=TCATAATTTCATTTTTATTTG;SOR=1.312;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=50;TCF=6;TCR=44;TR=48;WE=115004532;WS=115004514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr13	115004555	rs3831159	TGCATCTCTTAAATATGTGTGA	T	2370.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=22;PP=2957;SC=ATGAGTGTTATGCATCTCTTA;SOR=1.609;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=24;WE=115004583;WS=115004545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr13	115004914	rs2296971	C	T	7862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=106;NR=161;PP=2965;SC=ACTTGAAGGACGAAAGTGGCT;SOR=1.276;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=267;TCF=106;TCR=161;TR=267;WE=115004922;WS=115004904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,290:1.00:290
chr13	115004935	rs2296970	T	C	5989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=125;PP=2965;SC=TCAAAGATCCTTCCAGCGACT;SOR=1.587;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=192;TCF=67;TCR=125;TR=191;WE=115004943;WS=115004925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr13	115010330	rs2039092	G	T	2556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=468;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.180;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=61;PP=1646;ReadPosRankSum=0.298;SC=TCACCTGCTGGTTTGGGGGTA;SOR=0.792;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=431;TCF=234;TCR=197;TR=142;WE=115010338;WS=115010320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:316,151:0.32:467
chr13	115012590	rs5807004	GT	G	65.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.30;ReadPosRankSum=0.345;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr13	115027462	rs7985356	T	A	2404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=62;PP=1677;SC=ATACTTTGTGTCTCAAAGTTT;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=16;TCR=62;TR=78;WE=115027470;WS=115027452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr13	115030714	rs8809	T	C	5870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=120;PP=2965;SC=AAGCTTATATTGGTAAGATAA;SOR=1.343;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=198;TCF=78;TCR=120;TR=198;WE=115030722;WS=115030704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr13	115037613	rs2274638	G	A	1028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=0;PP=729;SC=GAAATGATAAGTGATGGAATT;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=27;WE=115037621;WS=115037603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr13	115039246	.	C	CAA	137	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;FR=1.0000;HP=12;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=17;MQ=57.88;NF=11;NR=0;PP=137;QD=13.0;SC=GCCTCCATCTCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=11;WE=115039254;WS=115039236;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,11:0.79:14
chr13	115039275	.	TA	T	41.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=0.000;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=9.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.25;MQRankSum=2.151;QD=0.97;ReadPosRankSum=2.216;SOR=2.531;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,8:0.19:43
chr13	115047305	rs3752105	G	A	2521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=33;NR=55;PP=1493;SC=GAGGAGAAGAGGACGGCCCTG;SOR=1.445;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=33;TCR=55;TR=88;WE=115047313;WS=115047295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr13	115047700	rs9590410	A	T	16936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=639;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=260;NR=332;PP=2965;SC=GATTTCTCCTATATGGGAGTC;SOR=0.979;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=592;TCF=260;TCR=332;TR=592;WE=115047708;WS=115047690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,639:1.00:639
chr13	115064423	rs3752107	G	A	4003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.661;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.454;NF=95;NR=69;PP=2350;ReadPosRankSum=-0.762;SC=TGCCCCCGGTGCAGTCGTAAA;SOR=0.851;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=233;TCF=134;TCR=99;TR=164;WE=115064431;WS=115064404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,181:0.70:259
chr13	115064542	rs2701318	T	C	6852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=143;PP=2965;SC=TTTGTCAGTATGAGTATGCCT;SOR=1.148;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=245;TCF=102;TCR=143;TR=245;WE=115064550;WS=115064532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,262:1.00:262
chr13	115067093	rs12584898	C	T	941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.415;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=7;PP=541;ReadPosRankSum=-2.076;SC=AGCAGTGCAGCGCTGAGCACT;SOR=0.151;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=57;TCF=48;TCR=9;TR=35;WE=115067101;WS=115067083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,39:0.62:63
chr13	115090019	rs3813131	G	A	7380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=502;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.541;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=151;NR=149;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.001;SC=CTCATTTCCCGGAAACATTGG;SOR=0.568;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=473;TCF=246;TCR=227;TR=300;WE=115090027;WS=115090009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:184,318:0.63:502
chr13	115090193	rs3813133	G	A	9404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=604;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.561;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=187;NR=188;PP=2962;ReadPosRankSum=2.130;SC=CTTGGAAGCCGTTCCCTGCTG;SOR=0.648;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=552;TCF=275;TCR=277;TR=375;WE=115090201;WS=115090183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:191,413:0.68:604
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chr14	19685269	rs376856717	C	T	301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.42;QD=25.15;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
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chr14	20202040	rs8011997	T	A	4498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=48;PP=2965;SC=TACTTGCTTATTCATAATGCA;SOR=1.251;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=82;TCR=48;TR=130;WE=20202048;WS=20202030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
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chr14	20248828	rs2635535	C	T	9900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=685;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.351;NF=199;NR=203;PP=2962;ReadPosRankSum=0.496;SC=TTCTTGCTCACAGTGATGGCC;SOR=0.725;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=632;TCF=314;TCR=318;TR=402;WE=20248836;WS=20248818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:241,442:0.65:683
chr14	20249176	rs2815960	G	A	8939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=0.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=617;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.456;NF=192;NR=165;PP=2962;ReadPosRankSum=0.333;SC=TCAGGCTCAGGTGAGAATACC;SOR=0.674;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=568;TCF=309;TCR=259;TR=357;WE=20249184;WS=20249166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:231,386:0.63:617
chr14	20249456	rs2815959	G	A	1413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.037;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.854;NF=20;NR=47;PP=1036;ReadPosRankSum=-0.958;SC=GTCCTCCTGAGGATCATTGTC;SOR=0.463;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=177;TCF=48;TCR=129;TR=67;WE=20249464;WS=20249446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,69:0.37:188
chr14	20295510	rs7145672	C	T	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=2.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQRankSum=-4.281;QD=3.22;ReadPosRankSum=0.423;SOR=0.196;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,9:0.23:39
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chr14	20295778	rs11621883	CC	AG	1050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQRankSum=-6.333;QD=7.01;ReadPosRankSum=0.204;SOR=0.758;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:116,34:0.23:150
chr14	20295834	rs2801164	T	C	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQRankSum=-7.086;QD=3.24;ReadPosRankSum=0.707;SOR=0.605;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,17:0.20:86
chr14	20296004	rs2318279	C	T	3194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=392;ExcessHet=3.0103;FS=3.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQRankSum=-9.332;QD=8.15;ReadPosRankSum=1.934;SOR=0.708;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:291,101:0.26:392
chr14	20296010	rs17114261	G	C	3224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=388;ExcessHet=3.0103;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQRankSum=-9.506;QD=8.31;ReadPosRankSum=2.147;SOR=0.616;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:287,101:0.26:388
chr14	20296658	rs10140079	A	G	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.80;ReadPosRankSum=-0.318;SOR=0.260;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr14	20404091	rs12885778	G	A	6412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=469;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.793;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=127;NR=132;PP=2962;ReadPosRankSum=0.471;SC=TTTATTGAGCGCAAGACTATC;SOR=0.549;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=429;TCF=205;TCR=224;TR=259;WE=20404099;WS=20404081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,286:0.61:469
chr14	20404614	rs34608158	C	A	4920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.604;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=105;NR=81;PP=2962;ReadPosRankSum=1.128;SC=GGCCTTTTAGCAGACTTCCTG;SOR=0.944;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=279;TCF=152;TCR=127;TR=186;WE=20404622;WS=20404604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,208:0.67:310
chr14	20404735	rs34394400	C	T	5376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=373;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.148;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=122;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.556;SC=GCTGAGAAACCGTCATGTGAA;SOR=0.916;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=344;TCF=159;TCR=185;TR=220;WE=20404743;WS=20404725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,240:0.65:372
chr14	20444490	rs11158071	C	T	11196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=414;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=202;NR=172;PP=2965;SC=TCACTGTGGTCACTTTATTCT;SOR=0.789;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=374;TCF=202;TCR=172;TR=374;WE=20444498;WS=20444480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,413:1.00:413
chr14	20470399	rs7493807	G	A	8604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=160;NR=119;PP=2965;ReadPosRankSum=0.805;SC=TTGAAGCAGGGCTATTTGTAC;SOR=0.320;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=282;TCF=163;TCR=119;TR=279;WE=20470407;WS=20470389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,319:1.00:320
chr14	20482471	rs12590785	C	T	5799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=111;NR=74;PP=2965;SC=CTGCTTTCATCTCCTCATTTC;SOR=0.991;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=185;TCF=111;TCR=74;TR=185;WE=20482479;WS=20482461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr14	20501962	rs2775261	G	C	352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=1;PP=280;SC=AAACAAGAGAGTGTCTCTTCA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=20501970;WS=20501952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr14	20502120	rs17277032	C	T	4876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.918;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=102;NR=67;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.706;SC=TTTTATCTACCGAGTATCTGC;SOR=0.891;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=171;TCF=103;TCR=68;TR=169;WE=20502128;WS=20502110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,174:0.99:175
chr14	20528304	.	T	TCTA	2638.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=0.612;ClippingRankSum=0.000;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.744;HP=1;HapScore=4;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=31;PP=2954;ReadPosRankSum=-2.676;SC=TTTTCCCTGATCTACGGTGCT;SOR=0.998;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=142;TCF=69;TCR=73;TR=59;WE=20528317;WS=20528294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,105:0.48:220
chr14	20528309	rs150605467	G	T	4698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=3.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.270;HP=1;HapScore=4;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=33;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.733;SC=CCTGATCTACGGTGCTACTGT;SOR=1.155;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=204;TCF=130;TCR=74;TR=93;WE=20528317;WS=20528294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,125:0.50:249
chr14	20528359	rs1959630	G	T	10674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=398;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=194;NR=156;PP=2965;SC=TGACATGTAGGTCAACCCTTC;SOR=0.908;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=350;TCF=194;TCR=156;TR=350;WE=20528367;WS=20528349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,397:1.00:397
chr14	20665887	rs4981823	G	C	5020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=80;PP=2965;SC=AGATCATCTCGTTCTCTGGCT;SOR=0.761;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=168;TCF=88;TCR=80;TR=168;WE=20665895;WS=20665877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr14	20666175	rs55781225	C	CA	5724.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-0.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=493;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.521;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.419;NF=13;NR=79;PP=2395;ReadPosRankSum=0.821;SC=CTCTCACTTGCAAAAAAGGCC;SOR=0.764;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=248;TCF=47;TCR=201;TR=92;WE=20666183;WS=20666165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:235,233:0.50:468
chr14	20666587	rs139162797	TA	T	210.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.696;NF=1;NR=7;PP=120;ReadPosRankSum=-0.234;SC=TTTTGGGGTTTAAAAAAAAAA;SOR=0.275;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=8;WE=20666595;WS=20666577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
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chr14	20692291	rs34693535	C	T	3044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.406;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=48;PP=1722;ReadPosRankSum=-0.178;SC=ATGATCGGTACCTGGCCATCT;SOR=0.786;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=248;TCF=145;TCR=103;TR=118;WE=20692299;WS=20692281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,142:0.49:288
chr14	20692453	rs17211285	G	T	2209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.091;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=51;PP=1475;ReadPosRankSum=-0.915;SC=TTGACCACTTGGTGTGTGACC;SOR=0.911;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=191;TCF=94;TCR=97;TR=94;WE=20692461;WS=20692443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,102:0.49:210
chr14	20692574	rs17277221	T	C	2429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.834;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=38;PP=1675;ReadPosRankSum=-1.595;SC=CTTGGGATCTTACACTCTGGT;SOR=0.944;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=194;TCF=107;TCR=87;TR=95;WE=20692582;WS=20692564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,106:0.50:214
chr14	20692595	rs61993884	G	C	2454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.485;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=36;PP=1622;ReadPosRankSum=-0.090;SC=CATCAGAGCTGTGCTTTGTAT;SOR=1.145;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=198;TCF=111;TCR=87;TR=97;WE=20692603;WS=20692585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,110:0.49:223
chr14	20692643	rs17277228	T	C	3564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.442;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=63;PP=1826;ReadPosRankSum=0.404;SC=TTTCTCCACATGTGGGTCCCA;SOR=0.654;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=251;TCF=142;TCR=109;TR=149;WE=20692651;WS=20692633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,169:0.60:282
chr14	20692999	rs11851950	T	G	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=60;ReadPosRankSum=1.068;SC=GCAGTTAAATTCAGCTCATTA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=20693007;WS=20692989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr14	20697589	rs61993889	C	T	2005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=34;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.369;SC=TCTACTGTGACGCAGTTTGTG;SOR=0.699;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=169;TCF=104;TCR=65;TR=87;WE=20697608;WS=20697579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,94:0.48:195
chr14	20697600	rs12434822	T	G	2288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.714;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=31;PP=2633;ReadPosRankSum=0.348;SC=GCAGTTTGTGTTGTTGGGGTT;SOR=0.850;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=186;TCF=114;TCR=72;TR=85;WE=20697608;WS=20697579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,104:0.49:211
chr14	20710906	rs17108372	G	A	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.222;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=161;ReadPosRankSum=1.193;SC=CTTGAGATACGTAGCAAGCAA;SOR=0.160;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=10;WE=20710914;WS=20710896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr14	20760066	rs1953549	T	A	2229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=51;NR=21;PP=1325;SC=ATTATTTCTATATCTTTTATA;SOR=1.445;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=51;TCR=21;TR=72;WE=20760074;WS=20760056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr14	20763446	rs1953551	T	C	3725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=75;NR=46;PP=2011;SC=AAGGGTAAAATGGGGGAAATC;SOR=1.187;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=75;TCR=46;TR=121;WE=20763454;WS=20763436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr14	20764585	rs1953552	A	C	5959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.98;NF=100;NR=115;PP=2965;SC=GATTGCTAGAAGCTTTTCTGT;SOR=0.955;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=215;TCF=100;TCR=115;TR=215;WE=20764593;WS=20764563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr14	20767618	rs2318864	G	A	7539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=135;NR=119;PP=2965;SC=CTGCAAATAGGAAGGGCACAT;SOR=0.707;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=256;TCF=137;TCR=119;TR=254;WE=20767626;WS=20767608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,288:1.00:288
chr14	20767706	rs945459	C	T	3255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=67;PP=2086;SC=TTTTACCTTTCTAAGTTTTTT;SOR=1.589;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=39;TCR=67;TR=106;WE=20767714;WS=20767696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr14	20769870	rs3825766	G	A	422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=3;PP=282;SC=CTGAGAAGTAGTATTACGTTG;SOR=1.911;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=14;WE=20769878;WS=20769860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	20770036	rs3742945	T	C	3529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=52;PP=1785;SC=CATCTCCTTCTGCACATCCTG;SOR=0.818;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=119;TCF=67;TCR=52;TR=119;WE=20770044;WS=20770026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr14	20784117	rs12889262	A	G	1911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=37;PP=1095;SC=TTACTTTTATACAGAAGAGAG;SOR=1.195;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=25;TCR=37;TR=62;WE=20784125;WS=20784107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr14	20824181	rs3093930	T	C	6651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=139;PP=2965;SC=ATGAAAGTTATGAGTTCAAAG;SOR=1.261;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=232;TCF=93;TCR=139;TR=232;WE=20824189;WS=20824171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chr14	20836923	.	GCA	G	357.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.208;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=1.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.25;MQRankSum=1.226;QD=9.41;ReadPosRankSum=-0.230;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,16:0.42:38
chr14	20851840	rs2297614	A	G	3359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.044;HP=8;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=60;PP=2079;ReadPosRankSum=0.651;SC=AGTGGGAGAGAAAAAAAAAGC;SOR=0.474;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=236;TCF=131;TCR=105;TR=128;WE=20851848;WS=20851830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,143:0.58:246
chr14	20852029	rs1760904	A	G	2739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.944;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=54;PP=1769;ReadPosRankSum=-0.924;SC=AAGACTAATGATGCCACCTTG;SOR=0.641;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=242;TCF=122;TCR=120;TR=114;WE=20852037;WS=20852019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,125:0.48:262
chr14	20854734	rs945011	A	G	3346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=60;NR=44;PP=1576;SC=CCCGCTCCCCATGCATGTCTC;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=60;TCR=44;TR=104;WE=20854742;WS=20854724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr14	20857306	.	TA	T	98.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.329;ClippingRankSum=0.000;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=5.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.74;ReadPosRankSum=-0.115;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,11:0.31:36
chr14	20859013	rs872072	G	A	6593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=112;NR=113;PP=2965;SC=ACTGTGTATTGTCTGTGCCTT;SOR=0.744;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=225;TCF=112;TCR=113;TR=225;WE=20859021;WS=20859003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr14	20859084	rs872073	T	C	6016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=103;NR=94;PP=2965;SC=ATGGTGGGTGTTGAGTGTCTG;SOR=0.731;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=197;TCF=103;TCR=94;TR=197;WE=20859092;WS=20859074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr14	20859205	rs872074	C	T	6716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=107;NR=104;PP=2965;SC=CCACCTGCTCCGCCCTCGTGA;SOR=0.839;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=211;TCF=107;TCR=104;TR=211;WE=20859213;WS=20859195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr14	20869819	rs2297612	A	T	3601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=79;PP=2279;SC=GCAGATTGTAAGACCATCCGA;SOR=1.376;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=47;TCR=79;TR=126;WE=20869827;WS=20869809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr14	20871645	rs8009925	C	A	4117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=90;PP=2550;SC=AAAAAGGGAACTGGCTGTCCT;SOR=1.488;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=51;TCR=90;TR=141;WE=20871653;WS=20871635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr14	20871846	rs55790286	A	G	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=240;ReadPosRankSum=1.224;SC=TCCTGGAGAAAAGGGGCGTGG;SOR=1.179;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=13;WE=20871854;WS=20871836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr14	20872740	rs2275009	G	A	1444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=24;PP=901;ReadPosRankSum=-2.062;SC=ATGAAGTGAAGGCCCAAGCTC;SOR=0.683;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=127;TCF=79;TCR=48;TR=64;WE=20872748;WS=20872730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,68:0.51:134
chr14	20872881	rs1760898	G	T	1762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.229;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=38;PP=1139;ReadPosRankSum=1.877;SC=TGGCCAAGATGTTATTGGCCA;SOR=0.577;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=149;TCF=71;TCR=78;TR=75;WE=20872889;WS=20872871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,82:0.50:163
chr14	20876253	rs1760897	A	G	3406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.318;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=75;PP=2297;ReadPosRankSum=1.440;SC=TTTAGACTAGAGAGGGTGGCC;SOR=0.497;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=303;TCF=143;TCR=160;TR=150;WE=20876261;WS=20876243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,158:0.49:320
chr14	20898308	rs17242648	C	T	2074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=42;PP=1283;ReadPosRankSum=0.362;SC=CCCGGCTGCCCGCACCCTCCG;SOR=0.670;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=160;TCF=80;TCR=80;TR=83;WE=20898316;WS=20898298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,90:0.52:173
chr14	20903349	rs1713408	T	C	5297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=86;NR=91;PP=2730;SC=ACATCTTCCCTGGCATTTCCA;SOR=0.875;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=177;TCF=86;TCR=91;TR=177;WE=20903357;WS=20903339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr14	20903906	rs8017603	C	T	1783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.329;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=50;PP=1209;ReadPosRankSum=0.955;SC=AAGGCAGTCCCTCTGGACGGG;SOR=0.854;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=140;TCF=55;TCR=85;TR=80;WE=20903914;WS=20903896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,83:0.55:151
chr14	20916249	rs2275008	T	C	3995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=350;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.266;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=82;PP=2667;ReadPosRankSum=1.665;SC=TCTGTCCCAGTTTTTTACTGC;SOR=0.617;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=323;TCF=174;TCR=149;TR=174;WE=20916257;WS=20916239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,188:0.54:349
chr14	20917442	rs938881	A	T	2581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.457;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=54;PP=1403;ReadPosRankSum=0.810;SC=GTGATGAGGAAGTCCATGAAA;SOR=0.756;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=232;TCF=116;TCR=116;TR=112;WE=20917450;WS=20917432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,128:0.50:254
chr14	20919623	rs3120067	T	C	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.17;ReadPosRankSum=0.305;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr14	20920250	rs2275007	T	C	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.997;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=7;PP=245;ReadPosRankSum=-0.651;SC=TATTCCACAGTTGGGCCACAG;SOR=0.491;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=41;TCF=22;TCR=19;TR=18;WE=20920258;WS=20920240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,21:0.43:49
chr14	20920340	rs2275006	A	G	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=7;PP=116;ReadPosRankSum=0.776;SC=TTATAATCCTAGAGATTGGAA;SOR=0.668;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=34;TCF=17;TCR=17;TR=12;WE=20920348;WS=20920330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,20:0.43:47
chr14	20920360	rs3215948	A	AG	523.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.289;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=241;ReadPosRankSum=-0.183;SC=AAAAAACAATAGTGGGGGACA;SOR=1.051;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=7;WE=20920368;WS=20920350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr14	20920749	rs1878703	C	G	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=388;ReadPosRankSum=1.132;SC=CACATTTTCACATCTACTCTT;SOR=1.609;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=12;WE=20920771;WS=20920739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr14	20920763	rs7151461	G	A	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=480;ReadPosRankSum=-0.875;SC=TACTCTTTCCGGCTTCTATAT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=9;WE=20920771;WS=20920739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr14	20925154	rs1130409	T	G	6083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=105;PP=2965;SC=CTATAGGCGATGAGGAGCATG;SOR=1.036;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=189;TCF=83;TCR=106;TR=188;WE=20925162;WS=20925144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr14	20940515	rs1049562	C	T	1261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.666;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=20;PP=695;ReadPosRankSum=-1.517;SC=TTCTGTCTCACACTAAGCACC;SOR=0.779;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=113;TCF=69;TCR=44;TR=52;WE=20940523;WS=20940505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,61:0.48:126
chr14	20940606	rs1049564	G	A	1514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=27;PP=886;ReadPosRankSum=1.295;SC=CTTTGACTACGGTGAAATCCC;SOR=0.709;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=123;TCF=69;TCR=54;TR=63;WE=20940614;WS=20940596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,71:0.53:135
chr14	20940626	rs1130650	C	T	1470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=27;PP=955;ReadPosRankSum=-0.412;SC=CCAACTTTCCCCGAAGTACAG;SOR=0.713;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=115;TCF=63;TCR=52;TR=61;WE=20940634;WS=20940616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,66:0.53:125
chr14	20940834	rs1713422	A	G	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.118;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=230;ReadPosRankSum=1.056;SC=AAGAGACAGGACATGTGTGTG;SOR=0.039;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=15;WE=20940842;WS=20940824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr14	20942744	rs1713420	A	G	1657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.340;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=36;PP=1102;ReadPosRankSum=0.092;SC=GGTAAGTCAGAGGGATAGGTC;SOR=0.554;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=125;TCF=57;TCR=68;TR=69;WE=20942752;WS=20942734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,76:0.54:142
chr14	20978531	rs2319198	G	A	2491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=26;PP=1540;SC=GGAGACCCCAGATACAATGCT;SOR=1.455;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=51;TCR=26;TR=77;WE=20978539;WS=20978521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr14	21024605	rs8014474	G	A	1229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.799;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=16;PP=1973;ReadPosRankSum=-0.406;SC=CTCAGAGAACGCTCTGCTAGG;SOR=0.811;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=93;TCF=66;TCR=27;TR=52;WE=21024627;WS=21024595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,55:0.55:100
chr14	21024619	rs1243647	A	G	1521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.396;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=20;PP=1973;ReadPosRankSum=0.195;SC=TGCTAGGGCGATATGACAAAG;SOR=0.951;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=119;TCF=81;TCR=38;TR=63;WE=21024627;WS=21024595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,67:0.53:127
chr14	21024786	rs12590446	A	G	1850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.145;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=40;PP=1193;ReadPosRankSum=-1.550;SC=TGGTATTTCAAATGCTTCTGT;SOR=0.810;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=167;TCF=80;TCR=87;TR=76;WE=21024794;WS=21024776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,86:0.46:186
chr14	21026773	rs891297	C	T	1792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.021;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=38;PP=1045;ReadPosRankSum=0.760;SC=TCGGAACATACTCTCACAAGA;SOR=0.749;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=133;TCF=71;TCR=62;TR=77;WE=21026781;WS=21026763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,83:0.54:154
chr14	21052259	rs1429539	T	C	2230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.056;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=41;PP=1278;ReadPosRankSum=-1.041;SC=GCATCACTTCTGTGGAGCTGC;SOR=0.613;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=192;TCF=108;TCR=84;TR=91;WE=21052267;WS=21052249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,104:0.49:213
chr14	21052414	rs35818240	T	A	4370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=408;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.095;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=94;PP=2848;ReadPosRankSum=-0.787;SC=GTCAGTAATGTGGAAGACATA;SOR=0.600;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=370;TCF=178;TCR=192;TR=185;WE=21052422;WS=21052404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:203,205:0.50:408
chr14	21052487	rs35238496	A	G	3583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=83;PP=2254;ReadPosRankSum=1.781;SC=TTAATATCTCAATGGTCTGTT;SOR=0.704;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=309;TCF=148;TCR=161;TR=157;WE=21052495;WS=21052477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,171:0.50:341
chr14	21058337	rs4981259	C	T	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=51;ReadPosRankSum=0.967;SC=TCCCCTTCCGCTCAAGGCATT;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=5;WE=21058345;WS=21058329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr14	21109141	rs17277522	C	T	5507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=87;PP=2965;SC=GGCCTTCTGACGGCCTGAAGC;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=182;TCF=95;TCR=87;TR=182;WE=21109149;WS=21109131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr14	21109170	rs11628297	T	A	5610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=85;PP=2965;SC=TGCTCAGGACTGCCAGCACAA;SOR=0.723;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=185;TCF=100;TCR=85;TR=185;WE=21109178;WS=21109160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr14	21109745	rs45443395	C	G	2539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.502;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=63;PP=1717;ReadPosRankSum=-1.371;SC=AGGAGATAGACAAGAAGAAAC;SOR=0.921;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=222;TCF=105;TCR=117;TR=111;WE=21109753;WS=21109735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,120:0.48:250
chr14	21215692	rs10136680	C	T	1535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=13;PP=959;SC=CTGGTTAATGCTTTTCTTTCT;SOR=1.877;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=36;TCR=13;TR=49;WE=21215700;WS=21215682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr14	21215728	rs10135976	G	C	2733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=30;PP=1751;SC=GCAGGTGGACGTGGTGACTGA;SOR=1.337;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=58;TCR=30;TR=88;WE=21215736;WS=21215718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr14	21215923	rs34552133	G	T	2869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.067;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=52;PP=1874;ReadPosRankSum=-1.122;SC=GGCTCTGAAAGGCAAGAGCTT;SOR=0.957;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=250;TCF=141;TCR=109;TR=126;WE=21215931;WS=21215913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,135:0.50:270
chr14	21238318	rs3827905	G	A	4529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=62;PP=2655;SC=AGATGGCATCGTCTCTAAAGA;SOR=1.048;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=90;TCR=62;TR=152;WE=21238326;WS=21238308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr14	21238798	rs3827907	T	C	569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=453;SC=ATTCAGTGCTTTCTAAGTAGC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=21238806;WS=21238788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr14	21250124	rs1045922	G	A	2758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=63;PP=1711;ReadPosRankSum=-0.427;SC=AAAAATCGTCGGCACAACTGC;SOR=0.700;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=234;TCF=101;TCR=133;TR=112;WE=21250132;WS=21250114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,127:0.48:263
chr14	21250366	rs7156801	T	C	593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=13;PP=312;SC=ATTGCATCCATGTTTTCTTTT;SOR=1.708;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=7;TCR=13;TR=20;WE=21250374;WS=21250356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr14	21360216	rs2073342	C	G	6255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=105;PP=2965;SC=TCAAACTGCACGTATGCAGAC;SOR=0.917;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=200;TCF=95;TCR=105;TR=200;WE=21360224;WS=21360206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr14	21387994	rs10459477	A	G	8445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=152;NR=124;PP=2965;SC=TGGAAAAACCAAAATACTTTT;SOR=0.887;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=277;TCF=153;TCR=124;TR=276;WE=21388002;WS=21387984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,314:1.00:314
chr14	21388266	rs3748340	G	C	11031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=405;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=196;NR=164;PP=2965;SC=AGTTCACCTGGATACCATCAT;SOR=0.813;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=362;TCF=197;TCR=165;TR=360;WE=21388274;WS=21388256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,403:1.00:403
chr14	21388302	rs3748341	G	A	10451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=392;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=176;NR=170;PP=2965;SC=AGCACTCCTCGTCATCACTCA;SOR=0.735;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=347;TCF=176;TCR=171;TR=346;WE=21388310;WS=21388292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,390:1.00:390
chr14	21458131	rs2741733	G	A	754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=2;PP=435;SC=ACAGGCACCTGTATTTCCGTT;SOR=2.468;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=24;WE=21458139;WS=21458121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr14	21460160	rs2741737	C	T	689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=4;PP=421;SC=TTGTCGTCTCCCTTGAGCTTT;SOR=1.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=23;WE=21460168;WS=21460150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr14	21463430	rs2741739	G	T	4516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=81;PP=2675;SC=CACCCATATGGCACCAATTAC;SOR=1.110;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=64;TCR=81;TR=145;WE=21463438;WS=21463420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr14	21463474	rs2783801	G	A	2572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=52;PP=1601;SC=AGACTGTCATGTATTGACAAG;SOR=1.289;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=34;TCR=52;TR=86;WE=21463482;WS=21463464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr14	21467913	rs2234632	T	G	849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.759;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=18;PP=546;ReadPosRankSum=1.042;SC=CATCACCGGCTAGTCCTCAGA;SOR=0.430;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=40;TCR=38;TR=37;WE=21467921;WS=21467903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,42:0.46:92
chr14	21468156	rs2149666	T	G	947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.305;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=10;PP=751;ReadPosRankSum=1.386;SC=TGACAGCTCTTGTGTGGGATG;SOR=1.146;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=77;TCF=53;TCR=24;TR=38;WE=21468164;WS=21468146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,38:0.49:78
chr14	21469151	rs2234636	T	C	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=303;ReadPosRankSum=0.614;SC=GGGCTTCTTTTTTGTCTTCTT;SOR=0.784;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=29;TCF=19;TCR=10;TR=21;WE=21469159;WS=21469141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,25:0.68:37
chr14	21486054	rs1243444	T	C	1970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=37;PP=1244;ReadPosRankSum=0.055;SC=ATTGGGCAGATAGCGGTGAGT;SOR=0.691;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=161;TCF=86;TCR=75;TR=78;WE=21486062;WS=21486044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,89:0.51:176
chr14	21486137	rs1243445	G	C	6539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=115;NR=106;PP=2965;SC=CTCTTGTCCCGATACTCACTG;SOR=0.718;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=221;TCF=115;TCR=106;TR=221;WE=21486145;WS=21486127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr14	21486442	rs1243446	A	G	4653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=410;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.521;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=93;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.418;SC=ACACACATAAATGAGCCATGC;SOR=0.750;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=372;TCF=191;TCR=181;TR=197;WE=21486450;WS=21486432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:195,215:0.52:410
chr14	21488046	rs1243448	G	C	1006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.779;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=23;PP=602;ReadPosRankSum=0.632;SC=TGCTGCTCCCGTCGACTCTTC;SOR=0.923;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=76;TCF=34;TCR=42;TR=39;WE=21488054;WS=21488036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,44:0.52:85
chr14	21489044	rs34056586	G	A	2644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.448;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=52;PP=1488;ReadPosRankSum=0.543;SC=GGGATCTGCTGTCCAAAACCT;SOR=0.651;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=235;TCF=121;TCR=114;TR=112;WE=21489052;WS=21489034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,129:0.49:263
chr14	21490125	rs1243449	A	C	1261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=24;PP=1001;SC=CTCCCAGAATAACCACTGCCC;SOR=1.206;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=17;TCR=24;TR=41;WE=21490133;WS=21490115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr14	21500395	rs1243462	A	G	875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.756;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=13;PP=624;ReadPosRankSum=0.326;SC=GAGGCAGCACAGGAGGGTGGG;SOR=0.943;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=91;TCF=62;TCR=29;TR=43;WE=21500403;WS=21500385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,44:0.46:95
chr14	21500411	rs3818613	C	A	1330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.661;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=22;PP=876;ReadPosRankSum=-1.432;SC=GTGGGTTCTCCACCACACACC;SOR=0.786;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=120;TCF=77;TCR=43;TR=60;WE=21500419;WS=21500401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,64:0.48:132
chr14	21500426	rs1754340	G	A	1488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=28;PP=838;ReadPosRankSum=-1.555;SC=CACACCCTTCGCTCTGCTTAG;SOR=0.662;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=139;TCF=84;TCR=55;TR=68;WE=21500434;WS=21500416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,75:0.48:156
chr14	21500455	rs3818615	T	A	1958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.501;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=38;PP=1099;ReadPosRankSum=-0.376;SC=CTACCAGCCATCAGTTAGCAT;SOR=0.653;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=187;TCF=107;TCR=80;TR=89;WE=21500463;WS=21500445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,99:0.47:211
chr14	21500597	rs3818616	C	T	1302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.644;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=32;PP=790;ReadPosRankSum=-0.831;SC=TCCACCCCCACCCCTCAAAAG;SOR=0.793;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=128;TCF=63;TCR=65;TR=63;WE=21500605;WS=21500587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,65:0.49:133
chr14	21501049	rs1952525	G	T	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.117;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=38;ReadPosRankSum=0.418;SC=TACAGAGGGGGCTCGTGTGCC;SOR=2.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=4;WE=21501057;WS=21501039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr14	21503743	rs1243463	G	A	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=120;ReadPosRankSum=-0.990;SC=CCTTTGCTGGGCAGCAGAAAA;SOR=0.247;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=9;WE=21503751;WS=21503733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr14	21503959	rs117360911	T	G	2930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.887;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=75;PP=1878;ReadPosRankSum=1.134;SC=TCAGTTTCCCTGGTTACCTAT;SOR=0.768;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=265;TCF=120;TCR=145;TR=132;WE=21503967;WS=21503949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,144:0.48:298
chr14	21504447	rs1243464	A	G	1572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.228;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=47;PP=1030;ReadPosRankSum=-0.784;SC=AAAAAGTGTGATCCCTTCTTT;SOR=0.348;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=156;TCF=51;TCR=105;TR=76;WE=21504455;WS=21504437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,78:0.48:162
chr14	21511458	rs1263872	G	C	3938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=388;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.366;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=88;PP=2503;ReadPosRankSum=0.947;SC=GAGCCACGGGGCCGTGTCCCT;SOR=0.725;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=341;TCF=167;TCR=174;TR=173;WE=21511466;WS=21511448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:194,193:0.50:387
chr14	21511497	rs1243469	C	T	3539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=350;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.288;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=87;PP=2053;ReadPosRankSum=-1.342;SC=CTCAGGGAAGCATCCGAACTG;SOR=0.834;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=303;TCF=140;TCR=163;TR=155;WE=21511505;WS=21511487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:177,172:0.49:349
chr14	21526044	rs12435011	T	C	1151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.905;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=11;PP=804;ReadPosRankSum=2.219;SC=CTGTCTCCCTTAAGAGAGATG;SOR=0.917;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=87;TCF=65;TCR=22;TR=47;WE=21526052;WS=21526034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,49:0.54:91
chr14	21526079	rs12437266	C	T	1740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=23;PP=1126;ReadPosRankSum=0.548;SC=AGGATGCTGCCCCCTGCTGCT;SOR=0.693;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=141;TCF=97;TCR=44;TR=72;WE=21526087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,76:0.51:149
chr14	21542037	rs4982405	C	T	3774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.089;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=45;PP=2224;ReadPosRankSum=-0.704;SC=ACTGCCCTCTCCTGCTGGTTT;SOR=1.012;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=129;TCF=83;TCR=46;TR=128;WE=21542045;WS=21542027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,140:0.99:141
chr14	21544056	rs7140850	C	T	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=51;ReadPosRankSum=1.691;SC=AGACTTCAAGCCATTGACCTT;SOR=0.631;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=5;WE=21544064;WS=21544046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr14	21544842	rs11483416	T	TG	1980.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.593;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.796;NF=8;NR=34;PP=1421;ReadPosRankSum=0.048;SC=CCATCAGTAGTGGGGAGAGGA;SOR=0.760;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=100;TCF=17;TCR=83;TR=42;WE=21544850;WS=21544832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,76:0.49:156
chr14	21549893	rs7143633	G	C	5380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=86;NR=89;PP=2965;SC=CCAGCAACACGTGGGAGAGGA;SOR=0.898;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=176;TCF=87;TCR=89;TR=175;WE=21549901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr14	21551058	rs1958395	G	A	1498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.629;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=35;PP=842;ReadPosRankSum=-2.143;SC=GTCTGGCTGCGCTCAGTCCCT;SOR=0.545;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=168;TCF=94;TCR=74;TR=71;WE=21551077;WS=21551048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,78:0.43:182
chr14	21551069	rs1958396	T	C	6680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=78;PP=2962;ReadPosRankSum=1.285;SC=CTCAGTCCCTTAAGCAAGGTA;SOR=0.288;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=177;TCF=99;TCR=78;TR=176;WE=21551077;WS=21551048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,192:0.99:193
chr14	21555087	.	AAATC	A	1526	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;FR=0.5000;HP=6;HapScore=1;MGOF=14;MMLQ=27;MQ=59.19;NF=15;NR=29;PP=1526;QD=35.1590909091;SC=AAAAAGAAAAAAATCAACCAT;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=90;TCF=33;TCR=57;TR=44;WE=21555098;WS=21555077;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:46,44:0.49:90
chr14	21556963	rs35186993	A	AT	3056.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.977;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=36;PP=1486;ReadPosRankSum=0.836;SC=ATGTCCCTAAATTCACTGTAG;SOR=0.620;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=94;TCF=20;TCR=74;TR=42;WE=21556971;WS=21556953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,105:0.53:197
chr14	21558558	rs6571653	G	C	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.141;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=292;ReadPosRankSum=0.079;SC=CGCCCGCCGCGCCTTCCACCT;SOR=1.685;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=13;WE=21558566;WS=21558548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr14	21562560	rs7149011	T	C	7222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=128;NR=121;PP=2965;SC=CGTATAGGATTCATCCCCTTG;SOR=0.700;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=250;TCF=129;TCR=121;TR=249;WE=21562568;WS=21562550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,279:1.00:279
chr14	21570273	rs745696	T	C	8255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=138;NR=132;PP=2965;SC=CACCCCGCCTTTGGAAGGTGA;SOR=0.726;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=270;TCF=138;TCR=132;TR=270;WE=21570281;WS=21570263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,311:1.00:311
chr14	21570614	rs4982408	A	C	5352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=108;NR=71;PP=2922;SC=TGGGTTTCATAGTGGTGGTGG;SOR=1.040;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=180;TCF=108;TCR=72;TR=179;WE=21570622;WS=21570604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr14	21571119	rs12432043	A	G	561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=2;PP=476;SC=GGGTAAGAGGAAACTGGGAAT;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=21571127;WS=21571109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr14	21571208	rs12880628	G	T	2389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=28;PP=1461;SC=AAACAGGATAGAAAATTGGGC;SOR=1.338;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=55;TCR=28;TR=83;WE=21571216;WS=21571198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr14	21623010	rs8007993	T	C	2812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=62;NR=35;PP=1644;SC=TTCACAGGGGTGGGCATGGGA;SOR=1.390;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=62;TCR=35;TR=97;WE=21623018;WS=21623000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr14	21623290	rs7145814	T	C	7152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=125;NR=119;PP=2965;SC=AAGAGGCAGATGGCAGTGAGG;SOR=0.701;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=244;TCF=125;TCR=119;TR=244;WE=21623298;WS=21623280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr14	21623648	rs7161544	G	A	4418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=71;PP=2566;SC=AGAGCAGGGGGTTACAAATAG;SOR=0.705;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=76;TCR=71;TR=147;WE=21623656;WS=21623638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr14	21623836	rs4982419	G	A	5867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=99;NR=96;PP=2965;SC=AAGAAGGAGAGGCTCTTCAGG;SOR=0.799;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=195;TCF=99;TCR=96;TR=195;WE=21623844;WS=21623826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr14	21624197	rs10135366	T	C	1146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=28;PP=872;SC=AGAGGATCTTTTCTCCTTGGT;SOR=3.026;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=34;WE=21624205;WS=21624187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr14	21770730	rs6571751	A	G	3602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.309;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=75;PP=2257;ReadPosRankSum=-0.008;SC=AGTAGCCAGTAAACCCAGTGA;SOR=0.781;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=297;TCF=153;TCR=144;TR=151;WE=21770738;WS=21770720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,165:0.51:325
chr14	21775816	rs8005773	G	C	609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=285;ReadPosRankSum=0.990;SC=ATTCTTACTAGGGCATAGTCA;SOR=0.784;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=48;TCF=33;TCR=15;TR=25;WE=21775824;WS=21775806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,29:0.57:51
chr14	21785790	rs3748357	G	A	1186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.619;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=21;PP=807;ReadPosRankSum=1.134;SC=GCTGAAACTGGATAATAAAGA;SOR=0.769;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=136;TCF=84;TCR=52;TR=57;WE=21785798;WS=21785780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,60:0.39:153
chr14	21790040	rs10151259	G	T	1304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.603;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=21;PP=536;ReadPosRankSum=0.482;SC=GATGACAAAAGCTGACAATGA;SOR=0.602;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=128;TCF=76;TCR=52;TR=53;WE=21790048;WS=21790030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,67:0.44:153
chr14	21792811	rs9322965	G	A	2300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.551;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=51;PP=1281;ReadPosRankSum=0.298;SC=GCACCCGACCGTTGTCGTTAT;SOR=0.655;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=221;TCF=115;TCR=106;TR=102;WE=21792819;WS=21792801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,116:0.48:241
chr14	21793236	rs7157052	G	A	1885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=46;PP=1230;ReadPosRankSum=1.771;SC=ATTGGTAAGTGCCGTTGGCTT;SOR=0.695;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=134;TCF=56;TCR=78;TR=79;WE=21793244;WS=21793226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,85:0.56:152
chr14	21813156	rs116014824	A	C	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=213;ReadPosRankSum=0.712;SC=TTCTAGATCCAGGCAAGGAGT;SOR=2.147;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=10;WE=21813164;WS=21813146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr14	21825924	rs3762156	T	C	508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=4;PP=334;SC=TGTGAGCCATTATGCCTGCCC;SOR=1.739;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=15;WE=21825932;WS=21825914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr14	21826718	rs3762157	T	G	1294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=27;PP=766;SC=TGGGCAGGATTTGCAGGTTTG;SOR=1.659;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=43;TCF=16;TCR=27;TR=42;WE=21826726;WS=21826708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr14	21828520	rs927412	T	A	2021.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=21;PP=1216;SC=AGAAGCTGAGTGAAATGAAGT;SOR=1.308;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=41;TCR=21;TR=62;WE=21828528;WS=21828510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr14	21829129	rs3762158	C	G	2941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=41;PP=2011;SC=GTTTTACAATCCCCTAAGCAA;SOR=0.946;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=59;TCR=41;TR=100;WE=21829137;WS=21829119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr14	21829404	rs1543494	T	C	6001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=0.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=113;PP=2965;ReadPosRankSum=-2.269;SC=TATAGACATTTCTTTTTCAGG;SOR=1.012;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=217;TCF=97;TCR=120;TR=209;WE=21829412;WS=21829391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,228:0.99:230
chr14	21830635	rs1983768	C	T	361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=298;SC=TTTTTAATAACGAAGTATCCT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=21830643;WS=21830625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr14	21831052	rs10138699	T	C	4933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=54;PP=2684;SC=CCCGAATATGTGGTTCCTTAG;SOR=1.316;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=156;TCF=102;TCR=54;TR=155;WE=21831060;WS=21831042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr14	21831112	rs10146717	G	A	7037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=123;NR=111;PP=2965;SC=GAGCTCTGGAGTGGGATAAAA;SOR=0.708;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=234;TCF=123;TCR=111;TR=234;WE=21831120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,262:1.00:262
chr14	21831692	rs10139379	T	A	293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=10;PP=260;SC=GAAGACACATTATTTAAAAGA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=21831700;WS=21831682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr14	21833147	rs2295866	G	A	2706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=48;NR=38;PP=1472;SC=AATGTGGAGAGGTGTGAGACA;SOR=0.753;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=48;TCR=38;TR=86;WE=21833155;WS=21833137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr14	21834815	.	C	CTTTT	60	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;FR=0.9998;HP=11;HapScore=2;MGOF=21;MMLQ=20;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=60;QD=34.5;SC=AGTCCACTCACTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=2;WE=21834823;WS=21834805;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,2:0.50:4
chr14	21836400	rs8008670	T	C	802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=1;PP=599;SC=TACACAACTTTCAAACCTCCT;SOR=4.174;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=21836408;WS=21836390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr14	21838160	rs2181125	A	G	1058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=22;PP=668;SC=TTATTTAGCAAACTATCACTG;SOR=2.368;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=30;WE=21838168;WS=21838150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr14	21838781	rs4982445	C	T	427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=12;PP=316;SC=CTACTTTTTACTTTTAAAGAG;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=21838789;WS=21838771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr14	21840910	rs78373622	C	T	627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.511;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=25;PP=475;ReadPosRankSum=0.904;SC=TTGTTTAACTCACTGTTACTT;SOR=1.552;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=68;TCF=15;TCR=53;TR=30;WE=21840918;WS=21840900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,31:0.39:79
chr14	21859079	rs35057134	GA	G	2937.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.151;NF=18;NR=32;PP=1841;ReadPosRankSum=0.610;SC=TGTGGGAATAGAGTGGTAATG;SOR=0.659;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=118;TCF=46;TCR=72;TR=50;WE=21859087;WS=21859069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,89:0.43:205
chr14	21859536	rs3762159	T	C	1609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=36;NR=10;PP=940;SC=GAAACGATGATACAGTATGTC;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=36;TCR=10;TR=46;WE=21859544;WS=21859526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr14	21859646	.	A	G	2593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=0.000;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=51;PP=1532;ReadPosRankSum=-0.128;SC=GATCAACAGCAAACTCTGGAT;SOR=0.685;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=235;TCF=133;TCR=102;TR=115;WE=21859654;WS=21859636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,132:0.49:271
chr14	21860360	rs1998332	G	A	8370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=152;NR=131;PP=2965;SC=CCAAGTTAGGGTAAAACTCCC;SOR=0.737;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=283;TCF=152;TCR=131;TR=283;WE=21860368;WS=21860350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,321:1.00:321
chr14	21861211	rs7152833	C	A	482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=1;PP=434;SC=CCCGGATATACTGTTACACTG;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=21861219;WS=21861201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	21864124	rs10134108	C	A	719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=17;PP=441;SC=AGGATGAAGACCTAGCCACAC;SOR=1.781;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=25;WE=21864132;WS=21864114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr14	21869705	rs113076568	C	CT	802.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5739;FS=0.000;HP=10;HapScore=3;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=22;PP=222;ReadPosRankSum=-0.780;SC=GTAAAGCTGACTTTTTTTTTT;SOR=0.826;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=23;WE=21869713;WS=21869695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,35:0.95:37
chr14	21871653	rs8022395	C	T	5807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=110;NR=80;PP=2965;SC=CTAGGCAGCGCACCATCTGAG;SOR=1.001;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=190;TCF=110;TCR=80;TR=190;WE=21871661;WS=21871643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr14	21874068	rs7155123	G	C	2125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=51;PP=1572;SC=AAACATGAAGGACTTCTGGGG;SOR=2.551;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=13;TCR=51;TR=64;WE=21874076;WS=21874058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr14	21883665	rs34695967	A	AAAAT	264.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=251;ReadPosRankSum=1.760;SC=CTCTATTTCAAAAATAAATAA;SOR=0.301;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=7;WE=21883673;WS=21883655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr14	21899631	rs10467770	C	T	1695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=31;PP=929;ReadPosRankSum=-2.047;SC=GAATTCCCCACATCACCACCT;SOR=0.697;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=156;TCF=87;TCR=69;TR=69;WE=21899639;WS=21899621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,83:0.46:182
chr14	21928338	rs1045812	C	T	3608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=373;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.188;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=75;PP=2101;ReadPosRankSum=0.140;SC=AATGAAATTCCGAGGCAGAGG;SOR=0.739;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=346;TCF=175;TCR=171;TR=160;WE=21928346;WS=21928328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:198,175:0.47:373
chr14	21928383	rs1045811	T	C	3116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.471;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=75;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.894;SC=ATCTAGGTAATTGCAAGTGTT;SOR=0.847;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=283;TCF=123;TCR=160;TR=131;WE=21928406;WS=21928373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,149:0.48:311
chr14	21928397	rs28927672	AT	GC	4946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=62;PP=2944;ReadPosRankSum=-1.154;SC=AAGTGTTCAAATAGAATGTCT;SOR=0.713;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=241;TCF=97;TCR=144;TR=107;WE=21928406;WS=21928373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,130:0.49:266
chr14	21928485	rs61973205	A	G	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=3.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=289;ReadPosRankSum=0.120;SC=GGTGGCTCACACCTGTAATCC;SOR=0.756;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=15;WE=21928493;WS=21928475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr14	21930381	rs56719531	T	G	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.388;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=9;PP=574;ReadPosRankSum=-0.110;SC=AAAAAAAAAGTGTTGAATTGG;SOR=1.286;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=61;TCF=41;TCR=20;TR=30;WE=21930389;WS=21930371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,22:0.51:43
chr14	21930596	rs10143000	G	A	1527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.344;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=42;PP=874;ReadPosRankSum=0.740;SC=GACATAAATCGTATCATCAGT;SOR=0.448;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=122;TCF=39;TCR=83;TR=66;WE=21930604;WS=21930586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,72:0.54:133
chr14	21931955	rs11848193	T	A	581.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=25;PP=496;ReadPosRankSum=0.313;SC=GGAGAAAATTTAAAAAAAAGA;SOR=0.593;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=84;TCF=26;TCR=58;TR=37;WE=21931963;WS=21931945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,33:0.41:81
chr14	21945058	rs185616664	C	G	1047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=29;PP=651;ReadPosRankSum=1.920;SC=GGTTCCGGGTCCGCCCGACTT;SOR=0.696;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=52;TCR=64;TR=53;WE=21945066;WS=21945048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,55:0.46:119
chr14	21945415	rs2282046	A	G	1307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.585;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=29;PP=905;ReadPosRankSum=-0.457;SC=AGGGTCTGAGACGGTGGGAGC;SOR=0.792;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=157;TCF=89;TCR=68;TR=68;WE=21945423;WS=21945405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,69:0.42:164
chr14	21945629	rs12878084	C	T	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.377;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=8;PP=244;ReadPosRankSum=-1.115;SC=CCTAACTTATCCCCGCGACTT;SOR=0.596;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=30;TCF=17;TCR=13;TR=17;WE=21945637;WS=21945619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr14	21950836	rs6571850	T	G	3219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=76;PP=2268;SC=AATATTTGCTTCAGTTTTAGT;SOR=1.382;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=43;TCR=76;TR=119;WE=21950844;WS=21950826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr14	21955930	rs1061031	G	A	345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=8;PP=207;SC=TCTATTCCCTGCTACACTTGG;SOR=1.609;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=12;WE=21955938;WS=21955920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	21956594	rs372957889	ATTTT	A	320.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.297;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=238;ReadPosRankSum=-0.392;SC=TAAAAAGCTTATTTTTTTATT;SOR=2.546;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=12;WE=21956605;WS=21956584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,11:0.31:36
chr14	21956695	rs3215876	GA	G	2496.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.230;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.223;NF=30;NR=36;PP=2055;ReadPosRankSum=-0.029;SC=ATTTAGGGGGGAAAAGTGGTT;SOR=1.180;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=157;TCF=59;TCR=98;TR=66;WE=21956711;WS=21956685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,101:0.40:250
chr14	21957159	rs12880071	T	C	764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=9;PP=597;ReadPosRankSum=-0.524;SC=ATTTCCAGTTTATAATTCTCC;SOR=0.700;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=45;TCF=29;TCR=16;TR=26;WE=21957167;WS=21957151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,27:0.59:46
chr14	21960408	rs3737050	A	G	829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=2;PP=717;SC=GTCTTTCCTAAGAGTATGGGG;SOR=5.136;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=28;WE=21960416;WS=21960398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr14	21960816	rs1060722	T	C	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.445;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=296;ReadPosRankSum=1.028;SC=ACTCCACCCTTTCATCCTATG;SOR=1.085;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=15;WE=21960824;WS=21960806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr14	21960969	rs7617	G	A	2813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.199;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=54;PP=1571;ReadPosRankSum=0.499;SC=TGACCTCCCGGGGGCTCCAAC;SOR=0.529;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=251;TCF=144;TCR=107;TR=118;WE=21960977;WS=21960959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,137:0.48:288
chr14	21967109	rs1061026	T	G	2142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.065;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=34;PP=1491;ReadPosRankSum=-0.869;SC=TCTACTAAGTTCTGTCCTTAA;SOR=0.917;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=208;TCF=133;TCR=75;TR=93;WE=21967117;WS=21967099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,100:0.44:227
chr14	21967916	rs1139130	A	G	3759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=425;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.522;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=92;PP=2208;ReadPosRankSum=0.227;SC=ACCCCCAGAGATTTAGACATT;SOR=0.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=389;TCF=188;TCR=201;TR=177;WE=21967924;WS=21967906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:232,193:0.45:425
chr14	21968876	rs3752411	G	A	2052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.570;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=54;PP=1437;ReadPosRankSum=0.284;SC=TGAGATTCATGGCCCGAGTCC;SOR=0.605;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=163;TCF=64;TCR=99;TR=89;WE=21968884;WS=21968866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,93:0.52:178
chr14	21971246	rs17106830	G	A	1646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=18;PP=1017;ReadPosRankSum=0.199;SC=CCTTGCCCTAGGGGTAAATCC;SOR=0.734;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=116;TCF=82;TCR=34;TR=63;WE=21971254;WS=21971236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,70:0.55:128
chr14	21971729	rs2242526	C	G	2180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.888;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=49;PP=1420;ReadPosRankSum=1.047;SC=GGCTAGAGAACGAGGGGAGGT;SOR=0.891;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=157;TCF=74;TCR=83;TR=88;WE=21971737;WS=21971719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,97:0.55:176
chr14	21991626	rs1263810	C	G	4504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=76;PP=2578;SC=GGGAAACTCCCTGCCCCGGAG;SOR=0.829;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=151;TCF=75;TCR=76;TR=151;WE=21991634;WS=21991616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr14	21993498	rs1263811	G	A	1634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.002;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=29;PP=1063;ReadPosRankSum=-0.206;SC=AAATGCCCTGGAGACTCCTCT;SOR=0.790;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=140;TCF=77;TCR=63;TR=69;WE=21993506;WS=21993488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,75:0.48:155
chr14	22037876	rs80231832	C	T	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=329;ReadPosRankSum=1.686;SC=GTTACCGAAGCCTAAACATTA;SOR=0.600;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=19;WE=22037884;WS=22037866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,20:0.54:37
chr14	22037905	rs8009501	G	A	2156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=23;PP=1385;SC=TCTAATTGTGGCAGCTTCCCT;SOR=1.580;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=47;TCR=23;TR=70;WE=22037913;WS=22037895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr14	22038162	rs17197261	A	C	1646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.927;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=31;PP=925;ReadPosRankSum=-2.540;SC=AAGTTGAAAAAGCCCGGCGCC;SOR=0.548;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=146;TCF=80;TCR=66;TR=68;WE=22038170;WS=22038152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,78:0.47:165
chr14	22038450	rs11626669	G	A	4994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=81;PP=2890;SC=CAAGCAAGGCGCTCAGCTTAG;SOR=0.770;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=171;TCF=90;TCR=81;TR=171;WE=22038458;WS=22038440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr14	22038659	rs17792778	T	C	7207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=118;NR=108;PP=2965;SC=GAGGAGATGCTCATATCAATG;SOR=0.724;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=226;TCF=118;TCR=108;TR=226;WE=22038667;WS=22038649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr14	22038915	rs4982462	A	G	3845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=77;PP=2321;SC=CAAAACAAGAATTAACATAGA;SOR=1.253;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=129;TCF=52;TCR=77;TR=129;WE=22038923;WS=22038905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr14	22133648	rs2874103	G	A	3240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=360;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.053;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=80;PP=2004;ReadPosRankSum=1.584;SC=GCTGATCATTGTGGCGTATGA;SOR=0.515;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=318;TCF=146;TCR=172;TR=152;WE=22133656;WS=22133638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:192,164:0.46:356
chr14	22133997	rs970382	A	G	1815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.339;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=39;PP=1148;ReadPosRankSum=3.295;SC=GAAGGGCGCCAGAAAGCCCTG;SOR=0.415;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=159;TCF=75;TCR=84;TR=81;WE=22134005;WS=22133987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,88:0.50:177
chr14	22167296	rs6572018	G	C	6890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=113;NR=121;PP=2965;SC=TTGGAGGCACGAACAAGATAT;SOR=0.856;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=234;TCF=113;TCR=121;TR=234;WE=22167304;WS=22167286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr14	22192106	rs926027	A	G	1137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=12;PP=782;SC=GACCCCCCCAATCCCGCCCGC;SOR=1.845;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=28;TCR=12;TR=40;WE=22192114;WS=22192096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr14	22204568	rs2049788	G	A	2157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.820;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=46;PP=1263;ReadPosRankSum=0.187;SC=GAAGAGGAATGGGATCTGGGC;SOR=0.560;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=163;TCF=77;TCR=86;TR=91;WE=22204576;WS=22204558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,103:0.56:185
chr14	22217356	rs2075477	G	A	1233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.795;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=12;PP=713;ReadPosRankSum=-0.401;SC=TAGGCTGACGGCAGAAGCAGA;SOR=0.321;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=67;TCF=51;TCR=16;TR=45;WE=22217364;WS=22217346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,54:0.70:77
chr14	22218051	rs2075478	C	T	599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.223;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=24;PP=526;ReadPosRankSum=-0.894;SC=TAAAGCCACACTCTATTTCCT;SOR=2.683;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=53;TCF=7;TCR=46;TR=25;WE=22218059;WS=22218041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,24:0.43:56
chr14	22236756	.	G	GCTGCAGACCACAACTC	1749.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.120;ClippingRankSum=0.000;DP=154;ExcessHet=3.0103;FS=1.374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQRankSum=1.436;QD=11.82;ReadPosRankSum=-0.014;SOR=0.643;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,49:0.33:148
chr14	22237127	rs760008	C	T	4905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=91;NR=68;PP=2855;SC=CAAACTATTCCCCAGCATACT;SOR=0.849;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=159;TCF=91;TCR=68;TR=159;WE=22237135;WS=22237117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr14	22279809	rs2856411	A	C	2144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.483;HP=1;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=40;PP=2962;ReadPosRankSum=0.194;SC=GGGTACAGCTAAGATCACGTC;SOR=0.655;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=210;TCF=120;TCR=90;TR=90;WE=22279825;WS=22279799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,105:0.45:231
chr14	22279817	rs7156201	G	A	2706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.465;HP=1;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=48;PP=2962;ReadPosRankSum=1.402;SC=CTAAGATCACGTCTAAGGTAA;SOR=0.727;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=221;TCF=129;TCR=92;TR=118;WE=22279825;WS=22279799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,127:0.51:247
chr14	22293510	rs2178782	T	C	1670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=10;PP=1092;SC=TTTGCATTCGTCCCGCCTGCA;SOR=2.342;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=40;TCR=10;TR=50;WE=22293518;WS=22293500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr14	22293554	rs35339724	G	GC	4798.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=33;NR=32;PP=2957;SC=ACATAGCGAAGCTGGTCTCTG;SOR=1.353;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=66;TCF=34;TCR=32;TR=65;WE=22293562;WS=22293544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr14	22309386	rs35372754	A	C	723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.217;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=5;PP=495;ReadPosRankSum=-0.578;SC=TTTTGGATTGAAAATTTTAAT;SOR=0.510;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=54;TCF=44;TCR=10;TR=29;WE=22309394;WS=22309376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,31:0.53:58
chr14	22314877	rs9635202	T	C	611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.811;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=2;PP=446;ReadPosRankSum=0.199;SC=TCCTAGCTCCTGAGGCTCAGG;SOR=1.542;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=43;TCF=37;TCR=6;TR=22;WE=22314885;WS=22314867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,24:0.51:47
chr14	22314985	rs34825426	T	C	2412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.028;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=47;PP=1482;ReadPosRankSum=0.417;SC=TGATTTTTACTCTGGGTGAGT;SOR=0.800;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=204;TCF=110;TCR=94;TR=104;WE=22314993;WS=22314975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,115:0.51:224
chr14	22315212	rs2075488	A	G	3806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=438;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=85;PP=2343;ReadPosRankSum=0.690;SC=CTTATTCACCATCTCTCTTCT;SOR=0.698;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=394;TCF=199;TCR=195;TR=175;WE=22315220;WS=22315202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:246,192:0.44:438
chr14	22315296	rs33959352	C	T	3267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-1.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.417;NF=71;NR=85;PP=2259;ReadPosRankSum=0.962;SC=TGGTTAAAGGCATCAACGGTT;SOR=0.699;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=309;TCF=139;TCR=170;TR=156;WE=22315304;WS=22315286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,155:0.49:316
chr14	22320728	rs2017224	T	C	684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=391;ReadPosRankSum=0.439;SC=GTTTCCCTTGTTCAGCCATGC;SOR=0.543;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=63;TCF=53;TCR=10;TR=27;WE=22320736;WS=22320718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,31:0.43:72
chr14	22321124	rs2017263	T	C	1587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.557;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=33;PP=1068;ReadPosRankSum=-0.421;SC=CTTCCTTCAATCTGAGGAAAC;SOR=0.769;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=157;TCF=93;TCR=64;TR=76;WE=22321132;WS=22321114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,81:0.46:176
chr14	22321261	rs2017432	C	T	1191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=2.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.53;ReadPosRankSum=0.389;SOR=1.027;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,34:0.41:82
chr14	22321269	rs2072609	T	C	1147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.40;ReadPosRankSum=0.098;SOR=0.838;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,30:0.43:70
chr14	22322168	rs760003	A	G	873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=4;PP=668;ReadPosRankSum=-0.572;SC=CATGGTAGAGAGTCACTGGAC;SOR=0.547;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=42;TCR=6;TR=31;WE=22322176;WS=22322158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,33:0.65:51
chr14	22322369	rs11626323	T	C	1502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.194;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=34;PP=926;ReadPosRankSum=1.263;SC=GTAGGAACCCTCAAATATAGA;SOR=0.933;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=124;TCF=57;TCR=67;TR=61;WE=22322377;WS=22322359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,70:0.51:136
chr14	22322411	rs11629404	G	C	915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.752;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=21;PP=574;ReadPosRankSum=0.608;SC=AATGGTACACGTTAGCCAAAT;SOR=0.511;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=84;TCF=32;TCR=52;TR=37;WE=22322419;WS=22322401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,42:0.45:93
chr14	22322523	rs11629446	G	A	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-4.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.503;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=293;ReadPosRankSum=-1.341;SC=GAAGGTAAATGGAACATTATA;SOR=0.330;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=17;WE=22322531;WS=22322513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,19:0.45:42
chr14	22322563	rs11620886	C	T	1290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-2.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.029;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=10;PP=761;ReadPosRankSum=0.860;SC=GATATGTACTCGTGTAATGTC;SOR=0.416;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=90;TCF=72;TCR=18;TR=43;WE=22322571;WS=22322553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,53:0.50:106
chr14	22322690	rs12878216	G	A	4037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=469;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=97;PP=2431;ReadPosRankSum=-0.267;SC=TGCCCACAGGGACTGTGATGG;SOR=0.658;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=426;TCF=194;TCR=232;TR=185;WE=22322698;WS=22322680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:264,204:0.44:468
chr14	22322794	rs12879611	C	T	1145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=34;PP=756;ReadPosRankSum=2.478;SC=ATATAGAAGTCGAATAGTCCA;SOR=0.741;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=87;TCF=27;TCR=60;TR=48;WE=22322802;WS=22322784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,52:0.53:99
chr14	22322856	rs12884453	T	C	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.468;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=218;ReadPosRankSum=-0.367;SC=CCTTGCCTCTTCCGTGAATGT;SOR=2.303;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=11;WE=22322864;WS=22322846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr14	22337119	rs909075	G	C	2318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=41;PP=1490;SC=GGGTAACAGAGTATATTAGTG;SOR=1.193;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=31;TCR=41;TR=72;WE=22337127;WS=22337109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr14	22337181	rs909076	C	T	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.229;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=10;PP=400;ReadPosRankSum=-1.117;SC=GGTTTCCTCTCGTTACTATGA;SOR=0.916;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=45;TCF=23;TCR=22;TR=25;WE=22337189;WS=22337171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,28:0.60:47
chr14	22337393	rs876093	G	A	8667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=142;NR=140;PP=2965;SC=ACTTGGAAAAGGACCTCAGCT;SOR=0.713;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=282;TCF=142;TCR=140;TR=282;WE=22337401;WS=22337383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,311:1.00:311
chr14	22356081	rs12885687	T	C	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.579;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=62;ReadPosRankSum=0.328;SC=ATATCCATTCTAGGTGCATTT;SOR=0.223;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=4;WE=22356089;WS=22356071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr14	22356225	rs17197550	G	T	1109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.712;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=21;PP=642;ReadPosRankSum=-0.376;SC=GGAAAATAATGTACAGTATCT;SOR=0.800;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=98;TCF=56;TCR=42;TR=49;WE=22356233;WS=22356215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,56:0.51:109
chr14	22356551	rs10483261	T	C	3802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=338;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=77;PP=2381;ReadPosRankSum=-0.945;SC=TTGATAATGTTCATATACTCC;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=304;TCF=157;TCR=147;TR=158;WE=22356574;WS=22356541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,176:0.52:336
chr14	22362971	rs2075481	A	G	2686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.431;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=54;PP=1601;ReadPosRankSum=0.905;SC=CTGTCTCTGAAGGAGCCCTGG;SOR=0.648;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=257;TCF=140;TCR=117;TR=115;WE=22362979;WS=22362961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,132:0.46:287
chr14	22363080	rs12895616	T	A	7521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FS=3.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.98;MQRankSum=0.273;QD=22.12;ReadPosRankSum=2.094;SOR=0.522;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:149,191:0.56:340
chr14	22363084	rs12890675	C	G	7477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=343;ExcessHet=3.0103;FS=4.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.66;MQRankSum=0.456;QD=21.80;ReadPosRankSum=2.076;SOR=0.562;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:150,193:0.56:343
chr14	22392250	rs17182937	C	T	1022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=7;PP=706;SC=CCAGGTTCACCTCACAGTACA;SOR=2.584;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=31;WE=22392258;WS=22392240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr14	22392283	rs28501628	G	A	2354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=29;PP=1412;SC=TAAAGAAGAAGATTTTTTTTT;SOR=1.192;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=47;TCR=29;TR=76;WE=22392292;WS=22392273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr14	22392304	rs34365759	G	A	3269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=40;PP=2075;SC=ATCTAGAAAAGGAACCAAACA;SOR=1.247;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=68;TCR=40;TR=108;WE=22392312;WS=22392294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr14	22392366	rs12437316	C	T	4543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=68;PP=2536;SC=TGGCTAGGTACGGGTGGCCCA;SOR=0.729;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=150;TCF=82;TCR=68;TR=150;WE=22392374;WS=22392356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr14	22392499	rs12435124	T	C	4021.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=60;PP=2575;SC=TATCCTTAAATCTTCAAATTC;SOR=0.869;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=136;TCF=75;TCR=61;TR=135;WE=22392507;WS=22392489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr14	22392626	rs10140810	A	C	5839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=101;NR=92;PP=2965;SC=ACCAGTGATCAAAGTTATGGT;SOR=0.752;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=193;TCF=101;TCR=92;TR=193;WE=22392634;WS=22392616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr14	22392703	rs8021861	G	C	8552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=149;NR=130;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.158;SC=GTCTTATGACGAGCAAAATGC;SOR=0.268;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=281;TCF=150;TCR=131;TR=279;WE=22392711;WS=22392693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,308:1.00:309
chr14	22392807	rs8008040	T	C	6348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=122;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.730;SC=CAGCAATGTATTTCTGTGCAA;SOR=0.382;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=218;TCF=95;TCR=123;TR=217;WE=22392815;WS=22392797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,232:1.00:233
chr14	22409517	.	ATCTCTC	A	239	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MMLQ=15;MQ=58.58;NF=2;NR=4;PP=239;QD=40.6666666667;SC=GGCTAAACAGATCTCTCTCTC;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=6;WE=22409530;WS=22409507;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,6:0.60:10
chr14	22409571	rs2178779	A	G	963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=30;NR=11;PP=722;SC=AACCCGTGGAAATTCAGTGAC;SOR=1.675;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=30;TCR=11;TR=41;WE=22409579;WS=22409561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr14	22446888	rs2075483	C	T	2289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=16;PP=1436;SC=CCGCCCAGCTCAAGGTCCTGC;SOR=2.162;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=55;TCR=16;TR=71;WE=22446896;WS=22446878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr14	22447248	rs2075484	A	G	17053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=381;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.88;SOR=0.758;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,380:1.00:380
chr14	22447251	rs2075485	G	A	17077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=382;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.82;SOR=0.741;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,381:1.00:381
chr14	22470693	rs5807105	T	TA	6439.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=49;PP=2957;SC=TATGATGTGATAGGACAGAAA;SOR=1.146;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=42;TCR=53;TR=88;WE=22470701;WS=22470683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr14	22470913	rs34215246	CT	C	1308.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=34;PP=769;SC=CTCACATTTTCTTTTTTTTTA;SOR=2.078;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=35;WE=22470922;WS=22470903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr14	22471333	rs3811327	C	T	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=282;ReadPosRankSum=-0.028;SC=CTCTGCTTAACACGTGAGTCA;SOR=0.638;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=18;WE=22471341;WS=22471323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,19:0.68:28
chr14	22509188	rs4982545	T	C	1950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=20;PP=1194;SC=GTAGCAGTCTTAACTGCAGTT;SOR=1.296;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=42;TCR=20;TR=62;WE=22509196;WS=22509178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr14	22520684	rs2072611	A	G	1560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.59;SOR=1.885;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr14	22520692	rs2072612	G	T	1837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.95;SOR=1.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr14	22521012	rs2072613	C	G	4672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=65;PP=2664;ReadPosRankSum=-0.635;SC=GTCTATTGCTCTTTTTCTGAA;SOR=0.297;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=151;TCF=86;TCR=65;TR=150;WE=22521020;WS=22521002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,170:0.99:171
chr14	22521051	rs2072614	G	A	4556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=67;PP=2557;ReadPosRankSum=-0.831;SC=AGGAGGTGACGCAGATTCCTG;SOR=0.803;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=153;TCF=85;TCR=68;TR=151;WE=22521059;WS=22521041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,171:0.99:173
chr14	22533887	rs3811312	C	T	2107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=16;PP=1373;SC=AAGAGGTGTCCTTTCTGACTG;SOR=1.949;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=53;TCR=16;TR=69;WE=22533895;WS=22533877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr14	22534497	rs3811306	T	G	5019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=64;PP=2682;SC=GAGGCTGAATTTAAGAAGAAT;SOR=0.904;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=94;TCR=64;TR=158;WE=22534505;WS=22534487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr14	22539108	rs2272547	C	T	4890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.67;SOR=1.262;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr14	22539116	rs2272548	G	A	5011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.47;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr14	22564821	rs61730868	C	T	4226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=414;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.429;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=83;PP=2602;ReadPosRankSum=-1.205;SC=AAGAAAGCAGCGAAATCCGTC;SOR=0.864;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=380;TCF=205;TCR=175;TR=187;WE=22564829;WS=22564811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:211,203:0.49:414
chr14	22565073	rs12897143	G	A	5812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=84;NR=115;PP=2965;SC=GGATCAGATGGTTTAATTCCA;SOR=1.142;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=199;TCF=84;TCR=115;TR=199;WE=22565081;WS=22565063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr14	22573582	rs2075498	A	C	5445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=106;NR=76;PP=2965;SC=ATTTTGGCTGAAAAACGTTTT;SOR=0.960;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=182;TCF=106;TCR=76;TR=182;WE=22573590;WS=22573572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr14	22580570	rs1040301	C	G	1782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=28;PP=1288;SC=ATGGATAAAGCTTGAGGGAGA;SOR=0.871;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=29;TCR=28;TR=57;WE=22580578;WS=22580560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr14	22580762	rs11628824	G	A	9346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=145;NR=156;PP=2965;SC=AAGAAGGAGAGGACTTCACCA;SOR=0.817;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=301;TCF=145;TCR=156;TR=301;WE=22580770;WS=22580752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,340:1.00:340
chr14	22591821	rs8018887	T	C	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.643;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=253;ReadPosRankSum=0.602;SC=GTCTTTATAATTAACAGCAAT;SOR=1.938;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=13;WE=22591829;WS=22591811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr14	22591988	rs2272550	C	A	6483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=119;NR=104;PP=2965;SC=CACCCAGCCCCCCTCCATGGA;SOR=0.769;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=223;TCF=119;TCR=104;TR=223;WE=22591996;WS=22591978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr14	22600490	rs8014493	C	T	2200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.197;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=34;PP=1298;ReadPosRankSum=-1.946;SC=TAGAATAGAGCTCTCAGCTTC;SOR=0.815;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=158;TCF=95;TCR=63;TR=91;WE=22600498;WS=22600480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,101:0.57:177
chr14	22600863	rs3811291	G	A	2484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.756;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=45;PP=1476;ReadPosRankSum=-0.156;SC=AGACCTAACAGAGGCCACCCA;SOR=0.780;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=220;TCF=115;TCR=105;TR=100;WE=22600871;WS=22600853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,117:0.46:252
chr14	22616440	rs184648604	C	T	2334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.638;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=51;PP=1437;ReadPosRankSum=1.751;SC=TGGGGAAGGTCCTGTCCTCCT;SOR=0.681;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=196;TCF=104;TCR=92;TR=103;WE=22616458;WS=22616430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,111:0.51:219
chr14	22670643	rs2075495	G	A	1008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-2.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=28;PP=641;ReadPosRankSum=0.747;SC=TGTGTTTCTTGAGGGTGTCTG;SOR=0.662;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=76;TCF=19;TCR=57;TR=38;WE=22670651;WS=22670633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,44:0.47:93
chr14	22690209	rs2272551	A	C	1392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.049;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=26;PP=746;ReadPosRankSum=0.188;SC=ACAAGCAGGAACCTGGGGAAG;SOR=0.566;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=120;TCF=71;TCR=49;TR=59;WE=22690217;WS=22690199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,68:0.49:138
chr14	22694777	rs2242544	A	G	1493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.108;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=28;PP=849;ReadPosRankSum=0.173;SC=AGAACACTAAAAGGGTAAAGT;SOR=0.926;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=124;TCF=59;TCR=65;TR=52;WE=22694785;WS=22694767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,65:0.45:146
chr14	22694926	rs2075496	C	T	1789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.821;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=31;PP=1035;ReadPosRankSum=1.529;SC=AGGGAGACACCGTAACTCTCA;SOR=0.844;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=156;TCF=87;TCR=69;TR=74;WE=22694934;WS=22694916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,85:0.47:182
chr14	22695084	rs4982579	C	T	2497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=59;PP=1515;ReadPosRankSum=2.578;SC=AAAGAACTTTCCAGCATCCTG;SOR=0.717;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=240;TCF=116;TCR=124;TR=114;WE=22695092;WS=22695074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,125:0.46:270
chr14	22695128	rs12889091	A	G	1534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.498;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=47;PP=1039;ReadPosRankSum=-2.319;SC=AGACTCGGCCATCTACCTCTG;SOR=1.365;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=159;TCF=71;TCR=88;TR=73;WE=22695136;WS=22695118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,76:0.44:173
chr14	22733490	rs7147374	A	G	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.679;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=84;ReadPosRankSum=-0.405;SC=GGTTTTGATTATCCGTAAAAA;SOR=0.859;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=7;WE=22733498;WS=22733482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr14	22733655	rs7145658	G	C	3091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=2.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.03;ReadPosRankSum=0.137;SOR=0.724;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,81:0.55:147
chr14	22733657	rs7152255	T	C	3091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=2.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.03;ReadPosRankSum=0.172;SOR=0.724;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,81:0.55:147
chr14	22733694	rs7147116	C	G	1230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.662;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=27;PP=660;ReadPosRankSum=0.647;SC=GTGAGTCAGGCGAGTCATGAG;SOR=0.610;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=54;TCR=59;TR=53;WE=22733702;WS=22733684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,61:0.49:125
chr14	22733758	rs7145836	G	T	875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.927;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=22;PP=510;ReadPosRankSum=-0.220;SC=GAAAGATCCCGGGGACAATCT;SOR=1.121;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=103;TCF=51;TCR=52;TR=38;WE=22733766;WS=22733748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,45:0.39:115
chr14	22733893	rs12589879	C	T	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.637;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=61;ReadPosRankSum=-1.224;SC=ACAGAATGCTCCTTCCCTGAA;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=5;WE=22733901;WS=22733883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr14	22772123	rs2009858	C	T	2298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=46;PP=1434;ReadPosRankSum=-1.673;SC=CAGTGAATGCCTCCTTCTGAA;SOR=0.715;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=217;TCF=111;TCR=106;TR=94;WE=22772131;WS=22772113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,106:0.45:237
chr14	22783165	rs118099595	C	T	2728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.761;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=47;PP=1666;ReadPosRankSum=-0.488;SC=ACATACACATCCACGGGGTAC;SOR=0.594;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=228;TCF=114;TCR=114;TR=106;WE=22783173;WS=22783155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,122:0.48:253
chr14	22887529	.	C	T	2916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-2.098;ClippingRankSum=0.000;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.858;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=57;PP=1681;ReadPosRankSum=0.610;SC=CTCTTCCATTCTGTTCCCAAA;SOR=0.747;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=277;TCF=145;TCR=132;TR=122;WE=22887537;WS=22887519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,142:0.46:311
chr14	22947814	rs227858	G	A	2961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.57;SOR=1.581;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr14	22947814	.	GTGATG	ATGATC,ATGATG	831	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=23,51;NR=10,24;PP=413,831;QD=14.1353901473;SC=CTCCCAGCCCGTGATGGAAGG;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=75;TCF=51;TCR=24;TR=33,75;WE=22947827;WS=22947804;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.44:75
chr14	22947819	rs117922172	G	C	836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.10;ReadPosRankSum=-0.769;SOR=0.544;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,42:0.46:92
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chr14	22952088	rs227861	G	A	2660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=58;PP=1610;ReadPosRankSum=0.566;SC=GGGAAGGGGGGATTCAAACAC;SOR=0.713;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=248;TCF=124;TCR=124;TR=112;WE=22952096;WS=22952078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,129:0.45:288
chr14	22958350	rs3833810	ATGCC	A	508.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.930;NF=13;NR=1;PP=618;ReadPosRankSum=-0.587;SC=GGGAAAGGAGATGCCTGCCTG;SOR=1.085;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=14;WE=22958361;WS=22958340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr14	22962908	rs10483278	G	C	1410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.404;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=24;PP=804;ReadPosRankSum=-2.920;SC=TTGGCCCAGAGTGTGTATTCA;SOR=0.764;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=107;TCF=59;TCR=48;TR=59;WE=22962916;WS=22962898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,65:0.56:116
chr14	22963632	rs11372266	G	GC	461.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=429;SC=TCTGGCCAGAGCCAGCTGCCC;SOR=2.985;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=22963654;WS=22963622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr14	22963646	rs226985	T	C	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=99;ReadPosRankSum=-3.176;SC=GCTGCCCTCATAGGAATTAAT;SOR=0.743;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=7;WE=22963654;WS=22963622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr14	22964840	rs137998884	T	TG	1634.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=13;PP=1186;SC=CCTGCCATGCTGGAGGTGGCT;SOR=1.814;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=32;TCF=18;TCR=14;TR=29;WE=22964848;WS=22964830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr14	22964880	rs226986	A	C	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.749;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=14;PP=362;ReadPosRankSum=-0.323;SC=TTTTTGTTAGAGCATGTATTA;SOR=0.818;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=105;TCF=62;TCR=43;TR=35;WE=22964888;WS=22964870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,37:0.32:117
chr14	22965118	rs11334443	TC	T	599.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=12;PP=581;SC=GTTGATGAATTCCTGGCAATC;SOR=1.739;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=22965126;WS=22965108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr14	22965144	rs11334442	AC	A	488.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=9;PP=446;SC=GATTAGGTCAACGAAGAAGTA;SOR=1.609;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=22965152;WS=22965134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	22966625	rs2331621	A	G	3086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.340;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=64;PP=1907;ReadPosRankSum=-0.862;SC=TTTTTTGTTTAGGGAGAACGC;SOR=0.783;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=282;TCF=143;TCR=139;TR=128;WE=22966633;WS=22966604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,144:0.46:314
chr14	22968854	rs226987	T	C	2664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.021;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=63;PP=1718;ReadPosRankSum=-0.424;SC=ATCACTGCTATCTGAAGCGGC;SOR=0.623;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=206;TCF=86;TCR=120;TR=111;WE=22968862;WS=22968844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,122:0.52:234
chr14	22972622	rs226990	A	G	1767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=43;NR=6;PP=1277;SC=CAGCCCGATTAAAAGTTTTCA;SOR=3.139;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=43;TCR=6;TR=49;WE=22972630;WS=22972612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr14	22972783	rs5807141	AC	A	12330.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=154;PP=2951;SC=GGACAACTTTACCAAGTAAAA;SOR=0.904;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=173;TCF=18;TCR=155;TR=171;WE=22972791;WS=22972773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,332:1.00:332
chr14	22974068	rs78140189	T	C	2502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FS=1.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQRankSum=-1.440;QD=10.05;ReadPosRankSum=-1.226;SOR=0.579;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:122,127:0.51:249
chr14	22974150	rs11324184	TC	T	8626.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=115;PP=2966;SC=TCACCGTTATTCCCCTGTAAG;SOR=0.890;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=138;TCF=15;TCR=123;TR=130;WE=22974158;WS=22974140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr14	22975476	rs3751470	A	G	1243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=1;PP=971;SC=TCAGGAAGGAAGGGCTGACAC;SOR=3.912;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=35;TCR=1;TR=36;WE=22975484;WS=22975466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr14	22976790	rs170543	C	T	463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=14;PP=364;SC=AGTTTTGCTCCTTGTTGCGCA;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=22976798;WS=22976780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	22978335	rs226997	C	T	3053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=58;NR=44;PP=1562;SC=TGAATTATGGCGGTGCTACAA;SOR=0.838;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=58;TCR=44;TR=102;WE=22978343;WS=22978325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr14	22978451	rs11443893	G	GC	4257.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=6;NR=41;PP=2149;SC=GGAAGCGACAGCACCCTTAGG;SOR=0.941;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=49;TCF=6;TCR=43;TR=47;WE=22978459;WS=22978441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr14	22978516	rs226998	G	A	865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.49;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=19;PP=515;SC=CTTATCTGCCGTGATATAGCA;SOR=2.093;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=24;WE=22978524;WS=22978506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr14	22978577	rs226999	A	G	198.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=6;PP=125;SC=TCAGGGGAGGAGAAACATGCT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=22978585;WS=22978567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr14	22982069	rs11444527	A	AG	568.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=376;SC=TCTCCCCTCCAGGCTGGAAAA;SOR=2.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=10;WE=22982077;WS=22982059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr14	22984499	rs227027	C	T	1399.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=3;PP=582;SC=GCCTATTGTCCGGTTGTTACA;SOR=3.407;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=24;WE=22984508;WS=22984489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr14	22984500	rs144430862	G	GGTT	1390.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=3;PP=998;SC=CCTATTGTCCGGTTGTTACAG;SOR=3.477;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=20;WE=22984508;WS=22984489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr14	22984586	rs3764159	A	C	1389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.623;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.245;NF=47;NR=18;PP=912;ReadPosRankSum=1.180;SC=TTTTGCAAAGAAAGGAAACTC;SOR=1.048;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=163;TCF=108;TCR=55;TR=65;WE=22984594;WS=22984576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,71:0.40:179
chr14	22985358	rs3764160	T	C	2698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.083;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=67;PP=1773;ReadPosRankSum=-0.261;SC=ATCAATCAAATCATTAGTTTG;SOR=0.847;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=241;TCF=105;TCR=136;TR=117;WE=22985366;WS=22985348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,130:0.49:263
chr14	22985463	rs227029	G	A	1534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=38;PP=1130;SC=CTTTAAAATGGGATATGAGTG;SOR=2.925;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=9;TCR=38;TR=47;WE=22985471;WS=22985453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr14	22985487	rs11453171	A	AC	879.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=21;PP=935;SC=GTATGCACACAGCATGCCCAC;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=21;WE=22985495;WS=22985477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr14	22988022	rs227009	C	G	936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=21;PP=663;SC=GAGGTGTGGACGGGAAGAAAC;SOR=1.542;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=11;TCR=21;TR=32;WE=22988030;WS=22988012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr14	22988748	rs227010	G	A	616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=1;PP=448;SC=CTTGCCGCCCGGGAGGTGCAG;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=22988756;WS=22988738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr14	22988972	rs1483979	G	C	1014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.578;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=24;PP=652;ReadPosRankSum=0.117;SC=GGGGGAAATTGCAGTTTGGAG;SOR=0.865;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=89;TCF=41;TCR=48;TR=40;WE=22988980;WS=22988962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,47:0.44:106
chr14	22990930	rs11380759	A	AT	4514.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=33;PP=2347;SC=GGCCTAATTCAAAAGGAAGCA;SOR=1.009;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=61;TCF=28;TCR=33;TR=59;WE=22990938;WS=22990920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr14	22993278	rs5807151	A	AG	2760.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=29;NR=22;PP=2151;SC=AGGTTTGTGTAGGCGACCTCG;SOR=1.734;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=55;TCF=33;TCR=22;TR=51;WE=22993286;WS=22993268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr14	22993491	rs227015	A	G	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=264;ReadPosRankSum=-0.088;SC=TAATTTTTCTACCTCACACGT;SOR=0.760;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=43;TCF=6;TCR=37;TR=16;WE=22993499;WS=22993481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,17:0.38:45
chr14	22994806	rs227019	C	T	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.523;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=60;ReadPosRankSum=0.050;SC=CTGGAGGACCCCAGTCCTAGG;SOR=0.061;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=6;WE=22994818;WS=22994796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr14	22994810	rs33919257	T	TC	505.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=492;SC=AGGACCCCAGTCCTAGGTAGA;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=12;WE=22994818;WS=22994796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	22997524	rs227024	A	G	6259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=113;PP=2965;SC=TTGCAAGGGGAACCATGTTAA;SOR=1.134;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=194;TCF=81;TCR=113;TR=194;WE=22997532;WS=22997514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr14	22998590	rs5807161	AG	A	6349.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=81;PP=2970;SC=CCAACCAGGCAGGGAACTGCT;SOR=0.885;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=99;TCF=17;TCR=82;TR=98;WE=22998598;WS=22998580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr14	22998619	rs5807162	AC	A	4693.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=68;PP=2971;SC=TGGGAAGGGAACCCACCTTAT;SOR=1.136;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=81;TCF=10;TCR=71;TR=78;WE=22998627;WS=22998609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr14	22999179	rs11412657	T	TC	3670.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=18;PP=1922;SC=AAAGGGGGAATCCAGCCAGAG;SOR=1.640;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=53;TCF=35;TCR=18;TR=52;WE=22999187;WS=22999169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr14	22999202	rs11412658	A	AG	5498.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=34;PP=2965;SC=CCCATGAGGGAGATAGCTGCA;SOR=1.277;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=70;TCF=33;TCR=37;TR=66;WE=22999210;WS=22999192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr14	23000062	rs227003	T	C	5934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=106;NR=84;PP=2965;SC=ACCTTTGGAATTGGAACAAAG;SOR=0.799;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=190;TCF=106;TCR=84;TR=190;WE=23000070;WS=23000052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr14	23000185	rs227004	C	T	4511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=82;PP=2516;SC=GCCTGCTCTTCTCTGGCTGTT;SOR=1.199;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=141;TCF=59;TCR=82;TR=141;WE=23000193;WS=23000175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr14	23001388	rs227006	T	A	1079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=7;PP=758;SC=CTTTTCCCTATGTAGATCATG;SOR=2.554;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=36;WE=23001396;WS=23001378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr14	23002265	rs11289756	GC	G	879.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=1;PP=975;SC=GGGTCCAATGGCCCTCTTTGG;SOR=5.136;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=25;WE=23002273;WS=23002255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr14	23005041	rs5807163	A	AG	11621.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=87;PP=2957;SC=TGGCAATCCTAGCTATGGCCC;SOR=0.977;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=144;TCF=55;TCR=89;TR=137;WE=23005049;WS=23005031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,309:1.00:309
chr14	23006663	rs11396434	G	GC	2721.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=45;PP=2194;SC=AATGGCCACAGCACCCCCATC;SOR=1.739;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=48;TCF=2;TCR=46;TR=47;WE=23006671;WS=23006653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr14	23018665	rs1263653	C	G	833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.911;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=25;PP=522;ReadPosRankSum=-2.536;SC=ACAGGATTGCCGAAGTGATGA;SOR=1.360;SbPval=0.1;Source=Platypus;TC=103;TCF=53;TCR=50;TR=39;WE=23018673;WS=23018655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,45:0.36:124
chr14	23019427	rs12431397	G	A	1208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.402;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=11;PP=712;ReadPosRankSum=0.176;SC=GGGGAAAACCGTGGGTGTGTC;SOR=1.289;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=82;TCF=57;TCR=25;TR=44;WE=23019435;WS=23019417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,51:0.57:90
chr14	23019657	rs1263658	C	G	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.431;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=330;ReadPosRankSum=0.914;SC=CGGGTCTCTGCGTGCATCCTA;SOR=0.064;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=47;TCF=11;TCR=36;TR=23;WE=23019665;WS=23019647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,26:0.54:48
chr14	23020489	rs371247	T	C	1283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=30;NR=9;PP=728;SC=CACCATCACATCCCTAACAGT;SOR=1.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=39;WE=23020497;WS=23020479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr14	23020688	rs11462449	G	GC	9310.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=81;PP=2957;SC=CCCCGGCAATGCACCAACTGG;SOR=0.717;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=27;TCR=85;TR=107;WE=23020696;WS=23020678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr14	23020820	rs5807168	G	GC	7401.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=48;PP=2957;SC=GGCTGCTGCAGCTCCGCTGGC;SOR=0.768;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=91;TCF=37;TCR=54;TR=80;WE=23020833;WS=23020810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr14	23020825	rs3699	G	C	7501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=52;PP=2489;SC=CTGCAGCTCCGCTGGCTGTGC;SOR=0.777;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=124;TCF=68;TCR=56;TR=120;WE=23020833;WS=23020810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr14	23020919	rs3700	C	T	8395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.14;SOR=0.737;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr14	23020919	.	CGG	TGC	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=84;NR=80;PP=2947;QD=20;SC=CTCTAGGTCCCGGAGAATGTT;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=171;TCF=87;TCR=84;TR=164;WE=23020929;WS=23020909;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:7,164:0.96:171
chr14	23020921	rs3701	G	C	8395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.90;SOR=0.725;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr14	23020970	rs3702	G	T	5475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=103;NR=85;PP=2965;SC=CATAAAGAAAGACATAGTATT;SOR=0.794;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=188;TCF=103;TCR=85;TR=188;WE=23020978;WS=23020960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr14	23021039	rs9125	G	A	5081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=82;NR=92;PP=2797;SC=TATGCTGTGTGTCTGGGCGTG;SOR=0.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=174;TCF=82;TCR=92;TR=174;WE=23021047;WS=23021029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr14	23025758	rs10873025	G	A	122.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.47;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr14	23025932	rs12888861	A	T	1428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=12;PP=813;SC=AGGAATCTGCAGGTCTCAGGG;SOR=1.402;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=36;TCR=12;TR=48;WE=23025940;WS=23025922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr14	23026369	rs33982989	C	CG	778.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=2;PP=713;SC=GGCTGGAGTCCGGATCCACCA;SOR=3.912;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=18;WE=23026377;WS=23026359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr14	23027743	rs4982639	G	C	1917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=45;PP=1323;SC=GCCAGAACACGCCACGTCACT;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=16;TCR=45;TR=61;WE=23027751;WS=23027733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr14	23044002	rs7621	G	T	3005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=33;PP=1925;SC=ATGAGAATGAGTCAGCCAACA;SOR=1.365;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=67;TCR=33;TR=100;WE=23044010;WS=23043992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr14	23058084	rs1051101	A	G	3367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=73;PP=2150;SC=AAGGTACTCCAGTCCGCGCCC;SOR=1.553;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=114;TCF=40;TCR=74;TR=113;WE=23058092;WS=23058074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr14	23235697	rs1957373	C	T	3173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.428;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=56;PP=1872;ReadPosRankSum=-2.958;SC=CTTCAACTTCCTTTCAATCTC;SOR=0.662;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=263;TCF=152;TCR=111;TR=131;WE=23235705;WS=23235687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,146:0.50:290
chr14	23235808	rs1957374	G	A	4485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=357;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.754;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=85;PP=2453;ReadPosRankSum=-0.305;SC=CGCCTGATCTGCGGCTACAAT;SOR=0.581;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=324;TCF=160;TCR=164;TR=180;WE=23235816;WS=23235798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,206:0.58:355
chr14	23236524	rs8572	C	T	1756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.548;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=38;PP=941;ReadPosRankSum=-0.284;SC=CTATTCCCAGCAGCCCCGTGC;SOR=0.631;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=163;TCF=87;TCR=76;TR=81;WE=23236532;WS=23236514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,88:0.49:179
chr14	23239512	rs2075846	A	G	3474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=69;PP=2110;ReadPosRankSum=-0.042;SC=TTCCTTCCTTATTTCATCCAG;SOR=0.705;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=290;TCF=153;TCR=137;TR=148;WE=23239520;WS=23239502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,162:0.51:319
chr14	23239880	rs1957502	G	A	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.716;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=294;ReadPosRankSum=-0.141;SC=GTGAACTGGGGTTGGAGGGTA;SOR=3.383;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=15;WE=23239888;WS=23239870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr14	23242828	rs1061040	T	C	3404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=59;PP=2141;SC=TTTAGTTAGATTTGGGATCCC;SOR=0.981;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=51;TCR=59;TR=110;WE=23242836;WS=23242818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr14	23244454	rs374608281	GGTGTACCATTC	G	422.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.22;ReadPosRankSum=0.428;SOR=0.874;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr14	23244455	.	G	C	577	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;FR=0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=7;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=6;NR=0;PP=577;QD=101.961868758;SC=TAGAGCAGAGGTGTACCATTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=6;WE=23244479;WS=23244448;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,6:0.43:14
chr14	23244456	.	TGTACCATTCCTTAGAG	T	2019	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;FR=0.5000;HP=3;HapScore=4;MGOF=7;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=9;NR=0;PP=2019;QD=228.222222222;SC=AGAGCAGAGGTGTACCATTCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=9;WE=23244479;WS=23244448;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,9:0.53:17
chr14	23244467	rs368022959	TTAGAG	T	423.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.42;ReadPosRankSum=-0.928;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr14	23244929	rs3751485	A	T	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.719;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=92;ReadPosRankSum=0.250;SC=ACAAGAAGAAAGAGGTTGTGG;SOR=0.368;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=7;WE=23244937;WS=23244919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr14	23245301	rs3850290	T	C	924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.904;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=20;PP=636;ReadPosRankSum=-1.437;SC=CTAAATGAACTCCTTTCAAGG;SOR=0.913;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=68;TCF=30;TCR=38;TR=34;WE=23245309;WS=23245291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,37:0.51:72
chr14	23249292	rs11568429	A	G	1635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=44;PP=979;ReadPosRankSum=0.537;SC=TTGGTGACTTACCCTTACCAC;SOR=0.632;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=118;TCF=33;TCR=85;TR=61;WE=23249300;WS=23249282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,72:0.56:129
chr14	23286343	rs10130537	T	A	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.07;QD=42.18;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr14	23286350	rs111507412	T	TATTTTTTA	412.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.07;QD=41.27;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr14	23286528	rs150800938	TTTTTA	T	1010.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=11;PP=541;SC=TATTTCGGTATTTTTATTTTA;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=11;WE=23286540;WS=23286518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr14	23291924	rs11625306	C	T	1062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.139;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=32;PP=738;ReadPosRankSum=0.457;SC=ACAACTGCCTCCGGCCCCGAG;SOR=0.525;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=72;TCF=14;TCR=58;TR=41;WE=23291932;WS=23291914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,44:0.59:74
chr14	23299135	rs1135641	G	T	1094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.254;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=22;PP=641;ReadPosRankSum=1.518;SC=GCTGCTTTAGGGACTGTTCTC;SOR=0.819;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=156;TCF=89;TCR=67;TR=55;WE=23299143;WS=23299125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,60:0.35:172
chr14	23299286	rs4982685	T	C	2069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=34;PP=1266;ReadPosRankSum=1.447;SC=CACTGCAGCGTAGCCGCTTGG;SOR=0.690;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=165;TCF=94;TCR=71;TR=83;WE=23299294;WS=23299276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,92:0.51:182
chr14	23300095	rs9646148	T	G	1736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.920;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=27;PP=1043;ReadPosRankSum=0.648;SC=TAGTAGCAAATCCAGGACTAG;SOR=0.478;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=135;TCF=85;TCR=50;TR=69;WE=23300103;WS=23300085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,80:0.52:154
chr14	23302585	rs12050397	T	A	1138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.607;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=19;PP=621;ReadPosRankSum=-0.880;SC=GGTGATGCAGTCCATCTCTAA;SOR=0.866;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=86;TCF=50;TCR=36;TR=47;WE=23302593;WS=23302575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,55:0.56:99
chr14	23306048	rs1042703	C	T	2164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.197;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=39;PP=1180;ReadPosRankSum=2.329;SC=CCCAAGACCCCCCCGTTGTCT;SOR=0.850;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=213;TCF=127;TCR=86;TR=97;WE=23306056;WS=23306038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,109:0.45:243
chr14	23311042	rs17879412	CT	C	445.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=4;PP=491;ReadPosRankSum=-0.752;SC=CACAGCAAGTCTTACCCAACA;SOR=0.495;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=12;TCF=6;TCR=6;TR=8;WE=23311052;WS=23311037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr14	23311044	rs57542488	T	C	454.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=4;PP=507;ReadPosRankSum=-0.556;SC=CAGCAAGTCTTACCCAACACT;SOR=0.495;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=14;TCF=8;TCR=6;TR=10;WE=23311052;WS=23311037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr14	23312594	rs1042704	G	A	3061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.847;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=67;PP=1748;ReadPosRankSum=-1.317;SC=TGTGCTGCCCGATGATGACCG;SOR=0.747;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=287;TCF=145;TCR=142;TR=138;WE=23312602;WS=23312584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,154:0.49:316
chr14	23314675	rs911912	C	T	2293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=47;PP=1365;SC=TGGAAAACAACGGCGATGATA;SOR=1.788;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=25;TCR=47;TR=72;WE=23314683;WS=23314665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr14	23315331	rs743257	T	C	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=30;ReadPosRankSum=-1.409;SC=GGGTGGGCTGTTCCCATCGTC;SOR=0.368;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=4;WE=23315339;WS=23315321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr14	23371255	rs61680322	G	GGGC	1992.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.962;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=88;PP=2079;ReadPosRankSum=0.401;SC=GCAGCAGCCTGGGCGGCGGCG;SOR=0.994;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=222;TCF=64;TCR=158;TR=125;WE=23371273;WS=23371245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,96:0.44:216
chr14	23371265	.	G	GGCA	2444.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.193;ClippingRankSum=0.000;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.609;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=88;PP=1904;ReadPosRankSum=1.438;SC=GGGCGGCGGCGGCAGCAGCAG;SOR=0.797;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=198;TCF=53;TCR=145;TR=113;WE=23371273;WS=23371245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,122:0.44:279
chr14	23373986	rs1043209	G	A	2756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=23;PP=1654;SC=GTATGCAGCAGGTTAATCACG;SOR=1.814;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=83;TCF=60;TCR=23;TR=82;WE=23373994;WS=23373976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr14	23374435	rs2295680	G	A	6326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=118;NR=91;PP=2965;SC=TCCGATCTGAGATGATACGTA;SOR=0.851;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=209;TCF=118;TCR=91;TR=209;WE=23374443;WS=23374425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr14	23374862	rs2295682	C	T	7380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=107;NR=126;PP=2965;SC=TGTGTCCATACCTATAACTAA;SOR=1.027;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=233;TCF=107;TCR=126;TR=233;WE=23374870;WS=23374852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,274:1.00:274
chr14	23391533	rs144411999	C	CACAA	2823.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=23;PP=1709;SC=TCTCTAATCACACAAAGATCT;SOR=0.854;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=30;WE=23391541;WS=23391523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr14	23391913	rs8007089	T	C	3044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=50;PP=2044;SC=AAGAAGCCCGTACCCCTCTAG;SOR=0.994;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=44;TCR=50;TR=94;WE=23391921;WS=23391903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr14	23394007	rs1956880	T	C	1029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=24;SC=GCTTTCTGAGTTTTAGTAAGA;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=33;WE=23394015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr14	23394069	rs1956881	A	C	842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=12;PP=540;SC=TTCCTCCTCTAAGTGCACTCC;SOR=0.976;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=16;TCR=12;TR=28;WE=23394077;WS=23394059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr14	23396680	rs12589539	T	C	1012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=10;PP=684;SC=AAGAAGGTACTTAGCACAATC;SOR=1.949;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=25;TCR=10;TR=35;WE=23396688;WS=23396670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr14	23416252	rs2008951	C	G	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.454;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.281;NF=19;NR=4;PP=272;ReadPosRankSum=1.041;SC=CTCGGCCTCCCAAAGTGCTGG;SOR=1.106;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=65;TCF=50;TCR=15;TR=23;WE=23416260;WS=23416242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,25:0.37:68
chr14	23416510	.	A	T	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.068;ClippingRankSum=0.000;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=2.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQRankSum=-4.094;QD=0.91;ReadPosRankSum=-0.501;SOR=0.145;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,5:0.11:47
chr14	23416515	.	CGT	C	52.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.857;ClippingRankSum=0.000;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=3.408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQRankSum=-4.467;QD=1.20;ReadPosRankSum=0.123;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,4:0.09:44
chr14	23416518	.	A	ACT	58.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.508;ClippingRankSum=0.000;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=3.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQRankSum=-4.296;QD=1.43;ReadPosRankSum=0.044;SOR=0.124;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,4:0.10:41
chr14	23416521	.	A	G	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=2.781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQRankSum=-3.626;QD=2.02;ReadPosRankSum=-0.929;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,5:0.13:38
chr14	23416530	rs374475424	C	T	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQRankSum=-3.215;QD=3.15;ReadPosRankSum=-1.102;SOR=0.259;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,5:0.16:31
chr14	23424186	rs2016392	A	G	2931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=35;PP=1771;SC=CACCCACCTCAGCCTCCCAAA;SOR=1.428;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=69;TCR=35;TR=104;WE=23424194;WS=23424176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr14	23426182	rs2273626	C	A	1999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.516;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=47;PP=1149;ReadPosRankSum=-0.984;SC=TCGGCTGGGGCGGGCTGGCCA;SOR=0.766;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=180;TCF=82;TCR=98;TR=87;WE=23426190;WS=23426172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,97:0.47:206
chr14	23495610	.	GA	G	39.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.538;ClippingRankSum=0.000;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=1.595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.74;ReadPosRankSum=0.451;SOR=0.346;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,11:0.20:54
chr14	23504021	rs11543947	G	A	3379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=342;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.816;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=79;PP=1945;ReadPosRankSum=-0.809;SC=AGATCTGCACGACCCCCAAGT;SOR=0.627;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=315;TCF=155;TCR=160;TR=159;WE=23504029;WS=23504011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,170:0.50:342
chr14	23504238	rs4144360	G	A	293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=8;PP=230;SC=CAAAAAGAAGGGCCAGATGCG;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=23504246;WS=23504228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr14	23511357	rs4981456	G	C	158.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5562;FS=6.021;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=97;ReadPosRankSum=0.674;SC=CAGCTTCTCTGTAGCGTCCCT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=5;WE=23511365;WS=23511347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr14	23524094	rs117055311	C	T	1133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.813;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=29;PP=678;ReadPosRankSum=-1.021;SC=GATGCCAGCACGCCATTCAGC;SOR=0.557;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=93;TCF=32;TCR=61;TR=47;WE=23524102;WS=23524084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,52:0.54:97
chr14	23530908	rs56402910	C	T	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=16;PP=349;ReadPosRankSum=1.043;SC=GATGGCCGGGCGCGGTGGCTC;SOR=0.703;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=26;TCR=38;TR=27;WE=23530916;WS=23530898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,31:0.44:70
chr14	23532865	rs57315948	A	G	664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.881;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=18;PP=368;ReadPosRankSum=0.525;SC=GTTCCCCGGTAAGAGTAGCAG;SOR=0.817;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=27;TCR=47;TR=29;WE=23532873;WS=23532855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,32:0.40:80
chr14	23549379	rs941719	C	G	5069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=82;PP=2965;SC=ATGAGGACAGCGGGGGCTGGG;SOR=0.749;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=167;TCF=85;TCR=82;TR=167;WE=23549387;WS=23549367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr14	23559973	rs8020434	T	C	142.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=5;PP=115;SC=GTTGGAAGGCTTTTTTCTAAG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=23559981;WS=23559963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr14	23571671	rs4444236	A	T	7543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=119;NR=124;PP=2965;SC=CCTTGTCACTAGTTGCCTTGT;SOR=0.815;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=243;TCF=119;TCR=124;TR=243;WE=23571679;WS=23571661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,276:1.00:276
chr14	23572776	rs148655160	T	TAAAAC	1552.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=1;PP=961;SC=AAAAGCAAAATAAAACAAAAC;SOR=5.610;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=22;WE=23572784;WS=23572766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr14	23574095	rs5807203	GGCA	G	238.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.6544;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=471;ReadPosRankSum=-2.447;SC=GACTAGTGGCGGCAGCAGCAG;SOR=0.657;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=13;WE=23574108;WS=23574085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr14	23574112	rs57331962	CA	C	424.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.62;ReadPosRankSum=1.600;SOR=0.650;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,21:0.52:40
chr14	23574114	rs55686792	GCA	G	424.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.62;ReadPosRankSum=1.558;SOR=0.650;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,21:0.52:40
chr14	23574116	.	A	G	189	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=4;NR=9;PP=189;QD=17.2131701959;SC=CAGCAGCAGCAGCAGCAGCAG;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=29;TCF=12;TCR=17;TR=13;WE=23574124;WS=23574106;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr14	23588320	rs78537674	C	T	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=236;ReadPosRankSum=-0.912;SC=GCCCCCTCGGCTCCCCGCCCC;SOR=0.776;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=27;TCF=10;TCR=17;TR=15;WE=23588328;WS=23588310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr14	23596320	rs761874	A	G	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=182;ReadPosRankSum=-0.468;SC=ATGTGTTGGCAGGACCAAGGC;SOR=0.892;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=12;WE=23596328;WS=23596312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr14	23598849	rs7157207	T	G	1239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.685;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=17;PP=804;ReadPosRankSum=-0.560;SC=CCAAAGGGAGTTTCTCTCACC;SOR=0.530;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=96;TCF=66;TCR=30;TR=51;WE=23598857;WS=23598839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,57:0.54:105
chr14	23598952	rs7157021	A	G	3896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.041;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=59;PP=1433;ReadPosRankSum=-1.650;SC=TGAAGCCCACATAGTTGATGA;SOR=0.822;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=236;TCF=120;TCR=116;TR=113;WE=23598960;WS=23598942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,123:0.46:267
chr14	23598976	rs17183863	G	A	3351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.094;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=45;PP=1144;ReadPosRankSum=-0.129;SC=TGTACATGTCGCTGGTGACCA;SOR=0.783;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=179;TCF=87;TCR=92;TR=83;WE=23598984;WS=23598966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,89:0.44:202
chr14	23607271	rs1569951	C	T	2687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=42;NR=47;PP=1347;SC=AAGGAGAGGTCACCACTCCCC;SOR=1.051;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=42;TCR=47;TR=89;WE=23607279;WS=23607261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr14	23609916	rs10151002	A	T	204.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=6;PP=140;SC=CCCACCTCTCACCCCTCCCTG;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=23609924;WS=23609906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr14	23612489	rs2273394	C	G	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.808;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=58;ReadPosRankSum=-0.799;SC=ACAAGCAGAACTGCTCCCTCA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=5;WE=23612497;WS=23612479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr14	23624583	rs8011016	C	T	1475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=36;PP=1022;SC=CCCCTCCTCCCTTCCTGGCTC;SOR=1.567;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=18;TCR=36;TR=54;WE=23624591;WS=23624573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr14	23727902	rs35193725	CTT	C	989.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=3.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.31;MQRankSum=0.500;QD=31.93;ReadPosRankSum=2.070;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,29:0.94:31
chr14	23727919	rs8015556	T	C	1211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.979;HP=18;HapScore=3;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.343;NF=13;NR=41;PP=1111;ReadPosRankSum=1.140;SC=TTTTTTTTTTTTTCTAAGAAG;SOR=1.000;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=57;TCF=16;TCR=41;TR=54;WE=23727927;WS=23727892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,34:0.97:35
chr14	23729188	rs2144038	T	C	739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=15;PP=422;SC=TATTATTTTCTCTCTTACTTT;SOR=1.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=7;TCR=15;TR=22;WE=23729196;WS=23729178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr14	23729736	rs149298511	T	C	1511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.775;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=17;PP=868;ReadPosRankSum=-0.481;SC=CTGCTACTTTTCCTCCTACTG;SOR=0.914;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=88;TCF=60;TCR=28;TR=58;WE=23729758;WS=23729726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,66:0.67:99
chr14	23729750	rs2064483	G	A	3087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=37;PP=1972;SC=CCTACTGGGAGTCTTAGCAAC;SOR=1.149;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=103;TCF=65;TCR=38;TR=102;WE=23729758;WS=23729726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr14	23731855	rs139713000	C	CT	3185.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=51;PP=1143;ReadPosRankSum=-0.244;SC=AGAGCCGCCTCTTTTTTTTTC;SOR=0.769;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=111;TCF=35;TCR=76;TR=77;WE=23731863;WS=23731845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:15,134:0.90:149
chr14	23732091	rs11625337	AT	GC	6623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=120;NR=98;PP=2947;ReadPosRankSum=-1.176;SC=CAAGGCAGGCATACCATTGAT;SOR=0.817;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=231;TCF=124;TCR=107;TR=218;WE=23732100;WS=23732081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,255:0.99:257
chr14	23733725	rs3811180	C	T	517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=2;PP=401;SC=ATGCCCACTGCAGTAGAACAA;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=23733733;WS=23733715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr14	23733978	rs59984693	GT	G	717.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=22;PP=416;ReadPosRankSum=0.347;SC=CATTTCACTTGTTTTTTTTTC;SOR=0.914;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=23;WE=23733986;WS=23733968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,29:0.97:30
chr14	23734032	rs11628689	T	A	350.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.34;QD=43.85;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr14	23734037	rs5807215	T	A	317.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.34;QD=39.72;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr14	23744826	rs67447855	TTCC	T	1555.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=7;PP=703;SC=CATCATCATCTTCCTCCTCCT;SOR=1.547;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=19;TCF=11;TCR=8;TR=16;WE=23744836;WS=23744816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr14	23746269	rs1057119	C	G	5416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=99;PP=2965;SC=GGGCTGCTTGCGTCCACACAA;SOR=0.776;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=195;TCF=95;TCR=100;TR=194;WE=23746277;WS=23746259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr14	23777374	rs910332	A	G	2092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=46;PP=1425;SC=CTGGAGACGCAGCTGGCTGAC;SOR=1.300;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=28;TCR=46;TR=74;WE=23777382;WS=23777364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr14	23789096	rs10640563	C	CTT	6338.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=76;PP=2930;SC=TAATGAGTCACTTGATTTTTT;SOR=1.483;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=94;TCF=8;TCR=86;TR=81;WE=23789104;WS=23789086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr14	23792019	rs8020117	T	C	796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=1;PP=622;SC=TTCAATTTATTGAATATTTAG;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=23792027;WS=23792009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr14	23793305	rs45528934	C	T	4058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=386;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=82;PP=2359;ReadPosRankSum=0.952;SC=ATAAACTCTCCAGGTTGCCTT;SOR=0.700;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=353;TCF=193;TCR=160;TR=180;WE=23793313;WS=23793295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:190,195:0.51:385
chr14	23816998	rs12896494	T	C	1224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.570;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=27;PP=785;ReadPosRankSum=0.579;SC=CGCAGCCTTCTACAGTGCTGA;SOR=0.970;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=96;TCF=46;TCR=50;TR=50;WE=23817006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,54:0.53:101
chr14	23826819	rs2231810	C	T	1335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FS=2.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.67;ReadPosRankSum=0.690;SOR=0.880;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,68:0.44:154
chr14	23826822	rs2231809	C	T	5243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.27;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr14	23828250	rs34060515	TC	T	297.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=257;ReadPosRankSum=2.911;SC=TTCTGCCCCTTCCCCGGACCC;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=9;WE=23828258;WS=23828240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr14	23828893	rs2231806	G	A	911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.814;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=17;PP=584;ReadPosRankSum=-0.276;SC=GGGCTCTGGAGAAGGGGGAGC;SOR=0.823;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=82;TCF=47;TCR=35;TR=42;WE=23828901;WS=23828883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,44:0.52:85
chr14	23829164	rs2231805	G	A	1275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.698;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=23;PP=860;ReadPosRankSum=1.910;SC=GGGGCAACCCGGGTCAGAGGG;SOR=0.582;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=109;TCF=65;TCR=44;TR=55;WE=23829172;WS=23829154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,60:0.51:117
chr14	23830042	rs2231798	T	C	2969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.04;SOR=1.131;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr14	23830048	rs2231797	T	G	2912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.13;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr14	23834174	rs72127341	TGGA	T	4240.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.362;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.963;NF=7;NR=42;PP=2062;ReadPosRankSum=0.642;SC=GGGCAGGCCGTGGAGGTCTCT;SOR=0.545;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=105;TCF=12;TCR=93;TR=49;WE=23834184;WS=23834164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,109:0.52:208
chr14	23842017	rs7145531	C	T	2124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=49;NR=15;PP=1164;SC=TGTTTTTTAACCTCAAGTCAC;SOR=1.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=49;TCR=15;TR=64;WE=23842025;WS=23842007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr14	23842040	rs7145551	C	T	2902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=60;NR=34;PP=1541;SC=CCTAAAAAGACAGTGGAAATA;SOR=1.168;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=60;TCR=34;TR=94;WE=23842048;WS=23842030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr14	23844979	rs79877597	C	A	3103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.442;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=58;PP=1799;ReadPosRankSum=0.846;SC=TGTCTTCTACCGGCGGCCATG;SOR=0.745;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=246;TCF=132;TCR=114;TR=131;WE=23844987;WS=23844969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,149:0.55:273
chr14	23845244	rs3811178	G	A	435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=13;PP=318;SC=TTTGGGGAAAGCCTGCACTTC;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=23845252;WS=23845234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	23848311	rs723840	C	T	1861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=35;PP=1095;ReadPosRankSum=0.704;SC=CCTCCCGGGACGGAGCTGCCA;SOR=0.663;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=148;TCF=81;TCR=67;TR=78;WE=23848319;WS=23848301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,87:0.52:167
chr14	23851874	rs178636	A	C	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.283;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=11;PP=212;ReadPosRankSum=0.575;SC=AGGCACCCATACCTCATGCAT;SOR=0.116;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=43;TCF=14;TCR=29;TR=21;WE=23851882;WS=23851864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,26:0.54:48
chr14	23854324	rs178638	A	G	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.973;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=344;ReadPosRankSum=0.197;SC=TTTCTCCAGAAAGAATTAAAG;SOR=1.651;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=48;TCF=17;TCR=31;TR=22;WE=23854332;WS=23854314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,26:0.46:56
chr14	23854351	.	TA	T	70	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000;HP=9;HapScore=4;MGOF=11;MMLQ=27;MQ=59.3;NF=0;NR=5;PP=70;QD=16.4;SC=ATTTTTTTTTTAAAACAACAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=5;WE=23854359;WS=23854331;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr14	23855569	rs178640	A	G	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQRankSum=-4.159;QD=5.56;ReadPosRankSum=-0.579;SOR=0.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,23:0.34:68
chr14	23858271	rs193922652	AG	A	674.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.440;HP=14;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.298;NF=1;NR=11;PP=120;ReadPosRankSum=-1.283;SC=TCGCCTGGGGAGGGGGGGGGG;SOR=0.595;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=12;WE=23858279;WS=23858261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,30:0.61:49
chr14	23859714	rs112405990	C	T	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=-0.058;NF=8;NR=11;PP=197;ReadPosRankSum=-0.801;SC=GGAATCCCCCCGGCTCTGAAA;SOR=0.650;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=35;TCF=14;TCR=21;TR=19;WE=23859722;WS=23859704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,21:0.52:40
chr14	23861811	rs365990	A	G	4208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.98;SOR=0.796;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr14	23865885	rs452036	G	A	8812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=144;NR=145;PP=2965;SC=CAACCACCCAGTGGGGCTCTA;SOR=0.861;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=289;TCF=144;TCR=145;TR=289;WE=23865893;WS=23865875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,332:1.00:332
chr14	23866713	rs412768	A	G	1590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=13;PP=1089;SC=GGGCTGGGCCATTCCACCAGG;SOR=2.265;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=43;TCR=13;TR=56;WE=23866721;WS=23866703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr14	23869806	rs28671012	A	G	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.346;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.447;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=5;PP=117;ReadPosRankSum=-0.111;SC=CTGTCACCACACAGTCCCCAC;SOR=0.169;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=8;WE=23869814;WS=23869796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr14	23870001	rs182373896	G	A	2629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.442;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=53;PP=1583;ReadPosRankSum=-0.100;SC=GCGTTGATGCGCGTCACCATC;SOR=0.645;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=251;TCF=146;TCR=105;TR=123;WE=23870009;WS=23869991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,131:0.48:275
chr14	23872666	rs434273	T	C	4149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=72;NR=75;PP=2196;SC=CTGAGGTGGGTGGAGGGGAGG;SOR=0.839;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=147;TCF=72;TCR=75;TR=147;WE=23872674;WS=23872656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr14	23873092	rs388914	G	A	1263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.684;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=34;PP=803;ReadPosRankSum=-0.037;SC=AAATGTAAACGACCTCTTTGG;SOR=0.580;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=113;TCF=44;TCR=69;TR=55;WE=23873100;WS=23873082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,58:0.46:126
chr14	23874117	rs440466	T	C	6789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=144;PP=2965;SC=CTTCCCAGCCTGGCCATCAGA;SOR=1.153;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=245;TCF=101;TCR=144;TR=245;WE=23874125;WS=23874107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr14	23874523	rs2277474	C	T	1956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.574;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=34;PP=1187;ReadPosRankSum=-1.929;SC=CGGCCACCACCTCGGCATTGT;SOR=0.624;Source=Platypus;TCF=96;TR=84;WE=23874531;WS=23874513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,91:0.54:169
chr14	23874541	rs17277970	C	T	1729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.448;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.246;NF=49;NR=33;PP=1038;ReadPosRankSum=1.943;SC=TGTACACCGGCAGCCACTTGT;SOR=0.889;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=188;TCF=106;TCR=82;TR=82;WE=23874549;WS=23874531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,87:0.43:201
chr14	23876267	rs28711516	C	T	3175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=57;PP=1887;ReadPosRankSum=-0.161;SC=ACCTTGCCTCCCTCCCGGGAC;SOR=0.705;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=254;TCF=147;TCR=107;TR=135;WE=23876275;WS=23876257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,150:0.53:283
chr14	23881920	rs12147570	G	T	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=41;ReadPosRankSum=-0.832;SC=GGTCCTCAGGGCAGTGAAGAA;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=4;WE=23881928;WS=23881910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr14	23882144	rs2284651	T	C	2683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=55;PP=1638;SC=GGACAGGGCATGGGAACAAAG;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=43;TCR=56;TR=97;WE=23882152;WS=23882131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr14	23882186	rs7149517	T	G	1165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=28;PP=815;SC=GGGGCCTGCTTTGTGGGCAGG;SOR=2.419;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=9;TCR=28;TR=37;WE=23882194;WS=23882176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr14	23883184	rs3729833	C	T	1561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.870;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=36;PP=927;ReadPosRankSum=-0.225;SC=CCTATGCCTCCCCTGGGCCTA;SOR=0.547;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=167;TCF=80;TCR=87;TR=71;WE=23883192;WS=23883174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,76:0.42:179
chr14	23884137	rs3729832	T	A	2506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.457;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=53;PP=1415;ReadPosRankSum=-0.619;SC=AACTCTTCATTCTCCTCAGCT;SOR=0.646;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=235;TCF=133;TCR=102;TR=119;WE=23884155;WS=23884127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,128:0.50:255
chr14	23884889	rs3729830	C	T	647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.871;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.734;NF=19;NR=9;PP=498;ReadPosRankSum=1.292;SC=GCTCCTGCTCCGCCAGCTTCC;SOR=1.383;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=56;TCF=36;TCR=20;TR=28;WE=23884897;WS=23884879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,27:0.47:57
chr14	23885997	rs3729828	G	A	690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=1;PP=624;SC=TGAACAAAACGGACAAAGCGG;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=24;WE=23886005;WS=23885993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr14	23886264	rs3729825	C	T	2701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.790;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=53;PP=1571;ReadPosRankSum=-0.465;SC=TGGAGGGACACGCCTCTTTGC;SOR=0.540;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=220;TCF=118;TCR=102;TR=111;WE=23886272;WS=23886254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,127:0.51:248
chr14	23887645	rs7159367	T	C	1991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=34;NR=36;PP=1218;SC=AGGAGGTGGGTTCAGCTTTCT;SOR=0.864;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=34;TCR=36;TR=70;WE=23887653;WS=23887635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr14	23888323	rs34598192	T	TG	6940.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=50;PP=2936;SC=AGGGAAGTGATTTGATGCAAG;SOR=1.101;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=39;TCR=50;TR=89;WE=23888331;WS=23888313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr14	23888665	rs2277475	A	T	1712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=40;NR=18;PP=1026;SC=TGTGGTGGGAACCATGGAGCC;SOR=1.270;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=40;TCR=18;TR=58;WE=23888673;WS=23888655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr14	23891481	rs45540831	C	T	765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=-1.511;QD=9.12;ReadPosRankSum=1.821;SOR=0.570;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,39:0.46:84
chr14	23892888	rs7157716	A	G	3260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=64;PP=2052;ReadPosRankSum=1.327;SC=TCAGCTTGGCAATGATCTCAT;SOR=0.566;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=105;TCF=40;TCR=65;TR=104;WE=23892896;WS=23892878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,116:0.99:117
chr14	23893453	rs45457293	G	A	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=11;PP=297;ReadPosRankSum=0.253;SC=AAATAGGAGGGTAACTCTAGG;SOR=0.622;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=33;TCF=16;TCR=17;TR=22;WE=23893461;WS=23893443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,23:0.68:34
chr14	23895479	rs28475411	C	A	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.53;ReadPosRankSum=-0.566;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr14	23897996	rs3729814	G	A	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=320;ReadPosRankSum=-0.448;SC=TCCATGTCAAGGCAGTGAAGG;SOR=0.722;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=17;WE=23898004;WS=23897986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
chr14	23898994	rs2231126	G	A	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.575;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.233;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=86;ReadPosRankSum=0.602;SC=CTTCAGTGCCGTCTGGCTCCG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=6;WE=23899002;WS=23898984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr14	23899027	rs735711	C	T	610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.064;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=11;PP=406;ReadPosRankSum=0.235;SC=GCTGCTTCAGCTTGAACTTCA;SOR=0.509;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=50;TCF=32;TCR=18;TR=28;WE=23899035;WS=23899017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,29:0.54:54
chr14	23899725	rs3729810	A	G	650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.045;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=6;PP=471;ReadPosRankSum=2.093;SC=TTTGCCCCTCACTGCCAATCC;SOR=1.356;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=65;TCF=50;TCR=15;TR=31;WE=23899733;WS=23899715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,32:0.48:66
chr14	23900794	rs2069542	G	A	2065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.536;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=49;PP=1312;ReadPosRankSum=0.670;SC=GACCACTCACGAAGCGGGAGG;SOR=0.945;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=207;TCF=107;TCR=100;TR=93;WE=23900802;WS=23900784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,100:0.44:227
chr14	23902753	rs2069540	G	A	3422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=72;NR=40;PP=2144;SC=TGCCATACTCGGTCTCGGCAG;SOR=1.215;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=112;TCF=72;TCR=40;TR=112;WE=23902761;WS=23902743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr14	23924767	rs60519724	AT	A	167.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=1.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.768;HP=7;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=165;ReadPosRankSum=-0.706;SC=AAAGCTGAGAATTTTTTTAAA;SOR=1.402;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=32;TCF=23;TCR=9;TR=8;WE=23924775;WS=23924757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr14	23924818	rs8005802	C	A	1361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=4.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.33;ReadPosRankSum=0.951;SOR=1.176;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,37:0.39:95
chr14	23924830	rs10131038	A	G	1435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.761;HP=2;HapScore=3;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=10;PP=1256;ReadPosRankSum=0.782;SC=AAAATATCAAAGCAGGATAAA;SOR=1.127;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=93;TCF=57;TCR=36;TR=34;WE=23924838;WS=23924808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,42:0.41:102
chr14	23938813	rs8015781	A	G	1005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.652;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=23;PP=711;ReadPosRankSum=3.270;SC=GGAAGTGAGAAAGCCCTTATT;SOR=0.582;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=133;TCF=79;TCR=54;TR=53;WE=23938821;WS=23938803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,54:0.38:142
chr14	23940081	rs1028587	A	G	2376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=0.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQRankSum=1.173;QD=15.85;ReadPosRankSum=1.241;SOR=0.585;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,64:0.43:150
chr14	23940086	rs1028588	A	G	2445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQRankSum=1.190;QD=15.78;ReadPosRankSum=1.382;SOR=0.661;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,65:0.42:155
chr14	23940089	rs3215682	AC	A	2460.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.693;NF=14;NR=19;PP=2954;ReadPosRankSum=1.144;SC=TAATCTAATCACTTGTTTTAT;SOR=0.662;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=87;TCF=38;TCR=49;TR=33;WE=23940097;WS=23940071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,66:0.42:159
chr14	23944514	rs2236261	C	A	1813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.270;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=42;PP=1101;ReadPosRankSum=0.221;SC=TGGAGATTCGCACGGTATGAA;SOR=0.440;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=168;TCF=73;TCR=95;TR=78;WE=23944522;WS=23944504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,87:0.46:188
chr14	23945366	rs2295706	A	G	3283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.428;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=73;PP=2276;ReadPosRankSum=0.603;SC=ATTATGGTATAAACTTTGGCT;SOR=0.745;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=262;TCF=130;TCR=132;TR=143;WE=23945374;WS=23945356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,150:0.52:288
chr14	23947374	rs1956950	G	A	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=146;ReadPosRankSum=-1.766;SC=AATTGATTTTGCTTATGAATT;SOR=0.307;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=10;WE=23947382;WS=23947364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr14	23991105	rs223122	G	A	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=206;ReadPosRankSum=1.728;SC=AGCTCCCACCGAACACCCCTT;SOR=0.950;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=33;TCF=30;TCR=3;TR=14;WE=23991113;WS=23991095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr14	24000990	.	CT	C	118.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=0.000;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=10.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.40;ReadPosRankSum=-0.101;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr14	24031600	.	A	G	3381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.408;ClippingRankSum=0.000;DP=344;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.780;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.97;MQRankSum=-1.067;NF=85;NR=63;PP=2141;ReadPosRankSum=-2.053;SC=TTTTCCAGCAATGCCAGCACT;SOR=0.803;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=317;TCF=177;TCR=140;TR=148;WE=24031608;WS=24031590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:184,160:0.47:344
chr14	24033027	rs12897422	G	A	2100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.799;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=55;PP=1378;ReadPosRankSum=-2.207;SC=TCGCACATTGGAGCTATTTAC;SOR=0.838;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=170;TCF=72;TCR=98;TR=90;WE=24033035;WS=24033017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,98:0.51:193
chr14	24107922	rs3818304	G	C	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.690;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=211;ReadPosRankSum=-0.644;SC=TAACCAGCCTGACTCTCTGCC;SOR=0.313;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=14;WE=24107930;WS=24107912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr14	24422991	rs146535891	C	G	2587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FS=2.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.20;ReadPosRankSum=-1.080;SOR=0.785;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:109,122:0.53:231
chr14	24429093	rs11158474	A	C	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=4.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.19;MQRankSum=-6.324;QD=1.36;ReadPosRankSum=0.487;SOR=1.322;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,15:0.14:106
chr14	24436381	rs33966071	GA	G	2454.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FS=4.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.05;MQRankSum=-3.936;QD=10.06;ReadPosRankSum=0.763;SOR=0.968;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:119,125:0.51:244
chr14	24439132	rs373068733	G	A	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.40;MQRankSum=-4.528;QD=3.27;ReadPosRankSum=-0.378;SOR=0.676;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,8:0.24:33
chr14	24439209	rs141737044	C	T	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=5.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQRankSum=1.978;QD=4.06;ReadPosRankSum=0.566;SOR=0.783;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,21:0.27:77
chr14	24439588	rs4048584	G	A	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.053;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=3.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.60;ReadPosRankSum=-2.391;SOR=2.215;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr14	24458162	rs2273946	G	C	2355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.450;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.168;NF=52;NR=57;PP=1513;ReadPosRankSum=-1.062;SC=GATCCATGCAGATGGCCAGGC;SOR=0.654;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=231;TCF=110;TCR=121;TR=109;WE=24458170;WS=24458152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,121:0.46:262
chr14	24458211	rs2273947	A	T	879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.536;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.093;NF=14;NR=26;PP=612;ReadPosRankSum=-0.625;SC=GTCGGTGCGGATGGCCAGCTC;SOR=0.313;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=85;TCF=24;TCR=61;TR=40;WE=24458219;WS=24458201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,41:0.45:92
chr14	24476689	.	T	TGG	225.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.711;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=7.259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQRankSum=-0.479;QD=12.54;ReadPosRankSum=0.134;SOR=0.763;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr14	24505614	rs8006288	A	G	1831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.320;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.210;NF=44;NR=27;PP=1037;ReadPosRankSum=-0.722;SC=GCGGGGAGGGAGCAGGCAGGG;SOR=0.928;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=123;TCF=75;TCR=48;TR=71;WE=24505622;WS=24505604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,78:0.60:130
chr14	24505722	rs8005834	C	G	3829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.390;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=86;PP=2235;ReadPosRankSum=0.273;SC=GCACAAGGCGCGGCTACGAGG;SOR=0.824;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=288;TCF=145;TCR=143;TR=164;WE=24505730;WS=24505712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,181:0.57:317
chr14	24507003	rs28599797	A	C	1811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.568;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=50;PP=1061;ReadPosRankSum=-1.279;SC=CCCACGTGGTAGTCAGCCGCC;SOR=0.608;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=164;TCF=71;TCR=93;TR=88;WE=24507011;WS=24506993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,89:0.52:171
chr14	24525634	rs4982851	C	A	3021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=69;PP=1771;ReadPosRankSum=1.892;SC=TGTCCCCATCCCAATGCAGAC;SOR=0.686;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=277;TCF=133;TCR=144;TR=135;WE=24525642;WS=24525624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,148:0.49:303
chr14	24525782	rs4982852	A	G	1603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.908;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=27;PP=1056;ReadPosRankSum=-0.377;SC=TGCCACCTGCACCCACTGCCC;SOR=0.947;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=136;TCF=78;TCR=58;TR=65;WE=24525790;WS=24525772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,73:0.49:150
chr14	24526287	rs7161473	G	C	1751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.171;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=32;PP=1105;ReadPosRankSum=1.628;SC=TAAGCTTCAGGAGCTGGGAGG;SOR=0.800;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=156;TCF=88;TCR=68;TR=75;WE=24526295;WS=24526277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,83:0.47:176
chr14	24527220	rs4982853	C	T	2996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=370;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=68;PP=1822;ReadPosRankSum=0.464;SC=GCAGCGCCTACACACTGAGCC;SOR=0.681;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=337;TCF=184;TCR=153;TR=148;WE=24527228;WS=24527210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:212,158:0.43:370
chr14	24529209	rs61564890	C	T	1488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.257;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=29;PP=940;ReadPosRankSum=0.717;SC=TGTCCTTCCCCGTGAGCGACA;SOR=0.632;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=133;TCF=74;TCR=59;TR=67;WE=24529217;WS=24529199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,73:0.47:155
chr14	24529260	rs58283036	C	T	1925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.557;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=29;PP=1236;ReadPosRankSum=2.781;SC=GCACCGAGGACGTCTGGCAGA;SOR=1.061;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=147;TCF=92;TCR=55;TR=82;WE=24529268;WS=24529250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,90:0.53:169
chr14	24529890	rs1951635	A	G	1160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.272;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=16;PP=625;ReadPosRankSum=0.184;SC=CCCTGAGACTATGCCCCCTGG;SOR=0.919;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=118;TCF=75;TCR=43;TR=48;WE=24529898;WS=24529880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,56:0.43:131
chr14	24530265	rs41317326	G	A	2314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=52;PP=1368;ReadPosRankSum=0.406;SC=TCCTGGAGGAGGGAGGAATCC;SOR=0.663;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=208;TCF=104;TCR=104;TR=103;WE=24530273;WS=24530255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,113:0.49:230
chr14	24531641	rs960266	G	C	1089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.705;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=18;PP=621;ReadPosRankSum=0.169;SC=GGGGCCATGCGGGGGACTGAG;SOR=0.446;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=97;TCF=63;TCR=34;TR=50;WE=24531649;WS=24531631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,52:0.52:100
chr14	24533539	rs10146906	C	A	1686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.033;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=32;PP=831;ReadPosRankSum=-0.871;SC=CCGAAGGGTCCTGGAGGAAAG;SOR=0.725;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=133;TCF=71;TCR=62;TR=71;WE=24533547;WS=24533529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,80:0.53:151
chr14	24534781	rs12590548	G	A	1167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=15;PP=768;ReadPosRankSum=0.055;SC=CACAGCCTGGGGAGCCCCCTT;SOR=0.746;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=57;TCR=26;TR=48;WE=24534789;WS=24534771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,51:0.59:86
chr14	24540710	rs372732697	GC	G	240.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=7.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.20;ReadPosRankSum=0.701;SOR=0.964;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr14	24542458	rs3742497	T	A	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.506;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=11;PP=240;ReadPosRankSum=2.675;SC=CTGGAGATGGTGTCCCAGAGG;SOR=0.180;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=33;TCF=12;TCR=21;TR=19;WE=24542466;WS=24542448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr14	24543873	rs2025256	G	A	3256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=381;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.210;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=70;PP=1829;ReadPosRankSum=0.415;SC=AAAGTAAGAAGACACAGACAG;SOR=0.716;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=354;TCF=180;TCR=174;TR=150;WE=24543881;WS=24543863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:215,166:0.44:381
chr14	24544248	rs2073350	C	T	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.996;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=170;ReadPosRankSum=-2.463;SC=TCCGGGCAGGCTGAGGATGTC;SOR=1.179;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=12;WE=24544256;WS=24544238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr14	24545366	rs2070342	T	C	775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=1143;ReadPosRankSum=1.365;SC=AGGTGGCCATTGACTTCACCG;SOR=0.719;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=44;TCF=34;TCR=10;TR=30;WE=24545383;WS=24545356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,31:0.66:47
chr14	24545375	rs2070341	C	T	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=462;ReadPosRankSum=-2.370;SC=TTGACTTCACCGCCTCCAATG;SOR=0.751;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=50;TCF=38;TCR=12;TR=17;WE=24545383;WS=24545356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,19:0.35:54
chr14	24545835	rs45621931	C	T	3481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.323;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=72;PP=1920;ReadPosRankSum=-0.304;SC=ACAGACTCCACTCCCCAGGGC;SOR=0.580;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=303;TCF=150;TCR=153;TR=150;WE=24545843;WS=24545825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,168:0.50:334
chr14	24545984	rs2070345	G	C	860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=11;PP=447;ReadPosRankSum=-0.188;SC=AGGAACTCGAGGGGAGGGCAG;SOR=0.653;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=70;TCF=44;TCR=26;TR=31;WE=24545992;WS=24545974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,38:0.49:77
chr14	24563212	rs4982856	T	C	1658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.154;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=33;PP=1010;ReadPosRankSum=-0.558;SC=GTTTGCCACCTAGTGTCTCTC;SOR=0.647;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=163;TCF=84;TCR=79;TR=68;WE=24563220;WS=24563202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,79:0.43:183
chr14	24563339	rs4982857	A	G	1632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=23;NR=35;PP=1041;SC=AATGGGAGAGATGGGTTTGGC;SOR=1.460;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=23;TCR=35;TR=58;WE=24563347;WS=24563329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr14	24564123	rs55646187	G	A	1430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.012;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=44;PP=1034;ReadPosRankSum=-1.520;SC=ATCCATTCCCGGCCTCTCCCG;SOR=1.325;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=125;TCF=48;TCR=77;TR=64;WE=24564131;WS=24564113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,66:0.49:134
chr14	24567304	rs2759409	C	A	957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=1;PP=685;SC=GGTGGGGAAACATAAGGCCAA;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=27;WE=24567312;WS=24567294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr14	24567498	rs3021119	A	C	8819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=143;NR=148;PP=2965;ReadPosRankSum=0.283;SC=GACACGGTACAACTCCCGCCT;SOR=0.244;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=292;TCF=143;TCR=149;TR=291;WE=24567519;WS=24567488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,324:1.00:325
chr14	24572495	rs2071586	G	C	2191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=48;PP=1527;SC=TCCCTCTCCTGTGTGTGCACA;SOR=1.640;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=25;TCR=48;TR=73;WE=24572503;WS=24572485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr14	24586833	rs3742499	C	T	1245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=16;PP=556;ReadPosRankSum=-1.631;SC=GCTGAAGTGGCCCTCTATTTC;SOR=0.725;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=96;TCF=61;TCR=35;TR=48;WE=24586841;WS=24586823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,59:0.54:110
chr14	24587504	rs2277479	A	G	1527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.559;HP=3;HapScore=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=20;PP=2359;ReadPosRankSum=-0.227;SC=TGATAAAGGGAAGACTCCACA;SOR=0.887;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=109;TCF=70;TCR=39;TR=57;WE=24587523;WS=24587494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,62:0.53:117
chr14	24587515	rs2277480	G	A	1451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=23;PP=2128;ReadPosRankSum=0.644;SC=AGACTCCACAGGTACACTGAG;SOR=0.734;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=133;TCF=80;TCR=53;TR=60;WE=24587523;WS=24587494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,65:0.45:146
chr14	24587545	rs2277481	A	G	6890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=124;NR=99;PP=2965;SC=TCTAATCTAGAAAAGTTACAA;SOR=0.904;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=224;TCF=124;TCR=100;TR=223;WE=24587553;WS=24587535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr14	24587639	rs3825584	G	A	3446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=381;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.209;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=80;PP=1926;ReadPosRankSum=0.651;SC=GGCCGTTTCCGTAAATTCAAG;SOR=0.779;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=330;TCF=160;TCR=170;TR=154;WE=24587647;WS=24587629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:206,174:0.46:380
chr14	24587667	rs17101367	C	T	2478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=2.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.249;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=58;PP=1496;ReadPosRankSum=0.528;SC=AGGCCCGCGACGTAGGCTGGA;SOR=0.894;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=240;TCF=119;TCR=121;TR=108;WE=24587675;WS=24587657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,123:0.43:285
chr14	24587795	rs2277482	C	T	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.822;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=14;PP=374;ReadPosRankSum=-1.884;SC=CCTGAGGTTTCCATGTGCCTG;SOR=0.330;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=52;TCF=19;TCR=33;TR=23;WE=24587803;WS=24587785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,25:0.45:56
chr14	24600390	rs927494	T	A	893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=3;PP=669;SC=GACCTCTGATTTCCCTGTGGA;SOR=3.841;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=26;WE=24600398;WS=24600380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr14	24601318	rs11574503	G	C	478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=3;PP=326;SC=AGGAGAGAACGAGTGATGATG;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=24601326;WS=24601317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr14	24608958	.	C	CCTGCTGGATGCTTGATGCACGA	3467.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.491;ClippingRankSum=0.000;DP=172;ExcessHet=3.0103;FS=4.941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.98;MQRankSum=6.066;QD=22.97;ReadPosRankSum=-0.455;SOR=1.128;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,79:0.52:151
chr14	24614361	rs7146672	T	G	6602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=122;NR=100;PP=2965;SC=TCCACACTTATGGACTGTGAG;SOR=0.814;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=222;TCF=122;TCR=100;TR=222;WE=24614369;WS=24614351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr14	24615435	rs4575	T	C	5828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=104;PP=2965;SC=AAAGATTCTGTCTGAAGACCT;SOR=0.902;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=197;TCF=93;TCR=104;TR=197;WE=24615443;WS=24615425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr14	24617238	rs2273913	C	T	11482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=436;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=206;NR=193;PP=2965;SC=TGGAGAAATACGGCCGCAACC;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=399;TCF=206;TCR=193;TR=399;WE=24617246;WS=24617228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,436:1.00:436
chr14	24624741	rs2295979	C	G	2037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.547;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=44;PP=1383;ReadPosRankSum=-0.082;SC=CTGCCCAGGGCAGCTACTGTG;SOR=0.628;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=165;TCF=75;TCR=90;TR=80;WE=24624749;WS=24624731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,91:0.50:181
chr14	24625031	rs4982862	C	G	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.976;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=174;ReadPosRankSum=-1.157;SC=TTACAGACTACTCAGAAAGAC;SOR=0.197;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=26;TCF=8;TCR=18;TR=14;WE=24625039;WS=24625021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr14	24633131	.	GAGC	G	64.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=0.000;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.80;ReadPosRankSum=0.024;SOR=1.152;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,8:0.10:81
chr14	24635589	rs111232493	C	CT	93.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.343;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.47;MQRankSum=0.728;QD=5.51;ReadPosRankSum=-0.510;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr14	24646406	rs10690822	G	GGAA	7993.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=45;PP=2969;SC=TGATCGCAGAGGAAGAAGCTA;SOR=1.140;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=93;TCF=42;TCR=51;TR=84;WE=24646414;WS=24646396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr14	24647522	rs3736840	G	T	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=314;ReadPosRankSum=-1.880;SC=TCAGGTGGGTGGGGGGAGGAT;SOR=0.551;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=39;TCF=6;TCR=33;TR=18;WE=24647530;WS=24647512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,20:0.47:43
chr14	24647814	rs1885711	T	C	513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.618;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=349;ReadPosRankSum=0.046;SC=CTACACAGCCTATGGTGCAGC;SOR=1.164;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=19;WE=24647822;WS=24647804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,21:0.52:40
chr14	24647957	rs1885710	C	T	3734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.914;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=73;PP=2440;ReadPosRankSum=2.693;SC=CCTCAAACCCCGTGCCTACTA;SOR=0.900;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=309;TCF=164;TCR=145;TR=163;WE=24647965;WS=24647947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,174:0.52:332
chr14	24649835	rs2273911	T	C	892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.653;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=11;PP=426;ReadPosRankSum=0.807;SC=TGCCCCAGGCTCTCTGAGCCC;SOR=1.015;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=89;TCF=53;TCR=36;TR=36;WE=24649843;WS=24649825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,45:0.43:104
chr14	24650047	rs7145633	A	G	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=94;ReadPosRankSum=1.043;SC=GAGTGGCAGAATCTCTTATCA;SOR=0.963;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=7;WE=24650055;WS=24650037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr14	24652107	rs34130297	A	AG	1872.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.213;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=24;PP=909;ReadPosRankSum=-0.079;SC=TCATGGGGGTAGGGGGTGGAC;SOR=0.571;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=91;TCF=12;TCR=79;TR=31;WE=24652115;WS=24652097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,75:0.44:169
chr14	24653523	rs11550452	G	C	743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.55;ReadPosRankSum=-1.222;SOR=0.650;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,44:0.33:134
chr14	24653954	rs7146310	G	A	1024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.397;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=18;PP=418;ReadPosRankSum=2.568;SC=CAGCAGCGAGGCCTGGGCAGC;SOR=0.487;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=97;TCF=56;TCR=41;TR=40;WE=24653962;WS=24653944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,51:0.44:116
chr14	24654489	rs2025258	T	C	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.887;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=11;PP=357;ReadPosRankSum=-0.288;SC=GCAGTGGCATTACCTCCCTTG;SOR=0.230;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=68;TCF=26;TCR=42;TR=23;WE=24654497;WS=24654479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,26:0.36:73
chr14	24656251	rs2295978	C	T	4130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=400;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.092;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=102;NR=73;PP=2279;ReadPosRankSum=2.087;SC=GACACTTCTGCACTCTCCTTC;SOR=0.799;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=350;TCF=195;TCR=155;TR=175;WE=24656259;WS=24656241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:201,199:0.50:400
chr14	24657407	rs6573607	T	G	2011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.568;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=38;PP=1114;ReadPosRankSum=-1.609;SC=CCGAGAGAAGTGGGTAGGTAC;SOR=0.780;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=150;TCF=79;TCR=71;TR=84;WE=24657415;WS=24657397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,94:0.55:170
chr14	24657740	rs150162934	G	A	2591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.023;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=49;PP=1723;ReadPosRankSum=-1.189;SC=GCTCGGAGGGGAGAGTCAGGG;SOR=0.508;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=209;TCF=126;TCR=83;TR=115;WE=24657748;WS=24657730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,120:0.53:225
chr14	24659408	rs67843857	ACT	A	578.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.214;NF=8;NR=4;PP=436;ReadPosRankSum=0.260;SC=TAAGTGAGACACTCTCATATC;SOR=0.578;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=21;TCR=10;TR=12;WE=24659417;WS=24659398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
chr14	24662296	rs62621251	T	C	2834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.641;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=70;PP=1946;ReadPosRankSum=-0.636;SC=CATTGGCAAATATAATTCGGT;SOR=0.856;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=252;TCF=118;TCR=134;TR=128;WE=24662304;WS=24662286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,134:0.49:272
chr14	24679877	rs2295322	C	T	2260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.319;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=42;PP=1225;ReadPosRankSum=2.283;SC=ACATCATCTCCAAAGCCCATA;SOR=0.761;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=194;TCF=104;TCR=90;TR=96;WE=24679885;WS=24679867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,108:0.50:215
chr14	24682858	rs140566221	T	G	1358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.672;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=34;PP=836;ReadPosRankSum=0.481;SC=AGCTGCCACATCATTTTCTAT;SOR=0.588;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=118;TCF=47;TCR=71;TR=58;WE=24682866;WS=24682848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,64:0.49:130
chr14	24686480	rs149980708	TTTG	T	430.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.086;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=199;ReadPosRankSum=0.737;SC=TTAGGAGTTTTTTGTTGTTGT;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=5;WE=24686490;WS=24686470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr14	24702987	rs11158615	A	G	4719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=95;PP=2927;SC=GGCCATCTGAATTAGTGAGAT;SOR=1.423;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=57;TCR=95;TR=152;WE=24702995;WS=24702977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr14	24710819	rs5807249	CA	C	290.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=4.148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQRankSum=0.000;QD=6.06;ReadPosRankSum=2.632;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,20:0.42:48
chr14	24718379	rs41294726	TCTCCGGGAGCCCTGGACTCCCC	T	1239.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=17;NR=4;PP=2967;SC=ACTGACTCCCTCTCCGGGAGC;SOR=3.334;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=21;WE=24718408;WS=24718370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr14	24718515	rs2229463	G	A	7313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=142;NR=109;PP=2965;SC=CTCCTGGCACGGGGCTAAGCT;SOR=0.850;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=251;TCF=142;TCR=109;TR=251;WE=24718523;WS=24718505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,272:1.00:272
chr14	24731622	rs17256811	C	T	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.744;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=87;ReadPosRankSum=-0.668;SC=GACCCAGAAACCCTCCATCCA;SOR=1.284;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=7;WE=24731630;WS=24731612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
chr14	24735624	rs2877612	A	G	3347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=354;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.256;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=74;PP=2044;ReadPosRankSum=0.141;SC=AGGCACCCAGAAGGAAGGATA;SOR=0.613;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=317;TCF=167;TCR=150;TR=154;WE=24735632;WS=24735614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:184,168:0.48:352
chr14	24736027	rs14193	G	A	4646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=86;PP=2790;SC=GGGTTCGGAGGCGATTGTGTG;SOR=0.992;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=159;TCF=73;TCR=86;TR=159;WE=24736035;WS=24736017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr14	24736961	rs729421	T	C	1379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=29;NR=15;PP=828;SC=TCCAGATACGTTGCCCGCATG;SOR=1.157;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=29;TCR=15;TR=44;WE=24736969;WS=24736951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr14	24737203	rs941502	A	T	1815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=23;PP=1222;SC=TTCTCTTGGAACCTCCTCTGC;SOR=1.044;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=35;TCR=23;TR=58;WE=24737211;WS=24737193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr14	24738379	rs59227799	T	C	2287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.798;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=54;PP=1404;ReadPosRankSum=-1.781;SC=TCTGTGGGGTTCCAGGAGGCA;SOR=0.558;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=178;TCF=73;TCR=105;TR=95;WE=24738387;WS=24738369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,105:0.54:196
chr14	24739363	rs58050348	A	AG	1081.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.816;HP=8;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=23;PP=419;ReadPosRankSum=-0.928;SC=CCAGAAGGGAAGGGGGGGGTC;SOR=0.800;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=62;TCF=5;TCR=57;TR=25;WE=24739371;WS=24739353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,50:0.54:93
chr14	24740272	rs78807053	G	A	1901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=40;PP=1077;ReadPosRankSum=-1.329;SC=CACTGGGGGTGAGGGCGCGGG;SOR=0.731;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=147;TCF=73;TCR=74;TR=80;WE=24740280;WS=24740262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,90:0.56:161
chr14	24760009	rs4568	G	A	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.20;ReadPosRankSum=-0.164;SOR=0.866;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,35:0.58:60
chr14	24760255	rs2295310	C	T	1622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.244;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=30;PP=916;ReadPosRankSum=0.745;SC=TCCTCAGATACCCTCACCTTG;SOR=0.687;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=170;TCF=89;TCR=81;TR=73;WE=24760263;WS=24760245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,84:0.43:197
chr14	24760808	rs1131941	C	T	1322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=25;PP=839;ReadPosRankSum=-0.489;SC=CTGTGGTTTCCGCAGATGAGA;SOR=0.698;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=148;TCF=87;TCR=61;TR=60;WE=24760816;WS=24760798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,65:0.40:161
chr14	24769663	rs11158632	T	G	1997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.227;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=41;PP=1088;ReadPosRankSum=-0.730;SC=AGGCCCTAGCTTTGTCCACGA;SOR=0.555;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=219;TCF=126;TCR=93;TR=95;WE=24769671;WS=24769653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,104:0.44:236
chr14	24769849	rs113258190	A	AGAG	851.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=0.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.26;ReadPosRankSum=1.303;SOR=0.841;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,24:0.26:92
chr14	24771080	rs4374085	T	C	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.260;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=47;ReadPosRankSum=0.210;SC=TTTGTGTCCATAGTGCCCTGT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=4;WE=24771088;WS=24771070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr14	24771101	rs4366641	C	T	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=92;ReadPosRankSum=0.674;SC=ATCTTGTTGCCTAAAGTTTGA;SOR=0.473;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=8;WE=24771109;WS=24771091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr14	24771137	rs4247000	G	A	999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=12;PP=733;SC=CTGGATTTTGGGAAAGCCGCT;SOR=1.432;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=38;TCF=26;TCR=12;TR=37;WE=24771145;WS=24771127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr14	24771256	rs4247001	T	C	3553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=70;NR=53;PP=2036;SC=TTTGCGCTCATCTCTGCAATG;SOR=0.799;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=123;TCF=70;TCR=53;TR=123;WE=24771264;WS=24771246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr14	24771285	rs4280164	G	A	1633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.638;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=31;PP=928;ReadPosRankSum=0.600;SC=GGCTACCTGAGTACTCGCGGT;SOR=0.718;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=120;TCF=63;TCR=57;TR=66;WE=24771293;WS=24771275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,74:0.55:135
chr14	24772829	rs4981501	A	T	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.831;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=353;ReadPosRankSum=1.424;SC=CATGGAGCTAACATTCTTGTG;SOR=0.361;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=52;TCF=42;TCR=10;TR=25;WE=24772837;WS=24772819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,25:0.45:55
chr14	24772922	rs4982895	C	T	6218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=118;NR=83;PP=2965;SC=TCATCATATTCTGTCTTCTCC;SOR=0.977;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=201;TCF=118;TCR=83;TR=201;WE=24772930;WS=24772912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr14	24773387	rs2144494	T	C	3228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.416;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=68;PP=1729;ReadPosRankSum=-0.285;SC=TTCTGTCCCTTGCCCAAAGTC;SOR=0.731;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=278;TCF=142;TCR=136;TR=140;WE=24773395;WS=24773377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,155:0.51:303
chr14	24776769	rs11158635	G	T	1294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.666;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=42;PP=923;ReadPosRankSum=-1.155;SC=GGGGCTTGGTGAGTGTAAAGG;SOR=1.047;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=151;TCF=65;TCR=86;TR=68;WE=24776777;WS=24776759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,69:0.41:167
chr14	24791136	rs4981504	A	G	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.058;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=167;ReadPosRankSum=1.153;SC=TTGTGAAAACAAAGACGCTTG;SOR=2.546;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=11;WE=24791144;WS=24791126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr14	24791798	rs45442399	G	A	2280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.470;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=42;PP=1355;ReadPosRankSum=-0.017;SC=ACTCATAGGTGGGCCCTGGTG;SOR=0.757;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=219;TCF=125;TCR=94;TR=101;WE=24791806;WS=24791788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,112:0.46:244
chr14	24793600	rs1884366	G	A	5665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=109;PP=2965;SC=CTGGGGGCCTGAAGGGAGACA;SOR=1.146;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=186;TCF=77;TCR=109;TR=186;WE=24793608;WS=24793590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr14	24793647	rs6573722	T	C	2815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=63;PP=1626;SC=AGGCTCCCTGTGTGCTATGAA;SOR=1.725;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=32;TCR=63;TR=95;WE=24793655;WS=24793637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr14	24794440	rs17184689	T	G	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=38;ReadPosRankSum=0.328;SC=GATTATCATTTTCCCCAGAAC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=3;WE=24794448;WS=24794430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr14	24795115	rs11622527	G	T	1199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.456;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=27;PP=749;ReadPosRankSum=-0.382;SC=TGGGAGGGTGGGTGAAAGCAC;SOR=0.672;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=59;TCR=51;TR=58;WE=24795123;WS=24795105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,60:0.50:119
chr14	24795231	rs67156008	CCA	C	8400.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=60;PP=2967;SC=CATCCCTTCTCCACCATATGA;SOR=1.223;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=109;TCF=46;TCR=63;TR=101;WE=24795245;WS=24795221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr14	24795237	rs55970272	T	C	8558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=110;NR=64;PP=2965;SC=TTCTCCACCATATGACCTCAG;SOR=1.244;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=192;TCF=119;TCR=73;TR=174;WE=24795245;WS=24795221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr14	24795258	rs11622863	C	T	7280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=150;NR=109;PP=2965;SC=GGCCTGCGGCCCCCCCAGCCC;SOR=0.986;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=260;TCF=151;TCR=109;TR=259;WE=24795266;WS=24795248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,269:1.00:269
chr14	24799024	rs1109152	G	C	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=323;ReadPosRankSum=-0.976;SC=TGGTAGGCCTGGTTGGCCTTC;SOR=0.743;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=41;TCF=31;TCR=10;TR=19;WE=24799032;WS=24799014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,18:0.42:43
chr14	24799287	rs1109153	A	T	1082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.018;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=27;PP=574;ReadPosRankSum=-1.308;SC=GAGACACCCCAGATTCTCACA;SOR=0.329;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=105;TCF=46;TCR=59;TR=53;WE=24799295;WS=24799277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,57:0.50:113
chr14	24799578	rs12436417	C	G	1025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=28;PP=664;ReadPosRankSum=-0.889;SC=GAAAAGTGGGCAGCGAGCGGG;SOR=0.776;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=75;TCF=19;TCR=56;TR=36;WE=24799586;WS=24799568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,44:0.49:89
chr14	24800879	rs3181256	G	A	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.502;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=317;ReadPosRankSum=0.000;SC=ATACAAAAGAGGAAACAGGTC;SOR=1.473;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=40;TCF=29;TCR=11;TR=20;WE=24800887;WS=24800869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,21:0.45:47
chr14	24801635	rs1950502	A	C	70.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=0;PP=49;SC=TTGCACCTTGACTTGGAGTCA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=24801643;WS=24801625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr14	24801956	rs2332322	G	C	1794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.175;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=42;PP=1171;ReadPosRankSum=2.984;SC=AGGGATCGAAGCCCGGGCCGT;SOR=0.569;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=162;TCF=81;TCR=81;TR=86;WE=24801964;WS=24801946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,88:0.50:176
chr14	24802263	rs8003158	A	G	1439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.82;ReadPosRankSum=-0.875;SOR=1.009;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,56:0.97:58
chr14	24803956	rs1124644	A	C	190.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=4;PP=112;SC=TCACCCGCTCAAAGCCGCTAC;SOR=1.609;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=24803964;WS=24803946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr14	24806229	rs724165	G	A	2994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=73;PP=1788;ReadPosRankSum=-0.338;SC=CCAAGTTTTCGCTGGCAAGGG;SOR=0.672;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=234;TCF=101;TCR=133;TR=127;WE=24806237;WS=24806219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,139:0.54:258
chr14	24806800	rs1950501	G	C	1057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.558;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=29;PP=680;ReadPosRankSum=1.114;SC=CAAAGGTCAAGGCATAAAAAG;SOR=0.637;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=175;TCF=88;TCR=87;TR=59;WE=24806808;WS=24806790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,63:0.32:197
chr14	24808168	rs3181248	G	A	2445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.314;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=45;PP=1553;ReadPosRankSum=0.666;SC=GGGCCTGGCTGGAGCAGCTCT;SOR=0.531;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=203;TCF=124;TCR=79;TR=107;WE=24808176;WS=24808158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,114:0.51:223
chr14	24835017	rs11362560	CG	C	374.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.645;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=240;ReadPosRankSum=-0.220;SC=GAACCAAGGACGGGGGGGCTG;SOR=0.148;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=12;WE=24835025;WS=24835007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr14	24838621	rs1955915	C	T	3931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=377;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.175;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=74;PP=2285;ReadPosRankSum=1.391;SC=GAAGGACTTGCGGCCTGGCCA;SOR=0.811;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=338;TCF=188;TCR=150;TR=171;WE=24838629;WS=24838611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:186,191:0.51:377
chr14	24839083	rs2229309	G	C	2181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.763;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=43;PP=1290;ReadPosRankSum=-1.019;SC=GAAGCAGGGGGCCAGGGTGGG;SOR=0.574;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=175;TCF=99;TCR=76;TR=93;WE=24839098;WS=24839073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,102:0.53:193
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chr14	24843620	rs2295298	T	C	1193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.387;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=16;PP=566;ReadPosRankSum=0.834;SC=TGGTACTGACTGGCTCCAACT;SOR=0.874;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=121;TCF=73;TCR=48;TR=51;WE=24843628;WS=24843610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,60:0.45:134
chr14	24843699	rs12890614	C	T	1376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.281;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=33;PP=790;ReadPosRankSum=-1.122;SC=GAGGGGAGGGCAGGCAGGGAG;SOR=0.906;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=113;TCF=55;TCR=58;TR=63;WE=24843707;WS=24843689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,68:0.55:123
chr14	24845154	rs12880769	C	A	633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=9;PP=399;ReadPosRankSum=-0.007;SC=CCCGAGGGCTCCCTGCCTCAT;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=42;TCR=19;TR=29;WE=24845162;WS=24845144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,32:0.50:64
chr14	24845841	rs7149586	T	C	2411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.320;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=46;PP=1715;ReadPosRankSum=-0.175;SC=CTCCTCTTTCTCCCTGGGGCT;SOR=0.815;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=199;TCF=103;TCR=96;TR=102;WE=24845849;WS=24845831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,110:0.51:216
chr14	24846757	rs2243891	A	G	5394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=110;NR=69;PP=2965;SC=CTAGATTAAGACCTGCCTGGA;SOR=1.078;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=181;TCF=111;TCR=70;TR=179;WE=24846765;WS=24846747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr14	24846961	rs10362	G	T	734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.823;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=21;PP=386;ReadPosRankSum=-0.812;SC=CCTCAGCCCTGCCCCCTTTCC;SOR=0.551;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=88;TCF=32;TCR=56;TR=35;WE=24846969;WS=24846951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,40:0.43:93
chr14	24879519	rs62000679	G	A	458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=14;PP=372;SC=TCCTATGGGCGACATGGGGAA;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=24879527;WS=24879509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	24882440	rs4982909	G	C	935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=6;PP=744;SC=GGGTCTCAGCGCCATGGAGAA;SOR=2.621;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=28;WE=24882448;WS=24882430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr14	24882802	rs11626443	A	G	1296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.23;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr14	24882805	rs10146609	T	C	1264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.17;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr14	24887462	rs3814811	T	C	2911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=44;PP=1677;SC=GGCATCTCTATCTGAAGAGCT;SOR=0.766;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=98;TCF=54;TCR=44;TR=98;WE=24887470;WS=24887452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr14	24898558	rs2273632	C	T	2476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=33;PP=1534;SC=AGCTTCAGGGCAGCCCTGCTG;SOR=1.154;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=51;TCR=33;TR=84;WE=24898566;WS=24898548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr14	24898693	rs2273631	C	T	6932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.60;SOR=0.958;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr14	24898696	rs2273630	T	C	6802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.05;SOR=1.007;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr14	24898751	rs2273629	G	A	1739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=45;PP=1182;SC=GCATCTTTCCGTTTGTTGGAA;SOR=2.194;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=17;TCR=45;TR=62;WE=24898759;WS=24898741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr14	24898780	rs5025771	C	G	817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=45;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=22;PP=605;SC=TACTCCACCACGGGTACCCTC;SOR=2.387;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=27;WE=24898788;WS=24898770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr14	24900209	rs1956905	C	G	1131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=26;PP=791;SC=AGAGCAGGGCCGAGGAGAGCA;SOR=1.480;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=12;TCR=26;TR=38;WE=24900217;WS=24900199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr14	24901249	rs3742520	A	C	1012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.509;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=24;PP=590;ReadPosRankSum=-2.677;SC=GAGGGAGGGAAACAGGGTGGT;SOR=1.011;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=102;TCF=47;TCR=55;TR=43;WE=24901257;WS=24901239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,49:0.45:110
chr14	24901276	rs7151995	G	T	3059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=52;PP=1926;SC=GAGATGGATTGGGGGTGGAAG;SOR=0.936;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=47;TCR=52;TR=99;WE=24901284;WS=24901266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr14	24901844	rs2255591	A	G	5367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=85;PP=2965;SC=CTAAGGGCCTAGGAGAGGGAG;SOR=0.861;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=171;TCF=85;TCR=86;TR=169;WE=24901852;WS=24901834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr14	24905533	rs2277488	G	A	5443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=110;NR=72;PP=2965;SC=TACTGGTCTCGGTTGTCTGGG;SOR=1.190;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=182;TCF=110;TCR=72;TR=182;WE=24905541;WS=24905523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr14	24905548	rs2277489	G	A	6259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=125;NR=89;PP=2965;SC=TCTGGGAGGTGGGCAAGGGCC;SOR=1.066;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=214;TCF=125;TCR=89;TR=214;WE=24905556;WS=24905538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr14	24909281	rs1043839	C	T	2956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=39;PP=1649;SC=GCCCTTGCCACGACCTACTTA;SOR=0.903;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=57;TCR=39;TR=96;WE=24909289;WS=24909271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr14	24909362	rs1043831	T	C	4098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=59;PP=2297;SC=CAGTGTTCGCTGTGGGATCAC;SOR=0.706;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=132;TCF=73;TCR=59;TR=132;WE=24909370;WS=24909352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr14	24909475	rs3211056	C	G	6369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=122;NR=88;PP=2965;SC=GGGCAGCACCCAAGGTCTGGG;SOR=1.009;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=210;TCF=122;TCR=88;TR=210;WE=24909483;WS=24909465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr14	24909731	rs2273628	C	T	7122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=124;NR=112;PP=2965;SC=TACAGGGGTCCTCTCAGCCTT;SOR=0.725;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=236;TCF=124;TCR=112;TR=236;WE=24909739;WS=24909721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
chr14	24910210	rs712487	C	A	4272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=69;PP=2560;SC=TCCCCTTGGCCTCACCTTCTC;SOR=0.813;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=141;TCF=72;TCR=69;TR=141;WE=24910218;WS=24910200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr14	24910317	rs10668100	C	CTT	2667.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=31;PP=1733;SC=TGGAGGAACTCTGGTTGCAGG;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=34;WE=24910325;WS=24910307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr14	24910846	rs11628143	C	T	611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=1;PP=483;SC=GTTCCCCTGGCGAATATAAGG;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=24910854;WS=24910836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr14	24910876	rs11158703	G	A	1003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=3;PP=793;SC=TTTGGGGGGCGTACCTACACC;SOR=4.047;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=31;WE=24910884;WS=24910866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr14	24910973	rs11625819	TT	GA	7159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=74;NR=64;PP=2947;SC=CGGCTGCCGATTACCTCTTTT;SOR=0.826;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=75;TCR=65;TR=138;WE=24910982;WS=24910963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr14	24911116	rs11158704	C	T	2122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=45;PP=1454;SC=CCCTGAATTTCGGCTTAAGAG;SOR=1.547;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=23;TCR=45;TR=68;WE=24911124;WS=24911106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr14	24911169	rs11158705	C	T	1057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=16;PP=812;SC=CATTCATTTCCTGGGCATCCT;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=34;TCF=17;TCR=17;TR=33;WE=24911177;WS=24911159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr14	24911764	rs1956903	G	A	954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=22;PP=686;SC=CTGACACCAGGCTTCTCCCCA;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=29;WE=24911772;WS=24911754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr14	24911852	rs12897925	C	G	1430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=10;PP=1070;SC=GCTAGGAGGCCAAGGCCAGGT;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=40;TCR=10;TR=50;WE=24911860;WS=24911842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr14	24970942	rs4600392	A	G	3525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=57;NR=58;PP=1958;SC=CTCCCAACCAAGTAAAGGGGT;SOR=0.945;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=115;TCF=57;TCR=58;TR=115;WE=24970950;WS=24970932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr14	24971008	rs4519248	C	T	342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.273;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=223;ReadPosRankSum=0.000;SC=GCTGCTGGAACAATGGGCCAT;SOR=2.039;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=37;TCF=14;TCR=23;TR=15;WE=24971016;WS=24970998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
chr14	24975435	rs5249	G	T	2701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=53;PP=1525;SC=AGTTGAATTGGGATGGGAAGG;SOR=1.368;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=35;TCR=53;TR=88;WE=24975443;WS=24975425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr14	24975509	rs1885108	T	C	846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=13;PP=578;SC=AATGAAGGACTGTCAGTCCTC;SOR=0.760;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=13;TCR=13;TR=26;WE=24975517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr14	24976574	rs5247	T	C	1172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=22;PP=707;ReadPosRankSum=-0.163;SC=TCCTGCACAATGAGCAGCCGT;SOR=0.735;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=136;TCF=86;TCR=50;TR=57;WE=24976582;WS=24976564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,61:0.39:156
chr14	25043068	rs1885597	T	G	450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=339;ReadPosRankSum=-1.366;SC=TGCTCCTGCTTCCCTGAGCTC;SOR=1.708;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=15;WE=25043076;WS=25043058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,16:0.70:23
chr14	25044712	rs1957523	C	T	946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.999;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=23;PP=507;ReadPosRankSum=0.965;SC=AAGATGGGGACGGCAGGAGAG;SOR=0.498;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=64;TCF=20;TCR=44;TR=35;WE=25044720;WS=25044702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,42:0.58:73
chr14	25078610	rs66505306	G	C	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.891;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=281;ReadPosRankSum=0.933;SC=TTCATTTTTCGATCTTTGCTG;SOR=0.223;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=17;WE=25078618;WS=25078600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr14	25078914	rs1957526	A	C	720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=23;PP=638;ReadPosRankSum=-0.475;SC=GGTACAGTAAACTCAGAGACC;SOR=3.528;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=24;WE=25078922;WS=25078904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,23:0.96:24
chr14	25100110	rs8192919	G	A	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=175;ReadPosRankSum=2.310;SC=CCTGCATAGCGCAGATGTGGT;SOR=0.169;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=10;WE=25100118;WS=25100105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr14	25100247	rs2236337	T	C	1825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.823;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=39;PP=1224;ReadPosRankSum=-0.174;SC=GGTGTTTCATTACAGCGGGGG;SOR=0.568;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=91;TCR=74;TR=86;WE=25100255;WS=25100237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,91:0.51:180
chr14	25100282	rs2236338	A	G	2039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.088;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=46;PP=1238;ReadPosRankSum=0.108;SC=TGTAGTTAGTAGCGTTTCATG;SOR=0.738;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=187;TCF=96;TCR=91;TR=94;WE=25100290;WS=25100272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,102:0.50:202
chr14	25100933	rs6573911	C	T	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=189;ReadPosRankSum=0.498;SC=CTAGTCCCCTCTTCTCTTTCC;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=9;WE=25100941;WS=25100923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr14	25101548	rs1126639	G	A	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.28;MQRankSum=-2.369;QD=12.72;ReadPosRankSum=-0.135;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr14	25101589	rs11539752	G	C	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.352;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.484;NF=8;NR=0;PP=150;ReadPosRankSum=2.298;SC=TGGGGGATGGGTCTTTTCACA;SOR=3.706;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=8;WE=25101597;WS=25101579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr14	25101629	rs10909625	T	C	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.237;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.261;NF=20;NR=5;PP=442;ReadPosRankSum=-2.810;SC=GCTCCTGTTCTTTGATATTGT;SOR=1.520;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=48;TCF=35;TCR=13;TR=25;WE=25101637;WS=25101619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,28:0.53:53
chr14	25101706	rs10873219	G	T	1174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.586;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.640;NF=29;NR=22;PP=789;ReadPosRankSum=1.000;SC=GGAGTCACAGGGTATACAGCC;SOR=0.922;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=92;TCF=52;TCR=40;TR=51;WE=25101714;WS=25101696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,55:0.53:104
chr14	25101878	rs8192918	C	CT	3548.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.755;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.094;NF=20;NR=38;PP=2287;ReadPosRankSum=-0.661;SC=AGTTTGTATTCTATGCCAAAG;SOR=0.769;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=138;TCF=38;TCR=100;TR=58;WE=25101886;WS=25101868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,117:0.46:255
chr14	25102056	rs9671454	G	C	664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.953;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=16;PP=441;ReadPosRankSum=-0.065;SC=GGAGCTCCTTGGGAAGAAGGC;SOR=0.930;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=49;TCF=23;TCR=26;TR=27;WE=25102075;WS=25102046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,29:0.56:52
chr14	25102160	rs8192917	C	T	1507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.676;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=25;PP=804;ReadPosRankSum=0.558;SC=GAAGTCGTCTCGTATCAGGAA;SOR=0.614;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=104;TCF=66;TCR=38;TR=62;WE=25102168;WS=25102150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,71:0.57:124
chr14	25103409	rs2273843	T	C	1546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.16;ReadPosRankSum=1.501;SOR=0.681;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,42:0.41:102
chr14	25103414	rs2273844	G	A	1552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.84;ReadPosRankSum=1.259;SOR=0.738;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,42:0.43:98
chr14	25281843	rs712491	C	T	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.898;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=294;ReadPosRankSum=-0.783;SC=GCGGAGGTCCCGAATTCTTGT;SOR=0.570;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=45;TCR=23;TR=23;WE=25281851;WS=25281833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,30:0.39:76
chr14	25287095	rs854398	T	C	462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=1;PP=356;SC=ATGAATGAGATGACAAGACAG;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=25287103;WS=25287085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	25288212	rs71405872	A	C	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=256;ReadPosRankSum=0.401;SC=AACACCCCAGAGCTGAGAAGC;SOR=0.498;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=17;WE=25288220;WS=25288202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr14	25288227	rs749594	T	C	624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.076;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=431;ReadPosRankSum=-0.785;SC=AGAAGCCTGCTCCTCTCTTGG;SOR=0.180;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=46;TCF=36;TCR=10;TR=26;WE=25288235;WS=25288217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,28:0.58:48
chr14	26939474	rs1245213	T	A	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.228;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=142;ReadPosRankSum=0.154;SC=CAAAGCTAAATTAATCAGGAC;SOR=0.177;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=11;WE=26939482;WS=26939464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr14	27065105	rs189205278	C	T	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=195;ReadPosRankSum=0.197;SC=TGAACTGACCCTTTAACAAAA;SOR=0.741;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=13;WE=27065113;WS=27065095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,14:0.33:43
chr14	29238047	rs68024132	GC	G	55.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=3;PP=52;SC=TTTTTATTAAGCCCCCCCCTC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=29238055;WS=29238037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr14	29261309	rs56025822	A	AAAC	4440.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.631;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.864;NF=25;NR=46;PP=2612;ReadPosRankSum=0.216;SC=AGCACTAAAAAAAACAAACAA;SOR=0.917;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=160;TCF=43;TCR=117;TR=71;WE=29261317;WS=29261294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,118:0.43:276
chr14	30047580	rs2273815	C	T	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.794;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=11;PP=278;ReadPosRankSum=-1.202;SC=AAAAAAATTACCAGTAAAAAT;SOR=0.321;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=49;TCF=22;TCR=27;TR=23;WE=30047588;WS=30047570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,25:0.45:56
chr14	30066929	rs2230505	A	G	1995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.175;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=50;PP=1323;ReadPosRankSum=0.871;SC=ACTTCTCTCCAATGATCCGGG;SOR=0.868;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=226;TCF=111;TCR=115;TR=92;WE=30066937;WS=30066919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,101:0.40:250
chr14	30066976	rs3783299	A	T	1835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.696;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=52;PP=1168;ReadPosRankSum=-1.682;SC=TGTTGATGAAAGGATTTGCAG;SOR=0.853;SbPval=0.69;Source=Platypus;TCR=113;TR=86;WE=30066984;WS=30066966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,94:0.43:217
chr14	30068194	rs2273813	T	G	3583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.392;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=75;PP=2293;ReadPosRankSum=-0.482;SC=TAGCAATGCTTCCAACTGGCT;SOR=0.648;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=303;TCF=160;TCR=143;TR=154;WE=30068211;WS=30068184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,170:0.50:340
chr14	30098349	rs1191601	T	C	1253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.658;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=28;PP=734;ReadPosRankSum=-1.678;SC=GTAAGAGATGTAATAGCAAAA;SOR=0.769;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=116;TCF=57;TCR=59;TR=55;WE=30098357;WS=30098339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,61:0.48:126
chr14	30102025	rs1209180	T	C	1825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=31;PP=1026;ReadPosRankSum=-1.817;SC=TACATTCCCATGAAAAAGCAA;SOR=0.483;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=141;TCF=92;TCR=49;TR=79;WE=30102033;WS=30102015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,87:0.56:156
chr14	30103441	rs1191599	T	C	147.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=0;PP=117;SC=TTTCCTAACTTCGTTGCTTGC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=30103449;WS=30103431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr14	31355096	rs1045644	C	G	9165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=342;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=169;NR=139;PP=2965;SC=AAGCTGTGCACTCATGAACAA;SOR=0.843;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=308;TCF=169;TCR=139;TR=308;WE=31355104;WS=31355086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,342:1.00:342
chr14	31380215	rs3830860	TA	T	2347.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.12;NF=21;NR=26;PP=1064;SC=TCCATTCACTTAAAAAAAATA;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=23;TCR=29;TR=47;WE=31380223;WS=31380205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr14	31381351	rs2273171	T	C	7138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=135;PP=2965;SC=ATACTTGGGATTCCATGTCTT;SOR=1.161;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=234;TCF=99;TCR=135;TR=234;WE=31381359;WS=31381341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr14	31404277	rs9322868	T	C	3062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=30;PP=1808;SC=TGCCACCATATATTTATACAC;SOR=1.546;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=96;TCF=65;TCR=31;TR=95;WE=31404285;WS=31404267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr14	31483761	rs179724	G	T	467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=4;PP=289;SC=TTTTACGTCTGTTTATAAAGT;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=13;WE=31483769;WS=31483751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr14	31535603	rs6571386	G	C	6850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=105;NR=124;PP=2965;SC=TTTGTTATTAGTGAGTCTCAG;SOR=0.996;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=230;TCF=106;TCR=124;TR=229;WE=31535611;WS=31535593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr14	31538939	rs7150619	A	G	601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=10;PP=300;ReadPosRankSum=-2.113;SC=TTAATATTCTATATTTCTAGG;SOR=0.568;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=52;TCF=33;TCR=19;TR=25;WE=31538947;WS=31538929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,29:0.50:58
chr14	31538984	rs7155228	C	G	3008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=38;PP=1822;SC=CTAGAACTTACGCATGTCATT;SOR=1.069;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=98;TCF=60;TCR=38;TR=98;WE=31538992;WS=31538974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr14	31549745	rs11621299	T	G	1851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.680;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=25;PP=1020;ReadPosRankSum=-1.189;SC=CAGTGTCTTTTTTCTAACCCT;SOR=0.586;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=117;TCF=77;TCR=40;TR=69;WE=31549753;WS=31549735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,80:0.60:133
chr14	31582380	rs1315794	A	G	1181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=21;NR=16;PP=772;SC=AGTAAACTGAAGCTGTTCATC;SOR=0.741;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=21;TCR=16;TR=37;WE=31582388;WS=31582370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr14	31582526	rs2273483	T	C	2145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.007;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=43;PP=1411;ReadPosRankSum=-1.318;SC=CAACTATATATAGAATACGCA;SOR=0.621;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=213;TCF=123;TCR=90;TR=99;WE=31582534;WS=31582516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,106:0.45:235
chr14	31583512	rs61976859	C	T	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.630;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=206;ReadPosRankSum=1.995;SC=TTTTCCTTTTCTTTATCAGAA;SOR=1.487;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=52;TCF=22;TCR=30;TR=16;WE=31583520;WS=31583502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,20:0.34:59
chr14	31597685	rs7157007	C	G	936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=1;PP=687;SC=TATTCCTGAACTGCTAAATTT;SOR=4.548;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=31597693;WS=31597675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr14	31610939	rs12888959	T	C	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.172;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=387;ReadPosRankSum=-0.130;SC=ACATGTATAATATGTTACTTT;SOR=0.988;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=51;TCF=38;TCR=13;TR=23;WE=31610947;WS=31610929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,25:0.45:55
chr14	31647241	rs2274201	G	A	2506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=43;PP=1646;ReadPosRankSum=-0.662;SC=CACACTGTTCGGCTAAGTCTC;SOR=0.678;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=236;TCF=148;TCR=88;TR=113;WE=31647249;WS=31647231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,122:0.46:263
chr14	31647448	rs34666986	G	A	1426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.243;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=44;PP=926;ReadPosRankSum=-1.077;SC=GTAAGAAAGTGCGAGGAGGAC;SOR=0.840;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=158;TCF=60;TCR=98;TR=69;WE=31647456;WS=31647438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,72:0.41:177
chr14	31793053	rs57656564	GAT	G	1152.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=23;PP=1096;SC=TCAACTGAAAGATATATATAT;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=23;WE=31793062;WS=31793043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr14	31795361	rs3736917	A	G	2956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=62;NR=34;PP=1785;SC=ATAATGTCCAATACTTACCAG;SOR=1.265;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=62;TCR=34;TR=96;WE=31795369;WS=31795351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr14	31806943	rs4595710	T	C	1403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=30;PP=938;SC=GGACACAATTTATAAATACAT;SOR=1.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=14;TCR=30;TR=44;WE=31806951;WS=31806933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr14	31809486	rs8012940	C	T	782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=4;PP=499;SC=TTTGCTTATACTGGTATCAAA;SOR=3.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=23;WE=31809494;WS=31809476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr14	31809568	rs11408327	G	GA	4476.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=36;PP=2972;SC=AGATGCAGAGGAAACAAACAT;SOR=1.389;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=46;TCR=39;TR=78;WE=31809576;WS=31809558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr14	31819047	rs3736918	C	T	5141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=76;PP=2965;SC=TCATCTACCACTTGGGCTAAT;SOR=0.823;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=176;TCF=100;TCR=76;TR=176;WE=31819055;WS=31819037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr14	31819913	rs7158257	A	G	4099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=69;PP=2256;SC=AGCTGTTCCAATATAAGAAGC;SOR=0.909;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=133;TCF=63;TCR=70;TR=132;WE=31819921;WS=31819903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr14	31819966	rs10602248	TTTTG	T	853.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=15;PP=1007;SC=GTAGGTAAGTTTTTGTTTGTT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=1;TCR=36;TR=15;WE=31819977;WS=31819956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr14	31828076	rs942907	A	C	4432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=66;NR=78;PP=2783;SC=ATTGAATCTAATCAAGAGTAA;SOR=0.944;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=144;TCF=66;TCR=78;TR=144;WE=31828084;WS=31828066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr14	31841162	rs5025288	T	C	4062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=95;PP=2274;SC=TAATCAACCATGAAAGGCACA;SOR=1.506;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=147;TCF=52;TCR=95;TR=147;WE=31841170;WS=31841152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr14	31849524	rs4981841	T	A	956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=1;PP=769;SC=AAAGGCTTTTTAAGGTGACTA;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=30;WE=31849532;WS=31849518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr14	31858025	rs3887865	C	T	3750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=38;PP=2294;SC=AAGAGTTAGACTGAGATACTG;SOR=1.558;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=122;TCF=84;TCR=38;TR=122;WE=31858033;WS=31858015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr14	31864300	rs7142126	T	C	811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=1;PP=570;SC=GAGATAGTCCTAGCTGACTAC;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=31864308;WS=31864290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr14	31864485	rs7141532	G	C	8404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=140;NR=146;PP=2965;SC=CTGTGACAAGGTGCAGCGGCA;SOR=0.866;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=287;TCF=140;TCR=147;TR=286;WE=31864493;WS=31864475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,311:1.00:311
chr14	31922408	rs34278949	G	A	3162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=32;PP=1945;SC=GCCTCCCAACGTGTTGGGATT;SOR=1.695;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=101;TCF=69;TCR=32;TR=100;WE=31922416;WS=31922398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr14	32019884	rs76342166	G	A	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=150;ReadPosRankSum=-0.953;SC=TTTGGCGAAAGGAAAACAGGG;SOR=0.512;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=8;WE=32019892;WS=32019874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr14	32031245	rs77709919	C	T	846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.030;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=15;PP=551;ReadPosRankSum=-0.145;SC=TTATTTAAAACGGCTTTTTAT;SOR=0.398;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=86;TCF=59;TCR=27;TR=42;WE=32031253;WS=32031235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,43:0.49:88
chr14	32032129	rs10143899	C	T	1164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.78;SOR=0.823;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr14	32032214	rs10144137	G	A	275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=8;PP=200;SC=TATTTGTGGTGGATCACTAAT;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=32032222;WS=32032204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr14	32034147	rs3759779	A	T	699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=16;NR=10;PP=419;SC=ATTACATGAAAATATTAAAAG;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=16;TCR=10;TR=26;WE=32034155;WS=32034137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr14	32142544	.	A	AT	46	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5165;HP=12;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=4;NR=0;PP=46;QD=13.0;SC=AAAAGAGAGGATTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=32142552;WS=32142534;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr14	32296018	rs1540425	A	G	1716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=37;PP=1104;SC=TTAGTCCTGTACAGAAGTCTT;SOR=2.226;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=11;TCR=37;TR=48;WE=32296026;WS=32296008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr14	32315901	rs8006872	A	G	1850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=44;PP=1327;SC=GGAGTCTCACACCTGTAATCC;SOR=1.963;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=18;TCR=44;TR=62;WE=32315909;WS=32315891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr14	32328508	rs4981131	G	C	1190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=25;PP=786;SC=TCTAAGGAAAGAATGTCTTCA;SOR=2.613;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=32;WE=32328516;WS=32328498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr14	32414145	rs1278926	C	A	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=338;ReadPosRankSum=0.944;SC=CTGCTGGGACCGACTGCAGCT;SOR=0.604;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=46;TCF=35;TCR=11;TR=23;WE=32414153;WS=32414135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,23:0.45:51
chr14	32414386	rs1278927	C	A	1120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.958;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=29;PP=735;ReadPosRankSum=-1.818;SC=TTAATAGGGTCAAAGGAGGGT;SOR=1.184;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=92;TCF=40;TCR=52;TR=46;WE=32414394;WS=32414376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,51:0.49:104
chr14	32414463	rs1278928	T	C	459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=343;SC=TGGGCAGGCATCCATTATGTG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=32414471;WS=32414453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr14	32419235	rs1278941	A	G	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=345;ReadPosRankSum=1.693;SC=CAGCCTGCCCAGGTTTATTAA;SOR=0.678;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=54;TCF=41;TCR=13;TR=26;WE=32419243;WS=32419225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,27:0.47:58
chr14	32419331	rs1278942	C	T	1777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.251;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=36;PP=894;ReadPosRankSum=-1.757;SC=TAAGAGCATACTCCCTGAAGA;SOR=0.741;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=204;TCF=110;TCR=94;TR=77;WE=32419339;WS=32419321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,95:0.40:236
chr14	32419398	rs2236532	G	A	1283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.969;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=26;PP=631;ReadPosRankSum=-0.299;SC=CTGAGCAATAGGAATTTCTTC;SOR=0.374;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=136;TCF=59;TCR=77;TR=53;WE=32419406;WS=32419388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,66:0.41:161
chr14	32419548	rs1278943	C	T	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.46;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr14	32563640	rs8004384	A	G	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.898;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=17;PP=385;ReadPosRankSum=-1.130;SC=GCTTGTTGTTACTTTTTTAAA;SOR=0.842;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=68;TCF=29;TCR=39;TR=28;WE=32563648;WS=32563630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,30:0.39:77
chr14	33014869	rs3742926	C	T	2817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=42;PP=1584;ReadPosRankSum=0.546;SC=ACAAATGCTGCTCAACCCTCC;SOR=0.710;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=199;TCF=119;TCR=80;TR=108;WE=33014877;WS=33014859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,129:0.55:234
chr14	33015014	rs7150894	G	A	9529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=163;NR=156;PP=2965;SC=ACTCTCCCACGCAGCCTACAT;SOR=0.710;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=319;TCF=163;TCR=156;TR=319;WE=33015022;WS=33015004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,349:1.00:349
chr14	33015082	rs17099240	A	G	3612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.752;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=79;PP=2245;ReadPosRankSum=-1.319;SC=CTGAAAGGCAATGGTGGAAAG;SOR=0.901;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=275;TCF=131;TCR=144;TR=147;WE=33015090;WS=33015072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,164:0.54:304
chr14	33046388	rs1950703	A	G	9118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=161;NR=140;PP=2965;SC=AAACTACAGAAAATTGGACTC;SOR=0.792;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=302;TCF=162;TCR=140;TR=301;WE=33046396;WS=33046378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,336:1.00:336
chr14	33046471	rs768787	T	G	2441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.035;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=65;PP=1588;ReadPosRankSum=-0.854;SC=GTGTTGTTCTTGCTGTCAATA;SOR=0.770;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=206;TCF=83;TCR=123;TR=107;WE=33046479;WS=33046461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,115:0.51:225
chr14	33068608	rs17506750	C	T	2174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.099;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=34;PP=1369;ReadPosRankSum=0.734;SC=TCATATTTTTCCTTGCAGAGT;SOR=0.794;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=178;TCF=107;TCR=71;TR=89;WE=33068616;WS=33068598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,102:0.50:203
chr14	33147414	rs1950697	C	G	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=129;ReadPosRankSum=0.928;SC=AAAAGGAGCACTATAATGATG;SOR=1.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=7;WE=33147422;WS=33147404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr14	33165182	rs3742929	C	T	728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.015;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=16;PP=424;ReadPosRankSum=0.666;SC=CTACATTTTGCGCCTTATCTT;SOR=0.420;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=65;TCF=41;TCR=24;TR=36;WE=33165190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,38:0.54:71
chr14	33242863	rs2273163	T	C	2985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=55;PP=1490;ReadPosRankSum=0.330;SC=ACTCATAGATTGGTTTCTCTC;SOR=0.712;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=232;TCF=128;TCR=104;TR=124;WE=33242871;WS=33242853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,142:0.54:264
chr14	33292743	rs2239647	A	C	7307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=117;NR=113;PP=2965;SC=GGCAAAAGGGAAAACCGAATG;SOR=0.731;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=230;TCF=117;TCR=113;TR=230;WE=33292751;WS=33292733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr14	33293122	rs1051695	A	G	9400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=350;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=153;NR=155;PP=2965;SC=TTCTATCAGCAACATTTCCTG;SOR=0.782;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=309;TCF=154;TCR=155;TR=308;WE=33293130;WS=33293112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,349:1.00:349
chr14	33293531	rs4647899	T	A	5637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=97;PP=2965;SC=GAGCCTTGTTTCTCTAGTGCT;SOR=0.849;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=188;TCF=91;TCR=97;TR=188;WE=33293539;WS=33293521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr14	33294042	rs2057121	G	A	2474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=60;PP=1760;SC=TCCTCATGCCGTATATGTATT;SOR=2.049;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=20;TCR=60;TR=80;WE=33294050;WS=33294032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr14	33525317	rs35719018	G	GA	164.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.499;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.674;NF=0;NR=11;PP=162;ReadPosRankSum=0.172;SC=TAGTGGGGGAGAAAAAAAAAC;SOR=1.781;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=11;WE=33525325;WS=33525307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr14	33836599	rs1609948	A	G	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.884;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=83;ReadPosRankSum=-1.033;SC=TTTTATCTTGAAATTCCGAAA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=33836607;WS=33836589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr14	34047414	rs1958541	T	C	2587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-0.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=61;PP=1487;ReadPosRankSum=-1.038;SC=TTTTTCCCTCTTTGAGACGGA;SOR=0.689;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=200;TCF=80;TCR=120;TR=103;WE=34047422;WS=34047404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,124:0.55:226
chr14	34149916	rs2297118	T	C	1982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.727;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=45;PP=1368;ReadPosRankSum=0.992;SC=CAAGGGGCTCTTGTGGCTTTT;SOR=0.495;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=156;TCF=76;TCR=80;TR=87;WE=34149924;WS=34149906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,90:0.54:168
chr14	34149997	rs2297117	T	C	689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.578;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=26;PP=467;ReadPosRankSum=0.055;SC=GCAAAATGCATGAGGCAGTAC;SOR=1.481;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=68;TCF=23;TCR=45;TR=34;WE=34150005;WS=34149987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,35:0.46:76
chr14	34243477	rs8019077	T	A	2175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=44;NR=31;PP=1257;SC=GCATTTCTCATAAGAAATGCT;SOR=1.048;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=44;TCR=31;TR=75;WE=34243485;WS=34243467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr14	34249813	rs61973025	A	C	2758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.419;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=54;PP=1836;ReadPosRankSum=-1.086;SC=GCATCATGCTATCTCTCTGGG;SOR=0.720;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=282;TCF=166;TCR=116;TR=131;WE=34249821;WS=34249803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,136:0.44:308
chr14	34263034	rs36025922	TAAA	T	757.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=6.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.40;MQRankSum=1.463;QD=16.12;ReadPosRankSum=0.858;SOR=2.007;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,25:0.53:47
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chr14	34396100	rs10137361	C	T	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=198;ReadPosRankSum=1.336;SC=TTTAAAACTACATAAAATTGA;SOR=0.714;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=36;TCF=25;TCR=11;TR=19;WE=34396108;WS=34396090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,20:0.54:37
chr14	34985645	rs7797	G	A	4062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=383;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.662;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=90;PP=2518;ReadPosRankSum=-0.570;SC=CTGCCTTCTCGGCAGCATCTT;SOR=0.791;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=349;TCF=173;TCR=176;TR=173;WE=34985653;WS=34985621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:190,191:0.50:381
chr14	34993863	rs61981524	A	G	335.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=3.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.11;MQRankSum=0.000;QD=4.00;ReadPosRankSum=0.200;SOR=1.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,16:0.19:84
chr14	34998705	rs12147949	T	C	1167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.368;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=36;PP=645;ReadPosRankSum=0.109;SC=TATTAGGATATGGCTAAGAAT;SOR=0.824;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=137;TCF=49;TCR=88;TR=56;WE=34998713;WS=34998695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,62:0.42:146
chr14	35037008	rs11156848	T	C	1491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.050;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=29;PP=991;ReadPosRankSum=-0.992;SC=TTATTTAATTTACATAATAGT;SOR=0.601;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=124;TCF=63;TCR=61;TR=62;WE=35037016;WS=35036998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,68:0.51:134
chr14	35062312	rs12432539	C	T	1172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.428;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=23;PP=560;ReadPosRankSum=1.155;SC=GGTTATGATACTCCAAAAGAA;SOR=0.879;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=108;TCF=52;TCR=56;TR=46;WE=35062320;WS=35062302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,58:0.46:125
chr14	35075022	rs7151774	G	T	2387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.491;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=59;PP=1363;ReadPosRankSum=-0.189;SC=AAGCTAAGGGGATCCAGAATG;SOR=0.748;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=201;TCF=90;TCR=111;TR=104;WE=35075030;WS=35075012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,116:0.52:224
chr14	35099099	rs11847568	A	G	1424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=18;PP=784;ReadPosRankSum=0.967;SC=GAGCGAAAGGAAGGCAGAACT;SOR=0.747;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=114;TCF=72;TCR=42;TR=54;WE=35099107;WS=35099089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,64:0.51:126
chr14	35182406	rs35219728	GATA	G	1819.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.926;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.407;NF=6;NR=22;PP=1060;ReadPosRankSum=-0.135;SC=GACTGACTATGATAATAATAA;SOR=0.397;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=68;TCF=27;TCR=41;TR=28;WE=35182416;WS=35182396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,48:0.51:94
chr14	35183548	rs10149653	C	A	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.201;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.73;ReadPosRankSum=0.424;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr14	35222626	rs3832925	A	ATTGT	907.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=3;PP=857;SC=TGGTCAATCAATTGTTATTGC;SOR=2.948;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=15;WE=35222634;WS=35222616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr14	35223956	rs8005659	A	G	456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=301;SC=ACCTCTTTAAACAAAAATAAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=35223964;WS=35223946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	35223971	rs8009900	A	G	569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=15;NR=0;PP=335;SC=AATAAATATCAAAGATGCTAT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=35223979;WS=35223961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	35227880	rs61981201	G	T	3077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=24;PP=2031;SC=ATAATATACAGGAATACATTT;SOR=2.259;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=76;TCR=24;TR=100;WE=35227888;WS=35227870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr14	35228090	rs61981202	G	A	4384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=99;PP=2866;SC=TGATAACAAAGCAAAATATTG;SOR=1.973;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=140;TCF=41;TCR=99;TR=140;WE=35228098;WS=35228080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr14	35230906	rs17526787	G	A	502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=420;SC=CTCAACATTCGATATTTCCAA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=35230914;WS=35230896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr14	35237874	rs61981228	C	A	1920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=41;NR=27;PP=1020;SC=ACATAAATTTCTTTAAAAAGT;SOR=0.963;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=41;TCR=27;TR=68;WE=35237882;WS=35237864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr14	35238045	rs10150083	G	C	260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=1;NR=11;PP=275;SC=AAGGGTTTAAGCATAAGTATG;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=35238053;WS=35238035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr14	35242828	rs2275145	G	A	2895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=33;PP=1546;SC=TCTCTTCTACGTCTTCATTCA;SOR=1.253;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=57;TCR=33;TR=90;WE=35242836;WS=35242818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr14	35243006	rs2275146	G	A	777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=22;PP=594;SC=AGTTCAATATGCATATAAAAT;SOR=4.255;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=24;WE=35243014;WS=35242996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr14	35245748	rs17102726	A	G	1266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=30;PP=829;SC=ATGTTTCATCATCATCATATT;SOR=3.109;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=37;WE=35245756;WS=35245738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr14	35468893	rs12433712	T	A	3217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=57;PP=1897;SC=AGGCACAGTTTAGTTTAGTTT;SOR=0.997;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=51;TCR=57;TR=108;WE=35468901;WS=35468883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr14	35476673	rs28456062	G	A	343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=11;PP=268;SC=ATATAAAAATGTAAAGCCTGG;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=35476681;WS=35476663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr14	35477785	rs1712351	G	A	588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=13;NR=5;PP=335;SC=TATATGTATAGTTTGTTATAT;SOR=1.508;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=18;WE=35477793;WS=35477775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr14	35482797	rs2383692	A	G	2479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=45;PP=1669;SC=ATATGTTTCAATAGTGAGCCT;SOR=1.153;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=34;TCR=45;TR=79;WE=35482805;WS=35482787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr14	35483882	rs13379372	A	C	1547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=12;PP=1077;SC=ATGTATGTGAATGTGTTTTGT;SOR=2.137;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=39;TCR=12;TR=51;WE=35483890;WS=35483872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr14	35488309	rs17102982	A	G	1190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=30;PP=947;SC=TTCCTCAGGCAAAAATGTTCT;SOR=2.191;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=10;TCR=30;TR=40;WE=35488317;WS=35488299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr14	35492298	.	AAGCTTGTTATTAGTTAAC	A	2930	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=0;NR=41;PP=2930;QD=20;SC=TAAGAAAAATAAGCTTGTTAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=0;TCR=44;TR=41;WE=35492326;WS=35492288;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,41:0.93:44
chr14	35492299	rs202204501	AG	A	4447.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.04;SOR=2.572;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr14	35492301	rs369856554	CTTGTTATTAGTTAACAG	C	4446.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.03;SOR=2.572;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr14	35492318	.	G	C	1297	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=6;NR=41;PP=1297;QD=28.3355577138;SC=TTAGTTAACAGACGGAAAAGA;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=52;TCF=6;TCR=46;TR=47;WE=35492326;WS=35492288;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,47:0.90:52
chr14	35497285	rs78609489	T	C	4338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.52;SOR=1.206;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr14	35497487	.	C	T	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.722;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=135;ReadPosRankSum=0.591;SC=AAAATATGTTCAAAAGGTGTG;SOR=0.941;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=11;WE=35497495;WS=35497477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,10:0.26:38
chr14	35498443	rs28577270	G	A	684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=21;PP=579;SC=CGAATTGGGGGGAAAGTGTAT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=35498451;WS=35498433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr14	35515606	rs4007475	TGG	T	862.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=0;PP=547;SC=AGGCGGGCGCTGGGCGGGTGA;SOR=3.716;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=35515615;WS=35515596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr14	35515920	rs2295103	C	G	5603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=106;NR=92;PP=2965;SC=CCTGCGCGGCCGTCCTCCGAG;SOR=0.778;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=198;TCF=106;TCR=92;TR=198;WE=35515928;WS=35515910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr14	35565856	rs17091786	A	T	4840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=91;PP=2965;SC=GAACACAAAGACATAATTAGA;SOR=0.911;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=170;TCF=79;TCR=91;TR=170;WE=35565864;WS=35565846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr14	35576458	rs10132769	A	C	2836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=62;NR=33;PP=1675;SC=ACTACAGTTTACATTTTAGTG;SOR=1.064;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=62;TCR=33;TR=95;WE=35576466;WS=35576448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr14	35579927	rs2295104	G	A	2064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=37;PP=1124;SC=GTATGCCACCGCCTCGAATTA;SOR=1.150;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=30;TCR=37;TR=67;WE=35579935;WS=35579917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr14	35585669	rs12437439	C	A	319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.9971;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=217;SC=CTATGTTGCCCTGGCTGGTCT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=35585677;WS=35585659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	35596092	rs10147080	C	A	492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=14;PP=374;SC=AGGATAATTACAAGTTTGTAA;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=35596100;WS=35596082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr14	35871093	rs696	C	T	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.385;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.15;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr14	35871217	rs8904	G	A	1447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=0.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.57;ReadPosRankSum=-1.293;SOR=0.791;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,78:0.46:169
chr14	35871407	rs1022714	A	G	849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.13;MQRankSum=1.047;QD=9.88;ReadPosRankSum=-0.294;SOR=0.466;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,42:0.49:86
chr14	35871441	rs70937092	A	AGTAAGCTATTAAAAAAAGG	689.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=1.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.00;MQRankSum=2.114;QD=18.15;ReadPosRankSum=-1.476;SOR=1.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr14	35872792	rs2233415	A	G	4032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=78;NR=51;PP=2451;SC=AGGTGAGGGTAAATAGTGCTC;SOR=1.067;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=78;TCR=52;TR=129;WE=35872800;WS=35872782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr14	35873770	rs1957106	G	A	8765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=131;NR=168;PP=2965;SC=CGTGGCGGTCGTCCAGTAGCC;SOR=1.031;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=299;TCF=131;TCR=168;TR=299;WE=35873778;WS=35873760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,333:1.00:333
chr14	36004075	rs1958260	A	G	6625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=121;NR=93;PP=2965;SC=GCACCCACGGACTGCGCGTCT;SOR=0.943;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=214;TCF=121;TCR=93;TR=214;WE=36004083;WS=36004065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr14	36042050	rs2296920	T	C	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.155;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=62;ReadPosRankSum=0.849;SC=TGATCAGTTTTACATATGAAA;SOR=0.631;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=5;WE=36042058;WS=36042040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr14	36121087	rs35892589	CA	C	785.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=21;PP=476;SC=GATCTGTAAGCAAAAAAAAAT;SOR=2.019;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=22;WE=36121096;WS=36121077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr14	36147012	rs1957830	C	T	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=327;ReadPosRankSum=0.516;SC=AAAAAAGTTACATTAACAAAT;SOR=0.674;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=19;WE=36147020;WS=36147002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr14	36153177	rs2274068	T	C	2041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.493;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.868;NF=46;NR=40;PP=1215;ReadPosRankSum=1.105;SC=CCAGTGTCGGTTCCAAAGCCA;SOR=0.703;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=193;TCF=102;TCR=91;TR=86;WE=36153185;WS=36153167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,100:0.45:222
chr14	36191030	rs2296168	A	G	864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.371;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.037;NF=23;NR=13;PP=431;ReadPosRankSum=0.902;SC=TGTCAACTGAAACTTTCTGAA;SOR=0.988;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=106;TCF=59;TCR=47;TR=36;WE=36191038;WS=36191020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,47:0.36:129
chr14	36221383	rs10136235	T	C	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=1.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.55;ReadPosRankSum=-1.783;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr14	36231816	rs11847872	G	A	1872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=21;PP=1300;SC=AGACAATTCAGAGATCTTTAG;SOR=1.473;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=42;TCR=21;TR=63;WE=36231824;WS=36231806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr14	36232026	rs17103516	G	A	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=319;ReadPosRankSum=-0.776;SC=GTTCTCGGTCGGACTTGAAAA;SOR=0.746;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=45;TCF=16;TCR=29;TR=23;WE=36232034;WS=36232016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,25:0.48:52
chr14	36244815	rs7142261	C	A	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.203;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr14	36298932	rs10146494	G	T	1420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.641;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=29;PP=747;ReadPosRankSum=-1.134;SC=TTTAGAAAATGAGAAAAAAAT;SOR=0.722;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=115;TCF=62;TCR=53;TR=60;WE=36298940;WS=36298922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,70:0.53:133
chr14	36300895	rs34375843	T	G	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=202;ReadPosRankSum=-0.825;SC=GGAGGCAGGGTTTTTTTGTGG;SOR=0.324;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=12;WE=36300903;WS=36300885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr14	36334030	rs12890607	G	C	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=125;ReadPosRankSum=0.970;SC=AATTTAGGATGCCAAAGCATT;SOR=0.520;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=43;TCF=28;TCR=15;TR=12;WE=36334038;WS=36334020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,12:0.27:44
chr14	36401091	rs10137072	C	G	889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.960;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=26;PP=629;ReadPosRankSum=-0.329;SC=ATATTTGTGGCACTTTTCTTT;SOR=0.361;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=56;TCF=10;TCR=46;TR=33;WE=36401099;WS=36401081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,35:0.59:59
chr14	36768276	rs4900833	T	C	2804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=35;PP=1583;SC=ATGACAAGGATGAGAGGAGTT;SOR=1.222;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=96;TCF=61;TCR=35;TR=96;WE=36768284;WS=36768266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr14	36769898	rs2296387	T	G	608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=9;PP=304;ReadPosRankSum=0.485;SC=GGGTATGACCTAAAAGCAACC;SOR=0.719;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=52;TCF=35;TCR=17;TR=28;WE=36769906;WS=36769888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,31:0.53:59
chr14	36770036	.	TA	T	58.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.313;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.37;MQRankSum=1.561;QD=2.67;ReadPosRankSum=0.918;SOR=0.382;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr14	36781037	rs7154340	C	T	1445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=8;PP=929;SC=CATCTAACCACAAGTATGAAG;SOR=2.400;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=32;TCR=8;TR=40;WE=36781045;WS=36781027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr14	36789729	rs3168891	T	G	2848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=49;NR=40;PP=1442;SC=AGAGGTTGGGTCTGCATCTTC;SOR=0.830;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=49;TCR=40;TR=89;WE=36789737;WS=36789719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr14	36789775	rs2899849	A	T	2379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=23;NR=32;PP=946;SC=CGGGCGATTAAGCTCCGTGGC;SOR=1.306;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=23;TCR=32;TR=55;WE=36789783;WS=36789765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr14	36789795	rs11558802	G	A	1847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=16;NR=21;PP=571;SC=CAGCAGCCATGATATCTTCTC;SOR=1.206;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=16;TCR=21;TR=37;WE=36789803;WS=36789785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr14	36840650	rs3742592	A	T	6645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=121;NR=105;PP=2965;SC=CCAACCTACAACCCAGGGTCT;SOR=0.792;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=228;TCF=122;TCR=106;TR=226;WE=36840658;WS=36840640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr14	36944188	rs1012914	G	A	2502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=57;PP=1656;SC=CTATTTCTGCGTAACAAATTA;SOR=1.662;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=27;TCR=57;TR=84;WE=36944196;WS=36944178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr14	37131993	rs12883298	G	C	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=237;ReadPosRankSum=-0.856;SC=GTAGTTAGTAGGGGACGGGTG;SOR=0.299;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=12;WE=37132001;WS=37131983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr14	37132020	rs17104895	G	A	579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.490;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=359;ReadPosRankSum=-1.076;SC=CCCAGTCCCCGGATGCGTAGG;SOR=0.339;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=43;TCF=34;TCR=9;TR=24;WE=37132028;WS=37132010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,25:0.56:45
chr14	37132048	rs12882923	A	G	1002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.177;HP=1;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=18;PP=1479;ReadPosRankSum=0.845;SC=AGTGGCAGGCAGCTGTCCCAA;SOR=0.217;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=84;TCF=58;TCR=26;TR=47;WE=37132069;WS=37132038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,50:0.54:92
chr14	37132061	rs12883049	A	G	1295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-4.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.036;HP=1;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=22;PP=1479;ReadPosRankSum=0.765;SC=TGTCCCAAGCAGCGGGTGCGC;SOR=0.255;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=102;TCF=70;TCR=32;TR=59;WE=37132069;WS=37132038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,65:0.57:114
chr14	37135605	rs7143727	G	C	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=4.259;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=165;ReadPosRankSum=0.726;SC=TTTGGGTCCCGTCTCAAGAGT;SOR=1.347;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=8;WE=37135613;WS=37135595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr14	37140504	rs8004187	C	T	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.808;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=147;ReadPosRankSum=-0.133;SC=TAACCTCTAACTGCCAGACAT;SOR=0.223;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=10;WE=37140512;WS=37140494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr14	37149943	rs146639486	G	GT	3591.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=1.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.759;NF=7;NR=55;PP=1637;ReadPosRankSum=1.144;SC=GAAAAGAGCTGTTTTTTATTG;SOR=0.685;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=151;TCF=13;TCR=138;TR=62;WE=37149951;WS=37149933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,148:0.49:299
chr14	37153163	rs1884217	A	G	3245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.731;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=49;PP=1167;ReadPosRankSum=0.617;SC=TGAGATAGGGACCCAGCATTT;SOR=0.843;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=173;TCF=75;TCR=98;TR=85;WE=37153171;WS=37153153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,100:0.49:206
chr14	37153185	rs10132292	T	A	2591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.661;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=36;PP=842;ReadPosRankSum=-0.741;SC=AAAAAATAAATTATTTGGAAT;SOR=0.776;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=114;TCF=45;TCR=69;TR=57;WE=37153193;WS=37153175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,67:0.49:136
chr14	37153862	rs17105034	C	G	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.600;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=128;ReadPosRankSum=0.230;SC=GGAGGGCTTACTGGTTCTCAT;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=7;WE=37153870;WS=37153854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr14	37203617	rs3061575	T	TTA	1355.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.782;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=14;PP=769;ReadPosRankSum=-1.954;SC=TTTTAGTGCTTTATATATAAT;SOR=0.576;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=60;TCF=25;TCR=35;TR=23;WE=37203625;WS=37203607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,42:0.43:98
chr14	37203642	rs5807904	TA	T	1647.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.625;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.257;NF=13;NR=19;PP=1042;ReadPosRankSum=1.968;SC=TTTAATGTCTTAAGAGTTTGT;SOR=0.755;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=81;TCF=28;TCR=53;TR=32;WE=37203650;WS=37203632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,57:0.39:145
chr14	37344229	rs5807914	A	AG	7105.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=71;PP=2936;SC=GATAAAGAAAATCCAATAAAC;SOR=0.899;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=22;TCR=71;TR=93;WE=37344237;WS=37344219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr14	37344275	rs712384	C	T	3351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=35;NR=63;PP=2066;SC=TCCTTGATCCCGTCGATTTCT;SOR=1.285;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=98;TCF=35;TCR=63;TR=98;WE=37344283;WS=37344265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr14	37344347	rs2021404	C	T	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.715;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.107;NF=5;NR=16;PP=337;ReadPosRankSum=-0.080;SC=TAGTAATAGGCTAGTGGCAAA;SOR=0.314;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=21;WE=37344355;WS=37344337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,21:0.58:36
chr14	37641659	rs1057564	G	C	2446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.144;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=44;PP=1433;ReadPosRankSum=0.207;SC=TGGTCCTCAAGCGCGTTGGCT;SOR=0.856;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=224;TCF=124;TCR=100;TR=103;WE=37641667;WS=37641649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,118:0.48:247
chr14	37641878	rs1404	C	T	2075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.075;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=55;PP=1227;ReadPosRankSum=0.089;SC=TTGGCGCCCACGCCCTTCTCT;SOR=0.805;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=195;TCF=82;TCR=113;TR=91;WE=37641886;WS=37641868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,101:0.48:212
chr14	37736054	rs17106526	T	C	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=163;ReadPosRankSum=0.052;SC=AGCTAAAGAGTGTTTCCAAAA;SOR=0.671;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=13;WE=37736062;WS=37736044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,18:0.40:45
chr14	37838604	rs35277854	C	CA	382.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.63;MQRankSum=0.500;QD=22.51;ReadPosRankSum=1.431;SOR=4.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,16:0.94:17
chr14	38016044	rs10151200	C	G	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-2.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.197;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=104;ReadPosRankSum=-1.408;SC=CTTTATCAGCCAGGACATTCT;SOR=0.269;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=10;WE=38016052;WS=38016034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr14	38061742	rs7144658	C	T	2458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.032;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=42;PP=1424;ReadPosRankSum=-0.407;SC=GGCATGCCGGCTACTGCGCCG;SOR=0.770;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=207;TCF=124;TCR=83;TR=109;WE=38061750;WS=38061732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,123:0.55:225
chr14	38064009	rs762083	G	C	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.563;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=271;ReadPosRankSum=1.216;SC=CCCCCGGCCCGCCTGCCTGCC;SOR=2.964;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=37;TCR=6;TR=15;WE=38064017;WS=38063999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,14:0.36:39
chr14	38064215	rs79519281	G	C	2216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.912;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=55;PP=1330;ReadPosRankSum=0.197;SC=ATCCAGCCCTGTGCGAAGCGA;SOR=0.961;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=189;TCF=77;TCR=112;TR=88;WE=38064223;WS=38064205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,103:0.47:218
chr14	38165784	rs960787	A	G	198.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=1;PP=117;SC=GAAACTATCAATTTACTTTTA;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=38165792;WS=38165774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr14	38205027	rs1570399	T	C	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.782;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=94;ReadPosRankSum=0.160;SC=TTCTCTTTGGTTCTTTTGTTA;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=6;WE=38205035;WS=38205017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr14	38206818	rs4901157	G	A	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=163;ReadPosRankSum=-1.166;SC=TAGCTTATCAGATAGTATCTG;SOR=0.542;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=42;TCF=32;TCR=10;TR=14;WE=38206826;WS=38206808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,17:0.36:47
chr14	38207008	rs11439106	A	AT	590.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=3.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.41;ReadPosRankSum=-1.266;SOR=0.227;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,21:0.51:41
chr14	38207018	rs17107021	A	T	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=3.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.16;ReadPosRankSum=-1.128;SOR=0.227;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,17:0.46:37
chr14	38218872	rs17768594	T	G	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.909;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=213;ReadPosRankSum=-0.620;SC=TAGGATATCCTCCTTTAACAA;SOR=1.402;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=15;WE=38218880;WS=38218862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr14	38222291	rs4901176	G	C	2694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=62;NR=37;PP=1758;SC=TGTACCTCCCGCTGTCCCTAT;SOR=1.190;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=62;TCR=37;TR=99;WE=38222299;WS=38222281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr14	38256944	rs12586423	T	C	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.154;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=228;ReadPosRankSum=-1.008;SC=ATGTAATATGTATACTACTAT;SOR=1.828;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=13;WE=38256952;WS=38256934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr14	38259876	rs12590844	G	A	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=183;ReadPosRankSum=0.589;SC=TTTACCTATGGTTATTTTAGA;SOR=0.481;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=13;WE=38259884;WS=38259866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr14	38260034	rs17107106	T	C	837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.695;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=18;PP=460;ReadPosRankSum=-0.892;SC=CTGTCATTTCTCTAGAAAGGT;SOR=0.522;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=77;TCF=36;TCR=41;TR=36;WE=38260042;WS=38260024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,43:0.47:91
chr14	38260089	rs7153624	C	T	787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=20;PP=536;SC=TGTAAAAAATCGAAAACCTGA;SOR=3.098;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=38260097;WS=38260079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr14	38264358	rs969446	C	T	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.993;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=152;ReadPosRankSum=-0.257;SC=TTAAGAAAAACATGTATGTTA;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=10;WE=38264366;WS=38264348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr14	38265344	rs1951639	T	A	278.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.98;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr14	38266074	rs9805910	C	T	3225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.864;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=67;PP=1830;ReadPosRankSum=0.840;SC=AGGTCTTGGACGGAATCAGCT;SOR=0.725;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=232;TCF=121;TCR=111;TR=130;WE=38266082;WS=38266064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,149:0.57:260
chr14	38276433	rs66496750	G	A	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.345;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=89;ReadPosRankSum=0.319;SC=TTTTTGGGAGGCATAGATTTG;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=5;WE=38276441;WS=38276432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr14	38295646	rs10483494	T	C	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=85;ReadPosRankSum=-0.297;SC=CTTTTTAAAGTGACTTATGGA;SOR=0.317;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=8;WE=38295654;WS=38295636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr14	38310606	rs10151474	G	A	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=106;ReadPosRankSum=0.158;SC=TTTCTGTATAGTAAGTTGCCA;SOR=0.859;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=7;WE=38310614;WS=38310596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr14	38679473	rs2228497	C	T	4140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=382;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=82;PP=2427;ReadPosRankSum=-0.982;SC=TGCAGCTGGTCAACGTGTTTG;SOR=0.712;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=335;TCF=176;TCR=159;TR=174;WE=38679481;WS=38679463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:187,195:0.51:382
chr14	38679814	.	C	T	273	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=8;NR=14;PP=273;QD=13.9896005703;SC=ACGCAGGGGCCCTGAGCCAAA;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=62;TCF=20;TCR=42;TR=22;WE=38679822;WS=38679804;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:40,22:0.35:62
chr14	39502539	rs11418467	G	GA	1466.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=27;PP=819;SC=ACTCCTAGAGGAAAAAAGATA;SOR=1.755;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=28;WE=39502547;WS=39502529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr14	39502626	rs11283010	A	AAATAGAAC	143	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=208;SC=AAATCATTTGAAATGCCTATG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=39502634;WS=39502616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr14	39511952	rs3837584	CT	C	608.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.067;NF=9;NR=5;PP=425;ReadPosRankSum=-1.527;SC=AGTAAAAAGACTTTACATGCA;SOR=0.638;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=14;WE=39511960;WS=39511942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,22:0.49:45
chr14	39512122	rs4902326	T	A	1444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=31;PP=831;SC=GGAAAAATAATCTACTCAATA;SOR=1.371;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=19;TCR=31;TR=50;WE=39512130;WS=39512112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr14	39514231	rs1884384	T	A	928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=5;PP=695;SC=GCGAATACATTAATAGGTTGA;SOR=3.126;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=32;WE=39514239;WS=39514221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr14	39514274	rs77051476	T	G	894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.258;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=15;PP=599;ReadPosRankSum=0.653;SC=TTCTTATATTTAGTAACTATA;SOR=0.387;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=76;TCF=53;TCR=23;TR=41;WE=39514282;WS=39514264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,42:0.53:79
chr14	39516714	rs374970367	CA	C	33.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.91;ReadPosRankSum=1.386;SOR=0.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,7:0.19:37
chr14	39517691	rs4902344	T	A	720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=5;PP=548;SC=GGTGGCACACTCCTGTAGTCC;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=26;WE=39517699;WS=39517681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr14	39517925	rs11556216	T	C	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.018;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=12;PP=283;ReadPosRankSum=1.258;SC=ATTCTCCAAATTTCTGACACT;SOR=0.465;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=53;TCF=24;TCR=29;TR=24;WE=39517933;WS=39517915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,26:0.44:59
chr14	39532492	rs55993688	T	C	842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.850;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=8;PP=471;ReadPosRankSum=2.058;SC=CAAATGTACGTTGTACGTTTT;SOR=0.840;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=80;TCF=61;TCR=19;TR=35;WE=39532500;WS=39532482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,40:0.44:91
chr14	39532704	.	GA	G	59.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.424;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=9.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.84;ReadPosRankSum=-0.624;SOR=0.045;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr14	39543508	rs12164875	T	C	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=70;ReadPosRankSum=0.502;SC=ATGTGTTGCCTTGAAGTAGTG;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=5;WE=39543516;WS=39543498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr14	39543814	rs147995893	T	TAAG	307.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.468;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=248;ReadPosRankSum=1.332;SC=CAAAATGATCTAAGGACTAAA;SOR=0.132;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=7;WE=39543822;WS=39543804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr14	39554891	rs56156769	T	C	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=3.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.90;ReadPosRankSum=-0.095;SOR=0.669;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,7:0.23:31
chr14	39554893	rs8009506	T	C	321.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=1.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.05;ReadPosRankSum=0.413;SOR=0.648;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr14	39556185	rs8018720	G	C	5014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=87;PP=2965;ReadPosRankSum=1.589;SC=GCTTGAGTAAGTGGTACTTTA;SOR=0.313;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=167;TCF=79;TCR=88;TR=166;WE=39556193;WS=39556175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,186:0.99:187
chr14	39564403	.	G	A	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.066;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=178;ReadPosRankSum=-0.099;SC=TGGCTGGGGGGAGAGGGAATG;SOR=0.818;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=12;WE=39564411;WS=39564393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr14	39565403	rs3818163	T	A	772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=22;PP=613;SC=GTTCAAAATATGAATGTTCTC;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=39565411;WS=39565393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr14	39583481	rs2277458	A	G	1596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=9;PP=860;SC=GTCTATTAGTACGCCTGCGCT;SOR=1.835;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=34;TCR=9;TR=43;WE=39583489;WS=39583471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr14	39587348	rs10136536	A	G	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.055;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=143;ReadPosRankSum=-1.707;SC=CTGTTCTTAGACTGTAGCTGG;SOR=0.312;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=12;TCR=23;TR=14;WE=39587356;WS=39587338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,14:0.38:37
chr14	39591613	rs60205535	G	GT	94.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=6.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQRankSum=-1.326;QD=3.95;ReadPosRankSum=-2.208;SOR=0.082;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr14	39597470	.	CT	C	133.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=0.000;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=1.286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.67;ReadPosRankSum=-0.061;SOR=1.101;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,13:0.26:50
chr14	39602849	rs77967037	CTT	C	74.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.67;ReadPosRankSum=0.071;SOR=0.033;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr14	39605542	rs9322993	T	C	1618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=15;PP=1097;SC=TTTAACCAGTTTCTTATTGAT;SOR=1.569;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=37;TCR=15;TR=52;WE=39605550;WS=39605532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr14	39620936	rs8003807	C	T	2769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=44;PP=1891;SC=GTAAGAAAGGCGAATTCAACT;SOR=0.772;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=104;TCF=60;TCR=44;TR=102;WE=39620944;WS=39620926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr14	39623533	rs12147991	T	C	968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.982;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=33;PP=569;ReadPosRankSum=0.131;SC=CCAAAGTCAATGTACCTAGCA;SOR=1.136;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=96;TCF=32;TCR=64;TR=46;WE=39623541;WS=39623523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,49:0.49:100
chr14	39627433	rs35270180	G	A	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5004;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=84;ReadPosRankSum=0.703;SC=ACTAAAATACGATATTTATAT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=5;WE=39627441;WS=39627423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr14	39627695	rs9322994	C	T	645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.840;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=19;PP=366;ReadPosRankSum=-0.222;SC=AATGCCAGAACAGCACTGAAC;SOR=1.329;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=67;TCF=24;TCR=43;TR=26;WE=39627703;WS=39627685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,32:0.41:78
chr14	39627747	rs761804	A	G	457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=13;PP=330;SC=TTTGAGACAGATTCTGGCTCT;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=16;WE=39627755;WS=39627737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr14	39644498	rs1061583	G	A	1087.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=22;PP=600;ReadPosRankSum=0.640;SC=CGGTCGCCGTGAGAACTTTGC;SOR=0.704;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=144;TCF=83;TCR=61;TR=52;WE=39644506;WS=39644488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,61:0.37:167
chr14	39645863	rs2252040	G	A	1670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=34;PP=1014;SC=AAATATAAATGTTTATTAACA;SOR=1.571;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=20;TCR=34;TR=54;WE=39645871;WS=39645853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr14	39645921	rs3215670	G	GC	222.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.912;NF=0;NR=9;PP=147;ReadPosRankSum=0.680;SC=GCCACTCCCTGCCCCCCCCAA;SOR=0.646;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=9;WE=39645929;WS=39645911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr14	39647188	rs68193573	T	A	99.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.588;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=102;ReadPosRankSum=1.955;SC=ATGTTTTTTTTAAAAAATCCT;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=6;WE=39647196;WS=39647178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr14	39650234	rs2180792	A	T	5804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=105;PP=2965;ReadPosRankSum=0.389;SC=AGAATGTAAAACCCTTTCTCC;SOR=0.289;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=203;TCF=95;TCR=108;TR=200;WE=39650242;WS=39650224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,218:1.00:219
chr14	39651193	rs532	A	G	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=201;ReadPosRankSum=1.419;SC=CTTTTTGGAAAATACAGACTG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=11;WE=39651201;WS=39651183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr14	39703324	rs7141840	A	G	2661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.422;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=60;PP=1736;ReadPosRankSum=-1.149;SC=TTAGCATGGCAAAATTTGGCG;SOR=0.673;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=266;TCF=141;TCR=125;TR=124;WE=39703332;WS=39703314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,135:0.45:298
chr14	39736680	rs7140561	T	C	2310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=29;PP=1476;SC=GAGCCCGGGGTTACCCCTCAA;SOR=1.206;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=50;TCR=29;TR=79;WE=39736688;WS=39736670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr14	39748480	rs7158558	G	A	852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=11;PP=499;SC=GACGTTAAATGAATTGATTTA;SOR=1.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=17;TCR=11;TR=28;WE=39748488;WS=39748470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr14	39763006	rs956109	T	C	416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=1;PP=334;SC=TTATGAAATATTAAAGTTATG;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=39763014;WS=39762996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr14	39773639	rs2274398	G	T	2414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=38;NR=47;PP=1404;SC=TACATCTCTTGGCAGAGAATG;SOR=0.982;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=38;TCR=47;TR=85;WE=39773647;WS=39773629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr14	39777676	rs1950952	G	C	288.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=208;SC=TCTTCAGACTGAACAAGCATC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=39777684;WS=39777666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr14	39784012	rs12436164	A	G	595.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=2.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQRankSum=3.514;QD=11.03;ReadPosRankSum=-2.928;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,15:0.28:54
chr14	39784014	rs2415539	A	G	1094.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.43;QD=34.21;SOR=0.846;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr14	39784042	rs2415540	A	G	291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.59;QD=26.52;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	39784042	.	ATA	GTG	414	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;FR=0.9999;HP=2;HapScore=3;MGOF=79;MMLQ=28;MQ=54.58;NF=0;NR=12;PP=414;QD=38.9556562385;SC=GTGTGTGTGTATATATATATA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=12;WE=39784052;WS=39784032;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:7,12:0.63:19
chr14	39784965	rs10150863	G	T	1704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=36;PP=1022;SC=CAAATTGTATGTTTTTTTCAG;SOR=1.850;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=16;TCR=36;TR=52;WE=39784973;WS=39784955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr14	39796048	rs36031495	GT	G	4131.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=66;PP=1766;SC=AGATTTGTATGTTTTTTTTTC;SOR=0.746;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=101;TCF=25;TCR=76;TR=89;WE=39796056;WS=39796038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr14	39818028	rs1140952	A	G	1461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.658;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=43;PP=1084;ReadPosRankSum=-0.027;SC=TCTTGCTCCAATCAGAGGTCC;SOR=0.956;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=101;TCF=33;TCR=68;TR=61;WE=39818036;WS=39818018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,63:0.57:111
chr14	39818222	rs7156249	G	T	947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.33;SOR=1.209;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr14	39856043	rs10146207	G	C	3453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=71;NR=40;PP=2053;SC=TCAGCAACTCGTCTCTCTTCT;SOR=1.188;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=71;TCR=40;TR=111;WE=39856051;WS=39856033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr14	39871159	rs36065920	AT	A	529.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=443;ReadPosRankSum=0.286;SC=AAAGCATGCAATTTTGAGATC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=14;WE=39871167;WS=39871149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,20:0.67:30
chr14	42355771	rs721222	C	T	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=253;ReadPosRankSum=-0.631;SC=AATTAAATCACTGGATGCTAA;SOR=0.382;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=15;WE=42355779;WS=42355761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr14	42360633	rs6572117	T	C	2661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=48;PP=1635;ReadPosRankSum=-0.200;SC=TCATGCAGTCTCAGTTTTTGG;SOR=0.667;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=244;TCF=140;TCR=104;TR=112;WE=42360641;WS=42360623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,127:0.45:283
chr14	42367989	.	A	T	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.415;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=122;ReadPosRankSum=-0.429;SC=TAAGTTTTTTAAAAAAAATCT;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=7;WE=42367997;WS=42367979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr14	42882525	rs2626451	C	T	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.13;ReadPosRankSum=0.524;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr14	42997963	rs9323070	A	G	1142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.736;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=27;PP=676;ReadPosRankSum=-0.643;SC=CACTTTTCCTATGCATTATTT;SOR=0.896;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=78;TCF=35;TCR=43;TR=45;WE=42997971;WS=42997953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,52:0.57:91
chr14	42998026	rs10148466	T	C	1145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=25;PP=659;SC=AACTGCTCATTGTTTTCTTAC;SOR=2.200;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=35;WE=42998034;WS=42998016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr14	44975511	rs45478391	G	A	1512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.617;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=30;PP=954;ReadPosRankSum=0.228;SC=TAAAAGTACCGGGGGACCTTT;SOR=0.596;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=136;TCF=74;TCR=62;TR=66;WE=44975519;WS=44975501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,70:0.49:144
chr14	44975918	rs45586531	G	A	3465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=374;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=77;PP=2116;ReadPosRankSum=0.967;SC=CAGGTACCACGGTTTCCTCAA;SOR=0.704;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=344;TCF=161;TCR=183;TR=148;WE=44975926;WS=44975908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:207,167:0.45:374
chr14	45468761	rs17115735	C	T	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=390;ReadPosRankSum=0.520;SC=GGGATTCCAACACTAACTTAT;SOR=0.569;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=21;WE=45468769;WS=45468751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,23:0.66:35
chr14	45576789	rs149209273	G	A	2503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.870;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=62;PP=1515;ReadPosRankSum=-0.039;SC=ATCTACCATCGGGAATTGAAG;SOR=0.759;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=277;TCF=132;TCR=145;TR=117;WE=45576797;WS=45576779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,131:0.42:314
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chr14	47310983	rs11844549	T	C	745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.791;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=5;PP=452;ReadPosRankSum=0.150;SC=TTATCCCCAGTGCTTAAAAAA;SOR=1.721;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=26;WE=47310991;WS=47310973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,30:0.75:40
chr14	47314938	rs1388568	C	T	1443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.99;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=25;PP=845;ReadPosRankSum=0.520;SC=TTTAACGTTACAACAAACCAA;SOR=0.720;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=165;TCF=104;TCR=61;TR=70;WE=47314946;WS=47314928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,76:0.41:184
chr14	47315127	rs1388567	G	A	1230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.682;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=36;PP=823;ReadPosRankSum=0.434;SC=TTGCAGATCAGTTTCTCTTGA;SOR=0.496;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=103;TCF=32;TCR=71;TR=53;WE=47315135;WS=47315117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,56:0.50:111
chr14	47315162	.	T	G	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.758;ClippingRankSum=0.000;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.59;ReadPosRankSum=-0.617;SOR=0.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,12:0.20:59
chr14	47324127	rs3007133	G	A	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.297;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=72;ReadPosRankSum=2.722;SC=TGCTTATATCGTGGAATTTCT;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=5;WE=47324135;WS=47324117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr14	47341055	rs1491910	C	G	1090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=26;PP=597;ReadPosRankSum=0.963;SC=AGTTTAACTTCTCAAAAGCTT;SOR=0.656;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=70;TCF=26;TCR=44;TR=41;WE=47341063;WS=47341045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,49:0.61:80
chr14	47341131	rs2933208	C	G	346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=230;SC=TGGGAAGATTCCTTGAGACCA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=47341139;WS=47341121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	47528470	rs8009302	T	C	6340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=122;NR=97;PP=2965;SC=TCTCAGACTTTGTAGAGCTTC;SOR=0.824;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=219;TCF=122;TCR=97;TR=219;WE=47528478;WS=47528460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr14	47528551	rs10144183	T	A	5069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=95;PP=2934;SC=TTGGAAGAAGTCAATATATTT;SOR=1.119;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=169;TCF=74;TCR=95;TR=169;WE=47528559;WS=47528541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr14	47530841	rs7147260	A	C	858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.94;SOR=6.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr14	47530845	rs7147741	G	C	858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.20;SOR=5.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr14	47687187	rs8011854	A	C	345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=2;PP=240;SC=GAAATCCATAATAGGCTTAAT;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=47687195;WS=47687177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	50044392	rs2883438	T	C	1799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=31;NR=22;PP=964;SC=ACCCTGTTGTTAATACCTCTG;SOR=0.822;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=31;TCR=22;TR=53;WE=50044400;WS=50044382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr14	50044465	rs41317310	G	A	978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=15;PP=607;ReadPosRankSum=0.901;SC=TGAACTTGGTGCTCTTTTTGA;SOR=0.641;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=60;TCR=34;TR=41;WE=50044473;WS=50044455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,47:0.43:110
chr14	50065359	rs2281837	C	G	11671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=443;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=210;NR=200;PP=2965;SC=GACGTGCGCCCGCAACGCGTA;SOR=0.758;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=411;TCF=211;TCR=200;TR=410;WE=50065367;WS=50065349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,442:1.00:442
chr14	50065717	rs2281836	G	C	3351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=70;NR=45;SC=CCAGCTTGACGTGGTTGTGGC;SOR=1.022;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=70;TCR=45;TR=115;WE=50065725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr14	50068299	rs11625804	C	G	4381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=59;PP=2713;SC=GATTCCTGCTCTCATGGAGTT;SOR=1.065;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=146;TCF=87;TCR=59;TR=146;WE=50068307;WS=50068289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr14	50069282	rs2354444	A	T	735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=19;PP=505;SC=TGAAGTACAGAGGCATAGTCA;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=50069290;WS=50069272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr14	50070384	rs7146398	T	C	501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.09;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr14	50074014	rs2354445	G	T	928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=0;PP=791;SC=GTAAATCATTGTATCACATTC;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=27;WE=50074022;WS=50074004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr14	50080871	rs6572592	G	A	435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=0;PP=362;SC=TATACTAATCGCTTAATAATT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=50080879;WS=50080861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr14	50087753	rs7519	T	C	3873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=68;PP=1995;SC=GCGGCGCCGATGCTCGAGCTG;SOR=0.895;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=64;TCR=68;TR=132;WE=50087761;WS=50087743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr14	50092471	rs9989177	T	C	2940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.651;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=51;PP=2086;ReadPosRankSum=1.731;SC=GTTTAAGTTATCTTTTTCCTC;SOR=0.717;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=93;TCF=42;TCR=51;TR=92;WE=50092479;WS=50092461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,101:0.99:102
chr14	50094913	rs2985696	C	A	275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=211;SC=CTAATAAGTCCCACTTGACAA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=50094921;WS=50094903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr14	50100283	rs139416233	G	A	3482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=369;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.274;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=76;PP=2251;ReadPosRankSum=1.560;SC=TCTTTGTCCTGATTACACAGT;SOR=0.579;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=340;TCF=163;TCR=177;TR=159;WE=50100291;WS=50100273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:194,173:0.47:367
chr14	50100386	rs2985687	T	C	6528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=105;NR=111;PP=2965;SC=ACTCCTCGCGTGTTTCCACAC;SOR=0.769;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=217;TCF=106;TCR=111;TR=216;WE=50100394;WS=50100376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr14	50100683	rs2985686	C	G	1759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=25;PP=877;SC=CTCCGTCCTCCGCGCGACTCC;SOR=0.818;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=31;TCR=25;TR=56;WE=50100691;WS=50100673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr14	50101370	rs2985685	G	A	7516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=142;NR=108;PP=2965;SC=CCAGGGCCGTGGCGTCCAGCA;SOR=0.805;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=251;TCF=143;TCR=108;TR=250;WE=50101378;WS=50101360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,281:1.00:281
chr14	50101682	rs2985684	C	G	8934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=167;NR=137;PP=2965;SC=CCACCCCGCGCTCACGCTCTA;SOR=0.868;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=304;TCF=167;TCR=137;TR=304;WE=50101690;WS=50101672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,333:1.00:333
chr14	50175792	rs11157703	T	C	520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=280;SC=TAGTATTTTATTAGCAATTTT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=50175800;WS=50175782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr14	50192609	.	A	G	173	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=0;NR=5;PP=173;QD=41.5542425094;SC=TCTGTTGCCCAGGCTGGAGTA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=50192617;WS=50192599;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr14	50195679	rs4301946	A	G	6210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=120;NR=97;PP=2965;SC=CCGCGCATACATGTGCAGTTC;SOR=0.816;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=217;TCF=120;TCR=97;TR=217;WE=50195687;WS=50195669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr14	50199337	rs60013005	A	AT	502.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=2;PP=282;SC=GTGAGGGCAGATTTTTTTTTT;SOR=3.611;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=14;WE=50199345;WS=50199327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr14	50199375	rs10146753	A	C	1210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.392;HP=8;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=10;PP=902;ReadPosRankSum=2.291;SC=AAAACCTTTTATTTTGATTAA;SOR=2.200;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=42;WE=50199383;WS=50199365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,44:0.96:46
chr14	50206702	rs4898631	G	A	396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=299;SC=AAGTTCAATCGTGTCTCTTTT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=50206710;WS=50206692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	50241258	rs4499141	A	C	3923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=41;PP=2554;SC=ACTTACATACATTTAATTTAT;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=92;TCR=41;TR=133;WE=50241266;WS=50241248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr14	50244835	rs4900949	C	T	3015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=57;NR=42;PP=1698;SC=CTAAGATAAACTGCTTGTATC;SOR=0.922;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=100;TCF=57;TCR=43;TR=99;WE=50244843;WS=50244825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr14	50245374	rs6572613	C	A	137.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.97;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr14	50247290	rs4900952	G	T	1372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=12;PP=909;SC=TAATTGCAGGGGGGGGAAAAA;SOR=1.911;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=34;TCR=12;TR=46;WE=50247298;WS=50247280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr14	50251369	rs10143621	A	G	2979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=34;PP=1703;SC=TCCTTTTTACATTCAGAAGAT;SOR=1.302;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=68;TCR=34;TR=102;WE=50251377;WS=50251359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr14	50251888	rs8009346	C	T	4300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=58;PP=2783;SC=ACTAAATAGACGTTACAAAAC;SOR=0.955;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=135;TCF=77;TCR=58;TR=135;WE=50251896;WS=50251878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr14	50280577	rs3126194	T	C	307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=2;PP=261;SC=ACACTTCAGCTTCCCAAAGTG;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=50280585;WS=50280567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	50280688	rs3126195	T	A	2009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=38;NR=29;PP=1104;SC=GAATTCTGAATAGAAAGAAAT;SOR=0.746;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=38;TCR=29;TR=67;WE=50280696;WS=50280678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr14	50280874	rs181995618	G	A	62.90	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.48;ReadPosRankSum=0.210;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr14	50298153	rs11365862	AT	A	369.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=256;SC=ACAGAATTTTATTTTTTTTTT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=15;WE=50298161;WS=50298143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr14	50298962	rs3100906	T	A	3472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=51;NR=74;PP=2033;SC=GCTTCCAAGCTTGGTTTTATT;SOR=1.222;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=127;TCF=51;TCR=76;TR=125;WE=50298970;WS=50298952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr14	50299051	rs56170989	CT	C	40.25	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.9971;FS=0.000;HP=16;HapScore=3;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=116;ReadPosRankSum=-1.383;SC=AGATTTACTTCTTTTTTTTTT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=9;WE=50299060;WS=50299041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr14	50300310	rs3100904	A	G	1298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=27;PP=859;SC=AAGTGCTTACAAAATAATGTT;SOR=2.147;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=10;TCR=27;TR=37;WE=50300318;WS=50300300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr14	50319327	rs3126160	T	C	6693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=136;NR=88;PP=2965;SC=TAAGGAAACATATCAAGCTGG;SOR=1.124;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=224;TCF=136;TCR=88;TR=224;WE=50319335;WS=50319317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr14	50319499	rs3100887	G	T	5297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=99;PP=2965;SC=ACTACCGCAAGTTCCTCTACT;SOR=1.090;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=175;TCF=76;TCR=99;TR=175;WE=50319507;WS=50319489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr14	50459609	rs10134002	T	C	5807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=99;PP=2965;SC=GATAAGAGAATAAGAGCTTCA;SOR=0.951;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=190;TCF=91;TCR=99;TR=190;WE=50459617;WS=50459599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr14	50459673	rs10134096	T	C	2229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=48;PP=1488;SC=TCATCTCCCATTGGGTTCAAT;SOR=1.552;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=27;TCR=48;TR=75;WE=50459681;WS=50459663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr14	50469628	rs7155104	C	A	3564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.846;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=71;PP=2171;ReadPosRankSum=-0.020;SC=AGATGACAGACACAACCAGAG;SOR=0.631;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=291;TCF=149;TCR=142;TR=147;WE=50469636;WS=50469618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,164:0.51:319
chr14	50472405	rs6572635	G	A	2195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.580;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=36;PP=1227;ReadPosRankSum=-1.271;SC=AAGACCTCTCGGTTCGTGAAT;SOR=0.604;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=150;TCF=87;TCR=63;TR=87;WE=50472413;WS=50472395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,100:0.60:168
chr14	50474062	rs11623184	C	G	1869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.517;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=48;PP=1268;ReadPosRankSum=-0.652;SC=TTGCGGTGAGCGTGGTGTCAT;SOR=0.628;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=179;TCF=91;TCR=88;TR=94;WE=50474070;WS=50474052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,97:0.48:202
chr14	50477578	rs8012757	G	A	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.224;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=76;ReadPosRankSum=0.159;SC=CATCCTCGGCGTTTGGCATAA;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=50477586;WS=50477568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr14	50477634	rs8012384	A	G	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=3.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.95;ReadPosRankSum=0.176;SOR=1.251;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,17:0.40:42
chr14	50477643	rs4900978	G	C	1678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.58;SOR=1.958;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr14	50477811	rs12589730	C	T	913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.710;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=20;PP=457;ReadPosRankSum=1.418;SC=CATGCCACTCCGTGATGTGCC;SOR=0.927;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=80;TCF=33;TCR=47;TR=33;WE=50477819;WS=50477801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,42:0.42:99
chr14	50555664	rs2883738	G	T	314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=260;SC=CCCAAATTCCGATGTTGAAAT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=50555672;WS=50555654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr14	50585574	rs10658395	C	CA	822.94	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=29;PP=553;ReadPosRankSum=0.357;SC=ATATTTCCCTCAAAAAAAAAA;SOR=0.578;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=1;TCR=37;TR=30;WE=50585582;WS=50585564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,34:0.89:38
chr14	50596862	rs3759597	T	C	217.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=178;SC=AAAAATTAACTCAGAACCTTC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=50596870;WS=50596852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr14	50600698	rs147458500	C	CA	39.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.157;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=0;PP=76;ReadPosRankSum=-0.115;SC=TTTCCCCCCCCAGTTTTAGAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=2;WE=50600706;WS=50600695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr14	50611845	rs2064667	C	T	2737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=30;PP=1695;SC=ATGCTAATTTCATCATCCCCG;SOR=1.473;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=64;TCR=30;TR=94;WE=50611853;WS=50611835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr14	50612401	rs1014879	T	C	149.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=124;SC=AAAAAGACAATTAACCCAAAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=50612422;WS=50612391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr14	50612414	rs726797	C	T	101.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=76;SC=ACCCAAAAGACAGATGAACAC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=50612422;WS=50612391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr14	50616878	rs2229869	G	A	6946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=97;NR=122;PP=2965;SC=GGCTTACTCCGTTTGCCTGAG;SOR=1.122;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=219;TCF=97;TCR=122;TR=219;WE=50616886;WS=50616868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,259:1.00:259
chr14	50619927	rs11628935	A	G	2725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=42;NR=49;PP=1410;SC=TTAGTGAAACATAAGTGTTCA;SOR=1.168;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=42;TCR=49;TR=91;WE=50619935;WS=50619917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr14	50623657	rs3736759	G	A	2586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=20;PP=1566;ReadPosRankSum=-0.942;SC=CACATAAAATGTGTGTGTGTG;SOR=0.896;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=59;TCR=21;TR=77;WE=50623665;WS=50623647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,73:0.95:77
chr14	50623679	rs3736760	G	A	3327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=30.53;ReadPosRankSum=0.312;SOR=0.929;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:5,104:0.95:109
chr14	50623683	rs3736761	A	G	3327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=30.53;ReadPosRankSum=0.681;SOR=0.929;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:5,104:0.95:109
chr14	50626836	rs4900992	C	T	610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=18;PP=480;SC=GCTTATTCAACAGCTAGCAAC;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=50626844;WS=50626826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr14	50641347	rs10782418	T	G	3479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=66;PP=2093;SC=AACAGAAACGTCTACTAAAAA;SOR=1.517;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=111;TCF=44;TCR=67;TR=110;WE=50641355;WS=50641337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr14	50655146	rs139780957	CTATT	C	1220.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=6;PP=691;SC=AAAAAAGTGACTATTTATGAT;SOR=1.609;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=16;TCF=10;TCR=6;TR=14;WE=50655157;WS=50655136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr14	50666263	rs1955924	C	T	353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=0;PP=290;SC=GGAAATATCACGGTTACTCTG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=50666271;WS=50666253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr14	50670965	rs1075537	G	C	2103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=16;PP=1336;SC=TCATACAGTGGTTGAGTGACT;SOR=1.885;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=49;TCR=16;TR=65;WE=50670973;WS=50670955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr14	50671133	rs12888783	A	G	2915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=62;PP=1968;SC=TGAACCTTTAAAAAAAAGTTA;SOR=1.586;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=33;TCR=62;TR=95;WE=50671141;WS=50671123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr14	50704331	rs4901000	C	T	7853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=138;NR=109;PP=2965;SC=AAGCTACAAGCGCTACCAGTC;SOR=0.877;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=248;TCF=138;TCR=110;TR=247;WE=50704339;WS=50704321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,293:1.00:293
chr14	50732042	rs12432673	G	A	5428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=103;NR=73;PP=2965;SC=CATAGGTCAGGACTGTATTTA;SOR=0.888;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=176;TCF=103;TCR=73;TR=176;WE=50732050;WS=50732032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr14	50745123	rs10658363	A	ATTACTT	727.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=3;PP=389;SC=TTCTCTCAGAATTACATTAGA;SOR=1.739;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=10;TCF=6;TCR=4;TR=7;WE=50745131;WS=50745113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr14	50750577	rs12433038	A	G	2555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=17;PP=1626;SC=AGAAAAGACAAGGATGGCTTA;SOR=2.140;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=55;TCR=17;TR=72;WE=50750585;WS=50750567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr14	50760030	rs12894758	C	T	4800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=100;PP=2965;SC=CACCTTGACCCCTAACTTATA;SOR=1.652;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=52;TCR=100;TR=152;WE=50760038;WS=50760020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr14	50769717	rs2297995	G	A	7431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=116;NR=140;PP=2965;SC=CGCCACCAACGATGACTATAT;SOR=0.963;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=256;TCF=116;TCR=140;TR=256;WE=50769725;WS=50769707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,273:1.00:273
chr14	50769868	rs1962578	G	A	293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=8;PP=211;SC=GCGGCCGGTCGCAGTGGCTCA;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=50769876;WS=50769858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr14	50778816	rs2275591	A	C	4819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.77;SOR=0.915;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr14	50779689	rs41301465	T	C	1082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.497;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=13;PP=730;ReadPosRankSum=0.000;SC=TTGCCACCATTTATAAGTCTG;SOR=0.350;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=85;TCF=63;TCR=22;TR=43;WE=50779697;WS=50779679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,46:0.52:89
chr14	50786004	rs12433794	A	G	9847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=359;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=140;NR=185;PP=2965;SC=GGCTGTAGTGAAAAAGGGATG;SOR=1.076;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=325;TCF=140;TCR=185;TR=325;WE=50786012;WS=50785994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,359:1.00:359
chr14	50788213	rs2275592	C	T	9079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=169;NR=130;PP=2965;SC=CAAATGATGCCGTTTGGAAAA;SOR=0.909;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=299;TCF=169;TCR=130;TR=299;WE=50788221;WS=50788203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,335:1.00:335
chr14	50789078	rs11357954	GT	G	305.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.22;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr14	50789101	rs10685266	A	AATAC	966.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=1;PP=672;SC=GGATCTCACTAATTTATCTTC;SOR=4.514;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=13;WE=50789109;WS=50789091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr14	50789578	rs8017316	G	C	589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=15;PP=428;SC=TCCTGTGTTTGATATTTATTT;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=50789586;WS=50789568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr14	50792273	rs8003113	A	G	1403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=11;PP=883;SC=AGTAAATTGAATTTATTTTTA;SOR=1.911;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=33;TCR=11;TR=44;WE=50792281;WS=50792263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr14	50798743	rs4901016	G	A	1898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=16;PP=1037;SC=CATGCAGGCTGGAAACCCTGG;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=44;TCR=16;TR=60;WE=50798751;WS=50798733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr14	50799126	rs7161563	G	C	6129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=98;NR=105;PP=2965;SC=GTCAGCCTTTGAGTAGGGTCC;SOR=0.939;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=204;TCF=98;TCR=106;TR=203;WE=50799134;WS=50799116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr14	50799338	rs7141289	T	C	3102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=39;PP=1836;SC=ATTAAATAAATAGTTTCTAGA;SOR=1.028;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=101;TCF=62;TCR=39;TR=101;WE=50799346;WS=50799328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr14	50801102	rs7141402	G	A	1280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=4;PP=915;SC=ACTGACCTCAGGTGATCTGCC;SOR=3.365;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=36;WE=50801110;WS=50801092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr14	50802727	rs7148089	A	C	5678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=115;NR=81;PP=2965;SC=TCCATAGCTTAAATATTTCTC;SOR=1.173;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=197;TCF=116;TCR=81;TR=196;WE=50802735;WS=50802717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr14	50802840	rs7148292	A	G	7333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=111;NR=139;PP=2965;SC=GATGAGGCCAACTGGTTGCCT;SOR=1.030;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=250;TCF=111;TCR=139;TR=250;WE=50802848;WS=50802830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,272:1.00:272
chr14	50808802	rs7142237	G	T	1422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=34;NR=14;PP=820;SC=GTTGTATCAAGAACTTTTTCA;SOR=1.654;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=34;TCR=14;TR=48;WE=50808810;WS=50808792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr14	50824839	rs11157737	G	A	4593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=95;NR=61;PP=2666;SC=TCTTCTTCCAGTGCACACAAA;SOR=1.075;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=156;TCF=95;TCR=61;TR=156;WE=50824847;WS=50824829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr14	50824954	rs11157738	T	C	4778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=98;PP=2638;SC=TTTTCACCTATGCTTGCTTCA;SOR=0.998;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=173;TCF=75;TCR=98;TR=173;WE=50824962;WS=50824944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr14	50825033	rs11570816	T	C	1333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=35;PP=1060;SC=CCGGATTGCTTCCAGTGAAAT;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=36;WE=50825041;WS=50825023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr14	50828838	rs10137638	A	G	71.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=17.76;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr14	50844367	rs59930863	G	GA	3651.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=3;NR=47;PP=2312;SC=GGGGTGGGAGGAGCCCAGGGA;SOR=1.384;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=3;TCR=49;TR=50;WE=50844375;WS=50844357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr14	50844856	rs1890978	A	G	1399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=14;PP=941;SC=TAGGAAAAGCAACTCAGTTCC;SOR=1.791;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=37;TCR=14;TR=51;WE=50844864;WS=50844846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr14	50845231	rs7151046	C	A	1017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=23;PP=647;SC=AGGACACCTGCAGACAGTTCT;SOR=2.368;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=31;WE=50845239;WS=50845221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr14	50857189	rs2015870	C	A	1462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.088;NF=25;NR=36;PP=894;ReadPosRankSum=0.178;SC=TACAATTATTCTATTGTATTA;SOR=0.731;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=116;TCF=49;TCR=67;TR=61;WE=50857197;WS=50857179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,69:0.53:129
chr14	50863716	rs10136595	C	G	404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.49;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr14	50877491	rs1265878	C	A	718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=20;PP=579;SC=AGATGAGATGCGATCTCTCAT;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=50877499;WS=50877481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr14	50889979	.	A	C	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=0.000;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.407;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=79;ReadPosRankSum=-0.154;SC=AGCAATTATTAACACAATAAA;SOR=3.867;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=10;WE=50889987;WS=50889969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,12:0.31:39
chr14	50923249	rs12881869	C	T	2234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=52;PP=1421;ReadPosRankSum=-1.025;SC=ATTTCTGAAGCTGTCCGTTCA;SOR=0.686;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=254;TCF=130;TCR=124;TR=106;WE=50923257;WS=50923239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,115:0.40:284
chr14	50929508	rs11624731	C	A	6123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=118;PP=2965;SC=TGCTAAAAGACAACAAAATGA;SOR=1.249;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=196;TCF=78;TCR=118;TR=196;WE=50929516;WS=50929498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr14	50942047	rs12717408	C	T	280.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=231;SC=AAAAAATTTACTGGCACTTTA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=50942055;WS=50942037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr14	50949196	rs11364906	TA	T	405.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=236;SC=ACAGTCTACTTAAAAAAAATG;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=11;WE=50949204;WS=50949186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr14	50952678	rs118161635	T	C	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.634;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=216;ReadPosRankSum=0.308;SC=GGGAAAACCGTAGAAATAGGA;SOR=0.141;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=15;WE=50952686;WS=50952668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,18:0.78:23
chr14	50971446	rs7146431	C	T	2495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=54;NR=30;PP=1593;SC=AAGACTTCTTCTGGGAAGAAG;SOR=1.230;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=54;TCR=30;TR=84;WE=50971454;WS=50971436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr14	51057727	rs1060197	G	A	2930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.407;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=64;PP=1571;ReadPosRankSum=2.594;SC=GTGGATCTGAGCGAGAGACCA;SOR=0.720;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=278;TCF=138;TCR=140;TR=130;WE=51057735;WS=51057717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,148:0.47:315
chr14	51058234	rs2934684	G	T	1877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=31;PP=1264;ReadPosRankSum=-0.939;SC=TATCAATAATGTACTCTTCTT;SOR=0.722;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=169;TCF=107;TCR=62;TR=86;WE=51058242;WS=51058224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,91:0.50:183
chr14	51060452	rs2291672	A	G	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.128;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=3;PP=53;ReadPosRankSum=1.074;SC=AAGCATGTACATAAGAGAGTC;SOR=0.188;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=7;WE=51060460;WS=51060442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr14	51062236	rs3834518	TTC	T	773.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.13;MQRankSum=1.106;NF=10;NR=7;PP=499;ReadPosRankSum=-0.538;SC=GGTGCTAAAGTTCTCTCTCTC;SOR=0.871;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=48;TCF=27;TCR=21;TR=17;WE=51062247;WS=51062226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,34:0.52:65
chr14	51062455	rs10131107	G	A	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=21;PP=542;ReadPosRankSum=0.385;SC=ATTTCATTGAGAAACCATTTT;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=19;TCR=41;TR=31;WE=51062463;WS=51062445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,32:0.50:64
chr14	51087263	rs11157759	A	G	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.679;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=53;ReadPosRankSum=-1.410;SC=ATTCTGTGGCATGGAGGACTG;SOR=1.514;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=6;WE=51087271;WS=51087253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,7:0.27:26
chr14	51089727	rs3736307	G	T	41.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=0;PP=24;SC=TGAAACTTTTGTACTACTTTT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=51089735;WS=51089717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr14	51096610	rs3080579	G	GTTCTT	884.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=3.025;NF=7;NR=10;PP=623;ReadPosRankSum=-0.008;SC=TATCTGTTCTGAAATGCTCAC;SOR=0.639;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=38;TCF=19;TCR=19;TR=17;WE=51096618;WS=51096600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,24:0.42:57
chr14	51097536	rs2934692	G	A	1589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=13;PP=1001;SC=GCAAATTTCAGCTTTGTAAAT;SOR=2.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=37;TCR=13;TR=50;WE=51097544;WS=51097526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr14	51107452	rs871643	T	C	680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.748;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=10;PP=391;ReadPosRankSum=-0.327;SC=CAAATTTGTGTTGTAAATGTA;SOR=0.327;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=81;TCF=58;TCR=23;TR=32;WE=51107460;WS=51107442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,34:0.41:82
chr14	51107737	rs4075253	G	A	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.022;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=114;ReadPosRankSum=-1.921;SC=TACACCACCTGAAAGGTAATG;SOR=0.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=7;WE=51107745;WS=51107727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr14	51196142	rs2984274	T	C	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.923;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=55;ReadPosRankSum=0.219;SC=TGTGTGCCATTAGATTTAGGT;SOR=0.061;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=6;WE=51196150;WS=51196132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr14	51202311	rs2295847	G	C	974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.779;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=29;PP=683;ReadPosRankSum=-1.043;SC=TCTAATTCTTGTTCAAGGGAA;SOR=0.953;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=93;TCF=30;TCR=63;TR=40;WE=51202319;WS=51202301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,43:0.43:100
chr14	51206021	rs3015485	A	G	5579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=91;PP=2965;SC=AGCTTCTCCAATTACCTTCTC;SOR=0.772;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=185;TCF=93;TCR=92;TR=184;WE=51206029;WS=51206011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr14	51208236	rs76858548	T	TGTA	3208.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=10;PP=2016;SC=ATAACCAAGTTGTCCTAAGAT;SOR=2.584;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=40;TCR=12;TR=44;WE=51208244;WS=51208226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr14	51223106	rs2295846	G	T	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=198;ReadPosRankSum=-0.570;SC=TGCTCTCTTCGTGAAGACTAC;SOR=0.941;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=12;WE=51223114;WS=51223096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr14	51223789	rs2073347	C	T	8571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=141;NR=125;PP=2965;SC=AACATTCAGCCCCTCATTTTC;SOR=0.812;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=266;TCF=141;TCR=125;TR=266;WE=51223797;WS=51223779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,301:1.00:301
chr14	51224374	rs12882191	T	G	7865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=157;NR=113;PP=2965;SC=CTGTAAAAACTGCTCTGTTTG;SOR=0.939;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=270;TCF=157;TCR=113;TR=270;WE=51224382;WS=51224364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,297:1.00:297
chr14	51224417	rs2236316	G	C	3703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=354;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.822;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=80;PP=2563;ReadPosRankSum=0.292;SC=TCAGTAGCTGGCTCATCCAAA;SOR=0.549;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=323;TCF=178;TCR=145;TR=170;WE=51224425;WS=51224407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,176:0.50:354
chr14	51224658	rs2073348	T	A	1878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=36;PP=1303;ReadPosRankSum=0.427;SC=TCTGAAGCATTGAGAGAGGAG;SOR=0.670;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=150;TCF=76;TCR=74;TR=73;WE=51224666;WS=51224648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,80:0.50:161
chr14	51225132	rs2073349	G	T	1689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.574;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=32;PP=806;ReadPosRankSum=1.592;SC=GCAGCTCCTGGGCTTCCGCAC;SOR=0.580;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=147;TCF=82;TCR=65;TR=68;WE=51225140;WS=51225122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,79:0.48:163
chr14	51228655	rs12883882	C	G	891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.193;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=26;PP=605;ReadPosRankSum=-1.597;SC=ACTCATTGATCCTGCAGCAGG;SOR=0.446;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=69;TCF=19;TCR=50;TR=37;WE=51228663;WS=51228645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,39:0.52:75
chr14	51228682	rs6572694	G	A	1236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=33;PP=872;SC=CAATAACACAGTGTGGCATCT;SOR=3.365;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=6;TCR=33;TR=39;WE=51228690;WS=51228672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr14	51230431	rs150650334	CTT	C	560.52	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.37;ReadPosRankSum=-1.129;SOR=1.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,17:0.74:23
chr14	51230445	rs117261593	T	G	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.05;ReadPosRankSum=1.242;SOR=1.048;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,21:0.62:34
chr14	51237701	rs17793018	A	G	3358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.893;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=77;PP=2121;ReadPosRankSum=-3.027;SC=CCACCTGATCAACTCGTTCCC;SOR=0.763;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=274;TCF=136;TCR=138;TR=151;WE=51237709;WS=51237691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,162:0.55:292
chr14	51239067	rs8020503	C	G	4533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=76;PP=2845;SC=GCCAGGTGTCCAGTATTCTCT;SOR=0.818;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=76;TCR=76;TR=152;WE=51239075;WS=51239057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr14	51245666	rs7143959	T	C	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.289;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=264;ReadPosRankSum=0.322;SC=AGTGTATCCATCTAGATGAGT;SOR=1.022;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=47;TCF=13;TCR=34;TR=17;WE=51245674;WS=51245656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,19:0.37:51
chr14	51289872	rs112915125	TG	T	417.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.11;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr14	51290141	rs9672090	A	G	3437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=71;PP=2085;SC=GTGATCGTCCATACGGCAGAT;SOR=1.498;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=113;TCF=42;TCR=71;TR=113;WE=51290149;WS=51290131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr14	51338875	rs11850408	A	C	446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=8;PP=259;SC=GTGGCGGCGTATCGGGACACG;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=10;TCR=8;TR=18;WE=51338883;WS=51338865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
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chr14	51347107	rs2185300	G	A	2928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=35;PP=1737;SC=GGAGACTTTCGGCCTTTGGAA;SOR=1.077;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=96;TCF=61;TCR=35;TR=96;WE=51347115;WS=51347097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr14	51348421	rs17794038	G	A	853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.524;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=22;PP=436;ReadPosRankSum=0.856;SC=CAGGCCCTCCGCGTGGTTGTT;SOR=0.842;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=107;TCF=55;TCR=52;TR=44;WE=51348429;WS=51348411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,48:0.42:113
chr14	51352345	rs35375734	G	A	3292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.832;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=63;PP=1952;ReadPosRankSum=2.041;SC=CTGAGTGATGGTGGCTTTCAT;SOR=0.634;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=301;TCF=174;TCR=127;TR=146;WE=51352353;WS=51352335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,160:0.48:335
chr14	51353236	rs113033362	G	A	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.80;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr14	51353493	rs7158183	T	C	454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=12;PP=341;SC=TTTGAACATATAGACACCAAA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=51353501;WS=51353483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr14	51355517	rs10144606	C	A	1555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.050;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=30;PP=865;ReadPosRankSum=-0.085;SC=TTACTGATTTCTTTCTTTCTT;SOR=0.520;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=135;TCF=81;TCR=54;TR=70;WE=51355525;WS=51355507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,77:0.51:151
chr14	51368495	rs17123103	G	A	666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=4;PP=469;SC=CTATATAACAGATGGCATAGC;SOR=2.400;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=23;WE=51368503;WS=51368485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr14	51368610	rs28564871	A	G	3318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=59;NR=53;PP=1922;SC=AGACAAAATAATCTTTCCTAA;SOR=0.709;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=59;TCR=53;TR=112;WE=51368618;WS=51368592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr14	51368756	rs28485307	T	A	880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=7;NR=20;PP=571;SC=AGAATATTGTTCTGCGCTTCT;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=27;WE=51368764;WS=51368746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr14	51370784	rs4901064	G	C	7508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=141;NR=114;PP=2965;SC=TCTTTCTGTCGCTTGCAGCTC;SOR=0.841;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=258;TCF=142;TCR=116;TR=255;WE=51370792;WS=51370773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,273:1.00:273
chr14	51371121	rs4901065	C	T	6391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.19;SOR=1.067;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr14	51371130	rs11157780	C	T	6132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.09;SOR=1.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr14	51371150	rs11157781	C	T	2572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=53;PP=1595;SC=GTATATTGTTCTAATGTAAAA;SOR=1.635;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=28;TCR=53;TR=81;WE=51371158;WS=51371140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr14	51372098	rs3216001	CA	C	3890.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=16;PP=2431;SC=TTTCTAGAGACAATTCTAGAG;SOR=2.652;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=61;TCF=45;TCR=16;TR=60;WE=51372111;WS=51372088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr14	51372103	rs1042266	C	G	4060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=17;PP=1918;SC=AGAGACAATTCTAGAGTTCAA;SOR=2.712;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=88;TCF=69;TCR=19;TR=83;WE=51372111;WS=51372088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr14	51372333	rs1959527	A	G	3086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=57;PP=1795;SC=GCTTTATAATAAACATCAGCC;SOR=1.371;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=38;TCR=58;TR=94;WE=51372341;WS=51372323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr14	51375699	rs11414268	T	TA	3503.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=55;PP=1973;ReadPosRankSum=0.164;SC=GGGTGGGTGATAAAAAAAGGC;SOR=0.997;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=77;TCF=13;TCR=64;TR=67;WE=51375707;WS=51375689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,118:0.98:120
chr14	51375797	rs8004768	T	G	989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=9;NR=21;PP=613;SC=ATTCAAAGACTTCATTATAGA;SOR=2.115;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=30;WE=51375805;WS=51375787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr14	51375826	rs8004788	T	C	682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=15;PP=432;SC=TGAGTATATATAACTTTTAAC;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=51375834;WS=51375816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr14	51378590	rs11356035	CT	C	6649.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=80;PP=2951;SC=CTGGGGCAGCCTTTGGGGAAG;SOR=0.802;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=136;TCF=50;TCR=86;TR=124;WE=51378598;WS=51378580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr14	51381286	rs4901066	T	C	302.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=225;ReadPosRankSum=1.855;SC=CAGCATGGAGTCCTGTGTGAC;SOR=1.329;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=11;WE=51381294;WS=51381276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr14	51382358	rs1890701	T	C	551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=4;NR=17;PP=448;SC=GTTAGCTCTATGGAGGTGCCA;SOR=3.056;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=51382366;WS=51382348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr14	51383432	rs2075643	G	A	2522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=54;PP=1602;SC=CAGGGTGAGTGTCATTCAGCT;SOR=1.460;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=31;TCR=54;TR=85;WE=51383440;WS=51383422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr14	51446216	rs2275462	T	G	5218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=89;PP=2965;SC=TTTTTCTATTTAAGTCGAGGA;SOR=1.054;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=162;TCF=73;TCR=89;TR=162;WE=51446224;WS=51446206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr14	51446290	rs11844823	G	T	1019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.823;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=25;PP=605;ReadPosRankSum=-1.631;SC=AGAAAAATTGGGGTTCATTTC;SOR=0.865;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=82;TCF=31;TCR=51;TR=39;WE=51446298;WS=51446280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,46:0.51:90
chr14	51446357	rs11844781	C	G	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=203;ReadPosRankSum=-0.883;SC=TGTCTTGCAACCTGTTTATAA;SOR=0.560;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=14;WE=51446365;WS=51446347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr14	51446387	rs11844864	G	T	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.688;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=79;ReadPosRankSum=-0.483;SC=CCCCAAAACCGTTTCCCTAAT;SOR=0.160;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=6;WE=51446395;WS=51446377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr14	51475794	rs2297889	A	T	2581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=31;PP=1557;SC=ATGCAAGGACATACCTTTCAC;SOR=1.190;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=56;TCR=31;TR=87;WE=51475802;WS=51475784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr14	51477220	rs113787131	T	TA	625.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.977;HP=10;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=1.164;NF=2;NR=24;PP=284;ReadPosRankSum=-0.052;SC=CACCTAGGATTAAAAAAAAAA;SOR=0.480;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=67;TCF=5;TCR=62;TR=26;WE=51477228;WS=51477210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,33:0.43:77
chr14	51491956	rs11848681	T	C	2555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.528;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=40;PP=1475;ReadPosRankSum=-0.372;SC=CCGGCGGGTTTCCTTGCGTCC;SOR=0.750;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=178;TCF=102;TCR=76;TR=98;WE=51491964;WS=51491946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,114:0.58:197
chr14	51492135	rs11268748	C	CCACACAGGTGTTTT	1122.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.455;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.304;NF=1;NR=16;PP=2897;ReadPosRankSum=0.801;SC=ACCAACAAGGCCAGCGAGACT;SOR=0.352;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=47;TCF=3;TCR=44;TR=17;WE=51492143;WS=51492124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,30:0.56:54
chr14	51710508	rs35110538	T	TA	1540.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=7;PP=1204;SC=TTAAATTTTTTATCCCAAGAT;SOR=2.303;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=27;WE=51710516;WS=51710498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr14	51710551	rs10131881	A	T	1740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.280;NF=52;NR=22;PP=1438;ReadPosRankSum=1.050;SC=AACTTTTTTTAAAAAAAAATC;SOR=0.990;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=75;TCF=53;TCR=22;TR=74;WE=51710559;WS=51710541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,70:0.99:71
chr14	51712092	rs4606635	T	C	1291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.777;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=18;PP=837;ReadPosRankSum=-1.129;SC=TATTTGAAGATTCTAAATTAT;SOR=0.567;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=100;TCF=67;TCR=33;TR=55;WE=51712100;WS=51712082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,58:0.55:106
chr14	51716161	rs59489282	GT	G	997	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=18;PP=401;ReadPosRankSum=-0.014;SC=CAGATTTTTAGTTTTTTTTTT;SOR=0.874;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=38;TCF=12;TCR=26;TR=29;WE=51716169;WS=51716151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,46:0.88:52
chr14	51716188	rs7161242	T	G	2226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.74;SOR=1.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr14	51716467	rs7160810	G	A	1201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=24;PP=799;SC=GACCACAGCCGTACCCATACC;SOR=1.105;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=19;TCR=24;TR=43;WE=51716475;WS=51716457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr14	51720906	rs11157811	T	G	396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=304;SC=TGGTTTTTTTTATCTTATCTT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=51720914;WS=51720896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr14	52165083	rs6572784	T	G	698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=21;PP=590;SC=TGATTTTCATTTTTAGTGTAG;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=52165091;WS=52165073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr14	52182081	rs731715	T	A	7212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=138;NR=107;PP=2965;SC=GCTTGCCTTCTGCCCGGAAGC;SOR=0.818;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=245;TCF=138;TCR=107;TR=245;WE=52182089;WS=52182071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,270:1.00:270
chr14	52186966	rs2277495	G	A	3375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.976;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=65;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.681;SC=CCCGGGACACGGGGCCAGAAG;SOR=0.779;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=256;TCF=135;TCR=121;TR=145;WE=52186980;WS=52186956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,155:0.55:280
chr14	52186972	rs2277494	A	G	2477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.428;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=55;PP=2962;ReadPosRankSum=1.303;SC=ACACGGGGCCAGAAGACAGCT;SOR=0.625;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=257;TCF=135;TCR=122;TR=113;WE=52186980;WS=52186956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,127:0.45:282
chr14	52194407	rs4433726	G	A	1685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.348;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=20;PP=1075;ReadPosRankSum=-0.738;SC=CTCTTTACAAGGCAAATATTC;SOR=0.391;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=137;TCF=98;TCR=39;TR=65;WE=52194415;WS=52194397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,74:0.49:151
chr14	52294397	rs6572795	G	A	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-4.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.893;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=238;ReadPosRankSum=-0.971;SC=ATTACACGCAGTGGAAAAGCA;SOR=0.052;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=40;TCF=36;TCR=4;TR=18;WE=52294405;WS=52294387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,20:0.47:43
chr14	52308314	rs10498437	G	A	2753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.892;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=65;PP=1519;ReadPosRankSum=-0.659;SC=GAAGTCCACAGTAATATTTCA;SOR=0.754;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=259;TCF=128;TCR=131;TR=125;WE=52308322;WS=52308304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,140:0.49:288
chr14	52383228	rs11322270	GA	G	958.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=2.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=1.449;QD=10.77;ReadPosRankSum=-0.023;SOR=0.439;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,50:0.56:89
chr14	52465460	rs1151570	G	A	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.155;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=185;ReadPosRankSum=0.599;SC=ATGTTTTTATGATGTGCTTTC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=9;WE=52465468;WS=52465450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr14	52474721	rs1476284	C	T	1522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=35;PP=830;ReadPosRankSum=1.328;SC=AAAGAATAGCCATGTAGCCTG;SOR=0.680;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=152;TCF=76;TCR=76;TR=68;WE=52474729;WS=52474711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,78:0.45:174
chr14	52477561	rs200451786	A	G	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.233;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=96;ReadPosRankSum=0.086;SC=CAGGATCTACAGGTAAGAGAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=7;WE=52477569;WS=52477551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr14	52477867	rs10146989	G	A	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-4.101;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=7;PP=133;ReadPosRankSum=0.895;SC=GCAGGGGAAAGCAAAGCCCAA;SOR=0.084;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=9;WE=52477875;WS=52477857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr14	52478315	rs1051069	A	G	2265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=36;PP=1277;SC=GTTCCAGACCAGCACGGCTGA;SOR=0.739;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=77;TCF=41;TCR=36;TR=77;WE=52478323;WS=52478305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr14	52481917	rs946615	C	T	1639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.115;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=39;PP=1050;ReadPosRankSum=0.606;SC=ACTGGTCATCCCGGGGGGTGC;SOR=0.603;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=187;TCF=92;TCR=95;TR=78;WE=52481925;WS=52481907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,81:0.41:200
chr14	52486961	rs77091361	C	T	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.193;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=259;ReadPosRankSum=2.351;SC=ACAATCTGTGCGACTGCATGG;SOR=0.034;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=19;WE=52486969;WS=52486951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr14	52495354	rs74049344	T	G	2242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=33;PP=1303;ReadPosRankSum=2.364;SC=AGCCTCTGAATAGCAGAAGTC;SOR=0.732;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=164;TCF=105;TCR=59;TR=91;WE=52495362;WS=52495344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,103:0.53:193
chr14	52495375	rs7144352	C	T	8930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=136;NR=89;PP=2965;SC=AAAACACTGACAGATTAAAGA;SOR=1.107;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=226;TCF=136;TCR=90;TR=225;WE=52495383;WS=52495365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr14	52496387	rs2273430	C	A	3695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=58;PP=2018;SC=GCAAGGATTCCCCGGAGTGGG;SOR=0.816;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=115;TCF=57;TCR=58;TR=115;WE=52496395;WS=52496377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr14	52496407	rs2273431	C	T	3683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=64;PP=2056;SC=GGTCTGAATCCTCTGCATGAG;SOR=1.006;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=117;TCF=53;TCR=64;TR=117;WE=52496415;WS=52496397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr14	52505360	rs753051	A	G	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-3.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.160;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=220;ReadPosRankSum=-1.843;SC=TACCTAGCACATAACACAGCA;SOR=0.249;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=16;WE=52505368;WS=52505350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr14	52505375	rs753050	A	G	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=4;PP=363;ReadPosRankSum=0.455;SC=ACAGCATGGCACTAGGTAACC;SOR=0.776;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=57;TCF=47;TCR=10;TR=26;WE=52505383;WS=52505365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,30:0.48:63
chr14	52505589	rs17853446	G	A	2748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=4.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.677;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=58;PP=1725;ReadPosRankSum=-0.972;SC=GTCTGGGGGCGTGCCTGCACA;SOR=0.822;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=234;TCF=119;TCR=115;TR=113;WE=52505597;WS=52505579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,125:0.47:267
chr14	52505771	rs2029978	TT	AG	1909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;JOINED;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=26;PP=1507;SC=TTTTCTGCAGTTTTTTTCATC;SOR=2.200;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=37;TCF=10;TCR=27;TR=35;WE=52505780;WS=52505761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr14	52505811	rs2029976	C	T	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=46;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=174;ReadPosRankSum=0.091;SC=CCTTGGGAACCTCCTGAGTTT;SOR=0.593;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=9;WE=52505819;WS=52505801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr14	52507429	rs3742536	A	G	1140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.276;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=23;PP=680;ReadPosRankSum=-0.982;SC=AAATTTGCTGAGACGTAAGGC;SOR=0.823;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=117;TCF=63;TCR=54;TR=54;WE=52507437;WS=52507419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,59:0.47:125
chr14	52509101	rs1982963	G	A	1799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.256;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=39;PP=835;ReadPosRankSum=-1.185;SC=AGGCTTGGACGTCATCCTGGC;SOR=0.570;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=139;TCF=58;TCR=81;TR=72;WE=52509109;WS=52509091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,88:0.53:167
chr14	52509483	rs56834750	TG	CA	2919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.238;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=20;PP=1894;ReadPosRankSum=0.883;SC=CAGGAGTTCCTGGCCCCAGTC;SOR=1.096;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=118;TCF=76;TCR=42;TR=64;WE=52509492;WS=52509473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,74:0.55:134
chr14	52509788	rs3818187	A	G	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.568;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.34;ReadPosRankSum=-0.789;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr14	52520368	rs2101919	C	T	5638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=98;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.140;SC=TGTAGTGTGACCTGAAGCAGG;SOR=0.880;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=185;TCF=86;TCR=99;TR=183;WE=52520376;WS=52520358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,208:0.99:210
chr14	52520853	rs904059	A	G	7147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=117;NR=136;PP=2965;SC=CATTCACATCATAGTAATCCA;SOR=0.897;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=253;TCF=117;TCR=136;TR=253;WE=52520861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr14	52534997	rs7151874	T	C	491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=17;PP=374;SC=CCTTCCCCACTGGCCAGGGAG;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=52535005;WS=52534987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr14	52535387	rs984051	A	C	2680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=19;PP=1772;SC=GGGCTCCAGGAGTGGGGTCTG;SOR=2.226;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=66;TCR=19;TR=85;WE=52535395;WS=52535377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr14	52535415	rs984050	G	A	4039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=93;NR=42;PP=2507;SC=CCCTCTGGAGGCAGGGTTTCC;SOR=1.454;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=137;TCF=95;TCR=42;TR=135;WE=52535423;WS=52535405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr14	52535648	rs3920038	G	T	3680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=69;PP=2115;SC=CATTAGCAACGGCAGCAGCAG;SOR=1.556;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=43;TCR=69;TR=112;WE=52535656;WS=52535638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr14	52536512	rs1497082	T	C	7530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=130;NR=112;PP=2965;SC=GACCATGAAATACTACTGTGT;SOR=0.743;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=242;TCF=130;TCR=112;TR=242;WE=52536520;WS=52536502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,283:1.00:283
chr14	52781195	rs1254598	G	A	1679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=40;NR=18;PP=1081;SC=GGAACGCTCCGGCTCTCAGAC;SOR=1.536;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=40;TCR=18;TR=58;WE=52781203;WS=52781181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr14	52793786	rs45622535	A	G	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=2.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=159;ReadPosRankSum=1.746;SC=TAAGGAAGAAAGGTAAGATTC;SOR=2.147;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=8;WE=52793794;WS=52793776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr14	52794234	rs708502	T	C	1799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=47;PP=1462;SC=AAATTGTTCCTTGGAGAAATG;SOR=3.422;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=8;TCR=48;TR=55;WE=52794242;WS=52794224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr14	52906081	rs2249922	T	G	1959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.576;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=50;PP=1264;ReadPosRankSum=0.305;SC=AAATATGCCCTCAAGATTCCT;SOR=0.577;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=218;TCF=101;TCR=117;TR=95;WE=52906089;WS=52906071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,102:0.42:243
chr14	52906179	rs2249925	C	T	533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=327;ReadPosRankSum=-0.728;SC=AATAGTAATTCGTAGAACATT;SOR=0.671;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=54;TCF=15;TCR=39;TR=24;WE=52906187;WS=52906169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,26:0.46:56
chr14	52907353	rs1952254	C	T	742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.954;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=13;PP=379;ReadPosRankSum=1.925;SC=CTTTTTTATACTGAGGATTTA;SOR=0.984;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=59;TCF=35;TCR=24;TR=31;WE=52907361;WS=52907343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,37:0.52:71
chr14	52923622	rs8008680	A	G	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.579;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=34;ReadPosRankSum=-0.180;SC=TTGGTCTAAAATAAAAGAATA;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=3;WE=52923630;WS=52923612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr14	52929575	rs79329980	T	A	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.902;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.58;ReadPosRankSum=-0.392;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr14	52937255	rs7155490	C	T	1341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=26;PP=730;ReadPosRankSum=1.961;SC=AGGAGATCTTCGGTTCCTAAC;SOR=0.746;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=108;TCF=59;TCR=49;TR=59;WE=52937276;WS=52937245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,67:0.55:122
chr14	52981552	rs11387534	G	GA	564.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.46;ReadPosRankSum=-0.467;SOR=0.493;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,27:0.50:54
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chr14	53080591	rs35832722	A	G	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.845;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=215;ReadPosRankSum=0.500;SC=TATACCCAGCAGTGGGATTGC;SOR=0.352;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=14;WE=53080599;WS=53080581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr14	53174981	rs2295827	C	T	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.128;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=79;ReadPosRankSum=-0.319;SC=CTTAAACACACTAAGATTACT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=6;WE=53174989;WS=53174977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr14	53176454	rs200184712	CT	C	53.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.278;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=8.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.60;MQRankSum=0.812;QD=4.48;ReadPosRankSum=0.235;SOR=0.027;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr14	53178346	rs76219229	G	A	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.837;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=355;ReadPosRankSum=-0.160;SC=TTGTCTAAATGGTAGTTAAGA;SOR=1.313;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=35;TCF=13;TCR=22;TR=20;WE=53178354;WS=53178336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr14	53194068	rs74620173	G	T	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=87;ReadPosRankSum=1.974;SC=ATTGAAAAAAGATAGTGGTTT;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=6;WE=53194076;WS=53194058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr14	53197042	rs2277493	G	C	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.257;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.91;ReadPosRankSum=0.463;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr14	53217337	rs3783446	A	G	601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.027;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=11;PP=371;ReadPosRankSum=-0.755;SC=ATATAGTAAGATGATGTTTGA;SOR=0.527;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=61;TCF=39;TCR=22;TR=28;WE=53217345;WS=53217327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,29:0.47:62
chr14	53217384	rs71720974	CT	C	66.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=4.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.84;ReadPosRankSum=0.107;SOR=0.493;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,13:0.16:79
chr14	53235728	rs2274275	G	T	734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=18;PP=393;ReadPosRankSum=0.018;SC=AAGTTACACTGAACAATTTAA;SOR=0.573;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=50;TCF=20;TCR=30;TR=31;WE=53235736;WS=53235718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,35:0.61:57
chr14	53237647	.	T	G	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.839;ClippingRankSum=0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=21;ReadPosRankSum=-0.709;SC=TGTGGAATTTTCATAGTGTAT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=5;WE=53237655;WS=53237637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr14	53250293	rs2296494	G	C	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=570;ReadPosRankSum=1.169;SC=TGGGCTTACAGGCAATTATTT;SOR=0.965;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=32;TCF=11;TCR=21;TR=18;WE=53250304;WS=53250283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,23:0.62:37
chr14	53250296	rs79312783	A	T	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=349;ReadPosRankSum=-0.339;SC=GCTTACAGGCAATTATTTTTT;SOR=0.627;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=11;WE=53250304;WS=53250283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,10:0.33:30
chr14	53325090	rs6572868	C	T	1350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.496;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=16;PP=938;ReadPosRankSum=0.111;SC=AAACAGTATTCCTATTCACAC;SOR=1.119;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=119;TCF=83;TCR=36;TR=55;WE=53325098;WS=53325080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,61:0.46:133
chr14	53326454	rs3818453	C	A	1441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=48;PP=1070;ReadPosRankSum=-1.233;SC=AAGAAAAGAACGGTTAAAAAC;SOR=0.637;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=151;TCF=52;TCR=99;TR=72;WE=53326462;WS=53326444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,69:0.45:152
chr14	53345266	rs2357946	G	C	2124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=41;PP=1147;ReadPosRankSum=-0.010;SC=ACCCTTTACCGGAATAAGTCC;SOR=0.686;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=228;TCF=135;TCR=93;TR=102;WE=53345274;WS=53345256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,110:0.44:248
chr14	53345378	rs2357947	G	A	1843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.151;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=48;PP=1064;ReadPosRankSum=0.456;SC=TGGCCTGCTCGTAAAGCTGAT;SOR=0.821;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=173;TCF=75;TCR=98;TR=83;WE=53345386;WS=53345368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,89:0.47:191
chr14	53385733	rs35536399	T	TAC	88.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.769;NF=3;NR=0;PP=66;ReadPosRankSum=-1.181;SC=CATACATATATACAGATAGTT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=3;WE=53385741;WS=53385732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr14	53386172	rs5808695	A	ATAAT	85.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=62.65;NF=0;NR=2;PP=55;SC=TTTAACAGCAATAATTAACTA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=2;WE=53386180;WS=53386162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr14	53409584	rs7157315	C	G	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=8;PP=164;ReadPosRankSum=0.535;SC=TAATAGTAAGCTAAGAAGTAA;SOR=0.675;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=35;TCF=16;TCR=19;TR=15;WE=53409592;WS=53409574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,17:0.44:39
chr14	53513478	rs10599915	AAG	A	5803.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=38;PP=2969;SC=CATGTCCTTCAAGAGAGTTCA;SOR=1.662;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=96;TCF=50;TCR=46;TR=85;WE=53513487;WS=53513468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr14	53522324	rs5808701	T	TA	1971.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=9;PP=1668;SC=CCCCCAAACTTATGTCTAGGA;SOR=2.746;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=38;WE=53522332;WS=53522314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr14	53525392	rs915436	C	T	1835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=38;PP=1137;ReadPosRankSum=-0.701;SC=GAAGTGTTATCTTTCAACAAA;SOR=0.954;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=55;TCF=16;TCR=39;TR=54;WE=53525400;WS=53525382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,65:0.98:66
chr14	53529669	rs4898778	A	T	7621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=155;NR=80;PP=2965;SC=ACCGTCGTTTAGTTATATAGA;SOR=1.426;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=235;TCF=155;TCR=80;TR=235;WE=53529677;WS=53529659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,273:1.00:273
chr14	53539471	rs875663	A	G	1185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=28;PP=823;SC=AGTCTCTGTTACAGGAAAGTA;SOR=2.247;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=10;TCR=28;TR=38;WE=53539479;WS=53539461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr14	53619463	rs2358188	G	A	2849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=34;NR=41;PP=1690;SC=GCTGCGGCGGGTGCAGCGACA;SOR=1.014;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=34;TCR=42;TR=75;WE=53619471;WS=53619453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr14	53619480	rs140904345	T	TGCCGCC,TGCC	3497.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001,0.4999;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=12,12;NR=26,26;PP=1679,12;SC=GACAAGGAGCTGCCGCCGCCG;SOR=0.720;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=58;TCF=17;TCR=41;TR=38,38;WE=53619488;WS=53619470;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:75
chr14	53619544	rs2358189	G	A	3585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=59;NR=59;PP=2166;SC=CGGCGGAGCTGAAGTCATAGT;SOR=0.708;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=59;TCR=59;TR=118;WE=53619552;WS=53619534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr14	54415291	rs12898159	C	T	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=124;ReadPosRankSum=0.312;SC=TCCCTACACCCGTCATTCCAG;SOR=0.693;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=8;WE=54415299;WS=54415281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr14	54417522	rs17563	A	G	1363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.241;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=27;PP=829;ReadPosRankSum=-0.110;SC=AGAGGAGATCACCTCGTTCTC;SOR=0.495;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=117;TCF=69;TCR=48;TR=61;WE=54417530;WS=54417512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,67:0.52:129
chr14	54418986	rs2761880	T	C	3182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=63;PP=2080;SC=AAAGAATAAATAAACACCAAT;SOR=1.791;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=31;TCR=63;TR=94;WE=54418994;WS=54418976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr14	54863577	rs2235961	G	A	1903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=44;NR=26;PP=1191;SC=CTAGGAACCAGTCAGCGATTA;SOR=1.308;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=44;TCR=26;TR=70;WE=54863585;WS=54863567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr14	54869027	rs35529322	C	CGT	174.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=282;ReadPosRankSum=1.496;SC=CATGTGTGTGCGTGTGTGTGT;SOR=0.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=7;WE=54869036;WS=54869017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr14	54875276	rs4251623	C	A	174.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=139;SC=AGAATCCTTGCTTAGGATGAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=54875284;WS=54875266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr14	54875514	rs2179896	A	G	2522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=49;PP=1491;SC=ACAGGTAGGTATAATATCACG;SOR=1.305;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=34;TCR=49;TR=83;WE=54875522;WS=54875504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr14	54875591	rs4251625	GT	G	154.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.392;HP=9;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=84;ReadPosRankSum=0.801;SC=GAACAAATCAGTTTTTTTTTA;SOR=1.552;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=7;WE=54875599;WS=54875581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr14	54875607	rs4251626	AA	GC	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.445;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=17.48;ReadPosRankSum=-0.620;SOR=0.175;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr14	54879473	rs2268332	G	T	2081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.059;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=36;PP=1122;ReadPosRankSum=1.491;SC=GCAACAGAGAGCCAGCCATGG;SOR=0.702;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=182;TCF=99;TCR=83;TR=84;WE=54879481;WS=54879463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,103:0.49:212
chr14	54896852	rs78534712	G	A	854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-3.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.797;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=21;PP=509;ReadPosRankSum=1.243;SC=ATTTGCTGGTGTGCACCATGC;SOR=0.133;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=49;TCF=9;TCR=40;TR=28;WE=54896860;WS=54896842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,33:0.58:57
chr14	54907863	rs28734951	C	G	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.057;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=395;ReadPosRankSum=0.641;SC=GCATCCCCGACGCGCAAAGCC;SOR=0.857;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=56;TCF=39;TCR=17;TR=25;WE=54907871;WS=54907853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,27:0.47:57
chr14	54947501	rs59955412	T	C	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.402;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=108;ReadPosRankSum=-0.571;SC=TCAACAATGTTCATCTTTAAA;SOR=0.385;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=11;WE=54947509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,13:0.37:35
chr14	54955677	rs3737314	A	T	1904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.649;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=32;PP=969;ReadPosRankSum=-0.014;SC=CCTGTCGCCTACACTCGGGCG;SOR=0.586;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=180;TCF=95;TCR=85;TR=77;WE=54955685;WS=54955667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,96:0.44:217
chr14	55154053	rs11626473	C	T	3420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=51;PP=2124;SC=CTTGGCATCTCGGGGAGGACC;SOR=0.916;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=117;TCF=66;TCR=51;TR=117;WE=55154061;WS=55154043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr14	55168673	rs1022754	A	G	440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=0;PP=358;SC=AAATATAGCCAGACTATGTAG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=16;WE=55168681;WS=55168663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr14	55218161	rs2295820	A	C	724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=393;ReadPosRankSum=-0.700;SC=CTTGTTATTTAATTACAGAAT;SOR=0.735;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=70;TCF=50;TCR=20;TR=30;WE=55218169;WS=55218151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,35:0.45:78
chr14	55218435	rs2295822	A	G	1264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=32;PP=976;SC=TGCTTCTTTGAAAGCTGATGC;SOR=3.556;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=5;TCR=32;TR=37;WE=55218443;WS=55218425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr14	55221543	rs11627203	T	C	1576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=26;PP=832;ReadPosRankSum=-1.948;SC=TGCAGAGCTCTTTTGTTCAGT;SOR=0.744;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=108;TCF=63;TCR=45;TR=65;WE=55221551;WS=55221533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,75:0.61:123
chr14	55255673	rs11431	C	T	3534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=374;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.909;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=86;PP=2071;ReadPosRankSum=0.735;SC=AAGCTGAAGACGAGAGTGACC;SOR=0.896;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=337;TCF=164;TCR=173;TR=160;WE=55255681;WS=55255663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:198,176:0.47:374
chr14	55310492	rs841	G	A	1470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.195;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=30;PP=618;ReadPosRankSum=1.841;SC=TTTTGTGCACGTACTTACACT;SOR=0.813;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=152;TCF=77;TCR=75;TR=63;WE=55310500;WS=55310482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,76:0.44:172
chr14	55429902	.	AGGGG	A	130.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.799;ClippingRankSum=-0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.88;ReadPosRankSum=3.067;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
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chr14	55473963	.	A	AAAAAG	63.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.161;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.63;MQRankSum=2.242;QD=3.98;ReadPosRankSum=0.135;SOR=1.104;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,3:0.19:16
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chr14	55817708	rs10144418	T	C	1600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.575;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=35;PP=875;ReadPosRankSum=0.092;SC=ATGGAGTCTATGCTGGGAGGC;SOR=0.759;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=148;TCF=74;TCR=74;TR=69;WE=55817716;WS=55817698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,78:0.48:164
chr14	55818517	rs1045002	T	A	4897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=448;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.731;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=106;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.700;SC=CAGCCTTCCATTTTAAACTCC;SOR=0.680;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=398;TCF=203;TCR=195;TR=210;WE=55818525;WS=55818507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:215,231:0.52:446
chr14	55818706	rs3742569	T	C	1555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.273;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=34;PP=910;ReadPosRankSum=1.496;SC=CCATTTGTACTGCCAGCCTCT;SOR=0.812;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=132;TCF=63;TCR=69;TR=62;WE=55818714;WS=55818696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,71:0.47:150
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chr14	55847466	rs946059	A	G	2005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.528;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=54;PP=1191;ReadPosRankSum=-1.416;SC=AACTACTAATAATCCACGAGT;SOR=0.742;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=198;TCF=68;TCR=130;TR=83;WE=55847474;WS=55847456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,94:0.43:217
chr14	55848972	rs3783650	A	C	1898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.255;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=49;PP=1259;ReadPosRankSum=1.171;SC=ATGCAATATAACTGCAAGACA;SOR=0.588;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=154;TCF=57;TCR=97;TR=79;WE=55848980;WS=55848962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,86:0.51:167
chr14	55864130	rs8003279	A	G	1950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.362;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=51;PP=1233;ReadPosRankSum=-0.857;SC=AGTCGGCTTAACCTTTCCTTC;SOR=1.052;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=164;TCF=70;TCR=94;TR=83;WE=55864138;WS=55864120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,91:0.50:182
chr14	55881276	rs1890256	C	T	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=102;ReadPosRankSum=0.221;SC=TTTAATATGACATCTCTTTAG;SOR=0.627;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=8;WE=55881284;WS=55881266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr14	55902542	rs7149317	G	A	965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=15;PP=568;ReadPosRankSum=0.220;SC=CTAATTATTGGAAGGAATACT;SOR=0.627;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=73;TCF=48;TCR=25;TR=40;WE=55902550;WS=55902532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,46:0.49:94
chr14	55907025	rs8020152	T	A	1734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.573;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=28;PP=860;ReadPosRankSum=1.691;SC=ATGGTCGCTATGAGTTTTAAG;SOR=0.623;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=142;TCF=83;TCR=59;TR=68;WE=55907033;WS=55907015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,83:0.50:165
chr14	55907172	rs8019270	C	G	917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.516;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=24;PP=584;ReadPosRankSum=0.880;SC=CTCCATGGACCGTAATCCCAC;SOR=0.963;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=96;TCF=44;TCR=52;TR=41;WE=55907180;WS=55907162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,46:0.43:107
chr14	56078739	rs1138345	T	G	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.27;ReadPosRankSum=0.939;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr14	56100160	rs10135907	G	T	335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=280;SC=AGACTTTTGTGTTTTTACATT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=56100168;WS=56100150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	56101164	rs139496974	AAACT	A	1310.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.363;NF=16;NR=3;PP=837;ReadPosRankSum=-1.380;SC=CAGCTCAGCAAAACTAACAAA;SOR=0.846;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=53;TCF=43;TCR=10;TR=19;WE=56101175;WS=56101154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,35:0.53:66
chr14	56101212	rs34111199	C	T	1869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.556;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.481;NF=48;NR=31;PP=1112;ReadPosRankSum=1.818;SC=TTTGTAATAACGGAAGGCTCC;SOR=0.754;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=162;TCF=100;TCR=62;TR=79;WE=56101220;WS=56101202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,88:0.48:183
chr14	56103882	rs10483647	A	G	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.972;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=213;ReadPosRankSum=0.954;SC=AGGCAAAGAAAGAGACCTCTG;SOR=1.154;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=12;WE=56103890;WS=56103872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,14:0.40:35
chr14	56106031	rs3831052	TGAC	T	1314.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.445;NF=0;NR=20;PP=845;ReadPosRankSum=1.769;SC=TTTATACCTCTGACGACCTGT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=0;TCR=42;TR=20;WE=56106041;WS=56106021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,35:0.50:70
chr14	56108007	rs10483649	G	A	765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.125;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=20;PP=417;ReadPosRankSum=-1.781;SC=GAAATACTACGTTTTGTATGA;SOR=1.101;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=61;TCF=24;TCR=37;TR=32;WE=56108015;WS=56107997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,36:0.54:67
chr14	56108033	rs2341890	G	A	1507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=33;PP=943;SC=CTCTGAAACAGTGTTTCTGTA;SOR=1.412;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=19;TCR=33;TR=52;WE=56108041;WS=56108023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr14	56108520	rs1951890	A	G	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.561;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=151;ReadPosRankSum=0.378;SC=TACTTGTTATATAACAAGATC;SOR=2.093;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=9;WE=56108528;WS=56108510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr14	56113917	rs17684916	A	C	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=226;ReadPosRankSum=2.483;SC=AGCATATAAGAATGAATTACT;SOR=0.551;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=14;WE=56113925;WS=56113907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,17:0.71:24
chr14	56114866	rs17128657	A	T	862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.707;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=24;PP=537;ReadPosRankSum=1.209;SC=TTTCCTTGTGATTATTCAGTG;SOR=0.606;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=108;TCF=47;TCR=61;TR=42;WE=56114874;WS=56114856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,46:0.38:120
chr14	56116576	rs71448463	AT	A	525.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=178;ReadPosRankSum=1.067;SC=TCTTTGGTCCATTTTTTTTTT;SOR=0.575;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=16;WE=56116584;WS=56116566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,27:0.60:45
chr14	56122689	rs35094494	G	A	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.032;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=239;ReadPosRankSum=1.016;SC=TTTTTCTTAGGGGTGATATTG;SOR=1.938;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=12;WE=56122697;WS=56122679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,12:0.41:29
chr14	56126456	rs7160678	C	A	3086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=48;NR=49;PP=1812;SC=TTTATAAAGTCGTAACTATTT;SOR=0.927;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=48;TCR=49;TR=97;WE=56126464;WS=56126446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr14	56133942	rs7150285	C	T	1186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=23;PP=746;ReadPosRankSum=0.470;SC=TTTGATTTGGCTCATCTTCTG;SOR=0.637;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=120;TCF=75;TCR=45;TR=56;WE=56133950;WS=56133932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,60:0.45:132
chr14	56139313	rs3215766	GT	G	1461.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.145;NF=11;NR=21;PP=992;ReadPosRankSum=-1.502;SC=ATCCTTGGTGGTTTTACTTGG;SOR=0.752;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=74;TCF=23;TCR=51;TR=32;WE=56139321;WS=56139303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,58:0.44:132
chr14	56142480	rs3736877	A	G	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=131;ReadPosRankSum=-0.117;SC=TTCATTCTTCAGTCCTAGAGG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=9;WE=56142488;WS=56142470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr14	56146228	rs12587735	T	G	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=321;ReadPosRankSum=-0.182;SC=TTGTTTGGTTTTACATTTCTT;SOR=0.997;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=15;WE=56146236;WS=56146218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr14	56147540	rs10483651	G	T	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=215;ReadPosRankSum=0.083;SC=TTAAGCCTCAGCTCAAATCTT;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=11;WE=56147548;WS=56147530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr14	56958173	rs1889382	C	G	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=208;ReadPosRankSum=0.217;SC=CCCTCAGGCCCATGTCTGTTC;SOR=0.765;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=16;WE=56958181;WS=56958163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr14	56958247	rs12893562	C	T	1174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.40;ReadPosRankSum=-2.098;SOR=0.673;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,61:0.49:125
chr14	56958328	rs12894026	G	A	1446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.613;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=29;PP=707;ReadPosRankSum=-0.799;SC=CAGTTTCAGCGCCACATCGGG;SOR=0.781;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=121;TCF=67;TCR=54;TR=60;WE=56958336;WS=56958318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,71:0.49:145
chr14	57070501	rs10782433	A	G	3788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=50;PP=2592;SC=TTTTTGTTGGAAAAGAAGATT;SOR=1.270;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=84;TCR=50;TR=133;WE=57070509;WS=57070491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr14	57082648	rs2275024	A	G	1695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=34;NR=22;PP=936;SC=AATAAGTTAGATTGTTTTTTG;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=34;TCR=22;TR=56;WE=57082656;WS=57082638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr14	57084208	rs3068785	T	TTTAA	353.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=282;SC=GAATGCAGTGTTTAACACAGT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=57084216;WS=57084198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr14	57099859	rs1041316	G	A	2811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=63;PP=1784;SC=CTTACAAAAAGTATCTATAAC;SOR=1.802;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=32;TCR=63;TR=95;WE=57099867;WS=57099849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr14	57101682	rs913742	A	G	10104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=370;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=163;NR=174;PP=2965;SC=TGACTATTCTACATTTTTGTG;SOR=0.772;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=337;TCF=163;TCR=174;TR=337;WE=57101690;WS=57101672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,368:1.00:368
chr14	57114285	rs34046661	C	CA	1196.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=25;PP=1072;SC=GTTTTTCCTTCAAGAAAAGAA;SOR=2.964;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=25;WE=57114293;WS=57114275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr14	57116979	rs1958530	A	G	124.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=3;PP=54;SC=TTCGGCCTGAAGAGCCAGTGG;SOR=1.981;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=57116987;WS=57116969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr14	57196766	rs10151357	C	T	614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.670;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=379;ReadPosRankSum=1.092;SC=TTTTTTTCCACTGGGGAAAAT;SOR=0.242;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=47;TCF=40;TCR=7;TR=25;WE=57196774;WS=57196756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,27:0.54:50
chr14	57271127	rs2277499	G	T	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.978;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=74;ReadPosRankSum=-0.571;SC=GTTTCCGCGGGTTCTCCGACG;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=5;WE=57271135;WS=57271117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
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chr14	57863385	rs12894584	C	T	626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.091;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=424;ReadPosRankSum=-0.845;SC=AAAATGCTTACCAATGGTTGG;SOR=0.162;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=40;TCF=35;TCR=5;TR=25;WE=57863393;WS=57863375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,27:0.64:42
chr14	57866623	rs2152360	A	G	2218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.73;SOR=0.928;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr14	57876265	rs11620639	G	A	7276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=115;NR=133;PP=2965;SC=ACTATCATCCGCACAGAATCG;SOR=0.916;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=248;TCF=115;TCR=133;TR=248;WE=57876273;WS=57876255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,276:1.00:276
chr14	57938124	rs1152531	C	T	4344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=65;PP=2797;SC=CTGTCCTGGTCCTCACCAGTG;SOR=0.924;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=151;TCF=86;TCR=65;TR=151;WE=57938132;WS=57938114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr14	57938260	rs1152530	T	C	2041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=44;PP=1433;SC=CCAGGGACAGTAGTTATTCAC;SOR=1.678;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=65;TCF=21;TCR=44;TR=65;WE=57938268;WS=57938250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr14	57945689	rs1152525	G	A	3629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=41;PP=2233;SC=TTTGGCCCACGGCACAGCGAT;SOR=1.402;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=75;TCR=41;TR=116;WE=57945697;WS=57945679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr14	57948380	rs1152522	T	C	1846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=37;PP=1133;SC=TAGTACCTGCTATGAAAGACA;SOR=1.473;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=59;TCF=22;TCR=37;TR=59;WE=57948388;WS=57948370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr14	57957654	rs1203339	T	C	1530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.02;SOR=1.819;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr14	57957664	rs1203338	T	A	1601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.15;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr14	58056257	rs1190313	G	T	1263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.738;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=34;PP=817;ReadPosRankSum=-1.483;SC=GAATACAAATGTGAGGAAAGC;SOR=0.566;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=40;TCR=63;TR=56;WE=58056265;WS=58056247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,59:0.53:112
chr14	58060586	rs180872	C	T	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=110;ReadPosRankSum=1.803;SC=CATTCTGTGACAATGGCGAGA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=3;WE=58060606;WS=58060576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr14	58060598	rs238377	C	G	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.744;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=110;ReadPosRankSum=1.876;SC=ATGGCGAGATCTTTCTATTTA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=3;WE=58060606;WS=58060576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr14	58060862	rs17724076	G	A	1719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.983;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=42;PP=1021;ReadPosRankSum=-0.544;SC=CAGAGTTCACGCCAGTTTGAG;SOR=0.477;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=140;TCF=57;TCR=83;TR=74;WE=58060870;WS=58060852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,82:0.54:152
chr14	58332385	.	C	T	1477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=0.000;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.396;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=21;PP=878;ReadPosRankSum=0.400;SC=CCGCGGCACCCCTGCGCGCCC;SOR=0.830;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=128;TCF=86;TCR=42;TR=65;WE=58332393;WS=58332375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,70:0.51:137
chr14	58471445	rs17094192	C	G	4096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=99;NR=57;PP=2782;SC=AATTAAAACCCAGTCCAATTC;SOR=1.319;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=156;TCF=99;TCR=57;TR=156;WE=58471453;WS=58471435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr14	58471699	rs727203	T	C	2953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=41;PP=2267;SC=GTGTGCTTTATTAAGTAAATT;SOR=0.714;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=47;TCR=41;TR=87;WE=58471707;WS=58471689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr14	58478873	rs3837616	GA	G	2283.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=40;PP=1267;SC=TTCTCACTAGGAAAAAAATAA;SOR=1.058;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=47;TCF=5;TCR=42;TR=45;WE=58478881;WS=58478863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr14	58478997	rs72714763	A	G	139.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=5;PP=109;SC=ATATAACATAATGACGATAAT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=58479005;WS=58478987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr14	58666882	rs61975916	A	G	912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=12;PP=560;ReadPosRankSum=0.664;SC=GCGAGCGCCGAGACTTGTTGG;SOR=0.660;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=76;TCF=53;TCR=23;TR=38;WE=58666890;WS=58666872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,42:0.51:82
chr14	58669660	rs75291796	AT	A	658.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.594;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=832;ReadPosRankSum=-0.458;SC=TTAAAAAAAAATATTAGCAAA;SOR=0.323;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=47;TCF=3;TCR=44;TR=23;WE=58669668;WS=58669650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,36:0.47:76
chr14	58697795	rs111932447	C	CAG	187.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=2;PP=113;SC=CTTTTTTTGACAGTGTTGCTC;SOR=1.022;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=58697803;WS=58697785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr14	58724817	rs35486640	C	CTT	973.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=11;PP=491;SC=AATAGAAACTCGTCGATAAGT;SOR=0.963;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=11;WE=58724825;WS=58724807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr14	58724849	rs140273752	AAC	A	151.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.282;HP=3;HapScore=2;MGOF=39;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=135;ReadPosRankSum=0.786;SC=GATTAAATAAAACAGTGTACA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=58724858;WS=58724839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr14	58730626	rs2348071	A	G	535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=14;PP=388;SC=CACCAACACTAATGATAGCTG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=58730634;WS=58730616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr14	58737766	rs8005100	A	T	1135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=20;NR=23;PP=671;SC=TCAGGGAATCACTTAGCCCAG;SOR=0.929;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=20;TCR=24;TR=43;WE=58737774;WS=58737756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr14	58758331	rs11461912	G	GT	3642.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=45;PP=1444;SC=TTACCTAAGAGTAACTAAGTA;SOR=1.037;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=53;TCF=6;TCR=47;TR=51;WE=58758339;WS=58758321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr14	58766617	rs1957038	A	G	5607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=101;PP=2965;ReadPosRankSum=-2.278;SC=TCGCGCCCTGAACACTGCCAA;SOR=0.849;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=194;TCF=92;TCR=102;TR=192;WE=58766625;WS=58766606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,205:0.99:207
chr14	58768333	rs45562837	C	T	1567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.551;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=37;PP=930;ReadPosRankSum=0.313;SC=CAGTGGGAACCGATGTCAGTG;SOR=0.616;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=167;TCF=83;TCR=84;TR=73;WE=58768341;WS=58768323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,79:0.44:181
chr14	58770389	rs10145481	C	G	3065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=62;PP=1856;SC=CTAAAGGGTCCCTCCAGACCA;SOR=1.322;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=101;TCF=39;TCR=62;TR=100;WE=58770397;WS=58770379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr14	58771632	rs7155580	A	G	948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=13;PP=557;SC=TAAAAGTAATATGCAAATTAT;SOR=1.061;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=21;TCR=13;TR=34;WE=58771640;WS=58771622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr14	58820297	.	C	T	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.072;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=35;ReadPosRankSum=-0.575;SC=TGTGAATAATCTACCTGTTGG;SOR=0.124;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=5;WE=58820305;WS=58820287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,7:0.25:28
chr14	58820568	rs17832939	T	C	1052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.705;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=28;PP=507;ReadPosRankSum=-1.425;SC=ATGGATGGAATGTCAGGTAAG;SOR=0.454;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=91;TCF=32;TCR=59;TR=46;WE=58820576;WS=58820558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,54:0.51:106
chr14	58831142	rs1051858	A	G	1853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.764;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=32;PP=1125;ReadPosRankSum=0.911;SC=AATGGAAAAAACAGAAGAAGT;SOR=0.806;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=150;TCF=81;TCR=69;TR=76;WE=58831150;WS=58831132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,85:0.52:162
chr14	58838668	rs1051860	A	G	2910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.521;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=53;PP=1427;ReadPosRankSum=0.980;SC=CCTCATCATCATCTCCCCCAC;SOR=0.657;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=261;TCF=135;TCR=126;TR=118;WE=58838676;WS=58838658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,142:0.48:294
chr14	58838701	rs1051861	C	T	2793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=56;PP=1389;ReadPosRankSum=0.266;SC=CTGTAGAATGCAGGTGATAAA;SOR=0.705;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=229;TCF=110;TCR=119;TR=110;WE=58838709;WS=58838691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,131:0.51:259
chr14	58869510	rs7153357	T	C	1634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=25;PP=738;SC=TTGTGAGTTATGACAGCTTAT;SOR=1.057;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=22;TCR=25;TR=47;WE=58869518;WS=58869490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr14	58906784	.	C	T	34	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000;HP=17;HapScore=2;MGOF=46;MMLQ=15;MQ=59.36;NF=4;NR=0;PP=34;QD=17.1928031368;SC=TTTTTTTTTTCTAGAGACAGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=4;WE=58906792;WS=58906774;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr14	58907006	rs138818880	TTC	T	122.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.61;ReadPosRankSum=1.205;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,9:0.19:47
chr14	58917225	rs1748970	C	G	1604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=1;PP=1223;SC=AAAGTATAGGCAAGAGTAATA;SOR=6.358;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=44;TCF=43;TCR=1;TR=44;WE=58917233;WS=58917215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr14	58917454	rs1748971	G	A	5633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=116;PP=2965;SC=TGGAAGTGTCGTGTCACAGAG;SOR=1.075;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=199;TCF=83;TCR=116;TR=199;WE=58917462;WS=58917444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr14	58920240	rs1748975	A	C	1244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=22;PP=843;SC=GAGTTTTGTTAAGATTTTTCA;SOR=1.501;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=14;TCR=22;TR=36;WE=58920248;WS=58920230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr14	58923395	rs1743721	G	A	3991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=81;NR=49;PP=2137;SC=ATCTTCTGTAGCGTTGAAACT;SOR=1.058;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=81;TCR=49;TR=130;WE=58923403;WS=58923385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr14	58926527	rs1748980	C	T	231.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=102;SC=TATTTGTAGACATTTTAAGTA;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=58926535;WS=58926517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr14	58932772	rs1743716	A	G	3582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.646;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=76;PP=2224;ReadPosRankSum=-0.952;SC=AATATGTGGGATGGATTTTAT;SOR=1.683;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=115;TCF=39;TCR=76;TR=114;WE=58932780;WS=58932762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,131:0.98:133
chr14	58934371	rs1632390	G	A	915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=0;PP=703;SC=TGAGAATATAGCCATTAAGAT;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=58934379;WS=58934361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr14	58937416	rs1748986	T	C	7165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=109;NR=132;PP=2965;SC=GAAGCATCTCTTCCTCCTGTG;SOR=0.947;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=241;TCF=109;TCR=132;TR=241;WE=58937424;WS=58937406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,262:1.00:262
chr14	58949210	.	AT	A	48.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.854;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.60;MQRankSum=1.477;QD=2.87;ReadPosRankSum=-2.163;SOR=0.963;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr14	58953617	rs1743702	T	C	590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=19;NR=0;PP=528;SC=TACTTAACCCTGCCATCAATT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=58953625;WS=58953607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr14	58953746	rs1617510	C	G	4868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=71;PP=2960;SC=CACCCCACTGCCTACCCCACA;SOR=0.784;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=94;TCR=71;TR=165;WE=58953754;WS=58953736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr14	58954588	rs5808973	T	TA	1933.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.423;NF=22;NR=22;PP=954;ReadPosRankSum=0.024;SC=TCTGTCCTTTTAAAAAAAAAC;SOR=0.527;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=59;TCF=26;TCR=33;TR=44;WE=58954596;WS=58954578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,70:0.99:71
chr14	59010649	rs28535751	T	C	1649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.903;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=46;PP=948;ReadPosRankSum=-1.061;SC=AAACTCGGGCTGTGGAGGTTT;SOR=0.964;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=141;TCF=68;TCR=73;TR=80;WE=59010657;WS=59010639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,82:0.54:151
chr14	59105188	rs2003021	C	T	751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=6.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.02;ReadPosRankSum=1.292;SOR=1.453;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,37:0.49:75
chr14	59112475	rs863091	C	T	2530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.629;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=46;PP=1405;ReadPosRankSum=-0.697;SC=GCGTTTGTGTCAGAGCCCCGG;SOR=0.855;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=242;TCF=133;TCR=109;TR=107;WE=59112483;WS=59112465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,123:0.45:275
chr14	59113430	rs698025	G	A	1969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.371;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=48;PP=1323;ReadPosRankSum=2.467;SC=GGCCCGGCGCGGTCGCCGGGA;SOR=0.976;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=170;TCF=83;TCR=87;TR=87;WE=59113438;WS=59113420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,94:0.51:184
chr14	59730422	rs67718668	AAGG	A	1386.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.717;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.103;NF=0;NR=24;PP=972;ReadPosRankSum=-0.391;SC=GGAGCCAGAGAAGGAGAAGAG;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=4;TCR=51;TR=24;WE=59730432;WS=59730412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,37:0.46:80
chr14	59730453	rs1253006	G	A	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.382;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=289;ReadPosRankSum=-0.454;SC=GAATGAGTTGGTTTGGTTTGA;SOR=1.071;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=54;TCF=19;TCR=35;TR=22;WE=59730461;WS=59730443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,23:0.38:61
chr14	59789586	rs8021976	A	G	6155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=122;NR=83;PP=2965;SC=GCACTTAAGCATGGTGCATTT;SOR=1.193;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=205;TCF=122;TCR=83;TR=205;WE=59789594;WS=59789576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr14	59789727	rs8022614	G	A	2498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.282;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=61;PP=1590;ReadPosRankSum=-1.248;SC=GCTGTATAAAGGCGTTAATGA;SOR=0.908;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=247;TCF=125;TCR=122;TR=109;WE=59789735;WS=59789717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,120:0.43:282
chr14	59797115	rs941883	A	G	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.663;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=216;ReadPosRankSum=0.761;SC=CCTAATAAAGATCCTCATAAT;SOR=1.096;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=13;WE=59797123;WS=59797105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr14	59797213	rs41285510	G	A	2096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.523;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=35;PP=1229;ReadPosRankSum=1.126;SC=TTGTTTTCTCGTGTAGAGCAC;SOR=0.758;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=181;TCF=108;TCR=73;TR=89;WE=59797221;WS=59797203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,100:0.50:201
chr14	59797235	rs941884	A	G	2509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.011;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=43;PP=1515;ReadPosRankSum=0.323;SC=ATGAGCTACAACAGAAACTGG;SOR=0.801;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=211;TCF=121;TCR=90;TR=105;WE=59797243;WS=59797225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,117:0.50:234
chr14	59797373	rs28927674	G	A	1645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.395;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=41;PP=1019;ReadPosRankSum=0.646;SC=AGCAGGTGGCGGACCTCACAG;SOR=0.845;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=130;TCF=47;TCR=83;TR=63;WE=59797381;WS=59797363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,72:0.50:143
chr14	59798473	rs2146012	C	G	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.127;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=360;ReadPosRankSum=-1.504;SC=AAATAACCATCCCTGTTCTTT;SOR=0.283;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=18;WE=59798481;WS=59798463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr14	59804999	rs1958180	A	G	3665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-1.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=419;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.524;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=74;PP=2116;ReadPosRankSum=-2.381;SC=CTTACCCTACATCACTTGTTT;SOR=0.647;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=370;TCF=206;TCR=164;TR=165;WE=59805007;WS=59804989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:228,191:0.46:419
chr14	59814502	rs941886	C	A	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.469;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=352;ReadPosRankSum=1.077;SC=AACTTAATGACCTTATTCTCT;SOR=2.303;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=18;WE=59814510;WS=59814492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr14	59834048	rs10130669	C	T	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-2.166;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=96;ReadPosRankSum=0.023;SC=ACAAAACTTACGTTTGACTCA;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=6;WE=59834056;WS=59834038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr14	59835350	rs41285512	A	C	2540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.843;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=38;PP=1767;ReadPosRankSum=-1.190;SC=CAAAGAGGTTATTTCTTTCTA;SOR=0.453;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=158;TCF=104;TCR=54;TR=102;WE=59835358;WS=59835340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,107:0.62:172
chr14	59931931	rs1752428	T	G	98.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.13;ReadPosRankSum=1.465;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr14	59939727	rs8660	T	C	3569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.850;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=71;PP=2259;ReadPosRankSum=0.464;SC=TCATCTTCTATTATAAAGCTT;SOR=0.640;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=281;TCF=153;TCR=128;TR=151;WE=59939735;WS=59939717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,169:0.53:317
chr14	59941143	rs8013894	A	G	1356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=15;PP=835;ReadPosRankSum=-0.302;SC=TAATAAATGCATCTACTTGCC;SOR=0.644;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=92;TCF=68;TCR=24;TR=53;WE=59941151;WS=59941133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,62:0.60:103
chr14	59942953	rs10634233	T	TCAAC	358.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=413;ReadPosRankSum=0.311;SC=CAAAAAAAGATCACATGCAAA;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=9;WE=59942961;WS=59942943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr14	59946099	rs1752436	T	C	1914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.182;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=62;PP=1202;ReadPosRankSum=-1.863;SC=GGAAAGAAGATGTGTTTGTTA;SOR=0.804;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=182;TCF=63;TCR=119;TR=91;WE=59946107;WS=59946089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,95:0.49:192
chr14	59950417	rs1268584	T	G	2717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.890;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=48;PP=1587;ReadPosRankSum=2.003;SC=AATTGCAAGGTTTCGCGGAGT;SOR=0.775;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=256;TCF=149;TCR=107;TR=120;WE=59950425;WS=59950407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,134:0.45:297
chr14	59950690	rs2296842	A	C	2173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.015;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=45;PP=1259;ReadPosRankSum=-1.403;SC=CGAAGTCCAAAGCGAAGCGGC;SOR=0.617;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=210;TCF=119;TCR=91;TR=98;WE=59950698;WS=59950680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,106:0.46:230
chr14	59951278	rs10140007	T	C	1897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.998;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=40;PP=1006;ReadPosRankSum=0.199;SC=GCTGATCTAGTGCTTCTCGAA;SOR=0.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=217;TCF=124;TCR=93;TR=93;WE=59951286;WS=59951268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,100:0.41:242
chr14	59953379	rs1253109	A	T	1092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.781;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=18;PP=731;ReadPosRankSum=-1.072;SC=TATTGCAATTATTTTTTATAA;SOR=0.813;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=86;TCF=56;TCR=30;TR=49;WE=59953387;WS=59953369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,51:0.53:96
chr14	59961971	rs35919683	TG	T	248.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.431;HP=1;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=676;ReadPosRankSum=-0.772;SC=TTAAGATCATTGTTTTTTTTT;SOR=0.089;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=16;WE=59961979;WS=59961960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,16:0.41:39
chr14	59965429	rs1271507	T	C	1132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.532;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=8;PP=826;ReadPosRankSum=0.852;SC=TACAAATTCTTTATTTTATTT;SOR=1.172;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=76;TCF=61;TCR=15;TR=43;WE=59965437;WS=59965419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,46:0.55:83
chr14	59965705	rs1271508	A	C	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=114;ReadPosRankSum=1.073;SC=AATTTTGGAGATTTTTCCTTA;SOR=0.536;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=8;WE=59965713;WS=59965695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,7:0.27:26
chr14	59977606	rs11305995	CA	C	739.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.727;NF=0;NR=25;PP=354;ReadPosRankSum=0.455;SC=GGATCATGTCCAAAAAAAAAT;SOR=0.871;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=1;TCR=48;TR=25;WE=59977614;WS=59977596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,36:0.59:61
chr14	59978366	rs10635523	A	ATG	7442.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=35;NR=47;PP=2957;SC=TTCCACCCTGATGCGTGCATG;SOR=1.158;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=36;TCR=50;TR=82;WE=59978374;WS=59978356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr14	59988324	rs12887189	C	T	3426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.905;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=75;PP=2111;ReadPosRankSum=-0.371;SC=AGACAAGTCGCTTGAGGTGTG;SOR=0.627;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=256;TCF=126;TCR=130;TR=147;WE=59988332;WS=59988314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,162:0.56:287
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chr14	59992284	rs1956365	C	T	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.488;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=412;ReadPosRankSum=2.241;SC=GATAGATATTCTTCCTTAGAA;SOR=1.981;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=53;TCF=10;TCR=43;TR=22;WE=59992292;WS=59992274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,22:0.38:58
chr14	59993663	rs8011271	A	G	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.192;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=182;ReadPosRankSum=-1.131;SC=TATATGTGTTATAACAAAGAT;SOR=0.264;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=12;WE=59993671;WS=59993653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr14	59998301	rs2145042	T	C	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.037;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=25.08;ReadPosRankSum=0.385;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
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chr14	60032046	rs1980579	A	G	945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.138;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=28;PP=625;ReadPosRankSum=-0.283;SC=TAAGAAAGGAATAGTCTGTGT;SOR=0.470;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=72;TCF=18;TCR=54;TR=38;WE=60032054;WS=60032036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,42:0.52:80
chr14	60034840	rs982862	G	C	982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=22;NR=12;PP=657;SC=TCTCCTACAAGCCATCTTCAC;SOR=1.371;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=22;TCR=12;TR=34;WE=60034848;WS=60034830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr14	60039374	rs12886261	G	A	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=9;PP=260;ReadPosRankSum=-2.970;SC=ACTTCATTCTGTTATAAGATC;SOR=0.817;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=56;TCF=36;TCR=20;TR=24;WE=60039382;WS=60039364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,25:0.40:62
chr14	60041749	rs35273647	G	GA	598.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.032;HP=9;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=237;ReadPosRankSum=-0.946;SC=TGATTGTTCTGAAAAAAAAAT;SOR=0.226;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=18;WE=60041757;WS=60041739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,27:0.61:44
chr14	60043323	rs6573272	G	A	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=2.917;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.99;ReadPosRankSum=0.385;SOR=0.346;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr14	60043422	rs4898996	A	G	911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=16;PP=486;SC=GGGAGGGGCCAGTGGAGACGG;SOR=1.002;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=30;TCF=14;TCR=16;TR=30;WE=60043430;WS=60043412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr14	60063472	rs6573275	A	G	5304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=94;PP=2965;SC=TTTACTCAGCATGCCTCTTAG;SOR=0.850;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=178;TCF=84;TCR=94;TR=178;WE=60063480;WS=60063462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr14	60071972	rs1950787	T	C	490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=305;ReadPosRankSum=-0.821;SC=CTTCTGACTCTAGAATATAAT;SOR=0.880;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=19;WE=60071980;WS=60071962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,21:0.54:39
chr14	60072023	rs1950786	G	A	4416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=98;NR=55;PP=2965;SC=GCAGTTTACAGTATTACACCT;SOR=1.383;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=153;TCF=98;TCR=55;TR=153;WE=60072031;WS=60072013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr14	60073935	rs1956372	A	G	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.987;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=224;ReadPosRankSum=-0.468;SC=TGCATCTGTGAGCTGAAATAC;SOR=0.321;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=17;WE=60073943;WS=60073925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,24:0.60:40
chr14	60076783	rs1998111	G	C	2395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.464;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=47;PP=1414;ReadPosRankSum=-0.598;SC=TTCAGACAAAGAGAAGATAGA;SOR=0.700;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=217;TCF=116;TCR=101;TR=97;WE=60076791;WS=60076773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,114:0.46:248
chr14	60394828	rs9323357	G	T	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.131;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=263;ReadPosRankSum=0.690;SC=TAGTGACTTTGGGAAGCAGAG;SOR=0.979;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=50;TCF=20;TCR=30;TR=20;WE=60394836;WS=60394818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,20:0.39:51
chr14	60405385	rs34650525	G	A	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.389;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=96;ReadPosRankSum=1.519;SC=AGGATTATCAGTTCAGTTCTT;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=6;WE=60405393;WS=60405375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr14	60411584	rs5809056	TCA	T	117.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.08;ReadPosRankSum=0.936;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr14	60426771	rs150683	T	C	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.838;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5008;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=145;ReadPosRankSum=-1.139;SC=TGATCTGAAATGGAGAGAATC;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=9;WE=60426779;WS=60426761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr14	60444652	rs219328	A	T	671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=4;PP=497;SC=GAGTTTGTTAATTATTAAACT;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=22;WE=60444660;WS=60444642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr14	60451770	rs219341	G	A	588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=3;PP=356;SC=ACTTCAGTTTGATGTAGAATG;SOR=2.636;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=60451778;WS=60451760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr14	60451816	rs219342	G	A	1401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.96;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr14	60468661	rs219369	C	T	1639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=12;PP=1014;SC=CCTTTTTTCACTGTATTTTTT;SOR=1.773;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=39;TCR=12;TR=51;WE=60468669;WS=60468651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr14	60483598	rs219388	C	T	274.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=225;SC=ATACAACTTACCTAAATATAA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=60483606;WS=60483588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr14	60484931	rs219391	C	T	297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=2;PP=229;SC=TTCAGCCGATCATTTAACCAA;SOR=3.258;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=60484939;WS=60484921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr14	60485240	rs219392	G	A	598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=8;NR=12;PP=291;SC=GGTTTCCAATGCAAATTATTC;SOR=1.426;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=21;TCF=8;TCR=13;TR=20;WE=60485248;WS=60485230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr14	60498579	rs17834334	C	A	110.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=84;SC=AATACTGTCACTCAAGCTCAC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=60498587;WS=60498569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr14	60498876	rs219409	C	T	450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=14;PP=378;SC=TAGTTTTATGCTTCTGTATGC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=60498884;WS=60498866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr14	60519920	rs95425	C	T	4747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=106;PP=2965;SC=CAAAGAAAAACTCGGTAATAA;SOR=1.491;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=164;TCF=58;TCR=106;TR=164;WE=60519928;WS=60519910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr14	60530107	rs61994053	C	T	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.27;ReadPosRankSum=-0.048;SOR=0.590;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,32:0.38:85
chr14	60574539	rs12465	A	G	7283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=124;NR=106;PP=2965;SC=GAACACTTTTATACCAGTTAG;SOR=0.748;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=230;TCF=124;TCR=106;TR=230;WE=60574547;WS=60574529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,259:1.00:259
chr14	60581673	rs35459418	CT	C	2083.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=1.885;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.11;MQRankSum=0.289;QD=22.90;ReadPosRankSum=0.017;SOR=0.901;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:5,86:0.95:91
chr14	60581863	rs219314	G	A	6376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=105;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.777;SC=CCAGTGGTCCGGAAAAACATT;SOR=0.285;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=204;TCF=98;TCR=106;TR=203;WE=60581871;WS=60581853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,228:1.00:229
chr14	60581935	rs150687	C	T	6527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=113;NR=102;PP=2965;SC=TAGAAACTAGCTTGCTTCATC;SOR=0.752;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=215;TCF=113;TCR=102;TR=215;WE=60581943;WS=60581925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr14	60582053	rs150688	G	A	4710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=72;PP=2910;SC=AATTCAAAGCGTATATATCAT;SOR=0.779;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=147;TCF=75;TCR=72;TR=147;WE=60582061;WS=60582043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr14	60712515	rs8018093	G	C	1286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.869;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=12;PP=840;ReadPosRankSum=2.207;SC=CCAGGGTAGGGGGCACACCCT;SOR=1.172;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=105;TCF=76;TCR=29;TR=54;WE=60712523;WS=60712505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,57:0.51:111
chr14	60750349	rs4899009	C	A	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.721;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.864;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=83;ReadPosRankSum=0.103;SC=AATTCTGAAACCAGTTTTTGG;SOR=0.053;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=8;WE=60750357;WS=60750339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr14	60750365	rs8012816	C	T	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.260;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=81;ReadPosRankSum=-1.210;SC=TTTGGCACAACTGTAGGATAC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=60750373;WS=60750355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr14	60864406	rs111689247	TA	T	630.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.10;SOR=3.383;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr14	60864408	.	A	T	281.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=129;ReadPosRankSum=0.149;SC=TCATAATTTAAAAAAAAAAAC;SOR=0.368;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=9;WE=60864416;WS=60864396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr14	60864583	rs1254293	G	T	6116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=94;PP=2965;SC=GAAACAGAAGGGTCGCGGCTT;SOR=0.710;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=200;TCF=106;TCR=94;TR=200;WE=60864591;WS=60864573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr14	60866165	rs56259273	A	G	139.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.79;QD=23.31;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr14	60900113	rs1254316	C	T	2849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=47;PP=1464;SC=CCCCTCATTCCGAAAACACTT;SOR=0.946;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=44;TCR=47;TR=91;WE=60900121;WS=60900103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr14	60903757	rs1254319	G	A	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=254;ReadPosRankSum=0.625;SC=GGCTTCTCAAGTAAGTTTCCT;SOR=0.665;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=18;WE=60903765;WS=60903747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr14	60921673	rs1262175	T	C	451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=2;PP=298;SC=ACTCAAAGTTTCACAGCAGAA;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=60921681;WS=60921663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	60923783	rs11625921	C	T	1387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=31;PP=970;SC=TCATTTTCTACTGACTTCCCA;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=13;TCR=31;TR=44;WE=60923791;WS=60923773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr14	60928201	rs1956549	G	A	2203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=34;PP=1286;SC=AGAGATTAAAGCATTTTCTTA;SOR=0.743;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=37;TCR=34;TR=71;WE=60928209;WS=60928191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr14	60932569	rs10529202	AACACACACACACACACACACACAC	AAC,A	1405.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5011,0.4989;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;NF=5,5;NR=5,5;PP=529,21;SC=ATAAATTTATAACACACACAC;SOR=1.609;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=18;TCF=8;TCR=10;TR=10,10;WE=60932600;WS=60932559;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:35
chr14	60932752	rs12586711	G	A	1478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=30;PP=853;SC=TGACTGCTTCGCAGAACTTTC;SOR=1.371;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=19;TCR=30;TR=49;WE=60932760;WS=60932742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr14	60933539	rs1126103	T	C	501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=5;PP=387;SC=GTATTGTTTTTACTTACACCA;SOR=1.739;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=11;TCR=5;TR=16;WE=60933547;WS=60933529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr14	60933607	.	G	GT	1011.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.444;ClippingRankSum=0.000;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=8;PP=500;ReadPosRankSum=-0.905;SC=AAAAAATGATGTTTTTGAATA;SOR=0.775;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=35;TCF=16;TCR=19;TR=16;WE=60933615;WS=60933597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,39:0.66:59
chr14	60944959	rs11845369	A	G	632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=7;PP=370;SC=ACATTCTTACACACCATGTCC;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=16;TCR=7;TR=23;WE=60944967;WS=60944949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr14	60975956	rs1956558	T	C	1420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=32;NR=15;PP=813;SC=GTCGGGGTCGTCCGCTCCCGG;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=32;TCR=15;TR=47;WE=60975964;WS=60975946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr14	60978071	rs1061108	C	G	2256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=55;PP=1717;SC=TCCAGCGCCACAGAAGCCAGG;SOR=2.568;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=17;TCR=55;TR=72;WE=60978079;WS=60978061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr14	61118783	rs4899014	C	T	833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=23;PP=609;SC=CCTCGGAGGCCGTGACTGGGC;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=61118791;WS=61118773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr14	61124940	rs10143202	A	G	7117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=122;PP=2965;SC=ATTCATGGACATATTTAAAGG;SOR=0.933;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=229;TCF=107;TCR=122;TR=229;WE=61124948;WS=61124930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr14	61180657	rs3742636	T	G	5039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=93;NR=70;PP=2965;SC=GGCCAGTGGATGCAGGCCACT;SOR=0.911;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=163;TCF=93;TCR=70;TR=163;WE=61180665;WS=61180647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr14	61184711	rs181789319	C	A	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=66;ReadPosRankSum=3.113;SC=GCCTGGGTGACAAAATGAGTC;SOR=0.859;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=7;WE=61184719;WS=61184701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr14	61445967	rs7142228	A	G	6821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=135;NR=94;PP=2965;SC=TGTTTGAAAGACAGCTGATGA;SOR=0.998;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=230;TCF=135;TCR=95;TR=229;WE=61445975;WS=61445957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr14	61448510	rs2296924	A	G	1761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=42;PP=1300;SC=GGGAGGGAAAATAATAAACAT;SOR=1.942;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=17;TCR=42;TR=59;WE=61448518;WS=61448500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr14	61449166	.	T	C	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.591;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=5.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.99;ReadPosRankSum=0.779;SOR=1.641;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,20:0.48:42
chr14	61449166	.	TT	CC	350	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=14;NR=3;PP=350;QD=23.7334044037;SC=TGGAATTTCTTTACGAAATTT;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=40;TCF=29;TCR=11;TR=17;WE=61449175;WS=61449156;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:23,17:0.43:40
chr14	61449167	rs2296923	T	C	1510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=11;PP=379;SC=GGAATTTCTTTACGAAATTTT;SOR=1.900;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=40;TCF=29;TCR=11;TR=39;WE=61449175;WS=61449156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr14	61449328	rs976272	T	A	5481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=103;PP=2965;SC=AGCTTATGTTTTGGCTAATAC;SOR=0.970;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=189;TCF=86;TCR=103;TR=188;WE=61449336;WS=61449318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr14	61451329	rs2182985	G	A	1287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=6;PP=902;SC=ACATAATTCTGCTACTCAGAG;SOR=2.935;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=35;TCR=6;TR=41;WE=61451337;WS=61451319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr14	61451589	rs2149303	C	T	819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=23;PP=621;SC=ACATATAGAACTGGATGTCTC;SOR=3.690;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=26;WE=61451597;WS=61451579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr14	61453739	rs33922839	C	CT	3165.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=18;PP=1798;SC=ATCTGTTTCTCTTCTTTTTTC;SOR=1.460;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=57;TCF=32;TCR=25;TR=44;WE=61453747;WS=61453729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr14	61497147	rs1465146	A	T	1324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=32;NR=14;PP=795;SC=TAGGAACACTATTTATTCTTT;SOR=1.473;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=32;TCR=14;TR=46;WE=61497155;WS=61497137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr14	61497285	rs1465145	T	C	1919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=30;PP=874;SC=TGTATTAATTTGATAAATATG;SOR=0.927;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=28;TCR=30;TR=58;WE=61497293;WS=61497275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr14	61509924	rs2296921	T	C	1800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=31;NR=25;PP=868;SC=TAGAGAAAGGTTTCCAGGTAA;SOR=0.849;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=31;TCR=25;TR=56;WE=61509932;WS=61509914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr14	61643045	rs4902033	C	A	8899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=152;NR=141;PP=2965;SC=AATTTCCCCCCTCAATACACA;SOR=0.718;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=293;TCF=152;TCR=141;TR=293;WE=61643053;WS=61643035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,328:1.00:328
chr14	61747644	rs3196765	A	G	5037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=85;PP=2965;SC=CCGAGCAGTTACCGGTGCCCG;SOR=0.890;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=163;TCF=78;TCR=85;TR=163;WE=61747652;WS=61747634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr14	61789318	rs1886466	C	G	419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=12;PP=306;SC=TCTTCGTCCACGTGGCCGCGG;SOR=2.049;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=16;WE=61789326;WS=61789308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr14	61857969	rs2230499	A	G	2198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=40;PP=1266;ReadPosRankSum=0.051;SC=AGGGGAAAGTATTTGTGGTAA;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=193;TCF=114;TCR=79;TR=97;WE=61857977;WS=61857959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,107:0.50:214
chr14	61915751	rs2296273	G	A	1976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=12;PP=1520;SC=AAGGATGGGCGCACCAGCTGC;SOR=2.799;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=68;TCF=55;TCR=13;TR=67;WE=61915759;WS=61915741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr14	61952429	rs1536016	T	C	4969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=95;PP=2965;SC=CCTCTCCTGGTATGATCCATC;SOR=1.262;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=157;TCF=61;TCR=96;TR=156;WE=61952437;WS=61952419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr14	61995691	.	CGT	C,CGTGTGTGTGTGT	72.87	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=6.990;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4,4;NR=0,0;PP=317,296;ReadPosRankSum=0.524;SC=TGTGGCCGCACGTGTGTGTGT;SOR=3.229;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=4,4;WE=61995700;WS=61995681;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.80:5
chr14	61997226	rs1088680	C	T	4131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=56;PP=2470;ReadPosRankSum=-0.841;SC=AGGCAGAGAACGAAGATGACC;SOR=1.003;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=141;TCF=84;TCR=57;TR=139;WE=61997234;WS=61997216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,153:0.99:155
chr14	61997393	rs1088679	T	C	2259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=51;PP=1520;SC=TTTTCAGTACTTCCCACCAGT;SOR=2.185;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=19;TCR=51;TR=70;WE=61997401;WS=61997383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr14	62037297	rs798792	C	A	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=1;PP=30;ReadPosRankSum=0.804;SC=TCCTGAACAGCATCCAGTTTG;SOR=0.344;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=4;WE=62037305;WS=62037287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr14	62037584	rs60214396	C	T	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.144;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=3;PP=61;ReadPosRankSum=-0.504;SC=GTGATGCCTGCTGAGACAGGG;SOR=0.096;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=7;WE=62037592;WS=62037574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr14	62205175	rs10138153	T	C	752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=19;PP=557;SC=TTCAAACACTTATTTGAACCA;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=62205183;WS=62205165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr14	62208005	rs4902080	T	C	861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=22;PP=672;SC=AACTTTCTGATATATATGCCC;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=62208013;WS=62207995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr14	62211578	.	CGTGT	C	120	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=120;QD=41.0;SC=TGTGCTATTTCGTGTGTGTGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=62211589;WS=62211568;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,3:0.75:4
chr14	62212675	rs4902082	C	T	380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=14;PP=376;SC=GGCGCGGTGGCTCACACCTGT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=62212683;WS=62212665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr14	62213848	rs2057482	T	C	3569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=65;PP=2403;SC=TGGTGGCTCATTACCTAAAGC;SOR=0.912;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=122;TCF=57;TCR=65;TR=121;WE=62213856;WS=62213838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr14	62213929	rs5809121	A	AT	967.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=23;PP=938;SC=GGTTAGTTCAATTTTGATCCC;SOR=2.376;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=24;WE=62213937;WS=62213919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr14	62229113	rs17099207	G	A	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=37;ReadPosRankSum=0.788;SC=TGGTTTCCTGGGCGACCACCG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=4;WE=62229121;WS=62229103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr14	62229138	rs138759765	A	AGAGGCGTGCGGGCTTCG	518.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=5.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.82;ReadPosRankSum=0.445;SOR=2.215;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,11:0.31:35
chr14	62229434	rs7151978	G	C	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=2.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=299;ReadPosRankSum=0.620;SC=TTGCCTCCATGACTCCTGGAC;SOR=0.963;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=13;WE=62229442;WS=62229424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr14	62233806	rs1254677	A	G	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.992;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=197;ReadPosRankSum=0.314;SC=CAAGTACCATATTTTTATAAT;SOR=0.264;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=13;WE=62233814;WS=62233796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr14	62234159	rs10145554	A	G	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.097;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=90;ReadPosRankSum=2.198;SC=AAAATGGAATAAGTATTGATA;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=7;WE=62234167;WS=62234149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr14	62235250	rs147257744	CTG	C	68.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.992;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=1;PP=43;ReadPosRankSum=0.241;SC=TTTGTTTTATCTGTGTTTACT;SOR=0.045;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=2;WE=62235259;WS=62235240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr14	62462766	rs8019076	T	C	2712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=34;PP=1908;SC=TCTCAGGATGTTCAGAACTTC;SOR=1.214;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=94;TCF=60;TCR=34;TR=93;WE=62462774;WS=62462756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr14	62463129	rs17099370	G	T	2358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.006;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=52;PP=1479;ReadPosRankSum=-0.843;SC=AGTGATGACCGCAAGTTACCA;SOR=0.903;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=204;TCF=93;TCR=111;TR=92;WE=62463137;WS=62463119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,105:0.47:223
chr14	62463214	rs1889806	C	T	2808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.527;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=59;PP=1628;ReadPosRankSum=1.010;SC=ATGGCTTTGACAGCCAGCTCC;SOR=0.601;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=215;TCF=109;TCR=106;TR=122;WE=62463222;WS=62463204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,135:0.55:247
chr14	62546001	rs1892051	C	G	342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.781;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=221;ReadPosRankSum=0.000;SC=TGCATGCTCACAGGAAAGGAT;SOR=0.153;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=14;WE=62546009;WS=62545991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr14	62550877	rs2353778	G	A	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=209;ReadPosRankSum=0.683;SC=GTAGTGCAGCGTGGGCCAATG;SOR=0.807;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=49;TCF=35;TCR=14;TR=19;WE=62550885;WS=62550867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,31:0.48:65
chr14	63174616	rs7161127	T	C	7485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=117;NR=110;PP=2965;SC=AATCTGTTTTTCTTAGTGGGT;SOR=0.715;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=228;TCF=118;TCR=110;TR=227;WE=63174624;WS=63174606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,271:1.00:271
chr14	63174960	rs4902176	C	T	1994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.864;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=46;PP=1271;ReadPosRankSum=0.019;SC=GTGATGGAGGCTCCATTCTGT;SOR=0.869;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=184;TCF=90;TCR=94;TR=86;WE=63174968;WS=63174950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,94:0.47:202
chr14	63269317	rs12588427	T	C	4238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=80;PP=2315;SC=AGGTGAGAGATGAATAAGTGA;SOR=1.049;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=61;TCR=80;TR=141;WE=63269325;WS=63269307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr14	63511977	rs150993304	G	A	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.99;ReadPosRankSum=1.227;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr14	63779846	rs5809192	G	GA	1822.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.667;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.063;NF=3;NR=35;PP=1292;ReadPosRankSum=-1.081;SC=CCCATAGATAGAAACAGAGAA;SOR=0.625;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=90;TCF=3;TCR=87;TR=38;WE=63779854;WS=63779836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,69:0.48:145
chr14	63784407	rs11382440	A	AG	7899.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=50;NR=58;PP=2936;SC=GGTGATCCGAAGCCCCTGCAG;SOR=1.168;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=51;TCR=60;TR=108;WE=63784415;WS=63784397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr14	63858433	rs113580022	G	A	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.951;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=257;ReadPosRankSum=0.620;SC=GAGCCACTGCGCCCAGCCCTG;SOR=0.103;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=17;WE=63858441;WS=63858423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr14	64009489	rs1271563	T	G	892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.02;ReadPosRankSum=-0.212;SOR=0.879;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,44:0.54:81
chr14	64375985	rs2275018	G	T	1879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.632;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=46;PP=1150;ReadPosRankSum=0.983;SC=ACAGAAACTGGGGAAACCTTA;SOR=0.920;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=162;TCF=73;TCR=89;TR=79;WE=64375993;WS=64375975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,89:0.50:179
chr14	64408852	rs33976862	G	C	718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=381;ReadPosRankSum=-0.092;SC=CAATTATCCTGCACTTTCATG;SOR=0.724;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=46;TCF=18;TCR=28;TR=26;WE=64408860;WS=64408842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,32:0.58:55
chr14	64416594	.	G	A	3310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.662;ClippingRankSum=0.000;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.432;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=65;PP=1989;ReadPosRankSum=-0.253;SC=GCCTTCCCTGGATGATGTGAG;SOR=0.653;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=254;TCF=124;TCR=130;TR=131;WE=64416602;WS=64416578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,153:0.54:284
chr14	64421392	rs1255874	G	A	991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.049;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=9;PP=506;ReadPosRankSum=0.725;SC=GGGGTGTTACGTTCTTTTTAA;SOR=0.492;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=71;TCF=55;TCR=16;TR=36;WE=64421400;WS=64421382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,43:0.54:80
chr14	64423187	rs2792201	C	A	1963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.536;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=34;PP=1038;ReadPosRankSum=1.638;SC=CAACTCTCTTCAGCTGATGTG;SOR=0.769;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=155;TCF=89;TCR=66;TR=80;WE=64423195;WS=64423177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,98:0.52:188
chr14	64423316	rs34939365	G	A	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.373;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=363;ReadPosRankSum=1.693;SC=TATCATTTAAGTATACAAATT;SOR=0.450;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=43;TCF=10;TCR=33;TR=24;WE=64423324;WS=64423306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,24:0.53:45
chr14	64430770	rs34753731	G	A	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=101;ReadPosRankSum=0.939;SC=AGAGTTGAGCGTAAGTATGTT;SOR=1.071;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=7;WE=64430778;WS=64430760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
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chr14	64444876	rs1255896	G	A	576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=402;ReadPosRankSum=0.481;SC=GTATCTTCACGTTTTATGTAG;SOR=0.573;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=41;TCF=5;TCR=36;TR=22;WE=64444884;WS=64444866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,25:0.53:47
chr14	64449256	rs75944377	G	A	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.41;ReadPosRankSum=-0.410;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
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chr14	64457079	rs1255907	G	A	608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=6;PP=396;SC=TTAATGTTTAGCATATAATCA;SOR=1.426;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=20;WE=64457087;WS=64457069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr14	64457441	rs1273193	G	A	197.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=158;SC=AATTTAAAGCGTATCAGAAAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=64457449;WS=64457431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr14	64457638	rs1255908	T	G	676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=6;PP=392;ReadPosRankSum=1.143;SC=CGTGTTAATTTGAGAATTTTT;SOR=0.644;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=50;TCF=38;TCR=12;TR=27;WE=64457646;WS=64457628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,29:0.56:52
chr14	64460536	rs60596461	A	AT	84.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.944;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.41;ReadPosRankSum=0.366;SOR=3.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr14	64462007	rs1255912	A	C	1624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=31;PP=970;SC=TAGGATGAAAACTGTTCTGAA;SOR=1.382;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=20;TCR=31;TR=51;WE=64462015;WS=64461997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr14	64462071	rs1255913	G	T	596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=14;PP=379;SC=CTTCACACTCGCAGCAGAGCC;SOR=2.200;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=19;WE=64462079;WS=64462061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr14	64464236	rs8009321	C	A	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=23;ReadPosRankSum=-0.566;SC=TGGAGAATTTCCACTTACACA;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=3;WE=64464244;WS=64464226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr14	64468918	rs12147217	G	A	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=2;PP=21;SC=AGCCATGACAGTTTTTTTTTC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=64468926;WS=64468908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr14	64469828	rs17751301	C	T	3493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=78;PP=2315;ReadPosRankSum=-0.744;SC=AGATGCTGAACGGGGTGATGA;SOR=0.678;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=295;TCF=153;TCR=142;TR=159;WE=64469836;WS=64469818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,166:0.52:317
chr14	64470137	rs34215796	C	A	1270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.778;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=38;PP=841;ReadPosRankSum=0.279;SC=CTTCCTATGTCTTTCTGCTTC;SOR=0.927;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=93;TCF=30;TCR=63;TR=54;WE=64470145;WS=64470127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,57:0.57:100
chr14	64470159	rs4027385	ACT	A	685.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=577;ReadPosRankSum=1.091;SC=ATTCCATCCCACTCTATTCAG;SOR=0.737;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=15;WE=64470183;WS=64470149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,19:0.43:44
chr14	64476680	rs7146588	T	A	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=110;ReadPosRankSum=-0.080;SC=TTTTCTATTCTTAGTCTTGAA;SOR=0.693;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=8;WE=64476688;WS=64476670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr14	64491695	rs4902264	T	C	8333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=149;NR=126;PP=2965;SC=TGGAAAGGAATGGAAGAACCA;SOR=0.712;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=275;TCF=149;TCR=126;TR=275;WE=64491703;WS=64491685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,315:1.00:315
chr14	64494278	rs10151127	C	T	2096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=18;PP=1131;SC=GCTCATAGAACTAAAGAAGAA;SOR=1.493;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=44;TCR=18;TR=62;WE=64494286;WS=64494268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr14	64496749	rs4027402	C	T	3567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=59;NR=69;PP=2044;SC=GATCAAATAGCGGTTGAGGAA;SOR=1.146;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=59;TCR=70;TR=128;WE=64496757;WS=64496739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr14	64496872	rs3866737	G	C	286.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=207;SC=AGAAATTCCAGTGGTATTCAG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=64496880;WS=64496862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr14	64497710	rs74413846	T	C	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.250;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=158;ReadPosRankSum=0.747;SC=AATGGAGATATAACAATCTTT;SOR=1.520;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=35;TCF=25;TCR=10;TR=12;WE=64497718;WS=64497700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,13:0.34:38
chr14	64497930	rs4027404	G	A	5692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=110;NR=78;PP=2965;ReadPosRankSum=0.433;SC=TGTCTCAACAGCATTCTCAAA;SOR=1.081;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=190;TCF=111;TCR=79;TR=188;WE=64497938;WS=64497920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,204:0.99:206
chr14	64498037	rs4027405	G	A	6919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=117;NR=131;PP=2965;SC=GGAATCAGCTGCAGTGGAAAA;SOR=0.846;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=248;TCF=117;TCR=131;TR=248;WE=64498045;WS=64498027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr14	64501192	rs9783605	G	A	411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=284;SC=TTTTTCTTTAGTAAATGTCAT;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=64501200;WS=64501182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	64519035	rs1890908	A	G	2388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=53;PP=1416;ReadPosRankSum=-2.135;SC=CTATGAGGGCAGTGATTTAAA;SOR=0.725;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=200;TCF=85;TCR=115;TR=96;WE=64519043;WS=64519025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,110:0.49:223
chr14	64519455	rs3829767	A	G	1599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.916;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=33;PP=900;ReadPosRankSum=-1.359;SC=GGAACACAAGATAAAGTTTTG;SOR=0.793;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=131;TCF=68;TCR=63;TR=67;WE=64519463;WS=64519445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,76:0.52:147
chr14	64520416	rs10138253	G	A	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=59;ReadPosRankSum=-1.068;SC=TGGGTGCGGGGGCTCACGCCT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=4;WE=64520424;WS=64520406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr14	64522550	rs10676670	T	TAATAA	212.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=21.27;ReadPosRankSum=-1.122;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
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chr14	64522843	rs8010699	A	G	2086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.883;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=48;PP=1353;ReadPosRankSum=0.582;SC=ACAGTAGCACACATCCAGGAC;SOR=0.537;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=220;TCF=105;TCR=115;TR=95;WE=64522851;WS=64522833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,105:0.44:236
chr14	64523094	rs7153376	G	A	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.275;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=74;ReadPosRankSum=-0.334;SC=TTTTTTCTCTGTCATTAACAC;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=64523102;WS=64523084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr14	64532107	rs1255972	A	G	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-3.923;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=107;ReadPosRankSum=-1.344;SC=CAGGAAAACCATAATAGTATG;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=8;WE=64532115;WS=64532097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr14	64537295	rs1255965	T	G	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=1.909;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=45;ReadPosRankSum=1.207;SC=AAAAATTATGTCTACTTCAGG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=4;WE=64537303;WS=64537285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr14	64537657	rs1255964	G	A	626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.381;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=23;PP=474;ReadPosRankSum=1.269;SC=TATTAAGGACGTGTGCTTGAC;SOR=0.998;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=51;TCF=9;TCR=42;TR=27;WE=64537665;WS=64537647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,27:0.51:53
chr14	64542872	rs1255960	G	A	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.479;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=156;ReadPosRankSum=-0.168;SC=ATGACTATCAGGAGGAAAATA;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=8;WE=64542880;WS=64542862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr14	64551688	rs1255953	C	T	1864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.439;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=35;PP=1100;ReadPosRankSum=0.692;SC=CTTACAGACACGTGGGCTCCT;SOR=0.894;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=160;TCF=87;TCR=73;TR=85;WE=64551696;WS=64551670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,92:0.52:178
chr14	64560091	rs2792205	TG	CA	1481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.838;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=9;PP=1055;ReadPosRankSum=-1.336;SC=GACCAATGAATGGGATGAAGA;SOR=0.844;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=86;TCF=58;TCR=28;TR=33;WE=64560100;WS=64560081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,40:0.44:90
chr14	64564527	rs8007972	C	T	620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=0;PP=525;SC=GGAGCTATACCGTACCAGAGA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=64564535;WS=64564517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr14	64612845	rs11629287	C	T	1481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.296;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=25;PP=2211;ReadPosRankSum=0.369;SC=AAATACAGATCTTGAACAACT;SOR=0.817;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=137;TCF=84;TCR=53;TR=66;WE=64612866;WS=64612835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,74:0.49:150
chr14	64612858	rs10151658	C	A	1924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.164;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=36;PP=2211;ReadPosRankSum=-2.539;SC=GAACAACTGGCTGGAAGCACA;SOR=0.603;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=162;TCF=94;TCR=68;TR=83;WE=64612866;WS=64612835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,95:0.53:179
chr14	64637147	rs7161192	C	A	2989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.443;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=70;PP=1864;ReadPosRankSum=1.615;SC=GCTTCAGCCTCTACCAAACCA;SOR=0.691;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=255;TCF=130;TCR=125;TR=138;WE=64637155;WS=64637137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,144:0.53:270
chr14	64640665	rs7148122	C	G	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=7;PP=106;ReadPosRankSum=-1.114;SC=AAAACAGGACCTTCGCTACTC;SOR=0.646;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=41;TCF=17;TCR=24;TR=13;WE=64640673;WS=64640655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,15:0.35:43
chr14	64655161	rs1255986	C	T	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.162;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=362;ReadPosRankSum=0.000;SC=AGGTTGAGTGCGGAGAGCTAC;SOR=3.248;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=42;TCF=36;TCR=6;TR=20;WE=64655169;WS=64655151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,21:0.45:47
chr14	64656855	rs2256191	T	C	1964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.082;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=41;PP=1188;ReadPosRankSum=0.070;SC=GGGTGACCAGTTGATCAAGGC;SOR=0.644;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=185;TCF=96;TCR=89;TR=89;WE=64656863;WS=64656845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,97:0.48:203
chr14	64657684	rs1255988	C	A	2118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.496;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=45;PP=1257;ReadPosRankSum=0.404;SC=TACAGCGAACCGTCACTTGGC;SOR=0.747;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=190;TCF=97;TCR=93;TR=90;WE=64657692;WS=64657674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,102:0.47:218
chr14	64674981	rs1152595	T	C	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=114;ReadPosRankSum=-1.957;SC=GCTGTGGGCATCCACACTGCT;SOR=0.169;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=8;WE=64674989;WS=64674971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,8:0.29:28
chr14	64676098	rs1152592	A	G	1190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.255;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=24;PP=754;ReadPosRankSum=-0.658;SC=GTGCAAAAGCACAGGCTTGGA;SOR=0.512;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=124;TCF=76;TCR=48;TR=57;WE=64676106;WS=64676088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,61:0.46:133
chr14	64680848	rs1152591	A	G	1180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.030;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=14;PP=726;ReadPosRankSum=1.035;SC=CAGACTTCTCATGCTCTTCTA;SOR=0.415;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=97;TCF=73;TCR=24;TR=51;WE=64680856;WS=64680838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,56:0.55:102
chr14	64681193	rs1152590	C	T	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.379;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=253;ReadPosRankSum=-0.854;SC=TGTCAGGTAACAGCTGGGTTC;SOR=1.106;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=42;TCF=11;TCR=31;TR=18;WE=64681201;WS=64681183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,19:0.44:43
chr14	64686125	rs35648226	G	T	1442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.679;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=36;PP=928;ReadPosRankSum=-0.479;SC=TGAAGAGACTGCAGGTGAGTT;SOR=0.588;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=118;TCF=44;TCR=74;TR=59;WE=64686133;WS=64686115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,67:0.52:128
chr14	64686207	rs915057	A	G	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.188;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=200;ReadPosRankSum=0.486;SC=AGCAGATCCCATGTATTCGTG;SOR=0.078;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=12;WE=64686215;WS=64686197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr14	64688175	rs1152588	G	C	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.082;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=306;ReadPosRankSum=0.305;SC=CTCGTATTCAGTGGGTAAGGC;SOR=0.874;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=49;TCF=34;TCR=15;TR=21;WE=64688183;WS=64688165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,22:0.40:55
chr14	64691206	rs150644129	G	A	763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=18;PP=427;ReadPosRankSum=0.354;SC=GCCCAGCTTCGACGAGGTAGA;SOR=0.648;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=47;TCR=44;TR=37;WE=64691214;WS=64691196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,41:0.39:104
chr14	64691644	rs35455974	AT	A	281.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=2.287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.84;ReadPosRankSum=0.108;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
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chr14	64699816	rs4986938	C	T	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=2.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=142;ReadPosRankSum=0.040;SC=ACGCTTCAGCCTGTGACCTCT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=8;WE=64699824;WS=64699806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr14	64746933	rs34967796	G	GA	333.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.342;HP=9;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=179;ReadPosRankSum=1.190;SC=GGCTTTCTAGGAAAAAAAAAT;SOR=1.078;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=13;WE=64746941;WS=64746923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr14	64814311	rs1256112	C	T	2711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=42;PP=1511;SC=ACTGAGCTGTCTCTGAAGTTT;SOR=0.775;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=45;TCR=42;TR=87;WE=64814319;WS=64814301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr14	64855041	rs1076991	T	C	4220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=80;NR=67;PP=2105;SC=TGTGATCCCCTGGCCAGTCCC;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=147;TCF=80;TCR=67;TR=147;WE=64855049;WS=64855031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr14	64882380	rs1950902	A	G	6458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=112;NR=95;PP=2965;SC=AATGCTGGGAAACTTGCTAGA;SOR=0.794;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=208;TCF=113;TCR=95;TR=207;WE=64882388;WS=64882370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr14	64892639	rs78891270	C	A	737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.747;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=18;PP=424;ReadPosRankSum=0.692;SC=TCTGAAGGTGCCTTCAGTGGT;SOR=0.223;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=54;TCF=18;TCR=36;TR=31;WE=64892647;WS=64892629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,34:0.56:61
chr14	64908845	rs2236225	G	A	3322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.428;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=63;PP=2137;ReadPosRankSum=1.302;SC=ATTGCAGACCGGATCGCACTC;SOR=0.643;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=263;TCF=143;TCR=120;TR=137;WE=64908853;WS=64908835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,150:0.52:289
chr14	64911627	rs1256143	T	C	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.191;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=120;ReadPosRankSum=0.313;SC=AGGGAAGATGTACCTCACAAA;SOR=0.078;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=8;WE=64911635;WS=64911617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr14	64920665	rs1256146	G	A	1814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.723;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=54;PP=1169;ReadPosRankSum=-1.459;SC=GCCCTGCCAAGTACCCGTTGC;SOR=0.803;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=127;TCF=39;TCR=88;TR=77;WE=64920673;WS=64920655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,80:0.61:132
chr14	64926433	rs75480958	GTGCT	G	412.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=380;SC=AAACATTTCAGTGCTTGCTTA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=8;WE=64926444;WS=64926423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr14	64935720	rs1256149	C	T	8061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=133;NR=140;PP=2965;SC=AGCAATAGCACAACTTCTGGA;SOR=0.820;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=273;TCF=133;TCR=140;TR=273;WE=64935728;WS=64935710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,298:1.00:298
chr14	64947181	rs8003790	C	T	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=16;PP=452;ReadPosRankSum=-0.131;SC=AGATTATGGTCGGTAAGAATT;SOR=0.654;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=69;TCF=38;TCR=31;TR=34;WE=64947189;WS=64947171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,37:0.47:79
chr14	64988114	rs10624421	C	CAA	379.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=235;ReadPosRankSum=-0.509;SC=ATTGTAATAGCAGTCATGCAA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=6;WE=64988122;WS=64988104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr14	65008251	rs1063391	C	T	3495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=358;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.796;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=75;PP=2010;ReadPosRankSum=-0.654;SC=CGGCCGGCGACACCCACCTGG;SOR=0.631;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=324;TCF=166;TCR=158;TR=154;WE=65008259;WS=65008241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:186,172:0.48:358
chr14	65009220	rs11551976	C	T	5280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-2.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=546;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.090;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=126;NR=113;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.892;SC=ATACCTACAACATCAAGCAGA;SOR=0.723;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=497;TCF=252;TCR=245;TR=239;WE=65009228;WS=65009210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:283,262:0.48:545
chr14	65009534	rs35270454	C	CT	256.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=2.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.84;ReadPosRankSum=-0.368;SOR=0.395;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,16:0.30:53
chr14	65016702	rs7156953	T	G	1707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.879;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=27;PP=1075;ReadPosRankSum=-1.205;SC=CCGTATGGCTTCCAGGGCGAG;SOR=0.851;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=164;TCF=100;TCR=64;TR=73;WE=65016710;WS=65016692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,80:0.45:179
chr14	65028728	rs2038271	C	G	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-4.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=263;ReadPosRankSum=-0.678;SC=ATATGAATTTCTTTCCTGTTT;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=13;WE=65028736;WS=65028718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr14	65031534	rs6573560	C	T	2954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.757;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=64;PP=1863;ReadPosRankSum=-2.629;SC=TTTGCAGAAACTGATGGTCCA;SOR=0.807;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=336;TCF=184;TCR=152;TR=143;WE=65031542;WS=65031524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:206,150:0.42:356
chr14	65031572	rs4902293	A	G	2624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=70;PP=1780;ReadPosRankSum=0.585;SC=TAACTTCCCAATCATGCCAGA;SOR=0.706;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=316;TCF=153;TCR=163;TR=132;WE=65031580;WS=65031562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:195,136:0.41:331
chr14	65032226	rs8007313	C	T	5008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=82;PP=2965;SC=CATACATACACATATCCATAC;SOR=0.796;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=165;TCF=83;TCR=82;TR=164;WE=65032234;WS=65032216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr14	65053999	rs45482504	T	C	3004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=57;PP=1724;ReadPosRankSum=-1.904;SC=AGGGAGACTCTTTCGTACCAA;SOR=0.677;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=277;TCF=149;TCR=128;TR=129;WE=65054007;WS=65053989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,148:0.47:312
chr14	65068221	rs11158545	C	A	1835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.474;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.787;NF=46;NR=40;PP=961;ReadPosRankSum=-1.104;SC=TTCGAATCCACCATTTCTGCG;SOR=0.654;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=222;TCF=113;TCR=109;TR=86;WE=65068229;WS=65068211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,96:0.39:245
chr14	65068330	rs372346293	CTG	C	2223.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FS=0.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.59;MQRankSum=-4.436;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.688;SOR=0.635;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:145,65:0.31:210
chr14	65068333	.	T	C	2229.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.999;ClippingRankSum=0.000;DP=211;ExcessHet=3.0103;FS=0.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.58;MQRankSum=-4.436;QD=10.62;ReadPosRankSum=-0.800;SOR=0.635;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:145,65:0.31:210
chr14	65068336	rs369006858	G	A	2246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.74;MQRankSum=-4.134;QD=10.75;ReadPosRankSum=-0.654;SOR=0.685;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:146,63:0.30:209
chr14	65068341	rs377267839	TTCTC	T	2152.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.96;MQRankSum=-3.342;QD=10.11;ReadPosRankSum=-0.480;SOR=0.711;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:151,62:0.29:213
chr14	65068346	.	G	A	2122.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.848;ClippingRankSum=0.000;DP=212;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQRankSum=-3.435;QD=10.06;ReadPosRankSum=-0.337;SOR=0.709;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:149,62:0.29:211
chr14	65195794	rs229644	T	C	2235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.152;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=50;PP=1393;ReadPosRankSum=-0.393;SC=ACATAGAAAATATCTACGCGC;SOR=0.843;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=182;TCF=92;TCR=90;TR=95;WE=65195802;WS=65195784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,105:0.52:203
chr14	65197126	rs229626	T	C	989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.022;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=21;PP=598;ReadPosRankSum=1.997;SC=TCCTGGGGATTCCTTTCCAGG;SOR=0.389;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=70;TCF=30;TCR=40;TR=39;WE=65197134;WS=65197116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,46:0.56:82
chr14	65197143	rs229625	C	G	930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=21;PP=562;ReadPosRankSum=1.235;SC=CAGGGAAAGTCCTGGGTGCTC;SOR=0.704;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=64;TCF=28;TCR=36;TR=37;WE=65197151;WS=65197133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,42:0.57:74
chr14	65197767	rs229624	G	A	3275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=360;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.244;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=80;PP=1833;ReadPosRankSum=-0.781;SC=AAATTGCCAAGCATTTTGATG;SOR=0.773;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=317;TCF=155;TCR=162;TR=153;WE=65197775;WS=65197757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:188,170:0.47:358
chr14	65199481	rs73273534	T	C	2060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.553;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=33;PP=1098;ReadPosRankSum=-0.362;SC=CCAAGGCCAATTGGGAATCAA;SOR=0.641;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=157;TCF=90;TCR=67;TR=81;WE=65199489;WS=65199471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,97:0.55:177
chr14	65204695	.	T	TGGA	411.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.960;ClippingRankSum=0.000;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.527;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.559;NF=4;NR=6;PP=300;ReadPosRankSum=-1.442;SC=GAGGAGGTGGTGGAGGAGGAG;SOR=0.385;SbPval=0.1;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=10;WE=65204703;WS=65204685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr14	65208026	rs229650	T	C	2281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.931;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=52;PP=1130;ReadPosRankSum=1.976;SC=TGCCACCCTCTGTGCTGGACC;SOR=0.731;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=243;TCF=125;TCR=118;TR=107;WE=65208034;WS=65208016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,119:0.44:268
chr14	65209680	rs41301473	A	G	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=3;PP=327;ReadPosRankSum=-0.429;SC=TGCTTCAGGCAGCTTGCTCTC;SOR=0.793;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=62;TCF=53;TCR=9;TR=25;WE=65209688;WS=65209670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,25:0.40:63
chr14	65230317	rs94789	C	T	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.337;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=352;ReadPosRankSum=0.765;SC=TTTATAAGAGCGCGGAGACTC;SOR=1.480;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=44;TCF=35;TCR=9;TR=21;WE=65230325;WS=65230307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,22:0.48:46
chr14	65230358	rs94788	C	T	1029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.743;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=13;PP=637;ReadPosRankSum=0.010;SC=TCTCAAATCACGCAGGAAGTT;SOR=1.049;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=101;TCF=69;TCR=32;TR=47;WE=65230366;WS=65230348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,49:0.47:105
chr14	65233900	rs60545775	G	A	1756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.120;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=25;PP=1044;ReadPosRankSum=0.231;SC=CCTTCCTGACGAGGGTGCCCA;SOR=0.813;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=191;TCF=123;TCR=68;TR=80;WE=65233908;WS=65233890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,88:0.42:208
chr14	65239877	rs92070	C	T	540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.054;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=327;ReadPosRankSum=-1.308;SC=TCTTGAGTGACGGCTGGCTGC;SOR=0.923;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=51;TCF=34;TCR=17;TR=23;WE=65239885;WS=65239867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,26:0.46:56
chr14	65239894	rs747860	C	T	770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.876;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=12;PP=423;ReadPosRankSum=-0.216;SC=CTGCGTCTACCGCATTAGAGA;SOR=0.570;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=70;TCF=46;TCR=24;TR=31;WE=65239902;WS=65239884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,36:0.46:78
chr14	65241228	rs229592	A	G	2654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=45;PP=1447;ReadPosRankSum=2.152;SC=TCAGCATCACAATGGCGCCCT;SOR=0.696;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=242;TCF=146;TCR=96;TR=120;WE=65241236;WS=65241218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,135:0.50:272
chr14	65242044	rs184528	C	T	1801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.501;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=36;PP=991;ReadPosRankSum=1.528;SC=CGATCTCCGCCGCCTCCACCA;SOR=0.460;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=152;TCF=77;TCR=75;TR=76;WE=65242052;WS=65242034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,86:0.49:174
chr14	65245863	rs1741489	C	G	708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=11;PP=502;ReadPosRankSum=0.316;SC=GGTGAGGTGACGCAGGACTCA;SOR=0.784;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=83;TCF=57;TCR=26;TR=36;WE=65245871;WS=65245853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,37:0.40:93
chr14	65245956	rs1741488	C	T	2336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FS=0.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.70;ReadPosRankSum=1.776;SOR=0.754;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,66:0.36:184
chr14	65245962	rs1741487	A	G	2240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FS=0.571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.38;ReadPosRankSum=2.323;SOR=0.740;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,64:0.35:181
chr14	65246006	rs1741486	G	A	813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.569;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=26;PP=609;ReadPosRankSum=-0.272;SC=TGACAATCACGGCCAACCTTT;SOR=0.931;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=106;TCF=44;TCR=62;TR=41;WE=65246014;WS=65245996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,42:0.34:122
chr14	65246040	rs2357726	G	A	432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.005;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=315;ReadPosRankSum=-1.398;SC=CATGGGCGGCGCAGAGCTTTG;SOR=0.883;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=67;TCF=22;TCR=45;TR=24;WE=65246048;WS=65246030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,24:0.32:74
chr14	65246350	rs1741485	A	G	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.450;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=131;ReadPosRankSum=-1.713;SC=CCAGTCATCTACTGCCAAAAA;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=8;WE=65246358;WS=65246345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr14	65246623	rs1626923	T	C	2559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.386;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=54;PP=1571;ReadPosRankSum=1.202;SC=GCTCCTCTTTTCGCACATTCA;SOR=0.598;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=265;TCF=136;TCR=129;TR=115;WE=65246631;WS=65246613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,129:0.43:301
chr14	65250939	rs229634	A	G	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-2.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.880;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=297;ReadPosRankSum=1.273;SC=CAGAGCACCCACCCGCCGCCC;SOR=0.201;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=22;WE=65250947;WS=65250929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,25:0.54:46
chr14	65253232	rs77806	T	C	1102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.701;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=25;PP=730;ReadPosRankSum=0.831;SC=CCCAGGGCATTCCAGCCAGTA;SOR=0.741;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=105;TCF=52;TCR=53;TR=48;WE=65253240;WS=65253222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,52:0.46:113
chr14	65260227	rs229591	T	G	3151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.413;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=69;PP=2089;ReadPosRankSum=-0.470;SC=ACACCTCCTTTATGCGGGCCT;SOR=0.721;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=279;TCF=131;TCR=148;TR=131;WE=65260235;WS=65260217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,143:0.47:307
chr14	65263300	rs229587	C	T	1010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.438;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=16;PP=557;ReadPosRankSum=-1.112;SC=CTGGTTTTCACTGAGCCAGGT;SOR=0.844;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=110;TCF=68;TCR=42;TR=45;WE=65263308;WS=65263290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,53:0.42:127
chr14	65267469	rs230703	T	C	626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.010;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=9;PP=426;ReadPosRankSum=0.389;SC=CAAAACAGCTTGTACCTTGCC;SOR=0.879;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=58;TCF=41;TCR=17;TR=28;WE=65267477;WS=65267459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,29:0.46:63
chr14	65268167	rs230704	C	T	2393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.025;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=52;PP=1468;ReadPosRankSum=-1.875;SC=AGCATCCCCACCAGGAGGGCA;SOR=0.783;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=200;TCF=98;TCR=102;TR=100;WE=65268175;WS=65268157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,113:0.50:225
chr14	65268605	rs2273475	A	G	2489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=50;PP=1494;ReadPosRankSum=-0.209;SC=TGTAGTCCCAAACAAGTGTAC;SOR=0.667;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=222;TCF=115;TCR=107;TR=105;WE=65268613;WS=65268595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,120:0.47:254
chr14	65269174	rs45607231	G	A	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.704;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.830;NF=5;NR=16;PP=332;ReadPosRankSum=0.736;SC=TATAAATGGCGCTTGGGTTGG;SOR=0.307;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=21;WE=65269182;WS=65269164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr14	65270272	rs17767579	C	A	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.086;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=100;ReadPosRankSum=-1.480;SC=GATTCTAAGGCCCTGGGCAGC;SOR=0.330;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=10;WE=65270280;WS=65270262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr14	65271634	rs1353857	G	A	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=4.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.455;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=362;ReadPosRankSum=1.311;SC=CAGCAGCCCCGGGGCCCACAG;SOR=1.151;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=49;TCF=41;TCR=8;TR=21;WE=65271642;WS=65271624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,23:0.43:53
chr14	65271650	rs229581	A	G	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=4.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.082;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=4;PP=569;ReadPosRankSum=0.545;SC=CACAGAAGGGACTTTACCAGC;SOR=0.964;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=74;TCF=61;TCR=13;TR=31;WE=65271658;WS=65271640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,35:0.43:81
chr14	65289966	rs1695751	A	G	617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=11;PP=365;SC=ATCCTGACAGAAGCAGAACGC;SOR=2.049;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=15;WE=65289986;WS=65289956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr14	65289978	rs179338	A	G	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=7;PP=216;SC=GCAGAACGCCATGTCATCTGC;SOR=1.802;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=10;WE=65289986;WS=65289956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	65392918	rs2147615	G	A	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.700;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=40;ReadPosRankSum=-0.398;SC=ATATATTAAAGGAGACTATGC;SOR=0.693;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=5;WE=65392926;WS=65392908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr14	65398783	rs9323457	C	G	995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.785;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=13;PP=722;ReadPosRankSum=-1.407;SC=TAGAGAACATCTTAACTAGAG;SOR=0.573;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=101;TCF=73;TCR=28;TR=44;WE=65398791;WS=65398773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,46:0.40:114
chr14	65407000	rs2071566	C	T	3827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=76;PP=2169;ReadPosRankSum=-0.825;SC=CCTACCGACCCACCTACCCAT;SOR=0.365;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=134;TCF=57;TCR=77;TR=133;WE=65407008;WS=65406990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,147:0.99:148
chr14	65410200	rs3831077	CT	C	315.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=328;ReadPosRankSum=2.106;SC=ACTGTACCATCTCCTATATTA;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=9;WE=65410208;WS=65410190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr14	65414976	rs11540871	C	T	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=104;ReadPosRankSum=-0.794;SC=GGTCATCACACGAGAGGACAG;SOR=0.247;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=9;WE=65414984;WS=65414974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr14	65418265	rs7157667	A	T	2510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=47;PP=1602;ReadPosRankSum=3.124;SC=AAATACCCAGAGCTGGGAGTG;SOR=0.708;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=216;TCF=122;TCR=94;TR=109;WE=65418273;WS=65418255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,120:0.50:239
chr14	65419293	rs45454295	A	G	3088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.402;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=62;PP=1957;ReadPosRankSum=2.265;SC=TCAACACCTGAAGAAAGGAAG;SOR=0.732;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=295;TCF=160;TCR=135;TR=135;WE=65419301;WS=65419283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,150:0.46:326
chr14	65419473	rs59000318	C	A	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-4.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=215;ReadPosRankSum=1.604;SC=TTGAAAGGGGCTTTCCTCCCT;SOR=1.501;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=12;WE=65419481;WS=65419463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr14	65453493	rs3215788	TG	T	278.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=0;PP=227;SC=CTCTGCCCAATGGGGGGCGGC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=8;WE=65453501;WS=65453492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr14	65470831	rs12587546	A	G	2441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=29;PP=1661;SC=TGCAGAACCCATCTTACAGTA;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=61;TCR=29;TR=90;WE=65470839;WS=65470821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr14	65511421	rs72728267	G	T	2351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=55;PP=1239;ReadPosRankSum=-1.474;SC=GGGGAGCGGGGAGGAAGTGGG;SOR=0.710;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=209;TCF=98;TCR=111;TR=102;WE=65511429;WS=65511411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,118:0.48:244
chr14	65544367	rs762810	C	A	1504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=34;PP=958;SC=AGCACCTGAGCCCCAAGAAGG;SOR=1.877;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=17;TCR=34;TR=51;WE=65544375;WS=65544357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr14	65550816	rs7159443	T	A	1571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=9;PP=816;SC=ATTACCAGGGTAAGGCAGAGC;SOR=1.569;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=37;TCR=9;TR=46;WE=65550824;WS=65550806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr14	65568215	rs2781373	G	A	4403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.06;QD=26.06;SOR=0.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr14	65733748	.	CTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCT	C,CTTCTTTCTTTCT	749.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.89;QD=37.49;SOR=6.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,6,14:0.30,0.70:20
chr14	65801811	rs12881755	A	G	4972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=90;PP=2922;SC=AATGTAGGTAAGAAAGGTGCT;SOR=0.915;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=172;TCF=82;TCR=90;TR=172;WE=65801819;WS=65801801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr14	65878807	rs1953416	C	T	2884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.466;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=60;PP=1957;ReadPosRankSum=1.111;SC=CTGTCGCAGCCGCGGGTCGGG;SOR=0.730;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=222;TCF=120;TCR=102;TR=131;WE=65878815;WS=65878797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,132:0.54:243
chr14	65878847	rs34007703	T	TG	2478.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.362;HP=9;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=37;PP=818;ReadPosRankSum=0.129;SC=CAGGCCCTCGTGGGGGGGGTC;SOR=0.771;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=146;TCF=32;TCR=114;TR=53;WE=65878855;WS=65878837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,114:0.47:245
chr14	66028446	rs2229677	A	G	2593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.969;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=54;PP=1568;ReadPosRankSum=1.309;SC=GCTTAAAACAACAGAATGAAG;SOR=0.606;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=217;TCF=105;TCR=112;TR=103;WE=66028454;WS=66028436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,123:0.49:250
chr14	66028505	rs3825639	T	C	1502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=40;PP=726;ReadPosRankSum=-0.470;SC=AAATACTGAATGAAGAATGAT;SOR=0.696;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=145;TCF=60;TCR=85;TR=66;WE=66028513;WS=66028495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,79:0.46:173
chr14	66082573	rs8012278	A	G	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=4.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=280;ReadPosRankSum=-0.253;SC=ATTTGGTACTACTTTTGTGCT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=14;WE=66082581;WS=66082563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr14	66209190	rs1054218	C	G	596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=397;ReadPosRankSum=0.379;SC=CAAACCATTTCAGCCAAACTG;SOR=0.866;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=55;TCF=15;TCR=40;TR=24;WE=66209198;WS=66209180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,26:0.46:56
chr14	66455502	rs17827111	A	G	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.242;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5008;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=29;ReadPosRankSum=-0.366;SC=TAGAAAAATAATAAAGGCGCT;SOR=1.609;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=4;WE=66455510;WS=66455492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr14	67759282	rs61744208	C	A	1316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=17;PP=746;ReadPosRankSum=-0.714;SC=TTGGTAGATTCTCAGAGCCAG;SOR=0.720;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=126;TCF=85;TCR=41;TR=56;WE=67759290;WS=67759272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,64:0.45:141
chr14	67790332	.	A	AAT	101.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.776;ClippingRankSum=-0.000;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=112;ReadPosRankSum=-1.738;SC=CCCTTAATCTAATATATATAT;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=5;WE=67790341;WS=67790322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr14	67799700	rs113964073	G	C	1110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=32;PP=619;ReadPosRankSum=0.288;SC=GTGGCATGTTGGACTTGATCT;SOR=0.740;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=126;TCF=55;TCR=71;TR=54;WE=67799708;WS=67799690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,59:0.40:146
chr14	67807242	rs33973037	TA	T	1603.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=3.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.653;HP=13;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=58;PP=608;ReadPosRankSum=0.329;SC=ATGACTAGAATAAAAAAAAAA;SOR=0.766;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=130;TCF=6;TCR=124;TR=59;WE=67807251;WS=67807231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,85:0.55:154
chr14	67819567	rs10718799	CA	C	713.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.67;MQRankSum=0.387;QD=22.30;ReadPosRankSum=0.108;SOR=2.649;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,31:0.97:32
chr14	67878717	rs12888674	A	G	4031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=398;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.171;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=83;PP=2483;ReadPosRankSum=0.040;SC=AATGTCCCGAAGCTCGACGCG;SOR=0.727;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=363;TCF=189;TCR=174;TR=177;WE=67878725;WS=67878701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:202,195:0.49:397
chr14	67912792	rs3742855	A	G	1629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.332;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=41;PP=1006;ReadPosRankSum=-0.047;SC=GAATATACAAACTCTCCCAGC;SOR=0.867;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=128;TCF=53;TCR=75;TR=67;WE=67912800;WS=67912782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,76:0.52:145
chr14	68022410	rs3742868	C	T	1671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.15;SOR=2.461;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr14	68022410	.	CGAGC	TGAGC,TGAGT	452	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=34,15;NR=11,5;PP=452,294;QD=10.8171380566;SC=CTGACACTCTCGAGCCACTTG;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=46;TCF=34;TCR=12;TR=45,20;WE=68022422;WS=68022400;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.98:46
chr14	68022414	rs3742869	C	T	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.51;ReadPosRankSum=-0.383;SOR=0.866;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,22:0.42:52
chr14	68024134	rs3825723	A	T	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.358;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=304;ReadPosRankSum=0.810;SC=CTGGAGAAGCAGGTAAGGGCT;SOR=0.368;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=41;TCF=12;TCR=29;TR=23;WE=68024142;WS=68024124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,25:0.58:43
chr14	68029313	rs2236235	G	A	1270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.332;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=35;PP=931;ReadPosRankSum=-0.736;SC=GGCACCCCGCGGGACAGCATC;SOR=1.050;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=133;TCF=65;TCR=68;TR=59;WE=68029321;WS=68029303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,61:0.41:147
chr14	68035879	rs3825725	A	G	1416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.641;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=24;PP=858;ReadPosRankSum=-0.993;SC=TGCTGTGGCCACATCGGGCAT;SOR=0.793;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=128;TCF=80;TCR=48;TR=66;WE=68035887;WS=68035869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,71:0.51:138
chr14	68038697	rs2236234	C	G	1138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=22;PP=987;SC=TGAACATGGGCGTCCCCACTT;SOR=1.121;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=15;TCR=22;TR=37;WE=68038705;WS=68038687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr14	68038729	rs2236233	A	G	1181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=14;PP=930;SC=GTGACCCCCCAGCAGCTCCAC;SOR=1.662;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=29;TCR=14;TR=43;WE=68038737;WS=68038719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr14	68038779	rs2236232	T	G	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.874;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=11;PP=671;ReadPosRankSum=0.790;SC=GGTGGTCAAGTCTCAGCAGCT;SOR=0.873;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=53;TCR=22;TR=38;WE=68038787;WS=68038769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,39:0.46:85
chr14	68039008	rs138418666	C	T	1406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=44;PP=939;ReadPosRankSum=0.826;SC=AGCCGGGAAACGGGCGGGGGC;SOR=0.646;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=131;TCF=47;TCR=84;TR=70;WE=68039016;WS=68038998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,70:0.52:134
chr14	68039027	rs2236231	A	G	3172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=60;PP=1674;SC=GCAGGGTGGAAGCAGAATGCA;SOR=2.055;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=21;TCR=60;TR=81;WE=68039035;WS=68039017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr14	68040389	rs11625701	T	C	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=338;ReadPosRankSum=0.527;SC=TCACCCATCATAACACAGCCA;SOR=0.631;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=46;TCF=34;TCR=12;TR=23;WE=68040397;WS=68040379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,26:0.52:50
chr14	68041124	rs1555400	G	C	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=413;ReadPosRankSum=0.026;SC=GACCAAGGTAGAGGGTGGGGC;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=42;TCF=8;TCR=34;TR=21;WE=68041132;WS=68041114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,22:0.50:44
chr14	68042255	rs4902490	A	G	3410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=61;PP=1857;SC=CTGCCACTCTATGTCCTGATG;SOR=1.075;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=112;TCF=51;TCR=61;TR=112;WE=68042263;WS=68042245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr14	68042496	rs4902491	A	G	617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=2;PP=502;SC=AGACTCCCTCATCCCCCACTG;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=23;WE=68042504;WS=68042486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr14	68042574	rs11158685	A	G	1368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=19;PP=722;ReadPosRankSum=0.144;SC=CGGGATGCGCACATAGAGGAA;SOR=0.642;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=110;TCF=75;TCR=35;TR=57;WE=68042582;WS=68042564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,66:0.51:129
chr14	68044005	rs4902492	C	T	3504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=64;NR=55;PP=2062;SC=TCTCTGGTTCCGTGCTTTGGG;SOR=0.772;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=119;TCF=64;TCR=55;TR=119;WE=68044013;WS=68043995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr14	68045753	rs7152499	T	C	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.667;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.670;NF=20;NR=6;PP=389;ReadPosRankSum=0.231;SC=CTGCCCCAGCTACAGTTTTGG;SOR=0.346;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=62;TCF=49;TCR=13;TR=26;WE=68045761;WS=68045743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,31:0.44:70
chr14	68045840	rs10635755	C	CTTCT	10314.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=77;PP=2918;SC=TCCCCTCTTCCGTCTTTTTAG;SOR=0.728;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=25;TCR=80;TR=101;WE=68045848;WS=68045830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr14	68045935	rs6573781	G	A	3483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=69;PP=2028;SC=CCAGGCCATCGCGCATGGAAG;SOR=1.170;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=48;TCR=69;TR=117;WE=68045943;WS=68045925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr14	68046602	rs6573782	C	T	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.552;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=336;ReadPosRankSum=-0.036;SC=AGGTGACAGCCTCCCACTAAG;SOR=1.321;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=40;TCF=8;TCR=32;TR=19;WE=68046610;WS=68046592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
chr14	68053149	rs749271	A	G	1058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.99;MQRankSum=0.844;NF=19;NR=28;PP=612;ReadPosRankSum=1.102;SC=AGCAGTCCTCAAGGCAGGGCA;SOR=0.711;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=117;TCF=48;TCR=69;TR=47;WE=68053157;WS=68053139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,55:0.41:135
chr14	68053802	rs734028	T	C	5590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=90;PP=2965;SC=TTGCAGAAGCTACCTTCATCA;SOR=0.744;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=183;TCF=93;TCR=90;TR=182;WE=68053810;WS=68053792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr14	68053977	rs6573783	A	C	6557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=110;NR=107;PP=2965;SC=CGATTCCCCAACACCACTAGT;SOR=0.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=218;TCF=111;TCR=107;TR=217;WE=68053985;WS=68053967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr14	68066949	rs11547225	G	A	3829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=79;PP=1903;ReadPosRankSum=2.147;SC=CCCGCACCGCGCGGCGCTGCA;SOR=0.695;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=251;TCF=114;TCR=137;TR=147;WE=68066957;WS=68066939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,176:0.60:291
chr14	68066971	rs12587848	G	C	1218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FS=2.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.349;SOR=0.916;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,69:0.37:186
chr14	68066979	rs7154825	C	T	5471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=91;PP=1624;SC=CCGGCCCTGGCCGTCTCGCCC;SOR=1.595;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=54;TCR=91;TR=145;WE=68066987;WS=68066961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr14	68113293	rs742869	G	A	4566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=56;PP=2651;SC=ACCCACGGACGCACATGATAA;SOR=1.080;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=96;TCR=56;TR=152;WE=68113301;WS=68113283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr14	68115001	rs3742879	A	G	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=95;ReadPosRankSum=-0.342;SC=ATCATTGCAGAGTTTGTTTTT;SOR=0.495;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=7;WE=68115009;WS=68114991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr14	68191368	rs61991867	G	A	1180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=26;PP=715;SC=TCCCACTGGGGCCTCTGTCCA;SOR=1.788;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=11;TCR=26;TR=37;WE=68191376;WS=68191358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr14	68192653	rs7156725	G	C	1158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=2;PP=814;SC=CTATCAAAATGTTACCCCAAC;SOR=4.863;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=31;WE=68192661;WS=68192643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr14	68196636	rs718212	C	T	1128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=31;PP=862;SC=GGTGAAATCTCTTTCCCATTC;SOR=4.921;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=33;WE=68196644;WS=68196626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr14	68200383	rs61991869	C	A	1032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.914;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=13;PP=714;ReadPosRankSum=1.496;SC=CATTTAGAAACATTCTGAGAA;SOR=1.488;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=94;TCF=64;TCR=30;TR=47;WE=68200391;WS=68200373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,49:0.45:109
chr14	68234539	rs3742883	T	C	7523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=105;NR=158;PP=2965;SC=AGGGCTTTCATTCTTGGAGCT;SOR=1.191;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=263;TCF=105;TCR=158;TR=263;WE=68234547;WS=68234529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,272:1.00:272
chr14	68236522	rs2295111	G	A	1423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=28;PP=742;SC=TTTATACATGGTATTAACTAC;SOR=1.445;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=17;TCR=28;TR=45;WE=68236530;WS=68236512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr14	68241648	rs141953477	CAAA	C	542.82	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=2.884;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.63;MQRankSum=0.548;QD=31.93;ReadPosRankSum=0.654;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,15:0.88:17
chr14	68242898	rs12886915	G	A	542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=14;PP=409;SC=TTCTCACTGGGAAGGGGAAGG;SOR=1.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=19;WE=68242906;WS=68242888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr14	68244202	rs767972	C	T	296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=2;PP=218;SC=CTCAGGTATGCCTTCCCAACA;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=68244210;WS=68244199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	68246855	rs2295106	T	A	2777.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=33;PP=1644;SC=GTTATTTTTTTAAAAAGTGAA;SOR=1.356;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=64;TCR=33;TR=97;WE=68246863;WS=68246845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr14	68246876	rs2295107	C	T	4017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=54;PP=2191;SC=CATTGATATGCAGAAAGGGGC;SOR=1.150;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=87;TCR=54;TR=141;WE=68246884;WS=68246866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr14	68248281	rs2235962	C	T	1235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.416;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=27;PP=760;ReadPosRankSum=-0.561;SC=AGGCAGCAAGCGTGGGACCAG;SOR=1.274;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=17;TCR=27;TR=44;WE=68248289;WS=68248271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,46:0.98:47
chr14	68252852	rs112787369	A	T	3098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.910;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=61;PP=1871;ReadPosRankSum=0.090;SC=TGACTGGCTGACATAAGCAGA;SOR=0.739;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=279;TCF=152;TCR=127;TR=138;WE=68252860;WS=68252842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,150:0.50:299
chr14	68257352	rs17192170	T	A	824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=10;PP=505;ReadPosRankSum=0.738;SC=CTCCGAATGGTGCTGCTACCC;SOR=0.746;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=71;TCF=52;TCR=19;TR=35;WE=68257360;WS=68257342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,38:0.46:83
chr14	68264867	rs12891164	A	G	5335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=96;NR=80;PP=2965;SC=GCTTCTCAGGAGGGCTGCGGC;SOR=0.812;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=176;TCF=96;TCR=80;TR=176;WE=68264875;WS=68264857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr14	68265484	rs7160083	G	A	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=31;ReadPosRankSum=0.842;SC=TGAGGTTACAGTGAGAAGAAT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=68265492;WS=68265474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr14	68273430	rs181576	A	G	1733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=33;PP=998;SC=GAAACCAAGAACTCTTCTTTT;SOR=1.498;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=19;TCR=33;TR=52;WE=68273438;WS=68273420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr14	68274020	rs181572	C	G	1182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=8;PP=679;SC=ATTAGATGTCCTGAGCCACAC;SOR=2.252;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=31;TCR=8;TR=39;WE=68274028;WS=68274010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr14	68331675	rs1474939	A	T	639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=9;NR=12;PP=433;SC=TTTATCTAAAAAACTTTTTTT;SOR=1.270;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=22;TCF=9;TCR=13;TR=21;WE=68331683;WS=68331665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr14	68773296	rs3837659	AC	A	4810.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.071;HP=2;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=56;PP=2948;ReadPosRankSum=1.584;SC=ATATCTTTTGACCAATTTGCA;SOR=0.801;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=147;TCF=35;TCR=112;TR=70;WE=68773306;WS=68773286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,128:0.48:267
chr14	68773298	rs60593979	C	G	4819.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.071;HP=2;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=55;PP=2962;ReadPosRankSum=1.699;SC=ATCTTTTGACCAATTTGCATT;SOR=0.801;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=226;TCF=115;TCR=111;TR=105;WE=68773306;WS=68773286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,128:0.48:267
chr14	68773353	rs2180770	G	A	1764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.495;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=49;PP=1194;ReadPosRankSum=-0.228;SC=TGATCCTCTGGCCTAATAAAC;SOR=1.061;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=156;TCF=66;TCR=90;TR=77;WE=68773361;WS=68773343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,82:0.46:177
chr14	68773469	rs3784104	A	G	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.738;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=226;ReadPosRankSum=-0.621;SC=ATGAACTTGCATGGCCGAAGT;SOR=0.129;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=15;WE=68773477;WS=68773459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr14	68934690	rs2074562	A	G	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=24;ReadPosRankSum=-0.253;SC=TGGAATAAGCATACAGCCTTT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=3;WE=68934698;WS=68934687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr14	68935789	rs2525505	T	C	3116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=54;PP=2051;SC=GCTCAGGATATACATCTGTCC;SOR=0.804;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=101;TCF=47;TCR=54;TR=101;WE=68935797;WS=68935779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr14	68944321	.	AT	A	120.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.763;ClippingRankSum=-0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQRankSum=-0.674;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.102;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr14	68944343	.	CTT	C	176.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.762;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=2.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=0.870;QD=6.80;ReadPosRankSum=-0.999;SOR=1.547;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr14	68963746	rs765899	C	T	903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=0;PP=654;SC=CCCATAACTTCAATAAACAAC;SOR=4.479;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=68963754;WS=68963736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr14	69012218	rs8017678	T	C	1148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=17;PP=641;ReadPosRankSum=0.312;SC=TGCCCTTGTCTTTAATGCCTT;SOR=0.705;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=60;TCR=31;TR=49;WE=69012226;WS=69012208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,54:0.56:97
chr14	69012355	rs2525529	C	G	6755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=112;NR=123;PP=2965;SC=AGAACGGGGACAGGGCATGCC;SOR=0.937;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=235;TCF=112;TCR=123;TR=235;WE=69012363;WS=69012345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr14	69012457	rs28672240	G	A	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.513;HP=2;HapScore=4;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=698;ReadPosRankSum=-1.550;SC=GAAGGGCTTGGGATTCACAGA;SOR=0.250;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=40;TCF=8;TCR=32;TR=19;WE=69012477;WS=69012447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,20:0.48:42
chr14	69012469	rs17105826	G	A	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.831;HP=2;HapScore=4;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=698;ReadPosRankSum=-1.115;SC=ATTCACAGATGAATAGGACAT;SOR=0.105;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=15;WE=69012477;WS=69012447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr14	69077688	rs17834971	G	A	1780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=6;PP=673;SC=AAAGTTTGTTGCATTTAAATC;SOR=2.419;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=32;WE=69077707;WS=69077678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr14	69077699	rs56104115	T	A	2071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=9;PP=873;SC=CATTTAAATCTGATCTTATTC;SOR=2.170;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=42;WE=69077707;WS=69077678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr14	69117387	rs8021657	A	G	3489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=46;PP=2312;SC=CAAAACAACTAGTTTCTCAGA;SOR=1.215;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=72;TCR=46;TR=118;WE=69117395;WS=69117377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr14	69117512	rs8023214	T	C	3760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=75;PP=2262;SC=TTGGCACATTTGCATATCTGG;SOR=1.016;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=134;TCF=59;TCR=75;TR=133;WE=69117520;WS=69117502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr14	69262441	rs3742887	A	G	870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.732;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=18;PP=615;ReadPosRankSum=0.785;SC=CCCGCCGACCAAGGGTTTGTT;SOR=0.513;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=88;TCF=54;TCR=34;TR=43;WE=69262449;WS=69262431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,43:0.48:89
chr14	69263074	rs6573857	G	A	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=167;ReadPosRankSum=0.000;SC=TGGGCCGCAGGACCCCAGAAG;SOR=0.663;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=10;WE=69263082;WS=69263064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr14	69328441	rs393673	A	G	2823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=29;PP=1811;SC=AGGGTCTCTCAGTTGTCTGGG;SOR=1.747;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=71;TCR=29;TR=100;WE=69328449;WS=69328431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr14	69328594	rs412638	G	A	7100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=117;NR=118;PP=2965;SC=TATGCCAACAGTAGCAATTAC;SOR=0.701;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=235;TCF=117;TCR=118;TR=235;WE=69328602;WS=69328584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr14	69328613	rs440689	C	T	7558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=124;NR=119;PP=2965;SC=ACAAAAATGACGTCATGATCA;SOR=0.745;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=243;TCF=124;TCR=119;TR=243;WE=69328621;WS=69328603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,277:1.00:277
chr14	69329116	rs424806	T	C	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.214;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=135;ReadPosRankSum=-1.464;SC=CAAAAATAGGTTCTCTTATTG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=8;WE=69329124;WS=69329106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
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chr14	69352230	rs15993	G	A	1105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=1.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.21;ReadPosRankSum=-1.572;SOR=0.532;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,57:0.47:120
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chr14	69392445	rs3742897	G	A	700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=21;PP=406;ReadPosRankSum=1.128;SC=CACCCTCATTGGACAAGCCAT;SOR=0.608;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=93;TCF=35;TCR=58;TR=35;WE=69392453;WS=69392435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,39:0.38:102
chr14	69444517	rs35512297	T	TC	68.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=13.78;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr14	69444661	rs11628773	G	A	801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.751;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=18;PP=398;ReadPosRankSum=1.492;SC=GGGGGCACAGGCTCACCGCGC;SOR=0.826;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=92;TCF=54;TCR=38;TR=41;WE=69444669;WS=69444651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,43:0.42:102
chr14	69445057	rs11620922	G	C	2116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.50;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr14	69445118	rs1983700	C	T	454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=13;PP=321;SC=GGTCCTTCTCCAGGCAGATCC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=69445126;WS=69445108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	69445646	rs4902685	A	G	393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=3;PP=269;SC=TGGGGGCTGCAGCGGGCGGGG;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=69445654;WS=69445636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr14	69529031	rs72718277	T	C	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=354;ReadPosRankSum=1.199;SC=CCTACATAAATTGTTCTAGTT;SOR=0.730;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=38;TCR=8;TR=22;WE=69529039;WS=69529021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,22:0.46:48
chr14	69695792	rs3742899	G	A	2710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=71;PP=1918;SC=CGGCAGAGGTGTGGTTTGTAT;SOR=2.935;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=17;TCR=71;TR=88;WE=69695800;WS=69695782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr14	69697453	rs1013762	C	G	562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=15;PP=450;SC=TGGTGATACTCCAGCTAACTG;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=69697461;WS=69697443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr14	69704553	rs8007859	G	T	5228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=78;PP=2965;SC=TGCCTACTCAGCGAAAGGAGG;SOR=0.872;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=174;TCF=95;TCR=79;TR=173;WE=69704561;WS=69704543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr14	69704662	rs8008141	G	A	1517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.975;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=42;PP=977;ReadPosRankSum=0.292;SC=CAAAGCACAGGAATTGTGGAA;SOR=1.092;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=143;TCF=54;TCR=89;TR=62;WE=69704670;WS=69704650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,70:0.45:156
chr14	69791213	rs12896878	G	C	102.84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5064;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=52;ReadPosRankSum=-0.431;SC=AGGACCCCAGGATGGGTGGCA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=4;WE=69791221;WS=69791212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr14	69791308	rs2045194	T	A	680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.966;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=9;PP=441;ReadPosRankSum=-2.852;SC=CTTCTCTGCCTGGCAGAAGTA;SOR=0.502;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=62;TCF=45;TCR=17;TR=30;WE=69791316;WS=69791298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,32:0.46:69
chr14	69792559	rs35024400	C	G	755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.740;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=5;PP=538;ReadPosRankSum=-1.864;SC=CATACCTCTTCCCAATCCCCA;SOR=1.185;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=55;TCF=44;TCR=11;TR=29;WE=69792567;WS=69792549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,30:0.51:59
chr14	69798284	rs1147461	G	A	4106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=81;PP=2474;SC=TTCTGCTCCCGGGGGTGGGGC;SOR=1.121;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=142;TCF=61;TCR=81;TR=142;WE=69798292;WS=69798274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr14	69799892	rs1275677	A	G	1076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=29;PP=661;ReadPosRankSum=-1.225;SC=ATAAGGTCAGAGCTGCGGTGG;SOR=0.693;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=102;TCF=48;TCR=54;TR=51;WE=69799900;WS=69799882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,54:0.47:115
chr14	69818599	rs35286134	C	A	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=108;ReadPosRankSum=0.306;SC=ACTGTAAGAACAAGGTCATGC;SOR=1.270;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=7;WE=69818607;WS=69818593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr14	69928307	rs1045301	G	T	689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=9;PP=414;ReadPosRankSum=0.107;SC=GAAAGGGAGTGGCTGTTTTGA;SOR=0.838;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=48;TCF=33;TCR=15;TR=28;WE=69928315;WS=69928297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,30:0.58:52
chr14	69966850	rs4902723	G	A	1397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.830;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=28;PP=947;ReadPosRankSum=2.074;SC=TCATCAAAGAGAGCTTTCTGC;SOR=0.853;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=179;TCF=105;TCR=74;TR=70;WE=69966858;WS=69966840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,73:0.38:194
chr14	69967470	rs4902724	C	T	1655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=39;PP=1122;ReadPosRankSum=1.518;SC=CATGTCCTGGCCTGGGAGAGG;SOR=0.732;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=142;TCF=63;TCR=79;TR=70;WE=69967478;WS=69967460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,74:0.49:151
chr14	69988954	rs10146531	T	G	6315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=123;NR=89;PP=2965;SC=GATCTCAGGGTTCCTTTGCTG;SOR=0.905;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=212;TCF=123;TCR=89;TR=212;WE=69988962;WS=69988944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
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chr14	69994473	rs1885400	C	G	3430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=34;PP=2160;SC=AGTCGGAACCCCACCCTTCCT;SOR=1.666;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=114;TCF=80;TCR=34;TR=114;WE=69994481;WS=69994463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
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chr14	70235741	rs3104	G	A	1247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.610;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=27;PP=818;ReadPosRankSum=0.803;SC=ACGTTAGCCAGTTGTTCTTGA;SOR=0.513;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=98;TCF=41;TCR=57;TR=49;WE=70235749;WS=70235731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,53:0.50:105
chr14	70245877	rs113692047	TA	T	95.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=1.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.29;MQRankSum=1.445;QD=2.74;ReadPosRankSum=0.993;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,12:0.34:35
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chr14	70418881	rs3742909	G	A	3976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=365;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=85;PP=2257;ReadPosRankSum=0.048;SC=GTGACCCACAGTGCAACCTCC;SOR=0.703;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=320;TCF=166;TCR=154;TR=175;WE=70418889;WS=70418871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,195:0.53:365
chr14	70477508	rs3825739	C	T	1369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.229;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=27;PP=810;ReadPosRankSum=-0.129;SC=GGCAGAGTGCCCTGGAAGAGG;SOR=0.485;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=113;TCF=63;TCR=50;TR=57;WE=70477516;WS=70477498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,65:0.52:126
chr14	70477695	rs34311408	C	T	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.933;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=101;ReadPosRankSum=0.456;SC=CTGGGAAAAACGCACCTGCTG;SOR=0.132;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=9;WE=70477703;WS=70477685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr14	70478173	rs139924326	CA	C	5103.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FS=3.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=64.46;MQRankSum=13.854;QD=18.63;ReadPosRankSum=0.741;SOR=0.822;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:133,141:0.51:274
chr14	70478176	rs116375526	C	T	5264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FS=3.281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=64.43;MQRankSum=13.720;QD=19.08;ReadPosRankSum=0.587;SOR=0.820;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:133,143:0.52:276
chr14	70478183	rs57609901	C	A	5134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FS=1.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=64.14;MQRankSum=14.171;QD=17.35;ReadPosRankSum=1.763;SOR=0.705;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:151,145:0.49:296
chr14	70490264	rs2281663	A	G	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.930;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.97;ReadPosRankSum=1.150;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr14	70496867	rs227402	C	T	1051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.591;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=11;PP=459;ReadPosRankSum=0.901;SC=ATGGACATAGCTGGATTTCTC;SOR=0.898;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=107;TCF=60;TCR=47;TR=39;WE=70496875;WS=70496857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,49:0.45:110
chr14	70522353	rs998919	T	G	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=243;ReadPosRankSum=-0.389;SC=TCTCATAATTTCTTCATGTGG;SOR=0.495;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=13;WE=70522361;WS=70522343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr14	70522684	rs10142899	A	C	1144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.840;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=29;PP=767;ReadPosRankSum=-0.873;SC=ACGCAAAAAGAAGCCTTTGGA;SOR=0.388;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=103;TCF=35;TCR=68;TR=49;WE=70522692;WS=70522674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,52:0.48:109
chr14	70527420	rs45554836	G	A	2300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.502;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=49;PP=1433;ReadPosRankSum=0.667;SC=TGGTCAAAAAGAGAAAGGAGG;SOR=0.748;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=185;TCF=95;TCR=90;TR=98;WE=70527428;WS=70527410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,108:0.51:211
chr14	70530530	rs72729840	G	T	1922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.591;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=34;PP=1194;ReadPosRankSum=0.768;SC=TGGAGGACAGGGTACTACACC;SOR=0.793;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=147;TCF=87;TCR=60;TR=83;WE=70530538;WS=70530520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,90:0.56:160
chr14	70530706	rs150956	C	G	422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=12;PP=342;SC=AGTCAGCCAGCAGACAAAAAC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=70530714;WS=70530696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	70634087	rs2114024	A	G	5744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=97;PP=2965;SC=GGTAGAAGGCACGGCTCTTCT;SOR=0.770;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=197;TCF=100;TCR=97;TR=197;WE=70634095;WS=70634077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr14	70712880	rs2296918	A	C	6877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.91;MQRankSum=-1.724;QD=28.19;ReadPosRankSum=0.293;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,243:1.00:244
chr14	70713586	rs150958502	T	G	3565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.823;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.447;NF=64;NR=79;PP=2222;ReadPosRankSum=-0.424;SC=GGAAAACATTTCCTTGATTCC;SOR=0.635;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=302;TCF=135;TCR=167;TR=143;WE=70713594;WS=70713576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,166:0.49:340
chr14	70713720	rs34309925	AATC	A	6471.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.233;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.156;NF=30;NR=64;PP=2964;ReadPosRankSum=-0.868;SC=TAAATGAAGAAATCATGGTTC;SOR=0.914;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=219;TCF=60;TCR=159;TR=94;WE=70713730;WS=70713710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,167:0.51:329
chr14	70713858	rs61979492	T	C	2754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=2.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-7.090;NF=54;NR=59;PP=1816;ReadPosRankSum=-0.309;SC=TCTGTTAAGCTACATCTCATA;SOR=0.697;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=275;TCF=129;TCR=146;TR=113;WE=70713866;WS=70713848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:181,129:0.42:310
chr14	70713981	rs12586570	A	G	2003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.720;HP=3;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.208;NF=36;NR=44;PP=2516;ReadPosRankSum=-0.440;SC=AATACTCCTCAAAAGCCCCCA;SOR=0.320;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=134;TCF=52;TCR=82;TR=80;WE=70714000;WS=70713971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,91:0.61:149
chr14	70713992	rs4902799	C	A	1143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.338;HP=3;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.469;NF=16;NR=32;PP=1823;ReadPosRankSum=-0.313;SC=AAAGCCCCCACAACAAGCACT;SOR=1.104;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=120;TCF=48;TCR=72;TR=48;WE=70714000;WS=70713971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,54:0.40:135
chr14	70714162	rs4899340	A	G	1198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.47;QD=27.88;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr14	70714162	.	ATGTTTCTGGT	GTGTTTCTGGC,GTGTTTCTGGT	367	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.39;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=24;MQ=48.01;NF=7,28;NR=2,13;PP=159,367;QD=23.6075416514;SC=TATGAACAACATGTTTCTGGT;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=41;TCF=28;TCR=13;TR=9,41;WE=70714180;WS=70714152;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.22:41
chr14	70714172	rs4899341	T	C	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=15.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.21;MQRankSum=-3.327;QD=2.14;ReadPosRankSum=-1.099;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,7:0.17:41
chr14	70714259	rs7144638	A	G	856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.021;NF=40;NR=20;PP=938;ReadPosRankSum=-5.030;SC=CACCACTTCCAGGGAAGTGAA;SOR=0.671;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=103;TCF=66;TCR=37;TR=60;WE=70714267;WS=70714249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,41:0.48:85
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chr14	70924566	rs3829452	CA	GT	952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.006;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.215;NF=15;NR=7;PP=696;ReadPosRankSum=-1.829;SC=TACGTGGAGGCAGCCCCTGAG;SOR=0.429;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=84;TCF=57;TCR=27;TR=22;WE=70924575;WS=70924556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,28:0.32:87
chr14	70924852	rs3829455	A	C	1897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.03;QD=28.75;SOR=2.939;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr14	70925257	rs12436346	A	G	967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.32;QD=33.37;SOR=4.479;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr14	70925665	rs10148733	G	A	5661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-0.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=513;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.722;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.119;NF=127;NR=112;PP=2962;ReadPosRankSum=0.615;SC=CATCTCATCAGTGTCCAGAAG;SOR=0.638;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=473;TCF=241;TCR=232;TR=239;WE=70925673;WS=70925655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:251,261:0.51:512
chr14	70925818	rs2022624	T	C	1959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.69;QD=33.79;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr14	70936714	rs2293873	T	C	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=4.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.346;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.299;NF=17;NR=1;PP=315;ReadPosRankSum=1.484;SC=GAGCTACGTATGGAAAATTAG;SOR=1.773;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=45;TCF=41;TCR=4;TR=18;WE=70936722;WS=70936704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,23:0.44:52
chr14	70937121	rs7152848	T	C	1184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.676;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=22;PP=515;ReadPosRankSum=-0.037;SC=CAACGTGGCCTGGCCTGCTAG;SOR=0.800;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=106;TCF=57;TCR=49;TR=48;WE=70937129;WS=70937111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,59:0.49:121
chr14	70937413	rs7153448	T	A	3820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FS=3.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.32;MQRankSum=-11.871;QD=14.47;ReadPosRankSum=-0.472;SOR=0.614;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:161,103:0.39:264
chr14	70937420	rs7153459	T	C	4025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FS=7.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.35;MQRankSum=-11.489;QD=15.08;ReadPosRankSum=-0.922;SOR=0.772;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:159,108:0.40:267
chr14	70937424	rs9323539	A	G	3895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FS=5.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.46;MQRankSum=-12.129;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.376;SOR=0.601;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:163,104:0.39:267
chr14	70937494	rs8015742	T	G	6502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=-0.309;NF=114;NR=102;PP=2965;ReadPosRankSum=0.594;SC=AGCCTCCAGGTGTTTGATTTC;SOR=0.233;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=218;TCF=114;TCR=104;TR=216;WE=70937502;WS=70937484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,241:1.00:242
chr14	70937725	rs10467821	T	C	2685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=344;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.918;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-17.723;NF=71;NR=71;PP=1584;ReadPosRankSum=0.487;SC=CACGTGTCTTTGGCCCCGGAA;SOR=0.745;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=333;TCF=171;TCR=162;TR=142;WE=70937733;WS=70937715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:202,141:0.41:343
chr14	70937988	rs28473545	G	A	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.508;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=303;ReadPosRankSum=-0.952;SC=GCAGAAAGAGGATTCCTCAGT;SOR=1.179;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=32;TCF=10;TCR=22;TR=18;WE=70937996;WS=70937978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr14	70989762	rs9323540	T	C	4997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=428;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.093;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=109;NR=95;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.378;SC=GATTGGGAATTACTCCCACAT;SOR=0.802;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=390;TCF=206;TCR=184;TR=204;WE=70989770;WS=70989752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:203,225:0.53:428
chr14	70990398	rs10162314	G	A	3673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=378;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.272;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=66;PP=2157;ReadPosRankSum=1.085;SC=ACTGTAGCTCGCACACACACC;SOR=0.855;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=332;TCF=183;TCR=149;TR=151;WE=70990406;WS=70990388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:204,174:0.46:378
chr14	71108784	.	CGCG	C	34.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.909;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.318;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=2;PP=56;ReadPosRankSum=0.050;SC=CCCGGGAAGGCGCGGCGGCGG;SOR=1.071;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=2;WE=71108794;WS=71108774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,3:0.14:21
chr14	71109153	rs4902834	C	G	3606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.301;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=75;PP=2147;ReadPosRankSum=0.610;SC=GGACTCGCGCCCGGCCTCCCC;SOR=0.757;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=309;TCF=156;TCR=153;TR=155;WE=71109161;WS=71109143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,174:0.51:341
chr14	71109276	rs3742852	G	T	2953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.40;ReadPosRankSum=1.171;SOR=0.702;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:122,137:0.53:259
chr14	71109352	rs3742851	G	C	534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.937;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=438;ReadPosRankSum=0.095;SC=CTCCTGCTGTGACTGTGTTGC;SOR=1.306;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=52;TCF=4;TCR=48;TR=21;WE=71109360;WS=71109342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,21:0.38:56
chr14	71197755	rs1476610	T	G	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=275;ReadPosRankSum=-0.234;SC=TGACCTAGAATGCCATGATCC;SOR=1.179;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=14;WE=71197763;WS=71197745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr14	71202650	rs4141095	C	T	2465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.050;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=50;PP=1454;ReadPosRankSum=-0.496;SC=ACCAGGACAGCTGGTGAAAGG;SOR=0.520;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=203;TCF=114;TCR=89;TR=109;WE=71202658;WS=71202640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,117:0.54:215
chr14	71208996	rs4899368	A	G	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.160;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=105;ReadPosRankSum=-0.779;SC=TCAGTCCCGGACTCCCTCAAA;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=6;WE=71209004;WS=71208990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr14	71215526	rs5809495	G	GT	1065.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=7.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.28;MQRankSum=1.188;QD=13.84;ReadPosRankSum=1.772;SOR=0.234;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,46:0.60:77
chr14	71216863	rs10630067	C	CAT	1880.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.753;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.948;NF=4;NR=24;PP=1236;ReadPosRankSum=0.733;SC=TGCAATAGCTCGAGTCTTTTC;SOR=0.970;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=52;TCF=7;TCR=45;TR=28;WE=71216871;WS=71216853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,49:0.54:91
chr14	71227913	rs3814872	A	C	2295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.374;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=58;PP=1150;ReadPosRankSum=-2.570;SC=GGCAAGGAAAAGAATACAGAA;SOR=0.532;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=197;TCF=86;TCR=111;TR=105;WE=71227921;WS=71227903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,114:0.53:215
chr14	71232147	rs55941560	C	T	487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.324;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=263;ReadPosRankSum=-0.826;SC=CATTCACTCACCACTCACTCA;SOR=1.519;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=41;TCF=27;TCR=14;TR=21;WE=71232155;WS=71232137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,24:0.52:46
chr14	71275773	rs3832971	GCCT	G	48.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.60;MQRankSum=1.097;QD=4.43;ReadPosRankSum=0.389;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr14	71434943	rs139623749	C	T	1392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=34;PP=773;ReadPosRankSum=0.406;SC=CGTCTTGGAACAGCAGCAACT;SOR=0.716;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=165;TCF=81;TCR=84;TR=66;WE=71434951;WS=71434933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,73:0.41:176
chr14	71444788	rs3814871	G	A	10494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=375;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=159;NR=178;PP=2965;SC=GCCGGCATAGGGACTATGTTT;SOR=0.835;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=337;TCF=159;TCR=178;TR=337;WE=71444796;WS=71444778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,375:1.00:375
chr14	71445413	rs4391999	A	G	1315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=27;PP=816;SC=CTGCTTTTTCATACTATTAAT;SOR=1.814;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=14;TCR=27;TR=41;WE=71445421;WS=71445403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr14	71455540	rs3829954	A	G	3762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=88;PP=2626;SC=TCTTTCCTATACATTTAAGCC;SOR=1.954;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=126;TCF=37;TCR=89;TR=125;WE=71455548;WS=71455530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr14	71462759	rs56021283	T	G	604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=20;PP=516;SC=TAGGAGCACTTTTTACATAGG;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=71462767;WS=71462749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr14	71485692	rs1859914	A	T	1319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=10;PP=817;SC=CTTATACTTAAGATATACTTA;SOR=2.030;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=43;WE=71485700;WS=71485682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr14	71495288	rs34488204	C	T	172.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=139;SC=AACTGAATTTCTGAAATTCAG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=71495296;WS=71495279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr14	71500626	rs11461235	G	GT	798.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.96;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr14	71513930	rs3217014	TG	T	321.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=280;SC=TGCAAGGCACTGTGAGATTAA;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=7;WE=71513938;WS=71513920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr14	71568683	rs34093157	T	A	1350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=36;NR=7;PP=874;SC=CCTTTAAAAATTTATATATTA;SOR=2.208;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=36;TCR=7;TR=43;WE=71568691;WS=71568673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr14	72040525	rs6574016	G	A	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.394;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=121;ReadPosRankSum=1.198;SC=TGGTATTCCAGTACTTTTTCC;SOR=1.828;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=7;WE=72040533;WS=72040515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr14	72055468	rs1859643	A	C	3633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=358;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.245;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=76;PP=2308;ReadPosRankSum=-1.358;SC=CTGGAGACTCATCTATTTTTC;SOR=0.612;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=325;TCF=172;TCR=153;TR=158;WE=72055476;WS=72055458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,176:0.49:358
chr14	72117156	rs8017465	T	C	1023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=22;PP=573;ReadPosRankSum=0.350;SC=TTGAAGAATTTCTTCAACTAT;SOR=0.773;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=85;TCF=43;TCR=42;TR=45;WE=72117164;WS=72117146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,51:0.50:102
chr14	72201985	rs2097887	C	A	2554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.959;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=50;PP=1441;ReadPosRankSum=-1.120;SC=TTTCTTCTCTCCTTTCCAGTC;SOR=0.699;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=227;TCF=119;TCR=108;TR=109;WE=72201993;WS=72201975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,125:0.49:254
chr14	72431599	rs61755651	C	T	1021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.820;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=19;PP=627;ReadPosRankSum=0.795;SC=CAAAGTAAGGCGCCTGGTCAA;SOR=0.495;Source=Platypus;TCF=45;TR=45;WE=72431607;WS=72431589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,48:0.58:83
chr14	72925171	rs2238186	G	C	948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.815;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=29;PP=690;ReadPosRankSum=-1.162;SC=AAAACCTAGGGATATCTGAGG;SOR=0.869;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=88;TCF=29;TCR=59;TR=41;WE=72925179;WS=72925161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,43:0.45:95
chr14	72932330	.	G	GTGGA	937.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.030;ClippingRankSum=0.000;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=9.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.38;MQRankSum=3.578;QD=15.63;ReadPosRankSum=0.690;SOR=2.154;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,25:0.42:60
chr14	72932563	rs75036480	G	A	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.555;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=429;ReadPosRankSum=2.015;SC=ATACATATAAGAAGAGAGTAA;SOR=1.179;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=70;TCF=21;TCR=49;TR=29;WE=72932571;WS=72932553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,30:0.41:73
chr14	72936954	rs8012037	T	C	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.757;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=79;ReadPosRankSum=1.341;SC=GGATAAGTTTTGTCTTCATAA;SOR=0.105;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=8;WE=72936962;WS=72936944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr14	72939495	rs10131300	C	A	1266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=20;PP=912;ReadPosRankSum=-1.489;SC=TAGCCCCTAGCAACAGGAGCA;SOR=0.647;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=121;TCF=79;TCR=42;TR=58;WE=72939503;WS=72939485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,60:0.45:133
chr14	72944943	rs2239277	T	G	1118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=23;PP=645;ReadPosRankSum=0.460;SC=AATTTTAGTTTGGTCTTAACA;SOR=0.655;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=98;TCF=51;TCR=47;TR=46;WE=72944951;WS=72944933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,54:0.46:118
chr14	73003165	rs148770406	T	A	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=175;ReadPosRankSum=-0.049;SC=CCAGCCCCACTGCAAGGTCCA;SOR=0.622;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=10;WE=73003173;WS=73003155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr14	73181428	rs4903049	T	G	1054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=29;PP=842;SC=TGTTCACAACTCCAAGAGGTG;SOR=4.112;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=32;WE=73181436;WS=73181418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr14	73198506	rs6574094	T	C	4004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=80;NR=62;PP=1985;SC=CCAGCAGGTGTGGGAATACCT;SOR=0.785;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=142;TCF=80;TCR=62;TR=142;WE=73198514;WS=73198496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr14	73220020	rs3742836	A	G	1145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.394;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=26;PP=725;ReadPosRankSum=1.354;SC=GGTGGGTGCAATCGTCTCTTC;SOR=0.829;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=114;TCF=59;TCR=55;TR=51;WE=73220028;WS=73220010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,56:0.43:129
chr14	73220153	rs3742835	C	T	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.882;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=12;PP=271;ReadPosRankSum=-1.198;SC=TGACTAACCCCGTCATTCACA;SOR=0.807;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=66;TCF=31;TCR=35;TR=23;WE=73220161;WS=73220143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,28:0.37:76
chr14	73220188	rs41314521	A	G	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=74;ReadPosRankSum=-1.403;SC=AAGCCCAGAGAGAAGTGACTT;SOR=0.791;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=35;TCF=16;TCR=19;TR=9;WE=73220196;WS=73220178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,12:0.29:41
chr14	73240486	rs8015749	A	G	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.070;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.158;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=119;ReadPosRankSum=-0.498;SC=GTTAACCTATATTATAGCATA;SOR=1.863;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=8;WE=73240494;WS=73240476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr14	73358945	rs11158986	A	C	5661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=86;PP=2965;SC=GGGGAAACTGAAAATCAGTTG;SOR=0.722;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=179;TCF=92;TCR=87;TR=178;WE=73358953;WS=73358935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr14	73360819	rs5809598	T	TTGTC	6371.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=55;PP=2965;SC=TAACAGAATATTGTCTCAGAG;SOR=0.996;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=96;TCF=14;TCR=82;TR=68;WE=73360827;WS=73360809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr14	73360949	rs2215901	A	G	830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=23;PP=623;SC=AGTTATTAGGAGAGCTGTCAA;SOR=3.690;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=26;WE=73360957;WS=73360939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr14	73404795	rs2302587	G	A	2617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=56;PP=1686;SC=GTGCCGCTCTGGGGAGCCACT;SOR=1.661;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=28;TCR=56;TR=84;WE=73404803;WS=73404785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr14	73408355	rs3742832	G	A	586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=1;PP=432;SC=TTTAGTGCCTGTTTCCTTCAT;SOR=4.514;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=73408377;WS=73408348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr14	73408369	rs3832967	A	AT	1084.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=1;PP=1085;SC=CCTTCATTACATCCTATGGAA;SOR=5.421;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=24;WE=73408377;WS=73408348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr14	73409613	rs2333012	G	A	1922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=11;PP=1197;SC=AGAGATGGGCGTCAGCGGGGC;SOR=2.566;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=47;TCR=11;TR=58;WE=73409621;WS=73409603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr14	73412739	rs2246976	C	T	6716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=100;NR=123;PP=2965;SC=CCGGAAGGTACGTTGCCCATC;SOR=1.025;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=223;TCF=100;TCR=123;TR=223;WE=73412747;WS=73412729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr14	73413965	rs2243443	G	C	693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=17;PP=486;SC=CTGGGTATCTGTGGGCTTCAT;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=73413973;WS=73413955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr14	73418732	rs3214336	GT	G	434.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=13;PP=282;SC=AGAAGCATGTGTTTTTTTTAC;SOR=2.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=13;WE=73418740;WS=73418722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr14	73422350	rs2806034	T	G	7318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=131;NR=128;PP=2965;SC=CAGTGACCTCTGTGCGGATCC;SOR=0.729;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=259;TCF=131;TCR=128;TR=259;WE=73422358;WS=73422340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,279:1.00:279
chr14	73572606	rs150988201	AAG	A	33.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=6.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.53;ReadPosRankSum=-1.855;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,7:0.11:64
chr14	73717527	rs80299161	G	A	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=186;ReadPosRankSum=1.256;SC=CCTGGGCTGCGTGGGTGCTGG;SOR=0.191;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=11;WE=73717535;WS=73717517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr14	73720376	rs139106887	C	T	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=152;ReadPosRankSum=-0.538;SC=CCTCAGGCCACCTGTGTGAGT;SOR=0.693;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=11;WE=73720384;WS=73720366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr14	73728957	rs177387	G	A	1456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=17;PP=916;SC=TGCTTTATAAGTGGGGAAGGG;SOR=1.445;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=33;TCR=17;TR=50;WE=73728965;WS=73728947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr14	73730290	rs177385	C	A	6115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=129;NR=81;PP=2965;SC=GAACACACTGCTTAGGGTGGT;SOR=1.149;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=210;TCF=129;TCR=81;TR=210;WE=73730298;WS=73730280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr14	73730586	.	GGTGTGACAGACCCCCTCCTCCTTTGACAGGTGT	G	30.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.237;ClippingRankSum=0.000;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.77;ReadPosRankSum=0.786;SOR=0.709;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,5:0.12:40
chr14	73730596	.	A	C	812	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;FR=0.5000;HP=5;HapScore=3;MGOF=15;MMLQ=15;MQ=59.15;NF=7;NR=11;PP=812;QD=47.0428451415;SC=GGTGTGACAGACCCCCTCCTC;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=49;TCF=26;TCR=23;TR=18;WE=73730617;WS=73730586;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:31,18:0.37:49
chr14	73730627	.	A	G	254	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MMLQ=21;MQ=58.22;NF=13;NR=10;PP=254;QD=12.5552701107;SC=TGTGTGTGACAGCCCCCCTAC;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=68;TCF=34;TCR=34;TR=23;WE=73730635;WS=73730617;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:45,23:0.34:68
chr14	73732302	rs177383	C	G	1391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=29;PP=855;SC=GAGCTGCTAGCGCATGGTCAT;SOR=1.802;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=15;TCR=29;TR=44;WE=73732310;WS=73732292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr14	73957682	rs10144461	C	G	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=182;ReadPosRankSum=-1.582;SC=TTTAGCTTCGCCCCCGGCCGG;SOR=0.941;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=10;WE=73957690;WS=73957672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr14	73957772	rs10144469	A	G	1207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=2.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.82;ReadPosRankSum=0.192;SOR=0.505;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,60:0.49:123
chr14	73957981	rs150704374	G	GC	4902.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=55;PP=2896;ReadPosRankSum=-0.222;SC=GGCGGTGGCGGCGTCCCGGAC;SOR=0.460;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=68;TCF=8;TCR=60;TR=63;WE=73957989;WS=73957971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,132:0.99:133
chr14	73958375	rs758109	T	C	2381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.041;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=45;PP=1613;ReadPosRankSum=0.376;SC=CAGATCACTTTTACCGGCGCC;SOR=0.786;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=209;TCF=116;TCR=93;TR=105;WE=73958383;WS=73958365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,110:0.50:219
chr14	73961765	rs11365617	CA	C	136.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.39;ReadPosRankSum=0.772;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr14	73961841	rs1019056	T	C	1185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.822;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=15;PP=680;ReadPosRankSum=1.507;SC=TTTCATCCTCTAAGGCTTGCT;SOR=0.578;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=60;TCR=28;TR=46;WE=73961849;WS=73961831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,53:0.56:95
chr14	73963383	rs8014577	T	C	1099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=27;PP=717;ReadPosRankSum=0.473;SC=GGTACATTTCTCTGAAAGATA;SOR=0.656;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=33;TCR=45;TR=47;WE=73963391;WS=73963373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,50:0.58:86
chr14	73973364	rs35842680	A	G	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=291;ReadPosRankSum=1.699;SC=GGCATCCTGCATAATTAATGT;SOR=0.627;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=17;WE=73973372;WS=73973354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr14	73989859	rs1074501	C	T	901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.563;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=22;PP=495;ReadPosRankSum=0.370;SC=CTGGTCATACCGCGTCCCAGC;SOR=0.304;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=80;TCF=32;TCR=48;TR=40;WE=73989867;WS=73989849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,45:0.49:92
chr14	74004639	.	CTG	C	206.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.427;ClippingRankSum=0.000;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=1.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.19;MQRankSum=3.335;QD=2.30;ReadPosRankSum=-2.189;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,14:0.16:90
chr14	74128945	rs45508195	A	G	269.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=9;PP=221;SC=TTTTAAAGACATTTAAAAGCT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=74128953;WS=74128935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr14	74138442	rs45599532	A	G	176.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=5;PP=141;SC=TTCTCAAGTTACCCTTCAATA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=74138450;WS=74138432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr14	74156316	rs62004949	C	T	1613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=45;PP=1311;SC=AGAAAAAATACCTCTGATCTT;SOR=4.534;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=4;TCR=45;TR=49;WE=74156324;WS=74156306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr14	74162452	rs11625036	G	C	146.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=0;PP=86;SC=GGATGGTCTTGAACTCCTGAC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=74162460;WS=74162449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr14	74192165	rs10136165	T	C	415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=11;PP=273;SC=CGCCCATGGTTTCTGCAGGCA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=74192173;WS=74192155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr14	74192994	rs2336074	A	G	559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=15;PP=428;SC=CAGAAAACAGACCTCAGGTCC;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=74193002;WS=74192984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr14	74193427	rs887508	A	G	4288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=68;PP=2550;SC=CCACAGGAGCATGAGGAGGGA;SOR=0.756;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=149;TCF=81;TCR=68;TR=149;WE=74193435;WS=74193417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr14	74196844	rs6574140	T	C	3134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=58;PP=1937;SC=AAAAGCCCTTTTTATCATCTC;SOR=1.159;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=101;TCF=43;TCR=58;TR=101;WE=74196852;WS=74196834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr14	74203690	rs8007548	G	A	390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=1;PP=263;SC=TAGAAGGGGCGCCTCTCATAC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=74203698;WS=74203680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr14	74206481	rs758774	T	C	6017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=102;NR=98;PP=2965;SC=CAGGCCCATATACCACAGAGT;SOR=0.757;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=200;TCF=102;TCR=98;TR=200;WE=74206489;WS=74206471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr14	74206855	rs17182544	C	G	1053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=28;PP=793;SC=ACAGTGAGGTCGGACACTGGG;SOR=2.432;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=35;WE=74206863;WS=74206845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr14	74399291	rs2336547	G	A	1158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=23;PP=659;SC=CTTGCTATCAGTCATCCTGTC;SOR=1.556;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=13;TCR=23;TR=36;WE=74399299;WS=74399281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr14	74404454	rs113885060	A	G	1335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=37;PP=886;ReadPosRankSum=-0.067;SC=CTAATCCAGAATACCCTTCAT;SOR=0.638;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=27;TCR=67;TR=52;WE=74404462;WS=74404444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,57:0.56:102
chr14	74422329	rs2302118	G	C	3135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=62;PP=2025;SC=TTCACATTCAGTCCGAGGAAG;SOR=1.546;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=35;TCR=62;TR=97;WE=74422337;WS=74422319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr14	74428286	rs7141392	A	G	4276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=76;SC=AAGGATTCAGATACTATGGGG;SOR=0.706;SbPval=0.53;Source=Platypus;TCF=76;WE=74428294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr14	74449980	rs71907518	CCT	C	139.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.142;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=90;ReadPosRankSum=-0.624;SC=AGGGCTCCAACCTCTCTCTGC;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=3;WE=74449989;WS=74449970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr14	74453706	rs199818408	AT	A	8238.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=88;PP=2957;SC=CCCTGAAGTTATCCCAAATGA;SOR=0.991;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=120;TCF=25;TCR=95;TR=110;WE=74453719;WS=74453696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr14	74453711	rs111623005	A	C	8191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=91;PP=2965;SC=AAGTTATCCCAAATGATCCTA;SOR=1.100;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=168;TCF=71;TCR=97;TR=157;WE=74453719;WS=74453696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr14	74454813	rs2302117	C	A	375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=12;PP=295;SC=CATTCTTTTCCCAAGATGTGG;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=74454821;WS=74454803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	74489735	rs3784039	G	A	1449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.660;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=31;PP=900;ReadPosRankSum=-1.369;SC=GATACTTCACGGATACTGGCA;SOR=0.474;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=144;TCF=67;TCR=77;TR=61;WE=74489743;WS=74489725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,70:0.43:163
chr14	74500585	rs62005101	AT	TA	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.90;MQRankSum=-0.000;QD=11.82;ReadPosRankSum=1.718;SOR=0.086;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr14	74500621	rs72725911	G	A	521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.620;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.040;NF=15;NR=4;PP=228;ReadPosRankSum=2.418;SC=AAAAAAGGGGGGATATTTCTT;SOR=0.212;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=19;WE=74500629;WS=74500611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,25:0.50:50
chr14	74512698	rs6574158	T	C	2005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=13;PP=1352;SC=AAAATAAATATCTTTTGATGA;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=48;TCR=13;TR=61;WE=74512706;WS=74512688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr14	74514674	rs3784038	A	T	4601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=57;PP=2828;SC=AAAGAGAATGATTATCTTCAG;SOR=1.254;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=157;TCF=100;TCR=57;TR=157;WE=74514682;WS=74514664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
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chr14	74523949	rs3742808	G	A	2735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.133;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=56;PP=1752;ReadPosRankSum=1.820;SC=AAGAACCTCAGGAGTCTGACA;SOR=0.753;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=277;TCF=143;TCR=134;TR=121;WE=74523957;WS=74523939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,131:0.44:298
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chr14	74527203	rs8017248	G	A	1079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=1;PP=908;SC=GAAACTTTGCGGGGGTTAATA;SOR=5.670;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=33;WE=74527211;WS=74527180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
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chr14	74537885	rs2072293	T	G	4816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=74;PP=2812;SC=GCCATATGCATAAGGGCAGTT;SOR=0.796;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=160;TCF=86;TCR=74;TR=160;WE=74537893;WS=74537875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr14	74538706	rs4646861	A	G	1394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.337;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=33;PP=984;ReadPosRankSum=-1.857;SC=AATAGAAATTAATGCAAGAAT;SOR=0.718;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=115;TCF=57;TCR=58;TR=60;WE=74538714;WS=74538696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,62:0.52:120
chr14	74539325	rs2302126	C	A	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=12.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.75;ReadPosRankSum=2.765;SOR=3.154;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,11:0.18:62
chr14	74544796	rs4903178	G	A	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-4.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=277;ReadPosRankSum=1.482;SC=AACACTTATTGTTTATTTTCA;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=15;WE=74544804;WS=74544786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr14	74550908	rs2074939	A	T	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=13;PP=448;ReadPosRankSum=-1.714;SC=TGGGCATGGGACAGGGCCGCA;SOR=0.671;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=58;TCF=34;TCR=24;TR=32;WE=74550916;WS=74550898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,33:0.58:57
chr14	74551518	rs2006731	T	A	724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=1.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.76;ReadPosRankSum=0.179;SOR=0.278;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,20:0.43:46
chr14	74551526	rs2006732	C	A	825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=2.790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.24;ReadPosRankSum=0.760;SOR=1.284;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,24:0.41:58
chr14	74564468	rs2098032	G	T	1523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.494;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=29;PP=876;ReadPosRankSum=0.789;SC=CTTTTTATGTGTCTGAATGGA;SOR=0.477;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=159;TCF=94;TCR=65;TR=64;WE=74564476;WS=74564458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,77:0.43:178
chr14	74564605	rs2079635	T	C	2008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FS=2.416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.05;MQRankSum=1.030;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.805;SOR=0.524;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,100:0.49:204
chr14	74567736	rs2300193	T	C	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.260;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=59;ReadPosRankSum=1.465;SC=ACGGATCCATTTTCTACTTAT;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=4;WE=74567744;WS=74567726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr14	74665543	rs10145171	G	A	1125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.272;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=10;PP=730;ReadPosRankSum=-0.423;SC=AAATCAATCTGCATTTTTAAA;SOR=1.158;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=72;TCF=54;TCR=18;TR=43;WE=74665551;WS=74665533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,48:0.60:80
chr14	74706171	.	G	A	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.989;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=7.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.75;ReadPosRankSum=0.646;SOR=0.092;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr14	74726515	rs11383441	G	GC	1974.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=32;PP=1347;SC=TTGGGGTCCTGCCCTGCGGTG;SOR=1.460;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=32;WE=74726523;WS=74726505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr14	74727661	rs117813701	C	T	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=56;ReadPosRankSum=0.163;SC=CAAGACTCTGCTCTCCTCGGG;SOR=0.693;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=5;WE=74727669;WS=74727651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr14	74753278	rs929449	T	C	10756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=403;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=194;NR=175;PP=2965;SC=CCCTGGCCGCTGGCAGAGGAG;SOR=0.708;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=369;TCF=194;TCR=175;TR=369;WE=74753286;WS=74753268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,403:1.00:403
chr14	74759006	rs3742801	C	T	2054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.070;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=40;PP=1257;ReadPosRankSum=-1.810;SC=AAGCCCCACTCGCTCTCGCCC;SOR=0.775;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=188;TCF=104;TCR=84;TR=88;WE=74759014;WS=74758996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,98:0.47:207
chr14	74759301	rs4148078	G	T	4227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=80;PP=2534;ReadPosRankSum=0.859;SC=ACAGGTCGATGAGCTGGGTGA;SOR=0.675;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=313;TCF=173;TCR=140;TR=178;WE=74759309;WS=74759291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,192:0.57:338
chr14	74759477	rs4148077	C	T	3497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.331;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=70;PP=2170;ReadPosRankSum=-0.655;SC=CTAAGCTCTGCGGGACTCAGG;SOR=0.618;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=284;TCF=143;TCR=141;TR=144;WE=74759485;WS=74759467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,161:0.51:314
chr14	74766352	rs2301345	A	G	1133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.404;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=26;PP=747;ReadPosRankSum=-0.255;SC=CTGGGGATCAAGCCAACCTGG;SOR=0.500;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=100;TCF=47;TCR=53;TR=49;WE=74766360;WS=74766342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,53:0.47:113
chr14	74767128	rs7158118	G	A	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.629;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=159;ReadPosRankSum=2.126;SC=AACAGACCACGGATACAAAGG;SOR=1.880;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=9;WE=74767136;WS=74767118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr14	74874540	rs11621669	A	G	948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.746;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=18;PP=661;ReadPosRankSum=0.189;SC=CCTGGGCCCCAGGTGCTCTTA;SOR=0.595;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=103;TCF=63;TCR=40;TR=45;WE=74874548;WS=74874530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,47:0.45:105
chr14	74874707	rs2884545	A	G	1961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.509;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=43;PP=1102;ReadPosRankSum=0.284;SC=AAAACAGTGGAGTTTGGTGAC;SOR=0.650;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=189;TCF=92;TCR=97;TR=86;WE=74874715;WS=74874697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,97:0.47:205
chr14	74876181	rs12590672	T	G	1869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.532;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=41;PP=1142;ReadPosRankSum=0.236;SC=CTGTGAAGCTTGTCTCACAGC;SOR=0.621;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=169;TCF=79;TCR=90;TR=76;WE=74876189;WS=74876171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,90:0.47:193
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chr14	74973579	rs45537036	T	C	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=3.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.04;MQRankSum=-3.159;QD=12.26;ReadPosRankSum=1.318;SOR=0.238;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,18:0.37:49
chr14	74973581	rs60130392	T	C	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=5.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.10;MQRankSum=-3.290;QD=12.78;ReadPosRankSum=0.975;SOR=0.183;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,18:0.38:47
chr14	74973583	.	C	CGT,CGCGCGCAT	1514.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=62.17;QD=36.94;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,22,19:0.54,0.46:41
chr14	74976986	rs7160756	A	G	1947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=52;PP=1545;SC=GGCAGGCTCCAAGCATCTCAG;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=16;TCR=52;TR=68;WE=74976994;WS=74976976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr14	74983491	rs147745131	GT	G	1489.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.921;HP=3;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQ=60.13;MQRankSum=1.074;NF=12;NR=11;PP=1525;ReadPosRankSum=-0.173;SC=GGGTGGTGGGGTGGCAGGGCG;SOR=0.478;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=53;TCF=30;TCR=23;TR=23;WE=74983503;WS=74983481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,39:0.48:82
chr14	74983495	rs63395061	C	G	1489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.859;HP=2;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=1.118;NF=25;NR=11;PP=1517;ReadPosRankSum=0.847;SC=GGTGGGGTGGCAGGGCGCTTC;SOR=0.541;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=58;TCR=25;TR=36;WE=74983503;WS=74983481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,40:0.45:88
chr14	74983841	rs2302114	C	T	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.132;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=166;ReadPosRankSum=-0.436;SC=TAGCTCAGGCCCCTGATAAAC;SOR=2.147;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=9;WE=74983849;WS=74983831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr14	74989433	rs699371	T	C	1179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=7;PP=754;SC=ACTCGGCCTCTTAGCCCCTGC;SOR=2.247;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=38;WE=74989441;WS=74989423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr14	74991855	rs862031	A	G	6180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=127;NR=91;PP=2965;SC=CCAGCACATCAGTGGAGGGGG;SOR=0.876;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=218;TCF=127;TCR=91;TR=218;WE=74991863;WS=74991845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr14	74991959	rs862030	T	C	1023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.454;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=28;PP=492;ReadPosRankSum=-1.433;SC=GAGGTGGGGTTGTGGCCCCTT;SOR=0.477;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=115;TCF=45;TCR=70;TR=48;WE=74991967;WS=74991949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,54:0.44:124
chr14	74992800	rs699374	A	G	818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.793;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=18;PP=399;ReadPosRankSum=-0.936;SC=CAGGTGCATGAGTGACACTGG;SOR=0.812;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=77;TCF=33;TCR=44;TR=31;WE=74992808;WS=74992790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,40:0.41:98
chr14	74992861	rs699375	A	C	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=171;ReadPosRankSum=-0.398;SC=CCTCTGCCGTACCTGTGATGT;SOR=0.976;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=11;WE=74992869;WS=74992851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
chr14	74999108	rs862025	C	T	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=206;ReadPosRankSum=0.256;SC=CCACCCCCACCCCATCCCTGC;SOR=0.821;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=50;TCF=39;TCR=11;TR=16;WE=74999116;WS=74999098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,20:0.36:55
chr14	75002607	rs3742794	G	T	769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.950;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=15;PP=477;ReadPosRankSum=-0.084;SC=CTTGAGCCCAGCCCTGGCCCT;SOR=0.493;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=71;TCF=45;TCR=26;TR=37;WE=75002615;WS=75002597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,39:0.53:73
chr14	75002774	rs4899521	C	T	1001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.786;HP=4;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=22;PP=1114;ReadPosRankSum=-1.536;SC=TGCTGGGAAGCGGGTGCAGTC;SOR=0.461;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=83;TCF=33;TCR=50;TR=40;WE=75002783;WS=75002764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,49:0.54:90
chr14	75002775	rs4899522	G	A	769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.314;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=27;PP=1503;ReadPosRankSum=2.661;SC=GCTGGGAAGCGGGTGCAGTCT;SOR=1.179;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=78;TCF=29;TCR=49;TR=39;WE=75002783;WS=75002764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,37:0.44:85
chr14	75016482	rs2196861	T	C	1524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=17;PP=968;SC=GCCTCTGACATCCTGGAGGGG;SOR=1.453;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=38;TCR=17;TR=55;WE=75016490;WS=75016472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr14	75017650	rs934999	G	C	2262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=18;PP=1498;SC=AAATGGGAGAGTCTGCAGACA;SOR=2.055;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=57;TCR=18;TR=75;WE=75017658;WS=75017640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr14	75019157	rs11622992	T	C	2071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.492;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=56;PP=1042;ReadPosRankSum=0.075;SC=GCTCTGTGGCTGGTGACCACC;SOR=0.741;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=208;TCF=90;TCR=118;TR=99;WE=75019165;WS=75019147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,110:0.49:224
chr14	75070493	rs3742793	G	C	1786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.256;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=51;PP=1381;ReadPosRankSum=-1.804;SC=CCACCTTCTAGAGGCAGGGCC;SOR=0.508;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=141;TCF=46;TCR=95;TR=78;WE=75070501;WS=75070483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,77:0.54:143
chr14	75137664	rs2302832	T	C	2811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=57;PP=1856;SC=ACTCTCCACATTCCCTCTATT;SOR=1.270;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=38;TCR=57;TR=95;WE=75137672;WS=75137654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr14	75139801	rs202071581	G	A	2360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=43;PP=1119;ReadPosRankSum=-0.375;SC=TGCAGGGAGCGGATAAAAGTG;SOR=0.689;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=151;TCF=67;TCR=84;TR=81;WE=75139809;WS=75139791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,107:0.59:182
chr14	75151047	rs9671386	G	A	368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=1;PP=270;SC=AGTTCCTGGAGGGAGTTGAAA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=75151055;WS=75151037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	75182937	rs2287400	G	A	514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=16;PP=401;SC=CACCATAGCAGTGACCATGTT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=75182945;WS=75182927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr14	75199555	.	TA	T	173.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.000;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=4.494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.00;ReadPosRankSum=1.165;SOR=0.500;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,15:0.26:58
chr14	75200697	rs3825708	G	A	7467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=142;NR=111;PP=2965;ReadPosRankSum=0.460;SC=TTCTCAGACTGGTCAGTCGTT;SOR=0.835;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=255;TCF=143;TCR=112;TR=253;WE=75200705;WS=75200687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,285:0.99:287
chr14	75276079	rs957345	C	G	3655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=45;PP=2195;SC=ATTCTGTTCTCTAGCCTCCAG;SOR=1.256;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=126;TCF=80;TCR=46;TR=125;WE=75276087;WS=75276069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr14	75278211	rs12588415	G	A	424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=3;PP=325;SC=AACATTTACTGTGTGGAGTAC;SOR=2.448;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=15;WE=75278219;WS=75278201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	75278302	rs8022046	G	A	3024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=37;PP=1843;SC=TTGCTGAAGCGCTTCCTATTA;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=101;TCF=63;TCR=38;TR=100;WE=75278310;WS=75278292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr14	75279395	rs2302834	T	A	3944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=49;PP=2165;SC=GCCACCAGCCTCCTCCAGCTC;SOR=1.103;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=81;TCR=49;TR=130;WE=75279403;WS=75279385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr14	75282873	rs5809679	AT	A	261.14	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.353;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,18:0.86:21
chr14	75378296	rs3081755	GTGTGTA	G	1846.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.861;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.840;NF=21;NR=12;PP=1797;ReadPosRankSum=-1.192;SC=ATGTGTGTTTGTGTGTATGTG;SOR=2.494;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=43;TCF=25;TCR=18;TR=33;WE=75378309;WS=75378286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,63:0.97:65
chr14	75378331	rs759057	T	C	3500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=36;PP=2110;SC=TGTGTGTGTGTGCATGCATGT;SOR=1.708;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=79;TCR=36;TR=115;WE=75378339;WS=75378321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr14	75386576	rs2286913	G	A	2472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=24;PP=1608;SC=ACTGCTCAGCGGCCGCTGCAG;SOR=1.531;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=60;TCR=24;TR=84;WE=75386584;WS=75386566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr14	75388183	rs7156590	C	T	5688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=110;PP=2965;SC=GGACCGTGCTCGTGAGCAAGG;SOR=1.246;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=182;TCF=72;TCR=110;TR=182;WE=75388191;WS=75388173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr14	75412908	rs8005277	A	G	1900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=24;PP=1239;SC=GGGACCCCGCACACTCACAGG;SOR=1.516;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=72;TCF=47;TCR=25;TR=71;WE=75412916;WS=75412898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr14	75415194	rs2159907	G	C	3530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=77;NR=38;PP=2199;SC=CTACCCACCCGACCCCGGAGA;SOR=1.306;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=116;TCF=77;TCR=39;TR=115;WE=75415202;WS=75415184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr14	75470446	rs175041	C	A	3724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=73;PP=2481;SC=GTCACAGGCACATAAGGGAAC;SOR=1.136;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=53;TCR=73;TR=126;WE=75470454;WS=75470436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr14	75483812	rs13712	T	C	3961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=51;PP=2382;SC=GAGGCATGGATTGCTGCAGGC;SOR=1.088;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=82;TCR=51;TR=133;WE=75483820;WS=75483802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr14	75485406	rs175052	G	A	721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=0;PP=494;SC=GAAACTTCCAGTGCAGATTTT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=75485414;WS=75485396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr14	75485489	rs175053	A	G	3920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=37;PP=2314;SC=AGAAAGAGAAAATAAACTTTG;SOR=1.476;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=120;TCF=83;TCR=37;TR=120;WE=75485497;WS=75485479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr14	75497130	rs175070	C	A	1585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=5;PP=1188;SC=CCTGGCACACCGCAGGTAAAT;SOR=4.133;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=44;TCR=5;TR=48;WE=75497138;WS=75497120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr14	75505008	rs3742780	G	C	8098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.50;SOR=1.347;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr14	75505016	rs175075	A	G	8464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.75;SOR=1.267;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr14	75513883	rs175081	T	C	6987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=115;NR=100;PP=2965;SC=TTCTCTGAGTTAAGGATGTGG;SOR=0.753;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=216;TCF=116;TCR=100;TR=215;WE=75513891;WS=75513873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr14	75528580	rs10129657	G	A	452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=380;SC=CAAGGTGGGCGGATCACCTGA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=75528588;WS=75528570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr14	75535927	rs175499	G	A	1505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=39;PP=786;ReadPosRankSum=1.634;SC=GGCCCGCCCAGCGCAGCCGAG;SOR=0.661;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=133;TCF=55;TCR=78;TR=68;WE=75535935;WS=75535917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,77:0.52:148
chr14	75537381	rs11546525	C	T	3248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.574;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=63;PP=2024;ReadPosRankSum=0.147;SC=AAGACTCTTACGAACAAGGTG;SOR=0.724;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=269;TCF=138;TCR=131;TR=138;WE=75537389;WS=75537371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,151:0.52:291
chr14	75538217	rs3742778	G	T	2791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.413;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=68;PP=1799;ReadPosRankSum=1.155;SC=CAAAATTCAGGTCCATTCCAG;SOR=0.652;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=293;TCF=140;TCR=153;TR=134;WE=75538225;WS=75538207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,139:0.44:314
chr14	75544101	rs12589815	C	T	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.705;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=275;ReadPosRankSum=1.251;SC=AGTCAGTTACCGCTGTTGCTC;SOR=1.292;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=17;WE=75544109;WS=75544091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr14	75544189	rs12589876	G	A	1259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=23;PP=679;ReadPosRankSum=-0.277;SC=ACTCAGGAAGGAGATAGGTGC;SOR=0.748;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=104;TCF=59;TCR=45;TR=54;WE=75544197;WS=75544179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,64:0.52:124
chr14	75551254	rs175487	C	T	2519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=21;PP=1386;SC=GGGGGCTCTACAGGCTCAGGA;SOR=1.661;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=58;TCR=21;TR=79;WE=75551262;WS=75551244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr14	75551442	rs175486	A	C	7972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=121;NR=130;PP=2965;SC=CTAGTCACAGAAGTAGTTCAG;SOR=0.901;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=251;TCF=121;TCR=130;TR=251;WE=75551450;WS=75551432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,294:1.00:294
chr14	75553655	rs175485	T	C	1735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=8;PP=1331;SC=TTCAGTACTTTGTGTTTTGTT;SOR=3.180;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=47;TCR=8;TR=55;WE=75553663;WS=75553645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr14	75572559	rs119077	T	C	434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=0;PP=333;SC=CGGAAATAAATACCTTGATAC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=75572567;WS=75572549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr14	75572824	rs147365841	C	T	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=154;ReadPosRankSum=-0.945;SC=TTTGGGAGGCCGAGGCAGGTG;SOR=0.299;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=10;WE=75572832;WS=75572814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr14	75574087	rs10146482	C	T	3426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.210;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=73;PP=1985;ReadPosRankSum=-0.148;SC=TGACACCTGACGGATAGCTTT;SOR=0.801;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=255;TCF=132;TCR=123;TR=144;WE=75574095;WS=75574077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,159:0.55:288
chr14	75580152	rs175464	G	A	3256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=63;PP=1896;SC=GGAAATGGGCGACATCGGATC;SOR=1.630;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=98;TCF=35;TCR=63;TR=98;WE=75580160;WS=75580142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr14	75587351	rs175454	T	C	1019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.90;SOR=2.517;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr14	75590822	rs8017642	G	A	2863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.627;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=46;PP=1353;ReadPosRankSum=-0.198;SC=TAATGTTGTCGTGCTGCAGCA;SOR=0.624;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=197;TCF=105;TCR=92;TR=106;WE=75590830;WS=75590812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,132:0.56:236
chr14	75590846	rs175449	A	T	1971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.652;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=51;PP=1128;ReadPosRankSum=-0.515;SC=CCAGAATAACAATCTCATTCA;SOR=1.176;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=201;TCF=98;TCR=103;TR=88;WE=75590854;WS=75590836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,99:0.42:236
chr14	75601737	rs12435391	A	G	2174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.866;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=59;PP=1395;ReadPosRankSum=-0.890;SC=CATTGTAAACATAATGAAGTG;SOR=1.078;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=192;TCF=83;TCR=109;TR=97;WE=75601745;WS=75601727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,103:0.50:205
chr14	75601782	rs175444	G	C	1518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.937;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=41;PP=1049;ReadPosRankSum=-0.270;SC=GGCAGGGGAGGTGGGTAAAGG;SOR=0.316;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=127;TCF=45;TCR=82;TR=67;WE=75601790;WS=75601772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,70:0.51:136
chr14	75601862	rs876402	A	G	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.570;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=107;ReadPosRankSum=-0.853;SC=TTTTAAGTTCATTATCCTGGC;SOR=0.180;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=9;WE=75601870;WS=75601852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr14	75605792	rs1047418	A	G	1865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.529;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=38;PP=983;ReadPosRankSum=-0.097;SC=TGGTTCCTCAATTCCCACATT;SOR=0.635;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=172;TCF=87;TCR=85;TR=78;WE=75605800;WS=75605782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,92:0.48:191
chr14	75614504	rs3832966	A	ACCCG	150.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.431;NF=0;NR=4;PP=160;ReadPosRankSum=0.431;SC=TTACCCACCCACCCGCCCGCC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=4;WE=75614512;WS=75614494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr14	75735859	rs4903300	G	A	2253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.104;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=42;PP=1340;ReadPosRankSum=0.069;SC=AGTACTAGTAGCAAAGGAACT;SOR=0.841;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=242;TCF=141;TCR=101;TR=107;WE=75735867;WS=75735849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,114:0.44:261
chr14	75745551	rs2239615	T	A	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.218;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=226;ReadPosRankSum=-2.015;SC=GCAGCGAGCATCTGAGAAGCC;SOR=1.656;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=13;WE=75745559;WS=75745541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr14	75745626	rs7101	C	T	1442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.230;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=20;PP=845;ReadPosRankSum=2.651;SC=CAGCTCTGCTCCACAGCGCCC;SOR=0.961;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=126;TCF=82;TCR=44;TR=64;WE=75745634;WS=75745616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,69:0.50:138
chr14	75745894	rs4645853	G	A	476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.741;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=328;ReadPosRankSum=0.658;SC=CACCGGGCGGGACGCTCCAGT;SOR=0.260;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=18;WE=75745902;WS=75745884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
chr14	75746690	rs1046117	C	T	2132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.398;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=38;PP=1249;ReadPosRankSum=0.266;SC=TCGTCTCCTCCGTGGCCCCAT;SOR=0.891;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=187;TCF=105;TCR=82;TR=91;WE=75746698;WS=75746680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,99:0.48:205
chr14	75746869	rs4645855	G	A	1591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.757;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=42;PP=953;ReadPosRankSum=0.566;SC=GGAATGTGGGGGCTGGGTGGG;SOR=1.000;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=157;TCF=61;TCR=96;TR=66;WE=75746877;WS=75746859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,73:0.44:167
chr14	75747258	rs4645856	T	C	1771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=27;PP=997;ReadPosRankSum=0.066;SC=TTGTGATTATTCTAGTTATCT;SOR=0.714;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=149;TCF=91;TCR=58;TR=71;WE=75747266;WS=75747248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,84:0.50:167
chr14	75747407	rs3216792	AG	A	3618.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.428;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.679;NF=21;NR=48;PP=2124;ReadPosRankSum=1.151;SC=TTAAAACTTAAGGGGAAAGTT;SOR=0.739;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=168;TCF=48;TCR=120;TR=69;WE=75747415;WS=75747397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,133:0.46:289
chr14	75758770	rs3742770	G	A	3836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=82;NR=53;PP=2341;SC=GAACCACTCCGGCTCTGGCCA;SOR=1.058;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=135;TCF=82;TCR=53;TR=135;WE=75758778;WS=75758760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr14	75758885	rs3742769	A	G	5997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;PP=2965;SC=AAGTTTGAGCATCCCTTGCTC;SOR=0.774;Source=Platypus;TCF=107;WE=75758893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr14	75759060	rs3742768	C	T	6000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=106;NR=107;PP=2965;SC=ATTATCCATACGGGCCTGCTG;SOR=0.822;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=213;TCF=106;TCR=107;TR=213;WE=75759068;WS=75759050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr14	75760855	rs3742767	G	C	8675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=170;NR=127;PP=2965;SC=TTGCTCCAGGGCAGGTCGCAG;SOR=0.997;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=297;TCF=170;TCR=127;TR=297;WE=75760863;WS=75760845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,328:1.00:328
chr14	75904660	rs3625	A	G	864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.781;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=11;PP=398;ReadPosRankSum=-1.945;SC=TTCGGTGACCACAGGCTCCCT;SOR=0.819;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=87;TCF=57;TCR=30;TR=37;WE=75904668;WS=75904650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,46:0.46:99
chr14	75904929	rs145288830	G	A	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=185;ReadPosRankSum=1.292;SC=AGTATCATCCGTACCACCCTG;SOR=1.314;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=10;WE=75904937;WS=75904919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
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chr14	76045220	rs11845734	T	C	1083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=9;PP=816;ReadPosRankSum=-1.485;SC=AATAGGCAAGTGTCCTTTCAA;SOR=0.738;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=91;TCR=21;TR=47;WE=76045228;WS=76045210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,47:0.41:116
chr14	76045362	rs2287015	T	C	4710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=506;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=111;PP=2464;ReadPosRankSum=-0.248;SC=GACACCCCTGTGCCGGAGTCC;SOR=0.656;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=464;TCF=221;TCR=243;TR=215;WE=76045370;WS=76045352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:267,237:0.47:504
chr14	76045858	rs2287016	G	A	1933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.784;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=33;PP=1215;ReadPosRankSum=0.409;SC=CGGTCACCGTGGTGGGCCAGC;SOR=0.555;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=177;TCF=107;TCR=70;TR=81;WE=76045866;WS=76045848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,92:0.47:195
chr14	76045963	rs2287017	C	G	3274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.816;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=81;PP=2189;ReadPosRankSum=1.689;SC=CAGCCTGCTCCGTGGCTGTCT;SOR=0.592;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=303;TCF=141;TCR=162;TR=154;WE=76045971;WS=76045953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,162:0.50:327
chr14	76046104	rs2287018	A	G	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=269;ReadPosRankSum=-0.218;SC=GGGTGACAGTAACTGGGTGTG;SOR=1.127;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=12;WE=76046112;WS=76046094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr14	76072028	rs4903337	T	C	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.368;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=20;PP=509;ReadPosRankSum=1.011;SC=TCCGGAGCCTTAGGAGGGAGG;SOR=1.207;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=42;TCF=10;TCR=32;TR=24;WE=76072036;WS=76072018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,25:0.54:46
chr14	76129287	rs2302592	C	G	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=5.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.180;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=3;PP=684;ReadPosRankSum=-1.060;SC=AGGTTGAGCACTGTTTAGGAA;SOR=1.919;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=64;TCF=54;TCR=10;TR=32;WE=76129295;WS=76129277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,32:0.48:67
chr14	76156609	rs2303345	C	T	4264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=491;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.733;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=103;PP=2599;ReadPosRankSum=-2.262;SC=GGATTCAAGGCTTTTCACATC;SOR=0.652;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=454;TCF=235;TCR=219;TR=207;WE=76156617;WS=76156599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:263,226:0.46:489
chr14	76173481	rs117908324	T	A	2498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-3.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.702;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=66;PP=1440;ReadPosRankSum=-1.412;SC=TTTGCTCAACTTTTTAAGCTT;SOR=0.502;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=217;TCF=82;TCR=135;TR=112;WE=76173489;WS=76173471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,122:0.51:239
chr14	76173860	rs1005224	T	A	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=173;ReadPosRankSum=1.576;SC=TCATGTGGAGTGTAGGAATGT;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=9;WE=76173868;WS=76173859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr14	76175565	rs1981898	C	A	976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.694;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=29;PP=606;ReadPosRankSum=0.494;SC=TAAAAGAAGGCTACCTATTTA;SOR=0.765;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=113;TCF=44;TCR=69;TR=47;WE=76175573;WS=76175555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,50:0.40:124
chr14	76175594	rs1981899	G	A	729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=22;PP=507;ReadPosRankSum=-2.289;SC=TGCTTTGACAGATATTATTGT;SOR=0.732;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=23;TCR=52;TR=32;WE=76175602;WS=76175584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,34:0.41:83
chr14	76198818	rs5809726	CT	C	641.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.116;SOR=0.548;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,34:0.55:62
chr14	76201482	rs2288141	G	T	5070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=109;NR=71;PP=2965;SC=GGTGCAGCCAGACCTGCTAAT;SOR=1.197;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=180;TCF=109;TCR=71;TR=180;WE=76201490;WS=76201472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr14	76203747	rs967889	A	T	841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=0;PP=569;SC=GTGTGAAAGAAAATAAATGTT;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=76203755;WS=76203738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr14	76224153	rs2113577	T	A	6997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=135;NR=103;PP=2965;SC=TCTAACCCGGTTGTCCTTTCT;SOR=0.837;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=238;TCF=135;TCR=103;TR=238;WE=76224161;WS=76224143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr14	76232398	rs2359870	T	C	1713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=18;PP=1143;SC=TGATTCTTCGTATTTAGTGAT;SOR=1.292;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=57;TCF=39;TCR=18;TR=56;WE=76232406;WS=76232388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr14	76242089	rs1035614	A	T	869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=20;PP=553;SC=CTCTGGCATCACCATCCCTTA;SOR=2.910;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=76242097;WS=76242079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr14	76287061	rs12206	T	C	3229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=52;NR=65;PP=1662;SC=ACGTAGCTTCTGGCAATAATG;SOR=1.224;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=118;TCF=52;TCR=66;TR=117;WE=76287069;WS=76287051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr14	76352929	rs1882827	C	T	553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=0;PP=466;SC=AGCTAAATCTCATTTGTCAGT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=76352937;WS=76352922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr14	76368544	rs1133834	T	C	4773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=73;PP=2835;SC=CCTGCAGCCTTTGTGCCCATC;SOR=0.716;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=156;TCF=83;TCR=73;TR=156;WE=76368552;WS=76368534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr14	76368592	.	A	C	1469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=0.000;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.650;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=32;PP=885;ReadPosRankSum=0.153;SC=GCTCTTCTGCAACTGGATAGA;SOR=0.624;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=115;TCF=51;TCR=64;TR=59;WE=76368600;WS=76368582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,67:0.51:132
chr14	76432136	rs3917187	T	C	1740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=47;PP=1240;ReadPosRankSum=-0.377;SC=TCTGCTCCTATAGGGACTCAT;SOR=0.628;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=30;TCR=78;TR=65;WE=76432144;WS=76432126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,69:0.57:122
chr14	76488551	rs2058941	A	G	398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=12;NR=3;PP=302;SC=CTGAGGTCGCACCACTGCACT;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=76488559;WS=76488541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	76524970	rs59989662	CT	C	583.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=7.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.20;MQRankSum=0.857;QD=11.67;ReadPosRankSum=0.119;SOR=0.165;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,30:0.60:50
chr14	76525515	rs2302856	A	C	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=118;ReadPosRankSum=1.676;SC=CGGCACACCCAGTGGCCTAAT;SOR=0.368;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=7;WE=76525523;WS=76525505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr14	76525553	rs2302857	A	G	610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.447;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=440;ReadPosRankSum=-0.243;SC=ACAGAGAAAAACAGGTTCAGG;SOR=1.079;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=63;TCF=49;TCR=14;TR=24;WE=76525561;WS=76525543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,27:0.39:70
chr14	76542856	rs7140892	A	G	881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.794;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=11;PP=520;ReadPosRankSum=0.260;SC=AGTTAGATTTATACTCCAGGT;SOR=0.496;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=88;TCF=64;TCR=24;TR=38;WE=76542864;WS=76542846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,42:0.43:98
chr14	76543004	rs17783366	G	A	2239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.425;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=59;PP=1355;ReadPosRankSum=-1.464;SC=GCATCACAGAGATTTGGGGCT;SOR=0.740;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=280;TCF=133;TCR=147;TR=110;WE=76543012;WS=76542994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:189,121:0.39:310
chr14	76548783	rs137916626	GGACCTT	G	2362.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.298;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.420;NF=3;NR=30;PP=1612;ReadPosRankSum=0.676;SC=CATCTATAGTGGACCTTGATG;SOR=1.019;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=72;TCF=9;TCR=63;TR=33;WE=76548796;WS=76548773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,62:0.50:123
chr14	76549377	rs7161722	G	A	354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=265;SC=CCCAGCATGTGGGAAGCATAG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=76549385;WS=76549367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr14	76549752	rs8536	G	A	902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=15;PP=607;ReadPosRankSum=0.753;SC=AGCTACAGTTGAGGGAAAAGG;SOR=0.685;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=47;TCR=31;TR=37;WS=76549742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,41:0.47:87
chr14	76619167	rs3813547	A	C	1873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=50;PP=1576;SC=CTGAGTTTTTAAAGCAGTAAT;SOR=4.332;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=5;TCR=50;TR=55;WE=76619175;WS=76619157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr14	76638466	rs3783997	A	G	1713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=42;PP=1153;SC=CACATTAACTATCTGAATTTT;SOR=1.926;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=16;TCR=42;TR=58;WE=76638474;WS=76638456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr14	76643157	rs17104191	G	A	707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=23;PP=468;ReadPosRankSum=0.602;SC=AGATTTGTACGTTGTAACAGT;SOR=0.578;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=52;TCF=10;TCR=42;TR=29;WE=76643165;WS=76643147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,31:0.56:55
chr14	76644623	rs2121069	G	A	6083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=114;NR=92;PP=2965;SC=AGAATCCTGCGTTGAGAAGTA;SOR=0.784;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=206;TCF=114;TCR=92;TR=206;WE=76644631;WS=76644613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr14	76662446	rs1900127	C	T	1256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=26;PP=778;SC=CATGGGAAAACTGAGACTACA;SOR=1.714;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=14;TCR=26;TR=40;WE=76662454;WS=76662436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr14	76906157	rs12432875	T	C	1191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=12;NR=32;PP=779;SC=CCTGCGGGTCTGGCAGAAGCC;SOR=2.059;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=12;TCR=32;TR=44;WE=76906165;WS=76906147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr14	76957887	rs2361293	T	C	1925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=29;PP=1221;SC=CGCTGCCCTATGACGACAAGC;SOR=1.002;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=41;TCR=29;TR=70;WE=76957895;WS=76957877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr14	77229539	rs2270324	G	A	1990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=36;PP=1137;SC=GGCCAAGAGTGAAGCCACACT;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=22;TCR=36;TR=58;WE=77229547;WS=77229529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr14	77279064	rs8008004	A	G	3350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=35;PP=1910;SC=CGCAGAGGCGAGCCCTGGCCG;SOR=1.207;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=69;TCR=35;TR=104;WE=77279072;WS=77279054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr14	77302384	rs17736283	C	T	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.55;ReadPosRankSum=-1.036;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr14	77302449	rs3742752	A	G	579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=17;NR=4;PP=450;SC=CCTAGCCTGCATCTCCACGCC;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=21;WE=77302457;WS=77302439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr14	77305833	rs12893724	C	T	658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=20;PP=541;SC=AATTATATTACCTCAGATGGT;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=77305841;WS=77305823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr14	77311296	rs12896621	A	G	3262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=66;PP=2009;SC=GGGAAGAATCACTTGGCAGAG;SOR=1.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=34;TCR=66;TR=100;WE=77311304;WS=77311286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr14	77311445	rs11620630	T	C	198.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=6;PP=150;SC=GGCAGAAGGATTGCTTGAGCC;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=77311453;WS=77311435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr14	77319773	rs372697027	GGTGTGT	G	218.94	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.157;NF=0;NR=9;PP=289;ReadPosRankSum=0.489;SC=AGCTGGAAAGGGTGTGTGTGT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=9;WE=77319786;WS=77319763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,7:0.88:8
chr14	77332367	rs1882844	C	T	4466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=59;PP=2481;SC=GCTTGAACCCCACTGGGACAA;SOR=0.948;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=88;TCR=59;TR=147;WE=77332375;WS=77332357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr14	77336428	rs11625243	G	A	1723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.239;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=34;PP=848;ReadPosRankSum=0.659;SC=CCATGAGGCTGTACGGGTGCT;SOR=0.566;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=143;TCF=73;TCR=70;TR=75;WE=77336436;WS=77336418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,86:0.53:161
chr14	77492891	rs879027	G	A	5785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=2.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=504;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.911;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=109;NR=122;PP=2962;ReadPosRankSum=0.476;SC=GCTTCAATTCGTAGTCCATGC;SOR=0.704;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=444;TCF=223;TCR=221;TR=231;WE=77492899;WS=77492881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:234,269:0.53:503
chr14	77493761	.	TTGCTGC	T	581	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MMLQ=27;MQ=59.72;NF=3;NR=6;PP=581;QD=65.2222222222;SC=TGAGCTGTTGTTGCTGCTGCT;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=9;WE=77493774;WS=77493751;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:11,9:0.45:20
chr14	77493788	rs28692724	C	T	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.216;HP=1;HapScore=3;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=9;PP=313;ReadPosRankSum=0.245;SC=GCTGCTGCTGCTGCTGTTGCT;SOR=0.273;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=22;TCF=12;TCR=10;TR=18;WE=77493801;WS=77493778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
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chr14	77493875	rs71428775	T	C	597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.912;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=3;PP=498;ReadPosRankSum=-0.833;SC=CCGCCGCCGCTTCCTTAGCCG;SOR=1.934;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=49;TCF=39;TCR=10;TR=25;WE=77493883;WS=77493865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,25:0.42:60
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chr14	77737088	rs4903565	G	A	699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.21;ReadPosRankSum=1.259;SOR=0.633;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,38:0.39:97
chr14	77745193	rs3209079	A	C	2407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=48;PP=1550;ReadPosRankSum=-1.050;SC=CGCCTCCTCGAAGCAGGACCT;SOR=0.660;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=205;TCF=111;TCR=94;TR=103;WE=77745201;WS=77745183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,114:0.50:230
chr14	77746812	rs4540995	T	C	2743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.895;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=58;PP=1340;ReadPosRankSum=-1.851;SC=TTCCCCTGCATGAAGGTAGCA;SOR=0.629;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=257;TCF=135;TCR=122;TR=121;WE=77746820;WS=77746802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,138:0.48:287
chr14	77750057	rs2216089	T	G	792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.549;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=3;PP=526;ReadPosRankSum=-2.034;SC=AATGGATCTGTAGCATGGCAT;SOR=1.536;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=54;TCF=45;TCR=9;TR=28;WE=77750065;WS=77750047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,32:0.52:61
chr14	77751925	rs2270419	C	T	2713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=54;PP=1580;ReadPosRankSum=-0.157;SC=TTCCAAATTTCCTGTTTACGA;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=274;TCF=148;TCR=126;TR=116;WE=77751933;WS=77751915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:180,135:0.43:315
chr14	77755221	rs2287387	T	G	2170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.633;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=54;PP=1355;ReadPosRankSum=1.681;SC=CTCACCAGGCTAGTATTAATC;SOR=0.839;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=204;TCF=95;TCR=109;TR=98;WE=77755229;WS=77755211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,108:0.48:223
chr14	77762342	rs67600987	G	A	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.627;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=313;ReadPosRankSum=0.458;SC=CACCTATGCTGATGCCTAGAG;SOR=1.578;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=19;WE=77762350;WS=77762332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr14	77772829	rs66502123	A	G	1460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=32;PP=820;ReadPosRankSum=-0.080;SC=CCTTTGGGAGAAGATTCCTCT;SOR=0.669;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=108;TCF=45;TCR=63;TR=54;WE=77772837;WS=77772819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,65:0.50:131
chr14	77787759	rs8177539	G	A	1333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=22;PP=845;ReadPosRankSum=-1.462;SC=GTAGCAGGGTGGAGTCGCTGT;SOR=0.720;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=111;TCF=71;TCR=40;TR=56;WE=77787767;WS=77787749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,62:0.50:123
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chr14	77795311	rs5809824	CT	C	331.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.693;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.415;NF=4;NR=3;PP=143;ReadPosRankSum=-1.404;SC=CCTCAGGGCCCTTGGTTGAAG;SOR=0.126;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=7;WE=77795319;WS=77795301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,14:0.35:40
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chr14	77843814	rs11844594	T	C	2812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=57;NR=39;PP=1491;SC=GATGGAGAGCTGGAGCCTGAG;SOR=0.872;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=57;TCR=39;TR=96;WE=77843822;WS=77843804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr14	77843971	rs45540040	C	T	2649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.928;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.960;NF=68;NR=45;PP=1444;ReadPosRankSum=0.127;SC=GGGAGCCAGACAGTGCTAAGA;SOR=0.756;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=243;TCF=141;TCR=102;TR=113;WE=77843979;WS=77843961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,131:0.48:271
chr14	77844265	rs45527334	G	A	2883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.564;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=60;PP=1730;ReadPosRankSum=-1.434;SC=CGGAAACCATGTCTGAGGTTT;SOR=0.507;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=212;TCF=103;TCR=109;TR=119;WE=77844273;WS=77844255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,132:0.54:243
chr14	77844592	rs10133824	T	A	1459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.646;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=30;PP=854;ReadPosRankSum=1.418;SC=AGGAGGCAGGTCTAGAGCCTC;SOR=0.818;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=122;TCF=61;TCR=61;TR=59;WE=77844600;WS=77844582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,66:0.50:132
chr14	77844869	rs4903576	A	G	9032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=164;NR=133;PP=2965;SC=GTCAAATGAGAAAAAAAATCC;SOR=0.946;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=298;TCF=164;TCR=134;TR=297;WE=77844877;WS=77844859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,325:1.00:325
chr14	77845121	rs2193595	A	G	5687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=98;PP=2965;SC=ACTAAGTGACAAATTTAGAAA;SOR=0.854;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=189;TCF=90;TCR=99;TR=188;WE=77845129;WS=77845111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr14	77872509	rs13379432	T	G	1073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=28;PP=714;ReadPosRankSum=0.199;SC=AAATACCAGTTAGCACCACCA;SOR=0.688;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=99;TCF=42;TCR=57;TR=47;WE=77872517;WS=77872499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,51:0.48:107
chr14	77872979	rs45557839	G	C	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.343;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=131;ReadPosRankSum=-1.661;SC=CACACACACAGAGAGAGAGAG;SOR=1.739;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=9;WE=77872987;WS=77872969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr14	77880305	rs10130481	C	T	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=67;ReadPosRankSum=-2.003;SC=GAGTGGAGATCCGCAGGCTTT;SOR=0.527;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=7;WE=77880313;WS=77880295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr14	77889040	rs8017215	T	C	1629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=23;PP=1049;ReadPosRankSum=1.660;SC=AGCAGTGAGATTCTTGTCCAT;SOR=0.750;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=135;TCF=90;TCR=45;TR=67;WE=77889048;WS=77889030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,77:0.50:154
chr14	77900165	rs34835605	C	T	1429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=32;PP=793;ReadPosRankSum=1.713;SC=GCCTCAGCAGCACAGGGGCAG;SOR=0.658;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=160;TCF=87;TCR=73;TR=70;WE=77900173;WS=77900155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,77:0.44:174
chr14	77900490	rs67370165	T	G	1150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.107;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=13;PP=711;ReadPosRankSum=-1.086;SC=ACTCATTCCTTTCCACCTTTA;SOR=0.421;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=78;TCF=57;TCR=21;TR=43;WE=77900498;WS=77900480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,48:0.55:87
chr14	77902418	rs2063997	A	G	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.324;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=29;PP=606;ReadPosRankSum=-1.087;SC=AAGACATCGCATGAATGGCGT;SOR=1.035;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=78;TCF=15;TCR=63;TR=35;WE=77902426;WS=77902408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,35:0.44:79
chr14	77914674	rs10483882	T	C	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.571;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=345;ReadPosRankSum=-1.309;SC=GCAACAGTAATGGAGAATCAG;SOR=0.269;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=57;TCF=45;TCR=12;TR=26;WE=77914682;WS=77914664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,26:0.46:57
chr14	77916205	rs760252	T	C	847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.946;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=21;PP=502;ReadPosRankSum=1.367;SC=TATAGGAACTTAAGGCTTAAA;SOR=0.920;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=23;TCR=49;TR=31;WE=77916213;WS=77916195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,37:0.47:78
chr14	77917412	rs11159260	A	G	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.25;ReadPosRankSum=1.204;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr14	77919587	rs2364158	T	C	6767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=136;NR=85;PP=2965;SC=GTAGAGCCTTTATCAGTGATA;SOR=1.222;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=222;TCF=137;TCR=85;TR=221;WE=77919595;WS=77919577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr14	77923783	rs11845345	C	T	2436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.499;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=58;PP=1465;ReadPosRankSum=-1.625;SC=GATCAAGATGCGGAGAGGCTG;SOR=0.747;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=197;TCF=93;TCR=104;TR=108;WE=77923791;WS=77923773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,117:0.54:216
chr14	77928525	rs1061638	A	G	2541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.860;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=50;PP=1435;ReadPosRankSum=0.898;SC=CAGGAGTACAATACAAAGGAC;SOR=0.608;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=192;TCF=107;TCR=85;TR=105;WE=77928533;WS=77928515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,118:0.55:215
chr14	77930752	rs11624314	G	A	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=163;ReadPosRankSum=0.360;SC=TGAACATACTGTATTCTATAG;SOR=0.693;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=11;WE=77930760;WS=77930742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr14	77930878	rs17751319	A	G	1845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.384;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=32;PP=1157;ReadPosRankSum=0.272;SC=TCAAGCTGTAATGAAACTCCA;SOR=0.972;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=164;TCF=92;TCR=72;TR=79;WE=77930886;WS=77930868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,87:0.48:183
chr14	77934601	rs3842329	CTA	C	1847.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=24;PP=1075;ReadPosRankSum=1.150;SC=TTTCTGAACTCTATAGGTAAA;SOR=0.728;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=49;TCF=3;TCR=46;TR=26;WE=77934610;WS=77934591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,47:0.62:76
chr14	77942316	rs3742732	G	A	1982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.227;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=34;PP=1195;ReadPosRankSum=2.455;SC=CCTGGTGCTCGTCCTGTAGGC;SOR=0.584;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=149;TCF=92;TCR=57;TR=81;WE=77942324;WS=77942306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,92:0.55:168
chr14	77942506	rs3742731	C	T	1231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.008;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=36;PP=862;ReadPosRankSum=-0.047;SC=GAGCCAGGCCCGTGTGGGGCG;SOR=0.946;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=134;TCF=57;TCR=77;TR=58;WE=77942514;WS=77942496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,61:0.43:143
chr14	77942578	rs3742729	G	A	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=174;ReadPosRankSum=0.473;SC=GTGCAAAGGCGTGGCTTGGTA;SOR=0.540;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=12;WE=77942586;WS=77942568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr14	77948566	rs8010861	A	G	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.319;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=232;ReadPosRankSum=-1.310;SC=GGCTTCCTCAATGGTCTTGCC;SOR=0.257;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=13;WE=77948574;WS=77948556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr14	77950585	rs73316987	A	G	1450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=5;PP=1012;SC=AATCCAGGATATAGGGTATCC;SOR=3.516;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=34;TCR=5;TR=39;WE=77950593;WS=77950575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr14	77951365	rs111368901	G	A	569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.875;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=17;PP=362;ReadPosRankSum=0.901;SC=GGTCTGACCGGGTCATAAACT;SOR=0.509;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=83;TCF=33;TCR=50;TR=30;WE=77951373;WS=77951355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,31:0.36:85
chr14	77964661	rs12434449	T	C	2700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=56;PP=1570;ReadPosRankSum=-0.789;SC=AGCGCGCACCTGGAAAGGGGG;SOR=0.720;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=218;TCF=119;TCR=99;TR=122;WE=77964669;WS=77964651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,127:0.55:231
chr14	77965094	rs12431905	G	A	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.84;ReadPosRankSum=2.088;SOR=0.587;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,21:0.46:46
chr14	77978621	rs73319080	A	C	432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.479;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=200;ReadPosRankSum=0.009;SC=GGAGCACCAAAAAGGCTCAGT;SOR=0.407;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=53;TCF=43;TCR=10;TR=18;WE=77978629;WS=77978611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,23:0.38:61
chr14	77984500	.	G	A	1405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=0.000;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.234;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=32;PP=773;ReadPosRankSum=2.392;SC=AGCATCTCCCGTCCAAAGGCG;SOR=0.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=139;TCF=68;TCR=71;TR=61;WE=77984508;WS=77984490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,71:0.44:161
chr14	77984573	rs926114	C	T	3081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=44;NR=57;PP=1821;SC=TACAGAGGACCTGCTGTCCTC;SOR=1.074;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=101;TCF=44;TCR=57;TR=101;WE=77984581;WS=77984563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr14	77987958	rs2072672	C	A	1654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=39;PP=1144;SC=ACAAAATAATCCTAAGTAAAA;SOR=2.001;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=15;TCR=39;TR=54;WE=77987966;WS=77987948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr14	78002223	rs28628767	G	A	1283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.085;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=25;PP=678;ReadPosRankSum=-0.737;SC=TGGAGAAGTAGACAGGTTCAA;SOR=0.291;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=129;TCF=79;TCR=50;TR=52;WE=78002231;WS=78002213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,65:0.45:144
chr14	78018614	rs2178876	C	T	1140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=28;PP=740;SC=TTGCATTCACCGGCAATGTCA;SOR=2.476;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=36;WE=78018622;WS=78018604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr14	78021952	rs79502009	G	A	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.935;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=190;ReadPosRankSum=1.916;SC=TTATTATTGAGTTTACTGCTT;SOR=1.639;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=11;WE=78021960;WS=78021942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr14	78028705	rs45613436	C	T	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=336;ReadPosRankSum=1.309;SC=AATAGCAAAACCAAGGCCAGC;SOR=0.641;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=51;TCF=36;TCR=15;TR=26;WE=78028713;WS=78028695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,28:0.52:54
chr14	78028803	rs2364602	A	G	1992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.215;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=34;PP=1328;ReadPosRankSum=0.412;SC=GTGATGCATGATTCAGTTCAT;SOR=0.938;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=188;TCF=113;TCR=75;TR=89;WE=78028811;WS=78028793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,95:0.47:203
chr14	78036658	rs76545605	C	G	656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=4;PP=472;ReadPosRankSum=-1.594;SC=TTTTAGCTCACTCTGACTGCT;SOR=0.651;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=62;TCF=50;TCR=12;TR=26;WE=78036666;WS=78036648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,29:0.43:67
chr14	78036935	rs4903606	A	G	603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.847;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=405;ReadPosRankSum=0.912;SC=AAATCATAGTATATGTGTTGT;SOR=1.270;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=43;TCF=5;TCR=38;TR=22;WE=78036943;WS=78036925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,25:0.53:47
chr14	78063440	rs12435993	A	C	714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=0;PP=658;SC=ATGTGTACCCAAATTTCTGAG;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=78063448;WS=78063430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr14	78063823	rs34670650	AT	A	518.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=473;SC=TACCTTAAGAATTTTCTAAGT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=13;WE=78063831;WS=78063813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr14	78170896	rs8021036	C	G	1936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=47;PP=1416;SC=AACCTCCAAACACATTTCTTG;SOR=2.566;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=61;TCF=14;TCR=47;TR=60;WE=78170904;WS=78170886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr14	78174473	rs11159286	A	C	4349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=62;PP=2396;SC=CTCAGCAGCGAGAGGTGCTGC;SOR=0.964;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=151;TCF=89;TCR=62;TR=151;WE=78174481;WS=78174463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr14	78176851	rs1076496	A	G	3415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=35;PP=2005;SC=ACCGGGAAACACACTGGATTG;SOR=1.501;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=74;TCR=35;TR=109;WE=78176859;WS=78176841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr14	78183706	rs176959	C	T	777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=0;PP=597;SC=GAGGAGAAAACGAAAGAACAA;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=78183714;WS=78183697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr14	78184566	rs176960	C	A	6411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=109;NR=89;PP=2965;SC=CCTCAAACTGCACTGGTCCTT;SOR=0.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=198;TCF=109;TCR=89;TR=198;WE=78184574;WS=78184556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr14	78187316	rs176965	A	C	483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=14;PP=399;SC=GATGATACATAATCAAGCTGG;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=78187324;WS=78187306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	78197365	rs114763	C	T	2223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=9;PP=1677;SC=CAGCTCTTCTCTCCCTGGCTT;SOR=3.489;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=58;TCR=9;TR=67;WE=78197373;WS=78197355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr14	78199019	rs12587825	T	A	2729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=66;PP=1849;SC=TTAATTTTATTTTTTTCGAGC;SOR=2.030;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=27;TCR=66;TR=93;WE=78199027;WS=78199009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr14	78200392	rs10134425	G	T	2105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=44;PP=1227;SC=TGTTTAGGGTGAGTATATAAA;SOR=1.264;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=30;TCR=44;TR=74;WE=78200400;WS=78200382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr14	78226850	rs1477264	G	A	1700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=12;PP=1184;SC=AAGGTAACCGGAAACAGCAAA;SOR=2.468;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=43;TCR=12;TR=55;WE=78226858;WS=78226840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr14	78285461	rs3214433	GT	G	4136.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=67;PP=2886;SC=GCTACGGTAGGTTTTTCCCTT;SOR=0.985;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=81;TCF=12;TCR=69;TR=79;WE=78285469;WS=78285451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr14	78325698	rs7149884	C	T	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=16;PP=340;ReadPosRankSum=-0.147;SC=CTTGCAGCCTCGACCAGGGTG;SOR=0.597;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=53;TCF=18;TCR=35;TR=24;WE=78325706;WS=78325688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,24:0.43:56
chr14	78353259	.	AC	A	385.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.57;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr14	78353261	.	ACACACACACAC	A	356.19	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;ClippingRankSum=0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.68;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr14	78353368	rs17826188	T	C	1152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.555;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=20;PP=766;ReadPosRankSum=-0.690;SC=CTGGCCCATCTTCCTGGCTCC;SOR=0.401;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=109;TCF=75;TCR=34;TR=52;WE=78353376;WS=78353358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,53:0.44:120
chr14	78365612	rs2287650	C	T	1729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=39;PP=952;ReadPosRankSum=-0.338;SC=GTAGGTGGGACGATGCAATGC;SOR=0.717;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=156;TCF=79;TCR=77;TR=79;WE=78365620;WS=78365602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,88:0.50:177
chr14	78366933	rs3837641	G	GAAC	6159.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.51;BaseQRankSum=0.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=373;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.401;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.079;NF=25;NR=44;PP=2414;ReadPosRankSum=-1.404;SC=GCGTCTCAAGGAACAACAACA;SOR=0.656;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=194;TCF=65;TCR=129;TR=69;WE=78366943;WS=78366923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,162:0.48:336
chr14	78366967	rs734654	A	G	5032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.48;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=505;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.102;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.444;NF=100;NR=88;PP=2705;ReadPosRankSum=1.259;SC=AATGGGACAGAAAGTTGTAAG;SOR=0.571;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=417;TCF=225;TCR=192;TR=188;WE=78366975;WS=78366957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:256,247:0.49:503
chr14	78374292	rs17106595	C	T	2807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.561;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=72;PP=1707;ReadPosRankSum=0.598;SC=GCTGCTGTGCCGGGGAACGTG;SOR=0.575;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=233;TCF=99;TCR=134;TR=127;WE=78374300;WS=78374282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,135:0.54:248
chr14	78390631	rs150422608	TAAACTC	T	457.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.72;MQRankSum=0.667;NF=6;NR=0;PP=247;ReadPosRankSum=0.368;SC=TAAGAAATCTTAAACTCAAAG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=6;WE=78390644;WS=78390621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,12:0.80:15
chr14	78390677	rs17753382	C	T	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.750;NF=14;NR=0;PP=268;ReadPosRankSum=0.946;SC=CCACCACAACCGCTCCGGCCC;SOR=0.334;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=14;WE=78390685;WS=78390667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,18:0.69:26
chr14	78392008	rs11850022	C	T	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.601;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=462;ReadPosRankSum=1.282;SC=AAGGCACAGTCCTCACCGTCG;SOR=0.264;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=48;TCF=42;TCR=6;TR=27;WE=78392016;WS=78391998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,26:0.55:47
chr14	78709814	rs1882821	T	C	1829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.479;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=48;PP=1010;ReadPosRankSum=-0.568;SC=TGATGCTTGATGGCGAGGGCC;SOR=0.743;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=220;TCF=110;TCR=110;TR=93;WE=78709822;WS=78709804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,98:0.41:240
chr14	78710044	rs11626446	G	A	2629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.884;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=63;PP=1640;ReadPosRankSum=-1.386;SC=GGACCCTGTGGTGAGCGTCCC;SOR=0.913;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=225;TCF=110;TCR=115;TR=114;WE=78710052;WS=78710034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,125:0.49:253
chr14	78710190	rs1882822	G	A	1448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=41;PP=873;ReadPosRankSum=-0.257;SC=CCACGGGATGGCTGAGGCTGG;SOR=0.677;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=119;TCF=42;TCR=77;TR=64;WE=78710198;WS=78710180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,69:0.52:133
chr14	78744823	rs10134857	G	A	734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=1;PP=503;SC=GGGTGAAGGTGGAACTAAGTG;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=78744831;WS=78744813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr14	78748366	rs10147289	C	T	1787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.890;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=33;PP=1017;ReadPosRankSum=-1.157;SC=TTTGAGTTTGCAGGGTTCCAA;SOR=0.558;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=159;TCF=98;TCR=61;TR=80;WE=78748374;WS=78748356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,87:0.51:172
chr14	79176021	rs71414707	A	T	1011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=26;PP=642;ReadPosRankSum=-1.965;SC=AGGATGTGTGACTGAGACTAG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=30;TCR=53;TR=41;WE=79176029;WS=79176011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,45:0.50:90
chr14	79176133	rs12147248	G	T	213.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=174;SC=AATGGCTGTTGTAAAATTATG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=79176141;WS=79176123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr14	79181046	rs1465481	A	T	6585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=126;NR=89;PP=2965;SC=TAGGTTTCTTACATTTGGTTA;SOR=0.954;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=216;TCF=127;TCR=89;TR=215;WE=79181054;WS=79181036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr14	79276733	rs4133797	C	A	99.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.76;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr14	79432805	rs11851757	C	T	1155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.868;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=33;PP=759;ReadPosRankSum=0.305;SC=TGAAGCTCTACGTAAAATATG;SOR=0.551;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=29;TCR=57;TR=50;WE=79432813;WS=79432795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,52:0.58:90
chr14	79433527	.	GTT	G	229.25	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.884;ClippingRankSum=0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.43;MQRankSum=0.829;QD=19.10;ReadPosRankSum=-0.216;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,10:0.83:12
chr14	79434392	.	C	T	37	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5040;HP=16;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=37;QD=35.8856062736;SC=TTTATGCTGTCCCCCCCCCCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=2;WE=79434400;WS=79434384;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:2,2:0.50:4
chr14	79454519	rs154325	G	C	1029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.406;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=31;PP=745;ReadPosRankSum=0.216;SC=GGAACTTTGTGAAGATGTTTG;SOR=0.838;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=127;TCF=52;TCR=75;TR=50;WE=79454527;WS=79454509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,53:0.37:142
chr14	80290425	rs932265	A	G	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.265;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=38;ReadPosRankSum=-0.522;SC=CCCCAGCTTCAGGTGTTGTGT;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=4;WE=80290433;WS=80290415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr14	80672711	rs56033314	A	G	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=155;ReadPosRankSum=1.757;SC=CTTTTTTTAGATATGGAAGTT;SOR=0.941;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=10;WE=80672719;WS=80672701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr14	80971261	rs61744330	C	T	1543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.688;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=23;PP=943;ReadPosRankSum=-0.354;SC=TTACAGTTCACGTATGAAAAT;SOR=0.620;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=111;TCF=74;TCR=37;TR=64;WE=80971269;WS=80971251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,71:0.55:128
chr14	80997021	rs17110731	G	A	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.869;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=240;ReadPosRankSum=1.961;SC=ACCCTGATAAGGTGGTATGTT;SOR=2.409;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=11;WE=80997029;WS=80997011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr14	81025522	rs1530771	C	A	1313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=18;PP=777;ReadPosRankSum=-0.893;SC=ATGTAGTTTTCGAAATGATTT;SOR=0.619;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=102;TCF=69;TCR=33;TR=54;WE=81025530;WS=81025512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,62:0.57:109
chr14	81046810	rs71456210	A	AACGAGTT	1704.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.776;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.077;NF=8;NR=11;PP=1026;ReadPosRankSum=1.355;SC=ACAATGTAAAAACGAGTTGCC;SOR=0.749;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=49;TCF=17;TCR=32;TR=19;WE=81046818;WS=81046800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,44:0.47:93
chr14	81251255	rs327463	T	C	2864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.897;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=41;PP=1479;ReadPosRankSum=0.992;SC=AGTCCTGATATGATTCTCAGC;SOR=0.889;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=220;TCF=136;TCR=84;TR=118;WE=81251263;WS=81251245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,133:0.55:243
chr14	81259078	rs4523859	G	A	1116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.684;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=9;PP=627;ReadPosRankSum=1.205;SC=ATTGAAAACCGTTCCTTAGGA;SOR=0.903;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=98;TCF=75;TCR=23;TR=42;WE=81259086;WS=81259068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,51:0.44:115
chr14	81297385	rs7156572	G	A	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.170;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=287;ReadPosRankSum=-0.407;SC=TGCTCACACTGGAGTTCATAA;SOR=1.501;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=15;WE=81297393;WS=81297375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr14	81307218	rs7142753	T	G	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=78;ReadPosRankSum=-0.054;SC=TGGATATGAGTTACACAAAAT;SOR=1.688;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=6;WE=81307226;WS=81307208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr14	81360893	rs34375242	C	CA	300.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=4;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=109;ReadPosRankSum=-1.454;SC=GAACTTTATGCAAAAAAAAAA;SOR=0.646;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=26;TCF=13;TCR=13;TR=10;WE=81360901;WS=81360883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr14	81360958	rs2288347	C	T	1025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.581;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=17;PP=529;ReadPosRankSum=0.348;SC=ATTGGAAAGACGTTGTCTACT;SOR=0.538;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=91;TCF=59;TCR=32;TR=42;WE=81360966;WS=81360948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,51:0.49:105
chr14	81371088	rs8016507	A	G	939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-2.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=9;PP=570;ReadPosRankSum=-1.158;SC=AAGTTCAAGCATTAGTCATTT;SOR=0.814;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=81;TCF=65;TCR=16;TR=42;WE=81371096;WS=81371078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,46:0.50:92
chr14	81422257	rs2239610	G	C	1196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=30;PP=705;ReadPosRankSum=0.408;SC=GAGGTGGCCCGAAGTGCACAA;SOR=0.616;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=98;TCF=35;TCR=63;TR=48;WE=81422265;WS=81422247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,55:0.50:110
chr14	81528412	rs17111401	T	A	385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.790;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=201;ReadPosRankSum=-1.333;SC=GCTTTTTAATTATGTGTTTTT;SOR=0.238;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=18;WE=81528420;WS=81528402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,21:0.49:43
chr14	81558806	rs2075176	C	T	1372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.377;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=20;PP=850;ReadPosRankSum=1.619;SC=AGTGCATATGCGCAGCAAGAC;SOR=0.828;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=135;TCF=89;TCR=46;TR=61;WE=81558823;WS=81558796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,66:0.46:143
chr14	81558965	rs2241119	A	G	2440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.496;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=64;PP=1581;ReadPosRankSum=1.118;SC=GAGTATTACCAGTTCTACTCC;SOR=0.732;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=200;TCF=81;TCR=119;TR=108;WE=81558973;WS=81558955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,116:0.52:222
chr14	81562808	rs2075178	A	G	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=5.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=323;ReadPosRankSum=-1.473;SC=ACTGAGAAATATTATCTTGTT;SOR=0.458;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=15;WE=81562816;WS=81562799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr14	81562998	rs2075179	T	C	3135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=69;PP=1466;ReadPosRankSum=0.818;SC=TGTACAACAATGGCTTTACTT;SOR=0.692;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=317;TCF=154;TCR=163;TR=136;WE=81563006;WS=81562988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:195,161:0.45:356
chr14	81574687	rs3837640	T	TTCTC	465.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.952;HP=1;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=309;ReadPosRankSum=1.207;SC=ACCTAATTCATTCTCTCTCTC;SOR=2.985;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=12;TCR=8;TR=9;WE=81574695;WS=81574677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr14	81574959	rs3783942	A	G	1960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.27;ReadPosRankSum=-1.473;SOR=0.708;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,98:0.51:191
chr14	81575005	rs3783941	C	A	1339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=36;PP=844;ReadPosRankSum=-0.780;SC=GAAGGCCCCACGCTCCAGTAT;SOR=0.733;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=110;TCF=42;TCR=68;TR=60;WE=81575013;WS=81574995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,62:0.56:110
chr14	81610583	rs1991517	G	C	8773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=157;NR=137;PP=2965;SC=TTACCCACGAGATGAGGCAGG;SOR=0.731;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=295;TCF=158;TCR=137;TR=294;WE=81610591;WS=81610573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,324:1.00:324
chr14	81667852	rs8019633	A	T	1294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=8;PP=919;SC=AACTTCAAGTAGTTAATATAG;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=34;TCR=8;TR=42;WE=81667860;WS=81667842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr14	81670558	rs8006015	A	G	925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=16;PP=542;ReadPosRankSum=0.968;SC=AAACTGATACAGACACAGAAA;SOR=0.732;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=95;TCF=58;TCR=37;TR=43;WE=81670566;WS=81670548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,49:0.47:104
chr14	81676360	rs201118427	C	CT	517.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=8.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.41;ReadPosRankSum=1.957;SOR=2.481;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,16:0.29:55
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chr14	88400449	.	TG	CA,CG	181	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=9;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0,2;NR=5,14;PP=38,181;QD=18.2935749724;SC=TATCTATTACTGCAGAAATAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=5,16;WE=88400458;WS=88400439;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.31:16
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chr14	88406127	rs45567441	G	C	1418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=3.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.09;ReadPosRankSum=-0.836;SOR=0.378;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,42:0.51:83
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chr14	88407875	rs421466	T	A	5782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=109;PP=2962;SC=TCTCTATGTATACATCACACT;SOR=1.274;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=184;TCF=75;TCR=109;TR=184;WE=88407896;WS=88407865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
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chr14	88407917	rs12432149	G	A	1220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.553;HP=1;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=32;PP=805;ReadPosRankSum=2.277;SC=AAAATAAAACGGTTGATTAGT;SOR=0.402;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=107;TCF=39;TCR=68;TR=54;WE=88407925;WS=88407907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,58:0.46:125
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chr14	88411837	rs366615	G	A	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.094;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=204;ReadPosRankSum=0.779;SC=ACTTCAAAATGTACCTGACAA;SOR=0.506;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=53;TCF=42;TCR=11;TR=20;WE=88411845;WS=88411827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,26:0.43:60
chr14	88411947	rs367327	T	C	5089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=76;PP=2204;SC=CGGCAGCCCATGTAATGGGTC;SOR=0.810;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=156;TCF=80;TCR=76;TR=156;WE=88411955;WS=88411937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr14	88414211	rs398076	G	A	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.536;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=23;PP=497;ReadPosRankSum=-0.667;SC=AACTGCCATCGCTGTCAAGGA;SOR=0.868;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=105;TCF=52;TCR=53;TR=44;WE=88414219;WS=88414201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,46:0.41:111
chr14	88414283	rs398343	G	A	1849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=29;NR=35;PP=1069;SC=CATGTGGACAGAATAGCTTTA;SOR=1.085;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=29;TCR=35;TR=64;WE=88414291;WS=88414273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr14	88416390	rs440426	A	G	1095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=25;PP=664;SC=CTATTTATCAAGAGAAACACC;SOR=1.845;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=12;TCR=25;TR=37;WE=88416398;WS=88416380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr14	88416441	rs451073	C	T	221.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=7;PP=168;SC=TAGGAAAACACTGTTCAAGCA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=88416449;WS=88416431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr14	88417095	rs11300320	GA	G	2386.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.338;NF=8;NR=42;PP=817;ReadPosRankSum=0.228;SC=TTATGACTCTGAAAAAAAAAA;SOR=0.406;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=62;TCF=11;TCR=51;TR=50;WE=88417104;WS=88417085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,99:0.97:102
chr14	88417161	rs431748	C	T	2091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=45;PP=1320;SC=AAAAGTTCAACAGTTAATGCC;SOR=1.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=21;TCR=45;TR=66;WE=88417169;WS=88417151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr14	88417244	rs443019	C	T	343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=240;SC=GACTTTTTTACAATATAATAT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=88417252;WS=88417234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr14	88431898	rs12888666	C	T	2121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.481;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=47;PP=1312;ReadPosRankSum=-1.873;SC=TCCATGGCTCCTGGGCCGTCA;SOR=0.682;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=214;TCF=111;TCR=103;TR=97;WE=88431906;WS=88431888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,105:0.45:231
chr14	88453186	rs2165567	A	G	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=38;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=375;ReadPosRankSum=0.865;SC=ACAACCTTCTATTACAAGCAG;SOR=1.179;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=14;WE=88453194;WS=88453176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr14	88453278	rs2119702	T	G	1348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.239;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=26;PP=854;ReadPosRankSum=-0.857;SC=TCTGTAGTTTTCAAATCCCCA;SOR=0.437;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=110;TCF=70;TCR=40;TR=60;WE=88453286;WS=88453268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,63:0.49:128
chr14	88453424	rs2119703	G	A	522.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=2.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.19;MQRankSum=0.000;QD=4.93;ReadPosRankSum=-2.001;SOR=1.028;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,36:0.34:106
chr14	88454691	rs2245387	C	T	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.003;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=4;PP=131;ReadPosRankSum=-0.196;SC=AAGTAATGTGCCATTTTTTCA;SOR=0.223;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=18;TCF=7;TCR=11;TR=8;WE=88454699;WS=88454681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr14	88454910	rs2289511	G	A	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.09;ReadPosRankSum=-2.658;SOR=0.631;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,39:0.52:75
chr14	88459826	.	A	G	1565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.294;ClippingRankSum=0.000;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.198;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=37;PP=871;ReadPosRankSum=1.005;SC=TGGCCCTACCATGGCTCTTCC;SOR=0.435;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=127;TCF=47;TCR=80;TR=63;WE=88459834;WS=88459816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,73:0.51:143
chr14	88477413	rs6574978	C	T	3238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=358;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.802;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=62;PP=2043;ReadPosRankSum=0.115;SC=TTGATTATACCTGGAATAAAG;SOR=0.840;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=325;TCF=178;TCR=147;TR=144;WE=88477422;WS=88477403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:199,159:0.44:358
chr14	88651826	rs144490234	A	AAC	818.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.848;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.296;NF=10;NR=11;PP=683;ReadPosRankSum=1.782;SC=GAATATTAAAAACACACACAC;SOR=0.887;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=60;TCF=26;TCR=34;TR=21;WE=88651837;WS=88651816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,33:0.36:92
chr14	88651962	rs17762463	C	T	2199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.970;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=45;PP=1429;ReadPosRankSum=-0.784;SC=TCCAACTCAGCGTGCTGCTGG;SOR=0.812;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=184;TCF=96;TCR=88;TR=99;WE=88651970;WS=88651952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,105:0.52:203
chr14	88658764	rs12898054	G	C	1533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.594;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=37;PP=889;ReadPosRankSum=-1.339;SC=TCTAGGAAGAGCAAAGGAGAA;SOR=0.795;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=136;TCF=63;TCR=73;TR=66;WE=88658772;WS=88658754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,77:0.48:159
chr14	88729931	rs761971	G	T	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=6;PP=82;ReadPosRankSum=-0.699;SC=GAAGAAGAGAGTTTGTTTATA;SOR=0.616;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=12;TCR=15;TR=11;WE=88729939;WS=88729921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr14	88737193	rs1298237	T	C	5501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=108;PP=2965;SC=ACATGGACCCTTGCTAACAAT;SOR=1.167;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=183;TCF=75;TCR=108;TR=183;WE=88737201;WS=88737183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr14	88792816	rs3742690	T	G	2984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=58;PP=1806;SC=AAGATGCCGCTCCAAGCGGTT;SOR=1.061;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=46;TCR=58;TR=104;WE=88792824;WS=88792806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr14	88852031	rs709886	A	G	509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=0;PP=333;SC=ACGGCCTGGCAACGGTTTCCC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=88852039;WS=88852021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr14	88852279	rs5810413	TG	T	1306.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=30;PP=1136;SC=GGCCGCCCCTTGGGGCGCTTC;SOR=2.891;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=30;WE=88852287;WS=88852269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr14	88862529	rs3179969	G	A	588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=15;PP=424;SC=TCCAGTAAGCGTGAGTACCAG;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=9;TCR=15;TR=24;WE=88862537;WS=88862519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr14	88881601	.	C	G	873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=0.000;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.347;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=20;PP=595;ReadPosRankSum=0.201;SC=TGCAAATATACCTAGGATAGG;SOR=0.765;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=107;TCF=57;TCR=50;TR=44;WE=88881609;WS=88881591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,48:0.39:123
chr14	88894210	rs2295135	T	G	657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=8;NR=14;PP=431;SC=TGGTTATAGCTCTCTCTGAAT;SOR=1.519;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=22;TCF=8;TCR=14;TR=22;WE=88894218;WS=88894200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr14	88895669	rs386579	T	G	1700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.84;SOR=2.107;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr14	88895941	rs61975260	C	G	426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=328;SC=AATTCAATAACAGTTTTAGTT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=88895949;WS=88895931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	88935925	rs2297129	A	G	5579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=118;NR=71;PP=2965;SC=TCTCTTGCCCAGTAAGGAGGT;SOR=1.257;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=189;TCF=118;TCR=71;TR=189;WE=88935933;WS=88935915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr14	88936254	rs2297128	A	G	9098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=149;NR=149;PP=2965;SC=CTTAAGAGAAATAAGTACCTA;SOR=0.796;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=298;TCF=149;TCR=149;TR=298;WE=88936262;WS=88936244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,326:1.00:326
chr14	88938652	rs2274736	A	G	8595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=150;NR=150;PP=2965;SC=CTCCACTCTCACATCATCATA;SOR=0.784;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=300;TCF=150;TCR=150;TR=300;WE=88938660;WS=88938642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,320:1.00:320
chr14	88945591	rs879932	A	G	2170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=25;PP=1458;SC=CACGTGCAGGAGGCGCCCGGG;SOR=1.300;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=47;TCR=25;TR=72;WE=88945599;WS=88945581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr14	88946622	rs2401751	G	A	7164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=113;NR=110;PP=2965;SC=CGACCGTTGAGGTCAATCTGG;SOR=0.762;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=223;TCF=113;TCR=110;TR=223;WE=88946630;WS=88946612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr14	88970925	rs1998670	C	T	6524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=87;NR=126;PP=2965;SC=TAATGACTCTCGTCACTATCA;SOR=1.226;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=214;TCF=88;TCR=126;TR=213;WE=88970933;WS=88970915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr14	88971758	rs2274735	T	G	742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=17;PP=468;SC=TATTTAAATTTCATTGCAAAA;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=9;TCR=17;TR=26;WE=88971766;WS=88971748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr14	88974131	rs34965888	GAT	G	133	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=62.65;NF=4;NR=0;PP=132;SC=AAGCCCCTTAGATAACAGAAT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=88974140;WS=88974121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr14	88974417	rs10143744	T	C	260.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=216;SC=CTCATTGAGATACAATGCATT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=88974425;WS=88974407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr14	88983670	rs10150986	G	A	1407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=39;PP=1005;ReadPosRankSum=0.324;SC=GACTTCAGTCGCACTAATCCC;SOR=6.316;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=41;TCF=1;TCR=40;TR=40;WE=88983678;WS=88983660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,46:0.98:47
chr14	89037482	rs10682918	C	CAT	2816.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=7;NR=33;PP=696;SC=AGATTCATAACTTTTTTTTTT;SOR=0.949;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=42;TCF=7;TCR=35;TR=40;WE=89037490;WS=89037472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr14	89039234	rs144601125	T	C	3347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=67;PP=2180;ReadPosRankSum=0.235;SC=AGCAGCTTGATATGCAGAGTA;SOR=0.692;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=282;TCF=145;TCR=137;TR=139;WE=89039242;WS=89039224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,155:0.50:308
chr14	89042180	rs1469602	T	G	2545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=30;PP=1375;SC=CTTAACTCTTTTAGACCTTCT;SOR=1.053;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=52;TCR=30;TR=82;WE=89042188;WS=89042170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr14	89063167	rs2297124	A	G	10216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=390;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=189;NR=174;PP=2965;SC=GTAATGTTTCAAGTTGTACTG;SOR=0.756;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=363;TCF=189;TCR=174;TR=363;WE=89063175;WS=89063157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,390:1.00:390
chr14	89082396	rs61173654	A	AT	882.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=2;PP=839;SC=TGACTAGCTGATTTCATAAAC;SOR=3.690;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=20;WE=89082404;WS=89082386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr14	89088266	rs4635267	C	T	6918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=135;NR=99;PP=2965;SC=TACATAAATACGTGATTCTTA;SOR=1.039;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=234;TCF=135;TCR=99;TR=234;WE=89088274;WS=89088256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,259:1.00:259
chr14	89088357	rs56144430	G	A	7076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=106;NR=129;PP=2965;SC=CCTTTAACCAGTCCTTCCCTA;SOR=0.986;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=235;TCF=106;TCR=129;TR=235;WE=89088365;WS=89088347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,269:1.00:269
chr14	89088388	rs2983488	G	C	4164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=85;PP=2656;SC=CCTCCCCCTTGTCCGCCTCCA;SOR=1.488;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=135;TCF=50;TCR=85;TR=135;WE=89088396;WS=89088378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr14	89089149	rs11382327	C	CT	895.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.624;NF=1;NR=25;PP=526;ReadPosRankSum=-1.312;SC=TAAGCAGAATCTTTTTTTTTT;SOR=0.730;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=26;WE=89089157;WS=89089139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,35:0.95:37
chr14	89094243	rs1144916	G	C	936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=24;PP=696;SC=ATATTCATCTGTGAAACATGG;SOR=2.694;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=30;WE=89094251;WS=89094233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr14	89105287	rs1152383	T	A	950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=23;PP=603;SC=GTTTGAAAATTTTAAGATGTA;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=31;WE=89105295;WS=89105277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr14	89148486	rs17260380	C	T	432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=14;PP=360;SC=AATAGGATACCGAATAGTGAG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=89148494;WS=89148476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr14	89163385	.	GCTTGA	G	241.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.255;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=92;ReadPosRankSum=-0.885;SC=GATTTTTACAGCTTGACTTAT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=3;WE=89163397;WS=89163375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr14	89205265	rs17188228	T	C	3172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=50;PP=1873;SC=ATCACAGTAATTGGTTTAAAA;SOR=0.800;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=104;TCF=54;TCR=50;TR=104;WE=89205273;WS=89205255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr14	89258877	rs61982739	G	A	274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=6;PP=170;SC=GCTCCCGCTCGGGCCCGCGGC;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=89258885;WS=89258867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr14	89307320	rs17700296	T	C	7236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=123;NR=128;PP=2965;SC=TTGATCAGACTGTATGAGAGT;SOR=0.752;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=252;TCF=124;TCR=128;TR=251;WE=89307328;WS=89307310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,278:1.00:278
chr14	89591829	rs17777553	G	T	804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.135;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=23;PP=500;ReadPosRankSum=-1.662;SC=CAAGGAATAAGTATTGAGTAT;SOR=0.405;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=75;TCF=21;TCR=54;TR=34;WE=89591837;WS=89591819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,37:0.46:81
chr14	89647259	rs140257053	G	GGCAGAGAACATGCATGGA	2607.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=17;PP=628;SC=AGAGACAGAGGGCAGAGACAG;SOR=2.753;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=18;WE=89647267;WS=89647249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr14	89647297	rs34338248	T	TAC	380.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=698;ReadPosRankSum=-0.682;SC=CACGTGCACATACACACACAC;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=22;WE=89647305;WS=89647287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr14	89747162	rs11845021	A	G	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.212;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=4;PP=304;ReadPosRankSum=-1.148;SC=CACCCACAACAGTCACACTTC;SOR=0.442;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=57;TCF=47;TCR=10;TR=27;WE=89747170;WS=89747152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,29:0.48:61
chr14	89747473	rs7147341	T	C	812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.197;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=24;PP=402;ReadPosRankSum=1.022;SC=TGACACCCTTTGAAAATGCAT;SOR=0.415;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=71;TCF=20;TCR=51;TR=35;WE=89747481;WS=89747463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,40:0.53:75
chr14	89750819	rs11627932	A	G	1767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=33;PP=1036;ReadPosRankSum=-0.825;SC=CTGATCTTCCAGCTTTCCTCT;SOR=0.657;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=173;TCF=104;TCR=69;TR=84;WE=89750827;WS=89750809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,91:0.49:184
chr14	89867978	rs12147030	T	C	12044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=445;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=195;NR=209;PP=2965;SC=CCCTCTACTATAGCCACGATT;SOR=0.753;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=404;TCF=195;TCR=209;TR=404;WE=89867986;WS=89867955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,445:1.00:445
chr14	89884022	rs7422	A	C	3819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=74;NR=63;PP=2406;SC=AAGAATTACGATGCGGGCGAG;SOR=0.793;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=137;TCF=74;TCR=63;TR=137;WE=89884030;WS=89884012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr14	90095445	rs100016	T	C	1891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.426;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=38;PP=1111;ReadPosRankSum=0.239;SC=CAGTGTGAGATGGATCATCTC;SOR=1.025;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=211;TCF=120;TCR=91;TR=94;WE=90095453;WS=90095435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,97:0.42:230
chr14	90097939	rs139214677	GC	G	422.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.537;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=320;ReadPosRankSum=-0.160;SC=CATCTGGGGAGCTTTTTTTTA;SOR=0.375;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=56;TCF=12;TCR=44;TR=19;WE=90097949;WS=90097929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,15:0.22:69
chr14	90097941	rs201292636	T	A	431.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=2.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.26;ReadPosRankSum=-0.349;SOR=0.375;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,15:0.22:69
chr14	90263500	rs9026	T	A	1080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.347;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=2;PP=745;ReadPosRankSum=-1.277;SC=ATCACAAGTCTGTAGCATGAC;SOR=1.755;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=71;TCF=65;TCR=6;TR=37;WE=90263508;WS=90263490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,42:0.53:79
chr14	90263525	rs1555616	C	A	3653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=31;PP=2493;SC=TTAGTAGAGTCGAGTCTGCTG;SOR=2.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=122;TCF=91;TCR=31;TR=122;WE=90263533;WS=90263515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr14	90303065	rs8021113	T	C	753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=1.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.60;ReadPosRankSum=0.926;SOR=0.888;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,33:0.51:65
chr14	90303113	rs8019848	A	T	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.347;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=69;ReadPosRankSum=0.305;SC=CTGTAATCCCAGCACTTTGGG;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=5;WE=90303121;WS=90303103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr14	90303383	rs8020323	A	G	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=2.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.13;ReadPosRankSum=0.758;SOR=0.452;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,30:0.52:58
chr14	90303435	rs12437204	T	A	1764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=2.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.65;ReadPosRankSum=-0.281;SOR=0.595;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,48:0.48:100
chr14	90303445	rs12437206	T	C	1792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.24;ReadPosRankSum=-0.144;SOR=0.659;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,48:0.46:104
chr14	90390948	rs12100727	A	G	1579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.388;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=33;PP=969;ReadPosRankSum=-0.093;SC=TGTTGATGGCAGGCAAAGTCA;SOR=0.487;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=170;TCF=98;TCR=72;TR=72;WE=90390956;WS=90390938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,80:0.43:185
chr14	90390968	rs12101251	T	A	1936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.373;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=39;PP=1168;ReadPosRankSum=-0.996;SC=AAGAAAGAACTTTAAGTCAGC;SOR=0.531;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=193;TCF=109;TCR=84;TR=85;WE=90390976;WS=90390958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,94:0.45:211
chr14	90391072	rs11159940	T	G	969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=29;PP=592;ReadPosRankSum=0.869;SC=GAAAATCACATGTAGACAGAG;SOR=0.645;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=106;TCF=38;TCR=68;TR=44;WE=90391080;WS=90391062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,46:0.40:114
chr14	90397718	rs57465932	C	T	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=143;ReadPosRankSum=0.718;SC=ATGGAAGGACCCATAGCTAAC;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=7;WE=90397726;WS=90397708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr14	90398834	rs3833988	A	AT	876.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.819;HP=8;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.105;NF=8;NR=11;PP=326;ReadPosRankSum=0.836;SC=CTTAAAAGTAATTTTTTTTAC;SOR=0.545;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=52;TCF=19;TCR=33;TR=19;WE=90398842;WS=90398824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,41:0.46:89
chr14	90398907	rs8778	G	A	1174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=22;PP=555;ReadPosRankSum=0.162;SC=GTCTTACTTCGTTCCGATATC;SOR=0.712;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=54;TCR=53;TR=44;WE=90398915;WS=90398897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,58:0.46:126
chr14	90399058	rs3752966	T	C	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=85;ReadPosRankSum=-0.431;SC=GTAATAAATCTCACCAATAAT;SOR=1.179;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=6;WE=90399066;WS=90399048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr14	90451303	rs1296406	A	G	117.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=0;PP=87;SC=TCTTGTAGGCATTCCATCATT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=90451311;WS=90451293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr14	90456188	rs2401863	G	T	2014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=41;PP=1209;SC=CTACTATTGCGTAGAAATTTG;SOR=1.516;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=21;TCR=41;TR=62;WE=90456196;WS=90456178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr14	90528967	rs12878088	C	A	893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=19;PP=418;ReadPosRankSum=-0.794;SC=CTCATCCTTTCATTCATCCAT;SOR=0.752;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=61;TCF=26;TCR=35;TR=34;WE=90528975;WS=90528957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,42:0.60:70
chr14	90529028	rs41286552	G	A	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.771;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=40;ReadPosRankSum=-0.326;SC=TGATCAACAGGTGGTATTGCC;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=4;WE=90529036;WS=90529018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr14	90650684	rs35931687	C	T	2061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.378;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=41;PP=1249;ReadPosRankSum=-2.027;SC=ACAGCCTGGCCGGCTGGAAGC;SOR=0.664;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=182;TCF=98;TCR=84;TR=86;WE=90650692;WS=90650674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,95:0.46:207
chr14	90722824	rs2277516	G	C	370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=1;PP=265;SC=AGCACAACTTGGTCAGCGCAG;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=90722832;WS=90722814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr14	90723000	rs2277515	A	G	2950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=50;PP=1540;SC=GGGTCTCAGCAGCCTGAGGCG;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=44;TCR=50;TR=94;WE=90723008;WS=90722990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr14	90723059	rs2277514	T	C	1080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=13;NR=20;PP=587;SC=TCTTCTCCTTTTGCCGGCCTG;SOR=1.552;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=13;TCR=20;TR=33;WE=90723067;WS=90723049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr14	90723109	rs6575119	T	G	286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=7;PP=188;SC=ACCGCGCTCATGTCCACCGCG;SOR=1.802;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=10;WE=90723117;WS=90723099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	90723152	rs3825662	A	G	140.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=3;PP=51;SC=TTGCCCGGGGATCCTGGGGCC;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=90723160;WS=90723142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr14	90726676	rs11844225	G	A	6049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=85;NR=122;PP=2965;SC=CTCTAGCTTTGTGATTCATTT;SOR=1.174;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=207;TCF=85;TCR=122;TR=207;WE=90726684;WS=90726666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr14	90729931	rs8022531	T	C	950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=21;PP=618;SC=GGCTGCTTTGTAAATCTAGCG;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=30;WE=90729939;WS=90729921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr14	90729984	rs8015510	C	T	326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=5;PP=258;SC=CTGCTTTTTTCCCTTGGCATT;SOR=0.859;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=11;TCF=6;TCR=5;TR=11;WE=90729992;WS=90729974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	90730071	rs4811	C	T	1111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=1;PP=931;SC=TGGAAGAGATCATTGATGACA;SOR=5.670;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=34;WE=90730079;WS=90730061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr14	90730265	rs2282030	G	A	2160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=49;PP=1314;SC=TTCCTGTCCCGTGGAAGTAGA;SOR=1.639;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=25;TCR=49;TR=74;WE=90730273;WS=90730255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr14	90731687	rs34260220	GA	G	118.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.836;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=3.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.42;ReadPosRankSum=0.778;SOR=2.215;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr14	90736055	rs10599013	CAG	C	478.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=340;ReadPosRankSum=0.093;SC=AGGGTTAAAACAGAGCATGAT;SOR=0.990;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=9;WE=90736064;WS=90736045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr14	90740274	rs6575121	T	C	4016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=404;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=79;PP=2557;ReadPosRankSum=0.072;SC=TGTGATTGCATTGGACCCATG;SOR=0.680;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=362;TCF=193;TCR=169;TR=170;WE=90740282;WS=90740264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:213,191:0.47:404
chr14	90752845	rs113463686	CA	C	886.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.388;NF=0;NR=20;PP=649;ReadPosRankSum=-2.153;SC=ACCTGCAAGGCAAAGGCTCAC;SOR=0.751;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=20;WE=90752853;WS=90752835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,33:0.49:68
chr14	90752908	rs7160304	G	T	488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=15;PP=379;SC=AGAGATGCCTGAGTGATGATA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=90752916;WS=90752898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr14	90754538	rs17799226	C	T	1227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.812;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=16;PP=787;ReadPosRankSum=1.690;SC=GCGGGGCACACGAACAGAACG;SOR=0.865;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=90;TCF=62;TCR=28;TR=53;WE=90754546;WS=90754528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,56:0.57:98
chr14	90767607	rs3825661	C	T	1763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=28;PP=812;ReadPosRankSum=0.159;SC=GCAGATCTTTCACGCTGTCGG;SOR=0.706;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=174;TCF=103;TCR=71;TR=73;WE=90767615;WS=90767597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,89:0.46:195
chr14	90767746	rs3742669	C	A	1485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.062;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=31;PP=779;ReadPosRankSum=0.947;SC=GGGGAAGAAGCCTGGTTGATA;SOR=0.908;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=67;TCR=66;TR=62;WE=90767754;WS=90767736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,72:0.48:149
chr14	90767860	rs3742666	T	C	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.135;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=7;PP=183;ReadPosRankSum=-0.294;SC=GATACATGTCTTGATTTAAAG;SOR=0.088;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=13;WE=90767868;WS=90767850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr14	90768183	rs8020828	C	T	2358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.954;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=52;PP=1245;ReadPosRankSum=0.882;SC=CTGAACATTCCAGTTCATCTT;SOR=0.613;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=231;TCF=98;TCR=133;TR=96;WE=90768191;WS=90768173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,117:0.43:270
chr14	90769635	rs2282033	T	G	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.047;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=329;ReadPosRankSum=0.188;SC=TTGTGTCACCTGATATGTTTG;SOR=1.999;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=16;WE=90769643;WS=90769625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr14	90770210	rs4904670	C	G	527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=3;PP=358;SC=AATTGCTGCACAGTCCATCAG;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=17;WE=90770218;WS=90770200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr14	90784612	rs74080912	A	G	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=102;ReadPosRankSum=1.825;SC=AGCTGAACAGAATCCATGAAA;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=7;WE=90784620;WS=90784602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr14	90863489	rs12886342	G	A	1036.56	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5363;FS=2.534;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=13;PP=1225;ReadPosRankSum=-0.430;SC=CAGCAGCAGCGGCATCGGAGG;SOR=1.714;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=57;TCF=43;TCR=14;TR=54;WE=90863497;WS=90863476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,40:0.93:43
chr14	90865283	rs2300497	T	C	1589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=10;PP=1219;SC=CACTTAAGAGTATAAACTTCA;SOR=2.670;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=42;TCR=10;TR=52;WE=90865291;WS=90865273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr14	90865462	rs2300498	C	G	3033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=54;PP=1912;SC=TTACTGCCTCCAACGAAGTGT;SOR=0.946;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=46;TCR=54;TR=100;WE=90865470;WS=90865452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr14	90866346	rs2268433	C	T	1143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=6;PP=722;SC=AACTGGAAAACCTATGTTGAA;SOR=2.891;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=36;WE=90866354;WS=90866336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr14	91007618	rs1294572	T	C	536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=6;PP=379;SC=GGCCTCAGTGTGGCAGATTCA;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=18;WE=91007626;WS=91007608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
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chr14	91084338	rs754247	C	T	1457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.269;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=28;PP=850;ReadPosRankSum=1.404;SC=TCAGCAGTGCCTCGTCCGGGC;SOR=0.572;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=116;TCF=66;TCR=50;TR=62;WE=91084346;WS=91084328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,67:0.54:124
chr14	91110582	rs3830889	TACATAC	T	269.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=462;ReadPosRankSum=-0.134;SC=AAAAAGGTTTTACATACACAC;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=6;WE=91110609;WS=91110572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr14	91110601	.	G	GCACA	363	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=3;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=0;NR=6;PP=363;QD=61.3333333333;SC=ACATGCACACGCACACACACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=6;WE=91110609;WS=91110572;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr14	91113471	rs2277512	G	A	1133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.848;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=30;PP=637;ReadPosRankSum=0.925;SC=CTAAGGGCCCGTATTTATTTA;SOR=0.531;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=84;TCF=33;TCR=51;TR=51;WE=91113479;WS=91113461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,54:0.61:89
chr14	91113537	rs1286422	A	G	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=219;ReadPosRankSum=-0.857;SC=CATGTAAACCATTTCCCTCTT;SOR=0.582;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=13;WE=91113545;WS=91113527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr14	91121273	rs3742661	G	A	3521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=56;PP=2327;SC=TGGGAATCCCGCAGGGTAGAC;SOR=0.912;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=71;TCR=56;TR=127;WE=91121281;WS=91121263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr14	91123575	rs3742660	T	C	7076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=134;NR=94;PP=2965;SC=TGGCATCGTCTGGCTTCAGGC;SOR=0.918;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=228;TCF=134;TCR=94;TR=228;WE=91123583;WS=91123565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,263:1.00:263
chr14	91142779	rs1077697	C	T	1608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=7;PP=1194;SC=TAGAGGGGGGCCCAGGACCAG;SOR=3.139;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=46;TCR=7;TR=53;WE=91142787;WS=91142769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr14	91156151	rs942738	G	A	668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=17;PP=461;SC=ATCACATTGTGCTAAGCACTA;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=91156159;WS=91156141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr14	91161862	rs10146731	C	T	8099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=151;NR=128;PP=2965;SC=GGTTTTGAGTCGTTCTTGTTT;SOR=0.817;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=279;TCF=151;TCR=128;TR=279;WE=91161870;WS=91161852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,306:1.00:306
chr14	91162063	rs12893100	C	T	580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=16;PP=429;SC=CATGCCTAGCCATCTTTGGTT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=91162071;WS=91162053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr14	91165572	rs1749699	G	A	8502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=142;NR=142;PP=2965;SC=GTCCCTCTGTGATCAAACCAA;SOR=0.706;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=284;TCF=142;TCR=142;TR=284;WE=91165580;WS=91165562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,320:1.00:320
chr14	91165606	rs1742100	G	A	7266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=112;NR=134;PP=2965;SC=ATGGGAAGAAGGCCAGAGCTC;SOR=0.931;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=246;TCF=112;TCR=134;TR=246;WE=91165614;WS=91165596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,269:1.00:269
chr14	91211121	rs76723365	G	A	1687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=30;PP=845;ReadPosRankSum=-0.916;SC=GAACAAACACGTGGTCCTCAC;SOR=0.662;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=86;TCR=64;TR=69;WE=91211129;WS=91211111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,82:0.48:170
chr14	91361016	rs143072679	A	G	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=164;ReadPosRankSum=-1.409;SC=TCTACCACCAATACGTTTAAA;SOR=0.610;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=9;WE=91361024;WS=91361006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr14	91592748	rs57615276	C	CTTCTT	2288.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=12;PP=1488;SC=ATGTCTGTGCCTTCTTATAAT;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=23;TCR=15;TR=31;WE=91592756;WS=91592738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr14	91636395	rs4900071	C	T	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=229;ReadPosRankSum=-3.258;SC=CCTGCACCGGCAGCCTGGCTT;SOR=0.824;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=18;WE=91636403;WS=91636385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr14	91636532	rs4900072	C	T	956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=16;PP=470;ReadPosRankSum=0.288;SC=CACAGCCAGGCGGGTGCATAC;SOR=0.651;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=78;TCF=47;TCR=31;TR=39;WE=91636540;WS=91636522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,47:0.51:93
chr14	91642234	rs2295528	A	G	2419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.462;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=49;PP=1451;ReadPosRankSum=-0.499;SC=TTCTAATTGGATGCTCCCTGC;SOR=0.641;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=226;TCF=123;TCR=103;TR=107;WE=91642242;WS=91642224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,120:0.48:250
chr14	91662615	rs2295527	A	G	1474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.741;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=24;PP=826;ReadPosRankSum=1.107;SC=ATGTTGTTCAACAACAGTAAT;SOR=0.363;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=108;TCF=69;TCR=39;TR=61;WE=91662623;WS=91662605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,70:0.57:122
chr14	91662832	rs2295525	A	G	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=330;ReadPosRankSum=-0.364;SC=CGTATGTCGCATCCCAGTTTA;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=19;WE=91662840;WS=91662822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr14	91662886	rs3818201	A	G	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=242;ReadPosRankSum=-1.335;SC=CACTTAGCCAACAAAGTGTCT;SOR=0.495;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=13;WE=91662894;WS=91662876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr14	91671124	rs2295524	G	A	1688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=34;PP=920;ReadPosRankSum=0.516;SC=ACGGCACGGGGATGTCATCGC;SOR=0.666;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=146;TCF=81;TCR=65;TR=76;WE=91671132;WS=91671114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,85:0.52:163
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chr14	91739081	rs941920	A	G	736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=15;PP=429;ReadPosRankSum=-0.617;SC=GGCCCGGCCGAGGTGGGGAGC;SOR=0.665;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=91;TCF=49;TCR=42;TR=34;WE=91739089;WS=91739071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,38:0.36:105
chr14	91751788	rs11341843	TC	T	3537.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=60;PP=2317;ReadPosRankSum=1.470;SC=ATCCTGAGGCTCCCCCTAAAA;SOR=0.690;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=144;TCF=26;TCR=118;TR=74;WE=91751796;WS=91751778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,133:0.52:256
chr14	91763637	rs3742656	C	T	692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=6;PP=435;ReadPosRankSum=-0.242;SC=GCTCCCCTGGCGCTGGCCTCA;SOR=0.582;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=49;TCR=12;TR=30;WE=91763645;WS=91763627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,32:0.51:63
chr14	91763971	.	CTTT	C,CTT	87.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=12;HapScore=3;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0,0;NR=6,6;PP=29,82;ReadPosRankSum=1.111;SC=CCTCTCTGGGCTTTTTTTTTT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=6,6;WE=91763981;WS=91763961;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.67:6
chr14	91773568	rs1970912	T	C	1219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=26;PP=553;ReadPosRankSum=-0.707;SC=ACTCCTTCTTTAGCTACAGGT;SOR=0.664;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=96;TCF=42;TCR=54;TR=48;WE=91773576;WS=91773558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,58:0.52:112
chr14	91776434	rs2277507	G	A	829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.915;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=22;PP=495;ReadPosRankSum=0.054;SC=CCCGGGCCACGGCTGCCTCCG;SOR=0.816;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=23;TCR=46;TR=33;WE=91776442;WS=91776424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,36:0.48:75
chr14	91826198	.	G	A	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=0.000;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=234;ReadPosRankSum=0.162;SC=ATGACAGCAAGGAGCACGTAA;SOR=0.784;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=13;WE=91826206;WS=91826188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,13:0.33:39
chr14	91874956	rs2295882	T	C	2174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=34;PP=1393;ReadPosRankSum=-2.581;SC=ACAGTGACGATACTGATGGAC;SOR=0.710;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=167;TCF=100;TCR=67;TR=88;WE=91874964;WS=91874946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,100:0.54:186
chr14	91883129	rs45437097	G	A	3261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.840;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=73;PP=1835;ReadPosRankSum=0.174;SC=CTAAATCCATGTACATAGTCA;SOR=0.808;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=295;TCF=147;TCR=148;TR=146;WE=91883137;WS=91883119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,162:0.51:319
chr14	91883267	rs1285844	A	C	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=217;ReadPosRankSum=0.315;SC=CAGAGACTGGACGGGTCAGTG;SOR=0.481;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=11;WE=91883275;WS=91883257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr14	91883364	.	C	T	676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.082;ClippingRankSum=0.000;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.112;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=409;ReadPosRankSum=-1.977;SC=CCCCTCCCCGCGCGGGGCAAC;SOR=1.040;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=51;TCF=36;TCR=15;TR=27;WE=91883372;WS=91883354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,31:0.55:56
chr14	91928933	rs4904784	T	C	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=50;ReadPosRankSum=1.180;SC=AACATTTATGTTGACCCTTAC;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=91928941;WS=91928923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr14	91942342	rs10145724	T	A	854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.451;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=22;PP=492;ReadPosRankSum=1.101;SC=TTTTCCTGTATTTATAAAAAT;SOR=0.313;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=74;TCF=27;TCR=47;TR=38;WE=91942350;WS=91942332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,42:0.50:84
chr14	91942407	rs10145809	T	G	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=130;ReadPosRankSum=1.567;SC=TGAAAAAACTTCAATGTAAAA;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=8;WE=91942415;WS=91942397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr14	91942843	.	G	A	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.357;ClippingRankSum=0.000;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.192;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=13;PP=303;ReadPosRankSum=1.312;SC=TTGGGAAAACGCACAAAATTC;SOR=0.474;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=39;TCF=16;TCR=23;TR=23;WE=91942851;WS=91942833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,24:0.55:44
chr14	91948643	rs6575195	G	A	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.607;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=326;ReadPosRankSum=0.231;SC=ACCTATAATGGTCATTTTCAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=16;WE=91948651;WS=91948633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
chr14	92053362	rs61991980	C	T	806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.708;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=2;PP=524;ReadPosRankSum=0.575;SC=GTCCTGGCACCCATGATGCAC;SOR=1.775;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=64;TCF=56;TCR=8;TR=30;WE=92053370;WS=92053352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,32:0.50:64
chr14	92074545	rs1743159	T	A	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.917;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.363;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=3;PP=82;ReadPosRankSum=0.483;SC=AGCTTCACCTTCTCATTTAAC;SOR=0.223;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=8;WE=92074553;WS=92074535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr14	92084004	rs1620238	C	G	966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.682;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=20;PP=560;ReadPosRankSum=-1.320;SC=CATCAAAAGTCACTTCAGCTG;SOR=0.573;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=113;TCF=68;TCR=45;TR=45;WE=92084012;WS=92083994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,51:0.41:124
chr14	92088016	rs1296082	G	A	1086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=14;PP=599;ReadPosRankSum=-0.377;SC=TGTATTTCACGATGTTGAGGG;SOR=0.735;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=92;TCF=64;TCR=28;TR=47;WE=92088024;WS=92088006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,52:0.52:100
chr14	92105643	rs1704630	G	A	572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=16;PP=416;SC=AACAGAAGTCGAAAAACTTTA;SOR=4.514;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=92105651;WS=92105633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr14	92126458	.	T	TCA	98.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.498;ClippingRankSum=-0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.17;ReadPosRankSum=0.394;SOR=0.141;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr14	92126460	rs1704673	T	A	390.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.06;ReadPosRankSum=1.531;SOR=1.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,13:0.87:15
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chr14	92251587	rs61990064	A	G	2628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.440;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=54;PP=1762;ReadPosRankSum=-1.379;SC=CACTCTGTATAAGTGGAAAAA;SOR=0.742;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=253;TCF=144;TCR=109;TR=120;WE=92251595;WS=92251577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,128:0.46:277
chr14	92268531	rs10498631	C	T	1966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=45;NR=16;PP=1225;SC=ATTCCCATATCTTACATTTGA;SOR=1.897;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=45;TCR=16;TR=61;WE=92268539;WS=92268521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr14	92268615	rs2402073	T	G	6024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=114;NR=91;PP=2965;SC=ATACAGTCTCTTCACTTCTGA;SOR=0.903;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=206;TCF=114;TCR=92;TR=205;WE=92268623;WS=92268605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr14	92279983	rs17127600	T	G	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.449;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=8;PP=329;ReadPosRankSum=-1.157;SC=ATTCTTTATATTACAAAATGC;SOR=0.418;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=47;TCF=32;TCR=15;TR=22;WE=92279991;WS=92279973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,24:0.47:51
chr14	92336775	rs929608	T	C	152.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=5;PP=117;SC=GCCTGCATGGTGGCCCTGCAG;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=92336783;WS=92336765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr14	92343764	rs2430341	C	T	3057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=64;NR=41;PP=1743;SC=GCATACAGCACGTTCCTAGGA;SOR=1.022;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=64;TCR=41;TR=105;WE=92343772;WS=92343754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr14	92344244	rs2430342	T	C	3300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.821;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=84;PP=1696;ReadPosRankSum=-0.661;SC=ACCAACCAGATGTTCTGGCTA;SOR=0.802;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=287;TCF=131;TCR=156;TR=151;WE=92344252;WS=92344234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,166:0.51:327
chr14	92344300	rs2498847	A	G	1524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.062;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=45;PP=1024;ReadPosRankSum=1.919;SC=AGAACATTAGAACATTCTCCA;SOR=0.871;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=143;TCF=51;TCR=92;TR=67;WE=92344308;WS=92344290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,73:0.46:160
chr14	92347680	rs2430347	A	G	1668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.645;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=35;PP=971;ReadPosRankSum=-1.532;SC=GGATGGGGTCAATGCATTTGA;SOR=0.745;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=153;TCF=84;TCR=69;TR=72;WE=92347688;WS=92347670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,83:0.48:173
chr14	92361280	rs372515145	C	A	2970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.450;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=49;PP=1757;ReadPosRankSum=-0.182;SC=GTGACCCCCCCAGAGAGCTGT;SOR=0.738;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=235;TCF=140;TCR=95;TR=120;WE=92361288;WS=92361270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,141:0.53:265
chr14	92420861	rs2430336	C	T	222.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=6;PP=140;SC=CCTCAAGCAACCCTCTCACCT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=92420869;WS=92420851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr14	92454604	rs2273182	A	G	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.345;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=117;ReadPosRankSum=-0.180;SC=GTAGTGGGGGAAAAATGAAAA;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=6;WE=92454612;WS=92454594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr14	92454748	rs2273184	A	T	1151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.741;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=15;PP=459;ReadPosRankSum=-1.013;SC=AAACTTTATTAAAAAAAAGTA;SOR=0.793;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=82;TCF=50;TCR=32;TR=43;WE=92454756;WS=92454738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,56:0.55:101
chr14	92460098	rs2273185	C	A	1322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.296;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=23;PP=785;ReadPosRankSum=-0.232;SC=AAAGACTCTACAAGTAACTGT;SOR=0.516;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=109;TCF=70;TCR=39;TR=58;WE=92460106;WS=92460088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,65:0.53:123
chr14	92473943	rs3818095	T	C	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.624;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=288;ReadPosRankSum=1.484;SC=TTAGTTTACTTAGTAGAATGT;SOR=0.324;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=16;WE=92473951;WS=92473933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr14	92477168	rs2277526	A	G	1700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=10;PP=1239;SC=TCTGAACTTTACCCAGGTACT;SOR=2.876;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=39;TCR=10;TR=49;WE=92477176;WS=92477158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr14	92491843	rs1555210	C	T	785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.73;ReadPosRankSum=-0.827;SOR=0.512;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,39:0.58:67
chr14	92491853	rs2295171	T	C	328.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=546;ReadPosRankSum=0.574;SC=CGTACTGCTTTCCCCCCCCAA;SOR=0.796;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=47;TCF=21;TCR=26;TR=20;WE=92491861;WS=92491833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,21:0.40:53
chr14	92537105	.	C	T	79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=20;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=29;MQ=56.49;NF=6;NR=0;PP=79;QD=18.9618687579;SC=TTTTTTTTTTCTTTTGGTAAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=6;WE=92537113;WS=92537095;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr14	92537163	rs3092822	T	G	783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.557;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=10;PP=407;ReadPosRankSum=0.334;SC=TTACTTAAGATTCTTAATATG;SOR=0.326;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=66;TCF=49;TCR=17;TR=31;WE=92537171;WS=92537153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,36:0.48:75
chr14	92537223	rs7158733	G	T	1856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.713;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=33;PP=1046;ReadPosRankSum=-1.391;SC=CATGGAGCTCGTATGTCAGAT;SOR=0.580;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=177;TCF=105;TCR=72;TR=79;WE=92537231;WS=92537213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,94:0.46:204
chr14	92537353	.	C	CG,CCCTGCTGCTGCTGCTGCTGCT,CGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCT	871.73	.	AC=1,0,0;AF=0.500,0.00,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-3.359;ClippingRankSum=0.000;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=15.373;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=4.194;NF=0,2;NR=17,17;PP=370,347;ReadPosRankSum=1.183;SC=TGATAGGTCCCCCTGCTGCTG;SOR=0.057;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=17,19;WE=92537362;WS=92537342;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.60:53
chr14	92537354	.	C	G	824	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;FR=1.0000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=25;MQ=60.81;NF=3;NR=13;PP=824;QD=53.6732007842;SC=GATAGGTCCCCCTGCTGCTGC;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=41;TCF=8;TCR=33;TR=16;WE=92537362;WS=92537342;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:25,16:0.39:41
chr14	92537354	.	C	CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTG,CCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTG	1566.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;ALERT;AN=2;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=64.32;QD=41.23;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,31,7:0.82,0.18:38
chr14	92537379	.	T	C	168	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=62;MMLQ=28;MQ=56.15;NF=1;NR=3;PP=168;QD=50.6928031368;SC=GCTGCTGCTGTTGCTGCTTTT;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=4;WE=92537387;WS=92537369;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:17,4:0.19:21
chr14	92546144	rs2003721	T	C	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.930;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=30;ReadPosRankSum=0.619;SC=TGCAATGGCGTTATCTCAGCT;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=3;WE=92546152;WS=92546134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr14	92547145	rs761551	G	T	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=117;ReadPosRankSum=-0.772;SC=CTCCCAAACTGCTAGCATCAC;SOR=1.136;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=8;WE=92547153;WS=92547135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
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chr14	92547425	rs761553	C	G	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.08;ReadPosRankSum=0.198;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
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chr14	92549586	rs16999141	G	A	4186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=56;NR=100;PP=2965;SC=CACCCTTAACGACAAATATAG;SOR=1.516;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=157;TCF=56;TCR=101;TR=156;WE=92549594;WS=92549576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr14	92549632	rs12590497	C	A	862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.737;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=30;PP=692;ReadPosRankSum=-0.202;SC=ATCAACCTAACCAGTTAGTAA;SOR=0.163;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=71;TCF=18;TCR=53;TR=43;WE=92549640;WS=92549622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,37:0.64:58
chr14	92555199	rs8003041	T	C	926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.758;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=21;PP=582;ReadPosRankSum=1.321;SC=TAGTGTATATTATAGGTAATA;SOR=0.845;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=88;TCF=45;TCR=43;TR=40;WE=92555207;WS=92555189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,45:0.45:99
chr14	92559678	rs4904834	G	C	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=70;ReadPosRankSum=-0.693;SC=AAAGAAAACAGACAATATTAA;SOR=0.859;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=21;TCF=8;TCR=13;TR=8;WE=92559686;WS=92559668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr14	92560008	rs1997920	G	A	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.923;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=164;ReadPosRankSum=-0.156;SC=TATTCAAAATGTATTTCTCTT;SOR=0.275;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=9;WE=92560016;WS=92559998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr14	92562277	rs17847278	C	T	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.319;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=344;ReadPosRankSum=0.216;SC=CAGAACGAGACTCTGTCTCAA;SOR=0.993;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=22;WE=92562296;WS=92562267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,23:0.51:45
chr14	92562568	rs12147767	T	C	1200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=31;PP=696;ReadPosRankSum=-0.300;SC=TTTAAAACAATATCTTGTGCA;SOR=0.662;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=108;TCF=40;TCR=68;TR=50;WE=92562576;WS=92562558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,58:0.46:126
chr14	92588155	rs34343740	AT	A	267.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=2.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.24;MQRankSum=0.786;QD=9.92;ReadPosRankSum=0.850;SOR=0.238;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
chr14	92792255	rs941646	G	A	5588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=107;PP=2965;SC=TGCCAGACACGTGGAGAAATA;SOR=1.201;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=183;TCF=76;TCR=107;TR=183;WE=92792263;WS=92792245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr14	92792432	rs941645	T	C	633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=14;PP=391;SC=GTTTATGGACTTGAGTGGGAA;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=92792440;WS=92792422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr14	92905817	rs4900122	A	G	1547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=38;PP=874;ReadPosRankSum=0.787;SC=ATAAATGCCAAGCCAAGAAGG;SOR=0.642;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=124;TCF=48;TCR=76;TR=63;WE=92905825;WS=92905807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,73:0.51:143
chr14	92908617	rs185129035	T	C	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=156;ReadPosRankSum=-1.924;SC=AGTTTTCTCATCTGTAAAATG;SOR=0.527;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=8;TCR=26;TR=12;WE=92908625;WS=92908607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr14	92909073	rs941650	T	C	2335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.963;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=50;PP=1300;ReadPosRankSum=1.513;SC=TCATCACCCATGGGGACGTCG;SOR=0.783;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=231;TCF=127;TCR=104;TR=114;WE=92909081;WS=92909063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,122:0.48:253
chr14	92909979	rs72631612	C	T	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=2.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=71;ReadPosRankSum=-0.349;SC=ACCAGCGCCCCGACCCCCAGC;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=6;WE=92909987;WS=92909969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr14	92911593	rs6575255	C	A	2448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.369;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=46;PP=1274;ReadPosRankSum=-1.283;SC=GCCTGGGTGTCCGTGCTTGTT;SOR=0.902;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=237;TCF=132;TCR=105;TR=113;WE=92911601;WS=92911583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,126:0.48:264
chr14	92915625	rs36219241	TACACACACACAC	T,TAC	726.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=24;NF=0,0;NR=13,13;PP=394,139;SC=CTCTTTTGTGTACACACACAC;SOR=3.500;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=13,13;WE=92915646;WS=92915615;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.57,0.43:21
chr14	92920371	rs7144273	C	T	1954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.080;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=41;PP=1049;ReadPosRankSum=1.622;SC=AGTTTGGACCCAGGACCCGAC;SOR=0.760;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=179;TCF=95;TCR=84;TR=83;WE=92920379;WS=92920361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,93:0.48:195
chr14	92920423	rs17783624	C	A	1419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.231;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=35;PP=745;ReadPosRankSum=1.003;SC=GGTGAGTTTGCTTGAAGGACC;SOR=0.412;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=123;TCF=54;TCR=69;TR=67;WE=92920431;WS=92920413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,72:0.54:133
chr14	92922681	rs7156906	A	G	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.464;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=209;ReadPosRankSum=1.281;SC=TGAGGGACCCAGCGTATAGCA;SOR=0.400;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=37;TCF=29;TCR=8;TR=16;WE=92922689;WS=92922671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,20:0.48:42
chr14	92922713	rs7158400	T	C	2781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=29;PP=1742;SC=CTTTATCACATGCCTTGGTGT;SOR=1.681;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=64;TCR=29;TR=93;WE=92922721;WS=92922703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr14	92922900	rs77671856	G	A	1257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.326;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=32;PP=662;ReadPosRankSum=0.009;SC=AGCCACCACCGCCAGAGCCAG;SOR=0.447;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=112;TCF=46;TCR=66;TR=58;WE=92922908;WS=92922890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,62:0.50:125
chr14	92959216	rs11623883	G	A	2534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=44;NR=32;PP=1187;SC=AGCCTTGATCGAGGGACAAGG;SOR=0.735;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=44;TCR=32;TR=76;WE=92959224;WS=92959206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr14	92960025	rs4904942	T	C	1449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=31;PP=934;SC=ACACTGGCGTTCTCCTCTCCC;SOR=1.702;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=16;TCR=31;TR=47;WE=92960033;WS=92960015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
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chr14	92981606	rs55930890	C	G	1254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.267;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=31;PP=869;ReadPosRankSum=-0.317;SC=TGGGGAAGAGCCCCCCAACCC;SOR=0.805;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=144;TCF=71;TCR=73;TR=59;WE=92981614;WS=92981596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,62:0.39:158
chr14	93118038	rs3829947	A	G	2633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.410;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=55;PP=1494;ReadPosRankSum=-0.643;SC=CCCACAGCCCATGACGCAAAC;SOR=0.665;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=296;TCF=165;TCR=131;TR=129;WE=93118046;WS=93118028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,141:0.45:315
chr14	93118198	rs3814830	C	T	2944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=67;PP=1876;SC=CCTCTGATGCCACCTCACCCA;SOR=1.791;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=31;TCR=68;TR=98;WE=93118206;WS=93118188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr14	93118668	rs3742717	C	T	6067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=112;NR=87;PP=2965;SC=CCTGAGGACACGCCCCGGGAG;SOR=0.914;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=200;TCF=112;TCR=88;TR=199;WE=93118676;WS=93118658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr14	93154537	rs71698059	TGGC	T	8369.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.310;NF=13;NR=91;PP=2985;ReadPosRankSum=-0.125;SC=TGGACGGTGGTGGCGGCGGCG;SOR=0.910;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=130;TCF=13;TCR=117;TR=104;WE=93154550;WS=93154527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,191:0.98:195
chr14	93170741	rs2250672	T	C	6475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=108;NR=114;PP=2965;ReadPosRankSum=0.992;SC=TGGTGAACCGTGTCAACTCTG;SOR=0.288;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=223;TCF=108;TCR=115;TR=222;WE=93170749;WS=93170731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,246:1.00:247
chr14	93170901	rs2402189	A	C	3391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=44;SC=AGAAGTGAAAATGCCCACTTG;SOR=1.104;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=64;TCR=44;TR=108;WE=93170909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr14	93170993	rs9791	C	T	2329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.138;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=47;PP=1423;ReadPosRankSum=0.218;SC=ACCTGTGAAGCGGATACGGCT;SOR=0.550;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=228;TCF=127;TCR=101;TR=103;WE=93171001;WS=93170983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,114:0.45:252
chr14	93173010	rs17128502	C	T	1645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.936;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=36;PP=882;ReadPosRankSum=0.911;SC=TGGGGAGAAACGCGGCCTGTC;SOR=0.914;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=127;TCF=67;TCR=60;TR=69;WE=93173018;WS=93173000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,78:0.54:145
chr14	93176188	.	A	C	759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.062;ClippingRankSum=0.000;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.63;ReadPosRankSum=0.120;SOR=0.641;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,38:0.43:88
chr14	93178191	rs1951708	A	G	11249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=425;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=197;NR=190;PP=2965;SC=CCACGTCCGAATCTTCCATCC;SOR=0.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=387;TCF=197;TCR=190;TR=387;WE=93178199;WS=93178181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,424:1.00:424
chr14	93182466	rs1242119	G	A	2176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.995;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=48;PP=1292;ReadPosRankSum=-2.805;SC=TGTAGTATCCGTAAACAGACA;SOR=0.623;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=210;TCF=114;TCR=96;TR=100;WE=93182475;WS=93182456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,107:0.45:237
chr14	93183565	rs2295987	C	T	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=225;ReadPosRankSum=-0.260;SC=TTTCAAAACTCTCATAATTTA;SOR=0.730;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=13;WE=93183573;WS=93183555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr14	93185297	rs78143291	C	CCT	466.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.067;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.925;NF=0;NR=9;PP=323;ReadPosRankSum=0.468;SC=TGAATCATCCCGTCGGTCAGG;SOR=0.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=9;WE=93185305;WS=93185287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr14	93199080	rs2236264	C	T	2549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.594;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=48;PP=1491;ReadPosRankSum=0.130;SC=TCTATAGGAACGGCACCAATG;SOR=0.806;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=202;TCF=108;TCR=94;TR=107;WE=93199088;WS=93199070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,123:0.54:229
chr14	93199203	rs1613441	T	A	4366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=61;NR=76;PP=2374;SC=CAACAAGAACTGATAAACATT;SOR=1.172;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=137;TCF=61;TCR=76;TR=137;WE=93199211;WS=93199193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr14	93276654	rs1040835	T	C	6330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=113;NR=88;PP=2965;SC=TCTGCAGACTTTTCAGGAGAG;SOR=0.832;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=201;TCF=113;TCR=88;TR=201;WE=93276662;WS=93276644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr14	93276806	rs1040833	C	T	1750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=37;PP=1110;SC=CATTAACTGTCTAATATAATT;SOR=2.080;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=16;TCR=37;TR=53;WE=93276814;WS=93276796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr14	93282872	rs142530146	T	TCTTCG	490.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQ=60.51;NF=0;NR=7;PP=397;SC=TTCTCGCTTCTCTTCGCTTCG;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=7;WE=93282880;WS=93282862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr14	93285962	rs12880298	G	A	386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=13;NR=0;PP=318;SC=TGGGTGACGTGAGACTCTGAT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=93285970;WS=93285952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	93286291	rs10716250	AC	A	1901.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=38;PP=1440;SC=GCTTAGGGTTACCCCACAAGT;SOR=2.107;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=39;WE=93286299;WS=93286281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr14	93290723	rs3818256	A	G	1226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=3;PP=873;SC=TATTCACTTAATTATATACTC;SOR=4.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=34;WE=93290731;WS=93290713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr14	93290856	rs2273646	T	C	10052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.48;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr14	93290859	rs2273645	C	T	10085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.03;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr14	93303604	rs4904994	C	T	1350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=1;PP=1051;SC=AATTGTTCTTCTGTGGTAGCC;SOR=6.043;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=39;TCF=38;TCR=1;TR=39;WE=93303612;WS=93303594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr14	93303850	rs113573267	T	TG	2795.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=43;PP=1748;SC=CTAGTTTTTTTTTTTGTTTGT;SOR=3.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=0;TCR=50;TR=43;WE=93303863;WS=93303840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr14	93303854	rs74598769	T	C	2762.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.83;SOR=3.296;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr14	93303855	rs34061602	G	T	2700.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=48.23;SOR=3.422;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr14	93389403	rs7159323	A	C	1463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=35;NR=12;PP=964;SC=GGGACTGGACACCTGGGGAGT;SOR=1.938;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=48;TCF=35;TCR=13;TR=47;WE=93389411;WS=93389393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
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chr14	93398144	rs11851859	A	G	2905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=66;PP=1898;SC=CTTCATAACAACCCTGAAAGG;SOR=1.725;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=33;TCR=66;TR=99;WE=93398152;WS=93398134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr14	93398849	rs9658664	G	A	794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.850;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=14;PP=521;ReadPosRankSum=0.105;SC=GGTCCCGCAAGGCCTCTTCCG;SOR=0.930;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=74;TCF=44;TCR=30;TR=36;WE=93398857;WS=93398839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,38:0.49:78
chr14	93401178	rs941581	A	G	5321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=97;PP=2965;SC=CGGCCATTGAAGCAGAGCTGG;SOR=0.810;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=187;TCF=89;TCR=98;TR=186;WE=93401186;WS=93401168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr14	93401316	rs7610	T	C	449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=13;PP=367;SC=ATGGCCCGGATGCTGCTTCCG;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=16;WE=93401324;WS=93401306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr14	93407062	rs1043542	A	G	2174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.079;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=43;PP=1394;ReadPosRankSum=-0.244;SC=CACTAGAGACAAGGGGGTGGA;SOR=0.802;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=187;TCF=104;TCR=83;TR=100;WE=93407070;WS=93407052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,107:0.52:206
chr14	93407248	rs11446	A	G	1737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=28;PP=927;SC=TGGGGGGCCCAGAGGACGCCC;SOR=1.092;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=24;TCR=28;TR=52;WE=93407256;WS=93407238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr14	93532678	.	T	G	774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.247;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.02;ReadPosRankSum=0.596;SOR=0.646;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,21:0.49:43
chr14	93532680	.	T	G	774.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=3.245;ClippingRankSum=0.000;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.37;ReadPosRankSum=0.352;SOR=0.337;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr14	93532681	rs200126261	GTGTGTA	G	736.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.42;ReadPosRankSum=0.325;SOR=0.337;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr14	93649501	rs1046099	A	G	619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=6;PP=395;SC=TGCTCTACTCATTGCCATATC;SOR=1.893;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=24;WE=93649509;WS=93649491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr14	93651992	rs1268371	T	C	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=155;ReadPosRankSum=1.189;SC=GCGGGTATTATGGACCTGTTT;SOR=0.914;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=12;WE=93652000;WS=93651982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr14	93652504	.	G	A	496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.873;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.144;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=362;ReadPosRankSum=-2.010;SC=GCGAGCCACCGCGCCCGGCCT;SOR=3.352;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=18;WE=93652512;WS=93652494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,20:0.53:38
chr14	93673580	rs2255370	A	G	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=335;ReadPosRankSum=0.222;SC=TACGCCCCTCACGGCCGCTTT;SOR=0.598;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=24;WE=93673588;WS=93673570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,24:0.80:30
chr14	93681725	rs1263395	G	A	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=16;PP=300;ReadPosRankSum=-0.110;SC=ACTGGGCTCTGTGGTTATAAA;SOR=0.593;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=19;TCR=35;TR=25;WE=93681733;WS=93681715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,26:0.46:57
chr14	93693234	.	G	A	882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.781;ClippingRankSum=0.000;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.060;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=9;PP=645;ReadPosRankSum=1.766;SC=CTATGACCTCGGATTGCGATT;SOR=1.002;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=78;TCF=57;TCR=21;TR=38;WE=93693242;WS=93693224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,38:0.46:82
chr14	93715052	rs45461596	C	T	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=82;ReadPosRankSum=1.501;SC=ACACAAAAGACGACCCCGTGA;SOR=1.179;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=6;WE=93715060;WS=93715042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr14	93720181	rs8012209	T	C	1329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=14;NR=30;PP=892;SC=TGTAGTACTATAATACTACTA;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=14;TCR=30;TR=44;WE=93720189;WS=93720171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr14	93762162	rs2273639	C	T	755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=5;PP=587;SC=ACAAACCAGACTTAAGATTTA;SOR=2.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=28;WE=93762170;WS=93762152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr14	93799221	rs2273640	G	A	2225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=32;NR=45;PP=1246;SC=CGTCGCCTCCGCCGCCGCCGC;SOR=1.165;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=32;TCR=45;TR=77;WE=93799229;WS=93799211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr14	93799284	rs146686071	ACCG	A	592.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=10;PP=513;SC=TCCTCCTCCCACCGCCGCCGC;SOR=2.985;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=11;WE=93799294;WS=93799274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr14	93943998	rs61992606	G	A	5214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=99;NR=66;PP=2615;SC=TGATATCAACGTTGGCTACCT;SOR=0.809;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=165;TCF=99;TCR=66;TR=165;WE=93944006;WS=93943988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr14	93953907	rs33942732	A	AT	503.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.99;ReadPosRankSum=-1.480;SOR=1.688;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,24:0.86:28
chr14	93954192	rs12884458	C	T	874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=24;PP=665;SC=CATGTGAGAACGTCATCATCA;SOR=2.985;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=29;WE=93954200;WS=93954182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr14	93962691	rs8006093	G	A	312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=1;PP=242;SC=TCTTATATATGTATATCAAAG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=93962699;WS=93962681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	93963402	rs6575337	A	G	282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=1;PP=177;SC=ACTCACCTCAATCCCTCCATT;SOR=2.303;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=93963410;WS=93963392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr14	93998806	rs942068	C	A	1928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=16;PP=1284;SC=ACAGAGTGAGCCACTGTCTCA;SOR=2.165;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=61;TCF=45;TCR=16;TR=60;WE=93998814;WS=93998796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr14	94008753	rs12893237	A	G	3061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=35;PP=1708;SC=TAATGCACCTATAATAATTTT;SOR=1.220;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=64;TCR=35;TR=99;WE=94008761;WS=94008743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr14	94087438	.	G	A	1225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=0.000;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.938;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=35;PP=755;ReadPosRankSum=0.331;SC=GTACTCTACCGTTTGTTTGGG;SOR=1.021;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=80;TCF=26;TCR=54;TR=50;WE=94087446;WS=94087428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,55:0.60:91
chr14	94245649	rs4905087	A	G	11127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.23;SOR=1.071;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr14	94245652	rs4900195	C	T	11160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.47;SOR=1.116;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr14	94394715	rs11554726	C	T	2998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.274;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=70;PP=1773;ReadPosRankSum=3.069;SC=TGGATAAGTCCGCACCCTGCC;SOR=0.614;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=316;TCF=160;TCR=156;TR=144;WE=94394723;WS=94394705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:192,154:0.45:346
chr14	94400431	rs11625548	T	C	662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=6;PP=441;SC=CACATCTGCCTCGCTCCCGCT;SOR=1.708;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=20;WE=94400439;WS=94400421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr14	94405871	rs10873442	G	C	6478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=105;NR=129;PP=2965;SC=CGCGCTCGGGGGCCAGCGGCG;SOR=0.963;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=234;TCF=105;TCR=129;TR=234;WE=94405879;WS=94405861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr14	94406096	rs7155320	A	C	285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=5;PP=147;SC=CCAGCAGGAGAGCTCGGGCGC;SOR=1.270;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=9;TCF=4;TCR=5;TR=9;WE=94406104;WS=94406086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	94408103	rs75590567	G	A	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.027;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=322;ReadPosRankSum=-0.613;SC=GTCACAGCTGGTCTCCGGCAG;SOR=0.852;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=54;TCF=21;TCR=33;TR=22;WE=94408111;WS=94408093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,22:0.37:59
chr14	94410447	rs10134105	T	C	1151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=26;PP=783;SC=CTTAGACACCTTGAAGCCTCA;SOR=2.362;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=37;TCF=10;TCR=27;TR=36;WE=94410455;WS=94410437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr14	94417421	rs7147919	G	A	6668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=126;PP=2965;SC=TGCCGTAGGCGTTCTTGGATT;SOR=1.007;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=229;TCF=102;TCR=127;TR=228;WE=94417429;WS=94417411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr14	94417541	rs4277287	A	G	2258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=48;PP=1435;SC=TGGTGTCTGCATTGTGCTGCA;SOR=1.292;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=32;TCR=49;TR=80;WE=94417549;WS=94417531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr14	94417586	rs4483793	G	A	1001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=23;PP=652;SC=TCTTGCGCTCGCAGGCTGTGC;SOR=1.329;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=14;TCR=23;TR=37;WE=94417594;WS=94417576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr14	94419888	rs4243701	A	G	419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=10;PP=269;SC=CATGTAGGAGAAAGATACTCA;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=94419896;WS=94419878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr14	94423294	rs3765494	T	C	2371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.955;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=53;PP=1190;ReadPosRankSum=1.159;SC=CAGGCAGGAATGAGGATGGAG;SOR=0.621;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=232;TCF=119;TCR=113;TR=110;WE=94423302;WS=94423284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,124:0.49:255
chr14	94423327	rs66925826	T	A	1844.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.549;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=45;PP=1176;ReadPosRankSum=-2.266;SC=AGAGACTGACTGACAGACACA;SOR=0.632;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=176;TCF=82;TCR=94;TR=84;WE=94423335;WS=94423317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,90:0.47:191
chr14	94554550	rs998518	T	G	798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=8;PP=580;ReadPosRankSum=-0.103;SC=TGCTTCGGCTTCTTCTACTGC;SOR=0.686;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=74;TCF=54;TCR=20;TR=33;WE=94554558;WS=94554540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,37:0.44:84
chr14	94563193	rs7157940	T	C	3302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.308;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=55;PP=1990;ReadPosRankSum=-0.282;SC=GCAGCTTTATTCAAACCAGAT;SOR=0.554;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=211;TCF=123;TCR=88;TR=129;WE=94563201;WS=94563183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,146:0.63:233
chr14	94564035	rs2896258	A	G	2933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FS=1.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.39;ReadPosRankSum=-1.328;SOR=0.887;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,78:0.44:179
chr14	94564039	rs2402407	A	G	2946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FS=2.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.28;ReadPosRankSum=-1.329;SOR=0.923;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:102,79:0.44:181
chr14	94564058	rs2402408	G	A	1878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.791;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=29;PP=939;ReadPosRankSum=-3.037;SC=TTGCTGTGAAGGAGAGAAACC;SOR=0.855;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=160;TCF=90;TCR=70;TR=73;WE=94564066;WS=94564048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,93:0.49:189
chr14	94567032	rs3818119	CC	TT	834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.961;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=372;ReadPosRankSum=0.247;SC=GTACCCACTCCCATAGGTTTG;SOR=0.307;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=15;WE=94567041;WS=94567022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr14	94578162	rs2239644	G	T	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=188;ReadPosRankSum=0.686;SC=GCGAGGAGGCGGCTGGGAAGG;SOR=0.321;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=12;WE=94578170;WS=94578152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr14	94578188	rs1243080	C	A	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.693;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=140;ReadPosRankSum=0.727;SC=GGTCCTGTCCCGGGACCCGTG;SOR=0.446;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=8;WE=94578196;WS=94578178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr14	94582130	rs3833507	T	TGGCCATGGC	1373.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=7;PP=2962;ReadPosRankSum=0.808;SC=CCTGCAGTTGTGGCTGTGCCC;SOR=0.787;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=36;TCR=19;TR=20;WE=94582138;WS=94582120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,33:0.43:77
chr14	94594768	rs958187	T	G	1741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.993;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=11;PP=1322;ReadPosRankSum=-1.429;SC=TCACGGAACTTCAGGGTGAGA;SOR=0.297;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=99;TCF=84;TCR=15;TR=62;WE=94594776;WS=94594758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,63:0.63:100
chr14	94595794	rs45539232	G	A	880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.027;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=20;PP=665;ReadPosRankSum=-0.038;SC=GCTGGTTGATGAAGTCAGGGA;SOR=0.373;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=92;TCF=57;TCR=35;TR=45;WE=94595802;WS=94595784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,40:0.43:94
chr14	94696808	rs3833506	CAT	C	272.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.767;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.611;NF=4;NR=1;PP=120;ReadPosRankSum=-1.183;SC=CCTTAAAGGTCATATGTCTTA;SOR=0.057;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=5;WE=94696817;WS=94696798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr14	94697192	rs35773091	G	A	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.198;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=93;ReadPosRankSum=-0.073;SC=CTGCCTAGGAGTTGAGCAGTG;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=7;WE=94697200;WS=94697182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr14	94700138	rs4905172	C	G	1410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=30;PP=930;SC=TTATTACATTCGTTTAAAATG;SOR=1.755;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=14;TCR=30;TR=44;WE=94700146;WS=94700128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
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chr14	94750292	rs1950641	G	A	1382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.985;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=26;PP=721;ReadPosRankSum=0.547;SC=GTGCTTATGCGTGTCCTGAAT;SOR=0.537;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=142;TCF=87;TCR=55;TR=62;WE=94750300;WS=94750282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,72:0.45:161
chr14	94756119	rs2232704	C	T	1177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.737;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=19;PP=678;ReadPosRankSum=0.793;SC=TAGAAAATCACGTAGCGTTAA;SOR=0.578;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=104;TCF=69;TCR=35;TR=53;WE=94756127;WS=94756109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,56:0.50:111
chr14	94756450	rs2232700	T	A	1552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=35;PP=983;ReadPosRankSum=-0.469;SC=CTCCCCTGTGTGAGGCCCAGT;SOR=0.728;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=156;TCF=79;TCR=77;TR=70;WE=94756458;WS=94756440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,76:0.44:174
chr14	94756750	rs941591	T	C	1830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.443;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=50;PP=1043;ReadPosRankSum=-0.396;SC=TCTTCCTCACTGGCCTTCTCC;SOR=0.902;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=184;TCF=90;TCR=94;TR=90;WE=94756770;WS=94756740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,94:0.47:199
chr14	94756794	rs941590	T	C	1201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.267;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=35;PP=893;ReadPosRankSum=0.464;SC=CTCTTCCTCCTTGGGAGCCTG;SOR=0.961;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=126;TCF=53;TCR=73;TR=56;WE=94756802;WS=94756784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,57:0.43:134
chr14	94772429	rs2228543	G	A	1340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.597;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=24;PP=818;ReadPosRankSum=-1.967;SC=TCAGCTGGGCGTCCTGGGTGA;SOR=0.786;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=145;TCF=85;TCR=60;TR=61;WE=94772437;WS=94772419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,67:0.42:160
chr14	94772504	rs1042394	G	A	2114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=50;PP=1248;ReadPosRankSum=-1.734;SC=GCACATCTCCGAGGTCATAGA;SOR=0.663;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=179;TCF=87;TCR=92;TR=98;WE=94772512;WS=94772494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,105:0.55:190
chr14	94776219	rs2228542	C	T	3321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=354;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.824;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=81;PP=1922;ReadPosRankSum=-0.862;SC=AGGGGAGCTCCGAGTCATGAA;SOR=0.845;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=322;TCF=146;TCR=176;TR=142;WE=94776227;WS=94776209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:191,163:0.46:354
chr14	94776387	rs2281520	A	G	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.111;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=12;PP=669;ReadPosRankSum=1.088;SC=AGAGGAAAACACAGTTCCAGG;SOR=0.461;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=46;TCF=18;TCR=28;TR=21;WE=94776409;WS=94776377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,25:0.48:52
chr14	94776401	rs11160168	T	C	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=669;ReadPosRankSum=1.186;SC=TTCCAGGTGATCTCACGGGCC;SOR=0.818;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=38;TCF=14;TCR=24;TR=18;WE=94776409;WS=94776377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,21:0.49:43
chr14	94780608	rs3748320	G	A	1305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.059;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=29;PP=770;ReadPosRankSum=-0.714;SC=CATTGCCCATGGTCATTTCTA;SOR=0.512;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=135;TCF=62;TCR=73;TR=56;WE=94780616;WS=94780598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,65:0.42:155
chr14	94830555	rs3819333	C	T	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=141;ReadPosRankSum=1.636;SC=GATGTGAGGTCCACCCTCCCC;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=9;WE=94830563;WS=94830545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr14	94832739	rs41310932	A	C	2055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.221;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=41;PP=1132;ReadPosRankSum=-3.875;SC=TCTCTGTGCGAGTGTCAGCCT;SOR=0.509;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=175;TCF=95;TCR=80;TR=86;WE=94832747;WS=94832729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,98:0.51:194
chr14	94833033	rs1956172	T	C	1873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.558;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=46;PP=1264;ReadPosRankSum=-0.903;SC=CAGAGAATGGTATTGTCCTGC;SOR=0.754;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=159;TCF=70;TCR=89;TR=82;WE=94833041;WS=94833023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,89:0.51:175
chr14	94844843	rs1303	T	G	1716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.072;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=29;PP=878;ReadPosRankSum=0.851;SC=TGGTATTTTGTTCAATCATTA;SOR=0.917;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=199;TCF=112;TCR=87;TR=76;WE=94844851;WS=94844833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,90:0.41:219
chr14	94847415	rs6647	A	G	596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=4.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.35;ReadPosRankSum=0.141;SOR=0.384;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,35:0.37:94
chr14	94849201	rs709932	C	T	1386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=29;PP=843;ReadPosRankSum=-1.523;SC=GTTGAGGGTACGGAGGAGTTC;SOR=0.698;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=130;TCF=68;TCR=62;TR=61;WE=94849209;WS=94849191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,66:0.48:138
chr14	94909630	rs3818257	C	T	1037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.656;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=26;PP=526;ReadPosRankSum=-0.497;SC=CTCTGTCTGTCGGCAGCCTGA;SOR=0.412;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=102;TCF=35;TCR=67;TR=43;WE=94909638;WS=94909620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,52:0.46:114
chr14	94914455	rs10129672	A	T	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.831;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=151;ReadPosRankSum=0.049;SC=TAATTCTGTCAGAGCAAGCCT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=8;WE=94914463;WS=94914445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
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chr14	94964789	rs12433651	A	G	743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=22;PP=534;ReadPosRankSum=0.432;SC=AGAAAAAAAGAACATGATAAC;SOR=0.593;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=17;TCR=43;TR=31;WE=94964797;WS=94964779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,32:0.51:63
chr14	95028020	rs910352	C	T	1414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.800;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=14;PP=797;ReadPosRankSum=-0.905;SC=AGAAAGGCCCCGACTTAGGGT;SOR=1.160;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=108;TCF=75;TCR=33;TR=53;WE=95028028;WS=95028010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,62:0.52:120
chr14	95053890	rs6115	G	A	7362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=124;NR=116;PP=2965;SC=CCCAGCCAGAGCATCTTCTTC;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=240;TCF=124;TCR=116;TR=240;WE=95053898;WS=95053880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,272:1.00:272
chr14	95054176	rs6112	T	C	10475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=377;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=173;NR=170;PP=2965;SC=ACACTTTCCCTACCAACTTTA;SOR=0.736;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=345;TCF=174;TCR=171;TR=343;WE=95054184;WS=95054166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,376:1.00:376
chr14	95057270	rs6107	G	A	2315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=48;PP=1297;SC=GCTTCCCAAGGTCTATTCTGT;SOR=1.230;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=36;TCR=48;TR=84;WE=95057278;WS=95057260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr14	95057344	.	C	CTCCACTCCACTCCAGTTCACTCTATTCAAT	48.50	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.25;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr14	95057374	.	TTCCAC	T	91	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;FR=0.9998;HP=2;HapScore=2;MGOF=28;MMLQ=28;MQ=47.43;NF=0;NR=2;PP=91;QD=54.0;SC=CTCTATTCAATTCCACTCCAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=2;WE=95057386;WS=95057364;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,2:0.40:5
chr14	95057401	.	T	C	27	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.6;FR=0.9998;HP=2;HapScore=2;MGOF=54;MMLQ=28;MQ=42.43;NF=0;NR=2;PP=27;QD=30.8856062736;SC=CCAGTTCACTTTATTCAATTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=95057409;WS=95057391;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr14	95058360	rs6109	A	G	477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=245;SC=ACCTGCCCCTAGTGGCCTGGT;SOR=2.049;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=95058368;WS=95058350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr14	95058462	rs6116	A	C	3473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=38;PP=2076;SC=CGGGGACAATATTCACTTTCA;SOR=1.215;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=110;TCF=72;TCR=38;TR=110;WE=95058470;WS=95058452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr14	95058631	rs6108	A	T	2024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=46;PP=1341;SC=AAGGGGGCTAAGCTATGGCCC;SOR=1.641;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=22;TCR=46;TR=68;WE=95058639;WS=95058621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr14	95078677	rs1884082	G	T	1623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.846;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=29;PP=907;ReadPosRankSum=2.866;SC=TCCCAAGCAGGGGGAGGAGTT;SOR=0.565;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=155;TCF=95;TCR=60;TR=68;WE=95078685;WS=95078667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,80:0.44:181
chr14	95080803	rs4934	G	A	1714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=21;PP=1012;ReadPosRankSum=2.127;SC=ACCTCTCCTGGCTCTGGGGCT;SOR=0.648;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=127;TCF=86;TCR=41;TR=68;WE=95080811;WS=95080793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,76:0.54:140
chr14	95081744	rs2896288	G	A	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=8;PP=176;ReadPosRankSum=2.013;SC=TCCAGGGCGCGTAGGAGCTAG;SOR=0.610;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=44;TCF=26;TCR=18;TR=18;WE=95081752;WS=95081734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,19:0.38:50
chr14	95085465	rs8004988	C	G	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=301;ReadPosRankSum=1.337;SC=TCCACTGCTGCGGAAGCAGGG;SOR=0.869;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=16;WE=95085473;WS=95085455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr14	95088626	rs9323910	G	C	1057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.711;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=16;PP=504;ReadPosRankSum=-0.638;SC=GTGGGAGGCAGGTAGGTACTG;SOR=0.612;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=104;TCF=69;TCR=35;TR=48;WE=95088634;WS=95088616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,55:0.49:113
chr14	95088847	rs11625058	G	A	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.762;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=261;ReadPosRankSum=-0.202;SC=TTAGACTTGGGTCAATTCATC;SOR=1.241;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=14;WE=95088855;WS=95088837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,17:0.46:37
chr14	95107973	rs4905226	C	T	1247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.775;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=26;PP=721;ReadPosRankSum=-0.598;SC=GGGGTTCACCCTCACCGTGGT;SOR=0.715;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=91;TCF=50;TCR=41;TR=52;WE=95107981;WS=95107963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,57:0.57:100
chr14	95110017	rs1884084	G	T	954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.147;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=27;PP=596;ReadPosRankSum=-0.818;SC=AGATGAGGCAGCTGGAAGATG;SOR=0.435;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=74;TCF=21;TCR=53;TR=40;WE=95110025;WS=95110007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,43:0.56:77
chr14	95566068	rs201969638	TACACACACACACAC	T,TACACACAC	420.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=8.375;HP=1;HapScore=4;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=10,10;NR=1,1;PP=338,64;ReadPosRankSum=1.124;SC=TCCCTCCAGTTACACACACAC;SOR=3.126;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=28;TCF=17;TCR=11;TR=11,11;WE=95566091;WS=95566058;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.43:42
chr14	95566103	rs35300142	AC	A	1146.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.33;ReadPosRankSum=0.247;SOR=0.748;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,44:0.55:80
chr14	95566105	rs367764979	ACAC	A	1142.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.77;ReadPosRankSum=0.507;SOR=0.754;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,44:0.53:83
chr14	95566108	.	C	A	693	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=24;MMLQ=26;MQ=60.0;NF=27;NR=12;PP=693;QD=18.6608003217;SC=CACACACACACAAACTTACCA;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=80;TCF=55;TCR=25;TR=39;WE=95566116;WS=95566098;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:41,39:0.49:80
chr14	95581899	rs2275182	G	A	1216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.949;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=13;PP=726;ReadPosRankSum=-1.294;SC=GCAAGTCTAAGTAAAGACTGG;SOR=0.493;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=82;TCF=60;TCR=22;TR=47;WE=95581907;WS=95581889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,53:0.60:89
chr14	95659747	rs3180753	C	T	781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.001;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=13;PP=282;ReadPosRankSum=-1.439;SC=CTTCTGAGTACTGTACCTGCA;SOR=0.526;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=61;TCF=23;TCR=38;TR=23;WE=95659755;WS=95659737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,26:0.41:64
chr14	95659768	rs10130428	A	G	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=225;ReadPosRankSum=0.566;SC=GTGGCAACAGAGAATGGACAG;SOR=0.560;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=41;TCF=12;TCR=29;TR=15;WE=95659776;WS=95659758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,17:0.40:43
chr14	95682152	rs367902287	CTGTGTGTGTGTGTGTG	C,CTG	678.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0,0;NR=9,9;PP=216,49;ReadPosRankSum=1.411;SC=CTCTCTCTCTCTGTGTGTGTG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=9,9;WE=95682175;WS=95682142;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.45,0.50:20
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chr14	95696275	rs72710126	G	A	2690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=24;PP=1765;SC=CCGGCAGGGGGAGGCACTTAT;SOR=1.906;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=57;TCR=24;TR=81;WE=95696283;WS=95696265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
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chr14	95898487	rs1187747	G	A	3910.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.07;SOR=1.108;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
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chr14	95898675	rs8015054	G	A	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.205;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=254;ReadPosRankSum=0.259;SC=AAAGGCCGTGGCCAAGGCCGG;SOR=0.208;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=16;WE=95898683;WS=95898665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
chr14	95899477	rs10139523	T	C	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=293;ReadPosRankSum=-1.665;SC=GTCACCACTGTCTGGTGTGTG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=14;WE=95899485;WS=95899467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr14	95905840	rs17092236	C	T	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=151;ReadPosRankSum=1.874;SC=CGGCCCCTGGCTCCACACTGG;SOR=0.527;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=10;WE=95905848;WS=95905835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr14	95906023	rs17828632	G	A	2012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.123;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=33;PP=1210;ReadPosRankSum=-0.800;SC=CCTGCACCACGGCAGCACCCT;SOR=0.818;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=176;TCF=100;TCR=76;TR=82;WE=95906031;WS=95906013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,93:0.48:193
chr14	95906321	rs9671369	G	A	1569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.742;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=37;PP=1098;ReadPosRankSum=0.775;SC=CAGCTTTTGCGTGGTCACAAC;SOR=0.331;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=177;TCF=78;TCR=99;TR=76;WE=95906329;WS=95906311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,78:0.42:185
chr14	95906441	rs910791	A	G	1450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=36;PP=1025;ReadPosRankSum=1.537;SC=AGCCCAGGGCATCCTGAGTGC;SOR=0.880;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=49;TCF=12;TCR=37;TR=48;WE=95906449;WS=95906431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,52:0.98:53
chr14	95906476	rs910790	C	T	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=1.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.39;ReadPosRankSum=0.944;SOR=1.292;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr14	95910933	rs9919918	T	C	1720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.771;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.586;NF=48;NR=33;PP=918;ReadPosRankSum=0.117;SC=GCTCAAAAGCTGCTCCAAAGT;SOR=0.829;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=173;TCF=98;TCR=75;TR=81;WE=95910941;WS=95910923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,87:0.46:191
chr14	95910969	rs36019358	CAG	C	5081.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.453;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.931;NF=8;NR=57;PP=2634;ReadPosRankSum=0.941;SC=GCAGGCTCTGCAGAGACACAG;SOR=0.737;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=135;TCF=24;TCR=111;TR=65;WE=95910978;WS=95910959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,134:0.52:257
chr14	95911008	rs9919887	A	G	2024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.940;NF=42;NR=50;PP=1261;ReadPosRankSum=-0.087;SC=AGCGTTCCTCATGAGCACCGT;SOR=0.668;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=189;TCF=86;TCR=103;TR=92;WE=95911016;WS=95910998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,101:0.47:213
chr14	95911123	rs8007583	G	T	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=243;ReadPosRankSum=2.121;SC=CCCTGATGGAGTTGGGTGCCT;SOR=0.352;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=13;WE=95911131;WS=95911113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,15:0.79:19
chr14	95916566	rs10148435	G	A	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.623;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=7;PP=134;ReadPosRankSum=-1.303;SC=GCCTTCTCCTGTTTCAGTTGC;SOR=0.368;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=23;TCF=9;TCR=14;TR=12;WE=95916574;WS=95916556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr14	95918466	rs7144636	A	G	1861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.74;SOR=2.613;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr14	95918473	rs7144641	A	G	2121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.80;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr14	95918548	rs11362194	AC	A	6846.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=63;PP=2967;SC=GTTCCAGCACACCCTGAGTCC;SOR=1.149;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=112;TCF=48;TCR=64;TR=109;WE=95918556;WS=95918538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr14	95918625	rs4905318	T	C	7102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=127;NR=119;PP=2965;SC=TATCAGAGAGTGGCTTCAGGT;SOR=0.723;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=246;TCF=127;TCR=119;TR=246;WE=95918633;WS=95918615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,270:1.00:270
chr14	95918741	rs4905319	G	A	2618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.65;SOR=3.113;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr14	95918745	rs4905320	C	T	2536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.50;SOR=3.461;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr14	95918759	rs4905321	C	T	1380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=35;PP=997;SC=AGGTGAGGCTCCTCAACAGGA;SOR=3.816;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=5;TCR=35;TR=40;WE=95918767;WS=95918731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr14	95921741	rs4905324	C	T	2767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=39;PP=1633;SC=GTGCCACCAGCTCGTCCTCGG;SOR=1.000;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=95;TCF=56;TCR=39;TR=95;WE=95921749;WS=95921731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr14	95923470	rs146162422	ACTGTC	A	5588.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=58;PP=2957;SC=ACCCTCTGTGACTGTCCCTAG;SOR=0.998;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=29;TCR=58;TR=87;WE=95923482;WS=95923460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr14	95923670	rs2024863	A	C	3686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=55;NR=73;PP=2176;SC=GCAGATCTACACGCTTCTGTG;SOR=1.048;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=131;TCF=55;TCR=76;TR=128;WE=95923678;WS=95923660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
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chr14	95932628	rs4900270	T	C	2471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=69;PP=1705;SC=ACCTGCCTCCTGGGTCGGGGG;SOR=2.571;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=20;TCR=69;TR=89;WE=95932636;WS=95932618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
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chr14	96009307	rs716315	C	T	1253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.71;ReadPosRankSum=-0.657;SOR=0.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,63:0.44:144
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chr14	96129955	rs8015466	A	C	2303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.698;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=50;PP=1552;ReadPosRankSum=-0.436;SC=GTGTGGAGCCAAAGAGGGGAC;SOR=0.503;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=203;TCF=98;TCR=105;TR=101;WE=96129963;WS=96129945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,109:0.48:227
chr14	96131432	rs1743491	A	G	2515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=39;NR=45;PP=1387;SC=TGGAGGTGATATGCTTGAGAT;SOR=1.085;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=39;TCR=45;TR=84;WE=96131440;WS=96131422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr14	96135857	rs1748965	C	T	5246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=108;NR=65;PP=2965;SC=TGAGCCACCACGCCCGGTCAC;SOR=1.289;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=173;TCF=108;TCR=65;TR=173;WE=96135865;WS=96135847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr14	96157187	rs1064017	G	A	3414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.401;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=69;PP=1981;ReadPosRankSum=0.764;SC=GCTCTACCCCGGGAGGAAGTA;SOR=0.466;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=256;TCF=123;TCR=133;TR=141;WE=96157195;WS=96157177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,162:0.56:291
chr14	96157331	rs2075770	G	T	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.600;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=196;ReadPosRankSum=0.487;SC=TGGCCCCCTTGGGGTTCTTGT;SOR=0.287;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=42;TCF=7;TCR=35;TR=16;WE=96157339;WS=96157321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,18:0.38:47
chr14	96157482	rs1743530	C	T	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=121;ReadPosRankSum=1.319;SC=GGGAAATCCACAAGCTGGAGT;SOR=0.941;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=9;WE=96157490;WS=96157472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr14	96157679	rs34993719	T	A	1434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=28;PP=599;ReadPosRankSum=0.386;SC=GGCTGGTATGTTGGGGCCCTG;SOR=0.747;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=127;TCF=67;TCR=60;TR=59;WE=96157687;WS=96157669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,73:0.51:144
chr14	96157698	rs1748958	A	G	3643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=60;NR=61;PP=1840;SC=TGTGCGTCTCAGTGTAGGGAT;SOR=0.926;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=121;TCF=60;TCR=61;TR=121;WE=96157706;WS=96157688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr14	96178173	rs2296311	G	A	1337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=34;PP=812;ReadPosRankSum=0.648;SC=GGCATTGATCGGCCAGAGCCC;SOR=0.681;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=125;TCF=52;TCR=73;TR=60;WE=96178181;WS=96178163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,65:0.49:133
chr14	96179118	.	GA	G	31.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.309;ClippingRankSum=0.000;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=12.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.27;MQRankSum=-0.637;QD=0.43;ReadPosRankSum=1.246;SOR=0.356;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,13:0.18:73
chr14	96180242	rs1122138	C	A	1480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=25;PP=876;ReadPosRankSum=-0.287;SC=CTCCCAGGGGCTGCCCCTGCT;SOR=0.706;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=147;TCF=91;TCR=56;TR=67;WE=96180250;WS=96180232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,74:0.45:163
chr14	96556846	rs61985272	C	T	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=212;ReadPosRankSum=-0.267;SC=CCAGGCCTGTCTTAAGAGGAC;SOR=0.770;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=14;WE=96556854;WS=96556836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,15:0.33:45
chr14	96556914	rs2093722	T	C	1849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.471;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=32;PP=1044;ReadPosRankSum=-1.342;SC=TCCAAGCCAATGCTGTCCTTC;SOR=0.909;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=178;TCF=106;TCR=72;TR=81;WE=96556922;WS=96556904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,92:0.46:201
chr14	96557070	.	A	G	1711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.208;ClippingRankSum=0.000;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=34;PP=1095;ReadPosRankSum=-0.072;SC=ATTTCGCTGGAAAGGCAGCAG;SOR=0.670;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=141;TCF=73;TCR=68;TR=69;WE=96557078;WS=96557060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,77:0.49:157
chr14	96557121	rs10148419	T	C	5010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=72;PP=2839;SC=GCTTGGAGGCTGGCCAGACCA;SOR=0.878;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=169;TCF=97;TCR=72;TR=169;WE=96557140;WS=96557111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr14	96671139	rs1799722	C	T	1353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.191;HP=1;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.000;NF=33;NR=22;PP=751;ReadPosRankSum=0.975;SC=GATGACATCACTACCCAGCCC;SOR=0.734;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=115;TCF=62;TCR=53;TR=55;WE=96671147;WS=96671129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,65:0.51:128
chr14	96671207	rs71103505	GGGTGGGGAC	G	2924.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=27;PP=2986;SC=CTCCGAGGAGGGGTGGGGACG;SOR=0.957;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=46;TCF=5;TCR=41;TR=30;WE=96671223;WS=96671197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr14	96703347	rs2069577	C	A	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.944;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=322;ReadPosRankSum=-0.389;SC=CTGGAGAATGCGTGTATTTTG;SOR=1.329;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=41;TCF=30;TCR=11;TR=20;WE=96703355;WS=96703337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,24:0.52:46
chr14	96703484	rs1046248	C	T	1309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.008;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=30;PP=780;ReadPosRankSum=-0.251;SC=TCTGTCTGTTCGTGAGGACTC;SOR=0.526;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=67;TCR=65;TR=60;WE=96703492;WS=96703474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,67:0.42:159
chr14	96707457	rs5224	A	G	8279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=147;NR=130;PP=2965;SC=AGATCCAGACAGAGAGGAGGG;SOR=0.726;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=278;TCF=147;TCR=131;TR=277;WE=96707465;WS=96707447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,311:1.00:311
chr14	96730142	rs2071084	A	G	3932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=48;PP=2042;SC=GAGTGCTGCCAACATTTATCA;SOR=0.792;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=74;TCR=48;TR=122;WE=96730150;WS=96730132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr14	96734584	rs11160324	T	A	286.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5005;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=152;ReadPosRankSum=2.630;SC=CTCATCTGACTCCAACACCAA;SOR=0.914;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=10;WE=96734592;WS=96734576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,12:0.86:14
chr14	96742603	rs12893091	G	A	6723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=115;NR=115;PP=2965;SC=AGCTGAAATGGAGGCGTGAGG;SOR=0.784;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=230;TCF=115;TCR=115;TR=230;WE=96742611;WS=96742593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr14	96757361	rs10454690	T	A	525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=16;PP=422;SC=TTAAAACAAATTCTACAAATT;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=96757369;WS=96757351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr14	96758160	rs2275022	C	T	41.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=1;PP=24;SC=AAATATATATCTTACAATACA;SOR=0.693;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=2;TCF=1;TCR=1;TR=2;WE=96758168;WS=96758150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr14	96761557	rs1770547	A	C	1386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=34;PP=982;SC=TTCTTAGCAAACATTTAAATC;SOR=2.935;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=8;TCR=34;TR=42;WE=96761565;WS=96761547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr14	96768514	rs3215949	G	GA	1387.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.330;NF=0;NR=42;PP=875;ReadPosRankSum=-0.167;SC=TTAAAAATAAGAAAAAAAAAG;SOR=0.957;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=0;TCR=52;TR=42;WE=96768522;WS=96768504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,51:0.98:52
chr14	96770952	rs36013915	C	CA	103.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.835;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.80;MQRankSum=1.020;QD=7.41;ReadPosRankSum=-0.065;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr14	96771959	rs2289622	A	G	5171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=97;NR=63;PP=2965;SC=GGGAGGGACTATTCCAAAATC;SOR=1.050;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=162;TCF=98;TCR=64;TR=160;WE=96771967;WS=96771949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr14	96777408	rs3759602	T	C	1879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=18;PP=1076;SC=AATGTAAACATGTCACGACAT;SOR=1.296;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=42;TCR=18;TR=60;WE=96777416;WS=96777398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr14	96777468	rs3759601	G	C	4105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=53;PP=2596;SC=GACCTTCTTTGAAAGGCTCCA;SOR=0.948;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=132;TCF=79;TCR=53;TR=132;WE=96777476;WS=96777458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr14	96779895	rs1890914	A	G	74.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=3;PP=53;SC=GAAAATCATAACGGTAAAAGG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=96779903;WS=96779885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr14	96781912	rs9323945	T	C	4367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=82;PP=2839;SC=ATCACTCCATTCACTATGCCT;SOR=1.157;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=141;TCF=59;TCR=82;TR=141;WE=96781920;WS=96781902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr14	96797724	rs1822372	G	A	4062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=49;PP=2430;SC=TAAGGTGATCGTGTGAGCAAG;SOR=1.218;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=135;TCF=85;TCR=50;TR=134;WE=96797732;WS=96797714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr14	96813703	rs4905483	A	T	1372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=26;PP=761;SC=CAGGTTCATTATGAATCACAA;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=13;TCR=26;TR=39;WE=96813711;WS=96813693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr14	96829290	rs12434329	G	A	4266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=74;NR=75;PP=2781;SC=TCTTCTTGATGGACTCCGAAA;SOR=0.857;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=149;TCF=74;TCR=75;TR=149;WE=96829298;WS=96829280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr14	96848565	.	CT	C	57.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.40;ReadPosRankSum=-0.754;SOR=0.963;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr14	96852071	rs1545280	T	C	2770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=54;PP=1784;SC=AATGTTGATATAAAGCTTAAA;SOR=1.202;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=37;TCR=54;TR=91;WE=96852079;WS=96852061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr14	96864309	rs8019939	A	G	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.85;ReadPosRankSum=-0.619;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr14	96864327	rs41301765	A	G	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.251;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=104;ReadPosRankSum=-0.046;SC=AGCACTCGGGAAAGGTAAGTT;SOR=1.755;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=7;WE=96864335;WS=96864317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr14	96909025	rs12431832	A	G	1703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.913;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=29;PP=1044;ReadPosRankSum=0.909;SC=ATAGCCATCCACATATAACTG;SOR=0.445;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=152;TCF=98;TCR=54;TR=80;WE=96909033;WS=96909015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,85:0.54:157
chr14	96916232	.	G	GT	106	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;FR=0.9998;HP=14;HapScore=4;MGOF=7;MMLQ=16;MQ=60.6;NF=1;NR=2;PP=106;QD=37.0;SC=TATATGCGGTGTTTTTTTTTT;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=3;WE=96916240;WS=96916218;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:8,3:0.27:11
chr14	96922752	rs2369679	C	G	5511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=97;PP=2965;SC=AATTGGCCAACTACTACAAAC;SOR=0.805;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=186;TCF=89;TCR=97;TR=186;WE=96922760;WS=96922742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr14	97022168	.	AT	A	368.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.682;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=1.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.48;MQRankSum=1.001;QD=8.78;ReadPosRankSum=-0.662;SOR=1.164;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,23:0.55:42
chr14	97299853	rs2145635	A	G	2455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.501;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=44;PP=1575;ReadPosRankSum=0.570;SC=AGAGCTCTGCAAAGAGACATC;SOR=0.938;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=231;TCF=138;TCR=93;TR=113;WE=97299861;WS=97299843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,123:0.49:253
chr14	97312642	rs1951311	G	A	68.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=3;PP=47;SC=TGGGATTTGTGTGAAAGAATT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=97312650;WS=97312632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr14	97327098	rs10651861	T	TTG	1151.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.250;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=923;ReadPosRankSum=0.594;SC=AAATTATTCTTTGGTCTTCTT;SOR=1.002;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=39;TCF=3;TCR=36;TR=21;WE=97327106;WS=97327088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,30:0.59:51
chr14	97397509	rs28709257	G	C	723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.244;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=0;PP=525;ReadPosRankSum=0.661;SC=AGAGAGGGTGGTAGTGGGCAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=39;TCR=3;TR=24;WE=97397517;WS=97397499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,26:0.57:46
chr14	98217929	rs12893126	T	C	174.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=0;PP=171;SC=TGAGGGGGACTGAGAGGAACG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=98217937;WS=98217919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr14	98435696	rs2124843	T	C	11116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=413;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=194;NR=174;PP=2965;SC=AATATGGCTGTAAAGCTCGGT;SOR=0.733;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=369;TCF=194;TCR=175;TR=368;WE=98435704;WS=98435686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,412:1.00:412
chr14	98444253	rs8015127	C	A	2816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=56;NR=31;PP=1593;SC=CTGTAGGGACCATTTCCCACC;SOR=0.973;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=56;TCR=31;TR=87;WE=98444261;WS=98444243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr14	98444369	rs8016584	T	C	2513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=47;PP=1464;SC=ACCAAGCTGGTTTCCTCTCCG;SOR=1.434;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=30;TCR=47;TR=77;WE=98444377;WS=98444359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr14	99392468	rs200318	C	G	374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=270;SC=TGCATCACCTCTGTGTTGGCG;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=99392476;WS=99392458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr14	99642647	rs2487507	T	A	1612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=41;PP=1172;SC=GGGATCCCAGTGCCCTGCCTG;SOR=3.056;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=9;TCR=41;TR=50;WE=99642655;WS=99642637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
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chr14	99876505	rs1047351	A	G	992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.456;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=16;PP=672;ReadPosRankSum=0.201;SC=TAAGGAATGGAGGGTCTTAGG;SOR=0.988;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=62;TCR=35;TR=44;WE=99876513;WS=99876495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,49:0.43:115
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chr14	99929801	rs2273386	G	A	1375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.388;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=24;PP=850;ReadPosRankSum=1.552;SC=TTAAAATACAGTTATCATTCT;SOR=0.560;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=129;TCF=83;TCR=46;TR=64;WE=99929809;WS=99929791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,68:0.50:137
chr14	99961830	rs2069492	T	C	835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=9;PP=347;ReadPosRankSum=0.091;SC=TTGTTTCCCTTTTAGGTGACA;SOR=0.735;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=49;TCF=33;TCR=16;TR=30;WE=99961838;WS=99961820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,39:0.68:57
chr14	99981858	rs11621993	G	A	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=208;ReadPosRankSum=-1.058;SC=GCTAACTATCGGGCCTGAGCA;SOR=0.321;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=13;WE=99981866;WS=99981848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr14	99988724	rs2400681	A	G	322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=9;PP=258;SC=CCGCTTATCCATCCCCCGAGC;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=99988732;WS=99988714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	100002473	rs12882209	A	G	4228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=66;NR=76;PP=2284;SC=AGCAGACTCCATCCCCATTGC;SOR=1.049;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=142;TCF=66;TCR=76;TR=142;WE=100002481;WS=100002463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr14	100046271	rs34139518	T	TC	3561.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.084;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.576;NF=23;NR=37;PP=2173;ReadPosRankSum=1.231;SC=TCTGGCTCAGTCCAAGACTTT;SOR=0.601;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=125;TCF=51;TCR=74;TR=60;WE=100046279;WS=100046261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,119:0.55:216
chr14	100069742	rs8007401	G	A	274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=4;NR=5;PP=143;SC=GCCCGCTCAGGCTGGCCTGGC;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=9;TCF=4;TCR=5;TR=9;WE=100069750;WS=100069732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr14	100125721	rs7145262	C	T	1632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=9;PP=1138;SC=TGAGCCCTGGCTCAGGGCGAC;SOR=2.387;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=43;TCR=9;TR=52;WE=100125729;WS=100125711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr14	100129327	rs34890784	G	A	2806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.351;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=61;PP=1584;ReadPosRankSum=-0.539;SC=ACTACTACCCGTACATCATCT;SOR=0.755;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=285;TCF=150;TCR=135;TR=128;WE=100129335;WS=100129317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,141:0.46:308
chr14	100135306	rs12436072	G	A	2725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=64;PP=1874;SC=CCCAGGGCCAGGGTGGGGCCC;SOR=1.896;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=93;TCF=28;TCR=65;TR=92;WE=100135314;WS=100135296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr14	100141689	rs7158073	T	C	1571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.649;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=36;PP=853;ReadPosRankSum=1.053;SC=GAGGTGTTCGTGGGCGGACGC;SOR=0.512;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=165;TCF=99;TCR=66;TR=82;WE=100141697;WS=100141679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,84:0.48:176
chr14	100158241	rs4900442	C	T	954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.814;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=29;PP=617;ReadPosRankSum=0.328;SC=CCCTGCCTTTCCTTGGGTTGG;SOR=0.494;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=86;TCF=28;TCR=58;TR=45;WE=100158249;WS=100158231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,48:0.51:94
chr14	100161941	.	T	TTTATTA	63	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9990;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=18;MQ=60.0;NF=0;NR=1;PP=63;QD=68.0;SC=CCATTCCAGCTTTATTATTAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=1;WE=100161949;WS=100161931;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,1:0.14:7
chr14	100166228	rs3742377	G	A	1644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.569;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=32;PP=972;ReadPosRankSum=0.467;SC=ACAATGTGGCGCAACCGTCGC;SOR=0.621;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=170;TCF=108;TCR=62;TR=81;WE=100166236;WS=100166218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,82:0.48:170
chr14	100166300	rs943881	T	C	3105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.325;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=94;PP=2674;ReadPosRankSum=1.065;SC=CATCAAGCAGTCGCTCCCCAC;SOR=0.971;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=344;TCF=160;TCR=184;TR=170;WE=100166317;WS=100166290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,153:0.49:314
chr14	100166489	rs943880	G	C	631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=20;PP=350;ReadPosRankSum=0.708;SC=AGGCAGTAGGGGCTGCCGAAG;SOR=0.911;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=46;TCF=15;TCR=31;TR=29;WE=100166497;WS=100166479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,32:0.65:49
chr14	100172899	rs2273839	A	G	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.128;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=46;ReadPosRankSum=0.459;SC=TCTGCACAGTATCCTCTCTGT;SOR=0.646;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=11;TCR=5;TR=6;WE=100172907;WS=100172889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr14	100182082	rs3752957	T	C	803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=3.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.29;ReadPosRankSum=-0.750;SOR=1.075;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,41:0.42:97
chr14	100184589	rs7151522	A	G	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.677;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=302;ReadPosRankSum=-1.744;SC=GCCTTGGCACATGCTGTTCCC;SOR=0.418;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=18;WE=100184597;WS=100184579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
chr14	100189423	rs12896665	A	G	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.109;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=25;PP=509;ReadPosRankSum=0.634;SC=CCGATTTTGTATCTGCTGCCA;SOR=0.430;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=74;TCF=22;TCR=52;TR=37;WE=100189431;WS=100189413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,37:0.49:76
chr14	100192685	rs141174869	G	GGGGCTGCT	263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.96;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr14	100317376	rs72708401	G	A	720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=7;NR=16;PP=530;SC=ACCAAAGGTGGGCGTTTGAGT;SOR=1.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=23;WE=100317384;WS=100317366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr14	100331876	rs11160553	T	C	2934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.485;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=60;PP=1823;ReadPosRankSum=0.920;SC=AGACCCTGCCTTTAAGAACCA;SOR=0.558;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=265;TCF=147;TCR=118;TR=127;WE=100331884;WS=100331866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,144:0.48:302
chr14	100344698	rs1191118	T	C	724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=1;PP=506;SC=TGATCTCCGTTGCTAGGCCTG;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=100344706;WS=100344688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
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chr14	100363336	rs17652784	T	C	690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=1;PP=515;SC=GTATTTGTCATGGAATATTTG;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=100363344;WS=100363326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
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chr14	100375707	rs34198557	C	T	3385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.318;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=72;PP=2011;ReadPosRankSum=-0.810;SC=GTGTTTGCTGCGGATTTCCAC;SOR=0.612;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=285;TCF=134;TCR=151;TR=139;WE=100375715;WS=100375697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,161:0.50:323
chr14	100376502	rs10140426	C	T	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.935;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=155;ReadPosRankSum=0.131;SC=GTTATTAGTACAAATGAAAGG;SOR=0.320;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=12;WE=100376510;WS=100376492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr14	100376715	rs2145859	G	A	630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.963;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=19;PP=391;ReadPosRankSum=0.363;SC=ATGGTTTTTGGTAATGTTGTA;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=63;TCF=23;TCR=40;TR=30;WE=100376723;WS=100376705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,31:0.45:69
chr14	100380948	rs2250718	T	C	3054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=53;NR=53;PP=1977;SC=TGCCTCAAAATCTCAGTTCTT;SOR=0.710;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=53;TCR=53;TR=106;WE=100380956;WS=100380938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr14	100383963	rs3818279	C	G	316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=3;PP=240;SC=AGCAGGAAAACATTTTTCTCT;SOR=1.802;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=11;WE=100383971;WS=100383953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	100384232	rs2273704	A	C	1649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=44;PP=1086;SC=CTTATGGAAAAGAGGCCTGTT;SOR=2.457;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=12;TCR=44;TR=56;WE=100384240;WS=100384222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr14	100387242	rs34263849	A	AT	7056.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=1.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.004;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.306;NF=9;NR=110;PP=2979;ReadPosRankSum=2.019;SC=TCACTACTTTATTTTTTTAAT;SOR=1.349;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=147;TCF=9;TCR=138;TR=119;WE=100387250;WS=100387232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,240:0.98:244
chr14	100402326	rs3215696	ATTG	A	2126.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.525;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.927;NF=21;NR=15;PP=1375;ReadPosRankSum=0.034;SC=CAAAATGTGTATTGTTAACAT;SOR=0.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=91;TCF=53;TCR=38;TR=36;WE=100402336;WS=100402316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,58:0.45:128
chr14	100402528	rs147052903	G	A	2718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.186;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=52;PP=1577;ReadPosRankSum=-0.994;SC=CCGTGGAACAGTGTTGGCAGG;SOR=0.552;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=235;TCF=120;TCR=115;TR=115;WE=100402536;WS=100402518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,126:0.49:255
chr14	100404067	rs2295788	A	G	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=190;ReadPosRankSum=0.845;SC=TCTGTACCCAACGGGGCACAG;SOR=0.641;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=9;WE=100404075;WS=100404057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr14	100404351	rs2295787	T	C	4359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=84;PP=2677;SC=TCTTGTCAGATTGCTCGGCTG;SOR=1.506;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=135;TCF=51;TCR=84;TR=135;WE=100404359;WS=100404341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr14	100405757	rs2236282	C	T	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=333;ReadPosRankSum=-0.355;SC=GGGCTGTGAGCGACTGCTGCC;SOR=0.950;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=18;WE=100405765;WS=100405747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
chr14	100406193	rs4900449	T	A	902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.817;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=10;PP=427;ReadPosRankSum=-2.282;SC=CAGAGCAGGTTCCCAAGTGAG;SOR=0.836;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=86;TCF=60;TCR=26;TR=36;WE=100406201;WS=100406183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,44:0.44:99
chr14	100592959	rs726514	G	A	1516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=15;PP=901;SC=CTCTGAAGCCGGGGCCGGCGG;SOR=1.371;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=34;TCR=15;TR=49;WE=100592967;WS=100592949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr14	100599164	rs941897	G	A	1057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=23;PP=693;SC=TGAGATGAGCGCATCGCCAGG;SOR=1.096;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=15;TCR=23;TR=38;WE=100599172;WS=100599154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr14	100607360	rs1951486	T	C	1138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=1;PP=889;SC=GGGCGTTAAATCCTTCTCAGG;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=34;WE=100607368;WS=100607350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr14	100608274	rs4905933	T	C	378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=11;PP=307;SC=TTACCATCTCTAGTTGAGGAA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=100608282;WS=100608264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr14	100615665	rs4905936	T	C	4865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=90;PP=2686;SC=TGCGGGCGGGTGTGCAGAAGA;SOR=0.971;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=166;TCF=76;TCR=90;TR=165;WE=100615673;WS=100615655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr14	100625902	rs7157599	C	T	5527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=99;NR=96;PP=2965;SC=CTCGAAGTCGCTGCGGCTCGC;SOR=0.770;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=195;TCF=99;TCR=96;TR=195;WE=100625910;WS=100625892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr14	100740904	rs4905942	G	C	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.123;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=82;ReadPosRankSum=1.150;SC=CATCCTTTCTGCTTCATGGAA;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=5;WE=100740912;WS=100740894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr14	100758502	rs11557208	G	A	1382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.038;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=23;PP=613;ReadPosRankSum=0.090;SC=TTCAGCCCACGTCTGATAGAC;SOR=0.763;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=112;TCF=61;TCR=51;TR=57;WE=100758510;WS=100758492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,70:0.51:137
chr14	100759046	rs3825555	C	A	4353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=392;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.642;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.370;NF=90;NR=99;PP=2859;ReadPosRankSum=-0.120;SC=CGAAGCTGGGCGTCTCACGCA;SOR=0.605;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=356;TCF=168;TCR=188;TR=189;WE=100759054;WS=100759036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:190,202:0.52:392
chr14	100759277	rs3742379	C	T	3039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.23;ReadPosRankSum=-0.306;SOR=0.705;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:147,150:0.51:297
chr14	100772672	rs11557209	G	C	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=139;ReadPosRankSum=0.824;SC=TGCCGGGGCTGGGCCTGGCCG;SOR=0.724;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=34;TCF=12;TCR=22;TR=15;WE=100772680;WS=100772662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,15:0.39:38
chr14	100792220	rs7155877	C	T	10207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=387;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=185;NR=158;PP=2965;SC=CACCTGTCCACGGCCAGGAGA;SOR=0.819;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=344;TCF=185;TCR=159;TR=343;WE=100792228;WS=100792210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,387:1.00:387
chr14	100792482	rs1951519	C	A	2629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.975;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=59;PP=1582;ReadPosRankSum=0.858;SC=CTGAAGCCCACTTCTCCTGCA;SOR=0.766;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=217;TCF=109;TCR=108;TR=113;WE=100792490;WS=100792472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,128:0.52:245
chr14	100793431	rs1535464	G	A	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.653;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=225;ReadPosRankSum=-0.670;SC=CCCGAGGTCCGACAGCGGAGT;SOR=0.018;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=18;WE=100793439;WS=100793421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr14	100795139	rs35007880	G	T	2950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.854;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=58;PP=1644;ReadPosRankSum=-1.411;SC=CAGCAGCGGCGGCTTTCGGCC;SOR=0.752;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=288;TCF=153;TCR=135;TR=128;WE=100795147;WS=100795129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,146:0.46:314
chr14	100795338	rs8015259	G	C	2301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-2.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.212;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=1.017;NF=53;NR=55;PP=1092;ReadPosRankSum=0.250;SC=TTTCCTACGCGGTCCTCTGCG;SOR=0.563;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=198;TCF=94;TCR=104;TR=108;WE=100795346;WS=100795328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,118:0.50:234
chr14	100801423	rs2234532	T	C	545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=19;PP=430;SC=ATGTCCTGAGTGGCTCCTTCC;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=100801431;WS=100801413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr14	100803364	rs2234530	A	G	1608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=21;PP=1023;ReadPosRankSum=-0.854;SC=TGGGTGGCAGAAGGCGGCTGT;SOR=0.762;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=107;TCF=71;TCR=36;TR=61;WE=100803372;WS=100803354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,69:0.57:122
chr14	100803655	rs2234528	C	A	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=319;ReadPosRankSum=-0.188;SC=ATTCTGGACCCGGGAAAGGCC;SOR=0.409;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=17;WE=100803663;WS=100803645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr14	100808493	rs5810992	G	GA	3378.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=37;PP=981;SC=AGGAAAAAAAGAAAAAAAATT;SOR=1.219;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=68;TCF=26;TCR=42;TR=59;WE=100808501;WS=100808483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr14	100808510	rs1373	T	A	1660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.282;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=29;PP=870;ReadPosRankSum=-1.273;SC=AATTCAAAATTTTACCTAAAT;SOR=0.589;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=126;TCF=76;TCR=50;TR=71;WE=100808518;WS=100808500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,83:0.55:152
chr14	100808845	rs9453	G	A	521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.517;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=314;ReadPosRankSum=-0.344;SC=GTGGAGTGCAGCAGGGCTGGT;SOR=1.626;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=40;TCF=16;TCR=24;TR=21;WE=100808853;WS=100808835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
chr14	100813077	rs941923	T	C	1375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.809;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=12;PP=815;ReadPosRankSum=0.321;SC=GCAGTGGGCCTCTTACCAATG;SOR=0.839;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=87;TCF=65;TCR=22;TR=52;WE=100813085;WS=100813067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,60:0.57:105
chr14	100820980	rs1009812	G	A	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.715;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=314;ReadPosRankSum=1.758;SC=TTTGGAAATGGAAAATATAGA;SOR=1.911;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=16;WE=100820988;WS=100820970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr14	100826773	rs2234524	C	G	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=142;ReadPosRankSum=-2.298;SC=TCAGTCTTACCACAGCTGGCC;SOR=0.822;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=13;WE=100826781;WS=100826763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,15:0.39:38
chr14	100832282	rs2146105	C	G	804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=11;PP=444;ReadPosRankSum=1.073;SC=AGTGACCTTGCGCACTTACAG;SOR=0.714;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=96;TCF=64;TCR=32;TR=36;WE=100832290;WS=100832272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,42:0.39:109
chr14	100832391	rs724391	T	C	1654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.121;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=35;PP=794;ReadPosRankSum=1.131;SC=GCCAAGGGAGTGTCACAGTTT;SOR=0.604;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=167;TCF=86;TCR=81;TR=78;WE=100832399;WS=100832381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,86:0.45:191
chr14	100847523	rs2181170	T	C	5290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=78;PP=2863;SC=GAGAAGCGATTGGGGATCTTG;SOR=0.756;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=167;TCF=89;TCR=78;TR=166;WE=100847531;WS=100847513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr14	100847707	rs2273800	A	G	6813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=123;NR=106;PP=2965;SC=TCATCTTTCCATGCTCAAAGT;SOR=0.774;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=229;TCF=123;TCR=106;TR=229;WE=100847715;WS=100847697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr14	100847930	rs3742387	A	G	8050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=141;NR=137;PP=2965;SC=TTATTCAGCCATATTTGAATA;SOR=0.726;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=278;TCF=141;TCR=137;TR=278;WE=100847938;WS=100847920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,303:1.00:303
chr14	100848359	.	A	G	1462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.294;ClippingRankSum=0.000;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.086;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=21;PP=805;ReadPosRankSum=0.218;SC=GAGAGTGATTAGTGGGAGAAG;SOR=0.882;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=126;TCF=77;TCR=49;TR=60;WE=100848367;WS=100848349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,70:0.49:144
chr14	100934602	rs4905966	C	T	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.392;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=300;ReadPosRankSum=0.448;SC=TATACGCTTGCGTGGCAGAGG;SOR=1.002;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=39;TCF=10;TCR=29;TR=17;WE=100934610;WS=100934592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
chr14	100995793	rs7493442	G	C	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.162;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=157;ReadPosRankSum=-1.088;SC=TCTCAGAAGTGGGGGGCAGGA;SOR=1.609;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=10;WE=100995801;WS=100995783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr14	100996312	rs13065	T	C	2058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.985;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=47;PP=1374;ReadPosRankSum=0.497;SC=GCACCACCTATCACCCCGTGC;SOR=0.624;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=233;TCF=129;TCR=104;TR=101;WE=100996320;WS=100996302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,107:0.44:245
chr14	101005215	rs12893951	T	C	2598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.858;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=35;PP=835;ReadPosRankSum=-0.294;SC=GCAGTGAGCCTGCGTAGCTGG;SOR=0.553;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=157;TCF=78;TCR=79;TR=70;WE=101005223;WS=101005205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,76:0.42:180
chr14	101005236	rs12892571	A	G	2269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.770;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=33;PP=898;ReadPosRankSum=1.668;SC=GGAAGGCCTCATGCTGGAAGC;SOR=0.482;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=70;TCR=82;TR=62;WE=101005244;WS=101005226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,66:0.38:172
chr14	101007072	rs6575788	C	G	1123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=26;PP=744;SC=CCCTCTCTGGCCTCCACACTC;SOR=3.797;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=30;WE=101007080;WS=101007062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr14	101012779	.	C	G	217	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=31;MMLQ=24;MQ=57.97;NF=8;NR=2;PP=217;QD=25.1771212547;SC=CCTCGCCCCGCCCCGGCCCTC;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=101012787;WS=101012769;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr14	101012796	.	C	G	486	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=18;NR=7;PP=486;QD=20.8308485019;SC=CCTCGCCCCGCCCCGGCCCTC;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=26;TCF=18;TCR=8;TR=25;WE=101012804;WS=101012786;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,25:0.96:26
chr14	101012813	.	C	G	683	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=22;MQ=60.0;NF=32;NR=13;PP=683;QD=15.9504713899;SC=CCTCGCCCCGCCCCGGCCCTC;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=77;TCF=54;TCR=23;TR=45;WE=101012821;WS=101012803;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:32,45:0.58:77
chr14	101013100	.	GGCGC	G	53	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MMLQ=21;MQ=60.49;NF=0;NR=6;PP=53;QD=10.1666666667;SC=CGCGAGTACCGGCGCGCGCGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=6;WE=101013111;WS=101013090;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:10,6:0.38:16
chr14	101034190	rs61993005	G	A	1013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.26;ReadPosRankSum=-1.392;SOR=0.563;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,48:0.53:90
chr14	101034419	rs58030748	T	C	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=318;ReadPosRankSum=-0.402;SC=CGTCCCCAGCTTCCAGTCCCG;SOR=0.293;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=16;WE=101034427;WS=101034409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr14	101036052	rs7141087	T	C	4115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=344;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.814;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=75;PP=2480;ReadPosRankSum=0.294;SC=AATCCAAGTGTTCCTCCATCC;SOR=0.741;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=310;TCF=172;TCR=138;TR=171;WE=101036060;WS=101036042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,189:0.55:344
chr14	101138230	rs8011237	A	C	8947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=166;NR=131;PP=2965;SC=CTCTCCTAGAACTTTCTGTCG;SOR=0.897;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=297;TCF=166;TCR=131;TR=297;WE=101138238;WS=101138220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,331:1.00:331
chr14	101138506	rs73358743	C	T	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=200;ReadPosRankSum=-0.304;SC=CCCCCTCACTCGAGACCACTC;SOR=1.078;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=13;WE=101138514;WS=101138496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr14	101198417	rs6575799	A	G	3952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=49;PP=2376;SC=TGCCAACAACAGGACCTGCGT;SOR=1.248;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=85;TCR=49;TR=134;WE=101198425;WS=101198407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr14	101198609	rs77235285	C	T	2859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=60;PP=1695;SC=CTGGACCTGTCGTCTGACAAA;SOR=1.480;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=37;TCR=60;TR=97;WE=101198617;WS=101198599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr14	101200445	rs17577779	T	C	923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=2;PP=703;SC=TGTTGTAGCCTAGCCCCTGAG;SOR=4.479;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=27;WE=101200453;WS=101200435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr14	101200645	rs1802710	T	C	11780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=444;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=198;NR=198;PP=2965;SC=GCACTGACATTGGGGGCGACT;SOR=0.768;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=396;TCF=198;TCR=198;TR=396;WE=101200653;WS=101200635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,444:1.00:444
chr14	101301012	rs10132552	T	C	1170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.773;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=16;PP=810;ReadPosRankSum=-0.028;SC=CAGCCCCGTGTCTCCTCAGGG;SOR=0.572;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=104;TCF=72;TCR=32;TR=50;WE=101301020;WS=101301002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,52:0.48:109
chr14	101301261	rs11160606	C	T	509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.191;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=360;ReadPosRankSum=-0.478;SC=TGCATTCACCCGCGCGGCCAT;SOR=0.020;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=38;TCF=5;TCR=33;TR=21;WE=101301269;WS=101301251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,20:0.53:38
chr14	101302463	rs55996894	G	C	663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.168;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=7;PP=510;ReadPosRankSum=0.947;SC=TTTCCGGGGCGCTTGCCTTGC;SOR=0.509;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=55;TCF=43;TCR=12;TR=29;WE=101302471;WS=101302453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,29:0.53:55
chr14	101302800	rs12889884	C	G	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=255;ReadPosRankSum=-0.652;SC=GGAGAGCTGCCTGGAGTGGAG;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=15;WE=101302808;WS=101302790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr14	101311731	rs139003317	CCCT	C	2220.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.704;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=20;PP=1337;ReadPosRankSum=0.711;SC=TCCTCATCCGCCCTCCTCCTC;SOR=0.601;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=76;TCF=29;TCR=47;TR=31;WE=101311741;WS=101311721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,58:0.50:117
chr14	101335604	rs12886011	A	C	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.742;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=55.38;MQRankSum=0.860;NF=0;NR=7;PP=80;ReadPosRankSum=-0.848;SC=TGTGGGCATGAGTGCAGAGGA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=7;WE=101335612;WS=101335594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr14	101340805	rs41286558	G	A	734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=14;PP=485;ReadPosRankSum=-0.502;SC=CTTGCACTGCGCTTCCGGGAG;SOR=0.679;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=35;TCR=26;TR=32;WE=101340813;WS=101340795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,34:0.53:64
chr14	101347037	rs34696219	AG	A	1961.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.333;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQ=60.08;MQRankSum=1.050;NF=14;NR=24;PP=1234;ReadPosRankSum=2.277;SC=TGCTGGAGACAGGGAGGCGTC;SOR=0.366;SbPval=0.1;Source=Platypus;TC=91;TCF=48;TCR=43;TR=38;WE=101347045;WS=101347027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,68:0.48:141
chr14	101347194	.	C	T	1731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.785;ClippingRankSum=0.000;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.930;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=43;PP=1009;ReadPosRankSum=2.154;SC=TGCCTGCTCCCGGCTGAGCAG;SOR=1.063;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=134;TCF=59;TCR=75;TR=73;WE=101347202;WS=101347184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,81:0.54:150
chr14	101348202	.	GAGA	G	4619.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.481;ClippingRankSum=0.000;DP=371;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.867;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.236;NF=12;NR=59;PP=2856;ReadPosRankSum=0.287;SC=GTTGAAGTGGGAGAAGAAGAA;SOR=0.818;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=208;TCF=34;TCR=174;TR=71;WE=101348212;WS=101348192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:208,126:0.38:334
chr14	101348584	rs11623267	C	G	1907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.786;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.107;NF=37;NR=42;PP=1314;ReadPosRankSum=-0.262;SC=TCTTGCTCCTCGACTCCCCAG;SOR=0.832;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=179;TCF=87;TCR=92;TR=79;WE=101348592;WS=101348574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,84:0.44:189
chr14	101349017	rs6575805	A	G	6719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=108;NR=115;PP=2965;SC=GGGAGAGCGCAAACGGCTGGT;SOR=0.811;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=223;TCF=108;TCR=115;TR=223;WE=101349025;WS=101349007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr14	101349764	rs34163305	C	T	3246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=344;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.392;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=74;PP=2085;ReadPosRankSum=0.207;SC=GCTGTGGGTACGGCTTCTCGT;SOR=0.648;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=308;TCF=157;TCR=151;TR=150;WE=101349772;WS=101349754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,158:0.46:343
chr14	101350298	rs3825569	T	C	3758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=53;PP=2427;ReadPosRankSum=0.262;SC=ACTCAAACACTTCGGACATGG;SOR=0.330;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=120;TCF=67;TCR=53;TR=119;WE=101350306;WS=101350288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,133:0.99:134
chr14	101350670	rs35401447	C	CTCT	1627.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.534;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=1062;ReadPosRankSum=-0.575;SC=TCTGGTTTTGCTCTTGAGGAG;SOR=1.105;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=75;TCF=22;TCR=53;TR=24;WE=101350678;WS=101350660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,44:0.38:116
chr14	101351283	rs41286564	C	G	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=37;ReadPosRankSum=-1.299;SC=GTATCAGGGTCTCAAGGACAA;SOR=0.582;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=6;WE=101351291;WS=101351273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr14	101377736	rs9324026	A	G	124.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=4;PP=84;SC=TGATGGGGAAACAGGCACAGA;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=101377744;WS=101377726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr14	101391354	rs34857222	G	T	1200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=32;PP=856;ReadPosRankSum=1.944;SC=ACAAAGAAATGTGTAAGTGAA;SOR=0.776;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=32;TCR=58;TR=50;WE=101391362;WS=101391344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,53:0.56:95
chr14	101396148	rs35436326	G	A	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=140;ReadPosRankSum=-0.666;SC=CAAGGATCTTGTTCTTAGTTT;SOR=0.719;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=12;WE=101396156;WS=101396138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr14	101403072	rs1956732	T	C	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.200;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=27.64;ReadPosRankSum=-0.282;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr14	101403075	rs1956731	C	A	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.200;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=27.64;ReadPosRankSum=-0.282;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr14	101406011	rs1951026	G	A	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=13;PP=636;ReadPosRankSum=0.721;SC=ATGAGTCTAGGACCTTGTTCA;SOR=0.665;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=82;TCF=42;TCR=40;TR=25;WE=101406030;WS=101406001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,29:0.29:99
chr14	101406022	rs1951025	T	A	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=13;PP=636;ReadPosRankSum=1.207;SC=ACCTTGTTCATGGGCCTTTTG;SOR=0.666;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=74;TCF=35;TCR=39;TR=23;WE=101406030;WS=101406001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,26:0.30:88
chr14	101409763	rs35829821	A	G	2254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.152;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=45;PP=1195;ReadPosRankSum=0.447;SC=GAAGGTATACATGAATGAAGA;SOR=0.842;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=222;TCF=123;TCR=99;TR=106;WE=101409771;WS=101409753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,117:0.48:244
chr14	101412173	rs11847325	G	C	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=2.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.468;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=241;ReadPosRankSum=1.201;SC=TTTTAGTAAAGAAGTATATGG;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=11;WE=101412181;WS=101412163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr14	101418192	rs10713875	TG	T	2890.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=30;PP=1755;SC=GGCCCAAGCTTGGGACCAATG;SOR=0.846;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=47;TCF=14;TCR=33;TR=44;WE=101418200;WS=101418182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr14	101420572	rs8015089	G	A	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.13;ReadPosRankSum=0.967;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr14	101421903	rs72700527	G	A	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.612;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=264;ReadPosRankSum=0.198;SC=TATTAAAATAGCAACGAAGAA;SOR=1.291;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=43;TCF=8;TCR=35;TR=16;WE=101421911;WS=101421893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,17:0.38:45
chr14	101423634	rs12887775	T	C	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.617;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=347;ReadPosRankSum=0.352;SC=TATTTAAGAATATATAAGGAT;SOR=2.124;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=51;TCF=17;TCR=34;TR=19;WE=101423642;WS=101423624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,22:0.39:56
chr14	101429287	rs34448411	G	A	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=64;ReadPosRankSum=-0.073;SC=ATACTGTTCTGTGGAATTTGT;SOR=0.859;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=6;WE=101429295;WS=101429277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr14	101429459	rs72700530	G	C	1345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.370;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=27;PP=806;ReadPosRankSum=0.815;SC=CTGAGACTCTGAGGTTAGTAC;SOR=0.764;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=116;TCF=62;TCR=54;TR=56;WE=101429467;WS=101429449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,63:0.48:130
chr14	101429568	rs16791	G	A	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.061;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=214;ReadPosRankSum=0.979;SC=TAGTTCATGAGTTTTGATTGT;SOR=0.882;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=56;TCF=20;TCR=36;TR=20;WE=101429576;WS=101429558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,23:0.38:60
chr14	101429659	rs17172	G	A	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.368;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.82;ReadPosRankSum=-0.652;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr14	101431194	rs4547276	A	G	1658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.575;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=43;PP=1085;ReadPosRankSum=0.387;SC=GTCTGTTAGAAAAGATACATG;SOR=0.634;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=151;TCF=66;TCR=85;TR=75;WE=101431202;WS=101431184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,80:0.48:168
chr14	101431216	rs34144313	C	G	1225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=35;PP=815;ReadPosRankSum=1.399;SC=CCCATTCTCTCTGTTTCAAAT;SOR=0.639;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=110;TCF=44;TCR=66;TR=56;WE=101431224;WS=101431206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,58:0.48:121
chr14	101432440	rs111435301	C	CAGA	5183.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=2.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.189;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.08;MQRankSum=1.368;NF=7;NR=45;PP=2325;ReadPosRankSum=-0.763;SC=AGGTCCATCACAGAAGTAGAG;SOR=0.806;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=123;TCF=17;TCR=106;TR=52;WE=101432448;WS=101432430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,133:0.52:256
chr14	101433552	rs2145502	C	T	706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=20;PP=442;ReadPosRankSum=0.118;SC=GTTCACTTCACTGTATTATTA;SOR=0.658;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=59;TCF=22;TCR=37;TR=32;WE=101433560;WS=101433542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,34:0.52:66
chr14	101434356	rs4143956	A	T	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=166;ReadPosRankSum=0.689;SC=TTCAAGAATCATATTCTTTTT;SOR=0.350;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=10;WE=101434364;WS=101434346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr14	101435167	rs34991312	A	C	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=202;ReadPosRankSum=-0.667;SC=ATATATAACGAATATTGGTGA;SOR=0.610;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=11;WE=101435175;WS=101435157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr14	101435371	rs12432302	A	G	1025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.721;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=31;PP=716;ReadPosRankSum=-0.707;SC=AGAAAAGAAAACCAGTTCTTT;SOR=0.828;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=102;TCF=46;TCR=56;TR=53;WE=101435379;WS=101435361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,52:0.46:112
chr14	101435515	rs35820579	T	C	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.94;ReadPosRankSum=1.383;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,2:0.50:4
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chr14	101439916	rs1956726	T	G	1642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.506;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=22;PP=1123;ReadPosRankSum=1.042;SC=GTATTAGTGTTAAATCAAAGA;SOR=0.554;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=122;TCF=84;TCR=38;TR=69;WE=101439924;WS=101439906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,72:0.56:129
chr14	101442218	rs12893444	A	G	2814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=61;PP=1869;ReadPosRankSum=1.125;SC=TACATGTCTGAAATTCTGAGG;SOR=0.672;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=223;TCF=112;TCR=111;TR=122;WE=101442226;WS=101442208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,133:0.53:253
chr14	101442793	rs12895798	T	C	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.94;ReadPosRankSum=-0.092;SOR=0.921;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,46:0.42:109
chr14	101442949	.	AAAATAAGT	A	536.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.175;ClippingRankSum=0.000;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=2421;ReadPosRankSum=0.507;SC=TCGGATCAATAAAATAAGTAA;SOR=0.990;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=11;WE=101442964;WS=101442939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr14	101447373	rs34158896	T	C	2455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.615;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=52;PP=1495;ReadPosRankSum=0.555;SC=GGCGTATGAGTCATCTACAGT;SOR=0.556;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=252;TCF=141;TCR=111;TR=113;WE=101447381;WS=101447363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,124:0.44:279
chr14	101447517	rs10131435	A	G	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.534;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=22;PP=444;ReadPosRankSum=0.015;SC=ATACATTTTCATTCTATTTTT;SOR=0.330;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=63;TCF=15;TCR=48;TR=31;WE=101447525;WS=101447507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,33:0.50:66
chr14	101451254	rs141703656	C	T	1468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=39;PP=875;ReadPosRankSum=-1.054;SC=AAATATAGAACATAATTTTTT;SOR=0.686;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=107;TCF=39;TCR=68;TR=61;WE=101451262;WS=101451244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,67:0.57:117
chr14	101453344	rs3742401	G	A	1428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=18;PP=863;ReadPosRankSum=-0.444;SC=TAAATTTAAAGACAACATAGA;SOR=0.668;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=99;TCF=67;TCR=32;TR=56;WE=101453352;WS=101453334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,64:0.58:111
chr14	101454403	rs35097045	G	C	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=328;ReadPosRankSum=0.285;SC=AAAGCTCTTGGATTTTTAAAA;SOR=0.866;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=36;TCR=2;TR=17;WE=101454411;WS=101454393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,18:0.43:42
chr14	101459660	rs12880424	C	T	1181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.579;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=31;PP=797;ReadPosRankSum=-0.525;SC=TAATAGAAATCTAATCTATTC;SOR=0.539;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=99;TCF=40;TCR=59;TR=53;WE=101459668;WS=101459650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,55:0.51:108
chr14	101489858	rs12892719	C	T	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.997;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=119;ReadPosRankSum=-0.451;SC=ATGTGTTTTTCTGCATGATGC;SOR=0.582;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=8;WE=101489866;WS=101489848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr14	101492224	rs7141987	T	C	836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.893;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=25;PP=467;ReadPosRankSum=-0.334;SC=GCGCTCAGTGTGACCCAGCGG;SOR=0.829;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=71;TCF=25;TCR=46;TR=38;WE=101492232;WS=101492214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,41:0.54:76
chr14	101492548	rs12586258	C	T	876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.598;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=33;PP=646;ReadPosRankSum=-0.712;SC=ATCTGCGAGGCGTTTGCGACA;SOR=1.293;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=113;TCF=30;TCR=83;TR=41;WE=101492556;WS=101492538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,42:0.36:118
chr14	101495787	rs4906031	G	A	575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=2;PP=359;SC=GTGAAGGCTTGAAGAGCTTTT;SOR=3.056;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=101495795;WS=101495786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr14	101496145	rs9324030	A	G	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=88;ReadPosRankSum=-1.006;SC=CGAGGCTGACAGCGTGCCATG;SOR=1.688;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=6;WE=101496153;WS=101496135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr14	101496574	rs12435041	C	T	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.68;ReadPosRankSum=-0.321;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,19:0.42:45
chr14	101496579	rs12435042	C	G	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.47;ReadPosRankSum=0.586;SOR=0.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,14:0.39:36
chr14	101498483	rs8018238	C	T	719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.053;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=19;PP=401;ReadPosRankSum=-0.303;SC=CTGATCAGGACCTCCCTACCC;SOR=0.516;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=56;TCF=20;TCR=36;TR=30;WE=101498491;WS=101498473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,33:0.54:61
chr14	101507727	rs12894467	C	T	3707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=72;NR=51;PP=1946;SC=TAATCCTTCACGCATTTGCTT;SOR=0.767;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=72;TCR=51;TR=123;WE=101507735;WS=101507717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr14	101512972	rs11160618	C	T	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.32;ReadPosRankSum=-0.099;SOR=1.002;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,8:0.26:31
chr14	101512972	.	CCA	TCG	204	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=2;NR=5;PP=204;QD=36.7811249803;SC=CGTGCTGTGCCCATTGTCTCA;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=7;WE=101512982;WS=101512962;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
chr14	101512974	rs10140057	A	G	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.40;ReadPosRankSum=-0.160;SOR=0.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
chr14	101514371	rs10132916	T	C	991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=26;PP=536;ReadPosRankSum=-0.109;SC=GAGGGGACATTGGTGCCTGCC;SOR=0.663;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=144;TCF=70;TCR=74;TR=50;WE=101514379;WS=101514361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,56:0.35:161
chr14	101514950	rs10144193	A	T	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.578;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=367;ReadPosRankSum=1.220;SC=GCATATGAATAGTTGGCTAGA;SOR=1.852;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=46;TCF=38;TCR=8;TR=19;WE=101514958;WS=101514940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,18:0.38:47
chr14	101518760	rs1951032	G	A	648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.143;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=9;PP=444;ReadPosRankSum=0.446;SC=TGGTGAAGACGTGGGCCGTCA;SOR=1.109;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=63;TCF=42;TCR=21;TR=31;WE=101518768;WS=101518750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,32:0.48:67
chr14	101518910	rs4906032	A	G	1226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.723;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=28;PP=810;ReadPosRankSum=-1.292;SC=CCTTCAGGCAAGGGGTCTTGG;SOR=0.604;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=99;TCF=49;TCR=50;TR=55;WE=101518918;WS=101518900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,56:0.53:106
chr14	101520527	rs28752084	A	C	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=64;ReadPosRankSum=-0.855;SC=GGACACCCGTAAGCTGCCTCA;SOR=1.302;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=5;WE=101520535;WS=101520517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr14	101522556	rs56103835	T	C	842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.941;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=12;PP=558;ReadPosRankSum=-0.057;SC=TGCCACCTCATGGTACTCGGA;SOR=0.866;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=70;TCF=47;TCR=23;TR=38;WE=101522564;WS=101522546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,38:0.53:72
chr14	101531854	rs61992671	A	G	1331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.784;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=32;PP=817;ReadPosRankSum=-0.175;SC=CTGGTCCACTAGCCGTCCGTA;SOR=0.941;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=143;TCF=68;TCR=75;TR=57;WE=101531862;WS=101531844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,66:0.39:169
chr14	102198525	rs140695303	G	A	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=169;ReadPosRankSum=-1.325;SC=CACCTAGGAGGTGGGAGATAT;SOR=0.382;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=10;WE=102198533;WS=102198521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr14	102322900	rs34486272	A	AC	421.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=380;ReadPosRankSum=0.843;SC=TGTTTACCCCACCCATCTCCT;SOR=0.425;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=10;WE=102322908;WS=102322894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr14	102349542	rs1741126	G	T	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.424;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=28.40;ReadPosRankSum=-0.017;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr14	102359489	rs2720219	A	G	4332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=418;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.519;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=105;PP=2707;ReadPosRankSum=0.594;SC=TTGGCATTTGATCAGGATTGA;SOR=0.639;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=394;TCF=185;TCR=209;TR=198;WE=102359503;WS=102359479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:210,208:0.50:418
chr14	102359568	rs2749902	A	G	1608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.675;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=44;PP=1011;ReadPosRankSum=-0.384;SC=TAACTTTGGTAACAAACTTCT;SOR=0.792;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=41;TCR=95;TR=63;WE=102359576;WS=102359558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,69:0.48:143
chr14	102360916	rs2251246	G	A	1829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.166;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=41;PP=1119;ReadPosRankSum=0.961;SC=TGATGCTAGCGCGTCTTGTAA;SOR=0.790;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=162;TCF=81;TCR=81;TR=79;WE=102360924;WS=102360906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,87:0.49:176
chr14	102454933	rs4906172	C	A	732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.246;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=6;PP=558;ReadPosRankSum=0.395;SC=GCTTCTAGTCCGGAACTGTGT;SOR=1.402;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=67;TCF=52;TCR=15;TR=32;WE=102454941;WS=102454923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,33:0.46:72
chr14	102458028	rs2749894	C	T	1032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.855;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=31;PP=676;ReadPosRankSum=-2.872;SC=TTTGGTGACTCGAGGCACACG;SOR=0.859;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=82;TCF=27;TCR=55;TR=45;WE=102458036;WS=102458018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,48:0.53:91
chr14	102458052	rs10138457	C	T	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.038;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=360;ReadPosRankSum=-0.882;SC=CTGACCAGGACTCTCATGGGC;SOR=0.853;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=57;TCF=18;TCR=39;TR=24;WE=102458060;WS=102458042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,26:0.40:65
chr14	102468797	rs17541006	C	T	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=134;ReadPosRankSum=-0.773;SC=TCCTGATCTGCGCTTTTTCAG;SOR=0.818;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=9;WE=102468805;WS=102468787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,9:0.28:32
chr14	102494586	rs4906173	T	C	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.493;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=6;PP=99;ReadPosRankSum=0.407;SC=CAGTGACTCATGCCTGTAATC;SOR=0.332;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=31;TCF=12;TCR=19;TR=11;WE=102494594;WS=102494576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,12:0.34:35
chr14	102496352	rs2253998	C	A	698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.552;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.147;NF=15;NR=14;PP=566;ReadPosRankSum=-0.629;SC=AATGTAGTTCCAAATGGGTCT;SOR=0.625;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=46;TCF=25;TCR=21;TR=29;WE=102496360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,28:0.60:47
chr14	102496394	rs60087609	A	AGTGTGTGTGT	598.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.373;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=695;ReadPosRankSum=0.202;SC=AGGGAGAGAGAGTGTGTGTGT;SOR=3.195;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=59;TCF=37;TCR=22;TR=15;WE=102496403;WS=102496384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,25:0.36:69
chr14	102506783	rs10147313	G	C	2507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.209;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=52;PP=1604;ReadPosRankSum=1.971;SC=GTAGGTAAATGTTGGCCTTTT;SOR=0.733;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=228;TCF=119;TCR=109;TR=112;WE=102506791;WS=102506773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,122:0.48:254
chr14	102507065	rs17541540	G	C	1957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.714;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=54;PP=1231;ReadPosRankSum=-2.049;SC=GGGTTTTGCTGCTTAAAGGGA;SOR=0.961;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=218;TCF=100;TCR=118;TR=93;WE=102507073;WS=102507055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,101:0.43:234
chr14	102508056	rs10129889	C	A	3026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FS=1.354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.96;ReadPosRankSum=3.597;SOR=0.616;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:149,155:0.51:304
chr14	102510428	rs1190606	A	G	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=79;ReadPosRankSum=-0.237;SC=TGTATCTGGGAAGGATGCTGC;SOR=0.502;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=6;WE=102510436;WS=102510418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr14	102510546	rs140015884	C	T	1835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.708;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=26;PP=1154;ReadPosRankSum=0.984;SC=CTGTGCCCCTCGAAAGGAAGC;SOR=0.603;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=118;TCF=79;TCR=39;TR=74;WE=102510554;WS=102510536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,81:0.63:129
chr14	102510863	rs17512884	G	A	2380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.017;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=47;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.913;SC=AGACAGTTGTGATGTCAGGGC;SOR=0.681;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=203;TCF=109;TCR=94;TR=100;WE=102510882;WS=102510853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,112:0.49:227
chr14	102510874	rs2273440	G	A	2180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.622;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=46;PP=2962;ReadPosRankSum=0.015;SC=ATGTCAGGGCGTCTGGTGTCA;SOR=0.813;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=200;TCF=104;TCR=96;TR=95;WE=102510882;WS=102510853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,104:0.47:222
chr14	102511064	.	AGGGTGGGTGGCGAGGGTCCCCTCACGCG	A	262.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.178;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=2.509;NF=0;NR=5;PP=1614;ReadPosRankSum=-1.182;SC=CCCCACACGCAGGGTGGGTGG;SOR=1.061;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=5;WE=102511099;WS=102511054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr14	102514227	rs13749	T	C	2441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.910;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=57;PP=1332;ReadPosRankSum=-1.238;SC=ACGCAGAGACTGAGAAGAAGA;SOR=0.728;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=249;TCF=133;TCR=116;TR=118;WE=102514235;WS=102514217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,127:0.46:278
chr14	102514713	rs941792	G	A	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.127;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=271;ReadPosRankSum=-0.661;SC=TCCAAGTCACGCTCTGCCAAA;SOR=1.414;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=14;WE=102514721;WS=102514703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr14	102515015	rs1004903	G	A	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=416;ReadPosRankSum=-0.210;SC=AGGTGCGTGAGAGGCCGAACT;SOR=0.569;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=39;TCF=6;TCR=33;TR=23;WE=102515023;WS=102515005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,25:0.58:43
chr14	102548224	rs2298877	T	C	4728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=76;PP=2700;SC=GGTAATACTCTTGGTTTCTAT;SOR=0.935;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=149;TCF=73;TCR=76;TR=149;WE=102548232;WS=102548214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr14	102548384	rs6575895	C	T	2231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=19;PP=1431;SC=ACTGAAAGTTCACCATTTTCT;SOR=1.402;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=46;TCR=19;TR=65;WE=102548392;WS=102548374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr14	102549262	rs10782495	A	G	776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=2;PP=556;SC=AGCCACACACAACATAGTTTT;SOR=3.841;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=26;WE=102549270;WS=102549252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr14	102550569	rs3742429	G	A	719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=2;PP=546;SC=ATTTAGTAGAGATGGGGTTTC;SOR=3.352;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=102550577;WS=102550559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr14	102550803	rs4947	G	A	5577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=93;PP=2965;SC=ACAATTTGATGTTGTTCTTTT;SOR=0.713;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=188;TCF=95;TCR=93;TR=188;WE=102550811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr14	102551795	rs35308930	T	TTAA	7020.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=53;PP=2924;SC=AAAAATTGACTTAATACATTC;SOR=0.801;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=74;TCF=16;TCR=58;TR=65;WE=102551803;WS=102551785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr14	102552773	rs8004640	A	G	16897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=379;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.70;SOR=1.149;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,378:1.00:378
chr14	102552773	.	AAT	GAG	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=140;NR=199;PP=2947;QD=20;SC=GGCAACACGAAATTCCATCGC;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=348;TCF=141;TCR=207;TR=339;WE=102552783;WS=102552763;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:9,339:0.97:348
chr14	102552775	rs3736807	T	G	16897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=375;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.18;SOR=1.139;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,374:1.00:374
chr14	102552856	rs36112665	G	A	996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-4.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.738;HP=1;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=31;PP=727;ReadPosRankSum=-0.827;SC=AAGGGCGGCTGACAAAGGATG;SOR=0.188;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=68;TCF=11;TCR=57;TR=39;WE=102552864;WS=102552846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,41:0.57:72
chr14	102568296	rs10873531	G	A	4016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=80;NR=55;PP=2418;SC=CCAGTGACGCGGTGACAGGGA;SOR=0.927;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=136;TCF=81;TCR=55;TR=135;WE=102568304;WS=102568286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr14	102568367	rs8005905	T	A	4692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=80;NR=75;PP=2420;SC=CCAGACACCATCAGATGCCAG;SOR=0.824;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=155;TCF=80;TCR=75;TR=155;WE=102568375;WS=102568357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr14	102802971	rs142156890	G	T	879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.67;ReadPosRankSum=-1.243;SOR=0.884;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,48:0.53:91
chr14	102808330	rs12590618	C	T	2281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.479;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=56;PP=1406;ReadPosRankSum=1.275;SC=TGGTTGCTGTCGGCGAAGCCA;SOR=0.754;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=203;TCF=92;TCR=111;TR=101;WE=102808338;WS=102808320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,112:0.47:236
chr14	102808554	rs34220197	CGTGGA	C	283.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.251;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=326;ReadPosRankSum=0.285;SC=CGGTCGTCACCGTGGAGCCAG;SOR=0.627;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=102808570;WS=102808544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr14	102808562	rs56144634	C	G	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.891;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=345;ReadPosRankSum=1.071;SC=ACCGTGGAGCCAGAGCCCTCA;SOR=0.627;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=6;WE=102808570;WS=102808544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr14	102814945	rs7012	G	A	831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.861;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=12;PP=478;ReadPosRankSum=1.616;SC=GATGCAGCCTGCTGTCGCTCT;SOR=0.982;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=73;TCF=48;TCR=25;TR=38;WE=102814953;WS=102814935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,41:0.49:83
chr14	102815042	rs7011	C	T	2153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=39;PP=1115;ReadPosRankSum=-0.528;SC=GGCCACCGTGCGCTTCAGGAG;SOR=0.643;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=170;TCF=95;TCR=75;TR=88;WE=102815050;WS=102815032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,105:0.54:196
chr14	102873886	rs60215817	A	G	1082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.802;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=29;PP=688;ReadPosRankSum=-1.194;SC=TCATCTGCTTAGAAAGTTTAT;SOR=0.479;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=85;TCF=29;TCR=56;TR=46;WE=102873894;WS=102873876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,50:0.54:93
chr14	102891646	rs4906197	A	G	915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.850;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=24;PP=555;ReadPosRankSum=-0.460;SC=AAGGGACGCCACCATATCTTC;SOR=0.865;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=79;TCF=30;TCR=49;TR=38;WE=102891654;WS=102891636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,43:0.49:87
chr14	102894593	rs1309353	G	A	1958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=23;PP=1583;SC=ACAGGCCACAGTTGCTGGTTT;SOR=1.745;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=77;TCF=53;TCR=24;TR=76;WE=102894601;WS=102894583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr14	102901201	rs10149146	A	G	2206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=53;PP=1436;ReadPosRankSum=0.248;SC=AGAGCAGGACATCCTAACCAG;SOR=0.688;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=224;TCF=111;TCR=113;TR=102;WE=102901209;WS=102901191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,109:0.45:244
chr14	102904551	rs142320181	CCCCGCTCCCTGCT	C	240.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.617;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.947;NF=2;NR=6;PP=1611;ReadPosRankSum=-0.415;SC=AGGTTCGCCTCCCCGCTCCCT;SOR=0.330;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=8;WE=102904571;WS=102904541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr14	102917012	rs144355367	G	T	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=231;ReadPosRankSum=0.486;SC=CCTCACTGAAGAATCTAGAGC;SOR=0.722;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=51;TCF=12;TCR=39;TR=18;WE=102917020;WS=102917002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,19:0.35:54
chr14	102918686	rs1190554	T	C	3644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=420;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=73;PP=1908;ReadPosRankSum=-0.870;SC=GCAGGCGGCTTGGTGCAGACA;SOR=0.668;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=392;TCF=227;TCR=165;TR=167;WE=102918694;WS=102918676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:235,184:0.44:419
chr14	102964359	rs146599191	C	CGCCCAAGCTCCCAGCTCCATCTGT	545.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=11.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.64;ReadPosRankSum=1.194;SOR=3.383;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,7:0.17:40
chr14	102964408	rs75405230	G	A	1399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.075;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.582;NF=40;NR=18;PP=857;ReadPosRankSum=-2.666;SC=CTGTGTGATTGACAAGTATGT;SOR=1.197;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=133;TCF=87;TCR=46;TR=58;WE=102964416;WS=102964398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,70:0.45:156
chr14	102964654	rs2403058	A	G	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=142;ReadPosRankSum=1.461;SC=CAGGGGCTTCAGAGTGACTCC;SOR=0.593;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=9;WE=102964662;WS=102964644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr14	103059220	rs1057881	G	A	576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=4.201;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.27;ReadPosRankSum=0.338;SOR=0.821;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,28:0.60:47
chr14	103177420	rs3783383	G	C	896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.367;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=25;PP=560;ReadPosRankSum=-0.005;SC=AAACATTCATGTTGCTTGTTC;SOR=1.426;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=77;TCF=23;TCR=54;TR=33;WE=103177428;WS=103177410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,38:0.46:83
chr14	103193028	rs2295695	G	A	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.779;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=189;ReadPosRankSum=0.315;SC=CCATGTTGGCGCCACTTCCCA;SOR=3.426;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=11;WE=103193036;WS=103193018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr14	103388939	rs59793431	C	G	2104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.787;HP=1;HapScore=3;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=17;PP=1395;ReadPosRankSum=-0.411;SC=AATGTGTAACCGACCCTGGTG;SOR=0.803;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=78;TCF=47;TCR=31;TR=46;WE=103388960;WS=103388929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,55:0.60:91
chr14	103388952	rs57687948	C	T	2188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.016;HP=4;HapScore=3;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=19;PP=1395;ReadPosRankSum=0.367;SC=CCCTGGTGCCCCCACCCGACC;SOR=0.765;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=82;TCF=48;TCR=34;TR=51;WE=103388960;WS=103388929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,58:0.62:94
chr14	103388999	rs2295828	T	C	2675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=31.85;ReadPosRankSum=1.970;SOR=0.351;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,83:0.99:84
chr14	103389003	rs2295829	G	C	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.16;ReadPosRankSum=0.459;SOR=0.759;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,28:0.37:75
chr14	103395105	.	C	A	2300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=0.000;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.627;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=37;PP=1342;ReadPosRankSum=-1.179;SC=GCGAACCTGCCGTCTTCCGCG;SOR=0.812;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=201;TCF=118;TCR=83;TR=96;WE=103395113;WS=103395095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,111:0.50:224
chr14	103397055	rs1190233	G	C	2918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=63;PP=2053;SC=CTCTCCACCCGCTCTGGCCCC;SOR=1.168;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=105;TCF=42;TCR=63;TR=105;WE=103397063;WS=103397045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr14	103405852	rs77448485	G	C	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.187;NF=12;NR=0;PP=252;ReadPosRankSum=1.551;SC=AGCCTCGCAGGCACTGCCTTT;SOR=0.874;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=12;WE=103405860;WS=103405846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr14	103412268	rs2403107	T	C	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-1.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.629;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=138;ReadPosRankSum=-0.581;SC=GGATTGAGTCTGCAAGGATTT;SOR=1.880;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=10;WE=103412276;WS=103412258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr14	103413941	rs8007924	T	C	393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=3;PP=234;SC=AGGCTGGAGGTTGAGACCCTA;SOR=1.765;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=13;WE=103413949;WS=103413931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr14	103434530	rs2093414	T	A	943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.46;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr14	103440282	rs1018550	G	T	6015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=130;NR=67;PP=2965;SC=TTCCATCATCGGCATGAACGT;SOR=1.523;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=198;TCF=131;TCR=67;TR=197;WE=103440290;WS=103440272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr14	103440618	.	TACAC	T	138	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=15;MQ=58.7;NF=0;NR=4;PP=138;QD=35.25;SC=TTTTTTTACTTACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=4;WE=103440629;WS=103440608;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr14	103449773	rs2269322	C	T	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=1.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.570;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.962;NF=10;NR=1;PP=182;ReadPosRankSum=1.102;SC=GTCCAAACCCCGTCACCTCTT;SOR=1.802;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=11;WE=103449781;WS=103449767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr14	103449863	rs59675332	CA	C	130.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=5.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.50;MQRankSum=-1.023;QD=2.56;ReadPosRankSum=1.045;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,17:0.33:51
chr14	103523598	rs34302315	T	C	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.744;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=97;ReadPosRankSum=0.545;SC=GCTCGGCGGCTGCGAGCCCCG;SOR=0.495;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=7;WE=103523606;WS=103523588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr14	103570134	rs373916287	CGT	C	327.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.160;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=228;ReadPosRankSum=0.909;SC=GGCGCGCGCGCGTGTGTGTGT;SOR=2.670;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=33;TCF=10;TCR=23;TR=10;WE=103570147;WS=103570124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr14	103576415	rs729184	A	G	3657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=53;PP=2189;SC=CTGGGCCGCCAGCGGAACCAG;SOR=0.910;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=129;TCF=76;TCR=53;TR=129;WE=103576423;WS=103576405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr14	103593950	rs1132339	C	G	6688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=110;NR=123;PP=2965;SC=GCTCTGGGTGCAGAACCTCTA;SOR=0.890;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=233;TCF=110;TCR=123;TR=233;WE=103593958;WS=103593940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr14	103593995	rs180870742	C	T	1641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.315;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=42;PP=1000;ReadPosRankSum=-0.080;SC=GGGCCCGGGCCGGCAGGGAGG;SOR=0.490;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=128;TCF=46;TCR=82;TR=69;WE=103594003;WS=103593985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,75:0.55:137
chr14	103595997	rs2234130	G	C	3220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=45;PP=1713;ReadPosRankSum=2.040;SC=CAGAGACCAAGGCTGAGGGCC;SOR=0.379;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=113;TCF=68;TCR=45;TR=112;WE=103596005;WS=103595987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,123:0.99:124
chr14	103596488	rs2234131	G	A	3042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=65;PP=1823;SC=CAGGGCACACGTACCGCCCGT;SOR=1.208;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=44;TCR=65;TR=109;WE=103596496;WS=103596478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr14	103596609	rs2234133	T	A	1464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=31;NR=23;PP=825;SC=TGCCCCCTTGTCCAGGCGAGC;SOR=0.800;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=54;TCF=31;TCR=23;TR=54;WE=103596617;WS=103596599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr14	103597565	rs749206	G	A	1287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=30;PP=911;SC=GTGGAGGGAGGAGGAGCTGCT;SOR=2.948;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=37;WE=103597573;WS=103597555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr14	103599938	rs2234143	C	T	2043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=35;PP=1260;SC=AGATAGGCCGCTGGTGCCTCT;SOR=1.103;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=28;TCR=35;TR=63;WE=103599946;WS=103599928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr14	103602278	rs710100	A	G	4148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=88;PP=2597;SC=CACCGCCAGCATTAGACGTCA;SOR=1.402;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=141;TCF=52;TCR=89;TR=140;WE=103602286;WS=103602268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr14	103807442	rs1137372	T	A	1460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.388;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=42;PP=1022;ReadPosRankSum=0.725;SC=TTTCCTCCATTATCAGCCAGA;SOR=0.576;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=45;TCR=85;TR=65;WE=103807450;WS=103807432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,68:0.48:142
chr14	103852725	rs3825566	C	T	3594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.811;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=69;PP=2084;ReadPosRankSum=-1.445;SC=ATTGTGCAAACGTGTGTGTCA;SOR=0.816;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=306;TCF=171;TCR=135;TR=163;WE=103852733;WS=103852715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,176:0.53:331
chr14	103852776	rs117480377	C	T	2327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=57;PP=1402;ReadPosRankSum=-1.541;SC=CCGAACTCTGCTTTTAACTTG;SOR=0.704;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=261;TCF=126;TCR=135;TR=108;WE=103852784;WS=103852766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,119:0.42:281
chr14	103915212	.	CTTGTG	C	522	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=15;MMLQ=26;MQ=57.9;NF=5;NR=3;PP=522;QD=72.0035561668;SC=TGTTTAATAACTTGTGTTGGG;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=16;TCF=8;TCR=8;TR=8;WE=103915234;WS=103915202;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,8:0.50:16
chr14	103915215	rs56683493	GTGTT	G	326.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=3.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.20;ReadPosRankSum=1.062;SOR=0.086;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr14	103915225	rs58490269	GA	G	326.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.85;ReadPosRankSum=1.619;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr14	103915226	.	A	G	541	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=6;HapScore=4;MGOF=15;MMLQ=16;MQ=58.69;NF=10;NR=4;PP=541;QD=41.1265151819;SC=TGTTGGGGGGATTATGTGTTT;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=32;TCF=22;TCR=10;TR=14;WE=103915234;WS=103915202;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:18,14:0.44:32
chr14	103918182	rs2273702	G	C	3956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=77;NR=47;PP=2215;SC=TTCATAGTTAGAGTTTATATG;SOR=1.047;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=77;TCR=47;TR=124;WE=103918190;WS=103918172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr14	103923414	rs2273700	A	G	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.103;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=114;ReadPosRankSum=1.049;SC=GTGAAACATCAATTTATGGGA;SOR=1.302;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=9;WE=103923422;WS=103923404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr14	103923475	rs2273699	A	G	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=10;PP=303;ReadPosRankSum=-4.234;SC=TCTCTCACCTATAGGTGAAGT;SOR=0.663;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=53;TCF=34;TCR=19;TR=24;WE=103923483;WS=103923465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,25:0.43:58
chr14	103928657	rs4906326	T	A	1740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=16;PP=1129;SC=TGAGTATTCATTATGTGTGAA;SOR=1.888;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=42;TCR=16;TR=58;WE=103928665;WS=103928647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr14	103932888	rs1951393	C	T	766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=22;PP=600;SC=AAGCACAAGTCATATGAACAG;SOR=3.098;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=26;WE=103932896;WS=103932878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr14	103934261	rs185457688	C	A	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-3.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=263;ReadPosRankSum=0.964;SC=TTCCTCCTCTCTCTGAATGAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=13;WE=103934269;WS=103934251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr14	103934488	rs10137161	T	C	5628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=87;PP=2965;SC=AGAAGTGTTTTTTCAAGCCAA;SOR=1.044;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=170;TCF=83;TCR=87;TR=170;WE=103934496;WS=103934478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr14	103946636	rs8014010	A	G	732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=0;PP=561;SC=TAAAAGACTGACATTCCTATT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=103946644;WS=103946626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr14	103986255	rs1803283	C	T	1483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.97;ReadPosRankSum=-0.338;SOR=0.752;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,74:0.60:124
chr14	103987305	rs8017780	C	A	1564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=27;PP=754;ReadPosRankSum=0.201;SC=CCAGGGCCGTCGGGGAGAGGC;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=135;TCF=76;TCR=59;TR=64;WE=103987313;WS=103987295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,78:0.50:156
chr14	103988180	rs1136165	G	T	624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.998;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=11;PP=375;ReadPosRankSum=-1.057;SC=TCTCGATGGCGCGGCGCTCCC;SOR=0.529;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=51;TCF=35;TCR=16;TR=29;WE=103988188;WS=103988170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,30:0.49:61
chr14	103995489	rs2765038	C	G	149.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=5;NR=3;PP=115;SC=GAGGGGGAGGCGGAGGCGGGG;SOR=2.303;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=8;WE=103995497;WS=103995479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr14	103996205	rs2296487	T	C	190.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=111;SC=TGCTGGGATGTAGGCCTCGAA;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=103996213;WS=103996202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr14	103996396	rs2765037	G	A	3214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=44;PP=1862;SC=CAATGGTGGCGGTGCGTGTGC;SOR=0.888;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=62;TCR=44;TR=106;WE=103996404;WS=103996386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr14	103996733	rs2756138	C	G	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.666;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=195;ReadPosRankSum=1.497;SC=CCTACAGACACATGTGGCTCC;SOR=0.352;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=14;WE=103996741;WS=103996723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr14	104029803	.	TTG	T	76.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=0.000;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=4.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.07;ReadPosRankSum=1.088;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,5:0.20:25
chr14	104135774	rs145739696	A	AAAAAGAAAAAAAAAG	1783.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=2;PP=247;SC=CTGTCTAAAAAAAAAGAAAAG;SOR=4.294;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=15;WE=104135782;WS=104135764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr14	104136469	rs11333716	CT	C	8106.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=73;PP=2965;SC=TAAATGTACTCTTATTTGGTT;SOR=1.297;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=131;TCF=56;TCR=75;TR=128;WE=104136477;WS=104136459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr14	104139570	rs11160757	G	T	6391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=101;NR=106;PP=2965;SC=GAGTGCTTTCGTCCCAAGTCC;SOR=0.898;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=207;TCF=101;TCR=106;TR=207;WE=104139578;WS=104139560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr14	104143928	rs4906357	A	C	4020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=90;PP=2800;SC=TTTTACATGAATTTTATTGAA;SOR=1.714;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=41;TCR=90;TR=131;WE=104143936;WS=104143918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr14	104166783	rs3212103	A	G	112.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=4;NR=2;PP=66;SC=GGGGAGGGTGACACAGCTGCT;SOR=1.981;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=104166791;WS=104166773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
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chr14	104194196	rs1535100	C	G	4006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=64;NR=68;PP=2124;SC=AGTGCGCCCTCGTGTCCCTCA;SOR=0.959;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=64;TCR=68;TR=132;WE=104194204;WS=104194186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr14	104194278	rs1535099	C	T	1230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=28;PP=802;SC=TGCACAGTCCCGCGCGCTCCG;SOR=1.464;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=16;TCR=28;TR=44;WE=104194286;WS=104194268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr14	104261002	.	TA	T	2040.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=0.000;DP=186;ExcessHet=3.0103;FS=7.135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.06;MQRankSum=0.800;QD=11.60;ReadPosRankSum=1.466;SOR=0.557;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,116:0.66:176
chr14	104378852	rs8095	G	A	1328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.682;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=18;PP=709;ReadPosRankSum=0.560;SC=CCAGGTAGCAGTGCATCTCAC;SOR=0.604;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=117;TCF=78;TCR=39;TR=54;WE=104378860;WS=104378842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,62:0.47:131
chr14	104380871	rs201217582	TC	T	666.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.093;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=557;ReadPosRankSum=0.810;SC=GTGTTGTGGCTCACGCTTGTT;SOR=0.906;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=16;WE=104380879;WS=104380861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,22:0.35:62
chr14	104394835	rs9324065	T	C	3922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=85;NR=56;PP=2154;SC=TGCCGACGCCTGGGCCTTGAG;SOR=1.027;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=85;TCR=56;TR=141;WE=104394843;WS=104394825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr14	104394850	rs9324066	C	T	1737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=40;PP=1152;ReadPosRankSum=2.164;SC=CTTGAGGATGCTGCGGAAGCT;SOR=0.687;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=158;TCF=87;TCR=71;TR=84;WE=104394858;WS=104394840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,86:0.52:166
chr14	104407788	rs78523783	A	G	2278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.476;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=45;PP=1441;ReadPosRankSum=-2.679;SC=AAGAACTTCAAGTTGTCTTTG;SOR=0.644;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=220;TCF=124;TCR=96;TR=102;WE=104407796;WS=104407778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,112:0.47:236
chr14	104429302	.	A	AGT	197	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5002;HP=2;HapScore=3;MGOF=14;MMLQ=19;MQ=60.0;NF=5;NR=0;PP=197;QD=40.0;SC=TTTGTATTTGAGTGTGTGTGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=5;WE=104429310;WS=104429292;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr14	104429453	rs6576013	A	G	2413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.41;SOR=0.757;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr14	104436931	rs11851097	C	T	2605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=62;PP=1745;ReadPosRankSum=-0.658;SC=TCCGCAAACTCTTAAGAACAA;SOR=0.685;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=235;TCF=108;TCR=127;TR=118;WE=104436939;WS=104436921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,124:0.49:253
chr14	104441925	rs10147923	C	T	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=312;ReadPosRankSum=-0.185;SC=TTATAGTGAGCGTACTCTTGT;SOR=0.480;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=19;WE=104441933;WS=104441915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr14	104452405	rs10143030	C	G	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.873;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=180;ReadPosRankSum=-0.732;SC=AGCACGTGTTCAGACATTGCT;SOR=0.180;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=13;WE=104452413;WS=104452395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,15:0.33:45
chr14	104452640	rs10143389	G	A	1884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.861;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=44;PP=1049;ReadPosRankSum=-1.626;SC=TTGATGACTTGGATATGAAGG;SOR=0.879;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=156;TCF=69;TCR=87;TR=76;WE=104452648;WS=104452630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,91:0.51:180
chr14	104465037	rs10133836	T	C	4378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=77;NR=75;PP=2579;SC=TGAGTTGGGCTTCTAAAACCA;SOR=0.743;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=158;TCF=77;TCR=81;TR=152;WE=104465045;WS=104465027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr14	104470686	rs28391043	G	A	562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=1195;ReadPosRankSum=0.513;SC=ATTCACTTTGGTCATTGTCAA;SOR=0.770;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=19;WE=104470717;WS=104470676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,22:0.63:35
chr14	104470698	rs151098927	GTTTATTTATTTA	G	368.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=1753;ReadPosRankSum=-0.336;SC=CATTGTCAAAGTTTATTTATT;SOR=1.061;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=6;WE=104470717;WS=104470676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr14	104471857	rs12147828	C	T	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=217;ReadPosRankSum=-0.557;SC=CTCACTTTCCCGCTAACTCTG;SOR=0.730;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=16;WE=104471865;WS=104471847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr14	104473253	rs4900607	A	G	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=174;ReadPosRankSum=0.937;SC=TACCACAAACATATGAGGTAG;SOR=0.941;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=12;WE=104473261;WS=104473243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr14	104475034	rs4906401	A	G	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.434;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=73;ReadPosRankSum=-0.998;SC=TATTTCCCCTATGTATACTTT;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=104475042;WS=104475024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr14	104481016	rs7150795	G	A	1319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=7;PP=1007;SC=CTGCTCTGATGACATATGTAC;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=37;TCR=7;TR=44;WE=104481024;WS=104481006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr14	104481083	rs11160779	T	C	1997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.569;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=26;PP=1237;ReadPosRankSum=0.978;SC=ATATGAAGAATTGAAGACTAG;SOR=0.745;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=159;TCF=107;TCR=52;TR=83;WE=104481091;WS=104481073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,94:0.53:177
chr14	104481200	rs59025288	A	AT	3182.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.445;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.174;NF=5;NR=57;PP=1077;ReadPosRankSum=-0.940;SC=TTTCCTGGATATTTTTTTTCC;SOR=0.736;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=146;TCF=18;TCR=128;TR=62;WE=104481208;WS=104481190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,140:0.52:270
chr14	104484346	rs34317359	G	A	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.853;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=67;ReadPosRankSum=-0.289;SC=CTAAAACAGTGTGCAGCAGCT;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=104484354;WS=104484336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr14	104484646	rs12589669	T	C	933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=27;PP=495;ReadPosRankSum=0.952;SC=TATGGGCTGCTGCAATTGGCT;SOR=0.661;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=88;TCF=32;TCR=56;TR=42;WE=104484654;WS=104484636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,47:0.48:98
chr14	104491086	rs72042212	TACACACACACAC	T	466.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=254;ReadPosRankSum=-0.408;SC=ACAGGAAGTTTACACACACAC;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=10;WE=104491105;WS=104491076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,12:0.92:13
chr14	104497543	rs10135507	C	T	2228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.560;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=56;PP=1250;ReadPosRankSum=-2.065;SC=AGAAATATCTCATCCGGATTT;SOR=0.825;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=215;TCF=98;TCR=117;TR=99;WE=104497551;WS=104497533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,113:0.46:245
chr14	104498472	rs4906405	G	A	843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=22;PP=592;SC=CTGCTTTTCTGTTTATAGATC;SOR=2.376;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=28;WE=104498480;WS=104498462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr14	104498530	.	ATCTTT	A	57	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5001;HP=3;HapScore=2;MGOF=28;MMLQ=27;MQ=62.13;NF=0;NR=2;PP=57;QD=34.0;SC=GGAATGTGTTATCTTTTCTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=2;WE=104498542;WS=104498520;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:3,2:0.40:5
chr14	104500427	rs10150865	A	G	5767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=110;PP=2965;SC=GATCCTGTTTATTCCTTGTCC;SOR=1.055;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=202;TCF=90;TCR=112;TR=200;WE=104500435;WS=104500417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr14	104501551	rs3830999	AT	A	279.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=250;ReadPosRankSum=0.439;SC=TTATTGATTTATTTATGCTTG;SOR=1.038;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=8;WE=104501559;WS=104501541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr14	104518453	rs7150461	A	G	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=269;ReadPosRankSum=0.461;SC=CACACCCCTCAGGAAGCTGTG;SOR=0.822;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=54;TCF=9;TCR=45;TR=19;WE=104518461;WS=104518443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,22:0.38:58
chr14	104559623	rs941952	T	C	3161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=41;PP=1844;SC=CATCCTGACCTACGTCCTTGC;SOR=0.955;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=60;TCR=41;TR=101;WE=104559631;WS=104559613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr14	104561998	rs1770983	T	C	7700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=117;NR=142;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.570;SC=GCCCAGGTAATCCCAGGGGCC;SOR=0.331;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=260;TCF=117;TCR=143;TR=259;WE=104562006;WS=104561988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,284:1.00:285
chr14	104563874	rs7156718	C	T	3643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=74;NR=49;PP=2118;SC=TCAGCTACTCCGTGGCCTCTC;SOR=1.055;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=75;TCR=50;TR=123;WE=104563882;WS=104563864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr14	104569801	rs8012482	C	G	398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=5;PP=180;SC=GCTCTGAAAACAAGGGAGGAG;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=9;TCR=5;TR=14;WE=104569809;WS=104569791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr14	104570904	rs1744299	T	C	2635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=49;PP=1379;SC=CCACCCCTCATGGGCTGGGGG;SOR=0.963;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=40;TCR=49;TR=89;WE=104570912;WS=104570894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr14	104571826	rs1744300	A	G	1103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=28;PP=805;SC=GCAGCTGGGGACTGTGCACCC;SOR=3.086;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=34;WE=104571834;WS=104571816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr14	104573690	rs1744301	A	G	2722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=47;PP=1606;SC=CAGGTAATGGAGCTAGGGCTG;SOR=0.957;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=44;TCR=47;TR=91;WE=104573698;WS=104573680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr14	104575466	rs1771012	C	T	1593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=9;PP=1021;SC=GGCCGGTCCCCGTCCCTGTGC;SOR=2.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=38;TCR=9;TR=47;WE=104575474;WS=104575456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr14	104624342	rs28718558	C	T	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.760;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=6;PP=99;ReadPosRankSum=-0.182;SC=GCTGTGGGCCCCTGGGGACCT;SOR=0.250;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=22;TCF=8;TCR=14;TR=11;WE=104624350;WS=104624332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr14	104639644	rs11622217	C	T	2258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.639;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=38;PP=1344;ReadPosRankSum=-0.220;SC=CTGAAGACGCCGCTGCCTCTG;SOR=0.949;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=177;TCF=94;TCR=83;TR=92;WE=104639652;WS=104639634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,102:0.55:187
chr14	104641792	rs2487305	C	T	1893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.552;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=37;PP=1156;ReadPosRankSum=0.429;SC=CCAGGAAGGCCGTGGGCACCC;SOR=0.741;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=159;TCF=81;TCR=78;TR=76;WE=104641800;WS=104641782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,85:0.49:174
chr14	104642341	rs2487304	A	G	3763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=85;PP=2326;ReadPosRankSum=1.657;SC=GGTCCCGGCCAGTCAGCATCA;SOR=0.714;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=322;TCF=167;TCR=155;TR=174;WE=104642349;WS=104642331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,185:0.52:354
chr14	104643409	rs2487303	A	G	1774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=42;PP=2227;ReadPosRankSum=-1.136;SC=AGGTAGAAGCAGCACACCGTC;SOR=0.711;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=211;TCF=112;TCR=99;TR=90;WE=104643429;WS=104643399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,97:0.41:234
chr14	104643421	rs2487302	T	C	1603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.045;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=40;PP=2227;ReadPosRankSum=-1.092;SC=CACACCGTCTTGCCGGACACG;SOR=0.784;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=201;TCF=104;TCR=97;TR=82;WE=104643429;WS=104643399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,90:0.40:225
chr14	104643721	rs2487301	C	A	1237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.751;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=22;PP=639;ReadPosRankSum=0.611;SC=GCCCTGTGGCCGGTCCCAGAG;SOR=0.582;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=89;TCF=53;TCR=36;TR=52;WE=104643729;WS=104643711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,60:0.59:102
chr14	104643859	rs2487300	A	G	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.30;ReadPosRankSum=-0.438;SOR=0.687;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,25:0.34:73
chr14	104644099	rs2497297	T	C	2242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.994;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=51;PP=1100;ReadPosRankSum=-0.411;SC=GTGGCAGCAGTGGCTATGAGA;SOR=0.511;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=204;TCF=99;TCR=105;TR=104;WE=104644107;WS=104644089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,114:0.51:223
chr14	104644147	rs11621644	C	T	1601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.328;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=40;PP=1078;ReadPosRankSum=0.337;SC=GCAGCGCCTCCTCCGCCCCTG;SOR=0.561;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=59;TCR=75;TR=72;WE=104644155;WS=104644137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,76:0.52:146
chr14	104647224	rs884996	C	T	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.409;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=202;ReadPosRankSum=-1.111;SC=AAAGATGCATCGATGGTTCCC;SOR=1.739;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=12;WE=104647232;WS=104647214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr14	104710505	rs7142555	T	G	659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=8;PP=505;SC=CATCTCTCAATAGTACTGCTG;SOR=1.519;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=25;WE=104710513;WS=104710495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr14	104710651	rs7141507	C	T	3189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=42;PP=2067;SC=CGGCTGGCTCCTGGCCTCGAC;SOR=1.121;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=66;TCR=42;TR=108;WE=104710659;WS=104710641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr14	104940930	rs28453989	C	T	7076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=115;NR=124;PP=2965;SC=CCTCACTCTCCCCTTAGAGCG;SOR=0.803;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=240;TCF=115;TCR=125;TR=239;WE=104940938;WS=104940920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr14	104940967	rs28699424	G	A	5105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=95;PP=2965;SC=AATTAAGCTGGGGGCAAATGG;SOR=1.006;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=169;TCF=74;TCR=95;TR=169;WE=104940975;WS=104940957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr14	104941016	rs28715110	G	A	2456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=55;PP=1561;SC=GAGGATGGGGGACTGCCCGGG;SOR=1.927;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=22;TCR=55;TR=77;WE=104941024;WS=104941006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr14	105052640	rs35246301	A	G	717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.789;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=412;ReadPosRankSum=1.144;SC=GCCGGTCGCAAGCCCGGGAAG;SOR=0.094;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=25;WE=105052648;WS=105052630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,30:0.68:44
chr14	105054260	rs9788527	A	G	1159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.608;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=31;PP=792;ReadPosRankSum=0.849;SC=GGTGGAGTCAAGCAGAGGGAG;SOR=0.533;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=102;TCF=39;TCR=63;TR=52;WE=105054268;WS=105054250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,54:0.51:106
chr14	105054709	rs9788432	T	A	1204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=38;PP=770;ReadPosRankSum=0.103;SC=CCACCCTCACTCCCTCCCCGA;SOR=0.646;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=109;TCF=34;TCR=75;TR=56;WE=105054717;WS=105054699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,57:0.49:116
chr14	105054934	rs12880814	A	G	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=9;PP=225;ReadPosRankSum=-2.170;SC=GGCCCAGGCCACACGGCGGCT;SOR=0.555;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=44;TCF=27;TCR=17;TR=22;WE=105054942;WS=105054924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,25:0.50:50
chr14	105055118	rs111285011	TGACGGGCAG	T	3507.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=11;NR=30;PP=2987;SC=CCTGCGGCTCTGACGGGCAGG;SOR=0.796;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=59;TCF=12;TCR=47;TR=41;WE=105055134;WS=105055108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr14	105055172	rs186046463	G	A	1020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.486;HP=4;HapScore=2;MGOF=91;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-1.929;NF=30;NR=19;PP=545;ReadPosRankSum=1.772;SC=CAAGCACTCCGGGGGCTCCGA;SOR=0.934;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=98;TCF=54;TCR=44;TR=49;WE=105055180;WS=105055162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,53:0.48:111
chr14	105055291	rs3840008	TG	T	856.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=1018;ReadPosRankSum=-1.146;SC=AGATCGGACATGGGGGGCACA;SOR=0.793;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=19;WE=105055312;WS=105055281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,34:0.54:63
chr14	105055304	rs11160811	A	G	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.327;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=19;PP=1008;ReadPosRankSum=-1.428;SC=GGGGCACAGCAGGCGGCCCCG;SOR=1.096;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=52;TCF=20;TCR=32;TR=29;WE=105055312;WS=105055281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,33:0.56:59
chr14	105060024	rs12879330	A	G	770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.190;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=24;PP=546;ReadPosRankSum=-0.560;SC=CAGGGTCAGAAGCCGTTGGGG;SOR=0.520;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=54;TCF=13;TCR=41;TR=32;WE=105060032;WS=105060014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,33:0.57:58
chr14	105063253	rs11629201	C	T	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.740;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=189;ReadPosRankSum=-0.656;SC=GGGAAGATCACCCACAGCAGG;SOR=1.755;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=13;WE=105063261;WS=105063243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr14	105070791	rs3803313	G	T	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.515;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=192;ReadPosRankSum=-0.728;SC=GTCCCTTGCAGAGGAAGAAGA;SOR=1.127;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=15;WE=105070799;WS=105070781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr14	105150273	rs7153053	C	T	741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=6;PP=424;ReadPosRankSum=0.125;SC=GGTTGGGGTGCGGGTGGGTCT;SOR=0.560;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=54;TCF=44;TCR=10;TR=31;WE=105150281;WS=105150263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,33:0.58:57
chr14	105150580	rs34369401	C	T	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=303;ReadPosRankSum=0.986;SC=GGAGGGACAGCTCGAGGGCTC;SOR=1.828;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=14;WE=105150588;WS=105150570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr14	105167807	rs4983530	C	T	4342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=91;NR=56;PP=2313;SC=GCGCGGACCCCGAGCTGTGCA;SOR=0.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=147;TCF=91;TCR=56;TR=147;WE=105167815;WS=105167797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr14	105170163	rs7145815	G	A	872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.713;HP=2;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=17;PP=1327;ReadPosRankSum=0.196;SC=AGTGCAGCAGGGCAGGGTCAG;SOR=0.766;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=85;TCF=46;TCR=39;TR=41;WE=105170183;WS=105170153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,44:0.47:94
chr14	105170175	rs7146817	T	G	1085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.726;HP=3;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=19;PP=1327;ReadPosRankSum=-0.479;SC=CAGGGTCAGGTGCTCTGGGTG;SOR=0.706;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=93;TCF=51;TCR=42;TR=45;WE=105170183;WS=105170153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,52:0.49:106
chr14	105170222	rs7145851	G	A	1614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.265;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=33;PP=847;ReadPosRankSum=0.042;SC=AGTGGCCTCCGAACCCTCTGA;SOR=0.821;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=74;TCR=62;TR=71;WE=105170230;WS=105170212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,81:0.53:153
chr14	105172315	rs79559717	G	A	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=129;ReadPosRankSum=-0.934;SC=AGGCTGCCCCGCCTGCGTGTT;SOR=0.732;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=9;WE=105172323;WS=105172305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr14	105173862	.	ACCCCACCCCCAC	A	715.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.099;ClippingRankSum=0.000;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=2297;ReadPosRankSum=2.266;SC=GCAGGCGTCCACCCCACCCCC;SOR=1.101;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=9;WE=105173881;WS=105173852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,18:0.86:21
chr14	105179043	rs4497619	G	C	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.203;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=7;PP=204;ReadPosRankSum=0.263;SC=CCTGCTCCTTGTCAGAGACCA;SOR=0.941;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=41;TCF=21;TCR=20;TR=15;WE=105179051;WS=105179033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,16:0.38:42
chr14	105179194	rs10133301	T	C	1628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.050;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=33;PP=840;ReadPosRankSum=-0.166;SC=GGGCACTGGATGAGCTGTTTG;SOR=0.975;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=177;TCF=102;TCR=75;TR=80;WE=105179202;WS=105179184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,88:0.44:199
chr14	105180484	rs9672043	C	T	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=8;PP=456;ReadPosRankSum=-1.021;SC=GAGGCTGCACCTGGGCTGGCT;SOR=0.869;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=35;TCR=14;TR=28;WE=105180492;WS=105180474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,27:0.53:51
chr14	105180565	rs4983535	T	C	1653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FS=1.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.21;ReadPosRankSum=-0.365;SOR=0.709;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,82:0.51:162
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chr14	105185083	rs138798126	TAC	T	1531.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.187;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.915;NF=3;NR=17;PP=709;ReadPosRankSum=-0.856;SC=CCTGATATTGTACCCAGCAAA;SOR=0.663;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=68;TCF=21;TCR=47;TR=20;WE=105185092;WS=105185073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,44:0.36:123
chr14	105196235	rs34672588	G	A	501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.41;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr14	105196365	rs33958252	T	C	1939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.86;SOR=0.832;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr14	105201596	rs7149183	T	C	257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=9;PP=165;SC=AGCCTCCACCTGCCCCACCAG;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=105201604;WS=105201586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	105206172	rs71421880	T	A	1769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.271;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=37;PP=911;ReadPosRankSum=-1.674;SC=GCCGGGACACTCTCACCCTCG;SOR=0.578;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=139;TCF=74;TCR=65;TR=79;WE=105206180;WS=105206162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,87:0.56:154
chr14	105207040	rs12894569	C	T	4729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-2.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=398;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.807;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=106;PP=2825;ReadPosRankSum=1.205;SC=ATGAGTTTTCCTCCAGGTACC;SOR=0.530;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=363;TCF=164;TCR=199;TR=201;WE=105207048;WS=105207030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,220:0.55:398
chr14	105207134	rs3803307	A	G	4524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=81;PP=2916;SC=GAGGACCAGCATGGACCATGA;SOR=0.999;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=148;TCF=67;TCR=81;TR=148;WE=105207142;WS=105207124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr14	105208037	rs4983539	A	C	540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=3;PP=335;SC=CGGCCACTCCACCAGGACAGG;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=105208045;WS=105208027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr14	105208057	rs4983384	C	T	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.570;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=233;ReadPosRankSum=-0.342;SC=GCCAGGCTGGCGACCCCACGG;SOR=2.910;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=13;WE=105208065;WS=105208047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr14	105208393	rs75268661	G	A	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=107;ReadPosRankSum=0.252;SC=CCAGGCAGGGGTGCCGGGGGT;SOR=0.593;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=9;WE=105208401;WS=105208383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr14	105211426	rs7155192	G	A	375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=11;PP=276;SC=TCTCCCCACAGCGTTCCCCAG;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=105211434;WS=105211416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr14	105213343	rs6644	A	G	4020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=80;PP=2549;SC=TGTTTTAGTCACAGACTGAGC;SOR=1.218;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=138;TCF=58;TCR=80;TR=137;WE=105213351;WS=105213333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr14	105219467	rs3809453	A	G	487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=3;PP=395;SC=ATGGGCGCGCAGCTGTGACGT;SOR=2.948;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=105219475;WS=105219457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr14	105219976	rs12889167	T	C	2290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=22;PP=1552;SC=CCTGGTGCTTTCTCAGGACTG;SOR=1.759;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=53;TCR=22;TR=75;WE=105219984;WS=105219966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr14	105220210	rs7151424	G	A	2535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=55;PP=1571;SC=GCCACAGGTGGTCGGGGCAGG;SOR=1.464;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=32;TCR=55;TR=87;WE=105220218;WS=105220200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr14	105222037	rs1132975	C	T	1373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.414;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=18;PP=706;ReadPosRankSum=-2.688;SC=AAGGCTGTGCCGTCGTTCACC;SOR=0.882;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=112;TCF=71;TCR=41;TR=55;WE=105222045;WS=105222027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,66:0.51:130
chr14	105223194	rs34992074	C	CAT	2081.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=24;PP=1406;SC=AGAACACACACGTGTGGCCCC;SOR=1.298;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=28;WE=105223202;WS=105223184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr14	105223495	rs35550015	G	C	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.084;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=177;ReadPosRankSum=-1.655;SC=TTTGGTTGTAGACCCTCTCAG;SOR=0.042;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=12;WE=105223503;WS=105223485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr14	105223525	rs12590163	T	C	1219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=5;PP=910;SC=GGAGTGTTTGTGTAGTCTCCC;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=31;TCR=5;TR=36;WE=105223533;WS=105223515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr14	105223694	rs143402483	CAT	C	6536.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=352;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.641;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=3.063;NF=19;NR=70;PP=2964;ReadPosRankSum=0.437;SC=CATCCAGACACATGTGGAACT;SOR=0.654;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=195;TCF=33;TCR=162;TR=89;WE=105223703;WS=105223684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,173:0.50:349
chr14	105223853	rs35165446	T	C	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=22;PP=424;ReadPosRankSum=-2.752;SC=CGGAGAGCCCTGGGCAGGGGG;SOR=1.002;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=43;TCF=6;TCR=37;TR=25;WE=105223861;WS=105223843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,23:0.56:41
chr14	105225620	rs10142660	G	T	1000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.923;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=10;PP=561;ReadPosRankSum=1.754;SC=CTAGACTGATGATGCCCGCAG;SOR=0.532;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=73;TCF=55;TCR=18;TR=39;WE=105225628;WS=105225610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,45:0.55:82
chr14	105233095	rs2498804	C	A	1253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.637;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=31;PP=713;ReadPosRankSum=-0.113;SC=TCTAAGTGCTCAAGTCACTTT;SOR=0.607;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=52;TCR=67;TR=56;WE=105233103;WS=105233085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,64:0.45:142
chr14	105238591	rs55839843	CCTGAG	C	733.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=2.238;NF=10;NR=5;PP=1222;ReadPosRankSum=0.214;SC=GCAGCAGGCTCCTGAGGTGAG;SOR=0.737;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=15;WE=105238612;WS=105238581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,21:0.47:45
chr14	105238604	rs2498800	C	T	827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=1241;ReadPosRankSum=-0.404;SC=GAGGTGAGGGCGAGTGTGTGG;SOR=0.693;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=44;TCF=35;TCR=9;TR=21;WE=105238612;WS=105238581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,22:0.46:48
chr14	105239894	rs1130233	C	T	509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.54;ReadPosRankSum=-0.638;SOR=0.544;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,29:0.37:78
chr14	105241378	rs3730346	C	T	1218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=4.781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.34;ReadPosRankSum=2.228;SOR=0.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,67:0.40:166
chr14	105242228	rs2498797	T	C	958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.087;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=30;PP=712;ReadPosRankSum=1.505;SC=CAAGCGTGGTTCCACAGCTGT;SOR=0.516;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=66;TCF=17;TCR=49;TR=41;WE=105242236;WS=105242218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,41:0.60:68
chr14	105242831	rs3001371	C	T	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.020;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=96;ReadPosRankSum=0.857;SC=CCAAACCCCACAGGCAGGACT;SOR=0.412;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=6;WE=105242839;WS=105242827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr14	105242966	rs2494735	T	C	2110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=39;PP=1078;ReadPosRankSum=-1.887;SC=GCTGCCCAAGTGCCTGGCCTG;SOR=0.689;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=187;TCF=113;TCR=74;TR=98;WE=105242974;WS=105242956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,104:0.52:199
chr14	105246325	rs2494737	T	A	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.10;ReadPosRankSum=-0.372;SOR=0.088;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr14	105258892	rs2494748	C	T	2711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FS=1.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.512;SOR=0.837;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,126:0.53:237
chr14	105258892	.	CA	TG	1490	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=69;NR=40;PP=1490;QD=14.1602557327;SC=CTACTACCCCCATCTCTCCCT;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=211;TCF=131;TCR=80;TR=109;WE=105258901;WS=105258882;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:102,109:0.52:211
chr14	105258893	rs2494749	A	G	8601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.54;SOR=1.241;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr14	105267579	rs12878684	A	G	6316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=129;NR=77;PP=2965;SC=GCCGCCTGAGACAGCAGCGCG;SOR=1.044;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=208;TCF=130;TCR=78;TR=206;WE=105267587;WS=105267569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr14	105267934	rs34284721	G	A	3650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.799;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=84;PP=2174;ReadPosRankSum=1.521;SC=TGCCCCTGGGGCAGAACCTGC;SOR=0.799;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=303;TCF=151;TCR=152;TR=163;WE=105267942;WS=105267924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,174:0.53:331
chr14	105268104	rs10141867	G	A	1374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.324;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=31;PP=771;ReadPosRankSum=-2.154;SC=CCCTGGACCTGTCGTTGAAGT;SOR=0.568;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=136;TCF=73;TCR=63;TR=65;WE=105268112;WS=105268094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,69:0.49:141
chr14	105268228	rs4983387	G	A	5997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=109;NR=102;PP=2965;SC=CTCACTGTCCGAACAGGAGGA;SOR=0.783;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=211;TCF=109;TCR=102;TR=211;WE=105268236;WS=105268218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr14	105309252	rs12895703	T	C	4539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.95;SOR=1.496;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr14	105309256	rs12894371	A	T	4750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.59;SOR=1.483;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr14	105309608	rs12878750	C	T	889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=23;PP=639;SC=TGATGGTCTGCGGGTGTGAGC;SOR=2.376;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=30;WE=105309616;WS=105309598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr14	105335049	rs12431850	C	T	107.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.76;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr14	105344111	rs78118267	G	A	205.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=0;PP=173;SC=TGGTGCCCCCGCGGCCCTGCC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=105344119;WS=105344107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr14	105344293	rs61995995	C	T	11898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=141;NR=111;PP=2965;SC=TCATCCGCTTCGGCTACGATA;SOR=0.797;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=254;TCF=142;TCR=112;TR=252;WE=105344301;WS=105344282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr14	105344318	rs2304758	G	A	12209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=135;NR=119;PP=2965;SC=GCCCCTGAGCGTCCCTCCTCC;SOR=0.735;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=255;TCF=135;TCR=120;TR=254;WE=105344326;WS=105344308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,292:1.00:292
chr14	105344347	rs2304757	C	G	6434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=109;NR=103;PP=2965;SC=TTCTCAGTCCCCAGGACCACA;SOR=0.759;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=214;TCF=110;TCR=104;TR=212;WE=105344355;WS=105344337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr14	105344419	rs34009344	A	G	2358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=48;PP=1448;SC=ACAGAGCACCAAGGATGACCC;SOR=1.754;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=25;TCR=48;TR=73;WE=105344427;WS=105344409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr14	105344603	rs41310934	C	T	601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=3;PP=411;SC=AGTCCTGGCCCGACCTTGGGA;SOR=3.056;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=105344611;WS=105344593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr14	105344761	rs41317300	C	T	7051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=127;NR=116;PP=2965;SC=GCTCTGTGTTCGCCTTAACAC;SOR=0.701;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=245;TCF=128;TCR=117;TR=243;WE=105344769;WS=105344751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,269:1.00:269
chr14	105344872	rs61995998	C	T	2509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=52;PP=1457;SC=GGCTCAGCCACGAGGGCTCAG;SOR=1.559;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=30;TCR=52;TR=82;WE=105344880;WS=105344862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr14	105349220	rs2028415	T	G	1359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=25;PP=998;SC=CAGAGGGTGGTGTGTGAAGGG;SOR=0.874;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=19;TCR=25;TR=44;WE=105349228;WS=105349210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr14	105349388	rs2028414	A	C	5728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=111;NR=88;PP=2965;SC=CCAAGGGACCAGTGCAGCAGG;SOR=0.811;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=199;TCF=111;TCR=88;TR=199;WE=105349396;WS=105349378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr14	105349877	rs10145119	C	T	1472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.91;SOR=1.949;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr14	105349886	rs10145122	C	T	1378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.54;SOR=2.226;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr14	105349891	rs10145270	G	A	1186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=49.45;SOR=2.925;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr14	105349897	rs10145031	A	G	916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.84;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr14	105350178	rs45449696	C	T	964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.928;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=8;PP=431;ReadPosRankSum=-1.172;SC=GCCACAAGCACGAGGACGGCA;SOR=0.941;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=66;TCF=47;TCR=19;TR=35;WE=105350186;WS=105350168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,44:0.57:77
chr14	105350355	rs2841236	A	G	6893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=121;NR=122;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.365;SC=ACGAGGACACACCCCGAAAGA;SOR=0.265;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=244;TCF=121;TCR=123;TR=243;WE=105350363;WS=105350345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,265:1.00:266
chr14	105350799	rs9788593	C	T	4259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=76;NR=69;PP=2370;SC=AGGAGGAGGACGACAGCCTCA;SOR=0.924;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=145;TCF=76;TCR=69;TR=145;WE=105350814;WS=105350789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr14	105350868	rs9788594	C	T	3087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=52;NR=56;PP=1706;SC=TGGAGGAGGCCCGGAAGATGA;SOR=0.950;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=109;TCF=53;TCR=56;TR=108;WE=105350876;WS=105350858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr14	105351637	rs2582549	A	G	1454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=15;PP=976;SC=GGGGGTGGCCAGTGTCAGTGG;SOR=1.781;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=39;TCR=15;TR=54;WE=105351645;WS=105351627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr14	105351673	rs894038	C	T	2694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=59;NR=28;PP=1428;SC=GCTTCTCTGACCCTCGGTGCC;SOR=1.321;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=59;TCR=29;TR=87;WE=105351681;WS=105351663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr14	105352255	rs2251389	T	A	3471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=77;NR=42;PP=2030;SC=CGGCAGGCCCTGGGTGGCGCG;SOR=1.323;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=119;TCF=77;TCR=42;TR=119;WE=105352263;WS=105352245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr14	105354293	rs2582548	A	G	3012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=47;NR=56;PP=1783;SC=GGGCCCGCTCAGGCAGTGCCC;SOR=1.054;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=103;TCF=47;TCR=56;TR=103;WE=105354301;WS=105354283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr14	105356137	rs2919629	G	C	3477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.787;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=89;PP=2893;ReadPosRankSum=-1.538;SC=GTGCCAGTGCGTTTTCTTGAG;SOR=1.779;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=142;TCF=51;TCR=91;TR=139;WE=105356145;WS=105356126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,130:0.98:132
chr14	105356240	.	CAAATG	C	154.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.119;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.89;ReadPosRankSum=-3.224;SOR=0.293;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr14	105356241	.	A	G	346	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MMLQ=24;MQ=58.09;NF=1;NR=11;PP=346;QD=31.7309343789;SC=ATGGATGGACAAATGGATGGA;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=12;WE=105356249;WS=105356231;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr14	105356247	.	ATGGATGG	A	153.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.240;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.81;ReadPosRankSum=-2.895;SOR=0.293;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr14	105359306	rs3742939	G	C	3331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=65;NR=47;PP=1995;SC=TTTCCTGCCGGCTGCAGGCTG;SOR=0.862;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=65;TCR=47;TR=112;WE=105359314;WS=105359296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr14	105359827	rs2247712	T	C	2488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=19;PP=1656;SC=AGCCTCTGCCTGGGGCCCACG;SOR=2.066;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=79;TCF=60;TCR=19;TR=78;WE=105359835;WS=105359817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr14	105360746	rs2841244	T	C	2954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;SC=CCCCTTGGCCTGCCCCCAGCC;SOR=1.168;Source=Platypus;TCF=41;WE=105360754;WS=105360736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr14	105363157	rs7152667	A	G	677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=18;PP=520;SC=CCCTGCACATAGGACAGACCA;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=105363165;WS=105363147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr14	105363202	rs10147348	A	G	349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=11;PP=291;SC=TGCCACCAGGAGGCGGCCTGG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=105363210;WS=105363192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	105393556	rs2841280	G	C	1438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=27;PP=958;ReadPosRankSum=-0.976;SC=GTGGGACAGAGAGGCTGGCAC;SOR=0.630;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=52;TCR=42;TR=59;WE=105393564;WS=105393546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,65:0.62:105
chr14	105393707	rs879448	C	T	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.107;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=6;PP=90;ReadPosRankSum=1.076;SC=AGGGAAGCCTCCCTGGGCTGC;SOR=0.145;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=29;TCF=10;TCR=19;TR=12;WE=105393715;WS=105393697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr14	105398787	rs2582533	G	C	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.27;ReadPosRankSum=-0.861;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr14	105404384	rs1048257	T	C	1342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.385;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=26;PP=677;ReadPosRankSum=2.136;SC=TCTCTTGTACTGATGAGCCAT;SOR=0.552;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=119;TCF=72;TCR=47;TR=62;WE=105404392;WS=105404374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,67:0.50:133
chr14	105405599	rs3742935	G	C	1797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.568;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=33;PP=1093;ReadPosRankSum=0.470;SC=CTGGGGGCAGGGAAGGAGAAC;SOR=0.763;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=154;TCF=89;TCR=65;TR=80;WE=105405607;WS=105405589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,85:0.50:169
chr14	105405942	rs28454709	G	A	2718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.316;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=58;PP=1714;ReadPosRankSum=-0.226;SC=CAGCAGTGGAGAGGTGCAGCT;SOR=0.722;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=200;TCF=101;TCR=99;TR=114;WE=105405950;WS=105405932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,124:0.56:220
chr14	105406238	rs2819419	A	C	2550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.912;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=53;PP=1829;ReadPosRankSum=-1.087;SC=TCCTGCGAGTACTTGGTCATG;SOR=0.635;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=257;TCF=133;TCR=124;TR=110;WE=105406246;WS=105406228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,118:0.42:283
chr14	105406372	rs61421370	C	T	2575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.262;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=61;PP=1685;ReadPosRankSum=0.448;SC=TGGGACATCCCCGAGCCCACA;SOR=0.904;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=238;TCF=120;TCR=118;TR=116;WE=105406380;WS=105406362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,121:0.49:249
chr14	105407031	rs11623422	A	G	2584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.164;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=56;PP=1746;ReadPosRankSum=-0.743;SC=CTGGGCCCTGAGACACACAGG;SOR=0.448;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=222;TCF=105;TCR=117;TR=116;WE=105407039;WS=105407021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,119:0.50:238
chr14	105407208	rs11851053	T	C	2684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.788;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=51;PP=1741;ReadPosRankSum=0.470;SC=TAGGAAAAGATACCTGACCAA;SOR=0.521;Source=Platypus;TCF=131;TR=114;WE=105407216;WS=105407198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,126:0.50:252
chr14	105407798	rs4465542	T	C	4016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=366;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.959;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=82;PP=2166;ReadPosRankSum=0.750;SC=ATGGGAAATGTGGAAGTCTTC;SOR=0.548;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=334;TCF=165;TCR=169;TR=172;WE=105407806;WS=105407788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,191:0.52:364
chr14	105408182	rs9672139	T	G	1443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.640;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=22;PP=865;ReadPosRankSum=-0.574;SC=ACCTCGGGCATGTGGCCTTCT;SOR=0.763;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=122;TCF=70;TCR=52;TR=57;WE=105408190;WS=105408172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,64:0.48:132
chr14	105408315	rs28600075	T	C	3234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.401;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=67;ReadPosRankSum=-0.877;SC=CCTCCATCTTTGGCGCAGACA;SOR=0.661;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=300;TCF=158;TCR=142;TR=140;WE=105408323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,158:0.49:325
chr14	105408811	rs2819421	A	G	2076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.616;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-7.246;NF=46;NR=51;PP=1328;ReadPosRankSum=-0.751;SC=CTCCACCTTCAGCGCAGACAC;SOR=0.836;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=209;TCF=105;TCR=104;TR=97;WE=105408819;WS=105408801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,103:0.45:227
chr14	105408955	rs2819422	A	G	2401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.960;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=47;PP=1310;ReadPosRankSum=-0.714;SC=CTCCAGCCGCACACTGTCCAG;SOR=0.654;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=221;TCF=115;TCR=106;TR=101;WE=105408963;WS=105408945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,119:0.47:253
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chr14	105410411	rs11160825	C	T	2860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.933;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=52;PP=1692;ReadPosRankSum=-0.606;SC=ACATCCTTGTCGGCCAGGGAC;SOR=0.621;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=243;TCF=136;TCR=107;TR=118;WE=105410419;WS=105410401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,134:0.50:267
chr14	105410775	rs2819424	A	G	3064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.342;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-5.072;NF=78;NR=60;PP=1883;ReadPosRankSum=-1.801;SC=GGAGACTCACATCGGCTTCCA;SOR=0.788;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=292;TCF=163;TCR=129;TR=138;WE=105410783;WS=105410765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,150:0.48:314
chr14	105410827	rs28380382	C	T	3660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=357;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.381;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.020;NF=87;NR=76;PP=2374;ReadPosRankSum=-0.411;SC=CATGGACTTCCCTGGGGCCGA;SOR=0.767;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=335;TCF=173;TCR=162;TR=163;WE=105410835;WS=105410815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,174:0.49:357
chr14	105411153	rs34499888	G	A	1785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.549;NF=43;NR=34;PP=1000;ReadPosRankSum=-0.634;SC=CCTCGGGCACGGGGCCCTCCA;SOR=0.664;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=170;TCF=95;TCR=75;TR=77;WE=105411161;WS=105411143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,88:0.45:194
chr14	105411700	rs4264326	A	G	2180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=45;PP=1371;ReadPosRankSum=1.520;SC=CTCCAGGTCCACAGAAGGGAG;SOR=0.719;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=211;TCF=114;TCR=97;TR=98;WE=105411708;WS=105411690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,108:0.46:233
chr14	105411781	rs10438247	G	A	2952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.955;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.384;NF=61;NR=51;PP=1840;ReadPosRankSum=-0.215;SC=CTCCGCCTTCGGCGCAGACAC;SOR=0.771;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=225;TCF=121;TCR=104;TR=112;WE=105411789;WS=105411767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,130:0.51:255
chr14	105411957	rs373797895	G	A	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=33.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.03;MQRankSum=-11.487;QD=0.81;ReadPosRankSum=-0.462;SOR=5.161;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:142,15:0.10:157
chr14	105411971	rs28737397	T	C	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=27.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.17;MQRankSum=-11.339;QD=0.90;ReadPosRankSum=-2.611;SOR=4.847;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:126,13:0.09:139
chr14	105412066	rs77154428	C	T	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=2.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQRankSum=-5.428;QD=1.42;ReadPosRankSum=2.652;SOR=1.162;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,11:0.18:61
chr14	105412541	rs12433837	CA	TG	1166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.690;HP=2;HapScore=3;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-7.821;NF=9;NR=21;PP=2944;ReadPosRankSum=-0.520;SC=GGGCCCTTGACATCTATCTGG;SOR=0.934;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=108;TCF=43;TCR=65;TR=30;WE=105412569;WS=105412531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,35:0.30:115
chr14	105412554	rs12436986	T	G	994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=4.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.05;MQRankSum=-8.985;QD=10.47;ReadPosRankSum=-1.380;SOR=1.264;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,28:0.29:95
chr14	105412561	rs3000771	C	T	991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.57;MQRankSum=-8.420;QD=10.78;ReadPosRankSum=-2.088;SOR=0.844;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,31:0.34:92
chr14	105413204	rs2582514	G	T	3651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.060;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.655;NF=51;NR=40;PP=1421;ReadPosRankSum=-0.140;SC=GGCTGAATGCGGATGTCAGTG;SOR=0.796;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=196;TCF=107;TCR=89;TR=91;WE=105413212;WS=105413194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,100:0.47:214
chr14	105413223	rs55797226	A	G	3862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.478;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.997;NF=54;NR=46;PP=1478;ReadPosRankSum=0.424;SC=TGGTCTTAAGATCCCCTTGCA;SOR=0.641;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=209;TCF=114;TCR=95;TR=100;WE=105413231;WS=105413213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,112:0.48:234
chr14	105413790	rs11848564	G	A	3369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=370;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.202;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=78;PP=2064;ReadPosRankSum=-0.785;SC=ACGCCTCGATGGACTCGCCTG;SOR=0.646;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=343;TCF=170;TCR=173;TR=160;WE=105413798;WS=105413780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:199,171:0.46:370
chr14	105414238	rs60754080	C	A	3100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.476;HP=2;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.810;NF=43;NR=36;PP=2795;ReadPosRankSum=0.882;SC=GGAGAGGCTCCCGTCGGCCTC;SOR=0.541;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=177;TCF=102;TCR=75;TR=79;WE=105414260;WS=105414228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,85:0.44:194
chr14	105414252	rs60106058	C	T	3480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.045;HP=2;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-5.138;NF=53;NR=40;PP=2795;ReadPosRankSum=-0.419;SC=CGGCCTCCACCTTCGGCGCAG;SOR=0.605;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=201;TCF=119;TCR=82;TR=93;WE=105414260;WS=105414228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,103:0.47:221
chr14	105414280	rs2819429	T	G	2507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-5.564;NF=64;NR=45;PP=1451;ReadPosRankSum=2.394;SC=CACCGAGGCCTCGATGGACTT;SOR=0.697;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=238;TCF=142;TCR=96;TR=109;WE=105414288;WS=105414270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,126:0.47:270
chr14	105414629	rs72702027	G	A	1794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.886;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.243;NF=44;NR=33;PP=1046;ReadPosRankSum=-0.342;SC=GGGCCCTCTGGGAGTTTCACA;SOR=0.489;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=136;TCF=80;TCR=56;TR=77;WE=105414637;WS=105414619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,86:0.56:153
chr14	105414790	rs2582513	A	G	2912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.678;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=55;PP=1696;ReadPosRankSum=0.803;SC=GGACTTGCCAAGGGCAGACAC;SOR=0.774;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=233;TCF=124;TCR=109;TR=119;WE=105414798;WS=105414780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,138:0.52:265
chr14	105414810	rs10145032	C	G	2645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.369;NF=58;NR=52;PP=1689;ReadPosRankSum=0.400;SC=CCCCAAACGACAGCATCTTGA;SOR=0.705;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=213;TCF=114;TCR=99;TR=110;WE=105414818;WS=105414800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,120:0.52:233
chr14	105415200	rs10145566	G	C	988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FS=1.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQRankSum=-4.904;QD=5.46;ReadPosRankSum=3.871;SOR=0.552;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:126,55:0.30:181
chr14	105415229	rs10134675	T	C	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FS=2.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQRankSum=-6.136;QD=2.94;ReadPosRankSum=-4.087;SOR=0.678;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:136,38:0.22:174
chr14	105415352	rs12890949	G	C	4549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=68;PP=2293;SC=TTGGTAGTCAGGTCCTTGTTG;SOR=0.705;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=145;TCF=77;TCR=68;TR=145;WE=105415360;WS=105415342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr14	105415745	rs117379881	C	G	3991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FS=3.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQRankSum=-5.463;QD=17.82;ReadPosRankSum=1.884;SOR=0.743;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:121,103:0.46:224
chr14	105415748	rs118171013	G	A	3994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FS=4.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQRankSum=-5.397;QD=17.37;ReadPosRankSum=2.721;SOR=0.714;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:123,107:0.47:230
chr14	105416010	rs2582511	T	C	1517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=39;PP=982;ReadPosRankSum=0.576;SC=CCTTAACATCTGTCTGGGGGC;SOR=0.707;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=130;TCF=55;TCR=75;TR=66;WE=105416018;WS=105416000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,73:0.51:143
chr14	105416220	rs2819435	T	A	3879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=362;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.248;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-8.744;NF=95;NR=78;PP=2440;ReadPosRankSum=-2.035;SC=GGAGGCTCACTTCGGCCTCCA;SOR=0.778;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=350;TCF=192;TCR=158;TR=173;WE=105416228;WS=105416210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,185:0.52:356
chr14	105417222	rs2013274	C	T	871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FS=26.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQRankSum=-10.029;QD=4.40;ReadPosRankSum=-0.380;SOR=2.002;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:164,34:0.17:198
chr14	105417225	rs2894635	C	G	818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FS=21.903;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQRankSum=-10.545;QD=4.05;ReadPosRankSum=0.499;SOR=1.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:170,32:0.16:202
chr14	105417228	rs2248960	C	T	792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FS=22.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQRankSum=-10.818;QD=3.89;ReadPosRankSum=-0.022;SOR=2.057;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:173,31:0.15:204
chr14	105418149	rs147978925	A	T	579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=17.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.88;MQRankSum=-9.665;QD=6.04;ReadPosRankSum=0.529;SOR=2.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,19:0.20:96
chr14	105418155	rs141600524	G	C	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=19.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.99;MQRankSum=-10.120;QD=5.18;ReadPosRankSum=1.360;SOR=2.838;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,20:0.19:105
chr14	105418166	rs78116894	T	C	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=19.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.46;MQRankSum=-9.914;QD=6.53;ReadPosRankSum=0.551;SOR=2.540;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,27:0.24:112
chr14	105418194	rs78447535	A	G	858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.804;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-10.074;NF=33;NR=12;PP=509;ReadPosRankSum=-0.055;SC=TGGAGGGGAGACTCACGTCGG;SOR=1.476;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=142;TCF=87;TCR=55;TR=45;WE=105418202;WS=105418184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,48:0.31:155
chr14	105452035	rs10150682	A	G	356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=1;PP=302;SC=GCGGGTCCTGAACGGCGGGGG;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=105452043;WS=105452025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	105452221	.	T	TGCGGGGCCCGGGCCCGGGCCCAGGACAC	527.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.52;BaseQRankSum=0.279;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.058;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=3;PP=2101;ReadPosRankSum=1.852;SC=CCAAGGTGGGTGCGGGGACTC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=3;WE=105452229;WS=105452211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr14	105455877	rs2241866	C	G	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=410;ReadPosRankSum=-1.705;SC=GCCCCAGGCCCAGCCCCAGGG;SOR=0.660;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=26;WE=105455885;WS=105455867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,28:0.58:48
chr14	105457771	rs2247140	A	G	3582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.13;SOR=1.454;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr14	105457771	.	ATGATCTCCT	GTGATCTCCG,GTGATCTCCT	658	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=30,61;NR=13,30;PP=636,658;QD=16.0341366247;SC=GCCGTGCCTCATGATCTCCTC;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=91;TCF=61;TCR=30;TR=43,91;WE=105457788;WS=105457761;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.47:91
chr14	105457780	rs2289454	T	G	1122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.12;ReadPosRankSum=0.067;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,58:0.52:111
chr14	105459140	rs2241865	A	C	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.721;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=139;ReadPosRankSum=-0.399;SC=AGGGCGACACAGGGGAAACTG;SOR=0.260;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=28;TCF=19;TCR=9;TR=16;WE=105459148;WS=105459130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr14	105461067	rs894039	C	T	5293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=92;NR=85;PP=2965;SC=CAAGCTCAAACTGACACTCTT;SOR=0.734;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=177;TCF=92;TCR=85;TR=177;WE=105461075;WS=105461057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr14	105477507	rs7144401	G	A	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=199;ReadPosRankSum=-1.083;SC=GTGTCAATGCGTCAGAGGCGG;SOR=0.798;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=44;TCF=30;TCR=14;TR=20;WE=105477515;WS=105477497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,20:0.41:49
chr14	105477613	rs7145565	T	C	1004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=18;PP=502;ReadPosRankSum=-0.546;SC=AGCTAGGGCCTGGGGTGGCCG;SOR=0.708;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=112;TCF=67;TCR=45;TR=47;WE=105477621;WS=105477603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,53:0.42:126
chr14	105478102	rs3803294	G	A	4770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=451;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=120;NR=110;PP=2962;ReadPosRankSum=0.783;SC=AGCGGCACAGGTTGGGCTCCA;SOR=0.728;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=433;TCF=223;TCR=210;TR=230;WE=105478110;WS=105478092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:217,233:0.52:450
chr14	105523663	rs7147439	G	A	1487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=36;PP=1045;SC=ATCAGATTGAGTCACAAGTTA;SOR=2.348;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=12;TCR=36;TR=48;WE=105523671;WS=105523653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr14	105609335	rs10149229	A	G	4651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=432;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.102;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=109;NR=103;PP=2962;ReadPosRankSum=1.349;SC=CCGGCCGCTCAATGGGGTTGC;SOR=0.629;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=399;TCF=204;TCR=195;TR=212;WE=105609343;WS=105609325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:206,225:0.52:431
chr14	105611282	rs2272591	A	G	1006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.071;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=22;PP=692;ReadPosRankSum=0.466;SC=CCACCTCCACAGCACTGGCCC;SOR=0.954;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=134;TCF=75;TCR=59;TR=55;WE=105611290;WS=105611272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,55:0.38:144
chr14	105622056	rs2816679	A	G	5607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=110;PP=2965;SC=CCCTCCACGCAGCCCAGCGGC;SOR=1.074;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=191;TCF=81;TCR=110;TR=190;WE=105622064;WS=105622046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr14	105715327	rs2816604	A	C	252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.98;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	105715515	rs2816605	C	T	2857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=55;NR=40;PP=1428;SC=TGTTCAACAACGAGCTCATGG;SOR=0.730;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=55;TCR=40;TR=95;WE=105715523;WS=105715505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr14	105716034	rs2816606	C	T	6745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=139;PP=2965;SC=CCACTCTGTACGCTGCTAAGA;SOR=1.317;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=226;TCF=86;TCR=140;TR=225;WE=105716042;WS=105716024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr14	105722726	rs1008628	T	C	5831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=103;NR=98;PP=2965;SC=ACTTCCTGACTGGGCAGGCAG;SOR=0.720;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=201;TCF=103;TCR=98;TR=201;WE=105722734;WS=105722716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr14	105851374	rs35509750	A	G	471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.479;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=298;ReadPosRankSum=0.488;SC=CCAGCCACCAACCCTCCGTGG;SOR=0.347;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=41;TCF=9;TCR=32;TR=19;WE=105851382;WS=105851364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,21:0.46:46
chr14	105905126	rs4983620	C	T	1984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=40;PP=1204;SC=GTGGGGGCTACGCCAGCTCCT;SOR=1.308;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=25;TCR=40;TR=65;WE=105905134;WS=105905116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr14	105911639	rs6576102	G	A	1583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=6;PP=1070;SC=CCCGAGGGGTGGTGTGGTTAC;SOR=3.180;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=43;TCR=6;TR=49;WE=105911647;WS=105911629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr14	105916420	rs4983409	C	T	10206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=385;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=189;NR=155;PP=2965;SC=AAATGGAGAACCCGGAAATGG;SOR=0.831;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=344;TCF=189;TCR=155;TR=344;WE=105916428;WS=105916410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,385:1.00:385
chr14	105924538	rs7492915	G	A	869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=25;NR=2;PP=634;SC=CCCCGCACCCGGGGAGGAGAG;SOR=3.912;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=27;WE=105924546;WS=105924528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr14	105924786	rs4074001	G	A	3584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=46;NR=65;PP=2077;SC=GGTGGGTGTTGGGGACGTGAC;SOR=1.288;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=46;TCR=65;TR=111;WE=105924794;WS=105924776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr14	105929443	rs7143366	C	T	1564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=6;PP=1130;SC=GCCTTCTGGCCGCAGCCCTGC;SOR=3.745;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=40;TCR=6;TR=46;WE=105929451;WS=105929433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr14	105930406	rs4983413	G	A	5164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=513;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.724;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=118;NR=120;PP=2962;ReadPosRankSum=0.816;SC=CGTCAACAACGTCAAGGCCGG;SOR=0.588;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=464;TCF=222;TCR=242;TR=238;WE=105930427;WS=105930396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:253,259:0.51:512
chr14	105930923	rs11845995	G	A	6414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=112;PP=2965;SC=GGGGACACCCGCCCTGCCTGC;SOR=0.773;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=220;TCF=108;TCR=112;TR=220;WE=105930931;WS=105930913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr14	105931585	rs4983339	A	G	1574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=24;NR=25;PP=723;SC=ACCCAAGCTCATGCACTGGTG;SOR=1.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=49;TCF=24;TCR=25;TR=49;WE=105931593;WS=105931575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr14	105935721	rs10150545	A	G	2759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=28;PP=1847;SC=CCATTGTCCCAAGGTGGCTGA;SOR=1.848;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=67;TCR=28;TR=95;WE=105935729;WS=105935711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr14	105935824	rs13707	G	A	7955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=146;NR=132;PP=2965;SC=CCACGGACAGGCCAGGCACAT;SOR=0.733;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=278;TCF=146;TCR=132;TR=278;WE=105935832;WS=105935814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,304:1.00:304
chr14	105936064	rs10150915	A	G	646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=119;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=15;NR=5;PP=392;SC=GGTCCGTGTAACTCACTGGGG;SOR=1.828;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=20;WE=105936072;WS=105936054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr14	105936100	rs144496498	A	ACCTTGGCTGGTGGCC	2316.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=5;PP=2900;SC=CAGGCACAGCACCTCCCAGCG;SOR=3.611;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=26;WE=105936108;WS=105936090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr14	105945129	.	G	C	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.416;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.03;ReadPosRankSum=0.041;SOR=0.728;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr14	105945891	rs11849001	C	T	4485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=69;NR=83;PP=2757;SC=TCCACTGTTCCCCCGACCCAC;SOR=1.044;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=69;TCR=83;TR=152;WE=105945899;WS=105945881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr14	105953474	rs7160858	G	T	272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=2;PP=208;SC=CGAGGGGCGGGGTCTCCAAGG;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=105953482;WS=105953464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr14	105953595	rs7140395	T	C	2252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.31;SOR=0.809;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr14	105954705	rs55633823	C	T	1931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.563;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=48;PP=1036;ReadPosRankSum=0.412;SC=CCCTGCTACGCAGCCATGTTT;SOR=0.747;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=155;TCF=70;TCR=85;TR=87;WE=105954713;WS=105954695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,95:0.54:175
chr14	105962234	rs7494350	T	C	3934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=54;PP=2149;SC=GAGCGGGAGCTGCCCAAAACC;SOR=0.922;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=72;TCR=54;TR=126;WE=105962242;WS=105962224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr14	105962369	rs7494717	A	G	3456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=74;PP=2135;SC=ACTGGGCAGCACCCTTGGATC;SOR=1.397;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=119;TCF=45;TCR=74;TR=118;WE=105962377;WS=105962359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr14	105963944	rs4983426	C	T	1518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.39;SOR=1.885;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr14	105963944	.	CT	TC	1199	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=6;NR=21;PP=1199;QD=46.387699069;SC=TCTGGGGAGGCTCACTGCTGC;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=31;TCF=10;TCR=21;TR=27;WE=105963953;WS=105963934;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,27:0.87:31
chr14	105963945	rs4983427	T	C	1468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.20;SOR=2.165;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr14	105996049	rs10569304	TGCC	T	1260.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.123;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.541;NF=4;NR=19;PP=916;ReadPosRankSum=-1.138;SC=CGCAACTCGGTGCCGCCGCCG;SOR=1.071;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=63;TCF=7;TCR=56;TR=23;WE=105996059;WS=105996039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,35:0.47:75
chr14	106053461	rs11970	T	A	103.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.81;QD=25.76;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr14	106054428	rs9972103	C	G	615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.22;QD=32.41;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr14	106054456	rs61984162	A	G	1229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.29;QD=29.28;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr14	106054748	rs74519992	G	A	1073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=571;ExcessHet=3.0103;FS=0.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQRankSum=-7.015;QD=1.89;ReadPosRankSum=3.012;SOR=0.605;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:465,104:0.18:569
chr14	106054791	rs73357622	G	T	3131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FS=3.313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQRankSum=-6.054;QD=8.85;ReadPosRankSum=4.265;SOR=0.526;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:259,95:0.27:354
chr14	106054796	rs74091253	A	G	3178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FS=4.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQRankSum=-5.498;QD=9.84;ReadPosRankSum=2.899;SOR=0.486;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:229,94:0.29:323
chr14	106054812	rs111444508	C	T	1430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FS=1.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQRankSum=-3.284;QD=5.79;ReadPosRankSum=0.756;SOR=0.594;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:168,79:0.32:247
chr14	106054854	.	A	T	472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.379;ClippingRankSum=0.000;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQRankSum=-3.383;QD=7.88;ReadPosRankSum=-2.265;SOR=0.271;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,16:0.27:60
chr14	106054858	.	T	C	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.486;ClippingRankSum=0.000;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQRankSum=-3.674;QD=7.56;ReadPosRankSum=-1.780;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,13:0.24:55
chr14	106066454	rs4983454	T	C	3752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.09;QD=28.87;SOR=0.788;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr14	106067618	rs12884681	G	A	2634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=52;NR=37;PP=1491;SC=TCTTGCCCCCGCGTCCTGGCC;SOR=0.820;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=52;TCR=37;TR=89;WE=106067626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr14	106091697	rs56210451	T	C	2162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.766;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=43;PP=1164;ReadPosRankSum=-0.845;SC=ATGATGGGCATGGGGGACCAT;SOR=0.775;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=183;TCF=95;TCR=88;TR=96;WE=106091705;WS=106091687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,104:0.54:194
chr14	106110137	rs8009156	C	T	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.329;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=193;ReadPosRankSum=1.243;SC=TGCACCTCCACGCCGTCCACG;SOR=0.936;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=14;WE=106110145;WS=106110127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,17:0.41:41
chr14	106110330	rs8014709	T	C	3509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=53;PP=2386;SC=CCAGCTGGGGTCTGTCCCTGG;SOR=0.775;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=117;TCF=64;TCR=53;TR=117;WE=106110338;WS=106110320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr14	106173790	rs17349690	A	G	1596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-6.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=40.681;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.127;NF=38;NR=35;PP=838;ReadPosRankSum=1.819;SC=GAACCAGCACATCCTTGGGGC;SOR=0.035;SbPval=0.09;Source=Platypus;TC=150;TCF=58;TCR=92;TR=73;WE=106173798;WS=106173780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,77:0.61:126
chr14	106173808	rs371291470	G	A	565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=6.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=52.601;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-8.257;NF=0;NR=42;PP=869;ReadPosRankSum=-1.613;SC=GGCTGAAGCCGCGTGCCAGGC;SOR=6.146;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=112;TCF=36;TCR=76;TR=42;WE=106173816;WS=106173798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,28:0.28:101
chr14	106173971	rs10220590	T	C	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.865;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.70;MQRankSum=0.385;QD=13.12;ReadPosRankSum=0.238;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr14	106174261	rs1407	C	G	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.898;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.538;NF=14;NR=20;PP=546;ReadPosRankSum=-1.446;SC=AGAGGTCACGCTCAGGTGGTC;SOR=0.446;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=71;TCF=27;TCR=44;TR=34;WE=106174269;WS=106174251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,36:0.46:79
chr14	106174518	rs12433324	A	G	921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.917;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.455;NF=13;NR=29;PP=650;ReadPosRankSum=-1.296;SC=GTCAGCACATACTTCCCCATG;SOR=1.639;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=82;TCF=33;TCR=49;TR=42;WE=106174526;WS=106174508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,43:0.48:89
chr14	106174654	.	C	G	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.187;ClippingRankSum=0.000;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.093;NF=12;NR=7;PP=158;ReadPosRankSum=-0.183;SC=TGTCAGGGCACGACGGGGTGG;SOR=0.544;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=54;TCF=31;TCR=23;TR=19;WE=106174662;WS=106174644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,8:0.19:43
chr14	106175037	rs58621233	C	CATGCCATG	1258.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FS=60.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQRankSum=-7.319;QD=7.77;ReadPosRankSum=-3.647;SOR=5.213;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:122,40:0.25:162
chr14	106175040	rs59809572	C	CCCAGGAGGACAG	812.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=37.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQRankSum=-8.309;QD=5.68;ReadPosRankSum=-4.006;SOR=4.291;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,26:0.18:143
chr14	106175044	rs57258431	A	G	300.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=5.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=10.152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQRankSum=-8.919;QD=2.64;ReadPosRankSum=-3.870;SOR=2.373;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,11:0.10:114
chr14	106175045	.	T	TG	183.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=4.412;ClippingRankSum=0.000;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=7.973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQRankSum=-8.549;QD=1.69;ReadPosRankSum=-3.771;SOR=2.236;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,10:0.09:109
chr14	106175046	.	A	C	123.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=4.425;ClippingRankSum=0.000;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=5.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQRankSum=-8.182;QD=1.18;ReadPosRankSum=-3.573;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,9:0.09:105
chr14	106208082	rs11621259	G	T	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=2.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.85;MQRankSum=-4.745;QD=12.80;ReadPosRankSum=0.963;SOR=1.547;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr14	106208086	rs1045853	A	C	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=9.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.47;MQRankSum=-4.817;QD=12.07;ReadPosRankSum=1.744;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr14	106209340	rs11552998	T	C	1387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=30;NR=20;PP=754;SC=AGCCCAGGGCTGCTGTGCCCC;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=30;TCR=20;TR=50;WE=106209348;WS=106209330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr14	106235485	rs112228168	T	C	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.55;MQRankSum=-2.079;QD=4.41;ReadPosRankSum=-0.676;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr14	106235528	rs368273969	C	T	353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=2.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.97;MQRankSum=-3.378;QD=6.00;ReadPosRankSum=1.884;SOR=0.337;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,12:0.20:59
chr14	106235535	rs371721170	C	G	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=2.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.74;MQRankSum=-3.546;QD=5.46;ReadPosRankSum=0.042;SOR=0.420;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,18:0.23:78
chr14	106235567	rs139488657	G	A	1491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=2.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.05;MQRankSum=-6.563;QD=12.64;ReadPosRankSum=-0.438;SOR=0.971;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,41:0.35:118
chr14	106235567	.	GTC	ATG	928	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MMLQ=24;MQ=50.05;NF=23;NR=12;PP=928;QD=28.0419392818;SC=CTTGCCGGCCGTCGCACTCAT;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=111;TCF=68;TCR=43;TR=35;WE=106235577;WS=106235557;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:76,35:0.32:111
chr14	106235569	rs4042058	C	G	1491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=3.579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.41;MQRankSum=-6.859;QD=12.75;ReadPosRankSum=-0.370;SOR=1.080;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,42:0.36:117
chr14	106235611	rs1051112	A	T	1485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.446;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-7.298;NF=36;NR=32;PP=771;ReadPosRankSum=-0.240;SC=CTTCTGCGTGAAGCGGTTGTG;SOR=0.653;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=114;TCF=60;TCR=54;TR=68;WE=106235626;WS=106235601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,70:0.57:123
chr14	106236128	rs12890621	T	A	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.193;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.925;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.362;NF=0;NR=5;PP=71;ReadPosRankSum=-0.886;SC=CGTGCTGTTGTACTGCTCCTC;SOR=3.236;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=5;TCR=8;TR=5;WE=106236136;WS=106236122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr14	106236143	rs74093865	G	A	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.622;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.876;NF=9;NR=3;PP=224;ReadPosRankSum=1.110;SC=CTCCTCCCGCGGCTTTGTCTT;SOR=1.981;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=17;TCF=11;TCR=6;TR=12;WE=106236151;WS=106236133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr14	106236451	rs12895160	T	G	1588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=4.589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.11;MQRankSum=-0.250;QD=12.71;ReadPosRankSum=-2.236;SOR=1.140;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,46:0.37:125
chr14	106236458	rs11628528	C	T	1508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=4.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.55;MQRankSum=-1.300;QD=12.68;ReadPosRankSum=-2.482;SOR=1.213;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,42:0.35:119
chr14	106237105	rs2753552	A	G	5055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=104;PP=2965;SC=GAGAGAAGGTATCTGAGCTGA;SOR=1.313;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=174;TCF=70;TCR=104;TR=174;WE=106237113;WS=106237095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr14	106237642	rs2983777	T	G	814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=10;PP=488;SC=TCACCGGTTCTGGGAAGTAGT;SOR=1.284;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=18;TCR=10;TR=28;WE=106237650;WS=106237632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr14	106237811	rs11621054	C	T	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=3.702;NF=5;NR=9;PP=155;ReadPosRankSum=-0.910;SC=AGAGGCCCCTCGGTTCTTGTC;SOR=0.941;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=16;TCF=7;TCR=9;TR=14;WE=106237819;WS=106237801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr14	106303325	rs3764172	A	G	1028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=11;PP=722;ReadPosRankSum=0.526;SC=AGAAGACTGGATTCTGTGGCG;SOR=0.582;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=64;TCF=48;TCR=16;TR=42;WE=106303333;WS=106303315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,42:0.66:64
chr14	106303699	rs10139433	G	A	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.935;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=218;ReadPosRankSum=-1.462;SC=CCCTGGACCAGCTCTGGCATG;SOR=1.296;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=11;WE=106303707;WS=106303689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr14	106303846	rs1005582	C	T	6639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=124;NR=104;PP=2965;SC=GTGGACAGGGCGGTCCACAGG;SOR=0.802;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=228;TCF=124;TCR=104;TR=228;WE=106303854;WS=106303836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr14	106303948	rs1005581	A	G	3817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=52;NR=74;PP=2322;SC=GGGGAGGAACAGGGGCTGAGT;SOR=1.270;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=52;TCR=75;TR=126;WE=106303956;WS=106303938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr14	106304899	rs762807	G	T	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.324;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=19;PP=384;ReadPosRankSum=-0.109;SC=ACAGATAATGGGAGACACGTG;SOR=1.230;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=66;TCF=26;TCR=40;TR=27;WE=106304907;WS=106304889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,28:0.35:81
chr14	106306841	rs709589	C	T	2132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=38;PP=1191;SC=GTGGTGCTCCCGGGCTGTGGA;SOR=1.136;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=70;TCF=32;TCR=38;TR=70;WE=106306849;WS=106306831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr14	106307054	rs2753491	C	G	225.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=4;PP=115;SC=AGGCTGTCAGCCTCTGGCCAC;SOR=0.892;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=8;WE=106307062;WS=106307044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr14	106307418	rs2753492	G	A	5572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=105;NR=84;PP=2965;SC=GGACCTTCCCGGCCACCTCCC;SOR=0.772;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=189;TCF=105;TCR=84;TR=189;WE=106307426;WS=106307408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr14	106310962	rs3751509	C	T	134.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=1;PP=76;SC=AGTCTGCTGGCTGTTTGGCAT;SOR=1.981;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=106310970;WS=106310952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr14	106311374	rs2856940	A	G	211.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=3;PP=116;SC=GAAGAAGGGAAGGGCCGCAGC;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=6;WE=106311382;WS=106311364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr14	106318342	rs2256593	T	C	4697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=80;NR=87;PP=2654;SC=ATGCTTTCCCTGTGGTCGGGA;SOR=0.950;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=167;TCF=80;TCR=87;TR=167;WE=106318350;WS=106318332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr14	106318440	rs2256589	T	C	3971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.13;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr14	106318450	rs2753504	G	A	4223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.24;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr14	106321590	rs12365	C	A	2711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=24;PP=1556;SC=CTCACCGGGGCCACACATGGA;SOR=1.469;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=62;TCR=24;TR=86;WE=106321598;WS=106321580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr14	106321663	rs1059216	T	C	2234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.520;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=45;PP=1125;ReadPosRankSum=1.508;SC=ATGCTCTGGCTGAGCCAGTCG;SOR=0.646;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=181;TCF=101;TCR=80;TR=100;WE=106321671;WS=106321653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,109:0.55:198
chr14	106321913	rs1136534	G	A	5742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=104;NR=93;PP=2965;SC=GAGGCAGCTCGGCAATCACTG;SOR=0.750;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=197;TCF=104;TCR=93;TR=197;WE=106321921;WS=106321903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr14	106322388	rs2753506	G	A	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=180;ReadPosRankSum=0.727;SC=CCTGCCTGTCGGGGCTGAGTG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=9;WE=106322396;WS=106322378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr14	106329435	rs1950943	T	G	3661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.505;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=32;PP=1057;ReadPosRankSum=1.335;SC=GTGGTCCCTTTGCCCCAGACG;SOR=0.639;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=179;TCF=106;TCR=73;TR=78;WE=106329443;WS=106329425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,97:0.46:213
chr14	106329449	.	ATG	A	4287.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.026;ClippingRankSum=0.000;DP=250;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.15;ReadPosRankSum=-0.223;SOR=0.675;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:140,110:0.44:250
chr14	106329451	.	GTA	ACC	2934	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MMLQ=24;MQ=59.98;NF=39;NR=35;PP=2934;QD=20;SC=AGACGTCCATGTAGTAGTAGT;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=207;TCF=118;TCR=89;TR=74;WE=106329461;WS=106329440;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:133,74:0.36:207
chr14	106329453	.	A	ACC	4262.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=0.000;DP=248;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.19;ReadPosRankSum=-1.157;SOR=0.701;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:137,111:0.45:248
chr14	106329919	rs3752943	G	A	1912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.525;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=34;PP=1073;ReadPosRankSum=-2.180;SC=CCCTCTCCCCGGCTTTCTTTC;SOR=0.649;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=181;TCF=111;TCR=70;TR=87;WE=106329927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,96:0.49:197
chr14	106330117	rs3752944	G	A	604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=4.642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.06;ReadPosRankSum=0.522;SOR=1.455;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,17:0.40:43
chr14	106330126	rs3752945	C	A	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=5.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.44;ReadPosRankSum=-0.837;SOR=1.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,16:0.42:38
chr14	106330178	rs61126474	G	A	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.484;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=164;ReadPosRankSum=0.335;SC=GGGTTGTTGGGCATTGGACCC;SOR=1.138;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=35;TCF=25;TCR=10;TR=12;WE=106330186;WS=106330168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,13:0.35:37
chr14	106330197	rs60847425	T	C	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=247;ReadPosRankSum=-0.355;SC=CCCAGAGGCCTAGGGTGGCCC;SOR=0.627;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=15;WE=106330205;WS=106330187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,17:0.44:39
chr14	106330320	rs2857385	A	C	10332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=378;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=187;NR=147;PP=2965;SC=GCCCCCCAGGATGCTCCGGGG;SOR=1.028;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=335;TCF=187;TCR=148;TR=334;WE=106330328;WS=106330310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,377:1.00:377
chr14	106330355	rs74678017	C	G	5203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=496;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.521;HP=2;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=117;NR=107;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.738;SC=GACCCAGCACCCTTATTTCCC;SOR=0.735;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=441;TCF=223;TCR=218;TR=224;WE=106330363;WS=106330345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:238,257:0.52:495
chr14	106330370	rs2857384	G	A	13616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=507;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=220;NR=229;PP=2965;SC=TTTCCCCCCAGAAATGCAGCA;SOR=0.737;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=450;TCF=221;TCR=229;TR=449;WE=106330378;WS=106330360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,505:1.00:505
chr14	106330880	rs2236228	C	T	1727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.018;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=38;PP=949;ReadPosRankSum=-1.598;SC=TGCCCAGACACAAACCTGTGC;SOR=0.522;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=146;TCF=70;TCR=76;TR=78;WE=106330888;WS=106330870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,85:0.54:156
chr14	106346740	rs2244932	A	G	917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=22;NR=9;PP=495;SC=CCCGGCCCCCATCCTCACCAT;SOR=1.547;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=31;WE=106346748;WS=106346730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr14	106346795	rs2244930	G	T	2963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=61;NR=41;PP=1680;SC=GGTCATGAGGGCTGGGAAGGT;SOR=1.009;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=61;TCR=41;TR=102;WE=106346803;WS=106346785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr14	106346990	rs2244917	G	C	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.192;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=136;ReadPosRankSum=-0.756;SC=TGGGCTGCTGGGTGGGGTCTC;SOR=0.264;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=11;WE=106346998;WS=106346980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr14	106347467	rs2516984	A	C	9622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=171;NR=169;PP=2965;SC=GGGGCCTTCCATTGCTGGGCT;SOR=0.699;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=340;TCF=171;TCR=169;TR=340;WE=106347475;WS=106347457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,355:1.00:355
chr14	106350569	rs2516978	C	T	2303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=12;PP=1535;SC=GTGCAGGGCACCAGCCCATCG;SOR=2.613;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=56;TCR=12;TR=68;WE=106350577;WS=106350559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr14	106350623	rs2753523	G	C	5413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=103;NR=71;PP=2965;SC=GGTCTGGGCAGAAACCCTCGG;SOR=1.074;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=174;TCF=103;TCR=71;TR=174;WE=106350631;WS=106350613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr14	106350696	rs2857368	A	G	9744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=371;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.98;NF=172;NR=156;PP=2965;SC=CTGCGAGTCCAGTCAGTTTTT;SOR=0.704;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=328;TCF=172;TCR=156;TR=328;WE=106350704;WS=106350686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,370:1.00:370
chr14	106354353	rs2516972	C	T	1195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=12;PP=763;SC=AGCCCCTCAGCCCCAGGAGTG;SOR=1.455;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=29;TCR=12;TR=41;WE=106354361;WS=106354347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr14	106356974	rs2753529	G	C	3859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.39;SOR=0.832;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr14	106357749	rs2254707	C	T	2163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=58;PP=1589;SC=AGAGGCCAGCCACCTCACAAC;SOR=2.743;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=15;TCR=58;TR=73;WE=106357757;WS=106357739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr14	106359259	rs2857366	A	G	670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=4;PP=388;SC=TCCCACTGAGAGAACCCTCCC;SOR=1.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=21;WE=106359267;WS=106359249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr14	106359327	rs3021114	GC	AG	1033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.10;MQRankSum=-1.804;QD=22.00;ReadPosRankSum=-0.955;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,27:0.57:47
chr14	106361418	rs2753533	T	C	5851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=116;NR=81;PP=2965;SC=CGATCAAAATTGTAACATGGC;SOR=0.936;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=198;TCF=116;TCR=82;TR=197;WE=106361426;WS=106361408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr14	106361561	rs61993631	GC	AT	7699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.69;QD=44.77;SOR=1.302;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr14	106361564	rs61993633	A	T	7699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.66;QD=45.83;SOR=1.320;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr14	106369335	rs2857353	G	A	1166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=7;PP=746;ReadPosRankSum=-0.173;SC=GGCTGAGATGGCCCAGGTGTC;SOR=0.787;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=75;TCF=64;TCR=11;TR=41;WE=106369343;WS=106369325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,46:0.55:83
chr14	106369534	rs2516960	A	G	2350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.086;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=67;PP=1568;ReadPosRankSum=-0.898;SC=GTGGCCAGAGACCTTTCCCAC;SOR=0.816;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=206;TCF=73;TCR=133;TR=103;WE=106369542;WS=106369524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,110:0.50:220
chr14	106370603	rs2857350	G	C	1152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=2.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.280;SOR=0.742;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,56:0.54:103
chr14	106375551	rs2857348	C	A	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.872;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=24.58;ReadPosRankSum=-2.128;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr14	106375555	rs2516957	A	G	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.547;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=18.98;ReadPosRankSum=-0.275;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr14	106375638	rs2857347	T	C	1235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=18;PP=653;ReadPosRankSum=0.012;SC=GTGGGGACACTGTGGGGCTCC;SOR=0.631;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=91;TCF=61;TCR=30;TR=52;WE=106375646;WS=106375628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,58:0.54:108
chr14	106376144	rs2516956	A	G	540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=387;ReadPosRankSum=-0.664;SC=GCAGGGTGCCATGGACAGGAG;SOR=0.843;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=42;TCF=36;TCR=6;TR=25;WE=106376152;WS=106376134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,26:0.59:44
chr14	106376354	rs2516955	A	G	3898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.244;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=92;PP=2580;ReadPosRankSum=-0.297;SC=TGGGCTCAGCACAACTTGGTC;SOR=0.628;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=330;TCF=160;TCR=170;TR=177;WE=106376362;WS=106376344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,187:0.53:355
chr14	106377944	rs2516952	C	G	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.087;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.881;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=64;ReadPosRankSum=-1.139;SC=GAATGAGGCCCTGGGATGTTG;SOR=0.197;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=7;WE=106377952;WS=106377934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr14	106380073	rs2856850	A	G	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.043;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=146;ReadPosRankSum=-0.837;SC=TTTGGGTCACAGGCTGCACTG;SOR=1.942;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=11;WE=106380081;WS=106380063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr14	106380144	rs149711953	G	A	840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.248;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=20;PP=509;ReadPosRankSum=-0.266;SC=CATGGCACGCGGCGGTGCCCC;SOR=0.368;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=72;TCF=41;TCR=31;TR=40;WE=106380152;WS=106380134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,42:0.52:80
chr14	106380174	rs2157630	C	A	2269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=36;PP=1341;SC=GCTGTGGCAGCAGGTTCCCAG;SOR=0.788;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=79;TCF=42;TCR=37;TR=78;WE=106380182;WS=106380164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr14	106382687	rs2857339	C	T	1489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.587;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=41;PP=954;ReadPosRankSum=-0.361;SC=TCACTGTGGGCATAGCAGCTG;SOR=0.634;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=144;TCF=63;TCR=81;TR=72;WE=106382695;WS=106382677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,75:0.47:160
chr14	106385211	.	AGTGGGGTTC	A	52.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.611;ClippingRankSum=0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.79;MQRankSum=-3.466;QD=3.77;ReadPosRankSum=-0.802;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,3:0.21:14
chr14	106385221	.	AG	A	91.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.282;ClippingRankSum=0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.94;MQRankSum=-3.611;QD=6.12;ReadPosRankSum=-0.704;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,3:0.20:15
chr14	106385233	rs2857334	A	G	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQRankSum=-2.623;QD=11.41;ReadPosRankSum=-1.713;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr14	106385233	.	AC	GT	427	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=3;HapScore=4;MGOF=15;MMLQ=24;MQ=53.24;NF=5;NR=2;PP=427;QD=68.6382678375;SC=TGGGGACTCCACTGTGCTCTG;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=7;WE=106385253;WS=106385223;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
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chr14	106385245	rs2857332	C	G	353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.887;NF=9;NR=4;PP=446;ReadPosRankSum=-2.099;SC=TGTGCTCTGGCTGCTGGGGGT;SOR=0.527;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=13;WE=106385253;WS=106385223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr14	106385332	rs2250700	G	C	703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.303;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-1.199;NF=18;NR=11;PP=387;ReadPosRankSum=-0.709;SC=GGCCAGGAGAGAGTTTTGGAC;SOR=0.711;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=53;TCF=28;TCR=25;TR=29;WE=106385340;WS=106385322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,34:0.58:59
chr14	106388588	rs2516944	A	T	342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=257;ReadPosRankSum=0.040;SC=GACAACCCCAAATTCAGACCT;SOR=0.569;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=14;WE=106388596;WS=106388578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr14	106436780	rs67875134	A	G	1438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.136;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=35;PP=807;ReadPosRankSum=0.367;SC=TCCATCTTGCATATAAACGTT;SOR=0.368;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=132;TCF=57;TCR=75;TR=68;WE=106436788;WS=106436770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,73:0.50:147
chr14	106437080	rs72715495	C	T	2262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.117;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=55;PP=1337;ReadPosRankSum=-0.756;SC=AAAAACACACCGGCCTGAATG;SOR=0.595;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=181;TCF=74;TCR=107;TR=96;WE=106437088;WS=106437070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,106:0.52:203
chr14	106452628	rs7144717	T	G	941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.907;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.380;NF=27;NR=17;PP=670;ReadPosRankSum=0.404;SC=CCTCCTCCCTTGGGTTTCTGA;SOR=0.383;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=92;TCF=60;TCR=32;TR=44;WE=106452636;WS=106452618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,45:0.44:103
chr14	106452766	rs112806369	T	A	3413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-2.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=412;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.523;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.492;NF=81;NR=76;PP=2019;ReadPosRankSum=0.768;SC=ATGGTGACCCTGCCCTGAAAC;SOR=0.649;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=366;TCF=192;TCR=174;TR=157;WE=106452774;WS=106452756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:234,178:0.43:412
chr14	106471268	rs1143505	A	G	4804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FS=4.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQRankSum=-2.785;QD=19.77;ReadPosRankSum=-1.584;SOR=0.993;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,125:0.51:243
chr14	106471273	rs77346190	C	T	4877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FS=5.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQRankSum=-2.798;QD=19.20;ReadPosRankSum=-1.038;SOR=1.042;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:124,130:0.51:254
chr14	106471353	rs34069216	C	T	5396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=428;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.367;NF=118;NR=116;PP=2962;ReadPosRankSum=0.073;SC=CCCTGGAACTCCTGTGAATAT;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=394;TCF=199;TCR=195;TR=234;WE=106471361;WS=106471343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,252:0.59:427
chr14	106471388	rs34874585	C	A	6098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=447;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.526;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-5.785;NF=112;NR=118;PP=2962;ReadPosRankSum=0.654;SC=GCCAGCGTTGCTCCATCCCAT;SOR=0.730;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=415;TCF=215;TCR=200;TR=230;WE=106471396;WS=106471378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:190,255:0.57:445
chr14	106471410	rs200773107	T	C	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=437;ExcessHet=3.0103;FS=5.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQRankSum=-5.244;QD=1.01;ReadPosRankSum=-4.587;SOR=1.629;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:398,37:0.09:435
chr14	106471417	rs201932522	G	A	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=421;ExcessHet=3.0103;FS=8.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQRankSum=-5.913;QD=1.47;ReadPosRankSum=-2.510;SOR=1.696;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:379,41:0.10:420
chr14	106471426	rs199743220	G	T	818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=400;ExcessHet=3.0103;FS=18.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQRankSum=-5.701;QD=2.05;ReadPosRankSum=-1.201;SOR=1.775;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:349,50:0.13:399
chr14	106471437	rs114502996	G	T	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=386;ExcessHet=3.0103;FS=25.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQRankSum=-8.046;QD=0.49;ReadPosRankSum=3.387;SOR=2.007;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:332,52:0.14:384
chr14	106471509	rs113475512	C	A	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FS=6.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQRankSum=-2.887;QD=1.49;ReadPosRankSum=-2.654;SOR=1.452;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:210,26:0.11:236
chr14	106471515	rs200143794	C	A	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FS=7.945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQRankSum=-1.946;QD=1.10;ReadPosRankSum=-2.746;SOR=1.667;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:211,21:0.09:232
chr14	106471522	rs111605692	C	T	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FS=8.753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQRankSum=-1.639;QD=0.41;ReadPosRankSum=-3.504;SOR=1.775;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:210,18:0.08:228
chr14	106471528	rs35966079	C	A	3179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FS=3.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQRankSum=-6.188;QD=13.77;ReadPosRankSum=2.602;SOR=0.899;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:143,88:0.38:231
chr14	106471534	rs36065697	A	G	3130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FS=4.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.21;MQRankSum=-7.276;QD=13.73;ReadPosRankSum=1.690;SOR=1.046;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:142,86:0.38:228
chr14	106471547	rs1143496	A	G	1718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.490;HP=2;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-7.963;NF=31;NR=43;ReadPosRankSum=0.129;SC=CTGGGAGTGGACACCTGTAGA;SOR=0.873;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=184;TCF=79;TCR=105;TR=74;WE=106471555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,81:0.41:200
chr14	106471580	rs56320742	GC	TT	1787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.301;HP=5;HapScore=2;JOINED;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-8.895;NF=18;NR=29;PP=2793;ReadPosRankSum=-1.063;SC=GTGGATGGAAGCCCCCTTGAC;SOR=0.927;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=125;TCF=49;TCR=76;TR=47;WE=106471603;WS=106471570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,50:0.36:137
chr14	106471595	rs34652473	T	C	763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=4.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.754;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-10.456;NF=18;NR=21;PP=2692;ReadPosRankSum=0.276;SC=CTTGACTGGCTTCGATCCCTT;SOR=0.840;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=107;TCF=51;TCR=56;TR=39;WE=106471603;WS=106471570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,36:0.31:115
chr14	106471689	rs56372013	A	C	946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.999;NF=24;NR=25;PP=538;ReadPosRankSum=-0.435;SC=CATGGTGAGGAGTTGTGCTCT;SOR=0.706;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=110;TCF=59;TCR=51;TR=49;WE=106471697;WS=106471679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,51:0.42:122
chr14	106478401	rs78225485	G	A	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=4.875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.71;MQRankSum=0.951;QD=4.29;ReadPosRankSum=-0.982;SOR=1.027;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,13:0.30:44
chr14	106494269	rs12895651	T	C	3207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=68;PP=2010;ReadPosRankSum=1.989;SC=TTATCATCATTCCAATAAATG;SOR=0.686;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=223;TCF=111;TCR=112;TR=133;WE=106494277;WS=106494259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,144:0.60:239
chr14	106518415	rs188349361	C	A	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=7.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.79;MQRankSum=-2.184;QD=0.32;ReadPosRankSum=1.418;SOR=0.895;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:144,22:0.13:166
chr14	106518418	rs113047412	A	G	1092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=1.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.368;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.693;NF=37;NR=21;PP=744;ReadPosRankSum=-2.368;SC=AGTAATACACAGCCGTGTCCT;SOR=1.328;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=162;TCF=93;TCR=69;TR=58;WE=106518426;WS=106518405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,60:0.36:169
chr14	106518848	rs2073679	T	C	3048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.98;MQRankSum=0.937;NF=63;NR=75;PP=2024;ReadPosRankSum=-0.186;SC=TCAGCCCCAATTCCATGGTGA;SOR=0.687;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=285;TCF=130;TCR=155;TR=138;WE=106518856;WS=106518838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,148:0.46:319
chr14	106578952	rs11160922	A	T	2504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=24;PP=1628;SC=TGATTCATTCAACAATCCCTG;SOR=1.749;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=56;TCR=24;TR=80;WE=106578960;WS=106578942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr14	106586259	rs11625174	T	G	1913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=44;PP=1280;ReadPosRankSum=1.195;SC=GGATAGTATGTGTCACCAGCA;SOR=0.678;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=252;TCF=139;TCR=113;TR=97;WE=106586267;WS=106586249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,103:0.37:276
chr14	106641761	rs72695948	A	G	3403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=73;PP=1953;ReadPosRankSum=0.627;SC=AGCTGATACCATAGCTGGTAA;SOR=0.703;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=295;TCF=148;TCR=147;TR=149;WE=106641769;WS=106641751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,168:0.51:331
chr14	106667810	rs112170273	C	A	3003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-2.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.572;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.228;NF=61;NR=58;PP=1854;ReadPosRankSum=-2.060;SC=AGAGGCTGCACAGGAGAGTCT;SOR=0.573;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=219;TCF=105;TCR=114;TR=119;WE=106667818;WS=106667800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,133:0.55:240
chr14	106667902	rs58794564	A	AC	10674.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=101;PP=2933;SC=ACACAGAGACACCTGGTCAGA;SOR=0.757;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=149;TCF=44;TCR=105;TR=140;WE=106667919;WS=106667892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,287:1.00:287
chr14	106667911	.	G	T	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.850;ClippingRankSum=0.000;DP=307;ExcessHet=3.0103;FS=1.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQRankSum=-1.096;QD=1.10;ReadPosRankSum=0.491;SOR=0.598;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:259,48:0.16:307
chr14	106725482	rs56069819	A	C	1524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=4.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.014;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.084;NF=23;NR=38;PP=1115;ReadPosRankSum=-1.388;SC=CCAGACTCCAACAGCTGCACC;SOR=0.878;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=144;TCF=63;TCR=81;TR=61;WE=106725490;WS=106725472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,67:0.42:158
chr14	106733520	rs2338199	C	A	1394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.397;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=25;PP=745;ReadPosRankSum=0.354;SC=CCCTGGAACTCAGGATTCTCT;SOR=0.483;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=100;TCF=48;TCR=52;TR=53;WE=106733528;WS=106733510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,64:0.55:116
chr14	106780586	rs202192620	G	C	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=6.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQRankSum=-8.297;QD=0.76;ReadPosRankSum=0.548;SOR=0.236;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,16:0.16:103
chr14	106780597	rs200197121	C	T	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=5.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.17;MQRankSum=-9.513;QD=0.26;ReadPosRankSum=1.810;SOR=0.251;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,18:0.14:128
chr14	106780801	rs56407212	C	T	690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.833;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-2.828;NF=11;NR=20;PP=410;ReadPosRankSum=1.662;SC=CCTGCAGCTGCACCTGGGACA;SOR=0.887;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=86;TCF=33;TCR=53;TR=31;WE=106780809;WS=106780791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,36:0.38:94
chr14	106780817	rs8009554	A	C	1023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.050;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-6.225;NF=17;NR=22;PP=571;ReadPosRankSum=-0.397;SC=GGACAGGACCACTGTGAACAG;SOR=0.399;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=73;TCF=29;TCR=44;TR=39;WE=106780825;WS=106780807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,46:0.55:83
chr14	106791006	rs10148365	C	T	3780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.714;NF=95;NR=55;PP=2377;ReadPosRankSum=-1.707;SC=CACTGTGTCTCTCGCACAGTA;SOR=0.702;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=213;TCF=134;TCR=79;TR=150;WE=106791014;WS=106790996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,156:0.71:221
chr14	106791119	rs4502119	A	G	2675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=519;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.572;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.631;NF=81;NR=71;PP=2962;ReadPosRankSum=1.067;SC=CGGAGTCTGCATAGTATTTAT;SOR=0.801;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=486;TCF=250;TCR=236;TR=152;WE=106791139;WS=106791109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:362,157:0.30:519
chr14	106791131	rs10148460	A	G	2976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=519;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.560;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.267;NF=81;NR=75;PP=2962;ReadPosRankSum=1.125;SC=AGTATTTATTACTTCCATCAT;SOR=0.656;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=486;TCF=249;TCR=237;TR=156;WE=106791139;WS=106791109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:355,164:0.32:519
chr14	106791200	rs8017285	GC	AG	3800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=354;ExcessHet=3.0103;FS=0.874;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.42;MQRankSum=0.317;QD=10.74;ReadPosRankSum=-0.953;SOR=0.754;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:244,110:0.31:354
chr14	106805236	rs61740539	C	T	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.147;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.444;NF=13;NR=6;PP=304;ReadPosRankSum=0.660;SC=CGGCCGTGTCCGCGGCAGTCA;SOR=0.963;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=33;TCR=15;TR=19;WE=106805250;WS=106805226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,19:0.36:53
chr14	106805278	rs61739320	A	G	1177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.821;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-3.185;NF=32;NR=10;PP=796;ReadPosRankSum=-0.795;SC=ACTGGTTCTTAGACGTGTCTA;SOR=0.960;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=89;TCF=65;TCR=24;TR=42;WE=106805286;WS=106805268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,44:0.46:96
chr14	106805282	rs199855112	G	C	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=3.676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQRankSum=-9.412;QD=0.42;ReadPosRankSum=-1.105;SOR=1.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,8:0.08:100
chr14	106805299	rs61739267	A	G	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=28.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.14;MQRankSum=-11.972;QD=1.09;ReadPosRankSum=-1.914;SOR=4.581;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:129,16:0.11:145
chr14	106805341	rs200481782	G	A	1646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FS=1.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQRankSum=-11.195;QD=5.21;ReadPosRankSum=-1.076;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:260,56:0.18:316
chr14	106805343	rs200864088	A	G	1646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQRankSum=-10.689;QD=5.07;ReadPosRankSum=-1.777;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:263,62:0.19:325
chr14	106805380	rs201158628	G	T	2382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=376;ExcessHet=3.0103;FS=3.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQRankSum=-11.708;QD=6.35;ReadPosRankSum=2.048;SOR=0.903;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:295,80:0.21:375
chr14	106805381	rs77489245	T	G	6322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=374;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.796;HP=4;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.973;NF=108;NR=101;PP=2962;ReadPosRankSum=0.920;SC=CTTCCCTGGGTGCTGGCGGAT;SOR=0.735;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=347;TCF=180;TCR=167;TR=209;WE=106805416;WS=106805370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,224:0.60:373
chr14	106805386	rs199616126	G	C	2447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=374;ExcessHet=3.0103;FS=1.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQRankSum=-10.961;QD=6.56;ReadPosRankSum=2.349;SOR=0.824;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:294,79:0.21:373
chr14	106805395	rs61995641	G	A	2558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=376;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.242;HP=1;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=4.139;NF=65;NR=70;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.401;SC=GGCGGATCCAGCTCCAGTAGT;SOR=0.779;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=351;TCF=177;TCR=174;TR=135;WE=106805416;WS=106805370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:232,143:0.38:375
chr14	106805402	rs117757529	T	G	1808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=369;ExcessHet=3.0103;FS=2.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQRankSum=-9.193;QD=4.92;ReadPosRankSum=-0.048;SOR=0.617;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:279,89:0.24:368
chr14	106805408	rs61995642	C	T	2274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=370;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.289;HP=2;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=3.229;NF=56;NR=62;PP=2962;ReadPosRankSum=0.086;SC=CCAGTAGTAACCACCACTGCT;SOR=0.785;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=343;TCF=168;TCR=175;TR=118;WE=106805416;WS=106805370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:240,129:0.35:369
chr14	106805439	rs142283571	T	C	614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FS=1.205;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.65;MQRankSum=-3.837;QD=2.36;ReadPosRankSum=1.266;SOR=0.578;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:207,54:0.21:261
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chr14	106805485	rs113376532	C	G	679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=1.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.27;MQRankSum=-4.557;QD=4.53;ReadPosRankSum=1.566;SOR=0.993;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:125,25:0.17:150
chr14	106805502	rs200772933	C	G	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=4.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.24;MQRankSum=-4.448;QD=4.13;ReadPosRankSum=-0.957;SOR=1.235;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:113,22:0.16:135
chr14	106805508	rs4462488	G	A	3939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=73;PP=1859;SC=TGCACCTGGGGCAGGACCCCT;SOR=1.416;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=118;TCF=45;TCR=73;TR=117;WE=106805516;WS=106805492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr14	106815944	rs375401993	C	G	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=5.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.02;MQRankSum=-5.525;QD=2.35;ReadPosRankSum=-2.667;SOR=1.596;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,19:0.18:105
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chr14	106845209	rs10129994	C	G	540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=0;PP=491;SC=ATGTGCACCTCCTCTGGGGTT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=106845217;WS=106845199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr14	106858882	rs114444490	T	C	2272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.551;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.883;NF=54;NR=42;PP=1446;ReadPosRankSum=-0.559;SC=CAGAGATCTTTAATTCATGAT;SOR=0.763;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=165;TCF=93;TCR=72;TR=96;WE=106858890;WS=106858872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,101:0.56:181
chr14	106859131	rs61997353	G	C	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.602;NF=2;NR=3;PP=75;ReadPosRankSum=0.473;SC=TATGAATATCGTAGGGCTGCC;SOR=1.270;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=12;TCF=5;TCR=7;TR=5;WE=106859139;WS=106859121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr14	106859191	.	G	C	78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=27;MQ=47.08;NF=5;NR=1;PP=78;QD=18.7952020912;SC=GGACTGTATTGTCTCACAGTT;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=6;WE=106859199;WS=106859181;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:17,6:0.26:23
chr14	106859351	rs1008525	G	C	1286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.72;QD=28.59;SOR=2.059;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr14	106859421	rs11160957	A	C	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.50;QD=20.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr14	106866828	rs112981911	A	G	2735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.896;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=60;PP=1420;ReadPosRankSum=0.919;SC=AATACCAACAAGGAAAACCCA;SOR=0.826;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=265;TCF=127;TCR=138;TR=111;WE=106866836;WS=106866818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,138:0.45:309
chr14	106877551	rs8020298	A	C	1888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=38;PP=1351;SC=TGCACCTGCGACCGCCCCCTC;SOR=1.162;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=24;TCR=38;TR=62;WE=106877559;WS=106877541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr14	106922052	rs10782500	T	G	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=197;ReadPosRankSum=2.860;SC=AATTGCATATTTAGGCTATTT;SOR=0.465;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=9;WE=106922060;WS=106922042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr14	106922368	rs6576168	C	T	1343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=36;PP=814;ReadPosRankSum=-0.885;SC=AGTAAAAACACAGGACTCATA;SOR=0.650;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=121;TCF=42;TCR=79;TR=57;WE=106922376;WS=106922358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,63:0.48:131
chr14	106926146	rs61999675	G	A	1244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.175;NF=35;NR=19;PP=880;ReadPosRankSum=-1.321;SC=TTCCTGCAGCGAGGTTTTTGT;SOR=0.700;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=86;TCF=57;TCR=29;TR=54;WE=106926154;WS=106926136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,56:0.57:98
chr14	106937467	.	G	GC	366.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=472;SC=ACTTTGAGAGGCAAGGTGGGT;SOR=4.977;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=106937475;WS=106937457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	107013129	rs2073674	A	C	3814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.399;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.92;MQRankSum=-1.309;NF=84;NR=84;PP=2596;ReadPosRankSum=-1.078;SC=GCCTGGCGGAACCAGCTCATA;SOR=0.652;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=311;TCF=154;TCR=157;TR=168;WE=107013137;WS=107013119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,178:0.54:331
chr14	107034659	.	A	G	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=0.000;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=4.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQRankSum=-6.606;QD=1.86;ReadPosRankSum=-1.437;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,10:0.11:94
chr14	107034665	.	TCA	T	162.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.000;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=2.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQRankSum=-5.359;QD=1.73;ReadPosRankSum=-0.369;SOR=1.233;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,9:0.10:94
chr14	107034668	.	T	TCC	81.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.724;ClippingRankSum=0.000;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=1.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQRankSum=-5.359;QD=0.87;ReadPosRankSum=-0.596;SOR=1.169;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,9:0.10:94
chr14	107034679	rs370585113	C	T	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=4.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQRankSum=-4.526;QD=2.97;ReadPosRankSum=-0.472;SOR=1.629;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,11:0.13:85
chr14	107034681	.	G	C	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=0.000;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=4.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQRankSum=-4.049;QD=3.05;ReadPosRankSum=-1.449;SOR=1.522;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,13:0.16:83
chr14	107034705	rs200210193	G	A	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=-2.236;QD=3.95;ReadPosRankSum=0.889;SOR=0.718;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,15:0.16:92
chr14	107034707	rs201053767	G	T	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-2.251;QD=3.91;ReadPosRankSum=1.082;SOR=0.749;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,15:0.16:93
chr14	107034789	rs72686840	G	A	1086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FS=5.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.35;ReadPosRankSum=-0.774;SOR=1.110;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:207,43:0.17:250
chr14	107034807	rs72686841	G	A	1406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FS=3.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-3.220;QD=4.74;ReadPosRankSum=1.113;SOR=1.010;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:249,48:0.16:297
chr14	107034822	rs199503234	C	G	1593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=347;ExcessHet=3.0103;FS=2.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-3.124;QD=4.59;ReadPosRankSum=1.315;SOR=0.895;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:288,59:0.17:347
chr14	107034846	rs199610746	TC	GT	2802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=416;ExcessHet=3.0103;FS=4.237;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-2.710;QD=6.74;ReadPosRankSum=-1.524;SOR=1.090;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:327,89:0.21:416
chr14	107034854	rs201350766	C	A	2987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=433;ExcessHet=3.0103;FS=5.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-2.631;QD=6.90;ReadPosRankSum=-1.923;SOR=1.119;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:336,97:0.22:433
chr14	107034863	rs199809351	C	T	3074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=441;ExcessHet=3.0103;FS=6.546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-2.676;QD=6.99;ReadPosRankSum=-0.525;SOR=1.226;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:344,96:0.22:440
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chr14	107034873	rs199524561	GA	CC	3029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=448;ExcessHet=3.0103;FS=7.724;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-2.668;QD=6.78;ReadPosRankSum=0.468;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:349,98:0.22:447
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chr14	107082879	rs59681319	C	CG	3292.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.23;QD=46.38;SOR=2.082;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
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chr14	107082881	rs59072447	T	TA,TTAG	3202.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.49;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=20;PP=1129;SC=ATGAGAAGCTTGATATATATT;SOR=1.931;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=107082905;WS=107082861;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:70
chr14	107082882	rs61261254	G	GA	3202.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.02;QD=48.53;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr14	107082889	rs4043174	A	ATTT	2401.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.49;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=20;PP=1129;SC=CTTGATATATATTTAATCTGT;SOR=2.137;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=20;WE=107082905;WS=107082861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr14	107082897	rs2337902	T	A	2224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.49;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=27;PP=858;SC=ATATTTAATCTGTAAGCTATA;SOR=2.004;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=10;TCR=27;TR=37;WE=107082905;WS=107082861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr14	107113780	rs200164853	G	A	604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FS=5.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQRankSum=-11.375;QD=2.72;ReadPosRankSum=-3.142;SOR=1.235;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:193,29:0.13:222
chr14	107113785	rs201264785	C	T	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FS=7.389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQRankSum=-11.209;QD=2.63;ReadPosRankSum=-2.300;SOR=1.335;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:215,33:0.13:248
chr14	107113846	rs201523378	A	G	4378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=548;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQRankSum=-7.896;QD=8.01;ReadPosRankSum=0.248;SOR=0.761;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:416,131:0.24:547
chr14	107113851	rs2072045	C	T	3670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=562;ExcessHet=3.0103;FS=1.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQRankSum=3.307;QD=6.57;ReadPosRankSum=-0.463;SOR=0.814;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:359,200:0.36:559
chr14	107113855	rs111637096	A	G	4862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=571;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQRankSum=-7.338;QD=8.53;ReadPosRankSum=-0.019;SOR=0.692;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:424,146:0.26:570
chr14	107113858	rs111853090	A	G	4844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=588;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQRankSum=-6.946;QD=8.25;ReadPosRankSum=0.538;SOR=0.706;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:438,149:0.25:587
chr14	107113968	rs113324720	C	A	1400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FS=6.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.14;MQRankSum=2.209;QD=4.49;ReadPosRankSum=1.881;SOR=0.857;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:229,83:0.27:312
chr14	107114009	rs11846079	T	C	3172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=3.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.676;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-6.871;NF=61;NR=64;PP=2230;ReadPosRankSum=-0.720;SC=GACCAAGCCTTCCCCAGACTC;SOR=0.537;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=252;TCF=130;TCR=122;TR=125;WE=107114017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,135:0.51:267
chr14	107114193	rs2073670	A	G	2604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.466;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=66;PP=1522;ReadPosRankSum=1.181;SC=CCCAAACTCCATCATGACTCT;SOR=0.740;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=224;TCF=94;TCR=130;TR=114;WE=107114201;WS=107114183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,127:0.50:253
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chr14	107131063	rs2583286	A	G	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FS=9.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.72;MQRankSum=-5.805;QD=0.67;ReadPosRankSum=2.898;SOR=0.873;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:129,22:0.15:151
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chr14	107170410	rs10220412	G	C	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=306;ReadPosRankSum=-0.023;SC=GAGGAGGAATGTGGTTGTTAT;SOR=0.571;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=66;TCF=23;TCR=43;TR=23;WE=107170418;WS=107170388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,25:0.36:70
chr14	107178795	rs10144331	A	G	2676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=56;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=20;PP=1331;SC=TTGTACAGGAAGCGCCCTGGG;SOR=1.576;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=43;TCR=20;TR=63;WE=107178803;WS=107178785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr14	107178832	rs10144402	A	G	3789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=43;PP=2332;SC=TCCGTGCACAATAATACGTGG;SOR=1.358;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=76;TCR=43;TR=119;WE=107178840;WS=107178822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr14	107178965	rs2073669	A	C	3516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=363;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.709;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=82;PP=1812;ReadPosRankSum=0.057;SC=CCAATCAATGAGTGCAAGCCA;SOR=0.799;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=328;TCF=162;TCR=166;TR=158;WE=107178973;WS=107178955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,178:0.49:363
chr14	107179268	rs10144801	A	G	2031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.586;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=55;PP=1323;ReadPosRankSum=1.026;SC=TCCATGGTGGAGAGCAGGATT;SOR=0.616;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=158;TCF=60;TCR=98;TR=90;WE=107179276;WS=107179258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,96:0.56:172
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chr14	107211211	rs2073668	G	A	2023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.522;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.760;NF=49;NR=46;PP=1372;ReadPosRankSum=0.625;SC=AGCCTCCCCCGGACTCCACCA;SOR=0.640;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=194;TCF=104;TCR=90;TR=95;WE=107211219;WS=107211195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,97:0.49:197
chr14	107259782	rs201707042	A	G	713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FS=9.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQRankSum=-9.602;QD=3.53;ReadPosRankSum=2.641;SOR=0.997;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:172,30:0.15:202
chr14	107259787	rs199655081	A	C	719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FS=9.573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQRankSum=-9.362;QD=3.73;ReadPosRankSum=2.997;SOR=0.996;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:163,30:0.16:193
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chr14	107259850	rs78504059	G	A	527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.424;HP=3;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.699;NF=7;NR=15;PP=253;ReadPosRankSum=-0.313;SC=GTTTAAGTGGGGAGGCCCCCA;SOR=0.278;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=82;TCF=22;TCR=60;TR=22;WE=107259858;WS=107259840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,22:0.25:87
chr14	107259865	rs76113443	A	C	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=1.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQRankSum=-3.981;QD=5.26;ReadPosRankSum=-0.559;SOR=0.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,16:0.25:64
chr14	107259887	rs72692489	G	A	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.324;NF=0;NR=8;PP=83;ReadPosRankSum=-0.219;SC=TGCCGCCCTGGCCTGAAGGGA;SOR=1.123;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=8;WE=107259895;WS=107259877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,8:0.23:35
chr14	107259908	rs72692491	A	G	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.737;NF=0;NR=5;PP=28;ReadPosRankSum=0.385;SC=AGAGTCTACAAGGTTTATAAC;SOR=0.434;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=5;WE=107259916;WS=107259898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,6:0.24:25
chr14	107282836	rs201902530	T	A	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FS=21.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQRankSum=-14.641;QD=0.97;ReadPosRankSum=-0.318;SOR=2.865;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:196,20:0.09:216
chr14	107282846	rs200859769	G	A	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FS=26.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQRankSum=-14.218;QD=1.82;ReadPosRankSum=-0.650;SOR=3.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:182,22:0.11:204
chr14	107282852	rs201336503	T	C	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FS=23.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQRankSum=-14.247;QD=2.06;ReadPosRankSum=-0.476;SOR=2.699;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:181,24:0.12:205
chr14	107282859	rs201095197	G	A	705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FS=14.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQRankSum=-12.119;QD=3.44;ReadPosRankSum=-1.311;SOR=1.873;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:172,33:0.16:205
chr14	107282872	rs61741319	T	A	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FS=5.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQRankSum=-10.917;QD=3.78;ReadPosRankSum=-3.202;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:174,50:0.22:224
chr14	107282909	rs202202987	T	C	1061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FS=1.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQRankSum=-10.301;QD=3.90;ReadPosRankSum=4.214;SOR=0.608;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:205,67:0.25:272
chr14	107282926	rs149038822	A	T	2126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FS=2.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQRankSum=-10.275;QD=7.38;ReadPosRankSum=5.328;SOR=0.826;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:221,67:0.23:288
chr14	107282935	rs201762529	A	T	2095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FS=3.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQRankSum=-10.403;QD=7.13;ReadPosRankSum=4.281;SOR=0.798;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:227,67:0.23:294
chr14	107282973	rs200848671	G	C	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FS=8.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQRankSum=-9.282;QD=1.70;ReadPosRankSum=-4.795;SOR=1.276;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:255,53:0.17:308
chr14	107282988	.	C	G	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.243;ClippingRankSum=0.000;DP=303;ExcessHet=3.0103;FS=11.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQRankSum=-9.147;QD=1.46;ReadPosRankSum=-5.309;SOR=1.535;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:265,36:0.12:301
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chr15	20444794	rs2722084	C	T	2213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=506;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.277;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-15.012;NF=59;NR=93;PP=1808;ReadPosRankSum=-5.756;SC=ATAATCTCCTCCCCGGGCTCC;SOR=0.834;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=497;TCF=201;TCR=296;TR=152;WE=20444802;WS=20444784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:368,138:0.27:506
chr15	20445987	rs4931804	C	T	1406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=396;ExcessHet=3.0103;FS=0.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-3.884;QD=3.56;ReadPosRankSum=-1.731;SOR=0.751;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:296,99:0.25:395
chr15	20446043	rs1823751	T	A	4987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=543;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.89;MQRankSum=-2.425;NF=113;NR=117;PP=2928;ReadPosRankSum=-0.076;SC=GGTGAAGCGGTTGCTTCGAGG;SOR=0.674;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=503;TCF=248;TCR=255;TR=230;WE=20446051;WS=20446033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:291,249:0.46:540
chr15	20447987	rs8024775	A	G	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=4.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.779;NF=10;NR=0;PP=194;ReadPosRankSum=0.918;SC=ATATATTTCTACTGTTCATAA;SOR=0.163;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=10;WE=20447995;WS=20447977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,7:0.28:25
chr15	20448056	rs8024950	A	G	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=3.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.740;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-10.159;NF=35;NR=6;PP=689;ReadPosRankSum=-2.295;SC=CACCATACTCACCAAAGTGAA;SOR=2.280;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=117;TCF=84;TCR=33;TR=41;WE=20448064;WS=20448046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,22:0.21:106
chr15	20448077	rs3963874	T	C	967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FS=7.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.86;MQRankSum=-12.841;QD=5.66;ReadPosRankSum=-5.237;SOR=1.349;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:121,50:0.29:171
chr15	20448164	rs55697731	T	C	2183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=642;ExcessHet=3.0103;FS=1.286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.61;MQRankSum=-6.235;QD=3.40;ReadPosRankSum=-0.895;SOR=0.849;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:480,162:0.25:642
chr15	20448306	rs12593272	G	A	445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.996;NF=2;NR=21;PP=358;ReadPosRankSum=0.592;SC=GAGGCAGGTGGATCAATGAGG;SOR=0.646;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=79;TCF=7;TCR=72;TR=23;WE=20448314;WS=20448296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,21:0.31:67
chr15	20450242	rs2444187	G	C	4421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=405;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.518;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.448;NF=105;NR=96;PP=2545;ReadPosRankSum=-0.819;SC=GTTCCTGTGCGGCACACAGCA;SOR=0.640;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=378;TCF=200;TCR=178;TR=201;WE=20450250;WS=20450232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:193,212:0.52:405
chr15	20450376	rs59373601	G	A	693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.81;ReadPosRankSum=0.208;SOR=0.669;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:193,54:0.22:247
chr15	20450433	rs60793038	G	T	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=1.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.81;ReadPosRankSum=-1.016;SOR=0.995;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,17:0.22:76
chr15	20453825	rs7167849	A	G	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.059;NF=12;NR=4;PP=189;ReadPosRankSum=-0.264;SC=CCCCTCTCCCAGGCCCTCTTC;SOR=0.641;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=16;WE=20453833;WS=20453815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr15	20453896	rs2601517	G	C	1458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=22;PP=1060;ReadPosRankSum=1.385;SC=GGACCCACATGTGGATGCAGA;SOR=0.771;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=90;TCF=57;TCR=33;TR=58;WE=20453904;WS=20453886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,59:0.62:95
chr15	20453913	rs2601516	C	T	671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.684;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-2.975;NF=20;NR=14;PP=405;ReadPosRankSum=-0.226;SC=CAGAGGGACACACACCCAGCT;SOR=0.406;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=117;TCF=76;TCR=41;TR=34;WE=20453921;WS=20453903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,38:0.30:126
chr15	20454042	rs7168242	A	T	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FS=3.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.55;MQRankSum=-4.397;QD=0.26;ReadPosRankSum=1.078;SOR=0.416;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:151,23:0.13:174
chr15	20454100	rs12324192	TT	AA	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.23;MQRankSum=1.843;QD=4.70;ReadPosRankSum=0.124;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,14:0.18:78
chr15	20454162	rs4931914	C	A	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-4.020;NF=0;NR=5;PP=45;ReadPosRankSum=-1.500;SC=ATTTGGGATCCTCGCTCTCCT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=5;WE=20454170;WS=20454152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,4:0.19:21
chr15	20456640	rs8041606	A	G	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQRankSum=-8.592;QD=1.69;ReadPosRankSum=-0.550;SOR=0.619;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,22:0.19:118
chr15	20456665	rs8026258	T	A	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=1.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQRankSum=-11.571;QD=2.84;ReadPosRankSum=-0.429;SOR=0.470;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:124,20:0.14:144
chr15	20456673	rs8033709	C	G	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=3.330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQRankSum=-11.962;QD=2.63;ReadPosRankSum=-0.428;SOR=0.575;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:126,19:0.13:145
chr15	20456677	rs8037872	G	A	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=1.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQRankSum=-11.426;QD=2.80;ReadPosRankSum=-0.613;SOR=0.466;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:129,20:0.13:149
chr15	20456682	rs58201907	G	C	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FS=1.918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.12;MQRankSum=-11.008;QD=2.63;ReadPosRankSum=-0.630;SOR=0.651;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:137,21:0.13:158
chr15	20456740	rs2954579	A	G	3072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.234;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-2.600;NF=61;NR=62;PP=1761;ReadPosRankSum=0.176;SC=CTCTTTCACCAGCGCCTGGCT;SOR=0.814;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=176;TCF=91;TCR=85;TR=123;WE=20456748;WS=20456730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,138:0.71:194
chr15	20456787	rs60265308	C	T	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQRankSum=-2.034;QD=0.50;ReadPosRankSum=-0.197;SOR=0.650;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:123,21:0.15:144
chr15	20457155	rs11856094	A	C	1107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=2.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.96;MQRankSum=-7.418;QD=13.68;ReadPosRankSum=-1.217;SOR=0.434;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,31:0.38:81
chr15	20457155	.	ACC	CCT	1715	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=27;MQ=48.26;NF=30;NR=10;PP=1715;QD=44.2116968716;SC=GCCAGCATTTACCGCCCACTC;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=91;TCF=71;TCR=20;TR=40;WE=20457165;WS=20457154;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:51,40:0.44:91
chr15	20457157	rs11854770	C	T	1107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=2.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.13;MQRankSum=-7.017;QD=13.19;ReadPosRankSum=-0.401;SOR=0.459;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,30:0.36:84
chr15	20457244	rs2060872	G	C	1015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FS=1.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.95;MQRankSum=-2.576;QD=4.66;ReadPosRankSum=0.832;SOR=0.799;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:161,57:0.26:218
chr15	20457291	rs6599891	T	C	6690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=449;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.610;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-11.414;NF=169;NR=146;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.489;SC=TGGGCTTGTGTAAGCATCATT;SOR=0.886;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=467;TCF=247;TCR=220;TR=315;WE=20457299;WS=20457281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,296:0.66:449
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chr15	20457447	.	G	C	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.295;ClippingRankSum=0.000;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.740;NF=3;NR=15;PP=251;ReadPosRankSum=1.123;SC=CGTTGCTGTAGAGAAAGATAG;SOR=0.734;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=72;TCF=13;TCR=59;TR=18;WE=20457455;WS=20457437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,19:0.24:78
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chr15	20462690	rs6422224	T	G	5891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=373;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.865;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-7.596;NF=115;NR=135;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.099;SC=CAGAACCCCATTGAGGGAGTC;SOR=0.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=357;TCF=164;TCR=193;TR=250;WE=20462698;WS=20462680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,264:0.71:373
chr15	20462720	rs28522508	G	A	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FS=1.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.66;MQRankSum=-3.425;QD=1.22;ReadPosRankSum=-1.198;SOR=0.550;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:252,49:0.16:301
chr15	20462792	rs62009635	T	G	1201.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=1.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.09;MQRankSum=2.742;QD=17.42;ReadPosRankSum=-1.195;SOR=0.467;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,35:0.51:69
chr15	20462793	rs77195941	ATTT	A	1192.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=2.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.16;MQRankSum=2.835;QD=18.35;ReadPosRankSum=-0.854;SOR=0.394;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,32:0.49:65
chr15	20462810	rs28679605	T	A	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.316;NF=2;NR=8;PP=108;ReadPosRankSum=0.219;SC=TTATTTATTTTTTTTGAGACA;SOR=0.619;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=10;WE=20462818;WS=20462800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,11:0.34:32
chr15	20462828	rs8039793	A	G	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.588;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=48;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.566;NF=0;NR=6;PP=97;ReadPosRankSum=0.517;SC=ACAGAGTCTCACTCTGTCGCC;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=6;WE=20462836;WS=20462818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr15	20464811	rs4983664	C	T	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FS=1.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.13;MQRankSum=2.750;QD=1.39;ReadPosRankSum=-1.003;SOR=0.562;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:242,51:0.17:293
chr15	20464860	rs7177447	G	T	4413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=2.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.628;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.621;NF=75;NR=117;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.343;SC=TGTTTTACTTGTTTATTTTTT;SOR=0.800;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=243;TCF=95;TCR=148;TR=192;WE=20464868;WS=20464850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,189:0.80:235
chr15	20465103	rs6599901	A	C	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=2.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQRankSum=-6.639;QD=0.79;ReadPosRankSum=-0.205;SOR=1.253;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,11:0.15:74
chr15	20465167	rs10794632	A	T	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=2.941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQRankSum=-3.675;QD=3.15;ReadPosRankSum=1.422;SOR=1.361;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,11:0.15:74
chr15	20465181	rs67892369	T	TA	335.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQRankSum=-0.870;QD=5.42;ReadPosRankSum=-1.712;SOR=0.538;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,15:0.24:62
chr15	20465182	rs10794633	T	A	222.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=3.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQRankSum=-2.761;QD=3.48;ReadPosRankSum=1.299;SOR=1.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,10:0.16:64
chr15	20466352	rs4983837	T	C	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=253;ReadPosRankSum=0.782;SC=GCATTATAGGTGTGAAAACCA;SOR=0.434;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=14;WE=20466360;WS=20466342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr15	20466516	rs4983836	C	T	1115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=31.017;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-8.965;NF=15;NR=48;PP=960;ReadPosRankSum=-4.222;SC=AAATCTGATCCAAGCTGAGTG;SOR=2.582;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=153;TCF=57;TCR=96;TR=63;WE=20466524;WS=20466506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,56:0.36:154
chr15	20467100	rs4983661	A	G	2421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-4.124;NF=66;NR=52;PP=1554;ReadPosRankSum=0.668;SC=CACGTGAAGCACCAGCGCAGA;SOR=0.726;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=229;TCF=131;TCR=98;TR=118;WE=20467108;WS=20467090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,122:0.50:244
chr15	20467151	rs4983660	C	T	918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=359;ExcessHet=3.0103;FS=0.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQRankSum=-6.507;QD=2.56;ReadPosRankSum=0.723;SOR=0.658;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:281,78:0.22:359
chr15	20467242	rs59808209	C	T	342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=4.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.55;MQRankSum=0.276;QD=2.48;ReadPosRankSum=-0.321;SOR=1.151;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,27:0.20:138
chr15	20468050	rs4983831	A	G	595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQRankSum=-4.685;QD=3.06;ReadPosRankSum=-0.766;SOR=0.710;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:154,41:0.21:195
chr15	20476942	rs4983659	C	T	891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=444;ExcessHet=3.0103;FS=0.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.000;QD=2.01;ReadPosRankSum=-2.783;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:362,81:0.18:443
chr15	20477005	rs4248783	G	C	3312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=924;ExcessHet=3.0103;FS=2.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=0.428;QD=3.59;ReadPosRankSum=1.133;SOR=0.968;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:697,226:0.24:923
chr15	20477090	rs4931940	T	C	2661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=602;ExcessHet=3.0103;FS=2.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.42;ReadPosRankSum=1.870;SOR=0.506;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:428,174:0.29:602
chr15	20482021	rs28602347	C	G	1642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=366;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.423;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.239;NF=56;NR=44;PP=1217;ReadPosRankSum=-1.110;SC=CTGAGATGTTCAGCCCCTCCA;SOR=0.734;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=343;TCF=185;TCR=158;TR=100;WE=20482029;WS=20482011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:264,102:0.28:366
chr15	20482083	rs28576026	G	A	1409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=1.091;QD=4.41;ReadPosRankSum=-0.290;SOR=0.705;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:230,90:0.28:320
chr15	20482115	rs28702675	A	G	969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FS=4.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=0.596;QD=3.94;ReadPosRankSum=-1.049;SOR=1.020;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:183,63:0.26:246
chr15	20482142	rs60748331	A	C	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FS=7.390;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQRankSum=0.543;QD=2.69;ReadPosRankSum=-1.043;SOR=1.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:136,38:0.22:174
chr15	20588563	rs2291972	A	G	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.162;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-6.192;NF=23;NR=5;PP=439;ReadPosRankSum=0.193;SC=GCGGTTGCAGAAGCCCAGTAG;SOR=1.308;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=74;TCR=16;TR=28;WE=20588571;WS=20588553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,25:0.26:95
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chr15	20613928	rs373703433	G	A	777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=424;ExcessHet=3.0103;FS=0.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQRankSum=1.726;QD=1.83;ReadPosRankSum=1.905;SOR=0.568;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:344,80:0.19:424
chr15	20614087	rs57902346	G	A	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=1.676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.958;QD=3.01;ReadPosRankSum=1.325;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,18:0.20:89
chr15	20874897	rs7497658	A	G	10831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=622;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.633;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.747;NF=234;NR=217;PP=2962;ReadPosRankSum=0.848;SC=CCTATTCTGCATATGGTGGTG;SOR=0.621;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=580;TCF=303;TCR=277;TR=451;WE=20874905;WS=20874887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,485:0.78:621
chr15	20874927	rs62000629	T	A	2647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=609;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.867;QD=4.36;ReadPosRankSum=-1.366;SOR=0.672;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:442,165:0.27:607
chr15	20876423	rs10902996	A	G	1303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=357;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.809;QD=3.65;ReadPosRankSum=0.062;SOR=0.695;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:270,87:0.24:357
chr15	20876515	rs6422240	A	G	12282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=685;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=58.58;MQRankSum=-5.655;NF=238;NR=251;PP=2962;ReadPosRankSum=0.377;SC=CAGCAAAGGTACTCCATGAGA;SOR=0.632;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=635;TCF=309;TCR=326;TR=489;WE=20876523;WS=20876505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,530:0.78:683
chr15	21145503	rs74912473	G	T	167.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=2;PP=108;SC=TGCAACTCTAGCTCTTAACAT;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=21145511;WS=21145493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	21145789	rs76524194	C	T	3548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.717;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=66;PP=1680;ReadPosRankSum=-0.933;SC=CGTGTGTTAACCTGTACTTCT;SOR=0.999;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=130;TCF=37;TCR=93;TR=91;WE=21145797;WS=21145779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,105:0.73:144
chr15	21145805	rs79921246	A	G	2610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.123;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=47;PP=1115;ReadPosRankSum=-0.453;SC=CTTCTGCCGCAGAGTTTGGAG;SOR=0.460;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=86;TCF=17;TCR=69;TR=60;WE=21145813;WS=21145795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,68:0.72:95
chr15	22318963	rs1429506	A	T	7092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=524;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-14.990;NF=178;NR=160;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.297;SC=TATCACAGAAAAGAACAAGGT;SOR=0.699;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=518;TCF=274;TCR=244;TR=338;WE=22318971;WS=22318953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:196,327:0.63:523
chr15	22319148	rs71455753	C	G	6134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=4.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=436;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.530;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.442;NF=132;NR=107;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.134;SC=AGCATAGGAACAAAGGATAAA;SOR=0.759;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=403;TCF=221;TCR=182;TR=239;WE=22319156;WS=22319138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,260:0.60:436
chr15	22319174	rs6602966	T	C	3579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=514;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.541;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.627;NF=90;NR=83;PP=2424;ReadPosRankSum=1.111;SC=AGGTGCCAATTATGAAGACAG;SOR=0.621;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=470;TCF=252;TCR=218;TR=173;WE=22319182;WS=22319164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:323,188:0.37:511
chr15	22319253	rs6602967	A	G	3065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=508;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=78;PP=2042;ReadPosRankSum=-1.122;SC=CTTCAATGGGACGGGATCACA;SOR=0.670;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=472;TCF=231;TCR=241;TR=156;WE=22319261;WS=22319243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:338,168:0.33:506
chr15	22319389	rs8025521	T	A	1107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.372;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.933;NF=28;NR=21;PP=859;ReadPosRankSum=0.201;SC=ACTTGTTTAGTCATGATGCAT;SOR=0.285;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=150;TCF=100;TCR=50;TR=49;WE=22319397;WS=22319379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,50:0.32:156
chr15	22319410	rs8029027	G	A	1309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.913;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-7.452;NF=38;NR=21;PP=954;ReadPosRankSum=-0.078;SC=GGATAACGTAGAGGGCGGCAG;SOR=0.475;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=190;TCF=129;TCR=61;TR=59;WE=22319418;WS=22319400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,62:0.31:198
chr15	22319445	rs6602968	G	A	2394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=381;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.339;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-15.069;NF=69;NR=53;PP=1520;ReadPosRankSum=0.677;SC=GTCAAAGGCCGTGATGCAAAG;SOR=0.567;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=359;TCF=208;TCR=151;TR=122;WE=22319453;WS=22319435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:249,130:0.34:379
chr15	22319565	rs4779265	G	A	6741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=423;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.929;NF=117;NR=154;PP=2962;ReadPosRankSum=0.514;SC=TTTAGTTGCAGTAACATAACA;SOR=0.648;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=392;TCF=169;TCR=223;TR=271;WE=22319573;WS=22319555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,295:0.70:423
chr15	22332751	rs930109	T	C	8796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=166;NR=134;PP=2965;SC=TGAGATGTTTTTGCTGACAGT;SOR=0.877;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=300;TCF=166;TCR=134;TR=300;WE=22332759;WS=22332741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,317:1.00:317
chr15	22333041	rs112228926	G	A	1651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.027;NF=46;NR=39;PP=1045;ReadPosRankSum=1.505;SC=TCTCTTGTCTGCTTCTTGGTC;SOR=0.722;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=250;TCF=136;TCR=114;TR=85;WE=22333049;WS=22333031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,91:0.34:266
chr15	22344871	rs28571003	A	G	1377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.18;MQRankSum=-0.142;QD=4.32;ReadPosRankSum=-0.518;SOR=0.719;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:233,86:0.27:319
chr15	22344879	rs1366870	C	G	9281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=147;NR=154;PP=2962;SC=CTATTCCTCACCCACAGCACC;SOR=0.792;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=301;TCF=147;TCR=154;TR=301;WE=22344887;WS=22344861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,294:1.00:294
chr15	22344951	rs1366871	T	C	3638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.06;QD=34.33;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr15	22345097	rs12440831	C	T	1724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.545;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.238;NF=50;NR=48;PP=1336;ReadPosRankSum=-0.848;SC=CATCACTGTCCTGGTTGGGGG;SOR=0.626;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=268;TCF=129;TCR=139;TR=98;WE=22345105;WS=22345087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,92:0.39:238
chr15	22345158	rs1529528	T	C	1514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.682;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.290;NF=36;NR=46;PP=974;ReadPosRankSum=-0.288;SC=GCTGCCCTTCTGTAATGCTCA;SOR=0.922;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=217;TCF=95;TCR=122;TR=82;WE=22345166;WS=22345148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,75:0.43:173
chr15	22345178	rs61690271	C	A	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=2.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.09;MQRankSum=0.828;QD=2.94;ReadPosRankSum=0.440;SOR=0.483;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,32:0.21:149
chr15	22345306	rs12438744	A	C	794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.703;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=17;PP=536;ReadPosRankSum=0.313;SC=TTGGCCTCCTACACAGTCATT;SOR=0.589;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=116;TCF=69;TCR=47;TR=41;WE=22345314;WS=22345296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,43:0.33:132
chr15	22368588	rs111484216	A	G	2278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=413;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.568;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.020;NF=72;NR=50;PP=1647;ReadPosRankSum=-3.208;SC=GGAAACTGCAAATTACACCAA;SOR=0.747;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=381;TCF=224;TCR=157;TR=122;WE=22368596;WS=22368578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:286,127:0.31:413
chr15	22368862	rs1835183	G	A	11505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-1.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=784;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.150;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.95;MQRankSum=-1.527;NF=218;NR=231;PP=2962;ReadPosRankSum=2.342;SC=TCTTTTGATGGATGCATTGCA;SOR=0.614;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=720;TCF=360;TCR=360;TR=449;WE=22368870;WS=22368852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:288,495:0.63:783
chr15	22368905	rs1835182	G	A	11704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=2.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=801;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.542;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.97;MQRankSum=-1.504;NF=222;NR=236;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.442;SC=CTGGGGCTTCGGAGATGTTCT;SOR=0.692;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=725;TCF=358;TCR=367;TR=458;WE=22368913;WS=22368895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:289,512:0.64:801
chr15	22369248	rs491208	T	C	12027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=424;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.92;QD=28.37;SOR=0.888;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,424:1.00:424
chr15	22382655	rs535034	A	C	683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=5.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.076;HP=6;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.190;NF=11;NR=18;PP=584;ReadPosRankSum=1.462;SC=CCCTCTATTTATTTCTGGGCA;SOR=0.457;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=67;TCF=24;TCR=43;TR=29;WE=22382663;WS=22382645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,26:0.43:61
chr15	22382704	rs62006708	G	C	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.06;MQRankSum=1.441;QD=9.52;ReadPosRankSum=0.408;SOR=0.764;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr15	22382728	rs2808136	C	T	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.49;MQRankSum=-1.902;QD=17.09;ReadPosRankSum=0.200;SOR=0.709;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr15	22382739	rs2671839	A	G	1353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.03;QD=34.71;SOR=2.362;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr15	22382821	rs12438969	G	C	4323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FS=1.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.21;MQRankSum=-0.272;QD=18.56;ReadPosRankSum=1.002;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:122,111:0.48:233
chr15	22382828	rs62006709	C	A	4480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FS=2.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.76;MQRankSum=0.132;QD=17.85;ReadPosRankSum=0.235;SOR=0.857;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:129,122:0.49:251
chr15	22382897	rs62006710	A	G	2712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.865;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.222;NF=57;NR=62;PP=1572;ReadPosRankSum=-2.547;SC=AGAGCCTGCTATGCAATGATG;SOR=0.528;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=214;TCF=99;TCR=115;TR=119;WE=22382905;WS=22382887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,130:0.54:241
chr15	22383064	rs12441468	C	A	2345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQRankSum=-4.641;QD=20.94;ReadPosRankSum=1.061;SOR=0.735;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,59:0.53:112
chr15	22383064	.	CTA	ATG	1616	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=57.71;NF=31;NR=19;PP=1616;QD=33.3893574972;SC=GGTGGAGCTTCTAATGGTCTT;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=98;TCF=59;TCR=39;TR=50;WE=22383074;WS=22383054;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:48,50:0.51:98
chr15	22383066	rs559754	A	G	2345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQRankSum=-4.590;QD=20.40;ReadPosRankSum=0.933;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,61:0.53:115
chr15	22383482	rs3841636	GA	G	877.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.838;NF=2;NR=12;PP=464;ReadPosRankSum=0.512;SC=GTTTTTCACTGAGTACCTCCC;SOR=0.650;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=40;TCF=5;TCR=35;TR=14;WE=22383490;WS=22383472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,29:0.34:86
chr15	22413693	.	G	T	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.657;ClippingRankSum=0.000;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=7.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.98;MQRankSum=-5.405;QD=7.28;ReadPosRankSum=-0.859;SOR=1.581;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,31:0.33:95
chr15	22413700	rs267612	A	G	1995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=20.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.00;MQRankSum=-9.456;QD=19.76;ReadPosRankSum=-2.768;SOR=2.341;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,59:0.58:101
chr15	22413940	rs7167256	T	C	1177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.185;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.280;NF=23;NR=33;PP=560;ReadPosRankSum=-1.030;SC=ATTATCCAGGTGGTCCTCATC;SOR=0.403;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=142;TCF=52;TCR=90;TR=56;WE=22413962;WS=22413930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,58:0.38:153
chr15	22413954	rs1810247	C	T	730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=2.658;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.41;MQRankSum=-0.182;QD=5.85;ReadPosRankSum=0.476;SOR=1.046;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,35:0.28:125
chr15	22414005	rs59278647	C	T	727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=1.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.28;MQRankSum=-0.400;QD=4.58;ReadPosRankSum=1.754;SOR=0.878;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:119,40:0.25:159
chr15	22414190	rs28695837	T	C	3587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=621;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.180;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.413;NF=86;NR=94;PP=2358;ReadPosRankSum=-1.128;SC=GCACCACCCATATCATTGTTA;SOR=0.797;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=563;TCF=277;TCR=286;TR=180;WE=22414198;WS=22414180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:416,202:0.33:618
chr15	22414262	rs1429510	C	T	4019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=556;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.132;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-11.795;NF=95;NR=107;PP=2521;ReadPosRankSum=0.620;SC=CTTTCCCAGCCGACAAGGTGG;SOR=0.596;SbPval=0.54;Source=Platypus;TCF=247;TR=202;WE=22414270;WS=22414252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:339,216:0.39:555
chr15	22414393	rs113528096	CA	C	759.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQRankSum=-1.123;QD=9.87;ReadPosRankSum=0.112;SOR=0.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,45:0.58:77
chr15	22440816	rs4505267	A	G	1875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=359;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.855;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=54;PP=1169;ReadPosRankSum=-0.376;SC=GTTTTGTGGCACTTGTGCCAG;SOR=0.623;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=335;TCF=167;TCR=168;TR=110;WE=22440824;WS=22440806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:243,116:0.32:359
chr15	22448436	rs62007810	G	A	3289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=510;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.836;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.402;NF=93;NR=68;PP=1982;ReadPosRankSum=-1.202;SC=GCTCAGCTCCGTGTAGGCTGT;SOR=0.843;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=469;TCF=255;TCR=214;TR=161;WE=22448444;WS=22448426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:332,177:0.35:509
chr15	22466126	rs1985064	A	C	7716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=488;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.179;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.694;NF=153;NR=133;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.293;SC=GCTGTGCTCGAAGATGTGTCC;SOR=0.586;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=434;TCF=238;TCR=196;TR=286;WE=22466134;WS=22466116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,328:0.67:488
chr15	22482858	rs1807224	A	G	5826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=447;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.809;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.547;NF=149;NR=98;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.089;SC=ATACACGGCCATGTCCTCAGA;SOR=0.840;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=411;TCF=246;TCR=165;TR=247;WE=22482866;WS=22482848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,268:0.60:446
chr15	22483277	rs753259	A	G	1030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.221;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=25;PP=632;ReadPosRankSum=1.155;SC=ACGGTGAGGCACTGAGCTCTA;SOR=0.150;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=51;TCF=17;TCR=34;TR=40;WE=22483285;WS=22483267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,44:0.75:59
chr15	22489900	rs113115466	T	C	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=0.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.442;QD=0.68;ReadPosRankSum=1.383;SOR=0.887;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:108,19:0.15:127
chr15	22489921	rs76846225	G	A	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=0.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.498;QD=1.30;ReadPosRankSum=1.140;SOR=0.691;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:109,25:0.19:134
chr15	22489958	rs111826301	C	T	684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=1.940;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.40;ReadPosRankSum=-0.660;SOR=0.475;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,23:0.21:107
chr15	22489966	rs72687799	A	C	690.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=2.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.84;ReadPosRankSum=-1.443;SOR=0.427;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,23:0.23:101
chr15	22489988	rs72687801	G	A	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=1.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.91;ReadPosRankSum=0.454;SOR=1.071;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,11:0.15:72
chr15	22490035	rs72687802	A	G	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=5.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQRankSum=-2.670;QD=1.60;ReadPosRankSum=-1.756;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,5:0.22:23
chr15	22848149	.	TC	T	39	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;FR=0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=14;MMLQ=15;MQ=60.1;NF=4;NR=4;PP=39;QD=10.25;SC=TGAGTCCCTGTCAAAAAAAAA;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=14;TCF=7;TCR=7;TR=8;WE=22848158;WS=22848139;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,8:0.57:14
chr15	22925851	rs4134802	C	T	1921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=13;PP=1080;SC=TGCCCCTGCCCGACCAGCAGC;SOR=1.751;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=44;TCR=13;TR=57;WE=22925859;WS=22925841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr15	22926229	rs2289824	G	A	2227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=34;PP=1387;SC=TTTTCTTAGTGTAAAAACAAT;SOR=0.954;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=46;TCR=34;TR=80;WE=22926237;WS=22926219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr15	22926307	rs7403459	A	G	3591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=67;NR=53;PP=1947;SC=TCAAGGGTGCACCTGCCCTGT;SOR=0.801;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=120;TCF=67;TCR=53;TR=120;WE=22926315;WS=22926297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr15	22927952	rs2289823	C	T	527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=4;PP=313;SC=TTTGGGTGGTCATTGTGGCCC;SOR=1.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=18;WE=22927960;WS=22927942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	22928533	rs12148589	G	C	1872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=39;PP=1099;SC=ATAATCTGGGGGGGGTGTAAC;SOR=1.362;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=24;TCR=39;TR=63;WE=22928541;WS=22928523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr15	22929905	rs2305094	CA	GG	1935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=30;PP=1711;SC=GGTGAGCACCCACCTCGCGCA;SOR=2.636;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=39;TCF=8;TCR=31;TR=38;WE=22929914;WS=22929895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr15	22933511	rs1867599	A	T	166.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.83;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	22939192	rs11633474	G	A	2325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=28;PP=1361;SC=AGGTGGTTCCGCTATTTGGGG;SOR=1.153;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=51;TCR=28;TR=79;WE=22939200;WS=22939182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr15	22940670	rs3751566	C	T	993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=9;PP=656;SC=TGAGCTGCCCCAGTGCTGTGG;SOR=1.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=33;WE=22940678;WS=22940660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr15	22969232	rs7170637	G	A	4222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=62;PP=2513;SC=GACGCTGGACGGCTTCGACGC;SOR=0.800;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=138;TCF=76;TCR=62;TR=138;WE=22969240;WS=22969222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr15	22999940	rs11307802	TG	T	75.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=0;PP=77;SC=AACAGCCACCTGGCTGCCCGG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=22999948;WS=22999931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	23000272	rs999842	A	G	1809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=33;PP=930;SC=CGCACCATCTATGGACCTTTT;SOR=1.263;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=24;TCR=33;TR=57;WE=23000280;WS=23000262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr15	23006215	rs78803812	CCTTT	C	1757.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=16;PP=1189;SC=TTTAATTACACCTTTCTTAAA;SOR=0.843;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=33;TCF=11;TCR=22;TR=22;WE=23006226;WS=23006205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr15	23021113	rs7170784	G	A	596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=4;PP=346;SC=CACTCACGAGGAATGAAGATG;SOR=2.093;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=18;WE=23021121;WS=23021103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	23049369	rs12592629	G	A	764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=17;PP=525;SC=ACAGTCACCCGGAGCCACCGC;SOR=1.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=23;WE=23049377;WS=23049359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	23052632	rs11263683	T	C	1626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=30;NR=23;PP=761;SC=CAGCCTGAGTTGTCACACTCT;SOR=0.826;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=54;TCF=30;TCR=24;TR=53;WE=23052640;WS=23052622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr15	23059394	rs1991922	C	T	3889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=58;PP=2188;SC=CTTCAATACACCCATCATGGA;SOR=0.750;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=121;TCF=63;TCR=58;TR=121;WE=23059402;WS=23059384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr15	23131745	rs7181884	G	A	401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.87;QD=28.70;SOR=1.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	23132075	rs56264744	G	GA	404.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.161;HP=10;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.371;NF=0;NR=18;PP=301;ReadPosRankSum=0.711;SC=CACTTTAACTGAAAAAAAAAA;SOR=1.508;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=18;WE=23132083;WS=23132065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,19:0.79:24
chr15	23138992	rs202076313	G	A	130.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=26.18;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	23181922	rs1994761	T	C	692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.805;NF=26;NR=15;PP=424;ReadPosRankSum=1.713;SC=TCAGTACTACTGTAACTATAT;SOR=0.668;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=136;TCF=82;TCR=54;TR=41;WE=23181930;WS=23181912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,44:0.29:154
chr15	23182267	rs12050782	G	A	2719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=2.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.085;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=5.330;NF=40;NR=54;PP=1833;ReadPosRankSum=2.577;SC=AAATGGAAAAGTCATCATATG;SOR=0.986;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=103;TCF=46;TCR=57;TR=94;WE=23182275;WS=23182257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:9,104:0.92:113
chr15	23200698	rs58552405	A	T	119.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.55;QD=23.98;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	23300079	rs417713	TT	GC	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=13.523;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQRankSum=-1.233;QD=1.47;ReadPosRankSum=1.300;SOR=2.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,7:0.11:64
chr15	23685004	.	G	GCAT	1010	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.49;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MMLQ=24;MQ=55.52;NF=1;NR=18;PP=1010;QD=55.4210526316;SC=TCCTTCTCTCGCATCTCCTCC;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=19;WE=23685012;WS=23684994;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,19:0.86:22
chr15	23685517	rs372380699	C	T	772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=3.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQRankSum=1.182;QD=6.23;ReadPosRankSum=1.137;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,46:0.37:124
chr15	23685541	rs375981990	CT	C	4819.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.54;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=38;PP=2274;SC=CCCACATCTTCTTCTTCCTGC;SOR=1.773;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=48;TCF=9;TCR=39;TR=47;WE=23685549;WS=23685531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr15	23685583	rs368496365	T	C	894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.907;HP=1;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.693;NF=11;NR=15;PP=332;ReadPosRankSum=-1.962;SC=TCCCACATCTTCTCCTCCTGC;SOR=0.540;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=67;TCF=29;TCR=38;TR=26;WE=23685591;WS=23685573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,33:0.42:79
chr15	23685604	.	TC	T	471.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=3.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQRankSum=0.367;QD=11.23;ReadPosRankSum=-1.296;SOR=0.265;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,14:0.33:42
chr15	23685606	.	TCTTCCTGCTCCCACATCTTCTCCTCCTGCTCCCGCATCTTC	T	439.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.341;ClippingRankSum=0.000;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=5.126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQRankSum=0.400;QD=10.73;ReadPosRankSum=-1.690;SOR=0.215;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,14:0.34:41
chr15	23685639	rs374969803	C	T	226.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=17.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQRankSum=-1.244;QD=9.07;ReadPosRankSum=2.245;SOR=4.479;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr15	23685639	.	CGCATCTTC	TGCATCTTC,TGCATCTTT	431	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=33;MMLQ=27;MQ=58.61;NF=2,2;NR=17,2;PP=431,91;QD=24.5142743446;SC=CTCCTGCTCCCGCATCTTCTC;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19,4;WE=23685655;WS=23685615;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:19
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chr15	23686019	.	G	C	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.144;ClippingRankSum=0.000;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=3.838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQRankSum=-0.069;QD=1.04;ReadPosRankSum=-0.901;SOR=1.252;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,6:0.09:65
chr15	23686045	.	A	ATCT	670	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MMLQ=27;MQ=55.66;NF=4;NR=5;PP=670;QD=78.3333333333;SC=CTGCCCCCACATCTCCTCCTG;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=37;TCF=17;TCR=20;TR=9;WE=23686053;WS=23686000;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:28,9:0.24:37
chr15	23686088	.	TCTC	T	412	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=35;MMLQ=28;MQ=53.68;NF=0;NR=11;PP=412;QD=39.8181818182;SC=TCCCATATCTTCTCCTCCTGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=9;TCR=34;TR=11;WE=23686098;WS=23686078;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:32,11:0.26:43
chr15	23686113	rs68177477	C	G	609.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=4.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQRankSum=-6.297;QD=7.26;ReadPosRankSum=3.768;SOR=1.312;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,20:0.24:84
chr15	23686113	.	C	CTGCTCTTGCATCTTCTCG	461	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=32;MMLQ=25;MQ=54.14;NF=0;NR=11;PP=461;QD=45.8181818182;SC=GCATCTTCTCCTGTTCCCACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=8;TCR=37;TR=11;WE=23686121;WS=23686103;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:34,11:0.24:45
chr15	23686143	.	C	T	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.337;ClippingRankSum=0.000;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQRankSum=-4.470;QD=5.89;ReadPosRankSum=-0.105;SOR=0.680;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,22:0.23:95
chr15	23686157	rs76062343	G	C	545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=3.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQRankSum=-5.848;QD=6.50;ReadPosRankSum=-3.361;SOR=1.243;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,17:0.20:84
chr15	23686162	rs75486959	T	A	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=4.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQRankSum=-6.189;QD=5.49;ReadPosRankSum=-3.618;SOR=1.431;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,15:0.19:81
chr15	23686163	rs74565846	C	T	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=4.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQRankSum=-6.101;QD=5.63;ReadPosRankSum=-4.021;SOR=1.418;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,15:0.19:79
chr15	23686598	rs35708006	T	C	261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=3;NR=5;PP=119;SC=TCCCGCAGCTTCTTCTGCTCC;SOR=1.085;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=8;WE=23686606;WS=23686588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	23686673	rs59122400	G	A	208.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=4;NR=2;PP=99;SC=TCCTGTCTCCGCATCTTCTCC;SOR=1.179;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=23686681;WS=23686663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	23686914	rs57504140	T	A	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.90;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	23686924	rs58446506	T	C	408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.42;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	23687812	rs2344891	T	G	722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=17;PP=376;SC=GGTCTCATTTTTTTTTCTTTT;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=23687826;WS=23687802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	23687818	rs72495057	CT	C	574.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.92;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	23688944	rs4778531	A	G	2491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=33;PP=1360;SC=TTCTTGTGCCATGTGGACACA;SOR=1.085;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=50;TCR=33;TR=83;WE=23688952;WS=23688934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr15	23689510	rs12902150	C	G	1883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=19;PP=1108;SC=GGAATCTTGGCGGTGAGCCTT;SOR=1.211;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=40;TCR=19;TR=59;WE=23689518;WS=23689500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr15	23889033	rs9785	G	T	158.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=1;PP=112;SC=AAATCCAAACGTACACTCGTG;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=23889041;WS=23889023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	24921649	rs3784246	T	C	3779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=55;PP=2439;SC=GAGGGAAATGTCTACCACAAG;SOR=0.801;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=119;TCF=64;TCR=55;TR=118;WE=24921657;WS=24921639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr15	24922230	rs3742950	C	G	3620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=50;PP=2099;SC=CCAACCTGTGCAGACCACAGA;SOR=0.708;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=112;TCF=62;TCR=50;TR=112;WE=24922238;WS=24922220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr15	24923390	rs60574723	C	T	4877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=68;PP=2911;SC=CCCATGATTTCCTGAGCCTTC;SOR=0.764;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=151;TCF=83;TCR=68;TR=151;WE=24923398;WS=24923380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr15	25213183	.	A	G	1218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.60;ReadPosRankSum=1.475;SOR=0.654;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,59:0.51:115
chr15	25219512	rs705	T	C	3905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=48;PP=1997;SC=TAGGAGAACCTGCGTCATACC;SOR=0.967;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=77;TCR=49;TR=124;WE=25219520;WS=25219502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr15	25220253	rs34842555	G	A	3805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=55;NR=70;PP=2013;SC=AGCATGCATCGTCACAGAGAA;SOR=1.235;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=55;TCR=71;TR=125;WE=25220261;WS=25220243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr15	25232026	rs3832976	CGT	C	62.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=4.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.53;ReadPosRankSum=-0.886;SOR=0.129;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,6:0.15:41
chr15	25307562	rs7402542	A	G	4234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=58;PP=2353;SC=CGTTCTCATCAGAACTGAGGT;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=89;TCR=58;TR=147;WE=25307570;WS=25307552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr15	25310440	rs6576402	A	G	557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=14;PP=370;SC=TACACAGGTCAGAGAGTCATA;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=25310448;WS=25310430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	25321029	rs4906699	C	T	3187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=55;PP=1972;SC=TATTGGTTTTCCAAAGGCACC;SOR=0.800;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=54;TCR=55;TR=109;WE=25321037;WS=25321019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr15	25324141	rs4344720	C	T	327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=242;SC=TCCCTTCATACGGTATGTGTT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=25324149;WS=25324131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	25328715	rs3803326	T	C	1780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=28;PP=952;SC=TCCTCATTTTTGGGCATGAAT;SOR=0.886;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=28;TCR=28;TR=56;WE=25328723;WS=25328705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr15	25330550	rs3803328	T	A	2377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=32;PP=1468;SC=GATGACTTCCTTATATACATT;SOR=0.954;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=41;TCR=32;TR=73;WE=25330558;WS=25330540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr15	25415693	rs2739837	T	C	107.28	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	25415693	.	TG	CA	121	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=121;QD=58.1559582874;SC=ATGGTGACCATGGAGGAAGAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=25415702;WS=25415692;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	25415694	rs1883008	G	A	107.28	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	25415759	rs2714734	G	A	388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=2;PP=235;SC=GCCAGCCCCCGGTGCGCTGAA;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=25415767;WS=25415749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	25415809	rs2739838	C	T	789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=6;PP=372;SC=CTGCACTGAGCTGTGGTGAGC;SOR=1.329;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=22;WE=25415817;WS=25415799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	25420134	rs12905695	T	C	412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=51.36;QD=41.28;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	25420134	.	TAG	CAA	331	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.62;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=27;MQ=46.14;NF=1;NR=5;PP=331;QD=64.0779791437;SC=AAATCATGCTTAGTAGGATTA;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=25420144;WS=25420124;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	25420136	rs12899841	G	A	412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.30;QD=45.86;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	25420155	.	T	C	196.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.34;QD=65.63;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	25420157	.	G	A	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.34;QD=35.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	25420159	.	C	T	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.34;QD=35.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	25430783	rs200831581	G	A	519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=6;PP=671;SC=GGGTTGGGTCGATGATGAGAA;SOR=1.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=30;WE=25430791;WS=25430751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	25436554	rs35421670	C	T	2137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=15;PP=1198;SC=GAGGGTGATGCCCTGGGTTGG;SOR=1.704;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=47;TCR=15;TR=62;WE=25436562;WS=25436544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr15	25652101	rs8032479	C	G	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr15	25925094	rs3816800	C	G	2036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=33;PP=1042;SC=TGGGGAAAACCCTCCCCTGGA;SOR=0.887;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=65;TCF=32;TCR=33;TR=65;WE=25925102;WS=25925084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr15	25925195	rs3736186	T	C	469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=8;PP=310;SC=GAGACCCACATAGAGCAGAAG;SOR=1.244;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=6;TCR=8;TR=14;WE=25925203;WS=25925185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	25925933	rs901003	C	A	222.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=1;PP=141;SC=TCTTCTGAGACGTGGCCATGC;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=25925941;WS=25925923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	25926186	rs2076743	G	A	1624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.79;SOR=0.724;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr15	25926325	rs35849027	T	TAAC	740.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.69;QD=41.15;SOR=1.493;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	25937004	rs2066705	C	T	2688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=47;PP=1457;SC=AATCAATGTGCTAGATTTTCT;SOR=1.354;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=33;TCR=47;TR=80;WE=25937012;WS=25936994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr15	25937033	rs4906745	T	G	1448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=33;PP=920;SC=CCCGCTGAACTCAGTCCTGTG;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=12;TCR=33;TR=45;WE=25937041;WS=25937023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr15	25961964	rs10873607	A	G	3604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=51;PP=1776;SC=CAGACAGCTCAGGCGAGAGGT;SOR=0.722;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=113;TCF=61;TCR=52;TR=112;WE=25961972;WS=25961954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr15	25963599	rs8024374	A	G	225.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=6;PP=167;SC=TGGGCGGAGCAGAAAGAAACC;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=25963607;WS=25963589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	25967085	rs1564828	T	C	3850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=62;PP=1792;SC=ACAGGATGAATGACCGTGAGG;SOR=0.945;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=61;TCR=62;TR=123;WE=25967093;WS=25967075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr15	25981190	rs7173593	A	G	1757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=32;NR=26;PP=884;SC=GCAGGCAGACACACGATACTC;SOR=0.723;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=58;TCF=32;TCR=26;TR=58;WE=25981198;WS=25981180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr15	25981367	rs7177724	C	T	368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=11;PP=278;SC=TTTTCTGTCTCGCATCCGCGG;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=25981375;WS=25981357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	26026139	rs8038726	A	G	150.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=0;PP=91;SC=TAATGCCTGCAAGGCCCTGGA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=26026147;WS=26026129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	26260450	rs12440137	C	T	129.85	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=21.64;ReadPosRankSum=-1.383;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr15	26260456	.	CTT	C	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=18.35;ReadPosRankSum=-1.282;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr15	26260477	rs12437822	T	C	680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.21;ReadPosRankSum=-1.482;SOR=0.468;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,26:0.96:27
chr15	26828651	rs72702138	G	A	445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=11;PP=293;SC=AAGCCCCTGTGGGAACCCTGC;SOR=1.739;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=16;WE=26828659;WS=26828641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	26887814	rs754186	A	G	2353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=4.864;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.78;ReadPosRankSum=-1.423;SOR=1.536;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,94:0.99:95
chr15	26887879	rs754185	T	C	1080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=4;NR=26;PP=745;SC=TGTGAGTTATTTGCGAGAAAG;SOR=3.321;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=30;WE=26887887;WS=26887869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr15	27017536	rs8179186	G	A	4304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=58;PP=2421;SC=GCCCTGGGAGGGCGGGCACTC;SOR=0.863;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=80;TCR=58;TR=137;WE=27017544;WS=27017526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr15	27018797	rs20318	G	A	854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=11;PP=412;SC=CTCACCTGCGGGGCTCAGAGC;SOR=1.002;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=19;TCR=11;TR=30;WE=27018805;WS=27018787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr15	27018937	rs20317	G	C	673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=10;NR=18;PP=399;SC=GCAGCCAAACGGCGACGCAGG;SOR=1.528;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=10;TCR=18;TR=28;WE=27018945;WS=27018927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr15	27182357	rs140682	T	C	4365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=67;PP=2521;SC=CTGAAGTCGTTTACGTCTGGA;SOR=0.784;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=72;TCR=67;TR=139;WE=27182365;WS=27182347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr15	27188335	rs140683	T	A	1242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=6;PP=572;SC=TTTCCGTTTTTCACTCTGCCC;SOR=2.468;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=28;WE=27188343;WS=27188325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr15	27188353	rs140684	C	A	1536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=28;NR=11;PP=742;SC=CCCTGCCTGACCCCCGCAGGG;SOR=1.788;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=28;TCR=11;TR=39;WE=27188361;WS=27188343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr15	27216746	rs2288694	C	T	1539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.24;SOR=0.725;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr15	27516740	rs76888516	GAGTC	G	3640.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=37;PP=2089;SC=ATGCAACCTAGAGTCAGTCAG;SOR=0.793;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=2;TCR=41;TR=39;WE=27516751;WS=27516730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr15	27777649	rs117171372	T	C	540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=1;PP=454;SC=TCTTTATCTATAGGAGACAGA;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=27777657;WS=27777639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	27890491	rs1871017	G	T	2204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=37;PP=1050;SC=GTGTGAAGCTGATCGTTGTGT;SOR=1.039;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=33;TCR=37;TR=70;WE=27890499;WS=27890481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr15	27890571	rs5811500	GT	G	715.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=166;SC=GATTGTTGGGGTTTTTTTTTA;SOR=1.493;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=9;WE=27890579;WS=27890561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	27890589	rs1871018	A	G	699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=9;PP=232;SC=TTAAGATATAACTAGACATGG;SOR=2.049;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=13;WE=27890597;WS=27890579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	28195534	rs11632387	C	T	832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=7;PP=578;SC=AGGCCTGAGGCGTAATTAAAA;SOR=2.019;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=29;WE=28195542;WS=28195524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	28196821	rs7173419	T	C	1031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=11;PP=693;SC=TCTCTGGCCTTCCACCAGCCC;SOR=1.371;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=23;TCR=11;TR=34;WE=28196829;WS=28196811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr15	28200408	rs7170989	T	C	1348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=26;PP=687;SC=TCACGCTGCGTGGTGAGATCG;SOR=1.358;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=44;TCF=18;TCR=26;TR=44;WE=28200416;WS=28200398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr15	28211758	rs4778218	A	G	932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=6;PP=653;SC=GATACTTCCTAATAAGAACTT;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=28;WE=28211766;WS=28211748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr15	28211921	rs1800411	G	A	1344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=25;PP=685;SC=GGAGAACAAGGCAAATCCCAA;SOR=1.519;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=15;TCR=25;TR=40;WE=28211929;WS=28211911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr15	28228644	rs12910433	G	A	2126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=31;NR=36;PP=1142;SC=CACAAATGGAGGAAAATGAAA;SOR=1.068;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=31;TCR=36;TR=67;WE=28228652;WS=28228634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr15	28230097	rs1900758	C	T	143.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=113;SC=TGGGCTCAACCGCCCCCACCT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=28230105;WS=28230091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	28231793	rs10852218	T	C	3010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=38;PP=1638;SC=AGATCATCTATGGGGAAAAGA;SOR=1.089;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=59;TCR=38;TR=97;WE=28231801;WS=28231783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr15	28235773	rs1800404	C	T	2200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=38;PP=1268;SC=CCAGCATGGCCGCCAGAGTTC;SOR=1.096;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=70;TCF=32;TCR=38;TR=70;WE=28235781;WS=28235763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr15	28356859	rs1129038	C	T	453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=14;NR=0;PP=348;SC=CAGCAGCGAGCGCTCTGCTGC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=28356867;WS=28356849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	28357230	rs4778245	T	C	847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=16;PP=485;SC=CGGCTGCAGTTTACTTTACTG;SOR=1.402;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=10;TCR=16;TR=26;WE=28357238;WS=28357220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr15	28359744	rs7495441	G	A	236.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=135;SC=CAACAGAGACGGATGACCACC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=28359752;WS=28359734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	28360081	rs7497014	T	C	119.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=5;PP=76;SC=TGCAAGTGCATGGCACACACC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=28360089;WS=28360071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	28360888	rs5811542	C	CT	297.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=388;SC=CTAAAAGCCTCTAACTCTTCA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=28360896;WS=28360878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	28361764	rs4778247	C	T	68.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=0;PP=47;SC=AACTCAAGAGCAGGCACAGGC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=28361772;WS=28361757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	28362459	rs7495875	G	A	2457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=49;PP=1378;SC=AGACCCTGCCGTCTGGGGCGC;SOR=1.508;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=30;TCR=49;TR=79;WE=28362467;WS=28362449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr15	28375872	rs6416603	A	G	516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=13;PP=335;SC=TTAGTGCAACATAAAATCATA;SOR=1.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=18;WE=28375880;WS=28375862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	28377196	rs10627923	C	CCT	2597.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=13;PP=1404;SC=CCTGGGGGCCCGACTGCGGTG;SOR=1.421;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=30;TCF=15;TCR=15;TR=28;WE=28377204;WS=28377186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr15	28377772	rs8025035	C	T	326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=1;PP=257;SC=ATGCAGCCTCCGGCCTCTGCA;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=28377780;WS=28377762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	28378122	rs4778141	T	G	169.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=106;SC=AACTCAAAAGTTCACCACTTC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=28378130;WS=28378112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	28414665	rs7494786	T	C	210.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=1;PP=124;SC=TAAGAATATGTGATAAGGCCT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=28414673;WS=28414655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	28419518	rs367948781	GAGAA	G	99.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.260;NF=3;NR=0;PP=25;ReadPosRankSum=-1.579;SC=AAAAATCTCAGAGAAGATACA;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=3;WE=28419529;WS=28419508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr15	28419746	rs139335991	G	A	723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.058;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=-0.883;NF=10;NR=21;PP=418;ReadPosRankSum=-0.448;SC=GGCCGTGGTCGTTGTCACCCC;SOR=0.272;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=58;TCF=17;TCR=41;TR=31;WE=28419754;WS=28419736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,33:0.53:62
chr15	28441817	rs2525936	G	T	320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=10;PP=258;SC=GTAGTTATTTGTTTTTTACAA;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=28441825;WS=28441807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
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chr15	28517295	.	A	G	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.310;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=2.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.36;MQRankSum=-0.900;QD=37.10;ReadPosRankSum=-0.267;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,14:0.78:18
chr15	28517303	.	T	G	703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.520;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=4.493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQRankSum=-1.072;QD=28.15;ReadPosRankSum=0.638;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,18:0.72:25
chr15	28517305	.	T	A	703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.467;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=7.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQRankSum=-1.152;QD=27.07;ReadPosRankSum=1.148;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,18:0.69:26
chr15	28517310	rs199951842	G	A	703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=7.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQRankSum=-1.152;QD=27.07;ReadPosRankSum=1.146;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,18:0.69:26
chr15	28517436	rs75181529	T	C	1679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.751;HP=5;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.118;NF=37;NR=36;PP=1042;ReadPosRankSum=0.353;SC=AGGGCAAAAGTGGGGCGCTGG;SOR=0.275;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=117;TCF=67;TCR=50;TR=73;WE=28517444;WS=28517426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,79:0.62:127
chr15	28517492	rs77399744	C	A	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=3.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQRankSum=-2.089;QD=1.59;ReadPosRankSum=1.289;SOR=1.120;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,24:0.18:134
chr15	28517539	rs80340439	G	A	861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=30.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQRankSum=-3.818;QD=8.98;ReadPosRankSum=-1.468;SOR=3.526;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,27:0.28:96
chr15	28517546	rs79819039	G	C	817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=19.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.93;MQRankSum=-3.896;QD=9.51;ReadPosRankSum=-2.596;SOR=2.960;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,24:0.28:86
chr15	28517555	rs112104080	T	TC	286.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.330;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.092;NF=0;NR=11;PP=1356;ReadPosRankSum=-2.733;SC=AGATATTTATTCTAGTAAAAA;SOR=2.284;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=1;TCR=40;TR=11;WE=28517563;WS=28517529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,15:0.22:67
chr15	28518102	rs75893088	C	T	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.01;MQRankSum=-5.317;QD=3.36;ReadPosRankSum=-1.031;SOR=0.929;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,5:0.17:30
chr15	28518112	rs200859595	C	A	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.37;MQRankSum=-5.684;QD=2.61;ReadPosRankSum=-0.779;SOR=0.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,5:0.15:34
chr15	28518114	.	TC	T	79.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=0.000;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.859;NF=2;NR=0;PP=188;ReadPosRankSum=-0.481;SC=GGGGGATGCTTCCTGGCCCTT;SOR=0.946;SbPval=0.1;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=2;WE=28518144;WS=28518092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,5:0.14:36
chr15	28518126	.	G	A	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=2.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.84;MQRankSum=-5.945;QD=1.10;ReadPosRankSum=-0.122;SOR=1.519;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,4:0.11:37
chr15	28518130	.	G	C	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.898;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=2.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.72;MQRankSum=-5.773;QD=1.34;ReadPosRankSum=-0.545;SOR=1.514;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,4:0.11:35
chr15	28518135	.	C	T	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=2.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.72;MQRankSum=-5.773;QD=1.34;ReadPosRankSum=-0.467;SOR=1.514;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,4:0.11:35
chr15	28518136	rs201979656	G	A	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=2.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.72;MQRankSum=-5.773;QD=1.34;ReadPosRankSum=-0.493;SOR=1.514;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,4:0.11:35
chr15	28518217	.	C	G	133	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.49;FR=0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=33;MMLQ=28;MQ=50.52;NF=0;NR=2;PP=133;QD=83.8856062736;SC=TACAATCACACTAACACATTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=5;TCR=7;TR=2;WE=28518252;WS=28518207;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:10,2:0.17:12
chr15	28953403	rs202182931	G	A	1396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.34;QD=43.65;SOR=0.957;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr15	28953412	rs200486442	C	T	1626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.86;QD=39.68;SOR=0.741;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr15	29008641	rs372586219	GCCCCTCCATGGATCACCGGCA	G	2512.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=6;NR=17;PP=2966;SC=GAGCTGGCAGGCCCCTCCATG;SOR=0.800;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=23;WE=29008669;WS=29008631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr15	29008851	rs145357312	C	T	168.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.21;QD=28.14;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	29009050	rs112804410	A	AC	5967.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=32;NR=59;PP=2957;SC=TATAGGACTTAGACACCCTTG;SOR=0.820;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=35;TCR=64;TR=91;WE=29009058;WS=29009040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr15	29009311	rs142374134	A	G	1214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.53;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=24;PP=655;SC=ATATAGTTACAGTAGTACTGA;SOR=1.464;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=14;TCR=24;TR=38;WE=29009319;WS=29009301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr15	29043336	rs11630550	C	T	448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.40;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	29043486	rs11630596	C	T	705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=16;PP=486;SC=GAATTTCCACCTTCTGAACAA;SOR=1.445;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=10;TCR=16;TR=26;WE=29043494;WS=29043476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	29043511	rs1877706	T	G	404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.45;QD=28.91;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	29052021	rs4036877	A	T	569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=1;PP=437;SC=TGAACATTTAATAATTGCATT;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=29052029;WS=29052011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	29385149	rs4779760	A	G	333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=1;PP=190;SC=TGCAGATGGCAATGGTTGGGC;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=29385157;WS=29385139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	29385204	rs4779761	A	G	1226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=9;PP=786;SC=TCCTTGTGCTATGGCCAGGCA;SOR=1.721;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=39;WE=29385212;WS=29385194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr15	29386593	rs8037972	G	A	946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=20;PP=559;SC=GTGGGGGCTGGGGGGTTCCCC;SOR=1.819;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=9;TCR=20;TR=29;WE=29386601;WS=29386583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr15	29415560	rs3751562	G	A	5334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=72;PP=2605;SC=GGTCCAGAACGTCAGCGCCGA;SOR=0.774;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=166;TCF=94;TCR=72;TR=166;WE=29415568;WS=29415550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr15	29415698	rs3751563	A	G	3006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=48;NR=44;PP=1407;SC=AAACCCTGGCATCCGCATAGG;SOR=0.922;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=93;TCF=48;TCR=45;TR=92;WE=29415706;WS=29415688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr15	29417099	rs12438521	G	C	2126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=40;PP=1299;SC=GACACCCACCGAGCGGCAGAT;SOR=1.547;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=24;TCR=40;TR=64;WE=29417107;WS=29417089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr15	29418520	rs2256273	C	T	586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.51;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr15	29418573	rs2672680	AT	GC	871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=14;NR=5;PP=709;SC=CTGGAGACACATGGCCAGGGG;SOR=1.721;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=19;WE=29418582;WS=29418563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	29418745	rs968476	G	T	988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=16;NR=15;PP=451;SC=GGGGACGCTGGCGTGGGACAG;SOR=0.927;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=16;TCR=15;TR=31;WE=29418753;WS=29418735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr15	29428556	rs8023368	C	G	696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=17;NR=8;PP=438;SC=TTGTCTGGGGCCCCAGGCCTC;SOR=1.528;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=26;TCF=17;TCR=9;TR=25;WE=29428564;WS=29428546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr15	29444130	rs59230279	GC	G	936.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=17;PP=791;SC=CCCAGAATGAGCCGAGGTCGA;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=19;WE=29444138;WS=29444120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	29862654	rs111717681	C	G	80.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.01;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	30008856	rs7166878	C	A	2335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=45;NR=38;PP=1341;SC=TCTGAGAATGCGCTGGCTTTG;SOR=0.738;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=45;TCR=38;TR=83;WE=30008864;WS=30008846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr15	30008889	rs2229518	G	A	1988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=37;PP=1280;SC=GATGGCTGGCGGCAATGTGTG;SOR=0.927;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=32;TCR=37;TR=69;WE=30008897;WS=30008879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr15	30011427	rs11073215	C	T	302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=2;NR=7;PP=164;SC=TATTAAACTACGATTTAATAT;SOR=2.494;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=30011435;WS=30011417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	30018553	rs4073316	A	T	2189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=26;PP=1277;SC=TTTACTGAACAAGTCAAAAAA;SOR=1.096;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=43;TCR=26;TR=69;WE=30018561;WS=30018543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr15	30064495	rs1383315	C	T	247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=5;PP=102;SC=AATTTCTCTTCAGATCAATGA;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=8;WE=30064503;WS=30064485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	30069920	rs34542662	AT	A	299.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=287;SC=CAAATGTACTATTCTTTTGAC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=30069928;WS=30069910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	30070198	rs1904812	A	C	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=11;PP=299;SC=TTTGGTAGTTATTTTATTTTC;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=30070206;WS=30070188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	30336850	rs7173045	G	T	1643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=9;PP=1036;SC=GACAGGTGGAGGCGGCCGCGT;SOR=2.468;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=41;TCR=9;TR=50;WE=30336858;WS=30336840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr15	30337377	rs10775120	G	C	2654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=46;NR=35;PP=1418;SC=GTCGACCCCAGTCCGGACCCC;SOR=0.734;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=82;TCF=46;TCR=36;TR=81;WE=30337385;WS=30337367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr15	30664453	rs149526715	C	T	1431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.80;QD=25.57;SOR=1.101;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr15	30700263	rs2564642	T	C	1510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=42;PP=1221;SC=TGCCCTCTCCTTCTCTGCCCC;SOR=3.126;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=8;TCR=42;TR=50;WE=30700271;WS=30700253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr15	30700278	rs62016505	C	T	1005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=32;PP=896;SC=TGCCCCCACCCCCACAAAGCC;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=32;WE=30700286;WS=30700268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr15	31042778	rs12902692	C	T	1922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=38;NR=37;PP=1203;SC=ACCTCCTTGTCCCCCACACCA;SOR=0.749;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=76;TCF=38;TCR=38;TR=75;WE=31042786;WS=31042768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr15	31048088	rs61998400	T	C	377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=55.83;NF=9;NR=3;PP=209;SC=AGCTCTGTGGTACTTCCAACT;SOR=1.329;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=12;WE=31048096;WS=31048078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	31048241	rs11633095	A	G	594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=10;NR=8;PP=303;SC=CACCTCACCCACTGCTGGGTC;SOR=0.874;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=19;TCF=11;TCR=8;TR=18;WE=31048249;WS=31048231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	31060115	rs4779494	T	C	1717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=33;NR=19;PP=877;SC=AACCACTTCCTTTGCTCATCC;SOR=0.976;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=33;TCR=19;TR=52;WE=31060123;WS=31060105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr15	31220709	.	TTG	T	122.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.353;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=3;PP=82;ReadPosRankSum=0.360;SC=AAAACAGATTTTGTGTGTGTG;SOR=0.836;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=19;TCF=8;TCR=11;TR=4;WE=31220720;WS=31220699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
chr15	31233220	rs2955792	C	T	199.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=160;SC=CAATTAGAGACGACAGAAAGT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=31233228;WS=31233210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	31233352	rs3840035	GTGAC	G	4892.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=33;PP=2804;SC=GGCTGCTAATGTGACTGACTA;SOR=1.069;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=57;TCF=20;TCR=37;TR=49;WE=31233363;WS=31233342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr15	31234981	rs11293	G	A	202.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=163;SC=TCAGAAACCCGCATTAGCAGT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=31234989;WS=31234980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	31235005	rs3512	G	C	353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=3;PP=257;SC=ACTCTTGGAAGTGCCTTTACT;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=31235013;WS=31234995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	31235357	rs2293319	C	T	87.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=92;SC=CTCATCATTACACAGGTTAAA;SOR=1.609;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=31235365;WS=31235347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	31238783	rs11637469	T	C	1363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=9;PP=742;SC=TTTCTGTTTCTCTCAATGGTC;SOR=1.755;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=31;TCR=9;TR=40;WE=31238791;WS=31238773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr15	31244263	rs2955789	C	T	2033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=42;PP=1221;SC=AAAGGAAAAGCAGTGTTAAAA;SOR=1.547;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=24;TCR=42;TR=66;WE=31244271;WS=31244253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr15	31245880	rs1404467	C	T	683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=15;PP=419;SC=TTATTTTATACGATCCCTATC;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=21;WE=31245888;WS=31245870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	31246840	rs34294266	A	G	480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=5;PP=352;SC=TATAATTTGTACAAATAGTTC;SOR=1.739;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=17;WE=31246848;WS=31246830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	31283844	rs28564430	T	C	460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=11;PP=365;SC=CGGGCGGGGATACGGCGCAGC;SOR=1.911;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=15;WE=31283852;WS=31283834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	31295151	rs17227996	T	G	2550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=39;PP=1300;SC=TTCAAGAGCATTCACCATTCT;SOR=0.870;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=40;TCR=39;TR=79;WE=31295159;WS=31295141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr15	31330280	rs2288242	A	G	2289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=37;PP=1486;SC=TGCCATCCTCATTTTCCTTGG;SOR=0.812;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=43;TCR=37;TR=80;WE=31330288;WS=31330270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr15	31339151	rs11636121	A	C	142.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=0;PP=82;SC=GGGGAGCTGGAGAATGCCGTG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=31339159;WS=31339141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	31341461	rs10851487	G	A	525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=13;NR=7;PP=400;SC=CTGCCATTAAGTACGGACCTC;SOR=1.292;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=13;TCR=7;TR=20;WE=31341469;WS=31341451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	31341516	rs2288241	C	T	1534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=16;PP=998;SC=ACAATATGCACCAGTGACAAA;SOR=1.371;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=34;TCR=16;TR=50;WE=31341524;WS=31341506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr15	31342744	rs1035705	C	T	2033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.791;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=34;PP=1048;ReadPosRankSum=-0.820;SC=TCTCCTTCTCCGTGGCTTTGC;SOR=0.824;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=65;TCF=31;TCR=34;TR=64;WE=31342752;WS=31342734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,78:0.99:79
chr15	31357138	rs919001	A	G	757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=7;PP=561;SC=GCAAGGATTGATATTTTCAAT;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=24;WE=31357152;WS=31357128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	31359457	rs3784599	T	G	1356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=28;PP=878;SC=TCATGAAATTTAGGGACACTT;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=14;TCR=28;TR=42;WE=31359465;WS=31359447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr15	31362352	rs2241493	C	T	1039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=13;NR=24;PP=701;SC=CACCTGTTTGCTTTCCTCTTC;SOR=1.552;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=13;TCR=24;TR=37;WE=31362360;WS=31362342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr15	31368915	rs2241497	C	G	429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=331;SC=GTGGTGGACACAAACTCTTTT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=12;WE=31368923;WS=31368906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	31369123	rs4779816	A	G	3058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=47;PP=1853;SC=AGAGTCTTTCATGCTAGGAAT;SOR=0.782;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=58;TCR=47;TR=105;WE=31369131;WS=31369113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr15	31369223	rs4779817	C	T	2728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=50;PP=1490;SC=TGGACCAATACATTCCCAAGC;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=44;TCR=50;TR=94;WE=31369231;WS=31369213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr15	31369258	rs4779818	C	T	1694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=38;PP=1143;SC=ATTCTTATACCTTTATAAAAC;SOR=1.688;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=19;TCR=38;TR=57;WE=31369266;WS=31369248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr15	31373727	rs4779504	T	C	598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=14;PP=454;SC=TGCCCTCCCTTTGTTCCAGTC;SOR=2.419;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=18;WE=31373735;WS=31373717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	31515933	rs28718174	G	C	3062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=52;NR=46;PP=1652;SC=AAAGCACAGAGAGCCCTTTAA;SOR=0.820;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=52;TCR=46;TR=98;WE=31515941;WS=31515923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr15	31521505	rs3835087	CGG	C	2304.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=28;PP=695;SC=CTGGTGGGGCCGGGGGGGGGG;SOR=1.179;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=31;WE=31521515;WS=31521495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr15	31523008	rs2304507	T	C	2817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=49;PP=1341;SC=CTTGAAAAGTTGGTGGGCAGA;SOR=0.869;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=46;TCR=49;TR=95;WE=31523016;WS=31522998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr15	31746320	rs12102124	T	C	550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=11;PP=330;SC=CGCTTGGAGGTGGGGACCTTC;SOR=0.990;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=10;TCR=11;TR=21;WE=31746328;WS=31746310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	32322929	rs2292571	G	A	1590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=30;PP=901;SC=TGCGCCCCGCGCCTGGGCCAG;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=28;TCR=30;TR=58;WE=32322937;WS=32322919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr15	32393663	rs28650375	C	A	282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=6;PP=131;SC=GGAAAAAAAACCAAAAAAACA;SOR=2.494;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=32393671;WS=32393653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	32926076	rs11632524	C	T	334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=8;NR=0;PP=113;SC=TTTCGTATTTCAAGTATTTCT;SOR=2.147;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=32926084;WS=32926066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	32984196	rs6494593	A	G	112.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=4;PP=86;SC=AGTCTGTAGCAATTCTAGCAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=32984204;WS=32984186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	33023486	rs12915554	C	A	516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=14;PP=346;SC=AGGAATGCAGCCCCAGGAAGT;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=33023494;WS=33023476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	33096624	.	AGGAGGTCTG	A	98.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.75;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	33096635	.	ATTCGGGGGGGGGG	A	98.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.75;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	33191023	rs173224	A	G	2947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=48;NR=42;PP=1722;SC=TCCACGTAATACCATTTCTTA;SOR=0.712;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=48;TCR=42;TR=90;WE=33191031;WS=33191013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr15	33202602	rs3812926	A	G	740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=18;NR=6;PP=432;SC=ACCAAAGAACATGAACAGCTC;SOR=2.147;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=24;WE=33202610;WS=33202592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr15	33218589	rs36016183	C	CTCT	502.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=442;SC=GCTGCATGCACTCTTTAAATA;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=9;WE=33218597;WS=33218579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	33357262	rs2306277	A	G	1874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=23;PP=986;SC=CTGCTCAGTCAGGCTGTGGTC;SOR=0.904;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=58;TCF=35;TCR=23;TR=57;WE=33357270;WS=33357252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr15	33359370	rs11072170	C	T	2540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=39;PP=1585;SC=GTCTTGGGACCCTTCTTCTCC;SOR=0.760;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=43;TCR=39;TR=82;WE=33359378;WS=33359360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr15	33359574	rs11858145	C	A	2922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=54;NR=43;PP=1589;SC=AGATAAAACACCACTAGGGGA;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=54;TCR=43;TR=97;WE=33359582;WS=33359564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr15	33380985	rs2291066	A	C	6775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=76;NR=60;PP=2434;SC=CACAATCACCAAGATTTCTAC;SOR=0.830;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=76;TCR=60;TR=136;WE=33380993;WS=33380975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr15	33381000	rs2291065	A	T	6769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=58;PP=2337;SC=TTCTACTTACATGGAGATCCA;SOR=0.887;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=136;TCF=78;TCR=58;TR=136;WE=33381008;WS=33380990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr15	33445983	rs114943683	G	A	3694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=57;NR=62;PP=2035;SC=ATGAGCCCCAGCCTCAGCTCC;SOR=0.862;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=119;TCF=57;TCR=62;TR=119;WE=33445991;WS=33445973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr15	33446258	rs28377066	G	A	2471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=38;PP=1207;ReadPosRankSum=1.226;SC=GCTCCAGCCCGCTCGGCGGCC;SOR=0.322;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=36;TCR=38;TR=74;WE=33446266;WS=33446248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,94:0.99:95
chr15	33446311	rs28507600	G	C	1562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=26;PP=858;ReadPosRankSum=-1.369;SC=CTGCAGTCAGGGGGCAGCACT;SOR=0.280;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=53;TCF=27;TCR=26;TR=53;WE=33446319;WS=33446301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,60:0.98:61
chr15	33757840	rs2596163	G	A	435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=4;PP=313;SC=GAAATGATGCGATCTCAGGTT;SOR=1.739;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=17;WE=33757848;WS=33757830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	33765761	rs2245508	A	G	767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=16;PP=458;SC=TGTCCGCCCTACACCTTCTTC;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=8;TCR=16;TR=24;WE=33765769;WS=33765751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr15	33795710	rs2572204	A	G	1189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=8;PP=793;SC=ACCTTTTTGCATTCCTATTCA;SOR=2.461;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=33;TCR=8;TR=41;WE=33795718;WS=33795700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr15	33840414	rs1435100	A	G	1445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=22;PP=818;SC=AGGTAATGGAAGGCCTGGGAA;SOR=0.767;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=49;TCF=27;TCR=22;TR=48;WE=33840422;WS=33840404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr15	33842222	rs1865496	C	G	254.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=210;SC=AGCAAGCCAGCAGCCTGGTGC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=33842230;WS=33842212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	33842260	rs2304381	G	A	617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=2;PP=511;SC=GACACCAGAAGGGTTATAAGT;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=33842268;WS=33842250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	33855345	rs2304379	G	A	156.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=4;PP=82;SC=ATTTTGTGATGGATTGTACAC;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=33855353;WS=33855335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	33872177	rs674155	C	T	1751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=40;NR=14;PP=828;SC=TGGTTTTTAGCGGAAACAATC;SOR=1.230;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=55;TCF=41;TCR=14;TR=54;WE=33872185;WS=33872167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr15	33876449	rs10431811	G	A	611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=2;PP=350;SC=AAAAAAGAAAGAATTGTGTCA;SOR=3.160;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=33876457;WS=33876439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	33876517	rs2643364	A	G	3339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=67;NR=36;PP=1734;SC=AGCAAGTGAAATATTCGACAG;SOR=1.160;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=67;TCR=36;TR=103;WE=33876525;WS=33876507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr15	33876543	rs624954	C	T	4153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=87;NR=45;PP=2159;SC=CAAGTTCTCACGCCCATCATT;SOR=1.135;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=87;TCR=45;TR=132;WE=33876551;WS=33876533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr15	33893567	rs12906396	C	G	360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=1;PP=223;SC=GGTGGTCCTGCCTGCTGTGCC;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=33893575;WS=33893557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	33893769	rs2437135	C	T	2443.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=33;PP=1382;SC=GCCACCACCACCATTCCAAAT;SOR=0.807;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=47;TCR=33;TR=80;WE=33893777;WS=33893759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr15	33893828	rs3829479	C	G	1521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=31;PP=1055;SC=AAAGAGGGCTCATCTGAACTC;SOR=1.402;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=19;TCR=31;TR=50;WE=33893836;WS=33893818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr15	33895613	rs2291729	G	T	542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=336;ReadPosRankSum=-0.875;SC=TGGAAATGATGGAGGCTCAAA;SOR=1.358;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=18;WE=33895621;WS=33895603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,20:0.95:21
chr15	33915964	.	GT	G	1546.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.087;ClippingRankSum=0.000;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=19;PP=576;ReadPosRankSum=1.449;SC=GGGCTGCATTGTTTTTTTTTT;SOR=0.542;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=44;TCF=19;TCR=25;TR=35;WE=33915973;WS=33915954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,63:0.98:64
chr15	33954652	rs4780144	C	T	3060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=48;PP=1760;SC=CAGGAATATCCGCCTCTTCCC;SOR=0.711;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=49;TCR=48;TR=97;WE=33954660;WS=33954642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr15	33955262	rs66533161	GTGAC	G	277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=294;SC=GCTTGGCATAGTGACTGACCA;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=6;WE=33955273;WS=33955252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	33962559	rs11072596	G	C	486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=4;PP=332;SC=AATGTTCTTTGTGACACTATG;SOR=1.739;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=16;WE=33962567;WS=33962549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	33990250	rs1111611	G	A	949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=17;PP=493;SC=GCAGGAGCACGAGGTGACTTG;SOR=1.542;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=11;TCR=17;TR=28;WE=33990258;WS=33990240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr15	33993143	rs11629683	G	C	1573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=17;PP=860;SC=GTCTTCCTCTGTCCTTTTCTT;SOR=1.262;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=46;TCF=29;TCR=17;TR=45;WE=33993151;WS=33993133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr15	34016274	rs6495228	G	A	940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=8;PP=569;SC=AGCAGCACGGGGGACGATGAA;SOR=1.751;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=29;WE=34016282;WS=34016264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr15	34021276	rs7498093	T	G	503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=11;PP=296;SC=ATTGTGAAATTAGTAATGTTG;SOR=2.712;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=34021284;WS=34021266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	34030865	rs4780171	T	C	1919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=38;PP=1166;SC=ACAGCCGTCATCTGTTTAGCA;SOR=1.418;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=25;TCR=38;TR=63;WE=34030873;WS=34030855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr15	34060740	rs2278317	C	T	1061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=8;PP=766;SC=TAGTGCATCTCCCTAGAATGC;SOR=2.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=35;WE=34060748;WS=34060730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr15	34064043	rs1429754	T	C	958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=9;PP=612;SC=TCTGCCCAGATGACACTGCCA;SOR=1.819;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=30;WE=34064051;WS=34064033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr15	34103272	rs4780181	C	G	1730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=32;PP=1003;SC=GAACTCACACCGGCTTTCCTT;SOR=1.366;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=23;TCR=32;TR=55;WE=34103280;WS=34103262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr15	34111876	rs150186949	AAAATAAATAAATAAAT	A	1653.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=6;PP=491;SC=CTCTGTCTCAAAAATAAATAA;SOR=2.362;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=26;TCF=11;TCR=15;TR=10;WE=34111903;WS=34111866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr15	34113010	rs2288613	C	T	2650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=42;PP=1472;SC=AAAAAACATTCGAAGTAAGTT;SOR=0.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=41;TCR=42;TR=83;WE=34113018;WS=34113000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr15	34113592	rs2288615	T	G	2688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=35;PP=1323;SC=AGTTTCTGGATGGGCTTATGT;SOR=0.733;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=82;TCF=47;TCR=35;TR=82;WE=34113600;WS=34113582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr15	34118994	rs4041449	C	CAG	2838.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=35;PP=912;SC=ACACAGCACTCGGGCAAAACT;SOR=1.270;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=38;TCF=1;TCR=37;TR=36;WE=34119002;WS=34118984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr15	34129357	rs7182398	C	T	741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=19;PP=497;SC=CCTGGTCTGACGGACGAAGCC;SOR=1.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=26;WE=34129365;WS=34129347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr15	34135826	rs2303868	G	A	587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=15;PP=428;SC=TACTAAGTATGCTATGTGTAG;SOR=2.531;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=34135834;WS=34135816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	34136971	rs7181900	T	C	500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=13;NR=4;PP=346;SC=ACTATTTGTATAGCACATGCT;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=17;WE=34136979;WS=34136961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	34137292	rs12899715	C	G	489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=15;PP=380;SC=TGGATCTAATCTCACTCCTTG;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=34137300;WS=34137282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	34140735	rs2278314	A	G	371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=7;PP=171;SC=TTTGATTTCTAGGACTTTTCT;SOR=1.765;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=11;WE=34140743;WS=34140725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	34146783	rs2303308	G	A	1819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=37;PP=1143;SC=ACGTGCTGGGGGAACACTTAT;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=21;TCR=37;TR=58;WE=34146791;WS=34146773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr15	34146886	rs713201	T	C	1752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=23;PP=1193;SC=TCAGTGTGTCTCCCAAAATAA;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=37;TCR=23;TR=60;WE=34146894;WS=34146876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr15	34146922	rs713203	C	T	2608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=57;NR=31;PP=1606;SC=AATGAGCACACTATGAGGCAA;SOR=1.251;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=57;TCR=31;TR=88;WE=34146930;WS=34146912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr15	34151668	rs7180084	G	C	1262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=10;PP=744;SC=TTCCCCTCTCGTGGCTTAGGG;SOR=1.880;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=39;WE=34151676;WS=34151658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr15	34152697	.	CT	C	40.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=6.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.95;ReadPosRankSum=0.561;SOR=2.331;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,8:0.19:43
chr15	34152777	rs2303310	T	A	3707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=68;NR=58;PP=2161;SC=TTGCTTTGTCTTTGTATTTAA;SOR=0.793;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=128;TCF=69;TCR=59;TR=126;WE=34152785;WS=34152767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr15	34156284	rs11072759	C	G	1384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=21;PP=808;SC=TTAATCCATGCGAATGAACTT;SOR=0.732;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=23;TCR=21;TR=44;WE=34156292;WS=34156274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr15	34156312	rs11072760	T	C	1278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=20;PP=692;SC=GACCAGAGTATCTAATACTAT;SOR=0.823;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=20;TCR=20;TR=40;WE=34156320;WS=34156302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr15	34380216	rs377063587	TA	T	238.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.87;ReadPosRankSum=1.709;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,21:0.43:49
chr15	34437863	rs4780222	A	G	419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=12;PP=307;SC=TTAAAAAAAAATCAAATAACT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=34437871;WS=34437853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	34441102	rs6495551	C	T	423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=12;PP=293;SC=CAGTTGACCACAGTAAACAAA;SOR=3.126;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=34441110;WS=34441092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	34521253	rs7167503	A	T	136.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.81;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	34528948	rs4577050	G	A	1929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=19;PP=1063;SC=GCATGTGCCGGAGCATCTGGG;SOR=1.244;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=38;TCR=19;TR=57;WE=34528956;WS=34528938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr15	34537435	rs4371122	C	T	1257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=11;PP=791;SC=AATAAACATGCATTATTTATC;SOR=1.814;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=32;TCR=11;TR=43;WE=34537443;WS=34537425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr15	34542606	rs17236791	T	C	1436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=23;PP=769;SC=TAACATGAGATAGAAAGTAGA;SOR=1.136;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=19;TCR=23;TR=42;WE=34542614;WS=34542596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr15	34543055	rs10851964	G	A	1167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=21;PP=768;SC=AAATCACTCCGTGGGTCTGAC;SOR=0.739;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=20;TCR=21;TR=41;WE=34543063;WS=34543045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr15	34543298	rs11382535	G	GA	774.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.546;HP=10;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=273;ReadPosRankSum=0.528;SC=GCAGCAGTATGAAAAAAAAAA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=23;WE=34543306;WS=34543288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,34:0.83:41
chr15	34547757	rs11421665	G	GA	261.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=5;PP=194;SC=AGTAAAAGGTGAAAGTGTTAT;SOR=3.056;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=6;WE=34547765;WS=34547747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	34640054	rs150911418	AAAAAAT	A	393.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=1;PP=175;SC=ACTCCATCTCAAAAAATAAAA;SOR=3.258;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=4;WE=34640067;WS=34640044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	34640218	rs374230	C	T	4379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=58;PP=2422;SC=AGTGCCGCCCCGTCTCCATCC;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=139;TCF=81;TCR=58;TR=139;WE=34640226;WS=34640208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr15	34640378	rs430083	T	C	3766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=0.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=73;PP=2296;ReadPosRankSum=-0.811;SC=TGACAGGGGATGGGGGCCCTT;SOR=0.898;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=66;TCR=74;TR=138;WE=34640386;WS=34640362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,148:0.99:150
chr15	34640959	rs371061	G	A	231.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=159;SC=AGTTTAGGCTGTTTAGGACTA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=34640967;WS=34640949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	34643103	rs347796	A	G	1838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=34;PP=1091;SC=CCGCAGAGAGACTTGTGTGGG;SOR=1.284;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=25;TCR=34;TR=59;WE=34643111;WS=34643093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr15	34656366	rs67950209	GAGA	G	4594.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-8.366;NF=10;NR=44;PP=2567;ReadPosRankSum=0.228;SC=CATGGAAAGTGAGAAGATGGT;SOR=1.036;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=57;TCF=10;TCR=47;TR=54;WE=34656376;WS=34656356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,106:0.98:108
chr15	34782792	rs2655313	C	A	73.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=0;PP=52;SC=AGTCTTGAGCCGCTTAGGGGC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=34782800;WS=34782782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	35045312	rs651724	T	A	2343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=41;NR=37;PP=1344;SC=CTAGGAAGACTGTAGAGTAGC;SOR=0.763;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=41;TCR=37;TR=78;WE=35045320;WS=35045302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr15	35149008	rs8035240	C	T	3021.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=44;PP=1547;SC=TGGTCTCTTCCGGGGCAGATG;SOR=0.846;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=48;TCR=44;TR=92;WE=35149016;WS=35148998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr15	35168056	rs2290321	C	T	541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=3;PP=291;SC=ATCAGCACACCCAAACTGTAC;SOR=1.721;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=35168064;WS=35168046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	35185807	.	T	TGCAC	257.94	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=28.66;ReadPosRankSum=1.593;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,8:0.89:9
chr15	35185810	.	A	ACG	74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=21;MMLQ=25;MQ=58.2;NF=3;NR=1;PP=74;QD=19.25;SC=GCATGCGTGCACACACACACA;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=4;WE=35185818;WS=35185797;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr15	35196492	rs12898639	C	T	165.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=130;SC=ATAAAAGTTACTTAAATTATG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=35196500;WS=35196482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	35207397	rs2044920	C	G	659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=9;NR=17;PP=438;SC=AGGAAAAAAACATCCATATTT;SOR=1.609;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=29;TCF=9;TCR=20;TR=26;WE=35207418;WS=35207387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	35230924	rs12594085	A	G	1916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=23;PP=1221;SC=TGCACTGAGTAAAAAAGAAGA;SOR=1.131;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=35;TCR=23;TR=58;WE=35230942;WS=35230914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr15	35230934	rs10701045	A	ATAGT	3182.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=23;PP=2394;SC=AAAAAAGAAGATACCAGAAAG;SOR=1.117;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=18;TCR=26;TR=39;WE=35230942;WS=35230914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr15	35252767	rs11636350	G	A	596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=3;PP=436;SC=AACCCTATGGGATTTGATACC;SOR=3.056;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=35252775;WS=35252757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	35256624	rs9920529	C	G	1332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=29;PP=815;SC=TATCTGAAGGCACTACACAGG;SOR=2.110;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=11;TCR=29;TR=40;WE=35256632;WS=35256614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr15	35261649	rs7164169	A	G	4548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=87;NR=49;PP=2389;SC=CCTCCTCCGGACTCCTAAATC;SOR=1.248;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=137;TCF=87;TCR=50;TR=136;WE=35261657;WS=35261639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr15	35261952	rs7164070	C	T	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=2;PP=25;SC=ATATCCTCAGCCTTCAGAGTC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=35261960;WS=35261942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr15	35834547	rs1020307	T	C	1347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.92;SOR=1.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr15	36218922	rs6495804	T	A	728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.49;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	36218926	rs62005169	T	A	728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.87;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	36218930	rs1532477	T	A	677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.87;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	36871957	rs3743337	C	T	941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=5;PP=643;SC=GGCGAGGACCCGGGCCTGTGC;SOR=3.056;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=28;WE=36871965;WS=36871947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr15	36937405	rs11073191	G	T	1157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.31;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr15	36937606	rs11073192	A	C	113.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=87;SC=TGTTTTAAGTATTTTATTCAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=36937614;WS=36937596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	36946153	rs10220771	G	A	1762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.31;SOR=1.410;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr15	36946441	rs10220785	C	T	173.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.56;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=110;SC=ACAATTATAACTACCTTTGGA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=36946449;WS=36946431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	36949952	rs6495863	T	A	426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=1;PP=313;SC=AATTGACTTATTCTTCAGTGT;SOR=2.985;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=36949960;WS=36949942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	36983572	.	ATT	A	34.71	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=17.35;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr15	36984409	rs3743338	T	C	1773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=29;PP=1020;SC=AGGTGCGCAATTGACGAGCTT;SOR=0.886;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=30;TCR=29;TR=58;WE=36984417;WS=36984399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr15	36989469	rs2381887	G	A	3192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=48;PP=1817;SC=TGGTATTAGCGTTTTCCTGCT;SOR=0.850;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=108;TCF=60;TCR=48;TR=107;WE=36989477;WS=36989459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr15	37026565	rs1037439	A	G	996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=14;PP=566;SC=TTCCAGAGGTACTTTATTCCT;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=18;TCR=14;TR=32;WE=37026573;WS=37026555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr15	37026600	.	ATT	A	1051.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.06;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	37110637	rs1194621	T	C	649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=10;NR=10;PP=255;SC=ACCACTGCCGTCGGCTCCGGC;SOR=1.022;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=10;TCR=10;TR=20;WE=37110645;WS=37110627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	37173119	rs67033548	A	AT	2329.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;BaseQRankSum=0.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=15;PP=961;ReadPosRankSum=1.050;SC=GTTTGCATTGATTTTTTGTGG;SOR=1.136;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=33;TCF=14;TCR=19;TR=29;WE=37173127;WS=37173109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,79:0.98:81
chr15	37173147	rs12909623	T	G	2524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=36;NR=25;PP=1101;SC=AAATTTGCGGTGTTTCAGGAA;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=36;TCR=25;TR=61;WE=37173155;WS=37173137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr15	37173267	rs12903788	G	A	3058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=43;PP=1613;SC=ACCCAACTCAGGACTCTAAAG;SOR=0.763;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=98;TCF=55;TCR=43;TR=98;WE=37173275;WS=37173257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr15	37173945	rs4451907	A	G	71.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=3;PP=50;SC=TGTTGCCACAATAAAGGGATG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=37173953;WS=37173935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	37187197	rs61146116	A	AT	84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=2;PP=73;SC=TCAAAGAGGAATTTTTTCCCC;SOR=1.609;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=37187205;WS=37187187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	37375938	rs77652060	C	T	1726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=15;PP=901;SC=TTAGTCATGCCTACTTTGCAC;SOR=1.306;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=35;TCR=15;TR=50;WE=37375946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr15	37390440	rs75232629	A	C	612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=7;NR=15;PP=289;SC=GCAGGAGGTGAGGGAGAACAG;SOR=1.609;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=22;WE=37390448;WS=37390430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr15	37391752	rs111602525	CT	C	62.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=4.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.14;ReadPosRankSum=-0.263;SOR=1.183;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,11:0.20:55
chr15	38230565	rs59125264	TG	T	934.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=623;SC=CTTGAACCACTGGAGTGCTGA;SOR=1.697;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=15;WE=38230573;WS=38230555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	38233869	rs2937991	T	C	2441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=52;NR=30;PP=1347;SC=TTTGATTTCCTAGGTAATGAA;SOR=1.085;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=52;TCR=30;TR=82;WE=38233877;WS=38233859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr15	38258772	rs2959336	A	C	1552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=14;PP=1030;SC=AGGCTACAGCAAGAAACCTCA;SOR=1.739;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=36;TCR=14;TR=50;WE=38258780;WS=38258762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr15	38590722	rs8040553	T	G	933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=6;PP=557;SC=TAAAAAAAATTAACTTCTGGT;SOR=1.751;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=29;WE=38590730;WS=38590712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr15	38590771	rs8036280	A	G	1291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.36;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr15	38590854	rs8034630	G	A	1522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=27;PP=843;SC=AAGGATTTTTGAAGTGATGAA;SOR=1.140;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=22;TCR=27;TR=49;WE=38590862;WS=38590844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr15	38614525	rs7182445	G	A	3050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=40;PP=1730;SC=TTGATGACAAGAAGTTTGGTC;SOR=0.841;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=55;TCR=40;TR=95;WE=38614533;WS=38614515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr15	38617113	rs1879938	C	T	265.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.97;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	38617113	.	CTC	TTG	252	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=1;NR=5;PP=252;QD=50.911312477;SC=TTCTAAGACACTCTATTTGTC;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=6;WE=38617123;WS=38617103;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,6:0.86:7
chr15	38617115	rs1879937	C	G	265.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.30;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	38631840	rs7163339	T	C	1218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=10;PP=833;SC=TATATACTTATTGACTTGCTA;SOR=2.147;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=39;WE=38631848;WS=38631830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr15	38631930	rs7180446	C	A	3367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=45;PP=1834;SC=GAGGGTTGTTCCCAATAGGCA;SOR=0.826;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=62;TCR=45;TR=107;WE=38631938;WS=38631920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr15	38632148	rs7181472	A	G	729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=19;PP=551;SC=GTAGAAATTGAATGATGTCAT;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=23;WE=38632156;WS=38632138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	38641773	rs61670754	G	GTT	1356.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.77;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr15	38641774	.	A	T	362	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;FR=1.0000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=2;NR=11;PP=362;QD=30.5208625036;SC=TAATTAATAGATAGGTAAAGT;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=38641785;WS=38641764;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	38641774	rs34352434	A	AAAT	1356.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.77;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr15	38641776	.	A	AAATTAGT	874	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;FR=1.0000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=2;NR=11;PP=874;QD=74.9230769231;SC=ATTAATAGATAGGTAAAGTTT;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=38641785;WS=38641764;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	38641777	.	G	A	358	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;FR=1.0000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=2;NR=11;PP=358;QD=30.2131701959;SC=TTAATAGATAGGTAAAGTTTT;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=38641785;WS=38641764;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	38641777	rs59928364	G	GTA	1177.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.30;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	38643574	rs3751526	T	C	4337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=62;PP=2690;SC=AAGAAAATGTTAGGGGAAAAT;SOR=0.786;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=78;TCR=62;TR=140;WE=38643582;WS=38643564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr15	38794566	rs12324402	A	G	3850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=58;PP=2259;SC=CAATCTTTTCAAATTCTTCCT;SOR=0.749;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=127;TCF=69;TCR=58;TR=127;WE=38794574;WS=38794556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr15	38804020	rs11413668	T	TA	597.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=11;PP=453;SC=GAGTCTCCCTTACGCTGGTTA;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=38804028;WS=38804010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	38990803	rs12595568	T	G	147.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=117;SC=GTGTGGTGTGTAAGATGTTGG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=38990811;WS=38990793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	40005793	rs372148357	GA	G	77.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=3.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.94;ReadPosRankSum=-1.160;SOR=0.197;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,10:0.25:40
chr15	40019053	rs370304453	AAC	A	31.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.60;MQRankSum=1.150;QD=2.64;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.275;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr15	40226495	rs566792	T	C	4420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=74;PP=2538;SC=TGGAGGCCATTTACGGCGCGG;SOR=1.031;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=134;TCF=60;TCR=74;TR=134;WE=40226503;WS=40226485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr15	40248122	rs8030025	G	A	109.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=83;SC=CAATATATTAGGTGTATTTTT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=40248130;WS=40248112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	40254155	rs510949	A	G	1270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=26;PP=823;SC=AGTTAATCACAAAGGAATGGG;SOR=1.329;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=17;TCR=26;TR=43;WE=40254163;WS=40254145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr15	40265799	rs2307105	A	G	3419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=71;NR=42;PP=1858;SC=TCAGATTCTGAAGGACAAGAT;SOR=0.962;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=113;TCF=71;TCR=42;TR=113;WE=40265807;WS=40265789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr15	40269052	rs34298786	G	A	2217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.85;QD=25.20;SOR=0.997;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr15	40269102	rs149792847	A	AT	947.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.78;QD=25.61;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr15	40270214	rs7174071	A	G	884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=13;PP=539;SC=GTATTTAAAAATGTCCATGTT;SOR=0.818;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=15;TCR=13;TR=28;WE=40270222;WS=40270204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr15	40282625	rs4144472	T	C	1088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=27;PP=784;SC=GACTCAGATGTCTTGATAATC;SOR=2.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=34;WE=40282633;WS=40282615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr15	40284523	rs7178419	C	T	1325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=1.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.955;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=28;PP=757;ReadPosRankSum=-1.234;SC=AGGTTTTATTCTACGGCAGAT;SOR=2.560;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=39;TCF=10;TCR=29;TR=37;WE=40284531;WS=40284513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,47:0.96:49
chr15	40284802	rs11070241	C	T	313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=159;SC=TGTGGCCATACGTGACTTATG;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=40284810;WS=40284798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	40285120	rs11633992	A	G	1444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=31;PP=851;SC=AGCATTTGGGATTTAGTCCCG;SOR=1.893;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=15;TCR=31;TR=46;WE=40285128;WS=40285110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr15	40291140	rs2412457	C	T	111.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.38;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	40293036	rs72248603	AAAT	A	445.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=437;SC=AAAGCAGAAAAAATAATGACC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=40293046;WS=40293026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	40300092	rs2279581	T	C	145.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=146;SC=CAGGTCAAATTTGTCTTTCAG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=40300100;WS=40300084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	40300443	rs2279579	T	G	809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=20;PP=605;SC=CTATATTTCTTCACCAAGTGT;SOR=4.174;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=40300451;WS=40300433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	40313083	rs12916520	G	T	653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=4;PP=331;SC=ACTGTAACCGGTCTGTTTCTG;SOR=2.124;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=19;WE=40313091;WS=40313073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	40313141	rs3207297	C	T	1598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=14;PP=810;SC=TAAGTGTTGGCCAGATGTCTA;SOR=1.316;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=47;TCF=33;TCR=14;TR=46;WE=40313149;WS=40313131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr15	40314967	.	C	G	24	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;FR=0.9998;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=24;QD=29.3856062736;SC=GACGGAGTCTCGCTGTCTCCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=40314975;WS=40314957;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr15	40322552	rs2250402	G	T	2256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=27;PP=1406;SC=AAACTCTCTTGGTCTCAGGTT;SOR=1.220;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=49;TCR=27;TR=76;WE=40322560;WS=40322542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr15	40324837	rs2291621	C	T	2329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=47;NR=27;PP=1130;SC=AGCCCTTTTACAGCACAATAG;SOR=0.965;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=47;TCR=27;TR=74;WE=40324845;WS=40324827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr15	40328575	rs7535	G	C	2394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;SC=GCTGTTGTTGGTGCTGTTGCT;SOR=0.824;Source=Platypus;TCF=34;WE=40328583;WS=40328565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr15	40328596	rs371085676	GTGC	G	130.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=3.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.97;ReadPosRankSum=-1.253;SOR=1.590;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,7:0.16:44
chr15	40328665	rs8208	G	A	2022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=32;PP=1288;SC=CTCTTCTTCAGCCCATCCATG;SOR=0.776;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=34;TCR=32;TR=66;WE=40328673;WS=40328655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr15	40328973	rs2291620	A	G	392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=2;PP=240;SC=TAGGTAGCATATATCTACAGC;SOR=2.147;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=40328981;WS=40328963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	40329033	rs2291619	A	G	1403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=12;PP=895;SC=CGGTATTAGCATTGAAATTCA;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=38;TCR=12;TR=50;WE=40329041;WS=40329023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr15	40330564	rs7321	C	T	2549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=52;NR=29;PP=1482;SC=CCACAGTACCCTTCTTTGGAA;SOR=1.240;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=52;TCR=29;TR=81;WE=40330572;WS=40330554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr15	40330629	rs8041057	C	T	3902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=73;NR=56;PP=2064;SC=TGAACACGGCCGCGTACGTGG;SOR=0.807;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=129;TCF=73;TCR=56;TR=129;WE=40330637;WS=40330619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr15	40330693	rs937215	C	T	2137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=44;PP=1399;SC=GATGACCTAACCCAGCCCCGC;SOR=1.432;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=28;TCR=46;TR=71;WE=40330701;WS=40330683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr15	40397936	rs539846	G	T	470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=13;NR=5;PP=318;SC=TTTGGGGAGGGAAAGTCCCCT;SOR=1.493;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=18;WE=40397944;WS=40397926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	40453307	rs2277559	A	G	1621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=35;NR=18;PP=958;SC=GGAGTCGTGTACGTGCCTTGG;SOR=1.382;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=35;TCR=18;TR=53;WE=40453315;WS=40453297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr15	40453497	rs2277560	G	A	753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=20;PP=527;SC=GGCCTGAGAGGACACGGCCTG;SOR=2.066;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=27;WE=40453505;WS=40453487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr15	40457129	rs3214012	A	C	91.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.76;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	40477831	rs1801376	G	A	1849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=24;PP=939;SC=GAGACTGCACGACAGCCAGTT;SOR=0.811;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=33;TCR=24;TR=57;WE=40477839;WS=40477821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr15	40488851	rs1047130	G	A	4032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=52;PP=2232;SC=ATCAGCAAGCGTCTGAGGAGA;SOR=0.945;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=122;TCF=70;TCR=52;TR=122;WE=40488859;WS=40488841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr15	40491952	rs2172742	A	G	1435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=32;PP=927;SC=TTTCATACACAAAACTAGAAT;SOR=1.848;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=14;TCR=32;TR=46;WE=40491960;WS=40491942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr15	40494952	rs2412482	A	T	1269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.33;SOR=1.536;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	40494960	rs12898804	A	C	1244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.92;SOR=1.942;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr15	40500986	rs11630664	C	T	1627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=32;PP=995;SC=GATATACATACCACTATATCC;SOR=1.421;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=20;TCR=32;TR=52;WE=40500994;WS=40500976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr15	40544493	rs55799438	A	G	770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=2;PP=326;SC=CGCTCAGCTGATTCTCCAGGT;SOR=1.528;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=40544501;WS=40544483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr15	40544520	rs55974545	G	C	802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=5;PP=442;SC=TCCGCGAGGCGGCCACTGGGC;SOR=1.536;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=23;WE=40544528;WS=40544510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	40544617	rs55863440	G	A	3759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=76;NR=42;PP=2161;SC=CAAGCAGGTGGAGAGAAAGAG;SOR=1.122;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=76;TCR=42;TR=118;WE=40544625;WS=40544607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr15	40545438	rs11636097	A	G	1208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=24;PP=730;SC=CGCCTAAGAGAGAGGCCCAGT;SOR=1.364;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=15;TCR=24;TR=39;WE=40545446;WS=40545428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr15	40556685	rs7162809	A	G	4909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=78;PP=2722;SC=ATTTTATAAAAACACACCCCC;SOR=0.759;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=162;TCF=84;TCR=78;TR=162;WE=40556693;WS=40556675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr15	40556713	rs12902461	T	C	4293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=69;NR=68;PP=2382;SC=GCCTGCTCCATAGGGGACTTG;SOR=0.884;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=137;TCF=69;TCR=68;TR=137;WE=40556721;WS=40556703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr15	40558744	rs748556	G	A	1597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=27;PP=904;SC=AGTGGGTGTAGGGACACAGGC;SOR=1.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=14;TCR=27;TR=41;WE=40558752;WS=40558734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr15	40565055	rs2253603	G	A	4233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=57;PP=2306;SC=TCAGGCCCCCGCCTGCCCCCA;SOR=0.994;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=83;TCR=57;TR=140;WE=40565063;WS=40565045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr15	40565705	rs936214	G	A	4380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.237;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=49;PP=2153;ReadPosRankSum=1.334;SC=GCACAGCCACGCTCCCACTTC;SOR=0.623;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=80;TCR=50;TR=129;WE=40565713;WS=40565695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,163:0.99:165
chr15	40573716	rs4924446	A	G	1733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=36;NR=22;PP=910;SC=ACCGAGACAGACAGAGCGTTG;SOR=0.980;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=36;TCR=22;TR=58;WE=40573724;WS=40573706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr15	40582128	.	AAGAGAGAGAGAGAGAG	A,AAG	922.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.76;QD=38.45;SOR=2.948;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:1,14,9:0.58,0.38:24
chr15	40582165	rs62021886	A	T	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=3.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQRankSum=-1.145;QD=6.49;ReadPosRankSum=2.304;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr15	40582167	rs62021887	A	T	640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=2.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQRankSum=-0.445;QD=23.73;ReadPosRankSum=2.278;SOR=1.734;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,21:0.78:27
chr15	40582169	rs8036867	A	T	2432.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.82;MQRankSum=0.000;QD=40.55;ReadPosRankSum=1.736;SOR=1.688;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,59:0.98:60
chr15	40582713	rs34370826	TAG	T	180.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=161;SC=GATCCATTTGTAGAGAGGCCC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=5;WE=40582722;WS=40582703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	40583093	rs2412506	A	G	745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.72;SOR=0.906;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr15	40583458	rs936209	A	G	2180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=32;PP=1235;SC=CACCGCCACGAGCCTTACCTC;SOR=0.796;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=34;TCR=32;TR=66;WE=40583466;WS=40583448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr15	40583876	rs9972418	T	G	3261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=55;PP=1924;SC=GGCTGGGCTGTCAGGTGCTCT;SOR=0.910;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=106;TCF=51;TCR=55;TR=106;WE=40583884;WS=40583866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr15	40593939	rs2305647	C	T	589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=15;PP=379;SC=GTAGGGGATACAGACAAACCT;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=19;WE=40593947;WS=40593929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	40595414	rs1869902	G	C	1335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=12;PP=880;SC=CTTCCCACCCGCACAGGGACC;SOR=1.562;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=31;TCR=12;TR=43;WE=40595422;WS=40595404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr15	40595627	rs1869901	G	A	1181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=17;NR=22;PP=667;SC=GGTCAAGAATGAGCAATAGGG;SOR=1.230;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=17;TCR=22;TR=39;WE=40595635;WS=40595617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr15	40627845	rs55641696	G	A	2307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=22;PP=1335;SC=GCTCCATCCCGCTCTGCTTCT;SOR=1.552;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=44;TCR=22;TR=66;WE=40627853;WS=40627835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr15	40630913	rs72733403	C	T	4136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=62;PP=2625;SC=GAAGAGGCTGCCTGCCGATGC;SOR=0.804;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=138;TCF=75;TCR=63;TR=137;WE=40630921;WS=40630903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr15	40632302	rs12440659	G	C	4046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.45;SOR=0.845;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr15	40645347	rs11853293	T	C	354.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.691;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.78;ReadPosRankSum=0.861;SOR=1.034;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,19:0.79:24
chr15	40646520	rs71132169	CT	C	2664.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=38;PP=995;SC=AAAGCTGCTTCTTTTTTTTCC;SOR=0.845;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=51;TCF=8;TCR=43;TR=43;WE=40646528;WS=40646510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr15	40648610	rs62017981	C	T	1566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=31;PP=875;SC=AAACAGCCTCCTAGAGGCCAC;SOR=1.919;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=14;TCR=31;TR=45;WE=40648618;WS=40648600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr15	40650449	.	G	GCCGCCA	151.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=2;PP=152;SC=CGCCGCTGCCGCCGCCACCGC;SOR=1.022;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=4;WE=40650457;WS=40650439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	40650784	rs111246437	GC	G	408.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=9;PP=263;SC=CAAGCTCCAGGCCCCCCTCGC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=9;WE=40650792;WS=40650774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	40655845	rs1898883	C	G	2242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=29;PP=1217;SC=CAAGGCTGTGCCCCCTGAGGC;SOR=0.815;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=43;TCR=29;TR=72;WE=40655853;WS=40655835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr15	40660566	rs72733420	G	A	3062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=49;PP=1981;SC=GCTTCGACGCGGAGTATCGCC;SOR=0.820;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=60;TCR=49;TR=109;WE=40660574;WS=40660556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr15	40676574	rs143882095	CA	C	40.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=2.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.40;ReadPosRankSum=1.257;SOR=0.250;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr15	40679206	rs149391290	T	C	349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=261;SC=GCCGAAGCAGTAATGCATAGT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=40679214;WS=40679197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	40681676	rs6492944	T	A	4188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=58;PP=2454;SC=AACCCTTTTATCTTTTCATGT;SOR=0.917;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=139;TCF=81;TCR=58;TR=139;WE=40681684;WS=40681666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr15	40683780	rs2289332	G	A	2390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=47;NR=30;PP=1244;SC=GTGAAAGGGCGCAAGGGCTGA;SOR=0.883;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=47;TCR=30;TR=77;WE=40683788;WS=40683770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr15	40684232	rs72733427	G	A	2677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=45;NR=38;PP=1248;SC=CAGGTGAGAGGCAGACATCAC;SOR=0.753;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=45;TCR=38;TR=83;WE=40684240;WS=40684222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr15	40684289	rs72733428	T	C	1498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=28;PP=950;SC=TGGGGTCTTTTCTGTTTTTCT;SOR=1.702;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=10;TCR=28;TR=38;WE=40684297;WS=40684279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr15	40685206	rs11321442	AT	A	957.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.543;HP=11;HapScore=3;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.504;NF=17;NR=10;PP=391;ReadPosRankSum=1.130;SC=TTTTCCACTAATTTTTTTTTT;SOR=1.996;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=36;TCF=21;TCR=15;TR=27;WE=40685225;WS=40685196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,42:0.98:43
chr15	40685326	rs28379196	A	G	4690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.060;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.205;NF=81;NR=73;PP=2610;ReadPosRankSum=1.166;SC=AATCCATTCTATGGAAACTTG;SOR=0.278;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=155;TCF=81;TCR=74;TR=154;WE=40685334;WS=40685316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,175:0.99:176
chr15	40685406	rs8036457	A	T	4741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=75;PP=2456;SC=TGCTTGGATGAATCATGGGAT;SOR=0.798;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=154;TCF=79;TCR=75;TR=154;WE=40685414;WS=40685396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr15	40685508	rs8037941	T	C	1025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=13;NR=24;PP=618;SC=CTAAAACCAGTGCATAGAAAT;SOR=1.552;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=13;TCR=24;TR=37;WE=40685516;WS=40685498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr15	40685850	rs11541643	A	G	2127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=36;PP=1122;SC=TCTCAGAGGAAGCTACTTAGG;SOR=1.108;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=66;TCF=30;TCR=36;TR=66;WE=40685858;WS=40685840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr15	40820805	rs7164166	A	G	89.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=0;PP=38;SC=AGGGGAAGACACCAGGTCTGG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=40820813;WS=40820801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	40824710	rs8029208	T	C	77.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=3;PP=56;SC=TTCACAGCTGTTCACCATGAG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=40824718;WS=40824700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	40849680	rs8029384	C	G	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=2;PP=23;SC=ATGAGGACATCCACACTCCCT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=40849688;WS=40849670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr15	40855210	rs10152546	T	A	3099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=59;PP=1807;SC=CTCAAACATTTTCATTTGGAA;SOR=1.066;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=47;TCR=59;TR=106;WE=40855218;WS=40855200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr15	40856989	rs3803354	C	T	5160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=87;PP=2714;SC=TGGCCCCTTACCCCAGGGCAG;SOR=0.969;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=166;TCF=79;TCR=87;TR=166;WE=40856997;WS=40856979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr15	40862064	rs1058734	C	T	3444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=48;NR=63;PP=1934;SC=AGCCCCTGGCCTACTATGAGG;SOR=1.252;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=48;TCR=63;TR=111;WE=40862072;WS=40862054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr15	40898643	rs7177192	G	C	710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=13;PP=484;SC=GGGAATGAAAGAGTTCAGGTA;SOR=0.846;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=12;TCR=13;TR=25;WE=40898651;WS=40898633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	40903684	rs12911738	A	G	271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.71;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	40907698	rs11427985	T	TG	112	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=2;PP=51;SC=CCAGGCACGGTGCTCACGCCT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=40907706;WS=40907688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	40913840	rs2412541	G	T	1700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=29;PP=1136;SC=CAGTAATTATGCTAAAATGTA;SOR=0.724;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=31;TCR=29;TR=60;WE=40913848;WS=40913830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr15	40915190	rs8040502	A	G	3949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.195;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=54;PP=2378;ReadPosRankSum=1.224;SC=ATATACATGTAGGCAGGATGA;SOR=0.381;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=126;TCF=71;TCR=55;TR=125;WE=40915198;WS=40915180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,143:0.99:144
chr15	40916237	rs17747633	A	G	4316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=58;PP=2697;SC=GGTCATAGGGAAAGTTGTAGA;SOR=0.760;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=133;TCF=75;TCR=58;TR=133;WE=40916245;WS=40916227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr15	40921669	.	C	CTT	49	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;FR=1.0000;HP=20;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=15;MQ=52.24;NF=1;NR=1;PP=49;QD=26.0;SC=AGAGAGTTTTCTTTTTTTTTT;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=2;WE=40921677;WS=40921659;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:7,2:0.22:9
chr15	40937727	rs6492959	C	T	993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=4;PP=626;SC=TAGACAATTACATGGAATTAA;SOR=2.649;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=32;WE=40937735;WS=40937717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr15	40939448	rs8041095	G	A	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr15	41032379	.	GCTT	G	5215.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=50;PP=2953;SC=AGCAGCCTCTGCTTCTTCTTT;SOR=0.744;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=67;TCF=12;TCR=55;TR=62;WE=41032389;WS=41032369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr15	41146880	rs8028552	T	C	2113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=36;NR=37;PP=1085;SC=ATTTCCCCAGTGACAAAGGTG;SOR=0.846;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=73;TCF=36;TCR=37;TR=73;WE=41146888;WS=41146870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr15	41193274	rs9806730	T	C	1084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=24;PP=618;SC=GCTTTAGATGTGGAAGGGCTT;SOR=1.666;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=13;TCR=24;TR=37;WE=41193282;WS=41193264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr15	41193316	rs9806683	C	T	637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=15;PP=448;SC=GCTGGCTTCCCTTGCAGAGAG;SOR=1.708;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=7;TCR=15;TR=22;WE=41193324;WS=41193306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr15	41224124	rs3212278	G	A	195.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.56;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=99;SC=CAGACCTCCTGTCTCTTCCCA;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=41224132;WS=41224114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	41246237	rs3033592	A	ATC	187.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.57;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	41315591	rs72527311	A	AAT	2036.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=29;PP=1400;SC=TTTAAAAAGTAAGTCTAGACT;SOR=1.981;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=30;WE=41315599;WS=41315581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr15	41339481	rs11070320	C	T	230.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=159;SC=TTATTCTTAACAAAAGAAAAT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=41339489;WS=41339471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	41346092	rs2899010	T	C	896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=7;PP=522;SC=TTGGTGCCTATTGAGGCTTAA;SOR=1.751;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=29;WE=41346100;WS=41346082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr15	41350768	.	C	CGT	435.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.392;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.02;MQRankSum=0.817;QD=21.79;ReadPosRankSum=0.331;SOR=1.244;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,16:0.80:20
chr15	41371788	.	AC	A	42	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=15;HapScore=2;MGOF=17;MMLQ=16;MQ=57.33;NF=4;NR=0;PP=42;QD=11.25;SC=AAAAAAAAAAACAAAAAATTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=4;WE=41371796;WS=41371778;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:19,4:0.17:23
chr15	41476101	rs521088	T	C	846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=6;PP=570;SC=AAGCCATCTGTATGGCCTTAA;SOR=2.019;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=27;WE=41476109;WS=41476091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	41476209	rs522063	T	C	2786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=38;PP=1721;SC=GAAACCACAGTCTTTCTGATA;SOR=0.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=93;TCF=54;TCR=39;TR=92;WE=41476217;WS=41476199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr15	41482289	.	G	A	2495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=46;PP=1479;SC=CAGTAAAGAGGGTGAAACAGG;SOR=1.191;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=32;TCR=46;TR=78;WE=41482297;WS=41482279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr15	41483631	rs11371504	T	TA	1841.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=5;PP=1263;SC=GGACATCCTTTACACCCACCT;SOR=2.726;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=28;WE=41483644;WS=41483621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr15	41483636	rs2412609	C	T	1915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=5;PP=886;SC=TCCTTTACACCCACCTGAATT;SOR=2.885;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=31;TCR=5;TR=36;WE=41483644;WS=41483621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr15	41570961	rs200745775	C	T	2075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=33;PP=1244;SC=TCTTGGTCTTCCAGGTGCTAC;SOR=0.927;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=65;TCF=32;TCR=33;TR=65;WE=41570969;WS=41570951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr15	41750096	rs11313160	TC	T	141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=7;PP=106;SC=CTCGTCGTTGTCCCCCCCCCG;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=7;WE=41750104;WS=41750086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	41766966	rs167581	G	A	507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=12;PP=353;SC=GGGGGCTGCTGTTCTCTCTGT;SOR=1.863;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=16;WE=41766974;WS=41766956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	41805237	rs2305030	C	T	1658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=28;PP=1068;SC=TTTCGGGTCCCGGGGGCTGGG;SOR=1.047;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=22;TCR=28;TR=50;WE=41805245;WS=41805227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr15	41815516	rs8027526	G	C	2923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=40;PP=1548;SC=GACAGGCGCTGCATGTCCTGG;SOR=0.946;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=43;TCR=40;TR=83;WE=41815524;WS=41815506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr15	41815649	rs2297377	A	G	845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=17;PP=546;SC=ACAGCCCAAAAGAGCACATTT;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=27;TCF=10;TCR=17;TR=27;WE=41815657;WS=41815639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr15	41820200	rs2289741	C	T	2865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=52;PP=1807;SC=GCCTGCTAGCCGGTCCCCAAA;SOR=0.946;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=44;TCR=52;TR=96;WE=41820208;WS=41820190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr15	41822025	rs2305031	C	A	1095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=23;NR=13;PP=599;SC=CCTGCCCTATCTCACCCACCC;SOR=1.259;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=23;TCR=13;TR=36;WE=41822033;WS=41822015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr15	41827243	rs7181115	A	G	327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=9;PP=229;SC=ATAGACCCAAACTTTCCTCAG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=41827251;WS=41827233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	41828459	rs3215915	CT	C	1925.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=28;PP=1282;SC=AATGGAGAAACTTCCCCAGGC;SOR=1.220;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=4;TCR=28;TR=32;WE=41828467;WS=41828449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr15	41851709	rs113721358	A	G	37.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.87;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr15	41856543	rs11070339	A	G	586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=16;PP=423;SC=AGTTAGAATCATTCTGTGTTC;SOR=3.056;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=41856551;WS=41856533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	41865488	rs2246444	C	T	2549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=28;PP=1444;SC=TGACTCTCTCCCTCAATGCCC;SOR=1.119;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=49;TCR=28;TR=77;WE=41865496;WS=41865478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr15	41976376	rs34300394	CTG	C	98.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=0;PP=111;SC=TTGTTAATCTCTGTGCCTAAC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=41976385;WS=41976373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	42028354	rs2577960	C	A	261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=1;PP=156;SC=TCAACTTTTTCTTTTTTATTA;SOR=2.303;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=42028362;WS=42028344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	42108921	.	T	G	448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=6;PP=333;SC=TCCCGGCTCTTGGACGTGGGG;SOR=0.976;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=7;TCR=6;TR=13;WE=42108929;WS=42108911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	42109223	rs1197689	T	C	1483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=24;NR=28;PP=893;SC=TCACTGCTGTTAAGTTTGCAG;SOR=0.960;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=24;TCR=28;TR=52;WE=42109231;WS=42109213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr15	42111745	.	C	CAGG	1169.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.77;QD=34.40;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,33:0.97:34
chr15	42114414	rs2303517	C	T	2193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.43;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr15	42115426	rs1197688	A	G	783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=16;PP=514;SC=ACAGGGTGAGAAGCCTGATGG;SOR=0.997;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=10;TCR=16;TR=26;WE=42115434;WS=42115416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr15	42120437	rs13380315	C	G	1200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=18;PP=492;SC=GGGAGGGGCCCTGGGATGCCG;SOR=1.329;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=14;TCR=18;TR=32;WE=42120445;WS=42120427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr15	42127443	rs2241523	G	C	271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=8;PP=199;SC=TGGGGTGGTCGTGGCCCTGGA;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=42127451;WS=42127433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	42127918	rs11070350	A	G	866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=20;PP=622;SC=CCAGGAGTGGAGGGATGGCCC;SOR=2.019;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=28;WE=42127926;WS=42127908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	42128553	rs80228953	C	T	1671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=15;PP=982;SC=CTGTGGCATCCCCAGTGCACC;SOR=1.355;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=36;TCR=15;TR=51;WE=42128561;WS=42128543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr15	42128855	rs7166139	T	C	1636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=36;PP=1183;SC=CTGAAAAGTCTCTAAGTCTGA;SOR=2.024;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=15;TCR=36;TR=51;WE=42128863;WS=42128845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr15	42129168	rs7165230	A	T	2457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.37;SOR=1.077;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr15	42129176	rs890504	T	C	2740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.91;SOR=1.146;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr15	42129373	rs11547012	C	G	1358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=25;PP=789;SC=TGGTGAACACCACCAAGCACG;SOR=1.345;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=18;TCR=25;TR=43;WE=42129381;WS=42129363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr15	42131965	rs57498313	A	G	1046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=12;PP=611;SC=AGGTGGAAGCAGGTCTGTGTG;SOR=1.292;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=23;TCR=12;TR=35;WE=42131973;WS=42131955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr15	42132200	rs2077543	C	G	523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=7;PP=292;SC=ATGGAGATATCATGTCTCCTC;SOR=0.793;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=10;TCR=7;TR=17;WE=42132208;WS=42132190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	42140998	rs4078788	C	G	89.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=4;PP=82;SC=CACAGTGACGCGTGAGTGGGT;SOR=1.609;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=42141006;WS=42140988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	42143533	rs1197665	T	G	1539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=19;NR=28;PP=748;SC=GCCCTGCAAGTTCCCGCGGCA;SOR=1.493;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=19;TCR=28;TR=47;WE=42143541;WS=42143523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr15	42143597	rs890507	A	G	458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=11;PP=285;SC=AGGTCGCATGAGCCACACGCA;SOR=2.584;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=42143605;WS=42143587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	42144979	.	C	G	1010	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;FR=1.0000;HP=11;HapScore=3;MGOF=8;MMLQ=16;MQ=59.23;NF=7;NR=37;PP=1010;QD=23.7448002852;SC=GGGGGGGGGGCCCAGAGCCTG;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=45;TCF=7;TCR=38;TR=44;WE=42144987;WS=42144957;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,44:0.98:45
chr15	42147206	rs1648826	T	C	1402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=28;PP=725;SC=CAGGGTCACTTGAGATGGTAT;SOR=1.061;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=50;TCF=21;TCR=29;TR=49;WE=42147214;WS=42147196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr15	42147639	rs2305655	A	C	2805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=48;PP=1620;SC=GTGGGAAGAGAGCGACAGTCT;SOR=0.813;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=48;TCR=48;TR=96;WE=42147647;WS=42147629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr15	42149472	rs1456235	T	C	864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=7;PP=562;SC=TTCCACATCTTGGGCAAGGCA;SOR=1.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=27;WE=42149480;WS=42149462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	42149506	rs12442525	G	C	1078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=8;PP=684;SC=ACAAAGGCCTGGGCCTGGCCC;SOR=1.802;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=34;WE=42149514;WS=42149496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr15	42156321	rs1197657	T	C	80.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=3;PP=39;SC=CCCCGGAGCATGAGGAACTGC;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=42156329;WS=42156311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	42159623	rs8032462	T	C	739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=5;PP=423;SC=ACCCCAGCCTTGCAGGCTCAT;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=23;WE=42159631;WS=42159613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	42166333	rs58090119	C	A	764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=16;PP=607;SC=CCAATCATGGCAAGACCCCCA;SOR=1.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=23;WE=42166341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	42168854	.	C	CG	88.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.180;ClippingRankSum=-0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.792;HP=12;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=85;ReadPosRankSum=-0.241;SC=CCCTGGAGGGCGGGGGGGGGT;SOR=3.901;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=7;TCR=7;TR=6;WE=42168862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr15	42169129	rs55757140	G	A	326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=7;PP=233;SC=GCAGGCTCAGGGCCTCCCTCA;SOR=1.022;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=12;TCF=5;TCR=7;TR=12;WE=42169137;WS=42169119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	42170499	rs1201690	T	G	140.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.47;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	42170578	rs747779	G	A	1535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=30;NR=13;PP=638;SC=GCAGGTCTTGGTGCTCCCTCA;SOR=1.342;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=30;TCR=13;TR=43;WE=42170586;WS=42170568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr15	42170841	rs1197680	T	C	1675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=34;PP=860;SC=GGAGACAGGGTGCGCTGCACA;SOR=1.341;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=23;TCR=34;TR=57;WE=42170849;WS=42170831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr15	42171483	rs1197682	G	A	1278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=19;PP=780;SC=TGGAGGAAGTGGACCCTCCTC;SOR=0.823;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=24;TCR=19;TR=43;WE=42171491;WS=42171473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr15	42171537	rs1197683	A	G	1311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=18;PP=847;SC=AGGGCGTGGCAGGTGTCCTCT;SOR=1.112;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=28;TCR=18;TR=46;WE=42171545;WS=42171527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr15	42171877	rs1197685	A	G	222.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=4;NR=3;PP=146;SC=AGTCAGGCCCAGGCTGGGCAC;SOR=0.892;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=7;WE=42171885;WS=42171867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	42172166	rs1197686	T	C	1618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=25;PP=996;ReadPosRankSum=-0.884;SC=ACAGGGATGCTCATGCTGCCT;SOR=0.758;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=58;TCF=32;TCR=26;TR=56;WE=42172174;WS=42172156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,62:0.97:64
chr15	42175104	rs1197691	G	C	184.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=119;SC=GAGAAAACTGGCAGGCCAACA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=42175112;WS=42175103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	42175507	rs1197692	T	C	2376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=38;PP=1423;SC=GTCCCCCACCTTGCTGTGTTT;SOR=0.839;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=38;TCR=38;TR=76;WE=42175515;WS=42175497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr15	42178122	rs2280016	T	C	3322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=52;PP=1708;SC=CTGCTCTGCATCCTTAAGGAA;SOR=0.824;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=52;TCR=52;TR=104;WE=42178130;WS=42178112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr15	42178155	rs1210795	T	C	2882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=46;PP=1350;SC=GGCTGCCTTGTGCTGGAAGCG;SOR=0.884;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=90;TCF=44;TCR=46;TR=90;WE=42178163;WS=42178145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr15	42179711	rs55913027	C	T	332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=7;PP=160;SC=TTCTTAAATGCACTCATGCTC;SOR=1.609;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=10;WE=42179719;WS=42179701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	42185297	rs55835308	G	GCCCAT	3765.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=27;PP=2002;SC=GGTCAGCCCAGCCTCACCTGT;SOR=0.987;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=40;TCF=8;TCR=32;TR=34;WE=42185305;WS=42185287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr15	42185439	rs1672459	C	G	1197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=17;PP=719;SC=AGCTGGGGGCCTGGTATGGGT;SOR=0.929;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=43;TCF=26;TCR=17;TR=42;WE=42185447;WS=42185429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr15	42187492	rs1197701	T	C	2739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=50;PP=1451;SC=TGCCAGACCTTGCCTCAGCCA;SOR=0.793;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=44;TCR=50;TR=94;WE=42187500;WS=42187482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr15	42187661	rs1704380	T	C	457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=11;PP=301;SC=TCCTTTCCCATTCTCCATCAT;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=42187669;WS=42187651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	42235316	rs11549015	C	T	4861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=88;NR=71;PP=2698;SC=CTGTCGATGACGCTGATGCTC;SOR=0.704;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=159;TCF=88;TCR=71;TR=159;WE=42235324;WS=42235306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr15	42287578	rs1668586	G	A	2041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=36;NR=33;PP=1227;SC=CTGATAGACCGGTGATGTAGC;SOR=0.719;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=36;TCR=33;TR=69;WE=42287586;WS=42287568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr15	42289522	rs1704357	C	T	503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=8;PP=242;SC=GACACAGCTTCAGGGTCCATT;SOR=1.022;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=7;TCR=8;TR=15;WE=42289530;WS=42289512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	42292532	rs1668557	T	C	201.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=7;PP=124;SC=ACTACCCACCTGCAACTTGGT;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=42292540;WS=42292522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	42297092	rs2598464	G	A	2537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=44;PP=1574;SC=GAAGCTACTTGATGGCCAGGA;SOR=0.757;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=45;TCR=44;TR=89;WE=42297100;WS=42297082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr15	42298133	rs1704366	A	G	467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=2;PP=297;SC=GGAATCAGCAACAGCTATGAG;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=42298141;WS=42298123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	42302590	rs1668568	A	G	269.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=220;SC=AGATAAAGAAATATTCCTGGC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=42302598;WS=42302580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	42305769	rs75965569	G	A	736.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.63;QD=43.34;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	42305770	rs76383211	C	T	736.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.63;QD=43.34;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	42305773	rs62004282	A	G	770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.60;QD=42.82;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	42305852	rs10625152	A	AGAG	3173.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=22;PP=1598;SC=TCCGGTAAGCAGAGAAGGAGA;SOR=0.874;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=29;WE=42305860;WS=42305842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr15	42305998	rs1668565	T	C	1363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=15;NR=18;PP=499;SC=CAAGCATTACTCCAAGGCCAT;SOR=1.121;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=34;TCF=15;TCR=19;TR=33;WE=42306006;WS=42305988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr15	42306015	rs1668564	G	A	984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=13;PP=352;SC=CCATTGCCCCGGGGGAGACTT;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=21;TCF=7;TCR=14;TR=20;WE=42306023;WS=42306005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	42311454	rs2724935	T	G	362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=9;NR=1;PP=192;SC=CTCAGCCTCCTCATTGGAGCT;SOR=2.985;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=10;WE=42311462;WS=42311444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	42342929	rs17690068	G	A	346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=10;PP=246;SC=GACTCAGGACGGGCTGTGTGG;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=42342937;WS=42342919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	42360950	rs750051	C	T	2312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=31;PP=1399;SC=CTCTAGAGTCCGGTGCTTCAG;SOR=0.947;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=45;TCR=31;TR=76;WE=42360958;WS=42360940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr15	42361022	rs750052	C	T	3039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=48;PP=1671;SC=GTCACTGAGCCGCAGCAGGCG;SOR=0.865;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=49;TCR=48;TR=97;WE=42361030;WS=42361012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr15	42361178	rs2412656	G	A	275.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=9;PP=226;SC=GCAGGACGCCGGGGCTTCTAC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=42361186;WS=42361168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	42362089	rs113792982	T	C	522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=11;PP=318;SC=CCTGGGTGCTTGGGAGGGGCT;SOR=0.784;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=12;TCR=11;TR=23;WE=42362097;WS=42362079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	42362365	rs78952694	C	T	189.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=5;PP=115;SC=CCAGCCCACACCAGCTGCTTC;SOR=1.179;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=8;WE=42362373;WS=42362355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	42362821	rs2459692	C	G	668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=4;PP=355;SC=TTCGGGACCCCGGCGGTGTGG;SOR=1.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=42362829;WS=42362811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	42363012	rs17690899	G	C	2219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=39;PP=1414;SC=GATGAAGTAGGCGGCGTCCAC;SOR=0.995;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=35;TCR=39;TR=74;WE=42363020;WS=42363002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr15	42363043	rs74678783	T	G	1583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=30;PP=949;SC=CGGGGCTCCTTGGGGGTCAGC;SOR=1.412;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=19;TCR=30;TR=49;WE=42363051;WS=42363033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr15	42363078	rs77186114	T	C	1169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=24;PP=815;SC=GTCAAGCTGGTAGTCTGGTGG;SOR=1.788;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=12;TCR=24;TR=36;WE=42363086;WS=42363068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr15	42363163	rs76192742	T	C	193.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=4;PP=145;SC=GGGTCACTCCTTAAATGCCAC;SOR=0.941;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=7;WE=42363171;WS=42363153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	42363395	rs78165678	C	T	1226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=26;NR=13;PP=704;SC=GTTGGGGCTGCGCTGGTGGAG;SOR=1.154;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=40;TCF=26;TCR=14;TR=39;WE=42363403;WS=42363385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr15	42363480	rs17747505	G	A	2246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=45;NR=28;PP=1406;SC=GCCTCCAGCCGCGAGGAGGTC;SOR=1.165;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=45;TCR=28;TR=73;WE=42363488;WS=42363470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr15	42363769	rs1668589	A	G	1644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=33;PP=938;SC=ACCAAAAGAGATCAGCCTCAG;SOR=1.571;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=20;TCR=33;TR=53;WE=42363777;WS=42363759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr15	42363852	rs141784593	AT	A	420.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=3;NR=7;PP=391;SC=CCTACAATGCATCCCCCCCGC;SOR=1.445;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=10;WE=42363860;WS=42363842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	42363917	rs74547767	C	T	311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=3;PP=289;SC=GGACCCATGTCCATTCAGACA;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=11;WE=42363925;WS=42363907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	42364143	rs74724325	G	A	2736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=52;PP=1606;SC=AGGAGTGTGAGGGGAGTGGAT;SOR=1.384;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=35;TCR=52;TR=87;WE=42364151;WS=42364133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr15	42364329	rs1712401	A	C	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=2;NR=0;PP=25;SC=GCACAGAGAGATGCCCTGAGC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=42364337;WS=42364319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr15	42364437	rs77172212	G	T	1279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.61;ReadPosRankSum=0.429;SOR=0.952;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,50:0.96:52
chr15	42374611	rs79419176	C	G	2308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=49;PP=1529;SC=ATCATTCATTCATTCATTCAT;SOR=1.668;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=24;TCR=49;TR=73;WE=42374619;WS=42374601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr15	42375683	rs78313382	A	C	303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=8;PP=160;SC=TCCCAGCCCAAGGGGCCCCAC;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=42375691;WS=42375673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	42377366	rs75621794	C	T	3011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=47;PP=1684;SC=CAAAGGCAAACGCTTCCTGCA;SOR=0.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=53;TCR=47;TR=100;WE=42377374;WS=42377356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr15	42377640	rs151065238	T	TCAGA	1344.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=7;PP=853;SC=GGCCATTTCCTCAGAGCCTGA;SOR=1.329;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=16;TCF=8;TCR=8;TR=15;WE=42377648;WS=42377630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	42377744	rs605253	C	G	2060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=33;PP=1136;SC=AATCAGAGAGCATGAGCAAGT;SOR=0.743;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=37;TCR=33;TR=70;WE=42377752;WS=42377734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr15	42378650	rs77332371	A	G	628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=9;NR=16;PP=437;SC=TCATTATGCCACCACACGTCT;SOR=1.358;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=9;TCR=16;TR=25;WE=42378658;WS=42378640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	42378672	rs148178869	TAA	T	412.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=232;SC=CGCTTCAAAATAAAAAAAAAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=11;WE=42378681;WS=42378662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	42379431	rs78042001	C	A	403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=138;SC=CATGCTCTACCCCAGGAACCC;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=42379439;WS=42379421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	42379594	rs4924619	G	A	3245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=53;PP=1862;SC=TTCCAGGTGCGGTCGACAGCT;SOR=0.906;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=104;TCF=51;TCR=53;TR=104;WE=42379602;WS=42379584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr15	42379939	rs79813811	C	G	3262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=58;NR=53;PP=1728;SC=CCTGCATTCCCTCCCTTATGC;SOR=0.725;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=111;TCF=58;TCR=53;TR=111;WE=42379947;WS=42379929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr15	42386480	rs75615772	C	T	1354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=12;PP=929;SC=CACTCTGCATCCCAAATCTCA;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=43;TCF=31;TCR=12;TR=42;WE=42386488;WS=42386470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr15	42386630	rs75734921	G	T	2876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=47;NR=46;PP=1545;SC=GGGTGGCCAGGTGGTCCCCCA;SOR=0.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=47;TCR=46;TR=93;WE=42386638;WS=42386620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr15	42433382	rs694456	A	T	2262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=47;NR=26;PP=1288;SC=TGATGCCCCTACTAGACACAC;SOR=1.320;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=47;TCR=26;TR=73;WE=42433390;WS=42433372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr15	42434254	rs655427	G	A	1271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=12;PP=606;SC=AGGTCTCCACGTTGTTCAGGA;SOR=1.067;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=26;TCR=12;TR=38;WE=42434262;WS=42434244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr15	42434505	rs654527	C	A	168.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=5;PP=104;SC=GGCTGGCTCCCTGCGGGCCCT;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=42434513;WS=42434495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
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chr15	42436599	rs636535	T	C	123.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=1;PP=49;SC=GAGCCAGAGGTGCAGGCAGGA;SOR=1.981;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=42436607;WS=42436589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	42437711	rs621560	T	C	360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=2;PP=264;SC=ATTCTTCTTGTCTCTGCCAGG;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=42437719;WS=42437701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	42439376	rs4923929	G	A	1506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.98;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr15	42503953	rs367909084	GA	G	39.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=9.061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.65;ReadPosRankSum=-0.309;SOR=0.101;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,12:0.20:61
chr15	42519136	rs1678988	T	C	974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=15;NR=14;PP=470;SC=GTACAACATTTATACACATTA;SOR=1.061;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=15;TCR=14;TR=29;WE=42519144;WS=42519126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr15	42520760	rs1678987	C	T	459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=0;PP=358;SC=TTAAAAACCACAGATCCTTCT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=42520768;WS=42520750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	42520829	rs1712417	T	C	2141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=50;NR=22;PP=1388;SC=ACTTTCTATGTCCACCCATGG;SOR=1.795;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=73;TCF=51;TCR=22;TR=72;WE=42520837;WS=42520819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr15	42523341	rs56119841	T	TC	5247.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.52;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=35;PP=2691;SC=GAAACCCATCTCAAGGGGAGA;SOR=1.043;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=63;TCF=28;TCR=35;TR=62;WE=42523349;WS=42523331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr15	42524065	rs1630294	T	C	3202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=64;NR=41;PP=1721;SC=CAGGCGTCAATTGCTGAGAGG;SOR=0.888;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=64;TCR=41;TR=105;WE=42524073;WS=42524055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr15	42524165	rs1712420	C	T	1767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=33;PP=1045;SC=GTTAAAGTTGCTAGAAGTCTA;SOR=1.306;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=22;TCR=33;TR=55;WE=42524173;WS=42524155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr15	42528676	rs1679012	C	T	1701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=35;PP=993;SC=AGGCCAGATGCCAATACTAGA;SOR=1.214;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=23;TCR=35;TR=58;WE=42528684;WS=42528666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr15	42531768	rs11070363	C	T	806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=8;PP=465;SC=CTGAATTGCACAGGAACAATT;SOR=1.536;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=27;WE=42531776;WS=42531758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	42553218	rs5812215	AT	A	1377.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.60;SOR=0.843;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr15	42560312	rs2412681	C	T	654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=17;PP=487;SC=ATATCCTATTCATTTCGTACC;SOR=2.400;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=22;WE=42560320;WS=42560302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr15	42564369	rs4244587	CA	TG	2115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.100;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=20;PP=1433;ReadPosRankSum=0.399;SC=CTTCAATTACCAAAGCATCAT;SOR=0.353;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=19;TCR=20;TR=39;WE=42564378;WS=42564359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,48:0.98:49
chr15	42564902	rs7181758	A	C	210.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.53;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=112;SC=CTATTTCTTCAATTTTAACCA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=42564910;WS=42564893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	42568547	rs8043515	C	G	1257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=20;NR=19;PP=608;SC=TTTATTTAGTCTTGAAGATGA;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=20;TCR=19;TR=39;WE=42568555;WS=42568537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr15	42568630	rs8023678	G	A	588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=8;NR=10;PP=233;SC=AAATATAGTAGCTAGATCAAA;SOR=1.426;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=8;TCR=10;TR=18;WE=42568638;WS=42568620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr15	42570201	rs12916523	A	G	275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=1;PP=138;SC=GCTTTCTAACATATTCCCTCT;SOR=2.494;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=42570209;WS=42570191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	42570433	rs8024390	C	T	181.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=103;SC=TCAAGAAAGACAAGATGTCAT;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=42570441;WS=42570423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	42570718	rs8024732	A	G	5409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=103;NR=77;PP=2919;SC=TCCACCTATCAGGCATTATTG;SOR=0.782;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=180;TCF=103;TCR=77;TR=180;WE=42570726;WS=42570708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr15	42573067	rs8037020	C	T	56.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	42575963	rs2412689	A	G	3567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=54;PP=2101;SC=CTCAGCAGATAAGGCACAACT;SOR=0.772;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=117;TCF=63;TCR=54;TR=116;WE=42575971;WS=42575953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr15	42579822	rs11070371	T	C	617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=2;PP=469;SC=CTAATTATTGTAATTGGTGCA;SOR=3.716;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=19;WE=42579830;WS=42579812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	42579948	rs8037627	T	C	3731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=55;PP=1916;SC=TTAAAATTAATGAAGAGACTC;SOR=0.844;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=123;TCF=68;TCR=55;TR=123;WE=42579956;WS=42579938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr15	42580106	rs8036596	A	C	844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=20;PP=570;SC=TGCACTTCTTATTTTGGCTGC;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=25;WE=42580114;WS=42580096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr15	42584909	rs4923939	C	T	3931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=76;NR=58;PP=2347;SC=CAGCTTGTTTCTCTCTTCCTG;SOR=0.852;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=76;TCR=58;TR=134;WE=42584917;WS=42584899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr15	42589987	rs4924651	T	C	534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.14;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	42589996	rs4924652	C	T	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.43;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	42603083	rs2412694	C	T	1977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=44;PP=1236;SC=TGTTCTGTTACATATCCAATG;SOR=1.426;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=24;TCR=44;TR=68;WE=42603091;WS=42603073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr15	42606094	rs7173358	A	G	116.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=65.19;NF=4;NR=0;PP=90;SC=AGGCTGCAGTAAGCACTGTTC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=42606102;WS=42606084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	42606153	rs141877658	A	AAACAACAACAAC	1414.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=1;PP=1375;SC=CTATCTCTAAAAACAACAGCA;SOR=4.712;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=10;WE=42606169;WS=42606143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	42606161	rs11637731	G	A	1608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.75;QD=38.30;SOR=1.900;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr15	42619508	rs1659215	C	T	1604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=15;PP=916;SC=ACAATGCATCCTACTGTGAGG;SOR=1.316;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=37;TCR=15;TR=52;WE=42619516;WS=42619498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr15	42694944	rs2241827	T	C	316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=2;PP=230;SC=CAGGACAGGATGTTCCTCCCG;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=42694952;WS=42694934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	42701688	rs3115883	T	C	917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=23;PP=554;SC=CTTTGGACTTTGGTGGAGCCA;SOR=1.885;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=9;TCR=23;TR=32;WE=42701696;WS=42701678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr15	42703406	rs3115884	T	C	1238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=8;PP=791;SC=ACTGGGCACATGGTCCTCTGA;SOR=1.828;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=31;TCR=8;TR=39;WE=42703414;WS=42703396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr15	42704105	rs3098423	C	T	3177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=52;PP=1728;SC=ATCAGTCATGCTCCTCCTCCA;SOR=0.955;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=46;TCR=52;TR=98;WE=42704113;WS=42704095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr15	42758159	rs2244773	T	A	394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=1;PP=185;SC=ACATTTGCTTTTGACGGATTA;SOR=1.911;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=42758167;WS=42758149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	42764519	rs7177521	G	C	3138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=47;PP=1721;SC=CAACGTCACAGCTGCAATGAG;SOR=0.710;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=57;TCR=47;TR=104;WE=42764527;WS=42764509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr15	42805000	rs4573906	G	A	388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=4;PP=225;SC=CTCCTGCCTCGGCCTCCCAAA;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=13;WE=42805008;WS=42804990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	42820451	rs9302112	C	T	1205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=16;PP=642;SC=ACTCCTGACTCTTATATAGAA;SOR=0.929;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=22;TCR=16;TR=38;WE=42820459;WS=42820441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr15	42851464	rs11070374	C	T	523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=0;PP=323;SC=GCTGGGATTACAGGAGTGAGC;SOR=3.500;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=42851472;WS=42851454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	42930891	rs1197550	A	T	1251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=26;NR=19;PP=770;SC=TTTCTACTTAACTCTAGTTTT;SOR=0.866;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=26;TCR=19;TR=45;WE=42930899;WS=42930881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr15	43025476	.	CTT	C	84.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.908;ClippingRankSum=0.000;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.07;ReadPosRankSum=1.925;SOR=0.811;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,7:0.17:41
chr15	43086737	rs16957167	G	T	883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=7;PP=581;SC=AGGCTTTCCCGGATGTCTTAG;SOR=2.093;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=28;WE=43086745;WS=43086727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr15	43109385	rs7182753	C	T	1806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=39;PP=1067;SC=GGAAGAAACACGTCCTTTATT;SOR=1.539;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=22;TCR=39;TR=61;WE=43109393;WS=43109375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr15	43170690	rs10650948	T	TAC	310.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.80;ReadPosRankSum=-0.126;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr15	43170793	rs6493068	A	G	4939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=57;NR=50;PP=1641;SC=CAGGATATCCAGCTGCTCTCC;SOR=0.796;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=58;TCR=50;TR=107;WE=43170801;WS=43170783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr15	43170823	rs16957250	C	T	4542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=50;NR=45;PP=1350;SC=CATTGCAATACACTGATATGG;SOR=0.772;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=50;TCR=45;TR=95;WE=43170831;WS=43170813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr15	43330175	rs7166596	A	T	893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=26;PP=709;SC=TTCTCACGTGAAAAATGGAAG;SOR=3.407;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=30;WE=43330183;WS=43330165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	43527236	rs579178	A	G	205.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=6;PP=139;SC=CAAGTACCAAATCCCAGGGAA;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=43527244;WS=43527226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	43531411	rs28756768	G	C	2729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=41;PP=1553;SC=GCCTCCATATGCAGGGGGCAG;SOR=0.754;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=87;TCF=45;TCR=42;TR=86;WE=43531419;WS=43531401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr15	43545728	rs555001	G	A	581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=6;PP=331;SC=CTCTGCTGACGTAGACGGGGC;SOR=1.329;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=19;WE=43545736;WS=43545718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	43558823	rs473016	A	C	188.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=1;PP=105;SC=GTTAGCAAGCAGCTGTGTGCT;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=43558831;WS=43558813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	43571390	rs567357	C	G	1259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.70;SOR=0.813;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr15	43579566	rs513970	A	G	914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=8;PP=550;SC=GGATGGCCACACTGCCCTTCC;SOR=1.802;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=33;WE=43579574;WS=43579556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr15	43762077	.	TGGGATA	T	1664.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=8;PP=1070;SC=GAGGCTGGGATGGGATAGGAA;SOR=1.179;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=20;TCF=11;TCR=9;TR=19;WE=43762090;WS=43762067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr15	43784000	rs555252	C	T	2084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=39;PP=1524;SC=ACCAACAAACCTTAATACAAA;SOR=1.410;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=23;TCR=39;TR=62;WE=43784008;WS=43783990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr15	43784435	.	TA	T	36.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.934;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=4.349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.36;ReadPosRankSum=-0.934;SOR=0.175;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,6:0.22:27
chr15	43924420	rs144399798	C	T	866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=33.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.36;MQRankSum=-8.859;QD=9.22;ReadPosRankSum=-1.664;SOR=3.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,24:0.26:94
chr15	43924420	.	CGT	TGC	808	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=54.88;NF=21;NR=0;PP=808;QD=41.0222797553;SC=TAACTTCTTACGTTCCTCTAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=81;TCF=55;TCR=26;TR=21;WE=43924430;WS=43924410;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:60,21:0.26:81
chr15	43924422	rs142408593	T	C	866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=22.257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.82;MQRankSum=-8.860;QD=8.84;ReadPosRankSum=-2.296;SOR=2.729;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,28:0.29:98
chr15	43924652	.	G	A	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.766;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.625;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.300;NF=2;NR=15;PP=303;ReadPosRankSum=-0.487;SC=GGAAAGGTGGGGTGGAAAGAG;SOR=1.329;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=41;TCF=8;TCR=33;TR=17;WE=43924660;WS=43924642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,16:0.38:42
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chr15	43941125	rs2470122	G	C	481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=8;NR=11;PP=233;SC=CCCGCCCGCCGGACGAAGGCG;SOR=1.127;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=8;TCR=11;TR=19;WE=43941133;WS=43941115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	44002670	rs373529135	TTG	T	288.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.82;MQRankSum=0.595;QD=3.56;ReadPosRankSum=1.207;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,17:0.21:81
chr15	44023810	.	CT	C	42.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.37;MQRankSum=-0.420;QD=1.71;ReadPosRankSum=1.020;SOR=0.602;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,6:0.24:25
chr15	44028569	rs56181031	G	C	431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.85;QD=28.78;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	44038899	rs2411284	C	T	2080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=31;PP=1092;SC=AGTTCTTCGCCCCCTGGTGAG;SOR=0.798;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=68;TCF=36;TCR=32;TR=67;WE=44038907;WS=44038889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr15	44061802	rs1053492	C	T	3294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=66;NR=43;PP=1850;SC=GGTGTGGTCACTGTAAGAACC;SOR=1.039;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=66;TCR=43;TR=109;WE=44061810;WS=44061792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr15	44062874	rs7181912	A	T	587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.72;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	44068160	rs3844075	C	G	1760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=35;NR=22;PP=1157;SC=AGGGTGGAGACCTCTTAAGCA;SOR=1.092;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=35;TCR=22;TR=57;WE=44068168;WS=44068150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr15	44084705	rs4644832	G	A	2670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=58;PP=1702;ReadPosRankSum=-1.211;SC=CGCGCTCTGTGGCCACCCTCA;SOR=1.586;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=33;TCR=59;TR=90;WE=44084713;WS=44084695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,99:0.98:101
chr15	44090854	rs654276	T	C	383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=10;PP=263;SC=TGAGAGGGGGTTGGGACAGGC;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=44090862;WS=44090844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	44091351	rs656473	A	T	923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=22;PP=593;SC=AGTGTGTGTGAGAGAAATGGC;SOR=1.209;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=18;TCR=22;TR=40;WE=44091359;WS=44091341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr15	44120559	rs678084	T	G	2266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=42;PP=1270;SC=TACCACACCATCCCTGGTAAG;SOR=1.112;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=32;TCR=42;TR=74;WE=44120567;WS=44120549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr15	44778936	rs2453275	T	A	321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=9;PP=221;SC=GGATTTTTTTTAAAAAAATGC;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=44778944;WS=44778926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	44903285	rs12909507	C	A	176.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=5;PP=97;SC=AACTCTATCCCCAGTAAAAAA;SOR=2.584;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=6;WE=44903293;WS=44903275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	44918690	rs78183930	C	T	1035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.66;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr15	44943757	rs3759871	A	G	3845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=66;NR=39;PP=1894;SC=GCCAAGGGAAAAACACTGCAT;SOR=0.880;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=66;TCR=39;TR=105;WE=44943765;WS=44943747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr15	44944037	rs77697105	C	T	2368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=38;NR=38;PP=1294;SC=TCAGGTGACTCCAAATGCAAA;SOR=0.859;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=38;TCR=38;TR=76;WE=44944045;WS=44944027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr15	44951174	rs7165146	A	G	673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=5;PP=409;SC=AACTAACCACACTTCCTATAT;SOR=2.584;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=22;WE=44951182;WS=44951164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	44962188	rs143691336	G	A	3397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=54;PP=2002;ReadPosRankSum=-0.940;SC=CTCTGCCTTCGGAATGTAAGG;SOR=0.249;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=111;TCF=56;TCR=55;TR=110;WE=44962196;WS=44962178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,126:0.99:127
chr15	44964168	rs180709551	A	G	614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-1.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=7;PP=363;ReadPosRankSum=-0.856;SC=GTCCAGGCCCATTTGACCCAA;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=24;WE=44964176;WS=44964158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,25:0.96:26
chr15	44966389	rs8026845	T	C	2595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=44;NR=39;PP=1443;SC=ATTCCCAGCATACCAGGGGCC;SOR=0.754;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=44;TCR=39;TR=83;WE=44966397;WS=44966379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr15	45028919	.	CT	C	208.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.000;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=2.689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.35;ReadPosRankSum=0.223;SOR=0.366;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,15:0.31:48
chr15	45052229	.	G	C	158.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=5;PP=115;SC=ATTTCTTCTAGTACCATGACC;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=45052237;WS=45052219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	45123909	.	TAAA	T	71.19	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.91;MQRankSum=0.524;QD=14.24;ReadPosRankSum=0.524;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,4:0.80:5
chr15	45250515	rs11633942	G	T	929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.29;QD=46.49;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	45250518	rs11633824	A	G	929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=51.25;QD=42.26;SOR=2.737;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	45250755	rs373082	CA	TG	633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=10;PP=620;SC=CAGCCAAATCCAGCTAATCTC;SOR=2.448;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=12;WE=45250764;WS=45250745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	45353230	rs2854446	C	T	2462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=30;PP=1482;SC=TGCTCCCACCCTCGGACATGG;SOR=1.046;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=81;TCF=50;TCR=31;TR=80;WE=45353238;WS=45353220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr15	45357410	rs2854437	T	G	1194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=13;PP=785;SC=GCATATATAATACTATTGTTA;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=28;TCR=13;TR=41;WE=45357418;WS=45357400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr15	45361011	rs28662287	C	T	144.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.48;QD=28.98;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	45387550	rs199138	A	G	967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=5;PP=498;SC=TGGAGCCAGGAGCTTTCTCTC;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=25;WE=45387558;WS=45387540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr15	45388382	rs2554451	C	T	533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=13;PP=331;SC=TCTGAGCAAGCGGGGCTCCTG;SOR=1.721;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=19;WE=45388390;WS=45388372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	45391566	rs269869	A	T	1641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=35;NR=20;PP=870;SC=AGGAGAAACCATCCCCAGAAC;SOR=0.933;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=35;TCR=20;TR=55;WE=45391574;WS=45391556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr15	45392075	rs269868	G	A	2553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=41;PP=1400;SC=CGAGGGTGGCGAGGCAAAGCC;SOR=1.061;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=34;TCR=41;TR=75;WE=45392083;WS=45392065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr15	45398965	rs269862	G	T	900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=18;NR=12;PP=607;SC=CAAATAGCCAGCCCCTCAGGC;SOR=0.880;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=18;TCR=12;TR=30;WE=45398973;WS=45398955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr15	45399467	rs190599	A	G	5433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=109;NR=70;PP=2965;SC=GACAGCACCAAGTGATTCCCC;SOR=1.048;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=179;TCF=109;TCR=70;TR=179;WE=45399475;WS=45399457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr15	45400164	rs269861	T	C	438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=1;PP=336;SC=CAAGGGCTCATAGGGGCTGTC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=45400172;WS=45400158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	45400358	rs269860	C	G	3831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=59;PP=2149;SC=CCAGGAGCCCCCCAAGGAGCA;SOR=0.735;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=125;TCF=65;TCR=60;TR=123;WE=45400366;WS=45400348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr15	45404066	rs2001616	G	A	4176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=50;PP=2372;SC=GTCGAACACGGGGTCTCCAGG;SOR=1.223;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=86;TCR=50;TR=136;WE=45404074;WS=45404056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr15	45404979	rs182090	T	G	1813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=23;NR=35;PP=981;SC=CCCAAACCTCTCCCTAAGCCT;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=23;TCR=35;TR=58;WE=45404987;WS=45404969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr15	45405463	rs269856	G	T	1130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=12;PP=837;SC=TCAGGGAGCCGCTTGCCGCAC;SOR=1.329;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=38;TCF=25;TCR=13;TR=37;WE=45405471;WS=45405453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr15	45406718	rs187290	C	T	256.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=0;PP=229;SC=CAAAGAGACGCCAAGGACGCG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=45406726;WS=45406709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	45408414	rs2576090	C	G	3078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=55;PP=1784;SC=AGCCCGTGTCCGTCTGCTCGT;SOR=0.918;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=49;TCR=55;TR=104;WE=45408422;WS=45408404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr15	45408691	rs2576091	C	G	3452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.43;SOR=1.349;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr15	45408699	rs2252371	C	T	3600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.87;SOR=1.423;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr15	45408710	rs2554459	A	G	2585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=53;NR=33;PP=1304;SC=GCCTCACCCCACAGGGACCCC;SOR=1.051;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=53;TCR=33;TR=86;WE=45408718;WS=45408681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr15	45408933	rs2576092	T	C	327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=7;PP=138;SC=CTATGGTAAGTGCTGGAGGGA;SOR=2.147;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=10;WE=45408941;WS=45408923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	45408956	.	CGT	C	63	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=63;QD=40.5;SC=GCTGTGTGCACGTGTGTGTGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=2;WE=45408965;WS=45408946;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:3,2:0.40:5
chr15	45409271	rs955152	C	T	1203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=14;PP=688;SC=CACAGCGGGTCCCCCCACTCC;SOR=1.203;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=28;TCR=14;TR=42;WE=45409279;WS=45409261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr15	45424286	rs1706810	C	G	358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=10;PP=259;SC=TCTGGGCTCCCCCAAGGACAG;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=45424294;WS=45424276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	45433646	rs1648283	T	G	3594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=56;PP=1964;SC=GTGGTGGGTCTGGAGCCTCGT;SOR=0.722;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=120;TCF=64;TCR=56;TR=120;WE=45433654;WS=45433636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr15	45439910	rs938129	A	G	1689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=36;PP=1023;SC=TCTGTTGGAGATGGGGAAGCC;SOR=1.467;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=21;TCR=36;TR=57;WE=45439918;WS=45439900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr15	45444518	rs1706804	A	G	3382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=47;PP=1947;SC=CGGGCATCACAGACACCACCC;SOR=0.845;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=60;TCR=47;TR=107;WE=45444526;WS=45444508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr15	45445499	rs1648304	G	C	356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=0;PP=303;SC=CTCTGGCCAGGGTCCTCGATC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=45445507;WS=45445489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	45445692	rs1648303	A	G	1185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.95;SOR=1.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr15	45445746	.	A	G	103	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=234;MMLQ=28;MQ=58.59;NF=0;NR=8;PP=103;QD=17.2214015684;SC=GTGTGTGTGTATAATGGGGAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=45445754;WS=45445736;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	45446084	.	CAA	C	93.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.738;ClippingRankSum=-0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.37;ReadPosRankSum=-0.345;SOR=1.919;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr15	45446156	rs2458236	C	T	2563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=39;PP=1455;SC=CAGGTCTGAGCTCCCCCAGAA;SOR=0.754;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=51;TCR=39;TR=90;WE=45446164;WS=45446146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr15	45454720	rs1706811	G	A	192.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.54;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	45467540	rs1632144	C	G	1208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=25;NR=18;PP=738;SC=TCACCTTCCGCGGTGGCCCCA;SOR=0.919;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=25;TCR=18;TR=43;WE=45467548;WS=45467530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr15	45545378	rs17215668	GC	G	1385.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=9;PP=1035;SC=TTCAGGCTTGGCCCTGAATTT;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=27;TCF=18;TCR=9;TR=26;WE=45545386;WS=45545368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr15	45545478	rs11854484	C	T	2127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=24;PP=1219;SC=ACAGTGAACCCGGGGCTGGAG;SOR=1.040;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=42;TCR=24;TR=66;WE=45545486;WS=45545468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr15	45554267	rs1060896	C	A	3380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=53;PP=1771;SC=CACACGCCAGCTTGTTCAAGA;SOR=0.772;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=111;TCF=58;TCR=53;TR=111;WE=45554275;WS=45554257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr15	45556829	rs11631021	A	G	450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=4;PP=332;SC=ACTCACATTGAAATAATATTC;SOR=2.049;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=16;WE=45556837;WS=45556819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
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chr15	45706909	.	T	C	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.243;ClippingRankSum=0.000;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.69;ReadPosRankSum=0.065;SOR=0.706;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,9:0.14:66
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chr15	45706936	.	G	C	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.040;ClippingRankSum=0.000;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.76;ReadPosRankSum=-0.519;SOR=0.779;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,5:0.10:52
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chr15	45706942	.	A	T	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.213;ClippingRankSum=0.000;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.78;ReadPosRankSum=-1.019;SOR=0.730;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,5:0.10:51
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chr15	45710787	.	A	C	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=0.000;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.73;ReadPosRankSum=0.136;SOR=0.811;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,15:0.16:95
chr15	45710789	.	C	A	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=0.000;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.66;ReadPosRankSum=0.574;SOR=0.817;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:82,15:0.15:97
chr15	45710797	rs182022407	A	G	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=1.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.04;ReadPosRankSum=1.889;SOR=0.896;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,15:0.14:107
chr15	45710811	.	C	T	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.011;ClippingRankSum=0.000;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=1.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.47;ReadPosRankSum=2.673;SOR=0.963;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:102,15:0.13:117
chr15	45710814	.	C	A	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.703;ClippingRankSum=0.000;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=1.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.76;ReadPosRankSum=2.176;SOR=0.852;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,16:0.13:120
chr15	45710815	.	T	C	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=0.000;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=1.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.76;ReadPosRankSum=2.177;SOR=0.852;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,16:0.13:120
chr15	45710826	.	C	A	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=0.000;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=1.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.29;ReadPosRankSum=1.911;SOR=0.926;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,16:0.14:117
chr15	45710841	.	T	C	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.928;ClippingRankSum=0.000;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.10;ReadPosRankSum=1.549;SOR=0.704;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,13:0.12:109
chr15	45710847	.	T	C	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.163;ClippingRankSum=0.000;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.61;ReadPosRankSum=0.920;SOR=0.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,14:0.13:107
chr15	45710850	.	T	A	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.575;ClippingRankSum=0.000;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.77;ReadPosRankSum=0.473;SOR=0.795;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,14:0.14:103
chr15	48443699	rs2470103	T	C	5580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=86;PP=2851;SC=TCCAAAGCCTTGATTTATTCC;SOR=0.751;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=175;TCF=89;TCR=86;TR=175;WE=48443707;WS=48443689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr15	48450517	rs3736482	T	C	561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.49;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=14;PP=402;SC=AACTCTCTGATATTTTAATTA;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=48450525;WS=48450507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	48460786	rs11070626	T	C	748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=4;PP=516;SC=CCCCTGCCTATATGAAGATTA;SOR=2.670;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=48460794;WS=48460776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	48460927	rs8023906	C	T	4120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=61;PP=2129;SC=TTTTCTCCAGCGCCCGAATTC;SOR=0.772;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=130;TCF=69;TCR=61;TR=130;WE=48460935;WS=48460917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr15	48520699	rs1484547	T	C	97.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.58;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	48538979	rs35669481	A	AAAC	437.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=1;PP=406;SC=TGTCTCAAACAAACAACAACA;SOR=3.442;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=48538987;WS=48538969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	48539026	rs11636073	A	T	2250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=12;PP=787;SC=CAGGGGGAAAAAATGTAGTTG;SOR=1.848;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=31;TCR=12;TR=43;WE=48539034;WS=48539016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr15	48539043	rs8028035	G	A	2829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=40;NR=19;PP=1087;SC=GTTGAAAGCCGTTTGCTTATG;SOR=1.577;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=40;TCR=19;TR=59;WE=48539051;WS=48539033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr15	48541700	rs2279365	G	A	2619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=25;PP=1550;SC=TTCAAGCTTCGAGGCTATAAC;SOR=1.420;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=56;TCR=25;TR=81;WE=48541708;WS=48541690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr15	48561834	rs1484551	A	G	2746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.97;SOR=0.888;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr15	48580713	rs1552311	T	C	1547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=26;PP=823;SC=GAAAAAATTGTGTAAGTAGTT;SOR=1.034;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=24;TCR=26;TR=50;WE=48580721;WS=48580703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr15	48623248	rs66822811	TCGGGCGCGGTGTCTTGCCCACAGCTTGGGGAGCGGCCC	T	869.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.55;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=1;PP=2497;SC=TGAAAGGAAATCGGGCGCGGT;SOR=3.056;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=4;WE=48623293;WS=48623238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	48703301	rs363847	A	G	1524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=16;PP=968;SC=TATAAAGTGGAGTACTACTGA;SOR=1.220;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=32;TCR=16;TR=48;WE=48703309;WS=48703291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr15	48713996	rs1820488	G	T	535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=4;PP=349;SC=GGCCAACAACGCTTCACATAC;SOR=1.061;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=14;WE=48714004;WS=48713986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	48729648	rs2042746	T	C	1209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=29;PP=878;SC=TCTCCACAAGTATTTTGAGGT;SOR=2.247;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=10;TCR=29;TR=39;WE=48729656;WS=48729638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr15	48749040	.	C	CGTGTGTGTGTGTGT	525	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.53;FR=0.9998;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MMLQ=17;MQ=59.32;NF=0;NR=2;PP=525;QD=264.0;SC=AAAGTGCGTGCGTGTGTGTGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=2;WE=48749048;WS=48749030;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:13,2:0.13:15
chr15	48755168	rs9806595	T	C	1017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=8;PP=694;SC=TTTTTTTCCCTGTAAAGATAA;SOR=2.368;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=35;WE=48755176;WS=48755158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr15	48755472	rs77105137	G	A	841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=18;PP=552;SC=TTGGAGGGTTGGTGATGCCAT;SOR=1.688;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=9;TCR=18;TR=27;WE=48755480;WS=48755462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr15	48758132	rs55694948	A	C	258.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=169;SC=AGAAATACTCACATATCCAAC;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=48758140;WS=48758122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	48779200	rs72132658	AATAAC	A	616.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=1;PP=209;SC=AATAAAATAAAATAACATAAC;SOR=2.303;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=14;TCF=7;TCR=7;TR=3;WE=48779213;WS=48779190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	48780504	rs143836403	TTAAAGA	T	6467.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=55;PP=2972;SC=CGACAATATGTTAAAGATAAA;SOR=0.823;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=19;TCR=61;TR=72;WE=48780517;WS=48780494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr15	48787245	rs6493325	T	C	1173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=25;NR=15;PP=541;SC=CCTAGATAAATGAAATACTAG;SOR=0.976;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=25;TCR=15;TR=40;WE=48787253;WS=48787235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr15	48789634	rs140605	T	C	803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=20;PP=606;SC=ATAAAATAAATACTGAATGAA;SOR=2.670;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=25;WE=48789642;WS=48789624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	48805637	rs2306352	G	A	1895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=26;PP=1092;SC=CCACGGGACTGTATTAGTCTC;SOR=1.195;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=41;TCR=26;TR=66;WE=48805645;WS=48805627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr15	48807637	rs4775765	C	T	2316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=40;PP=1331;SC=CTCACACCGGCAACTCCCAGG;SOR=1.005;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=77;TCF=37;TCR=40;TR=77;WE=48807645;WS=48807627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr15	49073296	rs72739866	T	C	498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=5;PP=345;SC=TGTTAACATATGAAAATAATA;SOR=1.863;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=18;WE=49073304;WS=49073286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	49088198	rs77732888	G	A	2061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=41;NR=26;PP=1164;SC=ATATAAACTTGATACCTACTC;SOR=0.976;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=41;TCR=26;TR=67;WE=49088206;WS=49088188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr15	49098016	rs1426200	C	A	246.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=202;SC=GGTGATTCACCGAAAATAGCT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=49098024;WS=49098006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	49143528	rs17382534	G	A	427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=11;PP=290;SC=AATAATCCCAGAAGAATATAG;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=49143536;WS=49143518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	49149828	rs4774526	C	T	797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=5;PP=515;SC=CAAATAAATACATACAGATAA;SOR=2.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=24;WE=49149836;WS=49149818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr15	49168649	rs34156861	TAC	T	77.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=0;PP=136;SC=CATATATATATACACACACAC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=49168658;WS=49168641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	49285001	rs34895054	G	C	4107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=55;PP=2118;SC=TTACCAATTGGGGGTGTGTCA;SOR=0.857;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=80;TCR=56;TR=133;WE=49285009;WS=49284991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr15	49325289	rs11638215	A	C	1381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=2.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.023;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=38;PP=1108;ReadPosRankSum=0.109;SC=GCTGTTGTAAAAGCTGTTGCT;SOR=3.209;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=49;TCF=10;TCR=39;TR=47;WE=49325297;WS=49325279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,45:0.96:47
chr15	49420816	rs17394420	A	G	339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=240;SC=TGAATAATCAAGAATCCAATT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=49420824;WS=49420806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	49421868	rs507054	T	G	478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=7;PP=266;SC=TGCTTGGCAATGATATAAAGT;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=9;TCR=7;TR=16;WE=49421876;WS=49421858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	49423098	rs2289390	C	T	55.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=2;PP=24;SC=TGCTTCTCAACTTTCATATGC;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=49423106;WS=49423088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	49429410	rs17473148	A	G	1146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=25;NR=13;PP=688;SC=CTCGTTCTAAATATAATTTTC;SOR=1.127;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=25;TCR=13;TR=38;WE=49429418;WS=49429400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr15	49487225	rs11635814	T	C	152.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=5;NR=2;PP=83;SC=TGATGTTGTATCATCTTATCC;SOR=0.941;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=49487233;WS=49487215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	49493250	.	AGT	A	54	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;FR=0.9998;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=54;QD=28.5;SC=AGGCATATGGAGTGTGTGTGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=49493259;WS=49493240;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr15	49620200	rs1055254	C	T	3305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=41;PP=1639;SC=GGGGAGGCTGCACAGTATCAA;SOR=0.828;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=59;TCR=41;TR=100;WE=49620208;WS=49620190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr15	49917341	rs3210227	G	A	1642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.08;SOR=1.010;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr15	49923026	rs1976551	C	G	307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=7;NR=1;PP=180;SC=TACAGCCGCTCCCCATCACTC;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=49923034;WS=49923016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	49927093	rs28671247	A	G	851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=18;PP=507;SC=CTGAATACCTATACATTTTGC;SOR=2.546;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=49927101;WS=49927083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr15	50152274	rs4494483	T	A	652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=3;PP=441;SC=AGATTTAAGTTAAGTGAGGCA;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=50152282;WS=50152264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr15	50152583	rs4774549	G	T	1293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=23;PP=692;SC=CAAAAGCATAGCCAGACCTTC;SOR=1.714;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=11;TCR=23;TR=34;WE=50152591;WS=50152573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr15	50158695	rs11630021	C	A	3716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=64;NR=50;PP=1833;SC=TAAATAAAATCAAATGCAAAC;SOR=0.707;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=64;TCR=50;TR=114;WE=50158703;WS=50158685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr15	50189448	rs2413976	C	A	956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.14;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr15	50226313	rs2452524	G	T	3052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=50;PP=1639;SC=TCCATCAGATGGTGGTCAAAG;SOR=1.081;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=44;TCR=50;TR=94;WE=50226321;WS=50226303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr15	50254280	rs12442430	T	C	323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.13;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	50366116	rs11412296	T	TA	415.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=361;SC=CCCATGACAATAAGCATACCA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=11;WE=50366124;WS=50366106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	50474766	rs1648348	A	C	3422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=51;PP=2201;SC=CAGCTACGGGAAGCGGCGGCC;SOR=0.776;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=107;TCF=56;TCR=51;TR=107;WE=50474774;WS=50474756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr15	50489677	rs1863511	A	T	1175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=9;PP=735;SC=TTGTTTTGATATTTTTCTTAT;SOR=1.900;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=39;WE=50489685;WS=50489667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr15	50521265	rs5812509	T	TA	6004.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.51;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=56;PP=2936;SC=GATCTGTACCTAACCCATAGA;SOR=0.741;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=78;TCF=17;TCR=61;TR=71;WE=50521273;WS=50521255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr15	50546935	.	T	TTCTC	139	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;FR=1.0000;HP=5;HapScore=2;MGOF=16;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=139;QD=35.5;SC=TTCTAGTTTTTTCTCTCTCTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=4;WE=50546943;WS=50546925;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,4:0.44:9
chr15	50574455	rs149766448	A	G	2197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=42;NR=26;PP=1130;SC=AATTTAAAAAAAGAGAGAGAA;SOR=0.987;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=42;TCR=26;TR=68;WE=50574463;WS=50574445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr15	50581869	rs374196509	GA	G	56.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=6.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.42;ReadPosRankSum=1.251;SOR=0.069;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,9:0.22:40
chr15	50773755	rs3131561	G	A	1620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=27;PP=832;SC=ACCATGAGCAGCAATCTCCTC;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=24;TCR=27;TR=51;WE=50773763;WS=50773745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr15	50782335	rs2289108	G	A	72.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=0;PP=51;SC=GAAGTTTATCGCCATTTTATT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=50782343;WS=50782325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	50888619	rs675011	A	T	518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=14;PP=339;SC=ACAACTTAAAAATAGTAATTC;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=50888627;WS=50888609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	50899312	rs72740441	C	G	1436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=19;PP=759;SC=CACACACCCCCCTACGTATAC;SOR=0.770;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=24;TCR=19;TR=43;WE=50899320;WS=50899302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr15	50941108	rs2063011	C	G	810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=20;PP=576;SC=GAGATTAAAACACCCTTCAAA;SOR=2.147;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=27;WE=50941116;WS=50941098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr15	51204364	rs1147129	G	A	3449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=58;PP=1912;SC=TGCATAGTCAGTGCCAACACA;SOR=0.859;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=47;TCR=58;TR=105;WE=51204372;WS=51204354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr15	51204394	rs3214932	C	CT	4064.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=52;PP=2664;SC=GAAATCTAGTCACTGTGGACT;SOR=1.270;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=6;TCR=52;TR=58;WE=51204402;WS=51204384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr15	51207818	rs2663553	G	C	810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=16;PP=482;SC=CCTTGAAGTTGCATCTATTAT;SOR=1.460;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=26;TCF=9;TCR=17;TR=25;WE=51207826;WS=51207808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr15	51350655	rs76241791	AT	A	1047.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.981;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=983;ReadPosRankSum=1.164;SC=GGTAAAAAAAATATATATAAA;SOR=1.292;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=22;WE=51350663;WS=51350645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,40:0.91:44
chr15	51507874	rs17601241	G	A	4083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=58;PP=2433;SC=TGTGGCATGGGAATTACAGTT;SOR=0.909;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=137;TCF=79;TCR=58;TR=136;WE=51507882;WS=51507864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr15	51519945	rs28892005	A	AAAG	1737.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.51;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=5;PP=944;SC=CATAGACAAAAAAGATTGTAG;SOR=2.649;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=26;TCF=17;TCR=9;TR=21;WE=51519953;WS=51519935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr15	51529349	rs10550124	GAAACA	G	131	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQ=61.78;NF=0;NR=3;PP=116;SC=AAAGTGATTTGAAACAAAACA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=51529361;WS=51529339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	51534547	rs727479	C	A	605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=14;PP=376;SC=GGGGGCATGGCGGAAACAAAG;SOR=1.426;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=22;TCF=8;TCR=14;TR=22;WE=51534555;WS=51534537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr15	51634255	rs2446421	T	G	2367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=47;PP=1681;ReadPosRankSum=-0.603;SC=GTAGGCGGGGTCTCTGTTCCC;SOR=1.166;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=84;TCF=36;TCR=48;TR=82;WE=51634263;WS=51634244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,90:0.98:92
chr15	51675625	rs2445738	C	T	1949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=30;NR=32;PP=1032;SC=ATTTTTTTTCCGTTGTAGGAC;SOR=0.927;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=30;TCR=32;TR=62;WE=51675633;WS=51675615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr15	51689624	rs1147142	A	C	501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=12;NR=7;PP=365;SC=TCCCCCTTCTACCTCTTGCCT;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=12;TCR=7;TR=19;WE=51689632;WS=51689614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	51693813	rs35223886	G	A	2307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=25;PP=1217;SC=GGAATTCAAGGATCAGCCCTC;SOR=0.922;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=47;TCR=25;TR=72;WE=51693821;WS=51693803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr15	51748610	rs3736485	A	G	149.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=119;SC=GTATGCAGAAAAGATGAGGAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=51748618;WS=51748600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	51749726	rs930920	A	C	899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=19;PP=556;SC=AATTCCAACTAAAAATCTTCT;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=24;WE=51749734;WS=51749716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr15	51750652	rs11630842	G	A	86.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=1;PP=49;SC=ATAACCATTTGGTGGGTACTT;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=51750660;WS=51750642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	51750846	rs7165887	G	A	2338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=28;PP=1305;SC=AGGCAGAATCGATGATTTAAG;SOR=1.039;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=71;TCF=43;TCR=28;TR=71;WE=51750854;WS=51750836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr15	51751091	rs111734926	TAGCAGC	T	594.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=833;SC=GAAGAAAATGTAGCAGCAGCA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=13;WE=51751104;WS=51751081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	51758345	rs10706765	CA	C	390.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.9995;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=4;PP=101;ReadPosRankSum=1.739;SC=AAAGAAAAGCCAAAAAAAAAA;SOR=0.446;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=12;TCF=7;TCR=5;TR=8;WE=51758353;WS=51758335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,18:0.95:19
chr15	51770456	rs11291027	AT	A	286.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=3;PP=146;SC=ATTTTGGGTGATTTTTTTTTA;SOR=1.445;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=8;WE=51770464;WS=51770446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	51783820	rs10851500	T	C	4535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=78;NR=62;PP=2575;SC=TCACCCACCATCCTATGCCCA;SOR=0.818;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=78;TCR=62;TR=140;WE=51783828;WS=51783810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr15	51783981	rs12101858	G	C	1383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=30;PP=864;SC=CTGCGTAACTGTATCAAATAA;SOR=1.565;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=16;TCR=30;TR=46;WE=51783989;WS=51783971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr15	51791559	rs12102203	A	G	5487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=76;PP=2965;SC=TCTGCATTAGAACTATCAGCT;SOR=0.735;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=159;TCF=83;TCR=76;TR=159;WE=51791567;WS=51791549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr15	51795172	rs12592889	G	A	2074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=47;PP=1250;SC=AAGAATCTACGTTCTTCTGTC;SOR=1.905;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=19;TCR=47;TR=66;WE=51795180;WS=51795162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr15	51857220	rs11070857	C	T	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=0;PP=21;SC=GACTATATCACATTATTATCA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=51857228;WS=51857210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr15	51868373	rs2414105	A	G	761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=17;PP=512;SC=AGCCTGATCCATATGCCTAAA;SOR=2.387;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=33;TCF=11;TCR=22;TR=28;WE=51868381;WS=51868363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr15	51914662	rs2278990	G	A	1624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=28;NR=25;PP=781;SC=TCACCGTGAAGGGGACATCCC;SOR=0.790;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=28;TCR=25;TR=53;WE=51914670;WS=51914652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr15	51914716	rs2278989	T	C	1735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=23;PP=858;SC=GGTTGACAGCTCCGGTGAGGA;SOR=0.818;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=29;TCR=23;TR=52;WE=51914724;WS=51914706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr15	51914778	rs6493514	T	G	474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=10;PP=268;SC=GCGCGGGAGGTGCGACAAGCT;SOR=1.022;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=8;TCR=10;TR=18;WE=51914786;WS=51914768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	51981596	rs11437327	G	GT	785.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.72;SOR=2.737;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	51981597	.	G	GTGTGT	785.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.42;SOR=2.636;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	52017345	rs2414116	A	G	327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=205;SC=GAGACACAGAATTACATATAA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=52017353;WS=52017335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	52043327	rs12903500	C	T	1057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=9;PP=564;SC=TTGGGCTCTCCAGCCCCTCAC;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=23;TCR=9;TR=32;WE=52043335;WS=52043317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr15	52060657	rs61348403	C	CT	488.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.23;MQRankSum=0.693;QD=14.81;ReadPosRankSum=-0.843;SOR=0.722;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,26:0.79:33
chr15	52155314	rs2570251	T	C	586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=14;PP=419;SC=CTTCCACCCTTTCCTCCACTT;SOR=2.093;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=19;WE=52155322;WS=52155304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	52185937	rs2959307	G	A	326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.62;QD=23.34;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	52185961	rs11370809	C	CA	352.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5293;FS=1.792;HP=13;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=1.117;NF=7;NR=8;PP=169;ReadPosRankSum=-1.331;SC=GACTCCGTCTCAAAAAAAAAA;SOR=1.003;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=11;TCR=13;TR=15;WE=52185969;WS=52185951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,20:0.74:27
chr15	52186158	rs2959285	A	C	717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=19;PP=491;SC=TGTGCTAATCAGAGTGGTTTT;SOR=2.670;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=23;WE=52186166;WS=52186148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	52192262	rs113447185	A	AGTTAT	407.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=277;SC=ACATTAAGGCAGTTAATTAAT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=5;WE=52192270;WS=52192256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	52246665	rs2959293	G	A	1209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=26;NR=13;PP=639;SC=CCCTTCAGGCGTTTTGTGCTC;SOR=1.038;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=26;TCR=13;TR=39;WE=52246673;WS=52246655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr15	52250789	rs2593187	T	C	113.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=87;SC=ATAAAATTCTTTCCTAATAGT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=52250797;WS=52250779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	52252799	rs2258248	C	T	2529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=53;NR=28;PP=1446;SC=AACTTTATGCCTGGCCTTGAA;SOR=1.305;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=53;TCR=28;TR=81;WE=52252807;WS=52252789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr15	52257874	rs2241503	A	G	799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=0;PP=591;SC=AGATGGGAATAAAGACTAAAT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=52257882;WS=52257864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr15	52486335	rs59434591	G	A	86.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=3;PP=48;SC=GCAAAACACAGCTATCTCTAG;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=52486343;WS=52486325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	52487523	rs3751604	T	A	670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=3;PP=524;SC=ATCAACATCTTATACCATAGT;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=52487531;WS=52487513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr15	52504142	rs2278295	T	C	430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=362;SC=CCTAAGGAACTTGTGACTAGG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=52504150;WS=52504132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	52505563	rs3751608	C	T	1197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=22;PP=592;SC=TCTCCTACCCCATTCTGGCTG;SOR=1.559;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=13;TCR=22;TR=35;WE=52505571;WS=52505553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr15	52506655	rs6493546	C	T	409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=3;PP=229;SC=AGGATCCTTTCGTTAGCCCAG;SOR=1.473;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=52506663;WS=52506645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	52515678	rs4405492	G	T	1402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=18;PP=907;SC=TGAATTTGACGCCACTGACAA;SOR=1.287;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=51;TCF=33;TCR=18;TR=50;WE=52515686;WS=52515668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr15	52531941	rs11635028	A	G	3004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=37;PP=1561;SC=TGATCTTCCAACTTTTTCTGC;SOR=0.946;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=57;TCR=37;TR=94;WE=52531950;WS=52531931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr15	52534344	rs3751631	G	A	2666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=30;PP=1513;SC=CAAGATACCCGCGGCAGTGCT;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=55;TCR=30;TR=85;WE=52534352;WS=52534334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr15	52539673	rs10163109	C	T	2025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=20;PP=1201;SC=CAACTGTGGTCCGGAAATGCT;SOR=1.288;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=42;TCR=20;TR=62;WE=52539681;WS=52539663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr15	52548784	.	A	ACACGCGCGCG,ACGCGCG	1871.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.26;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;NF=15,14;NR=13,13;PP=581,506;SC=ACACACACACACGCGCGCGCG;SOR=2.448;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=16;TCR=15;TR=28,27;WE=52548792;WS=52548774;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:38
chr15	52553007	rs4497629	C	G	1080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=5;PP=795;SC=AAAAACCATGCGGCTCTCAAC;SOR=3.026;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=33;WE=52553015;WS=52552997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr15	52556429	rs4776032	A	G	2621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=52;NR=40;PP=1501;SC=TGATCTGCACATTGCCCAGAT;SOR=0.713;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=52;TCR=40;TR=92;WE=52556437;WS=52556419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr15	52564191	rs3751629	T	C	77.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	52567851	rs55686434	G	A	6581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=119;NR=104;PP=2965;SC=ATGGCATAGCGAGCCGACACT;SOR=0.750;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=225;TCF=120;TCR=105;TR=223;WE=52567859;WS=52567841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr15	52587880	rs12907067	C	T	1012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.97;SOR=1.096;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr15	52628489	rs8035295	T	C	371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=1;PP=269;SC=TTTTCCTCATTTAAAAATGTA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=52628497;WS=52628479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	52640990	.	T	TA	51	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.9965;HP=13;HapScore=2;MGOF=18;MMLQ=15;MQ=57.21;NF=1;NR=3;PP=51;QD=14.0;SC=AAGTATTTACTAAAAAAAAAA;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=4;WE=52640998;WS=52640980;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:4,4:0.50:8
chr15	52667552	rs2414145	G	A	2953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=55;NR=39;PP=1554;SC=ACTGAAGAACGATAGTGGCAG;SOR=0.804;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=95;TCF=55;TCR=40;TR=94;WE=52667560;WS=52667542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr15	52668822	rs1009157	G	A	522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=15;PP=379;SC=AAGAAAAAATGTCTAAAAGCA;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=52668830;WS=52668812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	52671784	rs2242058	C	T	3069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=64;NR=36;PP=1682;SC=AACCACAAGGCCTTCTGCTCA;SOR=1.047;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=64;TCR=36;TR=100;WE=52671792;WS=52671774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr15	52675261	rs4774621	T	C	2640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=36;PP=1836;SC=TATGTACTTTTTCACTGGGTG;SOR=1.167;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=59;TCR=36;TR=95;WE=52675269;WS=52675251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr15	52681573	rs1724623	A	G	1275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=19;NR=24;PP=795;SC=ATATTCATGGAAAAAAGGAAG;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=19;TCR=24;TR=43;WE=52681581;WS=52681563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr15	52681643	rs71425744	AT	A	239.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=16;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=123;SC=AAGATCTTTTATTTTTTTTTT;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=8;WE=52681651;WS=52681633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	52684004	rs1669872	C	A	629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=1;PP=373;SC=GAAAGCATAACCCCTACTTGT;SOR=3.160;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=52684012;WS=52683994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	52689526	rs2924130	T	C	2762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=48;PP=1480;ReadPosRankSum=0.405;SC=CGCGGGCATTTGTGGCCTGCA;SOR=0.811;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=50;TCR=49;TR=97;WE=52689534;WS=52689516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,106:0.98:108
chr15	52689631	rs1724577	T	G	1857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=28;NR=29;PP=939;SC=CACCCATGAGTTCACAGAAGA;SOR=0.980;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=28;TCR=29;TR=57;WE=52689639;WS=52689621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr15	52897478	rs2414163	T	C	871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=20;PP=607;SC=AATTGTAATATTTAAATACCA;SOR=2.147;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=27;WE=52897486;WS=52897468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr15	52901433	rs12915981	C	T	1460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=12;PP=788;SC=TTATTAGGTACTAAGTTTTTC;SOR=1.402;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=32;TCR=12;TR=44;WE=52901441;WS=52901423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr15	52901638	rs3751614	T	C	3113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;SC=GCTCCAAGTGTTGAGCAATCC;SOR=0.746;Source=Platypus;TCF=57;WE=52901646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr15	52901977	rs2414166	G	A	3568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=51;NR=58;PP=1949;SC=TCAAATGTTGGGCAATTCTTG;SOR=0.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=109;TCF=51;TCR=58;TR=109;WE=52901985;WS=52901967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr15	52904046	rs4776063	C	A	307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=9;PP=229;SC=AGAAAATTATCATTGTAAAGT;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=52904054;WS=52904036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	53081677	rs146677141	C	T	712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.46;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr15	53082214	.	GTCTC	G	57.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.848;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.027;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=2;PP=70;ReadPosRankSum=-0.157;SC=GTGGGGCTCTGTCTCTCTCTC;SOR=0.072;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=2;WE=53082225;WS=53082204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,3:0.21:14
chr15	53907948	rs17730281	G	A	2445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=33;PP=1506;SC=AAAATATTGAGGTGCTTAATG;SOR=0.887;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=45;TCR=33;TR=78;WE=53907956;WS=53907938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr15	53994493	rs6416452	A	G	2001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=36;PP=1233;SC=GACCATGTGGATAGAGTAATG;SOR=1.061;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=66;TCF=30;TCR=36;TR=66;WE=53994501;WS=53994483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr15	53998314	rs690235	G	T	997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=23;PP=599;SC=ATTCTAACTAGAGAGAGATGG;SOR=2.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=9;TCR=23;TR=32;WE=53998322;WS=53998304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr15	54008795	rs690337	T	C	5651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=103;NR=83;PP=2965;SC=AGGAAGTGAGTGTACTTACAC;SOR=0.876;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=186;TCF=103;TCR=83;TR=186;WE=54008803;WS=54008785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr15	54008845	rs690346	T	C	5269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=96;PP=2667;SC=GCCTTCTCCATGCACTGTCCA;SOR=0.917;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=181;TCF=85;TCR=96;TR=181;WE=54008853;WS=54008835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr15	54306925	rs12437941	G	A	4032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=77;NR=54;PP=2260;SC=TTTGAATGGAGGTGTTCAGGG;SOR=0.834;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=77;TCR=54;TR=131;WE=54306933;WS=54306915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr15	54529629	rs7162346	T	C	1664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=13;PP=1030;SC=AGTTGTGGGATCGTTCCAGTT;SOR=1.942;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=40;TCR=13;TR=53;WE=54529637;WS=54529619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr15	54556259	rs12917364	A	G	1070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=6;PP=727;SC=ACTCCACAGAATGAAAGCACT;SOR=2.494;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=33;WE=54556267;WS=54556249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr15	54624313	rs11856987	T	A	1138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=19;NR=19;PP=616;SC=GTATAGGGTATGTACAAATTT;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=19;TCR=19;TR=38;WE=54624321;WS=54624303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr15	54685463	rs489526	G	A	481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=12;PP=319;SC=ATATACTGACGACAATAATAA;SOR=3.258;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=54685471;WS=54685453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	54804450	rs9920072	C	T	624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=6;PP=407;SC=GTTTATTTTTCACATTGAGAA;SOR=2.124;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=22;WE=54804458;WS=54804440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	55710369	rs6493785	T	A	1499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=18;PP=843;SC=ATTAAATTTTTTTTTTTTCAG;SOR=0.841;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=30;TCR=18;TR=48;WE=55710377;WS=55710359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr15	55759193	rs600753	T	C	1350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=19;PP=922;SC=TTTTTTTCTTTCTTCTTTAAT;SOR=0.784;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=20;TCR=19;TR=39;WE=55759201;WS=55759183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr15	55840995	rs2617227	A	G	799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=3;PP=481;SC=ATGAATGATTAAAAGTACAAT;SOR=2.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=21;WE=55841003;WS=55840985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	55841195	rs76876528	TA	T	116.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQRankSum=-0.507;QD=1.91;ReadPosRankSum=-0.875;SOR=0.503;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,14:0.23:61
chr15	55881111	rs1992236	A	G	1405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=19;NR=26;PP=831;SC=ACCTGTCTGTAGAATGCCTCC;SOR=1.094;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=19;TCR=26;TR=45;WE=55881119;WS=55881101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr15	55972660	rs35467969	CT	C	203.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=1.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.22;MQRankSum=0.000;QD=4.53;ReadPosRankSum=0.668;SOR=0.483;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,17:0.38:45
chr15	55974742	.	T	TTTTATTTA	363.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=451;SC=AGATTTCATATTTTATTTATT;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=6;WE=55974750;WS=55974732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	56030543	rs12906885	G	A	1587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=5;PP=954;SC=TTTTATTTATGAAGTTAGAAA;SOR=2.958;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=40;TCR=5;TR=45;WE=56030551;WS=56030533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr15	56030756	rs4774222	T	C	2114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=44;PP=1344;SC=CTACAAACTCTAAAAGGTGGG;SOR=1.379;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=26;TCR=44;TR=70;WE=56030764;WS=56030746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr15	56032519	rs10152116	G	A	858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=6;PP=511;SC=TATTAATAAAGCAAGAAATCA;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=26;WE=56032527;WS=56032509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	56032975	rs7182733	G	A	244.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=201;SC=TTCAGGGTATGAGATGACGAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=56032983;WS=56032965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	56034878	rs11632579	G	A	353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=1;PP=166;SC=TGGCGGTTCCGGACAGGCCGC;SOR=2.147;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=56034886;WS=56034868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	56035010	rs12910180	G	A	1919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=32;NR=29;PP=1064;SC=ACAGCGGTAAGAGAAAGCAGA;SOR=0.779;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=32;TCR=29;TR=61;WE=56035018;WS=56035000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr15	56122347	rs2288344	T	G	297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=10;PP=245;SC=GACGTAGGACTGGGTTCTGGG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=56122355;WS=56122337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	56122664	rs12910830	T	C	2720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=41;PP=1781;ReadPosRankSum=-0.896;SC=AACAGAGGAATCTCACTCTCT;SOR=0.776;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=47;TCR=42;TR=87;WE=56122672;WS=56122654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,98:0.98:100
chr15	56125135	rs8024944	C	A	1991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=43;NR=22;PP=1135;SC=TGGAAGCTTGCGGATTCGTCA;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=43;TCR=22;TR=65;WE=56125143;WS=56125125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr15	56125182	rs8026172	T	A	2884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=41;PP=1697;SC=TCCATTTTTTTAATGATCTAT;SOR=0.869;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=57;TCR=41;TR=98;WE=56125190;WS=56125172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr15	56130286	rs11071227	A	T	681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=11;PP=446;SC=AATAAAATACATACTAATAAA;SOR=0.922;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=15;TCR=11;TR=26;WE=56130294;WS=56130276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr15	56130909	rs8028559	A	G	187.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=6;PP=136;SC=ATGAGAGGTCAGATGGACATC;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=56130917;WS=56130899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	56139153	rs2288346	T	C	701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.06;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr15	56140995	rs12232351	T	A	3157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=58;NR=44;PP=1611;SC=AGCATTTCTATACACTTACAG;SOR=0.814;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=58;TCR=44;TR=102;WE=56141003;WS=56140985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr15	56152598	rs4774228	A	G	1636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=18;PP=956;SC=ATCTAAGAGCATCTTACTGAG;SOR=1.539;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=40;TCR=18;TR=58;WE=56152606;WS=56152588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr15	56152729	rs2303579	T	C	3332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=42;PP=2103;SC=GAAGGCCTGGTTGCTATACAT;SOR=0.896;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=57;TCR=42;TR=99;WE=56152737;WS=56152719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr15	56152872	rs2303580	C	T	3739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=66;PP=2193;SC=GGAAGACTCTCGGTTGTCAAC;SOR=0.969;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=121;TCF=55;TCR=66;TR=121;WE=56152880;WS=56152862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr15	56161919	rs1912402	C	T	789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=15;PP=421;SC=ACTTTAACACCGGGAGAAAAG;SOR=1.143;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=12;TCR=15;TR=27;WE=56161927;WS=56161909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	56386577	rs7170589	T	G	4838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=62;PP=2644;SC=CGACCAAAATTAGTGTCATGA;SOR=0.727;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=86;TCR=62;TR=148;WE=56386585;WS=56386567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr15	56387931	rs11071247	C	T	4655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=68;PP=2639;SC=CCTGGGTCTCCTGCAATGTAG;SOR=0.741;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=145;TCF=77;TCR=68;TR=145;WE=56387939;WS=56387921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr15	56535174	rs2460649	A	G	92.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=3;NR=1;PP=55;SC=ACCTCCAGAGATCCTACAAAT;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=56535182;WS=56535164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	56657581	rs2682033	A	C	317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=1;PP=236;SC=GCGGGAGGCAACCGGGATGTG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=56657589;WS=56657571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	56680944	rs1477589	T	C	113.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=87;SC=GGAAAAAATGTTAGGTGAAAT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=56680952;WS=56680934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	56719797	rs795785	G	T	747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=17;NR=7;PP=370;SC=TTTTTTCCTTGTGTAGGACAT;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=24;WE=56719805;WS=56719787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr15	56720715	rs1554410	T	G	192.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=5;PP=144;SC=TGGTTTGAATTATTTTTATTC;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=56720723;WS=56720705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	56721264	rs795787	G	A	1103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=22;NR=14;PP=588;SC=GTGGTAACATGCAAAAAATCT;SOR=1.005;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=22;TCR=14;TR=36;WE=56721272;WS=56721254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr15	56721406	rs808730	C	T	1172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=23;PP=704;SC=GAGAAAAATACTTTGTGGGTT;SOR=1.312;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=16;TCR=23;TR=39;WE=56721414;WS=56721396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr15	56923536	rs3803457	A	G	401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=341;SC=TGGTGAATTGATTTGTTTGAT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=56923544;WS=56923532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	56923714	rs8043381	G	A	4239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=60;PP=2482;SC=TTTCTTTTTCGTCTTCCAGGT;SOR=0.873;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=137;TCF=77;TCR=60;TR=137;WE=56923722;WS=56923704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr15	56946296	rs8028457	C	A	158.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQ=61.78;NF=5;NR=0;PP=84;SC=AAAACAACAACATACTTTAAT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=56946304;WS=56946286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	56946980	rs12911381	T	G	5088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=97;NR=67;PP=2745;SC=GAGTCAGTCTTGGCTCCACAA;SOR=0.947;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=164;TCF=97;TCR=67;TR=164;WE=56946988;WS=56946970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr15	56961272	rs12911191	T	A	138.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=5;PP=110;SC=ACTTGCGGTTTAACATCTCCT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=56961280;WS=56961262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	56981703	rs1871861	T	A	330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.56;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	57210297	rs3803455	G	A	303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=0;PP=249;SC=CGGAACGGCCGAGGAGGATGG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=57210305;WS=57210287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	57210562	rs213150	C	A	1669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.424;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=28;PP=851;ReadPosRankSum=-0.547;SC=ACGGTACCTGCCACCCCGCTC;SOR=0.572;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=28;TCR=29;TR=55;WE=57210570;WS=57210552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,65:0.98:66
chr15	57210627	rs2165461	G	C	427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=12;PP=338;SC=GCTTCTCGAGGTGCCTGCGAG;SOR=1.911;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=16;WE=57210635;WS=57210617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	57364814	rs2951904	G	A	718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.62;SOR=1.101;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr15	57523542	rs1037958	A	G	1361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=31;PP=901;SC=GAGAATACCTATATTCAGGCC;SOR=2.252;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=11;TCR=31;TR=42;WE=57523550;WS=57523532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr15	57524756	rs2248620	G	A	1200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=30;PP=933;SC=GGCTTACCGCGTTTACCATGC;SOR=2.093;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=12;TCR=30;TR=42;WE=57524764;WS=57524746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr15	57524857	rs2290938	T	C	1531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=9;PP=1015;SC=GTCCATTTTATGTGAATATTA;SOR=2.215;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=48;TCF=38;TCR=10;TR=46;WE=57524865;WS=57524847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr15	57555523	rs7182038	C	A	907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=21;PP=577;SC=CATAGGTAAACATACTTGAGA;SOR=2.165;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=28;WE=57555531;WS=57555513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr15	57730064	rs2458104	T	A	270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=10;NR=0;PP=227;SC=TCTTTGCTGTTTAAAATGTCT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=57730072;WS=57730054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	57730404	rs2934441	T	C	3540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=49;PP=1971;SC=GCACATCGTTTTCTGAAAATG;SOR=0.741;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=110;TCF=60;TCR=50;TR=108;WE=57730412;WS=57730394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr15	57731335	rs1280395	A	C	5658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=-0.050;NF=93;NR=82;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.027;SC=CAGAATTAATACAGATGACAG;SOR=0.764;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=178;TCF=95;TCR=83;TR=175;WE=57731343;WS=57731325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,203:0.99:205
chr15	57731728	rs1280396	A	G	1551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=22;PP=865;SC=GAACCGGGCAACAGCAACTTC;SOR=0.728;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=28;TCR=22;TR=50;WE=57731736;WS=57731718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr15	57732743	rs1280398	T	C	2112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=32;PP=1244;SC=TTTCCGAGGCTTTAATGGTTA;SOR=0.744;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=37;TCR=32;TR=69;WE=57732751;WS=57732733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr15	57743603	rs16977508	A	G	322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=12;NR=0;PP=259;SC=GTTATGCCTCATCTGTTACTG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=57743611;WS=57743595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	57743933	rs1280406	A	G	254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=250;SC=TAATCACTGAATAAATTCCTG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=57743941;WS=57743923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	57817066	rs2270488	C	G	270.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=164;SC=GTGCTTGACTCTTCATTCTTC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=57817074;WS=57817056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	57835868	rs1620315	C	G	3199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=59;NR=44;PP=1644;SC=CTTCTAACCTCTGGGCTTTTG;SOR=0.778;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=103;TCF=59;TCR=44;TR=103;WE=57835876;WS=57835858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr15	57835903	rs1620402	T	G	3243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=56;NR=51;PP=1673;SC=GATGGAGCAGTTGAGGAATGA;SOR=0.793;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=107;TCF=56;TCR=51;TR=107;WE=57835911;WS=57835893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr15	57836552	rs1908189	T	C	527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=5;PP=356;SC=GGCCCTGGTGTGGAAAGCAGC;SOR=1.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=19;WE=57836560;WS=57836542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	57836823	rs8029295	G	A	463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=14;PP=366;SC=ACTGCAGTGCGGAGGCCCCAG;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=57836831;WS=57836813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	57838258	rs2635390	T	C	948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=6;PP=490;SC=TCAGCCCACATTCTCTCCCGG;SOR=1.675;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=28;WE=57838266;WS=57838248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr15	57884181	rs1690328	T	C	419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=10;NR=6;PP=220;SC=GCACGCTTATTCTGCCCGGGA;SOR=1.061;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=10;TCR=6;TR=16;WE=57884189;WS=57884171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	57884219	rs2453089	A	G	706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=16;NR=8;PP=355;SC=CCCGCTACCGACCGCCGCTGC;SOR=0.997;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=16;TCR=8;TR=24;WE=57884227;WS=57884209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr15	57896366	rs2172611	A	T	228.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=184;SC=GTGTTCCCCAATGGAAGTAGG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=57896374;WS=57896356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	57896658	rs2453091	C	A	830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=20;PP=568;SC=GGTGTCTGCACCTCTGTTGAG;SOR=2.019;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=28;WE=57896666;WS=57896648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	57910164	rs937254	G	A	396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=12;NR=1;PP=295;SC=CAGTGGGCCCGTTATTACAAC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=57910172;WS=57910154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	57910444	rs935548	A	G	1878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=35;PP=1109;SC=CATGCAAGAGAATGGAGTTGG;SOR=1.574;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=22;TCR=35;TR=57;WE=57910452;WS=57910434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr15	57914094	rs2934439	G	T	106.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=80;SC=AAGAATAATCGTATTCATATT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=57914102;WS=57914084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	57917821	rs2470360	C	T	912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=9;PP=589;SC=GCCCTTCTCTCTGGATCATGC;SOR=1.542;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=31;WE=57917829;WS=57917811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr15	57918069	rs2069133	A	G	1952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=39;PP=1216;SC=CAGCCTTGGCATCAGATTCCA;SOR=1.308;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=66;TCF=27;TCR=39;TR=66;WE=57918077;WS=57918059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr15	57918090	rs2958059	A	G	1653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=33;PP=1005;SC=TTGGCCTGCAAGTACTCATCT;SOR=1.421;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=21;TCR=33;TR=54;WE=57918098;WS=57918080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr15	57924586	rs2733593	T	A	435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=4;PP=247;SC=TGCCAATTCCTCTGGGCCCTG;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=14;WE=57924594;WS=57924576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	57953564	rs986868	C	T	72.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=1;PP=51;SC=AAATGAAAACCAAGGGCATCT;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=57953572;WS=57953554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	57967219	rs1991252	T	C	4737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=81;NR=75;PP=2404;SC=AGGCCAAGACTGAAGTGGAAA;SOR=0.751;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=158;TCF=81;TCR=77;TR=156;WE=57967227;WS=57967209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr15	57967285	rs5812908	AT	A	1743.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=41;PP=713;ReadPosRankSum=-0.178;SC=GAATTTCCTGATTTTTTTTTT;SOR=0.573;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=57;TCF=3;TCR=54;TR=43;WE=57967295;WS=57967275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,75:0.99:76
chr15	57976523	rs6493944	A	G	396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=1;PP=354;SC=CATTTTCTAGAGTTGTCTTAC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=57976531;WS=57976513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	57976583	rs2554032	A	C	2360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=24;PP=1538;SC=CCTGACCTGCATTTTCTCATT;SOR=1.402;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=52;TCR=24;TR=76;WE=57976591;WS=57976573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr15	58000981	rs1062707	C	T	3694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=45;PP=2037;SC=TGAAAGCTGCCATTGCAGAAT;SOR=0.925;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=67;TCR=45;TR=112;WE=58000989;WS=58000971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr15	58287435	.	C	A	136	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;FR=1.0000;HP=22;HapScore=2;MGOF=82;MMLQ=27;MQ=48.3;NF=0;NR=5;PP=136;QD=34.1542425094;SC=AAAAAAAAAACAAACAGAAAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=58287443;WS=58287425;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	58459075	rs16939839	T	C	313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=4;PP=90;SC=CTGCTTCACATACCTTAATTT;SOR=1.445;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=8;WE=58459083;WS=58459065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	58465171	rs2292712	G	A	861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=5;PP=597;SC=GTAGTTCTCTGCCTAGAAGAC;SOR=2.621;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=28;WE=58465179;WS=58465161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	58465483	rs2292713	C	T	135.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.18;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	58467095	rs2280195	G	A	3754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=43;PP=1996;ReadPosRankSum=0.667;SC=ACACTAATGTGCCAGAGCTTT;SOR=1.270;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=123;TCF=79;TCR=44;TR=121;WE=58467103;WS=58467085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,141:0.99:143
chr15	58471368	rs2249783	C	T	1581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=31;NR=19;PP=763;SC=TCTTTGCCATCTTTGACTCCA;SOR=0.906;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=31;TCR=19;TR=50;WE=58471376;WS=58471358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr15	58471556	rs2271678	T	C	495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=14;PP=352;SC=TAAGTAACAGTGGTGGGGAAG;SOR=1.721;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=20;WE=58471564;WS=58471546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	58471626	rs17821117	G	A	158.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=113;SC=TGGAGATCCAGGGAAGTTCAG;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=58471634;WS=58471616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	58476281	rs1867380	A	G	2673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=44;PP=1369;SC=AGTCTTTAAGACAGAACAATC;SOR=0.925;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=43;TCR=44;TR=87;WE=58476289;WS=58476271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr15	58723426	rs1077835	A	G	200.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=1;PP=151;SC=TAGTAGGCATACCAAAATATA;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=58723434;WS=58723416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	58723479	rs1077834	T	C	424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=4;PP=321;SC=AAACTAGAGGTCCAAAAATAT;SOR=1.911;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=15;WE=58723487;WS=58723469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	58723675	rs1800588	C	T	1863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=32;PP=1067;SC=CCTTTTGACACGGGGGTGAAG;SOR=0.721;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=67;TCF=35;TCR=32;TR=67;WE=58723683;WS=58723665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr15	58833938	rs6076	G	A	478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=4;PP=333;SC=AAGGGTGAGCGGGGAGAAAGG;SOR=1.863;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=17;WE=58833946;WS=58833928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	58834741	rs690	G	T	1492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=10;PP=896;SC=AGGAATCTGTGCAACTCTCTC;SOR=2.049;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=34;TCR=10;TR=44;WE=58834749;WS=58834731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr15	58837910	rs2414592	T	C	1500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.33;SOR=0.877;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr15	58837957	rs6082	A	G	1718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=19;PP=916;SC=ATGCCGCGGGACCTTTGTTTG;SOR=0.933;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=35;TCR=19;TR=54;WE=58837965;WS=58837947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr15	58838010	rs6083	A	G	2290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=31;PP=1362;SC=GATGATGCCAATTTTGTGGAT;SOR=0.897;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=45;TCR=31;TR=76;WE=58838018;WS=58838000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr15	58840450	rs1007543	A	C	1085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=9;PP=745;SC=CTCCTGTGGGATGAGAACCAA;SOR=1.949;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=35;WE=58840458;WS=58840440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr15	58853079	rs3829462	C	A	1608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=41;NR=12;PP=940;SC=ATTACCAGTTCAAGATCCAGT;SOR=1.812;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=41;TCR=12;TR=53;WE=58853087;WS=58853069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr15	58853109	rs3829461	A	G	2241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=49;NR=30;PP=1234;SC=AAACTGAGACACCAATACAAA;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=49;TCR=30;TR=79;WE=58853117;WS=58853099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr15	58853211	rs77010273	T	C	4432.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=44;PP=1193;SC=CCTAGGGTGATGACACACTTA;SOR=0.957;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=88;TCF=42;TCR=46;TR=85;WE=58853226;WS=58853201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr15	58853212	rs71964604	GAC	G	4423.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=4;NR=40;PP=2112;SC=CTAGGGTGATGACACACTTAT;SOR=0.963;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=48;TCF=5;TCR=43;TR=44;WE=58853226;WS=58853201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr15	58853218	rs55913623	C	T	4345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=40;PP=1312;SC=TGATGACACACTTATTTTTCT;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=41;TCR=43;TR=80;WE=58853226;WS=58853201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr15	58853307	rs4774305	C	G	780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=47;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=19;PP=493;SC=AAACCAAAAACTATCTGAGAC;SOR=1.942;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=26;WE=58853315;WS=58853297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr15	58853363	rs1869129	C	T	110.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=3;PP=55;SC=AAAGACATTACCGTGACACAG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=58853371;WS=58853353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	58857230	rs4775080	G	C	442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=4;PP=287;SC=ACCCTCTTCCGTCACCCCCTG;SOR=2.049;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=14;WE=58857241;WS=58857220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	58857255	rs4775081	A	G	831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=7;PP=392;SC=TCACTGCCAGATGCCGGCCTG;SOR=1.284;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=24;WE=58857263;WS=58857245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr15	58891949	rs35772938	GA	G	595.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=270;ReadPosRankSum=-0.579;SC=TTTTTCCACTGAAAAAAAAAA;SOR=1.839;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=21;WE=58891957;WS=58891939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,26:0.96:27
chr15	58902769	rs12439189	A	C	2180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=41;PP=1197;SC=ATATAAGTTGAAGATCAGATT;SOR=1.550;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=66;TCF=23;TCR=43;TR=64;WE=58902777;WS=58902759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr15	58983318	rs7179724	G	C	3220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=45;PP=1840;SC=GTAGGTGCTGGTCACAATGCG;SOR=0.816;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=104;TCF=58;TCR=46;TR=103;WE=58983326;WS=58983308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr15	58983425	rs7161889	G	C	2755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=43;NR=41;PP=1501;SC=CAAACTTTACGTTGCTCTCCT;SOR=0.815;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=84;TCF=43;TCR=41;TR=84;WE=58983433;WS=58983415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr15	58983588	rs7163162	T	A	2875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=51;NR=42;PP=1439;SC=CTTCTTCCACTCTTGCTCCAC;SOR=0.749;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=51;TCR=42;TR=93;WE=58983596;WS=58983578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr15	58985164	rs4774310	T	G	3615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=53;PP=2136;SC=TTCCCGAGGGTTGGGGATGAT;SOR=0.822;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=113;TCF=60;TCR=53;TR=113;WE=58985172;WS=58985154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr15	59080203	rs7169205	A	G	339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=7;PP=181;SC=TTTCAAAACAAAAGTTTTCAA;SOR=0.976;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=12;TCF=5;TCR=7;TR=12;WE=59080211;WS=59080193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	59172382	rs34042545	T	TG	495.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=464;SC=GCACTGTTCTTGGTACTTTAT;SOR=3.126;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=12;WE=59172390;WS=59172372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	59185929	rs4238332	T	C	153.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=1;PP=110;SC=ACAAAGCTTATATCTGGATTA;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=59185937;WS=59185919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	59190930	rs10518991	C	T	952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.75;SOR=0.984;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr15	59213678	rs11630160	G	A	3515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=61;NR=47;PP=1735;SC=GGCAACAAGAGGCAGCACTGG;SOR=0.708;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=62;TCR=48;TR=108;WE=59213686;WS=59213668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr15	59225818	rs2279719	G	A	390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=10;PP=269;SC=GGCGGCGGCAGCAGCGCCAAC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=59225826;WS=59225808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	59323048	rs2899642	C	G	901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=7;PP=507;SC=CTGAATATAACGAGCTCTACA;SOR=1.542;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=27;WE=59323056;WS=59323038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr15	59470548	rs140986420	G	T	734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=6;PP=367;SC=GCTGGCGGGGGCCCCGCGGGA;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=23;WE=59470556;WS=59470538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr15	59494673	rs2306787	C	T	860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=20;PP=546;SC=GCCTGCCTTTCTAGAGGATGG;SOR=1.839;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=9;TCR=20;TR=29;WE=59494681;WS=59494663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr15	59499179	rs3809530	G	A	2804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=39;PP=1420;SC=CAGCCAGAGAGTGAGCTCGGT;SOR=0.750;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=55;TCR=39;TR=94;WE=59499187;WS=59499169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr15	59499228	rs3809529	C	T	3566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=54;PP=1871;SC=GCCCTGTGTCCGCGTCAAGCA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=118;TCF=64;TCR=54;TR=118;WE=59499236;WS=59499218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr15	59499274	rs3809528	C	A	3013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.76;SOR=0.856;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr15	59500114	.	A	C	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=0.000;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=1.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQRankSum=-8.238;QD=0.37;ReadPosRankSum=-3.102;SOR=1.051;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,6:0.07:84
chr15	59500116	rs3825937	T	C	1869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=7.799;NF=40;NR=30;PP=1302;ReadPosRankSum=3.765;SC=TCCACCATAATTAAGGGCCTC;SOR=0.513;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=73;TCF=42;TCR=31;TR=70;WE=59500124;WS=59500106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,76:0.90:84
chr15	59500119	.	A	G	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=0.000;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQRankSum=-7.543;QD=0.98;ReadPosRankSum=-3.317;SOR=1.028;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,9:0.10:90
chr15	59500123	.	C	T	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.647;ClippingRankSum=0.000;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=1.355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQRankSum=-7.932;QD=0.77;ReadPosRankSum=-2.265;SOR=0.978;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,9:0.09:99
chr15	59500128	.	A	G	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=0.000;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=1.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQRankSum=-7.974;QD=0.70;ReadPosRankSum=-1.657;SOR=0.955;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,9:0.09:100
chr15	59500178	rs79607288	A	G	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQRankSum=-9.674;QD=1.34;ReadPosRankSum=3.795;SOR=0.599;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:179,20:0.10:199
chr15	59500180	rs77368390	C	G	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQRankSum=-9.725;QD=1.21;ReadPosRankSum=3.803;SOR=0.620;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:181,20:0.10:201
chr15	59500186	rs77894854	T	C	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FS=0.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQRankSum=-9.751;QD=1.22;ReadPosRankSum=3.564;SOR=0.590;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:182,20:0.10:202
chr15	59500222	.	A	G	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=0.000;DP=203;ExcessHet=3.0103;FS=2.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQRankSum=-9.126;QD=0.32;ReadPosRankSum=-1.944;SOR=1.082;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:185,16:0.08:201
chr15	59500230	.	AT	CC	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.780;ClippingRankSum=0.000;DP=191;ExcessHet=3.0103;FS=3.771;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQRankSum=-9.200;QD=0.46;ReadPosRankSum=-3.051;SOR=1.337;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:176,15:0.08:191
chr15	59515434	rs2306779	C	T	1208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.86;SOR=1.154;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr15	59524056	rs7165587	T	C	381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=7;PP=173;SC=TACGCCAAACTTTCTCTAAGG;SOR=2.833;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=59524064;WS=59524046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	59528994	rs11356613	AT	A	210.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;BaseQRankSum=1.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.632;NF=0;NR=7;PP=111;ReadPosRankSum=0.862;SC=GCAGAAAAGAATTTTTTTTTT;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=7;WE=59529002;WS=59528984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,10:0.91:11
chr15	59548475	rs4508371	C	T	5749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=88;PP=2965;SC=TAAGGATCTTCTTCATACCTG;SOR=0.789;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=181;TCF=93;TCR=88;TR=181;WE=59548483;WS=59548465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr15	59664607	rs7175010	C	A	137.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.69;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	59750930	rs11071448	G	A	2675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=54;PP=1671;SC=TTACATTATCGGAGAATGGTT;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=28;TCR=54;TR=82;WE=59750938;WS=59750920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr15	59750960	rs7359171	A	G	1453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=34;PP=1038;SC=GGCAAGAGAAACACTATTGTG;SOR=2.400;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=9;TCR=34;TR=43;WE=59750968;WS=59750950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr15	59752053	rs3803445	G	A	718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=7;PP=491;SC=TGTATTTCCAGACTTCTCTGG;SOR=1.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=24;WE=59752061;WS=59752043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	59784334	rs4291860	C	A	104.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=0;PP=78;SC=TTAAGTGTGCCTTAGGTGACT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=59784342;WS=59784326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	59784493	rs4296198	C	T	1948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=23;PP=993;SC=AGATTCGTGCCCGGGACAACA;SOR=0.750;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=35;TCR=23;TR=58;WE=59784501;WS=59784483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr15	59784648	rs4417505	A	G	879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=10;NR=18;PP=462;SC=AAACTCCATTATAGTGGGGAA;SOR=1.751;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=10;TCR=18;TR=28;WE=59784656;WS=59784638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr15	59799278	rs4278683	T	C	142.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=0;PP=113;SC=GGAATTCATTTGAACCTCTGT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=59799286;WS=59799268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	59911892	rs3743119	G	T	550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=15;PP=379;SC=TGCTATTAGAGTGTGGGTAAG;SOR=4.514;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=59911900;WS=59911882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	59931429	rs2306354	G	C	977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=15;NR=14;PP=522;SC=ACTATTTTAAGACTATCAAAA;SOR=0.746;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=15;TCR=14;TR=29;WE=59931437;WS=59931419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr15	59931556	rs8033208	G	C	215.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=5;PP=123;SC=GAGATACAAAGATGCTTAGCT;SOR=1.863;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=59931564;WS=59931546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	59944300	rs4774340	T	C	816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=5;PP=484;SC=CTGGGTCAAATAGTCCAAGAT;SOR=1.765;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=27;WE=59944308;WS=59944290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	59960155	rs6151570	G	C	543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=1;PP=358;SC=AGGAACTCTGGGTTCACCCTG;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=59960163;WS=59960145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	59960941	rs6151566	CCT	C	230.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=1;PP=257;SC=ATGGCTTCTTCCTCTTTTTCT;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=59960950;WS=59960931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	59960980	rs6151565	C	T	291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=3;PP=207;SC=CACGCGCGCGCGCGCACAGTT;SOR=1.802;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=11;WE=59960988;WS=59960970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	59961646	rs2307273	T	C	94.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.63;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=2;PP=28;SC=TACAAAATAATAGTTGAAAAA;SOR=1.609;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=59961654;WS=59961636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	59964798	rs4774342	C	G	1213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=11;PP=846;SC=AATTAGCTCACAATTCTGTCC;SOR=2.093;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=29;TCR=11;TR=40;WE=59964806;WS=59964788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr15	59972353	.	GT	G	82.50	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.000;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=16.50;ReadPosRankSum=0.524;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr15	59972372	rs6151510	A	C	245.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=-0.000;NF=13;NR=2;PP=296;ReadPosRankSum=-0.385;SC=TTTTTTGGACAAAGAAACGTG;SOR=1.802;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=59972380;WS=59972362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,9:0.90:10
chr15	59974525	.	CAA	C	68.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.651;ClippingRankSum=-0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.73;ReadPosRankSum=0.568;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr15	60643302	rs3743269	T	C	1259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=24;NR=16;PP=596;SC=GTCCCCTTCCTCCATCCATGA;SOR=0.866;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=24;TCR=16;TR=40;WE=60643310;WS=60643292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr15	60649579	rs5813020	TC	T	1327.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=22;PP=860;SC=GAATCTATACTCCTACCCCTT;SOR=2.012;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=22;WE=60649587;WS=60649569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr15	60653205	rs17845226	C	A	2390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=45;NR=32;PP=1271;SC=CCCAAAATCACCGTCTCCAGG;SOR=0.906;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=45;TCR=32;TR=77;WE=60653213;WS=60653195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr15	60678298	rs11855679	T	A	2024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=22;PP=1068;SC=GGAAAAAAAGTACAACAAAAA;SOR=1.121;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=43;TCR=22;TR=65;WE=60678306;WS=60678288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr15	60678328	rs11858864	C	T	2535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=50;NR=35;PP=1309;SC=AAGAGGCTCTCCTTTACTCTG;SOR=0.820;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=50;TCR=35;TR=85;WE=60678336;WS=60678318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr15	60678350	rs7182242	T	C	2438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=40;NR=38;PP=1326;SC=AGCACAGCGATTCATTATGCT;SOR=0.855;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=40;TCR=38;TR=78;WE=60678358;WS=60678340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr15	60689877	rs12904258	A	G	147.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=3;PP=176;SC=AGGGCTTCTTAGAGAAGCCCG;SOR=1.329;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=9;WE=60689885;WS=60689867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	60689927	rs12904756	G	C	193.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=8;NR=2;PP=194;SC=CCGGCCCGAGGGCCGGTGGCC;SOR=1.863;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=60689935;WS=60689917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	60689995	rs12904906	G	T	1069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.09;SOR=0.843;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr15	60690089	rs12904657	A	G	1406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=25;NR=22;PP=707;SC=CAGCGTCTCCACACCCCGCTA;SOR=0.808;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=25;TCR=22;TR=47;WE=60690097;WS=60690079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr15	60724118	rs12437617	C	G	774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=13;PP=368;SC=AGCAAAATGCCTAAAAAATAC;SOR=1.071;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=12;TCR=13;TR=25;WE=60724126;WS=60724108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr15	60724317	.	T	TA	51	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.6;FR=0.9998;HP=6;HapScore=2;MGOF=15;MMLQ=26;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=51;QD=47.0;SC=ATACAAAAAATCTGAAACTTA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=60724325;WS=60724307;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr15	60728246	rs34160342	T	C	536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=2;PP=387;SC=AGACTAAAAGTCTTGAAAATA;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=60728254;WS=60728236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	60740915	rs1901993	C	T	443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=340;SC=ATCAATAGATCGAAAAAATGA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=60740923;WS=60740905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	60759011	rs12907068	A	G	434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=11;PP=279;SC=TTAAAGAATAATTAAAGTATC;SOR=2.049;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=15;WE=60759019;WS=60759001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	60771289	rs3743267	A	G	3337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=46;NR=57;PP=1912;SC=GCGCGCCCAAAAAAGACCATA;SOR=1.052;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=103;TCF=46;TCR=57;TR=103;WE=60771297;WS=60771279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr15	60771438	rs11389291	G	GC	149.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=4;PP=145;SC=GCAGCGAAGTGCGAGACTGGG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=4;WE=60771446;WS=60771428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	60789798	rs11071539	G	T	3181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=57;NR=57;PP=1892;SC=AGGCTCTTAAGGTAGACACCT;SOR=0.709;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=57;TCR=57;TR=114;WE=60789806;WS=60789788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr15	60795175	rs17270167	G	C	1233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=24;PP=759;SC=GGTGGGTGTCGTGTGCAGTTT;SOR=1.364;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=15;TCR=24;TR=39;WE=60795183;WS=60795165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr15	60824108	rs10851682	T	C	1569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=30;PP=753;SC=CTTATAAAAGTGTTCCCTGAT;SOR=1.460;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=19;TCR=30;TR=49;WE=60824116;WS=60824098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr15	62211450	rs963024	G	A	696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=4;PP=458;SC=CCATTTCTTGGTACACTGAAA;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=21;WE=62211458;WS=62211440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr15	62221592	rs28411984	A	C	318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=205;SC=ATGTTTAAATATAAAAGACTA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=62221600;WS=62221582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	62228696	rs11071641	G	C	199.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=160;SC=TACTGAATTAGTTCATACCAC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=62228704;WS=62228689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	62232796	rs7172838	C	T	359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=2;PP=268;SC=CTATGATCAACGAGAAAAGCC;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=62232804;WS=62232786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	62265019	rs3833020	A	AT	84.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=2;PP=60;SC=AAACTGCATGAAACACTCAAA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=62265027;WS=62265009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	62265507	rs11071645	G	A	263.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=2;PP=204;SC=AAGAGACTCAGAGTCACACTA;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=62265515;WS=62265497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	62304420	rs140372940	GACACAC	G,GAC	509.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=18;NF=0,0;NR=9,9;PP=114,258;SC=TTCAGACTCAGACACACACAC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=9,9;WE=62304433;WS=62304410;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.38,0.62:13
chr15	62325518	rs12917535	A	T	52.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=0;PP=54;SC=TTTTGAGATTAAAAAAAAATT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=62325526;WS=62325508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	62327127	rs2414758	T	C	1665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=14;PP=940;SC=TGTGATGTTATTGAATGGTTA;SOR=1.392;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=37;TCR=14;TR=51;WE=62327135;WS=62327117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr15	62352374	rs11639147	A	G	285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=1;PP=130;SC=GGGGAGTCTCAGGCGGCGCAG;SOR=2.670;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=62352382;WS=62352364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	62456358	rs8040712	A	C	987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=20;PP=601;SC=GCGCCTCCGAACAGGCTCTCC;SOR=1.675;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=30;WE=62456366;WS=62456348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr15	62534764	rs2414766	A	T	542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.14;SOR=2.531;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	62535030	rs1996469	G	A	548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=5;PP=444;SC=AAGCCTGGGCGCTCCTGGGGG;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=18;WE=62535038;WS=62535020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	62539151	rs7402021	T	C	961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=1;PP=492;SC=CATCCACCTCTCTGGCATTCT;SOR=3.912;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=19;WE=62539170;WS=62539141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	62539153	rs59880159	T	TGG	952.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=1;PP=819;SC=TCCACCTCTCTGGCATTCTAA;SOR=3.912;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=18;WE=62539170;WS=62539141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	62539162	rs2955803	A	C	1196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=6;PP=759;SC=CTGGCATTCTAAGCCATCCCC;SOR=2.621;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=31;WE=62539170;WS=62539141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	62539185	rs2945418	T	C	1367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=32;NR=16;PP=864;SC=AGCCCTCTGATGCCAGTCCTG;SOR=1.473;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=32;TCR=16;TR=48;WE=62539193;WS=62539175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr15	62539781	rs2611797	A	G	1625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.40;SOR=0.822;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr15	62936830	rs11852582	C	T	615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=17;PP=485;SC=CTCTCCTGTGCACCTTGCGGA;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=62936838;WS=62936820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	62939440	rs938979	T	C	430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=1;PP=251;SC=ATTATTATCGTGAACATCAGG;SOR=2.049;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=62939448;WS=62939430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	62944448	rs10775179	G	C	290.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=212;SC=TTAACACGCCGAGTTCTGCCT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=62944456;WS=62944438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	62967342	rs1878785	A	G	1814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=22;PP=1071;SC=CACCACATACAGTAACTACCT;SOR=1.211;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=40;TCR=22;TR=62;WE=62967350;WS=62967332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr15	62967395	rs1878784	C	T	2288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=35;PP=1266;SC=TAACTGGTCCCGACCACTGTC;SOR=0.716;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=39;TCR=35;TR=74;WE=62967403;WS=62967385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr15	62967554	rs1878783	T	C	796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=21;PP=469;SC=GTGTTCACCTTGGCCCCTTCT;SOR=1.839;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=30;WE=62967562;WS=62967544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr15	62979016	rs12917611	A	C	260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=8;PP=158;SC=GCAGAGGGCAAGGAGAGCACT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=62979024;WS=62979006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	62989775	rs8034474	T	C	881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=10;PP=472;SC=GTGCCTCTTTTAGTTGGCCTT;SOR=1.542;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=19;TCR=10;TR=29;WE=62989783;WS=62989765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr15	62991210	rs9630428	C	T	671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=16;PP=433;SC=TGAGTCTTTGCCTCTCAGTTG;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=8;TCR=16;TR=24;WE=62991218;WS=62991200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	62994428	rs12594220	G	C	78.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=3;PP=36;SC=CAATCACTCAGGTTCTGATGG;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=62994436;WS=62994418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	63009733	rs938983	A	G	2086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=32;PP=1244;SC=ATGCATGTATATTGCATATGC;SOR=0.801;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=68;TCF=36;TCR=32;TR=68;WE=63009741;WS=63009723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr15	63009804	rs1320191	C	T	2801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=36;PP=1487;SC=CAGCGGCAGCCACACAGACCA;SOR=0.813;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=89;TCF=53;TCR=36;TR=88;WE=63009812;WS=63009794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr15	63014548	rs10775181	A	G	989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=11;PP=500;SC=TCATCTCTCTATAGCCTGGAA;SOR=0.869;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=17;TCR=11;TR=28;WE=63014556;WS=63014538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr15	63030398	rs12900862	T	C	2997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=56;NR=42;PP=1617;SC=TGCTTCTCTCTCTCCACGAAT;SOR=0.728;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=56;TCR=42;TR=98;WE=63030406;WS=63030388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr15	63044379	rs7171264	A	G	1381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=15;PP=792;SC=AATCCAAATAAAGGAGAAAAT;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=24;TCR=15;TR=39;WE=63044387;WS=63044369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr15	63044637	rs7176359	A	G	2140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=44;PP=1301;SC=GTAAGGGGCTAGTCCCGATGC;SOR=1.358;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=30;TCR=44;TR=74;WE=63044645;WS=63044627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr15	63047778	rs8033767	C	T	3139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.340;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=45;PP=1613;ReadPosRankSum=2.052;SC=CAGCCTTGTGCAATGCCTGCC;SOR=0.490;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=108;TCF=62;TCR=46;TR=107;WE=63047786;WS=63047768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,122:0.99:123
chr15	63054439	rs2030040	C	G	737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=10;PP=357;SC=GTCTTCGACCCTGACTTTGAT;SOR=0.976;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=15;TCR=10;TR=25;WE=63054447;WS=63054429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	63055658	rs10152548	T	A	328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=289;SC=GAGGTGACTGTGTCAGGGAGG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=63055666;WS=63055648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	63075920	rs202118499	CTGTGTG	C	773.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.9997;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=5;PP=529;SC=GCGTTTCTCTCTGTGTGTGTG;SOR=1.493;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=5;TCR=5;TR=10;WE=63075933;WS=63075910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	63336099	rs62013181	C	G	1685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.93;SOR=0.787;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr15	63340569	rs62013182	C	T	1573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.23;SOR=1.071;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr15	63340647	rs4374117	A	G	469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=8;PP=217;SC=GGGCGCCGCCATCGCACAGAG;SOR=1.061;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=16;TCF=7;TCR=9;TR=14;WE=63340655;WS=63340637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	63349096	rs4775613	G	A	1504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=32;NR=12;PP=672;SC=CTTCCTATCTGAAATCAGCAT;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=32;TCR=12;TR=44;WE=63349104;WS=63349086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr15	63351687	rs4775614	A	G	1055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=12;PP=690;SC=AAGCCTCACAAGCCACAGCAG;SOR=1.493;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=24;TCR=12;TR=36;WE=63351695;WS=63351677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr15	63351840	rs1071646	C	A	1864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=35;PP=1165;SC=TGAAAGAGGCCAAGCACATTG;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=28;TCR=35;TR=63;WE=63351848;WS=63351830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr15	63353760	rs4774472	C	A	305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=200;SC=TCCTGGAAAACCTAAACATTT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=63353768;WS=63353750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	63363401	rs201620283	C	CATTTTGTTTT,CATTTGTTTT	539.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=2;PP=756;SC=CACATTCTTTCGTTTTGTTTT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=2;WE=63363410;WS=63363391;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:14
chr15	63363402	.	G	A	258	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=9;PP=258;QD=32.5301347275;SC=ACATTCTTTCGTTTTGTTTTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=9;WE=63363410;WS=63363391;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr15	63413997	rs8182083	C	T	651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=7;PP=412;SC=CCGCCCCCTGCCCTTCCCTCC;SOR=1.051;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=13;TCR=7;TR=20;WE=63414005;WS=63413987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	63414083	rs34317102	A	C	837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=14;NR=14;PP=426;SC=GTACCGGCTCATGTCAGCAGT;SOR=0.752;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=14;TCR=14;TR=28;WE=63414091;WS=63414073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr15	63414723	rs189796619	TGG	CTC	785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=2;PP=846;SC=GGGGCCCAGGTGGAGGGGGCG;SOR=2.712;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=13;WE=63414733;WS=63414713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	63433766	rs2729835	G	A	4376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=1.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=63;PP=2453;ReadPosRankSum=1.337;SC=GTTGTGGAAAGGAAACAAACG;SOR=0.771;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=132;TCF=69;TCR=63;TR=131;WE=63433774;WS=63433756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,158:0.99:160
chr15	63434110	rs8468	C	T	109.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=83;SC=TAGAGTATAACTGAATGCAGA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=63434118;WS=63434100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	63449543	rs7170846	A	C	3223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=40;PP=1983;ReadPosRankSum=1.278;SC=TCCGTCCCATATGACTCTCGG;SOR=0.436;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=106;TCF=66;TCR=40;TR=105;WE=63449551;WS=63449533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,117:0.99:118
chr15	63449680	rs2292038	C	G	3222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=61;PP=2055;SC=GATCTGCGCTCGGCATCAACT;SOR=1.015;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=108;TCF=47;TCR=61;TR=108;WE=63449688;WS=63449670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr15	63515946	rs11632192	A	G	31.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=15.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr15	63516266	rs17828874	G	C	773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=17;PP=502;SC=TCAAAACAAGGAAATGCTTAT;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=23;WE=63516274;WS=63516256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	63554824	rs72363505	GTA	G	199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=2;PP=117;SC=ATATATATGTGTATATATATA;SOR=1.609;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=3;WE=63554833;WS=63554814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	63639016	rs2270764	A	G	605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=14;PP=396;SC=TCTTTTCTGAATCCCCGGAGG;SOR=3.056;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=63639024;WS=63639006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	63848805	rs3751043	C	G	1512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=23;PP=990;SC=TTTATTCTTTCACCTGTGGTG;SOR=0.841;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=29;TCR=23;TR=52;WE=63848813;WS=63848795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr15	63922752	rs10851731	T	A	3576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=55;NR=60;PP=1890;SC=CCACATCTTCTATGATTACTC;SOR=0.937;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=115;TCF=55;TCR=60;TR=115;WE=63922760;WS=63922742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr15	63929599	rs71131175	GAT	G	485.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=378;SC=GTGAAAACCTGATATGATTTT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=63929608;WS=63929589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	63932513	rs2228517	G	C	2140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=37;PP=1566;SC=CAGGGTCAGGGAGACAGTTCT;SOR=0.746;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=35;TCR=38;TR=72;WE=63932521;WS=63932503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr15	63935149	rs10519223	A	G	3126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=33;PP=1822;SC=TATAACTACAATATTACCTTT;SOR=1.547;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=65;TCR=33;TR=98;WE=63935157;WS=63935139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr15	63937209	rs2229749	C	G	5521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=97;NR=82;PP=2965;SC=TTGATTCCTGCTCCCACCATC;SOR=0.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=180;TCF=98;TCR=82;TR=179;WE=63937217;WS=63937199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr15	63953153	rs2272209	A	G	1718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=22;PP=1005;SC=AAAATAAAGAAGCTCTCAAAA;SOR=1.143;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=33;TCR=22;TR=55;WE=63953161;WS=63953143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr15	63954029	rs2228511	C	T	2574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=29;PP=1443;SC=ACAGGTAGTACGGATTTCCAC;SOR=1.085;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=52;TCR=29;TR=81;WE=63954037;WS=63954019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr15	63958762	rs1815130	T	C	540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=11;PP=298;SC=CCTAGTATTGTCCAAGTTTAA;SOR=2.833;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=63958770;WS=63958752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	63966513	rs111577041	CA	C	45.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=1.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.43;ReadPosRankSum=0.741;SOR=0.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,9:0.28:32
chr15	63970456	rs2228510	T	C	3216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=52;PP=1631;SC=AGGATACGGATGAGCTGAATA;SOR=0.845;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=106;TCF=54;TCR=52;TR=106;WE=63970464;WS=63970446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr15	63982018	.	T	C	25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=25;QD=29.8856062736;SC=ATACCAGTGTTCAACAGCTAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=63982026;WS=63982008;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr15	63984772	rs11630720	T	C	3294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=56;PP=1672;SC=GCAGCTACAGTGAAGAGACAA;SOR=0.899;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=109;TCF=53;TCR=56;TR=108;WE=63984780;WS=63984762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr15	63988357	rs2255243	C	G	547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=12;NR=5;PP=297;SC=CTCTCCCTTGCCTCCTGTGTG;SOR=1.721;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=17;WE=63988365;WS=63988347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	63998914	rs34366173	CTT	C	314.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.98;QD=31.47;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	64017798	rs11632718	A	G	152.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=4;PP=107;SC=CCGTACTGCAATAAGATACTG;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=64017806;WS=64017788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	64020073	rs9920746	C	T	998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=21;PP=600;SC=GGGACAATTGCTTCAAATGAA;SOR=1.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=11;TCR=21;TR=32;WE=64020081;WS=64020063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr15	64039050	rs8034675	T	C	790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=5;PP=518;SC=GTTGAATATATTGTATAGCTA;SOR=2.226;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=27;WE=64039058;WS=64039040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr15	64039879	rs11631436	G	A	948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=12;PP=503;SC=ACACACGCGCGCGCACACACA;SOR=0.927;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=18;TCR=12;TR=30;WE=64039887;WS=64039869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr15	64048990	rs2271241	T	C	341.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=225;ReadPosRankSum=-0.814;SC=TCTGTGAGTATCAAAGTATAA;SOR=1.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=12;WE=64048998;WS=64048980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,15:0.94:16
chr15	64050300	rs12912999	G	A	1026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=6;PP=725;SC=AAAATACTCAGTATTATTTAA;SOR=2.899;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=32;WE=64050308;WS=64050290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr15	64056437	rs3764186	T	C	2022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=30;PP=1001;SC=GGGAGAGACATATGCATTAAA;SOR=1.134;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=28;TCR=30;TR=58;WE=64056445;WS=64056427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr15	64200675	rs113724599	C	T	785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=4;PP=643;SC=AAGGGAGCCCCGCTGGGCCCA;SOR=3.098;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=27;WE=64200683;WS=64200665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	64214954	rs920762	G	C	702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=297;ReadPosRankSum=0.953;SC=CAGCCTGCCAGAAATTCCTCA;SOR=1.071;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=26;TCF=17;TCR=9;TR=23;WE=64214962;WS=64214944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,29:0.94:31
chr15	64214993	rs920761	G	C	742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=10;PP=429;ReadPosRankSum=1.076;SC=AGCTCTGACAGGGATTCACTG;SOR=1.143;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=31;TCF=19;TCR=12;TR=28;WE=64215001;WS=64214983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,30:0.94:32
chr15	64215375	rs4776669	G	C	4743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=68;PP=2642;SC=ATCCCAGGTCGACCCGAGCCA;SOR=0.778;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=72;TCR=68;TR=140;WE=64215383;WS=64215365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr15	64217094	rs16947584	T	A	1749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.12;SOR=0.917;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr15	64283625	rs7168753	T	C	524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=4;NR=14;PP=313;SC=CCTCGTTTCATGAGCCTGTTT;SOR=2.531;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=18;WE=64283633;WS=64283615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	64365340	rs4622459	C	T	501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=12;PP=310;SC=GAACTTAAACCTGTTTTTGGC;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=16;WE=64365348;WS=64365330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	64367775	rs332234	T	C	576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=9;NR=11;PP=351;SC=AAAACATTAATGCATTCTAAG;SOR=0.776;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=9;TCR=11;TR=20;WE=64367783;WS=64367765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr15	64385851	rs332259	T	C	936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=3;PP=613;SC=TACCATAAACTTCTAGCGCTT;SOR=3.407;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=26;WE=64385859;WS=64385841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	64410484	rs2290117	G	T	956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=17;PP=520;SC=TTTAGATATTGAGGACTGTGT;SOR=1.061;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=32;TCF=15;TCR=17;TR=32;WE=64410492;WS=64410474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr15	64418221	rs2290119	C	G	993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=3;PP=792;SC=GGATGACTTTCAAGATACCAT;SOR=3.477;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=30;WE=64418229;WS=64418211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr15	64418397	rs1130603	G	A	2754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=44;NR=49;PP=1520;SC=TTGTCCCTCCGCCCCCGGAGA;SOR=0.925;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=44;TCR=49;TR=93;WE=64418405;WS=64418387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr15	64418483	rs2290121	C	T	1005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=21;PP=642;SC=AAAATTCACTCACTGTTCAGT;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=12;TCR=21;TR=33;WE=64418491;WS=64418473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr15	64428657	rs2290122	G	A	2939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=51;PP=1763;SC=TGCTTGTTTTGGGAGTACTCT;SOR=0.804;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=51;TCR=51;TR=102;WE=64428665;WS=64428647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr15	64445681	rs34975001	GC	G	738.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=6;PP=611;SC=GGGTGGAGGGGCTTTTTTTTG;SOR=1.402;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=10;TCR=6;TR=16;WE=64445689;WS=64445671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	64448365	rs2253557	C	T	637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=15;PP=406;SC=AAGGTGGAAGCAGGAGGGCAT;SOR=1.802;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=7;TCR=15;TR=22;WE=64448373;WS=64448355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	64675313	rs11635527	C	T	393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=10;PP=251;SC=ATGAATTGCTCGAACTTAGAA;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=64675321;WS=64675303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	64686097	rs374610419	CA	C	2750.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=17;NR=22;PP=1665;SC=TACTGAGAAACAGTGTAAGTT;SOR=1.385;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=43;TCF=20;TCR=23;TR=39;WE=64686105;WS=64686087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr15	64693149	rs11380356	G	GT	222.87	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.63;MQRankSum=0.640;QD=17.14;ReadPosRankSum=-0.990;SOR=0.250;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,11:0.85:13
chr15	64706259	rs2046356	G	A	2438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=30;PP=1412;SC=ACCAATTGTTGCATCCTTTTG;SOR=1.216;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=54;TCR=30;TR=84;WE=64706267;WS=64706249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr15	64710827	rs4776494	T	C	1496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=19;PP=953;SC=TCAGCACCAGTTGCGAATCCA;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=32;TCR=19;TR=51;WE=64710835;WS=64710817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr15	64737103	rs7167394	G	C	205.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=194;SC=ATGGAAAGTAGTATCATCAGA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=64737111;WS=64737097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	64737225	rs7167612	G	A	1147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=15;PP=647;SC=TCAGTCAAGAGTCTGATTCTC;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=20;TCR=15;TR=35;WE=64737233;WS=64737215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr15	64742670	rs7172012	T	A	260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=2;PP=186;SC=CTCAGAGCTTTGAGTTCCTGC;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=64742678;WS=64742660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	64915106	rs525878	C	T	3605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=55;PP=1996;SC=TCTCATCTCCCTGTGAGCAGA;SOR=0.802;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=115;TCF=60;TCR=55;TR=115;WE=64915114;WS=64915096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr15	64972760	.	TTG	T	33	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.4999;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=0;NR=1;PP=33;QD=36.0;SC=GGCATCTCACTTGTGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=1;WE=64972769;WS=64972750;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:3,1:0.25:4
chr15	65033311	rs6494489	C	T	1626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=30;NR=20;PP=816;SC=GGAGGAACTACGGCCCTTCAG;SOR=0.865;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=30;TCR=20;TR=50;WE=65033319;WS=65033301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr15	65040928	rs12911708	C	T	455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=12;PP=338;SC=CACGTTAAATCGGCCTGTCAT;SOR=2.049;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=16;WE=65040936;WS=65040918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	65041622	rs6494493	C	A	3155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=45;PP=1701;SC=TGTTCTCCACCTACTCACGTT;SOR=0.710;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=101;TCF=56;TCR=45;TR=100;WE=65041630;WS=65041612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr15	65054533	rs72744744	C	T	1210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=48;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=8;PP=829;SC=GCCTTGTGCCCCACTAGCTAT;SOR=2.476;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=32;TCR=8;TR=40;WE=65054541;WS=65054523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr15	65054562	rs57945504	T	TG	2888.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=18;PP=2212;SC=TGGGGATGGGTGCTGGAGCAG;SOR=2.043;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=34;TCR=18;TR=52;WE=65054579;WS=65054552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr15	65054571	rs71133474	A	AG	3375.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=24;PP=2200;SC=GTGCTGGAGCAGGCCCAGCCA;SOR=1.561;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=57;TCF=32;TCR=25;TR=55;WE=65054579;WS=65054552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr15	65113493	rs1872592	G	A	4343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=55;PP=2410;SC=GGAGAGGAGCGTGGGGTGCTT;SOR=0.948;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=132;TCF=77;TCR=55;TR=132;WE=65113501;WS=65113483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr15	65116328	rs12899195	A	G	791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=19;NR=7;PP=390;SC=CGCGCAGAGGAAAGCAGCGCG;SOR=1.143;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=26;WE=65116336;WS=65116318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	65140715	rs35048171	C	G	3963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=55;PP=2292;SC=GGACACATCCCTTGTGTGACC;SOR=1.051;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=84;TCR=55;TR=139;WE=65140723;WS=65140705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr15	65204285	rs11071820	G	T	922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=19;NR=18;PP=575;SC=TGGGGCGTCTGTGTGGCTCCG;SOR=0.804;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=19;TCR=18;TR=37;WE=65204293;WS=65204275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr15	65208227	rs1471834	G	A	1018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=10;NR=24;PP=653;SC=AGGGAGGCTCGGGCTCTGTCC;SOR=2.242;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=35;TCF=11;TCR=24;TR=34;WE=65208235;WS=65208217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr15	65209718	rs34503100	G	GTGTC	1726.79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=836;ReadPosRankSum=0.087;SC=CTGTGTGTACGTGTCTGTCTG;SOR=0.693;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=20;WE=65209730;WS=65209708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,42:0.95:44
chr15	65209818	rs2056496	A	G	798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=12;PP=368;SC=GCAGACATTCAGGTGCAGAGT;SOR=0.976;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=10;TCR=12;TR=22;WE=65209826;WS=65209808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	65209880	rs2056497	A	C	184.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=6;PP=132;SC=ATTCTGTTTTACTCCTGTACA;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=65209888;WS=65209870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	65235776	rs34988193	A	G	2453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.860;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=40;PP=1363;ReadPosRankSum=0.096;SC=CCTGAGAGATAAGGTACCTCT;SOR=0.867;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=76;TCF=35;TCR=41;TR=74;WE=65235784;WS=65235766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,89:0.99:90
chr15	65235861	rs35136467	TC	T	426.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.83;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	65236875	rs2414865	T	C	1165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=19;PP=635;SC=TGGCAGTGGCTGTCCGCAGCA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=21;TCR=19;TR=40;WE=65236883;WS=65236865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr15	65242260	rs67821096	C	T	640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=9;NR=14;PP=369;SC=GCAGCAGGGCCCTCCAAGGGC;SOR=1.358;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=9;TCR=14;TR=23;WE=65242268;WS=65242250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	65268979	rs4776255	C	G	135.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=105;SC=GACTCAAACACTGACATTTCT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=65268987;WS=65268969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	65275609	rs111408068	T	TATAA	53.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.85;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr15	65298672	rs4776660	G	A	262.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=186;SC=GGAACAGACCGTAAACATGAC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=65298680;WS=65298662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	65308981	rs12912782	T	A	709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=20;PP=511;SC=CAACTTTTCTTTATGTTCAAA;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=65308989;WS=65308971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	65344035	rs2946676	G	A	260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=8;PP=183;SC=TCACTTAGGGGTCATTGCTGT;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=65344043;WS=65344025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	65350743	rs2232759	C	G	2584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=25;PP=1225;SC=CTGGAGATAACGGCCAAGCAG;SOR=1.022;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=75;TCF=49;TCR=26;TR=74;WE=65350751;WS=65350733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr15	65350968	rs2232758	T	A	1195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=24;PP=676;SC=GGGGTGAAGGTGAGAAGCCCC;SOR=2.247;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=32;WE=65350976;WS=65350958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr15	65351484	rs7175752	C	G	77.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.26;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	65357434	rs2232754	C	T	181.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.55;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=1;PP=76;SC=GTCATCCTGGCGGCTTCTCCC;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=65357442;WS=65357424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	65357491	rs2232753	G	A	812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=17;NR=6;PP=489;SC=CCCACGGGGTGGGTCCCAGGA;SOR=1.765;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=23;WE=65357499;WS=65357481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	65369951	rs2919359	A	G	3884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=66;NR=50;PP=1789;SC=TCGGCGGCGAATTCCAGAGGA;SOR=0.762;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=66;TCR=50;TR=116;WE=65369959;WS=65369941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr15	65370353	rs2919360	T	C	3754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=65;PP=1991;SC=TGGTGCGCGGTGACACCGTCT;SOR=1.027;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=58;TCR=66;TR=123;WE=65370361;WS=65370343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr15	65370652	rs12901617	T	C	315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=9;PP=281;SC=ACACCCAGGTTTGGTGCCTTC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=65370660;WS=65370642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	65449169	rs2946670	C	T	3553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=47;PP=1904;SC=GAACAAAATACTCAACTGCTT;SOR=0.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=60;TCR=47;TR=107;WE=65449177;WS=65449159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr15	65477364	.	AC	A	178.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.484;ClippingRankSum=0.000;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.52;ReadPosRankSum=1.276;SOR=0.673;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,15:0.21:71
chr15	65489128	rs938952	C	T	2548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=41;NR=39;PP=1317;SC=ACCACTCCACCCTGGCGCTGG;SOR=0.799;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=41;TCR=39;TR=80;WE=65489136;WS=65489118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr15	65489688	rs2679117	T	C	5448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=2.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=100;NR=75;PP=2758;ReadPosRankSum=-0.701;SC=CCCCACTGTCTGCCGATGAGT;SOR=0.333;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=176;TCF=101;TCR=75;TR=175;WE=65489696;WS=65489678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,208:1.00:209
chr15	65490901	rs2679118	T	C	3853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=55;PP=2342;SC=GTGATGGGCTTTTTCCGACGA;SOR=0.814;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=121;TCF=66;TCR=55;TR=121;WE=65490909;WS=65490891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr15	65494212	rs2073711	A	G	732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=2;PP=516;SC=AGGCTTACCTATGACAATCAG;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=65494220;WS=65494202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	65495820	rs2072048	A	G	545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.98;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	65495827	rs2073707	A	G	546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.06;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	65496475	rs2585035	T	G	300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.52;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=1;PP=176;SC=GATAATATAGTGCCATGTGGG;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=65496483;WS=65496465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	65496587	rs2585034	C	T	2385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=21;PP=1262;SC=ACCAGCCCTACCCCAAAGAAT;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=50;TCR=21;TR=71;WE=65496595;WS=65496577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr15	65497849	rs2681038	A	G	1149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=26;PP=723;SC=CTCTTGAGGGAACTCTGTCAG;SOR=1.455;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=14;TCR=26;TR=40;WE=65497857;WS=65497839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr15	65621857	rs509652	T	C	2195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=45;NR=28;PP=1308;SC=CATTTAGGGCTAGAATGCCAG;SOR=0.995;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=74;TCF=45;TCR=29;TR=73;WE=65621865;WS=65621847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr15	65624228	rs686739	G	C	2723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=53;NR=29;PP=1468;SC=TCCAGGCCCCGCTTTCCCTGC;SOR=1.298;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=53;TCR=29;TR=82;WE=65624236;WS=65624213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr15	65667724	rs666623	A	G	372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=8;PP=200;SC=ATGCCAGTTCAGCAGAGTGGC;SOR=1.765;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=12;WE=65667732;WS=65667714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	65688554	.	GC	G	69.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.81;ReadPosRankSum=0.393;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr15	65782451	rs60062953	A	AT	406.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=1;PP=406;SC=AAGATTTAGAACTGTGCACTT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=65782459;WS=65782441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	65792839	rs11071846	G	A	797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=1;PP=604;SC=CTTTGTTGGTGGGTAAACTGA;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=65792847;WS=65792829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	65804213	rs352478	C	T	162.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=127;SC=ACATATTTAACATAGGCAGAC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=65804221;WS=65804203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	65804537	rs352477	A	T	169.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=134;SC=GTCACTGATTAATTTATTCAT;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=65804545;WS=65804527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	65822777	rs452306	C	T	201.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=2;PP=163;SC=AGGCCCGCTGCTGGCGCCGCC;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=65822785;WS=65822769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	65822823	rs422390	C	G	805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=6;PP=560;SC=GCGCGGCCCGCGAGCGTGGGG;SOR=2.066;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=25;WE=65822831;WS=65822813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr15	65994733	rs17810074	C	T	4344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=61;PP=2381;SC=GACAGACTTTCACATAAGCTG;SOR=0.879;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=140;TCF=79;TCR=61;TR=140;WE=65994741;WS=65994723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr15	66161723	rs12909265	G	C	575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=2;PP=391;SC=CACCGCCCTTGTTGGGCTCAG;SOR=2.948;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=66161731;WS=66161713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	66257236	rs36088570	C	CA	149.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=1;PP=30;SC=CGCCCATTCCCAGCTCATACC;SOR=1.022;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=2;TCF=1;TCR=1;TR=2;WE=66257244;WS=66257226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	66257408	rs333550	T	C	1133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=18;PP=559;SC=GCAGTCACAGTGCTGTGAGCA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=20;TCR=18;TR=38;WE=66257416;WS=66257398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr15	66273081	rs113207474	C	T	2043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=25;PP=1007;SC=GCTCAGCCCTCCAGTGCCCCA;SOR=0.914;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=41;TCR=25;TR=66;WE=66273089;WS=66273071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr15	66274690	rs551474	T	C	834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=13;PP=362;SC=GGGTGCCAGGTGCGCAGAGCT;SOR=0.818;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=14;TCR=13;TR=27;WE=66274698;WS=66274680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr15	66601254	rs8025589	G	T	476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=13;PP=323;SC=AGATCCCTTTGGTAACACAGA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=66601262;WS=66601244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	66604032	rs28616181	C	T	720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.74;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr15	66612818	rs750295	A	C	281.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=8;NR=0;PP=203;SC=CTTGGAACCCAGTATTGTTTG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=66612826;WS=66612808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	66618342	rs3803412	A	G	4968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=88;NR=79;PP=2838;SC=AAAGACTTGGATGAGAAGAGC;SOR=0.704;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=167;TCF=88;TCR=79;TR=167;WE=66618350;WS=66618332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr15	66629666	rs28537939	C	A	36.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr15	66644521	rs9806123	C	G	1937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.84;SOR=0.832;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr15	66645341	rs28614039	A	G	1039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=16;PP=542;SC=AATAGTCTCCACTATATAGAC;SOR=1.022;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=15;TCR=16;TR=31;WE=66645349;WS=66645331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr15	66694431	rs16949879	A	G	276.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=198;SC=TGTGGTTACTACATTGTTCCA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=66694439;WS=66694421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	66727597	rs16949924	G	C	1128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.54;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr15	66735551	rs6494573	C	T	1155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=25;NR=14;PP=647;SC=CAGCCACAGCCGAAAGTTATC;SOR=1.312;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=25;TCR=14;TR=39;WE=66735559;WS=66735541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr15	66745890	rs7169326	G	A	1945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=26;PP=1011;SC=CAGTGAGTAGGTGATTCCTGG;SOR=0.721;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=31;TCR=26;TR=57;WE=66745898;WS=66745880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr15	66792761	rs28706938	A	G	2430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=40;PP=1343;SC=AATCAACCAAAGAACAGGAAG;SOR=0.929;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=40;TCR=40;TR=80;WE=66792769;WS=66792751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr15	66793480	rs11071895	C	T	1421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=15;PP=679;SC=AGCCTGTATTCCAACAAAAGA;SOR=0.813;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=25;TCR=15;TR=40;WE=66793488;WS=66793470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr15	66793677	rs12101954	G	C	1681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=34;PP=1203;SC=GACTTGCAGAGTATACCTAGT;SOR=1.316;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=22;TCR=34;TR=56;WE=66793685;WS=66793667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr15	66795937	rs28673176	C	T	2909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=37;NR=53;PP=1575;SC=CATACGCCAACAATACCATTA;SOR=1.308;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=90;TCF=37;TCR=53;TR=90;WE=66795945;WS=66795927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr15	66795980	rs8043062	A	G	1504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=36;PP=1033;SC=TGGTATGGTGAGGCAAACAAC;SOR=2.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=10;TCR=36;TR=46;WE=66795988;WS=66795970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr15	66796911	rs139436991	GC	G	85.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=0;PP=47;SC=TTCCACTACTGCTTCCCGGCG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=66796919;WS=66796904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	66806308	rs4238406	C	T	1718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=22;PP=896;SC=TAATGTTGCTCGATACCTGTT;SOR=1.000;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=36;TCR=22;TR=58;WE=66806316;WS=66806298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr15	66806517	rs4420479	G	A	124.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=3;PP=54;SC=AATCAGCATCGGTGAAAATGA;SOR=1.981;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=66806525;WS=66806507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	66815908	rs28509265	A	G	233.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=1;PP=150;SC=TCCTTTATGAAATATATTTTT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=66815916;WS=66815898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	66816183	rs6494579	C	G	386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=11;PP=307;SC=CTCAAAACTTCTTCAGATGTT;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=66816191;WS=66816173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	66821174	rs6494580	G	C	2501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=32;PP=1453;SC=TTCTCTGAAGGTTGCTTCTTT;SOR=0.982;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=45;TCR=32;TR=77;WE=66821182;WS=66821164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr15	66824526	rs4488397	A	T	386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=223;SC=CTTCTCTTTTACTTGTTGGGT;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=66824534;WS=66824516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	66874670	rs8041988	C	T	1858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.46;SOR=0.720;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr15	66976149	rs2414910	G	T	102.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=3;NR=2;PP=52;SC=TCCAAAGGGAGCTCTGTCCCA;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=5;WE=66976157;WS=66976139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	67008708	rs2278603	G	A	2335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=27;PP=1362;ReadPosRankSum=1.111;SC=GAAGAAAAAAGAGAGCGCTGC;SOR=0.427;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=76;TCF=49;TCR=27;TR=75;WE=67008716;WS=67008691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,89:0.99:90
chr15	67009941	rs2469123	C	G	1115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=26;PP=724;SC=CTGCTCATGGCTGCCTGGCCA;SOR=1.666;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=11;TCR=26;TR=37;WE=67009949;WS=67009931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr15	67234251	rs266383	A	G	3311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=54;PP=1899;SC=TTCACCCAGAACAGTTTCTCC;SOR=0.742;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=57;TCR=54;TR=111;WE=67234259;WS=67234241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr15	67391394	rs5813427	GT	G	2857.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=8;NR=29;PP=1484;SC=CCTTTCTGTGGTTGCCGCCCT;SOR=0.744;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=41;TCF=8;TCR=33;TR=37;WE=67391402;WS=67391384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr15	67391497	rs1866319	C	A	476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=12;PP=345;SC=CTCTTGTTCACAGTCACAGGG;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=67391505;WS=67391487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	67430223	rs1866318	T	C	633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=5;PP=394;SC=TTGGATTTCTTCTGTCTGGGT;SOR=1.426;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=20;WE=67430231;WS=67430213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr15	67457335	rs1065080	A	G	1859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=17;PP=885;SC=ACCACGAGCTACGGGCCATGG;SOR=0.990;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=34;TCR=17;TR=51;WE=67457343;WS=67457325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr15	67457485	rs2289261	G	C	1540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=23;PP=1005;SC=ACCTCTCCCCGGCTCCCCATC;SOR=0.931;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=29;TCR=23;TR=52;WE=67457493;WS=67457475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr15	67459013	rs7179893	C	T	133.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=103;SC=CCTACAGCCACGGATGCTAGC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=67459021;WS=67459011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	67528374	rs7173826	T	G	4496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=66;NR=76;PP=2309;SC=CCATGTTTGATGCACCATTCT;SOR=0.996;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=142;TCF=66;TCR=76;TR=142;WE=67528382;WS=67528364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr15	67596815	rs10438290	T	G	1024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=21;PP=581;SC=GTTGTTTTAATGAGCTCTTAT;SOR=1.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=10;TCR=21;TR=31;WE=67596823;WS=67596805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr15	67692502	rs7495023	T	C	3799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=64;NR=54;PP=2251;SC=AAATACAGCGTTGGCTCTTTA;SOR=0.767;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=118;TCF=64;TCR=54;TR=118;WE=67692510;WS=67692492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr15	67768151	rs3985641	G	C	2408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=45;NR=38;PP=1336;SC=TGGCTATGATGTTGAGGTATG;SOR=0.737;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=45;TCR=38;TR=83;WE=67768159;WS=67768141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr15	67782440	rs10574862	AGGAAAT	A	3474.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=38;PP=2282;SC=CAATAAGCTAAGGAAATAGAC;SOR=1.329;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=43;TCF=4;TCR=39;TR=41;WE=67782453;WS=67782430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr15	67814542	rs62015089	G	A	613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=13;PP=347;SC=ACTGTCACTAGGTGTTTATTT;SOR=2.636;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=16;WE=67814550;WS=67814532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	67842286	.	A	G	989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=24;NR=9;PP=626;SC=AATCTTTCCCAGGTTCTCATA;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=33;WE=67842294;WS=67842276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr15	67842526	rs6494670	G	A	1079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=24;PP=725;ReadPosRankSum=-0.785;SC=GATTATTTATGACCATCATAT;SOR=0.859;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=36;TCF=11;TCR=25;TR=35;WE=67842534;WS=67842516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,38:0.97:39
chr15	67885058	rs28637534	T	C	255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=2;PP=133;SC=TTATTGCTTTTGATTACTAAC;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=67885066;WS=67885048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	67892991	rs60932739	AC	A	6303.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=85;PP=2965;SC=ACAGCATGACACCCTTTTTGT;SOR=0.959;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=100;TCF=13;TCR=87;TR=96;WE=67892999;WS=67892981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr15	67951228	rs5813451	GA	G	1789.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=37;PP=766;SC=AACTTCTTCTGAAAAAAAAAT;SOR=1.751;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=2;TCR=41;TR=39;WE=67951236;WS=67951218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr15	67962763	rs35395156	A	G	1129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=13;PP=636;SC=TTTAGCAAACAAAGACCTGTG;SOR=1.055;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=25;TCR=13;TR=38;WE=67962771;WS=67962753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr15	67984705	rs4343227	G	A	2715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=30;PP=1713;SC=ATTTCGGATTGAGCAGATGAT;SOR=1.563;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=61;TCR=30;TR=91;WE=67984713;WS=67984695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr15	67985931	rs8034680	T	C	663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=16;PP=344;SC=GCAAAAATAATGTTTAAAACC;SOR=1.528;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=9;TCR=16;TR=25;WE=67985939;WS=67985921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr15	68040864	rs12592919	G	A	1662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=23;PP=829;SC=TAAAGATATTGCATAGAGGCT;SOR=0.822;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=33;TCR=23;TR=56;WE=68040872;WS=68040854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr15	68041070	rs8037011	A	G	218.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=1;NR=6;PP=133;SC=GCTCTGAGCTATGTTACGTGA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=68041078;WS=68041060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	68112037	rs2127164	C	T	2825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=30;PP=1371;SC=GCGCTGGTCTCACCTATGATC;SOR=0.987;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=59;TCR=30;TR=89;WE=68112045;WS=68112027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr15	68112096	rs2127165	A	G	2372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=44;NR=37;PP=1222;SC=ACGGCCTCCCACCAAATCCGG;SOR=0.782;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=81;TCF=44;TCR=37;TR=81;WE=68112104;WS=68112086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr15	68112152	rs2127166	G	C	1330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=25;PP=810;SC=AGTGAGGTGGGCCCGGAGCTC;SOR=1.298;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=18;TCR=25;TR=43;WE=68112160;WS=68112142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr15	68119741	rs80000622	G	A	2342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=48;PP=1488;SC=CGGCGGCAGCGGCAGCTGCTG;SOR=2.272;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=18;TCR=48;TR=66;WE=68119749;WS=68119731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr15	68120014	rs62015251	C	T	2819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=50;NR=37;PP=1383;SC=GGGAGGCGTACGGCGCGGGGC;SOR=0.811;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=50;TCR=37;TR=87;WE=68120022;WS=68120004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr15	68121483	rs7183168	A	C	1956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.44;SOR=0.992;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr15	68124853	rs12901293	G	C	857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=22;NR=4;PP=588;SC=GTGGGAGTTGGGGGTAGGGGT;SOR=3.258;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=26;WE=68124861;WS=68124843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr15	68346549	rs11855475	T	C	278.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=0;PP=243;SC=GGGCGGAGGCTAGAGGCGGGC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=10;WE=68346557;WS=68346539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	68349914	.	AGT	A	354.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=305;SC=AGTTACTATGAGTGTGTCAGT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=7;WE=68349923;WS=68349904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	68445912	rs11633620	T	A	1120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.91;SOR=1.154;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr15	68468695	rs12438361	T	C	676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=6;PP=458;SC=GGTTTTCTACTCTCTGGCTCC;SOR=2.124;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=23;WE=68468703;WS=68468685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	68581898	rs143456679	T	C	218.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=166;SC=AAACATATGTTAGGCTGTGGC;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=68581906;WS=68581888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	68583175	rs6494729	T	C	5204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=89;NR=81;PP=2965;SC=TGGCTGTCAATTCCAATACTC;SOR=0.703;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=170;TCF=89;TCR=81;TR=170;WE=68583183;WS=68583165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr15	68603625	rs898591	C	T	909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=18;NR=14;PP=534;SC=AGGCCATCACCACCTCGTCCG;SOR=0.941;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=18;TCR=14;TR=32;WE=68603633;WS=68603615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr15	68609833	rs1516871	T	C	345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=9;PP=214;SC=TATGAAAGCCTGGACCACAGC;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=68609841;WS=68609823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	68612385	rs35808090	C	A	372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=0;PP=264;SC=ACCTCAGCCTCCCAAAGTGCT;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=68612393;WS=68612375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	68618961	rs2271722	T	C	1507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=34;NR=16;PP=811;SC=CTATAGGAGCTTGGGCTCTGC;SOR=1.262;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=34;TCR=16;TR=50;WE=68618969;WS=68618951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr15	68624175	rs7167822	C	T	654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=2;PP=526;SC=TTGCTCCATCCGCTTCCCCAG;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=68624183;WS=68624165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	68624396	rs7168069	A	C	1874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=36;PP=1015;SC=ATAAACAAACAGGTTCTGCAA;SOR=1.308;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=23;TCR=36;TR=59;WE=68624404;WS=68624386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr15	68624641	rs6494733	A	C	5247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=97;NR=80;PP=2965;SC=GGTTGGGGGCACCTGAGAAGC;SOR=0.856;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=178;TCF=97;TCR=81;TR=177;WE=68624649;WS=68624631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr15	68628143	rs2306023	C	T	3086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=52;NR=52;PP=1685;SC=CCACGTACACCCGCCCCTGCC;SOR=0.818;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=52;TCR=52;TR=104;WE=68628151;WS=68628133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr15	68631740	rs2125998	A	G	292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=0;PP=221;SC=GAATATACACAGCAGGCCCCT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=11;WE=68631748;WS=68631732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	68641362	rs61119953	AG	A	399.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=13;PP=343;SC=CTCTCTTTCGAGGGGGGGCTC;SOR=2.985;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=13;WE=68641370;WS=68641352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	68656864	rs2306013	A	G	158.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=2;PP=97;SC=CCGGAATGGCATAAGCAGGGA;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=68656872;WS=68656854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	68656960	rs2306012	A	G	821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=11;PP=475;SC=CAGGATGGACATGAGGGTGTG;SOR=1.112;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=17;TCR=11;TR=28;WE=68656968;WS=68656950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr15	68724262	rs2305078	G	C	1000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=16;PP=479;SC=CTGGGAGGAGGGTCGCGTCCC;SOR=0.798;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=19;TCR=16;TR=35;WE=68724270;WS=68724252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr15	68987315	rs11072043	A	C	171.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=2;PP=113;SC=TGTGGCCCAGACTGACTTGGC;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=68987323;WS=68987305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	68987341	rs7359311	A	G	248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=7;NR=3;PP=168;SC=AGGGCCCAAAAACAAAAATAA;SOR=1.609;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=10;WE=68987349;WS=68987331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	69003871	rs3736272	G	T	845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=21;NR=5;PP=444;SC=CCATGCATCTGCCCTCGCAGG;SOR=1.473;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=26;WE=69003879;WS=69003861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr15	69007656	rs1542746	T	G	3337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=67;PP=2028;SC=CCTAGGTAAGTGGCCCCGAGG;SOR=1.057;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=117;TCF=50;TCR=67;TR=117;WE=69007664;WS=69007646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr15	69011389	rs1491640	A	C	2187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.58;SOR=2.400;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr15	69011394	rs1491639	C	T	2322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.23;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr15	69112971	rs35802209	G	GCA	656.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.80;MQRankSum=0.692;QD=25.26;ReadPosRankSum=-0.997;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,22:0.85:26
chr15	69238445	rs3743093	G	A	4291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=69;PP=2462;SC=ACTGGCATTGGGATCTCTACA;SOR=0.952;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=130;TCF=61;TCR=69;TR=130;WE=69238453;WS=69238435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr15	69325581	rs311893	C	T	3735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=57;PP=1858;SC=CCAAGGGCTGCGGCCAGTGCC;SOR=0.707;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=122;TCF=65;TCR=57;TR=122;WE=69325589;WS=69325571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr15	69327825	rs311889	C	T	3355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=48;NR=60;PP=1806;SC=TCGTGCACACCGTGGCTCACA;SOR=1.039;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=48;TCR=60;TR=108;WE=69327833;WS=69327815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr15	69328226	rs12907196	C	T	1869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.97;SOR=0.749;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr15	69329623	rs34924807	GA	AG	556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=10;PP=529;SC=GGAGCAGCTGGATACCCTGTC;SOR=2.147;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=69329632;WS=69329613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	69347593	rs311905	G	A	344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=201;SC=AAGCCCCAGGGTAAGGTAGTG;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=69347601;WS=69347583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	69349087	rs311906	T	C	911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=14;NR=13;PP=376;SC=TCTGCTTCATTGCATTAGTAT;SOR=0.869;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=14;TCR=13;TR=27;WE=69349095;WS=69349077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr15	69561518	rs3865014	G	A	3244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=50;NR=37;PP=1481;SC=TGAGTCCCCAGTCTTCAAAGA;SOR=0.727;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=50;TCR=37;TR=87;WE=69561526;WS=69561508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr15	69676892	.	A	G	204	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;FR=1.0000;HP=1;HapScore=4;MGOF=17;MMLQ=24;MQ=49.96;NF=10;NR=0;PP=204;QD=23.8771212547;SC=CGTGTTCATCATGGAGGGTGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=69676912;WS=69676882;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	69676904	.	C	T	261	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;FR=1.0000;HP=4;HapScore=4;MGOF=17;MMLQ=17;MQ=51.11;NF=11;NR=2;PP=261;QD=22.7516317344;SC=GGAGGGTGAGCGGGCCCTCCG;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=69676912;WS=69676882;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	69676944	.	T	C	619	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MMLQ=24;MQ=57.06;NF=24;NR=8;PP=619;QD=20.4303503921;SC=GCGGGTCCTCTGTGTTCATGG;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=32;WE=69676952;WS=69676934;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,32:0.97:33
chr15	69683945	rs2242464	C	G	2146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=20;PP=1358;SC=AACCTGGACACTCTTGGACCT;SOR=1.842;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=69;TCF=49;TCR=20;TR=68;WE=69683953;WS=69683935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr15	69684376	rs7183388	G	A	998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=23;NR=16;PP=645;SC=AGCCCGGGCAGTGGAGCCAAG;SOR=1.096;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=23;TCR=16;TR=39;WE=69684397;WS=69684366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr15	69684389	rs11634798	A	T	1339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=29;NR=22;PP=745;SC=GAGCCAAGAAAAAAAAGAAAT;SOR=0.846;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=29;TCR=22;TR=51;WE=69684397;WS=69684366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr15	69684477	rs58280155	T	A	956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=16;PP=473;SC=GCTGGTTTTATTTTATTTTTT;SOR=1.209;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=13;TCR=16;TR=29;WE=69684489;WS=69684467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr15	69684481	rs112633523	AT	A	613.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=13;PP=266;SC=GTTTTATTTTATTTTTTTTTG;SOR=1.358;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=15;WE=69684489;WS=69684467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	69684507	rs11634850	A	G	543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=10;PP=347;SC=AGTAGAGACAAGGTTTCGCCA;SOR=1.292;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=7;TCR=10;TR=17;WE=69684515;WS=69684497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	69709686	rs3759825	G	A	2541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=22;PP=1440;SC=GCAAAAGGTCGAACTTTCTTC;SOR=1.440;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=57;TCR=22;TR=79;WE=69709694;WS=69709676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr15	69714638	.	AT	A	41.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.249;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=7.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.67;ReadPosRankSum=-1.717;SOR=0.048;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,7:0.28:25
chr15	69715488	rs7180624	C	T	52.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=0;PP=65;SC=TTGAACTTTTCTTTTTTTAGA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=2;WE=69715496;WS=69715478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr15	69728949	rs3825858	A	G	4175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=59;PP=2256;SC=CACCTTTGCCATCATGCGAAA;SOR=0.908;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=139;TCF=80;TCR=59;TR=139;WE=69728957;WS=69728939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr15	69732483	rs4776448	G	A	2296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=54;PP=1574;SC=AGTTAGGTTCGATATTTTGAA;SOR=1.697;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=26;TCR=54;TR=80;WE=69732491;WS=69732473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr15	69732736	rs937724	C	T	4212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=64;PP=2160;SC=CTATTGTTACCGAACCTAAAA;SOR=0.798;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=138;TCF=73;TCR=65;TR=137;WE=69732744;WS=69732726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr15	69740350	rs13613	A	G	532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=15;PP=387;SC=CTTGTATAGTATATGTTTTGC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=69740358;WS=69740340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	69747675	rs1463911	A	T	1406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=23;PP=754;SC=GAGATTTTTTAAAAAATAGTA;SOR=0.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=26;TCR=23;TR=49;WE=69747683;WS=69747665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr15	69754221	rs8041861	T	C	4891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=87;NR=73;PP=2190;SC=CAATGATGAATGGAACCAGAA;SOR=0.725;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=160;TCF=87;TCR=73;TR=160;WE=69754229;WS=69754211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr15	69857737	rs16953470	A	G	1814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=20;PP=1121;SC=AAAAATATACAATGCCTCCAA;SOR=1.576;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=42;TCR=20;TR=62;WE=69857745;WS=69857727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr15	70350457	rs2291982	C	G	1882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=26;PP=1078;SC=CCCCCTCCCCCCAATCAGATT;SOR=0.869;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=37;TCR=26;TR=63;WE=70350465;WS=70350447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr15	70351788	rs2133977	T	C	4608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=81;NR=70;PP=2653;SC=CACTCTTGTCTCCATCACTGT;SOR=0.716;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=151;TCF=81;TCR=70;TR=151;WE=70351796;WS=70351778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr15	70352968	rs2228176	C	G	3939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=77;NR=59;PP=2207;SC=GGAGGCTTTCCGAGGGTGACA;SOR=0.861;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=77;TCR=59;TR=136;WE=70352976;WS=70352958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr15	70353075	rs3825968	C	A	3177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=51;PP=1898;SC=GCAGGTGACACGGAGGTCAGG;SOR=0.899;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=100;TCF=49;TCR=51;TR=100;WE=70353083;WS=70353065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr15	70368571	rs3830411	A	ATGC	1659.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=26;PP=1434;SC=GCAAGTGGAAATGCAAACTCC;SOR=2.554;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=27;WE=70368579;WS=70368561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr15	70371571	rs12901770	A	T	248.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=204;SC=AATGCCACACAGATGCAGAAC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=70371579;WS=70371564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	70387560	rs12441129	A	C	195.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=6;NR=0;PP=129;SC=GATTTTTACCAACCCTAATTT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=70387568;WS=70387550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	70388449	rs71149952	AG	A	1645.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=12;PP=1017;SC=GGAGCCGCGCAGGGGACCCAC;SOR=1.755;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=31;TCF=16;TCR=15;TR=27;WE=70388457;WS=70388439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr15	70971741	rs67256203	CTAAA	C	232.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=5;NR=0;PP=245;SC=GACCCCATCTCTAAATAAATA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=70971752;WS=70971731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	71175296	rs1528828	A	G	770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=20;PP=524;SC=ACCTTATAGGATTTTATCTTT;SOR=1.942;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=28;WE=71175304;WS=71175286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr15	71186811	rs1881568	C	G	573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=1;PP=456;SC=AAGATTATTTCCCCATAATGT;SOR=5.784;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=71186819;WS=71186801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	71434029	rs2004101	T	A	66.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=3;PP=45;SC=ATACGTCCACTTGTGTAAAAG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=71434037;WS=71434019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	71507764	rs12324441	G	C	2454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=44;NR=36;PP=1322;SC=TGTCTGTGCCGCTCCCCGTCC;SOR=0.736;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=44;TCR=36;TR=80;WE=71507772;WS=71507754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr15	71535458	rs12440013	G	C	1348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=40;PP=976;SC=AACCCATACCGGGCCTGGAAA;SOR=3.126;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=7;TCR=40;TR=47;WE=71535466;WS=71535448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr15	72040774	rs1872056	C	T	3938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=52;PP=2122;SC=CGGTGCCCTGCGGCGTGGGAC;SOR=1.012;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=73;TCR=52;TR=125;WE=72040782;WS=72040764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr15	72050163	rs2625533	C	G	930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=9;PP=607;SC=AGCATTCCATCCTCCTTTCCA;SOR=1.542;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=31;WE=72050171;WS=72050153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr15	72105928	rs11351249	AC	A	2393.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=22;PP=1515;SC=TTGGCGGTGGACCCCCACGGA;SOR=1.164;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=50;TCF=21;TCR=29;TR=42;WE=72105936;WS=72105918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr15	72186286	rs2128112	A	T	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=2;PP=25;SC=ATAATCCTGAACCTACGCATA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=72186294;WS=72186276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr15	72191073	rs2415128	T	C	4063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=56;PP=2369;SC=CCTCCAAGGATCTGGGTCTCT;SOR=0.734;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=71;TCR=56;TR=127;WE=72191081;WS=72191063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr15	72191266	rs2415129	C	T	3716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=52;PP=2028;SC=ATCCTCCCATCCTGAAGGGTC;SOR=0.738;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=113;TCF=61;TCR=52;TR=113;WE=72191274;WS=72191256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr15	72300031	rs3759820	A	C	170.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=108;SC=TCTTTTGGAAATGCTATTTAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=72300039;WS=72300026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	72302894	rs2957742	G	C	76.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.43;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	72432583	rs930871	A	G	2324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=47;PP=1414;SC=AGATCTCATTACCACACTTGC;SOR=1.259;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=33;TCR=47;TR=80;WE=72432591;WS=72432573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr15	72454729	rs897731	C	G	3177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=52;NR=52;PP=1686;SC=CTGAAGAAAGCGGCAATACGG;SOR=0.910;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=52;TCR=52;TR=104;WE=72454737;WS=72454719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr15	72457551	rs2959944	A	G	185.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=147;SC=GGCAGGTTTAAGAGATGCCCT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=72457559;WS=72457541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	72460339	rs8025939	T	A	646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=19;PP=482;SC=AAACAGTCCATTCCCCAGCGT;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=72460347;WS=72460329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	72462165	rs11072348	A	C	1321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=29;NR=11;PP=779;SC=GTGTGTATCTATGACTGGGAA;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=29;TCR=11;TR=40;WE=72462173;WS=72462155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr15	72462831	rs7182776	T	C	272.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=7;PP=184;SC=GGAGCCGTCTTATACCAGGAA;SOR=2.093;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=72462839;WS=72462821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	72543656	rs2959904	T	C	823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=19;PP=621;SC=AGCTATCCTTTCTGAACAAGC;SOR=1.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=27;WE=72543664;WS=72543646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr15	72545876	rs1426166	T	C	688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=1.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.607;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=10;ReadPosRankSum=-0.742;SC=CGTTATCTCCTTGGAGAGGTG;SOR=1.447;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=18;TCF=8;TCR=10;TR=17;WE=72545884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,25:0.96:26
chr15	72546765	rs2912227	A	G	3160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=46;PP=1705;SC=TGGGCAGGCAAAGGAGAGGGG;SOR=0.781;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=49;TCR=46;TR=95;WE=72546773;WS=72546755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr15	72556799	rs11072352	G	A	1081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=10;PP=814;SC=TTTTGGAAGGGGGCATTCCAT;SOR=1.949;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=25;TCR=10;TR=35;WE=72556807;WS=72556789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr15	72557955	rs1426170	T	C	371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=8;PP=215;SC=GTCTTAGCTATAGCCTTACAC;SOR=2.147;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=72557963;WS=72557945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	72559326	rs62022788	T	G	74.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=2;PP=23;SC=TTTGTGAGAGTCTCAGTCTCT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=72559334;WS=72559316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	72581503	rs138555565	T	G	1329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=31;NR=14;PP=733;SC=AGCCCGTTATTGTAGAGCGTG;SOR=1.157;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=31;TCR=14;TR=45;WE=72581511;WS=72581493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr15	72637795	rs4777502	T	C	3038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.89;SOR=0.822;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr15	72638892	rs1800431	T	C	738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=14;NR=11;PP=364;SC=GGTTCCACTATGTAGAAATCC;SOR=0.760;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=14;TCR=11;TR=25;WE=72638900;WS=72638882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr15	72743458	rs16956956	G	C	1147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=20;PP=555;SC=TCTCCAGGCAGGTGAAGGATG;SOR=1.280;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=17;TCR=20;TR=37;WE=72743466;WS=72743448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr15	72875521	.	GT	G	570.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.354;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=4.783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.92;ReadPosRankSum=-1.872;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,34:0.83:41
chr15	72879653	rs139334001	A	ATTG	1246.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=14;PP=777;SC=TCTTAACTATATTGTACTTTT;SOR=1.071;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=72879661;WS=72879643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr15	72978552	rs56368716	C	T	403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=3;PP=180;SC=GGCCGCGCAGCGGTGGGCTGA;SOR=1.473;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=12;WE=72978560;WS=72978542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	72987588	rs4777527	G	T	1079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.71;SOR=1.005;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr15	73002035	rs8033604	G	A	1079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=15;PP=637;SC=AAAATATGCTGCCTAGCTCCA;SOR=1.127;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=24;TCR=15;TR=39;WE=73002043;WS=73002025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr15	73021855	rs6495015	T	C	520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=16;NR=0;PP=438;SC=CCTCCCAAAGTGCTGGGATTA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=73021863;WS=73021845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	73023937	rs12914333	T	C	3443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=53;PP=2105;SC=TGGCACCCTTTGATTGGAAGA;SOR=0.725;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=111;TCF=58;TCR=53;TR=111;WE=73023945;WS=73023927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr15	73024181	rs9806635	G	A	668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=19;PP=516;SC=TAGAGATCCTGTAGGAATCTG;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=23;WE=73024189;WS=73024171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr15	73027478	rs2277598	T	C	1138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=20;NR=19;PP=642;SC=CTGGAAGATATAGAAAATGCC;SOR=0.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=20;TCR=19;TR=39;WE=73027486;WS=73027468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr15	73028375	rs12324395	G	A	123.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=4;PP=82;SC=ATCAAGCCCAGATCATCCAAA;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=73028383;WS=73028365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	73044575	rs9460	G	A	208.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=1;PP=109;SC=ACCTGATACAGTTTAATCTGC;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=73044583;WS=73044565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	73067234	rs11634630	T	C	4520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=72;PP=2293;SC=GGAACTCTGATGCAACCTGGG;SOR=0.740;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=151;TCF=79;TCR=72;TR=151;WE=73067242;WS=73067224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr15	73408756	rs143744012	CTA	C	263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=284;SC=AGTGAGATGACTATATTTATG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=7;WE=73408765;WS=73408746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	73528937	rs747873	T	C	459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=13;PP=358;SC=TCTGTACCAATTTTTAGTCCA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=73528945;WS=73528927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	73541513	rs3736510	A	G	2756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=48;PP=1663;SC=AGAATTATAAATTGTACTACA;SOR=1.037;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=39;TCR=48;TR=87;WE=73541521;WS=73541503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr15	73545732	rs2623989	T	C	352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=1.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.274;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=11;PP=430;ReadPosRankSum=-1.248;SC=TTTTTTTTTGTTTCTCTAGTT;SOR=0.595;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=27;TCF=16;TCR=11;TR=21;WE=73545740;WS=73545722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,16:0.94:17
chr15	73551250	rs2251205	A	G	1600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=35;PP=1007;SC=CTGGAACACAATAGATACTAG;SOR=1.532;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=17;TCR=35;TR=52;WE=73551258;WS=73551240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr15	73564881	rs1131854	C	T	5025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=81;PP=2615;SC=AGCCTCCCTCCGAAGCCAATG;SOR=0.758;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=163;TCF=82;TCR=81;TR=163;WE=73564889;WS=73564871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr15	73566942	rs497539	G	A	3273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=67;NR=44;PP=1917;SC=GGGGGTTTTAGTTTTTTTCCT;SOR=1.107;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=67;TCR=44;TR=111;WE=73566950;WS=73566932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr15	73595089	rs3833036	T	TA	4150.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.28;NF=5;NR=51;PP=2644;SC=TCTTGGAACTTACCCTTGAAA;SOR=1.129;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=5;TCR=52;TR=56;WE=73595097;WS=73595079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr15	73614834	rs529004	T	C	1738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.57;SOR=1.098;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr15	73616635	rs481579	T	C	927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.07;SOR=0.746;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr15	73622161	rs188079757	T	C	1606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=33;PP=827;SC=GTGGGGACAGTGGATGAGAGG;SOR=1.270;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=24;TCR=34;TR=56;WE=73622169;WS=73622151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr15	74032783	rs28594180	A	G	6032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=110;NR=90;PP=2965;SC=CCGAGGGGGTAGAGACGTCCA;SOR=0.776;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=200;TCF=110;TCR=90;TR=200;WE=74032791;WS=74032773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr15	74033033	rs11858458	A	G	826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=19;PP=504;SC=GGGTCCCTGCATCAGCCAGGT;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=10;TCR=19;TR=29;WE=74033041;WS=74033023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr15	74043523	rs7497362	A	G	600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=18;PP=478;SC=CTGGGCACACACTGCGTCTGC;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=74043531;WS=74043513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	74173668	rs7496005	A	G	1922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=21;PP=1162;SC=AGTCCAGAACATATTATTTAA;SOR=1.516;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=65;TCF=44;TCR=21;TR=65;WE=74173676;WS=74173658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr15	74176453	rs66619071	GA	G	2416.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=25;PP=1541;SC=ATCAGAAGGGGAAAAGCCACC;SOR=1.079;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=48;TCF=20;TCR=28;TR=41;WE=74176461;WS=74176443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr15	74178605	rs2278864	G	T	368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=11;PP=308;SC=ATCATGGGGGGGCTGGAGAGC;SOR=2.147;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=74178613;WS=74178595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	74181255	rs7170803	A	G	434.88	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=280;ReadPosRankSum=1.712;SC=AGCAGGCTGTACTACTTGAGA;SOR=1.292;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=13;WE=74181263;WS=74181245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,15:0.94:16
chr15	74219546	rs1048661	G	T	2019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=42;NR=27;PP=1123;SC=GGCATGGCCCGGGCCCGCACC;SOR=1.051;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=42;TCR=27;TR=69;WE=74219554;WS=74219536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr15	74234171	rs8042181	A	G	842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=4;PP=461;SC=ATTCCAATGCAGAATGGAGTC;SOR=2.235;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=26;WE=74234179;WS=74234161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr15	74238734	rs2304720	T	C	677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=17;NR=14;PP=439;SC=CAACCCCCCCTCATCTCCCCC;SOR=1.101;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=35;TCF=19;TCR=16;TR=31;WE=74238742;WS=74238723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr15	74244278	rs8818	C	G	523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=12;PP=346;SC=CCCACAGGCACGGAGGGGCAT;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=18;WE=74244286;WS=74244268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	74277666	rs34353835	C	T	587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=8;PP=315;SC=CACCTGGCCCCGGGGACGGGG;SOR=0.963;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=13;TCR=8;TR=21;WE=74277674;WS=74277656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr15	74277795	rs10851866	T	C	938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=15;PP=513;SC=CGGCCTCCACTGCCAGCTCCA;SOR=0.804;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=19;TCR=15;TR=34;WE=74277803;WS=74277785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr15	74284406	rs2304715	C	G	1173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=29;NR=10;PP=764;SC=TCCCCCCCGGCTCCGCCGTGC;SOR=1.845;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=39;WE=74284414;WS=74284396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr15	74317043	rs2277599	T	C	476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=12;NR=5;PP=330;SC=TCCTTCCAGCTGCCCCTCCAG;SOR=1.739;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=17;WE=74317051;WS=74317033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	74317362	rs3825941	G	A	151.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=3;PP=76;SC=CAGGGAGAGCGTCTGAGTGAG;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=5;WE=74317370;WS=74317352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	74325182	rs2304716	A	G	420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=11;PP=298;SC=GTGTTTGCTCAACGCCTTCTC;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=74325190;WS=74325172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	74326711	rs2304718	G	A	469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=5;PP=359;SC=CAGGGCATCCGTTTCCCCCAG;SOR=1.863;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=19;WE=74326719;WS=74326701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	74336633	rs5742915	T	C	2682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=54;NR=35;PP=1509;SC=GCCTGAAGCCTTCTTCAGCAT;SOR=0.884;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=90;TCF=54;TCR=36;TR=89;WE=74336641;WS=74336623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr15	74421422	.	G	A	3796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=68;NR=62;PP=2140;SC=GGCGCCTTGCGCCCTCCCCAT;SOR=0.764;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=130;TCF=68;TCR=62;TR=130;WE=74421430;WS=74421412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr15	74466271	rs923118	G	T	212.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=7;PP=173;SC=TTGGGCGCCCGTGGCCCTGCA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=74466279;WS=74466261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	74467796	rs11854957	C	T	4986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=70;PP=2444;SC=TGACCACGGCCGTGTCCATCC;SOR=0.809;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=145;TCF=75;TCR=70;TR=144;WE=74467804;WS=74467786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr15	74468494	rs3848160	C	T	451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=12;PP=303;SC=TAGCCCCACCCAGGGCTTCCC;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=18;WE=74468502;WS=74468484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	74473073	rs12912578	A	G	185.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5564;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=0;PP=127;SC=CATCCTTCCTAGAAGAAGCTG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=74473081;WS=74473063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	74473302	rs12913041	A	G	2743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=47;NR=42;PP=1530;SC=GCGGATGGCAATGCTGGGGGA;SOR=0.773;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=47;TCR=42;TR=89;WE=74473310;WS=74473292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr15	74483415	rs351228	T	C	1524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=27;NR=22;PP=766;SC=ACAAGGATTCTGGGGAGCAGG;SOR=0.762;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=27;TCR=22;TR=49;WE=74483423;WS=74483405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr15	74486444	rs974456	C	T	674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=18;PP=469;SC=TTCCCCTTCTCGAGCCCTGCA;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=74486452;WS=74486434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	74487846	rs971757	G	A	3325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=42;PP=1817;SC=CCATGCTGGAGGGGCAGACAT;SOR=0.924;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=106;TCF=64;TCR=42;TR=105;WE=74487854;WS=74487836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr15	74487969	rs971756	A	T	3125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=53;PP=1790;SC=ACTAGTCTCAACTCTGTGATC;SOR=0.918;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=47;TCR=53;TR=100;WE=74487977;WS=74487959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr15	74488252	rs34147822	T	C	51.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr15	74488424	rs11857410	G	A	1909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=38;NR=19;PP=893;SC=AGGGAGCTCAGGAGGACCATG;SOR=0.934;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=38;TCR=19;TR=57;WE=74488432;WS=74488414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr15	74489883	rs351218	A	G	142.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.6;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=3;PP=53;SC=CACTCATGTGACATCTTGGGG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=74489891;WS=74489873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	74494388	rs12912258	C	T	275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=3;PP=158;SC=AGTGGCAGAGCCAGACCTAGC;SOR=1.802;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=10;WE=74494396;WS=74494378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	74494684	rs34975666	GA	G	3800.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.213;HP=10;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=53;PP=1491;ReadPosRankSum=0.101;SC=GCTTAAAAGAGAAAAAAAAAG;SOR=0.563;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=95;TCF=30;TCR=65;TR=80;WE=74494692;WS=74494674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,146:0.98:149
chr15	74528985	rs351175	T	G	822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=19;NR=8;PP=491;SC=CAGGACTGATTCCTGATCACC;SOR=1.536;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=27;WE=74528993;WS=74528975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	74529130	rs11633321	T	G	1629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=30;NR=26;PP=864;SC=CGTCCCTCCTTCAAAGTCCTT;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=30;TCR=26;TR=56;WE=74529138;WS=74529120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr15	74536400	rs10552820	TAAG	T	4386.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=33;PP=2188;SC=TGTCTCCCTCTAAGAAGGAGA;SOR=1.037;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=53;TCF=14;TCR=39;TR=46;WE=74536410;WS=74536390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr15	74558927	rs440793	A	G	859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=8;PP=503;SC=CCCTACTCTCAACAATGTCTC;SOR=1.751;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=29;WE=74558935;WS=74558917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr15	74560566	rs1038436	C	T	1733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=16;PP=1077;SC=ATTATCAGCTCGGAGCCCCAG;SOR=1.647;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=38;TCR=16;TR=54;WE=74560574;WS=74560556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr15	74572242	rs351165	T	A	291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=2;PP=226;SC=CAAATATCTGTGTATGCCTTG;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=74572250;WS=74572232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	74572917	rs351164	A	G	941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=7;PP=639;SC=GAAAGCAGGCAGCGGGAGACA;SOR=2.115;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=32;WE=74572925;WS=74572907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr15	74588024	rs1484212	T	C	602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=3;PP=455;SC=GGGGTGTAGATGGTGTGCTTA;SOR=2.636;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=74588032;WS=74588014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	74611182	rs751528	A	G	196.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.38;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	74611189	rs751527	T	C	196.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.38;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	74635369	rs4986873	G	A	797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=18;NR=10;PP=378;SC=TGATGTCCTCGAAGGACATCT;SOR=0.818;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=18;TCR=10;TR=28;WE=74635377;WS=74635359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr15	74659535	rs12442401	A	G	198.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.7370;FS=0.000;HP=17;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=8;NR=0;PP=159;SC=AAAAAAAAAAAAAGAAGTTAG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=8;WE=74659543;WS=74659525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	74659609	rs28681535	G	T	1767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=38;NR=18;PP=1052;SC=GGCTACCCAGGCCCCTCCTCC;SOR=1.539;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=57;TCF=39;TCR=18;TR=56;WE=74659617;WS=74659599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr15	74703022	rs2075592	G	A	766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=5;PP=397;SC=AGAGGGAGGCGGCCAGGGCAC;SOR=1.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=22;WE=74703030;WS=74703012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr15	74703929	rs741761	T	C	692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=6;PP=327;SC=TGCAGCGGCCTTGGTCCCAGC;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=21;WE=74703937;WS=74703919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	74706943	rs1046146	G	A	3101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=49;PP=1833;SC=GCATGCGGTGGACGGCCACTT;SOR=0.746;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=54;TCR=49;TR=103;WE=74706951;WS=74706933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr15	74709975	rs2075589	G	A	2660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=45;PP=1465;SC=TGAAGGGGGCGTAGCCTCTCA;SOR=0.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=42;TCR=45;TR=87;WE=74709983;WS=74709965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr15	74710593	rs28362912	C	T	2817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.84;SOR=1.064;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr15	75142761	rs2305668	T	G	1427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=34;NR=13;PP=823;SC=TATTCTGCTCTAAGACTCAGA;SOR=1.697;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=34;TCR=13;TR=47;WE=75142769;WS=75142751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr15	75165435	.	A	G	999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=12;PP=709;SC=TGGGCAGATGACCCGTCCCTC;SOR=1.432;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=24;TCR=12;TR=36;WE=75165443;WS=75165425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr15	75310075	rs12593566	C	A	1668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=37;NR=16;PP=880;SC=GAACTAACCCCTTCTGACCTC;SOR=1.270;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=37;TCR=16;TR=53;WE=75310083;WS=75310065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr15	75311036	rs2289583	C	A	212.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=2;PP=173;SC=GGGGAGGGAGCACTGTTTTTT;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=75311044;WS=75311026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	75336729	rs2304899	A	G	4676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=73;PP=2524;SC=TCTGCCAGATATGGAAGAGCC;SOR=0.827;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=149;TCF=76;TCR=73;TR=149;WE=75336737;WS=75336712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr15	75498548	rs1466663	A	G	2971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=57;NR=39;PP=1532;SC=GCCCCATGGCAGGTACTCCTA;SOR=0.922;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=57;TCR=39;TR=96;WE=75498556;WS=75498538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr15	75499602	rs12591506	C	A	3360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=56;NR=50;PP=1870;SC=GAACAATGTGCGGGCTGTGCC;SOR=0.760;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=56;TCR=50;TR=106;WE=75499610;WS=75499592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr15	75499619	rs11072531	T	C	2910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=45;PP=1602;SC=TGCCACAGCCTGGTGCCTTCC;SOR=0.711;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=53;TCR=45;TR=98;WE=75499627;WS=75499609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr15	75499861	rs11072532	G	A	3208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=63;NR=46;PP=1681;SC=CAGAAGGAGGGCGCAAGGCCA;SOR=0.795;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=63;TCR=46;TR=109;WE=75499869;WS=75499851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr15	75503147	rs3743211	G	A	2442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=49;NR=32;PP=1296;SC=GTGGCCAGAGGTGAGCCAGAG;SOR=0.953;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=49;TCR=32;TR=81;WE=75503155;WS=75503137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr15	75518246	rs1994640	A	G	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.37;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr15	75521833	rs6495165	G	C	1674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=35;NR=20;PP=1111;SC=TCCCCCTGGGGAGGTGAAAAG;SOR=1.355;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=35;TCR=20;TR=55;WE=75521841;WS=75521823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr15	75594075	rs145348085	T	G	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.51;MQRankSum=0.962;QD=1.40;ReadPosRankSum=0.815;SOR=0.597;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,12:0.17:69
chr15	75643759	rs7182283	G	T	1439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.26;SOR=0.728;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr15	75650836	rs1128933	G	A	3041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=55;NR=44;PP=1524;SC=GGCAGCCAACGTCCAGCACAA;SOR=0.836;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=55;TCR=44;TR=99;WE=75650844;WS=75650826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr15	75650972	rs3809549	G	A	2455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=34;NR=28;PP=1247;SC=ATGGGACAGGGGTGGACATAC;SOR=0.859;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=63;TCF=35;TCR=28;TR=62;WE=75650980;WS=75650962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr15	75651022	rs149997575	C	CCCACATGCTGCCCAGCCCATA	3445.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=15;PP=765;SC=CTCCACCATCCCCACATGCTG;SOR=0.750;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=19;WE=75651030;WS=75651010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr15	75651981	rs78610801	G	A	1179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=27;NR=8;PP=683;SC=GGCCCCGCCCGGTTTGGGCAG;SOR=1.900;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=35;WE=75651989;WS=75651971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr15	75653378	rs7174408	T	C	618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=6;PP=511;SC=AGCCAAGGCCTGGCCTGACCT;SOR=1.828;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=23;WE=75653386;WS=75653368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	75664570	rs4886696	A	T	1355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.37;SOR=1.284;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr15	75664571	rs56395816	A	T	1355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.73;SOR=1.214;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr15	75870906	rs138732372	G	A	153.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=3;PP=83;SC=CCTGGGGCGCGGTCGCCGGTG;SOR=0.941;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=7;WE=75870914;WS=75870896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	76017452	rs55905564	C	T	3700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=0.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=46;PP=2193;ReadPosRankSum=1.592;SC=CTTACAGGTCCGGGGCCCGCC;SOR=0.425;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=80;TCR=46;TR=125;WE=76017460;WS=76017442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,138:0.99:139
chr15	76075437	rs62028907	G	A	255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=57.31;NF=3;NR=6;PP=141;SC=AAGACGCTACGGGAGCAGGGT;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=76075445;WS=76075427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	76175828	rs1868020	G	A	455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=9;PP=263;SC=TTTTTTATAGGGACGAGATCT;SOR=1.371;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=6;TCR=9;TR=15;WE=76175836;WS=76175818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	76182949	rs335713	C	T	565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=13;PP=359;SC=TTTAAAATAGCGTCTACTTTC;SOR=2.093;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=18;WE=76182957;WS=76182939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	76183191	rs62028936	T	A	1305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.64;SOR=0.730;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr15	76191802	rs335689	G	A	2051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.05;SOR=0.761;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr15	76191852	rs335688	T	C	2573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=39;NR=43;PP=1411;SC=AAAATCTTTCTAACATGCAGA;SOR=0.985;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=39;TCR=43;TR=82;WE=76191860;WS=76191842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr15	76191966	rs335687	T	C	256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=7;PP=138;SC=TTACAGCCTTTGCATTTTGCT;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=76191974;WS=76191956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	76197071	rs3073843	A	ATCT	584.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=6;PP=278;SC=TTAAAGGAACATCTCGTTCCG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=6;WE=76197079;WS=76197061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	76222140	rs335679	G	T	198.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=159;SC=TGGAGTGCAAGTCAGTAACAT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=76222148;WS=76222135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	76248427	rs10711025	GT	G	190.90	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5051;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=114;ReadPosRankSum=2.174;SC=TAGAAAGAAAGTTTTTTTTTT;SOR=0.804;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=11;WE=76248435;WS=76248417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,11:0.85:13
chr15	76251344	rs11638364	C	T	326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=2;PP=238;SC=TTTTTAGAGACAGGGTCTTGC;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=76251352;WS=76251334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	76251452	rs12913434	A	G	1505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.18;QD=24.68;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr15	76452476	rs149378942	C	G	1986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=36;NR=26;PP=1014;SC=TTCACTGGATCAGCCTGGTCA;SOR=0.719;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=63;TCF=36;TCR=27;TR=62;WE=76452484;WS=76452466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr15	76510073	rs1533600	G	A	180.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=4;PP=75;SC=CTTGTGCAAAGTATCAATTAC;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=76510081;WS=76510063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	76518346	rs11281932	C	CCCTTA	187.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=214;SC=ATTTTAACTTCCAATATATTA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=76518354;WS=76518336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	76584686	rs3215000	T	TA	391.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=223;SC=ATTGGCTACATAAACAGTCTG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=7;WE=76584694;WS=76584676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	76630055	rs138217367	T	A	552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=1;PP=406;SC=GGGGCTGGAGTAGCCGAGGCC;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=76630063;WS=76630050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	76630303	rs4636879	T	C	4716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=78;PP=2350;SC=AGCGGGACTATGTCAGGTGAG;SOR=0.832;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=159;TCF=81;TCR=78;TR=159;WE=76630311;WS=76630280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr15	76632907	rs7180257	A	G	2482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=48;PP=1453;SC=GACGGTGAGCAGCCGCTGGGC;SOR=1.477;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=29;TCR=48;TR=77;WE=76632915;WS=76632897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr15	76673627	rs17460201	T	C	417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=1;PP=329;SC=TTATTCCTTATGCCCCAATTC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=76673635;WS=76673617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	76957958	rs280021	A	G	41.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr15	77064389	rs66496622	TGAA	T	308.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=245;SC=CTATTAACTATGAAGAAGAAG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=77064399;WS=77064379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	77085740	rs3102707	C	A	178.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=143;SC=TCACTGGAAACAACAAGGCAG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=77085748;WS=77085730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	77231158	rs4886841	C	T	1885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=43;PP=1221;SC=TAACTTTGGGCAAGTTATTAA;SOR=1.512;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=23;TCR=43;TR=66;WE=77231166;WS=77231148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr15	77241568	rs1711018	T	C	1716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=38;PP=983;SC=CTTTAATCTCTGAGCCTGTCT;SOR=1.926;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=58;TCF=19;TCR=39;TR=57;WE=77241576;WS=77241558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr15	77308387	rs7173067	G	A	1925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=32;NR=35;PP=1182;SC=ATAAGGACAGGAGAAGGGTTC;SOR=0.934;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=67;TCF=32;TCR=35;TR=67;WE=77308395;WS=77308377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr15	77310345	rs12900395	C	G	401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=0;PP=306;SC=AAAGCCAGGTCTGGAGTCCCA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=77310353;WS=77310335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	77310636	rs3812911	G	C	1399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=26;PP=995;SC=GAAGCAGGTGGCTTCCGCTCG;SOR=1.007;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=20;TCR=26;TR=46;WE=77310644;WS=77310626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr15	77323009	rs2469237	T	C	2077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=32;NR=31;PP=833;SC=GGGGCCCAAGTGAGGCAGTTG;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=63;TCF=32;TCR=31;TR=63;WE=77323017;WS=77322999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr15	77323029	rs12903227	C	A	1299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=23;PP=688;SC=GGGGAAGGTACCTGTTACTCA;SOR=1.562;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=16;TCR=23;TR=39;WE=77323037;WS=77323019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr15	77328108	rs11373069	G	GA	676.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=8;PP=581;SC=AGTGTCCCCAGAAGGGGAGGG;SOR=1.022;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=7;TCR=8;TR=15;WE=77328116;WS=77328098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	77907145	rs3743481	G	A	2639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=44;NR=40;PP=1480;SC=CCAGCGGGTTGGAGTCCAGGA;SOR=0.776;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=44;TCR=40;TR=84;WE=77907153;WS=77907135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr15	77907535	rs2271396	C	G	3219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=41;PP=1825;SC=TGAGTCGGTACAGCCTCTTGA;SOR=0.729;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=52;TCR=41;TR=93;WE=77907543;WS=77907525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr15	77907775	rs2271397	T	C	7843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.82;SOR=0.704;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr15	77907784	rs2271398	G	A	7856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.14;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr15	78189075	rs4569232	G	A	6239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=52.38;QD=44.57;SOR=0.812;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr15	78189084	rs4243062	T	C	6245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=52.40;QD=43.98;SOR=0.750;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr15	78189370	rs4441238	A	C	1114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=21;PP=712;SC=ATGCCTATGGACATTATGAAG;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=22;TCR=21;TR=43;WE=78189378;WS=78189360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
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chr15	78196212	rs7178928	A	G	257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=1;PP=86;SC=CAGGGCCAGGAAGGAAGGGGT;SOR=1.609;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=78196220;WS=78196202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	78211345	rs12592294	A	G	357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.75;QD=23.85;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	78232240	rs12907147	G	C	2553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=45;NR=39;PP=1106;SC=GTGGGTCCAGGGTGGCCCTGG;SOR=0.714;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=45;TCR=39;TR=84;WE=78232248;WS=78232230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr15	78234093	rs112736682	C	G	1598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=30;NR=27;PP=898;SC=TTGGCAGTTCCGGAGAGCATG;SOR=0.758;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=30;TCR=27;TR=57;WE=78234101;WS=78234083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr15	78235104	rs60257193	T	G	3396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=55;PP=1950;SC=AGGGAGGGAGTCAGGTAATCA;SOR=0.772;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=59;TCR=55;TR=114;WE=78235112;WS=78235094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr15	78268603	rs28360704	C	T	505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=54.83;NF=8;NR=9;PP=284;SC=CTCACCAGCCCGTGGATGCCA;SOR=1.022;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=8;TCR=9;TR=17;WE=78268611;WS=78268593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	78268738	rs28397171	T	C	184.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.10;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	78269731	rs11852862	G	T	761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.27;QD=42.32;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	78269737	rs11852790	A	T	761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.22;QD=44.81;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	78269738	rs11852821	C	T	761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.22;QD=44.81;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	78269747	rs11852867	G	A	556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.79;QD=50.62;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	78269760	rs71402931	C	T	401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.67;QD=40.18;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	78269762	rs78023616	CA	TG	401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.52;QD=44.64;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	78269793	rs67603081	CT	C	98.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=52.02;QD=32.75;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	78269798	rs142983118	G	A	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.07;QD=35.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	78269801	rs140951103	G	A	107.28	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.07;QD=35.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	78269802	rs143146370	T	TG	98.25	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.07;QD=32.75;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	78272330	rs56081051	C	T	141.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.70;QD=28.38;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	78276594	rs72732526	AC	CA	990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=4;PP=754;SC=ACCCACTAAAACTCCACACTC;SOR=1.708;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=21;WE=78276603;WS=78276584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr15	78276660	rs12916320	A	G	1727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.41;SOR=0.752;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr15	78301508	rs1985487	T	C	659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=18;PP=528;SC=CAGCTGCTACTACAGTCTCCA;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=78301516;WS=78301498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	78305054	rs16969405	T	C	144.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=1;PP=114;SC=CTTTTTTCTCTTAAAATATTG;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=78305062;WS=78305044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	78305718	rs74027709	T	C	527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=16;PP=373;SC=CAAAGACCAATGCAACAGAAA;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=78305726;WS=78305708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	78310043	rs16969407	T	C	572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=1;PP=438;SC=GCTCTATGTATTATATGTATT;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=78310051;WS=78310033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	78369972	rs7176425	G	C	328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=3;NR=6;PP=147;SC=GCCCTCCTCCGCCCGGGCTCC;SOR=1.981;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=78369980;WS=78369962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	78401540	rs12592068	A	C	37.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=0;PP=65;SC=ATGTTCCCCCACCGCATATTC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=78401548;WS=78401530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr15	78403004	rs1992469	A	G	2539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=34;PP=1488;SC=TCACCTGGGAACTTGCTCGAA;SOR=0.976;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=51;TCR=34;TR=85;WE=78403020;WS=78402994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr15	78403179	rs2867986	C	G	1576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=29;PP=881;SC=AGCCAGACAACGGGGAGACAG;SOR=1.123;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=22;TCR=29;TR=51;WE=78403187;WS=78403169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr15	78441769	rs11555541	T	C	418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.17;SOR=1.244;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	78457242	rs12904700	A	G	726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=5;PP=520;SC=ACTTCCTTTTAGTGGAGAATG;SOR=2.494;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=23;WE=78457250;WS=78457232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	78458485	rs3816253	T	C	936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=4;PP=537;SC=CTTTTCCCGATGTGTAGGTTC;SOR=3.126;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=27;WE=78458493;WS=78458475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr15	78458797	rs2304825	C	T	358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=267;SC=CCAGATTGAACAGGGTATGTG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=78458805;WS=78458787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	78463890	rs11638547	G	T	2280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=40;PP=1293;SC=GAAATGAGAAGAAATGAGTGA;SOR=0.947;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=77;TCF=37;TCR=40;TR=77;WE=78463898;WS=78463880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr15	78466127	rs2304824	T	C	1750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=29;PP=1027;SC=CAGAACTCCATAGCTTGTTCA;SOR=1.092;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=24;TCR=29;TR=53;WE=78466135;WS=78466117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr15	78466597	rs11631653	C	T	230.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=186;SC=GCAGGCAGCACGGACTTGAGT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=78466605;WS=78466592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	78472157	.	TCA	T	76	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=0.9998;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=62.65;NF=0;NR=2;PP=76;QD=39.5;SC=ACAGAAGAAATCACACACACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=2;WE=78472166;WS=78472147;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,2:0.67:3
chr15	78473309	rs12915634	G	A	1288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.815;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=29;PP=880;ReadPosRankSum=2.201;SC=AGGCCTGTTGGGTCAGGGGCA;SOR=1.814;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=14;TCR=29;TR=43;WE=78473317;WS=78473299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,47:0.96:49
chr15	78474517	rs6495277	T	C	1321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=25;PP=599;SC=ATCCCAGCAGTGTCCACAAGC;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=20;TCR=25;TR=45;WE=78474525;WS=78474507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr15	78474776	rs66983917	AC	A	1605.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=11;PP=420;SC=ACCCCCTTGCACCCCCCCCAC;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=22;TCF=9;TCR=13;TR=19;WE=78474784;WS=78474766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr15	78501420	rs139633551	C	CCTGT	502.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=1;PP=444;SC=TCCAGGGAGCCCTGTCTGTCA;SOR=3.611;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=9;WE=78501441;WS=78501410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	78501433	rs3902931	T	C	588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=4;PP=424;SC=GTCTGTCAGTTAGGGTGGGGC;SOR=2.531;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=19;WE=78501441;WS=78501410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	78556589	rs12898295	C	G	412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.28;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	78556771	.	G	T	835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=14;NR=13;PP=402;SC=GGCGTCGGGGGTCTGGGCCGC;SOR=0.880;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=14;TCR=13;TR=27;WE=78556779;WS=78556761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr15	78557005	rs28484827	A	G	624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=2;PP=326;SC=GTGACGCGCGAGCGGGCGGCG;SOR=2.636;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=78557013;WS=78556995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	78557086	rs66489434	GC	G	3105.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.10;QD=29.86;SOR=1.390;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr15	78558509	rs2037347	G	A	870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=5;PP=501;SC=CATTCATTGTGGTCCGCTTCT;SOR=1.911;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=28;WE=78558517;WS=78558499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr15	78563103	rs3169166	A	C	250.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=6;PP=184;SC=ATCATGCTTTAAAAGGATATG;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=78563111;WS=78563093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	78572359	rs9806426	C	G	2781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=54;NR=35;PP=1644;SC=CTGCCTTCCTCCTTCCTAATT;SOR=1.190;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=54;TCR=35;TR=89;WE=78572367;WS=78572349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr15	78581892	rs1879153	C	T	529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=3;PP=316;SC=AATGGCATTTCAATGAAAGAA;SOR=2.833;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=78581900;WS=78581882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	78587910	rs1040262	A	G	2017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=30;PP=1328;SC=TTTAGGAGCCAGGCAAGAATG;SOR=1.091;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=75;TCF=44;TCR=31;TR=74;WE=78587918;WS=78587900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr15	78632830	rs1127472	C	G	690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.58;SOR=0.922;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr15	78633595	rs2139440	T	G	2757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=49;PP=1673;SC=AGCGTCCCCGTGTCCCCGCTC;SOR=1.007;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=41;TCR=49;TR=90;WE=78633603;WS=78633585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr15	78635794	rs144235294	G	A	2595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=37;PP=1530;SC=CCCTGCTCCCGCTGCTGAGAC;SOR=1.022;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=91;TCF=54;TCR=37;TR=90;WE=78635802;WS=78635784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr15	78758677	rs2958720	G	C	1266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=19;PP=826;SC=GCTCTCTCCAGTTAAAGTGCA;SOR=0.784;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=21;TCR=19;TR=40;WE=78758685;WS=78758667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr15	78758853	rs2938672	A	C	356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=10;PP=216;SC=TTTTTCTTAAAGTTTATTAAT;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=78758861;WS=78758843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	78777312	rs9788758	G	A	959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=22;PP=613;SC=AATTATTGTTGGCTTTTCTGT;SOR=2.049;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=31;WE=78777320;WS=78777302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr15	78780104	rs2230940	T	C	1754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.81;SOR=0.814;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr15	78786410	rs4887060	A	C	1828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=26;PP=1098;SC=TGAGAATGCAAACAAAGTATT;SOR=0.723;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=31;TCR=26;TR=57;WE=78786418;WS=78786400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr15	78807231	rs148681032	C	CCTCTCT	290.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.65;QD=41.54;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	78834689	rs2292117	A	G	453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=10;NR=6;SC=AGCAATTATCATCACCAGGTT;SOR=1.061;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=10;TCR=6;TR=16;WE=78834697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	78836631	rs67437837	CTGA	C	1369.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=21;PP=563;SC=AATAGCATAACTGATGATACA;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=21;WE=78836641;WS=78836620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr15	78841220	rs8053	T	C	996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=16;NR=24;PP=640;SC=TCAAAAAACATGAGGAAGAAG;SOR=1.151;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=16;TCR=24;TR=40;WE=78841228;WS=78841210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr15	78857896	rs503464	T	A	598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=15;NR=5;PP=370;SC=GCTGCTAGGCTGAGGCTGCTG;SOR=1.426;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=20;WE=78857904;WS=78857886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr15	78873119	rs569207	C	T	213.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=1;PP=131;SC=GGGAGAGAAGCGAGTACATTA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=78873127;WS=78873109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	78879242	rs555018	G	A	231.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=5;PP=101;SC=AGTGCCTATTGTGTGCCAGAC;SOR=2.093;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=78879250;WS=78879232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	78880481	rs647041	T	C	41.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr15	78909452	rs3743075	T	C	1736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=33;NR=23;PP=957;SC=AGGGGTTCCATTTCAGCTTGT;SOR=0.822;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=33;TCR=23;TR=56;WE=78909460;WS=78909442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr15	78909480	rs3743074	G	A	1590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.51;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr15	78909539	rs3743073	G	T	734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=16;PP=440;SC=TTTACTTCCCGTGGCACCACC;SOR=1.781;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=9;TCR=16;TR=25;WE=78909547;WS=78909529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr15	78911261	rs2869547	T	C	854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=20;PP=460;SC=CTGGCCACTGTGGGAAGCAGC;SOR=1.751;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=9;TCR=20;TR=29;WE=78911269;WS=78911251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr15	78912943	rs7170068	G	A	303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=2;PP=194;SC=CCCCGGCGACGGCGCCAGCCC;SOR=1.802;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=78912951;WS=78912933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	78913067	rs66793222	ACAG	A	1975.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=19;PP=1039;SC=GGCAGCAGAGACAGCAGCAGC;SOR=0.737;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=21;WE=78913077;WS=78913057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr15	78917399	rs1948	A	G	3090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;SC=GGGCCTCATCAGCCACAACCC;SOR=0.914;Source=Platypus;TCF=65;WE=78917407;WS=78917389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr15	79058572	rs1809421	T	G	825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.81;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr15	79059449	rs1810165	G	A	412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=10;PP=270;SC=GCCAGGGGACGCTGGGGCAAG;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=14;WE=79059457;WS=79059439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	79065562	rs8036224	A	G	3357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.51;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=71;NR=55;PP=2015;SC=CACACAAGGAAGGGAGGGCCC;SOR=0.756;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=126;TCF=71;TCR=55;TR=126;WE=79065570;WS=79065552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr15	79069734	rs7161774	G	T	358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=3;PP=218;SC=GCTGCCCCCTGAGCCCTCCTG;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=12;WE=79069742;WS=79069724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	79070000	rs62012628	C	T	641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=18;PP=465;SC=TTGGTGGGGCCGGGACAGGAG;SOR=1.893;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=25;WE=79070008;WS=79069990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	79080798	rs3743058	C	T	201.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=3;NR=4;PP=105;SC=CCACAAGGTGCGCAGTCCTAG;SOR=1.179;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=7;WE=79080806;WS=79080788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	79083120	rs2127898	G	A	397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=11;PP=300;SC=TGCATGGTGCGTGATCTTTAG;SOR=1.473;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=7;TCR=11;TR=18;WE=79083128;WS=79083110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	79089007	rs3743057	T	C	3234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.30;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr15	79092603	rs6495329	G	A	387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=4;PP=194;SC=CGCCAAGCAGGTGGCAGGCCG;SOR=1.112;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=13;WE=79092611;WS=79092593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	79132814	rs7402877	T	C	902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=4;PP=712;SC=CCATCATGCCTAGCCAAAATC;SOR=2.985;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=30;WE=79132822;WS=79132804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	79133026	rs6495341	C	T	2077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=44;PP=1233;SC=AGGTAAAGCCCAGAATCCTTT;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=24;TCR=44;TR=68;WE=79133034;WS=79133016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr15	79189155	rs10519218	T	C	435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=1;PP=203;SC=TTGTATAACCTTATTTATTTA;SOR=2.303;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=79189163;WS=79189145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	79217690	rs2044226	G	C	3918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=74;NR=50;PP=1641;SC=AGTAGATGCCGGTTCTATACA;SOR=0.830;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=125;TCF=75;TCR=50;TR=124;WE=79217698;WS=79217680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr15	79231518	rs11638844	A	G	2343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.153;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=34;PP=1234;ReadPosRankSum=-0.280;SC=ACTTCTCTGTAAAAAGAAAAA;SOR=0.362;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=78;TCF=41;TCR=37;TR=74;WE=79231531;WS=79231508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,92:0.99:93
chr15	79231523	rs35398112	G	GA	2021.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.773;HP=15;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=35;PP=508;ReadPosRankSum=0.679;SC=TCTGTAAAAAGAAAAAAAAAA;SOR=0.616;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=52;TCF=6;TCR=46;TR=41;WE=79231531;WS=79231508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:5,80:0.94:85
chr15	79231616	rs10400902	A	G	1142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=22;PP=630;SC=CGAAAACTGGACTAAATTTAA;SOR=1.364;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=12;TCR=22;TR=34;WE=79231624;WS=79231606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr15	79237180	rs1036937	C	A	2187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.01;SOR=0.934;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr15	79237247	rs1036938	C	G	3424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=59;NR=52;PP=2008;SC=GGAGTTCACGCACAGTTCGGC;SOR=0.709;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=111;TCF=59;TCR=52;TR=111;WE=79237255;WS=79237237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr15	79237324	rs1036939	C	A	1693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=37;PP=1074;SC=TGGCCCACATCGCAGCGCTGG;SOR=1.306;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=59;TCF=22;TCR=37;TR=59;WE=79237332;WS=79237314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr15	79237401	.	G	C	319.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=4;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=5;PP=84;SC=GAGCGCGGGGGGGGAGCGGCA;SOR=2.833;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=79237412;WS=79237391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	79237403	rs67943698	GGA	G	310.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=4;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=4;PP=176;SC=GCGCGGGGGGGGAGCGGCACG;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=79237412;WS=79237391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	79254480	rs4778732	T	A	1301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=10;PP=735;SC=TGGGCTGGGCTCAGCTTCAGG;SOR=1.814;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=31;TCR=10;TR=41;WE=79254488;WS=79254470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr15	79264097	rs4238514	G	A	485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=1;PP=393;SC=AGCTGGGCTCGAGAGAATTCT;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=79264105;WS=79264091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	79277247	rs4778750	A	C	3345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=44;PP=1944;SC=TCAGCCCAGTACTTTGCCCAC;SOR=0.812;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=63;TCR=44;TR=106;WE=79277255;WS=79277237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr15	79277608	rs4778751	G	A	1635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=32;PP=845;SC=ATGATAAATGGTCACTATTTG;SOR=1.430;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=20;TCR=32;TR=52;WE=79277616;WS=79277598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr15	79288011	rs6495359	A	C	1303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=30;NR=13;PP=715;SC=GATGCCTGTGATGGGTCAGGG;SOR=1.225;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=30;TCR=13;TR=43;WE=79288019;WS=79288001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr15	79291262	rs12914556	C	T	1674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=38;PP=1061;SC=TCTGGCTGAGCTGGGGTGAGT;SOR=1.727;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=16;TCR=38;TR=54;WE=79291270;WS=79291252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr15	79304780	.	GTC	G	135.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.451;ClippingRankSum=0.000;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=2.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.62;ReadPosRankSum=0.325;SOR=0.619;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,11:0.13:84
chr15	79312330	rs2304993	G	A	681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=16;NR=8;PP=407;SC=AGGAGTGAGCGTGTGTGTATC;SOR=1.445;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=16;TCR=8;TR=24;WE=79312338;WS=79312320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	79586361	rs8038778	T	C	3156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=49;PP=1797;SC=CCCGTTTGCCTCAACTGAAGA;SOR=0.820;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=46;TCR=49;TR=95;WE=79586369;WS=79586351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr15	79606137	rs3825933	G	A	2279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=29;PP=1435;SC=ACTGCTATGTGGAGGACCCCC;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=47;TCR=29;TR=76;WE=79606145;WS=79606127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr15	79606408	rs3784544	C	T	140.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=110;SC=CTTCATTGGCCTCTGTCTAGG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=79606416;WS=79606398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	79614206	rs906440	T	A	334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=0;PP=293;SC=GCACAGACTCTTAGTTAGCAT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=79614214;WS=79614196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	79614418	rs906439	A	G	3811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=58;PP=1957;SC=GGGCCCGAGCAGAAGACCTTA;SOR=0.734;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=120;TCF=62;TCR=58;TR=120;WE=79614426;WS=79614408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr15	79748603	rs7183867	C	T	4716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=71;PP=2774;SC=GTGCCCGGTTCGACCTGTCGC;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=151;TCF=80;TCR=71;TR=151;WE=79748611;WS=79748593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr15	79749447	rs11634652	G	T	3613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=58;PP=2068;SC=GTATTCCCCGGTTCCTGACAA;SOR=0.851;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=59;TCR=58;TR=117;WE=79749455;WS=79749437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr15	79750307	rs1004724	T	C	2909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=39;PP=1655;SC=TTGGCGAAATTGAACGGAAGC;SOR=0.896;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=93;TCF=54;TCR=39;TR=93;WE=79750315;WS=79750297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr15	79755604	rs2297773	A	G	2856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=45;NR=48;PP=1408;SC=TTCTTGGACCATTGAGGAGTA;SOR=0.970;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=45;TCR=48;TR=93;WE=79755612;WS=79755594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr15	80137560	rs8923	T	C	1701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=35;NR=18;PP=1077;SC=ATTTAAGCTGTTGACGAGTCT;SOR=1.292;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=35;TCR=18;TR=53;WE=80137568;WS=80137550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr15	80191343	rs7257	G	A	3471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=50;PP=1982;SC=TTCACAATATGGAGTGTCCTT;SOR=0.788;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=55;TCR=50;TR=105;WE=80191351;WS=80191333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr15	80214976	rs78016257	GTGC	G	457.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=1;PP=314;SC=CTAAAGGGGAGTGCTGATCCA;SOR=3.442;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=80214986;WS=80214968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	80216165	rs17214656	G	T	1063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=24;PP=653;SC=CGGGCGCTAAGAAGACCTAGC;SOR=2.073;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=34;WE=80216184;WS=80216155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr15	80216176	rs34149442	G	T	863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=23;PP=596;SC=AAGACCTAGCGCAGAGAGGAC;SOR=3.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=27;WE=80216184;WS=80216155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	80365745	rs2866367	T	G	439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=10;PP=273;SC=AATTGTAGTGTATTTCAGTAC;SOR=2.448;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=80365753;WS=80365735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	80367831	rs2469600	G	C	327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=8;PP=199;SC=AGAGTGGAAAGTAGTTTTCTA;SOR=3.442;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=80367839;WS=80367821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	80405098	rs12594035	C	G	4886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=64;PP=2662;SC=CCTCATGTCTCTTTATTACCC;SOR=0.704;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=75;TCR=64;TR=139;WE=80405106;WS=80405088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr15	80413935	rs934003	C	T	102.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=0;PP=76;SC=CAACATACTACATATTAAAAG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=80413943;WS=80413925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	80414173	rs1522636	C	G	1027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=16;PP=419;SC=GTAAGATGTACTCTCTGAATT;SOR=1.387;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=13;TCR=16;TR=29;WE=80414181;WS=80414163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr15	80415269	rs74647991	A	G	443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=10;PP=291;SC=TGAACACAATACTTTATATCT;SOR=2.049;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=14;WE=80415277;WS=80415259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	80445512	rs71699670	A	AG	3494.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=52;PP=2472;SC=GGGCGCGGGGAGGGAGTGGAG;SOR=1.168;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=63;TCF=6;TCR=57;TR=58;WE=80445520;WS=80445502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr15	80450328	rs1370276	T	C	360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=2;PP=276;SC=CTTCAATAGATAGGCTTTCTG;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=80450336;WS=80450318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	80450389	rs1370275	G	A	979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=25;NR=12;PP=612;SC=TGACGGTGTCGTCTTCCTCCT;SOR=1.432;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=25;TCR=12;TR=37;WE=80450397;WS=80450379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr15	80452075	rs1370274	T	C	3522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=67;NR=46;PP=2025;SC=ACGTGATCTTTTTTCTCCCTG;SOR=0.962;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=67;TCR=46;TR=113;WE=80452083;WS=80452065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr15	80452268	rs1370273	G	A	436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=14;PP=347;SC=AGCAGGGGAGGTGAAGGCTGT;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=80452276;WS=80452258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	80452738	rs139830755	G	A	2412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=49;NR=29;PP=1205;SC=GAAGCCCCTGGTTCTGTGTTT;SOR=1.029;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=79;TCF=50;TCR=29;TR=78;WE=80452746;WS=80452728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr15	80452886	rs733679	T	G	2300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=34;NR=47;PP=1408;SC=TCTGCATCTGTGTGGAGGGTC;SOR=1.244;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=34;TCR=47;TR=81;WE=80452894;WS=80452876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr15	80454745	rs2114716	T	C	2246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=39;PP=1225;SC=AGCATATTTGTCTCAGGAGCT;SOR=1.101;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=71;TCF=32;TCR=39;TR=70;WE=80454753;WS=80454735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr15	80460524	rs1545119	A	G	1502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=16;PP=830;SC=CCTTGCTGGTACCCAGCTCTC;SOR=1.314;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=48;TCF=28;TCR=20;TR=44;WE=80460532;WS=80460514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr15	80464669	rs7180031	A	G	1016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=13;NR=21;PP=638;SC=GAAGCTGAAGATCTGGTGCAG;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=13;TCR=21;TR=34;WE=80464677;WS=80464659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr15	80465248	rs58363292	GA	G	1322.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=5;PP=1016;SC=GATCTTTGTGGAGATGGCAGT;SOR=2.584;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=24;WE=80465256;WS=80465238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr15	80470040	rs2162550	G	A	2173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=48;PP=1326;SC=GGGTCAGCCTGTGGGCCTGGA;SOR=1.670;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=25;TCR=48;TR=73;WE=80470048;WS=80470030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr15	80472431	rs2043691	C	A	1969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=29;PP=1221;SC=CTAAGCCTGCCGCTGCTCATT;SOR=0.927;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=41;TCR=29;TR=70;WE=80472439;WS=80472421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr15	80736696	rs72238944	GGT	G	104.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=124;ReadPosRankSum=1.136;SC=GTGTGTACGTGGTGTGTGTGT;SOR=0.412;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=6;WE=80736705;WS=80736686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
chr15	80762526	rs5814026	TC	T	2974.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.23;QD=30.99;SOR=1.378;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr15	80806183	rs11072922	T	C	1326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=12;PP=720;SC=ATCTACTTGATGGCAGCACCA;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=42;TCF=29;TCR=13;TR=41;WE=80806191;WS=80806173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr15	80845136	rs3924894	CT	TC	5566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=60;PP=2947;SC=AGTTTTGAGCCTATGGCAATT;SOR=1.197;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=103;TCF=42;TCR=61;TR=102;WE=80845145;WS=80845126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr15	80987812	rs62007944	T	C	1712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.19;SOR=0.752;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr15	81176721	rs35343835	C	G	469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=12;PP=309;SC=TCGGCTTCCACTGGGCTCTGG;SOR=2.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=16;WE=81176729;WS=81176711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	81179876	rs11631636	G	A	428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=1;PP=288;SC=GCTTCTTCTGGAGAAGAGAAG;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=81179884;WS=81179866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	81180981	rs8028511	G	A	686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=5;PP=472;SC=TTGCCTTGGAGTCACAACTTT;SOR=2.215;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=24;WE=81180989;WS=81180971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	81199236	rs2271164	A	G	1042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=15;NR=19;PP=516;SC=CTATGATGTCAGCCTCTAGAC;SOR=1.292;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=15;TCR=19;TR=34;WE=81199244;WS=81199226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr15	81212608	rs1553647	G	A	4402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=58;NR=86;PP=2598;SC=ACTCCTACCCGGGGTACATCC;SOR=1.172;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=144;TCF=58;TCR=86;TR=144;WE=81212616;WS=81212598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr15	81217848	rs2271163	C	T	377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=285;SC=GGTTTCTGTTCAGTCAATGCC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=81217856;WS=81217838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	81234741	rs1553646	C	G	357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=9;PP=230;SC=CTGTGTCCTGCGGCTGCTGGC;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=81234749;WS=81234731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	81410106	rs1533055	G	A	4995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=85;NR=70;PP=2502;SC=CTTCCTCCTCGCTGACTTCAT;SOR=0.758;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=155;TCF=85;TCR=70;TR=155;WE=81410114;WS=81410096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr15	81410202	rs2280440	C	T	3964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=62;PP=2271;SC=TCTCCTAGTCCTTCTCATCTT;SOR=0.904;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=119;TCF=57;TCR=62;TR=119;WE=81410210;WS=81410192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr15	81410488	rs2250029	G	A	1381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=15;PP=617;SC=TTTTTCTGCAGACATATTCAG;SOR=0.732;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=24;TCR=15;TR=39;WE=81410496;WS=81410478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr15	81426539	rs2683255	G	C	225.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=0;PP=141;SC=CAGGGCGAGGGTGCGCGCTGT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=81426547;WS=81426529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	81430305	rs55908952	C	G	170.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=85;SC=TGATTATAAACAAAATTGCAT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=81430313;WS=81430295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	81600995	rs4238526	A	G	1773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=29;PP=1067;SC=ATGAAATCTTACAGCTGGGTG;SOR=0.892;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=28;TCR=29;TR=57;WE=81601003;WS=81600985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr15	81624768	rs4417518	C	T	1982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=23;PP=963;SC=GCCTAGACATCTGAACAAATC;SOR=0.832;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=36;TCR=23;TR=59;WE=81624776;WS=81624758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr15	81625385	rs11636318	C	T	3889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=61;PP=2166;SC=GTAAGAGTCACATTCATTAAT;SOR=0.763;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=66;TCR=61;TR=126;WE=81625393;WS=81625375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr15	81631681	rs4489964	C	T	745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=4;PP=606;SC=TCAATATGATCTAATTCCCTT;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=81631689;WS=81631671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	81636267	rs7161991	C	T	4371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=66;PP=2441;SC=CAAACTTGCTCTCCAGATCCC;SOR=0.782;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=138;TCF=71;TCR=67;TR=137;WE=81636275;WS=81636257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr15	81637284	rs4278705	G	A	1140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=22;NR=15;PP=552;SC=CTTCTTCAGGGGCTGTCCTGG;SOR=0.829;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=22;TCR=15;TR=37;WE=81637292;WS=81637274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr15	81637357	rs147678536	GGA	G	49.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.087;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=2.193;NF=0;NR=4;PP=133;ReadPosRankSum=0.438;SC=CATTTCCTGGGGAGAGAGAGA;SOR=1.700;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=4;WE=81637366;WS=81637347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,5:0.19:27
chr15	81649001	rs7167034	T	C	1317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.34;SOR=1.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr15	81651651	rs12903128	G	A	1265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=11;PP=638;SC=CATTTTATGCGACTGCTGTAA;SOR=1.251;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=29;TCR=11;TR=40;WE=81651659;WS=81651641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr15	81666529	rs11634486	G	A	929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=21;PP=569;SC=TGCTCTGCCCGCTAGTTCTCA;SOR=1.819;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=10;TCR=21;TR=31;WE=81666537;WS=81666519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr15	82335444	rs11073028	G	A	231.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.97;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	82387862	rs3087595	G	C	3509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=63;PP=1770;SC=ATGCCATCGAGGAACTGAAAA;SOR=0.914;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=56;TCR=63;TR=119;WE=82387870;WS=82387852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr15	82387951	rs1969090	G	C	838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=20;PP=584;SC=GTCCAATGAAGCACTGACATT;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=25;WE=82387959;WS=82387941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr15	82431219	rs2457497	A	G	866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=22;PP=591;SC=TCATGGATCAATCATATGGCT;SOR=4.407;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=24;WE=82431227;WS=82431209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr15	82443939	rs4725	G	A	2385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=26;PP=1357;SC=GTCCATAGCAGTCAGTGAGTG;SOR=1.233;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=46;TCR=26;TR=72;WE=82443947;WS=82443929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr15	82444437	rs905450	A	G	3415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=55;PP=1940;SC=GAGTATTTTCACCCTCATTCA;SOR=0.899;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=49;TCR=55;TR=104;WE=82444445;WS=82444427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr15	82450268	rs9944185	C	A	723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=19;PP=489;SC=GACAATGGCTCTGGCTACTGA;SOR=3.014;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=23;WE=82450276;WS=82450258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	82512429	rs2292189	C	G	908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=5;PP=640;SC=CTCTTGGCTCCTCTCCTTTTG;SOR=2.899;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=32;WE=82512437;WS=82512419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr15	82517458	rs62012011	A	G	666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=8;PP=400;SC=CATCCCACCAAACATACACCA;SOR=1.445;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=25;TCF=16;TCR=9;TR=24;WE=82517466;WS=82517448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	82530630	rs1972460	A	G	1171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=6;PP=598;SC=AGATTTAATCAGATGCAAACA;SOR=2.147;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=32;WE=82530638;WS=82530620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr15	82544927	rs3902959	C	T	820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=6;PP=553;SC=GAATAAAATACGTGGAATATA;SOR=2.226;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=26;WE=82544935;WS=82544917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr15	82545214	rs4344697	A	T	440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=12;PP=296;SC=ACTTATATTTAATTTGTTATT;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=82545222;WS=82545204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	82558034	rs3858954	G	C	245.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=5;PP=231;SC=GAGTCTTAAAGCCAAGCAAGA;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=9;TCF=4;TCR=5;TR=9;WE=82558042;WS=82558024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	82563991	rs16973457	C	T	1656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=13;PP=858;SC=CGCCATGTGCCAGAAGAATAT;SOR=1.498;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=37;TCR=13;TR=50;WE=82563999;WS=82563981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr15	82575493	rs142677476	TAATA	T	761.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=13;PP=598;SC=ATTTATGATATAATAAATCAT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=13;WE=82575504;WS=82575483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	83215134	rs62009918	C	T	888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=5;PP=571;SC=TGTGAACCACCGCGCCCAGCC;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=25;WE=83215142;WS=83215124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	83221392	rs3850610	C	A	2544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=36;NR=41;PP=1283;SC=GGAAAAATCGCATTAATATCC;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=77;TCF=36;TCR=41;TR=77;WE=83221400;WS=83221382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr15	83222444	rs11390316	G	GT	1624.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=5;NR=29;PP=1543;SC=CTGATCTCCGGTGTAAGCTCC;SOR=1.880;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=34;WE=83222452;WS=83222434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr15	83224696	rs1145171	C	T	3034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=41;PP=1678;SC=GGTCCCAGGACGGCCACACAG;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=59;TCR=41;TR=100;WE=83224704;WS=83224686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr15	83240293	rs783544	A	C	3135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=51;NR=55;PP=1881;SC=CTGTTTTGGAAAGGAGCACAG;SOR=0.914;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=106;TCF=51;TCR=55;TR=106;WE=83240301;WS=83240283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr15	83241984	rs11336258	AT	A	218.19	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.72;MQRankSum=0.588;QD=14.55;ReadPosRankSum=1.020;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,13:0.87:15
chr15	83331155	rs2278355	C	T	121.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=1;NR=4;PP=80;SC=AGACTGTTCCCGGTTTCCTCC;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=83331163;WS=83331145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	83334128	rs72045599	AACACACACACACACACACACACACACACAC	A	530.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.83;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	83334419	rs7494860	T	C	1515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=31;PP=808;SC=TGATTCTGGTTGGGACTTCCC;SOR=1.961;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=15;TCR=31;TR=46;WE=83334427;WS=83334409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr15	83378248	rs78366152	G	C	196.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.86;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	83433778	rs8036185	A	G	330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=2;PP=174;SC=TCCCCTCCCCATTAGGCTCCT;SOR=2.147;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=83433786;WS=83433768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	83438317	rs71156049	C	CA	64.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.6282;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=81;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GGACTCATCTCAAAAAAAAAA;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=7;WE=83438325;WS=83438308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr15	83455137	rs11259947	A	G	1405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.91;SOR=2.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr15	83481880	rs35270670	A	G	89.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=17.98;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	83521036	rs1256429	C	T	4107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=64;NR=71;PP=2111;SC=AAAGCAGGGACGCCAGCTTAA;SOR=0.944;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=135;TCF=64;TCR=71;TR=135;WE=83521044;WS=83521026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr15	83680287	rs4842860	A	G	2735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=44;NR=45;PP=1470;SC=ATCTCGGCGCAAAGAAGCCGA;SOR=0.876;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=44;TCR=45;TR=89;WE=83680295;WS=83680277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr15	83680329	rs17361375	G	A	1566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=31;PP=889;SC=GTTGCCCGAAGGTGCCTCAGC;SOR=1.382;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=19;TCR=31;TR=50;WE=83680337;WS=83680319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr15	83680426	rs12906626	C	G	140.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=5;PP=96;SC=AGCGGCCCCACCGCCCGGCGC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=83680434;WS=83680416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	83735449	rs66531444	AGCCCG	A	498.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=3;PP=257;SC=GGGATCTCCCAGCCCGGCCCG;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=5;WE=83735461;WS=83735439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	83735926	rs8040457	C	G	41.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr15	83781474	rs1075619	T	C	1450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=14;PP=773;SC=AGGGAATGCATTCAATAGTCA;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=32;TCR=14;TR=46;WE=83781482;WS=83781464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr15	83793622	rs17507693	A	T	538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=14;PP=366;SC=TTTTTCCATCAGACTTCTTAG;SOR=3.500;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=83793630;WS=83793612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	83808103	rs8043224	T	C	415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=9;PP=273;SC=TATCCACACCTAGATAGTACA;SOR=2.049;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=13;WE=83808111;WS=83808093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	83832698	rs12440562	T	G	2154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=24;PP=1325;SC=TCCATAACAATGTAGCATAGC;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=47;TCR=24;TR=71;WE=83832706;WS=83832688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr15	83838062	rs75386403	A	AAAG	906.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=6;PP=338;SC=GCAAATAAGAAAAGAAGTCGC;SOR=1.508;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=6;WE=83838070;WS=83838052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	83838099	rs11259967	G	A	154.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.52;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=4;PP=84;SC=CCCGGGAGGCGGAGCTTGCAG;SOR=0.941;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=7;WE=83838107;WS=83838089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	83937081	rs11854520	C	T	819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=19;PP=515;SC=TTCGGCAGCACTTATTGAGCA;SOR=2.226;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=25;WE=83937089;WS=83937071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr15	83952138	rs113930428	A	T	306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=9;PP=252;SC=GAGACCCCGCAGCGGCCTCCT;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=83952146;WS=83952128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	83953236	rs113285762	T	C	698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.10;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr15	84257295	rs7182322	G	A	319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=249;SC=TGTAAAAATCGTCCCTTTCAT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=84257303;WS=84257285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	84257351	rs7182482	G	A	1548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=15;PP=1040;SC=AAGGCAGAGAGGATGTGTGTT;SOR=1.692;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=38;TCR=15;TR=53;WE=84257359;WS=84257341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr15	84373319	rs3079595	C	CAG	1422.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.907;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=25;PP=1347;ReadPosRankSum=1.109;SC=GGTCAGGAAACTGTCTCTAAA;SOR=1.885;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=25;WE=84373327;WS=84373309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,35:0.95:37
chr15	84442240	rs59307086	G	GT	247.14	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.60;ReadPosRankSum=-1.451;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr15	84473531	rs7179507	G	A	473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=12;PP=343;SC=CTCTAAAACTGATGGTCTCTT;SOR=1.739;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=17;WE=84473539;WS=84473521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	84539619	rs4144691	C	G	3083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=56;NR=39;PP=1490;SC=CGGCGTCTTTCTCGTAGAAAA;SOR=0.763;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=95;TCF=56;TCR=39;TR=95;WE=84539627;WS=84539609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr15	84554018	rs8028931	G	C	712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=17;PP=520;SC=AGATAAATTAGACATTTACAT;SOR=2.124;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=23;WE=84554026;WS=84554008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	84566444	rs7162129	T	C	191.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=1;PP=114;SC=GAAATACAAGTATCACAGAAA;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=84566452;WS=84566434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	84566544	rs11259927	C	T	2335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=50;NR=24;PP=1214;SC=CCTTTGCATTCGATAAAATAA;SOR=1.127;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=50;TCR=24;TR=74;WE=84566552;WS=84566534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr15	84568504	rs6603004	A	G	4632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=89;PP=2847;SC=GACCTTTTGTAGGAATAATCA;SOR=1.292;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=151;TCF=62;TCR=89;TR=151;WE=84568512;WS=84568494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr15	84581889	rs12439867	G	A	1974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=11;PP=743;SC=CGTGTGGGCCGGGTGTGCAGG;SOR=1.559;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=41;WE=84581897;WS=84581879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr15	84581904	rs4842923	T	C	2264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=35;NR=16;PP=814;SC=TGCAGGTCCGTGAGGTGAAGT;SOR=1.371;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=52;TCF=36;TCR=16;TR=51;WE=84581912;WS=84581894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr15	84582124	rs4842838	G	T	1954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=33;PP=1240;SC=AGCAACATGCGTGGGAGGTAT;SOR=0.904;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=65;TCF=32;TCR=33;TR=65;WE=84582132;WS=84582114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr15	84639350	rs2277849	C	T	2564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=37;PP=1511;ReadPosRankSum=1.896;SC=TCTACCAGGGCTCCCTCTTGT;SOR=0.317;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=55;TCR=37;TR=91;WE=84639358;WS=84639340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,98:0.99:99
chr15	84651006	.	CT	C	60.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.632;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.76;ReadPosRankSum=-0.671;SOR=0.321;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr15	84651185	rs8031704	C	A	2253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=32;NR=34;PP=1332;SC=TTAAGTGCCCCGTGCGACGAT;SOR=0.881;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=32;TCR=34;TR=66;WE=84651193;WS=84651175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr15	84651290	rs7176737	T	C	2083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=31;PP=1110;SC=TAAAAATCCATGGTCTTGCTG;SOR=0.718;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=36;TCR=31;TR=67;WE=84651298;WS=84651280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr15	84657642	.	T	TA	729.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.76;QD=40.54;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	84657645	.	T	TA	729.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.46;QD=42.93;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	84657647	.	T	TTA	704.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.13;QD=50.34;SOR=2.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	84753177	rs12437525	A	G	658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=15;PP=434;SC=AATTGCTGGCAAGAAAAACAG;SOR=2.030;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=21;WE=84753185;WS=84753167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr15	84758840	rs1567086	A	G	366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=1;PP=260;SC=AGACCCCGTCACTACAAAAAT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=84758848;WS=84758830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	84950209	rs10152249	T	C	212.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=52.63;QD=26.60;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	85149771	rs2271433	G	T	4443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=68;NR=57;PP=2114;SC=TGTAGCTGTCGTTGCTTCCCT;SOR=0.767;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=125;TCF=68;TCR=57;TR=125;WE=85149779;WS=85149761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr15	85159397	rs10083683	C	G	703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=2;PP=507;SC=GAACCTGGGACGCAGAGGTTG;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=85159405;WS=85159387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	85163998	rs2044502	G	C	4144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=73;PP=2625;SC=CAGGGACACAGCCCAGGTGAG;SOR=0.848;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=139;TCF=65;TCR=74;TR=137;WE=85164006;WS=85163988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr15	85175102	rs2121452	G	A	3169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=42;PP=1729;SC=TTTAGAGTGCGGTTGCAAAGC;SOR=0.950;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=64;TCR=42;TR=106;WE=85175110;WS=85175092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr15	85180401	.	C	CA	57	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=17;HapScore=2;MGOF=17;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=4;NR=0;PP=57;QD=15.0;SC=GACTCCGTCTCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=85180409;WS=85180397;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,4:0.67:6
chr15	85188994	rs2271432	T	C	5186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=77;PP=2584;SC=CCAGCCGGCCTGAAGCACAGC;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=165;TCF=88;TCR=77;TR=165;WE=85189002;WS=85188984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr15	85198350	rs66810580	G	C	689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=2;PP=515;SC=TGAAAGGAGAGGACCAGGCAT;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=24;WE=85198370;WS=85198340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	85198362	rs1107179	G	T	909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=4;PP=696;SC=ACCAGGCATTGTATGTAAAGA;SOR=3.407;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=30;WE=85198370;WS=85198340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	85198606	rs17598561	C	T	1106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=27;PP=725;SC=TTATTGGTGTCATTTCTGCAG;SOR=1.900;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=11;TCR=27;TR=38;WE=85198614;WS=85198596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr15	85200754	rs2292462	G	T	208.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=169;SC=TGGTGGCAAAGCCTGCTCCCT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=85200762;WS=85200744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	85213891	rs113664362	T	G	61.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=0;PP=40;SC=GATTACAGGCTTGAGCCACTG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=85213899;WS=85213881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	85224154	rs66516446	C	A	1242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=27;PP=788;SC=ATGTTTGTGGCACTGGGGTAT;SOR=1.828;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=11;TCR=27;TR=38;WE=85224162;WS=85224144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr15	85235757	rs12900890	C	T	841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=18;PP=552;SC=CTCCAACAAACTCTAAAATTC;SOR=1.536;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=10;TCR=18;TR=28;WE=85235765;WS=85235747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	85259053	rs6496355	C	A	695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=4;PP=484;SC=GCCCCGCCCCCGGTAGGCCCT;SOR=2.584;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=22;WE=85259061;WS=85259043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	85341072	rs56410875	A	G	5301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=100;NR=81;PP=2965;SC=TACTCCACCCACACTCACACT;SOR=0.849;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=181;TCF=100;TCR=81;TR=181;WE=85341080;WS=85341062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr15	85360101	rs11857356	T	C	1622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=20;PP=1026;SC=GGCTTGTCTATGTGCTGGGCC;SOR=1.034;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=31;TCR=20;TR=51;WE=85360109;WS=85360091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr15	85370597	rs891286	C	G	435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=2;PP=315;SC=CGGGGTGCTGCAGCTCTGGCC;SOR=2.448;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=85370605;WS=85370587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	85401259	rs306197	C	T	1702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=20;PP=965;SC=GAGGTTTCCCCTGAGGGGCCT;SOR=0.865;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=33;TCR=20;TR=53;WE=85401270;WS=85401249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr15	85401419	rs167379	T	C	3820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=50;PP=2294;SC=CTCTGACAGGTCTCCCGGCAG;SOR=0.965;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=73;TCR=50;TR=123;WE=85401427;WS=85401409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr15	85407564	rs2289138	A	C	144.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=114;SC=GCTGAGAATTACATTCTTGGA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=85407572;WS=85407554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	85438118	rs7166433	T	G	655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=3;PP=324;SC=GGCTGCAGGGTTCTGAAGAGG;SOR=2.049;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=85438140;WS=85438108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	85438132	rs7166440	T	C	745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=4;PP=375;SC=GAAGAGGTGGTGTCCTGGCTG;SOR=1.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=18;WE=85438140;WS=85438108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	85438311	rs151038463	C	CTTG	1188.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=849;SC=GAGGAGGTTTCTCAAGCCTCA;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=16;WE=85438319;WS=85438301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr15	85448906	rs2290269	C	T	1503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=31;PP=992;SC=GGTCTGGCTGCCCAGAGCATC;SOR=1.747;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=46;TCF=14;TCR=32;TR=45;WE=85448914;WS=85448896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr15	85469711	rs2343674	G	A	638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=8;PP=408;SC=TAGGATTACAGGCATGAGCCA;SOR=1.519;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=22;TCF=14;TCR=8;TR=22;WE=85469719;WS=85469701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	85478153	rs7163966	G	T	1226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=8;PP=856;SC=AGGATTTCCCGCTCTGAAATG;SOR=2.531;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=32;TCR=8;TR=40;WE=85478161;WS=85478143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr15	85478410	rs2242048	A	G	2636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=44;NR=35;PP=1303;SC=TGGACATCCAAGGGCTCAGCT;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=44;TCR=35;TR=79;WE=85478418;WS=85478400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr15	85478729	rs2242046	G	A	2891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=52;PP=1604;SC=GTGGGTCGGCGACAGGAAGCA;SOR=1.158;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=40;TCR=52;TR=92;WE=85478737;WS=85478719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr15	85487960	rs11479919	GC	G	6890.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=79;PP=2966;SC=CGGGGGCCCTGCCCCACCCAC;SOR=0.713;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=109;TCF=26;TCR=83;TR=102;WE=85487968;WS=85487950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr15	85488298	rs62021453	G	A	838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=18;NR=6;PP=422;SC=GCACAGCCTGGTGGTGGCCCG;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=24;WE=85488306;WS=85488288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr15	85488572	rs8025045	T	G	673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=17;PP=482;SC=TTGGGAAGGGTTCATGGAGTG;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=85488580;WS=85488562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	85525556	rs11540803	C	G	1006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=15;PP=511;SC=GGAGTCGGAGCTTCGCGACGG;SOR=0.859;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=15;TCR=15;TR=30;WE=85525564;WS=85525546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr15	86029097	rs11856869	C	G	348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=231;SC=AACCATATGTCCATGAATATA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=86029105;WS=86029087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	86063729	.	CAAAAAAAAAAAAAA	C	277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.68;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	86087212	rs7162720	C	T	3444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=62;NR=52;PP=1998;SC=GCCTTATTTCCCTCCTCTCAT;SOR=0.709;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=115;TCF=62;TCR=53;TR=114;WE=86087220;WS=86087202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr15	86087309	rs2291049	T	C	2768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=45;PP=1518;ReadPosRankSum=0.511;SC=CAGCTCTGTATCTTGCCTTCT;SOR=0.813;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=94;TCF=48;TCR=46;TR=92;WE=86087317;WS=86087291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,104:0.98:106
chr15	86125304	rs7179919	C	T	916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=17;PP=481;SC=CAGAGAAGATCATTTTACCTG;SOR=1.148;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=11;TCR=17;TR=28;WE=86125312;WS=86125294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr15	86198561	rs1861856	G	C	613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=3;PP=455;SC=GGAATCCACTGAGAAGCCATT;SOR=3.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=86198569;WS=86198551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	86253768	rs8037947	T	A	1630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=15;PP=1052;SC=TCAGGGCTTGTCAGAGGTGAA;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=38;TCR=15;TR=53;WE=86253776;WS=86253758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr15	86253911	rs8038249	T	G	3050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=56;PP=1806;SC=ATTCCCTTTCTGACTTTCTGG;SOR=0.965;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=48;TCR=56;TR=104;WE=86253919;WS=86253901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr15	86278174	rs2241267	C	T	656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.27;SOR=1.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	86278479	rs16943741	A	G	235.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=7;PP=164;SC=ACCGCTCCCAATCAGCAAATT;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=86278487;WS=86278469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	86278771	rs66907883	C	A	832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.91;SOR=1.040;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr15	86284342	rs16943792	C	T	1522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.81;SOR=0.726;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr15	86313048	rs2614657	T	C	2583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=46;PP=1499;SC=ACATGGTGCGTCAGCTTGTGG;SOR=1.132;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=38;TCR=46;TR=84;WE=86313056;WS=86313038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr15	86768264	.	C	CT	63	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000;HP=18;HapScore=2;MGOF=23;MMLQ=15;MQ=58.2;NF=0;NR=6;PP=63;QD=11.0;SC=ATGGCTGTTTCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=6;WE=86768274;WS=86768254;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr15	86814654	rs11852354	T	G	218.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=179;SC=ATATTTATGATTGCATTTAGG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=86814662;WS=86814644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	86814866	rs11858435	A	G	2360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=32;PP=1291;SC=AGCCCACCCTATATTCTGTGA;SOR=0.716;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=39;TCR=32;TR=71;WE=86814874;WS=86814856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr15	87097468	rs9788743	T	C	181.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=96;SC=TTAGGGTTAATAAATGATTTA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=87097476;WS=87097458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	87099537	rs752270	T	C	2844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=43;PP=1494;SC=AGCATTTATCTTGTGAAATTT;SOR=0.900;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=45;TCR=43;TR=88;WE=87099545;WS=87099527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr15	87217488	rs11853730	T	C	2409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=28;PP=1249;SC=CAGTTAATGCTTTGTTTAACT;SOR=0.883;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=47;TCR=28;TR=75;WE=87217496;WS=87217478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr15	87217613	rs8028043	A	G	860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=17;PP=528;SC=CTCCTGGCTCAAGCTGCAACT;SOR=1.402;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=29;TCF=11;TCR=18;TR=28;WE=87217621;WS=87217603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr15	87217721	rs11856329	C	G	145.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=115;SC=TTCCATTGCTCAATATCTCAG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=87217729;WS=87217711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	87531281	rs1006030	A	C	2658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=48;NR=35;PP=1566;SC=TTGCCATTACAAACTTTTTCA;SOR=0.866;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=48;TCR=35;TR=83;WE=87531289;WS=87531271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr15	88423463	rs1560975	C	T	1006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=8;PP=625;SC=TCTTATGAGCCCTCCCCCAAT;SOR=1.949;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=31;WE=88423471;WS=88423453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr15	88428702	rs2117655	C	A	192.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=1;PP=143;SC=TAGAACAATACGGGAGAGTTA;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=88428710;WS=88428692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	88679785	rs1863480	G	A	1497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=28;PP=828;SC=TGATAACAGCGTTGTCACCCT;SOR=1.199;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=22;TCR=28;TR=50;WE=88679793;WS=88679775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr15	88680798	.	G	A	1962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=31;NR=32;PP=1077;SC=ACTGCCTGTCGGCAAAGAGAG;SOR=1.032;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=63;TCF=31;TCR=32;TR=63;WE=88680806;WS=88680788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr15	88690736	rs66493620	CCTTCTT	CCTT,C	789.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;NF=0,0;NR=17,17;PP=34,807;SC=GCTTTGTTTTCCTTCTTCTTC;SOR=3.500;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=1;TCR=42;TR=17,17;WE=88690749;WS=88690726;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:21
chr15	89169614	rs3743476	A	G	1137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=13;PP=641;SC=TGCCTCCAGAACCAGGGTCCT;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=23;TCR=13;TR=36;WE=89169622;WS=89169604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr15	89169858	rs8027765	A	G	4785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=68;PP=2543;SC=CTACCATGGCAATGTCCTCTA;SOR=0.704;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=147;TCF=79;TCR=68;TR=147;WE=89169866;WS=89169848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr15	89172352	rs3826040	C	T	630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=3;PP=396;SC=GCTGCCTCCCCCCACAGGGAT;SOR=3.160;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=89172360;WS=89172342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	89172558	rs3743475	G	C	4602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=80;NR=75;PP=2928;SC=CCCGGGATACGACCTATGTCC;SOR=0.791;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=155;TCF=80;TCR=75;TR=155;WE=89172566;WS=89172548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr15	89173136	rs3826039	A	C	144.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=4;NR=0;PP=85;SC=TATGGTGTACAGTTGAGGTTC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=89173144;WS=89173126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	89173657	rs3826038	A	T	102.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=2;NR=3;PP=51;SC=CCAGAGGAGTAGGGGTCATCT;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=5;WE=89173665;WS=89173647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	89182596	rs3200942	A	G	1444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=12;PP=1049;SC=TCCCCAAGGAACATGGCTGGG;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=37;TCR=12;TR=49;WE=89182604;WS=89182586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr15	89193584	rs8041679	G	C	230.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=6;PP=177;SC=GGCTGGGGCAGTCACAGCTGG;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=89193592;WS=89193574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	89195526	rs1137166	A	G	1582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=36;PP=1042;SC=AGCGCCTCCTACACAAGAGCA;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=13;TCR=36;TR=49;WE=89195534;WS=89195516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr15	89382261	rs35600223	G	A	866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=24;PP=671;SC=AGGCCACCCTGGAAGTCGTGG;SOR=2.910;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=29;WE=89382269;WS=89382251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr15	89385151	rs2293087	T	G	1360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=31;PP=886;SC=AAGGCCACCTTCCCCTCCCCA;SOR=2.511;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=8;TCR=31;TR=39;WE=89385159;WS=89385141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr15	89386543	rs11324188	AG	A	2032.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.16;QD=31.27;SOR=1.162;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr15	89386652	rs34949187	G	A	3186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.194;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.183;NF=57;NR=51;PP=1807;ReadPosRankSum=0.854;SC=GAGTGCCGGCGGCTGGGTGCC;SOR=0.384;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=110;TCF=58;TCR=52;TR=108;WE=89386660;WS=89386642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,120:0.99:121
chr15	89390434	rs12911138	G	A	366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=9;NR=5;PP=246;SC=GCTGCACACCGTGGGTCCCTG;SOR=1.329;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=9;TCR=5;TR=14;WE=89390442;WS=89390424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	89391160	rs2272023	C	A	1228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=11;PP=653;SC=TTGTGAGCCCCCGGACCCCAT;SOR=1.514;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=30;TCR=11;TR=41;WE=89391168;WS=89391150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr15	89392745	rs1568116	T	C	1710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=16;PP=1032;SC=CTCACAATGCTACGCTGGCCA;SOR=1.392;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=37;TCR=16;TR=53;WE=89392753;WS=89392735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr15	89398105	rs2351491	C	T	2001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=39;NR=21;PP=962;SC=CTTGGCCTCCCACTGGCGCAG;SOR=1.073;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=39;TCR=21;TR=60;WE=89398113;WS=89398095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr15	89398330	rs3743399	G	A	3988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=54;PP=2065;SC=CATCAGCCTCGGAAGAGCCGT;SOR=0.823;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=117;TCF=63;TCR=54;TR=116;WE=89398338;WS=89398320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr15	89398407	rs3743398	C	T	3242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=43;PP=1744;SC=TCTGGGGCCCCTGATGTCAGT;SOR=0.710;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=101;TCF=58;TCR=43;TR=101;WE=89398415;WS=89398397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr15	89398605	rs938608	G	T	4039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=46;PP=1514;SC=GAGTGGCCCAGCACTCCTACG;SOR=1.007;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=40;TCR=46;TR=86;WE=89398613;WS=89398595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr15	89398631	rs938609	T	A	3580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=38;PP=1207;SC=TGAACTGCCCTCTGGAGCTGA;SOR=1.124;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=69;TCF=31;TCR=38;TR=68;WE=89398639;WS=89398621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr15	89400339	rs2882676	A	C	1848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=31;PP=1284;SC=GATGTCAGTGAACTTCCTTCA;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=33;TCR=31;TR=64;WE=89400347;WS=89400329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr15	89401109	rs4932439	A	G	4473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=79;NR=60;PP=2495;SC=ACAACCAGGTATTAGTGGAGA;SOR=0.908;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=79;TCR=60;TR=139;WE=89401117;WS=89401099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr15	89401615	rs3825994	T	G	2567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=35;PP=1569;SC=GTTTCCCCACTGTCTCTCTTG;SOR=0.892;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=53;TCR=35;TR=88;WE=89401623;WS=89401605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr15	89402051	rs1042630	A	G	2159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=28;PP=1365;SC=AGCTGGGGACATTAGTGGAGC;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=50;TCR=28;TR=78;WE=89402059;WS=89402041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr15	89402239	rs1042631	T	C	4914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=70;PP=2363;SC=AAGCTAACCTTGAGAGATCCT;SOR=0.704;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=155;TCF=85;TCR=70;TR=155;WE=89402247;WS=89402229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr15	89402596	rs698621	T	G	3599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=59;PP=2050;SC=CAACAGATGCTTCCATCCCAG;SOR=0.737;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=124;TCF=64;TCR=60;TR=123;WE=89402604;WS=89402586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr15	89415247	rs3817428	C	G	5546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=100;NR=84;PP=2943;SC=ATGCCCAAGACTACCAGTGGA;SOR=0.722;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=185;TCF=101;TCR=84;TR=184;WE=89415255;WS=89415237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr15	89456544	rs4945	G	T	337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=6;NR=7;PP=170;SC=AGGCGGGGGCGCGGCATGCTG;SOR=0.976;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=6;TCR=7;TR=13;WE=89456552;WS=89456534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	89734466	rs2239287	G	A	258.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=8;PP=200;SC=GAATTTTCCTGGTGGAAGCTC;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=89734474;WS=89734456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	89758552	rs4932483	A	G	281.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=230;SC=CAGAGACCTGACCTCCTGCCA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=89758560;WS=89758542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	89817689	rs11073853	G	C	63.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.09;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	89838236	rs7183618	G	A	2740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=45;NR=45;PP=1579;SC=CTCTGCAGAAGGTACAGCAGC;SOR=0.773;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=45;TCR=45;TR=90;WE=89838244;WS=89838226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr15	89844664	rs138675752	C	T	2394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=45;PP=1386;SC=TGGAGCCCTCCTCTCCTCAGG;SOR=1.080;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=33;TCR=45;TR=78;WE=89844672;WS=89844654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr15	89865023	rs113994098	C	T	1076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=24;NR=7;PP=545;SC=GTGATGGTGCCGGCAGTCACC;SOR=1.730;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=31;WE=89865031;WS=89865013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr15	90029795	.	CAGAG	C	432.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.17;QD=30.91;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	90118767	rs56144360	G	A	1654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=13;PP=1148;SC=AGGGACTAAGGGACGGTGGCG;SOR=2.221;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=53;TCF=39;TCR=14;TR=52;WE=90118775;WS=90118757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr15	90128799	rs893724	T	A	373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=281;SC=TCTACCTCTATTAATGATCAA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=90128807;WS=90128789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	90128910	rs893723	T	C	2821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=31;PP=1535;SC=GACAATAATATTCTCAACTAA;SOR=1.136;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=57;TCR=31;TR=88;WE=90128918;WS=90128900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr15	90129188	rs1540504	T	C	940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=18;PP=555;SC=GCTCCTAAACTAGTAACTAAC;SOR=1.911;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=9;TCR=18;TR=27;WE=90129196;WS=90129178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr15	90129227	rs1540503	A	C	434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=10;PP=272;SC=CAGTCTTTTCAAGCATCGGGA;SOR=2.448;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=90129235;WS=90129217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	90135196	rs8041127	A	G	502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=15;NR=0;PP=325;SC=CAGTCAGTCCAGGGGAGGAGC;SOR=4.514;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=90135204;WS=90135186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	90135432	rs34494298	A	G	1649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=37;PP=1003;SC=TATCTCTTGAATATTGATTAT;SOR=2.187;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=15;TCR=37;TR=52;WE=90135440;WS=90135422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr15	90138670	rs8042146	C	T	2032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=26;PP=1019;SC=ATACCATGTGCCGTTCCTTAA;SOR=0.798;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=38;TCR=26;TR=64;WE=90138678;WS=90138660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr15	90138926	rs16974170	A	G	39.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr15	90144851	rs4932233	T	C	1606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=27;PP=1175;SC=TCAAAACCTATGTATGGTGTT;SOR=0.729;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=54;TCF=26;TCR=28;TR=53;WE=90144859;WS=90144841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr15	90144894	rs4932234	T	C	1730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=21;PP=1284;SC=AGGACTACTTTTTAGGCTGGG;SOR=1.022;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=50;TCF=29;TCR=21;TR=49;WE=90144902;WS=90144884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr15	90144944	rs4244876	G	A	2861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=41;PP=1766;SC=TAACTGTTCCGTATTCGATCA;SOR=0.896;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=59;TCR=41;TR=99;WE=90144952;WS=90144934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr15	90159575	rs56036125	T	C	2371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=28;PP=1402;SC=CCCTTGGCCTTACTGCTGCTT;SOR=1.153;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=47;TCR=28;TR=75;WE=90159583;WS=90159565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr15	90161355	rs2289486	G	A	2278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=28;PP=1270;SC=GTGGTATGGAGTAATCCTTGT;SOR=1.039;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=48;TCR=28;TR=76;WE=90161363;WS=90161345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr15	90168108	rs894157	C	T	2087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=37;PP=1380;SC=GATGCCTTCCCGTGACGTGCA;SOR=0.963;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=31;TCR=37;TR=68;WE=90168116;WS=90168098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr15	90168693	rs1866928	T	A	2840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=46;PP=1680;SC=ACTGCTTGAGTCAGAGGGCAA;SOR=0.772;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=49;TCR=46;TR=95;WE=90168701;WS=90168683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr15	90169331	rs55653159	A	G	3067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=57;PP=1795;SC=TTCCTGTGACAGACTGTCTGA;SOR=0.973;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=107;TCF=50;TCR=57;TR=107;WE=90169339;WS=90169321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr15	90170237	rs3743372	C	T	2192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=35;PP=1133;SC=TCCTTTCAGTCGCGCTTTCTC;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=33;TCR=35;TR=68;WE=90170245;WS=90170227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr15	90172600	rs74251725	G	A	232.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=7;NR=1;PP=131;SC=GGGCCGGGCTGCTCACCTCGA;SOR=2.093;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=90172608;WS=90172590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	90172834	rs72750748	T	G	3315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=53;PP=1855;SC=GGCTCAGCCCTCATCATGACC;SOR=0.724;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=116;TCF=63;TCR=53;TR=116;WE=90172842;WS=90172824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr15	90176432	rs3803531	T	G	1210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=17;PP=621;SC=TCCTCTGGAATGCCGCGATCT;SOR=0.829;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=20;TCR=17;TR=37;WE=90176440;WS=90176422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr15	90177157	rs894156	C	T	1434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=30;PP=918;SC=ACGGGGCTACCGCGAGCCTGC;SOR=1.358;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=18;TCR=30;TR=48;WE=90177165;WS=90177147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr15	90188392	rs72750755	A	T	863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=21;PP=644;SC=TGCTCCCACCAACTGCTGCAA;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=10;TCR=21;TR=31;WE=90188400;WS=90188382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr15	90188514	rs894159	A	G	1345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=12;PP=822;SC=GCTGGCCCAGAACCGTGGAGG;SOR=1.426;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=31;TCR=12;TR=43;WE=90188522;WS=90188504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr15	90190048	rs1110060	A	G	587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=7;PP=318;SC=ACCCAGCCTCACCCTCTTCTC;SOR=1.270;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=14;TCR=7;TR=21;WE=90190056;WS=90190038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	90191827	rs8037349	T	C	1156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=11;PP=568;SC=CCGCTCGCCGTCTCTTCGGGT;SOR=1.127;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=24;TCR=11;TR=35;WE=90191835;WS=90191817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr15	90192905	rs4932240	T	C	846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=2;PP=588;SC=AGGTAAGCACTCCACTCCAAA;SOR=3.334;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=26;WE=90192913;WS=90192895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr15	90195765	rs11630003	AA	GG	3199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=15;PP=1884;SC=GCAAGAGGACAAGGCAGAAAT;SOR=1.394;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=54;TCF=38;TCR=16;TR=50;WE=90195774;WS=90195755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr15	90195967	rs8179066	C	G	2712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=50;PP=1539;SC=CCTCCTGCCCCGCATCCTCGG;SOR=1.134;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=37;TCR=50;TR=87;WE=90195975;WS=90195957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr15	90196008	rs8179065	C	T	2297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=42;PP=1236;SC=AAGTGTCGGTCACGGCCCAGA;SOR=1.275;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=29;TCR=42;TR=71;WE=90196016;WS=90195998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr15	90210257	rs2304796	G	A	1610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.53;SOR=0.984;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr15	90210263	rs2304795	A	G	1554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.19;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr15	90211047	rs894162	A	T	317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=222;SC=GGCAGCAGATAGCTGGCTCAA;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=90211055;WS=90211037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	90213134	rs2304794	T	A	521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=5;PP=336;SC=CAGTGGCTGGTTGAGCCACCT;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=17;WE=90213142;WS=90213124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	90213229	rs6496589	G	C	1935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=29;PP=1302;SC=TCCTTGTCTGGAGGGAGGAGG;SOR=0.807;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=38;TCR=29;TR=67;WE=90213237;WS=90213219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr15	90214948	rs1077903	C	A	654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=16;PP=438;SC=TGCCCTCTTTCGCCCTTGTCT;SOR=2.030;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=22;WE=90214956;WS=90214938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr15	90233969	rs8029037	G	C	80.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=2;PP=27;SC=CGCTGAGGGGGAGGGGCTGAG;SOR=2.833;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=90233977;WS=90233959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	90248819	rs17238056	A	T	1037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=17;PP=608;SC=ATAAGGAAGGACTTTACCTAG;SOR=0.984;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=14;TCR=17;TR=31;WE=90248827;WS=90248809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr15	90258144	rs17238390	C	G	281.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=1;PP=234;SC=AGAAGACAGGCCATTTCTCAG;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=90258152;WS=90258134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	90273040	rs16943559	C	G	1119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=20;PP=600;SC=AAGCTCAGGACTTGCAGACAT;SOR=1.347;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=12;TCR=20;TR=32;WE=90273048;WS=90273030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr15	90273070	rs12148067	A	G	722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=16;PP=449;SC=CAGCTTAGCTAAGAGCATGTG;SOR=2.215;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=21;WE=90273078;WS=90273060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	90274639	rs5814401	T	TG	1215.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=7;NR=15;PP=779;SC=GTGCAGAGTCTGGGGGAACCG;SOR=0.743;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=24;TCF=9;TCR=15;TR=22;WE=90274647;WS=90274629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr15	90293776	rs2305441	A	C	1517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=14;PP=534;SC=CCTGCCCTTCAGGGCACGCCG;SOR=0.927;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=20;TCR=14;TR=34;WE=90293784;WS=90293766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr15	90293794	rs2305440	G	C	1423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=18;NR=12;PP=518;SC=CCGCCTCGGCGAACAGCGCAG;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=18;TCR=12;TR=30;WE=90293802;WS=90293784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr15	90294306	rs6496598	C	G	443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=8;PP=282;SC=GCGGGGCTCGCCACGGGGCTG;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=7;TCR=8;TR=15;WE=90294314;WS=90294296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	90320134	rs199821487	AGGGCAGGGGCAG	A	232.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=65.19;QD=38.80;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	90328551	rs10584	G	C	2233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=22;PP=1321;SC=CACCTTGCATGGGGGCCGGGT;SOR=1.522;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=49;TCR=22;TR=71;WE=90328559;WS=90328541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr15	90328774	rs71464487	A	AAC	1689.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=17;PP=812;SC=CTGGGTCCCTAACAGCCTTGA;SOR=1.923;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=18;WE=90328782;WS=90328764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr15	90333851	rs17239917	G	A	1504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=30;PP=851;SC=TGGGTAGGGAGCCATGATTAT;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=17;TCR=30;TR=47;WE=90333859;WS=90333841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr15	90340719	rs893615	G	A	2422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.05;SOR=1.262;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr15	90340725	rs3934	A	C	2478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.49;SOR=1.238;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr15	90393808	rs4932252	G	C	440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=9;NR=5;PP=226;SC=GGGCATATTCGTACTGTATTT;SOR=1.061;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=9;TCR=5;TR=14;WE=90393816;WS=90393798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	90414642	rs3759831	C	G	2707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=54;NR=39;PP=1529;SC=GAGGTGGCTACAGATGCCCAA;SOR=0.813;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=93;TCF=54;TCR=39;TR=93;WE=90414650;WS=90414632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr15	90420673	rs12440156	G	A	1506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=34;PP=901;SC=TAAAATACACGTAACATAAAA;SOR=2.093;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=12;TCR=34;TR=46;WE=90420681;WS=90420663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr15	90455940	rs1256836	G	C	306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=4;PP=225;SC=AGCCGGGGCAGGGGAGGCCGA;SOR=1.022;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=12;WE=90455948;WS=90455930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	90627616	rs60147683	T	C	2478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.82;SOR=0.919;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr15	90634684	rs11316815	CG	C	1014.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=15;NR=9;PP=648;SC=ACCAGGACAACGGGGGGGTCC;SOR=2.049;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=30;TCF=18;TCR=12;TR=24;WE=90634692;WS=90634674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr15	90634941	rs10852126	A	G	1020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=26;PP=734;SC=CTCTCCTCCCAGCCAGGCCCG;SOR=2.649;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=33;WE=90634949;WS=90634931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr15	90744960	rs11547964	G	A	257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.43;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	90760991	rs1543116	T	C	5776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=95;NR=86;PP=2965;SC=CCCTTTCTCATTCCCCAGCTG;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=182;TCF=96;TCR=86;TR=181;WE=90760999;WS=90760981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr15	90762951	rs3833824	A	AG	175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=0;PP=159;SC=TGGGTGTGGAAGGGGGGGCTC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=6;WE=90762959;WS=90762941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	90764202	rs7174036	A	G	1351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=29;NR=18;PP=738;SC=CCATGTGTCCACCCTCCTGCA;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=29;TCR=18;TR=47;WE=90764210;WS=90764192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr15	90764359	rs3826001	T	G	3475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=56;NR=60;PP=1805;SC=TTCATTGAGGTTCCATGTAGG;SOR=0.921;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=56;TCR=60;TR=116;WE=90764367;WS=90764349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr15	90765093	rs66795544	CG	C	251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=243;SC=TTTCCCATCCCGCCAAGGAGT;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=90765112;WS=90765083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	90765104	rs35147120	A	G	196.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=5;PP=113;SC=GCCAAGGAGTACAGCTTGGCT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=90765112;WS=90765083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	90768156	rs1040083	A	G	1172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.95;SOR=1.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr15	90784207	rs7166441	A	G	4329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=69;PP=2282;SC=GGACTGGGGCAGGCAAACCAT;SOR=0.834;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=141;TCF=72;TCR=69;TR=141;WE=90784215;WS=90784197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr15	90801584	rs2048707	G	C	391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=330;SC=GTACACTCAGGTGGTGGAACA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=90801592;WS=90801574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	90809633	rs9635390	G	A	3775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.86;SOR=0.749;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr15	90984724	rs371210081	GT	G	124.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=17.281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.90;ReadPosRankSum=0.693;SOR=0.020;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,10:0.31:32
chr15	91017232	rs1145325	G	A	4054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=63;PP=2335;SC=GGCCATTAGGGGCAATTTTGC;SOR=0.991;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=57;TCR=63;TR=120;WE=91017240;WS=91017222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr15	91040725	rs2301832	A	T	685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=17;PP=508;SC=TGAGGGTTTCAGCATGTCTGG;SOR=2.400;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=22;WE=91040733;WS=91040715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr15	91043192	rs72311245	ATGTTTTGTTT	A	1482.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=7;PP=2990;SC=AACTGTCAAAATGTTTTGTTT;SOR=2.368;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=18;TCF=9;TCR=9;TR=13;WE=91043209;WS=91043182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr15	91083353	rs8033595	G	A	3336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=61;PP=1921;SC=CTGCGGAGCAGTGCGTCAGAG;SOR=1.016;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=49;TCR=61;TR=110;WE=91083361;WS=91083343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr15	91141810	rs7180867	A	C	453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=11;PP=302;SC=AGATCCTAACATGAGTGTCTT;SOR=2.049;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=15;WE=91141818;WS=91141800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	91147512	rs1104880	A	G	3211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=41;PP=1913;SC=ACTCTTGCAGAGCGAGGTGAG;SOR=0.978;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=64;TCR=42;TR=104;WE=91147520;WS=91147502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr15	91181567	rs6496717	C	T	382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=11;NR=0;PP=290;SC=CACAGAACACCGCGGTGAGGA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=91181575;WS=91181557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	91337479	rs2227933	G	A	1259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=23;NR=22;PP=735;SC=AAAATATAACGGAATGCAGGA;SOR=0.866;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=45;TCF=23;TCR=22;TR=45;WE=91337487;WS=91337469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr15	91337623	rs3214113	AT	A	47.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=15.75;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	91341599	rs17273842	T	G	600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=7;NR=12;PP=336;SC=TTTGAGTTACTTCAATTGAAA;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=19;WE=91341607;WS=91341589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	91346923	rs2227934	C	A	853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=20;PP=677;SC=GAAATAAAGCCCAAACTGTAC;SOR=1.765;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=30;WE=91346931;WS=91346907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	91354505	rs1063147	C	T	1170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=23;NR=7;PP=782;SC=CTGAGGAGCTCGACGAGGAAA;SOR=2.073;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=30;WE=91354513;WS=91354495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr15	91358271	rs10685387	G	GGAA	1929.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=7;PP=1236;SC=CAGGTTGAGAGGAAGGTCATT;SOR=2.780;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=30;WE=91358279;WS=91358261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr15	91419432	rs11372849	T	TC	1195.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=7;NR=14;PP=839;SC=GTCCCCCGCCTCCCGGGGACT;SOR=1.121;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=24;TCF=10;TCR=14;TR=21;WE=91419440;WS=91419422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr15	91420940	rs2071410	C	G	1047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=19;NR=17;PP=521;SC=GCCACTTTCCCACTGTGGATC;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=19;TCR=17;TR=36;WE=91420948;WS=91420930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr15	91420973	rs1573643	T	C	612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=14;PP=337;SC=GGCTGTTCCATGGAGGGTTCC;SOR=1.519;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=23;TCF=8;TCR=15;TR=22;WE=91420981;WS=91420963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	91422543	rs8039305	T	C	470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=3;PP=348;SC=AGCTGGGACCTGGGGTTCTTG;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=91422551;WS=91422533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	91423543	rs6224	G	T	89.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=4;PP=80;SC=CAGCGCCGCCGCCTCTCACAG;SOR=1.609;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=91423551;WS=91423533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	91424574	rs6226	G	C	5294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-1.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.231;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=73;PP=2747;ReadPosRankSum=-0.569;SC=GCCCTCCAGGGTTCGCCCCCC;SOR=0.400;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=169;TCF=95;TCR=74;TR=168;WE=91424582;WS=91424564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,201:1.00:202
chr15	91425232	rs6227	C	T	278.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=229;SC=GTGGAGACTGCTTCCCATCCT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=91425240;WS=91425222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	91428521	rs11330240	CT	C	2664.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=28;PP=1438;SC=TGGGTGCTGGCTGTATCTGCC;SOR=0.990;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=34;WE=91428529;WS=91428511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr15	91428955	rs1894400	C	T	278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=211;SC=AACCTTGATGCAGCTTCCTCT;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=91428963;WS=91428945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	91430436	rs2071383	T	C	4972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=79;PP=2956;SC=GTGACAAGGCTAAGGACAAGT;SOR=0.929;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=151;TCF=72;TCR=79;TR=151;WE=91430444;WS=91430426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr15	91437388	rs2521501	A	T	1195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=28;PP=783;SC=CCCACCAGGCAGAATAAGAAT;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=36;WE=91437396;WS=91437378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr15	92293814	.	GTAGTAGTGGTAGCAGTGA	G	619	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MMLQ=24;MQ=58.07;NF=0;NR=2;PP=619;QD=319.0;SC=GACAGTAGTGGTAGTAGTGGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=2;WE=92293860;WS=92293804;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:8,2:0.20:10
chr15	92293838	.	G	A	127	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MMLQ=17;MQ=57.28;NF=0;NR=2;PP=127;QD=80.8856062736;SC=AGTGATGGTGGTGGAGACAGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=2;WE=92293860;WS=92293804;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:7,2:0.22:9
chr15	92293852	.	G	C	106	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MMLQ=27;MQ=56.96;NF=0;NR=2;PP=106;QD=70.3856062736;SC=AGACAGTAGTGGTGGAGGTGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=2;WE=92293860;WS=92293804;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,2:0.25:8
chr15	92397106	rs368016879	AGCG	A	835.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;MQ=60.98;NF=8;NR=4;PP=528;SC=GGAAAGCGGCAGCGGCGGCGG;SOR=2.531;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=12;WE=92397116;WS=92397096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	92397615	rs56403444	T	TC	1138.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=11;PP=485;SC=ACTATTCCTCTCCCCCCATAA;SOR=0.798;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=26;TCF=11;TCR=15;TR=15;WE=92397623;WS=92397605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr15	92397670	rs7173207	C	A	1469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=23;PP=764;SC=TGGAGAGGAACGAAAAAGCGT;SOR=0.800;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=45;TCF=22;TCR=23;TR=45;WE=92397678;WS=92397660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr15	92484837	rs8027174	G	T	2002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=32;NR=36;PP=1057;SC=CTTCGTCTTGGAGGTTTTGAA;SOR=0.798;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=68;TCF=32;TCR=36;TR=68;WE=92484845;WS=92484827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr15	92638193	rs2286355	G	A	3210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=51;PP=1822;SC=ACGTGGATGCGGTCTTCATTG;SOR=0.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=54;TCR=51;TR=105;WE=92638201;WS=92638183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr15	92638326	.	GCCTCT	G	772.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.45;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	92638331	.	T	TGAG	772.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.45;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	92638332	.	GT	G	368	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=9;PP=368;QD=45.6666666667;SC=CCCTGCCTCTGTAGCTGGGGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=92638340;WS=92638317;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	92638333	.	T	TG	772.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.93;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	92647645	rs1517618	G	C	4120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.08;SOR=0.771;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr15	92647834	rs917355	A	G	403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=4;NR=10;PP=239;SC=GGGGTGATGAATGAAGGGGTG;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=14;WE=92647842;WS=92647824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	92663630	rs6496893	A	G	938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=6;PP=617;SC=AGGAGCAGGGAGCTATAAGAT;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=29;WE=92663638;WS=92663620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr15	92937268	rs3743365	G	T	2597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.39;SOR=2.221;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr15	92937276	rs3743364	C	T	2702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.23;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr15	92977670	rs2242113	T	G	603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=18;PP=511;SC=GCAAATTGCTTCTCTTCGTCA;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=92977678;WS=92977660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	93016398	rs71412551	A	G	644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=15;PP=417;SC=AGGACCAGAAAAGAACAGGAA;SOR=3.160;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=93016406;WS=93016388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	93043545	rs7178722	T	G	2267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=25;PP=1133;SC=GGCTCCATGCTAATGACCTCG;SOR=0.997;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=47;TCR=25;TR=72;WE=93043553;WS=93043535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr15	93198671	rs501381	A	G	1573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=24;NR=23;PP=825;SC=AGGCGTCGCCACTGCTGTTGG;SOR=0.997;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=47;TCF=24;TCR=23;TR=47;WE=93198691;WS=93198661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr15	93198678	rs68056278	TTGGAGC	T	2083.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=16;PP=1112;SC=GCCACTGCTGTTGGAGCTGGA;SOR=0.866;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=20;WE=93198691;WS=93198661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr15	93198784	rs2438194	A	G	356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=10;PP=282;SC=GGTTCGGGCCACGGCGCGGAG;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=93198792;WS=93198774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	93306348	rs8032507	C	T	858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=20;PP=611;ReadPosRankSum=-0.193;SC=TGCTATGTGCCCACAAAAATT;SOR=0.516;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=9;TCR=20;TR=29;WE=93306356;WS=93306338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,35:0.97:36
chr15	93306367	rs10636472	G	GA	566.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=12;PP=299;SC=TTAGAAATTAGAAAAAAAAAG;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=12;WE=93306375;WS=93306357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	93306644	rs28493166	G	A	243.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=46;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=1;PP=210;SC=CTCGTGATCCGCCCACCTTGG;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=93306652;WS=93306634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	93306681	rs12594947	G	A	800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.47;QD=42.15;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	93306688	rs12910258	G	A	864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.52;QD=41.18;SOR=1.828;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	93487854	rs1320819	G	C	305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=9;PP=224;SC=CTAGACACGTGCTAGGTTTAT;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=93487862;WS=93487844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	93496874	rs1371390	C	T	245.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=6;PP=129;SC=TTAAAGCCTTCAGTAGATCAT;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=93496882;WS=93496864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	93510603	rs4777755	A	G	1654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=17;PP=837;SC=AGGGGAGAGAAAATGGCTACC;SOR=0.871;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=28;TCR=17;TR=45;WE=93510611;WS=93510593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr15	93521604	rs11074121	A	G	2277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=41;PP=1258;SC=GAATTGGTCAAAAGAAGCAGG;SOR=1.005;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=37;TCR=41;TR=78;WE=93521612;WS=93521594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr15	93521651	rs11074122	T	G	626.81	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.033;HP=5;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=20;PP=627;ReadPosRankSum=-0.134;SC=GCTTTAGGGTTGGGGGCCAGG;SOR=1.981;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=11;TCR=21;TR=30;WE=93521659;WS=93521639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,26:0.93:28
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chr15	93552330	rs12915582	C	T	1647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=13;PP=868;SC=ACAAGACTTACTTTCTGCAGA;SOR=1.850;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=37;TCR=13;TR=50;WE=93552338;WS=93552320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr15	93563661	rs964034	G	C	77.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=56;SC=GTTTTGTTTTGTGGGTCATAG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=93563669;WS=93563651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	93567526	rs28558199	G	A	1060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=6;PP=514;SC=ATGAGGAAGAGCCAAGTGGGT;SOR=1.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=28;WE=93567534;WS=93567516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr15	93588336	rs4238485	A	C	3523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=2.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.206;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=45;PP=1890;ReadPosRankSum=-0.509;SC=CCCGAGTCCTATCATACAGGT;SOR=0.390;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=108;TCF=62;TCR=46;TR=107;WE=93588344;WS=93588326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,135:0.99:136
chr15	93595855	rs1997382	T	C	384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=14;PP=312;SC=GAGCCACCCATGCCACACACA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=93595863;WS=93595845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	93609460	rs11074135	A	T	2040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=28;PP=1071;SC=CGCTGCGCAGAAACTTCCTGG;SOR=0.887;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=38;TCR=28;TR=66;WE=93609468;WS=93609450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr15	93609617	rs4778090	A	G	1338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.32;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr15	93616283	rs112633977	A	AAGG	2832.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=5;NR=26;PP=863;SC=TTCAGAAAAAAAGAAGAAAAT;SOR=0.966;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=31;WE=93616291;WS=93616273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr15	93616933	rs55816698	C	G	4803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=77;NR=72;PP=2623;SC=CTCTGCATCTCAGCTACTAAC;SOR=0.839;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=149;TCF=77;TCR=72;TR=149;WE=93616941;WS=93616923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr15	93616975	rs4598860	A	G	2922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=46;NR=55;PP=1648;SC=TCGTGGCCCCAGGCCACCCAT;SOR=1.028;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=101;TCF=46;TCR=55;TR=101;WE=93616983;WS=93616965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr15	93844616	rs12914371	T	A	226.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=2;PP=172;SC=GACTTCTTAGTGGTAGCACCT;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=93844624;WS=93844614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	93844762	rs12909691	C	T	1587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=20;PP=944;SC=TTCGTCCAACCTTTTGGATTG;SOR=1.140;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=29;TCR=20;TR=49;WE=93844770;WS=93844752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr15	93844836	rs34239935	G	A	4615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.81;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr15	93844843	rs12914719	T	A	4622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.03;SOR=0.791;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr15	93844947	rs41446745	G	T	1199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=27;PP=761;SC=ACAGTTCAAGGTCTCATTAAA;SOR=2.093;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=11;TCR=27;TR=38;WE=93844955;WS=93844937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr15	94841440	.	A	AGTT	656	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;FR=1.0000;HP=1;HapScore=3;MGOF=3;MMLQ=27;MQ=61.07;NF=13;NR=1;PP=656;QD=49.9285714286;SC=GAGTCATTGCAGTTTTCAGTA;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=94841448;WS=94841410;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	94841691	rs61737195	G	A	1447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=26;PP=986;SC=CCAGAGGGCCGGCCTTACTCC;SOR=1.426;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=17;TCR=26;TR=43;WE=94841699;WS=94841681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr15	94842034	rs117268644	C	T	327.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.42;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	94883599	rs10152496	T	C	485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=4;NR=11;PP=296;SC=ATGACAAAAATAACATATCTG;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=15;WE=94883607;WS=94883589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	94884108	rs8025851	G	C	1609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=36;NR=13;PP=1033;SC=GAGTGATCGTGTTAAATTTGA;SOR=1.877;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=36;TCR=13;TR=49;WE=94884116;WS=94884098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr15	94927493	rs3217405	AT	A	116.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=154;SC=GTATCCTTTCATTTTTATAGA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=94927501;WS=94927483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	94942497	rs2289009	T	C	225.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.55;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=123;SC=ATAGAGTATGTATACTGGTAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=94942505;WS=94942487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	94945719	rs7178698	G	T	4508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=61;PP=2636;SC=ATTCAGCACCGCAAAGAGGAA;SOR=0.918;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=146;TCF=85;TCR=61;TR=146;WE=94945727;WS=94945709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr15	96876611	rs7173047	T	A	263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=6;PP=185;SC=CCTCGCCGGCTTTCCCCGGCC;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=96876619;WS=96876601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	96880510	rs3833035	ATTC	A	845.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=3;PP=645;SC=TGATGACTGAATTCTTCTTCT;SOR=2.531;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=14;WE=96880520;WS=96880500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	98301845	rs2048115	C	T	587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=12;PP=377;SC=TTTTTTCCAGCTTTAAGTTCA;SOR=1.085;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=9;TCR=12;TR=21;WE=98301853;WS=98301835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	98302002	rs143322276	TAAC	T	98.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=119;SC=GAACAATTTTTAACAATAGTG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=98302012;WS=98301992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	98512431	rs61747226	C	T	2960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=62;NR=33;PP=1505;SC=ATTTTCCAAACGCAGACATAT;SOR=1.061;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=62;TCR=33;TR=95;WE=98512439;WS=98512421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr15	98995052	rs56374714	G	GT	3153.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=25;PP=1981;SC=CACAAGGGGGGTTACCTTGGT;SOR=0.878;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=23;TCR=28;TR=46;WE=98995060;WS=98995042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr15	98995081	rs12101356	A	G	2812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.42;NF=43;NR=30;PP=1364;SC=GGAGACATCGAGCAGCTAACC;SOR=0.946;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=43;TCR=30;TR=73;WE=98995089;WS=98995071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr15	99456253	rs2272037	T	C	1523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=17;PP=692;SC=GAACTTTCTCTGAACTTAATT;SOR=1.123;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=29;TCR=17;TR=46;WE=99456261;WS=99456243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr15	99465274	rs28637929	C	T	627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=5;PP=408;SC=TCAATAGCTCCTTCTATTCCA;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=20;WE=99465282;WS=99465264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	99472734	rs4486868	T	C	2254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=27;PP=1207;SC=AGAAATGAAATGAGCAAATTG;SOR=1.192;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=47;TCR=27;TR=74;WE=99472742;WS=99472724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr15	99477911	rs2715449	T	G	337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=1;PP=269;SC=AAAGTTGACATCAAGCCATGC;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=99477919;WS=99477901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	99478225	rs2229765	G	A	2270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=40;PP=1307;SC=GCATGCGTGAGAGGATTGAGT;SOR=1.005;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=34;TCR=40;TR=74;WE=99478233;WS=99478215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr15	99478493	rs10400894	T	C	269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQ=60.98;NF=6;NR=3;PP=144;SC=AACACAGGCATCAGCAAGGGC;SOR=1.270;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=9;WE=99478513;WS=99478483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	99478505	rs34389972	A	AC	314.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=4;PP=186;SC=AGCAAGGGCCACCTGACCCTC;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=99478513;WS=99478483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	99478713	rs2293117	T	C	2708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=39;PP=1624;SC=TTTTCCTTTATAATCTCCCTG;SOR=0.795;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=49;TCR=39;TR=88;WE=99478721;WS=99478703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr15	99511873	rs2715423	G	A	2641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=44;PP=1517;SC=GATGAGTGCCGCGCAGCCCTT;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=39;TCR=44;TR=83;WE=99511881;WS=99511863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr15	99544429	rs2593051	G	A	1553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=36;NR=8;PP=920;SC=GAGAGTCCGCGGCTTCATTCT;SOR=2.137;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=36;TCR=8;TR=44;WE=99544437;WS=99544419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr15	99646107	rs60530833	A	AG	366.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.56;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=3;PP=68;SC=CGCAGGAGGCAAGGCGCTGCG;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=99646115;WS=99646097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	99762041	rs78534478	C	T	1616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=25;PP=799;SC=TGCTACGCAACGCACAAGCTC;SOR=0.986;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=25;TCR=25;TR=50;WE=99762049;WS=99762031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr15	100230908	rs325385	T	C	102.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=3;PP=76;SC=AAGCCAGGCATAGAAAGATAG;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=100230916;WS=100230898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	100243487	rs34131461	GT	G	934.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=3;PP=679;SC=GTCCAAATATGTTTTTTCTAA;SOR=3.193;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=22;WE=100243495;WS=100243477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr15	100246834	rs325409	T	G	206.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=136;SC=GAAAATGACATTCATATGAAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=100246842;WS=100246824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	100246936	rs325408	T	C	3169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.94;SOR=1.054;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr15	100246942	rs325407	G	A	3251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.36;SOR=1.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr15	100252892	rs34851361	A	G	3756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=68;NR=55;PP=2044;SC=TCCATTCTCCAATTGTGCTTG;SOR=0.821;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=123;TCF=68;TCR=55;TR=123;WE=100252900;WS=100252882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr15	100269309	rs6598263	T	G	891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=5;PP=648;SC=AAGCTGGGCCTAGTCTTTAAA;SOR=2.899;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=33;WE=100269317;WS=100269299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr15	100269796	rs6598264	A	G	2526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=44;PP=1630;SC=CTGTGGTCTCAGAAGACGGGC;SOR=1.080;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=36;TCR=44;TR=80;WE=100269804;WS=100269786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr15	100271253	rs12185079	C	T	922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=19;NR=12;PP=529;SC=AAAGAGATTTCTTAAATTAAG;SOR=1.002;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=19;TCR=12;TR=31;WE=100271261;WS=100271243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr15	100272337	rs73466515	A	G	137.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=5;PP=107;SC=CTCAGCATACATCATCAACAG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=100272345;WS=100272327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	100604019	rs77341156	C	T	651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=15;PP=423;SC=CACCAGAGGCCGTGCAGCATC;SOR=2.030;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=21;WE=100604027;WS=100604009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr15	100649465	rs142688382	C	CCAGCTCCTCTAAACACGCGGCA	186.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.37;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	100649473	rs75158695	C	T	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	100657065	rs34558152	G	A	1581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=34;NR=18;PP=819;SC=CAACCACCACGGCTGTCAGCA;SOR=0.986;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=34;TCR=18;TR=52;WE=100657073;WS=100657055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr15	100672237	rs12907333	T	G	3768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=71;NR=60;PP=2089;SC=TTCCTCTGCCTGAAGCGGGCT;SOR=0.706;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=132;TCF=71;TCR=61;TR=131;WE=100672245;WS=100672227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr15	100692782	rs7162227	C	G	1192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=15;PP=766;SC=TGGATCCATGCTCTGTCCCGA;SOR=1.312;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=25;TCR=15;TR=40;WE=100692790;WS=100692772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr15	100794172	rs7172834	T	A	351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=248;SC=TAACTTCAAATCATTTCAGGA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=100794180;WS=100794162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	100794363	rs4369638	C	T	2429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=36;PP=1206;SC=ACGGTTCATCCTTGTGTACAC;SOR=1.204;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=68;TCF=32;TCR=36;TR=68;WE=100794371;WS=100794353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr15	100801698	rs4965613	G	A	1031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=9;PP=578;SC=TCACAAACACGGCAGCATCCA;SOR=1.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=33;WE=100801706;WS=100801688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr15	100801965	rs6598316	G	T	602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=16;PP=461;SC=GATGACTCACGGCCCTCGAAG;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=100801973;WS=100801955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	100802495	rs4965296	G	A	1360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.36;SOR=1.143;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	100802499	rs4965297	A	G	1392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.21;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr15	100871329	rs11639041	G	A	1182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=28;PP=845;SC=CCCCCCGGAGGGGCAGGCAAG;SOR=1.981;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=40;TCF=11;TCR=29;TR=39;WE=100871337;WS=100871319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr15	100881612	.	CAG	C	40.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.18;ReadPosRankSum=1.383;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,2:0.50:4
chr15	100889496	rs2289584	T	G	2413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=38;PP=1357;SC=GACAGCTCGATTCTGATGGGC;SOR=0.738;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=44;TCR=38;TR=82;WE=100889504;WS=100889486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr15	100942843	rs1023782	G	T	41.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=0;PP=24;SC=ATGTGGGGTCGGTGTGGGGCC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=100942851;WS=100942840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr15	100942962	rs2439928	T	C	1067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=9;PP=623;SC=CTCTCAGCCCTGAGGCCGTTC;SOR=1.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=23;TCR=9;TR=32;WE=100942970;WS=100942952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr15	100996038	rs12595207	C	T	2778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=33;PP=1590;SC=TTCAACAGTCCGGGCCTCACC;SOR=1.125;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=59;TCR=33;TR=92;WE=100996046;WS=100996028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr15	101009474	rs34108242	A	T	181.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=8;NR=0;PP=159;SC=CACTTGACACAAATAACTGGA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=101009482;WS=101009470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	101009530	rs12909732	G	A	1100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=28;NR=7;PP=742;SC=ACCATGCACTGAGGCCACCTC;SOR=2.613;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=35;WE=101009538;WS=101009520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr15	101019529	rs2654574	C	T	521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=6;PP=257;SC=AGGGATGACACAGTAGTGAAC;SOR=0.990;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=10;TCR=6;TR=16;WE=101019537;WS=101019519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	101019693	.	GA	G	42.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.26;ReadPosRankSum=1.565;SOR=0.460;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,7:0.21:34
chr15	101019819	rs2587763	G	T	109.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=84;SC=ATTGACCTTTGCCATATTCTT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=101019827;WS=101019809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	101041896	rs1354332	T	C	1813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=39;NR=21;PP=1057;SC=CAAATACACGTCTGATAATCA;SOR=1.244;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=39;TCR=21;TR=60;WE=101041904;WS=101041886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr15	101112342	rs1493652	T	C	476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=14;PP=380;SC=TATATATAAATTCATAGTGTC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=101112350;WS=101112332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	101113862	rs12719734	C	T	2314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=29;PP=1218;SC=TTACCTTTCACTTCACTTGCT;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=47;TCR=29;TR=76;WE=101113870;WS=101113852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr15	101114482	rs34231390	AAC	A	882.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=627;SC=AAACAGGAAAAACAGTCTTCT;SOR=2.200;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=101114491;WS=101114472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	101152745	rs4965683	A	C	530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=14;PP=393;SC=TACTCAACATATTATTCTCTC;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=101152753;WS=101152735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	101550858	rs12595297	G	T	36.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=16;NR=4;PP=391;SC=TCATACTTTGGGTCTTTTTTT;SOR=2.303;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=31;TCF=18;TCR=13;TR=20;WE=101550869;WS=101550848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr15	101561980	rs146724273	CGTGTGTGTGTGTGT	CGT,C	481.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=8,8;NR=0,0;PP=60,354;SC=CACGTGTGTGCGTGTGTGTGT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=8,8;WE=101562001;WS=101561970;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:12
chr15	101562793	rs11247253	G	A	687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=16;PP=492;SC=CGGCTGGCTCGAGAGCCAAGG;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=21;WE=101562801;WS=101562783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	101566118	rs4427776	C	T	1119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=7;PP=778;SC=TCTGTCCTGTCCCTTGTTCCA;SOR=2.554;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=34;WE=101566126;WS=101566108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr15	101569467	rs11639307	T	C	1323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=28;PP=708;SC=CGCCAGGCTGTGCAGGTTGCT;SOR=1.244;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=19;TCR=28;TR=47;WE=101569475;WS=101569457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr15	101591857	rs10710683	CG	C	1391.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=18;NR=12;PP=911;SC=GAGTGCTGCTCGGGGGGCCCT;SOR=1.765;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=34;TCF=20;TCR=14;TR=30;WE=101591865;WS=101591847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr15	101593641	rs11631875	G	A	645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.83;SOR=1.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	101598200	rs11857803	G	A	3281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=61;NR=48;PP=1701;SC=CTCAGCGACCGCTGGCCCTGT;SOR=0.758;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=61;TCR=48;TR=109;WE=101598208;WS=101598190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr15	101598314	rs11853661	C	T	1485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=27;PP=841;SC=AGGAGTACACCGTGGTGTTTT;SOR=1.123;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=24;TCR=27;TR=51;WE=101598322;WS=101598304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr15	101601367	rs148929418	C	CACTT	3999.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.59;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=17;PP=1393;SC=CAGTTTCTGCCACTTACAGGA;SOR=0.947;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=29;TCF=10;TCR=19;TR=25;WE=101601375;WS=101601357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr15	101605847	.	G	A	4073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=76;NR=57;PP=2499;SC=CCCCCTCCATGGTTACGTCAG;SOR=0.881;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=133;TCF=76;TCR=57;TR=133;WE=101605855;WS=101605837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr15	101607513	rs2925201	T	C	2329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=40;PP=1216;SC=GTCTACATGGTTGCAGTGATG;SOR=1.039;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=35;TCR=40;TR=75;WE=101607521;WS=101607503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr15	101826919	rs28698071	G	A	74.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=114;SC=CATTACATAAGAGAGCTCCAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=101826927;WS=101826909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	101827759	rs35525027	T	C	845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=8;PP=475;SC=ATGGTGCATATGTGCCACATT;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=28;WE=101827767;WS=101827749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr15	101827855	rs61752834	C	T	1445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=21;PP=792;SC=TATGTAATTCCCATACCTTAG;SOR=0.770;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=21;TCR=21;TR=42;WE=101827863;WS=101827845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr15	101832387	rs8028930	A	G	183.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=148;SC=AAGCAAAAAGAACCCTTTTCT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=101832395;WS=101832377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	101862690	rs36022203	G	T	1941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=20;PP=1176;ReadPosRankSum=1.235;SC=CAGCGCCACCGCCCTGACATT;SOR=0.546;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=64;TCF=44;TCR=20;TR=63;WE=101862698;WS=101862680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,71:0.99:72
chr15	101862970	rs1871975	T	C	214.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=6;PP=144;SC=CAGAGGCCGCTTGTACCTGGT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=101862978;WS=101862960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	101871941	rs34318939	G	GA	2271.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=30;PP=1626;SC=CCAGGCAAGAGAGACACACAA;SOR=1.107;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=36;WE=101871949;WS=101871931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr15	101887767	rs2949	C	T	279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=9;NR=1;PP=215;SC=TGCACGCACACGCATTCATGC;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=101887775;WS=101887757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	101887794	rs1030	T	C	297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=1;PP=234;SC=TCAACAACTGTTTGTGAGCCA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=101887802;WS=101887784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	101888081	rs875293	C	T	241.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=197;SC=GAGGAAGCGCCCGGGGTTGAC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=101888089;WS=101888071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	101929632	rs33912717	AT	A	1353.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=1.413;HP=12;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=25;PP=370;ReadPosRankSum=0.506;SC=CAATCTAAACATTTTTTTTTT;SOR=0.477;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=43;TCF=11;TCR=32;TR=32;WE=101929641;WS=101929622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:8,67:0.89:75
chr15	101929825	rs6598460	G	C	351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=9;PP=269;SC=AACTCACTCTGTGGAGAAGGC;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=101929833;WS=101929815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	101970284	rs76959991	G	A	2603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=48;NR=41;PP=1478;SC=AAATGGAATCGTGGTGAGTGA;SOR=0.713;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=48;TCR=41;TR=89;WE=101970292;WS=101970274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr15	101970308	rs2643354	G	A	2641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=43;PP=1473;SC=GAAATGGCATGTGACAGCTCT;SOR=0.823;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=43;TCR=44;TR=86;WE=101970316;WS=101970298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr15	101970323	rs3825896	G	T	2121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=37;PP=1338;SC=AGCTCTGTTTGAAATGGATTT;SOR=0.927;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=31;TCR=37;TR=68;WE=101970344;WS=101970313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr15	101970336	rs3825895	T	C	1954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=37;PP=1103;SC=ATGGATTTTATGTTCCGTTGG;SOR=0.934;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=30;TCR=37;TR=67;WE=101970344;WS=101970313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr15	101971388	rs2643356	T	C	391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=284;SC=TCCTAATTCTTTCCAGCATAG;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=101971396;WS=101971380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	102003442	rs12907397	C	T	1921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=25;PP=818;SC=ATGGGAGAGACGAGAGAGGCA;SOR=1.042;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=27;TCR=25;TR=52;WE=102003450;WS=102003432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr15	102029685	rs199543153	G	GGC	1597.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=15;PP=696;SC=GCGCGGCGGGGGCGGAGCAGG;SOR=1.040;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=102029693;WS=102029675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr15	102191869	rs672314	G	A	1438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=12;PP=959;SC=ATAACTACATGTATTTACTAG;SOR=2.004;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=35;TCR=12;TR=47;WE=102191877;WS=102191859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr15	102192418	rs3743188	C	T	1310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=11;PP=788;SC=CTCGCAGCTCCCGGGGCCCTG;SOR=1.559;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=28;TCR=11;TR=39;WE=102192426;WS=102192408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr15	102192548	rs2939587	A	C	2280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=35;NR=39;PP=1010;SC=CCTCAGCGGGAGCACCCCTCC;SOR=0.990;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=35;TCR=39;TR=74;WE=102192556;WS=102192538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr15	102226333	rs28640036	T	C	640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.64;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	102251993	rs11247320	G	A	692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=5;PP=454;SC=GTAAGGGCCAGCAGTATACAG;SOR=2.124;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=22;WE=102252001;WS=102251983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	102264304	rs1143138	G	C	780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=11;PP=421;SC=CTGTGCGCCGGCCTCCTGCGC;SOR=0.906;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=14;TCR=11;TR=25;WE=102264312;WS=102264294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr15	102284542	rs71154345	AG	A	674.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=4;PP=670;SC=CAAATTGGGTAGGGTGAAGGG;SOR=2.531;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=17;WE=102284550;WS=102284532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	102291867	.	G	A	3606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=59;NR=60;PP=1947;SC=CAACAAGACCGTGTGGAACCT;SOR=0.768;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=59;TCR=60;TR=119;WE=102291875;WS=102291857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr15	102291955	rs397212	G	A	1760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=32;PP=985;SC=GGGGGTAGGCGGCTCCTGTGG;SOR=1.112;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=23;TCR=32;TR=55;WE=102291963;WS=102291945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr15	102312315	rs57638732	GA	G	2736.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=33;PP=1765;SC=GCTTCACCTGGAAGGGAGGGG;SOR=0.892;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=50;TCF=14;TCR=36;TR=45;WE=102312323;WS=102312305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr16	81639	rs118023239	C	A	892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.18;QD=30.79;SOR=5.353;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr16	103423	rs2541593	C	A	3901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=38;PP=2133;SC=AGTCGGAGGACGCGGAAGGCC;SOR=1.352;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=71;TCR=39;TR=109;WE=103431;WS=103413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr16	103449	rs11376822	C	CG	7343.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=30;NR=60;PP=2973;SC=GAGTCGCCCGCGCCCAGCGCC;SOR=1.083;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=93;TCF=33;TCR=60;TR=90;WE=103457;WS=103439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr16	103517	rs183360	A	C	7577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=120;NR=114;PP=2965;SC=GTGTTGCAGGAGAAGCGGTGG;SOR=0.707;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=234;TCF=120;TCR=114;TR=234;WE=103525;WS=103507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,288:1.00:288
chr16	103923	rs2562145	C	G	4287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=56;PP=2298;SC=AGACGGAGGCCGCGGGTGGGC;SOR=1.035;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=146;TCF=90;TCR=56;TR=146;WE=103931;WS=103913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr16	105320	rs216596	A	G	1285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.34;SOR=3.334;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr16	105325	rs2858042	G	A	1340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.90;SOR=3.545;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr16	105444	rs2541594	C	T	5601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=76;PP=2965;SC=CACTTCTGCCCTTGGTCTTTT;SOR=0.902;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=184;TCF=108;TCR=76;TR=184;WE=105452;WS=105434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr16	106777	rs216597	G	C	695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=17;PP=503;SC=GCAGAGGGCAGCTGGAGGGGC;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=106785;WS=106767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	106952	rs11435836	G	GC	784.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=0;PP=897;SC=GATGGCCACTGCACTTCCTGG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=20;WE=106960;WS=106942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr16	107275	rs1045001	T	G	1279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=31;PP=914;SC=TGCCCAACAGTAACTGTCAGC;SOR=2.356;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=41;WE=107283;WS=107265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr16	108585	rs216598	T	C	7815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=127;NR=143;PP=2965;SC=TGATGAACCCTGAGATGTGGG;SOR=0.901;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=270;TCF=127;TCR=143;TR=270;WE=108593;WS=108575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,294:1.00:294
chr16	108796	rs34941405	T	TG	3409.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=39;PP=1901;SC=GCAGTGGGGCTGGCAGGCCCC;SOR=1.132;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=46;TCF=6;TCR=40;TR=45;WE=108804;WS=108786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr16	109671	rs216599	A	G	8058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=136;NR=146;PP=2965;SC=GAGAAGGCACACCCTAGGGCG;SOR=0.856;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=283;TCF=137;TCR=146;TR=282;WE=109679;WS=109661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,303:1.00:303
chr16	110165	rs216600	T	C	5423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=113;NR=78;PP=2965;SC=TGGCATTCTCTCCCACATGAC;SOR=1.025;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=194;TCF=113;TCR=81;TR=191;WE=110173;WS=110155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr16	110925	rs2562146	T	C	1657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=9;PP=1152;SC=AATCAGATGATGGTCTACGGG;SOR=2.644;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=56;TCF=46;TCR=10;TR=55;WE=110933;WS=110915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr16	112151	rs216602	A	G	169.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.22;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	112513	rs216604	T	C	1999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=52;NR=9;PP=1489;SC=TCTCTGCCCCTCTTCCCTGCC;SOR=3.056;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=52;TCR=9;TR=61;WE=112521;WS=112503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr16	113883	rs10659183	G	GCC	6451.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=59;PP=2967;SC=GGGGCAGCATGCTGCCCCCAG;SOR=0.996;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=96;TCF=25;TCR=71;TR=84;WE=113894;WS=113873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr16	113886	rs11285099	GC	G	6556.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=64;PP=2850;SC=GCAGCATGCTGCCCCCAGGCC;SOR=0.959;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=89;TCF=21;TCR=68;TR=85;WE=113894;WS=113873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr16	113970	rs2157115	T	C	4231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;MQRankSum=0.337;NF=74;NR=75;PP=2488;ReadPosRankSum=1.339;SC=AGCCACCCCCTGAACTGTTAG;SOR=0.767;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=151;TCF=75;TCR=76;TR=149;WE=113978;WS=113959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,166:0.99:168
chr16	114535	rs2562147	A	G	2913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=44;NR=62;PP=1911;SC=GAGAGCGGTCAGTATCCAGAA;SOR=1.148;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=44;TCR=62;TR=106;WE=114543;WS=114525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr16	128179	rs2562162	T	C	901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.52;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr16	136888	rs743725	T	C	2520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=56;PP=1435;SC=GATGGGTGGGTGTGAGCCCAA;SOR=1.402;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=33;TCR=56;TR=89;WE=136896;WS=136878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr16	138772	rs57321480	A	AG	7321.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=23;NR=56;PP=2957;SC=ATGCTCCGACAGCTGGCCAGC;SOR=0.767;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=84;TCF=26;TCR=58;TR=79;WE=138780;WS=138762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr16	142714	rs1128426	C	T	2551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=66;PP=1620;ReadPosRankSum=-2.155;SC=GCTCGGCCAGCGGGGAGTACC;SOR=0.685;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=206;TCF=92;TCR=114;TR=117;WE=142722;WS=142704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,122:0.55:223
chr16	142825	rs2541618	T	C	872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=23;PP=690;SC=GGCAGGTGGGTCAGGACAGTG;SOR=3.690;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=26;WE=142833;WS=142815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr16	148352	rs2541616	G	A	3825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=47;NR=87;PP=2588;SC=ACCCTGCACCGGGTATGCACC;SOR=1.493;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=135;TCF=47;TCR=88;TR=134;WE=148360;WS=148342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr16	160668	rs808892	T	C	1964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=53;PP=1551;SC=GCCTCAGCCTTCCAAGTAGCT;SOR=3.223;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=9;TCR=53;TR=62;WE=160676;WS=160658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr16	188303	.	AGAGGAGGACGGAGCCGGAGGCGGAGGGGGCCT	A	366.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.369;ClippingRankSum=0.000;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=2.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.26;MQRankSum=2.662;QD=20.37;ReadPosRankSum=-1.028;SOR=1.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr16	203093	rs370948553	A	C	80.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQRankSum=0.842;QD=16.15;ReadPosRankSum=0.842;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr16	203093	.	AG	CA	43	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=54;MMLQ=28;MQ=45.31;NF=3;NR=0;PP=43;QD=32.1559582874;SC=GGGAGGGGACAGTGGGGAGGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=3;WE=203102;WS=203083;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr16	203094	.	G	A	80.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=-0.000;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQRankSum=0.842;QD=16.15;ReadPosRankSum=0.842;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr16	203132	rs2541598	C	G	273.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.11;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr16	203135	rs2858919	T	A	241.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.31;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr16	213310	.	GGAGGGGACAGTGAGTAGGAGACAGTGGGGAGAGGACAGTGGA	G	85.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=17.15;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr16	216190	rs11431675	C	CG	5291.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=24;NR=66;PP=2966;SC=TGCGGATCCCCGGGCTCTGGG;SOR=0.944;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=102;TCF=26;TCR=76;TR=90;WE=216198;WS=216180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr16	216420	rs118054833	G	T	1605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.359;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=33;PP=811;ReadPosRankSum=3.081;SC=CGCTGAGCCCGCTGGCGGACC;SOR=0.971;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=110;TCF=55;TCR=55;TR=62;WE=216428;WS=216410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,75:0.59:127
chr16	223706	rs2541640	A	G	2252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=56;PP=1666;SC=CTGAGTGGGCAGCAGCCTGTG;SOR=3.321;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=11;TCR=56;TR=67;WE=223714;WS=223696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr16	223735	rs2685121	A	G	1104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=32;PP=890;SC=GGTTCTCTCTATCCCGGAATG;SOR=4.921;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=35;WE=223743;WS=223725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr16	230455	rs141942919	G	T	36.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr16	230578	rs11863726	A	G	956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.198;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=6;PP=626;ReadPosRankSum=-0.562;SC=AGGCCCTGGAAAGGTGCGGCA;SOR=1.063;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=75;TCF=59;TCR=16;TR=36;WE=230586;WS=230568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,39:0.49:80
chr16	240280	rs1211375	A	C	1332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=25;PP=935;SC=TCCATCAGTTAATCTCCAATG;SOR=2.613;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=34;TCF=8;TCR=26;TR=33;WE=240288;WS=240270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr16	277064	rs72765805	C	G	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=1;PP=536;ReadPosRankSum=-0.804;SC=CACAGAGTGACACTCCATCGC;SOR=0.784;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=23;WE=277072;WS=277054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,24:0.71:34
chr16	277124	rs17135705	A	C	2888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.178;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=41;PP=2007;ReadPosRankSum=0.850;SC=TGCCATAATTAAGCCACTTAG;SOR=0.832;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=182;TCF=119;TCR=63;TR=119;WE=277132;WS=277114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,125:0.62:201
chr16	277458	rs1203974	G	A	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=54;ReadPosRankSum=-0.619;SC=CCCATCAAATGCAATGAAAAG;SOR=0.269;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=5;WE=277466;WS=277448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr16	277912	rs8045291	A	G	1634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.703;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=18;PP=966;ReadPosRankSum=-0.519;SC=CACTTTTAACAAGACAATACC;SOR=0.807;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=127;TCF=92;TCR=35;TR=67;WE=277930;WS=277902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,74:0.53:139
chr16	284556	rs7191945	G	C	1770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.53;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr16	284833	rs7202423	T	G	1752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=38;PP=1112;SC=AGCGGCGCGGTCGGGTGAGAG;SOR=1.850;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=18;TCR=38;TR=56;WE=284841;WS=284823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr16	304409	rs117105880	C	T	3241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.994;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=55;PP=2149;ReadPosRankSum=1.017;SC=GGGATGTGCCCGTGATGTTGG;SOR=0.827;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=270;TCF=162;TCR=108;TR=144;WE=304417;WS=304399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,150:0.52:289
chr16	304514	rs3213508	C	T	3787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.503;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=85;PP=2261;ReadPosRankSum=1.962;SC=ATGAGGATAACGTGAAAAGCG;SOR=0.555;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=278;TCF=123;TCR=155;TR=155;WE=304522;WS=304504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,175:0.57:309
chr16	309720	rs56337617	C	T	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=4.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.144;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=456;ReadPosRankSum=1.514;SC=GAACCCATCTCGTCATCCTTC;SOR=3.352;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=3;TCR=34;TR=21;WE=309728;WS=309710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,20:0.53:38
chr16	310243	rs56284809	G	A	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.687;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=160;ReadPosRankSum=-0.027;SC=AGGAGGCCGCGACGAGGCTCA;SOR=1.609;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=24;TCF=10;TCR=14;TR=10;WE=310251;WS=310233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr16	311970	.	CTCTCTTCCTGGGCCTTGTGTCATTGCAGCCCCAGGCTCAGGTCCT	C	1372.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.698;ClippingRankSum=0.000;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.55;ReadPosRankSum=-1.357;SOR=0.716;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,39:0.53:74
chr16	311992	.	A	C	107	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=28;MQ=58.52;NF=8;NR=1;PP=107;QD=15.7523569497;SC=GCCTTGTGTCATTGCAGCCCC;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=9;WE=312000;WS=311982;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:22,9:0.29:31
chr16	312253	rs10903013	A	G	1484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.349;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=37;PP=959;ReadPosRankSum=-0.987;SC=ATCCCTGGCCAGCCTCACTCG;SOR=1.098;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=114;TCF=54;TCR=60;TR=63;WE=312261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,68:0.55:124
chr16	313202	rs2239738	C	A	1292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.521;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=10;PP=805;ReadPosRankSum=0.721;SC=AGAGCCTCCACTGGGTGCCTG;SOR=0.396;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=69;TCF=55;TCR=14;TR=48;WE=313210;WS=313192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,53:0.69:77
chr16	313406	rs7189326	A	G	2422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.392;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=47;PP=1217;ReadPosRankSum=0.571;SC=CCTGAGGTACAGGGTTTCCCC;SOR=0.432;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=197;TCF=90;TCR=107;TR=99;WE=313414;WS=313396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,119:0.52:231
chr16	313848	rs12325227	C	T	1932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.606;HP=4;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=42;PP=1307;ReadPosRankSum=0.868;SC=GCAGACGGGGCTGCGGCCCAG;SOR=0.623;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=59;TCR=77;TR=74;WE=313856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,82:0.54:151
chr16	322934	rs9940585	C	T	3411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=69;NR=51;PP=2070;SC=CCCCGGGCTGCGGAGGGGAGA;SOR=0.879;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=69;TCR=51;TR=120;WE=322942;WS=322924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr16	324030	rs112344350	T	TG	978.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.111;HP=9;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.345;NF=14;NR=12;PP=692;ReadPosRankSum=-1.268;SC=GCGGGAAGGGTGGGGGGTCCC;SOR=1.176;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=59;TCF=24;TCR=35;TR=26;WE=324038;WS=324020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,49:0.54:90
chr16	324052	rs2685126	A	G	3121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=36;PP=1699;SC=CCTTCTCATAATCCACCAGGG;SOR=1.066;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=60;TCR=36;TR=96;WE=324060;WS=324042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr16	325683	rs200964940	C	CG	412.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=5;NR=5;PP=665;SC=GGGGAGACCCCGGAGACCCCC;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=11;TCF=5;TCR=6;TR=10;WE=325703;WS=325673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr16	325695	rs201791993	A	AG	412.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=6;PP=548;SC=GAGACCCCCAAGGGCCCCAGG;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=10;WE=325703;WS=325673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr16	325732	rs202190256	A	AG	509.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5004;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=63;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=6;PP=352;SC=GGCCTCGCAGACCTCCGCCCC;SOR=1.179;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=11;TCF=5;TCR=6;TR=11;WE=325740;WS=325722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr16	325771	rs111978133	GT	G	999.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=12;PP=613;SC=GCGCCCCCGTGTCCCCATGCT;SOR=0.765;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=325779;WS=325761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr16	325943	.	A	AG	891.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=10;PP=502;SC=GGGATGACCGACGTCCCGCCC;SOR=1.519;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=11;WE=325951;WS=325933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
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chr16	333138	rs28365941	T	C	71.85	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5081;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=37;ReadPosRankSum=0.524;SC=GGCCCCCTTATCTGCCCCCGC;SOR=0.223;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=4;WE=333146;WS=333128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr16	334580	rs432925	G	C	3792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.445;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=84;PP=1829;ReadPosRankSum=0.901;SC=GCACGCACCCGGAGGAGTACA;SOR=0.572;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=287;TCF=137;TCR=150;TR=166;WE=334588;WS=334570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,186:0.59:317
chr16	334732	rs45593734	C	T	2224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.606;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=39;PP=1365;ReadPosRankSum=-0.944;SC=GGCTGGAGGACGAGGCGGCCG;SOR=0.758;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=146;TCF=84;TCR=62;TR=92;WE=334740;WS=334722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,100:0.63:158
chr16	336660	rs11647490	G	A	3236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=408;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=77;PP=1964;ReadPosRankSum=0.419;SC=TGGATGCCACGGCCAACGAGC;SOR=0.712;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=375;TCF=184;TCR=191;TR=152;WE=336668;WS=336650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:243,165:0.40:408
chr16	336916	rs1048786	C	T	1556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.049;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=23;PP=1006;ReadPosRankSum=-0.997;SC=CACGGAGGAGCCCCCGGAGGA;SOR=1.044;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=106;TCF=60;TCR=46;TR=64;WE=336924;WS=336906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,69:0.57:121
chr16	338332	rs11374767	A	AC	1335.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.008;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.929;NF=0;NR=40;PP=1372;ReadPosRankSum=-0.054;SC=GCGTGTCCACACCCCATCCCG;SOR=0.955;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=83;TCF=0;TCR=83;TR=40;WE=338340;WS=338322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,51:0.55:93
chr16	339672	rs412243	T	C	1356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.683;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=39;PP=719;ReadPosRankSum=-0.465;SC=TCCCTCCTGCTGGCCTCAGGC;SOR=0.783;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=45;TCR=72;TR=63;WE=339680;WS=339662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,68:0.54:127
chr16	341079	rs12925669	G	A	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.067;NF=20;NR=7;PP=455;ReadPosRankSum=-0.268;SC=AGCTGCTTCTGAGCGTGGTAC;SOR=0.774;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=34;TCR=12;TR=27;WE=341087;WS=341069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,27:0.55:49
chr16	354287	rs62032881	C	T	647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.317;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=376;ReadPosRankSum=0.057;SC=AGCGCGACACCGACGCGGCCC;SOR=0.465;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=40;TCF=30;TCR=10;TR=26;WE=354295;WS=354277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,28:0.64:44
chr16	354493	rs62032882	C	T	4052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=389;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.222;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=91;PP=2345;ReadPosRankSum=0.707;SC=ACAGGCTAAACATTTCTTTGT;SOR=0.548;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=363;TCF=177;TCR=186;TR=187;WE=354501;WS=354483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:190,197:0.51:387
chr16	359953	rs2301522	A	G	3019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=37;PP=1978;SC=TGGGCTGAGGACCGCAAAGCC;SOR=1.365;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=68;TCR=37;TR=105;WE=359961;WS=359943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr16	396264	rs1805105	A	G	9115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=347;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=168;NR=151;PP=2965;SC=CATCGTCCTCATCCATGTCCT;SOR=0.734;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=319;TCF=168;TCR=151;TR=319;WE=396272;WS=396254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,345:1.00:345
chr16	397044	rs758033	G	T	2425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.139;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=68;PP=1550;ReadPosRankSum=0.393;SC=TCTGCGTCAAGGAACAATGAG;SOR=0.786;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=189;TCF=71;TCR=118;TR=107;WE=397052;WS=397034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,111:0.55:202
chr16	417276	rs117701892	G	A	2780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=1.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.55;ReadPosRankSum=0.010;SOR=0.563;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:97,71:0.42:168
chr16	417281	rs62032959	G	A	2974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.26;ReadPosRankSum=-0.118;SOR=0.645;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:105,78:0.43:183
chr16	417289	rs62033860	C	T	3150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FS=0.541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.93;ReadPosRankSum=-0.113;SOR=0.641;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:121,90:0.43:211
chr16	418429	rs11642334	A	G	1893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.384;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.822;NF=50;NR=43;PP=1211;ReadPosRankSum=-0.726;SC=GCAGGCAGAGATGGAAAGGGC;SOR=0.641;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=227;TCF=112;TCR=115;TR=93;WE=418437;WS=418419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,98:0.40:246
chr16	418462	rs11640313	C	G	7468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=121;NR=125;PP=2965;SC=GGCCGGGCCACGAGTCCCCAG;SOR=0.803;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=248;TCF=122;TCR=126;TR=246;WE=418470;WS=418452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr16	419092	rs3830160	A	G	2600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=57;NR=29;PP=1404;SC=AGTCGAGCCCATAAGCCTCAT;SOR=1.390;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=57;TCR=29;TR=86;WE=419100;WS=419082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr16	419154	rs1802752	G	A	2862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.168;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=47;PP=1633;ReadPosRankSum=-1.079;SC=TTCTTGTCCAGGATCTCACTG;SOR=0.796;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=173;TCF=100;TCR=73;TR=115;WE=419162;WS=419144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,130:0.66:197
chr16	419283	rs11434190	A	AG	2592.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=35;PP=1468;SC=AGGGGGGCCCAGGCAACTGCC;SOR=1.771;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=35;WE=419291;WS=419273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr16	420140	rs3194151	G	A	1427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.682;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=37;PP=867;ReadPosRankSum=-1.149;SC=CGCAGGTAGTGGCCGGGCAGG;SOR=1.184;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=111;TCF=44;TCR=67;TR=56;WE=420148;WS=420130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,64:0.51:125
chr16	420179	rs11557300	G	A	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.597;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=20;PP=434;ReadPosRankSum=-0.194;SC=CGCAGCTGCAGCCGCTTCCAG;SOR=1.286;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=49;TCF=15;TCR=34;TR=26;WE=420187;WS=420169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,28:0.53:53
chr16	424403	rs11641325	C	T	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=152;ReadPosRankSum=-0.221;SC=CGCCAGCCTGCGGTCACAAAA;SOR=0.784;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=12;WE=424411;WS=424393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,10:0.26:38
chr16	424420	rs3743888	C	G	779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=19;PP=523;SC=AAAACCCCGACGCGGAGGCTG;SOR=3.014;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=23;WE=424428;WS=424410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr16	425277	rs11642686	C	T	2061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.02;MQRankSum=-0.957;NF=42;NR=54;PP=1428;ReadPosRankSum=-1.077;SC=GCCAGAGGGCCCCATCAGAGG;SOR=0.657;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=193;TCF=85;TCR=108;TR=96;WE=425285;WS=425267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,99:0.48:205
chr16	425298	rs11648905	G	T	4869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.02;NF=73;NR=92;PP=2965;SC=AGGCCGGGGCGGGGGGCTGGC;SOR=1.078;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=165;TCF=73;TCR=92;TR=165;WE=425306;WS=425288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr16	426432	rs2071915	T	C	4131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=83;PP=2402;SC=AGGGGCTGGATGGTCACGCTC;SOR=1.088;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=147;TCF=64;TCR=83;TR=147;WE=426440;WS=426422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr16	426476	rs2071916	T	C	4296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=71;PP=2685;SC=GACAAGGGGTTTGGCTGGAGG;SOR=0.773;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=142;TCF=71;TCR=71;TR=142;WE=426484;WS=426466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr16	427013	rs763140	G	C	3031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=24;PP=2047;SC=GCAGAGCCGGGCTGCCCCCCA;SOR=1.970;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=96;TCF=72;TCR=24;TR=96;WE=427021;WS=427003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr16	427349	rs763142	C	A	518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=7;PP=301;SC=AGGTTCTCTGCCTCCATCCCG;SOR=0.914;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=8;TCR=7;TR=15;WE=427357;WS=427340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	427479	rs11248931	T	C	3725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=77;NR=49;PP=1764;SC=CTTCTCGGTGTGGTGCTCAGC;SOR=0.919;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=77;TCR=49;TR=126;WE=427487;WS=427469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr16	427516	rs11649031	T	C	4414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=86;NR=68;PP=2529;SC=AGGAGGGCTGTACCGCGGTGT;SOR=0.741;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=154;TCF=86;TCR=68;TR=154;WE=427524;WS=427506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr16	427657	rs11641693	G	A	2434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=42;PP=1608;SC=GCAGGCGGGCGGGCAGCCACC;SOR=0.788;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=40;TCR=42;TR=82;WE=427665;WS=427647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr16	427784	rs11641742	G	A	5005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=98;NR=72;PP=2736;SC=TGGCACTGCCGTACCAGCTGT;SOR=0.852;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=170;TCF=98;TCR=72;TR=170;WE=427792;WS=427774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr16	427820	rs12922073	C	T	3885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=68;NR=63;PP=2071;SC=GCGGGGCCTGCGAGAAGTGCT;SOR=0.778;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=131;TCF=68;TCR=63;TR=131;WE=427828;WS=427810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr16	427866	rs12933709	T	C	2564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=49;PP=1342;SC=GAGAAGGAGGTGTCAGCCAGG;SOR=0.957;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=43;TCR=49;TR=92;WE=427874;WS=427856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr16	427925	rs61261356	T	C	849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=25;PP=554;SC=GTCCCCCAGATGGAAAGGGCT;SOR=3.193;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=30;WE=427933;WS=427915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr16	431890	.	AGCCTCTGCCGCCTCC	A	55.52	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.76;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr16	456239	rs11391097	G	GC	3102.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=18;PP=2270;SC=TGGGCCTTCAGCCTGGACTGG;SOR=2.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=39;TCR=18;TR=57;WE=456247;WS=456229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr16	456291	rs11391098	G	GC	6351.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=21;NR=63;PP=2975;SC=CTGGGCAGATGCCCCGGGAGT;SOR=0.755;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=100;TCF=29;TCR=71;TR=84;WE=456299;WS=456281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr16	456416	rs3743890	T	G	4875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=82;NR=88;PP=2794;SC=GCCTCTCCCATGGTCCCCTGT;SOR=0.880;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=170;TCF=82;TCR=88;TR=170;WE=456424;WS=456406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr16	456483	rs3785290	T	C	1214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=39;PP=873;SC=CCAGAGGCTATGGGGATGTTG;SOR=2.786;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=9;TCR=39;TR=48;WE=456491;WS=456473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr16	460976	rs140561403	G	A	1505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=24;PP=827;ReadPosRankSum=0.309;SC=GTGCAGACGCGATGACGCGGC;SOR=0.711;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=134;TCF=79;TCR=55;TR=62;WE=460984;WS=460966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,73:0.48:152
chr16	476096	rs1883371	A	G	233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=5;NR=3;PP=79;SC=CGGGGGCGGCACAACTGGCTC;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=8;WE=476104;WS=476086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr16	476796	rs116962191	C	A	1137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.601;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=33;PP=779;ReadPosRankSum=0.170;SC=TGGGACCGGTCGACGCTGCCC;SOR=0.330;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=69;TCF=15;TCR=54;TR=44;WE=476804;WS=476786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,46:0.63:73
chr16	532248	rs9935319	A	G	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.408;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=101;ReadPosRankSum=0.388;SC=GTAGAGACAAATTTCACTTTG;SOR=0.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=6;WE=532256;WS=532238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr16	532279	rs12917958	C	G	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=138;ReadPosRankSum=0.453;SC=TGGTCTTGAGCTCCTGGGTTC;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=9;WE=532287;WS=532269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr16	539088	rs3830847	T	TAA	1015.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.529;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=3.215;NF=2;NR=19;PP=1320;ReadPosRankSum=1.342;SC=CGTGCATTGGTGAGAGAACTT;SOR=0.360;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=60;TCF=3;TCR=57;TR=21;WE=539101;WS=539078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,30:0.38:78
chr16	539093	rs74390230	G	C	975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.210;NF=4;NR=16;PP=1317;ReadPosRankSum=0.917;SC=ATTGGTGAGAGAACTTGCTTT;SOR=0.601;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=62;TCF=10;TCR=52;TR=20;WE=539101;WS=539078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,27:0.39:69
chr16	570454	rs11863276	T	C	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.536;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=457;ReadPosRankSum=0.193;SC=TTGCTGTGCCTTCAGGACAAC;SOR=1.470;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=52;TCF=34;TCR=18;TR=26;WE=570462;WS=570444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,27:0.48:56
chr16	570557	rs11537754	T	C	3710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.588;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=64;PP=1984;ReadPosRankSum=-1.324;SC=CAGCCTTCTCTGAGTCCCTGG;SOR=0.582;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=235;TCF=140;TCR=95;TR=154;WE=570565;WS=570546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,170:0.65:260
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chr16	601632	rs3213574	T	C	3873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.443;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=97;ReadPosRankSum=1.177;SC=GCAGTGAGGGTGTCTTCTGGA;SOR=0.639;SbPval=0.51;Source=Platypus;TCF=125;TR=178;WE=601640;WS=601622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,189:0.64:296
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chr16	614658	rs60243750	A	G	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.055;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.246;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=81;ReadPosRankSum=-1.060;SC=CCTCCTGACCAGCTTCCACCC;SOR=1.714;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=8;WE=614666;WS=614648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
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chr16	614821	rs1010761	A	G	596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.088;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=9;PP=418;ReadPosRankSum=-0.415;SC=ACCTGACCCGAGCCCTCGGTG;SOR=1.609;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=83;TCF=50;TCR=33;TR=29;WE=614829;WS=614811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,31:0.34:91
chr16	615326	rs59985111	T	C	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=121;ReadPosRankSum=-0.470;SC=GCCTGAGGTCTGACTGTCTCT;SOR=0.551;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=17;TCR=27;TR=15;WE=615334;WS=615316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,17:0.35:48
chr16	622557	rs71378518	T	C	3769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.090;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-1.354;NF=87;NR=68;PP=2962;ReadPosRankSum=1.940;SC=CTCTGTTCCCTCGTCCCTAAG;SOR=0.448;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=228;TCF=133;TCR=95;TR=155;WE=622576;WS=622547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,178:0.65:274
chr16	622565	rs12917944	A	G	3494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.765;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=1.348;NF=43;NR=28;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.748;SC=CCTCGTCCCTAAGGATGTGGT;SOR=0.937;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=234;TCF=128;TCR=106;TR=71;WE=622576;WS=622547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,99:0.36:277
chr16	622568	rs144282116	G	GATGT	3468.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FS=6.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.04;MQRankSum=1.380;QD=12.57;ReadPosRankSum=-1.465;SOR=0.991;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:177,99:0.36:276
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chr16	624713	rs4984669	C	T	942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.321;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=18;PP=612;ReadPosRankSum=0.342;SC=GACCCATTTGCCTGCTGTTGG;SOR=0.803;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=115;TCF=60;TCR=55;TR=42;WE=624721;WS=624703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,49:0.37:131
chr16	626346	rs2071980	A	C	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=27;ReadPosRankSum=-0.799;SC=CCACCGCCCCACAAAGCCAGT;SOR=0.551;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=4;WE=626354;WS=626336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr16	628302	rs3752568	A	G	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.27;ReadPosRankSum=-0.681;SOR=0.188;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr16	628994	rs113780855	TGGGC	T	895.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.464;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=824;ReadPosRankSum=2.433;SC=AGGCTCCGGCTGGGCGGGCGT;SOR=0.093;SbPval=0.04;Source=Platypus;TC=55;TCF=10;TCR=45;TR=14;WE=629014;WS=628984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,25:0.40:63
chr16	629006	rs59476302	C	T	921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.157;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=8;PP=818;ReadPosRankSum=2.506;SC=GGCGGGCGTTCGAGTGGGGCG;SOR=0.110;SbPval=0.03;Source=Platypus;TC=56;TCF=19;TCR=37;TR=20;WE=629014;WS=628984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,24:0.45:53
chr16	630089	rs7191939	C	T	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=131;ReadPosRankSum=-0.139;SC=CGCAAGGTCCCGACTGCAGCT;SOR=0.646;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=11;WE=630097;WS=630079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr16	630367	rs7192508	C	T	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=370;ReadPosRankSum=0.386;SC=TCTCCTGCTGCAGGCCACGTG;SOR=0.789;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=21;WE=630375;WS=630357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,21:0.60:35
chr16	630405	rs2071982	T	G	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.521;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=230;ReadPosRankSum=-1.619;SC=CTCTGGGCAGTGAGTGCTGCG;SOR=1.739;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=12;WE=630413;WS=630395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr16	630902	rs1045274	C	G	1911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.939;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=43;PP=1078;ReadPosRankSum=-1.016;SC=TCCATCTGCTCGTGGACCTCA;SOR=0.571;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=293;TCF=158;TCR=135;TR=89;WE=630910;WS=630892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:227,108:0.32:335
chr16	632011	rs74872027	C	T	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.07;ReadPosRankSum=1.876;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr16	632051	rs2018789	T	C	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.670;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=43;ReadPosRankSum=0.389;SC=CCACCGTGCCTGGCTGCAGGA;SOR=0.368;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=7;WE=632059;WS=632041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,10:0.31:32
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chr16	632115	rs916415	G	A	724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=4.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQRankSum=1.463;QD=6.53;ReadPosRankSum=1.491;SOR=0.355;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,36:0.32:111
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chr16	633125	rs1045277	T	C	2068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.823;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=40;PP=1197;ReadPosRankSum=0.382;SC=GCGCATGTCCTGTGCTTTGTG;SOR=0.871;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=227;TCF=126;TCR=101;TR=96;WE=633133;WS=633115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,105:0.43:246
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chr16	633843	rs8675	A	G	815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.32;ReadPosRankSum=1.084;SOR=0.910;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,23:0.46:50
chr16	633851	rs8909	T	C	827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.39;ReadPosRankSum=-0.506;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,22:0.49:45
chr16	646246	rs72767868	G	A	1977.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=38;PP=1139;ReadPosRankSum=0.451;SC=GGAGCTGAGAGGTGGGCGGGA;SOR=0.690;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=250;TCF=144;TCR=106;TR=92;WE=646254;WS=646236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,104:0.37:279
chr16	667490	rs12447387	A	G	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.793;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=135;ReadPosRankSum=-0.110;SC=TGCCCCGGAAAACCTGATTCC;SOR=2.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=8;WE=667498;WS=667480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr16	668443	rs34011309	A	G	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=233;ReadPosRankSum=0.057;SC=AGGCTGGAGTACAGTGGCACA;SOR=0.420;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=14;WE=668451;WS=668433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr16	679814	rs12447874	T	C	5324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=91;NR=89;PP=2965;SC=AAGCCCCTCCTTGGCAGCTCC;SOR=0.703;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=180;TCF=91;TCR=89;TR=180;WE=679822;WS=679804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr16	679953	rs17139376	C	T	1280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.570;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=27;PP=666;ReadPosRankSum=0.946;SC=TCTGACCAGACCAGGCTCCTG;SOR=0.761;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=156;TCF=80;TCR=76;TR=58;WE=679961;WS=679943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,69:0.40:173
chr16	681284	rs8062289	C	T	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.968;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=241;ReadPosRankSum=0.512;SC=CCTGCCGCTCCTGCTCCTCCT;SOR=0.542;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=43;TCR=21;TR=21;WE=681292;WS=681274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,23:0.32:71
chr16	681587	rs111991728	TTAAGAA	T	70.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=114;ReadPosRankSum=0.045;SC=CTCATTTGTCTTAAGAATAAG;SOR=1.022;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=5;WE=681600;WS=681577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr16	682668	.	G	C	1827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.918;ClippingRankSum=0.000;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.381;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=47;PP=1150;ReadPosRankSum=0.890;SC=GCCCAGCTGCGCCGACGACAG;SOR=1.117;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=214;TCF=103;TCR=111;TR=82;WE=682676;WS=682658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,92:0.39:236
chr16	684579	rs34560623	C	T	5652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=434;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=127;NR=116;PP=2962;ReadPosRankSum=0.490;SC=TGCAGGTGTGCGGGGGTGAAG;SOR=0.712;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=405;TCF=214;TCR=191;TR=243;WE=684587;WS=684569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,264:0.61:434
chr16	697352	.	GT	G	1333.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.571;ClippingRankSum=0.000;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.532;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=7;PP=996;ReadPosRankSum=0.204;SC=CTGCTCCTGAGTTCTGCCAGG;SOR=1.140;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=28;WE=697360;WS=697342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,41:0.75:55
chr16	700896	.	C	T	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.769;ClippingRankSum=0.000;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.176;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=242;ReadPosRankSum=-0.323;SC=TGGGGTGGGGCGGTGGCTGGG;SOR=1.380;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=52;TCF=36;TCR=16;TR=19;WE=700904;WS=700886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,21:0.38:56
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chr16	716631	rs117904014	C	T	3689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=420;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.104;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=83;PP=2269;ReadPosRankSum=-0.268;SC=TGGGTGGGGCCGGTACCCATC;SOR=0.592;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=388;TCF=189;TCR=199;TR=170;WE=716639;WS=716621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:235,185:0.44:420
chr16	718514	rs7204542	C	G	7646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=154;NR=104;PP=2965;SC=AGGAGATCACCATCCCCGCGG;SOR=1.059;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=259;TCF=155;TCR=104;TR=258;WE=718522;WS=718504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,285:1.00:285
chr16	726907	rs111852492	C	T	4820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=593;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=114;NR=110;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.670;SC=GTGGGCCCCCCGGCCGCTGCC;SOR=0.660;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=556;TCF=283;TCR=273;TR=224;WE=726915;WS=726878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:353,238:0.40:591
chr16	732287	rs3216838	GC	G	3990.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=344;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.964;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.228;NF=24;NR=63;PP=2934;ReadPosRankSum=2.212;SC=TGCAGGTGAGGCCTGCGGCTG;SOR=0.661;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=212;TCF=66;TCR=146;TR=87;WE=732295;WS=732277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:203,136:0.40:339
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chr16	771181	rs56225914	C	G	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.795;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.40;ReadPosRankSum=0.682;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
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chr16	772842	rs12599130	T	C	2248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.412;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.98;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=49;PP=1516;ReadPosRankSum=-1.796;SC=ACAGGTCTGCTTTTAGCGCCT;SOR=0.748;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=259;TCF=139;TCR=120;TR=96;WE=772850;WS=772832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:181,107:0.37:288
chr16	773291	rs35843452	GC	G	1482.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=38;PP=788;ReadPosRankSum=-0.350;SC=GGAGGCATGGGCCCCCCCCGT;SOR=0.732;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=130;TCF=36;TCR=94;TR=55;WE=773299;WS=773281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,68:0.40:169
chr16	773313	rs58842228	G	GC	1287.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.896;HP=9;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=35;PP=692;ReadPosRankSum=1.052;SC=CTCCTGTGGCGCCCCCCCCAG;SOR=0.691;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=121;TCF=42;TCR=79;TR=48;WE=773321;WS=773303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,63:0.39:160
chr16	773341	rs4984920	G	A	1349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.814;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=36;PP=971;ReadPosRankSum=1.496;SC=AGCCATCCGTGTATAGGGACA;SOR=0.604;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=181;TCF=96;TCR=85;TR=70;WE=773349;WS=773331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,73:0.37:197
chr16	773367	rs55787204	G	T	1617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.487;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=40;PP=1083;ReadPosRankSum=0.111;SC=GGCCCAGGGGGTCTGCTGGCT;SOR=0.637;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=227;TCF=125;TCR=102;TR=82;WE=773388;WS=773357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,89:0.37:242
chr16	774520	rs4984921	C	T	1512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.259;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=32;PP=955;ReadPosRankSum=-1.526;SC=CTGGAGGCGGCGGGCTGGGTC;SOR=0.813;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=137;TCF=68;TCR=69;TR=63;WE=774528;WS=774510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,71:0.46:154
chr16	774692	rs2071950	A	G	2509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.464;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=56;PP=1472;ReadPosRankSum=-0.766;SC=ACTGCCTGCCAGGCGCAGTGT;SOR=0.616;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=238;TCF=127;TCR=111;TR=121;WE=774700;WS=774682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,129:0.48:268
chr16	775947	rs12446058	G	C	2147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FS=8.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.26;ReadPosRankSum=2.890;SOR=0.302;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:102,60:0.37:162
chr16	775954	rs12448311	CC	AA	2157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=7.297;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.57;ReadPosRankSum=2.427;SOR=0.343;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,59:0.37:159
chr16	777627	rs7188886	C	T	1771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.050;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=54;PP=1142;ReadPosRankSum=-0.385;SC=GAGGGCAGGCCGCGGGCCGCA;SOR=0.588;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=234;TCF=89;TCR=145;TR=90;WE=777635;WS=777617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,94:0.38:245
chr16	779689	rs1054788	G	C	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=18;PP=370;ReadPosRankSum=-0.397;SC=CGGGGCCTCCGAACTATGAAT;SOR=0.688;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=102;TCF=47;TCR=55;TR=32;WE=779697;WS=779679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,38:0.33:114
chr16	780736	rs35455787	C	G	808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.416;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=17;PP=600;ReadPosRankSum=-1.612;SC=GGGAGGTGACCGGGCCCCCTC;SOR=0.208;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=48;TCF=16;TCR=32;TR=29;WE=780744;WS=780726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,31:0.62:50
chr16	782397	rs12443803	C	T	2849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=413;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=66;PP=1734;ReadPosRankSum=-0.568;SC=ACAGCGCAGACACTCTTTAGC;SOR=0.665;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=386;TCF=205;TCR=181;TR=138;WE=782405;WS=782387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:260,152:0.37:412
chr16	783486	.	G	A	1382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.804;ClippingRankSum=0.000;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.765;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=38;PP=986;ReadPosRankSum=2.262;SC=GCTGAGACGGGACCTGGAACT;SOR=0.602;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=33;TCR=64;TR=58;WE=783494;WS=783476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,60:0.57:106
chr16	784507	rs67935101	C	T	1871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.246;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=26;PP=1187;ReadPosRankSum=0.697;SC=ACGCGGAGCTCGGCGTGCAGG;SOR=0.561;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=176;TCF=122;TCR=54;TR=83;WE=784515;WS=784497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,87:0.48:183
chr16	784920	rs9932304	A	G	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.152;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=12;PP=250;ReadPosRankSum=-0.752;SC=GGACGCCCACACGAGCACACG;SOR=0.287;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=50;TCF=16;TCR=34;TR=21;WE=784928;WS=784910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,24:0.43:56
chr16	787827	rs12449156	A	C	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=110;ReadPosRankSum=0.619;SC=CAGACTCGCCAAACAGATGCA;SOR=0.467;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=10;WE=787835;WS=787817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr16	813783	.	C	A	126	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5565;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=7;PP=126;QD=22.9673160782;SC=CCAGCATCCCCTCCCCCTTCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=7;WE=813791;WS=813773;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:2,7:0.78:9
chr16	815628	rs1737340	A	G	2209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.502;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=47;PP=1259;ReadPosRankSum=-0.675;SC=GTGAGACCCCAATCCCCAGCC;SOR=0.823;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=241;TCF=130;TCR=111;TR=106;WE=815636;WS=815618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,116:0.45:259
chr16	837310	rs531278	A	G	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.808;HP=1;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=161;ReadPosRankSum=-0.579;SC=TGGGGTGGGAATCCTGAGTCC;SOR=1.162;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=9;WE=837318;WS=837292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr16	838051	.	C	G	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.18;ReadPosRankSum=-0.557;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,2:0.20:10
chr16	839262	rs569951	A	G	4938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=92;NR=82;PP=2753;SC=TGAACTTCAGATCGGAGGAGA;SOR=0.725;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=176;TCF=92;TCR=84;TR=174;WE=839270;WS=839252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
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chr16	846999	rs140737412	G	A	2116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=56;PP=1439;ReadPosRankSum=1.304;SC=GTCTGCTGGGGGGCATTGGGG;SOR=0.690;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=173;TCF=71;TCR=102;TR=92;WE=847007;WS=846989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,97:0.51:189
chr16	1014046	rs148550990	C	T	1603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=29;PP=938;ReadPosRankSum=-0.512;SC=CAGAGCCTGACCTGGGAGCTG;SOR=0.719;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=128;TCF=79;TCR=49;TR=70;WE=1014054;WS=1014036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,75:0.53:142
chr16	1020732	rs142343038	G	A	1527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.03;ReadPosRankSum=0.412;SOR=0.709;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,72:0.57:127
chr16	1034834	rs237674	T	C	11158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=435;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=210;NR=182;PP=2965;SC=ACTTCAGCAATGTGGACATCT;SOR=0.769;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=393;TCF=210;TCR=183;TR=392;WE=1034842;WS=1034824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,434:1.00:434
chr16	1115377	rs11649498	C	T	1394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=14;PP=799;SC=CACGCTGATCCGGGCTGAGAC;SOR=1.402;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=32;TCR=14;TR=46;WE=1115385;WS=1115367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr16	1115842	rs143173222	CGGCA	C	4953.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.247;NF=32;NR=81;PP=2954;ReadPosRankSum=0.648;SC=GAGGCAGGAACGGCAGGCGGT;SOR=0.565;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=123;TCF=37;TCR=86;TR=113;WE=1115853;WS=1115831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:5,199:0.98:204
chr16	1116220	rs34024516	T	TG	3562.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=44;PP=1397;SC=CGGGCCGCCCTGGGGGACGCT;SOR=0.787;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=13;TCR=53;TR=55;WE=1116228;WS=1116210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr16	1116445	rs530518	A	G	6494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQ=59.99;NF=119;NR=93;PP=2965;SC=GTTCGGGTCGAGGTCTGCAGC;SOR=0.806;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=214;TCF=121;TCR=93;TR=212;WE=1116453;WS=1116435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr16	1129912	rs642249	A	G	3918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=85;PP=2703;SC=AGGCCACGCCACCCGCGCACC;SOR=1.645;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=43;TCR=85;TR=128;WE=1129920;WS=1129902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr16	1244877	rs9936834	G	A	4006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.28;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr16	1244877	.	GTGGCGGGGCT	ATGGCGGGGCA,ATGGCGGGGCT	2390	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=22;MQ=60.0;NF=35,61;NR=24,34;PP=2390,1198;QD=41.4147097434;SC=GCGCACACCCGTGGCGGGGCT;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=95;TCF=61;TCR=34;TR=59,95;WE=1244900;WS=1244867;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.62:95
chr16	1244887	rs3751661	T	A	1715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.79;ReadPosRankSum=0.435;SOR=0.633;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,77:0.66:116
chr16	1244892	rs57052347	C	T	804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=18;PP=1198;ReadPosRankSum=-0.859;SC=GGGGCTCCGGCTGACCGGGTG;SOR=0.701;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=122;TCF=73;TCR=49;TR=45;WE=1244900;WS=1244867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,46:0.35:130
chr16	1250389	rs36117280	A	G	4707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=105;NR=89;PP=2942;ReadPosRankSum=-0.487;SC=CGAGCTGCGCATGCCCTGCAC;SOR=0.695;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=275;TCF=147;TCR=128;TR=194;WE=1250397;WS=1250379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,211:0.72:292
chr16	1250559	rs8044363	T	C	4242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.891;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=117;PP=2424;ReadPosRankSum=0.762;SC=ACGCCTGGATTGCCATCTTCC;SOR=0.629;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=304;TCF=122;TCR=182;TR=194;WE=1250567;WS=1250549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,199:0.62:321
chr16	1251803	rs9922076	C	T	2865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.171;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=60;PP=1700;ReadPosRankSum=0.627;SC=CCAGCTTCTCCGAGCCTGGCA;SOR=0.605;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=192;TCF=103;TCR=89;TR=129;WE=1251811;WS=1251793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,134:0.68:198
chr16	1252118	rs2407083	C	T	3415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.445;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=70;PP=2049;ReadPosRankSum=-0.487;SC=CTGGCGCGCCCCCCTCGCCAC;SOR=0.652;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=254;TCF=126;TCR=128;TR=141;WE=1252126;WS=1252108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,156:0.57:272
chr16	1252259	rs9934839	A	G	2719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.692;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=53;PP=1609;ReadPosRankSum=0.659;SC=CCAGCCTCAGACTGGCCACAG;SOR=0.589;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=193;TCF=104;TCR=89;TR=111;WE=1252267;WS=1252249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,123:0.58:213
chr16	1252369	rs61734410	C	T	2369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.150;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=55;PP=1473;ReadPosRankSum=0.560;SC=GCCGGTGGACCGCCAGGCACC;SOR=0.618;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=226;TCF=119;TCR=107;TR=108;WE=1252387;WS=1252359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,116:0.47:246
chr16	1252599	rs9924677	C	T	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.332;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=31;ReadPosRankSum=0.854;SC=GCCTCTGGAGCCCATAAGAAG;SOR=0.105;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=5;WE=1252607;WS=1252589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr16	1254369	rs3751664	C	T	1178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.231;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=22;PP=774;ReadPosRankSum=-0.195;SC=CAAGCTGCGCCGCATCGTGGA;SOR=0.987;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=134;TCF=71;TCR=63;TR=54;WE=1254377;WS=1254359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,57:0.40:143
chr16	1254577	rs11640345	T	C	118.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=16.99;ReadPosRankSum=-0.566;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr16	1255030	rs2974835	A	G	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=0.651;QD=1.44;ReadPosRankSum=-0.640;SOR=0.404;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,5:0.23:22
chr16	1255277	rs2745150	C	T	4770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=354;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.646;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=100;NR=96;PP=2939;ReadPosRankSum=0.574;SC=TGGGTCCCCACCCTCTCCCCA;SOR=0.468;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=324;TCF=155;TCR=169;TR=196;WE=1255285;WS=1255267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,217:0.61:353
chr16	1255390	rs2745165	C	T	1342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.963;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=34;PP=895;ReadPosRankSum=-0.596;SC=TATGACAGGCCGTGGGAAGCA;SOR=0.896;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=74;TCF=26;TCR=48;TR=51;WE=1255398;WS=1255380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,55:0.68:81
chr16	1256085	rs11646893	C	T	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.155;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=240;ReadPosRankSum=-1.595;SC=CGCTGACCCTCGCCCCCACCT;SOR=1.828;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=18;WE=1256093;WS=1256075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
chr16	1257940	rs2738896	T	C	1311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.991;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=28;PP=888;ReadPosRankSum=0.033;SC=CATAAGGCAATCCCTAGGTTG;SOR=0.979;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=64;TCF=26;TCR=38;TR=45;WE=1257948;WS=1257930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,51:0.70:73
chr16	1259456	rs2745166	G	C	1548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.531;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=42;PP=1057;ReadPosRankSum=-1.501;SC=GCCTTCGTCTGTCTGGGGCAG;SOR=1.145;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=118;TCF=41;TCR=77;TR=61;WE=1259464;WS=1259446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,66:0.51:130
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chr16	1260481	rs8063574	T	C	6526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=468;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.153;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=158;NR=129;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.107;SC=CTGACATTGATCCCGGCAGCA;SOR=0.618;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=445;TCF=248;TCR=197;TR=287;WE=1260489;WS=1260471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,301:0.65:466
chr16	1261282	rs4984637	T	C	6325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=476;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=127;NR=131;PP=2962;ReadPosRankSum=0.120;SC=TTTTTGGCATTTTGGGTGTGC;SOR=0.707;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=441;TCF=221;TCR=220;TR=258;WE=1261290;WS=1261261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:194,282:0.59:476
chr16	1261516	rs142856193	C	T	3057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=63;PP=1840;ReadPosRankSum=1.101;SC=GCGAGGGCCCCGACACCAGGA;SOR=0.721;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=267;TCF=143;TCR=124;TR=132;WE=1261524;WS=1261506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,145:0.50:290
chr16	1263767	.	G	C	1752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=0.000;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.450;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=23;PP=1174;ReadPosRankSum=1.326;SC=GCTCATGGCCGCCCTCCCCGC;SOR=0.435;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=122;TCF=87;TCR=35;TR=73;WE=1263775;WS=1263757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,79:0.59:134
chr16	1265621	rs2753322	G	A	2506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.038;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=51;PP=1330;ReadPosRankSum=0.230;SC=CATCCTCAGCGCAGGCCCCCG;SOR=0.521;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=193;TCF=94;TCR=99;TR=104;WE=1265629;WS=1265611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,120:0.55:217
chr16	1265720	rs3897150	C	T	835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=24;PP=536;ReadPosRankSum=0.335;SC=GCTGAAGCTGCGTCCCTGCTG;SOR=0.616;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=15;TCR=33;TR=35;WE=1265728;WS=1265710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,37:0.69:54
chr16	1266803	rs11395347	C	CT	1179.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=2;PP=1091;SC=TTCCACTTGGCCGGGCCCGGA;SOR=4.255;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=28;WE=1266811;WS=1266793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr16	1268044	rs147142971	C	T	4343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.430;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=106;PP=2823;ReadPosRankSum=-2.646;SC=CATGAAGGTACCCGCCGCGGC;SOR=0.986;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=325;TCF=154;TCR=171;TR=189;WE=1268052;WS=1268034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,201:0.58:344
chr16	1268485	rs2738891	C	T	2691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.499;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=60;PP=1699;ReadPosRankSum=0.046;SC=AGAGTCCGGGCGCCAGGGACG;SOR=0.721;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=205;TCF=106;TCR=99;TR=121;WE=1268493;WS=1268475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,127:0.58:220
chr16	1270111	rs1054644	G	A	3785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.733;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=93;PP=2405;ReadPosRankSum=1.231;SC=TCCCCACCACGCTCCCCACGG;SOR=0.888;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=251;TCF=115;TCR=136;TR=162;WE=1270119;WS=1270101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,172:0.62:276
chr16	1270349	rs4247094	T	C	1052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.734;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=22;PP=623;ReadPosRankSum=0.727;SC=ACAGCGTGGATGCTCAGGGCT;SOR=0.589;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=94;TCF=45;TCR=49;TR=45;WE=1270357;WS=1270339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,51:0.50:103
chr16	1271095	rs2745138	C	T	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=2.808;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=84;ReadPosRankSum=0.398;SC=ACTTGGGTCCCGTCGTGAGCA;SOR=1.981;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=5;WE=1271103;WS=1271085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr16	1272038	rs11248860	G	A	2801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.496;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=70;PP=1766;ReadPosRankSum=0.891;SC=CCAGCTCACAGTGCCAGCCTG;SOR=0.644;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=215;TCF=102;TCR=113;TR=133;WE=1272046;WS=1272028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,133:0.59:225
chr16	1272865	rs4984639	G	A	829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.891;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=21;PP=558;ReadPosRankSum=0.117;SC=TGGGGAGACAGAGTGATCTCC;SOR=0.829;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=64;TCF=31;TCR=33;TR=38;WE=1272873;WS=1272855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,39:0.55:71
chr16	1275001	.	C	G	41	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=4;NR=1;PP=41;QD=15.1542425094;SC=CCAACTCCCACCCGCACATCC;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=5;WE=1275009;WS=1274991;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr16	1275135	rs9938123	T	C	2209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=40;NR=29;PP=1189;SC=CAGCCCCCAGTTTCACCCCCA;SOR=0.876;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=40;TCR=29;TR=69;WE=1275143;WS=1275125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr16	1278599	rs4360940	A	G	4869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=104;NR=62;PP=2965;SC=TGGTGTTTTGAACAGGAGGGG;SOR=1.257;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=166;TCF=104;TCR=62;TR=166;WE=1278607;WS=1278589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr16	1278744	rs62012862	C	T	1633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=4.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.01;MQRankSum=1.211;QD=21.22;ReadPosRankSum=0.206;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,52:0.68:77
chr16	1278767	rs201725275	C	T	817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.97;MQRankSum=1.447;QD=25.56;ReadPosRankSum=-0.338;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,21:0.66:32
chr16	1278806	rs199504258	G	A	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.00;MQRankSum=-0.000;QD=17.40;ReadPosRankSum=-1.169;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr16	1279346	.	G	C	477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.43;QD=25.15;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr16	1279537	rs188458795	C	G	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=11.130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.24;MQRankSum=-2.194;QD=3.37;ReadPosRankSum=-0.018;SOR=3.383;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,7:0.16:45
chr16	1279545	rs1800990	T	C	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=10.613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.21;MQRankSum=-1.728;QD=3.69;ReadPosRankSum=-0.030;SOR=3.383;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,8:0.16:49
chr16	1279555	rs148897236	C	T	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=1.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.86;MQRankSum=-1.816;QD=6.94;ReadPosRankSum=-0.606;SOR=1.066;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,12:0.22:55
chr16	1279574	rs199887053	C	G	981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.91;MQRankSum=0.752;QD=12.59;ReadPosRankSum=-1.802;SOR=0.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,27:0.35:78
chr16	1279584	rs111992451	T	C	1163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.52;MQRankSum=0.682;QD=12.38;ReadPosRankSum=-1.096;SOR=0.679;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,37:0.39:94
chr16	1279623	rs72633259	G	A	995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=0.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQRankSum=-0.440;QD=7.78;ReadPosRankSum=2.314;SOR=0.720;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,54:0.42:128
chr16	1279704	rs202107419	A	G	614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.60;MQRankSum=2.782;QD=7.50;ReadPosRankSum=-2.059;SOR=0.735;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,23:0.28:82
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chr16	1306346	rs3865205	CG	GC	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=7.534;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.38;MQRankSum=-5.356;QD=0.66;ReadPosRankSum=-3.363;SOR=1.939;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,9:0.09:97
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chr16	1306410	rs3993979	A	G	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.70;MQRankSum=-3.499;QD=5.39;ReadPosRankSum=-1.016;SOR=0.576;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,13:0.34:38
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chr16	1306918	rs74470113	C	T	1551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=0.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQRankSum=-3.211;QD=13.61;ReadPosRankSum=-0.414;SOR=0.663;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,43:0.38:114
chr16	1306921	rs78324915	G	A	1570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=1.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQRankSum=-3.319;QD=13.20;ReadPosRankSum=0.156;SOR=0.603;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,43:0.36:119
chr16	1306927	rs79472859	C	T	1576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=1.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQRankSum=-3.673;QD=12.32;ReadPosRankSum=0.457;SOR=0.631;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,45:0.35:128
chr16	1306971	rs72775466	A	G	1215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=0.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQRankSum=-4.569;QD=9.73;ReadPosRankSum=2.540;SOR=0.785;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,36:0.29:125
chr16	1306971	.	ACA	GCG	1309	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MMLQ=24;MQ=58.9;NF=15;NR=17;PP=1309;QD=42.5771210894;SC=ATCTCCAGCCACATCCACACG;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=110;TCF=57;TCR=53;TR=32;WE=1306994;WS=1306961;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:78,32:0.29:110
chr16	1306973	rs79313952	A	G	1215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=0.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQRankSum=-4.519;QD=9.88;ReadPosRankSum=2.348;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,36:0.29:123
chr16	1306986	rs72775467	C	T	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.729;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-4.876;NF=12;NR=16;PP=1327;ReadPosRankSum=2.241;SC=CACACGGTCACGCTGCCCCCT;SOR=1.016;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=103;TCF=52;TCR=51;TR=28;WE=1306994;WS=1306961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,31:0.26:118
chr16	1311513	rs3085832	G	GGGCA	3936.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.909;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=19;PP=1619;ReadPosRankSum=0.241;SC=GGTGGGAGCAGGGCAGGCAGG;SOR=0.863;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=104;TCF=32;TCR=72;TR=33;WE=1311521;WS=1311503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,100:0.58:172
chr16	1312546	rs1610293	T	A	5639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=462;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.125;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=138;NR=120;PP=2962;ReadPosRankSum=0.398;SC=CATTAGCGGCTCAGATCATGG;SOR=0.809;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=434;TCF=227;TCR=207;TR=258;WE=1312554;WS=1312536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:188,271:0.59:459
chr16	1312826	rs7184111	A	G	2393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.565;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;ReadPosRankSum=-1.709;SC=AGTGGGCAGCAGTCAGCACCC;SOR=0.745;Source=Platypus;TCF=90;WE=1312834;WS=1312816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,111:0.62:178
chr16	1312976	rs8048322	T	G	4960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=418;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.757;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=112;NR=113;PP=2962;ReadPosRankSum=0.534;SC=GGTCATTCTCTGGGACGGGCA;SOR=0.614;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=384;TCF=195;TCR=189;TR=225;WE=1312984;WS=1312966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,241:0.58:415
chr16	1323539	rs8060254	T	C	631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.614;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=3;PP=391;ReadPosRankSum=0.737;SC=CCATGTGCGATGGAGGAGCAG;SOR=0.430;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=37;TCF=33;TCR=4;TR=23;WE=1323547;WS=1323529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,26:0.62:42
chr16	1323781	rs1610294	T	C	1257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.677;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=38;PP=743;ReadPosRankSum=-0.109;SC=ACCAGGGGGCTGCCTGAGTCA;SOR=0.951;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=99;TCF=34;TCR=65;TR=55;WE=1323789;WS=1323771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,60:0.57:106
chr16	1326785	rs35786958	A	T	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=2.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.18;ReadPosRankSum=-0.724;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr16	1358608	rs148430996	ATGAGGGAGGGAGGGAATTAG	A	3165.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=15;PP=2973;SC=GATCGAATGAATGAGGGAGGG;SOR=1.708;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=36;TCF=11;TCR=25;TR=23;WE=1358635;WS=1358598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr16	1358917	rs11644706	A	T	795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=10;NR=15;PP=379;SC=GGGAGGGGGGACCGGAAGCGC;SOR=1.609;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=26;TCF=11;TCR=15;TR=25;WE=1358925;WS=1358907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr16	1358976	rs11645809	T	A	86.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=2;NR=2;PP=20;SC=GTCCCCCACGTCCCGCCCGCG;SOR=1.022;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=4;WE=1358984;WS=1358966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr16	1364140	rs9941160	T	C	7041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NR=136;PP=2965;SC=GCGGACAGGCTCCCTCGGCTG;SOR=1.054;Source=Platypus;TCR=137;WE=1364148;WS=1364130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
chr16	1364281	rs4984806	T	C	5764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=87;PP=2965;SC=GTGGTTGTTTTCTTTTCTCTC;SOR=0.834;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=195;TCF=108;TCR=87;TR=195;WE=1364289;WS=1364271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr16	1364365	rs4610	A	G	1412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.221;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=32;PP=759;ReadPosRankSum=0.987;SC=GCGCCATTCCAGGAAAGAAAG;SOR=0.583;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=153;TCF=72;TCR=81;TR=64;WE=1364373;WS=1364355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,74:0.44:167
chr16	1370303	rs909916	T	C	3580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.63;SOR=0.791;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr16	1370309	rs909917	C	G	3451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.15;SOR=0.850;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr16	1370597	rs4017786	G	C	3843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=91;PP=2925;SC=GGGAGTGGAGGACACAGGCTC;SOR=2.341;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=29;TCR=91;TR=120;WE=1370605;WS=1370587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr16	1370614	rs8063770	C	G	2606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=70;PP=2055;SC=GCTCACCCTACGGACAGCCAG;SOR=3.456;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=11;TCR=70;TR=81;WE=1370622;WS=1370604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr16	1370630	rs8043720	A	G	1752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=50;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=49;PP=1410;SC=GCCAGGGTCCACGCCTCTGTG;SOR=3.990;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=5;TCR=49;TR=54;WE=1370638;WS=1370620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr16	1374656	rs761060	A	G	1683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=13;PP=1130;SC=TGGTCTGCCCAGCTGGCTCCG;SOR=2.419;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=45;TCR=13;TR=58;WE=1374671;WS=1374646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr16	1374818	rs8063	A	G	5472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=4.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=442;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=123;NR=114;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.697;SC=GGCATCGTCAAAAGGAAGGGA;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=429;TCF=219;TCR=210;TR=237;WE=1374826;WS=1374808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:196,246:0.56:442
chr16	1374951	rs9597	C	G	1000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.903;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=34;PP=806;ReadPosRankSum=-1.257;SC=TGTGCGGTCTCGATTCGCTGA;SOR=1.402;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=63;TCF=12;TCR=51;TR=40;WE=1374959;WS=1374941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,40:0.62:65
chr16	1388416	rs13338616	T	C	170.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=5;NR=2;PP=131;SC=CCATCCAGGCTGTGGGTGAGC;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=1388424;WS=1388406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr16	1388888	rs7197416	C	T	8992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=184;NR=120;PP=2965;SC=TGAGCTGACCCGGCTCTTTCT;SOR=1.078;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=306;TCF=185;TCR=121;TR=304;WE=1388896;WS=1388878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,333:1.00:333
chr16	1389153	rs7202563	C	A	4391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=70;NR=76;PP=2385;SC=TCACCCTGGGCCCCACACACA;SOR=0.908;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=146;TCF=70;TCR=76;TR=146;WE=1389161;WS=1389143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr16	1393020	rs2235632	G	A	2193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=34;NR=39;PP=1310;SC=GCCGTGCTGTGAGTGGGTGGA;SOR=0.934;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=73;TCF=34;TCR=39;TR=73;WE=1393028;WS=1393010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr16	1394430	rs12597545	C	T	3827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=51;PP=2586;SC=CTTCCTCTTCCCTGCAATCCA;SOR=0.889;SbPval=0.55;Source=Platypus;TCF=71;TR=122;WE=1394438;WS=1394420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr16	1394507	rs1132356	A	C	7655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=151;NR=98;PP=2965;SC=ATCCTGAATGACAAGAGTCCC;SOR=0.957;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=249;TCF=151;TCR=98;TR=249;WE=1394515;WS=1394497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,279:1.00:279
chr16	1394551	rs11248872	A	G	8104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=167;NR=114;PP=2965;SC=GACCCTGGCCATGAGGGGTAC;SOR=1.005;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=281;TCF=167;TCR=114;TR=281;WE=1394559;WS=1394541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,306:1.00:306
chr16	1396788	rs3215518	TGCAGGTGGGGCCAGCGGG	T	2150.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=21;NR=3;PP=2957;SC=CAGGCCATTCTGCAGGTGGGG;SOR=3.702;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=24;WE=1396813;WS=1396778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr16	1397518	rs34339539	G	GC	4182.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=43;PP=2966;SC=GCACCCAGGGGCCCCTCCTGA;SOR=1.061;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=88;TCF=41;TCR=47;TR=75;WE=1397526;WS=1397508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr16	1397815	rs1132358	C	T	7576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=132;NR=125;PP=2965;SC=TCCCCCTGGACGCCAACGGTG;SOR=0.715;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=257;TCF=132;TCR=125;TR=257;WE=1397823;WS=1397805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,279:1.00:279
chr16	1398077	rs34766513	C	CCT	17138.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=391;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=148;PP=2930;SC=GCGAGACTCCCGACTGGCCTC;SOR=0.843;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=207;TCF=47;TCR=160;TR=191;WE=1398085;WS=1398064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,385:1.00:385
chr16	1400693	rs2294605	C	T	1136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=10;PP=782;SC=CTGAACTGTTCCCCTGTCCGT;SOR=1.923;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=36;WE=1400701;WS=1400683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr16	1407792	rs4984644	T	C	224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.48;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr16	1407809	rs4984820	T	C	178.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=4;NR=4;PP=79;SC=CCACCGCGCCTGGCCTCGACT;SOR=1.179;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=8;WE=1407817;WS=1407799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	1417408	rs4984823	T	C	622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=10;NR=13;PP=390;SC=CTGCAGACCCTCTTGCCTGTG;SOR=1.051;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=10;TCR=13;TR=23;WE=1417416;WS=1417398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr16	1419947	rs11248874	A	G	3647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=45;PP=2209;SC=TTGCAGTCCAACCTGGGCGAC;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=122;TCF=77;TCR=45;TR=122;WE=1419955;WS=1419937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr16	1433766	rs12918814	T	C	8211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.99;NF=136;NR=151;PP=2965;SC=CGGGTCCTGATGGTGCTGGGG;SOR=0.873;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=288;TCF=136;TCR=152;TR=287;WE=1433774;WS=1433756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,312:1.00:312
chr16	1447278	.	A	G	490	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MMLQ=24;MQ=57.6;NF=10;NR=16;PP=490;QD=20.1835081749;SC=CGTGCTTCACACTGGGGCAGG;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=10;TCR=16;TR=26;WE=1447286;WS=1447268;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr16	1447319	.	G	A	82	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;FR=1.0000;HP=4;HapScore=2;MGOF=16;MMLQ=27;MQ=47.62;NF=1;NR=4;PP=82;QD=23.3542425094;SC=AGGTGTCAGGGGGACACAGAG;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=1447327;WS=1447309;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr16	1451519	rs761068	G	A	800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=20;NR=9;PP=438;SC=CTGTTCTCGCGCTGTGCCCGC;SOR=1.284;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=29;WE=1451527;WS=1451509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr16	1455900	rs8044833	C	T	11356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=419;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=210;NR=168;PP=2965;SC=CCTCAGGAAGCTCTCACCTGA;SOR=0.908;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=378;TCF=210;TCR=168;TR=378;WE=1455908;WS=1455890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,419:1.00:419
chr16	1458381	rs1609562	G	C	290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=1;PP=114;SC=GGCCTTTCCCGAGCGGGGCGG;SOR=1.802;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=1458389;WS=1458371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr16	1458561	rs2179534	T	C	4229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=78;NR=68;PP=2443;SC=TGGGGAGCCATAGGATGAGGA;SOR=0.706;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=146;TCF=78;TCR=68;TR=146;WE=1458569;WS=1458551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr16	1464636	rs111437424	A	C	4878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=91;NR=78;PP=2559;SC=TCGGCTTCTCAGTCTGCGGGG;SOR=0.792;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=170;TCF=91;TCR=79;TR=169;WE=1464644;WS=1464626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr16	1476465	rs4984834	A	G	450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=11;PP=318;SC=AGTTAATCTCAGTCTCAAACA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=1476473;WS=1476455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr16	1479250	rs11646599	C	T	2845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.959;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=37;PP=1843;ReadPosRankSum=0.636;SC=AAGGAGAAGCCGTAACTGGTG;SOR=1.018;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=191;TCF=128;TCR=63;TR=114;WE=1479258;WS=1479240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,126:0.58:216
chr16	1484338	rs7192100	A	G	3562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=53;PP=2189;ReadPosRankSum=1.699;SC=TCAGCCCCACAGGCCCTGGGT;SOR=0.365;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=131;TCF=78;TCR=53;TR=130;WE=1484346;WS=1484328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,140:0.99:141
chr16	1484392	rs12598718	G	C	2057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.021;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=34;PP=1048;ReadPosRankSum=-2.255;SC=GCTCTAATGAGTACAAAGCCA;SOR=0.781;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=203;TCF=116;TCR=87;TR=84;WE=1484400;WS=1484382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,102:0.45:229
chr16	1484473	rs7192331	A	G	5056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=87;NR=86;PP=2895;SC=GGGCTTCTCCAGGACCCCTCC;SOR=0.789;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=173;TCF=87;TCR=86;TR=173;WE=1484481;WS=1484463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr16	1485062	.	C	T	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.771;ClippingRankSum=0.000;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=1.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.16;ReadPosRankSum=-1.986;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,13:0.23:56
chr16	1486352	rs909974	T	C	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=1;PP=612;ReadPosRankSum=-0.124;SC=TCTGTCACGATACCAGGGGAT;SOR=0.565;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=57;TCF=55;TCR=2;TR=31;WE=1486360;WS=1486342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,35:0.57:61
chr16	1486875	rs3751894	C	T	3200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.795;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=83;PP=1956;ReadPosRankSum=0.482;SC=GATGGAAAGACGGACACGGGG;SOR=0.989;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=267;TCF=108;TCR=159;TR=132;WE=1486889;WS=1486865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,144:0.51:283
chr16	1486926	rs3751895	C	G	1377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=42;PP=892;ReadPosRankSum=-1.059;SC=ACTTCCAGCTCTGAGACATTT;SOR=0.756;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=128;TCF=43;TCR=85;TR=62;WE=1486934;WS=1486916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,66:0.49:135
chr16	1487975	rs4984839	A	G	1860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.814;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=31;PP=880;ReadPosRankSum=-1.219;SC=ACAGGTGGGCACGGGGAGGCC;SOR=0.553;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=161;TCF=95;TCR=66;TR=77;WE=1487983;WS=1487965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,93:0.50:185
chr16	1488015	rs4984840	A	G	5430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.637;HP=4;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=57;PP=1741;ReadPosRankSum=-1.848;SC=TGTGCGTGGGAGACCCCGTTG;SOR=0.550;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=244;TCF=136;TCR=108;TR=125;WE=1488023;WS=1488005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,142:0.52:272
chr16	1488039	rs4984841	C	T	6029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=68;PP=2095;ReadPosRankSum=0.414;SC=ACATGTTGCGCTACCCCCTCA;SOR=0.692;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=280;TCF=155;TCR=125;TR=151;WE=1488047;WS=1488029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,171:0.54:314
chr16	1488079	rs145873417	C	T	2436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.238;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=55;PP=1478;ReadPosRankSum=0.117;SC=CATCTCCTGCCGGGCCAGCTC;SOR=0.624;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=257;TCF=133;TCR=124;TR=111;WE=1488087;WS=1488069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,123:0.43:286
chr16	1488224	rs4984843	T	C	1876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=39;PP=1040;ReadPosRankSum=-2.362;SC=CCTGCCCACCTCTCAGCCCTG;SOR=0.642;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=126;TCF=57;TCR=69;TR=73;WE=1488232;WS=1488214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,86:0.61:142
chr16	1488646	rs8054054	A	G	3187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.425;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=69;PP=1895;ReadPosRankSum=-0.202;SC=CCAGTAGGACACGGTTCAGCG;SOR=0.704;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=259;TCF=134;TCR=125;TR=143;WE=1488654;WS=1488636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,160:0.55:293
chr16	1492660	rs760993	T	C	1033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=10;PP=685;SC=AACAGAGGAATGGGAAACACA;SOR=1.308;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=30;WE=1492668;WS=1492650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr16	1493030	rs1883480	C	G	1205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=31;PP=750;ReadPosRankSum=0.442;SC=GCAGCCTCGGCGGGCTGGGGG;SOR=0.665;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=111;TCF=48;TCR=63;TR=54;WE=1493038;WS=1493020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,59:0.48:124
chr16	1493098	rs760994	G	A	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.228;HP=5;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=213;ReadPosRankSum=0.354;SC=TCTGAAGGCCGCCCAGGCACG;SOR=0.177;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=13;WE=1493106;WS=1493088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr16	1493130	rs760995	C	T	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.829;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=4;PP=167;ReadPosRankSum=0.985;SC=CCTTTTCTAGCTGGACCTGGA;SOR=0.668;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=17;TCF=8;TCR=9;TR=9;WE=1493138;WS=1493120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr16	1493151	rs11641300	C	T	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=91;ReadPosRankSum=0.585;SC=TGTGTATCCCCCACTCCAGCG;SOR=0.743;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=7;WE=1493159;WS=1493141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr16	1493491	rs12929054	T	G	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.105;HP=8;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=105;ReadPosRankSum=0.040;SC=GACCTGTGGGTGGGGGAGCCG;SOR=1.536;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=7;WE=1493499;WS=1493481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr16	1493759	rs12596752	C	T	1223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.641;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=20;PP=710;ReadPosRankSum=0.091;SC=GCGGCGGCGACGTGGTCCTCC;SOR=0.773;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=125;TCF=73;TCR=52;TR=53;WE=1493767;WS=1493749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,60:0.44:135
chr16	1497137	rs12599176	C	T	342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=226;ReadPosRankSum=0.068;SC=CAGAGGCAGGCGGGACCCTCA;SOR=0.773;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=67;TCF=25;TCR=42;TR=20;WE=1497145;WS=1497127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,21:0.30:71
chr16	1498197	rs2235578	A	G	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.298;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=125;ReadPosRankSum=1.533;SC=GCGTCCACACAGCCCTCCATG;SOR=1.863;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=11;WE=1498205;WS=1498187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,10:0.33:30
chr16	1498520	rs12597739	A	G	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.517;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=268;ReadPosRankSum=1.390;SC=TGCCCGTCACACGCCACCAAC;SOR=1.219;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=48;TCF=20;TCR=28;TR=21;WE=1498528;WS=1498510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,21:0.42:50
chr16	1499377	rs742408	C	T	1409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FS=2.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.98;ReadPosRankSum=0.357;SOR=0.823;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:122,80:0.40:202
chr16	1500708	rs61073146	G	GC	1161.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.240;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=26;PP=857;ReadPosRankSum=1.701;SC=CACGACTCCCGCCTCCGCAGG;SOR=1.236;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=74;TCF=1;TCR=73;TR=26;WE=1500716;WS=1500698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,43:0.39:110
chr16	1504017	rs4786337	A	G	806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=22;PP=591;SC=GCAGGGGGCTAGGGGGTCCTG;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=1504025;WS=1504007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr16	1504633	rs4265806	C	T	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.688;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=134;ReadPosRankSum=-0.528;SC=ACTGGGTGTTCTGAGCAGGCC;SOR=0.132;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=10;WE=1504641;WS=1504623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr16	1505599	rs7190701	C	T	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.074;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=383;ReadPosRankSum=1.690;SC=TGGGCAGGACCAAGGCCTGAC;SOR=0.512;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=67;TCF=52;TCR=15;TR=26;WE=1505607;WS=1505589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,28:0.38:74
chr16	1507238	rs12933110	A	G	2604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=377;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.733;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=54;PP=1551;ReadPosRankSum=-0.083;SC=GCCCACCCACACAAGATTTCA;SOR=0.788;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=344;TCF=195;TCR=149;TR=126;WE=1507246;WS=1507228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:235,142:0.38:377
chr16	1507778	rs9922189	T	C	5460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=692;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.526;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=133;NR=144;PP=2896;ReadPosRankSum=-0.049;SC=GGGAGACGCATGGCCTCTGAT;SOR=0.747;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=646;TCF=311;TCR=335;TR=277;WE=1507786;WS=1507768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:398,292:0.42:690
chr16	1508988	rs35341445	T	C	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.61;ReadPosRankSum=-1.329;SOR=0.188;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr16	1509123	rs12923538	G	A	1081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.822;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=16;PP=659;ReadPosRankSum=0.790;SC=GCCGCACCACGTGGGGGATCT;SOR=1.387;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=162;TCF=101;TCR=61;TR=55;WE=1509131;WS=1509113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,60:0.35:173
chr16	1509273	.	A	AGGAGAGCAGCAGACACGTCGGGGCCTCAGGGAAGG	420.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.698;ClippingRankSum=0.000;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQRankSum=-2.028;QD=11.37;ReadPosRankSum=0.995;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,12:0.32:37
chr16	1510538	rs35280276	A	G	2209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.459;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=58;PP=1278;ReadPosRankSum=-0.823;SC=TCTGGGGCTCATCAAGGAGGG;SOR=0.816;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=257;TCF=117;TCR=140;TR=103;WE=1510546;WS=1510528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,116:0.41:282
chr16	1510567	rs2072950	T	G	5126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=94;PP=2965;SC=TTCCCCGTCATGACCACCCAG;SOR=1.042;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=166;TCF=72;TCR=94;TR=166;WE=1510575;WS=1510557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr16	1510634	rs34682071	G	A	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.889;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=7;PP=226;ReadPosRankSum=1.292;SC=CTGCTGGGTGGAGCCATGATG;SOR=0.526;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=51;TCF=19;TCR=32;TR=16;WE=1510642;WS=1510624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,18:0.33:55
chr16	1510707	rs35436553	C	G	648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.293;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=6;PP=500;ReadPosRankSum=0.849;SC=CCAGCCTGGCCGGGCCGCCTC;SOR=1.090;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=74;TCF=57;TCR=17;TR=31;WE=1510715;WS=1510697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,33:0.41:81
chr16	1511372	rs12926202	C	T	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.702;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=153;ReadPosRankSum=-0.877;SC=GGCCCCGCACCGTGGGGCCCT;SOR=1.981;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=9;WE=1511380;WS=1511362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr16	1511552	rs2744994	G	T	3418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=36;PP=2139;SC=GGAGTGGGCTGGCAGGGGGCA;SOR=1.188;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=69;TCR=36;TR=105;WE=1511560;WS=1511542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr16	1511758	rs11248878	A	G	626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=21;PP=366;ReadPosRankSum=-0.485;SC=ACACGAGGCCATTATCATCCC;SOR=0.741;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=86;TCF=32;TCR=54;TR=32;WE=1511766;WS=1511748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,35:0.38:91
chr16	1511811	rs12926972	C	T	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.366;HP=5;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=128;ReadPosRankSum=0.729;SC=GCACATGGGGCGCGGTGGCTG;SOR=0.242;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=10;WE=1511819;WS=1511801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr16	1515162	rs2235580	C	T	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.754;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=188;ReadPosRankSum=2.319;SC=GAACCCCGGCCCTGGGGCCCC;SOR=0.126;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=13;WE=1515170;WS=1515152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr16	1515415	rs12927645	G	T	722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.143;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=18;PP=365;ReadPosRankSum=-1.761;SC=TCCCGCCGCCGCACCCTGGCC;SOR=1.103;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=66;TCF=28;TCR=38;TR=29;WE=1515423;WS=1515405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,35:0.47:74
chr16	1515503	rs2744997	G	A	532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=12;PP=303;SC=GGGCTGGGACGGGCCTCCCTG;SOR=2.419;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=16;WE=1515511;WS=1515493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr16	1524261	rs28550432	G	T	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=15;PP=247;ReadPosRankSum=-1.977;SC=AACTCGGTGCGAAGGGAGACT;SOR=0.734;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=103;TCF=45;TCR=58;TR=28;WE=1524269;WS=1524251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,38:0.32:119
chr16	1524774	.	G	GGCGC	111	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=2;NR=1;PP=111;QD=48.0;SC=GGCTCACGAGGGCGCGGGCTG;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=3;WE=1524782;WS=1524764;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,3:0.30:10
chr16	1524850	rs3751884	A	G	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=291;ReadPosRankSum=1.434;SC=GCGCAGCCCCAGGCCCAGCCC;SOR=0.654;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=73;TCF=53;TCR=20;TR=23;WE=1524858;WS=1524840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,27:0.35:78
chr16	1536535	rs2745098	C	T	1808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.239;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=46;PP=1046;ReadPosRankSum=0.774;SC=GACCACGTTCCTGGTGGAGGC;SOR=0.860;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=222;TCF=105;TCR=117;TR=83;WE=1536543;WS=1536525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,95:0.39:244
chr16	1536677	rs12928073	C	A	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=113;ReadPosRankSum=-0.285;SC=CCACTCCCGGCTGCCACCCTT;SOR=0.681;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=33;TCF=10;TCR=23;TR=12;WE=1536685;WS=1536667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr16	1537283	rs36032546	G	T	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.207;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=332;ReadPosRankSum=0.045;SC=CTGGAGGGAAGCCTGGCCGTG;SOR=0.504;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=52;TCF=41;TCR=11;TR=22;WE=1537291;WS=1537273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,22:0.42:52
chr16	1537455	rs2667673	T	C	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.728;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=19;PP=329;ReadPosRankSum=0.128;SC=GGGGGGCCCCTGTGCTCAGAG;SOR=1.073;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=93;TCF=43;TCR=50;TR=33;WE=1537463;WS=1537445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,39:0.36:109
chr16	1537588	rs12932893	C	G	671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.825;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=14;PP=439;ReadPosRankSum=-1.487;SC=GGGCCACGGGCAGCCGCCCCT;SOR=0.566;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=81;TCF=48;TCR=33;TR=33;WE=1537596;WS=1537578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,35:0.40:87
chr16	1537839	rs2745101	G	A	3173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=428;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.549;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=64;PP=2068;ReadPosRankSum=-1.137;SC=GCCTGTGACCGGTTGACTGCC;SOR=0.862;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=397;TCF=221;TCR=176;TR=151;WE=1537847;WS=1537829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:267,160:0.37:427
chr16	1538363	rs1040499	C	A	974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.205;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=20;PP=518;ReadPosRankSum=-0.749;SC=CCCGACAGGCCCACAGCACTC;SOR=0.397;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=138;TCF=86;TCR=52;TR=46;WE=1538371;WS=1538353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,51:0.34:148
chr16	1538433	rs2745102	A	G	1653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=45;PP=1023;ReadPosRankSum=1.103;SC=GACTGCCACAAGGTGGACCTG;SOR=0.704;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=269;TCF=135;TCR=134;TR=91;WE=1538441;WS=1538423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:195,96:0.33:291
chr16	1538464	rs2745103	C	T	1648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=48;PP=1019;ReadPosRankSum=-0.864;SC=GTTTCCACTCCCCATGACACT;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=258;TCF=120;TCR=138;TR=92;WE=1538472;WS=1538454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:181,95:0.34:276
chr16	1538560	rs34993742	G	A	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.546;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=131;ReadPosRankSum=-0.444;SC=CACATGTTATGAGGCTTGTGT;SOR=0.364;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=36;TCF=10;TCR=26;TR=12;WE=1538568;WS=1538550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,12:0.33:36
chr16	1538692	rs2667675	A	C	1677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.678;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=29;PP=1080;ReadPosRankSum=1.371;SC=ATGTTTACCAATCTGCTTCTG;SOR=0.811;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=225;TCF=141;TCR=84;TR=83;WE=1538700;WS=1538682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,87:0.37:238
chr16	1544301	rs2667660	GA	CG	6253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=446;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.810;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=69;PP=2944;ReadPosRankSum=1.214;SC=AGCACCCTCAGAGGTTCGACT;SOR=0.535;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=408;TCF=223;TCR=185;TR=145;WE=1544310;WS=1544291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:278,168:0.38:446
chr16	1545448	rs2235624	A	G	2409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=61;NR=27;PP=1512;SC=CAGCAGACGCAGCCCGGCTTC;SOR=1.584;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=62;TCR=27;TR=88;WE=1545456;WS=1545438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr16	1547220	rs2235630	C	T	221.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=138;SC=TCCCCTTGCCCGGTCCTGTCC;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=1547228;WS=1547210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	1557792	.	TGA	T	69.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.602;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=161;ReadPosRankSum=0.751;SC=TGTGTGTGTGTGAGAGATGTG;SOR=0.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=6;WE=1557802;WS=1557782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,5:0.19:26
chr16	1557794	rs12927760	A	T	514.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=876;ReadPosRankSum=-0.783;SC=TGTGTGTGTGAGAGATGTGTC;SOR=0.804;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=23;WE=1557802;WS=1557782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,21:0.81:26
chr16	1573810	rs2745176	A	G	7279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=138;NR=125;PP=2965;SC=CCAGGTCCCCACCGGTGGCCA;SOR=0.729;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=263;TCF=138;TCR=125;TR=263;WE=1573818;WS=1573800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,279:1.00:279
chr16	1633446	rs147086637	A	C	10032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=382;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=174;NR=176;PP=2965;SC=GCAACTGTACACCCCACTGCA;SOR=0.792;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=352;TCF=175;TCR=177;TR=350;WE=1633454;WS=1633436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,378:1.00:378
chr16	1633559	.	G	A	846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.363;ClippingRankSum=0.000;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.363;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=33;PP=687;ReadPosRankSum=0.923;SC=GCTGTTTTCCGTGTTATATAA;SOR=1.118;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=73;TCF=16;TCR=57;TR=41;WE=1633567;WS=1633549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,38:0.54:70
chr16	1636311	.	T	TA	1176.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=0.000;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.43;MQRankSum=1.897;NF=5;NR=17;PP=507;ReadPosRankSum=1.446;SC=TGAACAGAGTTAAAAAAAGGG;SOR=0.702;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=44;TCF=7;TCR=37;TR=22;WE=1636319;WS=1636301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,50:0.54:93
chr16	1642026	rs116859784	G	A	2602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=8;PP=1766;SC=GAGTGGCTGCGGCACTCCGCC;SOR=4.021;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=63;TCR=8;TR=71;WE=1642034;WS=1642016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr16	1716010	rs8058190	A	C	1366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=10;PP=848;SC=CCCTGCGGCCACATCCTGCTG;SOR=1.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=32;TCR=10;TR=42;WE=1716018;WS=1716000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr16	1810116	rs57876690	C	A	1603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=46;PP=1227;SC=GAGCACCTGGCTCCAACGCCA;SOR=3.611;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=5;TCR=46;TR=51;WE=1810124;WS=1810106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr16	1812972	rs2294616	G	C	13300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=512;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=229;NR=249;PP=2965;SC=GCCCGATCTCGGCAGGCAGCC;SOR=0.836;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=482;TCF=230;TCR=252;TR=478;WE=1812980;WS=1812962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,508:1.00:508
chr16	1814391	rs2294618	T	C	2398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=38;NR=41;PP=1285;SC=CAGGCCGCGATCCCCTGACCT;SOR=1.046;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=38;TCR=41;TR=79;WE=1814399;WS=1814381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr16	1815337	rs2917508	G	A	524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=13;PP=381;SC=AGTCAAGTGAGGCCCTGGGCC;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=16;WE=1815345;WS=1815327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr16	1818153	rs2437734	T	C	6047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=120;NR=76;PP=2965;SC=CCTCTCCCACTCTCCACCTGT;SOR=0.973;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=196;TCF=120;TCR=76;TR=196;WE=1818161;WS=1818143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr16	1822159	rs2269123	T	C	2935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=30;PP=1938;SC=AAAGACGGTTTCTTTCATCAA;SOR=1.542;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=96;TCF=66;TCR=30;TR=96;WE=1822167;WS=1822149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr16	1823024	rs11552431	G	T	8680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=160;NR=153;PP=2965;SC=ACCGCGTAGAGCTGGGAGTCG;SOR=0.724;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=313;TCF=160;TCR=153;TR=313;WE=1823032;WS=1823014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,329:1.00:329
chr16	1824115	rs2076433	G	C	415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=4;PP=342;SC=TGGCAGGAAAGGGAACACTGG;SOR=1.765;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=14;WE=1824123;WS=1824112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr16	1825067	rs148313225	C	T	3562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.321;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=60;PP=2021;ReadPosRankSum=1.355;SC=CACTGGGTGCCCTGGATCTCC;SOR=0.855;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=209;TCF=118;TCR=91;TR=138;WE=1825075;WS=1825057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,158:0.66:238
chr16	1825774	rs13339350	T	C	8992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=160;NR=143;PP=2965;SC=CATGAGGTTCTAAAAGGCTTC;SOR=0.717;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=303;TCF=160;TCR=143;TR=303;WE=1825782;WS=1825764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,334:1.00:334
chr16	1826023	rs9929680	G	A	3187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=54;NR=46;PP=1734;SC=TCCAGGTGCAGAAGCCCCGTC;SOR=0.743;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=102;TCF=56;TCR=46;TR=100;WE=1826031;WS=1826013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr16	1826377	rs2235636	A	G	767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=22;PP=640;ReadPosRankSum=-0.685;SC=ACCTCAGGGGAAGGGTGGGTG;SOR=2.226;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=25;WE=1826385;WS=1826367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,25:0.96:26
chr16	1827522	rs13332165	T	G	416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=13;PP=346;SC=GACCTCACGCTACAGTCACCC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=1827530;WS=1827512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr16	1827836	rs1178432	T	C	3981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=56;PP=2083;SC=CGAACCGCGATGAGAAGCTGG;SOR=0.803;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=77;TCR=57;TR=133;WE=1827844;WS=1827826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr16	1828030	rs35816944	G	A	5029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=419;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.529;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=113;NR=116;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.147;SC=GTCCACATCCGACGTCCCGAT;SOR=0.613;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=390;TCF=190;TCR=200;TR=229;WE=1828038;WS=1828020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,244:0.59:417
chr16	1836709	rs2575351	G	C	7934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=142;NR=133;PP=2965;SC=CCCGCATCCCGGTGGAGGCCT;SOR=0.714;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=275;TCF=142;TCR=133;TR=275;WE=1836717;WS=1836699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,293:1.00:293
chr16	1837900	rs344358	T	C	3655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=61;PP=2400;SC=GTGTCCCTGCTGGTGCGCCTG;SOR=0.787;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=130;TCF=69;TCR=61;TR=130;WE=1837908;WS=1837890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr16	1838037	rs2272977	C	G	9264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=172;NR=157;PP=2965;SC=GCGGCTTCACCTGCCCACACT;SOR=0.722;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=329;TCF=172;TCR=157;TR=329;WE=1838045;WS=1838027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,353:1.00:353
chr16	1838479	rs28534374	A	T	165.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=130;SC=ATCCCCTCTAAGGCCACGGGT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=1838487;WS=1838471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr16	1838604	rs33933410	C	T	2412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=37;PP=1396;ReadPosRankSum=-1.236;SC=TCATGAGGACCCTGGAGGAGG;SOR=0.694;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=145;TCF=91;TCR=54;TR=98;WE=1838612;WS=1838594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,107:0.68:157
chr16	1838640	rs344359	T	C	5647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=113;NR=83;PP=2787;SC=AGGAGTTCCCTGGGAGCCCCG;SOR=0.853;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=197;TCF=113;TCR=84;TR=196;WE=1838648;WS=1838630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr16	1842209	rs3751893	A	G	6701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=128;NR=113;PP=2965;SC=CCGGGACTCCATCAGGCAGGC;SOR=0.716;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=242;TCF=128;TCR=114;TR=241;WE=1842217;WS=1842199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr16	1859150	rs1057071	G	A	6866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.71;SOR=2.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr16	1859153	rs1057070	T	C	6981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.37;SOR=2.118;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr16	1859432	rs1628812	G	C	2589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=60;PP=1513;SC=CACGCCCACCGGAGGAGCCAG;SOR=1.839;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=28;TCR=60;TR=88;WE=1859440;WS=1859422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr16	1859476	rs1629513	G	A	1662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.64;SOR=2.362;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr16	1859482	rs1629534	A	C	1626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.97;SOR=2.242;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr16	1859730	rs2745199	G	A	2971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=31;PP=1924;SC=AGGGGCCCGCGCCCACCACCT;SOR=1.769;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=100;TCF=69;TCR=31;TR=98;WE=1859738;WS=1859720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr16	1859850	rs1742442	A	G	7963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=134;NR=146;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.894;SC=AGAGAAACGCACCACTTTATC;SOR=0.832;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=282;TCF=135;TCR=147;TR=280;WE=1859858;WS=1859840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,306:0.99:308
chr16	1876949	rs7188401	G	C	2635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=53;PP=1586;SC=AACTTGTTTTGTCCGCGAGCC;SOR=1.739;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=25;TCR=53;TR=78;WE=1876957;WS=1876939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr16	1877698	rs3743852	C	G	5669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=84;NR=100;PP=2965;SC=ACGGCGAACTCAGACAGGAGG;SOR=0.927;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=185;TCF=84;TCR=101;TR=184;WE=1877706;WS=1877688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr16	1877913	rs13166	C	G	7536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=117;NR=143;PP=2965;SC=TGAGTTATTTCTTAACAAGTT;SOR=1.019;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=260;TCF=117;TCR=143;TR=260;WE=1877921;WS=1877903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr16	1884501	rs171162	A	T	515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=376;SC=ATAAACTTCCATTAGAGCTGT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=1884509;WS=1884491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr16	1894912	rs9806826	C	T	3421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=61;PP=1924;SC=CCAGAACATTCGTTTCTTTAT;SOR=0.988;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=116;TCF=55;TCR=61;TR=115;WE=1894920;WS=1894902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr16	1902889	rs1617255	T	C	320.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=1;PP=166;SC=TCAAAGTTCATTGTAAGTTTT;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=1902909;WS=1902885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr16	1902901	rs7187251	A	T	320.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=1;PP=215;SC=GTAAGTTTTTAAAAAAGTTAT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=1902909;WS=1902885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	1907652	rs428123	G	A	2442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=15;PP=1607;SC=CCAGCTGATCGTGACCACTCC;SOR=2.570;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=60;TCR=15;TR=75;WE=1907660;WS=1907642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr16	1907701	rs408286	AG	CA	8918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=59;PP=2947;SC=CTCCCCTGCCAGATTGCACTT;SOR=1.052;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=175;TCF=105;TCR=70;TR=155;WE=1907710;WS=1907691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr16	1907946	rs411193	C	T	702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=19;PP=466;SC=ATTGCAAAAACACAAGAAAGT;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=1907954;WS=1907936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr16	1910219	rs391288	A	T	180.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=147;SC=AAAGCCATTTATCATGTGACT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=1910227;WS=1910209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr16	1910373	rs433268	C	G	5445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=107;NR=72;PP=2965;SC=TGATCATTCTCGCACAATCTC;SOR=1.025;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=179;TCF=107;TCR=72;TR=179;WE=1910381;WS=1910363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr16	1912021	rs1657125	T	G	9402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=359;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=175;NR=156;PP=2965;SC=AGAAAGAGACTTGATGTAATC;SOR=0.744;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=332;TCF=175;TCR=157;TR=331;WE=1912029;WS=1912011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,359:1.00:359
chr16	1912139	rs380846	T	C	5018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=101;PP=2965;SC=CCAATGCTTTTATTTTTCAAA;SOR=1.491;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=159;TCF=58;TCR=101;TR=159;WE=1912147;WS=1912129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr16	1912205	rs1657126	T	C	1338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=35;PP=1017;SC=AAAAGTTTCATTTCAATTATA;SOR=3.716;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=5;TCR=35;TR=40;WE=1912213;WS=1912195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr16	1915886	rs58422887	T	A	1068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=23;PP=732;SC=CAGATGTACTTGATAAATTTA;SOR=1.949;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=10;TCR=23;TR=33;WE=1915894;WS=1915876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr16	1917998	rs1742444	T	C	1908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=12;PP=1304;SC=AATGAGTATCTATATACTTGC;SOR=2.267;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=46;TCR=12;TR=58;WE=1918006;WS=1917988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr16	1918094	rs78268797	T	G	6767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=123;NR=103;PP=2965;SC=AATCACCACATTATTGAAACC;SOR=0.775;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=226;TCF=123;TCR=103;TR=226;WE=1918102;WS=1918084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr16	1918125	rs1742446	T	G	6599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=112;NR=114;PP=2965;SC=GCCATATTTGTCTGCAGATCT;SOR=0.809;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=226;TCF=112;TCR=114;TR=226;WE=1918133;WS=1918115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr16	1961674	rs337285	G	C	6062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=127;NR=80;PP=2965;SC=CGCCGGACCAGGGCCTGGGGC;SOR=1.127;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=207;TCF=127;TCR=80;TR=207;WE=1961682;WS=1961664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr16	1962046	rs1742399	CG	TA	14832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;JOINED;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=162;NR=120;PP=2947;SC=AGCGTCTGGGCGTAGTCGGAG;SOR=0.936;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=295;TCF=168;TCR=127;TR=282;WE=1962055;WS=1962036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,328:1.00:328
chr16	1962132	rs8055325	G	A	7291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=117;NR=124;PP=2965;ReadPosRankSum=1.492;SC=GCGGCGGGGGGCCTCTCGCGT;SOR=0.904;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=242;TCF=117;TCR=125;TR=241;WE=1962140;WS=1962122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,279:0.99:281
chr16	1968338	rs199930198	T	TC	282.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=5;PP=200;SC=GTCGCGCCGCTCCAGGCCCGG;SOR=0.892;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=1968346;WS=1968328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	1990994	rs13331553	T	C	20513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=747;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=343;NR=348;PP=2965;SC=CCCACACGCCTATTTCCCAAG;SOR=0.696;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=691;TCF=343;TCR=348;TR=691;WE=1991002;WS=1990984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,747:1.00:747
chr16	1991014	rs111845910	G	A	9776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=728;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.801;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=191;NR=223;PP=2962;ReadPosRankSum=0.258;SC=GCTGACCGCCGACATAAGAGG;SOR=0.835;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=668;TCF=316;TCR=352;TR=414;WE=1991022;WS=1991000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:277,450:0.62:727
chr16	1994743	rs2754179	G	A	2330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.10;ReadPosRankSum=-0.567;SOR=0.768;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,56:0.65:86
chr16	1994749	rs2531332	A	C	2437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.22;ReadPosRankSum=0.587;SOR=0.751;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,66:0.63:105
chr16	1994931	rs61276345	C	CAAGAG	3200.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.502;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.763;NF=5;NR=36;PP=2367;ReadPosRankSum=-0.186;SC=GCCTTAGTCACTCTGGCCAGA;SOR=0.549;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=84;TCF=9;TCR=75;TR=41;WE=1994939;WS=1994921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,82:0.63:131
chr16	1994980	rs11640479	G	T	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.483;HP=2;HapScore=4;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=22;PP=941;ReadPosRankSum=-0.277;SC=ATCACTCAGGGCCGGCCCTAC;SOR=1.739;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=43;TCF=10;TCR=33;TR=26;WE=1995000;WS=1994970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,30:0.65:46
chr16	1994992	rs60819893	G	GC	523.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.436;HP=6;HapScore=4;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=950;ReadPosRankSum=0.385;SC=CGGCCCTACTGCCCCCCTAAG;SOR=0.077;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=17;WE=1995000;WS=1994970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,21:0.70:30
chr16	1995997	rs113439442	C	T	2486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.144;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=68;PP=1634;ReadPosRankSum=-0.500;SC=TGGCTGGGGGCCCTAGCAGAA;SOR=1.165;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=162;TCF=47;TCR=115;TR=92;WE=1996005;WS=1995987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,103:0.56:183
chr16	1996075	rs1003904	G	A	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-4.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=273;ReadPosRankSum=-0.772;SC=TGACTATCACGCCGCCCCTAC;SOR=0.610;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=16;WE=1996083;WS=1996065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,22:0.67:33
chr16	1996535	rs35725974	C	CA	596.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=582;ReadPosRankSum=0.624;SC=ATGCCCCCTACATGTATACCA;SOR=0.775;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=37;TCF=25;TCR=12;TR=16;WE=1996543;WS=1996525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,20:0.43:47
chr16	1996612	rs117421680	C	A	1466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.576;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQ=60.06;MQRankSum=-0.880;NF=39;NR=26;PP=794;ReadPosRankSum=1.260;SC=GCAGTCGCCCCCTCCCAGCCT;SOR=0.771;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=149;TCF=88;TCR=61;TR=65;WE=1996620;WS=1996602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,74:0.44:167
chr16	1997113	rs45467097	G	A	2813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.108;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=41;PP=1875;ReadPosRankSum=1.039;SC=TGAGTGAGAGGGGCTGGTGGC;SOR=0.941;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=211;TCF=132;TCR=79;TR=119;WE=1997121;WS=1997103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,126:0.57:222
chr16	1997157	rs79939323	C	G	2332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.586;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=54;PP=1562;ReadPosRankSum=-0.319;SC=TGCCTCCAGGCAGCCTGCCCT;SOR=0.541;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=280;TCF=158;TCR=122;TR=114;WE=1997165;WS=1997147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,119:0.40:295
chr16	1997385	rs79075024	C	G	2758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=441;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.848;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=73;PP=1808;ReadPosRankSum=-0.767;SC=GTTTCATCTGCAGGACATGGC;SOR=0.861;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=399;TCF=201;TCR=198;TR=139;WE=1997393;WS=1997375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:288,152:0.35:440
chr16	2003016	rs140185678	G	A	2645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.527;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=57;PP=1394;ReadPosRankSum=-0.744;SC=AATTGTCACCGCCTCCACCTC;SOR=0.751;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=185;TCF=92;TCR=93;TR=113;WE=2003024;WS=2003006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,126:0.62:204
chr16	2004485	.	C	T	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.332;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=124;ReadPosRankSum=0.466;SC=GCCCAGCCCTCGTCCCCTTGT;SOR=0.481;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=10;WE=2004493;WS=2004475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr16	2004718	rs2815301	T	C	2399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=41;NR=37;PP=1265;SC=CAGCTGCCAGTTCCCAGATTA;SOR=0.883;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=41;TCR=37;TR=78;WE=2004726;WS=2004708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr16	2011126	rs758335	A	G	1041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=6;PP=650;SC=CCGATGAGGCATTTGAGTCTG;SOR=2.613;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=37;TCF=31;TCR=6;TR=36;WE=2011134;WS=2011116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr16	2014031	rs6366	C	G	711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=21;PP=564;SC=TCAGTTCTTTCGAAATGAATT;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=2014039;WS=2014021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	2014283	rs2286466	A	G	3322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=37;PP=2286;SC=GTACCTTAATAGGCAGGGAGA;SOR=1.570;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=79;TCR=37;TR=116;WE=2014291;WS=2014273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr16	2014424	rs403609	C	G	4706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=69;NR=86;PP=2593;SC=CCCAGGGGCCCGACCCCGAGC;SOR=1.098;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=155;TCF=69;TCR=86;TR=155;WE=2014432;WS=2014414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr16	2027406	rs142298030	G	A	863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.021;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=18;PP=478;ReadPosRankSum=0.433;SC=TTTGTGAGCCGTGGCACGCAG;SOR=0.912;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=89;TCF=49;TCR=40;TR=36;WE=2027414;WS=2027396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,42:0.43:98
chr16	2049640	rs2286469	A	G	2352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.835;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=50;PP=1316;ReadPosRankSum=1.512;SC=CGGGCCCTCCATGTGTCCATT;SOR=0.817;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=317;TCF=173;TCR=144;TR=117;WE=2049648;WS=2049630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:216,128:0.37:344
chr16	2050941	.	A	C	78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=8;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=5;NR=2;PP=78;QD=16.110173221;SC=AACAAACAAAAAAAAAGAGCT;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=7;WE=2050949;WS=2050931;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr16	2059621	rs11366527	GC	G	7195.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=13;NR=92;PP=2974;SC=GGTCGCAGCGGCCCCAGCGCC;SOR=0.813;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=109;TCF=13;TCR=96;TR=105;WE=2059629;WS=2059611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr16	2059674	rs71384660	T	C	5119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=58;NR=60;PP=1848;SC=GCTCCCGCCTTCCCGCTCAGG;SOR=0.937;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=118;TCF=58;TCR=60;TR=118;WE=2059682;WS=2059664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr16	2059698	rs71384661	T	G	4040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.25;QD=45.92;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr16	2059708	rs71384662	T	G	3166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.32;QD=47.27;SOR=1.410;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr16	2059710	rs71384663	T	G	2986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.33;QD=45.25;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr16	2059736	rs71148116	CG	C	1159.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.58;QD=35.14;SOR=2.517;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr16	2059762	rs71148117	GC	G	845.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=96;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=15;PP=449;SC=CCGGGATCCGGCCCCCCTCTC;SOR=2.200;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=2059770;WS=2059752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr16	2059778	rs71148118	GT	G	829.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=95;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=7;PP=401;SC=CTCTCGGCCGGTCGTGGCGCC;SOR=1.473;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=10;WE=2059798;WS=2059768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	2059782	rs71384664	T	C	680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.38;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	2059790	rs968417	A	C	622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.91;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr16	2059939	rs968418	A	C	5247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=22;PP=2331;SC=CCGCTCTACCATGAGCCGACC;SOR=2.670;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=80;TCR=22;TR=102;WE=2059947;WS=2059929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr16	2059955	rs62038790	A	G	6584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=110;NR=45;PP=2965;SC=CGACCGCTCGAAGGTCCGCGC;SOR=1.911;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=155;TCF=110;TCR=45;TR=155;WE=2059963;WS=2059945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr16	2070200	rs11248906	G	C	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=9;PP=282;ReadPosRankSum=-0.162;SC=GGAGCTGTGGGAGACGCGACG;SOR=0.726;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=53;TCF=31;TCR=22;TR=22;WE=2070208;WS=2070190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,25:0.39:64
chr16	2070327	rs3217040	G	GA	855.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.023;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.034;NF=6;NR=12;PP=744;ReadPosRankSum=1.121;SC=CGTGAGAGGGGAGAGGCCTGG;SOR=0.463;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=33;TCF=14;TCR=19;TR=18;WE=2070335;WS=2070317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,29:0.50:58
chr16	2070433	rs12921264	G	A	1283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.608;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.287;NF=41;NR=19;PP=861;ReadPosRankSum=1.496;SC=CCTGCTCCGCGCCCAGAAGAG;SOR=0.632;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=159;TCF=108;TCR=51;TR=60;WE=2070441;WS=2070423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,64:0.38:168
chr16	2070568	rs2286472	A	C	3023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=418;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.787;NF=70;NR=75;PP=1859;ReadPosRankSum=1.948;SC=CCAGCGGTGGACCCCGCAGCA;SOR=0.688;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=375;TCF=180;TCR=195;TR=145;WE=2070576;WS=2070558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:257,161:0.39:418
chr16	2079717	rs200227663	C	T	1887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.412;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=44;PP=1015;ReadPosRankSum=-0.108;SC=CACCCGCCCACGACCCCTGGG;SOR=0.707;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=290;TCF=153;TCR=137;TR=93;WE=2079725;WS=2079707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:213,107:0.33:320
chr16	2083358	rs11544570	A	G	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=1.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.68;ReadPosRankSum=-0.424;SOR=0.430;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr16	2083504	.	G	A	962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=0.000;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.878;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=18;PP=554;ReadPosRankSum=-0.385;SC=GGTGGAAGGAGGGGACTCCGG;SOR=0.518;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=70;TCF=37;TCR=33;TR=40;WE=2083512;WS=2083494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,45:0.58:77
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chr16	2088312	rs11876	C	T	1181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.690;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=22;PP=753;ReadPosRankSum=0.854;SC=GCTGCTCTGCCGGGGCCTGCT;SOR=0.776;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=108;TCF=69;TCR=39;TR=58;WE=2088320;WS=2088302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,58:0.49:118
chr16	2088401	rs150212258	AC	A	1051.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.958;HP=9;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=46;PP=1660;ReadPosRankSum=0.712;SC=AATACCAGAGACCCCCCCCCT;SOR=1.166;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=69;TCF=5;TCR=64;TR=48;WE=2088424;WS=2088391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,47:0.45:104
chr16	2088405	rs149481694	CCCCCCTTCCCCT	C	1332.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.934;HP=8;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=46;PP=2983;ReadPosRankSum=1.541;SC=CCAGAGACCCCCCCCCTTCCC;SOR=0.900;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=60;TCF=0;TCR=60;TR=46;WE=2088424;WS=2088391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,37:0.43:86
chr16	2103345	rs45517097	C	T	707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.482;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=10;PP=392;ReadPosRankSum=-1.311;SC=GGTGACAGCACGCAGTGGAAG;SOR=1.112;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=44;TCF=27;TCR=17;TR=28;WE=2103353;WS=2103335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,32:0.64:50
chr16	2110571	rs2074968	C	G	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.257;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=143;ReadPosRankSum=0.796;SC=GGGCACTGCGCGCTCAGGCGT;SOR=0.190;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=43;TCF=41;TCR=2;TR=12;WE=2110579;WS=2110561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,13:0.26:50
chr16	2110608	rs12927333	G	A	1918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=25;PP=1181;ReadPosRankSum=1.378;SC=AGGGTGACTGGGAGGGCGTCC;SOR=0.660;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=126;TCF=85;TCR=41;TR=78;WE=2110616;WS=2110598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,86:0.62:138
chr16	2111779	rs17135764	T	C	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=333;ReadPosRankSum=-0.467;SC=GGGCTGAGGGTGTCTCCATGC;SOR=0.719;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=47;TCF=41;TCR=6;TR=21;WE=2111787;WS=2111769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,21:0.43:49
chr16	2114407	rs34012042	C	T	1360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=35;PP=799;ReadPosRankSum=1.083;SC=ACTTCAACAGCCTGCTGGACA;SOR=0.737;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=104;TCF=42;TCR=62;TR=58;WE=2114415;WS=2114397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,64:0.55:116
chr16	2115506	rs45517185	C	T	1881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.082;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=37;PP=1395;ReadPosRankSum=0.825;SC=TAAGTCCTGGCCTTCTCTTCA;SOR=0.680;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=141;TCF=75;TCR=66;TR=85;WE=2115514;WS=2115496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,86:0.61:142
chr16	2120402	rs7187438	T	C	1606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.869;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=13;PP=1149;ReadPosRankSum=1.551;SC=GGGTGCTGTCTTAGGACTGCG;SOR=1.001;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=106;TCF=81;TCR=25;TR=62;WE=2120410;WS=2120392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,66:0.59:112
chr16	2158672	rs146096401	G	A	974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.13;ReadPosRankSum=0.625;SOR=0.575;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,47:0.68:69
chr16	2201270	rs36234	G	C	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.178;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=6;PP=127;ReadPosRankSum=-1.077;SC=GTTGCAGCTCGTTAGTTACTG;SOR=0.860;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=25;TCR=20;TR=13;WE=2201278;WS=2201260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,16:0.32:50
chr16	2203456	rs26931	T	C	6367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=108;PP=2965;SC=GAGGAAGCCGTCCAGTCCCTA;SOR=0.907;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=205;TCF=97;TCR=108;TR=205;WE=2203464;WS=2203446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr16	2223142	rs117921232	G	A	1578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.874;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=18;PP=1116;ReadPosRankSum=0.309;SC=GGGAGGCACCGGCAGGGACCC;SOR=0.904;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=99;TCF=71;TCR=28;TR=66;WE=2223150;WS=2223132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,65:0.65:100
chr16	2230683	.	C	T	1037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.043;ClippingRankSum=0.000;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.869;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=27;PP=586;ReadPosRankSum=2.121;SC=AGCAGCTCGTCCCGCTCCGGC;SOR=0.492;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=152;TCF=68;TCR=84;TR=53;WE=2230691;WS=2230673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,60:0.36:169
chr16	2233565	rs889495	T	C	994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=5;PP=673;SC=CGGGTGGGAGTTGTGGCCAGG;SOR=2.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=30;WE=2233573;WS=2233555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr16	2255807	rs112805476	G	A	2070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=17;PP=1310;SC=GCGGAGGTGGGGGGGGGACGG;SOR=1.675;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=65;TCF=48;TCR=17;TR=63;WE=2255815;WS=2255797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr16	2259865	rs25852	C	G	812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=5;PP=570;SC=CCTGAAACCACAGCTCCAGCC;SOR=2.066;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=25;WE=2259873;WS=2259855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr16	2260612	rs26856	T	C	1812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.347;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=28;PP=975;ReadPosRankSum=-1.190;SC=AGGAGCAGGCTCACGGCTCTC;SOR=0.577;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=94;TCF=53;TCR=41;TR=60;WE=2260620;WS=2260602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,75:0.67:112
chr16	2260921	rs76610224	C	T	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=289;ReadPosRankSum=0.030;SC=GAACCCCTCCCCTCCTGACCC;SOR=0.711;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=18;TCR=43;TR=23;WE=2260929;WS=2260911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,25:0.40:63
chr16	2264404	.	G	A	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.947;ClippingRankSum=0.000;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=10;PP=275;ReadPosRankSum=-0.168;SC=GGGCTGGGCTGCCCAGCACGT;SOR=0.606;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=58;TCF=29;TCR=29;TR=20;WE=2264412;WS=2264394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,20:0.32:62
chr16	2282256	rs26839	G	A	5486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.854;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=115;NR=77;PP=2965;ReadPosRankSum=1.215;SC=GGCAGCCCCCGCCAGCAGGGG;SOR=0.844;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=193;TCF=115;TCR=78;TR=192;WE=2282264;WS=2282240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,203:1.00:204
chr16	2287026	rs117794268	C	T	2184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.564;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=49;PP=1349;ReadPosRankSum=-0.363;SC=CCGCACCCGCCGCTCCTCCCC;SOR=0.788;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=162;TCF=73;TCR=89;TR=87;WE=2287034;WS=2287016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,98:0.55:177
chr16	2317777	rs11646649	C	G	88.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.385;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.57;MQRankSum=1.282;QD=14.79;ReadPosRankSum=0.598;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr16	2317778	rs11642797	T	G	88.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.57;MQRankSum=1.282;QD=14.79;ReadPosRankSum=0.189;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr16	2318170	rs143373048	TA	T	9088.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=534;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.527;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=2.126;NF=40;NR=115;PP=2948;ReadPosRankSum=0.835;SC=AGCGATGACGTAAACGCCTGG;SOR=0.728;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=285;TCF=66;TCR=219;TR=155;WE=2318178;WS=2318160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:225,302:0.57:527
chr16	2320810	rs72766672	C	T	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.932;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.398;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=62;ReadPosRankSum=0.023;SC=AGCGGAGGGTCACCTGCTGAG;SOR=1.609;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=7;WE=2320818;WS=2320800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr16	2320828	rs4488445	C	T	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.316;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=17.80;ReadPosRankSum=-0.852;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr16	2328790	rs150928	G	A	965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=28;NR=0;PP=821;SC=TTCCTACGTGGAGCTACCTGG;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=28;WE=2328798;WS=2328780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr16	2331430	rs149532	A	G	6190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=97;PP=2965;SC=GGGAGTCCGGACTGGGGGCCA;SOR=0.711;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=206;TCF=109;TCR=97;TR=206;WE=2331438;WS=2331420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr16	2334554	rs1183064	A	T	355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=10;PP=272;SC=GTGAGGGGGCACCTCCCAGGG;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=2334562;WS=2334544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	2337993	rs313909	G	A	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=272;ReadPosRankSum=-0.086;SC=ACTGGCCCCCGATGCCCCCGT;SOR=1.106;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=16;WE=2338001;WS=2337983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr16	2338358	.	C	G	1124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.685;ClippingRankSum=0.000;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=2.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.06;ReadPosRankSum=-0.113;SOR=1.088;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,48:0.60:80
chr16	2338363	rs313908	C	G	2489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.30;SOR=2.129;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr16	2349371	rs170447	T	C	1663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=17;PP=1108;ReadPosRankSum=0.347;SC=GGGGGCCTGCTGGTGGCAGGG;SOR=0.704;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=116;TCF=88;TCR=28;TR=67;WE=2349379;WS=2349361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,68:0.57:120
chr16	2369485	rs5815117	C	CA	47.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=3.310;HP=13;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=3;PP=126;ReadPosRankSum=0.431;SC=GACTCCAACTCAAAAAAAAAA;SOR=0.105;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=11;WE=2369493;WS=2369475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr16	2373786	rs323060	C	A	788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=21;PP=554;SC=GCTGTCACAGCCGAGAACTCA;SOR=1.942;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=29;WE=2373794;WS=2373776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr16	2375961	rs46725	C	T	1061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=7;PP=598;SC=CCTGCCCAGCCGCGTGGAGGC;SOR=1.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=34;WE=2375969;WS=2375951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr16	2479712	rs13337091	A	C	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=56;ReadPosRankSum=-2.260;SC=AGCCCCTCGGAGCCTTCCCCC;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=5;WE=2479720;WS=2479702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr16	2480948	rs12923030	A	G	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.090;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=206;ReadPosRankSum=0.855;SC=AATTTGTGCAATGCCACTCCT;SOR=0.495;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=34;TCR=12;TR=19;WE=2480956;WS=2480938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,24:0.44:55
chr16	2485896	rs12928789	A	G	740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.815;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=22;PP=439;ReadPosRankSum=-1.050;SC=CCCCACCTGCATGTTGGCGCT;SOR=0.807;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=92;TCF=33;TCR=59;TR=33;WE=2485904;WS=2485886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,38:0.38:99
chr16	2486998	rs12921396	A	T	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.080;HP=1;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=817;ReadPosRankSum=1.001;SC=GGAGGGCTCTACTCTCCTGAA;SOR=2.049;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=10;WE=2487020;WS=2486988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr16	2487012	rs34456414	C	CT	569.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.722;HP=2;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=853;ReadPosRankSum=0.830;SC=TCCTGAAACACAGCTGCTTTG;SOR=1.171;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=15;WE=2487020;WS=2486988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr16	2488211	rs12926008	T	C	1094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.071;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=33;PP=640;ReadPosRankSum=1.215;SC=CAGAAGGGGGTGTCCAAGGCC;SOR=0.449;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=145;TCF=56;TCR=89;TR=57;WE=2488219;WS=2488201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,59:0.38:156
chr16	2489533	rs28647184	T	G	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=4;PP=100;ReadPosRankSum=-0.640;SC=CTTGGATGCGTTTCTGTCCAC;SOR=0.446;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=28;TCF=16;TCR=12;TR=8;WE=2489541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr16	2498828	rs28417759	A	G	1422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=27;PP=885;ReadPosRankSum=-0.798;SC=AGTGGGCTCCACCCTGAGACC;SOR=0.729;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=207;TCF=127;TCR=80;TR=74;WE=2498836;WS=2498818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,82:0.36:227
chr16	2498849	rs28670436	G	A	2142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.436;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=41;PP=1327;ReadPosRankSum=-1.265;SC=CCTTCTCGGCGTTGCAGGTTT;SOR=0.808;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=276;TCF=160;TCR=116;TR=105;WE=2498857;WS=2498839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:188,114:0.38:302
chr16	2499011	rs8060813	T	C	1256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=2.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.62;ReadPosRankSum=-0.078;SOR=0.881;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,62:0.38:165
chr16	2499786	.	G	GTCCCCTCCA	955.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.174;ClippingRankSum=0.000;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=13.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.48;MQRankSum=6.656;QD=9.85;ReadPosRankSum=-2.123;SOR=1.316;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,26:0.27:97
chr16	2510603	rs4786284	C	T	545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.423;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=266;ReadPosRankSum=0.197;SC=GGCCGTGCGACGGCTGCCCGT;SOR=1.289;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=90;TCF=57;TCR=33;TR=27;WE=2510611;WS=2510593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,33:0.32:103
chr16	2608001	rs77373540	G	A	2369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=644;ExcessHet=3.0103;FS=1.292;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.05;MQRankSum=-5.622;QD=3.68;ReadPosRankSum=-1.006;SOR=0.589;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:478,166:0.26:644
chr16	2645965	rs1005273	G	A	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.88;ReadPosRankSum=1.068;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
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chr16	2802684	rs2240146	T	C	789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.23;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
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chr16	2812939	rs2240140	C	A	2487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.896;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=56;PP=1468;ReadPosRankSum=0.444;SC=ATCCTCCCAACCTAAAGCTAA;SOR=0.721;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=270;TCF=138;TCR=132;TR=114;WE=2812947;WS=2812929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,123:0.42:295
chr16	2814162	rs3094775	G	A	2361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.432;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=56;PP=1524;ReadPosRankSum=-0.422;SC=CCCCGCCAAGGGAAAGAAGTG;SOR=0.729;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=275;TCF=134;TCR=141;TR=112;WE=2814170;WS=2814152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,119:0.41:290
chr16	2815237	rs3094773	A	C	9538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=165;NR=160;PP=2965;SC=AGCCAAGACAAGAACCCCACT;SOR=0.710;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=325;TCF=165;TCR=160;TR=325;WE=2815245;WS=2815227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,355:1.00:355
chr16	2818161	rs2301802	T	C	1584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.176;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=34;PP=998;ReadPosRankSum=0.370;SC=GCTCCTCCTCTTCTTCATCAT;SOR=0.832;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=157;TCF=81;TCR=76;TR=68;WE=2818169;WS=2818151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,75:0.41:181
chr16	2818704	rs3094792	T	G	1769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=347;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.510;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=48;PP=1143;ReadPosRankSum=2.005;SC=GGAAGGAGACTACCCAGCTTC;SOR=0.633;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=322;TCF=168;TCR=154;TR=97;WE=2818712;WS=2818694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:241,106:0.31:347
chr16	2820882	rs1050134	G	T	1191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=32;PP=693;ReadPosRankSum=-1.834;SC=GTCTTTGGGGGATTCCACCAC;SOR=0.658;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=99;TCF=39;TCR=60;TR=51;WE=2820890;WS=2820872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,58:0.52:112
chr16	2821525	rs4036	G	A	3051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.958;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=71;PP=1866;ReadPosRankSum=-0.567;SC=GGGTTCCCTCGTTGAACATGC;SOR=0.480;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=213;TCF=90;TCR=123;TR=132;WE=2821533;WS=2821515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,138:0.62:224
chr16	2821573	rs8017	C	T	794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.918;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=26;PP=557;ReadPosRankSum=-1.233;SC=TGTGTTTCTGCTCTTGGCCAT;SOR=1.637;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=92;TCF=28;TCR=64;TR=33;WE=2821581;WS=2821553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,37:0.39:96
chr16	2822174	rs2285877	G	A	4367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.327;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=100;PP=2551;ReadPosRankSum=0.181;SC=TGGTGTTCACGTGTGATCATC;SOR=0.795;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=305;TCF=148;TCR=157;TR=186;WE=2822182;WS=2822164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,202:0.60:334
chr16	2825594	rs3094774	A	G	971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.233;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=27;PP=586;ReadPosRankSum=1.360;SC=GAGGCCCTACATGGGGCAAGT;SOR=0.782;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=167;TCF=88;TCR=79;TR=54;WE=2825602;WS=2825584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,59:0.32:182
chr16	2834826	rs12931183	A	G	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.620;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=22;PP=399;ReadPosRankSum=-1.238;SC=GAGGAGCCTAAGTCCCAGCCC;SOR=0.597;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=145;TCF=66;TCR=79;TR=41;WE=2834834;WS=2834816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,53:0.31:170
chr16	2835189	rs12599918	G	A	1224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=30;PP=791;ReadPosRankSum=-0.622;SC=GAAGAGGAGGGACCTCTGAGA;SOR=0.655;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=141;TCF=67;TCR=74;TR=57;WE=2835197;WS=2835164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,61:0.40:151
chr16	2836027	rs7195287	T	G	2073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=42;PP=1370;ReadPosRankSum=0.622;SC=CAGGTGTTGGTGGGGAGACAC;SOR=0.727;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=218;TCF=115;TCR=103;TR=89;WE=2836035;WS=2836017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,97:0.41:239
chr16	2836271	rs11643898	C	G	687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.165;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=24;PP=453;ReadPosRankSum=0.607;SC=CTTATTTAACCCTCCCCAGAG;SOR=1.434;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=90;TCF=21;TCR=69;TR=28;WE=2836279;WS=2836261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,32:0.34:95
chr16	2837592	rs34341809	T	G	1177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.811;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=15;PP=795;ReadPosRankSum=1.065;SC=GGGCTTAAAGTGCCAGGAGAG;SOR=0.544;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=80;TCF=35;TCR=45;TR=30;WE=2837611;WS=2837582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,37:0.40:93
chr16	2837603	rs11076829	C	T	1080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=13;PP=795;ReadPosRankSum=-0.025;SC=GCCAGGAGAGCGCGAGGCTCA;SOR=0.646;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=63;TCF=26;TCR=37;TR=24;WE=2837611;WS=2837582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,30:0.42:72
chr16	2867450	rs71386691	G	C	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.07;ReadPosRankSum=1.151;SOR=0.616;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr16	2868641	rs2074907	A	G	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=5;PP=311;ReadPosRankSum=0.135;SC=CCAGCCCTCCATCCAGGGCCC;SOR=0.569;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=40;TCF=32;TCR=8;TR=26;WE=2868649;WS=2868631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,29:0.66:44
chr16	2871103	rs139303479	C	A	1989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.290;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=52;PP=1142;ReadPosRankSum=1.545;SC=GGGAAGGATGCCTGCTTCGTG;SOR=0.854;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=148;TCF=53;TCR=95;TR=80;WE=2871111;WS=2871093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,92:0.55:167
chr16	2871121	rs11076844	T	C	989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.462;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=31;PP=660;ReadPosRankSum=-0.245;SC=GTGAGTGTCCTTGCCACCACT;SOR=0.493;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=109;TCF=37;TCR=72;TR=48;WE=2871129;WS=2871111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,52:0.43:122
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chr16	2880614	rs2190809	T	C	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=308;ReadPosRankSum=-0.714;SC=CCTGGAGGGGTGGGGTCCCCT;SOR=0.789;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=49;TCF=38;TCR=11;TR=24;WE=2880622;WS=2880604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,29:0.47:62
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chr16	2891540	rs11859372	C	G	1709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.773;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=24;PP=986;ReadPosRankSum=-1.616;SC=GGAGTAGGGGCTGTTTGAGTG;SOR=1.073;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=140;TCF=85;TCR=55;TR=64;WE=2891548;WS=2891530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,77:0.49:158
chr16	2891635	rs11860210	C	G	2403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.103;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=54;PP=1394;ReadPosRankSum=0.467;SC=GGCACACAGGCTGGCAGGGGA;SOR=0.667;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=243;TCF=127;TCR=116;TR=104;WE=2891643;WS=2891625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,117:0.44:265
chr16	2892370	rs3810801	C	A	1029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.633;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=19;PP=624;ReadPosRankSum=1.831;SC=CCTGCTGCTGCCACTGCCCAA;SOR=0.765;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=133;TCF=78;TCR=55;TR=47;WE=2892378;WS=2892360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,53:0.36:148
chr16	2903047	rs1054912	G	C	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=342;ReadPosRankSum=-0.648;SC=AGATCCAGATGTGGATCTGGC;SOR=0.551;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=37;TCF=35;TCR=2;TR=17;WE=2903055;WS=2903037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
chr16	2903081	rs3743944	G	A	823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.990;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=7;PP=572;ReadPosRankSum=0.975;SC=CGAGCCCCGCGTCCCGCTGCG;SOR=0.521;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=91;TCF=74;TCR=17;TR=36;WE=2903089;WS=2903071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,38:0.39:98
chr16	2903845	rs2074294	G	T	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.562;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=266;ReadPosRankSum=-0.754;SC=GGCCAGGGGTGGGGGGCTCGA;SOR=0.376;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=53;TCF=41;TCR=12;TR=21;WE=2903853;WS=2903835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,26:0.46:57
chr16	2946433	rs2285824	C	T	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-1.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=327;ReadPosRankSum=0.427;SC=GCCTGAGGGACAGGCCCTGGG;SOR=0.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=16;WE=2946441;WS=2946428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr16	2972534	rs11865663	C	A	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=262;ReadPosRankSum=-2.669;SC=TTTGACTGCCCTGGGGACCTC;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=13;WE=2972542;WS=2972524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr16	2972698	rs35374464	C	G	1861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.456;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=47;ReadPosRankSum=0.379;SC=CCAAAGCATCCTGATCAGGAG;SOR=0.709;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=266;TCF=140;TCR=126;TR=97;WE=2972706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:180,107:0.37:287
chr16	2973088	rs36122103	G	T	1148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FS=3.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.18;ReadPosRankSum=-0.296;SOR=0.587;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:120,66:0.35:186
chr16	2973249	rs11642228	T	A	834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=21;PP=543;SC=GAGGCTGTTTTTGTTTATTTT;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=28;WE=2973257;WS=2973239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr16	2986323	rs9928222	T	C	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.241;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=276;ReadPosRankSum=-1.476;SC=TTCTGTCTCGTGGTCCCCAGG;SOR=1.053;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=44;TCR=20;TR=22;WE=2986331;WS=2986313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,23:0.34:67
chr16	2986431	rs739716	T	C	1508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=35;PP=925;ReadPosRankSum=-0.773;SC=TTGAAGGTAGTTCCACAGCCA;SOR=0.701;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=193;TCF=106;TCR=87;TR=78;WE=2986439;WS=2986421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,81:0.41:200
chr16	2987002	rs2074357	C	T	1006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.798;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=25;PP=526;ReadPosRankSum=0.279;SC=TCCTGGGCTCCGGGGCCACCT;SOR=0.850;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=87;TCF=32;TCR=55;TR=39;WE=2987010;WS=2986992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,46:0.45:102
chr16	2987074	rs140936158	G	GCTCTGAGAGCTGGTGTCCGCTGCTCCTCCCCTCCCATTTCTC	481.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=1.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.68;ReadPosRankSum=0.017;SOR=0.460;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,10:0.26:38
chr16	2988469	rs12929501	C	G	1488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.149;NF=29;NR=37;PP=844;ReadPosRankSum=0.436;SC=TACAGGCAGGCTGTGGGGCAG;SOR=0.699;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=157;TCF=67;TCR=90;TR=66;WE=2988477;WS=2988459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,75:0.44:172
chr16	2988553	rs71158126	C	CTG	442.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.569;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.146;NF=0;NR=8;PP=301;ReadPosRankSum=0.554;SC=ACTGAGCAGACTGCTTTTGTG;SOR=0.016;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=8;WE=2988561;WS=2988543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr16	2989841	rs17136161	A	G	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=44;ReadPosRankSum=-0.686;SC=GCTGAAGGTCAACTCTTAGGA;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=7;WE=2989849;WS=2989831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,8:0.27:30
chr16	3016805	rs111506442	T	A	1906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.249;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=57;PP=1202;ReadPosRankSum=0.351;SC=AGGTGAGGAGTGGGCGGGGAC;SOR=0.870;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=234;TCF=93;TCR=141;TR=90;WE=3016813;WS=3016795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,96:0.38:250
chr16	3016885	rs58462745	A	G	5627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=101;NR=79;PP=2965;SC=GGTCCTCAGGATGCTGACTGC;SOR=0.820;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=181;TCF=101;TCR=80;TR=180;WE=3016893;WS=3016875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr16	3017124	rs11641195	C	A	1056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=27;PP=556;ReadPosRankSum=0.447;SC=CTGCTCCGCGCCTTCGATGGC;SOR=0.811;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=66;TCF=24;TCR=42;TR=42;WE=3017132;WS=3017114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,48:0.64:75
chr16	3017272	rs2285827	G	T	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.356;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=172;ReadPosRankSum=-1.860;SC=CGCCCTGCCCGCTGTTCCCAC;SOR=0.803;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=29;TCF=16;TCR=13;TR=14;WE=3017280;WS=3017262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr16	3021116	rs4786365	T	C	5610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=121;NR=66;PP=2965;SC=CCCTTGAGGATGTGACTGAAA;SOR=1.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=187;TCF=121;TCR=66;TR=187;WE=3021124;WS=3021106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr16	3024188	rs2074528	T	C	2112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=39;NR=33;PP=1262;SC=AGGATGTGGGTGGGCGGACCC;SOR=0.772;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=39;TCR=33;TR=72;WE=3024196;WS=3024178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr16	3063264	rs2227269	C	T	3042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=64;NR=34;PP=1775;SC=ACAAGCCTTCCCCCTCCTGCT;SOR=1.407;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=64;TCR=34;TR=98;WE=3063272;WS=3063254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr16	3065596	rs2257295	T	C	1808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.511;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=36;PP=933;ReadPosRankSum=-0.296;SC=TCCCGGATGATGGCATGCGCC;SOR=0.682;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=185;TCF=98;TCR=87;TR=79;WE=3065604;WS=3065586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,91:0.44:207
chr16	3065924	rs2269911	G	A	6462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=120;NR=99;PP=2965;SC=CGATGAAAGCGGTCACCTTCC;SOR=0.771;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=219;TCF=120;TCR=99;TR=219;WE=3065932;WS=3065914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr16	3071420	rs2232798	T	A	1824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.07;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr16	3073240	rs10508	G	T	2043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.297;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=25;PP=1204;ReadPosRankSum=1.760;SC=CTACCTGAGTGGGGGCAGGGC;SOR=1.170;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=70;TCF=44;TCR=26;TR=69;WE=3073248;WS=3073230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,77:0.99:78
chr16	3074336	rs116159486	A	C	4574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=347;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.379;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=111;NR=81;PP=2377;ReadPosRankSum=0.868;SC=AGATGGAGCGAGCTGTGCCGC;SOR=0.560;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=323;TCF=189;TCR=134;TR=192;WE=3074344;WS=3074326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,212:0.61:347
chr16	3074426	rs56708449	G	C	10154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=394;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.475;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=166;NR=200;PP=2965;ReadPosRankSum=1.315;SC=TGGCTGGGACGGGGCGGGCAG;SOR=0.569;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=367;TCF=167;TCR=200;TR=366;WE=3074434;WS=3074416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,393:1.00:394
chr16	3075999	rs2245000	C	G	12813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=458;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=238;NR=195;PP=2965;SC=GGTGGGTATACCTGTGGAGTC;SOR=0.889;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=435;TCF=239;TCR=196;TR=433;WE=3076007;WS=3075989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,455:1.00:455
chr16	3076331	rs117469683	C	T	3136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.769;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=67;PP=2046;ReadPosRankSum=0.421;SC=CAGGGTGAAGCCACTTCCTCA;SOR=0.645;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=326;TCF=165;TCR=161;TR=140;WE=3076339;WS=3076321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:198,150:0.43:348
chr16	3077710	.	CTTT	C	205.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.86;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	3078165	rs12448103	A	G	5577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=96;PP=2965;SC=GCCCAGGCGCAGCGAGAAGCG;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=196;TCF=100;TCR=96;TR=196;WE=3078173;WS=3078155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr16	3078544	rs2079244	T	G	1863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=16;PP=1401;SC=GGGACTTCTGTACCCGGGCGG;SOR=1.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=44;TCR=16;TR=60;WE=3078552;WS=3078534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr16	3078616	rs5815143	CATT	C	8409.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=39;NR=69;PP=2957;SC=GAGTGGGGATCATTATAACCC;SOR=1.173;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=117;TCF=43;TCR=74;TR=108;WE=3078626;WS=3078606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr16	3086447	rs7206805	C	G	4688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=363;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.290;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=106;NR=104;PP=2794;ReadPosRankSum=-0.544;SC=CCTCCGGGGGCTCACCACCCA;SOR=0.661;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=345;TCF=179;TCR=166;TR=210;WE=3086455;WS=3086437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,223:0.61:363
chr16	3096863	rs2250306	G	T	135.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=1;PP=51;SC=GGTCCCCGGGGCGGCCCCAGC;SOR=1.329;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=3096871;WS=3096853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr16	3097074	rs909408	C	T	1592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=30;NR=23;PP=795;SC=AGAGGGAAGCCGGGCCCGGAC;SOR=0.758;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=30;TCR=23;TR=53;WE=3097082;WS=3097064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr16	3097568	rs3743937	C	A	1114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=11;NR=27;PP=716;SC=CCCCACCCCTCCCCAGCCCTG;SOR=2.038;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=11;TCR=27;TR=38;WE=3097576;WS=3097558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr16	3097596	rs3743936	T	A	357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=11;PP=264;SC=ACCCAGCCTGTCCACCGCCCA;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=3097604;WS=3097586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr16	3117272	.	CTGTG	C,CTGTGTGTGTGTGTG	598	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.1;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=22;MQ=58.47;NF=5,5;NR=1,1;PP=305,598;QD=51.3333333333;SC=CCATGTGTCTCTGTGTGTGTG;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=6,6;WE=3117283;WS=3117262;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.67:9
chr16	3117354	rs1555001	T	A	1078.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.768;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=17;PP=683;ReadPosRankSum=-0.108;SC=ACATGGAGACTGAGTGTCACC;SOR=0.545;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=100;TCF=65;TCR=35;TR=47;WE=3117362;WS=3117344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,51:0.50:102
chr16	3117937	rs2239303	G	A	2112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.168;NF=55;NR=39;PP=1364;ReadPosRankSum=-1.588;SC=ACTGATGTGGGGTGCAGAGGA;SOR=0.713;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=161;TCF=94;TCR=67;TR=94;WE=3117945;WS=3117927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,103:0.57:180
chr16	3118865	rs12934561	T	C	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.003;NF=10;NR=0;PP=197;ReadPosRankSum=0.969;SC=GGGCTGTGGTTGGGAAACCAA;SOR=0.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=10;WE=3118873;WS=3118858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr16	3119020	rs371244098	A	G	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=4.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.71;MQRankSum=-0.512;QD=2.23;ReadPosRankSum=-1.707;SOR=0.175;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,10:0.21:47
chr16	3119167	rs34184287	T	C	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.44;MQRankSum=-3.704;QD=6.91;ReadPosRankSum=-0.285;SOR=0.660;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,33:0.32:103
chr16	3119297	rs71818662	C	CG	2873.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=352;ExcessHet=3.0103;FS=3.662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.03;MQRankSum=-15.528;QD=9.07;ReadPosRankSum=2.126;SOR=0.955;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:226,91:0.29:317
chr16	3119304	rs2981599	A	G	3013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FS=4.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.84;MQRankSum=-15.352;QD=9.19;ReadPosRankSum=0.465;SOR=0.953;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:240,88:0.27:328
chr16	3131566	rs2741927	G	T	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=1.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.65;MQRankSum=0.532;QD=4.64;ReadPosRankSum=0.127;SOR=1.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,10:0.29:34
chr16	3131663	rs4247354	A	G	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.91;MQRankSum=-1.823;QD=5.03;ReadPosRankSum=-0.312;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr16	3131940	rs58826170	C	CGG	116.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=11.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQRankSum=-7.426;QD=1.24;ReadPosRankSum=-2.501;SOR=2.043;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,9:0.10:94
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chr16	3142463	rs3810807	A	G	3550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=62;PP=2256;ReadPosRankSum=1.196;SC=GGGGAAAGTGAAGTTTCCAGA;SOR=0.687;Source=Platypus;TCR=99;TR=142;WE=3142471;WS=3142453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,158:0.63:251
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chr16	3166618	rs4785928	C	G	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.66;ReadPosRankSum=-0.895;SOR=0.602;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,22:0.67:33
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chr16	3191356	rs2735537	G	A	754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.623;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=22;PP=479;ReadPosRankSum=-1.356;SC=TGAGCAGCTGGCTTGGCCGGA;SOR=1.142;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=49;TCF=20;TCR=29;TR=36;WE=3191364;WS=3191346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,35:0.70:50
chr16	3197623	rs2735507	C	T	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.645;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=372;ReadPosRankSum=0.287;SC=GTCAAGTCCACGACCTTGAAC;SOR=1.236;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=22;WE=3197631;WS=3197613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,22:0.54:41
chr16	3199118	rs2238385	C	T	862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=28;PP=660;ReadPosRankSum=-1.138;SC=ATTCTGATCACCTCCTATGAA;SOR=0.539;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=52;TCF=5;TCR=47;TR=31;WE=3199126;WS=3199108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,34:0.60:57
chr16	3199713	rs2735514	C	T	3237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.563;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=65;PP=1894;ReadPosRankSum=0.583;SC=GGCGGGTGTGCGAGCAGGAGG;SOR=0.654;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=232;TCF=118;TCR=114;TR=140;WE=3199721;WS=3199703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,154:0.61:253
chr16	3254470	rs1834026	T	C	9823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=365;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=175;NR=148;PP=2965;ReadPosRankSum=0.919;SC=TGCTTCTCCTTCACCACCGTC;SOR=0.279;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=325;TCF=176;TCR=149;TR=323;WE=3254478;WS=3254460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,363:1.00:364
chr16	3254678	rs184814626	G	T	3815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.677;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=100;NR=61;PP=2555;ReadPosRankSum=0.172;SC=GTGCCCTGCTGGTTGCTGGAT;SOR=0.885;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=268;TCF=161;TCR=107;TR=161;WE=3254686;WS=3254668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,169:0.59:286
chr16	3254972	rs2075851	T	C	6630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=113;NR=102;PP=2965;SC=CCACCTGTGGTTCTCACCTGG;SOR=0.736;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=215;TCF=113;TCR=102;TR=215;WE=3254980;WS=3254962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr16	3266071	rs2550401	A	G	11351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=417;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=213;NR=179;PP=2965;SC=GCCAACTCGAATGCTCTGCTG;SOR=0.852;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=393;TCF=213;TCR=180;TR=392;WE=3266079;WS=3266061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,417:1.00:417
chr16	3266552	rs2741916	G	A	3807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=78;PP=2148;SC=TTCAATAATGGTATAGGCTTA;SOR=1.576;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=44;TCR=78;TR=122;WE=3266560;WS=3266542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr16	3282605	rs2075852	T	C	8577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=126;NR=160;PP=2965;SC=ACAGCCCTACTGGTAAGAAAA;SOR=0.953;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=286;TCF=126;TCR=160;TR=286;WE=3282613;WS=3282595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,326:1.00:326
chr16	3294154	rs3974658	GT	G	2983.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.560;HP=11;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=62;PP=1274;ReadPosRankSum=-0.803;SC=CAGGTGTTTGGTTTTTTTTTT;SOR=0.357;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=115;TCF=20;TCR=95;TR=77;WE=3294173;WS=3294144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:7,125:0.95:132
chr16	3296429	rs224204	G	A	1621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=14;PP=1143;SC=AGACCCCGGGGTTGGGAACAT;SOR=2.107;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=56;TCF=42;TCR=14;TR=55;WE=3296437;WS=3296419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr16	3296616	rs224205	C	T	3611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=56;NR=66;PP=2152;SC=CTGGCCTCTACTTCTGGGCTC;SOR=1.055;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=56;TCR=66;TR=122;WE=3296624;WS=3296606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr16	3297073	rs224206	A	G	8553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.338;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=167;NR=138;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.670;SC=CAATCAGCGCATCGAGCAGGG;SOR=0.472;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=306;TCF=167;TCR=139;TR=305;WE=3297081;WS=3297063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,329:1.00:330
chr16	3297175	rs224207	T	C	14987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.95;SOR=0.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,341:1.00:341
chr16	3297181	rs224208	C	T	14726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.63;SOR=0.876;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,330:1.00:330
chr16	3298642	rs224211	G	A	4398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=88;PP=2636;SC=TCTTTCTGCAGTAGTCACCGG;SOR=1.264;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=145;TCF=57;TCR=88;TR=145;WE=3298650;WS=3298632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr16	3298865	rs224212	T	C	2501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=25;PP=1647;SC=TCTTCCCACCTTCCTCCCAGG;SOR=1.636;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=57;TCR=25;TR=82;WE=3298873;WS=3298855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr16	3299749	rs224213	G	A	10405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=392;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=173;NR=174;PP=2965;SC=GGGCGTGGCAGCGGGGACTCG;SOR=0.735;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=347;TCF=173;TCR=174;TR=347;WE=3299757;WS=3299739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,392:1.00:392
chr16	3301897	rs224218	A	G	695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=11;PP=408;ReadPosRankSum=2.130;SC=GCGGCCCTAGAAGACACCCAG;SOR=0.643;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=43;TCF=29;TCR=14;TR=29;WE=3301905;WS=3301887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,32:0.63:51
chr16	3304573	rs224223	G	T	1422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=30;PP=983;ReadPosRankSum=0.358;SC=GGCCCTCCGAGGCCTTCTCTC;SOR=0.678;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=97;TCF=54;TCR=43;TR=65;WE=3304581;WS=3304563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,65:0.64:101
chr16	3304654	rs224224	T	C	2322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.639;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=34;PP=1538;ReadPosRankSum=0.072;SC=GGCTGGCAGCTCCGCCCCCGT;SOR=0.635;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=146;TCF=96;TCR=50;TR=98;WE=3304665;WS=3304644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,99:0.65:152
chr16	3304762	rs224225	A	G	3610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.396;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.98;MQRankSum=-0.947;NF=81;NR=85;PP=2211;ReadPosRankSum=-1.557;SC=CTGCGGAATCATCTGTGCCGT;SOR=0.734;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=312;TCF=154;TCR=158;TR=166;WE=3304770;WS=3304752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,175:0.52:334
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chr16	3405994	rs1228348	A	G	6126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.76;SOR=1.107;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr16	3406387	rs1218763	C	G	8595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=181;NR=130;PP=2965;SC=TGATTGCCTGCCTGGGTGGCT;SOR=1.078;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=311;TCF=181;TCR=130;TR=311;WE=3406395;WS=3406377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,321:1.00:321
chr16	3406516	rs11643487	A	G	2604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.843;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=65;PP=1570;ReadPosRankSum=0.748;SC=GTGGCGACACAAGTCTCAACC;SOR=0.744;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=302;TCF=139;TCR=163;TR=118;WE=3406524;WS=3406506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:202,134:0.40:336
chr16	3406626	rs11648783	G	A	1467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.232;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=28;PP=932;ReadPosRankSum=0.047;SC=CTGAAAATCCGCTCTGCAGAG;SOR=0.762;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=146;TCF=76;TCR=70;TR=60;WE=3406634;WS=3406616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,69:0.43:162
chr16	3434699	rs27230	A	G	1241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=28;PP=842;ReadPosRankSum=-0.172;SC=ATTTCCTCATAAAAGATACAA;SOR=0.703;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=133;TCF=70;TCR=63;TR=56;WE=3434707;WS=3434689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,61:0.42:146
chr16	3434966	rs27231	T	C	1059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=31;PP=711;ReadPosRankSum=0.610;SC=ATAGGTCAATTAGATCTGTCA;SOR=0.650;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=116;TCF=45;TCR=71;TR=50;WE=3434974;WS=3434956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,51:0.43:119
chr16	3438865	rs11643983	G	A	2829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.562;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=58;PP=1485;ReadPosRankSum=-0.939;SC=GGGAGAAACTGCTGGATGGTT;SOR=0.646;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=174;TCF=81;TCR=93;TR=113;WE=3438873;WS=3438855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,129:0.67:192
chr16	3440390	rs4786412	C	T	1886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=3.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.29;ReadPosRankSum=-1.268;SOR=0.447;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,86:0.65:132
chr16	3440394	rs27237	A	G	5031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.31;SOR=0.933;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr16	3441697	.	A	AC	1088	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;FR=1.0000;HP=17;HapScore=1;MGOF=6;MMLQ=28;MQ=64.29;NF=23;NR=13;PP=1088;QD=30.3055555556;SC=AAAAAAAAAAACAAAATACTA;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=46;TCF=30;TCR=16;TR=36;WE=3441705;WS=3441687;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:10,36:0.78:46
chr16	3444157	rs12448573	T	C	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.471;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=120;ReadPosRankSum=-0.296;SC=CCCCAGCTATTTGGGAGGCTG;SOR=1.402;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=8;WE=3444165;WS=3444147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr16	3445112	rs11077333	C	T	2105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.021;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=30;PP=1257;ReadPosRankSum=-1.452;SC=TCAATATCAACGGTCACTGAA;SOR=1.048;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=172;TCF=109;TCR=63;TR=89;WE=3445120;WS=3445102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,103:0.51:202
chr16	3445239	rs1149492	A	G	1092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.289;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=34;PP=615;ReadPosRankSum=0.640;SC=GAGAAATTATATCAACCTCTA;SOR=0.584;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=151;TCF=59;TCR=92;TR=57;WE=3445247;WS=3445229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,62:0.38:163
chr16	3447282	rs27241	C	G	1713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.847;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=30;PP=1095;ReadPosRankSum=0.150;SC=AGGTCTGGATCTCCTCTGGCA;SOR=0.945;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=207;TCF=117;TCR=90;TR=77;WE=3447290;WS=3447272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,85:0.38:225
chr16	3452193	rs37811	T	G	4828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=81;PP=2965;SC=CCCAAGAGGCTCTCTCCCAGC;SOR=0.829;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=154;TCF=73;TCR=81;TR=154;WE=3452201;WS=3452183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr16	3452469	rs368416320	C	T	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.364;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.49;ReadPosRankSum=1.937;SOR=1.164;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr16	3455079	rs37813	T	C	1630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=37;PP=1157;SC=GCTTGTACTTTAGATCCTCAA;SOR=3.215;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=8;TCR=37;TR=45;WE=3455087;WS=3455069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr16	3458219	rs37819	C	T	288.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=1;PP=177;SC=AAGTTGCCAGCGGAGGGCCAC;SOR=3.056;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=9;WE=3458227;WS=3458209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	3459023	rs141406107	C	T	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=271;ReadPosRankSum=0.617;SC=AAGGAAAGCACGAGGCCCTTG;SOR=0.420;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=15;WE=3459031;WS=3459013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr16	3487556	rs40534	A	T	1077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.665;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=26;PP=515;ReadPosRankSum=3.043;SC=TAAAAACAAAAGAAAGCAAAA;SOR=0.271;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=114;TCF=43;TCR=71;TR=49;WE=3487564;WS=3487546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,56:0.44:128
chr16	3487576	rs37825	T	C	1037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.983;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=24;PP=573;ReadPosRankSum=0.593;SC=ACATAGACAATATCTTCAAGG;SOR=0.220;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=86;TCF=32;TCR=54;TR=45;WE=3487584;WS=3487566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,50:0.54:93
chr16	3490922	rs2270494	G	C	1335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=33;PP=933;ReadPosRankSum=0.355;SC=GATCCTCAAAGAGTATTGGTC;SOR=0.737;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=86;TCF=36;TCR=50;TR=55;WE=3490930;WS=3490912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,57:0.63:90
chr16	3493240	rs3816916	A	C	1182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=34;PP=813;ReadPosRankSum=1.129;SC=TAAAGGGACCAATTCCGCTGC;SOR=0.661;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=131;TCF=38;TCR=93;TR=48;WE=3493248;WS=3493230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,54:0.38:143
chr16	3493288	rs34496784	T	C	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=534;ReadPosRankSum=0.744;SC=CTCGATTCCCTCCGAACCCCC;SOR=0.368;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=13;WE=3493309;WS=3493278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,14:0.40:35
chr16	3493301	rs7500590	T	C	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=534;ReadPosRankSum=0.938;SC=GAACCCCCCCTTAAAAACCTA;SOR=1.352;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=10;WE=3493309;WS=3493278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr16	3533577	rs1137454	C	G	2739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=69;PP=1843;ReadPosRankSum=-2.347;SC=TCAACGGCGGCCACCCTCCCT;SOR=0.665;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=154;TCF=52;TCR=102;TR=105;WE=3533585;WS=3533567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,112:0.69:162
chr16	3534654	rs4785935	G	A	671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FS=2.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.07;ReadPosRankSum=-1.490;SOR=0.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:123,42:0.25:165
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chr16	3535116	rs4785936	T	C	9741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=362;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=167;NR=174;PP=2965;SC=GCCACAAAAGTGGAAGGCCCT;SOR=0.785;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=341;TCF=167;TCR=174;TR=341;WE=3535124;WS=3535106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,362:1.00:362
chr16	3535540	rs2240075	G	A	3350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.587;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.533;NF=79;NR=61;PP=2073;ReadPosRankSum=-1.288;SC=CGCATGCACCGTCCCCAGGGC;SOR=0.820;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=230;TCF=128;TCR=102;TR=140;WE=3535548;WS=3535530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,151:0.61:246
chr16	3535573	rs201536634	CT	C	2841.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.504;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=2.512;NF=27;NR=34;PP=2166;ReadPosRankSum=0.746;SC=GCTGCATTCACTGGGAGGGGC;SOR=0.756;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=156;TCF=60;TCR=96;TR=61;WE=3535581;WS=3535563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,89:0.39:227
chr16	3544040	rs56793723	G	T	713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=23;PP=485;ReadPosRankSum=0.445;SC=GGGAGGCTGGGGGGGAGGCTG;SOR=0.755;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=30;TCR=53;TR=36;WE=3544052;WS=3544030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,37:0.39:94
chr16	3551236	rs78624374	G	A	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.649;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=143;ReadPosRankSum=-0.403;SC=CGCCTGACCCGCGGCTGCAAC;SOR=0.495;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=9;WE=3551244;WS=3551226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr16	3586230	rs9790	C	T	1458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.066;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=38;PP=897;ReadPosRankSum=-0.326;SC=TCGAAGGGTCCGGAAATCTGA;SOR=0.781;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=209;TCF=105;TCR=104;TR=75;WE=3586238;WS=3586220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,80:0.35:227
chr16	3602227	rs56070390	AG	A	5809.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=65;PP=2951;SC=TTCTGCTTCAAGGGCATCTGC;SOR=0.718;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=26;TCR=68;TR=89;WE=3602235;WS=3602217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr16	3611610	rs8050566	C	T	896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.735;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=15;PP=524;ReadPosRankSum=0.101;SC=TCCGTGGCAGCGCCGCTGGCC;SOR=0.578;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=100;TCF=66;TCR=34;TR=42;WE=3611618;WS=3611600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,47:0.42:111
chr16	3613150	rs8044743	A	G	892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=18;PP=520;ReadPosRankSum=0.018;SC=GCGCGGGACCAGTCAGCCTGG;SOR=0.748;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=85;TCF=46;TCR=39;TR=39;WE=3613158;WS=3613140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,45:0.46:97
chr16	3639139	rs3810812	A	G	2199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.526;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=50;PP=1235;ReadPosRankSum=1.580;SC=TCGGCCTGCTATTCCCCAGGG;SOR=0.822;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=231;TCF=108;TCR=123;TR=95;WE=3639147;WS=3639129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,107:0.41:258
chr16	3708282	rs35081909	AT	A	694.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FS=17.809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.47;ReadPosRankSum=0.097;SOR=2.432;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,49:0.53:93
chr16	3724465	rs13926	G	C	1568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.677;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=45;PP=987;ReadPosRankSum=-1.257;SC=TGCCACTCACGGACATCCTTG;SOR=0.821;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=210;TCF=101;TCR=109;TR=82;WE=3724473;WS=3724455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,84:0.38:224
chr16	3726160	rs8050400	A	G	8508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=137;NR=151;PP=2965;SC=AGGCAGGCAAAGAAAGGAAAA;SOR=0.873;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=288;TCF=137;TCR=151;TR=288;WE=3726168;WS=3726150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,323:1.00:323
chr16	3738887	rs2072379	C	T	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-2.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=88;ReadPosRankSum=0.264;SC=GAAACCAAAACAGATTCTGGT;SOR=1.009;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=8;WE=3738895;WS=3738877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,10:0.28:36
chr16	4015729	rs879620	C	T	1939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=9;PP=1450;SC=ACAAATATTACTGTGTTTCGA;SOR=3.160;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=54;TCR=9;TR=63;WE=4015737;WS=4015719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr16	4016676	rs2230742	A	G	8267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=140;NR=144;PP=2965;SC=CTCCGCTGTCATGGTTCTTGG;SOR=0.767;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=286;TCF=142;TCR=144;TR=284;WE=4016684;WS=4016666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,307:1.00:307
chr16	4027423	rs2072346	C	T	456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=3;PP=324;SC=CCAGGCCCTACGCAACCTCGG;SOR=2.584;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=15;WE=4027431;WS=4027413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr16	4027605	rs2240735	C	T	6217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=100;NR=112;PP=2965;SC=CGGCAATCAGCGCGGCCGAGC;SOR=0.887;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=213;TCF=100;TCR=113;TR=212;WE=4027613;WS=4027595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr16	4027688	rs2531990	T	C	2116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=26;NR=48;PP=1443;SC=ACCCCTGCTATACCCGGCCGC;SOR=1.402;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=78;TCF=26;TCR=52;TR=74;WE=4027696;WS=4027678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr16	4027749	rs2601774	A	G	235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=4;NR=13;PP=359;SC=ACTGAGTCTCACTCTGTCGCC;SOR=1.085;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=17;WE=4027757;WS=4027739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr16	4039141	rs2072341	A	G	6705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=138;PP=2965;SC=CCAGCACCATAACTGTGCCAA;SOR=1.375;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=224;TCF=86;TCR=138;TR=224;WE=4039149;WS=4039131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr16	4042449	rs2239307	C	T	593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=15;PP=409;SC=CCCCGACCTCCGCTGCGGGGC;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=19;WE=4042457;WS=4042439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr16	4042470	rs2239308	T	C	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.830;HP=3;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=56;ReadPosRankSum=0.826;SC=GCTGCTGCACTGGGCGTGGGA;SOR=0.034;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=6;WE=4042478;WS=4042460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr16	4043292	rs2239309	C	G	2371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=26;PP=1540;SC=GTGCGGAGTGCTGTTACCCAA;SOR=1.501;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=52;TCR=26;TR=78;WE=4043300;WS=4043282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr16	4163683	.	CT	C	38.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.564;ClippingRankSum=0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.08;ReadPosRankSum=-0.520;SOR=0.512;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,7:0.19:36
chr16	4164364	rs2230738	C	T	3719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=442;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.107;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=89;PP=2471;ReadPosRankSum=-2.819;SC=AGGTGGCATGCCTCTTGACAG;SOR=0.757;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=417;TCF=209;TCR=208;TR=175;WE=4164372;WS=4164354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:256,185:0.42:441
chr16	4165432	rs2530898	T	C	447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=14;PP=305;SC=GCTGGTGGGGTGGGGAAGCCA;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=4165440;WS=4165422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr16	4245693	rs10852643	A	G	7458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=108;NR=143;PP=2965;SC=GTGAGAAGGAACGGGCGCTGT;SOR=1.019;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=251;TCF=108;TCR=143;TR=251;WE=4245701;WS=4245683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,273:1.00:273
chr16	4254479	rs4644864	G	A	1242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.805;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=10;PP=843;ReadPosRankSum=-0.532;SC=GAGTCTGCCCGGGCCCTGGTG;SOR=0.813;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=100;TCF=77;TCR=23;TR=50;WE=4254487;WS=4254469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,55:0.50:109
chr16	4254523	rs60137128	C	T	3309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=49;PP=2049;ReadPosRankSum=0.138;SC=ATATCTCCCTCCCCTGGTTAC;SOR=0.680;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=246;TCF=158;TCR=88;TR=138;WE=4254531;WS=4254513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,151:0.57:266
chr16	4254699	rs62039297	G	A	3897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.013;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=92;PP=2486;ReadPosRankSum=-2.512;SC=TCTGGGCCCCGGCACAGCAGA;SOR=0.613;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=240;TCF=92;TCR=148;TR=153;WE=4254707;WS=4254689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,165:0.63:262
chr16	4254725	rs8054937	A	G	2296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=62;PP=1624;ReadPosRankSum=-1.033;SC=GCTGGGCCTCAAGCAGGGGCT;SOR=0.678;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=150;TCF=45;TCR=105;TR=89;WE=4254733;WS=4254715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,95:0.58:164
chr16	4292201	.	G	A	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=114;ReadPosRankSum=0.431;SC=GAAGAAGCCCGGACCCCAGAA;SOR=0.527;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=6;WE=4292209;WS=4292191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr16	4310468	rs251732	C	G	2518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=51;PP=1585;ReadPosRankSum=-2.637;SC=GGGTCCGCAGCTGCTGCTGTT;SOR=0.701;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=197;TCF=108;TCR=89;TR=110;WE=4310476;WS=4310458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,119:0.55:216
chr16	4386814	rs669561	T	C	13210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=491;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=249;NR=212;PP=2965;SC=GCACCCACTATGTGGACAAGC;SOR=0.805;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=461;TCF=249;TCR=212;TR=461;WE=4386822;WS=4386804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,490:1.00:490
chr16	4410867	rs140995663	TCACTGCTGGCCCCACCTCTCCA	T	2355.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=25;NR=6;PP=2967;SC=CCGCCACTCCTCACTGCTGGC;SOR=3.180;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=31;WE=4410896;WS=4410857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr16	4414727	rs2277852	G	A	3478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=61;NR=56;PP=1959;SC=TGAGGCCCAGGCCCCCCGACT;SOR=0.740;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=117;TCF=61;TCR=56;TR=117;WE=4414735;WS=4414717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr16	4414987	rs2277851	G	A	7568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=139;NR=119;PP=2965;SC=GGATGGGGGCGAGGAAGCAAG;SOR=0.782;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=258;TCF=139;TCR=119;TR=258;WE=4414995;WS=4414977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr16	4415410	rs3747575	G	T	3705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=75;NR=48;PP=2024;SC=GGCCCTGTTCGAGTTCCTCCT;SOR=0.980;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=75;TCR=48;TR=123;WE=4415418;WS=4415400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr16	4415455	rs3747576	C	G	4323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=81;NR=68;PP=2293;SC=GGACTCCAGGCTGTGGATGTG;SOR=0.729;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=150;TCF=81;TCR=69;TR=149;WE=4415463;WS=4415445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr16	4431202	rs758044	A	G	14664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=541;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=255;NR=247;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.732;SC=TGGACCTGACAGCCAACAGGC;SOR=0.228;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=503;TCF=256;TCR=247;TR=502;WE=4431210;WS=4431192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,539:1.00:540
chr16	4432029	rs3810818	A	C	5998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=104;NR=104;PP=2965;SC=AGCCCCACAGAGCCGGCCACT;SOR=0.805;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=208;TCF=104;TCR=104;TR=208;WE=4432037;WS=4432019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr16	4445327	rs3747579	C	T	6572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=123;NR=98;PP=2965;SC=GTCAAAGATCCGCAGCTGCTT;SOR=0.803;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=221;TCF=123;TCR=98;TR=221;WE=4445335;WS=4445317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr16	4455675	rs3747580	G	A	2564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.44;SOR=1.044;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr16	4475868	rs2304631	A	T	460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=3;PP=271;SC=GCAGGCGCAGAGTCCCCGGGC;SOR=1.739;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=4475876;WS=4475858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr16	4476089	rs1139652	T	C	5501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=103;NR=81;PP=2965;SC=GTGTCAGCCTTACAGGTGAGG;SOR=0.809;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=184;TCF=103;TCR=81;TR=184;WE=4476097;WS=4476079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr16	4484328	rs4785962	A	G	993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=5;PP=738;SC=ATGTACTCACAGTTTTCTTTT;SOR=3.026;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=34;WE=4484336;WS=4484318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr16	4484396	rs1139653	A	T	4304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=45;PP=2573;SC=AACAAAACATAACCCTTTCAT;SOR=1.324;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=135;TCF=90;TCR=45;TR=135;WE=4484404;WS=4484386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr16	4484613	rs4785964	A	G	4072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=85;PP=2633;SC=TGCCCATATGAATAGGTCTCA;SOR=2.059;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=121;TCF=36;TCR=85;TR=121;WE=4484621;WS=4484603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr16	4494549	rs12446640	A	G	770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=0;PP=540;SC=GTTGGCCAGGATGGTCTCGAT;SOR=4.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=4494557;WS=4494539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr16	4496973	rs2304633	T	A	4155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=73;PP=2632;SC=TTCTTGGGGGTACAGCCAGAG;SOR=0.731;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=154;TCF=81;TCR=73;TR=154;WE=4496981;WS=4496963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr16	4500544	rs2304634	C	T	8750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=166;NR=144;PP=2965;SC=GGCCTCAGAGCCCCCCAGGGT;SOR=0.780;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=312;TCF=166;TCR=146;TR=310;WE=4500552;WS=4500534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,334:1.00:334
chr16	4516092	rs3747584	T	C	1888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=12;PP=1206;SC=CCGCGGTCTGTTACACCAACG;SOR=1.963;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=45;TCR=12;TR=57;WE=4516100;WS=4516082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr16	4519548	rs62039231	A	G	3899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=85;PP=2507;SC=GGAGTGCTCCACCACAGCAAG;SOR=1.712;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=124;TCF=39;TCR=85;TR=124;WE=4519556;WS=4519538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr16	4524060	rs3761680	C	A	4145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=97;NR=53;PP=2630;SC=GGCGCCCTGGCTCTGCAAGGG;SOR=1.285;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=97;TCR=53;TR=150;WE=4524068;WS=4524050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr16	4562351	rs8129	T	C	2091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=24;PP=1385;SC=AAGCTCATTGTCAGCCCCCTG;SOR=1.409;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=50;TCR=24;TR=73;WE=4562359;WS=4562341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
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chr16	4641814	rs5815211	AG	A	3052.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=54;PP=2200;SC=CCCTCCTGGTAGGGGTCCTGC;SOR=1.828;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=4;TCR=56;TR=58;WE=4641822;WS=4641804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
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chr16	4649108	rs11647273	A	G	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.728;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.990;HP=14;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=157;ReadPosRankSum=-1.501;SC=CTCAAGAAAAAAAAAAAAAAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=8;WE=4649116;WS=4649102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr16	4649955	rs11076843	T	C	1079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.95;SOR=4.003;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
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chr16	4660342	rs841184	C	T	2621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=45;PP=1968;SC=GCAGGACCCACGGAGCCGGGA;SOR=0.809;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=42;TCR=45;TR=87;WE=4660350;WS=4660332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr16	4664412	rs138923012	T	TG	366.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=5;PP=238;ReadPosRankSum=1.088;SC=ACAAAAGGGGTGGGGGGGGTC;SOR=0.412;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=11;WE=4664420;WS=4664402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,15:0.94:16
chr16	4664833	rs860889	T	G	5047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=103;PP=2965;SC=GCCTCCCTCCTCCGCCCGCGC;SOR=1.045;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=180;TCF=77;TCR=103;TR=180;WE=4664841;WS=4664823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr16	4674954	rs3747587	C	G	8246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=168;NR=124;PP=2965;SC=CCGGCAGCGCCGCGCACCATG;SOR=0.999;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=292;TCF=168;TCR=124;TR=292;WE=4674962;WS=4674944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,319:1.00:319
chr16	4675116	rs1386092	G	T	3841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=89;PP=2523;SC=CGGGCGCGGGGGCGGGGACTC;SOR=1.921;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=129;TCF=40;TCR=89;TR=129;WE=4675124;WS=4675106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr16	4700318	rs373572089	CA	C	84.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=6.314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.39;ReadPosRankSum=-0.709;SOR=2.044;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr16	4714639	rs1659479	T	C	7993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=165;NR=98;PP=2965;SC=TCCAGCTCATTTGTTGACCGA;SOR=1.211;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=263;TCF=165;TCR=98;TR=263;WE=4714659;WS=4714629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,287:1.00:287
chr16	4715012	rs3813746	C	T	1248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=9;PP=913;SC=GCTGAGCCCTCGGTGCCGCAG;SOR=2.147;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=34;TCR=9;TR=43;WE=4715020;WS=4715002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr16	4718388	rs34069734	A	G	5305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=105;PP=2965;SC=GCATACTCATACATAGACACA;SOR=1.305;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=173;TCF=67;TCR=106;TR=172;WE=4718396;WS=4718378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr16	4721468	rs715109	T	C	13839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=527;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=263;NR=224;PP=2965;ReadPosRankSum=0.431;SC=AAGGTGTGTATCTGGGTGAGG;SOR=0.844;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=489;TCF=264;TCR=225;TR=487;WE=4721476;WS=4721458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,523:1.00:525
chr16	4723451	rs2289314	A	G	3692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=48;PP=2400;SC=CAGGAGCCGTACTCTGGCCTT;SOR=1.112;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=77;TCR=48;TR=125;WE=4723459;WS=4723441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr16	4736080	rs144808025	TTCTGGCTGCGC	T	3338.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=15;PP=2938;SC=CCGCGTTGAATTCTGGCTGCG;SOR=2.211;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=43;TCF=24;TCR=19;TR=38;WE=4736098;WS=4736070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr16	4736316	rs841225	C	T	8404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=130;NR=158;PP=2965;SC=TACGTGACCTCCCAGACGCGC;SOR=0.950;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=288;TCF=130;TCR=158;TR=288;WE=4736324;WS=4736306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,312:1.00:312
chr16	4747136	rs841215	G	C	4938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=81;PP=2965;SC=GCCTCTCCCGGCCAGGCTCAG;SOR=0.786;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=165;TCF=84;TCR=81;TR=165;WE=4747144;WS=4747126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr16	4748825	rs841214	C	T	1927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.284;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=22;PP=1247;ReadPosRankSum=1.122;SC=TGGCGAGCTCCTGCATCTCAG;SOR=0.263;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=109;TCF=81;TCR=28;TR=75;WE=4748833;WS=4748815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,81:0.68:119
chr16	4750841	rs144388313	G	A	3002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.039;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=54;PP=1669;ReadPosRankSum=0.693;SC=GAGCCTAACAGGCCATGGGGA;SOR=0.771;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=203;TCF=111;TCR=92;TR=120;WE=4750849;WS=4750831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,139:0.61:228
chr16	4751045	rs863980	C	T	7713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=133;NR=125;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.218;SC=TCAGTTGCAGCGCGGGGAGGC;SOR=0.232;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=258;TCF=133;TCR=125;TR=258;WE=4751053;WS=4751035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,279:1.00:280
chr16	4751804	rs149783445	G	A	1992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.389;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=53;PP=1161;ReadPosRankSum=-1.333;SC=AACAGCTGCTGCACGGAGGTG;SOR=0.973;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=168;TCF=76;TCR=92;TR=92;WE=4751812;WS=4751794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,98:0.52:187
chr16	4752134	rs841210	A	G	4230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=91;NR=55;PP=2579;SC=TGCTCTCCACATCCCGCTCAT;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=147;TCF=91;TCR=56;TR=146;WE=4752142;WS=4752124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr16	4786456	rs859314	A	G	641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=18;NR=3;PP=462;SC=CACCCTGTGTACCCCACAGAG;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=4786464;WS=4786446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr16	4787987	rs859310	G	A	3597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=65;PP=2131;ReadPosRankSum=-0.583;SC=GTGTGTGTGCGATGTTAGTCT;SOR=0.437;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=116;TCF=50;TCR=66;TR=115;WE=4787995;WS=4787977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,132:0.99:133
chr16	4790273	rs859305	G	A	7586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=139;NR=122;PP=2965;SC=GCTCTGGTGAGGTCAGCGCTC;SOR=0.776;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=261;TCF=139;TCR=122;TR=261;WE=4790281;WS=4790263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,275:1.00:275
chr16	4792982	rs117234488	C	T	1376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.429;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=31;PP=747;ReadPosRankSum=-0.143;SC=AGCTGTGAAGCAGGTACTTGT;SOR=0.296;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=174;TCF=107;TCR=67;TR=66;WE=4792990;WS=4792972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,73:0.39:186
chr16	4794873	rs2075469	C	T	1772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=12;PP=1067;SC=ATCCTCAGACCGCATGGTGCC;SOR=1.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=42;TCR=12;TR=54;WE=4794881;WS=4794863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr16	4796393	rs737700	A	G	8495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=166;NR=131;PP=2965;SC=TCAAGGAAGCAGGGCTCCCAG;SOR=0.899;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=298;TCF=166;TCR=132;TR=297;WE=4796401;WS=4796383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,318:1.00:318
chr16	4796595	rs759988	T	C	3249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=76;PP=1839;SC=TGGTGGATCCTGATGGGGAGG;SOR=1.915;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=35;TCR=76;TR=111;WE=4796603;WS=4796585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr16	4796871	rs2341988	A	G	4718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=98;NR=65;PP=2965;SC=AGCCCCAACAAGAGTTGGAAC;SOR=1.065;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=163;TCF=98;TCR=65;TR=163;WE=4796879;WS=4796861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr16	4797226	rs759989	T	C	1240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=5;PP=915;SC=GCTGCCTGAATTGCATTCTTG;SOR=2.948;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=33;TCR=5;TR=38;WE=4797234;WS=4797216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr16	4797457	rs17853375	C	T	8763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=154;NR=142;PP=2965;SC=GCTCAGGCCCCTGAAGACACA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=297;TCF=155;TCR=142;TR=296;WE=4797465;WS=4797447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,320:1.00:320
chr16	4801723	rs921863	G	A	1776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.75;SOR=0.980;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr16	4802370	rs3747601	C	A	2758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=31;PP=1454;SC=AGTTTCAGGCCTGGTGATCAG;SOR=1.094;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=59;TCR=31;TR=90;WE=4802378;WS=4802360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr16	4802386	rs3747602	G	T	3054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=62;NR=37;PP=1647;SC=ATCAGGCTTTGGCACCGGGGC;SOR=1.009;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=62;TCR=37;TR=99;WE=4802394;WS=4802376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr16	4812209	rs12599765	G	A	3568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=64;NR=50;PP=1803;SC=TAACAAGGAAGTGTGACACAC;SOR=0.754;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=64;TCR=50;TR=114;WE=4812217;WS=4812199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr16	4815425	rs4786548	T	C	1496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=7;PP=1138;SC=GGCTGAGAAATCTTTTGCAGT;SOR=2.925;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=41;TCR=7;TR=48;WE=4815433;WS=4815415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr16	4815501	rs12928542	G	C	6148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=123;NR=79;PP=2965;SC=CAAGGAATCTGCAGCTGCAGA;SOR=1.112;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=202;TCF=123;TCR=79;TR=202;WE=4815509;WS=4815491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr16	4815602	rs12919587	T	C	1724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.41;ReadPosRankSum=-1.130;SOR=0.531;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,88:0.43:205
chr16	4815608	rs4786549	A	G	6443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=87;PP=1709;SC=GCCCTTCCACAAGGACCACGG;SOR=1.034;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=158;TCF=71;TCR=87;TR=158;WE=4815616;WS=4815592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr16	4861709	rs2085329	G	C	6189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=131;NR=92;PP=2965;SC=GGCCTGTCACGTGGGCCAGGG;SOR=0.996;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=223;TCF=131;TCR=92;TR=223;WE=4861717;WS=4861699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr16	4882270	rs200405424	G	A	932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.416;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=21;PP=388;ReadPosRankSum=1.611;SC=AGCTGCTGCCGCCATCGCCAC;SOR=0.555;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=134;TCF=53;TCR=81;TR=39;WE=4882278;WS=4882260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,49:0.33:148
chr16	4933939	rs2037912	G	C	11447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=422;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=197;NR=195;PP=2965;SC=TGCAGGTTTTGCCTCTCCAGC;SOR=0.741;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=392;TCF=197;TCR=195;TR=392;WE=4933947;WS=4933929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,422:1.00:422
chr16	4934549	rs1049208	G	A	17397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=416;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=191;NR=191;PP=2965;SC=CGGCAAAGGCGCTCGCCTCGG;SOR=0.742;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=383;TCF=191;TCR=192;TR=382;WE=4934557;WS=4934539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,416:1.00:416
chr16	4934564	rs1049207	C	G	17240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=401;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=184;NR=185;PP=2965;SC=CCTCGGCCCGCAGGCCTGGCT;SOR=0.749;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=369;TCF=184;TCR=185;TR=369;WE=4934572;WS=4934554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,401:1.00:401
chr16	4938160	rs2734742	T	G	5184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=105;NR=67;PP=2965;SC=TCACGTGGCTTCTCCTTCCAT;SOR=0.994;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=172;TCF=105;TCR=67;TR=172;WE=4938168;WS=4938150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr16	4938280	rs2075637	T	C	3591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=72;PP=2384;SC=GACAGACATGTTCCTGTACCC;SOR=1.152;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=52;TCR=73;TR=123;WE=4938288;WS=4938270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr16	4938321	rs2075636	A	T	2065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=45;PP=1438;SC=GCCCTGTGCCATGTGCTGGTT;SOR=2.265;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=15;TCR=45;TR=60;WE=4938343;WS=4938311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr16	4938335	rs55849185	T	G	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=277;ReadPosRankSum=0.723;SC=GCTGGTTTTATAATCTGCGTG;SOR=0.534;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=45;TCF=8;TCR=37;TR=17;WE=4938343;WS=4938311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,16:0.36:45
chr16	4939225	rs140073794	G	GTT	202.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=183;SC=GCAAAAGGCAGTTTTTTTGTT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=4939233;WS=4939215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr16	4939245	rs12919128	T	G	142.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.51;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr16	4940387	rs11644917	G	A	2549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.84;SOR=0.714;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr16	4940809	rs2471844	A	G	4221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=66;PP=2535;SC=CCAGGTCCGGACAGTGCTCCT;SOR=0.803;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=135;TCF=69;TCR=66;TR=135;WE=4940817;WS=4940799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr16	4940989	rs2471843	A	C	545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.98;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr16	4940994	rs760118	A	G	545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.48;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	4942099	rs1049205	C	T	4862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=97;NR=69;PP=2898;SC=GTCCTCCACCCGGGTCCTCAG;SOR=0.846;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=166;TCF=97;TCR=69;TR=166;WE=4942107;WS=4942089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr16	4944518	rs1876363	C	G	8760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.99;NF=155;NR=144;PP=2965;SC=TCACAAAACACACGGCCGGAG;SOR=0.712;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=300;TCF=155;TCR=145;TR=299;WE=4944526;WS=4944508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,325:1.00:325
chr16	4945221	rs12709119	A	G	9217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=350;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=172;NR=142;PP=2965;SC=TTACCCCAAAAACTTTGTAGT;SOR=0.814;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=314;TCF=172;TCR=142;TR=314;WE=4945229;WS=4945211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,348:1.00:348
chr16	4947534	rs8051246	T	C	385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=1;PP=218;SC=ATCAGAAGCATGGGTGCTGGG;SOR=2.303;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=4947542;WS=4947524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr16	4948936	rs12443906	C	T	906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=3;PP=671;SC=GGGGTCTGCCCGAGCTCCAGG;SOR=3.841;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=27;WE=4948944;WS=4948926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr16	4949137	rs55735519	G	A	2481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.407;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=59;PP=1482;ReadPosRankSum=-1.631;SC=GTGGGGGGCAGTGGAGGGGCC;SOR=0.729;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=325;TCF=169;TCR=156;TR=124;WE=4949145;WS=4949127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:199,131:0.40:330
chr16	4952598	rs2048098	C	G	1311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=32;PP=875;SC=GGCCCCCCACCCAGACCCCGG;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=13;TCR=32;TR=45;WE=4952606;WS=4952588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr16	4961003	rs8057613	A	G	1799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=20;NR=42;PP=1159;SC=GGTGGGGGCTATGTCCCCACC;SOR=1.716;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=20;TCR=42;TR=62;WE=4961011;WS=4960993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr16	5009232	rs78937023	C	T	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.264;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=305;ReadPosRankSum=0.923;SC=CCCTGCTTCCCGAGGTGGGAG;SOR=1.044;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=56;TCF=43;TCR=13;TR=21;WE=5009240;WS=5009222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,22:0.38:58
chr16	5009433	rs7200245	G	A	8212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=145;NR=143;PP=2965;SC=AGTTGGAGGGGCTTGAGATCA;SOR=0.800;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=288;TCF=145;TCR=143;TR=288;WE=5009441;WS=5009423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,312:1.00:312
chr16	5037499	.	G	GGA	306.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=8.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.22;MQRankSum=0.000;QD=6.26;ReadPosRankSum=2.158;SOR=0.706;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,21:0.43:49
chr16	5041778	rs2972265	T	C	2782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=65;NR=29;PP=1677;SC=CCTGTGGTGATCCTGTGACCC;SOR=1.522;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=65;TCR=29;TR=94;WE=5041786;WS=5041768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr16	5046202	rs2908676	T	A	1570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.10;ReadPosRankSum=0.616;SOR=0.740;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,42:0.40:104
chr16	5046208	rs2908675	C	A	1654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.02;ReadPosRankSum=0.708;SOR=0.703;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,47:0.40:118
chr16	5046787	rs2270260	G	C	1403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.024;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=11;PP=680;ReadPosRankSum=-0.797;SC=TGCCCCGGCTGGTTCTGTAAT;SOR=0.538;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=69;TCF=52;TCR=17;TR=48;WE=5046795;WS=5046777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,59:0.73:81
chr16	5046810	rs74455496	G	C	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.779;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=11;PP=514;ReadPosRankSum=-1.598;SC=TATCTGCTGGGTCAGGGGATA;SOR=1.142;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=115;TCF=77;TCR=38;TR=36;WE=5046818;WS=5046800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,37:0.29:129
chr16	5050897	rs2286966	G	C	1384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=35;PP=876;ReadPosRankSum=-1.335;SC=GGTGTGAGGGGAGCACAAGGC;SOR=0.750;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=102;TCF=42;TCR=60;TR=59;WE=5050905;WS=5050887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,62:0.55:112
chr16	5053331	rs2972280	C	T	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=152;ReadPosRankSum=-0.083;SC=CCTGTTCATCCCCTGTGGGGA;SOR=0.275;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=11;WE=5053339;WS=5053321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr16	5056122	rs2302555	C	T	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.140;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=101;ReadPosRankSum=0.261;SC=CTGGGATTCCCGGAGTGGGGC;SOR=0.132;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=10;WE=5056130;WS=5056112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr16	5061085	rs2908669	A	C	1819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=9;PP=1176;SC=GGCAGGGCTGATGTGTTTCAG;SOR=2.157;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=44;TCR=9;TR=53;WE=5061093;WS=5061075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr16	5075542	rs887854	G	A	4023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=86;NR=55;PP=2324;SC=GAGGCTCCCCGTTCATCTCCT;SOR=1.112;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=86;TCR=55;TR=141;WE=5075550;WS=5075532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr16	5077395	rs71402581	TGGGAGGA	T	4410.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.17;QD=44.55;SOR=1.808;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr16	5078841	rs1995278	T	C	7777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=162;NR=113;PP=2965;SC=GGGGCAGACCTGGACTTCAGC;SOR=1.053;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=275;TCF=162;TCR=113;TR=275;WE=5078849;WS=5078831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,289:1.00:289
chr16	5083209	rs35962888	G	A	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5041;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=271;ReadPosRankSum=0.000;SC=GAACACGGAGGCACGGCTACA;SOR=0.892;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=13;WE=5083231;WS=5083199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr16	5083483	rs2972272	T	C	3406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=65;PP=2373;SC=AGCCGCCGGGTCCACCGGGCT;SOR=1.217;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=44;TCR=65;TR=109;WE=5083491;WS=5083473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr16	5094570	rs8055684	G	A	1472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.273;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=37;PP=828;ReadPosRankSum=-0.223;SC=TCAGCCAGACGCGGTGGCTCA;SOR=0.322;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=104;TCF=37;TCR=67;TR=62;WE=5094578;WS=5094560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,68:0.62:109
chr16	5105365	rs741167	C	T	2120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.685;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=49;PP=1129;ReadPosRankSum=-1.535;SC=GAAGTAAAGACGGGGGCCCTC;SOR=0.804;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=131;TCF=59;TCR=72;TR=89;WE=5105373;WS=5105355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,103:0.71:145
chr16	5105440	rs741166	T	C	472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=357;ReadPosRankSum=0.216;SC=CCACCTGCCTTCATCTGCCTG;SOR=1.022;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=18;WE=5105448;WS=5105430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr16	5106184	rs741164	C	T	3164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.442;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=68;PP=1791;ReadPosRankSum=-0.460;SC=CCTGTGTGCACCCCCTCTGGG;SOR=0.652;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=244;TCF=121;TCR=123;TR=139;WE=5106192;WS=5106174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,155:0.56:275
chr16	5108808	rs17137557	G	A	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=211;ReadPosRankSum=2.095;SC=GAAAGATGACGCTAGAGCTAT;SOR=0.836;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=12;WE=5108816;WS=5108798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,16:0.73:22
chr16	5110271	rs2270834	C	T	5221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=395;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.374;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-0.779;NF=120;NR=104;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.429;SC=GCAAATAGGGCAAGTGCAGGG;SOR=0.722;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=365;TCF=194;TCR=171;TR=224;WE=5110279;WS=5110261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,244:0.62:394
chr16	5110444	.	G	T	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.552;ClippingRankSum=0.000;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=1.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.41;ReadPosRankSum=-0.266;SOR=1.089;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,10:0.13:77
chr16	5122072	rs112683515	G	GGTCT	5254.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.689;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.155;NF=14;NR=42;PP=2496;ReadPosRankSum=1.258;SC=AGTGGCCAAGGGTCTGGGAGG;SOR=0.657;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=109;TCF=25;TCR=84;TR=56;WE=5122080;WS=5122062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,131:0.60:217
chr16	5122191	rs34061670	C	CG	3407.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=56;PP=2516;SC=ATTAGACGAGCGGTTCTGCCC;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=2;TCR=60;TR=58;WE=5122199;WS=5122181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr16	5125365	rs4786590	C	T	6882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=127;NR=100;PP=2965;ReadPosRankSum=2.048;SC=GGTTTCCTCCCCTTCAAGTCT;SOR=0.343;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=228;TCF=128;TCR=100;TR=227;WE=5125373;WS=5125355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,251:1.00:252
chr16	5127335	rs11076869	T	A	5290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=120;NR=53;PP=2965;SC=CTCAGGGAGCTCAAACTCTCC;SOR=1.489;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=173;TCF=120;TCR=53;TR=173;WE=5127343;WS=5127325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr16	5517175	rs34212245	T	TTC	72.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.802;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=2;PP=116;ReadPosRankSum=-0.388;SC=TCAATGTTTCTTCTCTCTCTC;SOR=2.419;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=11;WE=5517183;WS=5517165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr16	5517334	.	C	G	2485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.384;ClippingRankSum=0.000;DP=177;ExcessHet=3.0103;FS=1.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.04;ReadPosRankSum=-0.725;SOR=0.808;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,118:0.67:177
chr16	5649140	rs71404537	T	TTAGGAAA	6394.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=518;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=3.348;NF=15;NR=66;PP=2954;ReadPosRankSum=1.426;SC=ACAATTTCTATCACTTGGGCC;SOR=0.704;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=273;TCF=34;TCR=239;TR=81;WE=5649148;WS=5649129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:329,178:0.35:507
chr16	6533549	rs7187508	C	A	6858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=121;PP=2965;SC=CCTTCAGGTACGGCGAGCGAA;SOR=1.013;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=221;TCF=100;TCR=121;TR=221;WE=6533557;WS=6533539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr16	6704474	rs11640601	A	G	6829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.23;SOR=2.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr16	6704480	rs11645523	C	G	6955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.75;SOR=1.780;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr16	6704749	rs2058527	T	G	5372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=98;PP=2965;SC=ATGATGGTTTTTAGGTGATTC;SOR=1.117;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=176;TCF=78;TCR=98;TR=176;WE=6704757;WS=6704739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr16	7102036	rs35212568	CT	C	10311.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=101;PP=2966;SC=GACTTTTCCCCTTCATTTTCT;SOR=1.084;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=52;TCR=106;TR=151;WE=7102048;WS=7102026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,281:1.00:281
chr16	7102271	rs76113361	A	G	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=68;ReadPosRankSum=0.752;SC=TGTTAAATACAGTATATCTTC;SOR=0.163;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=6;WE=7102279;WS=7102261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,7:0.28:25
chr16	7645808	rs12935264	C	G	188.79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=181;SC=ACTGGCCTTACTTTTTTTTTT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=7645816;WS=7645798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	7657373	rs1507010	A	G	5570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=97;PP=2965;SC=AAGTCTTCTCAGTCTTTTCTA;SOR=0.910;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=189;TCF=92;TCR=97;TR=189;WE=7657381;WS=7657363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr16	7657432	rs4616299	A	G	877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.012;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=24;PP=570;ReadPosRankSum=-0.304;SC=AATAACCTGAAGCAAGTGAAT;SOR=0.461;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=80;TCF=23;TCR=57;TR=35;WE=7657440;WS=7657422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,40:0.47:85
chr16	7703785	rs3217052	G	GCT	1544.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.619;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=23;PP=1009;ReadPosRankSum=-0.338;SC=GACAGCCTGTGCTCTCTCTCT;SOR=0.430;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=71;TCF=20;TCR=51;TR=29;WE=7703793;WS=7703775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,58:0.54:108
chr16	7715108	rs8064206	T	C	5015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=107;PP=2760;SC=TGGTTTGTCTTGCAGGACAGA;SOR=1.289;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=175;TCF=68;TCR=107;TR=175;WE=7715116;WS=7715098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr16	7721778	rs2286541	C	A	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.764;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=68;ReadPosRankSum=-0.240;SC=GGTGGCTATCCCTGTATCTAT;SOR=1.508;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=6;WE=7721786;WS=7721768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr16	7726691	rs2191134	A	G	179.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=1;PP=152;SC=TTTGGGTAACAGCTGCTCTGG;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=7726699;WS=7726681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr16	7759164	rs7196923	T	C	3355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=76;PP=2369;SC=GTCCTCACTTTCTCCTGCCTC;SOR=1.919;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=109;TCF=32;TCR=77;TR=108;WE=7759172;WS=7759154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr16	7759206	rs62011897	G	T	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.846;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=23;PP=505;ReadPosRankSum=1.034;SC=ACCTCAGTACGGGTTGACGTC;SOR=0.223;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=25;WE=7759214;WS=7759196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,25:0.62:40
chr16	8619750	rs7198383	C	T	3622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=83;NR=42;PP=2180;SC=GCCCCTCCCTCCCCTCCACGA;SOR=1.290;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=128;TCF=84;TCR=44;TR=125;WE=8619758;WS=8619740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr16	8620096	rs9922116	T	C	1254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=27;PP=834;SC=GCCACGCTGCTCAGCGTCCAG;SOR=1.828;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=13;TCR=27;TR=40;WE=8620104;WS=8620086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr16	8728953	rs1731044	C	T	3077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=46;PP=2035;SC=AGGTCTTGTCCGCTTCCTGTG;SOR=0.970;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=108;TCF=62;TCR=46;TR=108;WE=8728961;WS=8728943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr16	8729124	rs2302607	G	A	1944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.453;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=35;PP=1241;ReadPosRankSum=1.847;SC=CACGGGGCTCGCTAGCATCAT;SOR=0.912;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=123;TCF=68;TCR=55;TR=83;WE=8729132;WS=8729114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,86:0.68:127
chr16	8729220	rs7200578	A	G	614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.625;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=22;PP=370;ReadPosRankSum=-2.038;SC=TTCACAAAGCATGCACTGACT;SOR=0.992;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=110;TCF=45;TCR=65;TR=35;WE=8729228;WS=8729210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,37:0.31:118
chr16	8729254	rs3108687	C	A	2717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=41;PP=1222;SC=GGCAGAGGCACTGGAAATTGG;SOR=1.577;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=22;TCR=41;TR=63;WE=8729262;WS=8729244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr16	8729275	rs1641040	T	C	2129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=27;PP=895;SC=ATGTTAGCTGTTGTTGATTTT;SOR=1.931;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=13;TCR=27;TR=40;WE=8729283;WS=8729265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr16	8729323	rs1731043	A	T	419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=53;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=322;SC=CTCTCCATTTATTCTCAGTGA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=8729331;WS=8729313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr16	8732733	rs1362345	C	G	704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=1;PP=511;SC=CGCACTGTCTCTCCCCATCAG;SOR=3.912;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=8732741;WS=8732723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr16	8732882	rs5815485	CA	C	9390.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.26;NF=36;NR=132;PP=2975;SC=TCTCTCTAGGCAAAAAACATG;SOR=0.812;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=185;TCF=40;TCR=145;TR=168;WE=8732890;WS=8732872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,318:1.00:318
chr16	8733071	rs1641048	A	G	1739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=46;PP=1234;SC=TGTTTAGCAGATAGGACAGAC;SOR=2.093;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=18;TCR=46;TR=64;WE=8733079;WS=8733061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr16	8734803	.	G	A	311	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=53;MMLQ=19;MQ=66.26;NF=17;NR=2;PP=311;QD=18.1984848709;SC=GGATGGATGGGTGGGTGGATG;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=19;WE=8734811;WS=8734793;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,19:0.95:20
chr16	8734830	.	G	GCTGGCTGT	1030	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MMLQ=26;MQ=66.48;NF=23;NR=8;PP=1030;QD=33.4838709677;SC=TGGCTGGCTGGCTGGCTGGCT;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=39;TCF=27;TCR=12;TR=31;WE=8734838;WS=8734820;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:8,31:0.79:39
chr16	8735120	rs8062990	T	C	2552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=51;PP=1946;SC=GCTCTGTGGTTTTGACAGAGC;SOR=1.765;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=74;TCF=22;TCR=52;TR=73;WE=8735128;WS=8735110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr16	8735200	rs8045911	G	A	3924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=45;PP=2378;SC=ATGAGCACCAGCTGTCATTCT;SOR=1.228;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=127;TCF=81;TCR=46;TR=126;WE=8735220;WS=8735190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr16	8735212	rs1629322	T	C	4402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=59;PP=2434;SC=TGTCATTCTCTGAGCGCCTGC;SOR=1.026;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=148;TCF=89;TCR=59;TR=148;WE=8735220;WS=8735190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr16	8735245	rs1641055	C	T	7082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=137;NR=108;PP=2965;SC=ACCTCACGTTCATTTTCTTCT;SOR=0.862;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=245;TCF=137;TCR=108;TR=245;WE=8735253;WS=8735225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr16	8735355	rs1641056	A	G	4103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=58;NR=84;PP=2660;SC=GTAGGGGCATAGACCCGAGTT;SOR=1.171;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=142;TCF=58;TCR=84;TR=142;WE=8735363;WS=8735345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr16	8736028	rs1614616	T	C	9299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=350;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=175;NR=146;PP=2965;SC=AATTTCTGACTTGTACGATCA;SOR=0.826;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=321;TCF=175;TCR=146;TR=321;WE=8736036;WS=8736018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,350:1.00:350
chr16	8736150	rs1615559	A	C	4191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=61;PP=2813;SC=CCGGGAGTTCAGTTTTAGAAG;SOR=0.823;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=135;TCF=74;TCR=61;TR=135;WE=8736158;WS=8736126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr16	8736246	rs1731007	G	A	10117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=365;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=178;NR=147;PP=2965;SC=CTCTCTGTGCGGATTGCTCTG;SOR=0.970;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=326;TCF=179;TCR=147;TR=325;WE=8736254;WS=8736236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,365:1.00:365
chr16	8736499	rs1618219	C	T	1346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=43;PP=1125;SC=GTGTCCTTGTCAGTGTCATTA;SOR=7.614;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=43;WE=8736507;WS=8736489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr16	8738350	rs11645418	C	T	3896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=33;PP=2304;SC=GCAAGGTGGGCAGAAACAGCA;SOR=1.748;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=95;TCR=33;TR=128;WE=8738358;WS=8738340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr16	8738398	rs1641065	A	G	8315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=160;NR=124;PP=2965;SC=TGTGCGTCCGACTGGCTGGTT;SOR=0.889;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=284;TCF=160;TCR=124;TR=284;WE=8738414;WS=8738388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,310:1.00:310
chr16	8738427	rs1641066	T	C	10395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=381;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=189;NR=159;PP=2965;SC=CAACTTCACATTGAGACACTT;SOR=0.810;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=350;TCF=190;TCR=160;TR=348;WE=8738435;WS=8738417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,379:1.00:379
chr16	8738499	rs1731000	G	A	8382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=124;NR=159;PP=2965;SC=GGAGCAGCTCGCAGATGGCAA;SOR=1.005;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=283;TCF=124;TCR=159;TR=283;WE=8738507;WS=8738489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,306:1.00:306
chr16	8738579	rs1641067	A	G	1931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=53;PP=1508;SC=GCCTCCAGCAACTGGTAGGTC;SOR=3.477;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=9;TCR=53;TR=62;WE=8738587;WS=8738569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr16	8738622	rs9933132	C	T	727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=20;PP=542;SC=GGTTGCTTTACTGTGAAGCGG;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=8738630;WS=8738612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr16	8739954	rs1641070	G	A	1222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=10;PP=899;SC=TCTTTTCTCTGTTTGCTGCAG;SOR=2.584;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=34;TCR=10;TR=44;WE=8739962;WS=8739944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr16	8740015	rs1730994	A	C	3652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=81;NR=46;PP=2516;SC=TCGCCTCCACAAGGCGCGGCG;SOR=1.323;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=81;TCR=46;TR=127;WE=8740023;WS=8740005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr16	8740418	rs1641072	T	C	7044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=121;NR=114;PP=2965;SC=GCCATCATATTGCCGCTCGGC;SOR=0.708;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=235;TCF=121;TCR=114;TR=235;WE=8740426;WS=8740408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,262:1.00:262
chr16	8740503	rs1730992	G	A	4792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=85;PP=2965;SC=TGAGAAGGAAGAGGCAGGAGC;SOR=0.841;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=158;TCF=73;TCR=85;TR=158;WE=8740511;WS=8740493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr16	8740650	.	TTCC	T	1657.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.847;ClippingRankSum=0.000;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.604;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=28;PP=1209;ReadPosRankSum=0.220;SC=TGCAGTGATCTTCCTCAGAGG;SOR=1.852;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=1;TCR=48;TR=28;WE=8740661;WS=8740640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,43:0.57:76
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chr16	8829715	rs1640998	T	C	4499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=79;PP=2669;ReadPosRankSum=-0.571;SC=GAAGATACCATCCAGACTAGG;SOR=0.309;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=156;TCF=76;TCR=80;TR=155;WE=8829723;WS=8829705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,172:0.99:173
chr16	8832491	rs7205552	T	G	803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.79;SOR=2.621;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr16	8842128	rs1641011	T	A	292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=212;SC=TTTTTCTCATTTCCTTTGTGA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=8842136;WS=8842118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr16	8844389	rs2229157	C	T	2054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=26;NR=41;PP=1176;SC=TCTCCTCTGTCCCCATAGGTA;SOR=1.463;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=26;TCR=41;TR=67;WE=8844397;WS=8844379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr16	8858580	rs2302608	T	A	4883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=63;PP=2944;SC=CTCACGGCTATTTCCCTCCCC;SOR=1.128;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=169;TCF=106;TCR=63;TR=169;WE=8858588;WS=8858570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr16	8858700	rs112675542	GCA	G	684.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FS=3.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.39;ReadPosRankSum=-1.097;SOR=1.006;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:161,41:0.20:202
chr16	8862212	rs8049072	C	T	354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=11;PP=280;SC=ACATATTGTCCCACTGATTGC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=8862220;WS=8862202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	8862506	rs1273406	C	A	728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=2;PP=596;SC=ATATACACCTCCTATGCACCC;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=24;WE=8862514;WS=8862498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr16	8862592	rs1273407	T	C	3497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=32;PP=1907;SC=CTGACAGCCTTGCGCTGAAAT;SOR=1.591;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=75;TCR=32;TR=107;WE=8862600;WS=8862582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr16	8868776	rs1641022	C	A	2733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=62;NR=33;PP=1665;SC=TGGACGAGGTCCAGACCGGAG;SOR=1.270;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=62;TCR=33;TR=95;WE=8868784;WS=8868766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr16	8890574	rs11642272	G	A	1292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=32;PP=933;SC=ATTGCCAGACGAGGGAAGGGT;SOR=3.664;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=5;TCR=32;TR=37;WE=8890582;WS=8890564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr16	8896094	rs2304469	G	A	3449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=54;PP=2382;SC=AGTCAGACCGGTCTTCATATT;SOR=0.814;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=116;TCF=61;TCR=55;TR=115;WE=8896102;WS=8896084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr16	8904877	rs34742119	T	TATG	1924.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=5;PP=1512;SC=GCTGTTTATCTATGTTGCCCA;SOR=3.611;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=31;WE=8904885;WS=8904867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr16	8905054	rs11074924	T	C	4318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=86;PP=2825;SC=TTCTGAAATATCTTTGGTGAA;SOR=1.457;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=137;TCF=51;TCR=86;TR=137;WE=8905062;WS=8905044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr16	8907145	rs9924186	G	T	1550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=47;PP=1232;SC=TCAGACCCCCGACGCCTCTGT;SOR=5.630;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=49;TCF=2;TCR=47;TR=49;WE=8907153;WS=8907135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr16	8948974	rs6898	T	C	1579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=13;PP=1186;SC=GCCTCCTCCCTGCAAAGTCTC;SOR=2.345;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=42;TCR=13;TR=55;WE=8948982;WS=8948964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr16	8952113	rs62033507	C	A	654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=18;NR=5;PP=472;SC=GTCCTCACACCCAGCGCCCAT;SOR=2.494;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=23;WE=8952121;WS=8952103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr16	8952248	rs988065	A	G	6785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=134;NR=98;PP=2965;SC=CATCAGCTGGAGTAATGAAGC;SOR=0.905;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=232;TCF=134;TCR=98;TR=232;WE=8952256;WS=8952238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chr16	8953081	rs8097	C	G	3751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.18;SOR=0.945;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr16	8988386	rs28362503	CG	C,CGG	303.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=20;NF=9,9;NR=3,3;PP=76,149;SC=CACCAGCCCCCGGGGGGGGGA;SOR=2.833;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=12,12;WE=8988394;WS=8988376;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.54,0.46:13
chr16	8988777	rs2304467	C	G	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.128;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=247;ReadPosRankSum=-0.756;SC=CGTCACGTGGCAGCCGCCAAA;SOR=1.312;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=43;TCF=16;TCR=27;TR=16;WE=8988785;WS=8988767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,19:0.40:48
chr16	8989403	rs1677473	A	G	5746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=122;NR=79;PP=2965;SC=TAAAAACACAAATCAAGCTAC;SOR=1.157;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=202;TCF=122;TCR=80;TR=201;WE=8989411;WS=8989393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr16	8992342	rs2304465	G	A	5764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=450;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.107;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=124;NR=117;PP=2962;ReadPosRankSum=0.796;SC=CCAAAACCCCGAGCCTTCTCT;SOR=0.656;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=412;TCF=211;TCR=201;TR=241;WE=8992350;WS=8992332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:189,260:0.58:449
chr16	8992828	rs2289109	G	T	710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=2;PP=514;ReadPosRankSum=-0.957;SC=ATGTGGTCAAGATGTGAGTGG;SOR=0.977;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=56;TCF=51;TCR=5;TR=27;WE=8992836;WS=8992818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,29:0.48:60
chr16	8992868	rs2437724	AC	CA	6956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=32;PP=2947;SC=CAAGAAATGGACTGTCAGGTG;SOR=2.272;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=143;TCF=106;TCR=37;TR=132;WE=8992877;WS=8992858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr16	8994563	rs2447919	C	T	1370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.259;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=36;PP=837;ReadPosRankSum=0.173;SC=CTTCCATGTACTTAAGTATTT;SOR=1.165;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=125;TCF=52;TCR=73;TR=55;WE=8994571;WS=8994553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,65:0.47:138
chr16	8995177	rs199579856	GAAA	G	802.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.35;MQRankSum=0.463;QD=34.90;ReadPosRankSum=0.328;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,21:0.91:23
chr16	8995927	rs2304466	G	A	1360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.285;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=20;PP=833;ReadPosRankSum=-0.956;SC=CAGGCGTCTCGTGGGCACTTA;SOR=0.831;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=154;TCF=101;TCR=53;TR=63;WE=8995935;WS=8995917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,68:0.40:168
chr16	8996377	rs2447918	C	T	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.681;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=10;PP=196;ReadPosRankSum=1.715;SC=AATAAAAACACGCTCATATTT;SOR=0.238;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=26;TCF=9;TCR=17;TR=17;WE=8996385;WS=8996367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,21:0.68:31
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chr16	9004564	rs2447916	C	A	11495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=415;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=243;NR=136;PP=2965;SC=TAAAGAAGAACGCTACAACAG;SOR=1.422;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=380;TCF=243;TCR=137;TR=379;WE=9004572;WS=9004554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,414:1.00:414
chr16	9010213	rs7195624	T	G	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.75;ReadPosRankSum=-2.116;SOR=0.124;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,3:0.23:13
chr16	9010260	rs138207509	ATTTTCTGAATTAGGTC	A	1253.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=2963;ReadPosRankSum=-0.203;SC=AAAGATGGGCATTTTCTGAAT;SOR=0.693;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=13;WE=9010283;WS=9010250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,32:0.68:47
chr16	9010446	rs57510291	A	AC	4362.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=6;NR=54;PP=2742;SC=CTCCATTTAAAGCTCAACTTT;SOR=1.168;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=64;TCF=7;TCR=57;TR=60;WE=9010454;WS=9010436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr16	9014350	rs1677470	T	C	4605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=92;PP=2965;SC=AGAACACACATTTTATTCCCA;SOR=1.329;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=151;TCF=58;TCR=93;TR=150;WE=9014358;WS=9014340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr16	9014385	rs7189170	G	A	739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.747;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=24;PP=407;ReadPosRankSum=0.243;SC=TTAGTGCCCTGTACTTAATAG;SOR=0.457;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=102;TCF=31;TCR=71;TR=36;WE=9014393;WS=9014375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,40:0.36:112
chr16	9014434	rs2447912	T	G	835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=21;PP=595;SC=TCCCAACTTTTTTGCTAATTT;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=26;WE=9014442;WS=9014424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr16	9015252	rs30761	A	T	2417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.05;SOR=1.362;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr16	9015252	.	ATTTCAT	TTTTCAC,TTTTCAT	582	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.31;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=7,23;NR=13,36;PP=214,582;QD=13.3733937431;SC=CCCATTTATGATTTCATTGCT;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=59;TCF=23;TCR=36;TR=20,59;WE=9015266;WS=9015242;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.34:59
chr16	9015258	rs9940652	T	C	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=2.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.28;ReadPosRankSum=-1.353;SOR=0.989;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,26:0.39:66
chr16	9017061	rs139138924	T	TACAACGATGTGGGGGTTTGTAGTTGCATCATTTAA	4595.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.62;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=4;PP=2283;SC=AGTAATGAAATACTGTCTTAC;SOR=3.578;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=7;WE=9017069;WS=9017051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr16	9030444	rs1382390	C	G	4080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=74;NR=65;PP=2360;SC=ACTCACCTTCCAGCCCAAGCC;SOR=0.706;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=139;TCF=74;TCR=65;TR=139;WE=9030452;WS=9030434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr16	9186735	rs4630540	C	G	626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.39;QD=27.25;SOR=4.003;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	9210373	rs8045589	A	T	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.101;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=146;ReadPosRankSum=-1.569;SC=TGATATGTTTATCCAGAATAA;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=8;WE=9210381;WS=9210363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr16	9862556	rs11866328	G	T	854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=2;PP=641;SC=GCAACACCTGGCTTATGAATG;SOR=3.841;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=27;WE=9862564;WS=9862546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr16	9943666	rs2229193	C	T	1675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.127;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=40;PP=1058;ReadPosRankSum=-1.275;SC=ACGTCTCGGTCAGGGGGTCTA;SOR=0.835;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=250;TCF=133;TCR=117;TR=87;WE=9943674;WS=9943656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:177,95:0.35:272
chr16	10524957	rs34430103	G	T	3236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=399;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.221;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.198;NF=77;NR=76;PP=2066;ReadPosRankSum=0.113;SC=AGCATGAGGGGGCTTGTAGTC;SOR=0.624;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=374;TCF=192;TCR=182;TR=153;WE=10524965;WS=10524947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:236,163:0.41:399
chr16	10525230	rs34404959	T	C	1218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.077;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=25;PP=749;ReadPosRankSum=0.722;SC=TTTTGAAAACTGATGAGTGTA;SOR=0.899;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=139;TCF=78;TCR=61;TR=59;WE=10525238;WS=10525220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,62:0.41:150
chr16	10527613	rs7205853	C	A	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-0.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=89;ReadPosRankSum=-0.870;SC=CTTTCACTTGCTGCAGAGCTG;SOR=0.818;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=9;WE=10527621;WS=10527603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,10:0.33:30
chr16	10532211	rs1532824	A	C	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.53;ReadPosRankSum=-1.383;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr16	10566146	rs4453490	G	T	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=239;ReadPosRankSum=-0.943;SC=AAATGAAAAAGTTAAATGTAC;SOR=0.560;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=15;WE=10566154;WS=10566136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr16	10567984	rs62027485	G	A	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.575;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=210;ReadPosRankSum=0.873;SC=TTTAGCTCATGTGCAGATTCA;SOR=1.480;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=38;TCF=8;TCR=30;TR=15;WE=10567992;WS=10567974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,16:0.40:40
chr16	10625605	rs111364972	GATGAATGAATGA	G	508.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.642;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=1784;ReadPosRankSum=2.334;SC=GATTTATGTTGATGAATGAAT;SOR=0.223;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=25;TCF=12;TCR=13;TR=6;WE=10625624;WS=10625595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,16:0.34:47
chr16	10625997	rs7194566	G	A	1279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-1.076;NF=31;NR=27;PP=617;ReadPosRankSum=-0.211;SC=CAGGGAGCGCGTTAGAAATGC;SOR=0.735;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=167;TCF=85;TCR=82;TR=58;WE=10626005;WS=10625987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,69:0.37:187
chr16	10626122	rs12928389	G	C	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.314;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=18;PP=382;ReadPosRankSum=0.436;SC=GGTTAAGGATGACCATTCCTA;SOR=1.086;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=67;TCF=24;TCR=43;TR=27;WE=10626130;WS=10626112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,24:0.35:69
chr16	10631985	rs1504884	T	C	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=129;ReadPosRankSum=1.121;SC=GCCGGCACTGTGGGGTACACA;SOR=0.664;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=11;WE=10631993;WS=10631975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr16	10769958	rs2719710	T	C	3123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=461;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.536;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=73;PP=1575;ReadPosRankSum=2.372;SC=CTCCCGCAGCTGGATGGAGTT;SOR=0.733;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=418;TCF=215;TCR=203;TR=154;WE=10769966;WS=10769948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:289,172:0.37:461
chr16	10770075	rs2719711	A	G	1232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.229;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=36;PP=801;ReadPosRankSum=0.380;SC=GCAGTCCTGGAAGACCTCAGA;SOR=0.566;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=182;TCF=71;TCR=111;TR=61;WE=10770083;WS=10770065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,66:0.33:198
chr16	10770091	rs2719712	T	C	815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=29;PP=409;ReadPosRankSum=1.449;SC=TCAGAATCTGTGGTTTCTCCG;SOR=0.665;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=43;TCR=91;TR=43;WE=10770099;WS=10770081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,48:0.32:148
chr16	10775822	rs10221070	G	T	1375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.832;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=14;PP=782;ReadPosRankSum=-0.290;SC=GACACGCCAGGGATGGGGAGG;SOR=0.510;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=63;TCR=24;TR=50;WE=10775830;WS=10775812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,61:0.62:99
chr16	10775855	rs12918646	G	A	1297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=30;PP=786;ReadPosRankSum=-0.164;SC=CTTACGTGCCGTCAATTTTCT;SOR=0.682;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=177;TCF=103;TCR=74;TR=68;WE=10775863;WS=10775845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,72:0.36:198
chr16	10776063	rs10221071	G	T	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=302;ReadPosRankSum=-0.631;SC=CCACACAGCAGGTGTGTGTTG;SOR=1.106;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=17;WE=10776071;WS=10776053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr16	10782945	.	CT	C	49.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.555;ClippingRankSum=-0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.55;ReadPosRankSum=-0.324;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr16	10783088	rs77020408	TAA	T	39.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.62;ReadPosRankSum=-0.166;SOR=0.508;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,8:0.12:64
chr16	10788106	rs2251984	A	G	1193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=35;NR=6;PP=916;SC=CAAGGGAAGCAGAATGAGCGT;SOR=3.365;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=42;TCF=36;TCR=6;TR=41;WE=10788114;WS=10788096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr16	10788129	rs2251985	G	T	1984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=11;PP=1491;SC=AGTATCCCCAGGACACAGCCA;SOR=2.973;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=53;TCR=11;TR=64;WE=10788137;WS=10788119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr16	10788406	rs9922129	G	T	2188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.001;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=59;PP=1424;ReadPosRankSum=-0.439;SC=GCCCACAGCCGGGAGGCCTCG;SOR=0.831;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=262;TCF=125;TCR=137;TR=107;WE=10788414;WS=10788396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:177,114:0.39:291
chr16	10855739	rs1084544	G	A	4291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=102;PP=2965;SC=AGTGTGGGGCGGCACCTCACT;SOR=2.352;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=137;TCF=35;TCR=102;TR=137;WE=10855747;WS=10855729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr16	10861914	rs2233541	T	C	6224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=122;PP=2965;SC=GAGTACTAAATGCAGATGCCT;SOR=1.072;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=214;TCF=92;TCR=122;TR=214;WE=10861922;WS=10861904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr16	10862964	rs11716	A	G	8021.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=117;NR=150;PP=2965;SC=AGTTCCTGAAACGAGAGAATG;SOR=0.960;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=269;TCF=118;TCR=151;TR=267;WE=10862972;WS=10862954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,293:1.00:293
chr16	10864350	rs9925173	T	A	1717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=36;PP=1052;SC=AGGACGGTTCTACCCATTTCA;SOR=1.647;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=57;TCF=20;TCR=37;TR=56;WE=10864358;WS=10864340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr16	10989374	rs11074937	C	T	2754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=59;PP=1869;SC=CTGGTCCCTGCCCTCCCGTCA;SOR=1.735;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=31;TCR=59;TR=90;WE=10989382;WS=10989364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr16	10992715	rs6498121	T	G	1419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.226;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=30;PP=988;ReadPosRankSum=0.162;SC=CCAAGGTGGGTACAATAGAGA;SOR=0.793;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=160;TCF=84;TCR=76;TR=67;WE=10992723;WS=10992705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,70:0.42:167
chr16	10995289	.	G	C	6388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=0.000;DP=451;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=138;NR=131;PP=2962;ReadPosRankSum=0.946;SC=AGTTAAGGCCGTATAGCCTGC;SOR=0.646;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=412;TCF=208;TCR=204;TR=269;WE=10995297;WS=10995279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,288:0.64:450
chr16	10995933	rs8046121	A	G	3107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=72;NR=23;PP=2078;SC=TCTCCTAGTGAGACCAGTGAG;SOR=1.970;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=72;TCR=23;TR=95;WE=10995941;WS=10995923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr16	10996399	rs4781016	C	A	1136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=11;PP=691;SC=ACAGCTACTGCTCTTAGGGAA;SOR=1.721;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=28;TCR=11;TR=39;WE=10996407;WS=10996389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr16	10996682	rs35170497	G	A	2634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=56;PP=1677;SC=CTGGCTCCCCGACCACCTCTC;SOR=1.739;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=29;TCR=56;TR=85;WE=10996690;WS=10996672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr16	10998482	rs4780333	T	C	915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.769;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=0;PP=682;ReadPosRankSum=0.994;SC=CGCTATCTTATAACCTCCATC;SOR=3.451;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=48;TCR=2;TR=31;WE=10998490;WS=10998472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,34:0.63:54
chr16	10998557	rs200975989	G	A	1973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.253;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=36;PP=1272;ReadPosRankSum=0.770;SC=GGTCCCCAGGGGTAACCCTCA;SOR=0.854;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=216;TCF=132;TCR=84;TR=94;WE=10998565;WS=10998547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,101:0.42:238
chr16	11000848	rs4774	G	C	7316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=558;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=154;NR=161;PP=2962;ReadPosRankSum=0.636;SC=ATCCTAGACGGCTTCGAGGAG;SOR=0.664;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=529;TCF=257;TCR=272;TR=315;WE=11000856;WS=11000838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:227,329:0.59:556
chr16	11001770	rs34654419	G	T	2913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.565;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=56;PP=1746;ReadPosRankSum=1.931;SC=GGCAGCTGCTGGAGCTGCTGC;SOR=0.501;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=221;TCF=125;TCR=96;TR=121;WE=11001778;WS=11001760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,135:0.55:245
chr16	11002133	rs4781018	C	G	757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=16;PP=390;ReadPosRankSum=-0.590;SC=AGAATGGATTCTCTCCATTTT;SOR=0.653;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=88;TCF=45;TCR=43;TR=33;WE=11002141;WS=11002123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,39:0.39:101
chr16	11002904	rs2228238	G	A	1472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.661;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=20;PP=978;ReadPosRankSum=1.264;SC=TGAGCGACACGGTGGCGCTGT;SOR=0.895;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=184;TCF=124;TCR=60;TR=68;WE=11002912;WS=11002894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,74:0.38:196
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chr16	11003101	rs7196089	G	A	1848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-5.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.781;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=48;PP=1146;ReadPosRankSum=-0.806;SC=GGACATGTAGGACCCATTCTC;SOR=0.453;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=111;TCF=30;TCR=81;TR=70;WE=11003109;WS=11003091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,78:0.63:123
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chr16	11015906	rs6498134	A	G	2240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=14;PP=1496;SC=ATAAATATTGATTCCTTCCCC;SOR=2.432;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=53;TCR=14;TR=66;WE=11015914;WS=11015896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr16	11017058	rs4781024	G	A	2805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=359;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.806;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=65;PP=1842;ReadPosRankSum=0.110;SC=CCTCTAACCTGGCTCTGAGTC;SOR=0.748;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=335;TCF=181;TCR=154;TR=142;WE=11017080;WS=11017048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:209,150:0.42:359
chr16	11136048	rs2302557	C	G	1950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=32;PP=1082;ReadPosRankSum=-1.333;SC=GGATAGGCAGCAGTCTTGGGT;SOR=0.739;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=149;TCF=85;TCR=64;TR=79;WE=11136056;WS=11136038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,95:0.55:173
chr16	11214668	rs56282757	A	AAC	181.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=10;PP=344;ReadPosRankSum=1.689;SC=GTTGGCTACAAACACACACAC;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=10;WE=11214677;WS=11214658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr16	11349403	rs27829	A	C	2209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=54;PP=1383;SC=AGAGACAAAGAGGTGAGCTGG;SOR=1.528;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=28;TCR=54;TR=82;WE=11349411;WS=11349393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr16	11350059	rs27831	T	C	1278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.21;SOR=0.735;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr16	11367143	rs438289	G	A	4850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=36;PP=1796;SC=GTTGCGGGTCGGGAGGGTGTC;SOR=1.127;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=99;TCF=63;TCR=36;TR=99;WE=11367162;WS=11367133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr16	11367154	rs429744	C	T	5028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=66;NR=41;PP=1851;SC=GGAGGGTGTCCGCTTGGGCTC;SOR=1.022;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=66;TCR=41;TR=107;WE=11367162;WS=11367133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr16	11367195	rs35598356	G	C	2014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.647;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=28;PP=1372;ReadPosRankSum=0.560;SC=CGTTGTCCTTGTGGCCCTCCT;SOR=0.773;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=128;TCF=80;TCR=48;TR=77;WE=11367203;WS=11367185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,84:0.60:140
chr16	11369855	rs2070923	G	T	1462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=0.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.62;ReadPosRankSum=1.649;SOR=0.747;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,74:0.49:152
chr16	11369930	rs1646022	C	G	1569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.035;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=27;PP=1076;ReadPosRankSum=1.542;SC=CAGGGACATGCAGGGCAAGGC;SOR=0.770;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=108;TCF=57;TCR=51;TR=66;WE=11369938;WS=11369920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,69:0.61:113
chr16	11374866	rs737008	G	T	2772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.078;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=55;PP=1875;ReadPosRankSum=0.191;SC=CTTCTACATCGCGGTCTGTAC;SOR=0.795;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=199;TCF=105;TCR=94;TR=118;WE=11374874;WS=11374856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,122:0.58:210
chr16	11444403	rs2032929	T	C	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.516;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=240;ReadPosRankSum=1.230;SC=GCCGAGATTGTGCCACTGCAC;SOR=0.385;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=36;TCR=10;TR=18;WE=11444411;WS=11444393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,15:0.38:40
chr16	11444430	rs2032930	T	G	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=401;ReadPosRankSum=1.438;SC=CTGGGCGACATAGCAAGACTC;SOR=0.836;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=72;TCF=50;TCR=22;TR=26;WE=11444438;WS=11444420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,21:0.33:64
chr16	11444454	rs57767216	GA	G	3971.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.287;NF=38;NR=45;PP=2191;ReadPosRankSum=2.373;SC=CTCAAAAGAAGAAAAAAAAAA;SOR=1.430;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=112;TCF=54;TCR=58;TR=83;WE=11444477;WS=11444444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,130:0.98:132
chr16	11444469	rs2032931	C	T	822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.348;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.516;NF=35;NR=17;PP=629;ReadPosRankSum=-0.866;SC=AAAAAAAGAACATTACTATGG;SOR=0.865;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=177;TCF=114;TCR=63;TR=52;WE=11444477;WS=11444444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,52:0.30:176
chr16	11444716	rs2032932	A	G	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=170;ReadPosRankSum=-1.662;SC=AATGATGTGGATTTCATGGAC;SOR=0.668;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=12;WE=11444724;WS=11444706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr16	11537347	.	A	AAGAGAGAG,AAGAGAGAGAGAGAG	3516.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.17;QD=74.82;SOR=1.347;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,26,21:0.55,0.45:47
chr16	11537471	rs12925081	C	T	2457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.906;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.069;NF=40;NR=71;PP=1689;ReadPosRankSum=-1.277;SC=GGAAGAAGACCCGGATGGGGT;SOR=0.908;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=230;TCF=90;TCR=140;TR=111;WE=11537479;WS=11537461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,118:0.48:247
chr16	11540596	rs4359463	A	C	1879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.719;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=44;PP=1168;ReadPosRankSum=-1.341;SC=TGCCCCAGACACACTCACGTA;SOR=0.859;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=188;TCF=91;TCR=97;TR=80;WE=11540604;WS=11540586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,88:0.42:209
chr16	11540712	rs4500747	T	C	904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.646;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=27;PP=496;ReadPosRankSum=-1.918;SC=GCCTATCAGCTGTGAAGGTCT;SOR=0.591;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=136;TCF=63;TCR=73;TR=49;WE=11540720;WS=11540702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,51:0.34:152
chr16	11541685	rs4296278	A	G	693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.147;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=4;PP=489;ReadPosRankSum=0.503;SC=AGGTCAGCAGAGATTCTCCAG;SOR=1.008;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=57;TCF=47;TCR=10;TR=27;WE=11541693;WS=11541675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,29:0.46:63
chr16	11541896	rs4238608	G	A	1739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.142;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=53;PP=1069;ReadPosRankSum=1.454;SC=GCACCAATCCGCACAGCCGTG;SOR=0.809;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=189;TCF=70;TCR=119;TR=83;WE=11541904;WS=11541886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,88:0.43:205
chr16	11542894	rs4467099	C	T	1346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.072;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=30;PP=785;ReadPosRankSum=-2.279;SC=TGCACTGCTGCGTTCCAGGCT;SOR=0.608;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=226;TCF=139;TCR=87;TR=74;WE=11542902;WS=11542884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,79:0.32:248
chr16	11544673	rs12932948	G	A	1304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.634;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=25;PP=678;ReadPosRankSum=0.127;SC=CAGGTTCAAGGCTCCTGCAAG;SOR=0.793;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=150;TCF=80;TCR=70;TR=59;WE=11544687;WS=11544663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,69:0.41:167
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chr16	11544824	rs6498194	G	A	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=125;ReadPosRankSum=-0.815;SC=TTTCTAGGACGTTGGTAATGT;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=8;WE=11544832;WS=11544814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr16	11550979	rs4559925	C	T	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=4.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.155;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=148;ReadPosRankSum=0.734;SC=GAGGCAGCAGCGAGCCAAGAT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=9;WE=11550987;WS=11550969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,9:0.29:31
chr16	11553842	rs7206698	G	C	1902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=45;PP=1219;ReadPosRankSum=0.476;SC=TCTTGTCCCAGTGCTTCCCGT;SOR=0.691;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=251;TCF=128;TCR=123;TR=93;WE=11553850;WS=11553832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,102:0.37:277
chr16	11554737	rs8046254	C	T	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.04;ReadPosRankSum=0.470;SOR=0.193;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,4:0.22:18
chr16	11554867	rs8050530	C	T	981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=0.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.92;ReadPosRankSum=1.742;SOR=0.792;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,52:0.42:124
chr16	11555016	rs6498202	C	G	918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.353;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=20;PP=525;ReadPosRankSum=-0.401;SC=GGTCAGCCCCCAGGGACCAGC;SOR=0.481;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=106;TCF=55;TCR=51;TR=44;WE=11555024;WS=11555006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,50:0.41:123
chr16	11556121	rs4254342	A	G	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.798;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=193;ReadPosRankSum=0.587;SC=GGAACCGCTCAGCCTCGCCAC;SOR=0.168;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=51;TCF=15;TCR=36;TR=18;WE=11556129;WS=11556111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,20:0.38:53
chr16	11645776	rs35493477	CT	C	192.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=5.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.21;MQRankSum=1.356;QD=5.35;ReadPosRankSum=-0.779;SOR=0.197;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr16	11647492	rs4280262	T	C	2865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=417;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.139;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=72;PP=2036;ReadPosRankSum=-0.835;SC=CACATTTGGATAGGGCGGTCC;SOR=0.612;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=385;TCF=202;TCR=183;TR=145;WE=11647510;WS=11647475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:265,151:0.36:416
chr16	11650325	rs3743582	G	A	6559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=117;PP=2965;SC=CCAGGGTGGAGGGCCAAGGAA;SOR=0.834;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=225;TCF=108;TCR=117;TR=225;WE=11650333;WS=11650315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr16	11769948	rs1050068	C	T	2987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=67;PP=1853;ReadPosRankSum=-2.422;SC=CCACCACGGGCGTGGTCACAG;SOR=0.668;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=281;TCF=154;TCR=127;TR=144;WE=11769956;WS=11769938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,149:0.50:300
chr16	11769963	rs1050069	C	T	3033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.409;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=69;PP=1971;ReadPosRankSum=0.997;SC=TCACAGTCATCGTCATCCTCA;SOR=0.647;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=291;TCF=157;TCR=134;TR=144;WE=11769971;WS=11769953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,152:0.48:314
chr16	11773662	rs3190321	C	G	833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.610;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.276;NF=14;NR=22;PP=476;ReadPosRankSum=0.954;SC=GTGATGGGGACGTCTTCGGGG;SOR=0.534;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=98;TCF=35;TCR=63;TR=36;WE=11773670;WS=11773652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,43:0.37:115
chr16	11773733	rs8191352	C	G	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.45;ReadPosRankSum=-0.570;SOR=0.641;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,10:0.30:33
chr16	11773743	rs7188511	G	T	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.45;ReadPosRankSum=-2.068;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr16	11797365	rs71406275	TAC	T	549.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=425;ReadPosRankSum=-0.115;SC=AGGCTTTTGATACACACACAC;SOR=0.756;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=34;TCF=18;TCR=16;TR=13;WE=11797376;WS=11797355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,29:0.63:46
chr16	11815332	rs59025803	G	A	642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=391;ReadPosRankSum=-0.133;SC=TTGAGAAAAGGAATCAAGCAA;SOR=0.763;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=46;TCF=36;TCR=10;TR=25;WE=11815340;WS=11815322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,28:0.55:51
chr16	11821051	rs147902060	AT	A	322.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=211;ReadPosRankSum=1.754;SC=TAATTAATCAATTTTTTTTCT;SOR=0.627;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=13;WE=11821059;WS=11821041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,15:0.79:19
chr16	11824056	rs11639945	T	G	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=11;PP=341;ReadPosRankSum=-0.805;SC=GACCTTCAAATAGTTATATAC;SOR=0.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=65;TCF=33;TCR=32;TR=23;WE=11824064;WS=11824046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,28:0.39:72
chr16	11828018	rs4780398	A	G	1505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=37;PP=1115;SC=ATTTAAAAATAGAATGATTCC;SOR=2.880;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=10;TCR=37;TR=47;WE=11828026;WS=11828008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr16	11836398	rs3743587	C	G	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=10;PP=287;ReadPosRankSum=-0.642;SC=AGAGCAGCTCCGGCCGCTGGC;SOR=0.743;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=38;TCF=20;TCR=18;TR=22;WE=11836406;WS=11836388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,24:0.59:41
chr16	11850003	rs7198247	A	G	4546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=50;PP=2965;SC=TGGTGACACAACGAGACTCCA;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=153;TCF=101;TCR=52;TR=151;WE=11850025;WS=11849993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr16	11852354	rs8743	A	C	2516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.909;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=65;PP=1622;ReadPosRankSum=0.825;SC=AACAGTTTCCAACATATTGAC;SOR=0.767;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=265;TCF=115;TCR=150;TR=111;WE=11852362;WS=11852344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,123:0.42:295
chr16	11859341	rs7199993	A	G	5799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=123;NR=79;PP=2965;SC=TTTGGAGAACACACCTCACAA;SOR=1.098;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=202;TCF=123;TCR=79;TR=202;WE=11859349;WS=11859331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr16	11863086	rs2287198	G	A	2554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.104;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=62;PP=1588;ReadPosRankSum=2.744;SC=TCTTGCTCAAGGTTGACACCC;SOR=0.587;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=190;TCF=77;TCR=113;TR=105;WE=11863094;WS=11863076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,115:0.55:209
chr16	11870137	rs34393518	T	TA	265.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.315;HP=9;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=103;ReadPosRankSum=1.182;SC=TCCTTCCCTTTAAAAAAAAAT;SOR=0.954;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=33;TCF=19;TCR=14;TR=9;WE=11870145;WS=11870127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,15:0.36:42
chr16	11870863	rs78968205	T	C	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.319;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=335;ReadPosRankSum=-0.804;SC=CCCCATCCTATTACCCTCCCT;SOR=1.702;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=38;TCF=9;TCR=29;TR=18;WE=11870871;WS=11870853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,20:0.47:43
chr16	11873158	rs16958654	T	C	1151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FS=1.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.26;ReadPosRankSum=0.292;SOR=0.835;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:146,73:0.33:219
chr16	11876203	rs1429077	T	C	2904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=390;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.782;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=62;PP=1782;ReadPosRankSum=-0.928;SC=CTCGGACACATTGGACATGTT;SOR=0.666;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=351;TCF=180;TCR=171;TR=134;WE=11876211;WS=11876193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:237,151:0.39:388
chr16	11940390	rs8052900	T	C	2986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=24;PP=1726;SC=TGTTTAAGACTGTTCCACCTA;SOR=1.893;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=70;TCR=24;TR=94;WE=11940398;WS=11940380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr16	11940764	rs1019814	T	C	1237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=29;PP=927;SC=AAGAAATACTTAGGCAACAAT;SOR=2.038;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=10;TCR=29;TR=39;WE=11940772;WS=11940754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr16	11940829	rs1019813	C	T	361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=258;SC=TTAATGAACACTTGAGGGCCT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=11940837;WS=11940819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	11945231	rs2075158	T	C	6526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=124;NR=94;PP=2965;SC=ACCGCCACACTGCTTCCAAGC;SOR=0.775;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=218;TCF=124;TCR=94;TR=218;WE=11945239;WS=11945221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr16	12009150	rs28653099	C	A	392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=3;PP=249;SC=CAGGGCCGCGCGCCCCCGGAC;SOR=1.329;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=12009158;WS=12009140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr16	12009279	rs424518	A	G	7673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=96;NR=61;PP=2842;SC=GGCGCCGCCAACTGGGGGTGG;SOR=1.146;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=157;TCF=96;TCR=61;TR=157;WE=12009289;WS=12009269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr16	12009304	rs11544193	C	A	9790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=126;NR=104;PP=2965;SC=GCTGCCGGGCCCCGCAGGAAG;SOR=0.781;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=230;TCF=126;TCR=104;TR=230;WE=12009312;WS=12009294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,259:1.00:259
chr16	12009530	.	CCCGCCGCCG	C,CCCGCCGCCGCCG	1261.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.870;ClippingRankSum=0.000;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=6,6;NR=11,11;PP=690,1383;ReadPosRankSum=-0.419;SC=CGCTGCTGCTCCCGCCGCCGC;SOR=0.527;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=34;TCF=11;TCR=23;TR=17,17;WE=12009549;WS=12009520;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.33,0.56:43
chr16	12009614	rs435108	G	A	2710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=60;NR=29;PP=1707;SC=ACAGAGAGCGGGAAATGGAGG;SOR=1.284;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=60;TCR=29;TR=89;WE=12009622;WS=12009604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr16	12009781	rs434762	G	A	11651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=436;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQ=59.99;NF=199;NR=207;PP=2965;SC=CGGCGGCGGCGGCAGCTCAAC;SOR=0.784;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=406;TCF=199;TCR=207;TR=406;WE=12009795;WS=12009758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,435:1.00:435
chr16	12021332	rs256390	G	A	894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=24;PP=662;ReadPosRankSum=0.213;SC=TCTTGGGTTCGGGTGGTGATT;SOR=0.655;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=73;TCR=65;TR=50;WE=12021340;WS=12021322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,52:0.34:154
chr16	12031353	rs62040806	T	C	1746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.019;HP=2;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.996;NF=57;NR=34;PP=1314;ReadPosRankSum=0.169;SC=TTTATTCTTATTTGTGATTAC;SOR=0.539;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=168;TCF=107;TCR=61;TR=91;WE=12031361;WS=12031343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,82:0.51:162
chr16	12031379	rs62040807	G	A	2954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.944;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.449;NF=81;NR=55;PP=2055;ReadPosRankSum=0.133;SC=TACCTCTACAGAAAGTTAGTA;SOR=0.618;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=257;TCF=156;TCR=101;TR=136;WE=12031398;WS=12031369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,136:0.50:271
chr16	12031390	rs677507	C	T	10374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=169;NR=111;PP=2965;SC=AAAGTTAGTACACTCACCCAA;SOR=1.103;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=280;TCF=169;TCR=111;TR=280;WE=12031398;WS=12031369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,298:1.00:298
chr16	12031448	rs636664	T	C	9275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=358;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=163;NR=163;PP=2965;SC=TTCTCGGAAATGCAATAATGA;SOR=0.762;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=326;TCF=163;TCR=163;TR=326;WE=12031456;WS=12031438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,358:1.00:358
chr16	12060163	rs373496	A	G	5709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=125;PP=2965;SC=AGGAAGATAAACTCTGAACCA;SOR=1.646;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=188;TCF=63;TCR=125;TR=188;WE=12060171;WS=12060153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr16	12136954	rs1703492	A	C	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=3.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-2.213;QD=4.66;ReadPosRankSum=1.022;SOR=0.396;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,35:0.29:121
chr16	12140339	rs149496739	G	A	4575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=108;PP=2944;ReadPosRankSum=0.699;SC=CAGGGTGCAGGGCCTTGTGAC;SOR=0.709;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=300;TCF=127;TCR=173;TR=188;WE=12140347;WS=12140329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,200:0.62:321
chr16	12142130	rs56363861	C	T	1319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=39;NR=3;PP=1022;SC=GATCAACGTGCCTCCTCTTCT;SOR=4.712;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=42;TCF=39;TCR=3;TR=42;WE=12142138;WS=12142120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr16	12142172	rs3826097	T	G	3985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.37;QD=44.29;SOR=2.758;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr16	12142175	rs3826098	C	G	3985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.37;QD=44.29;SOR=2.758;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr16	12145683	rs373216147	CT	C	261.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQRankSum=-1.806;QD=7.70;ReadPosRankSum=1.089;SOR=0.314;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,21:0.62:34
chr16	12162969	rs1641843	A	G	1907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.006;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=48;PP=1198;ReadPosRankSum=0.598;SC=ACGTTCTCCCAGATCCTGGAC;SOR=0.767;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=215;TCF=98;TCR=117;TR=85;WE=12162977;WS=12162959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,97:0.40:240
chr16	12172873	rs4352067	C	A	30.81	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.967;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr16	12296803	rs1701115	G	T	8121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=165;NR=108;PP=2965;SC=CTGGTGGCGTGGGAGGTGACA;SOR=1.198;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=274;TCF=166;TCR=108;TR=273;WE=12296811;WS=12296793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,293:1.00:293
chr16	12297234	.	A	G	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MMLQ=18;MQ=56.17;NF=199;NR=152;PP=2962;QD=20;SC=GGAGGTGACAACTCTGAAGTT;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=870;TCF=463;TCR=407;TR=351;WE=12297255;WS=12297224;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:519,351:0.40:870
chr16	12297247	.	A	G	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MMLQ=25;MQ=56.62;NF=228;NR=174;PP=2962;QD=20;SC=CTGAAGTTGTATAGTGTGGCC;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=917;TCF=481;TCR=436;TR=402;WE=12297255;WS=12297224;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:515,402:0.44:917
chr16	12297313	.	T	A	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=22;MMLQ=27;MQ=55.97;NF=114;NR=185;PP=2962;QD=20;SC=TTGTGTAGTGTGGCCTTGCTG;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=734;TCF=333;TCR=401;TR=299;WE=12297321;WS=12297303;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:435,299:0.41:734
chr16	12297442	rs141716124	T	C	3829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.361;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.843;NF=82;NR=86;PP=2128;ReadPosRankSum=-0.454;SC=GTGGCCTTGCTGTCAGGTGGA;SOR=0.572;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=305;TCF=141;TCR=164;TR=168;WE=12297450;WS=12297432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,184:0.55:333
chr16	12297562	rs1701113	G	A	1933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=44;PP=1285;SC=TTTGCTGTAAGACAACCATCC;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=14;TCR=44;TR=58;WE=12297570;WS=12297552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr16	12371915	rs12448443	T	C	4905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=100;PP=2613;ReadPosRankSum=-0.899;SC=GGAGTCTGTGTGTCTTTGTTT;SOR=1.371;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=167;TCF=66;TCR=101;TR=165;WE=12371923;WS=12371905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,188:0.99:190
chr16	12449855	rs7190509	T	C	1144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=31;NR=8;PP=809;SC=ATTGAGCTTATGGGTGGATTG;SOR=2.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=31;TCR=8;TR=39;WE=12449863;WS=12449845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr16	12449925	rs11075062	C	G	1965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=24;PP=1203;ReadPosRankSum=1.776;SC=AGATGTTTTGCTGACAGGTGT;SOR=0.688;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=128;TCF=86;TCR=42;TR=73;WE=12449933;WS=12449915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,84:0.58:144
chr16	12450163	rs4781211	C	G	764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.419;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=24;PP=496;ReadPosRankSum=-0.400;SC=CCCTGTGTGTCTGTCAAGCCT;SOR=0.257;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=55;TCF=13;TCR=42;TR=34;WE=12450171;WS=12450153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,36:0.61:59
chr16	12536703	rs11075077	A	G	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=75;ReadPosRankSum=1.222;SC=CTCCCATCTCAGCCTCACAAG;SOR=0.892;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=9;WE=12536711;WS=12536693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr16	12662328	rs2288422	C	G	2013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=359;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.849;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=50;PP=1316;ReadPosRankSum=-0.238;SC=CTTTTCATCCCCAGACTTAAC;SOR=0.634;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=315;TCF=180;TCR=135;TR=112;WE=12662336;WS=12662318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:239,120:0.33:359
chr16	12662420	rs2288423	C	T	3431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=474;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.530;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=92;PP=2248;ReadPosRankSum=0.312;SC=CTTCCCGCTTCCCCAAACTGT;SOR=0.650;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=443;TCF=216;TCR=227;TR=182;WE=12662428;WS=12662410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:286,187:0.40:473
chr16	12662586	rs1075844	AC	CA	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.185;HP=4;HapScore=1;JOINED;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=300;ReadPosRankSum=-0.924;SC=AACCACGTCCACCTGGTGATC;SOR=0.042;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=8;WE=12662595;WS=12662576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,10:0.30:33
chr16	12758966	rs1713480	T	C	8467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=115;NR=158;PP=2965;SC=GAACACGACTTTGACACCTGC;SOR=1.164;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=274;TCF=115;TCR=159;TR=273;WE=12758974;WS=12758956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,311:1.00:311
chr16	12759027	rs1713479	A	G	3200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=71;PP=2023;SC=TAGGTAACCTAGGGTCTCCAG;SOR=1.802;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=31;TCR=71;TR=102;WE=12759035;WS=12759017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr16	12897578	rs3748976	G	T	3646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.390;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=64;PP=2208;ReadPosRankSum=0.247;SC=GGGAAACGCGGCCAGGGTCCT;SOR=0.805;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=281;TCF=166;TCR=115;TR=158;WE=12897586;WS=12897568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,172:0.56:306
chr16	13002359	rs9938751	T	C	8335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=139;NR=158;PP=2965;SC=CTGCTGTTTATGGAGGCACAG;SOR=0.881;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=297;TCF=139;TCR=158;TR=297;WE=13002367;WS=13002349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,322:1.00:322
chr16	13002387	rs72782632	C	T	3018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.688;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=71;PP=1856;ReadPosRankSum=0.392;SC=TCCAAGAGGACGAACCTGCCC;SOR=0.536;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=247;TCF=116;TCR=131;TR=136;WE=13002395;WS=13002377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,148:0.55:269
chr16	13297242	rs13331224	C	T	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=3;PP=430;ReadPosRankSum=1.451;SC=TCTGTGTCTTCACTTCCAGAT;SOR=0.899;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=59;TCF=51;TCR=8;TR=25;WE=13297250;WS=13297232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,28:0.45:62
chr16	13307302	rs7195991	C	A	1284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.001;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=41;PP=859;ReadPosRankSum=-0.396;SC=CGTCTAAGTTCCAGTGTGTAG;SOR=1.405;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=102;TCF=31;TCR=71;TR=54;WE=13307310;WS=13307292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,57:0.54:106
chr16	14013993	rs1799797	T	A	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.228;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=14;PP=558;ReadPosRankSum=1.080;SC=TTCCTTCGGCTGCGTTCGGCT;SOR=0.249;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=99;TCF=73;TCR=26;TR=40;WE=14014001;WS=14013983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,40:0.39:102
chr16	14014240	rs762521	G	A	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.892;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=320;ReadPosRankSum=0.349;SC=GTGCGGCCGCGCTGGCGCGGG;SOR=1.193;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=46;TCF=11;TCR=35;TR=20;WE=14014248;WS=14014230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,21:0.46:46
chr16	14026007	rs254942	G	A	2567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=37;PP=1543;SC=TTAACTTTTCGTATTAGGTTG;SOR=1.014;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=55;TCR=37;TR=92;WE=14026015;WS=14025997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr16	14026951	rs3136130	G	T	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=1.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.54;ReadPosRankSum=-2.255;SOR=0.900;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,14:0.18:76
chr16	14031520	rs31869	G	A	502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=1;PP=349;SC=TCAAATATTTGTTATTTGAGC;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=14031528;WS=14031510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr16	14038545	rs1799799	T	C	1987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FS=0.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.946;SOR=0.623;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:126,55:0.30:181
chr16	14038552	rs1799800	G	A	2159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.05;ReadPosRankSum=-0.992;SOR=0.680;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:147,68:0.32:215
chr16	14041958	rs1799801	T	C	2677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=357;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.769;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=64;PP=1412;ReadPosRankSum=-1.925;SC=CAGCAGATTCTGAAACCCTTC;SOR=0.596;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=331;TCF=161;TCR=170;TR=132;WE=14041966;WS=14041948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:214,142:0.40:356
chr16	14678349	rs374880534	A	AC	2728.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=77;PP=2027;ReadPosRankSum=1.613;SC=AGATTCACTGACCCCCCCAAA;SOR=0.667;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=158;TCF=13;TCR=145;TR=87;WE=14678364;WS=14678339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,137:0.59:232
chr16	14700254	rs4782156	G	A	734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.65;QD=27.21;SOR=2.066;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr16	14743923	rs142713532	G	C	842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.448;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.768;NF=8;NR=25;PP=604;ReadPosRankSum=-2.692;SC=CTCACACCTGGATCCCAGCAC;SOR=0.169;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=53;TCF=9;TCR=44;TR=33;WE=14743931;WS=14743913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,34:0.61:56
chr16	14958438	rs2445646	A	G	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=343;ExcessHet=3.0103;FS=12.148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.19;MQRankSum=-5.208;QD=0.76;ReadPosRankSum=-4.714;SOR=1.499;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:293,50:0.15:343
chr16	14962298	rs200141813	A	G	827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.310;NF=26;NR=5;PP=545;ReadPosRankSum=0.935;SC=AACTGCTCCAATGATTAATGG;SOR=0.629;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=65;TCF=53;TCR=12;TR=31;WE=14962306;WS=14962288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,35:0.49:72
chr16	14969016	rs79100490	T	A	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=35.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.49;MQRankSum=-0.544;QD=2.48;ReadPosRankSum=0.515;SOR=0.024;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,24:0.23:103
chr16	15068908	rs28418438	C	G	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.509;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-1.212;NF=3;NR=11;PP=216;ReadPosRankSum=0.622;SC=TTCGGCAGCCCGCGGCGCCGC;SOR=0.165;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=38;TCF=5;TCR=33;TR=14;WE=15068916;WS=15068898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,15:0.38:39
chr16	15069202	rs71232880	T	C	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.30;MQRankSum=-5.818;QD=3.25;ReadPosRankSum=0.378;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,12:0.28:43
chr16	15082865	rs4985167	C	T	3088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.788;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.355;NF=81;NR=61;PP=1996;ReadPosRankSum=-0.265;SC=TGGTCTCGCTCCCTGTGGCTC;SOR=0.809;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=333;TCF=190;TCR=143;TR=142;WE=15082873;WS=15082855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:195,151:0.44:346
chr16	15083131	rs4985166	A	T	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FS=14.426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.18;MQRankSum=-8.602;QD=2.34;ReadPosRankSum=-2.589;SOR=1.955;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:125,28:0.18:153
chr16	15083531	rs375114359	C	A	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.485;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.935;NF=5;NR=10;PP=254;ReadPosRankSum=1.028;SC=GCCACGGGGCCAGGACCTGGG;SOR=1.110;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=9;TCR=17;TR=15;WE=15083539;WS=15083521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr16	15083569	.	C	CGCA	280.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.739;NF=0;NR=3;PP=76;ReadPosRankSum=2.030;SC=ACGCACGCGGCGCAGCAGCCC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=3;WE=15083577;WS=15083559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
chr16	15083868	rs9928601	A	C	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.304;NF=9;NR=3;PP=111;ReadPosRankSum=-0.595;SC=AGGACCAGGGAAGCAGGTGCA;SOR=0.892;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=27;TCF=18;TCR=9;TR=12;WE=15083876;WS=15083858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr16	15084045	rs71374762	G	A	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.915;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=86;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GCAAGGGCGCGAGGGCGGCCG;SOR=0.859;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=6;WE=15084053;WS=15084035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr16	15090275	rs11279533	ATATTATATG	A	667.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.99;MQRankSum=-0.393;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.728;SOR=0.787;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,22:0.30:73
chr16	15091589	rs11421981	C	CT	205.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=3.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.31;MQRankSum=1.808;QD=4.90;ReadPosRankSum=0.837;SOR=1.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,14:0.33:42
chr16	15091601	rs28545123	G	C	597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=6.579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.47;MQRankSum=-5.069;QD=7.76;ReadPosRankSum=0.276;SOR=0.245;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,36:0.47:77
chr16	15095675	rs9921162	C	A	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.480;NF=6;NR=2;PP=53;ReadPosRankSum=-0.359;SC=TTCAGAATCTCATGCATGGAG;SOR=0.760;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=8;WE=15095683;WS=15095665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr16	15098047	rs11549900	C	G	2565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.813;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.735;NF=68;NR=43;PP=1575;ReadPosRankSum=-1.587;SC=TTAACAGAATCCAAAATATTG;SOR=0.537;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=223;TCF=141;TCR=82;TR=111;WE=15098055;WS=15098037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,123:0.48:257
chr16	15100202	rs71271216	A	G	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=1.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.66;MQRankSum=-3.068;QD=5.17;ReadPosRankSum=0.985;SOR=0.466;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,24:0.26:93
chr16	15110077	rs4262938	C	T	1296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FS=0.572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.60;MQRankSum=-5.641;QD=6.39;ReadPosRankSum=0.566;SOR=0.606;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:135,68:0.33:203
chr16	15111218	rs4985162	C	T	2926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=353;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.465;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.456;NF=69;NR=63;PP=1934;ReadPosRankSum=-0.700;SC=ACTCCTGGCCCGTGGCTGGGT;SOR=0.870;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=331;TCF=173;TCR=158;TR=132;WE=15111226;WS=15111208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:209,144:0.41:353
chr16	15116400	rs4985161	T	A	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQRankSum=-3.977;QD=2.60;ReadPosRankSum=-0.214;SOR=1.005;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,9:0.18:50
chr16	15116521	rs4985160	C	T	5567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=375;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.399;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-8.755;NF=123;NR=111;PP=2962;ReadPosRankSum=3.355;SC=TCATGTCCCACGTCCATCTAA;SOR=0.653;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=344;TCF=184;TCR=160;TR=234;WE=15116529;WS=15116511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,253:0.67:375
chr16	15116625	rs1058637	G	T	2177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.664;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.087;NF=29;NR=56;PP=1377;ReadPosRankSum=0.433;SC=TAGTATATAAGTTCATCTGTT;SOR=0.791;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=137;TCF=47;TCR=90;TR=85;WE=15116633;WS=15116615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,95:0.63:150
chr16	15120411	rs62039476	T	C	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=5.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.82;MQRankSum=-5.494;QD=16.31;ReadPosRankSum=0.928;SOR=2.348;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr16	15128416	rs35811052	A	G	2338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=59;PP=1505;ReadPosRankSum=-0.622;SC=AGCAGGTAGGACGGCATAGCC;SOR=0.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=158;TCF=65;TCR=93;TR=100;WE=15128424;WS=15128406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,105:0.63:167
chr16	15129459	rs4985155	A	G	954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.922;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=20;PP=583;ReadPosRankSum=-1.508;SC=TCCCCTGTTGACTGTTACTTG;SOR=0.925;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=63;TCF=31;TCR=32;TR=37;WE=15129467;WS=15129449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,42:0.59:71
chr16	15129940	rs3198697	C	T	1265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.151;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=20;PP=785;ReadPosRankSum=0.164;SC=CAGTCAGTCACATTGAAGACT;SOR=1.080;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=193;TCF=117;TCR=76;TR=60;WE=15129948;WS=15129930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,69:0.31:221
chr16	15129970	rs7200543	A	G	3263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.042;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=57;PP=2012;ReadPosRankSum=0.543;SC=TGGAGCGCCTATCCAGTGGGC;SOR=0.348;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=206;TCF=123;TCR=83;TR=129;WE=15129978;WS=15129960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,142:0.63:225
chr16	15131962	rs1135999	A	G	1527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.575;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=27;PP=1924;ReadPosRankSum=-0.497;SC=TTATTTCCAGAAAACAGTGTG;SOR=1.012;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=149;TCF=83;TCR=66;TR=68;WE=15131982;WS=15131952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,77:0.46:169
chr16	15131974	rs1136001	G	T	1586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.146;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=33;PP=1924;ReadPosRankSum=-0.609;SC=AACAGTGTGTGAGCTGGAGAT;SOR=0.791;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=160;TCF=86;TCR=74;TR=74;WE=15131982;WS=15131952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,84:0.46:182
chr16	15132108	rs2740	A	G	1173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.851;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=24;PP=616;ReadPosRankSum=0.186;SC=AGCCAACCTTACTGTCCCCTG;SOR=0.422;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=85;TCF=39;TCR=46;TR=49;WE=15132116;WS=15132098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,55:0.60:91
chr16	15132211	rs111536178	A	AAAAGTTG	160.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=232;ReadPosRankSum=-0.345;SC=TTAGTAAGAAAAAAGTTGATT;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=4;WE=15132219;WS=15132201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr16	15133783	rs34345533	C	CT	608.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.11;MQRankSum=1.159;QD=6.62;ReadPosRankSum=-0.514;SOR=0.673;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,35:0.38:92
chr16	15133889	rs14347	T	G	4340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=382;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.972;NF=107;NR=84;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.334;SC=CTTGAAAGGATGCTCTGTAAA;SOR=0.683;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=361;TCF=205;TCR=156;TR=191;WE=15133897;WS=15133879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:184,197:0.52:381
chr16	15135071	rs7498279	G	A	684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=20;PP=558;SC=GGAGCTCCTCGATGCAGAAAG;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=15135079;WS=15135061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr16	15135269	rs9926473	T	G	693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=1;PP=499;SC=TCCTTCCTGGTAGACGAGGGG;SOR=3.352;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=15135277;WS=15135264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	15155898	rs2966157	T	C	705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=17;PP=499;SC=AAAGCCAGTGTAGTGGCACAC;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=15155906;WS=15155888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr16	15162143	.	TA	T	354.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.528;ClippingRankSum=0.000;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=4.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.51;MQRankSum=-0.584;QD=3.81;ReadPosRankSum=1.471;SOR=0.493;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,27:0.29:93
chr16	15168760	rs4985147	T	C	730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=20;PP=445;SC=AAAAATTCAATGTCAAAGTGG;SOR=1.942;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=28;WE=15168768;WS=15168750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr16	15173746	rs2941253	G	A	934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=2;PP=731;SC=GAGTCACCACGCCTGGCCAAG;SOR=4.548;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=29;WE=15173754;WS=15173736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr16	15178688	rs8061051	C	A	1143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=31;PP=905;SC=TTTGGGAGGCCGAGGTGGGTG;SOR=4.294;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=34;WE=15178696;WS=15178678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr16	15187912	rs11075256	G	C	2445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=15;PP=1385;SC=CACGCCATGAGCTTTGTCCCA;SOR=1.775;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=75;TCF=59;TCR=16;TR=74;WE=15187920;WS=15187902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr16	15493046	rs153001	G	A	437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=2;PP=306;SC=AATGAGGCACGTAAACTACAT;SOR=3.126;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=15493054;WS=15493038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	15596142	rs12448500	G	C	3634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=50;PP=2005;SC=TAGCCAGGATGTGAAGCCTGT;SOR=0.708;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=63;TCR=50;TR=113;WE=15596150;WS=15596132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr16	15626831	rs12918517	C	T	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.231;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=370;ReadPosRankSum=1.000;SC=CATTCTACCTCTGCCATTTAT;SOR=1.447;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=20;WE=15626839;WS=15626821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
chr16	15626960	rs12919246	A	G	1822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=39;PP=975;ReadPosRankSum=0.362;SC=GAGATCAAGCATATTAAGTGC;SOR=0.645;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=104;TCF=48;TCR=56;TR=74;WE=15626968;WS=15626950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,84:0.72:116
chr16	15680642	rs2071332	C	T	2571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.288;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=48;PP=1407;ReadPosRankSum=-0.321;SC=GGGGCTGGCACTGATCAAGGA;SOR=0.368;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=143;TCF=72;TCR=71;TR=102;WE=15680650;WS=15680632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,113:0.71:160
chr16	15695059	rs2071331	A	G	1572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.638;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=40;PP=909;ReadPosRankSum=-0.543;SC=ACATGTGCACACCGTCGCCAG;SOR=0.464;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=110;TCF=34;TCR=76;TR=61;WE=15695067;WS=15695049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,69:0.58:119
chr16	15696480	rs71293163	A	AAGGAAAGAAGGAGGGAGGCAGAG	1691.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=7.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.43;ReadPosRankSum=1.555;SOR=1.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,30:0.47:64
chr16	15705605	rs7185421	A	G	1452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=40;PP=1019;ReadPosRankSum=0.819;SC=CAAAGCAAATAGTTTATTTAT;SOR=0.719;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=103;TCF=38;TCR=65;TR=62;WE=15705613;WS=15705595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,64:0.59:108
chr16	15718591	rs2071333	G	A	921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=5;PP=674;ReadPosRankSum=-0.623;SC=CCTATTACATGTAACCACCCC;SOR=0.514;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=53;TCR=8;TR=37;WE=15718599;WS=15718581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,38:0.60:63
chr16	15724113	rs3752422	C	T	1436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.682;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=15;PP=829;ReadPosRankSum=-0.816;SC=GCCTGGCAACCCCCTTATTAT;SOR=1.184;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=110;TCF=74;TCR=36;TR=54;WE=15724131;WS=15724103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,64:0.51:125
chr16	15727459	rs5815838	AT	A	872.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=1.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.41;MQRankSum=1.435;QD=11.48;ReadPosRankSum=-0.338;SOR=0.922;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,48:0.63:76
chr16	15771601	rs6498567	T	C	1304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=15;PP=764;ReadPosRankSum=-0.660;SC=TGTGCTACTGTGTCTAGCCTT;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=52;TCR=22;TR=50;WE=15771609;WS=15771591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,55:0.66:83
chr16	15781054	rs8044738	A	G	2239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.106;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=41;PP=1207;ReadPosRankSum=-1.131;SC=CCCATTCTGCAGGTAAAGAGC;SOR=0.688;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=171;TCF=90;TCR=81;TR=92;WE=15781062;WS=15781044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,109:0.55:198
chr16	15811023	rs1050163	C	T	3918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.163;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=79;PP=2326;ReadPosRankSum=0.319;SC=CCTGCTCCTCCAGCTGTGCAA;SOR=0.570;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=274;TCF=140;TCR=134;TR=167;WE=15811031;WS=15811013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,182:0.60:304
chr16	15811062	rs1050162	C	T	3835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=85;PP=2362;ReadPosRankSum=1.260;SC=CGATGGTGGACTTGAACTTGG;SOR=0.718;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=283;TCF=143;TCR=140;TR=169;WE=15811070;WS=15811052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,179:0.58:310
chr16	15813211	rs11646134	G	T	955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=32;PP=721;ReadPosRankSum=0.667;SC=GAAAGGCCAAGCCCCACCAAG;SOR=0.573;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=69;TCF=13;TCR=56;TR=40;WE=15813219;WS=15813201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,40:0.58:69
chr16	15813633	rs17284411	G	A	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.291;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=20;PP=416;ReadPosRankSum=1.653;SC=CTGCTGCCCAGTTCAGCTTTG;SOR=0.960;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=27;WE=15813641;WS=15813623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,28:0.62:45
chr16	15813945	rs2075512	C	T	1068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.982;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=9;PP=737;ReadPosRankSum=-1.997;SC=CTGCTGACTTCGGTGGCCTGA;SOR=0.933;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=81;TCF=62;TCR=19;TR=43;WE=15813953;WS=15813935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,45:0.54:83
chr16	15818141	rs2075511	A	C	2333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.900;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=42;PP=1063;ReadPosRankSum=-1.460;SC=GTTTATCATAAGCGGCCGCCT;SOR=0.583;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=156;TCF=83;TCR=73;TR=98;WE=15818149;WS=15818131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,109:0.61:178
chr16	15818310	rs11130	G	A	525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.141;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=16;PP=286;ReadPosRankSum=-1.559;SC=GGGACCATGAGTGGCCCCTGT;SOR=0.913;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=45;TCF=17;TCR=28;TR=25;WE=15818318;WS=15818300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,27:0.56:48
chr16	15838940	rs2384934	G	C	3845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=67;PP=2319;ReadPosRankSum=-1.577;SC=GAGTGAAGAAGCAGGGCTGGG;SOR=0.694;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=251;TCF=145;TCR=106;TR=159;WE=15838948;WS=15838930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,177:0.63:281
chr16	15843899	rs6498570	G	A	1821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.816;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=37;PP=1170;ReadPosRankSum=0.508;SC=TGGGGTCCTCGGGGTAGGTGG;SOR=0.687;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=162;TCF=87;TCR=75;TR=82;WE=15843915;WS=15843889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,89:0.49:183
chr16	15865472	rs4781689	G	A	1092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.052;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=15;PP=694;ReadPosRankSum=2.032;SC=TGGCCTCCACGGTTTCCTGGA;SOR=1.022;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=71;TCF=48;TCR=23;TR=47;WE=15865480;WS=15865462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,49:0.64:77
chr16	15869801	rs2072619	T	C	800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=8;PP=504;ReadPosRankSum=-0.491;SC=TGAAGAACTGTTCATATGTCA;SOR=0.805;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=53;TCF=39;TCR=14;TR=33;WE=15869809;WS=15869791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,35:0.60:58
chr16	15961192	rs12598941	C	T	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=60;ReadPosRankSum=-0.126;SC=GTAGAAACTCCAATTTCTACA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=4;WE=15961200;WS=15961182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr16	15961351	rs15784	T	C	3039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.98;ReadPosRankSum=0.216;SOR=0.666;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,76:0.65:117
chr16	15961356	rs12598966	C	T	3106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.11;ReadPosRankSum=-0.363;SOR=0.628;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,79:0.66:119
chr16	15961369	rs60244915	G	A	1629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=28;PP=2744;ReadPosRankSum=-0.212;SC=TTCTTAGGTGGTCATCTGAAA;SOR=0.673;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=99;TCF=53;TCR=46;TR=62;WE=15961377;WS=15961341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,75:0.66:114
chr16	15961513	rs12599003	C	A	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.537;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=7;PP=120;ReadPosRankSum=-0.312;SC=ATGAAAAAAACCCATTATTTT;SOR=0.582;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=9;WE=15961521;WS=15961503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr16	15967224	rs7193885	A	C	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.860;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=73;ReadPosRankSum=1.531;SC=CATAGGCTAGACATATTAGAT;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=5;WE=15967232;WS=15967214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr16	15967361	rs10656021	T	TCTA	6868.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-1.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.268;NF=30;NR=47;PP=2966;ReadPosRankSum=-2.413;SC=TTGGCTTTCTTCTACTAGGTT;SOR=0.713;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=165;TCF=58;TCR=107;TR=77;WE=15967369;WS=15967351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,174:0.58:299
chr16	15973605	rs12597051	T	C	431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.552;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=294;ReadPosRankSum=-0.046;SC=AAAACCACCATGGTGCAATTA;SOR=2.531;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=14;WE=15973613;WS=15973595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
chr16	15973628	rs12596557	A	G	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.552;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=459;ReadPosRankSum=0.840;SC=ACTCAATACAATATGTGGAAA;SOR=1.991;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=42;TCF=32;TCR=10;TR=24;WE=15973636;WS=15973618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,25:0.56:45
chr16	15973653	rs12597053	T	A	1180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=2.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.40;ReadPosRankSum=-1.211;SOR=0.995;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,52:0.63:82
chr16	15973653	.	TG	AT	773	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=7;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=31;NR=13;PP=773;QD=18.7833607923;SC=TTTAAAAAAATGTCTTACATT;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=76;TCF=52;TCR=24;TR=44;WE=15973662;WS=15973643;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:32,44:0.58:76
chr16	15973654	rs8045082	G	T	3144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.89;SOR=1.638;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr16	15973774	rs12598817	C	G	2199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.792;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=56;PP=1503;ReadPosRankSum=0.843;SC=TGAGAACACTCAGTCTATTAA;SOR=1.008;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=156;TCF=69;TCR=87;TR=95;WE=15973782;WS=15973764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,99:0.61:161
chr16	15982258	rs3213476	A	G	3053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-4.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.590;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=45;PP=1868;ReadPosRankSum=-1.498;SC=CGCACGGGCCAAGACAGCAGC;SOR=0.322;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=207;TCF=142;TCR=65;TR=127;WE=15982266;WS=15982248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,147:0.64:230
chr16	16101614	rs45538832	C	T	803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.519;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=7;PP=527;ReadPosRankSum=0.362;SC=ATGCTCCAGGCGAGCTCCTGT;SOR=0.152;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=55;TCF=46;TCR=9;TR=33;WE=16101622;WS=16101604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,35:0.59:59
chr16	16108282	rs4148337	T	C	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.249;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=239;ReadPosRankSum=1.617;SC=CCAGCCTGGGTGACAAGAGTG;SOR=1.055;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=39;TCF=26;TCR=13;TR=16;WE=16108290;WS=16108272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,17:0.37:46
chr16	16110244	rs185005	C	G	1448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.90;SOR=3.193;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr16	16110253	rs246215	T	C	1668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.70;SOR=2.476;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
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chr16	16138322	rs246221	T	C	1048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.917;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=15;PP=519;ReadPosRankSum=-2.100;SC=CGGTGAAGGTTGTGTACTCCT;SOR=0.567;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=65;TCF=44;TCR=21;TR=40;WE=16138330;WS=16138312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,46:0.61:76
chr16	16139714	rs35587	T	C	3550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.260;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=56;PP=1761;ReadPosRankSum=-0.068;SC=AGTTCGTGAATGACACGAAGG;SOR=0.878;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=222;TCF=128;TCR=94;TR=140;WE=16139722;WS=16139704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,161:0.65:249
chr16	16139878	rs35588	A	G	2233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.380;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=53;PP=1320;ReadPosRankSum=0.243;SC=AAGGTAGGGGACGCTGTGCCA;SOR=0.481;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=134;TCF=51;TCR=83;TR=88;WE=16139886;WS=16139868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,95:0.67:142
chr16	16142224	rs45494903	C	T	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=217;ReadPosRankSum=-0.557;SC=GGCAGTGGGCCGAGGGAGTGG;SOR=0.920;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=14;WE=16142232;WS=16142214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr16	16149871	rs35595	G	A	1121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=7;PP=785;ReadPosRankSum=-1.177;SC=AAGTTTATGAGAAAAATAGCT;SOR=0.684;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=56;TCF=47;TCR=9;TR=41;WE=16149879;WS=16149861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,43:0.74:58
chr16	16161928	rs4148348	G	A	1768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.377;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=23;PP=1075;ReadPosRankSum=0.017;SC=GAGGGCCCAAGCGCGTCTCCA;SOR=0.577;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=138;TCF=94;TCR=44;TR=72;WE=16161936;WS=16161918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,80:0.54:148
chr16	16161976	rs35604	G	A	9352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=187;NR=134;PP=2965;SC=ACTCTCACTCGGGGCACAGCA;SOR=1.039;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=321;TCF=187;TCR=134;TR=321;WE=16161984;WS=16161966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,346:1.00:346
chr16	16162019	rs35605	T	C	12808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=481;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=235;NR=206;PP=2965;SC=GCAGGTGGCCTTGTGCACATT;SOR=0.789;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=441;TCF=235;TCR=206;TR=441;WE=16162027;WS=16162009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,480:1.00:480
chr16	16184232	rs2074087	C	G	3779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=47;PP=2328;SC=CATGTGCACTCACGTGGCCGG;SOR=1.049;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=123;TCF=76;TCR=47;TR=122;WE=16184240;WS=16184222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr16	16200756	rs11075296	C	T	1598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=33;PP=985;SC=TAAGTGATGACAGTGGCTGGA;SOR=1.823;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=17;TCR=33;TR=50;WE=16200764;WS=16200746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr16	16205449	rs3851716	G	A	629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=19;PP=483;SC=GGTTGGTGCCGCTGTCTCCCA;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=16205457;WS=16205439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr16	16230290	rs212087	G	A	1305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=8;PP=836;ReadPosRankSum=-1.342;SC=CCATGTCAGCGTGACACAGGT;SOR=0.653;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=72;TCF=58;TCR=14;TR=45;WE=16230298;WS=16230280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,52:0.65:80
chr16	16244129	rs212097	T	C	4343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=73;NR=71;PP=2486;SC=GAGAGGCTCTTTGGACACCAG;SOR=0.794;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=144;TCF=73;TCR=71;TR=144;WE=16244137;WS=16244119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr16	16251435	rs3896244	G	A	1647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=15;PP=1091;SC=CTGTGGAGGTGGCTGGTGCCC;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=42;TCR=15;TR=57;WE=16251443;WS=16251425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr16	16251599	rs2238472	C	T	1463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.829;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=33;PP=867;ReadPosRankSum=-0.990;SC=CCCAAAGTCCCGGAACTCGAT;SOR=0.608;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=166;TCF=89;TCR=77;TR=66;WE=16251607;WS=16251589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,75:0.40:188
chr16	16253283	rs56822940	GC	G	2451.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.364;NF=40;NR=20;PP=1127;ReadPosRankSum=0.796;SC=GGGACCCATTGCCCCCCCCCA;SOR=1.426;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=74;TCF=46;TCR=28;TR=60;WE=16253291;WS=16253273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,86:0.97:89
chr16	16255195	rs3851721	T	G	256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=8;NR=1;PP=162;SC=ACACACCATGTTGGTTTGGAC;SOR=2.303;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=16255203;WS=16255189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr16	16263837	rs7201980	T	C	248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=8;PP=153;SC=CAGACCTCACTGGTTCTCCCG;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=16263845;WS=16263827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr16	16267079	rs11866320	A	G	725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=4;PP=601;SC=TTTGGTGGGAAGACTTGGGCC;SOR=3.442;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=25;WE=16267087;WS=16267069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr16	16271357	rs6416668	T	C	9518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=365;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=171;NR=156;PP=2965;SC=AGAAGACACATGAGGGCCCCC;SOR=0.755;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=327;TCF=171;TCR=156;TR=327;WE=16271370;WS=16271347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,365:1.00:365
chr16	16272508	rs2283508	G	A	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.764;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=96;ReadPosRankSum=0.350;SC=TTGTTACATAGCATTGTCACA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=8;WE=16272516;WS=16272498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr16	16272670	rs7500834	T	C	4555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=83;NR=69;PP=2630;SC=CCTGGAGTAGTCCACCAGGCC;SOR=0.705;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=83;TCR=69;TR=152;WE=16272678;WS=16272660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr16	16278695	rs2239323	A	T	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=0.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.02;ReadPosRankSum=-1.622;SOR=0.799;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,37:0.34:108
chr16	16278863	rs8058694	G	T	2634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FS=1.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.43;ReadPosRankSum=2.097;SOR=0.792;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:136,76:0.36:212
chr16	16278869	rs8058696	G	C	2578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.43;ReadPosRankSum=2.155;SOR=0.720;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:122,70:0.36:192
chr16	16280889	rs7192265	C	T	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.568;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.89;ReadPosRankSum=0.748;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr16	16280895	rs7192961	A	G	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=17.29;ReadPosRankSum=-0.841;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr16	16280921	rs8056103	T	C	824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=6;PP=450;SC=CATTATGGGCTGGGGTGGCCC;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=27;WE=16280929;WS=16280911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr16	16281007	rs12931472	A	G	1275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.992;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=21;PP=894;ReadPosRankSum=-0.470;SC=TGAGTCTACGACACCAGGGTC;SOR=0.881;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=155;TCF=100;TCR=55;TR=58;WE=16281015;WS=16280997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,65:0.37:174
chr16	16281154	rs4369696	C	A	654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.517;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=21;PP=337;ReadPosRankSum=0.545;SC=TGTGTGGCAACAGCTTCCTGT;SOR=0.978;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=119;TCF=48;TCR=71;TR=34;WE=16281162;WS=16281144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,40:0.30:135
chr16	16284272	rs7193932	C	T	2403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=46;PP=1341;SC=CAGTTGAGAACTCTTCCCTGC;SOR=1.338;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=32;TCR=46;TR=78;WE=16284280;WS=16284262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr16	16286614	rs6498618	G	C	3220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=37;PP=2114;SC=TCTCCCCTCCGCATCTCCCAC;SOR=1.417;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=71;TCR=37;TR=108;WE=16286622;WS=16286604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr16	16291858	rs12929920	G	C	6717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=141;NR=100;PP=2965;SC=TTCAAATCCCGTCTTCCTCCT;SOR=1.138;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=241;TCF=141;TCR=100;TR=241;WE=16291879;WS=16291848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr16	16291871	rs9940089	G	C	7940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=161;NR=127;PP=2965;SC=TTCCTCCTCTGGCATACCTGC;SOR=0.978;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=288;TCF=161;TCR=127;TR=288;WE=16291879;WS=16291848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,300:1.00:300
chr16	16291971	rs9940825	C	T	1935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.899;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=57;PP=2848;ReadPosRankSum=-0.021;SC=GCTGCACGTCCACGGACACCA;SOR=0.767;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=295;TCF=140;TCR=155;TR=105;WE=16291991;WS=16291961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:207,110:0.35:317
chr16	16291983	rs9930886	A	G	1844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.097;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=54;PP=2848;ReadPosRankSum=-2.008;SC=CGGACACCAGATTGACCACAT;SOR=0.834;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=256;TCF=118;TCR=138;TR=95;WE=16291991;WS=16291961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,101:0.36:279
chr16	16297168	.	C	T	54	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=25;MQ=40.46;NF=5;NR=0;PP=54;QD=17.7542425094;SC=GAGCACCAGACGTATAGGCAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=5;WE=16297176;WS=16297159;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr16	16306192	rs116914614	G	T	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=1.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.18;MQRankSum=-1.570;QD=9.18;ReadPosRankSum=-1.210;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr16	17190040	rs3889206	G	T	1151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.241;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.564;NF=36;NR=8;PP=741;ReadPosRankSum=1.472;SC=TTGAAAATCCGTCAGAATAAT;SOR=1.598;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=75;TCF=58;TCR=17;TR=44;WE=17190048;WS=17190030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,46:0.58:79
chr16	17221423	rs4782034	C	T	1037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=7;PP=796;SC=TCCAAGTCCTCTTCTCCTCCA;SOR=2.368;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=34;WE=17221431;WS=17221413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr16	17221755	rs3812961	T	G	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=145;ReadPosRankSum=0.042;SC=GGGCCCAAGGTGTGTAGGATC;SOR=0.593;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=9;WE=17221763;WS=17221745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr16	17228368	rs12708815	G	A	2688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.170;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=49;PP=1800;ReadPosRankSum=3.202;SC=GGGACGTCTCGGCCCGTCGAA;SOR=0.893;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=279;TCF=162;TCR=117;TR=123;WE=17228376;WS=17228358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,131:0.43:302
chr16	17294295	rs11075341	C	T	2597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=11;PP=1715;SC=GACGGACAGACCCCGAAGAAA;SOR=2.993;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=69;TCR=11;TR=80;WE=17294303;WS=17294285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr16	17432427	rs4782002	T	C	2829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.978;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=68;PP=1758;ReadPosRankSum=0.461;SC=CTGTTCTCTGTCGGGAATGGT;SOR=0.827;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=255;TCF=117;TCR=138;TR=122;WE=17432435;WS=17432417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,136:0.48:284
chr16	17564311	rs61758388	C	A	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.556;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=13;PP=425;ReadPosRankSum=-0.303;SC=GCGGGCAGTGCCCCCCGGCTG;SOR=0.654;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=59;TCF=31;TCR=28;TR=31;WE=17564319;WS=17564301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,37:0.53:70
chr16	18823379	rs2606556	T	C	5185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=88;PP=2922;SC=CAAGATTTTTTTGGATCAGCT;SOR=1.073;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=160;TCF=72;TCR=88;TR=160;WE=18823387;WS=18823369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr16	19041491	rs4381586	T	C	860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=20;NR=6;PP=529;SC=ACTACTCTTCTGGTTCCCTGC;SOR=2.019;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=26;WE=19041499;WS=19041481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr16	19041595	rs28583298	G	A	1254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.606;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=25;PP=691;ReadPosRankSum=-0.554;SC=ACCATTGATGGGGTGAAATTT;SOR=0.624;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=130;TCF=75;TCR=55;TR=57;WE=19041603;WS=19041585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,65:0.43:150
chr16	19046960	rs12933286	T	C	3475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=43;PP=2063;SC=TCTTTTGCTGTTGTTTCTATA;SOR=1.232;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=74;TCR=43;TR=117;WE=19046968;WS=19046950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr16	19063220	rs200146213	AT	A	43.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.21;MQRankSum=-0.586;QD=1.99;ReadPosRankSum=2.684;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr16	19079037	rs17357834	G	A	1450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.06;ReadPosRankSum=-3.072;SOR=0.714;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:109,71:0.39:180
chr16	19079095	rs4531717	T	G	1319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=29;PP=902;SC=CCTGCGCCGGTCTAGCGAGCT;SOR=2.200;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=41;TCF=11;TCR=30;TR=40;WE=19079103;WS=19079085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr16	19079997	.	AAAG	A	75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;FR=0.9998;HP=17;HapScore=2;MGOF=32;MMLQ=27;MQ=67.64;NF=2;NR=0;PP=75;QD=39.0;SC=AAAAAAAAAAAAAGAAATTTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=19080007;WS=19079991;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr16	19080000	rs78371372	G	A	34.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=70.00;QD=17.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr16	19080227	rs75015998	C	CTG	3239.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.49;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=21;PP=1322;SC=AAAAAACAAACAAATTAAAAA;SOR=0.720;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=25;WE=19080235;WS=19080217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr16	19083221	rs4782202	A	G	6496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=139;NR=81;PP=2965;SC=TTACCTGATCATAACGAAGAA;SOR=1.283;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=220;TCF=139;TCR=81;TR=220;WE=19083229;WS=19083211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr16	19089562	rs8051232	C	G	353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=4.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=247;ReadPosRankSum=-0.353;SC=GTACAGTTATCGTTGTACTTT;SOR=0.716;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=14;WE=19089570;WS=19089552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,15:0.39:38
chr16	19183957	.	CT	C	320.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.254;ClippingRankSum=0.000;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQRankSum=1.241;QD=5.01;ReadPosRankSum=0.937;SOR=0.773;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,26:0.41:64
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chr16	19333111	rs8049175	T	C	6385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=134;NR=76;PP=2965;SC=GGCCAAATATTATTCAGGGTG;SOR=1.371;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=210;TCF=134;TCR=76;TR=210;WE=19333119;WS=19333101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr16	19333153	rs8047832	A	C	8730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.03;NF=154;NR=159;PP=2965;SC=ACATTTGAATAGGTAGACTGA;SOR=0.748;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=313;TCF=154;TCR=159;TR=313;WE=19333161;WS=19333143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,335:1.00:335
chr16	19333224	rs8048432	G	A	2039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.583;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.834;NF=41;NR=55;PP=1203;ReadPosRankSum=-0.277;SC=TGCCCAACTAGAACTAAAAGG;SOR=0.580;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=235;TCF=93;TCR=142;TR=96;WE=19333249;WS=19333214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,105:0.42:253
chr16	19333241	rs6497343	G	C	5442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=66;NR=114;PP=2962;SC=AAGGCTGACCGTCCCCTGAAT;SOR=1.420;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=181;TCF=66;TCR=115;TR=180;WE=19333249;WS=19333214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr16	19455284	rs8052298	T	C	493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=47;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=2;PP=425;SC=GATGGATAAATGGATGGATAA;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=19;WE=19455292;WS=19455274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	19455318	rs144130376	AATGGATGG	A	1748.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5780;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=12;NR=10;PP=1535;SC=TACATGATTGAATGGATGGAT;SOR=1.900;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=29;TCF=15;TCR=14;TR=22;WE=19455337;WS=19455308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr16	19455615	rs4782247	G	A	1074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=23;PP=696;SC=GGAAAAAACTGAAATCACTGG;SOR=1.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=10;TCR=23;TR=33;WE=19455623;WS=19455605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr16	19460842	rs6497373	A	G	8168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=127;NR=142;PP=2965;SC=AATCGGCAATATCTCCTTCCT;SOR=0.927;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=269;TCF=127;TCR=142;TR=269;WE=19460850;WS=19460832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,302:1.00:302
chr16	19471665	rs6497375	T	C	13420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=497;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=217;NR=243;PP=2965;SC=AGGTATGGACTAAAGGCTTTT;SOR=0.853;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=460;TCF=217;TCR=243;TR=460;WE=19471673;WS=19471655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,497:1.00:497
chr16	19481234	rs4444328	T	G	670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=9.271;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.64;ReadPosRankSum=0.246;SOR=1.509;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,29:0.94:31
chr16	19485435	rs78883216	C	A	635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.390;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=368;ReadPosRankSum=-0.247;SC=TTCTCTCCCCCATCCCCTGCA;SOR=0.298;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=38;TCF=32;TCR=6;TR=24;WE=19485443;WS=19485425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,28:0.65:43
chr16	19503598	rs1475962	C	T	7090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=124;NR=115;PP=2965;SC=CCTTTTTAAACGCTGTATAAA;SOR=0.724;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=240;TCF=124;TCR=116;TR=239;WE=19503606;WS=19503588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
chr16	19503770	rs1967950	T	G	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.43;SOR=5.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	19503773	rs1967951	T	G	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.43;SOR=5.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	19505406	rs1475964	T	C	493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=3;PP=303;SC=GGGGATAATTTGGTTTTACTG;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=19505414;WS=19505396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr16	19505730	rs2245423	T	C	2734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=58;PP=1848;SC=GGACACGAGCTTGCCTCCATG;SOR=2.200;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=20;TCR=58;TR=78;WE=19505738;WS=19505720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr16	19505751	rs2856608	G	A	1582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=6;NR=40;PP=1106;SC=TAAAAAGCGCGTCAGAGAACT;SOR=3.570;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=6;TCR=40;TR=46;WE=19505759;WS=19505741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr16	19508573	rs2187659	A	G	3187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.87;SOR=2.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr16	19508583	rs2187660	C	G	2726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.70;SOR=3.877;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr16	19509333	rs2245086	C	T	8854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=149;NR=160;PP=2965;SC=GGGGAGGAGACGAAAATGGAA;SOR=0.835;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=309;TCF=149;TCR=160;TR=309;WE=19509341;WS=19509323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,330:1.00:330
chr16	19547747	rs226891	C	G	8730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=148;NR=117;PP=2965;SC=GAGGTAGTATCAACAGAATTG;SOR=0.939;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=266;TCF=148;TCR=118;TR=265;WE=19547755;WS=19547737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,297:1.00:297
chr16	19553183	rs17325092	T	C	4046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=89;NR=48;PP=2228;SC=AGGTTTAGCATGTTACAATAA;SOR=1.304;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=139;TCF=89;TCR=50;TR=137;WE=19553191;WS=19553173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr16	19580490	rs62026186	T	C	4355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=47;PP=2812;SC=GCTGTAGCCATCTCAGTCCAG;SOR=1.475;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=94;TCR=47;TR=140;WE=19580498;WS=19580480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr16	19598562	rs111461972	G	A	1069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=14;PP=707;ReadPosRankSum=-0.846;SC=CCAACACTGGGGATTACAATT;SOR=0.684;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=71;TCF=48;TCR=23;TR=44;WE=19598570;WS=19598552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,47:0.64:74
chr16	19640099	rs138081043	TTTTA	T	2371.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.02;QD=43.92;SOR=2.137;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr16	19653534	rs11647156	A	C	625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=0;PP=496;SC=TCTGTCTCAAAAGTTTAAAAA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=19653542;WS=19653525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	19653700	rs11643482	T	C	11067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=414;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=209;NR=179;PP=2965;SC=TTGACTTTTATCTTTAAATGT;SOR=0.815;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=388;TCF=209;TCR=179;TR=388;WE=19653708;WS=19653684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,414:1.00:414
chr16	19663269	rs875648	T	C	6127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=118;NR=101;PP=2965;SC=GTTGCACTGCTAGCGTTAATG;SOR=0.832;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=220;TCF=118;TCR=102;TR=219;WE=19663277;WS=19663259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr16	19680414	rs957675	C	T	940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=2;PP=764;SC=CTTCAGGCCACGTGAAGAAGA;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=31;WE=19680422;WS=19680404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr16	19680546	rs957676	T	C	6759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=123;NR=96;PP=2965;SC=TTAATATTGATGGGAAGATGC;SOR=0.875;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=219;TCF=123;TCR=96;TR=219;WE=19680554;WS=19680536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr16	19693729	rs3815036	C	T	1766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=36;PP=1006;SC=GAGCCTCCCCCACCAAACCAT;SOR=1.646;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=21;TCR=36;TR=57;WE=19693737;WS=19693719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr16	19799962	rs4782283	T	A	317.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=0;PP=297;SC=CTGTTTTTTTTAAAAAAATCC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=19799970;WS=19799961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	19868687	rs2729	G	C	443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=5;PP=315;SC=TCTGCCCATGGTTTACAGCCT;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=11;TCR=5;TR=16;WE=19868695;WS=19868677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr16	19883082	rs172907	A	G	2649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=20;PP=1827;SC=GAAGAAGAGTATCTTTTGAGA;SOR=1.954;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=62;TCR=20;TR=82;WE=19883090;WS=19883072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr16	19884285	rs2240047	C	T	787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=24;PP=646;SC=CAAGCGCACACGGCACCTTTG;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=26;WE=19884293;WS=19884275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr16	20015634	rs2764782	A	G	633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.823;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=0;PP=453;ReadPosRankSum=-0.677;SC=ATTTATTGAGAGTCCTTTATG;SOR=2.267;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=21;WE=20015642;WS=20015624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,24:0.59:41
chr16	20043330	rs2147865	T	C	3514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.966;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=63;PP=2330;ReadPosRankSum=-1.682;SC=ACATGATGTGTACCAGCCAGC;SOR=0.698;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=234;TCF=123;TCR=111;TR=136;WE=20043338;WS=20043320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,151:0.59:257
chr16	20052123	rs1379575	G	A	4187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.868;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=90;PP=2716;ReadPosRankSum=-1.327;SC=GAACTTTTTTGATTGCAATGG;SOR=0.632;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=293;TCF=143;TCR=150;TR=179;WE=20052131;WS=20052113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,192:0.60:318
chr16	20322425	rs11647569	T	C	463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=3;PP=324;SC=CTAACCTAGCTTGGCCTTGAT;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=20322447;WS=20322415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr16	20322439	rs11642182	A	G	624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=3;PP=464;SC=CCTTGATTCTATTAATACCAA;SOR=3.056;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=20322447;WS=20322415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	20328685	rs1129818	T	C	2685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.790;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=72;PP=1930;ReadPosRankSum=-0.819;SC=TGGAATCACGTTGATTTGAGC;SOR=0.871;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=193;TCF=76;TCR=117;TR=114;WE=20328693;WS=20328675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,117:0.57:205
chr16	20334679	rs4411505	C	T	2474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.242;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=30;PP=1571;ReadPosRankSum=-0.036;SC=GTGCCCCTAACTGGGGTAATT;SOR=1.112;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=192;TCF=131;TCR=61;TR=109;WE=20334687;WS=20334669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,114:0.56:204
chr16	20334807	rs368914613	AC	A	5652.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=448;ExcessHet=3.0103;FS=13.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.53;MQRankSum=3.493;QD=13.99;ReadPosRankSum=2.946;SOR=0.323;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:122,282:0.70:404
chr16	20334932	rs4393582	G	A	2388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=66;PP=1970;SC=TTTATAAACTGGGAAATTTCA;SOR=4.558;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=7;TCR=66;TR=73;WE=20334940;WS=20334922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr16	20335325	rs12930599	G	A	4440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=344;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=102;NR=88;PP=2778;ReadPosRankSum=0.528;SC=ACATGGGAGCGTCTGTCTGGC;SOR=0.706;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=321;TCF=175;TCR=146;TR=190;WE=20335333;WS=20335315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,201:0.59:343
chr16	20339131	rs4643330	T	C	1663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=3.411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.53;ReadPosRankSum=0.849;SOR=0.450;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,77:0.63:123
chr16	20355651	rs8054296	G	A	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=221;ReadPosRankSum=-0.392;SC=GTGGCCGGGCGCATTAGCTCA;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=12;WE=20355659;WS=20355641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,12:0.80:15
chr16	20359633	rs28544423	C	T	3685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=456;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.129;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=89;PP=2236;ReadPosRankSum=0.447;SC=CCTCACACGTCCCCTCCACGG;SOR=0.508;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=432;TCF=229;TCR=203;TR=176;WE=20359641;WS=20359623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:264,191:0.42:455
chr16	20359831	rs13335818	C	T	1567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-3.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.520;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=43;PP=933;ReadPosRankSum=-0.488;SC=CACAGGCCTTCACCTGGACGG;SOR=0.632;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=187;TCF=80;TCR=107;TR=78;WE=20359839;WS=20359821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,83:0.39:212
chr16	20360101	rs7193058	G	A	2100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.816;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.848;NF=45;NR=35;PP=1038;ReadPosRankSum=2.008;SC=GGTGCGCCTGGCACGGATCCG;SOR=0.482;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=143;TCF=82;TCR=61;TR=80;WE=20360109;WS=20360091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,96:0.59:163
chr16	20360993	rs71149135	G	GCCACATTC	1798.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=0.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.32;ReadPosRankSum=1.851;SOR=0.587;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:97,49:0.34:146
chr16	20361087	rs111285796	T	TTCTGCCAGA	1733.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FS=0.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.63;ReadPosRankSum=-0.407;SOR=0.774;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:150,51:0.25:201
chr16	20361950	rs36060036	C	T	2003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.418;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=52;PP=1324;ReadPosRankSum=-0.891;SC=ACATATACAACGCACACACAC;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=305;TCF=159;TCR=146;TR=109;WE=20361958;WS=20361940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:222,113:0.34:335
chr16	20370810	rs9652588	C	T	8362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=353;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.69;ReadPosRankSum=0.406;SOR=0.686;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:142,211:0.60:353
chr16	20370816	rs9652589	C	T	8394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=362;ExcessHet=3.0103;FS=1.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.19;ReadPosRankSum=0.710;SOR=0.772;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:146,216:0.60:362
chr16	20370981	rs9929710	A	C	1000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=5.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.426;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.768;NF=1;NR=30;PP=749;ReadPosRankSum=0.903;SC=TTGTGGTTGTAATAGTCAAGC;SOR=3.045;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=51;TCF=5;TCR=46;TR=31;WE=20370989;WS=20370971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,34:0.61:56
chr16	20376734	rs8052918	A	G	1974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=20;PP=1318;ReadPosRankSum=1.030;SC=CCTCTTGGAGATACTTACAGA;SOR=0.694;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=116;TCF=86;TCR=30;TR=76;WE=20376742;WS=20376724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,82:0.65:127
chr16	20376755	rs8054266	T	C	3160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.564;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=39;PP=1951;ReadPosRankSum=-0.055;SC=ACATCACAAATACGTCCTTTT;SOR=0.783;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=184;TCF=123;TCR=61;TR=122;WE=20376763;WS=20376745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,136:0.66:206
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chr16	20432545	rs142481473	G	A	1166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.018;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=17;PP=644;ReadPosRankSum=0.327;SC=TGTTTTTACCGTGGTAGTGCC;SOR=1.144;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=138;TCF=83;TCR=55;TR=50;WE=20432557;WS=20432535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,60:0.39:153
chr16	20441053	rs8062344	C	G	3298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.513;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-0.724;NF=55;NR=60;PP=1910;ReadPosRankSum=-0.687;SC=GCCCTCAACCCTGACGTGAGG;SOR=0.613;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=116;TCF=56;TCR=60;TR=115;WE=20441061;WS=20441043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,127:0.99:128
chr16	20441084	rs8063682	T	C	2203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.431;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-0.951;NF=30;NR=50;PP=1351;ReadPosRankSum=-0.770;SC=AACACCAGACTGGTGTGGAGC;SOR=1.257;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=81;TCF=31;TCR=50;TR=80;WE=20441092;WS=20441074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,85:0.99:86
chr16	20441215	rs8062563	A	G	445.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=293;ReadPosRankSum=-0.741;SC=CTTCTCAGGGACCACCCTTCC;SOR=1.085;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=16;WE=20441223;WS=20441205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,17:0.94:18
chr16	20442346	rs148243446	A	C	1978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.191;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.808;NF=47;NR=40;PP=1276;ReadPosRankSum=-1.060;SC=AAAGGCATGAAAATCAAGTCT;SOR=0.804;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=154;TCF=83;TCR=71;TR=87;WE=20442354;WS=20442336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,93:0.54:171
chr16	20448330	rs11646020	A	G	3134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=41;PP=2361;SC=TGGCCTTAGCAGTTGTTCCCA;SOR=1.823;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=81;TCR=41;TR=122;WE=20448338;WS=20448320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr16	20448520	rs7499667	T	C	15019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=343;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.16;QD=43.79;SOR=0.862;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,343:1.00:343
chr16	20448527	rs7499668	T	C	14819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.07;QD=44.64;SOR=0.904;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,332:1.00:332
chr16	20451054	rs199540360	C	G	43.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=21.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr16	20451086	rs112873171	G	T	981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.95;MQRankSum=-2.341;QD=17.85;ReadPosRankSum=-1.533;SOR=0.821;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,40:0.73:55
chr16	20471364	rs6497489	T	C	1507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=9;PP=1124;SC=CTCCTGAAGCTGCTGATGATC;SOR=2.348;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=54;TCF=44;TCR=10;TR=53;WE=20471372;WS=20471354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr16	20471450	rs59292608	G	A	5221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=138;NR=81;PP=2965;SC=CATTGGCTGCGAAAAGTTCAG;SOR=0.952;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=220;TCF=138;TCR=82;TR=219;WE=20471458;WS=20471440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr16	20476852	rs7187246	T	C	3582.96	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.070;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.148;NF=89;NR=58;PP=2418;ReadPosRankSum=4.255;SC=GGCAAGCGACTCCCAAGCCCA;SOR=0.462;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=184;TCF=118;TCR=66;TR=147;WE=20476860;WS=20476842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,150:0.89:169
chr16	20477163	rs7186805	G	C	622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.70;QD=41.52;SOR=4.047;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	20477163	.	GTA	CTC	427	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=50.21;NF=0;NR=16;PP=427;QD=30.0292421789;SC=ATGCTGTCCTGTATCATATGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=16;WE=20477173;WS=20477153;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,16:0.89:18
chr16	20477165	rs7186307	A	C	622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.33;QD=47.91;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr16	20480818	rs28615302	T	C	3006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.48;QD=28.10;SOR=1.265;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr16	20482368	rs1827711	A	G	1162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=6;PP=904;SC=CTAGCTCTGAAAAAATGACAA;SOR=2.494;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=34;WE=20482376;WS=20482358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr16	20482623	rs2271060	G	T	7425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=148;PP=2965;SC=TATTAAGTCAGGTCAACCGGG;SOR=1.217;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=250;TCF=102;TCR=148;TR=250;WE=20482631;WS=20482613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,270:1.00:270
chr16	20487125	rs1629314	T	G	2686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=56;PP=1634;SC=CCATGGGCTGTGTGCACTTTT;SOR=1.872;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=27;TCR=56;TR=83;WE=20487133;WS=20487115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr16	20488696	rs1700805	A	G	1368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.20;QD=32.59;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr16	20492000	rs146233716	A	G	617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.85;QD=32.51;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr16	20492304	rs1700809	A	T	1269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.67;QD=42.33;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr16	20492307	rs1700810	G	A	1237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.56;QD=49.51;SOR=5.058;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr16	20492316	rs1617049	C	T	1006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.69;QD=43.77;SOR=4.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	20494354	.	C	A	2004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.008;ClippingRankSum=0.000;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-8.806;NF=35;NR=17;PP=2511;ReadPosRankSum=-1.381;SC=CTAATCCCTTCTCTCTGGCCT;SOR=0.774;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=103;TCF=71;TCR=32;TR=52;WE=20494366;WS=20494344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,52:0.49:107
chr16	20494358	.	C	CT	2065.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=0.000;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-7.879;NF=22;NR=17;PP=2517;ReadPosRankSum=-0.568;SC=TCCCTTCTCTCTGGCCTTCAT;SOR=0.646;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=81;TCF=43;TCR=38;TR=39;WE=20494366;WS=20494344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,55:0.48:115
chr16	20498079	rs2072080	T	G	782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=4.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=27;PP=566;ReadPosRankSum=-1.392;SC=TTCCTATGATTATATGAGATT;SOR=0.815;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=13;TCR=71;TR=32;WE=20498087;WS=20498069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,34:0.37:92
chr16	20551855	rs28750179	A	G	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.588;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=7.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.20;ReadPosRankSum=0.056;SOR=0.034;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr16	20552075	rs16970280	G	T	1756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.081;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.395;NF=43;NR=52;PP=1123;ReadPosRankSum=-0.411;SC=GCGAGGCCAGGATCACAAATG;SOR=0.575;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=260;TCF=120;TCR=140;TR=95;WE=20552083;WS=20552065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,99:0.35:284
chr16	20554613	rs62035054	G	A	2126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-2.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.366;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-9.066;NF=25;NR=65;PP=1478;ReadPosRankSum=2.605;SC=CAGAGTCATTGTGCCTGCAAA;SOR=0.935;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=167;TCF=49;TCR=118;TR=90;WE=20554621;WS=20554603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,92:0.58:159
chr16	20557688	rs12927522	T	C	1713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=1.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.05;MQRankSum=-4.776;QD=12.79;ReadPosRankSum=1.160;SOR=0.829;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,83:0.62:134
chr16	20565160	rs374276624	G	A	1344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.08;MQRankSum=-0.349;QD=12.34;ReadPosRankSum=-0.635;SOR=0.801;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,62:0.57:109
chr16	20565396	rs6497500	C	T	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.653;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.443;NF=12;NR=1;PP=230;ReadPosRankSum=0.152;SC=ATCATGGGAGCCTGAGTCAAT;SOR=2.584;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=13;WE=20565404;WS=20565386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr16	20565585	rs6497501	G	A	1992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=48;PP=1213;ReadPosRankSum=0.648;SC=CTTAGCAAGAGCTCAATAAAT;SOR=0.631;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=115;TCF=47;TCR=68;TR=83;WE=20565593;WS=20565575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,88:0.70:125
chr16	20570466	rs28712600	A	G	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.823;NF=14;NR=6;PP=267;ReadPosRankSum=1.764;SC=GCTCCAAGGCAGAGACTTCTT;SOR=0.646;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=20;WE=20570474;WS=20570456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,21:0.58:36
chr16	20570661	rs62035059	T	C	608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.92;QD=30.44;SOR=1.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	20576048	rs112352583	C	A	3285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FS=0.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.88;MQRankSum=-2.067;QD=16.35;ReadPosRankSum=0.249;SOR=0.755;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,139:0.69:201
chr16	20576267	rs12920996	T	C	719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=3.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.735;NF=4;NR=17;PP=406;ReadPosRankSum=-0.967;SC=CCCAACCTTATAGGATTCTTC;SOR=1.179;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=21;WE=20576275;WS=20576257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,26:0.67:39
chr16	20599347	rs117305368	A	G	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=2.667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.00;MQRankSum=-4.408;QD=3.47;ReadPosRankSum=-2.229;SOR=1.267;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,14:0.24:59
chr16	20599444	rs201279014	C	A	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=2.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.27;MQRankSum=-1.235;QD=1.82;ReadPosRankSum=1.671;SOR=0.346;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,12:0.21:56
chr16	20599486	rs11643396	G	A	450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=-0.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.807;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.116;NF=8;NR=17;PP=355;ReadPosRankSum=2.566;SC=CCTTGAATAAGTGCCTACATT;SOR=0.368;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=15;TCR=33;TR=25;WE=20599494;WS=20599476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,22:0.54:41
chr16	20599530	rs11648828	T	G	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.691;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.955;NF=1;NR=12;PP=253;ReadPosRankSum=0.980;SC=ACTAGTTTTTTTTGGGCACAG;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=13;WE=20599538;WS=20599520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr16	20602082	rs7498598	T	A	4608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.076;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.079;NF=105;NR=83;PP=2904;ReadPosRankSum=0.712;SC=AAAAGTAGCCTTCCTTGTCCA;SOR=0.822;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=295;TCF=160;TCR=135;TR=188;WE=20602090;WS=20602072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,205:0.63:327
chr16	20602163	rs28669334	A	G	3524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.796;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=2.702;NF=65;NR=89;PP=2605;ReadPosRankSum=1.553;SC=GATTGTCCTGAAAGACAAAGA;SOR=0.875;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=257;TCF=116;TCR=141;TR=154;WE=20602171;WS=20602153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,154:0.59:259
chr16	20602287	rs28736286	A	G	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.383;NF=0;NR=15;PP=345;ReadPosRankSum=0.261;SC=CTAAAGTCCCAGCTGCCCAGA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=15;WE=20602295;WS=20602277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr16	20605328	rs11074464	C	T	747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.161;NF=10;NR=19;PP=470;ReadPosRankSum=1.230;SC=CATACCACCCCGCCCTCTGGT;SOR=0.758;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=50;TCF=19;TCR=31;TR=29;WE=20605336;WS=20605318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,33:0.56:59
chr16	20635418	rs3743690	C	T	1679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.632;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=25;PP=1252;ReadPosRankSum=-0.325;SC=CCTCACTCACCTTCCTTGGGT;SOR=0.776;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=144;TCF=98;TCR=46;TR=77;WE=20635426;WS=20635410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,77:0.51:150
chr16	20636814	rs2301672	G	A	3721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.461;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=91;PP=2199;ReadPosRankSum=-1.104;SC=CCACCAAAGCGCTTTCAACCT;SOR=0.804;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=265;TCF=120;TCR=145;TR=163;WE=20636822;WS=20636804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,172:0.60:286
chr16	20638576	rs1692729	A	T	2026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.676;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=48;PP=1275;ReadPosRankSum=-0.913;SC=CATCCATCTTACCTCTGTCCC;SOR=0.826;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=49;TCR=77;TR=79;WE=20638584;WS=20638566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,87:0.63:139
chr16	20749461	rs9788809	T	C	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.022;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=210;ReadPosRankSum=2.273;SC=CGTACTATAATGTATCTAATA;SOR=1.402;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=39;TCF=28;TCR=11;TR=16;WE=20749469;WS=20749451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,17:0.41:41
chr16	20753123	rs234271	T	C	9994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=369;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=189;NR=158;PP=2965;SC=TCCTCGTCTATCGCCGGCGCG;SOR=0.825;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=347;TCF=189;TCR=158;TR=347;WE=20753131;WS=20753113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,369:1.00:369
chr16	20792188	rs5715	T	C	2791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.467;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=69;PP=1867;ReadPosRankSum=-0.038;SC=AGGTATACTTTCACAAAAGTG;SOR=0.837;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=291;TCF=136;TCR=155;TR=127;WE=20792196;WS=20792178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,134:0.43:309
chr16	20796508	rs8058758	T	C	527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.104;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=380;ReadPosRankSum=-0.043;SC=ACAGTCTCCTTATGATTATTT;SOR=0.947;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=70;TCF=17;TCR=53;TR=24;WE=20796516;WS=20796498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,25:0.33:76
chr16	20810067	rs3213646	T	C	1674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.611;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=33;PP=959;ReadPosRankSum=-1.609;SC=CTTTTGCATATAGATAGGTGA;SOR=0.917;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=155;TCF=78;TCR=77;TR=64;WE=20810075;WS=20810057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,79:0.44:180
chr16	20811681	rs2301771	C	T	3825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=545;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.536;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=99;NR=87;PP=2347;ReadPosRankSum=0.024;SC=TTAACAGCTGCTTTCTTTTAC;SOR=0.745;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=502;TCF=266;TCR=236;TR=186;WE=20811689;WS=20811671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:339,206:0.38:545
chr16	20827647	rs5816137	AT	A	606.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=9.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.04;MQRankSum=1.737;QD=13.48;ReadPosRankSum=-0.309;SOR=2.955;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,33:0.73:45
chr16	20855309	rs9929443	A	G	2893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=57;PP=1826;SC=TGGCCATAGAATCCTTGGATG;SOR=1.413;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=34;TCR=57;TR=91;WE=20855317;WS=20855299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr16	20860897	rs6654	C	T	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=140;ReadPosRankSum=-0.862;SC=CAGCAGACAGCTTTATGGAAA;SOR=0.392;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=8;WE=20860905;WS=20860887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr16	20873767	rs7187522	T	G	2121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.121;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=63;PP=1535;ReadPosRankSum=0.490;SC=CCTGCACCCCTCCTGCTATGT;SOR=1.105;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=292;TCF=138;TCR=154;TR=108;WE=20873775;WS=20873757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:201,110:0.35:311
chr16	20956098	.	G	GAC	84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=84;QD=44.0;SC=AGTAGCACAGGACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=2;WE=20956106;WS=20956088;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:4,2:0.33:6
chr16	20970516	.	G	A	992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=0.000;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.727;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=12;PP=578;ReadPosRankSum=-2.576;SC=TCTGGCATTGGTGCTCTCAGG;SOR=0.799;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=106;TCF=72;TCR=34;TR=42;WE=20970524;WS=20970506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,49:0.41:120
chr16	20986506	rs3115438	C	T	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.242;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=69;ReadPosRankSum=0.200;SC=GGTATAACCACGCTCATTCGG;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=5;WE=20986514;WS=20986496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr16	20990671	rs139609202	A	C	1154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.978;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=15;PP=766;ReadPosRankSum=0.151;SC=TGCAAAGTCGAGTTTCTGCAA;SOR=1.018;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=83;TCF=57;TCR=26;TR=50;WE=20990679;WS=20990653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,50:0.60:83
chr16	20999464	rs4783517	C	A	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=439;ReadPosRankSum=0.783;SC=AGGATGCACACGAGGTGGCTT;SOR=0.578;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=74;TCF=17;TCR=57;TR=29;WE=20999472;WS=20999454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,29:0.37:78
chr16	21008690	rs3115446	T	C	2346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.167;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=44;PP=1482;ReadPosRankSum=1.304;SC=TTGTGTCTTTTTTGTCAAACC;SOR=0.525;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=291;TCF=174;TCR=117;TR=106;WE=21008698;WS=21008680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:197,119:0.38:316
chr16	21030897	rs3095922	T	C	2499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=62;NR=22;PP=1723;SC=GTTTAGAACATGTAATTCCAA;SOR=2.147;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=62;TCR=22;TR=84;WE=21030905;WS=21030887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr16	21035826	rs330135	G	C	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=57;ReadPosRankSum=1.312;SC=GTTGCCTCCAGGGACTATGAA;SOR=0.313;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=6;WE=21035834;WS=21035818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr16	21051209	rs330150	G	C	2774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=349;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.596;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=57;PP=1902;ReadPosRankSum=0.797;SC=AGTAGAGGGAGATTTCTCCAA;SOR=0.942;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=323;TCF=173;TCR=150;TR=130;WE=21051217;WS=21051199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:211,138:0.40:349
chr16	21073727	rs4783378	C	T	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=263;ReadPosRankSum=-0.845;SC=GGTGCTTAGTCCCAGTGCTTA;SOR=0.627;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=13;WE=21073735;WS=21073720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr16	21078693	rs861424	T	G	1113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.649;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=29;PP=660;ReadPosRankSum=0.381;SC=GAAGCTTCTCTGCCATCCGTG;SOR=0.639;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=171;TCF=87;TCR=84;TR=61;WE=21078701;WS=21078683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,66:0.35:186
chr16	21136477	rs7191215	A	G	4999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=97;NR=65;PP=2798;SC=AAAGGTCCAAATGCAGGTCCC;SOR=0.986;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=162;TCF=97;TCR=65;TR=162;WE=21136485;WS=21136467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr16	21152073	rs7202719	CA	TG	827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.762;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=12;PP=600;ReadPosRankSum=0.637;SC=TTTGGTTCTCCAGAGAGGTGC;SOR=0.349;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=45;TCF=13;TCR=32;TR=19;WE=21152082;WS=21152063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,23:0.45:51
chr16	21152481	rs8061542	G	T	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.385;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=72;ReadPosRankSum=0.992;SC=TTTTTTTTTTGATTAAAGTGA;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=5;WE=21152489;WS=21152471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr16	21156829	rs6497538	G	A	353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-4.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.198;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=228;ReadPosRankSum=-0.586;SC=AGTGCCTTATGCTATGTTTCT;SOR=0.013;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=17;WE=21156837;WS=21156819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chr16	21190853	rs1063087	A	C	7106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=132;PP=2965;SC=AGTCTGCAGAATTCGAGGGGC;SOR=1.266;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=228;TCF=95;TCR=133;TR=226;WE=21190866;WS=21190843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr16	21209981	rs62033379	C	T	666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=20;NR=3;PP=499;SC=GAGACTTAGTCTTTTATTCTT;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=21209989;WS=21209971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	21210006	rs7189430	C	T	1502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=20;PP=960;SC=TGTTTAGACTCACCACGGGTA;SOR=1.262;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=32;TCR=20;TR=52;WE=21210014;WS=21209996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr16	21210312	rs16971210	C	T	1297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=29;PP=791;SC=CCTTTGCAGGCGAGGTTATGC;SOR=1.814;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=13;TCR=29;TR=42;WE=21210320;WS=21210302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr16	21215672	rs2075526	A	G	1307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=30;PP=668;ReadPosRankSum=0.040;SC=CCTTCTGTCCAGGAGATATAA;SOR=0.702;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=178;TCF=89;TCR=89;TR=61;WE=21215680;WS=21215662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,72:0.36:200
chr16	21216992	rs2242551	A	G	3463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.449;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=67;PP=2086;ReadPosRankSum=-1.020;SC=TAAAGGTAATATCACCTTTAA;SOR=0.643;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=245;TCF=124;TCR=121;TR=137;WE=21217000;WS=21216982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,152:0.57:267
chr16	21221626	rs74755848	C	T	1310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=37;PP=939;ReadPosRankSum=-0.173;SC=AGGCAAGAATCGTCCCCTACC;SOR=0.752;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=78;TCF=24;TCR=54;TR=53;WE=21221634;WS=21221616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,53:0.67:79
chr16	21222596	rs2075519	C	A	1530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.343;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=19;PP=922;ReadPosRankSum=0.653;SC=GTTTTCTCTGCTAAGAAGACT;SOR=0.864;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=141;TCF=97;TCR=44;TR=66;WE=21222604;WS=21222586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,71:0.46:154
chr16	21222941	rs2075521	C	A	1570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=38;PP=1075;SC=AAGCCAGCCGCATCCACACCC;SOR=2.480;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=12;TCR=38;TR=50;WE=21222949;WS=21222931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr16	21388110	rs2686119	T	C	1508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=37;PP=1027;SC=CTCCCTGGAGTGCTACCTGCA;SOR=1.421;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=27;TCR=37;TR=64;WE=21388118;WS=21388100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr16	21397273	rs369341030	CTG	C	268.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.10;MQRankSum=-4.133;QD=4.55;ReadPosRankSum=0.872;SOR=0.671;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,15:0.25:59
chr16	21531111	rs7197243	T	C	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FS=2.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.40;MQRankSum=-0.877;QD=1.10;ReadPosRankSum=2.561;SOR=1.003;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:192,32:0.14:224
chr16	21531494	rs42138	T	C	8530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=147;NR=140;PP=2965;SC=ATGCCCGAGCTCATGATGGCG;SOR=0.770;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=289;TCF=147;TCR=142;TR=287;WE=21531502;WS=21531484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,322:1.00:322
chr16	21531609	rs42139	C	T	947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.706;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.97;MQRankSum=-0.989;NF=19;NR=19;PP=547;ReadPosRankSum=-0.101;SC=TGGCGGCCATCATCTTCTCCC;SOR=0.506;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=82;TCF=39;TCR=43;TR=38;WE=21531617;WS=21531599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,45:0.49:91
chr16	21531681	rs42140	C	G	596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=2.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQRankSum=0.485;QD=9.78;ReadPosRankSum=-2.327;SOR=0.418;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,31:0.51:61
chr16	21544339	rs200289835	C	T	684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=505;ExcessHet=3.0103;FS=0.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.79;MQRankSum=0.494;QD=1.36;ReadPosRankSum=0.844;SOR=0.756;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:422,83:0.16:505
chr16	21559162	.	CA	C	35.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.618;ClippingRankSum=0.000;DP=310;ExcessHet=3.0103;FS=4.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQRankSum=-5.351;QD=0.12;ReadPosRankSum=0.565;SOR=1.048;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:260,38:0.13:298
chr16	21608472	rs194548	G	A	744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=4;PP=497;SC=GCTGTCCCCAGTGGGCAATCT;SOR=2.670;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=21608480;WS=21608462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr16	21652720	rs1055740	A	G	285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=224;SC=TTACATTCTGACATCCTTCTT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=21652728;WS=21652710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr16	21658266	rs3091404	C	T	1066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.351;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=8;PP=770;ReadPosRankSum=-0.186;SC=TGAGCCACCACGCCCAGCCAG;SOR=1.901;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=76;TCF=57;TCR=19;TR=43;WE=21658274;WS=21658256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,45:0.57:79
chr16	21689728	.	C	CAT	78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=2;NR=1;PP=78;QD=29.6666666667;SC=TCTGAATGTCCATATATATAT;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=3;WE=21689736;WS=21689719;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:2,3:0.60:5
chr16	21689791	rs215894	T	A	379.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=2.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.45;MQRankSum=0.000;QD=15.82;ReadPosRankSum=1.133;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,17:0.71:24
chr16	21690559	rs12445216	G	A	1201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.941;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=32;PP=784;ReadPosRankSum=3.219;SC=GAGAGGGGAAGGGATGGTATA;SOR=0.473;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=147;TCF=63;TCR=84;TR=59;WE=21690567;WS=21690549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,62:0.39:157
chr16	21696089	rs674917	T	A	37.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr16	21730449	rs215901	C	T	566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.761;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=9;PP=322;ReadPosRankSum=-0.189;SC=ATTCTCTTCTCGCAGGCTCTG;SOR=0.960;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=91;TCF=58;TCR=33;TR=30;WE=21730457;WS=21730439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,33:0.33:101
chr16	21763602	.	ATG	A	36.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=2.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.83;MQRankSum=-1.874;QD=1.08;ReadPosRankSum=0.632;SOR=0.195;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,5:0.15:34
chr16	21809188	.	TA	T	177.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=0.000;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=0.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.70;MQRankSum=-2.721;QD=2.00;ReadPosRankSum=0.649;SOR=0.542;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,19:0.21:89
chr16	21821976	rs148768203	C	CA	171.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-2.591;NF=12;NR=0;PP=153;ReadPosRankSum=-0.283;SC=CAAGTGGATACAAAAAAAAAA;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=12;WE=21821984;WS=21821966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr16	21970546	rs2967178	T	C	3256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=33;PP=1958;SC=GCATGAGATGTTGTTTTTAGC;SOR=1.473;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=103;TCF=70;TCR=33;TR=102;WE=21970554;WS=21970536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr16	21992122	rs2965803	T	C	345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=11;PP=308;SC=GTATTATTCTTATGTTTGGTG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=21992130;WS=21992112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr16	22012146	.	AATGATG	A,AATG	1281.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.21;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=24;NF=8,8;NR=7,7;PP=466,238;SC=CTCCTTCTCAAATGATGATGA;SOR=2.235;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=17;TCF=9;TCR=8;TR=15,15;WE=22012159;WS=22012136;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.73,0.27:33
chr16	22019646	rs201044196	AG	A	141.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=3.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.18;ReadPosRankSum=1.092;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,10:0.15:65
chr16	22075589	rs139019870	G	A	1038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.764;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=13;PP=666;ReadPosRankSum=-0.352;SC=TACTTTTACAGATAATTCCAC;SOR=0.839;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=102;TCF=70;TCR=32;TR=45;WE=22075597;WS=22075579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,49:0.44:111
chr16	22128052	rs11649656	TT	GC	11196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=127;NR=91;PP=2947;SC=GACCTGGGATTTCCACTTCTC;SOR=1.001;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=224;TCF=132;TCR=92;TR=218;WE=22128061;WS=22128042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr16	22134674	.	TA	T	108.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.843;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.63;MQRankSum=1.946;QD=3.29;ReadPosRankSum=-0.325;SOR=0.787;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,12:0.36:33
chr16	22149612	.	CTG	C	123.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=2.586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.42;ReadPosRankSum=2.132;SOR=1.345;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,7:0.25:28
chr16	22161136	rs1991020	T	C	3298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=68;PP=2035;SC=TGCAGAGAGCTTTCAGTCATG;SOR=1.407;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=112;TCF=44;TCR=68;TR=112;WE=22161144;WS=22161126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr16	22269867	rs4783453	A	G	10821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=407;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=178;NR=184;PP=2965;SC=GGGAGCCCCCAAGTAAGGACC;SOR=0.790;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=362;TCF=178;TCR=184;TR=362;WE=22269878;WS=22269851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,407:1.00:407
chr16	22271671	rs35233038	TA	T	109.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.33;ReadPosRankSum=0.477;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,11:0.33:33
chr16	22278053	rs36095301	C	T	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.794;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=2;PP=467;ReadPosRankSum=-0.106;SC=GGCGCTTCTGCGAGAAGGGCG;SOR=2.376;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=70;TCF=55;TCR=15;TR=26;WE=22278061;WS=22278043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,27:0.36:76
chr16	22328094	rs2290830	G	T	2446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=52;PP=1477;ReadPosRankSum=-0.986;SC=GAGGACTGTGGCCCCTCCTGT;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=28;TCR=53;TR=80;WE=22328102;WS=22328084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,91:0.99:92
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chr16	22826339	rs208951	A	G	3383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=429;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.763;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=72;PP=2196;ReadPosRankSum=1.237;SC=TTATCCGAGTACACCCGGACG;SOR=0.841;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=400;TCF=213;TCR=187;TR=161;WE=22826347;WS=22826329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:256,172:0.40:428
chr16	23079353	rs8047644	T	C	478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.899;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=323;ReadPosRankSum=0.584;SC=TAAAACACTTTGATTGCAGAA;SOR=0.180;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=38;TCF=32;TCR=6;TR=20;WE=23079361;WS=23079343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr16	23079501	rs35254998	G	A	3280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.845;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=59;PP=1955;ReadPosRankSum=1.246;SC=TTGGATTTGCGAGCGGACAGC;SOR=0.802;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=223;TCF=121;TCR=102;TR=133;WE=23079509;WS=23079491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,148:0.60:248
chr16	23080634	rs10083789	C	A	3832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=4.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=432;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=87;PP=2705;ReadPosRankSum=-1.340;SC=GTGCTCACGGCGACTATGACT;SOR=0.723;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=398;TCF=193;TCR=205;TR=168;WE=23080642;WS=23080624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:254,177:0.41:431
chr16	23205657	rs4247210	G	C	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=342;ReadPosRankSum=1.218;SC=GGGGCAGCAGGACAGTGGGGA;SOR=0.838;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=45;TCF=10;TCR=35;TR=20;WE=23205665;WS=23205647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,21:0.44:48
chr16	23221183	rs5740	A	G	10342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=387;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=158;NR=191;PP=2965;SC=ACAGATTGGCAGGGGCACCCA;SOR=0.972;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=350;TCF=158;TCR=192;TR=349;WE=23221191;WS=23221173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,386:1.00:386
chr16	23221238	rs4281710	A	G	4684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=99;PP=2965;SC=GTTATATCTAAGCTGGGGTGT;SOR=1.638;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=53;TCR=99;TR=152;WE=23221246;WS=23221228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr16	23223233	rs9941210	G	T	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.821;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=200;ReadPosRankSum=-1.202;SC=GGCATAAGGGGCAGGTTCATG;SOR=0.097;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=15;WE=23223241;WS=23223223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr16	23223262	rs9941215	G	A	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.614;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=8;PP=266;ReadPosRankSum=0.240;SC=CAAGGTTAAGGGAGGCTGACC;SOR=0.121;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=48;TCF=37;TCR=11;TR=21;WE=23223270;WS=23223252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,21:0.41:51
chr16	23223300	rs9931527	T	C	885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.471;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=20;PP=644;ReadPosRankSum=0.920;SC=TGCAGGAAACTCCCTGACATC;SOR=0.520;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=121;TCF=74;TCR=47;TR=46;WE=23223308;WS=23223290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,47:0.36:132
chr16	23224106	rs12708649	T	C	1731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.261;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=56;PP=1066;ReadPosRankSum=0.807;SC=GTGAGACGGGTGGCTGGGTTG;SOR=0.852;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=228;TCF=97;TCR=131;TR=91;WE=23224114;WS=23224096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,94:0.39:244
chr16	23224416	rs13306653	G	A	1740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.511;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=29;PP=994;ReadPosRankSum=0.252;SC=TTCTCTCTCCGTTGTAGAAGT;SOR=0.739;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=184;TCF=116;TCR=68;TR=80;WE=23224424;WS=23224406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,89:0.42:213
chr16	23224517	rs13306654	T	G	1008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FS=2.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.00;ReadPosRankSum=-0.900;SOR=0.521;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,58:0.35:168
chr16	23225984	rs11643517	A	G	938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=11;PP=583;ReadPosRankSum=1.859;SC=GAGGACTGGTAATCTGGTAGG;SOR=0.726;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=112;TCF=77;TCR=35;TR=39;WE=23225992;WS=23225974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,44:0.37:120
chr16	23226787	rs5723	C	G	1152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.330;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=38;PP=774;ReadPosRankSum=0.490;SC=TGGATGAGCTCTGAGGCAGGG;SOR=0.996;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=144;TCF=41;TCR=103;TR=51;WE=23226795;WS=23226777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,56:0.37:153
chr16	23360199	rs238547	T	C	3099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.222;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=67;PP=1625;ReadPosRankSum=1.410;SC=TGGACTTCCCTGCCGTCACCA;SOR=0.449;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=264;TCF=149;TCR=115;TR=144;WE=23360221;WS=23360189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,155:0.54:289
chr16	23364081	rs63982	A	C	2135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.991;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=30;PP=1283;ReadPosRankSum=-1.957;SC=TGCTTTACAGATATGCATTCC;SOR=1.109;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=141;TCF=88;TCR=53;TR=86;WE=23364089;WS=23364071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,95:0.61:155
chr16	23400494	rs250586	C	A	642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=18;PP=503;SC=CTGAATACGACACAGAGAAGC;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=23400502;WS=23400484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr16	23486197	rs11074559	A	G	3554.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.53;SOR=1.219;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr16	23489711	rs1135045	C	G	2135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=14;PP=1340;SC=GCTGGCTGTGCTGAGAGGAGG;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=48;TCR=14;TR=62;WE=23489719;WS=23489701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr16	23490353	rs4968008	T	G	10676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=400;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=173;NR=205;PP=2965;SC=AGCAACTTACTGAAGGTCATG;SOR=0.956;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=379;TCF=173;TCR=206;TR=378;WE=23490361;WS=23490343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,399:1.00:399
chr16	23506940	rs722069	G	A	1186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=4;PP=945;SC=CCCTAAAACAGTCTTGAGAGA;SOR=3.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=33;TCR=4;TR=37;WE=23506948;WS=23506930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr16	23521643	rs1071685	G	C	3769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.93;SOR=0.751;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr16	23521750	rs2285522	T	C	1239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=29;PP=661;SC=GCCCCGACGCTGCGGCCGCGG;SOR=1.755;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=15;TCR=29;TR=44;WE=23521758;WS=23521740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr16	23521780	rs2285521	C	T	601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=15;PP=404;SC=CCTCTTCAGCCGCTGTAGCGT;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=19;WE=23521788;WS=23521770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr16	23533008	rs11074565	G	A	2148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=15;PP=1537;SC=TTGTCCTTTTGTGACTGACAT;SOR=2.463;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=58;TCR=15;TR=73;WE=23533016;WS=23532998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr16	23535680	rs1468138	A	C	3792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=34;PP=2420;SC=CACTGCCCGAAACATCCTCTC;SOR=1.754;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=84;TCR=34;TR=118;WE=23535688;WS=23535670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr16	23536366	rs6497670	T	C	435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=4;PP=289;SC=TAATTCTATATTGTATTCACT;SOR=2.049;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=16;WE=23536374;WS=23536356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr16	23536684	rs6497671	T	C	6498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=112;NR=112;PP=2965;SC=AAGCTCATACTAGATCTTTCT;SOR=0.796;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=224;TCF=112;TCR=112;TR=224;WE=23536692;WS=23536674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr16	23540798	rs2072062	C	T	6561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=137;NR=85;PP=2965;SC=GTGTGGAACCCTGAGCTCAGC;SOR=1.164;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=223;TCF=138;TCR=85;TR=222;WE=23540806;WS=23540788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr16	23541223	rs2072061	G	A	2202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=54;PP=1595;SC=TGCAGTCTGCGGAAGAAATCA;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=17;TCR=54;TR=71;WE=23541231;WS=23541213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr16	23546561	rs2073951	G	C	4485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=66;NR=75;PP=2389;SC=TCCAGCCATAGACCAGGTCCT;SOR=1.091;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=141;TCF=66;TCR=75;TR=141;WE=23546569;WS=23546541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr16	23555726	rs2369009	C	T	2202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=24;PP=1541;SC=AGATGCCTGACCCACAGAAAC;SOR=1.824;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=54;TCR=24;TR=78;WE=23555734;WS=23555716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr16	23557718	rs7196534	T	C	5348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=86;PP=2965;SC=AGCTCAGAGATCTTGGGCAAG;SOR=0.743;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=179;TCF=93;TCR=86;TR=179;WE=23557726;WS=23557708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr16	23557790	rs4968019	T	C	2770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=54;PP=1474;SC=AACTTTCTCATGAGGATCATC;SOR=1.300;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=37;TCR=54;TR=91;WE=23557798;WS=23557780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr16	23563501	rs7187920	C	T	3994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=46;PP=2247;SC=CAATATTCTCCGCTGCCCCAG;SOR=1.186;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=129;TCF=83;TCR=46;TR=129;WE=23563509;WS=23563491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr16	23573346	.	G	A	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=3.075;ClippingRankSum=0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=255;ReadPosRankSum=0.354;SC=GAACATATTCGCCCTCCCAGA;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=13;WE=23573354;WS=23573336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr16	23606895	rs240744	G	T	8558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=156;NR=140;PP=2965;SC=ATCCTTATTGGTCAAAGGTCA;SOR=0.731;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=297;TCF=156;TCR=141;TR=296;WE=23606903;WS=23606885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,324:1.00:324
chr16	23625463	rs249936	A	T	1012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=30;PP=832;SC=ACAAACCAGTATTCAGAAAAT;SOR=4.112;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=33;WE=23625471;WS=23625453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr16	23652769	.	G	C	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.083;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=305;ReadPosRankSum=0.752;SC=CACCTGGAGCGGAAGTGGAGG;SOR=0.527;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=15;WE=23652777;WS=23652759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr16	23711925	rs26764	C	G	2203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.268;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=40;PP=1139;ReadPosRankSum=0.315;SC=GCTCCTCCGGCTGGCCCCCGA;SOR=0.563;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=142;TCF=74;TCR=68;TR=88;WE=23711936;WS=23711915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,103:0.63:164
chr16	23712183	rs26763	A	G	635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.467;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=432;ReadPosRankSum=1.710;SC=AGGGGGCAAAATCAGAGCTGG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=37;TCR=5;TR=20;WE=23712191;WS=23712176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,24:0.52:46
chr16	23712448	rs26762	G	T	1738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.852;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=50;PP=1287;ReadPosRankSum=-0.525;SC=GGGGATAAAGGGCCCTTCACT;SOR=0.929;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=153;TCF=62;TCR=91;TR=77;WE=23712456;WS=23712438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,78:0.48:161
chr16	23717833	rs36047689	G	A	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.551;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=27;PP=581;ReadPosRankSum=1.147;SC=TCTTGCAGGAGTGGGGGTTTC;SOR=0.510;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=114;TCF=48;TCR=66;TR=46;WE=23717841;WS=23717823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,45:0.38:120
chr16	23721601	rs4967959	T	G	1443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=34;PP=866;ReadPosRankSum=-0.676;SC=ACCAATGGGTTCTTGCCCCCT;SOR=0.707;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=231;TCF=121;TCR=110;TR=73;WE=23721609;WS=23721591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,81:0.32:256
chr16	23722042	rs3899652	T	C	698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.281;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=22;PP=474;ReadPosRankSum=-0.689;SC=CCCCATTTTATAGATGAGGAT;SOR=1.112;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=79;TCF=27;TCR=52;TR=31;WE=23722050;WS=23722032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,32:0.39:83
chr16	23722280	rs56342512	G	A	3127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.458;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=64;PP=1767;ReadPosRankSum=-0.581;SC=TGCTTAGTGCGTGGAGACTTC;SOR=0.734;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=241;TCF=128;TCR=113;TR=138;WE=23722288;WS=23722270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,149:0.58:257
chr16	23724753	rs3809682	G	A	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.985;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=237;ReadPosRankSum=-0.587;SC=TGGAGAACTTGCCACGTGCCG;SOR=0.810;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=88;TCF=28;TCR=60;TR=23;WE=23724761;WS=23724743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,22:0.24:93
chr16	23768380	rs5816221	T	TG	1680.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=12;PP=980;SC=GGAAAATTATTGGGGGATATG;SOR=1.524;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=32;TCF=19;TCR=13;TR=26;WE=23768388;WS=23768370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr16	23768700	rs117059722	A	T	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=332;ReadPosRankSum=-1.477;SC=GGGCAGACAGACTTGGGAAAC;SOR=0.627;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=11;TCR=30;TR=18;WE=23768708;WS=23768690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,20:0.44:45
chr16	23768802	rs80950	T	G	1662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=16;PP=1136;SC=GTTGGGAGCATGGAGAGCTGA;SOR=1.692;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=37;TCR=16;TR=53;WE=23768810;WS=23768792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr16	23848762	rs3729883	G	A	3140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=58;NR=53;PP=1833;SC=CTATTTGTGGGAAGAGAGGGT;SOR=0.726;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=111;TCF=58;TCR=53;TR=111;WE=23848781;WS=23848752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr16	24043676	rs1971276	C	G	614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=438;ReadPosRankSum=-0.157;SC=CCCCTGTCCTCGTTGGGGCTG;SOR=0.804;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=23;WE=24043684;WS=24043666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,24:0.71:34
chr16	24104328	rs880824	A	G	1012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.963;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=32;PP=692;ReadPosRankSum=0.508;SC=TGCCACCTGAAATCAGGGAGT;SOR=0.520;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=19;TCR=89;TR=39;WE=24104336;WS=24104318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,43:0.37:117
chr16	24105669	rs7196765	G	A	1499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=46;PP=863;ReadPosRankSum=-0.976;SC=TCCATCAAACGCGGGGTCAAG;SOR=0.729;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=222;TCF=86;TCR=136;TR=73;WE=24105677;WS=24105659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,82:0.34:239
chr16	24166130	rs432998	T	C	1516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.587;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=41;PP=831;ReadPosRankSum=-0.629;SC=TGGCCCTGCCTGGGAAGCCGC;SOR=0.792;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=149;TCF=59;TCR=90;TR=66;WE=24166138;WS=24166120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,77:0.46:167
chr16	24192020	rs113575395	AAC	A	1662.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.974;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.748;NF=15;NR=13;PP=1169;ReadPosRankSum=-0.527;SC=CACAACACCTAACACAGTGTT;SOR=0.311;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=44;TCF=28;TCR=16;TR=28;WE=24192029;WS=24192010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,43:0.66:65
chr16	24196289	rs66639742	A	T	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.376;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=3;PP=410;ReadPosRankSum=-0.334;SC=GCCTCTGCAAAGCATGTCTGT;SOR=1.542;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=24;WE=24196297;WS=24196279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,27:0.63:43
chr16	24202615	rs198145	A	G	4944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=114;PP=2965;SC=CCTGTGCCTCATGTTTTCCAA;SOR=1.819;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=168;TCF=54;TCR=114;TR=168;WE=24202623;WS=24202605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr16	24357998	rs5816249	T	TG	518.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.285;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=522;ReadPosRankSum=-0.505;SC=GGACCCAGGCTGGCCCCCAGA;SOR=1.429;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=46;TCF=41;TCR=5;TR=18;WE=24358006;WS=24357988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,20:0.34:59
chr16	24564879	rs72133882	GTA	G	430.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.431;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=495;ReadPosRankSum=0.820;SC=GCTTACAAAGGTATATATATA;SOR=1.855;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=15;WE=24564890;WS=24564869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr16	24567318	rs16973827	T	G	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.792;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=23;PP=501;ReadPosRankSum=0.729;SC=TTTTTCTTGGTTAATACTGCC;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=39;TCF=5;TCR=34;TR=26;WE=24567326;WS=24567308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,27:0.61:44
chr16	24574645	rs139004713	AT	A	1705.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.354;NF=4;NR=48;PP=969;ReadPosRankSum=1.001;SC=TTAATTTGGGATTTTTTTTAC;SOR=0.668;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=88;TCF=9;TCR=79;TR=52;WE=24574653;WS=24574635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,76:0.63:121
chr16	24578330	rs7194163	G	T	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=214;ReadPosRankSum=-0.221;SC=TACTAATGTTGCTACACTAGT;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=9;WE=24578338;WS=24578327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr16	24578458	rs7195386	T	C	4030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=61;PP=2524;ReadPosRankSum=0.629;SC=GAATTTATTTTTCCAGAAGTA;SOR=0.718;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=270;TCF=165;TCR=105;TR=159;WE=24578466;WS=24578448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,176:0.59:296
chr16	24579397	rs7201851	T	C	567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=19;PP=459;ReadPosRankSum=-0.083;SC=AGTGTAAATTTTATTGTGTAG;SOR=0.804;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=20;WE=24579405;WS=24579387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,20:0.71:28
chr16	24582299	rs7196736	C	G	3710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.990;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=78;PP=2121;ReadPosRankSum=1.227;SC=ATGACAATACCGCGCCAGCTG;SOR=0.778;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=242;TCF=119;TCR=123;TR=152;WE=24582307;WS=24582289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,173:0.66:264
chr16	24583406	rs7593	A	G	4289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=357;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.068;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=82;PP=2579;ReadPosRankSum=-1.886;SC=TGGAGAAAGCAAAAGAGAGCC;SOR=0.730;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=326;TCF=173;TCR=153;TR=185;WE=24583414;WS=24583396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,203:0.57:356
chr16	24676090	rs149786252	T	TCA	56	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=14.00;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr16	24741005	.	TCGG	T	315.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.505;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.271;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.309;NF=5;NR=1;PP=270;ReadPosRankSum=-0.543;SC=GGCGGCGGTGTCGGCGGCGGC;SOR=1.911;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=15;TCF=8;TCR=7;TR=6;WE=24741015;WS=24740995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr16	24741686	rs7202252	T	C	5064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=77;NR=95;PP=2965;SC=CCGATTCGCCTTTTCTGGGTT;SOR=1.066;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=172;TCF=77;TCR=95;TR=172;WE=24741694;WS=24741676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr16	24801979	rs13336754	C	T	5177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=371;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.387;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=116;NR=105;PP=2962;ReadPosRankSum=1.451;SC=CAGTGGAGAGCGATGGTAGTA;SOR=0.664;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=356;TCF=185;TCR=171;TR=221;WE=24802000;WS=24801969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,227:0.62:368
chr16	24807165	rs1030211	G	A	2313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=26;PP=1542;SC=AGGTCTTCCAGTTCCAAACCC;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=57;TCR=26;TR=83;WE=24807173;WS=24807155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr16	24834482	rs191561176	C	T	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=197;ReadPosRankSum=-1.724;SC=CATTCCTAAGCGGGGAATCAG;SOR=0.602;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=13;WE=24834490;WS=24834472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr16	24838988	rs12933971	C	T	900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=27;PP=606;ReadPosRankSum=-0.416;SC=GGGAGGGTAACGGCATTGGTG;SOR=0.616;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=52;TCF=9;TCR=43;TR=33;WE=24838996;WS=24838978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,37:0.61:61
chr16	24873908	rs140369052	T	TC	374.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=2.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.20;ReadPosRankSum=-1.060;SOR=1.121;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,21:0.29:72
chr16	24881152	rs11866271	A	C	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=202;ReadPosRankSum=-0.045;SC=GGAGCATGGAAATAATTGGGG;SOR=0.460;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=12;WE=24881160;WS=24881142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr16	24886886	rs60449337	TG	T	426.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=318;ReadPosRankSum=0.889;SC=AGGGCTTGTGTGGGGGGGTCA;SOR=0.422;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=34;TCF=24;TCR=10;TR=7;WE=24886901;WS=24886876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,11:0.30:37
chr16	24886893	rs34534629	G	T	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=304;ReadPosRankSum=0.988;SC=GTGTGGGGGGGTCACGTGCTG;SOR=0.776;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=13;WE=24886901;WS=24886876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,15:0.31:49
chr16	24888593	rs8052587	A	G	2924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.372;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=62;PP=1616;ReadPosRankSum=1.292;SC=ACATGTATGCAGGTGCCATCT;SOR=0.781;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=269;TCF=138;TCR=131;TR=128;WE=24888601;WS=24888583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,144:0.48:298
chr16	24888646	rs11074656	T	C	2725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=64;PP=1724;ReadPosRankSum=-0.081;SC=CTGGCCATAGTTGGGCTACTG;SOR=0.711;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=229;TCF=114;TCR=115;TR=124;WE=24888654;WS=24888636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,133:0.53:252
chr16	24895361	rs72770465	C	T	3425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=383;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.209;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=82;PP=2042;ReadPosRankSum=-0.642;SC=CCTCCGTGCTCATCCCACCAG;SOR=0.621;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=354;TCF=165;TCR=189;TR=158;WE=24895369;WS=24895351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:212,171:0.45:383
chr16	24902194	rs274081	T	C	5763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=93;PP=2965;SC=TTCTAGGTTTTGCCGCGGTTG;SOR=0.702;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=195;TCF=102;TCR=93;TR=195;WE=24902202;WS=24902184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr16	24918048	rs17772929	C	T	6289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=495;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.530;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=139;NR=138;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.467;SC=GTTCGGACATCGCGTATCCCA;SOR=0.663;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=459;TCF=233;TCR=226;TR=277;WE=24918056;WS=24918038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:195,298:0.60:493
chr16	24919245	rs113206122	C	CAGGGA	3200.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.687;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.055;NF=26;NR=15;PP=2386;ReadPosRankSum=1.236;SC=AGTAAATGTTCAGATGATGCT;SOR=0.399;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=76;TCF=50;TCR=26;TR=41;WE=24919253;WS=24919235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,78:0.65:120
chr16	24921854	.	AT	A	91.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.854;ClippingRankSum=0.000;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.24;MQRankSum=-0.724;QD=1.83;ReadPosRankSum=0.352;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,11:0.22:50
chr16	25043277	rs11074669	G	A	4122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=349;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=80;PP=2416;ReadPosRankSum=0.412;SC=CGACGAGGGCGTGGGCTGCAC;SOR=0.679;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=313;TCF=173;TCR=140;TR=174;WE=25043285;WS=25043267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,193:0.55:349
chr16	25043569	rs7498149	A	G	1204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=33;PP=876;ReadPosRankSum=-0.005;SC=AACCAGGCGGACGGGGTCTTG;SOR=0.706;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=126;TCF=51;TCR=75;TR=54;WE=25043577;WS=25043559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,57:0.41:139
chr16	25066321	rs67051289	A	AG	112	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.13;QD=28.00;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr16	25066332	rs12924642	A	C	76.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=37.11;QD=25.43;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr16	25137289	rs7189229	G	C	437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=3;PP=410;SC=CTTCAGAACTGCCATCAGCAG;SOR=2.448;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=25137297;WS=25137279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	25137385	rs11861481	G	A	716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=19.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.93;MQRankSum=-3.826;QD=4.22;ReadPosRankSum=-1.921;SOR=2.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:128,42:0.25:170
chr16	25137449	rs7188975	A	T	3028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.755;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=4.368;NF=66;NR=68;PP=1638;ReadPosRankSum=-1.269;SC=TGGGAGGAGGAAAGTGTTAGG;SOR=0.667;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=244;TCF=124;TCR=120;TR=134;WE=25137457;WS=25137439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,149:0.58:259
chr16	25137480	rs71391595	G	A	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FS=0.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQRankSum=-3.050;QD=2.60;ReadPosRankSum=1.063;SOR=0.592;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:166,47:0.22:213
chr16	25163017	rs139504024	G	GGTGTGT,GGTGTGTGT	992.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=61.17;QD=45.12;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,6,16:0.27,0.73:22
chr16	25172307	rs111379361	A	AT	265.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=2.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.99;ReadPosRankSum=-0.200;SOR=0.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,15:0.79:19
chr16	25172531	.	AT	A	56.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.209;ClippingRankSum=0.000;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=3.341;QD=0.52;ReadPosRankSum=0.269;SOR=0.649;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,17:0.15:110
chr16	25180610	rs6497812	G	A	1745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=34;PP=985;SC=CTTTGCAGATGTGATCATGGA;SOR=1.214;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=25;TCR=34;TR=59;WE=25180618;WS=25180600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr16	25238420	rs117255669	G	A	2700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.552;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=35;PP=1578;ReadPosRankSum=-0.214;SC=CATGAATCCCGCCCGTGCTTT;SOR=0.614;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=188;TCF=130;TCR=58;TR=112;WE=25238428;WS=25238410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,123:0.59:207
chr16	25239805	rs2287798	G	C	5353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=95;NR=96;PP=2965;SC=CATCCTGAAGGCTCGGTGAAG;SOR=0.836;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=191;TCF=95;TCR=96;TR=191;WE=25239813;WS=25239795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr16	25239872	rs2287797	G	C	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=332;ReadPosRankSum=0.703;SC=GTCCCAGACTGAGGACAGGGG;SOR=0.719;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=72;TCF=25;TCR=47;TR=23;WE=25239880;WS=25239862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,24:0.32:76
chr16	25255080	rs141745999	T	TAAAACTCCTTGGTTTTGCACC	3025.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FS=1.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.04;MQRankSum=1.525;QD=12.40;ReadPosRankSum=0.231;SOR=0.800;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:170,74:0.30:244
chr16	25255242	rs8059494	T	A	3648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.939;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=66;PP=2397;ReadPosRankSum=-0.899;SC=AGCCTGTAGGTTCCTGGGGTT;SOR=0.519;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=219;TCF=122;TCR=97;TR=143;WE=25255250;WS=25255232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,156:0.63:246
chr16	25255506	rs11642611	C	T	1506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.484;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=44;PP=951;ReadPosRankSum=0.978;SC=ACAATTTGCTCTTCCGATGAC;SOR=0.642;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=242;TCF=105;TCR=137;TR=79;WE=25255514;WS=25255496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,86:0.32:268
chr16	25258035	rs11649280	A	G	2919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=360;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.269;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=58;PP=1729;ReadPosRankSum=-2.003;SC=TACCACTGAGATTCTGAAACA;SOR=0.607;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=325;TCF=191;TCR=134;TR=139;WE=25258043;WS=25258025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:206,153:0.43:359
chr16	25258780	rs36001886	T	A	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=22;PP=498;ReadPosRankSum=0.737;SC=TCTTCTGCTGTCACATGCTCT;SOR=0.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=4;TCR=31;TR=25;WE=25258788;WS=25258770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,26:0.72:36
chr16	25263278	rs2112811	G	A	1490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.784;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=32;PP=928;ReadPosRankSum=0.051;SC=TCCCGGTAGAGGTCCCTTTGG;SOR=0.836;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=180;TCF=95;TCR=85;TR=71;WE=25263286;WS=25263268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,78:0.40:195
chr16	25264196	rs4787702	G	A	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.472;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=155;ReadPosRankSum=-0.319;SC=CTGAGATTGCGCCACTGTACT;SOR=0.818;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=9;WE=25264204;WS=25264192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr16	25264440	rs11643089	T	C	2827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=68;PP=1717;SC=GAGATGAGTATGTATTGAAAC;SOR=1.588;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=103;TCF=35;TCR=68;TR=103;WE=25264448;WS=25264430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
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chr16	25704145	rs2943336	A	G	1552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=41;NR=13;PP=902;SC=GGAGGCGCCCAGGACGCCTGG;SOR=1.688;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=41;TCR=13;TR=54;WE=25704153;WS=25704135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
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chr16	27215380	rs908382	A	C	2364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.046;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=46;PP=1144;ReadPosRankSum=0.235;SC=GCCGCAAGGCAGGCTGGAAAC;SOR=0.744;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=191;TCF=104;TCR=87;TR=104;WE=27215388;WS=27215370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,118:0.54:217
chr16	27222390	rs142095780	G	A	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.22;ReadPosRankSum=-0.269;SOR=0.437;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
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chr16	27226437	rs8054431	G	T	1305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=37;PP=874;ReadPosRankSum=-0.342;SC=GAGGAGCCAGGCTGTAAGTCT;SOR=0.655;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=143;TCF=49;TCR=94;TR=56;WE=27226445;WS=27226427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,63:0.40:158
chr16	27227122	rs7405158	T	C	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.777;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=283;ReadPosRankSum=-1.186;SC=CCAGGGCCTCTAAGGGTTGGA;SOR=1.570;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=65;TCF=57;TCR=8;TR=19;WE=27227130;WS=27227112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,20:0.30:67
chr16	27227168	rs11645703	T	G	1460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.607;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=20;PP=971;ReadPosRankSum=-0.507;SC=GGGTGACGGGTGCTGCAGCTG;SOR=0.786;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=171;TCF=119;TCR=52;TR=68;WE=27227176;WS=27227158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,72:0.41:176
chr16	27231740	rs34577370	G	C	2490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=29;PP=1382;ReadPosRankSum=-1.174;SC=ACATCCGGCTGTATTCCCCGC;SOR=0.669;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=89;TCR=45;TR=86;WE=27231748;WS=27231730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,105:0.67:156
chr16	27244548	rs28456036	A	G	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.490;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=119;ReadPosRankSum=-1.255;SC=AGTCTGGCAGAGGCACAGTAA;SOR=1.281;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=4;TCR=35;TR=9;WE=27244556;WS=27244538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,9:0.21:43
chr16	27253059	rs28363677	G	A	526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=3;PP=383;SC=ACTTAGTGACGAACCGTCCTC;SOR=2.419;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=27253067;WS=27253049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr16	27268779	rs7195194	G	C	1665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=29;PP=1042;ReadPosRankSum=-1.626;SC=GTAGCAGTGCGTCTGCAAGCG;SOR=0.691;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=230;TCF=144;TCR=86;TR=79;WE=27268787;WS=27268769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,89:0.36:249
chr16	27269081	rs7200596	T	G	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=172;ReadPosRankSum=0.367;SC=GACTGGGCAGTGGTAAGAGGT;SOR=0.346;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=9;WE=27269089;WS=27269071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr16	27300315	rs8043633	A	T	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=48;ReadPosRankSum=-1.368;SC=ATGCTAGAGGAAAAAGGAGAG;SOR=0.354;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=6;WE=27300323;WS=27300305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,6:0.19:32
chr16	27356203	rs1805010	A	G	5290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=111;NR=74;PP=2965;SC=CCACACGTGTATCCCTGAGAA;SOR=1.022;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=185;TCF=111;TCR=74;TR=185;WE=27356211;WS=27356193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr16	27356359	rs2074572	C	T	1358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.873;HP=3;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NR=36;ReadPosRankSum=-0.743;SC=GGGCGGAGTGCGGCAGGGGTG;SOR=0.489;Source=Platypus;TCR=64;WE=27356367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,57:0.61:93
chr16	27356398	rs2072130	C	T	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=344;ReadPosRankSum=1.274;SC=GCTGCCTGGGCTGAGGGTGGG;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=40;TCF=14;TCR=26;TR=20;WE=27356406;WS=27356388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr16	27356655	rs56144432	G	T	1268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.655;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=39;PP=1870;ReadPosRankSum=0.765;SC=ATTGAAAACCGAACTGGGAAC;SOR=1.012;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=165;TCF=73;TCR=92;TR=65;WE=27356675;WS=27356645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,66:0.37:179
chr16	27356667	rs3024560	T	G	1927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=45;PP=2937;ReadPosRankSum=1.287;SC=ACTGGGAACATTCCTTCCATT;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=48;TCR=77;TR=73;WE=27356675;WS=27356645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,82:0.60:136
chr16	27357927	rs2234895	C	T	2217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=343;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.567;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=54;PP=1421;ReadPosRankSum=0.099;SC=GGAGTGAAAACGACCCGGCAG;SOR=0.506;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=313;TCF=149;TCR=164;TR=114;WE=27357935;WS=27357917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:223,119:0.35:342
chr16	27366562	rs3024634	A	G	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.188;HP=5;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=241;ReadPosRankSum=-0.061;SC=AGCGATGGGCAGGGGGCAACG;SOR=2.448;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=12;WE=27366570;WS=27366552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr16	27367334	rs4787423	C	T	2178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=31;NR=42;PP=1232;SC=CAATAATACGCATTTACTGAG;SOR=1.193;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=77;TCF=31;TCR=46;TR=73;WE=27367342;WS=27367324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr16	27367413	rs3116572	T	C	59.85	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.96;ReadPosRankSum=0.319;SOR=2.788;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr16	27370932	rs138640688	AGTG	A	400.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=61.07;NF=8;NR=1;PP=357;SC=TCTGGAATCTAGTGGTGTTGG;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=27370942;WS=27370922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr16	27371158	rs3024660	C	T	2130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=43;PP=1164;ReadPosRankSum=0.722;SC=GTGTAACAAACGACCCCGAAA;SOR=0.710;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=154;TCF=78;TCR=76;TR=89;WE=27371166;WS=27371148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,99:0.58:170
chr16	27414339	rs12934152	T	C	633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.985;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=7;PP=440;ReadPosRankSum=0.317;SC=TCAGTTTCTATGTCTTACCAC;SOR=0.925;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=100;TCF=76;TCR=24;TR=32;WE=27414347;WS=27414329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,33:0.32:102
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chr16	27494637	rs150174071	G	A	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.331;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=381;ReadPosRankSum=0.800;SC=ACCTCAGTCAGGTCTGTTCAC;SOR=1.002;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=20;WE=27494645;WS=27494627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,22:0.51:43
chr16	27561584	rs4787969	G	A	6812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=97;NR=125;PP=2965;SC=CCTAGGCCATGAACCCCTGGA;SOR=1.074;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=222;TCF=97;TCR=125;TR=222;WE=27561592;WS=27561574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr16	27629661	rs4787980	G	C	1162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=4;PP=956;SC=CTCTCAGCCTGCTGCGCCGGT;SOR=3.556;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=36;TCR=4;TR=40;WE=27629669;WS=27629651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr16	27642249	rs233453	A	G	1855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=14;PP=1295;SC=TGCCACAACCACGCTGTAGTC;SOR=2.406;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=51;TCR=14;TR=65;WE=27642257;WS=27642239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr16	27666204	rs233470	A	G	546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=15;PP=434;SC=TAATCCCAGCACTTTGGGAGG;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=27666212;WS=27666194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	27752314	rs5816442	T	TC	350.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.98;NF=1;NR=8;PP=317;SC=GCCAGTTAGCTCCTGGACCTC;SOR=3.442;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=9;WE=27752322;WS=27752304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr16	27772901	rs4787984	G	A	7578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=126;NR=137;PP=2965;SC=CGACTCCCGGGCCCTGGACAA;SOR=0.855;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=265;TCF=127;TCR=138;TR=263;WE=27772909;WS=27772891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,290:1.00:290
chr16	27777831	rs8043555	A	G	5301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=95;PP=2850;SC=TCAGTCCAGCATCAGGGAAGC;SOR=0.930;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=182;TCF=87;TCR=95;TR=182;WE=27777839;WS=27777821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr16	27802805	rs1644600	C	T	1102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.629;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=24;PP=558;ReadPosRankSum=0.849;SC=GGAGACAAGGCGGTCAGTGCT;SOR=0.716;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=134;TCF=70;TCR=64;TR=54;WE=27802813;WS=27802795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,60:0.42:142
chr16	27861762	rs9923711	C	T	763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=17;PP=470;ReadPosRankSum=2.034;SC=CATCTGCATGCGAATGATAAA;SOR=0.717;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=47;TCR=35;TR=39;WE=27861770;WS=27861752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,40:0.47:86
chr16	27861785	rs9923715	C	A	1027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=21;PP=593;ReadPosRankSum=1.064;SC=ACACAATGTGCCTAGAAGAGG;SOR=0.729;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=55;TCR=40;TR=49;WE=27861793;WS=27861775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,51:0.50:101
chr16	27861969	rs72782161	A	T	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.133;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=8;PP=150;ReadPosRankSum=0.992;SC=GAAGAGGAGGAGGGTAAATGA;SOR=0.437;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=58;TCF=27;TCR=31;TR=16;WE=27861977;WS=27861959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,16:0.26:61
chr16	27974418	rs2051742	T	C	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.823;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=255;ReadPosRankSum=-1.238;SC=GCCACCAAGGTAGGAAAGATG;SOR=0.186;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=57;TCF=44;TCR=13;TR=19;WE=27974426;WS=27974408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,22:0.38:58
chr16	28143489	rs9930464	C	T	894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=5;PP=631;SC=CACAGCTTTTCATCATAAGCC;SOR=2.621;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=27;WE=28143497;WS=28143479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr16	28157351	rs28379290	T	C	406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=320;SC=CATGGCTGTCTCTTAGGCCAC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=28157359;WS=28157341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr16	28167914	rs10445001	C	A	1757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=35;PP=1062;SC=TTAAGTAATTCTCCTTCAAAA;SOR=1.721;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=19;TCR=35;TR=54;WE=28167935;WS=28167904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr16	28181306	rs28479048	A	G	2705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=57;PP=1647;SC=CATTAAAGCTATGAAGCATCT;SOR=1.473;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=32;TCR=57;TR=89;WE=28181314;WS=28181296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr16	28508716	rs40832	T	C	4307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=90;NR=63;PP=2375;SC=TTGGAAGGGGTGCTTGGGCAA;SOR=0.995;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=153;TCF=90;TCR=63;TR=153;WE=28508724;WS=28508706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr16	28510393	rs40834	C	T	1008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.116;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=30;PP=795;ReadPosRankSum=0.219;SC=ACCTCTGGAGCTGCATCCAGG;SOR=0.208;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=63;TCF=15;TCR=48;TR=42;WE=28510401;WS=28510383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,41:0.60:68
chr16	28515228	rs17855750	A	C	3424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=67;PP=1730;ReadPosRankSum=-0.721;SC=CGAACCTCGGAGAGCAGCTTC;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=238;TCF=121;TCR=117;TR=138;WE=28515236;WS=28515218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,158:0.61:260
chr16	28549508	rs151227	G	A	3871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.972;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=87;PP=2391;ReadPosRankSum=-1.929;SC=GAGGTGAAGTGGGCATAGGCA;SOR=0.907;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=233;TCF=108;TCR=125;TR=160;WE=28549516;WS=28549498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,173:0.67:257
chr16	28550269	rs76007774	C	T	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5132;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=210;ReadPosRankSum=0.765;SC=CTTCTCCTAACGCTTTGTCTG;SOR=1.038;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=12;WE=28550277;WS=28550259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr16	28596884	rs10521145	G	A	2279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.647;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=23;PP=1308;ReadPosRankSum=-0.987;SC=GTGCCTCCACGAGTGTGATTC;SOR=1.015;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=155;TCF=106;TCR=49;TR=83;WE=28596892;WS=28596874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,99:0.55:181
chr16	28602991	rs11401	A	G	4956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=394;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.371;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=107;NR=115;PP=2909;ReadPosRankSum=0.930;SC=TGGCTCAGAGATACGTGGTGG;SOR=0.667;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=364;TCF=174;TCR=190;TR=222;WE=28602999;WS=28602981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,238:0.60:394
chr16	28603012	rs3194168	A	G	3956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.878;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=96;PP=2497;ReadPosRankSum=0.817;SC=CTTGTAAGGAACCCAAGAAAA;SOR=0.760;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=290;TCF=128;TCR=162;TR=171;WE=28603026;WS=28603002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,184:0.59:312
chr16	28603393	rs27742	T	C	43.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQ=42.57;NF=2;NR=0;PP=26;SC=GCCATCTTCTTCGCATAGTCC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=28603401;WS=28603383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr16	28604686	rs3743963	A	G	3623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.050;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQ=59.98;MQRankSum=-1.159;NF=88;NR=66;PP=2231;ReadPosRankSum=0.984;SC=GCGGGCAGGGAGTGCCGACAC;SOR=0.849;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=251;TCF=142;TCR=109;TR=154;WE=28604694;WS=28604676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,166:0.60:278
chr16	28607196	rs10797300	G	A	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.186;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.647;NF=4;NR=8;PP=157;ReadPosRankSum=-0.355;SC=CTTGATGAGCGGGACCCCCTT;SOR=1.718;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=22;TCF=9;TCR=13;TR=12;WE=28607204;WS=28607186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr16	28617485	rs1801030	C	T	5322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=109;NR=89;PP=2965;SC=TGCTGAACCACGAAGTCCACG;SOR=0.958;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=200;TCF=110;TCR=90;TR=198;WE=28617493;WS=28617475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr16	28618238	rs7499134	A	G	11119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=412;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=195;NR=189;PP=2965;SC=ACCACCCCTTAGCTCCACACT;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=384;TCF=195;TCR=189;TR=384;WE=28618246;WS=28618228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,412:1.00:412
chr16	28618708	rs11648192	C	T	1629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=38;PP=1077;SC=TGAGGACCCACCCTCTAGCTT;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=14;TCR=38;TR=52;WE=28618716;WS=28618698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr16	28620800	rs3760091	C	G	3162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.309;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=80;PP=2108;ReadPosRankSum=0.431;SC=AGCAAAAGCACAGGCCTAGGC;SOR=0.906;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=248;TCF=106;TCR=142;TR=131;WE=28620808;WS=28620790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,145:0.52:281
chr16	28621311	rs2077412	T	C	948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.814;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=24;PP=694;ReadPosRankSum=1.336;SC=ATTGTGGGTGTTGTGTGGGGA;SOR=0.736;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=78;TCF=41;TCR=37;TR=46;WE=28621319;WS=28621301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,46:0.54:85
chr16	28631314	rs141320733	T	TTGTGTG,TTGTG	1586.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;NF=6,6;NR=11,11;PP=36,607;SC=GTATTGTATATTGTGTGTGTG;SOR=1.085;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=17,17;WE=28631322;WS=28631304;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:0.95:42
chr16	28631360	rs28410083	A	T	1741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=25;PP=952;SC=AGATACTGATAACATTTTCAA;SOR=0.723;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=28;TCR=25;TR=53;WE=28631368;WS=28631350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr16	28835900	rs12920514	G	A	5892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=105;NR=99;PP=2965;SC=AGGTCGAGGGGATGGGGTGTG;SOR=0.749;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=204;TCF=105;TCR=99;TR=204;WE=28835908;WS=28835890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr16	28838073	rs12448482	A	G	1378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=9;PP=1010;SC=CGTACTCTGGACTTCTTAAAC;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=34;TCR=9;TR=43;WE=28838081;WS=28838063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr16	28842311	rs4344749	A	G	2052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=37;PP=1638;SC=CAAAGGCACAACGGCCTCTGA;SOR=0.992;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=73;TCF=36;TCR=37;TR=73;WE=28842319;WS=28842301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr16	28844068	rs7498491	T	A	1953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=23;PP=1243;SC=CCTCTGTTCTTTTGGCACTGT;SOR=1.163;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=66;TCF=42;TCR=24;TR=65;WE=28844076;WS=28844058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr16	28845584	rs35725751	C	T	8391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=153;NR=135;PP=2965;SC=GATTTGGTTGCGCTGGTTGAG;SOR=0.706;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=289;TCF=154;TCR=135;TR=288;WE=28845592;WS=28845574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,310:1.00:310
chr16	28856819	rs8061877	C	T	4456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=81;PP=2556;SC=AGGAAAAGAACACACCTCTCA;SOR=0.816;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=77;TCR=81;TR=158;WE=28856827;WS=28856809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr16	28883327	rs28433345	T	C	836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=21;PP=533;SC=TGAGTGTGCATGTCTCCAGGC;SOR=2.376;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=27;WE=28883335;WS=28883317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr16	28884755	rs373816615	C	T	739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FS=0.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.30;ReadPosRankSum=1.109;SOR=0.602;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:124,48:0.28:172
chr16	28903656	rs6565261	C	A	3471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=69;PP=2094;ReadPosRankSum=-0.931;SC=TGACCTCAGGCCAAGAACCCC;SOR=1.187;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=122;TCF=52;TCR=70;TR=120;WE=28903664;WS=28903646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,131:0.98:133
chr16	28906084	rs9931989	G	C	5487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=105;NR=77;PP=2965;SC=GGTGGAAGGAGGGTATGACAG;SOR=0.928;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=183;TCF=106;TCR=77;TR=182;WE=28906092;WS=28906074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr16	28913787	rs7189927	T	C	1265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=29;SC=CCCATGCAGGTGCTGAGAGGG;SOR=1.085;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=19;TCR=29;TR=48;WE=28913795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr16	28914026	rs41292394	G	A	2111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.767;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=46;PP=1368;ReadPosRankSum=0.094;SC=GGAGGGTGTGGGGATGCAGGA;SOR=0.526;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=249;TCF=137;TCR=112;TR=101;WE=28914034;WS=28914016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,108:0.41:261
chr16	28915527	rs10499	G	A	6086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=118;NR=91;PP=2965;SC=AAGGAAGTGAGCATCCTTTTG;SOR=0.782;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=209;TCF=118;TCR=91;TR=209;WE=28915535;WS=28915517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr16	28922149	rs11646653	C	T	5818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=98;NR=90;PP=2965;SC=CCTTCCACCACGTGCAACTGA;SOR=0.702;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=188;TCF=98;TCR=90;TR=188;WE=28922157;WS=28922139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr16	28925978	rs3924376	T	C	4947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=91;NR=80;PP=2678;SC=CAGCGCCCCCTGGCCGTGCCC;SOR=0.715;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=172;TCF=92;TCR=80;TR=171;WE=28925986;WS=28925968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr16	28944396	rs2904880	C	G	8220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=146;NR=134;PP=2965;SC=GCCTCCGTGTCTCCCACCGAG;SOR=0.713;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=281;TCF=147;TCR=134;TR=280;WE=28944404;WS=28944386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,301:1.00:301
chr16	28950051	rs34763945	G	A	2424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=37;PP=1391;ReadPosRankSum=1.679;SC=CCCCAGCTCCGCTCCATTCGG;SOR=0.675;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=162;TCF=100;TCR=62;TR=95;WE=28950059;WS=28950041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,109:0.60:181
chr16	28993049	rs6565300	A	C	2808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.044;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;ReadPosRankSum=0.168;SC=AATTCGGTCGATACTGTCCCC;SOR=1.956;Source=Platypus;TCF=28;WE=28993057;WS=28993039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,95:0.98:97
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chr16	28997997	rs1131543	G	A	8585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=155;NR=128;PP=2965;ReadPosRankSum=2.259;SC=GTGAGGATGCGGATGAGGATG;SOR=0.730;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=287;TCF=157;TCR=130;TR=283;WE=28998005;WS=28997987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,326:0.99:328
chr16	29001460	rs9929088	A	C	5378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=75;PP=2965;SC=TACCTGCTGAACCCCGTCAGC;SOR=0.925;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=177;TCF=101;TCR=76;TR=176;WE=29001468;WS=29001450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr16	29088128	rs67548829	TACAACTATTGCTGTTATACTAAAGACCAATAGAAATAGCAAGATTAATTAAGATACCAGTTGAAA	T	1062.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FS=4.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.21;MQRankSum=5.141;QD=3.88;ReadPosRankSum=-5.695;SOR=1.059;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:229,45:0.16:274
chr16	29088221	rs2442141	A	G	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=11.579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.80;MQRankSum=-1.416;QD=1.71;ReadPosRankSum=-0.738;SOR=0.013;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,6:0.17:35
chr16	29102189	rs56374327	C	CT	2945.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.61;MQRankSum=0.816;QD=29.75;ReadPosRankSum=1.928;SOR=1.337;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,97:0.98:99
chr16	29113263	rs149472124	C	T	542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-1.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.629;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.972;NF=21;NR=2;PP=467;ReadPosRankSum=0.742;SC=CAGAGTCACTCCAGCATGTTA;SOR=1.179;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=51;TCF=44;TCR=7;TR=23;WE=29113271;WS=29113253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,22:0.41:54
chr16	29113497	rs11366120	AT	A	1573.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.557;HP=10;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-11.227;NF=5;NR=60;PP=690;ReadPosRankSum=1.299;SC=GAGGAGGTGGATTTTTTTTTT;SOR=0.631;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=181;TCF=8;TCR=173;TR=65;WE=29113505;WS=29113487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,85:0.40:211
chr16	29127350	rs1540389	T	C	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.789;NF=8;NR=0;PP=113;ReadPosRankSum=-0.620;SC=TCTGAATAGATAGAGTTGAGA;SOR=0.536;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=8;WE=29127358;WS=29127343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,7:0.27:26
chr16	29142059	rs1642020	G	C	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-6.754;NF=12;NR=8;PP=183;ReadPosRankSum=-0.657;SC=CTGGCGGGGAGAGCCAGGAGA;SOR=0.675;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=69;TCF=39;TCR=30;TR=20;WE=29142067;WS=29142049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,19:0.27:70
chr16	29150636	rs34323521	A	AC	139.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.814;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=180;ReadPosRankSum=-2.178;SC=ACCAAGGGTGACCCCCCACAG;SOR=2.564;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=9;WE=29150644;WS=29150626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr16	29150785	rs1646119	G	A	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.748;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.462;NF=17;NR=18;PP=395;ReadPosRankSum=0.887;SC=TTGGCCGCTCGTTCTAGTTTA;SOR=0.852;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=101;TCF=53;TCR=48;TR=35;WE=29150793;WS=29150775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,38:0.34:112
chr16	29332380	rs257878	T	C	4212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=72;NR=71;PP=2045;SC=GAGCTTCTCGTGGAGAATGCC;SOR=0.796;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=143;TCF=72;TCR=71;TR=143;WE=29332388;WS=29332370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr16	29337658	rs2934463	T	G	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=4.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.596;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-9.451;NF=25;NR=6;PP=528;ReadPosRankSum=-1.168;SC=CACACCTGTTTCCTCCACAGA;SOR=1.921;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=87;TCF=64;TCR=23;TR=31;WE=29337666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,26:0.28:92
chr16	29340099	rs28598582	T	C	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQ=58.91;MQRankSum=-1.036;NF=1;NR=2;PP=20;ReadPosRankSum=-0.903;SC=GTGCACATAGTGGGCCTGCAG;SOR=0.892;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=3;WE=29340107;WS=29340089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr16	29342500	rs9745636	T	A	1090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-8.082;NF=23;NR=14;PP=436;ReadPosRankSum=1.095;SC=GTTTGCTGTGTCTGCGGGTGT;SOR=0.602;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=111;TCF=72;TCR=39;TR=37;WE=29342508;WS=29342490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,33:0.29:114
chr16	29342517	rs9745637	T	G	1182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.703;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-9.729;NF=25;NR=19;PP=533;ReadPosRankSum=-0.776;SC=GTGTCTTGGTTTGTTTCTACT;SOR=0.597;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=137;TCF=82;TCR=55;TR=44;WE=29342525;WS=29342507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,40:0.28:142
chr16	29342546	rs9745639	T	C	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.62;MQRankSum=-11.988;QD=2.74;ReadPosRankSum=-0.469;SOR=0.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:154,39:0.20:193
chr16	29376400	.	CTG	C	410.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=0.000;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=6.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.53;MQRankSum=-5.817;QD=3.70;ReadPosRankSum=-0.106;SOR=1.519;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,31:0.28:111
chr16	29645104	rs35388990	CA	C	98.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQRankSum=-4.773;QD=1.43;ReadPosRankSum=1.896;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,20:0.29:69
chr16	29675437	.	G	A	6115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.691;ClippingRankSum=0.000;DP=481;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.525;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=135;NR=126;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.483;SC=ATCCCACACCGTGACAGGTGG;SOR=0.757;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=440;TCF=227;TCR=213;TR=261;WE=29675445;WS=29675427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:203,278:0.58:481
chr16	29705854	rs9936468	C	T	482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=2;PP=382;SC=CCGCAGTCCCCCCCCTGGGAC;SOR=2.948;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=17;WE=29705862;WS=29705852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr16	29708350	rs9932770	A	G	2132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=25;PP=1194;SC=GGCTGACTTCACTCTGAAGGT;SOR=1.151;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=45;TCR=25;TR=70;WE=29708358;WS=29708340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr16	29790669	rs235634	T	A	3881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.30;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr16	29790678	rs183527	T	G	3528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.24;SOR=1.252;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr16	29790709	rs12933548	C	T	534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.517;HP=2;HapScore=2;MGOF=42;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=394;ReadPosRankSum=-1.023;SC=TGCTGTTGGCCAAGGCTTTTG;SOR=1.535;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=44;TCF=15;TCR=29;TR=21;WE=29790717;WS=29790699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,22:0.49:45
chr16	29790767	rs235635	A	G	1830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=37;NR=19;PP=1213;SC=AACAGGGGTGATGCAGAGAAA;SOR=1.467;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=37;TCR=19;TR=56;WE=29790775;WS=29790757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr16	29790864	rs235636	G	A	4510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;MQ=59.96;NF=89;NR=73;PP=2809;SC=AGAGTATGGAGGTGGTGGTGG;SOR=0.853;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=162;TCF=89;TCR=73;TR=162;WE=29790872;WS=29790854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr16	29791561	rs235637	T	G	9331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=157;NR=148;PP=2965;SC=GAAGAAGCTGTTATTTGTGAC;SOR=0.699;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=306;TCF=158;TCR=148;TR=305;WE=29791569;WS=29791551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,343:1.00:343
chr16	29791721	rs235638	G	C	4357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=82;PP=2626;SC=GTTTACCCCAGTAGCTGCAGC;SOR=1.364;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=135;TCF=53;TCR=82;TR=135;WE=29791729;WS=29791711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr16	29791818	rs35586094	TA	T	520.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=12;PP=282;SC=AATGGCTCAATAAAAAAAATA;SOR=2.531;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=13;WE=29791826;WS=29791808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	29811319	rs235648	C	T	6050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=114;PP=2965;SC=AAGAGGAGATCGGGAGCCCTG;SOR=1.200;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=195;TCF=81;TCR=114;TR=195;WE=29811327;WS=29811309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr16	29814234	rs2450399	G	A	9872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=371;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=176;NR=162;PP=2965;SC=TGAAGACAGTGGAAGAGAAGG;SOR=0.748;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=338;TCF=176;TCR=162;TR=338;WE=29814242;WS=29814224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,370:1.00:370
chr16	29817998	rs111993640	C	T	2192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=53;NR=21;PP=1239;SC=CGCTGAGCCCCGGGGGCCCCG;SOR=1.552;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=53;TCR=21;TR=74;WE=29818006;WS=29817988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr16	29818709	rs140085104	C	T	3829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=628;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.163;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=102;PP=2360;ReadPosRankSum=-0.123;SC=AGTTCAAGAACGGCTACAATC;SOR=0.802;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=595;TCF=299;TCR=296;TR=200;WE=29818717;WS=29818699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:412,214:0.34:626
chr16	29821744	rs2516825	G	A	7897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=131;NR=124;PP=2965;SC=CTCCTCTTCTGTCAGACCTGA;SOR=0.707;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=255;TCF=131;TCR=124;TR=255;WE=29821752;WS=29821734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,290:1.00:290
chr16	29822841	rs11150572	A	C	637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=16;NR=1;PP=439;SC=CCCCAGCCGCATCCCTCCCCA;SOR=3.716;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=29822849;WS=29822831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	29823202	rs12923293	A	G	409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=9;PP=231;SC=CTGCTCGTAGAGACGCCTCCA;SOR=1.911;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=13;WE=29823210;WS=29823192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	29824543	.	G	A	2002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.950;ClippingRankSum=0.000;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.650;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=42;PP=1304;ReadPosRankSum=-2.600;SC=ACACCACTGCGGCCCCTGTGG;SOR=0.712;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=173;TCF=94;TCR=79;TR=78;WE=29824551;WS=29824533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,89:0.46:195
chr16	29825126	rs11150573	T	C	8083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=128;NR=136;PP=2965;SC=CAGCTCCCAGTTGGCAGGTCC;SOR=0.838;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=266;TCF=130;TCR=136;TR=264;WE=29825134;WS=29825116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,294:1.00:294
chr16	29872361	rs3815822	G	A	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.936;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=268;ReadPosRankSum=0.051;SC=ACACCCTTCCGTCTAGGCTCA;SOR=0.506;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=56;TCR=19;TR=27;WE=29872369;WS=29872351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,30:0.35:85
chr16	29891206	rs113753753	C	T	1847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=24;PP=1041;ReadPosRankSum=1.070;SC=GGCTCTGTGTCGTTCCAGTGG;SOR=0.676;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=131;TCF=88;TCR=43;TR=74;WE=29891214;WS=29891196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,82:0.57:143
chr16	29908433	rs11649499	C	G	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=208;ReadPosRankSum=0.837;SC=CGTGGGGTCCCGATCAGATCC;SOR=0.776;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=41;TCF=14;TCR=27;TR=16;WE=29908441;WS=29908423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,17:0.40:42
chr16	29912802	rs140411458	G	GGGT	3846.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.128;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=33;PP=1965;ReadPosRankSum=0.631;SC=GGGCAGCTCAGGGTGGCCCAG;SOR=0.641;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=155;TCF=47;TCR=108;TR=45;WE=29912810;WS=29912792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,102:0.39:260
chr16	29982611	rs10624125	A	ATTTTCCC	562.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=359;ReadPosRankSum=-0.195;SC=TGAAAATAACATTTTCCCTTC;SOR=0.481;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=8;WE=29982619;WS=29982601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr16	29999488	rs10445105	T	G	59.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr16	30081367	rs2071390	G	T	2768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.473;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=50;PP=1736;ReadPosRankSum=2.145;SC=ATAGGCAGGAGGTGGGCAGGG;SOR=0.539;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=186;TCF=107;TCR=79;TR=111;WE=30081375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,123:0.61:203
chr16	30097630	rs2289292	C	T	2432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=48;NR=32;PP=1318;SC=GGAGAAAGTGCGGGGCAAAGG;SOR=0.929;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=48;TCR=32;TR=80;WE=30097638;WS=30097620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr16	30119525	rs8061772	C	A	589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=5;PP=319;SC=GTGGTGGTCACGGCCTCACCT;SOR=1.329;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=19;WE=30119533;WS=30119515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr16	30134679	rs61764202	C	T	633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=2;PP=438;SC=GTCACGTGACCCGCCCCGCGC;SOR=3.160;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=30134687;WS=30134669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr16	30198151	rs1132812	A	G	3660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=63;PP=2280;SC=GGGAGATCCCAGATGGGGGCC;SOR=0.831;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=64;TCR=63;TR=127;WE=30198159;WS=30198141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr16	30199713	rs150857828	C	A	2659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=344;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.315;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=73;PP=1538;ReadPosRankSum=1.288;SC=CTGTACCCACCCACCGCAGGG;SOR=0.791;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=316;TCF=142;TCR=174;TR=127;WE=30199721;WS=30199703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:207,137:0.40:344
chr16	30208527	rs2304624	C	T	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.09;MQRankSum=-1.019;QD=4.72;ReadPosRankSum=-0.461;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr16	30380486	rs4238961	T	C	705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=4;PP=442;SC=ATCGTTTTCGTTTCGCCCTCC;SOR=2.030;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=21;WE=30380494;WS=30380476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	30386262	rs8046445	C	T	5171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=96;NR=87;PP=2965;SC=GTAGCTGGTTCCCAGTCCAAC;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=183;TCF=96;TCR=87;TR=183;WE=30386270;WS=30386252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr16	30390314	rs12447833	T	C	2475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=15;PP=1704;SC=TTGGAGGCTCTGATACTGTCC;SOR=2.698;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=78;TCF=63;TCR=15;TR=77;WE=30390322;WS=30390304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr16	30393660	rs4787643	G	A	12416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=464;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=207;NR=232;PP=2965;SC=GGTTGGGGAGGGCAGCAAAAC;SOR=0.840;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=439;TCF=207;TCR=232;TR=439;WE=30393668;WS=30393650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,464:1.00:464
chr16	30393771	rs4788409	G	A	2314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=52;PP=1564;SC=GCTAGGAAGAGTCAGTGGGGT;SOR=1.996;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=19;TCR=52;TR=71;WE=30393779;WS=30393761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr16	30407269	rs13333093	C	A	6190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=122;NR=96;PP=2965;SC=TGTGGCCGGCCGAGATCCTGG;SOR=0.772;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=218;TCF=122;TCR=96;TR=218;WE=30407277;WS=30407259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
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chr16	30410445	rs4788413	C	T	3458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=71;PP=2109;SC=CCAGGGAGGGCGGAGGCCCAG;SOR=1.708;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=37;TCR=72;TR=108;WE=30410453;WS=30410435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
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chr16	30424888	rs11314620	GT	G	1454.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=28;PP=561;ReadPosRankSum=0.396;SC=GAAATTTTGGGTTTTTTTTTC;SOR=0.457;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=30;WE=30424896;WS=30424878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,56:0.98:57
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chr16	30495412	rs2285459	T	C	1209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=20;PP=711;ReadPosRankSum=-0.552;SC=ATTTCAGCTCTTCACTCTCCA;SOR=0.734;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=158;TCF=90;TCR=68;TR=52;WE=30495420;WS=30495402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,62:0.35:177
chr16	30495657	rs7197010	T	C	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=2.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.78;ReadPosRankSum=-0.955;SOR=0.165;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr16	30500761	rs3087438	G	A	1260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.617;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=31;PP=701;ReadPosRankSum=-1.262;SC=TCAGATGGTCGCTCAGCCTGG;SOR=0.904;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=95;TCF=35;TCR=60;TR=48;WE=30500769;WS=30500751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,58:0.53:109
chr16	30505513	rs4350585	A	G	3688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=584;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.545;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=95;PP=2285;ReadPosRankSum=1.383;SC=CTAACTCCACACCCCACACAC;SOR=0.640;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=536;TCF=273;TCR=263;TR=189;WE=30505521;WS=30505503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:376,206:0.35:582
chr16	30507972	rs28708641	T	C	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.245;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=151;ReadPosRankSum=-0.265;SC=TTTATTTTGGTTTTTTTTAGA;SOR=0.155;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=8;WE=30507980;WS=30507962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr16	30510571	rs1557672	C	T	1879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=42;PP=1340;ReadPosRankSum=0.082;SC=AGCTCTCCTCCTGCTCCCAGG;SOR=0.703;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=209;TCF=113;TCR=96;TR=89;WE=30510579;WS=30510561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,92:0.41:223
chr16	30522152	rs3087443	G	A	2611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.642;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=36;PP=1551;ReadPosRankSum=-0.836;SC=GGGCCATGAGGCTGCTCCTCA;SOR=0.635;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=147;TCF=96;TCR=51;TR=105;WE=30522160;WS=30522142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,117:0.70:166
chr16	30536672	rs3751847	A	G	2951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=68;PP=1999;ReadPosRankSum=-1.040;SC=CGCAGATGCCACAGATGTTAG;SOR=0.719;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=255;TCF=127;TCR=128;TR=132;WE=30536680;WS=30536662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,141:0.51:274
chr16	30536918	rs10871453	C	G	3802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.914;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=77;PP=2459;ReadPosRankSum=1.413;SC=GACTCTTTTCCTCGGGGTTCA;SOR=0.763;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=279;TCF=147;TCR=132;TR=167;WE=30536926;WS=30536908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,175:0.61:289
chr16	30538259	rs3794703	T	C	107.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=3;PP=61;SC=ACGGGGTGGGTGAGGACCGGA;SOR=1.981;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=30538267;WS=30538249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr16	30543810	.	T	A	3222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.315;ClippingRankSum=0.000;DP=390;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=62;PP=1963;ReadPosRankSum=-0.923;SC=GATGGTCACTTTTTAGGCCGT;SOR=0.703;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=362;TCF=213;TCR=149;TR=153;WE=30543818;WS=30543800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:221,168:0.43:389
chr16	30585139	rs142051127	TTAAA	T	952.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.28;MQRankSum=0.777;QD=25.07;ReadPosRankSum=-0.097;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,25:0.66:38
chr16	30724070	rs4889500	G	T	5508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=98;PP=2965;SC=AGTTGAAACGGTGGTGCCCCA;SOR=0.827;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=190;TCF=92;TCR=98;TR=190;WE=30724078;WS=30724060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr16	30724221	rs4889501	C	T	1000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.05;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr16	30732406	rs1470129	C	G	2207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=24;PP=1720;SC=GCTGGGGACACGGGTCTAGTA;SOR=1.516;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=73;TCF=48;TCR=25;TR=72;WE=30732414;WS=30732396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr16	30734963	rs4889502	C	A	4443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=51;PP=2835;SC=TGCCATCCTCCCTCCCTGGGC;SOR=1.480;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=99;TCR=51;TR=150;WE=30734971;WS=30734953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr16	30744826	rs62057183	C	T	1409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=30;PP=944;ReadPosRankSum=1.237;SC=TCTCCTTTTCCCAGGATTTGG;SOR=0.726;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=155;TCF=83;TCR=72;TR=65;WE=30744834;WS=30744816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,68:0.41:164
chr16	30745770	rs113536311	A	G	1907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.460;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=39;PP=1324;ReadPosRankSum=0.186;SC=TAGACCTAAGACTAGCATTCT;SOR=0.917;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=247;TCF=143;TCR=104;TR=97;WE=30745778;WS=30745760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,101:0.37:276
chr16	30745976	rs62057184	C	T	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=21;PP=424;ReadPosRankSum=0.753;SC=TGAGCTGATTCTTACAGAATA;SOR=0.671;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=90;TCF=30;TCR=60;TR=31;WE=30745984;WS=30745966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,31:0.32:96
chr16	30760409	.	GTGC	G	39	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5006;HP=1;HapScore=2;MGOF=155;MMLQ=15;MQ=44.31;NF=1;NR=3;PP=39;QD=12.25;SC=GGTGGTGGTGGTGCTGCTGCT;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=4;WE=30760419;WS=30760399;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr16	30762640	rs4889504	C	T	2569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=33;NR=58;PP=1678;SC=GCAGACGACCCCCCACCTCCT;SOR=1.420;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=93;TCF=34;TCR=59;TR=91;WE=30762648;WS=30762630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr16	30766247	rs9941201	G	A	6141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=121;NR=96;PP=2965;SC=TGGCAAATCAGTGCAACTTGG;SOR=0.870;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=218;TCF=122;TCR=96;TR=217;WE=30766255;WS=30766237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr16	30768492	rs71820772	GCTCTGGC	G	2116.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.451;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.632;NF=2;NR=39;PP=1751;ReadPosRankSum=-0.917;SC=GCTCCTCTGGGCTCTGGCCTC;SOR=2.231;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=2;TCR=41;TR=41;WE=30768506;WS=30768481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,64:0.97:66
chr16	30770267	rs7188077	C	G	1444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=8;PP=980;SC=GTCCTGATGTCATCCAAACCC;SOR=2.352;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=35;TCR=8;TR=43;WE=30770275;WS=30770257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr16	30772040	rs4889505	A	G	5204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=91;NR=88;PP=2842;SC=TATCATGACAAGGCTGTGACA;SOR=0.819;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=179;TCF=91;TCR=88;TR=179;WE=30772048;WS=30772030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr16	30773822	rs1550477	T	C	1108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=30;NR=1;PP=845;SC=CTCCTCCCGTTTGACGCCCCT;SOR=4.743;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=31;WE=30773830;WS=30773812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr16	30779716	rs7195142	A	G	6765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=121;PP=2965;SC=CGGGAGCTTCAGGAACGGGAA;SOR=0.787;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=230;TCF=109;TCR=121;TR=230;WE=30779724;WS=30779706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr16	30780828	rs4889506	A	G	5826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=91;NR=101;PP=2965;SC=TGCAGAAGCTAGAGGAGAAGG;SOR=0.831;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=192;TCF=91;TCR=101;TR=192;WE=30780836;WS=30780818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr16	30832463	rs6565205	A	C	4871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=53;PP=2917;SC=GACACCGTCCAGCAGGTGGGC;SOR=1.375;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=155;TCF=102;TCR=53;TR=155;WE=30832483;WS=30832453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr16	30832475	rs6565206	T	C	5153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=113;NR=50;PP=2965;SC=CAGGTGGGCATGCCGTGGTGT;SOR=1.649;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=163;TCF=113;TCR=50;TR=163;WE=30832483;WS=30832453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr16	30832701	rs8045550	A	C	10927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=395;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=177;NR=186;PP=2965;SC=TGGGCGGGGGAAGAGTGAAGG;SOR=0.788;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=364;TCF=178;TCR=186;TR=363;WE=30832709;WS=30832691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,394:1.00:394
chr16	30833246	rs9319587	C	T	4225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=516;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.534;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=113;NR=82;PP=2663;ReadPosRankSum=-0.942;SC=CATCCCCCTTCGTTCACACCT;SOR=0.795;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=481;TCF=275;TCR=206;TR=195;WE=30833254;WS=30833236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:301,214:0.42:515
chr16	30833272	rs8046609	A	G	17038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=648;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=315;NR=290;PP=2965;SC=AACCGACAGCAACATGGGAGC;SOR=0.773;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=605;TCF=315;TCR=290;TR=605;WE=30833284;WS=30833262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,647:1.00:647
chr16	30833321	rs8046001	C	T	6415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=551;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.522;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=133;NR=143;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.008;SC=GATACTCCTCCGGACTCTGGG;SOR=0.652;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=508;TCF=239;TCR=269;TR=276;WE=30833329;WS=30833311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:250,301:0.55:551
chr16	30833425	rs4889510	G	C	2386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=61;PP=1786;SC=CTCCCGTGTTGCAGGGGCTGC;SOR=3.640;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=10;TCR=61;TR=71;WE=30833433;WS=30833415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr16	30886643	rs897984	T	C	1189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=36;PP=791;ReadPosRankSum=-1.518;SC=ACTGCTGAGGTTGCCCGAGGT;SOR=0.661;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=145;TCF=57;TCR=88;TR=57;WE=30886651;WS=30886633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,62:0.40:154
chr16	30905359	rs111620019	C	T	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.425;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=127;ReadPosRankSum=-0.313;SC=GCCGCGCTCTCGGCCTGCCGT;SOR=1.347;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=8;WE=30905367;WS=30905349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr16	30938811	rs12930545	A	G	1178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.588;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=33;PP=845;ReadPosRankSum=1.906;SC=GGTGGGGCAGATTGTCAGGGA;SOR=1.436;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=145;TCF=70;TCR=75;TR=52;WE=30938819;WS=30938801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,57:0.35:163
chr16	30964940	rs9926903	A	G	12171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=433;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=202;NR=195;PP=2965;SC=CACCGTCCCAAGCTGAGCCAG;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=397;TCF=202;TCR=195;TR=397;WE=30964962;WS=30964930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,430:1.00:430
chr16	30965308	rs11647243	G	A	782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.841;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=11;PP=463;ReadPosRankSum=1.819;SC=TCAGATTCCTGCCCGCAGGGT;SOR=0.923;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=88;TCF=59;TCR=29;TR=35;WE=30965316;WS=30965298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,38:0.42:91
chr16	30975312	rs370118124	CA	C	193.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=7.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.61;ReadPosRankSum=1.246;SOR=1.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,15:0.36:42
chr16	30977799	rs11150601	G	A	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.780;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=133;ReadPosRankSum=0.261;SC=AGAGGAGACAGGTGATGGAGG;SOR=2.546;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=7;WE=30977807;WS=30977789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr16	30980902	rs897986	T	C	3114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.402;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=75;PP=2085;ReadPosRankSum=0.138;SC=CTGTTAGTCCTCATTTGTCTT;SOR=0.648;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=307;TCF=134;TCR=173;TR=136;WE=30980910;WS=30980892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:188,147:0.44:335
chr16	30999142	rs9938550	A	G	2781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=381;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.262;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=54;PP=1692;ReadPosRankSum=-0.843;SC=GCAGCGGGCAACCCTGATGGG;SOR=0.816;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=349;TCF=195;TCR=154;TR=129;WE=30999150;WS=30999132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:239,141:0.37:380
chr16	30999198	rs17849880	C	T	6878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=524;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=146;NR=148;PP=2962;ReadPosRankSum=0.441;SC=ACAGGAGCTACGAGGATTTCA;SOR=0.681;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=481;TCF=241;TCR=240;TR=294;WE=30999206;WS=30999188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:206,317:0.61:523
chr16	30999462	rs2305880	T	C	1394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.936;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=30;PP=777;ReadPosRankSum=0.960;SC=GCCGGACCCGTACCATTCTCT;SOR=0.775;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=152;TCF=79;TCR=73;TR=60;WE=30999470;WS=30999452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,70:0.42:166
chr16	31004812	rs12445568	T	C	4408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=367;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.832;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=108;PP=2284;ReadPosRankSum=0.493;SC=TGATCTAGGGTGACGAGGGAG;SOR=0.851;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=325;TCF=148;TCR=177;TR=194;WE=31004820;WS=31004802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,214:0.59:365
chr16	31004926	rs7194921	C	T	1260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=35;PP=955;SC=GCACATTATTCACCTGCTCTT;SOR=4.565;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=38;WE=31004934;WS=31004916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr16	31012813	rs61239537	G	T	638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.528;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=10;PP=460;ReadPosRankSum=2.230;SC=GGGTGCTGGGGCTGGGGCTGG;SOR=1.115;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=56;TCF=37;TCR=19;TR=32;WE=31012821;WS=31012803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,31:0.63:49
chr16	31044683	rs58726213	A	G	5744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=367;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.418;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=134;NR=94;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.674;SC=CGTACAAATGACGTATTCCTA;SOR=0.498;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=331;TCF=196;TCR=135;TR=228;WE=31044691;WS=31044659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,252:0.69:366
chr16	31044897	rs12445650	G	A	794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.770;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=23;PP=587;ReadPosRankSum=1.327;SC=TGCGGGAGCTGGAGCGGGGAA;SOR=2.584;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=44;TCF=8;TCR=36;TR=26;WE=31044905;WS=31044887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,29:0.59:49
chr16	31049155	rs55979739	A	G	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=222;ReadPosRankSum=-0.088;SC=ATAAGAGCTCATGCTATTTGC;SOR=0.627;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=15;WE=31049163;WS=31049145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr16	31050023	rs732173	C	A	719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=3.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.81;ReadPosRankSum=0.382;SOR=0.252;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr16	31050033	rs732172	C	T	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=1.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.26;ReadPosRankSum=0.886;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr16	31075175	rs2303223	G	A	2376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.483;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=41;PP=1362;ReadPosRankSum=-0.642;SC=CATAGGCTTTGCCGCAACGCT;SOR=0.763;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=226;TCF=140;TCR=86;TR=109;WE=31075183;WS=31075165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,116:0.49:237
chr16	31075708	rs2032917	C	G	10802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=392;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=167;NR=182;PP=2965;SC=GTACAGGACACGCACTTGTAG;SOR=0.817;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=349;TCF=167;TCR=182;TR=349;WE=31075716;WS=31075698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,391:1.00:391
chr16	31088333	rs200365125	T	G	4326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.403;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=91;PP=2962;ReadPosRankSum=0.178;SC=GCCCACCCAGTCCCCTCCTGC;SOR=0.827;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=301;TCF=147;TCR=154;TR=173;WE=31088355;WS=31088323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,191:0.59:325
chr16	31088347	rs749671	G	A	2608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.375;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=58;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.679;SC=CTCCTGCTGAGGAGGAGCGGC;SOR=0.615;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=276;TCF=139;TCR=137;TR=121;WE=31088355;WS=31088323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,130:0.43:301
chr16	31088625	rs749670	A	G	2180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.735;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=54;PP=1363;ReadPosRankSum=-0.229;SC=CGCTGGGAGGAGAAAGGGATG;SOR=0.894;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=304;TCF=150;TCR=154;TR=100;WE=31088633;WS=31088615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:218,116:0.35:334
chr16	31090094	rs78522165	G	A	3289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.152;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=66;PP=2090;ReadPosRankSum=-0.332;SC=TGGCTGGCAGGCTGGGGCCGC;SOR=0.717;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=271;TCF=138;TCR=133;TR=139;WE=31090102;WS=31090084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,151:0.52:293
chr16	31090407	rs35713203	G	C	1396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.191;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=29;PP=1012;ReadPosRankSum=0.150;SC=GAAGAGGAAGGAGTGGCAGAG;SOR=0.648;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=118;TCF=62;TCR=56;TR=57;WE=31090415;WS=31090397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,61:0.48:127
chr16	31091209	rs3751855	T	C	1862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.933;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=44;PP=1025;ReadPosRankSum=-2.217;SC=GGCTGGAGACTGCCGAGAAGG;SOR=0.478;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=144;TCF=70;TCR=74;TR=89;WE=31091217;WS=31091199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,92:0.60:153
chr16	31092075	rs7196726	G	A	2254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.637;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=47;PP=1395;ReadPosRankSum=0.725;SC=CATAGTGGAGGCTGGGTTCCT;SOR=0.627;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=157;TCF=82;TCR=75;TR=93;WE=31092083;WS=31092065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,101:0.61:166
chr16	31095171	rs11865038	C	T	1751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.320;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=36;PP=941;ReadPosRankSum=-0.098;SC=CTCATCCTCACGGCTTTGGTC;SOR=0.847;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=125;TCF=63;TCR=62;TR=70;WE=31095179;WS=31095161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,79:0.55:144
chr16	31095204	rs11864806	G	C	1507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.564;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=34;PP=1001;ReadPosRankSum=0.208;SC=CCCATTCCTCGAAGGAACAGG;SOR=1.203;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=109;TCF=51;TCR=58;TR=58;WE=31095212;WS=31095194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,65:0.52:124
chr16	31095251	rs11864839	G	C	701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=18;PP=376;ReadPosRankSum=2.046;SC=AGAATACTGAGGCTCAAAGCG;SOR=0.610;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=68;TCF=30;TCR=38;TR=33;WE=31095259;WS=31095241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,36:0.49:74
chr16	31096164	rs7199949	G	C	1135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.647;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=23;PP=821;ReadPosRankSum=-0.429;SC=TGGTGGTCAGGATAGGGCAGG;SOR=0.612;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=92;TCF=48;TCR=44;TR=50;WE=31096172;WS=31096154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,51:0.54:94
chr16	31097574	rs4889535	G	C	883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=8;PP=620;SC=CTGATTGCAGGTCTTTCCCCC;SOR=1.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=28;WE=31097582;WS=31097564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr16	31104509	rs8050894	C	G	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.328;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.47;ReadPosRankSum=1.006;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr16	31104878	rs9934438	G	A	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.228;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=246;ReadPosRankSum=0.428;SC=CTAGTCCAAGGGTCGATGATC;SOR=0.478;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=13;TCR=32;TR=17;WE=31104886;WS=31104868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,19:0.39:49
chr16	31106652	.	CA	C	193.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.637;ClippingRankSum=0.000;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=2.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.52;ReadPosRankSum=1.659;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,18:0.23:77
chr16	31121793	rs14235	G	A	1479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.125;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=36;PP=880;ReadPosRankSum=-0.501;SC=TGTTGGCCACGCATCACCTGG;SOR=0.611;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=182;TCF=90;TCR=92;TR=74;WE=31121801;WS=31121783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,78:0.40:195
chr16	31122229	rs1549296	C	T	404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=14;PP=372;SC=TTCTTTGTCACAGGGGCTGCC;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=31122237;WS=31122219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr16	31122571	rs889555	C	T	4444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.177;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=87;PP=2594;ReadPosRankSum=0.389;SC=GGCTTGGGGGCGGACAGGAAC;SOR=0.531;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=286;TCF=153;TCR=133;TR=182;WE=31122579;WS=31122561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,199:0.64:313
chr16	31131614	rs4527034	A	G	3334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.440;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=67;PP=1986;ReadPosRankSum=-1.229;SC=GCGTGGGTGCAGGGAGTTGGC;SOR=0.731;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=248;TCF=130;TCR=118;TR=140;WE=31131622;WS=31131604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,159:0.57:277
chr16	31139261	rs72785554	A	G	2271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.248;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=39;PP=1635;ReadPosRankSum=2.308;SC=TGAAGTGTTGAGGGGGGAAAC;SOR=0.440;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=143;TCF=92;TCR=51;TR=102;WE=31139269;WS=31139249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,106:0.69:153
chr16	31141826	rs1549295	A	G	5805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=103;NR=87;PP=2965;SC=CGGAGAAGCCACTGTCTGACC;SOR=0.730;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=190;TCF=103;TCR=87;TR=190;WE=31141834;WS=31141816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
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chr16	31141993	rs1549293	C	T	1434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.115;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=35;PP=868;ReadPosRankSum=-0.489;SC=CCTGCTTCCTCATACCCTGTC;SOR=0.925;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=215;TCF=112;TCR=103;TR=74;WE=31142001;WS=31141983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,79:0.34:230
chr16	31142381	rs2855479	A	G	766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=8;PP=655;SC=GGGCTTCCCTACCCCTCCCCA;SOR=1.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=25;WE=31142389;WS=31142371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr16	31151521	rs8047469	A	G	431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.84;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr16	31152697	rs150305650	T	TAAAC,TAAACAAAC	1827.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;NF=9,9;NR=9,9;PP=343,77;SC=TAATTTTTTTTAAACAAACAA;SOR=1.244;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=25;TCF=14;TCR=11;TR=18,18;WE=31152705;WS=31152687;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.50,0.50:34
chr16	31152717	rs889547	T	C	2290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.19;QD=40.19;SOR=1.453;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr16	31153105	rs1549300	A	G	6520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=113;NR=99;PP=2965;SC=CAGGGCCCCAATCCCAGGCTA;SOR=0.710;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=212;TCF=113;TCR=99;TR=212;WE=31153113;WS=31153095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr16	31153780	rs889546	G	A	755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=2;PP=593;SC=CGCGTTCCGCGGGCCCCGCCC;SOR=2.753;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=23;WE=31153800;WS=31153770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr16	31154146	rs1549299	G	A	3144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.896;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=65;PP=1612;ReadPosRankSum=1.272;SC=GCGAAGCCGCGCTCAGGTTCA;SOR=0.658;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=274;TCF=143;TCR=131;TR=134;WE=31154154;WS=31154136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,155:0.51:303
chr16	31154345	rs79912852	G	A	2720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.555;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=34;PP=2001;ReadPosRankSum=-1.330;SC=GACGTGGGCCGGATCCCGCAC;SOR=0.963;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=95;TCF=45;TCR=50;TR=62;WE=31154366;WS=31154335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,70:0.64:110
chr16	31154358	rs78924645	G	A	2638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=29;PP=2001;ReadPosRankSum=-0.588;SC=TCCCGCACACGTGGCTGGAAA;SOR=0.750;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=48;TCR=47;TR=58;WE=31154366;WS=31154335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,68:0.61:112
chr16	31191482	rs929867	A	G	9114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=173;NR=133;PP=2965;SC=AGGCGTCGGTACTCAGCGGTG;SOR=0.850;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=306;TCF=173;TCR=133;TR=306;WE=31191490;WS=31191472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,341:1.00:341
chr16	31193942	rs741810	C	A	3555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.432;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=79;PP=2017;ReadPosRankSum=-1.074;SC=ACACTTCAGGCTATGGCCAGA;SOR=0.736;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=269;TCF=129;TCR=140;TR=153;WE=31193950;WS=31193932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,167:0.58:290
chr16	31195279	rs1052352	C	T	1480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=45;PP=1007;ReadPosRankSum=1.411;SC=AGTCCTCCTACCCTGGCTATG;SOR=0.635;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=153;TCF=47;TCR=106;TR=66;WE=31195287;WS=31195269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,70:0.42:167
chr16	31196141	rs71771375	GTCTTTTTACTT	G	211.75	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=1609;ReadPosRankSum=1.465;SC=TTTCCTAGCTGTCTTTTTACT;SOR=1.179;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=6;WE=31196159;WS=31196131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr16	31202698	rs371057360	AT	A	110.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=2.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.92;ReadPosRankSum=0.816;SOR=0.197;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr16	31230463	rs7186832	C	T	879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.263;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=19;PP=431;ReadPosRankSum=-0.901;SC=CATGCATGCGCAAGGAGAAGA;SOR=0.518;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=115;TCF=68;TCR=47;TR=43;WE=31230471;WS=31230453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,49:0.37:133
chr16	31271545	rs11865830	G	A	644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=14;PP=436;SC=AGGAGAAAGGGTTCAAGAAGA;SOR=1.270;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=22;TCF=8;TCR=14;TR=22;WE=31271553;WS=31271535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr16	31273129	rs3764327	T	C	8161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=131;NR=147;PP=2965;SC=GTGAGACCCTTAGATGGAGCC;SOR=0.837;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=279;TCF=131;TCR=148;TR=278;WE=31273137;WS=31273119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,296:1.00:296
chr16	31289396	rs1143680	T	C	5959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=511;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.750;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=144;NR=133;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.546;SC=AACACTGGCATGTGGGAGTCC;SOR=0.698;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=476;TCF=240;TCR=236;TR=277;WE=31289404;WS=31289386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:218,292:0.57:510
chr16	31336719	rs1143682	G	A	3137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=417;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=70;PP=1772;ReadPosRankSum=0.178;SC=AGGTGTCCACGCTCCAGGTAG;SOR=0.642;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=371;TCF=201;TCR=170;TR=149;WE=31336727;WS=31336709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:250,167:0.40:417
chr16	31339625	rs28372932	G	A	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.856;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=309;ReadPosRankSum=-1.224;SC=CTGTGTGCATGAGTCTGTGCA;SOR=3.806;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=7;TCR=38;TR=16;WE=31339633;WS=31339615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,17:0.41:41
chr16	31340368	rs55742763	G	A	235.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=274;SC=AAATGGGCACGCACTGTGTGT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=31340376;WS=31340361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	31342608	rs7188189	T	C	1138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=22;PP=585;SC=TGCTCCCCGCTGCTCCCCCAC;SOR=1.154;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=21;TCR=22;TR=43;WE=31342616;WS=31342598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr16	31342788	rs111881239	C	CTTG	53.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=0;PP=183;SC=AGTCGCCCTCCTTGTAGTTTC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=4;WE=31342796;WS=31342778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr16	31343181	rs142861575	C	CGTGTGTGCGA	770.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=15;PP=2259;SC=TGTGTATGTGCGTGTGTGCAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=15;WE=31343189;WS=31343171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	31367318	rs2230424	T	C	3606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.501;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=89;PP=2023;ReadPosRankSum=-2.105;SC=TGCCAACTCCTGGTGAGGCCC;SOR=0.631;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=231;TCF=90;TCR=141;TR=149;WE=31367326;WS=31367308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,162:0.65:248
chr16	31368816	rs11574635	G	C	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.649;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=323;ReadPosRankSum=0.000;SC=ACGTGTTGCAGTGGTTCCTGA;SOR=1.965;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=15;WE=31368824;WS=31368806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
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chr16	31371674	rs2230428	G	A	2535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.699;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=45;PP=1301;ReadPosRankSum=0.430;SC=TAGGGATGCCGCCAAAATTCT;SOR=0.722;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=186;TCF=101;TCR=85;TR=103;WE=31371682;WS=31371664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,119:0.57:210
chr16	31372290	rs11150617	T	C	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=34;ReadPosRankSum=-0.052;SC=TGTGATCATGTTGATCTTGTG;SOR=0.330;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=5;WE=31372298;WS=31372280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr16	31374535	rs2230429	C	G	1975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.469;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=42;PP=1262;ReadPosRankSum=1.121;SC=CAGGGCCACCCCTGGGGTCGC;SOR=0.643;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=241;TCF=144;TCR=97;TR=103;WE=31374543;WS=31374525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,105:0.41:254
chr16	31380596	rs12930249	C	T	251.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=8;NR=1;PP=206;SC=GGCAGCTGGCCGGGCGGGGGG;SOR=3.056;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=9;WE=31380618;WS=31380586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	31392047	rs11574646	C	T	788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=21;PP=483;ReadPosRankSum=0.551;SC=GGGAGGAGGGCGAAGGCCTCT;SOR=0.794;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=57;TCF=16;TCR=41;TR=30;WE=31392055;WS=31392037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,33:0.55:60
chr16	31393308	rs2929	G	A	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.020;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=7;PP=132;ReadPosRankSum=-0.522;SC=CTGACGGGGAGGAACCACTGC;SOR=0.250;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=9;WE=31393316;WS=31393298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr16	31404571	rs8050500	T	C	1161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.738;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=27;PP=771;ReadPosRankSum=1.183;SC=TGTGCCCCTCTTCCTGCTGTG;SOR=0.508;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=170;TCF=105;TCR=65;TR=62;WE=31404579;WS=31404561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,64:0.36:179
chr16	31405467	.	A	G	728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=4.847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQRankSum=1.642;QD=15.84;ReadPosRankSum=1.533;SOR=1.536;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,33:0.72:46
chr16	31405736	rs62051538	C	G	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=120;ReadPosRankSum=1.950;SC=TGGGTTACCCCAGGGAGGTGT;SOR=0.922;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=7;WE=31405744;WS=31405726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr16	31415004	rs56304025	C	T	1111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.302;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=39;PP=828;ReadPosRankSum=0.517;SC=ATGTGACTGCCACCCCCACTT;SOR=0.996;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=67;TCF=11;TCR=56;TR=47;WE=31415012;WS=31414994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,47:0.70:67
chr16	31422429	rs12444660	T	C	521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=3;PP=335;SC=CCCTCTGCTCTGTGGATGTGG;SOR=1.863;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=31422437;WS=31422419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	31426065	rs62051540	G	A	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.760;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=153;ReadPosRankSum=-1.334;SC=AGGAGAACCTGGCTCCACGGC;SOR=1.236;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=10;WE=31426073;WS=31426055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr16	31427352	rs144776519	ATCTTG	A	221.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.125;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.549;NF=5;NR=1;PP=262;ReadPosRankSum=0.019;SC=GAAGCCAAGGATCTTGTCTTA;SOR=0.293;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=6;WE=31427364;WS=31427342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr16	31427678	rs8056122	C	T	584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=9;PP=420;SC=GATGCTTGTGCTGCTCTCTGG;SOR=0.892;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=10;TCR=9;TR=19;WE=31427686;WS=31427668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	31439239	.	G	GCCC	1098.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.77;QD=42.26;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr16	31439243	.	GACC	G	997.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=49.89;SOR=6.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	31439248	.	C	G	871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.59;SOR=6.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	31439253	.	C	G	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=49.41;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr16	31439256	.	CA	C	547.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.64;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	31470540	rs3813002	T	C	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.308;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=46;ReadPosRankSum=1.655;SC=TCGGAGGCCCTGGCCCACCTG;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=4;WE=31470548;WS=31470534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr16	31476458	rs11150624	C	T	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FS=1.351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.52;ReadPosRankSum=-1.100;SOR=0.545;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:123,48:0.28:171
chr16	31483622	rs11646911	C	T	1120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.119;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=36;PP=731;ReadPosRankSum=-1.362;SC=TGTCTTCTTACTTCTGCTTTT;SOR=0.800;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=211;TCF=102;TCR=109;TR=67;WE=31483630;WS=31483612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,70:0.32:221
chr16	31488916	rs10596	C	G	661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.062;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=25;PP=480;ReadPosRankSum=-0.177;SC=TCGGCTCGCCCTCTCCCCCGG;SOR=0.910;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=76;TCF=17;TCR=59;TR=31;WE=31488924;WS=31488906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,32:0.40:80
chr16	31495928	.	T	A	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.347;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=275;ReadPosRankSum=1.239;SC=GAGGAATGTGTTGAGGTGGCT;SOR=0.874;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=14;WE=31495936;WS=31495918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr16	31503751	rs4536493	A	G	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=191;ReadPosRankSum=0.627;SC=TGTCTGCCCCAAGACCTTGGC;SOR=0.836;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=32;TCF=11;TCR=21;TR=13;WE=31503759;WS=31503741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr16	31519048	rs11861164	A	G	4564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=68;PP=2965;SC=GCAGGGCTGAAAGCAGCAATA;SOR=0.821;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=154;TCF=86;TCR=68;TR=154;WE=31519056;WS=31519038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr16	31539430	rs4296276	G	A	2511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.508;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=51;PP=1478;ReadPosRankSum=-0.142;SC=AAACAGATATGTAAATTCTAC;SOR=0.638;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=194;TCF=105;TCR=89;TR=110;WE=31539438;WS=31539420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,118:0.56:211
chr16	31539934	rs17677	G	T	1675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.620;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=39;PP=884;ReadPosRankSum=-0.793;SC=TGAACACTCTGGCCAACCCTT;SOR=0.760;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=122;TCF=54;TCR=68;TR=67;WE=31539942;WS=31539924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,80:0.54:147
chr16	31575186	rs7192364	C	T	3432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=40;PP=2206;SC=CCTTTCCTGCCCAAACTCAGT;SOR=1.421;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=112;TCF=72;TCR=40;TR=112;WE=31575194;WS=31575176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
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chr16	31580530	rs4889548	A	C	1242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.300;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=31;PP=818;ReadPosRankSum=0.452;SC=CTGACGTTGAACCATTTGACA;SOR=0.841;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=139;TCF=66;TCR=73;TR=57;WE=31580538;WS=31580520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,61:0.40:153
chr16	31613277	rs11865800	C	T	4034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.413;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=81;PP=2510;ReadPosRankSum=-2.832;SC=TCGAGTAAGGCGTGAATTACG;SOR=0.664;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=284;TCF=148;TCR=136;TR=166;WE=31613285;WS=31613267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,180:0.58:312
chr16	31613625	rs34368131	GT	G	4324.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=379;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.735;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.094;NF=21;NR=56;PP=2772;ReadPosRankSum=-1.109;SC=TGAAGAATAAGTAAAACATTT;SOR=0.792;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=217;TCF=57;TCR=160;TR=77;WE=31613633;WS=31613615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:237,140:0.37:377
chr16	31614439	rs4550471	C	T	638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.580;NF=20;NR=4;PP=385;ReadPosRankSum=-1.625;SC=TTTGACTGAACATTTACTCCA;SOR=1.082;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=24;WE=31614447;WS=31614429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,27:0.71:38
chr16	31724836	rs2884713	T	C	3112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=68;PP=2082;SC=GAGGTTAGCTTCGGGGTCTGG;SOR=1.769;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=32;TCR=68;TR=100;WE=31724844;WS=31724826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr16	31734197	rs34186495	G	GA	1288.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.309;NF=1;NR=37;PP=520;ReadPosRankSum=0.986;SC=CTGTTTCCAGGAAAAAAAAAT;SOR=0.616;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=1;TCR=48;TR=38;WE=31734205;WS=31734187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,51:0.96:53
chr16	31770696	rs34487972	G	GA	6122.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=67;PP=1794;SC=ATCCTATGGTGAAAAAAATCA;SOR=0.817;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=104;TCF=31;TCR=73;TR=94;WE=31770704;WS=31770686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr16	31770723	rs12921028	T	A	6080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=91;PP=2965;SC=TAATCTCTGCTTGAGAAAAAG;SOR=0.755;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=183;TCF=92;TCR=91;TR=183;WE=31770731;WS=31770713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr16	31926619	rs3850114	G	A	5248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=86;NR=90;PP=2965;SC=GAGAAACCCTGTAAATGGAAA;SOR=0.845;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=176;TCF=86;TCR=90;TR=176;WE=31926627;WS=31926609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr16	31987859	rs370699866	C	T	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.00;MQRankSum=0.000;QD=1.94;ReadPosRankSum=0.374;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,4:0.19:21
chr16	31987931	rs489120	G	A	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.46;ReadPosRankSum=0.842;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr16	32486756	rs28495417	A	G	593.41	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.6306;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.738;NF=15;NR=6;PP=373;ReadPosRankSum=-0.487;SC=GGGAGACAGGACACCTACCAC;SOR=0.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=21;WE=32486764;WS=32486746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,23:0.92:25
chr16	32486962	rs28687622	T	C	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.139;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.350;NF=8;NR=16;PP=369;ReadPosRankSum=1.485;SC=GGCTCAGGCTTCACTGAGCCC;SOR=0.504;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=47;TCF=16;TCR=31;TR=24;WE=32486970;WS=32486952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,24:0.46:52
chr16	32487712	rs62043362	G	A	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.414;NF=6;NR=2;PP=58;ReadPosRankSum=0.186;SC=TCCCCAGACCGGGGGCTTGTC;SOR=0.426;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=8;WE=32487720;WS=32487702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr16	32487933	rs28612238	G	A	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.895;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=93;ReadPosRankSum=-0.682;SC=CAGAGTAGAGGTTACACTTCC;SOR=0.293;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=7;WE=32487941;WS=32487923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr16	32893876	rs375167306	T	C	962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FS=13.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.54;MQRankSum=-2.559;QD=5.98;ReadPosRankSum=0.326;SOR=0.225;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:102,59:0.37:161
chr16	32893880	rs149083075	G	A	673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FS=4.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.75;MQRankSum=-3.136;QD=3.70;ReadPosRankSum=-0.689;SOR=1.035;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:137,45:0.25:182
chr16	32896606	rs139370574	GC	AT	1263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.52;MQRankSum=-9.179;QD=6.38;ReadPosRankSum=-1.140;SOR=0.699;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:155,43:0.22:198
chr16	32896672	.	G	C	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.242;ClippingRankSum=0.000;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.71;MQRankSum=-6.158;QD=5.00;ReadPosRankSum=0.746;SOR=0.598;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,28:0.31:90
chr16	32896688	.	G	A	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.351;ClippingRankSum=0.000;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=2.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.34;MQRankSum=-4.924;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.248;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,19:0.33:57
chr16	32929099	.	G	A	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.75;ReadPosRankSum=0.674;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr16	32936832	.	A	G	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.129;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=13.244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.39;MQRankSum=-4.070;QD=22.93;ReadPosRankSum=-2.037;SOR=3.430;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr16	32936837	.	G	T	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=8.396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.46;MQRankSum=-3.388;QD=23.08;ReadPosRankSum=-1.584;SOR=2.416;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr16	32945402	rs57620987	A	C	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=1.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.10;ReadPosRankSum=0.857;SOR=0.888;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,17:0.29:58
chr16	32957041	rs62046846	C	T	1997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FS=0.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.01;MQRankSum=-10.371;QD=8.80;ReadPosRankSum=-2.436;SOR=0.745;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:164,63:0.28:227
chr16	32957043	rs62046847	T	C	1997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.91;MQRankSum=-10.965;QD=9.08;ReadPosRankSum=-1.496;SOR=0.736;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:162,58:0.26:220
chr16	33372666	rs4985326	C	T	1406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FS=2.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.94;MQRankSum=-13.596;QD=5.74;ReadPosRankSum=0.986;SOR=0.526;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:197,48:0.20:245
chr16	33372673	rs4985325	T	C	1404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FS=1.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.07;MQRankSum=-14.709;QD=5.11;ReadPosRankSum=1.422;SOR=0.559;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:226,49:0.18:275
chr16	33372677	rs4985324	C	T	1459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FS=1.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.90;MQRankSum=-15.064;QD=5.16;ReadPosRankSum=0.093;SOR=0.576;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:229,54:0.19:283
chr16	33372694	rs4985323	T	C	736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=361;ExcessHet=3.0103;FS=0.496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQRankSum=-16.679;QD=2.04;ReadPosRankSum=-0.821;SOR=0.730;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:294,67:0.19:361
chr16	33379851	rs4566180	G	A	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.159;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.641;NF=12;NR=5;PP=200;ReadPosRankSum=-0.156;SC=CGACACTCCCGGCCCTCCTCT;SOR=0.247;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=58;TCF=46;TCR=12;TR=17;WE=33379859;WS=33379841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,16:0.28:57
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chr16	33391348	rs7188099	G	A	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FS=7.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.21;MQRankSum=0.274;QD=2.77;ReadPosRankSum=1.307;SOR=1.318;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:142,37:0.21:179
chr16	33391395	rs7188064	G	A	692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FS=2.409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.91;MQRankSum=-1.033;QD=2.16;ReadPosRankSum=1.034;SOR=0.865;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:258,62:0.19:320
chr16	33391415	rs357994	A	C	4775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.413;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.336;NF=105;NR=102;PP=2962;ReadPosRankSum=2.517;SC=AGAATCGATTATTCCCACCCA;SOR=0.646;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=324;TCF=162;TCR=162;TR=207;WE=33391423;WS=33391405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,212:0.64:333
chr16	33392008	rs56739713	A	G	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FS=2.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.87;MQRankSum=0.056;QD=2.14;ReadPosRankSum=0.343;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:139,32:0.19:171
chr16	33392165	rs11150710	C	G	2202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=425;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.197;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-2.498;NF=57;NR=74;PP=1413;ReadPosRankSum=0.699;SC=GTGGTATGGCCGTAGACCCAG;SOR=0.608;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=417;TCF=170;TCR=247;TR=131;WE=33392173;WS=33392155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:287,134:0.32:421
chr16	33392215	rs11150709	G	A	740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.803;HP=5;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.709;NF=11;NR=31;PP=548;ReadPosRankSum=0.203;SC=AATACTTGGGGGGCTGGGTAC;SOR=0.538;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=139;TCF=35;TCR=104;TR=42;WE=33392223;WS=33392205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,42:0.29:144
chr16	33392231	rs11150708	C	T	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.321;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=23;PP=381;ReadPosRankSum=0.073;SC=GGTACAGTGGCTTTCATGCCT;SOR=0.258;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=90;TCF=10;TCR=80;TR=27;WE=33392239;WS=33392221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,27:0.29:94
chr16	33395795	rs373875949	TA	T	699.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.65;MQRankSum=-2.990;QD=14.28;ReadPosRankSum=0.289;SOR=0.613;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,17:0.35:49
chr16	33395797	.	A	AAAT	586.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.052;ClippingRankSum=0.000;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=4.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.62;MQRankSum=3.297;QD=11.50;ReadPosRankSum=-0.730;SOR=0.199;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,17:0.33:51
chr16	33395802	rs368088965	AT	A	795.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.68;MQRankSum=-3.075;QD=12.63;ReadPosRankSum=-0.391;SOR=0.844;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,22:0.35:63
chr16	33395820	rs113700056	A	ACAG	1161.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=0.927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.41;MQRankSum=-3.134;QD=11.17;ReadPosRankSum=0.141;SOR=0.816;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,32:0.31:104
chr16	33395882	rs4887691	A	G	1060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=419;ExcessHet=3.0103;FS=0.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQRankSum=-15.124;QD=2.54;ReadPosRankSum=1.302;SOR=0.613;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:336,82:0.20:418
chr16	33395983	rs28650990	T	C	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQRankSum=-10.366;QD=2.04;ReadPosRankSum=-0.298;SOR=0.648;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:253,58:0.19:311
chr16	33408626	rs8059234	T	C	1184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=542;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQRankSum=-17.257;QD=2.19;ReadPosRankSum=1.975;SOR=0.733;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:434,107:0.20:541
chr16	33408654	rs60406485	C	A	2637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=530;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.35;MQRankSum=-14.642;QD=4.99;ReadPosRankSum=1.446;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:429,100:0.19:529
chr16	33408673	rs28415216	G	A	2646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=530;ExcessHet=3.0103;FS=1.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.13;MQRankSum=-12.803;QD=4.99;ReadPosRankSum=-0.178;SOR=0.844;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:433,97:0.18:530
chr16	33408733	rs8058447	GC	AT	1337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FS=2.009;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.71;MQRankSum=-3.978;QD=4.58;ReadPosRankSum=0.525;SOR=0.854;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:242,50:0.17:292
chr16	33408793	rs58465568	G	A	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=4.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.10;ReadPosRankSum=0.039;SOR=1.769;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,14:0.16:90
chr16	33410561	rs2632816	T	C	726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-8.065;NF=47;NR=6;PP=1162;ReadPosRankSum=-1.521;SC=CCACCTGCCTTGGCCTCCCAA;SOR=0.842;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=104;TCF=91;TCR=13;TR=53;WE=33410569;WS=33410551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,29:0.35:82
chr16	33410777	rs74905055	G	T	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=786;ExcessHet=3.0103;FS=2.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.84;MQRankSum=-20.385;QD=0.28;ReadPosRankSum=5.672;SOR=0.541;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:678,107:0.14:785
chr16	33424634	rs60026982	T	C	2070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=5.373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.17;MQRankSum=-3.114;QD=27.25;ReadPosRankSum=-0.206;SOR=0.092;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,48:0.63:76
chr16	33424637	rs62033013	AA	GG	2112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=5.336;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQRankSum=-2.947;QD=26.08;ReadPosRankSum=-0.722;SOR=0.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,53:0.65:81
chr16	33424691	rs2632824	T	C	3993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.945;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.890;NF=101;NR=55;PP=2383;ReadPosRankSum=-0.744;SC=GGCCAGACTTTGTAGTTTGTA;SOR=0.245;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=238;TCF=165;TCR=73;TR=156;WE=33424699;WS=33424681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,170:0.66:257
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chr16	33424917	rs1906318	A	C	9177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=750;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.522;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-14.018;NF=205;NR=222;PP=2962;ReadPosRankSum=1.406;SC=TCAGCCAGCAACTTGTGCCTC;SOR=0.753;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=750;TCF=360;TCR=390;TR=427;WE=33424925;WS=33424907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:336,412:0.55:748
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chr16	33534330	rs28594967	G	A	1163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.107;HP=4;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.137;NF=6;NR=27;PP=1345;ReadPosRankSum=-3.133;SC=CACAACTTTTGATCCCAGCAC;SOR=1.460;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=62;TCF=14;TCR=48;TR=33;WE=33534362;WS=33534315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,38:0.56:68
chr16	33534344	rs78083012	G	T	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=3.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.64;MQRankSum=-6.623;QD=7.60;ReadPosRankSum=-0.863;SOR=1.639;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,11:0.24:46
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chr16	33534352	rs78884180	G	C	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=1.849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.54;MQRankSum=-6.260;QD=5.09;ReadPosRankSum=0.510;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,8:0.20:41
chr16	33534354	rs74594913	C	T	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=1.804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.26;MQRankSum=-6.011;QD=5.49;ReadPosRankSum=0.287;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,8:0.21:38
chr16	33534369	rs74800708	C	CAA	100.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.576;HP=1;HapScore=1;MGOF=45;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.220;NF=1;NR=5;PP=182;ReadPosRankSum=1.705;SC=GCAGATCATACGAGGTCAGGT;SOR=0.188;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=6;WE=33534377;WS=33534359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,5:0.17:29
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chr16	33539541	rs80334711	A	C	654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FS=13.566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.65;MQRankSum=-9.291;QD=3.15;ReadPosRankSum=-0.340;SOR=0.222;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:156,52:0.25:208
chr16	33539648	rs56161129	C	A	1040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=4.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.044;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-8.080;NF=30;NR=116;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.781;SC=CGGTCTGTAGCGACTCCTACA;SOR=0.919;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=399;TCF=152;TCR=247;TR=146;WE=33539656;WS=33539624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:263,68:0.21:331
chr16	33539747	rs56272308	G	T	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-4.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.504;NF=1;NR=20;PP=360;ReadPosRankSum=-1.677;SC=CCCTCCAAAAGAAATGGTAAA;SOR=0.741;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=61;TCF=3;TCR=58;TR=21;WE=33539755;WS=33539737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,22:0.33:66
chr16	33629620	rs2005870	C	T	1447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.802;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.217;NF=31;NR=9;PP=482;ReadPosRankSum=-0.463;SC=AGAAGAGCCCCAGCCCTGGGA;SOR=0.859;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=140;TCF=108;TCR=32;TR=40;WE=33629628;WS=33629610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,43:0.29:149
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chr16	33629700	rs2019670	G	A	2689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=556;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.113;NF=86;NR=71;PP=1863;ReadPosRankSum=-1.784;SC=GGGCTGAGCTGGGTTTTCCTT;SOR=0.702;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=527;TCF=289;TCR=238;TR=157;WE=33629708;WS=33629690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:392,163:0.29:555
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chr16	33961333	.	C	T	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.819;ClippingRankSum=0.000;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.06;MQRankSum=-0.174;QD=0.42;ReadPosRankSum=-2.252;SOR=0.761;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,7:0.08:86
chr16	33961352	.	G	A	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.398;ClippingRankSum=0.000;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.80;MQRankSum=-0.084;QD=0.52;ReadPosRankSum=0.097;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,11:0.14:80
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chr16	33961481	rs366164	A	C	1395.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=6.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FS=2.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.15;MQRankSum=-14.744;QD=5.74;ReadPosRankSum=-0.239;SOR=0.885;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:190,53:0.22:243
chr16	33961482	rs78161808	T	C	1762.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=9.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FS=4.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.27;MQRankSum=-15.146;QD=7.17;ReadPosRankSum=0.459;SOR=1.066;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:194,52:0.21:246
chr16	33961483	rs77018326	G	T	1126.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=5.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FS=16.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.23;MQRankSum=-13.984;QD=4.47;ReadPosRankSum=0.132;SOR=1.855;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:212,40:0.16:252
chr16	33961499	rs75192280	CA	TG	1840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FS=16.006;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.55;MQRankSum=-16.867;QD=6.22;ReadPosRankSum=-0.135;SOR=1.637;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:238,58:0.20:296
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chr16	33961529	rs77202604	G	A	1656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=384;ExcessHet=3.0103;FS=0.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.98;MQRankSum=-14.999;QD=4.31;ReadPosRankSum=1.849;SOR=0.646;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:320,64:0.17:384
chr16	33961539	rs72797452	A	C	4052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=441;ExcessHet=3.0103;FS=7.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.76;MQRankSum=-19.972;QD=9.19;ReadPosRankSum=-2.961;SOR=1.254;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:324,117:0.27:441
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chr16	33961544	rs79909802	C	T	1619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=475;ExcessHet=3.0103;FS=12.438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.57;MQRankSum=-13.925;QD=3.41;ReadPosRankSum=-6.990;SOR=1.768;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:411,64:0.13:475
chr16	33961552	rs76049930	G	A	2557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=549;ExcessHet=3.0103;FS=13.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.37;MQRankSum=-14.144;QD=4.66;ReadPosRankSum=-6.059;SOR=1.928;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:459,90:0.16:549
chr16	33961555	rs77111738	C	A	3900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=560;ExcessHet=3.0103;FS=14.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.36;MQRankSum=-14.485;QD=6.97;ReadPosRankSum=-5.599;SOR=1.862;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:464,96:0.17:560
chr16	33961556	rs75931509	A	G	7561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=572;ExcessHet=3.0103;FS=8.056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.36;MQRankSum=-21.806;QD=13.22;ReadPosRankSum=-2.231;SOR=1.275;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:398,174:0.30:572
chr16	33961563	rs112604583	C	G	5786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=656;ExcessHet=3.0103;FS=1.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.16;MQRankSum=-20.907;QD=9.96;ReadPosRankSum=-7.537;SOR=0.846;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:416,165:0.28:581
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chr16	33961902	rs72797463	C	G	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=2.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQRankSum=-6.740;QD=9.31;ReadPosRankSum=-0.546;SOR=0.639;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,19:0.27:70
chr16	33962365	.	C	T	967	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;FR=0.5000;HP=3;HapScore=4;MGOF=55;MMLQ=22;MQ=54.28;NF=8;NR=11;PP=967;QD=52.7248006604;SC=GGTTCGCCGCCCCACCACCCC;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=30;TCF=12;TCR=18;TR=19;WE=33962373;WS=33962341;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr16	33962391	rs77260646	C	A	62.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.37;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr16	33962400	rs74410326	C	A	62.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.37;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr16	33962412	rs72797477	A	C	62.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.37;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr16	33962416	rs75367546	G	C	62.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.37;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr16	33962434	rs149073555	CG	C	187.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.74;QD=37.57;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
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chr16	33962456	rs75550881	G	T	241.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.19;QD=40.31;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
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chr16	33965672	.	C	T	1863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.328;ClippingRankSum=0.000;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=3.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.77;ReadPosRankSum=-0.209;SOR=0.436;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,51:0.35:146
chr16	33965681	.	G	GA	711.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.445;ClippingRankSum=0.000;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=0.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.08;ReadPosRankSum=-0.466;SOR=0.565;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,24:0.21:117
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chr16	33965690	rs74964080	C	T	771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=3.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.57;ReadPosRankSum=-0.085;SOR=1.153;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,22:0.22:102
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chr16	33965711	rs76711006	G	A	1292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.211;HP=2;HapScore=1;MGOF=99;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=42;PP=758;ReadPosRankSum=0.458;SC=CTCTGCCGCCGTGCCCGCCCC;SOR=1.405;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=83;TCF=22;TCR=61;TR=55;WE=33965719;WS=33965698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,32:0.52:62
chr16	33965727	.	C	T	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=1.502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.51;ReadPosRankSum=0.677;SOR=1.042;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,11:0.20:54
chr16	33965731	.	C	T	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=0.000;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=3.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.73;ReadPosRankSum=1.461;SOR=1.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,11:0.21:53
chr16	33965735	.	C	T	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=0.000;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=1.490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.86;ReadPosRankSum=0.814;SOR=0.949;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,10:0.19:52
chr16	33965741	rs111610856	C	T	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.312;HP=2;HapScore=2;MGOF=82;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=237;ReadPosRankSum=-0.392;SC=CCCCCGCAGGCCCTGTGTGGT;SOR=1.091;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=53;TCF=20;TCR=33;TR=17;WE=33965749;WS=33965731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,19:0.45:42
chr16	34318731	rs6563853	T	G	4023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=80;PP=2557;SC=CATGCACATGTAGGAATGGGA;SOR=1.334;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=131;TCF=51;TCR=80;TR=131;WE=34318739;WS=34318721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr16	34681938	rs237988	C	T	2290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=43;PP=1445;SC=ATGAGTTCTTCCATGTTTAGA;SOR=1.013;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=34;TCR=43;TR=77;WE=34681946;WS=34681928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr16	34682019	rs237989	G	A	2002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=34;NR=28;PP=1016;SC=AGTATGAGTGGTTTCATGGTT;SOR=0.746;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=34;TCR=28;TR=62;WE=34682027;WS=34682009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr16	34682193	rs62057608	C	T	1766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.712;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=20;PP=1085;ReadPosRankSum=-0.096;SC=ATTTCTCTGACGTATATAAGG;SOR=0.832;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=83;TCR=33;TR=70;WE=34682201;WS=34682183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,77:0.60:128
chr16	46509877	.	G	T	2010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.628;ClippingRankSum=0.000;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.201;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=49;PP=1403;ReadPosRankSum=0.628;SC=AAGAAGTTTGGTACTGACATC;SOR=0.814;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=153;TCF=73;TCR=80;TR=92;WE=46509885;WS=46509867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,93:0.55:170
chr16	46565019	rs1436436	T	G	3863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=63;NR=69;PP=2215;SC=GTCGTACCTTTTTACAGGATT;SOR=0.919;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=132;TCF=63;TCR=69;TR=132;WE=46565027;WS=46565009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr16	46584429	rs117534519	T	A	2715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=441;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=71;PP=1703;ReadPosRankSum=0.918;SC=AAGCACGCCATCTTGTTAGAT;SOR=0.685;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=405;TCF=206;TCR=199;TR=143;WE=46584437;WS=46584419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:289,150:0.34:439
chr16	46593836	rs34737066	T	TA	246.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=183;ReadPosRankSum=-0.309;SC=AGTCAGGTTTTAAAAAAAGAA;SOR=0.540;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=9;WE=46593844;WS=46593826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr16	46602819	rs12934443	C	T	2414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=397;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.231;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=60;PP=1498;ReadPosRankSum=0.319;SC=AGCCAGAGCTCCTCCTCATGG;SOR=0.585;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=364;TCF=182;TCR=182;TR=125;WE=46602827;WS=46602809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:261,136:0.34:397
chr16	46637746	rs4967259	T	C	1518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=10;PP=1111;SC=CTACTGCTGATGAAAGGCAGG;SOR=2.540;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=40;TCR=10;TR=50;WE=46637754;WS=46637736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr16	46642114	rs147085903	GGT	G	82.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.76;ReadPosRankSum=1.725;SOR=0.404;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,5:0.23:22
chr16	46642456	rs8052092	A	G	292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=7;PP=169;SC=CACACAACATAGAGACCTTTT;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=46642464;WS=46642446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr16	46651417	rs34949348	TA	T	593.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=2;PP=580;SC=ACATGGCAATTAGATGTGAAA;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=46651425;WS=46651407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr16	46652286	.	TA	T	155.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.685;ClippingRankSum=0.000;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=3.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.83;ReadPosRankSum=-0.251;SOR=0.284;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,14:0.25:55
chr16	46655210	rs6598679	A	G	3642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=47;PP=2254;SC=CGCCCAGCCCATGCGCTCCGG;SOR=1.237;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=129;TCF=82;TCR=47;TR=129;WE=46655218;WS=46655200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr16	46696284	rs168745	G	A	6267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=109;PP=2965;SC=TCAGAGGTTCGTGATTCTCTT;SOR=0.830;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=208;TCF=99;TCR=109;TR=208;WE=46696292;WS=46696274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr16	46697098	rs2304492	A	G	3151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=71;PP=2113;SC=AAACATTTTAAGTTACCTTAA;SOR=2.115;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=101;TCF=29;TCR=72;TR=100;WE=46697106;WS=46697088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr16	46705502	rs36310	T	C	1580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=11;PP=1108;SC=TTTAATTCAGTTGCAATTCCT;SOR=2.522;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=41;TCR=11;TR=52;WE=46705510;WS=46705492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr16	46714512	rs112594824	T	C	687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.345;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=6;PP=474;ReadPosRankSum=-1.104;SC=TTTCTGTATATGTTTCCACAC;SOR=0.441;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=55;TCF=46;TCR=9;TR=30;WE=46714520;WS=46714502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,30:0.53:57
chr16	46714529	rs700582	A	G	2570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=18;PP=1754;SC=ACACTTTTATACATTCTACAA;SOR=2.275;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=59;TCR=18;TR=77;WE=46714537;WS=46714519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr16	46715191	rs700581	G	A	2277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=19;PP=1484;SC=TTGTTAAGAAGTTACCCTTAA;SOR=1.996;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=56;TCR=19;TR=75;WE=46715199;WS=46715181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr16	46723598	rs33994299	T	C	2906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=522;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=70;PP=1946;ReadPosRankSum=-0.620;SC=ACGGGAATTGTTCGCTTTAGT;SOR=0.715;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=475;TCF=246;TCR=229;TR=148;WE=46723606;WS=46723588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:359,163:0.31:522
chr16	46743675	rs4141491	G	A	5316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=121;PP=2965;SC=CTGAGTCAGTGGAACAGATTA;SOR=1.754;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=177;TCF=56;TCR=121;TR=177;WE=46743683;WS=46743665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr16	46755213	rs194055	C	G	1250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=37;PP=1005;SC=ACATGAATGGCTCAGGGCAGC;SOR=5.136;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=39;WE=46755221;WS=46755203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr16	46764482	rs36460	A	C	2349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=30;PP=1532;SC=TAAGCCCCCCAACCAAGGCAG;SOR=1.286;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=51;TCR=30;TR=81;WE=46764490;WS=46764472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr16	46764585	rs56003096	A	G	1167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=31;PP=808;ReadPosRankSum=-2.219;SC=GGTGTTCAAAAGGAGCTGGTG;SOR=0.686;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=225;TCF=125;TCR=100;TR=68;WE=46764593;WS=46764575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,72:0.30:244
chr16	46773752	rs28185	G	T	521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=14;NR=1;PP=378;SC=CAACCCCGAGGTGTTCAAGGG;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=46773760;WS=46773751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr16	46773999	rs28407821	C	A	4418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=71;PP=2595;SC=TCAGACTGCACCCCACTGGTG;SOR=0.718;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=149;TCF=78;TCR=71;TR=149;WE=46774007;WS=46773989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr16	47001626	rs2034598	G	A	2033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.595;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=62;PP=1491;ReadPosRankSum=0.048;SC=ATGACACACAGAAATTGTGCT;SOR=0.811;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=249;TCF=95;TCR=154;TR=97;WE=47001634;WS=47001616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,100:0.39:259
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chr16	47684686	rs150516784	TATTA	T	964.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.941;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.16;MQRankSum=1.233;NF=8;NR=12;PP=809;ReadPosRankSum=-0.227;SC=AGTATTAGATTATTAATTTAC;SOR=0.565;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=54;TCF=19;TCR=35;TR=20;WE=47684697;WS=47684676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,27:0.41:66
chr16	48122582	rs7193955	G	A	3240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.510;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=63;PP=2104;ReadPosRankSum=0.039;SC=ATCTCCCCACGGCTGGGCCAG;SOR=0.763;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=240;TCF=126;TCR=114;TR=134;WE=48122590;WS=48122565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,144:0.56:255
chr16	48164777	rs12149826	T	C	6255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=113;PP=2965;SC=AAAACTTCATTACATTAAACA;SOR=1.095;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=199;TCF=86;TCR=113;TR=199;WE=48164785;WS=48164767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr16	48201432	rs16945916	T	C	3577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.422;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=71;PP=1952;ReadPosRankSum=0.763;SC=AACCAGGATGTGGTCACAGTT;SOR=0.721;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=270;TCF=141;TCR=129;TR=150;WE=48201440;WS=48201422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,169:0.57:297
chr16	48201678	rs41280941	C	A	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.002;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=19;PP=430;ReadPosRankSum=-1.883;SC=TCCAGGTCTCCATTTCTTTAG;SOR=0.066;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=27;WE=48201686;WS=48201668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,29:0.74:39
chr16	48201702	.	GA	AT	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.338;ClippingRankSum=0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.36;ReadPosRankSum=-0.418;SOR=1.244;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr16	48201707	rs16945917	A	G	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.514;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=26.70;ReadPosRankSum=-0.771;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr16	48204078	rs61739606	T	A	4135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.209;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=65;PP=2613;ReadPosRankSum=-0.139;SC=ACAGAGAAGTTTCCACCGTTT;SOR=0.904;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=282;TCF=166;TCR=116;TR=166;WE=48204086;WS=48204068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,179:0.59:302
chr16	48209046	rs62058525	C	T	709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=1;PP=544;ReadPosRankSum=0.297;SC=CATGAGTGGCCCAGCAGGCCA;SOR=1.206;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=43;TCF=41;TCR=2;TR=25;WE=48209054;WS=48209036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,26:0.60:43
chr16	48227862	rs11866251	G	A	3374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.635;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=61;PP=1960;ReadPosRankSum=-0.322;SC=TCAGCACCACGAAGAAGAAAA;SOR=0.586;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=216;TCF=124;TCR=92;TR=139;WE=48227870;WS=48227852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,155:0.65:240
chr16	48242379	rs17822471	G	A	3149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.999;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=57;PP=1922;ReadPosRankSum=-0.206;SC=ACCACTCCCCGTGTTGCCGCA;SOR=0.463;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=196;TCF=116;TCR=80;TR=127;WE=48242387;WS=48242369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,137:0.63:218
chr16	48247523	rs11866529	T	G	1039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.080;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=32;PP=707;ReadPosRankSum=1.554;SC=CCATTCCCTGTCACCCGCATC;SOR=0.512;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=75;TCF=17;TCR=58;TR=42;WE=48247531;WS=48247513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,45:0.58:78
chr16	48248732	rs41282047	G	C	2434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.75;ReadPosRankSum=-1.768;SOR=0.928;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,60:0.56:107
chr16	48248738	rs17744321	G	A	2526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.23;ReadPosRankSum=-1.799;SOR=0.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,69:0.58:119
chr16	48248918	rs8047091	T	C	2254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=39;PP=1295;ReadPosRankSum=-0.757;SC=TCTCCAATAGTTTCCTTTCCT;SOR=0.698;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=123;TCF=61;TCR=62;TR=77;WE=48248926;WS=48248908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,96:0.66:146
chr16	48248949	rs200308896	T	TA	1902.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.450;HP=9;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=32;PP=1174;ReadPosRankSum=0.992;SC=GTCTGGGAAATAAAAAAGAAA;SOR=0.846;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=86;TCF=27;TCR=59;TR=43;WE=48248957;WS=48248939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,75:0.60:124
chr16	48292513	rs16946038	A	G	2772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.491;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=36;PP=1771;ReadPosRankSum=-0.390;SC=CTATTGATTGACTCACATTTC;SOR=0.752;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=215;TCF=142;TCR=73;TR=112;WE=48292521;WS=48292503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,126:0.53:237
chr16	48329918	rs5816590	TC	T	1641.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.354;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.806;NF=26;NR=12;PP=1232;ReadPosRankSum=1.190;SC=TTTTTTGTTCTCCCCTAGGTG;SOR=0.385;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=76;TCF=55;TCR=21;TR=38;WE=48329926;WS=48329908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,57:0.62:92
chr16	48333493	.	TA	T	286.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.643;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=10.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.95;ReadPosRankSum=0.766;SOR=3.383;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr16	48333535	rs34505973	A	G	940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.956;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=14;PP=547;ReadPosRankSum=-1.469;SC=TATGGGAGCCATGTAAATAAT;SOR=0.301;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=53;TCR=25;TR=43;WE=48333543;WS=48333525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,46:0.57:81
chr16	48390512	rs8053839	G	T	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.343;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=217;ReadPosRankSum=1.869;SC=TTTTTTGTTTGTTTTACAAAC;SOR=1.037;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=57;TCF=40;TCR=17;TR=18;WE=48390520;WS=48390489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,20:0.32:62
chr16	48419291	.	GGCC	G	601.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.078;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.183;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=291;ReadPosRankSum=-2.416;SC=GCTCCCCCCTGGCCGCCGCCG;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=8;WE=48419301;WS=48419281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,16:0.73:22
chr16	48643911	.	CG	C	454.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.285;ClippingRankSum=0.000;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=1.280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.57;MQRankSum=2.008;QD=10.11;ReadPosRankSum=-1.269;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,20:0.44:45
chr16	49412531	rs27813	A	G	2602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.488;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=64;PP=1705;ReadPosRankSum=1.743;SC=GGCCCCGGCCACCAGAATCCT;SOR=0.629;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=209;TCF=101;TCR=108;TR=122;WE=49412539;WS=49412521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,127:0.56:228
chr16	49557441	rs2287313	A	C	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.561;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=417;ReadPosRankSum=0.206;SC=CCAGCATAAGACTCCACCAGC;SOR=1.244;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=50;TCF=37;TCR=13;TR=23;WE=49557449;WS=49557431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,26:0.46:56
chr16	49557482	rs2287314	C	T	1193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.613;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=22;PP=749;ReadPosRankSum=1.121;SC=TCGGTGCTGACGGGGGAACCG;SOR=0.619;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=154;TCF=98;TCR=56;TR=59;WE=49557490;WS=49557472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,62:0.38:162
chr16	49671101	rs75294107	G	A	3288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=429;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=76;PP=1921;ReadPosRankSum=-0.236;SC=GCAGCTCCAGGTGCAGCTTCA;SOR=0.675;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=398;TCF=202;TCR=196;TR=155;WE=49671109;WS=49671091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:260,169:0.39:429
chr16	49672520	rs3803665	A	G	2514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.319;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=50;PP=1683;ReadPosRankSum=1.474;SC=TGTGCCGGTCACGGCTCCTCT;SOR=0.892;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=245;TCF=136;TCR=109;TR=116;WE=49672528;WS=49672510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,123:0.45:271
chr16	49672834	rs17195211	G	A	2058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.052;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=52;PP=1260;ReadPosRankSum=-0.225;SC=CAGGGCTGCCGAGAAACAAGG;SOR=0.517;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=208;TCF=83;TCR=125;TR=92;WE=49672842;WS=49672824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,101:0.44:229
chr16	49764948	rs2292155	C	T	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.532;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=184;ReadPosRankSum=-0.520;SC=TTAAAAGAATCGCCCGGCATT;SOR=0.069;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=13;WE=49764956;WS=49764938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr16	49856691	rs8060387	G	C	1600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=33;PP=993;SC=AGGCTAGTAAGCATGTGCAAT;SOR=1.781;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=49;TCF=15;TCR=34;TR=48;WE=49856699;WS=49856681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr16	50059279	rs9934704	C	A	1285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.21;SOR=0.813;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr16	50059314	rs9924833	A	G	870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=12;PP=348;SC=GCTCCGGAGGAGCCGGCGTCG;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=12;TCR=12;TR=24;WE=50059322;WS=50059304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr16	50059500	rs7194313	C	T	3045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=71;NR=30;PP=1761;SC=TTTCTTTTCACTGGCAGACAC;SOR=1.432;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=71;TCR=30;TR=101;WE=50059508;WS=50059490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr16	50067905	rs9302745	G	A	757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=3;PP=554;SC=CTTGTGATCCGACCGCCTCGG;SOR=3.098;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=24;WE=50067913;WS=50067895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr16	50069312	rs2041918	C	G	1890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.896;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=35;PP=1022;ReadPosRankSum=2.528;SC=AAAATTCTGTCTTTTCATTTT;SOR=0.479;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=142;TCF=83;TCR=59;TR=79;WE=50069320;WS=50069302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,90:0.58:156
chr16	50100214	rs7192665	G	C	3737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=358;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=72;PP=2290;ReadPosRankSum=2.177;SC=CGGGAGGCGAGACGAGGTTGC;SOR=0.673;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=332;TCF=185;TCR=147;TR=161;WE=50100222;WS=50100204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:180,178:0.50:358
chr16	50100253	rs4389139	T	A	5398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=462;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.451;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=134;NR=103;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.491;SC=GCGCGCCTTCTGACCCTTTTC;SOR=0.890;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=420;TCF=229;TCR=191;TR=237;WE=50100261;WS=50100243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:205,257:0.56:462
chr16	50100274	rs6500280	G	C	3893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=473;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.264;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=90;PP=2513;ReadPosRankSum=-0.293;SC=GCTCTCATCCGCAGCTCCAGC;SOR=0.712;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=430;TCF=222;TCR=208;TR=177;WE=50100282;WS=50100264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:274,199:0.42:473
chr16	50102618	rs60730387	G	GAAAT	5013.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=7;PP=2918;SC=GCTAAAAATAGAAATGTGAGA;SOR=4.017;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=92;TCF=77;TCR=15;TR=75;WE=50102626;WS=50102608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr16	50104234	rs7191384	T	C	1319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=36;PP=844;ReadPosRankSum=-0.646;SC=TCTCCTGCTATAGCAGTACCC;SOR=0.652;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=154;TCF=57;TCR=97;TR=57;WE=50104242;WS=50104224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,64:0.39:165
chr16	50106594	rs2287197	T	C	1633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=29;PP=963;ReadPosRankSum=-0.948;SC=TAAGTAGGTTTCCTACCAATG;SOR=0.725;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=110;TCF=65;TCR=45;TR=69;WE=50106602;WS=50106584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,76:0.62:123
chr16	50109478	rs12931497	G	A	2906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.357;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=46;PP=1687;ReadPosRankSum=-1.755;SC=TTTTTGCCTCGTAGCATATTG;SOR=0.551;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=207;TCF=129;TCR=78;TR=120;WE=50109486;WS=50109468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,132:0.60:221
chr16	50112971	rs66756058	GT	G	226.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=140;SC=TAATACAGCTGTTTTTTTTTT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=8;WE=50112979;WS=50112961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr16	50117828	rs5816672	CT	C	187.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=11.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.94;ReadPosRankSum=1.675;SOR=4.534;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr16	50118063	rs200665394	G	C	3520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.950;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=69;PP=1923;ReadPosRankSum=1.224;SC=GATGACGAATGGGAAGAGCTT;SOR=0.623;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=247;TCF=126;TCR=121;TR=143;WE=50118071;WS=50118053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,158:0.59:266
chr16	50118245	rs877639	G	A	1259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=33;PP=793;ReadPosRankSum=0.614;SC=GCATGGGAAAGGCTTAAGCAA;SOR=0.776;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=79;TCF=27;TCR=52;TR=49;WE=50118253;WS=50118235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,55:0.61:90
chr16	50120122	rs2287196	C	T	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=71;ReadPosRankSum=-0.647;SC=CACTTCCTTTCCAGAATGAAC;SOR=1.230;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=6;WE=50120130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr16	50128572	rs60561577	A	G	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.973;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=94;ReadPosRankSum=1.372;SC=AAAATAGCCTATCTTGGAGAA;SOR=0.255;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=9;WE=50128580;WS=50128562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr16	50251590	rs3887556	G	A	2018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.358;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=38;PP=1118;ReadPosRankSum=0.933;SC=AGAATTTAGCGTTTATACAAC;SOR=0.517;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=33;TCR=38;TR=70;WE=50251598;WS=50251580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,77:0.99:78
chr16	50251671	rs10530119	G	GTCTCTCTCTCTCTCTCTC,GTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC	526.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=0;NR=3;PP=1666;SC=GCATGTTGCTGTCTCTCTCTC;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=3;WE=50251679;WS=50251661;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:12
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chr16	50326661	rs8051594	A	G	11436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=435;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=199;NR=200;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.571;SC=TGCAGGATGCATCCCGGGACC;SOR=0.760;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=401;TCF=200;TCR=201;TR=399;WE=50326669;WS=50326651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,432:1.00:434
chr16	50327439	rs2302712	A	G	3224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=71;PP=2121;SC=TGTGATTAGCATATCCCGGGG;SOR=1.316;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=44;TCR=71;TR=115;WE=50327447;WS=50327429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr16	50327456	rs2302713	C	T	3829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.63;SOR=1.714;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr16	50327462	rs2302714	G	A	3499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.45;SOR=2.155;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr16	50328421	rs2302716	T	C	240.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=7;NR=0;PP=196;SC=CTATGGAGGCTGAGGAAGGAC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=50328429;WS=50328411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	50334840	rs3833062	AG	A	1801.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=30;PP=1557;SC=CTGTGGATGGAGGGTTCTGCG;SOR=1.747;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=41;TCF=9;TCR=32;TR=39;WE=50334848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr16	50335150	rs35262781	TG	T	1489.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=30;PP=875;SC=AGGCCGCAGCTGGGGGGGACC;SOR=2.078;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=31;WE=50335158;WS=50335140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr16	50338723	rs9924714	C	T	4851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=54;PP=2813;SC=TGGACGACCCCGACACCTTGT;SOR=1.329;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=154;TCF=100;TCR=54;TR=154;WE=50338731;WS=50338713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr16	50339289	rs12444679	C	T	2114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.326;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=17;PP=1321;ReadPosRankSum=1.904;SC=CTCAGTGGGACCCACCCATTC;SOR=1.837;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=67;TCF=49;TCR=18;TR=66;WE=50339297;WS=50339279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,74:0.99:75
chr16	50342847	rs2302681	C	G	1285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=28;PP=893;SC=CCCCTTTGTACACTCAGGGCT;SOR=1.559;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=15;TCR=28;TR=43;WE=50342855;WS=50342837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr16	50345778	rs2302679	T	C	99.82	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=23;PP=584;SC=TGGGGTGGGGTGGGCTCAGGT;SOR=2.584;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=24;WE=50345786;WS=50345768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr16	50346114	rs67323835	AGGGGCT	A	8727.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=5;NR=124;PP=2973;SC=TGTGCTGAGAAGGGGCTGGGG;SOR=1.563;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=147;TCF=6;TCR=141;TR=129;WE=50346127;WS=50346104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr16	50346748	rs3214383	T	TCC	1559.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=2;PP=962;SC=TTGCCACTCTTCCTGTCCCCT;SOR=4.112;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=27;WE=50346756;WS=50346738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr16	50348813	rs3841348	AGTT	A	347.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=1;PP=284;SC=CCTTCACTCTAGTTGTTTTGT;SOR=3.056;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=7;WE=50348823;WS=50348803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	50355996	rs7184802	G	A	1988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.50;SOR=0.744;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr16	50359901	rs8046783	G	A	1096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=27;PP=700;SC=TACTTCATTGGCTGGTTTGCA;SOR=3.855;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=31;WE=50359909;WS=50359891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr16	50367633	rs56370009	T	TA	232.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=1.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.7556;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=4;PP=130;ReadPosRankSum=-1.111;SC=TAATACTAAGTAAAAAAAAAA;SOR=0.859;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=7;WE=50367641;WS=50367623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr16	50402569	rs113637419	C	T	1224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=23;NR=17;PP=590;SC=CCCGGAGCCACTGGGAAAGAG;SOR=0.733;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=23;TCR=17;TR=40;WE=50402577;WS=50402559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr16	50642201	rs933566	G	C	2039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.475;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=50;PP=1357;ReadPosRankSum=0.000;SC=CTGTCTTCTTGTAGGAGCTCG;SOR=0.757;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=222;TCF=110;TCR=112;TR=95;WE=50642209;WS=50642191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,100:0.41:245
chr16	50667166	.	G	A	3428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.716;ClippingRankSum=0.000;DP=452;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.532;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=77;PP=2038;ReadPosRankSum=0.798;SC=ACTCGATCTCGCTCCCATGAG;SOR=0.636;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=411;TCF=225;TCR=186;TR=165;WE=50667174;WS=50667156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:271,180:0.40:451
chr16	50731096	rs5743266	G	A	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=140;ReadPosRankSum=0.736;SC=GGCTTTTGGCGTTCTGCACAA;SOR=1.179;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=9;WE=50731104;WS=50731086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr16	50733374	rs2076753	G	T	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.770;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=147;ReadPosRankSum=-1.101;SC=GAGAAGTCCCGCACTGACCTT;SOR=0.307;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=11;WE=50733382;WS=50733364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr16	50733859	rs2067085	C	G	1943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.471;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=47;PP=1247;ReadPosRankSum=0.046;SC=TCACACCGTCCCAGAGGGTGA;SOR=1.039;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=154;TCF=73;TCR=81;TR=82;WE=50733867;WS=50733849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,90:0.52:172
chr16	50733969	rs2111235	A	G	1073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=29;PP=773;SC=AACTTGGTCCATGGGATTTCC;SOR=3.026;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=35;WE=50733977;WS=50733959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr16	50743919	rs34133110	C	T	2569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.325;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=64;PP=1545;ReadPosRankSum=1.233;SC=CCCAGGTTTTCAAACTCAGGT;SOR=0.864;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=157;TCF=55;TCR=102;TR=98;WE=50743927;WS=50743909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,111:0.64:174
chr16	50744624	rs2066842	C	T	1295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.147;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=31;PP=682;ReadPosRankSum=1.715;SC=CATGGCTGGACCCCCGCAGAA;SOR=0.589;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=180;TCF=90;TCR=90;TR=64;WE=50744632;WS=50744614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,71:0.35:200
chr16	50745199	rs2066843	C	T	3241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=385;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.444;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=71;PP=1959;ReadPosRankSum=1.271;SC=TGAGGAAGCGCCATCATGAGC;SOR=0.525;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=350;TCF=189;TCR=161;TR=142;WE=50745207;WS=50745189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:221,163:0.42:384
chr16	50745583	rs1861759	T	G	2595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=48;PP=1419;ReadPosRankSum=0.090;SC=TCCTGGTGCGTGCCAAAGGTG;SOR=0.743;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=154;TCF=81;TCR=73;TR=103;WE=50745591;WS=50745573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,117:0.68:172
chr16	50757276	rs5743291	G	A	1500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=37;PP=899;ReadPosRankSum=2.069;SC=GGCAAAGAACGTCATGCTAGA;SOR=0.747;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=114;TCF=51;TCR=63;TR=65;WE=50757284;WS=50757266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,71:0.55:128
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chr16	50759269	rs4990643	T	A	580.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.271;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=624;ReadPosRankSum=1.499;SC=CACAACGTACTTTATCTGTTC;SOR=2.129;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=14;WE=50759277;WS=50759257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr16	50759547	rs1077861	A	T	1484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=38;PP=1082;SC=GCATTTCTGAATAAGATCTGG;SOR=2.348;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=51;TCF=12;TCR=39;TR=50;WE=50759555;WS=50759537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
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chr16	50815432	rs1420871	C	T	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=70;ReadPosRankSum=-0.299;SC=TTCTTGCCAACGCTCATTAAG;SOR=0.250;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=6;WE=50815440;WS=50815422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr16	50816436	.	G	GGT	1175.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.062;ClippingRankSum=0.000;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.825;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.198;NF=0;NR=21;PP=699;ReadPosRankSum=-1.796;SC=GACACATACCGGTGTGTGTGT;SOR=0.850;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=78;TCF=3;TCR=75;TR=21;WE=50816444;WS=50816426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,46:0.45:103
chr16	50826462	rs10451132	G	T	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.463;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=107;ReadPosRankSum=1.294;SC=AGGGAAAAGTGTTTTTTTTAA;SOR=0.743;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=8;WE=50826470;WS=50826452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr16	50827518	rs2066852	C	T	2201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=412;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.892;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=53;PP=1326;ReadPosRankSum=-0.919;SC=AATGCTACGACGATCCGGACA;SOR=0.645;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=377;TCF=192;TCR=185;TR=117;WE=50827526;WS=50827508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:283,129:0.31:412
chr16	50827601	rs2302759	A	G	5139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=104;PP=2965;SC=CTTAATGGATAAACTTTTGTT;SOR=1.519;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=164;TCF=60;TCR=104;TR=164;WE=50827609;WS=50827591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr16	50841386	rs74753645	C	T	1129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.082;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=24;PP=709;ReadPosRankSum=-1.215;SC=AGAGGCTTCCCGCCCCCTCAC;SOR=0.909;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=141;TCF=79;TCR=62;TR=56;WE=50841394;WS=50841376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,60:0.39:153
chr16	50841484	rs1054987	G	A	1515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.367;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=36;PP=781;ReadPosRankSum=-0.425;SC=TTCCCCCACTGCAATACCCTG;SOR=0.847;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=114;TCF=50;TCR=64;TR=60;WE=50841492;WS=50841474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,75:0.54:139
chr16	51170930	.	A	AGGGGC	394.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.274;ClippingRankSum=0.000;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.40;ReadPosRankSum=0.119;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,13:0.28:47
chr16	51171175	rs4614723	C	T	7258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=121;NR=133;PP=2965;SC=AGCCCACTAACAGGTGAGCTG;SOR=0.858;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=255;TCF=121;TCR=134;TR=254;WE=51171183;WS=51171165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,273:1.00:273
chr16	51173559	rs1965024	G	A	9353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=160;NR=150;PP=2965;SC=TCGACATCTCGAGGGGCAAAG;SOR=0.743;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=310;TCF=160;TCR=150;TR=310;WE=51173567;WS=51173549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,328:1.00:328
chr16	51177113	rs4399530	A	C	489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=388;SC=TGTCCTGAACATTTTATTATA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=15;WE=51177121;WS=51177103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr16	51177327	rs34204387	G	GAA	1764.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.53;MQRankSum=0.645;QD=30.43;ReadPosRankSum=-0.917;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,55:0.95:58
chr16	51185225	.	A	AGCG	371.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.606;ClippingRankSum=0.000;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=271;ReadPosRankSum=0.091;SC=ACGGAAATCGAGCGGCGGCGG;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=6;WE=51185233;WS=51185215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,12:0.31:39
chr16	51185298	.	G	A	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=-0.000;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.55;ReadPosRankSum=1.645;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr16	52061047	rs12149256	A	G	4646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.395;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=102;PP=2828;ReadPosRankSum=1.172;SC=GCTCATGTTGAATGCAAAAAA;SOR=0.491;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=311;TCF=134;TCR=177;TR=186;WE=52061059;WS=52061037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,208:0.62:336
chr16	52107849	rs33338	C	A	4658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=96;PP=2828;SC=TGAGGCTTGACTGCAAGGATT;SOR=1.398;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=155;TCF=59;TCR=96;TR=155;WE=52107860;WS=52107839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr16	52473263	rs9925256	A	G	1126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.895;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=32;PP=716;ReadPosRankSum=0.089;SC=GAGAGGCGACAGGGGAGTGCT;SOR=0.307;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=140;TCF=53;TCR=87;TR=57;WE=52473271;WS=52473253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,61:0.38:159
chr16	52479771	rs2075236	A	T	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=228;ReadPosRankSum=-1.229;SC=CTGGGTTTTTAAATTCCATTG;SOR=0.990;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=11;WE=52479779;WS=52479761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr16	52498167	.	A	AAC,AACAG	406.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.269;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=61.64;MQRankSum=2.268;NF=0;NR=9;PP=499;ReadPosRankSum=0.381;SC=CGGGGAGGGAAAGAGAAAGAC;SOR=0.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=9;WE=52498177;WS=52498157;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.48:25
chr16	52498169	.	G	A	492	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=4;HapScore=4;MGOF=2;MMLQ=27;MQ=61.19;NF=1;NR=8;PP=492;QD=58.5301347275;SC=GGGAGGGAAAGAGAAAGACAT;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=9;WE=52498177;WS=52498157;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:13,9:0.41:22
chr16	52498169	.	G	GAA	406.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.926;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=2.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.34;MQRankSum=2.021;QD=16.95;ReadPosRankSum=0.435;SOR=0.233;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr16	52502318	rs2287144	A	G	1995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-3.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.646;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=19;PP=1169;ReadPosRankSum=1.472;SC=CTTGTGCCACATAAGAGAGAG;SOR=0.510;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=123;TCF=93;TCR=30;TR=77;WE=52502326;WS=52502308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,91:0.65:141
chr16	52502571	rs9928698	A	C	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=330;ReadPosRankSum=1.958;SC=TGGTGTTGCTAAATAAAAGAG;SOR=1.022;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=16;WE=52502579;WS=52502561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
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chr16	52993016	rs9931362	A	C	3501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=56;NR=59;PP=1994;SC=TTTAGGCTCCATCCCCCTCCT;SOR=0.994;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=56;TCR=59;TR=115;WE=52993024;WS=52993006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr16	53035592	rs12149531	A	G	805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=21;PP=572;SC=GCACATTCCTAGCCCCCAGCC;SOR=3.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=25;WE=53035600;WS=53035582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
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chr16	53191470	rs12597487	T	C	3927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.068;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=90;PP=2519;ReadPosRankSum=0.518;SC=AGCTCTTTGCTTTTATTTTGG;SOR=0.827;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=249;TCF=110;TCR=139;TR=158;WE=53191478;WS=53191460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,173:0.62:281
chr16	53256494	rs12597253	T	A	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=176;ReadPosRankSum=-0.428;SC=ACAATCTTAATTTAATCAAAT;SOR=0.724;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=12;WE=53256502;WS=53256484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr16	53272216	rs8049913	A	C	899.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.237;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=10;PP=617;ReadPosRankSum=1.018;SC=TAGAAAAAAAACCCAATGTAT;SOR=0.476;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=64;TCF=51;TCR=13;TR=40;WE=53272224;WS=53272206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,43:0.61:71
chr16	53279123	rs138968213	TA	T	85.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=92;ReadPosRankSum=-1.103;SC=CACACACACATAACATATATA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=4;WE=53279131;WS=53279113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr16	53283966	rs8052283	G	A	2152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.525;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=51;PP=1363;ReadPosRankSum=0.768;SC=GGAATCCTCAGAATGATCTTC;SOR=0.473;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=161;TCF=67;TCR=94;TR=92;WE=53283974;WS=53283956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,99:0.55:179
chr16	53288265	rs6499510	G	A	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=359;ReadPosRankSum=-0.992;SC=AAGAATTCTTGTATGTGTTTA;SOR=0.512;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=18;WE=53288273;WS=53288255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr16	53289473	.	TA	T	1158.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.093;ClippingRankSum=0.000;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.166;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.415;NF=29;NR=8;PP=662;ReadPosRankSum=-0.737;SC=TTATGAACTTTAAAAAAAACT;SOR=1.085;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=71;TCF=50;TCR=21;TR=37;WE=53289481;WS=53289463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,53:0.68:78
chr16	53308315	rs57281432	A	T	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=179;ReadPosRankSum=0.944;SC=GCCTCCTGAGAGGCTCGCACT;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=9;WE=53308323;WS=53308305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr16	53319390	rs112281896	T	TAATGA	457.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=290;SC=GATTAAAAAATAATGAAATCC;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=6;WE=53319398;WS=53319380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	53320025	rs8056394	G	A	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.744;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=151;ReadPosRankSum=-0.038;SC=TCATTTTAATGTATTATCCCT;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=8;WE=53320033;WS=53320015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr16	53321734	rs3815548	T	C	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=154;ReadPosRankSum=-0.203;SC=TGCTGTGTCTTGGGCTCTTCT;SOR=0.586;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=12;WE=53321742;WS=53321724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,12:0.41:29
chr16	53325691	rs1894903	G	A	2017.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.929;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=39;PP=1040;ReadPosRankSum=-0.604;SC=TAAATTGCACGTACTTCTGTA;SOR=0.953;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=128;TCF=66;TCR=62;TR=78;WE=53325699;WS=53325681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,93:0.61:153
chr16	53326860	rs2287078	G	A	6253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=576;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=140;NR=129;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.144;SC=GACAAATTCAGCAGATACAAC;SOR=0.702;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=520;TCF=272;TCR=248;TR=269;WE=53326868;WS=53326850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:275,301:0.52:576
chr16	53327041	rs7188463	A	G	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=5.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.351;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=456;ReadPosRankSum=1.965;SC=GGGTACAATTATCACGCTTTG;SOR=2.570;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=20;WE=53327049;WS=53327031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,21:0.51:41
chr16	53340080	rs3760010	G	A	781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.162;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=4;PP=577;ReadPosRankSum=-1.520;SC=GAATAATTATGTAAAATCCTT;SOR=0.919;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=62;TCF=52;TCR=10;TR=32;WE=53340088;WS=53340070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,34:0.51:67
chr16	53341748	rs6499548	T	G	3685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.273;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=65;PP=2200;ReadPosRankSum=-0.003;SC=AATACAGCGATCCCAGTGTAC;SOR=0.741;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=256;TCF=132;TCR=124;TR=140;WE=53341756;WS=53341738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,161:0.57:282
chr16	53342860	rs12596466	C	T	595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=412;ReadPosRankSum=0.704;SC=ATTTATTTTTCCTTTGTTGGA;SOR=1.041;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=22;WE=53342868;WS=53342850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,25:0.62:40
chr16	53348157	rs62049810	T	A	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=27;ReadPosRankSum=0.598;SC=ATGATATTTTTAGTCCAAAAG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=3;WE=53348165;WS=53348155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
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chr16	53349000	rs12596829	G	A	1500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.880;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=41;PP=931;ReadPosRankSum=0.154;SC=ATTTTTATGAGTTGTCAGATC;SOR=1.169;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=104;TCF=36;TCR=68;TR=60;WE=53349008;WS=53348990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,66:0.59:111
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chr16	53358439	rs3743771	A	G	5626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=431;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=122;NR=112;PP=2962;ReadPosRankSum=0.356;SC=TTCTCCTTCCACATCCTCTAC;SOR=0.692;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=395;TCF=204;TCR=191;TR=234;WE=53358447;WS=53358429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,260:0.60:430
chr16	53404203	rs10775327	C	A	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=21;PP=386;ReadPosRankSum=0.999;SC=GGAACTTTTACCTGACTAAAA;SOR=0.735;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=79;TCF=20;TCR=59;TR=28;WE=53404211;WS=53404193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,31:0.35:89
chr16	53476838	.	G	GT	37.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.701;ClippingRankSum=0.000;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.48;ReadPosRankSum=-1.947;SOR=0.602;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,11:0.14:78
chr16	53699003	rs4133017	G	A	3260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=73;PP=2008;SC=TTTTAGTGGCGCAGAGACCAC;SOR=1.590;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=40;TCR=73;TR=113;WE=53699011;WS=53698993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr16	54018700	rs5816914	CTAAG	C	394.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=326;ReadPosRankSum=0.060;SC=AAGGCCTTGACTAAGTCAGTG;SOR=0.223;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=9;WE=54018711;WS=54018692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,12:0.33:36
chr16	54273780	rs17253625	C	T	1933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.956;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=39;PP=1080;ReadPosRankSum=-0.347;SC=CAAGCAAGAGCGGGCGGAATG;SOR=0.524;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=207;TCF=117;TCR=90;TR=86;WE=54273788;WS=54273770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,98:0.42:232
chr16	54274354	rs16953243	A	C	699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=7;PP=468;ReadPosRankSum=1.074;SC=CACAGCCTGGAAAAAGCAGAG;SOR=0.757;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=76;TCF=57;TCR=19;TR=30;WE=54274362;WS=54274344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,33:0.40:83
chr16	54274562	rs17253832	T	C	1527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.617;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=48;PP=1207;ReadPosRankSum=1.257;SC=AAAGTATCACTAAGAGCAAGG;SOR=1.016;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=185;TCF=66;TCR=119;TR=70;WE=54274570;WS=54274552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,71:0.37:193
chr16	54274615	rs55970991	G	T	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=18;PP=336;ReadPosRankSum=0.152;SC=AGGAAAGAAGGATTCATTTCA;SOR=0.901;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=45;TCF=9;TCR=36;TR=22;WE=54274623;WS=54274605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,22:0.45:49
chr16	54279640	rs72811791	G	T	1030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.745;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=26;PP=631;ReadPosRankSum=-0.361;SC=GCACCAGGGCGCTGGGAGTGC;SOR=0.591;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=98;TCF=38;TCR=60;TR=45;WE=54279648;WS=54279630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,49:0.46:107
chr16	54279687	rs16953255	G	C	1000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.41;ReadPosRankSum=-0.404;SOR=0.848;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,27:0.44:61
chr16	54279693	rs72811792	A	G	970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=1.071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.91;ReadPosRankSum=-0.553;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,26:0.43:61
chr16	54318102	rs8050831	C	T	2628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=22;PP=1693;SC=TGCTCGGCGTCCTCTCCTTTC;SOR=1.765;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=64;TCR=22;TR=86;WE=54318110;WS=54318092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr16	54318172	rs1126960	C	A	2101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.971;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=40;PP=1174;ReadPosRankSum=-0.783;SC=TGGGCACGGGCTGGAAAGCTG;SOR=0.781;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=228;TCF=132;TCR=96;TR=98;WE=54318180;WS=54318162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,111:0.44:253
chr16	54318528	rs1450355	A	G	1099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.58;SOR=1.055;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr16	54319571	rs1868692	A	G	3218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=69;PP=2256;SC=AGGGAGCGCGAGTGAGCCCCA;SOR=1.449;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=37;TCR=69;TR=106;WE=54319579;WS=54319561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr16	54319994	rs1868691	G	C	1950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=38;PP=1185;SC=GGAGAGGGGGGCCGACCCCCG;SOR=1.478;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=21;TCR=38;TR=59;WE=54320002;WS=54319984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr16	54602769	rs112946517	G	GGGAGAA	2763.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=9.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQRankSum=0.890;QD=23.42;ReadPosRankSum=-0.133;SOR=1.652;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,67:0.57:118
chr16	55359126	rs31078	A	T	1747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.595;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=39;PP=996;ReadPosRankSum=0.507;SC=GCCTCTGATCATCCTCCTCTT;SOR=0.756;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=59;TCR=82;TR=68;WE=55359134;WS=55359116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,81:0.51:159
chr16	55359141	rs31079	T	C	1518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.135;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=39;PP=978;ReadPosRankSum=1.019;SC=CCTCTTGTGTTCTGGGGGAAG;SOR=1.053;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=126;TCF=50;TCR=76;TR=61;WE=55359151;WS=55359131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,69:0.49:140
chr16	55360208	rs31081	G	T	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=169;ReadPosRankSum=2.248;SC=GGTGGGGGGGGGGTCTCTGAC;SOR=0.693;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=14;WE=55360216;WS=55360198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,16:0.80:20
chr16	55360493	rs79122224	G	T	1806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-1.144;NF=45;NR=40;PP=1010;ReadPosRankSum=0.032;SC=CCCCCTCACTGTATGGGGCAC;SOR=0.688;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=202;TCF=108;TCR=94;TR=85;WE=55360501;WS=55360481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,94:0.43:219
chr16	55361493	rs31082	C	T	1453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=32;PP=751;ReadPosRankSum=-1.273;SC=GGTTCTCCCCCACAGGTATGG;SOR=0.661;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=57;TCR=59;TR=64;WE=55361501;WS=55361483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,71:0.55:128
chr16	55362502	rs31085	G	A	585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=0;PP=434;SC=ATTACACTGAGGATGCCCTGA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=55362510;WS=55362492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	55362542	rs31086	C	G	593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.772;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=3;PP=397;ReadPosRankSum=0.668;SC=AAAAGCTTCTCGGGGATGGAC;SOR=1.247;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=49;TCF=38;TCR=11;TR=23;WE=55362550;WS=55362532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,25:0.48:52
chr16	55363238	rs31087	G	A	2196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=55;PP=1532;SC=TGGGCCCCCAGCGGCGCTGGG;SOR=2.103;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=22;TCR=55;TR=77;WE=55363246;WS=55363228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr16	55363266	rs55854654	C	T	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=146;ReadPosRankSum=-1.338;SC=ATGCAAAAGACACCCACCTAC;SOR=0.569;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=40;TCF=9;TCR=31;TR=14;WE=55363274;WS=55363256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,13:0.32:40
chr16	55364117	rs139328528	G	C	887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=16;PP=546;ReadPosRankSum=1.168;SC=TAGACCATTTGCTTGCCTTCA;SOR=0.729;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=134;TCF=83;TCR=51;TR=40;WE=55364125;WS=55364107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,47:0.32:146
chr16	55513623	rs243862	C	T	2194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.094;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=59;PP=1344;ReadPosRankSum=0.582;SC=TCTCCCCCTGCCCTCGGCGGT;SOR=0.609;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=202;TCF=74;TCR=128;TR=95;WE=55513631;WS=55513613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,103:0.47:218
chr16	55515593	rs1030870	G	A	513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=337;ReadPosRankSum=-0.857;SC=GTGTTGTCCAGAGGCAATGCA;SOR=0.611;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=54;TCF=39;TCR=15;TR=26;WE=55515601;WS=55515583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,26:0.46:57
chr16	55515621	rs1030869	T	C	887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=10;PP=631;ReadPosRankSum=0.092;SC=CTTAAGAAGATAACTCTGGAC;SOR=0.687;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=82;TCF=62;TCR=20;TR=40;WE=55515629;WS=55515611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,42:0.46:91
chr16	55515695	rs708269	A	T	3070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.013;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=53;PP=1765;ReadPosRankSum=1.378;SC=TGATGATGTTAGGCAAGTGAC;SOR=0.842;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=251;TCF=142;TCR=109;TR=129;WE=55515703;WS=55515685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,146:0.53:277
chr16	55516708	rs857403	T	A	585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=1;PP=349;SC=CCTGGCTTATTTCCTGTCTGG;SOR=3.716;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=55516716;WS=55516698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	55516767	rs1030868	G	A	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=222;ReadPosRankSum=-0.621;SC=GCTTTGGTCAGTACTGTGCCA;SOR=0.720;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=63;TCF=48;TCR=15;TR=19;WE=55516775;WS=55516757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,24:0.33:73
chr16	55519535	rs1132896	G	C	1639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.540;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=44;PP=1207;ReadPosRankSum=-1.277;SC=TGAAGTATGGGAACGCCGATG;SOR=0.587;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=248;TCF=133;TCR=115;TR=88;WE=55519543;WS=55519525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,93:0.34:271
chr16	55523705	rs243849	T	C	4043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=96;PP=2425;SC=ACTACGATGATGACCGCAAGT;SOR=1.874;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=45;TCR=96;TR=141;WE=55523713;WS=55523695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr16	55525913	rs243846	G	C	1847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=21;NR=46;PP=1321;SC=GAGGAGGGGGGAGGTCATGTA;SOR=1.376;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=69;TCF=21;TCR=48;TR=67;WE=55525921;WS=55525903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr16	55527026	rs11640428	A	T	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=279;ReadPosRankSum=0.242;SC=AGTGGGGAGAACCTCTGGAGC;SOR=0.859;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=15;WE=55527034;WS=55527016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr16	55527113	rs2287074	G	A	1405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.923;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=29;PP=676;ReadPosRankSum=0.790;SC=CCACCCCCACGCTGGGCCCTG;SOR=0.524;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=130;TCF=70;TCR=60;TR=58;WE=55527121;WS=55527103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,71:0.48:148
chr16	55527298	rs243843	G	A	1193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=31;PP=799;SC=TGAAGACTCCGCCAAATGCTT;SOR=3.056;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=8;TCR=31;TR=39;WE=55527306;WS=55527288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr16	55530762	rs171498	G	T	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.295;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.37;ReadPosRankSum=-0.691;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr16	55530772	rs243838	T	G	571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.59;ReadPosRankSum=-0.435;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,19:0.95:20
chr16	55532458	rs2287076	T	C	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.028;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=208;ReadPosRankSum=-0.384;SC=GTTCAGAGGTTGGTGGGCTCT;SOR=1.831;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=46;TCF=7;TCR=39;TR=16;WE=55532466;WS=55532448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,17:0.35:48
chr16	55536727	rs14070	C	T	5850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=101;NR=99;PP=2965;SC=ATCCTGGCTTCCCCAAGCTCA;SOR=0.845;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=202;TCF=101;TCR=101;TR=200;WE=55536735;WS=55536717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr16	55543073	rs17302903	G	C	3905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=58;PP=2249;SC=GCTTCGGCCGGGTTCTACGCC;SOR=0.915;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=135;TCF=77;TCR=58;TR=135;WE=55543081;WS=55543063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr16	55543322	rs2241147	G	T	1261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=11;NR=32;PP=853;SC=GTCAGAGGGGGGTCCAGGTAA;SOR=2.208;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=11;TCR=32;TR=43;WE=55543330;WS=55543312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr16	55562257	rs837549	G	A	1059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=0;PP=842;SC=TTAATTAACAGAGCTAATTAC;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=30;WE=55562265;WS=55562253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr16	55562466	rs837550	G	A	12039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=447;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=189;NR=218;PP=2965;SC=TACCTTCTATGGTATCTCGAA;SOR=0.899;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=408;TCF=189;TCR=219;TR=407;WE=55562474;WS=55562456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,446:1.00:446
chr16	55579899	rs2397722	G	A	686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=20;PP=516;SC=CAATCTATAAGTATTTTCCCC;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=24;WE=55579907;WS=55579889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr16	55583149	rs2160277	T	A	1416.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=40;NR=16;PP=996;SC=CTTTTTTTTTTAAAAAAAATG;SOR=2.256;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=57;TCF=41;TCR=16;TR=56;WE=55583157;WS=55583139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr16	55583448	rs9934904	A	T	72.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=51;SC=GTCAGAGTTGAGAATTTATCT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=55583456;WS=55583438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr16	55601388	rs1502003	A	G	3278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.403;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=72;PP=1986;ReadPosRankSum=0.261;SC=CTATCAAAGAATGGCTGCAGT;SOR=0.520;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=238;TCF=102;TCR=136;TR=130;WE=55601396;WS=55601378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,148:0.55:268
chr16	55728081	rs28613651	T	G	2617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=53;PP=1696;SC=TGACTCTTGTTGGGTGGCAGA;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=35;TCR=53;TR=88;WE=55728089;WS=55728071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr16	55729124	rs2279805	T	C	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=4.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.54;ReadPosRankSum=0.107;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:82,14:0.15:96
chr16	55730124	rs5568	A	C	1514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.686;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=30;PP=934;ReadPosRankSum=-0.862;SC=GAGGTCCTTGATGTTTCTTAC;SOR=0.779;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=153;TCF=82;TCR=71;TR=69;WE=55730132;WS=55730114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,75:0.45:168
chr16	55731835	rs5569	G	A	1723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=19;PP=1100;ReadPosRankSum=-1.261;SC=CTGTCATCACGGGCCTGGCAG;SOR=0.759;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=114;TCF=79;TCR=35;TR=67;WE=55731843;WS=55731825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,75:0.60:125
chr16	55731946	rs998424	G	A	2958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.560;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=70;PP=1852;ReadPosRankSum=1.746;SC=AGGTGAGTAGGGGCTGGGCTC;SOR=0.769;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=185;TCF=84;TCR=101;TR=126;WE=55731954;WS=55731936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,133:0.67:198
chr16	55735795	rs5560	G	A	2980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.547;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=43;PP=1761;ReadPosRankSum=0.877;SC=ATGGCATCACGCCAGAGAACG;SOR=0.651;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=189;TCF=120;TCR=69;TR=117;WE=55735803;WS=55735785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,131:0.64:204
chr16	55735912	rs2242447	C	T	9197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=153;NR=164;PP=2965;SC=CCCTGCTGTGCACTGCCCAAG;SOR=0.854;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=317;TCF=153;TCR=164;TR=317;WE=55735920;WS=55735902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,346:1.00:346
chr16	55806311	rs28538364	G	T	1917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.568;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=52;PP=1216;ReadPosRankSum=1.675;SC=CGGGGAACTGGGGTCACCTGG;SOR=0.779;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=260;TCF=134;TCR=126;TR=95;WE=55806319;WS=55806301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,103:0.36:285
chr16	55806409	rs28366434	T	C	1938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-1.826;QD=6.85;ReadPosRankSum=2.037;SOR=0.704;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:177,106:0.37:283
chr16	55806532	rs143032941	C	CAATACCT	3125.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FS=0.493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.25;MQRankSum=3.301;QD=12.55;ReadPosRankSum=0.034;SOR=0.641;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:158,91:0.37:249
chr16	55807252	rs62030211	G	T	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQRankSum=-2.412;QD=2.27;ReadPosRankSum=-0.253;SOR=0.749;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,8:0.12:67
chr16	55807256	rs60044394	A	G	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQRankSum=-2.822;QD=2.16;ReadPosRankSum=-1.056;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,9:0.13:69
chr16	55813552	rs28666799	C	T	734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.882;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.290;NF=20;NR=10;PP=448;ReadPosRankSum=0.288;SC=TTGCCCCACTCACCCAGCTCA;SOR=0.551;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=48;TCR=23;TR=30;WE=55813560;WS=55813542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,36:0.44:82
chr16	55813600	rs28538101	T	C	1102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.330;NF=29;NR=21;PP=664;ReadPosRankSum=-1.320;SC=CATCCTCTGCTTTTGTCTTCA;SOR=0.749;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=129;TCF=72;TCR=57;TR=50;WE=55813608;WS=55813590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,57:0.40:142
chr16	55813644	rs28418425	C	T	1492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FS=0.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQRankSum=-5.055;QD=8.25;ReadPosRankSum=0.142;SOR=0.681;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:102,79:0.44:181
chr16	55813712	rs28613114	G	T	701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.916;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQ=59.47;MQRankSum=-2.593;NF=14;NR=18;PP=343;ReadPosRankSum=-0.438;SC=AAGTTCCAATGAACTGTGAGT;SOR=0.520;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=67;TCF=27;TCR=40;TR=32;WE=55813720;WS=55813702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,36:0.49:74
chr16	55813750	rs28594163	G	A	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=280;ReadPosRankSum=-0.892;SC=GGTGGTTATAGTAACTCCTGT;SOR=0.990;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=14;WE=55813758;WS=55813740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr16	55844609	rs2244613	G	T	5016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=33.22;ReadPosRankSum=-0.523;SOR=0.978;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,149:0.99:151
chr16	55844609	.	GGGTGAGCG	TGGTGAGCA,TGGTGAGCG	953	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000,0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=23,59;NR=32,73;PP=830,953;QD=16.0630522702;SC=CACCAGCCCCGGGTGAGCGAT;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=135;TCF=60;TCR=75;TR=55,132;WE=55844625;WS=55844599;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.41:135
chr16	55844617	rs2244614	G	A	1274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.58;ReadPosRankSum=2.040;SOR=0.673;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,61:0.46:133
chr16	55844924	.	TA	T	2360.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.487;ClippingRankSum=0.000;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=12.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.19;ReadPosRankSum=2.485;SOR=0.814;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,81:0.66:123
chr16	55844926	rs112236246	A	AC	578.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=5.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.90;ReadPosRankSum=-1.944;SOR=0.832;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,32:0.27:118
chr16	55844928	rs375953001	A	C	1747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=13.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.55;ReadPosRankSum=4.075;SOR=0.835;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,76:0.59:129
chr16	55845084	.	T	TG	1315.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=29;PP=1226;SC=ATGAATCAAATGGGCTTATAT;SOR=3.312;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=30;WE=55845092;WS=55845074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr16	55845122	.	C	A	20	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;FR=0.5000;HP=13;HapScore=2;MGOF=26;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=20;QD=13.6928031368;SC=GCAAAGTTTACAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=55845130;WS=55845112;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:4,4:0.50:8
chr16	55847045	rs3859092	A	G	1760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.95;SOR=4.073;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr16	55847051	rs3859093	C	T	1636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.24;SOR=4.351;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr16	55850708	rs2302719	T	G	555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=2;PP=467;SC=TACCCCTCTCTGGGCCTCAGA;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=55850716;WS=55850698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	55854246	.	G	T	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=-0.000;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.84;MQRankSum=-0.431;QD=22.29;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr16	55854259	rs2307237	G	A	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.88;MQRankSum=-0.489;QD=20.10;ReadPosRankSum=-0.135;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr16	55854412	rs2307229	A	T	1573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=6.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.02;MQRankSum=1.972;QD=16.39;ReadPosRankSum=-3.178;SOR=0.422;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,71:0.74:96
chr16	55854452	rs2307233	G	A	2833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=5.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.53;MQRankSum=2.682;QD=31.49;ReadPosRankSum=5.436;SOR=0.286;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,69:0.77:90
chr16	55854455	rs2307235	A	C	2833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=7.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.17;MQRankSum=1.811;QD=32.57;ReadPosRankSum=4.836;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,70:0.80:87
chr16	55854514	rs8192940	G	A	887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=24;PP=668;SC=TCCAGTAGTGGGCTGACCCTC;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=26;WE=55854522;WS=55854504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
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chr16	55857396	rs150951789	A	C	471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=4.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.201;NF=17;NR=3;PP=315;ReadPosRankSum=1.453;SC=CTGGCATGACAAGAGCTGGGT;SOR=0.713;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=77;TCF=63;TCR=14;TR=20;WE=55857404;WS=55857386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,23:0.27:85
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chr16	55883618	rs2160276	T	C	1637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=38;PP=808;ReadPosRankSum=-0.545;SC=TGACAAAAGCTGGCTTCGTGT;SOR=0.698;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=195;TCF=97;TCR=98;TR=77;WE=55883626;WS=55883608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,86:0.39:221
chr16	55883761	rs7186875	A	C	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.140;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=89;ReadPosRankSum=0.057;SC=CCACCTATCAAGTCTTGGATG;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=7;WE=55883769;WS=55883751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
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chr16	55907811	rs2397965	C	T	1573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.070;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=29;PP=772;ReadPosRankSum=-0.352;SC=GTTCGTAAATCGCAGGGATCC;SOR=0.753;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=193;TCF=105;TCR=88;TR=71;WE=55907819;WS=55907801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,83:0.38:218
chr16	55909163	rs7194945	T	C	829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.792;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=26;PP=477;ReadPosRankSum=-1.330;SC=CTGTGAACATTGACGGCGGCT;SOR=0.508;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=89;TCF=28;TCR=61;TR=39;WE=55909171;WS=55909153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,41:0.43:95
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chr16	56228066	rs1190761	A	G	5406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=88;PP=2965;SC=TCTTATTTTTATTCGAGAGCT;SOR=0.734;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=181;TCF=92;TCR=89;TR=180;WE=56228074;WS=56228056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr16	56362725	rs2241952	T	C	6398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=146;PP=2965;SC=AGCGGGCGCATGGCCTGGAGC;SOR=1.433;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=229;TCF=83;TCR=146;TR=229;WE=56362733;WS=56362715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr16	56368495	rs4784656	T	C	1503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=8;PP=1141;SC=CCCCACTCCCTATGGCCTGGA;SOR=2.925;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=40;TCR=8;TR=48;WE=56368503;WS=56368485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
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chr16	56396486	rs4924	C	T	3200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=385;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.185;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=77;PP=1980;ReadPosRankSum=-1.118;SC=GTGGGACGTACGCATGAGGCA;SOR=0.807;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=356;TCF=167;TCR=189;TR=141;WE=56396494;WS=56396476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:229,156:0.41:385
chr16	56401294	rs2241957	T	C	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=96;ReadPosRankSum=0.044;SC=AAGACCACTGTCGGGACCACA;SOR=0.340;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=7;WE=56401302;WS=56401284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr16	56436824	rs2440472	A	G	1400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=20;PP=921;ReadPosRankSum=-0.826;SC=ACATTCTGACATACTCTGGGA;SOR=0.696;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=152;TCF=109;TCR=43;TR=67;WE=56436832;WS=56436814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,72:0.41:176
chr16	56441862	rs2920704	A	G	1459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.229;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=30;PP=841;ReadPosRankSum=1.402;SC=CAAGTCCTGCATCCAGTATCT;SOR=0.868;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=240;TCF=141;TCR=99;TR=77;WE=56441870;WS=56441852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,87:0.33:265
chr16	56442066	rs4238787	C	T	540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=334;ReadPosRankSum=-0.445;SC=CATTCTTCTTCATGGAAGTGT;SOR=0.836;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=64;TCF=15;TCR=49;TR=24;WE=56442074;WS=56442056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,27:0.39:70
chr16	56468561	rs8056687	C	T	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.046;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=88;ReadPosRankSum=-0.921;SC=AGTTTTACAACAAACCCAAAA;SOR=0.317;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=12;WE=56468569;WS=56468551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,15:0.33:45
chr16	56488565	.	GA	G	51	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=10;HapScore=2;MGOF=17;MMLQ=17;MQ=57.55;NF=5;NR=0;PP=51;QD=12.6;SC=ATTGGGGGGGGAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=5;WE=56488573;WS=56488555;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr16	56488600	.	AT	A	31.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.892;ClippingRankSum=0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.13;MQRankSum=2.522;QD=1.67;ReadPosRankSum=-0.444;SOR=0.313;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr16	56504724	rs13337155	G	C	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=5.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.509;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=24;PP=509;ReadPosRankSum=0.417;SC=GTTAGGATTTGTCCTTACTTA;SOR=1.041;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=78;TCF=7;TCR=71;TR=25;WE=56504732;WS=56504714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,30:0.35:85
chr16	56508775	rs145889680	C	T	3185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FS=2.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.80;ReadPosRankSum=-1.796;SOR=0.843;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,152:0.56:270
chr16	56533603	.	C	T	1267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.907;ClippingRankSum=0.000;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.095;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=14;PP=924;ReadPosRankSum=-0.733;SC=CAATATAACACATTAATGTAA;SOR=0.175;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=79;TCF=62;TCR=17;TR=53;WE=56533611;WS=56533593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,54:0.67:81
chr16	56535059	rs73547688	A	G	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.404;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=81;ReadPosRankSum=0.646;SC=TATCTCTACTAAAAATACAAA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=5;WE=56535067;WS=56535049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr16	56548501	rs4784677	C	T	6492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=128;PP=2965;SC=CTGGTTAATGCTGAGAAGAGA;SOR=1.332;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=210;TCF=82;TCR=128;TR=210;WE=56548509;WS=56548491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr16	56599221	rs182221	C	G	2861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=69;PP=2054;SC=CTGGCCACCTCTGGGGCAGCT;SOR=2.117;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=25;TCR=69;TR=94;WE=56599229;WS=56599211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr16	56601720	rs666636	A	G	7317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.08;SOR=1.220;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr16	56601720	.	ATT	GTC	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=57;NR=81;PP=2947;QD=20;SC=TGTAAAACATATTGGAAGAGT;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=58;TCR=83;TR=138;WE=56601730;WS=56601710;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,138:0.98:141
chr16	56601722	rs666647	T	C	7317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.62;SOR=1.228;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr16	56602671	rs762604	C	T	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=221;ReadPosRankSum=0.722;SC=TCTTTTCCTACTTCCTCTAAG;SOR=0.941;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=14;WE=56602679;WS=56602661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr16	56623191	rs7195310	C	T	439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=11;PP=281;SC=AGTGCGCGCACAGCGGCGGCG;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=56623199;WS=56623181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	56624079	rs11644094	A	G	3147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=70;PP=2010;SC=GAAGACTCCAATGGCAGCTGG;SOR=1.397;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=41;TCR=70;TR=111;WE=56624087;WS=56624069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr16	56660685	rs117777471	A	G	3574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=389;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.370;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=92;PP=2417;ReadPosRankSum=-0.342;SC=AGACGAAAAAAAGCATCCTCT;SOR=0.718;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=362;TCF=161;TCR=201;TR=164;WE=56660693;WS=56660675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:215,174:0.45:389
chr16	56667282	rs1827210	C	A	3836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=68;PP=2512;SC=GGCTCCTGCACGTGCAAAGAG;SOR=0.969;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=121;TCF=53;TCR=68;TR=121;WE=56667290;WS=56667272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr16	56667854	rs2270837	A	G	5183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.99;NF=57;NR=114;PP=2965;SC=TTCTTTTTATATTAAATATGT;SOR=1.535;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=171;TCF=57;TCR=114;TR=171;WE=56667862;WS=56667844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr16	56673227	rs11640851	C	A	1646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.598;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=19;PP=586;ReadPosRankSum=1.427;SC=TGCAAATGCACCTCCTGCAAG;SOR=0.389;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=129;TCF=84;TCR=45;TR=46;WE=56673235;WS=56673217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,47:0.35:135
chr16	56673249	rs11647171	T	C	1948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.248;HP=5;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=27;PP=682;ReadPosRankSum=0.833;SC=AGAGTGAGTGTGGGGCCATCT;SOR=0.564;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=165;TCF=95;TCR=70;TR=61;WE=56673257;WS=56673239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,63:0.36:175
chr16	56673436	rs58069153	A	AAG	2855.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=47;PP=2298;SC=AACTGAGGCCAAGAGTGCACC;SOR=3.360;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=54;TCF=1;TCR=53;TR=48;WE=56673444;WS=56673426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr16	56683626	rs7189840	G	A	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=118;ReadPosRankSum=0.081;SC=CAAGAGAGCTGGTATGTGTGA;SOR=0.242;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=8;WE=56683634;WS=56683616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,10:0.33:30
chr16	56686002	rs2070838	G	C	1761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FS=3.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.47;ReadPosRankSum=0.939;SOR=0.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:133,53:0.28:186
chr16	56686005	rs4619400	T	A	1770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FS=3.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.78;ReadPosRankSum=0.630;SOR=0.456;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:128,53:0.29:181
chr16	56686030	rs964372	C	G	658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.735;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=20;PP=414;ReadPosRankSum=0.593;SC=TTTCCTCTTGCCCAAGCTCCT;SOR=0.598;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=117;TCF=47;TCR=70;TR=35;WE=56686038;WS=56686020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,38:0.29:129
chr16	56686470	rs12051311	C	T	10434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=420;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=177;NR=208;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.540;SC=CTGCCTTTTTCGCTTCCTTGC;SOR=0.862;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=390;TCF=179;TCR=211;TR=385;WE=56686478;WS=56686459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,408:0.99:412
chr16	56687031	rs35231457	AT	A	2881.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.777;HP=11;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=1.969;NF=4;NR=65;PP=769;ReadPosRankSum=-1.431;SC=ACTAACCTGGATTTTTTTTTT;SOR=0.557;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=134;TCF=11;TCR=123;TR=69;WE=56687040;WS=56687021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,142:0.64:221
chr16	56700578	rs34777440	C	CTT	321.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-2.287;NF=7;NR=0;PP=268;ReadPosRankSum=0.253;SC=AGAGCCCAGTCTAAACTCCCA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=7;WE=56700586;WS=56700568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr16	56700722	rs12315	G	T	2747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.625;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=52;PP=1636;ReadPosRankSum=1.206;SC=CAAGATTGTAGCAAAAAACAA;SOR=0.589;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=208;TCF=122;TCR=86;TR=121;WE=56700730;WS=56700712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,131:0.58:227
chr16	56701294	rs2298847	T	A	2980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.454;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=53;PP=1767;ReadPosRankSum=2.464;SC=AGACACCTGCTAGAAGAGAAA;SOR=0.759;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=182;TCF=99;TCR=83;TR=116;WE=56701302;WS=56701284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,130:0.62:209
chr16	56702000	rs904770	T	C	2228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.262;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=66;PP=1520;ReadPosRankSum=-0.518;SC=CCAGCGGCTGTTTTTATAGTC;SOR=0.958;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=251;TCF=100;TCR=151;TR=104;WE=56702008;WS=56701990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,111:0.41:270
chr16	56704683	rs72784739	A	G	1824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.191;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=49;PP=1294;ReadPosRankSum=-0.700;SC=TCGTCTCCTGAAAAAGCTGTG;SOR=1.246;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=104;TCF=33;TCR=71;TR=68;WE=56704691;WS=56704673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,75:0.64:117
chr16	56704994	rs144687737	C	CT	4421.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=368;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.859;HP=7;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.313;NF=6;NR=89;PP=2189;ReadPosRankSum=-0.280;SC=TGCTACATTCCTTTTTTTCTG;SOR=0.769;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=193;TCF=14;TCR=179;TR=95;WE=56705002;WS=56704984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,181:0.56:324
chr16	56709728	rs8046181	GA	CG	6150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.32;SOR=0.842;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr16	56904587	rs1529927	C	G	7691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=131;NR=117;PP=2965;SC=CGCATCATTGCCGTGGTCTCG;SOR=0.715;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=248;TCF=131;TCR=117;TR=248;WE=56904595;WS=56904577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,281:1.00:281
chr16	56913419	rs3816119	C	T	2644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.206;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=40;PP=1678;ReadPosRankSum=-1.970;SC=GGCTCAGCCCCCACCGTGGAG;SOR=0.829;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=177;TCF=108;TCR=69;TR=109;WE=56913427;WS=56913409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,118:0.63:187
chr16	56913513	rs5801	C	T	2222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.513;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=52;PP=1357;ReadPosRankSum=-0.428;SC=TCGGGGCCACCCTCTCCTCTG;SOR=0.581;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=246;TCF=118;TCR=128;TR=105;WE=56913521;WS=56913503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,112:0.43:258
chr16	56916197	rs35116758	C	T	1194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.625;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=11;PP=862;ReadPosRankSum=0.069;SC=TTGAGACTGACTGAGCCTTGG;SOR=0.233;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=98;TCF=83;TCR=15;TR=53;WE=56916205;WS=56916187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,53:0.54:99
chr16	56917953	rs2304483	T	C	5340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=104;NR=69;PP=2883;SC=CTGGTGCCCTTGGCCCAGGGT;SOR=1.099;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=173;TCF=104;TCR=69;TR=173;WE=56917961;WS=56917943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr16	56919073	rs11076172	G	A	6796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=144;NR=80;PP=2965;SC=ACGGGTGCCCGGTGCCTAGAG;SOR=1.277;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=224;TCF=144;TCR=80;TR=224;WE=56919081;WS=56919063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr16	56919235	rs5802	G	A	4036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.951;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=94;PP=2593;ReadPosRankSum=-1.587;SC=TCAGCTACTCGGTGGGCCTCA;SOR=0.615;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=267;TCF=107;TCR=160;TR=160;WE=56919243;WS=56919225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,176:0.61:288
chr16	56919348	rs12596776	C	G	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=427;ReadPosRankSum=0.379;SC=GTTTCCAAGCCTAGACCTGTC;SOR=0.412;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=22;WE=56919356;WS=56919338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,22:0.79:28
chr16	56921829	rs13306676	C	T	961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=14;PP=583;ReadPosRankSum=1.424;SC=ACCCCTATCCCCTGGCAGGCC;SOR=0.748;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=106;TCF=71;TCR=35;TR=44;WE=56921837;WS=56921819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,48:0.41:117
chr16	56926176	rs12443855	G	A	862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=20;PP=543;SC=TTCTTGTGACGGTGGTGCCTG;SOR=3.611;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=56926184;WS=56926166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr16	56926828	rs2278489	T	A,C	2243.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=24;NF=41,22;NR=12,9;PP=946,403;SC=GATGCGCGGCTGCTGGCTCTG;SOR=2.066;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=84;TCF=63;TCR=21;TR=53,31;WE=56926836;WS=56926818;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.61,0.39:85
chr16	56928280	rs13306679	G	C	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=191;ReadPosRankSum=-0.096;SC=AGAGCACCGTGTGCGACTTGA;SOR=0.892;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=11;WE=56928288;WS=56928277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr16	56933315	rs9922270	T	C	878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=1;PP=717;SC=GCATGAGAATTGCTTGAACCT;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=27;WE=56933323;WS=56933305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr16	56933519	rs11643718	G	A	4511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=338;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.451;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=106;PP=2895;ReadPosRankSum=1.057;SC=CAGAACCCTCGGGCTGAGCAG;SOR=0.553;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=315;TCF=138;TCR=177;TR=192;WE=56933527;WS=56933509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,207:0.62:334
chr16	56936272	rs34772420	T	C	1438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=31;PP=986;ReadPosRankSum=-0.790;SC=TCAACCCACTTTCTCGTCCCC;SOR=0.677;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=188;TCF=113;TCR=75;TR=74;WE=56936286;WS=56936262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,77:0.38:204
chr16	56938290	rs2289116	G	A	5280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=403;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=118;NR=101;PP=2962;ReadPosRankSum=0.332;SC=GTGACCACTCGGCTTTCTCCC;SOR=0.699;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=373;TCF=201;TCR=172;TR=219;WE=56938298;WS=56938280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,240:0.60:403
chr16	56938387	rs2289115	C	T	4890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=104;PP=2965;SC=AAGTAGTGCCCGGCTGGTGGG;SOR=1.135;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=175;TCF=71;TCR=104;TR=175;WE=56938395;WS=56938377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr16	56966011	rs37025	G	A	10601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=395;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=200;NR=155;PP=2965;SC=CCGCAGAGCCGGGCGCGGGGC;SOR=0.910;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=355;TCF=200;TCR=155;TR=355;WE=56966019;WS=56966001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,395:1.00:395
chr16	56966071	rs37024	T	G	15304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=583;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=274;NR=259;PP=2965;SC=AGACGTGAACTGTCGTTGCAG;SOR=0.717;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=533;TCF=274;TCR=259;TR=533;WE=56966079;WS=56966061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,583:1.00:583
chr16	56968889	rs1820787	G	A	2308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.042;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.501;NF=69;NR=34;PP=1439;ReadPosRankSum=-1.773;SC=CTCCCACAGTGCTTGGATTAC;SOR=0.529;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=168;TCF=116;TCR=52;TR=103;WE=56968897;WS=56968879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,108:0.60:180
chr16	56973335	rs2133783	A	G	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.037;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=19;PP=424;ReadPosRankSum=-0.307;SC=AATTTTATCCATGTTACCTGT;SOR=0.319;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=46;TCF=13;TCR=33;TR=29;WE=56973343;WS=56973325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,31:0.65:48
chr16	56994394	rs61631085	GT	G	979.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.49;SOR=1.151;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr16	56994894	rs4783961	G	A	3608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.405;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=84;PP=2286;ReadPosRankSum=-0.305;SC=GTGCAAACTCGGGACTAGGGC;SOR=0.651;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=305;TCF=142;TCR=163;TR=159;WE=56994902;WS=56994884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,171:0.53:322
chr16	56995038	rs4783962	T	C	951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=25;PP=771;SC=CAGCACTTGGTCATCTGGTCA;SOR=2.694;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=31;WE=56995046;WS=56995028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr16	57003723	rs891141	G	T	1065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=11;PP=858;SC=GTTTGCAGGGGTGGGGACCCC;SOR=1.418;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=21;TCR=11;TR=32;WE=57003731;WS=57003713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr16	57003977	rs891142	T	C	7090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.32;SOR=1.439;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr16	57003980	rs891143	T	C	7066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.30;SOR=1.506;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr16	57006072	rs12720873	G	A	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=29;ReadPosRankSum=-0.074;SC=TGACAACCCCGTCCCCCAGCT;SOR=0.693;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=5;WE=57006080;WS=57006062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,6:0.25:24
chr16	57007192	rs9930761	T	C	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=1.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.48;ReadPosRankSum=1.127;SOR=0.321;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,13:0.21:62
chr16	57007353	rs5883	C	T	1704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.049;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=36;PP=819;ReadPosRankSum=2.791;SC=AGCGAGTCTTCCACTCGCTGG;SOR=0.617;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=196;TCF=98;TCR=98;TR=77;WE=57007361;WS=57007343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,90:0.41:221
chr16	57007451	rs289714	G	A	1941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=38;PP=1118;SC=GCTGCTAGGGGATCCAGATGG;SOR=1.545;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=23;TCR=38;TR=61;WE=57007459;WS=57007441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr16	57015463	rs7195984	G	A	3521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=29;PP=2324;SC=CTATGAGACAGAAGCACTGGC;SOR=1.971;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=109;TCF=80;TCR=29;TR=109;WE=57015471;WS=57015453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr16	57016092	rs5882	G	A	2971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.692;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=52;PP=1688;ReadPosRankSum=0.905;SC=CTCCGAGTCCGTCCAGAGCTT;SOR=0.784;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=193;TCF=107;TCR=86;TR=119;WE=57016100;WS=57016082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,131:0.61:216
chr16	57017474	rs289741	G	A	1548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.322;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=28;PP=1086;ReadPosRankSum=-0.648;SC=AGCCCAGCTCGCCCCTCTCTC;SOR=0.326;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=102;TCF=60;TCR=42;TR=61;WE=57017482;WS=57017464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,64:0.60:106
chr16	57017662	rs1801706	G	A	1572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.151;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=47;PP=931;ReadPosRankSum=-0.556;SC=CTCCTCCAGCGTGGTGGAAGT;SOR=0.800;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=187;TCF=73;TCR=114;TR=75;WE=57017670;WS=57017652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,81:0.40:201
chr16	57017762	rs289742	C	G	425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=345;SC=CCAAGAGCTGCGGAGTCCTTC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=57017770;WS=57017752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr16	57057619	rs1684575	G	T	3388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=44;PP=2055;ReadPosRankSum=1.136;SC=GTGGACTGGAGTTCCCCAAAG;SOR=1.241;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=121;TCF=77;TCR=44;TR=120;WE=57057627;WS=57057609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,129:0.98:131
chr16	57057654	rs1672865	A	G	4727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=64;PP=2870;SC=CTCAGCCCAGATCCCCAGACC;SOR=1.001;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=160;TCF=96;TCR=64;TR=160;WE=57057662;WS=57057644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr16	57059427	rs74439742	C	T	2292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.416;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=43;PP=1281;ReadPosRankSum=-0.629;SC=TTAGACACTCCGGAGGGGGCC;SOR=0.889;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=236;TCF=128;TCR=108;TR=99;WE=57059435;WS=57059417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,115:0.44:262
chr16	57060097	rs61738710	C	T	4558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=375;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=107;NR=92;PP=2690;ReadPosRankSum=0.833;SC=TCGCCTGTCTCTGCCTCCACC;SOR=0.678;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=348;TCF=187;TCR=161;TR=199;WE=57060105;WS=57060087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,218:0.58:375
chr16	57062177	rs1684576	T	A	1182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.05;ReadPosRankSum=-0.163;SOR=0.733;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:164,70:0.30:234
chr16	57065121	rs16965220	C	A	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-3.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=74;ReadPosRankSum=0.191;SC=CAGGATTCATCAAGCAAAGAC;SOR=0.892;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=6;WE=57065129;WS=57065111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr16	57065199	rs72780004	G	A	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.590;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=11;PP=496;ReadPosRankSum=-0.274;SC=CCTGTCAATTGCAAAATCAGC;SOR=0.931;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=110;TCF=75;TCR=35;TR=39;WE=57065207;WS=57065189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,43:0.35:122
chr16	57067595	rs58124158	A	T	624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=0.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.28;ReadPosRankSum=-0.196;SOR=0.755;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,42:0.29:146
chr16	57068048	rs4784753	C	T	1432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=25;PP=836;ReadPosRankSum=-1.707;SC=GCTGTTTGCCCTGAGCCCTTC;SOR=0.687;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=83;TCR=57;TR=61;WE=57068056;WS=57068038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,71:0.46:156
chr16	57071113	rs1684579	TA	CG	3505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.95;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr16	57071232	rs1684580	C	G	5518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=106;NR=98;PP=2965;SC=CCCATCCCCCCCCCCATCATG;SOR=0.702;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=206;TCF=107;TCR=99;TR=204;WE=57071240;WS=57071216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr16	57071335	rs1651670	G	A	1410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=33;PP=939;SC=CGTTACAGCCGGCACCCCTCT;SOR=1.958;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=13;TCR=33;TR=46;WE=57071343;WS=57071325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr16	57071375	rs1672866	T	C	519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=16;PP=359;SC=AGGCTGCTCATGGTTTATACC;SOR=4.514;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=57071383;WS=57071365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr16	57073683	rs864750	G	C	7944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=154;NR=110;PP=2965;SC=CCCCTCTTTTGTCTTCACAGC;SOR=0.989;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=264;TCF=154;TCR=110;TR=264;WE=57073691;WS=57073673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,290:1.00:290
chr16	57074451	rs289726	T	C	4169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=63;PP=2579;SC=CAAGGTCTGATTGACTCTAGG;SOR=0.830;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=144;TCF=81;TCR=63;TR=144;WE=57074459;WS=57074441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr16	57075379	rs35622257	G	GT	2745.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.630;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.07;MQRankSum=0.767;NF=25;NR=20;PP=1483;ReadPosRankSum=-0.582;SC=GCAGCACTGTGTTTTTGTCCC;SOR=0.628;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=93;TCF=47;TCR=46;TR=45;WE=57075387;WS=57075369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,102:0.64:160
chr16	57075781	rs289727	C	T	367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=0;PP=266;SC=GGCCTGGCAGCCCAGGGCTGT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=57075789;WS=57075771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr16	57076115	rs158482	T	G	946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=22;PP=705;SC=CAATGTAAGTTCTCGGTGAAG;SOR=1.885;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=11;TCR=22;TR=33;WE=57076123;WS=57076105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr16	57080528	rs289723	C	A	3817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.422;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=78;PP=2250;ReadPosRankSum=0.550;SC=AGGGTTCCGTCAGCGCTGCAT;SOR=0.658;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=275;TCF=133;TCR=142;TR=155;WE=57080536;WS=57080518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,176:0.58:303
chr16	57103579	rs289710	G	A	3003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=69;NR=42;PP=1770;SC=TCCAAGCTCTGTGGTGGCTTA;SOR=1.159;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=69;TCR=42;TR=111;WE=57103587;WS=57103569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr16	57103854	rs289711	T	C	426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=6;NR=10;PP=210;SC=GTGGAGGGATTGGGGACAAGT;SOR=1.493;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=6;TCR=10;TR=16;WE=57103862;WS=57103844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	57108676	rs183543527	G	A	1419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.659;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=35;PP=854;ReadPosRankSum=0.147;SC=GGGAAGCACTGAGGCCACCTC;SOR=1.023;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=91;TCF=37;TCR=54;TR=55;WE=57108684;WS=57108666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,63:0.59:106
chr16	57111825	rs27392	T	C	7800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=142;NR=124;PP=2965;SC=GCAGGCCCAGTACTCAATGCT;SOR=0.756;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=266;TCF=142;TCR=124;TR=266;WE=57111833;WS=57111815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,293:1.00:293
chr16	57113229	rs42221	A	G	3167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=65;PP=2077;SC=CTGCCTGCCTAGGGGACCAGT;SOR=1.938;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=29;TCR=65;TR=94;WE=57113237;WS=57113219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr16	57114924	rs154045	A	G	632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=9;PP=393;SC=CACGACTGGCACCCTGCTTTC;SOR=1.220;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=17;TCR=9;TR=26;WE=57114932;WS=57114914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr16	57114982	rs154044	C	T	1679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=23;PP=951;SC=GCTCTCCTGCCGCTGACTTTG;SOR=0.826;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=57;TCF=34;TCR=23;TR=56;WE=57114990;WS=57114972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr16	57115274	rs154043	T	C	836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=8;PP=607;SC=TCAGCCTTCCTGCTGCACCTG;SOR=1.460;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=27;WE=57115282;WS=57115264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr16	57115572	rs58379618	C	T	852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=26;PP=594;ReadPosRankSum=-0.574;SC=GCTACACCAACCCCCAGATCT;SOR=0.586;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=58;TCF=10;TCR=48;TR=32;WE=57115580;WS=57115562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,35:0.56:62
chr16	57116287	rs27195	A	G	4937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=63;PP=2965;SC=ACAGATGGCAAAGATGGGAGG;SOR=1.204;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=165;TCF=102;TCR=63;TR=165;WE=57116295;WS=57116277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr16	57116458	rs3751705	T	C	1193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=33;PP=808;ReadPosRankSum=-1.276;SC=CTCAAGACCTTTGGAATCCAG;SOR=0.750;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=73;TCF=22;TCR=51;TR=47;WE=57116466;WS=57116448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,50:0.64:78
chr16	57116514	rs27194	T	A	554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=16;PP=433;SC=ACTGGGATAATTGACTCAGGA;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=57116522;WS=57116504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr16	57128099	rs8057953	T	C	2144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.199;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=56;PP=1118;ReadPosRankSum=0.273;SC=TGTGGACGCTTGGGTTCGTTT;SOR=1.005;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=170;TCF=70;TCR=100;TR=90;WE=57128107;WS=57128089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,105:0.54:196
chr16	57144920	rs8053682	TG	AC	1550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=24;PP=1275;ReadPosRankSum=-0.360;SC=GGATCCAGGATGTCTGATGGA;SOR=0.723;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=59;TCF=11;TCR=48;TR=30;WE=57144929;WS=57144910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,41:0.61:67
chr16	57147388	rs2305701	G	T	1799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.664;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=46;PP=1111;ReadPosRankSum=0.697;SC=CGGTGAGCTGGGCCCTCCTGG;SOR=0.606;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=132;TCF=40;TCR=92;TR=69;WE=57147396;WS=57147378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,79:0.55:144
chr16	57153019	rs2305698	G	A	2032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.645;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=23;PP=1411;ReadPosRankSum=-0.560;SC=CCTGACACCCGGCTGGGGAGG;SOR=0.547;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=126;TCF=93;TCR=33;TR=83;WE=57153027;WS=57153009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,87:0.65:133
chr16	57155457	rs4783976	T	C	463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=15;NR=2;PP=414;SC=GTGGACATCCTGGGAGGCTCC;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=57155465;WS=57155447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	57157206	rs2305696	C	T	1340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.998;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=22;PP=854;ReadPosRankSum=-0.351;SC=TTAGATCAGGCCCATCAGCTT;SOR=1.053;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=222;TCF=142;TCR=80;TR=70;WE=57157214;WS=57157196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,77:0.32:237
chr16	57158352	rs72777119	C	A	1452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=25;PP=747;ReadPosRankSum=-0.599;SC=GCATTTGTCGCTTCTCCCTGA;SOR=0.725;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=128;TCF=76;TCR=52;TR=62;WE=57158360;WS=57158342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,71:0.48:147
chr16	57159248	rs4784771	C	T	4062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=73;NR=69;PP=2345;SC=ATCGGGGAGACGGGCACTGCT;SOR=0.745;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=143;TCF=74;TCR=69;TR=142;WE=57159256;WS=57159238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr16	57159402	rs4784772	A	G	1046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=22;PP=631;SC=GCAAAGTTAGACGGGAAGAAA;SOR=1.802;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=10;TCR=22;TR=32;WE=57159410;WS=57159392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr16	57168651	rs2305694	G	A	3173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=2.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=372;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=57;PP=2025;ReadPosRankSum=-0.200;SC=GTTTGGGGGCGGGAGGCTGCA;SOR=0.682;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=344;TCF=205;TCR=139;TR=147;WE=57168659;WS=57168628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:214,157:0.42:371
chr16	57171233	rs2305693	C	G	1496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.977;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=54;PP=1125;ReadPosRankSum=-0.012;SC=CCAGGAAACACGCACGTCCTC;SOR=0.857;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=210;TCF=60;TCR=150;TR=74;WE=57171241;WS=57171223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,74:0.34:215
chr16	57180158	rs2279407	C	A	3939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=442;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.473;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=78;PP=2505;ReadPosRankSum=1.718;SC=GGGACAGCCGCATGCTGCGCT;SOR=0.885;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=415;TCF=224;TCR=191;TR=179;WE=57180166;WS=57180148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:249,193:0.44:442
chr16	57197705	.	T	C	1123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.121;ClippingRankSum=0.000;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.308;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=9;PP=786;ReadPosRankSum=-0.199;SC=TCTAATATAATAACTTTTGCA;SOR=1.230;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=87;TCF=68;TCR=19;TR=44;WE=57197713;WS=57197695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,48:0.50:96
chr16	57197745	rs62037356	G	T	5265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=112;NR=61;PP=2965;SC=TATAAACTCTGGCCTGGTAAT;SOR=1.437;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=173;TCF=112;TCR=61;TR=173;WE=57197753;WS=57197735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr16	57197849	rs4783980	A	G	3232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=392;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.131;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=76;PP=2032;ReadPosRankSum=0.555;SC=GCAATGCATTACAGCCCTTTA;SOR=0.506;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=359;TCF=170;TCR=189;TR=154;WE=57197857;WS=57197839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:225,165:0.42:390
chr16	57238980	rs112725750	G	A	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=248;ReadPosRankSum=-0.092;SC=CCGGAACCATGACTTTAGGAC;SOR=0.963;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=15;WE=57238988;WS=57238970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr16	57241745	rs77694385	G	A	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=69;ReadPosRankSum=0.628;SC=GTATCCACCTGCCCATTTTGT;SOR=0.307;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=6;WE=57241753;WS=57241735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr16	57241802	rs201524384	A	AC	587.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.895;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=683;ReadPosRankSum=0.074;SC=CATATGGTATACATTCATCCT;SOR=1.469;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=17;WE=57241810;WS=57241792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,19:0.68:28
chr16	57255363	rs7206038	T	C	4254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=82;PP=2166;SC=ATGGGAGCAGTGGCAGTTTGC;SOR=1.199;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=142;TCF=60;TCR=82;TR=142;WE=57255371;WS=57255353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr16	57272951	rs3214478	GA	G	346.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.67;ReadPosRankSum=-0.407;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
chr16	57279408	.	G	GGGGCC	1024.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=0.000;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.19;MQRankSum=1.632;QD=15.53;ReadPosRankSum=-0.705;SOR=0.653;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,29:0.44:66
chr16	57284259	rs11866593	C	T	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.107;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=85;ReadPosRankSum=-0.928;SC=GAAAGAAAAACGAAAGCAATC;SOR=0.074;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=6;WE=57284267;WS=57284249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr16	57290788	rs3751707	C	T	1531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=45;NR=3;PP=1185;SC=GACCCAGCGGCGGCTTCAGCC;SOR=4.977;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=45;TCR=3;TR=48;WE=57290796;WS=57290778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr16	57291118	rs111854246	C	T	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=106;ReadPosRankSum=0.541;SC=GGGATACCAACATTACCTTCT;SOR=0.512;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=8;WE=57291126;WS=57291108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr16	57318135	rs11644185	G	A	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.767;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=204;ReadPosRankSum=0.121;SC=AGGGATGCAGGGCGATCTTGG;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=10;WE=57318143;WS=57318125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr16	57318518	rs11541873	G	C	783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=1.486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.76;ReadPosRankSum=1.028;SOR=0.522;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,48:0.35:136
chr16	57392733	rs4359426	A	C	6850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=110;NR=120;PP=2965;ReadPosRankSum=1.916;SC=CAGAGCATGGATCGCCTACAG;SOR=0.290;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=231;TCF=110;TCR=121;TR=230;WE=57392741;WS=57392723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,253:1.00:254
chr16	57447923	.	AG	A	764.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.055;ClippingRankSum=0.000;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.363;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=544;ReadPosRankSum=0.381;SC=AGGTGAGAGCAGGGGACAGGT;SOR=1.176;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=32;TCF=4;TCR=28;TR=17;WE=57447931;WS=57447913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,28:0.52:54
chr16	57481305	rs178602	T	C	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.421;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=244;ReadPosRankSum=1.055;SC=CTCCACGCCTTGCGCCTCTCG;SOR=1.059;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=47;TCF=32;TCR=15;TR=17;WE=57481313;WS=57481295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,18:0.32:56
chr16	57494178	rs223868	T	C	1137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.356;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=31;PP=788;ReadPosRankSum=-1.692;SC=TCCAAAAACCTCACTTCTTTA;SOR=1.206;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=77;TCF=29;TCR=48;TR=48;WE=57494186;WS=57494168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,49:0.64:77
chr16	57495026	rs223870	T	C	1049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.63;SOR=2.073;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr16	57496494	rs178601	A	G	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.922;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=159;ReadPosRankSum=-0.131;SC=GACGCTCGGCAGTTCTGGCCT;SOR=1.329;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=12;WE=57496502;WS=57496484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr16	57496931	rs223837	G	C	3220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.964;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=58;PP=2175;ReadPosRankSum=0.879;SC=CTTGGCTTTTGATCTTTCAGG;SOR=0.622;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=246;TCF=148;TCR=98;TR=139;WE=57496939;WS=57496921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,150:0.57:264
chr16	57497579	rs73561591	C	A	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=18;PP=416;ReadPosRankSum=-0.991;SC=ATAATGGCTTCCAGGCCGCGC;SOR=0.784;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=26;WE=57497587;WS=57497569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,28:0.65:43
chr16	57499782	rs1114156	T	A	1438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.743;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=22;PP=863;ReadPosRankSum=1.535;SC=TGTCAGGTGATTCCTAAATCT;SOR=0.789;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=96;TCF=60;TCR=36;TR=57;WE=57499790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,63:0.59:106
chr16	57499902	rs4937	T	C	1458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.563;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=22;PP=1027;ReadPosRankSum=-0.521;SC=ATTCCTCAGTTCTTCATGATG;SOR=0.997;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=94;TCF=52;TCR=42;TR=53;WE=57499910;WS=57499892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,58:0.56:104
chr16	57503773	rs223874	G	A	1209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-3.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.564;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=38;PP=899;ReadPosRankSum=0.273;SC=GCTTTAGACCGTTTTTCCAGA;SOR=1.117;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=6;TCR=59;TR=42;WE=57503781;WS=57503763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,46:0.64:72
chr16	57507991	rs75862393	C	T	1421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.666;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=37;PP=908;ReadPosRankSum=-0.554;SC=TGGGGACCCACCACAGACATG;SOR=0.925;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=95;TCF=39;TCR=56;TR=59;WE=57507999;WS=57507981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,62:0.60:104
chr16	57509164	rs223877	A	G	1050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.68;ReadPosRankSum=1.586;SOR=0.566;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,52:0.58:90
chr16	57509572	.	ATCTCTC	A	365.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.459;ClippingRankSum=0.000;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=3.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=30.48;ReadPosRankSum=0.757;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,10:0.83:12
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chr16	57562423	rs8045906	T	C	2926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.540;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=55;PP=1505;ReadPosRankSum=-0.311;SC=TTTACTAGCTTGTTTCTGAGC;SOR=0.628;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=183;TCF=100;TCR=83;TR=121;WE=57562431;WS=57562413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,135:0.66:205
chr16	57562804	rs12935069	G	A	10635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=407;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=179;NR=192;PP=2965;SC=TCCGACCACCGGCGCATGGTC;SOR=0.807;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=372;TCF=180;TCR=192;TR=371;WE=57562812;WS=57562794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,406:1.00:406
chr16	57563111	rs4784815	A	G	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.707;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=133;ReadPosRankSum=0.449;SC=GCGGGCCCTGAGCTCGAACTC;SOR=1.179;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=20;TCF=9;TCR=11;TR=10;WE=57563119;WS=57563101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr16	57595999	rs1004363	A	G	2365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.589;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=43;PP=1237;ReadPosRankSum=-0.549;SC=GAGACTCTGCACAGGGCATGG;SOR=0.602;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=150;TCF=81;TCR=69;TR=94;WE=57596007;WS=57595989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,110:0.64:171
chr16	57596552	rs1859259	C	T	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.691;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5436;FS=5.643;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=108;ReadPosRankSum=2.744;SC=AGTTTATCATCGAGGAATGGG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=6;WE=57596560;WS=57596542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr16	57601792	rs9937918	C	T	1795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.528;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=35;PP=985;ReadPosRankSum=-2.326;SC=CCTTAACACGCATCCACATGA;SOR=0.775;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=187;TCF=108;TCR=79;TR=86;WE=57601800;WS=57601782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,93:0.48:195
chr16	57625470	rs11646739	C	T	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.73;ReadPosRankSum=-0.245;SOR=1.002;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,8:0.26:31
chr16	57687314	rs2305307	T	C	2863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=61;PP=1476;SC=CTGGGCAGGGTGGGACCTGGA;SOR=1.445;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=38;TCR=61;TR=99;WE=57687322;WS=57687304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr16	57689230	rs34289485	GGT	G	573.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.302;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.891;NF=5;NR=7;PP=348;ReadPosRankSum=0.144;SC=GGAACGGATGGGTGTGTGTGT;SOR=0.418;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=30;TCF=16;TCR=14;TR=12;WE=57689241;WS=57689220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,22:0.50:44
chr16	57689385	rs1801257	C	G	6589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=134;NR=90;PP=2965;SC=AAGGCCGGAGCGGGGAGGCTG;SOR=0.991;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=224;TCF=134;TCR=90;TR=224;WE=57689393;WS=57689375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr16	57689805	rs1801255	A	C	5989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=110;PP=2965;SC=ATTCCAGCCAAGTCCTGGGTG;SOR=0.864;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=210;TCF=100;TCR=110;TR=210;WE=57689813;WS=57689795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr16	57689883	rs1376041	T	C	3505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=64;PP=2113;SC=TGGTGCTCACTTTCCAGCACC;SOR=1.161;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=51;TCR=64;TR=115;WE=57689891;WS=57689873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr16	57690606	rs11866912	C	A	3437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=77;PP=2342;SC=TTCATATATTCAGTCATTTAT;SOR=2.282;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=106;TCF=29;TCR=77;TR=106;WE=57690614;WS=57690596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr16	57691265	rs2305309	C	A	1004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.490;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=18;PP=619;ReadPosRankSum=0.773;SC=GGCCAGCTCTCTCCTGTCTCC;SOR=0.983;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=102;TCF=61;TCR=41;TR=49;WE=57691273;WS=57691255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,51:0.46:110
chr16	57693247	rs60907901	G	A	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.992;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=201;ReadPosRankSum=0.855;SC=AGTCTGGGAAGGCTTCCTGGA;SOR=1.545;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=35;TCR=6;TR=12;WE=57693255;WS=57693237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,16:0.36:45
chr16	57697532	rs10852554	T	G	1839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=47;PP=1246;ReadPosRankSum=0.818;SC=AAGCAGAGATTCGGCCTCGTC;SOR=0.645;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=155;TCF=63;TCR=92;TR=78;WE=57697540;WS=57697522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,84:0.52:163
chr16	57697568	rs10852555	C	A	990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=28;PP=643;ReadPosRankSum=-1.664;SC=CCCCCGAGCCCGGCCCAGCCC;SOR=0.741;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=12;TCR=48;TR=35;WE=57697576;WS=57697558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,40:0.62:65
chr16	57702274	rs62039891	G	T	970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.269;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=22;PP=499;ReadPosRankSum=1.213;SC=CGACGCCCAGGGGCCTGGGGG;SOR=0.685;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=107;TCF=61;TCR=46;TR=43;WE=57702282;WS=57702264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,51:0.41:125
chr16	57702473	rs7205731	T	C	244.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=5;PP=146;SC=CTCAGCACCTTCTCTAGCCCT;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=8;WE=57702481;WS=57702463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	57707435	rs72793599	A	G	674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.921;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=368;ReadPosRankSum=-0.485;SC=GAGGAGGACTATCAGGAAGGG;SOR=0.276;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=22;WE=57707443;WS=57707425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,26:0.67:39
chr16	57708483	rs4784842	T	C	3647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.927;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=70;PP=2165;ReadPosRankSum=-0.582;SC=CTGAAAAGGCTTCCATTCCCA;SOR=0.559;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=231;TCF=118;TCR=113;TR=149;WE=57708491;WS=57708473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,166:0.65:254
chr16	57710077	rs72793600	G	A	624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.429;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=3;PP=433;ReadPosRankSum=-0.900;SC=CAGCCTGCAGGATCCTACCCT;SOR=1.466;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=50;TCF=41;TCR=9;TR=25;WE=57710085;WS=57710067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,27:0.48:56
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chr16	57713250	rs4238795	C	T	2976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.179;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=78;PP=1952;ReadPosRankSum=0.710;SC=GGCCTGGCAGCCACTGCAGGG;SOR=0.835;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=192;TCF=69;TCR=123;TR=121;WE=57713258;WS=57713240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,131:0.64:206
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chr16	57738740	rs7194271	A	G	758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.594;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=11;PP=407;ReadPosRankSum=-0.141;SC=TGCACATGTAAAGGGGGGATG;SOR=0.861;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=95;TCF=61;TCR=34;TR=34;WE=57738748;WS=57738730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,40:0.37:108
chr16	57738810	rs58373934	T	A	1195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.991;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=26;PP=791;ReadPosRankSum=2.538;SC=GAGGAAAAGGTGCTGCCTAAG;SOR=0.645;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=153;TCF=90;TCR=63;TR=59;WE=57738818;WS=57738800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,62:0.37:169
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chr16	57756564	rs3826094	G	A	1084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.316;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=21;PP=742;ReadPosRankSum=-1.638;SC=ATGGCTGGGCGGGGCTGGCCC;SOR=0.551;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=167;TCF=109;TCR=58;TR=55;WE=57756572;WS=57756554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,59:0.33:177
chr16	57756643	rs3809611	C	T	4995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=371;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.247;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=114;NR=96;PP=2905;ReadPosRankSum=-0.537;SC=ACCCGCTGCCCGAACGGGAAG;SOR=0.626;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=344;TCF=186;TCR=158;TR=210;WE=57756651;WS=57756633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,226:0.61:371
chr16	57758508	rs12598604	A	C	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.143;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=80;ReadPosRankSum=0.227;SC=TCTCCTCCCAACTCCCGCTCC;SOR=0.178;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=47;TCF=37;TCR=10;TR=11;WE=57758516;WS=57758498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,16:0.29:55
chr16	57759844	rs4784008	C	T	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=29;ReadPosRankSum=-0.433;SC=CTAGGAGGGGCTATTCCACGT;SOR=0.382;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=5;WE=57759852;WS=57759834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
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chr16	57778550	rs2967153	C	G	1207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=23;PP=638;SC=AGCACTAACCCGGCAGTGTGG;SOR=1.828;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=12;TCR=23;TR=35;WE=57778558;WS=57778540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr16	57785138	rs9938236	C	T	2912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.961;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=47;PP=1903;ReadPosRankSum=1.670;SC=CTGACCTCTCCTGACTCTGCC;SOR=0.992;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=200;TCF=122;TCR=78;TR=122;WE=57785146;WS=57785128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,129:0.59:219
chr16	57785813	rs34438625	T	C	1549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.277;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=34;PP=781;ReadPosRankSum=1.088;SC=GCAGCCAAGATGCCTGGTCAC;SOR=0.770;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=116;TCF=60;TCR=56;TR=68;WE=57785821;WS=57785803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,75:0.59:127
chr16	57786517	rs2965797	C	T	873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.631;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=29;PP=555;ReadPosRankSum=0.940;SC=CCGTCAGGTACGCAGGCTGTG;SOR=0.762;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=164;TCF=64;TCR=100;TR=47;WE=57786525;WS=57786507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,51:0.28:180
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chr16	57787027	rs12922275	C	T	7393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=574;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.119;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=165;NR=148;PP=2962;ReadPosRankSum=0.201;SC=TCTCCTCCTACGTGGTGGATC;SOR=0.783;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=519;TCF=267;TCR=252;TR=313;WE=57787035;WS=57787017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:231,342:0.60:573
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chr16	57793595	rs12934801	T	C	6072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=503;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=135;NR=126;PP=2962;ReadPosRankSum=0.001;SC=CTGGTGACTATTACCCTGGGG;SOR=0.708;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=466;TCF=240;TCR=226;TR=261;WE=57793603;WS=57793585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:219,284:0.56:503
chr16	57794888	rs2965799	A	T	2187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.412;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=55;PP=1213;ReadPosRankSum=-0.353;SC=GGCACCCACCAGATCAGGCCT;SOR=0.655;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=300;TCF=145;TCR=155;TR=110;WE=57794896;WS=57794878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:215,121:0.36:336
chr16	57795343	rs12920931	G	A	6576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=511;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.533;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=155;NR=126;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.240;SC=TGTCGTCCACGCTCTGCACTT;SOR=0.758;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=472;TCF=258;TCR=214;TR=281;WE=57795361;WS=57795333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:205,305:0.60:510
chr16	57795394	rs2967172	G	A	3499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=450;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=91;PP=2025;ReadPosRankSum=-1.765;SC=GCCCACTGCCGTCTGGGCACA;SOR=0.708;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=420;TCF=197;TCR=223;TR=171;WE=57795402;WS=57795384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:265,184:0.41:449
chr16	57797913	rs11649013	C	T	1976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.109;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=32;PP=1109;ReadPosRankSum=0.204;SC=AGGGCTAACACAGATAACTAC;SOR=0.835;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=276;TCF=176;TCR=100;TR=93;WE=57797921;WS=57797903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:191,106:0.36:297
chr16	57803680	rs12148935	C	T	1588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.325;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=25;PP=1051;ReadPosRankSum=-1.459;SC=GGATGAGGGGCCGCGGCGTGG;SOR=0.958;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=126;TCF=80;TCR=46;TR=73;WE=57803688;WS=57803670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,76:0.58:130
chr16	57803911	rs3803590	A	G	5212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=98;PP=2965;SC=GGTGCGGGAGAGAGAGGGGCA;SOR=1.215;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=168;TCF=69;TCR=99;TR=167;WE=57803919;WS=57803901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr16	57805048	rs2967166	A	G	698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=5;PP=443;SC=CTTATGGGCTAGCCCTGCCCC;SOR=1.893;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=23;WE=57805056;WS=57805038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr16	57805078	rs2965790	C	T	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.211;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=128;ReadPosRankSum=0.717;SC=GGGCCTTGGGCTGAGGCACAG;SOR=1.000;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=38;TCF=26;TCR=12;TR=14;WE=57805086;WS=57805068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,17:0.38:45
chr16	57805176	rs2967165	A	G	3534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=41;PP=2311;SC=GGCGCCGACTAAGCCGCTCCT;SOR=1.215;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=75;TCR=41;TR=116;WE=57805184;WS=57805159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr16	57806030	rs2965789	A	G	379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=1;PP=305;SC=AGGGTGGGATATGCGGGCTCA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=57806038;WS=57806021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	57819370	.	A	G	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.747;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.353;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=398;ReadPosRankSum=0.774;SC=CAGCCTCCCCAGGTACCTGGT;SOR=1.035;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=41;TCF=33;TCR=8;TR=26;WE=57819378;WS=57819360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,27:0.60:45
chr16	57829099	rs71387196	A	C	2562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.600;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=54;PP=1519;ReadPosRankSum=-0.191;SC=ACCACTGGCCAAAGACTGCTA;SOR=0.783;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=153;TCF=67;TCR=86;TR=97;WE=57829107;WS=57829089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,109:0.64:169
chr16	57850141	rs1477404	C	G	3521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.447;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=69;PP=2298;ReadPosRankSum=-2.269;SC=AACCGAGGCCCGGAAAGTGTC;SOR=0.653;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=255;TCF=147;TCR=108;TR=157;WE=57850149;WS=57850131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,167:0.60:278
chr16	57921752	rs11076207	A	G	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.189;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=240;ReadPosRankSum=0.505;SC=GTTCCCAACCACATTACCTGT;SOR=3.327;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=14;WE=57921760;WS=57921742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr16	57935442	rs112002818	G	A	3908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=370;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.314;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=78;PP=2132;ReadPosRankSum=-3.160;SC=CTGAAAGAGTGCGACTTTGCT;SOR=0.709;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=338;TCF=175;TCR=163;TR=174;WE=57935450;WS=57935432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,194:0.53:369
chr16	57937856	rs413562	G	C	3750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=73;PP=2002;SC=AGGTCTGTCCGGCGGTGGCGG;SOR=1.195;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=128;TCF=55;TCR=73;TR=128;WE=57937864;WS=57937846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr16	57937895	rs437920	G	A	2305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=47;PP=1401;SC=TCTGGGGGAAGGGTTATGGGA;SOR=1.450;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=28;TCR=47;TR=75;WE=57937903;WS=57937885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr16	57946973	rs434961	A	G	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.081;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=24;PP=455;ReadPosRankSum=0.237;SC=ACGGGCGCCGAGACTCAGGGC;SOR=0.313;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=89;TCF=10;TCR=79;TR=28;WE=57946981;WS=57946963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,29:0.31:94
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chr16	57949251	rs483053	G	A	1591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.683;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=35;PP=826;ReadPosRankSum=0.262;SC=TGAAATCCCAGTGGGACACCA;SOR=0.580;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=189;TCF=94;TCR=95;TR=73;WE=57949259;WS=57949241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,86:0.40:217
chr16	57950057	rs376270	G	A	3677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.225;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=53;PP=2171;ReadPosRankSum=0.726;SC=ACTTCAGGTAGTTATTTCGCA;SOR=0.942;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=251;TCF=158;TCR=93;TR=151;WE=57950065;WS=57950047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,164:0.60:272
chr16	57950178	rs440565	G	C	4012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=92;PP=2634;ReadPosRankSum=-0.556;SC=ACCCCACCCTGAAACGAGCAT;SOR=0.670;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=255;TCF=106;TCR=149;TR=158;WE=57950186;WS=57950168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,173:0.62:277
chr16	57951421	rs691490	G	A	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.679;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=317;ReadPosRankSum=-0.141;SC=CATCAGCCAGGCAAGGCTCTT;SOR=0.249;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=19;WE=57951429;WS=57951411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,19:0.73:26
chr16	57952870	rs489106	A	G	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=1;PP=634;ReadPosRankSum=0.763;SC=TGAAAGGTATAAAAGATCATG;SOR=1.312;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=42;TCF=41;TCR=1;TR=27;WE=57952878;WS=57952860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,28:0.62:45
chr16	57954268	rs166000	A	G	1792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=32;PP=1135;ReadPosRankSum=-0.565;SC=ATCCAGGTAGACCCCCTCCAG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=158;TCF=93;TCR=65;TR=77;WE=57954276;WS=57954258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,85:0.50:170
chr16	57957138	rs247065	G	C	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=336;ReadPosRankSum=-0.552;SC=CACCCTCCCCGCAGTCTTTCA;SOR=0.776;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=18;WE=57957146;WS=57957128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr16	57973989	rs2303779	G	A	2251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.861;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=28;PP=1408;ReadPosRankSum=1.029;SC=CCAAGAGGGGGCCTCGCAGGA;SOR=1.059;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=150;TCF=100;TCR=50;TR=88;WE=57973997;WS=57973979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,99:0.59:169
chr16	57974240	rs2303778	G	A	2394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.179;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=64;PP=1565;ReadPosRankSum=0.804;SC=GACCCGGGGCGGGGTGGGGAG;SOR=0.793;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=176;TCF=72;TCR=104;TR=106;WE=57974248;WS=57974230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,109:0.59:185
chr16	57984483	rs152143	G	A	1033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=31;PP=868;SC=TGGGATGTGCGGGAGAGTGGG;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=36;WE=57984491;WS=57984473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr16	57991123	rs34759686	GC	G	2287.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=21;PP=1415;SC=GACCCTAACTGCCCCCCTGTG;SOR=1.516;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=52;TCF=29;TCR=23;TR=45;WE=57991131;WS=57991113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr16	57991317	rs503686	C	T	1315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.595;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=37;PP=891;ReadPosRankSum=1.206;SC=AATCCTGCCACGGCCTCTTCA;SOR=0.921;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=101;TCF=37;TCR=64;TR=55;WE=57991325;WS=57991307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,59:0.52:113
chr16	57992119	rs399634	T	A	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.9784;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=190;ReadPosRankSum=-0.897;SC=CCTCCCCCGCTGACTGTGAAC;SOR=1.329;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=10;WE=57992127;WS=57992117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,10:0.83:12
chr16	57992229	rs147036428	G	GGGTCCCTTCTTCCTACTGTGCCTTCACACCCCAGGGACACA	1020.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=7.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.14;ReadPosRankSum=-1.572;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:126,17:0.12:143
chr16	57996932	rs17821448	G	A	1546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.220;HP=4;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=25;PP=780;ReadPosRankSum=1.189;SC=CCTTCTCTACGCCCTTCATGA;SOR=0.724;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=123;TCF=66;TCR=57;TR=64;WE=57996940;WS=57996922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,75:0.53:141
chr16	57996960	rs13336595	C	T	1359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.314;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=25;PP=684;ReadPosRankSum=1.493;SC=CAGTACCCTGCGGCTGGGACT;SOR=0.574;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=109;TCF=57;TCR=52;TR=58;WE=57996968;WS=57996950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,67:0.54:125
chr16	57998345	rs3859043	C	T	1093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.028;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=11;PP=527;ReadPosRankSum=-1.280;SC=GGGGAGAATGCGGGCCCCCCT;SOR=1.002;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=70;TCF=47;TCR=23;TR=40;WE=57998353;WS=57998335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,49:0.62:79
chr16	58019065	rs35768173	TG	T	1659.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=8;PP=737;SC=GGGCTTGTCCTGGGGGGGGGC;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=21;TCF=12;TCR=9;TR=18;WE=58019078;WS=58019055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr16	58019070	rs2304485	G	C,T	1597.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=24;NF=10,12;NR=1,7;PP=106,242;SC=TGTCCTGGGGGGGGGCGGATG;SOR=1.609;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=11,19;WE=58019078;WS=58019055;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.45,0.55:40
chr16	58019253	rs2304486	G	C	2177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.086;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=49;PP=1252;ReadPosRankSum=-0.192;SC=GGGGTTGAGGGGGGAGGAGAC;SOR=0.616;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=198;TCF=108;TCR=90;TR=107;WE=58019261;WS=58019243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,109:0.54:201
chr16	58019396	rs9934227	G	A	7711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=140;NR=138;PP=2965;SC=TACTGCCTCAGCCAGAACCCC;SOR=0.707;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=280;TCF=142;TCR=138;TR=278;WE=58019404;WS=58019386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,292:1.00:292
chr16	58021395	rs2241771	A	C	3639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=87;PP=2200;SC=CTGGCCAGACAGAGGACTTAT;SOR=1.714;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=40;TCR=87;TR=127;WE=58021403;WS=58021385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr16	58030401	rs3743555	T	C	1995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=12;PP=1456;ReadPosRankSum=-0.921;SC=GTCAGGCTGGTAGGGGCCACA;SOR=1.730;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=52;TCR=12;TR=64;WE=58030409;WS=58030391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,67:0.99:68
chr16	58030634	rs3743556	C	T	8152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=150;NR=132;PP=2965;SC=ACTTGTAGGGCTTCTCGCCTG;SOR=0.753;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=284;TCF=151;TCR=133;TR=282;WE=58030642;WS=58030624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,307:1.00:307
chr16	58035652	rs12599089	A	T	194.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=185;SC=CCTCCCCCCCACCCCAGACAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=58035660;WS=58035642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr16	58036347	rs3743560	G	A	7606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=169;NR=91;PP=2965;SC=ATGCTAACAGGATAAATGTAC;SOR=1.428;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=261;TCF=170;TCR=91;TR=260;WE=58036355;WS=58036337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,276:1.00:276
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chr16	58053161	rs3743562	C	T	1060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=32;PP=827;SC=TTATTAACAACACAGATCTTT;SOR=3.500;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=5;TCR=32;TR=37;WE=58053169;WS=58053151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
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chr16	58313578	rs71155257	CT	C	353.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQRankSum=0.873;QD=13.61;ReadPosRankSum=0.423;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,18:0.69:26
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chr16	58533932	rs982697	A	C	734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=3;PP=559;SC=AGCAGCCAATATGGGAGCTGG;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=22;WE=58533940;WS=58533922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	58538662	rs9928398	C	T	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.28;ReadPosRankSum=-1.098;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,4:0.17:24
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chr16	58544640	rs12597973	C	G	1336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FS=3.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.73;ReadPosRankSum=1.260;SOR=0.460;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,70:0.40:173
chr16	58545426	rs42945	A	G	1533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.517;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=35;PP=1079;ReadPosRankSum=-2.012;SC=GCACCCACTCAGAGAGCAGCG;SOR=0.648;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=205;TCF=124;TCR=81;TR=85;WE=58545434;WS=58545416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,85:0.40:211
chr16	58549932	rs4784046	T	C	656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.25;ReadPosRankSum=0.649;SOR=0.679;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,33:0.46:71
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chr16	58550300	rs77328516	A	AAC	5117.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=426;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.553;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.415;NF=29;NR=44;PP=2876;ReadPosRankSum=0.893;SC=CTGCTGCAAGAAGTTTCCCCG;SOR=0.776;SbPval=0.04;Source=Platypus;TC=228;TCF=58;TCR=170;TR=73;WE=58550308;WS=58550290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:278,144:0.34:422
chr16	58550484	rs3743567	G	A	3056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-4.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=389;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.204;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=80;PP=1873;ReadPosRankSum=0.556;SC=CCATCGTGCTGCCCTTCATGG;SOR=0.873;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=363;TCF=182;TCR=181;TR=148;WE=58550492;WS=58550474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:232,157:0.40:389
chr16	58552921	rs3607	G	A	1520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.483;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=45;PP=919;ReadPosRankSum=2.099;SC=AGTTGTTGGAGCTGACAAGTT;SOR=0.648;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=235;TCF=102;TCR=133;TR=81;WE=58552929;WS=58552911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,87:0.33:263
chr16	58557342	rs11644694	G	A	2284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=369;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=59;PP=1305;ReadPosRankSum=0.961;SC=TGCAACTGAAGTAGTGAGTGT;SOR=0.712;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=333;TCF=162;TCR=171;TR=115;WE=58557350;WS=58557332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:241,128:0.35:369
chr16	58561954	rs37057	T	C	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.768;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=128;ReadPosRankSum=1.327;SC=GAAGGGGAGGTTGCAGTAAGC;SOR=0.016;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=13;WE=58561962;WS=58561944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,15:0.45:33
chr16	58566304	rs37060	G	A	835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.727;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=31;PP=534;ReadPosRankSum=-0.055;SC=AAGGACCTACGTAAAACACAA;SOR=0.774;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=124;TCF=41;TCR=83;TR=45;WE=58566312;WS=58566294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,46:0.36:129
chr16	58571185	rs2244453	C	T	672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=2.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.40;ReadPosRankSum=0.542;SOR=1.092;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,20:0.34:59
chr16	58571189	rs2243463	T	C	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.86;ReadPosRankSum=-0.984;SOR=0.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,20:0.38:53
chr16	58573901	rs246194	G	A	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=49;ReadPosRankSum=-0.360;SC=AGAGACAAAAGAATGTTAAGG;SOR=0.512;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=5;WE=58573909;WS=58573891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr16	58576498	.	T	G	467	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000;HP=13;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=15;MQ=57.88;NF=0;NR=32;PP=467;QD=15.6803503921;SC=GGTGGGGGGGTGGGGGGAATA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=63;TCF=21;TCR=42;TR=32;WE=58576506;WS=58576488;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:31,32:0.51:63
chr16	58577421	rs41260	C	T	1610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.551;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.136;NF=38;NR=30;PP=978;ReadPosRankSum=-0.031;SC=TAAGTGGTAACGCCCAGTGCC;SOR=0.750;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=146;TCF=83;TCR=63;TR=68;WE=58577429;WS=58577411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,79:0.44:179
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chr16	58579274	rs246258	C	T	1765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.500;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=37;PP=955;ReadPosRankSum=0.327;SC=CTGTTGGATTCAGAGTAATGT;SOR=0.743;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=191;TCF=100;TCR=91;TR=76;WE=58579282;WS=58579264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,91:0.42:218
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chr16	58620995	rs12443835	A	G	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.139;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=126;ReadPosRankSum=-1.613;SC=ATAAAGAGAAATTAATTTCAG;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=7;WE=58621003;WS=58620985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr16	58622596	rs34716647	TC	T	1226.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.397;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.867;NF=20;NR=6;PP=972;ReadPosRankSum=-1.218;SC=CCAGCTACAATCACTTCCGGA;SOR=0.466;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=47;TCF=38;TCR=9;TR=26;WE=58622604;WS=58622586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,36:0.59:61
chr16	58703966	rs9923128	A	G	1819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.311;NF=54;NR=48;PP=1232;ReadPosRankSum=0.302;SC=ACAAAGCCACATTCCAATCCA;SOR=0.690;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=267;TCF=141;TCR=126;TR=102;WE=58703974;WS=58703956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,107:0.37:289
chr16	58709824	rs34833577	TG	T	747.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=3.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.40;MQRankSum=2.578;QD=7.19;ReadPosRankSum=-0.149;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,40:0.38:104
chr16	58712130	rs2280398	C	T	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.413;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=280;ReadPosRankSum=1.538;SC=CCTACTCTTGCTCCCCAAGGT;SOR=2.261;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=47;TCF=39;TCR=8;TR=16;WE=58712138;WS=58712120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,17:0.31:54
chr16	58713621	rs11641633	G	A	2823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=364;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.386;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=65;PP=1731;ReadPosRankSum=-0.419;SC=TACTAGAATAGATTAGTCATG;SOR=0.659;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=332;TCF=177;TCR=155;TR=138;WE=58713629;WS=58713611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:217,147:0.40:364
chr16	59785902	rs3743708	G	A	5007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=375;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.720;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=99;NR=114;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.184;SC=GGAATATCAAGCCCTGCAATC;SOR=0.793;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=346;TCF=167;TCR=179;TR=213;WE=59785910;WS=59785892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,227:0.61:375
chr16	59785926	rs3743707	C	A	4208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.402;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=102;PP=2613;ReadPosRankSum=-0.101;SC=GTGTCTATCACCAGCCCAGAA;SOR=0.663;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=312;TCF=141;TCR=171;TR=186;WE=59785934;WS=59785916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,197:0.59:336
chr16	59786020	rs3743706	G	T	1109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.616;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=32;PP=717;ReadPosRankSum=0.147;SC=ATGGGTGAGGGGTTAACAGCA;SOR=1.158;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=14;TCR=50;TR=41;WE=59786028;WS=59786010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,45:0.64:70
chr16	60393404	rs2407146	T	A	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.561;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.771;NF=14;NR=16;PP=414;ReadPosRankSum=0.356;SC=ATCCCACCTGTCTGGAAAAGA;SOR=0.350;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=57;TCF=24;TCR=33;TR=30;WE=60393412;WS=60393394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,30:0.49:61
chr16	64982033	rs2280394	C	T	1425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.173;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=39;PP=898;ReadPosRankSum=0.669;SC=GGTAAGCATTCGTTAAGTCCA;SOR=0.576;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=177;TCF=78;TCR=99;TR=69;WE=64982041;WS=64982023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,75:0.39:191
chr16	65005462	rs12597529	G	A	3221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.590;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=53;PP=1894;ReadPosRankSum=-0.730;SC=CTCTGAATGCGTAGGAACCTT;SOR=0.889;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=308;TCF=184;TCR=124;TR=137;WE=65005470;WS=65005452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,152:0.45:337
chr16	65016087	rs35213	A	C	1290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.195;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=29;PP=714;ReadPosRankSum=-0.541;SC=TCTTCTACTGAGATCTTGACG;SOR=0.690;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=185;TCF=92;TCR=93;TR=64;WE=65016095;WS=65016077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,70:0.34:204
chr16	65016285	rs35212	C	A	487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=291;ReadPosRankSum=-0.331;SC=TTTATAGGGACGAGTGAATAT;SOR=0.599;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=75;TCF=18;TCR=57;TR=23;WE=65016293;WS=65016275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,25:0.32:77
chr16	65022114	rs28216	C	T	6319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=449;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.806;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=124;NR=137;PP=2962;ReadPosRankSum=0.084;SC=TGATTTCAAACGATTCCATAC;SOR=0.828;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=408;TCF=198;TCR=210;TR=261;WE=65022122;WS=65022104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,286:0.64:449
chr16	65025658	rs35196	T	C	2021.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=19;PP=1318;SC=GAAAGCCAAGTCCACCTACTT;SOR=1.675;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=46;TCR=19;TR=65;WE=65025666;WS=65025648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr16	65025849	rs35194	A	G	4420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=82;PP=2795;SC=CTGGACAGGTAAGCAGGCAAC;SOR=1.164;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=144;TCF=62;TCR=82;TR=144;WE=65025857;WS=65025839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr16	65397360	rs9939648	G	A	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.520;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=84;ReadPosRankSum=0.132;SC=TTGAAGCCACGTGACTTCAGC;SOR=0.105;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=6;WE=65397368;WS=65397350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr16	65839621	rs139083721	CTCT	C	727.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=3.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.06;MQRankSum=3.476;QD=11.93;ReadPosRankSum=-0.606;SOR=0.293;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,24:0.39:61
chr16	65839644	.	CTCT	C	592.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.293;ClippingRankSum=0.000;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=2.645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQRankSum=0.071;QD=11.40;ReadPosRankSum=1.809;SOR=0.362;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,18:0.35:52
chr16	66422318	rs112140637	A	G	2055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.899;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=44;PP=1249;ReadPosRankSum=-0.119;SC=TGAAGGGGAAAGAGTATTTTG;SOR=0.758;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=282;TCF=144;TCR=138;TR=93;WE=66422326;WS=66422308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:207,108:0.34:315
chr16	66425862	rs111289746	C	A	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.962;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.590;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=91;ReadPosRankSum=0.671;SC=TGAAGACAGACACCAGGCCCA;SOR=0.116;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=6;WE=66425870;WS=66425860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
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chr16	66503778	rs72788593	C	T	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.570;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=60;ReadPosRankSum=0.081;SC=GGTGAGCCGCCGCCCACCCTG;SOR=0.180;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=8;WE=66503786;WS=66503768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr16	66511627	rs11075636	A	G	614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.406;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=24;PP=472;ReadPosRankSum=1.021;SC=AGGAGGCCTCATGGGGAAGGG;SOR=1.242;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=96;TCF=37;TCR=59;TR=35;WE=66511635;WS=66511617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,34:0.33:103
chr16	66545982	rs16956600	C	T	987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.664;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=33;PP=617;ReadPosRankSum=-1.202;SC=GGAAATTAGACACATGGGTCA;SOR=0.773;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=131;TCF=50;TCR=81;TR=51;WE=66545990;WS=66545972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,54:0.39:140
chr16	66575772	rs187517309	G	A	2634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.108;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=55;PP=1533;ReadPosRankSum=1.478;SC=ACCTAGCATAGAGGCTGTACC;SOR=0.605;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=221;TCF=116;TCR=105;TR=108;WE=66575780;WS=66575762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,127:0.51:250
chr16	66584002	rs3743716	T	C	2575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.506;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=48;PP=1710;ReadPosRankSum=1.935;SC=GGGTTCCTTCTTGTGCGAGTC;SOR=0.563;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=289;TCF=175;TCR=114;TR=119;WE=66584010;WS=66583992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:187,128:0.41:315
chr16	66600479	rs7193473	G	A	3904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=451;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.074;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=94;PP=2288;ReadPosRankSum=1.910;SC=TGAAACAACCGGAGACTGCCG;SOR=0.751;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=405;TCF=207;TCR=198;TR=173;WE=66600487;WS=66600469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:250,201:0.45:451
chr16	66613525	rs11553598	G	A	1685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.973;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=32;PP=1121;ReadPosRankSum=-0.051;SC=CACCTAAGGCGGCAAAGGGGG;SOR=0.924;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=241;TCF=146;TCR=95;TR=89;WE=66613533;WS=66613515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,92:0.37:251
chr16	66613841	rs2290183	G	C	2130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.658;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=40;PP=1289;ReadPosRankSum=-0.503;SC=GGCCGAGGGTGGGGGGAAGGA;SOR=0.817;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=211;TCF=115;TCR=96;TR=95;WE=66613849;WS=66613831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,100:0.47:215
chr16	66614008	rs2290182	T	C	3877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=500;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.123;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=89;PP=2542;ReadPosRankSum=1.002;SC=ACCATGGAGATATCCTTCTTC;SOR=0.777;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=449;TCF=225;TCR=224;TR=169;WE=66614016;WS=66613998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:304,195:0.39:499
chr16	66761616	rs10990	T	C	2386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.337;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=42;PP=1575;ReadPosRankSum=-1.851;SC=CCGGCTTTTTTACTGACGTGC;SOR=0.902;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=170;TCF=92;TCR=78;TR=97;WE=66761624;WS=66761606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,105:0.56:188
chr16	66801241	rs201558171	CA	C	83.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=7.908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.81;ReadPosRankSum=-0.190;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr16	66861470	.	CAAA	C	43.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.712;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQRankSum=0.464;QD=1.33;ReadPosRankSum=0.776;SOR=0.631;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,4:0.12:33
chr16	66885652	rs151460	A	G	1337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.300;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=40;PP=855;ReadPosRankSum=-1.167;SC=CCCCTGACCCAAGCAGCCCGA;SOR=0.861;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=55;TCR=92;TR=64;WE=66885660;WS=66885642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,68:0.43:160
chr16	66886496	rs375038584	AAAAG	A	123.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=9.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.46;MQRankSum=2.965;QD=3.34;ReadPosRankSum=0.672;SOR=0.744;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,10:0.27:37
chr16	66886505	rs369232559	GAAAAGAA	G	105.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=8.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.24;MQRankSum=3.393;QD=2.30;ReadPosRankSum=0.360;SOR=0.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,10:0.22:46
chr16	66886559	rs152168	G	A	614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.666;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=3.930;NF=23;NR=11;PP=491;ReadPosRankSum=0.809;SC=GAAGTTGCTGGTTTGGTCCCA;SOR=0.911;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=108;TCF=71;TCR=37;TR=34;WE=66886567;WS=66886549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,35:0.29:121
chr16	66886777	rs79483016	C	T	2357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.152;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=60;PP=1564;ReadPosRankSum=0.494;SC=GCAGGTGAGTCCTCTCAGAGG;SOR=0.815;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=172;TCF=73;TCR=99;TR=100;WE=66886785;WS=66886767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,108:0.56:192
chr16	66946894	rs150509525	CGT	C	953.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FS=0.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.22;MQRankSum=3.403;QD=6.04;ReadPosRankSum=1.718;SOR=0.827;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:107,51:0.32:158
chr16	66969308	.	C	G	3239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.426;ClippingRankSum=0.000;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=59;PP=2059;ReadPosRankSum=-0.595;SC=GGAAAGTGGCCGTGCCCGGGC;SOR=0.722;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=267;TCF=162;TCR=105;TR=149;WE=66969316;WS=66969298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,162:0.56:289
chr16	67003618	rs61743167	C	T	3025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FS=2.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.27;ReadPosRankSum=1.825;SOR=0.536;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,138:0.65:212
chr16	67144115	rs115599330	G	A	817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=16;PP=436;ReadPosRankSum=1.118;SC=ACGCTCTCTGGGGAACGAGCA;SOR=0.727;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=126;TCF=73;TCR=53;TR=39;WE=67144123;WS=67144105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,46:0.34:136
chr16	67174637	rs139477881	GT	G	531.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=549;ReadPosRankSum=0.713;SC=GCCCAGGGTTGTTTTGCATAG;SOR=0.402;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=17;WE=67174645;WS=67174627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,20:0.71:28
chr16	67197776	rs5817616	C	CG	1427.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.863;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=31;PP=728;ReadPosRankSum=0.421;SC=TGAGAGGGAACGGGGGGGGTG;SOR=0.403;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=45;TCF=4;TCR=41;TR=33;WE=67197784;WS=67197766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:5,56:0.92:61
chr16	67198900	.	C	T	1100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.795;ClippingRankSum=0.000;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.097;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=34;PP=666;ReadPosRankSum=-0.572;SC=CAGTGAACACCCATGCCCGCC;SOR=0.779;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=208;TCF=103;TCR=105;TR=63;WE=67198908;WS=67198890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,70:0.30:233
chr16	67221050	rs9924876	A	G	4934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=87;PP=2965;SC=GCCTGGAGATAGGTGGCCTGG;SOR=0.821;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=172;TCF=84;TCR=88;TR=171;WE=67221058;WS=67221040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr16	67223152	.	C	CTTAT	349.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.492;ClippingRankSum=0.000;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=1.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.90;MQRankSum=3.440;QD=11.66;ReadPosRankSum=-0.155;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,10:0.33:30
chr16	67229793	.	A	ACAG	1797.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=0.000;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.006;NF=7;NR=35;PP=1566;ReadPosRankSum=-0.583;SC=GCCCTGCTGGACAGCAGCAGC;SOR=0.740;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=150;TCF=20;TCR=130;TR=42;WE=67229806;WS=67229783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,85:0.48:178
chr16	67233266	rs12923138	A	C	7290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=119;NR=130;PP=2965;SC=GATTGCCATCAAGATGCGTGA;SOR=0.887;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=249;TCF=119;TCR=130;TR=249;WE=67233274;WS=67233256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,268:1.00:268
chr16	67235672	rs33948247	C	T	4303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.003;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=79;PP=2692;ReadPosRankSum=0.187;SC=GCAGGTCCTACGCCAGGCTGC;SOR=0.612;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=261;TCF=145;TCR=116;TR=177;WE=67235680;WS=67235662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,188:0.69:274
chr16	67296088	rs72798023	C	A	2128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.863;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.732;NF=65;NR=48;PP=1323;ReadPosRankSum=0.190;SC=TTGTATTCATCCAAATCCACA;SOR=0.641;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=322;TCF=189;TCR=133;TR=113;WE=67296096;WS=67296078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:226,119:0.34:345
chr16	67315128	rs78476762	C	T	483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.12;QD=26.88;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	67316380	rs116918762	G	C	1328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.972;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=27;PP=907;ReadPosRankSum=0.876;SC=AAGGCAGGGGGTCTAAGATGG;SOR=0.526;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=169;TCF=105;TCR=64;TR=65;WE=67316388;WS=67316370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,66:0.38:175
chr16	67316600	rs7200919	G	A	9161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=161;NR=165;PP=2965;SC=TGAGCCCCCAGTCCATAGCAG;SOR=0.777;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=327;TCF=162;TCR=165;TR=326;WE=67316608;WS=67316590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,344:1.00:344
chr16	67324957	rs27860	T	C	2880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=59;PP=1544;SC=AGATGCAGAGTGGGGACTTCT;SOR=1.371;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=42;TCR=59;TR=101;WE=67324965;WS=67324947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr16	67432009	rs117591819	G	A	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.235;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.08;ReadPosRankSum=1.001;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr16	67441535	rs76701908	T	C	604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.633;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=442;ReadPosRankSum=1.469;SC=CAAATTACTTTGCCATTTGGG;SOR=1.536;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=39;TCF=31;TCR=8;TR=24;WE=67441543;WS=67441525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,24:0.63:38
chr16	67572456	rs200947620	AC	A	1680.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.033;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.500;NF=7;NR=28;PP=1159;ReadPosRankSum=1.388;SC=GGGCCCAGGTACGCGGCCGCG;SOR=0.531;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=116;TCF=21;TCR=95;TR=35;WE=67572464;WS=67572446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,56:0.31:180
chr16	67670472	.	GTA	G	49	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=27;MQ=58.48;NF=2;NR=0;PP=49;QD=27.5;SC=GAAAGAAAGTGTATATATATA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=7;TCR=5;TR=2;WE=67670481;WS=67670462;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:10,2:0.17:12
chr16	67685900	rs78320020	C	T	4138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=89;PP=2546;ReadPosRankSum=1.162;SC=GAGTGCAGCCCGGGATCAGCT;SOR=0.701;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=279;TCF=137;TCR=142;TR=173;WE=67685908;WS=67685890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,190:0.62:307
chr16	67691515	rs14920	C	A	4316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=347;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.928;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=106;NR=66;PP=2327;ReadPosRankSum=-3.196;SC=CGTCTCACATCGGAGTTGGCT;SOR=0.869;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=305;TCF=179;TCR=126;TR=172;WE=67691523;WS=67691496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,205:0.59:347
chr16	67691668	rs6979	A	G	8320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=150;NR=134;PP=2965;SC=CACTCACCTGACAGCTTGGAC;SOR=0.741;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=284;TCF=150;TCR=134;TR=284;WE=67691676;WS=67691658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,299:1.00:299
chr16	67863451	rs3743733	T	C	3338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=75;PP=2289;SC=TCACAGGGATTCCAGGCCTGA;SOR=1.590;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=39;TCR=76;TR=114;WE=67863459;WS=67863441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr16	67876823	rs377516180	ACAG	A	148.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=3.927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.54;ReadPosRankSum=0.104;SOR=1.525;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,7:0.17:42
chr16	67981698	rs182969827	G	A	1226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=32;PP=751;ReadPosRankSum=-0.424;SC=CGCCCTGGACGAGAGGGGAGG;SOR=0.730;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=115;TCF=45;TCR=70;TR=51;WE=67981706;WS=67981688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,58:0.45:128
chr16	68025801	rs255051	G	C	6938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=139;NR=102;PP=2965;SC=GTAGAAGGTAGGTAAGATGGA;SOR=0.881;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=242;TCF=139;TCR=103;TR=241;WE=68025809;WS=68025791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr16	68057096	rs237831	T	C	7738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=119;NR=148;PP=2965;SC=ACCGGCCGCGTTAGAGCCATG;SOR=0.968;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=267;TCF=119;TCR=148;TR=267;WE=68057104;WS=68057086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,285:1.00:285
chr16	68100461	rs2285912	C	T	4842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=77;PP=2951;SC=TGTGGTCCTCCTCCTCAGCTA;SOR=0.897;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=150;TCF=73;TCR=77;TR=150;WE=68100469;WS=68100451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr16	68260122	rs74625559	G	A	836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=3;PP=561;SC=TCAGGAGCAGGCTTCAGACAC;SOR=3.690;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=68260130;WS=68260112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr16	68267912	rs145978010	G	A	1782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.025;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=42;PP=1027;ReadPosRankSum=0.407;SC=TGGAGGCCTCGGGGTGCAGGA;SOR=0.611;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=220;TCF=101;TCR=119;TR=79;WE=68267920;WS=68267902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,92:0.38:239
chr16	68282528	rs149201520	G	T	1141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.960;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=13;PP=872;ReadPosRankSum=-0.345;SC=GACCGCAAGTGATCCACTCAC;SOR=1.034;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=81;TCF=57;TCR=24;TR=46;WE=68282536;WS=68282518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,47:0.55:85
chr16	68287385	rs141030968	TCTC	T	1377.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.678;NF=2;NR=11;PP=521;ReadPosRankSum=-1.172;SC=CTCAAGCACTTCTCCTGCCTC;SOR=0.869;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=13;WE=68287395;WS=68287375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,35:0.71:49
chr16	68325665	.	G	GGT	332	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=11;MMLQ=15;MQ=60.21;NF=0;NR=19;PP=332;QD=17.6315789474;SC=GGGCATATAGGGTGTGTGTGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=74;TCF=1;TCR=73;TR=19;WE=68325674;WS=68325655;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:55,19:0.26:74
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chr16	68591230	rs1728785	A	C	6460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=123;NR=98;PP=2965;SC=GCATTTTATTATTAATACGGC;SOR=0.815;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=221;TCF=123;TCR=98;TR=221;WE=68591238;WS=68591220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
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chr16	68591386	rs11859322	T	C	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.349;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=59;ReadPosRankSum=1.893;SC=TGTAGAACAATATGTATGGTA;SOR=0.117;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=5;WE=68591394;WS=68591376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr16	68598007	rs1177648	A	G	6990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=521;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=133;NR=146;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.762;SC=CTCTCACTCAAGATGAAAGCA;SOR=0.714;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=474;TCF=232;TCR=242;TR=279;WE=68598015;WS=68597997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:210,309:0.60:519
chr16	68710165	rs3118229	T	C	858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=6;PP=635;SC=AAGCCAAGTCTCCCTTCTGCA;SOR=2.621;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=28;WE=68710173;WS=68710155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr16	68711999	rs1952048	A	G	2273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.617;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=36;PP=1440;ReadPosRankSum=-1.880;SC=TGTCCCAGCTATTTGCACATC;SOR=0.571;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=216;TCF=140;TCR=76;TR=101;WE=68712007;WS=68711989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,109:0.45:241
chr16	68712217	rs2296410	T	C	2570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=58;PP=2008;SC=CATTGGTGGCTCCAGGGACCC;SOR=1.939;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=25;TCR=58;TR=83;WE=68712225;WS=68712207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr16	68712730	rs8049247	C	A	7387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=530;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.810;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=167;NR=147;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.039;SC=TCTCCATCATCGTGACCGACC;SOR=0.755;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=487;TCF=252;TCR=235;TR=314;WE=68712738;WS=68712720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:190,338:0.64:528
chr16	68713730	rs2296409	G	A	6894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=142;NR=88;PP=2965;SC=TGACAGCCACGGATGAGGATG;SOR=1.083;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=230;TCF=142;TCR=88;TR=230;WE=68713738;WS=68713720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chr16	68713823	rs2296408	C	A	9641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=367;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=164;NR=176;PP=2965;SC=TCATGTTCACCATTCACCGGA;SOR=0.857;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=340;TCF=164;TCR=176;TR=340;WE=68713831;WS=68713813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,366:1.00:366
chr16	68716066	rs1886698	G	A	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=4.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.71;ReadPosRankSum=1.097;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
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chr16	68718367	rs4783661	T	C	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=7;PP=433;ReadPosRankSum=-0.295;SC=GGCAGCACTGTTGCTAGTGAG;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=59;TCF=44;TCR=15;TR=28;WE=68718375;WS=68718357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,31:0.50:62
chr16	68718750	rs2281850	A	G	4795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=91;PP=2899;SC=TGGGCTCAGTAAGCAGCACGT;SOR=1.238;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=67;TCR=91;TR=158;WE=68718758;WS=68718740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr16	68721340	rs2296406	G	A	1766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=10;PP=1362;SC=AGAGCTGGGCGGTAAACAGGA;SOR=2.872;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=48;TCR=10;TR=58;WE=68721348;WS=68721330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr16	68721470	rs2296405	T	C	10192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=391;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=186;NR=180;PP=2965;SC=TTGATGTCAATGACCATGGCC;SOR=0.703;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=366;TCF=186;TCR=180;TR=366;WE=68721478;WS=68721460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,390:1.00:390
chr16	68721533	rs1126933	G	C	2599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.499;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=72;PP=1451;ReadPosRankSum=-0.103;SC=CTGTGCGCCAGGTGCTGAACA;SOR=0.567;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=287;TCF=120;TCR=167;TR=128;WE=68721541;WS=68721523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,135:0.44:309
chr16	68725783	rs2274239	G	A	2157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=49;PP=1477;SC=GACCCTGGAAGGGAGGTTTCA;SOR=1.949;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=69;TCF=20;TCR=49;TR=69;WE=68725791;WS=68725773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr16	68729112	rs8060790	A	G	5016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=110;NR=51;PP=2965;SC=GTCTTGGCCCACTGTGTGGTT;SOR=1.597;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=161;TCF=110;TCR=51;TR=161;WE=68729120;WS=68729102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr16	68729785	rs17715450	C	A	13649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=517;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=250;NR=222;PP=2965;SC=GTACCGTCCTCGGCCAGCCAA;SOR=0.745;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=473;TCF=250;TCR=223;TR=472;WE=68729793;WS=68729775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,515:1.00:515
chr16	68771372	rs3743674	C	T	3129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.53;QD=25.87;SOR=0.850;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr16	68771418	rs147838237	C	CGCCCCAGCCCCGT	4060.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.52;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=4;NR=20;PP=634;SC=GCAAGCTCCGCGCCCCAGCCC;SOR=0.906;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=24;WE=68771426;WS=68771407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr16	68771547	rs3743675	G	C	362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.91;SOR=1.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr16	68847584	rs8056633	T	G	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.629;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=183;ReadPosRankSum=0.876;SC=CAAGAAACTGTGCTGTGTGTG;SOR=1.880;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=10;WE=68847592;WS=68847574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr16	68857289	rs2276330	T	C	1692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.509;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=30;PP=1097;ReadPosRankSum=-0.230;SC=TTTCTTTTTATTGCTTTCTCC;SOR=0.548;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=115;TCF=70;TCR=45;TR=73;WE=68857297;WS=68857279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,78:0.63:124
chr16	68857441	rs1801552	T	C	2911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=50;PP=1595;ReadPosRankSum=-0.100;SC=AAGGGGCCGCTGGCGTCTGTA;SOR=0.723;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=216;TCF=126;TCR=90;TR=122;WE=68857449;WS=68857431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,134:0.57:234
chr16	68893781	rs17690624	C	T	2770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.544;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=40;PP=1797;ReadPosRankSum=-0.766;SC=TTTTCTTCTTCAAAAGGCTCG;SOR=1.069;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=180;TCF=110;TCR=70;TR=115;WE=68893789;WS=68893771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,122:0.65:189
chr16	68893953	rs4597312	T	C	5026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=379;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.716;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=104;PP=2788;ReadPosRankSum=-0.499;SC=CACAAAACTCTGTGGATGTCA;SOR=0.697;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=343;TCF=173;TCR=170;TR=208;WE=68893961;WS=68893943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,230:0.61:378
chr16	68952939	rs3833052	A	AT	1326.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=2.575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.06;ReadPosRankSum=-0.343;SOR=0.441;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,64:0.58:110
chr16	69007846	rs3743677	C	T	1709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.756;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=23;PP=1100;ReadPosRankSum=-1.948;SC=AGCATCTCTGCGTTCATCCCA;SOR=0.790;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=108;TCF=75;TCR=33;TR=71;WE=69007854;WS=69007836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,76:0.64:118
chr16	69117457	rs200318232	G	A	2234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=41;PP=1192;ReadPosRankSum=-0.481;SC=GCCCGATGACGTGGCCAAGCT;SOR=0.678;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=202;TCF=120;TCR=82;TR=100;WE=69117465;WS=69117447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,112:0.50:225
chr16	69143577	rs2232228	A	G	1956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.395;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=49;PP=1262;ReadPosRankSum=1.111;SC=GCATTGCCGCATACCAGGAGG;SOR=0.912;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=265;TCF=130;TCR=135;TR=94;WE=69143585;WS=69143567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:181,102:0.36:283
chr16	69153251	rs79051270	G	T	2164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.567;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.899;NF=51;NR=40;PP=1370;ReadPosRankSum=-0.406;SC=CTGGGAAAGGGATTGGCATTT;SOR=0.888;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=166;TCF=91;TCR=75;TR=91;WE=69153259;WS=69153241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,99:0.55:181
chr16	69334880	.	CA	C	154.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=0.000;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=4.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.686;QD=3.44;ReadPosRankSum=0.201;SOR=0.203;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,13:0.29:45
chr16	69357406	rs16958751	G	A	3506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.865;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=75;PP=2069;ReadPosRankSum=-1.063;SC=ATAATATGACGTCAATCCATG;SOR=0.762;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=293;TCF=160;TCR=133;TR=165;WE=69357414;WS=69357396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,172:0.55:312
chr16	69377553	rs153060	A	G	769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.300;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=24;PP=558;ReadPosRankSum=-2.011;SC=CCTATGAGAGAGACAATTTTA;SOR=0.469;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=10;TCR=41;TR=30;WE=69377561;WS=69377543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,32:0.57:56
chr16	69385426	rs72795299	G	A	1121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.120;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=27;PP=670;ReadPosRankSum=-0.499;SC=CCCCCAGTATGGCCAGTCACC;SOR=0.765;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=152;TCF=85;TCR=67;TR=59;WE=69385434;WS=69385416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,62:0.43:143
chr16	69599803	rs8048032	A	G	507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=10;NR=6;PP=216;SC=GGGGGCCGCCACGGCTCTTCC;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=10;TCR=6;TR=16;WE=69599811;WS=69599793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	69602247	.	ATATG	A	148	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=101;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=4;NR=0;PP=148;QD=40.25;SC=GTATATATATATATGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=69602258;WS=69602237;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr16	69602296	.	T	C	250	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=48;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=10;NR=0;PP=250;QD=28.4771212547;SC=TATATATATATACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=69602304;WS=69602286;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr16	69678835	rs13329844	G	A	2051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=41;PP=1230;SC=TGCAAATATTGCATGCTGCAT;SOR=1.708;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=23;TCR=41;TR=64;WE=69678843;WS=69678825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr16	69704122	rs72523664	C	CTG	3960.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=42;PP=2065;SC=TAATAAATCACTTTTTATTTC;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=11;TCR=42;TR=53;WE=69704130;WS=69704112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr16	69704204	rs3217435	CT	C	1378.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=27;PP=707;SC=AAAATTTAAGCTTTTTTTATA;SOR=1.270;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=29;WE=69704212;WS=69704194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr16	69718972	rs9934681	C	T	912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=21;PP=585;SC=ACTTATAATACTTTGCAGGGT;SOR=1.418;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=11;TCR=21;TR=32;WE=69718980;WS=69718962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr16	69873992	rs2291959	T	G	5815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=113;NR=87;PP=2965;SC=GGGTGCATTCTCTTTAGCCCA;SOR=0.890;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=200;TCF=113;TCR=87;TR=200;WE=69874000;WS=69873982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr16	69874198	rs2291960	C	T	1133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=25;PP=701;SC=AGGACTGTGCCGGGACAGGGT;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=11;TCR=25;TR=36;WE=69874206;WS=69874188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr16	69876164	rs9940315	A	G	2135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=23;NR=53;PP=1527;SC=AGTAGTTAAGAAAGCTAATAG;SOR=1.771;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=23;TCR=53;TR=76;WE=69876172;WS=69876154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr16	69942608	rs5817677	AG	A	12569.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=374;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=162;PP=2966;SC=CCTTTCTAACAGGGGCCTATG;SOR=0.755;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=212;TCF=41;TCR=171;TR=200;WE=69942616;WS=69942598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,367:1.00:367
chr16	69963355	rs1566452	G	A	7278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=132;NR=126;PP=2965;SC=TGGCAGAGAAGAGACAGGACA;SOR=0.759;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=259;TCF=133;TCR=126;TR=258;WE=69963363;WS=69963345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,279:1.00:279
chr16	69964003	rs192860069	C	G	1498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.560;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=28;PP=1095;ReadPosRankSum=-1.147;SC=GTGGGGCCAGCCCTTCACCCT;SOR=0.610;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=177;TCF=109;TCR=68;TR=71;WE=69964011;WS=69963993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,75:0.40:187
chr16	69965024	rs2270840	A	T	9059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=165;NR=143;PP=2965;SC=GAGAAATCGCATGAACCCCTG;SOR=0.742;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=309;TCF=165;TCR=144;TR=308;WE=69965032;WS=69965014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,336:1.00:336
chr16	69965281	rs8052727	T	G	2859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=33;PP=2087;SC=TCTAGGAAGCTAGTTTTCATT;SOR=1.725;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=109;TCF=75;TCR=34;TR=108;WE=69965289;WS=69965271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr16	69965396	rs368331143	CT	C	142.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FS=2.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.13;MQRankSum=3.476;QD=0.90;ReadPosRankSum=0.089;SOR=0.413;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:125,33:0.21:158
chr16	69965444	rs146199930	C	T	1437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.05;MQRankSum=1.296;QD=6.69;ReadPosRankSum=-0.664;SOR=0.702;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:134,81:0.38:215
chr16	69965592	rs2291961	A	G	2634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=53;NR=25;PP=1995;SC=CCAGGGCGTGAGTCTTGGTGA;SOR=1.423;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=53;TCR=25;TR=78;WE=69965600;WS=69965582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr16	69967093	rs2102066	G	A	1179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=15;NR=18;PP=538;SC=CCTCTGCGTCGACGGACTCCT;SOR=1.364;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=15;TCR=18;TR=33;WE=69967101;WS=69967083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr16	69967732	rs8047818	G	A	776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=2;PP=530;SC=AGGTTAGCCCGGGTGCTTGTC;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=69967740;WS=69967722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr16	69967897	rs2270841	T	C	7394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=140;NR=122;PP=2965;SC=TCCTGTCTCATGAGGTGCTCA;SOR=0.736;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=262;TCF=140;TCR=122;TR=262;WE=69967905;WS=69967887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,284:1.00:284
chr16	69970000	rs2270842	T	G	2259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=46;PP=1579;SC=CTGAGCTCTTTTCCAGCCTCT;SOR=2.082;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=16;TCR=46;TR=62;WE=69970008;WS=69969990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr16	69970329	rs1983016	A	G	8559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=127;NR=168;PP=2965;SC=TCCGGGTCACAGAGGAGAACA;SOR=1.186;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=295;TCF=127;TCR=168;TR=295;WE=69970337;WS=69970319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,319:1.00:319
chr16	69973127	rs2270843	A	G	7626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=129;NR=125;PP=2965;SC=AGTGGGATGGAGAAGAGCTGT;SOR=0.708;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=254;TCF=129;TCR=125;TR=254;WE=69973135;WS=69973117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,274:1.00:274
chr16	69973622	rs10712484	GC	G	3309.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=7;PP=2951;SC=GGCCTGACTGGCAGCCCCTGA;SOR=4.307;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=64;TCR=7;TR=71;WE=69973630;WS=69973612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr16	69973655	rs4985461	C	G	5358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=124;NR=46;PP=2965;SC=GTGGTGCAAGCCCTGTGGCCC;SOR=1.880;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=170;TCF=124;TCR=46;TR=170;WE=69973663;WS=69973645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr16	69988373	rs2549097	T	C	300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.19;QD=27.34;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr16	69988463	rs78531533	C	G	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.47;MQRankSum=-1.759;QD=5.50;ReadPosRankSum=-3.810;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,12:0.22:55
chr16	69988473	rs80122082	G	A	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=1.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.56;MQRankSum=-2.518;QD=5.15;ReadPosRankSum=-3.376;SOR=1.058;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,10:0.18:57
chr16	70010458	rs3206834	G	A	1981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=42;PP=1276;SC=GAGGGTGGAAGGGGAATAAGA;SOR=1.483;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=25;TCR=42;TR=67;WE=70010466;WS=70010448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr16	70016416	rs3748385	T	A	4097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=100;PP=2758;SC=GAAGAAACTCTTTTCTTTGTG;SOR=2.222;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=135;TCF=35;TCR=100;TR=135;WE=70016424;WS=70016406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr16	70048199	.	A	G	113	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=25;MQ=46.06;NF=0;NR=9;PP=113;QD=16.4190236164;SC=AAGTTCAGAGATTAATTTCAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=9;WE=70048207;WS=70048189;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
chr16	70068086	rs34921671	G	C	4692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=109;NR=53;PP=2965;SC=GATTACAAAGGTATTGGCCCA;SOR=1.475;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=163;TCF=110;TCR=53;TR=162;WE=70068094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr16	70076912	rs58544385	GA	G	304.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.05;MQRankSum=-0.868;QD=14.51;ReadPosRankSum=0.780;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,18:0.86:21
chr16	70099593	rs889377	T	C	105.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.96;QD=26.26;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr16	70154480	rs200469748	A	G	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=389;ExcessHet=3.0103;FS=4.826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.74;MQRankSum=-17.954;QD=1.20;ReadPosRankSum=-3.788;SOR=1.010;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:327,61:0.16:388
chr16	70161263	rs2549532	T	C	1970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.64;MQRankSum=-2.163;QD=30.79;ReadPosRankSum=-0.535;SOR=2.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,63:0.98:64
chr16	70162581	rs71151174	TC	T	1168.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.858;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=3.004;NF=37;NR=3;PP=1296;ReadPosRankSum=0.186;SC=TGAGTGGCAGTCCCAGGATTC;SOR=0.287;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=97;TCF=89;TCR=8;TR=40;WE=70162589;WS=70162571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,42:0.44:95
chr16	70163691	rs4985506	C	T	1617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;BaseQRankSum=8.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=629;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.040;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-22.074;NF=115;NR=124;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.569;SC=ACTTAACTAGCGTCCAGGGTA;SOR=1.186;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=720;TCF=366;TCR=354;TR=239;WE=70163699;WS=70163681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:511,118:0.19:629
chr16	70163825	rs4985403	G	C	1149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=3.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.738;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-11.846;NF=22;NR=73;PP=1726;ReadPosRankSum=0.723;SC=TTTAAACTGAGTTGCTATTTT;SOR=0.591;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=210;TCF=47;TCR=163;TR=95;WE=70163833;WS=70163815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,55:0.31:177
chr16	70164248	rs7206450	T	C	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=1.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.97;MQRankSum=-1.512;QD=4.97;ReadPosRankSum=-0.355;SOR=1.079;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,20:0.25:79
chr16	70164334	rs10852462	A	G	3570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=353;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.701;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.715;NF=107;NR=47;PP=2462;ReadPosRankSum=-2.112;SC=AGGTGTTCAGATCTATGACCG;SOR=1.306;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=336;TCF=217;TCR=119;TR=154;WE=70164342;WS=70164324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:190,162:0.46:352
chr16	70164741	rs2549541	T	C	6213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=475;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.144;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-17.427;NF=112;NR=186;PP=2962;ReadPosRankSum=0.591;SC=TTTCATTCTATAACCTAGCAA;SOR=0.593;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=487;TCF=184;TCR=303;TR=298;WE=70164749;WS=70164731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:197,278:0.59:475
chr16	70165439	rs62050965	C	T	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-5.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.144;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.746;NF=0;NR=17;PP=334;ReadPosRankSum=0.494;SC=ATTTCTAGAGCATGTTACAGG;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=17;WE=70165447;WS=70165429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr16	70165793	rs4985507	G	C	9164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=833;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.522;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.397;NF=196;NR=230;PP=2962;ReadPosRankSum=0.588;SC=TGGTTTGCTTGTGGGGACTAG;SOR=0.761;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=809;TCF=377;TCR=432;TR=426;WE=70165801;WS=70165783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:398,434:0.52:832
chr16	70165914	rs2113175	T	C	781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-6.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.068;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-8.038;NF=0;NR=38;PP=652;ReadPosRankSum=-0.006;SC=TGAATGCCTGTGTTCATTGAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=82;TCF=6;TCR=76;TR=38;WE=70165922;WS=70165904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,35:0.49:72
chr16	70166225	rs2549550	C	A	6523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=511;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.174;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-8.537;NF=96;NR=176;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.354;SC=GCATTATAACCGTAGTGCCTT;SOR=0.600;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=488;TCF=168;TCR=320;TR=272;WE=70166233;WS=70166215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:221,289:0.57:510
chr16	70170004	rs8045700	C	A	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.782;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.49;MQRankSum=1.071;QD=17.17;ReadPosRankSum=1.423;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr16	70170016	rs8045569	A	G	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.95;MQRankSum=1.591;QD=12.03;ReadPosRankSum=1.083;SOR=0.871;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr16	70176321	rs113493832	CT	C	552.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FS=13.152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQRankSum=1.509;QD=4.09;ReadPosRankSum=0.149;SOR=0.166;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,50:0.37:135
chr16	70177577	rs2303198	G	A	1624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.48;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.664;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-8.618;NF=67;NR=87;PP=1969;ReadPosRankSum=-2.035;SC=ATGAGCTGCCGTCCCGCTCTG;SOR=0.551;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=396;TCF=158;TCR=238;TR=154;WE=70177585;WS=70177567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:229,97:0.30:326
chr16	70177618	rs7191901	G	A	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-3.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.710;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-8.633;NF=17;NR=41;PP=761;ReadPosRankSum=0.290;SC=CCTTAGGGGTGCTGTAGCAGA;SOR=0.474;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=186;TCF=48;TCR=138;TR=58;WE=70177626;WS=70177608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,37:0.21:175
chr16	70177648	rs2303200	G	A	573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.390;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-7.241;NF=9;NR=29;PP=634;ReadPosRankSum=1.541;SC=GCGCTTCTCCGGGAACCATAA;SOR=0.180;SbPval=0.07;Source=Platypus;TC=100;TCF=13;TCR=87;TR=38;WE=70177656;WS=70177638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,28:0.29:96
chr16	70181537	rs145995386	C	T	3896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.00;QD=25.64;SOR=0.923;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr16	70182249	rs62050975	C	T	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.36;MQRankSum=0.000;QD=4.93;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr16	70182325	rs55843501	T	C	2143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.66;QD=33.50;SOR=4.277;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr16	70182375	rs62050977	T	C	3281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=5.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.375;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.351;NF=76;NR=30;PP=1421;ReadPosRankSum=-3.456;SC=AGGAGATGAGTGTGGGCTATG;SOR=1.279;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=334;TCF=205;TCR=129;TR=106;WE=70182383;WS=70182365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:210,91:0.30:301
chr16	70182390	rs62050978	T	G	3950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=4.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=357;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.406;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.560;NF=87;NR=46;PP=1938;ReadPosRankSum=-4.345;SC=GCTATGCAAATGGGATCCGGG;SOR=1.037;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=379;TCF=221;TCR=158;TR=133;WE=70182398;WS=70182380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:230,127:0.36:357
chr16	70182489	rs145754705	ACTTCCCTTCC	A	3872.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FS=2.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.63;MQRankSum=3.959;QD=22.39;ReadPosRankSum=0.602;SOR=0.472;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,102:0.59:173
chr16	70187164	rs2287979	G	A	3544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=9;PP=2762;SC=TCAAGGATGAGACATCCTGGG;SOR=4.466;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=97;TCR=9;TR=105;WE=70187172;WS=70187154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr16	70187270	rs2287980	T	G	10929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=850;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.530;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=267;NR=200;PP=2962;ReadPosRankSum=2.328;SC=CTGCTGCTTATGAACTTTCTG;SOR=0.659;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=817;TCF=467;TCR=350;TR=467;WE=70187278;WS=70187260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:355,493:0.58:848
chr16	70190401	rs6499302	C	T	7784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=620;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.128;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=202;NR=140;PP=2962;ReadPosRankSum=1.161;SC=TTGGTCGCGACGCCCTCCTGC;SOR=0.774;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=589;TCF=346;TCR=243;TR=342;WE=70190409;WS=70190391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:259,358:0.58:617
chr16	70191029	rs4985509	T	G	5568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=418;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.531;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=105;NR=131;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.053;SC=TCACTCAGCTTCTCGTGGTGG;SOR=0.658;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=395;TCF=175;TCR=220;TR=236;WE=70191037;WS=70191019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,249:0.60:417
chr16	70191161	rs11647087	C	T	1043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.204;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=33;PP=796;ReadPosRankSum=-0.226;SC=TCTCAGGGCACGAGTCCCTCT;SOR=1.101;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=62;TCF=16;TCR=46;TR=43;WE=70191169;WS=70191151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,44:0.70:63
chr16	70211226	rs150357848	T	C	1783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.38;MQRankSum=-7.712;QD=13.83;ReadPosRankSum=-0.858;SOR=0.637;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,81:0.63:129
chr16	70211290	rs76842247	T	C	4556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=408;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.02;MQRankSum=-15.581;QD=11.17;ReadPosRankSum=8.270;SOR=0.659;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:182,226:0.55:408
chr16	70211370	rs144090331	C	G	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.78;MQRankSum=-7.092;QD=7.29;ReadPosRankSum=1.183;SOR=0.755;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,32:0.27:120
chr16	70211380	rs200721332	G	A	709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=2.159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.51;MQRankSum=-6.348;QD=7.80;ReadPosRankSum=2.727;SOR=1.030;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,23:0.25:91
chr16	70219659	rs371530724	G	A	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=24.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.06;MQRankSum=-1.539;QD=9.02;ReadPosRankSum=-1.726;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr16	70219914	rs200703987	T	C	530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=37.25;QD=33.17;SOR=5.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr16	70285901	rs4985407	A	G	1146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=23;PP=703;SC=TGGGCTGTCGAGAGAGCGGCG;SOR=1.501;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=14;TCR=23;TR=37;WE=70285909;WS=70285891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr16	70287177	rs4081753	A	G	11239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=448;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=221;NR=199;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.848;SC=TGACCTGGGGAACTTGACACA;SOR=0.760;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=423;TCF=222;TCR=201;TR=420;WE=70287185;WS=70287166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,432:1.00:434
chr16	70292798	rs34846578	CAG	C	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=399;SC=TCTGATACAACAGAGTGAGAG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=9;WE=70292807;WS=70292794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	70303580	rs2070203	G	A	6734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=117;NR=114;PP=2965;SC=TGGTCCGAGCGTGGTCAGCCA;SOR=0.768;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=232;TCF=117;TCR=115;TR=231;WE=70303588;WS=70303570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr16	70350114	.	G	GT	140.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=0.000;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=7.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.35;ReadPosRankSum=-0.511;SOR=1.530;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,13:0.31:42
chr16	70384687	rs66588480	CTTAAAA	C	915.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=15;PP=727;SC=CCTTTGACTTCTTAAAATTAA;SOR=3.352;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=15;WE=70384700;WS=70384677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	70395387	rs1134074	C	T	9586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=366;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=166;NR=169;PP=2965;SC=TACAAGAGAACGCATTACCCA;SOR=0.767;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=335;TCF=166;TCR=169;TR=335;WE=70395395;WS=70395377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,365:1.00:365
chr16	70399907	rs79528925	C	G	2431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.043;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=41;PP=1426;ReadPosRankSum=1.152;SC=TCTCCTAGTCCTAGAAGGATG;SOR=0.522;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=157;TCF=99;TCR=58;TR=103;WE=70399915;WS=70399897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,114:0.66:173
chr16	70400857	rs8058224	A	G	455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=10;PP=301;SC=AGCGCCATGGAAAGAAGGGAA;SOR=2.448;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=70400865;WS=70400847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	70422231	rs4985526	C	T	603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=1;PP=466;SC=CAAGATGGTCCTGTCACCCAT;SOR=3.611;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=70422239;WS=70422221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr16	70502610	rs12446395	C	G	1936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=7;PP=1355;SC=TGGAGTCTGGCTGCTGGAGTG;SOR=3.021;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=52;TCR=7;TR=59;WE=70502618;WS=70502600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr16	70506907	rs7192865	T	C	7412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=132;NR=122;PP=2965;SC=TGTGGGACCCTGAGACGCTGC;SOR=0.772;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=254;TCF=132;TCR=122;TR=254;WE=70506915;WS=70506897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,287:1.00:287
chr16	70512349	rs17886060	G	A	2767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.148;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=65;PP=1765;ReadPosRankSum=0.059;SC=CGCCTGGCTCGGAACCTGCTG;SOR=0.790;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=188;TCF=86;TCR=102;TR=117;WE=70512357;WS=70512339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,124:0.63:196
chr16	70514828	rs7919	A	C	429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=3;PP=243;SC=CCCCCAAGCCAGACAGCCTCG;SOR=1.473;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=12;WE=70514836;WS=70514821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	70515355	rs11054	C	T	7411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=130;NR=110;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.578;SC=AGGCAATGAGCGACCTCAGCT;SOR=0.229;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=241;TCF=130;TCR=111;TR=240;WE=70515363;WS=70515345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,282:1.00:283
chr16	70515600	rs6416698	T	G	3868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=43;PP=2575;SC=GTCCTGGGGGTGGTGGCATGA;SOR=1.431;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=86;TCR=43;TR=128;WE=70515608;WS=70515590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr16	70516109	rs12447090	G	A	7197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=126;NR=126;PP=2965;SC=TGGTCACCATGGGCCTCATAA;SOR=0.785;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=252;TCF=126;TCR=126;TR=252;WE=70516117;WS=70516099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,272:1.00:272
chr16	70548297	rs3931036	G	A	4298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=70;NR=73;PP=2428;SC=GTAGCGATGAGTATGTGCTGC;SOR=0.895;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=143;TCF=70;TCR=73;TR=143;WE=70548305;WS=70548287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr16	70680850	rs3813905	C	G	1159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.957;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=18;PP=685;ReadPosRankSum=-1.525;SC=GGAACACCACCATGCCCCGGG;SOR=0.948;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=135;TCF=87;TCR=48;TR=56;WE=70680858;WS=70680840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,63:0.41:153
chr16	70688303	.	C	T	21	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=19;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=21;QD=18.5904041824;SC=TTCCAGATCCCGTGCCCCCCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=3;WE=70688311;WS=70688293;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr16	70690989	rs8046424	G	C	869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.721;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=19;PP=525;ReadPosRankSum=-1.321;SC=GCAGGAGGTGGAGACGCTGCT;SOR=0.781;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=101;TCF=53;TCR=48;TR=40;WE=70690997;WS=70690979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,44:0.40:109
chr16	70693872	.	CT	C	295.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.353;ClippingRankSum=0.000;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=7.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.18;ReadPosRankSum=-0.371;SOR=0.194;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,26:0.28:93
chr16	70708093	rs67662127	CAGTCTCAACAGCTATAGT	C	368.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=2;PP=2152;SC=GCCTTCAGGCCAGTCTCAACA;SOR=2.093;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=5;WE=70708118;WS=70708083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	70714811	.	C	CGG	392.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.604;ClippingRankSum=0.000;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=2.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.36;ReadPosRankSum=-0.062;SOR=1.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr16	70726795	rs2278983	C	A	4015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=50;PP=2390;ReadPosRankSum=1.409;SC=CGCTGCTCTGCGGCAGGAGCA;SOR=0.342;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=130;TCF=80;TCR=50;TR=129;WE=70726803;WS=70726785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,146:0.99:147
chr16	70726940	rs2278984	G	C	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.494;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=273;ReadPosRankSum=-1.019;SC=AGCCCACACTGCCTGCCTCCG;SOR=0.386;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=18;WE=70726948;WS=70726930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr16	70732483	rs7201952	G	A	2364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=19;PP=1482;SC=GCTCACACAGGGTGTGCCCCC;SOR=1.816;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=76;TCF=57;TCR=19;TR=75;WE=70732491;WS=70732473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr16	70732761	rs9673700	G	C	749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=20;PP=570;SC=GACCTGGAAGGCTCTGTGTCT;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=70732769;WS=70732751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr16	70796515	rs2305689	G	A	7820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=103;PP=2965;SC=ACATCTGGAGGGCAGAGAAGC;SOR=1.191;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=174;TCF=71;TCR=103;TR=174;WE=70796523;WS=70796505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr16	70796535	rs2305690	C	T	6973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=92;PP=2816;SC=CAGGGGTGCCCGTGAGTGCTC;SOR=1.383;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=147;TCF=55;TCR=92;TR=147;WE=70796543;WS=70796525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr16	70816893	rs1875941	C	T	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.484;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=200;ReadPosRankSum=-1.011;SC=GCAGTGGCAGCAGCAGTGGCA;SOR=1.147;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=56;TCF=43;TCR=13;TR=18;WE=70816901;WS=70816883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,21:0.33:63
chr16	70818142	.	T	G	1033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=0.000;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.702;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=20;PP=465;ReadPosRankSum=1.090;SC=CAGAGGAAAGTGAGCTGCCGA;SOR=0.440;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=81;TCF=34;TCR=47;TR=37;WE=70818150;WS=70818132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,50:0.51:99
chr16	70818759	rs2271047	A	G	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.977;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=14;PP=218;ReadPosRankSum=-1.243;SC=AGGCACAGACAGGGGAGGGAC;SOR=0.516;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=73;TCF=26;TCR=47;TR=23;WE=70818767;WS=70818749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,24:0.31:78
chr16	70867855	rs202133666	G	C	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-0.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.940;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.820;NF=19;NR=15;PP=357;ReadPosRankSum=1.230;SC=GATACACCACGGGTCCAAAGG;SOR=0.511;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=43;TCR=32;TR=34;WE=70867863;WS=70867845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,25:0.34:74
chr16	70926488	rs137965466	C	T	1858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.739;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.764;NF=24;NR=51;PP=1254;ReadPosRankSum=-2.066;SC=ACTCAAGATCCCAGAGAGGAG;SOR=0.598;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=137;TCF=42;TCR=95;TR=75;WE=70926496;WS=70926478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,77:0.60:128
chr16	70934974	rs12102425	T	C	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.60;MQRankSum=-4.262;QD=1.06;ReadPosRankSum=1.365;SOR=0.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:180,34:0.16:214
chr16	70935224	rs75445533	A	T	109.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=142;SC=ATAGGTAAACACATGTCATGG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=70935232;WS=70935214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr16	70954915	rs1798531	G	T	937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.58;QD=32.34;SOR=5.353;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr16	70972595	rs79004160	T	C	6243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=142;NR=105;PP=2965;SC=GGCATCATATTCTTCCTCATC;SOR=1.076;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=247;TCF=142;TCR=105;TR=247;WE=70972603;WS=70972585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr16	70972784	rs1615602	A	G	510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=18;PP=446;SC=CTCATCCCTGATTGCAGGGGT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=70972792;WS=70972774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
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chr16	71209398	rs145925047	TACC	T	403.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.039;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=228;ReadPosRankSum=-2.632;SC=CCACCATCAATACCACCACCA;SOR=0.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=5;WE=71209408;WS=71209388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr16	71218926	rs3785347	T	A	1134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.861;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=31;PP=611;ReadPosRankSum=-1.425;SC=CCAAAGATTCTTAAGTGGATG;SOR=1.144;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=96;TCF=33;TCR=63;TR=44;WE=71218934;WS=71218916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,53:0.50:107
chr16	71220880	rs12927616	T	C	513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=450;ReadPosRankSum=1.038;SC=ATACAGGTCATAATTTTTTTT;SOR=0.728;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=49;TCF=3;TCR=46;TR=21;WE=71220888;WS=71220870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,20:0.40:50
chr16	71318577	rs3803704	T	C	1116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.766;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=21;PP=720;ReadPosRankSum=1.015;SC=TAGCCAATTATTTCTGGAAAG;SOR=0.848;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=149;TCF=78;TCR=71;TR=52;WE=71318585;WS=71318567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,58:0.34:171
chr16	71319539	rs3826247	C	T	7135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=111;NR=120;PP=2965;SC=TGATTTTCCCCGCTTTATTAG;SOR=0.823;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=231;TCF=111;TCR=120;TR=231;WE=71319547;WS=71319529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr16	71319646	rs3096380	G	A	5742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=70;PP=2965;SC=AATGCATTAAGTTCAGTGTGG;SOR=1.040;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=179;TCF=109;TCR=70;TR=178;WE=71319654;WS=71319636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr16	71319900	rs9928675	T	C	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-4.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=186;ReadPosRankSum=-0.682;SC=CGAAATCTCATGAGCAGCAAA;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=1;TCR=38;TR=14;WE=71319908;WS=71319890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,17:0.38:45
chr16	71406024	rs7203012	C	T	1288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.547;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=28;PP=856;ReadPosRankSum=-0.842;SC=CTATTTAGTGCTGAGATTGAT;SOR=0.613;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=188;TCF=115;TCR=73;TR=66;WE=71406032;WS=71406014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,70:0.34:207
chr16	71411446	rs12445308	G	T	1850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.92;SOR=2.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr16	71411636	rs11545954	G	A	3307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=81;PP=1935;ReadPosRankSum=1.191;SC=GGGCTCCAGCGCCGAGTTTAT;SOR=0.679;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=259;TCF=110;TCR=149;TR=141;WE=71411644;WS=71411626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,156:0.56:279
chr16	71416431	rs12919213	T	C	402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=0;PP=275;SC=ATGAGATCACTGTCGAGATAC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=71416439;WS=71416421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr16	71417783	rs35885273	C	T	1745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.208;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=29;PP=1145;ReadPosRankSum=-0.521;SC=ACGTGTCACCCGTCCTCCTTC;SOR=0.923;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=199;TCF=121;TCR=78;TR=82;WE=71417791;WS=71417773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,87:0.41:211
chr16	71418586	.	ACATG	A	561	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=28;MQ=62.28;NF=10;NR=1;PP=561;QD=53.3636363636;SC=CACACATCACACATGCACACA;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=11;WE=71418597;WS=71418563;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,11:0.79:14
chr16	71419595	rs4327058	A	G	919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.878;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=29;PP=654;ReadPosRankSum=1.341;SC=CCCAGGGCACAGGAGAGGCTT;SOR=0.490;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=90;TCF=25;TCR=65;TR=41;WE=71419603;WS=71419585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,43:0.46:94
chr16	71423487	rs34538886	C	T	1676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.782;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=47;ReadPosRankSum=-1.572;SC=CTTTAACCTCCATCTGTCTGA;SOR=0.524;SbPval=0.47;Source=Platypus;TCF=120;TR=90;WE=71423495;WS=71423477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:192,94:0.33:286
chr16	71464943	rs7195767	A	G	1786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=30;PP=1059;ReadPosRankSum=-1.081;SC=CAGAAAAGGAAAGGGGGGTGA;SOR=0.652;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=182;TCF=108;TCR=74;TR=75;WE=71464951;WS=71464933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,87:0.45:193
chr16	71465613	rs7203200	T	G	2795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=26;PP=1929;SC=AGAGCCTCACTGGCAAGCCCT;SOR=1.825;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=68;TCR=26;TR=94;WE=71465621;WS=71465603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr16	71466088	rs4620964	A	G	16172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=602;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=251;NR=301;PP=2965;SC=TGATGTAGCCAGAGCCACACG;SOR=0.920;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=552;TCF=251;TCR=301;TR=552;WE=71466096;WS=71466078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,602:1.00:602
chr16	71484621	rs66920642	CA	C	411.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=13.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.20;MQRankSum=0.944;QD=8.40;ReadPosRankSum=1.162;SOR=1.379;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,27:0.55:49
chr16	71487206	rs2070832	T	C	1766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=33;PP=951;ReadPosRankSum=1.408;SC=CCCAGCTCACTTCCTCCCTCC;SOR=0.742;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=130;TCF=69;TCR=61;TR=72;WE=71487214;WS=71487196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,82:0.57:144
chr16	71509685	rs2288489	C	G	2752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=43;PP=1598;ReadPosRankSum=-1.477;SC=CGGAACTACTCGTGAAACTAT;SOR=0.682;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=181;TCF=109;TCR=72;TR=108;WE=71509693;WS=71509675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,124:0.60:205
chr16	71509796	rs8050871	C	G	2942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.118;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=60;PP=1915;ReadPosRankSum=-0.411;SC=ACTCCTCACACTGATAGGGTC;SOR=0.511;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=200;TCF=98;TCR=102;TR=120;WE=71509804;WS=71509786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,127:0.59:214
chr16	71570847	rs148657245	G	A	6209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=455;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.536;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=137;NR=125;PP=2962;ReadPosRankSum=0.742;SC=CCGCCTGGATGCTGCACATGG;SOR=0.625;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=422;TCF=222;TCR=200;TR=262;WE=71570855;WS=71570837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,283:0.62:455
chr16	71660115	rs4788820	G	C	4080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.19;SOR=0.796;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
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chr16	71668800	rs7206470	G	A	3159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=65;PP=1869;SC=GAAGTTTCCAGTGCTGGAAAA;SOR=1.510;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=37;TCR=65;TR=102;WE=71668808;WS=71668790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr16	71674882	rs2303225	C	G	4674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=629;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.129;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=116;NR=117;PP=2860;ReadPosRankSum=0.925;SC=GAGAACAGCCCGGAAGTTACA;SOR=0.585;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=581;TCF=280;TCR=301;TR=233;WE=71674890;WS=71674872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:381,248:0.39:629
chr16	71678663	rs3752681	T	C	800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FS=2.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.60;ReadPosRankSum=2.422;SOR=0.537;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:123,51:0.29:174
chr16	71678679	rs7204608	G	C	4797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=73;PP=2296;SC=TGCAGTGTCAGGGAATGTGGT;SOR=0.726;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=161;TCF=88;TCR=73;TR=161;WE=71678687;WS=71678669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr16	71682796	rs61733125	T	C	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=2.509;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=130;ReadPosRankSum=-1.120;SC=GGGGCAGTCATAGTGCTGTGT;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=7;WE=71682804;WS=71682786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr16	71682830	rs61733124	C	T	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.928;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=289;ReadPosRankSum=-0.158;SC=GGGCTCGGTCCGATCCTCTTC;SOR=0.302;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=41;TCF=30;TCR=11;TR=23;WE=71682838;WS=71682820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,27:0.59:46
chr16	71690657	.	CT	C	35.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.243;ClippingRankSum=0.000;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.99;ReadPosRankSum=2.424;SOR=0.169;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr16	71692443	rs2303224	A	G	1039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.312;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=13;PP=786;ReadPosRankSum=-0.856;SC=ATTTTTCCTTATAAGAATAAT;SOR=0.368;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=101;TCF=76;TCR=25;TR=44;WE=71692451;WS=71692433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,44:0.42:104
chr16	71697752	rs1035545	T	C	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.776;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=5;PP=374;ReadPosRankSum=0.749;SC=CTGACAAATATAGAATTAATG;SOR=1.386;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=69;TCF=48;TCR=21;TR=26;WE=71697760;WS=71697742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,30:0.38:80
chr16	71701248	rs1423983	G	A	2655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=53;PP=1451;SC=TAAGGGGGGAGCATACAAACA;SOR=1.469;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=33;TCR=53;TR=86;WE=71701256;WS=71701238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr16	71703436	rs2032918	T	G	1774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=49;PP=1428;SC=TAGGTGCTCATTGAATGCTGC;SOR=3.076;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=10;TCR=49;TR=59;WE=71703444;WS=71703426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr16	71715915	rs11439127	G	GA	341.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.79;ReadPosRankSum=-0.470;SOR=4.047;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,14:0.93:15
chr16	71718366	rs7195059	C	T	4137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=85;NR=53;PP=2234;SC=CAGAACATCCCATTACTTTTC;SOR=1.026;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=138;TCF=85;TCR=53;TR=138;WE=71718374;WS=71718356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr16	71736702	rs10626314	G	GTATTTT	861.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.09;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	71757939	rs7201649	C	G	397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=8;PP=224;SC=AAGCAGCTGCCGGCGCCGAGT;SOR=1.473;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=5;TCR=8;TR=13;WE=71757947;WS=71757929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	71768500	rs2278031	T	C	2021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.414;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=47;PP=1103;ReadPosRankSum=1.233;SC=TGGCTACAAATGTGCTACTCA;SOR=0.604;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=277;TCF=160;TCR=117;TR=108;WE=71768508;WS=71768490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:191,115:0.38:306
chr16	71772795	rs904764	G	A	955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.89;ReadPosRankSum=-1.399;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,38:0.95:40
chr16	71773190	rs904763	G	T	2768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.210;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.094;NF=58;NR=65;PP=1756;ReadPosRankSum=-3.328;SC=CAACAAGAAGGGGGGCTGGGA;SOR=0.871;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=219;TCF=107;TCR=112;TR=123;WE=71773198;WS=71773180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,130:0.55:237
chr16	71773284	rs3838874	C	CA	1801.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.981;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.215;NF=5;NR=33;PP=1472;ReadPosRankSum=-2.114;SC=CCTTAGGCAGCATGACAAAGC;SOR=0.962;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=11;TCR=75;TR=38;WE=71773292;WS=71773274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,61:0.41:149
chr16	71780485	rs2270832	G	A	1146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=22;PP=592;ReadPosRankSum=0.944;SC=AGTTTCTTTCGCTCACCTCAT;SOR=0.726;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=142;TCF=85;TCR=57;TR=56;WE=71780493;WS=71780475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,63:0.40:159
chr16	71780599	rs2270831	T	C	1119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.095;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=30;PP=656;ReadPosRankSum=0.333;SC=AATTCGGCTATAGATAAAATG;SOR=0.510;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=151;TCF=63;TCR=88;TR=54;WE=71780607;WS=71780589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,60:0.38:159
chr16	71784000	rs2270829	A	T	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.515;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=9;PP=363;ReadPosRankSum=0.601;SC=CTAGAGTGTTAGAAATAAAGA;SOR=0.412;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=28;TCF=16;TCR=12;TR=17;WE=71784008;WS=71783990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr16	71784348	rs149580087	C	T	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.767;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=168;ReadPosRankSum=0.397;SC=GACAGAGTCTCGCTCTGTCAC;SOR=2.891;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=9;WE=71784356;WS=71784338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr16	71790166	rs8053186	G	A	756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=22;PP=640;SC=CAGATGTGCTGACGTCCTTGC;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=71790174;WS=71790156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	71792190	rs11866559	G	A	753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=6;PP=443;ReadPosRankSum=-0.259;SC=CTCCACTGAGGGAAGAGATTT;SOR=0.968;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=27;WE=71792198;WS=71792180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,31:0.72:43
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chr16	71800384	rs12930206	T	A	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.895;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=12;PP=195;ReadPosRankSum=-1.236;SC=AAACAAAAGGTTTGCCACAAT;SOR=0.900;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=72;TCF=35;TCR=37;TR=22;WE=71800392;WS=71800374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,26:0.31:85
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chr16	71804956	rs9635524	C	G	6757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=131;NR=81;PP=2965;SC=ACAGCAGAAACGCGACTCCAC;SOR=1.113;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=212;TCF=131;TCR=81;TR=212;WE=71804964;WS=71804946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr16	71805159	rs111908998	TG	T	48.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=1.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.52;ReadPosRankSum=1.621;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,7:0.22:32
chr16	71805160	rs4788443	G	A	527.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.995;HP=10;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=31;PP=394;ReadPosRankSum=-1.552;SC=TGCTGCCTATGAAAAAAAAAA;SOR=1.402;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=46;TCF=10;TCR=36;TR=39;WE=71805168;WS=71805149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,25:0.78:32
chr16	71879868	rs4788563	A	C	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.594;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=213;ReadPosRankSum=-2.502;SC=GGGCGGGACGAGCTTGACGCC;SOR=0.330;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=17;WE=71879876;WS=71879858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr16	71880169	.	T	A	165.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=5;PP=131;SC=CGCGCTTCTCTCTGGCCTGTC;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=71880177;WS=71880159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr16	71913660	rs201654772	CTTT	C	1677.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=8.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.67;MQRankSum=4.948;QD=15.39;ReadPosRankSum=0.535;SOR=0.172;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,49:0.45:109
chr16	71917058	rs2288029	G	A	2000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.564;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=52;PP=1255;ReadPosRankSum=-0.348;SC=CACAGACTTTGGCAAGAAAAA;SOR=0.595;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=233;TCF=100;TCR=133;TR=92;WE=71917066;WS=71917048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,99:0.39:253
chr16	71928850	rs11075908	T	C	753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.181;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=23;PP=565;ReadPosRankSum=0.398;SC=TACTGAATTATACCACACAGA;SOR=1.095;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=72;TCF=25;TCR=47;TR=32;WE=71928858;WS=71928840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,34:0.43:79
chr16	71951094	rs7350856	G	T	1132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.268;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.438;NF=22;NR=34;PP=783;ReadPosRankSum=-0.325;SC=AGAAAGGTTGGTTAATATAAG;SOR=0.838;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=163;TCF=68;TCR=95;TR=56;WE=71951102;WS=71951084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,60:0.33:182
chr16	71951206	rs71391424	T	TAGAAC	300.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.49;MQRankSum=0.674;NF=0;NR=8;PP=396;ReadPosRankSum=0.606;SC=TATCGTAGAATAGAACAGTGT;SOR=1.781;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=8;WE=71951214;WS=71951196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr16	71955400	rs4788450	T	G	921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.634;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=22;PP=497;ReadPosRankSum=0.218;SC=TTTGTAGGTATGACCTTCTTT;SOR=0.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=134;TCF=64;TCR=70;TR=42;WE=71955408;WS=71955390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,52:0.34:152
chr16	71955426	rs56089063	C	CAT	1119.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=580;ReadPosRankSum=-0.100;SC=ACAAAAAAAACATTCTTTGCA;SOR=0.641;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=63;TCF=5;TCR=58;TR=18;WE=71955434;WS=71955416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,33:0.31:108
chr16	71956592	rs75418123	A	AAG,AAGTGTG	5583.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.861;NF=10;NR=47;PP=2971;ReadPosRankSum=-0.466;SC=CAGTAAGTATATATAAGTGTG;SOR=0.537;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=168;TCF=22;TCR=146;TR=57;WE=71956605;WS=71956578;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.47:315
chr16	71956593	rs3038732	T	TGTGG	5583.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FS=3.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.03;MQRankSum=1.090;QD=17.95;ReadPosRankSum=-0.602;SOR=0.520;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:168,143:0.46:311
chr16	71956596	rs2335708	A	G	5080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FS=6.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.76;ReadPosRankSum=-0.929;SOR=0.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:160,126:0.44:286
chr16	71956597	rs2335707	A	T	4912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FS=6.496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.36;ReadPosRankSum=-1.061;SOR=0.434;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:158,125:0.44:283
chr16	71958025	rs74891946	C	G	6634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=513;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=136;NR=145;PP=2962;ReadPosRankSum=1.715;SC=CTGAGTTTTTCTTATGCTTTG;SOR=0.651;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=479;TCF=231;TCR=248;TR=281;WE=71958033;WS=71958015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:208,305:0.59:513
chr16	71981414	rs149635567	C	CTTTG	2429.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.384;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=17;PP=1440;ReadPosRankSum=2.097;SC=CCAAGATCCTCTTTGTTGTTC;SOR=0.952;SbPval=0.06;Source=Platypus;TC=112;TCF=33;TCR=79;TR=32;WE=71981422;WS=71981404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,68:0.33:206
chr16	71981630	rs9934803	T	G	698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=250;ReadPosRankSum=0.950;SC=TAATTTCACATTAATTTTTGC;SOR=0.724;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=15;TCR=33;TR=19;WE=71981638;WS=71981620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,24:0.42:57
chr16	71981652	rs9934812	T	G	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.725;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=238;ReadPosRankSum=0.721;SC=CAATGATGGGTACCAGGAGAA;SOR=1.292;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=13;WE=71981660;WS=71981642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr16	71983772	rs1035543	G	C	1654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=31;PP=1062;ReadPosRankSum=0.123;SC=TCAATTCCAAGCTATAAAGTG;SOR=0.648;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=164;TCF=98;TCR=66;TR=77;WE=71983780;WS=71983762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,83:0.47:178
chr16	71986764	rs11648353	G	A	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.31;ReadPosRankSum=1.408;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr16	71986946	rs7204708	A	G	2291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=52;PP=1378;ReadPosRankSum=-1.017;SC=TGACAGCAGTATGGATGCTGA;SOR=0.678;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=224;TCF=117;TCR=107;TR=108;WE=71986954;WS=71986936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,116:0.47:245
chr16	71986995	rs12708919	G	A	1769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.518;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=45;PP=1044;ReadPosRankSum=0.523;SC=TGGACGCACTGAAAGAAAAGC;SOR=0.743;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=185;TCF=85;TCR=100;TR=82;WE=71987003;WS=71986985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,90:0.44:205
chr16	71987948	.	CA	C	82.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.14;ReadPosRankSum=1.032;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr16	71988106	rs9921412	C	T	1198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.200;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=25;PP=762;ReadPosRankSum=1.311;SC=AGCCGTTGGACCCTTGTAAAC;SOR=0.821;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=164;TCF=95;TCR=69;TR=60;WE=71988114;WS=71988096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,66:0.36:185
chr16	72001110	rs9928413	G	A	1753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=36;PP=1044;ReadPosRankSum=-0.208;SC=TCCAAGTGGTGAGAAGGAAGA;SOR=0.704;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=201;TCF=114;TCR=87;TR=83;WE=72001118;WS=72001100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,90:0.41:222
chr16	72001629	rs12708922	A	G	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.188;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=197;ReadPosRankSum=-1.198;SC=CTCCCAAAGTATTGGGATTAC;SOR=0.169;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=10;WE=72001637;WS=72001623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr16	72001971	rs9930930	A	G	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=203;ReadPosRankSum=-1.021;SC=TGCCTCCTCCAGCTGAGGAGC;SOR=0.986;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=40;TCF=4;TCR=36;TR=13;WE=72001979;WS=72001961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,14:0.32:44
chr16	72003732	rs28629271	C	T	921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.513;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=9;PP=661;ReadPosRankSum=0.042;SC=TTTAATTACTCAAAACATCAT;SOR=1.382;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=142;TCF=100;TCR=42;TR=44;WE=72003740;WS=72003722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,47:0.31:150
chr16	72003952	rs35259348	G	C	2086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.022;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=53;PP=1358;ReadPosRankSum=-1.142;SC=GGCAAAGAAGGTCAGGTGGTT;SOR=0.795;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=222;TCF=101;TCR=121;TR=94;WE=72003960;WS=72003942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,101:0.43:235
chr16	72007232	rs7197967	G	A	1924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.351;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=28;PP=1230;ReadPosRankSum=2.055;SC=CTTGGCATCCGGCGCTGCTCC;SOR=0.572;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=146;TCF=98;TCR=48;TR=83;WE=72007240;WS=72007222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,89:0.58:153
chr16	72011040	rs3929023	A	G	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=1.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.99;ReadPosRankSum=1.847;SOR=1.345;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,8:0.24:33
chr16	72011181	rs1559401	G	T	3778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.254;HP=2;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=33;PP=2962;ReadPosRankSum=0.284;SC=TCAGGTGGAAGTGAGTGCAGT;SOR=0.855;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=215;TCF=134;TCR=81;TR=92;WE=72011201;WS=72011171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,100:0.42:238
chr16	72011193	rs1559400	A	C	3826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.158;HP=2;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=37;PP=2962;ReadPosRankSum=0.967;SC=GAGTGCAGTTAGGCTGATACT;SOR=0.855;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=228;TCF=138;TCR=90;TR=98;WE=72011201;WS=72011171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,107:0.42:254
chr16	72011261	rs1559399	A	G	2468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.520;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=59;PP=1662;ReadPosRankSum=2.275;SC=CTCACTATCAAGGATTTCTCC;SOR=0.694;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=286;TCF=149;TCR=137;TR=115;WE=72011269;WS=72011251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,120:0.39:305
chr16	72011450	rs1559398	G	A	876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=1.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.69;MQRankSum=2.036;QD=23.07;ReadPosRankSum=2.641;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,24:0.63:38
chr16	72011456	rs139541803	G	GGTCTTC	816.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.00;MQRankSum=1.833;QD=25.52;ReadPosRankSum=2.093;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,22:0.69:32
chr16	72012072	rs8053841	C	T	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=313;ReadPosRankSum=-0.409;SC=TAACATAATTCCCTTTAAGTT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=16;WE=72012080;WS=72012062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chr16	72012374	.	A	ATATGTGTGTG	270	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MMLQ=25;MQ=62.07;NF=0;NR=11;PP=270;QD=25.0909090909;SC=ATATGTATATATGTGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=11;WE=72012382;WS=72012364;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:24,11:0.31:35
chr16	72012396	rs2113217	A	G	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.45;MQRankSum=2.458;QD=6.52;ReadPosRankSum=1.615;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr16	72012398	rs2878405	A	G	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.416;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.45;MQRankSum=2.458;QD=8.67;ReadPosRankSum=1.615;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr16	72012400	rs62053844	A	G	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.89;MQRankSum=2.253;QD=10.25;ReadPosRankSum=1.104;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr16	72012402	rs62053845	A	G	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.497;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.51;MQRankSum=1.981;QD=13.20;ReadPosRankSum=0.475;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr16	72013797	rs7185272	G	C	3484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=470;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.808;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=83;PP=2178;ReadPosRankSum=1.360;SC=CAGCGGTAAAGTTGATATGTT;SOR=0.814;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=441;TCF=218;TCR=223;TR=158;WE=72013805;WS=72013787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:294,175:0.37:469
chr16	72018099	rs12443563	C	T	805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.113;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=26;PP=529;ReadPosRankSum=0.379;SC=CAAAATTACTCATACAAAATT;SOR=0.398;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=74;TCF=19;TCR=55;TR=37;WE=72018107;WS=72018089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,39:0.45:86
chr16	72020294	rs4788590	G	A	943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=23;PP=600;ReadPosRankSum=-2.207;SC=GTTCAGATGCGGCTGATGTTA;SOR=0.641;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=136;TCF=66;TCR=70;TR=46;WE=72020302;WS=72020284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,51:0.35:145
chr16	72020323	rs4788591	A	G	708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.348;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=22;PP=445;ReadPosRankSum=0.163;SC=GTGATACTTGATAGTACTGAA;SOR=0.467;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=131;TCF=58;TCR=73;TR=42;WE=72020331;WS=72020313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,44:0.31:141
chr16	72027319	rs141893694	TAATC	T	223.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=247;ReadPosRankSum=-1.762;SC=ACGTATGTGATAATCAGGAAA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=7;WE=72027330;WS=72027309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr16	72032231	rs16973585	T	A	2133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=46;PP=1277;ReadPosRankSum=1.665;SC=GAGATCCGAATGAAGTTTCTG;SOR=0.732;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=156;TCF=74;TCR=82;TR=88;WE=72032239;WS=72032221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,98:0.58:170
chr16	72042635	rs34270657	A	G	1182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.245;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=20;PP=600;ReadPosRankSum=1.691;SC=TGGAAGGGAGACAGGGGCGGG;SOR=0.519;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=67;TCR=43;TR=51;WE=72042643;WS=72042625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,60:0.47:127
chr16	72042682	rs3213422	A	C	1539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=30;PP=966;ReadPosRankSum=1.416;SC=GAGACACCTGAAAGTGAGTCC;SOR=0.721;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=120;TCF=65;TCR=55;TR=63;WE=72042690;WS=72042672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,71:0.53:135
chr16	72042825	rs3213423	T	G	440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=14;PP=362;SC=GTTTCCGGGGTCTCCTGCAAA;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=72042833;WS=72042815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	72046268	rs1465457	C	G	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.681;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=160;ReadPosRankSum=1.602;SC=CCCAAGTGAGCAGTGGGGATT;SOR=0.129;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=11;WE=72046276;WS=72046258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr16	72048332	rs3764310	T	C	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.876;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=367;ReadPosRankSum=0.719;SC=AATACCGGGATAGCCTTAGCG;SOR=0.169;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=20;WE=72048340;WS=72048322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,23:0.55:42
chr16	72048632	rs8062895	A	G	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=336;ReadPosRankSum=1.398;SC=GCGTTCAGAGATATAAGATCT;SOR=0.722;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=20;WE=72048640;WS=72048622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,21:0.75:28
chr16	72050885	rs11075914	G	C	1722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=9;PP=1237;SC=CTATGGTGCCGTCTCACTCTG;SOR=2.546;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=47;TCR=9;TR=56;WE=72050893;WS=72050875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr16	72054984	rs1862752	G	T	1376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=27;PP=780;ReadPosRankSum=0.990;SC=GCACAGGAAAGGGTGTGCGGG;SOR=0.653;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=208;TCF=126;TCR=82;TR=72;WE=72054992;WS=72054974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,78:0.35:223
chr16	72057282	rs2288002	A	G	1347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.289;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=35;PP=892;ReadPosRankSum=-0.526;SC=TCGTGATGGGAATCATCATTC;SOR=0.832;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=144;TCF=59;TCR=85;TR=57;WE=72057290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,65:0.40:162
chr16	72088467	rs5472	A	G	684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.48;BaseQRankSum=0.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.734;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.664;NF=22;NR=15;PP=421;ReadPosRankSum=1.009;SC=CGAAATGGAGAAGGGGGAGAA;SOR=0.570;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=126;TCF=77;TCR=49;TR=37;WE=72088475;WS=72088457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,39:0.32:123
chr16	72088652	rs9927981	C	T	973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FS=1.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQRankSum=-0.324;QD=4.37;ReadPosRankSum=0.711;SOR=0.559;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:162,61:0.27:223
chr16	72088675	rs4788458	T	C	2019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.505;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.973;NF=28;NR=60;PP=1160;ReadPosRankSum=0.995;SC=TAAATTATAGTGAACCAAAGG;SOR=0.553;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=135;TCF=43;TCR=92;TR=88;WE=72088683;WS=72088665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,96:0.66:145
chr16	72089958	rs148260617	ATG	A	153.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=3.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.14;MQRankSum=2.363;QD=2.00;ReadPosRankSum=0.161;SOR=1.385;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,12:0.16:77
chr16	72092017	rs2070938	A	T	259.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=182;SC=ATTGTTTAAAAATAATACAGT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=72092025;WS=72092014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	72110948	rs12646	C	G	684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FS=5.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.42;MQRankSum=-0.909;QD=2.45;ReadPosRankSum=-1.943;SOR=1.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:227,53:0.19:280
chr16	72123992	rs7191127	G	T	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=9;PP=366;ReadPosRankSum=0.130;SC=TCTTACACGGGATGGTAGCAG;SOR=0.672;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=62;TCR=28;TR=28;WE=72124000;WS=72123982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,28:0.29:96
chr16	72124157	rs7190995	A	G	1180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.511;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-0.680;NF=37;NR=41;PP=758;ReadPosRankSum=0.463;SC=CCTGTGGGAAATTACTTGACC;SOR=0.645;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=249;TCF=116;TCR=133;TR=78;WE=72124165;WS=72124147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,75:0.32:233
chr16	72124219	rs7192730	T	C	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.764;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=27;PP=522;ReadPosRankSum=-0.431;SC=TATCCCACTATTGCGAGCACT;SOR=0.966;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=125;TCF=42;TCR=83;TR=39;WE=72124227;WS=72124209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,32:0.30:108
chr16	72124495	rs2303285	A	C	1835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.201;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=32;PP=1115;ReadPosRankSum=1.272;SC=ATAAAAACCAATTATTTTAGA;SOR=0.331;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=156;TCF=102;TCR=54;TR=79;WE=72124503;WS=72124485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,86:0.52:166
chr16	72130203	rs1050361	C	G	1191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.175;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=26;PP=756;ReadPosRankSum=0.751;SC=CTTCATTACTCGGACTGGACT;SOR=0.600;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=179;TCF=104;TCR=75;TR=60;WE=72130211;WS=72130193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,66:0.34:194
chr16	72130815	rs1050362	C	A	1530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.819;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=27;PP=1029;ReadPosRankSum=-1.432;SC=GCGGGAGCGGCGGGAACATGG;SOR=1.146;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=203;TCF=122;TCR=81;TR=75;WE=72130823;WS=72130805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,81:0.36:227
chr16	72131740	rs34749771	ACT	A	1592.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.785;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=24;PP=1085;ReadPosRankSum=-0.930;SC=AGAGTGAGTGACTCTCGTCTT;SOR=0.473;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=66;TCF=4;TCR=62;TR=27;WE=72131749;WS=72131730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,43:0.46:94
chr16	72132356	rs11862813	C	T	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=99;ReadPosRankSum=0.297;SC=AGGAAAAATACATCCTGGACC;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=8;WE=72132364;WS=72132353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr16	72132713	rs2072142	C	T	2688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.407;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=62;PP=1678;ReadPosRankSum=0.267;SC=GGCAGAGCAGCCCAGTTTCGC;SOR=0.660;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=306;TCF=154;TCR=152;TR=130;WE=72132721;WS=72132703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:188,136:0.42:324
chr16	72133211	rs2072141	G	A	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.950;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=12;PP=315;ReadPosRankSum=0.008;SC=GGGCTGATCGGGGCTGGTGGC;SOR=0.844;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=54;TCF=28;TCR=26;TR=23;WE=72133219;WS=72133201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,26:0.40:65
chr16	72135014	rs1050363	T	C	2823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=404;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.158;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=58;PP=1937;ReadPosRankSum=1.139;SC=TGAAGGATGCTACTTCTGACC;SOR=0.813;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=377;TCF=211;TCR=166;TR=137;WE=72135022;WS=72135004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:257,146:0.36:403
chr16	72135319	rs8043606	T	C	798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=13;PP=532;ReadPosRankSum=0.358;SC=CGGGGTGAAGTCTGCTCTCCC;SOR=0.758;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=85;TCF=54;TCR=31;TR=38;WE=72135327;WS=72135309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,40:0.47:86
chr16	72137561	rs2240243	G	A	2053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.398;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=48;PP=1234;ReadPosRankSum=-1.321;SC=CTCAGCTGACGCAGTACCTGC;SOR=0.591;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=282;TCF=155;TCR=127;TR=102;WE=72137569;WS=72137551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:202,114:0.36:316
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chr16	72139537	rs42544	T	C	6922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=112;NR=127;PP=2965;SC=AGAGAAGACATGGGAGGCAAG;SOR=0.935;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=239;TCF=112;TCR=127;TR=239;WE=72139545;WS=72139527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr16	72141640	rs11554765	C	T	1269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.293;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=34;PP=730;ReadPosRankSum=1.141;SC=GGCTGCAGCTCCGAGATCCTG;SOR=0.586;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=142;TCF=60;TCR=82;TR=61;WE=72141648;WS=72141630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,66:0.43:155
chr16	72142072	rs8051882	C	T	716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.973;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=8;PP=523;ReadPosRankSum=-0.319;SC=GGGATGTGCTCAGTGGGCCTG;SOR=0.853;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=63;TCF=48;TCR=15;TR=32;WE=72142080;WS=72142062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,33:0.46:72
chr16	72142895	rs9926156	G	C	893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.633;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=25;PP=577;ReadPosRankSum=0.000;SC=CCTTCACTGCGTTCTGGCATG;SOR=0.323;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=83;TCF=29;TCR=54;TR=42;WE=72142903;WS=72142885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,43:0.48:89
chr16	72146441	rs7940	C	G	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=306;ReadPosRankSum=-0.927;SC=ATTGGGTCCTCAGCCTTCTGG;SOR=0.446;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=7;TCR=34;TR=17;WE=72146449;WS=72146431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,17:0.44:39
chr16	72146570	rs6680	T	C	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=245;ReadPosRankSum=-1.325;SC=GGTGGAGTTCTTCCATGCAGG;SOR=0.722;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=56;TCF=45;TCR=11;TR=17;WE=72146578;WS=72146560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,18:0.30:60
chr16	72157000	rs12935266	C	G	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.299;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=94;ReadPosRankSum=0.708;SC=CTGCATCCCACGTCCCCCACG;SOR=0.223;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=7;WE=72157008;WS=72156990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr16	72157384	rs4788606	T	G	1045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.515;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=12;PP=733;ReadPosRankSum=-0.906;SC=TTGGCACGCATGTGGCTCCTC;SOR=0.982;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=123;TCF=86;TCR=37;TR=48;WE=72157392;WS=72157374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,49:0.39:127
chr16	72158950	rs3812986	T	C	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.894;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=265;ReadPosRankSum=-0.825;SC=TATTTTCTTCTCAGTGGCCAG;SOR=0.307;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=15;WE=72158958;WS=72158940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
chr16	72162978	rs372243897	T	C	1200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.562;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=14;PP=751;ReadPosRankSum=-0.559;SC=CTTGTCTTTCTTTTTAAATTC;SOR=0.549;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=109;TCF=80;TCR=29;TR=49;WE=72162986;WS=72162968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,56:0.46:122
chr16	72198958	.	C	G	673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.626;ClippingRankSum=0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=21;PP=477;ReadPosRankSum=1.288;SC=TCCTGTGTAACATTTACACAG;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=48;TCF=7;TCR=41;TR=24;WE=72198966;WS=72198948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,27:0.50:54
chr16	72822563	.	TTGCTGC	T,TTGCTGCTGC	2127.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.325;ClippingRankSum=0.000;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.270;NF=17,17;NR=15,15;PP=1379,2373;ReadPosRankSum=-1.545;SC=GCACCTGTGGTTGCTGCTGCT;SOR=0.693;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=47;TCF=22;TCR=25;TR=32,32;WE=72822576;WS=72822553;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.57,0.41:56
chr16	72827758	rs699444	T	C	1911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.746;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=41;PP=1227;ReadPosRankSum=1.836;SC=CAGGCCGATCTCCGCTGTCAC;SOR=0.564;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=185;TCF=104;TCR=81;TR=88;WE=72827766;WS=72827748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,93:0.47:198
chr16	72828403	rs2229286	A	G	1950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.949;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=41;PP=1429;ReadPosRankSum=-1.700;SC=TATGAGCCTCAAGAGCAGTCT;SOR=0.785;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=266;TCF=155;TCR=111;TR=101;WE=72828411;WS=72828393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:186,103:0.36:289
chr16	72832135	rs740178	T	A	1305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.588;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=27;PP=735;ReadPosRankSum=0.775;SC=TATGGTCCTCTGCCAGAGTGG;SOR=0.639;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=144;TCF=72;TCR=72;TR=57;WE=72832143;WS=72832125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,65:0.40:161
chr16	72991286	rs2157786	C	T	1214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.244;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=22;PP=674;ReadPosRankSum=-0.053;SC=CCTGGTTAAACTCCTATCATG;SOR=0.586;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=153;TCF=91;TCR=62;TR=57;WE=72991294;WS=72991276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,66:0.39:168
chr16	72991660	rs10852515	C	G	1596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.298;HP=2;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=36;PP=1060;ReadPosRankSum=-0.385;SC=TTGGTTTGGTCGGCGAGGGGG;SOR=0.852;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=141;TCF=63;TCR=78;TR=62;WE=72991668;WS=72991650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,69:0.45:153
chr16	72991715	rs4788682	A	G	1041.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=18;PP=704;ReadPosRankSum=-1.398;SC=CGCCGCAGCCACCGCCGCCGC;SOR=0.706;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=128;TCF=79;TCR=49;TR=49;WE=72991725;WS=72991702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,55:0.40:137
chr16	72992221	rs61735550	G	A	2179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.545;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=55;PP=1369;ReadPosRankSum=-1.258;SC=CACCCTCTGTGCTTTCATTTG;SOR=0.616;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=278;TCF=151;TCR=127;TR=110;WE=72992229;WS=72992211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:192,116:0.38:308
chr16	73126858	rs7189194	T	G	6121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=128;NR=75;PP=2965;SC=TATCCCTTCGTTTATGCTCTG;SOR=1.322;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=204;TCF=128;TCR=76;TR=203;WE=73126880;WS=73126848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr16	73517250	rs147828241	A	AAG	1047.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=3.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.98;MQRankSum=5.841;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.537;SOR=1.144;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,42:0.41:102
chr16	74320977	rs112297841	CA	C	400.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=5.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.89;ReadPosRankSum=1.772;SOR=0.287;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,29:0.43:68
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chr16	74366672	rs3743923	G	A	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.903;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-6.403;NF=2;NR=22;PP=375;ReadPosRankSum=-1.244;SC=GGAGACAGACGTCAAGGCAAG;SOR=1.204;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=69;TCF=6;TCR=63;TR=24;WE=74366680;WS=74366662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,22:0.36:61
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chr16	74443433	.	C	G	642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.862;ClippingRankSum=0.000;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.45;MQRankSum=-0.952;QD=8.93;ReadPosRankSum=1.262;SOR=0.257;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,25:0.35:72
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chr16	74490789	rs12446054	G	A	568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=15;PP=406;SC=TACATACTAGGAAACTTGATC;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=74490797;WS=74490779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	74493752	rs71158515	C	CT	1184.50	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.6857;FS=1.444;HP=14;HapScore=3;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=30;PP=475;ReadPosRankSum=0.850;SC=ACAGTTTCTTCTTTTTTTTTT;SOR=1.047;SbPval=0.07;Source=Platypus;TC=83;TCF=5;TCR=78;TR=35;WE=74493760;WS=74493742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,57:0.85:67
chr16	74503031	rs2303277	G	T	980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.871;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=33;PP=748;ReadPosRankSum=-0.847;SC=CTGGGCTTGGGGGGGGTCACA;SOR=1.814;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=60;TCF=14;TCR=46;TR=40;WE=74503039;WS=74503021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,40:0.66:61
chr16	74503860	rs2303278	T	A	10833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=399;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=205;NR=169;PP=2965;SC=GAAAGTGGAATGAAACAACTA;SOR=0.848;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=374;TCF=205;TCR=169;TR=374;WE=74503872;WS=74503850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,399:1.00:399
chr16	74504005	rs2303279	T	C	9691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=368;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=143;NR=185;PP=2965;SC=TCAGAAGTTTTGTGGCAACTT;SOR=0.974;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=328;TCF=143;TCR=185;TR=328;WE=74504013;WS=74503995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,368:1.00:368
chr16	74504052	rs3217262	C	CTCT	4324.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.660;NF=2;NR=51;PP=2686;ReadPosRankSum=-1.889;SC=TTTCATATAGCTCTCACAAGC;SOR=0.685;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=117;TCF=5;TCR=112;TR=53;WE=74504060;WS=74504042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,110:0.60:184
chr16	74504097	rs12716764	G	C	3349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=67;PP=2005;SC=TGACCCACACGTGAGACATCA;SOR=2.915;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=14;TCR=67;TR=81;WE=74504105;WS=74504087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr16	74530611	rs34221253	T	TACAC	432.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.27;MQRankSum=-0.000;QD=30.91;ReadPosRankSum=0.967;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,13:0.93:14
chr16	74566091	.	AATAT	A	369.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.22;QD=36.97;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr16	74729262	rs35589326	A	G	1273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.472;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=22;PP=666;ReadPosRankSum=0.631;SC=TGTGCCCAGGACGCTCCTTGG;SOR=0.473;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=162;TCF=102;TCR=60;TR=57;WE=74729270;WS=74729252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,70:0.36:194
chr16	74750405	rs2301865	G	A	8971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=149;NR=153;PP=2965;SC=CTACTGCCTCGGGCAGGATGA;SOR=0.780;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=302;TCF=149;TCR=153;TR=302;WE=74750413;WS=74750395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,334:1.00:334
chr16	74760292	rs11295057	CT	C	280.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=3;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;NF=0;NR=19;PP=345;SC=GTACAGCTTTCTTTTTTTTTT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=19;WE=74760301;WS=74760282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr16	74908439	rs2870148	C	T	3133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=78;PP=2115;SC=GTCTTCCTCTCAAGACTCTAG;SOR=2.045;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=30;TCR=78;TR=108;WE=74908447;WS=74908429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr16	74920191	rs14308	G	A	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=2.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.08;MQRankSum=-0.662;QD=4.94;ReadPosRankSum=2.667;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,44:0.31:140
chr16	74920374	rs4888305	C	T	261.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=7;PP=165;SC=TAAGACAGCACGTGGCCAATG;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=74920382;WS=74920364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	74921661	rs9940014	A	T	1609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.557;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=44;PP=1029;ReadPosRankSum=0.049;SC=AGGCTACAGAAGGGAAGAGAA;SOR=0.768;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=170;TCF=69;TCR=101;TR=74;WE=74921669;WS=74921651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,79:0.42:187
chr16	74923437	rs148567787	T	C	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=287;ReadPosRankSum=-0.264;SC=CTATAAGAAGTTTGTTCTGCA;SOR=0.484;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=15;WE=74923445;WS=74923427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
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chr16	74926520	rs11149776	C	T	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=24;PP=480;ReadPosRankSum=1.306;SC=CCCAAATCAACGACTCCCAGT;SOR=0.938;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=58;TCF=4;TCR=54;TR=25;WE=74926528;WS=74926510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,30:0.48:63
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chr16	75148604	rs755099	G	A	928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.371;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=14;PP=501;ReadPosRankSum=0.234;SC=GCGTACAGAAGGCAGCCTCAG;SOR=0.873;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=141;TCF=85;TCR=56;TR=41;WE=75148612;WS=75148594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,48:0.30:161
chr16	75149619	rs13330129	C	T	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.413;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=362;ReadPosRankSum=-1.344;SC=ACAGCCCTGCCCCAGTGTCGG;SOR=1.893;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=18;WE=75149627;WS=75149609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,21:0.75:28
chr16	75186727	rs11859007	G	A	6222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=129;NR=83;PP=2965;SC=GTCTCTAGGGGTTTCTAAACA;SOR=1.149;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=212;TCF=129;TCR=83;TR=212;WE=75186735;WS=75186717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr16	75200378	rs9929570	T	C	683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=4;PP=502;SC=CCCGCCCACCTAGCCTCCCAA;SOR=2.400;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=21;WE=75200386;WS=75200368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	75200407	rs11865310	G	C	2157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.91;SOR=2.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr16	75200416	rs7200789	T	C	2459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.00;SOR=2.080;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr16	75200595	rs71380707	CAT	C	1157.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=3.305;NF=6;NR=18;PP=809;ReadPosRankSum=-2.126;SC=TGATGAATGACATAAAGTTTT;SOR=0.774;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=70;TCF=19;TCR=51;TR=24;WE=75200604;WS=75200585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,35:0.37:95
chr16	75202998	rs12716783	A	C	1114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=5;PP=848;SC=GTTTGAAAGGAAACATTTGCA;SOR=3.500;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=34;WE=75203006;WS=75202988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr16	75204282	rs764551	C	A	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.644;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=326;ReadPosRankSum=-0.434;SC=ACTCTTCAAGCGGGTGAAAAA;SOR=0.250;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=19;WE=75204290;WS=75204272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,20:0.83:24
chr16	75238103	rs4737	C	T	6777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=131;NR=97;PP=2965;SC=ATGAGCTTGGCGACACGGGCG;SOR=0.872;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=229;TCF=131;TCR=98;TR=228;WE=75238111;WS=75238093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr16	75263974	rs6564241	T	C	2550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=48;PP=1484;SC=GAGTTGGAACTACAGGCCGAG;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=26;TCR=48;TR=74;WE=75263982;WS=75263964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr16	75267676	rs4888361	A	G	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=5;PP=544;SC=TCGGCCCTGCAGGGCAAGAGC;SOR=2.546;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=29;WE=75267684;WS=75267666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
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chr16	75276295	rs7195938	A	G	1358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=14;PP=905;ReadPosRankSum=0.500;SC=GGGTGGCTGGACCCTTCTGTG;SOR=1.157;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=48;TCF=32;TCR=16;TR=45;WE=75276303;WS=75276284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,50:0.96:52
chr16	75276775	rs1035539	G	A	1678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=20;PP=989;SC=GGAGGGCCGGGGCCAGGCCCT;SOR=1.092;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=36;TCR=20;TR=56;WE=75276783;WS=75276765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr16	75277344	rs4888363	A	T	7082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=122;NR=111;PP=2965;SC=ATCACGACAAAGCTGCCAAGT;SOR=0.746;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=233;TCF=122;TCR=111;TR=233;WE=75277352;WS=75277334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,269:1.00:269
chr16	75281964	rs1862737	A	C	12436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=485;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=223;NR=224;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.886;SC=CCATCTTACTAGACAGGAAAA;SOR=0.311;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=452;TCF=226;TCR=226;TR=447;WE=75281972;WS=75281954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,479:1.00:480
chr16	75285164	rs1862738	A	C	1577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=14;PP=1086;SC=CCGCCAACGCACCCGAGGCGC;SOR=1.781;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=39;TCR=14;TR=53;WE=75285172;WS=75285154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr16	75299928	rs117263010	C	A	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.076;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.25;ReadPosRankSum=-2.166;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
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chr16	75301605	rs9319482	A	G	251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.98;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	75327916	rs6624	A	G	11092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=402;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=164;NR=210;PP=2965;SC=CCACTCGGTCAAGGAAGGCTT;SOR=1.011;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=374;TCF=164;TCR=210;TR=374;WE=75327924;WS=75327906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,402:1.00:402
chr16	75338855	rs3743607	C	T	5710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=128;NR=61;PP=2965;SC=GGCAGTTTGTCTCCAATAAAT;SOR=1.633;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=190;TCF=128;TCR=62;TR=189;WE=75338863;WS=75338845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr16	75339131	rs7192981	T	G	2048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=43;PP=1323;SC=CTGATCTCTATATTAACAGTT;SOR=1.745;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=19;TCR=43;TR=62;WE=75339139;WS=75339121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr16	75445605	rs1109341	G	A	1205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=14;PP=822;SC=TTGAGTTCAAGTATAACTCTC;SOR=1.508;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=29;TCR=14;TR=43;WE=75445613;WS=75445595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr16	75445675	rs1109342	G	A	3672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=59;PP=2288;SC=AGAGAGAGACGCTCATTTTTG;SOR=0.965;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=137;TCF=78;TCR=59;TR=137;WE=75445683;WS=75445665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr16	75445906	rs247435	C	T	679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=16;PP=425;SC=ATATTGTTTACAGATACTTTT;SOR=2.215;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=22;WE=75445926;WS=75445896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr16	75448273	rs8056236	C	T	705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=0;PP=534;SC=TACCTATTAACATTTTCTTTA;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=75448281;WS=75448271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	75448659	rs8051407	A	G	717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=20;PP=535;SC=AGACATTTTCATTAATACAAG;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=75448667;WS=75448649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	75467076	rs3833048	G	GC	483.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=5;PP=415;SC=GAGAACAGGAGCCCCCCTGGA;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=13;WE=75467084;WS=75467066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr16	75498252	rs150429885	C	CT	6837.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=47;PP=2828;SC=CGGAGGACAGCGCCCACGCCG;SOR=0.892;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=74;TCF=17;TCR=57;TR=64;WE=75498261;WS=75498242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr16	75498253	rs34904236	G	T	6846.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=50;PP=1795;SC=GGAGGACAGCGCCCACGCCGC;SOR=0.892;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=99;TCF=47;TCR=52;TR=96;WE=75498261;WS=75498242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr16	75563330	rs3826107	G	A	5340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=402;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=105;NR=120;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.864;SC=GAGCTGTGGCGTGAGGGTCAG;SOR=0.676;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=376;TCF=172;TCR=204;TR=225;WE=75563338;WS=75563320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,242:0.61:399
chr16	75563746	rs8048818	T	G	9277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=596;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.468;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.679;NF=178;NR=198;PP=2962;ReadPosRankSum=0.841;SC=CCAGGCTGAATGGCTGCCGCG;SOR=0.692;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=558;TCF=275;TCR=283;TR=376;WE=75563754;WS=75563733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:196,400:0.67:596
chr16	75564287	rs3784932	T	C	1515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.463;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=38;PP=819;ReadPosRankSum=0.481;SC=GCCCATCCCATGCCCCAATTA;SOR=0.492;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=109;TCF=43;TCR=66;TR=65;WE=75564295;WS=75564277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,73:0.61:120
chr16	75565420	rs2641806	A	G	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=229;ReadPosRankSum=0.445;SC=GATGGAGCCCAAGAAGCAGAG;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=13;WE=75565428;WS=75565410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr16	75575410	rs7202717	G	A	2434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.618;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=53;PP=1484;ReadPosRankSum=1.631;SC=GGCAGTTGAAGGCTATAAAGA;SOR=0.896;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=159;TCF=73;TCR=86;TR=95;WE=75575418;WS=75575400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,108:0.59:183
chr16	75579233	rs2738801	A	T	2066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.103;NF=57;NR=30;PP=1319;ReadPosRankSum=-1.105;SC=GAGCTGGACAATGAGAAGCGC;SOR=0.740;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=147;TCF=95;TCR=52;TR=87;WE=75579241;WS=75579223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,94:0.58:162
chr16	75579470	rs200769675	T	G	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.50;QD=20.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr16	75579924	rs8055668	A	C	3783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=-1.712;NF=91;NR=79;PP=2464;ReadPosRankSum=1.485;SC=CACTTCTGTAAATACACAATG;SOR=0.691;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=324;TCF=175;TCR=149;TR=170;WE=75579932;WS=75579914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,181:0.52:345
chr16	75590113	rs3743602	C	G	3203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.643;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=63;PP=1956;ReadPosRankSum=0.626;SC=GCCATGAGCACCGCTCGCAGG;SOR=0.541;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=215;TCF=110;TCR=105;TR=136;WE=75590121;WS=75590103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,147:0.63:233
chr16	75634014	rs7206481	A	G	1802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.571;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=24;PP=1111;ReadPosRankSum=0.314;SC=CTCAGAAAGAATGTTCCCTGA;SOR=0.901;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=105;TCF=67;TCR=38;TR=70;WE=75634022;WS=75634004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,75:0.64:118
chr16	75646685	rs3743598	G	T	3425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=67;PP=1977;ReadPosRankSum=0.090;SC=GATGAGTTGTGGGCCCAATTT;SOR=0.677;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=243;TCF=123;TCR=120;TR=136;WE=75646693;WS=75646675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,154:0.57:270
chr16	75652359	rs138033682	A	C	172.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=21.60;ReadPosRankSum=-0.619;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr16	75652359	.	AT	CC	576	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=36;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=14;NR=1;PP=576;QD=41.9645249908;SC=AGCTGAGATCATGCCACTGCA;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=15;WE=75652368;WS=75652349;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr16	75652360	rs149521513	T	C	172.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=21.60;ReadPosRankSum=-0.619;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr16	75654031	rs11648478	A	T	1288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-4.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.377;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=4;PP=830;ReadPosRankSum=0.463;SC=GGTCCTTCCAACTGGACTGAT;SOR=1.038;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=77;TCF=69;TCR=8;TR=47;WE=75654039;WS=75654021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,51:0.61:83
chr16	75665019	rs7189895	A	G	2482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.840;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=41;PP=1436;ReadPosRankSum=-0.108;SC=AGAGGGAACCATTCAGCACCA;SOR=0.846;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=172;TCF=99;TCR=73;TR=103;WE=75665027;WS=75665009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,115:0.61:188
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chr16	75681420	rs117457640	T	C	1840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.065;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=30;PP=1086;ReadPosRankSum=0.007;SC=CTCGCGGCGCTTCCCAGCCCA;SOR=0.910;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=204;TCF=127;TCR=77;TR=85;WE=75681434;WS=75681410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,93:0.41:227
chr16	75703213	rs199883674	T	TA	478.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=8.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.94;ReadPosRankSum=-1.798;SOR=0.120;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,27:0.73:37
chr16	75728352	.	G	A	4862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.504;ClippingRankSum=0.000;DP=404;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=105;NR=111;PP=2950;ReadPosRankSum=-0.324;SC=CATTTGGGTCGTCTACCAATA;SOR=0.723;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=378;TCF=184;TCR=194;TR=216;WE=75728360;WS=75728342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,228:0.57:402
chr16	75730037	rs5817959	T	TA	1036.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-2.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.901;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.433;NF=0;NR=25;PP=854;ReadPosRankSum=0.777;SC=CAGAAGCTGTTGGGGAATTTT;SOR=0.870;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=77;TCF=4;TCR=73;TR=25;WE=75730045;WS=75730027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,36:0.34:105
chr16	75794738	rs7205764	T	C	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=2.321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.56;ReadPosRankSum=-0.148;SOR=0.477;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:129,41:0.24:170
chr16	76311602	rs59314262	G	GT	13340.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=365;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=115;PP=2957;SC=CGCTACTTCTGTATCTACTCA;SOR=0.756;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=172;TCF=50;TCR=122;TR=163;WE=76311610;WS=76311592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,357:1.00:357
chr16	76343767	rs9927750	C	T	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.872;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=111;ReadPosRankSum=0.072;SC=CTCTTGCAGCCGCCATGATTC;SOR=1.802;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=41;TCF=33;TCR=8;TR=9;WE=76343775;WS=76343757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,9:0.20:46
chr16	76343812	rs8053810	GG	AA	1041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=13;PP=839;ReadPosRankSum=-0.017;SC=CTGTGAGTCCGGTTAAGTCTC;SOR=0.685;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=84;TCF=50;TCR=34;TR=29;WE=76343821;WS=76343802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,30:0.33:90
chr16	76350438	rs747980	C	T	1364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.789;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=32;PP=775;ReadPosRankSum=-2.243;SC=TGCTTTTCTCCTCTGACTGGC;SOR=0.570;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=203;TCF=97;TCR=106;TR=71;WE=76350446;WS=76350428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,79:0.35:223
chr16	76389441	rs2866712	G	A	1810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.596;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=55;PP=1179;ReadPosRankSum=-1.295;SC=TAGTCTCTCGGGGAAAAAGTA;SOR=0.832;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=233;TCF=101;TCR=132;TR=94;WE=76389449;WS=76389431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,96:0.38:250
chr16	76461273	rs7192076	A	C	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.537;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=386;ReadPosRankSum=-0.356;SC=ACACATTGCTAATAGACATTA;SOR=1.048;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=60;TCF=53;TCR=7;TR=21;WE=76461281;WS=76461263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,22:0.35:63
chr16	76461519	rs9927638	C	A	944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.375;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=29;PP=525;ReadPosRankSum=0.477;SC=TTATCCAATACACTGACATAG;SOR=0.856;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=148;TCF=54;TCR=94;TR=44;WE=76461527;WS=76461509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,53:0.31:170
chr16	76461588	rs9938200	A	G	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.05;ReadPosRankSum=-0.655;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,7:0.19:37
chr16	76482546	rs56137120	C	T	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.244;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=10;NR=0;PP=163;ReadPosRankSum=-0.073;SC=GTATTTGAAACGGAATGCGTA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=10;WE=76482554;WS=76482536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr16	76482605	.	CT	C	131.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.861;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=1.373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.86;ReadPosRankSum=1.253;SOR=0.951;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,13:0.28:46
chr16	76482910	rs3947083	G	A	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=298;ReadPosRankSum=0.440;SC=TAATCTCCCAGAGGAAAATAC;SOR=0.260;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=15;WE=76482918;WS=76482900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr16	76495831	.	C	CT	1829.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=0.000;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.928;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=17;PP=2210;ReadPosRankSum=0.635;SC=AGAGCGATCTCTAACTGATTT;SOR=0.444;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=47;TCF=20;TCR=27;TR=29;WE=76495850;WS=76495821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,57:0.66:86
chr16	76495842	rs35994137	C	A	599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.788;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=12;PP=957;ReadPosRankSum=-0.804;SC=TAACTGATTTCATCTCCCTAG;SOR=0.821;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=83;TCF=50;TCR=33;TR=31;WE=76495850;WS=76495821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,35:0.34:102
chr16	76496025	rs57292037	A	G	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.345;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=15;PP=349;ReadPosRankSum=0.162;SC=GCCAGGCTCTATGAGCAACTG;SOR=0.446;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=36;TCF=13;TCR=23;TR=24;WE=76496033;WS=76496015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,26:0.63:41
chr16	76496131	rs34782687	C	T	72.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=51;SC=TCTTTGATCACGGACATTTTG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=76496139;WS=76496121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr16	76501222	rs72797097	G	A	1099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.398;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=12;PP=723;ReadPosRankSum=-1.482;SC=ATTGTGATGCGTACTGGATTT;SOR=0.431;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=70;TCF=54;TCR=16;TR=44;WE=76501230;WS=76501212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,46:0.64:72
chr16	76501542	rs1002974	A	G	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.203;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=190;ReadPosRankSum=-1.671;SC=ACAGGAAATGAATTATATTTA;SOR=0.165;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=11;WE=76501550;WS=76501532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr16	76523792	rs7201030	A	G	697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=16;PP=448;SC=TAAGTAAACCATGGTGTCTGT;SOR=1.445;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=9;TCR=16;TR=25;WE=76523800;WS=76523782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr16	76532392	rs12932943	C	T	1363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=4;PP=1010;SC=TAGTTCAGAACATCTTGGTTT;SOR=4.271;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=39;TCR=4;TR=43;WE=76532400;WS=76532382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr16	76532583	rs12933808	A	G	8291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=144;NR=154;PP=2965;ReadPosRankSum=-2.116;SC=CTGCTCTGCCAGGGAGACAGT;SOR=0.877;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=302;TCF=146;TCR=156;TR=298;WE=76532591;WS=76532572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,317:0.99:319
chr16	76555005	rs72373340	AT	A	551.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=0.918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.87;ReadPosRankSum=-0.071;SOR=0.501;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,33:0.35:94
chr16	76555015	rs11353699	CT	C	3261.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.86;ReadPosRankSum=-0.480;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,112:0.99:113
chr16	76569754	rs6564348	A	T	2273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=52;PP=1535;SC=GTTCTTTTCTATGCAGCTATT;SOR=1.697;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=25;TCR=52;TR=77;WE=76569762;WS=76569744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr16	76587202	rs7202925	T	G	3051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=34;PP=1669;SC=TGGACCAGGATACTGCACTGG;SOR=0.976;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=94;TCF=60;TCR=34;TR=93;WE=76587210;WS=76587192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr16	76587331	rs7184958	T	C	2943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=49;PP=1409;SC=GACACGTGACTGAGTCCAGCT;SOR=0.995;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=46;TCR=49;TR=95;WE=76587339;WS=76587321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr16	76587647	rs4243123	G	C	3028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=27;PP=2013;SC=ATAATTCTCTGTGGTTTAAAA;SOR=2.004;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=71;TCR=27;TR=98;WE=76587655;WS=76587637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr16	76592313	rs7196722	T	G	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5105;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=238;ReadPosRankSum=0.667;SC=TTATGATGACTTATTAAGCAA;SOR=2.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=13;WE=76592321;WS=76592311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,14:0.82:17
chr16	76902722	rs34106659	C	G	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.128;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=14;PP=425;ReadPosRankSum=0.008;SC=GCAATAATATCTGGTACAGAT;SOR=0.410;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=56;TCF=36;TCR=20;TR=36;WE=76902730;WS=76902712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,40:0.61:66
chr16	76902842	rs58353328	A	G	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.33;ReadPosRankSum=-0.266;SOR=0.748;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr16	76902847	rs7500280	T	C	1465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.42;SOR=1.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr16	76902850	rs7499278	G	A	1346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.44;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr16	77225217	rs3214483	A	AG	893.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.594;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=22;PP=617;ReadPosRankSum=0.134;SC=AAAGTGTTGGAGGGGGGACGT;SOR=0.922;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=74;TCF=10;TCR=64;TR=24;WE=77225225;WS=77225207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,41:0.36:113
chr16	77227180	rs2241416	G	A	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=249;ReadPosRankSum=-0.787;SC=AGATCATTGCGGGGTCCTAGG;SOR=1.022;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=14;WE=77227188;WS=77227170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr16	77228629	rs2232503	A	G	10073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=369;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=182;NR=162;PP=2965;SC=CCCAGGAGCGAAATGTGCTGG;SOR=0.726;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=345;TCF=183;TCR=162;TR=344;WE=77228637;WS=77228619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,368:1.00:368
chr16	77228866	rs2232504	T	C	1659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.29;ReadPosRankSum=-1.060;SOR=0.703;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:169,95:0.36:264
chr16	77231935	rs2232509	C	T	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=1;PP=38;ReadPosRankSum=-1.133;SC=CATGCAGCTGCACTGGGGTAG;SOR=0.368;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=4;WE=77231943;WS=77231925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr16	77233338	rs8398	C	T	1352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.665;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=25;PP=719;ReadPosRankSum=-2.410;SC=GCGCAGGCCCCGCGTTGGAAA;SOR=0.592;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=132;TCF=81;TCR=51;TR=57;WE=77233346;WS=77233328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,67:0.41:165
chr16	77233394	rs4888607	A	G	3614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=63;PP=2218;SC=GCCAGAAGCTACTGAGGAGGC;SOR=0.820;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=121;TCF=58;TCR=63;TR=121;WE=77233402;WS=77233384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr16	77240217	rs9928151	G	C	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.057;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=72;ReadPosRankSum=0.040;SC=AAACCTGTCTGTCATTCCATC;SOR=0.223;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=5;WE=77240225;WS=77240207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr16	77242035	rs9933799	G	A	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=154;ReadPosRankSum=-1.168;SC=CAGACACAGTGCTTCTCCGTC;SOR=0.914;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=11;WE=77242043;WS=77242025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr16	77242083	rs9934426	C	G	2066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=23;PP=1364;SC=CTCTGGCTCACTCTTTCTTCC;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=47;TCR=23;TR=70;WE=77242091;WS=77242073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr16	77242284	rs1424146	G	A	10122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=380;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=188;NR=159;PP=2965;SC=GAAGATGACTGTGCAATGTCA;SOR=0.852;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=347;TCF=188;TCR=159;TR=347;WE=77242292;WS=77242274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,378:1.00:378
chr16	77242513	rs2343035	C	T	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.755;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=334;ReadPosRankSum=-0.927;SC=GCACAGGCTGCTCCCTGGCCT;SOR=0.166;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=18;WE=77242521;WS=77242503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,19:0.68:28
chr16	77246218	rs13331769	G	A	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=34;ReadPosRankSum=0.096;SC=GTGGAGCGGCGGCTGCACTCG;SOR=0.307;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=4;WE=77246226;WS=77246208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr16	77246517	rs62049594	C	A	949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=18;PP=419;ReadPosRankSum=-1.203;SC=CCGGAGCGCCCCCGAGGTCGG;SOR=0.697;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=71;TCF=34;TCR=37;TR=38;WE=77246525;WS=77246507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,47:0.55:85
chr16	77246795	rs2278049	C	G	2782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.888;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=45;PP=1641;ReadPosRankSum=1.469;SC=AGGAGGATCCCGAGCCGCCGG;SOR=1.175;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=243;TCF=144;TCR=99;TR=128;WE=77246803;WS=77246785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,140:0.54:259
chr16	77246847	rs2278048	T	G	4844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=417;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.522;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=106;NR=98;PP=2962;ReadPosRankSum=0.123;SC=GACCCGCCCGTTCCCGACCTT;SOR=0.774;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=383;TCF=198;TCR=185;TR=204;WE=77246855;WS=77246837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:191,226:0.54:417
chr16	77246953	rs2278047	G	C	3474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.086;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=87;PP=2244;ReadPosRankSum=0.443;SC=GGCGGGGCGTGCTGGGATCTC;SOR=0.954;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=261;TCF=113;TCR=148;TR=149;WE=77246961;WS=77246943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,161:0.58:278
chr16	77246988	rs7203616	T	G	4113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=95;PP=2807;SC=GCCGGACCCCTCCCACCAGTC;SOR=1.625;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=144;TCF=49;TCR=95;TR=144;WE=77246996;WS=77246978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr16	77281779	rs35625788	GTC	G	561.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.77;NF=10;NR=1;PP=478;SC=CTGGCTTGAGGTCTCTCATCA;SOR=3.912;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=11;WE=77281788;WS=77281769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
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chr16	77389956	rs8059275	A	G	5862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=110;NR=99;PP=2965;SC=TCCCTTCTCCATCGTGAATCA;SOR=0.766;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=209;TCF=110;TCR=99;TR=209;WE=77389964;WS=77389946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr16	77393207	rs2650907	G	C	1737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.559;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=23;PP=1205;ReadPosRankSum=-0.942;SC=GTTCAAAGAGGCACTTACTTG;SOR=0.869;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=76;TCR=35;TR=73;WE=77393215;WS=77393197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,75:0.62:121
chr16	77393445	rs72406902	GGAAA	G	507.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.584;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=19.53;ReadPosRankSum=3.782;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,18:0.69:26
chr16	77393450	rs114891228	A	C	100.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=3.140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.93;ReadPosRankSum=2.203;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr16	77395948	rs1909802	C	G	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=219;ReadPosRankSum=-1.197;SC=TAGAAAGTTTCCATACTGTGT;SOR=0.404;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=11;WE=77395956;WS=77395938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr16	77397899	rs1948718	T	C	576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=466;ReadPosRankSum=1.449;SC=TATGTACATATAAATACAATT;SOR=1.092;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=20;WE=77397907;WS=77397889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,20:0.69:29
chr16	77398081	rs1948719	T	C	1790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=30;PP=1180;ReadPosRankSum=1.219;SC=ACACCCCCGCTTACCATGTTC;SOR=0.701;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=162;TCF=98;TCR=64;TR=78;WE=77398089;WS=77398071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,85:0.48:177
chr16	77398386	rs2562119	A	T	513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=12;PP=351;SC=TAACCAACACACCACCAATCC;SOR=1.863;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=17;WE=77398394;WS=77398376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	77401545	rs11643211	A	G	2236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.006;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=52;PP=1454;ReadPosRankSum=-0.026;SC=GGGGAGCTGTAGTTGTGTTCC;SOR=0.563;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=263;TCF=142;TCR=121;TR=102;WE=77401553;WS=77401535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:177,112:0.39:289
chr16	77401684	rs2434895	T	G	1515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.473;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=46;PP=1057;ReadPosRankSum=-0.513;SC=AGGGTTGGTTTTCAACAACTG;SOR=1.235;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=93;TCF=27;TCR=66;TR=62;WE=77401692;WS=77401674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,64:0.65:99
chr16	77465036	rs1366545	C	G	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=227;ReadPosRankSum=0.660;SC=TCTGGGAGCACATTAGATTAA;SOR=0.990;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=12;WE=77465044;WS=77465026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr16	77756613	rs2914456	G	A	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=290;ReadPosRankSum=-1.099;SC=TGATTTTGCAGCTCCCGCCAG;SOR=0.584;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=19;WE=77756621;WS=77756603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr16	77769288	rs6564469	C	T	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.95;ReadPosRankSum=-1.965;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr16	77769369	rs308926	C	T	1226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=22;NR=21;PP=642;SC=GCCAAGCAGACGCCAGCATCA;SOR=0.866;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=22;TCR=21;TR=43;WE=77769377;WS=77769359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr16	77769647	rs186305	C	T	2750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=25;PP=1680;SC=AAATAGAAGTCCAGTAAGTAT;SOR=1.683;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=60;TCR=25;TR=85;WE=77769655;WS=77769637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr16	77775459	rs11648791	G	A	1321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.531;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=21;PP=889;ReadPosRankSum=1.752;SC=TAATTTGTCTGTTTTGTTTTC;SOR=0.342;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=87;TCF=59;TCR=28;TR=58;WE=77775467;WS=77775449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,59:0.65:91
chr16	77775672	rs16946429	A	G	2613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.145;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=60;PP=1638;ReadPosRankSum=0.637;SC=ACAAACCCTGAAGACGGTGTC;SOR=0.802;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=268;TCF=135;TCR=133;TR=113;WE=77775680;WS=77775662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,129:0.43:301
chr16	77850966	rs2966053	T	C	1682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.523;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=46;PP=1095;ReadPosRankSum=1.296;SC=TGGCTCTCAATTGAAGAGTAA;SOR=0.766;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=193;TCF=81;TCR=112;TR=76;WE=77850974;WS=77850956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,85:0.40:213
chr16	77850999	rs2966052	A	G	1127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.429;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=36;PP=796;ReadPosRankSum=-0.658;SC=ATCCATTGAGACAACAAAAGA;SOR=1.075;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=125;TCF=42;TCR=83;TR=50;WE=77851007;WS=77850989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,54:0.40:136
chr16	77918801	rs1864228	T	C	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.635;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=314;ReadPosRankSum=-0.941;SC=TTTTCCCAGATGGGTTTGTTT;SOR=2.110;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=20;WE=77918809;WS=77918791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr16	78062190	rs2735403	T	C	2996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=58;PP=2029;SC=GACAAATCAATAATGTGGCCA;SOR=1.222;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=37;TCR=58;TR=95;WE=78062198;WS=78062180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr16	78062219	rs2204891	C	T	2009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=43;PP=1355;SC=GCCCCAATGCCGGGAGATGAT;SOR=1.745;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=20;TCR=43;TR=63;WE=78062227;WS=78062209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr16	78063143	rs7192416	C	T	3039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=58;PP=1698;SC=TCCAGTGCTACGGCCTAAAAC;SOR=1.322;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=100;TCF=42;TCR=58;TR=99;WE=78063151;WS=78063133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr16	78064351	rs2293776	C	G	6117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=119;NR=75;PP=2965;SC=CAGTCTGTCTCCGAGGCACTA;SOR=1.055;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=194;TCF=119;TCR=75;TR=194;WE=78064359;WS=78064341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr16	78085722	rs35713571	A	C	2055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=11;PP=1335;SC=TCAGCCTCCCAAAGTACTAGG;SOR=2.636;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=47;TCR=11;TR=58;WE=78085730;WS=78085712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr16	78085754	rs2344923	C	A	4457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=48;PP=2465;SC=GAGCCACCCCCCCTGGCCAAC;SOR=1.363;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=137;TCF=89;TCR=48;TR=137;WE=78085762;WS=78085744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr16	78133671	rs11545028	C	T	3241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=70;NR=37;PP=1892;SC=CCTCCACAGTCAGCCATGGCA;SOR=1.266;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=108;TCF=70;TCR=38;TR=107;WE=78133679;WS=78133661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr16	78142209	rs4887937	T	C	339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.31;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	78142307	rs149533117	TG	T	106.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.40;ReadPosRankSum=0.196;SOR=0.799;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,15:0.20:76
chr16	78142308	rs67493355	G	T	1203.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-2.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.84;ReadPosRankSum=-0.588;SOR=0.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,57:0.75:76
chr16	78148794	rs1469117	T	G	703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=2;PP=545;SC=AATGGGGTTTTCCTAAAGTAT;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=78148802;WS=78148784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr16	78148830	rs12934051	C	T	1822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=9;PP=1214;SC=TTATAAATGCCTGTGTTCATT;SOR=2.760;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=47;TCR=9;TR=56;WE=78148838;WS=78148820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr16	78149067	rs12934985	A	C	6065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=116;PP=2965;SC=CTCTTCACTTAGTTATTTATC;SOR=0.993;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=209;TCF=93;TCR=116;TR=209;WE=78149075;WS=78149057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr16	78149173	rs7203387	A	C	1049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=25;PP=714;SC=TCCTTTTCAGATATCGTTTCA;SOR=3.611;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=28;WE=78149181;WS=78149163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr16	78197911	rs4359451	T	C	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=49;ReadPosRankSum=-1.785;SC=ACCCCACAACTGTGGCCACTG;SOR=0.132;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=5;WE=78197919;WS=78197910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
chr16	78198192	rs2303191	T	C	8390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=132;NR=155;PP=2965;SC=AATGGGTAAGTGCTTGACTGT;SOR=0.912;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=287;TCF=132;TCR=155;TR=287;WE=78198200;WS=78198182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,320:1.00:320
chr16	78420775	rs11545029	G	A	7854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=147;NR=116;PP=2965;SC=CAAGGTAGAAGCAATGACCCT;SOR=0.852;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=264;TCF=148;TCR=116;TR=263;WE=78420783;WS=78420765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,296:1.00:296
chr16	78790765	rs7199110	C	T	1997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=34;PP=1184;ReadPosRankSum=0.970;SC=GACATCAGAGCATGTGACTTA;SOR=0.654;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=154;TCF=96;TCR=58;TR=90;WE=78790773;WS=78790755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,95:0.58:165
chr16	79619835	rs60533944	G	A	1054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.643;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=1.675;NF=23;NR=27;PP=560;ReadPosRankSum=-0.882;SC=ATTCCCTTGGGTACCTGATTT;SOR=0.757;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=118;TCF=58;TCR=60;TR=50;WE=79619843;WS=79619825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,56:0.42:133
chr16	79633805	rs5818251	TGCC	T	1233.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.9830;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=11;PP=712;SC=GCCATTCTCCTGCCGCCGCCG;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=11;WE=79633818;WS=79633795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr16	79998075	rs66539665	T	G	3054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FS=0.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.66;ReadPosRankSum=4.175;SOR=0.630;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:124,138:0.53:262
chr16	80574886	rs9922406	T	C	7645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=145;NR=121;PP=2965;SC=CCACTTCCTTTTTTGTCTCCT;SOR=0.803;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=266;TCF=145;TCR=121;TR=266;WE=80574894;WS=80574876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,285:1.00:285
chr16	80577098	rs8049769	G	T	2008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=18;PP=1295;SC=TAGGTATCTTGCTAAACATTA;SOR=1.678;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=43;TCR=18;TR=61;WE=80577106;WS=80577088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr16	80581547	rs6564762	C	T	3364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=28;PP=2322;SC=CTGAGCATTGCACCCTTAGTA;SOR=2.224;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=81;TCR=28;TR=109;WE=80581555;WS=80581537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr16	80581580	rs6564763	A	C	6265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=127;NR=83;PP=2965;SC=TTAGGATGCAAAATAAAACTG;SOR=1.204;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=210;TCF=127;TCR=83;TR=210;WE=80581588;WS=80581570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr16	80581631	rs6564764	G	A	11089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=423;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=214;NR=179;PP=2965;SC=TGCTTGCTACGTTTCCATTTT;SOR=0.879;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=395;TCF=215;TCR=180;TR=393;WE=80581639;WS=80581621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,420:1.00:420
chr16	80584604	rs74341389	C	G	579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=367;ReadPosRankSum=0.620;SC=CTCATTTAGTCCCTTTTGATT;SOR=0.888;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=47;TCF=7;TCR=40;TR=21;WE=80584612;WS=80584594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,24:0.48:50
chr16	80641906	rs9940301	G	A	1261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.627;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=17;PP=707;ReadPosRankSum=1.561;SC=TAGCAAGTCAGTGAAGCCCTC;SOR=0.975;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=84;TCF=53;TCR=31;TR=50;WE=80641914;WS=80641896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,59:0.58:101
chr16	80641931	rs9933302	T	C	2702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=3.164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.95;ReadPosRankSum=2.155;SOR=0.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,67:0.52:129
chr16	80641936	rs9940376	G	C	2759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=5.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.29;ReadPosRankSum=-0.121;SOR=1.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,73:0.54:136
chr16	80654526	rs4888101	T	G	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=218;ReadPosRankSum=0.711;SC=AGACCTCGAGTATTGCACAGG;SOR=0.776;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=11;WE=80654534;WS=80654516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr16	80654633	rs4889169	G	A	2555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.575;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=44;PP=1400;ReadPosRankSum=0.419;SC=CAGGACCCCAGGGTGTGTGAA;SOR=0.529;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=158;TCF=93;TCR=65;TR=102;WE=80654641;WS=80654623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,121:0.63:193
chr16	80666886	rs59675671	T	C	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=130;ReadPosRankSum=1.121;SC=ACAGCCCAGCTTGCCCTTCCC;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=7;WE=80666894;WS=80666876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr16	80704886	rs7195952	T	C	2200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.879;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=47;PP=1026;ReadPosRankSum=2.212;SC=CTCAGGATTTTGTCTCCTGGG;SOR=0.538;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=165;TCF=79;TCR=86;TR=96;WE=80704894;WS=80704876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,109:0.60:182
chr16	80718879	rs8049284	A	G	2729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.512;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=45;PP=1613;ReadPosRankSum=-0.490;SC=GACATGTGCAACCCATTGAAT;SOR=0.762;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=184;TCF=100;TCR=84;TR=103;WE=80718887;WS=80718869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,118:0.57:208
chr16	80719086	rs8047798	G	C	1203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.685;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=27;PP=729;ReadPosRankSum=-0.059;SC=AACTCAGTTCGAGGCAACAAG;SOR=0.327;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=66;TCF=24;TCR=42;TR=46;WE=80719094;WS=80719076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,50:0.68:73
chr16	81014700	rs1477381	T	C	148.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=57;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=8;PP=208;SC=AAAAAAAAAGTTCAAAAATAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=81014708;WS=81014690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr16	81015560	rs2549822	C	T	2240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=33;NR=42;PP=1191;SC=TAAATACTGCCACAGACATGA;SOR=1.192;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=33;TCR=42;TR=75;WE=81015568;WS=81015550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr16	81022203	rs34522854	TA	T	3614.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=70;PP=1800;SC=GCACGTTTCCTAAAAAAAACA;SOR=1.162;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=9;TCR=71;TR=79;WE=81022211;WS=81022193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr16	81022232	rs2549833	T	C	3088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=65;PP=1975;SC=AATTTAAGTCTCCATACGATT;SOR=1.449;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=39;TCR=65;TR=104;WE=81022240;WS=81022222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr16	81025372	rs2244452	A	T	784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=22;NR=2;PP=602;SC=TGTGGTCTTCATCCGAAAACA;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=24;WE=81025380;WS=81025362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr16	81025490	rs2113196	A	C	7202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=149;NR=93;PP=2965;SC=ATCAAAAACAAAGAAAATGTC;SOR=1.196;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=242;TCF=149;TCR=93;TR=242;WE=81025498;WS=81025480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr16	81025506	rs2113197	T	A	8357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=162;NR=124;PP=2965;SC=ATGTCACAGATAACAGGAGCC;SOR=0.937;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=286;TCF=162;TCR=124;TR=286;WE=81025514;WS=81025496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,308:1.00:308
chr16	81050965	rs935939	A	T	4526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=79;NR=80;PP=2474;SC=AAGTTTGGGAAGTTTTTCAGA;SOR=0.917;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=159;TCF=79;TCR=80;TR=159;WE=81050973;WS=81050955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr16	81051327	rs935940	C	T	2901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=46;PP=1737;SC=ATTGTAGCTCCCTTGATTTTT;SOR=0.730;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=101;TCF=55;TCR=46;TR=101;WE=81051335;WS=81051317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr16	81053682	rs10602593	CT	C	262.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5010;FS=0.000;HP=12;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=135;ReadPosRankSum=1.398;SC=GAAATTAAGCCTTTTTTTTTT;SOR=1.501;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=14;WE=81053702;WS=81053672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
chr16	81060197	rs184140976	C	T	1605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.374;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=33;PP=908;ReadPosRankSum=0.243;SC=ACTCAAGAAACATTTGGAGAT;SOR=0.473;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=112;TCF=54;TCR=58;TR=66;WE=81060205;WS=81060187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,74:0.60:123
chr16	81061827	rs2549887	G	A	6852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=132;NR=87;PP=2965;SC=GGCTGAGAGGGAAGAACCCCT;SOR=1.207;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=219;TCF=132;TCR=87;TR=219;WE=81061835;WS=81061817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr16	81062030	rs2549888	G	T	1482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=27;PP=981;SC=GCTCTCTCTTGCATCTTCTGC;SOR=1.473;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=14;TCR=27;TR=41;WE=81062038;WS=81062020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr16	81062151	rs35608064	CTT	C	11657.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.72;SOR=1.243;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr16	81062157	rs114305409	T	C	12136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=143;NR=85;PP=2965;SC=TTCCCTTTTTTTTTTTTTTAA;SOR=1.263;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=247;TCF=153;TCR=94;TR=228;WE=81062179;WS=81062141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr16	81062171	rs2602428	C	T	13830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=190;NR=118;PP=2965;SC=TTTTTAATTTCAGGTATTGCA;SOR=1.189;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=309;TCF=190;TCR=119;TR=308;WE=81062179;WS=81062141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,337:1.00:337
chr16	81069449	rs2602430	A	G	119.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.97;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr16	81077915	rs2257378	T	C	13495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=497;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=224;NR=220;PP=2965;SC=ATCTGCCTGCTCAGACATTGG;SOR=0.747;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=446;TCF=226;TCR=220;TR=444;WE=81077923;WS=81077905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,495:1.00:495
chr16	81094760	rs804884	A	G	3713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=39;PP=2307;SC=GTTCTACCGCAACCGCTCAGA;SOR=1.542;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=89;TCR=39;TR=128;WE=81094768;WS=81094750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr16	81095363	rs804885	C	T	7604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=128;NR=141;PP=2965;SC=CTGGGATGGACAGCCCTCTGT;SOR=0.846;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=269;TCF=128;TCR=141;TR=269;WE=81095371;WS=81095353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,278:1.00:278
chr16	81118289	rs7187102	C	T	1244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=13;NR=33;PP=854;SC=TCCTGTCATACAGCTATGATT;SOR=1.765;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=47;TCF=13;TCR=34;TR=46;WE=81118297;WS=81118279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr16	81118316	.	CT	C	76	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;FR=0.9250;HP=19;HapScore=3;MGOF=32;MMLQ=16;MQ=52.38;NF=0;NR=5;PP=76;QD=15.8;SC=TTCCAAATTTCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=5;WE=81118325;WS=81118306;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:8,5:0.38:13
chr16	81121145	rs7200400	T	C	433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=1;PP=343;SC=ACAAACAAATTACTATTCAAT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=81121153;WS=81121135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr16	81129822	rs8052579	G	A	112.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.88;QD=22.58;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr16	81145630	rs8053975	C	G	1226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=2;PP=981;SC=ACAGCAAAGACACCCTGTACT;SOR=4.977;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=33;TCR=2;TR=35;WE=81145638;WS=81145620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr16	81145664	rs8054611	A	G	4136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=19;PP=1953;SC=ACCTTCCTTGAGTTCCCAGGG;SOR=2.354;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=67;TCR=19;TR=86;WE=81145683;WS=81145654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr16	81145675	rs8059153	T	C	4869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=31;PP=2294;SC=GTTCCCAGGGTCTCCCTAACC;SOR=1.923;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=111;TCF=80;TCR=31;TR=110;WE=81145683;WS=81145654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr16	81145737	rs8059318	T	G	8446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=174;NR=130;PP=2965;SC=GCAGAGACCCTCCCCGAACTT;SOR=1.052;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=306;TCF=175;TCR=131;TR=304;WE=81145745;WS=81145726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,322:1.00:322
chr16	81145807	rs8054182	C	G	12161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=439;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=213;NR=192;PP=2965;SC=GGATGACAATCATAAAGCCTG;SOR=0.726;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=405;TCF=213;TCR=192;TR=405;WE=81145815;WS=81145797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,437:1.00:437
chr16	81151122	rs4889238	A	C	11574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=430;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=192;NR=203;PP=2965;SC=ACGTCTCTTTACTCATGCGCT;SOR=0.811;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=395;TCF=192;TCR=203;TR=395;WE=81151130;WS=81151112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,430:1.00:430
chr16	81151163	rs8053191	C	T	7908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=112;NR=148;PP=2965;ReadPosRankSum=0.461;SC=AAGTTGCGGCCGTGACTGCCC;SOR=0.409;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=261;TCF=112;TCR=149;TR=260;WE=81151171;WS=81151153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,291:1.00:292
chr16	81155068	.	CA	C	98.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.683;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.67;MQRankSum=2.251;QD=3.29;ReadPosRankSum=-0.136;SOR=0.437;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,9:0.30:30
chr16	81157324	rs4889241	G	A	4128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=52;PP=2439;SC=GTAGACAGTGGACTCCACAAA;SOR=1.003;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=138;TCF=86;TCR=52;TR=138;WE=81157332;WS=81157314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr16	81157521	rs4889242	G	A	1504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=34;PP=927;SC=GGGCCACCAGGCCAACAGAGC;SOR=1.739;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=17;TCR=34;TR=51;WE=81157529;WS=81157511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr16	81164274	rs11150345	C	G	267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=7;PP=164;SC=ACAGTCCCTGCTCAGGCAGGA;SOR=2.303;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=81164282;WS=81164264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr16	81167342	rs11150346	T	G	376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=10;PP=290;SC=CCCCTACGTGTGCAGAGGAGG;SOR=1.329;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=15;WE=81167350;WS=81167332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr16	81173030	rs4889243	A	G	843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=3;PP=615;SC=ATAAAGGAATAAAAGCCCAGG;SOR=3.180;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=26;WE=81173038;WS=81173020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr16	81173136	rs12918619	T	C	5418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=112;NR=63;PP=2778;SC=GTGACGAACATGCTCTCCACG;SOR=1.096;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=177;TCF=113;TCR=64;TR=175;WE=81173144;WS=81173126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr16	81173193	rs4889244	C	T	6844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=131;NR=96;PP=2965;SC=CTGGCCCTCCCGTAGTGCAGG;SOR=0.826;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=227;TCF=131;TCR=96;TR=227;WE=81173201;WS=81173183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr16	81180988	rs7194136	C	G	7167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=124;NR=122;PP=2965;SC=CTGATGTGTTCTGTGGATAAA;SOR=0.755;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=247;TCF=124;TCR=123;TR=246;WE=81180996;WS=81180978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr16	81183266	rs8044870	A	G	514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=3;PP=384;SC=CCAGCCACTAACCCTGACCTC;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=81183274;WS=81183256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	81185326	rs11649028	G	A	2874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=32;PP=1826;SC=CCTGGGTGGCGGAACAAGACC;SOR=1.314;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=63;TCR=32;TR=95;WE=81185334;WS=81185316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr16	81185416	rs8061038	A	G	7382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=132;NR=112;PP=2965;SC=GAAACACCTTATCGAGGACGC;SOR=0.730;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=245;TCF=133;TCR=112;TR=244;WE=81185424;WS=81185406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,271:1.00:271
chr16	81190294	rs4889251	G	A	1076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=3;PP=583;SC=CAGGTGATCCGTCCACCTTGG;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=25;WE=81190316;WS=81190284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr16	81190308	rs4889252	G	T	1391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=5;PP=763;SC=ACCTTGGCCTGCCAAAGTGCT;SOR=3.056;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=31;WE=81190316;WS=81190284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr16	81190328	rs4889253	G	A	1888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=36;NR=13;PP=1033;SC=TGGGATTACAGGCGTGAGCCA;SOR=1.958;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=36;TCR=13;TR=49;WE=81190336;WS=81190318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr16	81190601	rs1453325	T	C	6951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=115;NR=129;PP=2965;SC=TGGTGGATGTTGATGGCATTG;SOR=0.873;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=244;TCF=115;TCR=129;TR=244;WE=81190621;WS=81190591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
chr16	81190613	rs1453324	A	G	6657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=107;NR=121;PP=2965;SC=ATGGCATTGGACATCACCAGG;SOR=0.876;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=228;TCF=107;TCR=121;TR=228;WE=81190621;WS=81190591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr16	81190708	rs1453323	A	C	1635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=42;PP=1074;SC=CAACCCATAAAGGGGCTGTCA;SOR=2.546;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=12;TCR=42;TR=54;WE=81190716;WS=81190698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr16	81193156	rs10871403	C	G	1337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.803;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=13;PP=818;ReadPosRankSum=0.635;SC=GCCAGAGGCACCAAAAGGGAA;SOR=0.603;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=90;TCF=67;TCR=23;TR=48;WE=81193164;WS=81193146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,57:0.53:107
chr16	81193321	rs72628271	C	T	4642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=364;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.441;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=103;PP=2898;ReadPosRankSum=-0.253;SC=AGGTCCCTGCCGGGGGCTGGC;SOR=0.541;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=337;TCF=155;TCR=182;TR=197;WE=81193329;WS=81193311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,211:0.59:360
chr16	81193433	rs734823	G	C	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.641;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=204;ReadPosRankSum=-0.385;SC=CTGTAGGAAAGGGGGTTCCAG;SOR=1.188;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=63;TCF=17;TCR=46;TR=20;WE=81193441;WS=81193423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,21:0.33:63
chr16	81194382	rs2317117	T	C	1791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.048;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=38;PP=978;ReadPosRankSum=-1.326;SC=GTGCAATGTCTGGTCTCCAGT;SOR=0.606;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=201;TCF=118;TCR=83;TR=87;WE=81194390;WS=81194372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,94:0.42:222
chr16	81194528	rs11647564	C	T	518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.230;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=20;PP=358;ReadPosRankSum=2.591;SC=CAGAAACAATCCTATTGAAGG;SOR=1.503;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=81;TCF=24;TCR=57;TR=25;WE=81194536;WS=81194518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,27:0.31:86
chr16	81197117	rs4889255	A	G	3655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=42;PP=2412;SC=GCTTGAGCCCAGGAGGCAGAA;SOR=1.768;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=90;TCR=42;TR=132;WE=81197125;WS=81197107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
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chr16	81198306	rs10400943	C	A	1625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.228;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=36;PP=1034;ReadPosRankSum=1.326;SC=AGGCAGCGGGCAGCATGAAGG;SOR=0.520;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=123;TCF=57;TCR=66;TR=70;WE=81198314;WS=81198296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,73:0.55:132
chr16	81198441	rs7191852	T	C	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=214;ReadPosRankSum=0.246;SC=GAGGGAGCCCTCACACCTCCT;SOR=1.061;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=13;WE=81198449;WS=81198431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr16	81199520	rs12931217	T	C	1354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=39;PP=718;ReadPosRankSum=-0.130;SC=AGCAGGAGGGTGGTCTGCACA;SOR=0.644;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=61;TCR=91;TR=66;WE=81199528;WS=81199510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,72:0.42:170
chr16	81199572	rs12927442	A	G	835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.783;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=25;PP=611;ReadPosRankSum=-0.903;SC=TGGCAATCTGAAAAAGGAGGC;SOR=0.801;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=86;TCF=33;TCR=53;TR=38;WE=81199580;WS=81199562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,40:0.40:101
chr16	81201448	rs11313252	G	A	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.907;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=30;ReadPosRankSum=-1.013;SC=GATGGGGGGGGAAAGTTCCAC;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=4;WE=81201456;WS=81201447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr16	81201620	rs35292101	C	A	3566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FS=1.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.24;ReadPosRankSum=1.215;SOR=0.744;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:139,95:0.41:234
chr16	81201625	rs34504526	G	A	3705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FS=0.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.70;ReadPosRankSum=0.364;SOR=0.732;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:134,102:0.43:236
chr16	81201774	rs34172014	C	G	658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.927;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=17;PP=391;ReadPosRankSum=0.449;SC=CTGTGTCATTCAAGGGACAAG;SOR=0.886;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=63;TCF=26;TCR=37;TR=29;WE=81201782;WS=81201764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,32:0.46:70
chr16	81201837	rs35055907	G	A	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.823;HP=1;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=63;ReadPosRankSum=1.632;SC=CCTGGCACACGAGCTCCCTGT;SOR=1.751;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=5;WE=81201845;WS=81201827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr16	81201853	rs72822032	C	A	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=65;ReadPosRankSum=1.282;SC=CCTGTATCTCCGGCTTGAGAC;SOR=1.302;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=5;WE=81201861;WS=81201843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr16	81201868	rs34722210	G	T	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.88;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr16	81201872	rs76815905	C	T	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.80;ReadPosRankSum=-0.191;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr16	81204172	rs11648241	A	C	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.166;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=47;ReadPosRankSum=-0.000;SC=ATAAGGAAGCACAGGAGCTGG;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=4;WE=81204180;WS=81204166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr16	81204423	rs11640279	T	C	2769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=399;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.264;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=68;PP=1508;ReadPosRankSum=-0.634;SC=GGAAAGAAGATGACAGAGGTC;SOR=0.551;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=364;TCF=196;TCR=168;TR=144;WE=81204431;WS=81204413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:244,154:0.39:398
chr16	81208056	rs745209	A	G	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=3.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=408;ReadPosRankSum=0.351;SC=AAAGCAGGGGATGATGTGTTC;SOR=0.749;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=18;WE=81208064;WS=81208050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr16	81209390	rs117913342	T	C	1249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=30;PP=743;ReadPosRankSum=-0.283;SC=TGAGGGGGCATCGCTAAGCCC;SOR=0.880;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=61;TCF=19;TCR=42;TR=43;WE=81209398;WS=81209380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,52:0.73:71
chr16	81211496	rs9935113	C	A	1111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.837;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=22;PP=691;ReadPosRankSum=1.710;SC=AGAACGGTGCCCTCCTCTGGG;SOR=0.453;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=86;TCF=51;TCR=35;TR=50;WE=81211504;WS=81211486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,52:0.59:88
chr16	81211548	rs9934605	G	A	1819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.318;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=35;PP=1152;ReadPosRankSum=-0.559;SC=GCACAGTGCTGATCACATAGG;SOR=0.546;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=138;TCF=82;TCR=56;TR=80;WE=81211556;WS=81211538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,86:0.58:149
chr16	81211720	rs9925522	A	G	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.308;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=20;PP=443;ReadPosRankSum=0.928;SC=AACTTCAGACATCTCTGGATC;SOR=0.448;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=44;TCF=10;TCR=34;TR=27;WE=81211728;WS=81211710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,30:0.60:50
chr16	81213081	rs4889259	G	A	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=70;ReadPosRankSum=0.282;SC=CAGGAGGCTGGGACAGGAGGA;SOR=0.223;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=7;WE=81213089;WS=81213071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr16	81213142	rs4889260	C	T	674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.845;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=10;PP=454;ReadPosRankSum=0.976;SC=AGTGAGATCACATCTCTCTAT;SOR=0.502;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=97;TCF=71;TCR=26;TR=35;WE=81213150;WS=81213132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,36:0.35:104
chr16	81213378	rs4889261	A	G	1433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.510;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=42;PP=926;ReadPosRankSum=1.395;SC=GCAGGCATCCAGGAGGGGCTC;SOR=0.423;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=177;TCF=65;TCR=112;TR=72;WE=81213386;WS=81213368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,74:0.39:192
chr16	81213422	rs4889262	C	T	913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.608;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=29;PP=606;ReadPosRankSum=-1.384;SC=GGGCTGCTGACGCTACAGCCA;SOR=0.202;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=90;TCF=25;TCR=65;TR=45;WE=81213430;WS=81213412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,45:0.47:95
chr16	81219187	rs13339342	C	T	2305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.009;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=30;PP=1535;ReadPosRankSum=-1.829;SC=AACAGCCAGGCGCAGGGTGAC;SOR=1.099;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=151;TCF=104;TCR=47;TR=97;WE=81219195;WS=81219177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,101:0.62:164
chr16	81219329	rs9319563	G	T	11421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=436;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=188;NR=202;PP=2965;SC=CAGACACTATGATCCATCAGG;SOR=0.840;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=393;TCF=189;TCR=204;TR=390;WE=81219337;WS=81219319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,436:1.00:436
chr16	81219396	rs9674042	T	A	1639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=2.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.643;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=47;PP=1092;ReadPosRankSum=0.331;SC=TCATGAATAATAACATCAGCT;SOR=0.512;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=126;TCF=28;TCR=98;TR=62;WE=81219404;WS=81219386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,70:0.51:138
chr16	81222672	rs4889271	T	C	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=1.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=336;ReadPosRankSum=0.183;SC=TGGGGTGCTGTTGGCATTCCC;SOR=0.796;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=66;TCF=18;TCR=48;TR=23;WE=81222680;WS=81222662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,24:0.36:67
chr16	81224234	rs12716909	T	C	867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.578;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=13;PP=614;ReadPosRankSum=0.462;SC=CATCTTTTCCTTGTGAGGTTA;SOR=0.868;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=112;TCF=76;TCR=36;TR=43;WE=81224242;WS=81224224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,44:0.36:122
chr16	81224423	rs11647179	G	A	7764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=120;NR=141;PP=2965;SC=CACCAGGGGCGTCAGCCTGTC;SOR=0.945;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=262;TCF=120;TCR=142;TR=261;WE=81224431;WS=81224413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,291:1.00:291
chr16	81224495	rs72823811	G	C	1514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.474;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.528;NF=14;NR=42;PP=1104;ReadPosRankSum=-2.015;SC=GATTAAAAGTGAGTCATCTTG;SOR=0.412;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=80;TCF=18;TCR=62;TR=56;WE=81224503;WS=81224485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,58:0.71:82
chr16	81228814	rs72823822	G	T	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.366;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=24;PP=523;ReadPosRankSum=1.460;SC=GAAGGAGCTTGGTTCTTGTCC;SOR=0.507;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=48;TCF=9;TCR=39;TR=30;WE=81228822;WS=81228804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,32:0.64:50
chr16	81232275	rs7205673	G	A	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=10;PP=331;ReadPosRankSum=-1.200;SC=ACCTTCAACCGGAACAGCCAG;SOR=0.641;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=74;TCF=46;TCR=28;TR=29;WE=81232283;WS=81232265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,34:0.41:83
chr16	81232564	rs7194871	T	G	2134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=42;PP=1411;ReadPosRankSum=0.842;SC=CCCATCAGTTTCTGGGTTTCT;SOR=0.686;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=248;TCF=134;TCR=114;TR=92;WE=81232572;WS=81232554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,103:0.37:276
chr16	81232743	rs9924038	G	C	1705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.703;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=39;PP=1160;ReadPosRankSum=0.608;SC=GCAGCTCAGAGTCAGTCTCTG;SOR=0.486;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=99;TCF=36;TCR=63;TR=65;WE=81232751;WS=81232733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,71:0.65:110
chr16	81240931	rs11150368	T	C	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=30;ReadPosRankSum=0.366;SC=CCGGACAGCCTACCCCAGCCA;SOR=0.148;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=4;WE=81240939;WS=81240927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr16	81241098	rs11150369	C	T	3585.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FS=2.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.76;ReadPosRankSum=0.476;SOR=0.860;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:200,105:0.34:305
chr16	81241098	.	CGG	TGC	2689	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=22;MQ=60.0;NF=54;NR=41;PP=2689;QD=20;SC=CTTACCTCGGCGGGTTGTAGG;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=275;TCF=153;TCR=122;TR=95;WE=81241108;WS=81241088;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:180,95:0.35:275
chr16	81241100	rs11150370	G	C	1785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FS=3.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.99;ReadPosRankSum=0.733;SOR=0.900;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:199,99:0.33:298
chr16	81242085	rs7499175	C	T	2793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.785;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NR=48;ReadPosRankSum=-0.259;SC=TCAAGCAAGTCGGGGACTCAC;SOR=0.936;Source=Platypus;TCR=85;WE=81242093;WS=81242075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,129:0.58:223
chr16	81242102	rs6420424	G	A	1783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.911;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=40;PP=971;ReadPosRankSum=-0.194;SC=TCACCTTCCCGGCACTGGTAC;SOR=0.555;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=213;TCF=117;TCR=96;TR=84;WE=81242110;WS=81242092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,97:0.40:242
chr16	81242148	rs55980345	GTT	G	2060.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FS=2.669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.86;ReadPosRankSum=-0.041;SOR=0.903;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:150,59:0.28:209
chr16	81242151	rs5818326	T	C	2068.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.865;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=28;PP=1945;ReadPosRankSum=-0.755;SC=GACACAGGTTTCCAAAGTAGG;SOR=0.846;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=183;TCF=90;TCR=93;TR=52;WE=81242159;WS=81242138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,62:0.30:208
chr16	81242194	rs6564838	T	C	866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.646;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=25;PP=631;ReadPosRankSum=-1.097;SC=TGACTGTAGCTCCTGGCACTG;SOR=0.815;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=151;TCF=72;TCR=79;TR=47;WE=81242202;WS=81242184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,47:0.29:161
chr16	81242366	rs6564839	T	C	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=218;ReadPosRankSum=1.449;SC=GAAGACCAGGTACTGGGCTAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=10;WE=81242374;WS=81242356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr16	81242386	rs6564840	T	G	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.522;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=159;ReadPosRankSum=0.676;SC=GGTACTCAGGTGAGGGAGAAG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=8;WE=81242394;WS=81242376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr16	81248745	rs8060294	A	G	1864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.467;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=45;PP=1220;ReadPosRankSum=-0.848;SC=GACCTGCCCCAAGCCACAGTG;SOR=0.514;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=215;TCF=119;TCR=96;TR=91;WE=81248753;WS=81248735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,96:0.42:230
chr16	81248935	rs8044334	T	G	618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.799;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=384;ReadPosRankSum=0.661;SC=GCAGGGGTGATAAATTGAATA;SOR=0.096;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=39;TCF=7;TCR=32;TR=23;WE=81248943;WS=81248925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,25:0.58:43
chr16	81249954	rs7191351	T	A	2321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.473;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=42;PP=1367;ReadPosRankSum=-0.256;SC=AGCGGCGGCCTGCCCTCCATG;SOR=0.648;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=228;TCF=134;TCR=94;TR=105;WE=81249962;WS=81249944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,114:0.47:243
chr16	81253526	rs141224532	A	ATTATT	235.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=312;ReadPosRankSum=0.998;SC=TTAGACATGAATTATTTAATC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=6;WE=81253534;WS=81253524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr16	81253637	rs9924275	A	G	2606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FS=1.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.03;ReadPosRankSum=0.667;SOR=0.533;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:128,72:0.36:200
chr16	81253642	rs62052455	AG	TC	2721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FS=1.835;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.41;ReadPosRankSum=0.309;SOR=0.561;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:129,74:0.36:203
chr16	81253745	rs9934272	C	G	2055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.141;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=39;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.495;SC=GGGAGATGTGCTTCTGCAGAA;SOR=0.916;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=255;TCF=137;TCR=118;TR=93;WE=81253767;WS=81253735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,103:0.37:276
chr16	81253759	rs9924371	A	G	1968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.109;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=41;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.093;SC=TGCAGAAACCACTGGGTGCCT;SOR=0.785;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=250;TCF=130;TCR=120;TR=91;WE=81253767;WS=81253735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,102:0.38:269
chr16	81253917	rs9924530	A	G	1601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.664;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=46;PP=989;ReadPosRankSum=-1.595;SC=CTCTGGCTTAACAGTGGTGGC;SOR=0.583;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=216;TCF=90;TCR=126;TR=81;WE=81253925;WS=81253907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,87:0.37:233
chr16	81254023	rs35807120	T	TA	179.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=140;ReadPosRankSum=-0.742;SC=TCTTGGGACTTTCATATGCGG;SOR=0.760;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=6;WE=81254031;WS=81254013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr16	81301460	rs34500060	G	C	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=182;ReadPosRankSum=-1.257;SC=TGTGGTCTTGGGGGGGCAGCC;SOR=0.793;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=11;WE=81301468;WS=81301453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr16	81301694	rs12934922	A	T	2304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=58;PP=1324;ReadPosRankSum=-0.703;SC=ACATCCGGAGAATGAGCTGGG;SOR=0.697;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=182;TCF=76;TCR=106;TR=99;WE=81301702;WS=81301684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,110:0.57:193
chr16	81303759	rs4889294	T	C	2037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.100;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=26;PP=1220;ReadPosRankSum=0.802;SC=TGTGTCCTTTTTCAGACTTAT;SOR=0.886;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=129;TCF=84;TCR=45;TR=77;WE=81303767;WS=81303749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,88:0.57:154
chr16	81320830	rs8048342	A	G	1560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=14;PP=1019;SC=ATCTTCATGCACTCCTATTTG;SOR=2.080;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=41;TCR=14;TR=55;WE=81320838;WS=81320820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr16	81398520	rs4889313	G	A	4242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=66;PP=2261;SC=TTTAATATCTGTTCACCTGAC;SOR=0.718;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=146;TCF=80;TCR=66;TR=146;WE=81398528;WS=81398510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr16	81528953	rs17777059	A	G	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=28;ReadPosRankSum=-0.253;SC=GGCGACCCACAGGCTTCTTGG;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=81528961;WS=81528943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr16	81529174	rs2925994	A	G	2861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=357;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.758;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=72;PP=1767;ReadPosRankSum=-1.503;SC=GCTGCTGGCCACAGGCCAGTG;SOR=0.591;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=333;TCF=159;TCR=174;TR=139;WE=81529182;WS=81529148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:209,148:0.41:357
chr16	81641452	rs7203914	A	G	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=61;ReadPosRankSum=1.834;SC=GCTGTAAACCAGGTCTGACTG;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=81641460;WS=81641442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr16	81703861	rs11150398	G	A	869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.659;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=23;PP=526;ReadPosRankSum=0.223;SC=GTGGGTCTCCGGCGCGACGTC;SOR=0.795;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=131;TCF=68;TCR=63;TR=45;WE=81703869;WS=81703851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,48:0.34:141
chr16	81703902	rs9921880	G	T	1209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.780;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=26;PP=697;ReadPosRankSum=1.436;SC=CTTTCCTCTCGGATCCTGTTT;SOR=0.820;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=84;TCF=41;TCR=43;TR=49;WE=81703910;WS=81703892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,54:0.57:94
chr16	81704033	rs8044418	C	G	339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=282;SC=AGCAACACTGCTGTTTCCTCA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=81704041;WS=81704023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr16	81712240	rs74910737	G	GCC	1083.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.103;HP=8;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=24;PP=542;ReadPosRankSum=0.759;SC=TGCTGTGAGTGCCCCCCCCGC;SOR=0.941;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=59;TCF=5;TCR=54;TR=26;WE=81712248;WS=81712230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,37:0.53:70
chr16	81726584	rs11642818	A	C	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.048;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=84;ReadPosRankSum=1.278;SC=CGCCTCCTCAAAGAAGGCCTT;SOR=0.368;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=8;WE=81726592;WS=81726580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr16	81726863	rs2288011	C	G	2978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.303;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=59;PP=1981;ReadPosRankSum=-1.267;SC=CCTCCGTGGCCCATGCATTCT;SOR=0.574;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=210;TCF=106;TCR=104;TR=121;WE=81726871;WS=81726853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,131:0.58:224
chr16	81730381	rs9933631	C	A	435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=10;PP=289;SC=CGGAGTTTCCCGGCTAACACA;SOR=0.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=7;TCR=10;TR=17;WE=81730389;WS=81730371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr16	81736324	rs4888167	C	T	1159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.910;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=32;PP=765;ReadPosRankSum=0.048;SC=GTGGGTTGGTCCTCTCTGTTG;SOR=0.563;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=88;TCF=21;TCR=67;TR=44;WE=81736332;WS=81736314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,49:0.52:95
chr16	81739376	rs3968320	T	A	409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=12;PP=316;SC=CACCATTCCATGTGCCAGGAA;SOR=2.985;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=81739384;WS=81739366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr16	81739404	rs9936604	T	C	57.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=2;PP=27;SC=GGGAAAAATATCCCTAACCTC;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=81739412;WS=81739394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr16	81740829	rs67721827	T	C	856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=23;PP=548;ReadPosRankSum=2.480;SC=TAATGGCAGATCAAAAAGAGT;SOR=0.727;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=79;TCF=31;TCR=48;TR=36;WE=81740837;WS=81740819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,41:0.46:89
chr16	81743328	rs68116357	A	G	3366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.162;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=57;PP=1815;ReadPosRankSum=-1.584;SC=ACACGTGACAAGGACTCTTAT;SOR=0.554;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=224;TCF=126;TCR=98;TR=130;WE=81743336;WS=81743318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,153:0.60:254
chr16	81816733	rs8045964	C	T	1173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.307;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=23;PP=745;ReadPosRankSum=1.207;SC=TGGTTTCTGTCTAATTGAAGG;SOR=0.561;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=149;TCF=92;TCR=57;TR=58;WE=81816741;WS=81816723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,62:0.39:158
chr16	81816787	rs4476171	T	A	5130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=100;PP=2965;SC=TCCAGTGGACTATGGCCTAGA;SOR=0.947;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=182;TCF=82;TCR=100;TR=182;WE=81816795;WS=81816777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr16	81819486	rs4354929	C	G	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=4.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.874;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=255;ReadPosRankSum=-0.921;SC=GAAGTTCATGCCCTGTTAACT;SOR=1.661;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=52;TCF=44;TCR=8;TR=15;WE=81819494;WS=81819476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,16:0.30:53
chr16	81819768	rs1143685	T	C	940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.798;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=30;PP=493;ReadPosRankSum=-0.609;SC=GCAAGACCGCTGACAAGATCG;SOR=0.846;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=102;TCF=34;TCR=68;TR=45;WE=81819776;WS=81819758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,48:0.48:100
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chr16	81887977	rs34028338	G	C	2000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.501;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=25;PP=1310;ReadPosRankSum=0.899;SC=TGCCTGGGCTGCAGTTGTGTG;SOR=0.499;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=115;TCF=79;TCR=36;TR=76;WE=81887985;WS=81887967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,86:0.66:130
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chr16	81891790	rs36114479	C	G	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=265;ReadPosRankSum=-2.170;SC=TCTTCGTGATCTGTATGGGGC;SOR=0.859;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=15;WE=81891798;WS=81891780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr16	81891998	rs4341734	G	C	7522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=133;NR=125;PP=2965;SC=CGTAGTTGCTGATTCCTTTAT;SOR=0.723;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=259;TCF=134;TCR=125;TR=258;WE=81892006;WS=81891988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,272:1.00:272
chr16	81892043	rs67392656	GAAAA	G	8041.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.05;NF=11;NR=98;PP=2020;SC=CTACAGGGGGGAAAAAAAAAA;SOR=1.147;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=130;TCF=12;TCR=118;TR=109;WE=81892055;WS=81892032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr16	81892708	rs4888183	T	A	1678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.813;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=18;PP=1106;ReadPosRankSum=1.232;SC=TTTTGTCTCATATTTCTTTCC;SOR=0.586;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=99;TCF=72;TCR=27;TR=63;WE=81892716;WS=81892698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,69:0.62:111
chr16	81892913	rs12596639	C	T	687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=20;PP=401;ReadPosRankSum=-0.370;SC=ATGTTGGGTCCTGGGGTTGAG;SOR=0.642;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=58;TCF=25;TCR=33;TR=35;WE=81892921;WS=81892903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,35:0.57:61
chr16	81902797	rs12445580	A	G	1370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.582;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=22;PP=918;ReadPosRankSum=-0.764;SC=AGGTGACAGAACTGGGTCTCC;SOR=0.976;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=174;TCF=109;TCR=65;TR=63;WE=81902805;WS=81902787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,68:0.37:186
chr16	81902990	rs4889419	G	A	961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.029;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=28;PP=584;ReadPosRankSum=0.825;SC=TTTGAGTTCCGTGGAATAGTG;SOR=1.081;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=79;TCF=23;TCR=56;TR=38;WE=81902998;WS=81902980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,43:0.50:86
chr16	81903055	rs4889420	G	A	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=35;ReadPosRankSum=-1.515;SC=GAGGGATCATGGACATATCTG;SOR=0.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=4;WE=81903063;WS=81903045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr16	81904433	rs34761601	TG	T	324.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.338;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.793;NF=9;NR=4;PP=377;ReadPosRankSum=0.474;SC=AAAAATCATGTGGTCACTTTT;SOR=1.042;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=40;TCF=28;TCR=12;TR=13;WE=81904441;WS=81904423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,14:0.25:57
chr16	81904674	rs7192509	T	C	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=176;ReadPosRankSum=-0.832;SC=ATGAGAATGATGAAAGCATAC;SOR=0.811;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=60;TCF=17;TCR=43;TR=19;WE=81904682;WS=81904664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,20:0.32:62
chr16	81904711	rs7192535	T	A	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=25;ReadPosRankSum=-0.993;SC=ATTGGCAAAATTCTTTAACCA;SOR=0.160;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=5;WE=81904719;WS=81904701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr16	81914619	rs41305761	A	C	1080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.016;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=34;PP=698;ReadPosRankSum=0.763;SC=CCTGGTGCCCAGCCGGCCTCC;SOR=1.067;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=83;TCF=28;TCR=55;TR=49;WE=81914627;WS=81914609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,51:0.59:87
chr16	81917099	rs6564928	G	T	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.511;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=69;ReadPosRankSum=0.150;SC=AACGATTGCAGTCTGCCAGAT;SOR=0.859;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=6;WE=81917107;WS=81917089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr16	81927559	rs369775573	TTTC	T	98.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.77;MQRankSum=0.842;QD=9.87;ReadPosRankSum=0.108;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr16	81929488	rs1143688	C	T	2993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=406;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=69;PP=1930;ReadPosRankSum=-0.212;SC=TCAAGTTTGACGACGTCGTGC;SOR=0.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=379;TCF=206;TCR=173;TR=151;WE=81929496;WS=81929468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:244,160:0.40:404
chr16	81931403	rs8049305	A	G	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.232;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=308;ReadPosRankSum=-2.093;SC=TCCCGCCTCAACCTCCCAAAG;SOR=0.426;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=79;TCF=67;TCR=12;TR=23;WE=81931411;WS=81931393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,25:0.31:81
chr16	81939150	rs4435248	G	C	1346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=34;PP=912;ReadPosRankSum=0.617;SC=CTGCGGCCACGCCCCTTGCAG;SOR=0.582;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=19;TCR=51;TR=47;WE=81939158;WS=81939140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,53:0.67:79
chr16	81941085	rs72823102	C	G	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=40;ReadPosRankSum=1.345;SC=AGCTCAAATACCAAAAGAAGC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=81941093;WS=81941079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr16	81941101	rs72824903	A	G	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=174;ReadPosRankSum=1.815;SC=GAAGCTCAAAATGCATCGATA;SOR=0.283;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=11;WE=81941109;WS=81941091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr16	81941160	rs41301803	A	G	899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=5;PP=426;ReadPosRankSum=-1.123;SC=AGAATTCGCCATAAATGTCTA;SOR=0.760;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=54;TCF=44;TCR=10;TR=35;WE=81941168;WS=81941150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,42:0.69:61
chr16	81953081	rs12448130	T	C	1923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=21;PP=1143;SC=GTGTTCTTCCTGCTCCAGGGC;SOR=1.263;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=39;TCR=21;TR=60;WE=81953089;WS=81953071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr16	81953368	rs12448152	A	G	2266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=50;PP=1415;SC=TTCACCATGTATCTGATACTG;SOR=1.854;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=24;TCR=50;TR=74;WE=81953376;WS=81953358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr16	81954789	rs12446127	C	G	4289.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FS=0.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.58;ReadPosRankSum=1.423;SOR=0.723;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:122,194:0.61:316
chr16	81956927	rs4485360	C	G	465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=2;PP=387;SC=TTGGGGCCTTCGATCCTTTGC;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=81956935;WS=81956917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	81962071	rs4366702	A	C	903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.581;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=11;PP=562;ReadPosRankSum=-0.315;SC=TTCCACAGGCAGTATCTCTGC;SOR=1.228;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=60;TCF=42;TCR=18;TR=39;WE=81962090;WS=81962061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,41:0.61:67
chr16	81971403	rs1071644	T	C	7018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=122;NR=126;PP=2965;SC=TTTCTCTCAATGGGCGCACGG;SOR=0.845;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=248;TCF=122;TCR=126;TR=248;WE=81971411;WS=81971393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr16	81973474	rs4405546	C	A	2447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=23;PP=1565;SC=TGTGGCCTCTCATGAGCTTTG;SOR=1.744;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=55;TCR=23;TR=78;WE=81973482;WS=81973464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr16	82124776	rs2955154	G	T	3250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=70;PP=2101;SC=TCAGTTAAAGGGGTGAAAACA;SOR=1.493;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=110;TCF=40;TCR=70;TR=110;WE=82124784;WS=82124766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr16	82182832	rs11859599	C	G	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.016;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=393;ReadPosRankSum=-0.569;SC=AGCTGCCGTGCACTGTGGGGT;SOR=0.231;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=53;TCF=44;TCR=9;TR=24;WE=82182840;WS=82182822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,25:0.45:56
chr16	82197883	rs2303266	G	A	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.166;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.16;ReadPosRankSum=-0.023;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr16	82203705	rs2303265	A	C	2800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FS=1.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.77;ReadPosRankSum=-0.193;SOR=0.797;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:182,78:0.30:260
chr16	82203711	rs2303264	G	T	2891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.40;ReadPosRankSum=-1.373;SOR=0.722;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:188,90:0.32:278
chr16	82203742	rs1134847	T	C	3895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=362;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=50;PP=1400;ReadPosRankSum=1.485;SC=TCATGCGCAGTAGATTCTTGG;SOR=0.684;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=332;TCF=179;TCR=153;TR=107;WE=82203750;WS=82203732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:250,112:0.31:362
chr16	82203758	rs2303262	C	T	4128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=375;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.01;ReadPosRankSum=1.431;SOR=0.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:259,116:0.31:375
chr16	82203768	rs2303261	G	T	4131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=354;ExcessHet=3.0103;FS=0.861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.67;ReadPosRankSum=0.453;SOR=0.766;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:240,114:0.32:354
chr16	82203786	rs2303260	C	G	3572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.922;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=46;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.568;SC=GCCATGGTAGCTTCCGCCCAG;SOR=0.622;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=286;TCF=139;TCR=147;TR=94;WE=82203794;WS=82203748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:210,101:0.32:311
chr16	82673047	rs4782724	C	T	5531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=98;NR=94;PP=2965;SC=TGGGCGTGACCCACCTGCAGC;SOR=0.703;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=192;TCF=98;TCR=94;TR=192;WE=82673055;WS=82673037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr16	82882118	rs1585533	A	G	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=152;ReadPosRankSum=0.146;SC=TTTTTAAATTATTACTTTGTC;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=9;WE=82882126;WS=82882113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr16	82882187	rs35909991	TG	T	323.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=1.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.87;MQRankSum=4.455;QD=3.72;ReadPosRankSum=0.236;SOR=0.492;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,24:0.28:87
chr16	82882417	rs35862345	C	G	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=236;ReadPosRankSum=0.478;SC=TTGCATGTCTCTCTCTTTAAA;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=13;WE=82882425;WS=82882407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr16	82917768	rs929847	G	C	766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.593;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=11;PP=471;ReadPosRankSum=-0.291;SC=TCCTTATGCTGTTTCTTTCCA;SOR=1.009;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=108;TCF=67;TCR=41;TR=37;WE=82917776;WS=82917758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,40:0.34:116
chr16	82917852	rs929848	T	C	1159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FS=1.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.98;ReadPosRankSum=1.937;SOR=0.586;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:125,69:0.36:194
chr16	83065664	rs6565105	G	A	6680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=138;NR=92;PP=2965;SC=ATGAGGTCTCGAGCCCATACT;SOR=1.031;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=231;TCF=138;TCR=93;TR=230;WE=83065672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr16	83065904	rs7197530	T	C	2465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=57;PP=1743;SC=GGGTCTTTAATTTATTATGTT;SOR=2.112;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=21;TCR=57;TR=78;WE=83065912;WS=83065894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr16	83065965	rs2228685	T	A	560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=15;PP=432;SC=AATCCAACTCTAAAAATGTAG;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=83065973;WS=83065955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	83159350	rs7196370	A	C	1419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=36;NR=11;PP=1019;SC=GTTGAAATTAAGCAGGAAGAT;SOR=2.078;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=36;TCR=11;TR=47;WE=83159358;WS=83159340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr16	83542061	rs4782540	C	T	883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=19;PP=517;SC=CACTCCCATACAGGCTTTCAA;SOR=1.911;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=27;WE=83542069;WS=83542051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr16	83658649	rs11639522	C	G	2939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.118;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=48;PP=1981;ReadPosRankSum=-0.505;SC=TATTTAAGCACAAAAATGGAC;SOR=0.815;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=193;TCF=120;TCR=73;TR=122;WE=83658657;WS=83658639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,130:0.62:211
chr16	83781604	rs16961631	T	C	982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=6;PP=626;ReadPosRankSum=-2.138;SC=TTTGGATTTTTGTTACCTAGG;SOR=0.790;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=72;TCF=59;TCR=13;TR=36;WE=83781612;WS=83781594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,40:0.52:77
chr16	83816828	rs153654	A	G	2157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=21;PP=1314;SC=AGTCTCATCCACTCTCACCAG;SOR=1.854;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=51;TCR=21;TR=72;WE=83816836;WS=83816818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr16	83817019	rs1048612	A	G	2766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=57;PP=1694;SC=GCAACGCGGCAGGGGCCCTGC;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=35;TCR=57;TR=92;WE=83817027;WS=83817009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr16	83828683	rs11311412	GA	G	1947.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=463;ExcessHet=3.0103;FS=5.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.02;MQRankSum=1.451;QD=4.77;ReadPosRankSum=0.949;SOR=0.481;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:282,126:0.31:408
chr16	83842792	rs8053753	G	T	1142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=7;PP=760;SC=TAACAGTGTCGAAAGAAAATT;SOR=2.191;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=36;WE=83842800;WS=83842782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr16	83873259	rs435383	G	A	305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=1;PP=199;SC=AGGAACAGAGGACTCATTTCT;SOR=2.494;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=83873267;WS=83873249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr16	83873285	rs435367	G	A	451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=14;NR=1;PP=278;SC=GTGTGTGTGTGTGCTCCTGTG;SOR=2.179;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=15;WE=83873293;WS=83873275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr16	83873300	rs146203605	T	TTG	793.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=7;PP=508;ReadPosRankSum=-0.319;SC=CCTGTGTCCTTTGTGTGTGTG;SOR=1.022;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=9;TCR=10;TR=13;WE=83873320;WS=83873290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,19:0.70:27
chr16	83873310	.	GTC	G	61.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.801;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.32;MQRankSum=-0.417;QD=2.06;ReadPosRankSum=-0.726;SOR=0.430;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,6:0.20:30
chr16	83873312	rs367415	C	G	802.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=1.564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.32;MQRankSum=0.678;QD=26.76;ReadPosRankSum=-0.563;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,22:0.73:30
chr16	83873471	rs34854190	G	A	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.64;ReadPosRankSum=1.407;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr16	83886468	rs150603407	GTGCACACA	G	3283.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=5.062;NF=25;NR=30;PP=2974;ReadPosRankSum=0.209;SC=GCACACACACGTGCACACATG;SOR=0.724;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=114;TCF=50;TCR=64;TR=55;WE=83886483;WS=83886458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,92:0.57:162
chr16	83886589	rs12597522	A	T	1867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.405;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-3.045;NF=44;NR=56;PP=1127;ReadPosRankSum=-0.306;SC=CCAGGGCTGGATTGGGTTGGA;SOR=0.800;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=293;TCF=139;TCR=154;TR=100;WE=83886597;WS=83886579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:212,110:0.34:322
chr16	83933296	rs446036	T	C	1265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=33;PP=952;SC=CCGCCGTCGATCCCCCGGCAG;SOR=3.500;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=5;TCR=33;TR=38;WE=83933304;WS=83933286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr16	83940480	rs3815804	A	G	1050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.603;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=19;PP=1854;ReadPosRankSum=0.195;SC=GTCTTGCACAATTGTCTTATG;SOR=0.495;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=97;TCF=66;TCR=31;TR=48;WE=83940502;WS=83940470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,51:0.46:110
chr16	83940494	rs3815805	C	T	1468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.399;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=16;PP=1623;ReadPosRankSum=-0.134;SC=TCTTATGTATCGTGCTTGAGT;SOR=0.874;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=123;TCF=81;TCR=42;TR=58;WE=83940502;WS=83940470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,69:0.51:136
chr16	83982460	rs4782863	A	G	772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=1;PP=561;SC=GGATCACGTCACAAGCTCTCA;SOR=4.479;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=27;WE=83982468;WS=83982455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr16	83982960	rs4782864	C	T	4377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=49;PP=2413;SC=TTGAGCACTCCAGGGTGGGGG;SOR=1.319;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=143;TCF=94;TCR=49;TR=143;WE=83982968;WS=83982950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr16	83983071	rs4782865	C	T	7146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=115;NR=123;PP=2965;SC=AAGTGGAGACCGAGAGGCTGC;SOR=0.860;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=238;TCF=115;TCR=123;TR=238;WE=83983079;WS=83983061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,269:1.00:269
chr16	83983755	rs2245008	G	A	1287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=6;PP=825;SC=CATGGCCCCAGCTGTGCCTAA;SOR=2.584;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=32;TCR=6;TR=38;WE=83983763;WS=83983745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr16	83983775	rs12933677	T	C	1047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=8;PP=675;ReadPosRankSum=-0.798;SC=ACCTCTTCCCTAAGCCTTTTT;SOR=0.815;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=71;TCF=55;TCR=16;TR=38;WE=83983788;WS=83983765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,45:0.57:79
chr16	83983867	.	C	T	2965	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=50;MMLQ=24;MQ=57.39;NF=118;NR=117;PP=2965;QD=20;SC=GGCAGATACGCACACACAGAC;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=235;TCF=118;TCR=117;TR=235;WE=83983875;WS=83983857;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr16	83983892	.	CA	TG	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=36;MMLQ=27;MQ=56.48;NF=86;NR=102;PP=2947;QD=20;SC=GCATACATACCAGCACACACG;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=195;TCF=90;TCR=105;TR=188;WE=83983901;WS=83983882;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:7,188:0.96:195
chr16	83983920	.	G	A	2465	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=54;MMLQ=27;MQ=55.09;NF=57;NR=77;PP=2465;QD=18.6550090489;SC=ACATGCACACGTGAGCACATG;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=134;TCF=57;TCR=77;TR=134;WE=83983928;WS=83983910;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr16	83984706	rs147293432	CCT	C	383.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=3.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.51;ReadPosRankSum=0.756;SOR=0.877;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:130,23:0.15:153
chr16	83984776	rs28555129	A	C	4827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=84;NR=74;PP=2955;SC=TCTACCAGGAACCAGCCCCAG;SOR=0.704;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=158;TCF=84;TCR=74;TR=158;WE=83984784;WS=83984766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr16	83984844	rs2244899	A	C	3669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.67;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr16	83984850	rs2244898	C	G	3530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.46;SOR=1.519;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr16	83986885	rs7203516	C	G	18888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=417;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.30;SOR=0.831;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,417:1.00:417
chr16	83986888	rs7203864	G	A	18789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=423;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.42;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,423:1.00:423
chr16	83992785	rs2665296	G	A	5170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=113;NR=62;PP=2965;SC=TGAATGCGCCGCATCTAGATC;SOR=1.337;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=176;TCF=114;TCR=62;TR=175;WE=83992793;WS=83992775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr16	83999261	rs35132222	C	A	2616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.409;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=68;PP=1701;ReadPosRankSum=-0.548;SC=ACCGCAGCCTCCCCAGGCACC;SOR=0.740;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=307;TCF=147;TCR=160;TR=125;WE=83999269;WS=83999251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:198,131:0.40:329
chr16	84050037	rs12929392	G	C	969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=11;PP=721;SC=CCACCTTCCAGAACCTTGACC;SOR=1.675;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=24;TCR=11;TR=35;WE=84050045;WS=84050027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr16	84056325	rs5818479	CTT	C	5557.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=33;NR=44;PP=2974;SC=CGCTGTTACTCTTGTTTCTAC;SOR=1.206;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=78;TCF=34;TCR=44;TR=77;WE=84056334;WS=84056315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
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chr16	84065710	rs907043	A	G	673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.69;SOR=2.531;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	84065710	.	ATCCTCATCTG	GTCCTCATCTA,GTCCTCATCTG	75	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.31;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=0,4;NR=6,12;PP=75,75;QD=21.411312477;SC=CTGCCTCACCATCCTCATCTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=6,16;WE=84065728;WS=84065700;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.38:16
chr16	84065720	rs907044	G	A	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.837;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.38;ReadPosRankSum=-1.014;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr16	84070238	rs8057543	C	A	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.550;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=207;ReadPosRankSum=-2.226;SC=TCCTGCTCAACTGGAAACTCC;SOR=1.341;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=15;WE=84070246;WS=84070228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr16	84070500	rs1317524	C	G	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.20;ReadPosRankSum=1.971;SOR=0.519;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr16	84070510	rs1876962	G	A	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=2.865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.30;ReadPosRankSum=0.098;SOR=0.144;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr16	84070514	rs1876960	A	C	490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=2.865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.83;ReadPosRankSum=0.098;SOR=0.144;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr16	84075563	rs1105355	C	A	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=257;ReadPosRankSum=0.914;SC=ACTCACTTCCCGGGGACTTAC;SOR=0.756;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=20;WE=84075571;WS=84075553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,23:0.64:36
chr16	84088026	rs2280026	T	C	2020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.556;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=45;PP=1127;ReadPosRankSum=-0.901;SC=AGGCTCTCTCTGGCCCTCACG;SOR=0.761;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=156;TCF=75;TCR=81;TR=84;WE=84088034;WS=84088016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,96:0.55:176
chr16	84088047	rs11607	C	T	1428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=32;PP=805;ReadPosRankSum=-0.312;SC=GTCAGCCAGGCTGCCGGTCAC;SOR=0.704;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=148;TCF=72;TCR=76;TR=64;WE=84088055;WS=84088037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,73:0.43:169
chr16	84088267	rs17849045	G	A	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=393;ReadPosRankSum=-0.959;SC=GAGGACAGCCGGTTGAACAGG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=18;TCR=30;TR=26;WE=84088275;WS=84088257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,30:0.58:52
chr16	84088968	rs8053890	T	C	1720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.097;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=31;PP=1041;ReadPosRankSum=-0.476;SC=CTCCTCTTGGTAGCTATAAAC;SOR=0.800;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=183;TCF=100;TCR=83;TR=72;WE=84088976;WS=84088958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,83:0.40:206
chr16	84089207	rs6563996	G	T	1007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.658;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=29;PP=625;ReadPosRankSum=0.924;SC=GGGCCTTCTGGGCTGAGGGCT;SOR=0.912;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=100;TCF=36;TCR=64;TR=44;WE=84089215;WS=84089197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,48:0.47:103
chr16	84089536	rs11415464	T	TG	572.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=6;PP=406;SC=GCCCGCCTCCTGGGGAGGGAG;SOR=0.914;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=11;TCF=5;TCR=6;TR=11;WE=84089544;WS=84089532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	84089767	rs17849043	C	T	601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.754;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=20;PP=327;ReadPosRankSum=-0.143;SC=TAAAACAAAACAAAAATAAGC;SOR=0.576;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=47;TCR=60;TR=36;WE=84089775;WS=84089752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,36:0.31:118
chr16	84093062	rs2280024	G	A	1429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.495;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=42;PP=886;ReadPosRankSum=0.158;SC=TCAACAAAAAGGAAAATCATC;SOR=0.754;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=239;TCF=101;TCR=138;TR=72;WE=84093070;WS=84093052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,81:0.30:266
chr16	84093152	rs2280023	T	G	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.854;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=270;ReadPosRankSum=2.188;SC=ACAGAGCCCCTGTGCTCTATT;SOR=1.495;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=52;TCF=7;TCR=45;TR=16;WE=84093160;WS=84093142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,17:0.31:54
chr16	84094450	.	CT	C	171.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.490;ClippingRankSum=0.000;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=4.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.24;MQRankSum=2.545;QD=2.60;ReadPosRankSum=3.342;SOR=1.489;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,16:0.24:66
chr16	84100173	rs11550470	C	T	5229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=396;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.776;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=115;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.407;SC=GCAGCTCATTCAGAGCTGGGA;SOR=0.648;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=360;TCF=170;TCR=190;TR=219;WE=84100181;WS=84100163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,242:0.61:395
chr16	84101240	rs3835163	C	CACATTTT	1685.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.058;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=8;PP=1017;ReadPosRankSum=0.683;SC=CCCCAAAAGTCTTATCCAAAT;SOR=1.284;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=80;TCF=36;TCR=44;TR=21;WE=84101248;WS=84101230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,40:0.29:138
chr16	84101875	rs3817151	C	T	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.70;ReadPosRankSum=-1.766;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr16	84102135	rs870584	G	C	1175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.571;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=33;PP=764;ReadPosRankSum=-0.185;SC=CACAGGGCCGGCTCTGCAAGA;SOR=0.623;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=163;TCF=75;TCR=88;TR=60;WE=84102143;WS=84102125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,65:0.35:184
chr16	84104478	rs1980011	C	T	797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=20;PP=535;SC=AAACTGGTTCCGAGAAATACT;SOR=1.942;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=28;WE=84104486;WS=84104468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr16	84115279	rs3826139	T	C	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=204;ReadPosRankSum=0.718;SC=AGGCTTGTATTTTGTGCAGAG;SOR=1.179;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=10;WE=84115287;WS=84115269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr16	84115483	rs3743631	G	A	7579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=127;NR=126;PP=2965;SC=TCATACTGGCGGGATTCACCA;SOR=0.708;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=253;TCF=127;TCR=126;TR=253;WE=84115491;WS=84115473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,278:1.00:278
chr16	84115561	rs3743632	G	A	1454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.074;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=30;PP=918;ReadPosRankSum=1.941;SC=TAAAAGAATGGAAATTGGACC;SOR=0.599;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=209;TCF=105;TCR=104;TR=65;WE=84115569;WS=84115551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,77:0.33:235
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chr16	84121105	rs11312336	GA	G	135.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.08;ReadPosRankSum=-1.383;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
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chr16	84203939	rs11644164	C	T	4763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=624;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.125;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=128;NR=96;PP=2698;ReadPosRankSum=-1.709;SC=CCACCACCACCGCCCCTGGGA;SOR=0.761;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=582;TCF=322;TCR=260;TR=224;WE=84203947;WS=84203929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:374,248:0.40:622
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chr16	84205726	rs12926474	G	A	440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=266;SC=CTTGTGATCCGCCCACCTTGG;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=84205734;WS=84205720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	84208335	rs3826151	G	T	4324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=552;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=3.233;NF=104;NR=102;PP=2720;ReadPosRankSum=-1.164;SC=CCAGGTTAAGGTCATTAGAAA;SOR=0.692;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=501;TCF=257;TCR=244;TR=206;WE=84208343;WS=84208325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:329,222:0.40:551
chr16	84208442	rs67628212	T	C	4026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.982;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=4.317;NF=39;NR=70;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.083;SC=GCATAAAGCATTGAATTCCCC;SOR=0.765;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=255;TCF=93;TCR=162;TR=109;WE=84208454;WS=84208432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,114:0.42:270
chr16	84208446	rs111554344	AT	A	3908.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.683;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=4.432;NF=0;NR=65;PP=2948;ReadPosRankSum=0.379;SC=AAAGCATTGAATTCCCCCATA;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=159;TCF=4;TCR=155;TR=65;WE=84208454;WS=84208432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,101:0.41:246
chr16	84208495	rs62049864	T	C	642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=24;PP=524;ReadPosRankSum=-0.754;SC=AGAGTCTGGCTCTGTCACCCA;SOR=0.848;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=75;TCF=11;TCR=64;TR=28;WE=84208503;WS=84208485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,28:0.35:79
chr16	84209498	rs4782899	T	C	1400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.617;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=18;PP=810;ReadPosRankSum=-0.205;SC=GATTCTGTTGTGAAAACAGAA;SOR=0.610;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=153;TCF=108;TCR=45;TR=62;WE=84209506;WS=84209488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,68:0.40:168
chr16	84209634	rs2288019	C	G	3116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=419;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=75;PP=2148;ReadPosRankSum=-0.224;SC=TGGAAAACCTCCCCACAGACA;SOR=0.627;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=381;TCF=192;TCR=189;TR=148;WE=84209642;WS=84209624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:262,157:0.37:419
chr16	84209738	rs2288020	T	C	2646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.945;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=62;PP=1422;ReadPosRankSum=-0.061;SC=AAGAGGGACTTGGAAATCCGA;SOR=0.800;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=253;TCF=129;TCR=124;TR=121;WE=84209746;WS=84209728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,132:0.47:281
chr16	84209815	rs2288021	C	G	2433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.552;HP=1;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=47;PP=2888;ReadPosRankSum=-0.742;SC=CTCTGGCCAGCTACTGATGCC;SOR=0.423;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=198;TCF=90;TCR=108;TR=95;WE=84209824;WS=84209805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,114:0.52:221
chr16	84209816	rs2288022	T	C	2256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.475;HP=1;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=59;PP=2962;ReadPosRankSum=0.411;SC=TCTGGCCAGCTACTGATGCCC;SOR=1.034;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=199;TCF=91;TCR=108;TR=102;WE=84209824;WS=84209805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,109:0.49:224
chr16	84209864	rs2288023	G	C	1402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.397;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=38;PP=871;ReadPosRankSum=0.383;SC=CTCACTTCCAGTGGAGACAGG;SOR=0.536;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=130;TCF=50;TCR=80;TR=63;WE=84209872;WS=84209854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,67:0.48:139
chr16	84211483	rs8692	C	T	1171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.628;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=31;PP=670;ReadPosRankSum=-1.407;SC=ATGGTTTAATCATAAATGTCT;SOR=0.766;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=55;TCR=75;TR=54;WE=84211491;WS=84211473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,61:0.42:146
chr16	84211969	rs3208968	A	C	3407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=380;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.770;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.884;NF=69;NR=85;PP=2165;ReadPosRankSum=1.929;SC=CAGCCTAAAAAACGTGACCAT;SOR=0.565;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=354;TCF=150;TCR=204;TR=154;WE=84211977;WS=84211954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:210,166:0.44:376
chr16	84212571	rs1804500	C	A	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.197;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=9;PP=388;ReadPosRankSum=1.932;SC=GAGGCTTCTTCCGGAGGGGCT;SOR=1.022;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=62;TCF=43;TCR=19;TR=28;WE=84212579;WS=84212561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,27:0.42:65
chr16	84213114	rs2230130	C	T	814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.627;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=26;PP=603;ReadPosRankSum=0.331;SC=CCTTGCGGAGCACACCCAGCC;SOR=0.936;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=106;TCF=43;TCR=63;TR=40;WE=84213122;WS=84213104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,41:0.36:114
chr16	84213434	rs2230129	A	T	2474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=56;PP=1430;ReadPosRankSum=-0.408;SC=GCTGAGGGCAAGGGCGGGACG;SOR=0.698;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=304;TCF=168;TCR=136;TR=123;WE=84213442;WS=84213424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:192,132:0.41:324
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chr16	84213748	rs2278042	C	T	1170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.653;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=29;PP=683;ReadPosRankSum=-0.990;SC=ATCTCCCACACGCCGCCCACC;SOR=0.777;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=118;TCF=53;TCR=65;TR=51;WE=84213756;WS=84213738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,58:0.44:131
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chr16	84215133	rs4150149	C	T	2166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.516;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=53;PP=1277;ReadPosRankSum=0.437;SC=TCAAGGGTCGCGACATGCTCA;SOR=0.596;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=246;TCF=111;TCR=135;TR=99;WE=84215141;WS=84215123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,109:0.42:259
chr16	84215314	rs3815814	T	C	2144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.156;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=44;PP=1420;ReadPosRankSum=1.812;SC=CAGCCCTGCCTCCAGCCCCTC;SOR=0.568;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=223;TCF=126;TCR=97;TR=97;WE=84215322;WS=84215304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,107:0.43:247
chr16	84215390	rs2230127	T	C	2336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.408;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=58;PP=1312;ReadPosRankSum=1.053;SC=CCACCTGCATTGCCTGCAGAA;SOR=0.680;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=313;TCF=159;TCR=154;TR=121;WE=84215398;WS=84215380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:203,129:0.39:332
chr16	84215692	rs2303237	C	T	4510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=603;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.534;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=118;NR=109;PP=2697;ReadPosRankSum=-0.183;SC=GATCAGTGCACGAGCTATGAT;SOR=0.638;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=570;TCF=299;TCR=271;TR=227;WE=84215700;WS=84215682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:363,239:0.40:602
chr16	84217062	rs4782591	C	T	5808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=120;PP=2965;SC=CCGATACCGGCACCCTCCGCG;SOR=1.383;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=198;TCF=78;TCR=120;TR=198;WE=84217070;WS=84217052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr16	84224805	rs8044351	G	C	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.96;ReadPosRankSum=1.672;SOR=0.807;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,31:0.31:101
chr16	84224967	rs8044695	G	A	545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.304;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=12;PP=367;ReadPosRankSum=0.535;SC=AGTGCCTGGGGGCCCGCGCCC;SOR=0.535;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=68;TCF=31;TCR=37;TR=26;WE=84224975;WS=84224957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,28:0.37:75
chr16	84225327	rs8049081	C	G	1140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.287;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=21;PP=640;ReadPosRankSum=-2.146;SC=ACGTGGGGAGCAGGGGGTCTG;SOR=0.298;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=98;TCF=44;TCR=54;TR=46;WE=84225335;WS=84225317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,53:0.50:106
chr16	84228237	rs11646787	A	C	1308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.202;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=36;PP=792;ReadPosRankSum=1.072;SC=GGACAAGAGGACTGAGGCTGG;SOR=0.492;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=138;TCF=47;TCR=91;TR=56;WE=84228245;WS=84228227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,65:0.43:150
chr16	84228279	rs35446963	G	A	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.995;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=319;ReadPosRankSum=-1.951;SC=GTGGCTGTGCGTGTGAGCAGG;SOR=0.191;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=56;TCF=10;TCR=46;TR=24;WE=84228287;WS=84228269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,28:0.46:61
chr16	84228612	rs35353940	CT	C	4712.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=388;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.181;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.03;MQRankSum=1.204;NF=23;NR=64;PP=2919;ReadPosRankSum=-1.344;SC=CGGACCCAGGCTTGTAGTGTC;SOR=0.590;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=231;TCF=71;TCR=160;TR=87;WE=84228620;WS=84228602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:227,158:0.41:385
chr16	84229436	rs62049905	G	A	640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=18;PP=442;ReadPosRankSum=0.495;SC=CCCCCACCTCGGAAGGTGGCC;SOR=0.724;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=121;TCF=60;TCR=61;TR=35;WE=84229444;WS=84229426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,37:0.28:132
chr16	84229559	rs2303238	T	C	1089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FS=4.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.24;ReadPosRankSum=-2.064;SOR=0.515;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:139,69:0.33:208
chr16	84229580	rs2303239	C	T	1266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=29;PP=746;ReadPosRankSum=-1.140;SC=CACGCTGGGCCGTGCTGGGGC;SOR=0.714;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=188;TCF=107;TCR=81;TR=66;WE=84229588;WS=84229570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,71:0.34:209
chr16	84270381	rs244811	G	A	1324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.803;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=19;PP=670;ReadPosRankSum=1.379;SC=TGACACACAGGCTGACGGCTG;SOR=0.925;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=142;TCF=88;TCR=54;TR=54;WE=84270389;WS=84270371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,67:0.40:168
chr16	84270476	rs11646443	G	A	2880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=362;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.755;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=53;PP=1821;ReadPosRankSum=-0.314;SC=TCGCGCAGCCGGTTCATGCAC;SOR=0.790;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=317;TCF=177;TCR=140;TR=126;WE=84270484;WS=84270466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:217,144:0.40:361
chr16	84271193	rs11647665	C	T	1989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.055;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=56;PP=1358;ReadPosRankSum=0.601;SC=GGCAAAGAGTCCTGGATGTCA;SOR=0.796;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=220;TCF=87;TCR=133;TR=92;WE=84271201;WS=84271183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,97:0.42:231
chr16	84328494	rs400345	C	T	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.726;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=296;ReadPosRankSum=-0.881;SC=AGACTGTGCACGCTCCTGTCC;SOR=0.102;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=23;WE=84328502;WS=84328484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,23:0.64:36
chr16	84328752	rs369797	G	T	5742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.18;SOR=1.353;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr16	84328756	rs401782	G	C	5634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.72;SOR=1.379;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr16	84328826	rs429725	A	G	860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=22;PP=633;SC=TGCTCCCCCAAAACGTGGCAA;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=84328834;WS=84328816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr16	84351828	rs187372	G	A	1286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.608;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=22;PP=627;ReadPosRankSum=1.192;SC=AAGCCTGGGCGTTTCTCAGCT;SOR=0.770;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=128;TCF=73;TCR=55;TR=57;WE=84351836;WS=84351818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,68:0.46:148
chr16	84353040	.	A	G	1968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.038;ClippingRankSum=0.000;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.882;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=43;PP=1229;ReadPosRankSum=-1.445;SC=CCTGCAGCAGAGGCGTGCAGC;SOR=0.824;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=245;TCF=127;TCR=118;TR=97;WE=84353048;WS=84353030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,104:0.40:262
chr16	84357925	rs244786	G	T	2101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=23;PP=1315;SC=AGTGAGATGGGGAGACTGAAA;SOR=1.463;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=48;TCR=23;TR=71;WE=84357933;WS=84357915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr16	84358121	rs244787	A	C	1809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=38;PP=968;SC=AGGCAGTGAAAGTTTCTTATG;SOR=1.478;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=24;TCR=38;TR=62;WE=84358129;WS=84358111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr16	84431973	rs12148971	C	T	534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=2;PP=402;SC=GATCATGACACTGCACTCCAG;SOR=2.419;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=84431981;WS=84431963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
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chr16	84442172	rs149820649	A	G	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=186;ReadPosRankSum=1.514;SC=TTGTTATTGTATATAAAGAAA;SOR=0.498;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=42;TCF=3;TCR=39;TR=13;WE=84442180;WS=84442162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,15:0.34:44
chr16	84444113	rs2291006	C	T	811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=2;PP=626;SC=TAGCCTGCCACGCCCTGTCCC;SOR=3.690;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=26;WE=84444121;WS=84444109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr16	84444349	rs247818	A	C	6835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=124;PP=2965;ReadPosRankSum=1.355;SC=GCTGACCAAGATGGTTCCTCC;SOR=0.340;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=228;TCF=103;TCR=125;TR=227;WE=84444357;WS=84444339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,257:1.00:258
chr16	84455961	rs2288573	A	G	1602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.651;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=21;PP=1131;ReadPosRankSum=-3.025;SC=GGGGTGACAGAGAGATTCCAC;SOR=0.818;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=145;TCF=97;TCR=48;TR=69;WE=84455969;WS=84455951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,71:0.49:145
chr16	84456642	rs247814	G	A	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.608;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=278;ReadPosRankSum=-0.030;SC=ATACGCACAGGTCTTCAGTGC;SOR=0.330;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=60;TCF=46;TCR=14;TR=22;WE=84456650;WS=84456632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,23:0.35:65
chr16	84456905	rs72806604	C	T	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=28;PP=562;ReadPosRankSum=-0.372;SC=GTTTGTTCTGCAGATGGAGGG;SOR=0.747;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=95;TCF=31;TCR=64;TR=40;WE=84456913;WS=84456895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,42:0.41:102
chr16	84472972	rs247905	G	A	1138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.598;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=27;PP=735;ReadPosRankSum=0.434;SC=ATCCAGCCTGGGGGTTTCACA;SOR=0.639;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=147;TCF=79;TCR=68;TR=57;WE=84472980;WS=84472962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,60:0.38:158
chr16	84473137	rs247904	G	C	1011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.041;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=24;PP=567;ReadPosRankSum=-2.647;SC=CGAGGTGAGTGCCAAAGGAAT;SOR=0.539;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=154;TCF=74;TCR=80;TR=52;WE=84473145;WS=84473127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,57:0.35:164
chr16	84473195	rs247903	T	A	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.592;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=13;PP=223;ReadPosRankSum=0.236;SC=CTTTCTAAACTAAGCACACAA;SOR=0.358;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=72;TCF=23;TCR=49;TR=21;WE=84473203;WS=84473185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,24:0.31:77
chr16	84476200	rs247897	A	T	1264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.574;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=35;PP=742;ReadPosRankSum=-0.185;SC=GGCCCTGGCGATGAAGGTAGG;SOR=0.635;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=171;TCF=67;TCR=104;TR=61;WE=84476208;WS=84476190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,67:0.36:187
chr16	84481993	rs35658270	C	G	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.75;ReadPosRankSum=0.567;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr16	84481993	.	CCT	GCC	171	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=18;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=8;NR=2;PP=171;QD=22.4467874862;SC=CTGTCCAGCACCTGTGAACAG;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=10;WE=84482003;WS=84481984;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr16	84481995	rs247891	T	C	725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.29;SOR=2.531;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	84482012	rs34189707	T	C	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=231;ReadPosRankSum=0.692;SC=AGCACCAGCCTATGATAAATA;SOR=0.582;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=12;WE=84482020;WS=84482002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr16	84485573	rs247885	C	A	6500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=137;NR=84;PP=2965;SC=TGACGTTTCTCGGTCTTGTGG;SOR=1.197;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=221;TCF=137;TCR=84;TR=221;WE=84485581;WS=84485563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr16	84485749	rs12149888	C	T	1875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.395;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=48;PP=1083;ReadPosRankSum=-0.396;SC=CCATCCTTTACGATGGGGGGC;SOR=0.487;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=184;TCF=69;TCR=115;TR=81;WE=84485757;WS=84485739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,91:0.46:197
chr16	84486700	rs193704	G	A	1304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.994;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=19;PP=797;ReadPosRankSum=-1.906;SC=GAGGGGTGGGGACGCGGGCCT;SOR=0.976;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=76;TCF=48;TCR=28;TR=53;WE=84486708;WS=84486690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,55:0.68:81
chr16	84486867	rs2435172	A	G	5983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=117;NR=104;PP=2965;SC=CTTGGCTGGCAGTGGGGCTGG;SOR=0.824;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=221;TCF=117;TCR=104;TR=221;WE=84486875;WS=84486857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr16	84488368	rs77896881	G	A	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.284;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=76;ReadPosRankSum=-2.166;SC=GTGCATGGCCGGGCACTGGGA;SOR=0.693;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=6;WE=84488376;WS=84488362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr16	84488676	rs3085209	A	AGGG	670.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.77;ReadPosRankSum=0.217;SOR=0.395;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,25:0.44:57
chr16	84492683	rs693552	A	C	689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.497;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=472;ReadPosRankSum=0.473;SC=TCCAGCCCTCACGCAGGCCCG;SOR=0.191;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=41;TCF=33;TCR=8;TR=27;WE=84492691;WS=84492673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,29:0.63:46
chr16	84493032	rs3743654	C	T	1517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=32;PP=880;ReadPosRankSum=1.101;SC=TCTCTTTACCCACCTGCGGGG;SOR=0.679;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=182;TCF=97;TCR=85;TR=70;WE=84493040;WS=84493022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,78:0.39:199
chr16	84493081	rs437299	G	A	4133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.858;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=77;PP=2694;ReadPosRankSum=-0.248;SC=CAAGGCTATAGGGATGAACAA;SOR=0.803;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=295;TCF=164;TCR=131;TR=174;WE=84493089;WS=84493071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,190:0.59:324
chr16	84493144	rs410388	C	G	7081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=114;NR=125;PP=2965;SC=TGTTGCACTGCAGTGAGACTG;SOR=0.848;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=239;TCF=114;TCR=125;TR=239;WE=84493152;WS=84493134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr16	84493216	rs377261	T	C	943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.426;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=36;PP=665;ReadPosRankSum=1.112;SC=TGGAACTTTCTGCTCCCTCTG;SOR=1.033;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=69;TCF=8;TCR=61;TR=40;WE=84493224;WS=84493206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,42:0.57:74
chr16	84493927	rs35858301	G	A	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.053;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=148;ReadPosRankSum=-0.196;SC=GGCGGAGCCTGGAGCCTGTTT;SOR=0.165;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=32;TCF=23;TCR=9;TR=12;WE=84493935;WS=84493917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
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chr16	84494020	rs393515	G	T	4029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQ=60.07;NF=70;NR=47;PP=2029;SC=TTGGCCTTACGGGGTGGTCTT;SOR=0.912;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=70;TCR=47;TR=117;WE=84494028;WS=84494010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr16	84494275	rs2241640	C	T	2973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=366;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.679;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.212;NF=72;NR=68;PP=1870;ReadPosRankSum=1.877;SC=GGGTAGAGCCCGTTGACAAAG;SOR=0.643;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=338;TCF=169;TCR=169;TR=140;WE=84494283;WS=84494252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:217,149:0.41:366
chr16	84494450	rs381467	G	A	816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.264;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=22;PP=506;ReadPosRankSum=-0.625;SC=GCCCTGGTGCGGTGCAGACGC;SOR=0.324;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=45;TCF=10;TCR=35;TR=30;WE=84494458;WS=84494440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,33:0.69:48
chr16	84495224	rs369750	A	G	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=1;PP=481;ReadPosRankSum=0.180;SC=GCTCCCAGCCATGCCCCAGGA;SOR=0.804;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=54;TCF=52;TCR=2;TR=28;WE=84495232;WS=84495214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,30:0.53:57
chr16	84495761	rs34205686	G	C	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=243;ReadPosRankSum=-0.032;SC=GGGAACGACAGGTGACCTCGA;SOR=0.628;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=47;TCF=12;TCR=35;TR=20;WE=84495769;WS=84495751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,23:0.45:51
chr16	84497169	rs891258	G	A	1739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.685;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=20;PP=1087;ReadPosRankSum=0.183;SC=TCCTGCCGGCGCAACAGAGCT;SOR=0.580;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=130;TCF=97;TCR=33;TR=75;WE=84497177;WS=84497159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,79:0.55:144
chr16	84513463	rs899250	T	G	1031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=6;PP=681;SC=GCTGCAGGCGTTGCCCTCTAC;SOR=2.115;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=32;WE=84513471;WS=84513453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr16	84520223	rs431629	A	T	996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.730;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=9;PP=635;ReadPosRankSum=0.296;SC=AAGGTTCAGGACACCAAGTCT;SOR=1.320;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=79;TCF=57;TCR=22;TR=39;WE=84520231;WS=84520213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,43:0.51:84
chr16	84520292	rs3743667	C	T	2790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.491;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=51;PP=1750;ReadPosRankSum=-0.013;SC=CGAACACATGCTTGTCATGGT;SOR=0.755;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=214;TCF=124;TCR=90;TR=119;WE=84520300;WS=84520282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,132:0.57:230
chr16	84520325	rs431389	T	C	3206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=63;PP=2046;ReadPosRankSum=1.020;SC=CCACACAGGGTCCCCGGTGAG;SOR=0.708;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=240;TCF=127;TCR=113;TR=133;WE=84520333;WS=84520304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,147:0.57:260
chr16	84520396	rs422145	A	G	7032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=127;NR=102;PP=2965;SC=AAGAGCAGGCACCAGCGGTGC;SOR=0.782;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=229;TCF=127;TCR=102;TR=229;WE=84520404;WS=84520386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr16	84520537	rs431818	T	C	7497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=122;NR=136;PP=2965;SC=GAGCACAGGATGAGAAAGCCC;SOR=0.900;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=258;TCF=122;TCR=136;TR=258;WE=84520559;WS=84520527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,285:1.00:285
chr16	84520780	rs378384	G	C	431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=10;PP=276;SC=ACTGAGCACAGAAAACAGGGC;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=15;WE=84520788;WS=84520770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr16	84522867	rs422918	C	A	778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-2.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.880;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=428;ReadPosRankSum=0.112;SC=TGCATCACCGCGTCCACGCAC;SOR=0.305;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=32;TCF=23;TCR=9;TR=27;WE=84522875;WS=84522857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,32:0.82:39
chr16	84522897	rs436278	G	C	1311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.238;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=14;PP=818;ReadPosRankSum=2.215;SC=GCAGCTTCATGTCAGAGAGCA;SOR=0.210;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=61;TCF=46;TCR=15;TR=46;WE=84522905;WS=84522887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,53:0.74:72
chr16	84523084	rs1864267	G	A	2037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.570;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=52;PP=1245;ReadPosRankSum=1.795;SC=TGAGACCTATGTCATGCCCAC;SOR=0.756;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=155;TCF=66;TCR=89;TR=89;WE=84523092;WS=84523074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,96:0.56:172
chr16	84528235	rs62050761	T	C	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.509;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=205;ReadPosRankSum=0.348;SC=TTTCCAGTGTTGTCTTCCCTT;SOR=0.189;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=13;WE=84528243;WS=84528225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr16	84528293	rs2082037	C	T	648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=11;PP=468;ReadPosRankSum=-0.637;SC=TTTTTCTTCACGGGACATGAG;SOR=0.678;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=107;TCF=75;TCR=32;TR=35;WE=84528301;WS=84528283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,36:0.32:114
chr16	84528317	rs2435171	G	C	5477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=116;NR=73;PP=2965;SC=TCACAACCTGGTAAAAATGAG;SOR=1.213;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=190;TCF=116;TCR=74;TR=189;WE=84528325;WS=84528307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr16	84531071	rs58765533	C	T	1712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.008;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=37;PP=1055;ReadPosRankSum=0.065;SC=GTTCCTGGACCGACGAGTCCA;SOR=0.635;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=130;TCF=67;TCR=63;TR=73;WE=84531079;WS=84531061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,79:0.56:140
chr16	84531767	rs79169411	C	A	1071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=27;PP=687;ReadPosRankSum=-0.211;SC=TTAATAATCACAGAAAATAAA;SOR=0.760;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=20;TCR=42;TR=40;WE=84531775;WS=84531757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,45:0.64:70
chr16	84600347	rs247860	T	C	977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=6;PP=642;SC=CATGGCTTCTTTTCTCCCTGG;SOR=2.165;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=30;WE=84600355;WS=84600337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr16	84600595	rs12929880	T	C	2063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.620;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=39;PP=1167;ReadPosRankSum=-0.189;SC=GCGTTCCTATTAAGAAGGAAG;SOR=0.771;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=128;TCF=63;TCR=65;TR=77;WE=84600603;WS=84600585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,93:0.62:151
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chr16	84691044	rs3751762	C	T	6879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=479;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=145;NR=131;PP=2962;ReadPosRankSum=0.109;SC=GCACGACCTCCTGCAGGCCGC;SOR=0.727;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=441;TCF=230;TCR=211;TR=276;WE=84691052;WS=84691034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:179,298:0.62:477
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chr16	84695864	rs3087669	C	A	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.393;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=99;ReadPosRankSum=0.467;SC=TTTTATGATTCTTGGTATTTC;SOR=0.069;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=8;WE=84695872;WS=84695854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr16	84774120	rs4510001	T	C	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.893;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=212;ReadPosRankSum=-1.489;SC=TGTATTTAATTGCTGAATCAC;SOR=0.336;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=44;TCF=13;TCR=31;TR=21;WE=84774128;WS=84774110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,22:0.49:45
chr16	84774173	rs74032675	A	G	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=34;ReadPosRankSum=-0.071;SC=TGTGCTTCGGAGTGCCAGCCA;SOR=0.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=4;WE=84774181;WS=84774163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr16	84778685	rs1862792	A	G	4548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=403;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.517;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.973;NF=93;NR=109;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.705;SC=TATGGGTGACATGCCCCCGTC;SOR=0.737;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=379;TCF=177;TCR=202;TR=202;WE=84778693;WS=84778675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:188,214:0.53:402
chr16	84792291	rs41327444	A	G	3286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.628;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=50;PP=2061;ReadPosRankSum=0.304;SC=GATGTCATCAATTTCTGAAAT;SOR=0.922;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=227;TCF=139;TCR=88;TR=136;WE=84792299;WS=84792281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,148:0.59:249
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chr16	84797637	rs3213810	T	A	6990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=146;NR=88;PP=2965;SC=GTGCCTTTTTTTTTTTTGCTG;SOR=1.196;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=234;TCF=146;TCR=88;TR=234;WE=84797645;WS=84797627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr16	84797967	rs75396687	G	T	3714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.483;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=90;PP=2198;ReadPosRankSum=-0.039;SC=AGACTTCTTGGACGTAATGGT;SOR=0.637;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=238;TCF=92;TCR=146;TR=148;WE=84797975;WS=84797957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,166:0.63:262
chr16	84808824	rs774298	C	G	9093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=169;NR=127;PP=2965;ReadPosRankSum=0.481;SC=CCTATCGGCTCTTTGCAGGTG;SOR=1.008;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=298;TCF=170;TCR=128;TR=296;WE=84808832;WS=84808814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,325:0.99:327
chr16	84808900	rs774299	G	A	9744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=368;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=151;NR=189;PP=2965;SC=CTGGGCACAGGTTTGCTGCAA;SOR=0.990;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=341;TCF=151;TCR=190;TR=340;WE=84808908;WS=84808890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,366:1.00:366
chr16	84808969	rs2303232	G	C	4472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=79;PP=2525;SC=GAGTCGGGGAGTCACGTGAGA;SOR=2.200;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=28;TCR=79;TR=107;WE=84808977;WS=84808959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr16	84808984	rs774300	T	C	3424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=54;PP=1796;SC=GTGAGAGTTTTACCTGAAACT;SOR=2.568;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=16;TCR=54;TR=70;WE=84808992;WS=84808974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr16	84872051	rs1546124	G	C	995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=6;PP=641;SC=AGCTCTGCCCGAGGAGCCCAG;SOR=1.885;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=31;WE=84872059;WS=84872041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr16	84879286	rs12931881	G	A	1316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=9;PP=1032;SC=GCAGAGCATTGGCTGTAGGCT;SOR=2.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=37;TCR=9;TR=46;WE=84879294;WS=84879276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr16	84879324	rs12051168	T	C	3176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=41;PP=1952;SC=GGGGCGTTGCTGTATTTATGG;SOR=1.362;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=71;TCR=41;TR=112;WE=84879332;WS=84879314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr16	84879464	rs12051468	A	G	5755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=96;NR=100;PP=2965;SC=CGGGCCCACCAGTCTGCTGGT;SOR=0.914;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=198;TCF=96;TCR=102;TR=196;WE=84879472;WS=84879454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr16	84882911	rs4783086	T	C	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.979;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=187;ReadPosRankSum=0.863;SC=CCCTCCCTCCTACCTGCCCGT;SOR=0.154;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=15;WE=84882919;WS=84882901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr16	84882974	rs4783087	C	A	1458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.775;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=17;PP=687;ReadPosRankSum=-1.426;SC=ACTGAGTGAGCGGTTTCTGCC;SOR=0.790;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=89;TCF=61;TCR=28;TR=56;WE=84882982;WS=84882964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,65:0.64:102
chr16	84883102	rs8061351	C	T	1725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=40;PP=949;ReadPosRankSum=0.035;SC=GCTCGGGGCCCATGTGCACGC;SOR=0.733;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=177;TCF=88;TCR=89;TR=78;WE=84883110;WS=84883092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,86:0.44:196
chr16	84883195	rs140532417	A	ATTG	792.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.691;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=653;ReadPosRankSum=1.455;SC=CCCCTGGGGGATTGTCAAATC;SOR=1.355;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=16;WE=84883203;WS=84883185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr16	84884072	rs4782673	T	G	1198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=9;PP=610;ReadPosRankSum=0.348;SC=ACCCTTCACCTCGTACCTCTT;SOR=0.660;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=97;TCF=76;TCR=21;TR=46;WE=84884080;WS=84884062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,59:0.51:116
chr16	84884116	rs4783090	A	G	2574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.037;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=38;PP=1480;ReadPosRankSum=-0.573;SC=AGGCCAAATGATATCACCCTT;SOR=0.596;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=201;TCF=130;TCR=71;TR=103;WE=84884124;WS=84884106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,120:0.52:232
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chr16	84888597	rs2646126	C	G	1295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=38;PP=901;ReadPosRankSum=0.559;SC=TGAGCTGAGCCTCATCTCCAG;SOR=0.887;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=73;TCF=16;TCR=57;TR=49;WE=84888605;WS=84888587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,53:0.67:79
chr16	84900472	rs72799566	T	C	2500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=367;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.303;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=47;PP=1667;ReadPosRankSum=1.458;SC=TCCCAGTGTGTTATTTTTTTT;SOR=0.785;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=320;TCF=182;TCR=138;TR=117;WE=84900482;WS=84900462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:233,133:0.36:366
chr16	84902483	rs72799568	A	T	2100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.946;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=52;PP=1243;ReadPosRankSum=1.362;SC=TGACACCAAGATGAAGGACAG;SOR=0.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=248;TCF=119;TCR=129;TR=100;WE=84902491;WS=84902473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,110:0.40:272
chr16	84906098	rs721005	C	G	2297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.679;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=43;PP=1307;ReadPosRankSum=0.120;SC=ATCTTTGGAACTCTGTTCTAT;SOR=0.589;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=189;TCF=95;TCR=94;TR=93;WE=84906106;WS=84906088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,108:0.50:216
chr16	84906820	rs2934490	T	C	824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=28;PP=493;ReadPosRankSum=-0.415;SC=AGGCCGGGCGTGGTGGCTCAC;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=80;TCF=26;TCR=54;TR=42;WE=84906828;WS=84906810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,43:0.50:86
chr16	84907450	rs2968143	G	A	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=205;ReadPosRankSum=-0.134;SC=AAGTATAGGAGCAAGCGTTCA;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=10;WE=84907458;WS=84907440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr16	84907617	rs79287004	G	T	1488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=42;PP=848;ReadPosRankSum=1.144;SC=GGTTATCTCAGATTTTCCTGG;SOR=0.664;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=258;TCF=135;TCR=123;TR=86;WE=84907625;WS=84907607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:189,90:0.32:279
chr16	84907670	rs2934486	G	C	2222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.657;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=57;PP=1450;ReadPosRankSum=2.330;SC=TTTATCATGCGTGTGAACATT;SOR=0.769;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=140;TCF=52;TCR=88;TR=90;WE=84907678;WS=84907660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,97:0.65:149
chr16	84911195	rs2244486	G	C	1037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.285;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=29;PP=725;ReadPosRankSum=0.015;SC=GTGGCTCACAGCTGTAATCCC;SOR=1.381;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=61;TCF=15;TCR=46;TR=37;WE=84911203;WS=84911185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,40:0.63:63
chr16	84911219	rs2244487	G	A	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=235;ReadPosRankSum=0.024;SC=ACTTTGGGAGGCCGAGGCGGG;SOR=0.716;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=16;WE=84911227;WS=84911209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
chr16	84922859	rs767050	C	T	2283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=36;PP=1395;ReadPosRankSum=-2.072;SC=GCAAGACAGCCGTGCACGCGG;SOR=0.664;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=169;TCF=107;TCR=62;TR=96;WE=84922867;WS=84922849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,105:0.56:186
chr16	84940479	rs1874008	T	C	1440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=44;PP=1073;SC=TGCTGGGGCCTGGGGGTCTCC;SOR=4.534;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=4;TCR=44;TR=48;WE=84940487;WS=84940469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr16	85009970	rs7195377	A	G	4805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=93;PP=2965;SC=ACTCCGGGCCACCTTTTCTGG;SOR=1.140;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=155;TCF=62;TCR=93;TR=155;WE=85009978;WS=85009960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr16	85011423	rs57465878	CA	C	336.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=329;SC=AAAATAATTGCAATGATTTCC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=85011431;WS=85011418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr16	85011480	rs8045409	T	C	1026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=5;PP=762;SC=TCCCCTTTCATCCAATAACAG;SOR=3.026;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=34;WE=85011488;WS=85011470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr16	85011622	rs8044638	G	A	3461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=63;PP=1974;SC=CTAGAATGAGGGGGAGATTGG;SOR=1.117;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=110;TCF=47;TCR=63;TR=109;WE=85011630;WS=85011612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr16	85023855	rs931713	C	T	4702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=94;NR=54;PP=2523;SC=CAGCCACACCCGAGGACACTA;SOR=1.120;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=152;TCF=96;TCR=56;TR=148;WE=85023863;WS=85023845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr16	85100976	rs4783121	G	A	5148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=407;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.130;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=124;PP=2962;ReadPosRankSum=1.138;SC=GACTTCATGCGTGGCTACGTG;SOR=0.595;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=375;TCF=163;TCR=212;TR=222;WE=85100984;WS=85100966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,236:0.58:405
chr16	85105554	rs8058770	A	C	4589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.36;ReadPosRankSum=0.453;SOR=0.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,178:0.98:181
chr16	85116312	rs2291964	C	T	550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=14;PP=390;SC=ACAGCCCAGACGCAGGTGCAG;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=85116320;WS=85116302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	85120364	rs11410626	G	GA	5079.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.64;QD=38.19;SOR=1.055;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr16	85120609	rs2291962	A	G	4396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=105;NR=36;PP=2747;SC=TCCCAGAGACAAGGGCCCAGC;SOR=2.003;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=141;TCF=105;TCR=36;TR=141;WE=85120617;WS=85120599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr16	85121733	rs3751753	C	A	647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=3;PP=419;SC=GCACGCAAGCCGTGTGGCCTG;SOR=2.737;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=85121741;WS=85121723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr16	85132776	rs16975240	A	G	2730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=40;PP=1702;ReadPosRankSum=0.686;SC=TTGGGATTGCACTTACCCTAC;SOR=0.704;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=219;TCF=143;TCR=76;TR=121;WE=85132784;WS=85132766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,131:0.56:233
chr16	85133872	rs3764278	G	C	3935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.416;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=98;PP=2173;ReadPosRankSum=-0.733;SC=CAGGGTGGGTGGGATCCGATG;SOR=0.650;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=300;TCF=137;TCR=163;TR=181;WE=85133880;WS=85133862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,190:0.59:320
chr16	85135968	rs35852446	G	A	1097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.701;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=26;PP=616;ReadPosRankSum=0.187;SC=TGTAAGCATCGCAGTGAGAAA;SOR=0.460;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=88;TCF=36;TCR=52;TR=47;WE=85135976;WS=85135958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,52:0.54:97
chr16	85139173	rs8050910	G	T	3049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=68;PP=1995;SC=CTTGCTAATTGGGTCATCAAA;SOR=1.449;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=40;TCR=68;TR=108;WE=85139181;WS=85139163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr16	85145800	rs60296580	C	G	725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=4;PP=576;SC=GGTGGAGGCACCGTGGGAGGG;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=85145808;WS=85145790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	85145977	rs9931038	T	C	4946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=84;PP=2383;SC=GAGCTTTGGCTGTCCCGGTGC;SOR=0.887;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=166;TCF=82;TCR=84;TR=166;WE=85145985;WS=85145967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr16	85691294	rs7404958	A	G	3291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=63;PP=2046;SC=CTGTTTGCCCAACATCCTGCC;SOR=1.028;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=48;TCR=63;TR=111;WE=85691302;WS=85691284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr16	85699527	rs7195186	A	G	2115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=21;PP=1253;SC=CGTGCTGGACACTCAGCCTGT;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=50;TCR=21;TR=71;WE=85699535;WS=85699517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr16	85704534	rs150623492	G	A	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.695;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=120;ReadPosRankSum=-2.011;SC=GTGTGAAGAGGAGAGCACAAA;SOR=0.360;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=11;WE=85704542;WS=85704524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr16	85704584	rs2303202	A	G	2181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=27;PP=1386;SC=ATACATCACCATCTCCTGTCT;SOR=1.320;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=50;TCR=27;TR=77;WE=85704592;WS=85704574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr16	85706047	rs9940601	A	C	5346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=82;PP=2812;SC=GGTCTCAGAAAGGGAGCGGCT;SOR=0.774;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=182;TCF=100;TCR=82;TR=182;WE=85706055;WS=85706037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr16	85711860	rs1053328	C	T	2709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=54;NR=29;PP=1524;SC=GCTGGAGGTTCGTGCGGAGTT;SOR=1.156;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=54;TCR=29;TR=83;WE=85711868;WS=85711850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr16	85720945	rs3815796	C	T	1609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=6;PP=1151;SC=CAGTAGATAACGGAACAGAGG;SOR=3.611;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=46;TCR=6;TR=52;WE=85720953;WS=85720935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr16	85721297	rs9930592	T	A	2154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=51;PP=1459;SC=CCAAATGCAATTAATAAAAAC;SOR=2.334;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=18;TCR=51;TR=69;WE=85721305;WS=85721287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr16	85741818	.	T	C	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.950;ClippingRankSum=0.000;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.537;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=22;PP=407;ReadPosRankSum=-0.150;SC=AGCCCAGTGATGCTGGATCCT;SOR=1.056;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=47;TCF=7;TCR=40;TR=25;WE=85741826;WS=85741799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,25:0.51:49
chr16	85743732	rs2305357	C	G	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=9;PP=328;ReadPosRankSum=0.917;SC=CGGGCCCCCACAGCCGACCCG;SOR=0.765;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=32;TCF=21;TCR=11;TR=24;WE=85743740;WS=85743722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,28:0.74:38
chr16	85743906	rs141454251	T	A	1735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=37;PP=988;ReadPosRankSum=-0.356;SC=TGACACACATTTGAAAGCCTG;SOR=0.697;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=224;TCF=128;TCR=96;TR=88;WE=85743914;WS=85743896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,94:0.39:239
chr16	85775064	rs388855	A	G	600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=5;PP=365;SC=AGCTCCAGCCAGGATTCAGGT;SOR=1.708;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=21;WE=85775072;WS=85775054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	85775175	rs446444	G	A	5002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=71;PP=2648;SC=GAACTCCCACGTGGAGAGTTT;SOR=0.861;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=167;TCF=96;TCR=71;TR=167;WE=85775183;WS=85775165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr16	85813231	rs8587	A	C	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.914;NF=21;NR=8;PP=529;ReadPosRankSum=0.069;SC=CACAGGCTACAAGATATTTTA;SOR=0.843;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=41;TCR=16;TR=29;WE=85813239;WS=85813221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,30:0.53:57
chr16	85813526	rs301163	G	A	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=266;ReadPosRankSum=0.858;SC=CGGGCGGCTTGTAACAGCATC;SOR=0.622;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=14;WE=85813534;WS=85813516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr16	85813880	rs301164	T	C	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.452;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=372;ReadPosRankSum=0.543;SC=GGTATCATGCTTCTGGAGAAA;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=17;WE=85813888;WS=85813870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr16	85813963	rs301165	C	T	4938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=102;NR=60;PP=2710;SC=CCAGCCCGCGCGGCAGCATGG;SOR=1.204;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=162;TCF=102;TCR=60;TR=162;WE=85813971;WS=85813953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr16	85814899	rs3081701	T	TAGTC	17472.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=387;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=127;PP=2957;SC=GTCAAAGAAATAGGCTACCAC;SOR=0.714;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=179;TCF=38;TCR=141;TR=162;WE=85814907;WS=85814889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,382:1.00:382
chr16	85814995	rs301166	A	G	6195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=126;PP=2965;SC=AAAGACTGGCAGAGCCAACAG;SOR=1.457;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=193;TCF=67;TCR=126;TR=193;WE=85815003;WS=85814985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr16	85815074	rs301167	C	T	745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=19;PP=515;SC=TCTTGCTCTGCTGCCCTAGCT;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=85815082;WS=85815064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr16	85834818	rs11557187	G	A	2038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.877;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=46;PP=1095;ReadPosRankSum=-0.430;SC=CAGAATGTTGGCTACCAGGGT;SOR=0.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=298;TCF=155;TCR=143;TR=100;WE=85834837;WS=85834808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:215,115:0.35:330
chr16	85838093	rs2599088	G	A	75.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=55.45;NF=3;NR=0;PP=54;SC=CTTCCGAGTAGCTGGGACTAT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=85838101;WS=85838089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr16	85838115	rs2733963	G	A	104.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQ=48.09;NF=3;NR=0;PP=51;SC=GGCACGTGCCGCCACGCCCGG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=3;WE=85838123;WS=85838105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr16	85838166	rs2599089	G	A	503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=14;NR=4;PP=339;SC=GTTTCACCATGTTAGCCAGGA;SOR=1.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=18;WE=85838174;WS=85838156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr16	85838195	rs2733964	A	C	958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=22;NR=10;PP=582;SC=ATCTCCTGACATCGTGATCCG;SOR=1.371;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=22;TCR=10;TR=32;WE=85838203;WS=85838185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr16	85838503	rs2599090	T	C	1442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=10;PP=953;SC=GACTCTCAACTTACATGGATT;SOR=2.078;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=45;WE=85838511;WS=85838493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr16	85838532	rs2733965	A	G	2596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=25;PP=1657;SC=TTTATTCAATATGTTTTTCAG;SOR=1.636;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=58;TCR=25;TR=83;WE=85838540;WS=85838522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr16	85838653	rs2599091	T	C	5259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=92;PP=2965;SC=CCAGAAGGCATTGAAGGAGAA;SOR=0.857;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=179;TCF=87;TCR=92;TR=178;WE=85838661;WS=85838643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr16	85838804	rs11419687	G	GA	2868.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=35;PP=1579;SC=ACTGTCTAGAGGCAGTCTTGC;SOR=1.226;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=36;WE=85838812;WS=85838794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr16	85839140	rs2599092	T	C	1331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=7;PP=854;SC=CATTTTCTTCTTTCCTTGCCC;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=33;TCR=7;TR=40;WE=85839148;WS=85839130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr16	85839186	rs2733966	C	T	3143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=35;PP=1842;SC=TGTGCACGTACGTGCGTGAAC;SOR=1.297;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=72;TCR=35;TR=107;WE=85839194;WS=85839176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr16	85839211	rs2075532	G	C	1807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.564;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=26;PP=1116;ReadPosRankSum=-0.319;SC=TGTGGCCTGGGTTGGTGTATC;SOR=0.750;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=158;TCF=102;TCR=56;TR=78;WE=85839219;WS=85839201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,86:0.49:174
chr16	85839543	rs2641797	C	G	1279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=30;PP=861;SC=GGTGGGCTGTCGGGGACCTCC;SOR=2.007;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=12;TCR=30;TR=42;WE=85839551;WS=85839533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr16	85839977	rs2075553	G	C	867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.086;NF=26;NR=6;PP=593;ReadPosRankSum=-0.042;SC=AGGCATTTTTGCATTCTGAAT;SOR=0.824;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=58;TCF=46;TCR=12;TR=32;WE=85839985;WS=85839967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,35:0.56:63
chr16	85840035	rs5818557	CA	C	7907.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=55;NR=67;PP=2957;SC=GGGTTAATAACAGACCCGAAT;SOR=1.226;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=124;TCF=56;TCR=68;TR=122;WE=85840043;WS=85840025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr16	85945076	rs2292980	T	C	3180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.529;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=52;PP=1813;ReadPosRankSum=0.865;SC=ACTAACTTAATGTTTCCTTAA;SOR=0.508;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=198;TCF=123;TCR=75;TR=130;WE=85945084;WS=85945066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,141:0.65:216
chr16	85945231	rs8052064	C	T	2620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.744;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=67;PP=1724;ReadPosRankSum=1.860;SC=AGATGGAGTGCGGTCGCTCTG;SOR=0.843;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=195;TCF=81;TCR=114;TR=111;WE=85945239;WS=85945221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,116:0.56:208
chr16	86369306	rs3828516	C	A	477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=5;PP=341;SC=ACGCAGCACCCGCAGTCTCCA;SOR=1.863;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=18;WE=86369314;WS=86369296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	86544093	.	TTCC	T	47	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=1;NR=1;PP=47;QD=28.5;SC=CGTCGTCCTCTTCCTCCTCCT;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=14;TCF=7;TCR=7;TR=2;WE=86544103;WS=86544087;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:12,2:0.14:14
chr16	86565826	rs3751803	C	G	7606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=140;NR=126;PP=2965;SC=CGGGCGTCCCCGGGGAGGTTC;SOR=0.721;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=267;TCF=140;TCR=127;TR=266;WE=86565834;WS=86565816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,286:1.00:286
chr16	86565882	rs3751802	G	C	2990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.481;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=60;PP=1963;ReadPosRankSum=-1.673;SC=CCCTGGTGGGGAGCCAGGGGC;SOR=0.602;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=246;TCF=125;TCR=121;TR=126;WE=86565890;WS=86565872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,136:0.52:260
chr16	86574726	rs1025057	C	G	1975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.015;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=41;PP=1342;ReadPosRankSum=-1.206;SC=CCAGCAGAGACAGCATCATAA;SOR=0.836;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=289;TCF=169;TCR=120;TR=102;WE=86574734;WS=86574716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:202,107:0.35:309
chr16	86574818	rs17192954	C	G	1967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.995;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=61;PP=1232;ReadPosRankSum=-0.956;SC=GAGATAAAAACCACAAATGCA;SOR=1.005;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=349;TCF=157;TCR=192;TR=106;WE=86574826;WS=86574808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:244,111:0.31:355
chr16	86575460	rs3213418	C	G	6665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=140;PP=2965;SC=AAAGGGGCTGCTGGGAATGCC;SOR=1.345;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=222;TCF=81;TCR=141;TR=221;WE=86575468;WS=86575450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr16	86585905	rs8046613	C	A	5187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=109;PP=2965;SC=CGCCCTGTTTCCAATGCAATC;SOR=1.440;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=172;TCF=63;TCR=109;TR=172;WE=86585913;WS=86585895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr16	86588655	rs2354022	G	C	7392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.31;SOR=0.700;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,281:1.00:281
chr16	86588993	rs3751796	T	C	3132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=49;PP=2010;ReadPosRankSum=-1.836;SC=CTAGTCATTGTCGAGCGCCGC;SOR=0.670;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=264;TCF=164;TCR=100;TR=133;WE=86589001;WS=86588983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,146:0.52:281
chr16	86613143	rs62051072	G	A	4471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.404;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=90;PP=2823;ReadPosRankSum=0.376;SC=GGGAAAGCAGGGCCAGAAGCC;SOR=0.698;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=302;TCF=160;TCR=142;TR=188;WE=86613151;WS=86613133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,204:0.61:335
chr16	87339278	rs11646030	T	C	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.279;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.533;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=31;ReadPosRankSum=0.408;SC=CAGGTGGACGTCACCATGCCA;SOR=0.707;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=4;WE=87339286;WS=87339268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr16	87349333	rs6540037	A	G	1885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=15;PP=1314;SC=CCCCACAGGGATATGTTGGGG;SOR=2.129;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=61;TCF=46;TCR=15;TR=60;WE=87349341;WS=87349323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr16	87349489	rs7193801	A	G	5070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=99;PP=2965;SC=GGGATGCTAGAGCACAGGCCT;SOR=1.107;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=173;TCF=74;TCR=99;TR=173;WE=87349497;WS=87349479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr16	87349529	rs7198660	T	C	3831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.49;SOR=2.193;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr16	87349529	.	TAATA	CAATA,CAATG	890	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000,0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=19;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=26,10;NR=72,32;PP=890,716;QD=9.43644094436;SC=TGACTCTTAATAATAAAGCCC;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=99;TCF=26;TCR=73;TR=98,42;WE=87349541;WS=87349519;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.99:99
chr16	87349533	rs2277850	A	G	1048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.92;ReadPosRankSum=-0.221;SOR=0.740;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,45:0.47:96
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chr16	87416903	rs8058715	A	T	113.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.78;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
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chr16	87433313	.	T	TA	583.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.813;ClippingRankSum=0.000;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.668;HP=9;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=21;PP=345;ReadPosRankSum=0.698;SC=AGCTTAAAACTAAAAAAAAAC;SOR=1.142;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=46;TCF=2;TCR=44;TR=23;WE=87433321;WS=87433303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,28:0.54:52
chr16	87436382	rs8044820	G	A	700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=0;PP=543;SC=ATCAAAGGAAGTGTCCTGTGC;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=87436390;WS=87436372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr16	87436720	rs1054521	G	T	8058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=122;NR=170;PP=2965;SC=AAAAAATGCAGCTCTTCTAGA;SOR=0.923;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=293;TCF=122;TCR=171;TR=292;WE=87436728;WS=87436710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,297:1.00:297
chr16	87436764	rs1054528	A	G	4868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=105;PP=2965;SC=AAAAAAAGGGATGTTACCAAC;SOR=1.582;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=156;TCF=51;TCR=105;TR=156;WE=87436772;WS=87436754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr16	87445363	rs1050846	G	A	877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=24;PP=533;ReadPosRankSum=-0.029;SC=TGTAAGGGGCGTGCACGACGG;SOR=0.712;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=135;TCF=65;TCR=70;TR=45;WE=87445371;WS=87445353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,49:0.33:148
chr16	87445839	rs3748400	C	T	4707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=95;NR=58;PP=2884;SC=AGGGGGCCCACTGGCATACTG;SOR=1.165;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=154;TCF=95;TCR=59;TR=153;WE=87445847;WS=87445829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr16	87446053	rs2042395	G	A	7257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=105;NR=131;PP=2965;SC=TCCCCGTGGCGGCCGTGCTGG;SOR=0.996;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=236;TCF=105;TCR=131;TR=236;WE=87446061;WS=87446043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr16	87452546	rs4240794	C	A	5010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=109;PP=2965;SC=AATTTACAGACAATGAAAATA;SOR=1.706;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=164;TCF=53;TCR=111;TR=161;WE=87452554;WS=87452536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr16	87452584	rs8046992	C	T	1881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=47;PP=1308;SC=TTTTTTGAGACGGTGTTTTGC;SOR=3.407;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=8;TCR=47;TR=55;WE=87452592;WS=87452574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr16	87677791	rs918367	A	C	2925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=24;PP=2009;SC=TGGCTGCTTCAACCCTGTCCG;SOR=2.101;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=69;TCR=25;TR=93;WE=87677799;WS=87677781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr16	87677988	rs35224773	C	T	6311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=477;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.531;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=148;NR=124;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.067;SC=CCCTGCGCAGCGAGCACACCA;SOR=0.638;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=447;TCF=244;TCR=203;TR=272;WE=87677996;WS=87677978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,290:0.61:475
chr16	87678144	rs918368	T	C	17994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=445;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=195;NR=205;PP=2965;ReadPosRankSum=1.250;SC=CGCTGCTGAGTGGGCTGAAGC;SOR=0.802;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=402;TCF=196;TCR=206;TR=400;WE=87678152;WS=87678134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,443:1.00:445
chr16	87678165	rs3751725	G	A	17152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=396;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=168;NR=185;PP=2965;SC=TGCGCAAGTCGGAGTCCAAGA;SOR=0.867;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=353;TCF=168;TCR=185;TR=353;WE=87678173;WS=87678155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,396:1.00:396
chr16	87723838	rs34767155	T	C	3255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=422;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.133;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=76;PP=2196;ReadPosRankSum=0.094;SC=TGGAGACGCATCCCCAGAAAA;SOR=0.693;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=381;TCF=197;TCR=184;TR=151;WE=87723846;WS=87723828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:259,163:0.39:422
chr16	87729256	rs72810189	T	C	1840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.538;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.404;NF=55;NR=37;PP=1085;ReadPosRankSum=-0.637;SC=CCATTCCCTGTGCAGCAGGTA;SOR=0.957;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=268;TCF=143;TCR=125;TR=92;WE=87729264;WS=87729246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:195,100:0.34:295
chr16	87729334	rs34111279	C	CA	4014.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.358;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.236;NF=15;NR=52;PP=1985;ReadPosRankSum=0.308;SC=CGCTCCCTCTCCCCCTGCCTG;SOR=0.797;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=189;TCF=42;TCR=147;TR=67;WE=87729342;WS=87729324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:192,127:0.40:319
chr16	87735527	rs7199037	G	A	1913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.509;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=34;PP=1040;ReadPosRankSum=-0.675;SC=GTGCTCCCTCGGGCCCTCCCA;SOR=0.738;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=183;TCF=104;TCR=79;TR=80;WE=87735535;WS=87735517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,93:0.45:207
chr16	87741662	rs2290019	C	A	1683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.045;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=36;PP=878;ReadPosRankSum=-1.057;SC=ACTTGCCAGGCGCCCCTGGCA;SOR=0.607;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=206;TCF=102;TCR=104;TR=77;WE=87741670;WS=87741652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,89:0.39:228
chr16	87742092	rs2290018	G	A	2857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.365;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=60;PP=1605;ReadPosRankSum=0.905;SC=CAGAATGAACGCACATACACG;SOR=0.548;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=188;TCF=88;TCR=100;TR=118;WE=87742100;WS=87742082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,133:0.61:219
chr16	87742129	rs2290017	G	A	1070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.756;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=30;PP=612;ReadPosRankSum=1.758;SC=AGGTGGGGGAGGCTGCGGGAC;SOR=0.585;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=111;TCF=34;TCR=77;TR=43;WE=87742137;WS=87742119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,50:0.41:122
chr16	87748198	rs2081981	G	C	5821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=104;NR=94;PP=2965;SC=GAAAGGAATTGTGTGAGAACC;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=198;TCF=104;TCR=94;TR=198;WE=87748206;WS=87748188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
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chr16	87788756	rs2303770	A	G	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-2.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=129;ReadPosRankSum=0.440;SC=CCAGACTCCCACGTGGGAAGA;SOR=0.481;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=12;WE=87788764;WS=87788746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr16	87788836	rs17699859	G	A	1153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.245;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=17;PP=662;ReadPosRankSum=-1.056;SC=GACTGGGGATGTCAACTTTGG;SOR=0.957;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=132;TCF=83;TCR=49;TR=52;WE=87788844;WS=87788826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,57:0.41:140
chr16	87788864	rs2303771	G	A	1800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.061;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=35;PP=1125;ReadPosRankSum=0.396;SC=GTCCTTTCTGGTATTGTAGAC;SOR=0.773;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=203;TCF=116;TCR=87;TR=87;WE=87788872;WS=87788854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,92:0.43:216
chr16	87795580	rs2303772	G	C	2138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.613;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=51;PP=1383;ReadPosRankSum=-1.289;SC=GGGCACGGAAGTTCCACAGTC;SOR=0.815;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=210;TCF=102;TCR=108;TR=95;WE=87795588;WS=87795556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,103:0.45:227
chr16	87798732	rs4843266	G	C	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.958;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=248;ReadPosRankSum=0.028;SC=CATAAAACTGGCCCCGGTTAG;SOR=0.468;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=79;TCF=55;TCR=24;TR=25;WE=87798740;WS=87798722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,29:0.33:88
chr16	87871714	rs2287121	T	G	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.153;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=322;ReadPosRankSum=-0.208;SC=GCCTCTCAGTTCCCCCAACCA;SOR=2.419;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=15;WE=87871722;WS=87871704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr16	87873247	rs750950	A	C	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=293;ReadPosRankSum=0.096;SC=TCCGGTCTGGAAGGGACGGGC;SOR=0.443;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=16;WE=87873255;WS=87873237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr16	87873442	rs33992624	C	G	3219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.920;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=79;PP=2154;ReadPosRankSum=-1.775;SC=CTGGAAAGAACAGGGACGACA;SOR=0.763;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=266;TCF=121;TCR=145;TR=143;WE=87873450;WS=87873432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,149:0.54:277
chr16	87902684	rs17853938	G	T	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.076;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.173;NF=7;NR=6;PP=229;ReadPosRankSum=0.224;SC=AGGCGTAGTCGCCGCCCGATT;SOR=0.097;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=13;WE=87902692;WS=87902674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr16	87903082	rs3829509	G	C	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.82;ReadPosRankSum=2.189;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr16	87921654	rs58800453	G	A	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.283;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.119;NF=17;NR=0;PP=348;ReadPosRankSum=-0.427;SC=CAGAAGTCATGTACAATCACA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=17;WE=87921662;WS=87921644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,19:0.70:27
chr16	87921846	rs72816311	T	A	1705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.582;NF=33;NR=43;PP=1092;ReadPosRankSum=1.096;SC=CTTCACCAAGTGCAGAAAACA;SOR=0.646;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=126;TCF=57;TCR=69;TR=76;WE=87921854;WS=87921836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,81:0.58:140
chr16	87921935	rs60779524	T	C	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.494;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-3.044;NF=1;NR=11;PP=170;ReadPosRankSum=-0.228;SC=AGCCAGCCTCTGGGTGTCCCT;SOR=1.845;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=12;WE=87921943;WS=87921925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr16	87935958	.	CA	C	51.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.871;ClippingRankSum=0.000;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=13.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQRankSum=-1.543;QD=0.57;ReadPosRankSum=1.534;SOR=1.854;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,15:0.17:90
chr16	87938398	rs7186698	G	A	3109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.048;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.076;NF=74;NR=65;PP=2094;ReadPosRankSum=2.685;SC=AAACCTCTGCGGGGTACGCGT;SOR=0.777;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=224;TCF=120;TCR=104;TR=139;WE=87938406;WS=87938388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,141:0.62:227
chr16	87938611	rs200566309	C	T	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=2.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.128;NF=2;NR=15;PP=320;ReadPosRankSum=-0.677;SC=TGAGTTCACTCGCAAGGGGTT;SOR=1.255;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=17;WE=87938619;WS=87938601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,20:0.71:28
chr16	87960560	rs12922226	A	T	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=5.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.79;ReadPosRankSum=-0.266;SOR=1.781;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,10:0.14:73
chr16	88039979	rs8055024	G	C	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.945;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=153;ReadPosRankSum=-0.973;SC=GTGGCCAGGCGCGGTGGCTCA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=8;WE=88039987;WS=88039969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr16	88052161	rs7499814	C	A	4799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=75;PP=2762;SC=AGATGGCGCTCACGCTGCTGG;SOR=0.716;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=83;TCR=75;TR=158;WE=88052169;WS=88052151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr16	88066655	rs11641367	A	G	896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.89;MQRankSum=-6.359;QD=19.93;ReadPosRankSum=1.719;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,22:0.49:45
chr16	88066659	rs11646301	C	A	958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.57;MQRankSum=-6.501;QD=17.43;ReadPosRankSum=0.858;SOR=0.741;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,28:0.51:55
chr16	88066717	rs74992447	C	T	1526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.427;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=4.967;NF=47;NR=23;PP=1002;ReadPosRankSum=0.315;SC=CCCCACAGAGCCGATGATGAG;SOR=0.573;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=129;TCF=89;TCR=40;TR=70;WE=88066725;WS=88066707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,73:0.53:137
chr16	88071516	rs188770212	C	T	1974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.293;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=34;PP=1241;ReadPosRankSum=-0.872;SC=GCGTGTTTGCCGTGTCTGAGG;SOR=0.569;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=156;TCF=97;TCR=59;TR=88;WE=88071524;WS=88071506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,91:0.58:158
chr16	88105053	rs11117358	T	A	1616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=36;PP=1038;ReadPosRankSum=3.167;SC=TCTCATTCCATACTCTGGGAG;SOR=0.698;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=258;TCF=152;TCR=106;TR=87;WE=88105061;WS=88105043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,93:0.34:276
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chr16	88495407	rs7199961	G	C	10093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=400;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=194;NR=164;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.048;SC=CCCGCGGGGGGCCCCGAGTGG;SOR=0.763;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=360;TCF=195;TCR=165;TR=358;WE=88495415;WS=88495391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,385:0.99:387
chr16	88495654	rs12927001	A	G	10712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=403;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=203;NR=187;PP=2965;SC=GCGAGTCCCCACTGCCGTCAC;SOR=0.749;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=390;TCF=203;TCR=187;TR=390;WE=88495662;WS=88495644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,403:1.00:403
chr16	88496008	rs12918876	T	C	9778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=369;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=168;NR=168;PP=2965;SC=GTGCGCCGCCTCCGTACCCCA;SOR=0.721;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=337;TCF=169;TCR=168;TR=336;WE=88496016;WS=88495998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,367:1.00:367
chr16	88497031	rs9924504	T	C	10161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=378;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=181;NR=165;PP=2965;SC=AGGAGCTCATTCTGAAGATCG;SOR=0.720;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=347;TCF=181;TCR=166;TR=346;WE=88497039;WS=88497021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,377:1.00:377
chr16	88497400	rs9938800	G	A	4537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=92;NR=58;PP=2864;SC=CCCGTGGCCCGTCTCGAAGCC;SOR=1.165;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=150;TCF=92;TCR=58;TR=150;WE=88497408;WS=88497390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr16	88497446	rs7197071	A	G	8108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=177;NR=109;PP=2965;SC=GGGAGGCCCCAAGTGTGCTGA;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=286;TCF=177;TCR=109;TR=286;WE=88497454;WS=88497436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,308:1.00:308
chr16	88498221	rs4782300	C	T	14802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=529;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=265;NR=211;PP=2965;SC=GCATCGCCACCGACCTTGGAG;SOR=0.970;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=476;TCF=265;TCR=211;TR=476;WE=88498229;WS=88498211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,527:1.00:527
chr16	88498297	rs12445417	T	G	18641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=698;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=326;NR=329;PP=2965;SC=GCAGCCTGTCTGCGAACAGGG;SOR=0.716;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=657;TCF=326;TCR=331;TR=655;WE=88498305;WS=88498287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,698:1.00:698
chr16	88499539	rs9931465	C	G	7835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=142;NR=134;PP=2965;SC=TATCCAACACCCACCCTAGCA;SOR=0.700;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=277;TCF=142;TCR=135;TR=276;WE=88499547;WS=88499529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,299:1.00:299
chr16	88502482	rs3812953	C	T	7301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=112;NR=141;PP=2965;SC=CAGGCGGTCGCTTGACTAGAA;SOR=0.990;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=253;TCF=112;TCR=141;TR=253;WE=88502490;WS=88502472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,274:1.00:274
chr16	88502505	rs1983014	A	G	5407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=112;PP=2965;SC=AGGAACCCGCATGTCTACGGG;SOR=1.162;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=187;TCF=75;TCR=112;TR=187;WE=88502513;WS=88502495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
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chr16	88505635	rs4782301	A	G	8359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-0.100;NF=150;NR=147;PP=2965;ReadPosRankSum=3.121;SC=CTGCCGAGCCACACACCCACC;SOR=0.460;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=302;TCF=152;TCR=150;TR=297;WE=88505643;WS=88505625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:5,317:0.98:322
chr16	88505734	rs4782362	C	T	5549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=110;PP=2965;SC=AAGATGCTTCCGAGTAATTTC;SOR=1.254;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=184;TCF=74;TCR=110;TR=184;WE=88505742;WS=88505724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr16	88520027	rs189408382	G	C	2851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FS=1.663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.45;ReadPosRankSum=-0.566;SOR=0.825;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,138:0.60:229
chr16	88535242	rs55823018	C	T	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.980;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=55;ReadPosRankSum=0.487;SC=CCAGGGGCTGCCCTTGACCTG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=4;WE=88535250;WS=88535232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr16	88535341	rs56292801	G	A	732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.920;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=9;PP=529;ReadPosRankSum=-0.352;SC=GCCTTTTAGGGGCCTCGCTGT;SOR=0.942;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=83;TCF=58;TCR=25;TR=34;WE=88535349;WS=88535331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,35:0.41:85
chr16	88535407	rs35613341	C	G	2679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.448;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=52;PP=1616;ReadPosRankSum=-1.087;SC=ACCGTCAGAGCCCAGACCCAC;SOR=0.750;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=249;TCF=138;TCR=111;TR=120;WE=88535415;WS=88535397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,128:0.48:265
chr16	88535591	rs36024491	C	T	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=88;ReadPosRankSum=-1.570;SC=TGCCCCCCACCGCTCCACCCT;SOR=0.582;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=7;WE=88535599;WS=88535581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr16	88552370	rs3751673	A	G	1486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.486;HP=2;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=37;PP=967;ReadPosRankSum=-1.436;SC=CATGGAGGCCAGAGAGGAGGT;SOR=0.635;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=231;TCF=125;TCR=106;TR=79;WE=88552378;WS=88552360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,85:0.34:252
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chr16	88593209	rs199766456	CCT	C	92.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=3.044;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=11.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.13;ReadPosRankSum=1.790;SOR=3.905;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
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chr16	88599702	rs67873604	CTGG	C	5852.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.68;SOR=1.144;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
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chr16	88620195	rs2879897	T	G	3927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=83;NR=53;PP=2290;SC=TTTATACACTTTCCATTAAAA;SOR=1.017;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=83;TCR=53;TR=136;WE=88620203;WS=88620185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr16	88620312	rs2340955	T	C	1383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.756;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=36;PP=696;ReadPosRankSum=-1.034;SC=CCTGCAGGGCTGCCGTCTGCA;SOR=1.080;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=109;TCF=53;TCR=56;TR=63;WE=88620320;WS=88620302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,68:0.62:110
chr16	88620345	.	A	ACGCAGTGCAGAGCTGGGACGGACGCC	1274.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.301;ClippingRankSum=0.000;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.56;ReadPosRankSum=-0.062;SOR=0.749;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,21:0.44:48
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chr16	88644005	rs899728	A	G	729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=14;PP=425;ReadPosRankSum=-0.301;SC=ATGAGGAGAAAGGCGAAGGCA;SOR=0.715;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=86;TCF=47;TCR=39;TR=32;WE=88644013;WS=88643995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,37:0.39:96
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chr16	88666035	rs6500481	G	A	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.332;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=277;ReadPosRankSum=-1.212;SC=CTCCCCAGAAGGACAACTGTG;SOR=1.954;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=14;WE=88666043;WS=88666025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr16	88675177	rs9932685	A	G	1370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=1;PP=1120;SC=GCCTGCTCTTAGATGTAGTTT;SOR=5.943;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=37;WE=88675185;WS=88675172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr16	88675194	rs9932692	A	G	1515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=49;NR=2;PP=1157;SC=GTTTGTGAACAGATTTCCTAA;SOR=5.747;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=51;TCF=49;TCR=2;TR=51;WE=88675202;WS=88675184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
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chr16	88688832	rs3751675	A	G	1298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.838;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=38;PP=922;ReadPosRankSum=-2.622;SC=GGGTGTCAGCACCTTGGAGCC;SOR=1.015;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=92;TCF=34;TCR=58;TR=58;WE=88688840;WS=88688822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,58:0.63:92
chr16	88695300	rs4782387	C	T	732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=26;PP=466;ReadPosRankSum=1.759;SC=GGCAGAGGGACGGGAGCCTGG;SOR=0.615;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=87;TCF=18;TCR=69;TR=32;WE=88695308;WS=88695290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,37:0.39:95
chr16	88695332	rs4782306	G	C	609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=2.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.24;ReadPosRankSum=-1.262;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
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chr16	88697487	rs2291160	G	A	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.065;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=2;PP=110;ReadPosRankSum=0.232;SC=GGGGGCTCAAGGTCTTCCCCA;SOR=0.368;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=9;WE=88697495;WS=88697477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr16	88697974	rs138298379	G	A	2002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.560;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=43;PP=1213;ReadPosRankSum=0.476;SC=ACAAGCCCCAGCCGCCAGCCC;SOR=0.639;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=163;TCF=89;TCR=74;TR=91;WE=88697982;WS=88697964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,95:0.55:172
chr16	88705804	rs2254073	T	C	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=188;ReadPosRankSum=0.102;SC=TGGGCCTTGGTGGTTCTCACC;SOR=1.009;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=14;WE=88705812;WS=88705794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr16	88709712	rs7195830	A	G	770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.137;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=14;PP=470;ReadPosRankSum=0.667;SC=GCTTCGCTGCATTTATTGCAG;SOR=1.096;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=62;TCF=38;TCR=24;TR=38;WE=88709720;WS=88709702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,39:0.60:65
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chr16	88709828	rs1049254	A	G	961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.898;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=23;PP=551;ReadPosRankSum=0.760;SC=CCCCGCCGCCACCGCAGCCTC;SOR=0.929;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=74;TCF=36;TCR=38;TR=43;WE=88709836;WS=88709818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,45:0.60:75
chr16	88712712	.	T	TGCAGACCCAGGGGACGTGTGCGGACCGGGGCTGCAAAGTCTCAGCACAAG	964.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.205;ClippingRankSum=0.000;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=4.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.26;ReadPosRankSum=-2.133;SOR=1.209;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,33:0.35:94
chr16	88712731	.	C	T	292	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=24;MQ=59.77;NF=7;NR=17;PP=292;QD=13.6154671895;SC=AGGGGACGTGCGCGGACCGGG;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=79;TCF=33;TCR=46;TR=24;WE=88712739;WS=88712721;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:55,24:0.30:79
chr16	88712733	rs12926425	C	T	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=11.872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.83;ReadPosRankSum=-2.436;SOR=2.432;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,13:0.17:76
chr16	88712767	rs12933505	A	G	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.969;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=829;ReadPosRankSum=-0.286;SC=GGGTGTTCTCAGCCTTGATGT;SOR=1.445;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=45;TCF=25;TCR=20;TR=13;WE=88712790;WS=88712757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,12:0.25:48
chr16	88712780	rs12933512	A	C	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=7.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.54;ReadPosRankSum=1.026;SOR=2.047;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,13:0.28:46
chr16	88712780	.	ACA	CCG	810	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=10;NR=4;PP=810;QD=61.6762767759;SC=CTTGATGTGGACACTAGCGGC;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=44;TCF=27;TCR=17;TR=14;WE=88712790;WS=88712757;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:30,14:0.32:44
chr16	88712782	rs12709103	A	G	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=7.065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.56;ReadPosRankSum=1.451;SOR=1.866;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,13:0.27:48
chr16	88713236	rs4673	A	G	3077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=392;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.373;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=70;PP=1774;ReadPosRankSum=2.148;SC=GCGGTCATGTACTTCTGTCCC;SOR=0.657;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=359;TCF=179;TCR=180;TR=141;WE=88713244;WS=88713226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:236,155:0.40:391
chr16	88713473	rs4782308	G	A	1154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.129;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=16;PP=781;ReadPosRankSum=-2.078;SC=GGGCCCCGCAGCCCCCGGAGA;SOR=1.105;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=163;TCF=109;TCR=54;TR=56;WE=88713481;WS=88713463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,58:0.34:170
chr16	88713501	rs4782393	A	G	1845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.495;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=31;PP=1319;ReadPosRankSum=-0.178;SC=GAGCAGGAGGAGACTCACCAG;SOR=1.301;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=266;TCF=160;TCR=106;TR=92;WE=88713509;WS=88713491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:188,96:0.34:284
chr16	88714559	rs2306422	C	T	3654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=81;PP=2335;SC=GTGGGGCTCCCGTCCCGGGGG;SOR=1.839;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=117;TCF=36;TCR=81;TR=117;WE=88714567;WS=88714549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr16	88716534	rs3812948	A	G	404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=3;PP=276;SC=GAGTGGTGGCAGCGGGCCCCT;SOR=1.911;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=14;WE=88716542;WS=88716532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	88717386	rs8053867	T	C	6841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=112;NR=135;PP=2965;SC=CCAGCGCCTGTTCGTTGGCCC;SOR=0.914;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=250;TCF=113;TCR=137;TR=247;WE=88717394;WS=88717376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr16	88718865	rs8854	C	T	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.822;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=92;ReadPosRankSum=0.122;SC=GCCAGCCCACCACATCCGCTC;SOR=0.297;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=10;WE=88718873;WS=88718855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,10:0.33:30
chr16	88719877	rs12926212	C	G	2847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.950;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=63;PP=1599;ReadPosRankSum=-1.413;SC=CTACAACAGTCTACAACAGGC;SOR=0.907;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=207;TCF=95;TCR=112;TR=112;WE=88719885;WS=88719867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,129:0.55:235
chr16	88719980	rs8046018	G	T	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.648;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=17;PP=344;ReadPosRankSum=-0.144;SC=TCTTTTAGGGGTGATGAAAAA;SOR=0.124;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=46;TCF=11;TCR=35;TR=26;WE=88719988;WS=88719970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,33:0.63:52
chr16	88721012	rs12935454	G	A	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=193;ReadPosRankSum=0.307;SC=CTGTCTCAGCGCCACAGCCTT;SOR=0.460;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=15;WE=88721020;WS=88721002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr16	88721538	rs4782309	C	T	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.792;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=166;ReadPosRankSum=-0.599;SC=GGGGCCGTCTCCACGGCAGCA;SOR=1.329;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=11;WE=88721546;WS=88721528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr16	88723538	rs9302778	TGG	T,TGGG	1016.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=2.153;HP=9;HapScore=3;MGOF=8;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.484;NF=25,25;NR=5,5;PP=521,365;ReadPosRankSum=0.757;SC=TTTGTAGAGATGGGGGGGGGT;SOR=1.659;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=30,30;WE=88723547;WS=88723528;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.57,0.28:46
chr16	88723629	rs6500486	C	T	1602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQ=60.06;MQRankSum=1.042;NF=40;NR=38;PP=846;ReadPosRankSum=-0.027;SC=ACTGGGATTACAGGCGAGAGC;SOR=0.671;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=156;TCF=82;TCR=74;TR=78;WE=88723637;WS=88723619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,82:0.49:169
chr16	88724275	rs56812649	A	T	626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.922;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=2;PP=454;ReadPosRankSum=-0.012;SC=GGATGCTCGGACCCTGCTGAC;SOR=1.426;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=42;TCF=37;TCR=5;TR=23;WE=88724283;WS=88724265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,25:0.56:45
chr16	88724347	rs2279258	G	T	2506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=32;PP=1454;ReadPosRankSum=1.319;SC=GCCTGCAGCCGCGGCTGCCCC;SOR=0.721;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=164;TCF=108;TCR=56;TR=99;WE=88724355;WS=88724337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,112:0.61:183
chr16	88729008	rs7205116	G	A	707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.058;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=6;PP=431;ReadPosRankSum=-1.968;SC=GGGGAGCAGTGGCGCGATTTC;SOR=0.455;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=76;TCF=64;TCR=12;TR=32;WE=88729016;WS=88728998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,35:0.42:84
chr16	88729670	rs7193657	G	T	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.816;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=19;PP=336;ReadPosRankSum=0.173;SC=GACGGGATCGGACGATGGGTT;SOR=0.317;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=70;TCF=22;TCR=48;TR=31;WE=88729678;WS=88729660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,33:0.41:80
chr16	88752693	rs11076698	T	G	2492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.886;NF=72;NR=42;PP=1525;ReadPosRankSum=-0.439;SC=CTCCCGCCCCTCAGGGTCGAG;SOR=0.657;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=199;TCF=124;TCR=75;TR=114;WE=88752701;WS=88752683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,121:0.57:214
chr16	88762943	rs1132579	A	T	2023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FS=2.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.80;ReadPosRankSum=1.770;SOR=0.865;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:120,110:0.48:230
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chr16	88773414	rs57958330	G	T	987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-4.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=0;PP=774;ReadPosRankSum=1.044;SC=GCCTGGGTTTGTGTGTGTACC;SOR=1.302;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=51;TCR=0;TR=33;WE=88773422;WS=88773404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,35:0.62:56
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chr16	88776297	rs4390574	T	C	6792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=490;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=152;NR=139;PP=2962;ReadPosRankSum=1.403;SC=AGGACGCTGCTCACTGTGCGG;SOR=0.716;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=462;TCF=237;TCR=225;TR=291;WE=88776305;WS=88776287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:180,309:0.63:489
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chr16	88778427	rs11361741	GC	G	4072.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=43;PP=2787;ReadPosRankSum=0.995;SC=CTGATGGTGAGCGGGGGCCCA;SOR=0.681;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=102;TCF=43;TCR=59;TR=71;WE=88778435;WS=88778417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,117:0.70:166
chr16	88779132	rs2290895	C	T	901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=14;PP=482;ReadPosRankSum=-0.215;SC=CCAGCAGCAGCATGTGCTGGG;SOR=0.602;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=71;TCF=45;TCR=26;TR=39;WE=88779140;WS=88779122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,43:0.54:79
chr16	88779323	rs12148926	C	T	727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.383;HP=3;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.855;NF=8;NR=12;PP=529;ReadPosRankSum=0.276;SC=GGTGAGGCCCCGAGAGCCCCC;SOR=0.454;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=32;TCF=12;TCR=20;TR=20;WE=88779336;WS=88779313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,22:0.61:36
chr16	88779328	rs67815044	GC	G	634.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.885;NF=0;NR=9;PP=538;ReadPosRankSum=0.763;SC=GGCCCCGAGAGCCCCCCTTCC;SOR=0.986;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=9;WE=88779336;WS=88779313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr16	88779361	.	G	A	39	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=18;MMLQ=24;MQ=44.08;NF=0;NR=4;PP=39;QD=18.4428031368;SC=CCCCACTCATGCCCCTGAGAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=88779369;WS=88779351;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:4,4:0.50:8
chr16	88779655	.	T	TA	410	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=24;MQ=56.95;NF=9;NR=3;PP=410;QD=37.75;SC=CCCCCACTCATACCCGAGAGC;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=12;WE=88779663;WS=88779645;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:11,12:0.52:23
chr16	88779753	rs73262667	C	T	3781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.968;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.071;NF=95;NR=68;PP=2244;ReadPosRankSum=0.085;SC=CCCGAGCCCACGGCTACTCCA;SOR=0.613;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=257;TCF=149;TCR=108;TR=163;WE=88779761;WS=88779743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,175:0.64:274
chr16	88779952	rs74757912	C	CCT	1356.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.918;NF=19;NR=16;PP=1391;ReadPosRankSum=2.106;SC=AGTCCTGCGGCCTCGGATGGT;SOR=0.787;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=27;TCR=23;TR=35;WE=88779960;WS=88779942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,34:0.72:47
chr16	88780090	rs2290904	G	A	3636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.419;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=63;PP=2360;ReadPosRankSum=-0.354;SC=ACGTGGTGGTGGTGCGGCCCA;SOR=0.653;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=278;TCF=162;TCR=116;TR=149;WE=88780098;WS=88780080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,164:0.53:308
chr16	88780472	rs7205626	T	C	1161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.995;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=12;PP=847;ReadPosRankSum=0.518;SC=ACGGCACCTGTCCTGGGGACT;SOR=1.091;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=96;TCF=70;TCR=26;TR=49;WE=88780480;WS=88780462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,51:0.51:100
chr16	88780518	rs3826076	A	G	2553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.672;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.520;NF=68;NR=49;PP=1667;ReadPosRankSum=-2.017;SC=GGGCTTTCCCATAGCCTCCAA;SOR=0.826;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=204;TCF=119;TCR=85;TR=117;WE=88780526;WS=88780508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,124:0.57:219
chr16	88780634	rs11278302	AGGTGTG	A	4505.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.510;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=4.994;NF=5;NR=66;PP=2969;ReadPosRankSum=-1.067;SC=CACTGTGTACAGGTGTGGGTG;SOR=0.749;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=133;TCF=10;TCR=123;TR=71;WE=88780647;WS=88780624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,122:0.57:213
chr16	88780685	rs7191439	C	T	1239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.125;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.777;NF=17;NR=35;PP=863;ReadPosRankSum=-0.759;SC=GTGTGCTGTGCGCGGGTGTGT;SOR=0.442;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=82;TCF=24;TCR=58;TR=52;WE=88780693;WS=88780675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,53:0.64:83
chr16	88780923	rs8050715	C	G	2988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.594;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=44;PP=1933;ReadPosRankSum=-0.349;SC=TGGGGTGATGCGGGGAGGGAG;SOR=0.832;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=228;TCF=143;TCR=85;TR=122;WE=88780931;WS=88780913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,135:0.56:243
chr16	88781125	rs8043637	T	C	3643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.490;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=82;PP=2036;ReadPosRankSum=-2.097;SC=CCCAGCGCTGTGGCCAGGGGG;SOR=0.637;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=231;TCF=102;TCR=129;TR=148;WE=88781133;WS=88781115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,166:0.66:252
chr16	88781419	rs2306046	A	G	1093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=0.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.19;ReadPosRankSum=-0.930;SOR=0.733;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,58:0.49:119
chr16	88781534	rs61737996	C	T	2688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.521;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=50;PP=1549;ReadPosRankSum=1.151;SC=CCCACACTGCCGTGGCGCGTG;SOR=0.886;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=184;TCF=103;TCR=81;TR=115;WE=88781542;WS=88781524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,124:0.62:199
chr16	88782217	rs35544968	G	A	6541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=515;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.528;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=142;NR=132;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.877;SC=ATCCGCGCACGAACTTGCCGA;SOR=0.644;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=480;TCF=249;TCR=231;TR=274;WE=88782225;WS=88782207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:213,301:0.59:514
chr16	88782676	rs2290902	A	G	2233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=45;PP=1457;ReadPosRankSum=0.494;SC=GGAAGAGATTAGGGATGACCC;SOR=0.713;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=79;TCR=71;TR=95;WE=88782684;WS=88782666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,101:0.61:165
chr16	88783374	rs8044367	A	G	2948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=50;PP=2065;ReadPosRankSum=-0.894;SC=GTGGTGCACCACCTTGGCCAG;SOR=0.678;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=246;TCF=155;TCR=91;TR=132;WE=88783382;WS=88783364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,138:0.54:256
chr16	88783449	rs8057031	C	G	7797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=598;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.529;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=179;NR=142;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.042;SC=CGCCCAGCTTCAGGGTGACGG;SOR=0.781;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=551;TCF=299;TCR=252;TR=321;WE=88783457;WS=88783438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:255,341:0.57:596
chr16	88783521	rs6500491	T	C	10098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=780;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.01;MQRankSum=0.815;NF=215;NR=225;PP=2962;ReadPosRankSum=0.663;SC=TGAAGAGCAGTGGGAACCAGA;SOR=0.714;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=718;TCF=354;TCR=364;TR=440;WE=88783529;WS=88783511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:310,470:0.60:780
chr16	88783738	rs4782432	A	G	620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=445;ReadPosRankSum=2.028;SC=AGTATGGCACAGCGGTAGTAA;SOR=0.693;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=19;WE=88783746;WS=88783728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,22:0.79:28
chr16	88783903	rs7186082	A	G	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.617;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=199;ReadPosRankSum=-0.551;SC=AGGCAGGAGAATGAAACGCAA;SOR=0.120;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=11;WE=88783911;WS=88783893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr16	88785072	rs4620939	G	C	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.108;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5032;FS=3.136;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=41;ReadPosRankSum=1.368;SC=GTTACTAGGGGCCAGGGGAGG;SOR=1.492;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=4;WE=88785080;WS=88785062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr16	88786967	rs4401037	C	T	2066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.339;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=60;PP=1507;ReadPosRankSum=-0.180;SC=TCAGCCTGGGCCCAGTACCCG;SOR=1.497;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=150;TCF=59;TCR=91;TR=92;WE=88786975;WS=88786957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,89:0.64:140
chr16	88787704	rs8043924	G	C	3186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.987;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=68;PP=1898;ReadPosRankSum=1.708;SC=GTCCGACCCTGGCTTCCACCT;SOR=0.607;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=227;TCF=111;TCR=116;TR=136;WE=88787712;WS=88787694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,146:0.59:249
chr16	88788477	rs9935872	A	G	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.690;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=224;ReadPosRankSum=-0.378;SC=GCAGGCGCCTACAGGGAGACC;SOR=1.179;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=14;WE=88788485;WS=88788467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr16	88788903	rs4238687	T	G	2749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.529;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=66;PP=1832;ReadPosRankSum=-0.962;SC=TCCTTTGGGGTACAAGGGAAT;SOR=0.621;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=196;TCF=85;TCR=111;TR=119;WE=88788911;WS=88788893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,123:0.60:204
chr16	88788934	rs4238686	A	G	2277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.356;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=53;PP=1606;ReadPosRankSum=-1.458;SC=GGGGATGGCTAGGCGATGCCC;SOR=0.543;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=144;TCF=60;TCR=84;TR=92;WE=88788942;WS=88788912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,96:0.63:152
chr16	88789666	rs11281795	G	GCCTGCT	3727.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.416;NF=7;NR=34;PP=2419;ReadPosRankSum=1.104;SC=TTCCTGCCTTGCCTGCTCCTG;SOR=0.691;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=87;TCF=12;TCR=75;TR=41;WE=88789674;WS=88789656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,89:0.61:147
chr16	88791703	rs78217493	G	A	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=187;ReadPosRankSum=-1.273;SC=GTGATCATGCGGACAGGACAG;SOR=1.179;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=10;WE=88791711;WS=88791693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr16	88791754	rs116950354	G	A	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=34;ReadPosRankSum=0.084;SC=GGGCACAGACGCAGCACACGC;SOR=0.892;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=4;WE=88791762;WS=88791744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr16	88792047	rs4782430	A	G	2496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.240;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=57;PP=1590;ReadPosRankSum=-1.778;SC=TCCTGCGGTGAAAGTCAATGC;SOR=0.928;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=181;TCF=81;TCR=100;TR=99;WE=88792055;WS=88792037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,112:0.56:200
chr16	88792097	rs4782429	A	G	1591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=38;PP=1012;ReadPosRankSum=-0.113;SC=AAGCCCCTGTAGGGAGGCGGG;SOR=0.662;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=116;TCF=45;TCR=71;TR=62;WE=88792105;WS=88792087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,69:0.55:126
chr16	88792895	rs79092320	C	G	1824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.287;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=36;PP=1242;ReadPosRankSum=-0.057;SC=GGGTCAGGCCCAGGGCCCAGG;SOR=0.637;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=122;TCF=64;TCR=58;TR=77;WE=88792917;WS=88792885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,81:0.62:131
chr16	88793090	rs4516218	A	G	5943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.57;ReadPosRankSum=-1.073;SOR=0.681;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:130,159:0.55:289
chr16	88793103	rs4424896	C	G	3336.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.902;HP=8;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=66;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.555;SC=GCGGTGGGTGCGGGGGGGCCG;SOR=0.774;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=296;TCF=164;TCR=132;TR=153;WE=88793111;WS=88793080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,153:0.51:298
chr16	88793291	.	C	T	3997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.365;ClippingRankSum=0.000;DP=517;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.537;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=88;PP=2639;ReadPosRankSum=-1.664;SC=GGGTGGCCCCCGTGACAAACA;SOR=0.625;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=480;TCF=256;TCR=224;TR=183;WE=88793299;WS=88793281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:319,196:0.38:515
chr16	88793813	rs8057198	T	C	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.509;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.80;ReadPosRankSum=2.362;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr16	88793843	rs2242169	C	T	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=242;ReadPosRankSum=-1.417;SC=GCCTGCAGGCCGCCATGTGCC;SOR=0.853;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=15;WE=88793851;WS=88793833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr16	88793910	rs2242171	C	T	1311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.103;HP=6;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=12;PP=864;ReadPosRankSum=-0.521;SC=GATTTGGGGGCGTGAATGTAC;SOR=1.002;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=113;TCF=85;TCR=28;TR=62;WE=88793918;WS=88793900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,61:0.58:105
chr16	88798365	rs8055958	G	A	1911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.56;BaseQRankSum=-1.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.792;HP=5;HapScore=1;MGOF=52;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=-0.157;NF=0;NR=26;PP=568;ReadPosRankSum=0.306;SC=GAGTCTGGGGGGAGGGACTTT;SOR=2.245;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=26;WE=88798373;WS=88798355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,54:0.95:57
chr16	88798369	.	G	GGCGGGGCATGGGGATGCACTGAGTCTGGGGATGGGCGGGGTGTGGGGATGCACTGAGTCTGGGGATGGGC	1882.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.374;ClippingRankSum=0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=3.281;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.78;MQRankSum=-0.100;QD=36.21;ReadPosRankSum=-1.903;SOR=2.124;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,50:0.96:52
chr16	88802832	rs114153706	G	A	745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.978;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.629;NF=3;NR=26;PP=626;ReadPosRankSum=0.729;SC=CGGCAGAGAGGGCTGCACAGC;SOR=1.362;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=41;TCF=5;TCR=36;TR=29;WE=88802840;WS=88802822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,27:0.69:39
chr16	88803195	rs4782410	T	C	2733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=49;NR=46;PP=1593;SC=TCTGCAGGCCTCCCCACCCTG;SOR=0.712;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=49;TCR=46;TR=95;WE=88803203;WS=88803185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr16	88803925	rs66881450	G	GC	236.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.898;HP=10;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=239;ReadPosRankSum=1.682;SC=CCTCCGCCCCGCCCCCCGCAC;SOR=1.230;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=15;TCR=14;TR=10;WE=88803933;WS=88803915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,13:0.30:43
chr16	88803982	rs6500493	C	G	3420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=64;NR=42;PP=1747;SC=CGCCGCAGGACGGAGCTCTGG;SOR=0.843;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=64;TCR=42;TR=106;WE=88803990;WS=88803972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr16	88804734	rs7184427	A	G	3609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.010;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=75;PP=2398;ReadPosRankSum=-1.507;SC=CCCCACCGCGACGCAGAGTCT;SOR=0.639;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=271;TCF=138;TCR=133;TR=159;WE=88804742;WS=88804724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,164:0.58:281
chr16	88804924	rs34600315	TC	T	2252.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.241;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.925;NF=17;NR=25;PP=1400;ReadPosRankSum=0.981;SC=ATCAGGGAACTCCCAAGACCC;SOR=0.990;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=84;TCF=25;TCR=59;TR=42;WE=88804932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,76:0.55:139
chr16	88807896	rs7404939	G	A	760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.215;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=14;PP=475;ReadPosRankSum=-0.915;SC=CAGCTCCCGTGGATGTGGGCT;SOR=1.001;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=142;TCF=92;TCR=50;TR=42;WE=88807904;WS=88807886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,47:0.30:157
chr16	88808111	.	T	C	141	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=24;MQ=58.36;NF=0;NR=8;PP=141;QD=21.9714015684;SC=CGGGTGGGAGTGTGGATGGGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=8;WE=88808119;WS=88808101;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:10,8:0.44:18
chr16	88808743	rs6500495	A	G	3028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.471;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=61;PP=1695;ReadPosRankSum=-0.691;SC=GCGGGGCACAATATGCAGGCA;SOR=0.732;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=222;TCF=119;TCR=103;TR=132;WE=88808751;WS=88808733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,143:0.59:244
chr16	88808862	rs7201439	C	T	808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=22;PP=461;ReadPosRankSum=-1.805;SC=AGGCTGGTCCCGGGGACGGGG;SOR=0.675;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=16;TCR=40;TR=31;WE=88808870;WS=88808852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,36:0.58:62
chr16	88808918	rs11648555	C	A	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.291;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.119;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=4;PP=62;ReadPosRankSum=2.469;SC=GCCCCCAGCCCGGCCAGAGCC;SOR=0.111;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=8;WE=88808926;WS=88808908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr16	88809368	rs28525359	G	T	2714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.446;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=45;PP=1522;ReadPosRankSum=0.340;SC=GTTGCATCCCGATGCATGGCC;SOR=0.390;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=213;TCF=136;TCR=77;TR=114;WE=88809376;WS=88809358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,128:0.54:236
chr16	88809434	rs9925084	A	G	3776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=399;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.617;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=88;PP=2299;ReadPosRankSum=-1.197;SC=CCTGCTGTGCACCAGGTCAGG;SOR=0.651;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=379;TCF=198;TCR=181;TR=186;WE=88809442;WS=88809424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:207,192:0.48:399
chr16	88809480	rs9925171	A	G	3100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.917;HP=4;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=79;PP=1978;ReadPosRankSum=0.221;SC=CTGTGCACCCACACCTGGCAG;SOR=0.556;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=323;TCF=150;TCR=173;TR=155;WE=88809488;WS=88809470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,158:0.47:334
chr16	88809686	rs9927855	T	C	3367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.049;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=69;PP=2233;ReadPosRankSum=2.880;SC=AGCTCACCCTTCAGCAGGGGT;SOR=0.831;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=299;TCF=156;TCR=143;TR=150;WE=88809694;WS=88809676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,160:0.50:317
chr16	88809773	rs8048714	G	C	2527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=56;PP=1571;ReadPosRankSum=1.207;SC=ACCCCGGCACGTGCTGGCAGG;SOR=0.673;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=193;TCF=92;TCR=101;TR=107;WE=88809781;WS=88809763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,115:0.56:205
chr16	88809893	rs9933845	GG	AC	2131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.583;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=27;PP=2497;ReadPosRankSum=1.121;SC=TGGAGCTCAGGGACAGGTAGC;SOR=0.919;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=165;TCF=99;TCR=66;TR=75;WE=88809902;WS=88809883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,94:0.51:184
chr16	88810129	rs8053135	A	G	1971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.529;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=48;PP=1246;ReadPosRankSum=0.951;SC=CTGACCGTGAAGCAGCCCTCA;SOR=0.327;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=109;TCF=34;TCR=75;TR=74;WE=88810137;WS=88810119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,81:0.69:118
chr16	88815926	rs372308503	G	A	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=0.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=3;PP=81;ReadPosRankSum=-1.351;SC=GCCAACAGAGGATGGCCAGCC;SOR=0.582;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=14;TCF=8;TCR=6;TR=8;WE=88815934;WS=88815916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr16	88870099	rs865103	T	C	1976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.599;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=22;PP=1401;ReadPosRankSum=-1.003;SC=GCCCCGTCCCTTCCCTCCCCC;SOR=0.469;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=124;TCF=92;TCR=32;TR=79;WE=88870107;WS=88870089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,82:0.61:135
chr16	88872145	rs507329	T	C	4246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=62;PP=2298;SC=TTTTGAGGAGTGCAATGTTGG;SOR=0.839;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=143;TCF=81;TCR=62;TR=143;WE=88872153;WS=88872135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr16	88872229	rs480727	A	G	2149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.566;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=45;PP=1278;ReadPosRankSum=-2.581;SC=CAAGGATGGCACCAGGAGGTC;SOR=0.682;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=158;TCF=84;TCR=74;TR=93;WE=88872237;WS=88872219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,102:0.59:174
chr16	88872511	rs510862	T	C	8901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=167;NR=149;PP=2965;SC=TGGTGGAGCATGTCAAGGAGC;SOR=0.728;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=317;TCF=167;TCR=150;TR=316;WE=88872519;WS=88872501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,350:1.00:350
chr16	88874632	rs572275	C	G	3191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.524;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=74;PP=2112;ReadPosRankSum=1.203;SC=CCGCGGACCTCGCCCACATCA;SOR=0.942;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=232;TCF=113;TCR=119;TR=134;WE=88874640;WS=88874622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,145:0.57:253
chr16	88876666	rs8191489	C	G	1771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.097;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=41;PP=1071;ReadPosRankSum=1.147;SC=CTTGCTGTTACCTGGCTGTGT;SOR=0.508;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=131;TCF=60;TCR=71;TR=78;WE=88876674;WS=88876656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,84:0.56:149
chr16	88878048	rs8191473	G	A	882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=23;PP=566;ReadPosRankSum=0.584;SC=GGGTCCTTCAGGACGGGCGAG;SOR=0.766;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=103;TCF=46;TCR=57;TR=42;WE=88878056;WS=88878038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,45:0.40:113
chr16	88880811	rs11076715	C	T	723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.366;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=7;PP=438;ReadPosRankSum=0.884;SC=CAGGGCCAACCGGAGATTCTA;SOR=0.286;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=29;WE=88880819;WS=88880801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,31:0.70:44
chr16	88880965	rs11076716	C	G	982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=24;PP=517;ReadPosRankSum=-0.198;SC=AAAGAACATGCAGTTATTCAA;SOR=0.749;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=81;TCF=33;TCR=48;TR=39;WE=88880973;WS=88880955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,48:0.49:97
chr16	88884466	rs2303271	C	T	2766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.155;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=50;PP=1549;ReadPosRankSum=-0.738;SC=GGACCAAGGCCTCCTGGTGCT;SOR=0.690;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=174;TCF=93;TCR=81;TR=111;WE=88884474;WS=88884456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,125:0.64:195
chr16	88889025	.	G	A	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=0.000;DP=330;ExcessHet=3.0103;FS=0.568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.97;ReadPosRankSum=1.804;SOR=0.763;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:280,50:0.15:330
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chr16	88901850	rs11076721	T	A	962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.176;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=28;PP=616;ReadPosRankSum=-1.342;SC=TTCACGGAGTTCATTAAATCA;SOR=0.981;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=56;TCF=16;TCR=40;TR=38;WE=88901858;WS=88901840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,41:0.68:60
chr16	88902183	rs1064315	G	A	2525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.294;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=58;PP=1407;ReadPosRankSum=0.411;SC=AGACGGGTGCGTGCGTGGCGT;SOR=0.929;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=184;TCF=89;TCR=95;TR=106;WE=88902191;WS=88902173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,117:0.60:196
chr16	88902276	rs12934499	C	T	1234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.550;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=27;PP=711;ReadPosRankSum=0.417;SC=AGAGCCACACCGTCGTCCTCC;SOR=0.460;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=97;TCF=45;TCR=52;TR=53;WE=88902284;WS=88902266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,57:0.54:106
chr16	88902518	.	A	G	214	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=13;NR=4;PP=214;QD=14.6336007381;SC=AGGTTGATGCATTCCTGTCCC;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=17;WE=88902526;WS=88902508;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,17:0.77:22
chr16	88902780	rs12444543	A	G	3319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=84;PP=2232;ReadPosRankSum=-0.169;SC=AAAGAAGGCTAGGGCTGGGCG;SOR=0.663;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=232;TCF=87;TCR=145;TR=137;WE=88902788;WS=88902770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,143:0.58:245
chr16	88902820	rs11076722	T	C	2194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=3.164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.51;ReadPosRankSum=0.811;SOR=1.118;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,59:0.55:107
chr16	88902823	rs11076723	G	T	2109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.98;ReadPosRankSum=1.723;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,51:0.53:96
chr16	88907283	rs8054994	G	T	1621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.980;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=12;PP=1076;ReadPosRankSum=-1.057;SC=AGAATCAGCTGCCGTTTCCCA;SOR=1.199;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=110;TCF=83;TCR=27;TR=60;WE=88907291;WS=88907273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,67:0.56:119
chr16	88909028	rs71395332	C	T	785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=3;PP=510;ReadPosRankSum=-1.516;SC=TTGATGCAGCCGCCCAGAGTC;SOR=0.558;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=51;TCF=46;TCR=5;TR=28;WE=88909036;WS=88909018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,32:0.52:62
chr16	88909095	rs35137494	G	A	2600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=45;PP=1630;ReadPosRankSum=-0.744;SC=TCCTGGGGGCGAGGGCCCCGC;SOR=0.682;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=197;TCF=119;TCR=78;TR=112;WE=88909103;WS=88909085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,121:0.55:219
chr16	88921493	rs12932588	C	A	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=199;ReadPosRankSum=1.449;SC=ATGCAATTCCCTATTTACCGG;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=11;WE=88921501;WS=88921483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr16	88922989	rs113289677	A	AC	150.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.282;NF=0;NR=6;PP=146;ReadPosRankSum=-1.085;SC=GCACGGGGATACCCCCCGTCC;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=6;WE=88922997;WS=88922979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr16	88923829	rs72813576	T	C	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=229;ReadPosRankSum=1.727;SC=GCAGCAGGTCTCCTCCCCGCC;SOR=0.255;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=12;WE=88923837;WS=88923819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr16	88924982	rs72813578	T	C	2579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=375;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=56;PP=1536;ReadPosRankSum=-0.479;SC=TGGTGTGCGCTGGGTGGAGTC;SOR=0.669;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=351;TCF=211;TCR=140;TR=137;WE=88924990;WS=88924972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:234,141:0.38:375
chr16	88927221	rs3826061	T	C	1401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.105;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=17;PP=1024;ReadPosRankSum=1.887;SC=CTGGAGAAGGTCCCGAGCATC;SOR=0.216;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=79;TCF=58;TCR=21;TR=58;WE=88927229;WS=88927211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,58:0.73:79
chr16	88931274	rs76267236	C	T	1895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FS=0.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQRankSum=-1.285;QD=8.78;ReadPosRankSum=0.255;SOR=0.763;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,98:0.45:216
chr16	88931363	rs141563331	A	AGGGAG	3949.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FS=2.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQRankSum=1.226;QD=22.96;ReadPosRankSum=0.731;SOR=0.496;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,99:0.58:172
chr16	88931914	rs889753	T	C	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.172;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=6;PP=380;ReadPosRankSum=-0.714;SC=CGCCAGACCCTCTGGTAGAGA;SOR=0.948;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=47;TCF=35;TCR=12;TR=27;WE=88931922;WS=88931904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,30:0.60:50
chr16	88946955	rs564705	A	G	1585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=17;PP=1110;SC=GTCCTGCCCTAAGTGTGAACC;SOR=1.567;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=53;TCF=36;TCR=17;TR=52;WE=88946963;WS=88946945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr16	88948971	.	GGCATGGCTGTGGGCGTGGCTGTGTGT	G	295.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.765;NF=5;NR=1;PP=882;ReadPosRankSum=1.593;SC=GCTGTGTGTGGGCATGGCTGT;SOR=1.609;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=6;WE=88949004;WS=88948961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr16	88958282	rs3743541	C	G	1462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=20;PP=878;ReadPosRankSum=-0.023;SC=GGACGGGTTTCGCATTACCTT;SOR=0.677;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=94;TCF=63;TCR=31;TR=58;WE=88958290;WS=88958272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,64:0.63:102
chr16	89160158	rs76688594	G	C	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=43;ReadPosRankSum=-0.940;SC=CCGCCACGACGGGACGGGCGG;SOR=0.693;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=6;WE=89160166;WS=89160157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr16	89160452	rs9938075	A	G	246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=5;NR=4;PP=133;SC=GGCCGGGCGCAGAGCTCTCGG;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=9;TCF=5;TCR=4;TR=9;WE=89160460;WS=89160442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr16	89167066	rs57558972	C	G	1050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=1;PP=498;SC=TTGCCTTTCTCCAGCTCGGCC;SOR=3.126;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=41;TCF=36;TCR=5;TR=22;WE=89167083;WS=89167056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr16	89167075	rs11273288	C	CCCCAGGAGGCTCCCGGGAG	2904.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=1;PP=2967;SC=TCCAGCTCGGCCGCCTGTCAG;SOR=4.294;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=12;WE=89167083;WS=89167056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr16	89167094	rs7188200	T	C	3069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=63;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=20;PP=1270;SC=AGTGCAATGCTGCCCCATGTG;SOR=1.567;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=55;TCR=20;TR=75;WE=89167102;WS=89167084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr16	89167140	rs7201122	G	C	5692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=109;NR=64;PP=2965;SC=GCGCCTTGGCGTCCTGCCGGC;SOR=1.195;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=174;TCF=110;TCR=64;TR=173;WE=89167148;WS=89167130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr16	89167395	rs6500526	C	T	11931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.03;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,271:1.00:271
chr16	89167404	rs7193255	T	C	12204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.74;SOR=0.806;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,279:1.00:279
chr16	89167431	rs6500527	G	C	7737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=137;NR=124;PP=2965;SC=CCCAGTGGGCGTCATGGATGA;SOR=0.737;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=261;TCF=137;TCR=124;TR=261;WE=89167451;WS=89167421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr16	89167443	rs6500528	T	C	7660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=140;NR=132;PP=2965;SC=CATGGATGAGTGGCGGTGTGG;SOR=0.707;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=272;TCF=140;TCR=132;TR=272;WE=89167451;WS=89167421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,288:1.00:288
chr16	89167458	rs6500529	C	A	7506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=45;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=139;NR=129;PP=2965;SC=GTGTGGCAGTCCCCCTCTACA;SOR=0.736;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=268;TCF=139;TCR=129;TR=268;WE=89167466;WS=89167448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,282:1.00:282
chr16	89167792	rs8060043	C	T	1649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.992;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=48;PP=1104;ReadPosRankSum=0.312;SC=TTTCGGTGACCGCACAGCACT;SOR=0.552;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=94;TCF=21;TCR=73;TR=63;WE=89167800;WS=89167782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,67:0.68:99
chr16	89168981	rs4782457	T	C	959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=9;PP=648;SC=AGTCTTGCTCTTGCTCTCAGC;SOR=1.675;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=31;WE=89168989;WS=89168971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr16	89169205	rs4782456	C	G	4630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=70;PP=2073;SC=CACCCTCAGACTAGGCGCCTT;SOR=1.670;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=39;TCR=70;TR=109;WE=89169228;WS=89169195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr16	89169219	rs10578141	CCT	C	3771.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=45;PP=2157;SC=GCGCCTTTCCCCTGTCGGGGC;SOR=1.730;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=4;TCR=45;TR=49;WE=89169228;WS=89169195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr16	89169312	rs4782455	T	C	420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=12;PP=327;SC=AGACTAGGCATCTTTTCCTGG;SOR=3.126;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=89169320;WS=89169302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	89178457	.	G	GTGCCTGCTCATCTTCCCACCGAGTGCTTCCTTTCCTCCGCCGCCGTGGGTCTC	2825.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=148.72;SOR=2.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr16	89178773	rs4782449	A	G	1098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=28;PP=784;SC=TTTCCTTTCAATGTTCCCTCT;SOR=3.086;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=34;WE=89178781;WS=89178763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr16	89180664	rs9940965	C	G	3892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=90;NR=55;PP=2346;SC=CAAGGGCCGCCTCCTGAGGGG;SOR=1.186;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=145;TCF=90;TCR=55;TR=145;WE=89180672;WS=89180654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr16	89180883	rs3743979	G	A	2973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=68;PP=1916;SC=GACCACTGCCGTGCGCCTGCC;SOR=1.915;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=30;TCR=68;TR=98;WE=89180891;WS=89180873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr16	89180935	rs3743980	G	T	917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=26;PP=728;SC=CTTCCACTGTGCTCTGAGCCC;SOR=3.056;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=31;WE=89180943;WS=89180925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr16	89187378	rs3743983	G	C	1525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=46;PP=1111;SC=AGGCCCCCCAGGGTGGTTACA;SOR=3.180;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=9;TCR=46;TR=55;WE=89187386;WS=89187368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr16	89188672	rs8058601	C	A	1207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=27;NR=16;PP=705;SC=GGCCTGGGCCCCCCGCAGTGG;SOR=1.038;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=27;TCR=16;TR=43;WE=89188680;WS=89188662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr16	89212200	rs4302032	A	G	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=207;ReadPosRankSum=-0.374;SC=AGCCAGCACCAGGACGAGTGA;SOR=0.343;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=16;WE=89212208;WS=89212190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,19:0.83:23
chr16	89220473	rs72819316	C	T	1857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.301;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=18;PP=1246;ReadPosRankSum=-2.151;SC=GGGCAGTGCGCCTCAGGCTGT;SOR=1.127;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=128;TCF=94;TCR=34;TR=73;WE=89220481;WS=89220463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,83:0.55:150
chr16	89234676	rs12597281	A	G	1798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.506;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=30;PP=1256;ReadPosRankSum=-0.905;SC=GGAGCACAGCAGGGTCCAGGA;SOR=0.991;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=172;TCF=107;TCR=65;TR=88;WE=89234684;WS=89234666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,91:0.51:180
chr16	89234723	rs72819343	A	G	3795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.846;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=79;PP=2515;ReadPosRankSum=-1.181;SC=CTTCCTCCACACCCCGAGATC;SOR=0.765;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=313;TCF=173;TCR=140;TR=180;WE=89234731;WS=89234713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,184:0.56:327
chr16	89235258	rs72819344	C	A	1907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=40;PP=907;ReadPosRankSum=-0.595;SC=GCCTCCTCACCCCGGGGTCCC;SOR=0.673;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=125;TCF=64;TCR=61;TR=82;WE=89235266;WS=89235248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,93:0.67:139
chr16	89235483	rs72819346	C	T	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.090;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=49;ReadPosRankSum=0.192;SC=TTCCGCATCACGCCTGCCCCT;SOR=0.078;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=4;WE=89235491;WS=89235473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr16	89238119	rs2270415	C	G	487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.296;HP=5;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=10;PP=330;ReadPosRankSum=0.718;SC=CCCCGCCCCCCTCACACGTGC;SOR=0.287;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=39;TCF=26;TCR=13;TR=23;WE=89238127;WS=89238109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,26:0.72:36
chr16	89246670	rs59865771	T	C	1542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.651;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=26;PP=817;ReadPosRankSum=0.340;SC=CCGGCGTGGATGAGGAGCCCC;SOR=0.785;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=122;TCF=73;TCR=49;TR=67;WE=89246688;WS=89246660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,74:0.56:133
chr16	89251776	rs58079876	G	A	5005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.480;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=75;PP=2086;ReadPosRankSum=-0.927;SC=ACACCCGCACGGCCAGGGCAG;SOR=0.638;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=231;TCF=100;TCR=131;TR=135;WE=89251784;WS=89251766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,146:0.59:246
chr16	89251798	rs2287356	C	T	4143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.198;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=57;PP=1355;ReadPosRankSum=-1.792;SC=CCATCTCCTGCGGGTCCCTCT;SOR=0.595;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=169;TCF=66;TCR=103;TR=97;WE=89251806;WS=89251788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,109:0.59:186
chr16	89251851	rs2287354	A	G	1020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.897;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=26;PP=602;ReadPosRankSum=0.708;SC=CCCTGCCGTCACTGCAGAGCT;SOR=0.914;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=76;TCF=27;TCR=49;TR=39;WE=89251859;WS=89251841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,45:0.54:84
chr16	89254064	rs12929648	A	G	1367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.784;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=45;PP=1052;ReadPosRankSum=-2.326;SC=ATGGGGCAGGAGGATGGTGTG;SOR=1.748;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=91;TCF=12;TCR=79;TR=50;WE=89254072;WS=89254054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,52:0.55:94
chr16	89258747	rs75791347	A	C	1979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.588;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=30;PP=1025;ReadPosRankSum=0.399;SC=CCGCTGCGGCAAGGACGGCGT;SOR=0.616;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=139;TCF=80;TCR=59;TR=72;WE=89258755;WS=89258737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,90:0.56:160
chr16	89259010	.	G	T	56	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=25;MMLQ=15;MQ=54.8;NF=2;NR=6;PP=56;QD=11.3464015684;SC=CCCCAGCTCCGCCTCCTCCCT;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=8;WE=89259018;WS=89259000;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr16	89259993	rs3815615	A	G	5773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.61;SOR=0.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr16	89262657	rs117169628	G	A	1229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=28;PP=760;ReadPosRankSum=-0.359;SC=GGTGTCCAGGGGGCCGGCTGC;SOR=0.677;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=34;TCR=46;TR=49;WE=89262665;WS=89262647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,54:0.61:88
chr16	89263851	rs3743986	T	C	3064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.278;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=72;PP=1999;ReadPosRankSum=-0.261;SC=CCAGGCTCTCTCCCCAGGCCT;SOR=0.838;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=228;TCF=114;TCR=114;TR=136;WE=89263859;WS=89263841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,147:0.58:252
chr16	89264460	rs7202874	C	T	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=57;ReadPosRankSum=0.566;SC=GGCACTATGGCCCCCTGGTGT;SOR=0.446;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=5;WE=89264468;WS=89264450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr16	89265087	rs61732365	A	G	7581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=344;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=103;PP=2962;ReadPosRankSum=0.664;SC=TCCTCCAAGGAACTGTCCCCG;SOR=0.685;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=317;TCF=149;TCR=168;TR=193;WE=89265109;WS=89265077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,206:0.60:344
chr16	89265101	rs74640353	C	T	6986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=89;PP=2962;ReadPosRankSum=0.314;SC=GTCCCCGGGGCCCACGCCACT;SOR=0.688;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=270;TCF=127;TCR=143;TR=168;WE=89265109;WS=89265077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,180:0.61:296
chr16	89265466	rs12926888	A	G	5698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=440;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.531;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=119;NR=129;PP=2962;ReadPosRankSum=0.334;SC=TCATCAGGGCACCCAGCCCCT;SOR=0.650;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=412;TCF=199;TCR=213;TR=248;WE=89265474;WS=89265456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,267:0.61:440
chr16	89267769	rs34679577	GC	G	416.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.83;QD=32.06;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr16	89287460	rs72819396	A	G	1468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.567;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=30;PP=673;ReadPosRankSum=-1.127;SC=TACCTTCCACATAGATTCACA;SOR=0.755;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=151;TCF=78;TCR=73;TR=64;WE=89287468;WS=89287450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,76:0.45:168
chr16	89289624	rs12920028	G	A	3570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=67;PP=2168;ReadPosRankSum=-1.825;SC=GGACTTTACTGGACCCATCTC;SOR=0.670;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=246;TCF=140;TCR=106;TR=151;WE=89289632;WS=89289614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,164:0.61:269
chr16	89291309	rs28533907	A	T	243.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=7;PP=156;SC=GTGTCAAGTTAAGCGGCTGTG;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=89291317;WS=89291299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	89291945	rs11464538	A	AT	1283.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.199;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=26;PP=1917;ReadPosRankSum=0.341;SC=TTTTTAGGTCATTCTTCTTTC;SOR=0.586;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=108;TCF=34;TCR=74;TR=35;WE=89291959;WS=89291935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,67:0.36:186
chr16	89291948	rs12926996	C	T	2795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.64;ReadPosRankSum=-0.475;SOR=0.674;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:116,75:0.39:191
chr16	89291951	rs12926997	C	T	2789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.02;ReadPosRankSum=-0.201;SOR=0.663;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:122,77:0.39:199
chr16	89293271	rs28417933	A	C	4138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=451;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.522;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=89;PP=2883;ReadPosRankSum=0.995;SC=ACCTTGTTCAAAATTGGAGAG;SOR=0.751;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=417;TCF=219;TCR=198;TR=187;WE=89293279;WS=89293261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:253,198:0.44:451
chr16	89293614	rs4785626	A	G	1878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.576;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=44;PP=1175;ReadPosRankSum=-1.633;SC=ACCCTGGGGAAAAGCCCTGTG;SOR=0.740;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=268;TCF=144;TCR=124;TR=85;WE=89293622;WS=89293602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:196,99:0.34:295
chr16	89294381	rs28415940	T	C	2706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=56;PP=1645;ReadPosRankSum=0.383;SC=AAGCCCTTTATATGTACGGTA;SOR=0.696;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=259;TCF=130;TCR=129;TR=110;WE=89294389;WS=89294371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,129:0.45:288
chr16	89294439	rs9921361	G	T	2214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.357;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=56;PP=1254;ReadPosRankSum=-0.351;SC=AGCACATTCAGATTCACACTG;SOR=0.993;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=269;TCF=134;TCR=135;TR=102;WE=89294447;WS=89294429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:180,114:0.39:294
chr16	89294511	rs28638280	C	T	1561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.025;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=36;PP=876;ReadPosRankSum=-1.391;SC=CGAGCCTAACCGAGCACATAC;SOR=0.620;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=223;TCF=103;TCR=120;TR=71;WE=89294519;WS=89294501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,83:0.32:256
chr16	89294697	rs60437616	C	T	1459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.098;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=37;PP=980;ReadPosRankSum=0.966;SC=GAAGGACTCACACAGGAGAGA;SOR=0.667;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=215;TCF=114;TCR=101;TR=76;WE=89294705;WS=89294687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,79:0.35:228
chr16	89295046	rs12927047	T	C	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.230;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.392;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=165;ReadPosRankSum=0.252;SC=TCTCCAGATGTCCATGACTTG;SOR=1.552;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=9;WE=89295054;WS=89295036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr16	89299054	rs71158785	T	TA	1021.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.74;QD=35.23;SOR=5.353;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr16	89299200	rs61078268	C	A	5230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=488;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.864;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=69;PP=1718;ReadPosRankSum=-0.897;SC=TGCATATGCACATCAACTCAC;SOR=0.544;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=438;TCF=243;TCR=195;TR=143;WE=89299208;WS=89299190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:329,159:0.33:488
chr16	89299227	rs62068537	C	T	5355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-2.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=530;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.880;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=82;PP=2012;ReadPosRankSum=0.992;SC=TGCAACTCAACTCACACCGTA;SOR=0.731;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=482;TCF=243;TCR=239;TR=156;WE=89299235;WS=89299217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:358,172:0.32:530
chr16	89299268	.	A	ATCAACTCGCACTGCGTATGCAAC	3219.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.371;ClippingRankSum=0.000;DP=480;ExcessHet=3.0103;FS=15.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-3.537;QD=12.98;ReadPosRankSum=-0.508;SOR=1.450;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:136,112:0.45:248
chr16	89299280	rs62068538	T	A	2430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=493;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.226;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.047;NF=67;NR=64;PP=1578;ReadPosRankSum=-1.846;SC=CAACTCGCACTGCGTATGCAA;SOR=0.591;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=417;TCF=199;TCR=218;TR=131;WE=89299288;WS=89299270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:348,143:0.29:491
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chr16	89299851	.	GTG	ATA	2944	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MMLQ=24;MQ=59.54;NF=123;NR=103;PP=2944;QD=20;SC=CTCGCACTGCGTGTGCAACTC;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=331;TCF=178;TCR=153;TR=226;WE=89299861;WS=89299841;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:105,226:0.68:331
chr16	89299853	rs34789784	G	A	10501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FS=0.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.86;MQRankSum=-14.683;QD=30.89;ReadPosRankSum=0.531;SOR=0.631;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,264:0.78:340
chr16	89300015	rs62068548	A	G	14233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=534;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=262;NR=231;PP=2965;SC=CTCATACTGCATATGCAACTC;SOR=0.779;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=496;TCF=263;TCR=233;TR=493;WE=89300023;WS=89300005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,530:1.00:530
chr16	89300147	rs62068549	A	G	12821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=473;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-0.148;NF=211;NR=228;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.276;SC=CTCGCACTGCATATGCAACTC;SOR=0.259;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=441;TCF=211;TCR=230;TR=439;WE=89300155;WS=89300137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,472:1.00:473
chr16	89345122	rs3102367	G	A	1651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=20;PP=902;SC=GGAGACACAGGGGGTGGCTCT;SOR=0.726;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=24;TCR=20;TR=44;WE=89345130;WS=89345112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr16	89345408	rs3096305	G	A	10408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=381;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=186;NR=170;PP=2965;ReadPosRankSum=0.591;SC=CGGGCTGGAGGAAGCCGTGAC;SOR=0.232;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=358;TCF=187;TCR=171;TR=356;WE=89345416;WS=89345398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,380:1.00:381
chr16	89350038	rs2279348	G	A	8316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=138;NR=149;PP=2965;SC=CTCCCGGTGCGCCTCCTCGGG;SOR=0.823;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=288;TCF=139;TCR=149;TR=287;WE=89350046;WS=89350028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,309:1.00:309
chr16	89350178	rs2279349	G	A	6074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=103;NR=87;PP=2965;SC=TATGCTTTTCGGTCTGCTCTT;SOR=0.767;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=190;TCF=103;TCR=87;TR=190;WE=89350186;WS=89350168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr16	89356902	.	AAT	A	119	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=28;MMLQ=24;MQ=45.32;NF=2;NR=0;PP=119;QD=84.640143618;SC=TCAGGGCTCCAATGGGGGGAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=2;WE=89356913;WS=89356892;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,2:0.33:6
chr16	89356905	.	G	GC	144	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;FR=0.5000;HP=5;HapScore=4;MGOF=28;MMLQ=24;MQ=47.69;NF=2;NR=0;PP=144;QD=84.5;SC=GGGCTCCAATGGGGGGAGGCT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=2;WE=89356913;WS=89356892;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,2:0.25:8
chr16	89371827	rs3114912	G	A	5334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=110;PP=2965;SC=TGTTTCATATGCCAGGAGAAG;SOR=1.414;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=176;TCF=66;TCR=110;TR=176;WE=89371847;WS=89371817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr16	89371839	rs2277908	G	A	4361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=93;PP=2653;SC=CAGGAGAAGCGCATCTCTTAT;SOR=1.639;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=52;TCR=93;TR=145;WE=89371847;WS=89371817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr16	89379936	rs3102350	T	C	5129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=108;NR=68;PP=2965;SC=ACTGCAGAGTTGTGGGCTCCA;SOR=1.078;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=176;TCF=108;TCR=68;TR=176;WE=89379944;WS=89379926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr16	89389645	rs3114900	G	C	5032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.08;SOR=1.092;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr16	89574166	rs3809641	C	G	7058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=145;PP=2965;SC=AGTCCGAAGGCACAGGACGGA;SOR=1.314;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=235;TCF=90;TCR=145;TR=235;WE=89574174;WS=89574156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr16	89576879	rs5818722	GT	G	255.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.62;ReadPosRankSum=-1.071;SOR=1.931;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,16:0.73:22
chr16	89577046	rs3922633	C	T	6045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=116;PP=2965;SC=TGCACACTTACCGCCTCAGCT;SOR=1.048;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=207;TCF=91;TCR=116;TR=207;WE=89577054;WS=89577036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr16	89590060	rs28643511	G	A	232.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=0;PP=160;SC=CGCGATCACGGCTCACTGCAG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=89590068;WS=89590050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	89590168	rs113476208	T	TATCTC	6579.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=20;PP=2037;SC=GGTTTCCTCTTAGGTGGGAAC;SOR=2.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=89;TCF=66;TCR=23;TR=79;WE=89590176;WS=89590158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr16	89590243	rs3803680	G	A	10887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=405;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=205;NR=149;PP=2965;SC=ACAGCACAGCGTTAGTCTTTG;SOR=0.952;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=355;TCF=206;TCR=149;TR=354;WE=89590251;WS=89590233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,405:1.00:405
chr16	89590667	rs3803679	T	C	1112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=29;PP=712;SC=TGAGTGAGGGTGCGGGAGGCC;SOR=1.954;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=12;TCR=29;TR=41;WE=89590675;WS=89590657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr16	89596106	rs3803676	C	T	1602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=39;PP=1136;SC=TAGCCTGAAGCCACAATTAGA;SOR=3.014;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=9;TCR=39;TR=48;WE=89596114;WS=89596096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr16	89597057	rs4785690	G	T	3564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=43;PP=2199;SC=TCCTGACTTCGCCCAGCTCCT;SOR=1.397;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=74;TCR=43;TR=117;WE=89597065;WS=89597047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr16	89597221	rs4785691	A	G	2719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=59;PP=1826;SC=CTGAAGGTGAAAGCAGCGTGG;SOR=1.659;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=31;TCR=59;TR=90;WE=89597229;WS=89597211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr16	89598356	rs116319889	C	T	3162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.527;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=69;PP=1824;ReadPosRankSum=0.019;SC=TCCCAAAGGGCGCACTGCTGC;SOR=0.760;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=206;TCF=96;TCR=110;TR=131;WE=89598364;WS=89598346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,142:0.66:216
chr16	89598760	rs463701	A	G	1961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=6;PP=1481;SC=TAGGGAATGGAGCTGGTAGCT;SOR=4.139;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=51;TCR=6;TR=57;WE=89598768;WS=89598750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr16	89612511	.	T	G	23	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=13;HapScore=2;MGOF=19;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=1;NR=2;PP=23;QD=19.2570708491;SC=TTTTTTTTTTTTTTGAGACAG;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=3;WE=89612519;WS=89612501;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:4,3:0.43:7
chr16	89612979	rs35936864	AC	A	543.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=4.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQRankSum=1.000;QD=7.77;ReadPosRankSum=2.500;SOR=1.376;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,36:0.51:70
chr16	89628073	rs9930567	G	A	732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.656;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.314;NF=16;NR=20;PP=459;ReadPosRankSum=2.685;SC=GTCCCTGCAGGCCAACGTGCA;SOR=1.002;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=94;TCF=47;TCR=47;TR=36;WE=89628081;WS=89628063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,38:0.37:103
chr16	89629218	rs258327	A	G	2925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.22;SOR=0.918;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr16	89645437	rs369230	G	T	4042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=92;PP=2832;SC=GGTGGCTCACGCCTGTAATCG;SOR=1.802;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=137;TCF=45;TCR=92;TR=137;WE=89645445;WS=89645427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr16	89649675	rs455868	G	A	596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=2;PP=345;SC=AGGGTCCGGGGCCGTTTGAGC;SOR=3.056;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=89649683;WS=89649665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	89650371	rs408800	T	G	1659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=9;PP=1165;SC=CTGGGGCCTCTGGTCCCCCAC;SOR=2.658;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=60;TCF=51;TCR=9;TR=59;WE=89650379;WS=89650361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr16	89652210	rs111488481	A	AG	2701.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=41;PP=1308;SC=AGGACGGGGTAGGGGGTCCTC;SOR=1.455;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=56;TCF=2;TCR=54;TR=43;WE=89652223;WS=89652200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr16	89653032	rs452176	G	A	5771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=123;NR=79;PP=2965;SC=CCTGGTAGGTGTTCAGAGCCA;SOR=1.226;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=202;TCF=123;TCR=79;TR=202;WE=89653040;WS=89653022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr16	89653563	rs9924678	G	T	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.748;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.48;ReadPosRankSum=-2.838;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr16	89653999	rs140664874	TTGAG	T	6553.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQ=60.04;MQRankSum=0.134;NF=12;NR=127;PP=2947;ReadPosRankSum=-1.262;SC=GAGTGAGCGTTTGAGTGAACC;SOR=1.120;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=149;TCF=12;TCR=137;TR=139;WE=89654010;WS=89653989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,249:0.99:251
chr16	89654123	rs76691791	AG	GT	945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.99;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr16	89654130	rs71374184	C	G	949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.23;SOR=4.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr16	89696999	rs395593	C	T	374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=10;PP=222;SC=CTGGGGGAGCCGGGGCTGGGG;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=89697007;WS=89696989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr16	89703424	rs445537	A	G	4174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=62;NR=71;PP=2311;SC=GCATCTCCTCACGTGGGACCT;SOR=1.056;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=133;TCF=62;TCR=71;TR=133;WE=89703432;WS=89703414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr16	89703519	rs461115	C	T	1337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=19;PP=997;SC=CTTCCAGCCACGAAGGATGAT;SOR=1.038;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=23;TCR=19;TR=42;WE=89703527;WS=89703509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr16	89712889	rs460879	C	T	1191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=7;PP=638;SC=TCCCACAGCACCAGAGCGTGG;SOR=1.954;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=35;WE=89712897;WS=89712879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr16	89713174	rs460984	C	T	11667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=437;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=194;NR=219;PP=2965;SC=CCCATGGGGCCCCACTCAGCT;SOR=0.855;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=414;TCF=194;TCR=220;TR=413;WE=89713182;WS=89713164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,437:1.00:437
chr16	89717781	rs141950187	AAAAC	A	345.86	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.603;NF=12;NR=0;PP=573;ReadPosRankSum=-0.646;SC=TCCGTCTCAAAAAACAAACAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=12;WE=89717792;WS=89717778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,11:0.92:12
chr16	89720409	rs258338	T	A	5025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=96;PP=2760;SC=ACTCACTAGGTTCCTTCTAGA;SOR=1.185;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=167;TCF=71;TCR=96;TR=167;WE=89720417;WS=89720399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr16	89724572	rs154664	T	C	1025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=5;PP=721;SC=TTATTCTGGATCCACGCAGGC;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=29;WE=89724580;WS=89724562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr16	89751895	.	T	C	1252	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=24;MQ=57.49;NF=39;NR=18;PP=1252;QD=22.5749335535;SC=CGAGCTGGTCTCGCAGTGGGC;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=59;TCF=41;TCR=18;TR=57;WE=89751903;WS=89751885;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,57:0.97:59
chr16	89753031	rs397891	G	C	1752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=4;PP=1344;SC=GCTAAGGAGAGGAAGCCCGGG;SOR=4.731;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=54;TCF=50;TCR=4;TR=54;WE=89753039;WS=89753021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr16	89753971	rs258325	T	C	7361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=118;NR=144;PP=2965;ReadPosRankSum=2.125;SC=GTTGGCCTTTTCTTTTTTGTT;SOR=0.949;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=265;TCF=120;TCR=145;TR=262;WE=89753979;WS=89753961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,278:0.99:280
chr16	89754255	rs258324	T	G	3189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=68;PP=1904;SC=GGAAAGGGAGTTTGAGACTAG;SOR=1.550;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=39;TCR=68;TR=107;WE=89754263;WS=89754245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr16	89758973	rs187282	A	G	7726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=125;NR=140;PP=2965;SC=GCTGAGGCCTAACTCTGCTGC;SOR=0.947;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=265;TCF=125;TCR=140;TR=265;WE=89758981;WS=89758963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,289:1.00:289
chr16	89760492	rs465507	C	G	1409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=7;PP=1041;SC=TTCCAGGCCACCACAGGCTCT;SOR=2.985;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=37;TCR=7;TR=44;WE=89760500;WS=89760482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr16	89760552	rs460057	T	C	4106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=86;NR=57;PP=2196;SC=AGGAGCCGGCTGTATTGAGGT;SOR=1.017;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=143;TCF=86;TCR=57;TR=143;WE=89760560;WS=89760542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr16	89761214	.	ACCCGCAGCCCCCGCCCGTGCCCACGCCCTCTGCG	A	819.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.92;QD=51.23;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr16	89763045	rs460367	C	T	1980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=17;PP=1325;SC=GCCGCCTGGGCGGGCTGTCCA;SOR=1.997;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=52;TCR=17;TR=69;WE=89763053;WS=89763035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr16	89763263	rs462769	T	C	5509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=96;PP=2965;SC=GCAGATTGGCTCCAGCAGAGC;SOR=0.968;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=180;TCF=84;TCR=96;TR=180;WE=89763271;WS=89763253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr16	89764042	rs55645629	A	G	2567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.326;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=53;PP=1489;ReadPosRankSum=0.197;SC=CAGAGCTTTCAGGGGTGGCCA;SOR=0.616;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=302;TCF=174;TCR=128;TR=120;WE=89764050;WS=89764032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:195,136:0.41:331
chr16	89774411	rs11860230	T	C	5617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=85;NR=103;PP=2965;SC=AACAGAAGGATACCCCCGGCC;SOR=1.061;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=188;TCF=85;TCR=103;TR=188;WE=89774419;WS=89774401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr16	89775422	rs59660050	C	G	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=1.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.90;ReadPosRankSum=-0.625;SOR=0.458;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr16	89775429	rs143353176	C	CCCCG	127.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=2.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.32;ReadPosRankSum=1.436;SOR=1.284;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr16	89775437	rs76084865	A	G	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.45;ReadPosRankSum=-1.973;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr16	89778202	rs376041423	G	GC	583.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.265;HP=8;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=181;ReadPosRankSum=-1.270;SC=CTCTGGCTCCGCCCCCCACGG;SOR=0.080;SbPval=0.05;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=7;WE=89778210;WS=89778192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr16	89778219	rs28588261	A	T	754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=4.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.55;ReadPosRankSum=-0.756;SOR=0.275;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,23:0.53:43
chr16	89778224	rs7206836	G	C	1655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.99;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr16	89782989	rs7206570	A	G	4239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=76;NR=61;PP=2662;SC=CAGGCTGGGGAATGGGAGCAG;SOR=0.760;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=138;TCF=77;TCR=61;TR=137;WE=89782997;WS=89782979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr16	89783187	rs4785706	C	T	2008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.11;SOR=0.908;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr16	89784336	rs7190099	C	T	1145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FS=1.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQRankSum=-0.775;QD=5.23;ReadPosRankSum=2.762;SOR=0.714;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:136,83:0.38:219
chr16	89784521	rs10468304	T	A	9343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=364;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.439;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=160;NR=174;PP=2965;ReadPosRankSum=0.941;SC=CTGTGATCCTTTGTGCAGCGG;SOR=0.544;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=335;TCF=161;TCR=174;TR=334;WE=89784529;WS=89784511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,361:1.00:362
chr16	89787040	rs4785589	C	T	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.898;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=151;ReadPosRankSum=-1.011;SC=CCGGGAACCGCGGCCCGGGAT;SOR=0.089;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=15;WE=89787048;WS=89787031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,18:0.86:21
chr16	89787340	rs117990130	C	T	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=50;ReadPosRankSum=1.743;SC=GGAACGCAGCCGGCGCTGGTG;SOR=0.693;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=7;WE=89787348;WS=89787330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,8:0.26:31
chr16	89787962	rs115025067	G	A	689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.985;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=10;PP=343;ReadPosRankSum=-2.388;SC=CTCGCTTCCAGCGCGCCGAGC;SOR=0.853;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=55;TCF=34;TCR=21;TR=28;WE=89787970;WS=89787952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,34:0.58:59
chr16	89789311	rs8056353	G	A	1583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.162;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=48;PP=1104;ReadPosRankSum=-0.346;SC=TTGAGAGAGGGACAGGGCGTG;SOR=0.794;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=182;TCF=72;TCR=110;TR=76;WE=89789319;WS=89789301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,79:0.41:194
chr16	89790167	rs4785590	G	C	1254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.586;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=30;PP=709;ReadPosRankSum=1.493;SC=GCTCCTCAGTGGGGCAGGGTT;SOR=0.877;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=99;TCF=46;TCR=53;TR=54;WE=89790175;WS=89790156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,59:0.57:104
chr16	89793555	rs2099105	T	C	657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=4;PP=441;ReadPosRankSum=0.262;SC=GATGGGGCCATGGTGGGGAGA;SOR=0.788;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=43;TCF=36;TCR=7;TR=26;WE=89793563;WS=89793545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,27:0.63:43
chr16	89795485	rs7204478	C	T	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=43;ReadPosRankSum=-0.382;SC=TGTTCGGAAACGGGATTGGAA;SOR=0.591;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=7;WE=89795493;WS=89795475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr16	89800529	rs9935559	C	T	2926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.538;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=78;PP=1848;ReadPosRankSum=1.819;SC=TACCCATCCCCGCCCCAAGAG;SOR=0.940;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=244;TCF=103;TCR=141;TR=130;WE=89800537;WS=89800519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,136:0.54:253
chr16	89800550	rs7189734	G	A	1484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.226;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=45;PP=1036;ReadPosRankSum=1.609;SC=TTGGGGGTGCGTGAAGGTGGC;SOR=0.372;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=155;TCF=50;TCR=105;TR=70;WE=89800558;WS=89800540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,71:0.44:161
chr16	89805261	rs1800359	A	G	2312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=465;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=67;PP=1463;ReadPosRankSum=-2.980;SC=TGTCCCCCACATGGCCCAAGG;SOR=0.724;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=426;TCF=216;TCR=210;TR=129;WE=89805269;WS=89805251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:324,141:0.30:465
chr16	89831510	rs2159116	C	A	1778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.481;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=52;PP=1253;ReadPosRankSum=1.631;SC=TTCTTCATTGCGCAAGTTTCA;SOR=0.966;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=222;TCF=99;TCR=123;TR=85;WE=89831518;WS=89831500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,93:0.38:247
chr16	89836507	rs7200990	T	C	8985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=158;NR=144;PP=2965;SC=TGAAGACGAATTGAGAAGTAG;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=302;TCF=158;TCR=144;TR=302;WE=89836515;WS=89836497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,330:1.00:330
chr16	89836978	.	G	C	1818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.250;ClippingRankSum=0.000;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.736;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=30;PP=1094;ReadPosRankSum=-0.110;SC=TCACCTCTCCGGGGGAGCGAC;SOR=1.108;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=210;TCF=130;TCR=80;TR=89;WE=89836986;WS=89836968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,92:0.42:221
chr16	89849480	rs2239359	C	T	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.901;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=13;PP=285;ReadPosRankSum=0.399;SC=CGGTACTTGCCGGGAACCAGG;SOR=0.536;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=72;TCF=31;TCR=41;TR=26;WE=89849488;WS=89849470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,30:0.39:76
chr16	89858759	rs17226159	C	T	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=65;ReadPosRankSum=2.144;SC=AGCCACATCTCACCAGACATC;SOR=0.223;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=5;WE=89858767;WS=89858756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr16	89862202	rs17226075	C	T	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.640;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=85;ReadPosRankSum=-0.563;SC=TCAAGACAGACGTAAAAGAGG;SOR=1.230;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=6;WE=89862210;WS=89862192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr16	89865311	rs17226026	T	C	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=135;ReadPosRankSum=0.289;SC=GGGACAAACATTGGTGCAGGA;SOR=0.467;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=11;WE=89865319;WS=89865307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr16	89866177	rs34427386	G	A	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.758;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=22;ReadPosRankSum=0.274;SC=CGAGGCGGGCGGATCACGAGG;SOR=0.169;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=5;WE=89866185;WS=89866167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,6:0.21:28
chr16	89869564	rs35506335	G	A	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.917;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=308;ReadPosRankSum=-0.383;SC=CCGTAAATAGGTACAAACAGC;SOR=0.174;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=54;TCF=48;TCR=6;TR=21;WE=89869572;WS=89869554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,21:0.38:56
chr16	89869761	rs1800286	T	C	3607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=398;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.187;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=87;PP=2419;ReadPosRankSum=-0.267;SC=TGAAAAACCATAAAACCAAAG;SOR=0.851;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=380;TCF=184;TCR=196;TR=162;WE=89869769;WS=89869751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:224,174:0.44:398
chr16	89902482	rs12598477	T	C	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=153;ReadPosRankSum=0.533;SC=GTTTAGGAGGTTAAGGCAGGA;SOR=0.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=11;WE=89902490;WS=89902472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,11:0.33:33
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chr16	89930129	rs55999134	G	C	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.852;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=14;PP=434;ReadPosRankSum=1.057;SC=GAGCCCTGAGGGGGTAGCAGG;SOR=0.810;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=47;TCR=43;TR=28;WE=89930137;WS=89930119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,28:0.30:93
chr16	89973777	.	CTCCCAGT	C	800	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MMLQ=17;MQ=56.51;NF=0;NR=15;PP=800;QD=55.0666666667;SC=CACCTCCCTCCTCCCAGTTCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=15;WE=89973804;WS=89973767;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:20,15:0.43:35
chr16	89973796	.	A	G	649	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=22;MMLQ=27;MQ=54.37;NF=0;NR=15;PP=649;QD=45.5847475031;SC=CCCAGCTCCCAGCTCCCACCT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=15;WE=89973804;WS=89973767;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,15:0.75:20
chr16	89975248	.	G	C	293	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=44;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=6;NR=0;PP=293;QD=54.6285354245;SC=CTCCCACCTCGCAGCTCCCAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=6;WE=89975256;WS=89975245;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:17,6:0.26:23
chr16	89981303	.	G	T	83	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MMLQ=27;MQ=58.41;NF=8;NR=0;PP=83;QD=14.7214015684;SC=ACATTTGTGTGTGTGTGCCTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=8;WE=89981332;WS=89981293;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr16	89981345	.	T	TTG	842	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=27;MQ=59.36;NF=18;NR=12;PP=842;QD=28.4333333333;SC=GGGTGCACATTTGTGTGTGTG;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=76;TCF=34;TCR=42;TR=30;WE=89981354;WS=89981335;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:46,30:0.39:76
chr16	90000925	rs4396536	T	C	4758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=75;NR=89;PP=2873;SC=TTCTCAAGACTCTGTCCAGAG;SOR=0.993;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=164;TCF=75;TCR=89;TR=164;WE=90000933;WS=90000915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr16	90002290	rs1135425	T	C	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.084;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=132;ReadPosRankSum=-0.720;SC=GGAGCCATCTTGCTGCCGACA;SOR=1.292;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=38;TCF=12;TCR=26;TR=13;WE=90002298;WS=90002280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,15:0.35:43
chr16	90004868	rs56378598	C	T	1315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.138;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=18;PP=889;ReadPosRankSum=-0.760;SC=CTCGTGCCCTCGGTCTCTTGC;SOR=0.326;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=125;TCF=91;TCR=34;TR=60;WE=90004876;WS=90004858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,61:0.48:127
chr16	90020861	rs7195043	C	T	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=10;PP=167;ReadPosRankSum=0.728;SC=TTCTTCCTGCCGCGTCCTGCG;SOR=0.746;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=18;TCR=27;TR=17;WE=90020869;WS=90020851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,22:0.43:51
chr16	90037828	rs4785755	G	A	8238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=157;NR=131;PP=2965;SC=CAGCATTTCTGTGTACATGTC;SOR=0.823;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=288;TCF=157;TCR=131;TR=288;WE=90037836;WS=90037818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,309:1.00:309
chr16	90050880	rs4785759	A	C	4244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=103;NR=41;PP=2942;SC=GCCCCTGTTTACTGTTGAATA;SOR=1.739;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=144;TCF=103;TCR=41;TR=144;WE=90050888;WS=90050870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr16	90075100	rs11642185	C	G	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.30;MQRankSum=-2.128;QD=12.18;ReadPosRankSum=0.210;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr16	90075412	rs2241084	T	C	919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=29;PP=703;SC=GGAGAGAGTGTGCTGTGTCCT;SOR=4.743;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=31;WE=90075420;WS=90075402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr16	90076484	rs149716164	C	T	1290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.794;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=39;PP=839;ReadPosRankSum=-0.600;SC=GATGGAGTCTCGCTCTGTCAC;SOR=0.596;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=121;TCF=27;TCR=94;TR=52;WE=90076492;WS=90076474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,57:0.45:128
chr16	90093969	rs3743829	T	C	6592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=133;NR=71;PP=2965;SC=TGCCAAATGTTCCTGGGAGCA;SOR=1.377;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=205;TCF=133;TCR=72;TR=204;WE=90093977;WS=90093959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr16	90094195	rs3743827	A	G	1854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=46;PP=1418;SC=CAGGGTGCCTACGCCGAGTGT;SOR=4.029;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=7;TCR=46;TR=53;WE=90094203;WS=90094185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr16	90094214	rs3743826	C	T	1207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=30;PP=877;SC=GTCCATCTTGCCATGTGGATC;SOR=3.556;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=35;WE=90094222;WS=90094204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr16	90095277	rs7191175	T	A	658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=1;PP=513;SC=TGAAAGAGTCTCATGACCTGA;SOR=3.912;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=90095285;WS=90095267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr16	90095561	rs3785183	C	T	3035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=46;PP=1331;SC=GGGCAGCCTACGGGGCAGGCT;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=32;TCR=48;TR=76;WE=90095569;WS=90095551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr16	90095597	rs71137702	T	TGGGGCAGCCTACGGGGCAGGCTGC	4161.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=15;NR=24;PP=1422;SC=GGGCAGGCTATGGGGCAGCCT;SOR=0.804;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=65;TCF=19;TCR=46;TR=39;WE=90095605;WS=90095587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr16	90099061	rs4324129	C	T	3607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=24;PP=2514;SC=ACCAGGTGTGCACAGGTACGG;SOR=2.603;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=92;TCR=24;TR=116;WE=90099069;WS=90099051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr16	90104019	rs2241036	G	A	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.321;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=311;ReadPosRankSum=-0.276;SC=CGTGCTACCGGCCGGCCTTGG;SOR=0.913;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=60;TCF=51;TCR=9;TR=20;WE=90104027;WS=90104009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,21:0.33:63
chr16	90108832	rs2241035	C	T	4976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=371;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.805;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=110;NR=97;PP=2853;ReadPosRankSum=0.387;SC=CCCGTTGCCTCGGCCAAAAGA;SOR=0.724;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=338;TCF=176;TCR=162;TR=207;WE=90108840;WS=90108822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,229:0.62:370
chr16	90109519	rs2241032	G	A	982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.703;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=9;PP=635;ReadPosRankSum=0.545;SC=TGATGCTCACGCTGCCCCTCC;SOR=0.903;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=118;TCF=90;TCR=28;TR=44;WE=90109527;WS=90109509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,47:0.38:123
chr16	90109711	rs3743825	A	G	2423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.456;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=64;PP=1556;ReadPosRankSum=0.029;SC=TCGGACAGACACTGGGCCAGG;SOR=0.814;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=252;TCF=116;TCR=136;TR=113;WE=90109719;WS=90109701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,123:0.44:278
chr16	90109756	rs3833069	G	GC	1251.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.871;HP=6;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=36;PP=982;ReadPosRankSum=1.407;SC=CGACGTAGCTGCCCCCCTGGG;SOR=1.011;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=84;TCF=1;TCR=83;TR=36;WE=90109764;WS=90109746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,52:0.46:112
chr16	90110027	rs3743824	G	A	877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.821;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=11;PP=491;ReadPosRankSum=1.390;SC=CACAGTCGGCGGCACCTTCTC;SOR=0.595;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=82;TCF=57;TCR=25;TR=36;WE=90110035;WS=90110017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,42:0.47:90
chr16	90110284	rs3743821	G	A	4156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FS=3.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.93;ReadPosRankSum=-0.742;SOR=0.759;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:150,111:0.43:261
chr16	90110289	rs1048148	C	A	4227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FS=4.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.72;ReadPosRankSum=-0.075;SOR=0.706;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:155,114:0.42:269
chr16	90110737	rs3743817	A	G	1610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.654;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=42;PP=1001;ReadPosRankSum=-0.700;SC=CGTAGAGTCTATTGCTGCCTG;SOR=0.632;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=47;TCR=79;TR=67;WE=90110745;WS=90110727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,74:0.54:137
chr16	90127080	rs3826200	C	T	2209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.377;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.99;MQRankSum=0.765;NF=50;NR=58;PP=1242;ReadPosRankSum=2.497;SC=GAGTTCCCTCCAGGCAGGATG;SOR=0.595;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=303;TCF=133;TCR=170;TR=108;WE=90127088;WS=90127070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:210,121:0.37:331
chr16	90128224	rs2077426	C	G	988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.529;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=9;PP=708;ReadPosRankSum=1.048;SC=CAGAGCTAACCATGTTATCCC;SOR=1.215;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=94;TCF=71;TCR=23;TR=45;WE=90128232;WS=90128214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,47:0.48:98
chr16	90130136	rs2078478	C	T	1169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.340;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=23;PP=627;ReadPosRankSum=0.258;SC=TGACAATTCTCTCAAACTAGA;SOR=0.555;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=132;TCF=78;TCR=54;TR=53;WE=90130144;WS=90130126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,61:0.42:144
chr16	90133137	rs16966444	G	T	4946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=118;NR=47;PP=2965;SC=AATGATGATGGCAGACACTGC;SOR=1.974;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=165;TCF=118;TCR=47;TR=165;WE=90133145;WS=90133127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr16	90141288	.	TA	T	476.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.263;ClippingRankSum=0.000;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=0.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=2.218;QD=3.72;ReadPosRankSum=1.395;SOR=0.588;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,42:0.33:128
chr16	90141355	rs12925933	A	C	2721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.905;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.492;NF=75;NR=56;PP=1944;ReadPosRankSum=-1.625;SC=CTTCATCGGAATCTTCTGTGT;SOR=0.768;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=275;TCF=151;TCR=124;TR=131;WE=90141363;WS=90141345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,135:0.47:285
chr16	90141477	rs7196459	T	G	4254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.61;NF=55;NR=88;PP=2857;SC=AGAGCTGGGATGAGGAACAAA;SOR=1.360;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=143;TCF=55;TCR=88;TR=143;WE=90141485;WS=90141467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr16	90141724	.	G	A	2975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.489;ClippingRankSum=0.000;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.104;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-1.238;NF=72;NR=56;PP=1592;ReadPosRankSum=-0.537;SC=GTTTTATATCGCCCAGGCTGG;SOR=0.455;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=229;TCF=135;TCR=94;TR=128;WE=90141732;WS=90141714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,144:0.56:255
chr16	90142087	rs35256427	G	A	2793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.589;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.087;NF=77;NR=32;PP=1796;ReadPosRankSum=0.639;SC=CAGAGCAGTCGCTGATGCTAG;SOR=0.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=183;TCF=128;TCR=55;TR=109;WE=90142095;WS=90142077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,119:0.60:197
chr16	90161065	rs8051193	A	T	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.13;MQRankSum=-3.700;QD=0.80;ReadPosRankSum=1.626;SOR=0.539;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,9:0.18:50
chr16	90161231	rs8055916	T	G	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=1.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQRankSum=-9.208;QD=0.62;ReadPosRankSum=0.795;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,17:0.15:117
chr16	90161292	rs6500468	G	C	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.838;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.545;NF=4;NR=12;PP=280;ReadPosRankSum=0.224;SC=TGGCTATTGCGTTTCCTGAGA;SOR=0.204;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=41;TCF=8;TCR=33;TR=16;WE=90161300;WS=90161282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,13:0.35:37
chr17	6115	rs61739713	G	C	2773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.926;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=65;PP=1407;ReadPosRankSum=0.543;SC=TGTACTTGAGGGAGATGAGGA;SOR=0.887;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=194;TCF=98;TCR=96;TR=122;WE=6123;WS=6105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,135:0.63:214
chr17	6157	rs2294076	A	G	1577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.481;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=40;PP=959;ReadPosRankSum=-2.284;SC=ACTTGTCTTCAGTCTTGTCCA;SOR=0.856;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=113;TCF=48;TCR=65;TR=68;WE=6165;WS=6147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,74:0.60:123
chr17	11743	rs34663111	A	G	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=37;ReadPosRankSum=0.524;SC=CAAGCCCCCAAGCTGGAGTTG;SOR=1.609;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=4;WE=11751;WS=11733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr17	11830	rs62054999	A	G	790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=418;ReadPosRankSum=-0.139;SC=GGGTGGGAGTAGGGGTTGGGG;SOR=0.546;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=25;WE=11838;WS=11820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,33:0.75:44
chr17	13905	rs6565705	G	A	1625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=29;PP=949;ReadPosRankSum=-0.256;SC=GGGCAGGCCTGGGTGGAACCC;SOR=0.687;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=52;TCR=42;TR=65;WE=13913;WS=13895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,72:0.70:103
chr17	14008	rs2294075	G	C	2170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.902;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=40;PP=1427;ReadPosRankSum=0.780;SC=GGGCAGAGAAGAGCAAACGGT;SOR=0.558;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=139;TCF=73;TCR=66;TR=88;WE=14016;WS=13998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,99:0.63:156
chr17	22211	rs2294074	G	A	131.53	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=16.44;ReadPosRankSum=0.489;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr17	63824	rs77852841	G	A	432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.735;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=197;ReadPosRankSum=-0.259;SC=GGGGAAGGCAGGCTTCTGCTG;SOR=0.330;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=14;WE=63832;WS=63814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr17	69293	rs146351269	G	GTTTCT	78.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.08;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	69298	rs62057059	A	T	87.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.09;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
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chr17	69631	rs62059561	C	T	1073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=28;PP=753;SC=TACCACGTGGCGTAGCAGCTC;SOR=2.774;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=34;WE=69639;WS=69621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
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chr17	181474	rs12953074	T	C	4684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=82;NR=74;PP=2689;SC=GAGGGCCTCATCAGCCGACCC;SOR=0.704;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=156;TCF=82;TCR=74;TR=156;WE=181482;WS=181464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr17	181674	rs76348932	T	C	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.462;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=12;PP=162;ReadPosRankSum=-0.225;SC=CCATTTGTCCTGGACAAAAAT;SOR=1.209;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=68;TCF=31;TCR=37;TR=19;WE=181682;WS=181664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,23:0.31:75
chr17	182990	.	A	C	322	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=18;MQ=45.57;NF=3;NR=14;PP=322;QD=20.9865419145;SC=GACACAGAGAAGGCCATTAGA;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=182998;WS=182980;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	295585	.	TA	T	167.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.400;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.24;MQRankSum=1.489;QD=3.90;ReadPosRankSum=0.128;SOR=0.752;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,14:0.33:43
chr17	423051	rs2034088	T	C	1879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.310;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=34;PP=1031;ReadPosRankSum=-1.427;SC=GTGGACCAAATGTCCCGGCAC;SOR=0.481;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=127;TCF=76;TCR=51;TR=82;WE=423059;WS=423041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,90:0.66:137
chr17	435896	rs11650424	C	T	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=196;ReadPosRankSum=-0.915;SC=AGTAGGCGTTCAAACAAAATT;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=10;WE=435904;WS=435887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr17	436221	rs2304947	G	C	1170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=33;PP=845;ReadPosRankSum=0.341;SC=AAACTTTAAGGTTCCACGTAT;SOR=0.950;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=14;TCR=46;TR=43;WE=436229;WS=436211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,45:0.74:61
chr17	440108	rs11653961	A	C	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.569;HP=6;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=277;ReadPosRankSum=-0.380;SC=GTGTGTGGGGAGGTGTCGGTA;SOR=4.271;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=13;WE=440116;WS=440106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr17	455383	rs12450578	C	G	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=263;ReadPosRankSum=0.659;SC=CTCACCCAGTCAGGATATAGA;SOR=1.220;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=13;WE=455391;WS=455373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr17	463843	rs741677	A	G	1571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.459;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=30;PP=813;ReadPosRankSum=0.796;SC=ACAAGTCAGCATGGAATTTCT;SOR=0.527;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=101;TCF=57;TCR=44;TR=64;WE=463851;WS=463833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,75:0.64:118
chr17	465775	rs2075443	G	A	1961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.354;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=42;PP=1179;ReadPosRankSum=1.766;SC=TTTTCCAGGCGTATTCTCGGA;SOR=0.540;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=128;TCF=62;TCR=66;TR=81;WE=465783;WS=465765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,89:0.61:145
chr17	466005	rs200526370	C	A	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.78;ReadPosRankSum=-2.054;SOR=0.743;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr17	505162	rs4968055	A	G	3313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=61;PP=2076;SC=GAGAAAGAGAAGTGTTTTCTG;SOR=0.991;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=116;TCF=54;TCR=62;TR=114;WE=505170;WS=505152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr17	505227	rs7225041	G	C	636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.609;HP=2;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=22;PP=409;ReadPosRankSum=-1.089;SC=TCTCCAACAAGGAAGTCATGC;SOR=1.483;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=49;TCF=16;TCR=33;TR=31;WE=505235;WS=505217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,30:0.61:49
chr17	505249	rs7214036	T	C	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=4.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.47;ReadPosRankSum=1.033;SOR=2.336;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr17	505249	.	TA	CG	142	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=24;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=1;NR=9;PP=142;QD=19.5467874862;SC=CGCTATCTGATAAAGAAGAAC;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=10;WE=505258;WS=505239;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:14,10:0.42:24
chr17	505250	rs4968092	A	G	762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.32;SOR=2.636;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	530339	rs16954064	T	C	1384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=21;PP=854;ReadPosRankSum=-0.714;SC=CAGGACAACATGGAACCATTA;SOR=0.730;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=93;TCF=62;TCR=31;TR=59;WE=530347;WS=530329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,63:0.59:106
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chr17	600735	rs4968100	A	G	1909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.176;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=46;PP=1155;ReadPosRankSum=1.680;SC=CTAGCAAAACAGTTCAAGGAT;SOR=0.907;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=130;TCF=58;TCR=72;TR=78;WE=600743;WS=600725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,87:0.60:144
chr17	602469	rs2543781	G	C	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=144;ReadPosRankSum=-0.096;SC=TGGCAAACTTGAGATTTCAGT;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=8;WE=602477;WS=602459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr17	618039	rs2474694	G	A	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.228;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=468;ReadPosRankSum=-1.433;SC=ACTCCCTCGCGGCAGCGACCT;SOR=2.400;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=20;WE=618047;WS=618029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,20:0.67:30
chr17	618100	rs2955626	C	G	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.362;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=121;ReadPosRankSum=-0.447;SC=GCACTTCCGGCAGGCCAGGGC;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=7;WE=618108;WS=618090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr17	636266	rs141977343	A	AGGGCC	1990.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=8;PP=1364;SC=GTCAGGCCGAAGGGCCGGGCC;SOR=1.775;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=27;TCF=16;TCR=11;TR=22;WE=636274;WS=636256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr17	636320	rs111405529	T	TCTC	1329.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.715;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=14;PP=632;ReadPosRankSum=-1.134;SC=CGCGCGCTGTTCTCTCCGCCC;SOR=0.779;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=67;TCF=26;TCR=41;TR=23;WE=636328;WS=636310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,39:0.30:129
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chr17	648186	rs7813	G	A	2123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=23;PP=1202;SC=TTTAAGAAGCGCTGCTCGTGT;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=46;TCR=23;TR=69;WE=648194;WS=648176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr17	648498	rs2740349	C	T	3633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=53;PP=1823;SC=GGAAGCCAATCACGACAGCTA;SOR=0.708;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=116;TCF=63;TCR=53;TR=116;WE=648506;WS=648488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr17	649547	rs910925	G	C	4576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=69;PP=2880;SC=GAGAATCTGGGCCAGGAACTT;SOR=0.729;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=150;TCF=81;TCR=69;TR=150;WE=649555;WS=649537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr17	649935	rs2740348	G	C	5689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=87;PP=2965;SC=AAGTCTGGCTGTCGGAAGAGG;SOR=0.722;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=188;TCF=100;TCR=88;TR=187;WE=649943;WS=649925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr17	650206	rs3744742	C	T	2432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.045;HP=1;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=49;PP=1400;ReadPosRankSum=-1.814;SC=GGTAGAGCGTCGCGTTCTGGC;SOR=0.747;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=150;TCF=76;TCR=74;TR=97;WE=650214;WS=650196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,110:0.66:166
chr17	673895	rs2644706	C	G	303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=221;SC=CTAGTCCACACTTTCCTGTGT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=673903;WS=673885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	685640	rs2273454	G	T	3697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=75;PP=2493;ReadPosRankSum=0.071;SC=GGTGAGACCCGCGAGGTTTGT;SOR=0.686;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=230;TCF=119;TCR=111;TR=154;WE=685648;WS=685630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,163:0.64:253
chr17	686296	rs34512506	GT	G	110.76	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.602;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5127;FS=4.616;HP=13;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.230;NF=7;NR=0;PP=65;ReadPosRankSum=1.691;SC=ATAGTTACCTGTTTTTTTTTT;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=7;WE=686304;WS=686286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr17	686589	.	C	CT	210	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;FR=1.0000;HP=14;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=15;MQ=59.71;NF=0;NR=12;PP=210;QD=17.9166666667;SC=CCCAGTGTATCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=12;WE=686597;WS=686579;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:19,12:0.39:31
chr17	704480	rs570710	C	A	360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=5;NR=8;PP=262;SC=CCTGAAGAGCCGGCGTTTCCC;SOR=1.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=5;TCR=8;TR=13;WE=704488;WS=704470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	706862	rs598974	G	C	1232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=27;NR=14;PP=623;SC=GCCAGGATCAGTCCTGTGCCA;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=27;TCR=14;TR=41;WE=706870;WS=706852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr17	708263	.	CG	C	81	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=19;MQ=60.0;NF=2;NR=1;PP=81;QD=43.34363329;SC=CCTCCTGTCCCGCCCCCCAGC;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=11;TCF=6;TCR=5;TR=3;WE=708271;WS=708253;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,3:0.27:11
chr17	708264	rs183442140	G	C	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.20;ReadPosRankSum=-0.239;SOR=0.905;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr17	708568	rs74750766	G	A	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=360;ReadPosRankSum=0.265;SC=GGTCCAGCCCGGGGTCCCCCC;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=21;WE=708576;WS=708558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,19:0.79:24
chr17	725433	rs503779	C	T	312.31	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=255;ReadPosRankSum=-0.646;SC=GCAGGAGAATCGCTTGAACCC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=11;WE=725441;WS=725423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr17	909451	rs2586306	A	T	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=129;ReadPosRankSum=1.078;SC=TCCCTGTCCTAGGCCTCGTCC;SOR=0.976;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=10;WE=909459;WS=909441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr17	910385	rs201709354	C	T	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.702;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=138;ReadPosRankSum=0.258;SC=CAGCCACGGGCCCGGGCGGTG;SOR=1.981;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=9;WE=910393;WS=910375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr17	910401	rs2586305	G	A	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=137;ReadPosRankSum=0.999;SC=CGGTGCCAGGGTACCTGCGCC;SOR=0.527;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=12;WE=910409;WS=910391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr17	910636	rs2586304	A	G	615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=16;PP=439;SC=CGCTGTGGGAACTCCTGAAGG;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=910644;WS=910626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	912914	rs12600864	G	A	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=285;ReadPosRankSum=-0.544;SC=GCCGCTCCCCGTTACCTTTTC;SOR=0.706;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=51;TCF=36;TCR=15;TR=23;WE=912922;WS=912904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,27:0.46:59
chr17	915333	rs67186058	G	C	2767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=61;PP=1438;ReadPosRankSum=-0.192;SC=CATTTGGGATGGAGAGCTGGG;SOR=0.730;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=158;TCF=70;TCR=88;TR=108;WE=915341;WS=915323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,126:0.70:181
chr17	915368	rs333652	A	G	3981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=53;PP=2663;SC=AGGGCAGAGAAAGAGGCCACC;SOR=0.914;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=122;TCF=69;TCR=53;TR=121;WE=915376;WS=915358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr17	916466	rs4968074	C	T	2584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.376;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=50;PP=1366;ReadPosRankSum=0.751;SC=GAGATCTCCCCGTGGGTCAGC;SOR=0.539;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=147;TCF=70;TCR=77;TR=100;WE=916474;WS=916456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,115:0.71:162
chr17	925670	rs2586251	G	A	487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=8;PP=294;ReadPosRankSum=0.000;SC=TGAGAGGCACGGCGGGGCTGG;SOR=0.527;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=25;TCF=16;TCR=9;TR=21;WE=925678;WS=925660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,22:0.85:26
chr17	925764	rs2663345	A	G	1152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.445;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=14;PP=686;ReadPosRankSum=0.092;SC=CGTCAACGTGACTGCTCCGAG;SOR=0.426;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=36;TCR=18;TR=41;WE=925772;WS=925754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,47:0.73:64
chr17	953456	rs2257540	C	T	2293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=54;PP=1541;SC=CCTGAACCTCCGAAGCTGGGA;SOR=1.854;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=24;TCR=54;TR=78;WE=953464;WS=953446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr17	960221	rs2304959	C	G	5273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=106;NR=64;PP=2965;SC=TGGGCCACCTCTGGTTCCCGA;SOR=1.191;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=170;TCF=106;TCR=64;TR=170;WE=960229;WS=960211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr17	961149	rs9912632	T	A	505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=4;PP=290;SC=CGCTTAGAAATACAAAAGGCC;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=18;WE=961157;WS=961139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	961304	rs2260448	C	A	1488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=29;PP=865;SC=AGGAGATAAGCATAAAGTGGG;SOR=1.329;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=46;TCF=15;TCR=31;TR=44;WE=961312;WS=961294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr17	961900	rs2304961	G	A	306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=0;PP=266;SC=TTTCCGGTTCGTACAGGTCAG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=961908;WS=961890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	970251	rs2258097	TG	CA	1051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=14;NR=7;PP=709;SC=TACAACTTCCTGCCTCCACCT;SOR=1.519;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=23;TCF=15;TCR=8;TR=21;WE=970260;WS=970241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	970413	rs2262150	C	T	1933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=32;NR=31;PP=941;SC=TGGCCTCAGACTCCTCGGGGG;SOR=0.955;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=63;TCF=32;TCR=31;TR=63;WE=970421;WS=970403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr17	973405	rs55688032	C	T	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=226;ReadPosRankSum=1.412;SC=CACGGGGGCACGGCCAGCCAG;SOR=0.776;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=14;WE=973413;WS=973395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr17	976711	rs2258893	T	C	1506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=6;PP=905;SC=CCTGGCGGCATGGATACCGCG;SOR=2.584;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=37;TCR=6;TR=43;WE=976719;WS=976701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr17	986742	rs2257468	A	G	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.032;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=257;ReadPosRankSum=-0.983;SC=CAGGGTGGCTATGTGGGGAGC;SOR=0.463;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=59;TCF=43;TCR=16;TR=22;WE=986750;WS=986732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,25:0.37:68
chr17	1004061	rs76815113	C	G	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.171;HP=6;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=267;ReadPosRankSum=1.368;SC=GCCCTTCCCCCCCGACCTTTA;SOR=0.940;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=75;TCF=18;TCR=57;TR=20;WE=1004079;WS=1004051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,19:0.26:74
chr17	1012447	.	T	C	61	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=40;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=61;QD=23.9428031368;SC=GACCCGGGACTGCATCCCGGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=1012455;WS=1012437;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	1183354	rs6502774	T	C	5863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=124;NR=63;PP=2965;SC=TCCGCCGCATTCCTGGACCTG;SOR=1.336;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=187;TCF=124;TCR=63;TR=187;WE=1183362;WS=1183344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr17	1183464	rs6502776	A	G	7469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=122;NR=129;PP=2965;SC=GGAGCAGAACAGCCAGGGCCT;SOR=0.863;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=252;TCF=123;TCR=129;TR=251;WE=1183472;WS=1183454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,278:1.00:278
chr17	1265325	rs3752827	T	A	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=15;PP=299;ReadPosRankSum=0.457;SC=AAATTTTTTTTAAATCAGATT;SOR=0.709;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=83;TCF=32;TCR=51;TR=26;WE=1265333;WS=1265315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,23:0.32:73
chr17	1326754	.	GA	G	280.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.430;ClippingRankSum=0.000;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=1.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.30;ReadPosRankSum=0.721;SOR=0.484;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,24:0.45:53
chr17	1359363	rs2229075	T	G	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FS=3.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.66;ReadPosRankSum=-2.068;SOR=0.449;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:180,39:0.18:219
chr17	1370459	rs2302459	T	C	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.723;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=180;ReadPosRankSum=-0.648;SC=GTGAGGTGCCTGGGCTCTGCC;SOR=1.112;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=12;WE=1370467;WS=1370449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr17	1370720	rs2302457	C	T	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=11;PP=287;ReadPosRankSum=0.004;SC=CCTGGGTGCCCACACAGCCCC;SOR=0.618;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=94;TCF=51;TCR=43;TR=28;WE=1370728;WS=1370710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,28:0.27:103
chr17	1370753	rs118068886	C	T	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.800;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=13;PP=263;ReadPosRankSum=-0.508;SC=GCCCTGTCCCCGGGGGCCGCC;SOR=0.736;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=55;TCR=45;TR=28;WE=1370761;WS=1370743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,28:0.26:107
chr17	1371123	rs8072859	T	C	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=122;ReadPosRankSum=-0.809;SC=TCCCCATCCATGAAAAGGCAC;SOR=0.414;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=11;WE=1371131;WS=1371113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,11:0.29:38
chr17	1371473	rs8079811	C	G	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=17;PP=371;ReadPosRankSum=1.116;SC=GGCTCCGCCCCTGCCCTGACC;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=71;TCF=31;TCR=40;TR=29;WE=1371481;WS=1371463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,32:0.40:81
chr17	1371818	rs8080389	C	T	2662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=56;PP=1693;SC=GTGAGGAGAGCGTCATGGTGG;SOR=1.361;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=93;TCF=37;TCR=56;TR=92;WE=1371826;WS=1371808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr17	1372987	rs9303175	T	G	1250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.653;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=34;PP=766;ReadPosRankSum=0.215;SC=TGCTACTGCATCCTTTGGATA;SOR=0.507;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=172;TCF=78;TCR=94;TR=66;WE=1372995;WS=1372977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,69:0.36:192
chr17	1373518	rs9905106	T	C	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.37;ReadPosRankSum=-0.589;SOR=0.703;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,26:0.38:69
chr17	1373612	rs8081370	C	T	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=5.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.73;ReadPosRankSum=0.246;SOR=0.240;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,23:0.44:52
chr17	1377878	rs2286871	T	C	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.16;ReadPosRankSum=1.998;SOR=0.557;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,19:0.29:66
chr17	1377884	rs2286872	C	T	723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.78;ReadPosRankSum=0.282;SOR=0.614;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,24:0.32:74
chr17	1381005	rs2286876	T	C	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=132;ReadPosRankSum=-0.759;SC=TCACAGGGAGTCTCCACAGAG;SOR=0.495;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=8;WE=1381013;WS=1380995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr17	1384066	rs4790518	A	G	5367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=101;NR=87;PP=2965;SC=TCTCCTCCTCACCCCCCTCCA;SOR=0.733;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=188;TCF=101;TCR=87;TR=188;WE=1384074;WS=1384056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr17	1386094	.	G	GCACTGA	86	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=17;MMLQ=28;MQ=60.9;NF=2;NR=0;PP=86;QD=90.0835001538;SC=TCCCACACTGGGCTTCTCTCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=6;TCR=6;TR=2;WE=1386103;WS=1386084;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:10,2:0.17:12
chr17	1386095	.	G	C	145	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=17;MMLQ=28;MQ=60.58;NF=3;NR=1;PP=145;QD=44.9428031368;SC=CCCACACTGGGCTTCTCTCCC;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=4;WE=1386103;WS=1386084;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:16,4:0.20:20
chr17	1395682	rs12941864	C	T	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.633;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=10;PP=331;ReadPosRankSum=-0.280;SC=CCACCCTCCTCCCAGCCCAGA;SOR=1.057;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=105;TCF=64;TCR=41;TR=33;WE=1395690;WS=1395672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,37:0.31:119
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chr17	1412455	rs5818804	GC	G	953.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=10;NR=8;PP=683;SC=GGAACGGTCTGCCAGACCCAG;SOR=1.528;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=10;TCR=8;TR=18;WE=1412463;WS=1412445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
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chr17	1437278	rs2270228	C	T	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=289;ReadPosRankSum=-0.349;SC=CTGTAGCAGACACTGACGTGT;SOR=1.508;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=14;WE=1437286;WS=1437268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr17	1456507	rs9895971	G	A	1350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.200;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=30;PP=723;ReadPosRankSum=-0.162;SC=ACGTAATCCAGCTGCCAGTAA;SOR=0.371;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=83;TCF=36;TCR=47;TR=57;WE=1456515;WS=1456497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,62:0.70:88
chr17	1480088	rs7222193	G	A	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=85;ReadPosRankSum=0.687;SC=TGGTGACCCCGGGCTGCACCG;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=6;WE=1480096;WS=1480078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr17	1489076	rs72820319	G	A	1829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=34;PP=1073;ReadPosRankSum=1.795;SC=GTCTCTCTAAGGGCTCCGGGA;SOR=0.742;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=129;TCF=72;TCR=57;TR=77;WE=1489096;WS=1489066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,87:0.59:147
chr17	1489088	rs4790208	C	G	3839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.100;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=59;PP=2385;ReadPosRankSum=-0.694;SC=GCTCCGGGAGCAGCTGGAGTG;SOR=0.311;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=130;TCF=70;TCR=60;TR=129;WE=1489096;WS=1489066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,146:0.99:147
chr17	1489236	rs117776467	G	A	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.796;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=14;PP=280;ReadPosRankSum=-0.973;SC=CGGGCTCCTCGGAGGCGTCTT;SOR=0.922;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=102;TCF=53;TCR=49;TR=27;WE=1489244;WS=1489226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,27:0.25:107
chr17	1490379	rs143498029	A	ACACTGCGTTTCCCG	924.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.020;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=4.063;NF=0;NR=14;PP=1860;ReadPosRankSum=-0.659;SC=TGCATTTCCCACACTGCGTTT;SOR=0.218;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=14;WE=1490387;WS=1490369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,27:0.75:36
chr17	1490409	rs8078582	T	C	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.730;HP=2;HapScore=2;MGOF=61;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=2.048;NF=1;NR=6;PP=133;ReadPosRankSum=1.831;SC=CATTTCCCACTAAGCGTGACT;SOR=0.257;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=7;WE=1490417;WS=1490399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr17	1493972	rs7210368	T	G	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.233;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=47;ReadPosRankSum=-0.308;SC=GGCAGACAGCTCCTGGGATGC;SOR=0.093;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=6;WE=1493980;WS=1493964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr17	1493999	rs7406591	G	C	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=124;ReadPosRankSum=-1.144;SC=TCCATGGCCCGGCTGGCCCGG;SOR=0.693;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=9;WE=1494007;WS=1493989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr17	1494027	rs4790668	T	C	704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.854;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=4;PP=431;ReadPosRankSum=-1.031;SC=TAACACATTCTGGCCGGTGGC;SOR=0.385;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=26;WE=1494035;WS=1494017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,29:0.74:39
chr17	1494567	rs12953268	G	A	722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=10;PP=421;ReadPosRankSum=-0.381;SC=GGGTACCTGCGGCATCCGGCT;SOR=0.660;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=30;TCR=17;TR=28;WE=1494575;WS=1494557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,33:0.62:53
chr17	1496678	rs150883334	G	T	145.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5341;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=107;ReadPosRankSum=-0.792;SC=CTTCACCTGCGCCCCTTCCTG;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=6;WE=1496686;WS=1496668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr17	1516480	rs7219369	T	C	4560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=73;PP=2339;SC=TTAAAAAATCTGTACTCACTG;SOR=0.728;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=154;TCF=81;TCR=73;TR=154;WE=1516488;WS=1516470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr17	1530897	rs5018812	T	G	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.676;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=34;ReadPosRankSum=-0.207;SC=TCTGATACCCTAGAGGCACTG;SOR=0.368;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=6;WE=1530905;WS=1530887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr17	1530979	rs5818816	G	GC	832.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=401;ReadPosRankSum=-1.184;SC=AGCTCCAGGAGCCCCCCGCAA;SOR=0.818;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=32;TCF=15;TCR=17;TR=15;WE=1530987;WS=1530965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,32:0.64:50
chr17	1538546	rs4790250	C	T	4956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=88;NR=89;PP=2920;SC=ACTGTCCGGCCACCAAGTGGG;SOR=0.770;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=178;TCF=89;TCR=89;TR=177;WE=1538554;WS=1538536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr17	1538628	rs3744644	C	G	4836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=74;PP=2917;SC=CTTCTGCTTCCTCTGGGCCTG;SOR=0.808;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=168;TCF=94;TCR=74;TR=168;WE=1538636;WS=1538618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr17	1542153	rs2272012	G	A	1600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.557;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=26;PP=936;ReadPosRankSum=1.421;SC=AGCAGGCAAGGCCCAGGAAGA;SOR=0.875;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=63;TCR=42;TR=65;WE=1542161;WS=1542143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,73:0.63:115
chr17	1542190	rs2272011	G	A	1825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.379;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=37;PP=1037;ReadPosRankSum=-0.870;SC=AAGGCTGCCCGCGATGAGGGC;SOR=0.482;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=120;TCF=68;TCR=52;TR=80;WE=1542198;WS=1542180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,85:0.66:129
chr17	1550106	rs2293067	C	T	1027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=10;PP=686;SC=AGCAGGGTGACGGGCAGAGAA;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=18;TCR=10;TR=28;WE=1550114;WS=1550096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr17	1576369	rs11078563	C	T	471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.69;ReadPosRankSum=-0.844;SOR=0.678;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,32:0.25:128
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chr17	1577690	rs28715427	C	T	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=125;ReadPosRankSum=-1.832;SC=AGGCAAAGCACATGCCTCAGT;SOR=0.795;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=33;TCF=23;TCR=10;TR=14;WE=1577698;WS=1577680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
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chr17	1584324	rs7503397	A	G	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.848;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=235;ReadPosRankSum=-2.511;SC=TGTTAATATCATTGAATTCAT;SOR=1.911;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=64;TCF=22;TCR=42;TR=19;WE=1584332;WS=1584314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,21:0.30:69
chr17	1585055	rs17761292	G	A	1793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-2.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.055;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=46;PP=1074;ReadPosRankSum=0.608;SC=TGATCTCCCAGGACTCCTTCT;SOR=0.826;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=241;TCF=122;TCR=119;TR=89;WE=1585063;WS=1585045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,103:0.36:288
chr17	1585130	rs11559305	A	G	1274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.128;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=33;PP=931;ReadPosRankSum=-2.437;SC=CTGTCCCTCAACGGCTGGTGG;SOR=0.450;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=191;TCF=89;TCR=102;TR=65;WE=1585138;WS=1585120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,71:0.32:225
chr17	1611433	rs4790809	A	G	1665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=26;PP=1000;SC=GCAAGCAGGCAGAGTTCAGTT;SOR=0.756;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=58;TCF=32;TCR=26;TR=58;WE=1611441;WS=1611423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr17	1611545	rs4790810	A	C	768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=19;PP=545;SC=GGTCAGAGGAACCCCATGACC;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=9;TCR=19;TR=28;WE=1611553;WS=1611535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	1629969	rs80035274	C	T	3982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.307;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=79;PP=2427;ReadPosRankSum=0.390;SC=TGGACGCCCACACTCACCTGG;SOR=0.629;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=236;TCF=127;TCR=109;TR=162;WE=1629977;WS=1629959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,174:0.69:253
chr17	1630950	.	C	T	4104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=0.000;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.850;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=77;PP=2216;ReadPosRankSum=-0.077;SC=CCCAGGGGCGCGAGCTGGTGT;SOR=0.538;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=240;TCF=118;TCR=122;TR=158;WE=1630958;WS=1630940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,183:0.68:271
chr17	1637074	rs3809871	A	G	3846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.974;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=78;PP=2534;ReadPosRankSum=1.057;SC=ACCCCGGACCACTGGGCCCCA;SOR=0.776;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=249;TCF=132;TCR=117;TR=166;WE=1637082;WS=1637064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,179:0.66:273
chr17	1637302	rs3809872	A	G	4635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.514;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=81;PP=2821;ReadPosRankSum=0.486;SC=TGGCACCCCTAAGCAGCGAGG;SOR=0.591;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=258;TCF=136;TCR=122;TR=171;WE=1637310;WS=1637292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,198:0.68:290
chr17	1639074	rs78003847	G	A	969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.192;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=24;PP=608;ReadPosRankSum=-0.169;SC=AAGGAGGAGAGACTCCCCAAA;SOR=0.991;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=51;TCF=18;TCR=33;TR=36;WE=1639082;WS=1639064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,40:0.70:57
chr17	1639458	rs11549259	A	G	1573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.57;ReadPosRankSum=0.006;SOR=0.594;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,74:0.78:95
chr17	1640709	rs1045794	C	T	3716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.252;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=61;PP=2230;ReadPosRankSum=-0.271;SC=ATTCCTTGACCGTCTGGAAGG;SOR=0.545;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=229;TCF=141;TCR=88;TR=146;WE=1640717;WS=1640699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,166:0.64:258
chr17	1648294	rs2070862	C	T	743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.077;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=12;PP=371;ReadPosRankSum=-2.278;SC=AGGAACATGGCGCTGCTCTGG;SOR=0.869;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=26;TCR=16;TR=31;WE=1648302;WS=1648284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,35:0.66:53
chr17	1649267	rs7501729	A	G	1498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.679;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=33;PP=776;ReadPosRankSum=-0.931;SC=CAGTACTCCAATGGTTCTCCG;SOR=0.906;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=89;TCF=38;TCR=51;TR=56;WE=1649275;WS=1649257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,68:0.65:104
chr17	1651780	rs2277695	A	G	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=241;ReadPosRankSum=-0.116;SC=TGGGTGGGACAGGCAACGGGC;SOR=2.419;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=14;WE=1651788;WS=1651770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,15:0.79:19
chr17	1657899	rs1057355	G	T	478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.279;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=280;ReadPosRankSum=0.066;SC=CTTTCCAACCGGCTTTGTGGC;SOR=0.262;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=38;TCF=11;TCR=27;TR=22;WE=1657907;WS=1657889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,23:0.61:38
chr17	1673104	rs11658342	G	A	990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.648;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=17;PP=676;ReadPosRankSum=1.877;SC=GCATCTCTGCGAGTCCCTGAA;SOR=0.340;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=68;TCF=45;TCR=23;TR=44;WE=1673115;WS=1673094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,46:0.61:76
chr17	1673276	rs1136287	C	T	3396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=60;PP=1885;SC=CGATCCAGCACGAGCCCCACG;SOR=0.988;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=115;TCF=55;TCR=60;TR=115;WE=1673284;WS=1673266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr17	1675127	rs4274474	C	T	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=179;ReadPosRankSum=-0.106;SC=TGCTTGTCGTCGAGTCTCATA;SOR=1.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=10;WE=1675135;WS=1675123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr17	1675451	rs5008943	T	C	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=275;ReadPosRankSum=0.662;SC=TACTCTGTAGTCCTAACTGGA;SOR=0.507;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=15;WE=1675459;WS=1675441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr17	1678256	rs2269344	G	C	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=346;ReadPosRankSum=1.241;SC=TCCCTTGAGTGGGGCAATTTT;SOR=0.804;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=21;WE=1678264;WS=1678246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,24:0.63:38
chr17	1679776	rs141871966	C	T	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=170;ReadPosRankSum=0.631;SC=TGTCTGTCCCCGGCTTTTGGG;SOR=0.490;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=12;WE=1679784;WS=1679766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,12:0.31:39
chr17	1679805	rs2071022	A	G	1361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.024;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=14;PP=762;ReadPosRankSum=0.388;SC=GACTAACCACATGCTTTCTCA;SOR=1.005;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=71;TCF=51;TCR=20;TR=52;WE=1679813;WS=1679795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,62:0.75:83
chr17	1680002	rs6828	T	C	3193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.147;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=70;PP=1637;ReadPosRankSum=1.007;SC=AGCTGAGTTATGAAGGCGAAG;SOR=0.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=193;TCF=89;TCR=104;TR=128;WE=1680010;WS=1679992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,144:0.68:212
chr17	1684772	rs7224977	T	C	834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=21;PP=441;ReadPosRankSum=1.592;SC=TTCACTGATTTGTGAGGCAAA;SOR=0.735;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=68;TCF=31;TCR=37;TR=37;WE=1684780;WS=1684762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,41:0.55:74
chr17	1686410	rs9902398	T	C	930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=20;PP=553;ReadPosRankSum=0.040;SC=CTCCACCACGTAGAGACTCCT;SOR=0.736;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=68;TCF=30;TCR=38;TR=38;WE=1686418;WS=1686400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,43:0.55:78
chr17	1686600	rs12149986	G	A	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.899;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=257;ReadPosRankSum=-0.081;SC=GGGCCACGGCGAAGTGCCCAC;SOR=1.609;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=21;TCF=14;TCR=7;TR=14;WE=1686608;WS=1686590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr17	1687796	rs3815612	A	G	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.744;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=304;ReadPosRankSum=1.643;SC=TGCCAGGGTCAGTTATCAACA;SOR=0.324;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=18;WE=1687804;WS=1687786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr17	1690302	rs68098051	CAA	C	442.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=677;ReadPosRankSum=0.062;SC=ATATTGAAAGCAAGAGAGAGT;SOR=0.495;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=10;WE=1690313;WS=1690292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr17	1690305	rs117380376	G	T	451.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=693;ReadPosRankSum=-0.201;SC=TTGAAAGCAAGAGAGAGTCAA;SOR=0.582;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=10;WE=1690313;WS=1690292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr17	1703543	rs3809875	G	C	1885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=364;ExcessHet=3.0103;FS=0.849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.18;ReadPosRankSum=1.736;SOR=0.722;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:247,117:0.32:364
chr17	1704296	rs7224496	C	A	1440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.483;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=33;PP=774;ReadPosRankSum=-0.297;SC=TGTCTGTGCTCTGTTAATGTC;SOR=0.538;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=106;TCF=46;TCR=60;TR=62;WE=1704304;WS=1704286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,69:0.57:122
chr17	1707762	rs8067685	A	G	332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=2;PP=244;SC=ATGAGCGCCCAGTCCGACTTT;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=1707770;WS=1707752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	1707893	rs8072508	T	A	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.58;ReadPosRankSum=-0.378;SOR=0.531;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,27:0.28:95
chr17	1715435	rs7503422	G	A	2556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=48;PP=1323;SC=AGGAAACAAAGTAAGCAGAAA;SOR=1.190;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=36;TCR=48;TR=84;WE=1715443;WS=1715425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr17	1731268	rs8067660	T	C	5658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=105;PP=2965;SC=ATGATTTCCATTCATCCACAG;SOR=1.047;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=187;TCF=82;TCR=105;TR=187;WE=1731276;WS=1731258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr17	1733210	rs17291738	C	T	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.541;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=138;ReadPosRankSum=0.998;SC=TCACGTGGGCCGCGCCTCGGC;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=7;WE=1733218;WS=1733200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr17	1733331	rs17291745	C	G	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=4.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.44;ReadPosRankSum=0.938;SOR=1.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,14:0.28:50
chr17	1733399	rs5030749	A	G	824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.99;SOR=0.880;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr17	1748028	rs4790827	A	G	2219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=45;PP=1420;SC=GAATGGGAACAAATTTAGGAA;SOR=1.310;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=29;TCR=45;TR=74;WE=1748036;WS=1748018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr17	1756351	rs2287321	A	G	660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=8;PP=429;ReadPosRankSum=1.472;SC=TCATTTGAACAGAATTTGTTT;SOR=0.731;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=82;TCF=61;TCR=21;TR=32;WE=1756359;WS=1756341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,35:0.38:92
chr17	1761377	.	G	A	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=0.000;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.66;MQRankSum=-2.465;QD=0.48;ReadPosRankSum=-2.396;SOR=0.807;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,9:0.09:102
chr17	1761383	rs375054050	C	T	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=1.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.75;MQRankSum=-2.523;QD=0.45;ReadPosRankSum=-1.718;SOR=1.099;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,9:0.08:108
chr17	1761423	.	T	C	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.937;ClippingRankSum=0.000;DP=176;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.17;MQRankSum=-5.873;QD=3.05;ReadPosRankSum=-1.546;SOR=0.747;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:154,22:0.12:176
chr17	1761425	.	C	A	521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.586;ClippingRankSum=0.000;DP=186;ExcessHet=3.0103;FS=0.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.05;MQRankSum=-6.134;QD=2.81;ReadPosRankSum=-1.935;SOR=0.815;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:161,25:0.13:186
chr17	1761428	.	G	T	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.915;ClippingRankSum=0.000;DP=192;ExcessHet=3.0103;FS=0.809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.38;MQRankSum=-6.232;QD=3.08;ReadPosRankSum=-1.249;SOR=0.826;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:167,25:0.13:192
chr17	1761431	rs3809874	T	C	7564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=114;NR=83;PP=2962;SC=TTTCCTAGGTTCCACATCAAG;SOR=0.982;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=205;TCF=117;TCR=88;TR=197;WE=1761465;WS=1761413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr17	1761436	.	A	G	1055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.463;ClippingRankSum=0.000;DP=216;ExcessHet=3.0103;FS=2.351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.25;MQRankSum=-6.623;QD=4.89;ReadPosRankSum=-2.275;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:180,36:0.17:216
chr17	1761445	.	C	T	1157.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.132;ClippingRankSum=0.000;DP=227;ExcessHet=3.0103;FS=4.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.27;MQRankSum=-7.492;QD=5.10;ReadPosRankSum=-1.473;SOR=1.075;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:186,41:0.18:227
chr17	1761446	rs11656253	G	A	1923.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-0.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.029;HP=1;HapScore=2;MGOF=38;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.125;NF=46;NR=51;PP=997;ReadPosRankSum=-0.671;SC=ATCAAGTGTCGGATCCCATTC;SOR=0.657;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=223;TCF=115;TCR=108;TR=97;WE=1761465;WS=1761413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,95:0.42:227
chr17	1761447	.	G	A	1169.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=0.000;DP=228;ExcessHet=3.0103;FS=4.013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.48;MQRankSum=-7.782;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.411;SOR=0.989;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:186,42:0.18:228
chr17	1761457	.	C	T	1199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.357;ClippingRankSum=0.000;DP=239;ExcessHet=3.0103;FS=2.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.90;MQRankSum=-8.144;QD=5.02;ReadPosRankSum=-0.250;SOR=0.729;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:194,45:0.19:239
chr17	1761482	.	C	T	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.482;ClippingRankSum=0.000;DP=229;ExcessHet=3.0103;FS=3.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.81;MQRankSum=-8.581;QD=2.57;ReadPosRankSum=2.768;SOR=0.982;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:180,49:0.21:229
chr17	1783812	rs2277694	T	C	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.15;ReadPosRankSum=1.480;SOR=0.529;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,30:0.32:94
chr17	1795180	rs2230931	T	C	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.376;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=12;PP=196;ReadPosRankSum=-0.890;SC=TCCAGGAGTCTGCTGAAGCTA;SOR=1.218;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=66;TCF=34;TCR=32;TR=21;WE=1795188;WS=1795170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,24:0.31:77
chr17	1800217	rs7406062	G	C	794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=8;PP=501;SC=ACATTCAGGAGGAGGCTGTCA;SOR=1.942;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=29;WE=1800225;WS=1800207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr17	1839674	rs9902457	G	C	375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=9;NR=5;PP=267;SC=GCAGCCGAAGGCTCTACCAGC;SOR=1.329;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=9;TCR=5;TR=14;WE=1839682;WS=1839664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	1840468	rs9903800	C	T	4385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=68;PP=2505;SC=GGTCGTGGAACGCCTTGTGGT;SOR=0.705;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=144;TCF=76;TCR=68;TR=144;WE=1840476;WS=1840458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr17	1943880	rs35394823	C	G	986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FS=4.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.70;ReadPosRankSum=-1.185;SOR=1.054;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:149,61:0.29:210
chr17	1943888	rs2236375	T	C	5979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=92;PP=2044;SC=GCCTACTTCCTGAGGTGGATG;SOR=1.037;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=172;TCF=80;TCR=92;TR=172;WE=1943896;WS=1943870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr17	1945041	rs7216804	A	G	5813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=104;NR=81;PP=2965;SC=GCGAGACCCTAACCAAAGTCT;SOR=0.780;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=185;TCF=104;TCR=81;TR=185;WE=1945049;WS=1945031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr17	1945225	rs869020	T	G	666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=19;PP=504;SC=TGGGAACGCCTTGGCGCTCCG;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=1945233;WS=1945215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	1945621	rs2015866	G	T	1127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=15;NR=21;PP=566;SC=GCGTCCACCCGCATTCCTCCC;SOR=1.455;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=15;TCR=21;TR=36;WE=1945629;WS=1945611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr17	1945795	.	C	CCTCT	128	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=22;MQ=60.0;NF=5;NR=0;PP=128;QD=42.0077008746;SC=GCCTCGATTCCCTTTTTCTCT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=5;WE=1945803;WS=1945785;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:17,5:0.23:22
chr17	1946503	rs1051322	C	G	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.815;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=205;ReadPosRankSum=-0.087;SC=GTGCGCCTCACCAGAACCAGT;SOR=2.670;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=12;WE=1946511;WS=1946493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr17	1964759	rs145926620	C	CG	440.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.63;ReadPosRankSum=0.495;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,21:0.84:25
chr17	1965085	rs7214308	C	T	206.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=197;SC=CGGGGACCCTCCCCTGCTGGC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=1965104;WS=1965075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	1965096	rs12939002	C	T	139.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=82;SC=CCCTGCTGGCCTAGAGAGGGC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=1965104;WS=1965075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	1968983	rs2232486	T	C	3025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=47;NR=50;PP=1710;SC=ACTGATGAGATAGAGCCCCAC;SOR=0.927;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=47;TCR=50;TR=97;WE=1968991;WS=1968973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr17	1985050	rs8076897	T	C	300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=0;PP=106;SC=CATCCTCTCATGCCCTAGACA;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=1985058;WS=1985040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	2091765	rs903160	C	T	6286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=122;NR=90;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.620;SC=CCCAGAGCTGCGGCTTGTTCC;SOR=0.916;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=214;TCF=123;TCR=91;TR=212;WE=2091773;WS=2091755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,236:0.99:238
chr17	2092006	rs903161	A	T	580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=16;PP=444;SC=GTGTTTGATAAGATGATAAGG;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=2092014;WS=2091996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	2186100	rs749240	C	T	3263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=46;PP=1817;SC=CTTTCCGCCACTGGTCAGGGC;SOR=0.963;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=108;TCF=62;TCR=46;TR=108;WE=2186108;WS=2186090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr17	2196150	rs216205	C	T	2108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=31;PP=1432;SC=AATAACGAAGCAGAGGTAAAA;SOR=1.079;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=43;TCR=31;TR=74;WE=2196158;WS=2196140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr17	2200434	rs170043	A	C	1317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=9;PP=804;SC=CTGTATCATTATTTTATCCTC;SOR=1.814;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=32;TCR=9;TR=41;WE=2200442;WS=2200424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr17	2203348	rs216194	T	C	6101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=104;NR=99;PP=2965;SC=TCCCGCGGGCTGGGTCGTCGT;SOR=0.711;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=203;TCF=104;TCR=99;TR=203;WE=2203356;WS=2203338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr17	2222325	rs8081273	C	T	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=137;ReadPosRankSum=0.072;SC=TGTGGTTTCCCCTTTATTTCT;SOR=1.075;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=10;WE=2222333;WS=2222315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
chr17	2265113	rs2429906	C	A	2975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.323;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=63;PP=1770;ReadPosRankSum=0.215;SC=GGGCCAGCCCCTTCTTCCCTC;SOR=0.551;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=207;TCF=106;TCR=101;TR=130;WE=2265121;WS=2265103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,140:0.62:226
chr17	2266709	rs2003969	T	C	685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=396;ReadPosRankSum=0.335;SC=TTCCCAAGCCTTGAGGCCAGT;SOR=0.892;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=26;WE=2266717;WS=2266699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,30:0.67:45
chr17	2266799	rs745400	G	A	1822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=3.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.94;ReadPosRankSum=0.057;SOR=0.418;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,83:0.68:122
chr17	2266812	rs2003968	T	C	1757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=1.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.29;ReadPosRankSum=1.288;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,81:0.66:123
chr17	2267694	rs2286881	C	T	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.853;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=60;ReadPosRankSum=0.360;SC=AAGCTCTCAGCGGCTGAGACG;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=5;WE=2267702;WS=2267684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr17	2268139	rs2447099	G	C	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=8;PP=359;ReadPosRankSum=0.972;SC=GGCCAGCAGGGTGTGATAGCC;SOR=0.668;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=17;TCR=10;TR=22;WE=2268147;WS=2268129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,21:0.81:26
chr17	2268311	rs2248821	G	A	2065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.376;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=40;PP=1115;ReadPosRankSum=1.251;SC=CTGCTGCCTCGGGGACAGCTA;SOR=0.562;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=128;TCF=65;TCR=63;TR=83;WE=2268319;WS=2268301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,94:0.65:145
chr17	2268681	rs2429908	T	C	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.220;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=314;ReadPosRankSum=-1.518;SC=GAAGACGCTCTGGGAGGCGGG;SOR=0.055;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=22;WE=2268689;WS=2268671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,25:0.74:34
chr17	2270777	rs2429910	T	C	157.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=156;ReadPosRankSum=0.084;SC=ACCACAGGGGTTCGAACGGCA;SOR=2.303;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=9;WE=2270785;WS=2270767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr17	2276401	rs66956940	CTGA	C	3499.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.835;NF=4;NR=40;PP=1984;ReadPosRankSum=2.764;SC=TCCCATGGGGCTGATGAGATG;SOR=0.700;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=83;TCF=8;TCR=75;TR=44;WE=2276411;WS=2276391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,89:0.60:149
chr17	2276432	rs2302470	C	T	903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.759;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.814;NF=15;NR=24;PP=506;ReadPosRankSum=-2.609;SC=CCAGGGGACGCCAGGGAGGGG;SOR=0.846;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=99;TCF=37;TCR=62;TR=39;WE=2276440;WS=2276422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,45:0.41:110
chr17	2297571	.	GCA	G	67.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=0.000;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=1.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.20;MQRankSum=0.000;QD=1.54;ReadPosRankSum=1.960;SOR=0.734;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,9:0.20:44
chr17	2318550	rs4613098	G	C	940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FS=0.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.50;ReadPosRankSum=2.071;SOR=0.646;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:148,61:0.29:209
chr17	2318695	rs4790335	G	A	1484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=14;NR=30;PP=890;SC=AGCAACACACGACATGCATGG;SOR=1.848;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=14;TCR=30;TR=44;WE=2318703;WS=2318685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr17	2341350	rs7215857	T	C	1368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-3.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.035;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=17;PP=740;ReadPosRankSum=0.427;SC=TATGATGGACTGAAACCCACC;SOR=0.092;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=67;TCF=49;TCR=18;TR=51;WE=2341358;WS=2341340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,61:0.76:80
chr17	2371000	rs10163513	G	A	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.55;ReadPosRankSum=-1.140;SOR=0.639;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,12:0.20:61
chr17	2595215	rs5818873	GC	G	702.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=11;PP=283;SC=AAGGGATCAGGCCCCCCCGTG;SOR=1.426;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=11;WE=2595223;WS=2595205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	2595291	.	C	T	231	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;FR=1.0000;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=10;NR=3;PP=231;QD=20.4439394267;SC=ACGCCCCCGCCGCGCACCTGC;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=2595299;WS=2595266;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	2597723	rs66960934	GCAGCGGGGACA	G	4927.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=19;NR=38;PP=2987;SC=CAGCAGGGACGCAGCGGGGAC;SOR=1.054;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=68;TCF=23;TCR=45;TR=57;WE=2597741;WS=2597713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr17	2598627	rs1003398	T	C	7776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=126;NR=131;PP=2965;SC=TCCATCCCAGTCCCACAGCTC;SOR=0.827;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=257;TCF=126;TCR=131;TR=257;WE=2598647;WS=2598617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,284:1.00:284
chr17	2598639	rs1003399	C	G	7106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=115;NR=120;PP=2965;SC=CCACAGCTCCCGTTCCGCCCC;SOR=0.866;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=235;TCF=115;TCR=120;TR=235;WE=2598647;WS=2598617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr17	2599612	rs2302200	C	G	2471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=38;PP=1710;SC=TGCCGCCTGGCGCTGGCGGGG;SOR=0.716;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=45;TCR=38;TR=83;WE=2599620;WS=2599602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr17	2604375	rs758417	C	T	1175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=9;PP=856;SC=GCAGGTGGGCCGGCTCACCCC;SOR=2.419;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=32;TCR=9;TR=41;WE=2604383;WS=2604365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr17	2606715	rs1065479	G	A	4766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=80;PP=2741;SC=AGAAGCAGGTGCGGTGACACG;SOR=0.849;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=157;TCF=77;TCR=80;TR=157;WE=2606723;WS=2606705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr17	2607560	rs12953041	A	G	625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=4;PP=416;SC=CTGCCACAAAATGGGGCCGGT;SOR=2.200;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=18;WE=2607568;WS=2607550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	2699935	rs123059	T	C	784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=0.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.88;ReadPosRankSum=-1.002;SOR=0.830;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,45:0.39:114
chr17	2868935	rs12950923	T	C	1210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=22;PP=741;SC=GGGTCATCCTTAGGTAGGGCT;SOR=1.154;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=17;TCR=22;TR=39;WE=2868943;WS=2868925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr17	2883500	rs4790400	A	G	2062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=21;PP=1225;SC=GCCTCCCAAAATGCTGAGATG;SOR=1.457;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=64;TCF=43;TCR=21;TR=64;WE=2883508;WS=2883490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr17	2884545	rs7208690	A	G	3422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=56;NR=55;PP=1896;SC=ACCCCAAGGTAAGGACCTTCA;SOR=0.840;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=56;TCR=55;TR=111;WE=2884553;WS=2884535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr17	2888249	rs112744093	A	AT	2661.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.192;HP=10;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=28;PP=848;ReadPosRankSum=0.013;SC=ACAAATGTTGATTTTTTTTTT;SOR=0.971;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=81;TCF=35;TCR=46;TR=51;WE=2888257;WS=2888239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:12,109:0.90:121
chr17	2894569	rs8071529	C	G	3495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=46;PP=1898;SC=AATTCCTGCCCTTATTCCTGT;SOR=0.937;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=73;TCR=47;TR=118;WE=2894577;WS=2894559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr17	2908816	rs2289648	A	G	1043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.769;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=24;PP=590;ReadPosRankSum=-0.273;SC=GGATGGAGCCAAATTCAGGCT;SOR=0.786;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=37;TCR=47;TR=43;WE=2908824;WS=2908806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,50:0.53:95
chr17	2909414	.	CTTTTTTTTTTTTTT	C	985.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.28;QD=42.86;SOR=4.003;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	2921210	rs56791699	C	CGT	67.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.57;MQRankSum=1.532;QD=3.76;ReadPosRankSum=-1.593;SOR=0.512;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr17	2921251	rs8064800	A	G	1136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=26;NR=15;PP=715;SC=GTATGTGTGCACGCATACGTG;SOR=1.230;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=26;TCR=15;TR=41;WE=2921259;WS=2921241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	2923597	rs2304981	C	A	695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=3;PP=515;SC=CTGTGACTGGCCTGAGTCTCC;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=22;WE=2923605;WS=2923587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	2923767	rs2304982	A	G	4477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=68;PP=2567;SC=AATTTCATCGACAGCCTCCAG;SOR=0.819;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=147;TCF=79;TCR=68;TR=147;WE=2923781;WS=2923757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
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chr17	2929950	rs35984185	C	A	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.021;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=315;ReadPosRankSum=1.100;SC=ACCTCTCTCTCAGAGTGACAT;SOR=3.737;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=14;WE=2929958;WS=2929940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
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chr17	2966032	rs202049082	C	G	315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.02;QD=28.71;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
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chr17	3100802	rs2241094	C	A	3195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.931;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=47;PP=1699;ReadPosRankSum=-0.449;SC=CCCTTTCATGCTGAAGAAGCC;SOR=0.528;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=176;TCF=105;TCR=71;TR=118;WE=3100810;WS=3100792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,141:0.70:201
chr17	3101076	rs2241092	G	C	1339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.205;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=23;PP=872;ReadPosRankSum=-1.878;SC=ATCTCTTGGGGAGCAAGTTCA;SOR=0.768;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=98;TCF=52;TCR=46;TR=57;WE=3101084;WS=3101066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,60:0.56:107
chr17	3119008	rs4325604	T	C	1857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.295;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=32;PP=997;ReadPosRankSum=-1.160;SC=CATCCTCTTCTTGTTCATTTA;SOR=0.499;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=115;TCF=60;TCR=55;TR=71;WE=3119016;WS=3118998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,85:0.64:133
chr17	3119767	rs769427	C	T	2181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=46;PP=1362;ReadPosRankSum=0.303;SC=AATGTTAAATCCTTTCATCTA;SOR=0.694;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=144;TCF=72;TCR=72;TR=88;WE=3119775;WS=3119757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,96:0.60:160
chr17	3119871	rs17174920	C	T	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.495;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=21;PP=469;ReadPosRankSum=1.086;SC=CATTGGATACCGTAGTCACCA;SOR=1.473;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=38;TCF=9;TCR=29;TR=26;WE=3119879;WS=3119861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,26:0.67:39
chr17	3181384	rs769434	C	T	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=14;PP=327;ReadPosRankSum=-0.096;SC=AAACTCCAACCCCTTTATCCT;SOR=0.690;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=115;TCF=62;TCR=53;TR=32;WE=3181392;WS=3181374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,33:0.25:134
chr17	3182309	rs2014057	G	T	839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=25;PP=698;SC=TCAAAGCCCCGTGGCGAGTCC;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=27;WE=3182317;WS=3182299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	3195503	rs703903	C	T	3431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=50;PP=2201;SC=GGCCAGGAATCGGTCATAGGC;SOR=0.924;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=112;TCF=62;TCR=50;TR=112;WE=3195511;WS=3195493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr17	3213690	rs61734050	T	C	3022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.575;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=51;PP=1705;ReadPosRankSum=-0.780;SC=CTACAGCCCATCCTCTTTGTC;SOR=0.606;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=169;TCF=96;TCR=73;TR=118;WE=3213698;WS=3213680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,135:0.70:194
chr17	3214181	rs231678	T	G	4480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=70;PP=2757;SC=GCTCTCCTGCTCCAGTGTTCA;SOR=0.755;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=152;TCF=82;TCR=70;TR=152;WE=3214189;WS=3214171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr17	3301549	rs150988	G	A	3387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=70;PP=2495;SC=GGAGATGGGAGTCCAGTCGAA;SOR=0.937;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=71;TCR=70;TR=140;WE=3301557;WS=3301539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr17	3324810	rs227787	A	G	1922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=0.000;QD=12.82;ReadPosRankSum=-0.504;SOR=0.723;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,91:0.61:150
chr17	3337057	rs769431	A	G	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=4.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.22;MQRankSum=-2.350;QD=4.82;ReadPosRankSum=1.573;SOR=1.225;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,26:0.29:91
chr17	3343519	rs17822627	T	C	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.67;ReadPosRankSum=-0.080;SOR=0.652;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:131,50:0.28:181
chr17	3352294	rs1488689	A	G	2273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.413;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=53;PP=1292;ReadPosRankSum=-2.536;SC=AGGTTCAGGTATTCTTAATTG;SOR=0.643;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=290;TCF=146;TCR=144;TR=106;WE=3352302;WS=3352284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:207,123:0.37:330
chr17	3352331	rs1488690	C	T	1599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.143;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=47;PP=1009;ReadPosRankSum=1.594;SC=CCCGAACTCACTGGACAAGAA;SOR=0.848;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=251;TCF=118;TCR=133;TR=82;WE=3352339;WS=3352321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:191,92:0.33:283
chr17	3352455	rs34414986	C	CAA	32.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=48;ReadPosRankSum=0.361;SC=TGTAATAGTGCAAAAAAAAAG;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=5;WE=3352463;WS=3352445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,3:0.20:15
chr17	3397702	rs12948217	C	T	4016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=63;PP=2240;ReadPosRankSum=-0.697;SC=AAGTTGATTACCCCCGGGATG;SOR=0.245;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=138;TCF=73;TCR=65;TR=136;WE=3397710;WS=3397692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,154:0.99:155
chr17	3417123	rs906418	C	T	914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=3;PP=496;SC=CCGGACTCCACCATCCCTCAA;SOR=3.528;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=23;WE=3417131;WS=3417113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	3417143	rs10573788	GCA	G	1021.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.596;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.068;NF=11;NR=5;PP=594;ReadPosRankSum=-2.036;SC=AAGCCTCTCTGCACAGAGTCG;SOR=0.423;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=16;WE=3417152;WS=3417133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,27:0.66:41
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chr17	3417996	rs200648654	TC	T	2908.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.69;ReadPosRankSum=1.396;SOR=0.653;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,72:0.66:109
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chr17	3424183	rs8079980	A	G	890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=11;PP=569;SC=AATTGTTGCCAAGGCCGCCAT;SOR=1.483;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=22;TCR=11;TR=33;WE=3424191;WS=3424173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr17	3424507	rs925101	T	C	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=2.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.94;ReadPosRankSum=1.740;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
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chr17	3433595	rs4790512	C	T	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=217;ReadPosRankSum=0.466;SC=GGGGATACACCCGCCCAGAAT;SOR=0.682;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=10;TCR=23;TR=16;WE=3433603;WS=3433585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,20:0.54:37
chr17	3435935	rs454738	C	A	725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=2;PP=538;SC=TGCCTCCCCACGCCCCATGGC;SOR=4.091;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=24;WE=3435943;WS=3435925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	3436080	rs395357	C	T	1146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FS=2.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.10;ReadPosRankSum=0.596;SOR=0.557;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:202,78:0.28:280
chr17	3445901	rs11078458	T	G	8322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=148;NR=135;PP=2965;SC=GGATCCGCACTATCTCCTTGG;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=285;TCF=149;TCR=136;TR=283;WE=3445923;WS=3445891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,314:1.00:314
chr17	3447914	rs1039519	C	T	2826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.93;SOR=0.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
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chr17	3458072	rs322965	T	C	3603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=61;PP=1950;SC=TCTGGCAGGATGGCAGGGTTC;SOR=0.737;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=132;TCF=70;TCR=62;TR=130;WE=3458080;WS=3458062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr17	3474927	rs56315286	G	A	3179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.581;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=67;PP=1724;ReadPosRankSum=-0.662;SC=AGTTCACCTCGTCCACCCTGC;SOR=0.752;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=167;TCF=75;TCR=92;TR=119;WE=3474935;WS=3474917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,142:0.71:199
chr17	3475018	rs224547	A	G	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=186;ReadPosRankSum=-0.099;SC=AGCCCAAGAAACCCACCCATC;SOR=0.804;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=11;WE=3475026;WS=3475008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,10:0.33:30
chr17	3475367	rs224548	T	G	2341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=21;PP=1616;SC=TGTCCACAGGTGAGCCCCAAA;SOR=1.637;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=52;TCR=21;TR=73;WE=3475389;WS=3475357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr17	3475381	rs117452381	C	T	1673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=18;PP=902;ReadPosRankSum=-1.296;SC=CCCCAAAGCTCCCAAGCCCTG;SOR=0.740;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=85;TCF=59;TCR=26;TR=61;WE=3475389;WS=3475357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,73:0.74:99
chr17	3475405	rs224549	C	T	3381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=69;NR=43;PP=1855;SC=CAGGTGGAGCCTGGGCATTAC;SOR=1.068;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=69;TCR=43;TR=112;WE=3475413;WS=3475395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr17	3475564	rs224550	C	T	2485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=51;PP=1530;SC=ACACCAAGGGCAGAGGAGCTG;SOR=1.255;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=82;TCF=31;TCR=51;TR=82;WE=3475572;WS=3475554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr17	3480396	rs8078936	C	T	3275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.776;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=64;PP=1860;ReadPosRankSum=0.993;SC=CCTGCCCTCCCCCAGCGCTGA;SOR=0.559;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=197;TCF=104;TCR=93;TR=134;WE=3480404;WS=3480386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,150:0.68:220
chr17	3480447	rs8065080	T	C	3526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.066;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=75;PP=1768;ReadPosRankSum=-0.405;SC=AAGAAGACGATGTAGACAAAC;SOR=0.779;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=211;TCF=102;TCR=109;TR=144;WE=3480455;WS=3480437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,163:0.68:239
chr17	3486702	rs224534	G	A	4373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=71;PP=2531;SC=ATAGTCTCCAGTTTTTTCCAT;SOR=0.742;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=79;TCR=71;TR=150;WE=3486710;WS=3486692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr17	3489244	rs161394	G	A	1739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=37;PP=1163;SC=AGAGAAGTGAGGTTCCCTCCT;SOR=1.903;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=16;TCR=37;TR=53;WE=3489252;WS=3489234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr17	3492002	rs161390	A	G	214.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.16;QD=23.86;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	3492057	rs161389	G	A	227.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.13;QD=25.31;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	3492120	rs201774093	A	AC	1732.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;QD=30.40;SOR=2.115;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,55:0.96:57
chr17	3493533	rs161387	A	G	4275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=70;PP=2554;SC=GGTCTGCCACACTGTCTCCCT;SOR=0.705;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=145;TCF=75;TCR=70;TR=145;WE=3493541;WS=3493523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr17	3513719	rs465563	G	A	337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=2;PP=206;SC=GTTCTTGGCCGAGATGGGACC;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=3513727;WS=3513709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	3514028	rs224496	G	C	3782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=61;NR=63;PP=2278;SC=CCACGCCCCAGTCCTGGAGCT;SOR=0.877;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=124;TCF=61;TCR=63;TR=124;WE=3514036;WS=3514018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr17	3533412	rs9913319	G	A	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=0.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.63;ReadPosRankSum=1.038;SOR=0.837;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,29:0.25:115
chr17	3552038	rs222778	G	A	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.534;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=244;ReadPosRankSum=-1.353;SC=CATTTCCTAAGCCTAACTGCT;SOR=0.399;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=38;TCF=32;TCR=6;TR=16;WE=3552046;WS=3552028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
chr17	3552372	rs161351	G	C	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.965;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=225;ReadPosRankSum=0.573;SC=GTGTCTTTTGGGGATGAGTAT;SOR=0.368;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=16;WE=3552380;WS=3552362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
chr17	3553526	rs161350	A	G	2747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=46;NR=43;PP=1434;SC=GAGGCACATCAAGATGGGCTG;SOR=0.876;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=46;TCR=43;TR=89;WE=3553534;WS=3553516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr17	3558417	rs459613	C	G	4195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=73;PP=2656;SC=TCAGGGTGTGCGGGCCTCACG;SOR=1.012;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=137;TCF=64;TCR=73;TR=137;WE=3558425;WS=3558407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr17	3558695	rs457419	A	G	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.136;HP=3;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=479;ReadPosRankSum=1.059;SC=CCCTAGGAGCAGGGCGTTCCA;SOR=0.126;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=12;WE=3558706;WS=3558685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr17	3558698	rs467277	G	A	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.136;HP=2;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=418;ReadPosRankSum=-1.903;SC=TAGGAGCAGGGCGTTCCAGCA;SOR=2.133;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=9;WE=3558706;WS=3558685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr17	3561396	rs161400	C	T	2069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=41;NR=30;PP=1110;SC=GTGGGAGTGACCACGTGGCTG;SOR=0.744;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=41;TCR=30;TR=71;WE=3561404;WS=3561386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr17	3563124	rs78671385	C	T	1182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.97;ReadPosRankSum=0.117;SOR=0.929;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,54:0.68:79
chr17	3563339	rs222753	C	T	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-3.070;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=5;PP=46;ReadPosRankSum=-1.029;SC=TTCCCGGGACCTTCCAGCCAG;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=17;TCF=6;TCR=11;TR=8;WE=3563347;WS=3563329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr17	3563963	rs2873624	C	G	2380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.618;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=38;PP=1220;ReadPosRankSum=-0.550;SC=GGACTGGGCACCAAGCTTGCA;SOR=0.629;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=136;TCF=77;TCR=59;TR=87;WE=3563971;WS=3563953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,102:0.65:156
chr17	3566857	rs11541134	C	T	166.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=1;PP=127;SC=GAGAGAAAGCCGGTCCCAGAG;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=3566865;WS=3566853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	3567461	rs2235107	G	A	3714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=46;PP=2300;SC=CCCAAACCTTGTTTCTCCTCC;SOR=1.307;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=79;TCR=46;TR=125;WE=3567469;WS=3567451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr17	3568012	rs8278	A	G	4806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=67;PP=2965;SC=TCTGGGAAGGATCCTGGTCGA;SOR=0.960;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=161;TCF=94;TCR=67;TR=160;WE=3568020;WS=3568002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr17	3577273	rs160587	A	G	971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.652;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=24;PP=628;ReadPosRankSum=0.477;SC=AAGTCTGAAAAGAGCTACAGT;SOR=0.347;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=65;TCF=25;TCR=40;TR=42;WE=3577281;WS=3577263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,43:0.65:66
chr17	3593074	rs220486	A	G	224.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=7;PP=170;SC=GCGCCCCAGCACCACCCACCG;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=3593082;WS=3593064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	3594276	rs3215407	TG	T	3684.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=38;PP=2058;SC=TGCCGCTGGTTGGGGGTCACA;SOR=0.965;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=65;TCF=20;TCR=45;TR=57;WE=3594284;WS=3594266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr17	3618298	rs1367950	C	T	2461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.175;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=52;PP=1375;ReadPosRankSum=-0.148;SC=TTCAGAAAACCGGCATTCTGG;SOR=0.576;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=164;TCF=80;TCR=84;TR=104;WE=3618306;WS=3618288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,116:0.62:187
chr17	3620138	rs2293881	A	G	929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.005;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=26;PP=679;ReadPosRankSum=-0.420;SC=TGAAGCAAACAAGGAAAAAAT;SOR=0.560;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=66;TCF=25;TCR=41;TR=43;WE=3620146;WS=3620128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,42:0.66:64
chr17	3626816	rs16953429	G	A	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=4;PP=139;ReadPosRankSum=-1.327;SC=CGGCCCAAGCGAAGCTCCAGC;SOR=0.801;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=17;TCR=13;TR=9;WE=3626824;WS=3626806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,9:0.28:32
chr17	3627456	rs11653889	T	A	1443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.701;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=30;PP=919;ReadPosRankSum=1.553;SC=GGCAGCCCGGTGAGGCGGCGG;SOR=0.978;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=211;TCF=112;TCR=99;TR=69;WE=3627464;WS=3627446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,77:0.32:241
chr17	3627473	rs9907144	C	T	3458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.381;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=65;PP=1913;ReadPosRankSum=0.794;SC=GCGGCGGAGGCGTCCCGGCGG;SOR=0.641;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=212;TCF=115;TCR=97;TR=137;WE=3627481;WS=3627463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,155:0.64:243
chr17	3627840	rs220462	G	A	3121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.467;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=64;PP=1743;ReadPosRankSum=-0.514;SC=GTCCCGAGCGGCCTCCACCTC;SOR=0.747;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=231;TCF=119;TCR=112;TR=136;WE=3627848;WS=3627830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,150:0.60:252
chr17	3628212	rs220461	T	C	2551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.957;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=51;PP=1697;ReadPosRankSum=0.983;SC=CCAAGGGGAATAGACAGGCTG;SOR=0.616;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=159;TCF=86;TCR=73;TR=104;WE=3628220;WS=3628202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,112:0.64:174
chr17	3628362	rs3809806	T	C	2099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.266;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=38;PP=1427;ReadPosRankSum=-0.057;SC=TTACAGAATGTCTGCTTTTGG;SOR=0.813;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=141;TCF=79;TCR=62;TR=88;WE=3628370;WS=3628352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,95:0.60:158
chr17	3629698	rs170208	A	G	984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.159;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=30;PP=676;ReadPosRankSum=0.495;SC=TTCAACCTCCATCCCCACAGG;SOR=1.463;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=55;TCF=12;TCR=43;TR=36;WE=3629706;WS=3629688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,39:0.66:59
chr17	3632836	rs1716	G	A	2521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.520;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=51;PP=1308;ReadPosRankSum=1.079;SC=GCCAAAGACCGTCTTTCATTG;SOR=0.741;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=171;TCF=87;TCR=84;TR=101;WE=3632844;WS=3632826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,120:0.59:203
chr17	3634629	rs78134599	CTTTTTTTTTTTT	C	124.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=17.82;ReadPosRankSum=1.282;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr17	3635645	rs170209	A	G	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=201;ReadPosRankSum=-0.873;SC=AGAGCGAATCAGTCCAAACCG;SOR=0.470;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=51;TCF=41;TCR=10;TR=18;WE=3635653;WS=3635635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,18:0.33:55
chr17	3638037	rs184335	C	T	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=91;ReadPosRankSum=-1.406;SC=AGTGAGGGGGCCACCACAGAA;SOR=0.663;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=8;WE=3638045;WS=3638027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr17	3638344	rs9674606	G	A	888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.630;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=25;PP=487;ReadPosRankSum=-0.337;SC=TGGTGCTGTGGTGCAATGATC;SOR=0.924;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=101;TCF=36;TCR=65;TR=38;WE=3638352;WS=3638334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,45:0.39:114
chr17	3646977	rs10642081	C	CTT	237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=7;PP=224;SC=AACAATAATGCTTTTTTTCTT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=7;WE=3646985;WS=3646967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	3649214	rs1183610	G	A	3187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=50;NR=56;PP=1634;SC=GAAGTGCCTCGCGGAGGCCTG;SOR=0.906;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=50;TCR=56;TR=106;WE=3649222;WS=3649204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr17	3656959	.	TGA	T	73.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=-0.000;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=1;PP=38;ReadPosRankSum=1.292;SC=CTCAGGAGCCTGAGTTTCACC;SOR=0.818;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=2;WE=3656968;WS=3656949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr17	3657159	rs2272606	C	T	9232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=100;NR=93;PP=2965;ReadPosRankSum=0.481;SC=ATGTTTGTACCGTGGAGCCCC;SOR=0.238;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=195;TCF=101;TCR=94;TR=193;WE=3657167;WS=3657149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,218:1.00:219
chr17	3657175	rs220479	T	C	9000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.222;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=89;PP=2622;ReadPosRankSum=1.600;SC=GCCCCCGCGATGTAGGAGAGG;SOR=0.393;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=179;TCF=89;TCR=90;TR=178;WE=3657183;WS=3657165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,209:1.00:210
chr17	3658358	rs3833165	A	AGGCCCCGCCCTCATCAGGT	901.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=64.41;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	3664477	rs10687117	A	AATT	1869.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.362;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=842;ReadPosRankSum=0.284;SC=ATTTTCTTTAAAAACACACAT;SOR=0.567;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=76;TCF=12;TCR=64;TR=22;WE=3664485;WS=3664467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,52:0.36:146
chr17	3665116	rs8080482	A	G	1199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=9;PP=772;SC=CGGGAACAGCATGGCAGTCAG;SOR=2.059;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=32;TCR=9;TR=41;WE=3665124;WS=3665106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr17	3665160	rs220471	C	G	2229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=45;NR=30;PP=1277;SC=ACCACGAGGGCTAGCACCAGC;SOR=0.897;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=45;TCR=30;TR=75;WE=3665168;WS=3665137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr17	3687533	rs55722017	A	G	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=1.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.77;ReadPosRankSum=-0.481;SOR=0.297;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,6:0.22:27
chr17	3717896	rs9897428	A	T	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=31;ReadPosRankSum=1.645;SC=AGGGCCTGACAATCAGGCTGC;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=3717904;WS=3717886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr17	3728903	rs12940049	T	A	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=192;ReadPosRankSum=-0.148;SC=AATCGCTATATCCACACTAAC;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=9;WE=3728911;WS=3728893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr17	3765599	rs177985	C	G	996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.872;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=25;PP=583;ReadPosRankSum=0.999;SC=ACACCAGGGACAGAGGGACCT;SOR=0.795;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=153;TCF=86;TCR=67;TR=50;WE=3765607;WS=3765589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,56:0.32:177
chr17	3775848	rs7214723	T	C	5354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=95;NR=83;PP=2965;SC=GACAACTCACTCCTCAGGAAA;SOR=0.754;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=179;TCF=96;TCR=83;TR=178;WE=3775856;WS=3775838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr17	3775916	rs7214864	T	C	4295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=73;PP=2043;SC=CGTCGATGAATGGGCACTGTG;SOR=0.964;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=137;TCF=63;TCR=74;TR=136;WE=3775924;WS=3775906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr17	3776555	rs34231122	T	C	724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.909;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=8;PP=391;ReadPosRankSum=1.104;SC=CAGAGAAAGATAGAAAAAGCC;SOR=0.550;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=68;TCF=47;TCR=21;TR=28;WE=3776565;WS=3776545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,34:0.44:78
chr17	3776867	rs9904678	C	T	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.893;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=28;PP=585;ReadPosRankSum=-1.562;SC=CTCTGTCATGCACTCACTCGA;SOR=1.284;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=45;TCF=5;TCR=40;TR=31;WE=3776875;WS=3776857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,30:0.68:44
chr17	3783872	rs11651131	T	C	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=3.152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.49;ReadPosRankSum=-0.332;SOR=0.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,11:0.24:46
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chr17	3818620	rs10852862	T	C	6786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=124;NR=97;PP=2965;SC=ATGTGGGCACTCAGCACCAGG;SOR=0.800;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=221;TCF=124;TCR=97;TR=221;WE=3818628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr17	3818788	rs2875751	G	A	3221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=45;PP=2082;SC=GGACAGGTCCGGAGATGCCCA;SOR=0.881;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=103;TCF=58;TCR=45;TR=103;WE=3818796;WS=3818778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr17	3818830	rs2325788	A	G	3618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=50;PP=2086;SC=GACCAGAACCAATCTCTGTCC;SOR=0.833;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=68;TCR=50;TR=118;WE=3818838;WS=3818820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr17	3819002	rs11078475	T	C	3712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.563;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=63;PP=2269;ReadPosRankSum=1.170;SC=GGGTGTGGGGTATGGCCTCTG;SOR=0.647;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=114;TCF=51;TCR=63;TR=113;WE=3819010;WS=3818992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,133:0.99:134
chr17	3822926	rs56307755	C	T	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.59;ReadPosRankSum=-1.170;SOR=0.645;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:119,42:0.26:161
chr17	3910125	rs62072392	A	G	800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=11;PP=416;ReadPosRankSum=1.212;SC=ATGAGGTTAGATGTCTGCTCT;SOR=0.634;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=66;TCF=44;TCR=22;TR=34;WE=3910133;WS=3910115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,39:0.51:77
chr17	3921307	rs2247194	C	G	898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.851;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=21;PP=493;ReadPosRankSum=0.386;SC=ACAGTGTAGACAGGCCAGTTT;SOR=0.223;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=59;TCF=22;TCR=37;TR=38;WE=3921315;WS=3921297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,43:0.69:62
chr17	3922918	rs711178	A	G	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.072;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=87;ReadPosRankSum=0.967;SC=GCCCTCACATATTCTCTCCCT;SOR=0.346;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=7;WE=3922926;WS=3922908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr17	3923115	rs2290437	G	A	1251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=24;PP=693;ReadPosRankSum=-0.023;SC=GCTTCAATACGGTATTGATCA;SOR=0.770;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=68;TCF=35;TCR=33;TR=47;WE=3923123;WS=3923105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,56:0.67:84
chr17	3947644	rs781831	T	C	1556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.833;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=34;PP=953;ReadPosRankSum=0.030;SC=ACAGGTCTGATTTCCTCATGA;SOR=0.859;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=88;TCF=32;TCR=56;TR=52;WE=3947656;WS=3947634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,61:0.63:97
chr17	3953083	rs781853	T	C	1539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.479;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=34;PP=754;ReadPosRankSum=-0.961;SC=GCACAGTGACTGGTAGGGCCT;SOR=0.881;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=111;TCF=54;TCR=57;TR=64;WE=3953091;WS=3953073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,72:0.59:122
chr17	3953102	rs781852	A	G	1515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.717;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=29;PP=861;ReadPosRankSum=-0.699;SC=CTGATCTTCTAGGCTCGAGTC;SOR=0.779;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=48;TCR=51;TR=57;WE=3953110;WS=3953092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,66:0.59:111
chr17	3961200	rs12938597	C	T	902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.938;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=9;PP=509;ReadPosRankSum=1.509;SC=AGTCTAGCTCCGGAGTCTGTG;SOR=0.302;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=46;TCF=35;TCR=11;TR=33;WE=3961208;WS=3961190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,38:0.70:54
chr17	3961489	rs781839	C	T	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=354;ReadPosRankSum=-0.129;SC=GAGCTGCTTACTCCCAACAGA;SOR=0.512;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=20;WE=3961497;WS=3961479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
chr17	3962428	rs34838830	A	AT	1262.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.087;HP=8;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.659;NF=19;NR=9;PP=556;ReadPosRankSum=-0.438;SC=AAAAAAATACATTTTTTTTCT;SOR=0.554;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=60;TCF=42;TCR=18;TR=28;WE=3962436;WS=3962418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,53:0.72:74
chr17	3962450	rs9900661	A	G	2592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.701;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=28;PP=1544;ReadPosRankSum=0.699;SC=TAGAAATGATAAAGTTATCCA;SOR=0.582;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=139;TCF=97;TCR=42;TR=92;WE=3962458;WS=3962440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,108:0.71:153
chr17	3966064	rs781825	A	G	1189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=16;PP=644;ReadPosRankSum=-0.008;SC=AATCTTTCTGACAGGTCAGAA;SOR=0.662;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=62;TCF=41;TCR=21;TR=45;WE=3966072;WS=3966054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,53:0.74:72
chr17	3976075	rs781820	C	G	1057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=29;PP=731;ReadPosRankSum=-0.535;SC=AGACATATGACAGTTCTATTT;SOR=0.634;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=63;TCF=19;TCR=44;TR=42;WE=3976083;WS=3976065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,44:0.67:66
chr17	3977532	rs34760976	G	A	3181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=56;PP=1964;ReadPosRankSum=-1.850;SC=CCCAAGACACGGCAACATCGG;SOR=0.720;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=213;TCF=122;TCR=91;TR=133;WE=3977540;WS=3977522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,147:0.63:234
chr17	3978268	rs10521127	T	C	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.328;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=59;ReadPosRankSum=-1.204;SC=AAATCCTTCCTTTCACAAACG;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=4;WE=3978276;WS=3978258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr17	3978531	rs34356467	G	T	2247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.358;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=46;PP=1254;ReadPosRankSum=-0.535;SC=TTAGCGCTTGGGGGTGAAAGA;SOR=0.860;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=135;TCF=66;TCR=69;TR=88;WE=3978539;WS=3978521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,102:0.67:153
chr17	3979949	rs7207986	G	A	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=188;ReadPosRankSum=-0.163;SC=GTCCTCCTTCGGGGCCACTAC;SOR=0.914;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=9;WE=3979957;WS=3979939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr17	3980318	rs897026	T	C	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.421;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=210;ReadPosRankSum=0.500;SC=ATATATTATATAGTAGAAATG;SOR=0.426;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=15;WE=3980326;WS=3980308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr17	3981066	rs8070737	G	T	842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=6;PP=576;ReadPosRankSum=-0.628;SC=AATCTGAATCGTAATGAAGAA;SOR=0.614;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=34;TCR=8;TR=31;WE=3981074;WS=3981056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,33:0.73:45
chr17	3981148	rs8074454	G	C	3320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.573;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=52;PP=2109;ReadPosRankSum=-0.399;SC=AACGCCATCTGTTTTCATGGA;SOR=0.752;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=179;TCF=103;TCR=76;TR=126;WE=3981156;WS=3981138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,138:0.70:197
chr17	3985832	rs2727061	A	G	819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FS=0.589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.83;ReadPosRankSum=-0.918;SOR=0.601;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:162,52:0.24:214
chr17	3985864	rs8068804	G	A	3293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.931;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=71;PP=2054;ReadPosRankSum=0.732;SC=GACCTAGAGCGGCAATGAAAC;SOR=0.968;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=169;TCF=76;TCR=93;TR=124;WE=3985872;WS=3985854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,139:0.73:190
chr17	3989636	.	AGCG	A	425.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.04;ReadPosRankSum=-0.979;SOR=0.990;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,16:0.94:17
chr17	3989642	.	AATCCCTTTCTGGGGGATTCCCACAGCG	A	471.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.83;ReadPosRankSum=-1.125;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,18:0.95:19
chr17	3989669	.	G	A	344	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=14;NR=3;PP=344;QD=22.2806595616;SC=TTCCCACAGCGGCAATCCCTT;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=3989677;WS=3989659;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	3989968	rs2727060	C	T	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.938;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=88;ReadPosRankSum=-1.812;SC=AGACAAAAAACATCAGAGAGC;SOR=0.368;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=8;WE=3989976;WS=3989958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr17	3991943	rs67005107	A	G	408.10	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=298;ReadPosRankSum=0.240;SC=TCCTAAAGGAATGCCGTCTAA;SOR=2.584;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=13;WE=3991951;WS=3991933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,14:0.93:15
chr17	3993910	rs67533014	C	T	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=10;PP=618;ReadPosRankSum=-1.580;SC=AAGGTAGATTCGCCTCTGGGG;SOR=0.763;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=70;TCF=50;TCR=20;TR=38;WE=3993918;WS=3993900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,38:0.54:71
chr17	3994170	rs2727075	T	C	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.239;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=13;PP=214;ReadPosRankSum=-2.024;SC=TTGAAACTTCTCAAGGGTCTA;SOR=0.366;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=89;TCF=32;TCR=57;TR=24;WE=3994178;WS=3994160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,27:0.28:97
chr17	3994225	rs12950730	C	A	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=359;ReadPosRankSum=-1.029;SC=GTATCTGTAGCCTGTCAGTGA;SOR=0.402;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=18;WE=3994233;WS=3994215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,20:0.71:28
chr17	3999199	rs12947597	C	T	4267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.488;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=99;NR=71;PP=2594;ReadPosRankSum=0.963;SC=AGTGTTCTTCCGCACAAAATT;SOR=0.756;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=242;TCF=140;TCR=102;TR=170;WE=3999207;WS=3999189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,186:0.69:268
chr17	4005770	rs1869493	T	C	4529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=79;NR=81;PP=2283;SC=GAAACTAGCATGCCTATCTGT;SOR=0.849;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=160;TCF=79;TCR=81;TR=160;WE=4005778;WS=4005760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr17	4007875	rs9907500	C	T	327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=184;SC=AATGGTTTTACGATTTGTCCA;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=4007883;WS=4007865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	4015997	rs58625333	A	G	1583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.701;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=25;PP=815;ReadPosRankSum=-0.426;SC=GATCGCTGGCATTCCTCCCTA;SOR=0.781;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=94;TCF=53;TCR=41;TR=62;WE=4016005;WS=4015987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,72:0.68:106
chr17	4027036	rs11078481	C	G	182.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=0;PP=148;SC=CACCACCGTACTGGGGATGAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=4027055;WS=4027032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	4027047	rs7225521	A	G	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.309;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=93;ReadPosRankSum=-0.792;SC=TGGGGATGAAAGAGATGACTA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=5;WE=4027055;WS=4027032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr17	4027392	rs7208760	G	C	1375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=25;PP=835;SC=TCAAGTAAACGAGGGCAGTTT;SOR=1.426;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=16;TCR=25;TR=41;WE=4027400;WS=4027382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr17	4045809	rs4239043	T	C	2499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=58;NR=23;PP=1527;SC=CCCTGCCCCATCCCCGCAGTC;SOR=1.508;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=58;TCR=23;TR=81;WE=4045817;WS=4045799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr17	4046101	rs1454121	A	G	2200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=38;PP=1516;SC=CGTGCCCGAGACCGCGGCCCA;SOR=0.772;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=73;TCF=35;TCR=38;TR=73;WE=4046109;WS=4046091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr17	4046270	rs1454122	T	C	734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=21;PP=460;SC=CGACAGCAGCTGGCGGGCGGG;SOR=1.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=30;WE=4046278;WS=4046260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	4046936	rs71905319	CGA	C	123	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=1;PP=126;SC=CACTAGCGCGCGAGAGAGAGA;SOR=1.609;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=4046945;WS=4046926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	4058168	rs71936267	CCTT	C	700.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.047;NF=1;NR=14;PP=599;ReadPosRankSum=-0.074;SC=AGCAGGCTCCCCTTCTTCTCC;SOR=0.892;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=15;WE=4058178;WS=4058158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,19:0.68:28
chr17	4071302	rs4790583	G	C	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=62;ReadPosRankSum=0.515;SC=GGCAGCCAAGGCGCCCGCAAT;SOR=1.085;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=6;WE=4071310;WS=4071292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,7:0.27:26
chr17	4071326	rs4790178	C	G	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=64;ReadPosRankSum=2.126;SC=ACTCTGGCAACTCTGCCAACT;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=5;WE=4071334;WS=4071316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr17	4074261	rs897030	A	C	494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=417;SC=GCTGGCAGGAAATCTGTTCAC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=4074269;WS=4074251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	4077485	rs4790585	G	A	306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=8;PP=200;SC=TGGGAGCATAGGAGCTTCACA;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=4077493;WS=4077475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
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chr17	4088291	rs2020118	C	T	2964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=53;PP=1773;SC=GGAGCTCTGCCGTGAGGTTGG;SOR=0.865;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=102;TCF=49;TCR=53;TR=102;WE=4088299;WS=4088281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr17	4098573	rs5818941	A	AT	2019.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.12;MQRankSum=0.000;QD=22.44;ReadPosRankSum=0.367;SOR=0.734;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:9,81:0.90:90
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chr17	4145818	rs12709336	T	C	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.611;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=271;ReadPosRankSum=1.871;SC=CCTCATCCCATAGACAGGAAA;SOR=0.207;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=31;TCF=10;TCR=21;TR=20;WE=4145826;WS=4145808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,24:0.69:35
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chr17	4192401	rs71144179	TACAC	TACACAC,T	187.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.4972;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=5,5;NR=2,2;PP=123,16;ReadPosRankSum=0.319;SC=TGGGAAGAGATACACACACAC;SOR=0.697;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=13;TCF=7;TCR=6;TR=7,7;WE=4192412;WS=4192391;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.58:12
chr17	4337283	rs35751906	G	A	561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.511;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=299;ReadPosRankSum=0.608;SC=GGATGTCAGCGGAGTGCCCTG;SOR=1.638;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=18;WE=4337291;WS=4337273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,24:0.67:36
chr17	4337412	rs3809853	C	G	5842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=107;NR=93;PP=2965;SC=CTGCCGCCGTCCTCTGCTACA;SOR=0.749;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=200;TCF=107;TCR=93;TR=200;WE=4337420;WS=4337402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr17	4343150	rs3809852	G	A	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.636;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.041;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=5;PP=92;ReadPosRankSum=-0.405;SC=TGGGGTATGGGCCTGAGGGAC;SOR=0.116;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=8;WE=4343158;WS=4343140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr17	4350182	rs2047233	T	C	2020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=17;PP=1202;SC=CCCTGCCCCTTTGTTGCAGTG;SOR=1.852;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=45;TCR=17;TR=62;WE=4350190;WS=4350172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr17	4350367	rs2047232	A	G	2556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=39;PP=1198;SC=CATTAGGGGGACGGGGGGTGG;SOR=1.812;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=16;TCR=39;TR=55;WE=4350382;WS=4350357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr17	4350373	rs3055435	GGT	G	2196.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=35;PP=1694;SC=GGGGACGGGGGGTGGTGGTCA;SOR=1.848;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=35;WE=4350382;WS=4350357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr17	4350407	rs2047231	G	C	839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=51;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=24;PP=559;SC=TTGGACATGTGGGGCCTCATA;SOR=2.694;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=29;WE=4350415;WS=4350397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr17	4351396	rs6502786	C	T	481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=1;PP=376;SC=CCCGGGGGTCCCTTGGGCTGT;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=4351404;WS=4351386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	4351640	rs884250	G	A	6374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=106;NR=100;PP=2965;SC=AGAAAAGCCCGTTTGTCTGCC;SOR=0.769;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=206;TCF=106;TCR=100;TR=206;WE=4351648;WS=4351630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr17	4352539	rs7224464	C	T	4167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=81;NR=57;PP=2171;SC=GCTGGAGTTTCGTGTGGTCGA;SOR=0.839;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=138;TCF=81;TCR=57;TR=138;WE=4352547;WS=4352529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr17	4402803	rs184566	T	C	860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=26;PP=750;SC=GCTTTTGGTCTCAGGCCTGCT;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=27;WE=4402811;WS=4402793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
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chr17	4416674	rs7214270	T	C	602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.41;ReadPosRankSum=-0.318;SOR=0.741;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:136,41:0.23:177
chr17	4434489	rs62064929	C	T	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.56;ReadPosRankSum=0.139;SOR=0.626;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:128,35:0.21:163
chr17	4434617	rs62064930	G	A	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.27;ReadPosRankSum=0.863;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,3:0.21:14
chr17	4436005	rs9892232	T	C	2719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=57;PP=1484;SC=AGGGGTCTGGTGGGAAGAGAG;SOR=1.158;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=42;TCR=58;TR=99;WE=4436013;WS=4435995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr17	4437214	rs4790202	C	T	718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=18;PP=408;ReadPosRankSum=2.089;SC=ACAGGGGTGCCTGGGGAGGGC;SOR=0.859;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=43;TCF=15;TCR=28;TR=27;WE=4437222;WS=4437204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,31:0.65:48
chr17	4439313	rs1077200	A	G	608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=18;NR=5;PP=417;SC=GCCCGGGGCCAGGGCCAAGCG;SOR=2.124;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=23;WE=4439321;WS=4439303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	4439356	rs74592437	C	T	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=1.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.52;ReadPosRankSum=1.567;SOR=0.450;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,12:0.26:46
chr17	4439366	rs75075518	C	T	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=4.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.48;ReadPosRankSum=-0.419;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,16:0.28:58
chr17	4439497	rs12945732	A	G	6023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.34;SOR=0.929;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr17	4439501	rs1076071	C	G	6205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.70;SOR=1.011;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr17	4439512	rs11658114	A	G	1950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=1.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.82;ReadPosRankSum=-0.602;SOR=0.842;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,55:0.33:165
chr17	4439515	rs9908450	G	T	2076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.363;SOR=0.725;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:125,58:0.32:183
chr17	4439532	rs1076072	T	C	2288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.13;ReadPosRankSum=0.899;SOR=0.769;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:153,73:0.32:226
chr17	4439727	rs146210718	T	TGG	715.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.298;HP=8;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=1.601;NF=2;NR=15;PP=472;ReadPosRankSum=-0.105;SC=CAGCAGTGAGTGGGGGGGAGG;SOR=0.458;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=17;WE=4439735;WS=4439717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,23:0.56:41
chr17	4440139	.	C	G	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.753;ClippingRankSum=0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.53;ReadPosRankSum=1.240;SOR=0.598;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,13:0.24:54
chr17	4440395	.	CTGA	C	101.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=80;ReadPosRankSum=-2.253;SC=CCAGAATTTACTGATGGAGCC;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=3;WE=4440405;WS=4440385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr17	4442088	rs62064958	C	A	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=117;ReadPosRankSum=2.016;SC=GAGGGCCTGACAAGAGGATGG;SOR=0.223;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=8;WE=4442096;WS=4442078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr17	4443075	rs9905742	T	A	969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.675;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=18;PP=536;ReadPosRankSum=0.354;SC=TTCCTGCCCATGCTGGGGGGC;SOR=0.818;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=111;TCF=64;TCR=47;TR=44;WE=4443083;WS=4443065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,52:0.41:126
chr17	4445085	rs62066360	G	A	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.13;ReadPosRankSum=-2.033;SOR=0.708;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:149,35:0.19:184
chr17	4448236	rs9910749	C	T	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=1.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.74;ReadPosRankSum=0.030;SOR=0.463;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,12:0.19:62
chr17	4448756	rs2306266	C	T	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.076;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=159;ReadPosRankSum=0.228;SC=CTAGGAGAGGCGGCCAGGCCA;SOR=0.204;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=13;WE=4448764;WS=4448746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,12:0.34:35
chr17	4448853	rs2306267	C	T	186.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5064;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=3;NR=4;PP=62;SC=TGGTGCAGCTCGCTGCTCAGT;SOR=1.179;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=7;WE=4448861;WS=4448843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	4451545	rs9907224	C	T	1760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=37;PP=893;ReadPosRankSum=-1.529;SC=AGGTCCAGGGCTGCCCACCCT;SOR=0.690;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=240;TCF=122;TCR=118;TR=77;WE=4451553;WS=4451535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:188,100:0.35:288
chr17	4455500	rs7206974	T	C	6345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=118;PP=2965;SC=CTTCCTTGAGTGCCAGGCGGA;SOR=0.848;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=227;TCF=109;TCR=118;TR=227;WE=4455508;WS=4455490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr17	4457580	rs2306270	G	A	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=3.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.96;ReadPosRankSum=-0.840;SOR=1.356;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,9:0.15:61
chr17	4458302	rs1871348	C	A	8814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=2.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=138;NR=172;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.891;SC=AAGGTGCACGCCCCCGCGCAC;SOR=0.376;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=312;TCF=138;TCR=174;TR=310;WE=4458322;WS=4458292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,339:1.00:340
chr17	4458314	rs1871347	C	T	7738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=113;NR=146;PP=2965;SC=CCCGCGCACCCTGGCATCCAG;SOR=1.096;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=259;TCF=113;TCR=146;TR=259;WE=4458322;WS=4458292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,285:1.00:285
chr17	4461748	rs7215121	G	A	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.104;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=9;PP=158;ReadPosRankSum=-0.425;SC=CACTGCTCTCGGGGCTCACAG;SOR=0.946;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=52;TCF=27;TCR=25;TR=16;WE=4461756;WS=4461738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,17:0.29:59
chr17	4462304	rs201922735	G	A	806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.162;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=20;PP=459;ReadPosRankSum=-1.740;SC=TGTCAGGGCCGTGGAATTGCC;SOR=0.904;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=48;TCF=24;TCR=24;TR=36;WE=4462312;WS=4462294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,38:0.70:54
chr17	4463023	rs11657054	G	A	1246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=14;NR=25;PP=668;SC=CACTACACGGGCCCAGGTTCC;SOR=1.714;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=14;TCR=25;TR=39;WE=4463031;WS=4463013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr17	4495740	rs12449695	G	A	2447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=41;NR=42;PP=1311;SC=CCAGCCGGGGGCAGGTAGGGC;SOR=1.006;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=41;TCR=42;TR=83;WE=4495748;WS=4495730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr17	4497084	rs9908079	G	T	2375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.322;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=40;PP=1285;ReadPosRankSum=-0.904;SC=CTGGGGCCAGGGTTTGTTACT;SOR=0.567;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=145;TCF=88;TCR=57;TR=96;WE=4497092;WS=4497074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,111:0.68:164
chr17	4498611	rs12103697	G	A	1230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=32;PP=810;ReadPosRankSum=1.775;SC=AGCAGGAAACGGCGGCCGGCA;SOR=0.777;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=72;TCF=27;TCR=45;TR=50;WE=4498619;WS=4498601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,52:0.68:77
chr17	4498656	rs59211026	C	G	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=71;ReadPosRankSum=-0.809;SC=GGCCCGGCCCCACGGTGTGCC;SOR=0.606;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=38;TCF=17;TCR=21;TR=10;WE=4498664;WS=4498646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,12:0.29:42
chr17	4498682	rs4790655	C	G	584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=8;NR=13;PP=326;SC=CCAGACGGGGCTTGGGTGGGT;SOR=1.426;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=8;TCR=13;TR=21;WE=4498690;WS=4498672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	4500072	rs9906333	A	G	51.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=17.09;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	4513974	rs111699059	A	AAAAG	2936.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.447;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.981;NF=13;NR=19;PP=1334;ReadPosRankSum=1.173;SC=CCTGTCTCAAAAAAGAAAGAA;SOR=1.008;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=70;TCF=24;TCR=46;TR=32;WE=4513985;WS=4513964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,77:0.62:125
chr17	4520361	.	GA	G	41.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.344;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.61;ReadPosRankSum=1.250;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr17	4534834	rs916055	A	G	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.722;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=235;ReadPosRankSum=-0.239;SC=GGCTATAACCACGAAGGGGTC;SOR=0.223;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=16;WE=4534842;WS=4534824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,18:0.72:25
chr17	4535385	rs2619112	A	G	1433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.003;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=38;PP=863;ReadPosRankSum=-0.609;SC=GTCAGTGCCTACCAAGCACGC;SOR=0.601;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=240;TCF=126;TCR=114;TR=79;WE=4535393;WS=4535375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,86:0.32:269
chr17	4535413	rs6502804	T	C	927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FS=1.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.48;ReadPosRankSum=1.394;SOR=0.533;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:147,60:0.29:207
chr17	4536241	rs743646	T	C	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=0.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.51;ReadPosRankSum=1.055;SOR=0.664;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,29:0.29:101
chr17	4541744	rs899452	T	C	205.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.68;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=1;PP=139;SC=CAACCATGCCTCCTTGACTCC;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=4541752;WS=4541734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	4542717	rs11078528	G	A	1032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.166;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.811;NF=34;NR=8;PP=764;ReadPosRankSum=0.078;SC=CCTCAGCCCCGCGCTTACCGG;SOR=0.950;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=66;TCF=53;TCR=13;TR=42;WE=4542725;WS=4542707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,41:0.61:67
chr17	4544729	rs9906597	A	G	2196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=45;NR=31;PP=1282;SC=GCCAGAGGCCAACGGGGGCGC;SOR=1.065;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=45;TCR=31;TR=76;WE=4544737;WS=4544719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr17	4544978	rs369435246	G	GAGA	2288.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=27;PP=758;SC=CCTTCTGGTGGAGAAGGGTGG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=27;WE=4544987;WS=4544968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr17	4545581	rs2255888	C	T	4338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=75;NR=83;PP=2640;SC=CTCCCTGTTGCCTGCAGAATA;SOR=0.861;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=75;TCR=83;TR=158;WE=4545589;WS=4545571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr17	4575283	rs3862485	A	G	1573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=27;NR=24;PP=866;SC=GCCCGGGTTCAGGTTCGGGTT;SOR=0.726;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=27;TCR=24;TR=51;WE=4575291;WS=4575273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr17	4577112	rs11658808	G	A	1858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=44;PP=1267;SC=TAGAAAATGGGGATCATAAAA;SOR=2.231;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=15;TCR=44;TR=59;WE=4577120;WS=4577102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr17	4578007	rs4790673	C	G	8208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=138;NR=135;PP=2965;SC=AGGCAAACAACAAGGCAAGAC;SOR=0.713;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=273;TCF=138;TCR=135;TR=273;WE=4578015;WS=4577997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,305:1.00:305
chr17	4579638	rs8071990	G	A	1682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=27;PP=951;SC=CTAACTAGCAGCCCTGGTCCC;SOR=0.822;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=29;TCR=27;TR=56;WE=4579646;WS=4579628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr17	4580137	rs6502806	A	G	4424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=68;NR=82;PP=2673;SC=GGAAGAGGCCAGTGAGCCAGC;SOR=0.961;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=150;TCF=68;TCR=82;TR=150;WE=4580145;WS=4580127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr17	4580224	rs11078530	C	T	2020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=25;NR=45;PP=1249;SC=CCTGTAGACACAAGAAGCAAA;SOR=1.550;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=25;TCR=45;TR=70;WE=4580232;WS=4580214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr17	4585821	rs11541059	G	A	3560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.503;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=66;PP=2138;ReadPosRankSum=0.901;SC=AAGCCCGAGGGAAATAGGTCA;SOR=0.708;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=212;TCF=116;TCR=96;TR=142;WE=4585829;WS=4585811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,159:0.67:238
chr17	4586253	rs34352526	GA	G	2617.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=36;PP=1295;SC=TGGGTCTAAAGAAAAAAATAA;SOR=0.782;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=52;TCF=10;TCR=42;TR=46;WE=4586261;WS=4586243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr17	4594847	rs7226084	T	C	1324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=32;PP=941;SC=TGAAGTCACATCTCCTCTGAG;SOR=2.409;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=43;TCF=10;TCR=33;TR=42;WE=4594855;WS=4594837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	4620497	rs7208257	C	T	3985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=78;NR=50;PP=2081;SC=AAGTCTTCTCCTTCCTCCGCC;SOR=0.834;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=78;TCR=50;TR=128;WE=4620505;WS=4620487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr17	4622071	.	C	G	796	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=20;MQ=57.02;NF=18;NR=28;PP=796;QD=18.060243751;SC=CCTGAGCCATCTCCACCTTTT;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=63;TCF=18;TCR=45;TR=46;WE=4622085;WS=4622061;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:17,46:0.73:63
chr17	4622638	rs1045280	C	T	7519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.072;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=130;NR=120;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.230;SC=CACTGCTCAGCGACAACCGGG;SOR=0.280;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=251;TCF=131;TCR=120;TR=250;WE=4622646;WS=4622628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,283:1.00:284
chr17	4636565	rs8123	T	G	353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=220;ReadPosRankSum=0.837;SC=GGGTGGGGAGTATGAGCACCA;SOR=0.836;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=11;WE=4636573;WS=4636555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr17	4638010	rs3744700	T	G	3695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=78;PP=2363;ReadPosRankSum=-0.168;SC=TGGGGGATGATAGCTTGAACT;SOR=0.706;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=242;TCF=118;TCR=124;TR=151;WE=4638023;WS=4638000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,164:0.62:263
chr17	4641755	rs1050997	C	T	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.108;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=13;PP=251;ReadPosRankSum=0.910;SC=CCTTGTTGCCCCCACACACGC;SOR=0.434;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=65;TCF=26;TCR=39;TR=23;WE=4641763;WS=4641745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,24:0.30:79
chr17	4642069	rs2250333	A	G	4623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=56;PP=2699;SC=AGAGGCAGGTAAAATTACCTC;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=147;TCF=91;TCR=56;TR=147;WE=4642077;WS=4642059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr17	4644491	rs9903643	A	G	732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=15;PP=454;SC=CTCCCTTCGGAAGCCCTCCCC;SOR=2.494;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=20;WE=4644499;WS=4644481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	4645324	rs3826517	T	C	2766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=63;PP=1438;ReadPosRankSum=-0.199;SC=GAACCTGCCATGTGTGTCACA;SOR=0.740;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=162;TCF=72;TCR=90;TR=111;WE=4645332;WS=4645314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,127:0.67:189
chr17	4646480	rs12451720	C	T	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.13;ReadPosRankSum=-0.345;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr17	4647002	rs8082690	A	G	1102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=19;PP=707;ReadPosRankSum=-2.167;SC=GAAGGAAGAAAGAGATGGGTC;SOR=0.660;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=49;TCR=31;TR=48;WE=4647010;WS=4646992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,51:0.54:94
chr17	4648832	rs12940996	C	G	593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=21;PP=499;ReadPosRankSum=-0.588;SC=TCGTCGCCCCCATGGGAGGTC;SOR=0.620;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=40;TCF=4;TCR=36;TR=23;WE=4648840;WS=4648822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,23:0.56:41
chr17	4684095	rs13520	G	A	1295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.733;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=25;PP=697;ReadPosRankSum=0.291;SC=TACTGTGTCCGGGGATTGCAG;SOR=0.799;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=86;TCF=45;TCR=41;TR=54;WE=4684103;WS=4684085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,62:0.58:106
chr17	4686340	rs3853643	TT	GG	8297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=76;NR=81;PP=2947;SC=CAGGTGAAATTTCTTGCGGTG;SOR=0.979;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=159;TCF=77;TCR=82;TR=157;WE=4686349;WS=4686330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr17	4688996	rs2279962	A	C	882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.431;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=20;PP=582;ReadPosRankSum=1.185;SC=CGGGCCCCCCATTCACCAAGC;SOR=0.416;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=44;TCF=18;TCR=26;TR=35;WE=4689004;WS=4688986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,37:0.79:47
chr17	4689313	rs2279961	G	C	509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FS=1.263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.13;ReadPosRankSum=-1.571;SOR=0.800;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:192,47:0.20:239
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chr17	4692559	rs2304969	G	T	782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FS=3.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.40;ReadPosRankSum=-0.256;SOR=1.015;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:129,49:0.28:178
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chr17	4693170	rs34850425	T	C	1584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=34;PP=870;SC=TGGTCGCTGGTGGCCATGGCG;SOR=1.392;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=20;TCR=34;TR=54;WE=4693178;WS=4693160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr17	4693342	rs35910358	C	A	2098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=44;NR=26;PP=1076;SC=GAGGCCCGGACGCGGGCGTGC;SOR=1.031;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=44;TCR=26;TR=70;WE=4693350;WS=4693332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr17	4693508	rs34421346	G	C	1554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=24;PP=809;SC=GGCCGCGCTGGTCCGGGCCGC;SOR=1.061;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=21;TCR=24;TR=45;WE=4693516;WS=4693498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
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chr17	4699947	rs2241933	T	G	4498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=63;PP=2599;SC=TTTGTATTTTTGGAACTAGGT;SOR=0.961;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=84;TCR=63;TR=147;WE=4699955;WS=4699937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr17	4700695	rs76289772	AG	A	2190.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.415;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=19;PP=1273;ReadPosRankSum=-0.496;SC=GGTGGAAGACAGGTGGGCTCC;SOR=0.871;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=73;TCF=31;TCR=42;TR=36;WE=4700703;WS=4700685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,70:0.53:131
chr17	4701402	rs7468	C	T	2734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.709;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=41;PP=1610;ReadPosRankSum=0.534;SC=ATGCTACCTACCGGGAAGGCA;SOR=0.923;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=160;TCF=92;TCR=68;TR=103;WE=4701410;WS=4701392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,116:0.64:181
chr17	4710957	rs3867173	G	T	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=52;ReadPosRankSum=-1.472;SC=CGGTCAGGAGGCCGTGGGGGA;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=5;WE=4710965;WS=4710949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr17	4712314	rs3786043	G	A	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=1.013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.21;ReadPosRankSum=-0.236;SOR=0.468;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,23:0.35:66
chr17	4712395	rs1132446	A	T	2025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=33;PP=1163;ReadPosRankSum=0.779;SC=CTTTCCACAGATTTGCCGTTG;SOR=0.660;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=121;TCF=74;TCR=47;TR=80;WE=4712403;WS=4712373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,94:0.61:155
chr17	4712563	.	GTC	G	134.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.192;ClippingRankSum=0.000;DP=190;ExcessHet=3.0103;FS=4.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.06;MQRankSum=2.953;QD=0.77;ReadPosRankSum=-0.398;SOR=1.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:155,21:0.12:176
chr17	4712757	rs2286671	G	A	720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.642;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=22;PP=488;ReadPosRankSum=0.312;SC=AAAGCCAGGTGTCTCCTCCGG;SOR=0.613;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=144;TCF=74;TCR=70;TR=45;WE=4712765;WS=4712747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,46:0.28:163
chr17	4713981	rs7212512	A	G	736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.54;BaseQRankSum=-0.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=290;ReadPosRankSum=0.406;SC=TACACGCCCTATCCCTGTGCA;SOR=0.651;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=16;WE=4713989;WS=4713971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,33:0.67:49
chr17	4714021	rs3081314	G	GGAAA	4364.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=49.04;SOR=1.338;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr17	4718776	rs1132448	G	A	746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.661;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=17;PP=385;ReadPosRankSum=-3.193;SC=ACCAGGAGGAGGGTGTCCGTG;SOR=0.593;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=133;TCF=67;TCR=66;TR=38;WE=4718784;WS=4718766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,45:0.30:151
chr17	4719322	rs11658292	C	G	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=3.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.15;ReadPosRankSum=0.436;SOR=0.354;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,28:0.32:87
chr17	4720131	rs2302325	C	G	2251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.599;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=40;PP=1405;ReadPosRankSum=-0.515;SC=GAGGGGTCAACGGTGGTACAG;SOR=0.619;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=121;TCF=62;TCR=59;TR=86;WE=4720139;WS=4720121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,93:0.73:128
chr17	4720469	rs1052748	C	T	1402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=347;ExcessHet=3.0103;FS=7.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.04;ReadPosRankSum=-1.439;SOR=0.578;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:255,92:0.27:347
chr17	4722133	rs3764900	C	T	1917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.642;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=47;PP=1212;ReadPosRankSum=0.890;SC=GTGCTGGGGGCTGGGGGCTCA;SOR=0.789;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=134;TCF=60;TCR=74;TR=83;WE=4722141;WS=4722123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,90:0.62:144
chr17	4722299	rs2326097	T	C	573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=1;PP=412;SC=GTAGGAAGAGTTTCTGGAGTG;SOR=3.500;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=4722307;WS=4722293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	4722606	rs3764899	G	A	1414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=30;PP=917;ReadPosRankSum=0.306;SC=GCTGAGGCTCGTGTAGGGGTG;SOR=0.710;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=33;TCR=44;TR=53;WE=4722614;WS=4722596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,59:0.69:86
chr17	4750573	rs9890271	G	A	666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=20;PP=515;SC=ATGGAGTCTCGCTCAGGCTGG;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=4750581;WS=4750563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	4758174	rs73341669	C	A	3499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=61;PP=2059;SC=GAGTAAGAAGCGCTGAGAAAA;SOR=1.057;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=112;TCF=51;TCR=61;TR=112;WE=4758182;WS=4758164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr17	4778487	rs8078776	G	A	2737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=51;PP=1547;SC=AACTGAAGACGGATGAGATGA;SOR=1.562;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=33;TCR=51;TR=84;WE=4778495;WS=4778477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr17	4784194	.	C	CA	73.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.347;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=5.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.21;ReadPosRankSum=0.000;SOR=0.080;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr17	4795307	rs2586532	C	T	3246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=44;PP=1921;SC=TAACCCTGGACGTATTCACTA;SOR=1.071;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=65;TCR=44;TR=109;WE=4795315;WS=4795297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr17	4795619	rs36079581	TG	T	419.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=4;PP=357;SC=CCTACCCGCCTGGGGGTGGGA;SOR=1.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=11;WE=4795627;WS=4795609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	4835852	rs81663	A	T	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.378;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=302;ReadPosRankSum=1.605;SC=GGATGCTTCCAGGGGATGCAG;SOR=1.721;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=17;WE=4835860;WS=4835842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr17	4837210	.	A	G	272	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;FR=1.0000;HP=4;HapScore=2;MGOF=28;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=8;NR=6;PP=272;QD=21.9122294677;SC=CGACCACCCCAGAGCCCACCT;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=15;TCF=9;TCR=6;TR=14;WE=4837218;WS=4837200;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,14:0.93:15
chr17	4837952	rs199616811	A	AG	507.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=13;PP=548;SC=ACAGGGTGATAGGGAGGGGTC;SOR=3.383;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=4837960;WS=4837942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	4845768	rs238247	G	A	5878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=96;PP=2965;SC=CAAGGTTGCTGAATGAGGAAG;SOR=0.739;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=204;TCF=108;TCR=96;TR=204;WE=4845776;WS=4845758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr17	4846045	rs11871232	A	G	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.226;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=12;PP=314;ReadPosRankSum=-0.435;SC=AAAGAAGCCAATCCTTTAGGT;SOR=0.701;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=57;TCF=30;TCR=27;TR=23;WE=4846053;WS=4846035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,24:0.40:60
chr17	4856376	rs238238	A	G	3641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=54;PP=2032;SC=AACATCAACAATACTCTGGGC;SOR=0.708;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=118;TCF=64;TCR=54;TR=118;WE=4856384;WS=4856366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr17	4856580	rs238239	T	C	3068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=55;PP=1508;ReadPosRankSum=-0.948;SC=CTAAGCGTTGTGGATCAAGAA;SOR=0.660;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=186;TCF=103;TCR=83;TR=121;WE=4856588;WS=4856570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,139:0.66:212
chr17	4859102	.	T	TTGTCTCTGCTC	1191.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=20;PP=1918;SC=TGTCTCTGCCTTGTCTCTGCC;SOR=2.910;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=23;WE=4859110;WS=4859092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr17	4859156	.	C	T	114	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;FR=0.5016;HP=2;HapScore=4;MGOF=30;MMLQ=27;MQ=58.67;NF=5;NR=1;PP=114;QD=24.7952020912;SC=CTGTCTCTGCCCTGTCTCTGC;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=6;WE=4859175;WS=4859154;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr17	4859156	.	CCTGTCTCTGCT	C	162.94	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.59;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	4859167	.	T	C	291	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;FR=1.0000;HP=2;HapScore=4;MGOF=30;MMLQ=27;MQ=58.79;NF=8;NR=1;PP=291;QD=36.1968013941;SC=CTGTCTCTGCTCTGTCTCTGC;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=9;WE=4859175;WS=4859154;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,9:0.90:10
chr17	4863410	rs238224	A	G	4656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=80;NR=78;PP=2789;SC=CAAACTCCTGAAGAAGAGCAG;SOR=0.825;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=160;TCF=81;TCR=79;TR=158;WE=4863418;WS=4863400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr17	4875566	rs238230	T	C	4439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.547;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=81;PP=2366;ReadPosRankSum=-0.382;SC=CAGCGTCCTCTGGAGCAGCCC;SOR=0.631;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=154;TCF=73;TCR=81;TR=153;WE=4875574;WS=4875556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,171:0.99:172
chr17	4877120	rs238229	G	A	4326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=81;PP=2231;SC=CTGGCTTGAGGTGGCCTTGGC;SOR=1.348;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=135;TCF=54;TCR=81;TR=135;WE=4877128;WS=4877110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr17	4881776	rs376516	C	G	2663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=28;PP=1514;SC=AGTCCCTCCCCCTACGGTTCC;SOR=1.237;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=56;TCR=28;TR=84;WE=4881784;WS=4881766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr17	4882952	rs1859434	G	A	2505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.94;SOR=1.119;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr17	4883818	rs238234	C	G	1450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.37;SOR=0.808;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	4885982	rs238233	G	A	687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=4;PP=514;SC=AGCCCAGGTCGGGCTAGAGCC;SOR=2.494;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=22;WE=4885990;WS=4885972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	4886037	rs238232	A	G	2152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=21;PP=1432;SC=TGAGCTGAATATCTGACTCTC;SOR=1.641;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=47;TCR=21;TR=68;WE=4886045;WS=4886027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr17	4890843	rs8071428	T	C	1799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=13;PP=1316;SC=AGCTGCGCCCTCTGGCGCGGG;SOR=2.494;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=48;TCR=13;TR=61;WE=4890851;WS=4890833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr17	4891956	rs426475	G	A	1151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;SC=TCTCACCTACGTTATTTTTGT;SOR=1.005;Source=Platypus;TCF=18;WE=4891964;WS=4891946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr17	4893357	rs427703	G	C	4610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=71;PP=2965;SC=GAAATTAACCGCAGACTAGGG;SOR=0.782;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=76;TCR=71;TR=147;WE=4893365;WS=4893347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr17	4910337	rs35919356	G	A	818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.330;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=24;PP=503;ReadPosRankSum=2.505;SC=CCCCCAACACGGAGTCCCAGA;SOR=0.564;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=161;TCF=75;TCR=86;TR=48;WE=4910345;WS=4910327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,50:0.29:172
chr17	4926882	rs346828	A	G	2464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=44;NR=41;PP=1435;SC=CCCCCTCGCCACCACTGTCAA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=44;TCR=41;TR=85;WE=4926890;WS=4926872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr17	4927239	.	T	G	860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.055;ClippingRankSum=0.000;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.325;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=18;PP=474;ReadPosRankSum=-0.218;SC=ACTCCCTGGATGGAGGGGGCC;SOR=0.820;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=141;TCF=79;TCR=62;TR=42;WE=4927247;WS=4927229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,50:0.30:164
chr17	4936972	rs346821	G	A	5023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=80;PP=2924;SC=CAGCTGATGGGCCTCAGGGTC;SOR=0.737;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=168;TCF=88;TCR=80;TR=168;WE=4936980;WS=4936962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr17	4937575	rs346822	T	C	4825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=75;PP=2513;SC=CGGGGCCAGCTGCCTCCACAG;SOR=0.715;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=160;TCF=85;TCR=75;TR=160;WE=4937583;WS=4937555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr17	4937982	rs346824	T	C	879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=19;PP=571;SC=GATGCTTTGGTTCTTCTGGAA;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=10;TCR=19;TR=29;WE=4937990;WS=4937972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr17	5034048	rs11871054	A	G	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.748;NF=6;NR=17;PP=321;ReadPosRankSum=0.969;SC=GTTTGCTTTTAGAAAGGCCTT;SOR=0.680;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=62;TCF=18;TCR=44;TR=23;WE=5034056;WS=5034038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,22:0.34:65
chr17	5036205	rs80328123	A	C	1151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FS=5.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQRankSum=-10.082;QD=6.16;ReadPosRankSum=0.388;SOR=1.159;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:149,38:0.20:187
chr17	5036210	.	TC	GT	1127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.947;ClippingRankSum=0.000;DP=194;ExcessHet=3.0103;FS=6.726;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQRankSum=-10.098;QD=5.84;ReadPosRankSum=0.994;SOR=1.237;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:154,39:0.20:193
chr17	5036214	rs114647990	C	T	1415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FS=5.335;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQRankSum=-10.157;QD=6.87;ReadPosRankSum=1.378;SOR=1.192;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:165,41:0.20:206
chr17	5036224	rs72830922	C	G	1635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQRankSum=-8.967;QD=6.62;ReadPosRankSum=-0.772;SOR=0.841;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:186,61:0.25:247
chr17	5036249	rs140991770	G	T	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FS=2.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQRankSum=-1.936;QD=0.22;ReadPosRankSum=0.238;SOR=0.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:245,34:0.12:279
chr17	5036274	rs78465432	C	A	2489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FS=1.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQRankSum=-6.967;QD=8.86;ReadPosRankSum=2.815;SOR=0.592;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:205,76:0.27:281
chr17	5036281	rs76236903	G	C	2461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FS=2.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQRankSum=-6.819;QD=9.05;ReadPosRankSum=2.402;SOR=0.553;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:196,76:0.28:272
chr17	5036329	rs72830923	A	G	808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.202;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-3.768;NF=16;NR=25;PP=539;ReadPosRankSum=-1.667;SC=TCTCTGCAGAAACAGGGGACA;SOR=1.022;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=143;TCF=62;TCR=81;TR=41;WE=5036337;WS=5036319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,47:0.30:155
chr17	5036383	rs76207017	C	T	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQRankSum=-3.110;QD=1.60;ReadPosRankSum=1.983;SOR=0.539;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,7:0.17:41
chr17	5039318	rs12944361	T	C	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.097;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=40;ReadPosRankSum=0.230;SC=GCACACTCCTTGTGTTGCCAG;SOR=0.495;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=6;WE=5039326;WS=5039308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr17	5042346	rs11870506	C	A	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=1.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.67;ReadPosRankSum=-0.814;SOR=0.713;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,11:0.28:40
chr17	5042422	rs4080179	G	A	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.33;ReadPosRankSum=0.101;SOR=0.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,12:0.31:39
chr17	5042894	rs8073787	T	C	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.69;ReadPosRankSum=-0.717;SOR=0.747;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,23:0.28:82
chr17	5048207	rs2304447	A	G	857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=3.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.204;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-6.817;NF=9;NR=29;PP=674;ReadPosRankSum=1.700;SC=AAATGTTCTGACCACAAATAC;SOR=1.058;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=65;TCF=16;TCR=49;TR=38;WE=5048215;WS=5048197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,35:0.53:66
chr17	5058808	rs9899177	G	A	4114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=2.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.427;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.527;NF=72;NR=75;PP=2439;ReadPosRankSum=-1.534;SC=GTGCATACCCGGAAGAAAGAC;SOR=0.690;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=252;TCF=131;TCR=121;TR=147;WE=5058816;WS=5058798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,176:0.60:295
chr17	5066305	rs2307138	A	T	2410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.692;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.839;NF=31;NR=55;PP=1291;ReadPosRankSum=-1.655;SC=AAAGGGTAAGAATTTAGGGCC;SOR=0.591;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=123;TCF=45;TCR=78;TR=86;WE=5066313;WS=5066295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,108:0.71:152
chr17	5084763	rs1689965	G	A	5994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=108;PP=2965;SC=GTTTTCTCACGTTCTTCAAGT;SOR=1.091;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=192;TCF=84;TCR=108;TR=192;WE=5084771;WS=5084753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr17	5085893	rs4115657	C	T	3712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=69;ReadPosRankSum=-1.438;SC=CCCTAAGCTCCTCATCCTGGC;SOR=0.666;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=222;TCF=109;TCR=113;TR=139;WE=5085901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,166:0.64:258
chr17	5087040	rs9908414	A	G	2048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=42;PP=1325;ReadPosRankSum=1.019;SC=CTGATGTATAATAAGATTTGA;SOR=0.754;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=53;TCR=61;TR=78;WE=5087048;WS=5087030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,84:0.66:128
chr17	5087602	rs2641232	C	G	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-1.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=140;ReadPosRankSum=-0.644;SC=TTCTATAATTCCTAAAATACA;SOR=2.147;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=7;WE=5087610;WS=5087592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr17	5126674	rs2641256	A	G	5293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.588;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=57;PP=1819;ReadPosRankSum=0.293;SC=TGAGGCCCAGACCCACAGAGA;SOR=0.639;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=175;TCF=95;TCR=80;TR=124;WE=5126682;WS=5126664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,136:0.72:190
chr17	5126689	rs2585271	G	A	4864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.581;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=61;PP=1942;ReadPosRankSum=-0.116;SC=CAGAGACAACGATGATGGCCA;SOR=0.467;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=178;TCF=94;TCR=84;TR=123;WE=5126697;WS=5126679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,134:0.69:194
chr17	5126876	.	C	T	33	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=35;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=33;QD=22.5904041824;SC=CTCACTCTGTCGCCCAGGCTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=3;WE=5126884;WS=5126866;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr17	5235456	rs12941196	A	G	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.053;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=15;PP=350;ReadPosRankSum=1.533;SC=AGGTAAAGACAGAGAAAGATC;SOR=0.454;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=51;TCF=18;TCR=33;TR=25;WE=5235464;WS=5235446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,30:0.50:60
chr17	5266343	rs9903704	A	G	1127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FS=4.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.03;ReadPosRankSum=-0.156;SOR=0.447;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:152,72:0.32:224
chr17	5268356	rs71151866	TA	T	344.52	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.02;MQRankSum=0.605;QD=17.23;ReadPosRankSum=0.569;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,18:0.90:20
chr17	5421005	rs56750129	TC	AA	3345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=14;PP=2545;SC=TGTGCCCAGCTCCTTCATTGA;SOR=1.949;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=51;TCR=15;TR=62;WE=5421014;WS=5420995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr17	5424129	rs12946467	C	G	288.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=208;SC=AGCCCTGAGACCTGCCCCACA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=5424137;WS=5424119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	5424376	rs12944976	G	A	3100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=49;PP=1720;SC=CTTCTGCCCCGTGGAATGTGG;SOR=0.984;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=96;TCF=47;TCR=49;TR=96;WE=5424385;WS=5424366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr17	5425077	rs11651270	T	C	405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=10;PP=269;SC=AAGTGGGCCATTTGGAACAGG;SOR=1.244;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=6;TCR=10;TR=16;WE=5425085;WS=5425067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	5436263	rs2301582	C	T	6568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=105;NR=104;PP=2965;SC=GGAGAAGGCACGCACAAGAGT;SOR=0.922;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=209;TCF=105;TCR=104;TR=209;WE=5436271;WS=5436253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr17	5485367	rs12150220	A	T	1997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=34;NR=38;PP=1154;SC=TTGGTAGAGGAGTGAGGCAGA;SOR=0.976;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=34;TCR=38;TR=72;WE=5485375;WS=5485357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr17	5998691	rs41314095	C	G	508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=13;PP=386;SC=AGGCAGGCACCAGGTACCACA;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=5998699;WS=5998681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	6014176	rs2302837	A	G	3903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=77;PP=2343;SC=CCGGGAACACATGGGCACGGC;SOR=1.125;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=137;TCF=60;TCR=77;TR=136;WE=6014184;WS=6014166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
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chr17	6331836	rs12453262	T	G	941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.658;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=23;PP=582;ReadPosRankSum=1.156;SC=GCTGTGGGGATAAACGGATGG;SOR=0.336;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=133;TCF=56;TCR=77;TR=46;WE=6331844;WS=6331826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,51:0.35:146
chr17	6350727	rs12947546	C	T	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.730;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=12;PP=318;ReadPosRankSum=-2.321;SC=TGAGCCACCGCGCCCGGCCTA;SOR=0.497;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=87;TCF=55;TCR=32;TR=30;WE=6350735;WS=6350717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,34:0.34:99
chr17	6352863	rs34107703	C	T	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.421;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=191;ReadPosRankSum=-1.139;SC=GCCTCAGTCTCCCTCATCTCA;SOR=0.158;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=47;TCF=10;TCR=37;TR=17;WE=6352871;WS=6352853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,17:0.33:51
chr17	6353679	rs7218283	A	C	4490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=83;NR=61;PP=2434;SC=CTCTGTCTTGAAGGAAACAAG;SOR=0.777;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=83;TCR=61;TR=144;WE=6353687;WS=6353669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr17	6364753	rs11654099	A	G	1873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=40;PP=1116;ReadPosRankSum=-1.292;SC=GCACCAGCCCATCGGAGAAGA;SOR=0.685;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=141;TCF=73;TCR=68;TR=83;WE=6364761;WS=6364743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,91:0.58:156
chr17	6371738	rs35021251	A	G	1043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.112;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=26;PP=641;ReadPosRankSum=-1.342;SC=AGTGCCCACCAGCTTGTGGCC;SOR=1.054;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=64;TCF=27;TCR=37;TR=42;WE=6371746;WS=6371728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,46:0.64:72
chr17	6371780	rs34536093	T	A	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.760;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=105;ReadPosRankSum=0.964;SC=CCCCCCAACCTCACAGCCTGG;SOR=0.343;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=22;TCF=7;TCR=15;TR=11;WE=6371788;WS=6371770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr17	6373737	rs11654175	C	T	2050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=45;PP=1165;ReadPosRankSum=-1.004;SC=GACTGTGGGTCGGAGAGGAAG;SOR=0.712;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=163;TCF=88;TCR=75;TR=97;WE=6373745;WS=6373727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,105:0.57:185
chr17	6377986	rs12452411	T	C	556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=13;PP=363;SC=TGCGGGAGTGTTCACACAGCA;SOR=2.419;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=16;WE=6377994;WS=6377976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	6381939	rs938288	G	A	4092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=73;NR=66;PP=2227;SC=GCTCGATGACGGTGGCGACAG;SOR=0.744;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=139;TCF=73;TCR=66;TR=139;WE=6381947;WS=6381929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr17	6387482	rs11656015	G	C	2406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=20;PP=1648;SC=GAGGGCTCTTGCTAAAATCCT;SOR=2.133;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=56;TCR=20;TR=76;WE=6387490;WS=6387472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr17	6406731	rs3809836	T	C	105.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=0;PP=79;SC=GCAGGCAAGATGGCAGGGATC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=6406739;WS=6406721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	6428620	rs3809834	C	G	815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=17;NR=8;PP=411;SC=GCCCTACAGCCCCCCCTGCAA;SOR=1.214;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=25;WE=6428628;WS=6428610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr17	6441164	rs165106	T	C	585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=1;PP=449;SC=TCTTGGCACATCCACAGGATG;SOR=3.611;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=6441172;WS=6441154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	6483046	rs3744720	T	C	1915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=20;PP=1174;SC=GTGACACAAATGGCCTCGCCT;SOR=1.678;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=68;TCF=47;TCR=21;TR=66;WE=6483054;WS=6483036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr17	6493056	rs367918	T	C	336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=0;PP=207;SC=TCTAAAATTTTGCAATTTGGT;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=6493064;WS=6493046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	6493198	rs1443417	T	C	2848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=38;PP=1464;SC=GATGCTGTGCTGCATACCCGG;SOR=0.811;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=52;TCR=38;TR=90;WE=6493206;WS=6493188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr17	6493391	rs2278646	C	T	668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=17;PP=483;SC=TGTTAATTTACCCTCATGGTT;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=22;WE=6493399;WS=6493381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	6503518	rs2289640	C	T	346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=259;SC=CCCCTTGTCCCTTTATCTCTA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=6503526;WS=6503515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	6511781	rs4796519	A	G	1503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=28;PP=893;SC=TTAGCCATGCAGCACTGAAAT;SOR=1.445;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=18;TCR=28;TR=46;WE=6511789;WS=6511771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr17	6513329	rs2304977	G	A	1828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=17;PP=1189;SC=AGGAGACGCTGGTGGGGATGT;SOR=1.681;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=42;TCR=17;TR=59;WE=6513337;WS=6513319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr17	6515387	rs2289642	A	G	7061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=114;NR=121;PP=2965;SC=TCCTTCTTCCAGAACTATATC;SOR=0.853;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=235;TCF=114;TCR=121;TR=235;WE=6515395;WS=6515377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,268:1.00:268
chr17	6515454	rs2289643	C	T	3935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=75;PP=2144;SC=AGCTCCGTATCGGGCTGATAC;SOR=1.308;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=48;TCR=75;TR=123;WE=6515462;WS=6515444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr17	6515531	rs79749671	T	C	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.948;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=216;ReadPosRankSum=-0.611;SC=TTGCTGAGAATGATTATCTAC;SOR=1.931;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=13;WE=6515539;WS=6515521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,17:0.71:24
chr17	6524298	rs9889363	T	A	1249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=30;PP=807;SC=ACAGTTTCTTTTCCAGGAGAG;SOR=1.931;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=13;TCR=30;TR=43;WE=6524306;WS=6524288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr17	6524358	rs8074991	G	A	315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=229;SC=AGTTTATCTCGCAAAAGTATG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=6524366;WS=6524348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	6531648	rs2072149	A	G	3931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=51;PP=2446;SC=CTTTGGCACCAGAGCTGGAGA;SOR=0.971;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=75;TCR=51;TR=126;WE=6531656;WS=6531638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr17	6553410	.	TA	T	171.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.688;ClippingRankSum=0.000;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=1.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.13;MQRankSum=1.879;QD=2.23;ReadPosRankSum=-0.918;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,19:0.25:77
chr17	6555546	rs56268735	C	CG	8130.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=25;NR=67;PP=2974;SC=CCCGACCCCGCGGCCAAGCCG;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=102;TCF=28;TCR=74;TR=92;WE=6555554;WS=6555536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr17	6558768	rs8078913	C	T	1610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=38;NR=15;PP=1028;SC=ATTCCTTCTTCCTGCGTGTTT;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=38;TCR=15;TR=53;WE=6558776;WS=6558758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr17	6562141	rs17842437	G	A	36.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=18.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr17	6596497	.	AACACACACAC	A	325.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=0.000;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.36;ReadPosRankSum=-1.087;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr17	6659324	rs3785793	A	G	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=3.385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.41;ReadPosRankSum=0.505;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,10:0.21:48
chr17	6662948	rs3833979	GGT	GGTGT,G	157.70	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=5,5;NR=0,0;PP=139,103;ReadPosRankSum=-0.140;SC=ACCCACATCTGGTGTGTGTGT;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=5,5;WE=6662957;WS=6662938;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.64:11
chr17	6704121	rs2271233	C	T	1872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.627;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=25;PP=895;ReadPosRankSum=-1.131;SC=TATTGTGCGACATCACGACAC;SOR=0.631;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=125;TCF=81;TCR=44;TR=73;WE=6704129;WS=6704111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,89:0.61:146
chr17	6716385	rs8081510	T	C	1269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=31;PP=868;ReadPosRankSum=-0.272;SC=GAAACAGACCTCACGCTTTCA;SOR=0.757;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=82;TCF=33;TCR=49;TR=52;WE=6716393;WS=6716375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,56:0.64:87
chr17	6733672	rs8078571	T	C	1100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.636;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=30;PP=668;ReadPosRankSum=1.624;SC=GGAACTTGGGTGGAGGTTGTA;SOR=0.392;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=60;TCF=23;TCR=37;TR=50;WE=6733680;WS=6733662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,51:0.78:65
chr17	6899559	rs312467	C	G	552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=12;PP=313;SC=AGCTGCGGCCCGCGCGGGGCG;SOR=1.127;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=8;TCR=12;TR=20;WE=6899567;WS=6899549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	6900076	rs2073438	G	A	1099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.86;ReadPosRankSum=0.868;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,51:0.69:74
chr17	6900383	rs312468	T	C	76.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=3;PP=55;SC=GCACAAGGTCTCGGGAACTGC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=6900391;WS=6900373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	6902179	rs312470	G	A	3252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=58;NR=47;PP=1812;SC=CTAGACCTCGGAGTGAAATAA;SOR=0.710;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=58;TCR=47;TR=105;WE=6902187;WS=6902169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr17	6904934	rs434473	A	G	2232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=23;PP=1360;ReadPosRankSum=0.271;SC=CAGCCTCCCAACCCCAGCTCT;SOR=1.525;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=76;TCF=52;TCR=24;TR=74;WE=6904942;WS=6904924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,82:0.98:84
chr17	6909379	rs3934010	C	G	294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.56;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	6919093	rs14309	T	C	3422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=72;NR=45;PP=1904;SC=CTTCTGACAGTGCGAAGTGGA;SOR=1.075;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=117;TCF=72;TCR=45;TR=117;WE=6919101;WS=6919083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr17	6927350	rs312461	A	G	571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=14;NR=6;PP=336;SC=GAAGCTGCGCATGTCTCCCTT;SOR=1.426;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=20;WE=6927358;WS=6927340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	6928019	rs146207245	C	CCAG	2828.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.469;NF=4;NR=31;PP=1638;ReadPosRankSum=-3.230;SC=GACGAGGCCTCCAGCAGCAGC;SOR=0.683;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=63;TCF=8;TCR=55;TR=35;WE=6928027;WS=6928009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,73:0.84:87
chr17	6929924	rs379478	T	C	5103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=92;NR=69;PP=2929;SC=TTGCCAGTCATCGTACAGTGC;SOR=0.814;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=161;TCF=92;TCR=69;TR=161;WE=6929932;WS=6929914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr17	6933217	rs421264	T	G	835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=17;PP=482;SC=GTGTGGAGGCTGCAGGGAGAA;SOR=1.473;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=27;TCF=10;TCR=17;TR=27;WE=6933225;WS=6933207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	6942108	rs11078663	C	T	3803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.473;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=71;PP=2340;ReadPosRankSum=0.598;SC=TGGCCTTCTCCGTGCTGCCTG;SOR=0.633;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=229;TCF=124;TCR=105;TR=149;WE=6942116;WS=6942098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,168:0.65:260
chr17	6943266	rs4796576	G	A	1031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=22;PP=571;SC=CCAAGGAGGGGCTGGAAGAGG;SOR=1.292;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=37;TCF=15;TCR=22;TR=36;WE=6943274;WS=6943256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr17	7011064	rs199979065	GCACACTACACACACCGCACACGTA	G	3422.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=1.711;NF=9;NR=30;PP=2974;ReadPosRankSum=0.724;SC=ACGCACACGTGCACACTACAC;SOR=0.990;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=53;TCF=13;TCR=40;TR=39;WE=7011095;WS=7011054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,90:0.98:92
chr17	7011144	rs62058755	G	A	5590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;MQRankSum=0.823;NF=104;NR=95;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.154;SC=ACACCCCGGAGGCTCTCTGAC;SOR=0.721;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=201;TCF=105;TCR=96;TR=199;WE=7011152;WS=7011134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,215:0.99:217
chr17	7011722	rs62061385	G	A	891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.764;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=14;PP=626;ReadPosRankSum=0.107;SC=TTGCAGACTCGGCACTGAGCC;SOR=1.194;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=33;TCR=18;TR=39;WE=7011730;WS=7011712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,39:0.75:52
chr17	7017350	rs10459915	A	G	922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.469;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=6;PP=553;ReadPosRankSum=-0.623;SC=CTGTTCACAGAGTGGGTGCGG;SOR=1.203;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=63;TCF=46;TCR=17;TR=34;WE=7017358;WS=7017340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,40:0.57:70
chr17	7017420	rs10459916	G	A	1597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=2.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.31;ReadPosRankSum=-2.265;SOR=0.946;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,73:0.61:120
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chr17	7111624	rs178471	T	C	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.39;ReadPosRankSum=0.396;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,5:0.20:25
chr17	7121785	rs2521985	T	C	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.641;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=4;PP=38;ReadPosRankSum=1.590;SC=AAATGATCTCTGGGCTCCCAA;SOR=0.317;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=32;TCF=19;TCR=13;TR=7;WE=7121793;WS=7121775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,8:0.23:35
chr17	7123240	rs139223575	T	TGGGCGTGCAGGACGC	1913.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=2.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.20;MQRankSum=2.275;QD=13.97;ReadPosRankSum=2.092;SOR=0.937;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,51:0.37:137
chr17	7127718	rs17671352	T	C	1006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.823;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=32;PP=530;ReadPosRankSum=-0.754;SC=AGCTGGTAAGTGGCCAGGGGT;SOR=1.031;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=157;TCF=71;TCR=86;TR=52;WE=7127726;WS=7127708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,59:0.34:173
chr17	7129840	rs35594616	T	C	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.862;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=16;PP=405;ReadPosRankSum=0.499;SC=GGGCAGGGTATTGGTAGGAGA;SOR=0.414;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=86;TCF=40;TCR=46;TR=32;WE=7129848;WS=7129830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,34:0.35:96
chr17	7129974	rs2074222	A	G	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=2.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.63;ReadPosRankSum=-0.370;SOR=0.965;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,21:0.27:78
chr17	7132556	rs222837	C	T	1182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.610;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=21;PP=618;ReadPosRankSum=-0.298;SC=GCTCATTGCTCTGGCCAACAA;SOR=0.785;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=129;TCF=74;TCR=55;TR=50;WE=7132564;WS=7132546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,60:0.39:154
chr17	7133162	rs222836	G	A	689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=17;PP=347;ReadPosRankSum=0.467;SC=AGTCCCCCAGGCTGGTACTCT;SOR=0.677;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=96;TCF=48;TCR=48;TR=33;WE=7133170;WS=7133152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,39:0.35:111
chr17	7133609	rs2074216	G	A	974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=25;ReadPosRankSum=1.280;SC=CTCACTGGAAGGATGGAGGCC;SOR=0.695;SbPval=0.55;Source=Platypus;TCF=56;TR=44;WE=7133617;WS=7133599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,52:0.34:153
chr17	7134129	rs222835	A	G	1448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.951;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=45;PP=975;ReadPosRankSum=0.619;SC=GCCAAGCGACAAGGTAGAGGT;SOR=0.767;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=286;TCF=141;TCR=145;TR=86;WE=7134137;WS=7134119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:212,92:0.30:304
chr17	7139238	rs222851	G	A	4630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.393;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=95;PP=2925;ReadPosRankSum=-0.260;SC=GCCCCAGCCCGAACCTCTCAC;SOR=0.593;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=288;TCF=144;TCR=144;TR=190;WE=7139246;WS=7139228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,210:0.65:322
chr17	7140606	rs222852	A	G	1112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.887;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=10;PP=686;ReadPosRankSum=-1.006;SC=ATAATTTCTAAGGGCCTCCTT;SOR=0.840;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=70;TCF=49;TCR=21;TR=39;WE=7140614;WS=7140596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,48:0.59:81
chr17	7145492	rs58574748	C	CA	1444.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.206;NF=15;NR=9;PP=942;ReadPosRankSum=0.125;SC=CTGCCTGTCCCGATCCAAGGC;SOR=0.660;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=37;TCF=24;TCR=13;TR=24;WE=7145500;WS=7145482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,42:0.69:61
chr17	7150552	rs2074217	A	G	698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=16;PP=456;ReadPosRankSum=-0.567;SC=ACCCAGAGCTAGCCCCTACTT;SOR=0.689;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=124;TCF=73;TCR=51;TR=39;WE=7150560;WS=7150542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,42:0.31:137
chr17	7154534	rs414206	G	A	1172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=37;PP=783;ReadPosRankSum=-0.565;SC=TGCCTCCGCAGAAGGTAAATG;SOR=0.701;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=169;TCF=65;TCR=104;TR=58;WE=7154542;WS=7154524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,63:0.34:185
chr17	7156186	rs2074218	A	G	1534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.881;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=36;PP=852;ReadPosRankSum=1.291;SC=CCTACCCTGGATAGGGCACCT;SOR=0.524;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=235;TCF=135;TCR=100;TR=78;WE=7156194;WS=7156176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:181,88:0.33:269
chr17	7156447	rs2074219	A	G	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=124;ReadPosRankSum=-0.233;SC=TTGGATATGGATCTTTCAGGA;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=8;WE=7156455;WS=7156437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr17	7158203	rs402514	T	G	936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=3.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.06;MQRankSum=1.440;QD=5.61;ReadPosRankSum=0.337;SOR=0.448;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:112,55:0.33:167
chr17	7163739	rs4562	A	G	1755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.614;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=31;PP=1061;ReadPosRankSum=-0.971;SC=AGAGCGGGGTACACGGTACCC;SOR=0.841;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=231;TCF=135;TCR=96;TR=78;WE=7163747;WS=7163717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,87:0.35:252
chr17	7165395	rs56219105	CG	C	470.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=321;ReadPosRankSum=-0.282;SC=GGGCGCCGGGCGGGGAGACCC;SOR=0.654;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=42;TCF=3;TCR=39;TR=12;WE=7165403;WS=7165385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,20:0.33:60
chr17	7166660	rs77549883	C	T	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=254;ReadPosRankSum=-0.652;SC=CACACTCGCCCGTTTCTCTTT;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=16;WE=7166668;WS=7166650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr17	7185092	rs5418	G	A	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=59;ReadPosRankSum=0.792;SC=TGCTCTCCGGGTCCTTGGCTT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=4;WE=7185100;WS=7185083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr17	7185788	rs222848	T	C	3664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=53;PP=2201;ReadPosRankSum=1.516;SC=CCCCCCCTCCTCCAGCTCAGG;SOR=0.721;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=124;TCF=70;TCR=54;TR=122;WE=7185796;WS=7185767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,144:0.99:146
chr17	7185861	rs222849	T	C	2438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=43;NR=36;PP=1310;SC=CCCCTCACACTACCTTCCTGC;SOR=0.782;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=43;TCR=36;TR=79;WE=7185869;WS=7185851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr17	7187123	rs5435	T	C	4256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=63;PP=2318;SC=GCCTGGCCAATGCTGCTGCCT;SOR=0.866;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=141;TCF=78;TCR=63;TR=141;WE=7187131;WS=7187113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr17	7192091	rs222842	C	T	2701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=50;NR=39;PP=1400;SC=TGGGTGTCCTCTGAGTTGAGT;SOR=0.839;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=50;TCR=39;TR=89;WE=7192099;WS=7192081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr17	7192198	rs222841	T	G	1484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=26;PP=770;SC=GTTCTTTTTGTTTTTGAGACA;SOR=1.302;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=20;TCR=26;TR=46;WE=7192206;WS=7192188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr17	7193055	rs3833134	GA	G	2462.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=755;SC=CTAAGGCAAGGAACAAGGCTC;SOR=1.101;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=19;WE=7193068;WS=7193045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr17	7193060	rs55781423	A	G	2470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.92;SOR=1.159;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr17	7193255	rs3744405	G	A	497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=11;NR=2;PP=294;SC=ACACTGGAAGGGGAAGACCAA;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=13;WE=7193263;WS=7193245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	7193448	rs222838	A	G	2511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=43;NR=45;PP=1404;SC=CTGGAGCCAGATTATCCACAG;SOR=0.941;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=43;TCR=45;TR=88;WE=7193456;WS=7193438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr17	7194010	rs2521992	C	T	195.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=156;SC=GTGGAATGTGCTTGCACCCAT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=7194018;WS=7194000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	7197633	rs8069533	A	G	189.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=2;PP=55;SC=GGGGTGCGGGAGCCCGGCGCC;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=7197641;WS=7197623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	7197794	rs222859	C	A	216.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=3;PP=75;SC=CGCTGTAGCCCCCGCTGCCGC;SOR=0.892;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=6;WE=7197802;WS=7197784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	7213352	rs78916808	G	A	1099.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FS=3.173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.26;ReadPosRankSum=0.413;SOR=0.894;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:189,69:0.27:258
chr17	7217944	rs62059197	G	A	3556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.092;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.011;NF=73;NR=68;PP=2208;ReadPosRankSum=1.835;SC=ATGAAGAAGAGGCAGGGTAGT;SOR=0.512;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=213;TCF=115;TCR=98;TR=141;WE=7217952;WS=7217934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,158:0.67:236
chr17	7225425	rs2062771	T	C	1420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=36;PP=880;SC=GAAATGGGGATGCCAACGCCC;SOR=2.259;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=13;TCR=36;TR=49;WE=7225433;WS=7225415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	7228469	.	GCC	G	76	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=17;HapScore=4;MGOF=9;MMLQ=27;MQ=63.51;NF=2;NR=0;PP=76;QD=40.5;SC=TCCTTGCCCCGCCCCCCCCCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=2;WE=7228487;WS=7228459;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,2:0.33:6
chr17	7228479	.	C	T	44	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=12;HapScore=4;MGOF=9;MMLQ=27;MQ=64.19;NF=2;NR=0;PP=44;QD=39.3856062736;SC=GCCCCCCCCCCCCCATTAGAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=2;WE=7228487;WS=7228459;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:3,2:0.40:5
chr17	7230845	rs11655578	G	T	854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=19;PP=577;ReadPosRankSum=1.194;SC=GATGGGAGTAGGGGGGCTGAA;SOR=0.727;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=58;TCR=47;TR=42;WE=7230853;WS=7230835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,44:0.39:113
chr17	7245371	rs4796407	A	G	1607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=40;PP=996;ReadPosRankSum=-0.037;SC=TGGGTCCACCAGAGCCCATGA;SOR=0.656;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=44;TCR=64;TR=68;WE=7245379;WS=7245361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,72:0.62:117
chr17	7246940	rs3809829	T	G	2054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.008;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=31;PP=1052;ReadPosRankSum=-0.014;SC=CCTCGAGGCTTGGGGGTCTCC;SOR=0.743;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=123;TCF=69;TCR=54;TR=76;WE=7246948;WS=7246930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,92:0.63:147
chr17	7249870	rs11657406	G	T	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.384;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=302;ReadPosRankSum=-0.192;SC=AATCTGAAAGGCAGGGCCCAC;SOR=0.156;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=18;WE=7249878;WS=7249860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr17	7251605	rs2292066	G	C	2688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.334;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=45;PP=1723;ReadPosRankSum=2.601;SC=GGAAGACTGCGTGCTTCTCCC;SOR=0.556;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=148;TCF=89;TCR=59;TR=103;WE=7251613;WS=7251595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,113:0.68:165
chr17	7253659	rs2292068	T	C	80.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.01;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	7254315	rs35985803	G	A	937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.979;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=27;PP=538;ReadPosRankSum=-0.323;SC=CCAGGGGCAGGCAGGTAAAGA;SOR=0.949;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=144;TCF=70;TCR=74;TR=47;WE=7254323;WS=7254305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,54:0.35:155
chr17	7258481	rs72840988	C	T	192.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=1;PP=142;SC=GAGCATTCCTCGGCTCAGCTG;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=7258489;WS=7258471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	7259073	rs6503016	C	T	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=341;ReadPosRankSum=-0.925;SC=GACAGGAGGGCTGATCAGGGA;SOR=0.802;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=24;TCF=13;TCR=11;TR=9;WE=7259091;WS=7259063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr17	7259083	rs144825300	A	AG	94.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.128;HP=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;ReadPosRankSum=0.117;SC=CTGATCAGGGAGGGGCTGCGT;SOR=1.688;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=23;TCF=15;TCR=8;TR=5;WE=7259091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr17	7286266	rs1554947	C	T	2151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.446;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=36;PP=1391;ReadPosRankSum=-0.561;SC=AGGCTGGCTCCCTGTGGCTAC;SOR=1.007;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=127;TCF=72;TCR=55;TR=87;WE=7286274;WS=7286256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,92:0.68:135
chr17	7290787	rs5819155	TG	T	5896.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=82;PP=2974;SC=GTGGGTGTGGTGGACTCCAGA;SOR=1.122;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=94;TCF=9;TCR=85;TR=91;WE=7290795;WS=7290777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr17	7290821	rs968580	T	C	3565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=76;PP=2375;SC=TCAAGACCAGTCCTTCAATTC;SOR=1.353;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=48;TCR=76;TR=124;WE=7290829;WS=7290811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr17	7292107	rs6503018	G	A	4652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=72;PP=2965;SC=TCTGTCACAGGTGGAGCTGAG;SOR=0.867;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=162;TCF=90;TCR=72;TR=161;WE=7292115;WS=7292097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
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chr17	7296742	rs201903232	C	T	3103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.751;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=55;PP=1692;ReadPosRankSum=2.166;SC=GCCCACCATCCGGGCCACCAT;SOR=0.545;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=165;TCF=89;TCR=76;TR=115;WE=7296750;WS=7296732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,134:0.72:187
chr17	7297452	rs4613118	A	G	1834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=31;PP=979;ReadPosRankSum=0.361;SC=GGGGTTTTCGAGATGATGGTG;SOR=0.759;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=61;TCR=45;TR=73;WE=7297460;WS=7297442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,81:0.69:117
chr17	7306727	rs17882626	A	G	2019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.210;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=44;PP=1146;ReadPosRankSum=0.076;SC=AAAAACAGAAACGAAGGGATG;SOR=0.492;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=59;TCR=67;TR=84;WE=7306735;WS=7306717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,93:0.64:145
chr17	7307074	rs71370494	G	C	657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.050;SOR=0.502;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,35:0.56:63
chr17	7307287	rs9900153	T	C	2512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.868;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=42;PP=1530;ReadPosRankSum=-1.541;SC=ACGCCCCAAGTACAGTCCCAT;SOR=0.818;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=164;TCF=92;TCR=72;TR=102;WE=7307295;WS=7307277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,114:0.62:185
chr17	7317647	rs60631713	A	AC	2980.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=21;PP=1551;SC=CCACCTGCCCACCCCTCCCCA;SOR=1.119;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=44;TCF=22;TCR=22;TR=39;WE=7317655;WS=7317637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr17	7318061	rs78355381	T	C	3160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.047;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=51;PP=1542;ReadPosRankSum=0.874;SC=GCTGGCTCAGTGAAAACATCG;SOR=0.601;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=203;TCF=123;TCR=80;TR=124;WE=7318069;WS=7318051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,146:0.62:234
chr17	7318396	rs2241233	C	T	3512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=53;PP=1798;SC=GAGAGGACAGCGCTGAAGCTG;SOR=0.801;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=115;TCF=62;TCR=53;TR=115;WE=7318404;WS=7318386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr17	7318559	rs6503019	G	A	666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=16;PP=471;SC=TGGCAAGGAGGGATGGGCTTC;SOR=1.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=23;WE=7318567;WS=7318549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	7329134	rs72842820	G	A	2399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.175;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.627;NF=48;NR=45;PP=1198;ReadPosRankSum=-0.470;SC=TGGCATCAACGTGGCAACTAT;SOR=0.425;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=135;TCF=65;TCR=70;TR=93;WE=7329142;WS=7329124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,112:0.71:158
chr17	7329632	rs13290	T	G	4267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.831;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=100;PP=2640;ReadPosRankSum=0.094;SC=CTCCTCTTTCTCCTGCCACCA;SOR=0.904;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=293;TCF=139;TCR=154;TR=184;WE=7329640;WS=7329622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,199:0.63:314
chr17	7345819	rs4151129	A	AGGTAC	457.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=1.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=481;ReadPosRankSum=1.094;SC=TCCCCCAAAAAGGATTTGTGC;SOR=1.781;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=7;WE=7345827;WS=7345809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr17	7346302	rs3853818	T	C	1528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.515;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=21;PP=943;ReadPosRankSum=-1.370;SC=AGGGTGAATGTACGGGAAGGG;SOR=1.009;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=97;TCF=60;TCR=37;TR=60;WE=7346310;WS=7346292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,68:0.60:113
chr17	7350544	rs2302767	G	A	2217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.391;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=50;PP=1286;ReadPosRankSum=-1.650;SC=CTGACTCCCCGGCGACTCCCA;SOR=0.999;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=122;TCF=53;TCR=69;TR=85;WE=7350552;WS=7350534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,98:0.69:142
chr17	7357864	rs7210231	C	A	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=213;ReadPosRankSum=0.234;SC=CTCCTCCAACCCCAATTTTCC;SOR=0.910;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=14;WE=7357872;WS=7357854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr17	7358520	rs2302761	C	T	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=317;ReadPosRankSum=1.393;SC=CGGGAATGGGCATGTGGAGTG;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=16;WE=7358528;WS=7358510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,15:0.79:19
chr17	7358803	rs7214344	G	A	1873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=34;PP=1087;SC=ACCCACATAAGAGGGAGAGGG;SOR=0.980;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=27;TCR=34;TR=61;WE=7358811;WS=7358793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr17	7358861	rs2302762	T	C	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=211;ReadPosRankSum=-0.758;SC=GCCCATGCTCTCGGAAGACGC;SOR=0.793;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=29;TCF=11;TCR=18;TR=15;WE=7358869;WS=7358851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr17	7360110	rs2302764	T	C	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.227;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=16;PP=325;ReadPosRankSum=-1.191;SC=TGTCAAGCCCTATCCTTCTCT;SOR=0.196;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=68;TCF=15;TCR=53;TR=24;WE=7360118;WS=7360100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,27:0.35:77
chr17	7366348	rs78260319	A	C	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=13;PP=548;ReadPosRankSum=0.683;SC=ATTCCTCCTCATCCTCCTCCT;SOR=0.705;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=73;TCF=42;TCR=31;TR=32;WE=7366356;WS=7366335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,29:0.40:72
chr17	7366619	rs34914463	T	C	2375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=47;PP=1390;ReadPosRankSum=-1.962;SC=AGCCCGTGGATTCCGGCCCTT;SOR=0.681;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=68;TCR=70;TR=94;WE=7366627;WS=7366609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,106:0.69:154
chr17	7369851	.	AGAG	A	31.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.712;ClippingRankSum=0.000;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.86;ReadPosRankSum=1.842;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,4:0.11:37
chr17	7385174	rs8065577	G	C	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=94;ReadPosRankSum=-1.307;SC=TTCTAGCTCCGAAGAGTTCCT;SOR=0.340;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=7;WE=7385182;WS=7385173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr17	7385204	rs9891297	T	C	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=247;ReadPosRankSum=-0.547;SC=AGCCCAACACTGTACAGTCCC;SOR=0.656;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=13;WE=7385212;WS=7385194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr17	7385871	rs11658286	G	A	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.483;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=46;ReadPosRankSum=-0.202;SC=TGTCTACACCGCCCTGGGCTA;SOR=0.646;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=16;TCF=6;TCR=10;TR=6;WE=7385879;WS=7385861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr17	7399866	rs2301609	G	A	2507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.904;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=49;PP=1367;ReadPosRankSum=0.388;SC=GCGAGGGTGGGGAGGAGATGG;SOR=0.801;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=146;TCF=76;TCR=70;TR=100;WE=7399874;WS=7399856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,115:0.68:169
chr17	7400041	rs9890920	C	T	760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.219;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=11;PP=508;ReadPosRankSum=0.201;SC=AGGGAAATGGCCCACCCTCTG;SOR=0.383;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=81;TCF=59;TCR=22;TR=35;WE=7400049;WS=7400031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,37:0.41:90
chr17	7400137	rs9898024	T	C	7970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=147;NR=124;PP=2965;SC=TGGCCTAGAGTTGTATGCGGA;SOR=0.820;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=271;TCF=147;TCR=124;TR=271;WE=7400145;WS=7400127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,298:1.00:298
chr17	7402556	rs2277638	G	A	1287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.665;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=33;PP=767;ReadPosRankSum=0.253;SC=TCAAGGTTTCGCTGCAGACAT;SOR=0.675;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=220;TCF=117;TCR=103;TR=65;WE=7402564;WS=7402546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:177,76:0.30:253
chr17	7402600	rs2228129	T	C	1127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FS=2.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.19;ReadPosRankSum=0.489;SOR=0.705;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:196,73:0.27:269
chr17	7403942	rs12936464	A	C	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.980;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=155;ReadPosRankSum=-0.081;SC=TGTCTGCCTTACTCTTTGTCT;SOR=0.582;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=9;WE=7403950;WS=7403932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr17	7404107	rs7217707	T	C	7069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=126;NR=106;PP=2965;SC=GTACCCACAGTACCCATCCCG;SOR=0.821;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=233;TCF=126;TCR=107;TR=232;WE=7404115;WS=7404097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
chr17	7404209	rs6503030	G	A	5463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=99;PP=2965;SC=GAATTTGGACGTGGGAGCCAG;SOR=0.902;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=188;TCF=89;TCR=99;TR=188;WE=7404217;WS=7404199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr17	7404991	rs2228130	T	C	5388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=84;PP=2965;SC=CTGAATACAATAACTTCAAGT;SOR=0.745;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=181;TCF=96;TCR=85;TR=180;WE=7404999;WS=7404981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr17	7405074	rs8075218	C	T	783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.837;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=17;ReadPosRankSum=-0.346;SC=TTTCCATATACGGGGCCGCTG;SOR=0.714;Source=Platypus;TCF=58;TR=39;WE=7405082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,42:0.33:127
chr17	7406343	rs9890028	T	C	265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=231;SC=ACCACTGTACTTGGTCGGCTG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=7406351;WS=7406340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	7411770	rs2228132	C	T	2294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.246;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=48;PP=1270;ReadPosRankSum=-0.850;SC=TGGGCCAGTCCGCTCGAGATG;SOR=1.023;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=127;TCF=65;TCR=62;TR=90;WE=7411778;WS=7411760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,102:0.68:149
chr17	7411855	rs4796432	A	G	1143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=25;PP=724;SC=TCAACTGGGTATGGTGGCTCA;SOR=2.191;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=35;WE=7411863;WS=7411845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr17	7412212	rs9889368	A	G	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=11;PP=406;ReadPosRankSum=1.637;SC=GTTAGAAGAGACGTTTAGAGC;SOR=0.733;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=85;TCF=54;TCR=31;TR=31;WE=7412220;WS=7412202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,31:0.34:91
chr17	7413038	rs2269459	A	G	1211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.161;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=29;PP=689;ReadPosRankSum=0.218;SC=TGCAATCAACATTGAGGGGCG;SOR=0.414;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=71;TCF=26;TCR=45;TR=48;WE=7413046;WS=7413028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,52:0.68:77
chr17	7413057	rs7213878	C	T	1936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=35;PP=999;SC=CGGCCAGGCGCGGTGGCTCAC;SOR=2.448;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=12;TCR=35;TR=47;WE=7413065;WS=7413047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr17	7413120	rs7218412	A	G	397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=13;PP=349;SC=ACCTGAGCTCAGGAGTTCGAG;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=7413128;WS=7413110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	7414467	rs138833872	G	A	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=3;PP=410;ReadPosRankSum=2.639;SC=CAAAGAGGCTGTAGTTGGAGG;SOR=1.244;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=24;WE=7414475;WS=7414457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,26:0.76:34
chr17	7414958	rs2071502	G	C	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.980;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=2.80;ReadPosRankSum=-0.699;SOR=2.800;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr17	7416599	rs55931722	G	A	4569.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=405;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.155;HP=4;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=108;NR=87;PP=2707;ReadPosRankSum=3.470;SC=CCAGCTACTCGCCCACCTCTC;SOR=0.840;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=299;TCF=157;TCR=142;TR=195;WE=7416607;WS=7416589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,211:0.65:323
chr17	7416683	rs9894023	A	G	12578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=486;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=226;NR=204;PP=2965;SC=CCAGCTACTCACCGACATCTC;SOR=0.765;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=430;TCF=226;TCR=204;TR=430;WE=7416691;WS=7416673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,485:1.00:485
chr17	7417086	rs4344809	G	A	6927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=123;NR=110;PP=2965;SC=CTACAGCCCAGCCTCACCCAA;SOR=0.701;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=233;TCF=123;TCR=110;TR=233;WE=7417094;WS=7417076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,259:1.00:259
chr17	7417551	rs9533	T	C	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=61;ReadPosRankSum=0.586;SC=CCCGTGCTGCTGTGCAGTTCT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=7;WE=7417559;WS=7417541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr17	7452542	rs77711855	C	T	618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.248;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=351;ReadPosRankSum=0.416;SC=TGGTCCCGCTCGCGCTGGGCC;SOR=1.085;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=40;TCF=33;TCR=7;TR=23;WE=7452550;WS=7452532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,27:0.56:48
chr17	7452977	rs9899183	C	T	1283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=21;NR=21;PP=608;SC=TGCATGGGTGCGTGTCTGCAG;SOR=0.900;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=21;TCR=21;TR=42;WE=7452985;WS=7452967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr17	7460517	rs3803798	G	C	1290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=25;PP=881;ReadPosRankSum=1.149;SC=CCACTGCGGCGAGTTCCCTCG;SOR=0.623;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=33;TCR=36;TR=49;WE=7460525;WS=7460507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,53:0.73:73
chr17	7460559	rs4968189	T	G	1932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=30;PP=1243;SC=AGGTGTCTGGTCTGTTGGCCC;SOR=0.721;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=34;TCR=30;TR=64;WE=7460567;WS=7460549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr17	7460758	rs28362665	G	A	204.22	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5436;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=108;ReadPosRankSum=-0.524;SC=ACCCTCAGCCGCTCTTTGCTC;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=8;WE=7460766;WS=7460748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,9:0.90:10
chr17	7462555	rs11552708	G	A	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.259;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=11;PP=249;ReadPosRankSum=-1.007;SC=CCGGCTGCAGGGGACAGGAGG;SOR=1.123;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=33;TCF=16;TCR=17;TR=19;WE=7462563;WS=7462545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,24:0.59:41
chr17	7462657	.	T	TG	31	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5032;HP=6;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=31;QD=28.0;SC=ATGGTTAGCATGGGGGGTCTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=2;WE=7462665;WS=7462647;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:1,2:0.67:3
chr17	7462969	rs3803800	A	G	2391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.919;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=45;PP=1318;ReadPosRankSum=-1.374;SC=GCCTGGGAGAATGGGGAGAGA;SOR=0.627;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=145;TCF=83;TCR=62;TR=96;WE=7462977;WS=7462959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,109:0.65:167
chr17	7463644	rs72154130	TCAA	T	547.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.30;ReadPosRankSum=-0.661;SOR=0.719;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,18:0.24:75
chr17	7464413	rs6608	C	T	2505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=57;PP=1684;SC=CAGGCATTGTCCAGACCTGGT;SOR=2.049;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=22;TCR=57;TR=79;WE=7464421;WS=7464403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr17	7468216	rs4968212	T	C	7238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=136;NR=106;PP=2965;SC=CTCTCTCCCTTCTCCGACTCC;SOR=0.897;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=242;TCF=136;TCR=106;TR=242;WE=7468224;WS=7468206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr17	7470285	rs58837213	CA	C	5103.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=29;NR=48;PP=2951;SC=AACTCCGTACCAAAGGGTTAT;SOR=0.919;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=82;TCF=30;TCR=52;TR=77;WE=7470293;WS=7470275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr17	7474277	rs4968213	C	T	1006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=24;PP=648;SC=GGCCACCTCCCCTAGCTCTGA;SOR=2.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=33;WE=7474285;WS=7474267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr17	7477938	rs1057086	G	C	322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=2;PP=255;SC=GCATCTACGCGTATGGTTTTG;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=7477946;WS=7477928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	7480547	rs2270341	T	A	3587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=51;NR=69;PP=2204;SC=AGGGGAACCATATACTGGATT;SOR=1.162;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=51;TCR=69;TR=120;WE=7480555;WS=7480537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr17	7483662	rs78180894	G	C	2626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=52;PP=1388;ReadPosRankSum=-0.930;SC=CTAAAACTGGGGGATGAGAGG;SOR=0.673;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=159;TCF=83;TCR=76;TR=110;WE=7483683;WS=7483652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,119:0.70:170
chr17	7484101	rs9901673	C	A	5804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=97;PP=2965;SC=CCACGCAGCACGTAAGTAACC;SOR=0.721;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=202;TCF=105;TCR=97;TR=201;WE=7484109;WS=7484091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr17	7484812	rs9901675	G	A	1045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=33;PP=632;ReadPosRankSum=0.266;SC=ACGCCCATCCGCCTACCAGGC;SOR=0.694;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=182;TCF=82;TCR=100;TR=58;WE=7484820;WS=7484802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,60:0.30:198
chr17	7490379	rs2302661	G	C	1334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=33;NR=11;PP=768;SC=GGGGCAGGGTGGGGGGGAAGA;SOR=1.765;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=53;TCF=33;TCR=20;TR=44;WE=7490387;WS=7490369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr17	7490810	rs10852891	G	A	4444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=85;NR=60;PP=2340;SC=CCTCATCGCCGCCCAGCTGCT;SOR=0.846;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=145;TCF=85;TCR=60;TR=145;WE=7490818;WS=7490800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr17	7499382	rs858526	A	G	433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=14;PP=373;SC=GACCCTTTGCATAACTTAAAT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=7499390;WS=7499372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	7504858	rs17643401	G	A	963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=12;NR=18;PP=485;SC=GAGGAAACCAGTGGGAAAGTC;SOR=1.547;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=12;TCR=18;TR=30;WE=7504866;WS=7504848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr17	7529902	rs13894	G	A	860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.693;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=20;PP=441;ReadPosRankSum=1.430;SC=ACGGCCAGGCGGAATTGGGAG;SOR=0.829;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=109;TCF=53;TCR=56;TR=38;WE=7529910;WS=7529892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,46:0.37:125
chr17	7533901	rs9913778	C	T	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.99;ReadPosRankSum=-0.679;SOR=0.657;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,16:0.19:85
chr17	7536527	rs6259	G	A	2027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=33;PP=1245;ReadPosRankSum=-1.582;SC=TCTAGGAGAAGACTCTTCCAC;SOR=0.663;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=136;TCF=85;TCR=51;TR=86;WE=7536535;WS=7536517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,92:0.63:145
chr17	7536690	rs35338190	C	CT	440.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.973;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.679;NF=1;NR=12;PP=366;ReadPosRankSum=2.341;SC=TAAGAACCCCCTTTGAAAGTT;SOR=0.520;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=46;TCF=2;TCR=44;TR=13;WE=7536698;WS=7536680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,22:0.27:82
chr17	7554772	rs1642762	C	T	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.366;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=116;ReadPosRankSum=-0.314;SC=AGGGCTTCAGCGCGCGGCGCC;SOR=0.404;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=14;WE=7554780;WS=7554762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,17:0.44:39
chr17	7557419	rs1642763	A	G	1597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.933;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=40;PP=1015;ReadPosRankSum=1.822;SC=GCCGCCCTGGACGCTATTACG;SOR=0.768;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=288;TCF=155;TCR=133;TR=86;WE=7557427;WS=7557409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:218,96:0.31:314
chr17	7557834	rs1642764	C	T	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.08;ReadPosRankSum=-2.089;SOR=0.846;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr17	7569698	rs8073498	A	C	968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=28;PP=639;ReadPosRankSum=-1.557;SC=AGGGTAGGGAACATGTCTGCC;SOR=0.659;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=119;TCF=48;TCR=71;TR=46;WE=7569706;WS=7569688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,50:0.38:133
chr17	7576501	rs77697176	G	A	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=129;ReadPosRankSum=-0.651;SC=TAGATTAGGTGTATTAAATCC;SOR=0.527;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=12;WE=7576509;WS=7576491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr17	7577123	.	A	C	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.654;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=106;ReadPosRankSum=1.490;SC=ACAAACACGCACCTCAAAGCT;SOR=0.455;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=36;TCF=4;TCR=32;TR=9;WE=7577131;WS=7577113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,11:0.26:42
chr17	7578115	rs1625895	T	C	1648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=17;PP=845;SC=ACTGCTCACCTGGAGGGCCAC;SOR=1.292;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=51;TCF=33;TCR=18;TR=50;WE=7578123;WS=7578105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr17	7578645	rs2909430	C	T	1038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=27;PP=756;SC=AACAAACATGCGTAAGCACCT;SOR=2.242;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=36;WE=7578653;WS=7578635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr17	7579472	rs1042522	G	C	2536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=55;NR=37;PP=1414;SC=AGGGGCCACGGGGGGAGCAGC;SOR=0.936;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=55;TCR=37;TR=92;WE=7579480;WS=7579462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr17	7579643	rs146534833	CCCCCAGCCCTCCAGGT	C	5561.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=13;NR=41;PP=2062;SC=GCCCCCCAGCCCCCCAGCCCT;SOR=1.016;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=64;TCF=14;TCR=50;TR=54;WE=7579666;WS=7579632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr17	7579801	rs1642785	G	C	4339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.68;SOR=0.729;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr17	7630505	rs11867551	T	C	3036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.170;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=53;PP=1567;ReadPosRankSum=2.379;SC=CACAGGAGCATGATGCCATTC;SOR=0.495;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=164;TCF=96;TCR=68;TR=122;WE=7630513;WS=7630495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,138:0.75:184
chr17	7640300	rs150748195	A	AAAAT	927.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.014;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=457;ReadPosRankSum=-0.039;SC=AACTCCATCTAAAATAAATAA;SOR=0.235;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=19;TCF=12;TCR=7;TR=9;WE=7640308;WS=7640290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,23:0.70:33
chr17	7646166	rs2642160	A	G	149.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=0;PP=110;SC=GCATGCGCGCATGTGTAGGTC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=7646174;WS=7646160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	7673928	rs9909288	C	G	757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.12;ReadPosRankSum=1.364;SOR=0.723;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,47:0.32:148
chr17	7674850	rs7212989	C	T	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.195;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=35;ReadPosRankSum=-0.510;SC=GTCATGGTTGCGTGCTTCATT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=4;WE=7674858;WS=7674840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr17	7677927	rs4791759	A	G	227.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=0;PP=178;SC=CATGTTAGACAGTCTGGGGAT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=7677935;WS=7677922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	7680159	rs62059684	G	A	2061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.420;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=45;PP=1157;ReadPosRankSum=1.425;SC=TGCTGACAGCGAAGGAGCGGG;SOR=0.684;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=296;TCF=154;TCR=142;TR=99;WE=7680167;WS=7680149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:219,113:0.34:332
chr17	7681412	rs7359662	C	G	3730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=48;PP=2067;SC=ATGACTGTGTCATCCGCCAGA;SOR=0.883;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=68;TCR=48;TR=116;WE=7681420;WS=7681402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr17	7689576	rs117091920	C	T	1058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=30;PP=536;ReadPosRankSum=1.269;SC=GCACGGGCAGCGGCAAGACTG;SOR=0.714;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=164;TCF=70;TCR=94;TR=52;WE=7689584;WS=7689566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,61:0.33:186
chr17	7690404	rs72840094	G	A	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=45;ReadPosRankSum=0.354;SC=ACCGGAGGGCGTGGGCCGGGG;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=5;WE=7690412;WS=7690394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr17	7700712	rs1565817	C	T	3516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.405;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=74;PP=2171;ReadPosRankSum=0.159;SC=AGTTCCCTGCCCACAGAGTCT;SOR=0.768;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=212;TCF=107;TCR=105;TR=146;WE=7700720;WS=7700702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,157:0.68:231
chr17	7701204	rs8072174	A	G	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.574;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=67;ReadPosRankSum=0.225;SC=GGGTATGTCTAAGGAAATAGG;SOR=0.019;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=6;WE=7701212;WS=7701194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr17	7701463	rs143300355	C	T	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=6.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.92;ReadPosRankSum=-0.441;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr17	7702357	rs12949280	C	T	1259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=8;PP=962;SC=CCACCTGACCCGCTGCCCCCG;SOR=2.726;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=34;TCR=8;TR=42;WE=7702365;WS=7702347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr17	7704902	.	G	A	1356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=0.000;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.317;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=22;PP=657;ReadPosRankSum=1.054;SC=CCAGGAACTGGATCCGCCAGT;SOR=0.871;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=224;TCF=138;TCR=86;TR=64;WE=7704910;WS=7704892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:179,79:0.31:258
chr17	7705089	rs4791834	C	G	581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.723;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=12;PP=421;ReadPosRankSum=-2.207;SC=CGCCTCTCATCTCTCATCGCA;SOR=0.399;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=29;TCF=16;TCR=13;TR=24;WE=7705097;WS=7705079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,24:0.80:30
chr17	7705344	rs8073196	G	C	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.95;ReadPosRankSum=-0.369;SOR=0.663;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,36:0.32:114
chr17	7705410	rs8073332	G	T	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.016;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=59;ReadPosRankSum=0.052;SC=AAATGATGCTGATGTGCAAGG;SOR=0.084;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=8;WE=7705418;WS=7705400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr17	7708096	.	G	A	101	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=7;NR=0;PP=101;QD=19.3958875067;SC=CCCTGGGGGCGGAGGTTGCAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=7;WE=7708104;WS=7708086;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:5,7:0.58:12
chr17	7708163	rs367854692	CA	C	337.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=2.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.93;ReadPosRankSum=0.694;SOR=1.015;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,26:0.46:57
chr17	7720858	rs872345	A	T	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.399;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=20;PP=502;ReadPosRankSum=1.251;SC=AAGTTAAAGCATGGGGCTTTT;SOR=0.873;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=139;TCF=76;TCR=63;TR=45;WE=7720866;WS=7720848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,47:0.32:149
chr17	7721231	rs9916791	T	C	1200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.773;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=27;PP=772;ReadPosRankSum=0.643;SC=ACCTCTCCCGTAGTGTTCCTT;SOR=0.547;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=211;TCF=121;TCR=90;TR=61;WE=7721239;WS=7721221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,69:0.30:228
chr17	7721931	rs10153304	G	A	852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.275;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=12;PP=605;ReadPosRankSum=1.165;SC=AGGAGTGACAGCCCCTCACTG;SOR=0.465;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=50;TCF=34;TCR=16;TR=35;WE=7721939;WS=7721921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,35:0.70:50
chr17	7722365	rs7213894	C	T	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=14;PP=290;ReadPosRankSum=0.273;SC=GAGATCAACACTGACTTGGCG;SOR=0.619;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=65;TCF=30;TCR=35;TR=26;WE=7722373;WS=7722355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,30:0.42:71
chr17	7726665	rs55758061	C	CAG,CAGAG	689.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=10;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5,5;NR=9,9;PP=191,416;ReadPosRankSum=-1.263;SC=GAGAAAAATACAGAGAGAGAG;SOR=0.352;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=6;TCR=10;TR=14,14;WE=7726673;WS=7726655;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.64,0.32:22
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chr17	7733833	rs34121753	A	G	2920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=64;PP=1934;SC=AGGGGTCCTCATCCCAGCCCT;SOR=1.702;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=96;TCF=32;TCR=64;TR=96;WE=7733841;WS=7733823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
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chr17	7751050	rs62059713	C	T	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.144;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=22;PP=525;ReadPosRankSum=1.084;SC=CCCCCCACCACCCCCTGCCTG;SOR=1.542;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=26;WE=7751058;WS=7751040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,25:0.71:35
chr17	7754993	rs12939056	G	A	3919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=66;NR=73;PP=2387;SC=AGGAGCTGCTGAAGCTGCCCG;SOR=0.866;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=139;TCF=66;TCR=73;TR=139;WE=7755001;WS=7754983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr17	7788409	rs201772788	C	G	116.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.38;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
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chr17	7909945	rs368557900	G	A	472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.915;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=10;PP=271;ReadPosRankSum=0.383;SC=CCTCTCCGCCGGTACCCGGAT;SOR=0.573;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=62;TCF=32;TCR=30;TR=22;WE=7909953;WS=7909935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,26:0.37:71
chr17	7942434	rs73972649	A	G	565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.812;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=11;PP=356;ReadPosRankSum=0.020;SC=CCCGCTCTGCAGCCCTGTGCG;SOR=0.563;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=70;TCR=34;TR=33;WE=7942442;WS=7942424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,34:0.32:105
chr17	7942901	rs76589243	C	G	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=8.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.36;ReadPosRankSum=0.252;SOR=0.899;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr17	7945593	rs7503115	G	T	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=52;ReadPosRankSum=0.589;SC=GTCTGGCTGTGACCAGGCCCC;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=4;WE=7945601;WS=7945583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr17	7948175	rs6503070	C	T	1856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.494;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=29;PP=1147;ReadPosRankSum=-0.147;SC=GGCAGGAGGACGCCTTCTTCG;SOR=1.069;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=119;TCF=73;TCR=46;TR=81;WE=7948183;WS=7948165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,86:0.67:128
chr17	7950377	rs11541083	C	T	842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.690;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=18;PP=511;ReadPosRankSum=-1.248;SC=GGATGCAGATCTGGGGTGCAG;SOR=0.243;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=64;TCF=27;TCR=37;TR=36;WE=7950385;WS=7950367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,39:0.58:67
chr17	7950952	rs9898751	C	A	1317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.518;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=27;PP=717;ReadPosRankSum=-2.195;SC=TCACCTGCTCCGCCAAGCATG;SOR=0.789;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=92;TCF=48;TCR=44;TR=54;WE=7950960;WS=7950942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,63:0.59:107
chr17	7951819	rs4792147	A	G	2439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.644;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=45;PP=1531;ReadPosRankSum=0.910;SC=GAGCGGAACCAGGGCCTGGTG;SOR=0.769;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=152;TCF=86;TCR=66;TR=107;WE=7951827;WS=7951809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,113:0.71:159
chr17	7960380	rs8072641	T	C	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.622;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.160;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=139;ReadPosRankSum=1.102;SC=ACGGTCTCCTTGAACCCAGGT;SOR=3.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=7;WE=7960388;WS=7960370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr17	7960625	rs9896256	C	T	2537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.756;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=34;PP=1562;ReadPosRankSum=0.815;SC=AGAGCAATATCGTCCTTGGTT;SOR=1.101;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=120;TCF=73;TCR=47;TR=93;WE=7960633;WS=7960615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,103:0.76:136
chr17	7961115	rs7214969	G	C	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=103;ReadPosRankSum=-1.125;SC=ATGAATTGTGGCCTCAGGAAC;SOR=0.260;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=4;WE=7961137;WS=7961105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr17	7961129	rs7214975	G	A	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.478;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=356;ReadPosRankSum=0.191;SC=CAGGAACCACGAGCGCATGGT;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=7;WE=7961137;WS=7961105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr17	7977105	rs12937410	A	G	3464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=68;PP=2042;SC=CCCAGGCGACATCAGTCGTGC;SOR=1.241;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=115;TCF=47;TCR=68;TR=115;WE=7977113;WS=7977095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr17	7979463	rs2289586	A	G	5557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=104;NR=75;PP=2965;SC=TGTCCACCCTAAGAGCCACCC;SOR=0.898;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=179;TCF=104;TCR=75;TR=179;WE=7979471;WS=7979453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr17	7983799	rs2304907	A	G	1465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.556;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=26;PP=760;ReadPosRankSum=-0.103;SC=ATGTCTCAAGATCTTTGCATC;SOR=0.780;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=94;TCF=53;TCR=41;TR=57;WE=7983807;WS=7983789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,66:0.61:109
chr17	7983969	rs2304908	G	C	672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.211;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=10;PP=423;ReadPosRankSum=1.044;SC=CACTCACACGGACTCACATGG;SOR=1.121;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=47;TCF=26;TCR=21;TR=28;WE=7983977;WS=7983959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,29:0.60:48
chr17	7990577	rs7504003	G	C	784.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.25;ReadPosRankSum=1.863;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,25:0.58:43
chr17	7991330	rs9909784	T	G	353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.27;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	7999957	rs3809881	G	A	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.934;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.22;ReadPosRankSum=-2.933;SOR=0.557;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,26:0.34:77
chr17	8027593	rs3027279	G	T	737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=22;PP=580;SC=AAACTGGCCTGGGAGTGCGGG;SOR=3.098;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=27;WE=8027601;WS=8027583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	8045060	.	CT	C	1218	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;FR=1.0000;HP=8;HapScore=1;MGOF=7;MMLQ=27;MQ=59.23;NF=25;NR=21;PP=1218;QD=27.0217391304;SC=GAGCTCAATTCTTTTTTCTCC;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=54;TCF=31;TCR=23;TR=46;WE=8045068;WS=8045050;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:8,46:0.85:54
chr17	8046772	rs2585405	C	G	2742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.89;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr17	8048169	rs2253820	T	C	3064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=59;PP=1462;SC=CTTCCTTCTGTGTGTGCAGGG;SOR=1.236;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=46;TCR=59;TR=105;WE=8048177;WS=8048159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr17	8048283	rs2735611	G	A	377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=9;PP=212;SC=CTGGGGCTAGGCCAGGCAGGT;SOR=1.473;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=13;WE=8048291;WS=8048273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	8050737	rs885747	G	C	2682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=47;NR=45;PP=1412;SC=GGCTTGACCCGGCTTCCCACA;SOR=0.795;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=92;TCF=47;TCR=45;TR=92;WE=8050745;WS=8050727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr17	8052525	rs147233293	CAAAAACA	C	2943.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=5.075;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.72;MQRankSum=0.619;QD=39.78;SOR=1.679;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,73:0.99:74
chr17	8064083	rs1061032	T	G	942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=5;PP=627;SC=TCCAGGGGAGTGGGGGCTGAA;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=31;WE=8064091;WS=8064073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr17	8066107	rs2304909	G	A	134.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.47;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	8076778	rs9894790	C	T	1421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=5;PP=439;SC=AAGAATCAGACAGGAGCAATC;SOR=1.839;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=23;WE=8076786;WS=8076768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr17	8076802	rs9901637	T	A	1846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=10;PP=730;SC=GTGTTGCAAGTCCTGATTACG;SOR=1.708;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=39;WE=8076810;WS=8076792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr17	8076911	rs11655582	A	G	6069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.63;SOR=0.753;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr17	8076916	rs11650713	C	T	6027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.32;SOR=0.723;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr17	8079029	rs8064449	G	C	6421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=106;NR=101;PP=2965;SC=AGGGAGTCCTGATAGAAGTGG;SOR=0.756;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=207;TCF=106;TCR=101;TR=207;WE=8079037;WS=8079019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr17	8092694	rs8531	T	G	3401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=40;PP=2027;SC=CGGGGTCGATTGGGGGAATGG;SOR=0.818;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=57;TCR=40;TR=97;WE=8092702;WS=8092674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr17	8108331	rs1059476	A	G	6708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.73;SOR=0.720;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr17	8108339	rs2241909	G	A	6864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.17;SOR=0.731;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr17	8110764	rs2289590	C	A	1097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=24;PP=766;SC=CTTCCTCATCCCATCCTGTCC;SOR=1.236;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=14;TCR=24;TR=38;WE=8110772;WS=8110754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr17	8132763	rs3826543	T	C	2443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=51;PP=1338;SC=GGCAGGGGAATGCTAAATAAA;SOR=1.329;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=35;TCR=51;TR=86;WE=8132771;WS=8132753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr17	8135061	rs3027238	T	C	5269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=84;PP=2856;SC=CCAGGAGCTATGAGTCGGTAC;SOR=0.797;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=178;TCF=94;TCR=84;TR=178;WE=8135069;WS=8135051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr17	8137737	rs4792621	G	A	2450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=29;PP=1412;SC=ATGACAAAAAGGGAAATCACC;SOR=0.935;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=50;TCR=29;TR=79;WE=8137745;WS=8137727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr17	8139327	rs4791626	A	G	6621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=111;NR=113;PP=2965;SC=CCTCTTTGAAAACCCACATTT;SOR=0.821;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=224;TCF=111;TCR=113;TR=224;WE=8139335;WS=8139317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr17	8141707	rs6503093	T	C	4530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=76;NR=69;PP=2589;SC=ACCTTCCACTTACCTCACAGC;SOR=0.793;SbPval=0.52;Source=Platypus;TCR=69;TR=145;WE=8141715;WS=8141697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr17	8157310	rs9891699	C	T	5944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=103;NR=91;PP=2965;SC=GGGGGCAGCCCCTGGACACAC;SOR=0.739;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=194;TCF=103;TCR=91;TR=194;WE=8157318;WS=8157300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr17	8158273	rs6503094	A	G	1766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=20;PP=1047;SC=AGACAGCAGTAGGCAGGATCC;SOR=1.366;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=35;TCR=20;TR=55;WE=8158281;WS=8158263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr17	8159232	rs7221716	A	G	2023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=43;PP=1246;SC=CCAATAGGTGAGGAGAAATGG;SOR=1.708;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=23;TCR=43;TR=66;WE=8159240;WS=8159222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr17	8161149	rs4791641	C	T	1429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=15;PP=858;SC=TGGGAGGATCCAAGCTTCCAG;SOR=1.225;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=29;TCR=15;TR=44;WE=8161157;WS=8161139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr17	8166378	rs7206953	T	C	1613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.713;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=25;PP=992;ReadPosRankSum=-0.842;SC=GGGGAGCGTATAGGAGCTTCC;SOR=0.777;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=101;TCF=59;TCR=42;TR=61;WE=8166386;WS=8166368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,69:0.61:113
chr17	8167600	rs11078738	T	C	2671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=36;PP=1621;SC=CCGACACCCCTGCCAACCCCT;SOR=0.936;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=55;TCR=36;TR=90;WE=8167608;WS=8167590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr17	8168224	rs9902252	T	C	1269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=7;PP=749;SC=TGGACCGCTCTGTGGGAGGCC;SOR=2.059;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=38;WE=8168232;WS=8168214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr17	8168805	rs9897842	A	G	3561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=72;NR=59;PP=2332;SC=TGGGAGCCCCAGGGAGGGGAG;SOR=0.799;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=73;TCR=60;TR=131;WE=8168813;WS=8168795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr17	8169006	rs11655563	T	C	2283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=43;PP=1366;SC=GTGATCTTTGTTTGGCTCCTG;SOR=1.302;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=71;TCF=28;TCR=43;TR=71;WE=8169014;WS=8168996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr17	8193473	rs11245	G	A	110.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=84;SC=TGGGTCTCTCGATTCCCTTTG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=8193481;WS=8193463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	8194318	rs72835272	GT	AC	9408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=90;PP=2947;SC=GAGGAAGAGCGTTGTCAACCA;SOR=0.856;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=180;TCF=87;TCR=93;TR=175;WE=8194327;WS=8194308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr17	8215755	rs115065009	C	T	882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=24;PP=566;ReadPosRankSum=-0.755;SC=CCTCTGCTCCCCATGGCTGGA;SOR=0.644;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=115;TCF=54;TCR=61;TR=44;WE=8215763;WS=8215745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,46:0.36:127
chr17	8224133	rs3744646	T	C	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=48;ReadPosRankSum=-0.800;SC=CCCCACCTCATTGGAGCCTCT;SOR=0.631;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=6;WE=8224141;WS=8224123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr17	8224276	rs3744647	T	C	1882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.323;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=31;PP=1137;ReadPosRankSum=0.866;SC=GGCTGTTGGATCTTCTTCAGG;SOR=0.821;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=80;TCR=48;TR=82;WE=8224284;WS=8224266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,90:0.60:149
chr17	8243469	rs12943505	T	C	2302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=47;PP=1286;ReadPosRankSum=-0.611;SC=GGAGGCAGGATGGGGCACAGG;SOR=0.676;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=148;TCF=79;TCR=69;TR=99;WE=8243477;WS=8243459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,109:0.66:164
chr17	8243661	rs12601097	G	A	2899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.939;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=60;PP=1540;ReadPosRankSum=0.335;SC=ACTATTGGTCGTGGCCTTCTC;SOR=0.854;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=172;TCF=84;TCR=88;TR=118;WE=8243669;WS=8243651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,132:0.69:190
chr17	8243785	rs12936935	A	G	764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.316;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=18;PP=468;ReadPosRankSum=0.106;SC=CTGCACTTTTACAAATCCAGG;SOR=0.399;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=44;TCF=18;TCR=26;TR=32;WE=8243793;WS=8243775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,34:0.72:47
chr17	8283379	rs409445	C	G	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.88;ReadPosRankSum=-0.272;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,15:0.25:61
chr17	8296440	rs12601265	G	A	1214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=17;PP=953;SC=CTCCAGGCAGGGGAGGAGGCG;SOR=0.902;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=21;TCR=17;TR=38;WE=8296448;WS=8296430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr17	8339103	rs8065181	C	T	141.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=2;PP=87;SC=CCCCCTGTGACACCAGCCCCG;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=8339111;WS=8339093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	8339307	rs8064417	G	A	1718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=24;PP=1021;SC=TGGCCGGGCCGGCGGAGGGGA;SOR=0.854;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=37;TCR=24;TR=61;WE=8339315;WS=8339297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr17	8349984	rs369297844	T	TC	293.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=11;NR=0;PP=304;SC=TTCCTTGGGTTCCCCCCCACC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=11;WE=8349992;WS=8349974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	8363624	rs3817003	G	A	100.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=74;SC=GTGACATGACGTCTGTTGTTG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=8363632;WS=8363614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	8383253	rs4791316	G	C	324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=3;PP=233;SC=GTCCTCCCAGGCTCTGAATGC;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=12;WE=8383261;WS=8383249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	8383894	rs6503120	A	G	1696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=23;NR=37;PP=1137;SC=AGCACAGCACAGGAGCCTCAG;SOR=1.270;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=23;TCR=37;TR=60;WE=8383902;WS=8383884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr17	8384875	rs904417	T	G	310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=229;SC=AATTAAACTGTCAAGAAAATC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=8384883;WS=8384865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	8387438	rs113838551	G	GATGA	3786.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=21;PP=2214;SC=TGAACAAATGGATAAGTAACA;SOR=1.395;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=22;TCR=22;TR=42;WE=8387446;WS=8387428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr17	8390733	rs3826463	A	G	969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=10;PP=523;SC=CAGAGACTCCATGGGTGAAGG;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=24;TCR=10;TR=34;WE=8390741;WS=8390723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr17	8395894	rs904416	T	C	3007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=53;NR=56;PP=1438;SC=TCTTCCACCATGTGGCTGATT;SOR=0.728;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=116;TCF=53;TCR=63;TR=109;WE=8395902;WS=8395884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr17	8411812	rs11658073	C	T	678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=16;NR=3;PP=403;SC=GTTCTGATTACAGTAAAAGCT;SOR=3.352;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=8411820;WS=8411802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	8412133	rs9889907	A	G	877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=21;PP=612;SC=ACTGTACACAATCACATGCTG;SOR=2.376;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=28;WE=8412141;WS=8412123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr17	8413314	rs36135285	CCA	C	2597.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=37;PP=2009;SC=CGAGATTTGACCACACATTCA;SOR=1.498;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=44;TCF=4;TCR=40;TR=41;WE=8413323;WS=8413304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr17	8424270	rs8067456	G	A	4362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=66;PP=2696;SC=CCAGGACACCGTTACAGCGAA;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=145;TCF=79;TCR=66;TR=145;WE=8424278;WS=8424260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr17	8449716	rs35537538	TA	T	560.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.42;QD=22.43;SOR=3.816;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	8449767	rs4791724	A	G	2510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=56;NR=24;PP=1488;SC=AAGACAGTTTATATTGATTCA;SOR=1.434;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=56;TCR=24;TR=80;WE=8449775;WS=8449757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr17	8451744	rs57472344	GA	G	741.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.429;NF=5;NR=13;PP=308;ReadPosRankSum=-1.573;SC=TTGATAAAAAGAAAAAAAAAA;SOR=0.321;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=18;WE=8451752;WS=8451734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,31:0.97:32
chr17	8478605	rs268460	C	T	1117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=24;PP=643;SC=ATGTGTTCCACAGGGAATTTG;SOR=1.556;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=14;TCR=24;TR=38;WE=8478613;WS=8478595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr17	8479841	rs1431307	A	C	1757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.82;SOR=2.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr17	8645010	rs79895013	G	A	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.867;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=5.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.41;ReadPosRankSum=-1.860;SOR=0.082;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr17	8647127	rs9895426	C	T	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.459;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=175;ReadPosRankSum=-1.118;SC=AGCATCCCTGCCCCAGAGGCT;SOR=1.467;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=49;TCF=18;TCR=31;TR=15;WE=8647135;WS=8647117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,17:0.32:53
chr17	8647181	rs9902109	T	C	554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=14;PP=427;SC=TCCCACTTTCTACCCCATGCC;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=8647189;WS=8647171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	8647337	rs7218546	A	G	1197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=13;PP=675;SC=AGGCTCTCCCAGAGCCCCAGC;SOR=1.329;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=26;TCR=13;TR=39;WE=8647345;WS=8647327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr17	8647931	rs10852904	G	C	1316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.93;ReadPosRankSum=-0.925;SOR=0.684;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:144,78:0.35:222
chr17	8656594	rs141972356	ACCCCATCCCTCCCCAC	A	1212.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.633;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=10;PP=2971;ReadPosRankSum=0.947;SC=CCTCCAGTCCACCCCATCCCT;SOR=0.236;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=61;TCF=17;TCR=44;TR=17;WE=8656617;WS=8656584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,33:0.45:74
chr17	8701116	rs2242374	G	A	911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.65;ReadPosRankSum=-0.698;SOR=0.718;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:145,51:0.26:196
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chr17	8736394	rs12945801	T	C	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=81;ReadPosRankSum=-0.740;SC=GCCTGGGTCTTGGCCCAGCGC;SOR=0.859;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=8;WE=8736402;WS=8736384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,7:0.28:25
chr17	8738553	rs2072089	G	A	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.41;ReadPosRankSum=1.086;SOR=0.425;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,3:0.21:14
chr17	8738575	rs1005898	A	G	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.326;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=26;ReadPosRankSum=-0.806;SC=AAGGGGCTGCAGGCAGGGCCA;SOR=0.204;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=6;WE=8738583;WS=8738565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr17	8739735	rs12951637	A	C	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=57;ReadPosRankSum=0.253;SC=GACAAATATCATGGCTGGGGA;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=4;WE=8739743;WS=8739725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr17	8739821	rs12948724	G	C	581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=326;ReadPosRankSum=0.488;SC=AGCCACAACAGTTTTAGGAGG;SOR=0.648;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=70;TCF=48;TCR=22;TR=27;WE=8739829;WS=8739811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,30:0.39:76
chr17	8742862	rs9910741	C	T	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.673;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=6.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.67;ReadPosRankSum=0.104;SOR=0.048;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr17	8743118	rs16957654	G	A	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.897;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=22;PP=484;ReadPosRankSum=0.568;SC=CTGAGCCTCAGGAGGTGCCCG;SOR=0.818;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=70;TCF=25;TCR=45;TR=34;WE=8743126;WS=8743108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,39:0.52:75
chr17	8743174	rs28704961	G	A	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.318;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=171;ReadPosRankSum=-0.652;SC=GCCAGGGCTGGAATATAGCCT;SOR=1.473;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=10;WE=8743182;WS=8743164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr17	8753004	rs7218411	G	T	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.88;ReadPosRankSum=-1.580;SOR=0.709;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,15:0.30:50
chr17	8812683	rs181534	T	C	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.15;ReadPosRankSum=-1.036;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr17	9066098	rs2286510	C	T	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.897;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=10;PP=288;ReadPosRankSum=-0.795;SC=CGCGCCCCTGCGGCTGACACC;SOR=0.872;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=83;TCF=50;TCR=33;TR=26;WE=9066106;WS=9066088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,25:0.28:90
chr17	9066248	rs55687153	C	T	2186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.63;ReadPosRankSum=0.340;SOR=0.747;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,57:0.54:106
chr17	9066254	rs2286511	T	C	2173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=1.572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.10;ReadPosRankSum=-0.195;SOR=0.860;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,57:0.55:103
chr17	9083390	rs8081736	G	C	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=96;ReadPosRankSum=2.268;SC=GAGTCTCACTGTGTCGCCCAG;SOR=0.563;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=40;TCF=14;TCR=26;TR=11;WE=9083398;WS=9083380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,14:0.30:47
chr17	9086338	rs11078789	G	T	1315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.78;ReadPosRankSum=1.303;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,58:0.78:74
chr17	9153861	rs8974	G	C	3295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=34;PP=2231;SC=TCTGTCATTGGCAGGTGTCAC;SOR=1.650;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=74;TCR=34;TR=107;WE=9153869;WS=9153851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr17	9154078	rs17743659	G	C	2057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=48;PP=1474;SC=CCTTCAGTTTGTACGAAGTGG;SOR=2.269;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=18;TCR=48;TR=66;WE=9154086;WS=9154068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr17	9154118	rs17675967	C	T	667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=18;PP=496;SC=TGGGGCGCCGCTGCTGCTACA;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=9154126;WS=9154108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	9395033	rs6503214	A	G	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=452;ReadPosRankSum=-0.641;SC=TGTAACAATCATTGACATTAA;SOR=0.495;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=15;WE=9395042;WS=9395023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,16:0.76:21
chr17	9395034	rs7222078	T	C	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.70;ReadPosRankSum=0.740;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,5:0.24:21
chr17	9395231	rs9893664	G	A	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.293;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=206;ReadPosRankSum=-1.171;SC=CAAGGCCTGCGTCCTGTTCTG;SOR=1.022;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=33;TCF=14;TCR=19;TR=18;WE=9395239;WS=9395221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr17	9408594	rs2249929	A	C	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=172;ReadPosRankSum=1.249;SC=CAATTCAAACACAATTTATTG;SOR=0.941;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=11;WE=9408602;WS=9408584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr17	9408609	rs2125348	A	G	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.188;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.881;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=103;ReadPosRankSum=-0.349;SC=TTATTGCATCATTAGTTTATG;SOR=0.197;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=8;WE=9408617;WS=9408599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr17	9471711	rs1133295	T	G	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.60;ReadPosRankSum=-0.253;SOR=0.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr17	9479048	rs7210038	T	C	755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=9;PP=401;ReadPosRankSum=-2.692;SC=TTGCCTGCTCTCCGGAAGCCC;SOR=0.813;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=40;TCF=27;TCR=13;TR=27;WE=9479056;WS=9479038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,34:0.68:50
chr17	9479098	rs7224817	C	A	1349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=20;PP=674;ReadPosRankSum=0.848;SC=CCGCCCTCACCCGGGACTCAC;SOR=0.642;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=75;TCF=48;TCR=27;TR=54;WE=9479106;WS=9479088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,63:0.69:91
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chr17	9488986	.	T	TCA	61	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=4;NR=0;PP=61;QD=16.75;SC=CAAGACTCTGTCACACACACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=9488994;WS=9488983;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr17	9515777	rs6503235	G	A	4928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=94;PP=2917;SC=TGATGCTGTCGAGGATATTGT;SOR=1.130;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=161;TCF=67;TCR=94;TR=161;WE=9515785;WS=9515767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr17	9632247	rs12450515	A	G	2538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.676;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=54;PP=1755;ReadPosRankSum=-1.226;SC=CCTTTCAGAGAGTCAAATATC;SOR=0.647;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=142;TCF=73;TCR=69;TR=106;WE=9632255;WS=9632237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,108:0.72:150
chr17	9683087	rs11078817	G	C	953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.371;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=14;PP=543;ReadPosRankSum=0.516;SC=ATTAACAGAGGCCTCTGTAGA;SOR=0.281;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=54;TCF=37;TCR=17;TR=39;WE=9683095;WS=9683077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,43:0.74:58
chr17	9712092	rs56256681	G	A	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=157;ReadPosRankSum=-0.506;SC=TGTCCAGTCTGACACTCTGCT;SOR=0.527;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=10;WE=9712100;WS=9712082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr17	9712255	rs9908677	G	A	1122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.738;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=30;PP=682;ReadPosRankSum=0.092;SC=GTCAGTATCAGAACGATATCC;SOR=0.873;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=171;TCF=87;TCR=84;TR=57;WE=9712263;WS=9712245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,62:0.34:182
chr17	9714009	rs4079466	C	A	2891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=53;PP=1563;SC=AATTTCTAGCCCCTTAACTGG;SOR=1.265;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=90;TCF=37;TCR=53;TR=90;WE=9714017;WS=9713999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr17	9714086	rs4791362	G	A	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=311;ReadPosRankSum=1.841;SC=CTGTGTGGGAGCCTGATATAA;SOR=1.519;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=15;WE=9714094;WS=9714076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr17	9725091	rs28590474	G	A	11451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.56;SOR=0.982;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chr17	9725091	.	GGC	AGT	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=131;NR=92;PP=2947;QD=20;SC=TCACCGTTGAGGCTCTCCTCG;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=226;TCF=133;TCR=93;TR=223;WE=9725101;WS=9725081;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,223:0.99:226
chr17	9725093	rs28376468	C	T	11451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.22;SOR=0.999;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,259:1.00:259
chr17	9725279	rs9915294	C	T	3323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=66;PP=1981;SC=CTTCACCACCCGTCGGGTCCC;SOR=1.479;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=41;TCR=66;TR=107;WE=9725287;WS=9725269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr17	9764531	rs2001486	A	G	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.961;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=12;PP=271;ReadPosRankSum=-1.670;SC=GTAATTCACCAGGTGTTATTC;SOR=0.906;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=59;TCF=30;TCR=29;TR=25;WE=9764539;WS=9764521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,29:0.46:63
chr17	9764547	rs12150176	C	T	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.927;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=12;PP=227;ReadPosRankSum=-1.587;SC=TATTCTTTCACGAGCCGGTAA;SOR=0.906;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=65;TCF=33;TCR=32;TR=25;WE=9764555;WS=9764537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,29:0.42:69
chr17	9765514	rs12150273	G	C	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=43;ReadPosRankSum=-0.900;SC=CCTTGAGAGAGAGAAGCTGAA;SOR=1.179;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=5;WE=9765522;WS=9765504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr17	9768941	rs756224	A	G	827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=4;PP=642;ReadPosRankSum=1.058;SC=TGCACACATAAGCCTCAAGTG;SOR=0.507;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=28;WE=9768949;WS=9768931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,28:0.80:35
chr17	9774057	rs17810279	T	G	2250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=34;PP=1209;ReadPosRankSum=-1.062;SC=CTGCTCTTTTTTTCAAGGTCA;SOR=0.704;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=114;TCF=64;TCR=50;TR=80;WE=9774065;WS=9774047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,95:0.72:132
chr17	9783566	rs4791903	G	C	830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.033;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=7;PP=533;ReadPosRankSum=1.646;SC=ATGTTGTAGTGAAGGAGACCA;SOR=0.315;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=48;TCF=38;TCR=10;TR=29;WE=9783574;WS=9783556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,33:0.61:54
chr17	9783855	rs2277690	A	G	1239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.566;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=33;PP=838;ReadPosRankSum=-1.316;SC=TCTGAACCAAAATGCCTTGAC;SOR=0.351;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=81;TCF=27;TCR=54;TR=52;WE=9783863;WS=9783845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,54:0.63:86
chr17	9791375	rs17676067	T	C	683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=18;PP=347;ReadPosRankSum=-1.707;SC=GTGGATGGGATGATGCTACGG;SOR=1.066;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=11;TCR=22;TR=27;WE=9791383;WS=9791365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,31:0.84:37
chr17	9792768	rs17681684	G	A	3161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=54;PP=1833;ReadPosRankSum=0.528;SC=CCTGGGGAAGGACTTCCGGTT;SOR=0.722;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=178;TCF=96;TCR=82;TR=119;WE=9792776;WS=9792758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,136:0.68:201
chr17	9792872	rs17681708	T	C	2634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.820;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=53;PP=1454;ReadPosRankSum=2.037;SC=GGCTCCTACATCTAGCCATGC;SOR=0.492;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=151;TCF=68;TCR=83;TR=101;WE=9792880;WS=9792862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,113:0.65:174
chr17	9793240	rs17681738	C	T	686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.241;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=9;PP=366;ReadPosRankSum=0.340;SC=ATCCTAATAACCCCCACCAGT;SOR=0.425;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=45;TCF=31;TCR=14;TR=26;WE=9793248;WS=9793230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,29:0.60:48
chr17	9793417	rs55789050	A	T	2304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=42;PP=1155;ReadPosRankSum=1.343;SC=GGGTGCGTGAAAACCTCCTAG;SOR=0.747;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=110;TCF=52;TCR=58;TR=78;WE=9793425;WS=9793407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,100:0.72:139
chr17	9801316	.	T	TGTGTGTGC	318.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=-0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.82;MQRankSum=-0.000;QD=21.25;ReadPosRankSum=1.834;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
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chr17	9801370	rs16958933	A	G	1124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.035;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.215;NF=32;NR=15;PP=683;ReadPosRankSum=-0.878;SC=CACGGGTGTCATGTGAGTGGT;SOR=0.566;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=69;TCF=48;TCR=21;TR=47;WE=9801378;WS=9801360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,51:0.70:73
chr17	9801532	rs76286617	G	C	2898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.057;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=61;PP=1611;ReadPosRankSum=1.480;SC=CTGTGCATTGGGAAAAAATAT;SOR=0.826;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=185;TCF=97;TCR=88;TR=119;WE=9801540;WS=9801522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,134:0.64:211
chr17	9801635	rs62064489	A	G	979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.791;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=23;PP=652;ReadPosRankSum=0.706;SC=TATCTATTATAAGAATATTGA;SOR=1.280;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=62;TCF=25;TCR=37;TR=35;WE=9801643;WS=9801625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,41:0.58:71
chr17	9820695	rs4791910	C	T	2829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.344;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=58;PP=1570;ReadPosRankSum=0.114;SC=CTGTTAGAGACGGCGGCCAAG;SOR=0.824;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=156;TCF=80;TCR=76;TR=116;WE=9820703;WS=9820685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,128:0.74:174
chr17	9820739	rs11078821	A	G	1819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.619;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=42;PP=1115;ReadPosRankSum=1.061;SC=TGCTGTCCTCACCTTAGTGTC;SOR=0.927;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=107;TCF=47;TCR=60;TR=74;WE=9820747;WS=9820729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,81:0.69:118
chr17	9821249	rs11078822	C	T	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=196;ReadPosRankSum=0.743;SC=TAACCTGCCACGGCCTAGCGC;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=10;WE=9821257;WS=9821239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr17	9821474	rs2270122	C	T	1097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.526;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=31;PP=606;ReadPosRankSum=1.005;SC=TTGGGGGTCCCCCCACCAAGA;SOR=0.755;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=208;TCF=105;TCR=103;TR=61;WE=9821482;WS=9821464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,69:0.30:229
chr17	9821614	rs61532416	G	GA	559.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.825;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=771;ReadPosRankSum=1.481;SC=TTTACTTCCTGAAATCCTGCT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=12;WE=9821626;WS=9821604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr17	9821618	rs55976773	T	G	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.825;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=763;ReadPosRankSum=0.398;SC=CTTCCTGAAATCCTGCTCCGC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=12;WE=9821626;WS=9821604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr17	9830171	rs56199323	C	T	893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=1.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.939;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=22;PP=549;ReadPosRankSum=-0.712;SC=AGGGGCACCCCCACTTCCCCA;SOR=1.429;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=42;TCF=13;TCR=29;TR=30;WE=9830179;WS=9830161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,36:0.69:52
chr17	9846521	rs17339499	G	C	4563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=90;NR=57;PP=2269;SC=ACCCAGCCACGGTGCCGTTGC;SOR=1.039;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=148;TCF=90;TCR=58;TR=147;WE=9846542;WS=9846511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr17	9846631	rs8066006	G	A	3587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=64;PP=2095;SC=GAGGGAGGACGGCTCCTAGAT;SOR=1.136;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=51;TCR=64;TR=115;WE=9846639;WS=9846621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr17	9846724	rs733804	C	A	548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=16;PP=432;SC=CTGGTGCCCCCACTCCCAACA;SOR=3.500;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=9846732;WS=9846714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	9850440	rs62064532	C	T	1186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.661;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=31;PP=768;ReadPosRankSum=-1.599;SC=GCTCCAGGGGCCAGCATTTCA;SOR=1.327;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=68;TCF=23;TCR=45;TR=44;WE=9850448;WS=9850430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,48:0.65:74
chr17	10205047	rs62060457	C	G	604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.767;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=17;PP=422;ReadPosRankSum=-0.810;SC=GGGGGTATGACGCTGTAGAGC;SOR=0.855;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=105;TCF=54;TCR=51;TR=32;WE=10205055;WS=10205037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,34:0.30:115
chr17	10205067	rs2008528	C	T	2912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=52;NR=47;PP=1574;SC=CCTCTCAGTCCGATTATGAGG;SOR=0.825;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=52;TCR=47;TR=99;WE=10205075;WS=10205057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr17	10214628	rs2074867	C	T	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.796;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=22;PP=433;ReadPosRankSum=-0.039;SC=CAGGGATGGGCGATTCATTCA;SOR=0.961;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=92;TCF=34;TCR=58;TR=32;WE=10214636;WS=10214618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,35:0.35:99
chr17	10215411	rs147487203	G	A	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=212;ReadPosRankSum=-2.236;SC=ATGACAAAGGGACATGGGAGA;SOR=1.473;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=11;WE=10215419;WS=10215401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr17	10216105	rs62060458	C	T	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.47;ReadPosRankSum=-0.813;SOR=0.675;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,24:0.26:93
chr17	10216442	rs4239113	C	A	796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.447;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=16;PP=446;ReadPosRankSum=1.510;SC=TGTCCTCGGGCCCCCTCTGCT;SOR=0.856;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=116;TCF=64;TCR=52;TR=40;WE=10216450;WS=10216432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,46:0.34:135
chr17	10216686	rs9989461	G	A	1705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=25;PP=827;ReadPosRankSum=1.606;SC=GAATGACAGCGGTGACAAATT;SOR=0.719;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=96;TCF=54;TCR=42;TR=61;WE=10216694;WS=10216676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,77:0.68:113
chr17	10219366	rs2240577	C	T	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FS=1.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.62;ReadPosRankSum=0.698;SOR=0.547;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:122,41:0.25:163
chr17	10219486	rs12453404	A	G	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5033;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=253;ReadPosRankSum=0.534;SC=GTTTCAAAAAAATCATAATCG;SOR=1.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=12;WE=10219494;WS=10219476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,12:0.80:15
chr17	10227708	rs3826442	C	T	571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=16;PP=422;SC=CACACATGCACGCACATGTGC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=10227716;WS=10227698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	10231498	rs2277645	A	C	1264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=30;PP=914;SC=CTGCACCCCCAACCTGTCCCC;SOR=1.954;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=12;TCR=30;TR=42;WE=10231506;WS=10231488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr17	10235360	rs8064714	G	C	338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=1;PP=252;SC=GATCAGCTAAGAAGCAGCCCA;SOR=3.442;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=10235368;WS=10235350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	10236465	rs2240579	G	A	3667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=58;NR=59;PP=1918;SC=CGAGGACCCCGTTACAGCGCA;SOR=0.880;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=59;TCR=60;TR=117;WE=10236473;WS=10236447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr17	10243589	rs4445936	C	A	6052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=103;PP=2965;SC=CATTTAGCAACTGCCATTTCA;SOR=0.936;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=191;TCF=88;TCR=103;TR=191;WE=10243597;WS=10243579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr17	10243717	rs3760423	G	A	1645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=34;PP=979;SC=CTCCGGAGTCGCCTGGAGACA;SOR=1.498;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=21;TCR=34;TR=55;WE=10243725;WS=10243707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr17	10247083	rs12938209	G	A	680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.749;HP=1;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=11;PP=345;ReadPosRankSum=-1.413;SC=TACATAGAACGTCCCACAGAG;SOR=0.556;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=114;TCF=75;TCR=39;TR=34;WE=10247091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,39:0.31:127
chr17	10247199	rs12938754	G	A	1910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.937;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.673;NF=47;NR=42;PP=1070;ReadPosRankSum=1.837;SC=CCACAGTCTCGTTCAGGGGGT;SOR=0.702;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=257;TCF=133;TCR=124;TR=89;WE=10247207;WS=10247189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,102:0.36:287
chr17	10247544	rs12453187	C	T	739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=24;PP=529;ReadPosRankSum=-1.135;SC=CTGGCATGTACGCTCGGTGAG;SOR=0.929;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=45;TCF=8;TCR=37;TR=29;WE=10247552;WS=10247534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,30:0.65:46
chr17	10249888	rs34168540	G	GA	1606.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=5;PP=1427;SC=CTCTTAATGTGAAAGCTGATT;SOR=3.352;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=39;TCF=32;TCR=7;TR=34;WE=10249896;WS=10249878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr17	10254197	rs2108568	A	G	1608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=38;PP=1161;SC=TGGGTGGGTGAAGACTATGGG;SOR=2.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=14;TCR=38;TR=52;WE=10254205;WS=10254187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr17	10258153	rs3214260	GT	G	6678.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=24;NR=48;PP=2988;SC=ACTCTGGGTTGTTTTTTTTTT;SOR=1.003;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=86;TCF=28;TCR=58;TR=72;WE=10258163;WS=10258143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr17	10258155	rs5010940	T	C	6687.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=48;PP=2472;SC=TCTGGGTTGTTTTTTTTTTCC;SOR=1.031;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=136;TCF=81;TCR=55;TR=123;WE=10258163;WS=10258143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr17	10263572	rs2190730	A	T	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=22;ReadPosRankSum=-0.440;SC=ATAAAGTAACATTGGGGGTGG;SOR=0.199;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=5;WE=10263580;WS=10263562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,5:0.23:22
chr17	10296486	rs33969260	G	A	1420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=35;PP=784;ReadPosRankSum=0.742;SC=GTTGGGAAACGTCATTTTCTA;SOR=0.716;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=202;TCF=102;TCR=100;TR=68;WE=10296494;WS=10296476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,79:0.34:231
chr17	10297658	rs8069834	A	G	1879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=28;PP=894;SC=AGAGTGGCCCACAGCTCCTCG;SOR=1.085;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=28;TCR=29;TR=56;WE=10297666;WS=10297648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr17	10303144	rs3815314	G	C	162.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.26;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	10304261	rs3744552	G	A	2441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=36;PP=1506;SC=TCAAATTGCTGATTTCAAATT;SOR=0.739;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=40;TCR=36;TR=76;WE=10304269;WS=10304251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr17	10308043	rs147823087	TAC	T	375.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.78;ReadPosRankSum=-2.847;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr17	10318636	rs8068729	A	G	2195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=31;PP=1461;SC=CATTCCTCACAGTTTTGGCAT;SOR=0.961;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=44;TCR=31;TR=75;WE=10318644;WS=10318626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr17	10356736	rs71360263	C	T	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=149;ReadPosRankSum=-1.649;SC=ATAATGTCAGCGTAAGATGGA;SOR=0.773;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=29;TCF=11;TCR=18;TR=11;WE=10356744;WS=10356726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr17	10357281	rs3826444	T	G	1184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=30;PP=851;SC=AGGTGGAAATTTCAGTGACTA;SOR=2.670;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=8;TCR=30;TR=38;WE=10357289;WS=10357271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr17	10359782	rs970292	A	G	1579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=-0.697;NF=40;NR=18;PP=938;ReadPosRankSum=-0.218;SC=ATTTATCTGTAATTCAAGAAT;SOR=0.613;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=87;TCF=62;TCR=25;TR=58;WE=10359790;WS=10359772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,66:0.66:100
chr17	10400963	rs723903	C	G	1789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=43;NR=9;PP=1056;SC=TGAGAACAGCCCTCAGATGGT;SOR=2.869;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=43;TCR=9;TR=52;WE=10400971;WS=10400953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr17	10404046	rs17811250	G	A	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.64;ReadPosRankSum=0.573;SOR=0.755;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,23:0.22:106
chr17	10408799	.	G	A	2750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.858;ClippingRankSum=0.000;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=59;PP=1788;ReadPosRankSum=-1.090;SC=TTGTCCTTCAGGGATAGCACT;SOR=0.721;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=171;TCF=80;TCR=91;TR=110;WE=10408807;WS=10408789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,121:0.60:202
chr17	10415840	rs2007027	A	G	4927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=95;NR=70;PP=2933;SC=CATCTGAAGTAAAGCCCAGAA;SOR=0.844;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=165;TCF=95;TCR=70;TR=165;WE=10415848;WS=10415830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr17	10424897	.	CAT	C	117.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.135;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=160;ReadPosRankSum=-1.465;SC=TTATTGATGTCATATATATAT;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=4;WE=10424906;WS=10424887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr17	10426343	rs7223755	C	T	274.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=263;SC=ACAGCTTGTTCACTACAAGAA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=10426351;WS=10426333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	10430885	.	G	A	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.964;ClippingRankSum=0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=148;ReadPosRankSum=0.529;SC=TTGTCCTATTGAAACCTTTAT;SOR=0.693;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=9;WE=10430893;WS=10430875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr17	10435325	rs11379780	G	GA	298.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=275;SC=ACATGCAGATGAAAAAATTCT;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=9;WE=10435333;WS=10435315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	10533595	rs3216886	C	CT	547.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=413;ReadPosRankSum=0.324;SC=GGGGTTCCTCCTGCACACACC;SOR=0.743;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=42;TCF=8;TCR=34;TR=12;WE=10533603;WS=10533585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,21:0.32:66
chr17	10536018	rs2285479	G	A	991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.175;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=25;PP=634;ReadPosRankSum=0.650;SC=CCTTCTCGGCGATCTTTCTAT;SOR=0.789;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=187;TCF=101;TCR=86;TR=57;WE=10536026;WS=10536008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,61:0.29:208
chr17	10537142	rs78946532	C	T	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.025;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=177;ReadPosRankSum=-1.010;SC=CCTAAGGTTTCCTGCTTCCTA;SOR=0.490;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=67;TCF=22;TCR=45;TR=20;WE=10537150;WS=10537132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,23:0.30:76
chr17	10541515	rs2285477	C	T	476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=12;PP=293;ReadPosRankSum=-1.335;SC=TTCCTCAGCGCGGCCACCATG;SOR=0.665;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=94;TCF=55;TCR=39;TR=27;WE=10541523;WS=10541505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,30:0.28:106
chr17	10541741	rs201626	A	G	879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.940;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=21;PP=535;ReadPosRankSum=0.385;SC=CCAGCTCCTCAATTCGAGCCT;SOR=1.051;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=61;TCF=30;TCR=31;TR=35;WE=10541749;WS=10541731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,42:0.56:75
chr17	10542471	rs2285475	T	G	1093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.084;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=27;PP=667;ReadPosRankSum=0.479;SC=CCAGGTCTACTCGGAGCTTCT;SOR=0.793;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=127;TCF=66;TCR=61;TR=54;WE=10542479;WS=10542461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,60:0.41:148
chr17	10542765	rs2285474	A	G	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.890;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=97;ReadPosRankSum=-0.911;SC=CATCTAACCCAGAGAGTTCCT;SOR=0.799;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=43;TCF=22;TCR=21;TR=11;WE=10542773;WS=10542755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,12:0.24:50
chr17	10542803	rs2285473	T	C	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.105;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=127;ReadPosRankSum=-0.647;SC=TAAGAAGAATTCGCAAGCAAT;SOR=0.719;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=45;TCF=27;TCR=18;TR=14;WE=10542811;WS=10542793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,17:0.31:55
chr17	10542886	rs2285472	T	C	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=3.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.60;ReadPosRankSum=0.397;SOR=0.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,15:0.42:36
chr17	10543183	rs2285471	A	G	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=94;ReadPosRankSum=-0.572;SC=CCAGTATTTCACTATATATGA;SOR=0.616;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=25;TCF=10;TCR=15;TR=7;WE=10543191;WS=10543173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr17	10543218	rs2285470	A	G	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.609;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.154;HP=4;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=70;ReadPosRankSum=0.179;SC=CATTTCAACTAAAAAGCAAAA;SOR=1.447;Source=Platypus;TCF=14;TR=6;WE=10543226;WS=10543208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr17	10543281	.	TAAA	T	163.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.354;ClippingRankSum=-0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.63;ReadPosRankSum=1.934;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr17	10543463	rs2285469	T	C	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.65;ReadPosRankSum=0.735;SOR=0.650;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,27:0.31:87
chr17	10544018	rs876660	T	C	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-4.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.605;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=166;ReadPosRankSum=-0.203;SC=ATTGTAGACATGGAAATCATC;SOR=0.123;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=17;WE=10544026;WS=10544008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr17	10544696	rs3216884	GA	G	172.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=1.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.20;ReadPosRankSum=-0.030;SOR=1.041;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,14:0.26:54
chr17	10546130	rs2285468	T	G	1040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.205;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=23;PP=611;ReadPosRankSum=-0.455;SC=ACGGTGGGGATGGAACTGGAT;SOR=0.443;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=116;TCF=55;TCR=61;TR=46;WE=10546138;WS=10546120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,54:0.40:136
chr17	10549184	rs2239933	G	A	992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=17;PP=564;ReadPosRankSum=0.132;SC=AGGGCAGCACGTCAGTCAGTT;SOR=0.649;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=146;TCF=91;TCR=55;TR=50;WE=10549192;WS=10549174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,57:0.35:164
chr17	10550845	rs142213434	TTTTTG	T	145.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.395;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.873;NF=0;NR=5;PP=193;ReadPosRankSum=-0.415;SC=CCCCCTAAAATTTTTGTTTTG;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=5;WE=10550857;WS=10550835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,6:0.24:25
chr17	10553046	rs1989810	A	G	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.144;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=170;ReadPosRankSum=1.227;SC=CAAGTCTGTTAGTATAAACAG;SOR=1.094;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=72;TCF=33;TCR=39;TR=18;WE=10553054;WS=10553036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,21:0.26:80
chr17	10555028	rs2285466	G	A	513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=18;PP=252;ReadPosRankSum=0.172;SC=GTATGTATGTGCATATGGAAA;SOR=0.733;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=90;TCF=33;TCR=57;TR=28;WE=10555036;WS=10555018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,31:0.34:91
chr17	10555049	rs138453847	TTTA	T	156.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.53;ReadPosRankSum=1.407;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,6:0.25:24
chr17	10595388	rs2520178	A	G	3207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=68;PP=2077;SC=AGGTGTTTTGAAAGCAGATGG;SOR=1.490;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=38;TCR=68;TR=106;WE=10595396;WS=10595378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr17	10608518	rs34940296	T	G	2876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.199;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=59;PP=1750;ReadPosRankSum=-0.238;SC=TCCCTAGAACTTGTTATGGAC;SOR=0.764;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=179;TCF=91;TCR=88;TR=114;WE=10608526;WS=10608508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,131:0.65:200
chr17	10614051	rs3215180	AT	A	271.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.930;NF=8;NR=2;PP=116;ReadPosRankSum=0.410;SC=TGAGATAGCAATTTTTTTTTC;SOR=0.693;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=10;WE=10614059;WS=10614041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr17	10614442	rs406446	A	G	2220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.121;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=52;PP=1386;ReadPosRankSum=0.109;SC=TACAAGAAAGAAAGAGCCTTC;SOR=1.207;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=110;TCF=38;TCR=72;TR=76;WE=10614450;WS=10614432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,87:0.70:125
chr17	10618665	rs10676707	A	AAACT	253.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.210;NF=4;NR=0;PP=163;ReadPosRankSum=0.210;SC=GAGTTTTAAAACTATTAGCCC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=10618673;WS=10618655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr17	10632174	rs453318	A	G	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=254;ReadPosRankSum=-0.590;SC=ACATTACATTAGAACTCTGAT;SOR=0.693;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=13;WE=10632182;WS=10632164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr17	10632499	rs421541	G	A	375.10	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5083;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=252;ReadPosRankSum=0.772;SC=GGCATCGAGGGTACAAAATCT;SOR=0.560;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=16;WE=10632507;WS=10632489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,16:0.89:18
chr17	10633181	rs3826448	A	G	954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=14;PP=448;ReadPosRankSum=1.805;SC=CTCGGAGAACACGGCGCGGGG;SOR=0.850;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=54;TCF=35;TCR=19;TR=40;WE=10633189;WS=10633171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,46:0.73:63
chr17	10633245	rs202312	T	C	1561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=23;PP=790;SC=CGGTCCGCCTTCCTCCTTGCG;SOR=0.871;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=47;TCF=24;TCR=23;TR=47;WE=10633253;WS=10633235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr17	10633320	rs57860819	G	GT	304.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=2.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.93;MQRankSum=2.922;QD=13.85;ReadPosRankSum=-0.820;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr17	10633321	.	CC	TC	527	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=1.0000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MMLQ=25;MQ=65.19;NF=1,3;NR=12,6;PP=527,149;QD=45.4496738824;SC=CGTCGCTCCGCCCGGGGGCGG;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13,9;WE=10633329;WS=10633311;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr17	10633321	.	CC	CGC	527	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=1.0000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MMLQ=25;MQ=65.19;NF=1,3;NR=12,6;PP=527,149;QD=45.4496738824;SC=CGTCGCTCCGCCCGGGGGCGG;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13,9;WE=10633329;WS=10633311;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:0,13:1.00:13
chr17	10633321	rs60373482	C	CG,G	849.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;ALERT;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=64.28;QD=38.62;SOR=1.931;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,8,14:0.36,0.64:22
chr17	10633358	rs202311	C	T	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.188;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=60;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.670;NF=1;NR=6;PP=83;ReadPosRankSum=-1.191;SC=GTGTAGCCCCCACTCAGCGAC;SOR=1.085;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=7;WE=10633366;WS=10633348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr17	11459012	rs1030055	G	C	684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=1;PP=479;SC=ACCTGCCACAGACATGGTCCT;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=11459020;WS=11459002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	11511412	rs4792156	A	G	965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=5;PP=607;SC=GAATTGGAACACCTGCCTTTC;SOR=2.712;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=32;WE=11511420;WS=11511402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr17	11511457	rs11078022	C	T	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=304;ReadPosRankSum=1.030;SC=TTGTTCTACCCGTCCTGGCCA;SOR=0.749;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=69;TCF=51;TCR=18;TR=24;WE=11511465;WS=11511447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,24:0.33:72
chr17	11511622	rs374405924	G	A	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.708;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=24;PP=563;ReadPosRankSum=1.124;SC=TGGAGTTTGCGGATTCCAAAA;SOR=1.051;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=96;TCF=39;TCR=57;TR=37;WE=11511630;WS=11511612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,39:0.36:107
chr17	11513661	rs2191072	C	T	926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=7;PP=555;SC=ATTTTCACGCCTCAGGGTTTT;SOR=1.751;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=28;WE=11513669;WS=11513651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr17	11522764	rs10852799	G	A	1007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=8;PP=610;SC=TATTATCCTCGTGAAAAATAT;SOR=1.949;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=32;WE=11522772;WS=11522754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr17	11523082	rs9892256	A	G	2875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=59;PP=1852;SC=TTCCTGGGACAACTGCACGTG;SOR=1.633;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=31;TCR=59;TR=90;WE=11523090;WS=11523072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr17	11555990	rs4792159	T	C	41.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=1;PP=24;SC=CACTCGCAAGTATTAAATCCC;SOR=0.693;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=2;TCF=1;TCR=1;TR=2;WE=11555998;WS=11555980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr17	11583089	rs8071438	T	C	4742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=60;PP=2382;SC=CCAACCTGGATGCGTTTATAA;SOR=1.172;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=153;TCF=92;TCR=61;TR=151;WE=11583097;WS=11583079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr17	11604598	rs7214186	T	A	481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=12;PP=294;SC=TCCTCCATGGTTGGGGCTGTC;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=11604606;WS=11604588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	11622494	rs12945437	A	G	323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=7;NR=1;PP=210;SC=TTGCCCGCTAAAGAGTCCTCC;SOR=2.303;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=11622502;WS=11622486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	11648332	rs3744578	C	T	5539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=97;NR=88;PP=2965;SC=GAGACCCCAACTTCGAAGCTT;SOR=0.731;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=185;TCF=97;TCR=88;TR=185;WE=11648340;WS=11648322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr17	11648444	rs3744580	T	C	2278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=45;PP=1461;SC=ATCTCTTACTTATTGTCCAGG;SOR=1.552;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=27;TCR=45;TR=72;WE=11648452;WS=11648434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr17	11660722	rs11078030	G	T	298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=2;PP=203;SC=CCATTTACCCGCTCACATCTT;SOR=2.303;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=11660730;WS=11660712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	11672607	rs61744697	G	T	905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FS=2.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.72;ReadPosRankSum=0.643;SOR=0.886;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:140,52:0.27:192
chr17	11715010	rs112460231	T	C	932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.625;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.139;NF=27;NR=20;PP=668;ReadPosRankSum=1.317;SC=ACCTCGTCTCTACCTAGGACG;SOR=0.793;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=142;TCF=81;TCR=61;TR=47;WE=11715018;WS=11715000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,51:0.31:162
chr17	11772285	rs59647695	C	T	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=33;ReadPosRankSum=1.520;SC=AGATCTTCCCCGAATGTGCTT;SOR=0.148;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=4;WE=11772293;WS=11772275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr17	11778240	rs7211854	G	A	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.922;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=96;ReadPosRankSum=-1.404;SC=TGTTCTGAGCGTGGGGTGGTG;SOR=0.283;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=11;WE=11778248;WS=11778230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr17	11778577	rs11396360	G	GC	558.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=0.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.127;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.252;NF=0;NR=13;PP=328;ReadPosRankSum=-2.140;SC=CAGATTTTAAGCCCAGTGAAT;SOR=0.512;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=13;WE=11778585;WS=11778567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,23:0.40:57
chr17	11786951	rs8070256	T	C	4135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=66;PP=2501;SC=CCTGAAAACGTTGGAAGACAG;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=74;TCR=66;TR=140;WE=11786959;WS=11786941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr17	11787936	rs11868929	A	G	2973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=52;PP=1675;SC=TGGGTAAGACAGATAAACCAG;SOR=1.089;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=43;TCR=52;TR=95;WE=11787944;WS=11787926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr17	11787975	rs11078042	T	C	1997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=40;PP=1219;SC=TGAGGGACAGTTGAGGTTGGA;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=22;TCR=40;TR=62;WE=11787983;WS=11787965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr17	11806266	rs3815269	T	C	152.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=5;PP=117;SC=AGCATAGGCATGGGGCAAGGG;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=11806274;WS=11806256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	11827353	rs2286300	T	C	1451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=18;NR=29;PP=845;SC=CTTCTCCCCATCTGTCCTTTC;SOR=1.402;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=18;TCR=29;TR=47;WE=11827361;WS=11827343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	11833287	rs2286303	A	G	3066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.601;HP=2;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=52;PP=1860;ReadPosRankSum=0.029;SC=GTGCAGAGCCAGCACCCTCCC;SOR=0.878;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=186;TCF=105;TCR=81;TR=125;WE=11833295;WS=11833277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,135:0.67:202
chr17	11833365	rs1859887	G	A	3170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.534;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=60;PP=2013;ReadPosRankSum=-2.236;SC=AGCCCCCCACGGGCATGCATG;SOR=0.639;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=190;TCF=101;TCR=89;TR=129;WE=11833373;WS=11833355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,140:0.67:210
chr17	11835331	rs17612861	G	A	1217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.750;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=14;PP=624;ReadPosRankSum=-0.266;SC=CTCATTTCAGGACACTCTGGA;SOR=0.923;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=80;TCF=53;TCR=27;TR=47;WE=11835339;WS=11835321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,56:0.61:92
chr17	11837161	rs12948962	T	C	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.410;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=181;ReadPosRankSum=1.684;SC=GTGGAGGTCTTTCTTCCTTCC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=9;WE=11837169;WS=11837151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr17	11840528	rs2240521	A	C	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=84;ReadPosRankSum=0.903;SC=GGAGAGGGTGATGAAGTCAAC;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=5;WE=11840536;WS=11840518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr17	11886542	rs34660389	C	T	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.076;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.393;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=163;ReadPosRankSum=-0.875;SC=CCTCCTTCACCACCTCCCCAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=8;WE=11886550;WS=11886532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr17	11886864	rs17613212	T	C	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.056;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=163;ReadPosRankSum=0.372;SC=CTTAGAACAGTGTGTGGAGCT;SOR=0.154;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=11;WE=11886872;WS=11886854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr17	11985459	.	TA	T	97.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.563;ClippingRankSum=0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.62;ReadPosRankSum=-0.283;SOR=0.489;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr17	12606826	rs62058697	A	G	1353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.810;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=18;PP=809;ReadPosRankSum=0.276;SC=TATAATTGCTATTCCCTCTTA;SOR=0.851;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=55;TCR=28;TR=54;WE=12606834;WS=12606816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,61:0.64:96
chr17	12620761	rs12944823	A	G	978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.195;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=32;PP=642;ReadPosRankSum=-0.900;SC=GAAATCAGACACCAAGAGATG;SOR=0.791;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=180;TCF=81;TCR=99;TR=55;WE=12620769;WS=12620751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,60:0.29:205
chr17	12620897	rs12602716	G	A	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=131;ReadPosRankSum=-0.044;SC=TCTAGGCCACGTAGATACCCA;SOR=0.593;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=9;WE=12620905;WS=12620887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr17	12647490	rs12709295	T	C	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.794;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=12;PP=410;ReadPosRankSum=-0.078;SC=TTTCCTCATCTTCTTTGCAGT;SOR=0.827;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=92;TCF=60;TCR=32;TR=33;WE=12647498;WS=12647480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,35:0.34:104
chr17	12656711	rs4792277	G	A	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.543;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=515;ReadPosRankSum=0.493;SC=TTCTGGAAGTGGGTTACAAAT;SOR=2.760;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=22;WE=12656719;WS=12656701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,24:0.65:37
chr17	12664177	rs16946572	T	C	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.021;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=72;ReadPosRankSum=-0.521;SC=TCTCGCACATTTTTAGAGCTG;SOR=0.197;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=8;WE=12664185;WS=12664167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr17	12799985	rs2302068	G	A	837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.545;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=486;ReadPosRankSum=-0.835;SC=TTTTCTGTGGGGTAATGACCC;SOR=0.392;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=29;WE=12799993;WS=12799975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,34:0.71:48
chr17	12820421	rs35221864	T	C	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=159;ReadPosRankSum=0.050;SC=GGACACTCCATCTATATAAAA;SOR=0.818;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=11;WE=12820429;WS=12820411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr17	12820632	rs12451747	A	C	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.702;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=245;ReadPosRankSum=0.295;SC=CAGAGAAGCCAGTAGCATGGC;SOR=0.346;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=19;WE=12820640;WS=12820622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
chr17	12855719	rs2072253	G	A	2307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=19;PP=1366;SC=GTCAGTTACAGTGGTTGGTAT;SOR=1.725;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=49;TCR=19;TR=68;WE=12855727;WS=12855709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr17	12856005	rs2072252	A	G	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.902;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=27;ReadPosRankSum=0.328;SC=ATAGCATTTTATGATGTCCAA;SOR=0.086;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=3;WE=12856013;WS=12855995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr17	12859125	rs3214256	C	CG	583.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.263;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=2.997;NF=6;NR=10;PP=380;ReadPosRankSum=-1.391;SC=GTCCAGTCCCCGGGGGACATG;SOR=0.392;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=59;TCF=33;TCR=26;TR=16;WE=12859134;WS=12859115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,29:0.37:78
chr17	12859149	rs2190698	C	T	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=3.533;NF=18;NR=12;PP=377;ReadPosRankSum=1.673;SC=GGTGTTGAGCCTTGGTTAAAC;SOR=0.673;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=102;TCF=63;TCR=39;TR=30;WE=12859157;WS=12859139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,33:0.29:112
chr17	12860183	rs10602009	AACACAC	A	53.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=4;PP=135;SC=TTCCCCTATAAACACACACAC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=12860196;WS=12860173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr17	12862170	rs3213687	C	T	3905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.373;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=69;PP=2204;ReadPosRankSum=2.517;SC=GGCCCCTCAGCGTCGCCACGG;SOR=0.890;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=223;TCF=122;TCR=101;TR=156;WE=12862178;WS=12862151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,176:0.70:250
chr17	12862359	rs9904572	G	A	791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=24;PP=620;SC=AACTGTATCTGCTGTGTCTGG;SOR=3.690;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=27;WE=12862367;WS=12862349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	12897293	rs9915058	A	C	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=218;ReadPosRankSum=-1.155;SC=TAGCCAGCACAATCTCCCCTG;SOR=0.551;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=11;WE=12897301;WS=12897283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr17	12898994	rs2286338	C	G	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.97;ReadPosRankSum=-2.515;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr17	12899726	rs4792308	A	G	870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FS=1.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.56;ReadPosRankSum=-0.974;SOR=0.592;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:138,53:0.28:191
chr17	12899963	rs11545302	T	C	657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=2.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.39;ReadPosRankSum=1.134;SOR=0.853;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,42:0.34:122
chr17	12901544	rs11443554	T	TA	134.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.813;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=2;PP=90;ReadPosRankSum=-1.655;SC=ATTCCCAGGGTAAAGTTTGCT;SOR=0.105;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=5;WE=12901552;WS=12901534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
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chr17	12905525	rs56341811	TG	T	158.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.817;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=199;ReadPosRankSum=-0.641;SC=ATTTACTATGTGGCTATTTAC;SOR=1.954;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=7;WE=12905533;WS=12905515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr17	12905574	rs55674356	T	A	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=209;ReadPosRankSum=1.348;SC=ATTCCATTAGTTCAAGATGGC;SOR=0.733;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=66;TCF=53;TCR=13;TR=18;WE=12905582;WS=12905564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,19:0.27:70
chr17	12905743	rs55825263	G	A	1710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.447;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=42;PP=860;ReadPosRankSum=0.569;SC=ACAAGGGGCCGGTCTGAGACA;SOR=0.658;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=262;TCF=129;TCR=133;TR=86;WE=12905751;WS=12905733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:191,100:0.34:291
chr17	12908204	rs4792309	T	C	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.310;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=106;ReadPosRankSum=-0.352;SC=TAAACCCAGATAGTGGTCTTC;SOR=0.200;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=7;WE=12908212;WS=12908194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,7:0.27:26
chr17	12909046	rs3217019	A	AATC	514.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.80;ReadPosRankSum=-0.928;SOR=0.752;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,16:0.24:66
chr17	12914024	rs2302069	T	C	1132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FS=0.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.36;ReadPosRankSum=-0.392;SOR=0.757;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:186,74:0.28:260
chr17	12914832	rs73981621	C	T	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=11.335;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.22;ReadPosRankSum=0.328;SOR=0.010;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr17	12914834	rs73981622	A	C	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=12.330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.36;ReadPosRankSum=0.619;SOR=0.008;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr17	12914920	rs41494747	A	G	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=3.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.74;ReadPosRankSum=-0.400;SOR=1.219;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,21:0.26:81
chr17	12915009	rs4792311	G	A	1317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.477;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=28;PP=649;ReadPosRankSum=1.231;SC=ATTTTCATTCGACTCGGAGTC;SOR=0.552;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=152;TCF=78;TCR=74;TR=62;WE=12915017;WS=12914999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,72:0.42:172
chr17	12920260	rs58809197	A	G	1520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.013;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=35;PP=1037;ReadPosRankSum=0.018;SC=CTAAGAATGAAAAAACATTTA;SOR=0.799;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=241;TCF=127;TCR=114;TR=77;WE=12920268;WS=12920250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:184,84:0.31:268
chr17	12921348	rs4792315	G	C	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.870;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=8;PP=131;ReadPosRankSum=-0.070;SC=TCCGCATGGCGGATCCAGCCA;SOR=0.339;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=32;TCF=14;TCR=18;TR=16;WE=12921356;WS=12921338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,17:0.46:37
chr17	13399486	rs200853608	A	ATT	36.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.26;MQRankSum=2.608;QD=0.45;ReadPosRankSum=-0.718;SOR=0.673;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,10:0.12:81
chr17	13399616	rs62057033	A	T	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=4.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.63;MQRankSum=0.084;QD=3.38;ReadPosRankSum=-0.381;SOR=0.316;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,24:0.27:89
chr17	13446924	rs9913045	G	A	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=205;ReadPosRankSum=-1.723;SC=GACAAAAACCGCGATTACTTT;SOR=0.818;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=36;TCF=24;TCR=12;TR=18;WE=13446932;WS=13446914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr17	13928074	rs62052312	A	C	1035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=1.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.718;NF=28;NR=21;PP=706;ReadPosRankSum=-0.726;SC=TCAGGAGCTCATTGAGGCACA;SOR=0.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=99;TCF=56;TCR=43;TR=49;WE=13928082;WS=13928064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,50:0.51:98
chr17	13972811	rs6502330	G	A	372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=4;PP=222;SC=GCCGGAAGTGGCGGCCCGGAA;SOR=1.329;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=13;WE=13972819;WS=13972801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	13972955	rs8076787	C	T	1897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FS=0.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.01;ReadPosRankSum=-1.459;SOR=0.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,93:0.59:158
chr17	13977813	rs143814384	C	CTTTA	2430.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=24;PP=1324;SC=TACTTTCTGCCTTTTTCTCTG;SOR=2.024;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=25;WE=13977821;WS=13977803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr17	13980058	rs2230351	A	T	3801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=1.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.959;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=61;PP=2091;ReadPosRankSum=0.351;SC=TTAGTATGTCACACAGCTGAA;SOR=0.769;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=225;TCF=127;TCR=98;TR=142;WE=13980066;WS=13980048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,168:0.62:270
chr17	13980350	rs2072279	G	A	701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.750;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=22;PP=440;ReadPosRankSum=-0.270;SC=ATTTTGGCTCGACTATCCAAA;SOR=0.981;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=95;TCF=34;TCR=61;TR=32;WE=13980358;WS=13980340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,36:0.33:109
chr17	14005373	rs1017076	C	T	1768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=35;NR=24;PP=1007;SC=TTTTGTCGTTCTGGCCTTTAC;SOR=0.917;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=35;TCR=24;TR=59;WE=14005394;WS=14005363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr17	14005386	rs2108683	T	C	1865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=34;NR=28;PP=1056;SC=GCCTTTACAGTTGGGACTCCT;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=34;TCR=28;TR=62;WE=14005394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr17	14005439	rs2159132	G	A	1249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=24;PP=754;ReadPosRankSum=-1.257;SC=TCGCAGCTCTGGTTGTAAGTA;SOR=0.746;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=34;TCR=31;TR=49;WE=14005447;WS=14005429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,56:0.73:77
chr17	14005647	rs3217030	C	CAT	104.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=141;ReadPosRankSum=2.450;SC=CTTCCAAACTCATATATTGAT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=14005655;WS=14005637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr17	14063389	rs7212977	G	T	167.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=2;NR=8;PP=151;SC=AAGAAACAAAGTGATATGGAA;SOR=2.093;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=14063397;WS=14063379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	14095309	rs2230354	A	G	2994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=35;PP=1797;SC=TTTCCAGCCCATTGCTAGCTG;SOR=1.169;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=109;TCF=73;TCR=36;TR=108;WE=14095317;WS=14095299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr17	14095566	rs151441	T	C	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=3.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=19.412;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-6.441;NF=55;NR=43;PP=1653;ReadPosRankSum=0.756;SC=TGGAGTCTCATATGAGCACAC;SOR=1.034;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=232;TCF=103;TCR=129;TR=98;WE=14095574;WS=14095556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,29:0.18:159
chr17	14095639	rs373313742	A	G	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=19.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.38;MQRankSum=-0.984;QD=3.63;ReadPosRankSum=-5.024;SOR=1.675;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:121,39:0.24:160
chr17	14095682	rs2158978	T	C	2544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=60;PP=1996;SC=GACTGAAATTTTGTGGACGCA;SOR=0.714;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=51;TCR=60;TR=111;WE=14095690;WS=14095672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr17	14110041	rs4792446	G	A	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-3.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.906;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=113;ReadPosRankSum=-0.168;SC=GTGCCAGGCAGGCTCTCCCAG;SOR=0.223;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=9;WE=14110049;WS=14110031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr17	14139414	rs146117581	C	G	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=10.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.11;MQRankSum=-4.004;QD=16.20;ReadPosRankSum=-1.751;SOR=1.975;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr17	14139565	rs4791563	T	C	270.79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=2.220;NF=6;NR=3;PP=140;ReadPosRankSum=1.615;SC=ACGCTTTCAGTTCCAGGGTTA;SOR=0.399;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=9;WE=14139573;WS=14139555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,10:0.91:11
chr17	14139774	rs4791564	C	A	844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.53;QD=27.25;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr17	14139891	rs62052131	A	C	1815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=37;NR=38;PP=1035;SC=CACCTCACCAAGTGTCTGTGC;SOR=0.869;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=37;TCR=38;TR=75;WE=14139899;WS=14139881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr17	14140103	rs4792453	A	G	269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=3;NR=6;PP=137;SC=CACTCCCTCCATTCCTGAAGC;SOR=1.270;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=14140111;WS=14140093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	14248423	rs9906855	T	C	2450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=55;PP=1473;SC=GGGAGGCCCCTGCGCGCATCT;SOR=1.744;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=25;TCR=55;TR=80;WE=14248431;WS=14248413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr17	14673431	rs72815721	C	A	858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.061;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=8;PP=447;ReadPosRankSum=0.174;SC=ACAGCTGGGCCAGTGACAGAG;SOR=0.551;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=49;TCF=34;TCR=15;TR=28;WE=14673439;WS=14673410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,38:0.66:58
chr17	15207364	rs13961	T	G	3282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=43;PP=1776;SC=CATACTCGAGTGTGGCTTTGA;SOR=0.871;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=59;TCR=43;TR=102;WE=15207372;WS=15207354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr17	15217389	rs230897	G	A	2186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=13;PP=1480;SC=CAGCCGTGGCGTGTGCCTGAC;SOR=2.712;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=53;TCR=13;TR=66;WE=15217397;WS=15217379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr17	15217437	rs230898	C	G	4473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=90;NR=51;PP=2617;SC=GCGGAAGTAGCCGACACCGTC;SOR=1.256;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=90;TCR=51;TR=141;WE=15217445;WS=15217427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr17	15343524	rs71150251	C	CCTT	5650.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=37;PP=2863;SC=CCCAACCCTACCTTCTTTCTT;SOR=0.757;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=65;TCF=22;TCR=43;TR=55;WE=15343532;WS=15343514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr17	15406123	rs71974269	CCTCT	C	964.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.47;QD=41.94;SOR=1.708;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	15468718	.	G	A	58	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=26;MMLQ=23;MQ=47.7;NF=5;NR=1;PP=58;QD=15.4618687579;SC=TTTGGCTCAGGGGAAGATAAT;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=6;WE=15468726;WS=15468708;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:5,6:0.55:11
chr17	15469104	.	CTT	C	3709.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=1.792;ClippingRankSum=0.000;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=20.345;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-9.717;NF=6;NR=75;PP=2851;ReadPosRankSum=0.032;SC=CGAGGCCGTTCTTTCTTAAGA;SOR=1.569;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=233;TCF=35;TCR=198;TR=81;WE=15469113;WS=15469094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:194,105:0.35:299
chr17	15492409	rs151442	T	C	387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.92;QD=29.83;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	15492426	rs28445278	C	T	921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=6.363;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.52;MQRankSum=-1.718;QD=27.93;ReadPosRankSum=1.443;SOR=3.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,31:0.94:33
chr17	15602900	rs2601942	T	G	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.588;NF=5;NR=1;PP=43;ReadPosRankSum=0.803;SC=TCTTCGATCGTCCGATTCTCC;SOR=0.138;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=6;WE=15602908;WS=15602891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr17	15602924	rs72819895	G	C	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.652;NF=11;NR=1;PP=216;ReadPosRankSum=-0.794;SC=CCGCACCACGGGTGCTCCCAC;SOR=0.260;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=12;WE=15602932;WS=15602914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr17	15602950	rs12449956	G	T	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.378;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-5.338;NF=8;NR=4;PP=112;ReadPosRankSum=-1.606;SC=GAGAACCGGAGTCTGGCGATG;SOR=0.437;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=12;WE=15602958;WS=15602940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,14:0.37:38
chr17	15603021	rs12452845	T	C	640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.88;MQRankSum=-8.724;QD=6.67;ReadPosRankSum=1.603;SOR=0.831;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,22:0.23:96
chr17	15603031	rs12450403	G	T	618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.88;MQRankSum=-8.980;QD=6.31;ReadPosRankSum=1.006;SOR=0.781;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,21:0.21:98
chr17	15604395	rs77257979	TG	CA	1607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=8;PP=926;SC=TATGTTGAAGTGGTTTTTAGA;SOR=3.321;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=44;TCF=35;TCR=9;TR=41;WE=15604404;WS=15604385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr17	15604444	rs4792655	A	G	2860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=34;PP=1873;SC=AGGTCTCATCATTACTGCTTT;SOR=1.483;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=73;TCR=34;TR=107;WE=15604452;WS=15604434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr17	15607713	rs55992307	C	T	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.456;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=10.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQRankSum=-0.473;QD=14.43;ReadPosRankSum=1.899;SOR=2.526;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr17	15611495	rs3760299	T	C	1266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.161;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=26;PP=714;ReadPosRankSum=-0.429;SC=ACCTGAGAGCTACAACTTGGA;SOR=0.603;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=179;TCF=106;TCR=73;TR=59;WE=15611503;WS=15611485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,69:0.34:200
chr17	15613021	rs2654397	C	T	271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=4;PP=139;SC=CATTGTATTTCGATATTAATC;SOR=1.270;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=12;WE=15613029;WS=15613011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	15613114	rs142143149	AT	A	102.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=2.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQRankSum=-0.918;QD=5.71;ReadPosRankSum=-0.635;SOR=0.669;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr17	15620647	rs61435333	G	A	445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.46;QD=27.86;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	15884227	rs2286796	A	G	601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.042;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=422;ReadPosRankSum=-1.438;SC=CTGAAGACAAAGACAAAAAAC;SOR=1.688;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=22;WE=15884235;WS=15884217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,24:0.71:34
chr17	15884561	rs10491104	C	T	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=176;ReadPosRankSum=1.335;SC=CAAATTGCACCGAGAAGAACT;SOR=1.329;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=10;WE=15884569;WS=15884551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr17	15903602	rs758853	C	A	141.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5731;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=134;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GCGCGGTAGCCTTTGTGAGCG;SOR=1.609;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=8;WE=15903610;WS=15903592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr17	15905190	rs3760298	A	G	635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=412;ReadPosRankSum=1.417;SC=TGCATCTACTATATGTTTCAT;SOR=0.714;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=46;TCF=36;TCR=10;TR=25;WE=15905198;WS=15905180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,27:0.54:50
chr17	15905941	.	A	G	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.655;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=56;ReadPosRankSum=-0.712;SC=TAATTCTCACATGATTGCTGT;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=15905949;WS=15905931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr17	15909728	rs3760297	A	G	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.361;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=107;ReadPosRankSum=0.067;SC=CCATCTCAACAGAAGGAAGAA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=8;WE=15909744;WS=15909718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr17	15928584	rs2301652	T	G	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.031;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=166;ReadPosRankSum=1.743;SC=CAGCAGATGGTCCTAGATCCT;SOR=1.214;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=10;WE=15928592;WS=15928574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr17	15930087	rs35168566	G	A	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.341;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=328;ReadPosRankSum=0.052;SC=GATTTGTGAAGTGGTATGTAG;SOR=1.508;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=16;WE=15930095;WS=15930077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr17	15943910	rs1075901	T	C	593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.237;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=361;ReadPosRankSum=-1.064;SC=TTTTTATTTTTCATGATCTCA;SOR=0.998;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=41;TCF=15;TCR=26;TR=25;WE=15943918;WS=15943900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,27:0.63:43
chr17	15950198	rs1079533	G	A	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.054;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=233;ReadPosRankSum=0.089;SC=TTACAGGAGAGGCAACACTGG;SOR=1.550;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=12;WE=15950206;WS=15950188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr17	15961951	rs2157991	A	G	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=280;ReadPosRankSum=0.191;SC=AACTAATCCCAGGAAAAGTTT;SOR=0.533;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=9;TCR=18;TR=18;WE=15961959;WS=15961941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,24:0.69:35
chr17	15961993	rs2157990	T	A	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=102;ReadPosRankSum=0.906;SC=CCTGTAGCATTTTTTCAATTC;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=7;WE=15962001;WS=15961983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr17	15968143	rs2285583	T	C	1113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=12;PP=651;ReadPosRankSum=0.637;SC=AATGTAAACATGATGGTTCTA;SOR=0.693;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=70;TCF=52;TCR=18;TR=44;WE=15968151;WS=15968133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,48:0.63:76
chr17	15973844	rs12942295	A	T	2138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.482;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=46;PP=1228;ReadPosRankSum=0.336;SC=TGTGCCCTAAAGGGAAAGAAA;SOR=0.537;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=122;TCF=51;TCR=71;TR=80;WE=15973852;WS=15973834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,95:0.68:140
chr17	15977005	rs11078330	A	T	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=242;ReadPosRankSum=-0.909;SC=CTTAACCTACAATAAAATATG;SOR=1.085;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=13;WE=15977013;WS=15976995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,14:0.78:18
chr17	16005187	rs2285580	T	C	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=132;ReadPosRankSum=-0.656;SC=AGAAACCATGTTTGAAAGTAG;SOR=0.551;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=9;WE=16005195;WS=16005177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr17	16041636	rs2875265	T	C	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.29;ReadPosRankSum=-1.834;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr17	16046845	rs2285579	A	T	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-2.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.935;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=299;ReadPosRankSum=0.139;SC=TACATACAAAAAAACCCTTAG;SOR=1.981;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=16;WE=16046853;WS=16046835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,17:0.85:20
chr17	16049626	rs11078333	A	T	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=2.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.74;ReadPosRankSum=1.675;SOR=0.278;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,20:0.62:32
chr17	16052606	rs71299857	C	CATATAT	30.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=79;ReadPosRankSum=0.319;SC=AGATTTAAGTCATATATATAT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=6;TCR=4;TR=3;WE=16052614;WS=16052596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,1:0.25:4
chr17	16097899	rs149293452	C	T	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=10.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQRankSum=-5.846;QD=0.65;ReadPosRankSum=0.401;SOR=0.045;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,6:0.11:55
chr17	16185248	rs3785626	T	G	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.472;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=111;ReadPosRankSum=0.429;SC=ATGCAACCTGTAAGACCCATC;SOR=0.859;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=7;WE=16185256;WS=16185238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr17	16221271	rs56228407	A	AC	758.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=663;SC=CCTGCCCCAGACCCCTGTCTC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=17;WE=16221279;WS=16221261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	16221319	rs9890539	T	C	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.812;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=91;ReadPosRankSum=1.510;SC=TAACTGAAGGTTTTTCACAGT;SOR=0.446;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=6;WE=16221327;WS=16221309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr17	16229232	rs15739	A	G	1028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.954;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=26;PP=603;ReadPosRankSum=-1.569;SC=GGGTTTTCAGATCCAAGGAAC;SOR=0.999;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=69;TCF=30;TCR=39;TR=43;WE=16229240;WS=16229222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,48:0.61:79
chr17	16246016	rs7477	A	C	198.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5564;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=117;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GACCCTAGTCAACGGAACCAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=7;WE=16246024;WS=16246006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr17	16248083	rs9907546	T	A	984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=1.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.58;ReadPosRankSum=0.423;SOR=1.284;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,41:0.77:53
chr17	16251859	rs2286666	A	G	2310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.39;SOR=1.389;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr17	16256240	rs3095172	C	A	357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=3;PP=281;SC=AGGCTCAGAGCTGAAAGGCGC;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=12;WE=16256248;WS=16256234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	16322640	.	G	A	1856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=0.000;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=11;PP=438;ReadPosRankSum=-0.773;SC=CCCTTCCGGGGTCTGTGGGAG;SOR=0.648;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=60;TCF=40;TCR=20;TR=37;WE=16322648;WS=16322630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,48:0.65:74
chr17	16322661	.	T	A	2067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.078;ClippingRankSum=0.000;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=18;PP=587;ReadPosRankSum=0.000;SC=AGATTTCTCATTAGGTGTGCC;SOR=0.683;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=81;TCF=49;TCR=32;TR=49;WE=16322669;WS=16322651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,61:0.63:97
chr17	16323589	rs4273076	C	A	3857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.741;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.089;NF=41;NR=56;PP=1354;ReadPosRankSum=0.510;SC=GGATCCAAGGCTAGGCATCCT;SOR=0.919;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=161;TCF=71;TCR=90;TR=97;WE=16323597;WS=16323572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,112:0.63:177
chr17	16323608	rs68189233	ATAGT	A	3156.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.482;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.127;NF=1;NR=43;PP=2099;ReadPosRankSum=0.768;SC=CTGTGAGCTGATAGTTAGGTG;SOR=0.889;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=82;TCF=5;TCR=77;TR=44;WE=16323619;WS=16323598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,81:0.62:131
chr17	16325968	rs8121	A	G	2431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.625;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=37;PP=1465;ReadPosRankSum=1.516;SC=TTAAGGACGGAGTCAATGCCT;SOR=0.498;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=132;TCF=84;TCR=48;TR=99;WE=16325976;WS=16325958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,107:0.76:141
chr17	16326005	rs1129235	A	C	3303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.132;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=63;PP=1647;ReadPosRankSum=-0.813;SC=GCAGATCGACAGGGACTCTGG;SOR=0.527;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=185;TCF=105;TCR=80;TR=142;WE=16326013;WS=16325995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,151:0.77:196
chr17	16326253	rs7225104	G	T	732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.413;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=15;PP=331;ReadPosRankSum=-1.114;SC=AGTAAGGCCTGGTTCAAGGTC;SOR=1.241;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=34;TCF=15;TCR=19;TR=25;WE=16326261;WS=16326243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,32:0.73:44
chr17	16330280	rs151033397	G	A	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=222;ReadPosRankSum=1.873;SC=TAGTGCTGAGGCATGGGCTGC;SOR=1.270;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=13;WE=16330288;WS=16330270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr17	16331820	rs4792742	T	C	814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=24;PP=588;ReadPosRankSum=-1.254;SC=GAAGTCGGGATCTGTGTACAG;SOR=0.745;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=38;TCF=7;TCR=31;TR=30;WE=16331828;WS=16331810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,32:0.73:44
chr17	16335191	rs34786363	C	A	2985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.334;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=58;PP=1603;ReadPosRankSum=0.020;SC=GCCCCCTCCCCCTTCCCCACG;SOR=0.577;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=163;TCF=85;TCR=78;TR=123;WE=16335199;WS=16335181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,137:0.75:183
chr17	16336828	rs7213055	G	A	1498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.857;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=17;PP=839;ReadPosRankSum=1.957;SC=CTTGCCTTGTGTGCCTTTGCC;SOR=0.910;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=84;TCF=57;TCR=27;TR=56;WE=16336836;WS=16336818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,67:0.68:98
chr17	16336992	rs14039	C	G	1161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.647;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=29;PP=708;ReadPosRankSum=-0.295;SC=ATGGCAGCCCCGATGAGCGCT;SOR=1.286;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=66;TCF=27;TCR=39;TR=45;WE=16337000;WS=16336982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,50:0.68:73
chr17	16340316	rs7214366	A	C	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.032;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=264;ReadPosRankSum=0.594;SC=TTCACTAACTAACTCTTCTGG;SOR=0.307;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=22;TCF=9;TCR=13;TR=18;WE=16340324;WS=16340306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,23:0.82:28
chr17	16340405	rs7215836	T	C	51.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=17.09;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	16342813	rs4072454	T	C	3025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.843;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=60;PP=1907;ReadPosRankSum=-1.382;SC=GGAAGACTTATTCGACTGTCC;SOR=0.862;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=178;TCF=88;TCR=90;TR=114;WE=16342821;WS=16342803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,128:0.65:197
chr17	16344314	rs55710649	A	ACT	3758.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=25;PP=2022;ReadPosRankSum=0.234;SC=TCATTAATTGACTGTCATCAG;SOR=0.648;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=92;TCF=44;TCR=48;TR=45;WE=16344322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,96:0.59:163
chr17	16344523	.	C	CA	1196.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.632;ClippingRankSum=0.000;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.931;HP=10;HapScore=3;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=23;PP=591;ReadPosRankSum=0.397;SC=AAACTCGCTTCAAAAAAAAAA;SOR=0.380;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=74;TCF=27;TCR=47;TR=36;WE=16344531;WS=16344513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,54:0.67:81
chr17	16344600	rs4617905	TG	CC	4641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.491;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=52;PP=2944;ReadPosRankSum=-1.350;SC=GGTGAACCTATGGTTTTCTGA;SOR=0.490;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=171;TCF=95;TCR=76;TR=107;WE=16344609;WS=16344590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,117:0.64:184
chr17	16344875	rs9251	C	T	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.34;MQRankSum=0.489;QD=11.22;ReadPosRankSum=-0.514;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr17	16346932	rs4792745	G	T	935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.09;ReadPosRankSum=-0.445;SOR=0.757;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,44:0.71:62
chr17	16347567	rs4438345	T	G	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.771;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.451;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=187;ReadPosRankSum=-0.807;SC=AACACTTGGATGTCGGATGCC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=9;WE=16347575;WS=16347557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr17	16350156	rs1009237	T	C	635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=8.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.18;ReadPosRankSum=-1.164;SOR=0.055;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,27:0.73:37
chr17	16350239	rs2882581	A	G	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=7.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.50;ReadPosRankSum=0.014;SOR=0.065;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,35:0.73:48
chr17	16351592	rs2351084	T	C	1286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.842;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=38;PP=748;ReadPosRankSum=-0.831;SC=CCATGATCCCTGCCACTCCCC;SOR=0.561;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=90;TCF=30;TCR=60;TR=58;WE=16351600;WS=16351582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,60:0.62:97
chr17	16537082	rs17791901	A	G	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.805;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=307;ReadPosRankSum=-0.529;SC=TTGAACAAATATATCTTCAAA;SOR=1.270;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=17;WE=16537090;WS=16537072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr17	16593798	rs2349265	C	T	1061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQRankSum=-1.065;QD=13.44;ReadPosRankSum=-0.205;SOR=0.704;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,50:0.63:79
chr17	16623497	.	GT	G	44.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=0.000;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=4.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.02;MQRankSum=0.000;QD=0.59;ReadPosRankSum=1.710;SOR=0.197;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,12:0.16:76
chr17	16624049	.	T	C	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=0.000;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=9.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.00;MQRankSum=-4.785;QD=1.51;ReadPosRankSum=-2.485;SOR=2.769;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,10:0.17:58
chr17	16734855	rs688852	C	T	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.81;MQRankSum=-8.068;QD=1.03;ReadPosRankSum=1.608;SOR=0.659;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,12:0.18:67
chr17	16734869	rs62074145	A	G	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.60;MQRankSum=-7.682;QD=0.93;ReadPosRankSum=1.239;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,12:0.20:61
chr17	16855878	rs8072293	C	T	4803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=85;NR=73;PP=2548;SC=TAGCCACCCCCGTCCACAGGC;SOR=0.726;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=158;TCF=85;TCR=73;TR=158;WE=16855886;WS=16855868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr17	16892265	rs9907308	G	A	2424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.359;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=41;PP=1484;ReadPosRankSum=-1.131;SC=AGGGATGAATGTGATGCAATG;SOR=0.583;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=141;TCF=85;TCR=56;TR=98;WE=16892273;WS=16892255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,107:0.69:156
chr17	16892334	rs57096150	C	T	3110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.569;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=62;PP=1934;ReadPosRankSum=0.437;SC=CAGCAACGAGCGCGGACAGGC;SOR=0.631;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=179;TCF=88;TCR=91;TR=123;WE=16892342;WS=16892324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,134:0.69:194
chr17	16893462	rs9889250	T	C	1045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.894;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=26;PP=516;ReadPosRankSum=1.029;SC=AGTGCACTTGTGCTTTGTGGC;SOR=1.036;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=80;TCF=39;TCR=41;TR=48;WE=16893470;WS=16893452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,52:0.60:86
chr17	16946343	rs61242604	G	C	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.68;ReadPosRankSum=0.366;SOR=0.602;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,10:0.20:50
chr17	17035036	rs2271520	A	G	3459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=57;NR=59;PP=1878;SC=GGTTTGCCAGATGGCATCCCC;SOR=0.929;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=116;TCF=57;TCR=59;TR=116;WE=17035044;WS=17035026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr17	17046736	rs6502563	T	G	478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=3;PP=362;SC=CTTGCTATGGTGGCTAGGCAG;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=17046744;WS=17046726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	17050573	rs3744134	G	A	540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=0.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.20;ReadPosRankSum=-2.631;SOR=0.587;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,34:0.33:104
chr17	17062241	rs11551189	C	G	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.073;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.469;NF=10;NR=5;PP=132;ReadPosRankSum=-0.953;SC=TGCCCATCGCCCCCGTCCACC;SOR=0.504;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=57;TCF=37;TCR=20;TR=15;WE=17062249;WS=17062231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,19:0.31:62
chr17	17064775	rs5819603	G	GC	710.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.995;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.415;NF=0;NR=12;PP=393;ReadPosRankSum=0.922;SC=CTGAGCAGGGGTGTCTCCCAG;SOR=0.929;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=4;TCR=36;TR=12;WE=17064783;WS=17064765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,24:0.34:70
chr17	17069105	rs3744131	G	A	1486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=42;PP=923;ReadPosRankSum=-1.666;SC=TCAAAGACGTGACCGTGAGGC;SOR=0.680;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=246;TCF=115;TCR=131;TR=79;WE=17069113;WS=17069095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:193,87:0.31:280
chr17	17075318	rs2292530	A	G	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.405;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=108;ReadPosRankSum=-0.177;SC=TTCTTTGACTATTCACTCTGA;SOR=0.173;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=32;TCF=4;TCR=28;TR=10;WE=17075326;WS=17075308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,11:0.31:35
chr17	17118178	rs41442248	G	A	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5339;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=59;ReadPosRankSum=1.383;SC=TTGGAACCCCGCCCCCAACCT;SOR=0.368;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=6;WE=17118186;WS=17118177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr17	17118689	rs34311146	G	A	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.974;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.370;NF=4;NR=19;PP=348;ReadPosRankSum=-0.477;SC=CCTCCCCTGCGCTAGCCCACC;SOR=1.852;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=65;TCF=19;TCR=46;TR=23;WE=17118697;WS=17118679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,24:0.36:67
chr17	17120668	rs4985705	G	C	181.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=4;PP=86;SC=TAAAGGGGCAGAGAGAGAAGT;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=17120676;WS=17120658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	17122286	rs8065572	C	T	198.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=131;SC=CAGCCCATGACTGGCTCTCCT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=17122294;WS=17122284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	17122327	rs8065832	G	A	771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=18;NR=3;PP=388;SC=TGCCCCTGCCGCCTACCTGCC;SOR=1.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=17122335;WS=17122317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	17127471	rs1736219	G	A	1282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=7;NR=32;PP=945;SC=GAGGGACACCGGCGACTCAGA;SOR=3.056;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=7;TCR=32;TR=39;WE=17127479;WS=17127461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr17	17165012	rs139813720	GA	G	78.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.32;MQRankSum=2.721;QD=1.23;ReadPosRankSum=0.776;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,14:0.22:64
chr17	17165136	rs1736210	C	A	1836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=37;PP=1183;SC=GAATGTGTAGCAGACATTCAA;SOR=1.146;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=26;TCR=37;TR=63;WE=17165151;WS=17165126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr17	17168164	rs3182911	G	A	2243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=41;PP=1409;SC=GCCCAGTATAGATCATCCCTC;SOR=0.897;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=38;TCR=41;TR=79;WE=17168172;WS=17168154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr17	17179209	rs9892352	A	T	67.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.43;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	17179299	rs4985760	C	G	1545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=9;PP=1039;SC=AGGAAGTGCACAGTGTTCCAT;SOR=2.259;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=40;TCR=9;TR=49;WE=17179307;WS=17179289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	17179481	rs4985761	G	A	6222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=103;NR=109;PP=2965;SC=CATTTGCCCTGGAAAACAGGA;SOR=0.868;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=212;TCF=103;TCR=109;TR=212;WE=17179489;WS=17179471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr17	17184033	rs3853545	G	T	412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=10;PP=268;SC=CGCTCCCGGCGGCCTAGTCAG;SOR=2.448;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=17184041;WS=17184023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	17184080	rs1029829	G	C	86.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=43;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=0;NR=4;PP=71;SC=ACATGGCGGTGCGCCAATCAC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=17184088;WS=17184070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	17184399	rs2012954	A	C	3736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=79;NR=44;PP=1910;SC=GATCCAGGCCAGTTCCCGGTA;SOR=1.260;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=79;TCR=44;TR=123;WE=17184407;WS=17184389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr17	17394611	rs1242489	G	A	472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.488;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=246;ReadPosRankSum=1.258;SC=AGGACAGCCCGGAGGTCCACC;SOR=1.447;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=28;TCF=18;TCR=10;TR=18;WE=17394619;WS=17394601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,21:0.66:32
chr17	17409401	rs3816511	G	A	1076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=11;PP=746;SC=TACCATGGCCGCTCTGACCTG;SOR=1.148;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=20;TCR=11;TR=31;WE=17409409;WS=17409391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr17	17409560	rs7946	C	T	3858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=60;PP=2232;SC=AGGAGAGCCACTATGTAGGTG;SOR=0.707;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=67;TCR=60;TR=127;WE=17409568;WS=17409550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr17	17409709	rs1918249	T	A	484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=407;SC=GCCGTGACCCTGGCCCTCCGG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=17409717;WS=17409699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	17412032	rs4646407	G	C	4532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=82;NR=67;PP=2544;SC=CCTCTGACCCGCCGGGGGAGC;SOR=0.839;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=83;TCR=67;TR=149;WE=17412040;WS=17412022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr17	17480187	rs8068641	A	G	5847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.98;ReadPosRankSum=-1.691;SOR=0.691;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,145:0.69:209
chr17	17480195	rs2124344	A	G	5993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.76;ReadPosRankSum=-0.182;SOR=0.685;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,152:0.68:224
chr17	17682484	rs1006656	G	A	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=1.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.79;ReadPosRankSum=-0.778;SOR=0.437;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,15:0.28:54
chr17	17696531	rs3803763	G	C	680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.692;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=16;PP=396;ReadPosRankSum=0.069;SC=ACACAGCAAGGCCTGCAGGGG;SOR=0.995;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=90;TCF=43;TCR=47;TR=30;WE=17696539;WS=17696521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,36:0.33:108
chr17	17696755	rs11649804	C	A	1033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.732;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=21;PP=675;ReadPosRankSum=-0.477;SC=CGCCCAGGTGCCCTTTCGGAC;SOR=0.563;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=99;TCF=59;TCR=40;TR=47;WE=17696763;WS=17696745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,49:0.46:107
chr17	17697093	rs371983878	CCAG	C	530.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.987;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.513;NF=8;NR=10;PP=1009;ReadPosRankSum=2.109;SC=TCAGCTATGACCAGCAGCAGC;SOR=0.321;Source=Platypus;TCF=9;TR=18;WE=17697110;WS=17697083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,24:0.57:42
chr17	17697098	rs35068024	AGC	A	257.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=2.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.26;MQRankSum=1.016;QD=5.15;ReadPosRankSum=-2.081;SOR=1.150;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,16:0.32:50
chr17	17697101	rs34083643	AG	A	257.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=2.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.26;MQRankSum=1.016;QD=5.15;ReadPosRankSum=-2.164;SOR=1.150;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,16:0.32:50
chr17	17697102	.	G	A	236	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=28;NF=12;NR=3;PP=236;QD=18.0514141698;SC=ACCAGCAGCAGCAGCAGCAGC;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=49;TCF=35;TCR=14;TR=15;WE=17697110;WS=17697083;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:34,15:0.31:49
chr17	17698254	rs8067439	G	A	3168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.600;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=51;PP=2075;ReadPosRankSum=0.565;SC=CTGGGGAGCCGGAGGCCCTGC;SOR=1.110;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=190;TCF=107;TCR=83;TR=126;WE=17698262;WS=17698244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,136:0.67:202
chr17	17700573	rs4925112	T	C	2516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=51;PP=1202;ReadPosRankSum=-1.713;SC=CCCTGCAGCCTGGGGGGACTG;SOR=0.743;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=130;TCF=63;TCR=67;TR=96;WE=17700581;WS=17700563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,111:0.73:153
chr17	17700792	rs35686634	C	T	4266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.770;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=76;PP=2430;ReadPosRankSum=-0.057;SC=CCTCCCAGCCCCCGGAGGGCA;SOR=0.815;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=271;TCF=143;TCR=128;TR=169;WE=17700800;WS=17700782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,190:0.64:296
chr17	17715101	rs11868035	G	A	821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.910;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=24;PP=554;ReadPosRankSum=1.241;SC=CCAGGGACCTGATGGGGACAG;SOR=1.054;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=106;TCF=53;TCR=53;TR=41;WE=17715109;WS=17715091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,44:0.38:115
chr17	17715317	rs2297508	C	G	1667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=23;PP=972;ReadPosRankSum=0.527;SC=GGAAGCCTTTCCCTAGGTGCT;SOR=0.690;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=101;TCF=65;TCR=36;TR=65;WE=17715325;WS=17715307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,71:0.66:108
chr17	17716662	rs11653007	G	C	247.31	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5958;FS=4.393;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=148;ReadPosRankSum=-0.402;SC=CACATCCCTGGTCAGCAGCTG;SOR=1.447;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=9;WE=17716670;WS=17716652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,10:0.91:11
chr17	17721457	rs4925115	A	G	185.53	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=58;ReadPosRankSum=-0.385;SC=TGAGGTGGGCAGGGCAGAGGG;SOR=1.022;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=8;WE=17721465;WS=17721447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,9:0.90:10
chr17	17723843	rs147255505	AAGG	A	3676.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.362;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.832;NF=11;NR=37;PP=2057;ReadPosRankSum=0.106;SC=TGTCTGTGAAAAGGAGAAGAG;SOR=0.574;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=75;TCF=13;TCR=62;TR=48;WE=17723853;WS=17723833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,95:0.65:146
chr17	17726965	rs12936927	C	T	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=328;ReadPosRankSum=0.826;SC=AGCGCTGCGGCGCGCCCGCCC;SOR=0.922;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=20;WE=17726973;WS=17726955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,23:0.61:38
chr17	17740164	rs60282872	GC	G	671.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=1.631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.15;ReadPosRankSum=-0.188;SOR=0.428;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,23:0.62:37
chr17	17770355	rs11657074	G	A	680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=515;ReadPosRankSum=-1.069;SC=GTCCCACCTGGGGGCTAGGGA;SOR=0.793;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=40;TCF=10;TCR=30;TR=29;WE=17770363;WS=17770345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,28:0.70:40
chr17	17774118	rs9907287	C	T	669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=17;PP=360;ReadPosRankSum=2.681;SC=CCTCAAGCCCCGCACTGAGCC;SOR=0.662;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=16;TCR=25;TR=28;WE=17774126;WS=17774108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,32:0.70:46
chr17	17875407	rs59304093	A	G	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=89;ReadPosRankSum=1.082;SC=AGCGCCCGGCAAAGGCCCGAC;SOR=0.859;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=20;TCF=11;TCR=9;TR=10;WE=17875415;WS=17875397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr17	17880877	rs7219320	A	G	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=7;PP=212;ReadPosRankSum=0.802;SC=CCGTGAAGGAAGAATGCGGTG;SOR=0.722;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=68;TCF=46;TCR=22;TR=19;WE=17880885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,18:0.24:75
chr17	17896090	rs4368210	C	T	496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=2.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.38;ReadPosRankSum=0.094;SOR=0.937;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,37:0.25:147
chr17	17896205	rs4584886	C	T	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FS=3.811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.65;ReadPosRankSum=-0.471;SOR=1.090;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:132,29:0.18:161
chr17	17897739	rs4924832	T	C	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.938;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=16;PP=298;ReadPosRankSum=1.219;SC=CAAGGTACCGTTCCGGCAGGC;SOR=0.401;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=104;TCF=41;TCR=63;TR=31;WE=17897747;WS=17897729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,33:0.30:109
chr17	17900990	rs8071238	T	C	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=72;ReadPosRankSum=-0.969;SC=TCTCCTGCTGTAGGCCCTCCC;SOR=0.446;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=5;WE=17900998;WS=17900980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
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chr17	17948475	rs2955355	G	A	2175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.295;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=31;PP=1192;ReadPosRankSum=-1.112;SC=TGGACACGGGGAACTCTTACC;SOR=0.770;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=130;TCF=77;TCR=53;TR=79;WE=17948483;WS=17948465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,97:0.62:156
chr17	17997209	rs2230316	G	A	2358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.043;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=47;PP=1296;ReadPosRankSum=-0.727;SC=AATCGGCCTCGTCCAAAGGAG;SOR=0.517;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=144;TCF=68;TCR=76;TR=92;WE=17997217;WS=17997199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,108:0.65:166
chr17	18003648	rs854814	G	A	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=170;ReadPosRankSum=-0.900;SC=TGGACAGCCTGTGAGGGGCTT;SOR=0.904;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=11;WE=18003656;WS=18003638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr17	18003671	rs2272570	T	G	1280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=10;PP=910;SC=GGGGTACTCTTCCTAGGTCTC;SOR=1.954;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=31;TCR=10;TR=41;WE=18003679;WS=18003661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr17	18003845	rs854813	C	T	3362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=71;PP=2078;ReadPosRankSum=0.753;SC=TGTGACCCCTCGGTCAGCAGT;SOR=0.681;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=204;TCF=105;TCR=99;TR=143;WE=18003853;WS=18003835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,153:0.67:229
chr17	18005073	rs721669	A	G	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.441;HP=3;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=10;PP=214;ReadPosRankSum=0.236;SC=GCTTGAAACCAGGGTTCCAGC;SOR=0.349;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=59;TCF=23;TCR=36;TR=20;WE=18005081;WS=18005063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,20:0.34:58
chr17	18023897	rs2955365	G	A	800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.604;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=25;PP=534;ReadPosRankSum=-0.132;SC=CAGCCAGAAGGCCCGGGCGGG;SOR=0.748;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=155;TCF=80;TCR=75;TR=48;WE=18023905;WS=18023887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,51:0.28:182
chr17	18024013	rs2955366	A	G	581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.86;ReadPosRankSum=-0.558;SOR=0.682;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,32:0.43:74
chr17	18024266	rs2955367	T	G	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.869;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=129;ReadPosRankSum=0.074;SC=GCAGGCCAGCTGGTGGGCCTT;SOR=1.244;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=33;TCF=22;TCR=11;TR=14;WE=18024274;WS=18024256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,15:0.38:39
chr17	18025744	rs712268	C	G	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=194;ReadPosRankSum=0.370;SC=ACAGATTACACGGAGGGTTTG;SOR=0.593;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=12;WE=18025752;WS=18025734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,12:0.36:33
chr17	18028318	rs854790	C	G	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=6.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.06;ReadPosRankSum=0.432;SOR=1.938;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,9:0.20:44
chr17	18030240	rs854792	T	C	771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.518;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=23;PP=405;ReadPosRankSum=-1.943;SC=GGCCTGCATCTGGCCAGAACT;SOR=1.071;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=110;TCF=49;TCR=61;TR=38;WE=18030248;WS=18030230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,43:0.35:122
chr17	18030524	rs854793	G	A	1399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.480;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=39;PP=858;ReadPosRankSum=-0.064;SC=AACACCCTTTGATAAGCACAC;SOR=0.901;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=198;TCF=90;TCR=108;TR=69;WE=18030532;WS=18030514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,76:0.35:216
chr17	18039263	rs854785	A	T	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=54;ReadPosRankSum=0.545;SC=TGGGTCAGGCATGGAGGGGAG;SOR=0.301;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=6;WE=18039271;WS=18039253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr17	18041507	rs2280777	C	T	1061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.553;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=21;PP=712;ReadPosRankSum=-1.449;SC=CCTCATCTCACTGAAGCCTTA;SOR=0.966;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=184;TCF=112;TCR=72;TR=59;WE=18041515;WS=18041497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,63:0.32:194
chr17	18042276	rs2075658	A	C	808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.550;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=19;PP=453;ReadPosRankSum=-1.854;SC=GTCGGCCTGGACGCTGGTGCT;SOR=0.917;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=88;TCF=48;TCR=40;TR=37;WE=18042284;WS=18042266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,43:0.41:106
chr17	18042527	rs854783	A	G	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=1.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.26;ReadPosRankSum=-1.315;SOR=1.155;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,11:0.19:57
chr17	18042976	rs854782	C	A	205.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.287;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=121;ReadPosRankSum=-2.882;SC=ATGTCCCCACCCCCACACCCA;SOR=0.269;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=42;TCF=12;TCR=30;TR=14;WE=18042984;WS=18042966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,14:0.32:44
chr17	18043766	rs854780	C	G	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.08;ReadPosRankSum=0.609;SOR=0.669;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:105,31:0.23:136
chr17	18043817	rs2072652	C	T	710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.647;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=21;PP=450;ReadPosRankSum=-0.997;SC=TTCCCTGCCCCGACCCCTGCC;SOR=0.619;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=146;TCF=73;TCR=73;TR=42;WE=18043825;WS=18043807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,45:0.28:160
chr17	18045098	rs2072653	G	A	1457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.501;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=37;PP=919;ReadPosRankSum=-0.660;SC=AGTCCTGCCCGACAGTCAGCC;SOR=0.633;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=216;TCF=104;TCR=112;TR=72;WE=18045106;WS=18045088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,80:0.33:241
chr17	18046058	rs854778	A	C	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.50;ReadPosRankSum=0.384;SOR=0.655;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,23:0.25:93
chr17	18046898	rs854777	T	C	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.993;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=132;ReadPosRankSum=0.172;SC=AGAGTGGAGGTGCCAGGTGGA;SOR=0.086;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=11;WE=18046906;WS=18046888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr17	18047189	rs2272571	G	A	716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.631;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=13;PP=358;ReadPosRankSum=-1.535;SC=CACAGGCCTCGGGCTGGCCCA;SOR=0.612;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=85;TCF=50;TCR=35;TR=32;WE=18047197;WS=18047179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,39:0.38:104
chr17	18047671	rs11421905	G	GC	924.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=5;PP=634;SC=CCCCTCACCAGCCTCAGTTTC;SOR=1.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=9;TCR=5;TR=14;WE=18047679;WS=18047661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	18047772	rs11421904	T	TC	1024.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=627;ReadPosRankSum=0.180;SC=TGCCTGTCAGTCCAGCTCTGT;SOR=0.620;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=61;TCF=22;TCR=39;TR=21;WE=18047780;WS=18047762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,39:0.33:118
chr17	18051975	rs854774	T	C	732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=21;PP=467;ReadPosRankSum=1.432;SC=ATAGGGTCCATTCTGTTCATG;SOR=0.694;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=123;TCF=56;TCR=67;TR=37;WE=18051983;WS=18051965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,41:0.31:134
chr17	18052466	rs4303606	A	G	2413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=23;PP=1651;SC=GGGTGCAGAAAAAAATTTGGG;SOR=1.725;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=55;TCR=23;TR=78;WE=18052474;WS=18052456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr17	18052867	rs2955379	T	C	2165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=43;PP=1124;SC=ATAGCCTCTTTGACCCTGTGC;SOR=1.075;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=35;TCR=43;TR=78;WE=18052875;WS=18052857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr17	18054692	rs2056841	G	A	1487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=34;PP=848;ReadPosRankSum=-0.053;SC=TGTTCCCACCGCGCCCCTTGC;SOR=0.724;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=179;TCF=89;TCR=90;TR=68;WE=18054700;WS=18054682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,75:0.38:198
chr17	18054826	rs202073263	G	A	1019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=28;PP=615;ReadPosRankSum=-0.698;SC=CGGGGAGGCCGGCCTGAGGCC;SOR=0.741;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=136;TCF=56;TCR=80;TR=46;WE=18054834;WS=18054816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,54:0.36:151
chr17	18054868	rs854773	G	T	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.058;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=259;ReadPosRankSum=-0.305;SC=CCCCCAGCCCGCCAGCCCCCT;SOR=0.988;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=54;TCF=20;TCR=34;TR=19;WE=18054876;WS=18054858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,24:0.38:63
chr17	18057272	rs712271	A	G	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.237;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=277;ReadPosRankSum=-2.003;SC=GGCTGAAGCGAGCAGAGGAGG;SOR=1.007;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=70;TCF=23;TCR=47;TR=22;WE=18057280;WS=18057262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,24:0.32:74
chr17	18059454	rs2242595	G	A	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=2.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.60;ReadPosRankSum=-0.038;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr17	18069628	rs72827432	G	T	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.187;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=21;ReadPosRankSum=0.000;SC=GCACACATGTGTGTGCACACA;SOR=0.269;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=5;WE=18069636;WS=18069618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr17	18070761	rs854796	G	A	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=142;ReadPosRankSum=-1.271;SC=ATCATTCCCCGAAACCCAGGA;SOR=0.951;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=11;WE=18070769;WS=18070751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr17	18077175	rs854800	T	C	933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=27;PP=457;ReadPosRankSum=0.746;SC=GCTACCCCTATGTGGAGATTG;SOR=0.725;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=137;TCF=60;TCR=77;TR=48;WE=18077183;WS=18077165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,53:0.35:152
chr17	18087299	rs1064629	C	T	1308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.529;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=28;PP=682;ReadPosRankSum=-0.416;SC=GAGGCGCTGCCGGCGCCCCTG;SOR=0.745;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=196;TCF=112;TCR=84;TR=69;WE=18087307;WS=18087289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,74:0.35:209
chr17	18128990	.	G	C	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=0.000;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=1.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.05;ReadPosRankSum=0.799;SOR=0.544;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,22:0.39:57
chr17	18133495	rs2290502	G	A	1023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=22;PP=614;SC=GGGCTTCTGCGGAGGTTGGCG;SOR=1.493;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=13;TCR=22;TR=35;WE=18133503;WS=18133485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr17	18135668	rs139629070	G	A	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=79;ReadPosRankSum=1.423;SC=GGGGGCCTCCGTTCTTCAGGG;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=5;WE=18135676;WS=18135663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr17	18135753	rs2290503	T	C	1849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=19;PP=1264;SC=TTGGGTGTCTTCCTCACTGTG;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=45;TCR=19;TR=64;WE=18135761;WS=18135743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr17	18137141	rs2290505	A	G	5078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=68;PP=2755;SC=GGTGGCTGCCAGCGACATAGC;SOR=0.988;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=167;TCF=99;TCR=68;TR=167;WE=18137149;WS=18137131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr17	18139896	rs2746028	G	T	551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=4;PP=252;SC=AACTCGGGTAGCCCTGACATC;SOR=1.127;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=15;WE=18139904;WS=18139886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	18141705	rs2245430	C	T	1975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.309;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=34;PP=1035;ReadPosRankSum=-0.828;SC=GAACGTAGGGCGCAAAGCAGG;SOR=0.798;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=133;TCF=75;TCR=58;TR=81;WE=18141713;WS=18141695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,94:0.61:153
chr17	18149854	rs2856289	A	G	852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.622;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=23;PP=557;ReadPosRankSum=0.695;SC=GCTGGGTCTGAGCCCCACCAC;SOR=0.596;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=152;TCF=74;TCR=78;TR=46;WE=18149862;WS=18149844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,51:0.30:170
chr17	18156541	rs2071241	A	G	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.695;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=359;ReadPosRankSum=-0.965;SC=ACAGACCACAAGGTGGGCTCT;SOR=1.519;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=18;WE=18156549;WS=18156531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr17	18161945	rs145840264	G	T	1653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=0.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.62;ReadPosRankSum=0.222;SOR=0.768;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,81:0.62:131
chr17	18167505	rs2605143	T	C	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=8;PP=223;ReadPosRankSum=0.253;SC=CGCTGGCTGCTTCTGTCAACT;SOR=0.696;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=75;TCF=44;TCR=31;TR=20;WE=18167513;WS=18167495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,21:0.26:81
chr17	18167684	rs12603700	G	A	907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.05;MQRankSum=-0.599;QD=4.24;ReadPosRankSum=-0.384;SOR=0.709;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:156,58:0.27:214
chr17	18194362	rs6502645	C	T	1830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=31;PP=867;SC=AAGAGGAGTACGAAACTCCCC;SOR=1.385;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=21;TCR=31;TR=52;WE=18194370;WS=18194352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr17	18208334	rs7225932	C	A	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=383;ReadPosRankSum=0.299;SC=CTGCAGAGGACCTCATCCGTG;SOR=0.784;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=65;TCF=50;TCR=15;TR=25;WE=18208342;WS=18208324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,26:0.38:69
chr17	18220770	rs1563632	G	A	1106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=28;PP=664;ReadPosRankSum=0.384;SC=GGAGCCATCCGCTTCCAGGCA;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=82;TCR=76;TR=57;WE=18220778;WS=18220760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,62:0.36:174
chr17	18232326	rs77278763	C	T	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=7;PP=149;ReadPosRankSum=-0.393;SC=GAATGTCCCCCAGCTGGGGAG;SOR=0.693;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=30;TCF=13;TCR=17;TR=12;WE=18232334;WS=18232316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr17	18252010	rs3866955	T	C	509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.14;ReadPosRankSum=1.073;SOR=0.622;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,30:0.36:83
chr17	18256979	rs2273026	C	T	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQRankSum=-2.485;QD=3.05;ReadPosRankSum=-0.019;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,9:0.24:37
chr17	18259333	rs142013082	CAT	C	659.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.970;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.350;NF=0;NR=14;PP=395;ReadPosRankSum=0.058;SC=ATGGGAAAAACATGTGTAGCT;SOR=0.929;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=3;TCR=41;TR=14;WE=18259342;WS=18259323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,22:0.27:81
chr17	18259415	rs12950117	A	G	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.34;MQRankSum=0.887;QD=3.97;ReadPosRankSum=-0.566;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr17	18284262	rs570145	G	A	663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.717;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=24;PP=442;ReadPosRankSum=-0.756;SC=ATGCAAGCCAGCGCCGACCAG;SOR=0.803;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=116;TCF=51;TCR=65;TR=40;WE=18284270;WS=18284252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,41:0.32:127
chr17	18286916	rs112094897	A	AG	1558.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=14;PP=807;SC=GCCCTCGGGCAGCGGCAGGGC;SOR=0.914;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=19;WE=18286946;WS=18286906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr17	18286922	rs111736884	A	AG	1371.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.73;QD=45.72;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	18286930	rs200680358	A	AG	1199.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=13;PP=504;SC=GCAGGGCGGCAGGGCGGCAGG;SOR=0.784;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=16;WE=18286946;WS=18286906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	18286938	rs145486982	A	AG	1030.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=12;PP=591;SC=GCAGGGCGGCAGGGCGGGAGG;SOR=0.770;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=16;WE=18286946;WS=18286906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	18291432	.	TCACAGC	T	41	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MMLQ=27;MQ=57.05;NF=2;NR=0;PP=41;QD=34.5;SC=CTTTAATTAATCACAGCCAAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=2;WE=18291445;WS=18291422;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:14,2:0.12:16
chr17	18291544	rs586322	A	G	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQRankSum=-3.801;QD=2.77;ReadPosRankSum=-0.280;SOR=0.880;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,33:0.23:143
chr17	18291559	rs9890369	T	C	535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=0.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQRankSum=-3.645;QD=3.39;ReadPosRankSum=1.258;SOR=0.798;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:120,38:0.24:158
chr17	18291618	rs586757	C	T	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.805;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-2.268;NF=10;NR=18;PP=294;ReadPosRankSum=0.335;SC=AAATGAAGTACCAAGAAACTA;SOR=0.838;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=97;TCF=40;TCR=57;TR=28;WE=18291626;WS=18291608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,31:0.28:111
chr17	18314830	rs62074236	T	C	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=1.355;NF=5;NR=2;PP=69;ReadPosRankSum=-1.582;SC=TTCTTCCTCATCCCGCACCCT;SOR=0.735;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=7;WE=18314838;WS=18314824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr17	18314913	rs62074237	T	C	630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.39;MQRankSum=-3.320;QD=6.71;ReadPosRankSum=-0.189;SOR=0.740;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,23:0.24:94
chr17	18314964	rs62074238	T	G	1542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.085;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-10.630;NF=44;NR=30;PP=805;ReadPosRankSum=-0.981;SC=CCCAATCGTCTTCTTTCCCAG;SOR=0.784;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=212;TCF=123;TCR=89;TR=74;WE=18314972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,75:0.32:233
chr17	18380154	rs1682220	A	G	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQRankSum=-9.152;QD=0.80;ReadPosRankSum=-1.803;SOR=0.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:102,19:0.16:121
chr17	18380163	rs376412531	GGA	G	244.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=2.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQRankSum=-9.928;QD=2.25;ReadPosRankSum=0.119;SOR=0.903;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,14:0.13:109
chr17	18380260	rs77759205	C	A	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.358;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.751;NF=2;NR=6;PP=57;ReadPosRankSum=-0.578;SC=GGACACAGTTCTGGGGCTCTG;SOR=0.073;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=8;WE=18380268;WS=18380250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr17	18394431	rs140402450	T	C	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.43;MQRankSum=-2.189;QD=9.54;ReadPosRankSum=-0.180;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr17	18394552	rs201945348	G	A	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=5.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.20;MQRankSum=-5.652;QD=7.36;ReadPosRankSum=0.979;SOR=0.315;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,38:0.40:94
chr17	18394706	rs368033760	A	G	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.49;MQRankSum=-2.429;QD=1.31;ReadPosRankSum=-1.733;SOR=0.340;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,8:0.17:48
chr17	18395647	.	G	T	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.020;ClippingRankSum=0.000;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=6.571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.56;MQRankSum=-8.464;QD=1.13;ReadPosRankSum=0.366;SOR=1.779;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,15:0.15:103
chr17	18397711	rs75054442	G	A	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.80;MQRankSum=-1.481;QD=3.51;ReadPosRankSum=-1.542;SOR=0.544;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,14:0.29:49
chr17	18445547	.	G	A	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.932;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=9.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.81;MQRankSum=-2.674;QD=2.49;ReadPosRankSum=1.144;SOR=0.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr17	18456679	.	T	G	2039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.165;ClippingRankSum=0.000;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.369;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.221;NF=41;NR=59;PP=1559;ReadPosRankSum=0.271;SC=GAGATACTGCTGCTTGTTTCT;SOR=0.572;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=150;TCF=61;TCR=89;TR=100;WE=18456687;WS=18456669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,93:0.64:146
chr17	18498059	rs66528329	C	CA	330.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=36.96;QD=36.75;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	18498497	rs59933375	G	GA	493.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=12.125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQRankSum=-1.118;QD=14.11;ReadPosRankSum=0.603;SOR=3.690;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,25:0.71:35
chr17	18528623	rs34925025	A	G	2799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=47;PP=1690;SC=AGAAGCCCGAAGACCACTGGT;SOR=0.859;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=47;TCR=47;TR=94;WE=18528631;WS=18528613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr17	18541296	rs2386412	G	A	180.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.61;QD=25.83;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	18541775	rs9902086	A	G	1648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=37;PP=1188;SC=GACATGGGGCAACCCCGCAGA;SOR=2.024;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=15;TCR=37;TR=52;WE=18541783;WS=18541759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr17	18541852	.	ACCCAC	A	1920.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=52.26;QD=56.49;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr17	18541857	.	C	CGATGGTG	1920.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=52.26;QD=56.49;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr17	18541868	rs55807264	A	G	2314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=16;PP=1251;SC=CCAGGCCAAAACCATGGGCGC;SOR=2.019;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=44;TCR=16;TR=60;WE=18541876;WS=18541842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr17	18542074	rs9908833	G	A	5146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=101;PP=2965;SC=GTGGCCCGTGGATGCTGGGTC;SOR=1.248;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=64;TCR=101;TR=165;WE=18542082;WS=18542064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr17	18542107	rs80078274	G	A	1679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.774;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.275;NF=14;NR=48;PP=1197;ReadPosRankSum=0.120;SC=GCCCTGAAGGGACCCAACCTG;SOR=1.355;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=94;TCF=23;TCR=71;TR=62;WE=18542115;WS=18542097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,66:0.65:101
chr17	18542519	rs74452761	T	G	436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.41;QD=22.99;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	18544520	rs201807927	G	A	721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=32.81;SOR=6.273;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	18565143	rs55636053	T	C	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.235;NF=12;NR=0;PP=211;ReadPosRankSum=-0.888;SC=TAGATGCATATAGAATTGGTC;SOR=2.049;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=12;WE=18565151;WS=18565133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr17	18565350	rs9912644	G	C	2991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;BaseQRankSum=-0.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.934;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.454;NF=67;NR=65;PP=2068;ReadPosRankSum=-0.504;SC=TTTCTCTCCGGTATGAGTTCT;SOR=0.607;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=196;TCF=95;TCR=101;TR=132;WE=18565358;WS=18565340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,128:0.68:188
chr17	18565423	rs9912852	G	A	2352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.87;MQRankSum=-0.320;NF=40;NR=48;PP=1344;ReadPosRankSum=0.962;SC=CATTTGTACGGTTTCTTTCCA;SOR=0.710;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=148;TCF=68;TCR=80;TR=88;WE=18565431;WS=18565413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,104:0.60:172
chr17	18574794	rs201620470	C	T	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.00;MQRankSum=0.000;QD=17.84;ReadPosRankSum=-0.699;SOR=1.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr17	18574872	rs146810330	G	T	2201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=4.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.13;MQRankSum=-1.542;QD=14.78;ReadPosRankSum=0.674;SOR=0.400;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,100:0.67:149
chr17	18574998	rs9635701	A	T	2663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.493;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.443;NF=56;NR=51;PP=1674;ReadPosRankSum=-1.240;SC=GGTATACGGGAAGCTAGAACT;SOR=0.530;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=177;TCF=89;TCR=88;TR=107;WE=18575006;WS=18574988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,117:0.59:197
chr17	18575127	rs9635680	G	A	1659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.168;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-9.852;NF=19;NR=35;PP=2345;ReadPosRankSum=0.230;SC=TGCCTGCCATGTCAGTCAGCC;SOR=1.327;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=110;TCF=47;TCR=63;TR=54;WE=18575148;WS=18575117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,48:0.43:111
chr17	18575140	rs9635681	A	G	1502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=6.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.846;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-9.387;NF=20;NR=31;PP=2345;ReadPosRankSum=1.120;SC=AGTCAGCCGTAGCAGTTCCAC;SOR=1.111;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=102;TCF=46;TCR=56;TR=51;WE=18575148;WS=18575117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,41:0.42:97
chr17	18575675	rs55797270	T	G	1438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.579;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.628;NF=33;NR=39;PP=1119;ReadPosRankSum=0.756;SC=GGCACGCAACTCACCATCCAC;SOR=0.899;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=109;TCF=51;TCR=58;TR=72;WE=18575683;WS=18575665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,67:0.61:110
chr17	18576256	rs4924901	G	C	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.846;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.42;MQRankSum=-2.380;QD=9.89;ReadPosRankSum=-0.303;SOR=1.889;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr17	18602476	rs1969051	A	G	3023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.888;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=48;PP=1875;ReadPosRankSum=-0.990;SC=GTTTTTGGCAAAATGCTGGCA;SOR=0.886;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=179;TCF=106;TCR=73;TR=120;WE=18602484;WS=18602456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,134:0.67:199
chr17	18610134	rs1973459	T	G	716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.964;NF=12;NR=19;PP=470;ReadPosRankSum=0.296;SC=TTGTAAGAGTTGAGCTCTGGC;SOR=0.770;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=46;TCF=19;TCR=27;TR=31;WE=18610142;WS=18610124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,33:0.67:49
chr17	18630995	rs8075739	G	A	3189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=49;PP=1963;SC=CTGGAGTACAGGAGTGCCGAG;SOR=0.836;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=60;TCR=49;TR=109;WE=18631003;WS=18630985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr17	18638151	rs9916065	A	G	2524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=31;PP=1377;SC=ATCAGCTGTCAGTTCCTGAAC;SOR=1.112;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=57;TCR=31;TR=88;WE=18638159;WS=18638141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr17	18643642	rs150131079	T	C	242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.67;QD=24.28;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	18647539	rs116483657	G	A	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=1.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.646;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.965;NF=18;NR=9;PP=324;ReadPosRankSum=-0.407;SC=GGCTAAAATGGACTGGTTATC;SOR=2.192;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=90;TCF=53;TCR=37;TR=27;WE=18647547;WS=18647529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,11:0.14:81
chr17	18647625	rs74502778	T	A	1872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.793;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-7.988;NF=62;NR=40;PP=1457;ReadPosRankSum=-0.291;SC=ACCGATTCCATCCCTCTATGC;SOR=0.764;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=187;TCF=106;TCR=81;TR=102;WE=18647633;WS=18647615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,95:0.51:187
chr17	18653070	rs9895749	G	A	3424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.866;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.617;NF=94;NR=59;PP=2303;ReadPosRankSum=-0.211;SC=GTGTATATCCGAAATGAATAG;SOR=0.545;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=213;TCF=133;TCR=80;TR=153;WE=18653078;WS=18653060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,154:0.71:216
chr17	18670278	.	A	G	24	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=16;MQ=51.25;NF=0;NR=3;PP=24;QD=19.5904041824;SC=ACTGAGTATGACCTTCAAGAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=3;WE=18670286;WS=18670268;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr17	18671733	rs10775382	C	A	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.511;NF=9;NR=1;PP=171;ReadPosRankSum=-1.873;SC=TACCGAGTGACTGGCAGTCAC;SOR=0.264;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=10;WE=18671741;WS=18671723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr17	18675826	.	A	G	1598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.470;ClippingRankSum=0.000;DP=210;ExcessHet=3.0103;FS=0.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.61;ReadPosRankSum=1.646;SOR=0.648;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:134,76:0.36:210
chr17	18678548	rs4630608	C	T	2753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.059;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=55;PP=1459;ReadPosRankSum=-2.154;SC=ACAAGTGGCACGGATGGTGGG;SOR=0.791;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=184;TCF=85;TCR=99;TR=102;WE=18678556;WS=18678538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,126:0.58:219
chr17	18682350	.	GAA	G	142.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.623;ClippingRankSum=0.000;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=29.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.48;MQRankSum=-4.879;QD=2.38;ReadPosRankSum=-0.701;SOR=4.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,8:0.13:60
chr17	18684487	rs59588820	A	G	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5103;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=55;ReadPosRankSum=0.967;SC=GTGAGGCCGGACTGAGGCTCT;SOR=0.693;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=4;WE=18684495;WS=18684477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr17	18684642	rs75174617	G	T	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5165;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=56.37;MQRankSum=-0.329;NF=5;NR=5;PP=83;ReadPosRankSum=0.750;SC=GGCTCGCTGGGAGGGTGGCGG;SOR=0.569;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=13;TCF=7;TCR=6;TR=10;WE=18684650;WS=18684632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr17	18694277	rs61075345	G	A	1828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=3.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.587;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-12.588;NF=56;NR=45;PP=1569;ReadPosRankSum=0.447;SC=CTTCTCTGTGGGTTGCTCAGC;SOR=0.911;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=187;TCF=104;TCR=83;TR=101;WE=18694285;WS=18694267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,86:0.47:182
chr17	18700843	rs115776459	C	A	1207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=1.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.44;MQRankSum=-4.829;QD=12.08;ReadPosRankSum=-1.865;SOR=0.532;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,62:0.62:100
chr17	18702094	rs2270139	A	G	1133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=2.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.451;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.700;NF=40;NR=13;PP=1032;ReadPosRankSum=-1.168;SC=AAATTTCACAACATGATAATT;SOR=1.530;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=91;TCF=62;TCR=29;TR=53;WE=18702102;WS=18702084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,45:0.56:81
chr17	18702220	rs8080471	T	C	3882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.421;NF=69;NR=84;PP=2649;ReadPosRankSum=0.926;SC=TGATATTTGCTTTTAGTGCAC;SOR=0.685;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=213;TCF=101;TCR=112;TR=153;WE=18702228;WS=18702210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,166:0.69:239
chr17	18708830	rs55974180	G	GT	1059.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=10.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQRankSum=0.603;QD=11.91;ReadPosRankSum=-3.021;SOR=0.177;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,56:0.63:89
chr17	18769349	rs2386404	T	C	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=242;ReadPosRankSum=1.810;SC=TATTGTTAAATTTGAAAGCAG;SOR=0.507;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=12;WE=18769357;WS=18769339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr17	18770733	rs2305064	G	A	2097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.915;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=46;PP=1150;ReadPosRankSum=-2.044;SC=CTATTGAAACGATTTGATTCA;SOR=1.023;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=130;TCF=51;TCR=79;TR=73;WE=18770741;WS=18770723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,91:0.58:157
chr17	18775900	rs4393623	A	G	1800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.630;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=26;PP=988;ReadPosRankSum=0.400;SC=TGCCAGAAACAAGAGTACAAA;SOR=0.786;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=122;TCF=76;TCR=46;TR=70;WE=18775908;WS=18775890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,85:0.59:145
chr17	18776020	rs7503678	A	T	1250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=31;PP=732;ReadPosRankSum=-0.258;SC=GAGTGTTTAAAATAATGATAG;SOR=0.706;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=83;TCF=33;TCR=50;TR=51;WE=18776028;WS=18776010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,57:0.61:94
chr17	18793061	rs3803835	C	T	1263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=14;PP=639;ReadPosRankSum=-0.849;SC=TTCAACTAGCCAAGCATTTTT;SOR=0.754;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=52;TCR=23;TR=46;WE=18793069;WS=18793051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,58:0.65:89
chr17	18793225	rs3826380	A	G	1780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.835;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=35;PP=1141;ReadPosRankSum=-1.699;SC=TTCTGGATCTACTTCTAAGGA;SOR=0.350;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=108;TCF=55;TCR=53;TR=75;WE=18793233;WS=18793215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,78:0.66:118
chr17	18814661	rs55971101	T	TTA	1351.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=36;PP=436;SC=CGTTTTTTTTTAGTTGGCAAA;SOR=1.835;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=36;WE=18814669;WS=18814642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,60:0.98:61
chr17	18833810	rs1634411	C	T	1076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=12;PP=673;ReadPosRankSum=0.019;SC=CATGAAGCTACTTGGCTTTCT;SOR=0.791;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=58;TCF=41;TCR=17;TR=42;WE=18833818;WS=18833800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,47:0.73:64
chr17	18855486	rs2073078	G	A	947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.847;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=16;PP=530;ReadPosRankSum=0.779;SC=TCAGTCCCTCGGGCTCATACC;SOR=0.344;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=58;TCF=36;TCR=22;TR=39;WE=18855494;WS=18855476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,44:0.71:62
chr17	18863979	rs2074274	G	C	1411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FS=2.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.49;ReadPosRankSum=0.850;SOR=0.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:173,84:0.33:257
chr17	18872521	rs2074273	A	G	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=11;PP=333;ReadPosRankSum=-0.271;SC=TAAAGGGGTCAGAAGGCCACC;SOR=0.612;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=69;TCF=36;TCR=33;TR=26;WE=18872529;WS=18872511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,28:0.36:78
chr17	18872581	rs2074272	C	T	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.820;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=15;PP=322;ReadPosRankSum=-0.413;SC=CCAGCAGGAGCCCCAGAAGTT;SOR=0.699;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=83;TCF=46;TCR=37;TR=29;WE=18872589;WS=18872571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,31:0.33:93
chr17	18874685	rs3071666	C	CGGT	1214.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.894;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQ=60.09;MQRankSum=1.528;NF=5;NR=16;PP=865;ReadPosRankSum=0.058;SC=GGGGTCTTTGCGGTCCCGGGG;SOR=0.586;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=80;TCF=26;TCR=54;TR=21;WE=18874693;WS=18874675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,36:0.31:118
chr17	18874720	rs916823	C	G	1078.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.944;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=29;PP=657;ReadPosRankSum=0.031;SC=GTTTAGAATCCGATGAGGCCC;SOR=0.543;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=150;TCF=79;TCR=71;TR=57;WE=18874728;WS=18874710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,57:0.36:158
chr17	18882214	rs2074271	G	A	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=5.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.53;ReadPosRankSum=0.538;SOR=0.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr17	18882991	rs2472714	T	A	1575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=26;NR=25;PP=795;SC=GAGATTCTGTTTTGGGAACCA;SOR=0.906;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=51;TCF=26;TCR=25;TR=51;WE=18882999;WS=18882981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr17	18916893	rs11652575	T	C	119.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.03;NF=0;NR=4;PP=93;SC=GCCCAATGAGTATGGGGACTG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=18916901;WS=18916883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	18918258	rs28526726	C	G	812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=8;PP=470;SC=CTTGGAGGAGCATGCAAATGG;SOR=1.214;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=26;TCF=18;TCR=8;TR=26;WE=18918266;WS=18918248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr17	18918510	.	A	ACGGTACGGGGGTGGGGGC	239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=2;PP=285;SC=TGCTGGTGGGACGGTACGGGG;SOR=1.329;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=3;WE=18918518;WS=18918500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	18923818	rs1624825	G	A	217.41	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.6715;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=171;ReadPosRankSum=-0.765;SC=GGGATCCCGAGGCCCCAAGAG;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=8;WE=18923826;WS=18923808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr17	19213335	rs2296981	C	G	641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=16;PP=482;SC=CAGGTCTGCACTGCATTGACT;SOR=1.931;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=21;WE=19213343;WS=19213325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	19216917	rs3826405	T	C	5488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=88;PP=2965;SC=ACACCCAGCGTCCCAGCTGAA;SOR=0.713;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=186;TCF=98;TCR=88;TR=186;WE=19216939;WS=19216907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr17	19231898	rs7206963	T	C	403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=2;PP=350;SC=AGTACCCTTTTGATGGCTGTC;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=19231906;WS=19231888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	19232078	rs6587220	T	C	4606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=77;PP=2965;SC=GGAGCCACCGTACAATCTGTC;SOR=0.705;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=160;TCF=83;TCR=77;TR=160;WE=19232086;WS=19232068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr17	19233096	rs2296979	T	C	1649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=40;PP=1188;SC=GAGCCTGAAGTTTCTAATTCT;SOR=3.056;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=50;TCF=9;TCR=41;TR=49;WE=19233104;WS=19233086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	19237613	rs11656071	C	T	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=348;ReadPosRankSum=-0.262;SC=TGGAGGATGCCGAGCAGGGAC;SOR=1.445;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=18;WE=19237621;WS=19237603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,20:0.80:25
chr17	19240972	rs11652712	G	A	2536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=54;NR=35;PP=1467;SC=GGCTTCCCGCGGAAGTTTCTC;SOR=0.919;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=54;TCR=35;TR=89;WE=19240980;WS=19240962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr17	19247075	rs4924987	G	A	2091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=28;NR=43;PP=1354;SC=TATGGGGGATGGGGGTAAGAG;SOR=1.319;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=71;TCF=28;TCR=43;TR=71;WE=19247083;WS=19247065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr17	19265797	rs10445411	C	T	615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.99;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	19314611	rs739830	T	C	1164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.595;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=19;PP=675;ReadPosRankSum=0.872;SC=CCTCACCTTCTACCTACCGCA;SOR=0.631;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=148;TCF=94;TCR=54;TR=53;WE=19314619;WS=19314601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,61:0.36:168
chr17	19318031	rs1295330	A	G	1174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.621;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=33;PP=756;ReadPosRankSum=0.837;SC=GGTGGGGAAGACATGGGAGGC;SOR=0.527;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=171;TCF=80;TCR=91;TR=64;WE=19318039;WS=19318021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,67:0.35:194
chr17	19319015	rs1295329	C	T	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=2.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.93;ReadPosRankSum=0.410;SOR=0.931;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:112,32:0.22:144
chr17	19437165	.	C	T	156	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=5;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=2;NR=3;PP=156;QD=38.1542425094;SC=TGCGCGGTACCCACTGCCGGC;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=5;WE=19437186;WS=19437155;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr17	19437178	.	G	C	156	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=5;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=2;NR=3;PP=156;QD=38.1542425094;SC=CTGCCGGCCTGCGCGGTACTC;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=5;WE=19437186;WS=19437155;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:17,5:0.23:22
chr17	19437178	.	G	GCGCGGTACTCACTGCCGGCCTC	224.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.22;ReadPosRankSum=-0.196;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr17	19452711	rs2453572	TA	CG	511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=10;NR=1;PP=543;SC=GGGGTTTTACTATGTTAGCCA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=19452720;WS=19452706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	19453103	rs17683662	T	G	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.447;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=135;ReadPosRankSum=-0.667;SC=TTATCTGTGGTGTTGGTGCCT;SOR=0.018;SbPval=0.1;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=11;WE=19453111;WS=19453093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr17	19454575	rs2247518	A	C	321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=257;SC=GGGCCATAACACCCTGGCCCC;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=19454583;WS=19454565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	19454725	rs2247437	G	C	3927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.16;SOR=0.855;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr17	19454733	rs2247436	G	A	3917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.02;SOR=0.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr17	19458777	rs2440149	G	C	330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=4;PP=232;SC=GGAGGGTGAGGCTGCTCTGGG;SOR=0.859;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=6;TCR=4;TR=10;WE=19458785;WS=19458767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	19460972	rs1054715	G	A	686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=51.32;QD=27.47;SOR=2.215;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	19476588	rs2250486	T	C	946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=0.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.080;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=25;PP=482;ReadPosRankSum=1.149;SC=AATGTGGTTATGGTTTTCTTC;SOR=1.017;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=54;TCF=17;TCR=37;TR=36;WE=19476596;WS=19476578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,44:0.68:65
chr17	19480593	rs35672252	G	GA	1489.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=2.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQRankSum=0.792;QD=13.67;ReadPosRankSum=-0.766;SOR=0.429;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,67:0.61:109
chr17	19535920	rs28672254	C	A	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.101;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=324;ReadPosRankSum=-1.373;SC=TTGCGCCCAGCCCACAATGGC;SOR=0.933;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=60;TCF=44;TCR=16;TR=22;WE=19535928;WS=19535910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,26:0.40:65
chr17	19552476	rs4646793	C	T	620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=14;PP=290;ReadPosRankSum=-0.620;SC=AAACTGGCCCCCGCCGCGCAC;SOR=0.644;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=112;TCF=56;TCR=56;TR=32;WE=19552484;WS=19552466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,38:0.29:129
chr17	19555976	rs1004491	T	C	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.020;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=8;PP=183;ReadPosRankSum=0.623;SC=CTCCAACATATGTGTTTACTG;SOR=0.859;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=57;TCF=31;TCR=26;TR=19;WE=19555984;WS=19555966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,20:0.30:67
chr17	19559623	rs2072332	G	A	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.696;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=211;ReadPosRankSum=0.976;SC=GATTGCTGATGTTAGACGTTA;SOR=1.230;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=14;WE=19559631;WS=19559613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr17	19561011	rs3841513	GACTGAATT	G	5796.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=33;PP=2978;SC=ATGAATATTTGACTGAATTAC;SOR=1.609;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=72;TCF=37;TCR=35;TR=57;WE=19561026;WS=19561001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr17	19564634	rs1800869	C	G	1496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.364;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=45;PP=1039;ReadPosRankSum=0.792;SC=GCAGTTTTTGCTGACACTACT;SOR=1.663;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=96;TCF=36;TCR=60;TR=64;WE=19564642;WS=19564624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,67:0.64:105
chr17	19568486	rs59755039	CT	C	1411.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=23;PP=863;SC=TGAGGGAGACCTTTTCCTGGT;SOR=1.508;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=23;WE=19568494;WS=19568476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	19576291	rs71369434	T	C	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.224;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=106;ReadPosRankSum=-0.143;SC=GAGGTGGAGGTTGCAGTGAGC;SOR=0.293;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=6;WE=19576299;WS=19576282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr17	19578873	rs7216	A	T	5666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=91;PP=2965;SC=CTCTCCAGGCAGAATATTACT;SOR=0.789;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=186;TCF=95;TCR=91;TR=186;WE=19578881;WS=19578863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr17	19595540	.	CAAA	C	23	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;FR=0.5016;HP=14;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=23;MQ=55.75;NF=2;NR=0;PP=23;QD=13.5;SC=GACTCCATGTCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=2;WE=19595550;WS=19595530;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,2:0.33:6
chr17	19595585	rs12602112	C	T	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.341;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-1.302;NF=17;NR=4;PP=224;ReadPosRankSum=-0.897;SC=AATTGACCCACGCTTACCAAG;SOR=0.495;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=21;WE=19595593;WS=19595575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,24:0.65:37
chr17	19608773	rs4925042	G	A	445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.74;ReadPosRankSum=-0.643;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,28:0.30:94
chr17	19609947	rs12942065	C	G	4130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=79;NR=50;PP=2304;SC=CGCCCCCCATCCTCTTCCACG;SOR=1.134;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=79;TCR=50;TR=129;WE=19609955;WS=19609937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr17	19610104	rs35263947	C	T	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.606;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=193;ReadPosRankSum=1.550;SC=GAGCTGACAGCCTGCCCTGCT;SOR=0.351;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=63;TCF=24;TCR=39;TR=18;WE=19610112;WS=19610094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,22:0.28:80
chr17	19642268	rs4646791	T	TG	2271.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=16;PP=1503;SC=TGCCCAGCCCTGGGGCCCAGA;SOR=1.512;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=46;TCF=26;TCR=20;TR=39;WE=19642276;WS=19642258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr17	19643810	rs3826507	G	A	5782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=97;PP=2965;SC=AGAGGTGGGGGCTTCGGGTAA;SOR=0.827;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=192;TCF=95;TCR=97;TR=192;WE=19643818;WS=19643800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr17	19644226	rs3786036	C	G	318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=1;PP=264;SC=TGATCCTCCACTCTCTACCTC;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=19644234;WS=19644216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	19644472	rs2072330	A	T	2126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=41;PP=1258;SC=GGATGTAGTCAGGGGCCACGC;SOR=1.207;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=29;TCR=41;TR=70;WE=19644480;WS=19644462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr17	19645938	rs887241	A	C	5719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=107;NR=84;PP=2819;SC=AGGACCACTGAGTTCCCTGCA;SOR=0.749;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=191;TCF=107;TCR=84;TR=191;WE=19645946;WS=19645928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr17	19699358	rs192511	T	C	3590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=79;NR=35;PP=2198;SC=AATCTATGTTTTACTATTACA;SOR=1.366;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=114;TCF=79;TCR=35;TR=114;WE=19699366;WS=19699348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr17	19699605	rs10587010	CAT	C	1126.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.642;NF=2;NR=23;PP=966;ReadPosRankSum=-0.258;SC=TCTAAAGAGACATATATATAT;SOR=1.102;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=3;TCR=37;TR=25;WE=19699616;WS=19699595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,35:0.85:41
chr17	19713740	rs150122	C	T	6775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=132;NR=96;PP=2965;SC=GCAGTCCCCACTGGCATATCA;SOR=0.806;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=228;TCF=132;TCR=96;TR=228;WE=19713748;WS=19713730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr17	19729495	rs157397	T	C	2519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.45;SOR=0.797;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr17	19812541	rs203462	T	C	6820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=110;NR=115;PP=2965;SC=TGCTGCATAATGTCACTGACT;SOR=0.796;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=225;TCF=110;TCR=115;TR=225;WE=19812549;WS=19812531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,263:1.00:263
chr17	19835112	rs61749865	C	T	1394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.931;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=22;PP=767;ReadPosRankSum=1.091;SC=CGCAATCAGTCAATACCTGAG;SOR=0.911;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=46;TCR=29;TR=57;WE=19835120;WS=19835102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,63:0.73:86
chr17	19861458	rs2108978	C	T	4525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=65;PP=2587;SC=CATTTCAAGACGGAGAGAATG;SOR=0.922;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=153;TCF=88;TCR=65;TR=153;WE=19861466;WS=19861448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr17	19999781	rs12942179	G	A	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=81;ReadPosRankSum=0.957;SC=CTAGTATAAAGCCTATAAACC;SOR=0.602;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=6;WE=19999789;WS=19999775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr17	20000131	rs4925085	G	T	2468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=53;PP=1513;SC=AAAATGCACAGGGCCAGGCAG;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=36;TCR=53;TR=89;WE=20000139;WS=20000121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr17	20013802	rs3764436	G	A	1482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=0.677;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.15;ReadPosRankSum=-0.892;SOR=0.775;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,71:0.58:122
chr17	20059591	rs3833861	A	AC	398.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=1.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.13;MQRankSum=-0.738;QD=5.46;ReadPosRankSum=-1.744;SOR=0.623;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,27:0.37:73
chr17	20059596	rs200072578	C	CG	920.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=2.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.925;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.821;NF=14;NR=23;PP=613;ReadPosRankSum=1.878;SC=ACCCCACCCCCCCTCCAGGCG;SOR=0.822;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=38;TCF=14;TCR=24;TR=37;WE=20059604;WS=20059581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,46:0.61:75
chr17	20108184	rs9908032	C	G	2005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.682;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=31;PP=1410;ReadPosRankSum=1.004;SC=GCGACAGCAGCTGCCCAACAT;SOR=1.063;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=131;TCF=74;TCR=57;TR=79;WE=20108192;WS=20108174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,86:0.61:141
chr17	20108239	rs2703806	A	T	2515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.773;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=41;PP=1492;ReadPosRankSum=0.543;SC=TGGAAATCAGATGTCCAGTGA;SOR=0.824;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=155;TCF=86;TCR=69;TR=101;WE=20108247;WS=20108229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,114:0.66:172
chr17	20160925	rs3751979	C	T	4122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.484;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=88;PP=2491;ReadPosRankSum=-1.840;SC=ACTCAGGTATCGTGTTTCAAA;SOR=0.731;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=237;TCF=110;TCR=127;TR=161;WE=20160933;WS=20160915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,183:0.69:265
chr17	20163529	rs2703791	A	G	1296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.533;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=18;PP=629;ReadPosRankSum=0.666;SC=ACCCTCTGGCAGCCTTGGCCC;SOR=0.450;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=95;TCF=65;TCR=30;TR=56;WE=20163537;WS=20163519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,67:0.58:115
chr17	20163616	rs11868429	C	T	2468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.928;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=45;PP=1272;ReadPosRankSum=-0.502;SC=CGGTAAGGGACAACATCAGCC;SOR=0.409;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=149;TCF=76;TCR=73;TR=100;WE=20163624;WS=20163606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,113:0.66:170
chr17	20209474	rs2120282	C	T	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=333;ReadPosRankSum=-0.301;SC=AACAGTTTCTCGTAGAACATT;SOR=0.657;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=21;WE=20209482;WS=20209464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,23:0.72:32
chr17	20217375	rs75296798	G	A	2009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.479;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=40;PP=1129;ReadPosRankSum=-1.386;SC=ACTTTGAGACGTAACCCTGGA;SOR=0.555;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=116;TCF=56;TCR=60;TR=79;WE=20217383;WS=20217365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,92:0.68:135
chr17	20254598	rs143042302	A	G	1767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.270;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-6.563;NF=65;NR=43;PP=1456;ReadPosRankSum=1.615;SC=CCTGAGGCTGACTTTGCTGAC;SOR=0.578;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=183;TCF=110;TCR=73;TR=108;WE=20254606;WS=20254588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,87:0.55:158
chr17	20297545	rs3874846	T	G	249.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.19;QD=31.22;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	20305306	.	CAATAAT	C	399.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.37;QD=39.97;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	20354747	rs200108749	C	CCT	53.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=33.00;QD=26.85;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr17	20370767	rs4985834	G	C	88.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=34.13;QD=22.01;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	20370796	rs28699183	T	C	286.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=36.35;QD=40.97;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	20370806	rs8080001	G	A	311.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=36.82;QD=38.97;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	20435963	.	T	TGA	759.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=457;SC=GAGAAGACAGTGAGGAGAAGA;SOR=0.914;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=10;WE=20435971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	20436054	.	G	GAGA	143	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=35.75;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	20459595	rs57570943	A	G	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.480;NF=3;NR=8;PP=146;ReadPosRankSum=-1.954;SC=ACGTTGTAAGAGTCCTACACT;SOR=0.446;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=11;WE=20459603;WS=20459585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr17	20768839	rs372665136	GA	G	69.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.27;MQRankSum=-6.586;QD=0.49;ReadPosRankSum=0.299;SOR=0.577;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:131,12:0.08:143
chr17	20768850	rs114103783	G	T	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.08;MQRankSum=-6.611;QD=0.55;ReadPosRankSum=1.038;SOR=0.566;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:132,12:0.08:144
chr17	20768867	rs9906896	A	C	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=0.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.192;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-9.924;NF=17;NR=19;PP=399;ReadPosRankSum=1.849;SC=ATATGGTTCAATTAATCATCT;SOR=0.270;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=116;TCF=41;TCR=75;TR=36;WE=20768875;WS=20768857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,26:0.24:107
chr17	20768912	rs186155723	C	G	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.95;MQRankSum=-2.833;QD=0.86;ReadPosRankSum=-1.268;SOR=0.252;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,5:0.14:37
chr17	20768928	rs141057464	AAT	A	46.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.48;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.301;NF=0;NR=3;PP=151;ReadPosRankSum=0.702;SC=TCCAGAAAAAAATATGTGAGA;SOR=0.069;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=3;WE=20768939;WS=20768918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,3:0.18:17
chr17	20768931	rs76382049	A	G	55.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.48;BaseQRankSum=2.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.056;NF=0;NR=3;PP=137;ReadPosRankSum=1.143;SC=AGAAAAAAATATGTGAGAGAG;SOR=0.090;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=3;WE=20768939;WS=20768918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,3:0.20:15
chr17	20799119	rs2279263	A	G	1022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=12;PP=892;SC=ATCGTGCTGGAGCTGGTCTAA;SOR=2.115;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=27;TCR=12;TR=39;WE=20799127;WS=20799109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr17	20799194	rs9907420	A	G	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=0.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQRankSum=-1.926;QD=3.60;ReadPosRankSum=1.017;SOR=0.798;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,32:0.27:119
chr17	20906251	rs4985956	C	T	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.24;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	20906257	rs4985957	A	G	724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.63;SOR=4.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	20908081	rs66644145	CTAGTGGAGCTGCGGGCAGCCAA	C	1034.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=2;PP=1467;SC=GCGGCCTTTCCTAGTGGAGCT;SOR=3.442;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=3;WE=20908110;WS=20908071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	20908325	rs9797279	T	C	2808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=44;PP=1629;SC=AACGGCAGGATTCAGCATCAT;SOR=0.909;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=44;TCR=44;TR=88;WE=20908333;WS=20908315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr17	20910364	rs9907786	C	A	2932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=54;PP=1743;SC=CTGGAAGCTTCAGGGCCTTCT;SOR=0.927;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=48;TCR=54;TR=102;WE=20910372;WS=20910354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr17	20910424	rs9914758	T	C	1262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=28;PP=845;SC=TTGAACTGCCTTGTAGCTACA;SOR=1.828;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=41;WE=20910432;WS=20910414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	20916035	rs4985962	A	G	1047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=5;PP=696;SC=CATTTATCTCATAGCCTCCTT;SOR=2.891;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=35;WE=20916043;WS=20916025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr17	20919334	rs7213684	T	G	631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.12;SOR=2.448;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	20919337	rs7207753	G	C	631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.13;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	20921492	rs1038107	C	T	595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=20;PP=511;SC=TGGATCCCAGCGGCTTCCTCT;SOR=4.615;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=20921500;WS=20921482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	20922268	rs984007	G	A	407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=3;PP=310;SC=TGGTTGCTGAGCACATTGATG;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=14;WE=20922276;WS=20922258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	20924523	rs2291037	G	A	4081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=70;NR=68;PP=2234;SC=AGATGCCTCCGTACATCAGAT;SOR=0.786;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=138;TCF=70;TCR=68;TR=138;WE=20924531;WS=20924513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr17	20924620	rs899342	T	C	2373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=51;PP=1240;SC=TTAAACACAGTGAGGTTCTGT;SOR=1.414;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=82;TCF=31;TCR=51;TR=82;WE=20924628;WS=20924610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr17	20945887	rs4985967	G	A	1574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.74;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr17	20945896	rs112391166	C	A	1580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.72;SOR=2.774;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr17	21117837	rs4985988	T	C	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.840;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.077;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=7;PP=93;ReadPosRankSum=1.610;SC=CCCAGAGCACTGCGCGGAGGC;SOR=1.426;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=9;WE=21117845;WS=21117827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr17	21147404	rs897926	A	G	896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.051;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=8;PP=580;ReadPosRankSum=-0.912;SC=TGGCCCTGCCACCTGCCTGCC;SOR=0.919;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=69;TCF=52;TCR=17;TR=40;WE=21147412;WS=21147394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,42:0.59:71
chr17	21156530	rs201190568	G	GC	1244.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=15;PP=596;SC=GGATGGGGCAGCCTGCTCCAG;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=21156538;WS=21156520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr17	21194658	rs71160134	T	TACAACACAACACAAC	903.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=1.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.941;HP=3;HapScore=1;MGOF=43;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.133;NF=4;NR=4;PP=1054;ReadPosRankSum=0.466;SC=TACAATACAATACAACACAAC;SOR=1.501;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=18;TCF=8;TCR=10;TR=8;WE=21194666;WS=21194648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr17	21194769	rs72840055	C	T	2336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.13;MQRankSum=-1.085;QD=13.83;ReadPosRankSum=1.354;SOR=0.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:106,63:0.37:169
chr17	21194769	.	CGA	TGT	2466	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MMLQ=26;MQ=60.16;NF=31;NR=20;PP=2466;QD=49.4013308797;SC=ACTGGCCTGTCGACAGTGCAG;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=147;TCF=84;TCR=63;TR=51;WE=21194793;WS=21194759;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:96,51:0.35:147
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chr17	21198972	rs2363221	T	C	1296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=30.16;ReadPosRankSum=0.390;SOR=0.586;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,35:0.81:43
chr17	21198978	rs2363220	C	T	748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=1.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.64;ReadPosRankSum=0.410;SOR=1.079;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,30:0.67:45
chr17	21199022	rs35804189	A	T	3499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.514;HP=3;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=1.172;NF=51;NR=31;PP=1141;ReadPosRankSum=-0.397;SC=TATACCACCCAGGCCTGCGAG;SOR=0.985;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=127;TCF=77;TCR=50;TR=82;WE=21199030;WS=21199012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,88:0.69:127
chr17	21199037	rs2885719	G	A	3722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.650;HP=1;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.229;NF=54;NR=39;PP=1273;ReadPosRankSum=0.649;SC=TGCGAGGAGCGTGGTCCCCAC;SOR=0.819;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=147;TCF=85;TCR=62;TR=93;WE=21199045;WS=21199027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,100:0.67:149
chr17	21199083	rs4442881	T	A	2862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.531;HP=6;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=1.319;NF=61;NR=56;PP=1709;ReadPosRankSum=1.674;SC=CCTTGACAGGTGGGGAAACTG;SOR=0.642;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=187;TCF=100;TCR=87;TR=117;WE=21199091;WS=21199073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,130:0.64:204
chr17	21199105	rs3035435	AG	A	3242.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.102;HP=7;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.311;NF=8;NR=58;PP=1356;ReadPosRankSum=-0.541;SC=GGCTTGGTGAAGGGGGGGCCA;SOR=0.770;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=121;TCF=22;TCR=99;TR=66;WE=21199119;WS=21199095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,126:0.61:207
chr17	21199111	rs55963016	G	A	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FS=3.071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.40;MQRankSum=-1.380;QD=1.72;ReadPosRankSum=1.402;SOR=0.761;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:177,41:0.19:218
chr17	21199236	rs2363219	C	T	766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.563;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=17;PP=547;ReadPosRankSum=-1.842;SC=AAGGGTGGGACTCAAGGGGCT;SOR=0.327;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=60;TCF=25;TCR=35;TR=32;WE=21199244;WS=21199226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,33:0.52:63
chr17	21199275	rs2363218	G	T	1215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=3.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.00;ReadPosRankSum=1.228;SOR=0.801;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,32:0.50:64
chr17	21199275	.	GTG	TTA	692	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=17;NR=7;PP=692;QD=31.0611614526;SC=CAGGGTCTCTGTGCAGAGCTT;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=54;TCF=29;TCR=25;TR=24;WE=21199285;WS=21199265;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:30,24:0.44:54
chr17	21199277	rs2363217	G	A	1215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=2.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.00;ReadPosRankSum=1.116;SOR=0.873;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,32:0.50:64
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chr17	21199390	rs4997717	C	T	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=1.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.47;ReadPosRankSum=-0.040;SOR=0.933;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,37:0.33:113
chr17	21199403	rs4997718	C	T	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=8.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.47;ReadPosRankSum=-0.836;SOR=1.528;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,38:0.33:114
chr17	21199499	rs2885718	G	A	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.592;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=200;ReadPosRankSum=-0.207;SC=ATCTTGCTTCGTCCTGCAGCA;SOR=0.262;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=14;WE=21199507;WS=21199489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr17	21199515	rs5025581	C	T	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.467;HP=5;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=111;ReadPosRankSum=-0.877;SC=CAGCACTGTGCGGGGCAGGTG;SOR=0.139;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=10;WE=21199523;WS=21199505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr17	21201579	rs11651154	C	T	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=324;ReadPosRankSum=0.542;SC=GAAGGCCTAACGGCCTGGCTT;SOR=0.399;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=19;WE=21201587;WS=21201569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr17	21201719	rs8076154	T	C	3623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.036;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=73;PP=2157;ReadPosRankSum=0.165;SC=CTTCTCTCCATTCTAGGAAAA;SOR=0.515;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=332;TCF=185;TCR=147;TR=161;WE=21201733;WS=21201709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:180,176:0.49:356
chr17	21201851	rs8072386	A	G	1848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.582;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=49;PP=1178;ReadPosRankSum=-0.075;SC=ACAGGGCTCAATGGAAGGAGT;SOR=0.525;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=181;TCF=69;TCR=112;TR=83;WE=21201859;WS=21201841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,89:0.46:192
chr17	21201884	rs2305875	T	C	2144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=9.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.81;ReadPosRankSum=1.257;SOR=0.191;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,59:0.52:114
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chr17	21201894	rs8071865	C	T	1863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=9.827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.67;ReadPosRankSum=0.309;SOR=0.116;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,47:0.55:86
chr17	21201907	rs2305874	G	A	1363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-6.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.068;HP=2;HapScore=4;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=29;PP=2401;ReadPosRankSum=-0.452;SC=CCTGTCCTGGGCAGCCCCTGC;SOR=0.078;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=60;TCF=3;TCR=57;TR=32;WE=21201915;WS=21201874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,35:0.56:63
chr17	21202056	rs34676150	G	A	792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.54;ReadPosRankSum=0.090;SOR=0.865;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,18:0.35:51
chr17	21202063	rs77850849	G	C	1002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.74;ReadPosRankSum=0.092;SOR=0.628;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,27:0.37:73
chr17	21202067	rs76764437	A	G	1077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.82;ReadPosRankSum=0.031;SOR=0.748;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,29:0.37:78
chr17	21202078	rs35477472	G	A	1345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.947;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=6;PP=1789;ReadPosRankSum=0.358;SC=AGGCGCCTCCGGGGCAGGAGG;SOR=0.982;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=98;TCF=74;TCR=24;TR=32;WE=21202086;WS=21202046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,37:0.36:103
chr17	21202102	rs35701021	C	T	1880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=13;PP=712;ReadPosRankSum=-1.558;SC=CTCGTCCCCACGCCAGGCCCC;SOR=0.655;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=140;TCF=103;TCR=37;TR=54;WE=21202110;WS=21202092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,61:0.41:149
chr17	21202191	rs33911218	C	A	4532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=487;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.100;HP=6;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=114;NR=92;PP=2448;ReadPosRankSum=-0.350;SC=TCTCCACAGACCCCCCCGGAA;SOR=0.810;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=448;TCF=237;TCR=211;TR=206;WE=21202199;WS=21202181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:257,229:0.47:486
chr17	21202237	rs36047035	G	C	5334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=568;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.745;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=117;NR=114;PP=2962;ReadPosRankSum=0.367;SC=ATTGGAGACAGAGTAGGTGCC;SOR=0.564;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=518;TCF=250;TCR=268;TR=231;WE=21202245;WS=21202227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:301,262:0.47:563
chr17	21202272	rs34880480	C	G	3942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=428;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.220;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=1.093;NF=84;NR=91;PP=2533;ReadPosRankSum=-0.867;SC=CAGGGCCTCTCACTTCACCTG;SOR=0.502;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=393;TCF=177;TCR=216;TR=175;WE=21202280;WS=21202262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:231,195:0.46:426
chr17	21202310	rs77343934	GC	AT	3791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FS=6.429;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.04;MQRankSum=1.192;QD=15.80;ReadPosRankSum=2.151;SOR=1.086;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:140,100:0.42:240
chr17	21202316	rs78463537	T	C	3770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FS=3.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.05;MQRankSum=1.149;QD=16.91;ReadPosRankSum=1.661;SOR=0.957;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:126,97:0.43:223
chr17	21202318	rs77591777	G	T	3662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FS=4.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.05;MQRankSum=1.145;QD=17.20;ReadPosRankSum=1.812;SOR=0.967;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:120,93:0.44:213
chr17	21202370	rs34794731	G	A	1114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.992;HP=1;HapScore=4;MGOF=41;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.001;NF=4;NR=28;PP=1478;ReadPosRankSum=0.000;SC=GAAGAGCCTCGTCCTGCGCTG;SOR=1.291;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=61;TCF=10;TCR=51;TR=32;WE=21202390;WS=21202360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,32:0.52:62
chr17	21202382	rs35763451	TG	T	1006.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=41;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.019;NF=0;NR=21;PP=1482;ReadPosRankSum=0.347;SC=CCTGCGCTGCTGGCTGTGTGG;SOR=0.735;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=21;WE=21202390;WS=21202360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,27:0.51:53
chr17	21203689	rs71207220	G	A	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=50;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=31;ReadPosRankSum=0.598;SC=GGCTCAGAGAGGTTAAGTGAC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=3;WE=21203697;WS=21203682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr17	21203711	rs73311537	C	T	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=28;ReadPosRankSum=0.272;SC=TGCTGAGGGTCACACAGCAGG;SOR=0.148;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=4;WE=21203719;WS=21203701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr17	21203820	rs78304829	G	C	2243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=4.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.03;ReadPosRankSum=0.994;SOR=0.432;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,61:0.44:140
chr17	21203825	rs75854955	C	G	2312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=3.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.42;ReadPosRankSum=0.899;SOR=0.458;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,65:0.43:150
chr17	21203893	rs34105301	T	C	1757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.497;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=35;PP=1041;ReadPosRankSum=0.486;SC=GGTGACCATCTCAGAACTGGG;SOR=0.656;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=197;TCF=101;TCR=96;TR=76;WE=21203901;WS=21203883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,89:0.40:221
chr17	21203934	rs62057672	G	A	1404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.536;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=27;PP=665;ReadPosRankSum=-0.729;SC=TAGAGAAGGTGCGGCACGCCC;SOR=0.425;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=151;TCF=70;TCR=81;TR=59;WE=21203942;WS=21203924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,73:0.42:173
chr17	21203949	rs62057673	C	T	1110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.200;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=23;PP=527;ReadPosRankSum=-1.002;SC=ACGCCCAGAGCGGCACCATCA;SOR=0.417;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=119;TCF=51;TCR=68;TR=46;WE=21203957;WS=21203939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,58:0.42:137
chr17	21203998	rs62057674	G	A	490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.269;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=340;ReadPosRankSum=1.886;SC=GCAGCTGGGAGGGCTCCCTGG;SOR=1.022;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=53;TCF=13;TCR=40;TR=19;WE=21204006;WS=21203988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,21:0.38:56
chr17	21204153	rs66883103	C	T	1095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.811;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=12;PP=718;ReadPosRankSum=1.326;SC=GCCTCTGCCACGGCAACCTCT;SOR=0.826;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=96;TCF=70;TCR=26;TR=46;WE=21204161;WS=21204143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,50:0.49:102
chr17	21204187	rs56067280	G	T	3888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.25;ReadPosRankSum=-0.507;SOR=0.661;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:97,95:0.49:192
chr17	21204192	rs56216806	C	T	4107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FS=1.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.94;ReadPosRankSum=-0.716;SOR=0.588;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,102:0.50:206
chr17	21204210	rs55796947	C	T	4636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.949;HP=2;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=51;PP=1549;ReadPosRankSum=-1.106;SC=CGTGAACTCACAGGAGCAGAA;SOR=0.468;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=250;TCF=157;TCR=93;TR=126;WE=21204218;WS=21204200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,137:0.51:270
chr17	21204257	rs56166328	G	A	6857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=430;ExcessHet=3.0103;FS=1.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.02;ReadPosRankSum=2.273;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:242,186:0.43:428
chr17	21204266	rs2230435	T	C	7051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=456;ExcessHet=3.0103;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.50;ReadPosRankSum=1.167;SOR=0.558;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:261,194:0.43:455
chr17	21204308	rs55777930	G	T	7603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=504;ExcessHet=3.0103;FS=2.486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.09;ReadPosRankSum=-1.710;SOR=0.701;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:296,208:0.41:504
chr17	21204314	.	TTG	T	7333.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=0.000;DP=504;ExcessHet=3.0103;FS=0.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.55;ReadPosRankSum=0.092;SOR=0.681;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:307,197:0.39:504
chr17	21204318	.	A	ACG	7295.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.451;ClippingRankSum=0.000;DP=497;ExcessHet=3.0103;FS=1.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.68;ReadPosRankSum=0.776;SOR=0.750;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:303,194:0.39:497
chr17	21204428	rs36191822	G	T	1681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FS=3.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.44;ReadPosRankSum=-0.816;SOR=0.448;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,54:0.37:147
chr17	21204437	rs76549047	T	C	1494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=1.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.89;ReadPosRankSum=0.282;SOR=0.516;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,40:0.34:116
chr17	21204441	rs78162711	T	C	1398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.71;ReadPosRankSum=-0.535;SOR=0.493;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,37:0.36:102
chr17	21205352	rs66761201	CGGA	C	549.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.99;ReadPosRankSum=0.668;SOR=0.260;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr17	21205354	.	GA	AG	1186	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=34;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=10;NR=2;PP=1186;QD=103.288989572;SC=GCACACGTCGGAGAGGGGGCT;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=12;WE=21205371;WS=21205344;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:9,12:0.57:21
chr17	21205358	.	GGGGGCT	G	1223	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5000;HP=4;HapScore=4;MGOF=34;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=9;NR=2;PP=1223;QD=112.727272727;SC=ACGTCGGAGAGGGGGCTGGGG;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=11;WE=21205371;WS=21205344;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:12,11:0.48:23
chr17	21205360	rs74998514	G	A	574.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=2.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.11;ReadPosRankSum=0.390;SOR=0.299;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr17	21205361	rs67557217	GGCT	G	533.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=2.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.35;ReadPosRankSum=-0.028;SOR=0.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr17	21205396	rs75974715	C	A	1097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=2.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.00;ReadPosRankSum=1.507;SOR=1.162;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,28:0.46:61
chr17	21205406	rs72831582	A	G	1285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=3.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.29;ReadPosRankSum=1.116;SOR=1.365;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,39:0.43:90
chr17	21205460	rs62057721	C	T	3117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=59;PP=2040;ReadPosRankSum=-2.245;SC=CACAGGGAGACGTGTGGATCT;SOR=0.671;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=284;TCF=169;TCR=115;TR=141;WE=21205468;WS=21205450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,148:0.50:298
chr17	21205592	rs66644302	GGC	G	2490.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.692;HP=1;HapScore=4;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=2.992;NF=3;NR=45;PP=2947;ReadPosRankSum=-0.344;SC=TGGGTGGGCTGGCGGGGGGTC;SOR=0.269;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=103;TCF=5;TCR=98;TR=48;WE=21205612;WS=21205582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,68:0.49:140
chr17	21205604	rs62057722	T	C	2292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.251;HP=2;HapScore=4;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.468;NF=22;NR=39;PP=2962;ReadPosRankSum=0.402;SC=CGGGGGGTCCTAGGTGCATAG;SOR=0.201;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=121;TCF=37;TCR=84;TR=61;WE=21205612;WS=21205582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,59:0.49:121
chr17	21205642	rs62057723	T	G	930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.529;NF=5;NR=25;PP=1646;ReadPosRankSum=0.992;SC=CCAGCAGGCATGGAGCCTGCC;SOR=0.578;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=57;TCF=10;TCR=47;TR=30;WE=21205663;WS=21205632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,27:0.47:57
chr17	21205654	rs72831585	A	G	886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.55;MQRankSum=1.233;QD=22.74;ReadPosRankSum=-1.073;SOR=0.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,23:0.59:39
chr17	21205654	.	AT	GA	1627	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=3;HapScore=4;MGOF=31;MMLQ=27;MQ=60.79;NF=0;NR=19;PP=1627;QD=88.4456776243;SC=GAGCCTGCCTATTGATGGTGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=19;WE=21205663;WS=21205632;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:19,19:0.50:38
chr17	21205655	rs76165275	T	A	886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.57;MQRankSum=1.261;QD=23.34;ReadPosRankSum=-0.785;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr17	21206269	rs73982750	G	A	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=182;ReadPosRankSum=0.773;SC=AGGTGAGCCCGGGAGGATGAG;SOR=0.874;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=13;WE=21206277;WS=21206259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr17	21206294	rs73311581	C	T	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=331;ReadPosRankSum=-0.309;SC=GGCAGGAGGCCGAGTGTGTCT;SOR=0.520;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=44;TCF=39;TCR=5;TR=20;WE=21206302;WS=21206284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,21:0.46:46
chr17	21206360	rs67280439	A	G	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.12;ReadPosRankSum=-1.543;SOR=0.661;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:150,20:0.12:170
chr17	21206372	rs72838545	G	C	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.93;ReadPosRankSum=-0.878;SOR=0.645;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:175,22:0.11:197
chr17	21206385	rs72838547	C	T	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FS=0.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.77;ReadPosRankSum=-0.511;SOR=0.783;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:207,28:0.12:235
chr17	21206444	rs62057728	A	G	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=342;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.35;ReadPosRankSum=-0.113;SOR=0.734;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:301,41:0.12:342
chr17	21206556	rs736103	C	T	1493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.327;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=38;PP=843;ReadPosRankSum=-0.106;SC=GGTCAGTGCCCGGCAGCCACC;SOR=0.828;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=143;TCF=56;TCR=87;TR=63;WE=21206564;WS=21206546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,70:0.48:147
chr17	21206616	rs57761454	G	A	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.715;HP=1;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=22;PP=437;ReadPosRankSum=-0.166;SC=GCGGGTGGACGTCTCCCTATG;SOR=2.666;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=50;TCF=7;TCR=43;TR=23;WE=21206624;WS=21206606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,23:0.46:50
chr17	21206632	rs35678520	C	T	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=2.126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.47;ReadPosRankSum=-0.096;SOR=1.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr17	21206635	rs77285979	T	A	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.46;ReadPosRankSum=-0.057;SOR=0.927;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
chr17	21206642	rs59259996	G	A	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.67;ReadPosRankSum=-0.280;SOR=0.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr17	21206654	rs56821097	G	T	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=925;ReadPosRankSum=0.059;SC=GAGGTGATAGGTTGTGACGTG;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=11;WE=21206662;WS=21206622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr17	21207602	rs55677712	C	G	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=145;ReadPosRankSum=1.919;SC=GACCCTGGTGCAACCTGCCCA;SOR=0.616;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=10;WE=21207610;WS=21207592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr17	21207649	rs56342308	C	T	918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=8;PP=524;ReadPosRankSum=-0.954;SC=GGGTCTTGGGCGAGGGAGGGG;SOR=0.700;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=67;TCF=52;TCR=15;TR=37;WE=21207657;WS=21207639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,41:0.55:74
chr17	21207844	rs2230436	C	T	2539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=360;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.839;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=71;PP=1665;ReadPosRankSum=1.121;SC=CGATGGATGCCGGCTGCAAGC;SOR=0.627;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=316;TCF=152;TCR=164;TR=129;WE=21207857;WS=21207834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:214,135:0.39:349
chr17	21207909	rs41301807	G	A	962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=1.753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.96;ReadPosRankSum=-0.171;SOR=0.516;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,46:0.38:121
chr17	21207916	rs7209761	A	G	1911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.51;ReadPosRankSum=1.515;SOR=0.829;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,54:0.55:98
chr17	21207938	rs75147012	C	T	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=1.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.08;ReadPosRankSum=-0.385;SOR=0.333;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,16:0.27:60
chr17	21207945	rs9896440	A	G	930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=8.244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.80;ReadPosRankSum=0.537;SOR=2.649;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,29:0.62:47
chr17	21208292	rs7214432	T	C	891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.391;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=15;PP=480;ReadPosRankSum=-0.294;SC=AGTTTGGGGATTGGGAGGCAA;SOR=0.491;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=116;TCF=75;TCR=41;TR=40;WE=21208300;WS=21208282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,49:0.38:128
chr17	21208317	rs4456559	G	A	3242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.837;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=43;PP=1706;ReadPosRankSum=3.100;SC=TAGCCATGGGGGCTTACCTGG;SOR=0.488;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=167;TCF=104;TCR=63;TR=108;WE=21208325;WS=21208307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,125:0.68:185
chr17	21208347	rs4559960	C	A	1883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.85;ReadPosRankSum=0.167;SOR=0.683;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:189,86:0.31:275
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chr17	21208413	rs1657695	C	T	1245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.21;ReadPosRankSum=-0.043;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:218,78:0.26:296
chr17	21208449	rs1657694	G	T	2311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.736;SOR=0.635;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:175,71:0.29:246
chr17	21208456	rs1657693	A	G	2282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.974;SOR=0.662;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:158,66:0.29:224
chr17	21208640	rs7209152	G	A	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.46;ReadPosRankSum=-0.842;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr17	21215434	rs113634008	A	AC	515.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.171;HP=5;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=1203;ReadPosRankSum=-1.640;SC=GGGGCCTCTGACCCCCTGTCC;SOR=1.356;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=49;TCF=36;TCR=13;TR=18;WE=21215454;WS=21215424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,23:0.34:68
chr17	21215446	rs62055363	C	T	768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.636;HP=3;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=6;PP=1200;ReadPosRankSum=-2.324;SC=CCCCTGTCCCCGCTGCAGATT;SOR=1.477;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=80;TCF=62;TCR=18;TR=32;WE=21215454;WS=21215424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,33:0.39:85
chr17	21215483	rs55935757	C	T	1784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.949;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=20;PP=1100;ReadPosRankSum=-0.310;SC=GGTTCCCTTACGAGTCCTGGG;SOR=0.896;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=181;TCF=131;TCR=50;TR=79;WE=21215491;WS=21215473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,84:0.43:194
chr17	21215537	rs55736474	C	A	3647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=398;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.213;HP=5;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=72;PP=2253;ReadPosRankSum=0.630;SC=AGGAGCCGTCCCCCCAGCTCC;SOR=0.869;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=379;TCF=215;TCR=164;TR=173;WE=21215545;WS=21215525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:216,180:0.45:396
chr17	21215552	rs56369732	C	T	7893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=443;ExcessHet=3.0103;FS=1.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.86;ReadPosRankSum=0.246;SOR=0.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:237,205:0.46:442
chr17	21215557	rs35206134	G	A	7954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=461;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.29;ReadPosRankSum=0.841;SOR=0.774;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:249,211:0.46:460
chr17	21215637	rs66486636	G	A	5504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FS=0.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.60;ReadPosRankSum=0.285;SOR=0.645;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:149,147:0.50:296
chr17	21215643	rs73302034	A	G	5358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.07;ReadPosRankSum=0.237;SOR=0.682;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:141,140:0.50:281
chr17	21215682	rs73302038	G	A	1674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.521;HP=3;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=54;PP=1259;ReadPosRankSum=-0.337;SC=TTATTCCTTTGGCAAATAAAC;SOR=0.901;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=138;TCF=36;TCR=102;TR=71;WE=21215690;WS=21215672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,73:0.50:147
chr17	21215700	rs73302043	T	G	1035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.929;HP=1;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=33;PP=731;ReadPosRankSum=-0.492;SC=AACCCCCAGATGACTTGGCAT;SOR=0.561;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=85;TCF=20;TCR=65;TR=44;WE=21215708;WS=21215690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,45:0.49:91
chr17	21216661	rs4994551	C	T	533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=11.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.30;MQRankSum=1.311;QD=14.83;ReadPosRankSum=0.097;SOR=0.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,14:0.39:36
chr17	21216664	rs4081986	A	G	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=5.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.28;MQRankSum=1.318;QD=14.69;ReadPosRankSum=0.231;SOR=0.071;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,15:0.38:39
chr17	21216686	rs4994549	C	A	951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-4.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.471;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.225;NF=17;NR=5;PP=292;ReadPosRankSum=-0.521;SC=CCCTTCTTCCCTGGGTGCACG;SOR=0.109;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=50;TCF=43;TCR=7;TR=22;WE=21216694;WS=21216676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,24:0.41:58
chr17	21216710	rs4994548	T	C	1195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.823;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.344;NF=27;NR=10;PP=537;ReadPosRankSum=0.621;SC=CCCCTGCTGCTAGGCCTGGGG;SOR=0.548;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=98;TCF=73;TCR=25;TR=37;WE=21216718;WS=21216700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,41:0.36:113
chr17	21216758	rs5819747	G	GCTTC	3307.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FS=1.535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.04;MQRankSum=1.464;QD=11.65;ReadPosRankSum=0.493;SOR=0.592;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:193,91:0.32:284
chr17	21216788	rs1673840	C	T	2070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=371;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.61;ReadPosRankSum=-1.185;SOR=0.686;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:247,122:0.33:369
chr17	21216846	rs1657688	G	C	1837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.637;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=47;PP=1220;ReadPosRankSum=1.854;SC=ACCTGGAGCTGATGGTGAGTA;SOR=0.538;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=268;TCF=124;TCR=144;TR=90;WE=21216854;WS=21216836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:203,104:0.34:307
chr17	21216951	rs1673839	C	G	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.629;HP=1;HapScore=4;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=685;ReadPosRankSum=-0.465;SC=TGGGTAGCTCCTCTGGCTGGC;SOR=1.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=51;TCF=7;TCR=44;TR=22;WE=21216972;WS=21216941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,22:0.41:54
chr17	21216964	rs1657686	T	C	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=685;ReadPosRankSum=-1.477;SC=TGGCTGGCCCTGTGTTCTCTC;SOR=0.434;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=15;WE=21216972;WS=21216941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr17	21217239	rs4114291	G	A	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=2.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.47;ReadPosRankSum=2.253;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr17	21217258	rs4114290	A	G	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.194;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=98;ReadPosRankSum=2.944;SC=GTGGCTGGAGAGTGACCACAA;SOR=0.223;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=35;TCF=31;TCR=4;TR=10;WE=21217266;WS=21217248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,10:0.28:36
chr17	21217290	rs1673837	G	A	777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=7;PP=486;ReadPosRankSum=-2.398;SC=AGGAGCCACAGATGCCATCTG;SOR=0.754;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=69;TCF=52;TCR=17;TR=31;WE=21217298;WS=21217280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,35:0.49:72
chr17	21217397	rs1657685	A	G	6020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FS=5.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.87;ReadPosRankSum=-0.981;SOR=0.951;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:165,154:0.48:319
chr17	21217400	rs1622401	G	A	6049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FS=2.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.50;ReadPosRankSum=-1.437;SOR=0.844;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:166,161:0.49:327
chr17	21217411	rs1657684	T	C	3712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.393;HP=4;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=70;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.970;SC=TGGCCACCTCTCCCTCCCGCT;SOR=0.733;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=318;TCF=181;TCR=137;TR=160;WE=21217419;WS=21217387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,169:0.50:341
chr17	21217513	rs2363198	G	A	4523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=378;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.312;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=110;PP=2803;ReadPosRankSum=-0.495;SC=TGCTGCCTTCGTGAAGGAGAT;SOR=0.866;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=344;TCF=160;TCR=184;TR=199;WE=21217521;WS=21217503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,212:0.56:377
chr17	21217547	rs2363197	T	C	5361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FS=3.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.50;ReadPosRankSum=-1.277;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:126,149:0.54:275
chr17	21217554	rs2363196	C	T	5032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FS=3.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.80;ReadPosRankSum=-0.687;SOR=0.915;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,127:0.52:242
chr17	21217566	rs2363375	C	T	2292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.290;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=61;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.953;SC=GACCCCACTCCGGCCCTCCAG;SOR=0.929;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=183;TCF=72;TCR=111;TR=96;WE=21217574;WS=21217537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,103:0.52:198
chr17	21217586	rs2363374	G	T	2166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.93;ReadPosRankSum=-0.088;SOR=0.730;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,64:0.47:136
chr17	21217596	rs2363373	C	G	1899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=1.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.003;SOR=0.947;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,49:0.45:108
chr17	21318521	rs76804083	C	T	682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=81;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=358;ReadPosRankSum=-0.298;SC=CCTCCAGTCACGTCTGGGGGC;SOR=0.307;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=19;WE=21318529;WS=21318511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr17	21318546	rs112960185	A	G	834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=9.277;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.76;ReadPosRankSum=2.308;SOR=2.159;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,24:0.34:71
chr17	21318552	rs112854769	G	A	891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=9.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.29;ReadPosRankSum=2.697;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,25:0.32:79
chr17	21318555	rs58462457	C	T	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=2.405;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.78;ReadPosRankSum=-0.751;SOR=0.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,30:0.34:87
chr17	21318569	rs74584621	C	T	1644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.855;HP=2;HapScore=1;MGOF=43;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=7;PP=1813;ReadPosRankSum=0.845;SC=GCCACCAGCCCAGCCAGACAT;SOR=1.377;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=125;TCF=94;TCR=31;TR=43;WE=21318577;WS=21318536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,42:0.33:128
chr17	21318586	rs59891808	G	C	4501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FS=5.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.73;ReadPosRankSum=0.289;SOR=1.135;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,114:0.63:182
chr17	21318586	.	GTC	CTG	2478	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=38;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=48;NR=13;PP=2478;QD=41.4994733584;SC=ACATGCTGTCGTCTCTGTTGC;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=175;TCF=121;TCR=54;TR=61;WE=21318611;WS=21318576;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:114,61:0.35:175
chr17	21318588	rs77791524	C	G	2541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FS=8.299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.38;ReadPosRankSum=-0.552;SOR=1.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:125,65:0.34:190
chr17	21318595	rs58780973	G	C	1532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.40;ReadPosRankSum=1.402;SOR=0.671;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:151,56:0.27:207
chr17	21318603	rs79809401	C	T	2692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.108;HP=1;HapScore=2;MGOF=38;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=22;PP=2497;ReadPosRankSum=-1.536;SC=TTGCAGGAGCCGCCCTGCCTG;SOR=0.810;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=224;TCF=155;TCR=69;TR=79;WE=21318611;WS=21318576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,84:0.35:239
chr17	21318629	rs58862472	C	A	2534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.678;HP=6;HapScore=3;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=46;PP=1103;ReadPosRankSum=-0.488;SC=AGCCTGGGGGCGAGCCAGGGT;SOR=0.487;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=316;TCF=198;TCR=118;TR=113;WE=21318637;WS=21318619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,121:0.51:239
chr17	21318663	rs72846666	G	A	3111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=481;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.324;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=75;PP=2004;ReadPosRankSum=1.106;SC=GGATGACCGCGGCCAGCCGGG;SOR=0.448;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=450;TCF=259;TCR=191;TR=160;WE=21318671;WS=21318653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:311,170:0.35:481
chr17	21318698	rs1657738	C	T	2729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=584;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.570;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=74;PP=1903;ReadPosRankSum=0.188;SC=ATCGTGTCATCGGAGGAGGAC;SOR=0.732;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=551;TCF=295;TCR=256;TR=172;WE=21318706;WS=21318688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:400,172:0.30:572
chr17	21318741	rs75113504	C	T	1209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=605;ExcessHet=3.0103;FS=0.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.00;ReadPosRankSum=0.548;SOR=0.762;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:532,72:0.12:604
chr17	21318760	rs74880280	G	T	1018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=640;ExcessHet=3.0103;FS=0.861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.59;ReadPosRankSum=0.206;SOR=0.708;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:569,70:0.11:639
chr17	21318770	rs3752033	G	A	4189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=629;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.68;ReadPosRankSum=0.090;SOR=0.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:492,135:0.22:627
chr17	21318773	rs3752034	G	A	4177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=627;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.68;ReadPosRankSum=0.016;SOR=0.691;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:488,137:0.22:625
chr17	21318782	rs78117732	G	A	4333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=633;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.86;ReadPosRankSum=0.794;SOR=0.719;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:433,199:0.31:632
chr17	21318867	rs73979893	G	A	2558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=507;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.904;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=82;PP=1922;ReadPosRankSum=0.814;SC=TGGCTGACATGTTCACCACCT;SOR=0.717;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=489;TCF=238;TCR=251;TR=160;WE=21318875;WS=21318857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:345,154:0.31:499
chr17	21318897	rs1657739	G	C	2606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=493;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.568;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=79;PP=1875;ReadPosRankSum=-0.084;SC=TCCGCTGGCGGTACATGCTGC;SOR=0.752;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=475;TCF=222;TCR=253;TR=146;WE=21318905;WS=21318887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:344,149:0.30:493
chr17	21318912	rs35011501	C	A	1319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=462;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.96;ReadPosRankSum=1.698;SOR=0.656;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:365,81:0.18:446
chr17	21318918	rs79626424	G	A	2753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=428;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.77;ReadPosRankSum=-0.208;SOR=0.696;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:297,110:0.27:407
chr17	21318948	rs112314728	C	T	3425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=396;ExcessHet=3.0103;FS=0.409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.65;ReadPosRankSum=0.516;SOR=0.743;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:288,108:0.27:396
chr17	21318951	rs75757803	C	T	3506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=394;ExcessHet=3.0103;FS=0.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.90;ReadPosRankSum=1.338;SOR=0.768;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:292,102:0.26:394
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chr17	21319767	rs1612176	C	T	2543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FS=1.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.75;MQRankSum=0.000;QD=15.80;ReadPosRankSum=0.027;SOR=0.564;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,75:0.47:161
chr17	21319785	rs1657745	C	T	2259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FS=0.568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQRankSum=3.895;QD=11.89;ReadPosRankSum=-0.712;SOR=0.633;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:124,66:0.35:190
chr17	21319786	rs78547883	G	A	1663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FS=1.287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQRankSum=-8.689;QD=8.76;ReadPosRankSum=0.407;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:138,52:0.27:190
chr17	21319845	rs72846670	C	T	1246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.742;HP=2;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=19;PP=388;ReadPosRankSum=0.182;SC=GAGACCAGGACGGCCGAAGCC;SOR=0.356;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=122;TCF=52;TCR=70;TR=37;WE=21319853;WS=21319835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,39:0.29:136
chr17	21319860	rs2917720	C	T,A	1310.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=3.551;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.11;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=0.441;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:41,42,35:0.36,0.30:118
chr17	21319860	.	CGGCCTCAG	AGGCCTCAT,TGGCCTCAG	721	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=13,17;NR=16,19;PP=721,280;QD=26.7057887884;SC=GAAGCCGGGACGGCCTCAGCC;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=46;TCR=58;TR=29,36;WE=21319876;WS=21319850;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.28:104
chr17	21319868	rs73979902	G	T	1194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=0.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.469;QD=9.79;ReadPosRankSum=-0.479;SOR=0.578;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,38:0.31:122
chr17	21319908	rs66981137	C	T	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-1.389;NF=11;NR=13;PP=296;ReadPosRankSum=1.225;SC=TCCAGGCTGGCGGCGGGGTCC;SOR=0.756;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=34;TCR=41;TR=24;WE=21319916;WS=21319898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,28:0.33:84
chr17	21319943	rs5021699	A	G	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.383;HP=4;HapScore=3;MGOF=43;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.752;NF=9;NR=10;PP=157;ReadPosRankSum=0.457;SC=TACAGACGGGAGTCAGAGATC;SOR=0.392;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=54;TCF=22;TCR=32;TR=19;WE=21319963;WS=21319933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,20:0.34:59
chr17	21319955	rs76506689	G	A	606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=1.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.270;QD=12.38;ReadPosRankSum=-1.578;SOR=0.899;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,18:0.37:49
chr17	21319977	rs34762677	A	G	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-1.350;QD=9.54;ReadPosRankSum=-1.339;SOR=0.620;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,11:0.33:33
chr17	21319989	rs5021700	C	A	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-0.843;QD=28.04;ReadPosRankSum=0.819;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr17	21319993	rs5021701	T	C	861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=31.92;ReadPosRankSum=-0.117;SOR=1.058;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,21:0.78:27
chr17	21320008	rs78435971	C	T	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.57;ReadPosRankSum=1.111;SOR=1.051;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr17	21320012	rs77515828	C	T	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.87;ReadPosRankSum=2.177;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr17	21320025	rs5021702	C	T	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=2.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=51;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=509;ReadPosRankSum=-1.745;SC=TCAGGGGCCCCGGGTTTGAGC;SOR=0.693;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=10;WE=21320033;WS=21319998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr17	21536106	rs9325915	T	C	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FS=28.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.71;MQRankSum=-16.060;QD=1.33;ReadPosRankSum=4.125;SOR=2.128;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:243,43:0.15:286
chr17	21536168	rs9325916	G	A	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=-2.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.334;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-9.477;NF=22;NR=50;PP=1034;ReadPosRankSum=1.970;SC=GTTTTTCTTTGCTTTTCCTAT;SOR=0.386;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=179;TCF=57;TCR=122;TR=72;WE=21536176;WS=21536158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,49:0.30:161
chr17	21544462	rs9285742	G	A	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQRankSum=-2.073;QD=9.74;ReadPosRankSum=-0.726;SOR=0.188;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr17	21544470	rs9285743	A	G	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQRankSum=-2.339;QD=9.57;ReadPosRankSum=-1.385;SOR=0.293;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr17	21544587	rs9285744	A	G	1830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=34;PP=981;ReadPosRankSum=-0.037;SC=TTAAACTGAAAAAGAAACAAG;SOR=0.695;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=201;TCF=109;TCR=92;TR=76;WE=21544595;WS=21544577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,93:0.41:226
chr17	21544646	rs9285745	T	C	1117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=29;PP=671;ReadPosRankSum=-0.136;SC=TTTCTCCCTATAGAAGATATT;SOR=0.675;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=127;TCF=50;TCR=77;TR=50;WE=21544654;WS=21544636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,57:0.42:137
chr17	21544674	rs9747056	T	A	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=21;PP=383;ReadPosRankSum=0.129;SC=TTTCCATATTTTGAAACTGTA;SOR=0.788;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=66;TCF=13;TCR=53;TR=26;WE=21544682;WS=21544664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,28:0.40:70
chr17	21730653	rs11656087	G	C	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=207;ReadPosRankSum=1.654;SC=GAAATACAATGATCCTGAGAT;SOR=0.667;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=57;TCF=42;TCR=15;TR=17;WE=21730661;WS=21730643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,20:0.30:66
chr17	21825565	rs12453514	G	T	690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=16;PP=416;ReadPosRankSum=-0.466;SC=CCTGCCCGGAGGGTGTTCGGG;SOR=0.643;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=40;TCF=19;TCR=21;TR=30;WE=21825573;WS=21825555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,32:0.73:44
chr17	21826038	rs9989454	T	C	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.310;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=178;ReadPosRankSum=1.221;SC=CGTGAGGAGATGCGTCGATCC;SOR=1.833;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=12;WE=21826046;WS=21826028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr17	21826256	rs9989450	A	G	1498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.714;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=27;PP=869;ReadPosRankSum=2.282;SC=AGAGGAAGCCAGGAATGGGAG;SOR=0.570;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=87;TCF=48;TCR=39;TR=58;WE=21826264;WS=21826246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,67:0.67:100
chr17	22066735	.	CA	GG	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.427;ClippingRankSum=0.000;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=12.708;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQRankSum=-9.081;QD=2.72;ReadPosRankSum=-1.045;SOR=3.166;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,8:0.10:84
chr17	22066745	rs78440652	C	G	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=7.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.87;MQRankSum=-10.697;QD=4.45;ReadPosRankSum=-4.199;SOR=1.525;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,27:0.23:118
chr17	22066776	rs75644031	T	C	2240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FS=13.678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.30;MQRankSum=-12.392;QD=12.38;ReadPosRankSum=-2.921;SOR=1.520;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,63:0.35:181
chr17	22066780	rs78507742	C	T	2236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FS=10.538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.36;MQRankSum=-12.553;QD=11.77;ReadPosRankSum=-1.540;SOR=1.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:126,64:0.34:190
chr17	22066807	rs78727354	G	T	2276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FS=3.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.16;MQRankSum=-13.455;QD=9.73;ReadPosRankSum=1.549;SOR=0.763;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:137,97:0.41:234
chr17	22066822	rs137955476	C	T	2301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FS=6.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.83;MQRankSum=-13.052;QD=10.10;ReadPosRankSum=2.634;SOR=0.655;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:130,98:0.43:228
chr17	22066835	rs147079852	C	T	2322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-3.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.664;HP=3;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-12.428;NF=51;NR=45;PP=2350;ReadPosRankSum=2.922;SC=ATGCAGATGACAATACTCTTG;SOR=0.491;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=205;TCF=99;TCR=106;TR=96;WE=22066843;WS=22066812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,94:0.44:212
chr17	22066856	rs138169151	CAG	C	2967.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-3.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.087;HP=2;HapScore=3;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-11.172;NF=4;NR=39;PP=2739;ReadPosRankSum=0.414;SC=AAAATGGTGGCAGAGAAAAAA;SOR=0.318;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=101;TCF=7;TCR=94;TR=43;WE=22066878;WS=22066846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,83:0.51:162
chr17	22066870	rs79914182	G	T	1284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-2.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.185;HP=2;HapScore=3;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-10.190;NF=28;NR=36;PP=2738;ReadPosRankSum=1.065;SC=GAAAAAAAATGAAGGGAATAT;SOR=0.390;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=135;TCF=54;TCR=81;TR=64;WE=22066878;WS=22066846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,65:0.46:141
chr17	22066929	.	C	T	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=2.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.99;MQRankSum=-4.589;QD=4.14;ReadPosRankSum=-0.033;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,5:0.19:26
chr17	22066932	.	A	C	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.068;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.47;MQRankSum=-4.312;QD=4.49;ReadPosRankSum=0.816;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,4:0.17:24
chr17	22066948	rs369981603	AT	A	49.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=2.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=3;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-3.756;NF=0;NR=4;PP=347;ReadPosRankSum=0.685;SC=TCCAGAAAAAATATGTGAGAG;SOR=0.321;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=4;WE=22066968;WS=22066938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,3:0.19:16
chr17	22066950	.	A	G	58.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.818;ClippingRankSum=0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.95;MQRankSum=-3.756;QD=3.67;ReadPosRankSum=1.798;SOR=0.321;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,3:0.19:16
chr17	25628820	rs6561	T	C	717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.560;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=10;PP=525;ReadPosRankSum=0.768;SC=TTAGTGAGATTACGTACTATA;SOR=0.999;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=140;TCF=95;TCR=45;TR=39;WE=25628828;WS=25628810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,41:0.28:149
chr17	25630388	rs2270761	T	C	1176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.064;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=29;PP=717;ReadPosRankSum=0.217;SC=CTTCCCCCACTCCAGTCTCTT;SOR=0.410;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=197;TCF=115;TCR=82;TR=63;WE=25630396;WS=25630378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,71:0.32:223
chr17	25636954	rs11080131	T	G	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.782;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.990;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=100;ReadPosRankSum=0.921;SC=ATGTATCATCTCTACTGAGTC;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=8;WE=25636962;WS=25636944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr17	25639104	rs11305587	CT	C	64.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=0;PP=51;ReadPosRankSum=0.668;SC=TTGGTTAGTTCTTCCTGGTTG;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=3;WE=25639112;WS=25639094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr17	25753033	rs13341669	T	C	1325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-6.786;NF=29;NR=33;PP=710;ReadPosRankSum=-2.513;SC=CTGGCTTCTCTGGGTGCTGAA;SOR=0.660;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=86;TCF=39;TCR=47;TR=62;WE=25753041;WS=25753023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,62:0.70:89
chr17	25887530	rs2945397	G	C	935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.795;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=20;PP=1379;ReadPosRankSum=-2.153;SC=TTCTCTTTCCGCTCTCCTCTA;SOR=0.755;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=156;TCF=81;TCR=75;TR=47;WE=25887549;WS=25887520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,55:0.31:180
chr17	25887541	rs2948526	C	T	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.996;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=21;PP=1379;ReadPosRankSum=-2.576;SC=CTCTCCTCTACCCTTGCGTTC;SOR=0.533;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=148;TCF=74;TCR=74;TR=46;WE=25887549;WS=25887520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,51:0.30:169
chr17	25909816	rs2293180	C	T	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.22;ReadPosRankSum=0.630;SOR=0.768;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,26:0.24:109
chr17	25912828	rs2945373	A	G	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.082;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=187;ReadPosRankSum=-1.483;SC=GCTGGTGACCACCTCAGGAAA;SOR=0.446;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=70;TCF=24;TCR=46;TR=18;WE=25912836;WS=25912818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,20:0.26:78
chr17	25915281	rs62057826	C	G	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.730;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=115;ReadPosRankSum=-0.538;SC=CCTCAGAGGCCAGGAGCAAGC;SOR=1.483;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=8;WE=25915289;WS=25915271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr17	25917810	rs1403321	A	G	920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.708;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=14;PP=503;ReadPosRankSum=-0.660;SC=GCTGGTGCAAACATGTGCCTG;SOR=0.397;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=92;TCF=64;TCR=28;TR=37;WE=25917818;WS=25917800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,47:0.43:109
chr17	25924596	rs16966333	C	T	552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=379;ReadPosRankSum=1.877;SC=ACTTGTCCGGCGCCCCAAGCA;SOR=0.976;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=22;WE=25924604;WS=25924586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,23:0.70:33
chr17	25929036	rs4332787	A	G	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.976;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=12;PP=237;ReadPosRankSum=0.519;SC=TACACTTACTATGTACCAACC;SOR=0.526;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=69;TCF=28;TCR=41;TR=21;WE=25929044;WS=25929026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,22:0.28:79
chr17	25930725	rs2241904	G	A	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=3.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.07;ReadPosRankSum=1.930;SOR=2.211;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
chr17	25930730	rs2241905	T	C	684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.92;ReadPosRankSum=1.712;SOR=1.051;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,20:0.47:43
chr17	25931637	rs2289567	G	T	1534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=23;PP=804;ReadPosRankSum=2.284;SC=TCTCTCCCGGGAGTCCCCGCT;SOR=0.697;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=103;TCF=64;TCR=39;TR=62;WE=25931645;WS=25931627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,71:0.61:116
chr17	25932940	rs11433820	A	AT	155.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.976;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.769;NF=0;NR=5;PP=96;ReadPosRankSum=0.271;SC=GGAAGTTCTAATAGAGGCATA;SOR=0.293;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=5;WE=25932948;WS=25932930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,8:0.26:31
chr17	25935104	rs2289569	G	A	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=159;ReadPosRankSum=0.263;SC=TGTTCCTCTCGCCCTGTTACT;SOR=0.693;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=42;TCF=8;TCR=34;TR=13;WE=25935112;WS=25935094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,13:0.28:46
chr17	25944235	rs4267373	A	G	717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=3;PP=568;SC=TGAGAACATCAAAGGGACCCT;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=25;WE=25944243;WS=25944225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	25950220	rs1075952	G	A	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.021;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=103;ReadPosRankSum=-2.214;SC=TGGCCAATCAGTCATTTTCAT;SOR=1.276;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=8;WE=25950228;WS=25950210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr17	25958304	rs3751093	G	A	648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=21;PP=473;ReadPosRankSum=-0.983;SC=GGCCTTCAGCGGTTCCCAGGC;SOR=0.718;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=117;TCF=52;TCR=65;TR=36;WE=25958312;WS=25958294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,38:0.28:137
chr17	25974545	rs4794976	T	G	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.041;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.445;NF=7;NR=15;PP=296;ReadPosRankSum=-0.019;SC=CCTTGAACAGTATGGGGGCTG;SOR=0.503;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=64;TCF=21;TCR=43;TR=22;WE=25974553;WS=25974535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,23:0.33:69
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chr17	26092555	rs2297512	G	A	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.30;ReadPosRankSum=-0.283;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
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chr17	26099171	rs2274894	T	G	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=34;ReadPosRankSum=-0.108;SC=GTGTAAGTTTTGGAATCCCTG;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=3;WE=26099179;WS=26099161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr17	26100321	rs2248814	A	G	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.51;ReadPosRankSum=-0.137;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr17	26101237	rs3729966	G	A	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=1;PP=37;ReadPosRankSum=-0.730;SC=CACACATACAGCCACATCTGA;SOR=0.223;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=4;WE=26101245;WS=26101227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr17	26206414	rs3751972	C	A	573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=1;PP=396;SC=AGGCCAATGGCTCTTCCAAAC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=26206422;WS=26206404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	26574820	rs61141479	G	A	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.647;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=13;PP=251;ReadPosRankSum=-0.472;SC=GTGCTGACCAGGCCTGGGCCC;SOR=0.912;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=49;TCR=46;TR=26;WE=26574828;WS=26574810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,34:0.30:115
chr17	26633155	rs241778	A	T	3768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.486;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=71;PP=2180;ReadPosRankSum=-1.892;SC=GCAATGATCCATCTTATGGAT;SOR=0.461;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=226;TCF=124;TCR=102;TR=151;WE=26633163;WS=26633145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,169:0.67:251
chr17	26646434	rs5819836	G	GC	1880.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=29;PP=1221;SC=AGGCTCTCCCGGCGCTGCGTC;SOR=1.708;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=29;WE=26646442;WS=26646424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr17	26669245	rs5819838	A	AG	1394.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=7;PP=1130;SC=CCTCACTCCCAGCCGCTTGGC;SOR=2.073;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=26;WE=26669253;WS=26669235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr17	26684283	rs11314852	GT	G	1492.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=7;NR=13;PP=778;SC=TCCAGGCCCAGTTCCTCGCGC;SOR=1.206;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=7;TCR=13;TR=20;WE=26684291;WS=26684273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr17	26684390	rs11448856	G	GC	2451.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=25;PP=1164;SC=GCACAGAGCGGCTTTGCCACC;SOR=0.884;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=27;WE=26684402;WS=26684380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr17	26684394	rs17856014	T	G	2509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=22;NR=23;PP=716;SC=AGAGCGGCTTTGCCACCGGGC;SOR=0.914;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=48;TCF=22;TCR=26;TR=45;WE=26684402;WS=26684380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr17	26684449	rs4795429	G	C	824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=17;PP=506;SC=ACGGCCAGGGGCCGCCGGGCT;SOR=1.214;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=12;TCR=17;TR=29;WE=26684457;WS=26684439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr17	26684529	rs113967755	G	GGC	98.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.75;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	26687484	rs11379368	G	GC	1242.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=6;PP=904;SC=AGAGGGCTGAGCCAGACTGTC;SOR=2.179;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=22;WE=26687492;WS=26687474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr17	26687898	rs11382918	G	GC	826.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=15;PP=667;SC=AGGGCAGGGTGCCCTGGTGGG;SOR=1.697;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=17;WE=26687906;WS=26687888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	26691321	rs9910163	A	G	765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.306;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=14;PP=369;ReadPosRankSum=0.409;SC=GACAATGGCCAAGGCATAGAT;SOR=0.937;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=118;TCF=68;TCR=50;TR=40;WE=26691329;WS=26691311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,47:0.35:134
chr17	26692224	rs11387886	A	AG	7100.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=59;PP=2936;SC=GGGCCATGCCAGGCTGTGCCC;SOR=0.898;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=31;TCR=62;TR=89;WE=26692232;WS=26692214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr17	26695704	rs2227725	A	G	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.674;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=185;ReadPosRankSum=-0.062;SC=CCTGAGGAGCAGGGTGGTGGG;SOR=0.942;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=21;TCF=12;TCR=9;TR=11;WE=26695712;WS=26695694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr17	26699121	rs7212814	G	C	742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=11;PP=326;SC=GGCCCACGGCGGGGCGCCGAG;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=14;TCR=11;TR=25;WE=26699129;WS=26699111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	26699195	rs11437592	C	CG	667.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=7;PP=382;SC=TGCGGGTGGCCCGGGCCCGCG;SOR=0.941;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=10;WE=26699213;WS=26699185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	26699199	rs112387743	G	GC	627.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.84;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	26699205	rs11340312	GA	G	502.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=6;PP=293;SC=CCGGGCCCGCGAAAGTGTCGC;SOR=1.270;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=8;WE=26699213;WS=26699185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	26699367	rs11437594	G	GC	2085.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=6;NR=17;PP=1052;SC=CCTGGCTGCTGCGGCCGTGGG;SOR=0.877;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=23;WE=26699375;WS=26699357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr17	26708298	.	A	AGC	7319.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.685;ClippingRankSum=0.000;DP=286;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.24;ReadPosRankSum=-0.154;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,277:0.99:279
chr17	26708302	.	GGT	G	12588.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=280;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.96;SOR=0.761;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr17	26708550	rs11658194	TC	CG	7528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=57;PP=2947;SC=CGAGCTGCTTTCGCTGCACGC;SOR=0.819;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=134;TCF=74;TCR=60;TR=129;WE=26708559;WS=26708540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr17	26712165	rs144613221	T	C	1199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FS=1.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.28;ReadPosRankSum=0.935;SOR=0.603;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:123,68:0.36:191
chr17	26727721	rs5819844	GA	G	2197.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=27;PP=1185;SC=GTGAGTTGAAGAATGCCGGAG;SOR=0.986;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=29;WE=26727729;WS=26727711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr17	26729428	rs4795436	C	T	1313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=28;PP=849;SC=CCATACCCCACGTGGGGCTTA;SOR=1.931;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=14;TCR=28;TR=42;WE=26729436;WS=26729418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr17	26818676	rs9890678	T	C	4941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=74;PP=2965;SC=GATCTGCACATTCACTGGGAG;SOR=0.727;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=159;TCF=85;TCR=74;TR=159;WE=26818684;WS=26818666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr17	26850810	rs10527420	TTCTCTCTCTCTCTCTC	T	412.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=3;NR=1;PP=539;SC=CGCTCTCTGGTTCTCTCTCTC;SOR=3.258;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=26850833;WS=26850802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	26850929	rs483434	A	C	2123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=44;NR=23;PP=1111;SC=GTTGGTCCCCACTGGATGCTG;SOR=1.096;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=68;TCF=45;TCR=23;TR=67;WE=26850937;WS=26850919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr17	26851501	rs614434	G	A	3257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=65;NR=46;PP=1688;SC=TCACAGGCTCGCTACTCTCTG;SOR=0.862;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=65;TCR=46;TR=111;WE=26851509;WS=26851491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr17	26874314	rs2070139	G	A	5465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=105;NR=80;PP=2965;SC=CAGCCGTGGGGTCAGGGTGTC;SOR=0.869;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=185;TCF=105;TCR=80;TR=185;WE=26874322;WS=26874304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr17	26890310	.	C	CA	113.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.211;ClippingRankSum=0.000;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=1.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.22;MQRankSum=1.835;QD=2.47;ReadPosRankSum=-0.722;SOR=0.377;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,11:0.24:46
chr17	26911647	rs150084684	TAC	T	81.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=3.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.36;ReadPosRankSum=0.820;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,8:0.13:60
chr17	26923218	.	CA	C	47.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.279;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.08;ReadPosRankSum=0.912;SOR=0.465;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,10:0.23:44
chr17	27000391	rs9904043	A	G	1992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=21;PP=1138;SC=TTCCCTAGTTATCTTCAGGCA;SOR=1.073;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=39;TCR=21;TR=60;WE=27000399;WS=27000381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr17	27002402	rs9892089	A	G	4210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=77;NR=64;PP=2285;SC=GCCCCAACCCATCCTTTTCCT;SOR=0.823;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=142;TCF=77;TCR=65;TR=141;WE=27002410;WS=27002392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr17	27004703	rs7207976	C	A	1309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=10;PP=965;SC=AGATAAAGTCCGTCTCACCCT;SOR=2.511;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=45;WE=27004711;WS=27004693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr17	27009749	rs12051648	C	T	2522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=27;PP=1395;SC=CTTTAGATGGCCTGGCCAAAA;SOR=1.203;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=52;TCR=27;TR=79;WE=27009757;WS=27009739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr17	27050924	rs368186775	AAT	A	61.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.809;NF=0;NR=5;PP=121;ReadPosRankSum=-1.559;SC=CCTAATTCTGAATATATATAT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=5;WE=27050933;WS=27050914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr17	27053568	rs12952249	G	A	269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=7;NR=3;PP=140;SC=CCGGGCCACCGGCTACCCCGC;SOR=1.270;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=10;WE=27053576;WS=27053558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	27093542	rs9900141	G	A	3741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=44;PP=2550;SC=CTTCAAGGACGGCCCAAATGT;SOR=1.138;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=123;TCF=79;TCR=44;TR=122;WE=27093550;WS=27093532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr17	27185827	rs2242345	C	T	4216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=65;PP=2501;SC=GCCAGGAGGACGTGAAAACAC;SOR=0.826;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=144;TCF=79;TCR=65;TR=144;WE=27185835;WS=27185817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr17	27187636	rs9279	G	T	2607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=61;PP=1794;SC=GACCAGTTCTGTCCTTGGCTG;SOR=1.561;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=30;TCR=61;TR=91;WE=27187644;WS=27187626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr17	27188296	rs28448745	A	C	236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=7;NR=4;PP=152;SC=CCCTACCCCCAATCCCACGCC;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=11;WE=27188304;WS=27188286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	27225937	rs4795473	C	T	519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=15;PP=392;SC=AGAAAGGAGTCGGGCTAGGCA;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=27225945;WS=27225927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	27246368	rs68042462	CCTCCCCTCCTTGATCCTAACATT	C	666.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.383;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.442;NF=0;NR=8;PP=2258;ReadPosRankSum=1.557;SC=TGTGGAACAGCCTCCCCTCCT;SOR=4.003;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=8;WE=27246398;WS=27246358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,23:0.92:25
chr17	27382061	rs68136852	C	A	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.435;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=407;ReadPosRankSum=1.358;SC=ACCACTCATGCCACTCTGATT;SOR=1.061;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=22;WE=27382069;WS=27382051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,28:0.68:41
chr17	27412805	rs7209661	T	G	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=173;ReadPosRankSum=0.174;SC=GACCAGGTAGTGGGATGCGTG;SOR=1.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=9;WE=27412813;WS=27412795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr17	27413403	rs8080570	T	C	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.748;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=181;ReadPosRankSum=0.226;SC=GTTCCAGAGGTGGTCAAGAGG;SOR=0.387;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=23;TCF=15;TCR=8;TR=17;WE=27413411;WS=27413393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,17:0.71:24
chr17	27413908	rs4795495	C	G	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.387;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=137;ReadPosRankSum=-1.198;SC=TCAGCAGCTACTCAAGGGGCT;SOR=0.180;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=7;WE=27413916;WS=27413903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr17	27417209	rs79749090	A	G	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=251;ReadPosRankSum=0.401;SC=AGTGACCAGAAGGCAAGGGGA;SOR=0.520;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=37;TCF=13;TCR=24;TR=18;WE=27417217;WS=27417199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,18:0.43:42
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chr17	27420304	rs12603438	G	C	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.847;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=5;PP=525;ReadPosRankSum=-0.017;SC=CATGGGCAGGGAGCCGGCCAG;SOR=1.545;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=29;WE=27420312;WS=27420294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,27:0.69:39
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chr17	27422053	rs2320786	C	T	935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.00;ReadPosRankSum=-1.223;SOR=0.830;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,44:0.61:72
chr17	27424316	rs8067806	G	A	1438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.502;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=24;PP=821;ReadPosRankSum=1.718;SC=GCCGTTTCTTGGTGAAGTCCA;SOR=0.862;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=58;TCR=37;TR=61;WE=27424324;WS=27424306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,69:0.59:116
chr17	27425793	rs12450936	A	G	1514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=6.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.84;ReadPosRankSum=-0.889;SOR=0.339;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,74:0.63:118
chr17	27437134	rs2279958	A	G	1372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=28;PP=713;ReadPosRankSum=-0.564;SC=CGAGGGGAAGAGACTGCCCTC;SOR=0.763;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=93;TCF=48;TCR=45;TR=55;WE=27437147;WS=27437124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,63:0.59:107
chr17	27437208	rs2279959	A	G	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=21;PP=502;ReadPosRankSum=-0.564;SC=CACTGCTCACAGGGTAGCAGC;SOR=0.741;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=9;TCR=32;TR=27;WE=27437216;WS=27437198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,27:0.66:41
chr17	27437710	rs1994663	C	G	1492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=28;PP=750;ReadPosRankSum=-0.613;SC=CGCTCCTCCCCCAAGGCCCCA;SOR=0.654;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=73;TCF=33;TCR=40;TR=53;WE=27437718;WS=27437700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,66:0.75:88
chr17	27438469	rs8076604	G	A	1594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.937;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=15;PP=983;ReadPosRankSum=-1.824;SC=GAGCCGGGGGGCATTCTGGGT;SOR=0.481;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=89;TCF=66;TCR=23;TR=60;WE=27438477;WS=27438459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,68:0.68:100
chr17	27441077	rs12601535	C	G	3363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.523;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=52;PP=1948;ReadPosRankSum=-1.116;SC=AGTCATCCGTCGGGGGTTCCA;SOR=0.763;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=197;TCF=116;TCR=81;TR=128;WE=27441085;WS=27441067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,149:0.67:223
chr17	27443631	.	G	GCACACACACACACACA	934	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=934;QD=474.5;SC=TGGGACAAACGCACACACACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=2;WE=27443639;WS=27443621;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,2:0.25:8
chr17	27449059	rs877492	C	A	871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-3.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.377;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=20;PP=453;ReadPosRankSum=1.055;SC=TATCCTCCCCCCCACTGCATC;SOR=0.240;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=49;TCF=14;TCR=35;TR=31;WE=27449067;WS=27449049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,38:0.67:57
chr17	27455707	rs55939148	AC	A	194.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.502;NF=0;NR=7;PP=191;ReadPosRankSum=-0.424;SC=CCACGAGGCTACCCCAGGAAG;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=7;WE=27455715;WS=27455697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr17	27455736	rs8075284	A	G	156.88	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.53;MQRankSum=0.210;QD=26.15;ReadPosRankSum=0.210;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr17	27456255	rs11080078	G	C	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=79;ReadPosRankSum=-0.150;SC=CAAGCACTGAGGAGCCCAGCA;SOR=1.270;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=7;WE=27456263;WS=27456245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr17	27492869	rs6505113	A	G	850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.061;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=13;PP=464;ReadPosRankSum=1.779;SC=GGCTCTGATAACAGCTCTTGG;SOR=0.551;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=47;TCF=30;TCR=17;TR=32;WE=27492877;WS=27492859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,38:0.66:58
chr17	27579233	.	T	G	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=96;ReadPosRankSum=-0.324;SC=TGTGAGTCTCTGAAATTTCCA;SOR=0.476;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=10;WE=27579241;WS=27579223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr17	27809104	rs6505138	A	G	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=62;ReadPosRankSum=1.930;SC=ATGTCCAGATATATTGGCTAG;SOR=0.330;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=5;WE=27809112;WS=27809097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr17	27835138	rs508706	C	T	3789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=71;PP=2223;SC=ACCAGGCTGCCATGGAGAAAG;SOR=0.991;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=59;TCR=71;TR=130;WE=27835146;WS=27835128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr17	27861073	rs138929038	T	G	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=1.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.79;ReadPosRankSum=-1.378;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
chr17	27861113	rs150300324	TTC	T	143.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.99;ReadPosRankSum=-0.054;SOR=0.632;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,9:0.19:48
chr17	27861329	rs3744624	T	C	975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=22;PP=583;ReadPosRankSum=-0.764;SC=GTATAAGTAATAGAAGGAAAA;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=24;TCR=31;TR=39;WE=27861337;WS=27861319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,43:0.70:61
chr17	27889578	rs539307	T	C	2483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=22;PP=1338;SC=GGCCAGGTCTTTCACCTTGTG;SOR=1.356;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=51;TCR=22;TR=73;WE=27889586;WS=27889568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr17	27889986	rs542939	T	C	1417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.123;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=36;PP=915;ReadPosRankSum=1.969;SC=TCCCAGTAGGTATCCCAGCTG;SOR=0.866;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=213;TCF=109;TCR=104;TR=69;WE=27889994;WS=27889976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,77:0.33:231
chr17	27893015	rs2292973	G	A	1035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=8;PP=595;SC=GCCCACGCCTGTTCCAATGCT;SOR=2.133;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=34;WE=27893023;WS=27893005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr17	27893893	rs62070806	C	A	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.411;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=7;PP=142;ReadPosRankSum=1.087;SC=TCCGACGGCGCGCCCCCAGGG;SOR=0.210;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=42;TCF=16;TCR=26;TR=15;WE=27893901;WS=27893883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,17:0.35:48
chr17	27898828	rs565977	T	C	6385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=111;NR=97;PP=2965;SC=TTTCCTCTTGTTTGTCCCCAC;SOR=0.719;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=208;TCF=111;TCR=97;TR=208;WE=27898836;WS=27898818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr17	27901975	rs550818	A	G	5076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=82;PP=2895;SC=ACTTTAAGCCACCAGCTGAGA;SOR=0.703;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=173;TCF=90;TCR=83;TR=172;WE=27901983;WS=27901965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr17	27904322	rs601364	A	G	3667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=75;PP=2202;SC=CTGACGCAGGACGGCAGGGAC;SOR=1.591;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=40;TCR=75;TR=115;WE=27904330;WS=27904312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr17	27904617	rs2278217	C	A	3343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=74;NR=44;PP=2136;SC=GGAGGGACCGCGGGGATGAAG;SOR=1.188;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=74;TCR=44;TR=118;WE=27904625;WS=27904607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr17	27904711	rs11080105	G	A	5778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=103;NR=104;PP=2965;SC=GGAAGGGCACGGCACTGCGCT;SOR=0.869;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=207;TCF=103;TCR=104;TR=207;WE=27904719;WS=27904701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr17	27905673	rs563976	A	G	1682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=12;PP=1044;SC=TCAGAGGCAGAGGAAGCAAGA;SOR=1.733;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=54;TCF=41;TCR=13;TR=52;WE=27905681;WS=27905663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr17	27910706	rs2303623	C	T	740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=22;PP=582;SC=TGCTCTGGCCCGTGCCAAGCC;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=25;WE=27910714;WS=27910696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	27920578	.	C	T	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.403;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.32;ReadPosRankSum=-0.962;SOR=0.743;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr17	27949934	rs77991986	G	GC	1316.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.49;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=12;PP=577;SC=AGAGGGCGGGGCTAGCATAGG;SOR=1.121;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=13;WE=27949942;WS=27949924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr17	28029938	rs3102560	T	C	3406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=44;PP=2289;ReadPosRankSum=0.289;SC=ACAAAAGATATAGTTACCAAG;SOR=1.170;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=71;TCR=45;TR=114;WE=28029946;WS=28029924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,130:0.98:132
chr17	28268800	rs4567782	A	C	1613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=34;NR=20;PP=900;SC=TTTGGTGATAACTTTTGGAGT;SOR=1.022;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=55;TCF=34;TCR=21;TR=54;WE=28268808;WS=28268790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr17	28296327	rs9897794	T	G	4306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=57;PP=2568;SC=TTACCAGAGGTTGATGAAAGA;SOR=0.814;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=75;TCR=57;TR=132;WE=28296335;WS=28296317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr17	28320248	rs4795524	T	A	6122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=113;NR=85;PP=2965;SC=GACAAAATCATAGTCAAGGTG;SOR=0.936;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=198;TCF=113;TCR=85;TR=198;WE=28320256;WS=28320238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr17	28434826	rs5819880	ACTTTT	A	1046.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=21;NR=0;PP=976;SC=CTCCACTCTTACTTTTCTTTT;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=28434838;WS=28434816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	28444183	rs6505162	A	C	560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=16;PP=480;SC=TTGCTTCCTAACCCGCGCTTG;SOR=2.833;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=28444191;WS=28444173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	28444254	rs8067576	T	A	197.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=6;PP=130;SC=CCTGGCTTCCTTAGAGGGCCT;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=28444262;WS=28444244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	28505024	rs7221154	G	A	1815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=19;PP=1016;SC=TTCTCAAAAAGCATAGACTTT;SOR=1.078;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=37;TCR=19;TR=56;WE=28505032;WS=28505014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr17	28511978	rs1979572	G	A	6875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=117;NR=105;PP=2965;SC=ATCAGCACCAGCAGAAGCAAT;SOR=0.701;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=222;TCF=117;TCR=105;TR=222;WE=28511986;WS=28511968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr17	28538532	rs140701	C	T	2300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=31;NR=39;PP=1086;SC=ACAACAGTTACAATTCTCATC;SOR=1.259;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=31;TCR=39;TR=70;WE=28538540;WS=28538522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr17	28549898	rs6354	G	T	2721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=56;PP=1584;SC=TATTCTGCAAGAGAGGGCAAG;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=38;TCR=56;TR=94;WE=28549906;WS=28549888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr17	28549978	rs25528	G	T	446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=13;PP=349;SC=GGTGGTTGGTGTCGCCGTCCC;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=28549986;WS=28549968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	28778720	rs2253256	G	C	4716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=59;PP=2804;SC=ATTTCTGTTTGTGCTTCAGTT;SOR=0.954;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=143;TCF=84;TCR=59;TR=143;WE=28778728;WS=28778710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr17	28811658	.	G	GT	160	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=12;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=17;MQ=59.01;NF=6;NR=3;PP=160;QD=19.1111111111;SC=TATTTTGATTGTTTTTTTTTT;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=9;WE=28811666;WS=28811648;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:8,9:0.53:17
chr17	28890203	rs216455	T	C	1015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=16;PP=723;SC=CGGTAGCCTGTTCTCCCCCTC;SOR=0.984;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=21;TCR=16;TR=37;WE=28890211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr17	28900708	rs3764416	G	T	228.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=6;PP=167;SC=CCTCAGTGGGGGGAGAGGTGG;SOR=1.402;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=10;WE=28900716;WS=28900698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	28901151	rs11080128	G	C	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=1;PP=25;SC=ATTAGCACAGGCCCAAGAATG;SOR=0.693;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=2;TCF=1;TCR=1;TR=2;WE=28901159;WS=28901141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr17	29051705	rs9903735	C	T	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.789;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.80;MQRankSum=-0.852;QD=9.71;ReadPosRankSum=-0.541;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr17	29111368	rs11867457	A	G	866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.630;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=20;PP=597;ReadPosRankSum=-1.201;SC=GGTGGTTCCTAGAGTCACGGC;SOR=0.794;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=155;TCF=86;TCR=69;TR=47;WE=29111376;WS=29111358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,49:0.29:167
chr17	29221227	rs9898911	A	T	861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=22;PP=610;SC=GGGGAAATCAATAGAGTTTTT;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=29;WE=29221235;WS=29221217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	29226630	rs28539246	T	A	105.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.055;HP=7;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=153;ReadPosRankSum=-0.482;SC=GAAATCTTTTTAAAAAAAGAC;SOR=0.116;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=12;WE=29226638;WS=29226620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,9:0.30:30
chr17	29226652	rs9897628	A	G	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=58;ReadPosRankSum=1.908;SC=AAATAAAGGAACAGAAATAAT;SOR=0.197;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=6;WE=29226660;WS=29226642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr17	29482878	rs2269855	G	A	303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=245;SC=TGAGATGCAAGTATAGGTATC;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=29482886;WS=29482868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	29486152	rs2952976	G	A	5003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=80;PP=2780;SC=TTGTGAATTTGATCTTGAGAA;SOR=0.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=154;TCF=74;TCR=80;TR=154;WE=29486160;WS=29486142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr17	29496819	rs2905807	C	T	357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=2;PP=241;SC=CTGCCTTGGCCTCCTGAAGTG;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=29496827;WS=29496809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	29508775	rs1801052	G	A	1583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.31;SOR=0.997;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr17	29545987	rs67472948	A	AT	1533.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=7;PP=649;SC=CGATTTATTTATTTTTTTAAT;SOR=2.093;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=37;TCF=21;TCR=16;TR=25;WE=29545995;WS=29545977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	29546175	rs2905880	T	C	2563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=45;PP=1520;SC=GAAGGAAAGATTGTAACTATG;SOR=1.119;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=34;TCR=45;TR=79;WE=29546183;WS=29546165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr17	29553336	rs141114572	G	GAC	179.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.862;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5013;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.282;NF=1;NR=0;PP=43;ReadPosRankSum=1.383;SC=TGTATGCGGAGACACACACAC;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=1;WE=29553347;WS=29553326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr17	29587341	rs17881285	G	C	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=271;ReadPosRankSum=-1.513;SC=ACATAAGTCTGGGTGTATCTG;SOR=0.765;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=16;WE=29587349;WS=29587331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr17	29646032	rs1129506	G	A	5704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=99;PP=2965;SC=CCGTGGGCATGCTTGGCAATC;SOR=1.064;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=182;TCF=83;TCR=99;TR=182;WE=29646040;WS=29646022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr17	29653293	rs9894648	T	C	3128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=64;PP=2095;SC=CTGTGTTTTGTAAACGATTCA;SOR=1.524;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=36;TCR=64;TR=100;WE=29653301;WS=29653283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr17	29654876	rs2285894	T	A	375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=8;PP=208;SC=TTTAAAATTCTCTTCAGTTTG;SOR=1.765;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=29654884;WS=29654866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	29663625	rs7406039	T	A	87.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.09;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	29670190	rs7405740	C	G	1370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=33;PP=997;SC=TTATGAAGTACTATTAAGAAA;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=13;TCR=33;TR=46;WE=29670198;WS=29670180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr17	29675971	rs2525569	T	A	139.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=109;SC=TTAATTATTCTCATTCACATA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=29675979;WS=29675961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	29679246	rs964288	G	A	2117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=46;NR=23;PP=1155;SC=CATATTAATTGATTTTTCTCT;SOR=1.281;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=46;TCR=23;TR=69;WE=29679254;WS=29679236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr17	29684553	rs7350943	C	T	379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=317;SC=TTTTGACCTACTAGATCTATT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=29684561;WS=29684543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	29705947	rs2525574	T	C	6009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=92;PP=2965;SC=GAACAGCCTCTGACAAAGCTG;SOR=0.711;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=194;TCF=102;TCR=92;TR=194;WE=29705955;WS=29705937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr17	29758774	rs34137478	C	G	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=1.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.17;ReadPosRankSum=0.045;SOR=0.888;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,15:0.29:51
chr17	29815385	rs57391434	G	T	2011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.73;SOR=0.780;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr17	29815404	rs8075239	T	G	2112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=27;NR=21;PP=717;SC=TGGGAGGTCGTGTTACCTGAG;SOR=0.730;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=27;TCR=21;TR=48;WE=29815412;WS=29815394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	29848534	rs11653842	C	T	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=26;ReadPosRankSum=-0.484;SC=TTGCTACCTTCGCACCCTGAT;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=3;WE=29848542;WS=29848524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr17	29849423	rs72815700	G	A	3844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.010;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=89;PP=2188;ReadPosRankSum=0.336;SC=GGTAAGGCCCGCCTCGAGGGA;SOR=0.940;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=249;TCF=105;TCR=144;TR=147;WE=29849431;WS=29849413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,175:0.60:294
chr17	29849479	rs60594701	C	T	1347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-1.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.860;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=34;PP=774;ReadPosRankSum=-0.417;SC=GCCGGGGCTCCCTGCCAGCAG;SOR=0.848;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=84;TCF=24;TCR=60;TR=46;WE=29849487;WS=29849469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,57:0.56:101
chr17	29852092	rs2023795	A	G	3205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=46;PP=1762;SC=GAGCTTGCCCATTGCGCTGTC;SOR=0.882;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=68;TCR=46;TR=114;WE=29852100;WS=29852082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr17	29852199	.	G	A	1154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=0.000;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.364;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=29;PP=731;ReadPosRankSum=-0.940;SC=CGAGGCCTACGGCAAGCTGGA;SOR=1.096;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=60;TCF=23;TCR=37;TR=44;WE=29852207;WS=29852189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,47:0.71:66
chr17	29852289	rs9916390	C	T	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.96;ReadPosRankSum=0.842;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr17	29855026	rs72817704	C	T	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.494;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=42;ReadPosRankSum=0.561;SC=AAACAAATGCCGCACCCCCTA;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=4;WE=29855034;WS=29855016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr17	29855661	rs2074149	G	A	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FS=3.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.21;ReadPosRankSum=0.451;SOR=0.955;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:119,46:0.28:165
chr17	29857264	rs2074152	C	T	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.037;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=272;ReadPosRankSum=0.906;SC=AGGTCGGGGACGGTGGATGTG;SOR=0.495;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=57;TCF=42;TCR=15;TR=23;WE=29857272;WS=29857254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,24:0.38:64
chr17	30183663	rs71142094	G	GC	765.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=4;PP=563;SC=GAAGCTCCAAGCAAGGCTTCC;SOR=1.931;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=13;WE=30183671;WS=30183653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	30183857	rs8068049	T	C	1434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=26;NR=24;PP=718;SC=CTCTCCTGACTGGAGTGGTCA;SOR=0.800;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=26;TCR=24;TR=50;WE=30183865;WS=30183847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr17	30185565	rs9906443	G	A	276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=8;NR=2;PP=199;SC=TGTAATAACGGTCTGTAACGT;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=30185573;WS=30185555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	30185892	rs11542477	A	G	942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=24;PP=626;SC=CTGCTGACCCAGAGCGCCCAC;SOR=1.885;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=33;WE=30185900;WS=30185882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr17	30186375	.	C	CGGGGGCGGGGCGGCGCA	85.37	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQ=61.53;NF=0;NR=2;PP=463;SC=CACGAGCAAGCGGGGGCGGGG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=2;WE=30186383;WS=30186365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	30212931	rs35884435	C	G	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=128;ReadPosRankSum=0.841;SC=TCAAAACTAGCTAAAGATCTT;SOR=0.527;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=38;TCF=26;TCR=12;TR=13;WE=30212939;WS=30212921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,14:0.33:42
chr17	30222002	rs3760454	T	C	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.76;ReadPosRankSum=0.079;SOR=0.614;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,25:0.28:89
chr17	30321556	.	AT	A	30.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.329;ClippingRankSum=0.000;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.17;MQRankSum=2.346;QD=0.49;ReadPosRankSum=-0.019;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,10:0.16:63
chr17	30469470	.	CCCGCCGCCG	C	83.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-0.000;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=3.979;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=663;ReadPosRankSum=1.150;SC=TGCCGTCGTCCCCGCCGCCGC;SOR=0.859;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=3;WE=30469486;WS=30469460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr17	30509939	rs6505286	C	G	909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=20;PP=651;SC=TTACTAAATTCGGGTTTTAAA;SOR=2.019;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=28;WE=30509947;WS=30509929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	30593206	rs117530048	G	A	115.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=35;ReadPosRankSum=-0.319;SC=CCCCGTCTCGGCCATGGGCGA;SOR=1.329;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=5;WE=30593214;WS=30593196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr17	30643361	rs2344973	A	G	328.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5052;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=259;ReadPosRankSum=0.971;SC=CCAGGGCCTGAGGTTCAAAGA;SOR=1.739;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=13;WE=30643369;WS=30643351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,13:0.87:15
chr17	30659006	rs1019152	T	A	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.402;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=113;ReadPosRankSum=-1.094;SC=GCCTAGAAAATGATTACCCAG;SOR=1.022;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=7;WE=30659014;WS=30658996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr17	30821791	rs377477685	C	T	669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=375;ReadPosRankSum=-0.358;SC=TTCCCGGGCACGCTGAGGATG;SOR=0.685;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=56;TCR=12;TR=27;WE=30821799;WS=30821781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,32:0.43:74
chr17	30980972	rs2249638	G	A	1337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.672;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=33;PP=857;ReadPosRankSum=-0.348;SC=GCTTCTGAAAGAGAAAGGAAA;SOR=0.910;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=88;TCF=36;TCR=52;TR=54;WE=30980980;WS=30980962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,61:0.60:101
chr17	31039255	rs11080184	T	C	1090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.668;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=37;PP=708;ReadPosRankSum=0.239;SC=GAAAACCATATGGTCATCTCA;SOR=1.371;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=60;TCF=9;TCR=51;TR=43;WE=31039263;WS=31039245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,47:0.75:63
chr17	31072453	rs6505311	A	G	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.408;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=133;ReadPosRankSum=0.825;SC=GTATTAAAGGATACCAAATTT;SOR=0.818;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=8;WE=31072461;WS=31072443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr17	31082747	rs4548927	T	C	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=187;ReadPosRankSum=0.235;SC=ACCCTGATGCTCCCATTTGTA;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=9;WE=31082755;WS=31082737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr17	31107845	rs10512439	A	G	742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.841;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=21;PP=558;ReadPosRankSum=0.038;SC=CTGTGGTTACAGAGAAATGAT;SOR=0.079;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=28;WE=31107853;WS=31107835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,29:0.76:38
chr17	31258657	rs148593533	G	A	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=0.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.92;ReadPosRankSum=0.867;SOR=0.575;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,44:0.32:136
chr17	31266419	rs2726134	T	C	132.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.58;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	31318829	rs4999077	C	T	627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=1;PP=447;SC=GAAGGCCCTCCGTTGGCCTGG;SOR=3.816;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=31318837;WS=31318819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	31319024	rs2188953	A	C	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=5.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.34;ReadPosRankSum=0.826;SOR=0.481;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,19:0.25:76
chr17	31319033	rs3922357	G	C	628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=2.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.50;ReadPosRankSum=1.436;SOR=0.396;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,20:0.27:74
chr17	31319092	rs2188952	T	G	867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=11;NR=16;PP=451;SC=TAGGGTGGGGTTATCCTGGCC;SOR=1.284;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=11;TCR=16;TR=27;WE=31319100;WS=31319082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	31323728	rs140981292	A	AG	812.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=1;PP=800;SC=AGCAGGTGGGAGGCACCTGCC;SOR=4.003;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=20;WE=31323736;WS=31323718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	31324362	.	T	TGTGTGTGTGTAGAG,TGTGTGTGG	869.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=-0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=11.761;HP=1;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.383;NF=9,9;NR=5,5;PP=125,169;ReadPosRankSum=1.569;SC=TGTGTGTGTGTAGAGAGAGAG;SOR=4.166;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=14,14;WE=31324370;WS=31324352;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.84:25
chr17	31324395	.	T	TCA	68.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=0.000;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.07;MQRankSum=-1.278;QD=0.82;ReadPosRankSum=-1.137;SOR=0.585;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,10:0.12:84
chr17	31324657	rs28958	T	C	3986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=56;PP=2338;SC=ACTCTCCTTCTTGTTCTTCTC;SOR=0.750;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=69;TCR=56;TR=124;WE=31324665;WS=31324647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr17	31324673	rs28957	G	A	3743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=52;PP=2227;SC=TTCTCTGGGCGGTGACTGGCA;SOR=0.783;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=72;TCR=52;TR=124;WE=31324681;WS=31324663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr17	31344549	rs2074215	T	C	1210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.212;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=16;PP=880;ReadPosRankSum=0.866;SC=TTCCCTCTACTATGATTCTGA;SOR=0.421;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=61;TCF=43;TCR=18;TR=48;WE=31344557;WS=31344539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,50:0.77:65
chr17	31350741	rs75112067	C	T	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=299;ReadPosRankSum=0.450;SC=GAGCGCAGAGCGTGACACACA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=13;WE=31350749;WS=31350731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,15:0.83:18
chr17	31355227	rs58042873	A	AG	828.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=5;PP=581;SC=GGCAGATCCCAGGGCCCTGTG;SOR=1.697;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=16;TCF=11;TCR=5;TR=15;WE=31355235;WS=31355217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	31618732	rs9893935	A	G	5463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=106;NR=78;PP=2965;ReadPosRankSum=0.588;SC=TGTTGCACACAGTGACGGCGG;SOR=0.900;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=186;TCF=107;TCR=79;TR=184;WE=31618740;WS=31618722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,210:0.99:212
chr17	31618997	rs112647385	C	A	625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=12;PP=351;SC=CTGCAGCGCCCGCTCGCCGCC;SOR=1.426;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=9;TCR=12;TR=21;WE=31619005;WS=31618987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	32483237	rs2228990	A	G	3281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=39;PP=2048;SC=GGTACAGGTCATTGGTGGTGA;SOR=1.281;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=114;TCF=75;TCR=39;TR=114;WE=32483245;WS=32483227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr17	32483270	rs2228989	C	G	4592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=64;PP=2758;SC=GGAAGCCATTCAGGTTACAGA;SOR=0.792;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=149;TCF=85;TCR=64;TR=149;WE=32483278;WS=32483260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr17	32583132	rs2857657	G	C	931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=0;PP=661;SC=TGAGCTCTTTGTCTTCTCCTG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=32583140;WS=32583122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	32583269	rs4586	T	C	2263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.542;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=42;PP=1251;ReadPosRankSum=-0.261;SC=TCACCTGCTGTTATAACTTCA;SOR=0.613;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=156;TCF=77;TCR=79;TR=87;WE=32583277;WS=32583259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,106:0.57:187
chr17	32614425	rs3815341	G	A	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=41;ReadPosRankSum=0.507;SC=ATTTCTTCAAGTCAAGAGCAA;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=4;WE=32614433;WS=32614415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr17	32647544	rs3138036	A	G	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=4.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.70;ReadPosRankSum=-1.044;SOR=0.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
chr17	32647831	rs1133763	A	C	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.834;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=10;PP=426;ReadPosRankSum=0.591;SC=CTTCAAGACCAAACGGGGCAA;SOR=0.987;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=87;TCF=58;TCR=29;TR=31;WE=32647839;WS=32647821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,34:0.37:93
chr17	32684389	rs159313	T	C	2326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=22;PP=1465;SC=GTAAGATCTATTTCTTCCTCT;SOR=1.697;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=51;TCR=22;TR=73;WE=32684397;WS=32684379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr17	32688712	rs159271	T	C	320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=0;PP=222;SC=AACCTTATTCTGGTAAAATAC;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=32688720;WS=32688702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	32904480	rs887231	G	A	3288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=36;PP=1897;SC=TAAGATGAGCGAAGTGCATGA;SOR=1.316;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=70;TCR=36;TR=105;WE=32904488;WS=32904470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr17	32904586	rs887230	C	T	5476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=86;PP=2965;SC=TGGTTTTGTCCTGCTCACTGT;SOR=0.703;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=182;TCF=95;TCR=87;TR=181;WE=32904594;WS=32904576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr17	32908036	rs79263247	C	T	693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FS=0.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.56;ReadPosRankSum=-3.554;SOR=0.623;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:108,44:0.29:152
chr17	32908064	rs4795938	T	C	3602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=63;NR=54;PP=2054;SC=CGACTGTTGCTCTCTCGGACC;SOR=0.738;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=63;TCR=54;TR=117;WE=32908072;WS=32908054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr17	32908210	rs7218304	T	C	1418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.46;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr17	32953616	.	T	C	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.065;ClippingRankSum=0.000;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.43;ReadPosRankSum=-2.735;SOR=0.886;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,27:0.30:90
chr17	32961751	rs2058164	C	A	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.442;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=98;ReadPosRankSum=2.041;SC=GGCAAGGGTGCGGGGTGTGTA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=7;WE=32961759;WS=32961741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr17	32965275	.	AC	A	65.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.60;ReadPosRankSum=0.609;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,8:0.20:41
chr17	32965285	rs28442132	C	A	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.361;HP=10;HapScore=4;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=15;PP=357;ReadPosRankSum=0.850;SC=ACCCCCCCCCCCAACGGGGTC;SOR=0.412;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=47;TCF=19;TCR=28;TR=28;WE=32965293;WS=32965265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,30:0.71:42
chr17	33269648	rs2230553	C	G	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.929;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=7;PP=200;ReadPosRankSum=1.016;SC=ATAAAAGAAACCAGAGTTCAC;SOR=0.045;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=13;WE=33269656;WS=33269638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr17	33286664	rs2230552	A	G	985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.545;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=30;PP=706;ReadPosRankSum=0.182;SC=TGCACCAGAAACAAGCCTGTT;SOR=0.758;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=197;TCF=107;TCR=90;TR=61;WE=33286672;WS=33286654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,62:0.27:226
chr17	33288363	rs9635769	C	T	2721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=67;NR=40;PP=1826;SC=CAAAGCTGCCCGGGCCCGCGC;SOR=0.876;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=68;TCR=41;TR=107;WE=33288371;WS=33288353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr17	33288882	rs931196	T	G	6475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=100;PP=2965;SC=CAGCGCCTCATTCCGTCAAGA;SOR=0.702;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=210;TCF=109;TCR=101;TR=209;WE=33288890;WS=33288872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr17	33289046	rs3744355	G	C	1369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.155;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=41;ReadPosRankSum=-0.249;SC=TCAGGACTCAGTTTACTCCCC;SOR=0.834;SbPval=0.64;Source=Platypus;TCF=123;TR=76;WE=33289054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:207,85:0.29:292
chr17	33307586	rs12945428	G	A	2139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.246;NF=47;NR=36;PP=1167;ReadPosRankSum=0.035;SC=GGCTGCCCGCGGCCTGTAATG;SOR=0.656;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=125;TCF=70;TCR=55;TR=83;WE=33307594;WS=33307576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,96:0.65:147
chr17	33307700	rs57311484	GC	G	1863.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=34;PP=1319;SC=AAGGCAGCGGGCCCGGGGCGA;SOR=2.024;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=37;TCF=1;TCR=36;TR=35;WE=33307708;WS=33307690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr17	33330150	rs4796030	A	C	701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.32;ReadPosRankSum=0.040;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,34:0.50:68
chr17	33331575	rs1052536	C	T	1102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=33;PP=788;ReadPosRankSum=-0.420;SC=TACCATACTACTGGACTGGAC;SOR=0.770;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=79;TCF=24;TCR=55;TR=47;WE=33331583;WS=33331565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,48:0.57:84
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chr17	33332629	rs12948362	G	A	1992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.536;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=24;PP=1169;ReadPosRankSum=1.832;SC=TGGACCAGTCGAATGCACCAA;SOR=0.910;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=110;TCF=72;TCR=38;TR=74;WE=33332637;WS=33332619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,86:0.67:129
chr17	33341834	rs2074519	T	C	2881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.497;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=59;PP=1674;ReadPosRankSum=-0.900;SC=ATGGTACAAATACAGTCTCTT;SOR=0.647;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=200;TCF=94;TCR=106;TR=115;WE=33341842;WS=33341824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,132:0.59:224
chr17	33353332	rs3926358	T	C	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=2.334;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=129;ReadPosRankSum=0.174;SC=GAGGGGTCAGTGGCGCTTGCC;SOR=0.593;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=7;WE=33353340;WS=33353322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr17	33433820	.	A	G	26	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=4;NR=0;PP=26;QD=15.1928031368;SC=TGGAAGAATCAGTGTGAGTAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=4;WE=33433828;WS=33433814;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr17	33448818	rs1871892	T	C	2425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=380;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.388;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=51;PP=1270;ReadPosRankSum=1.432;SC=AAAACCCTTTTCAAACCCCAA;SOR=0.722;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=318;TCF=165;TCR=153;TR=107;WE=33448826;WS=33448797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:244,133:0.35:377
chr17	33454415	rs2306508	C	A	700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.437;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=22;PP=471;ReadPosRankSum=-0.085;SC=TTGAGCACACCGTCAACAATT;SOR=0.990;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=117;TCF=59;TCR=58;TR=39;WE=33454423;WS=33454405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,41:0.32:130
chr17	33463568	rs3736143	C	T	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.881;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=74;ReadPosRankSum=-0.303;SC=CACGCCTGGGCGATTAGCCCC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=33463576;WS=33463558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr17	33464864	rs7215209	C	T	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.87;ReadPosRankSum=-1.773;SOR=0.562;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,13:0.24:55
chr17	33469279	rs1471615	G	C	1296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=18;NR=24;PP=797;SC=ACACCCACCGGCACTGCTGCC;SOR=1.251;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=18;TCR=24;TR=42;WE=33469287;WS=33469269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr17	33478303	rs62062409	A	C	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.16;MQRankSum=-0.842;QD=8.79;ReadPosRankSum=-1.834;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr17	33478349	.	G	A	62.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.68;QD=31.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr17	33478354	rs369506584	C	G	62.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.68;QD=31.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr17	33478356	rs62062412	A	G	62.74	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.68;QD=31.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr17	33478357	.	C	A	62.74	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.68;QD=31.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr17	33479867	rs79901966	G	A	647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=16;PP=352;ReadPosRankSum=-0.882;SC=CTGAAATGACGTGGACCCCAC;SOR=0.668;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=53;TCR=46;TR=34;WE=33479875;WS=33479857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,38:0.33:115
chr17	33503922	rs9902956	G	A	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.218;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=131;ReadPosRankSum=2.499;SC=CTGATTATACGGCAGAATTTT;SOR=1.755;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=10;WE=33503930;WS=33503912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
chr17	33504465	rs12451132	C	T	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.270;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=117;ReadPosRankSum=1.001;SC=GTGAGGCACTCAGGGAACAAA;SOR=1.032;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=46;TCF=33;TCR=13;TR=12;WE=33504473;WS=33504455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,15:0.29:52
chr17	33513591	rs3744365	A	C	534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.82;ReadPosRankSum=-0.856;SOR=0.707;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,35:0.32:111
chr17	33679440	rs62079540	C	T	4130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-3.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.185;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.324;NF=75;NR=85;PP=2264;ReadPosRankSum=-0.207;SC=CAGATCAGAACATTGGGTAAG;SOR=0.839;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=236;TCF=114;TCR=122;TR=160;WE=33679448;WS=33679430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,185:0.68:272
chr17	33680807	rs9897352	G	A	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.73;MQRankSum=-1.741;QD=2.27;ReadPosRankSum=1.640;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,3:0.21:14
chr17	33680840	rs28571667	T	C	894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.07;QD=33.14;SOR=5.211;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	33689926	rs4796077	T	C	1760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.618;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=28;PP=844;ReadPosRankSum=1.290;SC=TTTAACACATTCACAATTTTG;SOR=0.838;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=203;TCF=117;TCR=86;TR=72;WE=33689934;WS=33689916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,92:0.38:239
chr17	33690466	rs12453150	C	A	1232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.560;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=31;PP=878;ReadPosRankSum=-0.762;SC=CGGGGCTTGACAGAGCGATCT;SOR=0.811;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=196;TCF=100;TCR=96;TR=60;WE=33690474;WS=33690456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,65:0.30:219
chr17	33690863	rs4796078	G	T	2321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=47;PP=1363;SC=AAGAAATGAAGTGTTACATGC;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=26;TCR=47;TR=73;WE=33690871;WS=33690853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr17	33768199	rs1822403	G	A	800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.666;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=25;PP=402;ReadPosRankSum=-1.391;SC=TCTGAAAGTAGTCCAGAAAGA;SOR=0.780;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=144;TCF=53;TCR=91;TR=41;WE=33768207;WS=33768189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,48:0.29:163
chr17	33768334	rs75812929	T	G	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.289;HP=4;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.880;NF=17;NR=9;PP=539;ReadPosRankSum=-0.156;SC=TGTGTTCAAATTTTTCTCTTA;SOR=1.018;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=39;TCF=25;TCR=14;TR=26;WE=33768342;WS=33768324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,27:0.64:42
chr17	33768354	rs3744371	C	T	1833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=14;PP=1024;SC=AGGAAAGTTTCCCGGGTCTCT;SOR=1.480;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=32;TCR=14;TR=46;WE=33768362;WS=33768344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr17	33770706	rs16970975	G	A	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=194;ReadPosRankSum=-0.581;SC=TTGTCACTGTGTACACCTGGA;SOR=0.818;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=10;WE=33770714;WS=33770696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
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chr17	33805150	rs2304968	T	C	5227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=90;PP=2965;SC=ACGAAGAGGATAACTCTGGGA;SOR=0.910;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=169;TCF=79;TCR=90;TR=169;WE=33805158;WS=33805140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr17	33806546	rs12451679	G	A	1105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.692;NF=28;NR=10;PP=703;ReadPosRankSum=-0.214;SC=CTTTTCAGTCGAGAAGTTTTT;SOR=0.752;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=56;TCF=42;TCR=14;TR=38;WE=33806554;WS=33806536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,46:0.66:70
chr17	33806863	rs12451746	G	A	4647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=69;PP=2843;SC=TCACAAAAATGTGAAAGTAGT;SOR=0.935;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=157;TCF=88;TCR=69;TR=157;WE=33806871;WS=33806853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr17	33807250	rs9905892	T	A	1490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=36;PP=1091;SC=GAGTTAAGCCTGAGAGACAGC;SOR=2.170;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=13;TCR=36;TR=49;WE=33807258;WS=33807240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr17	33814735	rs10626701	G	GAA	12906.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.56;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.269;NF=18;NR=79;PP=2973;ReadPosRankSum=0.047;SC=TAAAGAAAAAGAGAACGAACC;SOR=0.714;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=107;TCF=21;TCR=86;TR=97;WE=33814743;WS=33814725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,285:0.99:287
chr17	33875262	rs8073060	T	A	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=0.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.01;ReadPosRankSum=-0.043;SOR=0.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,28:0.23:123
chr17	33881631	rs321612	T	C	3005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FS=1.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.25;ReadPosRankSum=0.686;SOR=0.826;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,138:0.65:211
chr17	33881718	rs321613	G	A	3146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=46;PP=1186;ReadPosRankSum=0.316;SC=ACCAAACTGGGAGGAGCTAGA;SOR=0.755;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=132;TCF=51;TCR=81;TR=79;WE=33881726;WS=33881708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,90:0.66:136
chr17	33881734	rs321614	A	G	2588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=35;PP=791;ReadPosRankSum=0.498;SC=CTAGACAATTACATGGAAAGT;SOR=0.625;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=101;TCF=34;TCR=67;TR=59;WE=33881742;WS=33881724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,65:0.66:98
chr17	33921160	rs225305	C	T	619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=11;PP=377;SC=AGGCAGAATGCTGCTGACCTC;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=12;TCR=11;TR=23;WE=33921168;WS=33921150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	33933006	rs225284	A	C	701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=23;PP=574;ReadPosRankSum=0.301;SC=TCATCCAGGGAAATTCAAACC;SOR=1.426;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=25;WE=33933014;WS=33932996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,25:0.74:34
chr17	33963611	rs11345348	AT	A	949.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=24;PP=933;SC=AATCGGAAACATTAAAATGGT;SOR=3.690;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=33963619;WS=33963601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	33968871	rs225270	A	T	1573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=11;PP=968;SC=ATTCTTTCACACTATCACAAA;SOR=2.437;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=36;TCR=11;TR=47;WE=33968879;WS=33968861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	33998802	rs1049379	G	C	445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.183;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.055;NF=16;NR=1;PP=378;ReadPosRankSum=0.290;SC=CATCATCGGTGCCTGCAACCT;SOR=2.093;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=17;WE=33998810;WS=33998792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,16:0.73:22
chr17	34072898	rs12602590	C	T	2089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.948;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=46;PP=1262;ReadPosRankSum=1.100;SC=ACAGTGACGGCCCTTAGTGGG;SOR=0.992;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=138;TCF=70;TCR=68;TR=84;WE=34072906;WS=34072888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,95:0.60:158
chr17	34077232	rs11654604	G	A	1530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.448;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=28;PP=924;ReadPosRankSum=0.259;SC=TGTGGGCGCCGCAACACCAAA;SOR=1.056;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=239;TCF=134;TCR=105;TR=74;WE=34077240;WS=34077222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,85:0.33:254
chr17	34077428	rs11650416	A	C	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=1.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.99;ReadPosRankSum=-1.813;SOR=0.290;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,9:0.26:35
chr17	34090958	rs4796106	C	A	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.14;ReadPosRankSum=-0.205;SOR=0.617;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,16:0.30:54
chr17	34091078	rs4795087	C	G	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=1.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.28;ReadPosRankSum=0.128;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,43:0.33:131
chr17	34095417	.	AAG	A	50.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.695;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.125;NF=0;NR=3;PP=57;ReadPosRankSum=-1.087;SC=GTAAGGAAATAAGAGAGAGAG;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=3;WE=34095426;WS=34095407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,4:0.20:20
chr17	34097039	rs3826404	T	G	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=9;PP=304;ReadPosRankSum=1.707;SC=CAGGAGGCCTTGGGGGCAGGA;SOR=0.765;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=67;TCF=40;TCR=27;TR=23;WE=34097047;WS=34097029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,30:0.36:83
chr17	34100350	rs58543174	G	GC	5185.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=11;NR=52;PP=2892;SC=GCCGGCTCCGGAGATGCTCAG;SOR=0.962;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=64;TCF=11;TCR=53;TR=63;WE=34100358;WS=34100340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr17	34165601	rs4251773	G	GT	292.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=340;ReadPosRankSum=0.562;SC=TTGGATAAATGTTTTCTAGTC;SOR=0.670;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=50;TCF=2;TCR=48;TR=13;WE=34165609;WS=34165591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,17:0.23:73
chr17	34182341	rs2306630	G	A	962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.292;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=26;PP=618;ReadPosRankSum=-0.356;SC=CTCATATACAGAGAGAACCTT;SOR=0.808;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=154;TCF=73;TCR=81;TR=47;WE=34182349;WS=34182331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,52:0.30:173
chr17	34183956	rs78655848	G	A	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.089;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=280;ReadPosRankSum=-0.701;SC=GAAGCAGACAGGTAAATAGGC;SOR=0.449;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=60;TCF=22;TCR=38;TR=22;WE=34183964;WS=34183946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,30:0.41:73
chr17	34183983	rs77598005	AG	A	216.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=98;ReadPosRankSum=-0.880;SC=AATACTGTGTAGGGGTACACA;SOR=0.576;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=5;WE=34183991;WS=34183973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,10:0.33:30
chr17	34185535	rs35283303	AG	A	335.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.755;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=212;ReadPosRankSum=-1.113;SC=AGTGCCTATGAGGGGGCAGGG;SOR=0.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=9;WE=34185543;WS=34185525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,15:0.38:39
chr17	34191406	rs2291299	T	C	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.072;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=7;PP=170;ReadPosRankSum=-1.722;SC=TGGAATACCATCCCCACAACC;SOR=0.473;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=59;TCF=29;TCR=30;TR=16;WE=34191414;WS=34191396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,18:0.28:64
chr17	34251452	rs4796137	G	A	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.65;ReadPosRankSum=-0.117;SOR=0.846;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,4:0.22:18
chr17	34252537	rs2251660	A	C	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=82;ReadPosRankSum=0.978;SC=TCCTTTTGGAACACCCATTGA;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=6;WE=34252545;WS=34252527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr17	34257050	rs2280787	C	A	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=80;ReadPosRankSum=0.241;SC=TTCATTTCAGCGGAGCTAGGA;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=34257058;WS=34257040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr17	34257069	rs9913559	T	A	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=61;ReadPosRankSum=2.218;SC=GAATTCCATATTTGGACCCAC;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=5;WE=34257077;WS=34257059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr17	34257313	rs9907295	C	T	685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.492;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=23;PP=452;ReadPosRankSum=0.412;SC=AAAACAAAACCGCACATGCCC;SOR=0.990;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=117;TCF=53;TCR=64;TR=37;WE=34257321;WS=34257303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,40:0.31:128
chr17	34261831	rs9754	A	G	1009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FS=2.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.88;ReadPosRankSum=1.154;SOR=0.498;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:145,62:0.30:207
chr17	34261981	rs10562162	TGCTA	T	1504.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FS=1.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.23;MQRankSum=3.192;QD=9.18;ReadPosRankSum=-1.252;SOR=0.857;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,47:0.29:164
chr17	34310760	rs41495150	C	G	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=318;ReadPosRankSum=-0.356;SC=TGAGAGTTAGCGGTGGGTGGA;SOR=0.495;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=18;WE=34310768;WS=34310750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
chr17	34311387	rs16971802	T	C	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=93;ReadPosRankSum=0.018;SC=ATTCCGGGCTTGGAGCACTGG;SOR=0.830;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=51;TCF=35;TCR=16;TR=12;WE=34311395;WS=34311377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,19:0.28:68
chr17	34313612	rs75238886	G	A	765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.692;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=13;PP=404;ReadPosRankSum=0.933;SC=CTCACGTGAGGAGGATTCAGT;SOR=0.553;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=41;TCF=25;TCR=16;TR=29;WE=34313620;WS=34313602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,34:0.69:49
chr17	34313674	rs113937434	G	A	759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=15;PP=402;ReadPosRankSum=-0.367;SC=TGGCAGCCACGGAGATCTTCA;SOR=0.661;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=47;TCF=26;TCR=21;TR=32;WE=34313682;WS=34313664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,35:0.62:56
chr17	34325532	rs2075746	T	C	1839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=41;PP=1299;SC=CCTCCTCGGCTAGCACTTGCT;SOR=2.119;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=16;TCR=41;TR=57;WE=34325540;WS=34325522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr17	34328461	rs854625	A	G	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.14;ReadPosRankSum=1.105;SOR=0.583;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,30:0.32:94
chr17	34328542	rs2293788	G	A	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=67;ReadPosRankSum=-1.227;SC=CCTCCTGGTGGGCAGGCAGGG;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=5;WE=34328550;WS=34328532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr17	34340161	rs1734953	T	A	2569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=29;PP=1497;SC=AATGCTTCTTTAAAAAATAAT;SOR=1.251;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=85;TCF=55;TCR=30;TR=84;WE=34340169;WS=34340151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr17	34341398	rs61737011	A	G	2373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.635;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.04;MQRankSum=-0.393;NF=50;NR=40;PP=1320;ReadPosRankSum=1.410;SC=GGATTTTCCAATGGAAGCTTT;SOR=0.791;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=133;TCF=73;TCR=60;TR=90;WE=34341406;WS=34341388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,105:0.68:155
chr17	34341513	rs145880426	ATCC	A	863.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.242;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.861;NF=0;NR=17;PP=754;ReadPosRankSum=-0.912;SC=CCCATTGCTCATCCTCCTCCT;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=17;WE=34341523;WS=34341503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,23:0.61:38
chr17	34398495	rs14304	C	T	888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=25;PP=641;SC=CCCTGGAGGCCACCTCTTCTA;SOR=3.477;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=29;WE=34398503;WS=34398485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr17	34416246	rs1719130	T	C	250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=7;PP=137;SC=TGCCTATCTCTGTCTAGAGAG;SOR=3.258;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=34416254;WS=34416236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	34416537	rs1130371	G	A	1008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=9;PP=760;SC=ACATGACACCGGGCTTGGAGC;SOR=2.368;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=35;WE=34416545;WS=34416527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr17	34416665	rs1719133	A	G	5442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=94;NR=83;PP=2965;SC=GGAAGAGAATAAGCCCGAGTC;SOR=0.713;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=177;TCF=94;TCR=83;TR=177;WE=34416673;WS=34416655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr17	34431287	rs1049750	G	T	3161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=35;PP=1912;SC=AAACCTCTTTGCCACCAATAC;SOR=1.528;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=101;TCF=66;TCR=35;TR=101;WE=34431295;WS=34431277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr17	34431403	rs1719144	G	A	5670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=101;PP=2965;SC=CTGCTATTTCGAGTCAAGGTG;SOR=0.944;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=189;TCF=88;TCR=101;TR=189;WE=34431411;WS=34431393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr17	34431961	rs1719146	T	C	505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.47;QD=26.62;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	34432125	rs1719147	A	G	1537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=28;NR=26;PP=871;SC=GTGATTGAGCATTGGGGAGGC;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=55;TCF=28;TCR=27;TR=54;WE=34432133;WS=34432115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr17	34432581	rs1719149	T	C	13099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.15;QD=43.81;SOR=0.828;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,299:1.00:299
chr17	34432586	rs1719150	A	G	13027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.11;QD=44.16;SOR=0.799;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,295:1.00:295
chr17	34432663	rs1049807	AT	GA	12583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=117;NR=113;PP=2947;SC=ATCCCAGTGAATCCTGGGTCC;SOR=0.853;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=234;TCF=118;TCR=116;TR=230;WE=34432672;WS=34432653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,281:1.00:281
chr17	34842521	rs4796224	A	G	1571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.014;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=45;PP=1056;ReadPosRankSum=0.529;SC=GCGGCGCAGTAAACAGTCTCC;SOR=0.653;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=281;TCF=151;TCR=130;TR=90;WE=34842529;WS=34842511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:224,98:0.30:322
chr17	34848796	rs3830269	C	CGAAAG	3152.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.956;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=2.592;NF=2;NR=36;PP=2052;ReadPosRankSum=-1.281;SC=TAGAATAAGTCGAAGGAAAAG;SOR=1.052;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=85;TCF=5;TCR=80;TR=38;WE=34848804;WS=34848786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,84:0.56:151
chr17	34848874	rs2306589	T	C	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.242;NF=1;NR=10;PP=192;ReadPosRankSum=0.180;SC=TTCCTTAGCCTTGAGCATCAG;SOR=0.404;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=11;WE=34848882;WS=34848864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr17	34849697	rs2277662	C	G	2377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=40;PP=1439;ReadPosRankSum=0.712;SC=TTATCCTGTTCAAGTAGTGGT;SOR=0.640;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=132;TCF=73;TCR=59;TR=88;WE=34849705;WS=34849687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,101:0.66:152
chr17	34855069	rs2005488	C	G	1713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=1.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQRankSum=0.743;QD=14.40;ReadPosRankSum=0.447;SOR=0.526;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,78:0.66:119
chr17	34857165	rs117302385	T	C	757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.533;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=20;PP=544;ReadPosRankSum=-0.266;SC=CCTAGCACTCTACAGGTCTCT;SOR=0.148;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=42;TCF=10;TCR=32;TR=28;WE=34857173;WS=34857155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,31:0.66:47
chr17	34861303	rs2242308	G	A	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.568;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=53;ReadPosRankSum=0.705;SC=CCATCAACTGGGCTCTGGTTA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=4;WE=34861311;WS=34861293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr17	34862220	rs1109442	T	C	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.861;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=9;PP=353;ReadPosRankSum=-0.181;SC=GCACCGATCCTGGCAGGTGCT;SOR=0.814;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=91;TCF=67;TCR=24;TR=30;WE=34862228;WS=34862210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,30:0.29:105
chr17	34862256	rs3050532	GTT	G	5847.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.583;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.638;NF=21;NR=48;PP=2683;ReadPosRankSum=-0.012;SC=AGACCGTGGAGTTTGAACCAA;SOR=0.608;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=33;TCR=75;TR=69;WE=34862265;WS=34862246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,145:0.72:202
chr17	34867415	rs34476742	A	AGT	455.92	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5020;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=360;ReadPosRankSum=1.203;SC=TCATGGCCCAAGTGCCCATCT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=8;WE=34867423;WS=34867405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,12:0.92:13
chr17	34869150	rs6607296	C	A	1740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.27;SOR=1.562;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr17	34869150	.	CCAGAG	ACAGAA,ACAGAG	395	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=15,31;NR=6,13;PP=250,395;QD=14.4508511839;SC=TGGAGGTAGCCCAGAGGGGCC;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=44;TCF=31;TCR=13;TR=21,44;WE=34869163;WS=34869140;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.48:44
chr17	34869155	rs8882	G	A	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.90;ReadPosRankSum=1.301;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,22:0.42:52
chr17	34883618	rs117392945	T	C	1288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=30;PP=766;ReadPosRankSum=-0.021;SC=AACAGCCCTCTTTCTGCAATT;SOR=0.779;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=30;TCR=48;TR=49;WE=34883626;WS=34883608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,56:0.64:87
chr17	34884029	rs61738887	T	C	682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=21;PP=523;ReadPosRankSum=0.803;SC=ATTGTGGCCATTGACCTGGAA;SOR=0.610;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=26;WE=34884037;WS=34884019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,26:0.76:34
chr17	34935982	rs138383073	T	G	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=354;ReadPosRankSum=-0.120;SC=CTGGATATTGTTACATGGCTT;SOR=2.636;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=16;WE=34935990;WS=34935972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,17:0.81:21
chr17	34958917	rs112581593	T	C	1092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.118;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=20;PP=676;ReadPosRankSum=-1.973;SC=TTGGGAGCCCTGGGAGGGTAG;SOR=0.450;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=66;TCF=39;TCR=27;TR=45;WE=34958925;WS=34958907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,47:0.67:70
chr17	35299511	.	C	T	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=0.000;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.35;ReadPosRankSum=1.898;SOR=0.727;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,19:0.36:53
chr17	35299688	rs8075125	A	G	769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.66;ReadPosRankSum=0.499;SOR=0.731;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,39:0.59:66
chr17	35300494	rs138151008	GAA	G	211.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.322;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=16.29;ReadPosRankSum=-0.150;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr17	35306312	rs2306658	G	C	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=3.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.09;ReadPosRankSum=-0.042;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,8:0.20:41
chr17	35478362	rs1470452	T	C	3298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=33;PP=1561;SC=TGGCCTGATATGTCTTAAACG;SOR=0.950;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=98;TCF=64;TCR=34;TR=97;WE=35478370;WS=35478352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr17	35549275	rs2305099	T	C	3514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=65;PP=2022;SC=GAAAAAACAGTTCACAAGAGG;SOR=1.214;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=48;TCR=65;TR=113;WE=35549283;WS=35549265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr17	35550158	rs12603097	C	T	941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=5;PP=258;SC=AGAAAGGAATCGGCTTTAGTT;SOR=1.230;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=18;WE=35550166;WS=35550148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	35550179	rs12603098	C	T	1234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=19;NR=11;PP=420;SC=CTAAGACACACGTAAGGCAAC;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=19;TCR=11;TR=30;WE=35550187;WS=35550169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr17	35550416	rs2305098	A	G	1053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=8.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.21;ReadPosRankSum=2.022;SOR=0.133;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,49:0.75:65
chr17	35550448	rs2305097	C	A	1089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=14;NR=23;PP=597;SC=CATTTAGAAGCCAGTTTTCTA;SOR=1.501;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=14;TCR=23;TR=37;WE=35550456;WS=35550438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr17	35557289	rs11659129	C	T	552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.413;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=315;ReadPosRankSum=0.358;SC=TATTAGTAAGCATAAGATTAC;SOR=0.394;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=61;TCF=47;TCR=14;TR=25;WE=35557297;WS=35557279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,27:0.40:67
chr17	35562546	rs2278679	C	T	1005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=4;PP=708;SC=TATCCCTAAACGCAGAACTAG;SOR=3.675;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=32;WE=35562554;WS=35562536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr17	35581887	.	TTA	T	233	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=3;HapScore=3;MGOF=14;MMLQ=15;MQ=59.55;NF=7;NR=5;PP=233;QD=19.75;SC=CAGGAAAGGGTTATATATATA;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=24;TCF=15;TCR=9;TR=12;WE=35581898;WS=35581877;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:12,12:0.50:24
chr17	35608781	rs72010031	CCT	C	1800.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.25;NF=20;NR=11;PP=1436;SC=GTCAACATCCCCTCTCTTTCT;SOR=1.775;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=35;TCF=23;TCR=12;TR=31;WE=35608790;WS=35608771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr17	35608889	rs1519091	G	A	5829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=103;NR=85;PP=2965;SC=TGTACTCAGGGCCATTGATTA;SOR=0.859;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=188;TCF=103;TCR=85;TR=188;WE=35608897;WS=35608879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr17	35609746	rs2252757	G	A	654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=0;PP=468;SC=TCATGTAGTGGCAGGGATTGA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=35609754;WS=35609736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	35609866	rs2229416	C	T	3858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.829;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=62;PP=2435;ReadPosRankSum=0.152;SC=TTCTGTTCATCTGAAAGCTTT;SOR=0.888;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=242;TCF=143;TCR=99;TR=154;WE=35609874;WS=35609856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,172:0.64:270
chr17	35630997	rs2542659	T	C	1050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.035;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=12;PP=665;ReadPosRankSum=0.171;SC=ACCTTGGGTATATATCACGAG;SOR=0.470;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=69;TCF=50;TCR=19;TR=39;WE=35631005;WS=35630987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,45:0.58:78
chr17	35632979	rs2542660	C	A	2396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.590;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=44;PP=1331;ReadPosRankSum=1.476;SC=TGACTGTAACCCCTTGGCCTC;SOR=0.675;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=84;TCF=40;TCR=44;TR=82;WE=35632987;WS=35632969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,95:0.99:96
chr17	35634023	rs2302803	A	G	3621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.672;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=71;PP=2034;ReadPosRankSum=1.900;SC=AGGGAATACAATATAATTCAT;SOR=0.586;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=217;TCF=106;TCR=111;TR=143;WE=35634031;WS=35634013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,159:0.67:237
chr17	35696804	rs58654829	G	A	1881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.82;SOR=0.929;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr17	35696820	rs147333574	AAAAG	A	1764.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=4;NR=23;PP=1468;SC=CCTAGAGAGAAAAAGAGAGAA;SOR=0.902;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=27;WE=35696831;WS=35696810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr17	35771468	rs7211875	C	T	757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=20;PP=445;ReadPosRankSum=0.672;SC=CCGTTTGGGTCCCTTTAGCAG;SOR=0.787;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=81;TCF=32;TCR=49;TR=32;WE=35771476;WS=35771458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,38:0.43:89
chr17	35783565	rs8067120	C	T	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=84;ReadPosRankSum=-0.996;SC=TTAAGATAACCGTAAGGTGGT;SOR=0.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=28;TCR=14;TR=11;WE=35783573;WS=35783555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,11:0.23:47
chr17	35818592	rs9897879	T	C	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.241;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=7;PP=121;ReadPosRankSum=0.376;SC=ATATATGATATGTATATATAG;SOR=0.428;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=40;TCF=25;TCR=15;TR=15;WE=35818600;WS=35818582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,15:0.33:46
chr17	35818739	rs72377203	TTGTGTG	T	244.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.748;HP=3;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=3.614;NF=0;NR=8;PP=464;ReadPosRankSum=2.301;SC=GATTATTGTTTTGTGTGTGTG;SOR=1.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=8;WE=35818752;WS=35818729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr17	35818741	rs4795202	G	T	229.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=1.367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.56;MQRankSum=-1.967;QD=5.60;ReadPosRankSum=-0.650;SOR=0.430;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,15:0.37:41
chr17	35825459	rs142934801	TA	T	79.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=1.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.66;ReadPosRankSum=0.639;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,10:0.33:30
chr17	35896123	rs1045000	T	C	3746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=60;PP=2207;SC=GGTTATTCCATACTTTATCGA;SOR=0.851;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=121;TCF=61;TCR=60;TR=121;WE=35896131;WS=35896113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr17	35899141	rs1034686	T	A	2161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=10;PP=1444;SC=AGCCTCACCTTAGATGCATGA;SOR=2.712;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=54;TCR=10;TR=64;WE=35899149;WS=35899131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr17	35956263	rs4795207	T	C	3649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=41;PP=2405;SC=ACTAAAGAAGTAAGTACCTGC;SOR=1.358;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=119;TCF=78;TCR=41;TR=119;WE=35956271;WS=35956253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr17	35956391	rs12944821	G	C	4000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=85;PP=2617;SC=CATCAGGCCTGCTGAAAATAT;SOR=1.366;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=137;TCF=52;TCR=85;TR=137;WE=35956399;WS=35956381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr17	35984410	rs7216445	T	C	1435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=16;PP=779;SC=AGTTCTCTCATGGCCAGAAGT;SOR=1.270;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=31;TCR=16;TR=47;WE=35984418;WS=35984400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr17	35988672	rs7224513	C	T	2832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.98;SOR=0.876;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr17	35995638	rs4622555	T	A	2369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=32;PP=1410;SC=CATTCACCTGTTGAGGGACAT;SOR=0.859;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=49;TCR=32;TR=80;WE=35995646;WS=35995628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr17	36003275	rs3813911	T	A	630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=1;PP=514;SC=CGGGTGTCCATGTGCGCCGGC;SOR=3.816;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=36003283;WS=36003265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	36003359	rs3813910	A	G	4034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=47;PP=2465;SC=CTTGGGCACAATACCTGGAAT;SOR=1.210;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=82;TCR=47;TR=128;WE=36003367;WS=36003349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr17	36047275	rs1800929	C	T	3899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.21;SOR=1.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr17	36047275	.	CG	TG,TT	988	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=67,26;NR=36,15;PP=988,506;QD=9.92981759755;SC=TCGCAGGTGCCGGTCAGGTCA;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=106;TCF=70;TCR=36;TR=103,41;WE=36047284;WS=36047265;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.97:106
chr17	36047276	rs2229295	G	T	881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.73;ReadPosRankSum=1.882;SOR=0.713;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,45:0.39:114
chr17	36047417	rs3110641	A	G	2200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.668;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=52;PP=1546;ReadPosRankSum=0.394;SC=GAGGAGAGAGAGTGCTCAGCT;SOR=0.344;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=139;TCF=59;TCR=80;TR=95;WE=36047425;WS=36047407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,99:0.67:147
chr17	36059385	rs12938438	C	G	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.282;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=148;ReadPosRankSum=0.609;SC=ATAACCAACTCCCGAAAGCAT;SOR=1.609;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=8;WE=36059393;WS=36059375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr17	36061297	rs2074429	C	T	55.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=29;ReadPosRankSum=1.150;SC=GCCTGTTACACAGGAGATTCC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=36061305;WS=36061287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr17	36093863	rs3216929	G	GCAGA	568.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.322;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.15;MQRankSum=0.878;NF=1;NR=7;PP=363;ReadPosRankSum=0.790;SC=CCTTCACTCAGCAGACAGACA;SOR=0.976;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=37;TCF=3;TCR=34;TR=8;WE=36093871;WS=36093853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,26:0.59:44
chr17	36214798	rs12936785	G	T	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.06;ReadPosRankSum=-1.615;SOR=0.656;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
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chr17	36233930	rs2677184	G	A	5256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=97;PP=2965;SC=CATGGGCCCAGCCTAAAAATA;SOR=1.069;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=173;TCF=76;TCR=97;TR=173;WE=36233938;WS=36233920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr17	36234106	rs2677185	G	A	143.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=142;SC=ACCACTACTAGAAAAAGCATT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=36234114;WS=36234096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	36352408	rs11407739	G	GT	3319.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FS=1.898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.31;MQRankSum=-0.339;QD=18.14;ReadPosRankSum=0.700;SOR=0.973;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,158:0.86:183
chr17	36352489	rs4796259	A	C	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=3.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.57;MQRankSum=2.525;QD=0.98;ReadPosRankSum=-2.004;SOR=1.450;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,9:0.15:59
chr17	36352537	rs62074773	A	G	465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.94;QD=29.11;SOR=5.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	36353560	rs111638343	C	T	94.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=36.67;QD=23.51;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	36353761	rs62074778	C	T	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=0.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.52;MQRankSum=0.614;QD=3.79;ReadPosRankSum=0.277;SOR=0.770;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,35:0.26:134
chr17	36357295	rs79239780	A	G	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=0.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.832;HP=15;HapScore=3;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.250;NF=3;NR=24;PP=450;ReadPosRankSum=0.363;SC=AAAAAAAAAAAAGAAACAAAT;SOR=4.047;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=79;TCF=15;TCR=64;TR=27;WE=36357303;WS=36357285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr17	36357835	rs1848308	G	A	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FS=2.309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.87;MQRankSum=-1.067;QD=1.68;ReadPosRankSum=0.036;SOR=0.949;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:177,38:0.18:215
chr17	36358196	.	A	ATC	880	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=28;MMLQ=27;MQ=60.32;NF=11;NR=20;PP=880;QD=28.4838709677;SC=TGAGATATATATATATATATA;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=44;TCF=13;TCR=31;TR=31;WE=36358210;WS=36358179;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:13,31:0.70:44
chr17	36358265	rs71225228	T	C	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=6.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.09;MQRankSum=2.039;QD=10.54;ReadPosRankSum=-0.166;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr17	36358847	rs77355093	T	A	13142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=486;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=266;NR=188;PP=2965;SC=TTTACCTCTATTGCAAATTTT;SOR=1.111;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=455;TCF=266;TCR=189;TR=454;WE=36358855;WS=36358837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,486:1.00:486
chr17	36361750	.	T	C	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.291;ClippingRankSum=-0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.14;MQRankSum=-1.465;QD=8.72;ReadPosRankSum=-0.019;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr17	36361764	rs139025713	G	C	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.27;MQRankSum=0.022;QD=4.84;ReadPosRankSum=-0.426;SOR=0.320;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,9:0.28:32
chr17	36384810	rs142086381	A	G	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=4.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=0.497;QD=1.70;ReadPosRankSum=-1.107;SOR=0.232;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,13:0.18:74
chr17	36384868	rs71252892	C	G	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FS=2.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.25;MQRankSum=0.045;QD=0.65;ReadPosRankSum=1.079;SOR=0.470;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:128,20:0.14:148
chr17	36398144	rs2663721	A	T	638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-0.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.312;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.411;NF=37;NR=22;PP=1319;ReadPosRankSum=-0.011;SC=TCTCTCTCTCACACACACACA;SOR=0.313;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=150;TCF=96;TCR=54;TR=59;WE=36398174;WS=36398115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,39:0.33:119
chr17	36398156	rs147730015	ACACACACACC	A	290.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=1.844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.68;MQRankSum=1.281;QD=2.22;ReadPosRankSum=0.077;SOR=0.952;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:106,25:0.19:131
chr17	36398162	.	ACACC	A	450.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.378;ClippingRankSum=0.000;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=2.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.58;MQRankSum=0.536;QD=3.69;ReadPosRankSum=2.148;SOR=1.066;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,31:0.25:122
chr17	36398164	rs372289585	ACC	A	395.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=4.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.58;MQRankSum=-4.695;QD=3.19;ReadPosRankSum=0.422;SOR=0.336;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,25:0.20:124
chr17	36453208	rs149988943	T	C	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.373;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-10.865;NF=21;NR=24;PP=585;ReadPosRankSum=1.060;SC=GGCTGGTGGTTTCGGCAGGTG;SOR=0.829;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=156;TCF=77;TCR=79;TR=45;WE=36453216;WS=36453198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,45:0.28:163
chr17	36474601	rs59939216	A	G	1513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.982;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=38;PP=993;ReadPosRankSum=-1.273;SC=ACCATGACCGACTTCATACCT;SOR=0.770;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=240;TCF=126;TCR=114;TR=82;WE=36474609;WS=36474591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:179,91:0.34:270
chr17	36474701	rs200041488	T	TTTTTC	38.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.49;ReadPosRankSum=-0.572;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,4:0.15:26
chr17	36478300	rs73984499	T	C	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.141;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=86;ReadPosRankSum=0.689;SC=AAGGGAAGGCTGGGTGGGTGG;SOR=1.447;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=16;TCF=7;TCR=9;TR=6;WE=36478308;WS=36478290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr17	36478345	rs73302946	C	T	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.62;ReadPosRankSum=0.615;SOR=0.616;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr17	36478388	rs73302948	G	T	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=231;ReadPosRankSum=0.973;SC=TCCTACTCTTGCAGACGGTGA;SOR=0.593;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=38;TCR=18;TR=21;WE=36478396;WS=36478378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,25:0.38:66
chr17	36485753	rs35803744	G	C	854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=21;PP=585;ReadPosRankSum=-0.614;SC=CAGCGCTGCCGAGGGACTGGA;SOR=0.694;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=134;TCF=70;TCR=64;TR=44;WE=36485761;WS=36485743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,47:0.32:145
chr17	36489291	rs11871123	C	T	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.232;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=214;ReadPosRankSum=-0.645;SC=CTGGCAGGGGCGCATAAGAGT;SOR=0.920;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=42;TCF=14;TCR=28;TR=17;WE=36489299;WS=36489281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,18:0.40:45
chr17	36490466	rs4293432	C	G	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.402;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=73;ReadPosRankSum=-0.900;SC=GGGGGCCTTCCTCAACGTGCT;SOR=0.132;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=6;WE=36490474;WS=36490456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
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chr17	36493598	rs9894059	A	G	967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=22;PP=590;ReadPosRankSum=-0.993;SC=TCTCCAGGGGAACACACTATG;SOR=0.682;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=153;TCF=88;TCR=65;TR=51;WE=36493606;WS=36493588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,58:0.31:185
chr17	36508420	rs201577908	C	T	988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=21;PP=528;ReadPosRankSum=-0.393;SC=CAGCCGCCTGCTGCCGCCCCG;SOR=0.675;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=157;TCF=88;TCR=69;TR=51;WE=36508428;WS=36508410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,57:0.33:172
chr17	36551987	rs56024022	GA	G	57.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.5;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.674;NF=3;NR=0;PP=69;ReadPosRankSum=0.842;SC=AGAAAATGGGGATTGTGTTAG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=3;WE=36551995;WS=36551977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr17	36584681	rs9912941	G	A	53.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=1;PP=20;SC=CCGGGTCCCTGCCGGCGCCCC;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=36584689;WS=36584671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	36623183	rs199766741	G	A	1782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.091;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=48;PP=1207;ReadPosRankSum=-3.475;SC=ATCGGCTACCGGAGCTACAGC;SOR=0.610;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=279;TCF=146;TCR=133;TR=90;WE=36623191;WS=36623173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:210,97:0.32:307
chr17	36638179	rs144390029	G	A	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5051;FS=3.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=54.44;MQRankSum=-2.189;NF=3;NR=0;PP=35;ReadPosRankSum=-0.842;SC=ATCCCCATACGTCCAAATGTG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=3;WE=36638187;WS=36638169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr17	36638388	rs11867891	A	G	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.973;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=222;ReadPosRankSum=0.570;SC=GAACCAGGTGAGTCTCTGCCA;SOR=1.493;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=21;TCF=8;TCR=13;TR=15;WE=36638396;WS=36638378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,18:0.75:24
chr17	36638695	rs139165577	G	T	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.488;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.173;NF=11;NR=3;PP=205;ReadPosRankSum=-1.688;SC=GCCTTGCATTGTCCCCTTCTT;SOR=1.445;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=26;TCF=18;TCR=8;TR=14;WE=36638703;WS=36638685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr17	36646291	rs12937928	A	G	2083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.766;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=30;PP=1090;ReadPosRankSum=1.098;SC=GGCCGGGAGAACAGGGGAAGG;SOR=0.815;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=103;TCF=61;TCR=42;TR=76;WE=36646299;WS=36646281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,93:0.74:125
chr17	36646386	rs9891156	A	G	2655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=42;NR=42;PP=1351;SC=TTGAGGACGCACGGGAGCGAA;SOR=0.979;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=42;TCR=42;TR=84;WE=36646394;WS=36646376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr17	36666551	rs62074752	T	C	2202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.75;QD=25.61;SOR=0.788;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr17	36667022	rs15537	C	T	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.770;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=11;PP=281;ReadPosRankSum=-1.316;SC=GAGGGGGCCCCCCGGAGCCTG;SOR=0.409;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=89;TCF=46;TCR=43;TR=27;WE=36667030;WS=36667012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,36:0.32:111
chr17	36699322	rs2502364	A	G	1006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.517;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=25;PP=676;ReadPosRankSum=-0.472;SC=AAACACCCACAGGTGAGGTAT;SOR=0.957;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=175;TCF=96;TCR=79;TR=59;WE=36699330;WS=36699312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,62:0.32:193
chr17	36700347	rs8065291	C	T	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.205;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=30;ReadPosRankSum=-1.618;SC=TAGCTCCACACCCGAGTCCAG;SOR=0.255;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=6;WE=36700355;WS=36700337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr17	36700376	rs2502363	C	G	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.40;ReadPosRankSum=-0.834;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr17	36704829	rs56321748	G	A	533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=17;PP=333;ReadPosRankSum=0.084;SC=CGTCATCCTCGTCCTTGATGG;SOR=0.749;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=109;TCF=58;TCR=51;TR=34;WE=36704837;WS=36704819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,35:0.29:119
chr17	36708648	rs35447171	A	C	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=29;ReadPosRankSum=-1.485;SC=CGGTGTGTGAACCCATGGGAA;SOR=0.495;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=6;WE=36708656;WS=36708638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr17	36718610	rs6503709	T	A	2383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=37;NR=49;PP=1335;SC=GTCACCAAGGTCACCCCTGTC;SOR=1.154;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=37;TCR=49;TR=86;WE=36718618;WS=36718600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr17	36720590	rs370527028	ACC	A	173.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5905;FS=0.000;HP=13;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=50;ReadPosRankSum=-1.282;SC=AAGGATGAGCACCCCCCCCCC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=36720600;WS=36720580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,6:0.86:7
chr17	36734700	rs7503695	T	C	1828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=14;PP=755;SC=CCGCTGGCCGTGGCCGCAGCC;SOR=1.347;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=25;TCR=14;TR=39;WE=36734719;WS=36734690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr17	36734706	rs144253512	CAGCCGG	C	1876.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=13;NR=17;PP=1597;SC=GCCGTGGCCGCAGCCGGAGCC;SOR=1.105;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=16;TCR=21;TR=30;WE=36734719;WS=36734690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	36861983	rs17855918	T	C	2017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.87;SOR=0.744;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr17	36874034	rs117599834	G	A	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.902;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=217;ReadPosRankSum=-0.011;SC=CCTGCACCCCGGTACACACAG;SOR=2.344;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=49;TCF=36;TCR=13;TR=16;WE=36874042;WS=36874024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,18:0.34:53
chr17	36878582	rs118191934	T	C	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.450;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.35;ReadPosRankSum=1.242;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
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chr17	36896751	rs56171152	G	A	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=705;ReadPosRankSum=0.118;SC=GGTGGTTCACGCCTGTAATCC;SOR=3.352;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=21;WE=36896759;WS=36896736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,20:0.87:23
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chr17	36908985	rs78060524	TGAA	T	2284.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.048;NF=19;NR=17;PP=1511;ReadPosRankSum=0.112;SC=TATCAGCCAATGAAGAGACAG;SOR=0.700;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=54;TCF=31;TCR=23;TR=36;WE=36908995;WS=36908975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,58:0.74:78
chr17	36909061	rs228274	A	G	3866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=76;NR=60;PP=2273;SC=CGATCGAGGGATCCTAGTACA;SOR=0.836;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=138;TCF=77;TCR=61;TR=136;WE=36909069;WS=36909051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr17	36909499	rs4907	A	T	3772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.461;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=60;PP=2114;ReadPosRankSum=-0.710;SC=CCAGGCCCAGATGGTGACCAC;SOR=0.739;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=245;TCF=144;TCR=101;TR=153;WE=36909507;WS=36909489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,174:0.64:274
chr17	36918551	rs228280	G	T	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.971;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=146;ReadPosRankSum=-0.967;SC=CTTACTTCAGGCATGTCTTGG;SOR=1.329;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=10;WE=36918559;WS=36918541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr17	36926731	rs228289	T	G	608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=15;PP=342;ReadPosRankSum=-0.454;SC=CTTTCTTCTTTGTATCGTATG;SOR=0.719;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=99;TCF=53;TCR=46;TR=34;WE=36926739;WS=36926721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,37:0.33:112
chr17	36926767	rs228290	G	A	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.753;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=17;PP=355;ReadPosRankSum=2.264;SC=TGATGGCCATGAAATACACCT;SOR=1.048;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=98;TCF=48;TCR=50;TR=30;WE=36926775;WS=36926757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,32:0.29:112
chr17	36927690	rs25540	C	CTAAG	547.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=407;SC=CGCGAGCTCTCTCTAATGGGG;SOR=2.147;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=7;WE=36927698;WS=36927680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	36932200	rs228293	C	G	444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.16;SOR=5.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	36932891	rs228294	A	G	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=1.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.69;ReadPosRankSum=0.634;SOR=1.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,8:0.20:40
chr17	36934124	rs2075061	C	T	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=261;ReadPosRankSum=0.446;SC=ACTGTTCTGCCGGGAGCAACT;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=13;WE=36934132;WS=36934114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr17	36962670	rs228249	A	G	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.60;ReadPosRankSum=-0.606;SOR=0.669;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,29:0.25:117
chr17	36966701	rs3744073	G	T	1770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.845;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=26;PP=1080;ReadPosRankSum=-0.812;SC=GAGAAGGGAGGCCAGTCGCCA;SOR=0.563;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=95;TCF=63;TCR=32;TR=73;WE=36966709;WS=36966691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,78:0.73:107
chr17	36971804	rs143550966	C	CAAAT	1903.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=8;PP=1030;ReadPosRankSum=0.728;SC=GACCTTGTCTCAAATAAATAA;SOR=0.915;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=39;TCF=24;TCR=15;TR=21;WE=36971812;WS=36971794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,44:0.73:60
chr17	36993655	rs645686	T	C	744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=21;PP=479;SC=CCAGACCGGGTGCAGTGGCTC;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=26;WE=36993663;WS=36993645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	36997288	rs595306	T	C	287.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=238;SC=GAGCGAGACTTTGTCTCAAAA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=36997296;WS=36997283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	37010150	rs923370	G	A	548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=16;PP=428;SC=TGGGAGTTGAGGTAGAAGCGC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=37010158;WS=37010140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	37070658	rs525989	A	G	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=40;ReadPosRankSum=-0.413;SC=GTCGGGATTCACAGGACGGCA;SOR=0.693;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=29;TCF=10;TCR=19;TR=7;WE=37070666;WS=37070648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,6:0.21:28
chr17	37071189	rs2241009	C	T	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.83;ReadPosRankSum=0.672;SOR=0.596;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,26:0.40:65
chr17	37075286	rs144614922	A	AGGGCGAGGCCCGTGG	9243.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.59;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=6;NR=56;PP=2900;SC=TCTCTGGGGGAGGCAGGGCTG;SOR=1.762;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=98;TCF=7;TCR=91;TR=62;WE=37075294;WS=37075276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr17	37076331	rs646097	G	A	821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=20;NR=6;PP=398;SC=ATCTCTGAGTGGAGGAAGCCC;SOR=1.214;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=26;WE=37076339;WS=37076321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr17	37101101	.	ATG	A	43	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MMLQ=26;MQ=55.02;NF=2;NR=0;PP=43;QD=24.0;SC=GCGTGCATGCATGTGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=2;WE=37101110;WS=37101091;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,2:0.22:9
chr17	37101380	rs9906595	T	C	2783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=56;PP=1579;SC=CTCCAGTTTTTGGGCACTTCC;SOR=1.499;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=90;TCF=34;TCR=56;TR=90;WE=37101388;WS=37101370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr17	37228765	rs9907595	A	G	2178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=33;PP=1239;SC=CAGAAGGAGCAAGATTAGTGG;SOR=0.741;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=74;TCF=41;TCR=33;TR=74;WE=37228773;WS=37228755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr17	37234111	rs3744078	G	A	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.218;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=151;ReadPosRankSum=-0.309;SC=CCAGAGGGGTGGGTAGCTCTC;SOR=0.180;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=11;WE=37234119;WS=37234101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr17	37239671	rs9891236	A	G	1360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=15;PP=861;SC=TCCCCTCCACAGTCGGCCAGT;SOR=1.702;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=49;TCF=33;TCR=16;TR=48;WE=37239679;WS=37239661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr17	37253316	rs4795349	G	A	1107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=34;PP=785;ReadPosRankSum=2.183;SC=GAGGCTGTGAGGAGTCCTCCC;SOR=0.783;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=71;TCF=24;TCR=47;TR=50;WE=37253324;WS=37253306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,50:0.68:74
chr17	37261981	rs3744351	T	C	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=158;ReadPosRankSum=0.079;SC=CTTTCCTGCCTGGTTTCCCTC;SOR=0.693;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=12;WE=37261989;WS=37261971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr17	37265378	rs16490	C	T	1135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=28;PP=842;ReadPosRankSum=0.325;SC=CCCATGGGAACCCCTGGAAGG;SOR=1.378;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=37;TCF=8;TCR=29;TR=36;WE=37265386;WS=37265368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,38:0.97:39
chr17	37308792	rs3025194	G	A	606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=18;PP=421;ReadPosRankSum=2.274;SC=TCCCTCCCCTGACCTACTTCG;SOR=0.723;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=100;TCF=53;TCR=47;TR=35;WE=37308800;WS=37308782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,35:0.33:106
chr17	37316988	rs16522	T	C	1366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=32;PP=793;SC=TGAAGCATCCTGTAGAGCCTG;SOR=2.170;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=13;TCR=32;TR=45;WE=37316996;WS=37316978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr17	37317672	rs511163	C	G	828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=17;PP=480;SC=TGCCCTCTTTCTTTCCCCACT;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=14;TCR=17;TR=31;WE=37317680;WS=37317662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr17	37319029	rs544198	T	G	2723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=48;PP=1703;SC=ATGTCCCACATGAAGAAGTGG;SOR=1.044;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=39;TCR=48;TR=87;WE=37319037;WS=37319019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr17	37319065	rs657672	C	T	1923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=37;PP=1119;SC=ATCTCCTCCACGTTGCTGCCA;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=24;TCR=37;TR=61;WE=37319073;WS=37319055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr17	37319103	rs657723	T	C	948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=23;PP=666;SC=GACCACCTCATTGGTCAAGCT;SOR=2.448;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=30;WE=37319111;WS=37319093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	37321538	rs520054	G	A	462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=16;PP=355;SC=TTCCCACCCAGCTCCGACACC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=37321546;WS=37321528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	37321961	rs593772	C	T	7328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.617;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=145;NR=103;PP=2965;ReadPosRankSum=1.457;SC=CCCTGTGCGCCCCTTACCCTG;SOR=0.674;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=249;TCF=145;TCR=104;TR=248;WE=37321969;WS=37321951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,275:1.00:276
chr17	37322080	rs16527	T	C	4006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=77;PP=2586;SC=GGCCCTGGTATTCGGAGCTCC;SOR=1.179;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=136;TCF=57;TCR=79;TR=134;WE=37322088;WS=37322061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr17	37332036	rs529955	A	G	1689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=37;PP=1103;SC=CTGGCTCTAGAGGAGGGGCCC;SOR=2.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=14;TCR=37;TR=51;WE=37332044;WS=37332026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr17	37334426	rs186559351	A	T	2838.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=31;PP=868;SC=CAGCATGGAGAGCCAGTGTCA;SOR=2.869;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=4;TCR=31;TR=35;WE=37334437;WS=37334416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr17	37334427	rs200040112	G	GT	2829.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=30;PP=1385;SC=AGCATGGAGAGCCAGTGTCAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=30;WE=37334437;WS=37334416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr17	37334429	rs115149510	C	A	2806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=30;PP=864;SC=CATGGAGAGCCAGTGTCAAGA;SOR=2.794;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=34;WE=37334437;WS=37334416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr17	37343130	rs138029585	A	G	1737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=2.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.01;ReadPosRankSum=1.585;SOR=0.481;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,84:0.68:124
chr17	37349655	rs16531	T	C	1055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FS=1.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.91;ReadPosRankSum=1.102;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:148,67:0.31:215
chr17	37349710	rs16532	C	G	3841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=63;NR=62;PP=2116;SC=ACCACCACCACGGTCCGGCTG;SOR=0.922;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=63;TCR=62;TR=125;WE=37349718;WS=37349700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr17	37351285	rs534012	T	C	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=17;PP=258;ReadPosRankSum=0.467;SC=ACCCTCATCTTGCCAGCCCCA;SOR=0.746;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=82;TCF=32;TCR=50;TR=27;WE=37351293;WS=37351275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,30:0.33:90
chr17	37369416	rs1859262	G	A	2315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=45;PP=1359;SC=GAACACCCGCGCCACACCCCA;SOR=1.165;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=32;TCR=45;TR=77;WE=37369424;WS=37369406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr17	37371519	rs11078892	T	C	858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=20;PP=644;SC=TGGCTCTGCCTCAAAGCCCTG;SOR=2.147;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=26;WE=37371527;WS=37371509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	37396201	rs34473775	G	T	3912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=63;PP=2401;SC=TCTGGCTCAGGAGTCCTTGTG;SOR=0.764;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=135;TCF=71;TCR=64;TR=133;WE=37396209;WS=37396191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr17	37399364	rs2338795	T	G	941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=8;PP=628;SC=GGCTGACAGGTGGCAGGCGGG;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=30;WE=37399372;WS=37399354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr17	37399379	rs2879258	G	T	1218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=13;PP=767;SC=GGCGGGTAACGGGTTTTGGGT;SOR=1.559;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=28;TCR=13;TR=41;WE=37399387;WS=37399369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr17	37401051	rs11078895	A	G	558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=14;NR=6;PP=437;SC=GTTCCTCACCACCATTCGCTC;SOR=1.721;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=20;WE=37401059;WS=37401041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	37410700	rs752314	C	T	469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=1;PP=348;SC=TATGTCTGGACACCTCTCTTC;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=37410708;WS=37410699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	37410892	rs2879259	C	G	5426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=101;NR=80;PP=2965;SC=AAAAGGGGTGCAGTTGATCAG;SOR=0.775;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=181;TCF=101;TCR=80;TR=181;WE=37410900;WS=37410882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr17	37417575	rs3744348	C	G	528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=3;PP=420;SC=ATGTGTGGCTCTGGGGATCTG;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=37417583;WS=37417565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	37421767	rs2061338	T	C	572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=17;PP=405;SC=GAGTCATACCTGATTCTTTTT;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=37421775;WS=37421757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	37425238	rs1966916	T	G	344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=10;PP=260;SC=AATTCTTTGGTGTTTCAGAGC;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=37425246;WS=37425228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	37425262	rs1966915	A	C	230.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=7;PP=177;SC=TGTCATGCTAATTTTTTTTTC;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=37425270;WS=37425252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	37427114	rs11307198	TA	T	163.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.19;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	37587534	rs35691977	CT	C	210.37	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.35;MQRankSum=0.588;QD=14.02;ReadPosRankSum=-0.341;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,13:0.87:15
chr17	37671910	rs8070799	G	A	858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=4;PP=595;SC=TATCAATAATGTAAAAATTTT;SOR=2.985;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=27;WE=37671918;WS=37671900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	37783787	rs3751903	C	G	2290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=49;PP=1548;SC=GCTTCTTCGCCCTCCCAAGGC;SOR=1.367;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=28;TCR=49;TR=77;WE=37783795;WS=37783777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr17	37814080	rs1877031	G	A	5169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=103;NR=66;PP=2965;SC=GCCGTGCTGCGGCTCCGGCAC;SOR=1.041;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=169;TCF=103;TCR=66;TR=169;WE=37814088;WS=37814070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr17	37815899	rs11658786	G	A	3232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=61;PP=1838;SC=AAGATTACATGGGTTGGAGCC;SOR=1.382;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=40;TCR=61;TR=101;WE=37815907;WS=37815889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr17	37821435	rs931992	G	T	440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=1;PP=296;SC=CCTCTGACCGGGGGGCAGCCA;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=37821443;WS=37821425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	37822311	rs1053651	A	C	3641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=54;NR=65;PP=2031;SC=AGCCCGGTGCACTTCGTCGCT;SOR=1.027;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=54;TCR=65;TR=119;WE=37822319;WS=37822301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr17	37829129	rs2247862	A	G	2846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=58;PP=1897;SC=GCTGTGGGCCAAAGGAGTAGC;SOR=1.257;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=39;TCR=58;TR=97;WE=37829137;WS=37829119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr17	37830447	rs2934956	T	A	243.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=0;NR=8;PP=199;SC=CTGAGTCTTGTGTTCACATCA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=37830455;WS=37830437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	37830900	rs2941504	A	G	5526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=112;NR=71;PP=2965;SC=TGGTGTGGAAAACTGTGGACC;SOR=1.040;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=183;TCF=112;TCR=71;TR=183;WE=37830908;WS=37830890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr17	37831035	rs1565922	A	G	1825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=42;PP=1248;SC=GGGGCTCTGCAGGACAAGAAA;SOR=2.056;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=17;TCR=42;TR=59;WE=37831043;WS=37831025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr17	37855713	.	TA	T	360.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.196;ClippingRankSum=0.000;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.28;MQRankSum=1.970;QD=5.15;ReadPosRankSum=1.590;SOR=0.648;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,29:0.41:70
chr17	37866005	rs1810132	C	T	5287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=96;NR=72;PP=2822;SC=CTCTCTGTTACTAACCCGTCC;SOR=0.856;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=168;TCF=96;TCR=72;TR=168;WE=37866013;WS=37865995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr17	37868715	rs4252627	C	T	1474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=30;PP=967;SC=AGAGTGGGCACGATGACCTGA;SOR=1.244;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=20;TCR=30;TR=50;WE=37868723;WS=37868705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr17	37879762	rs903506	G	A	3657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=61;PP=2432;SC=ACCGGCCCCCGGCACTGACCC;SOR=0.708;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=65;TCR=61;TR=126;WE=37879770;WS=37879752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr17	37884037	rs1058808	C	G	3016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=45;PP=1807;SC=TCTGGAAAGGCCCAAGACTCT;SOR=0.711;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=53;TCR=45;TR=98;WE=37884045;WS=37884027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr17	37886770	rs369407025	C	A	842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=17;PP=462;SC=CCGCTCGGGCCCCTGCTTCCG;SOR=1.536;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=9;TCR=17;TR=26;WE=37886778;WS=37886760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	37898543	rs2952142	T	C	4083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=74;NR=64;PP=2056;SC=GCCCCTCTCTTGCTCAGACGC;SOR=0.706;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=74;TCR=64;TR=138;WE=37898551;WS=37898533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr17	37902887	rs150443878	GAAAAAGAAAAAGA	G	984.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.96;QD=41.03;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	37921899	rs2952141	C	T	375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=257;SC=ACAGTGTTTCCCTGGCTACCC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=37921907;WS=37921889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	37922259	rs907092	G	A	5438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=80;PP=2965;SC=TCACTTTGACGGAGTCTCTTG;SOR=0.766;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=179;TCF=99;TCR=80;TR=179;WE=37922267;WS=37922249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr17	37985801	rs3816470	A	G	936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=22;PP=653;SC=TTATAAATATATATTAAGTAG;SOR=2.448;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=29;WE=37985809;WS=37985791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	37988293	rs8069893	C	T	697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=11;PP=459;ReadPosRankSum=0.194;SC=ACATTCCTCTCTCTTTGGTAT;SOR=0.590;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=80;TCF=56;TCR=24;TR=34;WE=37988301;WS=37988283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,35:0.41:85
chr17	37988477	rs111944912	T	C	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.482;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=239;ReadPosRankSum=-0.288;SC=CCAAATTTAATAAGGGATACC;SOR=0.399;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=43;TCF=9;TCR=34;TR=16;WE=37988485;WS=37988467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,17:0.38:45
chr17	38020419	rs1453559	T	C	2225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=50;PP=1463;SC=CTGTGGCTACTCGGCCTCTCC;SOR=1.923;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=22;TCR=50;TR=72;WE=38020427;WS=38020409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr17	38024626	rs11557466	C	T	1887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=36;NR=23;PP=983;SC=AACGTGCGTCCTACTCTCCGC;SOR=0.840;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=36;TCR=23;TR=59;WE=38024634;WS=38024616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr17	38028634	rs11557467	G	T	2279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.20;SOR=0.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr17	38031674	rs10852935	C	T	5973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=110;PP=2965;SC=ACAGTAATTGCGCTAGCTGTT;SOR=1.189;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=190;TCF=80;TCR=110;TR=190;WE=38031682;WS=38031664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr17	38031714	rs10852936	C	T	2880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=65;PP=1823;SC=AATATCTAAACATTTAGGTTA;SOR=2.063;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=91;TCF=26;TCR=65;TR=91;WE=38031722;WS=38031704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr17	38062196	rs2305480	G	A	2993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=34;PP=1805;SC=GGCTTGTCTGGGTCCTCCATG;SOR=1.136;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=58;TCR=34;TR=92;WE=38062204;WS=38062186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr17	38062217	rs2305479	C	T	3598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=42;PP=2059;SC=TGTAGCTCCCCGGAAATCAGG;SOR=1.085;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=69;TCR=42;TR=111;WE=38062225;WS=38062207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr17	38063381	rs883770	C	T	336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=8;PP=222;SC=TCCTCACCAGCGTGTGTCAAT;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=38063389;WS=38063371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	38064405	rs11078927	C	T	6545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=120;NR=101;PP=2965;SC=AAATGACGAACGGGAAGCCCA;SOR=0.750;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=221;TCF=120;TCR=101;TR=221;WE=38064413;WS=38064395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr17	38064469	rs11078928	T	C	6839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=119;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.123;SC=AATGAATATCTAAACCAGCAC;SOR=0.588;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=227;TCF=106;TCR=121;TR=223;WE=38064477;WS=38064458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,258:0.99:261
chr17	38066240	rs2290400	T	C	1194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=22;PP=723;SC=ACTGACTCTTTTCCCTCTCTG;SOR=1.730;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=12;TCR=22;TR=34;WE=38066248;WS=38066230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr17	38066267	rs1008723	G	T	561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=13;PP=386;SC=AGCTCCTATTGAAGATTAATC;SOR=2.419;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=17;WE=38066275;WS=38066257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	38122680	rs7212938	G	T	1924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.10;SOR=2.030;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr17	38122686	rs7212944	G	A	986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=4.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.45;ReadPosRankSum=-1.075;SOR=1.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,38:0.83:46
chr17	38122708	rs9914973	T	C	562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.187;HP=1;HapScore=2;MGOF=40;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=342;ReadPosRankSum=-1.049;SC=TGGGCGGGACTGAGGGTCTCC;SOR=2.557;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=21;WE=38122716;WS=38122698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,25:0.81:31
chr17	38126911	rs60177750	AACACAC	A	530.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=600;ReadPosRankSum=-1.956;SC=GTTTGATTCAAACACACACAC;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=11;WE=38126924;WS=38126901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr17	38127713	rs3916061	A	G	1119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.891;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=21;PP=599;ReadPosRankSum=-0.689;SC=CCCCCAACTCACGCTCCCAAT;SOR=0.428;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=80;TCF=48;TCR=32;TR=49;WE=38127721;WS=38127703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,56:0.62:90
chr17	38128584	rs5820314	A	AG	423.37	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.6737;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.588;NF=1;NR=11;PP=480;ReadPosRankSum=0.122;SC=CCTCAACTTTAGAAAGACAGA;SOR=1.179;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=12;WE=38128592;WS=38128574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,14:0.93:15
chr17	38128765	rs8077456	G	C	1857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.642;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=27;PP=1127;ReadPosRankSum=0.991;SC=TGATGAAACTGCCTTGAAGAC;SOR=0.773;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=118;TCF=71;TCR=47;TR=70;WE=38128773;WS=38128755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,80:0.58:138
chr17	38137364	rs3087852	G	A	975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.050;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=22;PP=601;ReadPosRankSum=-1.560;SC=GTGGCGGGTCGACGGGGGAGG;SOR=0.560;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=27;TCR=31;TR=42;WE=38137372;WS=38137354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,44:0.71:62
chr17	38140524	rs3816471	T	C	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.377;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=181;ReadPosRankSum=-2.294;SC=AGTGACATCATTTTCTTCTCT;SOR=1.099;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=15;WE=38140532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr17	38142677	rs3816472	A	C	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=203;ReadPosRankSum=-0.399;SC=GAAAGACTGTAATCTTTATTT;SOR=0.610;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=12;WE=38142685;WS=38142667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr17	38145088	rs9915252	C	G	640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.511;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=437;ReadPosRankSum=-1.604;SC=GGCAGCCAAGCATCTCACTTG;SOR=1.112;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=33;TCF=12;TCR=21;TR=23;WE=38145096;WS=38145078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,25:0.71:35
chr17	38146303	rs376030438	A	G	1090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.634;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=10;PP=734;ReadPosRankSum=0.315;SC=GGGGAGTTGGATGACCCTACT;SOR=1.306;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=54;TCF=38;TCR=16;TR=37;WE=38146311;WS=38146293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,42:0.69:61
chr17	38152304	rs8071037	A	T	61.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5064;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=39;ReadPosRankSum=-0.319;SC=CCCGGGAGGTAAAGGTTGCAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=3;WE=38152312;WS=38152294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr17	38153473	rs12453334	C	T	687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=1;PP=471;ReadPosRankSum=0.302;SC=AGGGGCCCGCCGCTTCCTGCC;SOR=1.022;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=23;WE=38153481;WS=38153463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,25:0.83:30
chr17	38153554	rs2241244	G	C	2886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.464;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=48;PP=1898;ReadPosRankSum=0.255;SC=TCCTTCCCTCGCTCATCTCCT;SOR=0.877;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=195;TCF=118;TCR=77;TR=124;WE=38153562;WS=38153544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,132:0.63:211
chr17	38153714	rs10671123	T	TGA	5243.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=52;PP=2899;ReadPosRankSum=-0.290;SC=CTGGAAGGGCTGAGCTGCTCT;SOR=0.670;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=118;TCF=21;TCR=97;TR=63;WE=38153722;WS=38153704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,133:0.61:217
chr17	38172192	rs2227324	G	A	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=117;ReadPosRankSum=0.733;SC=TGGAAGGGACGTGGGAGAATA;SOR=1.022;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=16;TCF=6;TCR=10;TR=9;WE=38172200;WS=38172182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr17	38172305	rs2071369	T	C	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.40;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr17	38172452	rs2071370	T	C	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=1.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.89;ReadPosRankSum=1.041;SOR=1.140;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr17	38172942	rs2227338	A	G	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=392;ReadPosRankSum=0.188;SC=CACCACAGCCAGGCCTGTGTA;SOR=0.593;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=20;WE=38172950;WS=38172932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,20:0.67:30
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chr17	38176476	rs9899955	A	G	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.841;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=435;ReadPosRankSum=0.809;SC=ATGAGAAGAGAGACTCGTCCA;SOR=1.453;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=23;WE=38176484;WS=38176466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,23:0.72:32
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chr17	38179492	rs2302777	A	G	2770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-1.402;NF=63;NR=50;PP=1853;ReadPosRankSum=-1.591;SC=CCTTGGCAAAAATGTCCGTCA;SOR=0.663;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=165;TCF=93;TCR=72;TR=113;WE=38179500;WS=38179482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,120:0.67:180
chr17	38179667	rs2302778	A	G	1195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.873;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=29;PP=706;ReadPosRankSum=-0.541;SC=GGGCCGAGAGAACCTGAGGCT;SOR=0.951;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=76;TCF=31;TCR=45;TR=47;WE=38179675;WS=38179657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,54:0.63:86
chr17	38182844	rs2302775	T	C	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=2.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.26;ReadPosRankSum=-1.475;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,7:0.23:30
chr17	38183090	rs2302774	G	T	3126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.291;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=59;PP=1827;ReadPosRankSum=1.631;SC=CCCTTGGAGTGGGCGCCCGGG;SOR=0.653;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=187;TCF=103;TCR=84;TR=126;WE=38183098;WS=38183080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,139:0.68:205
chr17	38188419	rs3935281	C	T	1037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=27;PP=630;ReadPosRankSum=-1.251;SC=GGCATCCCCCCGAACCCCTGC;SOR=0.922;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=47;TCF=14;TCR=33;TR=38;WE=38188427;WS=38188409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,43:0.81:53
chr17	38188844	rs7502514	A	G	979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=5;PP=592;SC=CCAGGGTGCCACTGGTCTTGC;SOR=3.086;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=30;WE=38188852;WS=38188834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr17	38189049	rs4072639	G	A	3173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.06;ReadPosRankSum=1.841;SOR=0.673;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,139:0.75:186
chr17	38189055	rs3935280	A	G	6878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.46;SOR=0.925;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr17	38189793	rs11078934	T	C	1735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=28;PP=1177;SC=ATTTTGGCACTCCCTCCGGCA;SOR=0.865;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=28;TCR=28;TR=56;WE=38189801;WS=38189783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr17	38191924	rs6503534	A	G	596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=11;PP=358;ReadPosRankSum=-0.685;SC=ACCTCTGCACAAAGACAAGGC;SOR=0.777;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=97;TCF=64;TCR=33;TR=32;WE=38191932;WS=38191914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,35:0.33:106
chr17	38192137	rs11078935	T	G	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.965;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=241;ReadPosRankSum=0.701;SC=GGACTCCTGCTCCTCTCTCCT;SOR=0.368;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=16;WE=38192145;WS=38192127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
chr17	38244509	rs41283431	C	T	972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=21;PP=617;ReadPosRankSum=-1.779;SC=CTTGCGAAGACCAGATCATCC;SOR=0.736;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=176;TCF=106;TCR=70;TR=53;WE=38244517;WS=38244499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,59:0.30:199
chr17	38251385	rs141144358	A	AT	657.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=15;PP=582;SC=TGGGGGAGGAAAAGATTGAAG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=15;WE=38251393;WS=38251375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	38252582	.	G	GT	2055.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=11;PP=1212;SC=GACATCCCCTGGCACATGTGA;SOR=1.791;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=32;TCF=21;TCR=11;TR=30;WE=38252590;WS=38252572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	38252667	rs939346	G	A	4178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=58;PP=2548;SC=GGCGGAAGAAGGGGGGAGGAT;SOR=0.906;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=137;TCF=79;TCR=58;TR=137;WE=38252675;WS=38252657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr17	38256185	rs4795424	A	C	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.664;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=116;ReadPosRankSum=1.573;SC=ACACTAAAGCACCGCAGCACG;SOR=0.377;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=11;WE=38256193;WS=38256175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr17	38256401	rs17616365	G	A	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.903;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=17;PP=285;ReadPosRankSum=-0.570;SC=CAAACTAGAGGTTGCGATCGC;SOR=0.907;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=76;TCF=30;TCR=46;TR=27;WE=38256409;WS=38256391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,30:0.37:82
chr17	38324766	rs11327454	AT	A	323.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=278;SC=TTGAGAGAACATTTTCAGTGC;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=8;WE=38324774;WS=38324756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	38334359	rs66989091	A	AG	896.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=5;PP=866;SC=CCGCCCCCTGAGAGGAAGGAG;SOR=2.215;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=19;WE=38334367;WS=38334349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	38347755	rs374744582	G	T	783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=2.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.75;ReadPosRankSum=0.256;SOR=0.861;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,36:0.63:57
chr17	38348353	rs55772196	T	C	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=58;ReadPosRankSum=-0.780;SC=CCCAGCCCCCTACAAGCCATG;SOR=0.627;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=7;WE=38348361;WS=38348343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,8:0.20:41
chr17	38349127	rs2280400	G	A	902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.790;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=8;PP=515;ReadPosRankSum=0.876;SC=GGCCCCTTTCGAACTCCTCTC;SOR=1.420;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=105;TCF=74;TCR=31;TR=39;WE=38349135;WS=38349117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,47:0.37:127
chr17	38434251	rs112148679	T	C	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.561;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.802;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=25;ReadPosRankSum=1.201;SC=GTGCTGGGATTACAGGCGTGA;SOR=0.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=3;WE=38434259;WS=38434241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr17	38457151	rs13706	G	A	1275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.531;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=26;PP=695;ReadPosRankSum=-1.167;SC=CATCTCAGAAGTTGATGGTAA;SOR=0.757;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=185;TCF=104;TCR=81;TR=64;WE=38457159;WS=38457141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,73:0.35:210
chr17	38457343	rs4135029	G	T	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.572;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=135;ReadPosRankSum=0.238;SC=TGCAGAGCAGGTATTTTCCAA;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=7;WE=38457351;WS=38457333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr17	38507464	.	C	A	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.385;ClippingRankSum=-0.000;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.96;ReadPosRankSum=0.385;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr17	38519291	rs502041	C	G	876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=13;PP=608;SC=GCGGGGCGCACGGCTCGGGGC;SOR=0.826;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=14;TCR=13;TR=27;WE=38519299;WS=38519281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	38556770	rs471692	T	C	3941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=58;PP=2390;SC=AAGAAATCCATAATTATTTAC;SOR=0.778;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=130;TCF=72;TCR=58;TR=130;WE=38556778;WS=38556760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr17	38563710	rs558068	C	G	269.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=8;NR=1;PP=209;SC=TCCTATTTAACTAATTTATTT;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=38563718;WS=38563700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	38566396	rs2715548	G	A	692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=17;PP=496;SC=GGATAAGCAAGAAGTTTGCTA;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=25;WE=38566404;WS=38566386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	38566792	.	A	G	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=232;ReadPosRankSum=-0.307;SC=CATTCCAAGGAAAGGACTTAA;SOR=1.609;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=14;WE=38566800;WS=38566782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,16:0.76:21
chr17	38572366	rs2586112	G	A	469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=6;NR=10;PP=262;SC=AGTGTTTTAAGAAACATTCTG;SOR=1.493;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=6;TCR=10;TR=16;WE=38572374;WS=38572356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	38600092	rs598892	G	A	330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=3;PP=218;SC=AGGAGAAGCTGGCGCGCTGCC;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=12;WE=38600100;WS=38600082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	38609431	rs5820347	G	GAC	978.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.144;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=860;ReadPosRankSum=1.747;SC=CATGTGCATAGACACACACAC;SOR=1.542;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=18;WE=38609439;WS=38609421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,30:0.86:35
chr17	38711222	rs2229095	T	C	1703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.065;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=32;PP=1133;ReadPosRankSum=1.125;SC=CGATGTTGAGTTGCTTACTGA;SOR=0.822;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=278;TCF=163;TCR=115;TR=86;WE=38711230;WS=38711212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:219,93:0.30:312
chr17	38715102	rs3136689	G	A	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=111;ReadPosRankSum=-0.956;SC=TTGGGAGGCCGTGTGGAGAAG;SOR=0.650;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=38;TCF=30;TCR=8;TR=12;WE=38715110;WS=38715092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,14:0.31:45
chr17	38854406	rs2429549	G	A	1244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=6;PP=809;SC=CCAGAAAGATGCCTAGATTGA;SOR=3.716;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=32;TCR=6;TR=38;WE=38854414;WS=38854396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr17	38855772	rs2462961	T	C	3130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=41;PP=1542;ReadPosRankSum=-0.788;SC=AGCAATTGCTTGTACTCTGCG;SOR=0.347;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=63;TCR=42;TR=103;WE=38855780;WS=38855762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,117:0.99:118
chr17	38856662	rs887376	T	C	1551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.25;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr17	38857446	rs874889	C	A	3137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=46;PP=1762;SC=TCTCAATCTGCATCTCCAGGT;SOR=0.728;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=56;TCR=46;TR=102;WE=38857454;WS=38857436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr17	38858029	rs6416908	A	T	247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.52;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	38858134	rs11309872	CA	C	6073.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=44;PP=2957;SC=GCCAATCTGGCATTGTCAATG;SOR=1.112;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=26;TCR=44;TR=70;WE=38858142;WS=38858124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr17	38911212	rs12951078	G	A	1459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=29;PP=857;ReadPosRankSum=-0.786;SC=CCAGGTCAGCGTTGGCCTCCT;SOR=0.723;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=87;TCF=47;TCR=40;TR=61;WE=38911220;WS=38911202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,67:0.66:101
chr17	38911327	rs35076248	C	G	2046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=34;PP=1287;ReadPosRankSum=0.655;SC=CACAGTGAAGCCAGCACAGGG;SOR=0.725;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=113;TCF=63;TCR=50;TR=78;WE=38911335;WS=38911317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,86:0.70:122
chr17	38923932	rs5820359	AT	A	599.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.461;HP=9;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=257;ReadPosRankSum=-0.028;SC=AAATTATTGCATTTTTTTTTC;SOR=0.223;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=18;WE=38923940;WS=38923922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,28:0.68:41
chr17	38923986	rs975079	G	A	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.299;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=270;ReadPosRankSum=-0.325;SC=GGAAATAAGAGTTTTGGAATT;SOR=2.179;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=14;WE=38923994;WS=38923976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr17	38925413	rs200744358	TTTTA	T	319.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.31;ReadPosRankSum=0.042;SOR=0.204;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
chr17	38926002	rs16966256	G	A	3103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=49;PP=1714;ReadPosRankSum=0.732;SC=CGATTCCTACGTACCACAGCC;SOR=0.652;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=160;TCF=93;TCR=67;TR=120;WE=38926010;WS=38925992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,135:0.75:179
chr17	38928014	rs9898164	A	G	2406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.504;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=44;PP=1439;ReadPosRankSum=-0.338;SC=TTCTCGTACCAGCCCTTGATC;SOR=0.458;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=158;TCF=77;TCR=81;TR=92;WE=38928022;WS=38928004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,108:0.60:180
chr17	38935812	rs981684	A	G	2414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.455;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=43;PP=1418;ReadPosRankSum=1.353;SC=TTTCATCTCGATAAGCTCATT;SOR=0.713;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=127;TCF=68;TCR=59;TR=94;WE=38935820;WS=38935802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,105:0.71:147
chr17	38935876	rs17558532	C	T	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=0.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.81;ReadPosRankSum=0.218;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,35:0.29:119
chr17	38938222	rs72824004	T	C	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.702;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=154;ReadPosRankSum=1.004;SC=CCTGTTATTGTGATAGCTTAT;SOR=0.387;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=13;WE=38938230;WS=38938212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr17	38938316	rs12453124	C	T	1706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=30;PP=932;ReadPosRankSum=-0.291;SC=TTCTTAAGTTCGTCAATAATT;SOR=0.742;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=71;TCR=52;TR=71;WE=38938324;WS=38938306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,81:0.59:138
chr17	38938591	rs2469826	C	G	2585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.635;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=48;PP=1402;ReadPosRankSum=1.465;SC=TGCAGATGAGCTGCCCCCAAA;SOR=0.624;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=142;TCF=73;TCR=69;TR=101;WE=38938599;WS=38938581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,117:0.71:164
chr17	38950272	rs2250671	T	C	5230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=93;NR=84;PP=2732;SC=TCTCGGTCTCTGTCAAGGAGC;SOR=0.703;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=177;TCF=93;TCR=84;TR=177;WE=38950280;WS=38950262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr17	38953540	rs3813038	A	G	6495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=99;NR=100;PP=2965;SC=TCTCCTGGAGAGAAGCAAGAG;SOR=0.735;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=199;TCF=99;TCR=100;TR=199;WE=38953548;WS=38953530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr17	38954687	rs9914044	C	T	1725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=25;NR=32;PP=974;SC=TAAGACTACCCCAAGAAACAG;SOR=1.127;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=25;TCR=32;TR=57;WE=38954695;WS=38954677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr17	38955173	rs7222207	G	A	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.412;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQ=59.99;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=178;ReadPosRankSum=0.042;SC=ACTTACTTTAGCCTGAAATCA;SOR=1.199;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=68;TCF=47;TCR=21;TR=17;WE=38955181;WS=38955163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,17:0.22:78
chr17	38955274	rs7224150	A	C	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.85;ReadPosRankSum=-1.008;SOR=0.636;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,16:0.23:70
chr17	38955991	rs7209228	C	T	2415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.088;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=48;PP=1481;ReadPosRankSum=1.832;SC=ACTGCCCAAGCCCCCTCCCAA;SOR=0.577;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=147;TCF=74;TCR=73;TR=102;WE=38955999;WS=38955981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,106:0.66:161
chr17	38974612	rs1132367	T	C	2580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=37;PP=1598;ReadPosRankSum=2.121;SC=GGGAGACTCTTTCCTCTTGAT;SOR=0.713;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=91;TCR=53;TR=100;WE=38974620;WS=38974602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,111:0.69:160
chr17	38975328	rs17855579	G	A	498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.75;SOR=2.200;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	38976716	rs1799915	C	T	1995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-3.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.883;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=42;PP=1155;ReadPosRankSum=0.736;SC=ACACGAGGACCATAATGAACT;SOR=0.281;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=103;TCF=43;TCR=60;TR=76;WE=38976724;WS=38976706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,88:0.73:120
chr17	38976978	rs6503559	C	A	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.18;ReadPosRankSum=-0.769;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,22:0.23:95
chr17	38976998	rs1799873	G	A	2155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=47;PP=1314;SC=TTAAAAAGCAGCTACATAGTT;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=26;TCR=47;TR=73;WE=38977006;WS=38976988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr17	38978462	rs77919366	C	T	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.688;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=20;PP=438;ReadPosRankSum=-0.242;SC=CCTCCAAAGCCGCCTCCACCA;SOR=0.875;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=104;TCF=53;TCR=51;TR=37;WE=38978470;WS=38978452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,39:0.35:112
chr17	38978536	rs4261597	A	C	4271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=71;NR=72;PP=2534;SC=CCCTCCAAAGATGCCTCCATA;SOR=0.837;SbPval=0.53;Source=Platypus;TCF=71;TR=143;WE=38978544;WS=38978526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr17	38990834	rs2240078	G	C	1604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=13;PP=946;SC=CCAGCTATGTGCCCTCTGTTG;SOR=1.823;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=35;TCR=13;TR=48;WE=38990842;WS=38990824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr17	38991032	rs6694	T	A	8163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=100;PP=2965;SC=GTGCTTGCGGTCATCGGTTGA;SOR=0.936;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=196;TCF=96;TCR=100;TR=196;WE=38991040;WS=38991022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr17	38991052	rs1044806	TT	GA	5489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.771;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=57;PP=2944;ReadPosRankSum=-0.369;SC=AGAGAAGGACTTCTTCTTCCT;SOR=0.501;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=169;TCF=82;TCR=87;TR=113;WE=38991061;WS=38991042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,135:0.70:193
chr17	39018961	rs9894091	A	G	2304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.818;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=44;PP=1250;ReadPosRankSum=-0.647;SC=GGTCTGAGAAATTAGATTTCC;SOR=0.633;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=147;TCF=77;TCR=70;TR=94;WE=39018969;WS=39018951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,108:0.64:169
chr17	39221758	.	CGCAGGGGGGCCGGCA	C	241.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.445;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.683;NF=0;NR=4;PP=1238;ReadPosRankSum=-2.200;SC=GTCGGCTGGCCGCAGGGGGGC;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=4;WE=39221780;WS=39221748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr17	39240426	rs11658607	G	A	8862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=342;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=169;NR=175;PP=2965;SC=CACTCTCTTGGAAACCCACCC;SOR=0.741;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=344;TCF=169;TCR=175;TR=344;WE=39240434;WS=39240416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,342:1.00:342
chr17	39240504	rs11655310	A	G	5579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.51;QD=40.73;SOR=1.734;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr17	39240511	rs383835	A	T	2553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=35.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.05;MQRankSum=3.963;QD=21.83;ReadPosRankSum=4.491;SOR=0.006;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,98:0.84:117
chr17	39240661	rs11650484	C	G	2842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=-0.414;NF=49;NR=44;PP=1656;ReadPosRankSum=1.400;SC=TGTCGCCCCACCTGCTGTGAG;SOR=0.247;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=94;TCF=49;TCR=45;TR=93;WE=39240669;WS=39240651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,103:0.99:104
chr17	39240790	rs11650261	G	A	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.051;HP=6;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.957;NF=2;NR=12;PP=954;ReadPosRankSum=1.106;SC=ACCTGCTGCCGCCCCAGCTGC;SOR=1.793;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=22;TCF=9;TCR=13;TR=14;WE=39240803;WS=39240780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,15:0.94:16
chr17	39240794	.	CA	AT	375	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;FR=0.5000;HP=3;HapScore=4;MGOF=4;MMLQ=24;MQ=48.36;NF=7;NR=1;PP=375;QD=53.5584843578;SC=GCTGCCGCCCCAGCTGCTGCC;SbPval=0.01;Source=Platypus;TC=20;TCF=8;TCR=12;TR=8;WE=39240803;WS=39240780;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr17	39240804	.	C	A	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=-0.000;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=14.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.25;MQRankSum=-0.366;QD=37.10;ReadPosRankSum=-0.180;SOR=3.894;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr17	39240805	.	G	T	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.100;ClippingRankSum=-0.000;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=14.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.25;MQRankSum=-0.366;QD=37.10;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=3.894;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr17	39240807	rs188505452	C	T	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=13.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.52;MQRankSum=-0.712;QD=30.25;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=3.587;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr17	39240810	rs143685555	T	A	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=13.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.56;MQRankSum=-1.754;QD=18.86;ReadPosRankSum=0.464;SOR=3.590;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr17	39240818	.	C	T	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.701;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=11.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.50;MQRankSum=-2.287;QD=7.38;ReadPosRankSum=-0.728;SOR=2.204;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,2:0.20:10
chr17	39254335	rs201764113	A	AT	7117.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=70;PP=2957;SC=GGAGTTGACCATGGTGTCAGA;SOR=0.735;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=87;TCF=16;TCR=71;TR=86;WE=39254343;WS=39254325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr17	39254444	rs6416913	T	C	901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=23;PP=646;SC=AGGCCCGTTGTCACCACGTCA;SOR=3.912;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=26;WE=39254452;WS=39254434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	39258027	rs7503699	G	A	819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.84;SOR=0.880;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr17	39258495	rs168397	G	A	739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=19;PP=493;SC=TGATTTAAAGGTGGAATTCAT;SOR=2.670;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=23;WE=39258503;WS=39258485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	39261560	rs349792	T	A	105.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=33.00;QD=26.26;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	39261608	rs349791	G	A	1160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.38;QD=44.64;SOR=6.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	39261611	rs11654665	G	A	1160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.56;QD=42.99;SOR=6.666;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	39261933	rs7207685	C	T	1411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.57;QD=41.52;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr17	39261949	rs7212474	T	C	1359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.66;QD=41.21;SOR=0.752;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr17	39274069	rs349771	G	C	521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=9;NR=11;PP=275;SC=CAGGAGACTCGGCCACAGACT;SOR=1.127;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=21;TCF=10;TCR=11;TR=20;WE=39274077;WS=39274059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	39274415	rs425487	C	T	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=9.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQRankSum=-4.763;QD=4.31;ReadPosRankSum=-2.189;SOR=1.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,19:0.19:98
chr17	39274426	.	T	A	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=0.000;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=2.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQRankSum=-5.436;QD=2.51;ReadPosRankSum=-2.635;SOR=0.595;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,13:0.13:100
chr17	39274435	.	A	T	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.447;ClippingRankSum=0.000;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=1.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQRankSum=-5.794;QD=0.98;ReadPosRankSum=-3.298;SOR=0.491;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,10:0.10:105
chr17	39274437	.	C	T	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=0.000;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=1.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQRankSum=-5.207;QD=0.96;ReadPosRankSum=-3.453;SOR=0.730;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,9:0.09:104
chr17	39274518	rs9897031	C	T	5181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=75;PP=2965;SC=GCAGAGGTCTCGGCCACAGCC;SOR=0.899;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=171;TCF=96;TCR=75;TR=171;WE=39274526;WS=39274508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr17	39305956	rs1497383	G	A	2865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=35;PP=1723;SC=CAGCTGGGGCGGCAGCAGTTC;SOR=1.115;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=59;TCR=35;TR=94;WE=39305964;WS=39305940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr17	39333956	rs377518	T	C	531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=14;NR=7;PP=308;SC=CACAGGTGGATCATATCAAGA;SOR=1.329;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=14;TCR=7;TR=21;WE=39333964;WS=39333946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	39334133	rs389784	T	C	1637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=23;PP=1085;SC=GGGCTGGCAGTACACAGACTG;SOR=0.914;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=32;TCR=23;TR=55;WE=39334141;WS=39334123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr17	39334456	rs493514	G	A	3376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=59;PP=1897;SC=TTTCCAGGAAGGTGGGTTTGG;SOR=1.033;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=48;TCR=59;TR=107;WE=39334464;WS=39334446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr17	39340597	rs452216	G	A	3579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=73;NR=44;PP=2026;SC=ACATGGACAAGTTGATATAAA;SOR=1.136;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=117;TCF=73;TCR=44;TR=117;WE=39340605;WS=39340587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr17	39340707	rs398825	C	T	4199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=69;SC=CAGCAAGTTGCACGGCAGCAG;SOR=0.927;Source=Platypus;TCF=69;WE=39340715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr17	39340795	.	ACGGCAGCAGCTGGACATACCACAGCTGGGGTGGCAGGTGGTCTGACAGCAGAGTGGG	A	1847.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.59;QD=43.99;SOR=0.788;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr17	39340812	.	T	C	393	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=31;MMLQ=26;NF=6;NR=11;SC=CAGCTGGACATACCACAGCTG;Source=Platypus;TCF=6;TR=17;WS=39340802;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,17:0.94:18
chr17	39340826	.	T	C	183	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;FR=1.0000;HP=6;HapScore=2;MGOF=31;MMLQ=24;MQ=46.1;NF=6;NR=6;PP=183;QD=18.1476010456;SC=ACAGCTGGGGTGGCAGGTGGT;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=13;TCF=6;TCR=7;TR=12;WE=39340834;WS=39340802;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr17	39340910	rs2320231	T	C	1940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=26;NR=19;PP=743;SC=ACAGACTGGGTGGCAGCAGCT;SOR=0.846;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=26;TCR=19;TR=45;WE=39340918;WS=39340900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr17	39341158	rs452531	G	A	2621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=53;PP=1611;SC=TGAGTTTTTCGAATGTGGGAA;SOR=1.420;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=34;TCR=53;TR=87;WE=39341166;WS=39341148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr17	39341266	rs449817	A	G	374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=8;PP=193;SC=TAGATAGGCAATTATCAAGTT;SOR=1.609;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=12;WE=39341274;WS=39341256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	39341294	rs385122	T	A	124.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=4;PP=83;SC=TGTGGGAAAATATCTGTATAA;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=39341302;WS=39341284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	39346518	rs238824	T	C	5656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.26;QD=27.33;SOR=0.825;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr17	39346595	rs11283848	T	TGCTGTGGGTCCAGCTGCTGCCAGCCTA	4672.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.51;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.33;NF=7;NR=5;PP=1432;SC=CCAGCCCACCTGCTGTGGGTC;SOR=0.887;SbPval=0.02;Source=Platypus;TC=52;TCF=13;TCR=39;TR=12;WE=39346603;WS=39346585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr17	39406291	rs199605390	T	C	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=12.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.92;MQRankSum=-2.815;QD=1.28;ReadPosRankSum=-2.656;SOR=2.568;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:107,12:0.10:119
chr17	39406299	.	A	G	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.396;ClippingRankSum=0.000;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=17.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.90;MQRankSum=-2.320;QD=1.82;ReadPosRankSum=-1.591;SOR=2.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,14:0.12:118
chr17	39406343	rs148655704	A	G	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.272;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.415;NF=29;NR=16;PP=591;ReadPosRankSum=0.309;SC=TGTGGCTCCAACTGCTGCCAG;SOR=1.144;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=144;TCF=84;TCR=60;TR=45;WE=39406351;WS=39406333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,48:0.31:156
chr17	39406409	rs2191379	C	A	7444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.06;QD=33.09;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr17	39406409	.	CCAGCTGCTGTCAGCCTTT	ACAGCTGCTGCCAGCCTTC,ACAGCTGCTGTCAGCCTTT	2962	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MMLQ=17;MQ=57.09;NF=34,105;NR=34,97;PP=2150,2962;QD=32.5509981597;SC=ACCTGTGTGTCCAGCTGCTGT;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=203;TCF=105;TCR=98;TR=68,202;WE=39406435;WS=39406399;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.33:203
chr17	39406419	rs151209798	T	C	2940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FS=2.374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.80;MQRankSum=-8.308;QD=13.19;ReadPosRankSum=2.035;SOR=0.884;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:140,83:0.37:223
chr17	39406427	rs139224734	T	C	2885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FS=4.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.69;MQRankSum=-8.391;QD=13.68;ReadPosRankSum=0.564;SOR=1.049;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:133,78:0.37:211
chr17	39406447	rs3967754	A	G	2499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.834;HP=3;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=8.912;NF=45;NR=56;PP=2962;ReadPosRankSum=3.690;SC=ATCAAGTCCCAAGAGAACCAC;SOR=0.495;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=156;TCF=67;TCR=89;TR=101;WE=39406482;WS=39406437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,113:0.65:174
chr17	39406461	rs111927217	C	A	1355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.228;HP=1;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-9.183;NF=17;NR=28;PP=2131;ReadPosRankSum=-4.126;SC=GAACCACCATCCTCACACAAC;SOR=1.032;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=140;TCF=56;TCR=84;TR=45;WE=39406482;WS=39406437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,49:0.32:154
chr17	39406474	.	C	A	1029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=0.000;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=7.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.96;MQRankSum=-8.947;QD=8.58;ReadPosRankSum=-3.522;SOR=1.552;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,30:0.25:120
chr17	39406492	rs369118638	T	C	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=10.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.55;MQRankSum=-7.990;QD=4.06;ReadPosRankSum=-1.822;SOR=2.561;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,13:0.16:83
chr17	39432562	rs9893993	A	T	1485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=36;PP=993;SC=AAACCAACAAAGTGAACTTAG;SOR=1.697;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=17;TCR=36;TR=53;WE=39432570;WS=39432552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr17	39458765	rs1005197	A	G	5853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=108;NR=89;PP=2965;SC=GACAACAAGTAGATTCCGAGC;SOR=0.792;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=197;TCF=108;TCR=89;TR=197;WE=39458773;WS=39458755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr17	39459167	rs1005196	G	A	491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=14;PP=355;SC=AAAGACATCCGATACAGAGGG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=39459175;WS=39459157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	39593768	rs897416	A	G	437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=9;PP=230;SC=CAGGAGGGAGACGTGGAGCAC;SOR=1.371;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=6;TCR=9;TR=15;WE=39593776;WS=39593758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	39594809	rs2071612	C	T	2293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=27;PP=1557;SC=CCAGGATCTCCGACTGGCAGC;SOR=1.581;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=52;TCR=27;TR=79;WE=39594817;WS=39594799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr17	39594934	rs71155140	AC	A	6684.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=101;PP=2627;SC=CTGGTTCTATACCCCCCCCAC;SOR=0.837;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=125;TCF=13;TCR=112;TR=113;WE=39594943;WS=39594924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr17	39595661	rs2071611	T	A	3474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=66;PP=1909;SC=CAAGAGCCCCTCTCGGCTGCC;SOR=1.196;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=117;TCF=51;TCR=66;TR=117;WE=39595669;WS=39595651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr17	39596393	rs12601328	C	A	5914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.49;SOR=0.849;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr17	39596402	rs2071610	G	A	6063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.62;SOR=0.829;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr17	39596538	rs2071609	C	T	5299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=81;PP=2965;SC=AGCATCATGCCCTAGGCTCCT;SOR=0.780;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=172;TCF=91;TCR=81;TR=172;WE=39596546;WS=39596528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr17	39596611	rs1350046	T	C	5225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=81;PP=2965;SC=TTCTCTGAGCTTTACATGGAT;SOR=0.737;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=170;TCF=89;TCR=81;TR=170;WE=39596619;WS=39596601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr17	39616288	rs3840884	TG	T	84.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=0;PP=92;SC=GGGCTGGCCCTGCTCTTCTGG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=39616296;WS=39616283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	39616430	rs2604953	G	T	2396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=23;PP=1408;SC=ACGGTGCGGGGCACGCATGGG;SOR=1.434;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=81;TCF=58;TCR=23;TR=80;WE=39616438;WS=39616420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr17	39619093	rs2604954	GT	AC	1052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.209;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=7;PP=542;ReadPosRankSum=0.031;SC=TGCAGTCCTCGTTCTCCAGCA;SOR=0.928;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=34;TCF=22;TCR=12;TR=19;WE=39619102;WS=39619083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,26:0.62:42
chr17	39619115	rs2071563	G	A	1095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.414;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=9;PP=376;ReadPosRankSum=-0.039;SC=GCTCCGGTACGTGTTGATCTC;SOR=1.112;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=44;TCF=27;TCR=17;TR=26;WE=39619123;WS=39619105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,32:0.62:52
chr17	39619219	rs2857257	G	A	1299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.982;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=20;PP=607;ReadPosRankSum=-1.490;SC=GGGCCTCAACGTTGGTGATCA;SOR=0.382;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=78;TCF=49;TCR=29;TR=50;WE=39619227;WS=39619209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,62:0.64:97
chr17	39619388	rs4796636	C	A	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=79;ReadPosRankSum=-0.810;SC=CCAAATCTCCCTTTGATGCTG;SOR=0.399;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=7;WE=39619396;WS=39619378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr17	39620399	rs12948056	C	T	1402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.860;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=18;PP=898;ReadPosRankSum=-0.013;SC=TGATGTCTGACTGGTAGTTCT;SOR=0.940;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=84;TCF=57;TCR=27;TR=58;WE=39620407;WS=39620389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,63:0.68:93
chr17	39620565	rs72830046	C	T	1298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.824;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=26;PP=771;ReadPosRankSum=0.622;SC=CACGTCCCTGCGGTTGGCCTC;SOR=1.019;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=225;TCF=130;TCR=95;TR=71;WE=39620573;WS=39620555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,75:0.31:245
chr17	39622046	rs117928429	G	A	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=66;ReadPosRankSum=-0.370;SC=TCTTTTTGAGGCACATCAGCT;SOR=0.197;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=6;WE=39622054;WS=39622036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr17	39622068	rs2071561	G	T	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=91;ReadPosRankSum=-0.440;SC=CTCCTTCAGGGACTCAACCTG;SOR=0.368;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=9;WE=39622076;WS=39622058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,9:0.24:38
chr17	39623098	rs76526153	C	G	984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=16;PP=612;ReadPosRankSum=0.384;SC=TTCACCTCACCGCTGCCCTCA;SOR=0.656;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=65;TCF=42;TCR=23;TR=43;WE=39623106;WS=39623088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,46:0.65:71
chr17	39623363	rs3744786	T	C	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=0.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.71;ReadPosRankSum=1.193;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,31:0.32:98
chr17	39623622	rs1807434	A	C	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=272;ReadPosRankSum=0.176;SC=CTGGATGTCTACAGACCCCAT;SOR=0.669;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=68;TCF=30;TCR=38;TR=22;WE=39623630;WS=39623612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,22:0.29:76
chr17	39633317	rs2239711	A	G	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.038;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=263;ReadPosRankSum=1.117;SC=CTCAGAACCGACCCCCTGGGC;SOR=2.457;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=14;WE=39633325;WS=39633307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr17	39633349	rs2071601	G	C	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=10;PP=311;ReadPosRankSum=-0.156;SC=ATGGGGCGGGGGCTGCAGTTT;SOR=0.671;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=38;TCR=23;TR=26;WE=39633357;WS=39633339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,28:0.44:64
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chr17	39635340	rs2301352	C	T	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.114;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=239;ReadPosRankSum=-0.128;SC=ATGCTCACCCCTCCTAATGCT;SOR=0.307;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=14;WE=39635348;WS=39635330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr17	39636044	rs2011243	G	A	2600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=48;NR=39;PP=1456;SC=CTGGAGATATGAAGAAGTTAT;SOR=0.713;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=88;TCF=49;TCR=39;TR=87;WE=39636052;WS=39636034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr17	39637244	rs743686	A	G	1188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.868;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=30;PP=761;ReadPosRankSum=-0.880;SC=AGCTTGCAAGAGCTGCTGGAG;SOR=0.477;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=138;TCF=67;TCR=71;TR=62;WE=39637252;WS=39637234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,65:0.41:158
chr17	39643646	rs2301354	G	A	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.875;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=166;ReadPosRankSum=-0.475;SC=CGCGTTGACCGTACGTCTCAG;SOR=1.329;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=11;WE=39643654;WS=39643636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr17	39644057	rs2301353	G	A	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.503;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=124;ReadPosRankSum=0.806;SC=TCAATGACCTGAATTCAAACC;SOR=0.333;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=10;TCR=34;TR=12;WE=39644065;WS=39644047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,14:0.29:48
chr17	39645088	rs4796716	A	G	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=279;ReadPosRankSum=0.523;SC=CAGCCCCTTCACCATTTCCAG;SOR=0.836;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=8;TCR=26;TR=17;WE=39645096;WS=39645078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr17	39645572	rs34752082	C	A	974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=9;PP=630;ReadPosRankSum=-0.773;SC=TAAAAGCTACCGTCCCATCTG;SOR=0.572;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=42;TCF=32;TCR=10;TR=36;WE=39645580;WS=39645562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,38:0.86:44
chr17	39646021	rs1003842	A	G	822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.655;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=22;PP=472;ReadPosRankSum=-0.734;SC=AGCCCACAGAACGGATGGAGG;SOR=0.765;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=130;TCF=62;TCR=68;TR=41;WE=39646029;WS=39646011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,47:0.32:146
chr17	39659183	rs4796698	G	A	3325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=51;PP=2065;SC=TGGGAGGGCCGGGTACCTTGG;SOR=0.762;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=107;TCF=56;TCR=51;TR=107;WE=39659202;WS=39659173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr17	39659194	rs4796697	T	C	2885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=44;PP=1621;SC=GGTACCTTGGTGTGGAACCAT;SOR=0.711;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=98;TCF=54;TCR=44;TR=98;WE=39659202;WS=39659173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr17	39659529	rs7211835	T	C	3216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=36;PP=2038;SC=AGCCTGCAATTCCCGCTCACC;SOR=1.149;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=64;TCR=36;TR=100;WE=39659537;WS=39659519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr17	39659913	rs9891361	G	A	2059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=30;PP=1083;SC=GAAGTCGTCCGCAGCCAGCCT;SOR=0.850;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=37;TCR=30;TR=67;WE=39659921;WS=39659903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr17	39661689	rs8182306	G	A	2806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=45;NR=46;PP=1597;SC=CTGATCCCCCGGACACAAACC;SOR=0.994;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=45;TCR=46;TR=91;WE=39661697;WS=39661679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr17	39670912	rs897420	G	C	4865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=102;NR=68;PP=2965;SC=TTCCCTGATGGCAATGCCAGC;SOR=1.034;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=170;TCF=102;TCR=68;TR=170;WE=39670920;WS=39670902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr17	39671045	rs897421	T	C	2988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=34;NR=62;PP=1916;SC=CACCCACACATCTGACTCCTC;SOR=1.522;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=34;TCR=62;TR=96;WE=39671053;WS=39671035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr17	39671724	rs2305556	T	C	1930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.780;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=23;PP=1086;ReadPosRankSum=1.753;SC=AGGCGCCTACTTGGCATCCTG;SOR=0.923;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=90;TCF=58;TCR=32;TR=65;WE=39671732;WS=39671714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,82:0.73:112
chr17	39674540	rs3744784	A	G	2390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.589;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=37;PP=1188;ReadPosRankSum=1.282;SC=TGTACAGGGTACCAGCCACCT;SOR=0.299;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=107;TCF=64;TCR=43;TR=87;WE=39674548;WS=39674530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,102:0.79:129
chr17	39674641	rs1050784	T	C	710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.531;HP=2;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=16;PP=418;ReadPosRankSum=1.924;SC=TCTGGGCTGGTTGGGGTCTGC;SOR=0.718;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=104;TCF=53;TCR=51;TR=35;WE=39674649;WS=39674631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,41:0.36:115
chr17	39680580	rs1869719	A	C	4961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=82;NR=80;PP=2965;SC=TAGGGAACACAAAGCCCTCCC;SOR=0.871;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=163;TCF=83;TCR=80;TR=162;WE=39680588;WS=39680570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr17	39680796	rs1869720	T	A	4278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=78;PP=2472;SC=TGATTTCCTGTAAAGATACAG;SOR=0.985;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=138;TCF=60;TCR=78;TR=138;WE=39680804;WS=39680786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr17	39681475	rs4601	A	G	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=219;ReadPosRankSum=-0.102;SC=CCAGACGGGCATTGTCGATCT;SOR=0.709;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=38;TCF=26;TCR=12;TR=17;WE=39681483;WS=39681465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,19:0.44:43
chr17	39684321	rs4602	G	C	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=1.861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.69;ReadPosRankSum=-1.668;SOR=0.923;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,25:0.23:110
chr17	39684410	rs11550883	G	A	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.66;ReadPosRankSum=0.750;SOR=0.575;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,15:0.19:79
chr17	39723451	rs6503636	A	G	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.548;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.404;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.748;NF=5;NR=0;PP=90;ReadPosRankSum=-0.054;SC=TGAGACCTTGACTCTCCACCC;SOR=3.352;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=5;WE=39723459;WS=39723441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr17	39723990	rs3890472	T	A	1448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.668;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=31;PP=747;ReadPosRankSum=-0.024;SC=TTTTTCCAGCTCCGGAGGATT;SOR=0.622;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=114;TCF=59;TCR=55;TR=66;WE=39723998;WS=39723980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,72:0.58:124
chr17	39724047	rs1008753	T	C	1009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=23;PP=595;ReadPosRankSum=-0.222;SC=GCGGCCCCCATACACATATAT;SOR=0.711;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=66;TCF=27;TCR=39;TR=39;WE=39724055;WS=39724037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,45:0.61:74
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chr17	39728050	rs8070680	G	A	3030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.928;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=64;PP=1594;ReadPosRankSum=0.649;SC=AACTGCCACCGCCTCCCCTCC;SOR=0.475;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=169;TCF=78;TCR=91;TR=123;WE=39728058;WS=39728040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,138:0.73:189
chr17	39740323	rs2320456	T	C	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.51;MQRankSum=1.804;QD=25.61;ReadPosRankSum=0.122;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr17	39740325	.	T	C	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=64.81;MQRankSum=1.335;QD=37.25;ReadPosRankSum=-0.778;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr17	39742807	rs3826550	C	T	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.820;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=257;ReadPosRankSum=0.486;SC=CCCAAGCCAGCACCAAGGCCA;SOR=1.473;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=53;TCF=26;TCR=27;TR=19;WE=39742815;WS=39742797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,18:0.31:59
chr17	39742856	rs6503639	G	A	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.173;HP=1;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=7;PP=134;ReadPosRankSum=-1.545;SC=CAAAGCTGCTGCTGCTGCTGC;SOR=0.916;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=47;TCF=25;TCR=22;TR=13;WE=39742864;WS=39742839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,14:0.26:53
chr17	39742894	rs3826551	G	A	1225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.08;ReadPosRankSum=-1.690;SOR=0.819;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,32:0.68:47
chr17	39742898	rs11551758	G	A	1203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.17;ReadPosRankSum=-1.970;SOR=0.898;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,31:0.67:46
chr17	39742899	rs6503640	C	T	1760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.28;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr17	39766504	rs7406899	A	G	1775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=31;PP=1193;SC=GGAGAGAAAAAGCAGGGCAGT;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=33;TCR=31;TR=64;WE=39766512;WS=39766494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr17	39767744	rs4796681	A	G	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=18;PP=383;ReadPosRankSum=-0.639;SC=GGGCCAGTTCATGCTCATACC;SOR=0.765;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=49;TCF=19;TCR=30;TR=29;WE=39767752;WS=39767734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,30:0.59:51
chr17	39767836	rs2100509	G	A	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=6;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.473;NF=2;NR=4;PP=49;ReadPosRankSum=1.478;SC=TGGGTGGACCGCCCCACTCTT;SOR=0.148;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=6;WE=39767844;WS=39767826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr17	39768820	rs111383277	G	A	399.85	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQRankSum=2.521;QD=19.99;ReadPosRankSum=0.696;SOR=0.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,17:0.85:20
chr17	39871700	rs7220169	G	A	746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=14;PP=375;ReadPosRankSum=-0.311;SC=TGCAGCGACTGTGTGTGTATG;SOR=0.711;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=62;TCR=38;TR=36;WE=39871708;WS=39871690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,43:0.36:119
chr17	39874075	rs7213435	C	A	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=283;ReadPosRankSum=-0.074;SC=CTTCTGTATCCCCGGTGGCAA;SOR=0.638;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=58;TCF=41;TCR=17;TR=22;WE=39874083;WS=39874065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,24:0.38:64
chr17	39874137	rs7212417	G	A	1262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.994;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=19;PP=649;ReadPosRankSum=1.176;SC=TGAGTGGCTGGTGCAGGCATT;SOR=0.857;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=138;TCF=85;TCR=53;TR=54;WE=39874145;WS=39874127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,65:0.40:163
chr17	39874267	rs7218465	T	A	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.373;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=188;ReadPosRankSum=1.534;SC=TCTTAGGTCCTCGGCTGGGGC;SOR=2.257;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=51;TCF=17;TCR=34;TR=14;WE=39874275;WS=39874257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,18:0.29:63
chr17	39874283	rs11079007	T	A	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=4.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.783;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=229;ReadPosRankSum=0.817;SC=GGGGCTCTGTTATAAAAGACA;SOR=2.247;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=14;WE=39874291;WS=39874273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,17:0.35:49
chr17	39881289	rs8075017	G	C	1570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.698;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=29;PP=874;ReadPosRankSum=-0.489;SC=CCTGGGGCACGAACTCCTCCG;SOR=0.519;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=193;TCF=96;TCR=97;TR=67;WE=39881297;WS=39881279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,82:0.36:228
chr17	39881487	rs11869104	T	C	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=43;ReadPosRankSum=0.780;SC=TCCACACAGATCCTGATGGTT;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=4;WE=39881495;WS=39881477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr17	39883350	rs4523977	G	A	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.63;ReadPosRankSum=0.819;SOR=0.556;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,30:0.28:109
chr17	39883559	rs33914436	G	A	806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=21;PP=425;ReadPosRankSum=2.261;SC=CCAGAGGCACGCTGTATGGGT;SOR=0.660;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=46;TCR=52;TR=40;WE=39883567;WS=39883549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,44:0.40:110
chr17	39883595	rs7216154	T	C	645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=19;PP=346;ReadPosRankSum=0.504;SC=CAGTGGACACTGGGGGTTGCT;SOR=0.781;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=77;TCF=35;TCR=42;TR=33;WE=39883603;WS=39883585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,36:0.41:87
chr17	39883972	rs4796600	C	T	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.608;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=230;ReadPosRankSum=0.672;SC=TCTGGGCCAGCGGCTCTCCAG;SOR=1.112;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=16;WE=39883980;WS=39883962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr17	39884091	rs4796601	G	C	1518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=1.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=39;PP=831;ReadPosRankSum=-0.742;SC=GCCCCATACTGGAAGGACCCA;SOR=0.664;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=266;TCF=143;TCR=123;TR=82;WE=39884099;WS=39884081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:214,93:0.30:307
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chr17	39884419	rs4796692	C	T	1422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.509;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=32;PP=849;ReadPosRankSum=-0.247;SC=CCCATGGGGCCACGACAAGAG;SOR=0.735;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=196;TCF=109;TCR=87;TR=74;WE=39884427;WS=39884409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,81:0.37:220
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chr17	39912259	rs141010071	A	AC	137.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.607;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.726;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.776;NF=0;NR=6;PP=161;ReadPosRankSum=1.210;SC=GGTGGGCCTGACCCCTCCCCA;SOR=3.086;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=6;WE=39912267;WS=39912249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr17	39912581	rs9890858	A	G	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.10;ReadPosRankSum=0.778;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr17	39913645	rs7216034	T	C	912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.443;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=20;PP=501;ReadPosRankSum=0.398;SC=CCAACTACTGTGGTCCAACCT;SOR=0.537;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=118;TCF=75;TCR=43;TR=47;WE=39913653;WS=39913635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,50:0.36:137
chr17	39914070	rs8067890	G	T	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.447;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=21;ReadPosRankSum=0.241;SC=CAGGGGAGAGGTGGAAAGGGG;SOR=0.223;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=5;WE=39914078;WS=39914060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr17	39921125	.	C	T	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.325;ClippingRankSum=0.000;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=10;PP=400;ReadPosRankSum=0.219;SC=CTGAGCCTGGCAGCTGGGCAG;SOR=0.766;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=92;TCF=65;TCR=27;TR=33;WE=39921133;WS=39921115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,36:0.31:115
chr17	39925925	rs7405731	A	G	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.091;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=7;PP=158;ReadPosRankSum=-1.251;SC=GGTACTCCAGATCACCTGGGG;SOR=0.527;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=24;TCR=27;TR=14;WE=39925933;WS=39925915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,17:0.30:57
chr17	39959189	rs1065029	C	G	3058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=41;PP=1780;SC=CAAGCTTGAGCGGTGTGGGGT;SOR=0.927;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=55;TCR=41;TR=96;WE=39959197;WS=39959179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr17	39959511	rs3809877	C	T	1028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=2;PP=602;SC=GGCTGCATCCCCACCCCCCAA;SOR=3.611;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=27;WE=39959519;WS=39959501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr17	39977862	rs8072866	C	T	377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=2;PP=257;SC=GCCCAGACCCCGGCCTGACTA;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=39977870;WS=39977852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	39983644	rs9896766	A	C	485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=437;SC=GAGAAGAAAGACATGAAGAGA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=39983652;WS=39983634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	39983808	rs1046404	G	C	4585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=62;PP=2678;SC=GAAGTAACCAGAGTTCTCACA;SOR=0.794;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=78;TCR=62;TR=140;WE=39983828;WS=39983798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr17	39983820	rs1046403	G	A	4836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=73;PP=2642;SC=GTTCTCACACGCAGAGCTGTT;SOR=0.715;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=153;TCF=80;TCR=73;TR=153;WE=39983828;WS=39983798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr17	39983849	rs1128966	G	C	4988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=79;NR=77;PP=2854;SC=ATGTGTGTATGAGCTGGCCCT;SOR=0.760;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=156;TCF=79;TCR=77;TR=156;WE=39983857;WS=39983839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr17	39987130	rs4796712	T	C	6085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=124;PP=2965;SC=GGAGATTGTGTGCTTTGGTCC;SOR=1.349;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=203;TCF=79;TCR=124;TR=203;WE=39987138;WS=39987120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr17	39988601	rs7208062	C	T	1033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=25;NR=7;PP=660;SC=CAGCCTACTCCATCTCAAGGG;SOR=2.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=32;WE=39988609;WS=39988591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr17	39991790	rs1319763	C	T	2125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=15;PP=1206;SC=TATCAGGTCCCTCCTAAGAGA;SOR=1.673;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=46;TCR=15;TR=61;WE=39991798;WS=39991780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr17	39991867	rs3039772	A	ATATC	6556.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=20;NR=45;PP=2918;SC=GGGGAGGATAAGGCCCTAGGT;SOR=0.764;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=71;TCF=22;TCR=49;TR=65;WE=39991875;WS=39991857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr17	39991988	rs1865841	G	A	2526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=47;PP=1570;SC=TCAAGCTCCCGGCCATTTCTT;SOR=1.230;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=33;TCR=47;TR=80;WE=39991996;WS=39991978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr17	39998141	rs1529933	C	T	5631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=98;NR=83;PP=2965;SC=GCATTTCTCCCGACATGATGA;SOR=0.743;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=181;TCF=98;TCR=83;TR=181;WE=39998149;WS=39998131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr17	40001580	rs61752339	T	C	1303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.994;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=35;PP=845;ReadPosRankSum=0.262;SC=CTCTTTGCAATTGGTGGCTGG;SOR=0.772;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=190;TCF=104;TCR=86;TR=67;WE=40001588;WS=40001570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,72:0.33:215
chr17	40003421	rs4796721	C	T	308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=1;PP=268;SC=ACTGTACAGACTGGAATTAAG;SOR=3.442;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=12;WE=40003429;WS=40003411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	40003762	rs370591937	CT	C	79.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.47;ReadPosRankSum=0.873;SOR=0.665;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr17	40009955	rs17498875	C	T	757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.362;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=7;PP=426;ReadPosRankSum=0.510;SC=CTTCACGAAACGGGTGTAACA;SOR=1.204;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=51;TCF=36;TCR=15;TR=29;WE=40009963;WS=40009945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,35:0.59:59
chr17	40010979	rs3744782	G	A	7489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=124;NR=123;PP=2965;SC=CATCAACAAAGTATCCCACAC;SOR=0.729;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=247;TCF=124;TCR=123;TR=247;WE=40010987;WS=40010969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,279:1.00:279
chr17	40024023	rs7217218	A	T	1542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=11;PP=806;SC=GGGGGAAGAGATCTTGTCTTC;SOR=1.528;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=37;TCR=11;TR=48;WE=40024031;WS=40024013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr17	40024869	rs12946315	G	A	340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.40;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	40024895	rs8079008	A	G	1246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=9;PP=1266;SC=CAACCCCATGAGTAAGTGGTG;SOR=3.312;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=40;TCR=9;TR=49;WE=40024903;WS=40024885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr17	40025264	rs9912300	G	T	6379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=137;NR=75;PP=2965;SC=ATCAACAAACGTAATGAAGAA;SOR=1.238;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=213;TCF=137;TCR=76;TR=212;WE=40025272;WS=40025254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr17	40025285	rs9914829	A	G	8177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=156;NR=113;PP=2965;SC=GAAAACAGCTACAATGCTCAC;SOR=0.948;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=269;TCF=156;TCR=113;TR=269;WE=40025293;WS=40025275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,296:1.00:296
chr17	40025453	rs3744779	T	C	1499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=38;PP=1135;SC=CTGTCACTACTATTACTACGA;SOR=3.912;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=4;TCR=39;TR=42;WE=40025461;WS=40025443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr17	40025670	rs3744780	G	A	313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=2;PP=186;SC=CGTGGCTCCTGTTTCCTCCAA;SOR=1.981;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=40025678;WS=40025660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	40027869	rs1808787	A	T	885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=5;PP=520;SC=TGGCCTCCCAAAGTGCTGTGA;SOR=2.165;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=27;WE=40027877;WS=40027859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	40028450	rs8071627	A	T	5271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=95;PP=2965;SC=AGTGGGGGGAACAAAGGCCAG;SOR=1.139;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=170;TCF=74;TCR=96;TR=169;WE=40028458;WS=40028440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr17	40028541	rs8071753	A	G	1179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=31;PP=873;SC=GTAACTACCAATCCAAGTCTA;SOR=3.202;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=36;WE=40028549;WS=40028531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr17	40028568	rs8071234	C	G	635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=16;PP=451;SC=CCACACAACTCTAAGGCAAAA;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=40028576;WS=40028558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	40048613	rs8065502	A	G	3217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=68;NR=34;PP=1762;SC=CTACCTCCGGATGCTTCCTCA;SOR=1.198;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=68;TCR=34;TR=102;WE=40048621;WS=40048603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr17	40049171	rs4796735	G	A	384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.05;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	40049473	rs4796736	A	G	1645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=34;PP=1035;ReadPosRankSum=1.888;SC=ACATACCCCCAGGAGACCTGC;SOR=0.646;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=55;TCF=20;TCR=35;TR=54;WE=40049481;WS=40049463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,59:0.98:60
chr17	40053021	rs11652326	T	C	826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=21;PP=600;SC=AAAGCCCTCATCATCCCTCTC;SOR=2.468;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=27;WE=40053029;WS=40053011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	40058204	rs3816121	C	A	1973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.86;SOR=2.409;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	40058212	rs3816122	G	A	1939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.09;SOR=2.409;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	40068613	rs2304499	G	A	480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=2;PP=379;SC=TGCTGACCTGGAGGTGACCAT;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=40068621;WS=40068603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	40086986	rs34516580	C	T	2555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=57;PP=1545;ReadPosRankSum=0.070;SC=CATGTCGGACCCCGAAGGCGA;SOR=0.871;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=175;TCF=90;TCR=85;TR=110;WE=40086994;WS=40086976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,120:0.61:198
chr17	40105401	rs77012779	T	TATG	6643.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=40;PP=2924;SC=AAGTCTGACTTATGAACACAA;SOR=1.067;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=31;TCR=46;TR=67;WE=40105409;WS=40105391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr17	40118807	rs4432296	C	T	241.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=7;NR=1;PP=141;SC=GGGCTCGGGTCGTGCCACCGC;SOR=2.093;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=40118815;WS=40118797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	40123829	rs12602950	G	A	1522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=5;PP=1059;SC=AGTGTTTTGCGCTGGGCCTCG;SOR=4.047;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=39;TCR=5;TR=44;WE=40123837;WS=40123819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr17	40125864	rs2070106	G	A	2356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.629;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=41;PP=1095;ReadPosRankSum=-0.092;SC=TCTTCACGGGGTACTACGGGA;SOR=0.634;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=134;TCF=68;TCR=66;TR=87;WE=40125872;WS=40125854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,105:0.68:155
chr17	40139967	.	G	C	1965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.310;ClippingRankSum=0.000;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.817;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=47;PP=1248;ReadPosRankSum=1.863;SC=CACACCTTTGGTGACTGAGGG;SOR=0.925;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=137;TCF=63;TCR=74;TR=80;WE=40139975;WS=40139957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,90:0.57:159
chr17	40146970	rs6503679	G	A	2167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=41;PP=1276;SC=GAACTGCACCGGAAAATCAGA;SOR=1.810;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=19;TCR=41;TR=60;WE=40146978;WS=40146960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr17	40152431	rs374909941	CT	C	75.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=0;PP=77;SC=GCCACCAGGACTTGGCAGCTA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=40152439;WS=40152421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	40169519	rs4796758	G	T	1008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=24;PP=701;SC=CCGCGGCGCCGCGCCCAGAAG;SOR=4.047;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=28;WE=40169527;WS=40169509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	40173851	rs9894001	A	C	6278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=106;PP=2965;SC=CTGAACAAATACGGAGGGAGA;SOR=0.965;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=201;TCF=95;TCR=106;TR=201;WE=40173859;WS=40173841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr17	40174305	rs35557548	T	C	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.465;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=309;ReadPosRankSum=-0.336;SC=TTCTCTGGCCTCCTCAGCCCC;SOR=1.863;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=15;WE=40174313;WS=40174295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr17	40186128	rs4277396	C	A	304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=1;PP=196;SC=TGGAAAATACCGACCACAGCC;SOR=2.494;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=40186136;WS=40186118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	40215180	rs4796765	A	G	1312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=28;PP=790;SC=TGTATCCTCTATATCCCTCTG;SOR=2.110;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=40;WE=40215188;WS=40215170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr17	40256498	rs2074159	G	C	567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.47;ReadPosRankSum=-0.865;SOR=0.665;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,31:0.46:67
chr17	40257163	rs2074158	T	C	794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.785;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=22;PP=413;ReadPosRankSum=1.443;SC=TTGGAACTTCTGGATCACTTC;SOR=0.553;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=88;TCF=35;TCR=53;TR=38;WE=40257171;WS=40257153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,42:0.42:99
chr17	40259980	rs2074154	A	T	1521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.528;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=27;PP=952;ReadPosRankSum=1.349;SC=CGCCTCCGCCAGAAGGGCTGC;SOR=0.773;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=192;TCF=117;TCR=75;TR=74;WE=40259991;WS=40259970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,80:0.38:211
chr17	40263458	rs34891485	T	C	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FS=6.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.69;ReadPosRankSum=-0.228;SOR=1.012;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,34:0.23:151
chr17	40270040	rs146062629	G	GGA	777.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=712;ReadPosRankSum=3.184;SC=CTGAAGCTGAGGAGAGAGAGA;SOR=0.616;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=43;TCF=3;TCR=40;TR=13;WE=40270061;WS=40270030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,22:0.38:58
chr17	40270053	rs35478347	C	A	783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=692;ReadPosRankSum=2.009;SC=GAGAGAGAGACGTCAGGGATG;SOR=0.582;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=48;TCF=16;TCR=32;TR=12;WE=40270061;WS=40270030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,22:0.37:59
chr17	40270081	rs12952244	A	G	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.630;HP=3;HapScore=3;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=123;ReadPosRankSum=-1.575;SC=GAAGCTGAGGAGAGAGAGAGA;SOR=0.343;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=27;TCF=9;TCR=18;TR=8;WE=40270089;WS=40270069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr17	40270119	.	GGAGA	G	51	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=2;NR=3;PP=51;QD=13.8;SC=CTGAAGCTGAGGAGAGAGAGA;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=5;WE=40270130;WS=40270109;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr17	40270238	rs2074164	G	C	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=337;ReadPosRankSum=1.468;SC=TCCGGCCCAGGTGAGCTCTCT;SOR=0.318;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=20;WE=40270246;WS=40270228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,20:0.44:45
chr17	40271757	rs730086	G	A	1138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=25;PP=725;SC=GTGGGTGGGGGATAAAACCAG;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=11;TCR=25;TR=36;WE=40271765;WS=40271747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr17	40271970	rs8072215	A	G	379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=10;NR=2;PP=265;SC=GCTTGAGGAGAATGGAGAACA;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=40271978;WS=40271960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	40272406	rs35184688	G	C	5330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=90;PP=2965;SC=ACAGATGGCAGAGTTAGGAAA;SOR=0.958;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=169;TCF=78;TCR=91;TR=167;WE=40272414;WS=40272396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr17	40272594	rs2285657	C	A	633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.528;HP=8;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=529;ReadPosRankSum=1.602;SC=TGGTGCACACCCCCCCCCAAC;SOR=2.030;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=27;WE=40272602;WS=40272584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,24:0.96:25
chr17	40274873	rs1122326	A	C	1034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=7;PP=685;SC=ACTCGGATGCAGAGAGTCGGT;SOR=2.649;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=33;WE=40274881;WS=40274863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr17	40278081	rs2240010	T	A	272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=6;PP=139;SC=TGCGGCAAAGTAAGGTTAAAT;SOR=2.303;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=40278089;WS=40278071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	40280291	rs2230326	G	A	3057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=38;PP=1843;SC=GGAATTCCACGGCTCTCTTGC;SOR=1.199;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=68;TCR=38;TR=106;WE=40280299;WS=40280281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr17	40280944	rs739637	G	C	590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=14;PP=390;SC=GAACCCTCAAGCCAGGAGCCA;SOR=2.531;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=18;WE=40280952;WS=40280934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	40359505	.	GCACACACA	G	525.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.760;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=12.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.43;MQRankSum=-1.119;QD=11.95;ReadPosRankSum=0.267;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,17:0.39:44
chr17	40462796	.	TTG	T	106.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=1.011;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.317;HP=1;HapScore=3;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=189;ReadPosRankSum=0.326;SC=ATGCATGTGCTTGTGTGTGTG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=6;WE=40462805;WS=40462786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr17	40476667	rs17881940	C	G	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.018;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.48;ReadPosRankSum=-0.316;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr17	40481529	rs2293152	G	C	3905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=42;PP=2126;SC=AGCCCTCTCCGGCAGCCAGAG;SOR=1.276;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=85;TCR=42;TR=127;WE=40481537;WS=40481519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr17	40490539	.	T	G	214	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=28;MQ=55.95;NF=8;NR=0;PP=214;QD=31.0964015684;SC=GAATACTCCTTGACCTGAGGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=40490547;WS=40490532;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	40497828	rs12601611	C	T	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=3;PP=53;SC=TGAAGGCTCTCTGTCGGCGGG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=40497836;WS=40497818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	40500265	rs2306581	C	A	317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=1;PP=275;SC=AAAGGGTGCCCCTTTATCTCC;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=40500273;WS=40500255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	40619937	rs4796668	A	G	504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=0;PP=404;SC=ACTTTTTGTAACCAGGTCTTA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=40619945;WS=40619928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	40642452	rs9899168	T	C	3498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=39;PP=2040;SC=GTGTAACCACTACCACAATTA;SOR=1.196;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=66;TCR=39;TR=105;WE=40642460;WS=40642442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr17	40646803	rs11651671	G	A	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=423;ReadPosRankSum=-0.350;SC=AAGTTATTGCGGTTTTGGCTG;SOR=0.904;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=21;WE=40646811;WS=40646793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,21:0.66:32
chr17	40647486	.	C	A	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.86;ReadPosRankSum=0.282;SOR=0.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,2:0.22:9
chr17	40647488	.	C	G	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.86;ReadPosRankSum=0.282;SOR=0.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,2:0.22:9
chr17	40651117	rs77920152	TA	T	1350.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.906;NF=1;NR=23;PP=742;ReadPosRankSum=-2.127;SC=TGCTTTTGTGTAAAGAAATCA;SOR=0.635;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=79;TCF=8;TCR=71;TR=24;WE=40651125;WS=40651107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,51:0.36:142
chr17	40672739	rs8067384	G	A	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.59;ReadPosRankSum=-0.444;SOR=0.024;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
chr17	40689455	rs659497	T	C	5172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=90;NR=77;PP=2856;SC=AAAGCTACTCTTTCGTGTGGT;SOR=0.734;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=167;TCF=90;TCR=77;TR=167;WE=40689463;WS=40689445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr17	40689613	rs2071046	G	C	719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=18;PP=534;SC=GGGAGCCACCGTAGGTGTTTT;SOR=2.925;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=23;WE=40689621;WS=40689603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	40690261	rs2676533	A	G	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=1.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.96;ReadPosRankSum=-0.243;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,9:0.29:31
chr17	40696233	rs86312	C	G	3638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=60;PP=2203;SC=ATATTACCCCCGCTGGGTGGC;SOR=0.784;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=63;TCR=60;TR=123;WE=40696241;WS=40696223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr17	40699291	rs607740	G	A	2720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=46;NR=39;PP=1429;SC=CGCAGTGTGTGACACAGGCCT;SOR=0.773;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=46;TCR=39;TR=85;WE=40699299;WS=40699281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr17	40699332	rs607795	T	C	3001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=61;NR=40;PP=1448;SC=GGGAGGACGCTGTGGCCTCTG;SOR=0.763;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=102;TCF=61;TCR=41;TR=101;WE=40699340;WS=40699322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr17	40699475	rs67843205	G	GC	735.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=14;PP=624;SC=CAGGGACCGGGCCCGGAGCTC;SOR=2.030;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=16;WE=40699483;WS=40699465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	40700448	rs2854973	C	G	1551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=26;PP=1059;SC=GCGCGCAGCCCGGGCCAGAGC;SOR=0.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=26;TCR=26;TR=52;WE=40700456;WS=40700438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr17	40705100	rs597255	C	T	3907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=56;PP=2256;SC=CCTTGGAGGCCAGAAGGGAAG;SOR=0.735;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=124;TCF=68;TCR=56;TR=124;WE=40705108;WS=40705090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr17	40705955	rs2676530	C	T	6125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=422;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.551;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=118;NR=128;PP=2962;ReadPosRankSum=0.341;SC=GACCTAGAGACGCCGAGCACC;SOR=0.759;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=374;TCF=184;TCR=190;TR=246;WE=40705963;WS=40705945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,279:0.66:421
chr17	40706906	rs605059	G	A	1264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=33;PP=930;SC=GGCCGGGCGCGGTGCGGTGGG;SOR=2.636;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=44;TCF=10;TCR=34;TR=42;WE=40706914;WS=40706896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	40714804	rs615942	C	A	4392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=92;NR=64;PP=2704;SC=CAGCCCCAGTCCAGCCCCGTG;SOR=1.040;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=157;TCF=93;TCR=64;TR=156;WE=40714812;WS=40714794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr17	40716235	rs668799	C	T	769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.465;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=16;PP=412;ReadPosRankSum=-1.105;SC=GGATGGGGGACGGGGAAGGCC;SOR=0.691;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=117;TCF=64;TCR=53;TR=38;WE=40716243;WS=40716225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,44:0.33:135
chr17	40716520	rs598126	A	G	4349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=70;PP=2649;SC=TCAGACATACAGAGAATGAAG;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=74;TCR=70;TR=144;WE=40716528;WS=40716510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr17	40720605	rs646174	G	A	3176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=50;NR=61;PP=1931;SC=CCCCGACCTCGGGGGGCTCAG;SOR=1.052;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=50;TCR=61;TR=111;WE=40720613;WS=40720581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr17	40720632	rs646123	G	A	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.33;ReadPosRankSum=0.496;SOR=0.632;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,17:0.20:84
chr17	40721042	rs650558	C	T	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.705;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=137;ReadPosRankSum=0.471;SC=CCCACTCAGACAGTCCCAGGC;SOR=0.321;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=11;WE=40721050;WS=40721032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr17	40721360	rs632758	C	A	5779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=99;NR=85;PP=2965;SC=TGGAGCCAAGCGGGGCTGTGA;SOR=0.753;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=184;TCF=99;TCR=85;TR=184;WE=40721368;WS=40721350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr17	40722029	rs665268	A	G	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=0.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.97;ReadPosRankSum=0.004;SOR=0.801;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,22:0.21:106
chr17	40725656	rs2292752	G	C	2041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=38;PP=1270;SC=AACCACATCCGCCTGGGGTCA;SOR=1.091;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=31;TCR=38;TR=69;WE=40725664;WS=40725646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr17	40734987	rs35747013	AT	A	70.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.84;ReadPosRankSum=1.345;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr17	40735469	rs1517002	T	G	2812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=60;NR=37;PP=1656;SC=GGTTAAAAGGTAGCTAAAGAA;SOR=1.015;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=61;TCR=37;TR=97;WE=40735477;WS=40735459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr17	40735641	rs10454087	C	T	432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.73;ReadPosRankSum=-0.758;SOR=0.730;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,29:0.25:116
chr17	40737043	rs9889580	G	C	1084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=7;PP=798;SC=AACTACCCCCGACTTCCACTT;SOR=2.554;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=35;WE=40737051;WS=40737033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr17	40766546	rs1045710	C	G	1789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=34;NR=13;PP=1386;SC=TCCGGGAACGCAAGTTGGCCA;SOR=2.049;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=34;TCR=13;TR=47;WE=40766554;WS=40766536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr17	40811781	rs2292750	C	T	6659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=118;NR=94;PP=2965;SC=TCGTGTCAGCCTCTGAGACTA;SOR=0.875;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=212;TCF=118;TCR=94;TR=212;WE=40811789;WS=40811771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr17	40811919	rs525911	A	G	3228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=72;PP=2061;SC=TCGTGGAGGAATTCGCCACCG;SOR=1.650;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=110;TCF=38;TCR=72;TR=110;WE=40811927;WS=40811909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr17	40817990	rs7225374	G	A	790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=18;PP=550;SC=CAGAGCGGGCGACTTTCTTGC;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=9;TCR=18;TR=27;WE=40817998;WS=40817980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	40818451	rs1554227	G	A	7581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=154;NR=109;PP=2965;SC=ACCTGCCCTCGGCCCACCGGG;SOR=1.150;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=278;TCF=161;TCR=117;TR=263;WE=40818459;WS=40818441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,277:1.00:277
chr17	40818584	rs2292749	C	T	1796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=350;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.424;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=54;PP=1195;ReadPosRankSum=-0.483;SC=ACTCCTAACCCCCTGGCTCGC;SOR=0.730;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=321;TCF=147;TCR=174;TR=97;WE=40818592;WS=40818574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:245,105:0.30:350
chr17	40818699	rs1046097	A	G	7125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=128;NR=118;PP=2965;SC=TAAGGAGGACATGTTCAAGGA;SOR=0.801;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=247;TCF=128;TCR=119;TR=246;WE=40818707;WS=40818689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,272:1.00:272
chr17	40822308	rs8071056	C	A	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.57;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	40826525	rs35595844	AAGG	A	457.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=453;SC=GGGATTGAGGAAGGAGGAGTC;SOR=3.442;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=10;WE=40826535;WS=40826515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	40835819	rs36108420	A	AT	4428.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=28;NR=31;PP=2683;SC=GCTGACTAACAGTCGGTTTCC;SOR=1.445;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=61;TCF=28;TCR=33;TR=59;WE=40835827;WS=40835809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr17	40835922	rs2271029	A	C	4524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=67;PP=2439;SC=TACTGCGCCGAGATTCGCCAG;SOR=0.767;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=143;TCF=76;TCR=67;TR=143;WE=40835930;WS=40835912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr17	40836975	rs9889373	A	G	2111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=18;PP=1290;SC=AGCAGAGGGCAGGACGTGGTT;SOR=1.788;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=76;TCF=58;TCR=18;TR=75;WE=40836983;WS=40836965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr17	40841397	rs2271028	C	T	523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=1;PP=353;SC=CCTGCATCTGCGCTTATACCC;SOR=3.500;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=40841405;WS=40841387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	40842084	rs3760386	G	A	3620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=45;PP=2163;SC=AACTGCCTTTGTCTCAACCTA;SOR=1.112;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=81;TCR=46;TR=125;WE=40842092;WS=40842074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr17	40849842	rs1553468	A	G	5249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=82;PP=2965;SC=CACAGAGGACAGAAGGGAGGG;SOR=0.746;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=169;TCF=87;TCR=82;TR=169;WE=40849850;WS=40849832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr17	40850552	.	CGTGT	C	61	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=30;MMLQ=18;MQ=60.0;NF=0;NR=1;PP=61;QD=64.0;SC=TCAAAGAGTGCGTGTGTGTGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=1;WE=40850563;WS=40850542;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,1:0.12:8
chr17	40854534	rs3841620	G	GT	2674.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=21;NR=17;PP=1703;SC=AAGTGCTGCCGTGGGGCCTGG;SOR=1.547;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=39;TCF=21;TCR=18;TR=38;WE=40854542;WS=40854524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr17	40874643	rs11298431	CA	C	34.94	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=6.99;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	40880759	rs368020600	CA	C	77.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=4.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.70;ReadPosRankSum=2.088;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr17	40986454	.	GGA	G	573.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.492;ClippingRankSum=0.000;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.882;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=1.347;NF=9;NR=9;PP=541;ReadPosRankSum=-0.879;SC=GGAGATACCTGGAGAGAGAGA;SOR=1.329;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=68;TCF=24;TCR=44;TR=18;WE=40986467;WS=40986444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,27:0.36:74
chr17	40990587	rs139362124	G	A	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=81;ReadPosRankSum=2.369;SC=CACCCGCTTCGGGGTCCCAAA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=5;WE=40990595;WS=40990580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr17	41046440	rs324079	T	G	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=88;ReadPosRankSum=-1.294;SC=CCCTACCTGCTCAGTTCAAGG;SOR=1.688;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=7;WE=41046448;WS=41046430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr17	41046727	rs74933984	G	A	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=355;ReadPosRankSum=-1.112;SC=TTTGCACTTTGGGCTGTAGCC;SOR=0.368;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=17;WE=41046735;WS=41046717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr17	41063466	rs2229611	T	C	660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=4.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=521;ReadPosRankSum=0.112;SC=CTTCGGTGTTTAAAGTCAACA;SOR=0.741;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=22;WE=41063474;WS=41063456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,23:0.62:37
chr17	41103938	rs534720	T	C	3534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=63;NR=43;PP=1659;SC=GGAGATAAGCTCTGATACTGA;SOR=0.708;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=63;TCR=43;TR=106;WE=41103946;WS=41103928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr17	41113131	rs35166621	CA	C	105.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.763;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.81;ReadPosRankSum=0.547;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr17	41113543	rs2670865	C	G	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=2;PP=25;SC=CAGTCCTTTTCATTCTAAACA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=41113551;WS=41113533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr17	41116234	rs690941	G	A	6665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=118;PP=2965;SC=CGGGACAGCAGGAGACCACGG;SOR=0.974;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=218;TCF=100;TCR=118;TR=218;WE=41116242;WS=41116224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr17	41116291	rs11278824	CAGCCCT	C	3753.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=47;PP=2980;SC=GCCCCGACCCCAGCCCTAGCC;SOR=1.556;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=72;TCF=10;TCR=62;TR=56;WE=41116304;WS=41116268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr17	41116565	rs690971	G	T	3497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=63;NR=57;PP=1879;SC=AAGCAGGAGGGTAAGGAATGG;SOR=0.737;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=121;TCF=64;TCR=57;TR=120;WE=41116573;WS=41116555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr17	41116723	rs690979	G	A	397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=11;PP=301;SC=CAAGGCACGTGGTTTAGTGAG;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=41116731;WS=41116713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	41121207	rs373590793	GGGGC	G	247.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=2.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.88;MQRankSum=-1.087;QD=2.08;ReadPosRankSum=-1.527;SOR=1.101;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,27:0.23:119
chr17	41121210	rs113173233	GC	G	1450.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.456;HP=4;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.108;NF=13;NR=60;PP=1531;ReadPosRankSum=1.409;SC=CATCCTGGGGGCGGGGGGGAA;SOR=0.465;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=75;TCF=15;TCR=60;TR=73;WE=41121226;WS=41121198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,74:0.63:118
chr17	41121217	rs7217553	G	A	1964.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=2.667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.52;MQRankSum=1.243;QD=16.10;ReadPosRankSum=1.211;SOR=0.475;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,89:0.73:122
chr17	41121217	.	GG	AA,AG	2097	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000,0.5000;HP=6;HapScore=1;MGOF=16;MMLQ=17;MQ=60.4;NF=12,55;NR=13,59;PP=464,2097;QD=20.6987149945;SC=GGGGCGGGGGGGAAAAAAGAC;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=122;TCF=60;TCR=62;TR=25,114;WE=41121226;WS=41121198;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.20:122
chr17	41121218	.	G	GAA	452.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.314;ClippingRankSum=0.000;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=3.861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.35;MQRankSum=-1.179;QD=3.74;ReadPosRankSum=-0.787;SOR=1.015;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,31:0.26:121
chr17	41121263	rs4793187	G	A	1146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.090;HP=4;HapScore=1;MGOF=48;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.977;NF=21;NR=36;PP=926;ReadPosRankSum=-2.144;SC=AGGAACATTTGTGTTAACAAA;SOR=0.986;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=77;TCF=31;TCR=46;TR=57;WE=41121271;WS=41121253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,51:0.69:74
chr17	41122443	rs2670866	T	C	3252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=59;PP=1725;SC=GAAGAATGGTTGCAGCCAGAA;SOR=0.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=111;TCF=52;TCR=59;TR=111;WE=41122451;WS=41122433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr17	41132578	rs692074	T	C	300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=3;PP=201;SC=TGACGTGCGGTGGTGTTTCCG;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=12;WE=41132586;WS=41132568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	41133071	rs1708875	T	C	4118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=78;NR=64;PP=2304;SC=GGACCGGCCATGGTTGCGGGG;SOR=0.706;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=142;TCF=78;TCR=64;TR=142;WE=41133079;WS=41133061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr17	41133242	rs550285	G	A	2592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=52;PP=1599;SC=TGGAGTGCGGGGCCGGCTGAA;SOR=1.414;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=33;TCR=52;TR=85;WE=41133250;WS=41133232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr17	41150949	rs2271539	G	A	1310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.551;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=29;PP=706;ReadPosRankSum=0.267;SC=TGGGGCAGTAGCCAGTGAGCA;SOR=0.323;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=79;TCF=36;TCR=43;TR=56;WE=41150957;WS=41150939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,61:0.69:88
chr17	41150983	rs691954	T	C	1375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=17;NR=30;PP=872;SC=CGTGGGAGAGTTTTTGAGAGA;SOR=1.436;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=17;TCR=30;TR=47;WE=41150991;WS=41150973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr17	41154817	rs11871636	A	C	1220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=22;PP=554;ReadPosRankSum=-1.915;SC=AGGCTTTGGTAGTGAATGGTG;SOR=0.741;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=80;TCF=42;TCR=38;TR=47;WE=41154825;WS=41154807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,59:0.61:96
chr17	41158876	.	G	C	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.886;ClippingRankSum=0.000;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=337;ReadPosRankSum=0.338;SC=CAGCCCTTTGGGGGGTACAAA;SOR=0.658;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=83;TCF=60;TCR=23;TR=26;WE=41158884;WS=41158866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,35:0.34:102
chr17	41164126	rs692651	A	C	419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=3;PP=307;SC=AATAGGCCCCACTTCCCCTGG;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=41164134;WS=41164116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	41165493	rs588703	A	G	4721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=80;NR=80;PP=2965;SC=CTCCCCCTAGATGTCCAGCCA;SOR=0.803;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=160;TCF=80;TCR=80;TR=160;WE=41165501;WS=41165483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr17	41165734	rs443759	C	T	2198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.315;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=39;PP=1162;ReadPosRankSum=-0.487;SC=TGCAAGATTACGGTGCAGGGA;SOR=0.764;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=128;TCF=71;TCR=57;TR=85;WE=41165742;WS=41165724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,101:0.65:156
chr17	41165878	rs13229	C	T	2313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=38;PP=1237;SC=CGTATGTGAACGGGGAGATCC;SOR=0.972;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=38;TCR=38;TR=76;WE=41165886;WS=41165868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr17	41167957	rs455055	C	A	1397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.974;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=16;PP=859;ReadPosRankSum=-2.248;SC=ACCACAGAGACCTTCGGGGGA;SOR=1.015;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=81;TCF=56;TCR=25;TR=54;WE=41167965;WS=41167947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,60:0.67:89
chr17	41170898	rs429464	T	C	733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.202;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=18;PP=506;ReadPosRankSum=0.274;SC=GGTACAAGGCTACCTTCTTCC;SOR=0.960;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=44;TCF=19;TCR=25;TR=30;WE=41170906;WS=41170888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,32:0.68:47
chr17	41170943	rs55845054	GTAA	G	548.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=562;SC=AATAGTCATGGTAATAATAAT;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=12;WE=41170953;WS=41170933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	41174025	rs2070835	A	C	478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.84;ReadPosRankSum=1.565;SOR=0.680;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,24:0.34:70
chr17	41180772	rs12944458	C	T	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.920;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.16;ReadPosRankSum=-0.019;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr17	41215825	rs3092994	C	T	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.14;ReadPosRankSum=-0.666;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,5:0.19:26
chr17	41219560	rs8176235	C	T	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.02;ReadPosRankSum=0.313;SOR=0.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,19:0.22:85
chr17	41223094	rs1799966	T	C	1475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.961;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=33;PP=953;ReadPosRankSum=-3.307;SC=GCAGCTGGACTCTGGGCAGAT;SOR=0.536;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=154;TCF=74;TCR=80;TR=66;WE=41223102;WS=41223084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,70:0.42:165
chr17	41226601	rs273900734	G	C	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.85;ReadPosRankSum=-0.722;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,5:0.24:21
chr17	41234304	rs3737559	C	T	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.764;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=70;ReadPosRankSum=-0.696;SC=CCATAATTACCCATGTGCTGA;SOR=0.180;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=7;WE=41234312;WS=41234294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr17	41234470	rs1060915	A	G	1395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.054;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=30;PP=914;ReadPosRankSum=-0.756;SC=CAAGGGCAGAAGAGTCACTTA;SOR=0.741;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=221;TCF=120;TCR=101;TR=68;WE=41234478;WS=41234460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,77:0.31:252
chr17	41244000	rs16942	T	C	1322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.553;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=31;PP=833;ReadPosRankSum=0.651;SC=AAGCTCTCCTTTCTGGACGCT;SOR=0.637;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=182;TCF=82;TCR=100;TR=58;WE=41244008;WS=41243990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,65:0.33:199
chr17	41244435	rs16941	T	C	1021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=25;PP=715;ReadPosRankSum=-1.676;SC=TGAGCTGGCTTCTTTAAAAAC;SOR=0.684;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=146;TCF=71;TCR=75;TR=46;WE=41244443;WS=41244425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,53:0.32:166
chr17	41244936	rs799917	G	A	1485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FS=2.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.70;ReadPosRankSum=-0.971;SOR=0.570;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:229,87:0.28:316
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chr17	41245466	rs1799949	G	A	1619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=34;PP=836;ReadPosRankSum=-1.547;SC=GGAAAGTATCGCTGTCATGTC;SOR=0.710;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=195;TCF=106;TCR=89;TR=75;WE=41245474;WS=41245456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,86:0.39:222
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chr17	41291953	rs11657835	C	G	1202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.937;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=32;PP=810;ReadPosRankSum=-0.825;SC=GTTCCTGACACAAGGATTCCT;SOR=0.884;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=158;TCF=80;TCR=78;TR=61;WE=41291961;WS=41291943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,64:0.36:180
chr17	41296197	rs35170910	A	G	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-2.949;NF=10;NR=4;PP=136;ReadPosRankSum=0.759;SC=CCGAGATTGCACCACTGCACT;SOR=0.737;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=40;TCF=28;TCR=12;TR=14;WE=41296205;WS=41296187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,15:0.33:46
chr17	41296379	rs189325621	G	C	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=322;ReadPosRankSum=0.309;SC=TAGGCCCAGTGATCCTATGAG;SOR=1.292;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=14;WE=41296387;WS=41296369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr17	41327621	rs2271573	A	G	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=3.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=41;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.330;NF=12;NR=0;PP=262;ReadPosRankSum=-1.935;SC=TCCTGAAACAATTCCTATTTA;SOR=0.622;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=12;WE=41327629;WS=41327611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr17	41327648	rs2271574	T	C	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.948;HP=2;HapScore=4;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-1.095;NF=12;NR=3;PP=819;ReadPosRankSum=0.460;SC=ATGGTAAGTTTCGTAAGAACA;SOR=0.180;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=43;TCF=38;TCR=5;TR=15;WE=41327658;WS=41327638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,18:0.38:47
chr17	41327650	rs3215228	G	GT	659.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.456;HP=1;HapScore=4;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.089;NF=30;NR=9;PP=828;ReadPosRankSum=0.570;SC=GGTAAGTTTCGTAAGAACAGG;SOR=0.409;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=39;WE=41327658;WS=41327638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,19:0.38:50
chr17	41327684	rs10684756	C	CTG	3997.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=19;PP=2648;SC=TTGTTCATTGCTGTCTCCCAA;SOR=2.329;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=68;TCF=44;TCR=24;TR=60;WE=41327692;WS=41327674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr17	41330024	rs11657883	T	C	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=2.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.450;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=339;ReadPosRankSum=-0.689;SC=AGGTAAAATATATTATGGCAC;SOR=1.154;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=46;TCF=31;TCR=15;TR=19;WE=41330032;WS=41330014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,22:0.42:53
chr17	41330234	rs377016401	TA	T	77.92	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.13;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr17	41331306	rs11653460	C	T	1220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.132;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=26;PP=652;ReadPosRankSum=1.092;SC=AAAAGCTGAACGCTTGGCCTG;SOR=0.591;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=182;TCF=106;TCR=76;TR=62;WE=41331314;WS=41331296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,72:0.34:209
chr17	41331460	rs11653231	G	A	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.082;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=200;ReadPosRankSum=0.619;SC=GTTCAGCCTTGTTTAAAAACC;SOR=1.007;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=65;TCF=25;TCR=40;TR=19;WE=41331468;WS=41331450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,18:0.26:69
chr17	41332804	rs9904555	T	C	2784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=46;NR=51;PP=1651;SC=TATTTTTTGTTCTTTTAGGAG;SOR=0.872;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=46;TCR=51;TR=97;WE=41332812;WS=41332794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr17	41338178	.	C	T	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.027;ClippingRankSum=0.000;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.925;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=211;ReadPosRankSum=-2.124;SC=GCATAACTTACCACACTCTTC;SOR=1.550;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=57;TCF=40;TCR=17;TR=18;WE=41338186;WS=41338168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,20:0.31:65
chr17	41346283	rs4793217	G	A	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.196;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=300;ReadPosRankSum=-1.463;SC=GTACAGCAGCGTTTTTATTTT;SOR=0.212;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=48;TCF=39;TCR=9;TR=21;WE=41346291;WS=41346273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,22:0.44:50
chr17	41352643	rs35995789	C	T	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=257;ReadPosRankSum=0.000;SC=TCACAGCCCCCTCAGCTGGGG;SOR=0.681;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=13;TCR=38;TR=19;WE=41352651;WS=41352633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,20:0.36:55
chr17	41353806	rs2306829	C	T	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.818;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=18;PP=342;ReadPosRankSum=1.550;SC=AGGTAATGATCAGCCTAAGCT;SOR=0.466;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=87;TCF=32;TCR=55;TR=32;WE=41353814;WS=41353796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,35:0.37:94
chr17	41354888	rs17527933	A	G	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=229;ReadPosRankSum=-2.123;SC=GCTTTGAGCAACACTGAACAA;SOR=0.569;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=44;TCF=16;TCR=28;TR=18;WE=41354896;WS=41354878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,20:0.42:48
chr17	41361960	rs8482	A	G	810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.651;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=22;PP=497;ReadPosRankSum=-1.747;SC=CTGATGGCCCATCTCTTTGAA;SOR=0.763;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=138;TCF=77;TCR=61;TR=47;WE=41361968;WS=41361950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,49:0.34:143
chr17	41364910	rs3803871	A	G	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=38;ReadPosRankSum=-1.036;SC=TTCACATCCTATCTTCCTTAG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=3;WE=41364918;WS=41364903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr17	41454935	rs2061873	T	C	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.337;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=193;ReadPosRankSum=-0.330;SC=CAGACTGGTTTATGTGCCAGA;SOR=0.399;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=39;TCF=28;TCR=11;TR=16;WE=41454943;WS=41454925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,19:0.43:44
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chr17	41465867	rs12600401	A	G	1039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.58;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.364;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=19;PP=588;ReadPosRankSum=-1.223;SC=GGTCTGTGGAAGAGACCTGTA;SOR=0.853;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=133;TCF=76;TCR=57;TR=48;WE=41465885;WS=41465857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,54:0.38:143
chr17	41466000	.	C	CGAGGGG	141.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.425;ClippingRankSum=0.000;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=14.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.25;ReadPosRankSum=-2.101;SOR=2.020;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,9:0.08:113
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chr17	41466003	.	T	G	390.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=5.158;ClippingRankSum=0.000;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=34.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.43;ReadPosRankSum=-2.674;SOR=3.363;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:97,17:0.15:114
chr17	41466007	.	C	CG	522.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=0.000;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=40.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.80;ReadPosRankSum=-2.309;SOR=3.596;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,19:0.17:109
chr17	41466009	.	GC	G	1185.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.501;ClippingRankSum=0.000;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=44.608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.08;ReadPosRankSum=-1.891;SOR=3.702;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,20:0.19:107
chr17	41466019	.	T	G	1330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.127;ClippingRankSum=0.000;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=6.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.18;ReadPosRankSum=-2.761;SOR=0.404;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,41:0.34:119
chr17	41466022	rs79526563	G	C	1342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=4.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.58;ReadPosRankSum=-1.736;SOR=0.388;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,42:0.36:116
chr17	41466035	rs79889672	A	C	1032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-2.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.515;HP=1;HapScore=3;MGOF=66;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=10;PP=1468;ReadPosRankSum=1.779;SC=TCAGGGAAGCAGAAGGCCTGG;SOR=0.547;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=72;TCF=38;TCR=34;TR=25;WE=41466063;WS=41466009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,53:0.48:111
chr17	41466049	rs62080661	A	G	2378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.79;ReadPosRankSum=2.492;SOR=0.696;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,60:0.60:100
chr17	41466055	rs62080662	G	C	2406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.60;ReadPosRankSum=1.750;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,62:0.66:94
chr17	41466073	rs4986155	T	C	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.48;BaseQRankSum=0.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.089;HP=1;HapScore=2;MGOF=170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=10;PP=307;ReadPosRankSum=-0.572;SC=GGGGCTGGAGTTCCTCTGCCA;SOR=0.941;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=60;TCF=31;TCR=29;TR=22;WE=41466081;WS=41466063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,15:0.17:88
chr17	41466096	rs62080664	A	G	2155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=0.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.202;HP=1;HapScore=3;MGOF=55;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=17;PP=2842;ReadPosRankSum=-0.480;SC=CAGGAGGCTGACACCAGACAC;SOR=0.363;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=63;TCF=32;TCR=31;TR=41;WE=41466138;WS=41466086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,66:0.73:91
chr17	41466108	rs62080665	G	C	1922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=-1.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.226;HP=2;HapScore=3;MGOF=55;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=17;PP=2116;ReadPosRankSum=-0.746;SC=ACCAGACACCGGGCAGAGGGA;SOR=0.278;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=61;TCF=29;TCR=32;TR=39;WE=41466138;WS=41466086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,62:0.71:87
chr17	41466120	rs66825422	GCGGCGCATGGA	G	2351.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.573;HP=1;HapScore=3;MGOF=55;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=2971;ReadPosRankSum=-1.881;SC=GCAGAGGGAGGCGGCGCATGG;SOR=0.169;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=43;TCF=10;TCR=33;TR=21;WE=41466138;WS=41466086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,59:0.72:82
chr17	41522213	rs7207008	T	A	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.53;ReadPosRankSum=-1.838;SOR=0.685;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,30:0.34:88
chr17	41561601	rs140026870	CGGAAGGA	C	4262.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.586;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=-1.413;NF=4;NR=91;PP=2984;ReadPosRankSum=1.867;SC=TTGAGGGAAGCGGAAGGAGGA;SOR=1.640;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=138;TCF=5;TCR=133;TR=95;WE=41561615;WS=41561591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,156:0.99:158
chr17	41566783	rs141196624	CTCT	C	2092.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.608;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.701;NF=16;NR=11;PP=1080;ReadPosRankSum=-0.320;SC=TTGTTCATGTCTCTTCTTTTC;SOR=1.305;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=41;TCF=21;TCR=20;TR=27;WE=41566793;WS=41566773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,53:0.69:77
chr17	41566969	rs1807204	T	G	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.75;ReadPosRankSum=-1.180;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr17	41569933	rs11870101	C	T	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=1;PP=496;ReadPosRankSum=-0.387;SC=AACTCTAATTCAGTTCAAAAC;SOR=0.648;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=22;WE=41569941;WS=41569923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,21:0.68:31
chr17	41570427	rs2279191	T	C	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=278;ReadPosRankSum=0.010;SC=TGGTGCTCTTTTGTTCACACC;SOR=0.714;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=54;TCF=19;TCR=35;TR=19;WE=41570435;WS=41570417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,20:0.36:56
chr17	41573730	rs12602059	T	C	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.016;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=227;ReadPosRankSum=0.016;SC=CTATTAATCATTTGTTCTTTG;SOR=0.542;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=79;TCF=22;TCR=57;TR=22;WE=41573738;WS=41573720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,25:0.31:80
chr17	41573822	.	GTAT	G	40	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=1;NR=2;PP=40;QD=19.0;SC=AAGTGCTTATGTATTATTATT;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=3;WE=41573832;WS=41573812;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:12,3:0.20:15
chr17	41582284	rs55956367	A	G	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.677;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=165;ReadPosRankSum=-1.144;SC=CGGGACAAGTATGTGCCTACT;SOR=0.223;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=13;WE=41582292;WS=41582274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,13:0.32:41
chr17	41585657	rs2293014	G	A	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=433;ReadPosRankSum=-0.700;SC=CCTTGTATAGGACACACATAC;SOR=0.650;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=56;TCF=45;TCR=11;TR=27;WE=41585665;WS=41585647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,27:0.49:55
chr17	41590928	rs9893137	C	T	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=22;PP=461;ReadPosRankSum=-0.813;SC=CTTTCTGAAACTTTTTTATGG;SOR=0.757;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=98;TCF=35;TCR=63;TR=32;WE=41590936;WS=41590918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,36:0.34:107
chr17	41598940	rs2271957	T	C	1064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.51;ReadPosRankSum=-0.168;SOR=0.695;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:167,69:0.29:236
chr17	41599383	rs2271958	G	A	431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.176;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=199;ReadPosRankSum=-0.330;SC=TGAAAGCTGAGTGGGCTCATA;SOR=0.407;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=79;TCF=55;TCR=24;TR=21;WE=41599391;WS=41599373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,27:0.30:91
chr17	41603882	rs9915640	T	C	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=8;PP=255;ReadPosRankSum=-1.808;SC=ACTTCCTCCCTGTGGTTGCTG;SOR=0.711;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=85;TCF=56;TCR=29;TR=24;WE=41603890;WS=41603872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,29:0.30:96
chr17	41610398	rs2242598	C	T	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.209;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=162;ReadPosRankSum=1.052;SC=GAGTGGGCTCCGGAATGGGGG;SOR=1.579;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=35;TCF=20;TCR=15;TR=13;WE=41610406;WS=41610388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,13:0.36:36
chr17	41613691	rs56357945	G	T	698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.603;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=12;PP=315;ReadPosRankSum=2.038;SC=ACCCCACTGTGTTTTAGGAGA;SOR=0.899;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=102;TCF=61;TCR=41;TR=31;WE=41613699;WS=41613681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,39:0.34:115
chr17	41622507	rs79868029	A	G	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.957;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=3;PP=85;ReadPosRankSum=2.348;SC=AGAATGACCAAAATCCCTTGG;SOR=0.729;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=19;TCF=9;TCR=10;TR=8;WE=41622515;WS=41622497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr17	41622562	.	C	CGTGT	606.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.440;ClippingRankSum=0.000;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.34;ReadPosRankSum=-1.026;SOR=0.491;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,18:0.69:26
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chr17	41846964	rs1230403	T	C	261.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=1;PP=221;SC=CGAGCAGAGGTGGTGGGGGTG;SOR=3.056;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=41846972;WS=41846954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	41955158	rs231521	A	G	6251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=117;NR=85;PP=2965;SC=AGTGAGCCAAAGACCAGGTGA;SOR=0.974;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=202;TCF=117;TCR=85;TR=202;WE=41955166;WS=41955148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr17	41959808	rs124721	T	C	8918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=141;NR=156;PP=2965;ReadPosRankSum=2.527;SC=GCAGGCCTTGTTGAGCCACCA;SOR=0.782;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=298;TCF=142;TCR=156;TR=297;WE=41959816;WS=41959798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,328:0.99:330
chr17	41960343	rs124719	T	C	1390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=31;NR=21;PP=807;SC=GGTTGCTGAATGTAGGGTCCA;SOR=1.077;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=31;TCR=21;TR=52;WE=41960351;WS=41960333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	41960633	rs412849	CG	GC	4750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=56;NR=30;PP=2909;SC=TGCTCAGCCACGTGCGCCAGG;SOR=1.036;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=88;TCF=58;TCR=30;TR=86;WE=41960642;WS=41960623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr17	41961451	rs231518	T	C	4139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=77;NR=58;PP=2201;SC=AGCCACTTTATCCCAAAGTAT;SOR=0.756;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=135;TCF=77;TCR=58;TR=135;WE=41961459;WS=41961441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr17	41987062	rs3744416	A	G	1839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.745;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=37;PP=1093;ReadPosRankSum=-1.259;SC=GTATCTCTCTAATAAAGGCCT;SOR=0.605;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=107;TCF=56;TCR=51;TR=77;WE=41987070;WS=41987052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,83:0.70:118
chr17	41994794	rs231458	C	T	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.12;ReadPosRankSum=-1.358;SOR=0.547;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,30:0.33:91
chr17	42015818	rs1731897	G	A	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=2.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.34;MQRankSum=0.820;QD=23.61;ReadPosRankSum=0.810;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,13:0.81:16
chr17	42015831	.	C	CGG	341.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.00;MQRankSum=1.290;QD=24.41;ReadPosRankSum=0.355;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr17	42018471	rs231473	T	C	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.575;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=15;PP=327;ReadPosRankSum=1.606;SC=CCATTTCAGCTCCAGGGAGCT;SOR=0.717;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=62;TCR=52;TR=32;WE=42018479;WS=42018461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,36:0.27:131
chr17	42030531	rs1058046	G	C	1921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.468;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=46;PP=1178;ReadPosRankSum=-0.949;SC=GGAAAGAAGCGTGTCCGGGCC;SOR=0.636;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=239;TCF=111;TCR=128;TR=90;WE=42030539;WS=42030521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,99:0.38:259
chr17	42030743	rs229969	G	C	4839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=64;PP=2576;SC=GCGTCTTCGCGGGGAGCCTCG;SOR=1.075;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=162;TCF=98;TCR=64;TR=162;WE=42030751;WS=42030733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr17	42031331	rs2070592	C	T	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.837;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=5;PP=79;ReadPosRankSum=0.014;SC=CCTTGTGGGGCTTATATCCCC;SOR=1.027;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=18;TCR=15;TR=11;WE=42031339;WS=42031321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,15:0.37:41
chr17	42083840	rs228770	T	C	1069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=4;PP=870;SC=TCCGTGGGGGTAGGGGGGCAG;SOR=3.383;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=34;WE=42083848;WS=42083830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr17	42084097	rs228771	C	G	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=7.514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.612;SOR=0.119;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,26:0.63:41
chr17	42085150	rs228773	T	C	2168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=47;PP=1167;SC=TGGTAGGTCCTGCCACTCCCA;SOR=1.423;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=29;TCR=47;TR=76;WE=42085158;WS=42085140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr17	42085972	rs186636	C	T	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.360;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=262;ReadPosRankSum=1.018;SC=GCAGCTGACCCTCACCATGGA;SOR=1.201;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=35;TCF=12;TCR=23;TR=17;WE=42085980;WS=42085962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr17	42090587	rs228778	G	C	539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=15;PP=411;SC=TGGCTTCCCAGAGTGTAGAAC;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=42090595;WS=42090577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	42092328	rs77536093	A	G	1702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-1.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.450;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=43;PP=906;ReadPosRankSum=-0.955;SC=CATCTTGGGAAAGGGCAGTCC;SOR=0.660;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=244;TCF=110;TCR=134;TR=82;WE=42092336;WS=42092318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:195,98:0.33:293
chr17	42152103	rs3815076	G	A	781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=20;PP=404;ReadPosRankSum=-1.357;SC=CCATAATGACGGCCCTGTCTT;SOR=0.656;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=128;TCF=64;TCR=64;TR=41;WE=42152111;WS=42152093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,47:0.32:145
chr17	42156471	rs376816	A	C	1309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=19;PP=803;ReadPosRankSum=0.044;SC=GGCCCCTCAGACCTCTGGCCT;SOR=0.760;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=86;TCF=54;TCR=32;TR=51;WE=42156479;WS=42156461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,57:0.62:92
chr17	42157739	rs850856	C	T	2918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.187;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=55;PP=1691;ReadPosRankSum=1.017;SC=GGGGCTCCCACTGACTACCAT;SOR=0.857;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=211;TCF=116;TCR=95;TR=125;WE=42157747;WS=42157729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,143:0.58:245
chr17	42158310	rs377963	T	G	630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=3.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.608;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=22;PP=535;ReadPosRankSum=-0.452;SC=ATGGTCAAATTCCACCTGTCA;SOR=2.494;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=24;WE=42158318;WS=42158300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,23:0.62:37
chr17	42164885	rs228757	G	C	1394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=30;PP=793;ReadPosRankSum=-1.140;SC=CCTCCCCATCGTCTTCCTCGT;SOR=0.722;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=100;TCF=51;TCR=49;TR=59;WE=42164893;WS=42164875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,64:0.56:114
chr17	42170181	rs67111880	TG	T	667.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5008;FS=0.000;HP=14;HapScore=3;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=271;ReadPosRankSum=0.000;SC=TCCCCTGGGGTGGGGGGGGGG;SOR=0.631;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=19;WE=42170190;WS=42170165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,27:0.96:28
chr17	42170289	rs368328	G	A	117.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=4;PP=75;SC=GGAAGAGGACGTGGATCTTGG;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=42170297;WS=42170279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	42170871	rs117519930	C	T	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.693;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=206;ReadPosRankSum=-1.538;SC=GGCATGGGAACGGAGGCACAA;SOR=1.283;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=75;TCF=46;TCR=29;TR=21;WE=42170879;WS=42170861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,26:0.31:84
chr17	42171206	rs454192	T	C	3565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=71;NR=50;PP=1763;SC=ACCTCCACTGTGGGCAGAAGA;SOR=0.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=122;TCF=71;TCR=51;TR=121;WE=42171214;WS=42171196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr17	42188311	rs228767	C	G	180.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=1;PP=146;SC=GCAGCCCGCACAGCACAGGTT;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=42188319;WS=42188301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	42225547	rs227584	A	C	1224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FS=3.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.41;ReadPosRankSum=-1.520;SOR=0.957;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:201,77:0.28:278
chr17	42226029	rs141126495	G	T	1403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=29;PP=785;ReadPosRankSum=-0.705;SC=CTGCTAGAGGGACCATTCAGA;SOR=0.709;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=212;TCF=113;TCR=99;TR=64;WE=42226037;WS=42226019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,77:0.32:240
chr17	42232442	rs2246287	C	G	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.002;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=191;ReadPosRankSum=0.859;SC=GGCTTGAGCTCAGGGAAGGCC;SOR=1.355;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=56;TCF=27;TCR=29;TR=17;WE=42232450;WS=42232432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,18:0.30:60
chr17	42239349	rs730228	T	C	971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=3.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.48;ReadPosRankSum=-1.812;SOR=0.457;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,56:0.37:150
chr17	42248346	rs7218599	A	T	3453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=64;NR=44;PP=1763;SC=CTGTCCACCAAGCCCTCTTCT;SOR=0.824;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=64;TCR=44;TR=108;WE=42248354;WS=42248336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr17	42249717	rs10628218	A	ATG	132.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.336;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.477;NF=0;NR=3;PP=81;ReadPosRankSum=-1.961;SC=TTGGGGAGAAATGTGTGTGTG;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=3;WE=42249725;WS=42249707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr17	42254011	rs7220138	C	G	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.765;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=13;PP=500;ReadPosRankSum=0.744;SC=GGACCTCAAGCTGAGAGGGGT;SOR=0.809;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=105;TCF=65;TCR=40;TR=36;WE=42254031;WS=42254001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,35:0.31:114
chr17	42254281	rs7212573	A	G	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.331;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=4;PP=68;ReadPosRankSum=1.444;SC=TGCGCTGAACACGGCGTGCGC;SOR=0.766;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=36;TCF=20;TCR=16;TR=10;WE=42254289;WS=42254271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,11:0.26:43
chr17	42254417	rs7212854	A	G	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.42;ReadPosRankSum=-2.705;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,9:0.22:40
chr17	42254527	rs7217858	T	G	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.81;ReadPosRankSum=2.825;SOR=0.598;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,22:0.37:60
chr17	42255097	rs3826412	T	C	513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.08;ReadPosRankSum=0.026;SOR=0.669;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:130,37:0.22:167
chr17	42264962	rs4793082	A	G	2491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=22;PP=1516;SC=CATGGTTAATAACATTAACCT;SOR=1.504;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=52;TCR=22;TR=74;WE=42264970;WS=42264952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr17	42268274	rs757430	C	T	1359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=15;NR=34;PP=912;SC=TTCTCCTTTACGGCCTCCCCA;SOR=1.802;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=50;TCF=15;TCR=35;TR=49;WE=42268282;WS=42268264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr17	42287519	rs2071167	C	T	960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.403;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=18;PP=607;ReadPosRankSum=-0.379;SC=CTTCGGCTGCCTTCTTAATCC;SOR=0.828;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=126;TCF=76;TCR=50;TR=47;WE=42287527;WS=42287509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,51:0.37:138
chr17	42287595	.	C	T	2574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.925;ClippingRankSum=0.000;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.320;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=52;PP=1525;ReadPosRankSum=0.529;SC=GGCCTTCACCCGGTCATTCTG;SOR=0.457;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=169;TCF=83;TCR=86;TR=106;WE=42287603;WS=42287585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,115:0.62:186
chr17	42294198	rs2269908	G	C	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=124;ReadPosRankSum=1.041;SC=CCCATCTGAAGGCACAGACAA;SOR=0.693;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=11;WE=42294206;WS=42294188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,14:0.35:40
chr17	42294215	rs2269907	G	A	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.649;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=118;ReadPosRankSum=0.604;SC=ACAAGATATGGCTCAGCCCTA;SOR=0.143;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=9;WE=42294223;WS=42294205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr17	42329004	rs13306780	A	C	960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.789;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=27;PP=659;ReadPosRankSum=-2.446;SC=GAGGCCTGGCACCAGTGGGGG;SOR=0.313;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=47;TCF=11;TCR=36;TR=37;WE=42329012;WS=42328994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,39:0.81:48
chr17	42337091	rs2857082	C	T	833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.426;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=12;PP=508;ReadPosRankSum=-1.235;SC=TGCTTGTGGTCGGTTTTTCAG;SOR=0.986;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=118;TCF=77;TCR=41;TR=40;WE=42337099;WS=42337081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,44:0.34:130
chr17	42337976	rs2074107	G	A	1283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.815;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=31;PP=845;ReadPosRankSum=-0.932;SC=CATCTGCAGGGGGTCCAGAAG;SOR=0.789;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=189;TCF=101;TCR=88;TR=64;WE=42337984;WS=42337966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,68:0.33:206
chr17	42338248	rs2854528	A	G	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.153;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=226;ReadPosRankSum=-0.282;SC=GTGCTCAGCCACTCTCGAGAG;SOR=0.483;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=61;TCF=18;TCR=43;TR=19;WE=42338256;WS=42338238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,19:0.30:63
chr17	42338998	rs5035	T	G	1150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.05;ReadPosRankSum=-0.191;SOR=0.734;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:160,68:0.30:228
chr17	42339118	rs13306783	G	GC	432.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.230;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=279;ReadPosRankSum=1.172;SC=CCTTCCCAGTGCCCTGGGCTG;SOR=0.491;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=10;WE=42339126;WS=42339108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,18:0.39:46
chr17	42389814	rs72824724	C	T	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=161;ReadPosRankSum=0.967;SC=CCTGTCTCCCCACTCGCTCTG;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=7;WE=42389822;WS=42389804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr17	42392077	rs68030960	T	C	858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=17;PP=837;SC=GCCTGCTGCATCCTCTGGCCC;SOR=0.880;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=20;TCR=17;TR=37;WE=42392085;WS=42392067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr17	42392440	rs146658412	C	T	1169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.745;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=22;PP=812;ReadPosRankSum=-0.533;SC=TGGGGACGTCCTGGTCCCACC;SOR=0.851;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=85;TCF=45;TCR=40;TR=51;WE=42392448;WS=42392430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,53:0.59:90
chr17	42392622	rs708386	T	C	5007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=93;NR=88;PP=2472;SC=TCGTCACCGATGAGGACAGCT;SOR=0.820;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=181;TCF=93;TCR=88;TR=181;WE=42392630;WS=42392612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr17	42398052	rs2011951	A	G	2083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=19;PP=1126;SC=TTCGGCCTGAACCCATTGAGC;SOR=1.091;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=43;TCR=19;TR=62;WE=42398060;WS=42398042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr17	42398757	rs2011895	C	A	4358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=72;NR=70;PP=2551;SC=GGGTTTGGGCCGAGGTGGGGA;SOR=0.782;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=143;TCF=73;TCR=70;TR=142;WE=42398765;WS=42398747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr17	42400816	rs60776742	C	A	85.84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=111;ReadPosRankSum=1.981;SC=CATCCCCACCCGCCCCCACCC;SOR=1.022;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=9;TCF=4;TCR=5;TR=6;WE=42400824;WS=42400806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr17	42401002	rs72824725	G	A	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=214;ReadPosRankSum=0.248;SC=AAGGAGGCTGGGCCACTGTGA;SOR=0.836;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=9;TCR=14;TR=16;WE=42401010;WS=42400992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr17	42427544	rs113219200	G	GAGTC	1254.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.815;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=8;PP=783;ReadPosRankSum=1.763;SC=TGTGATGGGGGAGTCACCTTC;SOR=0.864;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=67;TCF=32;TCR=35;TR=17;WE=42427552;WS=42427534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,35:0.32:108
chr17	42427732	rs850713	G	A	633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=2.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.12;ReadPosRankSum=1.204;SOR=0.395;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,33:0.37:89
chr17	42475983	rs936019	G	C	1778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.215;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=34;PP=933;ReadPosRankSum=-0.483;SC=TGGGCTTTCGGGTAGCTGGGA;SOR=0.492;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=118;TCF=60;TCR=58;TR=72;WE=42475991;WS=42475973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,83:0.62:134
chr17	42483233	rs2045088	T	A	1763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=0.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.47;ReadPosRankSum=-1.739;SOR=0.614;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,79:0.69:114
chr17	42483531	rs1377808	T	A	74.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=3;PP=53;SC=GTATTAGTGTTGAACACATTA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=42483539;WS=42483521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	42501692	rs1869495	C	A	840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=10;PP=450;ReadPosRankSum=0.083;SC=GTACCTTCTTCTGTTAGCAAG;SOR=0.622;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=32;TCR=14;TR=33;WE=42501700;WS=42501682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,38:0.70:54
chr17	42751607	rs6416902	C	T	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.518;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=182;ReadPosRankSum=1.321;SC=GATAAATATACCAAGACATGC;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=9;WE=42751615;WS=42751597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr17	42800414	rs17682536	C	T	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.323;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=144;ReadPosRankSum=1.139;SC=TCTTCTCCTGCGATGCCATGT;SOR=0.593;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=9;WE=42800422;WS=42800404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr17	42824402	rs4793144	C	A	4670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=67;PP=2625;ReadPosRankSum=1.168;SC=GCTCCTCCCCCCAAGGGCCCC;SOR=1.005;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=165;TCF=96;TCR=69;TR=162;WE=42824410;WS=42824392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,181:0.99:183
chr17	42824648	rs9893320	T	C	338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=1;PP=289;SC=GCGATCTCTATGCTGCTATGG;SOR=2.670;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=42824656;WS=42824638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	42824731	rs9912745	G	A	2124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=51;NR=21;PP=1226;SC=CTCATCTAATGCCCTGTGCTC;SOR=1.609;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=73;TCF=52;TCR=21;TR=72;WE=42824739;WS=42824721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr17	42846994	rs8070918	T	C	136.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.81;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	42847033	rs58726064	C	G	268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=7;NR=2;PP=225;SC=CCCCCCGACTCCCACCTTCAG;SOR=2.303;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=42847041;WS=42847023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	42850352	rs68017435	T	C	2460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.059;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=43;PP=1188;ReadPosRankSum=-0.043;SC=CTGAGGAGCCTGGCCCTCCTC;SOR=0.553;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=149;TCF=77;TCR=72;TR=95;WE=42850360;WS=42850342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,113:0.67:168
chr17	42851634	rs62066014	G	A	215.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=1;PP=189;SC=GAGGGCAGGAGGCCATCCTGA;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=42851642;WS=42851624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	42851729	rs35936481	C	T	1035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.26;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr17	42852604	rs1558083	G	T	8627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.14;SOR=0.915;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr17	42852610	rs1558084	T	C	8603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.45;SOR=0.843;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr17	42853427	rs4792955	A	G	1613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=43;NR=15;PP=1201;SC=CCAGAGAGCGAGGGGCCTGGG;SOR=2.107;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=59;TCF=43;TCR=16;TR=58;WE=42853442;WS=42853417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr17	42853694	rs4793151	C	T	3510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=69;PP=2026;SC=GCATCGACCTCCACTGATCAG;SOR=1.482;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=38;TCR=69;TR=107;WE=42853702;WS=42853684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr17	42854208	rs1558085	G	A	4996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=97;NR=81;PP=2637;SC=GCAGTCTCTTGTCTCCACTCT;SOR=0.723;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=179;TCF=98;TCR=81;TR=178;WE=42854216;WS=42854198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr17	42854502	rs1558086	G	A	446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=4;PP=272;SC=GTCCTGGGGCGCGTGGGGTCA;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=14;WE=42854510;WS=42854492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	42854610	rs8075210	T	C	2237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=26;PP=1189;SC=GCAAGGGATCTGGCTGGGTCC;SOR=1.075;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=48;TCR=26;TR=74;WE=42854618;WS=42854600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr17	42855248	rs2070603	T	C	3344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=50;PP=1705;SC=GCCTGGAGCCTGGGATGGCGG;SOR=0.757;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=60;TCR=50;TR=110;WE=42855256;WS=42855238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr17	42855472	rs2070604	T	C	5101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=86;PP=2594;SC=CTGTCTGTCCTGCTCTCTATG;SOR=0.857;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=173;TCF=87;TCR=86;TR=173;WE=42855480;WS=42855462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr17	42855554	rs2070605	T	C	2578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=41;NR=49;PP=1312;SC=TTGGCTCCATTGCTGGGGCTG;SOR=1.145;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=41;TCR=49;TR=90;WE=42855562;WS=42855544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr17	42857430	rs35504352	G	A	8007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=135;NR=137;PP=2965;SC=ACTCGGGGGCGCCTGGAGGGA;SOR=0.768;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=272;TCF=135;TCR=137;TR=272;WE=42857438;WS=42857420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,301:1.00:301
chr17	42857517	rs16970986	C	T	3624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=80;PP=2549;SC=CAGGGTCTTACCTCTCTGGGA;SOR=1.705;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=119;TCF=39;TCR=80;TR=119;WE=42857525;WS=42857507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr17	42925559	rs12164	C	T	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.067;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=7;PP=170;ReadPosRankSum=-0.921;SC=CACCTGACGACGAAGACTGTG;SOR=1.042;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=71;TCF=42;TCR=29;TR=20;WE=42925567;WS=42925549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,23:0.29:80
chr17	42929759	rs117345300	C	G	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=3.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.40;ReadPosRankSum=-0.193;SOR=0.336;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,21:0.27:79
chr17	42929970	rs2289673	T	C	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.538;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=12;PP=250;ReadPosRankSum=-1.995;SC=TAGTCAAACATAGGCCAAAAG;SOR=0.357;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=46;TCF=17;TCR=29;TR=21;WE=42929978;WS=42929960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,24:0.45:53
chr17	42930859	rs78620114	G	A	2022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.094;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=51;PP=1236;ReadPosRankSum=-0.016;SC=TGAAGCAGATGGTCCCCTACC;SOR=0.789;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=233;TCF=118;TCR=115;TR=97;WE=42930867;WS=42930849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,106:0.40:266
chr17	42932244	rs2289672	C	T	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=178;ReadPosRankSum=0.044;SC=ACTGTGGCATCCCTGCCTCCT;SOR=0.693;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=51;TCF=39;TCR=12;TR=18;WE=42932252;WS=42932234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,19:0.32:59
chr17	42932474	rs16971033	A	G	1193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.761;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=32;PP=768;ReadPosRankSum=-0.289;SC=AAGTGACATCAGTGAAAGCCA;SOR=0.964;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=88;TCF=34;TCR=54;TR=50;WE=42932482;WS=42932464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,54:0.57:95
chr17	42934372	rs6503405	A	G	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=2.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.17;ReadPosRankSum=-0.273;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr17	42934694	rs2277615	T	C	664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=2.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=22;PP=486;ReadPosRankSum=0.627;SC=GCTGTCCAAATCATCACCAAA;SOR=0.859;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=51;TCF=9;TCR=42;TR=25;WE=42934702;WS=42934684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,28:0.49:57
chr17	42940382	.	A	G	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=20;ReadPosRankSum=0.499;SC=GAGGAGCTAGAGAAAGATGAG;SOR=0.576;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=5;WE=42940390;WS=42940372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,5:0.19:26
chr17	42945296	rs2120276	A	G	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.40;ReadPosRankSum=-0.347;SOR=0.653;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,32:0.25:128
chr17	42945763	rs17628110	G	A	2837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=56;PP=1560;ReadPosRankSum=-1.218;SC=GCAAAGTGTCGTTCAAAATTC;SOR=0.718;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=195;TCF=102;TCR=93;TR=115;WE=42945771;WS=42945753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,133:0.58:230
chr17	42945867	rs3785890	A	G	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.454;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=199;ReadPosRankSum=0.505;SC=GAGGAAAACGAGGACACTGAG;SOR=1.106;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=59;TCF=22;TCR=37;TR=16;WE=42945875;WS=42945857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,17:0.25:68
chr17	42953409	rs2289674	A	G	630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.69;ReadPosRankSum=1.800;SOR=0.822;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,35:0.43:82
chr17	42957139	rs2289676	C	T	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=2.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.29;ReadPosRankSum=-1.157;SOR=1.172;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,13:0.20:65
chr17	42957855	rs1443463	A	G	638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.63;ReadPosRankSum=-0.189;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:132,44:0.25:176
chr17	42961009	rs2289677	C	T	1357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.515;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=24;PP=783;ReadPosRankSum=0.512;SC=CTGAAAGTTCCGTCTTACCTT;SOR=0.745;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=205;TCF=122;TCR=83;TR=62;WE=42961017;WS=42960999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,75:0.32:234
chr17	42979592	rs12451394	G	A	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.328;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=234;ReadPosRankSum=-0.446;SC=AAATGAGGCCGCCAAGGACCA;SOR=0.382;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=44;TCF=35;TCR=9;TR=19;WE=42979600;WS=42979582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,20:0.43:47
chr17	42981654	rs3826425	A	G	1081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.155;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=28;PP=719;ReadPosRankSum=-1.624;SC=TTTCCAGGACAAGGGCCAGGA;SOR=0.774;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=189;TCF=101;TCR=88;TR=59;WE=42981662;WS=42981644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,65:0.31:210
chr17	42989063	rs1126642	C	T	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.021;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=145;ReadPosRankSum=-2.639;SC=GACTCCAGGTCGCAGGTCAAG;SOR=0.963;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=59;TCF=42;TCR=17;TR=17;WE=42989071;WS=42989053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,20:0.27:75
chr17	42989088	rs2289681	C	T	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.81;ReadPosRankSum=0.054;SOR=0.674;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,29:0.27:109
chr17	42991449	rs59291670	C	T	767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=2.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.38;ReadPosRankSum=0.485;SOR=0.460;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,38:0.61:62
chr17	43004541	rs8079709	G	T	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.008;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=24;ReadPosRankSum=-0.797;SC=GGGCATGGGGGAGGGTGGTTG;SOR=2.621;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=4;WE=43004549;WS=43004531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr17	43101708	rs3837839	G	T	315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.55;SOR=1.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	43111162	rs9303432	A	G	1167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=7;PP=872;SC=CCACTGCACAAATGAAAAAAT;SOR=2.613;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=38;WE=43111170;WS=43111152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr17	43131480	rs4793172	A	T	5678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=393;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.293;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=132;NR=112;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.842;SC=ACCCAATAAAAAGGATTCCAT;SOR=0.798;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=362;TCF=190;TCR=172;TR=244;WE=43131488;WS=43131470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,265:0.68:392
chr17	43131618	rs145150422	A	AT	849.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.117;HP=7;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.727;NF=1;NR=26;PP=894;ReadPosRankSum=-0.362;SC=AGACAGTTTTATTTATTTTTT;SOR=1.863;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=48;TCF=3;TCR=45;TR=27;WE=43131626;WS=43131608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,32:0.59:54
chr17	43138597	rs62065834	C	T	3096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=47;PP=1863;ReadPosRankSum=-1.345;SC=CAGCTCGCTTCGCCAGAAAAA;SOR=0.660;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=176;TCF=110;TCR=66;TR=123;WE=43138605;WS=43138587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,136:0.70:194
chr17	43158902	rs916661	G	A	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.697;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=14;PP=461;ReadPosRankSum=0.757;SC=TGCTTCTGAAGCCAACAGGCT;SOR=0.368;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=44;TCF=26;TCR=18;TR=33;WE=43158910;WS=43158892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,36:0.72:50
chr17	43163756	rs6416904	A	G	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=316;ReadPosRankSum=0.376;SC=GCCTCCCAAAATGTTGGGATT;SOR=0.452;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=18;WE=43163764;WS=43163746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,20:0.69:29
chr17	43163851	rs6503422	T	C	2276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.017;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=33;PP=1418;ReadPosRankSum=-1.476;SC=TGGGCCTTTTTTCTCCCCAAC;SOR=0.539;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=148;TCF=95;TCR=53;TR=88;WE=43163859;WS=43163841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,100:0.60:167
chr17	43170907	rs2239921	C	T	1119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.638;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=10;PP=619;ReadPosRankSum=0.648;SC=GCTGGAAAGACGGTTTGCAGT;SOR=1.214;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=67;TCF=50;TCR=17;TR=42;WE=43170915;WS=43170897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,49:0.64:76
chr17	43176632	rs877598	A	C	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.250;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=147;ReadPosRankSum=-0.689;SC=GGGAGGCTGGAGAGCAGGGTG;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=8;WE=43176640;WS=43176622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr17	43181287	rs4793167	A	G	3187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=52;PP=1993;SC=TGCAGGGAAGAGGCAGTGGAG;SOR=1.015;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=49;TCR=52;TR=101;WE=43181295;WS=43181277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr17	43183028	rs1053733	G	A	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=3.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.28;ReadPosRankSum=0.106;SOR=0.228;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,12:0.24:50
chr17	43192549	rs35911033	T	TC	4316.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=18;NR=30;PP=2241;SC=GGGTGCAGGGTCGCAGGCGGG;SOR=1.028;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=53;TCF=19;TCR=34;TR=48;WE=43192557;WS=43192539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr17	43192681	rs713102	C	A	1385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=1.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.70;ReadPosRankSum=-1.113;SOR=0.867;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,66:0.80:83
chr17	43192821	rs713101	A	G	2240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.00;SOR=0.872;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr17	43196546	rs4362432	G	A	596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=20;PP=403;ReadPosRankSum=-0.845;SC=TAAGACTTGTGACTCTAGCTC;SOR=0.558;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=72;TCF=17;TCR=55;TR=27;WE=43196554;WS=43196536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,28:0.39:72
chr17	43198166	rs11382448	A	AG	1222.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=5;PP=869;SC=CCCTCAGGACAGGGCCCTGCC;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=22;WE=43198174;WS=43198156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr17	43213772	rs2306828	A	C	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.34;ReadPosRankSum=-1.578;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,10:0.19:52
chr17	43227766	rs78243847	T	TTTGG	1438.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=16;PP=875;SC=TCCCCCTGGCTTTGGTTTCGT;SOR=2.303;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=17;WE=43227774;WS=43227756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr17	43316520	rs1023995	T	C	790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=20;PP=572;SC=TGGGGTCAGGTAGACCTGGGT;SOR=3.014;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=43316528;WS=43316510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	43318778	rs7218169	GC	CG	3328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=29;PP=1574;SC=CCGCCATGGGGCCCTCCAGGC;SOR=0.774;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=34;TCR=30;TR=61;WE=43318787;WS=43318767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr17	43319434	rs372669041	TCCG	T	48.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.80;ReadPosRankSum=0.370;SOR=0.533;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,6:0.10:61
chr17	43319770	rs1801353	C	T	4281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=81;NR=70;PP=2331;SC=CTGGGTGGCACTGAAACCCAG;SOR=0.705;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=151;TCF=81;TCR=70;TR=151;WE=43319778;WS=43319760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr17	43333125	rs11651968	C	T	4854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=106;NR=51;PP=2965;SC=CAGGCAGACACGTGGTTCTCC;SOR=1.450;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=157;TCF=106;TCR=51;TR=157;WE=43333133;WS=43333115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr17	43333785	rs76453679	AAGAC	A	5899.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=52;PP=2977;SC=AGTCATCTCTAAGACAGAAGA;SOR=0.925;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=6;TCR=53;TR=58;WE=43333796;WS=43333775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr17	43334649	rs60163605	C	A	2134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.57;SOR=1.345;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr17	43334653	rs58314091	T	C	2134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.47;SOR=1.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr17	43342141	rs1047833	G	C	3394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=55;NR=59;PP=1972;SC=CGTCTTTGGTGACCAAGCTGA;SOR=0.859;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=55;TCR=59;TR=114;WE=43342149;WS=43342131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr17	43342306	rs2285674	C	A	371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=10;PP=250;SC=CTCAGAGAATCCCACCCGGCT;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=43342314;WS=43342296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	43344073	rs2074293	G	A	3050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=55;PP=1630;SC=TTGGGTACGGGCTCAGGGCCC;SOR=1.412;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=37;TCR=55;TR=92;WE=43344081;WS=43344063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr17	43351127	rs2072090	G	C	1873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=34;PP=926;SC=TAATCGTGGAGGAAGGGAGGA;SOR=1.244;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=24;TCR=34;TR=58;WE=43351135;WS=43351117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr17	43364293	rs56405343	C	CG	10733.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=48;NR=87;PP=2969;SC=GAGGCAGAGCCGCCGTAGGCC;SOR=0.968;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=141;TCF=51;TCR=90;TR=135;WE=43364301;WS=43364283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,285:1.00:285
chr17	43910455	rs17689966	G	A	609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.79;QD=27.72;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	43923180	rs242944	G	A	373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.13;QD=24.92;SOR=2.448;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	43924412	rs242943	T	C	161.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.34;QD=26.97;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	44061333	rs138482356	ACCTCCCAGG	A	277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.38;QD=39.68;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	44248848	rs17662853	G	A	1539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.15;QD=26.55;SOR=1.278;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr17	44321273	rs370516109	A	C	103.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=25.76;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	44408406	.	A	G	71.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=23.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	44788253	rs78850923	G	A	96.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=0;PP=70;SC=AGCATGTACGGATTATAACTC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=44788261;WS=44788243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	44788310	rs183211	G	A	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=169;ReadPosRankSum=0.388;SC=AAATGCTTTAGACTCCTTTTT;SOR=0.596;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=17;WE=44788318;WS=44788300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr17	44828931	rs199533	G	A	2292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.098;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=36;PP=1278;ReadPosRankSum=-1.783;SC=AAGGGAAGAAGGTCTGGATAG;SOR=0.511;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=137;TCF=82;TCR=55;TR=86;WE=44828939;WS=44828921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,101:0.64:158
chr17	44833217	rs35732828	C	A	1627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.477;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=35;PP=800;ReadPosRankSum=-2.325;SC=CACACAGTGACCAAGGGAAGT;SOR=0.645;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=228;TCF=130;TCR=98;TR=82;WE=44833225;WS=44833207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,92:0.36:254
chr17	44950122	rs4968281	T	C	475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.04;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	45000547	rs183199	G	C	4274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=61;PP=2181;SC=CGTGGCCTGCGGGGCCGGCGA;SOR=0.772;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=78;TCR=62;TR=139;WE=45000555;WS=45000537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr17	45000565	rs12944167	C	A	2419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=45;PP=1353;ReadPosRankSum=0.314;SC=CGACATGGATCCCCTGTTCCA;SOR=0.659;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=148;TCF=80;TCR=68;TR=97;WE=45000573;WS=45000555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,110:0.67:165
chr17	45000736	rs12150668	C	T	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.04;ReadPosRankSum=0.485;SOR=0.644;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,28:0.44:64
chr17	45012248	rs169126	T	G	290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=137;SC=GCCTTTGCTTTGCTTTTTCTT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=45012256;WS=45012242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	45044147	rs11079745	C	A	1832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=45;PP=1296;SC=ACCTGCCTTGCAAGAATTATT;SOR=2.621;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=13;TCR=45;TR=58;WE=45044155;WS=45044137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr17	45050533	rs11079746	T	C	3359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=61;NR=49;PP=1527;SC=AAAACTGGAATGCCGGATGAG;SOR=0.708;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=61;TCR=49;TR=110;WE=45050541;WS=45050523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr17	45198343	rs731790	C	T	1055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.332;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=24;PP=521;ReadPosRankSum=-1.896;SC=GTGTGTCATCCGCATCTGTCA;SOR=0.826;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=130;TCF=67;TCR=63;TR=50;WE=45198351;WS=45198333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,57:0.39:145
chr17	45198400	rs938904	G	A	999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.943;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=30;PP=706;ReadPosRankSum=-1.073;SC=AAATAAAACAGAAGTCCACAG;SOR=0.911;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=69;TCF=24;TCR=45;TR=43;WE=45198408;WS=45198390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,45:0.59:76
chr17	45214519	rs74348171	A	G	734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FS=1.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.56;MQRankSum=-13.756;QD=3.28;ReadPosRankSum=-6.141;SOR=0.556;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:188,36:0.16:224
chr17	45214527	rs62075618	T	C	924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FS=1.337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.11;MQRankSum=-13.728;QD=4.20;ReadPosRankSum=-4.049;SOR=0.576;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:177,43:0.20:220
chr17	45214558	rs77685276	G	A	775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FS=4.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.95;MQRankSum=-11.382;QD=4.97;ReadPosRankSum=2.595;SOR=0.429;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,52:0.33:156
chr17	45214604	rs75661039	AT	TC	1006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.930;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.56;MQRankSum=-7.939;QD=13.60;ReadPosRankSum=-0.650;SOR=0.530;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,32:0.43:74
chr17	45214631	rs11570544	G	A	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=11.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.15;MQRankSum=-5.946;QD=1.26;ReadPosRankSum=0.248;SOR=3.318;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,6:0.16:37
chr17	45214685	rs11570543	T	C	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.253;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=7;PP=143;ReadPosRankSum=0.188;SC=CAATATCATGTTCCCGTTGCA;SOR=0.740;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=44;TCF=22;TCR=22;TR=13;WE=45214693;WS=45214675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,13:0.29:45
chr17	45234406	rs112848754	CA	C	196.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQRankSum=-3.201;QD=5.62;ReadPosRankSum=0.413;SOR=0.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,8:0.23:35
chr17	45234417	rs193061947	A	G	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=1.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQRankSum=-4.862;QD=4.67;ReadPosRankSum=0.563;SOR=1.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,7:0.19:37
chr17	45234420	rs78493795	T	G	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=1.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQRankSum=-4.787;QD=4.88;ReadPosRankSum=0.400;SOR=1.312;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,7:0.19:36
chr17	45259022	rs11570461	G	T	614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=13;PP=326;ReadPosRankSum=0.252;SC=GGAGGAAAAAGAACATAAATA;SOR=0.604;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=21;TCR=22;TR=26;WE=45259030;WS=45259012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,29:0.60:48
chr17	45266432	rs11079761	C	G	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.496;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=101;ReadPosRankSum=1.590;SC=CTAGGCCGCACCAGGCCGCGG;SOR=1.206;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=37;TCF=23;TCR=14;TR=10;WE=45266440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,10:0.26:38
chr17	45291103	rs11327482	TG	T	2767.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=21;PP=1441;SC=TACTTCCCTTTGGGGGGCCTT;SOR=1.559;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=61;TCF=33;TCR=28;TR=48;WE=45291111;WS=45291093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr17	45300218	rs4968309	C	T	408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=2;PP=325;SC=CTGCCCTCCACCCACCTTCTC;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=45300226;WS=45300208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	45380002	rs3760372	T	C	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=101;ReadPosRankSum=0.366;SC=CATACTTCCCTGGAAGTCCTG;SOR=0.571;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=37;TCF=25;TCR=12;TR=13;WE=45380010;WS=45379992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,14:0.34:41
chr17	45385012	rs3809863	C	T	595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=0.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.58;ReadPosRankSum=-0.392;SOR=0.601;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,37:0.28:130
chr17	45422628	rs7214410	A	G	720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=16;PP=511;SC=GCAAAAGTAGATAGTTTAATC;SOR=2.494;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=21;WE=45422636;WS=45422618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	45425115	rs7206971	G	A	727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=18;NR=5;PP=500;SC=AGAGTGGGGGGAATAAGGATA;SOR=2.584;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=23;WE=45425123;WS=45425105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	45425144	rs3851808	C	T	984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=22;NR=11;PP=551;SC=TTTTGATTAACTAACTAAATG;SOR=1.432;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=22;TCR=11;TR=33;WE=45425152;WS=45425134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr17	45438886	rs10538163	CAGTG	C	4483.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=53;PP=2930;SC=CCTATATTGACAGTGAGTTAT;SOR=1.496;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=3;TCR=57;TR=56;WE=45438897;WS=45438876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr17	45438952	rs6504872	C	T	784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=21;PP=563;SC=CATTTTTTTCCGGATATCAAT;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=45438960;WS=45438942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	45451894	rs4968318	G	A	1406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=22;PP=893;SC=GTTATCAAGTGTAGCAGGATG;SOR=0.808;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=52;TCF=30;TCR=22;TR=51;WE=45451902;WS=45451884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	45479446	rs12452315	A	C	1493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=10;PP=831;SC=GCTTTATTGGATCTGACTTTT;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=43;WE=45479454;WS=45479436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr17	45479706	rs11079774	C	G	540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=13;PP=368;SC=GCAGATGAAACTTGGTTTTGA;SOR=2.833;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=16;WE=45479714;WS=45479696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	45479733	rs12452796	A	C	374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=241;SC=ATTGGCTGGCATATAGGAACT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=45479741;WS=45479723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	45567593	rs142960189	ATC	A	9395.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=89;PP=2975;SC=TCTCTCTATCATCTCTCCTTT;SOR=0.778;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=111;TCF=19;TCR=92;TR=108;WE=45567602;WS=45567583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr17	45569815	rs2610367	A	G	2956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=68;PP=2023;SC=TTGAGGTATGAGGGCTGCCAT;SOR=1.300;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=41;TCR=68;TR=109;WE=45569823;WS=45569805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr17	45623409	.	G	GGT,GGTGT	197.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.48;BaseQRankSum=-1.889;ClippingRankSum=0.000;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=1.525;NF=1,1;NR=33,33;PP=283,568;ReadPosRankSum=0.706;SC=GCATATGTGGGGTGTGTGTGT;SOR=0.804;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=93;TCF=1;TCR=92;TR=34,34;WE=45623417;WS=45623399;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.42:33
chr17	45623441	rs181591349	A	T	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.25;MQRankSum=2.187;QD=3.35;ReadPosRankSum=0.815;SOR=0.506;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,9:0.24:37
chr17	45663680	rs372546318	GTA	G	335.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.5;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-2.391;NF=6;NR=6;PP=384;ReadPosRankSum=0.314;SC=TGATGCAAGAGTATATATATA;SOR=0.815;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=46;TCF=18;TCR=28;TR=12;WE=45663691;WS=45663670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,19:0.27:70
chr17	45663912	rs112743441	T	G	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.762;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.249;NF=3;NR=4;PP=87;ReadPosRankSum=0.150;SC=ATTTCAAGAATGCAGATGGAC;SOR=0.729;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=29;TCF=16;TCR=13;TR=7;WE=45663920;WS=45663902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,7:0.24:29
chr17	45668339	.	T	G	42	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;FR=0.5000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=29;MQ=43.55;NF=0;NR=5;PP=42;QD=15.3542425094;SC=ACTTTGAAAATAAGAGAAAAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=5;WE=45668347;WS=45668329;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:19,5:0.21:24
chr17	45742233	rs56226803	T	A	203.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=164;SC=TGGACCTATATTATATGGCCT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=45742241;WS=45742223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	45754569	rs11301979	AC	A	1192.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=22;PP=945;SC=TTAAATATCGACCAGGCTGGG;SOR=2.517;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=24;WE=45754577;WS=45754559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr17	45755810	rs4239162	G	A	747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=19;PP=511;SC=CCCTTCGTCCGCTCGCCAATG;SOR=1.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=27;WE=45755818;WS=45755800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	45759767	rs7223246	C	T	760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.369;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=23;PP=533;ReadPosRankSum=0.186;SC=CATCTGTTTTCAGATCTGTTA;SOR=1.136;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=46;TCF=15;TCR=31;TR=33;WE=45759775;WS=45759757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,33:0.72:46
chr17	45774072	rs8078309	T	C	4840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=88;NR=67;PP=2425;SC=CCACCCCACCTGCAGTACCCA;SOR=0.771;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=155;TCF=88;TCR=67;TR=155;WE=45774080;WS=45774062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr17	45786452	rs4794057	C	T	382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=5;PP=192;SC=CCAGCCACCACGTGAAGGCCG;SOR=0.818;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=13;WE=45786460;WS=45786442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	45786621	rs80267077	G	A	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.86;ReadPosRankSum=-1.662;SOR=0.559;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,26:0.39:66
chr17	45885687	rs9907142	A	G	1126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=11;PP=671;SC=CCATGTTCCCATAGCCTGGCT;SOR=1.662;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=30;TCR=11;TR=41;WE=45885695;WS=45885677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	45885756	rs9911983	C	T	914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=17;PP=523;ReadPosRankSum=-0.698;SC=CGCTGCTATCCGTCTGCCGCC;SOR=0.706;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=115;TCF=76;TCR=39;TR=44;WE=45885764;WS=45885746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,50:0.37:134
chr17	45887951	rs2074189	G	T	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.428;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=146;ReadPosRankSum=-1.838;SC=GAGAGTCTAAGAATCCCACCT;SOR=0.256;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=48;TCF=37;TCR=11;TR=13;WE=45887959;WS=45887941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,12:0.24:49
chr17	45888251	rs2074188	C	G	1361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=31;PP=813;ReadPosRankSum=-0.567;SC=CACCATTAGGCTACCCCAAAG;SOR=0.750;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=94;TCF=45;TCR=49;TR=58;WE=45888259;WS=45888241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,63:0.59:106
chr17	45890707	rs2301690	C	T	988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=25;PP=548;ReadPosRankSum=-0.225;SC=GGTTGAAGGGCTTGCAGCCGG;SOR=0.709;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=154;TCF=76;TCR=78;TR=51;WE=45890715;WS=45890697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,58:0.33:175
chr17	45890898	rs55928544	A	G	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.900;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=10;PP=326;ReadPosRankSum=1.852;SC=GGGAGAAAAGATCCCAGGGAG;SOR=0.524;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=69;TCF=43;TCR=26;TR=23;WE=45890906;WS=45890888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,27:0.34:80
chr17	45892545	rs55998645	T	C	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.654;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=213;ReadPosRankSum=1.257;SC=AGGTCCCCCCTACCCCGCCTC;SOR=1.501;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=13;WE=45892553;WS=45892535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr17	45892821	rs17700604	G	A	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.659;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=107;ReadPosRankSum=1.061;SC=AGGCATAACCGGGCACTTTTG;SOR=0.041;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=9;WE=45892829;WS=45892811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
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chr17	45897531	rs1985407	C	A	4323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=67;PP=2513;SC=TGTCTGGTTCCAGCTTGGCCC;SOR=0.718;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=74;TCR=67;TR=141;WE=45897539;WS=45897521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr17	45904163	rs3809869	A	G	4208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.688;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=75;PP=2604;ReadPosRankSum=0.695;SC=AACAGCAGGGAAAAATGGCTT;SOR=0.689;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=225;TCF=119;TCR=106;TR=164;WE=45904171;WS=45904153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,182:0.71:255
chr17	45904420	rs11538868	C	T	1170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.195;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=17;PP=690;ReadPosRankSum=0.511;SC=TTGGGGAAGACCTTCATCAGG;SOR=0.945;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=146;TCF=98;TCR=48;TR=55;WE=45904428;WS=45904410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,61:0.40:154
chr17	45905779	rs17774166	G	A	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-3.951;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=63;ReadPosRankSum=-0.753;SC=GACAATGGCTGAGTGTCCTAC;SOR=0.065;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=7;WE=45905787;WS=45905769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr17	45905850	rs4793671	C	T	1856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=44;NR=21;PP=1048;SC=GTGACATGTACCCAAATTCCT;SOR=1.478;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=65;TCF=44;TCR=21;TR=65;WE=45905858;WS=45905840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr17	45912696	rs17701113	C	T	682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.536;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=16;PP=378;ReadPosRankSum=0.020;SC=GCTTGGTTTCCCCACTTCGGT;SOR=0.554;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=103;TCF=53;TCR=50;TR=35;WE=45912704;WS=45912686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,40:0.34:118
chr17	45915468	rs878295	T	G	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=147;ReadPosRankSum=-0.169;SC=AGAAAGGAGATACCCCCCGAC;SOR=0.789;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=53;TCF=23;TCR=30;TR=14;WE=45915476;WS=45915458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,18:0.30:61
chr17	45915788	rs7350974	T	C	6187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.241;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=99;NR=106;PP=2965;ReadPosRankSum=0.635;SC=GCCACCCCCATCCCGAAGATG;SOR=0.406;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=207;TCF=100;TCR=107;TR=205;WE=45915796;WS=45915778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,231:1.00:232
chr17	45917147	rs1004770	C	G	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=35;ReadPosRankSum=-0.948;SC=TGGCACTGATCGTATCAAATG;SOR=0.382;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=5;WE=45917155;WS=45917137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr17	45992580	rs60876460	C	CA	320.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=1.571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.06;ReadPosRankSum=0.405;SOR=1.262;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr17	45994044	rs2228253	C	T	2602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.174;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=50;PP=1605;ReadPosRankSum=0.696;SC=TGTGGTGAAGCTGACAGGTGG;SOR=0.802;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=152;TCF=75;TCR=77;TR=96;WE=45994052;WS=45994034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,112:0.61:184
chr17	45994094	rs2228251	T	C	3278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=54;PP=1727;ReadPosRankSum=0.802;SC=TCAACAACCTTGTGAACGCCA;SOR=0.688;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=195;TCF=115;TCR=80;TR=129;WE=45994102;WS=45994084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,149:0.66:226
chr17	45994154	rs2229358	G	A	4278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.351;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=76;PP=2197;ReadPosRankSum=-0.337;SC=CCCCAACCCCGCTGTCTAAGA;SOR=0.530;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=227;TCF=126;TCR=101;TR=163;WE=45994162;WS=45994144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,192:0.72:265
chr17	46002744	rs1130932	G	T	1891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=36;PP=1085;ReadPosRankSum=1.048;SC=AGAAGCACGTGTGCCACATCC;SOR=0.652;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=120;TCF=67;TCR=53;TR=80;WE=46002752;WS=46002734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,86:0.66:130
chr17	46022889	rs2002136	C	T	1671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=26;PP=891;ReadPosRankSum=-1.313;SC=CTCTCCCTGTCCTGATGGCTG;SOR=0.611;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=87;TCF=52;TCR=35;TR=63;WE=46022897;WS=46022879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,75:0.73:103
chr17	46048157	rs2525084	A	G	365.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.64;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	46048165	rs2597168	T	C	331.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.47;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	46048168	rs2255697	C	T	331.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.47;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	46048592	rs2905846	A	G	3629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=61;NR=62;PP=2151;SC=CTCCCTCCGGAAGCGGCTCAA;SOR=0.883;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=61;TCR=62;TR=123;WE=46048600;WS=46048582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr17	46048858	rs2525085	C	G	2274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=43;PP=1397;SC=GAGCTCTGACCCCTGAAAGCC;SOR=1.048;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=80;TCF=36;TCR=44;TR=78;WE=46048866;WS=46048848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr17	46048920	rs72823513	A	G	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.591;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=72;ReadPosRankSum=-0.347;SC=CTGTGGCCAGACCTGCTTCCC;SOR=0.336;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=34;TCF=13;TCR=21;TR=9;WE=46048928;WS=46048910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,9:0.25:36
chr17	46051911	rs886444	G	A	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=45;ReadPosRankSum=1.253;SC=TCTGTGAGTGGGAAGAGACTG;SOR=0.593;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=5;WE=46051919;WS=46051901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr17	46052793	rs2597172	A	G	946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=16;PP=489;SC=GCCTGGTTGCACCCCCTTTGG;SOR=1.061;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=15;TCR=16;TR=31;WE=46052801;WS=46052783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr17	46054264	rs2525087	C	A	3538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=59;NR=60;PP=1915;SC=GTGTCTGTAACGGCATCACTT;SOR=0.886;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=59;TCR=60;TR=119;WE=46054272;WS=46054254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr17	46055106	rs2597173	C	T	2428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=25;PP=1534;SC=GAATGTGCAGCCATTGACCTC;SOR=1.531;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=57;TCR=25;TR=82;WE=46055114;WS=46055096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr17	46055347	rs2875746	A	G	1294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=27;PP=837;SC=CTAGAAACAAAAAATGCAGCG;SOR=2.007;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=11;TCR=27;TR=38;WE=46055355;WS=46055337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	46059071	rs2737	T	C	2149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=0.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.47;ReadPosRankSum=0.290;SOR=0.813;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,98:0.71:139
chr17	46103760	rs12051	A	G	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.676;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=16;PP=344;ReadPosRankSum=0.184;SC=TGGGGAAATGATCTGGGGGGC;SOR=0.650;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=97;TCF=52;TCR=45;TR=32;WE=46103768;WS=46103750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,36:0.34:107
chr17	46106634	rs9898218	G	T	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.465;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=105;ReadPosRankSum=-0.185;SC=CCTCTCCGAAGGCATCCTGCA;SOR=0.169;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=9;WE=46106642;WS=46106624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr17	46109371	rs72823530	G	A	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=1.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.13;ReadPosRankSum=2.299;SOR=0.437;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,19:0.42:45
chr17	46114692	rs41280120	C	G	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.576;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=140;ReadPosRankSum=-1.455;SC=GGCCCTGGCCCGGGTAGACTC;SOR=1.051;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=11;WE=46114700;WS=46114682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr17	46115009	.	TC	T	792.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=0.000;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=411;ReadPosRankSum=0.311;SC=CCGCCCGGGATCCCCGCGCCC;SOR=0.708;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=19;WE=46115017;WS=46114999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,29:0.47:62
chr17	46115072	rs199699704	C	CG	1405.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.16;SOR=1.483;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr17	46115084	rs201261614	T	TGG	1148.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.18;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	46115122	.	A	AG	261.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=83;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=8;PP=333;SC=GGACGTGGCCAGCCTCGGGCC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=46115130;WS=46115112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	46132212	rs373501023	T	TG	740.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=15;PP=677;SC=GGAAGGGGGCTGGCTGGGCCG;SOR=1.931;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=46132220;WS=46132202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	46132424	rs72823599	C	G	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.135;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=182;ReadPosRankSum=-0.960;SC=GGGGGCCATGCCAAAGGCAGC;SOR=0.454;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=39;TCR=14;TR=18;WE=46132432;WS=46132414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,19:0.31:61
chr17	46134798	rs2229368	C	T	1712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=32;PP=908;ReadPosRankSum=-0.572;SC=CTCTTCTGACCGGGACAGAGT;SOR=0.725;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=105;TCF=53;TCR=52;TR=67;WE=46134806;WS=46134788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,77:0.66:117
chr17	46190106	.	T	C	53	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;FR=0.5000;HP=15;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=28;MQ=53.18;NF=0;NR=3;PP=53;QD=29.2570708491;SC=TTTTTTTTTTTTTTGAGATGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=3;WE=46190114;WS=46190096;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:9,3:0.25:12
chr17	46190819	rs8080662	G	A	2514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=32;NR=44;PP=1218;SC=GGGTGCTTATGTAGGAACTGG;SOR=1.289;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=77;TCF=32;TCR=45;TR=76;WE=46190827;WS=46190809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr17	46198876	rs3744346	G	C	528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=11;PP=223;SC=AGTGAGCTCTGGGTTCTGCTC;SOR=1.329;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=7;TCR=11;TR=18;WE=46198884;WS=46198866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	46214736	rs74885375	T	C	2194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.945;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=54;PP=1100;ReadPosRankSum=-1.487;SC=AGTTAGAATTTGTTCATGCTT;SOR=1.078;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=140;TCF=60;TCR=80;TR=90;WE=46214744;WS=46214726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,104:0.65:161
chr17	46239985	rs208005	A	G	1689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=32;PP=963;SC=TTTCCGAGGTACCCATGTTTT;SOR=1.498;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=21;TCR=32;TR=53;WE=46239993;WS=46239975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr17	46262171	rs2278868	C	T	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=1.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.74;ReadPosRankSum=0.752;SOR=0.512;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,19:0.28:67
chr17	46265433	rs2305433	G	C	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=76;ReadPosRankSum=-0.073;SC=CACTCCCACAGGTTATCCCAT;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=7;WE=46265441;WS=46265423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr17	46423113	rs116928151	A	G	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=232;ReadPosRankSum=-0.391;SC=CAGCACCACAATGAAACAAAT;SOR=0.420;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=12;WE=46423121;WS=46423103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr17	46441132	rs77455117	G	A	3328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=65;PP=2031;ReadPosRankSum=0.353;SC=AAAACCATACGTGGTCAAAGA;SOR=0.716;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=217;TCF=117;TCR=100;TR=142;WE=46441140;WS=46441122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,151:0.65:233
chr17	46607021	rs7226137	T	C	4225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=83;NR=58;PP=2806;SC=GACCCGACCTTCCTCTCGCTC;SOR=0.923;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=141;TCF=83;TCR=58;TR=141;WE=46607029;WS=46607011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr17	46620288	rs1042815	G	A	915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=3;PP=718;SC=AGAAGAAAGGGAGTGGATTAA;SOR=3.912;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=29;WE=46620296;WS=46620278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	46622335	rs111979968	A	AC	456.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=52;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=18;PP=574;SC=ATCGGAAGGGACCCCCCTCCT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=46622357;WS=46622325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	46622349	rs9899351	C	A	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.697;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5125;FS=6.929;HP=7;HapScore=2;MGOF=52;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=14;PP=270;ReadPosRankSum=1.047;SC=CCCTCCTGCACCCCCCCCGAT;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=14;WE=46622357;WS=46622325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr17	46629593	rs2229304	G	T	2228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=42;NR=37;PP=1432;SC=GCCGACAGGGGCTCGGGGGCC;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=42;TCR=37;TR=79;WE=46629601;WS=46629583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr17	46629933	.	AC	A	25	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5031;HP=12;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=25;QD=10.3333333333;SC=GACACGCCGGACCCCCCCCCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=46629941;WS=46629923;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:2,3:0.60:5
chr17	46651061	rs2288277	T	C	1348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=36;NR=13;PP=845;SC=GCAAACCTGCTGAAGCATCCA;SOR=1.958;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=36;TCR=13;TR=49;WE=46651069;WS=46651051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
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chr17	46669430	rs9299	C	T	54.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=1;PP=23;SC=AGACCTAAGACCAAACGAAAT;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=46669438;WS=46669425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	46670520	rs7406798	T	C	577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=0;PP=346;SC=AGGGGAATATTTGCGGAGTCT;SOR=2.948;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=46670528;WS=46670510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	46673723	rs12949148	TC	GT	10780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=124;NR=70;PP=2947;SC=TCTGACGCCCTCGGCTCCCCA;SOR=1.252;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=210;TCF=131;TCR=79;TR=194;WE=46673732;WS=46673713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr17	46688256	rs7406910	T	C	8681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.949;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=119;NR=147;PP=2965;ReadPosRankSum=2.276;SC=GAAAATAAAGTATTCGCATAA;SOR=0.169;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=268;TCF=119;TCR=149;TR=266;WE=46688264;WS=46688246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,309:0.99:311
chr17	46691587	rs112987208	A	AGGCCCCCTGCCC	1076.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=1;PP=830;SC=CCGGCCTGCCAGGCCTTGGGC;SOR=2.636;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=14;WE=46691595;WS=46691577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	46691717	.	C	A	1451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.252;ClippingRankSum=0.000;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.958;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=31;PP=703;ReadPosRankSum=-1.783;SC=CTCGCCCAGGCCGCTGGCGGC;SOR=0.507;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=228;TCF=127;TCR=101;TR=65;WE=46691725;WS=46691707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:181,83:0.31:264
chr17	46709835	rs718079	A	G	217.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=2;PP=150;SC=CCAGCTAAGCAAGGAGCAGTA;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=46709843;WS=46709825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	46799775	rs117391237	T	G	1241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.807;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=32;PP=800;ReadPosRankSum=3.146;SC=TCTGCAAAGGTGGGGACCAGA;SOR=0.988;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=84;TCF=33;TCR=51;TR=50;WE=46799783;WS=46799765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,54:0.59:92
chr17	46799812	rs1054072	A	G	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=139;ReadPosRankSum=1.106;SC=CTTGCAAGCAAGCATCGGCCT;SOR=0.871;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=47;TCF=13;TCR=34;TR=13;WE=46799820;WS=46799802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,14:0.27:51
chr17	46840178	rs12936178	T	C	2198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=33;PP=1394;ReadPosRankSum=-0.208;SC=GTTGGCCCCATTGCTGCTACT;SOR=0.646;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=132;TCF=86;TCR=46;TR=90;WE=46840186;WS=46840168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,99:0.66:149
chr17	46862675	rs507973	TC	AT	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=300;ReadPosRankSum=-0.201;SC=AGGAAAGCAGTCGATAGTAAA;SOR=1.426;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=6;WE=46862684;WS=46862665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr17	46867199	rs1627452	G	T	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.429;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=55;ReadPosRankSum=1.097;SC=GATTACAGGTGTGAGCCACTG;SOR=0.527;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=5;WE=46867207;WS=46867189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr17	46874362	.	A	AT	102.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=0.000;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.53;ReadPosRankSum=-0.882;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,13:0.19:67
chr17	46878625	rs17634167	A	G	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.049;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=259;ReadPosRankSum=-0.792;SC=ACTCAGCAGGAAGACACCAGG;SOR=0.441;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=76;TCF=54;TCR=22;TR=21;WE=46878633;WS=46878615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,25:0.28:88
chr17	46879079	rs12947660	G	T	253.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=216;SC=CCATTACTAGGTGCTCCCAGA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=46879087;WS=46879069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	46881748	rs489005	T	C	5179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=76;PP=2401;SC=AAACAAGAACTGGAATGCACA;SOR=0.703;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=170;TCF=94;TCR=76;TR=170;WE=46881756;WS=46881738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr17	46894597	rs114722761	A	T	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.885;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=47;ReadPosRankSum=-1.255;SC=GCGCTAGGGGAGGGGCGCGCC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=4;WE=46894605;WS=46894587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr17	46926772	rs551605	A	G	300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=7;PP=191;SC=ACCTTGGAGCATGGAGATCAG;SOR=1.802;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=46926780;WS=46926762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	46929992	.	TAG	T	2306.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=1.116;ClippingRankSum=0.000;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.643;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=32;PP=1410;ReadPosRankSum=0.676;SC=ACTGAACAGGTAGAGTCATGA;SOR=0.977;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=95;TCF=13;TCR=82;TR=36;WE=46930001;WS=46929982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,64:0.36:178
chr17	46934001	rs72437948	GCATT	G	1054.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=17;PP=861;SC=TAAATGCTGTGCATTCATTCA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=17;WE=46934012;WS=46933991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	46970836	rs684682	A	G	1965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=41;PP=1246;SC=GCCGCGCCGCAGTGCTCTGTA;SOR=1.785;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=20;TCR=41;TR=61;WE=46970844;WS=46970826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr17	46972479	rs3080082	ATCTC	A	4488.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.539;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.948;NF=23;NR=41;PP=2974;ReadPosRankSum=1.903;SC=ATGCCATACTATCTCTCTGCT;SOR=0.993;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=131;TCF=40;TCR=91;TR=64;WE=46972490;WS=46972469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,118:0.52:228
chr17	46973139	rs35074390	TG	T	772.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=14;PP=399;SC=TGAGGCTCCATGGGGGGGTCA;SOR=1.981;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=15;WE=46973147;WS=46973129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	46985756	rs71144541	AG	A	481.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=1;PP=416;SC=GTGGAAGCGGAGGGGGTGGGG;SOR=4.174;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=13;WE=46985764;WS=46985746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	46993370	rs4378658	G	A	603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=341;ReadPosRankSum=0.732;SC=TGGTGTTGCCGGGCCCCAGGG;SOR=0.495;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=25;WE=46993380;WS=46993360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,26:0.70:37
chr17	47000251	rs1058018	C	T	911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.21;ReadPosRankSum=-0.172;SOR=0.754;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,45:0.65:69
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chr17	47011897	rs57901004	C	T	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.16;ReadPosRankSum=1.042;SOR=0.922;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,27:0.77:35
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chr17	47014754	rs2132200	T	C	763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=21;PP=593;SC=CTTTGGGACATCGAGCTAGGT;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=47014762;WS=47014744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	47035869	rs4793605	T	C	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.497;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.421;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=4;PP=115;ReadPosRankSum=-0.682;SC=TTCCTTTTCATTGGGTGGTGC;SOR=0.056;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=9;WE=47035877;WS=47035859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr17	47036043	rs72833611	C	G	689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.896;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=19;PP=436;ReadPosRankSum=0.605;SC=GGGCAGAATCCAGTCCTGAGC;SOR=1.036;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=81;TCF=40;TCR=41;TR=34;WE=47036051;WS=47036033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,36:0.41:87
chr17	47038391	rs6504587	T	C	924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=22;PP=695;SC=TAGCCTGAGCTTCGCCCAGAG;SOR=1.681;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=10;TCR=22;TR=32;WE=47038399;WS=47038381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	47039132	rs2291725	T	C	1251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.777;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=18;PP=566;ReadPosRankSum=-0.062;SC=TTAGCTTGACTGGCCAGCTCC;SOR=0.557;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=49;TCR=30;TR=47;WE=47039140;WS=47039122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,59:0.60:98
chr17	47039254	rs2291726	T	C	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.095;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=10;PP=219;ReadPosRankSum=-2.174;SC=TCTTTTAATATCTGAACCCCA;SOR=0.970;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=54;TCF=27;TCR=27;TR=19;WE=47039262;WS=47039244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,24:0.36:67
chr17	47044463	rs62078384	C	T	2118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FS=1.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.85;ReadPosRankSum=1.230;SOR=0.745;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,98:0.64:153
chr17	47076449	.	A	AT	227.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.048;ClippingRankSum=0.000;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=6.367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.74;ReadPosRankSum=-0.479;SOR=1.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,23:0.28:83
chr17	47076551	rs2411760	G	T	1239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.75;SOR=1.942;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr17	47076557	rs1948513	G	C	1190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.53;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	47103860	rs141422475	A	G	2133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.325;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=49;PP=1292;ReadPosRankSum=-0.634;SC=AGTATGGTACAGTAGAGAACT;SOR=0.858;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=145;TCF=68;TCR=77;TR=91;WE=47103868;WS=47103850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,98:0.63:155
chr17	47103973	.	CCCTT	C	62.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.799;ClippingRankSum=-0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.49;MQRankSum=1.150;QD=5.23;ReadPosRankSum=-1.248;SOR=0.275;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr17	47109368	rs34685424	TG	T	2300.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.263;NF=2;NR=54;PP=1081;ReadPosRankSum=-1.170;SC=CTGGGTGCGGTGGGGGGGGGT;SOR=1.112;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=2;TCR=62;TR=56;WE=47109376;WS=47109358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,79:0.99:80
chr17	47109427	rs8079385	C	G	684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=20;PP=536;SC=TCAGGGGGGTCTAGGCAGGCT;SOR=3.352;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=47109435;WS=47109417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	47119832	rs2289637	C	T	1305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=29;PP=852;SC=TGCCCTGTGCCGTGTGGCCTT;SOR=1.514;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=15;TCR=29;TR=44;WE=47119840;WS=47119822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr17	47120776	rs2289636	T	C	648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.21;SOR=2.030;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	47122492	rs72833654	G	A	5120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=97;PP=2954;ReadPosRankSum=1.363;SC=TTCCCCTGAGGTAGGAAAAAG;SOR=0.462;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=166;TCF=68;TCR=98;TR=165;WE=47122500;WS=47122482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,188:0.99:189
chr17	47210429	rs7207842	A	G	3442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.69;SOR=0.723;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr17	47210506	rs7207403	C	A	1176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.235;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=26;PP=661;ReadPosRankSum=-0.623;SC=GGCTTCGGGGCTCTCTGCTTG;SOR=0.407;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=69;TCF=32;TCR=37;TR=51;WE=47210514;WS=47210496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,54:0.73:74
chr17	47230360	rs62079773	T	G	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=3.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.081;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=18;PP=363;ReadPosRankSum=-1.509;SC=GGCTCATGCCTGTAATTCCAG;SOR=1.384;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=65;TCF=17;TCR=48;TR=22;WE=47230368;WS=47230350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,23:0.31:74
chr17	47237802	rs1523137	A	G	441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=2;PP=390;SC=TCTCATCCCAACCAGGACTCT;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=47237810;WS=47237792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	47238028	rs8071836	C	T	3740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=64;PP=2081;SC=CTTGGGGCTCCGTGGTGGCAA;SOR=0.945;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=123;TCF=59;TCR=64;TR=123;WE=47238036;WS=47238018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr17	47241604	rs8074457	T	C	5659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=106;PP=2965;SC=TTAAAGACAATCACGTGGAGT;SOR=0.994;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=191;TCF=85;TCR=106;TR=191;WE=47241612;WS=47241594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr17	47245929	rs59809949	C	T	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.48;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.410;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=99;ReadPosRankSum=1.559;SC=GAAGGATAGACAGAGAAATAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=6;WE=47245937;WS=47245919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr17	47246163	rs7224888	T	C	822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=22;PP=429;ReadPosRankSum=1.182;SC=CTTCCCCAGCTGCGTGGTGAC;SOR=0.706;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=51;TCF=19;TCR=32;TR=35;WE=47246171;WS=47246153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,38:0.72:53
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chr17	47280301	rs4794029	T	C	2590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.670;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=49;PP=1403;ReadPosRankSum=-0.914;SC=TGGATTCATGTGATGTCTTCT;SOR=0.585;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=147;TCF=81;TCR=66;TR=107;WE=47280309;WS=47280291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,116:0.73:158
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chr17	47390014	rs2072153	G	C	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=60;ReadPosRankSum=-0.842;SC=GCACACAGAAGAACAAGGGAA;SOR=0.368;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=4;WE=47390022;WS=47390004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr17	47588000	rs11466155	C	T	5940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=103;NR=97;PP=2965;SC=TGGTTGTGGGCCTTGTGGCCT;SOR=0.720;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=201;TCF=104;TCR=97;TR=200;WE=47588008;WS=47587990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr17	47688526	rs10514970	C	T	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.948;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=312;ReadPosRankSum=0.868;SC=TATTTAGCTGCAGTTTGTTTT;SOR=1.931;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=16;WE=47688534;WS=47688516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,17:0.71:24
chr17	47688881	rs140209761	T	TAGAG	1574.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=24;PP=1445;SC=TGCCAGCAGATAGACGACTTT;SOR=3.086;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=24;WE=47688889;WS=47688871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr17	47700311	rs3815473	T	G	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.763;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=405;ReadPosRankSum=1.626;SC=TTTGACCTGATAGAGGCTGGA;SOR=1.329;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=24;WE=47700319;WS=47700301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,24:0.71:34
chr17	47700372	.	A	AT	26	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5015;HP=14;HapScore=2;MGOF=19;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=26;QD=10.0;SC=AGGTCCTAAAATTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=3;WE=47700380;WS=47700362;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr17	47780707	rs375908491	TGC	T	114.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=3.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.10;ReadPosRankSum=-1.354;SOR=0.207;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
chr17	47780710	rs10595474	GCA	G	155.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.964;HP=2;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=274;ReadPosRankSum=1.598;SC=CAAAATGTGCGCACACACACA;SOR=2.187;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=9;WE=47780719;WS=47780697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr17	47785064	rs9908959	C	A	624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=9;PP=361;SC=TGGGGAGAGACTGTCGGCCCG;SOR=0.874;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=12;TCR=9;TR=21;WE=47785072;WS=47785054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	47801651	rs11079874	A	G	96.90	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5564;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=99;ReadPosRankSum=1.383;SC=CACCCCCCACACAAACCTGTT;SOR=0.368;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=7;WE=47801659;WS=47801641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr17	47888852	rs4462645	A	G	5389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=104;NR=75;PP=2965;SC=CAACGGAGAGACAGCTTCGAT;SOR=0.864;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=180;TCF=105;TCR=75;TR=179;WE=47888860;WS=47888842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr17	48046775	rs58769681	G	A	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=219;ReadPosRankSum=-0.531;SC=AAAGAGAGTTGGCAGCGGGAG;SOR=1.473;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=12;WE=48046783;WS=48046766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr17	48046963	rs61749026	A	G	2193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=381;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.816;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=53;PP=1293;ReadPosRankSum=1.033;SC=GCCTCCCCCAATTTGTCCTAC;SOR=0.748;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=350;TCF=182;TCR=168;TR=116;WE=48046971;WS=48046953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:253,128:0.34:381
chr17	48068720	rs8081044	T	A	205.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=81;SC=GTCCATGCAATTGTCATCTGG;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=48068728;WS=48068710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	48151353	rs2285524	T	C	3097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.576;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=56;PP=1999;ReadPosRankSum=-0.790;SC=AGGGGCTCCTTAGACAGCCCC;SOR=0.636;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=178;TCF=99;TCR=79;TR=127;WE=48151361;WS=48151343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,137:0.71:194
chr17	48151908	rs4793639	T	C	4604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=87;NR=71;PP=2617;SC=GGTGAGATTGTTCTGCCCACC;SOR=0.705;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=159;TCF=87;TCR=72;TR=158;WE=48151916;WS=48151898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr17	48153924	rs2301627	T	C	2794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.627;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=55;PP=1827;ReadPosRankSum=-2.181;SC=TGGTGCGGCCTTCACACCTCC;SOR=0.807;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=150;TCF=72;TCR=78;TR=104;WE=48153932;WS=48153914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,117:0.70:167
chr17	48155771	rs16948648	C	T	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=130;ReadPosRankSum=0.530;SC=CAGGCCTCCACTTTCCCTGGA;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=8;WE=48155779;WS=48155761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr17	48157827	.	G	GGGGTGT	250	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=17;MQ=62.97;NF=1;NR=7;PP=250;QD=31.625;SC=TCATAGCATGGGTGTGTGTGT;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=8;WE=48157835;WS=48157817;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,8:0.53:15
chr17	48157869	.	T	A	82	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=82;QD=29.1928031368;SC=TGTGTGTGTGTGATTTGCGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=4;WE=48157877;WS=48157859;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,4:0.80:5
chr17	48158685	rs55893410	C	T	1083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.730;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=15;PP=634;ReadPosRankSum=2.820;SC=ATTACAGAGACTTTGACCGAG;SOR=0.982;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=80;TCF=52;TCR=28;TR=46;WE=48158693;WS=48158674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,52:0.55:94
chr17	48158843	rs3785925	G	C	1505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.781;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=35;PP=1068;ReadPosRankSum=1.945;SC=CTTTTAAGAGGACACTGACGC;SOR=0.931;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=86;TCF=34;TCR=52;TR=55;WE=48158851;WS=48158833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,60:0.63:95
chr17	48165064	rs12951197	T	C	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.98;ReadPosRankSum=1.479;SOR=0.606;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,12:0.22:54
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chr17	48174908	rs9839	C	T	2208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.293;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=50;PP=1273;ReadPosRankSum=1.817;SC=GCACACCCTCCGTGCAGCTGG;SOR=0.485;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=137;TCF=57;TCR=80;TR=89;WE=48174916;WS=48174898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,99:0.67:147
chr17	48183471	rs11237	G	A	831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.744;HP=7;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=21;PP=437;ReadPosRankSum=-0.710;SC=CGGGCGGTGGGGGGGGCGGTG;SOR=0.573;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=109;TCF=42;TCR=67;TR=38;WE=48183491;WS=48183458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,44:0.39:114
chr17	48184288	rs847694	G	A	1375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.210;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=28;PP=900;ReadPosRankSum=0.603;SC=GAGAAGCCCCGGGGACCCCTC;SOR=0.423;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=71;TCF=32;TCR=39;TR=53;WE=48184296;WS=48184278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,57:0.74:77
chr17	48184377	rs847693	A	G	2277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.717;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=34;PP=1365;ReadPosRankSum=0.449;SC=CCCAGTATCAATGTCAGGAGG;SOR=0.803;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=116;TCF=70;TCR=46;TR=84;WE=48184385;WS=48184367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,97:0.72:135
chr17	48186131	rs3059824	T	TCTC	1120.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.549;NF=1;NR=21;PP=1043;ReadPosRankSum=-2.030;SC=GGGAGGCTTCTCTCCTCACTC;SOR=0.735;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=22;WE=48186139;WS=48186121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,29:0.78:37
chr17	48187193	rs847691	A	G	75.84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5130;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=47;ReadPosRankSum=-0.524;SC=AGGAGGGACCACCCTTTTGTG;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=4;WE=48187201;WS=48187183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr17	48212647	rs11317638	GA	G	822.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=5;PP=561;SC=GGGGAGGGAGGAACAATGGGA;SOR=2.030;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=14;WE=48212655;WS=48212637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	48216972	rs77141149	G	C	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=4.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.54;ReadPosRankSum=-1.644;SOR=0.288;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,20:0.27:74
chr17	48226445	rs112058541	G	GC	248.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=3;NR=1;PP=126;SC=TGGCTGGCGAGCGGGGGCGGC;SOR=2.584;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=4;WE=48226453;WS=48226435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	48226811	rs74676292	C	T	3501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.363;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=70;PP=2006;ReadPosRankSum=-1.408;SC=CTACCGCCGCCGCCTCCTTCT;SOR=0.480;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=191;TCF=90;TCR=101;TR=137;WE=48226819;WS=48226801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,155:0.70:221
chr17	48227384	.	G	GGC	3762.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=36;PP=1962;SC=GCCGCGCCGCGCTCCTTGTCG;SOR=1.347;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=42;TCF=3;TCR=39;TR=38;WE=48227392;WS=48227374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr17	48227403	.	G	GGC	2842.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=29;PP=1585;SC=CGCCGCCTGCGCGCTGGGGCG;SOR=1.688;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=31;WE=48227411;WS=48227393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr17	48243461	rs79410682	G	A	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.13;ReadPosRankSum=-0.395;SOR=0.608;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,31:0.32:96
chr17	48243504	rs9911548	C	T	2379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=42;NR=37;PP=1209;SC=GGTGGTAAGACGGAGGTGTGG;SOR=0.782;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=42;TCR=37;TR=79;WE=48243512;WS=48243494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr17	48245180	rs2696297	C	T	745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.084;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=384;ReadPosRankSum=-0.580;SC=GGATTGGGTGCTCATTCACAG;SOR=0.973;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=47;TCF=34;TCR=13;TR=24;WE=48245188;WS=48245170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,33:0.57:58
chr17	48245269	rs59944537	C	A	1391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.519;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=28;PP=821;ReadPosRankSum=-0.179;SC=CCACGTTTCTCCCCTAACCCA;SOR=0.765;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=195;TCF=114;TCR=81;TR=72;WE=48245277;WS=48245259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,78:0.36:219
chr17	48248906	rs1046329	C	G	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FS=3.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.66;ReadPosRankSum=0.542;SOR=0.810;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:129,42:0.25:171
chr17	48249450	rs2696293	C	G	2045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.338;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=44;PP=1272;ReadPosRankSum=-0.012;SC=GAAGTCTCCACTGGGCTGCCC;SOR=0.475;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=124;TCF=57;TCR=67;TR=83;WE=48249458;WS=48249440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,90:0.66:136
chr17	48249801	rs2696292	C	A	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.978;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=213;ReadPosRankSum=0.556;SC=ACGGTGCGTGCACATATGCAT;SOR=0.368;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=15;WE=48249809;WS=48249791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,16:0.73:22
chr17	48252804	rs2696288	T	C	3249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=64;NR=52;PP=1981;SC=ACTGACAGCCTAGCCAGGTAG;SOR=0.725;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=64;TCR=52;TR=116;WE=48252812;WS=48252794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr17	48258140	rs2586484	T	C	594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.03;SOR=0.874;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	48258321	rs2586485	C	T	784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.611;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.16;MQRankSum=0.848;NF=22;NR=22;PP=804;ReadPosRankSum=-0.653;SC=TACTGTATTCCGGTGATAGAA;SOR=0.312;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=74;TCF=38;TCR=36;TR=44;WE=48258329;WS=48258311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,39:0.60:65
chr17	48263021	rs2249492	C	T	1370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.201;HP=6;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=17;PP=786;ReadPosRankSum=0.023;SC=TGGGGTGGGGCGGAGACAACG;SOR=0.956;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=68;TCF=42;TCR=26;TR=49;WE=48263029;WS=48263011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,58:0.70:83
chr17	48264717	rs2696245	C	T	326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=2;PP=259;SC=GATTCTTCCTCTCTTTGCCCA;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=48264725;WS=48264707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	48265426	rs2586488	A	G	6498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=115;PP=2965;SC=GTAGAGTTCTAAAGGCATGGG;SOR=1.000;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=209;TCF=94;TCR=115;TR=209;WE=48265434;WS=48265416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr17	48265495	rs1800215	T	C	1935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=46;PP=1198;SC=ACAGGACCGGTGGGACCAGCA;SOR=1.997;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=19;TCR=46;TR=65;WE=48265503;WS=48265485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr17	48266160	rs138425306	CAG	C	348.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FS=1.704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.86;ReadPosRankSum=0.167;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:161,26:0.14:187
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chr17	48267291	rs2075559	G	C	3045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.490;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=64;PP=1724;ReadPosRankSum=0.933;SC=AGAGCACAGAGGCATCAAGCC;SOR=0.735;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=210;TCF=107;TCR=103;TR=129;WE=48267299;WS=48267281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,140:0.61:230
chr17	48267585	rs2075558	A	C	2289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.701;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=33;PP=1308;ReadPosRankSum=-0.254;SC=TCCCGTCTCCACCCTTCTCCC;SOR=0.813;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=77;TCR=47;TR=86;WE=48267593;WS=48267575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,97:0.70:138
chr17	48268223	rs2734272	A	G	4362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=86;NR=58;PP=2317;SC=CAATGGGGCCAGTCAGACCAC;SOR=0.979;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=144;TCF=86;TCR=58;TR=144;WE=48268231;WS=48268213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr17	48268626	rs2696246	A	G	4455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=54;PP=2676;SC=AAGGGGAAGAAGGGAGGATTA;SOR=1.264;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=91;TCR=54;TR=145;WE=48268634;WS=48268616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr17	48269302	rs2857396	G	A	3937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.455;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=80;PP=2424;ReadPosRankSum=-0.029;SC=GGCCAAGTACGACGCACCTTG;SOR=0.678;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=253;TCF=132;TCR=121;TR=163;WE=48269310;WS=48269292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,178:0.64:278
chr17	48269426	rs2586490	C	T	1424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=35;PP=789;ReadPosRankSum=1.496;SC=GAGCAAAACCCACCTGGGGCC;SOR=0.744;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=111;TCF=47;TCR=64;TR=59;WE=48269434;WS=48269416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,67:0.53:127
chr17	48271433	rs1007086	A	G	2447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.04;SOR=1.029;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr17	48272055	rs2253369	C	T	1173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.308;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=34;PP=800;ReadPosRankSum=0.461;SC=GAGGGTGGAGCGGGAGGGGGC;SOR=1.216;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=87;TCF=29;TCR=58;TR=48;WE=48272063;WS=48272045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,52:0.56:93
chr17	48273439	rs2734281	T	C	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.833;HP=4;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=11;PP=255;ReadPosRankSum=0.132;SC=CATAACCTGCTCCCATTGTCA;SOR=0.606;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=79;TCF=45;TCR=34;TR=24;WE=48273447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,29:0.31:93
chr17	48273464	rs2141279	T	C	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=3.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.70;ReadPosRankSum=-0.320;SOR=0.536;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,23:0.25:92
chr17	48274291	rs2075555	T	G	647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=2;PP=452;SC=TGCAACTCAGTATCTTTTGGG;SOR=3.160;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=48274299;WS=48274281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	48274309	rs2075554	T	C	909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=6;PP=620;SC=GGGGAAGAGGTTGGGACTGGA;SOR=2.165;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=29;WE=48274317;WS=48274299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	48276004	rs5820805	G	GC	2007.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=35;PP=1643;SC=AGACATTCCTGCAAAGATGCA;SOR=2.221;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=37;WE=48276012;WS=48275994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr17	48276971	rs2256835	G	C	3045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=54;PP=1663;SC=GAAGAGACGCGCGTTAGAGCC;SOR=0.984;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=49;TCR=54;TR=103;WE=48276979;WS=48276961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr17	48277059	rs150854949	AGCCCCAGGCCCCAGGCCCCAG	A	713.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=2;PP=1472;SC=CCCCAGCCCCAGCCCCAGGCC;SOR=1.863;SbPval=0.1;Source=Platypus;TC=13;TCF=5;TCR=8;TR=7;WE=48277087;WS=48277049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	48356260	rs6504642	G	C	1969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.509;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=40;PP=1262;ReadPosRankSum=-0.738;SC=GAGCCAGACAGCCCAGTGGAT;SOR=0.526;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=56;TCR=61;TR=78;WE=48356268;WS=48356250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,86:0.67:128
chr17	48423418	rs9912067	G	C	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.47;ReadPosRankSum=-1.803;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr17	48432042	rs11430429	G	GA	1442.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=23;PP=1228;SC=AGGTAGCCTAGGAGGGAAACT;SOR=1.432;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=29;WE=48432050;WS=48432032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr17	48432681	rs2526538	G	A	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=131;ReadPosRankSum=-1.383;SC=GCAAGGGGCAGAGGAAGGATG;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=7;WE=48432689;WS=48432678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr17	48432749	rs73344091	G	C	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=2.417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.60;ReadPosRankSum=1.472;SOR=0.138;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,6:0.17:36
chr17	48433081	rs886568	G	A	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.316;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=9;PP=210;ReadPosRankSum=-1.844;SC=TGCCAGGCGGGTGAAAGAGCT;SOR=0.389;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=55;TCF=35;TCR=20;TR=21;WE=48433089;WS=48433071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,23:0.40:57
chr17	48433958	rs4794136	T	C	1951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.281;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=56;PP=1019;ReadPosRankSum=-2.187;SC=TCCACCTGTATGGCAGCTACC;SOR=0.907;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=263;TCF=133;TCR=130;TR=103;WE=48433974;WS=48433948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,111:0.38:293
chr17	48437456	rs6504649	C	G	2502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.298;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=42;PP=1557;ReadPosRankSum=-0.416;SC=CAGCGGCACACACAGCTCACA;SOR=0.810;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=143;TCF=83;TCR=60;TR=98;WE=48437464;WS=48437446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,108:0.67:162
chr17	48440522	rs10656180	T	TCCA	5008.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.54;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=39;PP=2857;SC=CCTGTCCTTCTCCACCATATT;SOR=1.069;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=57;TCF=14;TCR=43;TR=53;WE=48440530;WS=48440512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr17	48445674	rs111380254	CCTGGTCAG	C	366.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=7.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.01;ReadPosRankSum=-0.181;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,13:0.21:61
chr17	48445699	rs2586438	C	T	1006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.707;HP=2;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=23;PP=639;ReadPosRankSum=-0.865;SC=AGCTGGTCAGCGAGGTGGTCC;SOR=0.216;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=53;TCF=21;TCR=32;TR=41;WE=48445707;WS=48445689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,45:0.76:59
chr17	48446130	rs17776853	A	G	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=135;ReadPosRankSum=-4.252;SC=CTAATAAAACAATCATACTAC;SOR=0.919;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=40;TCF=31;TCR=9;TR=13;WE=48446138;WS=48446120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,14:0.33:43
chr17	48448023	rs16948951	C	G	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=184;ReadPosRankSum=-1.423;SC=CATGCTGATACGTGAGAGGCG;SOR=0.593;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=12;TCR=32;TR=14;WE=48448031;WS=48448013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,12:0.27:44
chr17	48452776	rs3760413	A	C	4262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=48;PP=2596;SC=CTGTCCCAGAAATAGCTGAAA;SOR=0.978;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=78;TCR=48;TR=126;WE=48452784;WS=48452766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr17	48452978	rs3060668	A	AAGC	2797.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FS=2.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.04;MQRankSum=1.573;QD=10.40;ReadPosRankSum=-0.221;SOR=0.846;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:191,78:0.29:269
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chr17	48457609	rs917028	C	G	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=1.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.58;ReadPosRankSum=0.000;SOR=1.047;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,10:0.20:50
chr17	48460745	rs3744525	C	G	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.97;ReadPosRankSum=0.697;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr17	48460750	rs3744524	C	T	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.025;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.97;ReadPosRankSum=0.405;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr17	48469724	rs757509	T	C	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=4.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.853;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=231;ReadPosRankSum=-2.654;SC=CCAGGGAGTGTATAAGGAGCC;SOR=2.147;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=11;WE=48469732;WS=48469714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr17	48472270	rs3760407	C	T	2584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=27;PP=1658;SC=GAAGGAGTCACGGCTGCATGC;SOR=1.711;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=61;TCR=27;TR=88;WE=48472278;WS=48472260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr17	48504132	rs9901133	A	G	1228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=9;PP=690;SC=TCATGGGCAAACTTGGGGATC;SOR=1.981;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=34;WE=48504140;WS=48504122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr17	48539035	rs9674937	T	C	2679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.506;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=55;PP=1390;ReadPosRankSum=0.417;SC=AACTGGAGTATGTCCTCAAGA;SOR=0.757;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=191;TCF=99;TCR=92;TR=112;WE=48539043;WS=48539025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,128:0.59:216
chr17	48539763	rs2277631	C	A	823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.689;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=23;PP=559;ReadPosRankSum=-0.784;SC=TGTCTCTCACCATCGTCCCCA;SOR=0.818;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=118;TCF=57;TCR=61;TR=42;WE=48539771;WS=48539753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,45:0.34:131
chr17	48539997	rs8082089	T	C	2562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=33;NR=45;PP=1381;SC=ATGCCCCCTGTCCCTGTGACA;SOR=1.354;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=33;TCR=45;TR=78;WE=48540005;WS=48539987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr17	48540960	rs3744522	C	G	2268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=42;PP=1564;SC=AAACCCTCTTCTTCCTCACTC;SOR=1.108;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=32;TCR=42;TR=74;WE=48540968;WS=48540950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr17	48541443	rs2277630	G	C	1176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=12;PP=852;SC=CCAGCCCAGGGCCAGCTGCCA;SOR=2.093;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=29;TCR=12;TR=41;WE=48541451;WS=48541433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr17	48541491	rs2277629	A	G	788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=1.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.74;ReadPosRankSum=-1.580;SOR=0.538;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,43:0.37:117
chr17	48541707	rs898455	G	A	1392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=22;PP=1083;SC=TGGGATGACAGCAGATGGACA;SOR=0.735;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=24;TCR=22;TR=46;WE=48541715;WS=48541697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr17	48542572	rs898454	C	G	2508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=30;PP=1378;SC=CCCTCCAGGGCCAGGGGGTAT;SOR=1.119;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=83;TCF=53;TCR=30;TR=82;WE=48542580;WS=48542562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr17	48543391	rs2231506	A	C	98.81	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.990;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=88;ReadPosRankSum=-0.000;SC=ATCTCAGATAATCCAATCTAC;SOR=3.229;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=4;WE=48543399;WS=48543381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr17	48545596	rs34864120	G	A	1440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=29;PP=812;ReadPosRankSum=0.316;SC=GGTTCTCCACGTCGTCCAGGG;SOR=0.658;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=154;TCF=88;TCR=66;TR=67;WE=48545604;WS=48545586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,74:0.45:165
chr17	48546232	rs2412325	G	C	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=36;ReadPosRankSum=-1.068;SC=CGCGGGCAGCGGCGAGTCCTA;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=48546240;WS=48546222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr17	48549791	rs2305998	C	G	937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=1.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.33;ReadPosRankSum=-1.682;SOR=0.862;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,53:0.41:128
chr17	48556228	rs151222980	C	CGCGCT	327.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.097;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.230;NF=5;NR=2;PP=316;ReadPosRankSum=-1.231;SC=GTCAGTGCGCCGCGCTGCGCT;SOR=0.582;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=7;WE=48556236;WS=48556218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr17	48557326	rs2290862	G	A	3079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=43;PP=1713;SC=TGTGGCACAGGCAGCCCACCT;SOR=0.804;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=52;TCR=43;TR=95;WE=48557334;WS=48557316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr17	48557348	rs2290861	T	C	3419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=47;PP=1755;SC=CCTGCAGACTTGGAAGTCACA;SOR=0.826;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=59;TCR=47;TR=106;WE=48557356;WS=48557338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr17	48559559	rs7210579	A	G	1598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.621;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=35;PP=1097;ReadPosRankSum=-0.363;SC=GCGTGTCTGTAGACTTGATGC;SOR=0.630;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=129;TCF=68;TCR=61;TR=70;WE=48559567;WS=48559549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,73:0.52:140
chr17	48559722	rs137932823	G	C	1983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=42;PP=1296;ReadPosRankSum=2.024;SC=TCCAGCCCCTGACCCGGAGCT;SOR=0.714;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=131;TCF=61;TCR=70;TR=81;WE=48559730;WS=48559712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,86:0.61:142
chr17	48560550	rs111413847	A	G	59.85	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.96;ReadPosRankSum=0.319;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr17	48560883	rs1551717	A	G	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=379;ReadPosRankSum=-0.110;SC=CTCCTCCAGGATCCCCACACC;SOR=0.732;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=13;TCR=32;TR=24;WE=48560891;WS=48560873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,25:0.54:46
chr17	48562047	rs72834177	T	G	1679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.494;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=23;PP=1035;ReadPosRankSum=-0.421;SC=CCCTGCTGGGTGATGGGCTTG;SOR=0.896;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=108;TCF=64;TCR=44;TR=61;WE=48562055;WS=48562037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,71:0.59:120
chr17	48598785	rs1380657	G	A	2791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=54;PP=1681;SC=TGAAGACACAGCATACTTGTG;SOR=1.125;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=41;TCR=54;TR=95;WE=48598793;WS=48598775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr17	48599195	rs9893172	T	C	323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=2;PP=219;SC=GGAAGCTGCGTGGGAGTGGAG;SOR=1.981;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=48599203;WS=48599185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	48599450	rs7216625	A	T	2015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=39;PP=1058;SC=AAGGTAAAACAGCCTCCACCA;SOR=1.300;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=66;TCF=27;TCR=39;TR=66;WE=48599458;WS=48599440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr17	48602098	rs28535650	T	A	159.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=67.29;QD=22.83;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	48603503	rs9890721	C	T	4315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=74;PP=2511;SC=GAGTCCTCAGCGGAAGAGCAT;SOR=0.796;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=148;TCF=74;TCR=74;TR=148;WE=48603511;WS=48603493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr17	48603775	rs149225883	C	CTATTTATT	91.37	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.04;QD=30.46;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	48605780	rs8067733	C	G	958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=5;NR=26;PP=782;SC=CCTTTCTGTCCGCTGCCAGGA;SOR=3.126;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=31;WE=48605788;WS=48605770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	48606313	rs2290864	G	A	1235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=11;PP=723;ReadPosRankSum=0.037;SC=GTGAGCTACTGTTGAGGACAT;SOR=0.724;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=41;WE=48606321;WS=48606303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,47:0.98:48
chr17	48606537	rs1133818	C	G	1315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=31;PP=927;SC=ACACCCAGAGCCTGCACAGTG;SOR=2.252;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=11;TCR=31;TR=42;WE=48606545;WS=48606527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr17	48606606	rs4793659	G	A	295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=241;SC=TATTCATTCCGTTCAGTCTGC;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=48606614;WS=48606596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	48607280	rs6504671	G	C	4233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.49;SOR=0.984;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr17	48607614	rs4794156	G	A	321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=8;PP=182;SC=CAGCACTTTGGGAGGCCAAGG;SOR=1.609;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=12;WE=48607622;WS=48607604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	48608717	rs1064055	T	C	2261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=37;PP=1240;SC=CCCTGGTGACTGACCTGATGG;SOR=0.788;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=45;TCR=37;TR=82;WE=48608725;WS=48608707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr17	48608951	rs2277627	C	T	110.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=84;SC=GCCCTCAGATCCCCTCCTGCC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=48608959;WS=48608941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	48610272	rs755046	G	C	871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=15;NR=17;PP=509;SC=GTGCCGTCCCGCTGCTGCACA;SOR=0.941;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=32;TCF=15;TCR=17;TR=32;WE=48610280;WS=48610262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr17	48613837	rs3785915	A	G	3527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=43;PP=2192;SC=CCCATCCTTCAAGACTGTGAC;SOR=1.068;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=72;TCR=43;TR=115;WE=48613845;WS=48613827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr17	48614426	rs143725319	G	A	1063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.920;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=17;PP=618;ReadPosRankSum=-0.318;SC=GGCTTCAGCCGCCGCTACGGC;SOR=0.542;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=64;TCF=34;TCR=30;TR=39;WE=48614434;WS=48614416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,45:0.62:72
chr17	48616114	rs4794158	C	G	1313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=15;PP=840;SC=GCTGACTGAGCGGCAAATGGC;SOR=1.251;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=30;TCR=15;TR=45;WE=48616122;WS=48616104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr17	48618106	rs7215760	A	G	2921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=61;NR=33;PP=1682;SC=GCCCTGGGCGAGGGATAAGGG;SOR=1.200;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=61;TCR=33;TR=94;WE=48618114;WS=48618096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr17	48619249	rs4794159	C	A	3049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=50;PP=1607;SC=CGCGGGCGAGCCGGGCAGGCC;SOR=0.965;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=96;TCF=46;TCR=50;TR=96;WE=48619257;WS=48619239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr17	48624523	rs9890200	A	C	768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.63;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	48625828	rs8076470	C	T	8627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=136;NR=152;PP=2965;ReadPosRankSum=1.494;SC=AGCACCTCTCCTGGGGCCCTG;SOR=0.895;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=291;TCF=137;TCR=154;TR=288;WE=48625836;WS=48625818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,324:0.99:326
chr17	48625928	rs8076632	C	G	4039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=73;PP=2429;SC=CCCCTGGGGACAGGAAGCCTT;SOR=1.402;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=50;TCR=74;TR=123;WE=48625936;WS=48625918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr17	48626389	rs8077316	C	T	4965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.18;SOR=0.782;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr17	48626398	rs8077323	C	T	4797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.62;SOR=0.806;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr17	48626575	rs8077587	C	T	4005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=60;PP=2334;SC=AGTTGGGGGACCAGGGTGGGG;SOR=0.764;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=128;TCF=68;TCR=60;TR=128;WE=48626583;WS=48626565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr17	48626626	rs8076628	G	A	3990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=69;NR=64;PP=2205;SC=TGACCTCCAGGTGTGCCCCCA;SOR=0.762;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=133;TCF=69;TCR=64;TR=133;WE=48626634;WS=48626616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr17	48627860	rs10586811	CCT	C	5654.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=46;PP=2969;SC=TCCCCAGTGACCTCTCTGTTC;SOR=1.038;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=83;TCF=29;TCR=54;TR=68;WE=48627869;WS=48627850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr17	48628092	rs1132414	A	G	8621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=156;NR=128;PP=2965;SC=ATAGCGCAGAAGATGCAGACT;SOR=0.884;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=284;TCF=156;TCR=128;TR=284;WE=48628100;WS=48628082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,307:1.00:307
chr17	48628470	rs9913430	T	A	2601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=51;PP=1659;SC=CTTGCTCAATTCAGGGCTGGA;SOR=1.440;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=35;TCR=51;TR=86;WE=48628478;WS=48628460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr17	48628581	rs9913677	T	A	675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=8;NR=17;PP=400;SC=ACCGAGCCTGTCTGTAGGATC;SOR=1.781;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=25;WE=48628589;WS=48628571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
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chr17	48629458	rs8065903	A	G	4555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=87;NR=67;PP=2520;SC=ACACAGGACAAGCTCTTTTGG;SOR=0.776;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=154;TCF=87;TCR=67;TR=154;WE=48629466;WS=48629448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
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chr17	48631857	rs873839	G	A	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=73;ReadPosRankSum=-1.013;SC=TAGGAGGGAAGTTGGGGCTGC;SOR=0.293;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=6;WE=48631865;WS=48631847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr17	48646346	.	A	AGT	87.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.699;ClippingRankSum=-0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.86;MQRankSum=-0.000;QD=7.98;ReadPosRankSum=1.930;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr17	48647011	rs12946808	T	G	3006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.596;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=53;PP=1843;ReadPosRankSum=1.763;SC=TTGACCTCTTTTGACCCCACT;SOR=0.603;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=171;TCF=98;TCR=73;TR=120;WE=48647019;WS=48647001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,130:0.70:185
chr17	48652875	rs198550	A	G	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=3.090;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=110;ReadPosRankSum=0.238;SC=TCTTCAGGACATTTCCTCTTC;SOR=2.093;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=8;WE=48652883;WS=48652865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr17	48653354	rs12449998	C	A	3897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.147;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=72;PP=2154;ReadPosRankSum=-0.960;SC=TGGGTCCCGCCGGCTCATGCT;SOR=0.703;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=240;TCF=129;TCR=111;TR=155;WE=48653362;WS=48653344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,180:0.66:271
chr17	48678325	rs198530	A	T	3220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;SC=CTGGGAGGGCACTGGAGGGGC;SOR=0.967;Source=Platypus;TCF=58;WE=48678333;WS=48678315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr17	48683200	rs3744521	G	C	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.019;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=278;ReadPosRankSum=-1.465;SC=GGGCTCAGGAGTCCTGGGCTT;SOR=1.284;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=56;TCF=39;TCR=17;TR=21;WE=48683208;WS=48683190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,22:0.37:60
chr17	48712705	rs12604031	G	A	1175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=0.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.33;ReadPosRankSum=2.152;SOR=0.844;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,35:0.28:126
chr17	48712711	rs9890046	C	G	1243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.195;SOR=0.634;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,39:0.30:128
chr17	48738491	rs11568581	G	A	875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FS=5.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.00;ReadPosRankSum=1.474;SOR=1.115;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:124,51:0.29:175
chr17	48745035	rs11568601	A	C	1976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.413;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=31;PP=1028;ReadPosRankSum=0.853;SC=GGAGGGCATCAGGCAGGGTGA;SOR=0.691;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=114;TCF=65;TCR=49;TR=78;WE=48745043;WS=48745025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,91:0.69:132
chr17	48746135	rs879459	C	T	1016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=21;NR=10;PP=570;SC=GTCCTCCTTTCCCCTGCCCCC;SOR=1.209;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=21;TCR=10;TR=31;WE=48746143;WS=48746125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr17	48746923	rs4794176	G	C	2719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=58;PP=1499;SC=AAGAGGCTAGGGCATAGAGCT;SOR=1.358;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=36;TCR=58;TR=94;WE=48746931;WS=48746913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr17	48752600	rs4148415	C	T	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=3.848;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.43;ReadPosRankSum=-0.661;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,8:0.25:32
chr17	48752890	rs2072366	G	A	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=132;ReadPosRankSum=1.551;SC=GGCCTCCCCAGGCCCTGCCAG;SOR=0.804;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=10;WE=48752898;WS=48752880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,11:0.33:33
chr17	48761105	rs2277624	C	T	3398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.282;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=60;PP=1781;ReadPosRankSum=-1.643;SC=TGCATGTGCACGGTGGCGAGA;SOR=0.589;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=175;TCF=98;TCR=77;TR=137;WE=48761113;WS=48761095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,158:0.77:206
chr17	48768486	rs1051640	A	G	1307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=18;PP=737;ReadPosRankSum=1.860;SC=TAGTAGCTGAATTTGATTCTC;SOR=0.757;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=81;TCF=50;TCR=31;TR=50;WE=48768494;WS=48768476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,57:0.59:96
chr17	48777822	rs6504677	G	A	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.92;ReadPosRankSum=-3.195;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr17	48797210	rs11398903	T	TG	3021.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=36;PP=1705;SC=CCGCGGGCCTTGGCCTGAGCC;SOR=1.179;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=48;TCF=6;TCR=42;TR=42;WE=48797218;WS=48797200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr17	48834080	rs9303561	A	G	202.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=20;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=4;PP=312;SC=AAAAAAAAAAAGAAACCTAAA;SOR=1.863;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=12;WE=48834088;WS=48834070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	48834129	rs17564118	A	G	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.07;ReadPosRankSum=-2.192;SOR=0.557;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,22:0.34:65
chr17	48917333	rs9675120	C	T	3854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.438;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=67;PP=2136;ReadPosRankSum=-0.055;SC=AGACAGTGAGCTTCCTCTGTG;SOR=0.746;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=246;TCF=136;TCR=110;TR=148;WE=48917341;WS=48917323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,179:0.62:291
chr17	48940422	rs4626	T	C	3007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.546;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=50;PP=1828;ReadPosRankSum=-0.313;SC=CTACAAAAGATTTCTCATTGA;SOR=0.637;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=182;TCF=108;TCR=74;TR=123;WE=48940430;WS=48940412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,138:0.67:206
chr17	49048064	rs11656955	A	G	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=1.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.69;ReadPosRankSum=-0.434;SOR=0.882;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,35:0.27:129
chr17	49054439	rs9332407	T	C	2906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=17;PP=1979;SC=TCCTATTTGTTCCATGGCAGT;SOR=2.560;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=69;TCR=17;TR=86;WE=49054447;WS=49054429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr17	49060107	rs12453116	T	G	590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=16;PP=425;SC=AACATTTTATTTGTTGTATAA;SOR=4.514;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=49060115;WS=49060097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	49067763	rs9899816	T	C	1131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=12;PP=672;SC=GGCATCTGAGTGTAGCCTTAG;SOR=1.347;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=27;TCR=12;TR=39;WE=49067771;WS=49067753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
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chr17	49124845	rs11400140	G	GA	796.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=18;PP=623;SC=TTTAAAGAAAGAAAAAATACA;SOR=1.528;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=19;WE=49124853;WS=49124835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	49124944	rs12453437	C	T	72.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=51;SC=TCAGACTACTCGATTCCAAGT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=49124952;WS=49124934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	49156907	rs8081821	A	G	1599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=22;PP=1090;ReadPosRankSum=-1.080;SC=GCCAAGCCCAATCTTTAGTGT;SOR=1.217;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=37;TCR=23;TR=58;WE=49156915;WS=49156897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,59:0.97:61
chr17	49197654	rs5820842	A	AC	383.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.83;QD=29.52;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	49231623	rs34431255	C	G	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.16;ReadPosRankSum=0.193;SOR=0.752;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,5:0.22:23
chr17	49231627	rs11556835	G	A	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=5.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.92;ReadPosRankSum=0.154;SOR=2.129;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,6:0.21:29
chr17	49237562	rs2041296	C	T	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.057;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=153;ReadPosRankSum=0.000;SC=TTTTCATATACCAGCTAATGG;SOR=0.890;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=53;TCF=21;TCR=32;TR=16;WE=49237570;WS=49237552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,20:0.28:71
chr17	49239036	rs2159359	C	A	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.773;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=9;PP=289;ReadPosRankSum=-0.929;SC=TGGCAATGGGCGCATTTTAAT;SOR=0.855;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=102;TCF=67;TCR=35;TR=29;WE=49239044;WS=49239026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,34:0.29:119
chr17	49245891	rs60017501	G	T	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.691;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=102;ReadPosRankSum=1.068;SC=TGTTAGCTGGGTGTGGTGGTG;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=49245899;WS=49245881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr17	49270643	rs35987233	AT	A	70.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=0;PP=96;SC=TAAAGAAAATATTTATATTGT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=49270651;WS=49270638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	49296550	rs113352672	T	C	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=124;ReadPosRankSum=0.366;SC=ACAAGAATTTTAACATGAGAA;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=6;WE=49296558;WS=49296540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr17	49338257	rs14180	C	T	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=1.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.599;QD=2.54;ReadPosRankSum=0.206;SOR=0.979;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,9:0.22:40
chr17	49711045	rs2286634	A	G	795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=23;PP=662;SC=AGATCCAACCATCCTCTTAAA;SOR=4.174;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=49711053;WS=49711035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	49713428	rs139939914	GACATACAT	GACAT,G	506.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;NF=0,0;NR=12,12;PP=588,56;SC=TGGTATTGCTGACATACATAC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=12,12;WE=49713443;WS=49713418;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:11
chr17	50149899	rs5820905	C	CT	131.94	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=16.49;ReadPosRankSum=-1.534;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,7:0.88:8
chr17	51900780	rs117796484	A	G	4274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=0.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.868;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=102;NR=76;PP=2558;ReadPosRankSum=0.735;SC=GCCTCAGGGGACAGCCTGGAT;SOR=0.807;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=287;TCF=161;TCR=126;TR=178;WE=51900788;WS=51900770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,198:0.61:326
chr17	51901084	rs3803825	A	G	3923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=58;PP=2344;SC=AGACAACCTTAAAGGACCTGG;SOR=0.886;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=54;TCR=58;TR=112;WE=51901092;WS=51901074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr17	51901385	rs3803826	C	T	5277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=69;PP=2965;SC=CATTTATGCTCTGGTGGCACA;SOR=0.913;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=169;TCF=100;TCR=69;TR=169;WE=51901393;WS=51901375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr17	51901643	rs4561518	C	T	2563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=38;PP=1501;SC=CAGGCAAACACCTGTCAACGC;SOR=0.906;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=39;TCR=38;TR=77;WE=51901651;WS=51901633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr17	51901703	rs4561519	C	G	2358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=36;PP=1419;SC=GAAGTCAGGACGGATAATGCA;SOR=0.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=77;TCF=41;TCR=36;TR=77;WE=51901711;WS=51901693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr17	51902252	rs3826355	C	T	4318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=65;PP=2629;SC=TAGCCAATGGCTGGAAAACAT;SOR=0.706;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=143;TCF=78;TCR=65;TR=143;WE=51902260;WS=51902242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr17	51902492	rs10693171	A	AAAT	182.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.775;NF=0;NR=5;PP=94;ReadPosRankSum=0.222;SC=AAAACTGTCCAAATTATCTAA;SOR=0.723;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=5;WE=51902500;WS=51902482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
chr17	52989920	rs72829469	G	A	77.85	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.98;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr17	52992128	rs3834969	TA	T	2407.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.726;NF=3;NR=49;PP=1733;ReadPosRankSum=1.925;SC=TCATTGCATTTAATTGATGTC;SOR=0.655;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=126;TCF=7;TCR=119;TR=52;WE=52992136;WS=52992118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,85:0.40:210
chr17	52993346	rs2934935	G	A	646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=18;PP=458;SC=CCTGATTTCAGTTGATTTCTA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=52993354;WS=52993336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	53007655	rs12939352	T	G	363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=230;SC=TGCCTACAAGTGACCCCTCTT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=53007663;WS=53007645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	53013980	rs17745189	A	G	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.392;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=10;PP=266;ReadPosRankSum=-2.245;SC=TATTTTTTTAAAAACACATGC;SOR=0.407;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=44;TCF=27;TCR=17;TR=22;WE=53013988;WS=53013970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,22:0.42:52
chr17	53014232	.	A	ATTAAG	95	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=63.51;NF=0;NR=2;PP=95;QD=64.0;SC=ACTTAATGTTATTAACGTTAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=2;WE=53014240;WS=53014222;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,2:0.67:3
chr17	53014442	rs71361740	CT	C	51.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=1.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.29;ReadPosRankSum=-0.040;SOR=0.243;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,9:0.22:40
chr17	53026823	rs71159274	TAAAAG	T	1092.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.042;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.819;NF=9;NR=10;PP=749;ReadPosRankSum=0.561;SC=GTCTCAGTAATAAAAGAAAAG;SOR=0.410;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=68;TCF=39;TCR=29;TR=19;WE=53026835;WS=53026813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,33:0.34:96
chr17	53038430	rs4793784	A	G	564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=0;PP=393;SC=AACTATCAAAACTTATTTATT;SOR=3.500;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=53038438;WS=53038420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	53038654	rs1802212	A	C	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.10;ReadPosRankSum=1.693;SOR=0.708;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,26:0.19:136
chr17	53038745	rs17817901	A	G	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.437;NF=5;NR=9;PP=174;ReadPosRankSum=2.252;SC=ATTAAATAGAATAACAGTTCC;SOR=0.776;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=43;TCF=15;TCR=28;TR=14;WE=53038753;WS=53038735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,16:0.31:51
chr17	53038783	rs1057980	G	A	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.965;NF=2;NR=6;PP=103;ReadPosRankSum=0.584;SC=TGACAACAGCGTGAGATTTCA;SOR=0.784;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=8;WE=53038791;WS=53038773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr17	53041965	rs12951542	T	C	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=42;ReadPosRankSum=2.041;SC=ATTAGAATCATAGTGTTAAAA;SOR=0.743;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=5;WE=53041973;WS=53041955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr17	53042017	rs55801837	C	G	1248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=8;PP=1005;ReadPosRankSum=2.700;SC=AAGGAATTTACATTAATAAAG;SOR=0.711;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=41;TCF=27;TCR=14;TR=24;WE=53042031;WS=53042007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,31:0.62:50
chr17	53042023	rs56131849	TA	T	1294.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=1007;ReadPosRankSum=2.756;SC=TTTACATTAATAAAGTAATCT;SOR=0.751;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=30;TCF=12;TCR=18;TR=16;WE=53042031;WS=53042007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,34:0.61:56
chr17	53042208	rs145197312	A	G	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=58;ReadPosRankSum=-0.328;SC=CTCCAAGTCCAGTAGTCTAGA;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=53042216;WS=53042198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr17	53063743	rs958556	C	T	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=2;PP=21;SC=AGGATAGCAGCAATGAGTAGT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=53063751;WS=53063733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr17	53076799	rs1156287	G	A	1746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.681;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=34;PP=920;ReadPosRankSum=0.391;SC=CATAATTACCGGAGCCAAGTT;SOR=0.793;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=57;TCR=54;TR=70;WE=53076807;WS=53076789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,81:0.63:128
chr17	53076986	rs11658717	G	A	2124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=30;PP=1258;ReadPosRankSum=0.523;SC=TTTCTTTTTAGTACTAGGTTA;SOR=0.753;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=110;TCF=69;TCR=41;TR=81;WE=53076994;WS=53076976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,91:0.74:123
chr17	53111695	.	G	A	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.613;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.925;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=6;PP=101;ReadPosRankSum=-1.365;SC=ATATGTGTAGGCTTTTTTCAC;SOR=0.223;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=11;WE=53111703;WS=53111685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr17	53120855	rs1894936	A	G	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=2.458;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=113;ReadPosRankSum=0.647;SC=TAGAGAATTAATTTTTGGTCT;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=6;WE=53120863;WS=53120845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr17	53124546	rs71361750	C	CGT	127.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.080;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=11;PP=234;ReadPosRankSum=0.957;SC=TATATGTGCTCGTGTGTGTGT;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=11;WE=53124555;WS=53124536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr17	53155666	rs1026961	C	T	40.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.20;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr17	53158361	rs2628302	G	A	827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.203;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=12;PP=501;ReadPosRankSum=-1.498;SC=AGTAAAGATAGATGTTGTTTA;SOR=0.519;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=42;TCF=28;TCR=14;TR=32;WE=53158369;WS=53158351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,36:0.72:50
chr17	53342796	rs10635027	G	GTTTC	2458.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FS=4.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.04;ReadPosRankSum=-0.877;SOR=0.794;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:175,70:0.29:245
chr17	53392852	rs2287223	G	A	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.875;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=17;PP=298;ReadPosRankSum=0.364;SC=ATGGAGAGTGGGATCCACAGA;SOR=0.838;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=88;TCF=37;TCR=51;TR=27;WE=53392860;WS=53392842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,27:0.29:93
chr17	53478675	rs3744308	A	G	58.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=3;NR=0;PP=32;SC=CCACCATGCCAAGCTAAACAC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=53478683;WS=53478665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	53485186	rs2286806	C	T	1949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=41;PP=1310;SC=ACTGTCCTAGCGAGGGGGAAA;SOR=1.195;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=27;TCR=41;TR=68;WE=53485194;WS=53485176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr17	53498846	rs75646226	C	T	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-2.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5033;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=274;ReadPosRankSum=-0.404;SC=AGCTCCCATCCTTGGAGGAAG;SOR=1.609;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=15;WE=53498854;WS=53498836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,18:0.86:21
chr17	53498990	rs78612327	T	C	2088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.926;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=38;PP=1368;ReadPosRankSum=-1.390;SC=GGGAACCCGCTTCTGACACGG;SOR=0.401;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=136;TCF=78;TCR=58;TR=82;WE=53498998;WS=53498980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,92:0.60:153
chr17	53828706	rs890488	C	G	827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=12;PP=589;SC=GACAGGGGCGCGTCTTCTCCG;SOR=0.846;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=11;TCR=12;TR=23;WE=53828714;WS=53828696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	53844833	rs57156382	CT	C	2341.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.050;HP=14;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=52;PP=909;ReadPosRankSum=0.937;SC=GCTTGCTTTTCTTTTTTTTTT;SOR=1.683;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=72;TCF=2;TCR=70;TR=54;WE=53844855;WS=53844823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:6,97:0.94:103
chr17	53844847	rs35430620	C	T	2830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=28;NR=57;PP=1715;SC=TTTTTTTAGACGTACTTTCAC;SOR=1.656;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=28;TCR=57;TR=85;WE=53844855;WS=53844823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr17	53851071	rs2960063	A	G	1944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.20;SOR=0.990;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	53851078	rs2912558	T	C	2053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.91;SOR=0.909;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr17	53851228	rs2960062	C	T	3289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.53;SOR=0.759;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr17	53852111	rs2960061	T	C	1774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=28;PP=1160;SC=ATTTTTCTGGTATTTTTCCTT;SOR=0.723;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=31;TCR=28;TR=59;WE=53852119;WS=53852101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr17	54428067	rs2215756	C	T	510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=4;PP=370;SC=ATGATAAAATCATATGTCAAC;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=18;WE=54428075;WS=54428057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	54428436	rs17759670	A	G	391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=12;PP=310;SC=GATGCTTGCAATTTTATAAAT;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=54428444;WS=54428426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	54450038	rs957724	C	A	948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.682;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=7;PP=567;ReadPosRankSum=-0.778;SC=CAATGCACCTCAACACACTGG;SOR=2.091;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=32;WE=54450046;WS=54450028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,36:0.97:37
chr17	54450134	rs8069322	G	A	3041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=49;PP=1708;SC=AGAAAGAGAAGCAGCTGAAAG;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=55;TCR=49;TR=104;WE=54450142;WS=54450124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr17	54517855	rs7224536	T	C	345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=8;PP=208;SC=GTAGCAAATGTCTATTCTGAA;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=54517863;WS=54517845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	54526301	rs2024316	C	T	913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=6;PP=499;SC=TTGGCATCGCCTGCTTGCTCT;SOR=1.911;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=28;WE=54526309;WS=54526291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	54534634	rs10852985	G	A	750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=8;PP=475;SC=CTACATAGCCGTTATATTTTA;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=27;WE=54534642;WS=54534624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	54558282	rs68128704	GTA	G	204.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.9967;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=219;SC=GTGTGTGTGTGTAAATTTTCC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=6;WE=54558291;WS=54558272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	54892126	rs4794668	A	G	479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=5;PP=313;SC=AACTCTAACCAAACCCCTAAC;SOR=1.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=18;WE=54892134;WS=54892116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	54912737	rs7225724	A	G	711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=18;PP=489;SC=TTTTGAGGAAACAAGCTAATA;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=54912745;WS=54912727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	54921322	rs3760157	G	A	1483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=14;PP=807;SC=TTGTTTTGTGGGTTATCATTG;SOR=1.445;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=47;TCF=32;TCR=15;TR=46;WE=54921330;WS=54921312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr17	54921494	rs3760158	A	C	1108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=23;PP=777;SC=GTTATTTAACATCCATTAATC;SOR=1.151;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=16;TCR=23;TR=39;WE=54921502;WS=54921484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr17	54925262	rs6503775	G	T	839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=21;NR=10;PP=582;SC=AAAATAATTTGTCTTTTTCTT;SOR=1.765;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=21;TCR=11;TR=31;WE=54925270;WS=54925252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	54925480	rs56356802	C	CAT	252.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.111;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=325;ReadPosRankSum=1.366;SC=ATATACTATACATATATATAT;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=7;WE=54925488;WS=54925470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr17	54939715	rs9911560	T	C	815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=19;PP=435;SC=CAGTGGTTTATGGCTCATGCA;SOR=3.407;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=22;WE=54939723;WS=54939705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	54939737	rs3826295	T	A	670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=16;PP=436;SC=CTGGTCACTGTACACTAGCGG;SOR=4.712;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=17;WE=54939745;WS=54939727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	54978794	rs205498	G	A	1510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=9;PP=1088;SC=ACTGGGGGTGGGCTCCTGGAG;SOR=2.701;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=38;TCR=9;TR=47;WE=54978802;WS=54978784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr17	55026912	rs12942251	A	G	1494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.269;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=37;PP=886;ReadPosRankSum=-0.978;SC=GAGCCCTACCAGGAACCCGTA;SOR=1.244;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=92;TCF=39;TCR=53;TR=59;WE=55026920;WS=55026902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,66:0.64:103
chr17	55027850	rs8071691	T	C	2168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.608;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.581;NF=41;NR=51;PP=1424;ReadPosRankSum=-2.106;SC=CATCACAAGATTCAGACTCCG;SOR=0.779;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=150;TCF=68;TCR=82;TR=92;WE=55027858;WS=55027840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,97:0.61:158
chr17	55038062	rs9899845	T	C	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.516;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=59;ReadPosRankSum=-0.748;SC=GTCTAGCGGCTTCAGGCCCGG;SOR=1.022;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=6;WE=55038070;WS=55038052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr17	55058689	rs3095499	G	C	325.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5010;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=174;ReadPosRankSum=-0.175;SC=AGTGAAGGGCGGATTTGGTCC;SOR=1.863;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=11;WE=55058697;WS=55058679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,14:0.88:16
chr17	55065530	rs12453004	A	G	1192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.590;NF=29;NR=14;PP=756;ReadPosRankSum=0.135;SC=GTGTGACTCAAAAAGCAATCA;SOR=0.678;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=59;TCF=39;TCR=20;TR=43;WE=55065538;WS=55065520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,50:0.72:69
chr17	55065558	rs11437466	T	TA	2911.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=25;PP=1736;SC=TAATTCTGTGTAATTCCTTTT;SOR=1.013;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=17;TCR=27;TR=41;WE=55065566;WS=55065548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr17	55075582	rs1811258	A	G	148.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=9;NR=0;PP=223;SC=TGAGGCAGGAAAATCGCTTGA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=55075590;WS=55075575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	55075928	rs12941709	C	T	2093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=46;PP=1355;SC=AATTCAGAGACCTGAATTTGT;SOR=2.617;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=15;TCR=46;TR=61;WE=55075936;WS=55075918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
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chr17	55079471	rs12940187	T	C	1700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.925;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=28;PP=959;ReadPosRankSum=0.498;SC=CCCTAAATCTTTGGAAACATC;SOR=0.899;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=211;TCF=124;TCR=87;TR=74;WE=55079479;WS=55079461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,90:0.36:250
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chr17	55185241	rs75053167	G	A	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=1.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.53;ReadPosRankSum=-0.179;SOR=0.829;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,29:0.34:86
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chr17	55189723	rs3094444	T	G	1070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=8;PP=788;SC=AAGTGTTTTGTTACCTCAAAG;SOR=2.242;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=29;TCR=8;TR=37;WE=55189731;WS=55189713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr17	55197802	rs4583	C	A	1963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.785;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=54;PP=1361;ReadPosRankSum=-1.897;SC=TCCTTTCTTTCTCCATACTGT;SOR=0.829;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=112;TCF=40;TCR=72;TR=82;WE=55197810;WS=55197792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,84:0.71:119
chr17	55363421	rs11079286	G	C	2038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=39;PP=1246;SC=GCCTCTTTCTGTCTTTCCCTC;SOR=1.164;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=29;TCR=39;TR=68;WE=55363429;WS=55363411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr17	55606875	rs55990806	G	GT	852.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.395;HP=10;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=10;PP=446;ReadPosRankSum=0.682;SC=AAAGACCACTGTTTTTTTTTC;SOR=0.408;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=49;TCF=30;TCR=19;TR=28;WE=55606883;WS=55606865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,38:0.58:66
chr17	55674423	rs6503820	G	A	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=263;ReadPosRankSum=1.404;SC=GGGGTGGGGAGGGGGCTAGAT;SOR=0.527;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=16;WE=55674431;WS=55674413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr17	55704465	rs1861474	A	G	1788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=16;PP=1156;SC=AACCCTCATGAGAGACAAATT;SOR=1.573;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=59;TCF=43;TCR=16;TR=58;WE=55704473;WS=55704455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr17	55822171	rs12451748	T	C	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=230;ReadPosRankSum=-1.575;SC=ACCCACGAGGTTCAGTCAGCC;SOR=1.085;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=14;WE=55822179;WS=55822161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,17:0.71:24
chr17	55822214	rs12451753	T	A	791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=11;PP=354;ReadPosRankSum=1.299;SC=GGGCGTCACGTCCCCTGTCCA;SOR=0.689;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=31;TCR=19;TR=29;WE=55822222;WS=55822204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,37:0.64:58
chr17	55822467	rs12449409	G	A	1727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.776;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=29;PP=898;ReadPosRankSum=-0.944;SC=TTGCACCCCGGCCACCTTCTG;SOR=0.579;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=99;TCF=56;TCR=43;TR=68;WE=55822475;WS=55822457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,78:0.70:111
chr17	55917353	rs2099914	C	G	3278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=73;PP=2251;SC=TCAATTAATTCGCTAAAGATA;SOR=2.100;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=29;TCR=73;TR=102;WE=55917361;WS=55917343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr17	55950064	rs35704289	C	T	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.07;ReadPosRankSum=1.497;SOR=0.920;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,21:0.24:87
chr17	55950363	rs17762330	G	A	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=69;ReadPosRankSum=1.622;SC=ACCTGGTTGCGAGCCAAAATC;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=5;WE=55950371;WS=55950353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr17	55950826	rs11650742	G	A	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.01;ReadPosRankSum=0.657;SOR=0.552;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,15:0.18:82
chr17	55951037	rs17762338	C	T	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.936;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=12;PP=222;ReadPosRankSum=0.479;SC=GTTCCGATAGCGTCTCTGGCT;SOR=0.527;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=66;TCF=27;TCR=39;TR=22;WE=55951045;WS=55951027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,26:0.34:76
chr17	55963045	rs138237554	T	G	50.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=16.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	56083934	rs2233911	G	A	1151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.211;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=27;PP=699;ReadPosRankSum=-1.206;SC=ACCAGGAGGAGAAGCTCGCTC;SOR=0.488;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=55;TCF=17;TCR=38;TR=40;WE=56083942;WS=56083924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,47:0.75:63
chr17	56232899	rs143254667	C	A	2765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.490;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=46;PP=1542;ReadPosRankSum=-2.346;SC=CATCTCCCAGCCCCTCCGGTA;SOR=0.919;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=167;TCF=91;TCR=76;TR=108;WE=56232907;WS=56232889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,123:0.66:187
chr17	56235104	rs3863503	C	A	513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=0.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.20;MQRankSum=-0.472;QD=4.25;ReadPosRankSum=0.287;SOR=0.606;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,34:0.28:121
chr17	56270121	rs12602891	T	C	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.087;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=45;ReadPosRankSum=-0.718;SC=CGGCTGGGGGTCCTCAAAGTG;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=4;WE=56270129;WS=56270111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr17	56321451	.	GACACACAC	G	151.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=-0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.17;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr17	56351708	.	AGT	A	97	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;FR=0.9999;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=97;QD=50.0;SC=AGAATCTAGGAGTGTGTGTGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=2;WE=56351717;WS=56351698;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,2:0.25:8
chr17	56357833	rs2856857	G	A	1756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=2.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.31;ReadPosRankSum=-0.196;SOR=0.898;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,83:0.63:132
chr17	56381592	rs35853224	T	TA	866.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=734;ReadPosRankSum=-1.121;SC=TTCCCTGGACTACAGTGGGAA;SOR=0.569;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=19;WE=56381600;WS=56381582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,27:0.82:33
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chr17	56384374	rs11652816	A	G	1729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.869;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=46;PP=1164;ReadPosRankSum=1.024;SC=CTCACTCCCTATGCCCCTAGG;SOR=0.495;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=36;TCR=61;TR=74;WE=56384382;WS=56384364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,76:0.73:104
chr17	56384928	rs36057095	C	T	1124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=10;PP=625;SC=AGGGAAGACCCAGCTGGTGTT;SOR=1.788;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=24;TCR=10;TR=34;WE=56384936;WS=56384918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr17	56386118	rs2680689	A	G	1323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=23;PP=650;ReadPosRankSum=-0.285;SC=CCTCCTGCTCATCCTCCGAAT;SOR=0.732;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=89;TCF=50;TCR=39;TR=53;WE=56386126;WS=56386108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,65:0.64:102
chr17	56386358	rs2526360	T	A	3151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.908;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=53;PP=1722;ReadPosRankSum=0.330;SC=TGCAGTGTTCTCGGGGATCTG;SOR=0.864;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=185;TCF=106;TCR=79;TR=128;WE=56386366;WS=56386348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,142:0.70:202
chr17	56388238	rs2680704	C	G	1146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.684;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=26;PP=764;ReadPosRankSum=-1.473;SC=GACCCTTTTGCCATCTCTCTG;SOR=0.749;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=93;TCF=50;TCR=43;TR=50;WE=56388246;WS=56388228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,53:0.52:102
chr17	56388416	rs3744098	C	T	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.958;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=376;ReadPosRankSum=0.693;SC=GCAGGCTGGCCGGAGCCAGGG;SOR=1.426;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=48;TCF=29;TCR=19;TR=23;WE=56388424;WS=56388406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,23:0.43:53
chr17	56388927	rs2072144	T	C	1936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=28;PP=1020;ReadPosRankSum=-3.310;SC=TGGGCAGGGCTATACCTTCTG;SOR=0.701;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=112;TCF=66;TCR=46;TR=68;WE=56388935;WS=56388917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,86:0.63:137
chr17	56393251	.	G	GGGAT	467.06	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=-0.000;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=0;PP=143;ReadPosRankSum=0.126;SC=CTGGGCAGAGGGGATGGATGG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=1;WE=56393259;WS=56393241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,9:0.90:10
chr17	56398006	rs2526380	C	G	1779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.56;SOR=0.990;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr17	56404349	rs2526378	A	G	344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=9;PP=231;SC=CCACATAGACACCCCCAAACC;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=56404357;WS=56404339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	56429673	rs2680703	A	G	1306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=31;PP=882;SC=TTCTCCCGCCAGCAGGCGGGG;SOR=5.136;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=33;WE=56429681;WS=56429663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr17	56438301	rs2680701	G	A	680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=16;PP=433;SC=CTGCTGAAGCGGATCCTGGGA;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=56438309;WS=56438291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	56440526	rs2526372	G	A	1318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=3;PP=790;SC=GGACTAGAGGGTTTCCAGGAT;SOR=3.160;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=33;TCR=3;TR=35;WE=56440534;WS=56440516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	56440542	rs2680700	G	T	1592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=7;PP=965;SC=AGGATCTCTCGCAGCTCCAGG;SOR=2.628;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=45;TCF=38;TCR=7;TR=44;WE=56440550;WS=56440532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	56544280	rs1017089	T	G	6191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=114;NR=85;PP=2965;SC=GGAAGAGGCATTGGGAGTGAC;SOR=0.803;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=199;TCF=114;TCR=85;TR=199;WE=56544288;WS=56544270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr17	56659018	rs6503870	C	T	2037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.16;SOR=0.718;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr17	56676368	rs389389	T	C	5913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=113;NR=78;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.810;SC=TTGTAGGCATTTGTAAACTCT;SOR=0.991;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=193;TCF=114;TCR=79;TR=191;WE=56676376;WS=56676358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,212:0.99:214
chr17	56692800	rs302858	G	T	918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=24;PP=698;SC=CAGAGAAATGGTCTCCACACA;SOR=2.985;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=28;WE=56692808;WS=56692790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	56695008	rs302860	C	A	1699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=35;PP=959;SC=AGGAAAAAAACCTCAGAATTA;SOR=1.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=18;TCR=35;TR=53;WE=56695016;WS=56694998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr17	56708019	rs694720	T	C	1549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=33;PP=1023;SC=TACTTTCATATATTGCTGTGA;SOR=2.093;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=13;TCR=33;TR=46;WE=56708027;WS=56708009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	56798207	rs28363318	T	C	720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=12;PP=365;SC=TTTTAGTTTATCACAGTTTTT;SOR=1.302;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=9;TCR=12;TR=21;WE=56798215;WS=56798197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	56833457	rs201186780	G	GGAACCC	7605.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;BaseQRankSum=-2.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.519;NF=15;NR=48;PP=2990;ReadPosRankSum=1.127;SC=AGCCGGAGCCGGAACCCGAAC;SOR=0.243;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=104;TCF=22;TCR=82;TR=63;WE=56833465;WS=56833447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,162:0.99:163
chr17	57046980	rs142776229	C	G	4145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.484;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=82;PP=2429;ReadPosRankSum=1.082;SC=CCATTCACCTCCACGTTAACT;SOR=0.601;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=242;TCF=110;TCR=132;TR=152;WE=57046988;WS=57046970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,182:0.64:284
chr17	57158345	rs7214402	T	C	111.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=0;PP=56;SC=CCTATCAAATTTGCAAATCTT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=57158353;WS=57158336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	57208752	rs9652856	T	C	2121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.19;SOR=0.821;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr17	57287454	rs6503905	A	G	834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.388;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=18;PP=595;ReadPosRankSum=-1.470;SC=TAATGGGAGCATCAGCCTGGA;SOR=0.563;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=141;TCF=91;TCR=50;TR=47;WE=57287462;WS=57287444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,49:0.31:158
chr17	57474396	rs3214250	GA	G	258.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=1.535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.29;MQRankSum=1.200;QD=6.99;ReadPosRankSum=0.175;SOR=1.207;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr17	57642846	rs10713316	TG	T	247.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.049;NF=7;NR=2;PP=202;ReadPosRankSum=-1.584;SC=GGGAAATCCCTGGGGGGTGGA;SOR=0.368;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=9;WE=57642854;WS=57642836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr17	57683041	rs150025878	T	TA	2178.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.49;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=32;PP=1331;ReadPosRankSum=-1.182;SC=AAAGGGTGAGTAAATCATTTG;SOR=0.751;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=50;TCF=6;TCR=44;TR=36;WE=57683049;WS=57683031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,77:0.65:118
chr17	57717737	rs9910530	C	G	1346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=21;NR=22;PP=669;SC=TTAACCTTCTCTTAGCCAATA;SOR=0.866;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=52;TCF=21;TCR=31;TR=43;WE=57717745;WS=57717727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr17	57721907	rs113812535	T	TTTTG	339.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.13;QD=37.75;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	57725043	rs8071749	T	G	2588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=45;PP=1525;SC=ATTTTAACTATTTTTTTATGA;SOR=0.976;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=41;TCR=45;TR=86;WE=57725051;WS=57725033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr17	57733479	rs4349212	T	A	1348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=34;PP=963;SC=TCCCCAAGATTAAAAAATAGA;SOR=2.030;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=13;TCR=34;TR=47;WE=57733487;WS=57733469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr17	57743651	rs17580385	T	C	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=0.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.70;ReadPosRankSum=-0.513;SOR=0.819;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:114,36:0.24:150
chr17	57743691	rs9893154	G	A	2220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=43;PP=1451;SC=AGCTACTGAGGGGCCTACTCC;SOR=2.030;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=19;TCR=43;TR=62;WE=57743699;WS=57743681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr17	57746107	rs2272411	A	G	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=1.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=205;ReadPosRankSum=0.099;SC=AAGTGTGCCTATGCTTAATTG;SOR=0.327;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=12;WE=57746115;WS=57746097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr17	57750982	rs8065248	T	C	1691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=19;PP=935;SC=AAATTTAAAGTTTCCTTTTGT;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=35;TCR=19;TR=54;WE=57750990;WS=57750972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr17	57754591	rs28465103	A	G	581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.047;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=402;ReadPosRankSum=0.075;SC=CTGCATTTTTAAAAACCTGTT;SOR=0.223;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=29;TCF=9;TCR=20;TR=23;WE=57754599;WS=57754581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,25:0.76:33
chr17	57761384	rs3215190	CAT	C	683.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.537;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.047;NF=0;NR=12;PP=473;ReadPosRankSum=0.690;SC=TCTCAAGACTCATAAAGTTAT;SOR=1.931;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=12;WE=57761393;WS=57761374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,19:0.68:28
chr17	57886125	rs2645487	T	G	635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.199;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=12;PP=390;ReadPosRankSum=0.511;SC=TTCCTACTTCTCATTAATGTT;SOR=0.446;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=41;TCF=25;TCR=16;TR=28;WE=57886133;WS=57886115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,30:0.64:47
chr17	57889192	rs2063353	T	G	769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.694;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=27;PP=597;ReadPosRankSum=-0.196;SC=ATGAACCCATTACAAGACAAT;SOR=1.556;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=99;TCF=36;TCR=63;TR=36;WE=57889200;WS=57889182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,36:0.34:105
chr17	58040730	rs4968401	T	C	1016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=23;PP=734;SC=CTTTATTCACTAAAGGAGTAG;SOR=1.270;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=14;TCR=23;TR=37;WE=58040738;WS=58040720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr17	58066607	.	ATT	A	155.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.119;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=2.543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.06;MQRankSum=0.564;QD=4.87;ReadPosRankSum=0.436;SOR=0.124;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,9:0.28:32
chr17	58136654	.	A	G	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.006;ClippingRankSum=-0.000;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.97;ReadPosRankSum=-0.652;SOR=0.086;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr17	58149745	rs3744375	G	A	2295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.492;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=58;PP=1554;ReadPosRankSum=0.468;SC=AATGAGGCTTGCAAAAGACTA;SOR=0.463;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=131;TCF=48;TCR=83;TR=95;WE=58149753;WS=58149735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,99:0.71:140
chr17	58153603	.	CA	C	130.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.227;ClippingRankSum=0.000;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=4.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.74;ReadPosRankSum=-0.158;SOR=0.241;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,17:0.23:75
chr17	58180062	rs8075626	T	C	7894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=102;PP=2819;SC=GCTTGGCCGGTGGCGGCGGAG;SOR=0.958;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=190;TCF=88;TCR=102;TR=190;WE=58180070;WS=58180052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr17	58180079	rs8074512	C	G	7736.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=93;PP=2898;SC=GGAGCTTGGCCGGCGGCGGCG;SOR=1.049;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=161;TCF=68;TCR=93;TR=161;WE=58180087;WS=58180069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr17	58180172	rs8075789	T	C	1142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=27;PP=839;SC=CATTTCTATTTCTCATTCCAT;SOR=3.026;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=33;WE=58180180;WS=58180162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr17	58503180	rs202020451	G	A	795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=3.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.58;ReadPosRankSum=-0.783;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,45:0.37:121
chr17	58504201	rs11655643	C	T	2230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.410;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=55;PP=1256;ReadPosRankSum=-1.718;SC=ACATTCCGCCCGAGCACAGCT;SOR=0.943;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=167;TCF=76;TCR=91;TR=96;WE=58504209;WS=58504191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,105:0.57:184
chr17	58786625	rs2643103	A	G	5937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=84;PP=2965;SC=AGTACTGGGAATGAACCGCCT;SOR=0.837;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=192;TCF=108;TCR=84;TR=192;WE=58786633;WS=58786615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr17	58786758	rs113697207	CT	C	92.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQRankSum=1.962;QD=1.36;ReadPosRankSum=0.881;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,13:0.19:68
chr17	58824567	rs7501675	T	C	3598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=63;NR=49;PP=1538;SC=AGATCAGTGGTGAAGCACAAG;SOR=0.797;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=112;TCF=63;TCR=49;TR=112;WE=58824575;WS=58824557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr17	58885299	rs9904053	G	A	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.137;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=86;ReadPosRankSum=-0.367;SC=TTGAAAGCATGAAAATAGTGG;SOR=1.702;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=8;WE=58885307;WS=58885289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,8:0.25:32
chr17	58969056	rs9303430	T	C	798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=18;PP=385;ReadPosRankSum=-0.823;SC=CGTGCATGTTTGTTACACAGG;SOR=0.706;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=116;TCF=64;TCR=52;TR=41;WE=58969064;WS=58969046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,46:0.36:129
chr17	58969174	rs9303431	C	G	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.490;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=180;ReadPosRankSum=1.878;SC=CTTCCCTCCCCCTTTTGGAGT;SOR=1.179;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=64;TCF=26;TCR=38;TR=17;WE=58969182;WS=58969164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,16:0.23:70
chr17	59477903	rs75743672	C	A	1707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.869;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=40;PP=969;ReadPosRankSum=-1.832;SC=ACAAGCTAGGCACGGAGATGG;SOR=0.368;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=109;TCF=44;TCR=65;TR=73;WE=59477911;WS=59477893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,79:0.66:120
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chr17	59480313	rs140392356	GAGAGAGAGAGAGAGAGAGA	G	337.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=67.18;MQRankSum=0.593;QD=15.35;ReadPosRankSum=0.922;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr17	59482165	rs66504335	GC	G	867.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.97;ReadPosRankSum=1.912;SOR=0.897;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,25:0.29:87
chr17	59482169	rs35619711	C	G	891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.37;ReadPosRankSum=1.642;SOR=0.791;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,26:0.30:86
chr17	59482173	rs9891115	G	A	907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.56;ReadPosRankSum=1.322;SOR=0.737;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,27:0.31:86
chr17	59482300	rs8080990	G	C	2125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.098;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=33;PP=1234;ReadPosRankSum=0.257;SC=GGCGGTCCCCGGTAGCCAGAA;SOR=0.527;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=139;TCF=88;TCR=51;TR=84;WE=59482308;WS=59482290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,97:0.63:155
chr17	59485393	rs2240736	C	T	1455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.879;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=35;PP=785;ReadPosRankSum=0.469;SC=GTCTAACCCTCGTCTTGTTCT;SOR=0.484;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=204;TCF=116;TCR=88;TR=74;WE=59485401;WS=59485383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,83:0.36:228
chr17	59485555	rs1057987	C	T	1946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.976;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=37;PP=1164;ReadPosRankSum=1.421;SC=TCTCCCGGAGCCCCTTCCTGG;SOR=0.773;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=227;TCF=128;TCR=99;TR=88;WE=59485563;WS=59485545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,100:0.38:261
chr17	59489893	rs9907379	T	C	6109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=98;NR=101;PP=2965;SC=CGGCAACTCCTCACAGGTCCA;SOR=0.873;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=199;TCF=98;TCR=101;TR=199;WE=59489901;WS=59489883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr17	59557600	rs3744438	C	T	730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=19;PP=464;ReadPosRankSum=0.691;SC=TCACAGCTCGCGGAGCCGCAG;SOR=0.628;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=131;TCF=64;TCR=67;TR=40;WE=59557608;WS=59557590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,43:0.30:141
chr17	59557755	rs112008276	GCC	G	134.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5081;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=37;ReadPosRankSum=-0.712;SC=ACTCTGCAGCGCCCCCCCCCC;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=3;WE=59557764;WS=59557745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr17	59560463	rs7218485	C	T	1347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.026;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=29;PP=807;ReadPosRankSum=1.533;SC=CTGGGGTGGACGACCTGCCCC;SOR=0.770;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=230;TCF=132;TCR=98;TR=72;WE=59560477;WS=59560453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:179,81:0.31:260
chr17	59560685	rs2270150	C	T	3990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.005;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=80;PP=2423;ReadPosRankSum=0.664;SC=AGTCTCAGGTCCGAGAGCGGG;SOR=0.787;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=240;TCF=117;TCR=123;TR=157;WE=59560693;WS=59560675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,176:0.67:263
chr17	59667953	rs17610181	G	A	3765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.051;NF=84;NR=72;PP=2274;ReadPosRankSum=-0.003;SC=TTCAGAGCTCGGACTGCCTTT;SOR=0.696;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=239;TCF=128;TCR=111;TR=156;WE=59667961;WS=59667943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,170:0.66:257
chr17	59668021	rs61739273	G	C	3403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.534;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=64;PP=2150;ReadPosRankSum=0.177;SC=TTCTACACCTGTTTCATCGAC;SOR=0.654;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=198;TCF=102;TCR=96;TR=131;WE=59668029;WS=59668011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,143:0.67:213
chr17	59668352	rs17531723	C	T	2242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-3.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=43;PP=1258;ReadPosRankSum=-1.984;SC=GCTTTACCGACTGGTTCTTCA;SOR=0.650;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=146;TCF=80;TCR=66;TR=95;WE=59668360;WS=59668342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,109:0.65:168
chr17	59760996	rs4986763	A	G	1109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=19;PP=607;ReadPosRankSum=-2.790;SC=CTTCAGGATCATAAAGTTCAG;SOR=0.811;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=65;TCF=37;TCR=28;TR=44;WE=59761004;WS=59760986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,51:0.68:75
chr17	59763114	rs4988357	A	T	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.796;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=253;ReadPosRankSum=-0.433;SC=TTAAGGAATTAATCTATACCC;SOR=1.270;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=16;WE=59763122;WS=59763104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
chr17	59763347	rs4986764	A	G	2137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=33;PP=1268;ReadPosRankSum=0.989;SC=AAATAAGGTGAGGTACTGTAC;SOR=0.650;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=102;TCF=58;TCR=44;TR=79;WE=59763355;WS=59763337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,89:0.79:113
chr17	59763465	rs4986765	T	C	3844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.479;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=62;PP=2367;ReadPosRankSum=0.413;SC=CAGCCAAGGATTCCAGTGCAC;SOR=0.647;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=230;TCF=134;TCR=96;TR=151;WE=59763473;WS=59763455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,166:0.65:256
chr17	59857809	rs4988351	C	G	563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=15;PP=388;SC=TTAGAAGAGGCTGGGCAAAGT;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=59857817;WS=59857799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	59955426	rs606072	T	G	4074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=84;PP=2691;SC=ACTTGTGTGTTATTTACTGGG;SOR=1.406;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=135;TCF=50;TCR=85;TR=134;WE=59955434;WS=59955416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr17	59971067	rs8077835	A	T	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.12;ReadPosRankSum=0.265;SOR=1.140;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr17	59982085	rs72843757	G	A	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=21;ReadPosRankSum=-0.000;SC=ATCTCAAGTTGCCAAATGCAA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=3;WE=59982093;WS=59982075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr17	60043884	rs671347	G	A	7159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=138;NR=96;PP=2965;SC=CATTGTTACCGTCAGCTGCCT;SOR=0.978;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=234;TCF=138;TCR=96;TR=234;WE=60043892;WS=60043874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,268:1.00:268
chr17	60070111	rs11375626	G	GT	186.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=2;PP=67;SC=GATTCTTACAGTAACAAGTAA;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=60070119;WS=60070101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	60142662	.	CG	C	59.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.205;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.24;MQRankSum=-0.468;QD=2.39;ReadPosRankSum=0.000;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,6:0.24:25
chr17	60142710	.	G	GC	61.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=7;PP=285;SC=AGGCCGCCGGGCGCCCGCCCT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=60142718;WS=60142700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	60215748	rs11079465	T	C	146.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=3;PP=97;SC=CAGCTCCCGGTGCAGCTCGGC;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=6;WE=60215756;WS=60215738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	60217236	rs56068498	A	G	1393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=24;PP=778;SC=GGCGTTGTACATGTCCAGCGT;SOR=0.729;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=27;TCR=24;TR=51;WE=60217244;WS=60217226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr17	60360238	rs10163525	A	G	8553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=120;PP=2965;SC=GGTAGTAAGGATGAACATTCC;SOR=0.712;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=222;TCF=102;TCR=120;TR=222;WE=60360246;WS=60360228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr17	60360261	rs62069132	T	C	4255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;BaseQRankSum=0.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-1.831;NF=70;NR=101;PP=2586;ReadPosRankSum=-0.831;SC=TTGTAGATGGTGAAGAGGAGC;SOR=0.967;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=173;TCF=71;TCR=102;TR=171;WE=60360269;WS=60360251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,171:0.99:173
chr17	60363906	rs202158824	G	T	76.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.00;QD=25.43;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	60363941	rs148555715	G	C	204.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.24;QD=29.26;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	60364233	rs4968513	A	T	779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=2.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.244;NF=5;NR=23;PP=529;ReadPosRankSum=-0.162;SC=ATGTCCTATAATCCAATCAGA;SOR=0.773;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=8;TCR=37;TR=28;WE=60364241;WS=60364223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,30:0.65:46
chr17	60365992	rs149569922	C	G	999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.36;QD=33.33;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	60366741	rs2668983	C	G	1868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.46;QD=28.75;SOR=1.162;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr17	60369283	rs143698032	C	T	687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=5.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.94;MQRankSum=-5.165;QD=7.48;ReadPosRankSum=-0.876;SOR=0.309;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,36:0.39:92
chr17	60464688	rs9909704	C	T	2136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=45;NR=24;PP=1103;SC=AATATTTTCACATCTTTCCTC;SOR=1.124;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=45;TCR=24;TR=69;WE=60464696;WS=60464678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr17	60472623	rs11079476	C	T	1931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=36;PP=1230;SC=CAGTCAGCTCCCACTAACATC;SOR=1.085;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=65;TCF=29;TCR=36;TR=65;WE=60472631;WS=60472613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr17	60503892	rs2543409	A	G	2791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=81;PP=2549;SC=AGTGTTCTTCAAAGAGCCTTG;SOR=2.044;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=29;TCR=81;TR=110;WE=60503900;WS=60503882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr17	60503921	rs2319055	T	C	862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.99;QD=33.18;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	60637258	rs146385050	C	A	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.947;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.586;NF=7;NR=0;PP=130;ReadPosRankSum=-0.533;SC=CCTGTTTGAACTTTAATTTTG;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=7;WE=60637266;WS=60637248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr17	60651884	rs11314763	GT	G	130.75	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.98;MQRankSum=0.180;QD=14.53;ReadPosRankSum=0.792;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr17	60654358	.	G	C	119	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=18;MQ=48.99;NF=0;NR=5;PP=119;QD=30.7542425094;SC=GAGTCTCACTGTGTCTCCCAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=60654366;WS=60654348;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	60657334	rs12451705	C	T	1595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=19;PP=1051;SC=TCAGTATTTGCCATGTTGATG;SOR=1.278;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=35;TCR=19;TR=54;WE=60657342;WS=60657324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr17	60683503	rs8078132	A	G	1372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=8;PP=1026;SC=ATTTACCACCAGAGTGTTTTG;SOR=2.970;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=42;TCR=8;TR=49;WE=60683511;WS=60683493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr17	60741917	rs2014055	G	A	1076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.58;ReadPosRankSum=-0.832;SOR=0.571;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:166,69:0.29:235
chr17	60742348	rs2252814	G	T	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.402;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=104;ReadPosRankSum=0.971;SC=TGGGGTCCCCGATGTCCAGGG;SOR=0.268;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=39;TCF=11;TCR=28;TR=11;WE=60742356;WS=60742338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,11:0.25:44
chr17	60743806	rs73333680	G	A	1348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=15;PP=676;ReadPosRankSum=-0.414;SC=GAGGGCTGTCGTGGTGGCAGG;SOR=0.811;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=47;TCR=21;TR=48;WE=60743814;WS=60743796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,57:0.72:79
chr17	60748926	rs729647	C	T	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=90;ReadPosRankSum=-0.766;SC=TGGGAGGCCTCGCCTGTGTTG;SOR=0.368;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=8;WE=60748934;WS=60748916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr17	60749533	rs8072984	A	G	697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.162;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=19;PP=431;ReadPosRankSum=1.062;SC=CCCTCTCCCTATCACAGGGCC;SOR=1.040;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=46;TCF=15;TCR=31;TR=27;WE=60749541;WS=60749523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,30:0.56:54
chr17	60751272	rs9896444	C	T	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.158;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=96;ReadPosRankSum=-2.467;SC=GGGTTCATCCCGCCTTCCCCA;SOR=0.275;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=7;WE=60751280;WS=60751262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr17	60753904	rs4968617	A	C	2809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.441;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=55;PP=1695;ReadPosRankSum=-1.857;SC=TGAGCCCCTTATTTGACTTGC;SOR=0.524;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=190;TCF=95;TCR=95;TR=114;WE=60753912;WS=60753894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,128:0.61:209
chr17	60758273	rs2245463	G	C	5258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=98;NR=75;PP=2550;SC=AGCTGACCTCGGTGCACAGCC;SOR=0.843;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=173;TCF=98;TCR=75;TR=173;WE=60758281;WS=60758263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr17	60759340	rs2429389	A	G	5221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.51;SOR=0.726;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr17	60759347	rs2460300	A	G	5180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.90;SOR=0.727;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr17	60766224	rs2465430	A	G	1738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=12;PP=943;SC=CCAGCTGTGCAGTGGTCCTGC;SOR=1.758;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=42;TCR=12;TR=54;WE=60766232;WS=60766214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr17	60766483	rs2465429	A	G	667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=16;PP=444;SC=TGGAAAAGCAATAGCACCCAC;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=21;WE=60766491;WS=60766473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	60767015	rs2429387	G	A	3392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=54;PP=1886;SC=TGTGAGAGCCGCAATGCCAGC;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=114;TCF=60;TCR=54;TR=113;WE=60767023;WS=60767005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr17	60767135	rs56288724	A	G	1367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=28;PP=841;ReadPosRankSum=1.287;SC=GGCTCCCGACACTTTTGCCCT;SOR=0.693;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=99;TCF=57;TCR=42;TR=62;WE=60767143;WS=60767125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,66:0.59:112
chr17	60767151	rs740698	C	T	805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=1.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.01;ReadPosRankSum=0.789;SOR=0.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,44:0.38:115
chr17	60767461	rs2465426	C	G	1819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=41;NR=23;PP=1087;SC=CATGGGCAAGCTGTCGGTGGC;SOR=1.085;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=41;TCR=23;TR=64;WE=60767469;WS=60767451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr17	60767953	rs11357719	GC	G	3955.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=35;NR=38;PP=1685;SC=GGGGGACTCTGCCCCCCCCGG;SOR=1.488;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=82;TCF=38;TCR=44;TR=73;WE=60767961;WS=60767943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr17	60768243	rs2465425	A	G	2150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=23;PP=1349;SC=TCTAGAACACACCTGCTCTCC;SOR=1.252;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=48;TCR=23;TR=71;WE=60768251;WS=60768233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr17	60769406	rs35688424	T	C	709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=7;PP=424;ReadPosRankSum=-0.833;SC=GTGCTTTGTATGTTTACTTAA;SOR=0.892;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=40;TCF=30;TCR=10;TR=29;WE=60769414;WS=60769396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,31:0.69:45
chr17	60769803	rs3826537	A	G	1118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.028;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=24;PP=573;ReadPosRankSum=-0.349;SC=TGAATGAGCAACAAGAATAGA;SOR=1.014;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=63;TCF=29;TCR=34;TR=42;WE=60769811;WS=60769793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,48:0.64:75
chr17	60778932	rs2251393	G	A	1733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=42;NR=22;PP=1103;SC=AGAGTGGCACGAGGTGAAAAT;SOR=1.196;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=42;TCR=22;TR=64;WE=60778940;WS=60778922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr17	60779025	rs2251391	A	G	2913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=54;NR=55;PP=1720;SC=AAGGGCTGGCAGGAGAGGTCT;SOR=0.800;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=110;TCF=54;TCR=56;TR=109;WE=60779033;WS=60779015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr17	60802483	rs17683483	C	A	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.078;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=183;ReadPosRankSum=-1.797;SC=TGAAAACAAGCCCTCGTGACC;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=11;WE=60802491;WS=60802473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr17	60813245	rs17683602	T	C	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.141;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=324;ReadPosRankSum=-1.607;SC=ATGCTAATTTTGGCCTTGGGA;SOR=0.286;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=38;TCF=28;TCR=10;TR=25;WE=60813253;WS=60813235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,28:0.67:42
chr17	60813627	rs2041283	G	A	3844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.785;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=76;PP=2415;ReadPosRankSum=0.880;SC=CGTGTGCACTGTTTACTGGGA;SOR=0.746;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=242;TCF=128;TCR=114;TR=163;WE=60813635;WS=60813617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,175:0.65:270
chr17	60814273	rs9891498	A	G	2342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.340;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=41;PP=1413;ReadPosRankSum=-0.031;SC=TGTCCCCCCAAATCTACTTCT;SOR=0.560;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=136;TCF=68;TCR=68;TR=85;WE=60814281;WS=60814263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,96:0.64:150
chr17	60824224	rs17746153	A	G	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=119;ReadPosRankSum=-0.118;SC=CACTGCATTCACCTTCACAGG;SOR=0.522;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=53;TCF=38;TCR=15;TR=14;WE=60824232;WS=60824214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,15:0.26:58
chr17	61087073	rs16946713	A	G	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=1.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=197;ReadPosRankSum=-1.200;SC=GTAACACTTTATTAATGCTTA;SOR=0.782;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=9;TCR=26;TR=15;WE=61087081;WS=61087063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
chr17	61315272	rs2460111	G	A	1464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.618;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=31;PP=861;ReadPosRankSum=-0.273;SC=AACCTTGGCAGTCTCAAAAAT;SOR=0.826;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=231;TCF=129;TCR=102;TR=73;WE=61315280;WS=61315249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,83:0.32:259
chr17	61432774	rs4968765	A	G	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=121;ReadPosRankSum=-1.264;SC=TCTGTGATAAACAATTCTGAG;SOR=0.336;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=10;WE=61432782;WS=61432764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
chr17	61457217	rs8065950	G	C	1353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.579;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=35;PP=769;ReadPosRankSum=-2.590;SC=CCATTTTTCCGCCATCTCTAG;SOR=0.526;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=178;TCF=72;TCR=106;TR=61;WE=61457234;WS=61457199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,72:0.35:206
chr17	61473325	rs2270133	C	A	636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=1.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.24;ReadPosRankSum=0.350;SOR=0.515;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,37:0.36:102
chr17	61490196	rs56182741	G	A	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=86;ReadPosRankSum=0.590;SC=CACCTTAAAAGAAGATTTTTT;SOR=0.425;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=7;WE=61490204;WS=61490186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr17	61515412	rs4968774	G	T	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=296;ReadPosRankSum=-2.043;SC=CCATCGTCCTGAGGCAGAGGT;SOR=0.605;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=49;TCF=43;TCR=6;TR=19;WE=61515420;WS=61515402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,22:0.43:51
chr17	61548918	rs4277405	C	T	4935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=76;PP=2895;SC=GGGAGCCCTGCCATGCCATGT;SOR=0.726;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=166;TCF=90;TCR=76;TR=166;WE=61548926;WS=61548908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr17	61548948	rs4459609	C	A	4625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=77;PP=2668;SC=TATAGTATATCTATGCCCAGC;SOR=0.740;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=81;TCR=77;TR=158;WE=61548956;WS=61548938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr17	61554686	rs184457276	G	A	2433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.631;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=53;PP=1560;ReadPosRankSum=0.763;SC=ACATCACCGCGGAGAATGCAA;SOR=0.749;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=163;TCF=83;TCR=80;TR=103;WE=61554694;WS=61554676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,110:0.63:174
chr17	61556298	rs4295	C	G	2919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=33;PP=1835;SC=GCTCCTCCTTCTAGCAGCGAG;SOR=1.374;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=65;TCR=33;TR=98;WE=61556306;WS=61556288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr17	61556527	rs4296	A	G	786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=21;PP=639;SC=GCTGCACTCCAGACCATGCAG;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=24;WE=61556535;WS=61556517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	61559923	rs4309	C	T	823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.655;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=19;PP=534;ReadPosRankSum=0.736;SC=AGGATCTGCCCGTCTCCCTGC;SOR=0.595;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=138;TCF=83;TCR=55;TR=42;WE=61559931;WS=61559913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,47:0.30:159
chr17	61560763	rs4311	T	C	1266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=24;PP=811;ReadPosRankSum=0.343;SC=TCTACAAAAGTTAAATCCATC;SOR=0.733;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=177;TCF=105;TCR=72;TR=62;WE=61560771;WS=61560753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,69:0.36:192
chr17	61562309	rs4316	C	T	866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=0.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.06;ReadPosRankSum=0.178;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,50:0.35:143
chr17	61562553	rs4320	G	A	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.497;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=303;ReadPosRankSum=2.625;SC=AACCTGGAGAGGGGAGGCAGA;SOR=0.200;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=17;WE=61562561;WS=61562543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr17	61562774	rs4321	T	C	1316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.641;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=37;PP=802;ReadPosRankSum=-1.706;SC=AGCATGTGCATACACACAGAG;SOR=0.834;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=233;TCF=110;TCR=123;TR=67;WE=61562782;WS=61562764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,79:0.30:262
chr17	61564052	rs4331	A	G	1832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.989;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=46;PP=1083;ReadPosRankSum=0.107;SC=AACGGGCAGCACTGCCTGCCC;SOR=0.780;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=225;TCF=106;TCR=119;TR=84;WE=61564060;WS=61564042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,96:0.37:261
chr17	61564281	rs4332	T	C	990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.793;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=13;PP=623;ReadPosRankSum=0.227;SC=GGCCTGGGGGTAGTGCAGGCC;SOR=0.855;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=86;TCF=61;TCR=25;TR=39;WE=61564289;WS=61564271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,45:0.45:99
chr17	61564522	rs4333	T	C	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.098;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=104;ReadPosRankSum=0.367;SC=CAGAGTTGGGTTCCCCTCGCT;SOR=0.141;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=8;WE=61564530;WS=61564512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,7:0.28:25
chr17	61565990	rs4341	G	C	1711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FS=2.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.25;ReadPosRankSum=0.453;SOR=0.540;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:134,51:0.28:185
chr17	61565998	rs4342	A	C	1881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FS=0.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.36;ReadPosRankSum=-0.042;SOR=0.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:141,60:0.30:201
chr17	61566031	rs4343	G	A	1135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=28;PP=713;ReadPosRankSum=0.126;SC=TGATGGCCACGTCCCGGAAAT;SOR=0.709;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=191;TCF=99;TCR=92;TR=59;WE=61566039;WS=61566021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,69:0.31:222
chr17	61571516	rs150234417	AGT	A	57.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=3;PP=116;ReadPosRankSum=-0.229;SC=AGGGTAGGGGAGTGTGTGTGT;SOR=0.120;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=3;WE=61571525;WS=61571506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr17	61573761	rs4362	T	C	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.24;ReadPosRankSum=0.507;SOR=0.665;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:140,58:0.29:198
chr17	61574492	rs4363	G	A	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=162;ReadPosRankSum=-1.150;SC=CTTGCTTCCCGCTCAGCTCGC;SOR=0.701;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=35;TCF=22;TCR=13;TR=16;WE=61574500;WS=61574482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,17:0.41:41
chr17	61600717	rs71376915	A	G	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=507;ReadPosRankSum=0.954;SC=CCGAGGACAGACGGAGACGCC;SOR=0.968;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=40;TCF=32;TCR=8;TR=27;WE=61600725;WS=61600707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,27:0.66:41
chr17	61611423	rs7225568	T	C	2183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.247;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.685;NF=44;NR=33;PP=1248;ReadPosRankSum=-0.182;SC=TGCTCAGCGATCAGGACGAAT;SOR=0.442;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=118;TCF=69;TCR=49;TR=77;WE=61611431;WS=61611413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,98:0.67:146
chr17	61615371	rs4465659	T	G	1571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.662;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=18;PP=1011;ReadPosRankSum=-0.431;SC=GGTAAGCCCTTGGTGGTGTGG;SOR=0.311;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=80;TCF=58;TCR=22;TR=58;WE=61615379;WS=61615361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,65:0.74:88
chr17	61615660	rs148485289	T	TG	522.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=397;ReadPosRankSum=1.421;SC=GCCCCGGGCGTGGGGGGGAGC;SOR=0.643;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=17;WE=61615668;WS=61615650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,22:0.73:30
chr17	61621330	rs76957877	C	T	257.98	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.8387;FS=4.973;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=198;ReadPosRankSum=0.707;SC=GGCTGCAGCTCCCTGGGCAGT;SOR=3.258;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=10;WE=61621338;WS=61621320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,10:0.83:12
chr17	61621805	rs8070334	T	G	1394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.599;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=24;PP=755;ReadPosRankSum=1.033;SC=TGGGGGCTGGTCATGGGTAGC;SOR=0.535;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=91;TCF=48;TCR=43;TR=55;WE=61621813;WS=61621795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,64:0.61:105
chr17	61623052	rs35819807	C	T	4555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=89;PP=2754;ReadPosRankSum=0.093;SC=GCTGTGGCAACGGACAAAACT;SOR=0.689;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=298;TCF=161;TCR=137;TR=193;WE=61623060;WS=61623042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,210:0.64:327
chr17	61623351	rs141118688	G	A	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.04;ReadPosRankSum=1.395;SOR=0.829;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr17	61660889	rs66502552	CG	C	5623.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=28;NR=71;PP=2972;SC=TTAGCCGGGCCGGGGGGTGGC;SOR=0.847;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=32;TCR=80;TR=99;WE=61660897;WS=61660879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr17	61710010	rs6504171	G	A	921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.994;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=12;PP=506;ReadPosRankSum=0.306;SC=GTATTTAAGTGTCTTAGTCCA;SOR=1.021;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=60;TCF=39;TCR=21;TR=38;WE=61710018;WS=61710000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,44:0.60:73
chr17	61729882	rs8080211	A	G	1384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.178;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=16;PP=963;ReadPosRankSum=0.869;SC=TTTTAAGTATACAATTAACCA;SOR=1.075;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=78;TCF=54;TCR=24;TR=54;WE=61729890;WS=61729872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,56:0.70:80
chr17	61735056	rs6504173	T	C	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.458;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=181;ReadPosRankSum=-0.543;SC=TTCCTCCAAATGTATTTTTAT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=9;WE=61735064;WS=61735046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr17	61763031	rs11658329	G	C	819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=17;PP=447;ReadPosRankSum=-2.076;SC=GTTAGCTCTGGAGGCCCAGGG;SOR=0.828;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=57;TCF=27;TCR=30;TR=32;WE=61763039;WS=61763021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,38:0.60:63
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chr17	61769456	rs7211213	T	C	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=226;ReadPosRankSum=1.739;SC=GACTCCCCTTTGCTAAATCCT;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=10;WE=61769464;WS=61769446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr17	61776479	rs1877317	T	C	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=273;ReadPosRankSum=0.520;SC=AGGCCCTGGATCAGGGCTGCA;SOR=0.776;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=35;TCF=22;TCR=13;TR=18;WE=61776487;WS=61776469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr17	61776538	rs3817181	G	C	1131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=15;PP=508;ReadPosRankSum=-0.541;SC=AAAGGGGGCCGGCAAACTCTG;SOR=0.800;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=63;TCF=40;TCR=23;TR=44;WE=61776546;WS=61776528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,53:0.69:77
chr17	61781980	rs66871703	TG	T	1157.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=15;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=683;ReadPosRankSum=1.834;SC=CTGTAGCGGGTGGGGGGGGGG;SOR=1.536;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=17;WE=61781992;WS=61781970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,30:0.94:32
chr17	61781984	rs372457035	G	T	1166.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=653;ReadPosRankSum=1.911;SC=AGCGGGTGGGGGGGGGGGGTG;SOR=1.536;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=40;TCF=13;TCR=27;TR=22;WE=61781992;WS=61781970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,30:0.94:32
chr17	61782325	rs9897229	T	C	1079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.984;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=26;PP=719;ReadPosRankSum=0.300;SC=TCTGCCATGCTCAGGTGGATC;SOR=0.901;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=63;TCF=28;TCR=35;TR=45;WE=61782333;WS=61782315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,49:0.69:71
chr17	61783908	rs3817182	A	G	98.90	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5130;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=58;ReadPosRankSum=-0.210;SC=TAGTATTCCTAGTCTGTGTCC;SOR=0.941;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=5;WE=61783916;WS=61783904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr17	61791457	rs56163554	C	T	1314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.743;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=23;PP=853;ReadPosRankSum=-0.082;SC=ACTCTGAGCTCGCATCATTGG;SOR=0.786;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=86;TCF=49;TCR=37;TR=52;WE=61791465;WS=61791447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,58:0.57:101
chr17	61805607	rs2137144	G	A	2814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.880;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=56;PP=1792;ReadPosRankSum=-1.750;SC=CGACCCTCACGTAGAAAACCA;SOR=0.721;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=171;TCF=92;TCR=79;TR=119;WE=61805615;WS=61805597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,125:0.66:189
chr17	61805747	rs4968597	G	A	1010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.936;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=28;PP=620;ReadPosRankSum=-0.910;SC=TACTGTGTAGGCCTACTTCAG;SOR=0.892;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=68;TCF=25;TCR=43;TR=43;WE=61805755;WS=61805737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,46:0.61:76
chr17	61829157	rs11283431	A	ATAGTGTT	1365.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.730;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=3;PP=1625;ReadPosRankSum=0.873;SC=ATTCTTCTTTATAGTGTTATC;SOR=2.564;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=24;WE=61829165;WS=61829147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,32:0.65:49
chr17	61829989	rs3785572	C	T	781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=8;PP=485;ReadPosRankSum=-1.531;SC=TAAGCAAGCACAGGCTTATAG;SOR=0.527;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=29;WE=61829997;WS=61829979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,33:0.77:43
chr17	61838259	rs11654841	G	A	2462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.24;ReadPosRankSum=0.645;SOR=0.658;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,117:0.63:186
chr17	61842380	.	GA	G	320.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.125;ClippingRankSum=0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=298;ReadPosRankSum=-1.184;SC=CTTAAAATGAGAAAGTTCTGA;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=9;WE=61842388;WS=61842370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,10:0.83:12
chr17	61877666	rs3833115	AAT	A	642.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.733;NF=15;NR=0;PP=624;ReadPosRankSum=-0.414;SC=TGTTCTTCTGAATATTGCTAT;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=15;WE=61877675;WS=61877656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,17:0.71:24
chr17	61884120	rs2251164	G	A	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=307;ReadPosRankSum=0.432;SC=GTAGAACCTTGTTGATAAGGA;SOR=1.519;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=15;WE=61884128;WS=61884110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr17	61888618	.	T	TA	109.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=0.000;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.81;ReadPosRankSum=0.435;SOR=0.919;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,10:0.26:39
chr17	61888693	rs2584629	T	A	90.84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5130;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=63;ReadPosRankSum=-1.282;SC=GGGATAGACGTAACAAGACTG;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=4;WE=61888701;WS=61888683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr17	61889213	rs3217509	G	GA	2467.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.315;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=23;PP=1501;ReadPosRankSum=-1.615;SC=GATGCAGGTAGAAATATAATG;SOR=0.963;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=74;TCF=26;TCR=48;TR=42;WE=61889221;WS=61889203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,86:0.64:134
chr17	61898063	rs3833114	C	CGCTTGAACCTGGAAGACGG	142.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.89;ReadPosRankSum=0.975;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,2:0.17:12
chr17	61898135	rs2665836	C	A	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.982;NF=22;NR=10;PP=595;ReadPosRankSum=-0.397;SC=ATCTCAAAAACAAAAAATTAC;SOR=0.716;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=51;TCF=35;TCR=16;TR=32;WE=61898143;WS=61898124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,27:0.53:51
chr17	61901197	rs2727288	T	A	1732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=23;PP=953;ReadPosRankSum=0.191;SC=CGGATGGTGCTCAAGGAGAAC;SOR=0.631;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=103;TCF=67;TCR=36;TR=68;WE=61901205;WS=61901187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,78:0.68:115
chr17	61901439	rs2584627	T	C	1579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.465;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=34;PP=1018;ReadPosRankSum=-1.411;SC=CCCAGCTCCTTTCACCTCTTC;SOR=0.551;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=108;TCF=53;TCR=55;TR=66;WE=61901447;WS=61901429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,70:0.58:121
chr17	61901641	rs894407	T	C	3293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=36;PP=1229;ReadPosRankSum=-0.339;SC=TTCCCAGACTTTTCCCCTGGA;SOR=0.723;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=66;TCR=57;TR=78;WE=61901649;WS=61901631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,85:0.63:134
chr17	61901657	rs894406	A	G	3284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.384;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=34;PP=1090;ReadPosRankSum=0.778;SC=CTGGACACCCAGTCCACACCT;SOR=0.874;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=127;TCF=70;TCR=57;TR=78;WE=61901665;WS=61901647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,87:0.62:140
chr17	61901880	rs752621	G	C	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=147;ReadPosRankSum=-0.583;SC=TAAATCAAAAGGCTCAGGCCC;SOR=0.693;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=7;TCR=15;TR=13;WE=61901888;WS=61901870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr17	61902822	rs716880	C	G	3781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.326;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=62;PP=2019;ReadPosRankSum=0.787;SC=AATTAGTTGACGCACTCTGCA;SOR=0.856;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=208;TCF=116;TCR=92;TR=142;WE=61902830;WS=61902812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,167:0.68:245
chr17	61903445	rs2584625	G	C	791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=6;PP=611;ReadPosRankSum=1.058;SC=GTGATGTCCTGCTGGAGAGTC;SOR=0.671;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=50;TCF=41;TCR=9;TR=30;WE=61903453;WS=61903435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,31:0.58:53
chr17	61904337	rs141581810	TCCACTTCCAGTTTC	T	1060.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.675;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.612;NF=0;NR=9;PP=2865;ReadPosRankSum=-1.377;SC=AGCACCAGATTCCACTTCCAG;SOR=0.314;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=9;WE=61904358;WS=61904327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,27:0.77:35
chr17	61904465	rs28362566	C	CG	140.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.53;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5010;FS=4.260;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=225;ReadPosRankSum=-0.112;SC=ATGCAGCTAACTACTTCCGCT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=5;WE=61904473;WS=61904455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr17	61904724	rs2665834	T	C	1648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.98;ReadPosRankSum=-0.832;SOR=0.727;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,42:0.56:75
chr17	61904728	rs2727287	G	A	1815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.14;ReadPosRankSum=-1.877;SOR=0.684;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,50:0.61:82
chr17	61906846	rs2665833	T	C	2497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=49;PP=1230;ReadPosRankSum=-0.030;SC=GTCTCTTGTCTGCCACAGCTG;SOR=0.700;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=136;TCF=72;TCR=64;TR=101;WE=61906854;WS=61906836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,115:0.73:158
chr17	61908055	rs55833669	CT	C	203.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=4.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.36;MQRankSum=1.132;QD=7.03;ReadPosRankSum=-0.647;SOR=2.336;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
chr17	61908271	rs968719	C	T	2388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.830;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=48;PP=1492;ReadPosRankSum=1.433;SC=TGGCTCTGAACTGGTACAGAA;SOR=0.513;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=149;TCF=82;TCR=67;TR=98;WE=61908279;WS=61908261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,105:0.64:164
chr17	61908316	rs7220892	G	A	2514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.755;HP=1;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=47;PP=1420;ReadPosRankSum=1.345;SC=CTAGCAATGTGAGAAGCAAGA;SOR=0.482;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=159;TCF=89;TCR=70;TR=103;WE=61908324;WS=61908306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,115:0.66:173
chr17	61912261	rs2665832	C	T	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=305;ReadPosRankSum=0.721;SC=CCTGGAGCTCCGGATACTGAA;SOR=1.101;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=10;TCR=18;TR=20;WE=61912269;WS=61912251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,23:0.74:31
chr17	61958669	rs2006123	G	T	4222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=75;PP=2535;ReadPosRankSum=-0.492;SC=GCGGGGGAAAGTCACCCCTTC;SOR=0.673;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=266;TCF=150;TCR=116;TR=172;WE=61958677;WS=61958659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,193:0.63:304
chr17	61986027	rs2854152	A	G	928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=0;PP=712;SC=CTTACACCAAATTACCCCAAT;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=61986035;WS=61986017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	61987405	rs2006122	A	T	2141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.699;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-1.894;NF=56;NR=29;PP=1069;ReadPosRankSum=-1.481;SC=ATGAAGAATAAGGTGAGTTCT;SOR=0.833;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=124;TCF=79;TCR=45;TR=85;WE=61987413;WS=61987395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,98:0.70:140
chr17	61987570	rs2727307	G	T	1621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FS=0.575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.776;QD=6.96;ReadPosRankSum=0.053;SOR=0.768;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:180,53:0.23:233
chr17	61987576	rs2246207	G	A	1574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FS=0.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.772;QD=7.09;ReadPosRankSum=0.132;SOR=0.791;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:172,50:0.23:222
chr17	61988014	rs2006208	G	A	878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.284;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.378;NF=19;ReadPosRankSum=-0.669;SC=CTGCATTTTCGCTTCAGAAAA;SOR=0.496;SbPval=0.42;Source=Platypus;TCF=55;WE=61988022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,49:0.33:150
chr17	61995030	rs2665802	A	T	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.81;ReadPosRankSum=-0.743;SOR=0.675;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,17:0.23:75
chr17	61996199	rs695	T	A	1701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=0.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.42;MQRankSum=0.556;QD=11.98;ReadPosRankSum=0.365;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,48:0.34:142
chr17	61996204	rs6171	T	C	1698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.27;MQRankSum=0.718;QD=11.80;ReadPosRankSum=0.661;SOR=0.733;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,48:0.33:144
chr17	61996228	rs11568827	AC	A	2699.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.629;HP=3;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.602;NF=6;NR=40;PP=1605;ReadPosRankSum=2.091;SC=CCCTTTTTATACCCTGGCCCC;SOR=0.794;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=77;TCF=11;TCR=66;TR=46;WE=61996236;WS=61996218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,89:0.61:146
chr17	61996255	rs2005172	A	C	3642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=67;PP=2131;SC=CCCACTGTTGACCCCACCTGT;SOR=1.129;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=121;TCF=54;TCR=67;TR=121;WE=61996263;WS=61996245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr17	61996273	rs11568828	T	C	1546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.734;HP=1;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-2.714;NF=25;NR=35;PP=888;ReadPosRankSum=-0.616;SC=TGTTTCTGTGTACATTTATGC;SOR=0.781;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=98;TCF=42;TCR=56;TR=60;WE=61996281;WS=61996263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,70:0.62:112
chr17	61996366	rs2727338	A	G	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.624;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=54.55;MQRankSum=-0.525;NF=1;NR=5;PP=69;ReadPosRankSum=0.510;SC=CTGGCTTGTCATCTTTCCCTT;SOR=0.693;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=6;WE=61996374;WS=61996356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr17	62006497	rs1051684	A	G	172.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=1;PP=93;SC=TGGGGGGTCCAGGAAAGGGGT;SOR=1.609;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=62006505;WS=62006487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	62007498	rs2070776	A	G	6631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=132;NR=79;PP=2965;SC=ACTTCTGCTGACAGAAGTAGA;SOR=1.155;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=211;TCF=132;TCR=79;TR=211;WE=62007506;WS=62007488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr17	62018773	rs2070720	T	C	1372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.251;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=33;PP=983;ReadPosRankSum=-0.009;SC=ACTTCTCCCATGTCTCGTAGA;SOR=0.807;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=239;TCF=128;TCR=111;TR=75;WE=62018781;WS=62018763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:192,79:0.29:271
chr17	62019103	rs56342400	G	T	4797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.941;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=109;NR=86;PP=2716;ReadPosRankSum=1.010;SC=ACATATCATCGATGCCCGACT;SOR=0.628;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=283;TCF=161;TCR=122;TR=195;WE=62019111;WS=62019093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,216:0.69:311
chr17	62020348	rs2058194	T	C	6706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=113;NR=113;PP=2965;SC=TGGCTCTGGTTGTCTGTCTCC;SOR=0.782;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=227;TCF=114;TCR=113;TR=226;WE=62020356;WS=62020338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr17	62020563	rs150461653	CAGAGATGACAGAG	C,CAG	501.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.500;NF=0,0;NR=24,24;PP=317,276;ReadPosRankSum=-1.545;SC=ACAGAGATGACAGAGATGACA;SOR=4.294;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=24,24;WE=62020585;WS=62020553;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.53,0.41:17
chr17	62021374	rs11869827	C	T	71.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.39;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr17	62022659	rs58028318	A	AG	1305.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=1;PP=1490;SC=GTACAACGAGAGGACCGGGGT;SOR=5.892;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=33;WE=62022667;WS=62022649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr17	62025238	rs13341114	G	T	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=194;ReadPosRankSum=-0.923;SC=GGGCCAGCGTGGGGGGACTCA;SOR=0.798;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=13;WE=62025246;WS=62025228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,14:0.37:38
chr17	62041068	rs6504191	T	C	1894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=22;PP=1049;SC=TCTCCGCTGCTGCTCTGCCTC;SOR=1.244;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=40;TCR=22;TR=62;WE=62041076;WS=62041058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr17	62041317	rs2331408	G	T	452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=4;NR=11;PP=264;SC=CAAACTTAGTGCAGGTGGGGG;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=15;WE=62041325;WS=62041307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	62042078	rs2877373	T	C	258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=6;PP=145;SC=TCCCATGACGTCCACCTCCTT;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=62042086;WS=62042068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	62048467	rs2302236	A	G	2416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=40;PP=1385;SC=CCAGGCCTGCACATGGTACGG;SOR=0.826;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=46;TCR=40;TR=86;WE=62048475;WS=62048457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr17	62049235	rs9892013	A	G	2039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=31;NR=41;PP=1277;SC=GCCGGCCGGGACAGGCATGTC;SOR=1.103;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=31;TCR=41;TR=72;WE=62049243;WS=62049225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr17	62075994	rs76735942	G	GA	928.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=6;NR=11;PP=642;SC=CACTGGCCGGGGGGGTTGGGG;SOR=0.941;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=6;TCR=11;TR=17;WE=62076002;WS=62075984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	62079286	rs12939821	G	A	2338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.406;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=44;PP=1275;ReadPosRankSum=-1.414;SC=ATCAGTCCCTGCCCCACGCCA;SOR=0.430;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=133;TCF=67;TCR=66;TR=94;WE=62079294;WS=62079276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,104:0.72:144
chr17	62080969	rs4141180	A	C	3343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=68;NR=35;PP=1935;SC=AAAGTGACTTATCACTCCCAA;SOR=1.217;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=103;TCF=68;TCR=35;TR=103;WE=62080977;WS=62080948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr17	62082665	.	G	A	1056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.329;ClippingRankSum=0.000;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.233;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=28;PP=683;ReadPosRankSum=-0.773;SC=TTGACCTCGAGGGACCCTTTG;SOR=0.562;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=157;TCF=73;TCR=84;TR=57;WE=62082673;WS=62082655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,60:0.32:185
chr17	62083929	rs6504194	A	G	4192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=59;PP=2568;SC=CACAGGGAACAGGGCACCCCC;SOR=1.003;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=88;TCR=59;TR=147;WE=62083937;WS=62083919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr17	62121480	rs196912	T	C	2945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.228;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=52;PP=1442;ReadPosRankSum=1.853;SC=GGAAGCGAGATGTGAAGTAGC;SOR=0.561;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=168;TCF=95;TCR=73;TR=117;WE=62121488;WS=62121470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,136:0.70:194
chr17	62122145	rs196915	A	G	1211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=9;PP=693;SC=AAGATTTATAAAGAATGGATG;SOR=1.556;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=35;WE=62122153;WS=62122135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr17	62122677	rs196917	G	A	950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=6;PP=710;SC=AGGCGGCAGCGACTTTTGCAA;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=33;WE=62122685;WS=62122667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr17	62123022	rs196918	C	T	290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=6;PP=152;SC=CTGTTCCTCACGAAGCACAGG;SOR=1.802;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=62123030;WS=62123012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	62125209	rs113336518	C	T	1751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.511;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=22;PP=1225;ReadPosRankSum=-0.242;SC=AGAGAACAGACGTCTCTACCT;SOR=1.345;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=117;TCF=77;TCR=40;TR=72;WE=62125217;WS=62125199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,74:0.62:120
chr17	62125272	rs196923	A	G	4874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=77;PP=2753;SC=GTTTGAGCACATGCTTCGCTG;SOR=0.783;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=167;TCF=90;TCR=77;TR=167;WE=62125280;WS=62125262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr17	62130389	rs10689374	G	GCCT	682.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=403;SC=GCAACCCCAGGCCTCCTCCAA;SOR=2.049;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=8;WE=62130397;WS=62130379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	62132309	rs196931	C	T	455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=9;PP=258;SC=AGGCACTGCACCCCAGACTGC;SOR=1.371;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=6;TCR=9;TR=15;WE=62132317;WS=62132299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	62132330	rs4968607	G	A	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=28;ReadPosRankSum=0.426;SC=TGCTCAGCAAGAGCCTGCCAG;SOR=1.329;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=4;WE=62132338;WS=62132320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr17	62141455	rs187826	A	G	3123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=52;PP=1631;SC=CCTTGTCCCCAATGGTGACGC;SOR=0.973;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=49;TCR=52;TR=101;WE=62141463;WS=62141445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr17	62144344	rs16947425	C	A	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.220;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=213;ReadPosRankSum=-2.358;SC=ATCTTGCAACCACATCCTCTA;SOR=1.112;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=71;TCF=27;TCR=44;TR=19;WE=62144352;WS=62144334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,21:0.25:84
chr17	62145672	rs196939	A	G	906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=16;PP=452;ReadPosRankSum=1.298;SC=CAGACCAGCCAGCCCATTACC;SOR=0.739;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=35;TCR=28;TR=36;WE=62145680;WS=62145662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,43:0.59:73
chr17	62145728	rs196940	A	G	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.129;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=15;PP=318;ReadPosRankSum=-2.403;SC=TTATCTAATTATAACAAACAA;SOR=0.283;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=40;TCF=16;TCR=24;TR=28;WE=62145736;WS=62145718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,32:0.73:44
chr17	62156933	rs196947	T	C	686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=5;PP=469;SC=AAGCTCCAGGTGGGAGACACA;SOR=2.584;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=24;WE=62156941;WS=62156923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	62158012	rs196950	T	C	1267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.552;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=8;PP=772;ReadPosRankSum=1.310;SC=AGACTTTATATGTCACTCACT;SOR=1.279;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=71;TCF=54;TCR=17;TR=46;WE=62158020;WS=62158002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,53:0.65:82
chr17	62158278	rs196951	T	C	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.569;NF=2;NR=17;PP=310;ReadPosRankSum=0.150;SC=TTCTCCCTCCTGTTAACCTAC;SOR=0.843;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=19;WE=62158286;WS=62158268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,25:0.71:35
chr17	62158300	rs196952	C	T	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-3.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.527;NF=0;NR=12;PP=235;ReadPosRankSum=-0.314;SC=TGGGCTAGTGCACGTGAAGGT;SOR=1.828;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=12;WE=62158308;WS=62158290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr17	62158319	rs196953	T	C	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.645;NF=0;NR=8;PP=163;ReadPosRankSum=-0.340;SC=GTTATATGCATTTTTGTATCA;SOR=1.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=8;WE=62158327;WS=62158309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr17	62228161	rs2291678	T	C	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=43;ReadPosRankSum=-1.090;SC=CCAGAGCTTCTATACTTGGTG;SOR=0.614;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=7;WE=62228169;WS=62228151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,7:0.24:29
chr17	62232073	rs4968693	A	T	1430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.751;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=25;PP=876;ReadPosRankSum=0.556;SC=GGATATTAATAAAAAAACCAT;SOR=0.608;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=60;TCR=40;TR=63;WE=62232081;WS=62232063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,66:0.62:106
chr17	62232165	rs118141221	T	C	1097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=28;PP=574;ReadPosRankSum=-1.563;SC=TCCTGATCCCTGGAGACTCAG;SOR=0.668;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=191;TCF=99;TCR=92;TR=58;WE=62232173;WS=62232155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,67:0.31:213
chr17	62254983	rs1967130	G	A	266.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=189;SC=GTCCCACATTGTATTGGTGAC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=62254991;WS=62254973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	62265838	rs36104018	TC	T	3658.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=50;PP=2083;SC=GTAAGCGGACTCCCTGAGAAA;SOR=1.234;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=54;TCF=2;TCR=52;TR=52;WE=62265846;WS=62265828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr17	62270785	rs2166290	T	C	1535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=12;PP=977;SC=GTCATGAGAATGCACATTAGG;SOR=2.437;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=36;TCR=12;TR=48;WE=62270793;WS=62270775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	62270823	rs72009320	GCTTC	G	886.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=3.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.14;ReadPosRankSum=-1.482;SOR=1.164;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,27:0.28:97
chr17	62270941	rs34343500	C	T	1469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.957;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=39;PP=818;ReadPosRankSum=0.983;SC=CAGAGACACCCGATGACTTCT;SOR=0.734;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=264;TCF=139;TCR=125;TR=81;WE=62270949;WS=62270931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:213,91:0.30:304
chr17	62385609	rs113369705	A	AAAACAAAC	1379.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.27;MQRankSum=0.826;QD=34.49;ReadPosRankSum=0.923;SOR=0.573;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,25:0.62:40
chr17	62386078	rs28670385	T	C	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.345;NF=11;NR=18;PP=457;ReadPosRankSum=-2.036;SC=GGAAAGGAAATTGGCCACTAT;SOR=0.606;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=60;TCF=25;TCR=35;TR=29;WE=62386086;WS=62386068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,34:0.49:70
chr17	62401118	rs2812	T	C	1717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.400;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=29;PP=1076;ReadPosRankSum=1.196;SC=ATACAGGGATTATCTGTTCTT;SOR=0.504;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=106;TCF=59;TCR=47;TR=64;WE=62401126;WS=62401108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,76:0.63:120
chr17	62406971	rs2070783	A	G	1268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=17;PP=816;ReadPosRankSum=0.367;SC=GGAAGAATTCATGTGAATGCA;SOR=0.737;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=78;TCF=51;TCR=27;TR=51;WE=62406979;WS=62406961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,57:0.67:85
chr17	62463825	rs199721035	T	TG	1158.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=17;PP=803;SC=CTGAGGCAGGTGATTACTTGA;SOR=1.473;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=18;WE=62463833;WS=62463815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	62502435	rs1991401	A	G	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=164;ReadPosRankSum=-2.369;SC=AGCCGCTTTTATAGTCTGGAC;SOR=0.910;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=13;WE=62502443;WS=62502425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr17	62506274	rs66540667	AT	A	1824.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=1.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=350;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=44;PP=1456;ReadPosRankSum=1.405;SC=AAATTATGTGATTTTTTCCCC;SOR=0.670;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=205;TCF=59;TCR=146;TR=60;WE=62506288;WS=62506264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:214,109:0.34:323
chr17	62530885	rs145444747	TAAG	T	2541.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=32;PP=1214;ReadPosRankSum=-1.060;SC=CCAGCCCTGTTAAGAAGGTGA;SOR=0.697;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=119;TCF=7;TCR=112;TR=33;WE=62530895;WS=62530875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,72:0.33:220
chr17	62754586	rs9908143	T	C	3081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.756;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=58;PP=1909;ReadPosRankSum=-0.313;SC=TAAGTTTTCATCCCTTTCCAA;SOR=0.556;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=187;TCF=96;TCR=91;TR=121;WE=62754594;WS=62754576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,136:0.64:212
chr17	62758984	rs11374577	G	GC	689.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=17;PP=756;SC=TAAGTTAAAAGTAAAGCTAAT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=62758992;WS=62758974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	62782689	rs6504255	T	C	2151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=26;PP=1277;SC=GCATACCTGATTGTGGTGTCA;SOR=1.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=40;TCR=26;TR=66;WE=62782697;WS=62782679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr17	62788424	.	A	G	67.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.80;QD=22.43;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	62796759	.	A	C	1655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.92;QD=29.05;SOR=1.047;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr17	62801318	.	T	C	326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=17;PP=386;SC=CGCGCAACCTTGGCTCACTGC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=62801326;WS=62801308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	62811364	.	A	C	2126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=41;PP=1246;SC=CAACAATACCATAGAAGTTTT;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=28;TCR=41;TR=69;WE=62811372;WS=62811354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr17	62820746	rs9915020	G	T	1299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=20;PP=1036;SC=ATCTCACTTGGGGGTGACAGC;SOR=0.963;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=36;TCR=20;TR=56;WE=62820754;WS=62820736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr17	62924044	rs6504263	G	A	629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.32;QD=28.63;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	62952689	rs3960389	C	G	2761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=51.50;QD=26.81;SOR=0.880;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr17	63052344	rs12945514	G	T	323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=3;PP=227;SC=GCGACACAGCGGACCAGGGCG;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=11;WE=63052352;WS=63052334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	63052361	rs7216195	C	G	373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=5;PP=248;SC=GGCGGTGCCCCGCCCCGCACC;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=15;WE=63052369;WS=63052351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	63133804	rs2585858	A	G	2350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=41;NR=39;PP=1315;SC=AGGAGTGGAGAGCACCCCTTT;SOR=0.784;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=41;TCR=39;TR=80;WE=63133812;WS=63133794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr17	63532767	rs28684769	C	G	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.055;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=17;PP=289;ReadPosRankSum=1.014;SC=CTATTCTGCTCAGAGAGAGAG;SOR=0.453;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=68;TCF=19;TCR=49;TR=26;WE=63532787;WS=63532757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,28:0.37:75
chr17	63533768	rs1133683	G	A	1166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.682;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=14;PP=401;ReadPosRankSum=-0.139;SC=AGCGGGAGCGGGGGCTATAGC;SOR=0.463;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=91;TCF=55;TCR=36;TR=32;WE=63533776;WS=63533758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,36:0.34:105
chr17	63533789	rs9915936	T	C	1097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=1.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.36;ReadPosRankSum=-0.221;SOR=0.483;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,33:0.31:106
chr17	63534250	rs8078753	T	C	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=97;ReadPosRankSum=-0.059;SC=ACGCACCCCATGCACATGCGC;SOR=0.458;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=9;WE=63534258;WS=63534240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr17	63534538	rs4541111	C	A	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.908;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.60;ReadPosRankSum=-1.418;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr17	63554006	rs62640028	G	A	2718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.429;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=49;PP=1452;ReadPosRankSum=0.236;SC=ACCACGGTTGGCGAAAGTTTG;SOR=0.500;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=166;TCF=93;TCR=73;TR=104;WE=63554014;WS=63553996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,122:0.64:192
chr17	63554591	rs2240308	G	A	991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.37;ReadPosRankSum=1.310;SOR=0.669;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:166,61:0.27:227
chr17	63822357	rs62065084	T	C	1231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.855;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=26;PP=889;ReadPosRankSum=-0.817;SC=CTCATCTCTATCAGTCTCAGG;SOR=0.616;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=80;TCF=42;TCR=38;TR=53;WE=63822365;WS=63822347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,55:0.65:85
chr17	64001925	rs1015098	G	A	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=15;PP=387;ReadPosRankSum=-0.415;SC=ATTGGAAGACGAGTAAAGTTT;SOR=0.580;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=44;TCF=20;TCR=24;TR=29;WE=64001933;WS=64001915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,32:0.68:47
chr17	64023483	rs11079627	A	G	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=339;ReadPosRankSum=-1.316;SC=TGACAGAGCAAGACTCTGTCT;SOR=0.722;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=12;WE=64023501;WS=64023473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr17	64023493	rs35334393	T	TA	242.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.497;HP=9;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=360;ReadPosRankSum=-0.251;SC=AGACTCTGTCTAAAAAAAAAG;SOR=1.136;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=21;TCF=11;TCR=10;TR=10;WE=64023501;WS=64023473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr17	64023552	rs12449542	A	C	705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=13;PP=429;ReadPosRankSum=0.591;SC=GGTTTCATAAAAATCAGTCTG;SOR=0.749;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=50;TCF=29;TCR=21;TR=30;WE=64023560;WS=64023542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,35:0.57:61
chr17	64023642	rs11079628	A	G	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.615;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=284;ReadPosRankSum=-0.041;SC=ATGTGTTTTAAATGACTTTTC;SOR=1.376;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=25;TCF=12;TCR=13;TR=18;WE=64023650;WS=64023632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,21:0.72:29
chr17	64025069	rs11079632	G	A	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=58;ReadPosRankSum=-0.431;SC=TAGACATTTCGAATTTTAAAC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=64025077;WS=64025059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr17	64025435	rs60700240	T	TTAATCA	211.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=233;ReadPosRankSum=-1.465;SC=ATGAAATTTTTTAATCAGCTA;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=64025443;WS=64025425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr17	64025926	rs9908964	G	T	209.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=141;SC=GCAGATAACTGATACAGTTAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=64025934;WS=64025920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	64049733	rs1401049	A	G	740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.840;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=11;PP=497;ReadPosRankSum=-0.578;SC=GTAGGAAGGTAAAGTTTTTCT;SOR=0.577;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=83;TCF=60;TCR=23;TR=34;WE=64049741;WS=64049723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,37:0.38:97
chr17	64050007	rs11079637	G	A	534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-2.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=367;ReadPosRankSum=1.147;SC=GCTACATCAGGAAATCAAGAG;SOR=0.487;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=18;WE=64050015;WS=64049997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,20:0.74:27
chr17	64062830	rs908713	T	A	1772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=18;PP=951;SC=ATCAAATTTTTTTCTCCACAT;SOR=1.196;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=36;TCR=18;TR=54;WE=64062838;WS=64062820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr17	64179508	rs111614581	T	A	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.953;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=63;ReadPosRankSum=-1.760;SC=AAAAAAACTCTTAAGTGTTAG;SOR=1.312;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=7;WE=64179516;WS=64179498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,7:0.23:30
chr17	64179537	rs77237016	T	C	440.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5215;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=344;ReadPosRankSum=0.837;SC=TCTCCCCAAATTGACCTGTAG;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=16;WE=64179545;WS=64179527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,16:0.89:18
chr17	64213123	rs8178856	T	C	609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.201;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=390;ReadPosRankSum=1.564;SC=TAGTAATAAATAGTGCTATCC;SOR=0.941;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=39;TCF=10;TCR=29;TR=21;WE=64213131;WS=64213113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,26:0.54:48
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chr17	64222164	rs1801692	C	T	1051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.548;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=30;PP=680;ReadPosRankSum=1.749;SC=ACAAGAAAAACTGATCGTGTT;SOR=0.748;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=198;TCF=96;TCR=102;TR=59;WE=64222172;WS=64222154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,64:0.31:209
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chr17	64735143	rs4324167	G	A	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=367;ReadPosRankSum=-0.767;SC=TGGGACTACAGGCACACACCA;SOR=0.914;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=40;TCF=6;TCR=34;TR=11;WE=64735165;WS=64735133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,11:0.26:42
chr17	64735157	rs9892696	T	C	525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.099;HP=1;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=1027;ReadPosRankSum=1.926;SC=CACACCACCATGCCTGGCTAA;SOR=2.019;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=22;WE=64735165;WS=64735133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,23:0.72:32
chr17	64737717	rs3803821	T	A	1101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.304;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=23;PP=643;ReadPosRankSum=-0.106;SC=TTTGAGAATGTAAAGTATACA;SOR=0.567;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=135;TCF=81;TCR=54;TR=53;WE=64737725;WS=64737707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,60:0.38:156
chr17	64738635	rs61761552	G	A	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.311;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=115;ReadPosRankSum=-0.460;SC=AGTTAATATTGCCATTGAGCT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=10;WE=64738643;WS=64738625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,13:0.29:45
chr17	64783081	rs6504459	G	A	6456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=115;NR=89;PP=2965;SC=GGCTGTTTCTGTCTGCAAAGG;SOR=0.779;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=204;TCF=115;TCR=89;TR=204;WE=64783089;WS=64783071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr17	64785191	rs11420909	T	TG	1173.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=20;PP=925;SC=AGGAGGCCGGTGCCCCTGGCT;SOR=2.517;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=21;WE=64785199;WS=64785181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr17	65041073	rs16960487	G	A	1061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.052;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=28;PP=578;ReadPosRankSum=-0.016;SC=TGGCAAAGTTGCCCTTGCGAA;SOR=0.997;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=71;TCF=22;TCR=49;TR=39;WE=65041081;WS=65041063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,45:0.57:79
chr17	65051104	rs11322532	CA	C	503.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.768;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=392;ReadPosRankSum=-0.377;SC=GACACACACACAATGACACAC;SOR=1.508;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=22;TCF=14;TCR=8;TR=12;WE=65051112;WS=65051094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr17	65051180	rs2363844	A	G	1930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.248;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=32;PP=1121;ReadPosRankSum=-0.338;SC=AAGAGCTCCCATGCTGAGGCC;SOR=0.944;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=128;TCF=77;TCR=51;TR=84;WE=65051188;WS=65051170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,94:0.65:144
chr17	65052304	rs1799938	G	A	2226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.634;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=43;PP=1187;ReadPosRankSum=-1.196;SC=CTTTCTCGGCGGTCTCGCCCT;SOR=0.858;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=156;TCF=82;TCR=74;TR=90;WE=65052312;WS=65052294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,103:0.58:178
chr17	65104666	rs11657929	T	G	1129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=22;PP=687;ReadPosRankSum=-0.697;SC=CAGTCTGCCCTCACTGGCGGC;SOR=0.634;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=71;TCF=40;TCR=31;TR=46;WE=65104674;WS=65104656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,52:0.63:83
chr17	65104743	rs11653020	G	A	3356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=44;PP=1854;SC=TGGGTATGGAGCGCTGCCCTG;SOR=0.920;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=64;TCR=44;TR=108;WE=65104751;WS=65104733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr17	65110436	rs2302158	A	G	1524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=1.608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.61;ReadPosRankSum=-0.654;SOR=0.719;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,74:0.66:112
chr17	65116491	rs12709454	T	C	1676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=25;PP=934;ReadPosRankSum=-1.891;SC=CATCAGTTTATGAACAGGAGA;SOR=0.690;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=96;TCF=60;TCR=36;TR=68;WE=65116499;WS=65116481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,74:0.70:105
chr17	65119931	.	CTG	C,CTGTG	740.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.906;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=3.411;HP=1;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=6,6;NR=4,4;PP=137,387;ReadPosRankSum=-1.369;SC=TCCAAAGTGACTGTGTGTGTG;SOR=2.226;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=19;TCF=10;TCR=9;TR=10,10;WE=65119942;WS=65119921;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.48,0.45:33
chr17	65134341	.	T	TA	57	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;FR=0.7793;HP=15;HapScore=2;MGOF=27;MMLQ=16;MQ=59.93;NF=0;NR=6;PP=57;QD=10.0;SC=AGATGTCATTTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=65134349;WS=65134331;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:5,6:0.55:11
chr17	65156919	rs1035176	G	C	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.831;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=219;ReadPosRankSum=-1.128;SC=AGAGCTGCATGAAAACTGTCT;SOR=0.132;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=13;WE=65156927;WS=65156909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr17	65191647	rs3213753	T	G	901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=27;PP=593;ReadPosRankSum=-0.711;SC=TGAACTAAACTTGAACATTTT;SOR=0.752;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=53;TCF=13;TCR=40;TR=35;WE=65191655;WS=65191637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,38:0.64:59
chr17	65197158	rs7218955	A	G	2270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-2.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.226;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=34;PP=1337;ReadPosRankSum=0.610;SC=GGCTGATGCCACAATGGTTTT;SOR=0.490;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=142;TCF=95;TCR=47;TR=96;WE=65197166;WS=65197148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,106:0.67:159
chr17	65199627	rs1894928	T	C	1731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=39;PP=1028;ReadPosRankSum=0.806;SC=ATTATAGTATTAACACACTAT;SOR=0.674;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=40;TCR=61;TR=65;WE=65199635;WS=65199617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,75:0.65:116
chr17	65212042	rs8080100	C	T	679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.905;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=381;ReadPosRankSum=-0.654;SC=TCAGCTTGCACATAATTTTTC;SOR=1.236;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=44;TCF=22;TCR=22;TR=26;WE=65212050;WS=65212032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,31:0.62:50
chr17	65341976	rs62086002	A	G	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.906;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=8;PP=197;ReadPosRankSum=-2.675;SC=TTCAGAGCCTAAAAGAGTTGT;SOR=0.706;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=67;TCF=40;TCR=27;TR=21;WE=65341984;WS=65341966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,25:0.32:79
chr17	65362552	rs11079691	T	A	1428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.488;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=34;PP=783;ReadPosRankSum=0.879;SC=CACACTCGGGTAGGCGCTGAT;SOR=0.657;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=215;TCF=111;TCR=104;TR=72;WE=65362560;WS=65362542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,84:0.35:243
chr17	65528801	rs2304278	C	T	379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=2;PP=229;SC=ATGTGGCTGCCTTCTCTTCTC;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=65528809;WS=65528791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	65548540	rs2916133	G	T	3240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=49;NR=56;PP=1716;SC=GATTTACAGTGGATTATCCAA;SOR=1.078;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=112;TCF=49;TCR=63;TR=105;WE=65548548;WS=65548530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr17	65549847	rs2570046	A	G	590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=13;PP=383;SC=GAATAATTCCAAGTCAGAAAT;SOR=1.329;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=8;TCR=13;TR=21;WE=65549855;WS=65549837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	65574283	rs2570035	A	G	6666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=115;NR=98;PP=2965;SC=GCTAATGAAAATTTGCTTTTC;SOR=0.820;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=213;TCF=115;TCR=98;TR=213;WE=65574291;WS=65574273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr17	65574437	rs8082003	A	G	2433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=52;PP=1580;SC=AGCACTTCTCACAGCCCCTCT;SOR=1.781;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=26;TCR=52;TR=78;WE=65574445;WS=65574427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr17	65665608	rs36013607	AT	A	307.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=12;NR=0;PP=180;SC=AATTTCTTTGATTTTTTTTTT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=12;WE=65665616;WS=65665598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	65683387	rs12939664	G	A	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=20;PP=326;ReadPosRankSum=2.080;SC=TGCCCGGTTCGCAACCTTCCA;SOR=0.750;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=73;TCF=23;TCR=50;TR=28;WE=65683395;WS=65683377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,29:0.36:80
chr17	65689053	rs147971105	G	GT	417.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=3.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.53;MQRankSum=1.285;QD=11.94;ReadPosRankSum=-0.600;SOR=0.191;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr17	65714359	rs3760226	G	A	938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=24;PP=689;SC=AGTGAGGTCTGGAATCTGGCT;SOR=3.912;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=27;WE=65714367;WS=65714349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	65718798	rs5821454	TA	T	188.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.8399;FS=0.000;HP=12;HapScore=3;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=150;SC=GAAATTTCTTTAAAAAAAAAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=11;WE=65718807;WS=65718788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	65718839	.	C	T	45	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=1;NR=3;PP=45;QD=19.9428031368;SC=GTTGCCCTGTCACCCAGGCTT;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=65718847;WS=65718829;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	65720150	.	C	CT	21	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.4999;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=20;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=21;QD=11.0;SC=ATAAAATAACCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=6;TCR=4;TR=3;WE=65720158;WS=65720140;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr17	65720346	rs11654692	A	G	717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.36;ReadPosRankSum=0.217;SOR=0.730;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,32:0.64:50
chr17	65722849	rs3744268	G	A	507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=14;PP=379;SC=TTTTCATTTCGTTATTACCCA;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=65722857;WS=65722839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	65730404	rs4790943	G	A	2216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=41;NR=29;PP=958;SC=ATATTTAACTGTAACTCCCCC;SOR=0.763;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=41;TCR=29;TR=70;WE=65730412;WS=65730394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr17	65732959	rs7223990	A	G	242.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=6;PP=202;SC=TATCCTTACAACTCTTAGAGC;SOR=0.892;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=10;WE=65732967;WS=65732949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	65733119	rs3752647	T	C	490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.213;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=10;PP=323;ReadPosRankSum=1.213;SC=GAGTGTTTCATATCCCTCTAA;SOR=0.416;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=39;TCF=24;TCR=15;TR=23;WE=65733127;WS=65733109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,24:0.56:43
chr17	65734514	rs1542610	A	G	3098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=59;PP=1837;SC=TCTTTATAGGATATAGTTATA;SOR=1.302;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=38;TCR=59;TR=97;WE=65734522;WS=65734504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr17	65735540	.	A	ATTTT	319.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.859;ClippingRankSum=-0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=398;ReadPosRankSum=1.324;SC=TGATGTATAAATTGAACATTT;SOR=1.270;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=9;TCF=5;TCR=4;TR=4;WE=65735555;WS=65735530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr17	65735543	rs367732036	G	C	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=17.93;ReadPosRankSum=1.588;SOR=1.781;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr17	65735546	rs371211767	C	T	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.425;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=20.40;ReadPosRankSum=1.285;SOR=1.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr17	65735547	rs374993733	A	C	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.498;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=20.05;ReadPosRankSum=1.092;SOR=1.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr17	65735563	rs2286916	G	A	471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.449;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=7;PP=229;ReadPosRankSum=0.277;SC=TTCAATCTTCGTGATGGGTTT;SOR=1.567;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=30;TCF=17;TCR=13;TR=19;WE=65735571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr17	65737016	rs34886243	CT	C	310.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=158;SC=AAAATAACTTCTTTTTTTTTT;SOR=2.985;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=11;WE=65737024;WS=65737006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	65739627	rs10127	A	G	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-2.362;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=111;ReadPosRankSum=0.632;SC=TTCTGGATGCAAATTTTACTG;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=7;WE=65739635;WS=65739617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr17	65739789	rs2286917	A	G	3297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.91;SOR=0.763;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr17	65739789	.	ACTTACTCA	GCTTACTCA,GCTTACTCT	667	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=43,26;NR=33,22;PP=301,667;QD=4.41804227036;SC=TCCTTAAATAACTTACTCATG;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=43;TCR=33;TR=76,48;WE=65739805;WS=65739779;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:76
chr17	65739797	rs2286918	A	T	1257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=2.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.13;ReadPosRankSum=0.206;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,58:0.65:89
chr17	65821481	rs12945266	C	T	821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=4;PP=432;SC=AGCCCAGGCGCCCAGGGCTCC;SOR=2.019;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=25;WE=65821489;WS=65821471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	65822410	rs35711041	G	A	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=8.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQRankSum=0.808;QD=3.89;ReadPosRankSum=0.461;SOR=0.515;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
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chr17	65882172	rs4318247	A	G	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=3;PP=479;ReadPosRankSum=0.614;SC=TCCTAAAACAATTGTCTTTTC;SOR=0.793;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=23;WE=65882180;WS=65882162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,24:0.71:34
chr17	65882457	rs8072824	T	A	546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=14;PP=333;SC=CATCCATTCCTTTAAAGGGAA;SOR=3.056;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=65882465;WS=65882447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	65887896	rs8079754	A	G	919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.184;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=11;PP=594;ReadPosRankSum=-0.814;SC=GTTTTGGTGAAATAAGGTGGT;SOR=0.963;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=51;TCF=34;TCR=17;TR=35;WE=65887904;WS=65887886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,40:0.71:56
chr17	65906926	rs368956376	AT	A	312.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.903;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=31.27;ReadPosRankSum=-1.001;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr17	65906929	rs11327849	T	A	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=2.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.29;MQRankSum=1.583;QD=20.11;ReadPosRankSum=-0.925;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr17	65907278	rs34038380	A	G	708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.546;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=11;PP=425;ReadPosRankSum=-1.591;SC=GGTATAGGAAAGACTTCTACA;SOR=0.914;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=106;TCF=61;TCR=45;TR=31;WE=65907286;WS=65907268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,39:0.31:127
chr17	65918807	rs12600941	A	G	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.554;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=67;ReadPosRankSum=1.829;SC=GGCTGCTTTCATGATACAAAG;SOR=0.048;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=4;WE=65918815;WS=65918806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr17	65944515	rs11870068	A	C	1261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=28;PP=566;ReadPosRankSum=-2.092;SC=TTAAAATTTCAGTATGTTTTC;SOR=0.807;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=67;TCF=28;TCR=39;TR=48;WE=65944523;WS=65944505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,58:0.73:80
chr17	65955651	rs8068790	T	C	3948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=75;NR=60;PP=2299;SC=CTTTAATTGATAACAGGAAGA;SOR=0.832;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=135;TCF=75;TCR=60;TR=135;WE=65955659;WS=65955641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr17	65955758	rs139709271	T	TCCTCCAGCC	793.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=1.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.37;MQRankSum=1.804;QD=18.90;ReadPosRankSum=-0.958;SOR=1.125;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,21:0.50:42
chr17	65962538	rs5821446	A	AT	311.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.827;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=309;ReadPosRankSum=0.594;SC=TTAGGTAACTATTACTAGAGC;SOR=1.402;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=41;TCF=31;TCR=10;TR=11;WE=65962546;WS=65962528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,14:0.30:47
chr17	65972188	rs61489754	TA	T	332.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.77;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	65988049	rs9891146	T	C	527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.917;QD=4.47;ReadPosRankSum=-0.004;SOR=0.665;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,34:0.29:118
chr17	65989048	rs28368756	T	C	6569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=115;NR=106;PP=2965;SC=TGTCATTGTTTCCCATCGCTC;SOR=0.709;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=221;TCF=115;TCR=106;TR=221;WE=65989068;WS=65989038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr17	66036934	rs75756883	A	AT	2040.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-2.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.758;HP=9;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-1.340;NF=17;NR=65;PP=1391;ReadPosRankSum=1.311;SC=GTGTTTTTAGATTTTTTTTTG;SOR=0.675;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=105;TCF=24;TCR=81;TR=82;WE=66036951;WS=66036924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,108:0.65:167
chr17	66036943	rs141699894	T	TG	855.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FS=3.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.51;MQRankSum=1.581;QD=4.55;ReadPosRankSum=-0.271;SOR=0.893;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:132,56:0.30:188
chr17	66038181	rs62084696	C	G	1038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.859;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=18;PP=578;ReadPosRankSum=-0.475;SC=ACTTTTATTTCTCTTTTTGTT;SOR=1.017;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=141;TCF=84;TCR=57;TR=50;WE=66038189;WS=66038171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,57:0.35:162
chr17	66038556	rs62084697	G	A	1135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.939;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=28;PP=597;ReadPosRankSum=-2.395;SC=TAGTGACTTTGTCAAGTTTTG;SOR=1.101;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=75;TCF=33;TCR=42;TR=45;WE=66038564;WS=66038546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,54:0.61:89
chr17	66039350	rs4638	A	G	907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.638;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=19;PP=479;ReadPosRankSum=-0.734;SC=ATCCAGAAGTATTAGCAGATA;SOR=0.795;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=135;TCF=75;TCR=60;TR=42;WE=66039358;WS=66039340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,50:0.33:153
chr17	66039938	rs144471912	AT	A	97.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.59;MQRankSum=3.094;QD=1.81;ReadPosRankSum=-0.894;SOR=0.522;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,12:0.22:54
chr17	66121807	rs1964244	C	T	2730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=49;PP=1609;ReadPosRankSum=1.781;SC=CAGCCTTAAACGACTGAAGAA;SOR=0.648;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=156;TCF=89;TCR=67;TR=110;WE=66121815;WS=66121797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,123:0.70:175
chr17	66122038	rs7210681	A	G	1269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=3.955;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.91;ReadPosRankSum=-1.318;SOR=2.560;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,47:0.96:49
chr17	66124489	rs2240606	G	A	2085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=48;PP=1164;ReadPosRankSum=1.809;SC=GTCCACAGCTGTATGCCCCAG;SOR=0.723;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=102;TCF=36;TCR=66;TR=74;WE=66124497;WS=66124479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,89:0.70:127
chr17	66195838	rs78733882	A	T	4510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.964;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=102;NR=90;PP=2489;ReadPosRankSum=2.138;SC=GAAGACTTGGAATGAGCTCCC;SOR=0.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=285;TCF=149;TCR=136;TR=192;WE=66195846;WS=66195828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,210:0.66:318
chr17	66246416	rs3213690	A	G	604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=5.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.99;ReadPosRankSum=1.519;SOR=0.346;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,34:0.34:101
chr17	66250522	rs35309522	C	A	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=37;ReadPosRankSum=-1.402;SC=CTCATTCTGTCACTGTTTGTC;SOR=0.602;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=5;WE=66250530;WS=66250512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr17	66364691	rs1558876	C	G	313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=2;PP=235;SC=TGTTTCAGCACCAGCGGGAGG;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=66364699;WS=66364681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	66364749	rs1558877	T	C	1672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=15;PP=1064;SC=TGCCCTTACCTGTGACTCAGC;SOR=2.001;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=38;TCR=15;TR=53;WE=66364757;WS=66364739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr17	66364804	rs1558878	T	C	4899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=107;NR=60;PP=2736;ReadPosRankSum=0.910;SC=TGCAGGGCTCTGGGAGATGGA;SOR=0.516;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=168;TCF=108;TCR=60;TR=167;WE=66364812;WS=66364794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,183:0.99:184
chr17	66416357	rs62000424	C	T	1771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=19;PP=1200;SC=GATGGGAGCACGGGGCCTGAG;SOR=1.685;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=40;TCR=19;TR=59;WE=66416365;WS=66416347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr17	66420766	rs3785605	T	C	855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=25;PP=730;SC=CCTGTAATCCTAGCACTTTGG;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=66420774;WS=66420756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	66425995	rs3785610	T	G	1175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.22;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	66425995	.	TCC	GCT	1070	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=59.14;NF=18;NR=3;PP=1070;QD=53.4984702315;SC=CTCCCAAGGTTCCGGGATTAC;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=21;WE=66426005;WS=66425985;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,21:0.95:22
chr17	66425997	rs3785611	C	T	1175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.55;SOR=2.753;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	66430889	rs16972958	G	A	851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.006;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=27;PP=583;ReadPosRankSum=3.342;SC=AGAACACCACGTTGAGCATAG;SOR=0.938;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=64;TCF=22;TCR=42;TR=39;WE=66430897;WS=66430879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,39:0.58:67
chr17	66446803	rs2302782	T	C	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.34;ReadPosRankSum=-0.123;SOR=0.748;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,11:0.20:56
chr17	66447073	rs2302783	T	C	412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=10;PP=202;SC=TTACATGGATTGATCACTTCC;SOR=2.049;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=14;WE=66447081;WS=66447063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	66449122	rs883541	G	A	5274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=81;PP=2902;SC=TTTAGTTCCAGTTGCTAGGGA;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=175;TCF=94;TCR=81;TR=174;WE=66449130;WS=66449112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr17	66453305	rs71378928	C	G	519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=11;NR=0;PP=251;SC=GTGGGGGGTGCGGCAAACCCC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=66453313;WS=66453295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	66453320	rs67556103	A	C	1112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=5;PP=711;SC=AACCCCACTGAAGGGGTACGG;SOR=2.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=31;WE=66453328;WS=66453310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	66453410	rs71378929	C	T	738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.476;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=16;PP=372;ReadPosRankSum=-0.294;SC=CCACAAGCTGCTCTCAGGACG;SOR=0.481;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=118;TCF=73;TCR=45;TR=38;WE=66453418;WS=66453400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,43:0.34:126
chr17	66453572	rs146213184	GGCCCGGGAA	G	2263.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=23;PP=2941;SC=TCGGGGGCTCGGCCCGGGAAG;SOR=2.215;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=23;WE=66453588;WS=66453562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr17	66524987	rs2302230	G	A	4058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=62;PP=2334;SC=ATACAGAGCAGTTATTTTGAT;SOR=0.803;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=139;TCF=77;TCR=62;TR=139;WE=66524995;WS=66524977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr17	66526027	rs2302231	G	T	3251.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=35;PP=1720;SC=TTGAGAGTGTGTGTTTGTTTA;SOR=0.955;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=98;TCF=63;TCR=35;TR=98;WE=66526035;WS=66526017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr17	66533655	rs2907373	A	G	3472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=72;NR=48;PP=1996;SC=GTCTGGGGCCAACTGTTCCAC;SOR=1.011;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=120;TCF=72;TCR=48;TR=120;WE=66533663;WS=66533645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr17	66533979	rs2286556	C	G	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.823;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=61;ReadPosRankSum=-1.016;SC=AGCTGATACTCTTGGCGCCTC;SOR=1.751;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=5;WE=66533987;WS=66533969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr17	66536219	rs2286558	G	C	304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=8;PP=210;SC=AGACAGGGGTGTGAACGAAGC;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=66536227;WS=66536209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	66536749	rs2015212	C	T	1842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=39;PP=991;ReadPosRankSum=-0.585;SC=CACTCAGGCCCGTGGCAGGGT;SOR=0.708;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=110;TCF=50;TCR=60;TR=72;WE=66536757;WS=66536739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,84:0.66:127
chr17	66538223	rs35871101	C	T	1503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=19;PP=468;ReadPosRankSum=-1.052;SC=GAGAGGGAACCCTCCAGCAGG;SOR=0.649;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=131;TCF=74;TCR=57;TR=43;WE=66538231;WS=66538213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,45:0.31:144
chr17	66538239	rs2302234	G	T	1651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=22;PP=535;ReadPosRankSum=-0.901;SC=GCAGGTGTGGGTTGCCACAGA;SOR=0.675;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=155;TCF=84;TCR=71;TR=49;WE=66538247;WS=66538229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,52:0.31:170
chr17	66538418	rs2302235	G	A	709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.637;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=21;PP=510;ReadPosRankSum=-2.191;SC=CTCACAGCTCGGGAAGAGAAA;SOR=0.260;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=24;WE=66538426;WS=66538408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,26:0.72:36
chr17	66539721	rs74000753	G	A	827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.816;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=8;PP=603;ReadPosRankSum=0.199;SC=ACCCCTCCCAGAGGATTGGTC;SOR=1.550;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=40;TCF=29;TCR=11;TR=33;WE=66539729;WS=66539711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,33:0.80:41
chr17	66539847	rs2286562	C	T	627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=4.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.87;ReadPosRankSum=1.278;SOR=0.646;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,41:0.32:129
chr17	66547829	.	A	AATT	115	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5001;HP=1;HapScore=3;MGOF=11;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=115;QD=40.0;SC=TAGTATTTTCAATTATTATTA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=3;WE=66547837;WS=66547819;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr17	66899064	rs140171796	T	G	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.837;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=202;ReadPosRankSum=2.600;SC=TGTCATTTCCTGATCTAATAC;SOR=0.213;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=15;WE=66899072;WS=66899054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,17:0.40:42
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chr17	66933175	rs141488588	G	A	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=2.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.96;ReadPosRankSum=-0.502;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,12:0.21:58
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chr17	66938260	rs4147957	A	G	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=29;ReadPosRankSum=1.204;SC=CAACAAAAAAACGTAGCCTAA;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=3;WE=66938268;WS=66938250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr17	66972250	rs2191212	A	T	1950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.606;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=40;PP=1101;ReadPosRankSum=-0.679;SC=TCCATGGATGATATAGAATCA;SOR=0.604;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=133;TCF=62;TCR=71;TR=78;WE=66972258;WS=66972240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,91:0.58:156
chr17	66982341	.	C	A	1753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.303;ClippingRankSum=0.000;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.713;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=22;PP=1072;ReadPosRankSum=-0.384;SC=TTTCCTGAGACCTTTCACGGC;SOR=0.814;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=76;TCR=35;TR=70;WE=66982349;WS=66982331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,76:0.61:125
chr17	66985397	.	T	TCTCTCA	144	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;FR=0.9998;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=22;MQ=65.19;NF=0;NR=2;PP=144;QD=73.5;SC=TCTCTCTCTCTCACACACACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=66985405;WS=66985387;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr17	66985992	rs2302294	T	G	1443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.014;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=18;PP=869;ReadPosRankSum=-1.914;SC=TGTGGCAATTTTTTTCTTCCT;SOR=1.152;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=83;TCF=54;TCR=29;TR=55;WE=66986000;WS=66985982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,61:0.66:93
chr17	66986162	rs9902444	A	C	2790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=61;PP=1929;SC=TTTCCTTATAAAAAATCATGA;SOR=1.814;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=29;TCR=62;TR=90;WE=66986170;WS=66986152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr17	66987202	rs2302293	A	T	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=191;ReadPosRankSum=-0.465;SC=AGATTCATTCAGAGCACAACA;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=10;WE=66987210;WS=66987192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr17	67023755	rs6501947	A	G	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.394;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=211;ReadPosRankSum=0.000;SC=TTTTATGGCTATGTGACATCT;SOR=0.039;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=13;WE=67023763;WS=67023745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr17	67024585	rs12940103	T	C	1109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=12;PP=807;ReadPosRankSum=0.889;SC=GGATTACAGGTGTGAGCCACC;SOR=0.577;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=60;TCF=46;TCR=14;TR=47;WE=67024593;WS=67024575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,46:0.78:59
chr17	67024799	rs8066758	T	A	893.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=35;PP=888;ReadPosRankSum=0.324;SC=GGCATGATTTTAAAAAAAATT;SOR=0.588;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=62;TCF=14;TCR=48;TR=44;WE=67024807;WS=67024789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,41:0.66:62
chr17	67028260	rs2302291	T	C	2538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.290;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=34;PP=1422;ReadPosRankSum=-0.199;SC=TGATGGCTTCTTTCCCACAGA;SOR=0.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=145;TCF=90;TCR=55;TR=95;WE=67028268;WS=67028250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,113:0.66:170
chr17	67031369	rs1860448	T	C	2861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=37;PP=1498;SC=AAAGTGAAAGTGTTACCTTAA;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=60;TCR=37;TR=97;WE=67031377;WS=67031359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr17	67031457	rs1860447	C	T	6064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=110;NR=95;PP=2965;SC=TGCAGGAAGACGTGTATACAA;SOR=0.702;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=206;TCF=110;TCR=96;TR=205;WE=67031465;WS=67031447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr17	67075072	rs2302290	G	A	100.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=0;PP=74;SC=CATAAAACATGAGTTTATAGG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=67075080;WS=67075068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	67075294	rs2302289	C	T	3751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=58;PP=2029;SC=CAGGAAAATGCATGTTGCTTT;SOR=0.721;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=124;TCF=66;TCR=58;TR=124;WE=67075302;WS=67075284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr17	67080770	rs11657954	A	G	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.524;HP=1;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=280;ReadPosRankSum=-1.937;SC=CCTAACTCATAATTTTAAAAA;SOR=0.412;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=19;WE=67080792;WS=67080760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr17	67081130	rs62082718	T	A	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.306;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=75;ReadPosRankSum=0.819;SC=ACAGTCTCCCTGCATTCTGAC;SOR=0.458;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=7;WE=67081138;WS=67081120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr17	67081161	rs62082719	G	A	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.363;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=173;ReadPosRankSum=0.459;SC=CGCAGGTCCCGTCTGTACCTT;SOR=0.473;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=14;WE=67081169;WS=67081151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr17	67081278	rs77542162	A	G	873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.627;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=21;PP=526;ReadPosRankSum=-0.952;SC=TCTTGAGGGCAGTACCCCAGG;SOR=0.697;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=134;TCF=73;TCR=61;TR=44;WE=67081286;WS=67081268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,51:0.32:157
chr17	67081732	rs2302133	C	T	936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=4;PP=424;ReadPosRankSum=0.168;SC=TCATGAAATTCCTGTTTTGGA;SOR=0.700;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=46;TCF=39;TCR=7;TR=30;WE=67081740;WS=67081722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,39:0.72:54
chr17	67081830	rs2302134	T	C	1946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.350;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=33;PP=983;ReadPosRankSum=1.289;SC=TCCAGCACCATTGGGTCCTAG;SOR=0.487;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=112;TCF=62;TCR=50;TR=69;WE=67081838;WS=67081820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,87:0.66:132
chr17	67099129	rs2364315	A	G	378.10	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=259;ReadPosRankSum=0.708;SC=AGTTAATAAGAGAAGGCCATA;SOR=1.739;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=13;WE=67099137;WS=67099119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,14:0.93:15
chr17	67101718	rs7212506	C	T	614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=15;PP=357;SC=ACATAGCATACATTATATTTT;SOR=1.708;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=7;TCR=15;TR=22;WE=67101726;WS=67101708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	67109662	rs11659091	G	A	203.18	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.593;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=257;ReadPosRankSum=-0.589;SC=CTCTCTTGATGCATTACAATG;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=8;WE=67109681;WS=67109656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr17	67109673	rs7504026	A	G	224.41	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=286;ReadPosRankSum=-0.765;SC=CATTACAATGAAAGCTCTACC;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=8;WE=67109681;WS=67109656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr17	67109894	rs9282552	C	T	987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=24;PP=599;ReadPosRankSum=-0.308;SC=TGAGAAAATACGCAACTTTTA;SOR=0.804;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=26;TCR=37;TR=41;WE=67109902;WS=67109884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,44:0.67:66
chr17	67119593	rs4603621	G	C	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.929;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=256;ReadPosRankSum=-1.860;SC=AATAGTAAAAGAATGCGCAAA;SOR=2.833;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=12;WE=67119601;WS=67119583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr17	67125840	rs4968839	C	T	1207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=21;PP=603;ReadPosRankSum=-0.483;SC=ATAATTGTAACGAATATGGAA;SOR=0.786;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=65;TCF=33;TCR=32;TR=44;WE=67125848;WS=67125830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,53:0.71:75
chr17	67132022	rs7219200	T	C	860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=10;PP=436;ReadPosRankSum=-0.791;SC=TGCATCTGCATGCTCAACACA;SOR=0.622;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=45;TCF=31;TCR=14;TR=33;WE=67132030;WS=67132012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,38:0.75:51
chr17	67150176	rs2886232	T	C	1172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.021;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=28;PP=692;ReadPosRankSum=-2.342;SC=AATGTCAGATTCACCTTTGGT;SOR=0.998;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=67;TCF=24;TCR=43;TR=42;WE=67150184;WS=67150166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,49:0.60:81
chr17	67152893	rs10605889	CAAAT	C	273.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.799;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.431;NF=5;NR=0;PP=179;ReadPosRankSum=-0.301;SC=AAAACAAAAACAAATAAATAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=5;WE=67152904;WS=67152883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr17	67160186	rs7208382	T	C	1137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.877;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=19;PP=674;ReadPosRankSum=-0.971;SC=TTATGCAATATATATATTTAG;SOR=0.566;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=45;TCR=30;TR=47;WE=67160194;WS=67160176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,51:0.64:80
chr17	67170736	rs740520	A	G	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=11;PP=415;ReadPosRankSum=0.638;SC=TGTGGAAAAAATGATCACTTA;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=22;TCR=14;TR=28;WE=67170744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,34:0.77:44
chr17	67171748	rs12940557	A	G	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=165;ReadPosRankSum=-0.488;SC=GAAAAACTCTAGAAGCATTCA;SOR=0.941;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=11;WE=67171756;WS=67171738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr17	67178316	rs4968849	A	G	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5004;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=235;ReadPosRankSum=0.000;SC=AGTGCTCTCCATTTGAATAAG;SOR=1.276;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=19;WE=67178324;WS=67178306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,20:0.80:25
chr17	67178954	rs4968851	C	T	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.06;ReadPosRankSum=0.263;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr17	67181540	rs11658738	C	A	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.074;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=5.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=26.74;ReadPosRankSum=0.790;SOR=2.636;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr17	67181548	rs11655199	T	G	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=5.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.42;ReadPosRankSum=-0.605;SOR=2.566;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr17	67188576	rs8070232	A	G	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.690;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=200;ReadPosRankSum=-0.832;SC=AGACATTTTGAGCTGTTTATT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=9;WE=67188584;WS=67188566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr17	67188668	rs8074259	T	C	2600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=27;PP=1455;SC=CATATTAATATGCTCATTTAA;SOR=1.402;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=87;TCF=60;TCR=27;TR=86;WE=67188676;WS=67188658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr17	67210992	rs11657804	T	C	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=333;ReadPosRankSum=0.734;SC=AGGTGTGTAATCTGAGATTTA;SOR=0.754;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=19;WE=67211000;WS=67210982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
chr17	67211058	rs9909045	T	A	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=202;ReadPosRankSum=0.578;SC=CAATTTTTTTTAAAAAATAGT;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=11;WE=67211066;WS=67211048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr17	67212031	rs11077414	A	G	3639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.346;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=59;PP=2158;ReadPosRankSum=-1.870;SC=GAAGTTGTCTATATAACACAG;SOR=0.767;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=222;TCF=121;TCR=101;TR=141;WE=67212039;WS=67212021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,159:0.64:249
chr17	67212423	rs9909216	G	A	1100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.261;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=19;PP=664;ReadPosRankSum=-1.520;SC=AATACAATTGGGATTGATGTT;SOR=0.955;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=68;TCF=38;TCR=30;TR=46;WE=67212431;WS=67212413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,49:0.66:74
chr17	67212574	rs9912127	A	C	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5041;FS=9.979;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=215;ReadPosRankSum=-1.454;SC=GAAATGGTTAAGAGTAAAAGC;SOR=2.683;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=15;WE=67212582;WS=67212564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,17:0.77:22
chr17	67215712	rs12941264	C	T	648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=370;ReadPosRankSum=2.679;SC=GGAGACCCATCACTGTCATCA;SOR=0.829;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=25;TCR=12;TR=26;WE=67215720;WS=67215702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,29:0.73:40
chr17	67219703	rs11655507	G	A	877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=3;PP=624;SC=TATTAACTTTGTATCTCACTC;SOR=3.407;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=27;WE=67219711;WS=67219693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	67219768	rs1468512	C	T	654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.702;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=16;PP=493;ReadPosRankSum=2.561;SC=TGTAGCCATACCTTTCAAAAC;SOR=0.601;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=119;TCF=73;TCR=46;TR=40;WE=67219776;WS=67219758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,40:0.29:136
chr17	67220060	rs1468513	T	G	425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=13;PP=362;SC=GCTTACACTGTGCATACAGGA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=67220068;WS=67220050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	67245941	rs1420904	G	A	952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.20;QD=28.87;SOR=0.880;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr17	67245941	.	GTGC	ATGC,ATGT	227	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MMLQ=9;MQ=59.27;NF=18,4;NR=10,3;PP=227,18;QD=9.34897187669;SC=TACAACATAAGTGCTTTTCAA;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=18;TCR=10;TR=28,7;WE=67245952;WS=67245938;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:28
chr17	67245944	rs1420905	C	T	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQRankSum=0.799;QD=2.14;ReadPosRankSum=-0.210;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,7:0.21:33
chr17	67249711	rs77262773	C	T	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=0.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.53;ReadPosRankSum=-0.900;SOR=0.573;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,19:0.18:107
chr17	67249922	rs9909726	T	C	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.489;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=11;PP=258;ReadPosRankSum=0.802;SC=TATTTGGTGTTTAATGAAAGT;SOR=0.260;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=61;TCF=25;TCR=36;TR=21;WE=67249930;WS=67249912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,21:0.31:67
chr17	67260926	rs12449649	A	G	1027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.151;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=11;PP=554;ReadPosRankSum=0.330;SC=TGAAATGCCAATAAGCTTCCT;SOR=1.067;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=64;TCF=42;TCR=22;TR=39;WE=67260934;WS=67260916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,45:0.65:69
chr17	67264251	.	AGATATATCTTAG	A	1312	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=0;NR=5;PP=1312;QD=274.954832179;SC=TTATATCTTAAGATATATCTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=5;WE=67264270;WS=67264241;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr17	67264260	.	TTAGGA	T	184.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.255;ClippingRankSum=0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.55;ReadPosRankSum=0.597;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr17	67264271	.	CTTATATCA	C	184.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.143;ClippingRankSum=-0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.32;ReadPosRankSum=0.228;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr17	67267317	rs557491	T	C	904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.665;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=18;PP=594;ReadPosRankSum=1.262;SC=TCTGAATGCATCACATTTAAA;SOR=0.800;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=127;TCF=76;TCR=51;TR=43;WE=67267325;WS=67267307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,47:0.33:142
chr17	67273882	rs536009	C	A	1463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=31;PP=867;ReadPosRankSum=1.459;SC=CTCACTAGAGCAGCCTTGGTT;SOR=0.681;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=53;TCR=49;TR=64;WE=67273890;WS=67273872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,69:0.61:114
chr17	67274054	rs12452340	C	A	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=34;ReadPosRankSum=0.566;SC=GAAGCAGGAACATTTAAAGAA;SOR=0.330;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=4;WE=67274062;WS=67274044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr17	67279959	rs56193366	C	CAGTA	277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=282;SC=CTATCACTATCAGTATCTCAT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=5;WE=67279967;WS=67279949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	67282332	rs1550828	T	C	2377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.088;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=39;PP=1644;ReadPosRankSum=0.558;SC=GAGTATAATATAGAATAATGT;SOR=1.086;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=148;TCF=85;TCR=63;TR=100;WE=67282340;WS=67282322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,106:0.68:157
chr17	67287327	rs34164530	G	GT	676.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.141;HP=9;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=242;ReadPosRankSum=0.921;SC=ATATAATGAAGTTTTTTTTTC;SOR=1.597;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=43;TCF=26;TCR=17;TR=18;WE=67287335;WS=67287317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,34:0.57:60
chr17	67290840	rs17686569	T	C	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.085;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=15;PP=223;ReadPosRankSum=-0.952;SC=GTATGTCTTCTGAATACCACT;SOR=1.088;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=74;TCF=34;TCR=40;TR=25;WE=67290848;WS=67290830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,27:0.30:90
chr17	67293535	rs487382	A	G	577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=13;PP=355;SC=GAGTTACCATAATTAGTTTTT;SOR=1.828;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=19;WE=67293543;WS=67293525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	67297176	rs12938097	T	C	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.893;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=227;ReadPosRankSum=-0.768;SC=GAATATGACTTAGGGTACCCT;SOR=1.387;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=14;WE=67297184;WS=67297166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr17	67304447	rs11544715	C	T	852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=19;PP=474;ReadPosRankSum=2.677;SC=TCTATGGATGCTTGTAAAACT;SOR=0.646;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=150;TCF=86;TCR=64;TR=43;WE=67304455;WS=67304437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,51:0.29:176
chr17	67305364	rs11871086	C	T	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=26;ReadPosRankSum=-0.803;SC=CAAAGATATGCATTTAATTGA;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=4;WE=67305372;WS=67305354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr17	67501133	rs34498161	C	T	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=165;ReadPosRankSum=0.574;SC=ATTCTACTTCCATTGCTAACT;SOR=1.061;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=13;WE=67501141;WS=67501123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr17	67502138	rs2074027	G	A	1012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=31;PP=800;SC=ACCTGAAATAGTCATCTTATC;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=31;WE=67502146;WS=67502128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr17	67512924	rs35105918	G	GTT	1540.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=1.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.217;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.276;NF=14;NR=12;PP=874;ReadPosRankSum=1.444;SC=TATCCTCAGTGGTGTGTGATT;SOR=1.026;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=98;TCF=47;TCR=51;TR=26;WE=67512932;WS=67512914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,47:0.28:167
chr17	67513003	rs1133228	C	A	1612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=-0.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.304;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.549;NF=39;NR=45;PP=945;ReadPosRankSum=-0.525;SC=TAGACCACCTCGAGATTTAGA;SOR=0.819;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=277;TCF=144;TCR=133;TR=84;WE=67513011;WS=67512993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:233,98:0.30:331
chr17	67513055	rs2251855	A	G	1146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FS=2.495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.70;ReadPosRankSum=0.963;SOR=0.906;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:176,68:0.28:244
chr17	67519542	rs2251160	G	A	1951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=12;PP=1374;SC=GTGTTGGGCAGCTTGGGGAAA;SOR=2.602;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=50;TCR=12;TR=62;WE=67519550;WS=67519532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr17	67521241	rs2716206	C	A	2207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=51;PP=1419;SC=TCCTGCTGAGCTGGTAGGAGA;SOR=2.073;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=22;TCR=51;TR=73;WE=67521249;WS=67521231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr17	67522919	rs2074030	C	T	1095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=25;PP=703;SC=TTTCTTCCATCGGGGTTGAAT;SOR=1.788;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=35;WE=67522927;WS=67522909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr17	67522975	rs2074031	T	C	233.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=148;SC=GAGTATGCCCTCTCTGCTGGA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=67522983;WS=67522965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
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chr17	69334971	.	TATTTC	T	755.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=63.02;QD=37.79;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	69334972	.	A	C	447	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;FR=1.0000;HP=7;HapScore=2;MGOF=21;MMLQ=29;MQ=63.82;NF=3;NR=16;PP=447;QD=25.3563796077;SC=TGTTTCTTTTATTTCCTTTCT;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=69334980;WS=69334962;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	69334981	.	CTTTCTTTCTTCCTTCCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTT	C	719.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=63.71;QD=42.34;SOR=3.383;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	70119245	rs12950966	C	G	422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=11;PP=285;SC=TTGCGCCCGTCCCGCTCCCCT;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=70119253;WS=70119235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	70120551	rs1042667	A	C	4147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=67;NR=81;PP=2202;SC=CGAAGGGCGAAGATGGCCGAG;SOR=1.082;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=148;TCF=67;TCR=81;TR=148;WE=70120559;WS=70120541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr17	70845688	rs12449747	C	A	302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=275;SC=ACAATTGCCCCTTCCCCTTTT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=70845696;WS=70845678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	70846027	rs4998297	G	A	882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.230;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=24;PP=649;ReadPosRankSum=-0.263;SC=AGCTACAGCAGGAAGAAGCTT;SOR=1.038;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=51;TCF=19;TCR=32;TR=37;WE=70846035;WS=70846017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,39:0.72:54
chr17	70846116	rs4436821	C	T	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.433;NF=2;NR=9;PP=246;ReadPosRankSum=0.134;SC=CACTGCAGCCCCAACTTCCCG;SOR=0.430;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=11;WE=70846124;WS=70846106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr17	70943990	rs2466517	T	C	3176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.62;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr17	71027543	rs9912666	G	A	371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=1;PP=253;SC=AGAAATCACCGATCAGTTCCT;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=71027551;WS=71027533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	71081078	rs9891809	G	A	2568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.141;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=56;PP=1511;ReadPosRankSum=-0.054;SC=AAAGAGCCACGCAAATAAAGA;SOR=0.481;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=133;TCF=54;TCR=79;TR=95;WE=71081086;WS=71081068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,111:0.70:158
chr17	71189155	.	A	AGG	404	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;FR=0.5000;HP=7;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=6;NR=5;PP=404;QD=39.0909090909;SC=AAGATGGCGGAGGGGGCGGGA;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=23;TCF=14;TCR=9;TR=11;WE=71189163;WS=71189145;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr17	71189182	rs3764359	A	G	856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.988;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=10;PP=538;ReadPosRankSum=1.222;SC=GGGCGTAGGTAGATCGCCGGG;SOR=0.892;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=51;TCF=34;TCR=17;TR=31;WE=71189190;WS=71189172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,38:0.60:63
chr17	71192468	rs1052705	C	T	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.393;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=109;ReadPosRankSum=-1.248;SC=GATCTTACAACACTCCTGACT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=7;WE=71192476;WS=71192465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr17	71192663	rs1052706	G	A	1492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.824;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=27;PP=823;ReadPosRankSum=0.604;SC=AGCCATCCCAGGAGAAGTTCT;SOR=0.460;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=86;TCF=48;TCR=38;TR=59;WE=71192671;WS=71192653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,68:0.70:97
chr17	71192873	rs11544800	A	G	1439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=35;PP=922;ReadPosRankSum=-0.051;SC=GGCAGGTGGCAGCCGCCAGCC;SOR=0.721;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=85;TCF=32;TCR=53;TR=55;WE=71192881;WS=71192858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,60:0.64:94
chr17	71192955	rs1010442	C	T	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.935;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=8;PP=366;ReadPosRankSum=1.044;SC=GGGTTTATGGCGTTTGTCTTC;SOR=0.721;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=23;TCF=12;TCR=11;TR=18;WE=71192963;WS=71192945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,18:0.78:23
chr17	71193590	rs78661663	C	T	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.809;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=21;PP=1001;ReadPosRankSum=0.004;SC=ATAATTTGCTCAGCGTCTACC;SOR=0.788;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=84;TCF=34;TCR=50;TR=33;WE=71193602;WS=71193580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,36:0.39:93
chr17	71193594	rs7221701	G	A	1067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=25;PP=1442;ReadPosRankSum=-0.061;SC=TTTGCTCAGCGTCTACCGTGT;SOR=0.788;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=71;TCF=30;TCR=41;TR=44;WE=71193602;WS=71193580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,50:0.62:80
chr17	71195949	rs1009110	C	T	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.298;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=8;PP=328;ReadPosRankSum=-0.541;SC=CTCCCTGTTTCAATATGCACT;SOR=0.141;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=24;WE=71195957;WS=71195939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,24:0.77:31
chr17	71196809	rs1026128	A	G	1853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.511;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=32;PP=1125;ReadPosRankSum=1.309;SC=TTACTTACCAATGAGTCCACC;SOR=0.516;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=116;TCF=70;TCR=46;TR=78;WE=71196817;WS=71196799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,83:0.66:126
chr17	71196995	rs1026129	G	A	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.422;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=242;ReadPosRankSum=-0.199;SC=GATTTCTGTCGCTTCCCAAGT;SOR=0.058;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=17;WE=71197003;WS=71196985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,17:0.74:23
chr17	71197200	rs1026130	T	C	370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=0;PP=250;SC=TGTTTTGAAATGTCCTTAAAG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=71197208;WS=71197195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	71197439	rs1551036	C	T	1846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.697;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=33;PP=1240;ReadPosRankSum=0.468;SC=CCTGGGTCAGCGTGGCAAACC;SOR=0.775;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=117;TCF=64;TCR=53;TR=75;WE=71197447;WS=71197429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,79:0.65:122
chr17	71197748	rs1037256	G	A	3185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.479;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=68;PP=1992;ReadPosRankSum=-0.344;SC=GCATTGAAGAGGGTGTGCAAG;SOR=0.739;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=214;TCF=106;TCR=108;TR=132;WE=71197756;WS=71197738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,147:0.61:242
chr17	71201675	rs3829571	T	C	4690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=89;NR=78;PP=2510;SC=GGGTGGGGACTGGGAATTCAT;SOR=0.749;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=167;TCF=89;TCR=78;TR=167;WE=71201683;WS=71201665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr17	71202431	rs77740419	G	A	1139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.564;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=33;PP=673;ReadPosRankSum=-2.766;SC=TGCTTAGTGCGAACGAAGCGA;SOR=0.633;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=177;TCF=79;TCR=98;TR=60;WE=71202439;WS=71202421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,64:0.33:194
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chr17	71208647	rs10717516	GC	G	771.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.921;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.777;NF=15;NR=3;PP=636;ReadPosRankSum=-0.709;SC=AGGATTTGCAGCCAGCTGCAA;SOR=0.255;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=18;WE=71208655;WS=71208637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,25:0.66:38
chr17	71231604	rs3751925	A	C	2555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.423;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=28;PP=1676;ReadPosRankSum=0.574;SC=TCTCACATTTACCTTTTTCAG;SOR=0.844;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=138;TCF=96;TCR=42;TR=94;WE=71231612;WS=71231594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,106:0.68:156
chr17	71232687	rs745143	T	C	2466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.778;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=49;PP=1578;ReadPosRankSum=-0.239;SC=TTTAAGTTTGTTCATTCCGAG;SOR=0.876;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=144;TCF=71;TCR=73;TR=92;WE=71232695;WS=71232677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,103:0.63:163
chr17	71232804	rs904384	C	A	9113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.66;SOR=0.744;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr17	71232804	.	CATT	AATC,AATT	1685	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=71,113;NR=60,107;PP=1685,975;QD=13.2707471364;SC=CCAGAATCATCATTGTGTCCC;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=222;TCF=113;TCR=109;TR=131,220;WE=71232815;WS=71232794;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.59:222
chr17	71232807	rs904383	T	C	3286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FS=1.645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.87;ReadPosRankSum=-0.678;SOR=0.614;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,152:0.64:237
chr17	71232881	rs745142	G	C	3564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.547;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=65;PP=2018;ReadPosRankSum=-0.542;SC=CTGATAGTCAGTTCCAAGCAT;SOR=0.616;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=203;TCF=108;TCR=95;TR=143;WE=71232889;WS=71232871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,159:0.72:222
chr17	71233130	rs11869253	A	G	3866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=79;PP=2221;ReadPosRankSum=-0.179;SC=AAAGACTCTCACAAGGTAAAC;SOR=0.706;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=258;TCF=128;TCR=130;TR=158;WE=71233138;WS=71233120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,179:0.62:287
chr17	71238433	rs1566286	G	A	2867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-1.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.562;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=52;PP=1452;ReadPosRankSum=-1.207;SC=GGAACCCCCTGCCGGACTTAC;SOR=0.772;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=161;TCF=85;TCR=76;TR=109;WE=71238441;WS=71238423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,129:0.67:193
chr17	71238525	rs1566287	A	G	1988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.710;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=39;PP=1095;ReadPosRankSum=0.010;SC=CTTCTGTTGCAGGTTCTGGGC;SOR=0.612;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=107;TCF=51;TCR=56;TR=73;WE=71238533;WS=71238515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,87:0.69:127
chr17	71238649	rs5821951	T	TC	311.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.527;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=348;ReadPosRankSum=-0.844;SC=ATTTTGGAGTTGGACATAATT;SOR=1.721;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=9;WE=71238657;WS=71238639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr17	71238693	rs1566288	T	C	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.412;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=73;ReadPosRankSum=0.464;SC=CTACCATTTATTCAACAGCTT;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=71238701;WS=71238683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr17	71239000	rs2270726	T	C	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=157;ReadPosRankSum=1.897;SC=TAGTTTCAGTTGCTGTAACAA;SOR=0.307;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=12;WE=71239008;WS=71238990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,14:0.78:18
chr17	71239016	rs2270727	C	T	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=266;ReadPosRankSum=0.240;SC=AACAACAAGCCGTGTTTCCTT;SOR=1.179;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=17;WE=71239024;WS=71239006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,19:0.76:25
chr17	71239190	rs2270728	A	T	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=254;ReadPosRankSum=0.293;SC=CCATTCCGTTATGTGGACCTC;SOR=0.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=9;TCR=20;TR=17;WE=71239198;WS=71239180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr17	71239214	rs138600770	GAA	G	104.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.732;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=126;ReadPosRankSum=-0.272;SC=GGGATTCTCTGAATTTTTTTT;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=71239223;WS=71239204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr17	71239234	.	T	TTTG	41	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.7335;HP=23;HapScore=2;MGOF=82;MMLQ=27;MQ=58.52;NF=0;NR=4;PP=41;QD=11.0;SC=TTTTTTTTTTTTTTTTTACAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=71239242;WS=71239224;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:0,4:1.00:4
chr17	71241279	rs74822881	C	T	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.53;ReadPosRankSum=-0.243;SOR=0.700;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,11:0.17:64
chr17	71244630	rs8915	C	T	2054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.938;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=41;PP=1247;ReadPosRankSum=-0.353;SC=TAAGAAGCAACGCTTAGATCT;SOR=0.561;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=141;TCF=71;TCR=70;TR=88;WE=71244638;WS=71244620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,95:0.62:152
chr17	71246230	rs112790822	C	G	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.845;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=223;ReadPosRankSum=0.883;SC=CGTTCACTTACAGGATCAAAA;SOR=0.239;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=15;WE=71246238;WS=71246220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr17	71248777	rs74909356	T	C	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.843;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=12;PP=347;ReadPosRankSum=1.898;SC=ACTGAGCAAATTGGCACTTGG;SOR=0.917;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=47;TCR=36;TR=27;WE=71248785;WS=71248767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,28:0.32:88
chr17	71334473	rs3195414	G	A	5140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=109;NR=73;PP=2906;ReadPosRankSum=-0.688;SC=CCCCAGCTCCGTGTAATTCCC;SOR=0.366;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=182;TCF=109;TCR=73;TR=182;WE=71334481;WS=71334463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,196:0.99:197
chr17	71344584	rs4969105	G	A	2467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=18;PP=1531;SC=GGAGGGGACAGATGGCCCATA;SOR=1.916;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=61;TCR=18;TR=79;WE=71344592;WS=71344574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr17	71344889	rs9905883	C	T	581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=18;PP=467;SC=GGAGTGGGGCCGAGAGGTGCA;SOR=3.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=71344897;WS=71344879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	71346329	.	T	TGGGCACTGCTGGGCCTGGCCCCCCACCC	616	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MMLQ=24;MQ=64.31;NF=3;NR=2;PP=616;QD=128.2;SC=TCTCCCCACCTGGGCACTGCT;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=5;WE=71346337;WS=71346319;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:8,5:0.38:13
chr17	71346347	.	G	GC	952.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=66.83;QD=45.37;SOR=6.184;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	71346353	.	A	C	786	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=5;HapScore=1;MGOF=16;MMLQ=27;MQ=64.82;NF=32;NR=12;PP=786;QD=18.6538911943;SC=CCTGGCCCCCAACCCACGCAG;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=32;TCR=12;TR=44;WE=71346361;WS=71346343;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	71346353	.	A	ACCCGGGCACTGCTGGGCCTGGCCCCCC	1637.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=67.11;QD=71.21;SOR=4.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	71346750	rs1995163	C	G	3170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=59;NR=43;PP=1835;SC=ATACATAAAACTCAAGTCCAG;SOR=0.896;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=59;TCR=43;TR=102;WE=71346758;WS=71346740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr17	71346943	rs4969107	A	G	1618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=33;PP=957;SC=GAGCACAGATAGTCAGGTATA;SOR=1.532;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=20;TCR=33;TR=53;WE=71346951;WS=71346933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr17	71347027	rs12449590	G	A	360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=9;PP=230;SC=ACAATCTATGGGAAGGCAGGG;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=71347035;WS=71347017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	71353985	rs2279730	T	C	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=0.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.905;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=311;ReadPosRankSum=-0.413;SC=TGGTCCTCAGTTAGCACTAAC;SOR=0.330;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=20;WE=71353993;WS=71353975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,26:0.76:34
chr17	71358045	rs11657033	T	C	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.335;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=127;ReadPosRankSum=2.196;SC=CTGGAGGCCATGGGGAAGGGG;SOR=0.418;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=47;TCF=13;TCR=34;TR=16;WE=71358053;WS=71358035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,16:0.33:48
chr17	71365314	rs867998	A	G	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.429;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=153;ReadPosRankSum=0.109;SC=GCGCTGGCACATCAGCACTTA;SOR=1.077;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=48;TCF=20;TCR=28;TR=15;WE=71365322;WS=71365304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,19:0.34:56
chr17	71375794	rs62072075	C	T	1686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=39;PP=1148;SC=GAGGCACCCCCGCCATTCTAG;SOR=2.041;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=17;TCR=39;TR=56;WE=71375802;WS=71375784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr17	71376869	rs12941386	C	T	663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=1;PP=516;SC=CCTACTTTTCCGTGTGTTTAG;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=71376877;WS=71376859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	71382747	rs7212508	T	C	1757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=39;PP=1175;SC=CGCCCCATGCTCCCACCAAGG;SOR=1.685;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=19;TCR=39;TR=58;WE=71382755;WS=71382737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr17	71390366	rs904381	C	A	5079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=89;NR=81;PP=2707;SC=CCAGCACGAGCCCGTTGCGAT;SOR=0.768;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=170;TCF=89;TCR=81;TR=170;WE=71390374;WS=71390356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr17	71397375	rs7226251	T	G	2596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=53;PP=1659;SC=CGTGTTGGCATGAGCTTGGCT;SOR=0.992;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=95;TCF=42;TCR=53;TR=94;WE=71397383;WS=71397365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr17	71398170	rs9302962	G	C	1618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FS=3.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.04;ReadPosRankSum=-0.199;SOR=0.928;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:142,88:0.38:230
chr17	71415245	rs8071352	G	A	1607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=7;PP=1045;SC=GTCCACTCCCGATCTTCCCCC;SOR=2.670;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=41;TCR=7;TR=48;WE=71415253;WS=71415235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr17	71418605	rs9894213	T	C	2249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=51;PP=1647;SC=CAGAAGTGGGTATCTTGGGTG;SOR=1.734;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=24;TCR=51;TR=75;WE=71418613;WS=71418595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr17	71420035	rs6501636	T	C	1559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=11;PP=993;SC=TCTGCCGGGGTCTGGGAGGGC;SOR=2.024;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=39;TCR=11;TR=50;WE=71420043;WS=71420025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr17	71468356	rs117687984	A	G	1747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.606;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=39;PP=1119;ReadPosRankSum=-0.411;SC=GTGATCATGTATCTATGGGAC;SOR=0.807;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=217;TCF=117;TCR=100;TR=86;WE=71468364;WS=71468346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,91:0.38:237
chr17	71757021	rs35020317	A	T	676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=14;PP=370;ReadPosRankSum=1.124;SC=CTGGAAGTTAATTAGATCACT;SOR=0.706;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=50;TCR=35;TR=33;WE=71757029;WS=71757011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,38:0.38:100
chr17	71819962	rs752060	C	T	782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.039;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=20;PP=438;ReadPosRankSum=-0.087;SC=GTGCTGATGACGTCTGGTGGG;SOR=0.999;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=51;TCF=23;TCR=28;TR=34;WE=71819970;WS=71819952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,38:0.62:61
chr17	72209858	rs7206926	A	G	1092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=3.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.96;ReadPosRankSum=-0.002;SOR=0.517;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,61:0.39:157
chr17	72245986	rs36208397	CCACTGTGGGGCTCCTGGGAGACGGAGCCT	C	1598.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=0;PP=598;SC=GGCCCCTCAGCCACTGTGGGG;SOR=3.797;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=1;WE=72246022;WS=72245976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr17	72277879	rs3803792	A	G	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.129;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=97;ReadPosRankSum=-1.247;SC=CTGTCCTGGCAGGACCTGTGG;SOR=0.054;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=9;WE=72277887;WS=72277869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr17	72281367	rs6501706	A	G	4831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=92;PP=2965;SC=CCCCAGCTGCAAGAGCCCCAT;SOR=0.938;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=171;TCF=78;TCR=93;TR=170;WE=72281375;WS=72281357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr17	72297104	rs34880269	C	T	273.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5010;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=179;ReadPosRankSum=0.751;SC=GACCCCAGGACGGTGGGGTGA;SOR=1.473;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=10;WE=72297112;WS=72297094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,11:0.85:13
chr17	72297180	rs8076337	A	G	1163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.312;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=20;PP=642;ReadPosRankSum=-0.262;SC=CCCTCCTCCCACCAGGTCATG;SOR=0.217;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=67;TCF=44;TCR=23;TR=50;WE=72297188;WS=72297170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,56:0.75:75
chr17	72301432	rs8073660	A	G	6523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=401;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=142;NR=115;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.205;SC=CGTCAGCTGAAAAGATTGTGT;SOR=0.692;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=362;TCF=200;TCR=162;TR=257;WE=72301440;WS=72301422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,285:0.71:401
chr17	72303449	rs11867486	G	A	1407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=29;PP=696;ReadPosRankSum=-1.343;SC=GACCTGTGTCGTAGAACCTGG;SOR=0.701;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=109;TCF=55;TCR=54;TR=61;WE=72303457;WS=72303439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,69:0.58:119
chr17	72305534	rs2290955	C	T	2530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=51;PP=1423;ReadPosRankSum=0.086;SC=GAAGGTCACGCGCATGTCCCT;SOR=0.704;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=169;TCF=86;TCR=83;TR=104;WE=72305542;WS=72305524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,118:0.63:188
chr17	72305688	rs2290956	T	C	2321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=39;NR=42;PP=1272;SC=CGATTGCTTTTGAGCGTGTGC;SOR=0.883;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=39;TCR=42;TR=81;WE=72305696;WS=72305674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr17	72305753	rs2290957	C	T	800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=3.826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.81;ReadPosRankSum=-1.138;SOR=0.336;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,38:0.66:58
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chr17	72306291	rs28725418	G	A	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.49;ReadPosRankSum=0.295;SOR=0.733;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,30:0.26:117
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chr17	72308319	rs1979370	G	A	1799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.63;ReadPosRankSum=0.101;SOR=0.646;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,84:0.68:123
chr17	72308403	rs4239008	G	A	1777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.22;ReadPosRankSum=-0.651;SOR=0.665;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,46:0.73:63
chr17	72308410	rs4239009	C	T	1706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.43;ReadPosRankSum=-0.252;SOR=0.704;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,42:0.72:58
chr17	72308447	rs1979371	G	A	711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=19;PP=496;SC=TCTGCTTGCCGACTTCCTGGG;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=25;WE=72308455;WS=72308437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	72310476	rs2054400	G	A	1324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.044;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=32;PP=784;ReadPosRankSum=0.297;SC=GTGGTGGGCTGGGAGCATCGG;SOR=0.112;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=68;TCF=18;TCR=50;TR=48;WE=72310484;WS=72310466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,54:0.72:75
chr17	72321928	rs7207519	T	C	493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=4;PP=457;SC=GTGCAGACACTCACAGCACAG;SOR=2.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=19;WE=72321936;WS=72321918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	72322881	rs8082699	G	A	4235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=78;PP=2471;SC=CCCAGAAGGAGGGTGGCGGTT;SOR=1.246;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=134;TCF=56;TCR=78;TR=134;WE=72322889;WS=72322871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr17	72322997	rs141207337	CGGAGTGCCTGGTTCTT	C	293.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.721;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=3;PP=1315;ReadPosRankSum=0.687;SC=GGATGGGGCCCGGAGTGCCTG;SOR=0.374;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=3;WE=72323020;WS=72322987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr17	72324649	rs11412158	G	GC	2263.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.891;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=16;PP=1603;ReadPosRankSum=1.421;SC=GAGCAGGTATGCAGGGCTCTG;SOR=0.887;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=59;TCF=31;TCR=28;TR=38;WE=72324657;WS=72324639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,68:0.72:94
chr17	72332849	rs1111596	A	G	2019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=40;NR=24;PP=1084;SC=GAGACCCACAACTCTGAATCT;SOR=1.134;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=40;TCR=24;TR=64;WE=72332857;WS=72332839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr17	72338164	rs11285065	TC	T	2574.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=55;PP=2107;SC=CAGGAGCCCCTCCCCCACCCT;SOR=1.952;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=65;TCF=3;TCR=62;TR=58;WE=72338172;WS=72338154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr17	72338765	rs12601559	G	A	3259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=70;NR=46;PP=1873;SC=TTCCTTCCTCGCAGGAGATGG;SOR=1.071;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=70;TCR=46;TR=116;WE=72338773;WS=72338755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr17	72339369	rs72852205	C	T	609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=20;PP=553;SC=TGCAGCTTCCCGGGGCGCTCA;SOR=3.816;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=72339377;WS=72339359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	72339501	rs62063599	C	T	1202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=5;PP=893;SC=GATTCAAACTCAGGACCCTGC;SOR=3.202;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=37;WE=72339509;WS=72339491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr17	72339542	rs72852209	C	T	2313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=27;PP=1405;SC=CCCTGTGCCACGCTCACCACC;SOR=1.375;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=52;TCR=27;TR=79;WE=72339550;WS=72339532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr17	72340553	rs11870297	C	T	494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=14;PP=381;SC=GCAGGAGGGGCGGGGACAGAA;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=18;WE=72340561;WS=72340543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	72346736	rs12451539	C	T	3907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=54;PP=2421;ReadPosRankSum=-0.592;SC=TCCCAGGACCCTCCAGGCCCC;SOR=0.328;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=79;TCR=54;TR=133;WE=72346744;WS=72346726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,144:0.99:145
chr17	72346855	rs11077744	T	C	5363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=104;NR=80;PP=2965;SC=GCTGGAAGCATGAGAAGTCCC;SOR=0.914;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=184;TCF=104;TCR=80;TR=184;WE=72346876;WS=72346845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr17	72346868	rs2382644	C	T	5994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=111;NR=89;PP=2965;SC=GAAGTCCCGCCGGGCCCTCAA;SOR=0.829;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=200;TCF=111;TCR=89;TR=200;WE=72346876;WS=72346845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr17	72348741	rs11655890	T	C	534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=11;PP=458;SC=CACAAATGGCTCCAGCTGCCC;SOR=1.371;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=6;TCR=11;TR=17;WE=72348749;WS=72348731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	72348810	rs1814832	A	C	743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=4;PP=499;SC=CCACAGCTTAACCCCGAGGAC;SOR=2.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=25;WE=72348818;WS=72348800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	72350362	rs72852235	G	A	2902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=37;PP=1680;SC=GGCGGCGCTCGCGGGCCCTGG;SOR=1.036;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=55;TCR=37;TR=92;WE=72350370;WS=72350352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr17	72351406	rs2271536	C	T	2759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=39;PP=1469;SC=GCCTGCCCCACGGCACAAGCA;SOR=0.753;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=50;TCR=39;TR=89;WE=72351414;WS=72351396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr17	72352686	rs55690660	G	A	1468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=16;PP=793;SC=TAGGGTGGCCGGCGCCTGGCC;SOR=1.329;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=46;TCF=30;TCR=16;TR=45;WE=72352694;WS=72352676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr17	72356484	rs11870955	T	A	402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=10;PP=271;SC=TGCATGGGTGTGAGCAGAGGG;SOR=1.911;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=14;WE=72356492;WS=72356474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	72366695	rs2382647	C	A	4191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.72;SOR=0.756;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
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chr17	72439808	rs3840056	TG	T	4865.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=50;PP=2951;SC=ACCCCCAAGTTGGCCACTCCT;SOR=0.962;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=36;TCR=52;TR=85;WE=72439816;WS=72439798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr17	72443192	rs2706527	G	T	2917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=54;PP=1660;SC=GGAGAGGCGGGCGGATTTGGG;SOR=1.522;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=34;TCR=54;TR=88;WE=72443200;WS=72443182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
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chr17	72519850	rs139775917	C	A	760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.293;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=24;PP=550;ReadPosRankSum=1.362;SC=ATGCATGGGTCACAAAGCCAC;SOR=1.075;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=59;TCF=20;TCR=39;TR=34;WE=72519858;WS=72519840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,34:0.56:61
chr17	72521897	rs17553512	G	A	4190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=87;NR=49;PP=2392;SC=CTGGGTCAACGATCACTTTCA;SOR=1.114;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=87;TCR=49;TR=136;WE=72521905;WS=72521887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr17	72527718	rs965229	A	G	1218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=32;PP=924;SC=CACAGGGCTTAAGCATCGTCA;SOR=2.891;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=7;TCR=32;TR=39;WE=72527726;WS=72527708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr17	72537894	rs2140253	A	G	2747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=58;PP=1633;SC=ACACGGTGACAGGCAGTGAGT;SOR=1.477;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=31;TCR=58;TR=89;WE=72537902;WS=72537884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr17	72538917	rs7215669	A	G	140.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=3;PP=86;SC=AGGGACTGGAAGAAGGGACAT;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=6;WE=72538925;WS=72538907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	72541838	rs809740	A	G	1834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=46;NR=17;PP=1043;SC=AGAGCTCCCCAAGTCCAGGGT;SOR=1.451;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=46;TCR=17;TR=63;WE=72541846;WS=72541828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr17	72541980	rs783230	A	G	2940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=44;NR=56;PP=1620;SC=ACAAAATGTAATCTCCTCCCA;SOR=1.159;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=44;TCR=56;TR=100;WE=72541988;WS=72541970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr17	72575977	rs7219289	T	C	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=100;ReadPosRankSum=0.363;SC=TGAGCAGAGATTACACCATTG;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=7;WE=72575985;WS=72575967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr17	72584764	rs783239	C	T	4776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.621;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=107;NR=82;PP=2609;ReadPosRankSum=-0.282;SC=ACGGTGAACACGTGGTTTTTC;SOR=0.572;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=256;TCF=145;TCR=111;TR=189;WE=72584772;WS=72584754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,216:0.74:292
chr17	72588326	rs493430	A	C	3410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=45;PP=2336;SC=AGCAGCAGAGATGGGGACAGC;SOR=0.782;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=57;TCR=45;TR=102;WE=72588334;WS=72588316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr17	72588806	rs545652	C	A	1863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.704;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=33;PP=1037;ReadPosRankSum=-1.930;SC=AAAGCCCATGCCCCAGGCTTC;SOR=0.697;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=107;TCF=59;TCR=48;TR=75;WE=72588814;WS=72588796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,84:0.67:125
chr17	72608834	rs579238	G	A	1305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=27;PP=733;ReadPosRankSum=-0.821;SC=TCACCCAGAAGACAGCACCCA;SOR=0.690;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=151;TCF=88;TCR=63;TR=63;WE=72608842;WS=72608824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,72:0.40:178
chr17	72608926	rs509574	G	A	1510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.792;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=37;PP=850;ReadPosRankSum=0.628;SC=TGGTGGACACGGTGAAAATGA;SOR=0.764;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=168;TCF=86;TCR=82;TR=73;WE=72608934;WS=72608916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,80:0.42:190
chr17	72610089	rs1878061	C	T	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=8.280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.26;ReadPosRankSum=2.078;SOR=1.617;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,23:0.22:106
chr17	72613589	rs581157	T	G	937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.599;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=17;PP=434;ReadPosRankSum=0.667;SC=GCCGGGGCCCTTCAGAGACAA;SOR=0.303;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=69;TCF=31;TCR=38;TR=37;WE=72613597;WS=72613579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,44:0.58:76
chr17	72615293	rs12950039	C	T	2959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=50;PP=1822;ReadPosRankSum=1.320;SC=CCAGCAGCACCTCCTTCTAGG;SOR=0.698;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=168;TCF=102;TCR=66;TR=119;WE=72615301;WS=72615283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,130:0.70:187
chr17	72691928	rs2034310	T	C	2690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=35;PP=1479;SC=GGTAGCCTTTTGCGGGGAGGT;SOR=0.957;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=55;TCR=35;TR=90;WE=72691936;WS=72691918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr17	72692030	rs151168048	A	C	1243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.803;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=31;PP=818;ReadPosRankSum=0.910;SC=GGGGAGTCACAAGATCTGTCT;SOR=0.883;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=85;TCF=35;TCR=50;TR=50;WE=72692038;WS=72692020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,57:0.59:96
chr17	72699384	rs749780	C	A	117.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.58;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	72700943	rs35489971	A	G	7879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=117;NR=142;PP=2965;SC=GATTTGAGTGACAATGGAGTA;SOR=0.930;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=260;TCF=117;TCR=143;TR=259;WE=72700951;WS=72700933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,289:1.00:289
chr17	72736755	rs11651291	A	G	387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=1;PP=279;SC=CAGGGTGAAGATGGCGGCTGG;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=72736763;WS=72736745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	72744943	rs147405067	C	A	713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.602;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=20;PP=453;ReadPosRankSum=-2.002;SC=GTCCCGTCCCCATCGGAACCC;SOR=1.006;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=102;TCF=50;TCR=52;TR=36;WE=72744951;WS=72744933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,38:0.34:111
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chr17	72769694	rs878907	A	G	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.364;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=240;ReadPosRankSum=0.415;SC=GGGCTAGGGGAAGTGGGGGGG;SOR=1.107;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=36;TCF=25;TCR=11;TR=14;WE=72769702;WS=72769684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,14:0.35:40
chr17	72771637	rs750018	C	T	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=1.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.49;ReadPosRankSum=-0.216;SOR=0.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
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chr17	72781812	rs2166703	G	A	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.29;ReadPosRankSum=0.842;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
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chr17	72791088	rs3830567	A	AG	1348.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.53;MQRankSum=2.042;QD=22.48;ReadPosRankSum=1.207;SOR=0.722;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,43:0.72:60
chr17	72791266	rs9910463	G	A	1926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=45;PP=1332;SC=TACCCTCCTGGCCCCCAGGTT;SOR=1.785;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=22;TCR=46;TR=67;WE=72791274;WS=72791256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr17	72791618	rs7221435	A	G	1185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=27;NR=14;PP=700;SC=CAGCCCAGCCAGGCGGCCTCG;SOR=1.464;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=27;TCR=14;TR=41;WE=72791626;WS=72791608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr17	72832032	rs72851753	C	G	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.593;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=196;ReadPosRankSum=-0.272;SC=CCGTGCCTGTCCCCACCAGGT;SOR=1.942;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=11;WE=72832040;WS=72832022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr17	72832928	rs11558036	G	A	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.295;NF=2;NR=21;PP=465;ReadPosRankSum=1.058;SC=TCATGGGGCAGGTGGGACTGT;SOR=0.976;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=43;TCF=4;TCR=39;TR=23;WE=72832936;WS=72832918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,28:0.56:50
chr17	72834954	rs3826320	C	A	782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.549;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=5;PP=554;ReadPosRankSum=-0.172;SC=CACGTGCATCCGGCACGTTTC;SOR=1.348;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=42;TCF=34;TCR=8;TR=29;WE=72834962;WS=72834944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,31:0.69:45
chr17	72838481	rs939536	C	T	436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=2;PP=347;SC=GATTTCATGGCAGAAGCCAGA;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=72838489;WS=72838471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	72838649	rs3744215	C	A	3942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.764;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=65;PP=2063;ReadPosRankSum=-0.632;SC=CACGGGCTACCCTGCTGATCT;SOR=0.554;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=210;TCF=120;TCR=90;TR=150;WE=72838657;WS=72838639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,176:0.72:243
chr17	72839130	rs139495021	A	AGCTCCGGGG	686.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=3;NR=4;PP=2765;SC=CAGGTCCTCCAGCTCCGGGAA;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=7;WE=72839138;WS=72839120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	72843378	rs3826314	C	T	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=6;PP=147;ReadPosRankSum=-0.099;SC=CTGTCCAGGGCCTGCCCACTC;SOR=0.625;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=14;WE=72843386;WS=72843368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr17	72843411	rs3833106	GC	G	493.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=3;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=9;PP=228;ReadPosRankSum=1.541;SC=CACCCTCAGTGCCCCCCCCCA;SOR=0.990;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=33;TCF=17;TCR=16;TR=16;WE=72843428;WS=72843401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,21:0.72:29
chr17	72843923	rs3744192	G	A	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.540;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=63;ReadPosRankSum=1.294;SC=TGAAGGACCCGTTGCCCCTGA;SOR=1.230;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=5;WE=72843931;WS=72843913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr17	72844165	rs3744193	C	T	1462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=35;PP=803;ReadPosRankSum=-0.482;SC=TTCCCTGCCCCAGGCCCAGAA;SOR=0.745;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=78;TCF=25;TCR=53;TR=52;WE=72844173;WS=72844155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,62:0.66:94
chr17	72847548	rs3744194	G	T	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.643;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=230;ReadPosRankSum=1.370;SC=CACCCACCCCGGGGCACCTGG;SOR=1.938;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=12;WE=72847556;WS=72847538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr17	72848758	rs75018418	C	CG	4351.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=61;PP=2741;SC=CTCCTGGGGGCGGGCGGGGCC;SOR=1.681;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=74;TCF=5;TCR=69;TR=66;WE=72848786;WS=72848748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr17	72848772	rs199662980	G	GC	3899.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=58;PP=2865;SC=CGGGGCCTGAGCGGGGCGGGA;SOR=2.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=6;TCR=58;TR=64;WE=72848786;WS=72848748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr17	72848778	rs201209302	C	CG	3382.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=51;PP=2001;SC=CTGAGCGGGGCGGGAGGGCCG;SOR=2.147;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=6;TCR=51;TR=57;WE=72848786;WS=72848748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr17	72848800	rs117147802	C	G	780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.953;HP=2;HapScore=2;MGOF=115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=24;PP=633;ReadPosRankSum=-0.756;SC=GCCCCTCCTCCCGCCCCTTCC;SOR=0.169;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=46;TCF=9;TCR=37;TR=32;WE=72848808;WS=72848790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,30:0.68:44
chr17	72848828	rs116833065	A	G	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=399;ReadPosRankSum=-0.705;SC=CGGCCCCTCCATCAGCTCCCA;SOR=0.826;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=22;WE=72848836;WS=72848818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,20:0.67:30
chr17	72851133	rs689730	A	G	2750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=42;PP=1527;SC=TAAACACCACAGCCACCGTCA;SOR=0.900;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=42;TCR=42;TR=84;WE=72851141;WS=72851123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr17	72859078	rs690371	A	G	3693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=66;PP=2351;ReadPosRankSum=0.000;SC=CCCTGAAGCAAAGGGGAGATT;SOR=0.694;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=202;TCF=109;TCR=93;TR=143;WE=72859086;WS=72859068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,157:0.72:219
chr17	72860253	rs552432	A	G	2589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.560;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=47;PP=1501;ReadPosRankSum=1.870;SC=GGTGTCTTTGAGAAACATGAG;SOR=0.656;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=161;TCF=86;TCR=75;TR=103;WE=72860261;WS=72860243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,117:0.63:185
chr17	72861145	rs1996710	A	G	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=187;ReadPosRankSum=-0.491;SC=GGCCTGGAGAAGGCTGGCGGC;SOR=0.551;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=16;TCR=32;TR=17;WE=72861153;WS=72861135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,17:0.31:54
chr17	72862705	rs2070918	G	A	4556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=75;NR=77;PP=2382;SC=CAGGTCCCCCGGGAATGGGAG;SOR=0.932;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=152;TCF=75;TCR=77;TR=152;WE=72862713;WS=72862695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr17	72875727	rs116982675	G	A	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.922;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=85;ReadPosRankSum=0.250;SC=TGACAGACACGTGGGTCACGC;SOR=0.307;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=10;WE=72875735;WS=72875717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr17	72888836	rs489152	G	A	3405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=50;PP=1937;SC=GAGGAGGAAGGAGACGGGTCT;SOR=0.831;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=53;TCR=50;TR=103;WE=72888844;WS=72888826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr17	72889676	.	G	GGGCTCCGTAGGTTCCATGGGCTCCGTAGGTTCCATGGGCTCCGTAGGTTCCATGGGCTCCGTAGGTTCCATC	4792.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.73;QD=62.24;SOR=0.887;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr17	72889685	.	G	A	1376	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.69;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=4;MMLQ=24;MQ=52.39;NF=10;NR=23;PP=1376;QD=42.7506428045;SC=TGGGCTCCGTGGGTTCCATGG;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=71;TCF=35;TCR=36;TR=33;WE=72889693;WS=72889666;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:38,33:0.46:71
chr17	72927123	rs6501741	G	T	6493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=111;NR=104;PP=2965;SC=ACCCAACCCCGGGCTGGTTAG;SOR=0.701;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=217;TCF=111;TCR=106;TR=215;WE=72927131;WS=72927113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr17	72929380	rs2035835	G	C	755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=3;PP=569;SC=AGGATGGGCCGCCATCTAGCC;SOR=3.098;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=25;WE=72929388;WS=72929370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	72937605	rs7210616	G	A	3162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=48;PP=1912;SC=ACCCGGCCCCGGCAGAAGTCC;SOR=0.711;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=51;TCR=48;TR=99;WE=72937613;WS=72937595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr17	72937851	rs9890664	G	A	5170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=83;NR=91;PP=2965;SC=ACCACCCGCCGACCACACGCC;SOR=0.919;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=174;TCF=83;TCR=91;TR=174;WE=72937859;WS=72937841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr17	72938100	rs1542752	T	C	4471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=82;NR=73;PP=2464;SC=CCTTGTCTTCTCTGTCATCGA;SOR=0.752;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=155;TCF=82;TCR=73;TR=155;WE=72938108;WS=72938090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr17	72939446	rs4789110	C	T	3130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.079;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=61;PP=1844;ReadPosRankSum=0.851;SC=CTAGGTAAGACTTCTCTCCCT;SOR=0.587;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=197;TCF=109;TCR=88;TR=131;WE=72939454;WS=72939436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,140:0.63:221
chr17	72939663	rs8069015	G	A	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=259;ReadPosRankSum=0.843;SC=CTGGGGAGCCGGCCAGGGTGT;SOR=0.481;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=13;WE=72939671;WS=72939653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr17	72939854	.	AAC	A	299.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=0.000;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=1.260;NF=0;NR=16;PP=393;ReadPosRankSum=-0.932;SC=CTTGCCCTGAAACACACACAC;SOR=0.586;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=0;TCR=46;TR=16;WE=72939865;WS=72939844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr17	72943126	rs8066909	G	A	2751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.222;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=53;PP=1601;ReadPosRankSum=1.706;SC=CGTGCCTGGCGGGCACAGCCA;SOR=0.600;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=165;TCF=87;TCR=78;TR=110;WE=72943134;WS=72943116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,124:0.68:183
chr17	72948369	rs17853024	A	G	1981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=23;PP=1135;SC=CTCACTTGTCAATGCAGATCT;SOR=1.164;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=42;TCR=23;TR=65;WE=72948377;WS=72948359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr17	72951823	rs9899490	C	T	3844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=23;PP=1448;SC=GGCTGTGCCCCCCTTATGTAG;SOR=1.725;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=55;TCR=23;TR=78;WE=72951831;WS=72951813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr17	72951845	rs9903414	G	A	4590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=37;PP=1843;SC=AAGTAGGCCCGCTGGCCACCC;SOR=1.227;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=68;TCR=37;TR=105;WE=72951853;WS=72951835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr17	72952017	rs9906160	A	G	2022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=42;PP=1286;SC=ACTTGTTGGCAGTCACCATGG;SOR=1.675;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=23;TCR=42;TR=65;WE=72952025;WS=72952007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr17	72955227	rs902727	C	G	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.97;ReadPosRankSum=-2.369;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr17	72956124	rs3744198	G	A	2673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.063;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=52;PP=1704;ReadPosRankSum=1.502;SC=TCCTTACATCGGCATCATCCA;SOR=0.648;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=194;TCF=106;TCR=88;TR=112;WE=72956132;WS=72956114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,121:0.57:212
chr17	72957962	rs10719287	CT	C	1094.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.505;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.495;NF=11;NR=12;PP=689;ReadPosRankSum=0.458;SC=GCCAAGGGCCCTTCACCTGTT;SOR=0.990;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=73;TCF=26;TCR=47;TR=23;WE=72957970;WS=72957952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,41:0.33:124
chr17	72959000	rs7503218	G	C	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=202;ReadPosRankSum=0.897;SC=CAACTGGCCCGGCCCCAACCC;SOR=0.929;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=12;WE=72959008;WS=72958990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr17	72983888	rs7222918	A	C	51.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.87;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr17	72983897	.	T	A	51.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.87;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr17	72995420	.	C	CACACAA	258	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;FR=0.5000;HP=6;HapScore=4;MGOF=37;MMLQ=17;MQ=62.12;NF=9;NR=0;PP=258;QD=31.3333333333;SC=CAGACACACACAAAAAGAACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=9;WE=72995428;WS=72995402;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:3,9:0.75:12
chr17	72997364	rs58998428	T	TAGG	1097.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=0.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.17;MQRankSum=2.398;QD=8.44;ReadPosRankSum=2.310;SOR=0.777;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,34:0.26:130
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chr17	73000061	rs3744203	A	G	1509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.324;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=29;PP=798;ReadPosRankSum=0.832;SC=AGCGGCTGGAACAGAGCCAGC;SOR=0.499;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=174;TCF=104;TCR=70;TR=69;WE=73000069;WS=73000051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,79:0.40:196
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chr17	73016621	rs1044228	C	T	1157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.183;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=25;PP=681;ReadPosRankSum=1.208;SC=AGTTGATCCTCACCTCTGAGA;SOR=0.798;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=180;TCF=99;TCR=81;TR=58;WE=73016629;WS=73016611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,63:0.32:199
chr17	73043337	rs12952376	C	T	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.128;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=32;ReadPosRankSum=-0.125;SC=GTGGCGGCGGCGGTCCAAGAT;SOR=1.402;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=20;TCF=13;TCR=7;TR=6;WE=73043345;WS=73043327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
chr17	73089852	rs4788863	T	C	2234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=372;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.326;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=59;PP=1522;ReadPosRankSum=-1.046;SC=CTTCACTGAATTGCAATGGGA;SOR=0.634;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=344;TCF=175;TCR=169;TR=122;WE=73089862;WS=73089842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:242,128:0.35:370
chr17	73094072	rs10598249	TCTC	T	70.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.86;ReadPosRankSum=1.668;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr17	73096951	rs4238978	A	G	687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=16;PP=482;SC=TAGTGTGGTAAAAGGGGAACA;SOR=1.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=23;WE=73096959;WS=73096941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	73110144	rs1531565	G	T	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=164;ReadPosRankSum=1.674;SC=AGCCCCAGTTGCCCAGGTCCC;SOR=0.746;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=13;WE=73110152;WS=73110134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,13:0.32:40
chr17	73110279	rs1531564	C	T	690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=3.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.76;ReadPosRankSum=0.733;SOR=0.916;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,39:0.32:120
chr17	73124692	rs2291028	C	T	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.858;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=86;ReadPosRankSum=-0.044;SC=AGCCTGGGCCCCTACCTGGGG;SOR=0.037;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=7;WE=73124700;WS=73124682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr17	73126746	rs10715821	GT	G	7365.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.06;NF=31;NR=73;PP=2974;SC=GCCTAGGACAGTGAAAGACAG;SOR=0.819;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=108;TCF=33;TCR=75;TR=104;WE=73126754;WS=73126736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr17	73127024	rs9910084	C	G	3682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=59;NR=58;PP=2105;SC=GGGATAGGGACTTGGCTCTAA;SOR=0.889;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=59;TCR=58;TR=117;WE=73127032;WS=73127014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr17	73127217	rs3736075	G	C	1148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=1.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.64;ReadPosRankSum=-0.590;SOR=0.903;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,58:0.54:108
chr17	73127683	rs4788867	T	C	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.09;ReadPosRankSum=-0.815;SOR=1.219;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr17	73138711	rs372163854	AGGAGGGGAG	A	228.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.13;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	73138751	rs111454348	G	A	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.71;ReadPosRankSum=0.119;SOR=4.743;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,15:0.83:18
chr17	73138980	.	TAC	T	102	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=102;QD=37.0;SC=TATATGAAAATACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=3;WE=73138989;WS=73138970;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:12,3:0.20:15
chr17	73143574	rs1382508	T	A	326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=1;PP=229;SC=TTCCAGTGGGTGAACTGAAAC;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=73143582;WS=73143564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	73177444	rs1471453	C	A	576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=14;PP=374;SC=AATGTGAAAGCGGAAAAATCC;SOR=2.531;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=18;WE=73177452;WS=73177434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	73208182	rs12946479	C	T	1509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=25;NR=48;PP=1403;SC=CGCGTGCGCGCGTGTGTGTGT;SOR=1.848;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=76;TCF=25;TCR=51;TR=73;WE=73208190;WS=73208172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr17	73208205	rs56406015	G	GTT,GTGTT	1935.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=61.34;QD=42.08;SOR=2.247;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,14,32:0.30,0.70:46
chr17	73211642	rs9909306	A	G	497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=360;SC=TAAAATCACAACCACTAAAAC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=73211650;WS=73211632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	73221439	rs2291029	C	T	4169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=63;PP=2371;SC=TCCCTTAGCCCGGGAACACCC;SOR=0.848;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=129;TCF=66;TCR=63;TR=129;WE=73221447;WS=73221429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr17	73222847	rs1551967	C	T	6264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=54;PP=2403;SC=CAGGGATGTTCATTTAAAATA;SOR=0.978;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=132;TCF=78;TCR=54;TR=132;WE=73222855;WS=73222837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr17	73222865	rs1478785	G	A	6911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=62;PP=2826;SC=ATAACATCGCGGGAAACTACT;SOR=0.884;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=149;TCF=87;TCR=62;TR=149;WE=73222873;WS=73222855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr17	73228101	rs899318	T	C	1386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=38;PP=914;SC=CCCAGCCTACTGTCTGTGGGA;SOR=1.938;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=15;TCR=38;TR=53;WE=73228109;WS=73228091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	73230856	rs9988	C	T	5783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=94;PP=2965;SC=TGCTGACAGACGCCTTGCCCC;SOR=0.739;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=193;TCF=99;TCR=94;TR=193;WE=73230864;WS=73230846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr17	73231570	.	A	G	294.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.53;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=183;SC=GGAAGCTACTATGAATGTTAA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=73231578;WS=73231560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	73231817	rs3841603	AT	A	2462.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=48;PP=1379;SC=ATGTATATAGATTTTTTTAAA;SOR=1.455;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=60;TCF=2;TCR=58;TR=50;WE=73231825;WS=73231807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr17	73236605	rs11077781	C	A	244.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=1;NR=6;PP=126;SC=GTGAAGGCGCCGGGAGAAGCT;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=73236613;WS=73236595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	73240559	rs2306216	A	G	798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=23;NR=2;PP=520;SC=CGTTACCTCCAGGGCCTAGCT;SOR=3.334;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=25;WE=73240567;WS=73240549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr17	73240836	rs4789156	T	C	1924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=48;PP=1275;SC=AGTGAGGGCGTGCTCGGGGCT;SOR=2.049;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=19;TCR=48;TR=67;WE=73240844;WS=73240826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr17	73242895	rs2242230	A	G	6221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=88;NR=109;PP=2965;SC=CACAACAAAGAAGAGGACAAG;SOR=1.008;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=197;TCF=88;TCR=109;TR=197;WE=73242903;WS=73242885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr17	73242935	rs2242231	A	G	3918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=83;PP=2475;SC=GATGCAATGGAAGGTTTTCTT;SOR=1.593;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=128;TCF=45;TCR=83;TR=128;WE=73242943;WS=73242925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr17	73257830	rs2279161	C	T	2755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=38;PP=1748;SC=TTTTGGCGCTCCCCTTTGGAC;SOR=1.029;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=96;TCF=58;TCR=38;TR=96;WE=73257838;WS=73257820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr17	73257986	rs8075276	C	T	3395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=54;PP=2123;SC=GCCAAGATGGCTGCCCCCGCA;SOR=0.848;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=56;TCR=54;TR=110;WE=73257994;WS=73257976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr17	73258085	rs36039201	GGC	G	1802.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=34;PP=624;ReadPosRankSum=1.122;SC=GGCGAGCAGCGGCGGGGGGGC;SOR=1.366;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=37;WE=73258094;WS=73258075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,63:0.97:65
chr17	73258479	rs6501772	C	T	6577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=117;NR=97;PP=2965;SC=CGCGCCGCTCCCCCTCGTCGG;SOR=0.734;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=214;TCF=117;TCR=97;TR=214;WE=73258487;WS=73258469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr17	73259083	rs2279162	C	T	441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=397;SC=TGCATGTGTACGGGCTTTAAT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=73259091;WS=73259073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	73268801	rs3744231	C	T	1429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=23;NR=24;PP=755;SC=CCTGCACGGGCGCTGGGATCT;SOR=1.022;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=47;TCF=23;TCR=24;TR=47;WE=73268809;WS=73268791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr17	73269530	rs1809352	A	G	1698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=20;PP=875;SC=TCCTTCCTGCACTCAGCGCTG;SOR=1.146;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=38;TCR=20;TR=58;WE=73269538;WS=73269520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr17	73269676	rs4789164	C	T	757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=20;PP=540;SC=CTTCCTTTTGCAGCACCTGCT;SOR=1.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=9;TCR=20;TR=29;WE=73269684;WS=73269666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	73279544	rs140613554	T	C	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.377;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=203;ReadPosRankSum=1.746;SC=GCGCAGAACATCCACGGGGTG;SOR=1.048;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=16;WE=73279552;WS=73279534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr17	73279624	rs7213318	A	G	2890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=67;NR=33;PP=1529;SC=CCCGGGCGTCATACACGCTGC;SOR=1.138;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=67;TCR=33;TR=100;WE=73279632;WS=73279614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr17	73279700	rs4788882	C	T	3001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=56;NR=46;PP=1570;SC=AAGAAGTCACCGACAGCCCAA;SOR=0.711;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=56;TCR=46;TR=102;WE=73279708;WS=73279690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr17	73282299	rs2306218	C	T	387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=0;PP=292;SC=CTGCCCTGCGCGGCATTCCTG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=73282307;WS=73282289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	73282346	rs112001129	C	T	745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=7;PP=544;ReadPosRankSum=-0.684;SC=CACTGAGCAACGTGACCCCAG;SOR=0.864;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=28;TCR=9;TR=29;WE=73282354;WS=73282336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,31:0.77:40
chr17	73282636	rs2306219	C	T	6432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=123;NR=94;PP=2965;SC=GGATAGAATTCCAAGTTTTAG;SOR=1.025;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=217;TCF=123;TCR=94;TR=217;WE=73282644;WS=73282626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr17	73316679	rs8079197	G	C	871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=21;PP=602;SC=TTCCTGGTCTGTGACTGGCCA;SOR=1.839;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=29;WE=73316687;WS=73316669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr17	73317644	rs12946365	C	T	412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=1;PP=229;SC=GAAGGGCGCCCGCATGTTGAG;SOR=2.985;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=73317652;WS=73317634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	73328773	rs1529844	T	C	2835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=55;NR=37;PP=1615;SC=TAATGGAGCTTAACTTACGGA;SOR=0.853;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=55;TCR=37;TR=92;WE=73328781;WS=73328763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr17	73389446	rs4788890	A	G	358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=14;NR=0;PP=306;SC=ACCACACATCACACCAACTCA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=73389454;WS=73389436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	73402246	rs7220246	C	A	1821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=39;NR=31;PP=1157;SC=CCGGATTCTCCAATATAGGCC;SOR=0.963;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=39;TCR=31;TR=70;WE=73402254;WS=73402236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr17	73482110	rs11331365	TC	T	636.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=429;SC=CCCCAACCTCTCCAGCTGTGC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=73482118;WS=73482100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	73482664	rs9899149	T	C	611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=16;PP=475;SC=CCACTCTCTTTTGAGCAGGGC;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=73482672;WS=73482654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	73484753	rs11652993	C	G	2270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=23;PP=1266;SC=CTAACCCCAGCGAATGTCTGT;SOR=1.151;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=40;TCR=23;TR=63;WE=73484761;WS=73484743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr17	73484800	.	A	AGTG	2784.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=0.000;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.40;ReadPosRankSum=0.443;SOR=0.641;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,70:0.59:119
chr17	73484801	.	G	GT	2395	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;FR=0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=17;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=12;NR=15;PP=2395;QD=91.0683614989;SC=GCCTCTGATAGGACCCTCTCG;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=55;TCF=21;TCR=34;TR=27;WE=73484812;WS=73484791;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:28,27:0.49:55
chr17	73484802	.	GAC	G	2784.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=0.000;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=0.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.01;ReadPosRankSum=0.656;SOR=0.581;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,70:0.58:121
chr17	73484803	.	AC	GG	2405	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;FR=0.5000;HP=3;HapScore=4;MGOF=17;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=25;NR=15;PP=2405;QD=61.4616968716;SC=CTCTGATAGGACCCTCTCGTT;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=89;TCF=53;TCR=36;TR=40;WE=73484812;WS=73484791;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:49,40:0.45:89
chr17	73485033	rs11867527	T	C	1440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=31;PP=750;SC=TGGTGTCTTCTGTGAAGAGGG;SOR=1.412;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=17;TCR=31;TR=48;WE=73485041;WS=73485023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr17	73485781	rs8079362	C	T	5790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=103;NR=86;PP=2965;SC=TGCTTCCCTCCGACCCGCAGG;SOR=0.789;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=190;TCF=103;TCR=87;TR=189;WE=73485789;WS=73485771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr17	73488794	rs4078259	C	T	5298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=90;PP=2965;SC=TGTGCAACATCGCCCTGCAAG;SOR=0.836;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=176;TCF=86;TCR=90;TR=176;WE=73488802;WS=73488784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr17	73489220	rs7215753	T	C	3559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=72;PP=2223;SC=CCAGGCGAGATCTTCCAGAGC;SOR=1.323;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=120;TCF=48;TCR=72;TR=120;WE=73489228;WS=73489210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr17	73489567	rs4078474	C	G	7319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=128;NR=114;PP=2965;SC=AACTCTCTCCCCCAGGCACAG;SOR=0.855;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=242;TCF=128;TCR=114;TR=242;WE=73489575;WS=73489557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,277:1.00:277
chr17	73490611	rs8078131	A	G	433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=13;NR=4;PP=326;SC=CCTGGGGCCCATATGCTCATT;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=17;WE=73490619;WS=73490601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	73491894	rs11077792	G	A	446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=3;PP=327;SC=CAGAAGTGCCGATGTTCACAT;SOR=2.049;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=73491902;WS=73491884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	73493874	rs12949173	G	C	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=1.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.87;ReadPosRankSum=0.356;SOR=0.979;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,29:0.28:105
chr17	73494963	rs9894026	G	A	414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=4;PP=331;SC=AAGCAGTGTCGGGTTCACACG;SOR=1.765;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=14;WE=73494971;WS=73494953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	73497415	rs8081353	T	C	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.43;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	73497415	.	TTT	CTC	670	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=6;NR=8;PP=670;QD=51.6762767759;SC=ATCTAGGTGATTTCAACACCT;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=16;TCF=7;TCR=9;TR=14;WE=73497425;WS=73497405;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,14:0.88:16
chr17	73497417	rs8081354	T	C	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.43;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	73497439	rs8075850	G	A	659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=6;PP=495;SC=CTCTTATCCCGTTAGTGCCTG;SOR=1.931;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=21;WE=73497447;WS=73497429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	73497794	rs9892311	T	C	4626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=70;PP=2768;SC=AAAGGTTGGCTTGGGACTTGG;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=151;TCF=81;TCR=70;TR=151;WE=73497802;WS=73497784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr17	73498483	rs7503373	T	C	1068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=12;PP=841;SC=CCCTGGGCTCTCATCTAGTGG;SOR=1.547;Source=Platypus;TCF=24;TR=36;WE=73498491;WS=73498473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr17	73498623	rs7502835	A	G	4407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=75;NR=62;PP=2347;SC=TTGGGGTCACACTAGGACTGG;SOR=0.779;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=137;TCF=75;TCR=62;TR=137;WE=73498631;WS=73498613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr17	73499697	rs7207376	T	C	2720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=29;PP=1458;SC=CAGCTGAGGGTGACAGCACGT;SOR=1.103;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=55;TCR=29;TR=84;WE=73499705;WS=73499687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr17	73501752	rs8069700	G	A	1258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=29;PP=999;SC=CGGGGTGGGGGACAGGTGTCA;SOR=1.900;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=13;TCR=29;TR=42;WE=73501760;WS=73501742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr17	73502118	rs28558885	G	A	2135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=42;PP=1252;SC=CGATTTTACAGATGAGGACAT;SOR=1.580;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=25;TCR=42;TR=67;WE=73502126;WS=73502108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr17	73504416	rs6501815	T	C	2644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=48;PP=1540;SC=CTGCCCTCACTCAGCATCCCT;SOR=1.420;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=32;TCR=48;TR=80;WE=73504424;WS=73504406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr17	73510012	rs4789206	A	T	652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=20;PP=535;SC=GGAGCAAGTCAGGTGTCCCAG;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=73510020;WS=73510002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	73512653	rs7216673	G	T	117.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.58;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	73513185	rs7218675	C	A	3958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=72;PP=2384;SC=CGGGGACCGCCCTCCCTGCCC;SOR=0.775;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=72;TCR=72;TR=144;WE=73513193;WS=73513175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr17	73518203	rs9911502	G	C	4328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=62;NR=65;PP=2306;SC=GCAAGGAGAAGCTCTCCAGGC;SOR=0.924;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=127;TCF=62;TCR=65;TR=127;WE=73518211;WS=73518193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr17	73518284	rs6501820	G	C	2723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=43;PP=1554;SC=AGGTGCAGCGGTGCTCCAGCT;SOR=1.037;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=39;TCR=43;TR=82;WE=73518292;WS=73518274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr17	73519413	rs8064529	C	T	2018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=45;PP=1323;SC=GATGGAGGTGCCCGGTAAGTT;SOR=1.819;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=20;TCR=45;TR=65;WE=73519421;WS=73519403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr17	73539631	rs6501822	A	G	3451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=68;PP=2174;SC=TCGGCCAAGCAGCTCAGGCTG;SOR=1.027;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=122;TCF=54;TCR=68;TR=122;WE=73539639;WS=73539621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr17	73552062	rs2305528	G	C	658.31	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=2.879;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=483;ReadPosRankSum=-0.253;SC=TGCTGCAGCTGCAGCAGCCAT;SOR=1.942;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=25;WE=73552070;WS=73552052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,26:0.90:29
chr17	73552185	rs1671036	G	A	2213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.426;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=42;PP=1274;ReadPosRankSum=0.761;SC=CCGTCCCTGCGCATCCTGGCC;SOR=0.492;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=132;TCF=72;TCR=60;TR=88;WE=73552193;WS=73552175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,99:0.68:145
chr17	73554523	rs1671033	C	G	1235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=9;PP=656;SC=ACTGGGGCTGCGTGGCCCCAG;SOR=1.455;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=34;WE=73554531;WS=73554513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr17	73559342	rs936060	G	A	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=0.677;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.47;ReadPosRankSum=-1.118;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:128,38:0.23:166
chr17	73559563	rs1671028	G	A	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=114;ReadPosRankSum=-2.824;SC=TTCACCCGCCGGGCAGGGCCC;SOR=0.551;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=19;TCR=33;TR=13;WE=73559571;WS=73559553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,18:0.30:60
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chr17	73565171	rs1671021	T	C	1269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FS=1.015;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.57;ReadPosRankSum=-0.501;SOR=0.770;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:199,79:0.28:278
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chr17	73565288	rs142158542	C	G	2471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=48;PP=1446;ReadPosRankSum=0.653;SC=CACAGGGCCCCTCCCCTTCTC;SOR=0.645;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=66;TCR=67;TR=96;WE=73565296;WS=73565278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,109:0.73:150
chr17	73566561	rs2305525	G	A	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.670;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=19;PP=359;ReadPosRankSum=0.145;SC=AGCGGCACCCGGCTGGCCCCC;SOR=0.503;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=109;TCF=42;TCR=67;TR=33;WE=73566574;WS=73566551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,36:0.31:115
chr17	73567846	rs1661715	C	T	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=8;PP=231;ReadPosRankSum=0.353;SC=AATGGATGAGCCTGTGCGGGC;SOR=0.680;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=49;TCR=27;TR=22;WE=73567854;WS=73567836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,25:0.27:91
chr17	73568055	rs1661714	C	T	1494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.867;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=36;PP=962;ReadPosRankSum=1.394;SC=TACCCCTTCCCGAGCCCCTCG;SOR=0.812;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=244;TCF=132;TCR=112;TR=80;WE=73568063;WS=73568045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,86:0.32:269
chr17	73568984	rs1671020	G	A	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=201;ReadPosRankSum=-1.220;SC=GAGAGCCAAGGGTTTGTCAGG;SOR=0.915;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=15;WE=73568992;WS=73568974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,16:0.41:39
chr17	73569010	rs1661713	T	C	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.203;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=357;ReadPosRankSum=0.862;SC=GGGAGGCATGTGGGGAGGGGA;SOR=1.042;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=66;TCF=49;TCR=17;TR=26;WE=73569018;WS=73569000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,27:0.38:72
chr17	73569776	rs10648915	C	CCT	316.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.474;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=301;ReadPosRankSum=-0.471;SC=TCTGAGATACCGAGGCTCCCA;SOR=0.818;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=7;WE=73569784;WS=73569766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr17	73569927	rs1671019	G	T	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.167;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=338;ReadPosRankSum=0.182;SC=CAGGCTCTCCGGCTCAGGACA;SOR=0.471;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=63;TCF=49;TCR=14;TR=23;WE=73569935;WS=73569917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,24:0.36:67
chr17	73570718	rs1126939	C	G	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=8;PP=220;ReadPosRankSum=0.006;SC=CACATCGAGCCGCCGTGGGGT;SOR=0.760;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=69;TCF=38;TCR=31;TR=22;WE=73570726;WS=73570708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,29:0.36:81
chr17	73570756	rs1661712	G	T	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.979;HP=4;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=10;PP=263;ReadPosRankSum=-2.291;SC=GGAGGTGGGGGCTCTGGGCTT;SOR=0.533;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=32;TCR=23;TR=23;WE=73570764;WS=73570746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,26:0.42:62
chr17	73570774	rs1671016	G	A	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.754;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=9;PP=213;ReadPosRankSum=1.399;SC=CTTGAGTGCAGCTGCCAACCG;SOR=0.301;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=55;TCF=33;TCR=22;TR=19;WE=73570782;WS=73570764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,22:0.35:63
chr17	73570842	rs35199943	T	C	599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.823;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=11;PP=374;ReadPosRankSum=0.193;SC=CCCACGGGGCTGACACGTGCC;SOR=0.591;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=92;TCF=63;TCR=29;TR=31;WE=73570850;WS=73570832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,32:0.32:100
chr17	73571030	rs1042861	A	G	1242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.161;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=34;PP=790;ReadPosRankSum=-2.560;SC=CCCTGCCCCAACCGGAGAGGC;SOR=0.601;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=188;TCF=82;TCR=106;TR=63;WE=73571038;WS=73571020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,68:0.34:202
chr17	73587640	rs707709	T	C	4300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=61;PP=2310;SC=GGTGGTCCTATGTGCCCCTCC;SOR=1.049;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=147;TCF=86;TCR=61;TR=147;WE=73587648;WS=73587630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr17	73587910	rs12449676	C	T	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.267;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=343;ReadPosRankSum=-0.164;SC=GAGGGGTGGTCTCCAGGCCTC;SOR=1.371;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=25;TCF=10;TCR=15;TR=17;WE=73587918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,22:0.67:33
chr17	73588067	rs736523	A	G	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.704;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=16;PP=353;ReadPosRankSum=-1.222;SC=GGTGGAGGATATGCTGCCTAT;SOR=0.409;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=101;TCF=60;TCR=41;TR=34;WE=73588075;WS=73588057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,38:0.34:113
chr17	73590436	rs820254	A	G	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-2.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.684;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=51;ReadPosRankSum=-0.130;SC=AGATCTCCTCATGTGACATAT;SOR=0.090;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=7;WE=73590444;WS=73590426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr17	73590522	rs820255	G	A	939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-2.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=16;PP=442;ReadPosRankSum=0.917;SC=CATTCCTGAAGCAGAGATCTC;SOR=0.650;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=62;TCF=36;TCR=26;TR=37;WE=73590530;WS=73590512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,46:0.56:82
chr17	73590817	rs2305524	C	T	1863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.490;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=29;PP=1009;ReadPosRankSum=1.051;SC=GATCCCTGCCCGTGGAAAGTG;SOR=0.815;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=107;TCF=64;TCR=43;TR=72;WE=73590838;WS=73590807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,80:0.64:125
chr17	73590830	rs820256	T	G	3549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=71;NR=51;PP=2109;SC=GGAAAGTGCCTTTGATGCCAG;SOR=0.751;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=123;TCF=72;TCR=51;TR=122;WE=73590838;WS=73590807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr17	73590888	rs76361517	T	G	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FS=2.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.55;ReadPosRankSum=1.293;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:109,41:0.27:150
chr17	73592352	rs7359522	G	A	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=3;PP=39;ReadPosRankSum=-0.761;SC=GCAGCTAGAGGGACCTGTGGC;SOR=0.382;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=7;WE=73592360;WS=73592342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr17	73592568	rs145254299	CTG	C	1110.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.686;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=755;ReadPosRankSum=-1.074;SC=CCTGGAGCAACTGTGCAACAA;SOR=0.864;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=76;TCF=18;TCR=58;TR=21;WE=73592577;WS=73592558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,34:0.27:127
chr17	73592733	rs75861410	C	G	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=211;ReadPosRankSum=-0.728;SC=GAGAGCTCTGCCTGGAAGGCC;SOR=0.577;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=14;TCR=20;TR=14;WE=73592741;WS=73592723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,15:0.39:38
chr17	73597544	rs11871553	A	G	1646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=31;PP=1012;ReadPosRankSum=-1.551;SC=TTCCTCCAGAAGAGCCACTAT;SOR=0.684;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=123;TCF=69;TCR=54;TR=69;WE=73597552;WS=73597534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,78:0.54:144
chr17	73598904	rs62089251	C	G	124.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=4;NR=0;PP=65;SC=GCCCTTCACCCCCACAGCTGG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=73598912;WS=73598894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	73601517	.	T	TA	43	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5009;HP=16;HapScore=2;MGOF=15;MMLQ=15;MQ=54.7;NF=2;NR=2;PP=43;QD=11.5;SC=GACTCCGTCTTAAAAAAAAAA;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=16;TCF=10;TCR=6;TR=4;WE=73601525;WS=73601507;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:12,4:0.25:16
chr17	73601755	rs936054	G	A	1235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=26;PP=775;SC=GAAAGGAGAGGTGCATTCTGG;SOR=1.414;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=15;TCR=26;TR=41;WE=73601763;WS=73601745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr17	73602081	rs8068464	G	A	1480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=24;NR=25;PP=708;SC=ATGCAGGCTCGCATGCGTGGG;SOR=0.960;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=49;TCF=24;TCR=25;TR=49;WE=73602089;WS=73602071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr17	73606310	rs11657863	G	A	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.766;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=17;PP=286;ReadPosRankSum=1.041;SC=TGGTGGCCCAGCCCCTGCTCC;SOR=0.826;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=92;TCF=43;TCR=49;TR=31;WE=73606318;WS=73606300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,38:0.37:104
chr17	73608203	rs820140	T	C	1421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=32;PP=981;SC=TTGCCCTCCTTCCTCCCCAGC;SOR=1.656;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=49;TCF=16;TCR=33;TR=48;WE=73608211;WS=73608193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr17	73608744	.	CA	C	95	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;FR=1.0000;HP=14;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=17;MQ=59.68;NF=6;NR=3;PP=95;QD=11.0;SC=GACTCTGCCTCAAAAAAAAAA;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=9;WE=73608752;WS=73608734;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:7,9:0.56:16
chr17	73609112	rs820142	G	A	3385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=59;PP=2262;SC=GATCATGGGCGCATACCTGGT;SOR=0.888;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=113;TCF=54;TCR=59;TR=113;WE=73609120;WS=73609102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr17	73611724	rs35131709	G	GTC	3530.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=22;PP=1821;SC=TGGAGGAGAGGTCTGTGGCTC;SOR=1.058;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=40;TCF=17;TCR=23;TR=37;WE=73611732;WS=73611714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr17	73611823	rs820144	T	C	2377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=36;PP=1343;SC=GAGCAGCAGATGCAGCAGCGG;SOR=0.807;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=86;TCF=50;TCR=36;TR=86;WE=73611831;WS=73611813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr17	73612642	rs11439064	A	AT	9878.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=87;PP=2974;SC=TGAAGAAGCCATGAAGCAAGG;SOR=0.779;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=121;TCF=28;TCR=93;TR=115;WE=73612650;WS=73612632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr17	73613975	rs820145	G	A	2479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=38;PP=1270;SC=ACACCGGCACGCCCTGGAAGT;SOR=0.802;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=45;TCR=38;TR=83;WE=73613983;WS=73613965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr17	73614357	rs1093992	G	A	2898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=54;PP=1595;SC=TTAACACCACGTAGGGCATGT;SOR=1.287;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=41;TCR=54;TR=95;WE=73614365;WS=73614347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr17	73615644	rs820147	C	T	636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=9;PP=477;SC=GCAGGAGAGCCGGGGAGCAGA;SOR=0.784;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=10;TCR=9;TR=19;WE=73615652;WS=73615634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	73615887	rs820148	A	G	5544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=89;PP=2965;SC=CAGGTGCGCTAGCCCACGACC;SOR=0.773;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=180;TCF=91;TCR=89;TR=180;WE=73615895;WS=73615877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr17	73615933	rs820149	T	C	3901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=69;PP=2388;SC=CAAGGTGACCTCAGTTCATGC;SOR=1.048;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=59;TCR=69;TR=128;WE=73615941;WS=73615923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr17	73615962	rs820150	T	C	4072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=49;PP=1638;SC=TGCGCAGCTTTGCGGAGGTGC;SOR=0.876;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=46;TCR=49;TR=95;WE=73615970;WS=73615952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr17	73615983	rs820151	G	A	3660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=39;PP=1584;SC=TGGGTGTGGAGTGCCGGGGCG;SOR=0.791;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=38;TCR=39;TR=77;WE=73615991;WS=73615973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr17	73616088	rs820152	T	C	3226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=59;NR=53;PP=1659;SC=TATTCCTGAATGAGCTTAAGA;SOR=0.862;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=59;TCR=53;TR=112;WE=73616096;WS=73616078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr17	73616211	rs3840857	TG	T	1224.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=19;PP=848;SC=GCCAAATCCCTGGAAGTCTGG;SOR=1.244;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=22;WE=73616219;WS=73616201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr17	73616239	rs820153	C	G	861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=12;PP=584;SC=GGTGGAGGGGCAGGCCAGCAG;SOR=0.826;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=16;TCR=12;TR=28;WE=73616247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	73616446	rs820154	A	T	2231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=36;PP=1232;ReadPosRankSum=-0.128;SC=AGGTATCGCCAGAGGCCGGCA;SOR=0.897;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=38;TCR=37;TR=73;WE=73616454;WS=73616436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,84:0.98:86
chr17	73616853	rs10808	G	C	3792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=57;PP=2451;SC=CCCTCTGCCCGCTCCTGATGG;SOR=0.708;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=119;TCF=62;TCR=57;TR=119;WE=73616872;WS=73616843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr17	73616864	rs11470	C	A	3525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=52;PP=2204;SC=CTCCTGATGGCTCGCCTTGTC;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=58;TCR=52;TR=110;WE=73616872;WS=73616843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr17	73616920	rs10814	A	G	4134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=63;PP=2585;SC=GCTGGGCTGGATGCTGCTCTT;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=71;TCR=63;TR=133;WE=73616928;WS=73616910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr17	73617104	rs820182	A	C	3573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=47;PP=2370;SC=GTTTCTTGTGATCCCAGCGCC;SOR=0.950;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=106;TCF=59;TCR=47;TR=105;WE=73617112;WS=73617094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr17	73617377	rs820183	A	G	1650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=32;PP=1197;SC=GCTGGGATGAAGGCAGGAGGG;SOR=1.371;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=53;TCF=20;TCR=33;TR=52;WE=73617385;WS=73617367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr17	73617403	rs820184	T	C	1096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=17;NR=24;PP=754;SC=CAAGCTGGGCTGTCTCCCTCT;SOR=1.075;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=17;TCR=24;TR=41;WE=73617411;WS=73617393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr17	73618371	rs75625838	T	C	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.056;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=158;ReadPosRankSum=0.660;SC=GAGTGAGAGGTCACTGGAGAG;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=8;WE=73618379;WS=73618361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr17	73619920	rs820186	G	A	4135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=71;NR=58;PP=2214;SC=AGCAGGTCACGGGACACCCCC;SOR=0.732;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=129;TCF=71;TCR=58;TR=129;WE=73619928;WS=73619910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr17	73619952	.	GCTTCT	G	5348.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.95;SOR=0.710;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr17	73619953	.	CT	GG	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=51;NR=39;PP=2947;QD=20;SC=GGACCGGTGGCTTCTGGGGGT;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=95;TCF=53;TCR=42;TR=90;WE=73619965;WS=73619943;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,90:0.95:95
chr17	73619955	.	TCTG	T	2901	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=17;NR=39;PP=2901;QD=20;SC=ACCGGTGGCTTCTGGGGGTGG;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=57;TCF=17;TCR=40;TR=56;WE=73619965;WS=73619943;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,56:0.98:57
chr17	73619958	.	G	GGT	5347.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.56;SOR=0.726;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr17	73620804	rs820187	C	A	1996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=31;PP=1268;SC=GTGGCAGGGCCGGGTGTGTGT;SOR=0.917;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=28;TCR=31;TR=59;WE=73620812;WS=73620794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr17	73621432	rs820188	A	G	1499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=19;PP=1059;SC=GGGGCCTGTGAACATCTGTCC;SOR=0.733;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=25;TCR=19;TR=44;WE=73621440;WS=73621422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr17	73625286	rs820190	G	A	4979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=99;NR=60;PP=2679;SC=TGGCAAGGGAGCTGCCCCCAG;SOR=0.979;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=159;TCF=99;TCR=60;TR=159;WE=73625294;WS=73625276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr17	73625478	rs820191	T	C	4408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=83;NR=69;PP=2303;SC=TGATCCGAGTTGTCTCCATCA;SOR=0.754;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=83;TCR=69;TR=152;WE=73625486;WS=73625468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr17	73625629	rs820192	A	C	1543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=27;PP=1039;SC=CTGGAGCAGTAACTCACATTG;SOR=1.036;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=20;TCR=27;TR=47;WE=73625637;WS=73625619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr17	73626208	rs820193	G	C	424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=0;PP=361;SC=CAGCTTCTGCGTCAGAGTATG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=73626216;WS=73626198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	73626817	rs820194	G	A	4296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=41;PP=1828;SC=CGCGGCTGGGGGAGGGCCCCG;SOR=0.979;Source=Platypus;TCF=54;TR=95;WE=73626837;WS=73626807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr17	73626829	rs820195	C	G	4267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=51;NR=38;PP=1555;SC=AGGGCCCCGGCGGGTGGCTGA;SOR=0.985;Source=Platypus;TCF=52;TR=89;WE=73626837;WS=73626807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr17	73626983	rs9896073	G	C	1385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.636;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=29;PP=885;ReadPosRankSum=-0.482;SC=GTCCCCCACAGCCCGGATGAG;SOR=0.909;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=85;TCF=42;TCR=43;TR=54;WE=73626991;WS=73626973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,58:0.67:87
chr17	73627539	rs820196	T	C	3734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=65;NR=55;PP=1883;SC=CCTGCTGAAGTCCCCGTAGCC;SOR=0.796;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=121;TCF=65;TCR=56;TR=120;WE=73627547;WS=73627529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr17	73627565	rs820197	A	G	3784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.57;SOR=0.748;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr17	73647138	rs1661744	CA	TG	556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=0;PP=654;SC=CCCGACACAACAGCCTTTGCA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=12;WE=73647147;WS=73647135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	73658489	rs820159	T	C	307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=219;SC=GGTCTTAGACTAATCTCCATC;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=10;WE=73658497;WS=73658485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	73661411	rs820157	A	G	777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=23;PP=662;SC=TTCTATGAAAAAGGCAAGGAT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=73661419;WS=73661401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	73663296	rs2165635	CT	AG	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=0;PP=654;SC=AGCGCGAGCGCTGGCATGAGG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=73663305;WS=73663286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	73663313	rs864234	C	A	644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=17;NR=0;PP=438;SC=GAGGGCGGAGCCAGGCGCAGG;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=73663321;WS=73663303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	73663372	rs820156	A	T	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=197;ReadPosRankSum=-0.786;SC=GTCTCCTGGGATCCGAAAGAA;SOR=0.818;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=54;TCF=38;TCR=16;TR=18;WE=73663380;WS=73663362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,19:0.28:67
chr17	73687495	rs820218	G	A	5732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=98;NR=82;PP=2965;SC=AACAACCTCAGCTGAGCCTGG;SOR=0.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=180;TCF=98;TCR=82;TR=180;WE=73687503;WS=73687485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr17	73698557	rs820232	C	T	1808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.12;SOR=0.807;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr17	73702317	rs820230	A	G	776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=8;PP=448;SC=GGGGTGGGCCACTTCGGGGTC;SOR=1.255;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=16;TCR=8;TR=24;WE=73702325;WS=73702307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr17	73702402	rs820229	T	C	2697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=21;PP=1464;SC=GTGATCCTGATTTCTGCTTTA;SOR=1.585;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=80;TCF=58;TCR=22;TR=79;WE=73702410;WS=73702392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr17	73720638	rs820166	C	T	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=118;ReadPosRankSum=-2.800;SC=CAGGGCCCTGCCTCTGGCGGC;SOR=0.504;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=11;WE=73720646;WS=73720628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,12:0.31:39
chr17	73720727	rs3862481	G	A	2852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.594;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=49;PP=1733;ReadPosRankSum=0.912;SC=TGACGGCACCGACCATGGCTG;SOR=0.605;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=165;TCF=97;TCR=68;TR=115;WE=73720735;WS=73720717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,128:0.70:184
chr17	73720900	rs820167	A	G	1334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=28;PP=847;SC=TCCTGGCAGGATCATCCCTTG;SOR=1.659;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=40;WE=73720908;WS=73720890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr17	73723453	rs34275940	GC	G	5030.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=67;PP=2776;SC=AATGGGTGCTGCCCCCCAGTG;SOR=0.731;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=95;TCF=23;TCR=72;TR=87;WE=73723461;WS=73723443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr17	73725298	rs1661674	C	T	886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=1.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.64;ReadPosRankSum=0.342;SOR=0.544;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,22:0.34:65
chr17	73725301	rs34598265	C	T	944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=3.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.31;ReadPosRankSum=-0.103;SOR=0.385;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,25:0.35:71
chr17	73725304	rs1661675	C	G	941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=6.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.63;ReadPosRankSum=0.473;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,28:0.35:81
chr17	73732025	rs820174	C	T	608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.179;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=341;ReadPosRankSum=-0.988;SC=GCTAGCGGCACCCTGGCTCCC;SOR=0.469;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=51;TCF=37;TCR=14;TR=27;WE=73732033;WS=73732015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,29:0.55:53
chr17	73732045	rs820175	T	C	917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.875;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=12;PP=545;ReadPosRankSum=0.120;SC=CACAGCTCTGTTCCCACAGGC;SOR=0.580;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=73;TCF=49;TCR=24;TR=38;WE=73732053;WS=73732035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,44:0.55:80
chr17	73732522	rs820176	T	G	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=13;PP=329;ReadPosRankSum=-0.704;SC=CACAGGGCAGTGTGGGCAGGA;SOR=0.527;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=36;TCF=13;TCR=23;TR=21;WE=73732530;WS=73732512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr17	73732810	rs820177	A	C	1648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.646;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=44;PP=896;ReadPosRankSum=-0.418;SC=GGTTGCTGAGAGCCTAGGCAG;SOR=0.497;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=108;TCF=39;TCR=69;TR=71;WE=73732818;WS=73732800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,77:0.66:116
chr17	73733315	rs820179	G	C	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=2.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5048;FS=3.299;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=231;ReadPosRankSum=-0.060;SC=GAGGCAGATCGCAGAGTAGGG;SOR=2.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=12;WE=73733323;WS=73733305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr17	73735614	rs117608736	G	A	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=1.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.12;ReadPosRankSum=1.418;SOR=0.428;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,14:0.25:57
chr17	73746146	rs820387	T	C	4775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=53;PP=2607;SC=CCCCTGGTGGTGAAGGGGGAT;SOR=1.312;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=160;TCF=107;TCR=53;TR=160;WE=73746154;WS=73746136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr17	73751042	rs3988219	C	CACAT	1908.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=14;PP=1559;SC=CACGTGCACACGCATGCACAC;SOR=0.788;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=31;TCF=16;TCR=15;TR=30;WE=73751050;WS=73751032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr17	73752999	rs2249613	C	G	2315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=33;PP=1582;SC=GGGCCGCAGACGCTGAAGGCA;SOR=0.961;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=44;TCR=33;TR=77;WE=73753007;WS=73752989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr17	73753503	rs871443	T	C	3287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=58;PP=2021;SC=ACAGATGGGCTGACCCTGGGG;SOR=0.814;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=54;TCR=58;TR=112;WE=73753511;WS=73753493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr17	73753661	rs9367	C	T	2490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=53;PP=1532;SC=ACCCCCGCCACGTCCCACTAG;SOR=1.354;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=36;TCR=53;TR=89;WE=73753669;WS=73753651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr17	73759038	rs35008831	TC	T	4535.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=46;PP=2922;SC=GTGGGCACACTCCCACCCAGG;SOR=1.027;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=75;TCF=26;TCR=49;TR=72;WE=73759046;WS=73759028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr17	73759304	rs820386	G	T	812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=12;PP=572;SC=TCCAGGGAGAGTCCCTGCCAC;SOR=0.760;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=28;TCF=15;TCR=13;TR=27;WE=73759312;WS=73759294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr17	73759552	rs7209235	G	A	1073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=22;PP=640;SC=ATGGTAAGAGGGGCTGCCTGG;SOR=1.730;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=12;TCR=22;TR=34;WE=73759560;WS=73759542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr17	73780506	rs11655389	G	A	528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=8;PP=299;SC=GAACCTAGCTGTACTAAGTAT;SOR=0.990;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=12;TCR=8;TR=20;WE=73780514;WS=73780496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	73812909	rs9908146	A	G	2558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=26;PP=1449;SC=CCACCCAGCCAGGTCCTGTCC;SOR=1.274;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=56;TCR=26;TR=82;WE=73812917;WS=73812899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr17	73813181	.	CAGAGCCTGTGCTGATGAGCCTGTAGGACTGG	C	2922	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=5;PP=2922;QD=20;SC=GGGCAGTCCCCAGAGCCTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=5;WE=73813219;WS=73813171;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,5:0.83:6
chr17	73816026	rs11868471	A	G	3866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=57;PP=2094;SC=AGAGCTCTGCACCCGTGAACA;SOR=0.707;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=128;TCF=71;TCR=57;TR=128;WE=73816034;WS=73816016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr17	73913729	rs4788912	C	G	182.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=147;SC=AGTGAGGTCACGGGAGTGCCG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=73913737;WS=73913728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	73913965	rs11288315	TC	T	648.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=8;PP=558;SC=CAGCAGCTGCTCCCCCTTCCC;SOR=1.230;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=17;TCF=9;TCR=8;TR=16;WE=73913973;WS=73913955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	73927400	rs76534600	G	A	853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=13;PP=488;SC=GCCCCTACCTGCATCCCAGGG;SOR=1.112;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=13;TCR=13;TR=26;WE=73927408;WS=73927390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	73949540	rs1135640	G	C	1665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=4;PP=1184;SC=ACCCTGGCTTGATTTCAGACT;SOR=3.300;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=43;TCR=4;TR=47;WE=73949548;WS=73949530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	73951864	rs10852766	T	C	6675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=117;NR=102;PP=2965;SC=CAGAAGAAAGTGCTCAGTTTC;SOR=0.709;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=219;TCF=117;TCR=102;TR=219;WE=73951872;WS=73951854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr17	73953404	rs11077798	T	C	323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=1;PP=192;SC=TCAAGTGATCTGCCCACCTCA;SOR=3.442;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=73953412;WS=73953394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	74006660	rs140024580	C	T	1122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=32;PP=768;ReadPosRankSum=0.726;SC=ACGGGGTGGGCGGTAGAGATA;SOR=0.756;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=86;TCF=32;TCR=54;TR=50;WE=74006668;WS=74006650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,52:0.58:89
chr17	74076127	rs34700740	TC	T	635.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=14;PP=508;SC=GCCCTCCTTTTCCCCCATCTA;SOR=1.508;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=15;WE=74076135;WS=74076117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	74076415	rs2257020	G	A	8692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=152;NR=144;PP=2965;SC=CCTGGCCCTCGCCACGGAGAC;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=297;TCF=153;TCR=144;TR=296;WE=74076423;WS=74076405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,332:1.00:332
chr17	74076642	rs2257028	G	A	6747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=124;NR=100;PP=2965;SC=GAACTCCCAGGTCTGTGTTCA;SOR=0.809;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=224;TCF=124;TCR=100;TR=224;WE=74076650;WS=74076632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
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chr17	74081345	rs2246277	C	T	459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=12;NR=4;PP=244;SC=AGGAAGAGTGCGTGGTGGCAC;SOR=1.493;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=16;WE=74081353;WS=74081335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	74081618	rs2598450	C	T	847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=10;PP=572;SC=TCCCACCTTCCGGGTCCTGGG;SOR=0.906;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=16;TCR=10;TR=26;WE=74081626;WS=74081608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr17	74169682	rs11655525	C	G	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.97;ReadPosRankSum=-0.180;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
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chr17	74324729	rs346791	C	A	907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=3.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.91;ReadPosRankSum=-0.174;SOR=1.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,35:0.73:48
chr17	74326553	rs449114	G	A	1673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=6.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.00;ReadPosRankSum=0.872;SOR=1.705;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,41:0.66:62
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chr17	74349515	rs114276513	G	A	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.47;ReadPosRankSum=-0.619;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr17	74381567	rs346803	G	A	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.99;ReadPosRankSum=0.533;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr17	74387284	rs3803739	C	T	1098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=26;PP=674;ReadPosRankSum=0.790;SC=GAGGCCAGGCCCTGGGCACCG;SOR=0.648;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=142;TCF=74;TCR=68;TR=53;WE=74387292;WS=74387274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,57:0.35:163
chr17	74398510	rs34234366	C	A	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=216;ReadPosRankSum=2.265;SC=CAGAAATAGGCCACGGCAGAT;SOR=0.610;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=10;WE=74398518;WS=74398506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr17	74401405	rs11290311	AG	A	5222.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=75;PP=2974;SC=GTCCTGGGGGAGGGGAGGAGA;SOR=1.294;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=87;TCF=8;TCR=79;TR=82;WE=74401413;WS=74401395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr17	74468552	rs12942767	A	G	5735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=117;NR=86;PP=2965;SC=AAGATAAATGAGGCGGTGGAG;SOR=0.951;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=203;TCF=117;TCR=86;TR=203;WE=74468560;WS=74468542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr17	74471298	rs12951122	G	A	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=315;ReadPosRankSum=1.386;SC=GGGCCACCCTGGCCTGGTCAC;SOR=0.551;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=14;TCR=47;TR=21;WE=74471306;WS=74471288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,22:0.34:65
chr17	74473593	rs3833088	A	AG	286.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.638;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=3;PP=276;ReadPosRankSum=0.292;SC=ATGGGGGCCCAGCAGCTCCAC;SOR=0.250;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=16;TCR=9;TR=8;WE=74473601;WS=74473583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr17	74475024	rs3744045	G	A	2750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=52;NR=45;PP=1594;SC=CGGTGGGTGCGGGGCGTGGGG;SOR=0.732;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=52;TCR=45;TR=97;WE=74475032;WS=74475014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr17	74475975	rs3809694	C	A	1186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=20;PP=589;ReadPosRankSum=2.002;SC=GTGGTGTGTGCAGCCCAGGTC;SOR=0.634;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=40;TCR=33;TR=44;WE=74475983;WS=74475965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,52:0.63:83
chr17	74476045	rs3826287	G	C	1104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.668;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=22;PP=606;ReadPosRankSum=1.416;SC=CTTCAACCCTGATTTATGCCC;SOR=1.122;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=57;TCF=27;TCR=30;TR=40;WE=74476053;WS=74476035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,49:0.73:67
chr17	74476089	rs138608987	ATGTGTGTGTG	A	145.75	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.21;ReadPosRankSum=0.792;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr17	74477340	rs3826288	A	G	696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.496;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=8;PP=482;ReadPosRankSum=0.255;SC=GGCTGCACAGACAGCAGCTGT;SOR=1.140;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=39;TCF=27;TCR=12;TR=28;WE=74477348;WS=74477330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,28:0.72:39
chr17	74477620	rs12943385	C	T	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=57;ReadPosRankSum=-1.052;SC=GGGCAGGAGGCGGGAGGGCTG;SOR=0.693;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=29;TCF=15;TCR=14;TR=9;WE=74477628;WS=74477610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,10:0.31:32
chr17	74477691	rs11870168	C	T	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=56;ReadPosRankSum=0.792;SC=AGGACCCTGACGCCAGGGCAC;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=74477699;WS=74477681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr17	74524651	rs4238995	TT	GG	1159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=16;PP=897;ReadPosRankSum=-0.774;SC=GGGGGTGGAGTTAGGGGTCCT;SOR=0.687;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=45;TCR=46;TR=32;WE=74524660;WS=74524641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,34:0.34:100
chr17	74534650	rs9914222	G	T	2076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.382;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=45;PP=1189;ReadPosRankSum=-1.383;SC=GTCCAGAGAGGCACCGGATAG;SOR=0.879;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=131;TCF=65;TCR=66;TR=85;WE=74534658;WS=74534640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,94:0.65:145
chr17	74536332	.	TC	T	33	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=9;MMLQ=23;MQ=59.19;NF=3;NR=3;PP=33;QD=12.6666666667;SC=TGGCGGTTGGTCGGGGGGGGG;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=6;WE=74536343;WS=74536322;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,6:0.50:12
chr17	74536333	rs77817682	C	G	612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=32.25;ReadPosRankSum=-1.009;SOR=0.317;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,18:0.95:19
chr17	74536335	rs201716822	G	GT	637.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=42.52;ReadPosRankSum=-0.814;SOR=0.346;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,14:0.93:15
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chr17	74540492	rs2278639	C	T	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=3.979;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=30;ReadPosRankSum=1.282;SC=GCTGGGGAGGCGCTCAGGGTG;SOR=2.800;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=3;WE=74540500;WS=74540482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr17	74540917	rs895157	A	C	2636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.492;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=63;PP=1384;ReadPosRankSum=-0.401;SC=AGGAATTGTCAGGCCAAGGTC;SOR=0.918;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=146;TCF=64;TCR=82;TR=109;WE=74540925;WS=74540907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,119:0.75:158
chr17	74541129	rs4232870	A	G	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.95;ReadPosRankSum=-0.193;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr17	74541137	rs4648339	C	T	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.657;HP=3;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=7;PP=464;ReadPosRankSum=-0.369;SC=CCATGTGGGCCGGGTGGGGGG;SOR=0.368;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=25;TCF=10;TCR=15;TR=16;WE=74541145;WS=74541119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,18:0.69:26
chr17	74541171	rs5742903	T	C	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=11;PP=295;ReadPosRankSum=1.657;SC=GGGAGCAGGCTGGCTTTGGTG;SOR=0.474;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=27;TCF=13;TCR=14;TR=23;WE=74541179;WS=74541161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,24:0.73:33
chr17	74554739	rs4648343	C	G	1675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.038;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=14;PP=1050;ReadPosRankSum=2.562;SC=AAATGAGTAGCGTCTTTGCCC;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=78;TCF=57;TCR=21;TR=57;WE=74554747;WS=74554729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,67:0.73:92
chr17	74555106	rs4647885	T	C	1077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.206;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.616;NF=30;NR=12;PP=739;ReadPosRankSum=0.375;SC=AGGATCTTCATGATGAAATTT;SOR=0.433;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=58;TCF=43;TCR=15;TR=42;WE=74555114;WS=74555096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,45:0.70:64
chr17	74557681	rs4510053	A	C	3643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=43;PP=2243;SC=TGTTTGTAAGATTTGTTTACA;SOR=1.277;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=72;TCR=43;TR=115;WE=74557689;WS=74557671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr17	74557803	rs60161580	GT	G	3644.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.916;HP=10;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.208;NF=8;NR=81;PP=1543;ReadPosRankSum=-1.585;SC=TGGCTCCATGGTTTTTTTTTT;SOR=0.396;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=113;TCF=9;TCR=104;TR=89;WE=74557821;WS=74557793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,144:0.97:148
chr17	74559287	rs4451979	T	C	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.638;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.470;NF=0;NR=7;PP=107;ReadPosRankSum=-1.054;SC=ATGCGTTCTTTGGGCTTCATC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=7;WE=74559295;WS=74559277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr17	74563653	rs2241918	A	G	5307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=88;PP=2965;SC=AAAAAGAGACATTTCAGCTCA;SOR=0.774;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=174;TCF=86;TCR=88;TR=174;WE=74563661;WS=74563643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr17	74570408	rs7207173	A	G	4001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=73;NR=44;PP=2232;SC=GCAGGAAGCTAAGGCAGAAGG;SOR=0.926;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=117;TCF=73;TCR=44;TR=117;WE=74570416;WS=74570398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr17	74574826	rs2304921	C	T	2490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.474;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=45;PP=1435;ReadPosRankSum=1.345;SC=ACAGGGTAGTCGACCACTCTA;SOR=0.624;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=163;TCF=86;TCR=77;TR=100;WE=74574834;WS=74574816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,112:0.62:182
chr17	74581914	rs3135934	C	G	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.050;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=15;PP=293;ReadPosRankSum=0.349;SC=GCGAGCGCCCCGTCCGCTGAC;SOR=1.112;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=70;TCF=35;TCR=35;TR=27;WE=74581922;WS=74581904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,31:0.37:83
chr17	74581945	rs12449329	AA	GC	2054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=16;NR=22;PP=1302;SC=GAAGGGAGAGAACCGGGTGGG;SOR=1.251;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=16;TCR=22;TR=38;WE=74581954;WS=74581935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr17	74582025	rs1867561	G	C	106.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=2;PP=57;SC=TGCGGCGCCTGCCCGCCCGGC;SOR=1.022;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=4;WE=74582033;WS=74582015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	74621635	rs2286595	C	T	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.657;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=131;ReadPosRankSum=-0.659;SC=AGGAGAAACACGGCCTGTAGT;SOR=1.179;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=10;WE=74621643;WS=74621625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr17	74639530	rs719430	T	C	1274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.38;ReadPosRankSum=-0.034;SOR=0.563;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,62:0.60:103
chr17	74681435	rs2286593	A	G	108.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=4;PP=82;SC=CTACAACGAGACAGCCAGAGA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=74681443;WS=74681425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	74684401	rs2286587	T	C	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FS=2.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.22;ReadPosRankSum=2.284;SOR=0.871;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:154,48:0.24:202
chr17	74684452	rs2286586	G	A	933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.92;ReadPosRankSum=-0.070;SOR=0.850;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:175,63:0.26:238
chr17	74684598	rs4788942	C	T	3614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=57;PP=2138;SC=CTGCGGCCAGCAGACAAAGGG;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=122;TCF=65;TCR=57;TR=122;WE=74684606;WS=74684588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr17	74684858	rs7219390	T	C	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=141;ReadPosRankSum=0.857;SC=CTTGCAGGAATGTCAGAGGAT;SOR=0.412;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=10;WE=74684866;WS=74684848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr17	74707050	rs71383084	G	C	71.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=52.04;QD=17.76;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	74716759	rs12943725	A	G	367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=11;PP=278;SC=GAGAAACCCAATACGGTGCCC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=74716767;WS=74716749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	74717604	rs2240770	C	T	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.98;ReadPosRankSum=-1.940;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr17	74718155	rs2240769	C	T	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=57;ReadPosRankSum=-0.937;SC=CCTTCTGATCCAGGGATTGCA;SOR=0.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=5;WE=74718163;WS=74718145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr17	74728938	rs4789351	C	T	130.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=100;SC=TTTATACAAACCCAGAAAGAC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=74728946;WS=74728928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
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chr17	74734323	rs237054	G	A	387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=264;SC=CCTGGCTCCTGCATCTGCCTT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=74734331;WS=74734313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	74734598	rs237053	C	T	2544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=52;PP=1620;SC=TGAAAATAAACGTTCATTATA;SOR=1.559;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=31;TCR=52;TR=83;WE=74734606;WS=74734588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr17	74750215	rs11399997	C	CT	10038.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=23;NR=87;PP=2967;SC=TCAGGAACAACTCGGCATTTG;SOR=0.738;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=115;TCF=23;TCR=92;TR=110;WE=74750223;WS=74750205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,270:1.00:270
chr17	74750331	rs116719	C	T	1534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=35;PP=1020;SC=CAACATCTCTCTAACATGGGG;SOR=2.393;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=10;TCR=35;TR=45;WE=74750339;WS=74750321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr17	74857550	rs180900328	T	C	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.5;BaseQRankSum=1.458;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.219;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=59;ReadPosRankSum=-0.444;SC=TGGCTCACTATTCCACAGACT;SOR=1.938;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=5;WE=74857558;WS=74857540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr17	74900266	rs138164770	G	A	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=6.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.96;ReadPosRankSum=0.913;SOR=0.157;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr17	74920957	rs3889146	G	T	2115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=23;PP=1384;SC=CTCTGCACTTGTACAGTTCAT;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=49;TCR=23;TR=72;WE=74920965;WS=74920947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr17	74921257	rs8067585	G	A	576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.430;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=360;ReadPosRankSum=-1.428;SC=CTGCCCCCACGTCCCCACTCA;SOR=1.432;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=33;TCF=10;TCR=23;TR=23;WE=74921265;WS=74921247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,25:0.69:36
chr17	74922636	rs12450749	G	A	782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=5;PP=567;SC=AGGGACACACGGGGAGGTTGC;SOR=2.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=26;WE=74922644;WS=74922626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	74922652	rs11653088	C	T	1185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=7;PP=778;SC=GTTGCTGACCCTGGTTCCTGG;SOR=2.247;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=38;WE=74922660;WS=74922642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr17	74922706	rs33966966	C	T	2168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.428;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=29;PP=1215;ReadPosRankSum=1.795;SC=TCGACACCTTCGGGACGGAAC;SOR=0.555;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=135;TCF=91;TCR=44;TR=84;WE=74922714;WS=74922696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,96:0.65:148
chr17	74928758	rs79286496	C	T	4097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.933;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=76;PP=2185;ReadPosRankSum=-1.878;SC=TCATGGGCTTCGTGTCCGAGG;SOR=0.771;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=261;TCF=138;TCR=123;TR=161;WE=74928766;WS=74928741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,185:0.64:289
chr17	74928921	rs77352627	C	T	487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=4.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.07;ReadPosRankSum=1.877;SOR=2.012;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr17	74928931	rs8078608	C	T	445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.23;ReadPosRankSum=1.050;SOR=2.235;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr17	74929442	rs12600695	A	G	837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.665;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=559;ReadPosRankSum=-1.336;SC=TCCAGCAGCCACTCCAGGGGT;SOR=1.634;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=39;TCF=11;TCR=28;TR=29;WE=74929450;WS=74929432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,32:0.74:43
chr17	74936576	rs8081793	G	A	7465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=124;NR=116;PP=2965;SC=GCTTCAGCCCGCCCCACAGCT;SOR=0.729;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=240;TCF=124;TCR=116;TR=240;WE=74936584;WS=74936566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,285:1.00:285
chr17	74937066	rs9900337	C	G	420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=11;PP=279;SC=CATCCCTCCCCTGGTCAGACA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=74937074;WS=74937056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	74942478	rs8067984	C	T	4348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=84;NR=62;PP=2314;SC=ACCTACCCTACGAGTACACCT;SOR=0.859;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=146;TCF=84;TCR=62;TR=146;WE=74942486;WS=74942468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr17	74944709	rs9894270	T	C	5359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.98;MQRankSum=-0.049;NF=99;NR=79;PP=2560;ReadPosRankSum=1.045;SC=CGGTGCTGTGTGGTCCCTGCC;SOR=0.827;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=180;TCF=100;TCR=80;TR=178;WE=74944717;WS=74944699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,205:0.99:207
chr17	75085230	rs9900566	C	G	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-4.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=324;ReadPosRankSum=-0.452;SC=ACTTTTTCCCCCAAGGTTTCA;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=18;WE=75085238;WS=75085220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,21:0.66:32
chr17	75085322	rs11868249	A	G	833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.05;ReadPosRankSum=-1.506;SOR=0.673;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:151,55:0.27:206
chr17	75187248	.	CT	C	48.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=0.000;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.83;ReadPosRankSum=-0.886;SOR=0.719;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,10:0.17:59
chr17	75190846	rs673918	A	C	3701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=73;NR=58;PP=2205;SC=TTCCATCACGACCTCTTCAGA;SOR=0.707;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=131;TCF=73;TCR=58;TR=131;WE=75190854;WS=75190836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr17	75190962	rs674402	C	T	3191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=50;PP=1820;SC=GCAGCCCCAGCGCACCTGAGC;SOR=0.710;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=109;TCF=59;TCR=50;TR=109;WE=75190970;WS=75190952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
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chr17	75397802	rs139887327	C	CA	116.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.31;ReadPosRankSum=-2.188;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
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chr17	75401190	rs2164449	G	A	1657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.634;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=34;PP=1035;ReadPosRankSum=-0.378;SC=GGTGCTGGATGCACAGGGACG;SOR=0.504;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=101;TCF=53;TCR=48;TR=72;WE=75401198;WS=75401180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,76:0.68:112
chr17	75401310	rs2117924	C	T	730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.410;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=18;PP=483;ReadPosRankSum=0.700;SC=GAGACTGTGCCGGGAGCCAGG;SOR=1.119;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=39;TCF=17;TCR=22;TR=30;WE=75401318;WS=75401300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,31:0.77:40
chr17	75478694	rs416438	T	C	804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=22;PP=418;ReadPosRankSum=1.280;SC=TCCTGATGAGTGGTCGCTGCC;SOR=0.686;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=53;TCF=20;TCR=33;TR=34;WE=75478702;WS=75478684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,40:0.60:67
chr17	75494705	rs2627223	A	G	2491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.67;ReadPosRankSum=0.841;SOR=0.275;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,100:0.99:101
chr17	75494746	rs1059485	A	G	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=395;ReadPosRankSum=-0.462;SC=TGTAGACGCCACCCTGCCCAC;SOR=0.844;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=37;TCF=10;TCR=27;TR=24;WE=75494754;WS=75494736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,23:0.64:36
chr17	75494787	rs5822173	T	TC	194.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=0;NR=10;PP=216;SC=GTCATTTCCGTCCCCCCCCAG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=10;WE=75494795;WS=75494777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	75495065	rs448203	T	C	2464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=48;PP=1163;ReadPosRankSum=-0.099;SC=ATCATCCGTCTGTGTGGGGTT;SOR=0.709;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=145;TCF=79;TCR=66;TR=100;WE=75495073;WS=75495055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,117:0.68:172
chr17	75495397	rs9038	T	C	1543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.546;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=27;PP=978;ReadPosRankSum=0.470;SC=GCAGACTGCTTGGCCAGATGC;SOR=0.525;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=100;TCF=59;TCR=41;TR=61;WE=75495405;WS=75495387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,68:0.60:113
chr17	75834770	rs9910282	A	G	654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.641;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=17;PP=458;ReadPosRankSum=0.417;SC=CTGCTCAAGAAGAAATCTTGG;SOR=0.814;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=103;TCF=55;TCR=48;TR=37;WE=75834778;WS=75834760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,37:0.35:107
chr17	76046676	rs72894058	C	A	1352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.484;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=30;PP=819;ReadPosRankSum=-0.685;SC=GGTGGGTCAACGCGCCACCTG;SOR=0.699;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=185;TCF=94;TCR=91;TR=65;WE=76046684;WS=76046666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,73:0.35:207
chr17	76060866	rs34293811	C	G	919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.289;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=19;PP=504;ReadPosRankSum=-2.318;SC=TGGGGAGAACCATCCTCCCCT;SOR=0.721;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=147;TCF=79;TCR=68;TR=44;WE=76060874;WS=76060856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,54:0.32:169
chr17	76060954	rs61730171	A	C	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.42;ReadPosRankSum=0.342;SOR=0.604;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,25:0.38:66
chr17	76087407	rs60735984	C	CA	143.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.77;MQRankSum=0.791;QD=10.27;ReadPosRankSum=-1.790;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr17	76109491	.	G	A	1247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=0.000;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.008;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=15;PP=828;ReadPosRankSum=0.135;SC=TGGGCGCCGGGGGGGAGATTT;SOR=1.321;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=66;TCF=43;TCR=23;TR=49;WE=76109499;WS=76109481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,52:0.75:69
chr17	76114963	rs2748430	C	G	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=1;PP=93;ReadPosRankSum=-0.630;SC=GGGGAGGGTTCTAGTGTCCCA;SOR=0.223;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=4;WE=76114983;WS=76114953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr17	76114975	rs2748429	G	T	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=93;ReadPosRankSum=-0.534;SC=AGTGTCCCAGGCTCTGCCCAG;SOR=0.512;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=5;WE=76114983;WS=76114953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr17	76115181	rs2252496	A	T	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.964;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=14;PP=279;ReadPosRankSum=-0.874;SC=CCTCCCCGAGATCAGGCTGGT;SOR=0.715;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=80;TCF=42;TCR=38;TR=26;WE=76115189;WS=76115171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,26:0.31:83
chr17	76115353	rs2748428	T	C	1138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.853;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=18;PP=667;ReadPosRankSum=-1.479;SC=GGCCAGACAGTAGGAGGCAAG;SOR=0.915;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=101;TCF=56;TCR=45;TR=48;WE=76115361;WS=76115343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,54:0.48:113
chr17	76116017	rs743047	C	A	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.732;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=85;ReadPosRankSum=-0.648;SC=GCGTGAGCCACCACACCGGGC;SOR=2.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=8;WE=76116025;WS=76116007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,9:0.27:33
chr17	76116153	rs2926778	T	C	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.39;ReadPosRankSum=0.507;SOR=0.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,49:0.36:137
chr17	76117361	rs2073285	T	C	196.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=2;NR=6;PP=101;SC=CTCCAAGATCTGGCCCTCCCC;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=76117369;WS=76117351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	76117971	rs1997978	G	A	1777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=44;PP=1200;SC=CCCTCCAGGCGCAGAGAGGAC;SOR=4.407;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=6;TCR=44;TR=50;WE=76117979;WS=76117961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr17	76119930	rs55677349	T	C	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=116;ReadPosRankSum=-0.695;SC=AAGTGGATAGTTGGATAGGTG;SOR=0.818;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=9;WE=76119938;WS=76119920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,9:0.28:32
chr17	76128386	rs1354985	G	C	1871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=39;NR=28;PP=1258;SC=GACTCTCAGCGCGGCCCCAGC;SOR=1.054;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=67;TCF=39;TCR=28;TR=67;WE=76128394;WS=76128376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr17	76128662	rs1396149	G	C	595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=5;NR=10;PP=338;SC=CCAGGGCCCAGAGCGTGGCGA;SOR=2.093;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=15;WE=76128670;WS=76128652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	76130575	rs7208422	A	T	3723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.129;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=62;PP=2106;ReadPosRankSum=-1.624;SC=AACGTACTCAACGGGCTCCTG;SOR=0.915;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=218;TCF=122;TCR=96;TR=148;WE=76130592;WS=76130565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,167:0.69:241
chr17	76131070	rs12452890	G	A	2987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.562;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=54;PP=1595;ReadPosRankSum=0.263;SC=CCAACACGGAGGTCAACCTCA;SOR=0.768;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=180;TCF=98;TCR=82;TR=122;WE=76131078;WS=76131060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,137:0.69:199
chr17	76134828	rs7221365	C	A	1106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.817;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=24;PP=763;ReadPosRankSum=-0.091;SC=TCAGGGCAGCCGGGGCCATGG;SOR=1.069;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=58;TCF=25;TCR=33;TR=40;WE=76134836;WS=76134818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,42:0.69:61
chr17	76137198	rs369764	T	G	709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=13;PP=384;SC=CTGTAACCCCTACCCCTGCCT;SOR=1.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=8;TCR=13;TR=21;WE=76137206;WS=76137188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	76142402	rs2310998	G	A	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=124;ReadPosRankSum=-0.592;SC=CACCCACCCAGGGAGCATCCC;SOR=0.646;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=12;WE=76142410;WS=76142392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr17	76142811	rs147459634	GT	G	497.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=375;ReadPosRankSum=-0.717;SC=AAGAGCTTTTGTGAGTGATGG;SOR=1.058;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=14;TCF=9;TCR=5;TR=10;WE=76142819;WS=76142801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr17	76143009	rs7217374	G	A	1133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.363;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=25;PP=600;ReadPosRankSum=-0.917;SC=GGCATAGCCTGCTGCAGGGAG;SOR=0.908;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=63;TCF=34;TCR=29;TR=50;WE=76143017;WS=76142999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,53:0.76:70
chr17	76157266	rs4071641	T	C	1711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.524;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=39;PP=832;ReadPosRankSum=0.944;SC=CTACTTCTGCTGGGCGTCCTC;SOR=0.483;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=102;TCF=43;TCR=59;TR=70;WE=76157274;WS=76157256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,82:0.67:123
chr17	76162178	rs3642	G	A	241.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.9997;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=185;ReadPosRankSum=0.692;SC=GGCCATCAGCGTGCACTGTTC;SOR=1.179;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=13;WE=76162186;WS=76162168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,10:0.91:11
chr17	76168219	rs10358	C	T	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=224;ReadPosRankSum=-0.780;SC=TTCAGTCAGCCGCTCACTCCT;SOR=0.307;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=15;WE=76168227;WS=76168209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,15:0.83:18
chr17	76178748	rs1143697	T	C	1590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=34;PP=849;ReadPosRankSum=-0.209;SC=AGGCGGGCAGTGCCTCCATGG;SOR=0.730;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=96;TCF=43;TCR=53;TR=62;WE=76178756;WS=76178738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,71:0.66:107
chr17	76182766	.	AAGGGG	A	745.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.365;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.07;MQRankSum=2.221;QD=25.71;ReadPosRankSum=1.979;SOR=0.437;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,21:0.72:29
chr17	76183043	rs1071664	A	G	3728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.562;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=68;PP=2133;ReadPosRankSum=0.597;SC=TGGGGGAGCCAGGCAGCACAG;SOR=0.642;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=197;TCF=101;TCR=96;TR=143;WE=76183051;WS=76183033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,163:0.74:221
chr17	76187160	rs17640750	C	T	1464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=29;PP=746;ReadPosRankSum=1.564;SC=GTGACCTCTCCGTGGCCGCAT;SOR=0.701;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=76;TCF=35;TCR=41;TR=55;WE=76187168;WS=76187150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,65:0.76:86
chr17	76188753	rs12450989	C	A	4043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-2.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.905;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=77;PP=2356;ReadPosRankSum=0.581;SC=CTAGTGAAGTCTTAAGGTCCA;SOR=0.630;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=267;TCF=145;TCR=122;TR=167;WE=76188761;WS=76188743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,188:0.62:301
chr17	76198754	rs35822441	T	C	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.14;ReadPosRankSum=0.708;SOR=0.642;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,42:0.36:116
chr17	76218857	rs4789559	G	A	630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=13;PP=357;ReadPosRankSum=-0.006;SC=AAAAAATATGGTAGGGAAGGG;SOR=0.735;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=116;TCF=76;TCR=40;TR=36;WE=76218865;WS=76218847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,39:0.31:127
chr17	76219591	rs2071214	G	A	3200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=51;PP=1745;SC=GGAAACTGCGGAGAAAGTGCG;SOR=0.874;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=54;TCR=51;TR=105;WE=76219599;WS=76219581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr17	76219783	rs2239680	T	C	453.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=8;PP=444;ReadPosRankSum=0.274;SC=AACTGTGCTCTTGTTTTGTCT;SOR=0.784;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=9;TCR=9;TR=16;WE=76219792;WS=76219773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,21:0.91:23
chr17	76219784	.	T	TAA	101	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=1;NR=1;PP=101;QD=63.5;SC=ACTGTGCTCTTGTTTTGTCTT;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=2;WE=76219792;WS=76219773;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:9,2:0.18:11
chr17	76228048	rs186093980	C	T	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.98;ReadPosRankSum=0.105;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr17	76228088	rs8068943	T	A	572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=1;PP=303;SC=ACCCGTCCCCTCCCGCCGGCC;SOR=2.636;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=76228096;WS=76228078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	76230025	rs9894186	G	A	628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.81;ReadPosRankSum=-1.002;SOR=0.732;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:123,42:0.25:165
chr17	76230729	rs11077350	T	C	3516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=60;PP=1968;SC=TTCTCGTGTGTGGCTGGATCT;SOR=0.756;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=121;TCF=61;TCR=60;TR=121;WE=76230737;WS=76230719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr17	76235015	rs880190	G	A	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=353;ReadPosRankSum=-0.701;SC=TAGCGGGGCCGGGGATGCTGA;SOR=0.818;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=19;WE=76235023;WS=76235005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,20:0.71:28
chr17	76394042	rs16971107	G	A	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=256;ReadPosRankSum=0.464;SC=ACCTGGTGTCGTAGCGTTTCC;SOR=0.990;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=13;WE=76394050;WS=76394032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr17	76394449	rs2292644	C	T	1522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.168;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=37;PP=950;ReadPosRankSum=-0.448;SC=GGCATGCAAGCCTGGCCCCTC;SOR=0.448;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=74;TCF=25;TCR=49;TR=58;WE=76394457;WS=76394439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,63:0.80:79
chr17	76395421	rs2292643	G	A	878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=2.586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=31.38;ReadPosRankSum=-0.751;SOR=0.302;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,21:0.75:28
chr17	76395430	rs2292642	C	T	980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=2.572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.24;ReadPosRankSum=-0.396;SOR=0.207;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,27:0.75:36
chr17	76395634	rs2292641	C	T	1429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=1.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.516;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=42;PP=883;ReadPosRankSum=0.949;SC=TGCTTCCCACCGTCAGTGCTT;SOR=0.758;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=206;TCF=87;TCR=119;TR=71;WE=76395642;WS=76395624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,79:0.34:233
chr17	76395750	rs12450500	C	T	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=21.91;ReadPosRankSum=0.756;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
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chr17	76421709	rs8069521	C	A	676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=17;PP=490;SC=TGGGAACGACCGGGCCTTGGC;SOR=2.400;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=22;WE=76421717;WS=76421699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	76422903	rs72914887	A	G	374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=1;PP=237;SC=GAGCAGTACCATGCTGATCCG;SOR=2.985;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=76422911;WS=76422893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	76422933	rs72914891	G	C	701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=3;PP=468;SC=CTAGGCCTGGGTTGCCAGAGG;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=76422941;WS=76422923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	76424482	rs651806	A	G	500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=0;PP=383;SC=ACCCAAGCCCAAGGCTGGGGC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=76424490;WS=76424472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	76424502	rs691674	C	G	892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=8;PP=602;SC=CAGAGTGTACCTCACCAGCAA;SOR=2.115;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=33;WE=76424510;WS=76424492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr17	76424942	rs691113	T	C	370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=13;PP=280;SC=GGCTGCCCCCTGTGCTCCCAG;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=76424950;WS=76424932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	76425176	rs691094	G	A	1210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=25;NR=15;PP=615;SC=ATTACGTTGAGCTCCTGTTTA;SOR=0.919;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=25;TCR=15;TR=40;WE=76425184;WS=76425166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr17	76425444	.	G	GTCAGGC	1137.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=0.000;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.684;NF=2;NR=13;PP=818;ReadPosRankSum=-0.813;SC=CCATGAGAGGGTCAGGCTCAG;SOR=0.648;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=15;WE=76425452;WS=76425434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,30:0.75:40
chr17	76425480	rs666463	A	T	890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.49;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	76425490	rs1709752	TG	CA	690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.17;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	76433898	rs12941494	TG	CA	5650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=55;PP=2947;SC=CGTGCTGTAGTGCTCCAGCTT;SOR=1.075;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=107;TCF=49;TCR=58;TR=103;WE=76433907;WS=76433888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr17	76446169	rs200575201	G	A	1096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.909;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=27;PP=617;ReadPosRankSum=0.345;SC=GACTGATGGGGGCCCCTGGCT;SOR=0.861;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=72;TCF=33;TCR=39;TR=49;WE=76446177;WS=76446159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,52:0.67:78
chr17	76446872	rs35957404	A	G	630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.489;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=15;PP=344;ReadPosRankSum=0.627;SC=CCAGGAGCGAATCTTCCAGCT;SOR=0.740;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=119;TCF=64;TCR=55;TR=35;WE=76446880;WS=76446862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,40:0.29:137
chr17	76449505	rs2289751	G	C	2233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=49;PP=1066;ReadPosRankSum=0.473;SC=CAATGAGCAAGGTGTCCCCTT;SOR=0.723;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=139;TCF=64;TCR=75;TR=90;WE=76449513;WS=76449495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,106:0.65:163
chr17	76451652	rs112562857	G	A	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.473;NF=4;NR=1;PP=26;ReadPosRankSum=-0.349;SC=CAAGTAATCCGCCCGCCTCGG;SOR=0.330;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=5;WE=76451660;WS=76451642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr17	76451698	rs112076559	C	T	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.02;ReadPosRankSum=2.167;SOR=0.678;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,9:0.28:32
chr17	76451888	.	G	T	992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.582;ClippingRankSum=0.000;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.956;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=26;PP=624;ReadPosRankSum=0.263;SC=CAGCCCAGCGGATGTTTTCCG;SOR=0.803;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=164;TCF=89;TCR=75;TR=58;WE=76451896;WS=76451878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,60:0.33:180
chr17	76451921	rs8069561	A	G	4013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=69;PP=2438;SC=CGACCAGCCTAAAGTGGGATG;SOR=0.883;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=65;TCR=69;TR=134;WE=76451929;WS=76451911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr17	76456108	rs57622590	C	T	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.944;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.808;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=1;PP=24;ReadPosRankSum=0.921;SC=CGGGATGGGTCCGATGGGAGT;SOR=0.959;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=9;TCF=4;TCR=5;TR=3;WE=76456116;WS=76456098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr17	76456215	rs150414589	G	A	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.462;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=282;ReadPosRankSum=0.195;SC=ACCAGGCCAGGGGTCCCCTTT;SOR=0.374;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=72;TCF=52;TCR=20;TR=21;WE=76456223;WS=76456205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,20:0.28:72
chr17	76456352	rs623336	T	C	5356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=105;PP=2756;SC=GGAAGGAAGATGGACAGGAGA;SOR=0.949;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=193;TCF=88;TCR=105;TR=193;WE=76456360;WS=76456342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr17	76456403	.	C	CGTGCATGTGTGTGCATGTGT	791.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.793;ClippingRankSum=0.000;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=2.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.25;MQRankSum=1.131;QD=23.99;ReadPosRankSum=-0.780;SOR=1.460;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,21:0.64:33
chr17	76457559	rs692529	T	G	616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=4;PP=472;SC=TGACCACACGTGGAAGCCCAG;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=21;WE=76457567;WS=76457549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	76457910	rs640292	G	C	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.915;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=108;ReadPosRankSum=0.566;SC=CGTGTCTTACGACTCCCAGTG;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=6;WE=76457918;WS=76457900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr17	76462770	rs691225	G	A	3888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=75;NR=50;PP=1896;SC=GGAAGCGGGCGCTGACGGACA;SOR=0.834;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=75;TCR=50;TR=125;WE=76462778;WS=76462760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr17	76475809	rs28454411	T	C	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.200;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=107;ReadPosRankSum=1.150;SC=CCTGTCCTCATGTTCTAAGGT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=7;WE=76475817;WS=76475799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr17	76481608	rs11077370	A	G	661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=3;PP=465;SC=CCGGGTAGGCAGGGCGTGGCC;SOR=2.494;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=22;WE=76481616;WS=76481598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	76481693	rs11872051	C	G	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FS=0.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.36;ReadPosRankSum=-0.793;SOR=0.762;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:122,41:0.25:163
chr17	76481997	rs12944880	T	C	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.105;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=7;PP=183;ReadPosRankSum=0.880;SC=CACCGATTCCTGCCTCTAAAT;SOR=0.459;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=47;TCF=33;TCR=14;TR=20;WE=76482005;WS=76481987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,22:0.41:54
chr17	76482256	rs691142	A	G	5200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=71;PP=2936;SC=CCAGCTAAGCAGGATGCTGAG;SOR=0.898;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=173;TCF=102;TCR=71;TR=173;WE=76482264;WS=76482246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr17	76482432	rs691151	A	G	6599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=106;NR=101;PP=2965;SC=GCAGGTACAGAATCGTTTGGA;SOR=0.843;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=208;TCF=107;TCR=101;TR=207;WE=76482440;WS=76482422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr17	76490991	rs72927807	G	A	1250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.350;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=15;PP=629;ReadPosRankSum=-0.408;SC=GCTGCTGCCCGCATCTCAAAC;SOR=0.368;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=69;TCF=49;TCR=20;TR=44;WE=76490999;WS=76490981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,54:0.64:85
chr17	76491127	rs691652	TG	CC	3891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.680;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=41;PP=2626;ReadPosRankSum=-0.861;SC=CCCTCGGCCATGAGCATGATC;SOR=0.613;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=126;TCF=60;TCR=66;TR=83;WE=76491136;WS=76491117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,99:0.70:141
chr17	76491194	rs11077375	G	A	796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.380;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=23;PP=575;ReadPosRankSum=1.083;SC=GGAGGTCAGCGGTGCCTGTGG;SOR=1.193;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=44;TCF=12;TCR=32;TR=30;WE=76491202;WS=76491184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,32:0.68:47
chr17	76491211	rs11077376	G	A	604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=432;ReadPosRankSum=0.386;SC=GTGGGCTTCTGCCCACTCCCT;SOR=0.627;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=23;WE=76491219;WS=76491201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,24:0.73:33
chr17	76495050	rs691291	C	T	2496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.218;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=44;PP=1425;ReadPosRankSum=1.715;SC=ACGAGCCAGTCACCCGACGTG;SOR=0.804;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=159;TCF=89;TCR=70;TR=101;WE=76495058;WS=76495040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,113:0.64:177
chr17	76496492	rs2028734	A	G	2383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=50;PP=1504;ReadPosRankSum=-0.330;SC=CGGGGCCGGCAGGGGCTCCAC;SOR=0.711;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=164;TCF=86;TCR=78;TR=104;WE=76496500;WS=76496482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,111:0.63:175
chr17	76496577	rs2028735	C	T	1652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.868;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=36;PP=988;ReadPosRankSum=-0.070;SC=TGTGTGCCAGCGACCCCATGG;SOR=0.589;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=90;TCF=41;TCR=49;TR=68;WE=76496585;WS=76496567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,74:0.75:99
chr17	76497920	rs690844	C	A	4335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.289;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=94;PP=2584;ReadPosRankSum=0.631;SC=TGAGGTTCCCCATGAGCAGCG;SOR=0.919;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=258;TCF=125;TCR=133;TR=175;WE=76497928;WS=76497910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,191:0.68:282
chr17	76498406	rs930572	A	G	2074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.280;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=37;PP=1187;ReadPosRankSum=0.007;SC=TTTTTTTTAAAGACTCTCAGT;SOR=0.576;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=137;TCF=71;TCR=66;TR=81;WE=76498414;WS=76498383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,94:0.60:156
chr17	76498692	rs930571	C	T	4269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.910;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=89;PP=2599;ReadPosRankSum=0.515;SC=GTTATAATCTCTGATAGCGTT;SOR=0.615;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=272;TCF=132;TCR=140;TR=177;WE=76498700;WS=76498682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,196:0.64:305
chr17	76498844	rs7218164	A	G	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.597;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=249;ReadPosRankSum=-1.530;SC=TAACGCAGACATTCCTGCTGA;SOR=2.833;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=12;WE=76498852;WS=76498834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr17	76502734	rs11077378	T	C	440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=2;PP=291;SC=GCGGTTGAGGTAGAGGTGCCC;SOR=3.126;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=13;WE=76502742;WS=76502724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	76503527	rs9894913	G	A	7310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=110;NR=129;PP=2965;SC=GGGAACCACCGGGCTGTGCTC;SOR=0.894;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=239;TCF=110;TCR=129;TR=239;WE=76503535;WS=76503517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,271:1.00:271
chr17	76503593	rs9896398	T	C	4525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=85;PP=2348;SC=GGGAGCTGGGTGCGGATGTCT;SOR=1.080;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=152;TCF=67;TCR=85;TR=152;WE=76503601;WS=76503583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr17	76503966	rs9902653	T	C	1833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=42;PP=1353;SC=TTCCAGGACATAGACTGAAGC;SOR=1.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=18;TCR=42;TR=60;WE=76503974;WS=76503956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr17	76506607	rs867654	G	A	3098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=50;NR=42;PP=1526;SC=AAAAAATCCAGGCAGGATTCA;SOR=0.820;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=50;TCR=42;TR=92;WE=76506615;WS=76506597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr17	76521349	rs75793624	C	A	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=104;ReadPosRankSum=0.469;SC=CCCTGATAAACCTTCTGGGAG;SOR=0.859;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=6;WE=76521357;WS=76521339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr17	76525475	rs884714	T	G	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=189;ReadPosRankSum=-0.902;SC=ATGGTTGCGTTTGATGGGCTG;SOR=1.051;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=10;WE=76525483;WS=76525465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr17	76525565	rs4273108	A	G	1956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.360;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=32;PP=1115;ReadPosRankSum=-0.097;SC=TGCAGCTTCAAGTGGATCTCC;SOR=0.568;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=127;TCF=78;TCR=49;TR=79;WE=76525573;WS=76525555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,88:0.61:145
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chr17	76525759	rs61741523	G	C	2109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.309;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=50;PP=1294;ReadPosRankSum=-0.560;SC=TTTCATGAAGGCTTCCAGGTC;SOR=0.814;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=138;TCF=58;TCR=80;TR=83;WE=76525767;WS=76525749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,95:0.61:155
chr17	76525805	rs4969212	C	G	914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.575;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=25;PP=622;ReadPosRankSum=-0.421;SC=ATTTGTGTGGCCCCAGCCCCC;SOR=1.162;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=53;TCF=14;TCR=39;TR=32;WE=76525813;WS=76525794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,37:0.61:61
chr17	76525864	rs4597380	G	A	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=169;ReadPosRankSum=0.000;SC=GGGGACGACCGCGGTGAGGTC;SOR=0.269;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=10;WE=76525872;WS=76525854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr17	76528591	rs11868065	C	T	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=195;ReadPosRankSum=-0.806;SC=CCAGGGTGGGCGGTGTCTTGG;SOR=0.990;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=16;WE=76528599;WS=76528581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,19:0.73:26
chr17	76528790	rs11651537	A	G	1035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.966;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=23;PP=667;ReadPosRankSum=2.481;SC=CCTCATCTCTATGAGGTCTGT;SOR=0.976;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=63;TCF=34;TCR=29;TR=43;WE=76528798;WS=76528768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,46:0.62:74
chr17	76528831	rs11077379	G	A	887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.135;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=21;PP=572;ReadPosRankSum=-0.922;SC=GAAAGGGGCAGGGGAGAAGCA;SOR=1.042;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=53;TCF=24;TCR=29;TR=34;WE=76528839;WS=76528821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,38:0.58:65
chr17	76533269	rs111781371	A	AAAAG	1879.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=65.00;QD=43.71;SOR=1.455;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr17	76535759	rs7220871	T	C	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=127;ReadPosRankSum=0.869;SC=CTAGAAACTATAGATTCTAAC;SOR=0.869;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=9;WE=76535767;WS=76535749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,10:0.34:29
chr17	76535948	rs7221209	T	C	3735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=71;PP=2386;SC=CTGCCCTGAATAGTTCTGCGT;SOR=1.129;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=122;TCF=51;TCR=71;TR=122;WE=76535956;WS=76535938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr17	76547634	rs16971526	T	C	3779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-1.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.947;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=61;PP=1998;ReadPosRankSum=2.788;SC=GCCTGGGAAATTCCTTCTATA;SOR=0.556;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=177;TCF=98;TCR=79;TR=134;WE=76547642;WS=76547624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,165:0.76:218
chr17	76548866	rs61745194	C	T	1511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.259;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=40;PP=957;ReadPosRankSum=0.189;SC=AGAAATTCTACTGCCTTCACT;SOR=1.031;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=121;TCF=47;TCR=74;TR=62;WE=76548874;WS=76548856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,69:0.53:131
chr17	76554114	rs62075923	A	G	827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.193;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=15;PP=654;ReadPosRankSum=1.394;SC=ACATCTCTGAAACACACAAAC;SOR=1.080;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=164;TCF=107;TCR=57;TR=47;WE=76554122;WS=76554104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,48:0.26:185
chr17	76554147	rs4969171	A	G	1284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.367;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=31;PP=945;ReadPosRankSum=-0.741;SC=AAACCAAAACAATACAAAGCT;SOR=1.095;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=246;TCF=139;TCR=107;TR=79;WE=76554155;WS=76554137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:194,81:0.29:275
chr17	76554443	rs76926101	G	A	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=25;ReadPosRankSum=-0.623;SC=GACAGCCGGGGGGGATCTCAA;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=3;WE=76554451;WS=76554433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr17	76556811	rs78321431	C	T	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.893;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.38;ReadPosRankSum=0.052;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr17	76557862	rs894966	T	C	3180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=41;PP=2011;SC=CCAGGCTCCATTTGAGCTGCC;SOR=1.028;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=65;TCR=41;TR=105;WE=76557870;WS=76557852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr17	76557943	rs1108366	G	A	5843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=106;NR=90;PP=2965;SC=TCTGGGCATCGTACAAGATCT;SOR=0.799;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=196;TCF=106;TCR=90;TR=196;WE=76557951;WS=76557933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr17	76558159	rs2376587	T	C	474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=17;PP=371;SC=TCTTCAGGAGTGAGAGAATGT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=76558167;WS=76558149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	76565341	rs72920970	G	A	7946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=137;NR=129;PP=2965;SC=TGTCCTTAGAGGAGAGAAAGA;SOR=0.721;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=266;TCF=137;TCR=129;TR=266;WE=76565349;WS=76565331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,290:1.00:290
chr17	76566963	.	AAAAAG	A	486.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.28;QD=40.56;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	76567013	rs12948559	C	T	2325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=15;PP=1691;SC=AAAGCCGGCTCTCCCTTGCCT;SOR=1.854;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=57;TCR=15;TR=72;WE=76567021;WS=76567003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr17	76567332	rs12949510	C	A	941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=24;NR=5;PP=734;SC=CAGCTTCGTGCAGAACTCATG;SOR=2.985;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=29;WE=76567340;WS=76567322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	76567707	rs894968	T	C	2965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=38;PP=1439;SC=AGCAGCCGAGTGTCCCAGAAC;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=96;TCF=58;TCR=38;TR=96;WE=76567715;WS=76567697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr17	76567883	rs4969148	G	C	2453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=41;PP=1130;SC=TGGAAGGTTGGGGCATTGCTC;SOR=1.203;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=36;TCR=42;TR=76;WE=76567891;WS=76567873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr17	76567910	rs4969149	G	A	1734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=35;PP=973;SC=CGACACACACGTGGGTCCCAC;SOR=1.802;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=19;TCR=35;TR=54;WE=76567918;WS=76567900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr17	76568716	rs8073667	G	T	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.16;ReadPosRankSum=0.705;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
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chr17	76696614	rs183781134	T	C	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.08;ReadPosRankSum=-0.047;SOR=0.544;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,20:0.87:23
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chr17	76897733	rs12941365	G	T	256.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=8;NR=1;PP=192;SC=TAGGCCAAGCGACTTCACTCT;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=76897741;WS=76897723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
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chr17	76897974	rs4789936	C	T	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.542;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=254;ReadPosRankSum=-0.711;SC=CTTGAAATCACTGGGCTGACT;SOR=0.394;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=52;TCF=16;TCR=36;TR=21;WE=76897982;WS=76897964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,21:0.38:56
chr17	76970879	rs3744166	A	G	4379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=78;NR=69;PP=2385;SC=ACTGGACCTCATCCAGCATGA;SOR=0.717;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=78;TCR=69;TR=147;WE=76970887;WS=76970869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr17	76973339	rs1113032	T	C	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=223;ReadPosRankSum=0.386;SC=GGGAGCCAGATGGCCCGAGGC;SOR=0.976;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=17;WE=76973347;WS=76973329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,18:0.69:26
chr17	76988785	rs11891	G	A	1971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.373;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=33;PP=1099;ReadPosRankSum=-0.031;SC=GGCCAAGAACGCCGACATGTG;SOR=0.575;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=114;TCF=64;TCR=50;TR=73;WE=76988793;WS=76988775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,87:0.63:139
chr17	76989782	rs3803781	G	A	4174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.432;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=88;PP=2342;ReadPosRankSum=-0.281;SC=GGTCGTCGGTGTTGGGGATGA;SOR=0.643;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=275;TCF=143;TCR=132;TR=178;WE=76989790;WS=76989772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,198:0.64:308
chr17	76991424	rs3744170	C	A	103.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=77;SC=CGGCTCCACACCTGCCTCCCC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=76991432;WS=76991414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	76993546	rs8077024	A	G	1250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.749;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=24;PP=706;ReadPosRankSum=0.393;SC=AGAGGATGGCAGCACCCACAA;SOR=0.685;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=48;TCR=44;TR=49;WE=76993554;WS=76993536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,58:0.57:102
chr17	77039835	rs4789924	G	A	2804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=24;PP=872;ReadPosRankSum=-3.855;SC=ACGTGAGTGCGTCGTGAGTGC;SOR=0.635;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=102;TCF=65;TCR=37;TR=64;WE=77039843;WS=77039825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,71:0.61:116
chr17	77039852	rs4789854	G	A	3433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.309;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=38;PP=1224;ReadPosRankSum=-2.395;SC=GTGCGTGTATGCATGCATGGG;SOR=0.568;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=142;TCF=85;TCR=57;TR=91;WE=77039860;WS=77039842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,102:0.64:160
chr17	77040128	rs4789922	T	C	1119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.808;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=29;PP=582;ReadPosRankSum=0.638;SC=TCCTGAGTCGTGTGCCCCATG;SOR=1.011;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=80;TCF=37;TCR=43;TR=50;WE=77040150;WS=77040118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,55:0.62:89
chr17	77040185	rs4789853	G	C	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=413;ReadPosRankSum=-0.851;SC=AGCTGCCGTCGCCTCCGGACC;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=24;WE=77040193;WS=77040175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,26:0.65:40
chr17	77042718	rs11077409	C	T	1311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.553;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=24;PP=826;ReadPosRankSum=-0.555;SC=GCTGTGACCCCGGTACCTCCA;SOR=0.697;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=49;TCR=43;TR=51;WE=77042726;WS=77042708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,59:0.55:108
chr17	77043574	rs11077410	T	C	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.395;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=323;ReadPosRankSum=-1.127;SC=CTCAGGACACTACCGGATTGC;SOR=0.120;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=19;WE=77043582;WS=77043564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,19:0.76:25
chr17	77044218	rs3833103	T	TGCTGACCCCAGGGCTCAGCACCAG	658.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=3;PP=1990;ReadPosRankSum=-0.096;SC=CCCTGCGCTGTGCTGACCCCA;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=3;WE=77044226;WS=77044208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr17	77071002	rs8076010	C	G	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=2.447;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=121;ReadPosRankSum=-0.827;SC=CCTGCGATTGCCTCTCGGCGT;SOR=0.799;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=10;WE=77071010;WS=77070992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,12:0.80:15
chr17	77071040	rs56107536	C	A	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.28;ReadPosRankSum=0.763;SOR=0.741;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,14:0.82:17
chr17	77073566	rs3744181	G	A	971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=17;PP=543;ReadPosRankSum=-2.251;SC=GTTTTTCCCCGGACCCCCTGC;SOR=0.829;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=63;TCF=36;TCR=27;TR=41;WE=77073574;WS=77073556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,45:0.67:67
chr17	77075667	rs3744183	T	C	4200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FS=4.546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.34;ReadPosRankSum=-0.636;SOR=1.034;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,109:0.61:180
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chr17	77075673	rs3744185	A	G	4169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=3.848;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.12;ReadPosRankSum=-1.421;SOR=1.028;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,100:0.60:166
chr17	77076440	rs3744186	G	T	1763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.662;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=41;PP=1115;ReadPosRankSum=1.579;SC=TCGAGAACTCGCTGAGTGTGA;SOR=0.587;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=115;TCF=53;TCR=62;TR=75;WE=77076448;WS=77076430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,81:0.60:134
chr17	77078871	rs74001528	C	A	1648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.854;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=35;PP=1010;ReadPosRankSum=1.257;SC=CCCCTGCCCCCCTGCCCTTGC;SOR=0.836;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=89;TCF=43;TCR=46;TR=67;WE=77078879;WS=77078861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,73:0.74:99
chr17	77079755	rs2001248	C	T	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.271;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=11;PP=290;ReadPosRankSum=0.108;SC=CCAGCAGGCACGGTGGTGGTC;SOR=0.990;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=37;TCF=18;TCR=19;TR=21;WE=77079763;WS=77079745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
chr17	77081222	rs4789984	C	T	1343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.843;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=13;PP=839;ReadPosRankSum=0.331;SC=AATCAGGCAGCCTTCTCTGGA;SOR=1.053;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=96;TCF=68;TCR=28;TR=53;WE=77081230;WS=77081212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,60:0.57:105
chr17	77081788	rs4789879	G	A	3353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.256;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=66;PP=1859;ReadPosRankSum=1.882;SC=GAGGAGGAGAGCTTCACCTGT;SOR=0.567;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=187;TCF=97;TCR=90;TR=141;WE=77081796;WS=77081778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,155:0.75:207
chr17	77083180	rs57241083	C	G	1871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.654;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=43;PP=1039;ReadPosRankSum=1.006;SC=GGAAGTGGCTCTGAGGCAGTC;SOR=0.628;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=125;TCF=55;TCR=70;TR=79;WE=77083188;WS=77083170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,89:0.64:139
chr17	77086806	rs62063826	A	G	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.268;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=26;ReadPosRankSum=0.699;SC=GCGTGTGGCCAGGACGCGGGA;SOR=0.169;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=77086814;WS=77086796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr17	77086851	rs148863918	G	GT	273.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=2.917;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.41;ReadPosRankSum=-1.373;SOR=0.197;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr17	77087005	rs112100897	C	CA	4072.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.475;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.401;NF=14;NR=46;PP=2317;ReadPosRankSum=0.985;SC=TGCAGCTTCTCGGGGGAGGCA;SOR=0.533;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=107;TCF=19;TCR=88;TR=60;WE=77087013;WS=77086995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,123:0.61:202
chr17	77088634	rs10676066	G	GTAAT	449.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.151;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=469;ReadPosRankSum=-0.680;SC=GGTTTGGTGTGTAATAGGCAG;SOR=1.911;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=10;WE=77088642;WS=77088624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr17	77088790	rs11286198	GA	G	336.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=1.875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.28;MQRankSum=0.000;QD=14.03;ReadPosRankSum=0.601;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,18:0.75:24
chr17	77090473	rs61042144	A	G	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.105;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=12;PP=380;ReadPosRankSum=-1.731;SC=CAAGGGCCTCACCACCCATGC;SOR=0.489;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=46;TCF=29;TCR=17;TR=30;WE=77090481;WS=77090463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,33:0.63:52
chr17	77090637	rs200668420	TGGGAGGAGGGTGG	T	989.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.85;MQRankSum=0.763;QD=32.99;ReadPosRankSum=1.528;SOR=1.220;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,26:0.87:30
chr17	77093026	rs8072150	T	C	981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=26;PP=693;ReadPosRankSum=0.024;SC=CCCACCCCTTTAGTGATGGAG;SOR=0.890;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=13;TCR=35;TR=36;WE=77093034;WS=77093016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,38:0.73:52
chr17	77093734	rs59021665	A	G	886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.743;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=14;PP=633;ReadPosRankSum=1.115;SC=GGGGCCAAGTAGCTGGTCTCA;SOR=0.307;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=61;TCF=42;TCR=19;TR=37;WE=77093742;WS=77093724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,38:0.59:64
chr17	77093768	rs58352742	T	C	1572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.447;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=31;PP=1080;ReadPosRankSum=0.055;SC=CCGCCCCAGCTTTTACCTGCA;SOR=0.281;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=115;TCF=70;TCR=45;TR=69;WE=77093776;WS=77093758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,75:0.59:127
chr17	77100061	.	C	T	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.728;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.41;ReadPosRankSum=-0.090;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,5:0.17:29
chr17	77102966	rs36122090	T	TC	841.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=8;PP=499;SC=GGCCAGATTCTCCCCACCCTT;SOR=0.765;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=5;TCR=8;TR=13;WE=77102974;WS=77102956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	77681036	rs73410309	G	C	215.18	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.55;ReadPosRankSum=2.177;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,11:0.85:13
chr17	77704912	rs8074547	T	C	492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=12;NR=5;PP=223;SC=ATGAGAGGCCTGGCCGTCCTC;SOR=1.127;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=17;WE=77704920;WS=77704902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	77705045	rs8074728	T	C	2986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=32;PP=1707;SC=ACGACCAGGATGTGGACACCC;SOR=1.329;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=66;TCR=32;TR=98;WE=77705053;WS=77705035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr17	77707492	rs11150740	G	C	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=79;ReadPosRankSum=-1.122;SC=CAGAGCACGGGGGCACCTAGG;SOR=0.368;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=9;WE=77707500;WS=77707482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr17	77708793	rs72855484	G	C	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.719;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=64;ReadPosRankSum=-0.221;SC=CATGAGACAAGGGGCAGCCCA;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=5;WE=77708801;WS=77708783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr17	77709339	rs11657217	C	G	5178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=87;PP=2965;SC=TGTACGATGCCCTCAAGGACG;SOR=0.870;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=168;TCF=81;TCR=87;TR=168;WE=77709347;WS=77709329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr17	77709405	rs78553282	C	T	2582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.564;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=55;PP=1390;ReadPosRankSum=0.508;SC=CCTTCCACTACGCCAACAACC;SOR=0.782;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=163;TCF=80;TCR=83;TR=105;WE=77709413;WS=77709395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,120:0.64:187
chr17	77710700	rs55840948	G	A	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=3.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.49;ReadPosRankSum=-1.033;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr17	77751983	rs71368052	C	G	381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=0;PP=278;SC=GCGCGGCGGTCCGGGCGGGTG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=77751991;WS=77751976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	77752147	rs56050112	T	C	707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.45;ReadPosRankSum=-0.402;SOR=0.547;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,39:0.41:95
chr17	77753245	rs143293175	C	CTG	646.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.241;NF=0;NR=11;PP=363;ReadPosRankSum=0.614;SC=GCTGACAGCACTGGGGAGGGT;SOR=0.797;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=3;TCR=39;TR=11;WE=77753253;WS=77753235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,21:0.29:72
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chr17	77809591	.	GC	G	148.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.607;ClippingRankSum=0.000;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=3.191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.17;MQRankSum=0.000;QD=3.31;ReadPosRankSum=-0.532;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,14:0.31:45
chr17	77916134	rs2650236	G	A	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=54;ReadPosRankSum=-1.867;SC=AGCCCAGCTCGGGGGCCGTGT;SOR=0.283;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=6;WE=77916142;WS=77916124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr17	77923478	rs894858	G	A	609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=382;ReadPosRankSum=1.235;SC=TTTCCTCCGCGGCTCGGCGGG;SOR=0.787;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=44;TCF=33;TCR=11;TR=23;WE=77923486;WS=77923468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,26:0.55:47
chr17	77925393	rs35286723	G	A	802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.557;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=21;PP=399;ReadPosRankSum=0.072;SC=TGCAGGCCTCGTCGCTGAAGG;SOR=0.986;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=99;TCF=47;TCR=52;TR=38;WE=77925401;WS=77925383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,44:0.41:108
chr17	77926491	rs4889804	G	A	2830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.354;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=59;PP=1535;ReadPosRankSum=-1.377;SC=TGTGGCCCAGGTCCACGCGGA;SOR=0.558;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=152;TCF=68;TCR=84;TR=109;WE=77926499;WS=77926481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,122:0.71:171
chr17	78013724	rs2289527	G	C	4138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=71;PP=2665;SC=AGGGGGAGGTGGAGACAGAAG;SOR=0.778;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=137;TCF=66;TCR=71;TR=137;WE=78013732;WS=78013714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr17	78020941	rs76104475	GGC	TTT	1310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=0;PP=1447;SC=CCACGTGCCCGGCCAGGTTTT;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=18;WE=78020951;WS=78020931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	78039867	rs8082554	C	T	2577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.533;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=34;PP=1462;ReadPosRankSum=1.516;SC=GGGATGGATGCGTGGCTCAGG;SOR=0.634;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=49;TCR=35;TR=83;WE=78039875;WS=78039857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,96:0.99:97
chr17	78055758	rs35578653	T	G	5007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=75;PP=2879;SC=AGACGGATGCTGCCATCCGGG;SOR=0.769;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=162;TCF=87;TCR=75;TR=162;WE=78055766;WS=78055748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr17	78061317	rs11150839	A	C	561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=0;PP=475;SC=GAGAGACAAAACCTGGCTCAC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=78061325;WS=78061307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	78061353	rs11150840	G	A	1281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=5;PP=912;SC=GCCTGCGGGCGAGGACCCGTA;SOR=3.109;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=35;TCR=5;TR=40;WE=78061361;WS=78061343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr17	78061979	rs12942049	A	C	2770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=62;PP=1475;SC=AAGACCATGTAGGAGGCCAGG;SOR=1.522;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=36;TCR=62;TR=98;WE=78061987;WS=78061969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr17	78063635	rs118143944	C	T	2638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.277;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=57;PP=1507;ReadPosRankSum=1.783;SC=ATTCCGAGATCGGCCAGACGG;SOR=0.586;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=157;TCF=74;TCR=83;TR=109;WE=78063643;WS=78063625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,118:0.68:174
chr17	78063957	rs7210658	A	G	4773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.31;MQRankSum=-0.957;QD=40.80;ReadPosRankSum=-0.701;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,113:0.97:117
chr17	78063964	rs7210664	A	G	4773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.23;MQRankSum=-0.973;QD=41.88;ReadPosRankSum=-0.918;SOR=1.118;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,110:0.96:114
chr17	78063966	rs7210665	A	G	4699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.21;MQRankSum=-0.978;QD=41.59;ReadPosRankSum=-1.164;SOR=1.098;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,109:0.96:113
chr17	78063996	rs7210679	A	G	3452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;MQRankSum=-1.075;NF=46;NR=31;PP=1335;ReadPosRankSum=-2.067;SC=CACGGGACGCACGCAGGCACG;SOR=0.850;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=48;TCR=33;TR=77;WE=78064004;WS=78063986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,80:0.95:84
chr17	78064015	rs4889953	G	C	3023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=2.488;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.40;MQRankSum=-1.886;QD=35.16;ReadPosRankSum=-1.051;SOR=0.991;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,83:0.97:86
chr17	78064145	.	A	ACAC	2904	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.58;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MMLQ=25;MQ=48.14;NF=18;NR=49;PP=2904;QD=20;SC=TGCACGAACAAGGGACGCGCG;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=76;TCF=19;TCR=57;TR=67;WE=78064153;WS=78064135;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:9,67:0.88:76
chr17	78064185	.	CAGCACGTGCATGAACAACACAGGACACACACAGCACGTGCATGAACAACACAGGACACACACA	C	555.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.66;QD=42.75;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	78064216	.	C	CA	1319	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.67;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=46;MMLQ=27;MQ=54.29;NF=6;NR=27;PP=1319;QD=40.7272727273;SC=AGGACACACACAGCACGTGCA;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=33;WE=78064224;WS=78064206;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr17	78064247	.	CA	C	646	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MMLQ=25;MQ=46.17;NF=0;NR=16;PP=646;QD=42.0;SC=AGGACACACACAAGCACGTGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=78064255;WS=78064237;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	78071052	rs12952612	T	C	4438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=91;NR=60;PP=2323;SC=AGGCCACCGATGAGTGCACCA;SOR=1.044;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=151;TCF=91;TCR=60;TR=151;WE=78071060;WS=78071042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr17	78078709	rs1800300	T	C	6346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=111;NR=92;PP=2965;SC=CCCGCGGCTGTTGCTACATCC;SOR=0.763;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=203;TCF=111;TCR=92;TR=203;WE=78078717;WS=78078699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr17	78079481	rs8069491	C	G	1983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=41;NR=19;PP=1139;SC=CTGTCCTTGGCGTGCGGGTTG;SOR=1.394;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=41;TCR=19;TR=60;WE=78079489;WS=78079471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr17	78079509	rs12452721	T	G	3324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=66;NR=38;PP=1792;SC=GAGAGTAAGGTGGCTGTGGGG;SOR=1.150;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=66;TCR=38;TR=104;WE=78079536;WS=78079499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr17	78079544	rs3816256	C	G	4474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=81;NR=65;PP=2409;SC=CCCATCTCTTCTAGATCAAAG;SOR=0.766;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=146;TCF=81;TCR=65;TR=146;WE=78079552;WS=78079534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr17	78079597	rs1042393	A	G	3824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=66;NR=66;PP=2066;SC=GAGACCCCGCATGTCCACAGC;SOR=0.866;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=132;TCF=66;TCR=66;TR=132;WE=78079605;WS=78079587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr17	78079669	rs1042395	G	A	1436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=35;PP=918;SC=GTGATCGTGCGCCGGCAGCTG;SOR=2.215;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=14;TCR=35;TR=49;WE=78079677;WS=78079659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr17	78081526	rs3071247	A	AGCAGCGG	4572.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=9;NR=44;PP=2517;SC=CCCACGGTACAGCGGCGGGCG;SOR=0.976;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=56;TCF=10;TCR=46;TR=53;WE=78081534;WS=78081516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr17	78081551	rs2304845	T	C	3682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=40;PP=1442;SC=GCGGGGGCACTGAGCTGGGGA;SOR=0.784;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=38;TCR=40;TR=78;WE=78081559;WS=78081541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr17	78081707	rs2252455	G	A	2256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=42;PP=1266;SC=TAAGCTGCCCGCCGCCCAGCG;SOR=0.947;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=36;TCR=42;TR=78;WE=78081715;WS=78081697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr17	78081982	rs2241888	G	A	665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=3;PP=529;SC=TGAGCTCCTCGTGGGGAGAGA;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=22;WE=78081990;WS=78081972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	78082005	rs2241887	C	T	1182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=12;PP=815;SC=CTCAACTCTCCGCCTGTGATT;SOR=1.556;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=28;TCR=12;TR=40;WE=78082013;WS=78081995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr17	78082504	rs1800304	G	A	4204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=75;NR=72;PP=2254;SC=AGGACGTCCAGTGGAACGACC;SOR=0.782;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=147;TCF=75;TCR=72;TR=147;WE=78082512;WS=78082494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr17	78083565	rs2278620	G	A	615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=18;NR=1;PP=418;SC=GTCCTGACTCGCCCGGCCCTG;SOR=3.160;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=78083573;WS=78083555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	78083726	rs2278619	A	G	4904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=67;PP=2792;SC=TCACCTTGACAGGTTTCCCTC;SOR=0.979;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=167;TCF=100;TCR=67;TR=167;WE=78083734;WS=78083716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr17	78084507	rs2304844	G	C	313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=2;PP=237;SC=TCTCCCCACTGCAGCCTCTCG;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=78084515;WS=78084497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	78084688	rs2304843	C	A	5633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=106;NR=86;PP=2965;SC=GGGGACTACCCCACCCTCCTC;SOR=0.812;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=192;TCF=106;TCR=86;TR=192;WE=78084696;WS=78084678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr17	78084769	rs1042396	G	A	5257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=90;PP=2965;SC=ACTTCATCAGGGGCTCTGAGG;SOR=0.894;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=170;TCF=80;TCR=90;TR=170;WE=78084777;WS=78084759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr17	78084940	rs199788201	GC	G	405.86	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.33;ReadPosRankSum=-0.361;SOR=2.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,19:0.90:21
chr17	78084942	rs4889817	G	T	414.89	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.76;ReadPosRankSum=-0.541;SOR=2.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,19:0.90:21
chr17	78086043	rs2304838	C	T	586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=14;PP=366;SC=TCTCCCCACCCGCTGCCTGCA;SOR=3.056;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=78086051;WS=78086033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	78086846	rs2304836	A	G	3202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=50;NR=58;PP=1699;SC=GGGTGGCGGCATGGCAGGTGG;SOR=1.004;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=50;TCR=59;TR=108;WE=78086854;WS=78086836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr17	78090928	rs2304832	G	A	747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=22;PP=537;SC=GGGACCCTAAGCCCTGGGGAG;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=28;WE=78090936;WS=78090918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	78091405	rs1126690	G	A	2647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=50;NR=41;PP=1418;SC=CCAGGTGCCAGTAGAGGCCCT;SOR=0.753;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=50;TCR=41;TR=91;WE=78091413;WS=78091395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr17	78092063	rs1042397	G	A	2062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=36;PP=1107;SC=CCAAGGGTGGGGAGGCCCGAG;SOR=0.968;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=33;TCR=36;TR=69;WE=78092071;WS=78092053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr17	78109157	rs111881225	G	A	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=130;ReadPosRankSum=0.305;SC=CTCTTCAAAGGAAGGGAGACG;SOR=0.446;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=9;WE=78109165;WS=78109147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr17	78111877	rs2361710	T	C	3001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=41;PP=1499;SC=TCTTGATTTATGTCATTCAGA;SOR=0.899;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=60;TCR=41;TR=101;WE=78111885;WS=78111867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr17	78113832	rs2241886	G	A	3160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=48;PP=1963;SC=GAGTGCCCGCGACAACATGCT;SOR=0.728;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=58;TCR=48;TR=106;WE=78113840;WS=78113822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr17	78114996	rs12949569	C	T	2006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=12;PP=1380;SC=AAATGTTAATCAGGAAGAAAA;SOR=2.799;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=52;TCR=12;TR=64;WE=78115004;WS=78114986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr17	78157995	rs4889990	G	A	2881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=55;PP=1833;SC=CGCTGCAGGAGAAGGAGCTGG;SOR=1.146;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=93;TCF=38;TCR=55;TR=93;WE=78158003;WS=78157985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr17	78158063	rs4889991	G	A	917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=22;PP=633;SC=GCACCCCGGCGCGACCCTGCT;SOR=1.751;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=10;TCR=22;TR=32;WE=78158071;WS=78158053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr17	78164427	rs12942414	A	G	175.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.11;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	78171944	rs2066964	G	C	924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.240;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=22;PP=600;ReadPosRankSum=-0.206;SC=CCCCTGGAAGGCTTGATGTCT;SOR=0.920;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=67;TCF=34;TCR=33;TR=41;WE=78171952;WS=78171934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,42:0.58:72
chr17	78175483	rs2304856	T	C	2426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.646;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=34;PP=1461;ReadPosRankSum=-0.758;SC=GCGCCTTCTGTCTTCTGGCTG;SOR=0.904;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=126;TCF=81;TCR=45;TR=97;WE=78175491;WS=78175473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,107:0.77:139
chr17	78175854	rs3813063	C	A	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=125;ReadPosRankSum=2.124;SC=CCCACTGACTCCAGTGCCAGA;SOR=1.038;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=9;WE=78175862;WS=78175844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr17	78176233	rs8069255	T	A	1188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.017;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=35;PP=835;ReadPosRankSum=-0.097;SC=AGCAGCTGCCTCGAGCTCGGT;SOR=1.010;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=77;TCF=25;TCR=52;TR=50;WE=78176241;WS=78176223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,51:0.62:82
chr17	78178170	rs4889996	A	G	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=581;ReadPosRankSum=-0.075;SC=CACAGGGGCCACTGGCTCCAA;SOR=0.836;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=13;WE=78178197;WS=78178160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr17	78178182	rs4889836	T	C	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.15;ReadPosRankSum=1.806;SOR=0.657;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
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chr17	78180618	rs4889998	A	C	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=269;ReadPosRankSum=0.633;SC=GGCAAGCTCTATTCCCTCATC;SOR=1.721;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=12;WE=78180626;WS=78180611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr17	78181918	rs111745899	C	A	95.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.97;ReadPosRankSum=2.100;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr17	78184393	rs7503034	C	T	1190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.628;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=30;PP=746;ReadPosRankSum=0.974;SC=CTGAGCAAAGCGCGGGTCGGT;SOR=0.752;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=174;TCF=93;TCR=81;TR=59;WE=78184401;WS=78184383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,66:0.34:193
chr17	78187720	rs35087113	A	G	1418.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FS=6.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.81;ReadPosRankSum=-0.912;SOR=1.254;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,43:0.27:161
chr17	78187721	rs34029730	CAG	C	1400.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FS=6.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.49;ReadPosRankSum=-0.763;SOR=1.265;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:122,43:0.26:165
chr17	78187954	rs6565647	A	G	1016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=25;PP=569;ReadPosRankSum=0.616;SC=CCTGAAACACAGGAGGGGCCG;SOR=0.739;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=71;TCR=68;TR=50;WE=78187962;WS=78187944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,55:0.36:152
chr17	78188963	rs4889839	G	A	2011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.772;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=40;PP=1066;ReadPosRankSum=-1.109;SC=CATGAGGTCCGGGGCCCCCGG;SOR=0.486;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=148;TCF=70;TCR=78;TR=81;WE=78188971;WS=78188953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,96:0.57:168
chr17	78189009	rs4889840	C	T	846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=22;PP=463;ReadPosRankSum=0.199;SC=TGTTCTCCCACGGCCCTCCCA;SOR=0.680;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=64;TCF=22;TCR=42;TR=34;WE=78189017;WS=78188999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,39:0.54:72
chr17	78195772	rs12946329	C	T	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=54;ReadPosRankSum=-0.126;SC=GCCTGTTTGGCACACACAGAC;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=78195780;WS=78195762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr17	78196742	rs5822330	T	TGTG	274.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.221;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.98;MQRankSum=0.253;QD=27.47;ReadPosRankSum=-1.282;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr17	78201554	rs6565652	T	C	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=122;ReadPosRankSum=-2.545;SC=AGCAGCAGGATGCTTGAGTCA;SOR=0.722;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=10;WE=78201562;WS=78201544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr17	78201783	rs6565653	T	G	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.632;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=15;PP=266;ReadPosRankSum=-0.806;SC=GGCTGACATCTTATGCAACCT;SOR=1.239;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=84;TCF=44;TCR=40;TR=26;WE=78201791;WS=78201773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,29:0.30:96
chr17	78210944	rs8070283	G	A	703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=17;PP=451;SC=CTGAGGCTGCGGTGGCCCCTG;SOR=1.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=24;WE=78210952;WS=78210934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	78215441	rs12943906	A	G	855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=3;PP=688;SC=AATATTTTAGATGTGTATTCT;SOR=3.690;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=27;WE=78215449;WS=78215431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	78215566	rs12942462	T	G	6219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=109;NR=95;PP=2965;SC=TTGGTTCCCTTTAGCATCTCA;SOR=0.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=204;TCF=109;TCR=95;TR=204;WE=78215574;WS=78215556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr17	78219065	rs7406843	C	A	5164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.147;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=79;PP=2748;ReadPosRankSum=-1.189;SC=GGTGAGTGACCTGTCCGCCTC;SOR=0.340;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=171;TCF=92;TCR=79;TR=170;WE=78219073;WS=78219055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,193:0.99:194
chr17	78219100	rs7406844	C	T	3727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=62;PP=2189;SC=GTTGGACGCCCTAACGTTGTT;SOR=0.781;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=129;TCF=67;TCR=62;TR=129;WE=78219108;WS=78219090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr17	78219908	rs34818744	T	C	6825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=124;NR=101;PP=2965;ReadPosRankSum=1.544;SC=GAGGTCTCCCTTTTCCCGGCC;SOR=0.463;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=228;TCF=126;TCR=102;TR=225;WE=78219916;WS=78219898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,254:0.99:257
chr17	78222280	rs7209848	A	G	395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=9;NR=6;PP=193;SC=CCTGCAGCACACTAGGTTGGG;SOR=0.804;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=9;TCR=6;TR=15;WE=78222288;WS=78222270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	78222565	rs7214131	A	G	1821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=30;NR=27;PP=883;SC=CCCTGTCCCCAACGCTCTCCA;SOR=0.980;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=30;TCR=27;TR=57;WE=78222573;WS=78222555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr17	78222661	rs9904116	C	T	214.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=161;SC=GGGTGGTGGCCCCCCACATAT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=78222669;WS=78222651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	78223103	rs8064518	C	A	840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.02;SOR=0.749;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr17	78225055	rs8078855	G	T	2645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=60;NR=34;PP=1540;SC=TGAGATGGCAGGTCTACCAGG;SOR=1.247;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=96;TCF=61;TCR=35;TR=94;WE=78225063;WS=78225045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr17	78252770	rs7219131	T	C	1115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.798;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=35;PP=644;ReadPosRankSum=-0.588;SC=TGGCACAGCCTGGCACGGCCA;SOR=0.930;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=87;TCF=33;TCR=54;TR=54;WE=78252778;WS=78252760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,56:0.61:92
chr17	78261730	rs17853714	G	A	2032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.771;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=41;PP=1108;ReadPosRankSum=-0.219;SC=TTTCAAACCCGTGGCCTCAGG;SOR=0.486;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=106;TCF=51;TCR=55;TR=81;WE=78261738;WS=78261720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,92:0.77:120
chr17	78261805	rs7215243	A	G	1164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=21;PP=662;ReadPosRankSum=-0.704;SC=GCCAGCCCCCAGGCACAGCCA;SOR=0.852;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=29;TCR=27;TR=43;WE=78261813;WS=78261795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,51:0.77:66
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chr17	78280030	rs8066993	C	T	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.696;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=4;PP=516;ReadPosRankSum=0.815;SC=CTCTTTTCTCCGTCCCTATTT;SOR=1.270;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=37;TCF=31;TCR=6;TR=26;WE=78280038;WS=78280020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,28:0.70:40
chr17	78281088	rs61087724	G	T	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=330;ReadPosRankSum=0.000;SC=TGACCCACATGTGCTGTTGTA;SOR=1.047;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=19;WE=78281096;WS=78281078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,20:0.80:25
chr17	78283084	rs12945169	G	A	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=19;PP=468;ReadPosRankSum=-0.034;SC=GAGATGGAGCGGTGGTTTCAG;SOR=0.569;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=26;WE=78283092;WS=78283074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,27:0.73:37
chr17	78292877	rs55767628	G	C	188.10	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5731;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=146;ReadPosRankSum=0.157;SC=CTTAAAATTGGGGGAAACAGT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=7;WE=78292885;WS=78292869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr17	78298938	rs6565674	A	G	3157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=60;PP=2014;ReadPosRankSum=0.459;SC=GGACAACTTCAATGACATTTT;SOR=1.140;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=45;TCR=61;TR=104;WE=78298946;WS=78298928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,116:0.98:118
chr17	78302157	rs8082521	C	A	5077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=67;PP=2920;SC=CCAGGATGAACAATGTGCTGT;SOR=0.842;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=159;TCF=92;TCR=67;TR=158;WE=78302165;WS=78302147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr17	78305871	rs10782008	G	A	5012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=83;PP=2652;SC=AAATGACACCGTGACAGTGAG;SOR=0.899;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=161;TCF=78;TCR=83;TR=161;WE=78305879;WS=78305861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr17	78306102	rs9913636	G	C	7212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=134;NR=91;PP=2965;SC=CCTTGAGCTTGAAGAGGTGTA;SOR=1.048;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=225;TCF=134;TCR=91;TR=225;WE=78306110;WS=78306092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr17	78306280	rs8074015	A	G	5875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=88;NR=104;PP=2965;SC=GACCACCAGGACCAAAGAGAT;SOR=0.954;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=192;TCF=88;TCR=104;TR=192;WE=78306288;WS=78306270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr17	78306308	rs9908287	C	G	4139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=73;PP=2506;SC=AGGACCGAGTCGAACAGATCA;SOR=1.067;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=130;TCF=57;TCR=73;TR=130;WE=78306316;WS=78306298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr17	78308136	rs11658902	G	A	361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=10;PP=240;SC=ACTGTGTGGCGTTCCTAAACT;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=12;WE=78308144;WS=78308126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	78311360	rs7211876	C	T	737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.055;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=5;PP=344;ReadPosRankSum=-1.180;SC=AACCGTGGCCCGTGTTCTCTC;SOR=0.890;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=47;TCF=36;TCR=11;TR=26;WE=78311368;WS=78311350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,33:0.58:57
chr17	78311508	rs4890009	G	A	3640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=46;PP=2096;SC=TGATCCAGGCGCCCAAAGGTG;SOR=1.095;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=114;TCF=67;TCR=47;TR=113;WE=78311516;WS=78311498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr17	78319136	rs9674961	G	A	6842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=112;NR=109;PP=2965;SC=GATGCCATCAGTCACTTGACT;SOR=0.766;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=221;TCF=112;TCR=109;TR=221;WE=78319144;WS=78319126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr17	78319380	rs4890012	G	C	5423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=85;PP=2701;SC=GTGGGATCCCGGTTATCATCA;SOR=0.743;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=175;TCF=90;TCR=85;TR=175;WE=78319388;WS=78319370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr17	78323445	rs35993981	T	A	989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=3;PP=671;SC=TTGGATTCTGTGCCGTTGTGT;SOR=3.545;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=27;WE=78323453;WS=78323435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	78323757	rs7223115	T	C	760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=19;PP=451;SC=GCCGCAGCCGTGTGGCTTCTG;SOR=1.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=9;TCR=19;TR=28;WE=78323765;WS=78323747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	78324048	rs9944443	T	A	655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=8;PP=464;SC=GAATTTTCTTTTCCATTTTTT;SOR=1.519;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=25;WE=78324056;WS=78324038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	78324259	rs12051723	G	T	1036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.102;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=23;PP=520;ReadPosRankSum=0.341;SC=AAGTCCTAGAGAATTTTTTCC;SOR=0.946;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=53;TCF=22;TCR=31;TR=38;WE=78324267;WS=78324249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,47:0.72:65
chr17	78327358	rs7216493	G	A	2357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=34;PP=1502;SC=AGGCGATGGAGACGGAGGCCA;SOR=0.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=43;TCR=34;TR=77;WE=78327366;WS=78327348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr17	78332396	rs9915562	A	G	823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=22;PP=611;SC=CAACGTTGACATGGGTGCTTT;SOR=3.690;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=24;WE=78332404;WS=78332386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	78333840	rs8067292	T	C	5571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=85;PP=2965;SC=CCTCTTCTTATCATCCCTCAC;SOR=0.762;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=187;TCF=102;TCR=85;TR=187;WE=78333848;WS=78333830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr17	78348494	rs6565681	A	G	1231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=28;PP=797;SC=CCACTGATGCAGCCCATCACG;SOR=1.714;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=14;TCR=28;TR=42;WE=78348502;WS=78348484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr17	78354661	rs4889848	C	T	6253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=113;NR=89;PP=2965;SC=AGACCGGCCACGTGCTGGGCA;SOR=0.865;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=202;TCF=113;TCR=89;TR=202;WE=78354669;WS=78354651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr17	78362300	rs6565683	A	T	592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=4;PP=315;SC=AGGGATACACAGGGCAGCGCG;SOR=1.508;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=17;WE=78362308;WS=78362290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	78395734	rs34933300	G	A	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.110;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=10;PP=230;ReadPosRankSum=0.756;SC=CAGCAGCTGCGGGAGAAGGAG;SOR=0.620;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=74;TCF=42;TCR=32;TR=20;WE=78395742;WS=78395724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,21:0.27:79
chr17	78396091	rs9907097	C	G	1571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=34;PP=941;ReadPosRankSum=-0.714;SC=TGGGGAAGAGCGGGGGGAGAG;SOR=1.647;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=59;TCF=24;TCR=35;TR=57;WE=78396099;WS=78396080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,62:0.97:64
chr17	78401588	rs8065290	G	T	1638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=27;PP=757;SC=CAGGCGCTGCGGCGCTCCTGG;SOR=1.532;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=19;TCR=27;TR=46;WE=78401596;WS=78401578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr17	78404175	rs113730607	ATTTG	A	4240.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=54;PP=2523;SC=TATTTCACATATTTGTTTGTT;SOR=1.300;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=74;TCF=8;TCR=66;TR=58;WE=78404186;WS=78404165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr17	78444658	rs12943620	T	G	1798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=42;NR=22;PP=1059;SC=TGGTGGCCCCTCCGTAGATCT;SOR=1.163;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=42;TCR=22;TR=64;WE=78444666;WS=78444648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr17	78444679	rs28364735	T	C	2708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=-0.071;NF=61;NR=31;PP=1696;ReadPosRankSum=0.083;SC=CGATGTGGGATTCAGCCCAGG;SOR=1.284;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=62;TCR=32;TR=92;WE=78444687;WS=78444669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,100:0.98:102
chr17	78445702	rs1131609	A	G	2941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=53;NR=40;PP=1578;SC=ACAAAAGGCAACTTGGCCACC;SOR=0.769;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=53;TCR=40;TR=93;WE=78445715;WS=78445692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr17	78449948	rs144443274	C	T	6259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=102;PP=2965;SC=CCGGGCCTCGCCGGCTCCGGG;SOR=0.702;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=204;TCF=102;TCR=102;TR=204;WE=78449956;WS=78449938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr17	78599562	rs17848685	C	G	1614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=25;NR=22;PP=738;SC=TGGTGAAGACCACGCCCTGTG;SOR=0.941;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=25;TCR=22;TR=47;WE=78599570;WS=78599552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr17	78617439	rs6565469	T	C	870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=22;NR=4;PP=538;SC=CTTTGAAGTGTGTTATATAAG;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=26;WE=78617447;WS=78617429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	78681590	rs2306690	A	G	1070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=9;PP=773;SC=ATGAGTTCCAAGCATTCCCTG;SOR=1.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=36;WE=78681598;WS=78681580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr17	78795868	rs9911574	A	G	2285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=8;PP=1706;SC=GCCGTGCGCCAAGCTTCTGCT;SOR=4.047;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=70;TCR=8;TR=78;WE=78795876;WS=78795858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr17	78820212	rs3829572	G	A	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=3.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.27;ReadPosRankSum=0.278;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,25:0.25:101
chr17	78820329	rs3751945	C	T	836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.31;ReadPosRankSum=1.822;SOR=0.676;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:139,55:0.28:194
chr17	78829375	rs12943041	G	A	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.59;ReadPosRankSum=-0.646;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr17	78854056	rs6420478	A	G	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=2.712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.31;ReadPosRankSum=0.377;SOR=0.299;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,18:0.24:74
chr17	78854223	rs2289759	A	G	1181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.400;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=20;PP=668;ReadPosRankSum=-1.150;SC=AGTCGTGCCAAGCGGACCTCG;SOR=0.763;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=164;TCF=88;TCR=76;TR=52;WE=78854231;WS=78854213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,64:0.32:200
chr17	78854316	rs2289760	C	T	706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=21;PP=440;ReadPosRankSum=1.359;SC=ACGCTCTCCACGGGCTTGGGA;SOR=0.708;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=28;TCR=55;TR=32;WE=78854324;WS=78854306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,35:0.38:91
chr17	78859004	rs2016817	C	T	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=2.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.95;ReadPosRankSum=-0.718;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr17	78867712	rs117036523	C	T	1074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.223;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=28;PP=583;ReadPosRankSum=-0.578;SC=CCGAGGGTCTCCTCCCCACAC;SOR=0.598;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=166;TCF=79;TCR=87;TR=56;WE=78867720;WS=78867695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,62:0.35:179
chr17	78867733	rs3751943	A	G	746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.798;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=23;PP=432;ReadPosRankSum=-0.518;SC=AGAGCAGCACAGACCTGTGTC;SOR=0.374;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=116;TCF=41;TCR=75;TR=39;WE=78867741;WS=78867723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,42:0.34:124
chr17	78896529	rs2271603	C	T	4746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.419;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=105;PP=2842;ReadPosRankSum=1.648;SC=CCTAGGCCACCGTGAACGCCC;SOR=0.736;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=301;TCF=145;TCR=156;TR=201;WE=78896537;WS=78896519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,218:0.66:332
chr17	78897146	rs2271607	T	C	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=102;ReadPosRankSum=-0.392;SC=TCGGGAGCCATGATGGCATGC;SOR=0.354;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=10;WE=78897154;WS=78897136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,10:0.28:36
chr17	78897547	rs7217786	C	T	713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=24;PP=550;ReadPosRankSum=0.518;SC=ATGGCCTCAGCCTCAGGCTGC;SOR=0.941;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=40;TCF=6;TCR=34;TR=28;WE=78897569;WS=78897537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,28:0.68:41
chr17	78897561	rs6565491	C	T	754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=23;PP=832;SC=AGGCTGCTCACATCACCATGG;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=78897569;WS=78897537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	78919324	rs28403145	G	A	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.68;MQRankSum=-2.268;QD=3.32;ReadPosRankSum=1.166;SOR=0.055;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,4:0.17:24
chr17	78919327	rs68078977	GCTTGCAGTGAGC	G	52.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.36;MQRankSum=-2.613;QD=1.82;ReadPosRankSum=1.242;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,4:0.14:29
chr17	78919349	rs8080910	A	G	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.05;MQRankSum=-2.764;QD=2.16;ReadPosRankSum=0.401;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,5:0.14:35
chr17	78921117	rs4969231	C	T	917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=22;PP=544;ReadPosRankSum=-0.951;SC=AGTATCTGAACGGCCAGGACT;SOR=0.773;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=58;TCF=23;TCR=35;TR=36;WE=78921125;WS=78921107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,40:0.65:62
chr17	78937925	rs3751938	C	T	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-1.316;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=52;ReadPosRankSum=-1.550;SC=CCGGCATTTCCGGGCCTGAGG;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=4;WE=78937933;WS=78937915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr17	78938011	rs3751937	C	A	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.94;ReadPosRankSum=0.564;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,20:0.25:81
chr17	78938204	rs3751936	G	C	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.776;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=21;PP=369;ReadPosRankSum=0.261;SC=GGGGCACGGGGCGTCGGCTGC;SOR=1.078;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=113;TCF=41;TCR=72;TR=31;WE=78938212;WS=78938194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,36:0.29:126
chr17	78968524	rs56236825	C	T	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.192;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=140;ReadPosRankSum=-1.057;SC=GGCACCCTGTCGGCTGGGGTG;SOR=1.460;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=9;WE=78968532;WS=78968514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr17	78972067	rs148248306	G	A	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.662;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.150;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=21;ReadPosRankSum=-0.869;SC=CTCCGGCTGAGAGCGGCTGAC;SOR=0.074;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=4;WE=78972075;WS=78972057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr17	78972326	rs10871491	A	G	1294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=24;PP=771;SC=GGCCGTGGGCAAGCCCTGCTG;SOR=1.464;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=15;TCR=24;TR=39;WE=78972334;WS=78972316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr17	79004893	rs11548824	G	A	1556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.007;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=38;PP=867;ReadPosRankSum=-1.425;SC=TGAAGAACACGGGAGCCCATC;SOR=0.604;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=228;TCF=114;TCR=114;TR=79;WE=79004901;WS=79004883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,88:0.34:260
chr17	79006850	rs11870986	T	C	7852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=129;NR=133;PP=2965;SC=GCAGGCCAGCTCAGGAAGTAA;SOR=0.742;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=263;TCF=130;TCR=133;TR=262;WE=79006858;WS=79006840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,289:1.00:289
chr17	79007075	rs11150764	C	A	1716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=33;PP=1016;SC=TTCCTCCAGGCGAGCAGAGCT;SOR=1.214;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=24;TCR=33;TR=57;WE=79007083;WS=79007065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr17	79009153	rs8073224	T	C	3442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=52;NR=67;PP=1639;SC=CGTGTGCGCCTGGGTCGCGCG;SOR=1.187;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=119;TCF=52;TCR=67;TR=119;WE=79009161;WS=79009143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr17	79010533	rs4969350	G	A	1484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=14;PP=1003;SC=GGGGTTGTTAGGTTTGGTTTC;SOR=1.747;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=49;TCF=35;TCR=14;TR=48;WE=79010541;WS=79010523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr17	79010839	rs6565527	A	C	63.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=4;PP=66;SC=ACCGGGCAGTAGGCCTTCACC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=79010847;WS=79010829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	79060180	rs7210438	C	T	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=2.514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.69;ReadPosRankSum=-3.070;SOR=0.390;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,20:0.38:52
chr17	79077957	rs34057293	T	C	1380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.001;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=32;PP=833;ReadPosRankSum=-0.169;SC=ACGTGCCTCCTCAGACCCTAC;SOR=0.337;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=69;TCF=24;TCR=45;TR=52;WE=79077965;WS=79077947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,59:0.78:76
chr17	79077980	rs57792378	A	C	813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=24;PP=590;ReadPosRankSum=-1.087;SC=TCATGCCACAACCCTCAATAG;SOR=0.976;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=29;WE=79077988;WS=79077970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,31:0.82:38
chr17	79082362	rs55879913	C	T	1610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.023;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=38;PP=956;ReadPosRankSum=-0.088;SC=GTGAAGAGGCCGGGTGGGGCA;SOR=0.933;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=79;TCF=32;TCR=47;TR=62;WE=79082370;WS=79082352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,71:0.80:89
chr17	79089428	rs12450670	A	C	667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=2;PP=543;SC=AAAGCAGCGTATATTGTCTGT;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=79089436;WS=79089418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	79090198	rs62073016	C	T	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.299;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=235;ReadPosRankSum=-0.445;SC=TGGGGCTCTCCTGGGCCCCTC;SOR=1.609;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=13;WE=79090206;WS=79090188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr17	79093056	rs10655340	A	AGGAGC	98.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=49.12;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr17	79093142	rs144250320	C	CCGCGTGCCCTACCTCT	856.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=5;NR=4;PP=210;SC=GCCCTGCCTCCCGCGTGCCCT;SOR=1.329;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=16;TCF=8;TCR=8;TR=9;WE=79093150;WS=79093132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	79093427	rs62073018	C	T	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.688;HP=3;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.792;NF=1;NR=6;PP=413;ReadPosRankSum=0.754;SC=CCTGGGACCCCGGCCCGGCCC;SOR=1.911;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=7;WE=79093466;WS=79093417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr17	79093432	.	CGGCCCCGCTCCCACAGTCACGGGCCCA	C	65.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.036;NF=0;NR=2;PP=393;ReadPosRankSum=-0.319;SC=GACCCCGGCCCGGCCCCGCTC;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=2;WE=79093466;WS=79093417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr17	79093822	rs36000545	A	G	1243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.99;ReadPosRankSum=0.156;SOR=0.653;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,57:0.69:83
chr17	79093947	rs192541131	C	A	1231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=24;PP=731;ReadPosRankSum=-1.757;SC=CCCACCCCTTCCTGCGGGAGC;SOR=0.744;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=51;TCR=38;TR=55;WE=79093955;WS=79093937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,59:0.60:98
chr17	79095144	rs8073904	G	A	2166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=27;PP=1244;SC=AGGTGGCCTCGGCCGTGTCCT;SOR=0.770;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=71;TCF=43;TCR=28;TR=70;WE=79095152;WS=79095134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr17	79095629	rs7503604	C	A	2017.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=29;PP=1231;ReadPosRankSum=1.609;SC=TCAGCGTGGCCGCCCGCAGAG;SOR=0.766;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=73;TCR=42;TR=79;WE=79095637;WS=79095619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,89:0.67:133
chr17	79098838	rs141491493	GGCAGGGTGA	G	484.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=1.847;NF=0;NR=6;PP=1165;ReadPosRankSum=-1.905;SC=CAGGGGCAGGGGCAGGGTGAG;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=6;WE=79098854;WS=79098828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
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chr17	79105850	rs4969253	T	C	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.348;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=306;ReadPosRankSum=-2.264;SC=ATGTAGAGGCTGCACCTGTAT;SOR=1.706;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=44;TCF=18;TCR=26;TR=23;WE=79105858;WS=79105840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,21:0.46:46
chr17	79107017	rs148953276	CT	C	741.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.024;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=409;ReadPosRankSum=1.290;SC=CTTCAGAGGGCTCTGGAAGGT;SOR=0.588;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=47;TCF=17;TCR=30;TR=14;WE=79107025;WS=79107007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,25:0.32:77
chr17	79108141	rs4969397	A	G	2948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.557;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=48;PP=1680;ReadPosRankSum=-0.086;SC=GGATCCCACGACAGCTCCCGC;SOR=0.784;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=172;TCF=100;TCR=72;TR=117;WE=79108161;WS=79108131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,134:0.67:199
chr17	79140505	rs12946891	C	G	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.342;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=199;ReadPosRankSum=0.759;SC=GCCGCCCCCCCACCCCATGCC;SOR=0.990;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=38;TCF=26;TCR=12;TR=15;WE=79140513;WS=79140495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,16:0.39:41
chr17	79152798	rs9894262	G	A	1533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=22;PP=783;ReadPosRankSum=2.284;SC=GCCCCTGGGAGCTGCCCGTGC;SOR=0.589;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=43;TCR=28;TR=55;WE=79152806;WS=79152788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,66:0.78:85
chr17	79155116	rs906180	A	G	4701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=87;PP=2790;SC=TGCTGCCCACAGACATGAGAC;SOR=0.972;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=159;TCF=72;TCR=87;TR=159;WE=79155124;WS=79155106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr17	79163649	rs2292182	G	A	734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.461;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=18;PP=399;ReadPosRankSum=-1.848;SC=GCAGCCTGCAGCACACCCACA;SOR=0.546;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=108;TCF=64;TCR=44;TR=40;WE=79163657;WS=79163639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,43:0.36:120
chr17	79165171	rs869370	G	A	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.202;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=280;ReadPosRankSum=0.408;SC=GTTGCCACCCGGAGCCGGCCC;SOR=1.106;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=79;TCF=29;TCR=50;TR=22;WE=79165179;WS=79165161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,22:0.26:85
chr17	79166103	rs870187	T	C	525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=279;ReadPosRankSum=-1.227;SC=CCCACCTGGGTGCCCAGGCCC;SOR=0.938;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=34;TCF=21;TCR=13;TR=23;WE=79166111;WS=79166093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,25:0.69:36
chr17	79170576	rs1542961	C	T	1553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.054;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=16;PP=802;ReadPosRankSum=-0.404;SC=GCCGGCTCAGCGCCTTCTCTG;SOR=1.061;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=78;TCF=52;TCR=26;TR=56;WE=79170584;WS=79170566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,68:0.72:95
chr17	79171967	rs2659016	A	G	1079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=12;PP=607;SC=GCGGGGCAGCACGTCCGGCTC;SOR=1.364;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=28;TCR=12;TR=40;WE=79171975;WS=79171957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	79172119	rs112770207	G	C	1399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.846;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=27;PP=905;ReadPosRankSum=0.639;SC=CAGGGAGACAGATGCAGCAAG;SOR=0.831;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=73;TCF=38;TCR=35;TR=52;WE=79172127;WS=79172109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,60:0.67:89
chr17	79173184	rs2659015	T	C	1647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=17;PP=1104;SC=CTCTCACCAGTATTGTTGGCC;SOR=1.532;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=37;TCR=17;TR=54;WE=79173192;WS=79173174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr17	79173224	rs2725419	T	C	2800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=38;PP=1470;SC=TGCCGCCTGGTGTGGGGGACA;SOR=0.994;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=56;TCR=38;TR=94;WE=79173232;WS=79173214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr17	79173398	rs906176	A	G	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;ReadPosRankSum=-0.148;SC=GGACGACCCCAGGCTCCACAG;SOR=0.716;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=21;TCF=7;TCR=14;TR=9;WE=79173406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr17	79173462	rs906175	C	T	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=75;ReadPosRankSum=0.860;SC=CAGCAGCAGCCCCGCACGGTC;SOR=0.775;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=23;TCF=13;TCR=10;TR=9;WE=79173470;WS=79173452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr17	79174221	rs2466773	T	C	1670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=28;PP=750;SC=ATGGTGACAGTGGCCTGGTTC;SOR=1.329;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=21;TCR=28;TR=49;WE=79174229;WS=79174211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr17	79180369	rs55844247	C	G	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.922;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=2;PP=398;ReadPosRankSum=1.472;SC=TGCAAGACGCCACCTGGCAGC;SOR=1.426;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=43;TCF=39;TCR=4;TR=24;WE=79180377;WS=79180359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,25:0.56:45
chr17	79180775	rs2256881	A	G	1341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=11;PP=1049;SC=TCCCATACAGACAGGTGGATG;SOR=2.007;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=33;TCR=11;TR=44;WE=79180783;WS=79180765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	79182667	rs9896314	A	G	751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=3;PP=492;SC=GGAGCAGGCCAGGGTGGGGCA;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=25;WE=79182675;WS=79182657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	79182778	rs62075318	T	C	1093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.032;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=22;PP=622;ReadPosRankSum=0.523;SC=TGTTGGATCTTCTAAGGTTGT;SOR=0.519;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=148;TCF=88;TCR=60;TR=54;WE=79182786;WS=79182768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,61:0.37:164
chr17	79202956	rs2048057	T	C	815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=1.498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.03;ReadPosRankSum=-0.545;SOR=0.843;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,46:0.40:116
chr17	79204661	.	C	G	31	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=22;MQ=60.0;NF=1;NR=2;PP=31;QD=21.9237375157;SC=CCAGACACCACAGCCCTGTCC;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=3;WE=79204669;WS=79204651;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr17	79205736	rs11655759	G	A	2504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.562;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=47;PP=1331;ReadPosRankSum=0.095;SC=TGCTCAGGTCGCTGTTCTGGG;SOR=0.656;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=161;TCF=86;TCR=75;TR=101;WE=79205744;WS=79205726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,115:0.63:183
chr17	79210707	rs2271089	G	A	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=2.336;HP=3;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=202;ReadPosRankSum=-0.054;SC=ACCCTGGGCCGCTCGTCTGCT;SOR=1.609;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=11;WE=79210715;WS=79210697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
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chr17	79244802	rs2292184	T	C	2812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.529;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=52;PP=1283;ReadPosRankSum=0.806;SC=TGGTCGCTCCTGTGAGGCCCA;SOR=0.759;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=182;TCF=99;TCR=83;TR=116;WE=79244810;WS=79244792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,132:0.64:207
chr17	79244903	rs11150779	A	G	1291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=27;PP=695;ReadPosRankSum=0.083;SC=TGCCCTGCACACGGGTGAGCA;SOR=0.786;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=31;TCR=44;TR=46;WE=79244911;WS=79244893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,57:0.65:88
chr17	79246270	rs3841622	G	GC	87.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.746;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=152;ReadPosRankSum=1.884;SC=TGATGCCGAAGCCCCGGGTCC;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=6;WE=79246278;WS=79246260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr17	79249997	rs9898133	C	T	2534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.715;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=55;PP=1415;ReadPosRankSum=-0.101;SC=GACATCCTAGCCGAGTGGCAC;SOR=0.917;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=162;TCF=76;TCR=86;TR=99;WE=79250005;WS=79249987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,115:0.64:180
chr17	79255912	rs7213540	C	T	1637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=20;PP=960;ReadPosRankSum=0.372;SC=GACCTGGGCACGAGCCTGCTG;SOR=0.755;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=94;TCF=64;TCR=30;TR=61;WE=79255920;WS=79255902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,72:0.67:107
chr17	79255998	rs10871494	G	A	4247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.885;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=73;PP=2403;ReadPosRankSum=0.892;SC=CCACGAACATGAACACGGTGT;SOR=0.758;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=278;TCF=156;TCR=122;TR=168;WE=79256006;WS=79255988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,198:0.63:315
chr17	79258787	rs8077394	A	G	2374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.689;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=60;PP=1549;ReadPosRankSum=-0.057;SC=GGGCGATTTCACAGAAACCCA;SOR=0.947;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=166;TCF=76;TCR=90;TR=105;WE=79258795;WS=79258777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,111:0.61:181
chr17	79268562	rs8064597	A	G	1217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=17;PP=837;ReadPosRankSum=-2.612;SC=AGGACGACCCAGCCAGACGCC;SOR=0.634;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=57;TCR=26;TR=54;WE=79268570;WS=79268552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,56:0.63:89
chr17	79372928	.	A	AGTGT,AGT	489.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.473;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=6.643;HP=2;HapScore=3;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.929;NF=8,8;NR=12,12;PP=327,324;ReadPosRankSum=-0.503;SC=TGTGCGTGTGAGTGTGTGTGT;SOR=0.119;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=35;TCF=16;TCR=19;TR=20,20;WE=79372937;WS=79372918;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.64:39
chr17	79372952	.	T	TGC	313	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=25;MQ=60.17;NF=7;NR=12;PP=313;QD=16.6842105263;SC=TGTGTGTGTGTGCGAGTGTGC;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=19;TCR=34;TR=19;WE=79372960;WS=79372942;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:34,19:0.36:53
chr17	79373203	rs182760976	C	A	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.955;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=152;ReadPosRankSum=-0.595;SC=CCCCGCCACCCGGCCTGGCCG;SOR=2.093;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=9;WE=79373211;WS=79373193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr17	79380614	rs12450346	C	T	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=202;ReadPosRankSum=-1.142;SC=ATGAGGTCGGCGCGGGGTTTG;SOR=1.609;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=12;WE=79380622;WS=79380604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr17	79380707	.	G	A	878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.498;ClippingRankSum=0.000;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.444;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=14;PP=553;ReadPosRankSum=-0.612;SC=CTGTCCACACGATTAGGTTCC;SOR=0.877;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=122;TCF=77;TCR=45;TR=43;WE=79380715;WS=79380697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,49:0.35:139
chr17	79385306	rs146875944	GCCTGCCTGCCTTCCTTCCTT	G	81.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;NF=6;NR=7;PP=1109;SC=CTGCCTGCCTGCCTGCCTGCC;SOR=1.179;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=6;TCR=7;TR=13;WE=79385338;WS=79385296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr17	79386952	rs730209	A	G	2466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.558;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=62;PP=1569;ReadPosRankSum=0.624;SC=ACGCTCCCCAACCCCAGAGTG;SOR=1.060;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=129;TCF=45;TCR=84;TR=92;WE=79386960;WS=79386942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,103:0.71:145
chr17	79389251	rs9897258	C	T	1029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.576;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=22;PP=514;ReadPosRankSum=1.446;SC=GTAACGCGAGCGCGAGGCCCC;SOR=0.624;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=157;TCF=91;TCR=66;TR=52;WE=79389259;WS=79389232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,62:0.34:182
chr17	79389411	rs11655888	C	T	926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.825;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=22;PP=558;ReadPosRankSum=0.716;SC=GAGCCAACCTCGTTTTGGGAG;SOR=0.390;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=33;WE=79389419;WS=79389401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,39:0.85:46
chr17	79390260	rs151241907	G	GGT,GGTGT	786.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=47;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=15;NF=2,2;NR=11,11;PP=280,69;SC=GTCCATTGAGGGTGTGTGTGT;SOR=1.179;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=13,13;WE=79390268;WS=79390250;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.61,0.39:23
chr17	79390298	.	T	TGCGTGTGCGCGTGTGTGTCCATGAAAATGGGTGTGTGCATGTGTGTGCATGTGTATGTCCATGAGGATGGGTGTGTGC,TGC	2618.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.33;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=17;PP=1764;SC=GATGGGTGTGTGCATGTGTGC;SOR=0.914;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=35;TCF=18;TCR=17;TR=33;WE=79390314;WS=79390288;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:18
chr17	79390370	rs36169187	CGT	C	1966.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.700;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=30;PP=1272;ReadPosRankSum=0.468;SC=GGTGTATGTGCGTGTGTGTGT;SOR=0.995;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=93;TCF=22;TCR=71;TR=39;WE=79390381;WS=79390360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,65:0.38:169
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chr17	79395814	rs57878731	AT	A,ATT	1023.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=3;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=2,2;NR=38,38;PP=418,226;ReadPosRankSum=2.492;SC=TCCTCTCGTGATTTTTTTTTT;SOR=0.843;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=55;TCF=3;TCR=52;TR=40,40;WE=79395823;WS=79395804;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.71:70
chr17	79409189	rs12952981	G	A	2163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=27;PP=1137;SC=ACCCCGAGGGGCCTGCGAGGG;SOR=0.798;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=40;TCR=27;TR=67;WE=79409197;WS=79409179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr17	79409309	rs12938890	A	G	1893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=37;PP=1116;SC=GCGGCCTGGCACGGGGGTGGT;SOR=0.992;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=31;TCR=37;TR=68;WE=79409317;WS=79409299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr17	79409434	rs12939225	A	G	1030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=15;PP=577;SC=ACGCCGGGCCACCCCCGCCCC;SOR=0.902;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=21;TCR=15;TR=36;WE=79409442;WS=79409424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr17	79409710	rs12943867	G	A	4371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.549;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=60;PP=2826;ReadPosRankSum=1.507;SC=CCCACCTGAAGGCCGAGGGCA;SOR=0.633;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=86;TCR=61;TR=146;WE=79409718;WS=79409700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,162:0.99:163
chr17	79411662	rs11655860	G	A	2381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.07;SOR=0.757;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr17	79414307	rs7213444	A	G	4447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.290;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=77;PP=2719;ReadPosRankSum=-0.785;SC=CCCCTACCCTACCGAGCGGGG;SOR=0.667;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=152;TCF=74;TCR=78;TR=149;WE=79414315;WS=79414297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,165:0.98:168
chr17	79414897	rs11650750	C	A	2229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=27;NR=47;PP=1286;SC=GTTGCCGCCACCCCCCAGAGT;SOR=1.501;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=27;TCR=47;TR=74;WE=79414905;WS=79414887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr17	79414914	rs10871497	A	G	1896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=40;PP=1242;SC=GAGTCCCAGCAGTGGGACCCA;SOR=1.716;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=20;TCR=40;TR=60;WE=79414922;WS=79414904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr17	79418260	rs6565571	A	G	2404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=48;PP=1417;SC=GCTTCCGTGCACGAGGCCTCA;SOR=1.295;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=32;TCR=48;TR=80;WE=79418268;WS=79418250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr17	79418599	rs28576195	C	T	1121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=28;NR=8;PP=570;SC=GTCTTCAAGGCTGGGTGGCTT;SOR=1.609;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=38;TCF=28;TCR=10;TR=36;WE=79418607;WS=79418589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr17	79419025	rs35572189	G	A	1196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=25;PP=696;SC=GCCATCGACCGGCTGGACACG;SOR=1.251;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=17;TCR=25;TR=42;WE=79419033;WS=79419015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr17	79419159	rs142997686	TGGGAGGGTCGCAGCACCCCCACCCCC	T	233.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.6;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=1;PP=952;SC=CGGGGGGGCCTGGGAGGGTCG;SOR=1.329;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=2;TCF=1;TCR=1;TR=2;WE=79419192;WS=79419149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	79422252	rs1478610	G	A	1039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=30;NR=5;PP=855;SC=TGGGGCGGCCGGGCCTGCATC;SOR=3.321;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=35;WE=79422260;WS=79422242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr17	79422289	rs1842041	C	T	2221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=53;NR=23;PP=1431;SC=CCCCATGCCCCCAGGGCGGTG;SOR=1.795;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=53;TCR=23;TR=76;WE=79422297;WS=79422279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr17	79424516	rs12601317	A	G	2424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=37;PP=1157;SC=GCTGCTGCACACCGGGGCCAG;SOR=1.143;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=25;TCR=37;TR=62;WE=79424524;WS=79424506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr17	79424537	rs34224936	C	T	1897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=29;PP=860;SC=TGTGGCCGTGCTGGGGCCCTC;SOR=1.721;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=13;TCR=29;TR=42;WE=79424545;WS=79424527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr17	79426021	rs34202212	GC	G	3012.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=15;NR=37;PP=2134;SC=AAGGGTGCCAGCCGCCTGGGG;SOR=0.934;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=58;TCF=16;TCR=42;TR=52;WE=79426029;WS=79426011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr17	79426416	rs4969272	A	G	1763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=31;PP=1126;SC=GGACAAAGGAAGGCCTTGGCC;SOR=1.460;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=20;TCR=31;TR=51;WE=79426424;WS=79426406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr17	79426481	rs4969273	A	G	1706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=19;PP=1177;ReadPosRankSum=-0.580;SC=GCCCTGGGCCAGGCCCCACCT;SOR=0.606;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=60;TCF=41;TCR=19;TR=59;WE=79426489;WS=79426471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,63:0.98:64
chr17	79426756	rs11652589	C	T	819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=23;PP=599;SC=AGACAGAGTACGACAATAAAA;SOR=3.690;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=26;WE=79426764;WS=79426746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	79478007	rs1135989	G	A	1417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=21;PP=984;SC=GCATCCTGTCGGCAATGCCCG;SOR=0.776;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=23;TCR=21;TR=44;WE=79478027;WS=79477997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr17	79478019	rs1139405	G	A	1358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=19;PP=949;SC=CAATGCCCGGGTACATGGTGG;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=23;TCR=19;TR=42;WE=79478027;WS=79477997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr17	79479469	rs8064532	A	C	4397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=87;PP=2794;SC=TCCCGCGGGGAAGCCTCGGCC;SOR=1.406;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=53;TCR=87;TR=140;WE=79479477;WS=79479459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr17	79495519	rs2075720	C	T	2479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=24;PP=1613;SC=ACTCAGAGGGCGCATCCCAGG;SOR=1.718;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=60;TCR=24;TR=84;WE=79495527;WS=79495509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr17	79502316	rs138055235	A	C	209.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=5;PP=117;SC=CACCATCCGCATCCCCATCTC;SOR=1.863;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=79502324;WS=79502306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	79508263	rs62076028	A	G	758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=17;NR=6;PP=496;SC=CCGAGTGACTAGAGGGGGGCC;SOR=1.445;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=23;WE=79508271;WS=79508253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	79508400	rs14422	T	C	2778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.49;SOR=0.711;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr17	79508484	rs58483803	G	A	1271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=24;PP=779;SC=ACACCCCTTGGAGCAGGGTGA;SOR=1.280;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=15;TCR=24;TR=39;WE=79508492;WS=79508474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr17	79508506	rs2228698	G	T	811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=15;PP=504;SC=CCTCTCCCTCGAGCTGCCTGG;SOR=1.460;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=8;TCR=15;TR=23;WE=79508514;WS=79508496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr17	79510899	rs7406506	A	G	792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=6;PP=582;SC=GCGGCAGAGCAGACTTGGATC;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=29;WE=79510907;WS=79510889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	79511135	rs8077430	A	G	4354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=80;PP=2599;SC=GGCACAGGTCAGTCATGGCCA;SOR=0.995;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=146;TCF=66;TCR=80;TR=146;WE=79511143;WS=79511125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr17	79513881	rs369579337	TA	T	146.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.47;MQRankSum=0.919;QD=7.34;ReadPosRankSum=1.058;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr17	79514129	rs11552304	G	A	4111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=58;PP=2537;SC=TGTGTGTGGCGGGGCCAGGCC;SOR=0.848;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=136;TCF=77;TCR=59;TR=135;WE=79514137;WS=79514119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr17	79514832	rs7224579	G	A	4389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=85;PP=2784;SC=GTGGAGCCACGCCAGAGAGTG;SOR=0.972;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=150;TCF=65;TCR=85;TR=150;WE=79514840;WS=79514822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr17	79515075	rs6565593	A	G	742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=16;PP=438;SC=TTGGCTCCCCAGAATGTTCCT;SOR=1.781;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=23;WE=79515083;WS=79515065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	79519382	rs4076968	G	A	1338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=31;PP=874;SC=GTCAGAGTGAGAAGCCCCGGC;SOR=2.935;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=8;TCR=31;TR=39;WE=79519390;WS=79519372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr17	79526569	rs4076819	C	G	825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=22;PP=592;SC=CAGTGCTGGTCCTGCCCACAC;SOR=2.019;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=30;WE=79526577;WS=79526559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	79530993	rs8070929	G	T	2105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=43;PP=1277;SC=TGTAATCCCAGCTACTCGGGA;SOR=1.207;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=31;TCR=43;TR=74;WE=79531001;WS=79530983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr17	79539209	rs6565598	A	T	634.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.63;ReadPosRankSum=-2.035;SOR=0.653;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,27:0.75:36
chr17	79567610	rs7213849	C	T	640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=18;PP=476;SC=ATGCGACACGCCTCCCGGCTT;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=79567618;WS=79567600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	79573860	rs10695650	C	CTTAA	3529.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=27;PP=1687;SC=AGAGAAGCAACTTAAACATCA;SOR=0.941;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=36;TCF=4;TCR=32;TR=31;WE=79573868;WS=79573850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr17	79577127	rs8077038	T	G	649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=1;PP=509;SC=GTAAGTTCTTTGAACCACTCA;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=79577135;WS=79577117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	79615225	rs7406494	G	T	237.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=6;PP=124;SC=CTGCCCGCAGGGGGGCGGCGT;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=79615233;WS=79615215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	79637349	rs10438817	T	C	4667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=83;PP=2471;SC=AGGGGGAGTCTGACGGGGCCT;SOR=0.784;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=166;TCF=83;TCR=83;TR=166;WE=79637357;WS=79637339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr17	79662133	rs202027239	G	A	1635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.634;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=30;PP=986;ReadPosRankSum=2.026;SC=TAGTGGCAGGGTCCCTTGGAA;SOR=0.510;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=98;TCF=56;TCR=42;TR=66;WE=79662141;WS=79662123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,72:0.66:109
chr17	79769169	rs5386	C	G	1824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=28;PP=1199;ReadPosRankSum=2.105;SC=CCCTGGGGGCCCTGCTCCTCG;SOR=0.784;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=61;TCF=33;TCR=28;TR=60;WE=79769177;WS=79769159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,67:0.97:69
chr17	79784101	.	G	GCA	524.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.920;ClippingRankSum=0.000;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.156;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.430;NF=3;NR=8;PP=236;ReadPosRankSum=-1.329;SC=TGCCTTGTGTGCACACACACA;SOR=1.006;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=42;TCF=13;TCR=29;TR=11;WE=79784110;WS=79784091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,26:0.32:82
chr17	79862882	rs146889521	C	G	4292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=64;PP=2848;SC=GGGGAGGGCACGGTAAGTCTA;SOR=0.803;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=143;TCF=79;TCR=64;TR=143;WE=79862890;WS=79862872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr17	79872129	rs1879568	A	G	6365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.192;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=108;NR=108;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.707;SC=ACCCTCGGGCAGGCAGGGGCT;SOR=0.369;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=217;TCF=109;TCR=108;TR=216;WE=79872137;WS=79872119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,243:1.00:244
chr17	79872241	rs1879569	A	G	4878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=72;PP=2733;SC=TCCCAGTTCAAAGGCTGCCCC;SOR=0.774;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=149;TCF=77;TCR=72;TR=149;WE=79872249;WS=79872231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr17	79881137	.	CA	C	35	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;FR=0.5068;HP=1;HapScore=2;MGOF=85;MMLQ=15;MQ=57.84;NF=0;NR=4;PP=35;QD=15.25;SC=ACCCTCGCCGCACCCCCCCCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=79881145;WS=79881127;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr17	79891147	rs61747618	T	C	4130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=61;PP=2179;ReadPosRankSum=0.578;SC=GGCCAGAAGGTGACAGAGCGG;SOR=0.944;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=146;TCF=84;TCR=62;TR=143;WE=79891155;WS=79891137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,158:0.99:160
chr17	79893962	rs34419046	G	A	4587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=58;PP=2745;SC=AGCCCCACAGGGACTCAGTCT;SOR=1.192;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=150;TCF=92;TCR=58;TR=150;WE=79893970;WS=79893938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr17	79898644	rs2293098	G	A	1890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=45;NR=17;PP=1146;SC=CCCTCGCAGAGCCTGGAGCTG;SOR=1.751;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=45;TCR=17;TR=62;WE=79898652;WS=79898634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr17	79899272	rs4796856	A	G	5621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=83;PP=2965;SC=GGCTCGGGGGAACACTCCCGC;SOR=0.713;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=174;TCF=91;TCR=83;TR=174;WE=79899280;WS=79899262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr17	79899495	rs4796854	G	A	5016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=78;PP=2647;SC=CACCCCGGTGGGCCACCAGGC;SOR=0.944;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=156;TCF=78;TCR=78;TR=156;WE=79899503;WS=79899485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr17	79899698	rs4796852	G	A	480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=14;PP=433;SC=AGTCCTCTGCGGTAGTGGCAG;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=79899706;WS=79899688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	79911164	rs78951919	A	AG	406.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=363;SC=AAACCGGGGGAGGGGGTCACA;SOR=2.985;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=10;WE=79911172;WS=79911154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	79912103	rs4796851	C	T	6444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=107;PP=2965;SC=ATGTCATGGACGCAAGCTGCC;SOR=0.795;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=215;TCF=108;TCR=107;TR=215;WE=79912111;WS=79912093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr17	79914661	rs35872546	T	C	4690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=83;PP=2965;SC=CTGCCGTGGGTCTCGTCCCCC;SOR=0.964;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=156;TCF=73;TCR=83;TR=155;WE=79914669;WS=79914651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr17	79915629	rs36023555	A	G	167.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=1;PP=118;SC=CCTTCCATGCACCCTGCACAC;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=79915637;WS=79915619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	79915647	rs35069988	A	G	296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=1;PP=200;SC=CACCGTCCTCACCCCTCACCT;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=79915655;WS=79915637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	79915863	rs34107062	A	G	2229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=34;NR=37;PP=1176;SC=GCTGGCAGAGAAGTTCTTGCC;SOR=1.075;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=34;TCR=37;TR=71;WE=79915871;WS=79915853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr17	79935636	rs9906594	C	G	679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.56;SOR=2.400;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	79936986	rs55671960	T	C	1371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=11;PP=880;SC=CTGAATGCCCTTGGCTGACCT;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=42;WE=79936994;WS=79936976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr17	79952916	rs116096769	G	A	1132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=20;PP=584;SC=GCCGGCCCTCGGAGCCCGGGC;SOR=1.445;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=14;TCR=20;TR=34;WE=79952924;WS=79952906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr17	79952944	rs59606152	C	T	666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=10;PP=279;SC=AAACCTCCCTCGGCGCCCTGT;SOR=1.358;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=9;TCR=10;TR=19;WE=79952952;WS=79952934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	79954544	rs8074498	T	A	4290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=81;PP=2854;ReadPosRankSum=-0.082;SC=GGACAGAGACTGGGGGGCCCT;SOR=0.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=158;TCF=76;TCR=82;TR=156;WE=79954552;WS=79954520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,163:0.99:165
chr17	79977813	rs4969471	C	G	1800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=38;PP=1147;SC=GTCAGCGCCACGCCCCGCCCT;SOR=1.410;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=60;TCF=21;TCR=39;TR=59;WE=79977821;WS=79977803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr17	79980891	rs4444402	C	T	303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=5;NR=6;PP=163;SC=AGCCAATGAGCCCGGAGCGCG;SOR=1.022;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=11;TCF=5;TCR=6;TR=11;WE=79980899;WS=79980881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	79982477	rs11659000	T	C	1065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=13;PP=813;SC=ACCCCAGGCTTGTCCCCTGGC;SOR=1.493;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=27;TCR=13;TR=40;WE=79982485;WS=79982467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr17	79986156	rs72861736	C	T	3599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=51;PP=1994;SC=TTGTCTGCTGCCAATGAAAAG;SOR=0.831;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=67;TCR=51;TR=118;WE=79986164;WS=79986146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr17	79990728	rs72861739	C	T	5275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=82;PP=2965;ReadPosRankSum=1.309;SC=GGGCCAGCCCCGGGAGCTGGG;SOR=0.227;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=172;TCF=90;TCR=82;TR=171;WE=79990736;WS=79990718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,191:0.99:192
chr17	79990972	rs10708637	CG	C	744.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=16;PP=636;SC=AATTGCGATACGGGTTCTGCC;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=17;WE=79990980;WS=79990962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	79994019	rs8067668	A	G	5602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.18;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr17	79994026	rs6502047	G	A	5675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.33;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr17	79994600	rs61739740	C	T	7634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=119;NR=135;PP=2965;SC=AGCTCACCTGCGACACCTGGA;SOR=0.904;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=254;TCF=119;TCR=135;TR=254;WE=79994608;WS=79994590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,279:1.00:279
chr17	79995320	rs113680823	A	G	541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.09;SOR=1.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	79995490	rs113364103	C	CTT	3683.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=35;PP=1812;SC=CTTTGCCCACCTTTCCCCGCC;SOR=0.941;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=6;TCR=41;TR=40;WE=79995498;WS=79995480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr17	79995616	rs57552134	A	G	2384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.59;SOR=0.845;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr17	80000899	rs9907483	A	G	840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=22;PP=616;SC=GCATATGTGAACATGCAGGCC;SOR=3.690;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=25;WE=80000907;WS=80000889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	80006504	rs1128009	T	C	308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=9;NR=1;PP=254;SC=CTCACTGGTGTGGCCGTGGCA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=80006512;WS=80006494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	80006812	rs8069068	C	T	584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=7;NR=10;PP=376;SC=GGGCCGTGGGCGGAGGGAGCA;SOR=1.402;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=18;TCF=7;TCR=11;TR=17;WE=80006820;WS=80006802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	80006957	rs12948507	A	C	2232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=25;PP=1175;SC=TCACCACGTTATGTGGGTTCT;SOR=1.048;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=47;TCR=25;TR=72;WE=80006965;WS=80006947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr17	80007018	rs12939972	T	C	3310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=38;PP=1960;SC=GTGGGCAGAGTGTGTGGCCTG;SOR=1.258;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=68;TCR=38;TR=106;WE=80007026;WS=80007008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr17	80007055	rs62078730	T	C	4794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=57;PP=2929;SC=CGCCTGCCCCTGGCCAGGAGC;SOR=1.219;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=95;TCR=57;TR=152;WE=80007063;WS=80007045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr17	80007080	rs28404464	T	C	10602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.36;SOR=1.188;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr17	80007088	rs28696285	C	G	11286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=42.11;ReadPosRankSum=1.333;SOR=0.380;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,267:1.00:268
chr17	80007307	rs11653935	A	G	11551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=445;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=207;NR=199;PP=2965;SC=CCCAGCTGGCATGGGGCCTCA;SOR=0.698;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=406;TCF=207;TCR=199;TR=406;WE=80007315;WS=80007297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,445:1.00:445
chr17	80007887	rs9915228	A	G	13304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FS=3.180;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=42.37;ReadPosRankSum=1.204;SOR=0.357;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,313:1.00:314
chr17	80007897	rs9915742	G	T	12946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FS=3.272;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=44.49;ReadPosRankSum=0.882;SOR=0.425;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,290:1.00:291
chr17	80008018	rs9893491	A	G	5530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=89;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.069;SC=CTTGGAGCAAAAAGAGCCGGG;SOR=0.243;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=189;TCF=99;TCR=90;TR=187;WE=80008026;WS=80008008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,205:1.00:206
chr17	80008392	rs9916764	G	T	5645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=100;NR=89;PP=2965;SC=GGAGGCTCCTGGCGTTCACAT;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=189;TCF=100;TCR=89;TR=189;WE=80008400;WS=80008382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr17	80008676	rs4464142	A	C	3051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=60;PP=1895;SC=CACGTAGAGGATGGCACTGGG;SOR=1.655;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=90;TCF=30;TCR=60;TR=90;WE=80008684;WS=80008666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr17	80009156	rs28552909	T	G	3609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.14;SOR=1.406;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr17	80009668	rs117999554	C	G	388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=12;NR=5;PP=292;SC=CCCGGCGCTGCGAGCGGAGAA;SOR=1.473;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=17;WE=80009676;WS=80009658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	80013235	rs4969464	A	G	2006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=32;PP=1135;SC=GGGCACATGTACAGGTGTAGG;SOR=0.774;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=34;TCR=32;TR=66;WE=80013243;WS=80013225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr17	80014861	rs4969484	T	G	3924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=62;PP=2303;SC=GTGGGCTGGCTTGAGGGGGGG;SOR=0.734;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=136;TCF=74;TCR=62;TR=136;WE=80014869;WS=80014851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr17	80018714	rs58204115	C	T	4734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=91;NR=69;PP=2743;SC=CCTGCAAGGCCGGGCTCCCAC;SOR=0.851;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=160;TCF=91;TCR=69;TR=160;WE=80018722;WS=80018704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr17	80020974	rs4531805	C	T	549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=14;PP=375;SC=TGGGAGGCAGCCCGGGCCACC;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=80020982;WS=80020964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	80022656	rs34249409	C	CG	398.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=0;PP=370;SC=ATTCCAGGACCGGGAACCCAA;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=11;WE=80022664;WS=80022646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	80038952	rs4246444	T	G	749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=3;PP=624;SC=CGAAGGGCGGTATGCCTGCCG;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=80038960;WS=80038946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	80039028	rs4246445	A	G	2074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=30;PP=1173;SC=CCGCCTGGCCACCCACACGCA;SOR=0.968;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=42;TCR=30;TR=72;WE=80039036;WS=80039018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr17	80039481	rs1140616	G	A	2956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=59;NR=34;PP=1618;SC=GCTCACCCAGGATGTGTGCCA;SOR=0.912;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=59;TCR=34;TR=93;WE=80039489;WS=80039471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr17	80040607	rs4969465	T	C	789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=9;NR=15;PP=595;SC=GTCTCTTCCCTACACGCCGGG;SOR=1.358;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=9;TCR=15;TR=24;WE=80040615;WS=80040597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	80041466	rs2229425	G	A	8943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=163;NR=136;PP=2965;SC=AGCACCTCACGCTGGCCTGCA;SOR=0.736;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=299;TCF=163;TCR=136;TR=299;WE=80041474;WS=80041456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,335:1.00:335
chr17	80043349	rs17848939	C	T	1785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=22;PP=1084;SC=CCCTGCCCGGCGGCCGCACCT;SOR=0.925;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=33;TCR=22;TR=55;WE=80043357;WS=80043339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr17	80043739	rs2229422	A	G	897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.94;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr17	80050272	rs17848925	G	A	207.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=1;PP=110;SC=CCCAGCCATGGCGCAACCCAG;SOR=1.863;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=80050280;WS=80050269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	80050554	rs10591316	CGG	C	968.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.708;HP=16;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.915;NF=16;NR=7;PP=296;ReadPosRankSum=1.943;SC=GTGAGTGGGGCGGGGGGGGGG;SOR=3.407;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=36;TCF=20;TCR=16;TR=23;WE=80050564;WS=80050544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,30:0.88:34
chr17	80051183	rs2228309	A	G	3231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=52;PP=1751;SC=TCAGCAGGACATTGATGCCCC;SOR=0.742;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=111;TCF=59;TCR=52;TR=111;WE=80051191;WS=80051173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr17	80053166	rs45555535	C	T	5354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=84;PP=2965;SC=CAGGAGCCCTCGGCGCAGCAG;SOR=0.842;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=173;TCF=89;TCR=84;TR=173;WE=80053174;WS=80053156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr17	80054375	rs17848934	C	A	2573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=60;PP=1672;SC=GGCCACGACACCCCCGTCAAC;SOR=1.739;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=27;TCR=60;TR=87;WE=80054383;WS=80054365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr17	80059596	rs13949	T	C	4096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=79;NR=51;PP=2166;SC=TTGGGGGGCCTCTGGCAGCCT;SOR=0.873;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=130;TCF=79;TCR=51;TR=130;WE=80059604;WS=80059586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr17	80059758	rs7225637	G	A	2539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=48;PP=1617;SC=AGGTAAAGAGGAAAAAACAGC;SOR=1.130;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=85;TCF=37;TCR=48;TR=85;WE=80059766;WS=80059748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr17	80065244	rs112663677	C	CGGGAGTG	322.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=0;PP=197;SC=ACAGATGCCGCGGGAGTGGGG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=3;WE=80065252;WS=80065234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	80071244	rs7211808	T	C	4001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=75;NR=60;PP=2241;SC=CAGCGTGACCTGCTCTCTCAG;SOR=0.927;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=135;TCF=75;TCR=60;TR=135;WE=80071252;WS=80071234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr17	80085283	rs73360060	C	T	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=46;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=191;SC=AGTCAGCCTGCGCCCGGGTGT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=80085303;WS=80085273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	80085295	rs74001545	C	T	736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=46;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=1;PP=466;SC=CCCGGGTGTACGGTGCTGCAT;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=80085303;WS=80085273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	80085326	rs62078305	G	A	2077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=8;PP=847;SC=TGTGCGCCCGGGTGTACGGTG;SOR=2.461;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=33;TCR=8;TR=41;WE=80085334;WS=80085316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr17	80085341	rs62078306	A	G	2666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.237;NF=49;NR=16;PP=1192;ReadPosRankSum=1.493;SC=ACGGTGCTGCACTAGGAAATG;SOR=1.014;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=66;TCF=50;TCR=16;TR=65;WE=80085349;WS=80085331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,71:0.99:72
chr17	80085633	rs11077969	A	G	3797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=58;PP=2253;SC=CAACCTCCACATGTCCTGGAG;SOR=0.809;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=76;TCR=58;TR=134;WE=80085641;WS=80085623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr17	80085703	rs7213172	G	T	3345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=64;PP=2063;ReadPosRankSum=-0.751;SC=TCAGGGTGCTGGGGAGCCTGG;SOR=0.376;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=117;TCF=52;TCR=65;TR=116;WE=80085711;WS=80085693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,125:0.99:126
chr17	80086386	rs7406162	C	T	1321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.58;SOR=1.460;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr17	80086389	rs7406163	C	T	1370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.69;SOR=1.536;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	80086395	rs4625783	T	C	1395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.30;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr17	80086597	rs4459614	C	T	805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=7;NR=19;PP=514;SC=AAGACTCACACCATTTGGTGA;SOR=2.226;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=26;WE=80086605;WS=80086587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr17	80092131	rs4789753	T	C	3274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=53;NR=58;PP=1958;SC=TCCTCTTGTGTTGAATGCAAA;SOR=0.924;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=111;TCF=53;TCR=58;TR=111;WE=80092139;WS=80092121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr17	80092171	rs4789752	A	G	1965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=44;PP=1300;SC=GTTCCTTTTCAAAACCAAAGT;SOR=1.483;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=25;TCR=44;TR=69;WE=80092179;WS=80092161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr17	80103631	rs35131420	T	C	992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=8;PP=710;SC=TGCAGGCCCCTGAGTGGGGCT;SOR=2.368;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=35;WE=80103639;WS=80103621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr17	80141909	rs11650529	A	G	983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=37.84;ReadPosRankSum=-0.135;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,25:0.96:26
chr17	80141911	.	A	G	983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.717;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=42.77;ReadPosRankSum=-0.076;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,22:0.96:23
chr17	80141913	.	A	G	887.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.869;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=44.39;ReadPosRankSum=-0.088;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,19:0.95:20
chr17	80141915	.	A	G	779.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.772;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=38.95;ReadPosRankSum=-0.528;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,19:0.95:20
chr17	80141917	.	A	G	771.56	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.693;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=42.86;ReadPosRankSum=-0.993;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,17:0.94:18
chr17	80195582	rs9303026	T	C	5694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=97;NR=91;PP=2965;SC=ACCTGGCGGGTTCTACGGCGG;SOR=0.811;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=188;TCF=97;TCR=91;TR=188;WE=80195590;WS=80195572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr17	80198007	rs9901910	G	C	4841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=91;PP=2965;SC=CTGGCCTTGCGCCAGCTGGGC;SOR=1.098;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=162;TCF=71;TCR=91;TR=162;WE=80198015;WS=80197997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr17	80218800	rs35693344	G	A	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=236;ReadPosRankSum=1.409;SC=CCAGGCTGGAGGGCAGTGGCA;SOR=0.495;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=12;WE=80218808;WS=80218790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr17	80273407	rs4530194	G	C	921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.939;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=25;PP=447;ReadPosRankSum=-0.611;SC=AGACCCCCACGGGGCTCCTCT;SOR=0.574;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=63;TCF=22;TCR=41;TR=38;WE=80273415;WS=80273397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,45:0.60:75
chr17	80273446	rs146993799	A	G	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.988;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=173;ReadPosRankSum=0.999;SC=CCTGAGCCCCAGGGCTTCCCA;SOR=1.739;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=11;WE=80273454;WS=80273436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr17	80275253	rs3176829	T	C	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=4.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.78;ReadPosRankSum=1.993;SOR=0.157;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,6:0.21:28
chr17	80280865	rs11077986	G	A	1875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=45;PP=1083;ReadPosRankSum=0.352;SC=ACCCAGTGTCGGGGGCGGACT;SOR=0.697;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=243;TCF=122;TCR=121;TR=90;WE=80280873;WS=80280855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,101:0.37:271
chr17	80320003	rs11651514	C	G	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=222;ReadPosRankSum=-1.636;SC=CTGTCCACCCCGGCAGTAGGC;SOR=0.412;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=18;WE=80320011;WS=80319993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,20:0.77:26
chr17	80320561	rs7502620	G	A	952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.661;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=28;PP=576;ReadPosRankSum=1.713;SC=AGGGGAGCCCGTGGTGTTGAA;SOR=0.464;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=102;TCF=33;TCR=69;TR=42;WE=80320569;WS=80320551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,47:0.41:114
chr17	80350331	rs11903	G	A	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.672;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=16;PP=307;ReadPosRankSum=-0.832;SC=AGGCGATGGTGATGGCGTAAC;SOR=0.536;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=95;TCF=54;TCR=41;TR=32;WE=80350339;WS=80350321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,37:0.35:106
chr17	80352138	rs6502106	T	C	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.737;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=86;ReadPosRankSum=-1.482;SC=AGTGCTGGGATTACAGGCGTG;SOR=0.160;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=43;TCF=34;TCR=9;TR=12;WE=80352146;WS=80352128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,14:0.27:52
chr17	80356019	rs9905077	C	G	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.23;ReadPosRankSum=1.387;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,10:0.26:38
chr17	80356187	rs4789767	G	A	1692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.373;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=36;PP=853;ReadPosRankSum=-0.683;SC=CGAAGGAGCCGTAGGTCACCT;SOR=0.865;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=115;TCF=56;TCR=59;TR=68;WE=80356195;WS=80356177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,79:0.57:138
chr17	80356315	rs6502107	A	G	156.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=5;PP=112;SC=TTGCTCCATCACCCAGGCTGG;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=80356323;WS=80356305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	80367353	rs7211306	G	A	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.904;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=13;PP=348;ReadPosRankSum=-1.582;SC=CTAGGCAAACGTCAATCAGCA;SOR=0.622;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=65;TCF=34;TCR=31;TR=28;WE=80367361;WS=80367343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,29:0.38:77
chr17	80391684	rs4789773	A	G	812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FS=2.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.73;ReadPosRankSum=-0.811;SOR=0.825;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:120,52:0.30:172
chr17	80394530	rs4789777	G	T	1080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.592;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=25;PP=601;ReadPosRankSum=-0.601;SC=CCTCACGTCCGCTCTGTCTGC;SOR=0.603;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=142;TCF=70;TCR=72;TR=49;WE=80394538;WS=80394520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,60:0.35:171
chr17	80397484	rs28561791	A	G	875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.82;ReadPosRankSum=-1.981;SOR=0.630;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,47:0.42:112
chr17	80401946	rs2306758	A	G	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=1.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.16;ReadPosRankSum=-2.341;SOR=0.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,25:0.26:96
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chr17	80403951	rs72857478	C	T	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=137;ReadPosRankSum=-0.355;SC=GGGCTGGGGACCCTCCCAGTC;SOR=0.765;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=9;WE=80403959;WS=80403941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr17	80404326	rs11077994	G	T	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=143;ReadPosRankSum=1.108;SC=AACGGTCCCAGATGAGTGCAG;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=8;WE=80404334;WS=80404316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr17	80405552	rs3751913	T	C	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=78;ReadPosRankSum=1.137;SC=CCCACCTCCCTGGTGCAGCGG;SOR=0.760;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=28;TCF=13;TCR=15;TR=10;WE=80405560;WS=80405542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,11:0.32:34
chr17	80426550	rs3214988	TA	T	421.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.210;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=217;ReadPosRankSum=-1.074;SC=GACCATCTATTAACGTTGTTC;SOR=0.458;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=36;TCF=22;TCR=14;TR=9;WE=80426558;WS=80426540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,17:0.31:54
chr17	80438165	rs5822531	G	GCACA	163.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=1.606;NF=4;NR=0;PP=72;ReadPosRankSum=0.048;SC=GCCAGCGCGCGCACACACACA;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=4;WE=80438176;WS=80438155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,7:0.28:25
chr17	80438824	.	AAG	A	89	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=18;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=64.19;NF=4;NR=0;PP=89;QD=23.0;SC=AAAAAAAAAAAAGAGTGCAGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=80438833;WS=80438814;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr17	80438826	rs72859138	G	A	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=65.19;MQRankSum=2.450;QD=9.22;ReadPosRankSum=0.484;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr17	80439733	rs9909476	C	T	1516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=34;PP=841;ReadPosRankSum=-0.712;SC=ATAGCCATAGCGGGTCTCCTA;SOR=0.680;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=205;TCF=109;TCR=96;TR=74;WE=80439741;WS=80439723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,86:0.36:239
chr17	80439925	rs9905527	T	C	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.765;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=40;ReadPosRankSum=-0.566;SC=CCTGGAATTATGTAGAACCCA;SOR=1.179;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=4;WE=80439933;WS=80439917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr17	80440296	rs149259276	T	TAAAACATGCGCGGTGGGCTGTTGACAAAATA	119.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=23.95;ReadPosRankSum=-0.842;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr17	80441236	rs72859145	A	G	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.025;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=15;PP=337;ReadPosRankSum=-0.539;SC=TCATCATCCTATCTCTGTGAG;SOR=0.444;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=101;TCF=46;TCR=55;TR=29;WE=80441244;WS=80441226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,24:0.28:86
chr17	80517489	rs72861098	G	C	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-3.224;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=67;ReadPosRankSum=0.952;SC=CCTCGTGCCAGGCTGGTCTTC;SOR=0.293;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=7;WE=80517497;WS=80517479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr17	80521092	rs4789795	A	G	114.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=4;NR=0;PP=88;SC=TTGGCGACTTATAATAACACG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=80521100;WS=80521086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	80521135	rs4789796	T	C	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.858;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=252;ReadPosRankSum=-0.466;SC=GCATCCATGTTCTCAGCTGCT;SOR=3.312;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=11;WE=80521143;WS=80521125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr17	80526139	rs2291395	A	G	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.9992;FS=2.869;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=199;ReadPosRankSum=1.257;SC=AGGGCCCTCAATGTCACCTGC;SOR=2.494;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=10;WE=80526147;WS=80526129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr17	80529495	rs3794723	G	A	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=225;ReadPosRankSum=-0.871;SC=GACAAATGAGGTATCAGAGGA;SOR=1.148;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=13;WE=80529503;WS=80529485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr17	80540585	rs2306759	A	G	1891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=17;PP=1227;SC=AAATAAATATATGAATTCTAC;SOR=1.646;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=42;TCR=17;TR=59;WE=80540593;WS=80540575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr17	80544855	rs1387545	T	C	1300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=9;PP=1001;SC=GTGTGATAGCTATCTGGTTAT;SOR=2.409;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=42;WE=80544863;WS=80544845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	80545156	rs6502124	A	G	1305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=29;PP=814;SC=ATGGTAAGACATGCTGGTCGG;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=12;TCR=29;TR=41;WE=80545164;WS=80545146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr17	80574082	rs753569	T	G	849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.49;SOR=3.716;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	80574532	rs12950772	A	G	947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQ=59.98;MQRankSum=0.008;NF=30;NR=25;PP=641;ReadPosRankSum=0.959;SC=CTGTGAAGACAAGAAAAGAAA;SOR=0.698;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=178;TCF=95;TCR=83;TR=55;WE=80574540;WS=80574522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,59:0.29:201
chr17	80577126	rs59969975	ATCT	A	147.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=122;ReadPosRankSum=-1.465;SC=CACCCACATCATCTACTACTT;SOR=0.223;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=3;WE=80577136;WS=80577116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr17	80583230	rs3826309	A	G	1494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.494;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=37;PP=829;ReadPosRankSum=-0.832;SC=ATGTGGACCCATTTCCCATCG;SOR=0.627;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=209;TCF=114;TCR=95;TR=74;WE=80583238;WS=80583220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,84:0.35:243
chr17	80585094	rs2291393	C	T	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=229;ReadPosRankSum=0.390;SC=CTCGCCGCAGCTTGACTGCCT;SOR=0.368;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=15;WE=80585102;WS=80585084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr17	80601769	rs59318270	TA	T	6170.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=16;NR=68;PP=2951;SC=AGGTTAAATTTAAGACTCCGA;SOR=0.728;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=17;TCR=69;TR=84;WE=80601777;WS=80601759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr17	80602050	rs11649788	C	G	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.718;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=54;ReadPosRankSum=-1.068;SC=TGTCCTTGTACAAATGTTACT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=80602058;WS=80602040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr17	80617552	rs2279395	G	A	1727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.789;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=29;PP=910;ReadPosRankSum=0.349;SC=GAGGTCACAGGCTCAGCACGC;SOR=0.333;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=103;TCF=50;TCR=53;TR=66;WE=80617560;WS=80617542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,76:0.65:117
chr17	80619080	rs4789706	T	C	117.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=5;PP=87;SC=CCAATGTCCCTGAAGGGATCC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=80619088;WS=80619070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	80626055	rs72853027	C	T	1721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.060;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=21;PP=1054;ReadPosRankSum=1.887;SC=GGTAGCTCTCCGCAGCTGGTC;SOR=1.135;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=99;TCF=65;TCR=34;TR=67;WE=80626069;WS=80626045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,70:0.67:105
chr17	80626104	rs12952159	T	C	1079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.84;ReadPosRankSum=0.244;SOR=0.732;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:155,68:0.30:223
chr17	80626210	rs7221877	T	C	4078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=62;NR=89;PP=2307;SC=CCTTCCAGTCTGCAGGACTGG;SOR=1.088;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=151;TCF=62;TCR=89;TR=151;WE=80626218;WS=80626200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr17	80656616	rs2243606	T	G	207.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=4;PP=113;SC=ACAGCGCGCATCCCCGCCCGG;SOR=1.179;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=7;WE=80656624;WS=80656606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	80674643	rs2250000	C	G	1171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=6;PP=852;SC=TGGAGGAGCTCCTGAGGCGCG;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=34;WE=80674651;WS=80674633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr17	80674839	rs10714010	CG	C	907.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=1.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.63;MQRankSum=1.116;QD=20.63;ReadPosRankSum=-0.211;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,32:0.73:44
chr17	80676946	rs111661651	A	ACCACCCC	1109.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=15;PP=970;SC=GCATCTTCACACCACCCCCCA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=15;WE=80676954;WS=80676936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	80676971	rs7207719	C	G	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=50;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=33;ReadPosRankSum=1.049;SC=GCTTTATTACCTGAGCAGGTG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=4;WE=80676979;WS=80676961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr17	80684638	rs2246103	T	C	1643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=16;PP=879;SC=CTGGGGGCGGTGGGGACCTGG;SOR=1.460;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=36;TCR=16;TR=52;WE=80684646;WS=80684628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr17	80685126	rs2243446	T	C	510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=15;PP=337;SC=CTTCACATGCTGGACTAGCTT;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=80685134;WS=80685116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	80693705	rs2256322	A	G	1111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.86;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr17	80693805	rs2256316	C	G	87.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=4;PP=73;SC=GAGCCCGGCTCAAGCGTTCTG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=80693813;WS=80693795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	80696410	rs2253149	A	C	1540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=15;PP=868;SC=GGAGGCCCTCAGGAGCACGGG;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=36;TCR=15;TR=51;WE=80696418;WS=80696400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr17	80696542	rs2253132	G	A	3332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.87;SOR=1.116;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr17	80696542	.	GCACAT	ACACAA,ACACAT	599	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=22,35;NR=24,41;PP=599,290;QD=14.1840842361;SC=ACCCATATGCGCACATGTGTA;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=76;TCF=35;TCR=41;TR=46,76;WE=80696555;WS=80696532;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.61:76
chr17	80696547	rs2253131	T	A	1201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=3.163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.66;ReadPosRankSum=0.138;SOR=0.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,55:0.67:82
chr17	80696622	rs7216058	A	C	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=10.263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.24;ReadPosRankSum=-0.707;SOR=0.025;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr17	80699093	rs2252848	A	G	526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=1;PP=338;SC=ATATTCTAGCATGCGTAGCCC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=80699101;WS=80699090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	80700592	rs1994554	T	C	5250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=100;NR=72;PP=2830;SC=CCTGTGCTTCTCTTGAAGAAG;SOR=0.818;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=172;TCF=100;TCR=72;TR=172;WE=80700600;WS=80700582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr17	80700712	rs1994553	T	C	2071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=43;PP=1126;SC=TCTGTCTCCTTGTCGACGCCC;SOR=1.310;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=71;TCF=28;TCR=43;TR=71;WE=80700720;WS=80700702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr17	80706928	rs2243416	G	A	3675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=65;NR=57;PP=1921;SC=GGGTTCATCTGTAAAACGGAG;SOR=0.708;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=123;TCF=65;TCR=58;TR=122;WE=80706936;WS=80706918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr17	80708601	rs1056534	C	G	4275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=86;PP=2414;SC=GGAGCCCTTCCTTGGGCACCA;SOR=1.719;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=132;TCF=46;TCR=86;TR=132;WE=80708609;WS=80708591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr17	80710278	rs2451217	G	C	85.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=69;SC=CCGCGTGCCCGCTTCCTCCCC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=80710286;WS=80710268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	80730527	rs615630	T	C	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=1.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.46;ReadPosRankSum=-1.861;SOR=1.259;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,6:0.20:30
chr17	80785875	rs8067667	A	G	1967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.776;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=37;PP=974;ReadPosRankSum=-0.395;SC=AATCGAACGCACACACACCTG;SOR=0.955;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=243;TCF=139;TCR=104;TR=90;WE=80785883;WS=80785865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,111:0.39:285
chr17	80786008	rs6502134	G	A	8463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=127;NR=125;PP=2965;SC=CACCCACACAGTTGAATGTGC;SOR=0.825;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=252;TCF=127;TCR=125;TR=252;WE=80786016;WS=80785998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,273:1.00:273
chr17	80786026	rs78229497	CACAG	C	2686.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.498;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=34;PP=1962;ReadPosRankSum=0.026;SC=TGCATACACCCACAGACACAC;SOR=0.639;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=150;TCF=25;TCR=125;TR=43;WE=80786037;WS=80786016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,80:0.32:247
chr17	80786261	rs138156874	T	TACAC	7692.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=46;PP=2957;SC=CACTCACAGATACATGCACAC;SOR=0.941;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=86;TCF=34;TCR=52;TR=75;WE=80786269;WS=80786251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr17	80786427	rs11364632	GC	G	5887.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.290;NF=17;NR=101;PP=2635;ReadPosRankSum=1.630;SC=AATGGAATGTGCCCCCCCCGA;SOR=0.856;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=133;TCF=19;TCR=114;TR=118;WE=80786435;WS=80786417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,197:0.99:199
chr17	80786641	rs7207932	C	T	1230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=18;NR=20;PP=662;SC=ACACACACATCTAATCAGATG;SOR=1.154;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=18;TCR=20;TR=38;WE=80786649;WS=80786631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr17	80789468	rs35653278	G	A	3300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.390;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=53;PP=2000;ReadPosRankSum=0.351;SC=GATCGGCCCCGGGTGAGGCAG;SOR=0.766;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=195;TCF=108;TCR=87;TR=125;WE=80789476;WS=80789458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,144:0.65:222
chr17	80789628	rs8074277	T	C	2549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.989;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=58;PP=1509;ReadPosRankSum=-1.676;SC=GTGGGGTGCATGTAAGGGGAA;SOR=0.740;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=163;TCF=82;TCR=81;TR=109;WE=80789636;WS=80789618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,118:0.67:176
chr17	80790388	rs12450046	G	A	749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=23;PP=501;ReadPosRankSum=0.778;SC=TGTCGACGCCGCGTGCACTTC;SOR=0.776;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=28;WE=80790396;WS=80790378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,30:0.79:38
chr17	80790442	rs3744165	T	G	448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=13;PP=346;SC=TCTTTCCCGATCACTTCTATC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=80790450;WS=80790432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	80827955	rs7222931	A	G	759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=2;PP=518;SC=GGAGCCCCGAACCTCTGGGTG;SOR=4.174;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=80827963;WS=80827945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	80828057	rs3744161	G	A	5790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=115;NR=83;PP=2965;SC=CGTGTTGCCCGTGTGGTCTGC;SOR=0.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=198;TCF=115;TCR=83;TR=198;WE=80828065;WS=80828047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr17	80828303	rs3744160	G	A	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=2.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.47;ReadPosRankSum=0.040;SOR=0.464;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,33:0.27:124
chr17	80858669	rs9891862	G	A	5713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=109;PP=2965;ReadPosRankSum=1.217;SC=AGATTCAGTTGAGCTTATAAG;SOR=0.361;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=202;TCF=91;TCR=111;TR=200;WE=80858677;WS=80858659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,223:1.00:224
chr17	80861206	rs2271918	A	G	2122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=36;PP=1354;ReadPosRankSum=0.727;SC=TGTCTCCCTCACTTTCTTTTT;SOR=0.730;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=150;TCF=92;TCR=58;TR=95;WE=80861214;WS=80861196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,102:0.63:163
chr17	80867153	rs72861530	A	G	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=8;PP=223;ReadPosRankSum=-1.494;SC=TCAGTTTTTTATTTTCAGCTC;SOR=0.836;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=53;TCF=31;TCR=22;TR=19;WE=80867161;WS=80867143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,20:0.34:59
chr17	80878389	rs1471197	A	G	269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.98;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	80884247	rs1078334	T	C	957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.022;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=18;PP=507;ReadPosRankSum=-1.264;SC=TAGCTTATGGTTCTTCTGTGA;SOR=0.473;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=77;TCR=53;TR=44;WE=80884255;WS=80884237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,53:0.34:156
chr17	80887206	rs729124	A	G	885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.63;ReadPosRankSum=0.037;SOR=0.666;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:180,64:0.26:244
chr17	80887451	rs2034962	A	G	513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.403;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=12;PP=285;ReadPosRankSum=1.233;SC=TCTTGGGAGCATGTATGGAGC;SOR=0.327;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=76;TCF=50;TCR=26;TR=26;WE=80887459;WS=80887441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,30:0.34:88
chr17	80890638	rs898095	T	C	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.674;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=19;PP=476;ReadPosRankSum=1.621;SC=CATGACTTCCTTTCCGATTAA;SOR=0.577;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=142;TCF=77;TCR=65;TR=40;WE=80890646;WS=80890628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,42:0.27:153
chr17	80895253	rs8079398	G	A	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.912;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=20;PP=417;ReadPosRankSum=-1.018;SC=TTCAAGTGCTGCTGGCCTTAG;SOR=0.944;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=94;TCF=31;TCR=63;TR=28;WE=80895261;WS=80895243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,30:0.29:104
chr17	80895745	rs3785520	T	C	1421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.87;ReadPosRankSum=-0.516;SOR=0.663;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:128,79:0.38:207
chr17	80895769	rs3785521	A	G	1373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.525;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=31;PP=776;ReadPosRankSum=-0.109;SC=GTGCAGATGTACGCACACACA;SOR=0.756;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=174;TCF=93;TCR=81;TR=65;WE=80895777;WS=80895759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,77:0.37:208
chr17	80895841	rs72861574	T	C	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.62;ReadPosRankSum=-0.552;SOR=0.657;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:106,46:0.30:152
chr17	80895933	rs3785522	A	G	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=3.498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.24;ReadPosRankSum=-1.276;SOR=0.350;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,22:0.26:85
chr17	80899281	rs9390	G	A	1078.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=24;PP=582;ReadPosRankSum=0.526;SC=ACAGGGACGCGGAGCTTGCAG;SOR=0.725;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=175;TCF=96;TCR=79;TR=57;WE=80899289;WS=80899271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,64:0.32:200
chr17	80923536	rs4986144	C	T	1211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.059;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=12;PP=757;ReadPosRankSum=-0.106;SC=CCTGACCTCCCTCGTTAAAGG;SOR=0.457;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=70;TCF=51;TCR=19;TR=43;WE=80923544;WS=80923526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,51:0.63:81
chr17	81006286	rs10852789	G	A	633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=1.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.741;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=10;PP=385;ReadPosRankSum=0.633;SC=AAACTGTTTCGGTACGTAAGT;SOR=0.477;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=99;TCF=73;TCR=26;TR=34;WE=81006294;WS=81006276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,36:0.31:117
chr17	81006387	rs1143006	G	A	1555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=42;PP=1047;ReadPosRankSum=-0.083;SC=CAATGATCACGTGGACACCAG;SOR=0.707;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=271;TCF=145;TCR=126;TR=88;WE=81006395;WS=81006377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:213,94:0.31:307
chr17	81009582	rs60997109	A	G	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=39;ReadPosRankSum=-1.773;SC=CCCAGCCTGCACGGCGGGGCA;SOR=0.693;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=7;WE=81009590;WS=81009572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr17	81009636	rs57923322	T	G	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=130;ReadPosRankSum=2.231;SC=ATGGCCTGGCTCTCCTCGGAC;SOR=0.657;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=23;TCF=15;TCR=8;TR=11;WE=81009644;WS=81009626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr17	81043039	rs9908756	A	G	2674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=56;PP=1548;ReadPosRankSum=-0.479;SC=TGCTGGTACCAGACGGGGACG;SOR=0.739;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=155;TCF=70;TCR=85;TR=103;WE=81043047;WS=81043029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,118:0.69:170
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chr18	120683	rs11284195	TC	T	1712.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=25;PP=1279;SC=AATTAGTTTTTCCCCCCTCCC;SOR=1.140;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=48;TCF=20;TCR=28;TR=41;WE=120691;WS=120673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr18	252559	rs657138	G	A	3356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=57;NR=49;PP=1736;SC=GAGCTTCCTCGTCTCCCATTT;SOR=0.709;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=57;TCR=49;TR=106;WE=252567;WS=252549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr18	319944	.	CT	C	48.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.224;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.12;ReadPosRankSum=-0.947;SOR=0.665;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
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chr18	334994	rs2305025	A	G	1298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=16;PP=680;SC=TCCCCACTGGAGCCCTGAGGG;SOR=0.909;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=40;TCF=24;TCR=16;TR=39;WE=335002;WS=334984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr18	335244	rs5822558	G	GA	2195.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=28;PP=1364;SC=AAGCATAAAAGAAAAAGGTGT;SOR=0.840;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=40;TCF=8;TCR=32;TR=36;WE=335252;WS=335234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr18	480564	rs72856625	C	T	806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=2;PP=622;SC=CAGACACTCACTTTCCAACCA;SOR=3.690;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=25;WE=480572;WS=480554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr18	618201	rs16947455	C	T	271.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=193;SC=TAACCATATTCGCTGTTTTCA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=618209;WS=618191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr18	624783	rs495688	A	G	806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=5;PP=514;SC=TTTAGAATGTATACATTTCAA;SOR=2.387;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=24;WE=624791;WS=624773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr18	624824	rs495799	T	C	1539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=11;PP=944;SC=GCACATAGATTATGAAATGGA;SOR=1.893;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=34;TCR=11;TR=45;WE=624832;WS=624814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr18	625070	rs498466	G	A	713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=17;PP=464;SC=CACAGTTCTTGAGGCACCTAT;SOR=2.215;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=23;WE=625078;WS=625060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr18	645176	rs565034	C	A	837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=21;PP=591;SC=AACTTGTTTCCAAATACCTGG;SOR=2.546;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=27;WE=645184;WS=645166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr18	649759	rs1058151	T	C	1185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.35;SOR=1.038;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr18	724612	rs537141	A	G	3263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=57;NR=52;PP=1660;SC=ACTTGTTCTAATACTTCACGG;SOR=0.826;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=109;TCF=57;TCR=52;TR=109;WE=724620;WS=724602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr18	904766	rs2231181	G	C	1209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=28;NR=16;PP=710;SC=GCTCCTCCGCGCTTCACCTCA;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=28;TCR=16;TR=44;WE=904774;WS=904756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr18	905125	rs1893154	A	G	928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=10;NR=19;PP=534;SC=TTCGCTTGGCATCGCGTCAGG;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=10;TCR=19;TR=29;WE=905133;WS=905115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr18	905537	rs2231183	T	C	1070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=22;PP=667;SC=AGCTGGGGCTTCCCAGGCACA;SOR=2.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=29;WE=905545;WS=905527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr18	907675	rs8192597	G	A	2441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=39;NR=40;PP=1324;SC=AGGAAGAGGCGTACGGCGAGG;SOR=0.982;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=39;TCR=40;TR=79;WE=907683;WS=907652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr18	909561	rs2231187	A	G	2846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=60;NR=39;PP=1778;SC=CTGTCAAGAAATACTTGGCGG;SOR=1.106;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=60;TCR=39;TR=99;WE=909569;WS=909551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr18	1278665	rs1595005	C	T	1934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=37;PP=1255;SC=AATCTGAGTGCTCCCCTGTCT;SOR=0.934;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=31;TCR=37;TR=68;WE=1278673;WS=1278655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr18	2539016	rs8084295	C	G	3014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=40;PP=1843;SC=CCAGACTCCACAGCAATAAAA;SOR=0.808;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=55;TCR=40;TR=95;WE=2539024;WS=2539006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr18	2547500	rs2677879	G	T	3111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=47;NR=42;PP=1340;SC=GGTATTTGCTGTATTTGCAGG;SOR=0.892;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=47;TCR=42;TR=89;WE=2547508;WS=2547490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr18	2585077	rs6506019	G	A	681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=6;PP=381;SC=GTGTTTTTCAGATCAACTTGC;SOR=1.270;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=20;WE=2585085;WS=2585067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr18	2610978	rs3817350	G	A	699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=20;PP=559;SC=AGTATGATCTGGCAAAAATTT;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=2610986;WS=2610968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr18	2616457	rs9051	G	C	611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=7;PP=362;SC=GGAGCAGATTGCTAAAGTTGA;SOR=1.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=14;TCR=7;TR=21;WE=2616465;WS=2616447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr18	2674159	.	CT	C	497.86	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5981;FS=6.455;HP=12;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=240;ReadPosRankSum=-1.078;SC=GAAAACCTTACTTTTTTTTTT;SOR=0.201;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=21;WE=2674167;WS=2674148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,25:0.89:28
chr18	2688798	rs637651	G	A	361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=11;PP=288;SC=GATAGACGGTGGGACAGAACT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=2688806;WS=2688788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr18	2698125	rs626994	T	C	43.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr18	2705700	rs635132	A	G	705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.21;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr18	2707619	rs2276092	G	A	2442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=36;PP=1149;ReadPosRankSum=-0.738;SC=GCCTAATGAGGTTAGGCCTGC;SOR=0.290;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=43;TCR=37;TR=78;WE=2707627;WS=2707609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,93:0.99:94
chr18	2724930	rs633422	A	T	965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=12;PP=579;SC=AAATAACCAAAGGACCAAATT;SOR=1.061;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=22;TCR=12;TR=34;WE=2724938;WS=2724920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr18	2740625	rs521992	G	A	68.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=0;PP=47;SC=TTCTAAGCATGTTTTTATAGT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=2740633;WS=2740615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr18	2751475	rs300293	A	G	916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=21;PP=655;SC=GTAAATATATAATGTTATATA;SOR=2.468;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=27;WE=2751483;WS=2751465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr18	2763697	rs483547	C	T	3572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=76;NR=42;PP=1865;SC=CCATTAAAGGCTCTAATGAGG;SOR=1.043;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=76;TCR=42;TR=118;WE=2763705;WS=2763687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr18	2771516	rs300291	G	T	1385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=16;PP=807;SC=GCAAATTTTTGGTTTTTTATT;SOR=1.201;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=31;TCR=16;TR=47;WE=2771524;WS=2771506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr18	2847730	rs2289687	C	G	885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=11;NR=7;PP=272;SC=GGTCTGGTGCCGCAGTCCCCT;SOR=1.127;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=11;TCR=7;TR=18;WE=2847752;WS=2847720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr18	2847744	rs2289686	C	T	1018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=15;NR=8;PP=398;SC=GTCCCCTCTCCCCTGGCCTCA;SOR=1.358;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=15;TCR=8;TR=23;WE=2847752;WS=2847720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr18	2885118	rs592120	C	T	544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=5;NR=13;PP=327;SC=GGCCTCGAAACAGCTTGAAGA;SOR=2.093;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=18;WE=2885126;WS=2885108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr18	2946291	rs643507	C	T	3133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=47;PP=1972;SC=AGTTCCTTCTCCTCAGTAGTC;SOR=0.749;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=98;TCF=51;TCR=47;TR=98;WE=2946299;WS=2946281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr18	2954439	rs7226624	C	T	2436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=23;PP=1413;SC=AACGGTCCGTCTGGGCCACGT;SOR=1.408;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=54;TCR=23;TR=77;WE=2954447;WS=2954429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr18	2982817	rs1539792	C	A	697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=20;PP=549;SC=GTATATAATCCAAACAGAAAG;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=2982825;WS=2982807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr18	3067278	rs2230164	A	G	59.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=0;PP=38;SC=CCTTCTTGCCACCTTTCAGGG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=3067286;WS=3067268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr18	3075503	rs10667835	C	CAAA	6558.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.49;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=43;PP=2598;SC=AACAAACAGACGAAGAATTTT;SOR=0.871;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=23;TCR=43;TR=66;WE=3075511;WS=3075493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr18	3075712	rs2298539	C	A	2200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=41;PP=1309;SC=TTGCTAGGACCAGGGACTTAC;SOR=1.550;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=65;TCF=24;TCR=41;TR=64;WE=3075720;WS=3075702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr18	3075746	rs1143657	G	A	1396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=27;PP=821;SC=ATTCAGCATAGGCCTCATCGT;SOR=1.656;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=13;TCR=27;TR=40;WE=3075754;WS=3075736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr18	3075778	rs2298537	A	C	891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=16;PP=452;SC=GAAAAAAGAAAAGTTAGAATT;SOR=1.473;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=9;TCR=16;TR=25;WE=3075786;WS=3075768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr18	3075872	rs2298536	C	G	125.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=4;PP=85;SC=ATGACTAAACCGACTTTGATT;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=3075880;WS=3075862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr18	3089522	rs948298	G	T	1031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=6;PP=608;SC=CTTTATCCACGGCCTATTTTT;SOR=2.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=31;WE=3089530;WS=3089512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr18	3112568	rs8097874	C	A	120.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=4;PP=81;SC=TCAAACACTACGCAGGTGACT;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=3112576;WS=3112558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr18	3120037	rs368366828	GT	G	384.52	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5007;FS=2.969;HP=14;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=198;ReadPosRankSum=-1.500;SC=TTCCAGGTTTGTTTTTTTTTT;SOR=0.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=17;WE=3120045;WS=3120027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,19:0.90:21
chr18	3129131	rs8089599	T	C	104.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.01;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr18	3131593	rs34489383	CT	C	146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=121;SC=GAAAACAATTCTTTTTTTTTT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=7;WE=3131601;WS=3131583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr18	3215156	rs1662316	C	G	4416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.53;SOR=0.714;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr18	3215156	.	CAC	GAG	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=44;NR=41;PP=2947;QD=20;SC=CGGTGCTGCGCACGTCCTTGT;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=86;TCF=45;TCR=41;TR=85;WE=3215166;WS=3215146;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,85:0.99:86
chr18	3215158	rs1791085	C	G	4416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.73;SOR=0.713;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr18	3253543	rs1791105	G	A	583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=351;SC=TAAGGTTTGAGTAAAGTGTGG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=3253551;WS=3253533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr18	3253569	rs6417016	C	T	371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=279;SC=TGTTTCCCACCGGATCACCAG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=3253577;WS=3253559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr18	3272744	rs7242012	A	G	87.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.76;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr18	3272798	rs6506097	AG	TA	632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=2;PP=549;SC=TTTTACCTACAGACTTTAGGT;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=3272807;WS=3272788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr18	3272855	rs6506099	C	T	1430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.01;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr18	3272874	rs7407072	T	A	1409.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.69;ReadPosRankSum=-1.117;SOR=0.499;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,64:0.98:65
chr18	3273153	rs7407045	C	T	713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=19;PP=504;SC=TTTTTTTGTGCGATGTACAAA;SOR=1.781;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=26;WE=3273161;WS=3273143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr18	3277466	rs6506100	TG	CA	5420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=38;NR=54;PP=2947;SC=AAAGTACTTCTGTGAAATAGA;SOR=1.225;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=40;TCR=56;TR=92;WE=3277475;WS=3277456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr18	3277691	rs6506102	A	T	1790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=18;PP=1053;SC=TACGATTGACAAGCTTTAGGA;SOR=1.539;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=40;TCR=18;TR=58;WE=3277699;WS=3277681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
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chr18	3452222	rs11571510	CT	C	691.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.977;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=16;PP=352;ReadPosRankSum=-0.608;SC=TGCGCCCCCCCTCCTCCACCG;SOR=0.908;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=31;TCF=10;TCR=21;TR=24;WE=3452231;WS=3452211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,29:0.85:34
chr18	3580485	rs2240900	G	T	210.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.30;QD=26.35;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
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chr18	3742572	rs3745050	C	G	2352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=41;PP=1262;SC=GAAGCAATAACATGTGGCACT;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=31;TCR=41;TR=72;WE=3742580;WS=3742562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr18	5196992	rs292286	T	C	1976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=29;PP=1040;SC=TCCTCTACCCTGCTCCCCTCC;SOR=0.859;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=38;TCR=29;TR=67;WE=5197000;WS=5196982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr18	5238208	rs1061666	C	T	910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=3;PP=602;SC=AACGAGCTTACGGACCGGGTG;SOR=3.477;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=27;WE=5238216;WS=5238198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr18	5292030	rs620652	A	G	3171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=62;NR=39;PP=1759;SC=TTTTAAAGTAAGTGCTGCAGG;SOR=0.973;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=101;TCF=62;TCR=39;TR=101;WE=5292038;WS=5292020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr18	5292207	rs11327444	CA	C	216.50	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.74;ReadPosRankSum=1.197;SOR=1.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,15:0.88:17
chr18	5293443	rs116351410	G	T	427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=12;PP=307;SC=GCATTTTCAGGTTGGGGAGAG;SOR=2.049;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=16;WE=5293451;WS=5293433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr18	5407839	rs2874686	C	T	1761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=25;NR=31;PP=967;SC=GGCACGTGTACGCTCTTGCAT;SOR=1.214;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=25;TCR=31;TR=56;WE=5407847;WS=5407829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr18	5407911	rs2322093	A	G	482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=11;PP=330;SC=TAGGAAGCTTAATAAGAATAT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=5407919;WS=5407901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr18	5410574	rs3817466	A	G	2329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=40;PP=1496;SC=CCTCAGTGGCAGTGGTCTCCC;SOR=0.867;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=38;TCR=40;TR=78;WE=5410582;WS=5410564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr18	5420021	rs3752061	A	G	213.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=174;SC=ACTGAAAAAAAAAATACCAAC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=5420029;WS=5420011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr18	5423631	rs12607210	A	T	398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=331;SC=TTACTCTGAGAGGTCATGTGT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=5423639;WS=5423621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr18	5433570	rs2272130	A	C	3748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=57;PP=2163;SC=TGAGAAGAAAAATATGTTACA;SOR=0.707;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=67;TCR=57;TR=124;WE=5433578;WS=5433560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr18	5433722	rs3931700	C	T	234.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=6;PP=162;SC=GCACTACAAACGAACACCTGG;SOR=1.863;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=5433730;WS=5433712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr18	5437861	rs117320064	T	C	237.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=164;SC=AGTGAAAAGATAGGAACTGGC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=5437869;WS=5437851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr18	5437961	rs5822861	T	TC	3644.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=24;PP=2092;SC=GTAAGCACGCTCTTTCCGGAG;SOR=1.237;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=47;TCF=23;TCR=24;TR=47;WE=5437969;WS=5437951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr18	5577258	rs11876037	T	C	890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=5;PP=602;SC=GTATCCAATGTAGAGTTATAA;SOR=2.621;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=26;WE=5577266;WS=5577248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr18	5630531	rs4083186	G	A	1559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=28;PP=879;SC=GAATTCTCCGGGGTCCAGTCT;SOR=1.085;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=24;TCR=28;TR=52;WE=5630539;WS=5630521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr18	5630676	rs56114101	G	T	91.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=3;PP=55;SC=AGCCCGCGCCGCTCAGCCCTC;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=5630684;WS=5630666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr18	5891637	rs28656885	C	A	4136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=59;PP=2493;SC=AGGAGGAGGACGGGGAGGCGG;SOR=0.749;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=135;TCF=74;TCR=61;TR=132;WE=5891645;WS=5891627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr18	5956238	rs3737353	C	T	801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=3;PP=443;SC=GACTTCTTGGCCTGAGGCAAT;SOR=2.226;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=22;WE=5956246;WS=5956228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr18	5956425	rs3737354	C	T	1958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=33;PP=1036;SC=AAATGTTTTGCCACGGAAGCC;SOR=0.992;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=29;TCR=33;TR=62;WE=5956433;WS=5956415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr18	5956483	rs3737357	G	C	485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=10;PP=300;SC=TGTGGAACCCGTCATAGCCTC;SOR=1.739;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=14;WE=5956491;WS=5956473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr18	5956502	rs34472471	GCT	G	399.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=302;SC=TCCGTGTTGAGCTCACCAGTG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=7;WE=5956511;WS=5956492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr18	5960010	.	CAT	C	179	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=122;MMLQ=27;MQ=53.73;NF=4;NR=0;PP=179;QD=48.0;SC=GAAATACATACATATATATAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=5960019;WS=5960000;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr18	5960036	.	TACACAC	T	323	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=2;HapScore=3;MGOF=21;MMLQ=26;MQ=56.49;NF=8;NR=0;PP=323;QD=42.0;SC=TATATATATATACACACACAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=5960068;WS=5960026;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr18	5960048	.	T	C	272	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=2;HapScore=3;MGOF=21;MMLQ=26;MQ=57.39;NF=9;NR=0;PP=272;QD=34.085690283;SC=CACACACATATATATATATAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=5960068;WS=5960026;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr18	5960165	rs505559	G	A	3403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=60;NR=50;PP=1780;SC=CCTACAGTGCGAGATGAAAAG;SOR=0.724;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=60;TCR=50;TR=110;WE=5960173;WS=5960155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr18	6511473	rs4798453	C	T	697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=5;PP=453;SC=CTGTAATAATCGTGGACATCA;SOR=2.494;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=23;WE=6511481;WS=6511463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr18	6511669	rs4798454	T	G	2265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=39;PP=1235;SC=GAGCTCTTTGTTGGTGACATT;SOR=1.112;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=31;TCR=39;TR=70;WE=6511677;WS=6511659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr18	6870524	rs62082833	T	C	444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=2;PP=356;SC=ATTTGTTTTATAGCAAATAGT;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=6870532;WS=6870514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr18	6889973	rs4239328	A	G	4223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=58;PP=2392;SC=TGATGGCACCAAACCTTTTCT;SOR=0.955;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=137;TCF=79;TCR=58;TR=137;WE=6889981;WS=6889963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr18	6890434	rs1116757	A	G	2977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=45;PP=1707;SC=TCCAGGTTCCATCTTTCTTAA;SOR=0.729;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=50;TCR=45;TR=95;WE=6890442;WS=6890424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr18	6890591	rs1116756	C	T	526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=13;PP=349;SC=TAGATTTGTACTCCTCAAAGG;SOR=1.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=18;WE=6890599;WS=6890581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr18	6896450	rs11081282	C	T	1823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=21;PP=1102;SC=ATCATTGAGCCGATATTCATC;SOR=1.230;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=41;TCR=21;TR=62;WE=6896458;WS=6896440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr18	6898415	rs12185460	C	T	1215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=9;PP=773;SC=CACATTAACCCGTTTTCCACT;SOR=2.093;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=39;WE=6898423;WS=6898405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr18	6912004	rs1346931	G	A	4395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=63;PP=2342;SC=ATATGTGTGCGCACGCACACA;SOR=0.743;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=141;TCF=78;TCR=63;TR=141;WE=6912012;WS=6911994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr18	6912143	rs1056408	A	C	1405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=31;PP=1023;SC=AAACCCCAACAAAGTTCTTAA;SOR=1.708;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=46;TCF=14;TCR=32;TR=45;WE=6912151;WS=6912133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr18	6927348	rs2282629	G	A	5053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.12;SOR=1.315;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr18	6927352	rs2282630	TG	CA	5179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.04;SOR=1.121;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr18	6942295	rs733918	T	C	813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=12;NR=14;PP=419;SC=ATGCGATCCATAGCACAAAAG;SOR=1.044;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=12;TCR=14;TR=26;WE=6942303;WS=6942285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr18	6947013	rs489023	C	T	211.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=198;SC=AAAAGGTTTTCTTGTAGCAAT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=6947021;WS=6947003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr18	6947143	rs2155697	A	C	2612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=34;PP=1427;SC=GAAGACCCTCATGGAGAGGAA;SOR=0.820;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=51;TCR=34;TR=85;WE=6947151;WS=6947133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr18	6947362	rs12966847	C	G	426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=13;PP=345;SC=CATTTGGCCTCCTGGCTAGGG;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=16;WE=6947370;WS=6947352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr18	6948614	rs62081479	A	G	321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=7;PP=193;SC=GGGTTTGGACACATTTTCCTT;SOR=2.494;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=6948622;WS=6948604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr18	6948629	rs3840904	TTCA	T	232.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=2;PP=69;SC=TTCCTTCCACTTCATCAGACT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=6948639;WS=6948619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	6949052	rs500355	A	G	1955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=19;PP=1131;SC=TACAAAATAAACACGAACACA;SOR=1.163;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=40;TCR=19;TR=59;WE=6949060;WS=6949042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr18	6950999	rs62081480	A	G	1028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=21;PP=602;SC=CAGCGTTGAGAAAGGAAACTT;SOR=2.368;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=28;WE=6951007;WS=6950989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr18	6951060	rs17439137	G	A	133.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=103;SC=TTGTTTCAGCGTTTACATTGA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=6951068;WS=6951050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr18	6956393	rs11875257	T	C	567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=3;PP=399;SC=ATATTATACATCAGCCCAATG;SOR=2.531;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=6956401;WS=6956383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr18	6999315	rs525394	A	G	979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=5;PP=675;SC=CTATGCTTAGAAAATAAGAAA;SOR=2.584;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=30;WE=6999323;WS=6999305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr18	6999368	rs525231	C	T	4465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.11;SOR=1.384;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr18	6999377	rs525206	A	G	4838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.08;SOR=1.322;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr18	6999628	rs625106	T	C	670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=9;NR=12;PP=333;SC=CATAATAGCTTGAGGAGCACC;SOR=1.445;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=9;TCR=12;TR=21;WE=6999636;WS=6999618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr18	6999694	rs693754	T	C	220.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=6;PP=163;SC=GCTTCTAACTTGCGACAGTAA;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=6999702;WS=6999684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr18	6999963	rs12970643	G	A	2927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=52;PP=1679;SC=AACGGAAATCGTGGTCCCCTT;SOR=0.729;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=52;TCR=52;TR=104;WE=6999971;WS=6999953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr18	7002412	rs5822937	G	GA	4887.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.42;MQRankSum=0.320;QD=29.62;ReadPosRankSum=-1.073;SOR=0.705;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,163:0.99:165
chr18	7011338	rs12969598	C	T	721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=8;PP=433;SC=GCCAGTAAAACGGCTCTGCAC;SOR=1.528;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=25;WE=7011346;WS=7011328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr18	7011413	rs619106	G	A	2329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=41;NR=31;PP=1158;SC=AAACCCCCTCGGTCGTGCCCC;SOR=0.867;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=41;TCR=31;TR=72;WE=7011421;WS=7011403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr18	7011959	rs496865	T	A	568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=2;PP=334;SC=GGGAGTGGGGTTAGAAGCAGA;SOR=2.531;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=7011967;WS=7011949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr18	7012123	rs9946794	A	G	2493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=35;PP=1215;ReadPosRankSum=-0.600;SC=TGCACTGAGGACCAAAGACAT;SOR=0.269;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=79;TCF=43;TCR=36;TR=78;WE=7012131;WS=7012113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,93:0.99:94
chr18	7015714	rs603258	T	C	434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=3;PP=246;SC=TGGATGACAGTGCTCACCTGG;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=14;WE=7015722;WS=7015704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr18	7016794	rs35419086	TC	T	268.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=61.19;NF=0;NR=9;PP=314;SC=CATGACACCATCCCCATCCCT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=7016802;WS=7016784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr18	7017322	rs539713	A	G	1808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=28;PP=1097;SC=GTTTGCAGTCACAGAGCCCGG;SOR=0.781;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=36;TCR=28;TR=64;WE=7017330;WS=7017312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr18	7035915	rs677136	A	C	1776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=41;NR=23;PP=1274;SC=CTCACCTAGTAACTTTCAGTC;SOR=1.376;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=41;TCR=23;TR=64;WE=7035923;WS=7035905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr18	7037866	rs647595	T	C	119.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=6;PP=117;SC=TCTCTAGGGATGGCATTAACA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=7037874;WS=7037856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr18	7040277	rs4798530	A	G	3223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=55;NR=52;PP=1808;SC=TGAAGGCAAAAGAGGTTTAAA;SOR=0.795;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=55;TCR=52;TR=107;WE=7040285;WS=7040267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr18	7042402	rs648161	A	G	269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=6;PP=137;SC=GGAAGATAAGATGATCCCAAG;SOR=1.802;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=7042410;WS=7042392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr18	7117623	rs334406	G	C	1946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=43;NR=21;PP=943;SC=GCCCGCCTGCGGGGGACAGGG;SOR=1.134;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=64;TCF=43;TCR=21;TR=64;WE=7117631;WS=7117613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr18	7117782	rs334407	A	G	572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=13;PP=446;SC=GGAACGCTCCACGGGACGCGA;SOR=0.990;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=8;TCR=13;TR=21;WE=7117790;WS=7117772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr18	7117880	rs36201812	CCCCGCCCCGT	C	219.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=3;PP=1280;SC=CTGCGCCCCGCCCCGCCCCGT;SOR=1.329;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=4;WE=7117897;WS=7117870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	7567803	rs67536179	C	G	1993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=27;PP=1156;SC=GCGGCCCGGCCCGCACTCAGC;SOR=1.108;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=44;TCR=27;TR=71;WE=7567811;WS=7567793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr18	7955477	rs138927856	G	A	75.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=3;PP=54;SC=GCAGCACTGGGGTTGATCAGA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=7955485;WS=7955467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr18	8088969	rs488952	G	C	178.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=143;SC=AAATCCATATGTTTATTAGCT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=8088977;WS=8088959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	8343333	rs2246146	G	A	341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=2;PP=254;SC=CTGCATGTGGGTATTAATAGA;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=8343341;WS=8343323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr18	8379046	rs3826631	A	G	689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.11;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr18	8379046	.	AGG	GGC	302	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=8;HapScore=2;MGOF=18;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=11;NR=3;PP=302;QD=25.3905624902;SC=TTGGGGAGGGAGGGGGAAGGG;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=14;WE=8379056;WS=8379036;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,14:0.82:17
chr18	8379048	rs9789240	G	C	689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.11;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr18	8379095	rs3819095	G	C	641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=4;PP=510;SC=TGCATCTTTCGAAAACTGCAC;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=8379103;WS=8379085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr18	8380473	rs657374	T	A	1355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=34;PP=921;SC=GGGGGTCAAGTTTGTTTTTAC;SOR=2.208;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=12;TCR=34;TR=46;WE=8380481;WS=8380463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr18	8387058	rs664201	T	G	5052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.94;SOR=1.121;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr18	8387065	rs594742	C	T	5060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.39;SOR=1.009;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr18	8387195	rs593978	G	A	1936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=33;PP=908;SC=GGCAAGAGGAGTACAATGGCG;SOR=1.340;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=26;TCR=33;TR=59;WE=8387203;WS=8387185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr18	8387219	rs593950	G	C	1424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=27;PP=664;SC=AAGGCCGCACGGTTGTGCACT;SOR=1.528;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=47;TCF=19;TCR=28;TR=46;WE=8387227;WS=8387209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr18	8545593	rs7236554	A	G	2896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=18;PP=1363;SC=ATGGACAACTAAGGCAAATTG;SOR=1.839;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=44;TCR=18;TR=62;WE=8545601;WS=8545583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr18	8545617	rs7234996	G	A	4709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.29;SOR=1.436;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr18	8545622	rs7236681	A	G	4807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.71;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr18	8545736	rs7236864	A	G	5107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=85;PP=2878;SC=TGAAGGTAGCAATCAACACTG;SOR=0.874;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=163;TCF=78;TCR=85;TR=162;WE=8545744;WS=8545726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr18	8545785	rs7236891	A	G	4362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=74;PP=2540;SC=GCACCAGAACAAGGACCAGGA;SOR=0.968;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=139;TCF=65;TCR=74;TR=139;WE=8545793;WS=8545775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr18	8545823	rs7241117	T	C	2633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;NF=37;SC=TGGTGAGGCGTGAGTGGCTCT;SOR=1.201;Source=Platypus;TCF=37;WE=8545831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr18	8545859	rs7237030	A	G	1708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=26;NR=28;PP=1040;SC=CATGGGGCATATGCCACAGGA;SOR=1.022;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=55;TCF=27;TCR=28;TR=54;WE=8545867;WS=8545849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr18	8705583	.	ACGCCGC	A	620.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=3;PP=334;SC=GGGAGGCTGCACGCCGCCGCC;SOR=1.112;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=6;WE=8705596;WS=8705573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr18	8705679	rs8089706	C	T	1053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=13;PP=571;SC=TGAACGGCCCCGCGGGCGGAG;SOR=0.798;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=18;TCR=13;TR=31;WE=8705687;WS=8705669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr18	8705871	rs142882599	T	G	407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=10;PP=258;SC=GAGCCCCGGCTCCCGCCGCCC;SOR=1.911;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=14;WE=8705879;WS=8705861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr18	8706143	rs11661625	C	T	1337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=12;PP=931;SC=GGCCGCAAAGCCAAGCGCGGC;SOR=1.814;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=33;TCR=12;TR=45;WE=8706151;WS=8706133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr18	8777991	rs146648024	A	G	246.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=6;PP=148;SC=TAAAACATCCAAAGAAACATT;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=8777999;WS=8777981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr18	8783835	rs35739383	T	C	2851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=44;PP=1581;SC=ATGGAGGACATGCGGGGCCAG;SOR=0.731;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=50;TCR=44;TR=94;WE=8783843;WS=8783825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr18	8784370	rs918272	A	G	4620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=84;NR=73;PP=2965;SC=ACTCGGAGGAAATGTTTGAGA;SOR=0.793;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=157;TCF=84;TCR=73;TR=157;WE=8784378;WS=8784360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr18	8785897	rs775291	G	A	509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=13;NR=7;PP=274;SC=AAATTTTAAAGAACAACAACA;SOR=1.085;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=13;TCR=7;TR=20;WE=8785905;WS=8785887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr18	8786117	.	C	CCCCA	326	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;FR=0.9987;HP=10;HapScore=4;MGOF=9;MMLQ=23;MQ=59.52;NF=3;NR=5;PP=326;QD=41.875;SC=ATCCCCCCCCCCCGCCCTCCC;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=20;TCF=10;TCR=10;TR=8;WE=8786125;WS=8786098;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:12,8:0.40:20
chr18	8793236	rs556991	T	C	2069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=38;PP=1048;SC=GCTAGACTCCTGGGCACGTAT;SOR=1.493;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=24;TCR=38;TR=62;WE=8793244;WS=8793226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr18	8806815	rs11877424	A	G	941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=8;PP=545;SC=CTACCTTGATAGCCAGATCCT;SOR=1.418;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=30;WE=8806823;WS=8806805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr18	8809418	rs10583994	TCA	T	4582.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-1.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.810;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.220;NF=20;NR=38;PP=2714;ReadPosRankSum=-1.273;SC=TAAAAAGTAATCACACACATC;SOR=0.825;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=69;TCF=25;TCR=44;TR=58;WE=8809427;WS=8809408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,112:0.99:113
chr18	8809445	rs632423	G	C	3906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-1.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.343;HP=3;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.191;NF=69;NR=52;PP=2251;ReadPosRankSum=0.442;SC=TTTCCCGTTAGAATTGTTGTG;SOR=0.487;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=69;TCR=53;TR=121;WE=8809453;WS=8809435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,148:0.99:149
chr18	8821301	rs656602	T	C	456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=3;PP=235;SC=GATTGTACTTTAAAGGCCTCA;SOR=1.739;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=14;WE=8821309;WS=8821291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr18	8821556	rs629142	G	T	245.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=172;SC=GTCTTAAAATGTTGTTTTGTC;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=8821564;WS=8821546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr18	8826083	rs3744977	G	C	2677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=47;NR=36;PP=1497;SC=CTGGCTACACGCTCACTGAGA;SOR=0.733;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=47;TCR=36;TR=83;WE=8826091;WS=8826073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr18	9105108	rs1396740	C	T	522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=11;PP=261;SC=ATTACTTATACAACCAGGCCC;SOR=1.230;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=8;TCR=11;TR=19;WE=9105116;WS=9105098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr18	9117867	rs906807	T	C	1129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=24;NR=18;PP=699;SC=CATAAGACAGTTATGCAAAAT;SOR=0.883;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=24;TCR=18;TR=42;WE=9117875;WS=9117857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr18	9182329	rs149819427	T	TA	277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.68;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr18	9182331	.	A	AACTTCAGGTAGGT	1976	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=4;NR=0;PP=1976;QD=519.0;SC=GTGGTGCGTAACCTATTGTAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=9182340;WS=9182321;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr18	9182332	.	C	T	64	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=4;NR=0;PP=64;QD=24.6928031368;SC=TGGTGCGTAACCTATTGTATA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=4;WE=9182340;WS=9182321;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,4:0.50:8
chr18	9182332	rs60039834	C	CTTCAGGTAGGTT	322.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.11;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr18	9255982	rs4798791	A	G	1779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=26;PP=1057;SC=AGTAGAGAAAAGATGGATAGG;SOR=0.756;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=30;TCR=26;TR=56;WE=9255990;WS=9255972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr18	9577352	rs329000	C	T	73.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=2;PP=52;SC=TTAGCTAGGACTGAAAAATTC;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=9577360;WS=9577342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr18	9775372	rs6506697	A	G	1408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=20;NR=24;PP=662;SC=CCTGTATGTCATTCTCCTTCG;SOR=1.159;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=20;TCR=24;TR=44;WE=9775380;WS=9775362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr18	9775411	rs6506698	A	G	674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=13;PP=310;SC=CATCAGAATGACCACTCTGTC;SOR=2.215;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=18;WE=9775419;WS=9775401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr18	9859134	rs10695443	A	AAATATT	1703.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=3;PP=1179;SC=TGCACAGCCCAAAGCAGGAGT;SOR=3.981;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=22;WE=9859142;WS=9859124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr18	9886890	rs601874	A	G	6095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=0.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=-0.247;NF=108;NR=101;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.920;SC=CCAAGTCCTCAGAAAAAGCCA;SOR=0.736;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=211;TCF=109;TCR=102;TR=209;WE=9886898;WS=9886879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,237:0.99:239
chr18	10454960	rs28769876	C	G	2345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.50;SOR=0.737;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr18	10455077	rs28379930	A	G	1167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=16;NR=21;PP=626;SC=CAGCCGGCGGAGGCAGCCCGG;SOR=1.230;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=16;TCR=21;TR=37;WE=10455085;WS=10455067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr18	10455133	rs28484275	C	T	387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=12;PP=307;SC=CGCGGCACGGCCTACACTGTC;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=10455141;WS=10455123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr18	10485357	rs489837	T	C	961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.72;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr18	10485363	rs91958	T	C	1221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=48.87;SOR=3.528;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr18	10485369	rs91959	G	A	1390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.74;SOR=3.737;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr18	10487918	rs3185480	C	T	2439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=43;PP=1427;SC=CAGAGGACCTCGCAGAAGACA;SOR=0.990;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=82;TCF=38;TCR=44;TR=81;WE=10487926;WS=10487908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr18	10488091	rs1045584	G	T	796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=16;PP=504;SC=TGACAGATTTGCTTTACCAAA;SOR=0.892;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=30;TCF=14;TCR=16;TR=30;WE=10488099;WS=10488081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr18	10526187	rs2290279	A	G	1218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=24;PP=682;SC=GCCTGTGTGTAGACGCCGGGT;SOR=1.508;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=41;TCF=14;TCR=27;TR=38;WE=10526195;WS=10526177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr18	10526263	rs12962879	C	G	56.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=50;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=6;PP=140;SC=GGCTGAGGGGCCTCGGCGCGC;SOR=1.179;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=10526271;WS=10526253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr18	10530928	rs509370	T	C	264.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=6;PP=171;SC=ATGCTTTCTATAAGGCTTTAA;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=10530936;WS=10530918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr18	10532897	rs652521	T	C	77.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=3;PP=56;SC=TAAAATGTTTTTAAATTAGAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=10532905;WS=10532887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr18	10539739	rs640832	A	G	1624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=31;NR=17;PP=769;SC=TGACCTGTCTACTGTATCCTT;SOR=1.071;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=31;TCR=17;TR=48;WE=10539747;WS=10539729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr18	10540299	rs17546495	A	G	2739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=0.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.854;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=31;PP=1491;ReadPosRankSum=-0.966;SC=AAAGCAGCCAACACTTGTTTT;SOR=0.858;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=50;TCR=32;TR=80;WE=10540307;WS=10540289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,101:0.99:102
chr18	10540432	rs510110	A	C	1733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=37;PP=1117;SC=GTGTTTAACTATACTTTGAAT;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=18;TCR=37;TR=55;WE=10540440;WS=10540422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr18	10680104	rs1944383	C	T	170.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=53;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=108;SC=ATCTAAAGTTCCCATTCTTCC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=10680112;WS=10680101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	10680132	rs688237	C	T	556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.83;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr18	10680142	rs688222	T	A	802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.23;SOR=4.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr18	10680163	rs487037	G	A	1039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=3;PP=676;SC=ACTGGGGAAAGGGATAAATTA;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=30;WE=10680171;WS=10680153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr18	10691192	rs3748423	T	G	782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=5;PP=660;SC=TCTTCCCCCATAAGTGACTGT;SOR=2.584;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=26;WE=10691200;WS=10691182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr18	10691216	rs3748422	G	A	1052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=27;NR=12;PP=714;SC=GTTGCAGAGCGTCCTACCCTT;SOR=1.730;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=27;TCR=12;TR=39;WE=10691224;WS=10691206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr18	10691357	rs3748421	G	A	3170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=56;PP=1831;SC=ACCAAAGCTGGGCAACCAGGT;SOR=0.978;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=43;TCR=56;TR=99;WE=10691365;WS=10691347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr18	10696043	rs11661737	T	C	828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=8;PP=476;SC=TGGAGGCAGGTTGGTGCCTCT;SOR=1.329;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=25;WE=10696051;WS=10696033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr18	10696227	rs2277860	C	T	2574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=35;PP=1380;SC=TCACCAAAAACGGCCCCGGGA;SOR=0.737;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=44;TCR=35;TR=79;WE=10696235;WS=10696217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr18	10696333	rs868525	C	G	4238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.62;SOR=0.757;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr18	10696337	rs868526	A	G	4287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.75;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr18	10698010	rs6146217	C	CGGATGCATTTGTGAACAATTACTGA	590.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=4;PP=2830;SC=TGAGTATGCACGGCCTTGGGA;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=4;WE=10698018;WS=10698000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr18	10731665	.	A	ATT	25	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;FR=0.5009;HP=11;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=25;QD=17.0;SC=ATGAGATTCAATTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=2;WE=10731673;WS=10731655;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,2:0.33:6
chr18	10736515	rs12455888	T	G	2534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=26;PP=1387;SC=ATATGAATATTACAGGAGGTG;SOR=1.481;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=48;TCR=26;TR=74;WE=10736523;WS=10736505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr18	10741011	rs5024299	G	A	2589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=48;NR=35;PP=1360;SC=AGGTTGTAAGGGGATCGAGAA;SOR=0.756;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=48;TCR=35;TR=83;WE=10741019;WS=10741001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr18	10757888	rs7407954	G	A	75.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=0;PP=54;SC=CCCAAGTATAGCAGAGAAAGT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=10757896;WS=10757878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr18	10758023	rs7407105	G	A	2410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=52;NR=23;PP=1240;SC=CCGCATCAAGGTTCATGCAGA;SOR=1.382;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=52;TCR=23;TR=75;WE=10758031;WS=10758013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr18	10758284	rs79054145	T	C	234.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=8;PP=161;SC=TGGAGTCCAATGTCGGGGCCA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=10758292;WS=10758274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr18	10759935	rs2865119	A	G	2588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=50;PP=1642;SC=GAGGCAAAAAAAAAAAATCAG;SOR=1.265;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=33;TCR=51;TR=83;WE=10759943;WS=10759925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr18	10759961	rs2865118	G	A	1770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=18;NR=39;PP=1222;SC=TGGGAAAGGGGACTGGTGATA;SOR=1.685;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=18;TCR=39;TR=57;WE=10759969;WS=10759951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr18	10762962	rs7241380	G	A	2900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=41;PP=1521;SC=TAATGGTTTGGAGCTGGTACA;SOR=0.916;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=48;TCR=41;TR=89;WE=10762970;WS=10762952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr18	10763007	rs7227167	T	C	3029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=40;PP=1563;SC=ACGTCCAGACTGTGCAGACAC;SOR=0.903;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=50;TCR=40;TR=90;WE=10763015;WS=10762997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr18	10763132	rs7507093	C	T	2183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=27;NR=37;PP=1190;SC=GACAAAAATACGTAACACGGC;SOR=1.310;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=27;TCR=37;TR=64;WE=10763140;WS=10763122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr18	10763218	rs2865131	T	C	127.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=6;PP=96;SC=ATTCCTAGCATGCGCAAGGAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=10763226;WS=10763208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	10784733	rs3830641	GA	G	205.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=190;SC=TAGGGTTGAAGAGCTGCCTTC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=10784741;WS=10784723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	10785070	rs12604151	A	C	57.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.09;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr18	10787047	rs6505592	G	A	1235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=26;NR=19;PP=730;SC=TCTTTTTTCAGTCCAGTCATA;SOR=0.776;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=26;TCR=19;TR=45;WE=10787055;WS=10787037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr18	10789014	rs2870106	G	A	844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=6;PP=611;SC=AATCTCTGCAGAGGTAGCTCA;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=30;WE=10789022;WS=10789004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr18	10795051	rs7236574	C	A	1694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.37;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr18	10795057	rs7236576	C	G	1618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.75;SOR=1.432;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr18	10795128	rs7237911	T	C	152.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=6;PP=99;SC=TAGAGAGTTGTGGTGGAGTGA;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=10795136;WS=10795118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr18	11066010	rs7236754	T	C	319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=252;SC=CCATGCCATATTAGCCCTGCT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=11066018;WS=11066009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr18	11619799	rs112261054	ATGT	A	1232.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=643;SC=CAGTTATAGAATGTTGTTGAG;SOR=1.536;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=11619809;WS=11619789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr18	11824829	rs1647555	A	G	633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.53;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=357;SC=CTTGCAAAAAACAGTTTTTGC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=11824837;WS=11824820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr18	11824880	rs1647556	T	A	3583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.80;SOR=2.026;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr18	11824886	rs1647557	T	G	3962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.71;SOR=1.790;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr18	11864707	rs4315401	A	G	378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=11;PP=286;SC=TGTGCATGGCAGCCCTTTCAG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=11864715;WS=11864697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr18	11884670	rs643652	C	G	672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=15;PP=427;SC=ACCAGGCACACGTTGAACACC;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=8;TCR=15;TR=23;WE=11884678;WS=11884660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr18	11999038	rs45442994	G	A	3633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=41;PP=2057;SC=CCCAAATCCCGTACTTTTATT;SOR=1.196;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=117;TCF=76;TCR=41;TR=117;WE=11999046;WS=11999028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr18	12012457	rs635370	A	C	62.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.37;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr18	12012467	rs16976956	A	C	62.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.37;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr18	12014220	rs45512594	G	A	2207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=29;PP=1207;SC=CACATCAAACGAGTGAACCAT;SOR=0.876;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=43;TCR=29;TR=71;WE=12014228;WS=12014210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr18	12014411	rs643107	T	G	1572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=25;PP=911;SC=ACTTCTGAAATAAAAGTGTGA;SOR=0.836;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=49;TCF=24;TCR=25;TR=49;WE=12014419;WS=12014401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr18	12057195	rs9959517	A	G	702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=14;NR=9;PP=471;SC=GTCCTCCTCTATGAGCCGCGA;SOR=1.136;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=14;TCR=9;TR=23;WE=12057203;WS=12057185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr18	12057389	rs9959781	C	G	9805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=106;NR=86;PP=2965;SC=GGTCCTGCAGCGCCTGCAGCT;SOR=0.785;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=192;TCF=106;TCR=86;TR=192;WE=12057411;WS=12057379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr18	12057403	rs9959774	A	G	9750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=84;PP=2965;SC=TGCAGCTCCCAGTCCTTGCTG;SOR=0.730;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=186;TCF=102;TCR=84;TR=186;WE=12057411;WS=12057379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr18	12057809	rs9960429	G	C	392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=9;PP=269;SC=TGCAAGGGGCGCTGCGCTTAC;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=12057817;WS=12057799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr18	12067762	rs7506731	C	T	667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=12;PP=347;SC=TGCCCCTGGGCTCGTGGGGAG;SOR=1.022;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=11;TCR=12;TR=23;WE=12067770;WS=12067752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr18	12067777	rs6505712	T	C	681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=10;NR=11;PP=357;SC=GGGGAGGGCTTCATGGCGCCA;SOR=1.051;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=10;TCR=11;TR=21;WE=12067785;WS=12067767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr18	12067919	rs12966234	G	A	1016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.80;SOR=1.347;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr18	12076504	rs12966109	A	C	252.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=7;PP=208;SC=CCCCTCGGGGACGCCCATCGT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=12076512;WS=12076494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr18	12094006	rs9964971	C	T	377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=4;PP=252;SC=GAGAAGATCTCTGGCTTCAGG;SOR=2.147;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=14;WE=12094014;WS=12093996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr18	12096249	rs1986751	G	T	1754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=25;PP=978;SC=GCAAATGGTGGCATTTTTGTT;SOR=0.784;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=31;TCR=25;TR=56;WE=12096257;WS=12096239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr18	12097547	rs4796945	A	G	320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=205;SC=TTCTACATGGACAGGCATATT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=12097555;WS=12097541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr18	12099654	rs6505715	T	C	1139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=24;NR=13;PP=609;SC=AAACAAGAGATGTAAAAGTCT;SOR=1.105;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=24;TCR=13;TR=37;WE=12099662;WS=12099644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr18	12115002	rs9959641	A	G	77.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=0;PP=56;SC=AAACACAGAGATTTTATATAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=12115010;WS=12114992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr18	12115310	rs8091585	C	T	496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=7;PP=332;SC=TGTAAAAAGACGGATAATTCC;SOR=0.914;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=10;TCR=7;TR=17;WE=12115318;WS=12115300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr18	12115339	rs8091463	A	G	943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=20;NR=12;PP=580;SC=TATATTTAGTATATGCTATAA;SOR=1.148;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=20;TCR=12;TR=32;WE=12115347;WS=12115329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr18	12115509	rs4519391	G	A	356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=10;PP=259;SC=GTTACTCATTGAACAAAGTGG;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=12115517;WS=12115499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr18	12125657	rs7243248	G	A	4096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=57;PP=2493;SC=GAATGAGGAAGCATTAACAAA;SOR=0.850;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=135;TCF=78;TCR=57;TR=135;WE=12125665;WS=12125647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr18	12126407	rs9303759	T	A	599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=17;PP=432;SC=AGATAAGTATTTTTCAAACTT;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=12126415;WS=12126397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr18	12254562	rs71369912	C	CCCGCGCACACACCCAT	4719.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=21;PP=2973;SC=GCTCCGCGACCCCGCGCACAC;SOR=1.225;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=64;TCF=5;TCR=59;TR=22;WE=12254570;WS=12254552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr18	12308243	rs8087840	T	A	241.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.31;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	12308243	.	TGC	AGT	121	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=3;NR=2;PP=121;QD=34.8935749724;SC=GGCCCGCAGTTGCCGCTGTCG;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=5;WE=12308253;WS=12308233;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr18	12308245	rs8086821	C	T	241.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.31;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	12348285	rs11553521	T	C	2002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=26;PP=1201;SC=CAATCACTCGTTCAATTGCCT;SOR=1.061;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=40;TCR=26;TR=66;WE=12348293;WS=12348275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr18	12351342	rs11080572	C	T	1629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=26;PP=1019;SC=CCGGCCTAAGCAGCGCGGGGT;SOR=0.726;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=29;TCR=26;TR=55;WE=12351350;WS=12351332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr18	12358997	rs7407640	A	G	1676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=37;PP=1078;SC=TCCAGCTTTCACATGTGGTGC;SOR=1.812;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=17;TCR=37;TR=54;WE=12359005;WS=12358987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr18	12359920	rs8097342	G	A	178.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=143;SC=TTATATTTGAGATTACCCATC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=12359928;WS=12359912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	12363950	rs2298542	C	T	427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=9;PP=213;SC=GTTTCAGCCACACAAGGAAAG;SOR=2.049;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=13;WE=12363958;WS=12363940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr18	12421442	rs3906620	T	A	451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=0;PP=346;SC=TATCATTTCTTGAATAGTGAA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=12421450;WS=12421438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr18	12429313	rs3760550	C	T	868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=5;PP=524;SC=GGAGGCGGGACGACCCACTCA;SOR=2.093;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=27;WE=12429321;WS=12429303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr18	12453005	rs499013	A	G	408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=298;SC=AATAAGGAAGATAATTGGTAT;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=12453013;WS=12452995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr18	12512385	rs139581657	CAA	C,CA	1594.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.34;QD=26.58;SOR=1.118;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,46,14:0.77,0.23:60
chr18	12512559	rs550613	C	A	2439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=49;PP=1466;SC=CAGGCATAAACATTTCATTAA;SOR=1.637;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=26;TCR=49;TR=75;WE=12512567;WS=12512549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr18	12512574	rs567709	T	C	1930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=38;PP=1134;SC=CATTAAGTTATCTTCTCAAAT;SOR=1.793;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=19;TCR=38;TR=57;WE=12512582;WS=12512564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr18	12546608	rs35057526	GA	G	45.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=3;NR=0;PP=52;SC=TCCAGGGGGGGAAAAAAAAGA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=12546616;WS=12546601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr18	12634986	rs12454931	T	G	933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=20;NR=11;PP=488;SC=TATAGTGAGATAGTTCAGTAC;SOR=0.927;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=20;TCR=11;TR=31;WE=12634994;WS=12634976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr18	12657431	rs34472716	G	A	958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.91;SOR=1.121;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr18	12658191	rs3902981	T	G	571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=14;NR=5;PP=327;SC=GGCCGGGGGATGCACGCTCTG;SOR=1.508;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=19;WE=12658199;WS=12658181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr18	12658600	rs1062235	A	G	3900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=65;NR=59;PP=2099;SC=GTCTGGTTGAAAACTTGAACC;SOR=0.823;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=66;TCR=59;TR=124;WE=12658608;WS=12658590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr18	12662148	rs1129214	G	A	818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.81;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr18	12678486	rs12966424	A	G	792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=14;PP=418;SC=TAAAAATTAAAAAGGCAGCAT;SOR=2.066;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=7;TCR=14;TR=21;WE=12678494;WS=12678476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr18	12695415	rs34277169	C	A	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr18	12700092	rs2542173	A	G	39.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr18	12700918	rs137976891	CATAT	C	1246.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=4;PP=1039;SC=TTAGTATATACATATATACTC;SOR=3.407;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=22;WE=12700929;WS=12700908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr18	12703067	rs3809916	A	G	2184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.70;SOR=0.922;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr18	12703192	rs3809919	C	T	2621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.96;SOR=0.795;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr18	12718593	rs2302768	A	G	2525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=45;PP=1531;SC=TTGTTCTTTCAAGCAGTCATT;SOR=0.896;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=44;TCR=45;TR=89;WE=12718601;WS=12718583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr18	12951738	rs1474043	G	A	1033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=11;PP=572;SC=TGCTGATTGTGTTCTTTTGTT;SOR=1.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=23;TCR=11;TR=34;WE=12951746;WS=12951728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr18	12955439	rs11286163	CT	C	143.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.65;QD=15.97;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr18	12963146	rs35999381	AT	A	885.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.31;SOR=1.675;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr18	12979028	rs56263236	T	C	99.85	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=16.64;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	12982760	rs12955780	G	A	943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=24;PP=668;SC=AATATTTTTTGAAAATGGTCT;SOR=2.235;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=32;WE=12982768;WS=12982750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr18	12984144	rs6505776	C	A	2170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=33;PP=1140;SC=CTAGGTTCAACTATTCCAAGT;SOR=0.995;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=67;TCF=34;TCR=33;TR=67;WE=12984152;WS=12984134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr18	13001512	rs4499304	G	C	1690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=35;NR=23;PP=832;SC=GTTCCATCCGGGTCATCTCCC;SOR=0.925;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=35;TCR=23;TR=58;WE=13001531;WS=13001502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr18	13001523	rs11080618	G	A	1738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=26;PP=1029;SC=GTCATCTCCCGGAAGCCAGAG;SOR=0.784;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=35;TCR=26;TR=60;WE=13001531;WS=13001502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr18	13008369	rs6505777	A	G	112.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.01;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr18	13030383	rs9964466	G	A	35.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=17.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr18	13040084	rs7229869	A	C	1170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=16;PP=497;SC=GAAGTTGAAGAGTAACTGAAT;SOR=0.780;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=22;TCR=16;TR=38;WE=13040092;WS=13040074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr18	13049948	rs11441028	G	GA	566.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.51;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=279;SC=TAGGAACTGGGAAAAAAATGT;SOR=1.721;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=10;WE=13049956;WS=13049938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr18	13056333	rs2282541	C	T	3660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=53;PP=2104;SC=CTGCTGTGCACGCACTCTTGA;SOR=0.708;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=117;TCF=64;TCR=53;TR=117;WE=13056341;WS=13056323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr18	13068132	rs578208	T	C	1707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=30;NR=29;PP=1004;SC=TTCCAAGGAATCCGTCCGAGC;SOR=0.892;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=59;TCF=30;TCR=29;TR=59;WE=13068140;WS=13068122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr18	13069782	rs6505780	C	T	2986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=55;NR=50;PP=1687;SC=AAAGAATCTACTCCTTAAACC;SOR=0.800;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=55;TCR=50;TR=105;WE=13069790;WS=13069772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr18	13072979	rs1787013	T	C	2810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=32;PP=1850;SC=CTGCTTTGTTTTATGCATTTA;SOR=1.130;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=46;TCR=32;TR=78;WE=13072987;WS=13072969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr18	13087789	rs472992	A	G	393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=13;PP=321;SC=ATTTATGTGGATGATGAGCTA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=13087797;WS=13087779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr18	13087815	rs527839	G	A	156.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=5;PP=111;SC=ATGTGAGGAAGAAATACCCGT;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=13087823;WS=13087805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	13088673	rs498685	T	C	109.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=0;PP=84;SC=ATACGCCTGTTTCCTTCTGAC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=13088681;WS=13088663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr18	13095401	rs476191	A	T	36.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr18	13095609	rs474337	T	C	2807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=53;NR=44;PP=1384;SC=CGCCCGCCTCTGGATCAGCTG;SOR=0.769;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=53;TCR=44;TR=97;WE=13095617;WS=13095599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr18	13096436	rs556371	T	C	518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=13;PP=268;SC=GCACAAAGCATGTGCATGGTT;SOR=2.200;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=18;WE=13096444;WS=13096426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr18	13116432	rs1786263	G	T	3520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=62;NR=51;PP=1838;SC=TACAGGTTCCGGCCGACTAGT;SOR=0.723;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=114;TCF=62;TCR=52;TR=113;WE=13116440;WS=13116422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr18	13387626	rs9957861	T	C	637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=3;PP=418;SC=GCGATGGACTTGGACAGGCTA;SOR=2.636;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=13387634;WS=13387616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr18	13611088	rs76532494	T	C	2721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=51;NR=36;PP=1284;SC=GAGAAAGTGATGTCTTCTAGC;SOR=0.876;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=51;TCR=36;TR=87;WE=13611096;WS=13611078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr18	13643179	rs11080665	C	A	519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=1;PP=422;SC=GTGATCCATCCGCCTCTGCCT;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=13643187;WS=13643171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr18	13666768	rs1149356	A	G	2453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=52;PP=1560;SC=TGTCATCTTAAGCAAAAACAA;SOR=1.664;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=25;TCR=52;TR=77;WE=13666776;WS=13666758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr18	13742365	rs4239313	A	C	76.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=0;PP=55;SC=TAGCCCAGATATAATTAAAAG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=3;WE=13742373;WS=13742363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr18	13759816	rs4797812	T	C	286.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.97;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr18	13759820	rs4797813	G	T	320.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.10;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr18	13761926	rs78482894	G	T	100.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=0;PP=74;SC=GTTAGGAAGAGGACTAGAAAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=13761934;WS=13761916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr18	13762011	rs4461147	C	A	1219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=28;NR=14;PP=659;SC=CACACCTTGTCGTCTAAATGT;SOR=1.132;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=28;TCR=14;TR=42;WE=13762019;WS=13762001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr18	13763114	rs45596939	T	C	4720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=64;PP=2850;SC=TGATGGCCTGTTGGTCAAATA;SOR=0.845;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=149;TCF=85;TCR=64;TR=149;WE=13763122;WS=13763104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr18	14105923	rs2159940	T	C	1574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=31;NR=21;PP=846;SC=TAAGGCTTTTTTTGAATATGG;SOR=0.831;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=31;TCR=21;TR=52;WE=14105931;WS=14105913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr18	14156143	rs149108958	A	G	241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.83;QD=24.18;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr18	14156241	rs115684852	A	T	1748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.24;MQRankSum=-2.283;QD=23.63;ReadPosRankSum=0.833;SOR=1.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,72:0.97:74
chr18	14156271	rs182414960	A	G	2953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=1.635;NF=68;NR=46;PP=1941;ReadPosRankSum=-0.846;SC=AGCAATGCCTATTGGACTTAC;SOR=0.374;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=70;TCR=47;TR=114;WE=14156279;WS=14156261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,113:0.99:114
chr18	14157291	rs9959262	A	T	4077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=76;PP=2513;SC=TCAGCTGCCTACTTCCTCCGT;SOR=1.032;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=135;TCF=59;TCR=76;TR=135;WE=14157299;WS=14157281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr18	14157373	rs7505684	T	A	1303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=30;PP=844;SC=ATAAGATAATTTATGAAGTTT;SOR=1.814;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=14;TCR=30;TR=44;WE=14157381;WS=14157363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
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chr18	14378621	rs55811695	C	T	517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=7;NR=11;PP=296;SC=ACCAGGCCCGCGTCCTCCTCC;SOR=1.230;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=7;TCR=11;TR=18;WE=14378629;WS=14378611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr18	14542979	rs200806970	A	G	2041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.405;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-9.157;NF=39;NR=57;PP=1272;ReadPosRankSum=-0.110;SC=GCTCCTGAGCATCTTCATAAA;SOR=1.232;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=181;TCF=85;TCR=96;TR=96;WE=14542987;WS=14542969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,100:0.51:197
chr18	14543139	rs28535987	T	C	1616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.639;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=-0.513;NF=18;NR=36;PP=1064;ReadPosRankSum=1.837;SC=CAAACCTCAGTCACCATCTGC;SOR=1.688;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=55;TCF=19;TCR=36;TR=54;WE=14543147;WS=14543129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,60:0.97:62
chr18	14779919	.	G	T	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQRankSum=-5.677;QD=2.26;ReadPosRankSum=-0.852;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,3:0.09:34
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chr18	14779925	.	C	T	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.383;ClippingRankSum=0.000;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=1.906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.55;MQRankSum=-6.272;QD=2.51;ReadPosRankSum=-1.847;SOR=1.292;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,6:0.15:41
chr18	14779940	rs200991381	C	T	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.43;MQRankSum=-7.052;QD=10.77;ReadPosRankSum=-3.034;SOR=0.813;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,16:0.30:53
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chr18	14779951	rs200058168	A	C	1065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=2.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.84;MQRankSum=-6.084;QD=16.40;ReadPosRankSum=-3.884;SOR=1.077;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,28:0.43:65
chr18	14779955	.	T	TA	1110.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.285;ClippingRankSum=0.000;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.08;MQRankSum=-5.723;QD=16.58;ReadPosRankSum=-3.785;SOR=0.852;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,30:0.45:67
chr18	14779969	rs9675365	C	G	951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=3.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.04;MQRankSum=5.526;QD=13.41;ReadPosRankSum=1.335;SOR=0.415;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,39:0.55:71
chr18	14779986	rs76927023	G	A	713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.839;HP=1;HapScore=2;MGOF=62;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.736;NF=19;NR=13;PP=374;ReadPosRankSum=1.090;SC=GAATCCAAACGAGAGGAAGAT;SOR=0.804;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=68;TCF=39;TCR=29;TR=32;WE=14779994;WS=14779976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,38:0.49:78
chr18	14780019	rs72873710	G	T	1662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=2.936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.81;MQRankSum=-5.611;QD=20.78;ReadPosRankSum=1.562;SOR=0.436;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,42:0.52:80
chr18	14780024	rs79199021	T	C	1687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=2.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.60;MQRankSum=-5.630;QD=21.10;ReadPosRankSum=0.888;SOR=0.425;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,43:0.54:80
chr18	14780037	rs72873711	C	A	1469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=1.943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.38;MQRankSum=-5.240;QD=19.86;ReadPosRankSum=-0.245;SOR=0.462;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,41:0.55:74
chr18	14780064	rs78339886	A	G	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.187;HP=3;HapScore=2;MGOF=80;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.197;NF=9;NR=15;PP=290;ReadPosRankSum=-1.090;SC=AAATATTAATATTGAGTGATG;SOR=0.097;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=44;TCF=12;TCR=32;TR=24;WE=14780072;WS=14780054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,24:0.52:46
chr18	14780082	rs11080793	GC	AT	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=57;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.624;NF=1;NR=11;PP=473;ReadPosRankSum=1.828;SC=ATGTGAAAATGCAAAATCAGA;SOR=1.096;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=12;WE=14780091;WS=14780072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr18	14780108	.	C	T	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.002;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.81;MQRankSum=-3.381;QD=12.54;ReadPosRankSum=0.078;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr18	14780116	rs79644245	A	C	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.85;MQRankSum=-3.221;QD=12.09;ReadPosRankSum=0.170;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr18	14780130	rs72873713	G	C	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.83;MQRankSum=-3.361;QD=8.06;ReadPosRankSum=-0.453;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr18	14796214	rs9303863	G	T	1102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=17;PP=593;SC=GTCCCTTTACGTTTAGAGTCT;SOR=0.941;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=22;TCR=17;TR=39;WE=14796222;WS=14796204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr18	14803680	.	C	T	165	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=47.99;NF=0;NR=10;PP=165;QD=19.9771212547;SC=TTTGATACTCCTCATTATTGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=12;TCR=29;TR=10;WE=14803688;WS=14803670;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:31,10:0.24:41
chr18	14814511	rs201268819	A	G	46.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=23.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr18	14830262	.	C	T	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.420;ClippingRankSum=-0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.101;NF=0;NR=9;PP=174;ReadPosRankSum=-0.406;SC=TTAGAGAAATCCAACTATCAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=9;WE=14830270;WS=14830252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr18	14837168	rs56391489	GT	G	1463.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=19;NR=14;PP=596;SC=TTTTTCTGAAGTTTTTTTTTT;SOR=1.823;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=42;TCF=22;TCR=20;TR=33;WE=14837176;WS=14837158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr18	14848821	rs28555630	G	A	1944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=44;PP=1507;SC=TGGAACAAACGAAAAATAAGT;SOR=0.776;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=44;TCR=44;TR=88;WE=14848829;WS=14848811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr18	14848935	rs3878726	C	T	463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.08;QD=28.99;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr18	14850375	rs3126404	G	A	2732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=53;PP=1697;SC=CAAGTAATTTGAATCAGGTAA;SOR=1.134;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=43;TCR=53;TR=96;WE=14850383;WS=14850365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr18	14851756	rs148887033	G	A	310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.81;QD=31.08;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr18	14852335	rs12386087	C	A	1941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.77;QD=28.14;SOR=0.722;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr18	14866355	rs1770756	T	C	303.79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=-1.150;NF=6;NR=2;PP=134;ReadPosRankSum=1.150;SC=GGTAGGAGGGTGGCCTGAGTG;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=14866363;WS=14866345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,7:0.88:8
chr18	14866373	rs1713892	G	C	275.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=6;NR=2;PP=133;SC=GTGGTAGGAGGGGGGCTGGAG;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=14866381;WS=14866363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr18	18983766	rs2117317	C	T	1144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=7;PP=767;SC=TTATGGATTGCGTCCCCATCA;SOR=2.948;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=36;WE=18983774;WS=18983756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr18	19065494	rs7234335	C	G	1252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=15;PP=654;SC=CCTCTTACAGCGGTCATTTCT;SOR=1.085;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=24;TCR=15;TR=39;WE=19065502;WS=19065484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr18	19079525	rs149004190	C	A	142.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=112;SC=GGCAAGGAAGCAACACGGAGC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=19079545;WS=19079518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr18	19079537	rs8087553	A	G	182.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=150;SC=ACACGGAGCAATGTGGAGAGC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=19079545;WS=19079518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	19079853	rs4800747	A	G	3549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=61;NR=53;PP=1945;SC=TGAAGCAGGAATGTGACTCCC;SOR=0.708;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=61;TCR=53;TR=114;WE=19079861;WS=19079843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr18	19100517	rs1395251	T	C	617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=4;PP=463;SC=TTTAAGTTAATATTGGAAAAA;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=21;WE=19100525;WS=19100507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr18	19100758	rs34960489	A	ATCT	2120.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.49;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=24;PP=1361;SC=GTAGGTGCTGATCTTAAGAAA;SOR=1.708;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=26;WE=19100766;WS=19100748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr18	19115896	rs4800780	A	T	70.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=0;PP=49;SC=ATTAAAACTGATCTTTACATG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=19115904;WS=19115891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr18	19119813	.	TA	T	63.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.110;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=1.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.35;ReadPosRankSum=-0.849;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr18	19119974	.	GAT	G	169	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=27;MQ=59.98;NF=1;NR=6;PP=169;QD=25.1428571429;SC=TCCAGCCCTAGATATATATAT;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=7;WE=19119983;WS=19119964;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:15,7:0.32:22
chr18	19154143	rs13381941	G	A	4693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=82;PP=2432;SC=AGATCCTTGCGTGCATTGAGA;SOR=1.060;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=68;TCR=82;TR=149;WE=19154151;WS=19154133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr18	19192255	rs2850556	C	T	2837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=27;PP=1690;SC=CCGCCATGCGCCTGCAGTGCT;SOR=1.751;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=66;TCR=27;TR=93;WE=19192263;WS=19192245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr18	19208851	rs2847117	A	G	831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=3;PP=571;SC=TGGGGGGTGGAGGGAATCTGA;SOR=2.753;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=19208859;WS=19208841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr18	19243976	rs11665314	T	G	285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=2;PP=209;SC=AATCAGACATTTATTTAAAAA;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=19243984;WS=19243966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr18	19282515	rs148633631	A	ATTTTG	723.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=643;SC=TCATGTCTTAATTTTAATTCT;SOR=3.383;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=11;WE=19282523;WS=19282505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr18	19408950	rs9989532	C	T	1169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=20;PP=606;SC=TTTAATTCTCCCTTGGTGGTT;SOR=0.929;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=20;TCR=20;TR=40;WE=19408958;WS=19408940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr18	19423963	rs3216119	GT	G	310.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=311;SC=TCTTCAGTAGGTCCAGGGTGT;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=19423971;WS=19423953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr18	19756856	rs3764504	C	T	126.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=2;PP=76;SC=CCCGGGGTGACGCGGGGAGGG;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=5;WE=19756864;WS=19756846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	19780527	rs11352746	AC	A	2980.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=27;NR=28;PP=2083;SC=GGCTGCACAGACCCCGTTCAT;SOR=1.382;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=57;TCF=29;TCR=28;TR=55;WE=19780535;WS=19780517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr18	19996011	rs7227477	G	A	949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=11;PP=656;SC=TTTGTGGAGGGAGAGCTGAAT;SOR=1.418;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=21;TCR=11;TR=32;WE=19996019;WS=19996001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr18	20555219	rs2336916	T	C	1825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=30;NR=27;PP=906;SC=TTTTATTTTATTTAGCTATAC;SOR=0.844;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=30;TCR=27;TR=57;WE=20555227;WS=20555209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr18	20564800	rs3052770	TTCA	T	680.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=1;PP=586;SC=GATAATGCTTTTCATCATCAT;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=11;WE=20564810;WS=20564790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr18	20932384	rs8084251	A	G	226.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=179;SC=TGTTTTCTAGATCTGTGATCT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=20932392;WS=20932374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr18	20953485	rs9944662	C	A	371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=1;PP=304;SC=TGCAGCCCTGCGGAGAAGGCA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=20953493;WS=20953475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr18	20953720	rs8099409	G	A	2253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=44;PP=1362;SC=GCCAGGAGGAGGAGGGCACTG;SOR=1.552;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=27;TCR=44;TR=71;WE=20953728;WS=20953710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr18	20964769	rs8094375	A	G	200.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=1;PP=169;SC=ATATTCCCACATATGTCTGGT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=20964777;WS=20964759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr18	21017836	rs7226498	T	C	3256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=49;NR=58;PP=1972;SC=CGTCCCCTTCTCGGGGATCCA;SOR=0.968;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=107;TCF=49;TCR=58;TR=107;WE=21017844;WS=21017826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr18	21033582	rs8086258	G	C	1929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=42;PP=1015;SC=GGGACCCCGCGGACCTCGGCA;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=20;TCR=42;TR=62;WE=21033590;WS=21033572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr18	21044607	rs2291993	G	A	1976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=43;PP=1241;SC=GTTACAGAAAGTATCTATCTC;SOR=1.483;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=25;TCR=43;TR=68;WE=21044615;WS=21044597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr18	21055092	rs7235571	A	C	554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=12;PP=359;SC=CTTTTAAAAGAATTCACACAC;SOR=1.230;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=8;TCR=12;TR=20;WE=21055100;WS=21055082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr18	21084265	rs117624142	T	A	3327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=40;PP=1791;SC=AATAATCGCTTGCGGGTTGGC;SOR=0.986;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=63;TCR=40;TR=103;WE=21084273;WS=21084255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr18	21088081	rs1652381	T	C	449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=14;PP=332;SC=AGCGGGGCATTGGGGTCGCAG;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=21088089;WS=21088071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr18	21100240	rs1367083	C	T	1796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=21;NR=33;PP=1057;SC=CCGTGCTTCCCGCTCGATCGA;SOR=1.402;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=21;TCR=33;TR=54;WE=21100248;WS=21100230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr18	21103909	rs891387	T	C	212.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=173;SC=CCTGGATTGTTAGCTCCTTCC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=21103917;WS=21103899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr18	21103971	rs891386	T	G	1358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=30;NR=15;PP=667;SC=CATTTCTTCCTTGACTACAAT;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=30;TCR=15;TR=45;WE=21103979;WS=21103961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr18	21107628	rs111369676	G	GTATTGTATTTCT	1297.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=2;PP=2957;SC=GGTCTTTAAAGTAGAGTGTCC;SOR=4.003;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=13;WE=21107636;WS=21107618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr18	21109250	rs1788825	T	C	2380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=38;NR=37;PP=1108;SC=TGTCAGCCTTTGTGGAAAAGA;SOR=0.990;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=38;TCR=37;TR=75;WE=21109258;WS=21109240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr18	21109269	rs1652375	T	C	2125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=34;PP=962;SC=GAAGGTGGGCTGCAGCTTTCC;SOR=0.961;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=36;TCR=34;TR=70;WE=21109277;WS=21109259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr18	21109466	rs1652376	G	T	974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=27;NR=5;PP=752;SC=CTGGAGCGATGTGTGCAAAAC;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=32;WE=21109474;WS=21109456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr18	21113285	rs2510344	T	C	2533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.51;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=28;PP=1315;SC=AATGTCCTTCTATTGTGCCAC;SOR=1.029;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=67;TCF=39;TCR=28;TR=67;WE=21113293;WS=21113275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr18	21119291	rs6507720	A	G	3060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=40;PP=1775;SC=TCAGCAAAACAGGAAAGATTT;SOR=1.150;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=67;TCR=40;TR=107;WE=21119299;WS=21119281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr18	21119777	rs1140458	G	A	1444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=16;PP=868;SC=GTACTGACTAGTTGTCCAGCT;SOR=1.445;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=33;TCR=16;TR=49;WE=21119785;WS=21119767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr18	21120035	rs7239575	T	C	328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=11;PP=228;SC=GCGAGGATCATGGAGAATAAG;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=21120043;WS=21120025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr18	21120444	rs1805082	T	C	3114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=49;PP=2216;SC=TCCAATCCAATATCTACTTTG;SOR=0.814;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=118;TCF=69;TCR=49;TR=116;WE=21120452;WS=21120434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr18	21124907	rs55809701	A	ACCC	231.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;QD=28.97;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr18	21124945	.	C	G	1498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=35;NR=28;PP=1222;SC=GACAGCTTTTCATGTGCCCCA;SOR=0.841;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=65;TCF=37;TCR=28;TR=63;WE=21124953;WS=21124935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr18	21127910	rs2435307	C	T	2745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=58;NR=36;PP=1466;SC=AAGTGCTTGCCGCAAGTGTCT;SOR=0.946;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=58;TCR=36;TR=94;WE=21127920;WS=21127900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr18	21140432	rs1805081	T	C	1052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=18;NR=15;PP=440;SC=CTCCATCCCATGGACTGGAAA;SOR=0.788;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=18;TCR=15;TR=33;WE=21140440;WS=21140422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr18	21192261	rs1652366	G	T	1122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=19;NR=20;PP=615;SC=CCTCATACCCGTAACCTTCCT;SOR=0.990;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=19;TCR=20;TR=39;WE=21192269;WS=21192251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr18	21293869	rs112340800	CT	C	95.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.16;ReadPosRankSum=0.373;SOR=0.774;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr18	21338515	rs11308832	TC	T	698.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=15;PP=454;SC=CGTGGCCTTCTCCCCCCTCTC;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=21338523;WS=21338505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr18	21474827	rs1268716	G	A	1020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=12;PP=643;SC=GCAGTCCCACGGCTCCCCCCA;SOR=1.432;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=24;TCR=12;TR=36;WE=21474838;WS=21474817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr18	21475153	rs1262340	G	A	218.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=3;NR=5;PP=108;SC=TGATCCAAATGAAGATAAGAC;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=8;WE=21475161;WS=21475143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr18	21481233	rs1154226	C	G	1366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=24;PP=753;SC=CTGCCCAAGCCAAGCAGGCAA;SOR=1.270;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=17;TCR=24;TR=41;WE=21481241;WS=21481223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr18	21481340	rs1154227	A	G	175.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=6;PP=140;SC=TGAGAGAAGCAGGGATCTTTA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=21481348;WS=21481330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	21483206	rs729814	G	A	236.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=166;SC=CTCTTAGATGGAAGAGAATAT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=21483214;WS=21483196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr18	21495483	rs1541836	T	C	444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=5;NR=11;PP=237;SC=GAGATGCTATTGATGTTGCTA;SOR=1.493;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=16;WE=21495491;WS=21495473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr18	21511034	rs1154232	C	A	4684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=76;PP=2616;SC=AGACAAGGAACCTGCAGGTCA;SOR=0.727;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=158;TCF=82;TCR=76;TR=158;WE=21511042;WS=21511024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr18	21511089	rs1154233	A	G	4767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=84;PP=2722;SC=CGATAGCGGCAGCCCAATTTT;SOR=0.897;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=162;TCF=77;TCR=85;TR=161;WE=21511097;WS=21511079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr18	21511172	rs1258107	G	C	1473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=32;PP=786;SC=CTGGGTGAGTGGAATAATACT;SOR=1.781;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=15;TCR=32;TR=47;WE=21511180;WS=21511162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr18	21513768	rs1131521	C	T	2144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=28;PP=1239;SC=TCCTGAAGTCCTAGATTTGAC;SOR=0.941;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=42;TCR=28;TR=70;WE=21513776;WS=21513758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr18	21529722	rs2241643	G	A	362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=3;PP=258;SC=TTTCTGCTTGGTTGCAGAGCC;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=21529730;WS=21529712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr18	21531906	rs11873358	C	T	294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=6;PP=142;SC=GCTTCCGTCACTCATGGTTGC;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=21531914;WS=21531896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr18	21534701	rs1051149	C	A	650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.67;SOR=2.049;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr18	21534701	.	CTC	ATT	443	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=2;NR=9;PP=443;QD=45.1334431693;SC=TCATTCTTCACTCAGGACACA;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=11;WE=21534711;WS=21534691;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr18	21534703	rs1051150	C	T	650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.48;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr18	21662816	rs2305024	A	C	1547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=11;PP=1131;SC=TGGAGTTTTGAAAAATGGAAA;SOR=2.393;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=37;TCR=11;TR=48;WE=21662824;WS=21662806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr18	21693671	rs894931	G	A	4307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=71;NR=63;PP=2249;SC=AGATTAAACTGATGCTTTGAA;SOR=0.783;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=134;TCF=71;TCR=63;TR=134;WE=21693679;WS=21693661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr18	21694618	rs4800176	G	A	3063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=53;PP=1565;SC=ATTGGTAAATGTGAAATGTCT;SOR=1.188;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=43;TCR=53;TR=96;WE=21694626;WS=21694608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr18	21703649	rs9956079	A	G	44.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=0;PP=27;SC=GGGATTACTGACATGAACCAC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=21703657;WS=21703639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr18	21705624	rs2306811	G	A	339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=282;SC=ATCGGAGTCAGGGAGAGTACA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=21705632;WS=21705614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr18	21710321	rs12970083	C	T	2780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=41;NR=51;PP=1489;SC=GTCAGAATAACTTATATGTTC;SOR=1.158;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=41;TCR=51;TR=92;WE=21710329;WS=21710311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr18	21714228	rs4800548	G	T	69.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.22;QD=23.09;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr18	21736933	rs1049683	T	G	1004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=16;PP=501;SC=AGAAGGGGAATCAACAGCTGA;SOR=1.308;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=13;TCR=16;TR=29;WE=21736941;WS=21736923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr18	21759593	rs12604451	T	C	619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=3;PP=283;SC=ACATCAAAATTGTTAACTTGC;SOR=1.931;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=21759601;WS=21759583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr18	21883552	rs1487377	G	A	2615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=28;PP=1546;SC=CAACAGGTCAGTATCTATGTG;SOR=1.305;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=56;TCR=28;TR=84;WE=21883560;WS=21883542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr18	21891975	rs2337961	A	G	1866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=24;PP=1054;SC=GGTCTGCAGCAGAAACCGTAT;SOR=1.209;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=41;TCR=24;TR=65;WE=21891983;WS=21891965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr18	21894351	rs12966893	A	G	1218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=31;PP=828;SC=ATTCATTCACATAAAAGAGGA;SOR=2.409;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=9;TCR=31;TR=40;WE=21894359;WS=21894341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr18	21894409	rs12966456	C	T	324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=237;SC=CATGACTTAACGATACCCAGT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=21894417;WS=21894399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr18	21897189	rs34306542	A	G	2091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=31;NR=36;PP=1379;SC=TCAAAATAAAAATGAAATTAT;SOR=0.864;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=31;TCR=36;TR=67;WE=21897197;WS=21897179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr18	21898556	rs12955338	T	C	105.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=2;PP=57;SC=AAAAACCACCTCAACTTACCT;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=5;WE=21898564;WS=21898546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr18	21901628	rs34481824	T	C	1989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=32;NR=36;PP=968;SC=TGGGTATGTATGAATAAAATG;SOR=0.914;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=68;TCF=32;TCR=36;TR=68;WE=21901636;WS=21901618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr18	21912865	rs2848605	A	G	1466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=31;NR=14;PP=762;SC=TCATTTTATAATTTCAAAATG;SOR=1.199;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=31;TCR=14;TR=45;WE=21912873;WS=21912855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr18	22008913	rs582358	C	T	1759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=39;PP=1116;SC=GTTTATATTGCTATAAAAAGA;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=18;TCR=39;TR=57;WE=22008921;WS=22008903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr18	22010165	rs571102	A	G	188.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=91;SC=TTATACAAATATAAGACCATT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=22010173;WS=22010155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	22017800	rs620931	T	A	636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.47;SOR=1.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr18	22018129	rs1791254	A	C	74.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=3;PP=53;SC=ATTATAAAATACAAGTTTCTC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=22018137;WS=22018119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr18	22020467	rs582234	T	A	930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=7;PP=611;SC=TAGGCCCAGATGTAAAGAAGA;SOR=1.751;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=31;WE=22020475;WS=22020457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr18	22020543	rs677688	C	G	2092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=28;PP=970;SC=GGAAAGTTCGCTTAAAGCATT;SOR=0.743;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=35;TCR=28;TR=63;WE=22020551;WS=22020533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr18	22804244	rs4129657	T	C	257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=3;PP=179;SC=GTGGAGAGTGTAAACATAAAG;SOR=1.609;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=10;WE=22804252;WS=22804234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr18	22804549	rs34380309	G	C	2748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=41;PP=1413;SC=TATTCGTGCCGGGAGGGACGT;SOR=0.791;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=53;TCR=41;TR=94;WE=22804557;WS=22804539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr18	23598160	rs607404	A	T	997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=9;PP=605;SC=TTATAACTAAACCACAAAGGC;SOR=1.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=33;WE=23598168;WS=23598150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr18	23866185	rs74947492	G	C	3426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=47;PP=1998;SC=AAAACCACTTGTGACATCTGT;SOR=0.743;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=55;TCR=47;TR=102;WE=23866193;WS=23866175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr18	23873463	rs1677016	T	C	980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=13;PP=541;SC=CTCAGAAAAATAGAATAAAAG;SOR=0.804;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=16;TCR=13;TR=29;WE=23873471;WS=23873453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr18	23875336	rs1382260	T	A	248.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=7;PP=188;SC=GACTGATTTCTTGGAAGGCAA;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=23875344;WS=23875326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr18	24039964	rs3835044	AT	A	1221.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.01;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=27;PP=780;SC=CTAAGAGGTGATTTTTTTCCA;SOR=1.154;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=29;WE=24039972;WS=24039954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr18	24436519	rs68006382	A	G	574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=15;PP=446;SC=GCAGCTCATGAATGTAGAATC;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=24436527;WS=24436509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr18	25562831	rs8092870	C	T	408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=2;PP=271;SC=CATTTTCTTACTGATGTATTA;SOR=2.448;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=25562839;WS=25562821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr18	25565082	rs1220144	A	G	2206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=37;NR=33;PP=1146;SC=AAACCTTCACACGCAGGATGG;SOR=0.791;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=37;TCR=33;TR=70;WE=25565090;WS=25565072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr18	25570228	rs1628684	G	C	5053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=76;PP=2503;SC=TTGACTGAGGGGGGTGCTGAA;SOR=0.735;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=155;TCF=79;TCR=76;TR=155;WE=25570236;WS=25570218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr18	25572837	rs1662733	G	A	2068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=35;NR=37;PP=1127;SC=TCAGAGGAGGGGCATGGACCA;SOR=0.995;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=35;TCR=37;TR=72;WE=25572845;WS=25572827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr18	25573308	rs1662734	C	T	584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=0;PP=542;SC=GGATGCCTCACGTAAGGCCCT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=25573316;WS=25573298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr18	25573622	rs2957286	G	C	1672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=33;PP=999;SC=ATAAAGATAAGAACTTAAATG;SOR=1.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=15;TCR=33;TR=48;WE=25573630;WS=25573612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr18	28598866	rs5823777	CTG	C	254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=6;PP=259;SC=ACACACACATCTGTGTGTTTC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=28598875;WS=28598856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr18	28605715	rs202439	A	T	1202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=17;PP=659;SC=GCATATCAATAAAAGTCCTAC;SOR=0.780;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=24;TCR=17;TR=41;WE=28605723;WS=28605705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr18	28610901	rs34818241	G	GA	480.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=0;PP=443;SC=GTATTTTAATGAAAAAATGAC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=14;WE=28610909;WS=28610891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr18	28611139	rs276936	A	C	2926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=37;NR=57;PP=1716;SC=TCCAAATTAAATGCAAGTAAA;SOR=1.322;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=37;TCR=57;TR=94;WE=28611147;WS=28611129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr18	28622524	rs276924	C	T	1417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.78;SOR=0.729;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr18	28659724	rs1658128	T	C	470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=0;PP=393;SC=AGTGCATGTATCCAGCTTTAA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=28659732;WS=28659714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr18	28666526	rs35717505	T	TTAA	1447.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=6;PP=865;SC=TCAGGTTTTATTGTTTATGTT;SOR=1.751;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=17;TCF=11;TCR=6;TR=16;WE=28666534;WS=28666516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr18	28666826	rs17799745	T	C	205.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=7;PP=163;SC=GGCAAAGTCATGGCTTTTATA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=28666834;WS=28666816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr18	28673565	rs12954874	T	C	3063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=49;PP=1668;ReadPosRankSum=-0.700;SC=AGGGAACATGTAATGTCACAT;SOR=0.286;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=49;TCR=50;TR=98;WE=28673573;WS=28673555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,112:0.99:113
chr18	28711519	rs1789072	C	T	2000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=22;PP=1233;SC=TAGCATTTAACTTCCATGTAA;SOR=1.349;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=47;TCR=22;TR=69;WE=28711527;WS=28711509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr18	28712737	rs36112658	CA	C	51.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=3;PP=71;SC=GCATATGTCTCAAAAAATTCA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=28712745;WS=28712727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr18	28719674	rs1789043	A	G	433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=3;PP=273;SC=AAAACATGTCATATATTTATA;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=28719682;WS=28719664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr18	28728384	rs2577067	C	T	183.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=1;PP=105;SC=AATGATAAAACGTAAACATCT;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=28728392;WS=28728374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr18	28734749	rs2249810	A	G	3008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=30;PP=1343;SC=CAAACTGTTCATATTTCTCAC;SOR=1.159;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=57;TCR=30;TR=87;WE=28734757;WS=28734739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr18	28737198	rs2246736	C	T	168.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=2;PP=107;SC=TTTATTTACACTAATTGTAAG;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=5;WE=28737206;WS=28737188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	28737299	rs2118342	T	G	1094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=9;PP=586;SC=GTAAGCATATTACTGTGCTAG;SOR=1.151;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=23;TCR=9;TR=32;WE=28737307;WS=28737289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr18	28898201	rs1834582	A	G	2634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=30;PP=1470;SC=TGGGAGAAAGAAAAAGAACAG;SOR=1.167;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=49;TCR=30;TR=79;WE=28898209;WS=28898191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr18	28898294	rs1426310	A	G	3273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=51;PP=1843;SC=AGTAGTTGCAATGCTGTTCAT;SOR=0.743;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=51;TCR=51;TR=102;WE=28898311;WS=28898284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr18	28906460	rs57200666	TG	CA	511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=1;PP=392;SC=TATGGTTTCATGTTGTTTTTA;SOR=1.981;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=9;WE=28906469;WS=28906450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr18	28907096	rs765054	C	T	533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=12;PP=320;SC=ACTATAGTCACCTAGATGATG;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=28907104;WS=28907086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr18	28908090	rs2303465	G	A	1131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=7;PP=674;SC=GAAAGCTGTCGTATATCAAAT;SOR=2.191;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=33;WE=28908098;WS=28908080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr18	28913599	rs12967407	C	T	3763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=50;PP=2069;SC=ACCGAGATGGCGGGGCAGATG;SOR=0.960;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=75;TCR=50;TR=125;WE=28913607;WS=28913589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr18	28913929	rs5823800	TTC	T	1318.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=7;PP=744;SC=CCTACTGTAGTTCTCTCTCTT;SOR=1.542;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=17;TCF=9;TCR=8;TR=16;WE=28913938;WS=28913919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr18	28916230	rs74277377	G	GAT	143	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=191;SC=AAGATAATAAGTTTTTTTTGC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=28916238;WS=28916220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr18	28916290	rs6506917	G	A	392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.10;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr18	28923983	rs11660224	AT	CA	1685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=21;PP=1295;SC=TTTGTTTAACATCTCAAATGC;SOR=1.552;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=33;TCF=12;TCR=21;TR=32;WE=28923992;WS=28923973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr18	28935375	rs8099566	C	T	360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=10;PP=237;SC=ACTAAAAAACCAACAATGTGA;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=12;WE=28935383;WS=28935365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr18	28966518	rs1460597	G	C	150.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=5;NR=0;PP=120;SC=GTTGTGAATTGGTGAAAACAT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=28966526;WS=28966513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr18	28968371	rs16959856	G	A	3979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.36;SOR=0.878;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr18	28968959	rs9956865	C	T	1841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=33;PP=986;SC=ACACAGCCAGCATTGAAGAAA;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=28;TCR=33;TR=61;WE=28968967;WS=28968949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr18	28969008	rs16959863	C	T	931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=25;PP=676;SC=TCCTTCTCTACGTCACAGCAT;SOR=2.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=30;WE=28969016;WS=28968998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr18	28986333	rs4799570	A	C	1553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=22;NR=32;PP=1003;SC=CCTGCTACTGATTTGTAAGTA;SOR=1.412;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=22;TCR=32;TR=54;WE=28986341;WS=28986323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr18	28993183	rs12960081	A	G	5783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=85;PP=2965;SC=ATGCTGATCCATGTGTGCAAC;SOR=0.730;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=186;TCF=100;TCR=86;TR=185;WE=28993191;WS=28993173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr18	28993501	rs7234288	C	A	2970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=47;PP=1746;SC=CCACATCCCCCATGACATCTC;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=42;TCR=47;TR=89;WE=28993509;WS=28993491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr18	29027757	rs8085523	C	T	610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=3;PP=428;SC=CTGCAGAGGGCTTTTCTTAGA;SOR=2.636;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=29027779;WS=29027747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr18	29027771	rs8085532	C	T	896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=5;PP=558;SC=TCTTAGACATCAACTGCAGAC;SOR=2.093;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=27;WE=29027779;WS=29027747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr18	29028057	rs141268501	T	TTTTG	98.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.75;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr18	29036316	rs3848485	A	G	291.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=2;PP=212;SC=TATGAACAATAGAATATAATA;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=29036324;WS=29036306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr18	29036518	rs140490580	ATATT	A	413.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=365;SC=GTAGAAATGAATATTTAATTT;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=8;WE=29036529;WS=29036508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr18	29037209	rs72925121	G	A	143.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=113;SC=CAAGTGAACTGGTATCCTCAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=29037217;WS=29037199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr18	29038536	rs7240789	C	T	4174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=70;PP=2369;SC=CAGCTATAGTCGACCGGGAGG;SOR=0.800;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=144;TCF=74;TCR=70;TR=143;WE=29038544;WS=29038526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr18	29040756	rs3737364	T	A	719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=3;PP=470;SC=TATAATTCTTTGGGATTAATT;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=29040764;WS=29040746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr18	29040981	rs72925137	C	T	637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.86;SOR=2.049;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr18	29040990	rs72925140	G	A	545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.48;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr18	29041410	rs7229490	T	A	1743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=37;PP=1039;SC=GTAAAAAAAATTCTGTATTAA;SOR=1.503;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=59;TCF=21;TCR=38;TR=58;WE=29041418;WS=29041400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr18	29045257	rs1460595	G	A	200.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=1;PP=78;SC=AAAGAAAACTGATTTTTTTAA;SOR=1.863;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=29045265;WS=29045247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr18	29046398	rs2035042	G	A	173.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=144;SC=AAGACACACTGAGTTGGCTAC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=29046406;WS=29046389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr18	29054100	rs72925163	G	A	3206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=43;PP=1763;SC=GTACAAATACGTATGCCAGAG;SOR=0.910;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=61;TCR=43;TR=104;WE=29054108;WS=29054090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr18	29055957	rs1380866	A	G	2578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=43;PP=1545;SC=TGCTTTGTCCACCTCTGGGTC;SOR=0.734;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=90;TCF=46;TCR=44;TR=89;WE=29055965;WS=29055947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr18	29078121	rs149048465	G	C	277.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.86;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr18	29078333	.	C	G	789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=15;PP=445;SC=ACCTCGCGACCAGACTTGCCC;SOR=1.143;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=11;TCR=15;TR=26;WE=29078341;WS=29078323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr18	29098323	rs2276149	G	A	2083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=40;PP=1180;SC=TTACTAGATTGAAGACACATG;SOR=1.096;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=30;TCR=40;TR=70;WE=29098331;WS=29098313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr18	29098345	rs9807377	C	T	1488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=30;PP=881;SC=TGTATTAGACCCAGCCATTCC;SOR=1.371;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=17;TCR=30;TR=47;WE=29098353;WS=29098335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr18	29104564	rs3737378	C	A	1460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=26;PP=959;SC=TATTATTCTTCTAATAACTGT;SOR=0.859;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=21;TCR=26;TR=47;WE=29104572;WS=29104554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr18	29104698	rs2230233	C	T	3800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=50;PP=2136;SC=ATCAAGTCAACGTAGAAGTTA;SOR=0.874;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=76;TCR=50;TR=126;WE=29104706;WS=29104688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr18	29104878	rs62095194	G	A	2226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=42;PP=1197;SC=CAAAACTGGCGTGGGCCAAGT;SOR=1.165;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=76;TCF=34;TCR=42;TR=76;WE=29104886;WS=29104868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr18	29104973	rs181195879	T	C	288.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=239;SC=ACTACAGTTGTTTGAGAAAGG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=29104981;WS=29104963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr18	29122799	rs2278792	G	A	1470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.74;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr18	29122922	.	GT	G	40	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;FR=1.0000;HP=14;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=15;MQ=59.18;NF=0;NR=3;PP=40;QD=14.6666666667;SC=GAGACTTTGGGTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=29122930;WS=29122912;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,3:0.50:6
chr18	29126670	rs1791235	T	C	4614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=1.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=58;PP=2305;ReadPosRankSum=-1.465;SC=CCACCAGAGTTACCAAGCATA;SOR=0.741;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=79;TCR=60;TR=135;WE=29126678;WS=29126660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,170:0.98:174
chr18	29206121	rs3764474	A	G	403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=2;PP=238;SC=TCAGCAAAAAATACTTCCCTT;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=29206129;WS=29206111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr18	29207155	rs1026123	C	T	1097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=25;PP=732;SC=AAGGTTTCAGCCTTTTATGTG;SOR=2.073;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=33;WE=29207163;WS=29207145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr18	29237765	rs1449086	T	A	380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=0;PP=305;SC=CCCTTCAAAATGCGCTTTGCC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=29237773;WS=29237755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr18	29237860	rs1449087	C	T	1677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=36;NR=14;PP=977;SC=CCTGCTCCTGCTGCACTCAAA;SOR=1.812;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=36;TCR=14;TR=50;WE=29237868;WS=29237850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr18	29264182	rs1449081	G	A	584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=3;PP=356;SC=GCCCCTGTTTGAACAGCTTCC;SOR=2.636;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=29264190;WS=29264172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr18	29426868	rs682279	A	T	291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=8;PP=203;SC=AGTGGAAATAATATGGCCAAT;SOR=1.802;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=29426876;WS=29426858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr18	29493616	rs35203717	A	G	56.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr18	29497573	rs6506948	A	G	1720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.94;SOR=0.781;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr18	29672559	rs8095867	A	G	100.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.18;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr18	29708981	rs684359	G	A	1443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=34;NR=18;PP=787;SC=TGTAATGTGTGTCAAGATGTG;SOR=1.140;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=34;TCR=18;TR=52;WE=29708989;WS=29708971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr18	29775226	.	TACAC	T	33	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.4999;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=26;MQ=60.0;NF=1;NR=2;PP=33;QD=12.0;SC=AAAGTAGGGCTACACACACAC;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=13;TCF=7;TCR=6;TR=3;WE=29775237;WS=29775216;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:10,3:0.23:13
chr18	29783164	rs17735714	G	A	37.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr18	29784370	rs17663067	C	T	457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=10;PP=292;SC=GACTGAATTTCTAAGCATGTG;SOR=1.739;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=15;WE=29784378;WS=29784360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr18	29788107	rs4799640	G	A	1802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=39;NR=23;PP=1066;SC=TTATGGACTCGTGCAGTTTTG;SOR=1.098;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=39;TCR=23;TR=62;WE=29788115;WS=29788097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr18	29790378	rs2241891	C	T	278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=0;PP=187;SC=TTATGCCTCGCGTAAAGAATC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=29790386;WS=29790368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr18	29796831	.	T	TA	31	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;FR=0.9998;HP=12;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=27;MQ=58.17;NF=2;NR=0;PP=31;QD=18.5;SC=ATCTCACCTCTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=2;WE=29796839;WS=29796821;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,2:0.25:8
chr18	29797921	rs616114	C	T	4952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQ=59.98;NF=76;NR=86;PP=2682;SC=AATTTGACTCCGCAAAATGTA;SOR=0.956;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=163;TCF=76;TCR=87;TR=162;WE=29797929;WS=29797911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr18	29797958	rs680321	T	C	2947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=57;PP=1845;SC=TGATTATTCATAACCTATTGG;SOR=1.322;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=39;TCR=58;TR=96;WE=29797966;WS=29797948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr18	29800119	rs673408	A	G	1248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=14;PP=736;SC=AGACCAGATCATTTTATTATG;SOR=1.203;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=25;TCR=14;TR=39;WE=29800127;WS=29800109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr18	30050356	rs11664566	C	T	2739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=49;NR=40;PP=1405;SC=ACTTCACATCCTTGAGGCTGC;SOR=0.712;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=49;TCR=40;TR=89;WE=30050364;WS=30050346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr18	30352057	rs200605696	GCGCCGGCC	G	2450.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.55;QD=42.25;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr18	30352114	rs71366355	C	G	2100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=31;PP=1309;SC=CGCCGCCGCCCGGCTCGGAGG;SOR=0.976;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=40;TCR=31;TR=70;WE=30352122;WS=30352104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr18	30672631	rs1995096	G	A	382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=4;PP=242;SC=GGATATCATCGTCAGATCAGA;SOR=1.765;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=13;WE=30672639;WS=30672621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr18	30804756	rs466113	C	T	1328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=32;NR=14;PP=837;SC=TGTTCTTTGTCGAGACTTCTG;SOR=1.708;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=32;TCR=14;TR=46;WE=30804764;WS=30804746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr18	30846895	rs9965081	A	T	1023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=9;PP=671;SC=ATTGGTTTTTACTGTTATTTT;SOR=1.949;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=33;WE=30846903;WS=30846885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr18	30950168	rs9965655	T	C	2197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=45;PP=1456;SC=AGAGAACAAATAGAAGTTCAT;SOR=1.550;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=24;TCR=45;TR=69;WE=30950176;WS=30950158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr18	30976968	rs4447495	C	G	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr18	30977255	rs6507018	G	A	379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=10;PP=260;SC=GTAAGGATACGGGAAGAAAAT;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=30977263;WS=30977245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr18	31225030	rs4799705	G	T	1012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=24;PP=729;SC=ACATGTGAAGGTAAACAAAAT;SOR=2.115;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=32;WE=31225038;WS=31225020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr18	31241497	rs9304126	C	G	597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=0;PP=439;SC=TTTTCAATTGCAGAAAAGCTC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=31241505;WS=31241487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr18	32402808	rs57525293	G	GTCT	1848.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=12;PP=993;SC=TACAAAATGTGTCTTCTGAGA;SOR=1.179;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=9;TCR=15;TR=19;WE=32402816;WS=32402798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr18	32408892	rs117594057	A	G	1364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.49;SOR=1.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr18	32408900	rs9946576	T	C	1530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.52;SOR=1.949;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr18	32409571	rs1790534	T	C	307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=244;SC=GATAGAGGTCTTCTGGGGTTT;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=32409579;WS=32409561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr18	32418186	rs17557695	T	A	1017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=22;PP=631;SC=AAACTAAAAATGGAGATTTCT;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=12;TCR=22;TR=34;WE=32418194;WS=32418176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr18	32418265	rs1954861	G	A	167.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=105;SC=CTTTAACCCAGTTAACAGCAC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=32418273;WS=32418255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	32444040	rs1617318	G	A	926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=16;PP=525;SC=AGACCTGCCAGATAAATTTTC;SOR=1.085;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=30;TCF=14;TCR=16;TR=30;WE=32444048;WS=32444030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr18	32459697	rs76713874	G	A	1658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=27;PP=838;SC=AGTATCTTCCGCTTGGAAGCA;SOR=0.892;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=27;TCR=27;TR=54;WE=32459705;WS=32459687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr18	32585367	rs80105629	C	T	642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=1;PP=416;SC=CTGGCCACACCCACTAAACTA;SOR=4.712;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=17;WE=32585375;WS=32585357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr18	32720359	rs3786313	C	T	2423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=39;PP=1336;SC=CTTGACACTTCCATTGTGTGT;SOR=0.906;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=36;TCR=39;TR=75;WE=32720367;WS=32720349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr18	32823327	rs182575010	T	C	4233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=67;SC=CAGAATTAATTGCACTTGACA;SOR=0.839;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=136;TCF=69;TCR=67;TR=136;WE=32823335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr18	32917176	rs371928337	CT	C	54.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.56;ReadPosRankSum=-0.393;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr18	33272291	rs201969184	AAT	A	41.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.967;NF=0;NR=3;PP=88;ReadPosRankSum=-0.480;SC=AGAGGTAAGAAATATATATAT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=3;WE=33272300;WS=33272281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr18	33647251	.	G	A	6070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.97;SOR=1.393;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr18	33647254	rs1789517	A	C	6152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.95;SOR=1.296;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr18	33694120	rs1050631	G	A	2108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=27;PP=1296;SC=ATCCAGGCCAGAGTGGCGACG;SOR=0.859;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=66;TCF=39;TCR=27;TR=66;WE=33694128;WS=33694110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr18	33696772	rs1789504	A	C	505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=12;PP=340;SC=CAATACTTTAAAACAGTAATT;SOR=1.863;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=17;WE=33696780;WS=33696762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr18	33706614	rs1789528	C	G	5526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=93;NR=93;PP=2965;SC=GATGCTCGTGCTCTGAGTGAT;SOR=0.839;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=186;TCF=93;TCR=93;TR=186;WE=33706622;WS=33706604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr18	33709762	rs1632169	G	C	816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=8;PP=444;SC=TCAGGGGGGCGGGGCTGCCTC;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=26;TCF=18;TCR=8;TR=26;WE=33709770;WS=33709752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr18	33713132	rs1785904	T	C	155.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=1;PP=140;SC=CTGAAATCTGTTTTTACTTAT;SOR=2.303;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=33713140;WS=33713122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	33713287	rs1785905	T	A	1523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=26;NR=23;PP=724;SC=GCTGTAAGTATTAACCAGATT;SOR=0.796;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=26;TCR=23;TR=49;WE=33713295;WS=33713277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr18	33718326	rs1785934	A	C	1547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=25;PP=883;SC=TGCATTATGTACACTGATCGT;SOR=0.922;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=51;TCF=26;TCR=25;TR=51;WE=33718334;WS=33718316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr18	33719434	rs1785932	C	T	1134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=9;PP=705;SC=AGCCACCAGCCTCTCTCGCCC;SOR=1.923;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=35;WE=33719442;WS=33719424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr18	33722425	rs1789549	A	G	430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=12;PP=294;SC=ATGTTTTTCTATTGTCCCAAT;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=33722433;WS=33722415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr18	33725874	rs1789546	T	G	1275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=13;PP=793;SC=ACATGATGATTGTTGATCACC;SOR=1.280;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=24;TCR=13;TR=37;WE=33725882;WS=33725864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr18	33725931	rs1785928	G	A	2204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=31;PP=1361;SC=ACAGCAGCCAGTGAGATTATT;SOR=0.934;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=40;TCR=31;TR=71;WE=33725939;WS=33725921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr18	33726447	rs1785927	C	G	319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=249;SC=AGTAGAGGCACTTGAAGTTCA;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=33726455;WS=33726437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr18	33744677	rs684890	T	C	112.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=3;PP=56;SC=ACAGTTATGTTCATTTTATCT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=33744685;WS=33744667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr18	33750046	rs8299	C	T	3609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=65;NR=51;PP=1907;SC=GGGGTGAGTGCGACTCCACTG;SOR=0.814;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=65;TCR=51;TR=116;WE=33750054;WS=33750036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr18	33767479	rs11665282	G	A	269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.52;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr18	33778607	rs596644	C	A	3708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=56;PP=2163;SC=ACAAAAGAAGCGACCCTAAGT;SOR=0.708;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=65;TCR=56;TR=121;WE=33778615;WS=33778597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr18	33779821	rs646424	C	A	3892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=47;PP=2374;SC=AGTGGGTATGCGGAACGTGAC;SOR=1.016;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=72;TCR=47;TR=118;WE=33779829;WS=33779811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr18	33779855	rs623053	C	T	3751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=49;PP=2234;SC=GTCATATCCACCCCGGTCAGG;SOR=0.985;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=120;TCF=71;TCR=49;TR=120;WE=33779863;WS=33779845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr18	33779896	rs540967	A	G	4595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=62;PP=2619;SC=AGAGGAACGTAGTGCTTCAGC;SOR=0.872;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=142;TCF=80;TCR=62;TR=142;WE=33779904;WS=33779886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr18	33780020	rs623558	A	G	5605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=89;PP=2965;SC=GGGCGGTTGCACCCTGTGAGC;SOR=0.760;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=184;TCF=95;TCR=89;TR=184;WE=33780028;WS=33780010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr18	33783030	rs579596	T	C	3888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=53;PP=2149;SC=GCACATGGATTGTTTTGACCA;SOR=1.006;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=129;TCF=76;TCR=53;TR=129;WE=33783038;WS=33783020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr18	33785093	rs678560	G	A	1879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=37;NR=23;PP=941;SC=GTATACCTACGTGGCCCTGTC;SOR=0.840;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=37;TCR=23;TR=60;WE=33785101;WS=33785083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr18	33785185	rs667667	A	G	1402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.50;SOR=0.970;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr18	33785304	rs667195	T	C	95.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=3;PP=60;SC=GAGAGCAATGTAGTGTGACAA;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=33785312;WS=33785294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr18	33793511	rs687387	T	C	217.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=8;PP=164;SC=TTGCTGCCTGTGTGTCTGGGG;SOR=2.093;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=33793519;WS=33793501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr18	33848663	rs111317566	A	ATACAT	1177.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.72;NF=0;NR=16;PP=715;SC=AATTTTTAGCATAAAGTTTCT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=16;WE=33848671;WS=33848653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr18	33877687	rs188660514	T	C	362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=0;PP=258;SC=AGCCTGCGAGTCCGCGAGCCA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=33877695;WS=33877677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr18	34092327	rs12454451	G	C	1678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=39;NR=17;PP=1003;SC=CTTGTACATAGTTTTAGCAGC;SOR=1.430;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=39;TCR=17;TR=56;WE=34092335;WS=34092317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr18	34174958	rs8087763	T	C	835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=17;PP=582;SC=TAAGAATTAATAGAATTCCCG;SOR=1.863;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=25;WE=34174966;WS=34174948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr18	34205385	rs2644253	A	G	57.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.09;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr18	34261559	rs542241	T	A	1226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=16;PP=456;SC=AGATTTTTTTTAAATAGTGAG;SOR=1.473;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=11;TCR=16;TR=27;WE=34261567;WS=34261549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr18	34261581	rs34100890	AG	A	1001.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.93;NF=0;NR=13;PP=492;SC=TAAAAATTAAAGGCATGTGAC;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=34261589;WS=34261571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr18	34273440	rs483351	C	T	216.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=0;NR=8;PP=186;SC=AGACAGGCTTCCTCAGGGCAG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=34273448;WS=34273430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr18	34297753	rs3809994	C	T	665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=3;PP=466;SC=GAAGTGAGGCCCCCTTGCCCC;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=34297761;WS=34297743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr18	34408969	rs9958080	C	G	328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=1;PP=163;SC=CCTTCGCCCCCACCCTCTCGC;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=34408977;WS=34408964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr18	34647176	rs3747895	T	C	6176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=92;PP=2965;SC=ATCTTAAGCCTACTCCTAGTC;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=195;TCF=103;TCR=92;TR=194;WE=34647184;WS=34647166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr18	34647323	rs3747896	T	A	3821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=60;PP=2156;SC=TGCATGGTGGTGGGGCACTGC;SOR=0.933;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=117;TCF=57;TCR=60;TR=117;WE=34647331;WS=34647313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr18	34664093	rs323295	A	G	2293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=22;PP=1224;SC=TACAGGTTAAAAGCTCAGGCT;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=45;TCR=22;TR=67;WE=34664101;WS=34664083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr18	34809470	rs1786073	G	A	1908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=31;PP=1025;SC=ATAGAATTCAGACTCAGAAAC;SOR=1.002;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=30;TCR=31;TR=61;WE=34809478;WS=34809460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr18	34809591	rs1631150	G	A	230.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=186;SC=GTAATCCCAGGCTTTGGGAGG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=34809599;WS=34809581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr18	35065396	rs4799451	T	C	55.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.43;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr18	35145660	rs138975334	T	TCTCG	240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=2;PP=69;SC=CGCTCCTCTCTCTCGCTCGCT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=2;WE=35145668;WS=35145650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	39535169	rs3833864	T	TC	727.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=7;NR=5;PP=437;SC=AACCGGAAGTTCCGTGTTGTG;SOR=1.508;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=12;TCF=7;TCR=5;TR=12;WE=39535177;WS=39535159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr18	39542407	rs33946724	GAT	G	1597.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=11;PP=1053;SC=TTAAAAGAAAGATATATATAT;SOR=1.900;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=29;TCF=13;TCR=16;TR=23;WE=39542416;WS=39542397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr18	39584264	rs3819162	C	T	376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=1;PP=242;SC=GCCTAGTCAACTTCTCTATCC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=39584272;WS=39584254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr18	39584412	rs34205132	T	C	2586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=36;PP=1212;ReadPosRankSum=-0.982;SC=AGCCGATGGATGTAGAGGACT;SOR=0.275;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=87;TCF=51;TCR=36;TR=86;WE=39584420;WS=39584402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,100:0.99:101
chr18	39600755	rs8095411	A	G	70.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.43;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr18	39623942	rs534507	A	G	271.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=8;PP=193;SC=ATGCTTTGACATAATAGTATT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=39623950;WS=39623932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr18	40613840	rs12954451	A	G	728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=15;PP=427;SC=TTGCTGAAAGAAAAAAAACAC;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=10;TCR=15;TR=25;WE=40613848;WS=40613830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr18	41559268	rs7230555	T	G	486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=6;PP=292;SC=GAAATGATGGTTAGTAACAAA;SOR=1.371;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=11;TCR=6;TR=17;WE=41559276;WS=41559258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr18	41559321	rs7229587	C	G	1637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=36;NR=12;PP=858;SC=ATATTTGACACCATCCAGGAT;SOR=1.733;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=36;TCR=12;TR=48;WE=41559329;WS=41559311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr18	42456653	rs663651	G	A	2327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=36;NR=22;PP=979;SC=CCCATTCCCCGCAAAACCCGG;SOR=1.055;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=36;TCR=22;TR=58;WE=42456661;WS=42456643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr18	42456670	rs3085861	C	CTCTT	4312.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=28;PP=2513;SC=CCGGTTCTCTCACTCTTCCTT;SOR=0.919;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=15;TCR=28;TR=43;WE=42456678;WS=42456660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr18	43206985	rs1484873	A	G	480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=9;NR=4;PP=202;SC=GGTGATGTTCATCAACAATCC;SOR=1.022;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=13;WE=43206993;WS=43206975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr18	43221341	rs7233416	T	C	2381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=35;PP=1327;SC=AACCAGGTTATTCTGGCTATT;SOR=0.809;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=40;TCR=35;TR=75;WE=43221349;WS=43221331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr18	43243679	rs8092227	A	G	67.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.43;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr18	43245986	rs7234198	T	G	852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=3;PP=411;SC=GCTTCCTCAGTAGGAACAGGA;SOR=1.839;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=43245994;WS=43245976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr18	43246156	rs9960464	G	A	3115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=50;NR=48;PP=1590;SC=TTTCCCTATCGATACCGGAAG;SOR=0.918;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=98;TCF=50;TCR=48;TR=98;WE=43246164;WS=43246146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr18	43246779	rs2170973	C	T	323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=0;PP=290;SC=GGAGGTTAAACAGCAATTTAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=43246787;WS=43246769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr18	43247001	rs2156609	C	G	1423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=20;PP=672;SC=GGAAAAGGGTCAGCAAAGCCC;SOR=0.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=21;TCR=20;TR=41;WE=43247009;WS=43246991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr18	43247784	rs9964193	C	T	1145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=11;PP=721;SC=CTTCCTGCCCCGGTTCCATTT;SOR=1.666;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=27;TCR=11;TR=38;WE=43247792;WS=43247774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr18	43248504	rs6507631	T	C	3902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.89;SOR=0.807;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr18	43248509	rs10451385	T	C	3845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.72;SOR=0.788;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr18	43248578	rs9304319	C	A	907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=17;PP=508;SC=GTCCACTGGACTAATAACTAA;SOR=1.542;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=27;TCF=10;TCR=17;TR=27;WE=43248586;WS=43248568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr18	43252786	rs1531926	A	G	1085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=11;PP=704;SC=GGAAGGGTTCAGTGCCAAGTC;SOR=1.721;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=29;TCR=11;TR=40;WE=43252794;WS=43252776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr18	43253100	rs1000501	C	T	297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=216;SC=TTCAACACTCCACCTGCTGAT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=43253108;WS=43253090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr18	43262359	rs3745009	G	A	4739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.76;SOR=0.831;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr18	43262501	rs3745008	C	T	933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=16;PP=403;SC=CTGTCTAAAACACATCAGTGT;SOR=1.209;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=12;TCR=16;TR=28;WE=43262509;WS=43262491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr18	43262532	rs3745007	C	A	577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=12;PP=320;SC=TTCAGCACGCCGTCCAGATCC;SOR=1.828;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=16;WE=43262540;WS=43262522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr18	43307246	rs11877062	C	T	1890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=29;PP=1070;ReadPosRankSum=-0.608;SC=GATGAATGGACGGTCTTTGAT;SOR=0.310;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=70;TCF=41;TCR=29;TR=69;WE=43307254;WS=43307236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,73:0.99:74
chr18	43307338	rs11877086	C	A	2326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=43;NR=34;PP=1140;SC=CGCGCAGAGGCATCGCCCGGC;SOR=0.716;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=80;TCF=44;TCR=36;TR=77;WE=43307346;WS=43307328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr18	43307455	rs3861806	C	T	318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=9;PP=219;SC=GTATCTTTTCCGGGCAGAGCC;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=43307463;WS=43307445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr18	43310845	rs3819178	G	C	440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=2;PP=389;SC=ACAATGGGTTGAGAGAGAAAT;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=43310853;WS=43310835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr18	43314401	rs35812340	G	GA	84.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=100;SC=ATGCCTTTTTGAAAAAAAAAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=6;WE=43314409;WS=43314391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr18	43314473	.	T	A	23	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=4;HapScore=2;MGOF=21;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=23;QD=28.8856062736;SC=CAAGATGAAATATGTTCTCTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=43314481;WS=43314463;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr18	43316538	rs2298718	A	G	2710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.10;SOR=0.730;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr18	43319359	rs531281	C	T	775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=10;PP=519;SC=TCCAGATCTTCCTTGAGATCT;SOR=0.922;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=15;TCR=10;TR=25;WE=43319367;WS=43319349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr18	43319519	rs1058396	G	A	2834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=54;NR=42;PP=1529;SC=CCCATTTGAGGACATCTACTT;SOR=0.750;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=97;TCF=54;TCR=43;TR=96;WE=43319527;WS=43319509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr18	43405792	rs1440822	T	C	2751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=51;PP=1458;SC=ACAGAATAGATGCTGAAAGCA;SOR=0.961;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=41;TCR=51;TR=92;WE=43405800;WS=43405782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr18	43435738	rs514001	A	C	555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=16;PP=461;SC=TATGACATAAAAAGATGAACA;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=43435746;WS=43435728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr18	43438156	rs567801	C	T	320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=220;SC=CACAGGCTAACGGCTGATGTT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=43438164;WS=43438146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr18	43438836	.	A	AT	49	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;FR=1.0000;HP=11;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=49;QD=19.3333333333;SC=AAGCTTCATGATTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=3;WE=43438844;WS=43438826;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,3:0.43:7
chr18	43446734	rs3826633	T	C	2173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=43;NR=28;PP=1196;SC=AGGAACAGTCTCTGCCTTTTA;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=71;TCF=43;TCR=28;TR=71;WE=43446742;WS=43446724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr18	43492121	rs67738770	CAGAG	C	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=2;PP=351;SC=AACATAGAGACAGAGAAAGAG;SOR=2.093;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=43492132;WS=43492111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr18	43497710	rs3744998	A	G	3477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=53;PP=2090;SC=CAGGACATGAACCACTGTTCT;SOR=0.824;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=116;TCF=63;TCR=53;TR=116;WE=43497718;WS=43497700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr18	43502190	rs1075906	G	T	365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=4;PP=213;SC=ATTATTATTTGGCCCAATTGC;SOR=1.329;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=13;WE=43502198;WS=43502180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr18	43505558	rs4476262	C	G	393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.61;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=178;SC=GAGAATTAAACAGAAAATCCT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=43505566;WS=43505556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr18	43523886	.	CA	C	47.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.416;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.16;ReadPosRankSum=-0.104;SOR=0.536;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,8:0.20:41
chr18	43547127	rs11301517	TG	T	2026.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.31;NF=25;NR=16;PP=1511;SC=CTCGGGAGGGTGGGGGAGATC;SOR=1.573;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=44;TCF=25;TCR=19;TR=41;WE=43547135;WS=43547117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr18	43572222	rs78858602	C	T	1004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=24;PP=639;ReadPosRankSum=-0.673;SC=CATTGTGACACAGCTCCTTAA;SOR=0.732;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=34;WE=43572230;WS=43572212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,38:0.97:39
chr18	43578844	rs73438238	T	C	2981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=52;NR=45;PP=1665;SC=AGAGCAAGCATTGGGAATGCT;SOR=0.728;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=52;TCR=45;TR=97;WE=43578852;WS=43578834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr18	43585536	rs9675392	A	C	869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=21;PP=631;SC=AAAAACACAAATCATTATTAA;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=26;WE=43585544;WS=43585526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr18	43595802	rs73438258	C	T	1805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=42;NR=23;PP=1098;SC=TTAAAACACACCTTTGACGAC;SOR=1.296;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=66;TCF=42;TCR=24;TR=65;WE=43595810;WS=43595792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr18	43595850	rs11349070	TA	T	1906.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=2.379;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.12;MQRankSum=0.263;QD=23.83;ReadPosRankSum=0.887;SOR=0.787;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,77:0.96:80
chr18	43652203	rs8085444	G	A	1483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=24;NR=24;PP=783;SC=AGGTAGCACAGAGCGGGGAGG;SOR=0.922;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=24;TCR=24;TR=48;WE=43652211;WS=43652193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr18	43652345	rs3745002	A	G	374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=8;PP=201;SC=TCCCTGCGCGAGACCTGGGCG;SOR=1.765;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=43652353;WS=43652335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr18	43666280	rs146099416	TAGTTAATATATTAATACCTTAAGA	T	1425.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=7;PP=2974;SC=TATACAAATATAGTTAATATA;SOR=1.179;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=6;TCR=8;TR=12;WE=43666311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr18	43666861	rs8095031	T	C	1026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=25;NR=7;PP=625;SC=AAATTTTCCATAATAAAAAGT;SOR=2.012;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=32;WE=43666869;WS=43666851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr18	43666952	rs8097521	C	A	3257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=65;NR=44;PP=1897;SC=TTTAACATTTCTTTTAATCAT;SOR=0.885;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=65;TCR=44;TR=109;WE=43666960;WS=43666942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr18	43667528	rs7244921	T	C	742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=16;PP=471;SC=AAAAATTACCTAAGTGCTAAA;SOR=1.528;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=9;TCR=16;TR=25;WE=43667536;WS=43667518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr18	43668321	rs11659795	G	T	264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=8;PP=187;SC=TGTCTATGCAGAAAGAAGAAG;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=43668329;WS=43668311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr18	43669980	rs2298787	T	C	4879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=93;NR=59;PP=2606;SC=AAAGACACAATTGAACATCAA;SOR=0.977;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=170;TCF=94;TCR=76;TR=152;WE=43669988;WS=43669970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr18	43674879	rs28699609	A	T	181.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=1;PP=77;SC=AATGGTAACAATATGGTTTAA;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=43674887;WS=43674869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr18	43678024	rs56181324	G	A	90.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=3;NR=1;PP=54;SC=ACGGGTGCAAGATGGCGGCAT;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=43678043;WS=43678014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr18	43678035	rs3753069	T	C	173.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=5;NR=2;PP=118;SC=ATGGCGGCATTCGCCACAGCC;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=43678043;WS=43678014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr18	43678328	rs143002048	ACC	A	191.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=63.51;QD=31.97;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	43678334	.	T	C	152.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=2;PP=28;SC=GTTCACCACCTCTCCCCCCGC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=43678342;WS=43678318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr18	43678336	.	T	C	152.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=50.68;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr18	43698309	rs1866321	C	T	1364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.75;SOR=0.730;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr18	43702733	rs9965812	C	T	316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=292;SC=ACTCAGGCATCCAGGCTCTGA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=43702741;WS=43702723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr18	43703223	rs12954742	C	G	66.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.09;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr18	43833701	rs34068795	T	TCTG	4009.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.51;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=26;PP=1609;SC=TGACAAAACATCTGGCAATGC;SOR=0.693;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=33;WE=43833709;WS=43833691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr18	43914438	rs8084936	A	C	849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=24;PP=695;SC=CCCCCACCCCATTTTAGGGGG;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=26;WE=43914446;WS=43914428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr18	44063598	rs1377016	G	A	2041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=36;PP=1049;ReadPosRankSum=1.272;SC=GACATGCCAGGCAAGTTCTCT;SOR=0.289;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=36;TCR=37;TR=72;WE=44063606;WS=44063588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,80:0.99:81
chr18	44109115	rs59252058	G	A	1188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=29;NR=10;PP=764;SC=AGGGAAGGAGGGTAAACTCCG;SOR=2.093;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=39;WE=44109123;WS=44109105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
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chr18	44124967	rs988213	A	G	111.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.76;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr18	44126909	rs1893566	T	C	4776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=79;PP=2965;SC=CCGCCTCCCCTACCCTCCTCG;SOR=0.751;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=159;TCF=80;TCR=79;TR=159;WE=44126917;WS=44126899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr18	44138902	rs4243280	C	T	241.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=198;SC=GGCTTAGCACCGACCACAGCT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=44138910;WS=44138892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr18	44171827	rs12606558	G	A	561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=1;PP=365;SC=CAGCTCATAGGTCAGGCCCAT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=44171835;WS=44171817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr18	44173449	rs328145	A	C	212.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=7;NR=0;PP=173;SC=TCCATCGTACATTTTTGTCTT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=44173457;WS=44173443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr18	44174499	rs12608365	G	T	103.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.76;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr18	44197963	rs328130	A	C	110.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=84;SC=TCACACACATAAACTTTACAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=44197971;WS=44197960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr18	44272034	rs533027	A	C	845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=6;PP=617;SC=GGGAAGATGCACGCTGAGAGC;SOR=2.226;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=28;WE=44272042;WS=44272024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr18	44424105	rs34052557	G	GA	576.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.90;MQRankSum=0.482;QD=22.18;ReadPosRankSum=0.267;SOR=0.544;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,25:0.96:26
chr18	44426877	rs644731	C	T	147.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=5;PP=101;SC=AAGATAGATACAGGATCCTGC;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=44426885;WS=44426867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	44526798	rs2187092	A	C	745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=4;PP=543;SC=GTAACTGACTACTTTTCTCCC;SOR=2.584;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=44526806;WS=44526788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr18	44560337	rs3744864	G	T	391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=4;PP=295;SC=GGCTTTCCTGGACAGGAGGCA;SOR=1.765;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=13;WE=44560345;WS=44560327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr18	44589450	rs80196369	C	T	3909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=73;PP=2308;SC=CAGTAAGTGGCGAAGATGTGA;SOR=0.982;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=131;TCF=58;TCR=73;TR=131;WE=44589458;WS=44589440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr18	44595809	rs2289036	A	T	1548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=28;PP=1063;SC=AAGCAGGGGGATGGAGTTGAA;SOR=0.841;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=54;TCF=26;TCR=28;TR=54;WE=44595817;WS=44595799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr18	44635048	rs2635058	C	T	1990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=22;PP=1180;SC=GATGCACACACTGCTTCACAA;SOR=1.488;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=46;TCR=22;TR=68;WE=44635056;WS=44635038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr18	45555613	rs55732061	G	C	538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=14;NR=4;PP=296;SC=TGGTGGGCTGGAGCCGACAGG;SOR=1.508;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=18;WE=45555621;WS=45555603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr18	45555829	rs7231151	T	C	5355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=86;PP=2681;SC=GCTTCATCTGTGTCTCCTCGA;SOR=0.754;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=177;TCF=91;TCR=86;TR=177;WE=45555837;WS=45555819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr18	45566276	rs80109066	G	A	850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=4;PP=601;SC=CGCACCTGGTGAAGCGGACCT;SOR=2.546;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=27;WE=45566284;WS=45566266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr18	45688841	rs4939747	C	T	586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=10;PP=285;ReadPosRankSum=-1.125;SC=ATAATAGGGACTTCATAGACA;SOR=1.051;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=10;TCR=11;TR=19;WE=45688849;WS=45688831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,24:0.92:26
chr18	46196856	rs3830253	AC	A	277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=2;PP=102;SC=TTACGGGAGGACCCCCCCCCC;SOR=1.609;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=46196864;WS=46196846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr18	46196880	rs2279304	T	G	435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=2;PP=246;SC=CACACACAGCTTCTCTAGGGC;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=46196888;WS=46196870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr18	46284587	rs1038308	T	C	2931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=53;NR=55;PP=1624;SC=ACAGCAGCCTTGAGGCCCCCC;SOR=0.747;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=108;TCF=53;TCR=55;TR=108;WE=46284595;WS=46284577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr18	46343818	rs9951895	T	C	1059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=25;PP=610;SC=CTCAGATAACTGGGACAAAGC;SOR=1.501;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=13;TCR=25;TR=38;WE=46343826;WS=46343808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr18	46343913	rs62103298	A	G	214.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=6;PP=145;SC=TTGGGAGGCCAAGGCAGGTGG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=46343921;WS=46343903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr18	46384073	rs937021	A	G	2403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=43;PP=1310;SC=ATGCCTTAACAGTTCTAGGGG;SOR=1.230;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=33;TCR=43;TR=76;WE=46384081;WS=46384063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr18	46385948	rs3752082	A	G	3027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=61;PP=1893;SC=GGGGCCTGGCAGGCGGCCCAC;SOR=1.295;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=39;TCR=61;TR=100;WE=46385956;WS=46385938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr18	46889624	rs3840892	A	AT	1562.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-2.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.375;NF=1;NR=27;PP=531;ReadPosRankSum=0.239;SC=ACATAAAAAGATTTTTTTTTA;SOR=1.355;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=28;WE=46889632;WS=46889614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,60:0.94:64
chr18	47093790	rs2000812	C	T	2490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=31;PP=1254;SC=GAATAAAAAACAACTTCCACT;SOR=1.109;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=50;TCR=31;TR=81;WE=47093798;WS=47093780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr18	47102002	rs2276269	T	C	1137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=20;PP=652;SC=CTCAGTTTATTCCATCTCCTT;SOR=1.347;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=14;TCR=20;TR=34;WE=47102010;WS=47101992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr18	47108656	rs41469449	T	G	1727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=18;PP=1040;SC=TCTGTGCTGGTGACTCAGTTT;SOR=1.498;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=37;TCR=18;TR=55;WE=47108664;WS=47108646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr18	47113008	rs6507931	C	T	728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=3;PP=483;SC=CGGGGCATGGCATGAAAATTT;SOR=3.014;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=21;WE=47113016;WS=47112998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr18	47339798	rs2945506	G	A	1594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=35;PP=1027;SC=GGGAGGGCAGGACCCCGAGGG;SOR=1.493;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=20;TCR=35;TR=55;WE=47339806;WS=47339788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr18	47363009	rs621101	C	T	1776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=34;NR=28;PP=953;SC=TAACCACCAACGAGAACAGAC;SOR=0.784;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=34;TCR=28;TR=62;WE=47363017;WS=47362999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr18	47363917	rs138128932	A	G	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=4.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQRankSum=-10.604;QD=1.40;ReadPosRankSum=0.808;SOR=1.220;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,11:0.10:114
chr18	47363930	rs79271359	AG	GC	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=1.075;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQRankSum=-10.103;QD=3.09;ReadPosRankSum=0.995;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,15:0.14:104
chr18	47373466	rs3017176	G	A	1206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.23;SOR=0.780;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr18	47375932	rs488890	C	G	254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=3;PP=149;SC=CTCACACCCCCCTACCTTCTA;SOR=1.085;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=9;WE=47375940;WS=47375922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr18	47376103	rs490648	C	G	683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=11;PP=393;SC=ATCCTGCTTGCAGTTGGAGGT;SOR=0.941;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=10;TCR=11;TR=21;WE=47376111;WS=47376093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr18	47376128	rs490697	A	G	537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=8;NR=10;PP=250;SC=AGTGCGGCCCATGGGCAGCCG;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=8;TCR=10;TR=18;WE=47376136;WS=47376118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr18	47376162	rs17713847	G	A	256.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=179;SC=AGTCAGGGACGCTGCCAGGAG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=47376170;WS=47376152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr18	47402280	rs657424	A	C	388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=10;PP=256;SC=GCCTCCCTCTATATCAGCCAT;SOR=1.911;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=14;WE=47402288;WS=47402270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr18	47406913	rs1217632	A	G	2988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=46;PP=1305;SC=AACTGGATACATGTAAATGCT;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=27;TCR=46;TR=73;WE=47406921;WS=47406903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr18	47406938	rs1217633	T	C	2220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=34;PP=815;SC=TTAAGAAAATTGATTTGGTTA;SOR=1.958;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=14;TCR=34;TR=48;WE=47406946;WS=47406928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr18	47563299	rs1815930	T	C	3488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=66;NR=48;PP=2102;SC=CCACTGTAGGTATAGATGACA;SOR=0.949;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=115;TCF=66;TCR=49;TR=114;WE=47563307;WS=47563289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr18	47581611	.	G	C	33	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;FR=0.5000;HP=11;HapScore=2;MGOF=38;MMLQ=17;MQ=59.2;NF=6;NR=0;PP=33;QD=11.2952020912;SC=CCTCACCCCCGCCCCCCTGCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=6;WE=47581619;WS=47581601;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:4,6:0.60:10
chr18	47765121	rs35839946	G	C	1359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=24;NR=20;PP=680;SC=TTTCAGACAAGAATTGCCAAC;SOR=0.808;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=24;TCR=20;TR=44;WE=47765129;WS=47765111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr18	47777012	rs1790458	C	T	246.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=128;SC=ATGCTGTTGGCTTGTGGACCA;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=47777020;WS=47777002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr18	47777358	rs920791	T	A	600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=15;PP=375;SC=TAAGGTAGAATCATAATAAAG;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=47777366;WS=47777348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr18	47778172	rs35295154	A	G	2299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=43;PP=1429;SC=GAAAATTTTAAAAAGACAAAA;SOR=1.416;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=27;TCR=43;TR=70;WE=47778180;WS=47778162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr18	47788256	rs698617	C	T	45.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=3;NR=0;PP=35;SC=TTAATATAAACATCTCAGCCA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=47788264;WS=47788254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr18	47793973	rs34500680	G	A	2601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=29;PP=1465;ReadPosRankSum=1.916;SC=GAACCAGGACGGACCTGCAGC;SOR=0.364;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=86;TCF=57;TCR=29;TR=85;WE=47793981;WS=47793963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,98:0.99:99
chr18	47801800	rs140690	G	A	1294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=28;PP=825;SC=GGCGACGCAGGCGGTGAGCAA;SOR=1.659;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=15;TCR=28;TR=43;WE=47801808;WS=47801790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr18	47802971	rs10775495	A	G	1754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=34;NR=25;PP=985;SC=CCAGCCTAGCATGACACTGGA;SOR=0.849;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=34;TCR=25;TR=59;WE=47802979;WS=47802961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr18	47809871	rs12458654	G	T	2402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=50;NR=29;PP=1381;SC=TCACTGCGTGGCACCCTCACT;SOR=1.046;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=50;TCR=29;TR=79;WE=47809879;WS=47809861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr18	47810351	rs7228084	A	G	3601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=61;PP=2104;SC=CCTGAAGGCGAGTGCGGGCAC;SOR=0.788;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=58;TCR=62;TR=119;WE=47810359;WS=47810341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr18	47810731	rs2276367	T	C	463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=3;PP=236;SC=CCCTTGAACCTCTCAGGAATG;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=47810739;WS=47810721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr18	47908556	rs6507992	G	A	971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=19;PP=522;SC=TAAAGAAAACGTTCCTTCCCA;SOR=1.547;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=12;TCR=19;TR=31;WE=47908564;WS=47908546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr18	48190271	rs3752085	T	G	627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=5;PP=475;SC=TAGCCGAGACTTGGCCTTTCC;SOR=2.494;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=24;WE=48190279;WS=48190261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr18	48190440	rs3752087	G	A	3610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=45;PP=2158;SC=GCTGTCGGCCGTGGACAGCCG;SOR=0.978;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=74;TCR=45;TR=119;WE=48190448;WS=48190430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr18	48331524	rs2586776	G	A	1574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=14;PP=895;SC=ATTTACTTACGTCATCTAATA;SOR=1.569;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=36;TCR=14;TR=50;WE=48331532;WS=48331514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr18	48331553	rs2849233	T	C	2554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.260;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=26;PP=1410;ReadPosRankSum=-1.589;SC=GTCTGAAGGGTGATATCTATG;SOR=1.138;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=86;TCF=59;TCR=27;TR=85;WE=48331574;WS=48331543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,95:0.99:96
chr18	48333203	rs4940019	C	G	2100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=33;NR=30;PP=1055;SC=GCTTCTGGAACCTCAGTTTCC;SOR=0.828;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=33;TCR=30;TR=63;WE=48333211;WS=48333193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr18	48335773	rs79313911	A	G	2593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=44;NR=42;PP=1412;SC=TGGTCCATGGAACTAAAAACA;SOR=0.820;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=45;TCR=42;TR=86;WE=48335781;WS=48335763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr18	48446953	rs674210	C	T	1194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=22;PP=749;SC=AAAAAAACTTCAGGGTTTTGA;SOR=0.883;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=19;TCR=22;TR=41;WE=48446961;WS=48446943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr18	48591976	rs377767353	G	A	1458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=18;NR=28;PP=823;SC=GAGAGAGCAAGGTATTGATTG;SOR=1.524;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=18;TCR=28;TR=46;WE=48591984;WS=48591966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr18	48723145	rs147438518	CGCCGCCGCG	C	2507.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=2.917;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.70;MQRankSum=0.375;QD=40.45;ReadPosRankSum=-1.276;SOR=0.193;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,60:0.97:62
chr18	48723217	rs35675106	C	T	1579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=61;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=23;NR=25;PP=884;SC=GGGACCCGCCCGGGATCTGCT;SOR=1.085;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=23;TCR=25;TR=48;WE=48723225;WS=48723207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr18	48723439	rs4396619	C	T	413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=12;PP=314;SC=ACAGCTCCGCCGCCCGCCGGG;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=17;WE=48723447;WS=48723429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr18	49867224	rs9951523	T	C	3059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=57;NR=44;PP=1716;SC=AGCTTCCTTGTTCAGCGCGCA;SOR=0.746;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=101;TCF=57;TCR=44;TR=101;WE=49867232;WS=49867214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr18	50450240	rs2276204	T	G	1813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=31;PP=926;SC=ATTTCACATTTAAGACTTTTT;SOR=1.410;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=24;TCR=31;TR=55;WE=50450248;WS=50450230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr18	50451821	rs2298654	T	G	1508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=27;PP=886;SC=ATCACTGAATTGATTCCTATG;SOR=1.009;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=22;TCR=27;TR=49;WE=50451829;WS=50451811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr18	50589905	rs57166441	G	GA	39.06	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.81;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr18	50731802	rs7227069	G	A	862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=19;PP=471;SC=TAGCTCTAGGGCTGGAGAAAT;SOR=1.418;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=12;TCR=19;TR=31;WE=50731810;WS=50731792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr18	50731823	rs2298606	T	C	765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.30;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr18	50731829	rs4497763	A	G	765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.86;SOR=2.049;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr18	50832102	rs1431196	A	G	2006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=38;PP=1178;SC=CAGTGTTCACATGGTGTAGTC;SOR=1.209;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=29;TCR=38;TR=67;WE=50832110;WS=50832092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr18	50912352	rs3764496	T	C	1243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=9;PP=829;SC=AATGTTTGCCTTGAGTATTTT;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=39;WE=50912360;WS=50912342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr18	50917982	rs12604262	C	T	1786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=19;PP=1111;SC=CTTTTATTTACGTATTTATTT;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=38;TCR=19;TR=57;WE=50917990;WS=50917972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr18	50918311	rs1393331	A	G	1025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=21;PP=583;SC=TTTGTTTAACACATTGTTTTA;SOR=1.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=11;TCR=21;TR=32;WE=50918319;WS=50918301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr18	50923932	rs7231978	G	T	363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=260;SC=ATATAAAATAGTTCATCCTCT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=50923940;WS=50923922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr18	50936780	rs10853631	G	A	270.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=221;SC=GAACTGCAGCGTGTAGGACAC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=50936788;WS=50936774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr18	50936994	rs2229082	T	C	2372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=39;PP=1390;SC=TCTCTGATCCTATCCTCTTCA;SOR=0.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=36;TCR=39;TR=75;WE=50937002;WS=50936984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr18	50937026	rs11873515	A	G	1487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=30;PP=876;SC=GGTTTGAATAATTTCCTATTA;SOR=1.262;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=19;TCR=30;TR=49;WE=50937034;WS=50937016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr18	50942653	rs2270951	C	T	2985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=48;NR=50;PP=1534;SC=ACTGGCGTGACGATTAATCTT;SOR=0.918;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=98;TCF=48;TCR=50;TR=98;WE=50942661;WS=50942643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr18	50994208	rs1502229	G	T	1398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=17;PP=785;SC=CTAGAAATTAGGTAAAGTGTT;SOR=1.036;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=27;TCR=17;TR=44;WE=50994216;WS=50994198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr18	51053176	rs17515923	T	G	747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=18;PP=507;SC=ACAGATTGACTGGCGCTGTGT;SOR=1.460;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=10;TCR=18;TR=28;WE=51053184;WS=51053166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr18	51053218	rs113173464	T	TCACCCCAGGC	230.82	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=949;SC=TACTGTCCATTCACCCCAGGC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=3;WE=51053226;WS=51053208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	51750584	.	T	TGCC	504.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=9;PP=467;SC=CCGCCACCGCTGCCGCCGCCG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=9;WE=51750592;WS=51750574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr18	51795957	rs10584411	GCGA	G	1714.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=15;PP=766;SC=GAAGGCGGCGGCGACGACGAC;SOR=0.954;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=17;WE=51795967;WS=51795947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr18	51797620	rs3730685	C	CTA	2786.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=15;NR=14;PP=1443;SC=CAGGAGAAAACACGTCACTCT;SOR=1.270;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=33;TCF=19;TCR=14;TR=29;WE=51797628;WS=51797610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr18	51804259	rs610281	C	T	1671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=37;PP=1017;SC=ACCTACTAACCAAAAGTACAT;SOR=1.727;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=18;TCR=37;TR=55;WE=51804267;WS=51804249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr18	51809122	rs2956141	A	T	176.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=145;SC=CTTAAAGATAAGATTGATATA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=51809130;WS=51809120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr18	51819989	rs660793	G	C	413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=5;PP=297;SC=TATCAGATATGTAAATTAGTC;SOR=1.473;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=15;WE=51819997;WS=51819979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr18	51820805	rs8305	G	A	2287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=48;PP=1340;SC=GTGGAAGAGAGCAGGATCAGA;SOR=1.582;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=25;TCR=48;TR=73;WE=51820813;WS=51820795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr18	51858197	rs17470798	A	G	3546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=58;PP=1761;SC=CCACGGCAAAACTTTGTGTAA;SOR=1.102;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=48;TCR=58;TR=106;WE=51858205;WS=51858187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr18	51880586	rs141426557	AT	A	124.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.86;ReadPosRankSum=-1.383;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr18	51880986	rs1370363	C	T	1071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=22;PP=639;SC=AAGAATATAACCATATAAAAA;SOR=1.552;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=13;TCR=22;TR=35;WE=51880994;WS=51880976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr18	51889056	rs6508290	A	G	89.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=0;PP=38;SC=CCAAATGATCAGAACTCTTGT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=51889064;WS=51889053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr18	51900788	rs71297084	T	TTTAA	1006.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=699;SC=GAGCACACTGTTTACACTAAA;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=13;WE=51900796;WS=51900778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr18	51904461	rs35286005	C	CTTTA	776.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=2;PP=410;SC=TAATAGTCAACTTTATTTATT;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=10;WE=51904469;WS=51904451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr18	51904641	rs3753056	A	G	5163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.03;SOR=1.123;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr18	51904644	rs3753055	G	A	5064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.63;SOR=1.241;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr18	52258548	rs35428499	T	C	3965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=66;NR=62;PP=2154;SC=ATATTGAACGTTGAGCACTCT;SOR=0.818;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=66;TCR=62;TR=128;WE=52258556;WS=52258538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr18	52551716	rs3737477	C	T	894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=20;PP=540;SC=ACTCAACTGCCTTAGGTGCTT;SOR=1.681;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=27;WE=52551724;WS=52551706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr18	52555398	rs4343367	G	A	1418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=17;NR=26;PP=775;SC=CTGCTGTTCAGCAAATGGAGC;SOR=1.702;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=17;TCR=26;TR=43;WE=52555406;WS=52555388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr18	52571434	rs4801109	T	C	234.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=119;SC=TTTGTTTGATTTTCTGAAATG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=52571442;WS=52571424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr18	52571741	rs4801110	C	T	531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=16;PP=399;SC=ATACTATTCACATCAAATCTG;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=52571749;WS=52571731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr18	52575002	rs1944382	G	A	3188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=47;PP=1763;SC=GGGTGGAAGAGGACAGAGACC;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=103;TCF=56;TCR=47;TR=103;WE=52575010;WS=52574992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr18	52585071	rs138785518	GACACACAC	G	277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.6689;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=1;PP=247;SC=CACGTGCACAGACACACACAC;SOR=2.584;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=4;WE=52585086;WS=52585061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr18	52586691	rs8090983	A	G	158.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.47;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	52608329	rs8087479	C	A	1064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=19;NR=18;PP=631;SC=AGAAGGAAAACAAAACCATTT;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=19;TCR=18;TR=37;WE=52608337;WS=52608314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr18	53131202	rs143184224	TGTGTGTGA	T	356.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=767;ReadPosRankSum=1.742;SC=TGTGTGTGTGTGTGTGTGAGA;SOR=1.473;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=10;WE=53131217;WS=53131192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr18	53131488	rs3760600	C	A	41.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=2;PP=24;SC=AACCAGGCACCGGGCTACCAT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=53131496;WS=53131478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr18	53252388	rs599550	G	A	106.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=80;SC=TGCAATAACCGTATGATTACA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=53252396;WS=53252378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr18	53255634	.	GA	G	81.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.92;ReadPosRankSum=1.001;SOR=1.284;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,8:0.29:28
chr18	53302845	rs610362	C	T	420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=293;SC=TAGAAACTACCGTTATGTTTG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=53302853;WS=53302835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr18	53303101	rs611326	C	G	1443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=28;PP=843;SC=GGCACCTGTGCTATTTTCTCC;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=16;TCR=28;TR=44;WE=53303109;WS=53303091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr18	54293843	rs11664091	C	T	69.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=3;PP=48;SC=GACAGAGTCTCACTCTGTCGG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=54293851;WS=54293833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr18	54339818	rs568078	C	G	3307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=49;PP=1780;SC=GCATCTCAGCCGTACTTTTAA;SOR=0.709;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=59;TCR=49;TR=108;WE=54339826;WS=54339808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr18	54339977	rs566956	A	G	393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=12;PP=317;SC=TATAGTCCCCAAATGATGCTT;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=54339985;WS=54339967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr18	54346482	rs683248	T	G	634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=4;PP=411;SC=GTCTTCTATTTTACTATGGCT;SOR=2.636;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=19;WE=54346490;WS=54346472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr18	54346510	rs597585	G	A	1045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=9;PP=756;SC=CACTCAAATAGAAGGTTAATT;SOR=2.012;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=35;WE=54346518;WS=54346500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr18	54346745	rs11452823	A	AT	396.52	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.83;ReadPosRankSum=2.338;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,18:0.90:20
chr18	54346804	.	T	G	38	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=37;MMLQ=22;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=38;QD=24.2570708491;SC=TAAATCTAAATGTAGATATTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=54346812;WS=54346794;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr18	54348514	rs605067	C	T	937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=9;PP=563;SC=AAAAGTCACACTCAAAGCTGA;SOR=1.418;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=30;WE=54348522;WS=54348504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr18	54348650	rs474607	T	C	482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=12;PP=371;SC=TGACTCTAAGTACAAACTATT;SOR=2.049;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=16;WE=54348658;WS=54348640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr18	54353382	rs609195	A	T	478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=12;PP=316;SC=TTATTTTTTGATAATTTTCTT;SOR=3.258;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=54353390;WS=54353372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr18	54354074	rs1943016	C	T	2581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=11;PP=685;SC=TTTTACAAATCTTTCTTTTCA;SOR=1.278;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=41;TCF=26;TCR=15;TR=35;WE=54354084;WS=54354064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr18	54354076	rs5825199	T	TTC	2572.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=11;PP=1017;SC=TTACAAATCTTTCTTTTCAGG;SOR=1.278;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=29;TCF=16;TCR=13;TR=23;WE=54354084;WS=54354064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr18	54354239	rs576095	T	C	489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=11;PP=302;SC=AGCTGTATTTTTATCCTTCAA;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=54354247;WS=54354229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr18	54359062	rs2110414	G	A	502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=8;NR=10;PP=259;SC=AAATTCTTGAGGTGTCATTTA;SOR=1.230;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=8;TCR=10;TR=18;WE=54359070;WS=54359052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr18	54448778	rs2302845	G	A	2377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.85;SOR=0.737;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr18	54483146	rs3745038	A	G	117.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=91;SC=GTGAACATATATATTTTTTAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=54483154;WS=54483136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr18	54605919	rs78895434	A	C	2342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=46;PP=1467;SC=TGGAGGTAAGAATATCCTGTT;SOR=1.375;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=28;TCR=46;TR=74;WE=54605927;WS=54605909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr18	54694452	rs3745033	C	T	1374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=29;PP=870;SC=TGCTGCCTGCCGCCGTGACTG;SOR=1.390;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=16;TCR=29;TR=45;WE=54694460;WS=54694442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr18	55019963	.	T	TCA	236.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.826;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=1.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.49;MQRankSum=0.925;QD=10.76;ReadPosRankSum=-0.201;SOR=1.244;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr18	55027212	rs1942964	T	G	1962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=24;PP=1053;ReadPosRankSum=1.096;SC=CCAAATGTACTTATTGTTCCA;SOR=0.485;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=43;TCR=24;TR=66;WE=55027220;WS=55027202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,78:0.99:79
chr18	55143589	rs618953	A	G	1064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=26;NR=9;PP=779;SC=ATCTCTTTGTACAACTTTGTC;SOR=2.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=35;WE=55143597;WS=55143579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr18	55143766	rs3745074	C	T	5485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=98;NR=77;PP=2930;SC=GAACACTCTTCGCCATCTTCA;SOR=0.772;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=176;TCF=98;TCR=78;TR=175;WE=55143774;WS=55143756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr18	55240455	rs577152	T	C	2306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=29;PP=1326;SC=AGGTTATAATTGAGGTGTTTA;SOR=1.165;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=47;TCR=29;TR=76;WE=55240463;WS=55240445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr18	55253710	rs317815	G	A	1212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=31;NR=8;PP=798;SC=GCGAGGGCCCGGGCGCCAGCT;SOR=2.531;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=31;TCR=8;TR=39;WE=55253718;WS=55253700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr18	55287739	rs388644	A	C	622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=7;PP=367;SC=GCAAGTCACAAGAAAATTGAC;SOR=1.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=14;TCR=7;TR=21;WE=55287747;WS=55287729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr18	55288007	rs389031	G	A	214.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=131;SC=AGGTCCATAAGTAATTAATAT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=55288015;WS=55287997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr18	55288879	rs368935	A	G	1507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=31;NR=12;PP=901;SC=CCGAAACCCGACTGGAGCAGA;SOR=1.702;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=31;TCR=12;TR=43;WE=55288887;WS=55288869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr18	55317676	rs222581	C	T	3641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=61;PP=2201;SC=ACAGCAACAGCCAGGATGATA;SOR=0.738;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=65;TCR=61;TR=126;WE=55317684;WS=55317666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr18	55319472	rs7226404	A	C	994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=21;PP=655;ReadPosRankSum=-0.647;SC=AGGATCTAACAATCCTGAAAA;SOR=0.495;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=35;TCF=13;TCR=22;TR=34;WE=55319480;WS=55319462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,37:0.97:38
chr18	55322502	rs12968116	C	T	4626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=59;PP=2205;SC=AAAGAAGTATCGTAGGAACTT;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=138;TCF=79;TCR=59;TR=138;WE=55322510;WS=55322492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr18	55334440	rs45454792	T	TTTTTA	446.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=329;SC=ATTCCTGCTGTTTTTATTTTA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=8;WE=55334448;WS=55334430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr18	55335240	rs4940499	A	G	881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=5;PP=577;SC=TTCCTTAGGTATACAATTTTA;SOR=2.147;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=26;WE=55335248;WS=55335230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr18	55335495	rs317844	A	G	1113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=16;PP=745;SC=GATGCAGAAGAATGTGCTGGA;SOR=0.743;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=19;TCR=16;TR=35;WE=55335503;WS=55335485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr18	55352436	rs319459	G	A	1973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=29;NR=28;PP=848;SC=AGTGATGGTGGTAAGACCATA;SOR=1.022;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=29;TCR=28;TR=57;WE=55352444;WS=55352426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr18	55352470	rs143958246	TTTA	T	1730.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=23;PP=1055;SC=GGCTAAAATATTTATTATCTG;SOR=1.788;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=55352480;WS=55352460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr18	55362532	rs319443	T	G	1406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=23;PP=841;SC=TTATCTAGTCTGTTATTGGGT;SOR=0.808;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=23;TCR=23;TR=46;WE=55362540;WS=55362522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr18	55362816	rs319442	G	A	277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=213;SC=TGAGTTCAAAGTGGAAGTTAA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=55362824;WS=55362806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr18	55364852	rs319438	A	G	1473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=17;PP=776;SC=ACACTTACCCATCCAGTTCTG;SOR=1.140;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=32;TCR=17;TR=49;WE=55364860;WS=55364842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr18	55397512	rs319432	T	G	397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=1;PP=185;SC=TAGAAAGCCTTCAAGGGCAGA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=55397520;WS=55397502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr18	55397624	rs33964473	GATA	G	4908.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=33;PP=2697;SC=AGAACACTATGATAATGATTT;SOR=1.109;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=26;TCR=35;TR=58;WE=55397634;WS=55397614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr18	55397674	rs319433	G	C	3863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=56;PP=1976;SC=TAGAATTTTAGGGAACACCAT;SOR=0.850;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=134;TCF=78;TCR=56;TR=134;WE=55397682;WS=55397664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr18	55397871	rs319434	T	C	4582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=78;PP=2765;SC=TTCTACTGCCTTCAGTGATGT;SOR=0.829;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=155;TCF=77;TCR=78;TR=155;WE=55397879;WS=55397861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr18	55398756	rs651867	T	C	3051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=50;PP=1883;SC=GAGAAGATTCTCTCCTAGACC;SOR=0.710;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=102;TCF=52;TCR=50;TR=102;WE=55398764;WS=55398746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr18	55816791	rs4149601	G	A	5335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=79;NR=90;PP=2955;SC=CATTTGAGCAGGTAACACTCG;SOR=0.898;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=169;TCF=79;TCR=90;TR=169;WE=55816799;WS=55816781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr18	55832896	rs564442	C	T	108.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=0;PP=82;SC=TGCTTATGCTCGAATTGATTT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=55832904;WS=55832888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr18	56008148	rs4149609	A	G	318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=280;SC=AGTGTTTTCTATATAAATAGA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=56008156;WS=56008138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr18	56040649	rs1943994	T	C	1265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=31;PP=933;SC=GCAGCACCTTTTTGTCATGCC;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=36;WE=56040657;WS=56040639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr18	56054616	rs5825274	AT	A	40.15	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5415;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=7;NR=0;PP=65;SC=TTCCTGTGAAATTTTTTTTTT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=7;WE=56054624;WS=56054606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr18	56056502	rs2277718	G	A	243.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=7;PP=157;SC=CTCCATTGTGGTCTGACTTCA;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=56056510;WS=56056492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr18	56149048	rs3744867	A	G	833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=6;PP=542;SC=TAGGTTACCCAGGGACGTTAG;SOR=2.694;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=28;WE=56149056;WS=56149038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr18	56149099	rs7240666	T	C	2211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=24;PP=1205;SC=GCCTTCTTTATTGTCATAGAG;SOR=1.151;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=43;TCR=24;TR=67;WE=56149107;WS=56149089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr18	56171404	rs113399920	G	A	1535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=32;PP=925;SC=GAACACAGGCGCACATCAAGG;SOR=1.528;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=18;TCR=32;TR=50;WE=56171412;WS=56171394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr18	56182145	rs59425126	A	G	504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=2;PP=371;SC=CACTTGCCCTACTGTTCCTTC;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=56182153;WS=56182135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr18	56182174	rs7505023	T	C	896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=10;PP=665;SC=TCGTCCCTCCTAGTCCCCAAC;SOR=1.681;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=22;TCR=10;TR=32;WE=56182182;WS=56182164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr18	56191351	rs7228617	C	T	144.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=114;SC=TGCATTTTTTCCTAATATACT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=56191359;WS=56191341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr18	56196451	rs7236563	C	T	1594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=24;PP=819;SC=CAGCTTGGATCTTTTTCAGTA;SOR=1.034;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=24;TCR=24;TR=48;WE=56196459;WS=56196441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr18	56202059	rs10469211	A	G	2971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=38;PP=1829;SC=CAGCAACAGAACCTCACCTCT;SOR=1.077;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=59;TCR=38;TR=97;WE=56202067;WS=56202049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr18	56202418	rs10469212	T	C	3397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=66;NR=42;PP=1801;SC=CCTGCAGTAATTTAGGGGCTT;SOR=0.826;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=109;TCF=66;TCR=43;TR=108;WE=56202426;WS=56202408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr18	56202768	rs3809983	C	A	3530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=51;PP=2160;SC=CCAAGAGAAGCGTGAGTCATT;SOR=0.772;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=64;TCR=51;TR=115;WE=56202776;WS=56202758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr18	56202982	rs3826594	A	T	1953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=34;PP=1270;SC=GAATTTGTTCAGCCTCCTGCT;SOR=0.904;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=30;TCR=34;TR=64;WE=56202990;WS=56202972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr18	56203074	rs3809982	G	A	1890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=26;PP=1033;SC=AAAATGGCCGGCTGGATTTCC;SOR=0.722;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=30;TCR=26;TR=56;WE=56203082;WS=56203064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr18	56203120	rs3809981	C	T	2133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=25;PP=1227;SC=TTGATTGACCCCCTTCTCTGG;SOR=0.804;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=34;TCR=25;TR=59;WE=56203128;WS=56203110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr18	56203411	rs3809980	G	C	2749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=49;PP=1518;SC=CCAGGAGTCTGGGTTGGCTGA;SOR=0.772;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=46;TCR=49;TR=95;WE=56203419;WS=56203401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr18	56203447	rs3809979	A	G	2447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=39;PP=1615;SC=GACTTCTCCAATGTACACTGA;SOR=0.786;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=44;TCR=39;TR=83;WE=56203455;WS=56203437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr18	56203891	rs3809978	G	T	3755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.19;SOR=0.867;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr18	56203898	rs3809977	T	G	3853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.30;SOR=0.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr18	56204250	rs3809976	A	C	5424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=78;PP=2965;SC=ATATGATCCAACTGCACTTGG;SOR=0.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=177;TCF=99;TCR=78;TR=177;WE=56204258;WS=56204240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr18	56204387	rs67925233	ACAGTTGATGTGTCCT	A	5008.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=16;NR=36;PP=2933;SC=GGCAATGGTAACAGTTGATGT;SOR=0.730;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=59;TCF=20;TCR=39;TR=52;WE=56204418;WS=56204377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr18	56204410	rs55910046	C	T	5337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=47;PP=2311;SC=CCTCAGTCTCCCTGGTCGCTT;SOR=0.776;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=53;TCR=47;TR=100;WE=56204418;WS=56204377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr18	56204671	rs4940404	A	T	1155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=15;PP=764;SC=GGTAGGTGGAATTCTCCACCT;SOR=0.954;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=23;TCR=15;TR=38;WE=56204679;WS=56204661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr18	56204747	rs3826593	G	A	1813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=26;PP=1072;SC=GAAAGTACTGGTAAAAAGAGG;SOR=0.849;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=35;TCR=26;TR=61;WE=56204755;WS=56204737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr18	56204932	rs3809973	T	G	4105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=57;PP=2274;SC=GAGGCGAATATTTATCAACTG;SOR=0.875;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=135;TCF=78;TCR=57;TR=135;WE=56204953;WS=56204922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr18	56204945	rs3809972	C	G	4371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=59;PP=2410;SC=ATCAACTGGTCTCCCAACAAG;SOR=0.908;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=141;TCF=82;TCR=59;TR=141;WE=56204953;WS=56204922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr18	56204977	rs3809971	C	T	3910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=52;PP=2289;SC=TATCAAAACACGTTCCTTGGT;SOR=1.011;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=122;TCF=70;TCR=52;TR=122;WE=56204999;WS=56204967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr18	56204991	rs3809970	C	T	3929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=61;PP=2287;SC=CCTTGGTCACCAGCCTCAAAA;SOR=0.779;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=65;TCR=61;TR=126;WE=56204999;WS=56204967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr18	56205262	rs12103986	A	C	5694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=90;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.331;SC=GTTTTTCTTCATGCTGTGGAC;SOR=0.246;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=187;TCF=96;TCR=91;TR=186;WE=56205270;WS=56205252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,214:1.00:215
chr18	56205481	rs9962203	G	A	1131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=26;PP=664;SC=AGTGATATTAGTAGAATTGTT;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=14;TCR=26;TR=40;WE=56205489;WS=56205471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr18	56205551	rs9962964	C	T	265.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=216;SC=CCTCAATGACCGTAATAATGG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=56205559;WS=56205541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr18	56274514	rs6566986	A	G	2535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=52;NR=27;PP=1379;SC=ACAGAATATAAGGATATTAGT;SOR=1.167;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=52;TCR=27;TR=79;WE=56274522;WS=56274504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr18	56279025	rs6566987	T	G	643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=11;NR=16;PP=433;SC=TTCGGAGTCTTTCATCCTTTC;SOR=1.136;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=28;TCF=11;TCR=17;TR=27;WE=56279033;WS=56279015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr18	56412784	rs58993112	C	T	163.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=128;SC=CCAAAATTCACGAGAGGCCAG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=56412792;WS=56412774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	56646583	rs35743757	A	AAAAT	53.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=2;PP=86;SC=GAAAATAAAAAAAAAAGGAGC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=56646591;WS=56646573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr18	56702945	rs17695181	A	C	330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=5;PP=236;SC=TTTTCTTGGCAGAAGAATGTG;SOR=1.022;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=12;TCF=7;TCR=5;TR=12;WE=56702953;WS=56702935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr18	56703194	rs9961940	A	C	757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=12;NR=15;PP=442;SC=CCACGAGCAGACTTCCTTCTG;SOR=0.976;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=12;TCR=15;TR=27;WE=56703202;WS=56703184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr18	56711225	rs11152115	A	C	385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=3;PP=255;SC=TTTATTCTGTACAGATTGGGA;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=56711233;WS=56711215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr18	56711284	rs11152116	C	T	1653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=17;PP=920;SC=GTAATTCCTGCGACAATTCTT;SOR=1.536;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=38;TCR=17;TR=55;WE=56711292;WS=56711274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr18	56807308	rs3744890	C	G	1145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=23;PP=673;SC=GCCGGGACCGCCTGTGCTAGC;SOR=1.312;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=16;TCR=23;TR=39;WE=56807316;WS=56807298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr18	56807339	rs3744891	T	G	589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=13;PP=377;SC=GGCTTCCCAGTCAGGGCTCCG;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=7;TCR=13;TR=20;WE=56807347;WS=56807329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr18	56819930	rs3760555	T	C	705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=14;PP=428;SC=AAAGAGGCTTTATTTCCTTTT;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=22;TCF=8;TCR=14;TR=22;WE=56819938;WS=56819920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr18	56887507	rs1062557	C	A	268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;NF=6;NR=0;PP=81;SC=CATGCGCGGCCGTGAGCTCCC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=6;WE=56887515;WS=56887497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr18	56963742	rs4940456	C	T	143.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=84;SC=GTAAGGTTCCCGCTGCAAGGT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=56963750;WS=56963738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr18	56963767	rs17769193	C	G	296.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=184;SC=GCTAAATGCTCTGCCAGGAAT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=56963775;WS=56963757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr18	56963852	rs17696504	T	G	1563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=28;NR=22;PP=822;SC=CATTAAAACATGTACTGCTTG;SOR=0.796;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=51;TCF=28;TCR=23;TR=50;WE=56963860;WS=56963842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr18	56979805	.	AAT	A	88	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=88;QD=48.5;SC=ATATATCTTGAATATATATAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=56979814;WS=56979795;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr18	56985729	rs12955045	G	A	577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=14;PP=403;SC=CCAAAATTCAGACAAAAGCTG;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=56985737;WS=56985719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr18	56998901	rs12959578	C	T	218.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.593;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=177;ReadPosRankSum=0.282;SC=CCCAGAAAACCTTCTATCCCC;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=8;WE=56998909;WS=56998891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr18	57000274	rs7238054	T	C	952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=9;PP=625;SC=GTATGAGTTCTTCCTTTCCTA;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=31;WE=57000282;WS=57000264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr18	57000518	rs10714229	GT	G	450.87	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.682;HP=11;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.516;NF=0;NR=16;PP=222;ReadPosRankSum=1.144;SC=TCACTATAAAGTTTTTTTTTT;SOR=1.814;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=16;WE=57000526;WS=57000508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,20:0.87:23
chr18	57005739	rs35746038	T	A	196.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=185;SC=GTCACAAATTTAGGATAAAAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=57005747;WS=57005729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr18	57014704	rs10632432	A	AAACC	637.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=5;NR=4;PP=554;SC=CTAAAAGGCAAACTAAACTGA;SOR=1.112;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=9;TCF=5;TCR=4;TR=9;WE=57014712;WS=57014694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr18	57014889	rs8095245	T	C	115.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=4;PP=117;SC=ATATTTATTGTTTTAAATAAC;SOR=3.258;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=57014897;WS=57014879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr18	57022754	rs1127220	T	C	3520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=54;PP=2135;SC=CAGCTCCAATTCGACCTCTTC;SOR=0.709;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=113;TCF=59;TCR=54;TR=113;WE=57022762;WS=57022744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr18	57026361	rs33926449	A	G	4975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=78;NR=79;PP=2719;SC=TGGCAACGCGACCGCGGGGTC;SOR=0.842;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=157;TCF=78;TCR=79;TR=157;WE=57026369;WS=57026351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr18	57115133	rs3809990	T	C	107.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=0;PP=52;SC=CTGGAGAACATTGTCCAGGCC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=57115141;WS=57115132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr18	57115203	rs1893788	T	C	650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=6;PP=368;SC=CTGTGCCCTCTTCCACACTCA;SOR=1.519;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=20;WE=57115211;WS=57115193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr18	57115490	rs749999	T	A	385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=10;PP=234;SC=ATAAAGAGCCTCTTTCTAAAC;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=57115498;WS=57115480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr18	57134152	rs4940876	A	G	732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=15;PP=470;SC=AGAGAATACTAAGTTTCTGAG;SOR=0.997;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=12;TCR=15;TR=27;WE=57134160;WS=57134142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr18	57147351	rs1663548	G	A	313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=3;PP=171;SC=ATGAACATCTGAAGTTGATAG;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=11;WE=57147359;WS=57147341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr18	57147390	rs1790508	C	G	961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.72;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr18	57147390	.	CAG	GAT	839	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=14;NR=6;PP=839;QD=44.6233937431;SC=TGAATAAAGTCAGACAATATC;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=20;WE=57147400;WS=57147367;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,20:0.95:21
chr18	57147392	rs1663549	G	T	961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.72;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr18	57567638	rs11663656	G	C	2155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=43;NR=25;PP=1234;SC=CCTCCAGAAAGTTCTTCGGGG;SOR=1.236;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=43;TCR=25;TR=68;WE=57567646;WS=57567628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr18	57638330	rs10871774	G	A	2356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=38;PP=1445;SC=TTTCTGCGCAGAACTGTCGTA;SOR=0.897;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=33;TCR=39;TR=71;WE=57638338;WS=57638320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr18	59157764	rs680530	T	C	4120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=78;NR=51;PP=2134;SC=TTCTCCTTCATTTTCTGAAAA;SOR=0.920;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=79;TCR=52;TR=129;WE=59157785;WS=59157754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr18	59158065	rs681902	T	G	319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=1;NR=10;PP=250;SC=GACCCGGGTATTGGATATTGA;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=59158073;WS=59158055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr18	59166541	rs12964819	C	T	1905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=35;PP=1212;SC=AGAGGCTCGACCGAGAGGAAA;SOR=0.779;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=31;TCR=35;TR=66;WE=59166549;WS=59166531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr18	59170304	rs595093	C	G	2318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=38;NR=36;PP=1315;SC=CCACAACAGTCAACATCACCC;SOR=0.739;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=38;TCR=36;TR=74;WE=59170312;WS=59170294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr18	59174759	rs1943330	C	A	964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=22;PP=599;SC=AGCACAGATCCCAATTTCCAA;SOR=2.584;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=28;WE=59174767;WS=59174749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr18	59174817	rs1547956	C	A	101.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=75;SC=TTTTTCTAAACCACTTTCATG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=59174825;WS=59174807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr18	59203707	rs62097360	G	A	2019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=21;PP=1282;SC=AATGATGTACGTAATCCATGT;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=47;TCR=21;TR=68;WE=59203715;WS=59203697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr18	59206197	rs5825446	C	CT	968.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.788;HP=9;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=7;PP=451;ReadPosRankSum=0.383;SC=AACCATTACTCTTTTTTTTCT;SOR=1.802;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=34;TCF=21;TCR=13;TR=20;WE=59206205;WS=59206187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,37:0.95:39
chr18	59483514	rs9319985	A	G	4024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=69;PP=2268;SC=AGAAGCCGGGAGGCAGCTTGG;SOR=0.892;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=134;TCF=65;TCR=69;TR=133;WE=59483522;WS=59483504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr18	59768375	rs17714063	A	G	4215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=64;NR=69;PP=2240;SC=GACTACTCTGAGTGCTATACA;SOR=0.931;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=133;TCF=64;TCR=69;TR=133;WE=59768383;WS=59768365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr18	59770033	rs12326381	C	T	2438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=23;PP=1239;SC=TGACCTGTAACAGATGTACCA;SOR=1.485;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=51;TCR=23;TR=74;WE=59770041;WS=59770023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr18	59772926	rs17714262	G	A	994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=24;PP=652;SC=TATCATTAGTGTTTCACAGAC;SOR=1.949;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=34;WE=59772934;WS=59772916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr18	59774037	rs9319997	C	T	3086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=57;NR=52;PP=1664;SC=CTCGAGTCCACAGCCGAGTGA;SOR=0.710;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=109;TCF=57;TCR=52;TR=109;WE=59774045;WS=59774027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr18	59774186	rs2840359	T	C	1613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=22;PP=1017;SC=ATAAAAGAAATTTGCAAATGT;SOR=0.997;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=31;TCR=22;TR=53;WE=59774194;WS=59774176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr18	59780424	rs17714875	A	G	2613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=50;NR=30;PP=1487;SC=TGATCAACAAAGAGGCATAAG;SOR=1.076;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=50;TCR=30;TR=80;WE=59780432;WS=59780414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr18	59781800	rs13381627	A	G	1841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=29;NR=30;PP=884;SC=TTACCACTTCATCAAACTTTC;SOR=0.864;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=59;TCF=29;TCR=30;TR=59;WE=59781808;WS=59781790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr18	59781955	rs13381633	A	T	71.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=3;PP=50;SC=TAAAAAACAAAGATAGTGAAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=59781963;WS=59781945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr18	59805532	rs9959632	T	C	1585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=20;NR=32;PP=984;SC=TCATTTTCACTTGGGAACCAA;SOR=1.493;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=20;TCR=32;TR=52;WE=59805540;WS=59805522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr18	59807604	rs55715769	G	A	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=20;NR=5;PP=410;SC=TTTACTGTGCGATAGTTTTTT;SOR=1.688;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=25;WE=59807612;WS=59807594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr18	59807796	rs56189211	A	T	295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=8;PP=185;SC=TATTTTGGAAAATAACCATGA;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=59807804;WS=59807786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr18	59810563	rs34227891	A	G	1051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=13;PP=646;SC=GCCTCTTCCAATTCTCCAATC;SOR=0.914;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=21;TCR=13;TR=34;WE=59810571;WS=59810553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr18	59813265	rs61751989	A	T	1443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=27;PP=805;SC=GAACCTACAAATAAGATATAA;SOR=1.220;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=19;TCR=27;TR=46;WE=59813273;WS=59813255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr18	59814268	rs9320000	G	A	1385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=22;PP=673;SC=TTCCATAGAAGTGGTTAAACA;SOR=1.136;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=20;TCR=22;TR=42;WE=59814276;WS=59814258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr18	59814324	rs9320001	G	C	375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=6;PP=241;SC=TTAATATTGTGCTTGTAGTCT;SOR=1.445;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=59814332;WS=59814314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr18	59815284	rs7243994	G	C	107.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=81;SC=TGATTTAAACGACTATATTGG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=59815292;WS=59815274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr18	59821949	rs11659731	G	A	292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=266;SC=TAAAATATGAGCTAGTCATTC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=59821957;WS=59821939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr18	59824209	rs1021952	A	T	320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=211;SC=GGAAAAAAAAATACTGTAATT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=59824217;WS=59824200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr18	59824490	rs1021953	A	T	1681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=38;PP=1118;SC=AGTAATAGTTATATACACATG;SOR=2.001;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=15;TCR=38;TR=53;WE=59824498;WS=59824480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr18	59825109	rs17715866	A	C	961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=23;PP=703;SC=AAGCTTTAGAAACATAAGATT;SOR=3.407;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=26;WE=59825117;WS=59825099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr18	59855291	rs17644012	C	T	485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=13;PP=356;SC=TGTCACACTCCGGCAGGGTAT;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=17;WE=59855299;WS=59855281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr18	59894764	rs17717783	T	C	3321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=54;PP=2027;SC=CCACAGAAAGTATTTAAACTA;SOR=0.871;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=50;TCR=55;TR=103;WE=59894772;WS=59894754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr18	59936081	rs55806215	A	T	290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.43;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr18	59936142	rs17645999	C	T	881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=20;NR=6;PP=433;SC=AAGCTACAGTCCCCATTTATG;SOR=1.244;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=26;WE=59936150;WS=59936132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr18	59946943	rs10515985	G	A	393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=5;PP=316;SC=CCTTCTTCCCGTGGCGCACTG;SOR=1.765;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=15;WE=59946951;WS=59946933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr18	59947118	rs2980981	G	A	3991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=60;PP=2164;SC=TTTTATATTCGGCATCCCTTT;SOR=0.806;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=67;TCR=60;TR=127;WE=59947126;WS=59947108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr18	59947988	rs1506325	G	A	1449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=19;PP=744;SC=TATTGATGTGGTCATGATACA;SOR=0.767;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=27;TCR=19;TR=46;WE=59947996;WS=59947978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr18	59954765	rs1567038	G	T	1137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=24;PP=705;SC=AACTTGGTTGGTAAAGATTGA;SOR=2.554;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=32;WE=59954773;WS=59954755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr18	60036083	rs8092336	A	G	2960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=48;PP=1792;SC=GTCAGGGCACATGTGTAGGAG;SOR=0.784;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=59;TCR=48;TR=107;WE=60036091;WS=60036073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr18	60212013	rs143702074	ATG	A	1471.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=14;PP=707;SC=ACCATATAATATGTGTGTTTT;SOR=0.746;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=16;WE=60212022;WS=60212003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr18	60225865	rs72941651	G	C	293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=2;PP=145;SC=TATTATATTTGTTTTCTTTAT;SOR=1.802;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=60225873;WS=60225855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr18	60227939	rs146609669	TAATTA	T	457.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=394;SC=ATGTAACATTTAATTAAATTT;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=60227951;WS=60227929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr18	60232405	rs4940561	C	T	580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=12;PP=306;SC=TTAATAGATACTGAGCTGTTG;SOR=1.426;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=18;WE=60232413;WS=60232395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr18	60237388	rs8096750	A	G	3371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=44;PP=1700;SC=AAACATCTTCAGAGAGTTACA;SOR=0.876;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=60;TCR=44;TR=104;WE=60237396;WS=60237378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr18	60562298	rs624821	A	T	1915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=33;NR=27;PP=846;SC=GGGACTTCCCACTGGCAGTCT;SOR=0.804;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=33;TCR=27;TR=60;WE=60562306;WS=60562288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr18	60562957	rs144369901	TA	T	412.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=375;SC=TGTATGTTGATAATAAAGATG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=10;WE=60562965;WS=60562947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr18	60572437	rs3217528	GT	G	883.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.88;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr18	60985879	rs1801018	T	C	6157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=101;NR=93;PP=2891;SC=TATCGTACCCTGTTCTCCCAG;SOR=0.808;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=194;TCF=101;TCR=93;TR=194;WE=60985887;WS=60985869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr18	61022634	rs1809319	T	C	2519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.110;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=38;PP=1770;ReadPosRankSum=1.043;SC=ATTAAACCTATAGAGAAGTTG;SOR=0.332;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=44;TCR=39;TR=81;WE=61022642;WS=61022624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,87:0.99:88
chr18	61022791	rs2003149	C	T	1728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=25;NR=35;PP=928;SC=ATATGCAAAGCACCACCTGTT;SOR=1.318;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=25;TCR=35;TR=60;WE=61022799;WS=61022781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr18	61060873	rs898890	G	A	329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=215;SC=ATGTATAATAGTTTTGTATGT;SOR=2.670;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=61060881;WS=61060863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr18	61066463	rs2276317	A	G	1650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=35;NR=18;PP=934;SC=GATATTTACTATATTATCCTA;SOR=1.255;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=35;TCR=18;TR=53;WE=61066471;WS=61066453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr18	61067959	rs952245	T	C	1641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=38;PP=939;SC=TTTAGAAAAATGTCATGAGAA;SOR=1.366;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=22;TCR=38;TR=60;WE=61067967;WS=61067949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr18	61154043	rs34587228	T	C	1247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=9;PP=852;SC=GTGCTGAGGTTGAGGAGCCTT;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=31;TCR=9;TR=40;WE=61154051;WS=61154033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr18	61154388	rs2271254	C	T	155.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=93;SC=GTTAGACCTACAACTTTTTTT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=61154396;WS=61154378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	61156606	rs12454742	G	C	2988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=27;PP=1732;SC=CGAAGAGACCGTATGCAAAGG;SOR=1.524;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=68;TCR=27;TR=95;WE=61156614;WS=61156596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr18	61160287	rs2289519	T	C	3978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=65;PP=2372;SC=GAAGAAATTTTCTGAATCAGA;SOR=0.956;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=61;TCR=65;TR=126;WE=61160295;WS=61160277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr18	61160385	rs2289521	T	C	1970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=28;NR=35;PP=1206;SC=TGAAAAATGATAGGGACAGAG;SOR=1.117;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=28;TCR=35;TR=63;WE=61160393;WS=61160375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr18	61166269	rs56208842	C	T	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr18	61166273	rs12458191	C	T	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr18	61166280	.	G	GTATATA	98.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9993;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=0;PP=63;SC=GCGCGTGTGTGTATATATATA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=1;WE=61166288;WS=61166259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr18	61170467	rs1840557	G	A	343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=256;SC=CTGCTTTGAAGCTGGGCTTAT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=61170475;WS=61170460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr18	61170500	rs1455557	T	C	716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=19;NR=2;PP=500;SC=TGTTTTCAATTGAGCCAGGTC;SOR=3.352;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=61170508;WS=61170490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr18	61170721	rs1455556	T	C	4242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=77;PP=2302;SC=ATATCTTCAGTGAAGACACAT;SOR=0.848;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=147;TCF=70;TCR=77;TR=147;WE=61170729;WS=61170711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr18	61170782	rs1455555	A	G	4299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=73;PP=2662;SC=ATCAAATGTTATCCACAAAGT;SOR=0.798;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=142;TCF=69;TCR=73;TR=142;WE=61170790;WS=61170772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr18	61170925	rs8093128	T	C	3054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=45;NR=49;PP=1636;SC=CTCGAAACATTATTTTCTTTG;SOR=0.965;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=45;TCR=49;TR=94;WE=61170933;WS=61170915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr18	61225801	rs7244584	C	T	2098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=42;PP=1218;SC=GTGATAGTTGCTTATCCCCAA;SOR=1.358;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=27;TCR=42;TR=69;WE=61225809;WS=61225791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr18	61226694	rs11152391	G	A	177.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=0;PP=84;SC=AACAGAGACAGCTGACATCTT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=61226702;WS=61226687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	61226740	rs12103954	G	A	680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=3;PP=472;SC=TACAAAACACGCATCTTTTAG;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=61226748;WS=61226730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr18	61228248	rs9676250	T	C	90.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.51;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr18	61231143	rs33927218	AAAAAT	A	647.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.44;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr18	61231417	rs9957786	A	G	1819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=41;PP=1267;SC=GGAATGATTTACAATATGTAT;SOR=1.721;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=21;TCR=41;TR=62;WE=61231425;WS=61231407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr18	61233739	rs2077549	T	C	368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=0;PP=317;SC=TCTTGAAGGTTGTCACTGCCC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=61233747;WS=61233729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr18	61254525	rs3216123	A	AT	2033.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=32;PP=1158;SC=TTGGGCATAGATTTTTTTTAA;SOR=1.002;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=55;TCF=17;TCR=38;TR=47;WE=61254533;WS=61254515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr18	61256117	rs77936810	GC	G	248.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=249;SC=AATTCATTTGGCGGGGGGGTT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=61256125;WS=61256107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr18	61257084	.	A	C	112	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=18;MQ=60.0;NF=0;NR=11;PP=112;QD=13.3428375043;SC=CTTTACTATTAAGCAATAATA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=11;WE=61257092;WS=61257074;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr18	61261515	rs11152394	T	C	3744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=44;PP=1412;SC=CAAGTCCATCTGCATCATATT;SOR=0.737;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=45;TCR=44;TR=89;WE=61261523;WS=61261505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr18	61261540	rs11152395	T	C	4015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=42;PP=1778;SC=ATACATATTATTTGTCATTTG;SOR=0.738;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=45;TCR=42;TR=87;WE=61261548;WS=61261530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr18	61261565	rs11152396	C	G	3596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=35;PP=1511;SC=ATGGGTCAACCTTTTTCTGTT;SOR=0.887;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=82;TCF=47;TCR=35;TR=82;WE=61261573;WS=61261555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr18	61264298	rs1020694	G	A	2991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=38;PP=1754;SC=GGTGGAGGACGGTTACGATCT;SOR=1.002;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=57;TCR=38;TR=95;WE=61264306;WS=61264288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr18	61264468	rs1020693	C	T	5270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=78;PP=2965;SC=CAGCTGCCACCGGCATAGGCT;SOR=0.779;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=173;TCF=95;TCR=78;TR=173;WE=61264476;WS=61264458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr18	61271065	rs7229459	G	A	302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=277;SC=CAGATTCAACGGATAGTTACA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=61271073;WS=61271055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr18	61308895	rs2518061	A	G	2207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=19;PP=1160;SC=TCTCCACCTGAGTCGGCCAGG;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=45;TCR=19;TR=64;WE=61308903;WS=61308885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr18	61323095	.	G	A	4050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=67;PP=2539;SC=CAGATAGCACGAGACCGCGGC;SOR=0.776;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=136;TCF=69;TCR=67;TR=136;WE=61323103;WS=61323085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr18	61325905	rs7228687	T	G	1109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=20;PP=602;SC=TAAGAGTAATTTATGTAACTA;SOR=1.005;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=18;TCR=20;TR=38;WE=61325913;WS=61325895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr18	61326505	rs8089032	T	A	1547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=16;PP=893;SC=AACGGAGCTATTGCACTCTGA;SOR=1.238;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=34;TCR=16;TR=50;WE=61326513;WS=61326495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr18	61326597	rs8085479	A	C	5503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.70;QD=44.03;SOR=0.882;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr18	61326602	rs8085482	A	G	5705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.70;QD=45.65;SOR=0.920;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr18	61326609	rs8089201	T	G	5799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.84;QD=43.94;SOR=0.820;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr18	61326628	rs11370831	A	AT	4722.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=44;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=47;PP=2827;SC=GCCAGGTGAAATTACCTGTAA;SOR=0.739;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=67;TCF=18;TCR=49;TR=65;WE=61326636;WS=61326618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr18	61377579	rs1395268	A	C	1348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=27;PP=874;SC=GGAGAGACTGAAGAGCAATTG;SOR=1.225;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=19;TCR=27;TR=46;WE=61377587;WS=61377569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr18	61383181	rs8087185	A	C	167.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=102;SC=TTTTCTCTGCATTAGAATTTT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=61383189;WS=61383171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	61387993	rs12607732	T	C	55.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.43;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr18	61388269	.	AAC	A	29	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=1;PP=29;QD=39.0;SC=TGTGCATGTTAACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=1;WE=61388278;WS=61388259;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:2,1:0.33:3
chr18	61390316	rs1395265	C	A	4751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=76;PP=2822;SC=ACACCTCCCCCGATTCAAACT;SOR=0.815;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=76;TCR=76;TR=152;WE=61390324;WS=61390306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr18	61390332	rs1395266	C	T	4462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=72;PP=2521;SC=AAACTTGAAACTAAGTATGAG;SOR=0.807;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=72;TCR=72;TR=144;WE=61390340;WS=61390322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr18	61390361	rs1395267	T	C	3784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=62;PP=2408;SC=CCTGTTAAAATCTCTAGGGGT;SOR=0.867;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=56;TCR=62;TR=118;WE=61390369;WS=61390351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr18	61390570	rs953695	T	G	4027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=60;PP=2019;SC=ACCCCTTCCTTTTCTTTATAA;SOR=0.909;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=63;TCR=60;TR=123;WE=61390578;WS=61390560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr18	61390649	rs953696	C	T	1882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=38;PP=1069;SC=TGGGGTTGAGCAAGGCTCAGA;SOR=1.512;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=24;TCR=38;TR=62;WE=61390657;WS=61390639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr18	61391228	rs2089318	T	C	1472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=28;NR=18;PP=732;SC=AATTTTTGGCTAATTGCTTGA;SOR=0.877;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=28;TCR=18;TR=46;WE=61391236;WS=61391218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr18	61391323	rs147160513	CTCT	C	971.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.25;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr18	61391449	rs144614464	C	CTCTTCT	727.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.81;SOR=1.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr18	61391505	rs144622175	CTCT	C	1295.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=63.20;QD=39.26;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr18	61391697	rs12326861	A	G	1167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=29;PP=795;SC=TATACTCAGGATAACATGGAG;SOR=2.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=8;TCR=29;TR=37;WE=61391705;WS=61391687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr18	61393442	rs9965604	T	C	356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=3;PP=260;SC=CCAACCCAAATCCACAGAAGG;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=61393450;WS=61393432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr18	61393644	rs1893563	T	A	1455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=25;PP=853;SC=CTGCTATTTCTGACTCCTAAG;SOR=0.931;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=49;TCF=24;TCR=25;TR=49;WE=61393652;WS=61393634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr18	61394300	rs8097334	C	T	1065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=9;PP=671;SC=GTTCCCTCCACTCTCAGTTCT;SOR=1.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=34;WE=61394308;WS=61394290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr18	61394403	rs8098025	A	G	1505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=22;NR=25;PP=801;SC=ACCAGAGGCAACCACACCCTC;SOR=0.922;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=22;TCR=25;TR=47;WE=61394411;WS=61394393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr18	61394522	rs6567386	A	G	277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=6;PP=142;SC=TAGTCCTTGGACAGGTCATTC;SOR=2.303;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=61394530;WS=61394512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr18	61654463	rs3826616	A	G	2274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=44;PP=1421;SC=TTCATCAGGCACCACAAAACC;SOR=1.127;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=80;TCF=36;TCR=44;TR=79;WE=61654471;WS=61654453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr18	63430340	rs2276190	G	A	678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.42;SOR=1.244;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr18	63430344	rs2276191	T	G	678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.25;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr18	63430357	.	CTA	C	457.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=225;SC=TGAAAAACTGCTATATATATA;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=63430366;WS=63430330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr18	63477317	rs11332924	GA	G	193.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.385;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.77;MQRankSum=0.126;QD=16.15;ReadPosRankSum=-1.036;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
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chr18	63511413	rs201084225	A	T	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=70.00;QD=20.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr18	63530016	rs2291343	A	G	3262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=55;PP=2047;SC=AGCAGCACCAACACCCTCACC;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=103;TCF=48;TCR=55;TR=103;WE=63530024;WS=63530006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr18	64211251	rs72954429	C	T	1417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=18;PP=804;SC=GCAGACACCACGCCTACAAAT;SOR=1.244;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=30;TCR=18;TR=48;WE=64211259;WS=64211241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr18	64239196	rs10516000	T	C	1546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=14;PP=1026;SC=CTCCAACATATTTATTTACAT;SOR=2.024;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=36;TCR=14;TR=50;WE=64239204;WS=64239186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr18	64749014	.	C	G	2215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=42;PP=1329;SC=TGGCAGATGTCAACAAAAGCA;SOR=1.165;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=31;TCR=42;TR=73;WE=64749022;WS=64749004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr18	66358403	rs309228	G	T	488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=11;NR=6;PP=209;SC=AAAACATCAGGCATTCAAGTC;SOR=1.127;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=11;TCR=6;TR=17;WE=66358411;WS=66358393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr18	66358514	rs143627864	TAA	T	862.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=390;SC=TTACATGAGTTAAAGATTTGG;SOR=0.693;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=66358523;WS=66358504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr18	66365129	rs433550	T	G	404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=3;PP=241;SC=TAAATTAAATTACAATACATC;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=12;WE=66365137;WS=66365119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr18	66368825	rs3745058	A	C	750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=8;PP=445;SC=AAGCATAAAGAAGCAGTCCCT;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=25;WE=66368833;WS=66368815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr18	66504093	rs485613	A	C	3874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=48;PP=2135;SC=ACATGGTGGCACCTGCCTCAC;SOR=0.811;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=66;TCR=48;TR=114;WE=66504101;WS=66504083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr18	66504459	rs572020	A	T	2045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=25;PP=1082;SC=TAGAAGCTAAAGTTACCCAGG;SOR=0.720;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=36;TCR=25;TR=60;WE=66504467;WS=66504449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr18	66513471	rs1954878	C	G	212.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=173;SC=TAGGAAAATGCCTATAAAATT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=66513479;WS=66513461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr18	66513615	rs2187094	A	G	3373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=64;NR=41;PP=1805;SC=TGGAAGTGGAAGTATGAAGAA;SOR=0.971;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=64;TCR=41;TR=105;WE=66513623;WS=66513605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr18	66513787	rs67139927	A	G	1105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=22;PP=697;SC=TTTCCTCTATAAGAGTAATAC;SOR=1.292;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=15;TCR=22;TR=37;WE=66513795;WS=66513777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr18	66678131	rs7234663	A	G	373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=269;SC=TTTTATCAGAATAGACTATAA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=66678139;WS=66678121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr18	66678453	rs930164	A	G	270.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=9;PP=221;SC=ATAAATATTCATATCTTAATG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=66678461;WS=66678443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr18	67345034	rs8099030	T	C	1732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=29;NR=27;PP=1014;SC=GGCTCAATGATATCAGCCTTG;SOR=0.966;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=29;TCR=27;TR=56;WE=67345042;WS=67345024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr18	67365585	rs4581806	A	G	2390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=43;NR=34;PP=1238;SC=TCGTATGGCCATAGACACTCA;SOR=0.976;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=44;TCR=34;TR=77;WE=67365593;WS=67365575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr18	67531797	rs763362	A	G	551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.65;SOR=3.500;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr18	67563309	rs1630425	A	C	1702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=24;NR=31;PP=964;SC=ATGATTAGATACAGGTTGTCA;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=24;TCR=31;TR=55;WE=67563317;WS=67563299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr18	67563348	rs1788115	T	C	878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=20;PP=551;SC=TGGAAGATACTTAATCATAAA;SOR=2.621;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=26;WE=67563356;WS=67563338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr18	67613926	rs10782036	A	G	397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.72;QD=28.41;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr18	67614674	rs3214811	T	TA	551.19	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.22;ReadPosRankSum=-0.713;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,28:0.88:32
chr18	67687860	rs2304378	T	C	1415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=15;PP=919;SC=CCTTCTGAATTACTCCTTTAC;SOR=1.244;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=31;TCR=15;TR=46;WE=67687868;WS=67687850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr18	67718688	rs4891392	A	G	2798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=50;PP=1651;SC=CACGGTAACAAACGGGAGTGT;SOR=1.270;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=38;TCR=50;TR=88;WE=67718696;WS=67718678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr18	67724802	rs12968602	A	G	258.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=182;SC=TCTCTTTTCTAACATCCAGAC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=67724810;WS=67724798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr18	67724840	rs17805883	G	C	767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=4;PP=514;SC=TTCAAGTAACGTATTTCGAAT;SOR=3.014;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=22;WE=67724848;WS=67724830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr18	67726975	rs11876398	A	G	289.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=241;SC=GAGCCTAAAAAAGAATAAAGC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=67726983;WS=67726965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr18	67727003	rs1435086	A	T	476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=1;PP=408;SC=CCAGGTCACAAGAAATCTTGT;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=67727011;WS=67726993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr18	67733234	rs11151561	T	A	561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=12;PP=345;SC=ACACACAAGATATCCTTAAAC;SOR=2.419;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=16;WE=67733242;WS=67733224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr18	67741117	rs1369292	G	A	1807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=37;NR=29;PP=1076;SC=TCAAAATAAAGGACTTATGCA;SOR=0.904;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=37;TCR=29;TR=66;WE=67741125;WS=67741107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr18	67741309	rs1369293	G	A	800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=18;PP=557;SC=CGCATTACAGGAAACCAATTC;SOR=1.255;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=11;TCR=18;TR=29;WE=67741317;WS=67741299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr18	67742801	rs285228	G	A	1463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=22;PP=675;SC=GGGAAAGAAGGAGGAGACACT;SOR=1.061;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=20;TCR=22;TR=42;WE=67742809;WS=67742791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr18	67759549	rs4891394	C	A	347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=259;SC=ATGAAAACAACGTGAAAATGT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=67759557;WS=67759539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr18	67809647	.	A	C	266	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;FR=1.0000;HP=14;HapScore=2;MGOF=32;MMLQ=27;MQ=58.8;NF=1;NR=9;PP=266;QD=30.0771212547;SC=AAAAAAAAAAACCAAAATTAC;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=10;WE=67809655;WS=67809637;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,10:0.83:12
chr18	67812773	rs11662011	G	A	241.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=198;SC=ACAAACTGAAGAATGTCACAT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=67812781;WS=67812763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr18	67817744	rs12606964	T	C	490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=1;PP=330;SC=GGTTTCTTTTTAGTTTCTCAC;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=67817752;WS=67817734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr18	67818046	rs12604751	C	T	181.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=6;PP=130;SC=CTTCTGTTTACAATCCCATTT;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=67818054;WS=67818036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr18	67860719	rs283250	T	C	764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=18;PP=532;SC=ATAAAATTATTCTTTAGTAGA;SOR=1.781;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=26;TCF=8;TCR=18;TR=26;WE=67860727;WS=67860709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr18	67863850	rs74941514	T	TCTC	4924.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=43;PP=2446;SC=ATGCTTTCCATCTCCAAAGGC;SOR=0.869;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=59;TCF=8;TCR=51;TR=50;WE=67863858;WS=67863840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr18	67871343	rs3911730	A	C	3037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=60;NR=36;PP=1342;SC=GTTTGGTATGAGGCAGAAGAT;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=60;TCR=36;TR=96;WE=67871351;WS=67871333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr18	70209321	rs7237888	C	A	556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=11;PP=317;SC=CGCAGCCGCCCGGCTCGCGCA;SOR=1.230;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=8;TCR=11;TR=19;WE=70209329;WS=70209311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr18	70417396	rs922999	C	T	891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=10;PP=566;SC=TTGCGAGTAGCTGTGTTTCAT;SOR=1.284;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=30;WE=70417404;WS=70417386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr18	70532185	rs71924600	TA	T	72.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.57;MQRankSum=0.319;QD=9.09;ReadPosRankSum=-0.854;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr18	70532840	rs10164255	T	G	1749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=31;NR=23;PP=986;SC=CATCTCTGAATGAAGAGAGGG;SOR=0.724;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=54;TCF=31;TCR=23;TR=54;WE=70532848;WS=70532830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr18	70532977	rs10163845	A	G	364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=10;PP=290;SC=CAGACTGTGGAGGAGGAGAAT;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=13;WE=70532985;WS=70532967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr18	70534401	rs6566677	G	T	245.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=6;NR=2;PP=130;SC=GGGTCCGCCGGAGCGCGGCGC;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=70534409;WS=70534391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr18	71749154	rs3831448	G	GT	718.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=5;PP=398;SC=AAACGGTTCTGTTTTTACCTT;SOR=1.519;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=11;TCF=6;TCR=5;TR=11;WE=71749162;WS=71749144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr18	71807614	rs17088833	T	C	1053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=20;PP=617;SC=TATTCCCTTCTACAAAATTCC;SOR=0.902;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=18;TCR=20;TR=38;WE=71807622;WS=71807604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr18	71815063	rs3813115	G	A	2014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=25;PP=925;SC=GGGCTGAAACGAAGAGTGCAC;SOR=0.892;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=30;TCR=25;TR=55;WE=71815071;WS=71815053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr18	71815122	rs3813114	G	A	707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=11;NR=11;PP=384;SC=GCGCATGCGCGCGTGAGCAAA;SOR=1.022;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=11;TCR=11;TR=22;WE=71815130;WS=71815112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr18	71822321	rs3737513	A	G	404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=10;NR=3;PP=213;SC=CAAAAGCAGCAGACAAGCTTG;SOR=1.244;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=71822329;WS=71822311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr18	71825718	.	T	TAATCA	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.86;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr18	71825719	.	A	AATCAAGCAAGC	1721	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=1721;QD=607.0;SC=TGATTAAAATAGGGTTTCTGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=3;WE=71825728;WS=71825709;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,3:0.38:8
chr18	71825720	.	G	A	60	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=60;QD=31.5904041824;SC=GATTAAAATAGGGTTTCTGAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=71825728;WS=71825709;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr18	71825720	.	G	GCAAGCA	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=52.53;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr18	71920966	rs1790871	T	C	2447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=40;NR=42;PP=1302;SC=AAATCTTTGCTCCTTCTAACA;SOR=0.919;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=40;TCR=42;TR=82;WE=71920974;WS=71920956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr18	71922899	rs3831450	T	TG	999.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=6;NR=6;PP=427;SC=ACCCAGAAGGTGGGGGACGCA;SOR=1.214;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=17;TCF=9;TCR=8;TR=12;WE=71922907;WS=71922889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr18	71927852	rs7238784	G	T	99.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=0;PP=46;SC=AAATCTTTTAGATCAGAAGCA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=71927860;WS=71927842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr18	71930734	rs2032262	T	C	1624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=24;NR=26;PP=839;SC=AGAGGTAGAATAAAAATTTTT;SOR=1.022;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=24;TCR=26;TR=50;WE=71930742;WS=71930724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr18	71930834	rs144732931	C	CTG	53.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.85;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr18	71930844	rs2032264	C	G	62.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr18	72021717	rs12606060	T	C	1597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=36;NR=16;PP=949;SC=AAATCAAAACTTAAGAAATCT;SOR=1.532;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=53;TCF=36;TCR=17;TR=52;WE=72021725;WS=72021707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr18	72109174	rs1559805	C	A	951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=2;PP=584;SC=CCAGCCCTGGCGGACTCTCAT;SOR=2.765;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=27;WE=72109182;WS=72109164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr18	72113730	rs3861310	A	G	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=7;PP=455;SC=CTGCAGAAGCAACAGTAGTTT;SOR=1.781;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=26;WE=72113738;WS=72113720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr18	72114455	rs8087020	C	T	2539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=43;PP=1395;SC=AACAGCAGCTCTCCCGCCACA;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=37;TCR=43;TR=80;WE=72114463;WS=72114445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr18	72186059	rs733062	G	A	964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=8;PP=657;SC=GACCTTGAACGCGGGCTTGCT;SOR=2.049;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=31;WE=72186067;WS=72186049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr18	72186175	rs5826329	T	TC	3861.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=44;PP=2117;SC=TTATTTCATTTCCCCCCAGTT;SOR=0.843;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=70;TCF=22;TCR=48;TR=65;WE=72186183;WS=72186165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr18	72186404	rs2241508	G	A	475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=10;PP=242;SC=CCTTCCCCCCGTGTGCAGCTG;SOR=2.712;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=72186412;WS=72186394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr18	72226455	rs12605490	A	T	378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=259;SC=CTTGATCAACAGAAAAGTACC;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=72226463;WS=72226445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr18	72226539	rs12607796	T	C	1684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=22;PP=850;SC=GCTAATGGCCTGCTTGCTCTT;SOR=1.000;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=59;TCF=37;TCR=22;TR=59;WE=72226547;WS=72226529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr18	72228124	rs4263028	A	G	3517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=55;PP=2012;SC=AATACCTCCCATCATCCTGGC;SOR=0.708;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=62;TCR=55;TR=117;WE=72228132;WS=72228114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr18	72228269	rs4329999	G	A	1019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.004;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=24;PP=731;ReadPosRankSum=-0.038;SC=TGAGGCGCCCGGGCTACAGTG;SOR=1.949;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=36;TCF=11;TCR=25;TR=34;WE=72228277;WS=72228259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,36:0.95:38
chr18	72238283	rs4892244	A	G	534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=3;PP=368;SC=TGAGAAACACAGAAAGTGAAG;SOR=2.636;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=72238291;WS=72238273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr18	72247278	rs4892247	C	T	356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=266;SC=ATTAACTGTACTAATCAGTTT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=72247286;WS=72247268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr18	72250762	rs11659237	T	C	3295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=41;PP=1956;SC=GTTCTTGTCCTTACCCTATTC;SOR=1.262;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=72;TCR=41;TR=113;WE=72250770;WS=72250752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr18	72264397	rs7505285	A	C	1991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.27;SOR=1.662;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr18	72264406	rs7505289	A	G	2345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.44;SOR=1.382;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr18	72264473	rs7505334	C	T	2744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=46;NR=44;PP=1404;SC=TTTTTCTCATCATCTAAAGTA;SOR=0.793;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=91;TCF=46;TCR=45;TR=90;WE=72264481;WS=72264463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr18	72343008	rs7243081	T	C	3857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=48;PP=1954;SC=CCGAAAATGATGAGGATGAAA;SOR=0.991;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=74;TCR=48;TR=122;WE=72343016;WS=72342998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr18	72593118	rs2628126	C	T	751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=16;PP=481;SC=GCAGAGAGGACGGCAAGACAC;SOR=1.781;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=8;TCR=16;TR=24;WE=72593126;WS=72593108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr18	72776121	rs3744913	G	A	3095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=51;NR=44;PP=1518;SC=TCATCGTGACGGAGGAGCTGG;SOR=0.781;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=51;TCR=44;TR=95;WE=72776129;WS=72776111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr18	72914280	rs7230037	G	A	1877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=32;NR=33;PP=1039;SC=TGTCAGATGCGTTAACACCAA;SOR=0.869;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=65;TCF=32;TCR=33;TR=65;WE=72914288;WS=72914270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr18	73130653	rs3214645	G	GTT	389.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.98;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr18	73139335	rs7235563	C	G	2114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=19;PP=1050;SC=TAGGACCATACCTGTGCAGTG;SOR=1.150;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=39;TCR=19;TR=58;WE=73139343;WS=73139325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr18	74090957	rs56087742	CG	C	1617.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=24;PP=791;SC=GAGTGTAGGACGGGGGGGCGC;SOR=1.077;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=28;WE=74090965;WS=74090947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr18	74092366	rs12970367	G	A	819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=20;PP=555;SC=TGTCTTCAGCGGGAGAAGCCA;SOR=3.180;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=74092374;WS=74092356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr18	74153146	rs59762437	G	A	639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.59;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr18	74208485	rs3841258	CG	C	999.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=12;PP=446;SC=GGCGATCAGACGGGGGGGGGC;SOR=0.693;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=16;WE=74208493;WS=74208475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr18	74208553	.	C	G	77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;FR=0.5000;HP=13;HapScore=2;MGOF=29;MMLQ=15;MQ=56.12;NF=0;NR=6;PP=77;QD=18.6285354245;SC=GGTCGGGGGGCGGGGGGGAGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=6;WE=74208561;WS=74208543;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr18	74208573	rs4891164	G	A	31.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=220;SC=TCAGGCAGAAGGACAGGGACA;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=74208581;WS=74208563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr18	74648536	rs630229	G	T	527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=11;PP=349;SC=TTTATGAGATGTATTTTGACC;SOR=1.292;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=7;TCR=11;TR=18;WE=74648544;WS=74648526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr18	74671768	rs470403	T	C	1370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=21;PP=741;SC=GCCGCATACATACAGGTAACG;SOR=0.952;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=21;TCR=21;TR=42;WE=74671776;WS=74671758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr18	74680114	rs17575711	T	C	848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=18;NR=6;PP=391;SC=TAAATAGGAATCATTTTGTGC;SOR=1.352;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=24;WE=74680122;WS=74680104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr18	74680208	rs73968242	C	T	1408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=15;PP=879;SC=CGGAGCAGGACGGGGAGGAGC;SOR=1.157;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=28;TCR=15;TR=43;WE=74680216;WS=74680198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr18	74680259	rs657066	C	T	2347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=30;PP=1416;SC=TGCAGGAGGCCGCCGGCGAGT;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=43;TCR=30;TR=73;WE=74680267;WS=74680249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr18	74680369	rs470774	C	T	1360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=27;PP=738;SC=TTGGAATCTCCGTTTTAAAGC;SOR=1.436;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=14;TCR=27;TR=41;WE=74680377;WS=74680359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr18	74721697	rs3752070	G	A	656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.26;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr18	74778239	rs79369339	A	G	5150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.02;SOR=0.745;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr18	74778245	rs77350096	G	A	5115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.48;SOR=0.746;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr18	74778515	rs7241461	G	T	3803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=61;PP=2166;SC=CGCAGGATTCGGAATTCTGGC;SOR=0.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=132;TCF=70;TCR=62;TR=131;WE=74778523;WS=74778505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr18	74779595	rs59444395	C	T	249.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=8;NR=0;PP=205;SC=TGTGGGCAGCCGCGCTGGCCC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=74779603;WS=74779590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr18	74779612	rs58166941	T	C	316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=262;SC=GCCCTGGTGCTACCCACCAGC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=74779620;WS=74779602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr18	74779653	rs76352616	A	G	678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=5;PP=399;SC=CTCGGGTGCCACTCCCTGCAG;SOR=1.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=22;WE=74779661;WS=74779643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr18	74780966	rs58228302	G	A	3057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=53;NR=42;PP=1627;SC=ATGGCTTCCAGGCTCCCAGCA;SOR=0.746;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=53;TCR=42;TR=95;WE=74780974;WS=74780956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr18	74781011	rs60875774	T	C	3698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=61;NR=48;PP=1806;SC=TGTGTCTCTATTACAGAAACT;SOR=0.737;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=61;TCR=48;TR=109;WE=74781019;WS=74781001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr18	74781086	rs58502912	A	C	2167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=33;NR=40;PP=1061;SC=GAACAAGAACAGTGCCTTACA;SOR=1.039;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=33;TCR=40;TR=73;WE=74781094;WS=74781076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr18	74962645	rs5374	T	C	2220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=35;PP=1258;SC=TCGCGCTGGGTGTGCTGGGCA;SOR=0.741;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=41;TCR=35;TR=76;WE=74962653;WS=74962635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr18	74980809	rs5376	G	A	3978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=68;PP=2144;SC=ACTAAAGAAAGTAAAAGTCGA;SOR=0.963;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=128;TCF=60;TCR=68;TR=128;WE=74980817;WS=74980799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr18	76753491	rs7233194	C	T	4635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=88;PP=2569;SC=TCCCCTACGGCATGTCGCTGC;SOR=1.103;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=159;TCF=71;TCR=88;TR=159;WE=76753499;WS=76753481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr18	76753588	rs7240860	A	G	1348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=26;PP=908;SC=ACTGCCGCCCACTGTCCCTGG;SOR=1.714;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=15;TCR=26;TR=41;WE=76753596;WS=76753578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr18	76753768	rs2447437	C	G	3435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=61;NR=54;PP=1818;SC=CGGGCCGCCCCTCACTAAAGC;SOR=0.787;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=116;TCF=62;TCR=54;TR=115;WE=76753776;WS=76753758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr18	76754466	rs2472644	C	T	2285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=43;PP=1433;SC=TCCTGTCCTACGCGGGGTCCT;SOR=1.193;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=30;TCR=43;TR=73;WE=76754474;WS=76754456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr18	77067000	rs3760541	T	G	4087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=81;NR=53;PP=2123;SC=AGTCTCAAGCTGGTGGAAACA;SOR=0.958;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=81;TCR=53;TR=134;WE=77067008;WS=77066990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr18	77107934	rs9965202	C	T	1117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=23;NR=22;PP=656;SC=AGGTACTAAGCCTTCTGTGCT;SOR=0.737;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=46;TCF=23;TCR=23;TR=45;WE=77107942;WS=77107924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr18	77137202	rs1110784	A	G	2631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=31;PP=1589;SC=AGGGCCCAGGACTTCTTGGTC;SOR=1.251;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=56;TCR=31;TR=87;WE=77137210;WS=77137192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr18	77156448	rs111602851	C	G	170.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=6;PP=144;SC=CGGAGGGGTCCGGGCCAGAGA;SOR=3.912;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=77156456;WS=77156438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	77170006	rs182507	C	T	1466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=22;PP=909;SC=GAATGAAGAGCGGAACCCGTG;SOR=1.061;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=30;TCR=22;TR=52;WE=77170014;WS=77169996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr18	77171061	rs2230112	T	G	3588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=69;NR=48;PP=1859;SC=CCGCGTCCCCTTGCAACAAGA;SOR=0.862;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=69;TCR=48;TR=117;WE=77171069;WS=77171051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr18	77209015	rs2278801	A	G	1277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=27;PP=770;SC=GGCCTCTGGCAGGGGGCGGTA;SOR=1.562;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=15;TCR=27;TR=42;WE=77209023;WS=77209005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr18	77210902	rs680802	C	T	1050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=11;PP=695;SC=CAGGCCTTTACGCTCCCGCGT;SOR=1.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=25;TCR=11;TR=36;WE=77210910;WS=77210892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr18	77211175	rs2290154	T	C	244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=8;PP=161;SC=TCCCGTCACATGCGCTTCACT;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=77211183;WS=77211165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr18	77227476	rs25656	A	G	2643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=38;PP=1456;SC=AGATCCCGCCATTTCGGAATC;SOR=0.946;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=96;TCF=58;TCR=38;TR=96;WE=77227484;WS=77227466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr18	77246444	rs7233684	C	T	2487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=46;NR=32;PP=1285;SC=CGGCCCCTGGCGTGAGCCCCA;SOR=0.782;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=46;TCR=32;TR=78;WE=77246452;WS=77246434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr18	77287385	rs451691	T	C	664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=9;PP=323;SC=TGGACCAGGGTGGGACCGAGG;SOR=1.136;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=14;TCR=9;TR=23;WE=77287393;WS=77287375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr18	77402305	rs56014953	C	G	51.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=17.09;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr18	77420703	rs868678	C	G	1857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=37;NR=21;PP=917;SC=AGCTCCCTCCCGGGGTCTTTC;SOR=1.042;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=37;TCR=21;TR=58;WE=77420711;WS=77420693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr18	77439532	rs3826573	T	C	1853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=35;PP=1151;SC=CCCGCCATGCTCTGTCCGCGG;SOR=1.647;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=20;TCR=35;TR=55;WE=77439540;WS=77439522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr18	77439844	rs56006341	G	T	86.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=1;PP=48;SC=CCGGTACCGAGAGGAACTACA;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=77439852;WS=77439834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr18	77440128	rs17855830	T	G	105.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=3;PP=55;SC=CGCGCAGTCCTCCGGGGCCTC;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=5;WE=77440136;WS=77440118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr18	77455871	rs558700	C	T	1725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=18;PP=1060;SC=AAGATAGCAGCGTGTGTCCGT;SOR=1.467;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=40;TCR=18;TR=58;WE=77455879;WS=77455861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr18	77458037	rs2242174	T	C	2039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=35;PP=1191;SC=CCGCGGGTCCTAGAATTTTGA;SOR=1.512;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=23;TCR=35;TR=58;WE=77458045;WS=77458027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr18	77513721	rs626169	T	C	3044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=57;PP=1464;SC=GCAACGAGGATGAGGGCAGCA;SOR=1.258;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=42;TCR=57;TR=99;WE=77513729;WS=77513711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr18	77623611	rs62103176	G	C	124.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=0;PP=54;SC=CCCTAACGCGGTCCGTTCCTT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=77623619;WS=77623601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr18	77659561	rs3744886	G	T	3683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=49;PP=2136;SC=GCCTGCCCGGGCAGGTGGTGG;SOR=1.098;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=72;TCR=49;TR=121;WE=77659569;WS=77659551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr18	77663940	rs3744881	G	A	104.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=2;PP=49;SC=ACCAGTGCCCGCGGCTGGCGG;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=5;WE=77663948;WS=77663934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr18	77694128	rs3837882	TA	T	459.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=268;ReadPosRankSum=0.867;SC=TGCATTTCTTTAAAAAAAAAA;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=19;WE=77694137;WS=77694118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,22:0.96:23
chr18	77703476	rs2277723	A	G	1155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=27;PP=847;SC=CGGGAGAGACACTGTGTCAGG;SOR=1.788;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=12;TCR=27;TR=39;WE=77703484;WS=77703466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr18	77724726	rs8095764	A	C	828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.68;SOR=0.749;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr18	77894865	rs138162057	C	A	3150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=40;PP=1664;ReadPosRankSum=0.353;SC=TTTCTCCCAACCAGACAGTCT;SOR=0.836;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=98;TCF=57;TCR=41;TR=96;WE=77894873;WS=77894855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,118:0.98:120
chr18	77896699	.	C	CAA	47	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.6684;HP=14;HapScore=2;MGOF=80;MMLQ=18;MQ=58.82;NF=0;NR=3;PP=47;QD=17.0;SC=ATAAAACTTGCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=77896707;WS=77896689;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:1,3:0.75:4
chr18	77917479	rs62101564	G	A	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr18	77921331	rs33942860	CAG	C	5335.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=50;PP=2946;SC=CACTGACTCACAGAGTTTGAG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=14;TCR=50;TR=64;WE=77921340;WS=77921321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr18	77926795	rs11275834	T	TACAAATAAC	3501.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.53;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=22;PP=2900;SC=AATATTTTCTTACAAATAACC;SOR=0.776;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=47;TCF=14;TCR=33;TR=31;WE=77926803;WS=77926785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr18	77927028	rs1879105	A	G	720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=13;PP=399;SC=GAGAGCTTGCACCGGGGTGGA;SOR=1.445;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=8;TCR=13;TR=21;WE=77927036;WS=77927018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	281360	rs7815	C	T	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.885;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=114;ReadPosRankSum=0.000;SC=GGACTCACAGCAGCTCCCTGC;SOR=1.426;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=8;WE=281368;WS=281350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr19	311988	.	GC	G	539.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=0.000;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=11.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQRankSum=-0.632;QD=4.57;ReadPosRankSum=-3.865;SOR=0.304;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,35:0.30:118
chr19	311989	.	C	A	920	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=24;MQ=59.91;NF=20;NR=40;PP=920;QD=15.9128535425;SC=GGCGGGGCCGCAGCGGAAGGA;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=123;TCF=38;TCR=85;TR=60;WE=311997;WS=311979;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:63,60:0.49:123
chr19	311990	.	AGCGGAAGGAAGGCCCAGGCCGGGGAGAACAGTCAGCGGCGCCCAGGGCGGGGCCGC	A	502.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.292;ClippingRankSum=0.000;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=8.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQRankSum=0.566;QD=4.26;ReadPosRankSum=-4.433;SOR=0.252;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,34:0.29:118
chr19	312020	.	A	G	557	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=24;MQ=59.81;NF=5;NR=24;PP=557;QD=20.4059038809;SC=CGGGGAGAACAGTCAGCGGCG;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=55;TCF=7;TCR=48;TR=29;WE=312028;WS=312010;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:26,29:0.53:55
chr19	312143	rs10416918	T	C	2967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=31;PP=1943;SC=CGGTCAGCAGTGCCCAGGGCG;SOR=1.796;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=104;TCF=73;TCR=31;TR=104;WE=312151;WS=312133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr19	335946	rs3816322	G	A	1595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=37;NR=10;PP=846;SC=CCATCTGAACGGGTGGGAGCT;SOR=1.569;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=37;TCR=10;TR=47;WE=335954;WS=335936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr19	367313	rs585487	G	A	1042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.798;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=29;PP=663;ReadPosRankSum=-0.512;SC=GAGCAACACTGAAAGACACAA;SOR=0.582;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=95;TCF=33;TCR=62;TR=46;WE=367321;WS=367303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,48:0.49:97
chr19	371369	rs644609	G	T	39.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.35;MQRankSum=1.316;QD=0.52;ReadPosRankSum=0.464;SOR=0.659;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,13:0.17:77
chr19	371396	rs644644	G	C	2143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.07;QD=37.61;SOR=3.219;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr19	372551	rs652081	A	G	1571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=14;PP=949;SC=CCTTTCCCACACAGCATCCTG;SOR=1.688;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=56;TCF=41;TCR=15;TR=55;WE=372559;WS=372541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr19	373897	rs668447	G	C	1604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.528;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=31;PP=1034;ReadPosRankSum=0.322;SC=CCTGACACGTGTCCCCCAGCA;SOR=0.618;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=194;TCF=116;TCR=78;TR=75;WE=373905;WS=373887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,82:0.40:207
chr19	374016	rs2303815	G	A	2508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.048;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=58;PP=1415;ReadPosRankSum=-1.329;SC=CCCTTCCTGCGAGGAGACAGG;SOR=0.985;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=184;TCF=82;TCR=102;TR=101;WE=374024;WS=374006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,116:0.57:205
chr19	374547	rs648770	T	C	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.395;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=306;ReadPosRankSum=0.884;SC=CCGCCTCTCCTTTCCCTCGAG;SOR=1.569;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=14;WE=374555;WS=374537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
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chr19	422534	rs12984753	G	A	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=4.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.41;ReadPosRankSum=-0.112;SOR=1.705;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
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chr19	425200	rs374201934	G	A	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.222;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=17;PP=362;ReadPosRankSum=-0.058;SC=GGCCCCGGGCGTCCGCCTGCA;SOR=0.379;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=60;TCF=22;TCR=38;TR=29;WE=425208;WS=425190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,31:0.50:62
chr19	425290	rs73916977	G	A	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.769;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=39;ReadPosRankSum=1.589;SC=GGCTCGCAGGGAGCAAGGCGG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=4;WE=425298;WS=425280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr19	460475	rs12980271	G	C	188.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.97;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	460668	rs189741717	C	G	538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.55;SOR=1.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	463810	rs60512152	GC	G	504.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=9;NR=3;PP=359;SC=AGGCCCGCCAGCCCCCCGTTC;SOR=2.179;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=12;WE=463818;WS=463800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	464310	rs34551779	A	G	1291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=23;NR=19;PP=727;SC=CCGATGGCGCACAGGGGGCAC;SOR=0.866;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=23;TCR=19;TR=42;WE=464318;WS=464300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr19	498212	rs12461640	A	C	1784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=34;PP=851;ReadPosRankSum=-0.780;SC=GATTGCAGGCAGGGTCCCAGC;SOR=0.455;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=58;TCF=23;TCR=35;TR=57;WE=498220;WS=498202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,71:0.99:72
chr19	501719	rs62130832	T	C	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.209;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQRankSum=0.674;QD=8.26;ReadPosRankSum=1.455;SOR=0.184;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr19	501743	.	T	TCTCCCGACACCACCTCCCAGGAGCCTCCCGACACCACCTCCCAGGAGC	1716.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.445;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.16;MQRankSum=0.000;QD=85.84;ReadPosRankSum=-1.526;SOR=1.292;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,18:0.90:20
chr19	504830	rs7246543	C	G	3779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=79;NR=50;PP=1952;SC=CCTTGCCCACCTATCACCTCT;SOR=0.930;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=79;TCR=50;TR=129;WE=504838;WS=504820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr19	505071	rs1140823	T	C	1102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=25;PP=722;SC=CATCCCTCTGTTCACAGAGAT;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=13;TCR=25;TR=38;WE=505079;WS=505061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr19	507450	rs7246920	G	T	1619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=20;PP=892;SC=GCCTTGGGGGGGCTCTAGCGC;SOR=0.986;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=31;TCR=20;TR=51;WE=507458;WS=507440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr19	518957	rs117112129	C	A	1753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.557;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=41;PP=1053;ReadPosRankSum=1.220;SC=AGGAAGAGGCCGGGGCTGGAC;SOR=0.763;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=156;TCF=81;TCR=75;TR=82;WE=518965;WS=518947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,87:0.50:173
chr19	532066	rs6507	C	T	2336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.042;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=54;PP=1333;ReadPosRankSum=-2.994;SC=AGGTGGCCATCTTCGGGCCCC;SOR=0.835;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=248;TCF=126;TCR=122;TR=108;WE=532074;WS=532056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,121:0.45:270
chr19	536086	rs112405171	C	T	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=13.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=-0.684;QD=10.60;ReadPosRankSum=-1.620;SOR=2.522;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr19	536090	rs10426138	A	G	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=13.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=-0.566;QD=9.88;ReadPosRankSum=-1.973;SOR=2.212;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr19	544277	rs12981692	C	G	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.557;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=12;PP=238;ReadPosRankSum=-0.941;SC=TGGGGCATCCCGAGCTCCTCA;SOR=0.368;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=43;TCF=16;TCR=27;TR=21;WE=544285;WS=544267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,26:0.54:48
chr19	544315	rs3760874	A	G	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=120;ReadPosRankSum=-1.150;SC=ACATCCCGGGACCGTGGGAGA;SOR=0.941;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=10;WE=544323;WS=544305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr19	547224	rs4919846	A	G	2654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=28;PP=1511;SC=GGACAGTCGCAGCAGGCAGCA;SOR=1.540;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=67;TCR=28;TR=94;WE=547242;WS=547214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr19	547491	rs2070795	C	T	311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=10;PP=258;SC=CCGACGGCGCCCATTCTCTGC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=547499;WS=547481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	548865	rs12972174	C	T	222.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.85;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	549595	rs1599883	T	C	1716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=13;PP=1154;SC=CCTCAGCAGGTGCAGAGGCTG;SOR=2.507;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=44;TCR=13;TR=57;WE=549603;WS=549585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr19	549678	rs1599882	A	G	6383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=127;NR=99;PP=2965;SC=GGTGTTGGCCAGAGTCCTGTC;SOR=0.846;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=226;TCF=127;TCR=99;TR=226;WE=549686;WS=549668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr19	582253	rs4919862	T	C	5391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=114;NR=68;PP=2965;SC=GTGGGGCCAGTGCTGACAGGC;SOR=1.242;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=182;TCF=114;TCR=68;TR=182;WE=582261;WS=582243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr19	590172	rs113534512	G	A	54.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.09;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr19	603513	rs4919815	C	T	813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.194;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=9;PP=586;ReadPosRankSum=-1.624;SC=GGGGAGGCACCGGCCTGAGGT;SOR=1.038;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=65;TCF=47;TCR=18;TR=35;WE=603521;WS=603503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,35:0.53:66
chr19	605171	rs12981860	T	C	803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=20;PP=595;SC=TCCTGGTGCCTATGCTGCAGG;SOR=1.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=28;WE=605179;WS=605161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	613091	rs114094185	C	T	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.710;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=85;ReadPosRankSum=-1.025;SC=TTCTTTCTCCCGTCCTTGGCG;SOR=1.508;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=5;WE=613099;WS=613081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr19	613307	rs2301778	C	T	1370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.274;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.386;NF=36;NR=22;PP=718;ReadPosRankSum=0.095;SC=TCGCCAACGCCGACCCCAACT;SOR=0.966;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=113;TCF=66;TCR=47;TR=58;WE=613315;WS=613297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,64:0.51:126
chr19	613506	.	GCGCCTGGAGGGGGAGGGGGCA	G	1859.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.494;ClippingRankSum=0.000;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=20.772;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=2964;ReadPosRankSum=-0.128;SC=TGAGGGGGGCGCGCCTGGAGG;SOR=1.842;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=45;TCF=1;TCR=44;TR=17;WE=613534;WS=613496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,49:0.56:87
chr19	613898	rs1054786	T	C	1928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=25;PP=931;SC=GCGTGCGGGCTGACACCTACT;SOR=0.869;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=37;TCR=25;TR=62;WE=613906;WS=613888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr19	617195	rs11670098	C	T	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.79;ReadPosRankSum=-3.528;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
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chr19	617354	rs201291168	T	C	1443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.554;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=34;PP=737;ReadPosRankSum=0.511;SC=ACGGCGTGGGTGGCGGGAAAG;SOR=0.611;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=169;TCF=79;TCR=90;TR=67;WE=617362;WS=617344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,76:0.42:183
chr19	617614	rs41551212	G	A	1218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=20;PP=882;ReadPosRankSum=0.200;SC=GGTCCTGCAGGATGGGCTCGC;SOR=0.706;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=63;TCR=41;TR=50;WE=617622;WS=617604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,54:0.49:110
chr19	617963	rs41546612	T	G	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=272;ReadPosRankSum=0.471;SC=AAGCCCACCCTCCTGCAGGCC;SOR=0.634;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=17;WE=617971;WS=617953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr19	619021	rs14155	G	C	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=78;ReadPosRankSum=0.403;SC=CCAGGCGATAGGGCTGGATGA;SOR=0.495;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=10;WE=619029;WS=619011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr19	619574	rs10853990	T	G	868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.452;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=16;PP=417;ReadPosRankSum=-0.384;SC=CAGCGCGACATGCCTGGCGCA;SOR=0.568;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=105;TCF=54;TCR=51;TR=36;WE=619582;WS=619564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,46:0.36:127
chr19	619772	rs11669381	G	C	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.54;ReadPosRankSum=-0.720;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,36:0.51:70
chr19	621020	.	T	C	189	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=6;HapScore=2;MGOF=23;MMLQ=24;MQ=59.0;NF=11;NR=0;PP=189;QD=20.3428375043;SC=GGCGCGGGGGTGCCGGGAGGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=11;WE=621028;WS=621010;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:19,11:0.37:30
chr19	621712	rs2238547	A	G	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.353;NF=5;NR=2;PP=104;ReadPosRankSum=0.230;SC=TGAGCAGGAAAGCACCAGAGT;SOR=1.140;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=7;WE=621720;WS=621702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr19	622000	rs2238548	C	G	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=77;ReadPosRankSum=-0.921;SC=CGGCCGGACACCTGCATGGAC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=622008;WS=621990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr19	622336	rs2238549	T	G	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-1.372;NF=12;NR=14;PP=286;ReadPosRankSum=1.140;SC=CGCCCCCAGCTCCTCCCAGTA;SOR=0.668;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=30;TCR=37;TR=26;WE=622344;WS=622326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,29:0.40:73
chr19	623003	rs2017580	G	A	1034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.362;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=1.214;NF=25;NR=22;PP=491;ReadPosRankSum=-0.189;SC=GGATGAACGGGCCCGGTGAGC;SOR=0.565;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=120;TCF=61;TCR=59;TR=47;WE=623011;WS=622993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,57:0.41:139
chr19	623080	rs41563114	A	AT	716.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.001;NF=0;NR=15;PP=538;ReadPosRankSum=-0.418;SC=CAGAGACCTCATGGCCCTCAA;SOR=0.614;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=15;WE=623088;WS=623070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,26:0.52:50
chr19	625198	rs1056766	A	G	1640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.606;NF=45;NR=31;PP=1051;ReadPosRankSum=0.201;SC=GCAGGTCCGGAGTCAAGCCGG;SOR=0.708;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=169;TCF=102;TCR=67;TR=76;WE=625206;WS=625188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,80:0.45:179
chr19	629438	rs2283576	G	C	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.38;ReadPosRankSum=1.111;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr19	629503	rs2283577	G	A	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.740;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=89;ReadPosRankSum=-0.770;SC=TGTCTCCAACGACCAGGGCAG;SOR=0.627;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=20;TCF=11;TCR=9;TR=10;WE=629511;WS=629493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr19	629846	rs11550305	G	A	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.521;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.535;NF=11;NR=9;PP=275;ReadPosRankSum=1.088;SC=CCAGGCACCCGGCCATCTGCT;SOR=0.368;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=48;TCF=30;TCR=18;TR=20;WE=629854;WS=629836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,21:0.44:48
chr19	633381	rs11669858	A	G	4212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.477;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=84;PP=2414;ReadPosRankSum=-0.103;SC=GGAGGAGCCCACGCCGTGGCC;SOR=0.646;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=319;TCF=166;TCR=153;TR=181;WE=633397;WS=633371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,204:0.58:351
chr19	633529	.	G	GGCGCCGCCGCCGCCGCCGCC	1910.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.183;ClippingRankSum=0.000;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=8.135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.17;MQRankSum=0.000;QD=16.91;ReadPosRankSum=2.784;SOR=1.521;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,51:0.45:113
chr19	641215	rs7246140	T	C	3472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=55;NR=58;PP=1646;SC=CCCACCCTCCTGGGGCTCCCA;SOR=0.957;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=55;TCR=58;TR=113;WE=641223;WS=641205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr19	643104	.	G	T	57	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5081;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=5;NR=0;PP=57;QD=18.3542425094;SC=GTCGTGGTCGGGAGGGGACTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=5;WE=643112;WS=643094;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr19	643104	.	G	GGAGGGGACTCGTGGTCTGGGGCAGGGGGGGCTCCTCGTGTCTGTCGTGGTCAT	316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=158.38;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr19	646891	rs10403235	G	A	1693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=42;PP=2637;ReadPosRankSum=2.451;SC=CAGACACGTCGCGGGACACAG;SOR=0.682;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=178;TCF=94;TCR=84;TR=83;WE=646908;WS=646881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,87:0.42:205
chr19	646900	rs7249518	A	G	1990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.633;SOR=0.676;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,104:0.54:194
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chr19	649110	rs2040736	G	C	226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=8;PP=156;SC=GAGCCCGCCCGGGGTCGGAGA;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=649118;WS=649100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	652206	rs8102953	G	A	3418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.30;SOR=0.966;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr19	652739	rs12973146	C	G	2669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=11;PP=2094;SC=CCACACTCGGCGGGGCGGACG;SOR=3.664;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=70;TCR=11;TR=81;WE=652747;WS=652729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr19	652948	rs10153505	T	G	1944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.853;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=55;PP=1360;ReadPosRankSum=-0.580;SC=CCCCCCCAAGTGTGAGGACAG;SOR=0.563;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=176;TCF=64;TCR=112;TR=88;WE=652956;WS=652938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,93:0.48:192
chr19	676559	rs62134281	G	A	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.944;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.431;NF=4;NR=1;PP=53;ReadPosRankSum=-0.241;SC=CGGGCGGGGCGGGCCACCCAC;SOR=0.804;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=10;TCF=6;TCR=4;TR=5;WE=676567;WS=676549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr19	676610	.	CGCG	C	51.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.286;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.90;MQRankSum=1.097;QD=4.70;ReadPosRankSum=-0.105;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr19	680378	rs7246311	C	T	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.886;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=129;ReadPosRankSum=0.337;SC=CCCGGCGCGGCTGCAGGTCTG;SOR=0.986;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=35;TCF=20;TCR=15;TR=14;WE=680386;WS=680368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,15:0.38:40
chr19	685985	rs62131270	G	C	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=16;PP=335;ReadPosRankSum=0.630;SC=ATCTCACCACGGCCCTCCCTG;SOR=0.538;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=45;TCF=14;TCR=31;TR=25;WE=685993;WS=685975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,26:0.58:45
chr19	687142	rs8102982	G	A	3763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=80;PP=2476;SC=TCTCCCTGGCGGCCTCAGCAG;SOR=1.290;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=131;TCF=51;TCR=80;TR=131;WE=687150;WS=687132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr19	691909	rs4375794	T	C	4639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.08;SOR=0.867;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr19	727262	.	A	G	101	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;FR=1.0000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=18;MQ=60.0;NF=3;NR=4;PP=101;QD=19.3958875067;SC=CCCTGACCCCAACCTGACCCC;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=7;WE=727270;WS=727252;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,7:0.88:8
chr19	727448	rs79721592	C	A	3276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=33;PP=2096;SC=ATAACCCTGACCCCAACCTTG;SOR=1.670;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=80;TCR=33;TR=113;WE=727456;WS=727438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr19	727544	rs3746168	C	G	11191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.72;SOR=0.757;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
chr19	727550	rs3746169	T	C	11124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.59;SOR=0.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr19	727552	rs3746170	C	T	11000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.09;SOR=0.888;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr19	731055	rs10405821	G	C	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.63;ReadPosRankSum=-0.844;SOR=0.749;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,21:0.27:77
chr19	731077	rs10405836	GG	CT	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=6.477;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.66;ReadPosRankSum=-0.215;SOR=1.463;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,23:0.27:86
chr19	731144	rs1050457	A	G	1278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.391;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=26;PP=713;ReadPosRankSum=0.368;SC=CGCCCCAGCCACTGCCAAGGA;SOR=0.791;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=114;TCF=62;TCR=52;TR=57;WE=731152;WS=731134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,66:0.51:129
chr19	740560	rs10419493	T	C	709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=21;PP=543;SC=CGTGTGGGTCTGGCGTCTGCC;SOR=2.066;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=28;WE=740568;WS=740550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	746206	rs2384776	C	T	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-3.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.368;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=231;ReadPosRankSum=-0.886;SC=GCCAAGGTTTCCCTCCTGCCT;SOR=0.223;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=18;WE=746214;WS=746196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr19	756985	rs8110536	T	G	2751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.133;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=58;PP=1683;ReadPosRankSum=-0.537;SC=TGGGCATCCCTCAGGCACACC;SOR=0.738;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=230;TCF=119;TCR=111;TR=126;WE=756993;WS=756975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,136:0.55:249
chr19	757399	rs3746172	A	C	2256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.163;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=30;PP=1603;ReadPosRankSum=0.980;SC=AGGGCCAGGCAGTCAGGAAGA;SOR=0.979;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=114;TCF=53;TCR=61;TR=54;WE=757420;WS=757389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,64:0.49:130
chr19	757412	rs3746173	A	G	2201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.412;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=26;PP=1603;ReadPosRankSum=2.019;SC=CAGGAAGAGCAGCACCGTGGC;SOR=0.847;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=112;TCF=55;TCR=57;TR=51;WE=757420;WS=757389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,59:0.47:126
chr19	805441	rs117971528	G	C	1259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.546;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=20;PP=821;ReadPosRankSum=-1.774;SC=CACAGCGCCCGCTCGCGGTGG;SOR=0.521;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=111;TCF=77;TCR=34;TR=58;WE=805449;WS=805431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,60:0.49:122
chr19	808474	rs149887681	G	A	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.533;SOR=0.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,44:0.50:88
chr19	812801	rs3746137	C	G	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.796;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=6;PP=205;ReadPosRankSum=0.212;SC=CGTCGCTGACCGACGAGCCGG;SOR=1.609;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=19;TCF=12;TCR=7;TR=15;WE=812809;WS=812791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr19	815086	rs351988	A	G	2253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.263;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=53;PP=1460;ReadPosRankSum=-0.712;SC=GGACACCTGCAGGGCGGAAGG;SOR=0.861;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=208;TCF=99;TCR=109;TR=98;WE=815094;WS=815076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,108:0.48:226
chr19	827975	rs649411	T	C	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.373;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=18;PP=412;ReadPosRankSum=-0.157;SC=AACTCAGACTTAAAGCACAGA;SOR=1.173;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=61;TCF=27;TCR=34;TR=28;WE=827983;WS=827965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,30:0.43:69
chr19	829568	rs12460890	C	T	1504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.594;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=25;PP=888;ReadPosRankSum=0.607;SC=TCAGGAACCCCGGGGTTAGCA;SOR=0.752;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=141;TCF=87;TCR=54;TR=67;WE=829576;WS=829558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,73:0.46:158
chr19	829723	rs678976	A	G	3243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=81;PP=2035;ReadPosRankSum=-0.178;SC=GGATGGTGCCACCTGTGATCC;SOR=0.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=263;TCF=118;TCR=145;TR=144;WE=829731;WS=829713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,156:0.52:299
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chr19	843692	rs2301879	A	G	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.055;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=20;PP=449;ReadPosRankSum=2.552;SC=TGGCCCGGCCACTGTCCCTCT;SOR=0.509;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=61;TCF=18;TCR=43;TR=29;WE=843700;WS=843682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,30:0.46:65
chr19	855966	rs17216649	C	A	949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.848;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=11;PP=632;ReadPosRankSum=1.430;SC=AGGGGGACTCCGGCAGCCCCT;SOR=0.859;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=90;TCF=65;TCR=25;TR=41;WE=855974;WS=855956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,44:0.46:96
chr19	859831	rs8107095	T	G	1120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.688;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=23;PP=739;ReadPosRankSum=-0.374;SC=CTCCAGCCCCTCCAGGTGGGC;SOR=0.804;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=102;TCF=61;TCR=41;TR=55;WE=859839;WS=859821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,57:0.49:117
chr19	860852	rs1629038	G	C	1394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=25;PP=798;ReadPosRankSum=-0.460;SC=GACTCCGTCCGGTCCCCAGGG;SOR=0.710;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=132;TCF=80;TCR=52;TR=65;WE=860860;WS=860842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,69:0.49:142
chr19	861102	rs1626564	C	A	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.066;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.96;MQRankSum=1.461;NF=4;NR=11;PP=207;ReadPosRankSum=-0.809;SC=CCAGCCTCGACCTCTCCTGCT;SOR=0.307;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=15;WE=861110;WS=861092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr19	861593	.	C	G	25	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=25;QD=19.9237375157;SC=GACCCACGCCCCTGCCCTGAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=3;WE=861601;WS=861592;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr19	862024	rs1683561	C	G	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=19;PP=390;ReadPosRankSum=-0.930;SC=AGAGGGAGCGCGAAGCGGGGG;SOR=0.569;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=51;TCF=13;TCR=38;TR=26;WE=862032;WS=862014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,27:0.51:53
chr19	863388	rs1135146	C	G	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=18;PP=307;ReadPosRankSum=-0.732;SC=CTCAGGAGTTCGAGATCAGCA;SOR=0.627;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=71;TCF=13;TCR=58;TR=22;WE=863396;WS=863378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,24:0.31:77
chr19	868115	rs13090	C	T	534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.897;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=11;PP=293;ReadPosRankSum=1.447;SC=GGACGGTCCTCTGGATGCAGA;SOR=0.533;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=67;TCF=42;TCR=25;TR=28;WE=868123;WS=868105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,30:0.40:75
chr19	868551	rs1631848	T	C	618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.204;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=17;PP=424;ReadPosRankSum=-0.630;SC=GGGCCTCCCTTACGCCTGCCC;SOR=0.453;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=56;TCF=20;TCR=36;TR=28;WE=868559;WS=868541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,29:0.48:61
chr19	868620	rs1651891	G	A	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.774;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.158;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=69;ReadPosRankSum=1.294;SC=TGCTCCCCACGTCCCCACCTG;SOR=1.245;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=12;TCF=5;TCR=7;TR=6;WE=868628;WS=868610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr19	869037	rs1683591	A	G	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=38;ReadPosRankSum=1.465;SC=GGGTGGAGGGAATGGCCGGCC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=3;WE=869045;WS=869027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr19	871033	rs72984029	G	A	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.810;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=156;ReadPosRankSum=1.366;SC=AGGGACACACGCACCTGGCGA;SOR=0.317;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=14;WE=871041;WS=871023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr19	871135	rs1683569	A	G	1053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.45;ReadPosRankSum=0.928;SOR=0.762;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,51:0.55:92
chr19	871222	rs8100258	G	A	863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.699;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=16;PP=401;ReadPosRankSum=-0.414;SC=CCAGCGCCTCGTCCGGCTCGC;SOR=0.462;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=81;TCF=41;TCR=40;TR=36;WE=871230;WS=871212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,42:0.45:93
chr19	871447	rs1683570	A	G	2284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.39;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr19	871447	.	AGTTCTCTCCC	GGTTCTCTCCC,GGTTCTCTCCT	556	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=42,21;NR=9,5;PP=556,532;QD=11.5837492656;SC=GTGACCCCAGAGTTCTCTCCC;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=42;TCR=9;TR=51,26;WE=871465;WS=871437;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:51
chr19	871457	rs2288546	C	T	993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=3.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.74;ReadPosRankSum=0.970;SOR=0.355;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,44:0.56:78
chr19	871724	rs73492568	G	A	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.911;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=331;ReadPosRankSum=-0.740;SC=ATGTTCTGGCGGGGGGCTCAG;SOR=1.295;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=48;TCF=10;TCR=38;TR=19;WE=871732;WS=871714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,22:0.44:50
chr19	871987	rs78047294	G	A	1938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.203;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=29;PP=1193;ReadPosRankSum=1.845;SC=GGGTATCCGAGGTGGCCGTAT;SOR=0.808;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=153;TCF=98;TCR=55;TR=85;WE=871995;WS=871977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,91:0.52:176
chr19	872089	rs72984031	A	G	2455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.465;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=57;PP=1436;ReadPosRankSum=-0.827;SC=CGTCCCGCAGAAAGCTGTGGC;SOR=0.634;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=227;TCF=102;TCR=125;TR=108;WE=872097;WS=872079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,123:0.50:248
chr19	873743	rs1651888	G	A	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=25;ReadPosRankSum=-0.136;SC=GTTGCCGGACGGAGAGGAACT;SOR=0.169;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=3;WE=873751;WS=873733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr19	875389	rs11546307	G	A	935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.954;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=23;PP=612;ReadPosRankSum=1.068;SC=CGCACACGCGGGTCACCGTGC;SOR=1.026;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=63;TCF=29;TCR=34;TR=39;WE=875397;WS=875379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,42:0.56:75
chr19	876911	.	G	A	59	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MMLQ=27;MQ=60.98;NF=5;NR=0;PP=59;QD=18.7542425094;SC=CACCTGCCACGGGGCCCCCAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=5;WE=876919;WS=876901;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:5,5:0.50:10
chr19	876911	.	G	GGGGCCCCCACCTGCCACA	176.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=-0.000;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=25.25;ReadPosRankSum=-1.068;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr19	884782	rs2965294	C	G	1368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=21;PP=924;ReadPosRankSum=0.793;SC=CGAGGCGAGACGATCGCTTAG;SOR=0.712;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=75;TCR=42;TR=58;WE=884790;WS=884772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,63:0.49:128
chr19	885818	rs1060442	A	G	6181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=114;NR=83;PP=2965;SC=TGATGGCGGGAAACTTGTCCT;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=197;TCF=114;TCR=83;TR=197;WE=885826;WS=885808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr19	886257	rs2930900	A	G	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.960;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=229;ReadPosRankSum=-0.124;SC=GGGCTGCCCCATGACCCCCAG;SOR=0.157;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=16;WE=886265;WS=886247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr19	890165	rs6678	G	A	908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.643;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=17;PP=499;ReadPosRankSum=0.124;SC=GGCAGGTGATGGCCTCGTGGT;SOR=0.467;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=91;TCF=57;TCR=34;TR=43;WE=890173;WS=890155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,48:0.48:99
chr19	897519	rs61745572	C	T	914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.805;SOR=0.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,46:0.53:87
chr19	897571	rs3746149	G	C	1408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=22;NR=27;PP=870;SC=GCAAGAACGGGAGGAATTTGG;SOR=1.118;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=22;TCR=27;TR=49;WE=897579;WS=897561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	899444	rs2965284	C	T	3191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.910;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=61;PP=2045;ReadPosRankSum=-0.250;SC=ACTTACTGGCCGAGATGAGGT;SOR=0.589;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=287;TCF=173;TCR=114;TR=147;WE=899452;WS=899434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,154:0.50:306
chr19	899567	rs2930885	C	G	2270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.771;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=55;PP=1433;ReadPosRankSum=0.675;SC=GCCGCAGCCTCGGAGGGTCCG;SOR=0.861;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=181;TCF=75;TCR=106;TR=90;WE=899575;WS=899557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,99:0.49:201
chr19	900789	.	A	G	26	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=27;MQ=57.57;NF=3;NR=0;PP=26;QD=20.2570708491;SC=CCCCATCCATACCCTGGCCCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=3;WE=900797;WS=900779;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr19	920170	rs350131	G	T	308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=9;PP=219;SC=GGTGGGAGGCGCCGGTGGGGG;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=920178;WS=920160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	920642	rs350132	T	A	1728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=32;PP=1119;SC=GCGGAGCTGCTCCGCCTGGGG;SOR=1.329;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=23;TCR=32;TR=55;WE=920650;WS=920632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr19	929678	rs3826948	G	A	1785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.26;SOR=0.814;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr19	929753	rs1799595	A	G	1565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=20;PP=897;SC=TGGGACACCCAGCCAGCCCCG;SOR=0.906;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=34;TCR=20;TR=54;WE=929761;WS=929743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr19	960187	rs1637993	G	C	2145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=50;PP=1343;ReadPosRankSum=0.416;SC=CCCCCACCCCGCTGGAGGGAG;SOR=0.666;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=153;TCF=66;TCR=87;TR=87;WE=960195;WS=960177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,95:0.59:162
chr19	960266	rs1683584	C	T	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.187;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=223;ReadPosRankSum=1.329;SC=GTGAGCACCCCGTGGCTGGAG;SOR=0.260;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=14;WE=960274;WS=960256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr19	965043	rs12608658	T	C	991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=21;PP=514;ReadPosRankSum=-0.705;SC=CAAGCACCAATGGCAGCTCCA;SOR=0.741;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=45;TCR=42;TR=43;WE=965051;WS=965033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,48:0.48:99
chr19	966693	rs6510986	C	T	2237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.217;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=43;PP=1478;ReadPosRankSum=-1.303;SC=CAGCTGTGGCCGCACAGGCAG;SOR=0.670;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=176;TCF=91;TCR=85;TR=95;WE=966701;WS=966683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,99:0.54:185
chr19	968318	rs8105235	C	T	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.221;NF=7;NR=0;PP=113;ReadPosRankSum=1.321;SC=GAGATCGCGCCACTGCACTCC;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=7;WE=968326;WS=968308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr19	968345	rs7251219	CA	TG	760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQRankSum=-1.283;QD=20.56;ReadPosRankSum=-0.244;SOR=0.714;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,20:0.54:37
chr19	971933	rs1051504	A	G	1322.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.664;HP=4;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=46;PP=2669;ReadPosRankSum=0.673;SC=CCAACAAAGGAGGCGGCGGCG;SOR=0.804;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=159;TCF=83;TCR=76;TR=89;WE=971957;WS=971923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,68:0.45:150
chr19	971949	rs1051505	G	A	3036.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=44;PP=2669;ReadPosRankSum=2.000;SC=CGGCGGCGGCGGCAGCAGCAG;SOR=0.683;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=153;TCF=77;TCR=76;TR=87;WE=971957;WS=971923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,90:0.55:164
chr19	984218	rs8112598	C	T	200.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=0;PP=116;SC=ACAAGAAAGCCCCTCTCTCCG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=984239;WS=984215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	984231	rs34402804	G	A	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=106;ReadPosRankSum=-0.683;SC=TCTCTCCGAGGCACGGGCGCA;SOR=1.828;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=6;WE=984239;WS=984215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr19	984533	rs2301810	T	C	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.409;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=22;PP=458;ReadPosRankSum=-0.514;SC=TGGGCAAGAATTACATCAGCG;SOR=0.830;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=124;TCF=60;TCR=64;TR=41;WE=984541;WS=984523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,48:0.35:139
chr19	984554	rs4806884	C	G	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.804;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=16;PP=301;ReadPosRankSum=-1.772;SC=CCTGGGAGCTCCAGCGGAAGG;SOR=0.808;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=89;TCF=40;TCR=49;TR=29;WE=984562;WS=984544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,33:0.33:99
chr19	984578	rs2301811	T	G	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=1.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.13;ReadPosRankSum=0.197;SOR=0.455;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,17:0.28:60
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chr19	985815	rs2074573	T	G	1625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.425;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=18;PP=1074;ReadPosRankSum=0.485;SC=ACTGCTGTAGTAGCTCCCGTG;SOR=0.419;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=133;TCF=99;TCR=34;TR=66;WE=985823;WS=985805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,72:0.51:140
chr19	985997	rs2074574	C	G	5549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=108;PP=2965;SC=AAAGCGTGAGCGTTTCCCACA;SOR=1.157;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=187;TCF=79;TCR=108;TR=187;WE=986005;WS=985987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr19	990185	rs10409367	G	C	1552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=15;PP=1063;SC=TGTTCCCTCCGCTCCCCGCCT;SOR=2.024;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=36;TCR=15;TR=51;WE=990193;WS=990175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr19	990281	rs2158367	G	A	6461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=113;NR=107;PP=2965;SC=GTCTCACCACGCGCTCCCCAT;SOR=0.701;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=220;TCF=113;TCR=107;TR=220;WE=990289;WS=990271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
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chr19	990819	rs2240149	G	A	2572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=57;NR=25;PP=1476;SC=TCCCCCTGCCGGGCCGAGCCC;SOR=1.489;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=57;TCR=25;TR=82;WE=990827;WS=990809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr19	991196	rs60416441	CGTCCCAG	CCCCAG,C	8973.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=76;PP=2957;SC=CTGTCTGGCACGTCCCAGGTG;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=100;TCF=17;TCR=83;TR=91;WE=991212;WS=991186;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:202
chr19	991199	rs201372013	CCCAGG	C	5281.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.41;ReadPosRankSum=0.221;SOR=0.713;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,198:0.99:200
chr19	991204	.	G	C	2958	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=20;MQ=60.0;NF=81;NR=75;PP=2958;QD=20;SC=CACGTCCCAGGTGACCCCTGT;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=167;TCF=87;TCR=80;TR=156;WE=991212;WS=991186;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:11,156:0.93:167
chr19	991873	rs71335284	G	T	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=6.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.913;SOR=0.042;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr19	991892	rs71335285	T	C	1432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=35;NR=6;PP=790;SC=GGGGCGGAACTTGGCTTGCTG;SOR=3.365;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=43;TCF=35;TCR=8;TR=41;WE=991900;WS=991882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr19	991968	rs1127043	T	C	1158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.303;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=29;PP=651;ReadPosRankSum=-0.418;SC=CAGTCACCAATGCCGCCATCC;SOR=0.552;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=148;TCF=83;TCR=65;TR=62;WE=991976;WS=991958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,63:0.41:153
chr19	1000799	rs2301813	G	C	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5040;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=24;ReadPosRankSum=0.566;SC=TCCTGGCGGCGGCCACCGAGA;SOR=1.022;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=5;WE=1000807;WS=1000789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr19	1003158	rs35163060	C	T	950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.983;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=15;PP=504;ReadPosRankSum=0.860;SC=TGCACTGGGCCAGCCCCCTGG;SOR=0.507;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=62;TCF=39;TCR=23;TR=39;WE=1003166;WS=1003148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,44:0.65:68
chr19	1003221	rs35592366	C	A	1195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.922;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=21;PP=555;ReadPosRankSum=-1.860;SC=CCTGGGAAGACGTCGGCCTGG;SOR=0.342;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=96;TCF=57;TCR=39;TR=48;WE=1003229;WS=1003211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,59:0.53:112
chr19	1003374	rs34585248	G	A	2304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=40;PP=1144;ReadPosRankSum=-0.336;SC=CGATGGCGGCGCCAGTGGGGG;SOR=0.659;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=188;TCF=111;TCR=77;TR=98;WE=1003382;WS=1003364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,115:0.53:217
chr19	1003808	rs2240155	A	G	650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=14;PP=315;ReadPosRankSum=-0.385;SC=ACGTGAGGCCAGACGCGGTGG;SOR=0.631;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=64;TCF=32;TCR=32;TR=29;WE=1003816;WS=1003798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,34:0.46:74
chr19	1003823	rs148285135	C	T	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.072;HP=1;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=868;ReadPosRankSum=-0.929;SC=CGGTGGCTCACGCCTGTAATC;SOR=0.885;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=49;TCF=19;TCR=30;TR=26;WE=1003832;WS=1003813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,30:0.56:54
chr19	1003824	rs12972813	G	C	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.072;HP=3;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=14;PP=728;ReadPosRankSum=0.949;SC=GGTGGCTCACGCCTGTAATCC;SOR=0.532;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=19;TCR=30;TR=23;WE=1003832;WS=1003813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,24:0.44:54
chr19	1004687	rs12978900	T	C	2754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.542;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=52;PP=1591;ReadPosRankSum=1.296;SC=CAGCTGGACTTGGAACCGGGA;SOR=0.802;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=223;TCF=117;TCR=106;TR=115;WE=1004695;WS=1004677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,129:0.53:243
chr19	1004710	rs4807399	C	T	2781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.944;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=60;PP=1732;ReadPosRankSum=-0.186;SC=TGCCTCTGCACGGCCCCCGCC;SOR=0.695;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=256;TCF=131;TCR=125;TR=121;WE=1004718;WS=1004700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,136:0.47:291
chr19	1004740	rs2240157	T	C	9579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=361;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=164;NR=149;PP=2965;SC=TGCCCAGGTCTGGCCCAAGCT;SOR=0.756;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=313;TCF=164;TCR=149;TR=313;WE=1004748;WS=1004730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,361:1.00:361
chr19	1004844	rs4806909	T	C	3961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=398;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.753;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=84;PP=2245;ReadPosRankSum=-0.647;SC=GCCTGGACCCTGGCACCAACG;SOR=0.650;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=371;TCF=198;TCR=173;TR=176;WE=1004852;WS=1004833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:205,190:0.48:395
chr19	1005230	rs2240158	C	T	2334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.969;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=42;PP=1369;ReadPosRankSum=0.711;SC=CACTGGTCCACGTGGCTGGGC;SOR=0.925;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=229;TCF=119;TCR=110;TR=99;WE=1005238;WS=1005220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,111:0.45:246
chr19	1005531	rs12973948	G	C	1965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=43;PP=1160;ReadPosRankSum=1.030;SC=TCGAGGAGCTGTCGGGGATCC;SOR=0.664;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=140;TCF=58;TCR=82;TR=75;WE=1005539;WS=1005521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,87:0.55:157
chr19	1005598	rs11671828	T	C	638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.006;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=20;PP=372;ReadPosRankSum=-0.837;SC=GGGCTAGCGGTGGCCCCGGGC;SOR=1.402;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=43;TCF=13;TCR=30;TR=27;WE=1005606;WS=1005588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,30:0.64:47
chr19	1008358	.	A	G	96	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MMLQ=26;MQ=41.02;NF=0;NR=5;PP=96;QD=26.1542425094;SC=CCTTGTCTGAAGTGACCAACC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=1008366;WS=1008348;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	1009365	rs10417824	T	A	709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.35;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	1009413	rs145392111	G	A	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=6;PP=155;ReadPosRankSum=-0.078;SC=CCAGCCCGGGGAGCTGCAGGA;SOR=0.693;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=20;TCF=11;TCR=9;TR=12;WE=1009421;WS=1009403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr19	1009485	rs10401245	C	G	700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=8;PP=503;SC=GCGGCGCGGCCAGCTCCTGGC;SOR=1.302;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=25;WE=1009493;WS=1009475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	1009550	rs142516571	GGCCCCCGCGGAGGCCCCACCACACTCT	G	944.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=2915;ReadPosRankSum=1.563;SC=AGGCCAGAGCGGCCCCCGCGG;SOR=0.817;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=7;WE=1009593;WS=1009540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,26:0.42:62
chr19	1009585	rs10401454	C	G	777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=15;PP=1652;ReadPosRankSum=-0.272;SC=TCTGGCCGACCGGGGAGCCAG;SOR=0.594;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=36;TCR=25;TR=36;WE=1009593;WS=1009540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,38:0.55:69
chr19	1010406	rs62131162	G	A	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=226;ReadPosRankSum=1.179;SC=GGCTAGGCCCGCCTACCGCAG;SOR=0.765;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=33;TCF=23;TCR=10;TR=15;WE=1010414;WS=1010396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr19	1010691	rs2240159	A	G	1472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=22;PP=902;SC=CGCTGGCCCCAGGCGAGACGG;SOR=1.051;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=19;TCR=22;TR=41;WE=1010699;WS=1010681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr19	1010908	rs7248769	A	G	936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.83;ReadPosRankSum=-0.538;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,30:0.41:73
chr19	1010910	rs7252527	T	C	936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.38;ReadPosRankSum=-0.118;SOR=0.599;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,28:0.40:70
chr19	1011338	rs34750262	C	T	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=327;ReadPosRankSum=-1.300;SC=CCAGCACCCACTCCACCCTGC;SOR=0.848;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=35;TCF=15;TCR=20;TR=20;WE=1011346;WS=1011328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr19	1011823	rs2240161	A	G	12259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=174;NR=121;PP=2965;SC=AGGAAGCGCTATGAGGGGCTG;SOR=1.069;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=296;TCF=175;TCR=121;TR=295;WE=1011831;WS=1011813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,334:1.00:334
chr19	1011846	rs10420656	T	C	8422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=412;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.44;ReadPosRankSum=1.175;SOR=0.847;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:195,217:0.53:412
chr19	1011856	rs113138803	C	A	8559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=434;ExcessHet=3.0103;FS=2.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.72;ReadPosRankSum=1.269;SOR=0.875;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:208,226:0.52:434
chr19	1012120	rs7145	G	A	2264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.012;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=56;PP=1428;ReadPosRankSum=-0.577;SC=GGATGTCATCGTAGCCCAGGA;SOR=0.776;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=210;TCF=104;TCR=106;TR=106;WE=1012128;WS=1012110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,111:0.48:230
chr19	1012379	rs2240162	C	G	1250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.67;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	1012379	.	CGT	GGC	436	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=5;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=21;NR=3;PP=436;QD=20.3944947859;SC=CACAGCCCCCCGTCCCGCACC;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=24;WE=1012389;WS=1012369;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,24:0.92:26
chr19	1012381	rs2240163	T	C	1250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.13;SOR=2.910;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr19	1012416	rs112926823	G	A	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=8;PP=532;ReadPosRankSum=1.299;SC=AGGGAGGAGGGGAGGCCCCGC;SOR=0.767;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=71;TCF=54;TCR=17;TR=36;WE=1012424;WS=1012406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,38:0.51:74
chr19	1012440	rs11672715	A	C	1111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.596;HP=4;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=15;PP=738;ReadPosRankSum=-0.194;SC=GGAGCTCCCCAAGCCCAGCAG;SOR=0.928;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=100;TCF=66;TCR=34;TR=48;WE=1012448;WS=1012430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,52:0.49:107
chr19	1012611	rs970100	A	C	2989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=41;NR=55;PP=1670;SC=GCGCCCCCACACACGTCCCCC;SOR=1.220;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=41;TCR=55;TR=96;WE=1012619;WS=1012601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr19	1012639	rs62131163	A	G	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.146;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=19;PP=431;ReadPosRankSum=0.689;SC=GCCAGCAGGCAAGGCAGGCGT;SOR=1.061;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=50;TCF=16;TCR=34;TR=26;WE=1012647;WS=1012629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,28:0.50:56
chr19	1013148	rs3815170	G	A	928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.571;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=1.107;NF=28;NR=17;PP=563;ReadPosRankSum=1.066;SC=CAGCCAGCAGGCTGGGGATGT;SOR=0.878;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=103;TCF=63;TCR=40;TR=45;WE=1013156;WS=1013138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,49:0.46:107
chr19	1014377	rs1058506	A	G	1261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.177;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=23;PP=589;ReadPosRankSum=0.453;SC=GGATGCCCTCACGCGGCCACT;SOR=0.604;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=111;TCF=58;TCR=53;TR=56;WE=1014385;WS=1014367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,67:0.52:128
chr19	1014398	rs7146	A	G	3262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=60;NR=48;PP=1667;SC=TGTCACGCACATGCTCCAGGC;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=60;TCR=48;TR=108;WE=1014406;WS=1014388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr19	1014537	rs67806247	ACGTGATGGGG	A	445.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=61.13;NF=0;NR=7;PP=1961;SC=CCAAGGGCCTACGTGATGGGG;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=7;WE=1014554;WS=1014527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	1020673	rs1005504	C	G	720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=21;NR=5;PP=518;SC=GTGGCGCTCGCTGTCCCCAGC;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=26;WE=1020681;WS=1020663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	1031212	rs7247087	A	G	4538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.64;SOR=0.704;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr19	1031329	rs56707950	G	A	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.260;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=82;ReadPosRankSum=0.269;SC=TTTGGAGGCCGAGGGTGGTGG;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=6;WE=1031337;WS=1031319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr19	1031340	rs12978059	C	G	214.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.81;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	1032369	rs10401325	C	T	898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=7;PP=628;SC=CTGTTTCCCCCGCCCCATGTT;SOR=2.165;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=31;WE=1032377;WS=1032359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	1032474	rs62131196	G	T	1400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.563;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=31;PP=887;ReadPosRankSum=-0.844;SC=GGCTGGTGGAGCGGAGCAGGG;SOR=0.635;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=105;TCF=54;TCR=51;TR=66;WE=1032482;WS=1032464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,68:0.61:111
chr19	1032702	rs4315451	C	T	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=1.078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.06;ReadPosRankSum=0.000;SOR=0.879;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,18:0.30:61
chr19	1032756	rs55784632	C	T	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=1.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.74;ReadPosRankSum=-0.988;SOR=0.457;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,11:0.23:47
chr19	1032871	rs4630683	A	G	125.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=4;PP=85;SC=TCCAACTCCCAGGTTCAAGCG;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=1032879;WS=1032861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
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chr19	1037731	rs75808449	C	T	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=1.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQRankSum=-5.544;QD=0.74;ReadPosRankSum=1.195;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,8:0.15:54
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chr19	1037756	rs77830704	G	A	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=3.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQRankSum=-5.720;QD=1.51;ReadPosRankSum=-0.012;SOR=1.571;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,7:0.11:62
chr19	1037766	rs78386506	G	A	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=7.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQRankSum=-4.644;QD=1.74;ReadPosRankSum=0.237;SOR=1.932;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,5:0.08:59
chr19	1037932	rs3848639	G	C	105.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.18;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	1042809	rs3764645	A	G	1244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.981;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=26;PP=610;ReadPosRankSum=-0.281;SC=GAGGCCGCTGAGGACCTGGCC;SOR=1.076;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=125;TCF=62;TCR=63;TR=50;WE=1042817;WS=1042799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,62:0.42:147
chr19	1043103	rs72973581	G	A	1482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.661;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=16;PP=854;ReadPosRankSum=1.512;SC=AGGGACCAGCGGCCCCCTGGA;SOR=0.802;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=126;TCF=90;TCR=36;TR=57;WE=1043111;WS=1043093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,67:0.47:144
chr19	1043864	rs4622634	G	C	916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.762;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=25;PP=484;ReadPosRankSum=-1.354;SC=CTGGGGAGGTGGGATGTGGCT;SOR=0.592;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=102;TCF=35;TCR=67;TR=41;WE=1043872;WS=1043854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,47:0.43:110
chr19	1044753	rs3764648	T	C	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.923;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.726;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=5;PP=48;ReadPosRankSum=-0.732;SC=GGTGAGGGCCTGTCCACCTGC;SOR=0.047;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=8;WE=1044761;WS=1044743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr19	1047002	rs3752234	A	G	891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=19;PP=600;ReadPosRankSum=-1.757;SC=TCAGCGCCGCACTGCTGGTTC;SOR=0.624;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=89;TCF=49;TCR=40;TR=40;WE=1047010;WS=1046992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,44:0.45:98
chr19	1047161	rs3752237	A	G	3327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.837;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=71;PP=2109;ReadPosRankSum=0.688;SC=CACAGCTGGGAGACATCCTCC;SOR=0.769;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=295;TCF=153;TCR=142;TR=148;WE=1047169;WS=1047151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,163:0.50:326
chr19	1049012	rs4147912	A	C	959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=19;PP=588;SC=AGGGTGAGGCACTACGAGGCT;SOR=1.244;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=12;TCR=19;TR=31;WE=1049020;WS=1049002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	1049471	.	C	CCA	473.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.108;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=2.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.74;ReadPosRankSum=2.292;SOR=1.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr19	1049480	rs75864702	A	T	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=3.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.41;ReadPosRankSum=1.993;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr19	1049490	rs79814850	C	G	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=36.68;ReadPosRankSum=1.465;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr19	1050781	rs145363837	AAATAATAATAATAAT	A,AAATAATAATAATAATAATAATAAT	417.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5431;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=39;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=2;NR=0;PP=36;SC=TCCGTCTCAAAAATAATAATA;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=2;WE=1050789;WS=1050771;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.64,0.36:11
chr19	1050836	rs55999131	T	A	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=210;ReadPosRankSum=0.571;SC=AAAAATTTTTTAAAAACAGAA;SOR=0.612;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=18;WE=1050844;WS=1050826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,20:0.53:38
chr19	1050874	rs12151021	A	G	2772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=28;PP=1465;SC=TGTAACTGCCAGTGCACTCTG;SOR=1.346;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=57;TCR=28;TR=85;WE=1050882;WS=1050864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr19	1051214	rs3752240	A	G	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.638;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=11;PP=374;ReadPosRankSum=0.874;SC=GTGCCGCTGTAGTGGGCCCCG;SOR=0.332;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=56;TCF=24;TCR=32;TR=23;WE=1051222;WS=1051204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,28:0.44:63
chr19	1051751	rs3764651	A	G	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5005;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=134;ReadPosRankSum=1.393;SC=AGAGTTGGGGATAGACAGAGG;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=8;WE=1051759;WS=1051741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr19	1052005	rs3764652	C	T	1255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=23;PP=596;ReadPosRankSum=1.063;SC=ACCGTGTGGCCGTGGTGGCAG;SOR=0.725;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=111;TCF=64;TCR=47;TR=53;WE=1052013;WS=1051995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,63:0.50:127
chr19	1053677	rs3752242	G	A	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=5;PP=431;ReadPosRankSum=-0.338;SC=TGGCTCAGATGTCCCTTGGGA;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=26;WE=1053685;WS=1053667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,26:0.68:38
chr19	1054060	rs3752243	A	G	3697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=396;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.98;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=87;PP=2480;ReadPosRankSum=-2.074;SC=ACGTAACCCTACGGCTCAAGA;SOR=0.711;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=369;TCF=176;TCR=193;TR=168;WE=1054068;WS=1054050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:214,180:0.46:394
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chr19	1063930	rs4807499	C	T	877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.453;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=27;PP=557;ReadPosRankSum=-0.492;SC=AGCCCCAAAGCACAAGGCCAC;SOR=1.473;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=67;TCF=17;TCR=50;TR=33;WE=1063938;WS=1063920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,39:0.51:76
chr19	1064193	rs4147930	G	A	2818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=52;NR=34;PP=1316;SC=GCTCGCGCCTGGCCATCATGG;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=52;TCR=34;TR=86;WE=1064201;WS=1064183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr19	1064453	rs4147931	G	C	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=36;ReadPosRankSum=0.652;SC=CAGGAGGCGTGAGCCGGGGGC;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=1064461;WS=1064443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr19	1065018	rs4147934	G	T	1604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=17;PP=955;SC=GTTCCCTGGGGCGGAGCTGCG;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=35;TCR=17;TR=52;WE=1065026;WS=1065008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr19	1065044	rs4147935	C	T	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.950;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=10;PP=357;ReadPosRankSum=-0.251;SC=CACATGGAGGCCGCCTGCGCT;SOR=0.532;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=57;TCF=39;TCR=18;TR=27;WE=1065052;WS=1065034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,30:0.45:66
chr19	1065197	rs4147936	G	C	6078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=127;NR=81;PP=2965;SC=GGTCGGGCTGGGGGAGGCAGG;SOR=1.143;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=208;TCF=127;TCR=81;TR=208;WE=1065205;WS=1065187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr19	1065945	rs2242436	C	T	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.352;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=75;ReadPosRankSum=-2.352;SC=CCCGGTGTCCCGGAGCACAGG;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=6;WE=1065953;WS=1065936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr19	1066256	rs4147938	G	A	1357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.69;SOR=1.159;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr19	1068734	rs3764653	T	C	5252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FS=0.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.63;ReadPosRankSum=0.999;SOR=0.641;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:143,139:0.49:282
chr19	1068738	rs1801284	G	A	5202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.20;ReadPosRankSum=0.667;SOR=0.707;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:135,136:0.50:271
chr19	1071312	rs4807506	C	T	2362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.41;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr19	1073409	rs2074441	C	G	3997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=54;PP=2649;SC=CAAGCTCCCTCCTGTTCCCCC;SOR=0.880;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=127;TCF=72;TCR=55;TR=126;WE=1073417;WS=1073399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr19	1074000	rs2074442	A	T	2722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.93;SOR=0.921;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr19	1074064	rs12610818	C	G	2442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=30;PP=1689;ReadPosRankSum=-0.154;SC=GGCCATTGCGCGGGTCGGGCC;SOR=1.029;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=86;TCF=55;TCR=31;TR=84;WE=1074072;WS=1074053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,94:0.98:96
chr19	1074252	rs11084881	T	G	6462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=120;NR=102;PP=2965;SC=TGAGAGCTGGTGTCCCAGCAG;SOR=0.797;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=222;TCF=120;TCR=102;TR=222;WE=1074260;WS=1074242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr19	1077985	rs7251797	A	G	1534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.663;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=28;PP=908;ReadPosRankSum=-0.881;SC=GGGAGCAGGCAGCACGGCCAC;SOR=0.585;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=117;TCF=61;TCR=56;TR=62;WE=1077996;WS=1077975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,70:0.55:127
chr19	1078101	rs72975505	G	A	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.939;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=211;ReadPosRankSum=-0.331;SC=CCAATGCTTGGTGTGACATTT;SOR=3.003;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=13;WE=1078109;WS=1078091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr19	1080189	rs2074453	G	C	2724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.431;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=73;PP=1472;ReadPosRankSum=0.347;SC=CTCTGTCGGGGGCATGAAGAT;SOR=0.795;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=303;TCF=153;TCR=150;TR=132;WE=1080197;WS=1080179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:186,141:0.43:327
chr19	1080311	rs2074454	G	C	8789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=157;NR=144;PP=2965;SC=TGGCGCGGCCGGAGGCTGCCG;SOR=0.717;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=302;TCF=157;TCR=145;TR=301;WE=1080319;WS=1080301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,338:1.00:338
chr19	1080925	rs11551696	G	A	3193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.919;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=75;PP=1952;ReadPosRankSum=0.296;SC=AGCTGCCGGTGGCCGTGCCCA;SOR=0.826;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=273;TCF=128;TCR=145;TR=136;WE=1080933;WS=1080915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,153:0.51:300
chr19	1081120	rs8113708	A	G	800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=20;PP=587;SC=TGGGGTGCCCAGCACCGCCGG;SOR=2.147;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=27;WE=1081128;WS=1081110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	1081462	rs34275968	C	CG	384.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=366;ReadPosRankSum=0.696;SC=GGGCTGTGAGCGCCCCGGGGA;SOR=0.481;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=10;WE=1081470;WS=1081452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr19	1081617	rs10404947	A	G	5037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=81;PP=2935;SC=AGAAGCTGCAAGGCCGCCTGC;SOR=0.769;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=169;TCF=88;TCR=81;TR=169;WE=1081625;WS=1081607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
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chr19	1086043	rs3761026	T	C	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=285;ReadPosRankSum=-0.286;SC=GCTTCTCTCTTGCCTGCTCCT;SOR=0.831;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=59;TCF=13;TCR=46;TR=24;WE=1086051;WS=1086033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,26:0.42:62
chr19	1090020	rs61585798	TG	T	1109.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=13;NR=10;PP=412;SC=GGGGTGTGTGTGGGGGGGGAA;SOR=2.833;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=30;TCF=14;TCR=16;TR=23;WE=1090028;WS=1090010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr19	1090803	rs3787016	A	G	2499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=49;NR=27;PP=1392;SC=ATGCACTAATAGGAACACCTG;SOR=1.255;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=77;TCF=49;TCR=28;TR=76;WE=1090811;WS=1090793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr19	1094004	rs12459404	G	A	5856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=116;NR=79;PP=2965;SC=CTTGTCCCCAGATTGGGCTTT;SOR=0.931;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=195;TCF=116;TCR=79;TR=195;WE=1094012;WS=1093994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr19	1095122	rs2074446	C	G	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.154;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=407;ReadPosRankSum=-1.729;SC=CCGGCGACCTCTGGGCCTCCC;SOR=1.061;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=35;TCR=13;TR=25;WE=1095130;WS=1095112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,24:0.47:51
chr19	1095151	rs10416031	A	G	692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=11;PP=443;ReadPosRankSum=0.374;SC=CCGGCCCTTCATCGCTGCTGC;SOR=0.792;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=67;TCF=48;TCR=19;TR=35;WE=1095159;WS=1095141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,36:0.46:78
chr19	1095352	rs17554924	C	G	4040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FS=2.499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.05;ReadPosRankSum=-1.039;SOR=0.537;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,104:0.54:192
chr19	1095355	rs17554917	C	T	4049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FS=2.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.77;ReadPosRankSum=-1.873;SOR=0.517;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,103:0.55:186
chr19	1095430	rs17554909	T	G	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.330;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=320;ReadPosRankSum=1.156;SC=CCCGCGCTGGTCTGTCGTCGG;SOR=1.609;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=37;TCF=10;TCR=27;TR=18;WE=1095438;WS=1095420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr19	1109595	rs185032569	G	T	1609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.316;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=37;PP=912;ReadPosRankSum=-1.464;SC=GGTCCACGCTGATCTGCCACG;SOR=0.751;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=146;TCF=68;TCR=78;TR=71;WE=1109603;WS=1109585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,76:0.53:144
chr19	1110656	rs145346898	C	T	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.445;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=262;ReadPosRankSum=-1.543;SC=GGTGTTCCCACGAGCCCCGAG;SOR=1.085;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=19;WE=1110664;WS=1110646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr19	1113523	rs112914802	G	T	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.666;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=354;ReadPosRankSum=1.422;SC=CAGCTGCCACGTCCCACCCAC;SOR=1.802;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=37;TCF=24;TCR=13;TR=23;WE=1113535;WS=1113513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,24:0.71:34
chr19	1128312	rs10412207	A	G	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.459;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=315;ReadPosRankSum=1.919;SC=GGGCGGGGGCAGCCACGCCCA;SOR=0.361;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=49;TCF=8;TCR=41;TR=21;WE=1128320;WS=1128302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,23:0.46:50
chr19	1207238	rs3764640	G	T	1943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.565;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=53;PP=1344;ReadPosRankSum=0.663;SC=GCCGGGCCGGGCCAGTCACGG;SOR=1.199;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=124;TCF=48;TCR=76;TR=79;WE=1207246;WS=1207228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,84:0.61:137
chr19	1207280	rs3764641	C	T	973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.53;ReadPosRankSum=-0.177;SOR=0.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,40:0.60:67
chr19	1218523	rs2075604	G	T	870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=19;PP=423;ReadPosRankSum=-2.619;SC=TGTTGGGACCGCGGGGCCTCC;SOR=0.656;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=25;TCR=31;TR=35;WE=1218531;WS=1218513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,42:0.65:65
chr19	1219274	rs34928889	G	A	1350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.188;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=28;PP=905;ReadPosRankSum=-0.147;SC=GTGCTCCCTGGGCCTGTGAGT;SOR=0.452;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=127;TCF=78;TCR=49;TR=65;WE=1219282;WS=1219264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,67:0.50:133
chr19	1219443	rs147990629	G	GCGGGGGC	141.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.25;MQRankSum=1.873;QD=5.67;ReadPosRankSum=-0.191;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,6:0.24:25
chr19	1220321	rs2075606	T	C	969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=8;PP=710;ReadPosRankSum=1.707;SC=AGGGGACCCCTGTGAGGGGCA;SOR=0.760;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=70;TCF=54;TCR=16;TR=37;WE=1220329;WS=1220311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,40:0.54:74
chr19	1231142	rs8110590	T	C	1754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.575;HP=6;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=39;PP=983;ReadPosRankSum=0.855;SC=GGGGCGGGGGTGCGGGAAGGC;SOR=0.639;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=156;TCF=84;TCR=72;TR=82;WE=1231150;WS=1231132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,87:0.54:162
chr19	1251781	rs2285811	A	G	2475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=51;PP=1632;ReadPosRankSum=-1.847;SC=TCCACCCCCTATTCCAGCCCA;SOR=0.668;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=282;TCF=164;TCR=118;TR=121;WE=1251789;WS=1251771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,120:0.42:288
chr19	1254122	rs2301761	G	A	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=349;ReadPosRankSum=1.301;SC=GGCTGGGGGCGCCGCAAGCTG;SOR=0.873;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=22;WE=1254130;WS=1254112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,21:0.58:36
chr19	1256998	rs9823	C	T	2678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.666;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=56;PP=1623;ReadPosRankSum=-0.134;SC=TTGCAGGGGACCGGCTTCGGC;SOR=0.480;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=239;TCF=134;TCR=105;TR=117;WE=1257006;WS=1256988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,128:0.49:262
chr19	1268178	rs12975875	G	A	271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=2;PP=219;SC=GGGGCAGAGAGGCAGGGGTCC;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=1268186;WS=1268168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	1270231	rs56378951	GC	G	584.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=3;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=19;PP=327;ReadPosRankSum=-0.679;SC=CTGACAGCCAGCCCCCCCCCC;SOR=1.179;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=20;WE=1270240;WS=1270221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,24:0.96:25
chr19	1271274	rs12609287	C	T	8925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=163;NR=142;PP=2965;SC=AGCAGGAGTCCCGTCTCGAGG;SOR=0.775;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=305;TCF=163;TCR=142;TR=305;WE=1271282;WS=1271264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,327:1.00:327
chr19	1271529	rs4807050	C	T	2262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=44;NR=36;PP=1313;SC=AGCTGGTACTCACTTTTTCCT;SOR=0.788;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=81;TCF=44;TCR=37;TR=80;WE=1271537;WS=1271519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr19	1272040	rs12488	T	C	5724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=118;NR=77;PP=2965;SC=GAGACAGTTATGACAGTTACG;SOR=1.195;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=195;TCF=118;TCR=77;TR=195;WE=1272048;WS=1272030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr19	1274539	rs8108009	T	C	810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=23;PP=584;SC=TATGGCCCCATGGCGGGCGCC;SOR=2.621;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=29;WE=1274547;WS=1274529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	1277275	rs757292	G	C	3962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=70;NR=70;PP=2345;SC=AGGAGACGGTGTTTGAGTCCC;SOR=0.761;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=70;TCR=70;TR=140;WE=1277283;WS=1277265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr19	1349357	rs147416206	T	C	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.305;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=422;ReadPosRankSum=0.658;SC=AAAATTAATTTTTTTCTCATC;SOR=1.112;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=67;TCF=19;TCR=48;TR=24;WE=1349365;WS=1349347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,25:0.35:71
chr19	1357082	rs713042	T	C	1515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.100;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=42;PP=1002;ReadPosRankSum=-1.000;SC=AAATCCTCTCTCTAGAGGAAA;SOR=0.525;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=139;TCF=53;TCR=86;TR=71;WE=1357090;WS=1357072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,75:0.50:151
chr19	1358726	rs2285972	C	T	2173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.614;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=58;PP=1565;ReadPosRankSum=2.090;SC=TCTCGTACCCCCGTGGCCTCC;SOR=1.007;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=199;TCF=83;TCR=116;TR=94;WE=1358734;WS=1358716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,104:0.45:231
chr19	1358773	rs145541401	G	C	771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-2.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=30;PP=521;ReadPosRankSum=-1.282;SC=CTGCCATAAGGGGGGAGGTCC;SOR=0.757;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=80;TCF=19;TCR=61;TR=38;WE=1358781;WS=1358763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,41:0.43:95
chr19	1360575	rs3826942	G	A	2668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.393;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=53;PP=1763;ReadPosRankSum=0.825;SC=TAAGAGGGGAGGAAACTCAGC;SOR=0.598;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=272;TCF=156;TCR=116;TR=121;WE=1360583;WS=1360565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,132:0.44:299
chr19	1364306	rs17673260	A	G	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=200;ReadPosRankSum=2.004;SC=TCACTGTCTCATCATTGGTGG;SOR=0.551;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=10;WE=1364314;WS=1364296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr19	1366179	rs72377165	CGCTGGGGTCACCCCCAGA	C	1448.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.532;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.255;NF=9;NR=6;PP=2954;ReadPosRankSum=0.520;SC=CGGGAGACTTCGCTGGGGTCA;SOR=1.288;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=56;TCF=36;TCR=20;TR=15;WE=1366204;WS=1366169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,40:0.40:101
chr19	1366422	rs2668418	C	G	1616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=46;PP=1123;ReadPosRankSum=-0.772;SC=GCCTGAGGGGCCAGGCCGGCC;SOR=0.681;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=127;TCF=41;TCR=86;TR=68;WE=1366430;WS=1366412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,71:0.53:133
chr19	1370675	rs12608765	C	G	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.943;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=10;PP=405;ReadPosRankSum=1.100;SC=AGCAGGACGTCTTGGGGACCA;SOR=1.027;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=71;TCF=44;TCR=27;TR=31;WE=1370683;WS=1370665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,34:0.41:82
chr19	1383649	rs3848638	G	T	535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-3.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=334;ReadPosRankSum=-1.389;SC=GGTGACTTTTGCCCTCCTGGA;SOR=0.746;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=36;TCF=31;TCR=5;TR=19;WE=1383657;WS=1383639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,22:0.51:43
chr19	1388538	rs1142530	C	T	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.49;ReadPosRankSum=-1.210;SOR=0.846;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr19	1389064	rs7258846	G	T	2437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.160;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=52;PP=1439;ReadPosRankSum=0.921;SC=ACTCACATGCGCACATGTGCA;SOR=0.563;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=219;TCF=108;TCR=111;TR=107;WE=1389072;WS=1389054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,119:0.49:243
chr19	1389324	rs66919466	ACT	A	745.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.459;NF=10;NR=16;PP=910;ReadPosRankSum=0.280;SC=ACACATGCACACTCACACACA;SOR=0.768;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=56;TCF=26;TCR=30;TR=26;WE=1389333;WS=1389314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,36:0.41:87
chr19	1389517	rs11666067	C	A	3131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-1.062;NF=73;NR=70;PP=1732;ReadPosRankSum=-0.018;SC=TGGAGATGACCCCTCCGTTTC;SOR=0.671;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=306;TCF=158;TCR=148;TR=143;WE=1389525;WS=1389507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,156:0.47:334
chr19	1391235	rs2074897	G	A	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.65;ReadPosRankSum=-0.455;SOR=0.787;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr19	1407618	.	A	AGCC	62.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.84;ReadPosRankSum=1.345;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr19	1426111	rs117428133	C	T	837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=27;PP=551;ReadPosRankSum=-0.308;SC=GGTCTGTAGACGTGAGGAGGG;SOR=0.596;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=79;TCF=22;TCR=57;TR=38;WE=1426119;WS=1426101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,40:0.46:87
chr19	1453705	rs12985827	T	C	623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=16;PP=346;SC=CATATGTCTCTGCCCACACCT;SOR=1.893;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=22;WE=1453713;WS=1453695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	1455933	rs146334923	C	CAGAGTCAGAGCCCAGGGCGAAGTCATCCCAGGA	1466.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.96;QD=77.20;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	1456544	rs2656869	A	G	115.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=1;PP=45;SC=TCTGGCGTGCAGCTCATGCAG;SOR=1.022;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=1456552;WS=1456534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	1456730	rs3896893	G	T	493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=0;PP=418;SC=CCCCTCATCTGTCCCCCAGGT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=1456738;WS=1456720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	1457875	rs12005	G	A	56.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=1;PP=111;SC=GATCCTTCAGGCCTGGGGCGG;SOR=1.179;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=1457883;WS=1457865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr19	1467684	rs265273	A	C	2316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=32;PP=1282;SC=GGGCAAGAACAGAGCAGGGCT;SOR=0.812;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=77;TCF=45;TCR=32;TR=76;WE=1467692;WS=1467674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr19	1482396	rs61733913	G	A	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.813;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=373;ReadPosRankSum=-0.094;SC=CGCGCTGCTGGTCACCTGGGG;SOR=1.609;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=59;TCF=37;TCR=22;TR=27;WE=1482404;WS=1482386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,31:0.48:65
chr19	1487561	rs62128466	C	G	1868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-2.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.213;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=29;PP=1016;ReadPosRankSum=0.713;SC=ACCCCCTTCCCTCTCTGTCCC;SOR=0.507;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=135;TCF=92;TCR=43;TR=81;WE=1487569;WS=1487551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,90:0.60:150
chr19	1488147	rs4807120	C	T	1394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.649;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=32;PP=949;ReadPosRankSum=0.157;SC=AGGGCGCCAGCGGCCCCGTCC;SOR=0.587;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=121;TCF=58;TCR=63;TR=60;WE=1488155;WS=1488126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,65:0.49:132
chr19	1489770	rs791468	T	G	2930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.863;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=71;PP=1793;ReadPosRankSum=1.620;SC=GGGCAGGGGGTTGGCCTCCAG;SOR=0.641;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=277;TCF=127;TCR=150;TR=132;WE=1489778;WS=1489759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,147:0.47:310
chr19	1490377	rs791469	T	G	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.702;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=182;ReadPosRankSum=-0.476;SC=CCTGCGCAAATCCCCTCCCTC;SOR=1.981;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=10;WE=1490385;WS=1490367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr19	1491171	rs791473	T	G	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.542;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=191;ReadPosRankSum=1.071;SC=GGCCGGAGCATCGCGGCTCAG;SOR=1.150;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=15;WE=1491179;WS=1491161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr19	1495277	rs12459408	C	T	1986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.857;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=42;PP=1271;ReadPosRankSum=0.753;SC=GGCACACCACCGCCTCTCTCC;SOR=0.535;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=176;TCF=104;TCR=72;TR=97;WE=1495285;WS=1495267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,97:0.53:182
chr19	1495634	rs2277748	G	A	2083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.605;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=57;PP=1336;ReadPosRankSum=1.279;SC=GGGCACAGCCGTGGAGCGCAT;SOR=0.508;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=183;TCF=66;TCR=117;TR=92;WE=1495642;WS=1495624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,97:0.49:196
chr19	1496263	rs2244686	A	G	828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.996;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=8;PP=616;ReadPosRankSum=1.656;SC=GCCCGCGTGTAACTCCTGCCC;SOR=0.892;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=68;TCF=51;TCR=17;TR=34;WE=1496271;WS=1496253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,35:0.49:72
chr19	1496716	.	TGC	T	175	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=25;MQ=57.8;NF=0;NR=4;PP=175;QD=45.75;SC=TGTGTGTGTGTGCGCGCGCGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=4;WE=1496725;WS=1496706;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr19	1497121	rs2244801	G	T	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.808;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=61;ReadPosRankSum=0.840;SC=AGCAGCTCCGGGGAGCCCAGG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=5;WE=1497129;WS=1497111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr19	1497144	rs2292456	C	T	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.583;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=188;ReadPosRankSum=-1.347;SC=TGCCTCACGGCCCTCCCCCAC;SOR=1.148;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=27;TCF=18;TCR=9;TR=14;WE=1497152;WS=1497134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr19	1497543	rs1050017	A	G	2034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.645;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=35;PP=1231;ReadPosRankSum=-0.416;SC=TACTTCCTCCAGCCCCTCCCA;SOR=0.985;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=200;TCF=110;TCR=90;TR=88;WE=1497551;WS=1497533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,99:0.46:217
chr19	1506710	rs3215149	TC	T	1360.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=19;PP=995;SC=TCCCCACTCATCCCCCACCCT;SOR=0.836;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=32;TCF=10;TCR=22;TR=28;WE=1506718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	1507483	rs791460	T	C	5197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=97;PP=2965;SC=GGCCTCAGTCTCCCCATCTGT;SOR=1.191;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=68;TCR=97;TR=165;WE=1507491;WS=1507473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr19	1507535	rs791461	T	C	3793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=65;PP=2453;SC=CGGGTGCCTCTCGCCTCACAT;SOR=0.864;Source=Platypus;TCF=62;TR=127;WE=1507543;WS=1507525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr19	1507710	rs791462	T	A,G	4261.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=19;NF=38,45;NR=41,50;PP=1004,1372;SC=CTTGAGGATTTAATGAGCTAC;SOR=0.923;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=174;TCF=83;TCR=91;TR=79,95;WE=1507718;WS=1507700;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.45,0.55:181
chr19	1508737	rs55810939	C	T	638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.078;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=311;ReadPosRankSum=0.019;SC=AGGTGCTCTGCGTCCAGCAAC;SOR=0.314;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=18;WE=1508745;WS=1508727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr19	1508757	rs56135389	G	C	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=292;ReadPosRankSum=-1.900;SC=CCTGGGACTCGCAGGCAAGTA;SOR=0.473;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=14;WE=1508765;WS=1508747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr19	1510661	rs265291	A	G	835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=10;PP=434;SC=GGCTGCGCACAGAGACGCCAC;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=27;TCF=17;TCR=10;TR=27;WE=1510669;WS=1510651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	1526931	rs2656858	A	C	6736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=116;NR=108;PP=2965;ReadPosRankSum=0.458;SC=AACTTCCTGGACCCTGAGGTT;SOR=0.739;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=225;TCF=117;TCR=108;TR=224;WE=1526939;WS=1526921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,264:0.99:266
chr19	1527051	rs11288093	CG	C	745.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.68;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	1528231	rs2668408	T	C	3773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=45;PP=2465;SC=CCCCGCCCTGTCCCAGGTAAC;SOR=1.312;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=124;TCF=79;TCR=45;TR=124;WE=1528239;WS=1528221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr19	1529527	rs2668409	G	C	2828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=32;PP=882;SC=GCTGCAGGTGGGGAGGGAGGA;SOR=1.103;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=29;TCR=33;TR=61;WE=1529535;WS=1529517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr19	1529550	rs2656863	A	G	2473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=24;PP=952;SC=TACAAGTGACAGGGGGACCAA;SOR=0.793;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=28;TCR=24;TR=52;WE=1529558;WS=1529540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr19	1530015	rs2668410	C	G	84.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.09;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr19	1530015	.	CGG	GGT	76	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=76;QD=64.7339374311;SC=GAGGGCTCTGCGGCAGCCTTA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=2;WE=1530025;WS=1530005;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,2:0.67:3
chr19	1530017	.	G	T	84.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.09;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr19	1533870	rs265286	T	G	78.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=2;PP=116;SC=GTGCTGGGTGTGGGGGCGAGG;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=5;WE=1533878;WS=1533860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr19	1535179	rs55953917	G	A	5367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=81;PP=2965;SC=GACGTCCCGCGGAGCCACGGC;SOR=0.745;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=179;TCF=98;TCR=81;TR=179;WE=1535187;WS=1535169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr19	1535349	rs265281	G	A	1083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=30;PP=846;SC=CCTGGGGGAGGGCTGGGGGGC;SOR=3.026;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=34;WE=1535357;WS=1535339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
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chr19	1556140	.	G	GGAAGTC	3288.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.234;ClippingRankSum=0.000;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.606;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=2.358;NF=8;NR=21;PP=1673;ReadPosRankSum=0.229;SC=TCCAGCGCCAGGAAGTCGAAG;SOR=0.654;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=89;TCF=15;TCR=74;TR=29;WE=1556148;WS=1556130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,85:0.48:177
chr19	1605543	rs76421407	C	G	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=182;ReadPosRankSum=-0.969;SC=CGCCACTGTGCGCGCAGACCC;SOR=0.527;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=10;WE=1605551;WS=1605533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr19	1611856	rs62130064	G	A	1571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.454;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=37;PP=1026;ReadPosRankSum=-1.162;SC=GCTCTGGAGGGAGGGGGGAGA;SOR=0.883;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=49;TCR=70;TR=63;WE=1611864;WS=1611846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,70:0.56:126
chr19	1611941	.	T	G	76	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.9923;HP=16;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=15;MQ=55.57;NF=1;NR=5;PP=76;QD=18.4618687579;SC=GGGGGGGGGGTGGGGGCAGAG;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=6;WE=1611949;WS=1611931;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:9,6:0.40:15
chr19	1615852	rs41275838	C	T	950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.168;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=26;PP=523;ReadPosRankSum=-2.274;SC=GGGCCTGCGTCGGCCTCCAGG;SOR=1.029;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=125;TCF=60;TCR=65;TR=44;WE=1615860;WS=1615842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,51:0.36:143
chr19	1619333	rs1140828	G	A	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=6.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.85;ReadPosRankSum=0.576;SOR=1.177;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,19:0.39:49
chr19	1619339	rs8140	T	C	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=4.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.41;ReadPosRankSum=2.230;SOR=1.182;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,16:0.33:48
chr19	1619749	.	A	AGGGTGGGGTG	36	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MMLQ=22;MQ=58.53;NF=1;NR=0;PP=36;QD=60.0;SC=CTGTCGGGGAAGGGTGGGGTG;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=1;WE=1619757;WS=1619739;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,1:0.14:7
chr19	1621907	.	TGAG	T	2007.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.056;ClippingRankSum=0.000;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.430;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=23;PP=1293;ReadPosRankSum=-0.303;SC=CTCCGGGGGCTGAGGAGAAGG;SOR=0.892;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=77;TCF=22;TCR=55;TR=32;WE=1621917;WS=1621897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,54:0.42:128
chr19	1624007	rs55677929	A	G	3204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=65;PP=1866;ReadPosRankSum=0.578;SC=TGTCTGTTAGAAGCAAAAGGG;SOR=0.673;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=290;TCF=150;TCR=140;TR=141;WE=1624015;WS=1623997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,160:0.48:336
chr19	1625811	rs11084904	T	C	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.79;ReadPosRankSum=1.024;SOR=0.608;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,34:0.47:72
chr19	1650134	rs1860661	A	G	1097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=1.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.71;ReadPosRankSum=0.401;SOR=0.871;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,58:0.46:126
chr19	1753589	rs112596908	C	T	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.81;ReadPosRankSum=2.618;SOR=0.631;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr19	1789556	rs12978609	C	T	4146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=76;PP=2548;SC=CTCTGGAGTCCTGGGCTGGCG;SOR=1.071;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=137;TCF=61;TCR=76;TR=137;WE=1789564;WS=1789546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr19	1792190	rs2286004	A	C	361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=12;PP=259;SC=TCCGAGGCTCAGCCCTCCCCA;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=1792198;WS=1792180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	1796166	rs8100856	C	T	2888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.055;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=69;PP=1741;ReadPosRankSum=-0.728;SC=ATGATCGTGACGGTGTCCTGG;SOR=0.493;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=251;TCF=114;TCR=137;TR=131;WE=1796174;WS=1796156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,142:0.52:272
chr19	1799763	.	CA	C	139.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.78;ReadPosRankSum=0.692;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,13:0.35:37
chr19	1802433	rs10418344	T	C	787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.799;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=21;PP=835;ReadPosRankSum=-1.108;SC=CACATCCATCTACCACGCTCC;SOR=0.430;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=101;TCF=64;TCR=37;TR=50;WE=1802441;WS=1802423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,41:0.46:90
chr19	1806210	rs7252063	A	C	2688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=55;PP=1700;SC=CTCCCTCTGCAAACCCTCCCC;SOR=1.821;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=25;TCR=55;TR=80;WE=1806218;WS=1806200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr19	1808275	rs61739534	G	A	1728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.693;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=38;PP=895;ReadPosRankSum=-0.622;SC=GGAACTGCTCGTACAGGTTCA;SOR=0.500;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=153;TCF=69;TCR=84;TR=73;WE=1808283;WS=1808265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,85:0.49:174
chr19	1809836	rs8107742	T	C	657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=24;PP=522;SC=ACCCAGGCACTGGGGAGGCCC;SOR=4.174;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=26;WE=1809844;WS=1809826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	1810605	rs716993	T	C	5298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=107;NR=79;PP=2775;SC=CCGCCCCCTCTGCCCAGGATC;SOR=0.806;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=186;TCF=107;TCR=79;TR=186;WE=1810613;WS=1810595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr19	1811547	rs12609187	A	G	5442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.457;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=109;NR=71;PP=2749;ReadPosRankSum=-0.793;SC=GCCTCCTCTCAGGTGCCCCTC;SOR=0.562;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=181;TCF=109;TCR=72;TR=180;WE=1811555;WS=1811537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,214:1.00:215
chr19	1817134	.	C	CCCAGATGGGG	1095.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=2;PP=1922;SC=GTGAGCCAGGCCCAGATGGGG;SOR=3.258;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=9;WE=1817142;WS=1817124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	1818459	rs1610106	A	G	1412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=36;NR=18;PP=1051;SC=TGGGAAGGGGAAGGACCCGGG;SOR=1.480;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=55;TCF=36;TCR=19;TR=54;WE=1818467;WS=1818449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr19	1818952	rs893538	C	G	1343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=19;PP=913;SC=CCGTGTGGCACAGCAGGGGCT;SOR=0.784;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=21;TCR=19;TR=40;WE=1818960;WS=1818942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr19	1819234	rs113598561	ACT	A	670.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=15;PP=699;SC=CTCTGCCTCAACTCCCCCTTT;SOR=4.174;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=16;WE=1819243;WS=1819224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	1821637	rs4807145	A	G	4746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=84;PP=2774;SC=CCGTTGGAGGACTGGCTGCCG;SOR=1.233;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=145;TCF=61;TCR=84;TR=144;WE=1821645;WS=1821627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr19	1828148	rs77108843	G	A	1685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.939;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=33;PP=820;ReadPosRankSum=0.188;SC=GGAACGGGGCGGCTGTGCCGC;SOR=0.531;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=148;TCF=74;TCR=74;TR=73;WE=1828156;WS=1828138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,87:0.53:165
chr19	1848243	rs12984809	A	G	1521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.79;SOR=1.217;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr19	1863587	.	CGGA	C	52.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.082;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.869;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=2;PP=48;ReadPosRankSum=1.313;SC=GTGCGGGAGGCGGAGGAGGAG;SOR=0.155;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=2;WE=1863597;WS=1863577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,3:0.20:15
chr19	1863628	rs112570276	A	C	91.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.76;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	1880950	rs4807160	T	C	3343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=52;PP=1944;SC=CCCCAGCTCTTGCCCAGCAGG;SOR=0.743;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=113;TCF=61;TCR=52;TR=113;WE=1880958;WS=1880940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr19	1908694	rs4806818	C	T	1380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=30;PP=897;SC=AACAGGGTCTCTCTATCTTGC;SOR=1.755;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=15;TCR=30;TR=45;WE=1908702;WS=1908684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr19	1914795	rs11666645	C	T	669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=2;PP=467;SC=GCACTGGAGCCGAGGGGAGGG;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=1914803;WS=1914785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	1914940	rs11084918	A	G	4257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=71;PP=2603;SC=TGCCCAGGGCAGCTCAGGGTT;SOR=0.705;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=148;TCF=77;TCR=71;TR=148;WE=1914948;WS=1914930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr19	1915059	rs75226495	G	A	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.965;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=25;PP=570;ReadPosRankSum=-0.229;SC=CTCCAGCAGCGTGGGCGGGAG;SOR=1.168;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=94;TCF=39;TCR=55;TR=40;WE=1915067;WS=1915049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,44:0.43:103
chr19	1915118	rs10853957	A	C	1028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=26;PP=845;SC=GCCGTTGGCAAACAGTGTCCT;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=9;TCR=26;TR=35;WE=1915126;WS=1915108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	1918023	rs10415845	T	C	739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=4;PP=590;SC=ATGGGGTCACTGGGCTGGGGA;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=1918031;WS=1918013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	1918134	rs45562539	G	A	1838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.545;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=34;PP=1018;ReadPosRankSum=-0.862;SC=AGTTTACTGCGCCACCCTCGG;SOR=0.611;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=167;TCF=99;TCR=68;TR=83;WE=1918142;WS=1918124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,92:0.50:184
chr19	1924050	.	T	C	650	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=40;MMLQ=24;MQ=58.7;NF=35;NR=16;PP=650;QD=13.4268865205;SC=TGAGTCCCCGTGCCCGGCCGC;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=52;TCF=35;TCR=17;TR=51;WE=1924058;WS=1924034;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,51:0.98:52
chr19	1924076	rs7255232	TC	CT	1146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.407;NF=31;NR=18;PP=1880;ReadPosRankSum=-2.412;SC=TCATTTTCTGTCTTCTGCCTC;SOR=0.804;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=63;TCR=36;TR=49;WE=1924085;WS=1924066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,30:0.41:73
chr19	1952841	rs2396366	T	C	2623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.439;HP=3;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=54;PP=2962;ReadPosRankSum=0.540;SC=GGCCGAACCCTGCTGTGCCCT;SOR=0.723;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=237;TCF=127;TCR=110;TR=117;WE=1952858;WS=1952831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,132:0.49:270
chr19	1952850	rs45437201	C	G	2760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.913;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=55;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.977;SC=CTGCTGTGCCCTTCACTCTGC;SOR=0.780;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=245;TCF=133;TCR=112;TR=124;WE=1952858;WS=1952831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,142:0.51:278
chr19	1953637	rs35628322	C	T	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=162;ReadPosRankSum=2.122;SC=CAGCTCTGCCCGTGGCCCTCA;SOR=0.105;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=13;TCF=5;TCR=8;TR=10;WE=1953645;WS=1953627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,12:0.80:15
chr19	1954126	rs34622118	C	CA	3664.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.230;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.724;NF=3;NR=52;PP=2954;ReadPosRankSum=-0.135;SC=GCACCTGATGCGTTAAACCCA;SOR=1.063;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=145;TCF=15;TCR=130;TR=55;WE=1954136;WS=1954116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,100:0.40:247
chr19	1954128	rs34797288	T	C	3673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.314;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=52;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.094;SC=ACCTGATGCGTTAAACCCATT;SOR=1.072;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=219;TCF=90;TCR=129;TR=78;WE=1954136;WS=1954116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,97:0.40:243
chr19	1970013	rs35089119	C	G	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=89;ReadPosRankSum=1.868;SC=AGGGCCGCCCCGAGTCACCGG;SOR=0.495;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=12;TCF=5;TCR=7;TR=9;WE=1970021;WS=1970003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr19	1986414	rs2286352	G	A	725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.959;HP=6;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=8;PP=476;ReadPosRankSum=-1.121;SC=TGGTGGGGGGGCCCCAGCAGC;SOR=0.483;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=79;TCF=61;TCR=18;TR=32;WE=1986422;WS=1986404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,35:0.41:85
chr19	1986455	rs7254820	A	G	1665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.593;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=22;PP=1013;ReadPosRankSum=0.958;SC=GGCTATCCCCACGGAGGGAGG;SOR=0.749;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=158;TCF=112;TCR=46;TR=76;WE=1986463;WS=1986445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,82:0.47:173
chr19	1987506	.	G	A	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=0.000;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.323;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=291;ReadPosRankSum=-0.985;SC=CACCTGATGCGGTCACTGGTC;SOR=1.174;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=23;WE=1987514;WS=1987496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,22:0.54:41
chr19	1997363	rs1610045	A	G	1833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.740;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=32;PP=966;ReadPosRankSum=-0.092;SC=CGAGGAAGGCAGCGGGTTCCA;SOR=0.547;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=175;TCF=109;TCR=66;TR=81;WE=1997371;WS=1997353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,93:0.45:205
chr19	2037846	rs1064543	A	C	74.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.507;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.75;ReadPosRankSum=-1.408;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr19	2037847	.	A	AC	126.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.545;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.75;ReadPosRankSum=1.408;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr19	2039727	rs34475638	C	T	2140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=45;PP=1336;ReadPosRankSum=0.891;SC=TGAGGTAGCTCGGACCAGGAC;SOR=0.714;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=165;TCF=85;TCR=80;TR=92;WE=2039735;WS=2039717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,97:0.54:179
chr19	2041032	rs2287003	T	C	1328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.715;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=22;PP=856;ReadPosRankSum=-3.548;SC=GTGCGGCTGGTACTCACCCCC;SOR=0.911;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=164;TCF=102;TCR=62;TR=63;WE=2041040;WS=2041022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,68:0.38:179
chr19	2041317	rs72981428	G	A	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=176;ReadPosRankSum=-0.552;SC=CCTAGACCACGCACGCCTGGG;SOR=0.606;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=13;WE=2041325;WS=2041307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,14:0.40:35
chr19	2042886	rs7253052	A	G	699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=3.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.29;ReadPosRankSum=0.489;SOR=0.346;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,34:0.55:62
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chr19	2078176	rs35452475	C	T	2234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=39;PP=1218;ReadPosRankSum=-0.925;SC=TGTTGATCTGCGCCTCGATCC;SOR=0.651;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=168;TCF=99;TCR=69;TR=97;WE=2078184;WS=2078166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,107:0.57:187
chr19	2078409	rs2074893	A	G	1498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.314;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=28;PP=1040;ReadPosRankSum=0.216;SC=CCCGGGGGCAACTGCACGGCC;SOR=0.894;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=168;TCF=87;TCR=81;TR=64;WE=2078417;WS=2078399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,72:0.39:185
chr19	2078488	rs2074894	T	C	2223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=48;PP=1126;ReadPosRankSum=0.967;SC=GCTGGGTGCCTGGCTCAAACT;SOR=0.690;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=222;TCF=120;TCR=102;TR=104;WE=2078496;WS=2078478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,112:0.47:239
chr19	2098063	rs45506200	A	T	5068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=528;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=117;NR=100;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.792;SC=ATCTTCCAGTACGAGACCATC;SOR=0.721;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=483;TCF=254;TCR=229;TR=217;WE=2098071;WS=2098053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:282,244:0.46:526
chr19	2099109	rs2240649	G	T	923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.40;ReadPosRankSum=0.483;SOR=0.846;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,26:0.43:60
chr19	2099109	.	GCT	TCG	965	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=11;NR=9;PP=965;QD=50.9233937431;SC=TGCACACCCTGCTGACATCCC;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=58;TCF=31;TCR=27;TR=20;WE=2099119;WS=2099099;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:38,20:0.34:58
chr19	2099111	rs12984606	T	G	923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=2.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.50;ReadPosRankSum=1.217;SOR=1.101;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,23:0.41:56
chr19	2099362	rs1051767	C	T	1343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.337;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=31;PP=759;ReadPosRankSum=0.170;SC=TGGGCCTGCCCCAGGGCAACG;SOR=0.546;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=127;TCF=58;TCR=69;TR=60;WE=2099370;WS=2099352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,67:0.47:143
chr19	2109019	rs2072306	T	C	907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.727;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=12;PP=685;ReadPosRankSum=-0.106;SC=CCGGCTCCAATAGGAAGGGAC;SOR=1.118;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=108;TCF=74;TCR=34;TR=44;WE=2109027;WS=2109009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,45:0.38:117
chr19	2109071	rs56150334	C	T	1778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.300;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=34;PP=1105;ReadPosRankSum=-0.177;SC=CCATCAGCCCCTCACTCTCCT;SOR=0.863;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=205;TCF=119;TCR=86;TR=87;WE=2109079;WS=2109061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,93:0.41:228
chr19	2109157	rs25673	T	C	2166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.349;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=47;PP=1260;ReadPosRankSum=-0.902;SC=TCGACTTTGATTGAGCTCATG;SOR=0.953;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=202;TCF=104;TCR=98;TR=91;WE=2109165;WS=2109147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,107:0.44:242
chr19	2109812	rs79162849	G	C	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=292;ReadPosRankSum=-1.398;SC=ACAGGTGTCTGCAAGGTAGAG;SOR=0.602;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=36;TCF=24;TCR=12;TR=21;WE=2109820;WS=2109802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,22:0.59:37
chr19	2109988	rs77265501	A	T	658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.270;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=12;PP=483;ReadPosRankSum=0.950;SC=TGCAGTTGAGAGGGGAGTCGG;SOR=0.620;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=73;TCF=38;TCR=35;TR=28;WE=2109996;WS=2109978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,30:0.35:86
chr19	2110019	rs2074958	T	C	703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.877;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=12;PP=531;ReadPosRankSum=0.809;SC=GGGCTCAGGGTTCCCCAGGCA;SOR=1.090;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=71;TCF=40;TCR=31;TR=32;WE=2110027;WS=2110009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,33:0.41:81
chr19	2110108	rs113684349	T	C	1934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.547;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=37;PP=1288;ReadPosRankSum=-2.155;SC=GAGTCGGCTCTTCAACGCCAA;SOR=0.628;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=166;TCF=96;TCR=70;TR=85;WE=2110116;WS=2110098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,91:0.50:181
chr19	2110746	rs20567	G	A	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=1.905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.66;ReadPosRankSum=2.074;SOR=0.463;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,37:0.47:78
chr19	2111382	rs17604954	G	A	566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=11;PP=214;ReadPosRankSum=1.108;SC=CTCCGTCTCAGCGAAGACTCC;SOR=0.588;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=44;TCF=20;TCR=24;TR=21;WE=2111390;WS=2111372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,27:0.48:56
chr19	2111397	rs75865123	T	C	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.744;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=9;PP=139;ReadPosRankSum=1.923;SC=GACTCCAGTATGGCCCAATAC;SOR=0.345;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=34;TCF=13;TCR=21;TR=16;WE=2111405;WS=2111387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,20:0.45:44
chr19	2111649	rs2074959	T	C	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=536;ReadPosRankSum=-0.290;SC=AACCCCGGCGTGGGGCGGGGG;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=10;WE=2111669;WS=2111639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr19	2111661	rs55759847	G	A	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=4.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.174;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=536;ReadPosRankSum=-0.112;SC=GGGCGGGGGCGCTGAAGTACC;SOR=2.437;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=13;WE=2111669;WS=2111639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr19	2114175	rs55698722	T	C	2086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=34;PP=1366;ReadPosRankSum=1.866;SC=TCTCTTTGTGTTTTTTCTCTT;SOR=0.683;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=217;TCF=137;TCR=80;TR=95;WE=2114183;WS=2114165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,105:0.44:240
chr19	2115439	rs2066764	C	G	2096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.287;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=47;PP=1365;ReadPosRankSum=0.771;SC=CAGCGGGCAGCCACTCAGCAC;SOR=0.707;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=197;TCF=99;TCR=98;TR=87;WE=2115447;WS=2115429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,98:0.44:223
chr19	2115493	rs2066775	A	G	2760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.927;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=57;PP=1559;ReadPosRankSum=-3.927;SC=AGCACCCCACAGCCCATGTGA;SOR=0.756;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=254;TCF=132;TCR=122;TR=119;WE=2115501;WS=2115483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,142:0.49:292
chr19	2116400	rs9676693	C	T	1837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=52;PP=1186;ReadPosRankSum=-0.825;SC=ACTGAGCTTTCACTAACAGGG;SOR=0.691;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=176;TCF=72;TCR=104;TR=87;WE=2116408;WS=2116390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,91:0.49:187
chr19	2116466	rs734727	G	C	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=444;ReadPosRankSum=-2.513;SC=AATCGCTAACGCTCTGGGAGG;SOR=0.490;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=46;TCF=8;TCR=38;TR=24;WE=2116474;WS=2116456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,25:0.50:50
chr19	2116649	rs2074960	A	G	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=4.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.444;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=430;ReadPosRankSum=-0.019;SC=GGTGCTTGGGACGCCGCTGCT;SOR=1.473;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=66;TCF=45;TCR=21;TR=24;WE=2116657;WS=2116639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,29:0.38:76
chr19	2116760	rs78648742	A	G	2308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=2.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.76;ReadPosRankSum=0.527;SOR=0.964;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,65:0.50:130
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chr19	2117075	rs75223679	G	A	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=216;ReadPosRankSum=-0.948;SC=TGGTGAGTCCGTGTGAGGGAT;SOR=0.368;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=12;WE=2117083;WS=2117065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
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chr19	2121316	rs11667435	C	T	1381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.377;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=36;PP=815;ReadPosRankSum=0.037;SC=GACACCTGGGCAAAAGTGTAC;SOR=0.858;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=121;TCF=51;TCR=70;TR=60;WE=2121324;WS=2121306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,68:0.50:137
chr19	2123328	rs76578931	A	G	1300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.661;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=24;PP=719;ReadPosRankSum=-1.505;SC=GGACACGAAAATGACAGCACT;SOR=0.578;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=123;TCF=74;TCR=49;TR=59;WE=2123336;WS=2123318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,65:0.50:130
chr19	2123516	rs2072304	A	G	737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=21;PP=448;ReadPosRankSum=-0.250;SC=CGTCAGCCCCACCCACCAATC;SOR=0.723;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=70;TCF=23;TCR=47;TR=32;WE=2123524;WS=2123506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,36:0.47:77
chr19	2123712	rs2072305	G	C	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.235;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=191;ReadPosRankSum=1.342;SC=CTCCCAAGCCGCAAGATGGCG;SOR=1.739;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=12;WE=2123720;WS=2123702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,13:0.37:35
chr19	2123928	rs75483641	C	T	3093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.428;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=76;PP=1777;ReadPosRankSum=-0.969;SC=TGGCCAGCGCCGACACCAACT;SOR=0.747;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=277;TCF=129;TCR=148;TR=143;WE=2123936;WS=2123918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,152:0.52:291
chr19	2127272	rs4807203	A	G	1595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.630;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=42;PP=969;ReadPosRankSum=-1.049;SC=CAGTGCCGGCAGCTCAGCTGG;SOR=0.812;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=134;TCF=50;TCR=84;TR=66;WE=2127280;WS=2127262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,75:0.50:150
chr19	2128987	.	GCC	ACA	308	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;FR=1.0000;HP=7;HapScore=4;MGOF=57;MMLQ=24;MQ=44.23;NF=5;NR=0;PP=308;QD=72.2935749724;SC=GCCCGCCCCCGCCGCTCCGAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=5;WE=2128997;WS=2128971;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,5:0.56:9
chr19	2129029	rs59192911	C	A	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=3.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQRankSum=3.427;QD=2.04;ReadPosRankSum=-1.841;SOR=0.241;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,9:0.22:40
chr19	2129067	rs142361260	A	G	1238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=2.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.02;MQRankSum=-2.704;QD=10.15;ReadPosRankSum=3.079;SOR=0.917;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,69:0.57:122
chr19	2130562	rs142453291	C	A	1426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=42;PP=961;ReadPosRankSum=0.542;SC=CTTCAGCCTGCGCGGGCTTTC;SOR=0.756;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=126;TCF=41;TCR=85;TR=62;WE=2130570;WS=2130552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,66:0.49:135
chr19	2208859	rs2301799	T	C	1297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.498;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=22;PP=796;ReadPosRankSum=0.988;SC=GTTGCTGTTGTTACCTGGGTG;SOR=0.539;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=103;TCF=63;TCR=40;TR=54;WE=2208867;WS=2208849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,61:0.53:116
chr19	2214057	rs2074552	C	T	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=100;ReadPosRankSum=0.763;SC=GTCCTCTGTGCGGGTGGGAGG;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=7;WE=2214065;WS=2214047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr19	2244903	rs6510652	T	G	898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=24;PP=659;SC=CCTGGGCGCTTGAGTACGGTT;SOR=3.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=28;WE=2244911;WS=2244893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	2246652	rs2074861	G	A	969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=8;PP=606;SC=GGCCTCCCCCGGGGTCCCGCT;SOR=1.885;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=31;WE=2246660;WS=2246642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	2249477	rs10407022	G	T	5167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=90;PP=2965;SC=CCTCCAGGCAGCCCACAAGAG;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=183;TCF=93;TCR=90;TR=183;WE=2249485;WS=2249467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr19	2250528	rs8112524	G	A	525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=9;NR=8;PP=318;SC=GGGGGGCATGGATTTGTTGCA;SOR=0.793;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=9;TCR=8;TR=17;WE=2250536;WS=2250518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	2251512	rs7252789	T	A	680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=7;PP=321;SC=TCTGCCCAGGTGGCCCCGGCG;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=12;TCR=7;TR=19;WE=2251520;WS=2251502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	2251817	rs10417628	T	C	7696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=151;PP=2965;SC=AAGATGCAGGTCCGTGGGGCC;SOR=1.309;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=250;TCF=99;TCR=151;TR=250;WE=2251825;WS=2251807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,273:1.00:273
chr19	2253590	rs3746158	C	T	3006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=57;NR=49;PP=1703;SC=ACCCCAGCCTCGCCCCACCTC;SOR=0.728;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=57;TCR=49;TR=106;WE=2253598;WS=2253580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr19	2255336	rs886363	A	G	975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=20;PP=552;SC=AGCAGGTCCCAGGCCAGGCTG;SOR=1.885;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=30;WE=2255344;WS=2255326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	2271282	rs2074457	T	C	514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=2;PP=393;SC=GCGGGGTCTTTTGGCCGAGGC;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=2271290;WS=2271272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	2271323	rs2523175	A	G	1878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=17;PP=1239;SC=GGCCGCCCGGACGCCCTGGAG;SOR=1.716;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=46;TCR=17;TR=63;WE=2271331;WS=2271313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr19	2271577	rs28384674	CT	C	3889.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=57;PP=2623;SC=GCCACAGGTACTTTCTTGTGC;SOR=0.995;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=68;TCF=8;TCR=60;TR=65;WE=2271585;WS=2271567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr19	2271741	rs2074458	G	A	5497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=78;PP=2965;SC=GTCCTGTGGGGTGAGTCAGGG;SOR=0.990;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=187;TCF=109;TCR=78;TR=186;WE=2271749;WS=2271731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr19	2275817	rs145140408	G	A	1407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.063;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=31;PP=680;ReadPosRankSum=0.927;SC=CCAGCAGCCCGCGGCGCACCC;SOR=0.348;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=93;TCF=38;TCR=55;TR=57;WE=2275825;WS=2275807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,66:0.61:109
chr19	2290870	rs8111892	G	C	2597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.457;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=58;PP=1568;ReadPosRankSum=-0.129;SC=GCAGGGCCCCGGCCAGGTGCA;SOR=0.634;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=230;TCF=114;TCR=116;TR=114;WE=2290878;WS=2290860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,126:0.50:254
chr19	2321854	rs886881	C	G	1383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.020;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=33;PP=803;ReadPosRankSum=-1.463;SC=GACTGAGGGACCTCCAGGAAG;SOR=0.872;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=132;TCF=61;TCR=71;TR=59;WE=2321862;WS=2321844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,70:0.45:156
chr19	2321939	rs77028998	G	A	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=277;ReadPosRankSum=0.685;SC=CCACGAGCACGCAGGGACCTC;SOR=0.665;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=18;WE=2321947;WS=2321929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr19	2324060	rs2302057	G	A	197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=9;NR=6;PP=317;SC=CCCTCGTCCCGCTGCCCCCCT;SOR=1.085;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=9;TCR=6;TR=15;WE=2324068;WS=2324050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	2324113	rs140121434	A	AC	2619.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=21;PP=1887;SC=CTCGGCCGCCACCCCACTCAC;SOR=1.416;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=56;TCF=29;TCR=27;TR=46;WE=2324121;WS=2324103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr19	2324384	rs10404826	A	G	901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=26;PP=780;SC=GCAGCAGACCACGTCTGCGGG;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=28;WE=2324392;WS=2324374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	2328245	rs113860855	G	A	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=61;ReadPosRankSum=-0.040;SC=CTCCAGCCCGGGTGACAGAGC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=4;WE=2328253;WS=2328235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr19	2328281	rs11666344	G	A	843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.13;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	2337377	rs3752204	C	G	1319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=13;PP=831;SC=GGTGGGAGAACGGGCAGCTGG;SOR=1.378;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=29;TCR=13;TR=42;WE=2337385;WS=2337367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr19	2337408	rs55710409	C	T	1169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.741;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=15;PP=765;ReadPosRankSum=0.236;SC=TGACTCACATCACGTGAGACA;SOR=0.941;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=60;TCR=26;TR=49;WE=2337416;WS=2337398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,51:0.54:95
chr19	2339773	rs60107832	G	A	1991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.373;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=26;PP=1216;ReadPosRankSum=-0.046;SC=CCCGAGCCCCGTGTCGGCCAG;SOR=0.965;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=189;TCF=125;TCR=64;TR=85;WE=2339781;WS=2339763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,93:0.46:201
chr19	2339949	rs3746285	T	C	2510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FS=5.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.73;ReadPosRankSum=2.294;SOR=0.992;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:140,118:0.46:258
chr19	2339958	rs1609752	T	C	8168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=109;PP=2965;SC=ATTTCTACGATCTCCTCGGTG;SOR=1.002;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=203;TCF=93;TCR=110;TR=202;WE=2339966;WS=2339953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr19	2340050	rs1609753	C	T	1971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.819;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=34;PP=1202;ReadPosRankSum=-0.124;SC=GCCTGGCCCCCGGCCTCACGG;SOR=0.699;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=139;TCF=73;TCR=66;TR=77;WE=2340058;WS=2340040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,87:0.55:158
chr19	2340154	rs5826760	G	GC	2851.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=41;PP=1921;SC=TGCGGCGGCTGCCTTCGGCAA;SOR=1.310;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=44;TCF=2;TCR=42;TR=42;WE=2340162;WS=2340144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr19	2341047	rs55818311	C	T	2361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.654;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=47;PP=2962;ReadPosRankSum=1.367;SC=CGGCGGGCAGCGGAGTCCTCG;SOR=0.822;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=199;TCF=107;TCR=92;TR=104;WE=2341068;WS=2341037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,113:0.53:215
chr19	2341059	rs11880345	G	A	1721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FS=1.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.44;ReadPosRankSum=1.290;SOR=0.644;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:114,90:0.44:204
chr19	2341059	.	GT	AC	2378	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=41;NR=38;PP=2378;QD=30.7780743653;SC=GAGTCCTCGGGTGCACCAGGG;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=190;TCF=100;TCR=90;TR=79;WE=2341068;WS=2341037;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:111,79:0.42:190
chr19	2341060	rs7245824	T	C	6968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=88;PP=2962;SC=AGTCCTCGGGTGCACCAGGGC;SOR=0.703;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=189;TCF=98;TCR=91;TR=185;WE=2341068;WS=2341037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr19	2341192	rs55856585	TG	T	4075.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.497;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.738;NF=12;NR=51;PP=2041;ReadPosRankSum=0.075;SC=GCGTTTCACCTGGGGTTTGTC;SOR=0.713;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=131;TCF=26;TCR=105;TR=63;WE=2341200;WS=2341182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,108:0.50:215
chr19	2341209	rs7246088	T	C	4223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=52;PP=1626;ReadPosRankSum=-1.253;SC=TGTCCGGGTGTCATGGGAACC;SOR=0.728;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=211;TCF=108;TCR=103;TR=106;WE=2341217;WS=2341199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,115:0.50:228
chr19	2341488	rs76434007	T	A	1828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.525;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=43;PP=1118;ReadPosRankSum=-1.120;SC=ACCTCCCACGTGGCCTGGACT;SOR=0.821;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=174;TCF=89;TCR=85;TR=84;WE=2341496;WS=2341478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,91:0.49:187
chr19	2341674	rs3210	G	C	2010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.216;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=39;PP=1123;ReadPosRankSum=-0.095;SC=GTGTGTATTGGAGCCACGGCA;SOR=0.753;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=151;TCF=78;TCR=73;TR=83;WE=2341682;WS=2341664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,96:0.57:167
chr19	2343142	rs3746289	G	A	487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=310;ReadPosRankSum=-1.467;SC=TGTGTGGCTCGTGGGAGGCGG;SOR=0.693;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=17;WE=2343150;WS=2343132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,20:0.69:29
chr19	2344022	rs1128392	G	A	888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=19;PP=931;ReadPosRankSum=0.022;SC=TGTTCATCACGCCCTTCCTGA;SOR=0.619;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=31;TCR=40;TR=34;WE=2344042;WS=2344012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,46:0.53:87
chr19	2344034	rs17852546	C	A	717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=19;PP=1022;ReadPosRankSum=-0.513;SC=CCTTCCTGACCAAGGTAGGCG;SOR=0.682;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=29;TCR=38;TR=34;WE=2344042;WS=2344012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,38:0.47:81
chr19	2344484	rs55704748	A	G	2431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.554;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=60;PP=1513;ReadPosRankSum=-0.814;SC=CGGAGCGGATAGGGCTCGAGG;SOR=0.936;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=222;TCF=99;TCR=123;TR=103;WE=2344492;WS=2344474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,116:0.47:249
chr19	2353148	rs10402284	T	C	2158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.252;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=60;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.512;SC=CCCAGCTGAATCCGAGGGCCG;SOR=0.488;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=193;TCF=74;TCR=119;TR=102;WE=2353158;WS=2353138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,106:0.51:206
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chr19	2363785	.	TGA	T	244	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=44;MMLQ=22;MQ=60.0;NF=6;NR=0;PP=244;QD=44.5;SC=ACTCTGTGTGTGAGTGTGTGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=2363794;WS=2363775;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
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chr19	2382678	rs148093377	TACAC	T	841.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=921;ReadPosRankSum=-0.581;SC=CGTGCACACATACACACATGC;SOR=0.924;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=0;TCR=47;TR=23;WE=2382689;WS=2382668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,23:0.44:52
chr19	2389872	rs891174	G	C	3062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.302;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=67;PP=2053;ReadPosRankSum=0.896;SC=CGAGCGGCCAGCATTGGCGTG;SOR=0.546;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=255;TCF=133;TCR=122;TR=131;WE=2389880;WS=2389862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,141:0.52:273
chr19	2389954	rs891175	G	A	3077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.60;ReadPosRankSum=-2.055;SOR=0.686;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,81:0.52:157
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chr19	2398849	rs10407225	A	G	3161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.695;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=57;PP=1852;ReadPosRankSum=-1.074;SC=GTTGCTCGGTACTGAATTATA;SOR=0.551;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=236;TCF=133;TCR=103;TR=127;WE=2398857;WS=2398831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,144:0.55:264
chr19	2405641	rs4807260	C	T	1667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.634;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=42;PP=950;ReadPosRankSum=0.743;SC=CTTAGAGCCCCTGGAAGTAAT;SOR=0.521;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=110;TCF=32;TCR=78;TR=63;WE=2405649;WS=2405631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,73:0.60:121
chr19	2408486	rs62120712	T	C	5826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=343;ExcessHet=3.0103;FS=0.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.99;ReadPosRankSum=-1.145;SOR=0.724;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:186,157:0.46:343
chr19	2408495	rs62120713	T	G	5923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=349;ExcessHet=3.0103;FS=0.390;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.97;ReadPosRankSum=-0.793;SOR=0.737;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:187,162:0.46:349
chr19	2408530	rs62120714	G	A	3945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=368;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.205;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=81;PP=2528;ReadPosRankSum=0.124;SC=CCTTTCGGCCGGCACATCCAG;SOR=0.826;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=333;TCF=176;TCR=157;TR=174;WE=2408538;WS=2408520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:179,189:0.51:368
chr19	2408746	rs79792172	G	A	487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=257;ReadPosRankSum=-1.100;SC=AGGCCGAGGCGGGTGGATCAC;SOR=0.551;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=40;TCF=8;TCR=32;TR=17;WE=2408754;WS=2408736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,22:0.47:47
chr19	2410166	rs3848634	T	C	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.94;ReadPosRankSum=0.361;SOR=0.970;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,8:0.21:39
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chr19	2410483	rs3848636	C	T	1114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=31;PP=685;ReadPosRankSum=0.909;SC=TCTGGATGCCCGCTGTGAGCC;SOR=0.669;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=111;TCF=41;TCR=70;TR=50;WE=2410491;WS=2410473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,54:0.46:117
chr19	2413961	rs10153475	G	C	2474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.959;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=49;PP=1702;ReadPosRankSum=-0.385;SC=CCACCAAATCGATGCAGGCCC;SOR=0.621;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=233;TCF=132;TCR=101;TR=109;WE=2413969;WS=2413951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,118:0.46:257
chr19	2415801	rs61732208	G	A	903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.802;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=22;PP=569;ReadPosRankSum=-1.385;SC=CTGTGGTGGGGGACCGCTGGC;SOR=0.857;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=80;TCF=36;TCR=44;TR=37;WE=2415809;WS=2415791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,42:0.46:92
chr19	2418031	rs11084939	C	T	1454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=30;PP=1008;ReadPosRankSum=-0.034;SC=AGAAGGCGTCCGTGGGCATCA;SOR=0.692;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=203;TCF=124;TCR=79;TR=75;WE=2418039;WS=2418021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,76:0.35:220
chr19	2422177	rs735911	G	A	1847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.555;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=48;PP=1134;ReadPosRankSum=-0.097;SC=TCTGCCGTGAGCACCACTGCT;SOR=0.766;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=157;TCF=73;TCR=84;TR=82;WE=2422185;WS=2422167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,89:0.50:179
chr19	2424406	rs7259330	C	G	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.045;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=395;ReadPosRankSum=-1.444;SC=CCTCCCACCCCCCATCTCCCC;SOR=0.330;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=41;TCF=8;TCR=33;TR=21;WE=2424414;WS=2424396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr19	2425196	rs7247162	G	A	2394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-2.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.877;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=63;PP=1325;ReadPosRankSum=-0.155;SC=CTGCCTGCCCGAGCCCGCGCC;SOR=0.527;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=234;TCF=80;TCR=154;TR=101;WE=2425204;WS=2425186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,117:0.44:268
chr19	2426186	rs149380178	T	TG	546.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=237;ReadPosRankSum=2.051;SC=AGGACGGGTGTGGGGGGGCTG;SOR=0.896;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=12;WE=2426194;WS=2426176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,17:0.40:43
chr19	2426198	.	G	GGGTCATGGGCATGCATTTTGGTACCACCCTTTGTTCCAA	560.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.76;ReadPosRankSum=1.808;SOR=0.724;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,15:0.39:38
chr19	2426208	.	G	C	220	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=4;NR=10;PP=220;QD=18.1979437534;SC=GGGTCATGGGGATGCATTTTG;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=14;WE=2426216;WS=2426198;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:13,14:0.52:27
chr19	2426828	rs6945	G	C	1191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.734;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=18;PP=708;ReadPosRankSum=1.599;SC=ACAGTCCCGTGTGTCCCAGCA;SOR=0.556;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=105;TCF=71;TCR=34;TR=52;WE=2426836;WS=2426818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,57:0.50:114
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chr19	2432555	rs736705	A	G	4817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=74;NR=92;PP=2776;SC=ACCCTCAGCCACCAGGACTGT;SOR=1.071;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=167;TCF=74;TCR=93;TR=166;WE=2432563;WS=2432545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr19	2433751	rs147405167	C	T	1162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.706;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-2.143;NF=39;NR=16;PP=752;ReadPosRankSum=0.037;SC=CCGGCAGCCCCGTCACCCTGA;SOR=0.779;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=111;TCF=78;TCR=33;TR=55;WE=2433759;WS=2433741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,56:0.47:120
chr19	2433890	rs11084940	A	G	11624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=430;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=193;NR=193;PP=2965;SC=TGCTGACGCTACCCGAGGCCG;SOR=0.731;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=386;TCF=193;TCR=193;TR=386;WE=2433898;WS=2433880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,430:1.00:430
chr19	2434551	rs2304241	A	G	1464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=31;PP=859;SC=AGGGCAGCCCATGGGTCACAA;SOR=1.938;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=16;TCR=31;TR=47;WE=2434559;WS=2434541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr19	2444363	rs11668494	A	G	5552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=119;NR=83;PP=2965;SC=CCGTGGTGCCAGGATCAGGGT;SOR=0.984;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=205;TCF=121;TCR=84;TR=202;WE=2444371;WS=2444353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr19	2444565	rs4806848	C	T	1769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=41;PP=1071;ReadPosRankSum=-0.011;SC=CAGGGTGAAGCGAGAGGGACC;SOR=0.681;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=179;TCF=88;TCR=91;TR=81;WE=2444573;WS=2444555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,90:0.45:200
chr19	2444608	rs2288942	G	A	1545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=38;PP=927;ReadPosRankSum=-0.876;SC=CAGGGGGCCCGGCCACTGGCC;SOR=0.678;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=41;TCR=63;TR=63;WE=2444616;WS=2444598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,71:0.60:119
chr19	2456877	rs3764582	C	T	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.782;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=149;ReadPosRankSum=-0.536;SC=GCCATGGTGGCGGCGGCTCGC;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=8;WE=2456885;WS=2456867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr19	2477665	rs3214277	A	AC	316.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.882;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=1.071;NF=1;NR=10;PP=313;ReadPosRankSum=-1.450;SC=AAATATTTGAACCCCCTCCCC;SOR=1.585;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=11;WE=2477673;WS=2477655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr19	2506056	.	G	GA	45	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.58;FR=0.5000;HP=22;HapScore=2;MGOF=99;MMLQ=16;MQ=56.43;NF=3;NR=1;PP=45;QD=12.0;SC=TCTCAAAAAAGAAAAAAAAAA;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=4;WE=2506064;WS=2506046;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:15,4:0.21:19
chr19	2514966	rs67860726	CAG	C	471.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.290;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.101;NF=4;NR=7;PP=268;ReadPosRankSum=-0.461;SC=GAGACAGAGACAGAGAGAGAG;SOR=0.111;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=35;TCF=18;TCR=17;TR=11;WE=2514975;WS=2514956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
chr19	2520716	rs1133692	T	C	2296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=40;PP=1381;SC=GCCCCGTTGTTCAGAGAGCTG;SOR=0.979;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=77;TCF=37;TCR=40;TR=77;WE=2520724;WS=2520706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr19	2520791	rs3764585	C	A	696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=7;NR=16;PP=442;SC=CAGGGGCGCCCGGCCTTGGCT;SOR=1.893;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=23;WE=2520799;WS=2520781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	2538074	rs71337145	C	CAAACA	397.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.900;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=155;ReadPosRankSum=1.754;SC=GACTCTCTCTCAAACAAAACA;SOR=0.275;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=4;WE=2538082;WS=2538064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr19	2557312	rs76966814	GAC	G	1183.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.085;HP=2;HapScore=2;MGOF=67;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=11;PP=518;ReadPosRankSum=2.228;SC=TACACGCACAGACACACATGT;SOR=0.526;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=58;TCF=37;TCR=21;TR=28;WE=2557321;WS=2557302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,34:0.52:65
chr19	2557343	.	GCACACACACAGA	G	1957.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.712;ClippingRankSum=0.000;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.483;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=2.012;NF=6;NR=19;PP=2976;ReadPosRankSum=0.732;SC=ACACACATGTGCACACACACA;SOR=0.549;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=73;TCF=25;TCR=48;TR=25;WE=2557362;WS=2557333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,54:0.43:125
chr19	2557392	rs10421267	C	G	2522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.959;NF=63;NR=41;PP=1466;ReadPosRankSum=0.331;SC=CACGCAGGAGCGAGCGCCTCC;SOR=0.729;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=190;TCF=111;TCR=79;TR=104;WE=2557400;WS=2557382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,116:0.56:207
chr19	2575984	.	C	CAG	626	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=32;MMLQ=29;MQ=57.07;NF=16;NR=0;PP=626;QD=40.625;SC=CAGGCAGACACACACATGCTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=16;WE=2575992;WS=2575983;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr19	2576075	.	GCAGACACACACA	G	2973	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=27;MQ=59.24;NF=9;NR=35;PP=2973;QD=20;SC=ACGCAGACATGCAGACACACA;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=111;TCF=26;TCR=85;TR=44;WE=2576094;WS=2576065;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:67,44:0.40:111
chr19	2576272	rs1029753	T	C	1288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=40;PP=946;SC=CCCAGGGGACTGCAGCAAAAA;SOR=3.126;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=7;TCR=40;TR=47;WE=2576280;WS=2576262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr19	2643436	rs7247161	C	T	1079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=2.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.39;MQRankSum=1.015;QD=7.66;ReadPosRankSum=-0.039;SOR=0.764;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,62:0.44:141
chr19	2717880	rs7343093	A	G	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=16;PP=313;ReadPosRankSum=-0.418;SC=GAGCCTGTGCAGAGAGGAGGG;SOR=0.629;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=59;TCF=20;TCR=39;TR=24;WE=2717888;WS=2717870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,26:0.42:62
chr19	2732986	rs759073	T	C	1959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=32;PP=1300;ReadPosRankSum=-0.039;SC=TCATGGCGCTTACGGTGACCG;SOR=0.714;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=139;TCF=79;TCR=60;TR=73;WE=2732994;WS=2732976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,81:0.51:159
chr19	2733250	rs61736898	C	T	1606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.576;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=37;PP=982;ReadPosRankSum=-0.636;SC=CGTGGGGCTCCACGTACAGCG;SOR=0.723;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=150;TCF=77;TCR=73;TR=73;WE=2733258;WS=2733240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,78:0.48:163
chr19	2823257	rs6510702	CT	AC	1010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=650;ReadPosRankSum=-0.690;SC=TGAGGTACTCCTGCTGCTCCC;SOR=0.857;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=44;TCF=16;TCR=28;TR=14;WE=2823277;WS=2823247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,29:0.50:58
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chr19	2841695	rs10412693	G	T	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.297;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.52;ReadPosRankSum=-1.861;SOR=0.074;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr19	2841718	rs11667713	C	T	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.63;ReadPosRankSum=1.960;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr19	2851678	rs11880407	A	T	1782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.388;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=43;PP=989;ReadPosRankSum=0.439;SC=AGAACATAGTATTTCAGGAGA;SOR=0.868;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=46;TCR=76;TR=69;WE=2851686;WS=2851668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,80:0.56:144
chr19	2853566	rs10412087	A	G	3259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.174;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=76;PP=1913;ReadPosRankSum=-0.987;SC=ATATGAGAAGACATACCGCAG;SOR=0.886;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=261;TCF=113;TCR=148;TR=134;WE=2853574;WS=2853556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,152:0.51:298
chr19	2867583	rs8104536	C	A	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=74;ReadPosRankSum=-0.210;SC=CCTCCCCTGCCCCAGTCTTCA;SOR=1.609;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=6;WE=2867591;WS=2867573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr19	2873439	rs9304900	C	T	814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=5;PP=521;SC=AGTTCAGTTCCGCAGTGCTGT;SOR=2.147;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=26;WE=2873447;WS=2873429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	2877365	rs10421121	C	T	3603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=65;PP=2077;ReadPosRankSum=-0.279;SC=TCGTCATCTGCGCAAGAATTG;SOR=0.674;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=272;TCF=153;TCR=119;TR=149;WE=2877373;WS=2877355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,172:0.56:308
chr19	2878397	rs11084965	A	G	743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.325;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=22;PP=490;ReadPosRankSum=-0.098;SC=GGCCGGGCGCAGTGGCTCACG;SOR=0.469;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=9;TCR=41;TR=27;WE=2878405;WS=2878387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,31:0.53:58
chr19	2896818	rs8100809	C	T	5757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=109;NR=93;PP=2965;SC=CAAATGTCCTCGAAAAGATGA;SOR=0.780;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=203;TCF=109;TCR=94;TR=202;WE=2896826;WS=2896808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr19	2896948	rs8104326	T	C	8117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.36;SOR=0.704;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr19	2896953	rs8101379	A	G	8074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.65;SOR=0.704;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr19	2900865	rs10420989	G	A	174.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=50;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=1;PP=141;SC=GGGGCTTAGAGATTGTCCAAT;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=2900873;WS=2900862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	2900915	rs7255359	GA	AT	817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=4;PP=515;SC=CCGAGGGCGGGACGTTTCGTC;SOR=2.419;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=15;WE=2900938;WS=2900905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	2900930	rs12981209	C	T	1140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=27;NR=10;PP=734;SC=TTCGTCCTCCCTGCCGCGCGT;SOR=1.845;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=27;TCR=10;TR=37;WE=2900938;WS=2900905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	2901114	rs11279103	CGCCGAAGTCT	C	2817.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=32;PP=2967;SC=AACCAGAGTCCGCCGAAGTCT;SOR=1.214;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=34;WE=2901131;WS=2901104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr19	2915738	rs2043336	T	A	4085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=84;PP=2442;SC=GGGAAAGGACTAAGACAGACA;SOR=1.398;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=132;TCF=48;TCR=84;TR=132;WE=2915746;WS=2915728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr19	2916048	rs2043335	T	A	3749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=43;PP=2477;SC=CTTATTCCTTTTGAGATTTGT;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=85;TCR=43;TR=128;WE=2916056;WS=2916038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr19	2916358	rs34115054	C	CA	185.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.30;ReadPosRankSum=-0.100;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,11:0.85:13
chr19	2917186	rs2288959	T	C	6288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=125;NR=94;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.704;SC=ACGGAAGAACTGACACTGAGG;SOR=0.283;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=220;TCF=126;TCR=94;TR=219;WE=2917194;WS=2917176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,236:1.00:237
chr19	2917287	rs2288958	C	A	6750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=114;NR=111;PP=2965;SC=GCAGAGAAAACCTACAAATGC;SOR=0.768;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=226;TCF=114;TCR=112;TR=225;WE=2917295;WS=2917277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr19	2917542	rs138288250	A	G	2099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=44;PP=1370;ReadPosRankSum=-0.363;SC=GAGAAGCCCTATGAATGCAAG;SOR=0.695;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=192;TCF=106;TCR=86;TR=98;WE=2917550;WS=2917532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,99:0.50:200
chr19	2917612	rs10410539	T	C	6669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=126;NR=103;PP=2965;SC=GGATCCACACTGGGGACAAAC;SOR=0.792;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=230;TCF=127;TCR=103;TR=229;WE=2917620;WS=2917602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr19	2933480	rs3786948	C	T	548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=1;PP=407;SC=CCACTGTATTCGTAGATTCAC;SOR=3.500;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=2933488;WS=2933479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
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chr19	2936443	rs7251272	A	G	348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=0;PP=231;SC=CCCTGTGCCCAGCCGATACTT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=2936451;WS=2936433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	2936623	rs4807371	C	T	3310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=55;PP=1986;SC=ACTTTACAATCTCTTCATCAT;SOR=0.795;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=55;TCR=55;TR=110;WE=2936631;WS=2936613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr19	2939268	.	A	G	164	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=24;MQ=59.36;NF=13;NR=1;PP=164;QD=14.1979437534;SC=AGGGAATGACACCACCCTTAC;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=47;TCF=42;TCR=5;TR=14;WE=2939276;WS=2939258;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:33,14:0.30:47
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chr19	2978135	rs445657	G	C	1306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=20;PP=925;ReadPosRankSum=-0.471;SC=CGGGTGCCTTGCTTCCCTGGC;SOR=0.761;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=66;TCR=36;TR=56;WE=2978143;WS=2978125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,56:0.52:107
chr19	2980269	rs4807380	G	A	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.703;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=67;ReadPosRankSum=-0.257;SC=GTGGTCTAGAGGCTGCTGGCC;SOR=0.105;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=6;WE=2980277;WS=2980259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr19	2981487	rs10407929	G	C	853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.487;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=14;PP=479;ReadPosRankSum=1.540;SC=ACTCTGGGGAGGGAGTCCTGA;SOR=1.067;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=113;TCF=71;TCR=42;TR=43;WE=2981495;WS=2981477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,47:0.38:123
chr19	2982047	rs10445609	G	C	525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=2;PP=450;ReadPosRankSum=0.546;SC=AATTTAAGGTGGGGGAGTAGG;SOR=0.465;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=49;TCF=44;TCR=5;TR=22;WE=2982055;WS=2982037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,21:0.44:48
chr19	2982293	rs11673024	T	C	740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.139;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=23;PP=411;ReadPosRankSum=-1.440;SC=CCCAGCACTTTGGGAGGCCGA;SOR=0.446;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=76;TCF=19;TCR=57;TR=32;WE=2982301;WS=2982283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,36:0.44:81
chr19	2989380	rs3746075	C	G	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.408;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=309;ReadPosRankSum=0.163;SC=TTGAGTCTGGCAGAGCCCAGA;SOR=0.395;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=44;TCF=8;TCR=36;TR=19;WE=2989388;WS=2989370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,20:0.43:47
chr19	2989697	rs6510730	T	C	1898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.066;NF=45;NR=34;PP=808;ReadPosRankSum=-0.163;SC=AGGCCCTGGATGCCAACCTGG;SOR=0.718;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=177;TCF=98;TCR=79;TR=79;WE=2989705;WS=2989687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,95:0.47:201
chr19	2989801	rs143049112	G	GA	1619.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.056;NF=2;NR=19;PP=1325;ReadPosRankSum=0.191;SC=TGGGGGGTGGGAAGGGGAAGC;SOR=0.684;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=53;TCF=3;TCR=50;TR=21;WE=2989818;WS=2989791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,44:0.48:91
chr19	2989810	rs504199	G	T	1605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=18;PP=1319;ReadPosRankSum=0.716;SC=GGAAGGGGAAGCATCCTGTGC;SOR=0.637;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=72;TCF=27;TCR=45;TR=28;WE=2989818;WS=2989791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,40:0.46:87
chr19	2991814	rs428113	T	C	7277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=129;NR=126;PP=2965;SC=CTTGACCTGATTGCCTCCCGA;SOR=0.723;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=255;TCF=129;TCR=126;TR=255;WE=2991822;WS=2991804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,268:1.00:268
chr19	2993946	rs35271493	G	A	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.174;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=8;PP=240;ReadPosRankSum=1.569;SC=AAAAAGGTGGGTGGGGAGGAT;SOR=0.861;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=30;TCR=21;TR=19;WE=2993954;WS=2993936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,18:0.40:45
chr19	2994107	rs34438430	C	CT	277.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.316;NF=0;NR=7;PP=210;ReadPosRankSum=-0.024;SC=CTGCGGTGGGCTGGGGGCAGG;SOR=1.002;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=7;WE=2994115;WS=2994097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr19	2994814	rs439808	T	C	1975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=41;NR=27;PP=1004;SC=TTTGAAGAGATGATGCTTCAT;SOR=0.887;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=41;TCR=27;TR=68;WE=2994822;WS=2994804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr19	2994837	rs401886	A	G	739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.655;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=16;PP=510;ReadPosRankSum=-0.803;SC=TTGAGCTGACAGGTGGAGACC;SOR=0.954;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=87;TCF=49;TCR=38;TR=39;WE=2994845;WS=2994827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,41:0.41:99
chr19	2997790	rs14089	T	C	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.752;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=120;ReadPosRankSum=1.438;SC=ATGTCTGTCCTGGCTGCTGAT;SOR=1.179;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=10;WE=2997798;WS=2997780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr19	3009788	rs216284	T	C	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5026;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=229;ReadPosRankSum=0.000;SC=GCCTTTCATTTAGAGTTTCCA;SOR=1.781;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=11;WE=3009796;WS=3009778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr19	3013616	rs216271	G	A	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=127;ReadPosRankSum=-0.620;SC=GTCTGCTTCGGGGCCCCCGGG;SOR=0.582;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=10;WE=3013624;WS=3013606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr19	3015545	rs12984941	C	T	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.214;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=170;ReadPosRankSum=0.713;SC=TGGGAGGCTCCGGAGTGAGAG;SOR=0.105;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=10;WE=3015553;WS=3015541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr19	3015937	rs67167576	CTGTTT	C	985.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=0.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQRankSum=1.365;QD=12.17;ReadPosRankSum=-0.572;SOR=0.902;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,29:0.36:81
chr19	3019660	rs12972232	G	A	897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.087;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=15;PP=540;ReadPosRankSum=0.167;SC=GGGAGTGGGCGTCTCCCCATG;SOR=0.440;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=72;TCF=49;TCR=23;TR=39;WE=3019668;WS=3019650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,42:0.55:76
chr19	3019986	rs59931576	T	G	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=328;ReadPosRankSum=-0.560;SC=GCAGGTAGAATAGTTACAAAT;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=15;WE=3019994;WS=3019976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
chr19	3028572	rs117117014	C	T	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.384;HP=2;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=6;PP=171;ReadPosRankSum=0.078;SC=TGCACCTGCGCTTCCACCTGG;SOR=0.387;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=21;TCF=13;TCR=8;TR=11;WE=3028580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
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chr19	3053802	rs425485	T	C	3580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=74;NR=46;PP=2022;SC=CCAACCTCCCTGTCCCGGCCC;SOR=1.016;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=74;TCR=46;TR=120;WE=3053810;WS=3053792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr19	3054089	rs2302301	C	T	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.432;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=6;PP=125;ReadPosRankSum=2.300;SC=ACCTGTCCCCCGCCCACCCGC;SOR=1.179;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=9;TCR=9;TR=12;WE=3054097;WS=3054079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr19	3055855	rs117344826	G	C	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=298;ReadPosRankSum=-0.815;SC=GTCTGGCCAGGGTGGGATGAG;SOR=1.316;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=1;TCR=37;TR=18;WE=3055863;WS=3055845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,18:0.44:41
chr19	3056285	rs58280427	G	C	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.74;ReadPosRankSum=0.631;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr19	3061354	rs112386926	C	T	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=85;ReadPosRankSum=-0.431;SC=GGCGCCCCCCCTCCTGCCCCA;SOR=1.179;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=6;WE=3061362;WS=3061344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr19	3062047	.	TG	T	61.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=-0.000;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=48;ReadPosRankSum=-0.842;SC=GCCGGGGAGTTGGGGGGGGCG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=4;WE=3062055;WS=3062037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr19	3062857	rs11539938	T	C	2078.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.470;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=41;PP=1203;ReadPosRankSum=-1.430;SC=TGCTGAGCCTTAGTTTCCTTT;SOR=0.718;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=218;TCF=115;TCR=103;TR=90;WE=3062865;WS=3062847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,104:0.42:245
chr19	3062986	rs56193569	C	G	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=6.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.00;ReadPosRankSum=-0.948;SOR=0.430;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,15:0.31:48
chr19	3110340	rs143987260	G	A	3055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=76;PP=2962;ReadPosRankSum=0.805;SC=AGGTGAGCCCGCGGGCGCCTG;SOR=0.667;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=274;TCF=125;TCR=149;TR=139;WE=3110357;WS=3110330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,150:0.50:300
chr19	3110349	rs11085000	T	G	2454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=62;PP=2962;ReadPosRankSum=0.167;SC=CGCGGGCGCCTGGGGAGGGGA;SOR=0.721;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=229;TCF=105;TCR=124;TR=112;WE=3110357;WS=3110330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,121:0.48:251
chr19	3113305	rs1682811	G	C	1518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=9;PP=1051;SC=AGCTCTCGACGTCTCCCCTGC;SOR=2.970;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=38;TCR=9;TR=47;WE=3113313;WS=3113295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr19	3115124	rs10407783	C	T	1685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.277;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=40;PP=931;ReadPosRankSum=1.687;SC=CTCATTTGCCCGGTGTGCCGG;SOR=0.478;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=120;TCF=50;TCR=70;TR=71;WE=3115132;WS=3115114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,80:0.59:135
chr19	3119184	rs308046	T	G	2278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=36;PP=1540;SC=TCTGATTCCCTCTGCCTTCGC;SOR=0.872;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=41;TCR=36;TR=76;WE=3119192;WS=3119174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr19	3119239	rs4900	C	T	1872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=36;PP=1129;ReadPosRankSum=1.174;SC=TGTTCCGGACCATCATCACCT;SOR=0.702;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=180;TCF=107;TCR=73;TR=88;WE=3119247;WS=3119229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,91:0.48:191
chr19	3119405	rs370286	T	G	4362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.47;SOR=1.374;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr19	3119405	.	TG	GG,GT	915	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000,0.5000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=40,17;NR=65,27;PP=915,694;QD=9.0454401195;SC=AGGGCCTTACTGGGGGGAGGG;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=116;TCF=42;TCR=74;TR=105,44;WE=3119414;WS=3119393;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.91:116
chr19	3119406	rs451778	G	T	1332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=1.494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.75;ReadPosRankSum=-0.340;SOR=0.915;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,62:0.50:124
chr19	3136692	rs411210	T	C	650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=20;PP=572;SC=AGGTCAGACATTGGCATCGTG;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=3136700;WS=3136682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	3148819	rs8113569	G	T	1068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=26;PP=753;SC=CAGGGGCCCAGGGCAGGGTTC;SOR=2.432;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=33;WE=3148827;WS=3148809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	3149990	rs170159	G	C	319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=9;NR=2;PP=222;SC=GTGCGGGGGGGTCGGGAGCTC;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=3149998;WS=3149986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	3150238	rs310680	A	G	6156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=95;NR=109;PP=2965;SC=ATCCGGGCCTACTATGAGCGT;SOR=0.943;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=204;TCF=95;TCR=109;TR=204;WE=3150246;WS=3150228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr19	3155736	rs2074864	T	C	2294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=12;PP=1620;SC=TTATGGATCTTGGCATATCCC;SOR=3.167;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=56;TCR=12;TR=68;WE=3155744;WS=3155726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr19	3193180	rs538197	C	G	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.52;MQRankSum=0.431;QD=6.79;ReadPosRankSum=0.842;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,2:0.33:6
chr19	3193484	rs499877	A	G	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=140;ReadPosRankSum=-1.107;SC=AGGCGTCCCCATCCCAAGGGC;SOR=0.446;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=10;WE=3193492;WS=3193474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr19	3196122	rs311615	T	C	964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=11;PP=559;ReadPosRankSum=2.298;SC=GTGCTGGGGATGCCCCCTGGC;SOR=0.674;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=81;TCR=29;TR=42;WE=3196130;WS=3196112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,47:0.41:116
chr19	3201480	rs1978729	G	A	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.885;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=10;PP=270;ReadPosRankSum=-0.146;SC=TGCGGGAGCCGGGCGGGGGTG;SOR=0.443;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=49;TCF=31;TCR=18;TR=21;WE=3201488;WS=3201470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,23:0.42:55
chr19	3201695	rs311625	A	G	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=28;ReadPosRankSum=0.552;SC=CCCACCAGGCACCTCTGCAGA;SOR=0.368;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=4;WE=3201703;WS=3201685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr19	3204155	rs199629540	T	C	2448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FS=2.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.30;ReadPosRankSum=-1.170;SOR=0.529;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,65:0.41:160
chr19	3204159	rs28372911	T	C	2433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=0.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.31;ReadPosRankSum=-0.381;SOR=0.597;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,65:0.41:159
chr19	3204172	rs8106438	A	G	1887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.666;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=23;PP=2056;ReadPosRankSum=2.182;SC=ATGGGTCCGGAGCTCTGCGGA;SOR=0.620;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=108;TCF=52;TCR=56;TR=44;WE=3204180;WS=3204145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,52:0.40:131
chr19	3206086	.	CACCCCT	C	76.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.097;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=5.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.48;ReadPosRankSum=-1.292;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,5:0.16:31
chr19	3206100	.	G	C	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.768;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=2.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.38;ReadPosRankSum=-2.371;SOR=1.828;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,3:0.09:34
chr19	3206215	.	T	G	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=153;ReadPosRankSum=1.305;SC=AGTGGGTGGGTGGGTGGGCGG;SOR=0.941;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=24;TCF=15;TCR=9;TR=9;WE=3206223;WS=3206205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr19	3206235	rs482758	A	G	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.193;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=249;ReadPosRankSum=2.438;SC=GGGCCAGGCCATGACTACCAC;SOR=3.767;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=15;WE=3206243;WS=3206225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr19	3207338	rs312068	T	C	4421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FS=2.677;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.14;ReadPosRankSum=0.249;SOR=0.884;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:151,123:0.45:274
chr19	3207348	rs312069	G	C	4403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FS=4.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.37;ReadPosRankSum=0.203;SOR=0.978;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:152,117:0.43:269
chr19	3207422	rs3816054	T	C	1566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.240;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=37;PP=760;ReadPosRankSum=1.088;SC=TGCTCCTGGCTGTTGGCATTG;SOR=0.567;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=144;TCF=68;TCR=76;TR=70;WE=3207430;WS=3207412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,79:0.49:162
chr19	3207646	rs2288949	A	G	2480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=52;PP=1392;ReadPosRankSum=0.264;SC=CTCCTCTACAAGACCGTCCAG;SOR=0.685;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=208;TCF=104;TCR=104;TR=107;WE=3207654;WS=3207636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,119:0.51:232
chr19	3273789	rs76295518	C	T	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=289;ReadPosRankSum=0.941;SC=GCAGGGCTGGCCTGCAGAGCT;SOR=0.746;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=48;TCF=33;TCR=15;TR=21;WE=3273797;WS=3273779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,22:0.45:49
chr19	3273818	rs312928	T	C	2249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=52;NR=26;PP=1384;SC=ACCCCCCGCCTGCCACACCCC;SOR=1.395;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=52;TCR=26;TR=78;WE=3273826;WS=3273808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr19	3281298	rs36030381	G	A	3138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.425;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=65;PP=1833;ReadPosRankSum=0.313;SC=TCCTGACGCCGTCCCTCACAT;SOR=0.662;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=260;TCF=138;TCR=122;TR=136;WE=3281306;WS=3281288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,149:0.51:290
chr19	3284819	rs3746064	T	C	1065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=21;PP=748;ReadPosRankSum=0.224;SC=TTTGTTGCTGTCCTTGCGGCT;SOR=0.705;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=106;TCF=60;TCR=46;TR=47;WE=3284827;WS=3284809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,51:0.43:120
chr19	3284996	.	T	TGGCCCCGCCCCCGCCCAG	149.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.255;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=2.864;NF=0;NR=4;PP=784;ReadPosRankSum=-0.290;SC=CGCTGGGCCCTGGCCCCGCCC;SOR=0.454;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=4;WE=3285004;WS=3284986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr19	3285012	rs59656659	T	C	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=2.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.60;MQRankSum=2.004;QD=5.43;ReadPosRankSum=0.638;SOR=0.188;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,4:0.22:18
chr19	3293593	rs313784	A	G	443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=14;PP=388;SC=GTGATGCTTCAAGAGGCTACA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=3293601;WS=3293583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	3381645	rs67426967	GC	G	6419.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=27;NR=71;PP=2966;SC=AGCCTTCGGGGCCGGGCAGTG;SOR=0.926;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=102;TCF=29;TCR=73;TR=98;WE=3381653;WS=3381635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr19	3435254	rs2072349	T	C	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.188;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=311;ReadPosRankSum=1.771;SC=TGAGTCACCGTGGCGGGAACT;SOR=1.410;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=56;TCF=15;TCR=41;TR=24;WE=3435262;WS=3435244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,26:0.43:61
chr19	3448869	rs4807473	A	G	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.793;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=210;ReadPosRankSum=0.040;SC=TAATGGGCTCACAGCCTCTCC;SOR=0.238;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=14;WE=3448877;WS=3448859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr19	3452683	rs8105687	A	G	1521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.656;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=42;PP=923;ReadPosRankSum=0.631;SC=GGCGGGGCGCATTCGGGCCTC;SOR=0.598;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=135;TCF=48;TCR=87;TR=67;WE=3452691;WS=3452673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,72:0.50:143
chr19	3453692	rs144206161	G	A	975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.403;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=15;PP=605;ReadPosRankSum=-3.258;SC=AGCCGGGGGCGGCCGGCGCCA;SOR=0.942;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=121;TCF=80;TCR=41;TR=47;WE=3453700;WS=3453682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,50:0.38:130
chr19	3456656	rs76909566	G	A	838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.18;ReadPosRankSum=0.245;SOR=0.720;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,44:0.59:75
chr19	3456738	rs2240665	T	C	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=7;PP=222;ReadPosRankSum=0.271;SC=GCCACACCCCTGGCACAGGGG;SOR=0.730;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=13;TCR=14;TR=14;WE=3456746;WS=3456728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr19	3462773	rs202152750	GTCT	G	4361.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.151;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=2.180;NF=4;NR=58;PP=2425;ReadPosRankSum=1.041;SC=GATAGCAAAGGTCTTCTTCCC;SOR=0.837;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=145;TCF=14;TCR=131;TR=62;WE=3462783;WS=3462763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,118:0.46:256
chr19	3462849	rs8047	C	T	710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.206;NF=7;NR=25;PP=505;ReadPosRankSum=-0.592;SC=CCCACGTTTTCGGTGGAAAAT;SOR=0.818;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=74;TCF=19;TCR=55;TR=32;WE=3462857;WS=3462839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,33:0.42:79
chr19	3475133	rs76884950	C	T	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.364;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=190;ReadPosRankSum=1.602;SC=CCTAACTACGCGGCCTCACGA;SOR=2.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=11;WE=3475141;WS=3475123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,10:0.29:34
chr19	3478646	rs10413312	C	G	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.726;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr19	3480232	rs2240666	A	G	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.788;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=248;ReadPosRankSum=0.080;SC=GCCCAGCGAGAGGGAGGCCGG;SOR=1.179;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=17;WE=3480240;WS=3480222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,20:0.47:43
chr19	3480358	rs2074961	T	C	732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.780;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=20;PP=575;ReadPosRankSum=-0.526;SC=CCAACTCCCCTATCCCGCGAC;SOR=0.859;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=85;TCF=45;TCR=40;TR=38;WE=3480366;WS=3480348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,37:0.37:99
chr19	3526452	rs2286543	A	G	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.971;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=177;ReadPosRankSum=0.914;SC=CCCACCTCCCAGGCACCAGCT;SOR=1.329;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=11;WE=3526460;WS=3526442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr19	3533274	rs740681	G	A	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.69;ReadPosRankSum=-1.345;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,23:0.77:30
chr19	3534540	rs202198946	G	A	2954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=78;PP=1735;ReadPosRankSum=0.583;SC=AGCGCCACTCGCCCCCGCCCC;SOR=0.716;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=290;TCF=128;TCR=162;TR=141;WE=3534548;WS=3534530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,149:0.49:303
chr19	3534842	rs10155	G	A	4223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=411;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.068;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=111;PP=2717;ReadPosRankSum=-0.475;SC=TAAACCTGCCGGGCAGGACCG;SOR=0.985;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=388;TCF=181;TCR=207;TR=194;WE=3534850;WS=3534832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:203,208:0.51:411
chr19	3538638	rs8644	G	A	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=7.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.14;ReadPosRankSum=1.003;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr19	3538646	rs114420443	A	G	817.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=15.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.02;ReadPosRankSum=0.875;SOR=3.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,18:0.42:43
chr19	3538647	rs113259909	C	CGTGGGTGCGTG	808.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=4.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.469;HP=2;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=2392;ReadPosRankSum=0.911;SC=CGTTCCAGCACGGTGGCGGCG;SOR=3.368;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=24;TCF=15;TCR=9;TR=8;WE=3538662;WS=3538628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,18:0.42:43
chr19	3538654	rs1128872	G	C	861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=6.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.41;MQRankSum=1.538;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.615;SOR=1.630;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,25:0.47:53
chr19	3539444	rs7258234	T	G	425.28	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.662;HP=4;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=534;ReadPosRankSum=1.209;SC=CACTGTGGGGTCTACAGACCT;SOR=4.174;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=16;WE=3539452;WS=3539433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,16:0.89:18
chr19	3543177	.	G	A	1070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.795;ClippingRankSum=0.000;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.499;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=19;PP=585;ReadPosRankSum=1.788;SC=ATCGCAAAGGGGTCAAAGCAC;SOR=0.488;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=91;TCF=57;TCR=34;TR=47;WE=3543185;WS=3543167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,54:0.51:106
chr19	3543397	rs12608919	C	T	716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.786;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=16;PP=334;ReadPosRankSum=1.205;SC=CCACGGGCCCCGGCCAGCCCC;SOR=0.908;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=69;TCF=33;TCR=36;TR=28;WE=3543405;WS=3543387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,37:0.45:83
chr19	3543478	.	GC	G	85.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=-0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.34;MQRankSum=1.207;QD=7.14;ReadPosRankSum=-0.621;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr19	3544971	rs12976454	C	T	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.182;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=241;ReadPosRankSum=-1.015;SC=GTAGGCACCGCGGGTACCACC;SOR=0.425;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=40;TCF=17;TCR=23;TR=20;WE=3544979;WS=3544961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,25:0.53:47
chr19	3548057	rs6510759	T	C	11719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=449;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=205;NR=207;PP=2965;SC=CAGTCAGTGGTGGCGGGCCCA;SOR=0.762;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=412;TCF=205;TCR=207;TR=412;WE=3548065;WS=3548047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,449:1.00:449
chr19	3548313	rs2240752	T	C	767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=19;PP=575;SC=GGAACCTGGGTCACTTCCTCC;SOR=2.584;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=23;WE=3548321;WS=3548303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	3557005	rs1715092	A	G	254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.16;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	3576314	rs35766767	CCTT	C	6878.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=391;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.193;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=2.509;NF=20;NR=66;PP=2966;ReadPosRankSum=-2.181;SC=AGGTAAGCGACCTTCTTCCTC;SOR=0.809;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=200;TCF=41;TCR=159;TR=86;WE=3576324;WS=3576304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:187,181:0.49:368
chr19	3578773	rs13269	C	T	4217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=404;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=93;PP=2423;ReadPosRankSum=-0.506;SC=TGCCCCTCCTCGGAGGACAGC;SOR=0.762;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=362;TCF=178;TCR=184;TR=180;WE=3578781;WS=3578763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:200,203:0.50:403
chr19	3579000	rs1443	C	T	1491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.731;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=33;PP=928;ReadPosRankSum=1.449;SC=CTCCTCCAGCCGAGGGACCCT;SOR=0.364;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=107;TCF=47;TCR=60;TR=64;WE=3579008;WS=3578990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,69:0.58:119
chr19	3586471	rs8100350	A	G	1052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.694;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=17;PP=661;ReadPosRankSum=0.980;SC=GGCTAACTCTAGGCTCCTTCT;SOR=0.789;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=113;TCF=72;TCR=41;TR=48;WE=3586479;WS=3586461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,52:0.42:124
chr19	3586543	rs8113232	G	A	2070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.438;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=40;ReadPosRankSum=0.928;SC=AGAAGCTCCTGGGGGGTCAGA;SOR=0.966;SbPval=0.64;Source=Platypus;TCF=122;TR=96;WE=3586551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,103:0.44:236
chr19	3589413	rs10406702	T	C	3743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.872;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=35;PP=1034;ReadPosRankSum=1.215;SC=CCAGAACCCATGGCCATCCCT;SOR=1.068;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=185;TCF=102;TCR=83;TR=89;WE=3589421;WS=3589403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,101:0.50:202
chr19	3589435	rs10426399	C	T	4036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.233;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=45;PP=1407;ReadPosRankSum=-0.073;SC=ACTCTGTTCCCTCCAGATATG;SOR=0.854;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=209;TCF=114;TCR=95;TR=104;WE=3589443;WS=3589425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,118:0.52:229
chr19	3589768	rs28532669	G	A	919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=8;PP=598;ReadPosRankSum=2.517;SC=GGGTCGGGAGGGGGCTGGGCT;SOR=0.748;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=47;TCF=35;TCR=12;TR=34;WE=3589776;WS=3589758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,37:0.74:50
chr19	3595794	rs4523	A	G	1973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.893;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=34;PP=1067;ReadPosRankSum=1.214;SC=GGAACAGGATATACACCCAGG;SOR=0.761;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=145;TCF=82;TCR=63;TR=80;WE=3595802;WS=3595784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,93:0.54:171
chr19	3595923	rs1131882	G	A	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.243;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=244;ReadPosRankSum=-2.069;SC=CTGTCTGGGCGATGAAGACCT;SOR=0.495;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=43;TCF=13;TCR=30;TR=18;WE=3595931;WS=3595913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,19:0.42:45
chr19	3600198	rs5748	C	T	1487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.178;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=28;PP=932;ReadPosRankSum=-0.043;SC=CGCGGCGCTGCGAGGCGACCG;SOR=0.512;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=124;TCF=70;TCR=54;TR=61;WE=3600206;WS=3600188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,67:0.50:135
chr19	3611678	.	C	T	1221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.845;ClippingRankSum=0.000;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.671;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=18;PP=856;ReadPosRankSum=0.804;SC=GCGCCCCCTCCGTTGCATCAG;SOR=1.207;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=123;TCF=80;TCR=43;TR=56;WE=3611686;WS=3611668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,56:0.43:130
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chr19	3612819	rs62130601	G	A	2850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.361;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=64;PP=1758;ReadPosRankSum=-0.882;SC=GACAGCGGCCGGTAAAAGCTT;SOR=0.753;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=277;TCF=143;TCR=134;TR=134;WE=3612827;WS=3612809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,143:0.47:302
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chr19	3613596	rs57918402	A	G	1146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.638;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=33;PP=789;ReadPosRankSum=0.007;SC=TGGGACGCAGAGCCGGGGTCA;SOR=0.781;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=132;TCF=57;TCR=75;TR=56;WE=3613604;WS=3613586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,58:0.40:144
chr19	3614403	rs7255692	T	C	3414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=25;PP=2229;SC=ACCGGGCCCGTGCCATGTGGG;SOR=2.364;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=83;TCR=25;TR=108;WE=3614411;WS=3614393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr19	3614538	rs60651483	C	T	3829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=369;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.766;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=89;PP=2250;ReadPosRankSum=0.690;SC=CCTTGAACACCGACTGCACAT;SOR=0.556;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=332;TCF=148;TCR=184;TR=165;WE=3614546;WS=3614528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,187:0.51:369
chr19	3618928	rs3746125	G	A	964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=1.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.60;ReadPosRankSum=1.340;SOR=0.895;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,50:0.55:91
chr19	3623505	rs7252742	C	T	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.95;MQRankSum=-0.513;NF=14;NR=8;PP=323;ReadPosRankSum=-2.104;SC=CCAGCCTGGGCGACAGAGCGA;SOR=0.504;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=22;WE=3623513;WS=3623495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,27:0.75:36
chr19	3623534	rs7253265	A	G	1335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.774;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=16;PP=772;ReadPosRankSum=1.701;SC=GTCAAAAAAGAAAGCTGATAG;SOR=0.474;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=87;TCF=62;TCR=25;TR=49;WE=3623542;WS=3623524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,58:0.58:100
chr19	3626476	rs4806945	T	C	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.436;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=118;ReadPosRankSum=-0.561;SC=TCCCCTTCTCTAGGAAGCCCT;SOR=0.269;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=11;WE=3626484;WS=3626466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
chr19	3633192	rs542462	A	G	1684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.535;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=39;PP=1032;ReadPosRankSum=-0.746;SC=GGACAGGTGAAGGTGGGCGGG;SOR=0.648;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=168;TCF=86;TCR=82;TR=79;WE=3633200;WS=3633182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,85:0.45:187
chr19	3637380	rs10402336	C	T	4529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=403;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.469;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=115;NR=99;PP=2934;ReadPosRankSum=-0.053;SC=CCGGGGCCAGCGTGGCTGACC;SOR=0.529;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=380;TCF=213;TCR=167;TR=214;WE=3637388;WS=3637370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,221:0.55:403
chr19	3637395	rs10408855	T	C	5380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=473;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.223;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=134;NR=116;PP=2962;ReadPosRankSum=0.311;SC=CTGACCTCAATTGCAGCCGTG;SOR=0.505;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=443;TCF=247;TCR=196;TR=250;WE=3637403;WS=3637385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:213,260:0.55:473
chr19	3638041	rs1879038	G	C	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.440;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=279;ReadPosRankSum=1.303;SC=ATGAAGCAGCGAGGAGGTGCC;SOR=1.127;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=30;TCF=12;TCR=18;TR=17;WE=3638049;WS=3638031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr19	3638856	rs2286435	C	T	566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.166;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=356;ReadPosRankSum=-0.702;SC=GACGAGCCGGCGGCAGGAGGA;SOR=0.941;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=47;TCF=35;TCR=12;TR=24;WE=3638864;WS=3638846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,26:0.51:51
chr19	3644337	rs10413486	G	A	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=104;ReadPosRankSum=1.005;SC=TATACCCCACGTCCCTGTGGC;SOR=0.804;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=10;WE=3644345;WS=3644327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr19	3647440	rs4806948	A	G	2749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=43;NR=52;PP=1585;SC=ATGCCAGGCCACCTCACTCAG;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=43;TCR=53;TR=95;WE=3647448;WS=3647430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr19	3648545	.	GCTGCAGACCCGGGCGCCCACCTGTGGGA	G	1190.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.229;ClippingRankSum=0.000;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=3.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQRankSum=-1.016;QD=18.32;ReadPosRankSum=-0.942;SOR=0.379;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,31:0.48:65
chr19	3648573	.	A	G	452	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=28;MQ=59.81;NF=15;NR=12;PP=452;QD=18.0285634277;SC=CACCTGTGGGACTGCAGACCC;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=66;TCF=42;TCR=24;TR=27;WE=3648581;WS=3648563;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:39,27:0.41:66
chr19	3648599	rs72620514	A	G	1921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.434;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.945;NF=32;NR=29;PP=939;ReadPosRankSum=-1.246;SC=GTCCACCTGTAGGACTGCAGA;SOR=0.533;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=121;TCF=67;TCR=54;TR=61;WE=3648607;WS=3648589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,65:0.52:125
chr19	3653525	rs2074957	C	T	2994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=70;PP=1710;ReadPosRankSum=-0.556;SC=TCTTGCCCCCCGACTGCACGC;SOR=0.683;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=229;TCF=105;TCR=124;TR=126;WE=3653533;WS=3653515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,141:0.55:255
chr19	3656652	rs10432303	G	A	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.783;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.674;NF=2;NR=18;PP=406;ReadPosRankSum=0.614;SC=AACTGATGACGGGTCGCTGCA;SOR=0.246;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=20;WE=3656660;WS=3656642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
chr19	3660944	rs3826944	G	A	4201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=381;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=99;PP=2628;ReadPosRankSum=-1.212;SC=CTGGAAGCCCGTAACAGCAAA;SOR=0.712;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=348;TCF=163;TCR=185;TR=188;WE=3660952;WS=3660934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:181,200:0.52:381
chr19	3661719	rs66697450	G	C	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=269;ReadPosRankSum=0.329;SC=CAAACGTCCTGACGGACAGAG;SOR=0.656;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=12;WE=3661727;WS=3661709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr19	3665058	rs74471407	G	A	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=22;PP=449;ReadPosRankSum=1.032;SC=CGACTCCGGGGTGCAGCAGGA;SOR=0.699;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=51;TCF=13;TCR=38;TR=30;WE=3665066;WS=3665048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,29:0.54:54
chr19	3667460	rs74964157	C	T	597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=2.148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.79;ReadPosRankSum=-0.585;SOR=0.986;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,28:0.41:68
chr19	3667460	.	CT	TC	379	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=6;NR=17;PP=379;QD=18.802951081;SC=GTGTGTAACTCTGCGTGGGGC;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=56;TCF=18;TCR=38;TR=23;WE=3667469;WS=3667450;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:33,23:0.41:56
chr19	3667461	rs7257360	T	C	2301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.85;SOR=1.644;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
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chr19	3733831	rs34564453	G	A	2724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.630;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=62;PP=1554;ReadPosRankSum=-1.676;SC=AGCTAAGCCTGCTGGTGCTGA;SOR=0.829;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=197;TCF=96;TCR=101;TR=115;WE=3733839;WS=3733821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,132:0.58:228
chr19	3733925	rs117778290	G	A	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=338;ReadPosRankSum=-0.528;SC=GGACCTAGAGGTTAGGACCTG;SOR=0.616;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=19;WE=3733933;WS=3733915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,23:0.62:37
chr19	3734175	rs3746122	G	C	1564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=10;PP=1165;SC=GTGAGCCACCGTGCCCAGCTC;SOR=2.437;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=44;TCR=10;TR=54;WE=3734183;WS=3734165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr19	3738402	rs62130650	C	A	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.978;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=270;ReadPosRankSum=-0.173;SC=GGTGATACCCCAGTCGGAAAG;SOR=0.278;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=17;WE=3738410;WS=3738392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,21:0.68:31
chr19	3738649	rs599587	A	C	2560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=48;PP=1349;SC=GGTGACGCAGAGGAAGCAGGA;SOR=1.090;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=40;TCR=48;TR=88;WE=3738657;WS=3738639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr19	3738971	rs600986	A	G	4586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=77;NR=74;PP=2515;SC=AGCCCAGTCCACCGTCTGGCC;SOR=0.812;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=151;TCF=77;TCR=74;TR=151;WE=3738979;WS=3738961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr19	3740658	rs10416362	T	G	1026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.27;ReadPosRankSum=0.042;SOR=0.695;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,49:0.49:100
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chr19	3749971	rs7257905	A	G	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=180;ReadPosRankSum=-1.697;SC=TCCCAGCCTCAGTTTTCTCAT;SOR=0.616;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=12;WE=3749979;WS=3749969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr19	3750205	rs10692689	T	TG,TGG	9774.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36,36;NR=95,95;PP=1699,2092;ReadPosRankSum=-0.340;SC=TATTCCAGATTGGGGCCCTCA;SOR=0.743;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=154;TCF=44;TCR=110;TR=131,131;WE=3750213;WS=3750195;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.49,0.50:285
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chr19	3751409	rs115055172	G	A	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.51;MQRankSum=0.883;NF=5;NR=8;PP=429;ReadPosRankSum=-0.797;SC=CCCCCACCCCGGGGCCAGGGG;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=21;TCF=8;TCR=13;TR=13;WE=3751417;WS=3751386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr19	3752601	rs147130540	G	A	1102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.712;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=18;PP=641;ReadPosRankSum=-0.520;SC=GCCCCCGAGCGCTCAGCAGGC;SOR=0.823;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=97;TCF=60;TCR=37;TR=49;WE=3752609;WS=3752591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,55:0.49:113
chr19	3752874	rs8102086	A	G	5980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=115;NR=100;PP=2965;SC=TGGAGGTGGCAGGCGCCTGGG;SOR=0.774;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=215;TCF=115;TCR=100;TR=215;WE=3752882;WS=3752864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr19	3753148	rs10414283	A	C	945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.196;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,26:0.46:57
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chr19	3753656	rs12609548	T	A	1698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=13;PP=1020;ReadPosRankSum=0.687;SC=AAAAAGAATTTAAAAATAAGC;SOR=0.818;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=59;TCF=46;TCR=13;TR=58;WE=3753664;WS=3753646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,63:0.98:64
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chr19	3771880	rs11085039	C	T	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=2.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.78;ReadPosRankSum=-0.758;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
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chr19	3781566	rs11671881	C	A	2354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.847;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=58;PP=1587;ReadPosRankSum=1.268;SC=ACGCACCTCCCATCTTCCTTC;SOR=0.814;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=219;TCF=107;TCR=112;TR=110;WE=3781574;WS=3781556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,114:0.48:238
chr19	3783070	rs3746115	G	A	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.173;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=6;PP=420;ReadPosRankSum=-0.519;SC=CCTTCCTCCCGGACTGGGCTA;SOR=0.505;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=61;TCF=49;TCR=12;TR=29;WE=3783078;WS=3783060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,31:0.49:63
chr19	3783310	.	T	G	236	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=6;HapScore=2;MGOF=41;MMLQ=15;MQ=59.03;NF=0;NR=20;PP=236;QD=13.5385606274;SC=GTGGGGTGGGTGGGACCGGGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=12;TCR=40;TR=20;WE=3783318;WS=3783300;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:32,20:0.38:52
chr19	3784757	rs2074976	T	G	4196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=80;NR=67;PP=2514;SC=CAGGAAGGGGTCTCAGGGTGT;SOR=0.744;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=148;TCF=81;TCR=67;TR=147;WE=3784765;WS=3784747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
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chr19	3806162	rs8109765	T	C	1069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.724;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=32;PP=764;ReadPosRankSum=-1.255;SC=CCCCGCCCGCTCTGCTCCCCG;SOR=0.816;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=100;TCF=39;TCR=61;TR=49;WE=3806170;WS=3806152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,52:0.45:116
chr19	3810961	rs75643607	G	A	1234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=34;PP=757;ReadPosRankSum=0.104;SC=GGCGGGCCTCGAAGGTGGCGG;SOR=0.520;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=116;TCF=40;TCR=76;TR=56;WE=3810969;WS=3810951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,58:0.47:124
chr19	3811456	rs201194156	CG	C	93.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.26;MQRankSum=1.518;QD=3.02;ReadPosRankSum=0.360;SOR=0.770;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
chr19	3811457	rs10413220	G	C	396.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.28;MQRankSum=-1.380;QD=12.80;ReadPosRankSum=-0.338;SOR=0.622;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,21:0.68:31
chr19	3811459	.	T	C	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=0.000;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.28;MQRankSum=1.518;QD=3.32;ReadPosRankSum=0.592;SOR=0.770;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
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chr19	3820191	rs2301843	C	T	1291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.626;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=24;PP=617;ReadPosRankSum=1.434;SC=TGGAGTGGGGCGCTGGCGGGT;SOR=0.754;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=120;TCF=66;TCR=54;TR=56;WE=3820199;WS=3820181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,66:0.49:136
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chr19	3820389	rs2301846	A	C	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.032;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=18;PP=432;ReadPosRankSum=1.806;SC=GCAAGGAAGGAAGGGCCAAAG;SOR=1.008;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=64;TCF=28;TCR=36;TR=30;WE=3820397;WS=3820379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,31:0.46:68
chr19	3820441	rs2301847	A	G	754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=21;PP=552;SC=TGCCTGCTGTATGCACAGAAG;SOR=2.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=27;WE=3820449;WS=3820431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	3822008	rs28510805	C	G	683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=3;PP=479;SC=GGCCCGACCACAGGCCTCCCA;SOR=2.737;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=3822016;WS=3821998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
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chr19	3823237	rs2240231	G	A	3141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.819;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=70;PP=2119;ReadPosRankSum=-0.932;SC=TGACAGCCTCGACTTACCTCC;SOR=0.640;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=319;TCF=178;TCR=141;TR=154;WE=3823245;WS=3823227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,160:0.47:343
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chr19	3831525	rs2240233	C	A	2509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=45;PP=1391;ReadPosRankSum=-0.110;SC=GCGGAGTACACCGACGCGTCA;SOR=0.692;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=190;TCF=107;TCR=83;TR=104;WE=3831533;WS=3831515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,120:0.57:209
chr19	3831765	rs2240235	G	A	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.022;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=10;PP=217;ReadPosRankSum=-1.141;SC=GGTGTATCCCGAGGACAAGGT;SOR=0.864;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=44;TCF=25;TCR=19;TR=20;WE=3831773;WS=3831755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,25:0.46:54
chr19	3833572	rs56713158	TA	T	915.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=1.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.668;QD=12.90;ReadPosRankSum=0.374;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,57:0.80:71
chr19	3869128	rs35860262	C	T	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=353;ReadPosRankSum=-2.193;SC=GCGCGAAGCCCTCACCTTCTC;SOR=0.852;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=19;WE=3869136;WS=3869118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr19	3902722	rs2060247	C	G	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.191;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=21;PP=414;ReadPosRankSum=-0.400;SC=TGATGGCGCTCTCATGAAGCC;SOR=1.336;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=52;TCF=9;TCR=43;TR=24;WE=3902730;WS=3902712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,24:0.46:52
chr19	3908039	rs3810374	C	T	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.593;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=128;ReadPosRankSum=-0.616;SC=TTCGGGTGGACGGACTGTGGG;SOR=0.169;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=8;WE=3908047;WS=3908029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr19	3908201	rs3810373	T	C	2754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=60;NR=34;PP=1696;SC=TGGTGGGTGGTGCGCGGGAGG;SOR=1.368;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=60;TCR=34;TR=94;WE=3908209;WS=3908191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr19	3910933	rs4807527	G	A	2240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.166;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=59;PP=1353;ReadPosRankSum=-0.996;SC=CTCAGTGTGCGTGTGTGCGTG;SOR=0.792;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=175;TCF=67;TCR=108;TR=94;WE=3910941;WS=3910923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,102:0.54:190
chr19	3911012	rs4807528	T	A	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=340;ReadPosRankSum=-0.696;SC=TGTGTGTGCATCCATGTGTGT;SOR=0.732;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=20;WE=3911020;WS=3911002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr19	3918721	rs11667520	A	G	545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=378;ReadPosRankSum=1.228;SC=CAGGAAAACCAGAGAGGCCAG;SOR=0.563;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=50;TCF=38;TCR=12;TR=26;WE=3918729;WS=3918711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,27:0.47:57
chr19	3920616	rs8108660	T	C	334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=10;NR=2;PP=210;SC=GCTGGGATTATAGGCATGAGC;SOR=2.670;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=12;WE=3920624;WS=3920606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	3922125	rs56225015	A	T	1112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=27;PP=611;ReadPosRankSum=0.683;SC=AACTACATACACCTGGCTGAC;SOR=0.701;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=122;TCF=57;TCR=65;TR=49;WE=3922133;WS=3922115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,59:0.43:138
chr19	3958324	rs3745980	C	G	823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.137;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=8;PP=490;ReadPosRankSum=-0.180;SC=CCCGGTTTGTCCCCTCCTTCC;SOR=1.024;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=66;TCF=45;TCR=21;TR=32;WE=3958332;WS=3958314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,35:0.51:69
chr19	3958397	rs7255123	A	G	1730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.377;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=38;PP=1005;ReadPosRankSum=0.779;SC=GCATATCCCCAGTGGCCAAGG;SOR=0.479;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=170;TCF=94;TCR=76;TR=80;WE=3958405;WS=3958387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,88:0.48:184
chr19	3961263	rs137989425	G	A	1576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.767;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=21;PP=1070;ReadPosRankSum=0.968;SC=ACAGGCTGACGGCAGGTGCCT;SOR=0.819;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=109;TCF=73;TCR=36;TR=65;WE=3961271;WS=3961253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,68:0.60:113
chr19	3961533	rs76315900	G	A	1041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=25;PP=622;ReadPosRankSum=-0.163;SC=CAACAGCCCGGCAGTGAGAGG;SOR=0.690;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=104;TCF=44;TCR=60;TR=45;WE=3961541;WS=3961523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,50:0.43:115
chr19	3963724	rs2278437	G	A	1944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.126;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=48;PP=1129;ReadPosRankSum=-0.098;SC=ACCCTCCCAGGACCGTGGCGT;SOR=0.604;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=176;TCF=81;TCR=95;TR=90;WE=3963732;WS=3963714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,97:0.51:190
chr19	3969505	rs2304194	G	A	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=9;PP=260;ReadPosRankSum=1.104;SC=ATTCACAGCCGGGGCTGTCTG;SOR=0.575;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=41;TCF=25;TCR=16;TR=22;WE=3969513;WS=3969495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,23:0.53:43
chr19	3976863	rs62130414	C	T	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=208;ReadPosRankSum=-0.612;SC=ACCAGACACTCGGCCTGGTGC;SOR=0.892;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=12;WE=3976871;WS=3976853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr19	3977486	rs36527	A	G	3426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=58;PP=2016;SC=GCACACTGGCATAGAGGCAGC;SOR=0.723;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=120;TCF=62;TCR=58;TR=120;WE=3977494;WS=3977476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr19	3979408	rs36526	A	G	6816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=128;NR=96;PP=2965;SC=CCGCGATGATATGCTCTCCCG;SOR=0.815;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=226;TCF=129;TCR=97;TR=224;WE=3979416;WS=3979398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,259:1.00:259
chr19	3980824	rs36525	A	G	3907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=74;PP=2385;SC=GGGCCCGGCCACCGGGACCAC;SOR=1.203;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=49;TCR=74;TR=123;WE=3980832;WS=3980814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr19	3981526	rs45443207	A	G	2012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.333;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=58;PP=1381;ReadPosRankSum=-0.267;SC=TCCTGCTTGGAAGACTCAGGT;SOR=0.939;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=193;TCF=70;TCR=123;TR=86;WE=3981534;WS=3981516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,92:0.45:203
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chr19	3983184	rs2230560	A	G	4614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=417;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.099;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=106;NR=102;PP=2559;ReadPosRankSum=-0.397;SC=AGAAGTCGACATGCCCGGGGG;SOR=0.680;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=389;TCF=199;TCR=190;TR=208;WE=3983192;WS=3983174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:191,226:0.54:417
chr19	3983302	rs2305107	G	A	1974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.789;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=49;PP=1217;ReadPosRankSum=0.781;SC=GATGGAGGGAGGGACTCGTCA;SOR=0.340;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=171;TCF=65;TCR=106;TR=87;WE=3983310;WS=3983292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,93:0.52:180
chr19	3984453	rs8100131	G	A	718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.217;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=20;PP=384;ReadPosRankSum=2.146;SC=CCAGGAGGGGGTTGGTGCTGG;SOR=0.288;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=64;TCF=12;TCR=52;TR=27;WE=3984461;WS=3984443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,33:0.45:73
chr19	3985250	rs62131469	C	G	628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.319;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=3;PP=456;ReadPosRankSum=0.409;SC=AGCCCCGGGTCCTCCGGCCCC;SOR=1.476;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=49;TCF=40;TCR=9;TR=23;WE=3985258;WS=3985240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,23:0.48:48
chr19	4013322	rs2289865	T	C	1211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.780;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=31;PP=584;ReadPosRankSum=0.249;SC=ATATGCTGGATGAGCTGCTGA;SOR=0.587;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=98;TCF=34;TCR=64;TR=49;WE=4013330;WS=4013312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,56:0.54:104
chr19	4013389	rs7257356	C	T	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.083;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=237;ReadPosRankSum=0.467;SC=GAGGCTTCACCTAGGCCCCGT;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=12;WE=4013397;WS=4013379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr19	4037322	rs75488612	G	A	700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.95;SOR=1.697;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	4037525	rs2305106	C	T	2827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.444;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=60;PP=1667;ReadPosRankSum=1.242;SC=CCCCACCAGCCGCGCAGTCCG;SOR=0.636;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=243;TCF=122;TCR=121;TR=118;WE=4037533;WS=4037515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,134:0.50:268
chr19	4042077	rs4410205	C	A	609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=10;PP=325;ReadPosRankSum=-1.272;SC=CTCTGAAGCACAGAGGTTAGG;SOR=0.608;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=63;TCF=41;TCR=22;TR=27;WE=4042085;WS=4042067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,32:0.45:71
chr19	4101062	rs10250	G	T	693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=4;PP=307;SC=CCATGGAGTCGATGAGCTGGC;SOR=1.302;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=19;WE=4101070;WS=4101052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	4102449	rs17851657	G	A	2682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.579;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=59;PP=1361;ReadPosRankSum=-1.504;SC=GGGAGCCGCCGTCCTAGAGGG;SOR=0.759;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=242;TCF=128;TCR=114;TR=119;WE=4102457;WS=4102439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,134:0.50:270
chr19	4117528	rs8157	G	A	1788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.673;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=24;PP=1101;ReadPosRankSum=-0.604;SC=TGAGTTCGCCGACCTTGGCTT;SOR=0.937;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=164;TCF=108;TCR=56;TR=75;WE=4117536;WS=4117518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,85:0.46:184
chr19	4117705	rs350890	T	C	1073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=27;PP=776;SC=CCGTGGTGCATCGGCCCCCAG;SOR=2.242;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=36;WE=4117713;WS=4117695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr19	4153659	rs350879	G	A	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=9;PP=466;ReadPosRankSum=-0.717;SC=GAGCTTGCCCGGCCCCAGGTA;SOR=0.588;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=52;TCF=38;TCR=14;TR=31;WE=4153667;WS=4153649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,31:0.57:54
chr19	4156866	rs112691598	AC	A	1250.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=65.19;MQRankSum=6.201;QD=22.33;ReadPosRankSum=0.575;SOR=0.512;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,33:0.59:56
chr19	4156869	rs63310862	C	T	1259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=65.10;MQRankSum=6.280;QD=22.10;ReadPosRankSum=0.703;SOR=0.478;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,33:0.58:57
chr19	4156881	rs350871	G	A	1075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.63;MQRankSum=5.535;QD=13.28;ReadPosRankSum=0.091;SOR=0.758;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,47:0.58:81
chr19	4169998	rs350852	G	A	325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=1;PP=194;SC=CTGACCTGCCGAGTAACCTTG;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=4170006;WS=4169992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	4170378	rs350851	G	A	1054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=23;PP=678;SC=AGGCCGAGGCGGGTGGATCAC;SOR=1.949;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=31;WE=4170386;WS=4170368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	4174950	rs350845	A	G	3207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=61;NR=44;PP=1838;SC=GGTCCTGCCGAGGGGCGGGAC;SOR=0.778;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=61;TCR=44;TR=105;WE=4174958;WS=4174940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr19	4177051	rs350844	A	G	2732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=36;PP=1671;SC=CAGAGCCCCCACCCCTGCACC;SOR=1.127;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=98;TCF=62;TCR=36;TR=97;WE=4177059;WS=4177041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr19	4177331	rs350843	A	C	670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=20;PP=563;SC=GGGCAAGTGGACCAACCTCTC;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=4177339;WS=4177321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	4180690	rs7260071	T	G	4817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=56;PP=2965;SC=CAGATGGATGTGTTCTCATTC;SOR=1.316;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=155;TCF=99;TCR=56;TR=155;WE=4180698;WS=4180680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr19	4180836	rs352493	C	T	5367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=87;NR=91;PP=2965;SC=GAACACCACACTGGAAGACTG;SOR=0.936;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=178;TCF=87;TCR=91;TR=178;WE=4180844;WS=4180826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr19	4198154	rs1963331	C	T	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.568;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=147;ReadPosRankSum=0.083;SC=CGGCGGCCTGCGCTGGTGAGG;SOR=1.143;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=48;TCF=27;TCR=21;TR=17;WE=4198162;WS=4198144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,18:0.37:49
chr19	4198463	rs74178438	G	A	979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.33;ReadPosRankSum=0.272;SOR=0.639;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,55:0.52:105
chr19	4199809	rs112892199	C	CA	2365.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.190;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.993;NF=23;NR=17;PP=1475;ReadPosRankSum=-0.044;SC=GAGCCCCTGTCGGGGGCGTGG;SOR=0.892;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=85;TCF=44;TCR=41;TR=40;WE=4199817;WS=4199799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,73:0.51:143
chr19	4199839	rs6510793	A	C	2257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.127;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=36;PP=1295;ReadPosRankSum=0.087;SC=AGCAGCCAACACTGCCCCACG;SOR=0.820;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=162;TCF=92;TCR=70;TR=85;WE=4199847;WS=4199829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,107:0.55:194
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chr19	4202683	rs352513	T	C	527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=4;PP=354;SC=CCTCAAATTCTCAGCTGCTTC;SOR=1.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=18;WE=4202691;WS=4202673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
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chr19	4203030	rs72343536	TCTC	T	43.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.58;ReadPosRankSum=0.967;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr19	4207161	rs34976536	A	T	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.638;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=147;ReadPosRankSum=-1.054;SC=ACTCAAGCGAACCTCCTGCCT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=8;WE=4207169;WS=4207151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr19	4207940	rs2240669	G	A	2267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.486;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=48;PP=1379;ReadPosRankSum=0.008;SC=TGCAAGAGGCGGCCCAGCGCC;SOR=0.629;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=204;TCF=110;TCR=94;TR=103;WE=4207948;WS=4207930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,111:0.49:226
chr19	4208082	rs2240670	T	C	1892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=38;PP=1174;SC=TAGGAGGTCCTAGAGCTTACC;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=22;TCR=38;TR=60;WE=4208090;WS=4208072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr19	4210017	rs67953324	G	A	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=140;ReadPosRankSum=-0.647;SC=ATGGCCCCCCGATCGGCCCCC;SOR=0.861;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=48;TCF=32;TCR=16;TR=15;WE=4210025;WS=4210007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,17:0.33:52
chr19	4210356	rs12978469	G	A	3856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=56;PP=2143;SC=CACAAGGAACGGAGGCAGCAG;SOR=0.780;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=108;TCF=52;TCR=56;TR=108;WE=4210364;WS=4210346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr19	4210382	rs72980936	C	T	1410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.266;HP=2;HapScore=2;MGOF=50;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=30;PP=839;ReadPosRankSum=3.484;SC=TAGGAGGCCTCGGAGATTTGG;SOR=0.519;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=95;TCF=40;TCR=55;TR=56;WE=4210390;WS=4210372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,68:0.54:125
chr19	4210401	rs60239405	C	CA	4885.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=52;PP=2806;SC=GGGCGTGGGCCAGCCTGGGTG;SOR=1.140;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=61;TCF=7;TCR=54;TR=59;WE=4210409;WS=4210391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr19	4210465	rs12710072	A	G	1491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.28;QD=27.63;SOR=1.697;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	4212808	rs58559746	C	A	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.412;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.103;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr19	4216269	rs12459920	G	A	802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.895;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=9;PP=456;ReadPosRankSum=-0.924;SC=CTGACTCTGCGTCCCCCTCCA;SOR=0.881;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=69;TCF=50;TCR=19;TR=36;WE=4216277;WS=4216259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,38:0.49:77
chr19	4216910	rs10413818	G	A	2722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=56;NR=34;PP=1618;SC=CACGGGAGCCGAGGCCACGGG;SOR=1.007;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=91;TCF=57;TCR=34;TR=90;WE=4216918;WS=4216900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr19	4217207	rs353693	T	G	5496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=91;PP=2965;SC=AGGGATGGAATCCACAGGAGT;SOR=0.827;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=185;TCF=93;TCR=92;TR=183;WE=4217215;WS=4217197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr19	4217510	rs12980998	A	T	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.24;ReadPosRankSum=1.102;SOR=0.512;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,6:0.25:24
chr19	4217587	rs58333777	G	A	356.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.84;ReadPosRankSum=-1.111;SOR=0.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,17:0.85:20
chr19	4217956	rs6510794	A	G	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=115;ReadPosRankSum=-0.065;SC=GGGGCCGGGCAGCCAGTCTGG;SOR=0.818;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=11;WE=4217964;WS=4217946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr19	4229635	rs400089	A	G	1160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.712;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=26;PP=638;ReadPosRankSum=-0.859;SC=CCCCTGGGGGACTGGGGGGCC;SOR=0.597;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=102;TCF=45;TCR=57;TR=48;WE=4229643;WS=4229625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,55:0.50:111
chr19	4233095	rs117467902	TG	CA	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.666;HP=3;HapScore=3;JOINED;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=1107;ReadPosRankSum=-1.670;SC=AGGCACTCCCTGAGGCGCTCA;SOR=0.402;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=18;WE=4233115;WS=4233085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,21:0.70:30
chr19	4233107	rs111301100	C	T	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.317;HP=2;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=10;PP=1126;ReadPosRankSum=-0.909;SC=AGGCGCTCAGCGAGCCCCACC;SOR=0.394;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=42;TCF=28;TCR=14;TR=28;WE=4233115;WS=4233085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,30:0.67:45
chr19	4234856	rs9807908	T	A	728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=23;PP=506;ReadPosRankSum=0.392;SC=GAAAGGGTGGTGCCTGGCAGA;SOR=0.896;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=48;TCF=9;TCR=39;TR=28;WE=4234864;WS=4234846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,30:0.59:51
chr19	4236996	rs4740	G	A	1125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.506;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=31;PP=660;ReadPosRankSum=-1.684;SC=CAGGTACTACGTCCAAGTGGC;SOR=0.911;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=106;TCF=42;TCR=64;TR=49;WE=4237004;WS=4236986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,56:0.47:120
chr19	4237067	rs4905	A	G	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=214;ReadPosRankSum=-0.217;SC=CCACTGCCACAATGAGCCTGG;SOR=0.892;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=12;WE=4237075;WS=4237057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr19	4250991	rs3803908	A	G	1101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.748;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=18;PP=624;ReadPosRankSum=-0.441;SC=CAGCGTCCCAAGACAGCTCAC;SOR=0.796;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=91;TCF=55;TCR=36;TR=47;WE=4250999;WS=4250981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,52:0.51:101
chr19	4251069	rs1045750	T	C	1942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=38;PP=892;ReadPosRankSum=2.097;SC=AGAAATTCAATGCTCGGAAGG;SOR=0.695;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=178;TCF=97;TCR=81;TR=86;WE=4251077;WS=4251059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,99:0.49:202
chr19	4254211	rs10853970	T	C	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.723;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=225;ReadPosRankSum=0.801;SC=ATCTCACCAGTCAAAGCAATA;SOR=0.399;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=15;WE=4254219;WS=4254201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr19	4254308	rs11085067	T	C	1402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.053;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=25;PP=673;ReadPosRankSum=0.426;SC=AAGATTCTAGTGCCTGGGGAT;SOR=0.922;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=134;TCF=77;TCR=57;TR=61;WE=4254320;WS=4254285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,69:0.46:151
chr19	4254375	rs11085068	C	T	1616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.927;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=30;PP=758;ReadPosRankSum=-0.523;SC=ACACAGACTACACCATGGAGC;SOR=0.545;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=147;TCF=79;TCR=68;TR=69;WE=4254383;WS=4254365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,80:0.48:165
chr19	4268543	rs4807565	G	C	1018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.809;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=16;PP=630;ReadPosRankSum=-1.451;SC=CCTGTCTGCTGTGGAGCTGAG;SOR=0.574;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=82;TCF=53;TCR=29;TR=42;WE=4268551;WS=4268533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,47:0.52:90
chr19	4280186	rs10419363	C	T	9287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=352;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=160;NR=149;PP=2965;SC=ACCTGGACTTCGAGGACCCCT;SOR=0.716;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=309;TCF=160;TCR=149;TR=309;WE=4280194;WS=4280176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,350:1.00:350
chr19	4292961	rs11287595	CT	C	97.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=4.917;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.17;ReadPosRankSum=0.176;SOR=1.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,13:0.29:45
chr19	4294551	rs62129297	T	C	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.922;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=77;ReadPosRankSum=1.627;SC=TCCTCCGCCCTACCCTCCCTT;SOR=0.307;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=9;WE=4294559;WS=4294541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr19	4297968	rs6510801	C	T	2099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.022;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=39;PP=1144;ReadPosRankSum=-1.119;SC=TCCCTCTCCCCGCTGGCTCCC;SOR=0.622;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=217;TCF=128;TCR=89;TR=99;WE=4297976;WS=4297958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,108:0.48:225
chr19	4352763	rs11668153	C	T	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.41;ReadPosRankSum=0.696;SOR=0.184;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,3:0.21:14
chr19	4352838	rs11668187	C	G	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=176;ReadPosRankSum=-0.362;SC=TAGCAGGGAGCGGGGGGGCAC;SOR=0.657;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=42;TCF=26;TCR=16;TR=13;WE=4352846;WS=4352828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,14:0.30:47
chr19	4352959	rs11882587	A	G	1438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=1.355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.50;ReadPosRankSum=-0.228;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,74:0.54:137
chr19	4353841	rs7246177	T	C	189.18	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=116;ReadPosRankSum=-0.674;SC=ATTTCTTCTTTGTAAATAAGA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=6;WE=4353849;WS=4353831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr19	4355035	rs2041772	A	G	801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=11.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.57;ReadPosRankSum=-0.999;SOR=0.868;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,48:0.39:122
chr19	4355054	rs2041773	A	G	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=8.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.70;ReadPosRankSum=0.266;SOR=0.893;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,34:0.37:93
chr19	4355203	rs2041774	G	A	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=32;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GCATTCTGGGGAGGGTTGGGA;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=4;WE=4355211;WS=4355193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr19	4357555	rs4807583	A	G	4723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=80;NR=74;PP=2460;SC=CCAAGATCTCACCTTTCTGGG;SOR=0.811;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=154;TCF=80;TCR=74;TR=154;WE=4357563;WS=4357545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr19	4363289	rs62129346	C	T	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.831;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=260;ReadPosRankSum=-0.048;SC=CACCCCACAGCGAGGTGTGCT;SOR=1.863;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=14;WE=4363297;WS=4363279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr19	4400314	rs62129356	C	T	1188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=21;PP=665;ReadPosRankSum=2.275;SC=CCTGGGCCTGCGCTCACCTGG;SOR=0.681;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=101;TCF=58;TCR=43;TR=51;WE=4400322;WS=4400304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,57:0.52:110
chr19	4402659	rs200677191	G	GGCGGCAGCA	227.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=2;PP=954;SC=CGGCGGCCGCGGCGGCAGCAG;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=4;WE=4402667;WS=4402649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	4406160	rs243342	G	A	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.601;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=80;ReadPosRankSum=1.085;SC=ACTTATGCACGATTGGTGTTT;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=4406168;WS=4406150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr19	4408751	rs243347	A	G	834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=27;NR=2;PP=607;SC=GATTACAGGCATGAGCCACCA;SOR=3.981;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=29;WE=4408759;WS=4408741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	4409756	rs2230636	A	G	1590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.788;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=42;PP=993;ReadPosRankSum=-0.192;SC=CCCTCCGCAGAGTGAGTATCT;SOR=0.433;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=101;TCF=30;TCR=71;TR=64;WE=4409764;WS=4409746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,69:0.61:113
chr19	4417845	rs34080966	T	C	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.929;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=67;ReadPosRankSum=-0.244;SC=CCGTAGTCTCTCTTGTTATCT;SOR=3.126;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=5;WE=4417853;WS=4417835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr19	4417967	rs45487594	G	A	1336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.453;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=23;PP=710;ReadPosRankSum=1.445;SC=TCTTTTTCTCGAAGCAATTGA;SOR=0.446;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=99;TCF=61;TCR=38;TR=56;WE=4417975;WS=4417957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,64:0.56:114
chr19	4429007	rs62130978	C	T	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.824;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=140;ReadPosRankSum=0.504;SC=CTAGTGCCCTCGGGCCCTGGG;SOR=0.078;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=12;WE=4429015;WS=4428997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr19	4442336	rs9352	C	T	1672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.529;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=40;PP=1122;ReadPosRankSum=0.644;SC=CCGGATGCTGCGGGTGAGAAG;SOR=0.646;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=177;TCF=99;TCR=78;TR=83;WE=4442344;WS=4442326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,83:0.43:193
chr19	4442999	rs243383	T	G	4431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=94;NR=59;PP=2526;SC=CACCCTGACCTCGAGCCCACT;SOR=1.133;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=153;TCF=94;TCR=59;TR=153;WE=4443007;WS=4442989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
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chr19	4453235	rs72990638	C	T	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.119;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=35;ReadPosRankSum=-1.160;SC=GGCTCGTGTACCTGAGGCCCA;SOR=0.039;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=4;WE=4453243;WS=4453234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
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chr19	4453324	.	TG	CC,CG	546	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=59.35;NF=22,47;NR=16,27;PP=546,328;QD=15.7754703911;SC=CCACAACCTGTGTCCACCTTG;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=77;TCF=48;TCR=29;TR=38,74;WE=4453333;WS=4453314;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.49:77
chr19	4453325	rs411833	G	C	924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=1.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.63;ReadPosRankSum=-0.401;SOR=0.498;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,43:0.49:87
chr19	4454000	rs11909	G	A	1018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.473;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=19;PP=591;ReadPosRankSum=0.449;SC=GGGCTAGGGCGGCAGCGGCTG;SOR=0.836;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=113;TCF=61;TCR=52;TR=46;WE=4454008;WS=4453990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,50:0.41:121
chr19	4454083	rs1127888	C	T	855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.790;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=22;PP=509;ReadPosRankSum=-0.931;SC=TCTTTGTGGGCCTTTTCCCTG;SOR=0.556;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=85;TCF=37;TCR=48;TR=41;WE=4454091;WS=4454073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,44:0.48:92
chr19	4457496	rs10425328	CG	GC	1102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=20;NR=1;PP=503;SC=CTGACCCTCGCGTGCCGCTCC;SOR=5.058;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=21;WE=4457505;WS=4457486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	4457518	rs56153949	C	G	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.863;HP=1;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=256;ReadPosRankSum=1.943;SC=AGCCCCTCATCCTCTCCGATC;SOR=1.218;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=47;TCF=37;TCR=10;TR=20;WE=4457526;WS=4457508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,21:0.43:49
chr19	4475606	rs3816048	T	C	2728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=57;PP=1537;SC=GGAGAGCCAGTGTGAAGCGCG;SOR=1.454;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=36;TCR=57;TR=93;WE=4475614;WS=4475596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr19	4488926	rs10421685	G	A	1849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=36;PP=1021;SC=CTGATGTCTCGCCTGGCAGCT;SOR=1.503;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=72;TCF=23;TCR=49;TR=59;WE=4488934;WS=4488916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr19	4491476	rs11878416	G	C	686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=19;NR=1;PP=542;SC=GAGCTCAGCTGTCGTGGGTGG;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=4491484;WS=4491466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	4493708	rs892161	A	G	1336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=10;PP=717;SC=AGAAGGCGCCATCAGCCTCCG;SOR=1.519;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=34;TCR=10;TR=44;WE=4493716;WS=4493698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr19	4496198	rs2288930	A	G	1830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=15;PP=1010;SC=GTGGAGGGCGACAGAAAGGGT;SOR=1.473;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=40;TCR=15;TR=55;WE=4496206;WS=4496188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr19	4498154	rs919798	G	A	944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.94;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	4498157	rs919797	G	A	944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.99;SOR=3.816;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	4498245	rs2288926	A	G	709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=5;PP=507;SC=CTGCCCTTGAACAGCTGGCCC;SOR=2.124;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=23;WE=4498253;WS=4498235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	4498700	rs10406139	A	T	262.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=202;SC=TTCTGCAGATACAGCTCCCCT;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=4498708;WS=4498697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	4499632	rs72100503	AAGCTGGCCGGGGAGG	A	1264.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.481;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.303;NF=0;NR=27;PP=2933;ReadPosRankSum=1.701;SC=GGCCGAGGAGAAGCTGGCCGG;SOR=2.256;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=65;TCF=0;TCR=65;TR=27;WE=4499654;WS=4499622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,49:0.96:51
chr19	4502201	rs8887	T	C	2845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.87;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr19	4502282	rs13041	C	T	395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.97;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	4502287	rs7254167	G	T	363.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.42;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	4508945	rs8105775	A	G	6910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=118;NR=116;PP=2965;SC=CCTTTGGCCCAGGCTGGGAGG;SOR=0.805;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=234;TCF=118;TCR=116;TR=234;WE=4508953;WS=4508935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,262:1.00:262
chr19	4511350	rs7259721	T	A	7841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-6.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=441;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.317;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.914;NF=174;NR=138;PP=2962;ReadPosRankSum=3.358;SC=CTTTGGCCACTTTCGCAGCAC;SOR=0.494;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=382;TCF=194;TCR=188;TR=312;WE=4511358;WS=4511340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,346:0.78:441
chr19	4511453	rs7255187	G	A	12860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=481;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=207;NR=206;PP=2965;SC=GGCCACGTTCGCAGCACCGGT;SOR=0.731;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=418;TCF=211;TCR=207;TR=413;WE=4511461;WS=4511443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,481:1.00:481
chr19	4511525	rs7256712	A	G	9051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=182;NR=178;PP=2965;SC=GTCTACACCCATCTGGACGGC;SOR=0.723;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=361;TCF=182;TCR=179;TR=360;WE=4511533;WS=4511515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,339:1.00:339
chr19	4511647	rs7256387	C	G	5196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=54;NR=77;PP=2965;SC=CTTTGGCCAACTTCACAGCCC;SOR=1.066;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=54;TCR=77;TR=131;WE=4511655;WS=4511624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr19	4511725	rs73920825	T	C	3843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=51.99;QD=45.22;SOR=1.101;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr19	4511730	rs62115190	T	C	3470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=51.62;QD=45.07;SOR=0.948;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr19	4511737	.	T	C	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=25;MMLQ=28;MQ=53.16;NF=46;NR=22;PP=2962;QD=20;SC=GGATGGCCCCTTTGGCCACAT;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=189;TCF=118;TCR=71;TR=68;WE=4511754;WS=4511714;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:121,68:0.36:189
chr19	4511746	.	A	T	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MMLQ=24;MQ=54.21;NF=80;NR=34;PP=2962;QD=20;SC=CTTTGGCCACATTCGCAGCAC;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=223;TCF=139;TCR=84;TR=114;WE=4511754;WS=4511714;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:109,114:0.51:223
chr19	4511791	.	A	C	2557	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=39;MMLQ=23;MQ=57.7;NF=108;NR=68;PP=2557;QD=20;SC=CCTTGGTACCAGTTAGGACAG;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=349;TCF=208;TCR=141;TR=176;WE=4511799;WS=4511781;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:173,176:0.50:349
chr19	4511830	.	A	G	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=36;MMLQ=24;MQ=58.64;NF=93;NR=100;PP=2962;QD=20;SC=TGGTCTGGACAGTCCCTTTGG;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=427;TCF=222;TCR=205;TR=193;WE=4511838;WS=4511820;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:234,193:0.45:427
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chr19	4511927	rs10422025	G	A	5950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=369;ExcessHet=3.0103;FS=3.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQRankSum=-3.935;QD=16.30;ReadPosRankSum=0.813;SOR=0.536;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:203,162:0.44:365
chr19	4511927	.	GCA	ACG	2944	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MMLQ=24;NF=91;NR=114;PP=2944;QD=20;SC=ACCTGTCTGGGCAGCCCCTTT;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=395;TCF=200;TCR=195;TR=205;WE=4511943;WS=4511898;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:190,205:0.52:395
chr19	4511929	rs10424401	A	G	5947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=364;ExcessHet=3.0103;FS=1.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQRankSum=-3.565;QD=16.39;ReadPosRankSum=0.386;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:201,162:0.45:363
chr19	4511955	rs7260518	T	C	10761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=398;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=204;NR=180;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.607;SC=TTCACAGCACTGGTCACCCCA;SOR=0.307;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=386;TCF=205;TCR=181;TR=384;WE=4511963;WS=4511945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,396:1.00:397
chr19	4512514	rs7259625	G	C	3908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=379;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.771;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.918;NF=91;NR=83;PP=2726;ReadPosRankSum=-0.082;SC=TGTCCAGGCCGCCCTGGACGG;SOR=0.749;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=352;TCF=181;TCR=171;TR=174;WE=4512522;WS=4512504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:195,184:0.49:379
chr19	4512669	rs55901236	T	C	2141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.476;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=54;PP=1514;ReadPosRankSum=0.309;SC=CTGCAGACGGTGTCCTTTGTA;SOR=0.752;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=219;TCF=104;TCR=115;TR=98;WE=4512677;WS=4512659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,103:0.43:241
chr19	4512748	rs112063407	T	C	4026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=357;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.731;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=86;PP=2015;ReadPosRankSum=-0.784;SC=TCGCTGCCCCTGTGAGCCCAG;SOR=0.796;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=314;TCF=154;TCR=160;TR=167;WE=4512756;WS=4512738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,189:0.53:356
chr19	4513143	.	CA	TG	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.57;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=45.31;NF=49;NR=28;PP=2947;QD=20;SC=TTCATGGCACCAGTCACCCCA;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=83;TCF=52;TCR=31;TR=77;WE=4513152;WS=4513133;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,77:0.93:83
chr19	4513559	rs4807597	A	G	4944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=73;PP=2965;SC=GCTGGACACCACCTCCTTGGT;SOR=0.857;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=170;TCF=96;TCR=74;TR=169;WE=4513567;WS=4513549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr19	4525046	rs1610090	A	G	1584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=0.679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.68;ReadPosRankSum=0.191;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,75:0.60:125
chr19	4525264	rs117658601	G	A	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.842;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr19	4529622	rs147345372	TACACACACACAC	T	250.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=27.86;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr19	4534144	.	A	G	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.878;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.491;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=207;ReadPosRankSum=2.103;SC=GCACCTGCCCAGGCATCAGAT;SOR=1.061;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=14;WE=4534152;WS=4534134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,13:0.37:35
chr19	4538599	rs966384	G	A	1519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.315;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=34;PP=1005;ReadPosRankSum=0.606;SC=AAGAGGCCCGGGGGCAGCCCG;SOR=0.858;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=124;TCF=60;TCR=64;TR=62;WE=4538607;WS=4538589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,68:0.47:145
chr19	4544645	rs28731213	T	A	260.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.26;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	4546592	rs112691576	T	TTTAA	456.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.52;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	4548015	rs4807602	G	A	1223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=12;PP=673;SC=TCCCGCCCACGGCTGGCCTGG;SOR=1.154;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=25;TCR=12;TR=37;WE=4548023;WS=4548005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr19	4548245	rs10853972	C	A	9024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=173;NR=137;PP=2965;SC=CTCCTGCTGGCGACCCCTTCC;SOR=0.876;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=310;TCF=173;TCR=137;TR=310;WE=4548253;WS=4548235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,330:1.00:330
chr19	4550383	rs28667487	G	T	1113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=2.826;NF=13;NR=24;PP=1598;ReadPosRankSum=0.309;SC=CGACCCTCAGGTTTTTTGTTT;SOR=0.735;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=82;TCF=32;TCR=50;TR=37;WE=4550397;WS=4550373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,54:0.52:104
chr19	4550386	rs138569803	T	TTTTG	1481.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.756;NF=0;NR=21;PP=1606;ReadPosRankSum=-0.095;SC=CCCTCAGGTTTTTTGTTTGTT;SOR=0.698;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=2;TCR=49;TR=21;WE=4550397;WS=4550373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,42:0.54:78
chr19	4550698	rs2043328	C	T	521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=1;PP=406;SC=AACTGTATAACGGGTACAGCT;SOR=3.500;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=4550706;WS=4550688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	4554583	rs1610094	A	C	1005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.854;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=21;PP=510;ReadPosRankSum=-0.312;SC=AAGGGGGGACATAGGCTGGTT;SOR=0.576;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=75;TCF=28;TCR=47;TR=36;WE=4554591;WS=4554573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,45:0.53:85
chr19	4555310	rs10853973	T	C	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=124;ReadPosRankSum=-1.519;SC=AAGCCCCAAATCCCGCTGAGC;SOR=0.551;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=9;WE=4555318;WS=4555300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr19	4557056	rs10422881	A	C	1607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.058;HP=1;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=38;PP=936;ReadPosRankSum=-1.273;SC=TGAGGGGGTAACGGGTCCCAG;SOR=0.887;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=136;TCF=54;TCR=82;TR=61;WE=4557064;WS=4557046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,72:0.46:156
chr19	4558431	rs2304213	C	G	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.70;ReadPosRankSum=0.336;SOR=0.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr19	4682878	rs148398571	CAG	C	40.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FS=3.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.24;ReadPosRankSum=0.974;SOR=0.542;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:152,17:0.10:169
chr19	4720031	rs3833278	C	CCCT	897.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=11;PP=546;SC=CCCCTTCGCCCCCTCCTCATT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=11;WE=4720060;WS=4720021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	4720042	rs11672100	G	T	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=266;SC=CCTCCTCATTGCTCCAGGCAG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=4720060;WS=4720021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
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chr19	4723670	rs2277732	C	A	319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=2;PP=248;SC=GGACGAGGCGCGCGGGCGCTG;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=4723678;WS=4723660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
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chr19	4844633	rs17363814	C	T	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=3;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=182;ReadPosRankSum=-0.897;SC=AGAGTGGCATCGGGACTCCAA;SOR=0.160;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=12;WE=4844641;WS=4844623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr19	4844665	rs36066928	TC	T	1065.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=5;PP=854;SC=CACCCCCCAGTCCCCTCATGG;SOR=2.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=23;WE=4844673;WS=4844655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	4847713	rs9973235	A	G	1220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=11;PP=750;SC=CAGGCTTAGGACCTGCGACAG;SOR=1.501;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=26;TCR=11;TR=37;WE=4847721;WS=4847703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	4847874	rs9304915	A	G	4950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=91;NR=81;PP=2849;SC=ACGCGACGTCAAAGCCATCCA;SOR=0.759;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=172;TCF=91;TCR=81;TR=172;WE=4847882;WS=4847864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr19	4852106	rs2271058	A	G	11458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=436;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=209;NR=195;PP=2965;SC=ACCCCACTCAACACCATCTGG;SOR=0.712;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=404;TCF=209;TCR=195;TR=404;WE=4852114;WS=4852086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,436:1.00:436
chr19	4852137	rs1055919	C	T	3319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=403;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.526;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=83;PP=2071;ReadPosRankSum=1.695;SC=AGCCCATGACCGATTGGACGC;SOR=0.615;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=380;TCF=184;TCR=196;TR=165;WE=4852145;WS=4852127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:230,173:0.43:403
chr19	4859937	rs8289	T	C	3239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=50;PP=1759;SC=ACAGTCTTGATGTGCGGGTAG;SOR=0.831;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=66;TCR=50;TR=116;WE=4859945;WS=4859927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr19	4902950	rs2602717	C	T	444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=408;SC=CTCAGAGTTCCGGGAAGTGGG;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=15;WE=4902958;WS=4902940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	4941456	rs2251519	C	T	1496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=3;PP=996;SC=CCAGGCATCCCGAGAACCCGT;SOR=4.003;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=44;TCF=40;TCR=4;TR=43;WE=4941464;WS=4941446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr19	4944555	rs2602730	G	A	7347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=99;NR=138;PP=2965;SC=CCAGGGGTCAGGGTGGTTACC;SOR=1.166;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=238;TCF=99;TCR=139;TR=237;WE=4944563;WS=4944545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,269:1.00:269
chr19	4944596	rs2251117	T	C	3167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=77;PP=1918;SC=AGGAGGGGTGTGGAAAGCCTG;SOR=1.971;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=109;TCF=32;TCR=77;TR=109;WE=4944604;WS=4944586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr19	4945914	rs2250982	A	C	452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.34;QD=45.28;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	4945917	rs2250981	C	T	452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.59;QD=41.16;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	4945974	rs2250978	T	C	701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.03;QD=24.20;SOR=2.226;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr19	4954454	rs2247238	C	T	1507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=28;NR=20;PP=742;SC=AGGGGGGCTTCGCGTCCCCCA;SOR=0.836;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=28;TCR=20;TR=48;WE=4954462;WS=4954444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr19	4954679	rs55946225	G	GC	1857.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=12;PP=1777;SC=CCCGAGCAGGGCGGGTCCCCG;SOR=2.540;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=30;TCR=13;TR=40;WE=4954687;WS=4954669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr19	5041178	rs2240678	T	C	9649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=375;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=183;NR=158;PP=2965;ReadPosRankSum=1.953;SC=AGGACTTTGATGACCTTGAAC;SOR=0.800;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=344;TCF=184;TCR=160;TR=341;WE=5041186;WS=5041168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,373:0.99:375
chr19	5041316	rs2240679	T	G	3641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=86;PP=2626;SC=TGGGTGGTGGTGGGAGGGCCC;SOR=1.972;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=119;TCF=33;TCR=86;TR=119;WE=5041324;WS=5041306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr19	5070809	rs730291	C	T	976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=4;PP=755;SC=TCCTCACTCCCCGCTCCTCCA;SOR=3.611;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=32;WE=5070817;WS=5070799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	5110794	rs2613739	A	G	1468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=38;PP=1058;SC=CCTGGAGTGCATCCCGGGCCT;SOR=2.393;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=12;TCR=38;TR=50;WE=5110802;WS=5110784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr19	5111385	rs200439733	GA	G	4878.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=45;PP=2951;SC=CTCCCACTCAGAACCCCTCCC;SOR=1.239;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=82;TCF=35;TCR=47;TR=78;WE=5111393;WS=5111375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr19	5111994	rs2613736	A	G	2250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=53;PP=1501;SC=GCCAGGCACGATCGCTCACAC;SOR=2.332;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=18;TCR=53;TR=71;WE=5112002;WS=5111984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr19	5114116	rs1017820	T	G	5574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=87;PP=2965;ReadPosRankSum=0.442;SC=GGTGGCGCTGTGCGTTCTGGT;SOR=0.261;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=185;TCF=98;TCR=87;TR=184;WE=5114124;WS=5114106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,203:1.00:204
chr19	5119544	rs2256523	C	T	1301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=2;PP=868;SC=AGGAGGCCCCCTGCTCATGGA;SOR=3.160;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=39;TCF=37;TCR=2;TR=39;WE=5119552;WS=5119534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr19	5132051	rs2620839	G	A	1230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=34;PP=998;SC=GGCTCTCATCGGCCCTGCTCC;SOR=3.556;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=5;TCR=34;TR=39;WE=5132059;WS=5132041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr19	5134096	rs2251561	C	T	716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=17;PP=479;SC=CCTCACGGGTCCCAGAGAACC;SOR=2.215;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=23;WE=5134104;WS=5134086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	5135392	rs2620836	A	G	9081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=171;NR=138;PP=2965;SC=CTCCCTCGGAAAGGGCTGCCC;SOR=0.984;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=309;TCF=171;TCR=138;TR=309;WE=5135400;WS=5135382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,333:1.00:333
chr19	5137192	rs2613790	C	T	1592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=43;NR=11;PP=1157;SC=CCAAGTTACCCGGCCCCTCCC;SOR=2.522;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=55;TCF=44;TCR=11;TR=54;WE=5137200;WS=5137182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr19	5137846	rs2613786	G	A	447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=6;PP=358;SC=AGGAGCATACGCCTGCACCGA;SOR=1.112;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=9;TCR=6;TR=15;WE=5137854;WS=5137836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	5174030	rs2620822	A	G	3478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=37;PP=2186;SC=GCGTGAATCCAGGAGGCGGAG;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=120;TCF=83;TCR=37;TR=120;WE=5174038;WS=5174020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr19	5174180	rs2620821	C	T	3487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=77;PP=2286;SC=AGCAAAGTCTCGTCACCACGG;SOR=1.667;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=39;TCR=77;TR=116;WE=5174188;WS=5174170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr19	5206775	rs1143700	A	G	5802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=119;NR=88;PP=2965;SC=GCCTGGGGGGAACCATGGCTT;SOR=1.028;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=207;TCF=119;TCR=88;TR=207;WE=5206783;WS=5206765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr19	5208216	rs60630722	G	A	1985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=19;PP=1370;SC=TCCCCAGCAGGGCCAAAAGCT;SOR=1.681;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=42;TCR=19;TR=61;WE=5208224;WS=5208206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr19	5208236	rs55727125	G	A	2681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=28;PP=1591;SC=TGGGACACTCGAGGGAGCTCA;SOR=1.378;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=58;TCR=28;TR=86;WE=5208244;WS=5208226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr19	5208514	rs139873720	TG	T	1964.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=35;PP=1550;SC=GTTTTTGAGATGGAGTTTCAC;SOR=2.137;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=4;TCR=35;TR=39;WE=5208522;WS=5208504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	5210622	rs2302224	G	A	8208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=159;NR=117;PP=2965;SC=AGGAGATGGCGGCCGTGGTCA;SOR=0.939;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=276;TCF=159;TCR=117;TR=276;WE=5210630;WS=5210612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,297:1.00:297
chr19	5212380	rs1064300	C	T	4615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=93;NR=63;PP=2622;SC=CGGCATCTGGCGGGTTGCAGG;SOR=0.944;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=157;TCF=93;TCR=64;TR=156;WE=5212388;WS=5212370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr19	5212482	rs2230611	G	A	4285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=67;NR=73;PP=2220;SC=GGCGGACCTCGCGTTTCTCAC;SOR=0.921;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=140;TCF=67;TCR=73;TR=140;WE=5212490;WS=5212472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr19	5212586	rs4807696	G	T	1414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=25;PP=788;SC=CGGGTGTGGTGGCTCATGCCT;SOR=1.201;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=19;TCR=25;TR=44;WE=5212594;WS=5212576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr19	5214533	rs9304921	A	G	6297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=103;NR=103;PP=2965;SC=GGACAGGCTGACTGGCAGGGG;SOR=0.720;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=206;TCF=103;TCR=103;TR=206;WE=5214541;WS=5214523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr19	5214697	rs4807697	A	G	6100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=114;PP=2965;SC=GCGTTCTGACACCGGTAGCCG;SOR=0.955;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=210;TCF=96;TCR=114;TR=210;WE=5214705;WS=5214687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr19	5215474	rs73919781	G	A	2412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=34;NR=45;PP=1581;SC=CTGTGAGGCCGAGGTGATGAG;SOR=1.065;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=80;TCF=34;TCR=46;TR=79;WE=5215482;WS=5215464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr19	5220900	rs10412973	T	C	1199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=10;PP=750;SC=TGATAGGGTCTGTGTTTCATA;SOR=1.880;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=31;TCR=10;TR=41;WE=5220908;WS=5220890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr19	5222071	rs3746132	G	C	1147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=7;PP=752;SC=TGAGCCTTAAGCCCTGCTGAA;SOR=2.891;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=34;WE=5222079;WS=5222061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr19	5250958	rs10598598	CGGGGGGGGGG	C	1001.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.05;QD=41.74;SOR=1.519;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	5255992	rs34548642	A	AT	485.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=238;ReadPosRankSum=0.174;SC=TCATTTTTCTATTTTTTTTCC;SOR=2.303;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=12;WE=5256000;WS=5255982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,19:0.95:20
chr19	5256251	.	G	GT	375	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;FR=1.0000;HP=12;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=22;MQ=56.98;NF=0;NR=20;PP=375;QD=19.35;SC=ATAGTTTGTTGTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=20;WE=5256259;WS=5256238;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:10,20:0.67:30
chr19	5260878	rs36016542	T	C	9284.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=97;NR=94;PP=2965;SC=ACAAGGCGGTTGTTGGGGGGC;SOR=0.781;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=192;TCF=97;TCR=95;TR=191;WE=5260897;WS=5260868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr19	5260879	rs10708972	GT	G	5910.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.155;NF=23;NR=89;PP=2969;ReadPosRankSum=-1.002;SC=CAAGGCGGTTGTTGGGGGGCC;SOR=0.781;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=115;TCF=23;TCR=92;TR=112;WE=5260897;WS=5260868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,188:0.99:190
chr19	5260933	rs7246162	A	T	3063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=59;PP=1880;SC=GCCAGGCCTCAGCACTCTGCC;SOR=1.074;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=47;TCR=60;TR=106;WE=5260941;WS=5260923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr19	5263061	rs55840918	G	T	1514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.83;ReadPosRankSum=0.508;SOR=0.250;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,60:0.98:61
chr19	5264967	rs4807017	A	G	1570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=16;PP=1005;SC=GATGCTCCCCACCCCCTGCTG;SOR=1.609;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=58;TCF=42;TCR=16;TR=57;WE=5264975;WS=5264957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr19	5265222	rs4807703	G	A	813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=20;PP=559;SC=GGGCAGAGACGTGAGAGAAAT;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=24;WE=5265230;WS=5265212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	5273571	rs1141371	T	G	5889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=114;PP=2965;SC=GCACTGCCCCTGCACTCTCAT;SOR=1.059;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=205;TCF=91;TCR=114;TR=205;WE=5273579;WS=5273561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr19	5286162	rs368042337	G	A	2582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.533;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=60;PP=1415;ReadPosRankSum=2.794;SC=GCTTGGCAGCGACCTCCGATC;SOR=0.512;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=229;TCF=95;TCR=134;TR=107;WE=5286170;WS=5286152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,126:0.50:250
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chr19	5667204	rs148831822	AC	A	606.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=3.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQRankSum=0.000;QD=5.78;ReadPosRankSum=0.000;SOR=0.397;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,35:0.33:105
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chr19	5692311	rs3818815	G	C	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=242;ReadPosRankSum=-0.959;SC=CCTGGGGACCGGCGATACACA;SOR=1.609;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=15;WE=5692319;WS=5692301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr19	5694630	rs2436514	C	T	759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=21;PP=640;SC=GGTGGGGTGACGGGCACAGAA;SOR=2.303;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=27;WE=5694638;WS=5694620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	5696101	rs1062367	C	T	2050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.864;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=37;PP=1173;ReadPosRankSum=1.018;SC=CCACGTAGCCCGACACGTTGA;SOR=0.964;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=188;TCF=104;TCR=84;TR=87;WE=5696109;WS=5696091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,100:0.47:214
chr19	5696146	rs3745624	G	A	2654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.401;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=54;PP=1510;ReadPosRankSum=-0.280;SC=GCTCGGGGATGGTGTCCGTGA;SOR=0.552;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=230;TCF=125;TCR=105;TR=117;WE=5696154;WS=5696136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,133:0.52:258
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chr19	5696452	rs45534135	A	G	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.282;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=160;ReadPosRankSum=1.970;SC=GGGAGACCCCAGGGTCAGGGC;SOR=0.202;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=11;WE=5696460;WS=5696442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,14:0.37:38
chr19	5696530	rs45554833	G	A	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.237;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=3;PP=41;ReadPosRankSum=2.044;SC=GGGCGTGGCTGTGGGTGGGAG;SOR=0.105;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=5;WE=5696538;WS=5696522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr19	5696646	rs3840916	C	CGGGTCAGGGTTGCCTGGGGCTCT	1795.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=14.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQRankSum=0.000;QD=14.84;ReadPosRankSum=0.058;SOR=1.955;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,37:0.31:121
chr19	5696820	rs58283603	A	G	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=22;PP=528;ReadPosRankSum=0.662;SC=GCTCGGCCACAACGACACCAT;SOR=0.657;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=23;TCR=47;TR=33;WE=5696828;WS=5696810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,38:0.49:77
chr19	5707204	rs945828	T	C	4504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=85;PP=2434;SC=GGCATCTGTGTGTGTAGGGCC;SOR=0.947;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=160;TCF=74;TCR=86;TR=159;WE=5707212;WS=5707194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr19	5707628	rs3737237	G	A	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.445;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=158;ReadPosRankSum=0.695;SC=GGAGGAACGGGGGCAGCCGGG;SOR=1.200;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=35;TCF=24;TCR=11;TR=13;WE=5707636;WS=5707618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr19	5727414	rs5826899	C	CT	4435.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=42;PP=2392;SC=TAGATTTGCCCCATTCATTCG;SOR=0.865;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=59;TCF=13;TCR=46;TR=55;WE=5727422;WS=5727404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr19	5737317	rs146750120	A	T	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.776;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=105;ReadPosRankSum=0.494;SC=CATACCTGTAATCCCAGCACT;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=6;WE=5737325;WS=5737307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr19	5749070	rs58136456	C	T	2936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.432;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=57;PP=1628;ReadPosRankSum=1.170;SC=CAGAAATGACCAGCATTTCAA;SOR=0.708;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=251;TCF=128;TCR=123;TR=123;WE=5749078;WS=5749060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,140:0.50:281
chr19	5759231	rs11879365	T	G	727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=18;PP=512;SC=GAGAAGCAGGTCTGAGATCAG;SOR=2.494;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=5759239;WS=5759221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	5766090	rs2446200	T	C	3436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=63;NR=51;PP=1902;SC=CCTGGGTCCATATTTCTGTCT;SOR=0.788;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=114;TCF=63;TCR=51;TR=114;WE=5766098;WS=5766080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr19	5768331	rs10680062	T	TTTTA	602.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=12;PP=616;SC=AAATTAGGAATTTTATTTATT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=12;WE=5768339;WS=5768321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	5787215	.	G	GGTGGGAGGTCGTGGGAGATGGTGGGAGGTCGTGGGAGATGGTGGGAGGTAGTGGGAGACAGTGGCAGACAGTGGGAGGTGGTGGGAGATGGTGGCAGACGGTGGGAGGTGGTGGGAGACA	2656.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.34;QD=55.35;SOR=0.963;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr19	5788228	rs113274115	GCA	G	211.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FS=2.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.49;ReadPosRankSum=-1.079;SOR=1.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:120,22:0.15:142
chr19	5824420	rs71934499	GGT	G	2066.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=38;PP=1983;SC=AGTGGGAGGTGGTGGGGGGGT;SOR=0.910;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=45;TCF=5;TCR=40;TR=43;WE=5824429;WS=5824410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr19	5844537	rs778986	A	G	10413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=396;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=185;NR=185;PP=2965;SC=CACGATGACCATGTCTGCCTG;SOR=0.750;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=371;TCF=185;TCR=186;TR=370;WE=5844545;WS=5844527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,395:1.00:395
chr19	5844649	rs812936	G	A	4104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.31;SOR=1.094;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr19	5866585	rs778982	C	T	2187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=30;PP=1206;SC=AGTGAGGTCCCGGCAGCCCAG;SOR=0.934;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=47;TCR=30;TR=77;WE=5866593;WS=5866575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr19	5866654	rs778983	A	G	1827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=37;PP=1219;SC=TCTGGTACCTAGATTCCTGCT;SOR=0.910;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=39;TCR=37;TR=76;WE=5866662;WS=5866644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr19	5866736	rs57100281	T	C	509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.13;QD=26.83;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	5867177	rs778970	G	A	870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.807;NF=24;NR=19;PP=1642;ReadPosRankSum=1.666;SC=GCCGGACCACGGCTCCAGCCA;SOR=0.648;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=73;TCF=39;TCR=34;TR=43;WE=5867199;WS=5867167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,38:0.58:65
chr19	5867191	rs10412834	G	A	626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.381;NF=17;NR=16;PP=1127;ReadPosRankSum=-0.526;SC=CCAGCCAGCCGTAGGGCGTGA;SOR=0.610;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=84;TCF=47;TCR=37;TR=33;WE=5867199;WS=5867167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,32:0.40:80
chr19	5867748	rs778971	G	T	2771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.222;NF=51;NR=76;PP=1850;ReadPosRankSum=-0.655;SC=GGTCAGAGTAGCTGGGAAGAG;SOR=0.713;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=293;TCF=120;TCR=173;TR=127;WE=5867756;WS=5867738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:184,136:0.43:320
chr19	5892317	rs1626918	C	T	478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=2;PP=256;SC=CCTCAGCGCGCGCATCCGTGG;SOR=1.863;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=5892325;WS=5892307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	5892382	rs1678867	C	T	1275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=16;PP=781;SC=CCTGGAGGGCCGGGGAAGGGC;SOR=1.203;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=28;TCR=16;TR=44;WE=5892390;WS=5892372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr19	5892486	rs1628564	C	T	792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=16;PP=494;ReadPosRankSum=0.568;SC=ACTAGTCTTTCCTCCTGTCCA;SOR=0.680;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=111;TCF=67;TCR=44;TR=39;WE=5892494;WS=5892476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,43:0.35:123
chr19	5892568	rs1629368	G	T	1196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.296;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=29;PP=723;ReadPosRankSum=0.451;SC=TCCCGGCTGCGGTGGGCAGGA;SOR=0.797;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=140;TCF=75;TCR=65;TR=64;WE=5892576;WS=5892558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,66:0.44:149
chr19	5892585	rs60236148	G	A	1327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.924;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=30;PP=815;ReadPosRankSum=0.082;SC=AGGATGCATGGGAAGGAAGGG;SOR=0.763;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=138;TCF=71;TCR=67;TR=67;WE=5892593;WS=5892575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,69:0.47:147
chr19	5892770	rs1631032	C	T	1453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.168;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=25;PP=778;ReadPosRankSum=1.301;SC=CCGGTGCCCTCGAGTGGATGC;SOR=0.434;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=117;TCF=73;TCR=44;TR=59;WE=5892778;WS=5892760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,69:0.52:133
chr19	5893058	rs12980262	G	A	2682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=56;PP=1657;ReadPosRankSum=-1.979;SC=CGAGGCCCGGGCACCCAGCTC;SOR=0.663;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=233;TCF=125;TCR=108;TR=118;WE=5893066;WS=5893048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,129:0.50:258
chr19	5894584	rs12974991	G	A	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.645;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=242;ReadPosRankSum=-0.096;SC=GCAGGCAGGCGCGTGTGCAGG;SOR=0.148;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=16;WE=5894592;WS=5894574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr19	5894645	rs12975210	G	C	864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.580;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=15;PP=461;ReadPosRankSum=1.038;SC=CGCCCTCACCGGCTGCTGTGT;SOR=0.204;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=80;TCF=60;TCR=20;TR=41;WE=5894653;WS=5894635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,44:0.49:89
chr19	5896766	rs702064	C	T	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=135;ReadPosRankSum=0.356;SC=TACATGTATTCCTGATAAAGG;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=8;WE=5896774;WS=5896756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr19	5903807	rs8108064	G	T	4052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=76;PP=2367;SC=GACTTCTCGGGCTGCGCGCGC;SOR=1.298;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=129;TCF=53;TCR=76;TR=129;WE=5903815;WS=5903797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr19	5905141	rs10406399	G	A	854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.90;SOR=0.752;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	5908969	rs10404195	G	A	1548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=34;PP=963;ReadPosRankSum=1.480;SC=GACATCTGCCGCCGCCGGCCA;SOR=0.723;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=134;TCF=67;TCR=67;TR=66;WE=5908977;WS=5908959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,71:0.50:143
chr19	5913826	rs274784	C	T	562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.475;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=356;ReadPosRankSum=-0.968;SC=CCTAGACCTCCCAAAGTGCTG;SOR=0.148;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=42;TCF=34;TCR=8;TR=23;WE=5913834;WS=5913816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,25:0.53:47
chr19	5915151	rs74174355	C	T	1949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.550;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=34;PP=1277;ReadPosRankSum=0.788;SC=CTGAGAAGGACGGGCAGGTGG;SOR=0.522;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=168;TCF=104;TCR=64;TR=86;WE=5915159;WS=5915141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,93:0.50:187
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chr19	5962553	rs35941975	G	A	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.197;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=170;ReadPosRankSum=-1.594;SC=AGGACCCAGGGAGCCATGGTC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=8;WE=5962561;WS=5962544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr19	5994823	rs71942694	CGAG	C	1856.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.341;NF=16;NR=26;PP=1080;ReadPosRankSum=-1.751;SC=TTTGGAACCTCGAGGAGGCGC;SOR=1.073;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=49;TCF=17;TCR=32;TR=42;WE=5994838;WS=5994813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,72:0.97:74
chr19	5995450	rs452767	T	C	630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=5;PP=414;SC=CACCTGCTGCTCAGGCATCAC;SOR=1.931;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=21;WE=5995458;WS=5995440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	5995582	rs2302222	T	C	5289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=99;NR=78;PP=2965;SC=CCTGGGAGGGTCGTGGTGGGA;SOR=0.842;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=177;TCF=99;TCR=78;TR=177;WE=5995596;WS=5995572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr19	6002917	rs28421560	A	G	2133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=39;PP=1208;SC=AGGGGTTCGCAGGGAGAGCCT;SOR=1.281;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=30;TCR=39;TR=69;WE=6002925;WS=6002907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr19	6141471	rs10853992	C	A	765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.086;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=9;PP=493;ReadPosRankSum=-1.851;SC=TTGGCCTCATCCCTACAGCCC;SOR=0.322;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=57;TCF=45;TCR=12;TR=33;WE=6141479;WS=6141461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,35:0.56:62
chr19	6141758	rs9304926	G	T	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.721;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=172;ReadPosRankSum=-1.898;SC=CCACCCTTTTGTTTTGAGACA;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=7;WE=6141766;WS=6141747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr19	6147743	rs9304929	G	C	945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.994;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=25;PP=580;ReadPosRankSum=-0.243;SC=ATAGGTAACAGACATACATAC;SOR=0.911;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=73;TCF=18;TCR=55;TR=33;WE=6147751;WS=6147733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,39:0.46:84
chr19	6151549	rs10422296	T	C	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=4.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.99;ReadPosRankSum=-2.287;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr19	6151703	rs7252466	C	T	910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.933;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=15;PP=490;ReadPosRankSum=1.200;SC=TTTCTGTTTGCTTTTTCCTTC;SOR=0.862;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=81;TCF=47;TCR=34;TR=41;WE=6151711;WS=6151693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,46:0.50:92
chr19	6156483	rs4807840	T	C	4287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=370;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.374;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=87;PP=2768;ReadPosRankSum=0.730;SC=TCTGCCGAGGTTTGTCAATAT;SOR=0.670;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=343;TCF=180;TCR=163;TR=185;WE=6156491;WS=6156473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,198:0.54:370
chr19	6156510	rs33937754	A	G	3389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=80;PP=2062;ReadPosRankSum=-0.689;SC=ACTCATGCCAAAGTGAACATC;SOR=0.701;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=327;TCF=163;TCR=164;TR=156;WE=6156518;WS=6156500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,167:0.47:352
chr19	6190809	rs72157010	CAT	C	204.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.020;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=2;HapScore=4;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=177;ReadPosRankSum=0.281;SC=AAAACACACACATACACACAT;SOR=0.141;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=6;WE=6190827;WS=6190799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr19	6213734	rs2233196	C	G	1929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.543;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=40;PP=1192;ReadPosRankSum=1.420;SC=GGTGCCCCCCCACCTTGTCGT;SOR=0.767;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=177;TCF=100;TCR=77;TR=92;WE=6213742;WS=6213724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,100:0.54:184
chr19	6230771	rs2233185	T	G	1313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=31;PP=785;ReadPosRankSum=2.599;SC=GTGGCCGTGGTGCAGGGACAC;SOR=0.735;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=105;TCF=45;TCR=60;TR=54;WE=6230779;WS=6230761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,61:0.52:118
chr19	6262355	rs2227261	C	T	3121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=342;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.824;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=65;PP=1800;ReadPosRankSum=-0.846;SC=ACCCATCAGCCTCCTGCCTGT;SOR=0.573;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=308;TCF=155;TCR=153;TR=138;WE=6262363;WS=6262345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,157:0.46:342
chr19	6306971	rs4807863	G	A	1120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=29;PP=890;SC=ACTTCTCATGGCTCTTGACCA;SOR=3.383;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=34;WE=6306979;WS=6306961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	6307179	rs142427159	T	C	1962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.117;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=35;PP=1292;ReadPosRankSum=0.311;SC=GCTGTGCAGATAGAAGAAATG;SOR=0.798;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=175;TCF=101;TCR=74;TR=85;WE=6307187;WS=6307169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,93:0.48:194
chr19	6333290	rs2335192	T	C	1174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=2;PP=876;SC=ACCACAGAGCTTGGCATCAAG;SOR=4.351;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=34;WE=6333298;WS=6333280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr19	6361845	rs57445020	G	GC	6061.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-2.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.127;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.146;NF=22;NR=62;PP=2973;ReadPosRankSum=0.284;SC=TCGGCTGGCTGCCCCGGCCCC;SOR=0.325;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=92;TCF=25;TCR=67;TR=84;WE=6361853;WS=6361835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,188:0.99:189
chr19	6415443	rs1616305	T	C	8511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=151;NR=155;PP=2965;SC=GCTGTGGGGGTGCTCCGGGCT;SOR=0.768;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=306;TCF=151;TCR=155;TR=306;WE=6415451;WS=6415433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,330:1.00:330
chr19	6415795	rs8103311	T	C	1385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.316;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=28;PP=792;ReadPosRankSum=-1.483;SC=GGGCCTGCCCTCCGCCAGGTG;SOR=0.737;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=107;TCF=56;TCR=51;TR=55;WE=6415803;WS=6415785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,64:0.53:121
chr19	6416443	rs146253337	G	GT	4335.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.630;NF=19;NR=56;PP=2933;ReadPosRankSum=0.916;SC=AGTAACCAAGGTAAGTGGGCT;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=176;TCF=45;TCR=131;TR=75;WE=6416451;WS=6416433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,142:0.46:308
chr19	6417855	rs2258496	G	A	2534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=40;PP=1360;ReadPosRankSum=0.262;SC=ACTGGCACCTGGGGAGGGAGG;SOR=0.687;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=181;TCF=107;TCR=74;TR=99;WE=6417863;WS=6417845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,114:0.57:201
chr19	6418142	rs2860167	C	T	3037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.075;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=70;PP=1744;ReadPosRankSum=-1.281;SC=TGCCCCACACCCCCCCACCTC;SOR=0.519;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=201;TCF=81;TCR=120;TR=121;WE=6418150;WS=6418132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,138:0.60:230
chr19	6419275	rs2305059	A	G	2324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=48;PP=1382;ReadPosRankSum=1.054;SC=CCGCTGTCTGAAAAGAGGAGA;SOR=0.674;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=191;TCF=102;TCR=89;TR=98;WE=6419283;WS=6419265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,111:0.51:219
chr19	6436304	rs2860182	TC	CT	608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;JOINED;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=646;ReadPosRankSum=-0.229;SC=TCCAGTTGTTTCGGTGGAGGG;SOR=0.399;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=14;WE=6436313;WS=6436294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr19	6443675	rs348341	G	A	1267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=24;PP=626;ReadPosRankSum=1.326;SC=CATCTCCAGTGAAAATCACAA;SOR=0.734;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=114;TCF=58;TCR=56;TR=51;WE=6443683;WS=6443665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,63:0.48:131
chr19	6452305	rs173229	A	G	1073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.232;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=17;PP=702;ReadPosRankSum=-0.414;SC=GGGAAAGAGGAACGCGCTGCC;SOR=1.244;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=87;TCF=54;TCR=33;TR=50;WE=6452313;WS=6452295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,52:0.55:94
chr19	6456019	rs10424879	T	C	1732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.43;ReadPosRankSum=0.589;SOR=0.604;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,44:0.47:94
chr19	6456019	.	TGC	CGA	1119	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=26;NR=12;PP=1119;QD=30.8544177595;SC=TGTGAGCCACTGCGCCTGGCC;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=86;TCF=60;TCR=26;TR=38;WE=6456029;WS=6456009;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:48,38:0.44:86
chr19	6456021	rs10418566	C	A	1732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.99;ReadPosRankSum=0.405;SOR=0.681;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,48:0.47:102
chr19	6456146	rs111282539	A	C	880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.680;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=25;PP=408;ReadPosRankSum=-1.602;SC=CCATCTGGTGAGCTCTTTCTT;SOR=0.819;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=126;TCF=52;TCR=74;TR=44;WE=6456154;WS=6456136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,52:0.38:137
chr19	6456324	rs10425555	T	C	742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.341;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=4;PP=534;ReadPosRankSum=0.972;SC=GCCTTCTCCTTCTGGAAAGTC;SOR=0.188;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=46;TCF=42;TCR=4;TR=26;WE=6456332;WS=6456314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,28:0.56:50
chr19	6456339	rs10425567	T	C	894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.829;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=7;PP=659;ReadPosRankSum=0.619;SC=AAAGTCCTGGTCCAGCCCATC;SOR=0.349;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=63;TCF=52;TCR=11;TR=33;WE=6456347;WS=6456329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,36:0.53:68
chr19	6457367	rs348370	T	C	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.049;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=142;ReadPosRankSum=0.154;SC=TGTGAGCCACTGCGCCTGGCC;SOR=0.223;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=12;WE=6457375;WS=6457357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr19	6458240	rs2289784	G	C	1217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.636;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=14;PP=811;ReadPosRankSum=0.675;SC=TGTGAAACATGAGCAGCAGAC;SOR=1.182;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=118;TCF=79;TCR=39;TR=53;WE=6458248;WS=6458230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,57:0.45:127
chr19	6459677	rs118160965	C	T	1046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.978;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=36;PP=768;ReadPosRankSum=0.369;SC=CCGGCAGCGGCGGCCTCAGTG;SOR=0.478;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=92;TCF=20;TCR=72;TR=47;WE=6459685;WS=6459667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,48:0.49:97
chr19	6466482	rs348362	A	G	2093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.502;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=45;PP=1285;ReadPosRankSum=0.283;SC=TGCAGCGTCCAGAAGCCATCA;SOR=0.638;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=196;TCF=110;TCR=86;TR=101;WE=6466490;WS=6466472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,107:0.50:213
chr19	6468907	rs35001260	G	A	906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.736;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=17;PP=582;ReadPosRankSum=1.480;SC=CGGTCTGAGCGGCTGGGGAGG;SOR=0.572;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=99;TCF=58;TCR=41;TR=41;WE=6468915;WS=6468897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,44:0.41:107
chr19	6469735	.	C	CT	138.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.114;ClippingRankSum=0.000;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.02;ReadPosRankSum=-0.238;SOR=0.487;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,12:0.26:46
chr19	6471123	rs202082317	AT	A	132.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.425;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.616;HP=12;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.431;NF=4;NR=1;PP=45;ReadPosRankSum=-2.287;SC=CACCTAGCGAATTTTTTTTTT;SOR=1.863;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=5;WE=6471131;WS=6471113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr19	6478925	rs3745570	C	G	2407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.431;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=65;PP=1702;ReadPosRankSum=0.970;SC=CCCATCCCCCCCTCCAACCCC;SOR=0.660;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=269;TCF=130;TCR=139;TR=123;WE=6478933;WS=6478915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,127:0.44:287
chr19	6495064	rs446199	C	G	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=124;ReadPosRankSum=-0.159;SC=TTAGGGTCAGCGGGGAGTCAG;SOR=0.446;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=10;WE=6495072;WS=6495054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr19	6585921	rs453462	G	C	175.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=140;SC=CCACCACTACGCCCCACCACA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=6585929;WS=6585911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	6589960	rs11361927	CT	C	1169.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=20;NR=2;PP=920;SC=CTGTCTCCCCCTCTCCGTTTC;SOR=2.448;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=6589968;WS=6589951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	6665020	rs344560	T	C	9818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=155;NR=146;PP=2965;SC=ACGACCACCTTCTCCCCAGCC;SOR=0.751;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=301;TCF=155;TCR=146;TR=301;WE=6665028;WS=6665010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,354:1.00:354
chr19	6677989	rs17030	G	A	4231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=74;NR=71;PP=2501;SC=CGTCCTCCTCGGGCCAGTGCT;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=145;TCF=74;TCR=71;TR=145;WE=6677997;WS=6677979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr19	6679360	rs344555	T	C	2499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=35;PP=1766;SC=ATGGGATAGATGACCTGGGTA;SOR=1.153;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=48;TCR=35;TR=83;WE=6679368;WS=6679350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr19	6679511	rs2277984	C	T	9066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=157;NR=145;PP=2965;SC=CTTTCCTCTGCGGGCAGATGT;SOR=0.699;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=302;TCF=157;TCR=145;TR=302;WE=6679519;WS=6679501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,341:1.00:341
chr19	6679563	rs2277983	T	C	6514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=127;PP=2965;SC=CCAAAGACCATGCCTGGGAGG;SOR=1.231;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=217;TCF=90;TCR=127;TR=217;WE=6679571;WS=6679553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr19	6685304	rs2241393	G	C	403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=12;PP=332;SC=ATAACTGGAGGTCACTGGACT;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=6685312;WS=6685294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
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chr19	6696496	rs2287847	T	C	5573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=108;NR=76;PP=2965;SC=GAGTGAGAGATACCGATGGCT;SOR=0.902;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=184;TCF=108;TCR=76;TR=184;WE=6696504;WS=6696486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr19	6696557	rs2287846	C	G	5882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=105;NR=100;PP=2965;SC=TCATTTACCCCCCTTACCCTG;SOR=0.766;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=205;TCF=105;TCR=100;TR=205;WE=6696565;WS=6696547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr19	6696597	rs2287845	G	A	4482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=68;PP=2558;SC=CCCTGCAGCCGACTCACCACG;SOR=0.705;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=144;TCF=76;TCR=68;TR=144;WE=6696605;WS=6696587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr19	6696691	rs2355315	G	T	6022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.96;SOR=0.898;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr19	6696699	rs2253756	G	A	5908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.10;SOR=1.033;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr19	6696789	rs2355316	G	A	654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=18;PP=461;SC=GCGGTGGCTCGTGCCTGTGAT;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=6696797;WS=6696779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	6697214	rs5826946	AT	A	342.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=393;SC=TGCTTCTGAAATTCTGGGACT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=10;WE=6697222;WS=6697204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	6697406	rs423490	A	G	7798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=150;NR=113;PP=2965;SC=GATGGTAGACAGCAGCCTTGA;SOR=0.939;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=263;TCF=150;TCR=113;TR=263;WE=6697414;WS=6697396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,297:1.00:297
chr19	6697829	rs366510	G	T	717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=18;PP=535;SC=GACAGAACACGGAGTGTCAAG;SOR=2.494;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=23;WE=6697837;WS=6697819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	6702042	rs433594	A	G	342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=228;SC=TAAAGTGCCAAGAAACATAGG;SOR=2.670;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=6702050;WS=6702032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	6702157	rs428453	C	G	2248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=25;PP=1281;SC=CCGACATGCTCACAGCCAGAA;SOR=0.995;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=44;TCR=25;TR=69;WE=6702165;WS=6702147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr19	6702246	rs432823	T	C	2825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=47;NR=46;PP=1585;SC=GAGGTTGGGGTATTAGGAGAT;SOR=0.811;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=47;TCR=46;TR=93;WE=6702254;WS=6702236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr19	6702598	rs406514	G	A	4733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=100;PP=2965;SC=TACCTGCAGGGGGTTTAGATC;SOR=1.352;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=160;TCF=60;TCR=100;TR=160;WE=6702606;WS=6702588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr19	6708107	rs10659507	T	TTCTC	708.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.69;SOR=5.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	6709848	rs2230204	C	T	2461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=66;PP=1852;SC=CGCTTTTTACCACCAGCTGTG;SOR=3.030;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=15;TCR=66;TR=81;WE=6709856;WS=6709838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr19	6710572	rs189367	G	A	910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.39;QD=32.53;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	6710584	rs112132860	GGA	G	1251.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.28;MQRankSum=0.333;QD=33.83;ReadPosRankSum=0.143;SOR=2.948;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,36:0.97:37
chr19	6718078	rs2547438	T	G	644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.849;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=6;PP=443;ReadPosRankSum=-0.172;SC=TGCCCCTGCTTCCCCTGGGGC;SOR=1.589;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=71;TCF=53;TCR=18;TR=27;WE=6718086;WS=6718068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,29:0.37:79
chr19	6718534	rs2250656	T	C	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=290;ReadPosRankSum=1.628;SC=TTCTTGGTCTTCCGAGGTGGC;SOR=1.179;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=15;WE=6718542;WS=6718524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr19	6731057	rs2279624	T	C	1860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.430;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=36;PP=1078;ReadPosRankSum=-0.722;SC=ACGGGTTGTTTCCTGTGGGCT;SOR=0.873;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=174;TCF=98;TCR=76;TR=82;WE=6731065;WS=6731047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,96:0.48:198
chr19	6731766	rs1702375	C	A	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.09;ReadPosRankSum=-0.545;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr19	6732018	rs2291666	C	T	4011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=350;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.770;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=70;PP=2244;ReadPosRankSum=-1.060;SC=AGCCTCAGCCCGGGGGCAGGG;SOR=0.812;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=312;TCF=178;TCR=134;TR=164;WE=6732026;WS=6732008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,188:0.54:349
chr19	6732241	rs344618	C	T	3261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-3.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.654;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=65;PP=1985;ReadPosRankSum=-0.045;SC=TGCAGCCCTCCCCGCCCTGCT;SOR=0.671;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=203;TCF=101;TCR=102;TR=125;WE=6732249;WS=6732231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,140:0.61:228
chr19	6733517	rs339395	A	G	1392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.624;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=19;PP=875;ReadPosRankSum=-0.022;SC=GGGGTGAGGCACTCTGGGCCC;SOR=0.541;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=108;TCF=77;TCR=31;TR=62;WE=6733525;WS=6733507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,66:0.57:116
chr19	6733582	rs201134279	G	A	2930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.039;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=55;PP=1524;ReadPosRankSum=1.306;SC=TCCGCTCACCGTGATGTCGAA;SOR=0.562;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=248;TCF=146;TCR=102;TR=129;WE=6733590;WS=6733572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,144:0.53:272
chr19	6737481	rs340138	T	C	2519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.755;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=55;PP=1303;ReadPosRankSum=-1.200;SC=CAGCGCCAGCTGGTGGATGCG;SOR=0.629;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=232;TCF=125;TCR=107;TR=115;WE=6737489;WS=6737471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,127:0.50:253
chr19	6737509	rs339401	G	A	2509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=56;PP=1408;ReadPosRankSum=1.078;SC=CAGCCACCCAGCAGCAGCACC;SOR=0.694;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=240;TCF=125;TCR=115;TR=117;WE=6737517;WS=6737499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,130:0.49:266
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chr19	6743399	rs381897	A	T	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=2.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.93;ReadPosRankSum=1.222;SOR=1.751;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
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chr19	6821545	rs7258040	C	T	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=306;ReadPosRankSum=0.614;SC=TGGGATCTAGCGCCTCAGACA;SOR=0.409;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=16;WE=6821553;WS=6821535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr19	6821625	rs28617395	C	T	1861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.559;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=34;PP=1194;ReadPosRankSum=-1.691;SC=GCCACTGCCCCGTCACAGGTC;SOR=0.781;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=163;TCF=98;TCR=65;TR=85;WE=6821633;WS=6821615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,89:0.51:176
chr19	6821931	rs906331	G	C	1393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.718;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=35;PP=900;ReadPosRankSum=0.994;SC=GGTGGAGGGTGTGGGGGGACA;SOR=0.621;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=97;TCF=35;TCR=62;TR=54;WE=6821939;WS=6821921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,63:0.55:115
chr19	6822219	rs347033	T	C	508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=14;NR=6;PP=336;SC=ATCCCTGACCTCACAACCCAC;SOR=1.721;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=20;WE=6822227;WS=6822209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	6825032	rs12979659	T	C	628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=17;PP=447;ReadPosRankSum=1.495;SC=GGGAATCTTATCTTCCGTCAT;SOR=0.643;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=60;TCF=28;TCR=32;TR=31;WE=6825040;WS=6825022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,32:0.49:65
chr19	6828040	rs164022	G	C	1558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=28;PP=942;ReadPosRankSum=0.647;SC=GCAACTGGCTGTTTCTGGGAC;SOR=0.654;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=144;TCF=86;TCR=58;TR=66;WE=6828048;WS=6828030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,76:0.46:167
chr19	6832060	rs625828	T	A	726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=10;PP=496;ReadPosRankSum=-1.579;SC=TCCCACCCTCTGCGGGGGCAG;SOR=0.741;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=34;TCR=16;TR=31;WE=6832068;WS=6832050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,32:0.62:52
chr19	6833072	rs308200	C	T	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=30;ReadPosRankSum=0.674;SC=GACCCAAAAGCCAATCAATGA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=3;WE=6833080;WS=6833062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr19	6833162	rs78698684	CT	C	43.14	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.63;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr19	6833777	rs186295	A	G	2982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=48;PP=1670;SC=CCTGTGTACCACAAATAATGG;SOR=1.028;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=93;TCF=44;TCR=49;TR=92;WE=6833785;WS=6833767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr19	6833989	rs308199	G	T	2150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=36;PP=1130;SC=GTTGCTGTGTGGGGGCAGGAG;SOR=1.031;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=66;TCF=30;TCR=36;TR=66;WE=6833997;WS=6833979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr19	6836271	rs308196	A	C	285.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=236;SC=AAATAGTTTTACAAAGAGTAT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=6836279;WS=6836261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	6836836	rs308194	G	A	1651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=3;PP=553;SC=CCATTGAGCAGAGAGATGGAC;SOR=2.964;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=23;WE=6836875;WS=6836826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	6836844	.	GACACACACACACACACACACACAC	G,GAC	1641.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.23;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=25;NF=8,8;NR=3,3;PP=606,117;SC=CAGAGAGATGGACACACACAC;SOR=2.891;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=11,11;WE=6836875;WS=6836826;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.26,0.74:39
chr19	6848220	rs331679	G	A	823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.102;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=22;PP=519;ReadPosRankSum=-0.958;SC=AGAAGTGTACGGTAATAGCAT;SOR=1.085;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=63;TCF=25;TCR=38;TR=34;WE=6848228;WS=6848210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,37:0.54:69
chr19	6896483	rs330877	G	A	4924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=91;PP=2728;SC=TTACTATTGCGCTTGCAAACA;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=165;TCF=74;TCR=91;TR=165;WE=6896491;WS=6896473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr19	6897392	rs330879	G	A	2489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.056;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=53;PP=1630;ReadPosRankSum=-0.088;SC=TTTCTGAACTGAGGCACCCAA;SOR=0.802;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=194;TCF=98;TCR=96;TR=103;WE=6897400;WS=6897382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,114:0.53:214
chr19	6897464	rs330880	C	G	2470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.566;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.884;NF=50;NR=55;PP=1591;ReadPosRankSum=-1.772;SC=TCACCAGCAGCGTCTGCCCTG;SOR=0.784;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=223;TCF=111;TCR=112;TR=105;WE=6897472;WS=6897454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,116:0.49:238
chr19	6898219	rs330881	C	T	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=47.47;MQRankSum=-1.834;NF=4;NR=0;PP=55;ReadPosRankSum=-0.524;SC=CAAAGTGAAGCGCATATGGGA;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=6898227;WS=6898209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr19	6898248	rs3029890	C	CT	149.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.335;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.28;MQRankSum=-2.572;QD=12.48;ReadPosRankSum=0.325;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr19	6898290	rs2607129	G	A	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.949;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-5.944;NF=19;NR=4;PP=352;ReadPosRankSum=0.262;SC=TAGTATAAGTGAATTTGTAAC;SOR=1.367;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=46;TCF=36;TCR=10;TR=23;WE=6898298;WS=6898280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,22:0.45:49
chr19	6898487	rs330882	G	T	2152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.129;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=47;PP=1475;ReadPosRankSum=1.162;SC=ATGCCCTCAGGTTCCCAGGGA;SOR=0.588;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=174;TCF=87;TCR=87;TR=94;WE=6898495;WS=6898477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,99:0.52:189
chr19	6901891	rs897738	G	A	2670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=54;PP=1598;ReadPosRankSum=1.203;SC=TTCAGACGTGGATGAATGTGC;SOR=0.695;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=216;TCF=114;TCR=102;TR=115;WE=6901899;WS=6901881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,129:0.55:235
chr19	6903920	rs443658	A	G	2965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.420;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=56;PP=1576;ReadPosRankSum=-0.897;SC=GCACCAAGCAATGGACAGTTG;SOR=0.654;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=258;TCF=139;TCR=119;TR=120;WE=6903928;WS=6903910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,143:0.48:300
chr19	6904137	rs370094	C	T	1897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=42;PP=1100;ReadPosRankSum=-0.369;SC=GGCTGCATTGCAGGCTTTCAT;SOR=0.694;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=180;TCF=93;TCR=87;TR=89;WE=6904145;WS=6904127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,97:0.49:198
chr19	6906321	rs447684	T	C	645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.400;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=424;ReadPosRankSum=-0.785;SC=ATTTTCCCCCTTGTGTATTAG;SOR=1.133;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=41;TCF=31;TCR=10;TR=25;WE=6906329;WS=6906311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,27:0.61:44
chr19	6906357	rs366181	C	G	1326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.816;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=19;PP=784;ReadPosRankSum=0.415;SC=TTAAGTCGGGCACGGGAGGAC;SOR=0.862;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=81;TCF=50;TCR=31;TR=52;WE=6906365;WS=6906347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,58:0.62:94
chr19	6908456	rs452907	A	G	1733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=39;PP=1102;ReadPosRankSum=-0.793;SC=AGCTGGTTTCAGCAATCACTA;SOR=0.716;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=167;TCF=89;TCR=78;TR=83;WE=6908464;WS=6908446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,87:0.47:187
chr19	6908557	rs8113805	G	A	1445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.388;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=31;PP=908;ReadPosRankSum=0.322;SC=ATGAGTTTTAGTTTCCCTGAG;SOR=0.575;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=124;TCF=60;TCR=64;TR=62;WE=6908565;WS=6908547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,65:0.51:128
chr19	6913707	rs466876	C	T	3758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.848;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=80;PP=2100;ReadPosRankSum=1.220;SC=CAAATATCCACGTGGACTAAA;SOR=0.772;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=289;TCF=146;TCR=143;TR=158;WE=6913715;WS=6913697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,180:0.56:319
chr19	6913811	rs457857	A	G	4170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=93;PP=2698;SC=CTCAGCAAATATCACTCCGGC;SOR=1.657;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=140;TCF=47;TCR=93;TR=140;WE=6913819;WS=6913801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr19	6913878	rs462913	G	T	1144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=31;PP=874;SC=TACACCTAGGGGATGATTTTG;SOR=3.855;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=4;TCR=31;TR=35;WE=6913886;WS=6913868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr19	6919529	rs171674	T	C	449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=1;PP=319;SC=AAACGATTCCTTCCTTTTTTT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=6919537;WS=6919519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	6919624	rs373533	A	C	3997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=54;PP=2713;SC=GCGCTTCTTCAAAGACCACCA;SOR=1.242;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=86;TCR=54;TR=140;WE=6919632;WS=6919614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr19	6919753	rs461645	A	G	3737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=70;PP=2264;SC=TCTGGAGAACATTCAGGTTTG;SOR=1.114;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=55;TCR=70;TR=125;WE=6919761;WS=6919743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr19	6919879	rs252566	C	T	358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=295;SC=CCACAATTTCCAGCAATTCAA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=6919887;WS=6919869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	6921713	rs34941944	G	GT	1225.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=4.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.50;ReadPosRankSum=-0.275;SOR=1.090;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,57:0.44:129
chr19	6924672	rs2290634	A	G	4500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=49;PP=2739;ReadPosRankSum=-0.204;SC=GCCAACTCTGAAATTCCTTCC;SOR=1.348;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=145;TCF=95;TCR=50;TR=143;WE=6924680;WS=6924662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,162:0.99:164
chr19	6926355	rs4807915	T	C	581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=2;PP=328;SC=AGGATTCTGATGCGCATGCTT;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=6926363;WS=6926345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	6926378	rs2228539	T	C	882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=17;NR=7;PP=499;SC=CCCCTCCAGATGGGCTGCGCC;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=24;WE=6926386;WS=6926368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	6935113	rs252551	C	T	6605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=76;NR=87;PP=2965;SC=TCACCTCCCCCCCTCTTTTAA;SOR=0.821;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=163;TCF=76;TCR=87;TR=163;WE=6935129;WS=6935103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr19	6935121	rs1160969	T	TAA	9946.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.18;NF=16;NR=84;PP=2966;SC=CCCCCTCTTTTAATTTCCTCT;SOR=0.927;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=102;TCF=16;TCR=86;TR=100;WE=6935129;WS=6935103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr19	6937172	rs12981770	C	A	1178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=10;PP=689;SC=AGAGTGGCCACCTCAGACCAT;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=28;TCR=10;TR=38;WE=6937180;WS=6937162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	6937683	rs388711	A	G	4077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=81;PP=2453;SC=TGCTCCCTGCAGGTGCTGGTC;SOR=1.194;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=141;TCF=60;TCR=81;TR=141;WE=6937691;WS=6937673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr19	6939910	rs463891	G	A	1811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=9;PP=1300;SC=TAACATTTTAGTGTTTATCCT;SOR=2.985;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=49;TCR=9;TR=58;WE=6939918;WS=6939900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr19	6940189	rs464849	G	C	1005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=26;PP=610;SC=TGTTGGGGGCGGTCTTCCTGT;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=9;TCR=26;TR=35;WE=6940197;WS=6940179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr19	6953167	rs11085208	C	G	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.691;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=242;ReadPosRankSum=-0.435;SC=CGGAAAGGAGCGGTAACTTCC;SOR=0.298;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=16;WE=6953175;WS=6953157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr19	6954725	rs11085209	G	A	2555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.460;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=61;PP=1471;ReadPosRankSum=-0.063;SC=AAATTTGAGTGGAGAGGTCCG;SOR=0.738;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=230;TCF=103;TCR=127;TR=112;WE=6954733;WS=6954715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,124:0.49:254
chr19	6960200	rs79324166	G	A	1261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.384;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=17;PP=768;ReadPosRankSum=1.581;SC=GCTCTTTATCGCGTACCAGAA;SOR=0.920;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=116;TCF=77;TCR=39;TR=54;WE=6960208;WS=6960190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,59:0.46:127
chr19	6960834	rs459883	A	C	613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=1;PP=455;SC=GAATCCAAGGAAAGAAAAGTG;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=6960842;WS=6960824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	6961182	rs460698	G	A	703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=19;PP=522;SC=ATTTTAGATGGAGTCAGATGT;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=6961190;WS=6961172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	6974564	rs466123	C	T	7492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=143;NR=120;PP=2965;SC=TTCAAACCGACGGTGCCGCTC;SOR=0.841;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=263;TCF=143;TCR=120;TR=263;WE=6974572;WS=6974554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,288:1.00:288
chr19	6977211	rs4807919	A	G	5045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=105;NR=55;PP=2965;SC=AAATAAAACAATGATGTGTAG;SOR=1.596;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=160;TCF=105;TCR=55;TR=160;WE=6977219;WS=6977201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr19	6977409	rs7255801	C	T	4096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=86;PP=2650;SC=AAGTCTCATACCTAAATAATT;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=132;TCF=46;TCR=86;TR=132;WE=6977417;WS=6977399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr19	6980939	rs2035972	T	C	1097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=30;NR=5;PP=832;SC=TTTTTGAAAATGGAGTCCTTC;SOR=3.383;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=35;WE=6980947;WS=6980929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	6981582	rs2035971	A	T	1294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=4;PP=1041;SC=GTGTCCCCAGACATTGACAGA;SOR=3.767;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=39;TCR=4;TR=43;WE=6981590;WS=6981572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	6981849	rs1874003	T	C	2383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=53;PP=1636;SC=TCCCTTCTTCTAGTCACCCTC;SOR=2.804;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=14;TCR=53;TR=67;WE=6981857;WS=6981839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr19	6981885	rs1874002	T	C	623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=20;PP=453;SC=CTAATAATTCTGCAGCCCATC;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=6981893;WS=6981875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	6984708	rs7247453	G	A	6665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=109;NR=109;PP=2965;SC=GGTTCTTACCGTAACAATCCG;SOR=0.750;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=220;TCF=109;TCR=111;TR=218;WE=6984716;WS=6984698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr19	6984927	rs34752448	T	C	683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=17;PP=517;SC=CCCATGAAATTTTTATTGCCC;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=6984935;WS=6984917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	6988662	rs8107779	T	C	874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=6;PP=534;SC=AAACAGCTCTTGGGACCTCCA;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=27;WE=6988670;WS=6988652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	6988791	rs8103492	G	C	4879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=95;NR=68;PP=2936;SC=GCTATGAATAGACTCACCTCC;SOR=0.894;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=163;TCF=95;TCR=68;TR=163;WE=6988799;WS=6988781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr19	6988914	rs1466715	A	G	1545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=41;PP=1145;SC=GCTGAAGACTAGGTGAGTTAG;SOR=2.628;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=11;TCR=41;TR=52;WE=6988922;WS=6988904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr19	6991010	rs8108538	C	T	311.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=7;PP=158;SC=ATCGCATCACCGCACTCCAGC;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=6991018;WS=6991000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	7005818	rs10414331	T	C	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.158;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.056;NF=4;NR=3;PP=79;ReadPosRankSum=1.217;SC=CCGAGCTGGCTTAATCCATGA;SOR=1.245;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=19;TCF=10;TCR=9;TR=7;WE=7005826;WS=7005808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr19	7005905	rs62126094	T	A	370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.51;QD=28.52;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	7005935	rs73492763	G	C	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=7.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.99;MQRankSum=-1.763;QD=5.89;ReadPosRankSum=0.255;SOR=0.528;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr19	7011717	rs7254172	T	C	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.016;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=246;ReadPosRankSum=0.067;SC=TGACCAGAGGTCACCCTCACA;SOR=0.324;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=17;WE=7011725;WS=7011707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,18:0.75:24
chr19	7011766	rs6510942	T	C	1319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=13;PP=713;SC=TCTTGCTTCTTGTTGGCAAAG;SOR=1.345;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=30;TCR=13;TR=43;WE=7011774;WS=7011756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr19	7011826	rs7254322	T	C	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.230;HP=3;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.170;NF=11;NR=14;PP=318;ReadPosRankSum=-0.862;SC=GATGTGTAGCTGGGAGGTCAC;SOR=1.163;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=52;TCF=27;TCR=25;TR=25;WE=7011834;WS=7011816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,27:0.48:56
chr19	7011858	rs114601404	C	G	750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=2.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.89;MQRankSum=-4.900;QD=14.72;ReadPosRankSum=-0.948;SOR=1.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,21:0.41:51
chr19	7011858	.	CAG	GAC	586	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=29;MMLQ=17;MQ=51.65;NF=9;NR=12;PP=586;QD=30.4508511839;SC=GCCTTGGGACCAGTTCTGCCT;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=48;TCF=23;TCR=25;TR=21;WE=7011868;WS=7011848;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:27,21:0.44:48
chr19	7011860	rs7249689	G	C	750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=2.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.78;MQRankSum=-5.075;QD=15.02;ReadPosRankSum=-0.764;SOR=1.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,20:0.40:50
chr19	7011876	rs113730497	GT	G	514.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=2.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.681;HP=1;HapScore=4;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.079;NF=0;NR=10;PP=577;ReadPosRankSum=-0.542;SC=CCTCCGAGGAGTCCCTTACTG;SOR=2.170;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=10;WE=7011886;WS=7011866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,14:0.36:39
chr19	7011878	.	C	A	484.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.774;ClippingRankSum=0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.780;HP=2;HapScore=4;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.894;NF=3;NR=10;PP=575;ReadPosRankSum=0.276;SC=TCCGAGGAGTCCCTTACTGAT;SOR=2.533;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=36;TCF=14;TCR=22;TR=13;WE=7011886;WS=7011866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,12:0.32:37
chr19	7012162	rs66626943	C	A	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.771;NF=1;NR=7;PP=129;ReadPosRankSum=0.221;SC=CTTCACCCTCCAATTCTCCTT;SOR=0.446;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=8;WE=7012170;WS=7012152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr19	7074872	.	G	A	95	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;FR=0.9991;HP=6;HapScore=2;MGOF=17;MMLQ=27;MQ=55.76;NF=6;NR=2;PP=95;QD=16.2214015684;SC=CGGGCAGGAGGGGGGGTGACC;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=8;WE=7074880;WS=7074862;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,8:0.89:9
chr19	7083818	rs17637922	C	T	935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.769;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=24;PP=534;ReadPosRankSum=0.447;SC=TGAGCAAACTCTAACAAGATG;SOR=0.596;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=90;TCF=34;TCR=56;TR=41;WE=7083826;WS=7083808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,47:0.47:100
chr19	7116963	rs1051690	T	C	365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=302;SC=CTGAACTCCATTGGACATGGT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=7116971;WS=7116955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	7119636	.	G	GAC	270.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=-0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=225;ReadPosRankSum=-0.728;SC=AAGCCATTTAGACACACACAC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=5;WE=7119644;WS=7119626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr19	7119651	rs184752862	G	A	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=27.98;ReadPosRankSum=-0.493;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr19	7119651	.	GCG	ACA	68	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=22;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=5;PP=68;QD=24.2935749724;SC=ACACACACACGCGCGCGCGCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=5;WE=7119661;WS=7119641;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:2,5:0.71:7
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chr19	7293898	rs7508518	G	C	280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=7;PP=177;SC=GCCCCCGGTGGCCATGGCTGC;SOR=2.303;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=7293906;WS=7293888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	7427607	rs11260007	T	C	1479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=8;PP=966;SC=AGAATCCAGGTCCTGGCTTCC;SOR=2.494;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=36;TCR=8;TR=44;WE=7427615;WS=7427597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr19	7504767	rs10401415	G	T	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=114;ReadPosRankSum=0.622;SC=GCCTGGAGGGGTTGTTTTTTT;SOR=0.540;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=11;WE=7504775;WS=7504757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr19	7504982	rs10422503	C	T	1778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.544;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=32;PP=1116;ReadPosRankSum=-0.344;SC=GAGCCCCGGGCGCGAACATGG;SOR=0.616;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=172;TCF=105;TCR=67;TR=81;WE=7504990;WS=7504972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,87:0.46:191
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chr19	7506755	rs2287910	A	G	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.783;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=15;PP=491;ReadPosRankSum=0.320;SC=TTGGGGTGGCATGGCTCTGGG;SOR=0.564;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=53;TCF=30;TCR=23;TR=29;WE=7506763;WS=7506745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,30:0.55:55
chr19	7506982	rs10424311	C	G	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.282;HP=2;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=331;ReadPosRankSum=0.255;SC=GCCCTCCACTCTCTTCTCTGC;SOR=1.358;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=38;TCF=9;TCR=29;TR=21;WE=7506990;WS=7506972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr19	7507010	rs200202576	CCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTT	C,CCCTTCCTTCCTT	526.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.72;QD=37.62;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,7,7:0.50,0.50:14
chr19	7509436	rs12983399	G	A	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.421;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=197;ReadPosRankSum=2.142;SC=TTGCCGTGTCGCCCAGGCTGG;SOR=0.426;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=32;TCF=9;TCR=23;TR=17;WE=7509444;WS=7509426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr19	7509492	rs12983450	G	A	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.282;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=45;ReadPosRankSum=-0.825;SC=AACCTCTCAGGCTCAGGTGAT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=4;WE=7509500;WS=7509482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
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chr19	7518268	rs11463454	T	TC	1525.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=12;PP=1021;SC=ACCTCATAGATCCACATGTCC;SOR=1.775;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=29;TCF=16;TCR=13;TR=26;WE=7518276;WS=7518258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	7524727	rs34322626	G	A	2146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=32;PP=1001;ReadPosRankSum=2.044;SC=CAGAACCAGCGTCTGTGCCGA;SOR=0.695;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=149;TCF=90;TCR=59;TR=82;WE=7524735;WS=7524717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,100:0.57:175
chr19	7524743	rs11259996	G	C	1693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=29;PP=1131;ReadPosRankSum=1.787;SC=GCCGAGGCTGGCCTGCCTGGG;SOR=0.678;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=165;TCF=102;TCR=63;TR=74;WE=7524751;WS=7524733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,82:0.42:193
chr19	7524846	rs2287914	C	T	2398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=3.033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.38;ReadPosRankSum=0.721;SOR=0.966;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,65:0.47:138
chr19	7524855	rs2287915	C	T	2329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=1.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.78;ReadPosRankSum=0.047;SOR=0.877;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,63:0.48:131
chr19	7528734	rs2287918	A	G	3640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=49;PP=2192;SC=ATCTGCAGGCAGCTGGGCAGC;SOR=1.302;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=84;TCR=49;TR=133;WE=7528742;WS=7528724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr19	7529415	rs2287919	C	T	1899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.319;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=25;PP=1188;ReadPosRankSum=0.666;SC=GGGATGGCAGCATCCTCATGC;SOR=1.067;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=136;TCF=91;TCR=45;TR=81;WE=7529423;WS=7529405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,86:0.61:142
chr19	7531722	rs112677825	A	AAAGGAAGAAG	1231.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.51;BaseQRankSum=2.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.630;HP=8;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=2983;ReadPosRankSum=-0.812;SC=AGTTAAAAAAAAAGAAGAAGA;SOR=2.400;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=47;TCF=29;TCR=18;TR=12;WE=7531730;WS=7531712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,23:0.49:47
chr19	7532252	rs2303142	G	C	614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.78;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=0.795;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,35:0.44:79
chr19	7533767	rs10405143	T	G	3125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=46;PP=1880;ReadPosRankSum=-1.136;SC=AGGGCCCTCGTGTGAGCATGC;SOR=0.274;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=64;TCR=47;TR=109;WE=7533775;WS=7533757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,119:0.99:120
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chr19	7534075	rs2241396	C	T	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.484;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=99;ReadPosRankSum=-0.605;SC=CAGGCTCTAGCGGCTCGCTGG;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=6;WE=7534083;WS=7534065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
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chr19	7615682	rs66529260	GA	G	146.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.054;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=127;ReadPosRankSum=-1.235;SC=CATTTCGTTGGAAAAAGGGGA;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=5;WE=7615690;WS=7615674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
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chr19	7616347	rs473899	G	A	2164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.658;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=53;PP=1229;ReadPosRankSum=0.163;SC=GGCCCAGAGCGTGCTGGGAGA;SOR=0.816;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=200;TCF=91;TCR=109;TR=95;WE=7616355;WS=7616337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,104:0.48:217
chr19	7616474	rs661825	C	G	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=75;ReadPosRankSum=0.105;SC=AAGTAGGACCCAGGTGCAGAG;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=5;WE=7616482;WS=7616464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr19	7618660	rs508740	A	G	1438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=22;PP=945;ReadPosRankSum=0.186;SC=CACAGGAGCAAGAATTTCAGA;SOR=0.733;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=134;TCF=90;TCR=44;TR=67;WE=7618668;WS=7618650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,68:0.50:137
chr19	7619199	rs534464	C	G	4113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=65;NR=65;PP=2112;SC=GGTGGGTGGGCCTGGAGCCTC;SOR=0.927;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=132;TCF=66;TCR=66;TR=130;WE=7619207;WS=7619189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr19	7619229	rs563266	T	C	1083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=0.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.81;ReadPosRankSum=0.372;SOR=0.807;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,53:0.43:123
chr19	7619239	rs597582	T	C	3848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.76;SOR=1.302;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr19	7619329	rs598023	G	A	1788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.63;SOR=1.206;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	7619338	rs598028	G	C	1832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.73;SOR=1.414;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr19	7619647	rs599328	GT	CC	1793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=21;PP=1625;SC=CCCACCTCGGGTCCCGTCCTT;SOR=1.206;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=35;TCF=14;TCR=21;TR=34;WE=7619656;WS=7619637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	7619700	rs524530	G	A	1599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=28;NR=22;PP=1126;SC=CCCTCGCCATGGGGGTAGGCG;SOR=0.841;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=28;TCR=22;TR=50;WE=7619708;WS=7619690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr19	7619760	rs539887	A	C	1079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=17;PP=614;ReadPosRankSum=0.491;SC=TGGTGACCTCAGCCGTCCGTA;SOR=0.633;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=100;TCF=63;TCR=37;TR=47;WE=7619768;WS=7619750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,52:0.49:106
chr19	7620116	rs563826	A	G	3118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.829;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=66;PP=2048;ReadPosRankSum=2.111;SC=CTGGGTCGCGACTATCTCCCC;SOR=0.822;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=306;TCF=170;TCR=136;TR=149;WE=7620137;WS=7620106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,155:0.48:325
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chr19	7621981	rs2446176	A	G	1012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=25;NR=16;PP=702;SC=CAGCGAGCCCATCGGGCCGGC;SOR=0.968;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=25;TCR=16;TR=41;WE=7621989;WS=7621971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
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chr19	7684770	rs80188016	C	T	2212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=44;PP=1491;ReadPosRankSum=0.287;SC=TGCCTCAGTTCCCCACCCCGG;SOR=0.700;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=186;TCF=105;TCR=81;TR=100;WE=7684778;WS=7684760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,104:0.52:199
chr19	7685843	rs794078	G	A	1525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.130;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=37;PP=1005;ReadPosRankSum=0.092;SC=CCACGGCCCTGGTGGCACGCT;SOR=0.845;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=133;TCF=66;TCR=67;TR=69;WE=7685851;WS=7685833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,72:0.52:139
chr19	7688798	rs794080	C	T	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.302;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=204;ReadPosRankSum=-2.114;SC=TTGTCAGGGGCGGAGACCCAG;SOR=1.071;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=14;TCR=22;TR=16;WE=7688806;WS=7688788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr19	7692058	rs794084	G	A	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.177;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=10;PP=329;ReadPosRankSum=2.118;SC=GACATCCTACGCGGAGCTAGT;SOR=0.458;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=43;TCF=29;TCR=14;TR=26;WE=7692066;WS=7692048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,26:0.57:46
chr19	7694602	rs794085	C	G	2596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.471;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=52;PP=1638;ReadPosRankSum=-0.534;SC=GATGCGCCATCAGGATACACA;SOR=0.586;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=245;TCF=130;TCR=115;TR=108;WE=7694610;WS=7694592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,120:0.45:269
chr19	7698226	rs151032321	C	CTAAT	3155.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.212;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=24;PP=2078;ReadPosRankSum=1.321;SC=GCCCTACAAACTAGTCTTGTC;SOR=0.798;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=81;TCF=25;TCR=56;TR=41;WE=7698234;WS=7698216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,81:0.49:164
chr19	7702136	rs794076	G	A	810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.069;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=16;PP=430;ReadPosRankSum=0.111;SC=GGACGCACGGGCTCTGGGATC;SOR=0.570;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=58;TCF=33;TCR=25;TR=34;WE=7702144;WS=7702126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,37:0.58:64
chr19	7710269	rs710951	A	G	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=98;ReadPosRankSum=-1.087;SC=GCAGAGGGCCATTGGTGCACA;SOR=0.346;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=7;WE=7710277;WS=7710259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
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chr19	7712277	rs6791	A	G	2020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.054;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=40;PP=1025;ReadPosRankSum=-0.983;SC=CAAGGCTGGCATAGAAGCCCG;SOR=0.683;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=189;TCF=99;TCR=90;TR=86;WE=7712285;WS=7712267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,102:0.48:213
chr19	7712474	rs794074	G	A	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.410;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=207;ReadPosRankSum=0.565;SC=CTAGGTGTCTGGACTCCAGAG;SOR=1.193;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=29;TCF=13;TCR=16;TR=12;WE=7712482;WS=7712464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr19	7712585	rs794073	T	G	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.750;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=19;PP=482;ReadPosRankSum=-0.407;SC=CCCCAACATCTTCCCCAAACC;SOR=0.611;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=95;TCF=57;TCR=38;TR=43;WE=7712593;WS=7712575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,42:0.42:100
chr19	7734369	rs3219177	C	T	1250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=3.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.878;SOR=0.438;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,64:0.55:117
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chr19	7734814	rs34788323	C	T	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.983;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=370;ReadPosRankSum=-0.760;SC=GTCCAGGCGCCCATTTCTGTT;SOR=1.287;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=46;TCF=18;TCR=28;TR=21;WE=7734822;WS=7734804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,22:0.40:55
chr19	7735089	rs10402265	G	C	2080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=19;PP=1243;SC=CCACGCTCCTGTGTTCCGGGC;SOR=1.270;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=48;TCR=19;TR=67;WE=7735097;WS=7735079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr19	7735318	rs11270887	AGATGATGATGAT	A,AGAT	413.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=17;NF=0,0;NR=7,7;PP=186,123;SC=ATAAACCTGGAGATGATGATG;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=7,7;WE=7735337;WS=7735308;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.55,0.45:11
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chr19	7743879	rs4804766	C	T	1231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.755;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=20;PP=593;ReadPosRankSum=0.548;SC=CGTAAGTTGGCGCCCCGACAG;SOR=0.594;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=86;TCF=53;TCR=33;TR=50;WE=7743887;WS=7743869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,60:0.59:101
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chr19	7764363	rs61499635	GTTTTT	G,GT	1660.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=3.522;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=61.44;MQRankSum=0.556;QD=36.91;ReadPosRankSum=-0.077;SOR=0.663;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:1,27,17:0.60,0.38:45
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chr19	7764741	rs2287867	G	A	1137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.760;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=29;PP=723;ReadPosRankSum=-1.385;SC=GCTGATTTGGGATTTAATGAT;SOR=0.584;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=92;TCF=38;TCR=54;TR=49;WE=7764749;WS=7764731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,53:0.52:102
chr19	7764772	rs2287868	T	C	527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.080;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=329;ReadPosRankSum=-0.201;SC=AGCCATCAAATCCTAGTTACC;SOR=0.990;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=51;TCF=19;TCR=32;TR=22;WE=7764780;WS=7764762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,25:0.45:56
chr19	7794605	rs2277997	T	C	4130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=46;PP=2732;SC=CATCCCTAAGTATGGAGCCCC;SOR=1.470;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=138;TCF=91;TCR=47;TR=137;WE=7794613;WS=7794595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr19	7795813	rs6603117	G	A	523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=10;NR=12;PP=270;SC=ACCAGCCCCCGCCCCGCACCA;SOR=0.874;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=23;TCF=11;TCR=12;TR=22;WE=7795821;WS=7795803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	7796235	rs12978097	C	T	1328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=30;PP=707;ReadPosRankSum=-1.319;SC=CAGGCGAGGCCGGGAACTCGG;SOR=0.636;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=112;TCF=54;TCR=58;TR=57;WE=7796243;WS=7796225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,67:0.50:134
chr19	7796366	rs12978401	C	T	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.200;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=197;ReadPosRankSum=-0.155;SC=CGCGGGGACTCGCGCACATAC;SOR=0.169;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=20;TCF=13;TCR=7;TR=12;WE=7796374;WS=7796356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr19	7796497	rs11260026	C	G	5198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=60;PP=2965;SC=TGGGGGTTTTCTGTCCCCAGG;SOR=1.100;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=162;TCF=102;TCR=60;TR=162;WE=7796505;WS=7796487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr19	7831166	rs868875	A	G	1154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.965;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=34;PP=883;ReadPosRankSum=-0.968;SC=TTGAGTTACCAACCCTGCCTG;SOR=0.861;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=75;TCF=22;TCR=53;TR=47;WE=7831174;WS=7831156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,48:0.62:78
chr19	7831226	rs868876	A	T	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.623;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=130;ReadPosRankSum=-0.280;SC=AACTGCGATCATTGCACTTGG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=7;WE=7831234;WS=7831216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr19	7831429	rs475896	C	G	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=212;ReadPosRankSum=-1.309;SC=AGCGGTCCACCCAACATGGAC;SOR=0.379;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=42;TCF=41;TCR=1;TR=17;WE=7831437;WS=7831428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,19:0.40:47
chr19	7831628	rs2277998	G	A	3782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=391;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.185;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.105;NF=76;NR=93;PP=2290;ReadPosRankSum=0.913;SC=GAACTGGCACGACTCCGTCAC;SOR=0.762;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=358;TCF=169;TCR=189;TR=169;WE=7831636;WS=7831618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:205,186:0.48:391
chr19	7831700	rs562607	G	C	3781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=89;PP=2770;SC=GCAGGTACACGTGGTGGGGGT;SOR=2.075;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=33;TCR=89;TR=122;WE=7831708;WS=7831690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr19	7832664	rs2161525	T	C	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=4.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.515;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=203;ReadPosRankSum=0.435;SC=GTGGTCTTCATACCCACCTCC;SOR=2.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=11;WE=7832672;WS=7832654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,13:0.33:39
chr19	7912816	rs2307003	C	T	920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=21;PP=625;SC=AGGTGGGGGGCGGCCAGGCAG;SOR=0.984;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=16;TCR=21;TR=37;WE=7912824;WS=7912806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr19	7913752	rs3826742	C	T	1987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=13;PP=1398;SC=TGGGTGGCCACGGGGAGGCTG;SOR=2.799;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=52;TCR=13;TR=65;WE=7913760;WS=7913742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr19	7913974	rs555609	T	C	11054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=422;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=202;NR=193;PP=2965;ReadPosRankSum=1.564;SC=ACCCGGAACATGAGTTCTTCA;SOR=0.237;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=396;TCF=203;TCR=193;TR=395;WE=7913982;WS=7913964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,421:1.00:422
chr19	7916475	rs2452012	T	C	5200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=90;PP=2965;SC=TGAGGACCGATGGTGCCTGGG;SOR=0.921;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=171;TCF=81;TCR=90;TR=171;WE=7916483;WS=7916465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr19	7916620	rs580790	A	G	3023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=56;PP=1852;SC=TGAACCAGGCAGAGCTGATGC;SOR=1.015;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=103;TCF=47;TCR=56;TR=103;WE=7916628;WS=7916610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr19	7917919	rs12975442	C	T	4244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=40;PP=2673;SC=GGGCGGCCCCCGGTGGTCAGG;SOR=1.774;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=135;TCF=95;TCR=40;TR=135;WE=7917927;WS=7917909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr19	7918103	rs526464	A	G	9967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=369;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=150;NR=180;PP=2965;SC=GGTACTGGTAAGAAGGGGGGA;SOR=0.996;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=330;TCF=150;TCR=180;TR=330;WE=7918111;WS=7918093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,367:1.00:367
chr19	7920771	rs74176255	T	C	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=341;ReadPosRankSum=0.262;SC=GAACGTAAGATGCTGGCTGTG;SOR=0.608;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=19;WE=7920779;WS=7920761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr19	7927465	rs57122454	G	C	546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=13;PP=436;SC=ACCGCCCCCGGACGCGCCCCT;SOR=1.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=18;WE=7927473;WS=7927455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	7928462	rs10410459	T	C	6862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=127;NR=108;PP=2965;SC=ACGCATTGTATCCTCTGTCCC;SOR=0.709;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=236;TCF=127;TCR=109;TR=235;WE=7928470;WS=7928452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr19	7935716	rs12984133	G	A	3288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=53;NR=53;PP=1828;SC=GGAAGAGGGCGTCTCCGGAGG;SOR=0.865;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=54;TCR=54;TR=106;WE=7935724;WS=7935706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr19	7935879	.	G	A	69	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=29;MQ=49.77;NF=4;NR=4;PP=69;QD=12.9714015684;SC=GTGGTCAGGGGAGCAGAAGCT;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=21;TCF=13;TCR=8;TR=8;WE=7935887;WS=7935869;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:13,8:0.38:21
chr19	7936208	rs525420	A	G	6758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=135;NR=104;PP=2965;SC=AGAAGGTGAGATCAAAGAAGC;SOR=0.843;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=239;TCF=135;TCR=104;TR=239;WE=7936216;WS=7936198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
chr19	7938306	rs58971992	A	AG	3114.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=16;NR=30;PP=1884;SC=CTGGGGTACCAGGTTTCGGGA;SOR=0.761;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=50;TCF=16;TCR=34;TR=46;WE=7938314;WS=7938296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr19	7944348	rs56796931	TC	T	8167.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=88;PP=2965;SC=CAGCAACTTCTCCAAGAAATT;SOR=0.869;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=124;TCF=31;TCR=93;TR=118;WE=7944356;WS=7944338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr19	7944849	rs11260038	A	C	2677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=36;NR=55;PP=1808;SC=GACAGATGGAATTGACGTGAG;SOR=1.313;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=37;TCR=56;TR=91;WE=7944857;WS=7944837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr19	7963914	rs524029	A	C	10262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=367;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=150;NR=185;PP=2965;SC=TATCCGAGGTATCCGGGGAGA;SOR=0.968;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=335;TCF=150;TCR=185;TR=335;WE=7963922;WS=7963904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,367:1.00:367
chr19	7970831	.	G	A	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.850;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=55;ReadPosRankSum=-1.172;SC=CAGCCCCCATGCTCTGTGTGT;SOR=0.160;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=6;WE=7970839;WS=7970821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr19	7974719	.	C	T	513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=0.000;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=1.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.04;ReadPosRankSum=2.026;SOR=0.548;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,29:0.40:73
chr19	7975560	rs374003248	C	T	2830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.907;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=50;PP=1409;ReadPosRankSum=-0.346;SC=ACAGCTCCCCCGGGTGCCCCT;SOR=0.621;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=241;TCF=122;TCR=119;TR=109;WE=7975568;WS=7975550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,133:0.47:282
chr19	7976112	rs7260355	G	A	728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.12;ReadPosRankSum=1.764;SOR=0.716;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,34:0.47:72
chr19	7976116	rs10412007	T	C	2712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.78;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr19	7976513	.	G	T	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.040;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.744;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=138;ReadPosRankSum=-0.425;SC=GCTGCTCTGGGCAGCTGGGGA;SOR=1.284;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=9;WE=7976521;WS=7976503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
chr19	7986638	rs475002	C	G	1678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=42;PP=980;ReadPosRankSum=-2.121;SC=GGAAGAAGCCCTGGCAGTGGC;SOR=0.714;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=150;TCF=66;TCR=84;TR=71;WE=7986646;WS=7986628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,79:0.45:174
chr19	7990134	rs112578370	T	G	1113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.236;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=16;PP=670;ReadPosRankSum=-0.399;SC=GCCGGCCCTCTGAGACCCCGG;SOR=1.237;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=90;TCF=57;TCR=33;TR=49;WE=7990142;WS=7990124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,54:0.55:99
chr19	7997676	rs2279528	G	A	3472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=72;PP=2412;ReadPosRankSum=1.109;SC=GGAAGGCCGGGGACCCCGCCC;SOR=0.696;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=267;TCF=140;TCR=127;TR=152;WE=7997684;WS=7997666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,159:0.55:291
chr19	8006186	rs373554761	AT	A	100.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.522;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=9.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.30;MQRankSum=0.502;QD=7.75;ReadPosRankSum=1.071;SOR=1.724;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr19	8032432	rs3826740	G	A	870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=2;PP=665;SC=TCAGGAGCGCGCACCCTCCCG;SOR=3.841;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=28;WE=8032440;WS=8032422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr19	8121369	rs1129763	C	T	3158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=46;NR=59;PP=1721;SC=CACCACAACACGCAGACCTTC;SOR=1.123;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=46;TCR=59;TR=105;WE=8121377;WS=8121359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr19	8122737	rs2303164	G	A	6039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=107;NR=100;PP=2965;SC=AGTTATCATCGTCCAAGTTTA;SOR=0.702;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=207;TCF=107;TCR=100;TR=207;WE=8122745;WS=8122727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr19	8122767	rs2303165	T	C	5953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=92;NR=100;PP=2965;SC=TCAGCAGCAGTAAGAGGAATG;SOR=0.906;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=193;TCF=93;TCR=100;TR=192;WE=8122775;WS=8122757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr19	8137102	rs7256904	G	T	2887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=69;PP=2065;SC=GATGGGCAGGGTGGAGGGGTT;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=25;TCR=69;TR=94;WE=8137110;WS=8137092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr19	8137192	rs17160134	C	T	533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=17;PP=447;SC=CAAATGCCCACGCACACAAAT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=8137200;WS=8137182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	8137850	.	CGTGTGTGT	C,CGT	592.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.26;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=3,3;NR=0,0;PP=75,183;SC=CACAAAGCCCCGTGTGTGTGT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=3,3;WE=8137865;WS=8137840;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:12
chr19	8137902	rs7254691	C	T	2383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.14;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	8137908	rs28657412	C	T	2575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.44;SOR=1.508;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr19	8138054	rs7257948	C	A	6591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=122;NR=99;PP=2965;SC=ACTCATCCACCTCCTGGCAGC;SOR=0.917;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=221;TCF=122;TCR=99;TR=221;WE=8138062;WS=8138044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr19	8145801	rs61501857	T	C	1303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=8;PP=703;SC=CCATTGCGCCTGGCCAACTTG;SOR=1.514;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=31;TCR=8;TR=39;WE=8145809;WS=8145791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr19	8145921	rs2303168	C	T	3580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=66;PP=2206;SC=TGAAGCCGGGCGGACAGCGGC;SOR=0.784;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=65;TCR=66;TR=131;WE=8145929;WS=8145911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr19	8146114	rs2303169	T	C	518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=6;NR=7;PP=296;SC=GAGAAAGACCTCGGAGATGGT;SOR=0.804;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=6;TCR=7;TR=13;WE=8146122;WS=8146104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	8146510	rs35618038	G	A	483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=16;PP=401;SC=AAAAAGCCAGGTGGGAAATAC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=8146518;WS=8146500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	8148301	rs17202517	G	A	6597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=137;PP=2965;SC=GCTGCTTCGCGCCTCCACCGA;SOR=1.313;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=226;TCF=89;TCR=137;TR=226;WE=8148309;WS=8148291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr19	8151239	rs8103000	G	C	981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.786;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=29;PP=584;ReadPosRankSum=-0.117;SC=GCAGGTGGGCGGGGAGGCCAC;SOR=0.560;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=35;TCR=57;TR=47;WE=8151247;WS=8151229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,49:0.49:100
chr19	8159362	rs7245429	G	T	2626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=55;PP=1757;SC=CTGGAAGCCAGGGGGACAGAT;SOR=1.251;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=38;TCR=56;TR=93;WE=8159370;WS=8159352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr19	8159409	rs7245552	G	T	2014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=35;PP=1285;SC=GGCAAGTGCCGGGTAGGCAGG;SOR=1.117;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=30;TCR=35;TR=65;WE=8159417;WS=8159399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr19	8160334	rs12608849	G	A	6342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=114;NR=104;PP=2965;SC=GCTGTGTTGAGGCAATGGCCA;SOR=0.753;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=218;TCF=114;TCR=104;TR=218;WE=8160342;WS=8160324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr19	8160517	rs10413994	A	G	1440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=32;PP=877;SC=TGTATAGACTATGTATATTAG;SOR=2.170;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=12;TCR=32;TR=44;WE=8160525;WS=8160507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr19	8160812	rs10404258	C	T	4750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=89;NR=74;PP=2667;SC=TCTGAGAACCCACTTTGTGGC;SOR=0.749;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=163;TCF=89;TCR=74;TR=163;WE=8160820;WS=8160802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr19	8165868	rs56182050	G	A	2686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=49;PP=1624;SC=TGCGCAAAGGGGAACAAAGCT;SOR=1.214;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=38;TCR=49;TR=87;WE=8165876;WS=8165858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr19	8167830	rs12986396	A	G	2420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=33;NR=43;PP=1346;SC=CCAAAGAGATAGGAACTCCTT;SOR=1.356;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=33;TCR=43;TR=76;WE=8167838;WS=8167820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr19	8167873	rs56921504	A	G	1096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=10;NR=24;PP=700;SC=TGGCTTGTCCAGGCACAGTGG;SOR=2.073;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=34;WE=8167881;WS=8167863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr19	8168326	rs3865463	G	A	234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=2;PP=189;SC=ACTGCCACATGTCAGCACTTC;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=8168334;WS=8168316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	8171252	rs2126971	A	G	1375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=35;PP=1054;SC=ATAGACATTTAAAGGGTCTAT;SOR=3.417;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=6;TCR=35;TR=41;WE=8171260;WS=8171242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	8174650	rs3813779	A	G	3185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=61;PP=1920;SC=GTAGGGAGGAAGCGCGGTCCT;SOR=1.015;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=50;TCR=61;TR=111;WE=8174658;WS=8174640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr19	8174724	rs11672038	C	T	826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=24;PP=635;SC=CTACAGCCCTCGCTCAAGGTC;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=26;WE=8174732;WS=8174714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	8176463	rs11260057	A	G	3146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=41;PP=1747;SC=TGACCATGGCAGCCACCGTGA;SOR=0.928;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=65;TCR=41;TR=106;WE=8176471;WS=8176453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr19	8176919	rs4804264	C	T	4452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=93;NR=54;PP=2529;SC=TGAAACTCCCCGGGATGTTGA;SOR=1.165;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=147;TCF=93;TCR=54;TR=147;WE=8176927;WS=8176909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr19	8176945	rs4804063	T	C	5596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=112;NR=85;PP=2901;SC=GAGGCGTGACTGTCACAGTTG;SOR=0.912;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=197;TCF=112;TCR=85;TR=197;WE=8176953;WS=8176935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr19	8181483	rs1038081	C	T	2696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=56;NR=30;PP=1514;SC=TATGTGCCACCTTGTGGAAGA;SOR=1.145;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=87;TCF=56;TCR=31;TR=86;WE=8181491;WS=8181473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr19	8186281	rs57957109	A	AG	2483.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=53;PP=2061;SC=CTGTGGGGAGAGGGGGCAGAG;SOR=2.362;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=64;TCF=0;TCR=64;TR=53;WE=8186289;WS=8186271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr19	8188250	rs10419582	G	A	562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.80;ReadPosRankSum=-0.420;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,19:0.90:21
chr19	8188935	rs4804064	G	A	2754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=56;PP=1733;SC=CTGCCACACTGTGCCCACTGC;SOR=1.408;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=36;TCR=56;TR=92;WE=8188943;WS=8188925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr19	8188999	rs4804269	T	A	743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=22;PP=595;SC=CCGGACGTAGTCAGGTCGAGG;SOR=4.174;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=24;WE=8189007;WS=8188989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	8191184	rs35025963	C	T	3866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=82;NR=47;PP=2076;SC=CAGTTACCATCGCAGGTGACA;SOR=1.094;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=129;TCF=82;TCR=47;TR=129;WE=8191192;WS=8191174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr19	8191238	rs10906993	C	T	10224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.88;SOR=0.909;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr19	8191248	rs10906994	A	G	10195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.57;SOR=0.763;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr19	8191323	rs7260558	T	C	4127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=77;PP=2515;SC=TTCCCATGGGTGCCTGGGAGG;SOR=0.873;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=143;TCF=66;TCR=77;TR=143;WE=8191331;WS=8191313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr19	8196073	rs67775982	G	A	1082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=6;PP=694;SC=CCCACATCTGGTAGGGGCAGG;SOR=2.554;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=34;WE=8196081;WS=8196063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr19	8196222	rs3813777	T	C	4240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=77;NR=67;PP=2563;SC=TAGCCATGGCTCGGATTCAGC;SOR=0.706;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=144;TCF=77;TCR=67;TR=144;WE=8196230;WS=8196212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr19	8196444	rs4804271	C	T	3660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=80;NR=39;PP=2159;SC=TCACCGGAGTCTTTGGCAGGA;SOR=1.239;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=120;TCF=80;TCR=40;TR=119;WE=8196452;WS=8196434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr19	8198144	rs112342830	A	AT	307.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=391;SC=GAGCTTGTATATTAGTCCGTC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=8198152;WS=8198134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	8200759	rs6603148	G	T	253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=3;PP=82;SC=AGGTGGGTTTGGGGGCACAGT;SOR=0.859;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=7;WE=8200767;WS=8200751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	8201051	rs8112525	T	C	12145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=445;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=204;NR=198;PP=2965;SC=ACATCACCCCTACTCTTGGAT;SOR=0.739;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=402;TCF=204;TCR=198;TR=402;WE=8201059;WS=8201041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,444:1.00:444
chr19	8201249	rs9749144	C	A	4520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=80;PP=2965;SC=AACCGCCCCCCCTTCCACCTG;SOR=0.796;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=156;TCF=76;TCR=80;TR=156;WE=8201257;WS=8201239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr19	8202944	rs1531547	G	C	524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=1;PP=330;SC=CCTGGACACCGTCCCCTGTTT;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=8202952;WS=8202934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	8203328	rs7246376	G	A	4103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=67;PP=2567;SC=CTCAGGGACCGGGCCAGCTGC;SOR=0.790;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=136;TCF=69;TCR=67;TR=136;WE=8203336;WS=8203318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr19	8206553	rs73922237	T	C	451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=3;PP=307;SC=GCCCCCCAGGTCATGAGTCAC;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=8206561;WS=8206543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	8206748	rs12162233	G	A	10257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=385;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=176;NR=174;PP=2965;SC=AAGCCCGGCAGGGGAGTGAGA;SOR=0.704;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=352;TCF=177;TCR=175;TR=350;WE=8206756;WS=8206738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,384:1.00:384
chr19	8207070	rs12162237	G	A	4747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=74;NR=94;PP=2965;SC=GCCCCTGTCTGGAGATCTCTG;SOR=1.073;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=168;TCF=74;TCR=94;TR=168;WE=8207078;WS=8207060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr19	8209926	rs899208	T	C	505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=13;PP=280;SC=ACAGCAAGCCTGTCTTCACCC;SOR=1.402;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=19;WE=8209934;WS=8209916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	8315847	rs379983	A	G	907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=3;PP=748;SC=CTGGTTGTCAACTGCGCTGAT;SOR=3.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=28;WE=8315855;WS=8315837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	8320656	rs144397154	TGGGGCGGGGC	T	2857.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FS=0.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.30;MQRankSum=5.459;QD=16.15;ReadPosRankSum=-0.512;SOR=0.635;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,83:0.47:177
chr19	8320890	rs2306199	T	G	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=19.592;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=327;ReadPosRankSum=0.020;SC=GAGCGAGCTTTGCAAGATGGT;SOR=3.101;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=33;TCF=20;TCR=13;TR=15;WE=8320898;WS=8320880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,15:0.45:33
chr19	8321182	rs28334	A	T	1460.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=41;PP=936;ReadPosRankSum=0.798;SC=TGAGTGGCAGAGTGTGTGTGA;SOR=0.659;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=146;TCF=61;TCR=85;TR=73;WE=8321190;WS=8321172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,72:0.48:149
chr19	8321946	rs36247	T	C	1013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=26;PP=569;ReadPosRankSum=-1.849;SC=ACGATTCCTCTGACTACCTGC;SOR=0.671;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=68;TCF=28;TCR=40;TR=42;WE=8321954;WS=8321936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,47:0.59:79
chr19	8321969	rs36248	C	T	700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=17;PP=391;ReadPosRankSum=0.210;SC=GAGGTGGGCCCGACCCCTGCC;SOR=0.593;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=47;TCF=20;TCR=27;TR=29;WE=8321977;WS=8321959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,33:0.60:55
chr19	8322594	rs36250	G	A	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.970;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.674;NF=9;NR=0;PP=159;ReadPosRankSum=-1.307;SC=GATTACAGGCGTGAGCCACCA;SOR=1.781;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=9;WE=8322602;WS=8322584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr19	8326904	rs36259	G	A	6399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=113;NR=103;PP=2965;SC=AAAGAACGGGGCAGCTGGAGG;SOR=0.735;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=216;TCF=113;TCR=103;TR=216;WE=8326912;WS=8326894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr19	8367033	rs250510	T	C	579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=16;NR=0;PP=418;SC=CAACTTTAATTGCCACCCTCA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=8367041;WS=8367023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	8367525	rs2227288	G	C	1267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.647;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=27;PP=608;ReadPosRankSum=-0.514;SC=GTAAGGAGGGGGAAGGCAAGA;SOR=0.767;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=115;TCF=57;TCR=58;TR=53;WE=8367533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,63:0.48:130
chr19	8370120	rs2232778	T	C	2093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=40;PP=1160;SC=CTGGCTGTGATCCGCAGGAGA;SOR=1.439;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=68;TCF=28;TCR=40;TR=68;WE=8370128;WS=8370110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr19	8376204	rs35669830	G	A	269.41	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.6997;FS=3.680;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=141;ReadPosRankSum=1.810;SC=CAGGAGGATCGCTTGAGGCCA;SOR=0.916;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=14;TCF=8;TCR=6;TR=13;WE=8376212;WS=8376194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
chr19	8386701	rs2241590	G	A	3368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.440;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=68;PP=1865;ReadPosRankSum=-0.960;SC=ATTTCATCACGGGGTTCTGAT;SOR=0.792;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=245;TCF=123;TCR=122;TR=134;WE=8386709;WS=8386691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,156:0.56:278
chr19	8387207	rs1057232	G	A	829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.215;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.59;MQRankSum=-1.668;NF=8;NR=28;PP=570;ReadPosRankSum=0.097;SC=GTCTGTCACAGTCTGCTCCTT;SOR=0.290;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=69;TCF=13;TCR=56;TR=36;WE=8387215;WS=8387197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,37:0.52:71
chr19	8387809	rs71702233	GGA	G	1821.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.530;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.056;NF=4;NR=24;PP=1098;ReadPosRankSum=0.852;SC=GACTCGCTCTGGAGAGAGGGG;SOR=1.045;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=62;TCF=7;TCR=55;TR=28;WE=8387818;WS=8387799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,52:0.48:108
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chr19	8388380	rs11260080	G	T	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=42;ReadPosRankSum=0.177;SC=AACCTGGGAGGTGGAGGTTGC;SOR=1.329;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=5;WE=8388388;WS=8388370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
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chr19	8533504	rs7258281	T	C	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=1.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.99;ReadPosRankSum=0.101;SOR=1.204;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,24:0.53:45
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chr19	8536143	rs146004771	CTT	C	1574.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.802;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.825;NF=9;NR=16;PP=795;ReadPosRankSum=-1.328;SC=ACTAAACACTCTTTTCCTTTG;SOR=0.590;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=53;TCF=21;TCR=32;TR=25;WE=8536152;WS=8536133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,43:0.48:89
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chr19	8551852	rs11669139	A	G	4861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=106;NR=70;PP=2919;SC=GCTGCAAGGCATGCCTTAGGA;SOR=1.006;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=176;TCF=106;TCR=70;TR=176;WE=8551860;WS=8551842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr19	8553630	rs6992	C	T	2196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.750;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=48;PP=1293;ReadPosRankSum=1.371;SC=AGGGGTGTGGCGTGGTTAAGT;SOR=0.729;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=176;TCF=94;TCR=82;TR=98;WE=8553638;WS=8553620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,109:0.55:198
chr19	8555743	rs150081714	G	A	2354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=49;PP=1612;ReadPosRankSum=-1.207;SC=CGCCCTGCCAGGACTCCTGCT;SOR=0.718;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=213;TCF=116;TCR=97;TR=105;WE=8555751;WS=8555733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,110:0.48:229
chr19	8555886	rs2303110	G	C	8399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=135;NR=140;PP=2965;SC=CTTCCTGATAGCCCCCACCAA;SOR=0.855;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=275;TCF=135;TCR=140;TR=275;WE=8555894;WS=8555876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,318:1.00:318
chr19	8556034	rs149261635	C	T	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.032;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=345;ReadPosRankSum=1.313;SC=GAACTGAGGGCGCTTCATCTG;SOR=2.280;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=18;WE=8556042;WS=8556024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
chr19	8563456	rs2910435	C	G	2699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=55;NR=33;PP=1456;SC=GTGTCCCAGCCGCTCCAAACC;SOR=0.946;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=55;TCR=33;TR=88;WE=8563464;WS=8563446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr19	8564523	.	T	G	1786	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=68;NR=61;PP=1786;QD=14.1145055236;SC=GGGGCCTTCTTGGGGTGCTCG;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=256;TCF=142;TCR=114;TR=129;WE=8564531;WS=8564513;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:127,129:0.50:256
chr19	8576307	rs2910443	A	G	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=75;ReadPosRankSum=-1.839;SC=GGTATCCACCAGACCCCGCAG;SOR=0.368;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=10;WE=8576315;WS=8576297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr19	8576888	rs2042302	C	G	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.657;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=207;ReadPosRankSum=-1.300;SC=CCTCCAGGGGCACCAGGGAGA;SOR=0.339;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=14;WE=8576896;WS=8576878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr19	8578035	rs8100431	T	C	841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.997;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=11;PP=439;ReadPosRankSum=-0.138;SC=GGAGCCCTGCTGCATCCCTCC;SOR=0.497;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=52;TCF=33;TCR=19;TR=29;WE=8578043;WS=8578025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,37:0.60:62
chr19	8579081	rs2287862	C	T	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.039;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=186;ReadPosRankSum=-0.098;SC=CTGCGCAGGGCGCTCGGAGAG;SOR=1.538;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=12;WE=8579089;WS=8579071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr19	8601051	rs369541772	GTC	G	170.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.680;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=154;ReadPosRankSum=0.642;SC=GTCTCCCTCTGTCTCTCTCTC;SOR=0.125;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=29;TCF=18;TCR=11;TR=6;WE=8601060;WS=8601041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,9:0.24:37
chr19	8642160	rs4542783	T	C	5680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=118;NR=79;PP=2965;SC=CTCCTCTTTCTTCTTCCAGAT;SOR=0.977;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=197;TCF=118;TCR=79;TR=197;WE=8642168;WS=8642150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr19	8645786	rs7252299	A	C	3672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=47;PP=2349;SC=CCTAGTGGCCATGGCAGGTTT;SOR=1.170;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=81;TCR=47;TR=128;WE=8645794;WS=8645776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr19	8657092	rs71179860	C	CGGGATGGGGCTGGAAG	981.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=10;PP=2900;SC=TCAGCCTCTCCGGGATGGGCA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=10;WE=8657100;WS=8657082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	8662347	rs5827006	TTGC	T	380.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=63.17;QD=38.07;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	8669867	rs11670030	T	G	940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.80;ReadPosRankSum=2.134;SOR=0.608;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,44:0.46:96
chr19	8669873	rs7260282	T	C	3506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=34.72;ReadPosRankSum=-0.758;SOR=0.470;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,100:0.99:101
chr19	8669931	rs7255721	G	C	4239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=58;PP=2661;SC=CACATGGGAGGTGCTGGCCTG;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=133;TCF=75;TCR=58;TR=133;WE=8669939;WS=8669921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr19	8808373	rs4804079	G	T	1681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.572;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.99;MQRankSum=0.977;NF=40;NR=34;PP=1075;ReadPosRankSum=-0.498;SC=GCGGTCAGGTGGTTGCCCGCC;SOR=0.701;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=154;TCF=80;TCR=74;TR=74;WE=8808381;WS=8808363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,80:0.48:166
chr19	8808900	rs10410943	A	G	1708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.906;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=42;PP=1105;ReadPosRankSum=0.178;SC=AATAACCACCACGCCGGTCTT;SOR=0.834;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=219;TCF=115;TCR=104;TR=83;WE=8808908;WS=8808890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,91:0.37:247
chr19	8808942	rs2340550	A	G	1730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.506;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=41;PP=1080;ReadPosRankSum=-1.302;SC=CATGCCGGGGAAGTCCCGCTG;SOR=0.745;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=196;TCF=100;TCR=96;TR=83;WE=8808950;WS=8808932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,90:0.42:213
chr19	8841558	rs28324	T	C	5596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=82;PP=2965;SC=CCCGGCTCCATACACCCATGT;SOR=0.734;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=176;TCF=94;TCR=82;TR=176;WE=8841566;WS=8841548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr19	8923117	rs250315	A	G	886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=6;PP=577;SC=CCAGGAACACAGCATTCTCAA;SOR=2.517;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=30;WE=8923125;WS=8923107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	8932092	rs2910347	G	A	618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=17;PP=418;SC=AGCACGAGATGTTGGGGGGGG;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=8932100;WS=8932082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
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chr19	8953922	rs2972588	C	T	6490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=99;NR=125;PP=2965;SC=CCAAGAAGGCCGTCCTGAAAA;SOR=1.007;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=224;TCF=99;TCR=125;TR=224;WE=8953930;WS=8953912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr19	8961772	rs2972591	A	G	680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=2;PP=468;SC=ATTATTTGTCAATTAATTAAA;SOR=4.174;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=8961780;WS=8961762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	8961981	rs1035442	C	G	9886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=366;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=159;NR=176;PP=2965;SC=CATGTGATGACTCCCAGGAGT;SOR=0.870;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=336;TCF=159;TCR=177;TR=335;WE=8961989;WS=8961971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,366:1.00:366
chr19	8979112	rs73493609	G	C	618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-2.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=289;ReadPosRankSum=2.277;SC=CACCACCTCAGGGGACCAGCC;SOR=0.667;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=49;TCF=41;TCR=8;TR=22;WE=8979120;WS=8979102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,28:0.46:61
chr19	8982084	rs3752139	C	G	590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=16;NR=5;PP=410;SC=AGAGAACCGGCAAACAGACAC;SOR=2.200;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=21;WE=8982092;WS=8982074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	8982146	rs3752140	T	G	1039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=12;PP=648;ReadPosRankSum=2.090;SC=ATGGGGCTGATAGCTGCTCAC;SOR=0.750;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=84;TCF=59;TCR=25;TR=41;WE=8982154;WS=8982136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,45:0.48:94
chr19	8987133	rs3764555	T	C	4314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=68;PP=2712;SC=AGAAGGGAGCTTGGGTTGGTC;SOR=0.821;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=154;TCF=86;TCR=68;TR=154;WE=8987141;WS=8987123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr19	8987218	rs3764556	G	T	1336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.459;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=30;PP=767;ReadPosRankSum=-1.681;SC=ACCAGGTGCTGCATGACGTTG;SOR=0.849;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=105;TCF=49;TCR=56;TR=55;WE=8987226;WS=8987208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,62:0.52:119
chr19	8987348	rs150904213	A	AAG	302.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.64;ReadPosRankSum=0.547;SOR=0.919;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr19	8992971	.	T	G	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.023;ClippingRankSum=0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=1.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQRankSum=-3.345;QD=2.58;ReadPosRankSum=0.863;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,6:0.17:36
chr19	8992972	.	A	G	144.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.024;ClippingRankSum=0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=1.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQRankSum=-3.877;QD=4.02;ReadPosRankSum=0.752;SOR=1.524;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,7:0.19:36
chr19	8992980	.	C	G	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.151;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=4.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQRankSum=-4.606;QD=3.76;ReadPosRankSum=0.992;SOR=1.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,7:0.17:42
chr19	8992981	.	T	G	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.240;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=4.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQRankSum=-4.606;QD=3.68;ReadPosRankSum=0.886;SOR=1.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,7:0.17:42
chr19	8992988	rs371102230	G	A	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=1.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQRankSum=-4.365;QD=3.53;ReadPosRankSum=0.884;SOR=1.341;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,6:0.14:43
chr19	8992993	rs114497462	G	A	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=3.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQRankSum=-4.365;QD=2.62;ReadPosRankSum=0.440;SOR=1.508;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,6:0.14:43
chr19	8992996	.	T	A	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.151;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=1.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQRankSum=-4.479;QD=2.24;ReadPosRankSum=-0.201;SOR=1.385;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,6:0.13:45
chr19	8992997	.	G	A	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.201;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=1.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQRankSum=-4.590;QD=2.14;ReadPosRankSum=-0.128;SOR=1.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,6:0.13:47
chr19	8994113	rs2009979	T	C	1261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=11;PP=765;SC=ACACTTGGGGTAGCCAGACTG;SOR=1.559;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=41;TCF=29;TCR=12;TR=40;WE=8994121;WS=8994103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr19	8994285	rs752410	T	A	1121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.814;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=30;PP=739;ReadPosRankSum=0.708;SC=TGGAAGGGGCTGTAATCAGGG;SOR=0.885;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=83;TCF=39;TCR=44;TR=52;WE=8994293;WS=8994275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,53:0.59:90
chr19	8994373	rs873869	A	G	1470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=18;PP=977;SC=TAGGTGGAACAAGACAAGGTG;SOR=0.994;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=29;TCR=18;TR=47;WE=8994381;WS=8994363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr19	8995853	rs11672574	T	C	494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=7;PP=407;SC=CTCTCAGATCTTTCCCTCATG;SOR=1.061;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=10;TCR=7;TR=17;WE=8995861;WS=8995843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	8996019	rs73493652	A	T	1428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=0.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.91;ReadPosRankSum=-1.452;SOR=0.606;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,70:0.53:131
chr19	8996182	rs56136170	C	T	888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.814;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=12;PP=611;ReadPosRankSum=-0.759;SC=GAAGAAGAAACGGTGAAGTTC;SOR=1.117;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=95;TCF=54;TCR=41;TR=35;WE=8996190;WS=8996172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,40:0.39:102
chr19	8997189	rs111427194	T	TGGGAGA	2072.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.435;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.045;NF=4;NR=16;PP=1130;ReadPosRankSum=1.086;SC=ACCTGAGCTGTGGGAGAGGGA;SOR=0.483;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=62;TCF=10;TCR=52;TR=20;WE=8997197;WS=8997179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,54:0.49:111
chr19	8997343	rs55785038	C	T	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=255;ReadPosRankSum=-0.115;SC=CTTCCATGCCCTGTCATGAGT;SOR=0.656;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=27;TCF=18;TCR=9;TR=16;WE=8997351;WS=8997333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr19	8997415	.	G	A	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.928;ClippingRankSum=0.000;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=8.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQRankSum=-9.210;QD=1.57;ReadPosRankSum=-3.554;SOR=0.493;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,9:0.09:98
chr19	8997421	.	A	C	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.842;ClippingRankSum=0.000;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=9.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQRankSum=-9.761;QD=2.59;ReadPosRankSum=-3.937;SOR=0.405;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,13:0.12:106
chr19	8997424	.	G	A	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.477;ClippingRankSum=0.000;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=8.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQRankSum=-10.043;QD=2.45;ReadPosRankSum=-4.043;SOR=0.406;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,15:0.14:111
chr19	8997454	rs76629162	G	A	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=8.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQRankSum=-11.815;QD=2.41;ReadPosRankSum=1.307;SOR=0.751;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:147,21:0.12:168
chr19	8997463	rs73001893	C	T	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FS=6.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQRankSum=-12.829;QD=1.45;ReadPosRankSum=3.255;SOR=0.798;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:176,21:0.11:197
chr19	8997472	rs113387108	C	T	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FS=5.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQRankSum=-13.768;QD=0.97;ReadPosRankSum=4.219;SOR=0.835;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:205,21:0.09:226
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chr19	8997482	.	C	T	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=0.000;DP=250;ExcessHet=3.0103;FS=4.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQRankSum=-14.498;QD=0.66;ReadPosRankSum=3.525;SOR=0.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:229,21:0.08:250
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chr19	9002113	rs12462672	A	G	698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.13;ReadPosRankSum=-0.288;SOR=0.843;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,37:0.43:86
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chr19	9003749	rs11085779	G	T	707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.428;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=21;PP=484;ReadPosRankSum=0.378;SC=TTAATCTGTTGCATATAGTTA;SOR=1.201;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=65;TCF=18;TCR=47;TR=27;WE=9003757;WS=9003739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,29:0.44:66
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chr19	9005719	rs4804375	A	G	1189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=0.633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.707;SOR=0.770;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,64:0.47:136
chr19	9006370	rs79341062	A	G	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=9.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.10;MQRankSum=-8.127;QD=5.47;ReadPosRankSum=-0.568;SOR=1.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,40:0.31:127
chr19	9006463	rs11668219	C	G	2916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;NR=41;PP=1882;SC=AGTAGAGGCACGGCAGAAGTG;SOR=0.836;Source=Platypus;TCR=41;WE=9006471;WS=9006453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
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chr19	9009570	rs80323209	G	A	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=5.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.43;MQRankSum=-7.617;QD=3.36;ReadPosRankSum=-1.029;SOR=0.212;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,11:0.18:60
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chr19	9010685	.	C	T	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.601;ClippingRankSum=0.000;DP=317;ExcessHet=3.0103;FS=8.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQRankSum=-13.726;QD=0.69;ReadPosRankSum=2.311;SOR=1.144;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:291,26:0.08:317
chr19	9010688	.	A	T	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=0.000;DP=317;ExcessHet=3.0103;FS=9.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQRankSum=-13.878;QD=1.07;ReadPosRankSum=2.292;SOR=1.211;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:290,27:0.09:317
chr19	9010693	.	C	G	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=0.000;DP=323;ExcessHet=3.0103;FS=6.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQRankSum=-13.474;QD=0.92;ReadPosRankSum=1.866;SOR=0.963;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:294,29:0.09:323
chr19	9010694	.	C	T	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.872;ClippingRankSum=0.000;DP=321;ExcessHet=3.0103;FS=7.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQRankSum=-13.431;QD=0.93;ReadPosRankSum=2.017;SOR=0.955;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:292,29:0.09:321
chr19	9010720	rs73005893	A	G	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FS=0.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQRankSum=-12.787;QD=1.97;ReadPosRankSum=-0.245;SOR=0.621;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:251,33:0.12:284
chr19	9010725	rs73005896	T	A	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQRankSum=-12.175;QD=2.08;ReadPosRankSum=-0.479;SOR=0.731;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:238,31:0.12:269
chr19	9010743	.	G	GC	449.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.343;ClippingRankSum=0.000;DP=229;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQRankSum=-10.556;QD=1.98;ReadPosRankSum=-2.604;SOR=0.603;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:200,27:0.12:227
chr19	9010748	.	A	T	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=0.000;DP=213;ExcessHet=3.0103;FS=0.848;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQRankSum=-12.307;QD=1.94;ReadPosRankSum=-2.634;SOR=0.808;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:190,23:0.11:213
chr19	9011412	rs114676657	C	T	1999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.592;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=39;PP=1206;ReadPosRankSum=1.025;SC=TACAGCTGCTCTCTGTTGAGT;SOR=0.636;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=139;TCF=71;TCR=68;TR=80;WE=9011420;WS=9011402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,90:0.58:156
chr19	9012813	rs4992696	G	A	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FS=17.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.53;MQRankSum=-10.515;QD=2.21;ReadPosRankSum=-2.085;SOR=2.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:167,23:0.12:190
chr19	9012816	rs4992695	G	T	593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FS=17.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.57;MQRankSum=-11.229;QD=3.18;ReadPosRankSum=-1.411;SOR=2.519;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:164,23:0.12:187
chr19	9012819	rs4992694	T	A	1611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FS=17.865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.34;MQRankSum=-13.819;QD=7.79;ReadPosRankSum=-3.847;SOR=1.943;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:157,50:0.24:207
chr19	9012823	rs4992693	T	C	595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FS=11.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.46;MQRankSum=-11.106;QD=2.70;ReadPosRankSum=-1.569;SOR=1.780;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:191,30:0.14:221
chr19	9012825	.	AT	TC	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.511;ClippingRankSum=0.000;DP=239;ExcessHet=3.0103;FS=6.696;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.10;MQRankSum=-6.111;QD=0.78;ReadPosRankSum=-3.152;SOR=1.598;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:220,19:0.08:239
chr19	9012832	.	T	G	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.095;ClippingRankSum=0.000;DP=279;ExcessHet=3.0103;FS=0.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.05;MQRankSum=-6.332;QD=0.80;ReadPosRankSum=-3.432;SOR=0.589;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:250,29:0.10:279
chr19	9012840	rs4992692	G	A	2986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;BaseQRankSum=0.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.878;HP=1;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-16.080;NF=65;NR=34;PP=1159;ReadPosRankSum=-5.752;SC=TGTCCTCCTCGTACTGCAGGT;SOR=0.761;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=304;TCF=183;TCR=121;TR=99;WE=9012848;WS=9012830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:204,122:0.37:326
chr19	9012905	.	T	TG	5243.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.162;ClippingRankSum=0.000;DP=391;ExcessHet=3.0103;FS=4.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.96;MQRankSum=-17.040;QD=13.87;ReadPosRankSum=3.882;SOR=0.663;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:234,144:0.38:378
chr19	9012910	.	GT	G	5192.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=0.000;DP=378;ExcessHet=3.0103;FS=5.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.08;MQRankSum=-16.989;QD=13.81;ReadPosRankSum=4.756;SOR=0.651;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:234,142:0.38:376
chr19	9012918	rs75899847	C	T	5124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=365;ExcessHet=3.0103;FS=7.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.07;MQRankSum=-16.722;QD=14.12;ReadPosRankSum=5.295;SOR=0.591;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:224,139:0.38:363
chr19	9012930	rs76135098	C	T	4554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FS=6.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.19;MQRankSum=-15.678;QD=14.23;ReadPosRankSum=4.635;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:193,127:0.40:320
chr19	9012937	.	A	G	4411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.653;ClippingRankSum=0.000;DP=292;ExcessHet=3.0103;FS=8.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.28;MQRankSum=-14.760;QD=15.21;ReadPosRankSum=3.249;SOR=0.396;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:171,119:0.41:290
chr19	9012947	.	G	A	4410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.252;ClippingRankSum=0.000;DP=267;ExcessHet=3.0103;FS=11.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.30;MQRankSum=-13.948;QD=16.64;ReadPosRankSum=1.065;SOR=0.332;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:152,113:0.43:265
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chr19	9015830	.	A	C	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.075;ClippingRankSum=0.000;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=13.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQRankSum=-8.050;QD=0.58;ReadPosRankSum=-3.091;SOR=0.872;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:82,8:0.09:90
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chr19	9018479	rs111639147	G	T	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=32.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.22;MQRankSum=-11.075;QD=3.59;ReadPosRankSum=-1.857;SOR=3.036;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:105,20:0.16:125
chr19	9018539	.	CA	TG	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.811;ClippingRankSum=0.000;DP=178;ExcessHet=3.0103;FS=24.369;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.12;MQRankSum=-12.821;QD=1.10;ReadPosRankSum=1.363;SOR=3.383;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:159,17:0.10:176
chr19	9019348	.	A	G	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.527;ClippingRankSum=0.000;DP=179;ExcessHet=3.0103;FS=6.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQRankSum=-6.651;QD=1.36;ReadPosRankSum=-1.931;SOR=1.601;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:156,18:0.10:174
chr19	9019352	.	T	C	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.150;ClippingRankSum=0.000;DP=173;ExcessHet=3.0103;FS=6.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQRankSum=-6.736;QD=1.25;ReadPosRankSum=-1.934;SOR=1.535;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:151,17:0.10:168
chr19	9019353	.	G	T	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=0.000;DP=173;ExcessHet=3.0103;FS=6.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQRankSum=-6.736;QD=1.34;ReadPosRankSum=-1.948;SOR=1.535;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:151,17:0.10:168
chr19	9019371	.	A	C	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.959;ClippingRankSum=0.000;DP=148;ExcessHet=3.0103;FS=23.627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQRankSum=-6.716;QD=0.52;ReadPosRankSum=-2.271;SOR=4.271;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:133,12:0.08:145
chr19	9019374	.	A	G	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.831;ClippingRankSum=0.000;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=23.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQRankSum=-6.666;QD=0.55;ReadPosRankSum=-2.711;SOR=4.320;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:131,12:0.08:143
chr19	9019376	.	A	C	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.172;ClippingRankSum=0.000;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=18.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQRankSum=-7.220;QD=0.59;ReadPosRankSum=-2.280;SOR=4.003;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:128,10:0.07:138
chr19	9019377	.	A	C	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.601;ClippingRankSum=0.000;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=18.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQRankSum=-6.538;QD=0.60;ReadPosRankSum=-1.965;SOR=3.842;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:127,9:0.07:136
chr19	9019605	rs12981679	C	G	714.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=7;PP=461;ReadPosRankSum=0.854;SC=CTCACTGCTGCTGGTGGGCAC;SOR=0.741;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=53;TCF=40;TCR=13;TR=29;WE=9019613;WS=9019595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,32:0.53:60
chr19	9020154	rs11882881	A	G	1216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.697;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=30;PP=764;ReadPosRankSum=0.653;SC=CATCCTTCTCAGACCTGGGGA;SOR=0.593;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=45;TCR=63;TR=52;WE=9020162;WS=9020144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,58:0.48:120
chr19	9020211	rs11882373	C	T	1459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=38;PP=1082;SC=AGGTTGTGTCCTGAGACTGCT;SOR=2.701;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=9;TCR=38;TR=47;WE=9020219;WS=9020201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
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chr19	9024758	rs1862463	T	C	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.715;HP=1;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=377;ReadPosRankSum=0.866;SC=GGGAGTGTGATCTCTAGTTAG;SOR=2.303;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=17;WE=9024766;WS=9024748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr19	9024871	rs62118272	C	T	2019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=38;PP=1173;ReadPosRankSum=1.668;SC=GGGCCCAGCTCTTCAATGTCA;SOR=0.661;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=134;TCF=71;TCR=63;TR=79;WE=9024879;WS=9024861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,92:0.61:151
chr19	9025536	.	G	T	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.676;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.90;MQRankSum=-5.576;QD=8.24;ReadPosRankSum=-2.643;SOR=0.418;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,8:0.24:33
chr19	9025539	.	T	C	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.266;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.67;MQRankSum=-5.747;QD=7.68;ReadPosRankSum=-2.675;SOR=0.465;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,9:0.26:35
chr19	9025542	.	T	G	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.017;ClippingRankSum=0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.55;MQRankSum=-5.902;QD=8.32;ReadPosRankSum=-2.730;SOR=0.509;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,10:0.27:37
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chr19	9025707	.	A	T	513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.372;ClippingRankSum=0.000;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=41.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-2.268;QD=3.92;ReadPosRankSum=-3.683;SOR=5.538;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,21:0.16:131
chr19	9025709	rs150194004	AGC	A	510.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=37.943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.96;ReadPosRankSum=-3.793;SOR=5.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:109,20:0.16:129
chr19	9025713	.	AGGCAGAAG	A	486.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.101;ClippingRankSum=0.000;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=32.638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.06;ReadPosRankSum=-3.881;SOR=5.055;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,17:0.14:120
chr19	9026257	rs62118274	G	A	1928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.259;NF=49;NR=41;PP=1098;ReadPosRankSum=-1.463;SC=TGTCCTCCTCGTACTGCAGGT;SOR=0.741;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=161;TCF=86;TCR=75;TR=90;WE=9026265;WS=9026247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,94:0.56:169
chr19	9026318	rs62118275	A	G	2436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.575;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.141;NF=45;NR=50;PP=1439;ReadPosRankSum=0.629;SC=GCCAGCAGCTATAGTGGGAGT;SOR=0.645;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=152;TCF=71;TCR=81;TR=95;WE=9026326;WS=9026308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,102:0.60:169
chr19	9026422	rs117968462	C	T	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.992;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=364;ReadPosRankSum=-0.401;SC=ATATTTTCCACGCCTTTCTTA;SOR=0.850;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=51;TCF=21;TCR=30;TR=26;WE=9026430;WS=9026412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,32:0.52:61
chr19	9027790	rs61097680	C	G	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=30;ReadPosRankSum=0.598;SC=GGTGTGGTGGCTCAAGCCTGT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=3;WE=9027798;WS=9027780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
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chr19	9049726	rs11670328	G	A	2765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.877;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=51;PP=1682;ReadPosRankSum=-1.388;SC=CTGAGCTGACGTCTGCCCCAT;SOR=0.484;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=195;TCF=109;TCR=86;TR=111;WE=9049734;WS=9049716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,124:0.57:216
chr19	9056982	rs11670318	G	A	3140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.851;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=69;PP=1934;ReadPosRankSum=0.466;SC=CTCAAATCCTGTGGTCTCAAA;SOR=0.635;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=286;TCF=149;TCR=137;TR=141;WE=9056990;WS=9056972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,153:0.49:315
chr19	9057408	rs1423051	A	G	2702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.898;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=57;PP=1812;ReadPosRankSum=1.591;SC=TTCCACAAAGAGAGAGCTCTT;SOR=0.763;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=267;TCF=142;TCR=125;TR=123;WE=9057416;WS=9057398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,131:0.45:288
chr19	9057687	rs1895364	A	G	1939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.512;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=36;PP=1021;ReadPosRankSum=0.570;SC=AGGGATGTGTATTCTATTAGA;SOR=0.665;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=170;TCF=92;TCR=78;TR=76;WE=9057695;WS=9057677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,93:0.45:206
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chr19	9072313	rs2121133	A	G	1627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.629;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=30;PP=994;ReadPosRankSum=-3.116;SC=GCAGGTGAGGACAGAAAGGAA;SOR=0.616;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=122;TCF=56;TCR=66;TR=60;WE=9072321;WS=9072303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,70:0.50:141
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chr19	9073628	rs200716112	G	T	2275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.692;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=50;PP=1391;ReadPosRankSum=-0.358;SC=GGAGGGTGCTGTTCTCTTTTC;SOR=0.499;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=159;TCF=72;TCR=87;TR=94;WE=9073636;WS=9073618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,102:0.58:177
chr19	9074950	rs2591591	G	T	2414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-3.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=44;PP=1253;ReadPosRankSum=2.363;SC=GTTGTAGCATGGATAGGTACC;SOR=0.728;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=185;TCF=98;TCR=87;TR=97;WE=9074958;WS=9074940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,114:0.54:212
chr19	9075217	rs2547068	T	A	1367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.627;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=28;PP=718;ReadPosRankSum=0.071;SC=GACAGCCTGGTGATGGCTTCT;SOR=0.784;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=119;TCF=63;TCR=56;TR=58;WE=9075225;WS=9075207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,68:0.49:139
chr19	9075346	rs2591592	T	A	1427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=25;PP=918;ReadPosRankSum=0.437;SC=GAAGAGATAATACTTGTTTGT;SOR=0.718;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=129;TCF=79;TCR=50;TR=65;WE=9075354;WS=9075336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,69:0.50:137
chr19	9075584	rs2547069	T	A	1201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.357;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=28;PP=714;ReadPosRankSum=2.091;SC=TGACCCAGCCTGTGGTCTCTA;SOR=0.916;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=108;TCF=48;TCR=60;TR=49;WE=9075592;WS=9075574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,55:0.47:117
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chr19	9075737	rs2547071	T	C	1806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.951;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=35;PP=1091;ReadPosRankSum=0.122;SC=GGGTCCTTAATACACTGGAGG;SOR=0.531;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=146;TCF=83;TCR=63;TR=78;WE=9075745;WS=9075727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,86:0.53:163
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chr19	9076950	rs2547076	C	A	1657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=32;PP=929;ReadPosRankSum=-0.115;SC=TACATTGGCCCTCAGAGTCTC;SOR=0.653;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=68;TCR=59;TR=69;WE=9076958;WS=9076940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,78:0.53:147
chr19	9076991	rs2591595	C	T	2076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.211;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=40;PP=1217;ReadPosRankSum=-1.659;SC=TGACAGATGACGCAGAGCTTG;SOR=0.575;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=149;TCF=81;TCR=68;TR=85;WE=9076999;WS=9076981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,97:0.57:170
chr19	9077060	rs2591596	C	T	1606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=34;PP=1005;ReadPosRankSum=0.413;SC=AGGGCAGAGACACTAGTGAGG;SOR=0.719;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=146;TCF=76;TCR=70;TR=70;WE=9077068;WS=9077050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,77:0.48:161
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chr19	9077902	rs2547077	A	G	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=20;PP=403;ReadPosRankSum=1.901;SC=GTATATGCAAATGGTACAGAA;SOR=0.803;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=59;TCF=21;TCR=38;TR=30;WE=9077910;WS=9077892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,31:0.43:72
chr19	9077984	rs2547078	T	C	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.328;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=43;ReadPosRankSum=-0.328;SC=TTCCTCCTTCTCTGGGAAAGA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=9077992;WS=9077974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr19	9080343	.	GAAAGAAAAGA	G,GAAAGA	1977.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.18;QD=40.36;SOR=1.755;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,28,21:0.57,0.43:49
chr19	9080462	rs2547065	C	G	1523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.955;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.839;NF=37;NR=29;PP=997;ReadPosRankSum=0.780;SC=TGCTGGACTGCTCCCCGTCTC;SOR=0.536;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=148;TCF=85;TCR=63;TR=66;WE=9080470;WS=9080452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,71:0.42:169
chr19	9083124	rs12608495	G	A	2766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.943;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=60;PP=1705;ReadPosRankSum=0.147;SC=CCAAACTTGGGACCTCAGAAA;SOR=0.788;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=232;TCF=119;TCR=113;TR=117;WE=9083132;WS=9083114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,131:0.50:262
chr19	9083791	rs60106152	G	A	2440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.763;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=50;PP=1570;ReadPosRankSum=0.333;SC=AAGACTATCCGAAGCTATAGT;SOR=0.644;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=182;TCF=98;TCR=84;TR=104;WE=9083799;WS=9083781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,110:0.57:194
chr19	9085958	rs1108380	A	G	2833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=63;PP=1790;ReadPosRankSum=-1.438;SC=TCTGGTCCTGAGGTTATGCCT;SOR=0.701;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=235;TCF=117;TCR=118;TR=122;WE=9085966;WS=9085948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,134:0.52:259
chr19	9086145	rs45611441	G	C	1794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.931;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.97;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=35;PP=1200;ReadPosRankSum=-0.299;SC=TGTGAGTGCTGTTTCCCATAG;SOR=0.557;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=151;TCF=81;TCR=70;TR=75;WE=9086153;WS=9086135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,82:0.51:162
chr19	9087615	rs1596798	T	A	9552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=348;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=176;NR=146;PP=2965;SC=TTTCTGCCAATTTTGTGTAAT;SOR=0.776;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=322;TCF=176;TCR=146;TR=322;WE=9087623;WS=9087605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,348:1.00:348
chr19	9088017	rs1596797	T	G	2509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=53;PP=1565;ReadPosRankSum=0.436;SC=CCATGGTAAGTTTGATGGTGC;SOR=0.699;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=252;TCF=133;TCR=119;TR=115;WE=9088025;WS=9088007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,124:0.45:276
chr19	9090182	rs17000957	T	C	1821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.265;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=36;PP=1033;ReadPosRankSum=0.809;SC=GGTCTCTCTGTTTTCATGCTA;SOR=0.535;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=168;TCF=93;TCR=75;TR=73;WE=9090190;WS=9090158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,89:0.46:194
chr19	9090784	rs73495785	C	T	1825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.385;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=36;PP=1067;ReadPosRankSum=0.376;SC=AATTGTGCTTCTGACCCTTTC;SOR=0.621;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=162;TCF=84;TCR=78;TR=79;WE=9090792;WS=9090774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,87:0.48:181
chr19	9204307	rs4804097	A	G	3548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.887;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=61;PP=1984;ReadPosRankSum=-0.531;SC=TCTGCCACCCATTGCACTACG;SOR=0.753;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=263;TCF=153;TCR=110;TR=146;WE=9204315;WS=9204297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,169:0.57:299
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chr19	9225973	rs7246980	G	A	2193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.959;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=54;PP=1431;ReadPosRankSum=-0.782;SC=CTGAACCAGGGCATCCATAGT;SOR=0.785;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=247;TCF=116;TCR=131;TR=99;WE=9225981;WS=9225963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,106:0.40:267
chr19	9226017	rs2217657	C	G	1757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.363;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=40;PP=1268;ReadPosRankSum=-0.100;SC=TCAGCAAGCCCCAGAAATGGA;SOR=0.532;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=203;TCF=99;TCR=104;TR=81;WE=9226025;WS=9226007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,86:0.39:220
chr19	9226540	rs36095111	A	G	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=290;ReadPosRankSum=-0.753;SC=GAAAAGGGGTAGATTCTAAGG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=14;WE=9226548;WS=9226530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,18:0.69:26
chr19	9236698	rs111867493	G	GATGGT	217.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=1.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.831;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=296;ReadPosRankSum=-0.607;SC=TCAATGGAAAGATGGTATCCT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=6;WE=9236706;WS=9236688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr19	9236886	rs10424352	A	G	3470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.641;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.976;NF=83;NR=70;PP=2052;ReadPosRankSum=0.175;SC=ACAAGGAAACAACGATTAAAT;SOR=0.475;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=298;TCF=169;TCR=129;TR=153;WE=9236894;WS=9236876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,172:0.51:334
chr19	9236916	rs75266995	AG	A	5151.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=342;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.853;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.537;NF=23;NR=68;PP=2966;ReadPosRankSum=-0.640;SC=AGATGGAAAAAGCTTTATACT;SOR=0.408;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=196;TCF=66;TCR=130;TR=91;WE=9236924;WS=9236906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,165:0.49:339
chr19	9237435	rs10407484	A	G	1023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.690;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=20;PP=723;ReadPosRankSum=-0.114;SC=AGGACAGGATAGAGAGGAGGA;SOR=0.525;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=83;TCF=39;TCR=44;TR=37;WE=9237443;WS=9237425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,41:0.45:91
chr19	9237542	rs10414255	T	C	1665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=36;PP=797;ReadPosRankSum=1.079;SC=AGGAACAGCATGAAGAGGATG;SOR=0.663;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=193;TCF=107;TCR=86;TR=77;WE=9237550;WS=9237532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,88:0.42:211
chr19	9237723	.	TCTTC	T	95.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.409;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.98;ReadPosRankSum=0.061;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr19	9266874	rs139210933	CTG	C	1103.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.483;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.535;NF=1;NR=22;PP=903;ReadPosRankSum=-0.023;SC=ACCCCAGTGACTGTGTCTGCT;SOR=1.739;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=37;TCF=4;TCR=33;TR=23;WE=9266883;WS=9266864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,30:0.65:46
chr19	9267319	rs3752199	G	T	1263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.683;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=20;PP=619;ReadPosRankSum=-0.263;SC=CCTGTCTCCAGGACTCAGAAT;SOR=0.622;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=96;TCF=55;TCR=41;TR=47;WE=9267327;WS=9267309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,60:0.52:116
chr19	9268261	rs3829682	G	A	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.125;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=184;ReadPosRankSum=-0.696;SC=GTGGTTCTCCGGTGTGTGTCT;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=9;WE=9268269;WS=9268251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr19	9346427	rs1968136	T	C	10336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=392;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.189;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-0.849;NF=170;NR=188;PP=2965;ReadPosRankSum=0.577;SC=TATGTGGCCATGGCACTGCTG;SOR=0.537;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=362;TCF=172;TCR=190;TR=358;WE=9346435;WS=9346417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,389:0.99:392
chr19	9346599	rs1985937	C	G	4736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;PP=2965;SC=GGGTCTATCTCAGTTCTGCTG;SOR=0.794;Source=Platypus;TCF=80;WE=9346607;WS=9346589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr19	9346762	rs2015157	T	G	1887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.783;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=42;PP=1097;ReadPosRankSum=-1.790;SC=TCTCTTACGGTACACAACCTC;SOR=0.834;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=166;TCF=83;TCR=83;TR=81;WE=9346770;WS=9346752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,92:0.49:188
chr19	9361740	rs201985790	CT	C	210.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=3.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.82;ReadPosRankSum=0.246;SOR=0.363;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,23:0.20:116
chr19	9408811	rs55772378	AT	A	142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.34;QD=20.40;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	9434930	rs10411624	T	C	6582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=105;NR=117;PP=2965;SC=TGGGCGGCGTTCGGTGGTGTC;SOR=0.897;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=222;TCF=105;TCR=117;TR=222;WE=9434938;WS=9434920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr19	9435306	rs7251157	A	C	124.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.81;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	9435320	.	GAA	G	241.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.264;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=3.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.62;MQRankSum=-1.607;QD=10.99;ReadPosRankSum=3.418;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr19	9448917	rs8113427	T	G	265.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=9;PP=219;SC=GATCAGTTTCTTTTTTGGCAA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=9448925;WS=9448907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	9449149	rs8110197	A	G	873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=9;PP=499;SC=GGATTCTCAGATTTTATTTCT;SOR=1.542;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=29;WE=9449157;WS=9449139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	9449337	rs8110584	G	A	1557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=31;PP=998;SC=AGTGGAACAGGGCCCCTGCAA;SOR=1.412;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=21;TCR=31;TR=52;WE=9449345;WS=9449327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr19	9452026	rs55837495	ACT	A	5767.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=45;PP=2738;SC=TTTGACAAACACTCTAAACAT;SOR=0.840;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=61;TCF=12;TCR=49;TR=57;WE=9452035;WS=9452016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr19	9489132	rs2304110	C	T	3606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=72;PP=2287;SC=CTTCATCTTCCGCAGCTCCCA;SOR=1.095;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=52;TCR=72;TR=124;WE=9489140;WS=9489122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr19	9490358	rs12461520	C	T	740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=18;PP=552;SC=TTGGGAATGTCACTCAGTGAA;SOR=1.781;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=26;TCF=8;TCR=18;TR=26;WE=9490366;WS=9490348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	9490814	rs2217652	C	T	6247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=107;NR=97;PP=2965;ReadPosRankSum=1.697;SC=GGCATAAACACGGTAAGACTT;SOR=0.233;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=205;TCF=107;TCR=98;TR=204;WE=9490822;WS=9490804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,237:1.00:238
chr19	9491210	rs1347165	C	G	460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=16;NR=0;PP=357;SC=TCATACGCACCTACTGAAAAT;SOR=4.294;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=9491218;WS=9491200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	9492141	rs3826783	C	T	5326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=89;PP=2965;SC=AAGCCTTCATCGATCAGTCAT;SOR=0.788;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=185;TCF=96;TCR=89;TR=185;WE=9492149;WS=9492131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr19	9492370	rs2230752	A	T	4749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=61;PP=2905;SC=TTATAAATGTATTCAGTGTGA;SOR=0.889;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=83;TCR=61;TR=144;WE=9492378;WS=9492360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr19	9524185	rs2241356	A	G	4725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=57;PP=2965;SC=GAAACTTAAAAGCTTTGCCAC;SOR=1.347;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=158;TCF=100;TCR=58;TR=157;WE=9524193;WS=9524175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr19	9582164	.	G	GA	110	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=8;HapScore=2;MGOF=61;MMLQ=18;MQ=60.0;NF=0;NR=5;PP=110;QD=27.2;SC=ATAAACATAAGAAAAAAGAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=9582172;WS=9582154;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	9586099	.	G	A	1384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.220;ClippingRankSum=0.000;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=29;PP=719;ReadPosRankSum=-1.143;SC=TCCAACATTCGCATGCATGGA;SOR=0.670;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=127;TCF=56;TCR=71;TR=55;WE=9586107;WS=9586089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,67:0.46:147
chr19	9646739	rs888872	C	G	323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=1;PP=147;SC=ACAGGCAGAGCCTGACTCACA;SOR=3.258;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=9646747;WS=9646729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	9673271	rs147918159	CTCT	C	1897.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=24;PP=1165;SC=CTCTCTCCTCCTCTTCCCAGG;SOR=2.356;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=25;WE=9673281;WS=9673261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	9958878	rs2010457	A	G	844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=23;PP=665;SC=GGTAGAGGCCAGGAGGGTCTG;SOR=1.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=9;TCR=23;TR=32;WE=9958886;WS=9958868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	9964823	rs8111802	A	G	1602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=46;NR=11;PP=1197;SC=CCCAGCCCCCAGAGGCCCCCC;SOR=2.872;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=46;TCR=11;TR=57;WE=9964831;WS=9964813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr19	10071063	rs10406152	T	C	1473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=15;PP=897;SC=GGCTCCCTCATGGTCCCTCCC;SOR=1.791;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=33;TCR=15;TR=48;WE=10071071;WS=10071053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr19	10071634	rs918542	T	C	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.736;HP=5;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=270;ReadPosRankSum=0.215;SC=AGCCACCCCCTGGAATCTCCA;SOR=1.362;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=18;WE=10071642;WS=10071624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr19	10079206	rs79625961	G	T	1766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.215;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=40;PP=947;ReadPosRankSum=-1.170;SC=GGAGGACGTGGGAGGATTCAG;SOR=0.878;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=157;TCF=83;TCR=74;TR=78;WE=10079214;WS=10079196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,88:0.49:180
chr19	10090649	rs11879687	A	G	1577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=29;PP=888;ReadPosRankSum=-0.803;SC=CCCAACCCCCAATGAGGGTGA;SOR=0.410;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=23;TCR=29;TR=52;WE=10090657;WS=10090639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,61:0.98:62
chr19	10108277	.	C	T	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.257;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=248;ReadPosRankSum=0.288;SC=ACGCTACTCTCGGACCCCTCT;SOR=0.784;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=13;WE=10108285;WS=10108267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr19	10108714	rs7254800	G	A	2225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.018;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=41;PP=1187;ReadPosRankSum=0.676;SC=GAAGGGAGAAGTGAGTGTCGG;SOR=0.599;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=213;TCF=131;TCR=82;TR=104;WE=10108722;WS=10108692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,115:0.50:232
chr19	10108929	rs3745596	C	T	432.70	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.680;HP=2;HapScore=4;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=187;ReadPosRankSum=-1.219;SC=CACACACACACACACGGAGTC;SOR=0.257;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=13;WE=10108937;WS=10108919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,20:0.77:26
chr19	10112058	rs8108105	A	C	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=143;ReadPosRankSum=-0.610;SC=CCTGACCTCAAATGATCTGCC;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=9;WE=10112066;WS=10112048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr19	10112091	rs113865073	C	G	660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=5;PP=485;ReadPosRankSum=-1.448;SC=CCAAAGTGTTCGGATTACAGG;SOR=0.651;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=44;TCF=36;TCR=8;TR=26;WE=10112099;WS=10112081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,27:0.54:50
chr19	10112346	rs2287803	T	C	10371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=384;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.172;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=188;NR=163;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.656;SC=TCCAAGCTCCTCTGAGAACGT;SOR=0.350;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=352;TCF=188;TCR=164;TR=351;WE=10112355;WS=10112336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,383:1.00:384
chr19	10114893	rs73007122	C	T	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=262;ReadPosRankSum=-0.043;SC=CCCCTAACCCCCAGCAGTCCT;SOR=0.892;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=16;WE=10114901;WS=10114883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr19	10116076	rs11085529	G	C	598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=1;PP=577;SC=CACAATCACAGGCTGCAACGG;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=24;WE=10116084;WS=10116066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	10116375	rs2303099	G	T	1910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.076;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=41;PP=1174;ReadPosRankSum=-1.229;SC=CTATGCTGACGGCCACACGGT;SOR=0.810;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=186;TCF=96;TCR=90;TR=82;WE=10116383;WS=10116365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,92:0.44:209
chr19	10116703	rs11085530	A	G	3852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=344;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.811;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=83;PP=2477;ReadPosRankSum=-1.549;SC=AGGGCCCAGCAGTGCCTCCCT;SOR=0.668;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=318;TCF=160;TCR=158;TR=170;WE=10116711;WS=10116693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,185:0.54:344
chr19	10116776	rs143826566	C	T	2711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.423;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=64;PP=1700;ReadPosRankSum=-0.765;SC=GTGGGGATGCCGAGCGTGCTG;SOR=0.723;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=268;TCF=128;TCR=140;TR=121;WE=10116784;WS=10116766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,133:0.45:296
chr19	10127668	rs2233792	C	T	113.98	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=16.28;ReadPosRankSum=-1.068;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
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chr19	10131999	rs1644731	T	C	2276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.163;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=39;PP=1257;ReadPosRankSum=1.679;SC=CAGGTTTCTATGGCTGAGTTC;SOR=0.579;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=163;TCF=96;TCR=67;TR=92;WE=10132007;WS=10131989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,106:0.57:186
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chr19	10149207	rs57198581	G	A	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=224;ReadPosRankSum=0.085;SC=ATCTCTCTCAGGTTCCCGAGA;SOR=1.061;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=12;WE=10149215;WS=10149187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr19	10149223	rs16997792	A	G	389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=12;PP=310;SC=CGAGAGCCTGATGTACCTCCC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=10149231;WS=10149213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	10157806	rs73009214	C	T	450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.174;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=8;PP=251;ReadPosRankSum=-0.388;SC=AACAGCATCTCCCATTACCCC;SOR=0.443;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=35;TCR=21;TR=21;WE=10157814;WS=10157796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,24:0.38:63
chr19	10160578	rs11085554	C	T	768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=10;PP=434;ReadPosRankSum=-1.311;SC=CTGTCACCTACGCAGGCATCT;SOR=0.765;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=72;TCF=49;TCR=23;TR=35;WE=10160586;WS=10160568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,38:0.49:77
chr19	10165844	rs60321046	G	A	2279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=2.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.25;ReadPosRankSum=-0.279;SOR=0.462;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,59:0.63:94
chr19	10165854	rs56717463	T	C	2345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=2.577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.56;ReadPosRankSum=0.844;SOR=0.480;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,62:0.60:104
chr19	10165932	rs8113341	A	G	3388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=58;PP=1997;SC=GGCTACACTCAGATGCTGACC;SOR=0.804;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=120;TCF=62;TCR=58;TR=120;WE=10165940;WS=10165922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr19	10166114	rs10426597	A	G	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.719;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=256;ReadPosRankSum=0.509;SC=TGGGGTGTCCAGCGCACGGCC;SOR=1.179;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=21;TCF=9;TCR=12;TR=13;WE=10166122;WS=10166104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr19	10166233	rs10405132	C	T	4245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.70;ReadPosRankSum=1.204;SOR=0.688;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:121,106:0.47:227
chr19	10166243	rs10403535	G	T	4941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FS=0.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.84;ReadPosRankSum=1.093;SOR=0.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:150,127:0.46:277
chr19	10166253	rs10411594	T	C	5267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FS=2.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.72;ReadPosRankSum=0.055;SOR=0.546;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:169,146:0.46:315
chr19	10169245	rs1993466	A	G	1400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.891;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=25;PP=952;ReadPosRankSum=-1.729;SC=CATCCACAGGATGGCTACCAA;SOR=0.971;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=136;TCF=80;TCR=56;TR=62;WE=10169253;WS=10169235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,68:0.44:155
chr19	10169261	rs11667703	C	T	1618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.164;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=30;PP=983;ReadPosRankSum=-1.321;SC=ACCAAGGCTCCGAGGAGGATG;SOR=0.792;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=154;TCF=87;TCR=67;TR=69;WE=10169269;WS=10169251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,79:0.44:179
chr19	10169278	rs4552116	T	G	1816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.947;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=34;PP=1168;ReadPosRankSum=0.222;SC=GATGTATCCCTCACAGCTCTT;SOR=0.891;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=182;TCF=101;TCR=81;TR=81;WE=10169286;WS=10169268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,92:0.44:209
chr19	10169477	rs11667515	G	A	4825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=74;PP=2965;SC=CCTCCCTCTGGCCCTCTAGAA;SOR=0.929;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=169;TCF=95;TCR=74;TR=166;WE=10169485;WS=10169467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr19	10192425	rs112439574	G	GGAA	846.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.07;QD=42.34;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	10197479	.	C	CG	95.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.281;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.229;HP=12;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=69;ReadPosRankSum=-0.413;SC=GGATGAAAGGCGGGGGGGGGG;SOR=0.039;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=8;WE=10197487;WS=10197469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr19	10218030	rs1551570	C	T	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=142;ReadPosRankSum=-0.055;SC=CTGCGTCCGACTGACTCTAAA;SOR=1.112;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=10;WE=10218038;WS=10218020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr19	10218408	rs2305790	G	A	2396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.451;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=52;PP=1641;ReadPosRankSum=1.324;SC=AAGAAGAGATGGGGCAAAGGT;SOR=0.732;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=240;TCF=124;TCR=116;TR=102;WE=10218416;WS=10218398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,115:0.44:262
chr19	10218434	rs55752217	C	T	2683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.441;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=63;PP=1641;ReadPosRankSum=0.048;SC=CTCCGGGCACCTCTGCTAGAC;SOR=0.637;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=246;TCF=121;TCR=125;TR=126;WE=10218442;WS=10218424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,136:0.50:272
chr19	10218524	rs2305791	C	G	2089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.017;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=46;PP=1183;ReadPosRankSum=0.945;SC=CCTTCCAGGTCAAGAAGGTGA;SOR=0.603;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=206;TCF=104;TCR=102;TR=94;WE=10218532;WS=10218514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,106:0.46:231
chr19	10218621	rs113903089	C	A	1229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.681;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=27;PP=856;ReadPosRankSum=0.225;SC=GTCACCCCCTCCTCTCTCCTG;SOR=0.821;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=93;TCF=47;TCR=46;TR=51;WE=10218629;WS=10218611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,53:0.56:95
chr19	10221151	rs2305792	C	G	2150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.879;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=51;PP=1328;ReadPosRankSum=1.905;SC=ACCCGCGTCTCTTGGCTCAGT;SOR=0.887;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=156;TCF=71;TCR=85;TR=86;WE=10221159;WS=10221141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,97:0.54:178
chr19	10222558	rs2010353	G	T	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=117;ReadPosRankSum=0.363;SC=GAGGTCGAGGGGGGTGGAACA;SOR=0.631;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=9;WE=10222566;WS=10222548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr19	10224526	rs3745600	C	T	3144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.558;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=61;PP=2011;ReadPosRankSum=0.410;SC=TGCTCTGCGCCCTGACGCTGC;SOR=0.685;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=216;TCF=111;TCR=105;TR=125;WE=10224534;WS=10224516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,138:0.57:244
chr19	10225682	rs3816556	G	C	2339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.448;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=44;PP=1534;ReadPosRankSum=-0.633;SC=AGAACAAAAAGAACCAAGTAG;SOR=0.724;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=242;TCF=137;TCR=105;TR=104;WE=10225690;WS=10225672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,114:0.43:267
chr19	10225777	rs7401	A	G	2056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.495;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=51;PP=1277;ReadPosRankSum=-1.905;SC=CCGAGTACACAGTGGCAGCTG;SOR=0.731;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=196;TCF=94;TCR=102;TR=96;WE=10225785;WS=10225767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,103:0.47:217
chr19	10226052	rs2305795	G	A	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.148;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=308;ReadPosRankSum=0.626;SC=AAAACCAGCCGGGGGACTGTT;SOR=0.223;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=40;TCF=34;TCR=6;TR=21;WE=10226060;WS=10226042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,24:0.55:44
chr19	10226256	rs7710	A	G	1829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.202;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.978;NF=50;NR=31;PP=1142;ReadPosRankSum=0.401;SC=TGATGAAGGCAAAGCCCTGTG;SOR=0.582;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=161;TCF=101;TCR=60;TR=81;WE=10226264;WS=10226246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,90:0.52:174
chr19	10226340	rs71188883	GTGCC	G	4849.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.453;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.770;NF=7;NR=51;PP=2551;ReadPosRankSum=1.792;SC=CAGCCCCACCGTGCCTGCCTG;SOR=0.665;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=152;TCF=23;TCR=129;TR=58;WE=10226351;WS=10226330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,127:0.49:258
chr19	10229297	rs11667630	C	A	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.391;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=19;PP=681;ReadPosRankSum=-1.808;SC=TCCGGGAGCACGGTTTTCCAA;SOR=1.053;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=117;TCF=68;TCR=49;TR=47;WE=10229305;WS=10229287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,46:0.37:125
chr19	10229521	rs2290687	C	T	2023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.500;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=44;PP=1495;ReadPosRankSum=-2.104;SC=AGGGTCCCCACTCCCTGCACC;SOR=0.483;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=169;TCF=88;TCR=81;TR=94;WE=10229529;WS=10229511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,97:0.56:173
chr19	10229726	rs149991692	TGGCAGTCCTCACTCACCTCCC	T	1230.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=3.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.32;MQRankSum=2.256;QD=16.41;ReadPosRankSum=-0.823;SOR=1.123;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,34:0.45:75
chr19	10244563	.	A	G	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.363;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.783;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=275;ReadPosRankSum=-0.298;SC=CGGTCCCCAGAGGGTTCTAGA;SOR=0.053;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=17;WE=10244571;WS=10244553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr19	10246776	.	G	A	1313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.114;ClippingRankSum=0.000;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.555;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=22;PP=734;ReadPosRankSum=0.787;SC=CCAGGCCCTCGGATGCCCCCT;SOR=0.527;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=101;TCF=64;TCR=37;TR=55;WE=10246784;WS=10246766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,61:0.55:111
chr19	10251048	.	AT	A	36.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.49;MQRankSum=-0.674;QD=4.59;ReadPosRankSum=0.566;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr19	10257245	rs2288349	G	A	2636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=52;PP=1672;SC=TGAGGTGGCCGGCAGTGGCCG;SOR=1.167;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=88;TCF=36;TCR=52;TR=88;WE=10257253;WS=10257235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr19	10265248	rs2114724	T	C	4295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=79;PP=2958;ReadPosRankSum=-0.455;SC=CTCTGGTCCCTGCCGCATCCT;SOR=0.741;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=168;TCF=86;TCR=82;TR=164;WE=10265256;WS=10265236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,168:0.99:170
chr19	10265312	rs721186	T	C	4667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=86;NR=86;PP=2708;SC=GCATGCAGGGTGTCAGGAAGA;SOR=0.738;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=172;TCF=86;TCR=86;TR=172;WE=10265320;WS=10265302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr19	10267077	rs2228611	T	C	6194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=120;NR=89;PP=2965;SC=CTTCAAGAGATGGGTCATCAT;SOR=0.847;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=210;TCF=120;TCR=90;TR=209;WE=10267085;WS=10267067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr19	10270746	rs3079962	GA	G	4093.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.230;NF=11;NR=103;PP=2037;ReadPosRankSum=0.498;SC=CGTTCTGGGGGAAAAAAAAAA;SOR=1.379;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=137;TCF=14;TCR=123;TR=114;WE=10270755;WS=10270736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,171:0.99:173
chr19	10334443	rs2116941	A	C	136.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=5;NR=0;PP=106;SC=AGTAGCCCCAAGTCTCTATCT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=10334451;WS=10334442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	10334663	rs2116942	T	G	2660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=33;PP=1763;SC=ACCCCCGGCCTCCAGCACTGC;SOR=1.368;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=93;TCF=59;TCR=34;TR=91;WE=10334671;WS=10334653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr19	10340912	rs2288937	A	G	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.205;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=40;ReadPosRankSum=-0.205;SC=CGCGGTATCCACGCTCGCTCG;SOR=1.179;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=5;WE=10340920;WS=10340902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr19	10362882	rs2358580	G	A	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.087;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=178;ReadPosRankSum=0.464;SC=GGCGCCTCGCGAGGCTCCAGT;SOR=1.609;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=8;WE=10362890;WS=10362872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr19	10370490	rs1059840	T	A	2347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.663;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=57;PP=1346;ReadPosRankSum=0.469;SC=CCACTGTTGATGTGAAGCACC;SOR=1.077;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=240;TCF=114;TCR=126;TR=101;WE=10370498;WS=10370480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,117:0.44:267
chr19	10370542	rs11115	C	T	1105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.357;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=32;PP=615;ReadPosRankSum=-0.035;SC=TTGGGAGCCTCAGGCCCACGC;SOR=1.109;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=122;TCF=48;TCR=74;TR=50;WE=10370550;WS=10370532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,56:0.43:131
chr19	10385743	rs5030352	C	G	1119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.063;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=33;PP=830;ReadPosRankSum=-0.419;SC=TAGGCAGACCCGGTGGGAGAG;SOR=1.747;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=59;TCF=12;TCR=47;TR=39;WE=10385751;WS=10385733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,42:0.66:64
chr19	10395683	rs5498	A	G	1408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.556;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=32;PP=852;ReadPosRankSum=-0.493;SC=GGTCACCCGCAAGGTGACCGT;SOR=0.884;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=39;TCR=59;TR=53;WE=10395691;WS=10395673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,61:0.55:111
chr19	10402131	rs901886	T	C	1836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.570;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=40;PP=1032;ReadPosRankSum=1.191;SC=CAAGTCCCGGTGTTCAAAGAG;SOR=0.691;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=173;TCF=89;TCR=84;TR=85;WE=10402139;WS=10402121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,90:0.50:181
chr19	10402938	rs1056538	G	A	1127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.219;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=32;PP=646;ReadPosRankSum=1.829;SC=CAGGCAGCTGGTCTGCAACGT;SOR=1.115;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=124;TCF=54;TCR=70;TR=52;WE=10402946;WS=10402928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,58:0.41:141
chr19	10403368	rs2228615	G	A	2816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.109;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=43;PP=1752;ReadPosRankSum=-0.709;SC=CGCAGCTGGGGCCCAAGCTCT;SOR=0.507;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=211;TCF=138;TCR=73;TR=120;WE=10403376;WS=10403358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,129:0.56:231
chr19	10403947	rs2569702	T	C	1269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.342;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=26;PP=672;ReadPosRankSum=1.730;SC=GCAGGGTGCATTTCTATCTGG;SOR=0.505;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=108;TCF=49;TCR=59;TR=52;WE=10403955;WS=10403937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,61:0.51:120
chr19	10404227	rs2569703	C	G	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=390;ReadPosRankSum=2.086;SC=AGAGTGCATGCCTCGACTAGC;SOR=0.516;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=18;WE=10404235;WS=10404220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,23:0.64:36
chr19	10405906	rs34124276	C	CT	378.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=431;ReadPosRankSum=0.129;SC=AGGCAGGATCCTCTTCTGCCC;SOR=0.724;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=12;WE=10405914;WS=10405896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr19	10407169	rs710845	G	C	802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=14;PP=382;ReadPosRankSum=0.032;SC=CCGTGTGTCTGAACGGAGCGG;SOR=0.736;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=50;TCR=38;TR=32;WE=10407177;WS=10407159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,38:0.38:99
chr19	10418784	rs281416	A	G	614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=2;PP=410;SC=CCGACGCCAGAGAGCACCCCT;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=19;WE=10418792;WS=10418774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	10419130	rs281417	C	T	1711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.345;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=37;PP=984;ReadPosRankSum=1.026;SC=GCCCCAGGACCGGGGTGTCCT;SOR=0.686;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=164;TCF=85;TCR=79;TR=71;WE=10419138;WS=10419120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,79:0.44:180
chr19	10421385	rs281418	G	C	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.233;HP=4;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=200;ReadPosRankSum=0.357;SC=GGCCAGAGGTGGGGGAGGGAG;SOR=1.855;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=26;TCF=10;TCR=16;TR=13;WE=10421393;WS=10421375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr19	10426422	rs378395	A	C	2167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.581;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=35;PP=1316;ReadPosRankSum=-1.560;SC=CCTCCTCTCCAGCCGGGCGCG;SOR=0.645;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=161;TCF=102;TCR=59;TR=93;WE=10426430;WS=10426412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,98:0.58:170
chr19	10426628	rs395782	T	C	2467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.759;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=65;PP=1790;ReadPosRankSum=0.006;SC=CAGCCTGCAGTAGAACCCTGG;SOR=0.971;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=219;TCF=94;TCR=125;TR=111;WE=10426636;WS=10426618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,113:0.49:231
chr19	10429120	rs281427	T	C	2592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=38;NR=56;PP=1481;SC=ATCTTCCCTCTGCCTCCCAGG;SOR=1.225;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=38;TCR=56;TR=94;WE=10429128;WS=10429110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr19	10431799	rs281425	G	T	476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=8;PP=170;ReadPosRankSum=-0.040;SC=CCACAGGGGCGGGGGGAGGAG;SOR=0.542;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=30;TCF=15;TCR=15;TR=18;WE=10431807;WS=10431789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,23:0.64:36
chr19	10439225	.	C	CA	35	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.6684;HP=12;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=18;MQ=57.15;NF=2;NR=1;PP=35;QD=13.6666666667;SC=GAGACTGTCTCAAAAAAAAAA;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=3;WE=10439233;WS=10439215;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,3:0.33:9
chr19	10441117	rs3181049	G	A	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.418;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=9;PP=251;ReadPosRankSum=0.201;SC=GCCCTGGCCCGCCCCATGGCC;SOR=0.346;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=51;TCF=36;TCR=15;TR=25;WE=10441125;WS=10441107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,28:0.50:56
chr19	10444826	rs2278442	G	A	3443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=89;PP=2427;ReadPosRankSum=0.370;SC=GCAGCCCCGTGTTAGCTCACC;SOR=0.682;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=328;TCF=165;TCR=163;TR=169;WE=10444834;WS=10444816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,170:0.54:313
chr19	10446568	rs2304237	T	C	1580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.649;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=34;PP=883;ReadPosRankSum=0.830;SC=GGGCGACCCATCCTCCACTTG;SOR=0.812;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=119;TCF=59;TCR=60;TR=64;WE=10446576;WS=10446558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,72:0.54:133
chr19	10449252	rs7257871	T	C	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.867;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.48;ReadPosRankSum=-0.464;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr19	10449358	rs7258015	T	C	701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.391;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=7;PP=378;ReadPosRankSum=-0.295;SC=GTCGACTCACTGTACACGGTG;SOR=1.248;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=77;TCF=52;TCR=25;TR=29;WE=10449366;WS=10449348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,35:0.40:88
chr19	10449392	rs2304240	A	G	3421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=41;PP=2093;SC=CTGTTATCTGAGAGCCATTGC;SOR=1.089;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=66;TCR=41;TR=107;WE=10449400;WS=10449382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr19	10449665	rs3176768	C	T	1001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=25;PP=617;ReadPosRankSum=-1.368;SC=GTTTCCTTGTCCCCCAACCCA;SOR=0.815;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=22;TCR=39;TR=39;WE=10449673;WS=10449655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,45:0.62:73
chr19	10450285	rs281414	G	A	1623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.634;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=40;PP=938;ReadPosRankSum=-0.049;SC=GTACCATGGTGGCCATTCTGA;SOR=0.793;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=135;TCF=55;TCR=80;TR=68;WE=10450293;WS=10450275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,76:0.52:145
chr19	10464687	rs280497	A	G	776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=12;PP=424;ReadPosRankSum=-2.974;SC=ACGCCCCCTCAAGTCTCTAGG;SOR=0.627;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=56;TCR=27;TR=36;WE=10464695;WS=10464677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,42:0.45:94
chr19	10467565	rs12720307	C	T	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=76;ReadPosRankSum=0.671;SC=TGCTCACAGCCGTAGAACCAG;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=5;WE=10467573;WS=10467555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr19	10468668	rs12720299	C	G	1574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.641;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=28;PP=897;ReadPosRankSum=-0.609;SC=CAGGTCCCCTCAGGTACTCAC;SOR=0.591;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=114;TCF=66;TCR=48;TR=63;WE=10468676;WS=10468658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,73:0.54:135
chr19	10472933	rs280519	A	G	2106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.140;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=46;PP=1331;ReadPosRankSum=-0.125;SC=TCCCCCTATCATCGTACCTCC;SOR=0.585;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=178;TCF=91;TCR=87;TR=98;WE=10472941;WS=10472923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,102:0.55:187
chr19	10473138	rs280520	A	G	1566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.760;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=35;PP=932;ReadPosRankSum=-1.350;SC=GGTGCCTGGCAGGAGGTGGCA;SOR=0.745;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=149;TCF=80;TCR=69;TR=71;WE=10473146;WS=10473128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,79:0.49:161
chr19	10473392	rs280521	G	A	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.746;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=242;ReadPosRankSum=0.533;SC=ACCCATACCCGGGAACAATGA;SOR=2.494;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=13;WE=10473400;WS=10473382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,16:0.84:19
chr19	10475649	rs2304255	C	T	3310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.849;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=72;PP=2042;ReadPosRankSum=0.806;SC=GCCGGCTGGCCGACTGCCTTG;SOR=0.555;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=296;TCF=145;TCR=151;TR=151;WE=10475657;WS=10475639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,158:0.50:316
chr19	10477072	rs79337061	C	T	658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=421;ReadPosRankSum=-0.205;SC=TACACAGCGTCCCCACCCCAT;SOR=0.703;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=26;WE=10477080;WS=10477062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,27:0.63:43
chr19	10527645	rs117320342	C	G	938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.470;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=15;PP=475;ReadPosRankSum=-0.299;SC=GTGCCCTGTCCGTGGCAGGGA;SOR=0.946;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=99;TCF=60;TCR=39;TR=44;WE=10527653;WS=10527635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,49:0.45:109
chr19	10600442	rs1048290	G	C	1480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=30;PP=972;ReadPosRankSum=0.595;SC=CGGCATAAAGGAGACGATTGA;SOR=0.738;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=88;TCR=64;TR=70;WE=10600450;WS=10600432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,74:0.44:168
chr19	10625067	rs6511701	A	C	8144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=155;NR=116;PP=2965;SC=GTGCACAGATAGCGGCCAGGA;SOR=0.895;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=273;TCF=156;TCR=117;TR=271;WE=10625075;WS=10625057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,302:1.00:302
chr19	10659737	rs12979378	C	T	2729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FS=3.390;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.50;ReadPosRankSum=1.348;SOR=0.525;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:129,131:0.50:260
chr19	10664632	rs3087689	A	G	696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=11;PP=509;ReadPosRankSum=0.090;SC=GGTGCTCAGGAGCTGTTCTTG;SOR=0.586;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=78;TCF=56;TCR=22;TR=35;WE=10664640;WS=10664622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,35:0.42:83
chr19	10665691	rs10419405	T	C	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.97;ReadPosRankSum=-1.016;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr19	10665912	rs6146467	C	CCCGCCCTGCCCGCAGCGCACCTGGCT	1975.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=0.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.70;MQRankSum=3.759;QD=16.74;ReadPosRankSum=-0.353;SOR=0.832;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,48:0.41:118
chr19	10668383	rs3745256	T	C	3550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=348;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.391;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=91;PP=2004;ReadPosRankSum=-0.213;SC=GCCAGGCTGCTGGGCTATGCC;SOR=0.655;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=339;TCF=154;TCR=185;TR=165;WE=10668391;WS=10668373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,170:0.49:346
chr19	10668452	rs3745255	A	G	2126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.387;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=53;PP=1394;ReadPosRankSum=1.088;SC=CACCGGGTTCAAACACGGGCT;SOR=0.953;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=184;TCF=74;TCR=110;TR=85;WE=10668460;WS=10668442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,93:0.48:193
chr19	10668953	rs875569	G	A	1310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.806;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=37;PP=868;ReadPosRankSum=-0.494;SC=GAGCCCACTCGAGACATAGGA;SOR=1.314;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=127;TCF=53;TCR=74;TR=57;WE=10668961;WS=10668943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,62:0.43:144
chr19	10669032	rs892084	T	C	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=102;ReadPosRankSum=0.000;SC=TAGGGCTCCCTACAGCCCTCC;SOR=0.616;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=6;WE=10669040;WS=10669022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr19	10670184	rs3826709	C	G	1818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.839;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=42;PP=1332;ReadPosRankSum=-0.295;SC=TGCTTGAGCTCTTCCTGCTTC;SOR=0.645;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=171;TCF=87;TCR=84;TR=86;WE=10670192;WS=10670174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,86:0.48:179
chr19	10670992	rs3745249	C	T	1775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=37;PP=958;ReadPosRankSum=-0.536;SC=GCTCACCCCTCCTCTTCCTCC;SOR=0.722;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=132;TCF=70;TCR=62;TR=76;WE=10671000;WS=10670982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,84:0.58:144
chr19	10672493	rs12984043	C	T	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.801;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=24;PP=601;ReadPosRankSum=1.149;SC=GAAGTCTCCCCGTCTGAGTTC;SOR=0.993;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=77;TCF=33;TCR=44;TR=38;WE=10672501;WS=10672483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,40:0.45:88
chr19	10673302	rs35523350	C	A	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.318;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=88;ReadPosRankSum=1.533;SC=AGCCACCATGCCCGGCCCAGG;SOR=0.155;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=8;WE=10673310;WS=10673293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr19	10673340	rs12977138	C	T	724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.347;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=7;PP=518;ReadPosRankSum=-0.662;SC=TCTCCTGCCCCTAAGACCCCC;SOR=1.071;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=43;TCF=32;TCR=11;TR=30;WE=10673348;WS=10673330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,30:0.64:47
chr19	10676343	rs3745246	A	T	1456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=35;NR=12;PP=863;SC=CGGGGTGCAGAGGGGGGCTTG;SOR=1.791;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=35;TCR=12;TR=47;WE=10676351;WS=10676333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr19	10676423	rs3745245	G	A	4578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=101;NR=63;PP=2684;SC=CCGACTCGGAGCTGGAGTCGC;SOR=1.096;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=172;TCF=101;TCR=71;TR=164;WE=10676431;WS=10676413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr19	10676487	rs34864064	G	GCC	3535.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FS=1.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.06;MQRankSum=0.000;QD=30.75;ReadPosRankSum=-0.534;SOR=0.535;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:23,92:0.80:115
chr19	10676537	rs3745244	C	A	1979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=1.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.367;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=1.058;NF=51;NR=53;PP=1497;ReadPosRankSum=0.606;SC=ACTTCCCAACCGGCCGGCGCG;SOR=0.535;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=211;TCF=102;TCR=109;TR=104;WE=10676545;WS=10676527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,100:0.48:210
chr19	10676681	rs3218222	T	C	1043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=27;PP=766;SC=GGCATGGCGGTTCTGTGGCCC;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=31;WE=10676689;WS=10676671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	10679067	rs33926515	GAGA	G	2574.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=11;NR=14;PP=1183;SC=TGAAAGCCTAGAGAAGAAGGA;SOR=1.217;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=30;TCF=15;TCR=15;TR=25;WE=10679077;WS=10679057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr19	10679240	rs1968445	C	G	4916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=89;NR=79;PP=2965;SC=GCACCAGCTCCCGGTGCAGAA;SOR=0.759;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=169;TCF=90;TCR=79;TR=168;WE=10679248;WS=10679230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr19	10685859	rs1560712	G	C	2487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=57;PP=1743;SC=GAGATACCATGTCTACAAAAA;SOR=1.664;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=27;TCR=57;TR=84;WE=10685867;WS=10685849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr19	10687757	rs7252007	T	C	920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=3;PP=709;SC=TCATGAGCCATCACACCTGAC;SOR=3.407;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=29;WE=10687765;WS=10687747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	10690321	rs73018660	C	T	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=147;ReadPosRankSum=-0.498;SC=TGAGCCACTGCGCTGGGCCCA;SOR=0.527;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=10;WE=10690329;WS=10690311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr19	10690557	rs10426276	G	C	3471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=62;PP=2067;SC=GTGGAGAGTGGAGAGTGACCC;SOR=1.133;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=108;TCF=46;TCR=62;TR=108;WE=10690565;WS=10690547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr19	10697773	rs75323740	A	G	935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.328;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=17;PP=597;ReadPosRankSum=-1.112;SC=GTGTTCCCAGACCTCTTCCTG;SOR=0.970;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=125;TCF=76;TCR=49;TR=46;WE=10697781;WS=10697763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,49:0.36:135
chr19	10697801	rs75192074	G	T	1392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.823;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=28;PP=798;ReadPosRankSum=-0.482;SC=CGGAGGGGTCGCCCCTGAATC;SOR=0.868;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=181;TCF=104;TCR=77;TR=69;WE=10697809;WS=10697791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,75:0.38:196
chr19	10738639	rs3087969	C	T	8204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=140;NR=130;PP=2965;SC=ACCCCACTGACAGCCGGGGCG;SOR=0.781;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=270;TCF=140;TCR=130;TR=270;WE=10738647;WS=10738629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,307:1.00:307
chr19	10741622	rs12710257	A	G	413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=28;NR=1;PP=542;SC=CGGAGGTTGCAGTGAGCCGAG;SOR=4.174;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=29;WE=10741630;WS=10741612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	10741681	rs60016481	C	CA	439.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=10.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.58;MQRankSum=2.490;QD=6.37;ReadPosRankSum=0.330;SOR=0.692;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,28:0.41:69
chr19	10741907	rs12972963	A	G	6165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=112;NR=108;PP=2965;SC=AGTCCTGAGCAGTCTGCCCCA;SOR=0.855;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=221;TCF=112;TCR=109;TR=220;WE=10741915;WS=10741897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr19	10742170	rs2288904	A	G	5065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=79;PP=2965;SC=GAGGTGCTTCAAGATGGTGAC;SOR=0.780;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=171;TCF=92;TCR=79;TR=170;WE=10742178;WS=10742160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr19	10742287	rs1560711	C	T	6231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=117;NR=85;PP=2965;SC=TGGTGCCATCCTCTGCTCCAT;SOR=0.907;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=202;TCF=117;TCR=85;TR=202;WE=10742295;WS=10742277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr19	10742443	rs1560710	C	T	8499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=143;NR=144;PP=2965;SC=TATTGGCGCACCGCGCCAGGG;SOR=0.739;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=288;TCF=143;TCR=145;TR=287;WE=10742451;WS=10742433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,309:1.00:309
chr19	10742463	rs1560709	G	T	8340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=137;NR=147;PP=2965;SC=GTCTCACTTTGCTGGGTGGGA;SOR=0.795;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=284;TCF=137;TCR=147;TR=284;WE=10742471;WS=10742453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,307:1.00:307
chr19	10745764	rs2163832	T	C	10343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=403;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=182;NR=184;PP=2965;SC=GGGGCCAGGGTGCCAGGGGCC;SOR=0.723;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=367;TCF=182;TCR=185;TR=366;WE=10745772;WS=10745754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,400:1.00:400
chr19	10748820	rs3859514	T	C	5201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=76;PP=2965;SC=GATTTCTGTCTTCTGTGATGA;SOR=0.749;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=167;TCF=91;TCR=76;TR=167;WE=10748828;WS=10748810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr19	10748850	rs76374006	C	G	2037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.804;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=39;PP=1294;ReadPosRankSum=-1.236;SC=TCTTAGGAGGCTGTTTCCTAT;SOR=0.685;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=173;TCF=92;TCR=81;TR=83;WE=10748858;WS=10748840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,91:0.49:185
chr19	10751769	rs111569642	G	GA	409.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.07;ReadPosRankSum=-1.344;SOR=0.677;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,20:0.54:37
chr19	10752968	rs10405617	A	G	3521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=88;NR=39;PP=2164;SC=TGGTCCCAGCATAGGATGGAC;SOR=1.609;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=127;TCF=88;TCR=39;TR=127;WE=10752989;WS=10752958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr19	10793749	rs2738039	A	G	2545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=25;PP=1673;SC=CTCCCATGTGACTGGAATGCC;SOR=1.718;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=83;TCF=58;TCR=25;TR=82;WE=10793757;WS=10793739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr19	10794630	rs2229383	G	T	10616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=392;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=165;NR=188;PP=2965;SC=GAGGCAACTCGGCGACAGCAG;SOR=0.905;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=353;TCF=165;TCR=188;TR=353;WE=10794638;WS=10794620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,392:1.00:392
chr19	10794793	rs892087	C	T	597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=17;PP=441;SC=AGACGGCCCTCGACCCCCACC;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=10794801;WS=10794783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	10818092	rs892085	G	A	6894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=110;PP=2965;SC=GGGATATGTGGTGGGAGGGGA;SOR=0.848;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=214;TCF=104;TCR=110;TR=214;WE=10818100;WS=10818082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr19	10883126	rs3826803	C	G	3441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=37;PP=2287;SC=AGCTCTTTCTCATTTTCAGCA;SOR=1.495;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=75;TCR=37;TR=112;WE=10883134;WS=10883116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr19	10960996	rs145427182	G	A	1232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.733;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=17;PP=762;ReadPosRankSum=0.007;SC=GCAGCCAAGAGGACCCCATCC;SOR=1.081;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=92;TCF=61;TCR=31;TR=54;WE=10961004;WS=10960986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,58:0.56:103
chr19	10970558	rs8100581	A	G	661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.439;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=387;ReadPosRankSum=1.358;SC=GGCAACCCTGATCCCTGTCAC;SOR=0.393;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=51;TCF=39;TCR=12;TR=25;WE=10970566;WS=10970548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,30:0.52:58
chr19	11019927	.	G	GT	349.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.082;ClippingRankSum=0.000;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.315;HP=10;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=238;ReadPosRankSum=-1.353;SC=TTCTGTCTCGGTTTTTTTTTT;SOR=1.159;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=69;TCF=4;TCR=65;TR=23;WE=11019935;WS=11019917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,21:0.33:64
chr19	11034803	rs139757178	G	A	1169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.635;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=25;PP=699;ReadPosRankSum=-0.448;SC=CTCTGGGCCAGCACCAGCGTC;SOR=0.612;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=128;TCF=59;TCR=69;TR=50;WE=11034811;WS=11034793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,57:0.40:142
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chr19	11172712	.	AAG	A	53	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=1;NR=1;PP=53;QD=31.5;SC=AACTGTCTTAAAGAGAGAGAG;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=2;WE=11172721;WS=11172702;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:11,2:0.15:13
chr19	11221454	rs2738442	T	C	16159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=436;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.06;SOR=0.702;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,436:1.00:436
chr19	11221454	.	TCCG	CCCC,CCCG	2569	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=114,204;NR=100,193;PP=2569,2275;QD=20;SC=GAAGGTGATTTCCGGGTGGGA;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=399;TCF=204;TCR=195;TR=214,397;WE=11221465;WS=11221444;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.54:399
chr19	11221457	rs12710260	G	C	5047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=438;ExcessHet=3.0103;FS=1.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.52;ReadPosRankSum=1.347;SOR=0.742;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:195,243:0.55:438
chr19	11224181	rs1003723	C	T	1502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.184;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=33;PP=962;ReadPosRankSum=-0.050;SC=GGGCTCCTGGCGCTGATGCCC;SOR=0.588;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=166;TCF=92;TCR=74;TR=71;WE=11224189;WS=11224171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,76:0.43:177
chr19	11224265	rs5930	A	G	2461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.125;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=37;PP=1548;ReadPosRankSum=-0.945;SC=TCATCAGCAGAGACATCCAGG;SOR=0.939;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=249;TCF=151;TCR=98;TR=104;WE=11224273;WS=11224255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,116:0.42:275
chr19	11224491	rs1569372	A	G	1106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.026;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=36;PP=793;ReadPosRankSum=-1.572;SC=AGCAGGAAGGAGCTTCAGGAA;SOR=0.190;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=91;TCF=22;TCR=69;TR=52;WE=11224499;WS=11224481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,51:0.54:94
chr19	11227480	.	A	C	54	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=2;NR=1;PP=54;QD=29.5904041824;SC=GGCCCTCAGGACCCTCTGGGA;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=3;WE=11227488;WS=11227470;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr19	11227554	rs1799898	C	T	657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=8;PP=409;ReadPosRankSum=-0.175;SC=GTGGCCGCCTCTACTGGGTTG;SOR=0.719;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=31;TCR=12;TR=28;WE=11227562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,30:0.61:49
chr19	11227602	rs688	C	T	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.890;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=238;ReadPosRankSum=-1.373;SC=TCGATGTCAACGGGGGCAACC;SOR=1.291;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=65;TCF=43;TCR=22;TR=23;WE=11227610;WS=11227592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,26:0.37:70
chr19	11230645	rs2569549	T	C	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.441;NF=12;NR=0;PP=243;ReadPosRankSum=0.329;SC=AGTGAAACTCTGTCTGAAACA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=12;WE=11230661;WS=11230635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr19	11230650	rs145643854	GAAAC	G	1387.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=1;PP=966;SC=AACTCTGTCTGAAACAAACAA;SOR=4.743;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=14;WE=11230661;WS=11230635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	11230881	rs5925	T	C	2776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.396;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=56;PP=1768;ReadPosRankSum=-0.989;SC=AGGATATGGTTCTCTTCCACA;SOR=0.607;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=253;TCF=125;TCR=128;TR=113;WE=11230889;WS=11230871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,129:0.44:295
chr19	11238473	rs2738459	A	C	342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=228;ReadPosRankSum=-1.183;SC=TCTATCCCCCACAAAAAGAAC;SOR=0.776;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=13;WE=11238481;WS=11238463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr19	11238548	rs2569538	A	G	763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.832;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=12;PP=488;ReadPosRankSum=0.729;SC=GTGGCCTCTCACAGACTTGGG;SOR=0.593;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=84;TCF=58;TCR=26;TR=37;WE=11238556;WS=11238538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,40:0.45:89
chr19	11242307	rs2738464	G	C	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.389;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=145;ReadPosRankSum=0.114;SC=GATGAAAGGGGAGGGGATGTC;SOR=1.445;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=8;WE=11242315;WS=11242297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
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chr19	11258593	rs372171481	AAAAAAAAAAAAAAG	A	2327.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FS=2.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.32;ReadPosRankSum=-0.290;SOR=0.934;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,119:0.63:189
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chr19	11303459	rs35706290	GC	G	4992.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.216;NF=29;NR=71;PP=1935;ReadPosRankSum=1.673;SC=GAAGAAAGAGGCCCCCCCCCC;SOR=0.825;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=123;TCF=40;TCR=83;TR=100;WE=11303477;WS=11303449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:6,175:0.97:181
chr19	11303469	rs7254270	C	G	8214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=77;PP=2965;SC=GCCCCCCCCCCCCAAGCCATT;SOR=0.836;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=174;TCF=97;TCR=77;TR=173;WE=11303477;WS=11303449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr19	11303943	rs3745681	A	G	6878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=123;NR=93;PP=2965;SC=CCCGTTCTCGAACCCAGGTGC;SOR=0.760;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=216;TCF=123;TCR=93;TR=216;WE=11303951;WS=11303933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr19	11310920	rs8101345	C	T	181.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=102;SC=CCATCCTGTACCTGTCCTGGT;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=11310928;WS=11310910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	11313256	rs3745682	G	A	7982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=145;NR=125;PP=2965;SC=CCACAAGGACGTGCCTCCAGC;SOR=0.829;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=272;TCF=146;TCR=126;TR=270;WE=11313264;WS=11313246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,295:1.00:295
chr19	11314738	.	TCCA	T	589.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=1.334;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.634;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=354;ReadPosRankSum=-1.820;SC=CAGGTGGCTGTCCACCAAGGC;SOR=1.536;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=9;WE=11314748;WS=11314728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
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chr19	11348098	rs34301174	G	A	1084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.23;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
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chr19	11409684	rs422496	A	G	1288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.506;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=29;PP=689;ReadPosRankSum=-2.064;SC=GGACGGGCACAGTGGCTCACG;SOR=0.478;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=104;TCF=36;TCR=68;TR=48;WE=11409692;WS=11409674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,59:0.50:119
chr19	11411868	rs420703	C	A	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=9;PP=333;ReadPosRankSum=0.007;SC=TTCCTGTCCTCTCTGTGAGGT;SOR=0.776;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=65;TCF=43;TCR=22;TR=27;WE=11411876;WS=11411858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,33:0.46:72
chr19	11436302	rs56363898	A	AG	2983.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=43;PP=2172;SC=AAGACCCCTGAGGGCAGAGTC;SOR=1.105;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=55;TCF=8;TCR=47;TR=51;WE=11436310;WS=11436292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr19	11437480	rs318687	C	G	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=2;PP=23;SC=AGGTGGGGGTCTCGCTATGTT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=11437488;WS=11437470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr19	11437566	rs318688	G	A	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=50;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GTTTACCAGCGTGAGCCACCA;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=4;WE=11437574;WS=11437556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr19	11446520	rs3816864	T	G	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.243;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=335;ReadPosRankSum=-1.483;SC=ACCCCTGTCTTAGAGGGGCAC;SOR=0.976;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=45;TCF=13;TCR=32;TR=21;WE=11446528;WS=11446510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,22:0.44:50
chr19	11459260	rs12976608	T	C	1198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=23;PP=643;ReadPosRankSum=-2.221;SC=CCACCATTGCTGGCCGCGTCT;SOR=0.638;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=118;TCF=72;TCR=46;TR=56;WE=11459268;WS=11459250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,59:0.46:127
chr19	11464003	rs12975236	C	G	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.206;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.160;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=140;ReadPosRankSum=0.530;SC=GTCTCAATCTCCTGACCTCGT;SOR=3.737;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=7;WE=11464011;WS=11463993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr19	11465129	rs7251786	C	T	939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=10;PP=506;ReadPosRankSum=-1.039;SC=TGGTGTCACACTGGATCACAT;SOR=0.631;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=67;TCF=49;TCR=18;TR=38;WE=11465137;WS=11465119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,44:0.59:75
chr19	11465316	rs6887	G	C	1691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=38;PP=1068;ReadPosRankSum=1.704;SC=GACTCCGACTGTGACCAGGAC;SOR=0.706;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=150;TCF=69;TCR=81;TR=72;WE=11465324;WS=11465306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,79:0.49:162
chr19	11473415	rs12983706	C	T	889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=23;PP=518;ReadPosRankSum=1.792;SC=CACCAGCTCTCTGACCCAAGA;SOR=0.659;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=74;TCF=29;TCR=45;TR=37;WE=11473423;WS=11473405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,42:0.49:85
chr19	11492555	rs117580409	G	A	3986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=381;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.200;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=82;PP=2374;ReadPosRankSum=2.470;SC=TCAGGTGGGCGAGGACTGAGA;SOR=0.622;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=354;TCF=188;TCR=166;TR=174;WE=11492563;WS=11492545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:190,191:0.50:381
chr19	11495381	.	T	TTTCCTTCCTTCCTTCC	96.37	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.17;QD=32.12;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr19	11508177	rs2291516	G	A	2890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.239;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=53;PP=1495;ReadPosRankSum=0.502;SC=CGGATGACACGGGCCTCCGAG;SOR=0.544;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=202;TCF=100;TCR=102;TR=110;WE=11508185;WS=11508167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,135:0.57:236
chr19	11526759	rs160838	G	A	2913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=58;PP=1801;SC=GTCCGAATGGGCAGGGGGGTC;SOR=1.232;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=40;TCR=58;TR=98;WE=11526767;WS=11526749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr19	11529958	rs1549168	C	T	875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=3.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.42;ReadPosRankSum=1.274;SOR=0.395;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,45:0.48:93
chr19	11532400	.	G	A	2363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.749;ClippingRankSum=0.000;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.492;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.964;NF=55;NR=56;PP=1551;ReadPosRankSum=-0.171;SC=CTGGAGCTGCGCCTGCAGTTT;SOR=0.653;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=202;TCF=102;TCR=100;TR=111;WE=11532408;WS=11532390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,114:0.52:218
chr19	11534503	.	TGG	T,TG	1268.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.115;ClippingRankSum=0.000;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=3.381;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.07;ReadPosRankSum=-1.094;SOR=2.262;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:3,11,41:0.20,0.75:55
chr19	11541685	rs34095	G	A	4523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=79;PP=2936;SC=ATCCACCGCCGCGGGAACCCT;SOR=0.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=152;TCF=73;TCR=79;TR=152;WE=11541693;WS=11541675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr19	11541712	rs34094	T	C	3984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=61;PP=2601;SC=ACCCCTTTGCTCCTTACCTTG;SOR=0.766;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=128;TCF=67;TCR=61;TR=128;WE=11541720;WS=11541702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr19	11558240	rs186375	T	C	4742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=64;PP=2396;SC=CCGACCGCACTGCTCACCCGC;SOR=0.926;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=156;TCF=92;TCR=64;TR=156;WE=11558248;WS=11558230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr19	11558340	rs3217229	AGAG	A	281.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=1.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.14;ReadPosRankSum=1.481;SOR=0.875;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,12:0.18:68
chr19	11568022	rs311788	A	T	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.306;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=243;ReadPosRankSum=1.334;SC=CTGCTGTGACACCGTCGGCCT;SOR=2.049;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=24;TCF=10;TCR=14;TR=15;WE=11568030;WS=11568012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr19	11568067	rs311787	G	A	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=55;ReadPosRankSum=0.431;SC=GCCTGCAGCAGAGCCCTGCCC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=4;WE=11568075;WS=11568057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
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chr19	11687908	rs62638747	G	A	5704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=519;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=125;NR=123;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.176;SC=GCACACCAGTGAAGTAAAAAT;SOR=0.745;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=468;TCF=235;TCR=233;TR=248;WE=11687916;WS=11687898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:243,276:0.53:519
chr19	11725413	rs12151212	G	A	2666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.832;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=43;PP=1762;ReadPosRankSum=0.219;SC=ATCCTTCCCAGAAGAATCTCT;SOR=0.970;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=252;TCF=149;TCR=103;TR=115;WE=11725421;WS=11725403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,125:0.45:275
chr19	11727384	rs4411616	G	C	77.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=0;PP=56;SC=GTTCACGCCTGGGCAACATAG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=11727392;WS=11727380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr19	11727503	rs4545929	T	C	699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.025;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=8;PP=431;ReadPosRankSum=0.560;SC=CTCATTTTTCTGACAAGTCAT;SOR=0.495;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=65;TCF=50;TCR=15;TR=29;WE=11727511;WS=11727493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,32:0.43:74
chr19	11878095	rs384148	T	G	1800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=50;PP=1140;ReadPosRankSum=1.513;SC=TGGCACCAGGTCTTCCCCGCC;SOR=0.718;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=173;TCF=75;TCR=98;TR=87;WE=11878103;WS=11878085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,92:0.50:185
chr19	11889347	rs371134	C	T	88.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5164;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=35;ReadPosRankSum=-0.253;SC=GATCATAGCTCGCTGTAGCCT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=11889355;WS=11889337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr19	11891003	rs799193	G	A	7447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=131;NR=108;PP=2965;SC=TAATTGCTACGTTAGAGTTGA;SOR=0.886;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=239;TCF=131;TCR=108;TR=239;WE=11891011;WS=11890993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,270:1.00:270
chr19	11918093	rs71166630	AT	A	419.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.948;NF=1;NR=11;PP=283;ReadPosRankSum=-0.556;SC=GAGAAATGCTATTTTTTAATT;SOR=0.735;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=12;WE=11918101;WS=11918083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr19	11941221	rs424132	T	A	2088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=2.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.460;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-9.276;NF=50;NR=50;PP=1498;ReadPosRankSum=-1.419;SC=CCTGACCTCTTTAGGTAAGGA;SOR=0.677;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=230;TCF=119;TCR=111;TR=100;WE=11941229;WS=11941211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,103:0.39:262
chr19	11941256	rs421355	A	G	1890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=2.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-6.909;NF=40;NR=47;PP=1330;ReadPosRankSum=0.894;SC=CCCTCAGTCCATTAGTGAACC;SOR=0.664;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=186;TCF=88;TCR=98;TR=87;WE=11941264;WS=11941246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,90:0.44:206
chr19	11941363	rs2545810	G	A	1127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.728;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.520;NF=19;NR=25;PP=781;ReadPosRankSum=1.136;SC=AATCATGGGCGTAGAATCTAA;SOR=0.952;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=84;TCF=38;TCR=46;TR=44;WE=11941371;WS=11941353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,48:0.53:90
chr19	11941532	rs35392612	C	G	1728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.169;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.675;NF=34;NR=47;PP=1227;ReadPosRankSum=1.267;SC=TCTCTCTAGACAATCTTAGAA;SOR=0.581;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=173;TCF=72;TCR=101;TR=81;WE=11941540;WS=11941522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,83:0.44:188
chr19	11941617	rs410885	G	A	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.847;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.401;NF=7;NR=17;PP=322;ReadPosRankSum=-0.942;SC=TAGAATATTTGATCAAAAAAC;SOR=0.132;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=49;TCF=10;TCR=39;TR=24;WE=11941625;WS=11941607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,24:0.48:50
chr19	11942362	rs427880	A	G	4596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=446;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.519;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.517;NF=106;NR=93;PP=2887;ReadPosRankSum=0.972;SC=TTTAATATGAACATCAGAGGT;SOR=0.631;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=399;TCF=220;TCR=179;TR=199;WE=11942370;WS=11942352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:228,218:0.49:446
chr19	11942615	rs394416	A	C	2872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.689;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.492;NF=57;NR=61;PP=1811;ReadPosRankSum=-0.166;SC=GTGGGAAAGCATTCCATTGTC;SOR=0.459;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=207;TCF=94;TCR=113;TR=118;WE=11942623;WS=11942605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,127:0.57:221
chr19	11942771	rs436411	G	A	3955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=374;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.780;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.428;NF=94;NR=79;PP=2506;ReadPosRankSum=1.960;SC=AATATCAGGAGTGTGGGAAAG;SOR=0.635;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=345;TCF=188;TCR=157;TR=173;WE=11942791;WS=11942761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:189,185:0.49:374
chr19	11943697	rs400106	G	A	7583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=97;NR=100;PP=2965;SC=ATGGAGAGAAGCCCTATGCAT;SOR=0.790;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=198;TCF=97;TCR=101;TR=197;WE=11943705;WS=11943687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr19	11943713	rs56167415	G	A	2301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.328;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=53;PP=1508;ReadPosRankSum=-0.635;SC=TGCATGTAAGGAATGTGGGAA;SOR=0.536;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=200;TCF=97;TCR=103;TR=105;WE=11943721;WS=11943703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,111:0.52:215
chr19	11943823	rs375049	G	A	900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.772;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-2.669;NF=11;NR=27;PP=631;ReadPosRankSum=1.280;SC=TATGTGGGAGGGGCTTTTATT;SOR=0.898;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=88;TCF=30;TCR=58;TR=38;WE=11943831;WS=11943813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,40:0.42:95
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chr19	11977572	rs11671596	G	C	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.852;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=88;ReadPosRankSum=-0.473;SC=GATCAAGGCTGAGGGCTCACT;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=11977580;WS=11977562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
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chr19	12250983	rs45536046	C	G	1177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.546;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=19;PP=654;ReadPosRankSum=-0.182;SC=GACTCCGGCCCCATACACTCA;SOR=0.441;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=106;TCF=71;TCR=35;TR=52;WE=12250991;WS=12250973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,60:0.51:117
chr19	12360647	rs10411611	A	G	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=97;ReadPosRankSum=1.689;SC=GATTACAGGCATGAGCCACTG;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=7;WE=12360655;WS=12360637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr19	12385749	rs2459040	C	T	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.92;ReadPosRankSum=0.491;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,11:0.20:54
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chr19	12405552	rs386901	T	C	4491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=398;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.363;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=92;PP=2874;ReadPosRankSum=1.549;SC=ACTCCCGTAGTCAGGGTAGGT;SOR=0.732;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=364;TCF=192;TCR=172;TR=196;WE=12405560;WS=12405542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,214:0.54:397
chr19	12461691	rs61735342	C	T	2597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.848;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-2.147;NF=55;NR=48;PP=1401;ReadPosRankSum=-0.663;SC=TACATTCATACGGTTTCTCTC;SOR=0.505;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=238;TCF=114;TCR=124;TR=103;WE=12461699;WS=12461681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,125:0.47:268
chr19	12491302	rs145317058	TTTC	T	3367.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.049;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.105;NF=14;NR=35;PP=2129;ReadPosRankSum=1.402;SC=ATTCATAGAGTTTCTTCTCTC;SOR=1.005;SbPval=0.51;Source=Platypus;TR=49;WE=12491312;WS=12491292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,86:0.60:144
chr19	12491498	rs4804664	C	T	3956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.950;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=70;PP=2341;ReadPosRankSum=0.007;SC=AGTGGTTTCACGTCTTTGAAG;SOR=0.854;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=297;TCF=161;TCR=136;TR=161;WE=12491506;WS=12491488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,180:0.55:328
chr19	12491639	rs59301182	A	G	6021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-3.871;NF=75;NR=77;PP=2158;ReadPosRankSum=1.602;SC=ACATTCATACAGTTTCTCCCC;SOR=0.686;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=301;TCF=143;TCR=158;TR=152;WE=12491647;WS=12491629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,166:0.49:337
chr19	12491654	rs57371898	C	T	5860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.859;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.807;NF=69;NR=74;PP=2092;ReadPosRankSum=0.935;SC=CTCCCCAGTACGTGTTCTTTC;SOR=0.758;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=281;TCF=134;TCR=147;TR=143;WE=12491662;WS=12491644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,156:0.50:311
chr19	12491779	rs17706075	T	C	3699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.953;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.438;NF=81;NR=65;PP=1923;ReadPosRankSum=-2.384;SC=GCCAGAAAAATGCTTTCCCAC;SOR=0.578;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=259;TCF=143;TCR=116;TR=146;WE=12491787;WS=12491769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,172:0.58:297
chr19	12491949	rs11668955	T	C	5026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FS=2.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.30;ReadPosRankSum=-1.875;SOR=0.543;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,133:0.56:236
chr19	12491955	rs11668074	A	C	4982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FS=1.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.05;ReadPosRankSum=-0.543;SOR=0.616;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,125:0.55:226
chr19	12492036	rs10417283	A	T	4320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FS=2.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.003;QD=26.51;ReadPosRankSum=0.196;SOR=0.894;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,108:0.66:163
chr19	12492039	rs10414984	G	T	4305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FS=2.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.984;QD=26.74;ReadPosRankSum=-0.259;SOR=0.937;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,108:0.67:161
chr19	12494612	rs10418011	T	C	1076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=6.463;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=34.73;ReadPosRankSum=1.065;SOR=2.565;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,30:0.97:31
chr19	12494621	rs10412448	A	G	812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.78;SOR=2.948;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	12502457	rs4804669	A	G	7992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=125;NR=140;PP=2965;SC=ACATTCATACAGTTTCTCCCC;SOR=0.956;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=265;TCF=125;TCR=140;TR=265;WE=12502465;WS=12502447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,297:1.00:297
chr19	12503054	rs62111327	G	A	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=22.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.76;MQRankSum=2.459;QD=6.31;ReadPosRankSum=-1.021;SOR=0.066;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,29:0.35:83
chr19	12503074	rs62111328	G	C	880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=4.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.46;MQRankSum=2.143;QD=12.95;ReadPosRankSum=1.091;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,25:0.37:68
chr19	12503077	rs62111329	A	G	880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=4.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.96;MQRankSum=1.735;QD=12.58;ReadPosRankSum=1.720;SOR=0.256;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,25:0.36:70
chr19	12503096	rs62111330	A	G	533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=1.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.54;MQRankSum=0.713;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.286;SOR=0.458;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,25:0.41:61
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chr19	12540818	rs28438452	G	C	451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQ=57.01;NF=14;NR=0;PP=378;SC=AGGTATCAAGGGATGACTGTA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=12540826;WS=12540809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
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chr19	12540971	rs28559848	T	A	1783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.53;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.022;NF=46;NR=38;PP=1192;ReadPosRankSum=0.738;SC=GAGAGAATGCTAGTGAGTCTT;SOR=0.658;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=197;TCF=107;TCR=90;TR=84;WE=12540979;WS=12540961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,87:0.43:201
chr19	12541214	rs7256321	G	T	5743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=113;NR=100;PP=2965;SC=ACCACATTGTGGACATTCATA;SOR=0.898;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=213;TCF=113;TCR=100;TR=213;WE=12541222;WS=12541204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr19	12541532	rs10422063	C	A	10636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.78;QD=44.51;SOR=0.701;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
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chr19	12541544	rs35055629	A	C	11132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.47;QD=45.63;SOR=0.743;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr19	12541795	rs35699767	C	A	7280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=129;NR=112;PP=2965;SC=CTTTCCCACACTGCTTGCATT;SOR=0.831;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=242;TCF=129;TCR=113;TR=241;WE=12541803;WS=12541789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr19	12542355	rs4804183	A	G	6399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=125;NR=93;PP=2965;SC=ATATGTAATAAACTGGGCCAA;SOR=0.954;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=218;TCF=125;TCR=93;TR=218;WE=12542371;WS=12542345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr19	12542653	rs4239550	TT	GA	23390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=521;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=245;NR=201;PP=2947;SC=GACCCATGACTTTTTCTCCTC;SOR=0.823;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=466;TCF=253;TCR=213;TR=446;WE=12542662;WS=12542643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,520:1.00:520
chr19	12542828	rs4804691	G	A	1094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.61;QD=33.17;SOR=7.054;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	12542848	rs4804692	G	C	701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.62;QD=41.28;SOR=5.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	12542851	rs4804693	A	G	669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.57;QD=44.65;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	12542870	rs76308383	A	G	285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.36;QD=28.58;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	12542891	rs140908232	G	A	74.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=37.81;QD=24.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr19	12543121	rs74181652	C	G	2450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=34;PP=1997;SC=TTCTTTGCTTCTTTTTAAATT;SOR=1.230;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=100;TCF=66;TCR=34;TR=98;WE=12543129;WS=12543111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr19	12543251	rs138584869	A	C	1068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.41;QD=30.54;SOR=2.649;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	12543866	rs138105074	A	G	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.21;MQRankSum=-3.921;QD=16.13;ReadPosRankSum=0.831;SOR=0.733;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,21:0.75:28
chr19	12551671	rs11878378	G	T	4417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.82;QD=45.08;SOR=1.634;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr19	12551674	rs11878523	C	A	4475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.04;QD=42.63;SOR=1.522;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr19	12551715	rs11881297	A	C	6213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=132;NR=91;PP=2965;SC=ACGCCGGCCCAGCACACGCAC;SOR=1.116;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=223;TCF=132;TCR=91;TR=223;WE=12551723;WS=12551705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr19	12551789	rs3745658	A	C	8967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=352;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=164;NR=153;PP=2965;SC=TGCGTGTTCCAGCCAGACAAA;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=317;TCF=164;TCR=153;TR=317;WE=12551797;WS=12551779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,350:1.00:350
chr19	12551895	rs3745657	A	T	2078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=22;NR=52;PP=1434;SC=TCAACCACACACACTTCTCTG;SOR=2.043;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=22;TCR=52;TR=74;WE=12551903;WS=12551885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr19	12624750	rs62113566	C	T	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.706;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=90;ReadPosRankSum=1.424;SC=CTCGCCCCAGCGCCCCCGATT;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=7;WE=12624758;WS=12624740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr19	12661335	rs2861411	C	T	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.718;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.108;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr19	12662318	rs79749579	G	GC	5905.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=82;PP=2973;SC=GTTGAACATTGCCCCTGTCCC;SOR=1.308;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=104;TCF=8;TCR=96;TR=90;WE=12662326;WS=12662308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr19	12691335	rs3745652	G	A	1910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.570;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=27;PP=1083;ReadPosRankSum=-1.338;SC=TTTCGTGCACGTGCAAAGACT;SOR=0.781;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=157;TCF=99;TCR=58;TR=76;WE=12691343;WS=12691325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,88:0.51:174
chr19	12694089	rs12461643	T	G	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.683;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=157;ReadPosRankSum=-0.079;SC=TCCTGACCTCTTAATCCGCCC;SOR=0.132;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=15;WE=12694097;WS=12694079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr19	12707904	rs1864082	T	C	888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.246;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=11;PP=561;ReadPosRankSum=-0.853;SC=GGTCTTCCCATAGCCGGTTCC;SOR=0.372;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=79;TCF=59;TCR=20;TR=37;WE=12707912;WS=12707894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,41:0.47:88
chr19	12707978	rs1864081	G	A	3175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=57;PP=1894;ReadPosRankSum=-0.703;SC=CTCGGCTTACGGAGGCTCCAG;SOR=0.695;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=251;TCF=147;TCR=104;TR=135;WE=12707986;WS=12707968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,151:0.54:279
chr19	12720631	rs8100964	C	T	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.676;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.44;ReadPosRankSum=-1.326;SOR=0.204;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr19	12760287	rs12984441	A	C	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.24;ReadPosRankSum=0.073;SOR=1.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr19	12760664	.	T	C	58	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=19;MQ=60.0;NF=4;NR=0;PP=58;QD=23.1928031368;SC=CAAATTTCCCTCACCACCCCT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=4;WE=12760672;WS=12760654;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:4,4:0.50:8
chr19	12768391	rs73002392	G	A	2085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.835;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=42;PP=1227;ReadPosRankSum=-1.245;SC=CAATGAGTCCGGTGAGGTTCT;SOR=0.536;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=166;TCF=91;TCR=75;TR=90;WE=12768399;WS=12768381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,101:0.55:183
chr19	12774208	rs1054486	G	C	3073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=347;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=65;PP=1823;ReadPosRankSum=0.097;SC=TCCTCCACCAGCGGCTGATCG;SOR=0.696;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=307;TCF=153;TCR=154;TR=128;WE=12774216;WS=12774198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:194,153:0.44:347
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chr19	12830222	rs80264991	A	G	654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=20;PP=505;ReadPosRankSum=-0.554;SC=TGTACCTGACACTATCTCTGA;SOR=0.601;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=48;TCF=13;TCR=35;TR=28;WE=12830230;WS=12830212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,28:0.55:51
chr19	12876278	rs1205169	C	A	1594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.525;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=43;PP=1059;ReadPosRankSum=-1.854;SC=GAAAAGAAAGCAGGCCAGGCG;SOR=0.547;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=122;TCF=38;TCR=84;TR=64;WE=12876286;WS=12876268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,69:0.53:129
chr19	12883305	rs188772552	C	T	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.438;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.832;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=3;PP=94;ReadPosRankSum=-0.411;SC=AGATGTCTGGCCAGCTGAGTT;SOR=0.132;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=6;WE=12883313;WS=12883295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr19	12908142	.	CTT	C	50.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=-0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.46;ReadPosRankSum=0.189;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr19	12911285	rs10427027	T	C	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=122;ReadPosRankSum=0.632;SC=TGTATCCCCATGGCTGGGAAG;SOR=0.821;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=11;WE=12911293;WS=12911275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr19	12917761	rs55668927	A	T	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.534;SOR=0.880;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr19	12937510	rs149645338	G	GAAAT	493.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.971;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=1;PP=135;ReadPosRankSum=-1.587;SC=CTCCGTCTCAGAAATAAATAA;SOR=1.329;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=15;TCF=9;TCR=6;TR=3;WE=12937518;WS=12937500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr19	12939792	rs1466306	T	C	2506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=44;PP=1563;SC=CCCTGTGAGCTAGGGTCTTGG;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=30;TCR=44;TR=74;WE=12939800;WS=12939782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr19	12958360	rs2290689	T	C	6380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=121;PP=2965;SC=GGTTACATCTTGGGGCGGGGG;SOR=0.994;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=221;TCF=99;TCR=122;TR=219;WE=12958368;WS=12958350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr19	12958697	rs2290688	T	C	3733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=28;PP=2590;SC=TGCGCGACTTTACCCGCGCCT;SOR=2.191;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=83;TCR=28;TR=111;WE=12958705;WS=12958687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr19	12962648	rs7250751	A	G	642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=2;PP=444;SC=CACCTGTAAGATGGGACAGTA;SOR=3.160;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=12962656;WS=12962638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	12963143	rs1078264	T	C	3704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=60;PP=1978;SC=CCTCCCTAGATGTGGTGCATC;SOR=0.949;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=56;TCR=60;TR=116;WE=12963151;WS=12963133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr19	12963285	rs2077544	C	T	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-3.353;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.410;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=49;ReadPosRankSum=-0.014;SC=GGCTTCTTTGCCCTCAGGCTT;SOR=0.061;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=6;WE=12963293;WS=12963275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr19	12975599	rs2242512	G	A	3331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.30;SOR=2.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr19	12975599	.	GCGGGCCCAT	ACGGGCCCAC,ACGGGCCCAT	980	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=33,61;NR=13,22;PP=980,469;QD=22.4666929318;SC=CCCTTTTTATGCGGGCCCATT;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=83;TCF=61;TCR=22;TR=46,83;WE=12975616;WS=12975589;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.55:83
chr19	12975608	rs7256794	T	C	1392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=1.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.36;ReadPosRankSum=-1.906;SOR=1.012;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,60:0.62:97
chr19	12976481	rs150724539	AAAC	A	9649.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=28;NR=75;PP=2985;SC=TCCTGTGTCCAAACAACAACA;SOR=0.904;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=120;TCF=34;TCR=86;TR=103;WE=12976491;WS=12976471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr19	12985576	rs11085822	A	G	5572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=92;PP=2965;SC=TCTTGGGCTCAGGCACCAAGC;SOR=0.772;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=188;TCF=96;TCR=92;TR=188;WE=12985584;WS=12985566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr19	12989560	rs2293682	G	A	1832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=42;PP=991;ReadPosRankSum=-1.771;SC=TATGAGGCCAGCTGTATGCAG;SOR=0.741;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=145;TCF=65;TCR=80;TR=75;WE=12989568;WS=12989550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,88:0.52:169
chr19	12996500	rs2072596	A	G	936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=19;PP=592;ReadPosRankSum=-1.969;SC=GTCCGCGGGAAGTAGCCACCC;SOR=0.643;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=75;TCF=36;TCR=39;TR=38;WE=12996508;WS=12996490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,42:0.51:83
chr19	12996740	rs2072597	A	G	4495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=75;PP=2965;SC=TGCGCCCCGGAGGCCTCGCTG;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=154;TCF=78;TCR=76;TR=153;WE=12996748;WS=12996727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr19	13002384	rs3745647	T	C	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.298;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=187;ReadPosRankSum=0.719;SC=TGTTCAGCTGTCTGTCTGCCG;SOR=2.027;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=11;WE=13002392;WS=13002374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,11:0.35:31
chr19	13002563	rs2242517	T	G	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.97;ReadPosRankSum=-0.566;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr19	13006685	rs2238641	T	C	1348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.44;ReadPosRankSum=1.290;SOR=0.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,36:0.55:66
chr19	13006685	.	TGG	CGA	1278	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=24;MQ=59.78;NF=26;NR=7;PP=1278;QD=40.3475113595;SC=CCACCTGCCTTGGCCTCCTAA;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=66;TCF=51;TCR=15;TR=33;WE=13006695;WS=13006675;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:33,33:0.50:66
chr19	13006687	rs12151303	G	A	1348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=2.265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.73;ReadPosRankSum=2.626;SOR=1.167;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,36:0.50:72
chr19	13008607	rs1060218	G	T	2594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.512;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=63;PP=1544;ReadPosRankSum=-3.979;SC=TGCTGGGGGGGAATGGGATTT;SOR=0.810;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=239;TCF=111;TCR=128;TR=118;WE=13008615;WS=13008597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,127:0.50:255
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chr19	13015530	rs17706531	A	G	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=6.021;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=118;ReadPosRankSum=-0.921;SC=AGAGTACAGGAAGCGGCCAGG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=6;WE=13015538;WS=13015520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr19	13029188	rs2965214	G	A	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.735;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=278;ReadPosRankSum=-1.332;SC=AAGGAGGGAGGATGAGGAGTG;SOR=0.330;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=18;WE=13029196;WS=13029178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr19	13030939	.	AT	A	80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=42;MMLQ=19;MQ=60.0;NF=4;NR=0;PP=80;QD=20.75;SC=ACACACACACATAATTATATT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=4;WE=13030947;WS=13030929;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:10,4:0.29:14
chr19	13031210	rs2967897	T	C	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.830;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=379;ReadPosRankSum=-0.363;SC=TCTAGACAGATAGGCCTTGCT;SOR=0.238;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=42;TCF=6;TCR=36;TR=21;WE=13031218;WS=13031200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,22:0.49:45
chr19	13035722	rs35087277	T	C	1569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=37;PP=805;ReadPosRankSum=1.296;SC=CCGCACCTTCTGGGCAAGGCG;SOR=0.715;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=152;TCF=72;TCR=80;TR=69;WE=13035730;WS=13035712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,78:0.44:177
chr19	13039284	rs2293683	A	G	2443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.158;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=49;PP=1477;ReadPosRankSum=1.706;SC=GGTGGGAGACACAGCCTGACT;SOR=0.819;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=216;TCF=114;TCR=102;TR=107;WE=13039292;WS=13039263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,120:0.49:243
chr19	13041442	rs33925420	G	A	3532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.006;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=77;PP=2261;ReadPosRankSum=1.166;SC=CTCGCTCTGGGCCAGGCCCTC;SOR=0.506;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=253;TCF=117;TCR=136;TR=148;WE=13041450;WS=13041432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,160:0.57:279
chr19	13044544	rs2974750	C	A	743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=20;PP=426;ReadPosRankSum=-1.132;SC=TGTCCGGGCCCGGGTGGGCGG;SOR=0.664;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=30;TCR=38;TR=36;WE=13044552;WS=13044534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,37:0.53:70
chr19	13186524	rs66502314	C	T	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.401;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=291;ReadPosRankSum=-0.274;SC=GCAAGGGCAGCCCAGAGTCTT;SOR=1.973;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=56;TCF=11;TCR=45;TR=17;WE=13186532;WS=13186514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,20:0.35:57
chr19	13211508	rs142687463	C	T	4768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-2.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=461;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.233;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=111;PP=2767;ReadPosRankSum=0.021;SC=TTGGTCTCCGCTTCAACCGGC;SOR=0.494;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=419;TCF=188;TCR=231;TR=212;WE=13211516;WS=13211498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:224,236:0.51:460
chr19	13249244	rs8112067	A	G	1572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=38;PP=1156;SC=CCGCGGGGCCACACACTTCCC;SOR=2.584;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=50;TCF=11;TCR=39;TR=49;WE=13249252;WS=13249234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr19	13255536	rs2304095	T	C	5073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=79;PP=2965;SC=CACACCAGGGTGGCCGAGAGC;SOR=0.747;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=173;TCF=94;TCR=79;TR=173;WE=13255544;WS=13255526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr19	13260240	.	A	AAAAG	975.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=0.000;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=66.76;MQRankSum=3.518;QD=28.70;ReadPosRankSum=-1.445;SOR=0.957;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,32:0.94:34
chr19	13317490	rs143342886	GTTA	G	1774.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.793;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.001;NF=13;NR=15;PP=1082;ReadPosRankSum=0.986;SC=ATTGTTTATTGTTATTATTAT;SOR=0.858;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=31;TCR=37;TR=28;WE=13317500;WS=13317480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,48:0.51:94
chr19	13318672	.	CCTGCTGCTGCTGCTGCTG	C,CCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTG	624.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7,7;NR=2,2;PP=1870,648;ReadPosRankSum=1.371;SC=CTGGCCACCGCCTGCTGCTGC;SOR=1.179;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=16;TCF=9;TCR=7;TR=9,9;WE=13318697;WS=13318662;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.42,0.53:19
chr19	13318988	.	GGGAGGGGGA	G	250.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.628;ClippingRankSum=-0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.02;MQRankSum=1.111;QD=16.72;ReadPosRankSum=0.337;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr19	13319693	rs16051	A	G	859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=23;NR=8;PP=578;SC=GGGGCGGGGGATGGTGGTGGT;SOR=2.049;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=31;WE=13319701;WS=13319683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	13319989	rs10413221	T	C	1234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=12;PP=633;SC=TTCCTGCAGCTGCTGCCTGGC;SOR=0.906;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=16;TCR=12;TR=28;WE=13320010;WS=13319979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr19	13320002	rs2304093	C	G	1354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=10;PP=672;SC=TGCCTGGCCCCCTCTGTCCCC;SOR=1.483;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=23;TCR=10;TR=33;WE=13320010;WS=13319979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	13322822	rs3217380	AG	A	348.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.434;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.49;MQRankSum=0.925;NF=7;NR=3;PP=275;ReadPosRankSum=0.436;SC=TGAGTCCGGCAGGGAGGGGAT;SOR=0.180;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=10;WE=13322830;WS=13322812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr19	13322848	rs60185051	T	G	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.942;HP=8;HapScore=3;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.569;NF=9;NR=1;PP=185;ReadPosRankSum=2.004;SC=GGGCTGCTTGTGGGGGGGCCT;SOR=1.489;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=10;WE=13322856;WS=13322837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,9:0.29:31
chr19	13323124	rs16048	T	G	2019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=34;PP=1367;SC=TGTGTGTGTGTGGGGGGCCCA;SOR=0.807;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=32;TCR=34;TR=66;WE=13323132;WS=13323114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr19	13323606	rs72995963	G	A	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=29;ReadPosRankSum=0.674;SC=GTGGTGGGACGGTGGTACCCA;SOR=1.329;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=4;WE=13323614;WS=13323596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr19	13323641	rs140435495	T	TACACAC	179.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;QD=44.93;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,3:0.75:4
chr19	13325229	rs17846925	G	C	904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=19.429;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=13;PP=627;ReadPosRankSum=2.528;SC=TACCAGCCCAGGCCAACACTC;SOR=1.283;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=85;TCF=45;TCR=40;TR=38;WE=13325237;WS=13325219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,40:0.44:91
chr19	13335432	rs3816027	G	A	1338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=0.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.77;ReadPosRankSum=0.367;SOR=0.792;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,66:0.48:137
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chr19	13339405	rs34941295	TAG	T	54.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.399;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=115;ReadPosRankSum=-0.608;SC=TCTGTTTTTTTAGAGAGAGAG;SOR=0.693;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=7;WE=13339428;WS=13339395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
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chr19	13339673	rs17846918	G	A	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=16;PP=299;ReadPosRankSum=-1.130;SC=TGGGCACACAGCGAGGTCATG;SOR=0.743;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=48;TCF=15;TCR=33;TR=24;WE=13339681;WS=13339663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,28:0.51:55
chr19	13341037	rs16042	G	A	2580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.529;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=63;PP=1622;ReadPosRankSum=0.031;SC=TGGGGACCCCGGGGACCAAGA;SOR=1.030;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=202;TCF=94;TCR=108;TR=111;WE=13341045;WS=13341027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,118:0.54:220
chr19	13345657	rs3765012	C	A	1578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=13;PP=1075;SC=GAGGGTACATCCTCTATGGGA;SOR=2.221;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=41;TCR=13;TR=54;WE=13345665;WS=13345647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr19	13355900	rs16039	T	G	1002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=3;PP=801;SC=AGCTATGGCTTCCGGGACACA;SOR=3.912;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=30;WE=13355908;WS=13355890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	13356150	rs16035	T	G	1615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.032;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=49;PP=1153;ReadPosRankSum=-0.397;SC=GCTGGCCGGGTGCATGTTAGA;SOR=0.951;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=138;TCF=49;TCR=89;TR=72;WE=13356158;WS=13356139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,77:0.51:151
chr19	13373477	rs16031	A	G	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.503;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=172;ReadPosRankSum=-0.558;SC=TGAGCAGTGTACAACCTGCTC;SOR=0.368;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=9;WE=13373485;WS=13373467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr19	13387904	rs16030	A	G	3436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=343;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.392;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.946;NF=81;NR=63;PP=2108;ReadPosRankSum=-1.298;SC=TCTCAAAGGTAAAGACGCCTG;SOR=0.651;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=311;TCF=176;TCR=135;TR=144;WE=13387912;WS=13387887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:180,163:0.48:343
chr19	13394301	.	T	C	695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.635;ClippingRankSum=0.000;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.032;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=20;PP=351;ReadPosRankSum=-0.520;SC=CTACCACTACTGAGATCTCCA;SOR=0.551;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=60;TCF=19;TCR=41;TR=31;WE=13394309;WS=13394291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,34:0.55:62
chr19	13409390	rs16025	C	T	1939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.142;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=41;PP=1136;ReadPosRankSum=-0.639;SC=CCTTGTCCTCCCTCCGCGCGT;SOR=0.501;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=184;TCF=89;TCR=95;TR=86;WE=13409398;WS=13409380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,96:0.47:206
chr19	13409472	rs16023	T	A	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.466;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=393;ReadPosRankSum=0.667;SC=GCCCTCGCCCTCGCCCTCGCC;SOR=1.748;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=74;TCF=34;TCR=40;TR=24;WE=13409480;WS=13409462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,24:0.29:83
chr19	13409696	rs16022	C	G	837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.734;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=16;PP=439;ReadPosRankSum=-0.007;SC=CGGCCTCGCCCTCCCAGAACC;SOR=0.850;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=98;TCF=57;TCR=41;TR=40;WE=13409704;WS=13409686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,45:0.42:108
chr19	13410235	rs12985136	G	T	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.584;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=211;ReadPosRankSum=0.688;SC=TGACCCAGGCGAACCAACCCA;SOR=0.238;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=17;WE=13410243;WS=13410225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr19	13411482	rs16018	G	A	1468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.449;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=33;PP=814;ReadPosRankSum=-0.064;SC=TAAAAGGCACGTGGAATCTTT;SOR=0.539;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=51;TCR=61;TR=62;WE=13411490;WS=13411472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,71:0.57:125
chr19	13414594	rs16016	C	T	2295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.488;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=53;PP=1307;ReadPosRankSum=-0.053;SC=TCCCAAAGAGCGTCAGTACAA;SOR=0.594;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=242;TCF=117;TCR=125;TR=106;WE=13414602;WS=13414584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,118:0.45:263
chr19	13440985	rs3834988	C	CT	249.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.148;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=243;ReadPosRankSum=0.154;SC=TGCAAGCCCTCTGCCCCCACC;SOR=0.275;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=7;WE=13440993;WS=13440975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr19	13443770	rs16008	T	C	2548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=60;PP=1414;ReadPosRankSum=0.071;SC=GTTAAGCTCCTGCATTTGGAG;SOR=0.695;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=245;TCF=125;TCR=120;TR=122;WE=13443778;WS=13443760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,129:0.47:272
chr19	13445144	rs2306348	C	T	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.337;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=81;ReadPosRankSum=0.791;SC=CTTTGTACTCCGTGGCCTGGG;SOR=0.070;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=7;WE=13445152;WS=13445134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr19	13445208	rs2248069	C	T	1124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.554;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=18;PP=564;ReadPosRankSum=-2.148;SC=TTGAGATCCACTCCATGTACC;SOR=0.534;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=64;TCR=34;TR=51;WE=13445216;WS=13445198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,57:0.52:110
chr19	13445375	rs2306347	T	G	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.625;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.71;ReadPosRankSum=1.063;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr19	13616693	rs16003	C	T	1287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.71;ReadPosRankSum=-0.971;SOR=0.735;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,61:0.55:110
chr19	13868117	rs693151	A	G	789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.228;HP=3;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=836;ReadPosRankSum=-0.417;SC=TCCCGTTAACAGGGCAGTCTA;SOR=0.414;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=44;TCF=32;TCR=12;TR=16;WE=13868133;WS=13868107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,20:0.41:49
chr19	13868125	rs111431984	C	CT	877.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=828;ReadPosRankSum=-0.494;SC=ACAGGGCAGTCTAATACCCCA;SOR=0.773;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=43;TCF=23;TCR=20;TR=14;WE=13868133;WS=13868107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,24:0.41:59
chr19	13868669	rs6511886	G	A	1633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=41;PP=976;ReadPosRankSum=-1.567;SC=AGGTAAGGGCGGCTTGGTGGC;SOR=0.690;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=123;TCF=48;TCR=75;TR=66;WE=13868677;WS=13868659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,76:0.56:136
chr19	13870153	rs371671	C	A	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.891;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=143;ReadPosRankSum=-2.327;SC=TCCAGCCCTCCCCCCACCACA;SOR=0.223;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=13;WE=13870161;WS=13870143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr19	13875258	.	C	G	45	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=25;MQ=58.28;NF=4;NR=2;PP=45;QD=13.2952020912;SC=TGGAATCCGCCTCCTGGGAAC;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=6;WE=13875266;WS=13875256;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr19	13875626	rs2922288	T	C	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.842;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr19	13899980	rs4926171	A	T	2986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=45;PP=1610;SC=GCCAGCCCTGAGGTCCTGTTT;SOR=0.802;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=103;TCF=58;TCR=45;TR=103;WE=13899988;WS=13899970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr19	13900981	rs57398315	G	A	1545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.926;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=30;PP=944;ReadPosRankSum=0.450;SC=CACTGCACCCGGCCATCCTTT;SOR=0.547;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=146;TCF=92;TCR=54;TR=72;WE=13900989;WS=13900971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,79:0.46:171
chr19	13940959	rs10403445	G	C	644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.257;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=1;PP=503;ReadPosRankSum=0.335;SC=ATGTACGTGTGTCTGCCCCCG;SOR=2.019;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=37;TCF=33;TCR=4;TR=22;WE=13940967;WS=13940949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,24:0.57:42
chr19	13988040	rs897790	C	T	5705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=121;NR=67;PP=2965;SC=TGACTCCTTCCGCCTGGCACA;SOR=1.211;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=189;TCF=121;TCR=68;TR=188;WE=13988048;WS=13988030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr19	13988416	rs2016163	A	G	8424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=151;NR=133;PP=2965;SC=GCGGCGCCACACGTGAGCGCG;SOR=0.752;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=284;TCF=151;TCR=133;TR=284;WE=13988424;WS=13988406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,313:1.00:313
chr19	13993457	rs2242130	C	T	363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=0;PP=284;SC=CAGGTGAGGCCAGGACCTCAC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=13993465;WS=13993447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	13996587	rs3803894	G	A	493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=3;PP=382;SC=GGTCACTGTCGCCCATTCTCT;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=13996595;WS=13996577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	13996647	rs3803893	T	C	1655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=15;PP=1272;SC=AGGGCTCAGCTCCCCTGCTGG;SOR=2.001;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=42;TCR=15;TR=57;WE=13996655;WS=13996637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr19	14000170	rs3803892	T	C	6736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=124;NR=100;PP=2965;SC=TGGAATGCCCTGCTGAGCCCC;SOR=0.800;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=224;TCF=124;TCR=100;TR=224;WE=14000178;WS=14000160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr19	14000400	rs3803891	A	G	6649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=125;PP=2965;SC=CTCCGCTCCCAGGTGCCAGAG;SOR=1.074;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=223;TCF=97;TCR=126;TR=222;WE=14000408;WS=14000390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr19	14000870	rs2305775	C	T	6476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=124;NR=87;PP=2965;SC=TGGGGCCCTCCAGGCAGGCCA;SOR=1.038;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=212;TCF=124;TCR=88;TR=211;WE=14000878;WS=14000860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr19	14003896	rs11085875	C	T	1171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=21;PP=912;SC=GACACAGAGCCGGAACTTTAA;SOR=1.040;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=16;TCR=21;TR=37;WE=14003904;WS=14003886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr19	14015711	rs6511898	C	A	6439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=106;NR=111;PP=2965;SC=GTCATTTTATCTTCCCCTTGA;SOR=0.831;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=217;TCF=106;TCR=111;TR=217;WE=14015719;WS=14015701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr19	14015815	rs6511899	T	C	2483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=50;PP=1615;SC=AGGTTACCCCTACCTCCACCT;SOR=1.504;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=29;TCR=50;TR=79;WE=14015823;WS=14015805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr19	14020573	rs12971500	T	C	7916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=156;NR=120;PP=2965;SC=TCTCTGGCCATCATGGCTGCC;SOR=0.905;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=276;TCF=156;TCR=120;TR=276;WE=14020581;WS=14020563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,299:1.00:299
chr19	14023495	rs8111764	T	C	2371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=55;PP=1677;SC=AGATGGAGTCTTGCTGTGTCA;SOR=2.245;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=20;TCR=55;TR=75;WE=14023503;WS=14023485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr19	14029269	rs2305776	A	C	5763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=109;NR=77;PP=2965;SC=CACAGGGTCCAAGCCCCCAAC;SOR=0.951;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=186;TCF=109;TCR=77;TR=186;WE=14029277;WS=14029245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr19	14030054	.	C	T	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.080;ClippingRankSum=0.000;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=265;ReadPosRankSum=-0.067;SC=CAGTAGGCCCCGCCCCCGTAG;SOR=0.589;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=58;TCF=24;TCR=34;TR=24;WE=14030062;WS=14030044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,24:0.39:61
chr19	14030689	rs10410239	T	C	4771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=101;NR=71;PP=2582;SC=GTCTGGTGGGTGTCCTGGAGA;SOR=1.005;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=173;TCF=102;TCR=71;TR=172;WE=14030697;WS=14030679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr19	14037768	rs750580	C	T	7338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=138;NR=124;PP=2965;SC=CACCCAACTTCCTCTCCCTCC;SOR=0.708;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=262;TCF=138;TCR=124;TR=262;WE=14037776;WS=14037758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,268:1.00:268
chr19	14038102	rs10405523	G	A	3568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.646;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=72;PP=2066;ReadPosRankSum=-1.453;SC=ATTCATCCGCGTGCTCCGGTA;SOR=1.683;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=115;TCF=41;TCR=74;TR=112;WE=14038110;WS=14038092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,131:0.98:133
chr19	14045311	.	A	AGT	81	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=19;MQ=65.19;NF=0;NR=2;PP=81;QD=42.0;SC=GGTCGCCTTCAGTGTGTGTGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=14045319;WS=14045301;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr19	14049143	rs79805695	G	C	2055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=52;PP=1343;SC=CTGTTCTCCCGGGGCTTTGGG;SOR=1.996;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=26;TCR=52;TR=78;WE=14049151;WS=14049133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr19	14049191	rs74933767	G	A	525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=13;PP=361;SC=TGGGGAGGACGGGCAGGCGGC;SOR=1.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=18;WE=14049199;WS=14049181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	14065534	rs1056142	A	C	1430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=29;PP=876;SC=GGTCACAGCAACCTCTGAGCC;SOR=1.519;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=16;TCR=29;TR=45;WE=14065542;WS=14065524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr19	14070706	rs141180609	A	AGGTGGGCCCAGGGCGGGCAG	845.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.10;QD=36.77;SOR=2.400;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	14083761	rs2305780	T	C	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=3.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.04;ReadPosRankSum=-0.632;SOR=0.321;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,26:0.39:66
chr19	14091543	rs146048336	T	TGCATCCTCTCTGGGGTGGGCTC	5356.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.54;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=9;NR=26;PP=2900;SC=GGGGTGGGCTTGCATCCTCTC;SOR=0.693;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=46;TCF=10;TCR=36;TR=35;WE=14091551;WS=14091533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr19	14104251	rs12459114	G	A	42.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.70;ReadPosRankSum=0.319;SOR=0.916;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr19	14104688	rs143370000	CT	C	85.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=1.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.45;ReadPosRankSum=0.782;SOR=1.162;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,11:0.31:35
chr19	14139004	rs1982632	A	G	831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=1;PP=684;SC=CGTTCAAAGCATCTCCGTCCA;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=31;WE=14139012;WS=14138994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	14140981	.	G	GT	97.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.899;ClippingRankSum=0.000;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=3.543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.17;ReadPosRankSum=-0.969;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,10:0.22:45
chr19	14141480	rs4263049	A	G	1525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=19;PP=705;ReadPosRankSum=1.194;SC=TGGGTGCAGCAGCAGCTGAGC;SOR=0.740;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=136;TCF=88;TCR=48;TR=61;WE=14141488;WS=14141470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,79:0.48:163
chr19	14142616	rs6511905	C	G	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=30;ReadPosRankSum=-0.023;SC=ACCCAGAGCTCGAAGAGGAGC;SOR=0.551;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=4;WE=14142624;WS=14142606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr19	14153190	.	GA	G	65.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.285;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=6.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.65;ReadPosRankSum=1.451;SOR=0.074;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr19	14161745	rs10404803	T	G	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.84;ReadPosRankSum=-0.577;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr19	14162347	rs10404921	C	G	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=321;ReadPosRankSum=0.432;SC=GGGCAAGACTCTGTCTCAAAA;SOR=0.593;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=39;TCF=31;TCR=8;TR=22;WE=14162355;WS=14162337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,24:0.56:43
chr19	14162676	rs2306190	A	C	963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=17;PP=576;ReadPosRankSum=0.983;SC=TGCCCTGACTACTCCTGTCTT;SOR=0.725;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=91;TCF=53;TCR=38;TR=43;WE=14162684;WS=14162666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,48:0.44:108
chr19	14165598	rs56361194	C	T	1318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=29;PP=836;ReadPosRankSum=-0.861;SC=CTGCCACCCACCCCCTCCCAG;SOR=0.698;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=124;TCF=63;TCR=61;TR=58;WE=14165606;WS=14165588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,65:0.47:138
chr19	14166065	rs148192106	A	AGGACAAAAGGGAAGACAGGGTTAAGATG	4454.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FS=4.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.12;MQRankSum=9.026;QD=22.73;ReadPosRankSum=-0.679;SOR=1.001;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:109,87:0.44:196
chr19	14184713	rs35666756	C	CG	3752.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQ=60.04;MQRankSum=0.974;NF=7;NR=44;PP=1706;ReadPosRankSum=-1.891;SC=GTAGCAACGCCGGGACCCCCA;SOR=0.676;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=127;TCF=13;TCR=114;TR=51;WE=14184724;WS=14184703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,136:0.52:263
chr19	14185226	rs7258963	T	C	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=3.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.93;ReadPosRankSum=0.532;SOR=1.131;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,23:0.33:70
chr19	14194458	rs35357458	C	A	2378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.057;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=53;PP=1615;ReadPosRankSum=-0.266;SC=AGCTGGCCTGCGAGGAGTGGG;SOR=0.607;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=200;TCF=92;TCR=108;TR=100;WE=14194466;WS=14194448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,107:0.50:215
chr19	14200109	rs8062	T	A	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.855;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=16;PP=411;ReadPosRankSum=-2.013;SC=CATCATCTTCTTCATCTTCAT;SOR=0.573;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=70;TCF=40;TCR=30;TR=33;WE=14200117;WS=14200099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,36:0.47:77
chr19	14200201	rs73509717	A	G	743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.323;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=11;PP=330;ReadPosRankSum=0.000;SC=AAGCATGCAAAATTAGTAGCT;SOR=0.639;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=71;TCF=38;TCR=33;TR=30;WE=14200209;WS=14200191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,37:0.46:80
chr19	14200319	rs78310020	G	A	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=191;ReadPosRankSum=1.233;SC=TCCGTGCCAGGCTCTGTGTTA;SOR=0.430;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=12;WE=14200327;WS=14200309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr19	14200896	.	C	CG	120	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.54;FR=0.5003;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.83;NF=4;NR=0;PP=120;QD=35.25;SC=TGTGGCGGCGCCGGCGGGGCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=4;WE=14200904;WS=14200886;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr19	14204135	rs3729859	G	C	1436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.852;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=41;PP=1073;ReadPosRankSum=1.333;SC=TAACATTCAAGAGATATTTAC;SOR=1.002;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=94;TCF=27;TCR=67;TR=55;WE=14204143;WS=14204125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,59:0.58:101
chr19	14204156	rs41296308	G	A	925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.917;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=31;PP=669;ReadPosRankSum=-0.487;SC=TCTGACTCAGGCCTGTGCTTA;SOR=1.244;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=58;TCF=11;TCR=47;TR=37;WE=14204164;WS=14204146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,38:0.63:60
chr19	14218359	rs41296258	G	A	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.74;ReadPosRankSum=-1.126;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr19	14231243	rs3745464	C	T	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=234;ReadPosRankSum=0.942;SC=CCCCTCCCGGCGTGCTGGGAC;SOR=0.641;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=31;TCR=4;TR=16;WE=14231251;WS=14231233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr19	14231325	rs8102267	C	G	2350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FS=0.588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.43;ReadPosRankSum=-1.185;SOR=0.638;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,64:0.37:175
chr19	14231330	rs8102698	A	G	2543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.91;ReadPosRankSum=-1.346;SOR=0.661;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:123,74:0.38:197
chr19	14266312	rs11554838	C	T	1571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.991;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=46;PP=1044;ReadPosRankSum=-2.807;SC=GCAGGAACAGCAGCGCGATGG;SOR=1.089;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=146;TCF=55;TCR=91;TR=69;WE=14266320;WS=14266302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,73:0.48:151
chr19	14269195	rs35068509	G	A	2691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.148;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=49;PP=1514;ReadPosRankSum=2.337;SC=TGAGGAAGACGCGGCTGGACT;SOR=0.557;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=238;TCF=146;TCR=92;TR=122;WE=14269203;WS=14269185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,130:0.51:254
chr19	14269279	rs41276898	T	G	2944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=359;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.386;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=72;PP=1750;ReadPosRankSum=-0.767;SC=CCGGGCCTGCTTCGCCGGCCA;SOR=0.733;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=331;TCF=162;TCR=169;TR=137;WE=14269287;WS=14269269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:206,153:0.43:359
chr19	14271678	rs77969107	C	T	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=271;ReadPosRankSum=-0.591;SC=TCGAAAGAGGCGCCACTCACT;SOR=0.569;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=16;WE=14271686;WS=14271668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr19	14273641	rs3745462	A	G	3873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=385;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=78;PP=2355;ReadPosRankSum=0.207;SC=CGTACACGGAACGCAGGACGT;SOR=0.704;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=330;TCF=174;TCR=156;TR=162;WE=14273649;WS=14273631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:200,185:0.48:385
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chr19	14294288	rs61051191	GC	G	3844.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=46;PP=1754;SC=CATTTTATCTGCCCCCCCCAG;SOR=1.161;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=91;TCF=34;TCR=57;TR=76;WE=14294296;WS=14294278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr19	14294436	rs55683520	C	T	1151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.439;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=31;PP=689;ReadPosRankSum=-0.596;SC=GGTGCGTGTCCGGAGCTCTCA;SOR=1.149;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=118;TCF=49;TCR=69;TR=49;WE=14294444;WS=14294426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,56:0.42:132
chr19	14492265	rs2302997	T	C	4914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.98;QD=46.81;SOR=2.280;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
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chr19	14499357	rs2302094	T	A	680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.20;QD=28.37;SOR=1.051;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	14499410	rs2302092	G	C	897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=11;NR=14;PP=648;SC=GAAAGAGAGGGCTCGCGCACG;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=11;TCR=14;TR=25;WE=14499418;WS=14499400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	14507128	rs75902260	C	T	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=5.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQRankSum=-4.978;QD=3.55;ReadPosRankSum=-0.675;SOR=1.706;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,16:0.21:76
chr19	14507307	rs62122581	C	T	1757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=390;ExcessHet=3.0103;FS=0.855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQRankSum=-10.087;QD=4.51;ReadPosRankSum=-0.942;SOR=0.746;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:281,109:0.28:390
chr19	14507342	rs62122582	G	T	1233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FS=13.797;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQRankSum=-13.263;QD=5.30;ReadPosRankSum=-4.425;SOR=1.634;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:188,45:0.19:233
chr19	14507345	rs62122583	C	G	1242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FS=13.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQRankSum=-13.434;QD=5.62;ReadPosRankSum=-4.851;SOR=1.734;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:180,41:0.19:221
chr19	14508223	rs10412108	A	G	2128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=59;PP=1731;SC=ACTGAGGGGGAAGGCTCAGGG;SOR=5.486;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=62;TCF=3;TCR=59;TR=62;WE=14508231;WS=14508213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr19	14508385	rs10410071	G	A	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.630;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.752;NF=11;NR=1;PP=183;ReadPosRankSum=0.194;SC=CACTAATGCCGGGAGGAATGA;SOR=1.022;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=12;WE=14508393;WS=14508375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr19	14508964	rs7508244	T	C	4783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=84;PP=2550;SC=AAGGGCAGGATGCTGGGGGAC;SOR=0.829;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=164;TCF=80;TCR=84;TR=164;WE=14508972;WS=14508954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr19	14512448	rs28548336	T	C	2290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.476;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=53;PP=1303;ReadPosRankSum=2.150;SC=TAATCACAACTGCCCCTCTCC;SOR=0.731;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=216;TCF=106;TCR=110;TR=103;WE=14512456;WS=14512438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,113:0.49:232
chr19	14515510	rs73517819	C	T	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=233;ReadPosRankSum=0.484;SC=GGTGTCCCCACGTCACACCCT;SOR=0.665;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=16;WE=14515518;WS=14515500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr19	14520079	rs73517823	G	A	2247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.977;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=45;PP=1305;ReadPosRankSum=1.172;SC=CCACCCCACCGCCAGGGGAAA;SOR=0.612;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=221;TCF=119;TCR=102;TR=95;WE=14520087;WS=14520069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,110:0.44:249
chr19	14522434	rs55968966	GCCTTA	G	11740.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=125;PP=2971;SC=TAAGAAGAGGGCCTTACCTTA;SOR=0.813;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=176;TCF=26;TCR=150;TR=148;WE=14522446;WS=14522424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,263:1.00:263
chr19	14561284	rs376296280	C	A	1005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=25;PP=613;ReadPosRankSum=1.026;SC=AGGTGAGGGGCGGAGCTTTCA;SOR=0.748;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=93;TCF=43;TCR=50;TR=44;WE=14561292;WS=14561274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,49:0.49:101
chr19	14561722	rs8107892	A	G	2634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=54;NR=30;PP=1391;SC=AGGAGAAATTAACAGAATCCA;SOR=1.037;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=54;TCR=30;TR=84;WE=14561730;WS=14561712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr19	14581756	rs59891980	TGCCTCAAGGGCCTCGTTGC	T	1845.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=31;PP=2974;SC=CTAGCCGCTTTGCCTCAAGGG;SOR=4.174;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=51;TCF=3;TCR=48;TR=32;WE=14581782;WS=14581746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	14582468	rs10846	G	A	9637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=369;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=186;NR=145;PP=2965;SC=CCGCACCGACGTCAGCAACTT;SOR=0.862;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=333;TCF=188;TCR=145;TR=331;WE=14582476;WS=14582458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,369:1.00:369
chr19	14583264	rs2241363	G	C	526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=3;PP=311;SC=CGGGACACACGGTCCTGCCTG;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=14583272;WS=14583254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	14590236	rs3815715	C	T	354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=2;PP=298;SC=GATCCTCCACCGTGGCGGGGC;SOR=1.981;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=14590244;WS=14590226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	14674235	rs891089	C	T	642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=16;PP=441;SC=CGTGGCACTCCGCAGGAACGC;SOR=3.258;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=14674243;WS=14674225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	14682804	rs9543	G	C	1452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=24;PP=823;SC=GGACCAGGTGGGCCCCCATGG;SOR=0.804;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=50;TCF=25;TCR=25;TR=49;WE=14682812;WS=14682794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr19	14693777	.	ATG	A	57	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=4;NR=0;PP=57;QD=15.25;SC=CTCTGTGTGTATGTGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=4;WE=14693786;WS=14693768;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:18,4:0.18:22
chr19	14717791	rs10409868	A	G	1548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.248;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.975;NF=38;NR=29;PP=854;ReadPosRankSum=0.148;SC=GCTGAATGGAATTTTTATTTG;SOR=0.660;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=137;TCF=74;TCR=63;TR=67;WE=14717799;WS=14717781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,76:0.48:158
chr19	14719854	rs10404194	T	C	1144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.008;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=12;PP=820;ReadPosRankSum=-2.132;SC=TCAGGTGATCTACCCGTCTTG;SOR=0.986;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=67;TCF=48;TCR=19;TR=45;WE=14719862;WS=14719844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,48:0.65:74
chr19	14721019	rs6511944	C	T	679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.260;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=20;PP=396;ReadPosRankSum=0.293;SC=AGCCCAGGGCCGAGGCTGGGG;SOR=1.110;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=68;TCF=25;TCR=43;TR=29;WE=14721027;WS=14721009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,33:0.45:74
chr19	14736288	rs34381727	C	G	1571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.780;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=15;PP=1032;ReadPosRankSum=-1.155;SC=TAGAACAATTCAGATGTTTCA;SOR=0.613;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=70;TCR=24;TR=58;WE=14736296;WS=14736278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,64:0.58:111
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chr19	14741065	rs62124014	G	A	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.321;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=18;PP=337;ReadPosRankSum=0.598;SC=AACTAATAATGAGCATGAACA;SOR=1.077;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=50;TCF=12;TCR=38;TR=22;WE=14741073;WS=14741055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,20:0.41:49
chr19	14743562	rs10405678	C	A	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-2.495;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.119;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=63;ReadPosRankSum=-1.880;SC=TTTATCACAGCAGCTTAGCTT;SOR=0.039;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=6;WE=14743570;WS=14743552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr19	14744032	rs732722	G	A	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.445;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=7;PP=506;ReadPosRankSum=0.607;SC=TGGGAACATCGAAGGCACATA;SOR=1.173;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=56;TCF=40;TCR=16;TR=29;WE=14744040;WS=14744022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,29:0.52:56
chr19	14744181	rs899217	T	A	2127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=41;PP=1161;SC=ACATAAAGTGTCTCTTTTCCT;SOR=1.409;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=27;TCR=41;TR=68;WE=14744189;WS=14744171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr19	14752325	rs8102646	C	T	2208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=5.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.310;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-9.271;NF=57;NR=35;PP=1637;ReadPosRankSum=-0.376;SC=GCTGGTGTTCCGGATGGCTTT;SOR=1.011;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=228;TCF=137;TCR=91;TR=92;WE=14752333;WS=14752315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,97:0.38:253
chr19	14758168	rs34226397	G	A	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=26;PP=483;ReadPosRankSum=-1.210;SC=AAAGGCAATGGCACTGGGACC;SOR=0.724;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=85;TCF=19;TCR=66;TR=33;WE=14758176;WS=14758158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,32:0.38:84
chr19	14769207	rs4488589	G	T	545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.75;ReadPosRankSum=1.029;SOR=0.370;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,27:0.48:56
chr19	14769339	rs4606855	C	G	1372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.585;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=27;PP=672;ReadPosRankSum=-0.739;SC=TTCCTGCCCTCGGTTGTCTTT;SOR=0.414;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=95;TCF=44;TCR=51;TR=55;WE=14769347;WS=14769329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,66:0.59:112
chr19	14772984	rs8111916	G	T	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=189;ReadPosRankSum=-0.237;SC=TTATTGAGCAGCTACTATGTG;SOR=0.132;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=11;WE=14772992;WS=14772974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr19	14779550	rs4239642	C	A	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.093;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=258;ReadPosRankSum=-1.061;SC=CCACTGGAGACCATGAGTGGC;SOR=1.609;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=13;WE=14779558;WS=14779540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr19	14846897	rs1859257	T	A	3067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.039;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=56;PP=1975;ReadPosRankSum=-0.128;SC=ATTGAATGCCTAGCACGCCTT;SOR=0.566;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=260;TCF=156;TCR=104;TR=138;WE=14846905;WS=14846887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,145:0.52:277
chr19	14857179	rs1029476	T	C	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=4.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.53;ReadPosRankSum=0.000;SOR=2.012;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr19	14857673	rs117913748	C	G	1467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=20;PP=903;ReadPosRankSum=-0.750;SC=TGACCCTCAGCGGGGCAGCGA;SOR=0.659;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=108;TCF=70;TCR=38;TR=59;WE=14857681;WS=14857663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,66:0.56:118
chr19	14857891	rs10403842	A	G	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=95;ReadPosRankSum=0.176;SC=CAACAATATTAAGTGTTTCTT;SOR=0.293;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=6;WE=14857899;WS=14857881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr19	14862430	rs2524383	C	G	4918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=414;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.103;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=107;PP=2962;ReadPosRankSum=0.682;SC=GCATCCAGGTCAAGGTGGCCA;SOR=0.784;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=379;TCF=189;TCR=190;TR=211;WE=14862438;WS=14862420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:186,228:0.55:414
chr19	14862517	rs3752189	A	G	2894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.950;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=69;PP=1755;ReadPosRankSum=-2.114;SC=CAGAGCGGCGATCAGATTTGA;SOR=0.631;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=238;TCF=102;TCR=136;TR=120;WE=14862525;WS=14862507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,135:0.51:263
chr19	14866698	rs28420691	C	T	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.533;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=142;ReadPosRankSum=0.741;SC=GCCTGCAGGGCGAGGCCAAGG;SOR=0.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=8;WE=14866706;WS=14866688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr19	14866974	rs2253472	T	C	1769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.574;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=26;PP=969;ReadPosRankSum=-2.850;SC=ATCTTTAAATTTCTTATTTTT;SOR=0.633;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=142;TCF=88;TCR=54;TR=73;WE=14866982;WS=14866964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,85:0.51:166
chr19	14867186	rs2524386	G	A	740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=23;PP=505;ReadPosRankSum=-0.411;SC=ACATAAGGGGGGTTAGGTTAG;SOR=0.733;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=76;TCF=21;TCR=55;TR=31;WE=14867194;WS=14867176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,34:0.42:81
chr19	14875201	rs7253782	G	T	3763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.14;SOR=1.155;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr19	14875388	rs35612307	G	A	732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=26;PP=535;ReadPosRankSum=0.372;SC=GTCCCCAGGGGCCTCCAGCAG;SOR=0.627;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=58;TCF=11;TCR=47;TR=32;WE=14875396;WS=14875378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,33:0.49:68
chr19	14877630	rs6511971	T	A	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.203;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.917;NF=12;NR=0;PP=248;ReadPosRankSum=-0.097;SC=GTGTGGCGAGTCCTTCCTGGG;SOR=2.608;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=12;WE=14877638;WS=14877625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr19	14877799	rs12976472	G	C	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FS=13.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQRankSum=-9.328;QD=3.47;ReadPosRankSum=-5.836;SOR=1.476;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:150,30:0.17:180
chr19	14877806	rs12976475	G	A	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FS=17.373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQRankSum=-9.591;QD=2.38;ReadPosRankSum=-5.407;SOR=2.177;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:151,21:0.12:172
chr19	14884946	rs2302090	A	G	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.779;HP=2;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-4.225;NF=3;NR=7;ReadPosRankSum=0.320;SC=GATGGGGCAGAGCGCTGAGTT;SOR=2.067;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=27;TCF=12;TCR=15;TR=10;WE=14884954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr19	14887596	rs2286362	A	G	3885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=410;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.469;NF=83;NR=103;PP=2485;ReadPosRankSum=-0.129;SC=CGGCAGGAGCAGCAGGGGAAA;SOR=0.733;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=383;TCF=170;TCR=213;TR=186;WE=14887604;WS=14887586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:213,197:0.48:410
chr19	14910438	rs10415312	C	T	7189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=115;NR=119;PP=2965;SC=ATTTCCATTTCGGTGCAGAAG;SOR=0.821;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=234;TCF=115;TCR=119;TR=234;WE=14910446;WS=14910428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
chr19	14910573	rs10415562	C	T	1731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.014;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=31;PP=974;ReadPosRankSum=0.138;SC=GGGTGACAGACGGCCACGAAG;SOR=0.524;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=129;TCF=67;TCR=62;TR=72;WE=14910581;WS=14910563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,81:0.57:142
chr19	14910637	.	G	GA	968.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.397;ClippingRankSum=0.000;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=3;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=26;PP=380;ReadPosRankSum=0.659;SC=CAAATGAAGTGAAAAAAAAAA;SOR=0.738;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=85;TCF=14;TCR=71;TR=34;WE=14910645;WS=14910627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,56:0.39:145
chr19	14938616	rs2190686	T	C	2758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;ReadPosRankSum=0.555;SC=TCCAGGATGCTAGAACCAGCA;SOR=0.700;Source=Platypus;WE=14938624;WS=14938606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,128:0.48:266
chr19	14951889	rs3752194	A	G	795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.824;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=14;PP=1163;ReadPosRankSum=-1.120;SC=CTGTGTGTGAATTGTGGGTGG;SOR=0.399;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=91;TCF=56;TCR=35;TR=34;WE=14951906;WS=14951879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,39:0.38:102
chr19	14951898	rs3752195	G	T	1421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.681;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=22;PP=1954;ReadPosRankSum=1.242;SC=AATTGTGGGTGGCAGCAGAAC;SOR=0.964;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=90;TCF=55;TCR=35;TR=57;WE=14951906;WS=14951879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,63:0.62:101
chr19	14952706	.	C	CAG	855.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.954;ClippingRankSum=0.000;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.372;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=33;PP=978;ReadPosRankSum=-0.185;SC=ATGTGACTACCAGAGAGAGAG;SOR=1.105;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=95;TCF=6;TCR=89;TR=35;WE=14952717;WS=14952696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,35:0.49:72
chr19	14974930	rs10407452	G	A	7798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=161;NR=104;PP=2965;SC=GCTGCAAAATGCATCACCATG;SOR=1.093;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=265;TCF=161;TCR=104;TR=265;WE=14974938;WS=14974920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,287:1.00:287
chr19	14975040	rs10407682	G	A	3429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=375;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.230;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=86;PP=2261;ReadPosRankSum=-0.637;SC=CAACTGCAATGTCACTAAGCT;SOR=0.778;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=340;TCF=156;TCR=184;TR=156;WE=14975048;WS=14975030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:207,166:0.45:373
chr19	14975368	rs10415965	A	G	4773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=85;PP=2965;SC=GTGTGGAGGCAGGAGTCTGAG;SOR=0.919;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=161;TCF=76;TCR=85;TR=161;WE=14975376;WS=14975358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr19	14975471	rs11085912	C	T	3914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=68;PP=2447;SC=ATTCTTGTTTCTCTGAAAATC;SOR=0.922;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=59;TCR=68;TR=127;WE=14975479;WS=14975461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr19	14991643	rs10401818	G	A	3863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=382;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.661;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=85;PP=2471;ReadPosRankSum=-0.172;SC=AGAAAAAGTGGGGGATTTCCA;SOR=0.606;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=348;TCF=180;TCR=168;TR=175;WE=14991651;WS=14991633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:193,188:0.49:381
chr19	14991963	rs10404119	C	A	1818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.585;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.917;NF=40;NR=44;PP=1167;ReadPosRankSum=0.065;SC=CAGATGTCTGCAAAGGACAGG;SOR=0.526;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=170;TCF=77;TCR=93;TR=84;WE=14991971;WS=14991953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,88:0.49:181
chr19	14992031	rs10405129	A	G	1049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.387;NF=26;NR=23;PP=2962;ReadPosRankSum=0.673;SC=TGTGGCCAGGATGATGAGCAG;SOR=0.711;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=58;TCR=50;TR=49;WE=14992053;WS=14992021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,48:0.44:110
chr19	14992042	rs10405136	A	G	1937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.62;MQRankSum=-5.272;QD=16.56;ReadPosRankSum=1.166;SOR=0.678;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,52:0.44:117
chr19	14992045	rs10404335	C	T	1971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=0.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.76;MQRankSum=-5.344;QD=15.90;ReadPosRankSum=1.636;SOR=0.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,54:0.44:124
chr19	14992178	rs149867911	CTATTTATTTATT	C,CTATTTATTTATTTATT	1763.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=26;NF=0,0;NR=21,21;PP=2994,1818;SC=CTTTTTTTTTCTATTTATTTA;SOR=1.714;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=57;TCF=1;TCR=56;TR=21,21;WE=14992197;WS=14992158;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.55,0.41:49
chr19	14992226	rs10410793	A	G	1017.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=57;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=363;ReadPosRankSum=1.137;SC=ATTAACATAGACAGGGTCTCT;SOR=0.511;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=20;WE=14992234;WS=14992216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,25:0.61:41
chr19	15052603	.	AT	A	1145.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.276;ClippingRankSum=0.000;DP=290;ExcessHet=3.0103;FS=3.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.04;MQRankSum=0.000;QD=4.24;ReadPosRankSum=0.141;SOR=0.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:198,72:0.27:270
chr19	15052983	rs3044711	T	TATC	10312.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=91;PP=2957;SC=GTCCTAAGAGTATCTGCCAGA;SOR=1.068;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=137;TCF=32;TCR=105;TR=122;WE=15052991;WS=15052973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr19	15060983	rs5827264	TG	T	332.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=158;ReadPosRankSum=0.171;SC=CCCTCCTCTCTGGGGGGGCAG;SOR=0.976;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=8;WE=15060991;WS=15060973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr19	15064858	rs2269913	A	C	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=277;ReadPosRankSum=-1.183;SC=GCTCCAGCTGAGGCCCCCTCC;SOR=0.693;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=19;WE=15064866;WS=15064848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,22:0.55:40
chr19	15065169	rs757465	T	C	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.65;ReadPosRankSum=-0.723;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr19	15065169	.	TGG	CGT	176	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=3;NR=5;PP=176;QD=28.6834843578;SC=GGACTGAGGATGGGGCGTGGC;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=16;TCF=6;TCR=10;TR=8;WE=15065179;WS=15065159;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,8:0.50:16
chr19	15065171	rs2269914	G	T	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.105;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=23.24;ReadPosRankSum=0.034;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr19	15072787	rs3827000	A	T	581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=284;ReadPosRankSum=0.466;SC=TGGCTCCACCATCCCGTGGGC;SOR=0.784;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=53;TCF=37;TCR=16;TR=26;WE=15072795;WS=15072777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,29:0.49:59
chr19	15075020	rs10407669	A	G	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-4.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=136;ReadPosRankSum=0.444;SC=ACCCCTGCCCATTGCTCTGTC;SOR=0.560;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=10;WE=15075028;WS=15075010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
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chr19	15079104	rs11668879	G	A	1741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.037;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=27;PP=1091;ReadPosRankSum=-0.859;SC=TGGTTTTTTAGGTTGGCACAC;SOR=0.974;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=136;TCF=83;TCR=53;TR=77;WE=15079112;WS=15079094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,81:0.56:144
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chr19	15083734	rs181299732	G	C	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.251;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=174;ReadPosRankSum=1.092;SC=GTCTATCTGCGGGAAACAGAG;SOR=0.193;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=13;WE=15083742;WS=15083724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr19	15124474	rs11085935	C	T	1795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.136;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=32;PP=924;ReadPosRankSum=0.767;SC=ATTCTCTCCTCGTTTTCTAGG;SOR=0.505;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=128;TCF=76;TCR=52;TR=75;WE=15124482;WS=15124464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,85:0.59:145
chr19	15124694	rs11085936	A	T	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=32;ReadPosRankSum=-0.598;SC=AATTCCTTCAAGCCACACTGA;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=3;WE=15124702;WS=15124684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr19	15131213	rs7248834	G	T	323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=2;PP=230;SC=GAAATCACTTGCATCCACTTC;SOR=1.981;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=15131221;WS=15131203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	15131261	rs4405675	C	T	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=5.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.82;ReadPosRankSum=0.017;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr19	15131330	rs35352238	G	A	921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.761;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=15;PP=472;ReadPosRankSum=-0.522;SC=GCTCCAAGCCGTGGACCTCAT;SOR=0.829;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=78;TCF=50;TCR=28;TR=39;WE=15131338;WS=15131320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,47:0.48:97
chr19	15132574	rs757463	C	G	4941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=91;NR=70;PP=2965;SC=GTGCCGGTGGCTGGAGGCTGG;SOR=0.839;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=161;TCF=91;TCR=70;TR=161;WE=15132582;WS=15132564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr19	15133762	rs8111625	G	C	14547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=419;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=199;NR=181;PP=2965;SC=AAGAACCTCAGCTGGGGCCTC;SOR=0.757;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=380;TCF=199;TCR=181;TR=380;WE=15133770;WS=15133752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,417:1.00:417
chr19	15133787	rs10424547	C	A	4756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=467;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.518;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=113;PP=2962;ReadPosRankSum=0.761;SC=GCAAGAACATCGGGCATGAGG;SOR=0.745;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=428;TCF=207;TCR=221;TR=216;WE=15133795;WS=15133777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:232,234:0.50:466
chr19	15133926	rs8112667	C	A	567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=269;ReadPosRankSum=-0.516;SC=CAGCGCGGACCCCTAGTGACC;SOR=0.752;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=18;TCR=41;TR=22;WE=15133934;WS=15133916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,29:0.41:70
chr19	15165818	rs3181162	A	C	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.309;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=60;ReadPosRankSum=0.253;SC=TGGTGCAATCATGGCTCACTG;SOR=1.179;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=5;WE=15165826;WS=15165817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr19	15166762	rs73518121	G	T	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.341;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=218;ReadPosRankSum=0.345;SC=CCATGACACTGACTCCTCCAA;SOR=0.426;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=20;WE=15166770;WS=15166752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,22:0.48:46
chr19	15166997	rs11574685	C	T	1083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=29;PP=646;ReadPosRankSum=-0.189;SC=CTTCTGTTCCCAAGGCCAAAT;SOR=0.706;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=92;TCF=36;TCR=56;TR=47;WE=15167005;WS=15166987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,53:0.48:111
chr19	15167088	rs11574686	A	G	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.245;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=151;ReadPosRankSum=0.708;SC=AACTTAGCACAAGGCATGGTG;SOR=0.086;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=9;WE=15167096;WS=15167078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr19	15198024	rs59166286	A	T	2807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.415;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=56;PP=1830;ReadPosRankSum=0.354;SC=CCTGGCCATCATCACGGACTC;SOR=0.732;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=275;TCF=147;TCR=128;TR=123;WE=15198032;WS=15198014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,137:0.44:309
chr19	15198263	rs8105277	A	G	8495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=156;NR=127;PP=2965;SC=TTGTCCACCCACAGCGTTACT;SOR=0.884;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=285;TCF=156;TCR=129;TR=283;WE=15198271;WS=15198253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,318:1.00:318
chr19	15198292	rs8104843	C	G	10510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=396;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=197;NR=161;PP=2965;SC=ATGTGCTCCCCTGTCTGTGGG;SOR=0.867;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=358;TCF=197;TCR=161;TR=358;WE=15198300;WS=15198282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,396:1.00:396
chr19	15198441	rs73008811	G	T	4665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=419;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.729;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=102;NR=99;PP=2947;ReadPosRankSum=-0.244;SC=GAAGCTCTCCGGCTCAGACAC;SOR=0.581;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=386;TCF=192;TCR=194;TR=201;WE=15198449;WS=15198431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:203,215:0.51:418
chr19	15198507	rs8108721	T	C	8428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=132;NR=144;PP=2965;SC=CACCAGCCCATTCTCCTGCAT;SOR=0.867;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=277;TCF=133;TCR=144;TR=276;WE=15198515;WS=15198497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,309:1.00:309
chr19	15198606	rs73008812	C	T	2909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=54;PP=1670;ReadPosRankSum=-0.260;SC=CTGTGGCTTACACCTCACTGT;SOR=0.659;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=200;TCF=107;TCR=93;TR=117;WE=15198614;WS=15198596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,132:0.59:223
chr19	15198631	rs8105737	A	C	1835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.701;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=40;PP=1255;ReadPosRankSum=0.753;SC=TCACTGTCCTATGGGACCATC;SOR=0.572;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=196;TCF=107;TCR=89;TR=83;WE=15198639;WS=15198621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,88:0.42:210
chr19	15198751	rs16980312	T	C	2711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.436;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=57;PP=1769;ReadPosRankSum=0.254;SC=ATCTACAGCATACGGAACAAG;SOR=1.009;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=207;TCF=102;TCR=105;TR=105;WE=15198772;WS=15198741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,117:0.52:226
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chr19	15220850	rs2240297	G	A	535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=8;PP=201;ReadPosRankSum=-0.056;SC=GGTGGGTCCCGCAGCCCGGGC;SOR=0.705;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=59;TCF=36;TCR=23;TR=22;WE=15220858;WS=15220840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,29:0.41:71
chr19	15222428	rs2040858	A	G	2141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.271;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=50;PP=1350;ReadPosRankSum=-1.600;SC=ACCAGAGGGGACCCTGTGTTC;SOR=0.679;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=206;TCF=107;TCR=99;TR=100;WE=15222436;WS=15222418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,108:0.48:224
chr19	15223466	rs4808977	A	G	359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=8;PP=230;SC=TCAGTGTCTTAGGCTTGAAGC;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=15223474;WS=15223456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	15224225	rs8109071	G	C	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.997;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=363;ReadPosRankSum=-0.135;SC=GCCTAGTTGCGTAAGCAACCA;SOR=0.086;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=20;WE=15224233;WS=15224215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr19	15224265	rs8109089	G	C	998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.914;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=10;PP=666;ReadPosRankSum=-0.782;SC=AAACCTGAAAGGGTCGAAGGC;SOR=0.822;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=83;TCF=62;TCR=21;TR=44;WE=15224273;WS=15224255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,45:0.52:86
chr19	15226611	rs2074261	C	A	1508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.690;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=30;PP=1172;ReadPosRankSum=-1.782;SC=CCCCTGGTGACATCTCCCAGA;SOR=0.986;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=146;TCF=83;TCR=63;TR=71;WE=15226619;WS=15226601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,71:0.45:159
chr19	15227030	rs2074263	G	A	4636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=475;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.447;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=98;PP=2648;ReadPosRankSum=1.585;SC=CGAAGTCCCCGCCATCCACCA;SOR=0.590;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=433;TCF=229;TCR=204;TR=201;WE=15227038;WS=15227020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:248,225:0.48:473
chr19	15227638	rs875803	A	G	1523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=25;PP=817;ReadPosRankSum=-0.309;SC=GAAACACTCAATGAAAAGAGC;SOR=0.681;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=147;TCF=90;TCR=57;TR=62;WE=15227646;WS=15227628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,74:0.44:169
chr19	15227798	rs12972958	G	C	2077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.550;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=50;PP=1286;ReadPosRankSum=-2.569;SC=GTGAGGCTCTGCCGCTGTTCA;SOR=0.614;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=168;TCF=69;TCR=99;TR=86;WE=15227806;WS=15227788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,98:0.52:188
chr19	15229993	rs1131177	A	G	1058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.022;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=26;PP=690;ReadPosRankSum=-0.170;SC=GGACAATGACATCCGCCTTCT;SOR=0.510;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=158;TCF=97;TCR=61;TR=60;WE=15230001;WS=15229983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,61:0.35:173
chr19	15230219	rs12463209	C	G	1699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.544;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=44;PP=1120;ReadPosRankSum=2.350;SC=GCAGGGCTGGCGCTTCTCACC;SOR=0.755;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=170;TCF=83;TCR=87;TR=83;WE=15230227;WS=15230209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,85:0.47:182
chr19	15233581	rs2074265	C	A	1410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.895;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=28;PP=826;ReadPosRankSum=-1.191;SC=AGTAGGGGTACAGCACGTCAA;SOR=0.607;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=132;TCF=73;TCR=59;TR=61;WE=15233589;WS=15233571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,68:0.46:149
chr19	15233631	rs2074266	G	A	1909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.143;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=30;PP=1125;ReadPosRankSum=-0.563;SC=GGGACAGGGAGGACGCTGAGT;SOR=0.788;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=157;TCF=92;TCR=65;TR=79;WE=15233639;WS=15233621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,89:0.49:182
chr19	15233732	rs59102460	G	A	2393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.472;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=50;PP=1432;ReadPosRankSum=-0.266;SC=GGCAGCCATCGCGGCCCTCAG;SOR=0.729;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=211;TCF=111;TCR=100;TR=103;WE=15233740;WS=15233722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,112:0.47:236
chr19	15235932	rs4141356	G	A	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.294;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=9;PP=195;ReadPosRankSum=0.379;SC=GAACCTCTCCGGAAGAAATCG;SOR=0.399;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=32;TCF=14;TCR=18;TR=18;WE=15235940;WS=15235922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,21:0.54:39
chr19	15271771	rs1044009	G	A	825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=16;PP=386;ReadPosRankSum=-1.639;SC=TGCCCCAGCCGCCGGGTACTC;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=73;TCF=38;TCR=35;TR=35;WE=15271779;WS=15271761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,41:0.50:82
chr19	15273221	rs757472	T	C	626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.77;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	15273231	rs4809028	A	G	687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.46;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	15273248	rs4809029	A	C	527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=6;PP=353;SC=CACTGCTGACACCCAGTGGAC;SOR=1.292;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=18;WE=15273256;WS=15273238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	15273381	rs4809030	A	G	2802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=35;PP=1496;SC=TCCCTGGAGGATGAAGGGGAG;SOR=0.925;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=50;TCR=35;TR=85;WE=15273389;WS=15273371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr19	15276007	rs2886698	C	A	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=166;ReadPosRankSum=-0.147;SC=CCCTGAGGCACCCTAAGGACT;SOR=0.527;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=10;WE=15276015;WS=15275997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr19	15276055	rs2074617	C	G	1537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=9;PP=1121;SC=CTTCATGAAGCCTGGTTATGT;SOR=2.584;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=51;TCF=41;TCR=10;TR=50;WE=15276063;WS=15276045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr19	15276143	rs2074618	C	T	5391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=103;NR=74;PP=2965;SC=CAGGTGACACCAACCCAGCTT;SOR=0.914;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=177;TCF=103;TCR=74;TR=177;WE=15276151;WS=15276133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
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chr19	15276923	rs10416777	C	T	7015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.97;SOR=1.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
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chr19	15277938	rs1548554	C	T	2425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=17;PP=1362;SC=TTGCTGAATACACACACCCTT;SOR=1.954;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=58;TCR=17;TR=75;WE=15277946;WS=15277928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr19	15278057	rs1548555	A	G	6132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=103;NR=100;PP=2965;SC=CACTGTCACTAACCTGGGCCA;SOR=0.794;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=203;TCF=103;TCR=100;TR=203;WE=15278065;WS=15278047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr19	15281386	rs2074620	C	A	1709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=37;ReadPosRankSum=-0.802;SC=AAGCAGAGGGCGGGGCTTCAG;SOR=0.722;SbPval=0.58;Source=Platypus;TCF=50;TR=62;WE=15281394;WS=15281376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,72:0.51:140
chr19	15281459	rs56277836	C	G	718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.432;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=13;PP=461;ReadPosRankSum=1.642;SC=CCCCGCCACCCCCTCCCCAAG;SOR=0.470;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=48;TCF=25;TCR=23;TR=30;WE=15281467;WS=15281449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,33:0.62:53
chr19	15285052	rs1044006	T	C	2936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=53;NR=40;PP=1256;SC=GTAGCTCCTCTGGCGGCAGCA;SOR=0.711;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=53;TCR=40;TR=93;WE=15285060;WS=15285042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr19	15285272	rs10422818	T	C	4683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.02;SOR=0.785;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr19	15285382	.	ATTTTT	A	227.76	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.54;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	15289613	rs11670823	A	T	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.262;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=175;ReadPosRankSum=0.190;SC=TCCTCCTCCAAAGGCCGCCAC;SOR=0.195;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=16;WE=15289621;WS=15289603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,18:0.69:26
chr19	15290125	rs56061231	G	A	1295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.269;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=27;PP=998;ReadPosRankSum=0.384;SC=GGTCAAGAGGGAATGAAGACA;SOR=0.839;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=82;TCR=65;TR=61;WE=15290133;WS=15290115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,63:0.39:161
chr19	15290412	rs2074621	G	A	882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=27;PP=611;ReadPosRankSum=1.144;SC=GACACACACAGATGTTCAGCG;SOR=0.649;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=71;TCF=20;TCR=51;TR=39;WE=15290420;WS=15290402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,40:0.51:78
chr19	15292088	rs7257550	G	C	120.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.14;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	15292366	rs11669982	C	T	878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=5;PP=614;SC=TCCCTGCTCTCCAAGCAGAGG;SOR=2.621;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=28;WE=15292374;WS=15292356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	15292437	rs1043997	T	C	2162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=44;NR=33;PP=1120;SC=CTCCGTAGCCTGGCGGGCAGG;SOR=0.872;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=44;TCR=33;TR=77;WE=15292445;WS=15292427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr19	15294991	rs2074616	C	T	1513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=13;PP=928;SC=ATAAATAAAACGGGAAAAGTA;SOR=1.781;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=52;TCF=39;TCR=13;TR=51;WE=15294999;WS=15294981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr19	15295134	rs1043996	G	A	2210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.454;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=44;PP=1159;ReadPosRankSum=-1.805;SC=TGTCCTGATCGCAGGAAGGGC;SOR=0.635;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=238;TCF=121;TCR=117;TR=93;WE=15295142;WS=15295124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,111:0.42:263
chr19	15300069	rs10423702	T	C	8194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=148;NR=132;PP=2965;SC=TCACAGACGATGGAGCTCCCC;SOR=0.746;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=280;TCF=148;TCR=132;TR=280;WE=15300077;WS=15300059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,310:1.00:310
chr19	15302844	rs1043994	T	C	5713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=96;PP=2965;SC=ATGGTGAGGGTGCACAGGGCA;SOR=0.779;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=193;TCF=97;TCR=96;TR=193;WE=15302852;WS=15302834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr19	15303225	rs3815188	G	A	1612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.521;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=40;PP=1016;ReadPosRankSum=-0.536;SC=AGAATCGGGCGGTGCCAGCCA;SOR=0.768;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=185;TCF=86;TCR=99;TR=75;WE=15303233;WS=15303215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,83:0.40:209
chr19	15349545	rs200578182	C	A	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.719;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=4;PP=72;ReadPosRankSum=-0.806;SC=ACCAGGCCTCCAGACTCACGG;SOR=0.368;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=20;TCF=13;TCR=7;TR=9;WE=15349553;WS=15349535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr19	15350594	rs11669901	G	A	2365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=53;PP=1517;ReadPosRankSum=-0.953;SC=TCACCACCACGAGGGGCTGGG;SOR=0.711;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=173;TCF=87;TCR=86;TR=103;WE=15350602;WS=15350584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,109:0.57:190
chr19	15366010	rs34027119	A	AG	39.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.360;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=2.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.64;MQRankSum=1.691;QD=3.31;ReadPosRankSum=-0.420;SOR=1.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr19	15378434	rs139141985	GCCAC	G	961.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=643;ReadPosRankSum=1.167;SC=GGCACCCCATGCCACCCACCC;SOR=0.714;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=15;WE=15378445;WS=15378424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,25:0.60:42
chr19	15383582	rs34855805	C	A	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=75;ReadPosRankSum=0.489;SC=ATGCAGGAGACGACCTCCAGG;SOR=0.859;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=7;WE=15383590;WS=15383572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr19	15466240	rs111237991	T	C	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.217;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=282;ReadPosRankSum=0.080;SC=AGGCCCATGATTGCGGGGATG;SOR=1.628;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=53;TCF=12;TCR=41;TR=18;WE=15466248;WS=15466230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,18:0.33:54
chr19	15471856	rs4809184	T	C	2596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.456;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=61;PP=1210;ReadPosRankSum=-0.128;SC=ACTCCCCATCTGGGCCCACGT;SOR=0.639;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=241;TCF=114;TCR=127;TR=119;WE=15471864;WS=15471846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,132:0.51:257
chr19	15485350	rs4809185	C	T	1505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=23;PP=920;ReadPosRankSum=0.391;SC=CGGGCTGACCCGCCTGGCCTT;SOR=0.694;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=155;TCF=105;TCR=50;TR=69;WE=15485358;WS=15485340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,73:0.43:169
chr19	15508130	rs7247749	G	A	950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=0.698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.86;ReadPosRankSum=-0.507;SOR=0.592;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,50:0.41:121
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chr19	15549255	rs1005953	C	T	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=63;ReadPosRankSum=0.084;SC=AGGTGGCCTTCACTGTGGCTC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=15549263;WS=15549250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
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chr19	15563394	.	G	GT	44	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=12;HapScore=4;MGOF=1;MMLQ=30;MQ=54.85;NF=1;NR=1;PP=44;QD=24.5;SC=TTTGGGGGGGGGGGGGAGGGC;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=2;WE=15563408;WS=15563384;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,2:0.33:6
chr19	15563400	.	A	G	51	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=16;HapScore=4;MGOF=1;MMLQ=18;MQ=57.2;NF=2;NR=0;PP=51;QD=42.8856062736;SC=GGGGGGGGGGAGGGCCTGGTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=2;WE=15563408;WS=15563384;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:10,2:0.17:12
chr19	15563528	rs370102998	C	G	2082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.83;ReadPosRankSum=-0.836;SOR=0.687;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:151,115:0.43:266
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chr19	15566829	rs55890042	G	C	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=7;PP=498;ReadPosRankSum=-2.301;SC=AGTGTCTCCTGTATTTTATCT;SOR=0.613;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=55;TCF=43;TCR=12;TR=29;WE=15566837;WS=15566819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,29:0.48:60
chr19	15568787	.	C	T	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.718;ClippingRankSum=-0.000;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.10;ReadPosRankSum=0.697;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr19	15570931	rs3764566	G	A	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=226;ReadPosRankSum=-1.212;SC=GGTGTTTGGTGTAGATTGGAA;SOR=0.667;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=17;WE=15570939;WS=15570921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,19:0.40:47
chr19	15648715	rs11666601	G	A	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=321;ReadPosRankSum=-0.696;SC=AGGGCTCAGCGGTCTCCCTTG;SOR=0.752;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=19;WE=15648723;WS=15648705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,23:0.51:45
chr19	15651539	rs201608860	GCC	G	676.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=6.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.67;ReadPosRankSum=-0.507;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,20:0.34:58
chr19	15651548	rs372183725	AAT	A	654.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=3.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.35;ReadPosRankSum=-1.234;SOR=1.834;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,19:0.36:53
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chr19	15651553	rs62113202	C	G	672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=1.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.63;ReadPosRankSum=-1.651;SOR=1.301;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,17:0.37:46
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chr19	15651560	rs62113205	C	G	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.35;ReadPosRankSum=-2.402;SOR=0.678;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,14:0.36:39
chr19	15651562	rs139932061	CG	C	475.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=5.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.86;ReadPosRankSum=-2.374;SOR=0.646;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,13:0.35:37
chr19	15651564	rs60465772	A	T	445.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.05;ReadPosRankSum=-2.469;SOR=0.646;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,13:0.35:37
chr19	15651568	rs55832992	C	A	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.60;ReadPosRankSum=-1.647;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,10:0.30:33
chr19	15726487	rs4646523	G	T	3994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=52;PP=2436;SC=CCCCGTGGCTGCTCCTGCTGG;SOR=1.103;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=132;TCF=80;TCR=52;TR=132;WE=15726495;WS=15726477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr19	15726560	rs73001907	G	T	3619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.415;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.288;NF=81;NR=70;PP=2180;ReadPosRankSum=2.636;SC=CTATCACAACGGCCGCCGCCT;SOR=0.741;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=274;TCF=145;TCR=129;TR=151;WE=15726568;WS=15726550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,168:0.55:308
chr19	15726589	rs11673150	C	A	2717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=59;PP=1438;ReadPosRankSum=-0.331;SC=TCCCGCAGCCCCGGAAACAGA;SOR=0.687;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=284;TCF=146;TCR=138;TR=122;WE=15726597;WS=15726579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,140:0.44:315
chr19	15726721	rs148338083	A	AACTCACTCATTCCTCTGATC	380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.69;QD=38.08;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	15730498	rs55848814	G	GC	6082.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=29;NR=54;PP=2962;SC=ACCGTCGCTTGTGACGCCTGC;SOR=0.707;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=85;TCF=30;TCR=55;TR=83;WE=15730510;WS=15730488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr19	15730502	rs61746468	C	T	1719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=29;PP=1001;ReadPosRankSum=1.630;SC=TCGCTTGTGACGCCTGCCTTC;SOR=0.667;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=121;TCF=60;TCR=61;TR=59;WE=15730510;WS=15730488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,78:0.52:151
chr19	15730606	rs28669833	C	T	1786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.159;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=45;PP=1149;ReadPosRankSum=-1.066;SC=CCAGCTGCAGCCTTGGGGTGG;SOR=0.796;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=164;TCF=78;TCR=86;TR=83;WE=15730614;WS=15730596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,88:0.49:180
chr19	15730632	rs11668616	T	C	1615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.635;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=39;PP=1044;ReadPosRankSum=0.485;SC=TCACATACAATTGGGTCTGGA;SOR=0.763;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=130;TCF=56;TCR=74;TR=68;WE=15730640;WS=15730622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,74:0.54:138
chr19	15739084	rs4239613	T	C	1383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.611;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=14;PP=792;ReadPosRankSum=0.861;SC=GTGTATGCTCTCTGGATAATT;SOR=1.112;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=108;TCF=74;TCR=34;TR=50;WE=15739092;WS=15739074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,61:0.49:125
chr19	15739274	rs2056820	C	T	3633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.719;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=74;PP=2206;ReadPosRankSum=-1.244;SC=GAGGAGGGTCCTGGGCAGGGC;SOR=0.584;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=277;TCF=147;TCR=130;TR=146;WE=15739282;WS=15739264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,165:0.53:309
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chr19	15740220	rs4239614	C	T	2129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=49;PP=1191;ReadPosRankSum=0.783;SC=TTTGCACCAACTACCTTTTCA;SOR=0.699;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=153;TCF=65;TCR=88;TR=84;WE=15740228;WS=15740210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,99:0.56:178
chr19	15740268	rs2239367	C	G	1393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=2.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.89;ReadPosRankSum=-0.759;SOR=0.361;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,38:0.68:56
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chr19	15754893	rs2203998	A	G	3925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=376;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.372;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=97;PP=2456;ReadPosRankSum=0.890;SC=GGTGGGTGCTATGGTGCATTT;SOR=0.718;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=333;TCF=156;TCR=177;TR=178;WE=15754901;WS=15754883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,192:0.51:375
chr19	15754975	rs2203999	C	T	1270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=36;PP=839;ReadPosRankSum=-0.871;SC=CTTTCCTTCTCTCTCAGCCAT;SOR=0.798;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=95;TCF=20;TCR=75;TR=45;WE=15754983;WS=15754965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,52:0.48:109
chr19	15757927	rs1290626	T	C	7012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=120;NR=113;PP=2965;SC=TGAGTATCTGTAGGTGAACAG;SOR=0.717;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=233;TCF=120;TCR=113;TR=233;WE=15757935;WS=15757917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chr19	15760053	rs1053037	G	A	2258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.490;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=42;PP=1423;ReadPosRankSum=-0.733;SC=TGGACAGTCTGCAGAAATGTG;SOR=0.760;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=203;TCF=114;TCR=89;TR=96;WE=15760061;WS=15760043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,105:0.46:226
chr19	15760213	rs2283612	C	T	1387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.599;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=38;PP=800;ReadPosRankSum=0.965;SC=TATACCTGATCGTTGAAGGAC;SOR=0.769;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=145;TCF=54;TCR=91;TR=57;WE=15760221;WS=15760203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,69:0.41:170
chr19	15760881	rs1805040	C	A	2355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.871;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.325;NF=39;NR=62;PP=1710;ReadPosRankSum=1.590;SC=TTCACAGATGCCGTCATCCAG;SOR=0.850;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=183;TCF=76;TCR=107;TR=101;WE=15760889;WS=15760871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,102:0.55:185
chr19	15763577	rs2733750	A	C	1312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.728;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.346;NF=22;NR=36;PP=939;ReadPosRankSum=2.249;SC=AGGTTGCTGTACACCCTCGGG;SOR=0.840;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=105;TCF=42;TCR=63;TR=58;WE=15763585;WS=15763567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,59:0.52:113
chr19	15763691	rs1805041	G	A	1181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.727;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.149;NF=29;NR=21;PP=733;ReadPosRankSum=0.828;SC=CAAAGCACCCGGAATACCAGG;SOR=0.585;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=57;TCR=40;TR=50;WE=15763699;WS=15763681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,54:0.50:107
chr19	15763721	rs1805042	G	A	1487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.061;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=4.296;NF=39;NR=26;PP=856;ReadPosRankSum=-1.112;SC=GGCAGGAGGTGCAAGAGCTTC;SOR=0.910;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=138;TCF=79;TCR=59;TR=65;WE=15763729;WS=15763711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,71:0.48:149
chr19	15763775	rs4646511	G	A	1526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-2.977;NF=41;NR=38;PP=873;ReadPosRankSum=-0.724;SC=GAGTGCAGGTGCTGGTGCCCT;SOR=0.678;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=165;TCF=87;TCR=78;TR=79;WE=15763783;WS=15763765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,83:0.45:185
chr19	15763798	rs2683039	G	C	1397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.558;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=36;PP=896;ReadPosRankSum=-0.542;SC=TCCTGAGCCTGTCTCATTGGC;SOR=0.622;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=156;TCF=82;TCR=74;TR=74;WE=15763806;WS=15763788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,77:0.44:176
chr19	15763929	rs2683040	C	G	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=58.43;MQRankSum=-0.566;NF=0;NR=4;PP=90;ReadPosRankSum=-1.068;SC=ACTGTCTGGGCAAAGGTTATA;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=15763937;WS=15763919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr19	15769253	rs4646513	C	A	2820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=62;PP=1713;ReadPosRankSum=-0.098;SC=GGAAGAGGGGCCCCTCAGGCA;SOR=0.695;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=247;TCF=123;TCR=124;TR=125;WE=15769261;WS=15769242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,135:0.50:272
chr19	15769270	rs4646514	A	C	2715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.929;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=58;PP=1781;ReadPosRankSum=0.491;SC=GGCAGGGAGCATTGTCCTGAC;SOR=0.621;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=241;TCF=119;TCR=122;TR=116;WE=15769278;WS=15769260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,128:0.47:270
chr19	15769379	rs4646515	G	C	1986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.571;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=49;PP=1303;ReadPosRankSum=1.008;SC=CGGGCCCCCCGTCTCTGTTTT;SOR=0.765;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=160;TCF=72;TCR=88;TR=91;WE=15769387;WS=15769369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,94:0.56:169
chr19	15769449	rs4646516	A	G	729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.015;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.960;NF=11;NR=17;PP=441;ReadPosRankSum=-0.981;SC=ATCCAACATCACCTCCCTCCA;SOR=1.071;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=62;TCF=26;TCR=36;TR=28;WE=15769457;WS=15769439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,33:0.46:71
chr19	15769529	rs4646518	GC	TT	1302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.147;HP=3;HapScore=2;JOINED;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=12;PP=1106;ReadPosRankSum=-1.179;SC=TCTTGGTCTCGCCTCCAGGTC;SOR=1.213;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=73;TCF=43;TCR=30;TR=33;WE=15769538;WS=15769519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,35:0.43:82
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chr19	15769775	rs4646520	A	G	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.154;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=195;ReadPosRankSum=-0.069;SC=ACAGAGTAGGATTGGGTTGGT;SOR=1.828;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=12;WE=15769783;WS=15769765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
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chr19	15769992	rs2460817	A	T	109.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=27.26;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	15770012	rs56167713	T	C	146.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.70;QD=29.38;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	15770027	rs55876862	A	T	238.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.96;QD=29.85;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	15784061	rs7254013	C	A	5271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=85;PP=2918;SC=TTCCTGGTAACTGGACTCCTA;SOR=0.797;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=184;TCF=98;TCR=86;TR=183;WE=15784069;WS=15784051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr19	15784116	rs7253210	G	A	5453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=84;NR=91;PP=2965;SC=GACTCTAATCGGCCCATCTCT;SOR=0.884;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=177;TCF=85;TCR=92;TR=175;WE=15784124;WS=15784106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr19	15784167	rs7254627	A	G	3477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=64;PP=2008;SC=GAGGCCACTTAGTTGTTGGTT;SOR=1.426;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=42;TCR=64;TR=106;WE=15784175;WS=15784157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr19	15784195	rs10414690	G	C	3371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.79;SOR=1.734;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr19	15784200	rs55794585	C	T	3295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.54;SOR=1.949;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr19	15784214	rs56398124	C	T	1556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=28;PP=819;SC=TCTCAGCCCTCGTTTACTCAC;SOR=1.877;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=15;TCR=28;TR=43;WE=15784222;WS=15784185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr19	15784285	rs56205003	C	T	610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=7;PP=429;SC=ACACTGTCCCCGGAGCTCTTC;SOR=1.230;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=12;TCR=7;TR=19;WE=15784293;WS=15784275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	15784319	rs56124328	G	T	1051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=8;PP=801;SC=TCCTCACCCTGCATCCCCTCT;SOR=2.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=33;WE=15784327;WS=15784309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	15784386	rs16995378	C	T	3549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=37;PP=2238;SC=CCGGTGGCAACGTCCCCATGG;SOR=1.591;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=117;TCF=80;TCR=37;TR=117;WE=15784394;WS=15784376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr19	15784617	rs61666630	A	G	2577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=50;PP=1415;SC=TCAGTGAGCTAGGTATTGATG;SOR=2.245;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=20;TCR=50;TR=70;WE=15784625;WS=15784607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr19	15784660	rs62104452	A	G	949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=18;PP=490;SC=GAGAAGCAAGAGAGATGGCTC;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=15784668;WS=15784650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	15789034	rs28416595	C	A	6280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=116;NR=88;PP=2965;SC=CTAAAATTAACCATCACAGGA;SOR=0.847;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=205;TCF=117;TCR=88;TR=204;WE=15789042;WS=15789024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr19	15789098	rs609636	A	G	6675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=115;PP=2965;SC=GGGCTTGAAGAACTCGACCCA;SOR=0.966;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=216;TCF=100;TCR=116;TR=215;WE=15789106;WS=15789077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr19	15789140	rs609290	A	G	4026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=72;PP=2514;SC=GGGCTTTACGATATGGCTGGG;SOR=1.117;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=131;TCF=58;TCR=73;TR=130;WE=15789148;WS=15789130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr19	15791180	rs8100667	C	T	5575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=105;PP=2965;SC=CTCTTGCCCACTGTCCTTGGC;SOR=1.090;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=184;TCF=79;TCR=105;TR=184;WE=15791188;WS=15791170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr19	15793062	rs7253816	G	A	813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.74;QD=45.21;SOR=3.500;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	15793068	rs7254785	C	T	862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.28;QD=41.08;SOR=3.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	15795842	rs2018030	C	T	1422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=23;PP=1020;SC=GTCCACCCTCCGGTGCTGAAG;SOR=0.773;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=27;TCR=23;TR=50;WE=15795850;WS=15795832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr19	15838746	rs11672695	A	G	809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.373;HP=1;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=1223;ReadPosRankSum=0.407;SC=GCTTGGACAGATGAAGGAGGC;SOR=0.233;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=41;TCF=39;TCR=2;TR=20;WE=15838761;WS=15838736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,21:0.45:47
chr19	15838753	rs34728106	AG	A	819.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.632;HP=4;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=1;PP=1225;ReadPosRankSum=0.853;SC=CAGATGAAGGAGGCGCTCTCA;SOR=1.045;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=43;TCF=37;TCR=6;TR=22;WE=15838761;WS=15838736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,23:0.43:53
chr19	15838967	rs2285955	G	A	2220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.368;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.063;NF=43;NR=54;PP=1375;ReadPosRankSum=0.647;SC=ACCTGTTCACGCTGCTGGGCA;SOR=1.024;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=216;TCF=106;TCR=110;TR=97;WE=15838975;WS=15838957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,105:0.45:231
chr19	15839174	rs2285956	C	T	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=5.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.02;MQRankSum=0.415;QD=10.66;ReadPosRankSum=0.363;SOR=1.461;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,32:0.46:69
chr19	15852223	rs1966357	A	C	752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.977;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=12;PP=556;ReadPosRankSum=0.294;SC=AGAACTACAGAACCATATCTG;SOR=0.491;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=69;TCF=47;TCR=22;TR=35;WE=15852231;WS=15852213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,36:0.48:75
chr19	15852872	rs2240228	G	A	2249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.450;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=48;PP=1238;ReadPosRankSum=0.774;SC=TGTCTTCATTGTGGCTGCCAT;SOR=0.638;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=249;TCF=137;TCR=112;TR=108;WE=15852880;WS=15852862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,117:0.44:265
chr19	15881751	rs8112713	A	C	3033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=1.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.435;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=48;PP=2019;ReadPosRankSum=0.931;SC=CATTTGACATAAAGCTCCATT;SOR=0.643;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=255;TCF=155;TCR=100;TR=122;WE=15881759;WS=15881741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,140:0.47:295
chr19	15881953	rs4807986	A	G	2249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.484;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.526;NF=43;NR=51;PP=1415;ReadPosRankSum=0.434;SC=CGGAAGCGCCACCCGTCATGG;SOR=0.629;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=211;TCF=98;TCR=113;TR=94;WE=15881961;WS=15881943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,107:0.46:232
chr19	15884810	rs10421246	A	T	1520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.020;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=18;PP=906;ReadPosRankSum=-0.634;SC=ATTCCAGACCAGATCTGTCCA;SOR=1.089;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=128;TCF=86;TCR=42;TR=63;WE=15884818;WS=15884800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,71:0.47:150
chr19	15890388	rs7259595	A	G	321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=267;SC=GAGTGAGTGAATGAGCCGCCT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=15890396;WS=15890383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	15890517	rs11669449	A	C	1243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.968;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=27;PP=910;ReadPosRankSum=-1.006;SC=CTGCTGCCACACTCACGAGGT;SOR=0.536;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=166;TCF=102;TCR=64;TR=63;WE=15890525;WS=15890507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,65:0.37:178
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chr19	15890625	.	CG	GA,GG	1497	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=24;MQ=60.04;NF=38,86;NR=59,114;PP=1497,1327;QD=15.9842048955;SC=GCCAGGAAGCCGGCCAGGAGC;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=200;TCF=86;TCR=114;TR=97,200;WE=15890634;WS=15890615;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.49:200
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chr19	15890725	rs56378626	G	T	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.423;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=352;ReadPosRankSum=0.843;SC=GCGGCATCCTGCAGGGCAGAC;SOR=1.071;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=20;WE=15890733;WS=15890715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,22:0.56:39
chr19	15890771	rs56317414	T	G	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.38;ReadPosRankSum=0.123;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr19	15890777	rs55926517	G	T	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.091;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=23.91;ReadPosRankSum=1.247;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr19	15890800	rs56180406	A	G	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.352;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=25.38;ReadPosRankSum=2.037;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr19	15905002	rs4808379	T	C	1907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.140;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.905;NF=47;NR=43;PP=1059;ReadPosRankSum=1.460;SC=TCATGGCCACTGTCTGGAGCG;SOR=0.694;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=185;TCF=102;TCR=83;TR=90;WE=15905010;WS=15904992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,97:0.47:206
chr19	15905289	rs61754873	G	T	2404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.470;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.159;NF=57;NR=49;PP=1584;ReadPosRankSum=0.752;SC=TGCACCTGCCGGGTGGGCTGC;SOR=0.730;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=221;TCF=118;TCR=103;TR=106;WE=15905297;WS=15905279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,113:0.47:238
chr19	15905431	rs4808381	T	C	1833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.573;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.341;NF=42;NR=49;PP=975;ReadPosRankSum=1.491;SC=CCTGTGGAGATGATGTGCTGG;SOR=0.801;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=235;TCF=117;TCR=118;TR=91;WE=15905439;WS=15905421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,97:0.40:244
chr19	15905468	rs62106065	T	G	1347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=0.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.357;NF=29;NR=38;PP=905;ReadPosRankSum=-1.177;SC=GGGCTTGGTGTGTATCACGGC;SOR=0.717;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=182;TCF=87;TCR=95;TR=67;WE=15905476;WS=15905458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,70:0.39:178
chr19	15905505	rs62106066	T	C	1093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=1.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.53;MQRankSum=-3.499;QD=10.94;ReadPosRankSum=-1.314;SOR=0.945;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,35:0.35:100
chr19	15905529	rs62621417	C	A	935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=4.847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.26;MQRankSum=-1.713;QD=13.00;ReadPosRankSum=0.463;SOR=1.341;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,28:0.39:72
chr19	15905941	rs56117700	T	C	625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.80;SOR=2.200;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	15918380	rs28426969	C	T	2927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.201;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.294;NF=62;NR=61;PP=1786;ReadPosRankSum=1.656;SC=TCACCACCATCCCCATGACCA;SOR=0.542;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=223;TCF=108;TCR=115;TR=123;WE=15918388;WS=15918370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,134:0.56:240
chr19	15918500	rs148327766	G	A	958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=8.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.63;MQRankSum=-3.388;QD=15.22;ReadPosRankSum=1.696;SOR=0.157;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,39:0.62:63
chr19	15918802	rs4808383	C	G	2051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-1.297;NF=49;NR=45;PP=1206;ReadPosRankSum=0.982;SC=ACAGAGAAGCCGACGAGGATG;SOR=0.732;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=170;TCF=91;TCR=79;TR=94;WE=15918810;WS=15918792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,102:0.53:194
chr19	15932684	rs62106092	G	A	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.384;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=267;ReadPosRankSum=-0.027;SC=CCATGTATTCGAAATGAACTG;SOR=1.814;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=15;WE=15932692;WS=15932674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr19	15932760	rs3761011	A	G	1040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=21;PP=653;ReadPosRankSum=-0.835;SC=GCATTTTCACATCTTTGAAGG;SOR=0.690;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=128;TCF=78;TCR=50;TR=53;WE=15932768;WS=15932750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,56:0.40:140
chr19	15932941	rs3761012	A	G	1481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.058;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=26;PP=839;ReadPosRankSum=-0.574;SC=GTTTGCGTCCAAGGCGATCTC;SOR=0.540;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=107;TCF=54;TCR=53;TR=63;WE=15932949;WS=15932931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,69:0.58:119
chr19	15933155	rs367984219	A	AT	590.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.40;QD=29.54;SOR=1.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	15934656	rs10411865	A	G	4956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=84;NR=77;PP=2711;SC=TGAGACTGACAGCCCTGGGTA;SOR=0.803;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=161;TCF=84;TCR=77;TR=161;WE=15934664;WS=15934646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr19	15989696	rs3952537	G	C	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=12.734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.82;MQRankSum=-5.011;QD=0.64;ReadPosRankSum=-1.243;SOR=1.706;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,11:0.14:79
chr19	15989730	rs4020346	T	C	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=3.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQRankSum=-4.463;QD=4.00;ReadPosRankSum=0.920;SOR=0.970;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,24:0.28:86
chr19	15989811	rs201777106	T	G	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.686;NF=6;NR=11;PP=210;ReadPosRankSum=-0.353;SC=ATCAAGCCGGTAACCTGGCCT;SOR=0.668;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=46;TCF=17;TCR=29;TR=17;WE=15989819;WS=15989801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,18:0.37:49
chr19	15989857	rs376410257	T	C	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-2.539;NF=0;NR=6;PP=191;ReadPosRankSum=-1.416;SC=GTTTGAGGAATAGAGAAGGGG;SOR=0.260;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=6;WE=15989879;WS=15989847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr19	15989871	rs3093199	T	A	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.335;NF=0;NR=6;PP=266;ReadPosRankSum=1.068;SC=GAAGGGGGTATCCGTGCCTGG;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=15989879;WS=15989847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr19	15990048	rs3093198	A	G	988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=9;PP=528;SC=GGTGAGGGAAAGAGAGCTGGA;SOR=1.270;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=23;TCR=9;TR=32;WE=15990056;WS=15990038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr19	15990431	rs2108622	C	T	2386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.923;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=38;PP=1472;ReadPosRankSum=-1.145;SC=TCCGGCCACACAGCTGGGTTG;SOR=0.977;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=197;TCF=118;TCR=79;TR=104;WE=15990439;WS=15990421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,112:0.53:213
chr19	15996820	rs2074900	G	A	943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.877;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.398;NF=19;NR=22;PP=525;ReadPosRankSum=-2.397;SC=GCTTTGCAAGGTGGTACAGGA;SOR=0.827;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=68;TCF=33;TCR=35;TR=41;WE=15996828;WS=15996810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,46:0.61:76
chr19	15996907	rs3093160	C	T	642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQ=59.97;MQRankSum=-1.358;NF=15;NR=11;PP=315;ReadPosRankSum=0.731;SC=GCTGCTTCAGCACCCGAAGGT;SOR=0.693;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=51;TCF=28;TCR=23;TR=26;WE=15996915;WS=15996897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,32:0.52:62
chr19	15997136	rs3093159	A	AC	1352.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.875;HP=8;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=28;PP=602;ReadPosRankSum=0.015;SC=GAAGGCAGTAACCCCCCCCAA;SOR=0.976;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=99;TCF=15;TCR=84;TR=35;WE=15997144;WS=15997126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,66:0.41:161
chr19	16006178	rs8109064	A	G	808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.444;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=530;ReadPosRankSum=0.384;SC=AAATTGATGAATACATGAAAG;SOR=0.406;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=47;TCF=41;TCR=6;TR=27;WE=16006186;WS=16006168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,31:0.57:54
chr19	16006413	rs3093114	G	A	1023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.811;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=29;PP=688;ReadPosRankSum=-0.019;SC=GGGGGTAGGTGGCCACCAGCT;SOR=0.843;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=86;TCF=31;TCR=55;TR=42;WE=16006421;WS=16006403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,45:0.48:94
chr19	16008257	rs3093106	T	C	2802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=60;PP=1451;ReadPosRankSum=0.943;SC=AGTTCCGTCTTGGGGGTTGTG;SOR=0.697;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=266;TCF=148;TCR=118;TR=134;WE=16008265;WS=16008247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,142:0.49:288
chr19	16008388	rs3093105	A	C	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=21;PP=324;ReadPosRankSum=1.974;SC=GCCACTGGCCAGAGGCCCAGC;SOR=0.841;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=61;TCF=14;TCR=47;TR=27;WE=16008396;WS=16008378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,30:0.46:65
chr19	16008434	rs3093103	A	G	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.104;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=200;ReadPosRankSum=-0.231;SC=TGCAGGGCAGACGGGATGGAC;SOR=2.985;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=10;WE=16008442;WS=16008424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr19	16008469	rs3093100	C	G	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.560;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=79;ReadPosRankSum=-1.038;SC=GCCCAGAGAACGGCCCAGGGA;SOR=1.085;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=6;WE=16008477;WS=16008459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr19	16008512	rs3093098	A	G	63.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=15.76;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	16024538	rs1060467	A	G	1881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FS=0.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.84;ReadPosRankSum=-1.579;SOR=0.772;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:134,106:0.44:240
chr19	16024662	rs1064796	G	C	2854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=58;PP=1606;SC=AGTGCAGCAGGGTGAGCGCCA;SOR=1.220;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=42;TCR=58;TR=100;WE=16024683;WS=16024652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr19	16025176	rs1060463	C	T	1061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=18;PP=672;ReadPosRankSum=-0.319;SC=TTCTCTTGGTCGAAACGGAAG;SOR=0.683;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=95;TCF=55;TCR=40;TR=43;WE=16025184;WS=16025166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,50:0.46:109
chr19	16025312	rs12985248	T	G	1199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.531;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=25;PP=672;ReadPosRankSum=0.378;SC=GTGTCTCCATTGAGGAGAGGT;SOR=0.669;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=101;TCF=52;TCR=49;TR=50;WE=16025320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,56:0.51:109
chr19	16033379	rs4808409	G	T	764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.245;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=480;ReadPosRankSum=-1.679;SC=GATGTCTCTTGGTCACCACCA;SOR=0.421;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=55;TCF=12;TCR=43;TR=29;WE=16033387;WS=16033369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,33:0.51:65
chr19	16034714	rs8104361	A	G	10061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=380;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.222;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=160;NR=180;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.128;SC=GGGAGGGTGCAGCGCCGCTCC;SOR=0.387;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=341;TCF=161;TCR=180;TR=340;WE=16034722;WS=16034704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,377:1.00:378
chr19	16035517	rs3746156	G	A	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=380;ReadPosRankSum=0.021;SC=TCCTTTTCCAGCCTACTCCCT;SOR=1.044;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=17;WE=16035525;WS=16035516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr19	16038334	rs2219358	G	A	1169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.761;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=33;PP=814;ReadPosRankSum=1.233;SC=GGAGAGGGGTGAGAGAAGGAC;SOR=0.811;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=99;TCF=34;TCR=65;TR=48;WE=16038342;WS=16038324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,53:0.48:111
chr19	16038390	rs2305803	G	T	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.660;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=305;ReadPosRankSum=-0.535;SC=GCACTTCCACGCATCCCACCC;SOR=0.133;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=17;WE=16038398;WS=16038380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr19	16040292	rs3765070	A	G	720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=7.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.36;ReadPosRankSum=0.841;SOR=0.252;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,36:0.47:77
chr19	16040473	rs4808414	T	C	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.215;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=7;PP=125;ReadPosRankSum=-1.693;SC=CCTGAATTAATCATGAATTCC;SOR=0.402;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=44;TCF=19;TCR=25;TR=14;WE=16040481;WS=16040463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,15:0.29:52
chr19	16045141	rs2305801	T	C	5335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=91;PP=2965;SC=GCCAGGAGCCTCCAACCAGCA;SOR=1.041;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=168;TCF=76;TCR=92;TR=166;WE=16045149;WS=16045131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr19	16060827	rs1594685	T	G	2872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=59;PP=1785;SC=CTGTTGTAAGTGTTCAGGTAT;SOR=1.211;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=37;TCR=59;TR=96;WE=16060835;WS=16060817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr19	16178587	rs4808031	A	C	1692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.14;ReadPosRankSum=-1.927;SOR=0.688;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,88:0.53:167
chr19	16186815	rs10633690	C	CCA	1883.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=5;PP=839;SC=GGGACGTGACCCCCCCCCCAG;SOR=3.767;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=32;WE=16186823;WS=16186805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	16192898	rs3826722	A	G	6077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=107;NR=101;PP=2965;SC=GTTTGCTTTTAGAAAATGGGG;SOR=0.793;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=208;TCF=107;TCR=101;TR=208;WE=16192913;WS=16192888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr19	16192958	rs3786577	A	G	3136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=66;PP=1960;SC=CAAGGTCACAAGGACATGCAT;SOR=1.449;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=105;TCF=38;TCR=67;TR=104;WE=16192966;WS=16192948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr19	16197421	rs2303149	A	G	3796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=61;NR=64;PP=2009;SC=TAGGGAGGACACCGGGGCCAA;SOR=0.937;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=125;TCF=61;TCR=64;TR=125;WE=16197429;WS=16197411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr19	16236557	rs10416989	G	A	1888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=41;PP=1186;SC=GCCCCACCCCGGAGCCCCTCG;SOR=1.751;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=20;TCR=41;TR=61;WE=16236565;WS=16236547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr19	16254422	rs4321304	T	C	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.432;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=3;PP=501;ReadPosRankSum=-0.387;SC=TGACTTGAGCTGTCCTTGTTC;SOR=0.110;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=42;TCF=39;TCR=3;TR=26;WE=16254430;WS=16254412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,32:0.67:48
chr19	16254694	rs2446366	A	G	2004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=26;NR=42;PP=1259;SC=GGGATTTTCTAGGGGCATGGG;SOR=1.362;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=69;TCF=26;TCR=43;TR=68;WE=16254702;WS=16254684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr19	16259383	rs6512085	G	A	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=2;PP=58;ReadPosRankSum=-0.366;SC=CATGTGAGCCGTCACACCCAG;SOR=0.368;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=5;WE=16259391;WS=16259373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr19	16259460	rs285290	C	T	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=0.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.366;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=161;ReadPosRankSum=-0.665;SC=GGAGGCACCACAAGCTTCAAG;SOR=1.480;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=37;TCF=28;TCR=9;TR=15;WE=16259468;WS=16259450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,19:0.38:50
chr19	16259623	rs8103852	C	T	1148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.32;ReadPosRankSum=0.787;SOR=0.644;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,61:0.39:157
chr19	16263202	.	G	T	74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;FR=1.0000;HP=5;HapScore=2;MGOF=24;MMLQ=19;MQ=50.62;NF=5;NR=1;PP=74;QD=18.1285354245;SC=CACTCCAGCCGGGGGGACAGA;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=16263210;WS=16263198;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	16265241	rs36088948	C	T	787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.541;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=463;ReadPosRankSum=0.782;SC=ACGAGGATCTCTTCCTCTACT;SOR=1.291;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=37;TCF=26;TCR=11;TR=27;WE=16265249;WS=16265231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,34:0.77:44
chr19	16265494	rs111524	G	A	118.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=4;PP=76;SC=CTTTCTGCCTGTCACCTACCC;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=16265502;WS=16265484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	16268207	rs5827321	TA	T	9525.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=379;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=-9.526;NF=64;NR=160;PP=2975;ReadPosRankSum=-0.133;SC=CGGCAGCAGCTAAAAAAGCCA;SOR=0.807;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=245;TCF=69;TCR=176;TR=224;WE=16268215;WS=16268197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,368:0.99:370
chr19	16268664	rs7250494	C	T	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.593;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=33.86;ReadPosRankSum=-0.589;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr19	16268664	.	CCT	TCC	390	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5001;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=8;PP=390;QD=55.4334843578;SC=CTCCTGAATGCCTTAACATTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=8;WE=16268674;WS=16268654;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr19	16268666	rs7254242	T	C	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=33.86;ReadPosRankSum=-0.589;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr19	16275515	rs6512086	A	G	3784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=46;PP=2324;SC=GTGGGCGGTGACGGAGAGCAT;SOR=1.213;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=75;TCR=46;TR=121;WE=16275523;WS=16275505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr19	16275655	rs6512087	C	T	7223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=136;NR=133;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.225;SC=GGCACTCAGCCCCCCCCGCGT;SOR=0.729;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=272;TCF=138;TCR=134;TR=269;WE=16275663;WS=16275643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,281:0.99:285
chr19	16275772	rs4808461	A	G	2316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=54;PP=1595;SC=CAGGAGGGCTAGGCCGGCTGT;SOR=2.133;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=21;TCR=54;TR=75;WE=16275780;WS=16275762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr19	16280634	rs2003419	A	G	706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=15;PP=410;SC=TTTTTGAGACAGAGTCTCGGT;SOR=1.893;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=21;WE=16280642;WS=16280624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	16301312	rs206231	A	G	3246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=45;PP=1720;ReadPosRankSum=1.242;SC=ACTCACCTCCATGTCTCTTCT;SOR=0.302;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=62;TCR=45;TR=106;WE=16301320;WS=16301302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,127:0.99:128
chr19	16301544	rs2242143	G	C	3093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=42;PP=1811;SC=GGGAGCCCAGGGTTCAGGAGT;SOR=1.121;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=66;TCR=42;TR=108;WE=16301552;WS=16301534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr19	16314299	rs117647142	C	T	1775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.577;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=30;PP=1022;ReadPosRankSum=1.132;SC=ACCGTGGCGACGTGGACATGT;SOR=0.633;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=149;TCF=91;TCR=58;TR=74;WE=16314307;WS=16314289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,81:0.49:165
chr19	16320075	rs2290802	C	G	1558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=40;PP=1142;SC=GGCAAAGCCCCGAGAGCCGTT;SOR=4.047;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=5;TCR=40;TR=45;WE=16320083;WS=16320065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr19	16321047	rs7258138	T	C	416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=1;PP=332;SC=TTTATATTTATTTTCTGTTCT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=16321055;WS=16321045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	16337423	rs2305939	T	C	3542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=70;PP=2273;SC=CATTACAGCCTAGGGCAGGGT;SOR=1.379;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=46;TCR=70;TR=116;WE=16337431;WS=16337413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr19	16338532	rs2124904	G	A	2512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=55;PP=1622;SC=CTGGGCTGTCGGCAGACTCCT;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=24;TCR=55;TR=79;WE=16338540;WS=16338522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr19	16339014	.	A	C	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.598;ClippingRankSum=0.000;DP=369;ExcessHet=3.0103;FS=257.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.74;ReadPosRankSum=-1.800;SOR=8.885;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:284,84:0.23:368
chr19	16339069	rs2305937	G	A	4596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=105;PP=2965;SC=TCTCTGGCCCGTCCCAGGAGC;SOR=1.638;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=161;TCF=56;TCR=105;TR=161;WE=16339077;WS=16339059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr19	16339715	rs3752797	C	T	11886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=443;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=182;NR=227;PP=2965;SC=ACAGCGAGATCGTGTGGTCCA;SOR=1.007;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=409;TCF=182;TCR=227;TR=409;WE=16339723;WS=16339705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,443:1.00:443
chr19	16344528	rs2279060	C	G	2206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=46;PP=1557;SC=CAGTCAGCTGCAATCAGGACC;SOR=1.997;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=20;TCR=46;TR=66;WE=16344536;WS=16344518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr19	16345099	rs897774	T	C	3195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=59;NR=52;PP=1983;SC=AGTGAGGCCCTACCCGTGGGG;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=111;TCF=59;TCR=52;TR=111;WE=16345107;WS=16345089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr19	16435717	rs8106384	T	C	4568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.11;SOR=0.728;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr19	16436262	rs3745318	T	C	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.92;ReadPosRankSum=0.642;SOR=0.801;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,39:0.48:82
chr19	16466444	rs55712949	A	G	2061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.103;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=47;PP=1455;ReadPosRankSum=-0.862;SC=GTGTGTGTGTATATATAGACA;SOR=0.583;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=200;TCF=110;TCR=90;TR=106;WE=16466452;WS=16466432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,98:0.49:198
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chr19	16487905	rs11086030	T	C	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=275;ReadPosRankSum=-1.705;SC=CGGTAGGCGGTGGCTGCGAGA;SOR=0.604;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=43;TCF=29;TCR=14;TR=23;WE=16487913;WS=16487895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,27:0.56:48
chr19	16513357	rs34782743	CT	C	748.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.925;HP=11;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.727;NF=3;NR=20;PP=244;ReadPosRankSum=0.555;SC=AGAAAAGACGCTTTTTTTTTT;SOR=0.582;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=49;TCF=3;TCR=46;TR=23;WE=16513366;WS=16513347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,40:0.59:68
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chr19	16539347	rs71178694	G	GAAGA	2197.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.65;QD=45.79;SOR=4.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr19	16539356	rs4808510	C	A	818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=1.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.34;MQRankSum=0.961;QD=13.88;ReadPosRankSum=-1.696;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,34:0.58:59
chr19	16547607	rs17709957	G	A	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.712;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.84;ReadPosRankSum=-0.719;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr19	16547929	rs62118102	G	A	708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.697;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=20;PP=442;ReadPosRankSum=0.637;SC=ACTTCACAAAGTTAAACACAG;SOR=1.209;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=47;TCF=16;TCR=31;TR=29;WE=16547937;WS=16547919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,31:0.63:49
chr19	16552914	rs2305781	G	A	1662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=26;PP=876;ReadPosRankSum=0.940;SC=CCGCTCAGCCGGGCTTCTATT;SOR=0.676;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=137;TCF=83;TCR=54;TR=66;WE=16552922;WS=16552904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,80:0.47:170
chr19	16591361	.	TA	T	43.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=0.000;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.62;ReadPosRankSum=0.270;SOR=0.735;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,12:0.17:70
chr19	16591464	rs9305079	G	A	2104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.978;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=45;PP=1337;ReadPosRankSum=0.292;SC=AATTATCTGCGTACTCTTCAT;SOR=0.761;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=222;TCF=121;TCR=101;TR=99;WE=16591472;WS=16591454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,108:0.44:245
chr19	16593189	rs138347151	CAACAA	C	1728.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=12;NR=9;PP=1080;SC=GACCCTGTCTCAACAAAACAA;SOR=2.419;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=50;TCF=30;TCR=20;TR=21;WE=16593211;WS=16593179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr19	16593203	rs75847259	A	G	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.87;MQRankSum=-0.299;QD=9.54;ReadPosRankSum=-2.196;SOR=0.671;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,29:0.47:62
chr19	16593415	rs8100755	G	A	1671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.543;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=39;PP=1031;ReadPosRankSum=2.646;SC=AACCATATGGGGTGGTCTCAA;SOR=0.739;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=160;TCF=79;TCR=81;TR=74;WE=16593423;WS=16593405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,83:0.46:181
chr19	16593573	rs10403020	G	A	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.992;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=17;PP=346;ReadPosRankSum=0.484;SC=TGGTGCTGGCGTCCAGAAAAT;SOR=0.557;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=56;TCF=21;TCR=35;TR=28;WE=16593581;WS=16593563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,29:0.48:61
chr19	16594967	rs10413787	A	G	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.744;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.89;ReadPosRankSum=-1.200;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr19	16601154	rs3810196	T	C	808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.208;HP=2;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=8;PP=1390;ReadPosRankSum=-0.610;SC=CTAGAAGTGGTTGTGTTGCAC;SOR=0.387;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=86;TCF=70;TCR=16;TR=36;WE=16601176;WS=16601144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,38:0.40:95
chr19	16601168	rs3810197	G	A	1669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.654;HP=1;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=14;PP=2061;ReadPosRankSum=0.555;SC=GTTGCACCACGTAAACTCACC;SOR=0.977;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=109;TCF=82;TCR=27;TR=62;WE=16601176;WS=16601144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,72:0.59:122
chr19	16601194	rs3810198	C	T	1441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.940;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=27;PP=918;ReadPosRankSum=-0.084;SC=TAATATAGTACTGCGATTTTC;SOR=0.551;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=161;TCF=102;TCR=59;TR=68;WE=16601202;WS=16601184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,74:0.42:178
chr19	16606742	rs3810199	G	C	3088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=56;PP=2083;SC=GGGGACCCTCGAGGATTCGAG;SOR=1.352;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=36;TCR=56;TR=92;WE=16606750;WS=16606732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr19	16606766	rs3810200	G	C	2113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=35;PP=1401;SC=TCGCTGCCGTGGACCCCGTGG;SOR=0.927;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=67;TCF=31;TCR=36;TR=66;WE=16606774;WS=16606756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr19	16611527	rs62118143	T	A	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.521;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=172;ReadPosRankSum=0.240;SC=TGTGAGCTTTTGCCAAGTAGG;SOR=1.739;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=12;WE=16611535;WS=16611517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr19	16611978	rs728116	T	C	2687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=49;PP=1611;ReadPosRankSum=0.088;SC=CCGCCGATGCTGGTCTTCCAA;SOR=0.684;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=224;TCF=130;TCR=94;TR=117;WE=16611986;WS=16611968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,125:0.53:237
chr19	16612011	rs728117	T	C	3540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.411;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=64;PP=1989;ReadPosRankSum=-0.151;SC=GAATCCTCTCTGGGGGTGCAC;SOR=0.607;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=275;TCF=160;TCR=115;TR=152;WE=16612019;WS=16612001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,165:0.56:295
chr19	16612365	rs7251978	G	A	696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=5.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.17;MQRankSum=-0.839;QD=10.72;ReadPosRankSum=-1.359;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,28:0.43:65
chr19	16617646	rs28716321	T	A	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=2.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.92;ReadPosRankSum=-1.065;SOR=1.099;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,21:0.40:53
chr19	16628186	rs28447467	G	A	1203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.399;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=33;PP=776;ReadPosRankSum=1.917;SC=GCACACACACGCACACAAACA;SOR=0.842;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=123;TCF=55;TCR=68;TR=58;WE=16628194;WS=16628174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,59:0.44:135
chr19	16628259	.	GAC	G	81	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=81;QD=22.75;SC=TGGGGTGATGGACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=4;WE=16628268;WS=16628249;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:15,4:0.21:19
chr19	16631322	rs2303119	T	C	1752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.888;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=45;PP=965;ReadPosRankSum=-0.378;SC=GGGTCCGCTGTGGGGAGAGGC;SOR=0.471;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=143;TCF=57;TCR=86;TR=78;WE=16631330;WS=16631312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,86:0.54:159
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chr19	16665857	rs731617	C	T	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=187;ReadPosRankSum=1.065;SC=TGGCAAAGCTCTGACATACAA;SOR=0.818;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=37;TCF=24;TCR=13;TR=16;WE=16665865;WS=16665847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr19	16666101	rs2287869	G	C	2095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.960;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=53;PP=1117;ReadPosRankSum=0.035;SC=AGTAGCTCAGGGGGCTAACGA;SOR=0.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=232;TCF=110;TCR=122;TR=100;WE=16666109;WS=16666091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,110:0.42:259
chr19	16676026	.	CT	C	102.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.132;ClippingRankSum=-0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.90;ReadPosRankSum=0.979;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
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chr19	16798927	rs2547112	T	C	5513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=118;NR=71;PP=2965;SC=CTGTCTCTCTTGCTGTCTCCC;SOR=1.162;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=189;TCF=118;TCR=71;TR=189;WE=16798935;WS=16798917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr19	16841831	rs8108763	A	G	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=21;ReadPosRankSum=1.465;SC=GAGGAGAGAGAATCTCTTGAG;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=3;WE=16841839;WS=16841821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr19	16842052	rs8107776	G	T	3686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=57;NR=57;PP=1828;SC=ACCCTGAAGTGCCAGACCTTC;SOR=0.895;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=57;TCR=59;TR=114;WE=16842060;WS=16842042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr19	16855265	rs812847	A	G	2490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=47;PP=1560;ReadPosRankSum=0.281;SC=CCCCTGTCTGATTCCCTCGCG;SOR=0.709;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=230;TCF=132;TCR=98;TR=109;WE=16855273;WS=16855255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,119:0.48:246
chr19	16860105	rs706764	G	A	11003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=412;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=180;NR=189;PP=2965;SC=CTGCCTGGACGCTGATGCCCA;SOR=0.763;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=369;TCF=180;TCR=189;TR=369;WE=16860113;WS=16860095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,412:1.00:412
chr19	16872940	rs773852	G	A	1855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.648;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=50;PP=1304;ReadPosRankSum=-0.024;SC=CACTGAACTTGGACCGAAAGG;SOR=1.106;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=163;TCF=65;TCR=98;TR=78;WE=16872948;WS=16872930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,83:0.49:168
chr19	16876099	rs4808526	T	C	2270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=29;NR=47;PP=1494;SC=TTTTCATCAATTCTCATACCT;SOR=1.339;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=29;TCR=47;TR=76;WE=16876107;WS=16876089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr19	16899838	rs2608737	A	T	1562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=14;PP=917;SC=ACCCTCGCCAACTCTGCTTCA;SOR=1.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=37;TCR=14;TR=51;WE=16899846;WS=16899828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr19	16905474	rs2431802	G	T	448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=13;PP=333;SC=GGTTAGCAACGTTTTCTGCCA;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=16905482;WS=16905464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	16918323	rs141852361	A	G	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=3.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.42;ReadPosRankSum=2.192;SOR=0.287;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr19	16918485	rs117690411	G	A	1865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FS=0.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.67;ReadPosRankSum=1.394;SOR=0.636;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:97,96:0.50:193
chr19	16923494	rs773894	C	G	978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=2.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQRankSum=-0.757;QD=14.39;ReadPosRankSum=1.121;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,42:0.62:68
chr19	16957638	rs2241377	A	C	620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=0;PP=450;SC=AAGATCCACAAGTGTGCAGAC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=16957646;WS=16957629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	16976117	rs10625481	A	AC	53.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.96;ReadPosRankSum=-1.834;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr19	16976286	rs773911	A	G	3168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=66;NR=43;PP=1804;SC=AGAAGAAGCTATCTCGGATGG;SOR=0.997;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=66;TCR=43;TR=109;WE=16976294;WS=16976276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr19	16988456	rs2303090	A	G	2439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=36;PP=1338;SC=CAGAGGTAAGAGGCCCTGAGA;SOR=0.832;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=42;TCR=36;TR=78;WE=16988464;WS=16988446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr19	16988476	rs2258663	T	C	2110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=37;PP=1018;SC=ATGCATGCTCTGTTCCTTCCT;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=35;TCR=37;TR=72;WE=16988484;WS=16988466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr19	16999897	rs773905	T	C	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=30;ReadPosRankSum=1.068;SC=GGTTTATCTCTACCGGCGCGA;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=3;WE=16999905;WS=16999888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr19	17003789	rs773901	T	G	3031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.910;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=57;PP=1702;ReadPosRankSum=1.153;SC=ACGTGTATTCTTGTCAATATC;SOR=0.616;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=253;TCF=146;TCR=107;TR=132;WE=17003797;WS=17003779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,149:0.52:284
chr19	17004049	rs1054533	T	C	1120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=29;PP=559;ReadPosRankSum=2.361;SC=ACTATGTCTCTGAGGGGCCGG;SOR=0.670;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=91;TCF=39;TCR=52;TR=50;WE=17004057;WS=17004039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,56:0.54:103
chr19	17006697	rs2227366	C	A	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=6.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.56;ReadPosRankSum=2.667;SOR=1.928;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr19	17006700	rs2981473	G	T	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=6.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.31;ReadPosRankSum=2.201;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr19	17006738	rs146763898	A	ACACGCG	258.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=4;PP=267;ReadPosRankSum=1.630;SC=ACACACACACACGCGCGCGTG;SOR=1.506;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=16;TCF=9;TCR=7;TR=8;WE=17006746;WS=17006728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
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chr19	17008578	rs2608732	G	C	708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.149;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=7;PP=333;ReadPosRankSum=-1.934;SC=GTGGGCTGTGGGTGCTGACGT;SOR=1.150;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=75;TCF=52;TCR=23;TR=31;WE=17008586;WS=17008568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,36:0.42:86
chr19	17011860	rs60122837	G	T	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=1.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.20;MQRankSum=0.929;QD=10.53;ReadPosRankSum=2.226;SOR=1.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,29:0.56:52
chr19	17011950	rs77345177	A	AC	7933.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=73;PP=2936;SC=AGCCAGCCTGACCTGGGTGCC;SOR=0.777;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=107;TCF=31;TCR=76;TR=101;WE=17011958;WS=17011940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr19	17014655	.	C	T	2248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.412;ClippingRankSum=0.000;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.357;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=48;PP=1239;ReadPosRankSum=1.621;SC=GCCTGCAGAGCCACGCAGGTG;SOR=0.529;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=195;TCF=86;TCR=109;TR=94;WE=17014663;WS=17014645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,107:0.50:216
chr19	17015428	rs773863	G	A	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.384;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=246;ReadPosRankSum=-1.876;SC=CCCATGGAGCGCATCCAAGCA;SOR=1.101;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=16;WE=17015436;WS=17015418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,21:0.52:40
chr19	17025292	rs706761	G	A	6940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=115;NR=122;PP=2965;SC=CAGCGGGACAGTGCCGTGGAT;SOR=0.840;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=237;TCF=115;TCR=122;TR=237;WE=17025300;WS=17025282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr19	17032550	rs3745331	A	G	1356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=2.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.54;ReadPosRankSum=-0.331;SOR=0.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,34:0.54:63
chr19	17032559	rs3745332	T	C	1472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.18;ReadPosRankSum=0.203;SOR=0.507;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,42:0.52:81
chr19	17104239	rs151335087	T	C	478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.268;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=256;ReadPosRankSum=0.029;SC=CAGCCACACGTGCTGGGCTGA;SOR=0.016;SbPval=0.09;Source=Platypus;TC=41;TCF=35;TCR=6;TR=21;WE=17104247;WS=17104229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr19	17107825	rs3745337	G	A	888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=11;PP=444;ReadPosRankSum=-1.296;SC=CAGGGGATCCGTTTTCAGCTG;SOR=0.729;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=75;TCF=49;TCR=26;TR=34;WE=17107833;WS=17107815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,43:0.51:85
chr19	17108135	rs3745340	C	T	1799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.137;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.218;NF=44;NR=37;PP=1131;ReadPosRankSum=-0.375;SC=GTCGAAGTCCCGGGAGCCGAG;SOR=0.796;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=171;TCF=95;TCR=76;TR=81;WE=17108143;WS=17108125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,87:0.47:186
chr19	17111297	rs4808551	A	G	3171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=39;PP=1806;SC=CATGTTGATCATTAAGGCACC;SOR=1.255;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=70;TCR=39;TR=109;WE=17111305;WS=17111287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr19	17111411	rs4808064	A	G	5390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=84;NR=93;PP=2897;SC=GGCCAGGTTGACATAGTGTGG;SOR=0.979;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=177;TCF=84;TCR=93;TR=177;WE=17111419;WS=17111401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr19	17119560	rs897768	T	C	1856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=44;PP=1132;SC=CAGAAGGGGATGGGCTGGGCC;SOR=2.269;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=17;TCR=44;TR=61;WE=17119568;WS=17119550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr19	17122630	rs35560062	G	A	1873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=50;PP=1289;ReadPosRankSum=-1.330;SC=AGATACTGGGGAAGGAGTTTG;SOR=0.669;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=169;TCF=75;TCR=94;TR=90;WE=17122638;WS=17122620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,92:0.50:183
chr19	17133028	rs80035294	C	A	2487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=54;PP=1434;ReadPosRankSum=2.011;SC=GTTCTCACCCCAGACCCCTGG;SOR=0.719;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=247;TCF=125;TCR=122;TR=111;WE=17133036;WS=17133018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,125:0.45:278
chr19	17137290	rs11878608	A	C	7974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=163;NR=110;PP=2965;SC=TCGCTGCAACACTCTGAGCCA;SOR=1.014;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=274;TCF=163;TCR=111;TR=273;WE=17137298;WS=17137280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,305:1.00:305
chr19	17160564	rs4808557	T	C	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.139;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=111;ReadPosRankSum=-0.127;SC=TCATAGAAAATGGAGGCTTCA;SOR=2.115;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=7;WE=17160572;WS=17160554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr19	17163661	rs2305758	C	T	1690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.066;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=36;PP=1024;ReadPosRankSum=-1.954;SC=CCTTTTTCGCCGTCACGTCCT;SOR=0.789;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=199;TCF=115;TCR=84;TR=86;WE=17163669;WS=17163651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,90:0.41:217
chr19	17166896	rs3214849	TAA	T	1051.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.204;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.522;NF=0;NR=11;PP=316;ReadPosRankSum=-0.434;SC=TGTGCAGGGTTAAGATACAGC;SOR=0.453;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=11;WE=17166905;WS=17166886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,29:0.48:61
chr19	17169758	rs2305757	G	C	1099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.672;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=28;PP=762;ReadPosRankSum=-0.062;SC=CCAGCAGGGGGAGAACTCTGG;SOR=0.773;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=115;TCF=51;TCR=64;TR=47;WE=17169766;WS=17169748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,52:0.40:131
chr19	17170540	rs1551552	GG	AT	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=678;ReadPosRankSum=0.580;SC=TTCTAATGATGGGTTTATTGG;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=15;WE=17170549;WS=17170530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr19	17170885	rs1130222	C	T	1953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.508;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=36;PP=1220;ReadPosRankSum=0.050;SC=TCACCCTTTCCGACCCCACTG;SOR=0.741;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=192;TCF=110;TCR=82;TR=85;WE=17170893;WS=17170875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,95:0.45:210
chr19	17173418	rs71338609	A	G	1614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=30;PP=1038;ReadPosRankSum=0.118;SC=CCCTTCCCAGAAAGGAAAGAA;SOR=0.693;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=133;TCF=81;TCR=52;TR=72;WE=17173426;WS=17173408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,79:0.53:149
chr19	17173487	rs3816550	A	G	1953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.706;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=37;PP=1201;ReadPosRankSum=0.819;SC=TCACTGCCCGAGGACCATGGC;SOR=0.828;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=179;TCF=101;TCR=78;TR=87;WE=17173495;WS=17173477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,96:0.47:204
chr19	17179789	rs2305754	G	A	2824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=36;PP=1688;SC=AATTCCAGTTGCTCAGAACCT;SOR=1.168;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=62;TCR=36;TR=98;WE=17179797;WS=17179779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr19	17180033	rs2305753	C	T	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.681;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=403;ReadPosRankSum=0.784;SC=GTCACCACTCCTCCTGCTCGC;SOR=0.411;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=39;TCF=5;TCR=34;TR=23;WE=17180041;WS=17180023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,22:0.56:39
chr19	17186127	rs2305752	A	C	2851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.11;ReadPosRankSum=1.039;SOR=0.701;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:174,139:0.44:313
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chr19	17212992	rs3745349	C	T	5609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=519;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.521;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=122;NR=130;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.089;SC=GTAACCTCCCCGAGCTAACCG;SOR=0.717;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=485;TCF=240;TCR=245;TR=252;WE=17213000;WS=17212982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:252,267:0.51:519
chr19	17256032	rs59360945	G	A	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=238;ReadPosRankSum=0.374;SC=GTTGCAGTGAGCCAAGATTGT;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=11;WE=17256040;WS=17256029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr19	17264963	rs2305768	C	T	742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.353;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=22;PP=568;ReadPosRankSum=-1.500;SC=CAGAGGCAGCCTGCCCTGGCC;SOR=1.058;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=47;TCF=11;TCR=36;TR=28;WE=17264971;WS=17264953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,29:0.60:48
chr19	17273893	rs7256689	G	T	2104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.233;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=38;PP=1336;ReadPosRankSum=-0.012;SC=ATGAGCAGCTGCAGTATTACT;SOR=0.808;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=155;TCF=87;TCR=68;TR=90;WE=17273901;WS=17273883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,97:0.59:165
chr19	17283303	rs2279008	T	C	990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.780;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=32;PP=707;ReadPosRankSum=0.707;SC=TGTCTGCCCATCACCACTGGT;SOR=1.030;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=97;TCF=31;TCR=66;TR=44;WE=17283311;WS=17283293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,46:0.45:103
chr19	17283383	rs11463235	A	AG	920.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=17;PP=992;SC=GCGAGGTTCCAGGTGCTCAGA;SOR=1.781;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=24;WE=17283391;WS=17283373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	17294679	.	TA	T	81.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=0.000;DP=163;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.54;ReadPosRankSum=0.755;SOR=0.613;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:124,26:0.17:150
chr19	17311226	rs117099942	G	A	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=267;ReadPosRankSum=1.306;SC=CATGAAGAAGGGCCTGGAAGG;SOR=0.674;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=51;TCF=16;TCR=35;TR=21;WE=17311234;WS=17311216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,23:0.39:59
chr19	17316697	rs12327728	C	G	954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=3;PP=702;SC=GACCAGGAGGCAGAGGCCCCC;SOR=3.126;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=30;WE=17316705;WS=17316692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	17326567	rs388484	A	T	1145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=36;NR=8;PP=854;SC=CATGATCAGGACATGGGAAAG;SOR=1.845;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=36;TCR=8;TR=44;WE=17326575;WS=17326557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	17330060	rs414528	T	C	6088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=114;NR=104;PP=2965;SC=GAGAAGCAGTTGGCAGCTGAG;SOR=0.753;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=218;TCF=114;TCR=104;TR=218;WE=17330068;WS=17330050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr19	17374726	rs8112782	G	C	1553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=22;PP=1019;ReadPosRankSum=0.535;SC=GTAGGTGTGTGAGCAGAGCAG;SOR=0.740;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=118;TCF=78;TCR=40;TR=64;WE=17374734;WS=17374716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,71:0.55:129
chr19	17382505	rs10420922	A	T	896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.070;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=26;PP=570;ReadPosRankSum=-0.028;SC=CAGCCATGGCAGGGAGGGTCC;SOR=1.134;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=84;TCF=31;TCR=53;TR=38;WE=17382513;WS=17382495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,42:0.46:92
chr19	17392483	rs7246262	C	G	1808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=39;NR=27;PP=1044;SC=TCCTCCCACCCGGGCTCTTAT;SOR=1.002;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=40;TCR=27;TR=66;WE=17392491;WS=17392473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr19	17392894	rs8100241	G	A	1206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=1.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.44;ReadPosRankSum=-1.724;SOR=0.587;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,64:0.45:143
chr19	17393015	rs1864116	C	T	345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=4;NR=11;PP=259;SC=GACCCCAACGCTCGGTAAGAT;SOR=1.765;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=15;WE=17393023;WS=17393005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	17393504	rs1864113	G	C	971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=23;NR=10;PP=579;SC=TGGCCGCCGCGTGGGGCTGCC;SOR=1.371;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=23;TCR=10;TR=33;WE=17393512;WS=17393494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	17393530	rs8108174	T	A	750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=14;PP=425;ReadPosRankSum=-1.647;SC=GGCCTGGAGCTGCTGCTGAGC;SOR=0.582;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=55;TCF=33;TCR=22;TR=33;WE=17393538;WS=17393520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,36:0.59:61
chr19	17393925	rs56069439	C	A	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.885;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=171;ReadPosRankSum=0.083;SC=CTATTTGTGGCCAGCTCTTTC;SOR=1.445;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=12;WE=17393933;WS=17393915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr19	17394124	rs2363956	T	G	2874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=55;PP=1768;ReadPosRankSum=-0.494;SC=GACATTGGCTTGGAGGCTGAC;SOR=0.718;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=250;TCF=137;TCR=113;TR=121;WE=17394132;WS=17394114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,134:0.49:275
chr19	17394504	rs891017	A	C	8937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=146;NR=149;PP=2965;SC=ACGGACACCAACCCCTGGAGC;SOR=0.763;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=295;TCF=146;TCR=149;TR=295;WE=17394512;WS=17394494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,325:1.00:325
chr19	17395003	rs11086065	A	G	3582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=66;PP=2126;SC=CAGTTTGAGCAGCCAGATCCT;SOR=1.335;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=45;TCR=66;TR=111;WE=17395011;WS=17394993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr19	17395055	rs11882562	C	G	2563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=43;PP=1338;SC=CTAGCTTCACCTATCTGCTGC;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=38;TCR=43;TR=81;WE=17395063;WS=17395045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr19	17395182	rs4808614	G	T	127.75	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.441;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.180;NF=2;NR=9;PP=209;ReadPosRankSum=1.465;SC=ATCATCAGCTGCTTCTTCTTC;SOR=2.225;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=11;WE=17395200;WS=17395172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
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chr19	17396549	rs751599	T	C	3790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.61;SOR=0.720;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
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chr19	17417080	rs11548548	C	T	2764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.368;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=60;PP=1729;ReadPosRankSum=0.658;SC=AGCCGAGCAACATCAAACGCA;SOR=0.614;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=272;TCF=153;TCR=119;TR=130;WE=17417088;WS=17417069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,140:0.46:302
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chr19	17435884	rs755123	T	C	9830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=34.98;ReadPosRankSum=0.721;SOR=0.715;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,279:0.99:281
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chr19	17435887	rs56286266	C	T	2955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FS=1.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.05;ReadPosRankSum=-0.104;SOR=0.729;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:151,143:0.49:294
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chr19	17438918	rs11667523	T	C	754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=4;PP=2057;ReadPosRankSum=0.197;SC=TCGGACGGTGTGTCCCGTCCC;SOR=0.454;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=47;TCF=40;TCR=7;TR=28;WE=17438938;WS=17438908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,29:0.73:40
chr19	17438923	rs113207944	C	T	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.755;HP=2;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=1329;ReadPosRankSum=0.426;SC=CGGTGTGTCCCGTCCCCGGCG;SOR=1.417;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=53;TCF=44;TCR=9;TR=15;WE=17438938;WS=17438908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,11:0.24:46
chr19	17438930	.	G	GGCGAGGCCCCGCCCCCT	292.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.513;ClippingRankSum=0.000;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=7.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.97;ReadPosRankSum=1.473;SOR=2.376;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,9:0.18:49
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chr19	17441093	rs75616124	G	T	2391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.180;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=49;PP=1417;ReadPosRankSum=0.319;SC=GCTCATCCCAGCTGCAGGGCT;SOR=0.756;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=179;TCF=93;TCR=86;TR=97;WE=17441101;WS=17441083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,109:0.54:201
chr19	17441488	rs1529482	C	T	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=139;ReadPosRankSum=0.869;SC=ACCTCTCCCCCTGGGGAGCAC;SOR=1.609;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=9;WE=17441496;WS=17441485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr19	17441834	rs11670898	T	A	4628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=412;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.092;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=98;PP=2962;ReadPosRankSum=0.943;SC=TCATTGTTTGTGCCAGTCCAG;SOR=0.615;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=377;TCF=183;TCR=194;TR=194;WE=17441842;WS=17441824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:198,214:0.52:412
chr19	17441909	rs61734355	T	G	3343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.881;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=82;PP=2079;ReadPosRankSum=-0.277;SC=GATCAGCCTCTGTGAATGTGT;SOR=0.558;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=316;TCF=149;TCR=167;TR=157;WE=17441917;WS=17441899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,165:0.49:339
chr19	17443891	rs79771034	G	A	2853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.441;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=58;PP=1562;ReadPosRankSum=-0.734;SC=TGCATGCGGGGGCCCAGAGCC;SOR=0.751;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=234;TCF=118;TCR=116;TR=114;WE=17443899;WS=17443881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,137:0.50:272
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chr19	17449157	rs75326392	C	G	3893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.802;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=86;PP=2405;ReadPosRankSum=0.351;SC=CCTCCTGTCACCTGTCTGTCA;SOR=0.751;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=315;TCF=162;TCR=153;TR=170;WE=17449165;WS=17449147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,187:0.53:355
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chr19	17450016	rs3810206	T	C	4389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.97;SOR=0.884;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
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chr19	17452527	rs919333	G	T	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.527;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=302;ReadPosRankSum=0.335;SC=ATCCAGGGAAGTCGCACCCAA;SOR=1.051;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=18;WE=17452535;WS=17452517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr19	17502698	rs2278235	G	A	1059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=28;PP=842;SC=AGGCAGAGGAGAGGAGGAGTG;SOR=2.649;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=35;WE=17502706;WS=17502688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	17514440	rs919265	G	C	420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=11;NR=3;PP=322;SC=TCCCCGCCCCGCTTCCCCAGC;SOR=1.765;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=14;WE=17514448;WS=17514430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	17514646	rs113321277	T	TGGG	11508.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.49;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=79;PP=2924;SC=GCGGTACAGATGGCAAATCAG;SOR=0.843;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=20;TCR=88;TR=97;WE=17514654;WS=17514636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
chr19	17516400	rs111617488	A	AGCTGAAAG	6420.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=51;PP=2965;SC=TCTCCCCTTTAGAGTCTGGCC;SOR=1.577;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=71;TCF=6;TCR=65;TR=57;WE=17516408;WS=17516390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr19	17531450	rs2303680	G	A	1292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.610;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=30;PP=705;ReadPosRankSum=1.825;SC=TCCAGTAAGGGCTGCTTCGGA;SOR=0.614;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=131;TCF=67;TCR=64;TR=61;WE=17531458;WS=17531440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,67:0.45:148
chr19	17533126	rs2303678	A	G	2405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=26;PP=1522;SC=TCACTCCCCTACCCCCCACTC;SOR=1.477;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=82;TCF=54;TCR=28;TR=80;WE=17533134;WS=17533116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr19	17534693	rs2288408	T	C	4840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=67;PP=2965;SC=ATCTTCCTACTTCCCTCTCCC;SOR=0.865;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=159;TCF=92;TCR=67;TR=158;WE=17534701;WS=17534683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr19	17535546	rs4808636	C	T	1808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=35;PP=1287;SC=CCTGAGGGGCCGGCACCCGCC;SOR=1.000;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=27;TCR=35;TR=62;WE=17535554;WS=17535536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr19	17535658	rs4808637	A	C	3417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=70;NR=47;PP=1995;SC=CTAAGTACCCACTCTGCCATT;SOR=0.933;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=70;TCR=47;TR=117;WE=17535666;WS=17535648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr19	17544039	rs62125232	C	T	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.197;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=165;ReadPosRankSum=2.148;SC=ACTGTCCACACCCTAGAACAT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=8;WE=17544047;WS=17544029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr19	17544165	rs10415889	C	T	3990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=60;PP=2256;SC=AGATCACCTCCGTTTGTAAAG;SOR=0.719;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=76;TCR=60;TR=136;WE=17544173;WS=17544155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr19	17544244	rs34189069	C	T	1324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.351;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=32;PP=803;ReadPosRankSum=-1.005;SC=CTCTGAAAGCCGCACGCCAAA;SOR=0.921;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=105;TCF=49;TCR=56;TR=55;WE=17544252;WS=17544234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,62:0.52:119
chr19	17544375	rs55761990	G	A	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.767;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=84;ReadPosRankSum=1.017;SC=TCCCCTTCCAGGCAGTGCAGA;SOR=0.368;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=7;WE=17544383;WS=17544365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr19	17547292	rs4808641	A	G	1639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=19;PP=834;SC=GTCCTTCCCCATGCTCCCTGG;SOR=1.044;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=35;TCR=19;TR=54;WE=17547300;WS=17547282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr19	17556054	rs3810209	A	G	3109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=63;PP=1897;SC=CAAGGGCCACATGTCTGAGGA;SOR=1.131;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=44;TCR=63;TR=107;WE=17556062;WS=17556044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr19	17559076	rs4808643	T	C	3317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=54;NR=56;PP=1879;SC=GGCAGCAGCGTCCCGGCCGCG;SOR=0.848;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=54;TCR=56;TR=110;WE=17559084;WS=17559066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr19	17571200	rs12984622	A	G	404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=2;PP=317;SC=CATGGAAGCCAGCATGTGGAA;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=17571208;WS=17571190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
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chr19	17571766	rs890839	A	G	637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=16;PP=444;SC=AAATCTTTAGAAAACCAGCTT;SOR=3.160;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=17571774;WS=17571756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	17597830	rs12979251	G	T	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.421;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=7;PP=137;ReadPosRankSum=-1.319;SC=CGGGCGGGGAGATGCTGCGCC;SOR=1.058;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=35;TCF=17;TCR=18;TR=12;WE=17597838;WS=17597820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,11:0.31:35
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chr19	17608516	rs11672333	T	C	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=42;ReadPosRankSum=1.645;SC=AGTTGGAGGATAGGTATGGCT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=17608524;WS=17608506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
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chr19	17644224	.	CAA	C	63	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.7042;HP=20;HapScore=3;MGOF=24;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=4;NR=1;PP=63;QD=13.2;SC=GTCTCAAAAACAAAAAAAAAA;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=5;WE=17644235;WS=17644214;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr19	17648350	rs8107859	T	C	744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=19;PP=548;SC=CTTCAGGGCATAGGTGGGTCT;SOR=2.584;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=24;WE=17648358;WS=17648340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	17651370	rs11878663	A	G	1560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.927;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=29;PP=996;ReadPosRankSum=1.061;SC=AGAGCCCCTCAGGCACGCGGC;SOR=1.079;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=136;TCF=78;TCR=58;TR=71;WE=17651378;WS=17651360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,77:0.53:145
chr19	17660300	rs11666267	G	A	3325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.341;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=53;PP=1917;ReadPosRankSum=-1.211;SC=CACTCTGGACGGCTGCTTGGA;SOR=0.861;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=259;TCF=143;TCR=116;TR=129;WE=17660308;WS=17660290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,153:0.53:291
chr19	17666636	rs7259723	C	T	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=177;ReadPosRankSum=0.242;SC=ACGCCTACTTCCCCGAGGAGC;SOR=0.807;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=14;WE=17666644;WS=17666626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr19	17679597	rs3848645	A	G	1046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=24;PP=503;ReadPosRankSum=-0.077;SC=CCAGTTCAGAACACACTGAAG;SOR=0.763;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=76;TCF=27;TCR=49;TR=38;WE=17679605;WS=17679587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,47:0.55:86
chr19	17691751	rs891184	C	T	918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.991;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=29;PP=682;ReadPosRankSum=0.676;SC=TGGGGTTTCACGGTGGGTCTG;SOR=1.071;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=74;TCF=22;TCR=52;TR=40;WE=17691759;WS=17691741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,41:0.52:79
chr19	17692324	rs8100092	T	G	1695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.120;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=39;PP=1003;ReadPosRankSum=-0.535;SC=GGACATCAGGTCCACCTCTGG;SOR=0.514;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=136;TCF=62;TCR=74;TR=76;WE=17692332;WS=17692314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,81:0.56:145
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chr19	17734488	rs10419420	A	G	243.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=5;PP=143;SC=CCAGCCCAGAAGAGGTGGAAG;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=8;WE=17734496;WS=17734478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	17739976	rs11667290	T	C	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.918;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.282;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=101;ReadPosRankSum=0.143;SC=GTCAGGGCCCTGGGGAGAAGG;SOR=0.105;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=7;WE=17739984;WS=17739966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr19	17741047	rs10413821	A	G	1549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.636;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=29;PP=1034;ReadPosRankSum=1.409;SC=GTTGGGAGAAAACATCCACCA;SOR=0.723;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=124;TCF=65;TCR=59;TR=65;WE=17741055;WS=17741037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,70:0.52:135
chr19	17746940	rs77267738	C	T	1553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FS=1.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.42;ReadPosRankSum=0.089;SOR=0.577;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,74:0.45:165
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chr19	17750183	rs11882798	T	C	960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.855;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=18;PP=569;ReadPosRankSum=-0.043;SC=TCACTTGTCCTGGGAGCTGGG;SOR=1.020;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=93;TCF=53;TCR=40;TR=47;WE=17750191;WS=17750173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,48:0.47:102
chr19	17750207	rs11879994	C	A	1175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.316;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=26;PP=793;ReadPosRankSum=-1.493;SC=CCTAGAGAACCCTCCTTGGAG;SOR=0.760;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=112;TCF=60;TCR=52;TR=58;WE=17750215;WS=17750197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,58:0.48:121
chr19	17760561	rs11665951	C	T	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.122;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=34;ReadPosRankSum=0.431;SC=GGTGACCTTACTTGGAAACGG;SOR=0.527;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=5;WE=17760569;WS=17760551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr19	17763392	rs1159365	A	G	2078.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.922;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=47;PP=1300;ReadPosRankSum=-0.718;SC=CCAGCCTTGGACTTGGGGTTC;SOR=0.512;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=216;TCF=118;TCR=98;TR=99;WE=17763400;WS=17763382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,108:0.46:233
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chr19	17769166	rs7258943	C	T	712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=17;PP=444;SC=CTTACGGTGCCGCTACCGAAG;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=17769174;WS=17769156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
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chr19	17844229	rs114901293	G	C	1488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=31;PP=1042;ReadPosRankSum=0.559;SC=TTGGGACCGTGACCTGCAGGT;SOR=0.733;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=146;TCF=80;TCR=66;TR=67;WE=17844237;WS=17844219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,71:0.44:161
chr19	17844325	rs2287860	T	C	1341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.704;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=31;PP=726;ReadPosRankSum=-1.136;SC=TAAGCTGTGTTCCCCAGGCCA;SOR=0.826;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=46;TCR=59;TR=56;WE=17844333;WS=17844315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,65:0.55:118
chr19	17881171	rs12327667	G	A	890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.619;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.072;NF=23;NR=18;PP=496;ReadPosRankSum=0.022;SC=CTGACATCACGTGGAGTGTTT;SOR=0.538;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=87;TCF=52;TCR=35;TR=41;WE=17881179;WS=17881161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,47:0.47:99
chr19	17881552	rs3746197	C	T	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.965;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=249;ReadPosRankSum=-1.796;SC=CTGGGGGAGGCCCCCTGAGTA;SOR=1.012;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=32;TCF=19;TCR=13;TR=15;WE=17881560;WS=17881542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr19	17885270	rs2287859	A	G	813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=22;PP=511;ReadPosRankSum=0.060;SC=AGCGGGAGCCAGAGCCACCTG;SOR=0.720;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=71;TCF=27;TCR=44;TR=34;WE=17885278;WS=17885260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,39:0.49:80
chr19	17885308	rs2287858	G	A	697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.722;HP=3;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=340;ReadPosRankSum=-0.082;SC=ACCCCTGCCCGGTCTGGCCCA;SOR=0.371;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=38;TCF=6;TCR=32;TR=20;WE=17885316;WS=17885298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,22:0.55:40
chr19	17885325	rs2287857	A	C	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.802;HP=2;HapScore=4;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=317;ReadPosRankSum=-0.154;SC=CCCAGGCTAGACCGAGATCCC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=14;WE=17885344;WS=17885315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr19	17885336	rs2287856	C	T	826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=20;PP=603;SC=CCGAGATCCCCTCCCCTGCCC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=17885344;WS=17885315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	17886940	rs2287854	G	A	2179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.559;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=44;PP=1431;ReadPosRankSum=-0.179;SC=GGGCCACCGCGGGCAGCCTCA;SOR=0.751;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=160;TCF=81;TCR=79;TR=89;WE=17886948;WS=17886930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,96:0.55:173
chr19	17887024	rs2287853	T	C	6516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=124;NR=99;PP=2965;SC=GCTGGATGCATTCGTGTGTGA;SOR=0.830;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=224;TCF=125;TCR=99;TR=223;WE=17887032;WS=17887014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr19	17887563	rs13345379	G	A	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=-0.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.480;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=102;ReadPosRankSum=-0.886;SC=CCATGTCTCCGCCTGGTGTTC;SOR=1.071;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=10;WE=17887571;WS=17887553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr19	17888787	rs4808690	G	A	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=47;ReadPosRankSum=-0.921;SC=AGCGGAGGTTGCAGCAAGCTG;SOR=0.330;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=6;WE=17888795;WS=17888777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr19	17889044	rs34062212	G	A	576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=16;PP=323;ReadPosRankSum=-0.491;SC=ACAGGTGATGGGGATAAGGGA;SOR=0.756;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=61;TCF=27;TCR=34;TR=28;WE=17889052;WS=17889034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,30:0.45:66
chr19	17892193	rs2287852	G	C	4171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=81;NR=60;PP=2665;SC=TGGGGGTCGCGTCTGGGGTCC;SOR=0.915;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=141;TCF=81;TCR=60;TR=141;WE=17892201;WS=17892183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr19	17892478	rs2042299	A	G	965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=13;PP=629;SC=CTATATTCACACTGTCTATCC;SOR=1.002;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=19;TCR=13;TR=32;WE=17892486;WS=17892468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	17892591	rs2042298	A	G	4065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=82;NR=51;PP=1917;SC=CAGCCTTCACAGAGTATGTCC;SOR=0.811;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=82;TCR=51;TR=133;WE=17892599;WS=17892581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr19	17894878	rs265558	C	T	1412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.603;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=24;PP=720;ReadPosRankSum=0.771;SC=GGGCATGTCCCGAGGATTGGG;SOR=0.627;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=74;TCR=52;TR=58;WE=17894886;WS=17894868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,71:0.48:149
chr19	17898717	rs265553	G	A	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=1.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.72;ReadPosRankSum=-1.056;SOR=0.289;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,8:0.22:36
chr19	17931077	rs10410852	A	G	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.79;ReadPosRankSum=0.253;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr19	17937429	rs3008	A	G	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=3.389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.34;ReadPosRankSum=-1.827;SOR=0.273;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,13:0.30:43
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chr19	17941937	rs3212777	A	G	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.191;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=268;ReadPosRankSum=-0.268;SC=GGGCGGGGCTAAGGCTGGGGA;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=12;WE=17941945;WS=17941927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
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chr19	17948732	rs3212752	T	C	2744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.267;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=55;PP=1632;ReadPosRankSum=1.396;SC=TGGTCCACATTGCTCTCACCT;SOR=0.925;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=304;TCF=167;TCR=137;TR=133;WE=17948740;WS=17948722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:190,142:0.43:332
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chr19	17952185	rs3212733	G	T	1631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.592;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=28;PP=1004;ReadPosRankSum=-0.161;SC=GGGAATGGGGGACAGGTCCTT;SOR=0.787;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=155;TCF=94;TCR=61;TR=75;WE=17952193;WS=17952175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,79:0.49:161
chr19	17952609	rs3212730	T	G	562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.076;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=20;PP=435;ReadPosRankSum=2.189;SC=GGGGCCCAGCTGGACCCCGCC;SOR=1.345;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=59;TCF=17;TCR=42;TR=25;WE=17952617;WS=17952599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,25:0.40:63
chr19	17955001	rs3212713	C	T	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.87;ReadPosRankSum=-1.313;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
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chr19	17955021	rs3212711	G	A	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=49;ReadPosRankSum=-0.409;SC=CCTCTGGCCCGATCCACTAGG;SOR=0.495;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=7;WE=17955029;WS=17955011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr19	17973862	rs73020697	G	C	832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.987;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=8;PP=466;ReadPosRankSum=-0.141;SC=GACTCCCCTGGAGGGAAGTGC;SOR=0.929;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=58;TCF=41;TCR=17;TR=32;WE=17973870;WS=17973852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,38:0.58:66
chr19	17983561	rs740695	C	T	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.921;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=18;PP=426;ReadPosRankSum=1.310;SC=GGCGCTGGGGCTTTGGGCCGC;SOR=0.377;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=22;WE=17983569;WS=17983551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,25:0.66:38
chr19	18047283	rs4808722	T	G	2153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.638;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=41;PP=1469;ReadPosRankSum=0.982;SC=CCCGGGCACGTAGGGCAGAGG;SOR=0.563;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=203;TCF=123;TCR=80;TR=96;WE=18047291;WS=18047273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,106:0.46:229
chr19	18047521	rs12151269	C	T	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.978;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=366;ReadPosRankSum=0.626;SC=CAGGCGCTGTCGCTCACGCCT;SOR=1.349;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=45;TCF=12;TCR=33;TR=23;WE=18047529;WS=18047511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,23:0.52:44
chr19	18053340	rs4808105	T	C	100.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=1;PP=72;SC=TTGTTCCTGGTATGTCCCCTG;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=18053348;WS=18053331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	18053364	rs7249080	G	C	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.152;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=79;ReadPosRankSum=-1.005;SC=CCAGCACAGAGCCTAAATCCT;SOR=0.627;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=7;WE=18053372;WS=18053354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr19	18054643	rs1052564	C	T	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=173;ReadPosRankSum=-0.200;SC=CGCCGGGCCCCGGGGCCATGC;SOR=0.420;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=12;WE=18054651;WS=18054633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr19	18110890	rs4808110	C	T	687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.983;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=19;PP=432;ReadPosRankSum=-0.014;SC=AGGGATCACACTGGAGTCTTT;SOR=0.874;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=59;TCF=21;TCR=38;TR=28;WE=18110898;WS=18110880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,32:0.48:66
chr19	18110994	rs4808733	T	C	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=43;ReadPosRankSum=0.967;SC=ACCCAGGGTTTGGTTAAGGAA;SOR=0.527;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=5;WE=18111002;WS=18110984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr19	18119399	rs28597966	G	A	1624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.536;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=34;PP=1046;ReadPosRankSum=-0.055;SC=GCCAGGTACGGATGGAGGACC;SOR=0.534;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=176;TCF=98;TCR=78;TR=73;WE=18119407;WS=18119389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,79:0.42:188
chr19	18119678	rs2305738	C	A	1015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.449;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=21;PP=746;ReadPosRankSum=-0.168;SC=CTCTGAGCCCCAAGACTCTCC;SOR=0.348;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=74;TCF=42;TCR=32;TR=43;WE=18119686;WS=18119668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,44:0.57:77
chr19	18123617	rs7255640	A	G	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=314;ReadPosRankSum=0.390;SC=TGATGGCCTCATCCCTGGTCA;SOR=0.804;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=40;TCR=18;TR=22;WE=18123625;WS=18123607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,25:0.38:65
chr19	18123738	rs7259041	T	C	1649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.847;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=39;PP=1067;ReadPosRankSum=1.710;SC=CCAAACCCACTCTTGGGGGAC;SOR=0.564;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=161;TCF=79;TCR=82;TR=78;WE=18123746;WS=18123728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,83:0.47:177
chr19	18170265	rs3833286	T	TC	352.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=350;ReadPosRankSum=-1.971;SC=CATCTAGGGTTCCCCCGCAGG;SOR=1.085;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=11;WE=18170273;WS=18170255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,14:0.78:18
chr19	18170384	rs3746190	G	A	1956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=28;PP=1306;ReadPosRankSum=1.326;SC=ACGTAGCCTCGGGCGAGTCAC;SOR=0.724;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=151;TCF=95;TCR=56;TR=79;WE=18170392;WS=18170374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,88:0.53:167
chr19	18170657	rs12461312	C	A	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.500;HP=5;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=9;PP=324;ReadPosRankSum=0.724;SC=CCCCACCCCCCGGGCAGGGTT;SOR=0.409;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=45;TCF=29;TCR=16;TR=23;WE=18170665;WS=18170647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,26:0.55:47
chr19	18170680	rs17882555	G	A	753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.928;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=11;PP=373;ReadPosRankSum=1.260;SC=ACCCCTGACCGTCTGGCCCAC;SOR=0.494;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=62;TCF=40;TCR=22;TR=29;WE=18170688;WS=18170670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,35:0.50:70
chr19	18170962	rs1870063	C	T	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.479;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=357;ReadPosRankSum=0.618;SC=CAGGATGGAACGGACCAGGTC;SOR=3.426;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=17;WE=18170970;WS=18170952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
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chr19	18180451	rs375947	A	G	1881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.081;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=36;PP=1012;ReadPosRankSum=-1.852;SC=GCAATACGTCATGCTCTGAGC;SOR=0.602;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=183;TCF=106;TCR=77;TR=85;WE=18180459;WS=18180441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,98:0.48:206
chr19	18180646	rs391410	G	A	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-3.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=98;ReadPosRankSum=-0.402;SC=AGGGCCAGGGGTGTCTGTGTT;SOR=0.481;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=7;WE=18180654;WS=18180636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr19	18186575	rs17852635	G	A	1690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.219;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=30;PP=1007;ReadPosRankSum=-0.787;SC=GAACGCACACGGGGCTGCTCC;SOR=0.583;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=146;TCF=85;TCR=61;TR=72;WE=18186583;WS=18186565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,82:0.50:165
chr19	18186618	rs11575934	T	C	1567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.595;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=22;PP=877;ReadPosRankSum=-1.409;SC=GCTCCCCAGCTGCCGTCGTCG;SOR=0.750;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=141;TCF=88;TCR=53;TR=62;WE=18186626;WS=18186608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,70:0.44:160
chr19	18186752	rs429774	T	C	2141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.970;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=60;PP=1216;ReadPosRankSum=0.514;SC=AACCATCATGTGCTTATTGAG;SOR=0.787;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=238;TCF=113;TCR=125;TR=109;WE=18186760;WS=18186742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,111:0.43:256
chr19	18188408	rs11575926	C	T	2013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.523;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=35;PP=1122;ReadPosRankSum=0.414;SC=CCACTCCATACGCAGCTGCCC;SOR=0.616;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=179;TCF=107;TCR=72;TR=86;WE=18188416;WS=18188398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,100:0.50:200
chr19	18193191	rs2305743	G	A	913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=31;PP=675;ReadPosRankSum=0.633;SC=AACCCTCCCCGCGTCCTTCCT;SOR=0.697;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=93;TCF=31;TCR=62;TR=46;WE=18193199;WS=18193181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,44:0.47:94
chr19	18197635	rs436857	G	A	3685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=61;PP=2289;ReadPosRankSum=1.053;SC=CGGCTCCATCGGATCCACGTA;SOR=0.672;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=274;TCF=166;TCR=108;TR=158;WE=18197643;WS=18197625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,170:0.57:298
chr19	18197744	rs393548	T	A	3058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.353;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=84;PP=2077;ReadPosRankSum=0.432;SC=GAGAAAAGACTGAAAAAAAAG;SOR=0.891;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=260;TCF=107;TCR=153;TR=137;WE=18197752;WS=18197734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,141:0.52:270
chr19	18218444	rs62123561	A	G	2501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.008;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=49;PP=1564;ReadPosRankSum=-0.649;SC=TTCACCTGGGACTGGCGGGCT;SOR=0.597;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=216;TCF=118;TCR=98;TR=106;WE=18218452;WS=18218432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,116:0.50:232
chr19	18218610	rs67234314	A	T	1000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.139;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=25;PP=679;ReadPosRankSum=0.336;SC=CAAACATGGGAGGCCATGCCA;SOR=0.271;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=68;TCF=21;TCR=47;TR=39;WE=18218618;WS=18218600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,43:0.57:75
chr19	18232778	rs273483	A	G	2273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=51;PP=1467;ReadPosRankSum=-2.027;SC=ACCACGGGCAAGGGTTGGGCA;SOR=1.255;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=37;TCR=51;TR=87;WE=18232786;WS=18232768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,91:0.98:93
chr19	18233279	rs273486	C	G	254.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=152;SC=GGCAGCTGGACTCACGGGGGG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=6;WE=18233291;WS=18233269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	18233283	rs55849352	C	CG	60.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=48;ReadPosRankSum=0.144;SC=GCTGGACTCACGGGGGGGCTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=3;WE=18233291;WS=18233269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr19	18234441	rs740691	C	T	2035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.523;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=41;PP=1017;ReadPosRankSum=-0.102;SC=TGATGAATCACGTGTACCGGG;SOR=0.628;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=165;TCF=86;TCR=79;TR=84;WE=18234449;WS=18234431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,102:0.52:197
chr19	18235352	rs123202	T	G	1350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=8;PP=883;SC=GGAGACCCAGTGGGTGAGCTG;SOR=2.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=36;WE=18235360;WS=18235342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	18235424	rs123203	T	C	4694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=63;PP=2693;SC=AACCAAGCCCTGGGTGACCAG;SOR=1.312;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=163;TCF=100;TCR=63;TR=162;WE=18235432;WS=18235414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr19	18242675	rs273497	C	T	416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.52;SOR=3.383;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	18245512	rs2270623	C	T	2744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.430;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=58;PP=1536;ReadPosRankSum=1.572;SC=GAGAGTTCATCGACAAGCAGG;SOR=0.655;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=257;TCF=132;TCR=125;TR=118;WE=18245520;WS=18245502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,134:0.47:285
chr19	18245807	rs12983325	C	T	940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.35;ReadPosRankSum=-1.240;SOR=0.758;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,51:0.40:128
chr19	18245813	rs273499	T	C	3729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.01;SOR=1.129;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr19	18248146	rs541225	T	C	13996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=537;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=241;NR=244;PP=2965;SC=AGCTCGAAGCTGAGGATGATA;SOR=0.774;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=485;TCF=241;TCR=244;TR=485;WE=18248154;WS=18248136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,537:1.00:537
chr19	18252829	rs613339	A	G	3307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=57;NR=61;PP=1938;SC=ACATCCGGTAAGTGGCCTGGG;SOR=0.862;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=58;TCR=61;TR=118;WE=18252837;WS=18252819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr19	18255359	rs8108738	G	A	1219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.717;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=25;PP=766;ReadPosRankSum=0.773;SC=TCTGGATGCCGGCCGGGGCCG;SOR=0.616;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=95;TCF=51;TCR=44;TR=52;WE=18255367;WS=18255349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,58:0.55:106
chr19	18256418	rs11305984	TC	T	970.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=1;PP=988;SC=GAGTAGGAGTTCCCCCAGGAT;SOR=4.615;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=35;TCF=33;TCR=2;TR=28;WE=18256426;WS=18256416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	18257750	rs2072490	C	T	1892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.996;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=41;PP=1100;ReadPosRankSum=-0.193;SC=TCAAGGTGGGCCCCGCCCGGA;SOR=0.525;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=137;TCF=65;TCR=72;TR=79;WE=18257758;WS=18257740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,90:0.56:161
chr19	18257875	rs273279	C	T	366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=303;SC=GGCGGGGCCACGGGGACTGGG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=18257883;WS=18257865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	18258459	rs1566030	A	G	586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=15;PP=435;SC=ACCCCCCACCACCCCGGCTAC;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=18258467;WS=18258449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	18272190	rs2241088	A	C	113.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=2;PP=43;SC=CCGCGTGGCCAGCCGCGCCCC;SOR=1.022;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=4;WE=18272198;WS=18272180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	18273047	rs1011320	T	C	1695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=19;PP=1010;SC=AAAGCCGGCCTCCACAGTCCT;SOR=1.085;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=32;TCR=19;TR=51;WE=18273055;WS=18273037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr19	18273410	rs2006885	A	G	601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=14;PP=408;SC=TCAAGAATGGAGGGCCAGGCA;SOR=2.531;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=18;WE=18273418;WS=18273400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	18276856	rs4808755	T	C	105.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.18;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	18277206	rs3730179	G	A	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=133;ReadPosRankSum=-0.243;SC=CAGCCACTTGGAGGCAAAGAG;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=7;WE=18277214;WS=18277196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr19	18279638	rs273269	T	C	6667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=126;NR=94;PP=2965;SC=AGATGCTGAGTGGCAAGCGGG;SOR=0.792;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=223;TCF=128;TCR=95;TR=220;WE=18279646;WS=18279628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr19	18279816	rs3746187	A	G	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.097;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=11;PP=325;ReadPosRankSum=0.568;SC=CATCCGGGACAGGGGAGCACG;SOR=0.882;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=48;TCF=21;TCR=27;TR=19;WE=18279824;WS=18279806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,20:0.41:49
chr19	18285944	rs11554159	G	A	2790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.352;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=61;PP=1656;ReadPosRankSum=-0.251;SC=GGTGGCTGCCGAGCCTTCCTG;SOR=0.779;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=277;TCF=139;TCR=138;TR=121;WE=18285952;WS=18285934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,140:0.45:309
chr19	18286546	rs200373	T	A	959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.957;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=22;PP=535;ReadPosRankSum=0.385;SC=GAGGGGGACATGGGTGGTAAC;SOR=1.094;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=72;TCF=31;TCR=41;TR=35;WE=18286554;WS=18286536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,44:0.52:84
chr19	18287907	rs140154009	C	T	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=237;ReadPosRankSum=1.927;SC=GTTGAGATAACGGGGAGGAAG;SOR=0.862;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=53;TCF=41;TCR=12;TR=21;WE=18287915;WS=18287897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,22:0.41:54
chr19	18288069	rs7125	A	G	1799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.033;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=44;PP=1029;ReadPosRankSum=-1.671;SC=TCCAGCCACCACACGAGTATG;SOR=0.917;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=226;TCF=116;TCR=110;TR=85;WE=18288077;WS=18288059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,98:0.38:257
chr19	18304700	rs874628	A	G	1657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.538;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=32;PP=942;ReadPosRankSum=-0.718;SC=GGGCTGCAGCATGGGTCCCTT;SOR=0.768;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=185;TCF=109;TCR=76;TR=82;WE=18304708;WS=18304690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,87:0.45:194
chr19	18305578	rs16982263	G	C	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.769;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=113;ReadPosRankSum=0.088;SC=TTCTTGGTTTGCTTCCCAGGC;SOR=1.536;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=24;TCF=15;TCR=9;TR=9;WE=18305586;WS=18305568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr19	18305824	rs2271881	C	T	2293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.898;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=51;PP=1415;ReadPosRankSum=0.513;SC=TCGTGCCCCCCCAATTTCGAG;SOR=0.631;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=267;TCF=149;TCR=118;TR=117;WE=18305832;WS=18305814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,127:0.43:292
chr19	18307108	rs1044821	C	T	3030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.788;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=72;PP=1804;ReadPosRankSum=0.113;SC=GAACCTCATGCGACCTGTGAC;SOR=0.800;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=305;TCF=149;TCR=156;TR=133;WE=18307116;WS=18307098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:190,150:0.44:340
chr19	18309365	rs2271882	A	G	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.054;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=188;ReadPosRankSum=1.121;SC=TCTGCATGGCAAACTCCTACA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=13;WE=18309373;WS=18309355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,13:0.37:35
chr19	18322095	rs12611244	G	A	1424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=37;PP=1071;SC=ACCTGTGGCGGGGGGTGGGGC;SOR=3.564;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=6;TCR=37;TR=43;WE=18322103;WS=18322085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr19	18324329	rs2302209	C	T	669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=17;PP=327;ReadPosRankSum=0.414;SC=AGGTGACAGGCGCGAGGACCC;SOR=0.651;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=64;TCF=23;TCR=41;TR=28;WE=18324337;WS=18324319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,33:0.47:70
chr19	18329240	rs1042050	T	C	3130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FS=0.943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.77;ReadPosRankSum=-1.067;SOR=0.770;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,151:0.57:266
chr19	18331357	rs5827400	AC	A	559.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.184;NF=1;NR=21;PP=444;ReadPosRankSum=0.169;SC=GGCCTGCCCAACCCCCCCGCT;SOR=0.793;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=52;TCF=2;TCR=50;TR=22;WE=18331365;WS=18331347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,25:0.43:58
chr19	18344273	rs35421958	AC	A	5844.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.332;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.226;NF=15;NR=93;PP=2084;ReadPosRankSum=0.202;SC=GGCTGAAGAGACCCCCCCCCA;SOR=0.271;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=118;TCF=16;TCR=102;TR=108;WE=18344282;WS=18344263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,203:0.98:207
chr19	18358783	rs4808122	A	G	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-1.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.318;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=110;ReadPosRankSum=-2.267;SC=ACACCTGTCCAGGTTCAGCAG;SOR=0.260;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=9;WE=18358791;WS=18358773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr19	18368810	rs999813	G	T	2449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.088;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=49;PP=1379;ReadPosRankSum=0.115;SC=CCGCCTGGGAGGCACCACCGC;SOR=0.544;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=194;TCF=100;TCR=94;TR=105;WE=18368818;WS=18368800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,117:0.55:212
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chr19	18375846	rs2277921	G	A	2572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.443;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=58;PP=1532;ReadPosRankSum=-1.005;SC=GGGTGCCATCGGCGGCACCAG;SOR=0.739;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=247;TCF=117;TCR=130;TR=110;WE=18375854;WS=18375836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,124:0.45:273
chr19	18375882	rs12608777	G	C	2177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.486;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=50;PP=1147;ReadPosRankSum=1.181;SC=ACAGGCTGCCGGGCATGGTCC;SOR=0.743;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=208;TCF=102;TCR=106;TR=97;WE=18375890;WS=18375872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,108:0.48:226
chr19	18376407	rs8110972	T	A	2980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.468;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=61;PP=1919;ReadPosRankSum=-1.220;SC=TACAGGCACATACACGTGAGG;SOR=0.740;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=225;TCF=125;TCR=100;TR=132;WE=18376415;WS=18376397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,142:0.57:247
chr19	18376517	rs61740752	C	T	4831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FS=5.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.13;ReadPosRankSum=0.867;SOR=0.649;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:114,126:0.52:240
chr19	18376522	rs2277922	T	G	4764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FS=3.608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.10;ReadPosRankSum=0.853;SOR=0.624;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:113,124:0.52:237
chr19	18377274	rs3746186	A	G	1733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.599;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=30;PP=845;ReadPosRankSum=-1.469;SC=GGTGGTGGTCATCGTGGACGC;SOR=0.612;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=137;TCF=74;TCR=63;TR=72;WE=18377282;WS=18377264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,84:0.55:153
chr19	18377496	rs8104533	C	G	5120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=490;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=114;NR=110;PP=2962;ReadPosRankSum=0.599;SC=GGTCCGGGCACTTACACGTTT;SOR=0.677;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=440;TCF=223;TCR=217;TR=224;WE=18377504;WS=18377486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:240,248:0.51:488
chr19	18377647	rs8103906	G	C	1852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.605;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=42;PP=1256;ReadPosRankSum=-0.029;SC=AGGAAGGCCAGCCCCCGGACT;SOR=0.786;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=144;TCF=65;TCR=79;TR=75;WE=18377655;WS=18377637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,82:0.54:153
chr19	18377761	rs12609001	A	G	1747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=36;PP=1132;ReadPosRankSum=-1.377;SC=AGATTGTCACAGGAAGGGAAC;SOR=0.651;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=181;TCF=98;TCR=83;TR=79;WE=18377769;WS=18377751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,86:0.44:197
chr19	18378219	rs1469023	A	G	2111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.695;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=44;PP=1301;ReadPosRankSum=-0.753;SC=CATTTTGTCCAGGAGACTGGG;SOR=0.574;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=208;TCF=108;TCR=100;TR=96;WE=18378227;WS=18378209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,106:0.47:227
chr19	18391171	rs7249	C	T	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=103;ReadPosRankSum=1.198;SC=GCACCCTCTCCAAGTCCGGGG;SOR=1.688;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=6;WE=18391179;WS=18391161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr19	18392873	rs7247222	C	A	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.83;ReadPosRankSum=-2.871;SOR=0.922;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,27:0.46:59
chr19	18420704	rs2227270	C	A	2713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=57;PP=1747;SC=ATTAACTTACCACCGGGCCGT;SOR=1.306;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=37;TCR=57;TR=94;WE=18420712;WS=18420694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr19	18423402	rs2232968	T	C	7688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=150;NR=98;PP=2965;SC=CGTTGGTGGGTGCAGCACCCA;SOR=1.143;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=248;TCF=150;TCR=98;TR=248;WE=18423410;WS=18423392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,286:1.00:286
chr19	18426950	rs2232965	T	C	2345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=48;PP=1295;SC=GTCCCACCCATGACTCATAGA;SOR=1.295;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=32;TCR=48;TR=80;WE=18426958;WS=18426940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr19	18451381	rs7251555	A	T	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=120;ReadPosRankSum=-0.293;SC=ACCGGGGGCGAGGCCGGGGGC;SOR=0.627;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=11;WE=18451389;WS=18451371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr19	18453629	rs66732430	G	A	1493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.171;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=25;PP=814;ReadPosRankSum=1.140;SC=ACTGGGAAGGGCCACTCTTGG;SOR=0.433;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=121;TCF=78;TCR=43;TR=64;WE=18453637;WS=18453619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,72:0.54:134
chr19	18466840	rs34068189	C	T	1963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.215;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=52;PP=1167;ReadPosRankSum=0.371;SC=TGCCAAGGGGCGGCACTTCCT;SOR=0.804;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=159;TCF=59;TCR=100;TR=83;WE=18466848;WS=18466830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,91:0.52:176
chr19	18497024	rs1059519	G	C	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.820;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=250;ReadPosRankSum=-2.204;SC=ACTCAGGACGGTGAATGGCTC;SOR=0.223;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=17;WE=18497032;WS=18497014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr19	18497141	rs1059369	T	A	2225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.478;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=42;PP=1099;ReadPosRankSum=-0.316;SC=AGAGTTGCACTCCGAAGACTC;SOR=0.730;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=203;TCF=112;TCR=91;TR=96;WE=18497149;WS=18497131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,113:0.49:230
chr19	18499238	rs1804826	G	T	2274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=34;PP=1269;ReadPosRankSum=0.214;SC=TGACACGACCGCTGCGGCGTC;SOR=0.732;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=170;TCF=104;TCR=66;TR=91;WE=18499246;WS=18499228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,105:0.55:191
chr19	18499780	rs1227733	A	G	3526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.62;SOR=1.732;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr19	18499780	.	AGGAC	GGGAC,GGGAG	702	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000,0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=28,14;NR=56,30;PP=298,702;QD=3.96156205413;SC=ACCTGCGCGGAGGACGCGACC;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=28;TCR=56;TR=84,44;WE=18499792;WS=18499770;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:84
chr19	18499784	rs1055150	C	G	1128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.54;ReadPosRankSum=-0.596;SOR=0.616;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,50:0.56:90
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chr19	18541579	rs11395316	G	GA	3307.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=19;PP=1722;SC=CTGCAGAGAGGGGGGGCACAC;SOR=1.582;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=56;TCF=37;TCR=19;TR=52;WE=18541596;WS=18541569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr19	18544149	rs12972236	G	A	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=107;ReadPosRankSum=-0.161;SC=CCCCCCGGGGGCCGCTCAGTG;SOR=0.542;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=9;WE=18544157;WS=18544139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr19	18544498	rs2544723	A	C	1006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.76;SOR=2.737;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
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chr19	18544505	rs2544724	G	C	1375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.31;SOR=2.115;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	18544677	rs78783575	G	GC	3368.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=49;PP=2692;ReadPosRankSum=0.494;SC=GGCCGGAGGGGCTGGCGGGCA;SOR=0.788;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=59;TCF=9;TCR=50;TR=58;WE=18544685;WS=18544667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,130:0.98:132
chr19	18650278	rs7247733	T	C	3012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=62;NR=36;PP=1551;SC=GCCTGGGGTGTGTGGGGATAG;SOR=0.941;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=99;TCF=63;TCR=36;TR=98;WE=18650286;WS=18650268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr19	18652844	rs10854166	A	G	2897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=49;PP=1563;SC=AGAATCCTACACAGCCCCTCA;SOR=0.995;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=45;TCR=49;TR=94;WE=18652852;WS=18652834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr19	18675612	rs62137086	T	G	3328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=35;PP=2183;SC=ATGAACAGTCTTCTGGGCCAG;SOR=1.831;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=81;TCR=35;TR=116;WE=18675620;WS=18675602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr19	18675854	rs10692700	G	GGGC	5064.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=59;PP=2972;SC=TGCCACCCCAGCCCAGCTGAC;SOR=1.761;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=75;TCF=4;TCR=71;TR=63;WE=18675862;WS=18675844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr19	18679155	rs1468475	C	T	3826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=42;PP=2553;SC=ACAATAAGTCCTACATCACAG;SOR=1.424;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=122;TCF=80;TCR=42;TR=122;WE=18679163;WS=18679145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr19	18679379	rs7648	C	G	7857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=127;NR=143;PP=2965;SC=CCATGTCCAGCCTGGCTCCCC;SOR=0.871;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=271;TCF=127;TCR=144;TR=270;WE=18679387;WS=18679369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,290:1.00:290
chr19	18684563	rs2302055	C	T	7185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=138;NR=109;PP=2965;SC=AGAAAGGTACCGGGGTTGGGG;SOR=0.918;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=248;TCF=138;TCR=110;TR=247;WE=18684571;WS=18684553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,263:1.00:263
chr19	18685964	rs6554	G	T	2992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=56;PP=1770;SC=CAAATAAGGTGGTTCTTTCCT;SOR=1.049;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=41;TCR=56;TR=97;WE=18685972;WS=18685954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr19	18699489	rs10415257	T	C	104.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.98;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	18699990	rs2074174	T	C	4738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=65;PP=2704;SC=GGTCCTTGTGTGGCTGCAGAG;SOR=1.083;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=161;TCF=96;TCR=65;TR=160;WE=18699998;WS=18699980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr19	18700047	rs2074175	A	G	8381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=158;NR=110;PP=2965;SC=ACCTTCACGAAAAAGGCCCCA;SOR=0.928;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=269;TCF=158;TCR=111;TR=268;WE=18700055;WS=18700037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,300:1.00:300
chr19	18701499	rs7258589	C	T	709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=5;PP=529;SC=CTGAGAGAGCCTCTAAACTGA;SOR=2.494;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=23;WE=18701507;WS=18701489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	18703077	rs3170474	T	C	564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=18;PP=405;SC=TGGCTGGGGTTGCGCCCCACT;SOR=3.816;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=18703085;WS=18703067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	18704528	rs7256319	C	T	1829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=47;PP=1295;SC=TGCCCCTCTCCGGGCCTTGGC;SOR=2.231;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=15;TCR=47;TR=62;WE=18704536;WS=18704518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr19	18707878	rs7247346	A	C	1789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=45;PP=1337;SC=CAGAGGAGGGACCCTCTCAGC;SOR=2.722;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=60;TCF=13;TCR=47;TR=58;WE=18707886;WS=18707868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr19	18709175	rs35521276	C	T	2429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=14;PP=1582;SC=GTGCAGGGGACCCCTCGGGAT;SOR=2.625;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=62;TCR=14;TR=76;WE=18709183;WS=18709165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr19	18709768	rs8108207	G	A	1164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=30;PP=794;SC=GCTGAGCCTCGGCTGAGGGGT;SOR=2.531;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=9;TCR=30;TR=39;WE=18709776;WS=18709758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr19	18717264	rs113093604	C	T	314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=8;NR=2;PP=186;SC=GTCCAGGTGGCGCCCGCGCCC;SOR=1.445;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=18717272;WS=18717254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	18726856	rs709679	T	C	2352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=50;PP=1151;ReadPosRankSum=-1.313;SC=GCAATGACCTTGTCAACTCAG;SOR=0.692;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=213;TCF=112;TCR=101;TR=108;WE=18726864;WS=18726846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,119:0.51:232
chr19	18728139	.	G	A	980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.251;ClippingRankSum=0.000;DP=387;ExcessHet=3.0103;FS=1.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.53;ReadPosRankSum=1.923;SOR=0.737;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:298,89:0.23:387
chr19	18778445	rs10421503	C	G	1716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.932;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=33;PP=1006;ReadPosRankSum=-1.301;SC=CAGCCACTGCCAGCCACACGT;SOR=0.432;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=124;TCF=72;TCR=52;TR=72;WE=18778453;WS=18778435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,81:0.55:146
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chr19	18858138	rs199625555	C	CA	128.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.509;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=47;ReadPosRankSum=-1.393;SC=CCACTTATGACAAAAAAAAAG;SOR=0.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=4;WE=18858146;WS=18858128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
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chr19	18942888	rs4808161	C	G	755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=6;PP=534;SC=CGCCGGGGCGCGCGGTTTGGT;SOR=1.697;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=25;WE=18942896;WS=18942878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
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chr19	18971322	rs757115	T	C	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=366;ReadPosRankSum=-0.241;SC=ATTCTACTTATTTTTAACATG;SOR=0.468;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=17;WE=18971330;WS=18971312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr19	18974200	rs2238658	A	G	771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=9;PP=394;ReadPosRankSum=0.070;SC=GTCCTGTGAGACGGGCAGCTC;SOR=0.740;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=78;TCF=55;TCR=23;TR=32;WE=18974208;WS=18974190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,39:0.43:91
chr19	18976985	rs73001386	C	G	804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=24;PP=523;ReadPosRankSum=0.274;SC=GGCAAGCCCCCCTGGAGCAGG;SOR=0.766;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=66;TCF=17;TCR=49;TR=32;WE=18976993;WS=18976975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,35:0.49:72
chr19	18979324	rs11673194	A	C	976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=5;PP=543;SC=CCTCCCCACCACCCAGGCAAG;SOR=2.368;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=28;WE=18979332;WS=18979314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	18980172	rs4808863	G	A	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.72;ReadPosRankSum=-1.298;SOR=0.575;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,25:0.58:43
chr19	18980213	rs4808864	A	G	635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=11;NR=10;PP=319;SC=GGGAGGTAGGAACAGGAACTC;SOR=0.941;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=11;TCR=10;TR=21;WE=18980221;WS=18980203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	18989859	rs2075762	G	A	2597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.689;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=56;PP=1591;ReadPosRankSum=0.858;SC=CTGCGAGAGGGGAGGGGAGGT;SOR=0.490;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=258;TCF=120;TCR=138;TR=115;WE=18989867;WS=18989849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,128:0.45:283
chr19	18993503	rs62138063	C	T	104.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=2;PP=23;SC=TATTTATGTACGTGTTTGTTT;SOR=1.022;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=4;WE=18993511;WS=18993493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	19006666	rs3746263	G	C	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.99;ReadPosRankSum=-2.231;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,24:0.71:34
chr19	19011244	rs1127821	T	C	1655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.604;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=55;PP=1037;ReadPosRankSum=-0.606;SC=CCAGCGTCTCTGGGTAGCCAC;SOR=1.631;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=140;TCF=47;TCR=93;TR=74;WE=19011252;WS=19011234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,80:0.53:151
chr19	19016450	rs4808874	G	A	673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=18;PP=408;ReadPosRankSum=0.869;SC=TGCAGGACAGGGCGAGGGGGC;SOR=0.727;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=58;TCF=22;TCR=36;TR=28;WE=19016458;WS=19016440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,30:0.46:65
chr19	19018866	rs758032	A	G	1974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=34;PP=1151;ReadPosRankSum=-0.323;SC=AAGCTTCCTGAGGCTCCAGCA;SOR=0.680;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=141;TCF=80;TCR=61;TR=81;WE=19018874;WS=19018856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,90:0.59:152
chr19	19021970	rs1468461	T	C	2108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=55;PP=1280;ReadPosRankSum=-1.288;SC=AGACAGGAAGTCCCTGCCCCA;SOR=0.736;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=161;TCF=58;TCR=103;TR=86;WE=19021978;WS=19021960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,97:0.54:180
chr19	19022007	rs1468462	C	A	1018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.870;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=27;PP=566;ReadPosRankSum=0.742;SC=CCAGCATGGGCCACCTCCACT;SOR=0.826;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=79;TCF=26;TCR=53;TR=40;WE=19022015;WS=19021997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,46:0.52:88
chr19	19023853	rs3177137	T	C	3765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.396;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=84;PP=2586;ReadPosRankSum=1.386;SC=CTGGGCTTGATAGCTGTGGGA;SOR=0.704;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=319;TCF=162;TCR=157;TR=170;WE=19023861;WS=19023843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,176:0.53:333
chr19	19023881	rs111654958	C	T	2816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.433;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=64;PP=1734;ReadPosRankSum=-0.209;SC=TGAGTCAGGACGCACAGTGGG;SOR=0.641;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=259;TCF=130;TCR=129;TR=130;WE=19023889;WS=19023871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,139:0.49:282
chr19	19032637	rs2231997	T	C	2463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.059;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=55;PP=1293;ReadPosRankSum=-0.104;SC=CTGCCTCTCATGCTCTGTCCC;SOR=0.612;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=199;TCF=105;TCR=94;TR=114;WE=19032645;WS=19032627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,122:0.57:214
chr19	19035159	rs5827425	CT	C	1015.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.327;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.137;NF=0;NR=21;PP=695;ReadPosRankSum=0.278;SC=CCTGGGATACCTTCCCCGCCT;SOR=0.427;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=21;WE=19035167;WS=19035149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,35:0.59:59
chr19	19035354	rs2301659	GC	TT	2867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=16;PP=1993;ReadPosRankSum=0.240;SC=GACTGTCCCGGCCTCCACCCT;SOR=0.705;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=131;TCF=94;TCR=37;TR=59;WE=19035363;WS=19035344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,73:0.51:142
chr19	19037053	rs2301661	T	C	3726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.892;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=74;PP=2215;ReadPosRankSum=-1.277;SC=AGGATCTACCTTTATTCGCCC;SOR=0.618;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=264;TCF=143;TCR=121;TR=159;WE=19037061;WS=19037043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,177:0.59:300
chr19	19037294	rs2301662	G	A	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=3.979;HP=3;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=102;ReadPosRankSum=-1.180;SC=GCCTGCTCCCGTGAGCAGATT;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=6;WE=19037302;WS=19037284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr19	19039908	rs62138076	G	A	657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=8;PP=517;ReadPosRankSum=0.392;SC=ATCTGCAAGCGGCTTATAACT;SOR=0.667;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=51;TCF=38;TCR=13;TR=29;WE=19039916;WS=19039898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,30:0.53:57
chr19	19040312	rs1059240	G	C	2576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=37;PP=1396;SC=GCTCAAACAGGCTGACGTCCA;SOR=0.757;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=42;TCR=37;TR=79;WE=19040320;WS=19040302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr19	19049198	rs1064351	G	A	2642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.555;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=44;PP=1448;ReadPosRankSum=0.521;SC=AGCCCAGGCCGTAGACTGTGT;SOR=0.926;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=224;TCF=129;TCR=95;TR=115;WE=19049206;WS=19049188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,128:0.52:244
chr19	19105773	rs3180770	G	A	4234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=58;PP=2471;SC=ACAGAAAGGAGCCCTGTAAAC;SOR=1.003;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=145;TCF=87;TCR=58;TR=145;WE=19105781;WS=19105763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr19	19135319	rs6511010	A	G	1148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=3;PP=916;SC=TAAAATCCTGATATGTTTCCA;SOR=4.294;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=33;TCR=3;TR=35;WE=19135327;WS=19135309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	19136541	rs4808907	C	T	10907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=397;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=186;NR=176;PP=2965;SC=ACTTGACTGCCGCCCCTAAGC;SOR=0.698;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=363;TCF=186;TCR=177;TR=362;WE=19136549;WS=19136531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,397:1.00:397
chr19	19145193	rs2269806	G	A	1230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=13;NR=29;PP=803;SC=AGATAGAGAAGGTGCGGATAA;SOR=1.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=13;TCR=29;TR=42;WE=19145201;WS=19145183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr19	19150183	rs12979565	C	T	1217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=8;PP=843;SC=AGACTTGAAACAGTCCTCCCA;SOR=2.780;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=30;TCR=8;TR=38;WE=19150191;WS=19150173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr19	19151692	rs8104799	T	C	6503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=115;NR=108;PP=2965;SC=CTACCAGGCATCCCTTAGGGT;SOR=0.734;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=223;TCF=115;TCR=108;TR=223;WE=19151700;WS=19151682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr19	19153801	rs3214143	G	GC	781.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=552;SC=GAAACCAGGTGCCATTGGGCC;SOR=1.708;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=14;WE=19153809;WS=19153791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	19168183	rs7258637	C	T	297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=1;PP=233;SC=GGACCCCACCCCAAAGCCCCA;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=19168191;WS=19168173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	19215612	rs56247515	T	TA	1596.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=10;PP=1393;SC=GGGACAAGATTGGGGGGAAAA;SOR=2.093;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=30;WE=19215620;WS=19215602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr19	19230868	rs756791	A	G	1762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=25;PP=1065;SC=GGCCACCCAGAGCCCCGGCAA;SOR=1.127;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=34;TCR=25;TR=59;WE=19230876;WS=19230858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr19	19243843	rs10414676	T	C	754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.72;SOR=4.514;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	19243843	.	TGTGTCC	CGTGTCC,CGTGTCT	255	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=3;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=19,8;NR=1,1;PP=255,145;QD=14.4885606274;SC=GGGCCGGTCCTGTGTCCCTGA;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20,9;WE=19243857;WS=19243833;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:20
chr19	19243849	rs118087714	C	T	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.25;ReadPosRankSum=-0.228;SOR=0.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr19	19245771	rs3746259	A	G	1111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.814;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=20;PP=462;ReadPosRankSum=-2.278;SC=AACCCAGGCTATTTATAGAGA;SOR=0.565;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=77;TCF=38;TCR=39;TR=43;WE=19245779;WS=19245761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,52:0.59:88
chr19	19327896	rs45519443	T	G	727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.895;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.987;NF=15;NR=16;PP=349;ReadPosRankSum=-0.969;SC=ATGGGGCAGCTTTTGAATTCC;SOR=0.850;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=61;TCF=31;TCR=30;TR=31;WE=19327904;WS=19327886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,37:0.52:71
chr19	19348947	rs12981871	T	C	528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=0;PP=463;SC=GAGGGGTGATTTCGCCCCGCA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=19348955;WS=19348937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	19431423	rs3934667	T	G	1184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=10.062;HP=12;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=65;PP=1274;ReadPosRankSum=-0.381;SC=CGACTGGGTTTTTTTTTTTTT;SOR=2.443;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=88;TCF=20;TCR=68;TR=82;WE=19431431;WS=19431410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:5,54:0.92:59
chr19	19431963	rs12460764	G	T	5578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=93;PP=2965;SC=GGGCCGGGCCGCGAGGGAGGA;SOR=0.907;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=179;TCF=86;TCR=93;TR=179;WE=19431971;WS=19431953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr19	19446936	rs769267	G	A	5688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=110;NR=71;PP=2965;SC=ACTAGATCCCGCAGTTCGAAG;SOR=0.980;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=181;TCF=110;TCR=71;TR=181;WE=19446944;WS=19446926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr19	19449603	rs2074089	G	A	5907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=112;NR=88;PP=2965;SC=GGCAGGTACCGTAAAACTGAT;SOR=0.821;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=201;TCF=113;TCR=88;TR=200;WE=19449611;WS=19449593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr19	19449686	rs2074090	G	T	5941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=106;NR=96;PP=2965;SC=ACCTGGTGTCGGCCTGTGACC;SOR=0.730;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=202;TCF=106;TCR=96;TR=202;WE=19449694;WS=19449676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr19	19451591	rs2965190	A	G	4500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=71;PP=2388;SC=CCTTGGGGTAATCACAGTCAT;SOR=0.717;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=151;TCF=80;TCR=71;TR=151;WE=19451599;WS=19451581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr19	19453521	rs2965191	T	G	2846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=60;NR=48;PP=2010;SC=GGGCCAGGGCTGGGGGCGGGG;SOR=1.008;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=112;TCF=60;TCR=52;TR=108;WE=19453529;WS=19453511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr19	19453560	rs2301669	C	A	4117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=87;NR=66;PP=2766;SC=CCCTGGTAACCCCTGCTGTCT;SOR=1.142;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=153;TCF=87;TCR=66;TR=153;WE=19453568;WS=19453550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr19	19453742	rs2965192	A	G	1416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=38;PP=1121;SC=GCCAGACGCTAGCTGTACCAG;SOR=2.608;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=10;TCR=38;TR=48;WE=19453750;WS=19453732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr19	19454828	rs2965193	G	A	1741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=34;PP=975;SC=GACTGAATTCGCCAAGTGCAT;SOR=1.341;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=22;TCR=34;TR=56;WE=19454836;WS=19454818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr19	19547086	rs2916077	T	C	1917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=55;PP=1327;SC=CAGCAGGCTTTGGTCAGCTTC;SOR=2.932;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=12;TCR=55;TR=67;WE=19547094;WS=19547076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr19	19637930	rs7251447	A	G	255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=3;PP=442;SC=CTCTGCCCACAGCCCTTGCCC;SOR=1.085;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=19637938;WS=19637920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	19656421	.	G	A	1660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.207;ClippingRankSum=0.000;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=45;ReadPosRankSum=3.774;SC=GCGCGTGGCCGTCAACGGACT;SOR=0.696;SbPval=0.55;Source=Platypus;TR=91;WE=19656429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:206,98:0.32:304
chr19	19735257	rs1266503	G	T	11561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=429;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=200;NR=187;PP=2965;SC=CATTGACCAGGGAGTTGGCCT;SOR=0.741;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=389;TCF=201;TCR=188;TR=387;WE=19735265;WS=19735247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,428:1.00:428
chr19	19737686	rs33982830	C	T	1146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.398;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=26;PP=678;ReadPosRankSum=1.375;SC=TGTGCAGCTGCACGGCCATCA;SOR=0.603;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=116;TCF=64;TCR=52;TR=55;WE=19737694;WS=19737676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,59:0.45:130
chr19	19740729	rs880090	C	G	1177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=11;PP=813;SC=ATGGGTCCGTCTTCACAATCT;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=27;TCR=11;TR=38;WE=19740737;WS=19740719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr19	19740960	.	G	A	940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.628;ClippingRankSum=0.000;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.277;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=14;PP=520;ReadPosRankSum=0.672;SC=CCCCGCCCCCGCAAACTCCCT;SOR=0.836;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=83;TCF=45;TCR=38;TR=38;WE=19740968;WS=19740938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,44:0.48:92
chr19	19745073	.	G	A	748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.040;ClippingRankSum=0.000;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=19;PP=462;ReadPosRankSum=1.189;SC=GGTGGGACACGCAGGCCAGCC;SOR=0.765;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=54;TCF=21;TCR=33;TR=31;WE=19745081;WS=19745063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,35:0.49:71
chr19	19750822	rs45458192	C	T	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.447;HP=3;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=616;ReadPosRankSum=1.052;SC=TGCTGGGAAACGAGGGGATCA;SOR=1.646;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=12;WE=19750832;WS=19750812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr19	19750824	rs11298700	AG	A	577.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=617;ReadPosRankSum=0.593;SC=CTGGGAAACGAGGGGATCAGG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=11;WE=19750832;WS=19750812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr19	19751456	rs2043293	C	A	609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=19;PP=480;SC=CCCAGACCAGCCCAGTGGCAC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=19751464;WS=19751446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	19753292	rs7248885	G	A	1545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=26;PP=886;ReadPosRankSum=-2.902;SC=TAAATGGTTAGGGGCTTGGGG;SOR=0.701;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=164;TCF=98;TCR=66;TR=68;WE=19753300;WS=19753282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,79:0.43:183
chr19	19758190	rs892035	T	C	1581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.60;ReadPosRankSum=-1.097;SOR=0.538;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,91:0.49:184
chr19	19790891	.	C	CTA	2735.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=0.000;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.038;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.972;NF=11;NR=26;PP=1466;ReadPosRankSum=0.266;SC=TGGAGAAAAGCCATATGAATG;SOR=0.539;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=81;TCF=26;TCR=55;TR=37;WE=19790899;WS=19790881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,71:0.52:136
chr19	19822049	rs7246866	T	C	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=143;ReadPosRankSum=-0.202;SC=CTGGAACAATTAAGGGCTTTA;SOR=0.368;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=8;WE=19822057;WS=19822039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr19	19824850	rs11085270	T	G	1583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.088;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=32;PP=1117;ReadPosRankSum=0.676;SC=TTGCTTGCTTTCTTTTGAAAT;SOR=0.361;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=151;TCF=98;TCR=53;TR=79;WE=19824858;WS=19824840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,76:0.49:154
chr19	19868879	rs247782	A	C	1126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.894;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=10;PP=703;ReadPosRankSum=0.037;SC=AGACTTTTCCATGAATCTTCC;SOR=0.877;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=80;TCF=59;TCR=21;TR=43;WE=19868887;WS=19868869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,49:0.55:89
chr19	19910183	rs34277739	A	G	4295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=53;PP=2648;SC=TAATGAAGGTATAGAGAACAC;SOR=1.164;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=86;TCR=53;TR=139;WE=19910191;WS=19910173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr19	19916736	rs12973032	T	C	2035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=16;PP=1413;SC=AACTATTTCCTTGGGAACACA;SOR=2.173;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=50;TCR=16;TR=66;WE=19916744;WS=19916729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr19	20044932	rs62135329	G	A	6745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=114;NR=113;PP=2965;SC=ACATAAGAGAGTTCATACTGG;SOR=0.742;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=228;TCF=114;TCR=114;TR=227;WE=20044940;WS=20044922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr19	20150075	rs2286920	A	G	1556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=11;PP=934;SC=GGGAGGCCCCAGTCCCGTCAC;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=38;TCR=11;TR=49;WE=20150083;WS=20150065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr19	20150125	rs2286921	T	C	3898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=81;NR=46;PP=2275;SC=TGCCCCCACCTCGGGATGCGC;SOR=1.186;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=81;TCR=46;TR=127;WE=20150133;WS=20150115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr19	20150175	rs2286922	G	C	5617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=88;PP=2965;SC=CCGGGATGTCGTGGAGTCTTA;SOR=0.721;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=183;TCF=95;TCR=88;TR=183;WE=20150183;WS=20150165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr19	20150247	rs2286923	A	C	3683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=69;PP=2294;ReadPosRankSum=-0.628;SC=GTCACCGGGAACTACTAGAGC;SOR=0.400;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=118;TCF=48;TCR=70;TR=117;WE=20150255;WS=20150237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,135:0.99:136
chr19	20150380	rs2335896	T	C	352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=11;PP=294;SC=GTTCCCACTCTAGCGCCCATG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=20150388;WS=20150370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	20229486	rs1725935	G	A	7468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=134;NR=117;PP=2965;SC=TGATAAATGTGGCAAAGCATT;SOR=0.768;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=251;TCF=134;TCR=117;TR=251;WE=20229494;WS=20229476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,276:1.00:276
chr19	20230264	rs1654275	T	A	886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=28;PP=781;SC=ACCACCCCTCTACTCTTACTA;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=30;WE=20230272;WS=20230254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	20232177	rs11321273	TA	T	149.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=4;PP=119;SC=CATGCCCGGCTAATTGTTTCA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=20232185;WS=20232167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	20242092	rs1654287	C	T	87.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.76;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	20242274	rs1618723	G	A	2611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.36;SOR=0.752;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr19	20295146	rs1097510	G	A	774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.678;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=9;PP=460;ReadPosRankSum=-0.777;SC=GAAAATGTGTGTGTGTGTGTG;SOR=1.378;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=98;TCF=67;TCR=31;TR=36;WE=20295154;WS=20295145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,41:0.38:109
chr19	20296738	rs836897	C	G	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.967;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=9;PP=399;ReadPosRankSum=-0.967;SC=GAGCACATTACTAGCTTGTAA;SOR=0.859;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=64;TCF=45;TCR=19;TR=29;WE=20296746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,31:0.46:67
chr19	20297019	rs149807694	T	TTTTA	245.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.373;NF=0;NR=7;PP=298;ReadPosRankSum=2.836;SC=TGGGCAGCTGTTTTATTTATT;SOR=0.346;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=7;WE=20297027;WS=20297009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr19	20307777	rs112723967	G	A	1226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.521;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.088;NF=38;NR=30;PP=840;ReadPosRankSum=1.698;SC=TTTCAGTTGTGTGTTCTCATT;SOR=0.527;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=198;TCF=117;TCR=81;TR=68;WE=20307785;WS=20307767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,70:0.32:218
chr19	20308301	rs113493829	G	C	1574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.734;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=38;PP=1077;ReadPosRankSum=1.025;SC=AAAATTCATAGTGGAGAGAAA;SOR=0.672;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=188;TCF=97;TCR=91;TR=72;WE=20308309;WS=20308291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,80:0.39:207
chr19	20308954	rs112134607	C	T	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.101;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=16;PP=386;ReadPosRankSum=-0.754;SC=AGAGGTAATTCTGCTGTTGTT;SOR=0.414;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=58;TCF=24;TCR=34;TR=31;WE=20308962;WS=20308944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,35:0.52:67
chr19	20369503	rs8103002	C	G	9275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=158;NR=147;PP=2965;SC=TTATTGACTGCTGTAGTGGTA;SOR=0.729;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=306;TCF=158;TCR=148;TR=305;WE=20369511;WS=20369493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,336:1.00:336
chr19	20414197	rs7256650	C	T	989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=22;PP=548;ReadPosRankSum=1.257;SC=GTGGCAAAACCTTCAGTTGGT;SOR=0.761;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=91;TCF=43;TCR=48;TR=41;WE=20414205;WS=20414179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,48:0.47:103
chr19	20414254	rs10425483	A	G	1453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=23;PP=773;SC=GAGAGAAACCATACAAGTGTG;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=26;TCR=23;TR=49;WE=20414262;WS=20414244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr19	20415575	rs73000781	C	A	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.127;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=17;PP=434;ReadPosRankSum=-1.419;SC=AGCAGTTGCTCAAGCTTTGTT;SOR=0.136;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=48;TCF=13;TCR=35;TR=27;WE=20415583;WS=20415565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,30:0.58:52
chr19	20727463	rs10411329	T	C	1084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.703;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=15;PP=412;ReadPosRankSum=-1.061;SC=TTAAAGCCTTTGCCACATTCT;SOR=0.818;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=95;TCF=57;TCR=38;TR=41;WE=20727471;WS=20727453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,53:0.47:113
chr19	20727932	rs33926	G	A	866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.519;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.423;NF=16;NR=24;PP=524;ReadPosRankSum=1.667;SC=GAATTATCTTGTGTGTAGTAA;SOR=1.038;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=100;TCF=48;TCR=52;TR=40;WE=20727940;WS=20727922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,45:0.41:111
chr19	20735196	rs7250860	A	T	1283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-1.109;NF=39;NR=21;PP=858;ReadPosRankSum=-0.612;SC=AGCTTCCCAAATCACACTTTA;SOR=0.642;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=104;TCF=65;TCR=39;TR=60;WE=20735204;WS=20735186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,61:0.56:109
chr19	20735272	rs7251976	T	C	2599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.165;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=52;PP=1268;ReadPosRankSum=-0.845;SC=CATTTTCACTTGCACCTACCT;SOR=0.562;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=213;TCF=118;TCR=95;TR=113;WE=20735280;WS=20735262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,126:0.52:242
chr19	20736677	rs2562632	A	G	2635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.438;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=68;PP=1588;ReadPosRankSum=-0.944;SC=TTTACCAAGTAGCCAAGGGTG;SOR=0.661;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=255;TCF=111;TCR=144;TR=119;WE=20736685;WS=20736667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,130:0.47:279
chr19	20748522	rs12979592	C	A	2062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.609;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.273;NF=33;NR=53;PP=1150;ReadPosRankSum=-0.728;SC=GCCACAGAGGCTGGGCCTCTA;SOR=1.112;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=202;TCF=87;TCR=115;TR=86;WE=20748530;WS=20748512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,99:0.44:223
chr19	20806770	rs34554673	T	TCA	503.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=6;PP=488;SC=ATATCAATTCTTAGTTAGAAA;SOR=1.445;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=13;TCF=5;TCR=8;TR=11;WE=20806778;WS=20806762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	20806824	rs10409289	T	C	489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=4;PP=228;SC=CACATTCACATGGTTTCTCTC;SOR=1.292;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=17;WE=20806832;WS=20806814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	20808149	rs1991528	A	G	3426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=58;PP=2244;SC=AAGCTTTGCCACATTCTATAT;SOR=0.741;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=121;TCF=63;TCR=58;TR=121;WE=20808157;WS=20808139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr19	20808515	rs1968385	T	A	3089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=70;PP=2058;SC=AATATAAATATATATATGCAG;SOR=1.449;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=110;TCF=40;TCR=70;TR=110;WE=20808523;WS=20808505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr19	20828106	rs34588720	C	CAA	409.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=-0.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=2;PP=44;ReadPosRankSum=0.185;SC=AGATCTGATGCAAAGAGAACT;SOR=0.569;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=9;TCF=4;TCR=5;TR=3;WE=20828114;WS=20828096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr19	20828410	rs34679916	A	AAAG	2141.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.662;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=14;PP=1465;ReadPosRankSum=0.628;SC=CCCAAATCACACTTTAAGGAC;SOR=0.795;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=79;TCF=37;TCR=42;TR=31;WE=20828418;WS=20828400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,56:0.41:136
chr19	20844340	rs3217340	G	GAAGT	3325.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.487;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.291;NF=9;NR=30;PP=1734;ReadPosRankSum=-0.150;SC=GCCTTTAGGAGAAGAACCAGA;SOR=0.653;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=137;TCF=27;TCR=110;TR=39;WE=20844348;WS=20844330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,90:0.37:242
chr19	20973560	rs377604472	GAAA	G	2748.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.599;HP=10;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=33;PP=638;ReadPosRankSum=1.104;SC=ATCAGAAAGAGAAAAAAAAAG;SOR=0.638;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=84;TCF=7;TCR=77;TR=38;WE=20973570;WS=20973537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,72:0.48:151
chr19	20976742	rs1808542	A	G	1626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=37;PP=972;ReadPosRankSum=-0.754;SC=CAAGGTCAAAAAGAAAGCCAG;SOR=0.706;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=135;TCF=56;TCR=79;TR=64;WE=20976750;WS=20976728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,77:0.49:156
chr19	20988637	rs6511163	G	A	2172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.942;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=34;PP=1264;ReadPosRankSum=0.932;SC=TTTCAGTTTTGTGTTCTCATT;SOR=0.389;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=158;TCF=106;TCR=52;TR=94;WE=20988645;WS=20988627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,101:0.59:170
chr19	20988708	rs12461983	G	A	3808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.644;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=69;PP=2348;ReadPosRankSum=-1.305;SC=CTGATACTGAGAAGGCATAAA;SOR=0.878;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=285;TCF=154;TCR=131;TR=159;WE=20988716;WS=20988698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,176:0.55:321
chr19	21132072	rs61738573	T	C	1747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.093;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=34;PP=1093;ReadPosRankSum=1.265;SC=CATAAGAAAATTCATACTGGA;SOR=0.460;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=123;TCF=72;TCR=51;TR=74;WE=21132080;WS=21132062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,80:0.58:138
chr19	21203552	rs2081054	C	T	5020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=99;NR=65;PP=2839;SC=CCCTGTGACCCGCAGGTATTG;SOR=1.042;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=100;TCR=65;TR=164;WE=21203560;WS=21203542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr19	21216536	rs3760839	G	A	715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=21;PP=580;SC=TTCCATATAGGAAAGAATTTT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=21216544;WS=21216526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	21217211	rs1470020	A	G	178.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=134;SC=CAAGTTTGCTATCAGAACCAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=21217219;WS=21217201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	21299774	rs36125838	T	TATA	12891.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=108;PP=2924;SC=CAAAAAAGGTTATGAACTAAA;SOR=0.873;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=36;TCR=122;TR=140;WE=21299782;WS=21299754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,288:1.00:288
chr19	21300462	rs2884554	A	G	4796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=82;NR=81;PP=2957;SC=ACAAAACATAAAAGAATTCAT;SOR=0.812;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=163;TCF=82;TCR=81;TR=163;WE=21300470;WS=21300452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr19	21349311	rs7256576	C	T	4815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=99;PP=2965;SC=CTAAATGTTTCATGTCTCTTT;SOR=1.198;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=164;TCF=65;TCR=99;TR=164;WE=21349319;WS=21349301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr19	21350520	rs113788883	TA	T	470.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FS=9.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.13;ReadPosRankSum=-0.458;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:171,50:0.23:221
chr19	21477403	rs1781872	T	G	2081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.98;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=42;PP=1193;ReadPosRankSum=2.418;SC=GTGACCTCCTTTGTGCAACTT;SOR=0.676;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=188;TCF=103;TCR=85;TR=91;WE=21477411;WS=21477393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,102:0.47:215
chr19	21477431	rs1781873	T	C	2146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.544;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=41;PP=1231;ReadPosRankSum=0.023;SC=TCCACACTTTTACAGCCTTTC;SOR=0.614;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=162;TCF=79;TCR=83;TR=82;WE=21477445;WS=21477421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,96:0.52:185
chr19	21492062	rs547516	G	A	7957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=141;NR=134;PP=2965;SC=GGGTTTGGCTGCCATCTCGTG;SOR=0.720;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=276;TCF=141;TCR=135;TR=275;WE=21492070;WS=21492052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,302:1.00:302
chr19	21493278	rs34067558	TA	T	82.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=9.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.60;ReadPosRankSum=0.000;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr19	21541806	rs2012013	T	C	1310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.119;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=11;PP=680;ReadPosRankSum=0.598;SC=TTCTTTGTCTTTGGCTGCCGC;SOR=0.316;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=59;TCF=46;TCR=13;TR=45;WE=21541814;WS=21541796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,53:0.80:66
chr19	21544503	rs12981775	C	T	1381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.863;HP=2;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=13;PP=2117;ReadPosRankSum=1.656;SC=ACCGAGATATCTGCCATGGTT;SOR=0.591;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=92;TCF=70;TCR=22;TR=53;WE=21544522;WS=21544493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,58:0.59:98
chr19	21544514	rs12981564	A	G	1601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.591;HP=3;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=17;PP=2117;ReadPosRankSum=2.112;SC=TGCCATGGTTATGTCAGCTAG;SOR=0.477;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=113;TCF=84;TCR=29;TR=61;WE=21544522;WS=21544493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,67:0.55:121
chr19	21544571	rs1142653	G	A	2332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FS=0.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.56;ReadPosRankSum=-2.290;SOR=0.641;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:127,117:0.48:244
chr19	21544714	rs12982282	C	G	1388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.819;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=37;PP=887;ReadPosRankSum=0.240;SC=AAAACATGCTCTACTAAAAAT;SOR=0.559;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=91;TCF=32;TCR=59;TR=56;WE=21544722;WS=21544704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,61:0.61:100
chr19	21558169	rs2358993	G	A	2874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.471;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=64;PP=1737;ReadPosRankSum=1.555;SC=GTTCTTGGGTGAGAATAACTT;SOR=0.752;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=218;TCF=103;TCR=115;TR=121;WE=21558177;WS=21558159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,134:0.55:244
chr19	21558311	rs2914645	C	T	389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=321;SC=ATTATCCATGCAGAAAAAAAT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=21558319;WS=21558301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	21558818	rs376940300	CA	C	330.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.94;ReadPosRankSum=1.305;SOR=0.807;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,31:0.37:84
chr19	21560141	rs1875256	G	A	171.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=136;SC=ACTGCCTTCAGTTCCTCTCTT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=21560149;WS=21560135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	21560314	rs112058265	G	GCA	1092.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.172;NF=2;NR=17;PP=426;ReadPosRankSum=-0.157;SC=ACACAGACGTGCACACACACA;SOR=0.678;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=56;TCF=4;TCR=52;TR=19;WE=21560323;WS=21560304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,43:0.39:109
chr19	21587918	rs7254059	G	T	1902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=0.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.03;MQRankSum=-0.581;QD=11.19;ReadPosRankSum=-1.659;SOR=0.622;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,87:0.51:170
chr19	21588165	rs2650847	G	A	1162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=34;PP=918;SC=TGAGTTTCTGGTGCCTGTTTT;SOR=4.461;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=3;TCR=34;TR=37;WE=21588173;WS=21588155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr19	21588692	rs1055753	T	C	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=-1.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.153;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=11;PP=287;ReadPosRankSum=0.417;SC=TTGACATAGATGAAAGGTTGA;SOR=0.523;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=50;TCF=20;TCR=30;TR=22;WE=21588700;WS=21588682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,31:0.63:49
chr19	21605645	rs11666213	G	A	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.881;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=78;ReadPosRankSum=-0.175;SC=TAATATTATAGTTTAGATTTG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=5;WE=21605653;WS=21605635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr19	21606429	rs4621113	G	T	1484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.254;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.315;NF=34;NR=31;PP=935;ReadPosRankSum=-0.351;SC=CCCTATAAATGTGAAGAATGT;SOR=0.787;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=142;TCF=72;TCR=70;TR=65;WE=21606437;WS=21606419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,72:0.46:157
chr19	21606719	rs10414834	C	G	2202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.507;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.378;NF=46;NR=48;PP=1232;ReadPosRankSum=-0.083;SC=GTCTTCACACCTTACTACACA;SOR=0.629;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=191;TCF=91;TCR=100;TR=94;WE=21606727;WS=21606709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,108:0.51:211
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chr19	21688602	rs10420016	C	G	3055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.491;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=58;PP=1705;ReadPosRankSum=-0.056;SC=CTGACATCCCCAGAGAGGGGG;SOR=0.665;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=210;TCF=108;TCR=102;TR=126;WE=21688610;WS=21688592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,143:0.61:233
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chr19	21736788	rs2562502	T	C	2961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=39;NR=51;PP=1687;SC=TTGGTTTTTTTACATACTCCC;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=39;TCR=51;TR=90;WE=21736796;WS=21736778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr19	21736838	rs2681370	T	C	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=116;ReadPosRankSum=-0.415;SC=TTTGTTATTTTTTCTCTAATG;SOR=0.392;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=9;WE=21736846;WS=21736828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr19	21838002	rs7351091	G	T	978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.588;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-6.124;NF=25;NR=21;PP=613;ReadPosRankSum=-1.001;SC=AGCAGGACATGAAAGATTCTT;SOR=0.469;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=93;TCF=56;TCR=37;TR=46;WE=21838010;WS=21837992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,49:0.49:101
chr19	21838113	rs34320073	A	AGAT	1317.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=844;ReadPosRankSum=1.227;SC=TACACAAAGAAGATAACAAAC;SOR=0.747;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=53;TCF=7;TCR=46;TR=17;WE=21838121;WS=21838103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,36:0.41:88
chr19	21838146	rs7351088	CA	TG	855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.978;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=660;ReadPosRankSum=-1.767;SC=TGATAACTACCAAGAGCAATA;SOR=0.845;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=55;TCF=23;TCR=32;TR=18;WE=21838155;WS=21838136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,24:0.37:65
chr19	21838240	rs6511279	C	A	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.162;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.219;NF=21;NR=9;PP=526;ReadPosRankSum=0.092;SC=TAGAAAGAAACCTTTCAAATG;SOR=0.511;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=52;TCF=37;TCR=15;TR=30;WE=21838248;WS=21838230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,29:0.56:52
chr19	21838351	rs7508059	A	G	1576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.772;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.632;NF=34;NR=36;PP=1037;ReadPosRankSum=-0.378;SC=TTGTGGCAAAACCTTCAACTG;SOR=0.836;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=178;TCF=89;TCR=89;TR=70;WE=21838361;WS=21838341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,78:0.39:199
chr19	21838492	rs6511280	C	G	1090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.570;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=16;PP=660;ReadPosRankSum=-0.227;SC=TGGAGAGAAACCGTACAGATG;SOR=0.527;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=92;TCF=58;TCR=34;TR=41;WE=21838500;WS=21838482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,49:0.45:109
chr19	21838565	rs6511281	T	C	1988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.545;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=34;PP=1217;ReadPosRankSum=0.227;SC=AGAATTCATATTGGAGAGAAA;SOR=0.751;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=157;TCF=89;TCR=68;TR=80;WE=21838573;WS=21838555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,93:0.51:181
chr19	21838657	rs7508494	G	A	2355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.476;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=48;PP=1434;ReadPosRankSum=-0.536;SC=TGCTGGAGAGGAGCCCTACAA;SOR=0.749;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=205;TCF=105;TCR=100;TR=96;WE=21838665;WS=21838647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,109:0.46:235
chr19	21838785	rs10422946	C	T	1092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.778;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=29;PP=701;ReadPosRankSum=-0.216;SC=TTAACCACTCCTCAACTCCTA;SOR=1.144;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=91;TCF=37;TCR=54;TR=45;WE=21838793;WS=21838775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,50:0.49:103
chr19	21838830	rs10422804	A	C	754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.134;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.545;NF=12;NR=15;PP=419;ReadPosRankSum=0.007;SC=GAGAGAAACCATACAAATGTG;SOR=1.086;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=60;TCF=28;TCR=32;TR=27;WE=21838838;WS=21838820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,34:0.45:75
chr19	21909948	rs7246400	G	A	3153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=57;NR=46;PP=1853;SC=CTTATGTTTAGTAAGGTATGA;SOR=0.820;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=103;TCF=57;TCR=46;TR=103;WE=21909956;WS=21909938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr19	21948748	rs11085493	T	C	852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=21;PP=622;SC=TTTTTCCAAATCAAAACCTTG;SOR=4.255;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=21948756;WS=21948738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	21950402	rs6511291	T	C	4573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=88;PP=2874;ReadPosRankSum=-1.031;SC=CCGGAAGCCGTCCAGTCCGCT;SOR=1.145;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=154;TCF=65;TCR=89;TR=152;WE=21950410;WS=21950392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,168:0.99:170
chr19	22153495	rs2359812	A	T	842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=2.033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.04;ReadPosRankSum=2.770;SOR=0.791;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,42:0.60:70
chr19	22154954	rs2214301	C	T	1048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.468;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=17;PP=567;ReadPosRankSum=0.904;SC=CTTATGATAACTAAGGGTTGA;SOR=0.564;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=103;TCF=61;TCR=42;TR=43;WE=22154962;WS=22154944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,51:0.44:117
chr19	22157302	rs10419899	G	A	3008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.820;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.586;NF=80;NR=64;PP=1895;ReadPosRankSum=0.040;SC=ATGATCTGACGTATTCTTTAC;SOR=0.638;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=314;TCF=179;TCR=135;TR=144;WE=22157310;WS=22157292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:193,151:0.44:344
chr19	22171646	rs202153431	A	T	769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=402;ExcessHet=3.0103;FS=20.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.94;MQRankSum=-11.062;QD=1.91;ReadPosRankSum=3.146;SOR=2.460;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:357,45:0.11:402
chr19	22171651	rs199911466	C	T	788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=401;ExcessHet=3.0103;FS=20.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.91;MQRankSum=-11.052;QD=1.97;ReadPosRankSum=3.385;SOR=2.461;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:356,45:0.11:401
chr19	22171701	.	G	A	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.194;ClippingRankSum=0.000;DP=339;ExcessHet=3.0103;FS=9.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQRankSum=-16.496;QD=0.20;ReadPosRankSum=-1.428;SOR=1.454;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:309,29:0.09:338
chr19	22171880	rs4574045	C	T	288.86	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.90;MQRankSum=-3.015;QD=24.07;ReadPosRankSum=0.438;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr19	22193451	rs2040654	C	G	1763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=18;PP=1087;SC=ATGGCTGAACCGGACTGAGGT;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=40;TCR=18;TR=58;WE=22193459;WS=22193441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr19	22235307	rs415291	C	G	816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.984;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=9;PP=412;ReadPosRankSum=0.226;SC=CGCTCTAGCCCGAGCTGCAGG;SOR=0.961;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=59;TCF=40;TCR=19;TR=33;WE=22235315;WS=22235297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,40:0.60:67
chr19	22235491	rs387343	T	G	1611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=39;PP=1076;ReadPosRankSum=-0.722;SC=GGTTGGAACCTGTGGGAAGTC;SOR=0.703;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=144;TCF=65;TCR=79;TR=70;WE=22235499;WS=22235481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,76:0.47:163
chr19	22235526	rs387315	T	C	1145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=31;PP=661;ReadPosRankSum=0.148;SC=CAGGCCTCCTTGCAGTCAGCC;SOR=0.637;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=114;TCF=48;TCR=66;TR=53;WE=22235534;WS=22235516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,58:0.45:128
chr19	22235577	rs408312	C	T	725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.046;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=22;PP=467;ReadPosRankSum=-0.141;SC=AGCTCGGCCTCGGTCCCCCTC;SOR=0.941;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=59;TCF=18;TCR=41;TR=31;WE=22235585;WS=22235567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,33:0.52:64
chr19	22235620	rs423926	G	C	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=273;ReadPosRankSum=1.682;SC=TGACAGCCGGGACCCCGGGCG;SOR=0.542;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=14;WE=22235628;WS=22235610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr19	22255799	rs200402014	T	TA	2215.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=5.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.87;MQRankSum=3.213;QD=18.31;ReadPosRankSum=0.739;SOR=1.190;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,62:0.51:121
chr19	22255803	rs368701052	T	A	2138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=6.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQRankSum=1.046;QD=19.62;ReadPosRankSum=1.881;SOR=1.332;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,53:0.49:109
chr19	22256396	rs3752163	G	A	3551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=342;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.132;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=73;PP=2042;ReadPosRankSum=-0.902;SC=AGTACAACAGGTGAAACAGAT;SOR=0.578;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=301;TCF=150;TCR=151;TR=155;WE=22256404;WS=22256386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,174:0.51:341
chr19	22270882	rs78380474	T	C	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FS=1.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQRankSum=-10.758;QD=1.13;ReadPosRankSum=2.054;SOR=0.885;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:260,28:0.10:288
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chr19	22270899	.	G	T	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.233;ClippingRankSum=0.000;DP=303;ExcessHet=3.0103;FS=0.711;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQRankSum=-11.531;QD=1.33;ReadPosRankSum=1.488;SOR=0.603;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:273,30:0.10:303
chr19	22270912	.	G	A	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.595;ClippingRankSum=0.000;DP=306;ExcessHet=3.0103;FS=0.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQRankSum=-11.812;QD=1.21;ReadPosRankSum=0.535;SOR=0.689;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:277,29:0.09:306
chr19	22270921	.	T	C	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.351;ClippingRankSum=0.000;DP=307;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQRankSum=-11.605;QD=0.94;ReadPosRankSum=-0.560;SOR=0.658;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:279,28:0.09:307
chr19	22270928	.	T	C	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.405;ClippingRankSum=0.000;DP=302;ExcessHet=3.0103;FS=0.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQRankSum=-11.982;QD=0.83;ReadPosRankSum=-0.752;SOR=0.782;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:276,26:0.09:302
chr19	22270929	.	G	A	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.877;ClippingRankSum=0.000;DP=302;ExcessHet=3.0103;FS=2.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQRankSum=-12.516;QD=0.85;ReadPosRankSum=-0.075;SOR=0.978;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:278,24:0.08:302
chr19	22270934	.	G	C	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.191;ClippingRankSum=0.000;DP=302;ExcessHet=3.0103;FS=2.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQRankSum=-12.516;QD=0.39;ReadPosRankSum=-0.680;SOR=0.978;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:278,24:0.08:302
chr19	22270935	.	G	A	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.089;ClippingRankSum=0.000;DP=303;ExcessHet=3.0103;FS=2.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQRankSum=-12.538;QD=0.43;ReadPosRankSum=-0.673;SOR=0.987;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:279,24:0.08:303
chr19	22363826	rs7252593	G	C	787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.533;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.474;NF=12;NR=23;PP=504;ReadPosRankSum=-2.904;SC=TAAAAGCTTTGCCACATTCTT;SOR=0.865;SbPval=0.07;Source=Platypus;TC=113;TCF=60;TCR=53;TR=35;WE=22363834;WS=22363823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,36:0.27:132
chr19	22363844	rs7252604	G	A	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=4.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQRankSum=-3.269;QD=2.82;ReadPosRankSum=-3.572;SOR=1.322;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,12:0.11:108
chr19	22364492	rs10419666	A	T	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=52;ReadPosRankSum=0.262;SC=AAGCAAGACGACATTGCAATA;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=4;WE=22364500;WS=22364482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr19	22375868	rs8104929	C	T	3096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=353;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.811;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.069;NF=70;NR=75;PP=2005;ReadPosRankSum=1.024;SC=GGGCTCTTTTCCTTGCTCCAG;SOR=0.764;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=334;TCF=163;TCR=171;TR=145;WE=22375879;WS=22375858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:198,154:0.44:352
chr19	22379587	rs2360001	G	T	1253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.662;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=38;PP=891;ReadPosRankSum=0.956;SC=AACTTTTAATGTGACTCAAGG;SOR=0.800;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=120;TCF=45;TCR=75;TR=59;WE=22379595;WS=22379577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,62:0.45:139
chr19	22469233	rs808373	G	C	1108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.351;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=17;PP=738;ReadPosRankSum=1.297;SC=CGTTGTTTCTGGTTGCAGCCG;SOR=1.270;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=93;TCF=62;TCR=31;TR=53;WE=22469241;WS=22469223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,52:0.55:95
chr19	22486535	rs9304996	A	G	3303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.325;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=56;PP=1823;ReadPosRankSum=0.019;SC=GGAAATGTATATGTGTCTTTC;SOR=0.776;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=285;TCF=151;TCR=134;TR=134;WE=22486543;WS=22486525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,156:0.49:318
chr19	22585517	rs35315232	A	C	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=2.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.30;MQRankSum=-3.365;QD=4.27;ReadPosRankSum=-0.626;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,7:0.28:25
chr19	22586084	rs113181884	A	C	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.434;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.09;MQRankSum=-1.304;QD=8.44;ReadPosRankSum=-0.274;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr19	22586192	rs1368476	A	G	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=2.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.773;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.705;NF=29;NR=17;PP=672;ReadPosRankSum=-3.355;SC=CCTCACCCACAAAGACCAGGT;SOR=0.565;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=153;TCF=88;TCR=65;TR=46;WE=22586200;WS=22586182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,30:0.21:143
chr19	22605103	rs11669353	G	C	1618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.576;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=42;PP=797;ReadPosRankSum=1.423;SC=GACACAGAAGGGCGAAGACGA;SOR=0.781;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=65;TCR=85;TR=74;WE=22605111;WS=22605093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,83:0.49:169
chr19	22605120	rs11669356	G	T	1340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.242;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=36;PP=743;ReadPosRankSum=-0.329;SC=ACGAGACCAGGAACTCCGGCT;SOR=0.928;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=121;TCF=48;TCR=73;TR=59;WE=22605128;WS=22605110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,66:0.49:136
chr19	22782955	rs3214614	CT	C	101.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=1;PP=52;SC=TTATTGTCTGCTTTTTTTTCC;SOR=1.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=3;WE=22782963;WS=22782951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	22783220	rs9305001	C	A	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.620;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=252;ReadPosRankSum=0.230;SC=CCATGGAGACCACACCGCTGT;SOR=1.561;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=28;TCF=11;TCR=17;TR=15;WE=22783228;WS=22783210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr19	22784679	rs115581662	G	A	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.690;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=240;ReadPosRankSum=1.140;SC=ACGGAGGGTGGGGGAGAAGGA;SOR=3.383;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=13;WE=22784687;WS=22784669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr19	22784697	rs13343382	G	C	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.73;ReadPosRankSum=0.747;SOR=1.034;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
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chr19	22785134	rs11670207	T	C	7871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=131;NR=141;PP=2965;SC=CCAGTGCAGATGGGGAGCAGG;SOR=0.775;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=272;TCF=131;TCR=141;TR=272;WE=22785142;WS=22785124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,304:1.00:304
chr19	22785453	rs60588450	G	A	1999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.674;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=34;PP=1059;ReadPosRankSum=1.319;SC=GAAAGAGCGGGTGGAGGAGCT;SOR=0.584;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=183;TCF=105;TCR=78;TR=80;WE=22785461;WS=22785443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,97:0.46:212
chr19	22786020	rs2304141	G	T	2253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=47;NR=29;PP=1314;SC=TCTCTCCAAAGATCTTTGCCA;SOR=1.048;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=47;TCR=29;TR=76;WE=22786028;WS=22786010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr19	22786126	rs2304143	T	A	6415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=134;NR=80;PP=2965;SC=ATGCAGCTGTTTGGTGAGATG;SOR=1.264;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=215;TCF=135;TCR=80;TR=214;WE=22786134;WS=22786116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr19	22786284	rs141668737	G	GC	2793.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.524;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=58;PP=1388;ReadPosRankSum=-0.490;SC=GGGAGGCTCCGCCCCCCCATG;SOR=0.879;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=152;TCF=6;TCR=146;TR=61;WE=22786292;WS=22786274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,117:0.54:216
chr19	22939224	rs17172927	G	A	1052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.966;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=20;PP=559;ReadPosRankSum=-0.523;SC=AAGGTTTGAGGACTAAATGCT;SOR=0.645;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=65;TCF=38;TCR=27;TR=41;WE=22939232;WS=22939214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,49:0.59:83
chr19	22941191	rs11667397	T	A	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.394;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.588;NF=10;NR=16;PP=376;ReadPosRankSum=-1.229;SC=TTTGCAAGGTTTCTCTTCCAT;SOR=1.182;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=61;TCF=27;TCR=34;TR=26;WE=22941199;WS=22941181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,29:0.44:66
chr19	22942325	rs7255780	G	C	1139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.427;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=20;PP=808;ReadPosRankSum=1.786;SC=TTTATTATAAGCTTCTTCGTG;SOR=0.943;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=102;TCF=57;TCR=45;TR=51;WE=22942333;WS=22942315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,53:0.44:121
chr19	22952249	rs11669602	C	T	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=193;ReadPosRankSum=0.492;SC=GATGACTGAACGTATTCAGTA;SOR=0.836;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=37;TCF=13;TCR=24;TR=17;WE=22952257;WS=22952239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,21:0.49:43
chr19	22952946	rs12980509	T	C	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.711;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=93;ReadPosRankSum=-0.585;SC=TTTTGTTAAATATTCAGCAAG;SOR=0.368;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=8;WE=22952954;WS=22952936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
chr19	23159486	rs289318	T	C	1963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.391;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=33;PP=1346;ReadPosRankSum=0.366;SC=AATTCTCTTATAAGTAAGGGC;SOR=0.567;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=131;TCF=80;TCR=51;TR=80;WE=23159494;WS=23159476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,84:0.60:139
chr19	23169954	rs289302	G	A	729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-3.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=5;PP=425;ReadPosRankSum=-2.157;SC=GACAGAAGATGCCACTGTGTG;SOR=0.640;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=66;TCF=55;TCR=11;TR=28;WE=23169962;WS=23169944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,34:0.45:75
chr19	23328940	rs7247102	G	A	776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=20;PP=457;ReadPosRankSum=0.416;SC=CATACTGGAGGGAAACCCTAC;SOR=0.730;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=103;TCF=54;TCR=49;TR=40;WE=23328948;WS=23328930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,44:0.37:120
chr19	23406165	rs2885604	T	C	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=3.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.83;ReadPosRankSum=0.512;SOR=0.383;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,33:0.40:82
chr19	23406801	rs8110795	G	C	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=1.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.32;ReadPosRankSum=-0.652;SOR=0.874;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,43:0.43:100
chr19	23413937	rs7256859	A	G	819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=2;PP=643;ReadPosRankSum=1.110;SC=TGCCCGCCTTAGCCTCTCCAA;SOR=1.022;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=48;TCF=44;TCR=4;TR=28;WE=23413945;WS=23413927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,29:0.57:51
chr19	23414167	rs4932841	T	G	1769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.771;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=51;PP=1138;ReadPosRankSum=0.787;SC=GCAATACCTGTTTTATTAAAA;SOR=0.955;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=161;TCF=59;TCR=102;TR=76;WE=23414175;WS=23414157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,84:0.47:177
chr19	23433107	rs10405424	G	C	1433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.205;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=28;PP=859;ReadPosRankSum=1.869;SC=TTGCAGGTCAGAGGGCCACAG;SOR=0.501;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=114;TCF=53;TCR=61;TR=56;WE=23433115;WS=23433097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,66:0.49:136
chr19	23542290	rs428549	AG	GC	2116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=10;PP=772;SC=CTCCCAAAGTAGTGGGATTAC;SOR=1.863;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=45;TCF=34;TCR=11;TR=39;WE=23542299;WS=23542280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr19	23542291	.	G	C	774	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MMLQ=27;MQ=57.96;NF=29;NR=10;PP=774;QD=20.7377233986;SC=TCCCAAAGTAGTGGGATTACA;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=45;TCF=34;TCR=11;TR=39;WE=23542299;WS=23542290;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,39:0.87:45
chr19	23543834	rs7255296	C	T	2667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.9993;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=41;PP=1601;SC=TATGAATTCTCTTATGTTTAG;SOR=0.963;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=102;TCF=54;TCR=48;TR=95;WE=23543842;WS=23543827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr19	23545004	rs296092	G	A	6602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=110;NR=108;PP=2965;SC=CTTTAGCACAGATTATTTTAT;SOR=0.842;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=219;TCF=110;TCR=109;TR=218;WE=23545012;WS=23544994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr19	23545530	.	GA	G	141.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.483;ClippingRankSum=0.000;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=7.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.37;ReadPosRankSum=-0.192;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,12:0.29:42
chr19	23557966	rs12976946	T	A	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=5.927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.99;ReadPosRankSum=-0.615;SOR=0.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr19	23557967	.	T	A	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.655;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=5.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.74;ReadPosRankSum=1.441;SOR=2.461;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
chr19	23837145	rs11671053	A	G	830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=15;PP=449;ReadPosRankSum=-0.788;SC=GCAGAAATTCACCTTGGTATA;SOR=0.866;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=44;TCF=21;TCR=23;TR=29;WE=23837153;WS=23837135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,35:0.69:51
chr19	23837365	rs4380159	A	C	5613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=101;NR=82;PP=2965;SC=CCCTTGTGCAACTTACATTCA;SOR=0.732;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=183;TCF=101;TCR=82;TR=183;WE=23837373;WS=23837355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
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chr19	23927468	rs1818989	A	G	1821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=31;PP=1035;SC=AGTAAGGGTTAAGGACTGATT;SOR=1.214;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=25;TCR=31;TR=56;WE=23927476;WS=23927458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr19	23927741	rs61397759	CCA	C	940.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=487;ReadPosRankSum=0.590;SC=AAAGGCTTTTCCACAGTCTTC;SOR=0.616;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=12;WE=23927750;WS=23927731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,25:0.51:49
chr19	23928102	rs7248674	C	G	3724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=75;PP=2237;SC=GGTGAAAAGTCTTGGGCAAAA;SOR=1.307;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=51;TCR=76;TR=126;WE=23928110;WS=23928092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr19	23941459	rs6417220	G	A	3650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=77;NR=39;PP=2109;SC=GGAGAACTCAGGGCGCAAATT;SOR=1.424;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=77;TCR=39;TR=116;WE=23941467;WS=23941449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr19	29704002	rs11666764	T	C	4568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.08;QD=44.79;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr19	29704010	rs8100724	A	C	4698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.76;QD=43.11;SOR=0.749;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr19	30017572	.	G	A	2326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.237;ClippingRankSum=0.000;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=37;PP=1283;ReadPosRankSum=-0.537;SC=CGTGGCCGACGGTGAGCGCGG;SOR=0.657;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=191;TCF=119;TCR=72;TR=95;WE=30017580;WS=30017562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,110:0.50:220
chr19	30097134	.	G	A	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=154;ReadPosRankSum=-1.459;SC=GCGAGCGCCGGTGATGTCACG;SOR=0.853;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=11;WE=30097142;WS=30097124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr19	30193721	rs10424582	G	A	3843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=52;PP=2378;SC=TGACCAGCGCGGTCAGCTGCA;SOR=0.991;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=129;TCF=77;TCR=52;TR=129;WE=30193729;WS=30193711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr19	30303714	rs3218029	T	TC	3718.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=55;PP=2126;ReadPosRankSum=1.581;SC=TTGGGGAGCATCCCCCCCATC;SOR=0.376;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=89;TCF=25;TCR=64;TR=73;WE=30303722;WS=30303703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,147:0.98:150
chr19	30313523	rs67602822	CCTT	C	730.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.026;NF=1;NR=11;PP=442;ReadPosRankSum=-1.041;SC=CAGTGCTGCTCCTTCTTTCAG;SOR=0.495;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=12;WE=30313533;WS=30313513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr19	30313576	rs3218069	C	T	349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=11;PP=275;SC=ATAGGCCAGCCGCGGTGGTTC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=30313584;WS=30313566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	30314666	rs7257694	C	T	1971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=48;PP=1366;SC=AGCAGAGCAGCGGGCCGGAAA;SOR=2.139;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=18;TCR=48;TR=66;WE=30314674;WS=30314656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr19	30433668	rs1990903	C	T	1096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=25;PP=684;SC=CCCAGCTGCCCGGGCCCCCGG;SOR=1.923;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=11;TCR=25;TR=36;WE=30433676;WS=30433658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr19	30500118	rs3840928	GTGA	G	6257.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-1.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.572;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.396;NF=28;NR=102;PP=2993;ReadPosRankSum=1.076;SC=TCTTACCACAGTGATGATGAT;SOR=0.442;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=162;TCF=36;TCR=126;TR=130;WE=30500131;WS=30500108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:13,247:0.95:260
chr19	30500143	.	TGAC	T	2306	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MMLQ=25;MQ=60.47;NF=22;NR=102;PP=2306;QD=18.6612903226;SC=ATGATGATGATGACGACGACG;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=244;TCF=53;TCR=191;TR=124;WE=30500153;WS=30500130;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:120,124:0.51:244
chr19	31038995	rs1469705	T	C	2571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.641;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=51;PP=1442;ReadPosRankSum=0.625;SC=ACCACAAGGATGAGATGTCAA;SOR=0.536;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=211;TCF=105;TCR=106;TR=108;WE=31039003;WS=31038985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,121:0.52:232
chr19	31840190	rs71173962	AG	A	1517.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=29;PP=1154;SC=ACAGGGAGGGAGGGGGCGGCG;SOR=1.708;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=32;WE=31840198;WS=31840180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr19	32083696	rs7245697	T	C	7816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=134;NR=123;PP=2965;SC=ATGGCTCTACTGCCGTCCACC;SOR=0.721;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=257;TCF=134;TCR=123;TR=257;WE=32083704;WS=32083686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,290:1.00:290
chr19	32873698	rs2270399	A	G	2498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.481;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=51;PP=1416;ReadPosRankSum=-0.066;SC=CTGGAAGTTCAGAAAATGCAG;SOR=0.636;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=207;TCF=107;TCR=100;TR=106;WE=32873706;WS=32873688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,121:0.52:231
chr19	32930069	rs6510249	G	A	3229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.509;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=78;PP=1934;ReadPosRankSum=-0.635;SC=AGAACTGGGCGCTGCCATTCT;SOR=0.825;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=268;TCF=132;TCR=136;TR=144;WE=32930077;WS=32930059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,157:0.53:297
chr19	32948885	rs11385163	A	AT	779.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=7;PP=432;ReadPosRankSum=-0.523;SC=ACATTTACTGATTTTGTACAC;SOR=0.650;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=40;TCF=23;TCR=17;TR=14;WE=32948893;WS=32948875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,32:0.44:73
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chr19	33098632	rs2302970	G	C	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.555;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=317;ReadPosRankSum=0.118;SC=CAGCAGGAGGGGGATGAGGTC;SOR=0.335;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=58;TCF=45;TCR=13;TR=26;WE=33098640;WS=33098622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,29:0.44:66
chr19	33098870	rs2903755	C	T	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.16;ReadPosRankSum=-2.065;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,15:0.42:36
chr19	33098875	rs2868150	T	C	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.54;ReadPosRankSum=-1.339;SOR=0.562;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,11:0.35:31
chr19	33106621	rs405858	C	T	2052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.048;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=41;PP=1163;ReadPosRankSum=0.557;SC=ATTCGGGGTCCGCTGCACTGA;SOR=0.671;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=184;TCF=100;TCR=84;TR=87;WE=33106629;WS=33106611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,100:0.47:215
chr19	33110149	rs28615461	T	C	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.966;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=9;PP=372;ReadPosRankSum=1.071;SC=CCCCAGCCCTTCCTCTGGAAG;SOR=0.303;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=39;TCF=26;TCR=13;TR=25;WE=33110157;WS=33110139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,28:0.67:42
chr19	33110204	rs2287669	T	C	1062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=14;PP=571;ReadPosRankSum=0.004;SC=TGCCTTGAGCTGGCTGACATG;SOR=0.659;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=72;TCF=50;TCR=22;TR=42;WE=33110212;WS=33110194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,50:0.56:89
chr19	33117666	rs6510271	T	C	1796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.564;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=33;PP=1100;ReadPosRankSum=-0.987;SC=GCGGAGTGGCTCCATGGTAGT;SOR=0.642;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=151;TCF=87;TCR=64;TR=76;WE=33117674;WS=33117656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,86:0.51:170
chr19	33117842	rs6510272	C	A	1549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.692;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=45;PP=1005;ReadPosRankSum=-1.369;SC=GGCATGAAACCCACGGTAGAT;SOR=0.610;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=41;TCR=81;TR=68;WE=33117850;WS=33117832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,70:0.54:129
chr19	33117884	rs6510273	T	C	599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=5.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.474;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=491;ReadPosRankSum=-1.139;SC=CTACAGCTAATATAAAGTAAG;SOR=1.905;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=48;TCF=5;TCR=43;TR=22;WE=33117892;WS=33117874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,22:0.46:48
chr19	33119883	rs6510274	A	G	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.458;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=63;ReadPosRankSum=0.018;SC=CTGGAGTGCAATGGTGTGATC;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=5;WE=33119891;WS=33119873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr19	33130496	rs11084666	T	C	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=169;ReadPosRankSum=-0.226;SC=TCTAGTCAGTTGGTTCGCTCA;SOR=0.368;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=13;WE=33130504;WS=33130486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr19	33131112	rs3760943	G	A	635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=4.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.576;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.109;NF=23;NR=0;PP=458;ReadPosRankSum=0.643;SC=CTCGTGATCCGCCCGCCTTGG;SOR=1.819;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=43;TCR=3;TR=23;WE=33131120;WS=33131102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,25:0.51:49
chr19	33131336	rs10416829	T	C	3523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=412;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=102;PP=1922;ReadPosRankSum=-0.698;SC=GAGATTCAAATGGACTGACAA;SOR=0.672;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=378;TCF=157;TCR=221;TR=173;WE=33131344;WS=33131326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:228,184:0.45:412
chr19	33133936	rs3841621	CG	C	363.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.927;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=409;ReadPosRankSum=0.753;SC=ATCAAACCAGCGTGTCACCTC;SOR=1.525;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=12;WE=33133944;WS=33133926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,13:0.31:42
chr19	33134425	rs259229	G	A	2310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.132;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=48;PP=1504;ReadPosRankSum=-0.320;SC=AAAGGGCTTGGATTTGCATGG;SOR=0.688;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=171;TCF=91;TCR=80;TR=98;WE=33134433;WS=33134415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,105:0.55:190
chr19	33134635	rs259228	A	G	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5729;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=120;ReadPosRankSum=0.084;SC=AAGTGCTAACACAAGCTTTAT;SOR=1.022;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=7;WE=33134643;WS=33134625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr19	33135458	rs259225	C	T	450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.582;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=281;ReadPosRankSum=2.970;SC=TCCTACAGGGCCTAGGCCCTC;SOR=0.301;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=38;TCF=8;TCR=30;TR=18;WE=33135466;WS=33135448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr19	33137629	rs259220	T	A	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.539;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=292;ReadPosRankSum=-1.472;SC=CTTCACCCCATTGTGGGTTTG;SOR=0.118;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=18;WE=33137637;WS=33137619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr19	33140457	rs117928561	C	A	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=310;ReadPosRankSum=0.222;SC=CAGCCCCCCACGGGGCTGCAG;SOR=0.818;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=17;WE=33140465;WS=33140447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr19	33149768	rs259251	G	A	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.706;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=245;ReadPosRankSum=-0.696;SC=AGTCTACCACGTCTCTGGAAC;SOR=0.188;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=19;WE=33149776;WS=33149758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,22:0.56:39
chr19	33150045	rs11486502	C	T	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=7.908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.44;ReadPosRankSum=-0.481;SOR=2.266;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
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chr19	33182993	rs200386314	C	T	1670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=23;PP=940;ReadPosRankSum=1.697;SC=CGAGGGCTTCCGGCTGCTGCT;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=117;TCF=78;TCR=39;TR=70;WE=33183001;WS=33182983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,76:0.60:126
chr19	33183291	rs8108621	G	A	4219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=74;PP=1835;ReadPosRankSum=-0.399;SC=CTGCTGCTGCGGCCCAGGACT;SOR=0.715;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=237;TCF=95;TCR=142;TR=123;WE=33183299;WS=33183281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,137:0.52:262
chr19	33183316	rs8109823	A	G	3236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.317;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=53;PP=1355;ReadPosRankSum=1.606;SC=CACCAGGCCCAGCACCCGGGC;SOR=0.865;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=153;TCF=51;TCR=102;TR=77;WE=33183324;WS=33183306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,85:0.51:167
chr19	33211069	rs13346373	C	T	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=173;ReadPosRankSum=0.627;SC=CAGCCGCGCACAGCCTCCCAC;SOR=0.850;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=10;WE=33211077;WS=33211059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,10:0.34:29
chr19	33239450	rs4805805	C	G	1643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.856;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=51;PP=1097;ReadPosRankSum=0.719;SC=AAGCCAGTGCCTGATCACTGC;SOR=0.838;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=173;TCF=69;TCR=104;TR=79;WE=33239458;WS=33239440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,81:0.44:185
chr19	33240570	rs9783983	G	A	685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=284;ReadPosRankSum=-0.690;SC=GGTCCTGCCCGAGGAAGACAT;SOR=0.668;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=21;WE=33240578;WS=33240560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,30:0.70:43
chr19	33248164	.	A	G	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.012;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=183;ReadPosRankSum=-0.724;SC=TAATGTAACCAATTTGTGATG;SOR=1.314;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=10;WE=33248172;WS=33248154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr19	33264348	rs12608647	G	T	2064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.715;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=33;PP=1130;ReadPosRankSum=2.076;SC=CTGAAGAAAAGTTTTCTTTTA;SOR=0.932;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=199;TCF=118;TCR=81;TR=91;WE=33264356;WS=33264338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,104:0.46:228
chr19	33281924	rs11881633	A	G	1848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.125;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=38;PP=1158;ReadPosRankSum=-1.794;SC=GAACAAGATCAAGCCCTGCTT;SOR=0.604;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=171;TCF=96;TCR=75;TR=82;WE=33281932;WS=33281914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,91:0.48:189
chr19	33282109	rs11878874	C	T	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=159;ReadPosRankSum=2.501;SC=TTTGAGATTACAGGCATGAGC;SOR=0.446;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=10;WE=33282117;WS=33282099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr19	33291240	.	T	C	2059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.112;ClippingRankSum=0.000;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.139;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=54;PP=1106;ReadPosRankSum=2.568;SC=TGGAAGAGGCTGCTCTCTATG;SOR=0.800;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=173;TCF=70;TCR=103;TR=90;WE=33291248;WS=33291230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,102:0.53:191
chr19	33292568	rs12976876	A	T	1111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.787;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=12;PP=595;ReadPosRankSum=0.531;SC=TCACAGATAAATTAAAGTGCT;SOR=0.818;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=86;TCF=58;TCR=28;TR=42;WE=33292576;WS=33292558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,52:0.52:100
chr19	33294082	rs10404371	G	A	1596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.298;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=39;PP=943;ReadPosRankSum=2.000;SC=TTAAACTGATGTATAACCTGC;SOR=0.570;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=58;TCR=72;TR=72;WE=33294090;WS=33294072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,78:0.52:150
chr19	33304690	rs8107900	C	T	1105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.408;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=25;PP=647;ReadPosRankSum=-2.089;SC=ATGGTAAGTACGCATTTTTTC;SOR=0.881;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=95;TCF=50;TCR=45;TR=46;WE=33304698;WS=33304680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,54:0.48:112
chr19	33304711	rs67051599	ATTTG	A	1065.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.913;HP=3;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=1320;ReadPosRankSum=0.221;SC=TTAGAAATAAATTTGTTTGAA;SOR=1.765;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=45;TCF=8;TCR=37;TR=19;WE=33304725;WS=33304701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,30:0.38:78
chr19	33304717	rs61062732	T	C	1077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.406;HP=2;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=16;PP=1315;ReadPosRankSum=0.281;SC=ATAAATTTGTTTGAATGGGCG;SOR=1.558;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=63;TCF=29;TCR=34;TR=24;WE=33304725;WS=33304701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,30:0.40:75
chr19	33308824	.	AG	A	623	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=20;NR=4;PP=623;QD=27.0416666667;SC=CAGCCCACCCAGGCATCCTAG;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=42;TCF=36;TCR=6;TR=24;WE=33308832;WS=33308814;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:18,24:0.57:42
chr19	33308875	rs373375139	CA	C	189.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=3.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.14;MQRankSum=1.363;QD=2.64;ReadPosRankSum=-0.324;SOR=0.317;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,22:0.31:72
chr19	33316928	rs140235732	G	GTA	736.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.144;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=743;ReadPosRankSum=0.729;SC=GTACAAAAAAGTATATATATA;SOR=0.439;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=47;TCF=32;TCR=15;TR=17;WE=33316936;WS=33316918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,25:0.38:65
chr19	33321447	rs2287884	A	G	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=3.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.662;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=171;ReadPosRankSum=1.115;SC=TTTATTCGTAAGAAAAAAAGG;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=8;WE=33321455;WS=33321437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr19	33321717	.	AG	GG	1129	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=60.28;NF=2,14;NR=22,21;PP=1129,804;QD=49.9545836849;SC=CCCTGTGCTCAGGATGGCCAG;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=49;TCF=2;TCR=47;TR=24,35;WE=33321725;WS=33321707;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:43,35:0.45:78
chr19	33321717	.	AG	AGGG	1129	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=60.28;NF=2,14;NR=22,21;PP=1129,804;QD=49.9545836849;SC=CCCTGTGCTCAGGATGGCCAG;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=49;TCF=2;TCR=47;TR=24,35;WE=33321725;WS=33321707;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:25,24:0.49:49
chr19	33321717	rs3214460	A	G,AGG	2958.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.34;QD=32.87;SOR=1.434;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,39,51:0.43,0.57:90
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chr19	33333155	rs2287881	G	A	2943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=68;PP=1727;ReadPosRankSum=0.015;SC=ACAGCCATGCGGCAAAGCTGA;SOR=0.689;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=262;TCF=117;TCR=145;TR=125;WE=33333163;WS=33333145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,141:0.49:287
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chr19	33353041	rs1007161	G	A	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.634;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=329;ReadPosRankSum=-0.197;SC=CATAGGCCCAGAGTCCATTGT;SOR=1.220;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=54;TCF=36;TCR=18;TR=23;WE=33353049;WS=33353031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,24:0.39:62
chr19	33353061	rs1007160	G	T	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.693;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=397;ReadPosRankSum=0.209;SC=TAAAACGCCAGGCTGATGGCT;SOR=1.332;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=74;TCF=51;TCR=23;TR=30;WE=33353069;WS=33353051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,33:0.37:89
chr19	33353343	rs11084671	A	G	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.302;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=7;PP=236;ReadPosRankSum=-0.194;SC=GTGCCCGTGCAGGGCCCACCC;SOR=0.420;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=36;TCF=24;TCR=12;TR=18;WE=33353351;WS=33353333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr19	33353464	rs11084673	G	A	1652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=35;PP=844;ReadPosRankSum=0.516;SC=CCAGCCGCACGCTCAGTGAGT;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=145;TCF=77;TCR=68;TR=73;WE=33353472;WS=33353454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,84:0.50:168
chr19	33355055	rs12150889	A	G	1265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=20;PP=716;ReadPosRankSum=0.746;SC=CTTGCAGCCCACATAGAAGGG;SOR=0.632;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=110;TCF=72;TCR=38;TR=56;WE=33355063;WS=33355045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,64:0.50:128
chr19	33355081	rs35170371	G	A	1895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.168;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=30;PP=1055;ReadPosRankSum=-1.311;SC=ACACATACTCGGAGAAGCTGA;SOR=0.793;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=151;TCF=92;TCR=59;TR=80;WE=33355089;WS=33355071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,92:0.52:177
chr19	33355513	rs12150904	A	C	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=3;PP=402;ReadPosRankSum=-0.845;SC=CGGGGCTGCAACAGGCTCCCA;SOR=0.793;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=42;TCF=36;TCR=6;TR=24;WE=33355521;WS=33355503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,26:0.52:50
chr19	33370070	rs745961	A	G	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=695;ReadPosRankSum=0.000;SC=CGCAGATTCTAGCAGGTGGGG;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=11;WE=33370092;WS=33370060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr19	33370084	rs745960	T	A	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.084;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=665;ReadPosRankSum=0.788;SC=GGTGGGGGCATGAGACTTCAG;SOR=2.904;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=16;WE=33370092;WS=33370060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr19	33370161	rs745959	A	C	2509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.140;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=40;PP=1508;ReadPosRankSum=1.010;SC=GGCTGGGGGCAACCAGAGCTC;SOR=0.594;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=172;TCF=105;TCR=67;TR=100;WE=33370169;WS=33370151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,113:0.57:197
chr19	33390693	rs10420862	T	A	703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.964;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=450;ReadPosRankSum=1.572;SC=GATCATTTTTTAAAATACTCT;SOR=0.493;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=55;TCR=19;TR=30;WE=33390701;WS=33390683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,34:0.41:82
chr19	33390796	rs10418340	G	A	8455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=163;NR=131;PP=2965;SC=CCTGGGTTATGTTTTCTGCCA;SOR=0.846;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=294;TCF=163;TCR=131;TR=294;WE=33390804;WS=33390786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,321:1.00:321
chr19	33392087	rs7253415	C	T	2114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=11;PP=1390;SC=CCACTGTACCCAGACCATTTG;SOR=2.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=51;TCR=11;TR=62;WE=33392095;WS=33392077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr19	33406442	rs7246178	A	G	3639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=70;PP=2221;SC=CAAAAGAGGAAGATAAAAACT;SOR=1.724;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=36;TCR=70;TR=106;WE=33406450;WS=33406432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr19	33406484	rs7260149	G	T	2081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=43;PP=1220;SC=ACACAATTATGGGCTATTAGG;SOR=1.802;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=22;TCR=43;TR=65;WE=33406492;WS=33406474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr19	33406549	rs7246326	A	G	508.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=287;ReadPosRankSum=-1.569;SC=CTTTTGAGCCAGACGTGGTGG;SOR=1.270;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=16;WE=33406557;WS=33406539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,19:0.95:20
chr19	33418037	.	C	CCCAT	202.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.840;ClippingRankSum=-0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.52;ReadPosRankSum=2.484;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr19	33430746	rs73051180	A	T	664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.109;HP=7;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=4;PP=396;ReadPosRankSum=-0.492;SC=ATCAGTTTTTAAAAAAAATGA;SOR=1.675;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=61;TCF=43;TCR=18;TR=26;WE=33430754;WS=33430736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,31:0.45:69
chr19	33430816	rs12461782	T	G	1297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.288;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=30;PP=789;ReadPosRankSum=-0.791;SC=GAGAGAGAGATAAACTTTTAA;SOR=0.825;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=107;TCF=55;TCR=52;TR=55;WE=33430824;WS=33430806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,63:0.49:128
chr19	33439158	rs12710001	T	C	1112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=30;NR=11;PP=772;SC=AAAATTGTGGTTTTTTTTTTC;SOR=1.900;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=43;TCF=32;TCR=11;TR=41;WE=33439166;WS=33439148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr19	33439187	rs3764633	G	A	992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=16;PP=643;ReadPosRankSum=0.263;SC=TGTTGTGTCCGCTGTGGTGCA;SOR=0.760;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=80;TCF=54;TCR=26;TR=46;WE=33439195;WS=33439177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,48:0.54:89
chr19	33444453	rs75223967	T	G	18256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=635;ExcessHet=3.0103;FS=0.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.84;ReadPosRankSum=1.774;SOR=0.766;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:164,469:0.74:633
chr19	33444456	rs2944021	A	G	11613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=656;ExcessHet=3.0103;FS=0.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.76;ReadPosRankSum=0.116;SOR=0.752;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:237,417:0.64:654
chr19	33444479	rs79480383	C	T	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=765;ExcessHet=3.0103;FS=1.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.35;ReadPosRankSum=1.620;SOR=0.878;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:660,100:0.13:760
chr19	33444511	rs80283382	T	C	11445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=740;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.838;HP=2;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=307;NR=358;PP=2962;ReadPosRankSum=1.593;SC=ACTGGGAACATAGAAAACACC;SOR=0.883;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=921;TCF=440;TCR=481;TR=665;WE=33444519;WS=33444501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:266,466:0.64:732
chr19	33444556	.	T	C	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=40;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=151;NR=276;PP=2962;QD=20;SC=AGGTCATCACTGTGGCCTCCT;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=654;TCF=257;TCR=397;TR=427;WE=33444564;WS=33444546;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:227,427:0.65:654
chr19	33444576	.	C	T	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=26;MMLQ=28;MQ=59.95;NF=75;NR=192;PP=2962;QD=20;SC=TCTGTCCTCCCGGGCACTGAC;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=467;TCF=163;TCR=304;TR=267;WE=33444596;WS=33444566;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:200,267:0.57:467
chr19	33444588	.	T	G	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;FR=0.5000;HP=5;HapScore=1;MGOF=26;MMLQ=27;MQ=59.93;NF=40;NR=149;PP=2962;QD=20;SC=GGCACTGACATCCCCCAATTC;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=368;TCF=122;TCR=246;TR=189;WE=33444596;WS=33444566;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:179,189:0.51:368
chr19	33462564	.	T	TA	129.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.130;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.35;MQRankSum=1.350;QD=4.47;ReadPosRankSum=1.037;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr19	33464225	rs73037453	C	T	1422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.614;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=31;PP=1099;ReadPosRankSum=0.825;SC=GGCCTGCCCTCTGCCAGCCCT;SOR=0.803;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=153;TCF=91;TCR=62;TR=77;WE=33464233;WS=33464215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,69:0.47:147
chr19	33467620	rs7247715	T	C	929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=29;PP=650;SC=CATCTTCTCCTGAGACCACAA;SOR=3.797;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=33;WE=33467628;WS=33467610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	33481388	rs7250684	C	T	1451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.614;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.243;NF=41;NR=18;PP=865;ReadPosRankSum=1.155;SC=TCCACGCCACCACTGACTGCC;SOR=0.925;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=104;TCF=70;TCR=34;TR=59;WE=33481396;WS=33481378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,64:0.56:114
chr19	33484776	rs28370302	G	T	1032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.686;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=10;PP=721;ReadPosRankSum=-0.235;SC=AAGCCCCCCAGTTTGAGGCAT;SOR=1.302;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=73;TCF=53;TCR=20;TR=44;WE=33484784;WS=33484766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,45:0.59:76
chr19	33486810	rs4805026	A	G	740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=1;PP=701;SC=CTCAGTCCCTACCCTGTGCAG;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=33486830;WS=33486808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	33486822	rs8110267	T	C	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.191;HP=2;HapScore=4;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.305;NF=8;NR=1;PP=162;ReadPosRankSum=-1.156;SC=CCTGTGCAGCTCTCCTTGTGC;SOR=0.078;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=9;WE=33486830;WS=33486808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr19	33486845	rs35671943	G	A	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.818;NF=15;NR=4;PP=303;ReadPosRankSum=-0.772;SC=AGCACACAGCGAGGGCTCGCT;SOR=0.760;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=41;TCF=32;TCR=9;TR=19;WE=33486853;WS=33486835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,19:0.46:41
chr19	33487071	rs12610600	G	C	1865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.291;NF=47;NR=42;PP=1000;ReadPosRankSum=-1.037;SC=TGCAGAGGCTGGCCTCCCGCA;SOR=0.720;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=221;TCF=120;TCR=101;TR=89;WE=33487079;WS=33487061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,98:0.40:245
chr19	33487182	rs11084689	A	G	755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.874;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.111;NF=9;NR=23;PP=470;ReadPosRankSum=-1.466;SC=CAGAGCATAAAGGCCCAAGGG;SOR=0.303;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=70;TCF=16;TCR=54;TR=32;WE=33487190;WS=33487172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,36:0.48:75
chr19	33487251	rs8110730	T	C	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.627;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.447;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-2.352;NF=1;NR=7;PP=106;ReadPosRankSum=-1.179;SC=AGCTAGAGCCTGTGATACCCT;SOR=1.609;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=8;WE=33487259;WS=33487241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr19	33490480	rs74603434	G	A	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=6.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.41;MQRankSum=-8.209;QD=3.66;ReadPosRankSum=-1.639;SOR=1.778;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,14:0.18:77
chr19	33490487	.	C	T	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.357;ClippingRankSum=0.000;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=15.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.67;MQRankSum=-6.151;QD=0.71;ReadPosRankSum=-3.278;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,11:0.13:87
chr19	33490500	rs201438314	C	T	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=11.495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.84;MQRankSum=-6.351;QD=2.62;ReadPosRankSum=-4.415;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,22:0.19:113
chr19	33490585	rs78615454	G	A	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.16;MQRankSum=-2.353;QD=1.05;ReadPosRankSum=1.922;SOR=0.692;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:235,47:0.17:282
chr19	33490667	rs200498530	G	A	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.017;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-8.647;NF=8;NR=18;PP=288;ReadPosRankSum=-5.380;SC=ACAGACCCACGTAGAGATTTC;SOR=1.356;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=80;TCF=32;TCR=48;TR=26;WE=33490675;WS=33490657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,29:0.33:88
chr19	33517376	rs73039418	A	G	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=189;ReadPosRankSum=0.203;SC=TCTCTGGCTCAGAGGCTTTTG;SOR=0.624;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=56;TCF=37;TCR=19;TR=21;WE=33517384;WS=33517366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,25:0.39:64
chr19	33585219	rs58636263	CT	C	130.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.28;MQRankSum=0.904;QD=8.17;ReadPosRankSum=0.327;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr19	33685836	rs60145560	T	C	1266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=19;NR=21;PP=617;SC=CTGACCGACCTCCTCTCCGGC;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=19;TCR=21;TR=40;WE=33685844;WS=33685826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr19	33695830	rs11666900	G	A	1795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=47;PP=1361;SC=CCGGCCCACAGGGGCGGCACC;SOR=2.760;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=61;TCF=14;TCR=47;TR=60;WE=33695838;WS=33695820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr19	33696402	rs376311103	C	T	1561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.631;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=26;PP=1004;ReadPosRankSum=1.444;SC=ACTGCGGCGACGGCTCGGATG;SOR=0.597;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=132;TCF=82;TCR=50;TR=66;WE=33696410;WS=33696392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,71:0.49:144
chr19	33696708	rs2112800	T	C	5260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=92;PP=2965;SC=GCCGCCTCACTGTGGCCTACC;SOR=0.822;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=182;TCF=90;TCR=92;TR=182;WE=33696716;WS=33696698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr19	33698291	rs3745974	T	C	3359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=44;PP=1948;SC=GAGCCACTGGTAGACGGCCCA;SOR=0.743;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=60;TCR=44;TR=104;WE=33698299;WS=33698281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr19	33698655	rs376080905	C	CGG	541.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.53;QD=41.67;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	33698657	.	G	GGGC	378	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=34;MMLQ=24;MQ=61.34;NF=0;NR=12;PP=378;QD=34.25;SC=GGACTGAACGGCGGGGGGGAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=12;WE=33698665;WS=33698647;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr19	33699664	rs57394649	T	TA	1484.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=8;PP=1083;SC=AGGGCTTCCTTAAACAGGCTT;SOR=2.303;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=33;TCF=21;TCR=12;TR=27;WE=33699672;WS=33699654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr19	33700445	rs2303093	C	T	1685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=35;PP=983;SC=GCTGTCTGTACCCCCGACCCC;SOR=1.609;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=52;TCF=16;TCR=36;TR=51;WE=33700453;WS=33700435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr19	33702245	rs2241378	A	G	7359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=120;PP=2965;SC=CTGGGTGGGCACAGTAGAGAG;SOR=0.806;Source=Platypus;TCF=120;WE=33702267;WS=33702235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,279:1.00:279
chr19	33702259	rs61759827	A	G	2612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.473;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=59;PP=1665;ReadPosRankSum=1.062;SC=TAGAGAGGCCATGTGTAAGGC;SOR=0.630;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=216;TCF=97;TCR=119;TR=113;WE=33702267;WS=33702235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,125:0.52:241
chr19	33703103	rs11669156	C	T	2725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=14;PP=1983;SC=AGGACCAGCCCGAGCCTTGGG;SOR=3.134;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=85;TCF=71;TCR=14;TR=84;WE=33703111;WS=33703093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr19	33703706	rs11673535	A	G	526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=12;NR=6;PP=367;SC=GGCAGGATGGAGCCCGGGCAG;SOR=1.292;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=18;WE=33703714;WS=33703696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	33792754	.	GGGC	G	52.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=2;PP=34;ReadPosRankSum=-0.165;SC=GCGGGTGCGAGGGCGGCGGCG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=2;WE=33792764;WS=33792744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,4:0.13:30
chr19	33953743	rs6510386	A	G	2240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=18;PP=1409;SC=GGGCGCAGTCAGAAGAAAAAT;SOR=1.967;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=78;TCF=60;TCR=18;TR=77;WE=33953751;WS=33953733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr19	33968814	rs35273650	GA	G	2598.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.13;NF=32;NR=19;PP=1984;SC=AAGCAAAACAGAAAAGGCTAT;SOR=1.854;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=57;TCF=33;TCR=24;TR=51;WE=33968822;WS=33968804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr19	33984050	rs10411395	T	C	1365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=27;NR=21;PP=781;SC=TCAAGGCACTTGGATAACAGG;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=27;TCR=21;TR=48;WE=33984058;WS=33984040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr19	34012861	rs40500	C	T	154.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.11;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	34288152	.	G	GGT	121	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5005;HP=1;HapScore=3;MGOF=9;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=4;NR=0;PP=121;QD=31.0;SC=CCTGCCGCGCGGTGTGTGTGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=4;WE=34288160;WS=34288150;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr19	34303985	rs117133644	C	A	2756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.448;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=58;PP=1733;ReadPosRankSum=0.238;SC=GCCCAGCGAGCACCAGGGTCC;SOR=0.679;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=246;TCF=130;TCR=116;TR=122;WE=34303993;WS=34303975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,133:0.51:263
chr19	34304260	rs60235724	A	AT	1730.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.935;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.084;NF=12;NR=26;PP=1312;ReadPosRankSum=-0.006;SC=GAGATGGCTTATTTTCTACAG;SOR=0.487;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=88;TCF=31;TCR=57;TR=38;WE=34304268;WS=34304250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,69:0.47:148
chr19	34583729	rs61743238	A	G	1199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.201;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=17;PP=570;ReadPosRankSum=-0.931;SC=CCAGTCTCCAAATCAATCTGA;SOR=0.764;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=106;TCF=60;TCR=46;TR=47;WE=34583737;WS=34583719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,60:0.45:133
chr19	34584137	rs574004	A	G	1170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=19;PP=753;ReadPosRankSum=-0.330;SC=CGAGCAGCAAACACACCAGTC;SOR=0.759;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=108;TCF=68;TCR=40;TR=50;WE=34584145;WS=34584127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,55:0.44:124
chr19	34687746	rs3119815	C	A	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=73;ReadPosRankSum=-0.227;SC=AACTCAACACCAACTATTAGA;SOR=0.569;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=6;WE=34687754;WS=34687736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr19	34706440	rs57270694	A	G	1130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=23;PP=720;ReadPosRankSum=1.414;SC=ATTTCTAACTATGGAAGTTTT;SOR=0.643;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=101;TCF=58;TCR=43;TR=50;WE=34706448;WS=34706430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,54:0.47:114
chr19	34710532	rs2297521	A	G	1090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.036;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=13;PP=568;ReadPosRankSum=0.165;SC=TGTGAATTACAGATGTTTCTC;SOR=1.106;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=81;TCF=50;TCR=31;TR=44;WE=34710540;WS=34710522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,52:0.57:91
chr19	34710807	rs2599557	A	C	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=17;PP=372;ReadPosRankSum=0.628;SC=CTGTTCTTTTATCTTATGATA;SOR=0.684;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=59;TCF=20;TCR=39;TR=27;WE=34710815;WS=34710797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,27:0.45:60
chr19	34712654	rs536367	C	T	1661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.986;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=34;PP=1007;ReadPosRankSum=0.049;SC=GTAAGTGTTACTGTTAATAAA;SOR=0.678;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=143;TCF=77;TCR=66;TR=75;WE=34712662;WS=34712644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,81:0.52:157
chr19	34712736	rs537252	T	C	978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.585;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=31;PP=751;ReadPosRankSum=-0.383;SC=GTGAATTGTTTTGAGGACATT;SOR=1.790;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=62;TCF=14;TCR=48;TR=37;WE=34712744;WS=34712726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,38:0.59:64
chr19	34810671	rs149401501	AG	A	446.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.251;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=334;ReadPosRankSum=-1.432;SC=ATCCTTCTGAAGCATGGTGGC;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=10;WE=34810679;WS=34810661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr19	34842488	rs392340	T	C	1912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.605;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=39;PP=960;ReadPosRankSum=0.481;SC=CGGTGGAGGATGTGAACCAGG;SOR=0.750;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=135;TCF=71;TCR=64;TR=82;WE=34842496;WS=34842478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,90:0.60:151
chr19	34843761	rs397414	C	A	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.819;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=12;PP=235;ReadPosRankSum=1.508;SC=AGACCCCACCCCAGCCCCCAC;SOR=0.328;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=42;TCF=17;TCR=25;TR=22;WE=34843769;WS=34843751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,25:0.58:43
chr19	34843874	rs72121022	AGCCTGCCT	A	128.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=1177;ReadPosRankSum=1.282;SC=CAGGCCAGCCAGCCTGCCTGC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=3;WE=34843889;WS=34843864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr19	34859457	rs2099099	G	A	729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.988;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=10;PP=509;ReadPosRankSum=-0.992;SC=GTTGGGGGGGGCAGTCTTTAT;SOR=0.512;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=68;TCF=53;TCR=15;TR=34;WE=34859465;WS=34859447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,36:0.46:78
chr19	34885006	rs8108038	A	G	2560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=50;PP=1582;SC=GGAGTCAGCAAGATTTGTGGG;SOR=1.346;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=32;TCR=50;TR=82;WE=34885014;WS=34884996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr19	34890322	rs2301263	G	A	2444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=38;PP=1436;SC=GGCTTGGGGCGTGCCTGGCTT;SOR=0.859;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=38;TCR=38;TR=76;WE=34890330;WS=34890312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr19	34904539	rs9653103	C	G	209.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=0;PP=116;SC=ACTGCGCCTGCCCTGATAAAA;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=34904547;WS=34904529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
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chr19	34945331	.	CT	C	58.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=0.000;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=10.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.61;MQRankSum=3.336;QD=1.47;ReadPosRankSum=-0.086;SOR=0.414;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,9:0.22:40
chr19	34954873	rs10412944	C	G	469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=2;PP=372;SC=TTTAAAAAATCAACCTGACTG;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=34954881;WS=34954863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
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chr19	34959979	rs7259160	A	G	2736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=50;PP=1844;SC=TAGTTGATTCAGATGAAGAAG;SOR=0.992;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=41;TCR=50;TR=91;WE=34959987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr19	34971763	rs7257588	T	C	3484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=37;PP=2076;SC=CCCTGACAGATAACGGTTTGG;SOR=1.317;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=74;TCR=37;TR=111;WE=34971771;WS=34971753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr19	34971846	rs4344866	C	T	6560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=122;NR=95;PP=2965;SC=CCCTAGTCACCTCTCGATTCC;SOR=0.760;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=217;TCF=122;TCR=95;TR=217;WE=34971854;WS=34971836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr19	34971998	rs7248705	G	A	3034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=45;PP=1989;SC=GGGGAGGCTCGCCGCCCACCG;SOR=0.749;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=55;TCR=45;TR=100;WE=34972006;WS=34971988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr19	34972146	rs7248847	G	C	5296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=93;PP=2936;SC=TTCAGAGGCCGGTGCGCGGCC;SOR=0.776;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=183;TCF=90;TCR=93;TR=183;WE=34972154;WS=34972136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr19	34972892	rs12609305	A	C	302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.29;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	34973413	rs1465433	T	C	545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=11;PP=380;SC=CGGGGCCGGCTCCCTTCCCGC;SOR=1.292;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=7;TCR=11;TR=18;WE=34973421;WS=34973403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	34973476	rs8107479	G	A	267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=4;PP=133;SC=GCGCGGCCGAGCGGCGGCTGG;SOR=0.859;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=6;TCR=4;TR=10;WE=34973484;WS=34973466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	34981505	rs4321301	G	A	1336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=33;PP=864;SC=CCCAGGCTGGGCTGTGGAGGA;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=7;TCR=33;TR=40;WE=34981513;WS=34981495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr19	34985466	rs11671685	C	T	3571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=61;NR=61;PP=2064;SC=CAGCTGATCACTTCTGGTTTC;SOR=0.769;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=61;TCR=62;TR=122;WE=34985474;WS=34985456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr19	34986767	rs35126035	A	C	1570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.45;SOR=2.774;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr19	34986776	rs35570240	G	A	1473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.54;SOR=2.694;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	35033937	rs2021382	T	C	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=23.748;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-8.721;NF=26;NR=7;PP=530;ReadPosRankSum=-2.187;SC=GAAAGCTTTCTCACATTCTCT;SOR=2.715;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=117;TCF=71;TCR=46;TR=33;WE=35033945;WS=35033927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,27:0.22:122
chr19	35036089	rs7259820	G	A	594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=4;PP=497;SC=GAATTCAGCCGTTTACTTAGG;SOR=2.948;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=35036097;WS=35036083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	35036256	rs10402223	A	T	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=12.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.76;MQRankSum=-3.240;QD=0.72;ReadPosRankSum=-0.370;SOR=1.921;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,12:0.12:98
chr19	35226089	rs187306978	G	T	1031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.967;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=28;PP=629;ReadPosRankSum=0.441;SC=TAGGAAGGACGGAGCCCACAG;SOR=1.099;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=75;TCF=23;TCR=52;TR=38;WE=35226097;WS=35226079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,45:0.49:91
chr19	35231472	rs11426796	T	TA	843.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=3;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=6;PP=441;ReadPosRankSum=0.656;SC=TTCAAATAGTTAAAAAAAAAC;SOR=1.236;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=30;WE=35231480;WS=35231462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,31:0.97:32
chr19	35260281	rs2242129	G	A	1284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.303;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=24;PP=801;ReadPosRankSum=-0.043;SC=CCTAGAAAGGGTGGATTCAAA;SOR=0.581;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=77;TCR=59;TR=55;WE=35260289;WS=35260271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,62:0.42:148
chr19	35270362	rs11673342	G	C	1391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.309;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=25;PP=934;ReadPosRankSum=-1.201;SC=TGAACTCTCTGATGTTTACTG;SOR=0.510;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=114;TCF=68;TCR=46;TR=59;WE=35270370;WS=35270352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,62:0.51:122
chr19	35270543	rs7259475	G	T	903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.769;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=28;PP=581;ReadPosRankSum=-0.852;SC=GCACTCATAAGGCCTTTCTCC;SOR=0.804;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=90;TCF=36;TCR=54;TR=44;WE=35270551;WS=35270533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,46:0.46:99
chr19	35420841	rs2546001	A	G	6438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=101;NR=124;PP=2965;SC=AGTTCTTACAATTCTCAAAGC;SOR=1.012;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=225;TCF=101;TCR=124;TR=225;WE=35420849;WS=35420831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr19	35420966	rs2651123	A	G	651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=19;PP=544;SC=CTAATTGCCTACTTGATTCCT;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=35420974;WS=35420956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	35422808	rs10422961	C	T	7769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=130;NR=140;PP=2965;SC=ATAGCCTTCTCCCAGCAGGAG;SOR=0.736;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=271;TCF=131;TCR=140;TR=270;WE=35422816;WS=35422798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,284:1.00:284
chr19	35424504	rs2859486	C	A	4488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=98;NR=49;PP=2605;SC=TATTTTATTTCTTTTCTACAT;SOR=1.419;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=98;TCR=49;TR=147;WE=35424512;WS=35424494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
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chr19	35424759	rs2651101	G	C	703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=18;PP=525;SC=AAAAGGCTGAGACTTGGGTAA;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=35424767;WS=35424749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
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chr19	35434512	rs2651109	T	C	6038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=119;PP=2965;SC=AGACTATTAGTGGTAGCTATC;SOR=1.041;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=210;TCF=91;TCR=119;TR=210;WE=35434520;WS=35434502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr19	35435006	rs1345658	G	A	6164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=96;PP=2965;SC=GAATGCGGGAGAACCTTCAGT;SOR=0.832;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=193;TCF=97;TCR=96;TR=193;WE=35435014;WS=35434996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr19	35435069	rs765746	A	G	1324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.275;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=27;PP=682;ReadPosRankSum=0.322;SC=GAGAAGCCCTATGAATGTAAG;SOR=0.504;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=110;TCF=47;TCR=63;TR=51;WE=35435077;WS=35435046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,62:0.48:130
chr19	35435589	rs3761066	C	T	1376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.103;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=22;PP=839;ReadPosRankSum=0.550;SC=GTAAGGAATGCGGGAAGGCCT;SOR=0.903;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=140;TCF=88;TCR=52;TR=62;WE=35435597;WS=35435579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,68:0.44:153
chr19	35435776	rs1053213	G	A	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.427;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=350;ReadPosRankSum=2.515;SC=CTTCGTGTGTGGCTCAAACAT;SOR=1.101;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=46;TCF=10;TCR=36;TR=19;WE=35435784;WS=35435766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,19:0.39:49
chr19	35448803	rs1063235	C	A	841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=7;PP=512;SC=CGCTGATAAACTCTACAGTAA;SOR=1.765;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=25;WE=35448811;WS=35448793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	35449082	rs3746243	G	A	1715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.333;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=27;PP=1031;ReadPosRankSum=0.139;SC=CGTAAGGCCTGTCTGGTTTGT;SOR=0.857;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=126;TCF=75;TCR=51;TR=70;WE=35449090;WS=35449072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,79:0.55:143
chr19	35449409	rs2651081	G	A	1341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.940;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=22;PP=623;ReadPosRankSum=1.397;SC=CACCACACCCGTGAGGCCGCT;SOR=0.712;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=125;TCF=67;TCR=58;TR=56;WE=35449417;WS=35449399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,67:0.47:144
chr19	35449486	rs34687332	T	C	1014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=22;PP=709;ReadPosRankSum=-1.004;SC=CCACATTCGTTACACTTGTAA;SOR=0.681;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=111;TCF=58;TCR=53;TR=44;WE=35449494;WS=35449476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,47:0.39:121
chr19	35449760	rs2651080	G	C	1247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.107;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=27;PP=697;ReadPosRankSum=-0.506;SC=GGCTTTCACCGGTGTGAACCC;SOR=0.538;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=126;TCF=72;TCR=54;TR=58;WE=35449768;WS=35449750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,63:0.45:141
chr19	35450229	rs2651079	C	T	8331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=155;NR=130;PP=2965;SC=CACCTGTTTCCGGGGAAGGTT;SOR=0.824;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=285;TCF=155;TCR=130;TR=285;WE=35450237;WS=35450219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,307:1.00:307
chr19	35451124	rs77771822	C	T	782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=16;PP=403;ReadPosRankSum=0.456;SC=TCCCCTAGCTCCCATCGCTGC;SOR=0.638;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=100;TCF=54;TCR=46;TR=35;WE=35451132;WS=35451114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,42:0.38:110
chr19	35451330	rs2546024	A	G	373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=9;PP=231;SC=ATAGACTACAAGACAGGAAGC;SOR=1.765;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=35451338;WS=35451320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	35451742	rs2651078	G	A	923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.707;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=10;PP=586;ReadPosRankSum=1.031;SC=AGAGGAGCTCGGGACACCGGG;SOR=0.892;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=93;TCF=65;TCR=28;TR=39;WE=35451750;WS=35451732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,44:0.43:103
chr19	35454604	rs2546028	AA	CG	5619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=63;PP=2947;SC=ACGGTGCGGGAAACCACGGGG;SOR=1.517;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=103;TCF=39;TCR=64;TR=101;WE=35454613;WS=35454594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr19	35487125	rs67018685	G	A	2179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=42;PP=1199;ReadPosRankSum=2.164;SC=GGAGTCCCCCGCCTGCACCCC;SOR=0.690;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=165;TCF=87;TCR=78;TR=89;WE=35487133;WS=35487115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,105:0.55:192
chr19	35491326	rs3072398	A	AGCCCT	772.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=5;PP=304;SC=CGCGCAGCCCAGCCCTGCCCT;SOR=0.914;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=5;WE=35491334;WS=35491316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	35500919	rs11084797	T	C	3219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.066;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=71;PP=1804;ReadPosRankSum=0.254;SC=CCCAGCCCTGTGACTCTCCGC;SOR=0.604;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=259;TCF=136;TCR=123;TR=139;WE=35500927;WS=35500909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,153:0.53:291
chr19	35502352	rs140658050	CCT	C	105.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FS=2.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQRankSum=3.053;QD=0.39;ReadPosRankSum=0.277;SOR=0.896;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:243,28:0.10:271
chr19	35504627	rs7251988	C	A	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.682;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=21;ReadPosRankSum=0.947;SC=GGGTGGGATACTGATAGGAAG;SOR=1.022;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=4;WE=35504635;WS=35504617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr19	35506622	rs2290648	G	T	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.727;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=155;ReadPosRankSum=-0.186;SC=TCCAGGAGGTGGGGTCCGCCC;SOR=0.094;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=12;WE=35506630;WS=35506612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr19	35506729	rs2290647	G	A	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.771;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=14;PP=553;ReadPosRankSum=-0.857;SC=TGTCTCCAGCGGACTTGGCTG;SOR=0.547;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=90;TCF=55;TCR=35;TR=37;WE=35506737;WS=35506719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,41:0.41:101
chr19	35510102	rs2290646	G	C	1273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.650;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=20;PP=655;ReadPosRankSum=1.284;SC=TAGACGTGACGCTGAGCCCCT;SOR=0.796;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=67;TCR=43;TR=52;WE=35510110;WS=35510092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,64:0.49:131
chr19	35510321	rs147041737	C	T	1633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=32;PP=991;ReadPosRankSum=-0.087;SC=GCCCCCAGGCCGGCGGGTGTG;SOR=0.686;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=189;TCF=109;TCR=80;TR=77;WE=35510329;WS=35510311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,84:0.41:206
chr19	35510504	rs68162641	A	G	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.206;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=209;ReadPosRankSum=0.555;SC=CCACTCCTCAAGTCAGCAGCA;SOR=0.239;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=40;TCF=4;TCR=36;TR=14;WE=35510512;WS=35510494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,14:0.35:40
chr19	35513050	rs66984916	G	A	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=141;ReadPosRankSum=1.717;SC=AAGTGGGAGCGTGGGTTTGCT;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=9;WE=35513058;WS=35513040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
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chr19	35533550	rs11399986	A	AC	1029.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=22;PP=909;SC=ATGCATCCCCACCCCTGTTAG;SOR=2.235;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=23;WE=35533558;WS=35533540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	35541278	rs12463218	G	A	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=154;ReadPosRankSum=0.210;SC=CACCCGCCTCGGCCTCCCAAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=8;WE=35541286;WS=35541268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr19	35541330	rs57035236	TA	T	974.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=5;PP=917;SC=CTGTCCCTGGTAATTAGCTCC;SOR=2.753;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=23;WE=35541338;WS=35541320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	35556123	rs2305744	G	A	2069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=22;PP=1252;SC=GCAGGCCAGCGGGGGCTGGAC;SOR=1.488;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=46;TCR=22;TR=68;WE=35556131;WS=35556113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr19	35556281	rs2305745	G	A	5008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=84;NR=83;PP=2695;SC=TGATGCCACCGTTTGGGAGAC;SOR=0.814;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=167;TCF=84;TCR=83;TR=167;WE=35556289;WS=35556271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr19	35556300	rs2305746	A	G	5048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=78;NR=83;PP=2933;SC=ACTCTGAACTAGGCTGGGGAT;SOR=0.918;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=161;TCF=78;TCR=83;TR=161;WE=35556308;WS=35556290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr19	35556357	rs2305747	C	T	4000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=59;PP=2556;SC=GGAGTAGGGACGCTGAGGGGA;SOR=0.707;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=126;TCF=67;TCR=59;TR=126;WE=35556365;WS=35556347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr19	35556640	rs1688031	T	C	1426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=43;PP=1028;SC=GGGATGGAGATGCAGGGGAGT;SOR=3.056;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=9;TCR=43;TR=52;WE=35556648;WS=35556630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr19	35556659	rs1672991	A	G	1111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=30;PP=838;SC=GTGGGTGGTCAGGCTCCCCAT;SOR=3.442;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=34;WE=35556667;WS=35556649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr19	35556744	rs1688030	T	C	447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=47;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=2;PP=393;SC=ACTTTGGCCTTCAGCCAGACC;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=35556752;WS=35556735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	35557260	rs1042328	T	G	1325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=34;PP=987;SC=ACGCTGGGCCTAGGATGGGAC;SOR=2.885;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=8;TCR=34;TR=42;WE=35557268;WS=35557250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr19	35577870	rs7250814	G	A	3560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=66;PP=2190;ReadPosRankSum=1.091;SC=CTGTGTGTCCGTCTTTGCCGA;SOR=0.669;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=276;TCF=154;TCR=122;TR=151;WE=35577878;WS=35577860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,165:0.53:310
chr19	35590180	rs1687994	T	A	4837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=76;NR=93;PP=2866;SC=CCTGTGGGTGTGACATGCATA;SOR=1.112;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=170;TCF=77;TCR=93;TR=169;WE=35590188;WS=35590170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr19	35597215	rs10422803	C	A	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.31;ReadPosRankSum=0.967;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr19	35597352	rs2445826	T	C	1520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=11;PP=1004;SC=ACCACCCGGCTGGGGAGGCCT;SOR=2.004;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=35;TCR=11;TR=46;WE=35597360;WS=35597342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr19	35597462	rs10424084	A	G	2493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.668;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=51;PP=1706;ReadPosRankSum=-2.016;SC=CAGAGATGTGAGACCCTCAGG;SOR=0.541;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=240;TCF=142;TCR=98;TR=117;WE=35597470;WS=35597452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,124:0.45:275
chr19	35597620	rs10423723	C	T	2794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=60;PP=1665;ReadPosRankSum=0.091;SC=CAGCTCATTGCGCCTTTTCAA;SOR=0.662;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=227;TCF=111;TCR=116;TR=118;WE=35597628;WS=35597610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,128:0.52:245
chr19	35597729	rs7258700	C	T	1846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=44;PP=1059;ReadPosRankSum=1.195;SC=GAGAGAGCCCCGACCTGATGA;SOR=0.714;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=186;TCF=88;TCR=98;TR=83;WE=35597737;WS=35597719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,94:0.45:209
chr19	35597790	rs62120431	G	T	848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.690;HP=7;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=24;PP=507;ReadPosRankSum=-2.424;SC=GAAGCTAAAAGAAATACATTG;SOR=1.055;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=89;TCF=35;TCR=54;TR=37;WE=35597798;WS=35597780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,43:0.41:105
chr19	35602014	rs4806085	T	C	6662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.319;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=129;NR=104;PP=2965;ReadPosRankSum=1.722;SC=GTGTCAACCATGCCCCGAGGC;SOR=0.461;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=233;TCF=129;TCR=104;TR=233;WE=35602022;WS=35602004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,261:1.00:262
chr19	35602338	rs11665663	T	C	2298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.99;SOR=0.737;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
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chr19	35608092	rs1006162	C	T	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.997;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=115;ReadPosRankSum=-0.444;SC=GAATGGGGAACGTGAGGGCAG;SOR=0.569;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=7;WE=35608100;WS=35608082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
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chr19	35614336	rs1672974	T	C	1767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.077;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=38;PP=1176;ReadPosRankSum=-0.452;SC=ACCCCATCACTTCCCGCAGGC;SOR=0.645;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=187;TCF=99;TCR=88;TR=78;WE=35614344;WS=35614326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,85:0.40:214
chr19	35616087	rs3826989	G	A	1856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.729;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=30;PP=997;ReadPosRankSum=-0.202;SC=CCAGAGTCCCGTTGGTGGTCT;SOR=0.830;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=182;TCF=111;TCR=71;TR=81;WE=35616095;WS=35616077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,94:0.46:204
chr19	35622695	rs1673007	A	G	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.44;ReadPosRankSum=0.512;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,22:0.51:43
chr19	35624890	rs11666576	C	T	1198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.240;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=17;PP=881;ReadPosRankSum=0.137;SC=TGTGCATAAACGCACACTCCC;SOR=1.112;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=124;TCF=80;TCR=44;TR=55;WE=35624898;WS=35624880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,58:0.41:140
chr19	35642651	rs36072726	G	T	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.248;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=21;PP=513;ReadPosRankSum=-0.361;SC=AAGGGAAGTCGCGGGGATGGA;SOR=0.169;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=53;TCF=15;TCR=38;TR=33;WE=35642659;WS=35642641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,36:0.61:59
chr19	35644855	rs62111370	T	C	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.08;ReadPosRankSum=1.716;SOR=0.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,36:0.61:59
chr19	35648264	rs12980648	G	A	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=108;ReadPosRankSum=-0.987;SC=AGGCGAGGGCGGGGGTGGTGA;SOR=0.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=9;WE=35648272;WS=35648254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,12:0.36:33
chr19	35648365	rs1688005	T	G	2017.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=39;PP=1146;ReadPosRankSum=-1.939;SC=TTCAGCAGACTCAACTATCAT;SOR=0.722;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=201;TCF=119;TCR=82;TR=93;WE=35648373;WS=35648355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,105:0.47:222
chr19	35649324	rs1633915	C	G	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.167;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=378;ReadPosRankSum=-0.283;SC=CAGGGGCAGGCGGCGGGGACA;SOR=0.198;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=44;TCF=11;TCR=33;TR=24;WE=35649332;WS=35649314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,27:0.56:48
chr19	35650593	rs4806093	G	A	1413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.101;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=43;PP=853;ReadPosRankSum=-0.072;SC=AATATTTTGCGTATGTTAACT;SOR=0.884;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=148;TCF=53;TCR=95;TR=65;WE=35650601;WS=35650583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,70:0.44:160
chr19	35651531	rs1617607	A	G	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=262;ReadPosRankSum=1.704;SC=ATACAGACATAAGCCACCGCG;SOR=1.292;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=13;WE=35651539;WS=35651521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr19	35655151	rs1672994	T	C	1085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=32;PP=815;ReadPosRankSum=1.500;SC=GCCATCTGGTTAGTAACTGCC;SOR=0.757;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=65;TCF=9;TCR=56;TR=37;WE=35655159;WS=35655141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,41:0.55:74
chr19	35657351	rs8106303	A	C	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=311;ReadPosRankSum=-0.901;SC=AGCTGCATATACATACAAACC;SOR=0.631;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=41;TCF=17;TCR=24;TR=20;WE=35657359;WS=35657341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,23:0.49:47
chr19	35660508	rs12110	G	A	1533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=34;PP=811;ReadPosRankSum=0.441;SC=TGCCGGAATCGTTGCAGGTGA;SOR=0.666;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=58;TCR=67;TR=64;WE=35660516;WS=35660498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,75:0.53:142
chr19	35715641	rs2291532	G	A	557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=1;PP=411;SC=CCTGGGCTACGGGGCACCGGG;SOR=3.611;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=35715649;WS=35715631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	35718819	rs542977	C	A	2083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=13;PP=1339;SC=GATCCCCTGACCGGAAGAATC;SOR=2.472;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=49;TCR=13;TR=62;WE=35718827;WS=35718809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr19	35719020	rs541169	C	T	10790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=404;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=189;NR=181;PP=2965;SC=AGCGGCTAGACCACACCAGCA;SOR=0.718;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=370;TCF=189;TCR=181;TR=370;WE=35719028;WS=35719010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,403:1.00:403
chr19	35719106	rs565791	A	G	9840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=371;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=162;NR=172;PP=2965;SC=AGGCGTTTACACTCGCCCGGC;SOR=0.789;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=334;TCF=162;TCR=172;TR=334;WE=35719114;WS=35719096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,371:1.00:371
chr19	35739702	rs16970163	G	A	5171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=118;NR=58;PP=2965;SC=GGAGGACCGCGGCGGGTCAAG;SOR=1.462;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=176;TCF=118;TCR=58;TR=176;WE=35739710;WS=35739692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr19	35757427	rs34259399	G	A	2910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=43;NR=55;PP=1694;SC=GTTGACAGGAGTAGCTCAGGT;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=44;TCR=56;TR=98;WE=35757435;WS=35757417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr19	35758275	rs142507475	G	GGGA	9172.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=47;PP=2663;SC=GAGTAATGGTGGGAGAAGCCG;SOR=1.284;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=112;TCF=52;TCR=60;TR=92;WE=35758283;WS=35758258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr19	35758789	.	AT	A	41.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.990;ClippingRankSum=0.000;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=4.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.46;ReadPosRankSum=0.914;SOR=1.437;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,14:0.16:90
chr19	35760167	rs2515621	G	C	50.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=16.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr19	35760930	rs150053370	TG	T	233.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=106;SC=CACCCCTGGGTGGGGGGGGGA;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=6;WE=35760938;WS=35760920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
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chr19	35785378	rs55976703	C	T	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=368;ReadPosRankSum=0.158;SC=ACTGTGTGGCCTTGGGCGAGT;SOR=0.811;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=13;TCR=39;TR=24;WE=35785386;WS=35785368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,25:0.45:55
chr19	35793589	rs1126770	C	T	6497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=127;PP=2965;SC=AGAGGGCCACCGCCTTCAACC;SOR=1.264;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=215;TCF=88;TCR=127;TR=215;WE=35793597;WS=35793579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr19	35800720	rs10411883	G	C	157.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=5;NR=1;PP=107;SC=AGGAGTCTCCGGGGCCGGGCC;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=35800728;WS=35800717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	35801221	rs73031732	G	C	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.923;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.081;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=4;PP=139;ReadPosRankSum=-1.087;SC=AAGCCGCCCTGAGTTTGCCCC;SOR=0.697;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=14;TCF=8;TCR=6;TR=7;WE=35801229;WS=35801211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr19	35835940	rs45453699	C	T	2519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.932;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=62;PP=1559;ReadPosRankSum=0.201;SC=CACACATGTGCCTTTATTTCT;SOR=0.761;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=245;TCF=108;TCR=137;TR=109;WE=35835948;WS=35835930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,125:0.46:273
chr19	35836855	rs10413526	C	G	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.15;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr19	35836859	rs4805120	A	G	415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.65;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	35837150	rs117316915	C	T	2839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=73;PP=1754;ReadPosRankSum=0.850;SC=TAAGGAGGGTCTCCCCAGGTC;SOR=0.693;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=259;TCF=110;TCR=149;TR=129;WE=35837158;WS=35837140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,137:0.50:274
chr19	35837428	rs12985354	G	A	1802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-3.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.836;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=28;PP=1013;ReadPosRankSum=-0.048;SC=GTGGAGGCTGGCGACAGTGGG;SOR=0.325;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=121;TCF=82;TCR=39;TR=75;WE=35837436;WS=35837418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,84:0.60:139
chr19	35843086	rs2301151	G	A	4456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=87;PP=2510;SC=GCACTGGCCCGCTCCGGCCTG;SOR=1.456;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=54;TCR=87;TR=141;WE=35843094;WS=35843076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr19	35849813	rs146397125	G	C	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.01;MQRankSum=-1.094;QD=6.74;ReadPosRankSum=0.743;SOR=0.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,20:0.37:54
chr19	35850264	rs142434838	G	A	918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.65;MQRankSum=-4.552;QD=10.81;ReadPosRankSum=1.214;SOR=0.887;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,46:0.54:85
chr19	35850560	rs77988018	G	A	2711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-6.681;NF=79;NR=70;PP=1920;ReadPosRankSum=2.221;SC=AAAGCCCGGCGTGGAGGATCT;SOR=0.707;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=322;TCF=170;TCR=152;TR=149;WE=35850568;WS=35850550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,140:0.45:312
chr19	35863180	rs201159994	A	G	970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.97;QD=28.55;SOR=5.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	35863226	rs150552589	G	T	1537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=4.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.84;MQRankSum=-2.633;QD=11.56;ReadPosRankSum=0.442;SOR=1.086;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,71:0.53:133
chr19	35991442	rs909072	T	G	2825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=41;NR=51;PP=1614;SC=CACCTGATCGTCTCTGCCTGC;SOR=1.201;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=41;TCR=51;TR=92;WE=35991450;WS=35991432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr19	35997363	rs6510492	C	T	899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.18;ReadPosRankSum=0.292;SOR=0.664;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,46:0.47:98
chr19	35997457	rs6510493	G	T	1422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=32;PP=851;ReadPosRankSum=-1.029;SC=CAACACCTTGGTCTGGTGGTG;SOR=0.719;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=71;TCR=63;TR=67;WE=35997465;WS=35997447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,72:0.51:141
chr19	35997644	rs6510494	C	G	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=164;ReadPosRankSum=2.510;SC=GGCTGGGCATCGTGGGTCACG;SOR=0.446;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=10;WE=35997652;WS=35997634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr19	35998213	rs4358061	A	C	901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.785;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=14;PP=683;ReadPosRankSum=0.577;SC=GGATCCCAGAACCCTGTTTTG;SOR=0.851;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=89;TCF=58;TCR=31;TR=41;WE=35998221;WS=35998203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,43:0.43:100
chr19	35998362	rs4254439	T	G	1305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.418;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=31;PP=715;ReadPosRankSum=-1.381;SC=AGGCTCACCCTATAATTGTCT;SOR=0.568;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=113;TCF=45;TCR=68;TR=53;WE=35998370;WS=35998352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,64:0.49:131
chr19	35999251	rs11084818	C	G	1819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=52;PP=1147;ReadPosRankSum=1.148;SC=TAATGGCACTCTCTTTTGGAA;SOR=0.702;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=198;TCF=76;TCR=122;TR=84;WE=35999259;WS=35999241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,90:0.43:210
chr19	36003962	rs7247001	T	C	1121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.949;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=14;PP=687;ReadPosRankSum=-3.211;SC=CCAAGCACCATTGTGGCCAGG;SOR=1.298;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=113;TCF=74;TCR=39;TR=48;WE=36003970;WS=36003952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,54:0.42:130
chr19	36004106	rs4806163	A	G	3693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=374;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.681;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=82;PP=2237;ReadPosRankSum=-2.052;SC=AGCATCTGCTACGCCAAAGCC;SOR=0.710;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=335;TCF=172;TCR=163;TR=166;WE=36004114;WS=36004096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:190,183:0.49:373
chr19	36015491	rs67543901	G	T	1248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=8;PP=866;SC=AGGTTGGAGGGTCTTTGCAGA;SOR=2.252;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=34;TCR=8;TR=42;WE=36015499;WS=36015481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr19	36015865	rs2285511	A	C	678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=16;PP=473;SC=AACCCCACAAACGCGGAGGGT;SOR=3.160;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=36015873;WS=36015855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	36018407	.	T	C	1118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.272;ClippingRankSum=0.000;DP=243;ExcessHet=3.0103;FS=9.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQRankSum=-5.290;QD=4.60;ReadPosRankSum=-4.253;SOR=1.420;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:196,47:0.19:243
chr19	36018413	rs368150998	T	A	882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FS=21.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQRankSum=-5.421;QD=3.92;ReadPosRankSum=-3.944;SOR=2.198;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:192,33:0.15:225
chr19	36038390	rs7599	A	G	2504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=52;PP=1511;ReadPosRankSum=-0.622;SC=TCCCTGCCTCACTCCAGGTTT;SOR=0.541;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=84;TCF=31;TCR=53;TR=83;WE=36038398;WS=36038380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,95:0.99:96
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chr19	36048791	rs748214	G	A	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.719;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.570;HP=3;HapScore=4;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=101;ReadPosRankSum=0.066;SC=ACGGGGGAACGGGGCGGGGCT;SOR=3.906;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=5;WE=36048803;WS=36048781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
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chr19	36105917	rs34572637	A	G	3939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=52;PP=2411;SC=CGATCAGACCATCTGACCCTG;SOR=1.201;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=142;TCF=90;TCR=52;TR=142;WE=36105925;WS=36105907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr19	36110655	rs111599954	G	A	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=206;ReadPosRankSum=0.014;SC=GGCACAGGCCGGGAGAGTGAG;SOR=0.676;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=39;TCF=14;TCR=25;TR=17;WE=36110663;WS=36110645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,18:0.43:42
chr19	36113658	rs2285414	A	G	6063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=112;NR=91;PP=2965;SC=CGTGCCGCGGATGGGAAACAG;SOR=0.856;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=203;TCF=112;TCR=91;TR=203;WE=36113666;WS=36113648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr19	36122441	rs2285415	G	A	1383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=32;PP=1017;SC=CCTAAAGCACGAACCTGATCA;SOR=2.511;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=10;TCR=32;TR=42;WE=36122449;WS=36122431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr19	36133982	rs3214104	TG	T	2104.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=43;PP=1671;SC=AGGTGGGGACTGGGGTCCCGA;SOR=2.494;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=49;TCF=1;TCR=48;TR=44;WE=36133990;WS=36133972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr19	36135279	rs3835005	C	CT	3327.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=35;PP=1863;SC=CAGCCAAATCCGCCCCGTCTC;SOR=0.954;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=6;TCR=35;TR=41;WE=36135287;WS=36135269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr19	36145409	rs377609041	CA	C	179.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=1.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.59;ReadPosRankSum=0.260;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,18:0.36:50
chr19	36168663	rs10413852	G	C	275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=3;PP=86;SC=CTCGCTTTCAGCGGCTACCCT;SOR=1.085;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=8;WE=36168671;WS=36168653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	36168914	rs2285421	T	C	4351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.45;SOR=0.829;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr19	36206986	rs2234371	G	A	5933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=104;NR=96;PP=2965;SC=CAGTGAGTTGGCGCTGGGATT;SOR=0.757;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=200;TCF=104;TCR=96;TR=200;WE=36206994;WS=36206974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr19	36212478	.	C	T	2121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.601;ClippingRankSum=0.000;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=40;PP=1247;ReadPosRankSum=0.741;SC=CCCTGCAGGCCTTGCAAACCC;SOR=0.682;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=142;TCF=77;TCR=65;TR=88;WE=36212486;WS=36212468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,95:0.62:154
chr19	36214632	rs11373774	A	AG	2128.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=12;NR=20;PP=1461;SC=CTGTTCCCGCAGCCGGACGAT;SOR=1.085;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=33;TCF=12;TCR=21;TR=32;WE=36214640;WS=36214622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr19	36216056	rs3848662	G	T	7902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=139;NR=131;PP=2965;SC=GTGTCATCGAGAAGCCAGGTG;SOR=0.735;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=270;TCF=139;TCR=131;TR=270;WE=36216064;WS=36216046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,290:1.00:290
chr19	36221051	rs2242520	G	A	1332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=35;PP=843;ReadPosRankSum=0.777;SC=TGGGGTACACGGTTCCTTCCC;SOR=0.655;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=166;TCF=73;TCR=93;TR=65;WE=36221059;WS=36221041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,70:0.38:182
chr19	36224705	rs231591	A	G	3080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=47;NR=57;PP=1718;SC=CTTCCGGAAGATGGTCCTCCC;SOR=1.121;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=47;TCR=57;TR=104;WE=36224713;WS=36224695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr19	36229119	.	CAGTG	C	5761.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.993;ClippingRankSum=0.000;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.884;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=2.586;NF=20;NR=68;PP=2971;ReadPosRankSum=0.422;SC=TGTGGGAAGACAGTGGGTGAA;SOR=0.634;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=176;TCF=40;TCR=136;TR=88;WE=36229130;WS=36229109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,152:0.52:294
chr19	36230174	rs12459634	T	C	4253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=57;PP=2280;SC=AAGTTCTTTATTGGGTGTTAA;SOR=0.866;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=135;TCF=78;TCR=57;TR=135;WE=36230182;WS=36230164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr19	36235431	rs3761087	A	G	5851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=102;NR=109;PP=2965;SC=CCTCCACGTCACTCACATGAC;SOR=0.856;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=213;TCF=103;TCR=110;TR=211;WE=36235439;WS=36235421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr19	36235928	rs2293686	A	C	563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=2;PP=462;SC=GTGGGGAGGGACTCAGGAACC;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=36235936;WS=36235922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	36236120	rs231597	A	G	10365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=385;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=181;NR=163;PP=2965;SC=AACCCTGGAAAAGGTGCAAAG;SOR=0.736;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=344;TCF=181;TCR=163;TR=344;WE=36236128;WS=36236110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,382:1.00:382
chr19	36236909	rs10402601	G	C	5414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=103;PP=2819;SC=CAGATCGCTAGGGTCCCAGGA;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=180;TCF=77;TCR=103;TR=180;WE=36236917;WS=36236899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr19	36237245	rs2293688	C	G	5879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=112;NR=78;PP=2965;SC=AAATAGATCTCGGTGGGAGTT;SOR=0.964;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=191;TCF=113;TCR=78;TR=190;WE=36237253;WS=36237235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr19	36239484	rs3746277	A	G	955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=0;PP=703;SC=GCCACGGTCCAGGCTGGACAC;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=31;WE=36239492;WS=36239474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	36243089	rs170758	T	C	6702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=133;NR=97;PP=2965;SC=CTGGAGATGGTCAAAGCCCGG;SOR=0.943;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=230;TCF=133;TCR=97;TR=230;WE=36243097;WS=36243079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chr19	36243190	rs231244	T	C	4382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=78;PP=2284;SC=GGCACCCTGGTGGGTTGGGCC;SOR=1.017;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=67;TCR=78;TR=145;WE=36243198;WS=36243180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr19	36243813	rs231243	G	A	4752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=64;PP=2672;SC=CTCCCTACGCGGGCCATCTGC;SOR=0.865;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=154;TCF=90;TCR=64;TR=154;WE=36243821;WS=36243803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr19	36246418	rs11549030	C	G	2662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=46;PP=1750;SC=CGGCCCAGCCCCCTCCTACTT;SOR=0.799;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=90;TCF=44;TCR=46;TR=90;WE=36246426;WS=36246408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr19	36253317	rs807479	C	T	1512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=36;PP=970;SC=AGCCCTAGGACAGAATTAGAA;SOR=2.437;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=11;TCR=36;TR=47;WE=36253325;WS=36253307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr19	36257932	rs35876904	CCT	C	1431.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=23;PP=1177;SC=GACCCTCCACCCTCTCTCTCT;SOR=1.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=26;WE=36257941;WS=36257922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr19	36258937	rs5827939	AG	A	2946.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=29;PP=2172;SC=CTGCTTGCCCAGGGCCGCCCT;SOR=0.954;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=27;TCR=31;TR=55;WE=36258945;WS=36258927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr19	36273534	rs2291067	G	A	2822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=40;PP=1618;SC=AGGAGCGTCTGGTGCGGGTGC;SOR=0.752;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=51;TCR=40;TR=91;WE=36273542;WS=36273524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr19	36275074	rs62112163	G	A	1584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=10;PP=987;SC=TCCCACCCAGGTCCATGGAGC;SOR=2.345;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=40;TCR=10;TR=50;WE=36275082;WS=36275064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr19	36276086	rs2239949	C	T	4189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=80;NR=69;PP=2531;SC=TCCCCCAAACCGCAGGAGGAA;SOR=0.746;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=149;TCF=80;TCR=69;TR=149;WE=36276094;WS=36276076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr19	36279862	rs59882609	AG	A	613.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=17;PP=622;SC=ATCTGCAGAGAGGGGAACCAT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=36279870;WS=36279852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	36290900	rs1133745	C	G	358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=300;SC=TTAGGCAGCACCTAAGGACTT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=36290908;WS=36290890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	36321910	rs731934	G	A	2717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.022;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=59;PP=1659;ReadPosRankSum=2.073;SC=TCCAGGCGTCGGGGGTACCTC;SOR=0.795;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=200;TCF=99;TCR=101;TR=111;WE=36321918;WS=36321900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,124:0.54:229
chr19	36322270	rs2071327	C	T	2274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.012;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=41;PP=1294;ReadPosRankSum=0.051;SC=GGTCCTCTTCCGACCTTCCAG;SOR=0.774;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=211;TCF=119;TCR=92;TR=101;WE=36322278;WS=36322260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,112:0.49:230
chr19	36322456	rs113650287	G	A	2218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.117;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=49;PP=1485;ReadPosRankSum=-1.379;SC=CCCCCACCCCGGCCCCAGGAA;SOR=0.594;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=187;TCF=94;TCR=93;TR=100;WE=36322464;WS=36322434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,104:0.54:194
chr19	36322509	rs466452	G	A	1502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=33;PP=914;ReadPosRankSum=-1.596;SC=TATCACCCTCGGGTCTCCACC;SOR=0.659;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=139;TCF=68;TCR=71;TR=65;WE=36322517;WS=36322499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,72:0.48:150
chr19	36340009	rs113825926	G	A	1011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.741;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=20;PP=528;ReadPosRankSum=-0.630;SC=CACCGCCTGGGTGTGCTCTGT;SOR=0.629;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=83;TCF=48;TCR=35;TR=44;WE=36340017;WS=36339999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,51:0.50:102
chr19	36351768	rs60849332	G	A	2408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.411;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=33;PP=1590;ReadPosRankSum=-2.497;SC=GTCAGTGGCTGCATTCCGCCC;SOR=1.213;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=185;TCF=118;TCR=67;TR=102;WE=36351776;WS=36351758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,109:0.55:197
chr19	36351935	rs35854130	G	T	3458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.691;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=72;PP=2128;ReadPosRankSum=-1.297;SC=GCGGTGGCGCGCAGGTACAGC;SOR=0.677;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=276;TCF=142;TCR=134;TR=142;WE=36351943;WS=36351925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,160:0.52:308
chr19	36355595	rs382789	A	G	3754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.63;SOR=0.736;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr19	36369450	.	G	GA	54.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=0.000;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=4.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.11;MQRankSum=0.000;QD=0.59;ReadPosRankSum=-1.171;SOR=1.326;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,15:0.16:93
chr19	36398454	rs111477177	G	C	1254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.699;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=22;PP=644;ReadPosRankSum=-1.724;SC=CTGCCAGCACGCCCGGGCTCA;SOR=0.726;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=100;TCF=55;TCR=45;TR=50;WE=36398462;WS=36398444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,60:0.53:113
chr19	36435647	rs376643067	C	G	2108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.530;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=47;PP=1278;ReadPosRankSum=1.588;SC=CTGGGCGGCACGATGATCATC;SOR=0.619;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=173;TCF=81;TCR=92;TR=90;WE=36435655;WS=36435637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,101:0.52:193
chr19	36486445	rs7249826	G	C	4227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=80;NR=61;PP=2699;SC=GGCGTGGGTTGCCAGCCTGAC;SOR=0.974;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=80;TCR=61;TR=141;WE=36486453;WS=36486435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr19	36496125	.	CT	C	133.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=4.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.78;ReadPosRankSum=-1.745;SOR=0.122;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr19	36497358	rs2285422	C	G	593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.037;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=271;ReadPosRankSum=-0.399;SC=GGGGCCCCCTCTGGCCACACA;SOR=0.487;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=51;TCF=37;TCR=14;TR=24;WE=36497366;WS=36497348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,29:0.48:60
chr19	36517655	rs10418015	C	T	579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.681;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=388;ReadPosRankSum=1.071;SC=GTCCCCTGCGCGATAGGCCGG;SOR=0.243;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=46;TCF=7;TCR=39;TR=24;WE=36517663;WS=36517645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,25:0.54:46
chr19	36526281	rs66987345	TATA	T	2394.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=21;PP=1278;ReadPosRankSum=1.191;SC=CAAGCCCACGTATAATGTCTT;SOR=0.657;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=76;TCF=34;TCR=42;TR=32;WE=36526291;WS=36526271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,63:0.48:130
chr19	36530332	rs10420353	G	A	2312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.715;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=40;PP=2853;ReadPosRankSum=0.203;SC=TCCTGGCACCGTTGCAGCCTC;SOR=0.582;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=186;TCF=112;TCR=74;TR=100;WE=36530351;WS=36530322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,115:0.56:205
chr19	36530343	rs10421966	C	T	2474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=42;PP=2853;ReadPosRankSum=-0.522;SC=TTGCAGCCTCCGCACCCGGCG;SOR=0.724;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=193;TCF=112;TCR=81;TR=104;WE=36530351;WS=36530322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,120:0.56:214
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chr19	36558113	rs12608517	T	C	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.170;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=166;ReadPosRankSum=0.191;SC=AGACTTGGAGTGGGGACGAGC;SOR=0.184;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=14;WE=36558121;WS=36558103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr19	36558712	rs10423651	C	T	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.649;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=97;ReadPosRankSum=-0.585;SC=TATCTCACTACGCCCTCTGTG;SOR=0.151;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=10;WE=36558720;WS=36558702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
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chr19	36572279	rs142105577	G	GTCATTTTC	1064.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=3.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.247;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=8;PP=1126;ReadPosRankSum=0.057;SC=AAATGCAACAGTAAGTCATAG;SOR=1.477;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=31;TCR=24;TR=18;WE=36572287;WS=36572269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,26:0.35:74
chr19	36572564	rs7246292	T	C	738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=16;PP=520;ReadPosRankSum=-0.346;SC=TGATGGACCCTAGATGTTAGG;SOR=0.693;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=59;TCF=28;TCR=31;TR=29;WE=36572572;WS=36572554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,31:0.50:62
chr19	36581263	rs3746271	G	C	1080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.732;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=12;PP=577;ReadPosRankSum=1.958;SC=GGCTTCCAGGGGAGGGGAGGA;SOR=0.598;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=109;TCF=78;TCR=31;TR=44;WE=36581271;WS=36581253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,50:0.42:119
chr19	36582270	rs2301736	G	A	1190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.063;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=31;PP=734;ReadPosRankSum=0.074;SC=CTCTGACTCCGAAGGCAAGTG;SOR=0.956;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=124;TCF=59;TCR=65;TR=56;WE=36582278;WS=36582260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,62:0.46:135
chr19	36590329	rs2285745	T	C	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=343;ReadPosRankSum=-0.951;SC=GCAGATGGCTTGGCCTTCCAC;SOR=0.462;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=48;TCF=43;TCR=5;TR=19;WE=36590337;WS=36590319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,21:0.38:55
chr19	36592752	rs2311004	G	T	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=9;PP=389;ReadPosRankSum=0.313;SC=CTAAGCACAGGCCCTGCACTT;SOR=0.474;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=29;TCF=14;TCR=15;TR=19;WE=36592760;WS=36592742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,21:0.68:31
chr19	36594659	rs2074435	A	T	3181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.891;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=79;PP=1970;ReadPosRankSum=1.641;SC=GGGCTCCTGCAGCCCCCCGTG;SOR=0.621;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=271;TCF=115;TCR=156;TR=137;WE=36594667;WS=36594649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,151:0.51:299
chr19	36595436	rs1008328	A	C	2246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.524;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=33;PP=1476;ReadPosRankSum=0.161;SC=TTGGTCTGTTACAGGGCAGCC;SOR=0.764;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=186;TCF=115;TCR=71;TR=88;WE=36595444;WS=36595426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,97:0.48:202
chr19	36602729	rs1003470	G	C	2616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.468;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=54;PP=1520;ReadPosRankSum=-1.416;SC=TGAAAGCAAGGCACTGTTCTA;SOR=0.646;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=211;TCF=104;TCR=107;TR=109;WE=36602737;WS=36602719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,127:0.52:244
chr19	36603703	rs2072605	T	A	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=1.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.82;ReadPosRankSum=-0.876;SOR=0.906;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,25:0.53:47
chr19	36605647	rs2227260	T	C	2042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.588;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=50;PP=1269;ReadPosRankSum=0.271;SC=AGGGGTTAGTTCTGGAGCCAT;SOR=0.586;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=218;TCF=102;TCR=116;TR=97;WE=36605655;WS=36605637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,107:0.46:235
chr19	36605794	rs2231568	C	T	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=85;ReadPosRankSum=0.760;SC=CCCAGCCTTCCGCGCTTGCTC;SOR=0.730;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=8;WE=36605802;WS=36605784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr19	36612396	rs2075474	A	G	789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=2.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.40;ReadPosRankSum=-0.295;SOR=1.007;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,43:0.46:94
chr19	36640769	rs14100	T	C	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.61;ReadPosRankSum=0.114;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,7:0.24:29
chr19	36642310	rs2008683	T	C	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.334;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=192;ReadPosRankSum=-1.431;SC=CAGCCACCTCTTACTCTGGGT;SOR=0.184;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=14;WE=36642318;WS=36642300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,17:0.40:43
chr19	36685753	rs7259854	A	G	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.075;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=163;ReadPosRankSum=0.059;SC=TTGACCCAGGAGCTCTGGAAG;SOR=0.190;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=12;WE=36685761;WS=36685743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr19	36727365	rs2070132	G	A	6767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=122;NR=100;PP=2965;SC=AGCCAGCAGAGAATTTACAGT;SOR=0.899;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=222;TCF=122;TCR=100;TR=222;WE=36727373;WS=36727355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr19	36940760	rs2967532	G	T	11118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=411;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=189;NR=186;PP=2965;SC=TTAAACTGCCGATTACATTCC;SOR=0.748;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=376;TCF=189;TCR=187;TR=375;WE=36940768;WS=36940750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,411:1.00:411
chr19	36940965	rs2912441	A	G	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.814;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=117;ReadPosRankSum=-1.503;SC=CAAAACTTCAATCAATATGGG;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=7;WE=36940973;WS=36940955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr19	36963637	rs2967539	C	T	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.702;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=240;ReadPosRankSum=-0.854;SC=AGGAGAAAAGCAGGCAAAGTG;SOR=0.382;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=18;WE=36963645;WS=36963627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr19	36963743	rs73049826	C	T	1088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.542;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=11;PP=636;ReadPosRankSum=-0.479;SC=GGAGAGTTTCCCAGATAGCAT;SOR=1.575;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=109;TCF=67;TCR=42;TR=42;WE=36963751;WS=36963733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,49:0.41:119
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chr19	36967352	rs150830509	T	TTTTC	1541.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=6;PP=1014;SC=AAGGTGTTGTTTTTCTAACAT;SOR=2.694;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=23;WE=36967360;WS=36967342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
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chr19	37065914	rs3108597	G	A	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.381;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=214;ReadPosRankSum=0.096;SC=AGTTTGCTTTGCTATGTTTGT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=11;WE=37065922;WS=37065904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr19	37068081	rs2912410	G	C	536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=4;PP=370;SC=GGGCTGGTCTGGAACTCCTGA;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=17;WE=37068089;WS=37068071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	37068235	rs3108598	T	C	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.877;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=15;PP=428;ReadPosRankSum=-0.353;SC=GGTCCTCCCATGTTACATTGT;SOR=0.584;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=65;TCF=32;TCR=33;TR=31;WE=37068243;WS=37068225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,32:0.44:73
chr19	37117302	rs3108171	A	G	2456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.958;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=43;PP=1396;ReadPosRankSum=1.027;SC=ACTGGATGGGAGAAATCACTC;SOR=0.608;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=220;TCF=123;TCR=97;TR=97;WE=37117310;WS=37117292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,118:0.46:257
chr19	37117448	rs140960165	T	G	2511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.655;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=45;PP=1381;ReadPosRankSum=1.220;SC=CCATAATGAATGTGAAAAATC;SOR=0.577;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=178;TCF=88;TCR=90;TR=93;WE=37117456;WS=37117438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,114:0.53:216
chr19	37203249	rs1830031	T	C	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=323;ReadPosRankSum=0.375;SC=TGTACCTGGCTAAGTCCACCT;SOR=0.620;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=19;WE=37203257;WS=37203239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,20:0.62:32
chr19	37210805	rs3108201	C	T	2711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=48;PP=1586;ReadPosRankSum=2.166;SC=AGAAACCCTACATTTGTAAAG;SOR=0.718;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=222;TCF=130;TCR=92;TR=117;WE=37210813;WS=37210795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,128:0.53:241
chr19	37239278	rs11672680	C	A	2380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.233;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=42;PP=1558;ReadPosRankSum=-0.269;SC=TGTGAATTCGCCGATGTTGGA;SOR=0.955;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=170;TCF=90;TCR=80;TR=96;WE=37239286;WS=37239268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,103:0.55:186
chr19	37241141	rs1673082	A	G	8605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=156;NR=146;PP=2965;SC=GTTGAATAAGATGTGCAGACG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=304;TCF=156;TCR=148;TR=302;WE=37241149;WS=37241131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,324:1.00:324
chr19	37310344	rs3745775	T	C	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=11;PP=388;ReadPosRankSum=-0.956;SC=ATGAATTCTCTGATGTCGAGT;SOR=0.653;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=69;TCF=43;TCR=26;TR=30;WE=37310352;WS=37310334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,33:0.45:74
chr19	37368535	rs112729744	G	C	1207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.318;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=28;PP=783;ReadPosRankSum=-1.230;SC=AAGGCCTTTAGTTTTGGATCA;SOR=0.895;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=104;TCF=53;TCR=51;TR=53;WE=37368543;WS=37368525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,57:0.47:122
chr19	37399412	rs10418144	C	T	2924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.087;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=69;PP=1787;ReadPosRankSum=-2.206;SC=AAAAAGATGGCGGTAGAGGTG;SOR=0.861;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=277;TCF=139;TCR=138;TR=132;WE=37399420;WS=37399402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,144:0.47:305
chr19	37406662	rs8101922	C	T	1400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.91;ReadPosRankSum=-1.155;SOR=0.849;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,36:0.54:67
chr19	37406671	rs2010342	G	C	1550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.88;ReadPosRankSum=-1.099;SOR=1.903;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,42:0.54:78
chr19	37413945	rs34898479	T	TG	164.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=4;PP=124;SC=TTTTATTTCTTAAGAGTATGT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=37413953;WS=37413935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	37416022	rs1667382	C	A	1662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=8;PP=1117;SC=AGAGGGTCTTCTAGCCACCTG;SOR=2.753;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=43;TCR=8;TR=51;WE=37416030;WS=37416012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr19	37441111	rs571294	C	T	5008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=78;PP=2939;SC=TTATTGAGCACGAGAAAATTC;SOR=0.815;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=173;TCF=95;TCR=78;TR=173;WE=37441119;WS=37441101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr19	37441365	rs547483	T	C	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.91;ReadPosRankSum=-0.563;SOR=0.671;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,37:0.32:114
chr19	37441462	rs546589	T	C	2136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=32;PP=1289;SC=AAATTCACACTGGAGAGAAAC;SOR=0.850;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=44;TCR=32;TR=76;WE=37441470;WS=37441452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr19	37441980	rs1644634	A	G	1817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=31;NR=28;PP=925;SC=GAGAGACACCAAGTATATTAA;SOR=0.811;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=31;TCR=28;TR=59;WE=37441988;WS=37441970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr19	37442078	rs4806380	T	C	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=5;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=169;ReadPosRankSum=1.329;SC=TATGGAAAAATTTTAATACTT;SOR=0.148;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=10;WE=37442086;WS=37442068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr19	37465414	rs1375477	A	G	5273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=107;PP=2965;SC=ACTGGTTTTCAGGACAGTGTC;SOR=1.313;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=180;TCF=72;TCR=108;TR=179;WE=37465422;WS=37465404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr19	37482068	rs1644679	T	G	4635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=55;PP=2679;SC=GTATTTATTTTTGGTTTCAGG;SOR=1.145;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=143;TCF=88;TCR=55;TR=143;WE=37482076;WS=37482058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr19	37482151	rs1667354	A	G	7579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=124;NR=128;PP=2965;SC=GCTCAGAAGGATTTGTACCGA;SOR=0.831;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=255;TCF=125;TCR=130;TR=252;WE=37482159;WS=37482141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,291:1.00:291
chr19	37482765	rs1644681	T	C	3612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.01;SOR=1.845;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr19	37482765	.	TGGAATGG	CAGAATGA,CGGAATGA	513	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.38;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=8,10;NR=16,22;PP=368,513;QD=17.9778281193;SC=GACGATGAACTGGAATGGGGA;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=21;TCR=43;TR=24,32;WE=37482780;WS=37482755;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.38:64
chr19	37482766	rs7248693	G	A	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.64;ReadPosRankSum=-0.514;SOR=0.716;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,37:0.45:83
chr19	37482772	rs1644682	G	A	3385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.75;SOR=1.949;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr19	37482817	rs2547049	G	A	817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=22;PP=560;SC=TGAGAAGGCAGCACTTCAGGG;SOR=3.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=25;WE=37482825;WS=37482807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	37487632	rs935706	G	A	2256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=30;PP=1509;SC=TAACAAATGTGCCTTTAATCA;SOR=1.003;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=42;TCR=30;TR=72;WE=37487640;WS=37487622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr19	37487723	rs935707	G	A	4076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=60;PP=2573;SC=AAAGCCTTTCGTTCCAGCTCA;SOR=0.898;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=138;TCF=78;TCR=60;TR=138;WE=37487731;WS=37487713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr19	37487866	rs1667363	A	T	9458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.79;SOR=0.731;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr19	37487873	rs1667364	C	A	9438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.11;SOR=0.790;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr19	37487975	rs16971886	G	A	2411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=50;PP=1211;ReadPosRankSum=0.446;SC=AAGGCTTTTCGTTATGACACA;SOR=0.662;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=214;TCF=108;TCR=106;TR=103;WE=37487983;WS=37487959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,115:0.49:234
chr19	37488055	rs10405238	T	G	1907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.655;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=42;PP=1159;ReadPosRankSum=2.149;SC=TGGAAAGGTGTACAGTTGTGC;SOR=0.622;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=123;TCF=57;TCR=66;TR=80;WE=37488063;WS=37488045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,87:0.64:137
chr19	37488197	rs1345748	G	A	4146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=78;NR=55;PP=2168;SC=GAGAAACCCTGTAAGTGTAAG;SOR=0.814;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=78;TCR=55;TR=133;WE=37488205;WS=37488182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr19	37488299	rs1363752	A	G	6135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=120;NR=84;PP=2965;SC=AAGGAATGTGAAAAGGCCTTT;SOR=0.917;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=204;TCF=120;TCR=84;TR=204;WE=37488307;WS=37488289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr19	37488472	rs1644698	C	G	4934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.06;SOR=1.209;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr19	37488481	rs1363753	G	C	4917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.39;SOR=1.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr19	37488499	rs1667366	T	C	4325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=44;PP=1575;SC=AGAACTTAGTTGACACCAGAA;SOR=0.859;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=45;TCR=44;TR=89;WE=37488507;WS=37488489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr19	37488565	rs3745770	C	G	831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.583;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=21;PP=464;ReadPosRankSum=0.127;SC=GGCCTTCATTCGGGCCTCACA;SOR=0.908;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=96;TCF=48;TCR=48;TR=39;WE=37488573;WS=37488555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,43:0.39:109
chr19	37488677	rs3833257	G	GA	810.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=16;PP=350;SC=TACTGATTTGGAAAAAAAAAC;SOR=1.402;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=17;WE=37488685;WS=37488667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	37488809	rs3745768	A	G	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.79;ReadPosRankSum=-1.150;SOR=0.991;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr19	37579810	rs35162188	G	A	278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=1;PP=185;SC=CACAACATATGTCTGTCCCCC;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=37579818;WS=37579800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	37605917	rs7258360	G	A	3721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=47;PP=2410;SC=GAATTTTAATGGAGCTAAGAG;SOR=1.324;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=81;TCR=47;TR=128;WE=37605925;WS=37605907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr19	37606028	rs4806412	T	C	6065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=115;PP=2965;SC=AATCTCTCGTTGACTTGTCCT;SOR=0.999;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=211;TCF=96;TCR=115;TR=211;WE=37606036;WS=37606018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr19	37642917	rs77675231	G	A	5420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.46;MQRankSum=-0.983;QD=26.44;ReadPosRankSum=-1.580;SOR=0.920;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,203:0.99:205
chr19	37642922	rs79071992	C	T	8815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.37;QD=44.98;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr19	37644051	rs57916401	T	C	1041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.485;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-7.105;NF=25;NR=19;PP=589;ReadPosRankSum=0.669;SC=TTTGTGTGAATGCTTTGCCAC;SOR=0.786;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=99;TCF=54;TCR=45;TR=44;WE=37644059;WS=37644041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,51:0.45:114
chr19	37646994	rs112401881	C	T	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.475;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=179;ReadPosRankSum=0.551;SC=ATTCTGAGTGCCCTAAACAAA;SOR=0.361;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=31;TCF=10;TCR=21;TR=14;WE=37647002;WS=37646984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr19	37676528	rs75662394	G	A	3049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.858;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.293;NF=72;NR=63;ReadPosRankSum=0.974;SC=TCCCACACTCGGCACACACAT;SOR=0.685;SbPval=0.56;Source=Platypus;TCF=148;TR=135;WE=37676536;WS=37676518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,150:0.48:311
chr19	37677748	rs45626541	T	A	1026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.711;NF=25;NR=22;PP=760;ReadPosRankSum=-1.396;SC=TTCTCATGTATACTGAGATCT;SOR=0.659;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=110;TCF=62;TCR=48;TR=47;WE=37677756;WS=37677738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,48:0.41:116
chr19	37681098	rs28701616	G	A	3740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=369;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.619;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=86;PP=2185;ReadPosRankSum=0.119;SC=AGCTTTGCACGGTGGAGTGAC;SOR=0.512;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=338;TCF=150;TCR=188;TR=164;WE=37681106;WS=37681088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,185:0.50:368
chr19	37690332	rs34213131	TG	T	517.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.394;HP=8;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=445;ReadPosRankSum=-0.262;SC=CAGGCTAAGGTGGGGGGATCG;SOR=1.085;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=56;TCF=41;TCR=15;TR=19;WE=37690340;WS=37690322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,23:0.39:59
chr19	37690420	rs1234250	C	T	1915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.107;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=37;PP=1200;ReadPosRankSum=2.089;SC=AGTGAGACCCCGTTTCAAAAA;SOR=0.787;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=174;TCF=97;TCR=77;TR=84;WE=37690428;WS=37690410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,93:0.48:194
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chr19	37918609	rs7254009	C	T	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=98;ReadPosRankSum=-0.243;SC=AATCATGATGCTTGCAATAAA;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=6;WE=37918617;WS=37918599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr19	37936025	rs2303131	G	A	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=104;ReadPosRankSum=-0.230;SC=ATAGGTGTGAGGATGATTGGA;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=37936033;WS=37936015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr19	37966923	rs4801803	C	T	385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.508;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=265;ReadPosRankSum=-1.877;SC=AGGATATCTTCTTGCAAAACT;SOR=1.073;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=49;TCF=15;TCR=34;TR=19;WE=37966931;WS=37966913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,20:0.36:56
chr19	37967214	rs7253091	C	T	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.795;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=266;ReadPosRankSum=0.169;SC=CATGACAAAACTCTACTTTTT;SOR=0.278;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=19;WE=37967227;WS=37967204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr19	38022358	rs10404945	T	C	724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.105;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=16;PP=344;ReadPosRankSum=-0.040;SC=GGTGAGCCACTGTGCCCGGCC;SOR=0.368;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=62;TCF=39;TCR=23;TR=34;WE=38022366;WS=38022348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,38:0.50:76
chr19	38024367	rs2279149	T	C	1839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=39;PP=1071;ReadPosRankSum=2.745;SC=GGAATTTTGTTCAGCATTCTT;SOR=0.693;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=156;TCF=76;TCR=80;TR=78;WE=38024375;WS=38024357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,89:0.50:178
chr19	38033251	rs9797618	C	T	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=2;PP=48;ReadPosRankSum=1.094;SC=GCCAAGATCGCGCCATTGCAC;SOR=0.883;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=12;TCF=6;TCR=6;TR=5;WE=38033259;WS=38033241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr19	38040076	rs1564206	C	T	929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=28;PP=652;ReadPosRankSum=1.614;SC=TGCCTGTGTTCCCCGGGGCGC;SOR=0.800;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=69;TCF=17;TCR=52;TR=36;WE=38040084;WS=38040066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,38:0.52:73
chr19	38046967	rs10420552	G	A	1330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=2.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.770;SOR=0.490;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,67:0.53:126
chr19	38047075	rs10420268	A	G	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.395;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=15;PP=351;ReadPosRankSum=-0.977;SC=TGGGAACAGTACACATAAATC;SOR=0.252;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=46;TCF=14;TCR=32;TR=24;WE=38047083;WS=38047065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,25:0.51:49
chr19	38055612	rs4802029	A	T	1865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.534;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=41;PP=1081;ReadPosRankSum=-2.133;SC=ATGCAGAGTAAGTTCTGAGCC;SOR=0.511;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=163;TCF=77;TCR=86;TR=80;WE=38055620;WS=38055602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,92:0.49:188
chr19	38056574	rs28512414	T	A	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=340;ReadPosRankSum=0.056;SC=ATTTCTTACATTCATATGGTT;SOR=0.788;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=49;TCF=32;TCR=17;TR=23;WE=38056582;WS=38056564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,24:0.44:54
chr19	38056763	rs8111790	C	G	708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=14;PP=504;ReadPosRankSum=0.675;SC=TCTCACCAGTCTGAATTCTCT;SOR=0.811;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=36;TCR=26;TR=33;WE=38056771;WS=38056753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,34:0.50:68
chr19	38077474	rs2306201	G	A	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=284;ReadPosRankSum=-0.954;SC=TTCCCTTAAGGAACCAAACAA;SOR=0.625;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=62;TCF=50;TCR=12;TR=20;WE=38077482;WS=38077464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,23:0.35:65
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chr19	38090759	rs17305228	C	G	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=325;ReadPosRankSum=1.904;SC=AATTTCTTCTCTCTTCCTCAA;SOR=0.598;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=43;TCF=11;TCR=32;TR=22;WE=38090767;WS=38090749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,24:0.52:46
chr19	38091932	rs1975937	A	T	1536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.691;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=12;PP=1031;ReadPosRankSum=1.628;SC=TCAAAGCCAGATGTGATTACC;SOR=1.136;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=129;TCF=99;TCR=30;TR=63;WE=38091940;WS=38091922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,69:0.49:141
chr19	38135403	rs2972458	T	C	602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.902;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=9;PP=379;ReadPosRankSum=-0.482;SC=CCACTGCACTTCAGCCTGGTG;SOR=0.927;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=75;TCF=49;TCR=26;TR=28;WE=38135411;WS=38135393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,31:0.37:84
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chr19	38160565	rs113316386	C	T	1103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=21;PP=617;ReadPosRankSum=0.679;SC=TTCTCTGATGCTGAATAAGAG;SOR=0.730;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=81;TCF=42;TCR=39;TR=44;WE=38160573;WS=38160555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,53:0.56:95
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chr19	38202516	rs2909097	A	C	4991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=56;PP=2864;SC=CTTACATAGGACATGGTTTGA;SOR=0.962;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=94;TCR=56;TR=150;WE=38202524;WS=38202506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr19	38229378	rs1291	G	A	1742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.662;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=29;PP=842;ReadPosRankSum=-0.271;SC=TGGCGCGCTCGTACTCTTTAC;SOR=0.501;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=164;TCF=102;TCR=62;TR=73;WE=38229386;WS=38229368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,87:0.48:181
chr19	38229824	rs3095726	T	C	786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=17;PP=492;ReadPosRankSum=-1.259;SC=TAGGGTTTCATACCAGTATGA;SOR=0.655;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=83;TCF=44;TCR=39;TR=37;WE=38229832;WS=38229814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,40:0.45:89
chr19	38230783	rs367739628	T	C	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.471;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=10;PP=322;ReadPosRankSum=-1.617;SC=AGTCAGCTGATAACCACTTCT;SOR=0.404;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=45;TCF=20;TCR=25;TR=20;WE=38230791;WS=38230773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,21:0.45:47
chr19	38314767	rs2305105	A	G	4060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=51;PP=2599;SC=GAAGTGACAAAAGAACAAATG;SOR=1.101;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=130;TCF=79;TCR=51;TR=130;WE=38314775;WS=38314757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr19	38376103	rs73027454	A	G	3548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.940;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=81;PP=2343;ReadPosRankSum=-0.795;SC=GTTTATCCTTAAAATCCCAGA;SOR=0.859;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=307;TCF=141;TCR=166;TR=146;WE=38376111;WS=38376093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,161:0.49:330
chr19	38376485	rs10408510	T	A	5134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=77;PP=2965;SC=AATGGCTTCATGTTTGGCCAG;SOR=0.761;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=81;TCR=77;TR=158;WE=38376493;WS=38376475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr19	38377409	rs7252765	A	T	1716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.89;QD=29.60;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr19	38377564	rs7253969	T	C	12171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=444;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=211;NR=194;PP=2965;SC=AAAACTTTTCTTTTGGTTTGT;SOR=0.758;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=406;TCF=211;TCR=195;TR=405;WE=38377572;WS=38377554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,444:1.00:444
chr19	38377773	rs34785154	G	A	3068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.012;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=61;PP=1853;ReadPosRankSum=-0.061;SC=CTCTGCTTCCGAGCCAGTTTC;SOR=0.504;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=277;TCF=136;TCR=141;TR=132;WE=38377781;WS=38377763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,148:0.49:304
chr19	38378107	rs60704260	G	A	3117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=359;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.383;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=60;PP=1654;ReadPosRankSum=0.398;SC=TGGCAATTTCGCTTTCCTCCA;SOR=0.745;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=319;TCF=168;TCR=151;TR=139;WE=38378115;WS=38378097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:198,160:0.45:358
chr19	38378539	rs10422056	G	C	8075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=122;NR=130;PP=2965;SC=CCAGTATCTTGTTGAACATTC;SOR=0.853;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=252;TCF=122;TCR=130;TR=252;WE=38378547;WS=38378529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,281:1.00:281
chr19	38379446	rs6508750	C	T	2566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=54;PP=1472;ReadPosRankSum=-1.157;SC=TTTTTCAGCTCGGGCTCGTTT;SOR=0.686;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=252;TCF=126;TCR=126;TR=111;WE=38379454;WS=38379436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,124:0.45:275
chr19	38381053	.	A	AC	141.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.067;ClippingRankSum=-0.000;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.605;NF=0;NR=7;PP=143;ReadPosRankSum=0.172;SC=TAAAAAAAAAAAGCATTCTCT;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=7;WE=38381061;WS=38381043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr19	38382328	rs953370	C	T	3040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=71;PP=1931;ReadPosRankSum=-2.263;SC=AAGAAAAAGCCGGCTTTTCAT;SOR=0.673;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=319;TCF=154;TCR=165;TR=137;WE=38382336;WS=38382318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:198,148:0.43:346
chr19	38384421	rs3894129	C	G	5519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=86;PP=2965;SC=GTCCAGAATGCCTATGAGTCT;SOR=0.745;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=178;TCF=90;TCR=88;TR=176;WE=38384429;WS=38384411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr19	38621473	rs861304	G	A	2387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=60;PP=1626;SC=CTGGCATGAGGCCTCCCTGGC;SOR=2.476;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=19;TCR=60;TR=79;WE=38621481;WS=38621463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr19	38633159	rs2304132	C	T	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.670;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=327;ReadPosRankSum=-0.199;SC=CCTCCCAGGGCAGGGGTACCC;SOR=1.179;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=22;WE=38633167;WS=38633149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,22:0.69:32
chr19	38652714	rs116972169	C	T	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.74;ReadPosRankSum=-2.485;SOR=0.252;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
chr19	38652993	rs332864	C	T	1350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.456;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=33;PP=818;ReadPosRankSum=0.147;SC=GCAAAGATTCCCCCAACAGGC;SOR=0.566;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=50;TCR=60;TR=62;WE=38653001;WS=38652983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,64:0.54:119
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chr19	38702950	rs11547760	G	A	1535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FS=1.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.838;SOR=0.598;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,83:0.53:158
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chr19	38708398	rs2304175	A	C	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=11;PP=390;ReadPosRankSum=-1.288;SC=GTCTCTGGGCACCCCTCTCTC;SOR=0.651;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=102;TCF=66;TCR=36;TR=32;WE=38708406;WS=38708388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,33:0.31:108
chr19	38817110	rs7250755	A	G	1145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=7;PP=828;SC=AGGATCACTTAGGTCCAGGAG;SOR=2.554;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=37;TCF=29;TCR=8;TR=36;WE=38817118;WS=38817100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr19	38861333	rs1052375	G	A	6750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=133;PP=2965;SC=CGAGCATGCCGTCTCTGAGAC;SOR=1.045;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=233;TCF=100;TCR=133;TR=233;WE=38861341;WS=38861323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr19	38877997	rs62123482	G	T	2701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=65;PP=1855;SC=TTGATCTAATGCGTCCGCACC;SOR=2.303;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=87;TCF=21;TCR=66;TR=86;WE=38878005;WS=38877987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr19	38896204	rs117354953	T	G	2475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.440;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=61;PP=1567;ReadPosRankSum=1.695;SC=TCAGTACCGCTGCCGCCGCTG;SOR=0.752;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=248;TCF=116;TCR=132;TR=114;WE=38896212;WS=38896194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,124:0.44:279
chr19	38935280	rs2229139	A	G	6523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=115;NR=75;PP=2965;SC=TGCAGACACTATGGAACATGA;SOR=0.960;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=191;TCF=115;TCR=76;TR=190;WE=38935288;WS=38935270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr19	38935350	rs35018208	T	TC	11817.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=395;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=125;PP=2975;SC=TAAATGGAGATCCCCCCAAAA;SOR=0.698;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=174;TCF=38;TCR=136;TR=150;WE=38935358;WS=38935340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,383:1.00:383
chr19	38939408	rs10406027	T	C	2579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=58;PP=1475;SC=TCACCTATGCTGCTCCAGACC;SOR=1.431;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=35;TCR=58;TR=93;WE=38939416;WS=38939398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr19	38939505	rs4476278	T	C	194.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=3;PP=55;SC=ATCGCTTGAGTCCAGGAGGTC;SOR=2.584;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=38939513;WS=38939495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	38942714	rs4802469	G	A	365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=11;PP=289;SC=GGATCGCTTGGGCCCAGGAGC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=38942722;WS=38942704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	38943728	rs12460768	G	A	933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=24;PP=618;SC=GGGCCACGGCGCTGGGCGGGG;SOR=2.517;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=31;WE=38943736;WS=38943718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	38945851	rs7254832	T	C	3120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=37;PP=1764;SC=CCTATTGTGATGCCTCTTATT;SOR=1.159;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=67;TCR=37;TR=104;WE=38945859;WS=38945841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr19	38946182	rs2288888	G	A	7074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=112;NR=125;PP=2965;SC=TGGAGGCCTCGTCTGGTAGGA;SOR=0.939;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=237;TCF=112;TCR=125;TR=237;WE=38946190;WS=38946172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr19	38946215	rs2288889	G	C	4599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=94;PP=2794;SC=GTGGGACAGAGGCTTGTGGGA;SOR=1.219;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=160;TCF=66;TCR=94;TR=160;WE=38946223;WS=38946205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr19	38948356	rs2071085	T	C	4652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=83;PP=2740;SC=ATGGATGTCCTTTCCTTAATC;SOR=1.213;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=146;TCF=63;TCR=83;TR=146;WE=38948364;WS=38948346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr19	38948420	rs73044990	C	G	1848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=43;PP=1328;SC=TGGCCCCACTCTCCCTTGGCA;SOR=1.926;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=17;TCR=43;TR=60;WE=38948428;WS=38948410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr19	38949904	rs3745847	C	T	3358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=49;PP=1905;SC=ACGGCTGCCCCGTGCAGGGTG;SOR=0.920;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=65;TCR=49;TR=114;WE=38949912;WS=38949894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr19	38950947	rs2304147	C	T	1769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=16;PP=1136;SC=GCTTCCATGTCCCCCACTGAC;SOR=1.839;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=58;TCF=41;TCR=17;TR=57;WE=38950955;WS=38950937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr19	38953996	rs2304148	A	G	4853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=62;PP=2843;SC=GTGTTCTTGGAAAGAGGGGTC;SOR=1.085;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=157;TCF=95;TCR=62;TR=157;WE=38954004;WS=38953986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr19	38956803	rs2228069	G	A	8135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=149;NR=134;PP=2965;SC=CGGCGCAGACGACACTGGTGG;SOR=0.706;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=283;TCF=149;TCR=134;TR=283;WE=38956811;WS=38956793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,306:1.00:306
chr19	38998289	rs35648526	A	G	1988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.553;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=30;PP=1329;ReadPosRankSum=-0.979;SC=GGCGGACCTGAGAAGGGTGGG;SOR=0.775;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=176;TCF=114;TCR=62;TR=87;WE=38998297;WS=38998279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,92:0.48:190
chr19	39077253	rs73032657	G	T	1455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.516;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=39;PP=921;ReadPosRankSum=2.026;SC=TGGGCAGGACGTGGAGCCCTT;SOR=0.554;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=117;TCF=43;TCR=74;TR=63;WE=39077261;WS=39077233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,66:0.55:121
chr19	39138608	rs2303040	T	C	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.23;ReadPosRankSum=-0.480;SOR=0.689;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,29:0.52:56
chr19	39191383	rs2112649	G	C	1461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.707;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=34;PP=924;ReadPosRankSum=0.254;SC=CAGTGCGGCCGAGCCCTGGCA;SOR=0.508;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=100;TCF=31;TCR=69;TR=52;WE=39191391;WS=39191373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,61:0.55:110
chr19	39196745	rs3745859	C	T	2532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.494;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=49;PP=1456;ReadPosRankSum=0.191;SC=CGTATAAGAACGTCAATGTGC;SOR=0.625;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=193;TCF=104;TCR=89;TR=103;WE=39196753;WS=39196735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,120:0.54:221
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chr19	39297007	rs74176466	C	CA	164.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=1.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.68;ReadPosRankSum=-0.808;SOR=0.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,8:0.28:29
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chr19	39299362	rs1035525	A	G	955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.785;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=17;PP=619;ReadPosRankSum=-1.054;SC=AGCTTGGGAAACAAGAGAGAA;SOR=0.468;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=81;TCF=53;TCR=28;TR=44;WE=39299370;WS=39299352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,46:0.52:89
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chr19	39322087	rs9419	T	G	1988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.664;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=50;PP=1296;ReadPosRankSum=0.040;SC=TCCGGAAGCCTCCTCTTGTGC;SOR=0.563;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=206;TCF=90;TCR=116;TR=92;WE=39322095;WS=39322077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,99:0.45:221
chr19	39328145	rs2278010	A	C	2437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.217;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=44;PP=1586;ReadPosRankSum=1.150;SC=GGGGAAAAGTAAAGGTTTTAG;SOR=0.547;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=211;TCF=127;TCR=84;TR=106;WE=39328153;WS=39328135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,117:0.49:238
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chr19	39334830	rs2278012	C	T	1248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=30;PP=753;ReadPosRankSum=-0.260;SC=GACAAGGTAGCACCCCAAGAC;SOR=0.631;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=85;TCF=31;TCR=54;TR=48;WE=39334838;WS=39334820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,54:0.59:92
chr19	39338125	rs862454	G	A	2049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.496;HP=5;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=46;PP=1179;ReadPosRankSum=-0.729;SC=ACAAGATGACGCCCCACTGGC;SOR=0.636;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=194;TCF=98;TCR=96;TR=92;WE=39338133;WS=39338115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,102:0.47:218
chr19	39338142	rs862455	A	G	1864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.766;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=45;PP=1172;ReadPosRankSum=0.218;SC=TGGCCTCTGTACTGTTGTAGA;SOR=0.846;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=171;TCF=84;TCR=87;TR=81;WE=39338150;WS=39338132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,90:0.46:194
chr19	39360720	rs8110393	G	A	1454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.552;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=40;PP=919;ReadPosRankSum=0.350;SC=GGCGGGGGCGGGGCTCTGCCC;SOR=1.007;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=115;TCF=35;TCR=80;TR=56;WE=39360728;WS=39360710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,63:0.50:127
chr19	39361658	rs8100220	G	C	1565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.686;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=27;PP=1103;ReadPosRankSum=-0.104;SC=GCATTCGGTCGCCTAGAACAG;SOR=0.980;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=149;TCF=90;TCR=59;TR=74;WE=39361666;WS=39361648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,75:0.47:159
chr19	39364415	rs6508823	C	T	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=201;ReadPosRankSum=-0.216;SC=ATCCACCCGCCTCGACCTACC;SOR=0.711;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=15;WE=39364423;WS=39364405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr19	39366899	rs1529713	A	G	1960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.065;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=33;PP=1131;ReadPosRankSum=0.907;SC=AATTTGTGTCATGTTTGTCAC;SOR=0.901;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=199;TCF=123;TCR=76;TR=91;WE=39366907;WS=39366889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,103:0.47:221
chr19	39367111	rs1001413	T	C	1316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.296;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=27;PP=782;ReadPosRankSum=0.465;SC=TCTGCTTTGTTCACCTGTGGT;SOR=0.499;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=109;TCF=52;TCR=57;TR=54;WE=39367119;WS=39367101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,62:0.50:125
chr19	39372244	rs2082435	C	G	1010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.512;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=24;PP=446;ReadPosRankSum=2.103;SC=ACCTCCATCACTTGGAGTGTG;SOR=0.507;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=111;TCF=48;TCR=63;TR=47;WE=39372252;WS=39372234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,54:0.46:118
chr19	39398416	rs3136642	A	G	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=19;PP=451;ReadPosRankSum=-0.922;SC=GAACTCAGGCAGCAGCGCCAG;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=50;TCF=16;TCR=34;TR=27;WE=39398424;WS=39398406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,28:0.53:53
chr19	39400054	rs11404115	T	TA	1294.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=25;PP=1072;ReadPosRankSum=1.046;SC=TCGGTTCTCATAGTGGCATCC;SOR=0.713;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=56;TCF=4;TCR=52;TR=28;WE=39400062;WS=39400044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,43:0.47:91
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chr19	39407014	rs4801945	C	A	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.835;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=283;ReadPosRankSum=1.486;SC=GCAAGAGGAACAAATGGAAAC;SOR=1.593;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=46;TCF=13;TCR=33;TR=17;WE=39407022;WS=39407004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,20:0.37:54
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chr19	39433136	rs77963530	C	CA	190.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5041;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=201;ReadPosRankSum=-0.431;SC=TCCCGAGCTCCAGTGATCCTC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=7;WE=39433144;WS=39433133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
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chr19	39433497	rs11313800	GT	G	560.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=772;ReadPosRankSum=1.710;SC=TCCTGCGCTAGTTTGCTGGGG;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=13;WE=39433507;WS=39433487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr19	39433499	rs57290038	T	G	569.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=786;ReadPosRankSum=1.426;SC=CTGCGCTAGTTTGCTGGGGAC;SOR=0.368;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=14;WE=39433507;WS=39433487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr19	39435485	rs10416055	G	A	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=107;ReadPosRankSum=0.751;SC=AGAAGGGCTCGATACTTCTTA;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=6;WE=39435493;WS=39435475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr19	39435933	rs11672849	C	G	1810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.50;SOR=1.042;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr19	39437258	rs10568003	TCA	T	5543.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=64;PP=2970;ReadPosRankSum=-0.370;SC=GGCATTCAAGTCACAGTCAGA;SOR=0.725;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=138;TCF=20;TCR=118;TR=71;WE=39437278;WS=39437248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,140:0.56:251
chr19	39437270	rs2278412	G	A	5558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.467;HP=2;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=66;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.162;SC=ACAGTCAGAAGCCACCTCCTC;SOR=0.751;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=230;TCF=114;TCR=116;TR=130;WE=39437278;WS=39437248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,142:0.57:249
chr19	39440918	rs2304117	T	C	697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=21;PP=348;ReadPosRankSum=-0.944;SC=GGGCCAGGGATGGGTCCGCCG;SOR=0.743;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=85;TCF=36;TCR=49;TR=36;WE=39440926;WS=39440908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,38:0.44:87
chr19	39440966	rs2304118	T	C	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.026;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=293;ReadPosRankSum=-0.023;SC=CCATCTCCAGTAGCCAGAGTC;SOR=0.985;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=55;TCF=25;TCR=30;TR=22;WE=39440974;WS=39440956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,24:0.40:60
chr19	39441046	rs78365239	G	A	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=42;ReadPosRankSum=-1.902;SC=TTGTCCCCCAGGGCGCAAGGC;SOR=0.941;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=18;TCF=7;TCR=11;TR=6;WE=39441054;WS=39441036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr19	39687592	rs12462614	T	C	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.08;ReadPosRankSum=0.286;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr19	39688815	rs12610064	C	T	1659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.637;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=26;PP=873;ReadPosRankSum=0.514;SC=GTTGGGGTGTCCTAACCCTTT;SOR=0.906;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=149;TCF=92;TCR=57;TR=72;WE=39688823;WS=39688805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,84:0.48:174
chr19	39688901	rs12610093	G	T	1476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.292;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=33;PP=827;ReadPosRankSum=-0.418;SC=AAGGTGAGTCGCCAGGGCCAG;SOR=0.841;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=135;TCF=71;TCR=64;TR=67;WE=39688909;WS=39688891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,73:0.49:149
chr19	39689943	rs12610530	G	A	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-4.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.572;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=328;ReadPosRankSum=0.451;SC=CCCCGTGATCGCGCAGGGCTG;SOR=0.105;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=38;TCF=8;TCR=30;TR=23;WE=39689951;WS=39689933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,26:0.63:41
chr19	39691136	rs11672471	C	A	2461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.191;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=43;PP=1606;ReadPosRankSum=0.597;SC=TGAGACTCTCCGCGCCGGGGC;SOR=0.499;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=195;TCF=119;TCR=76;TR=103;WE=39691144;WS=39691126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,112:0.54:208
chr19	39691216	rs11672475	A	T	3315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.038;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=60;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.052;SC=GCGGGTCCTCAAAAAGGGCTC;SOR=0.536;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=293;TCF=175;TCR=118;TR=143;WE=39691225;WS=39691206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,154:0.48:322
chr19	39691217	rs144574051	A	G	3815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=4.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.340;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=55;PP=2962;ReadPosRankSum=1.549;SC=CGGGTCCTCAAAAAGGGCTCC;SOR=0.918;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=295;TCF=178;TCR=117;TR=149;WE=39691225;WS=39691206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,167:0.52:324
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chr19	39734220	rs4803217	C	A	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.673;NF=16;NR=5;PP=328;ReadPosRankSum=-0.578;SC=ATAAATTAAGCCAAGTGGCTA;SOR=0.598;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=54;TCF=42;TCR=12;TR=21;WE=39734228;WS=39734210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,24:0.41:58
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chr19	39760069	rs30481	G	C	1272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=21;PP=1082;SC=TCTCTATCCTGCTCCCCAACC;SOR=0.793;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=19;TCR=21;TR=40;WE=39760077;WS=39760059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr19	39760191	rs8103362	A	G	2030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.653;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.153;NF=47;NR=41;PP=1145;ReadPosRankSum=-0.601;SC=TCTGGAGGCCACCGCTGACAC;SOR=0.513;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=165;TCF=91;TCR=74;TR=88;WE=39760199;WS=39760181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,98:0.56:175
chr19	39760336	rs58736064	T	G	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.893;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.625;NF=13;NR=19;PP=440;ReadPosRankSum=-1.383;SC=TCCTTCCCCTTGCCAAGGCCC;SOR=0.500;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=32;TCR=49;TR=32;WE=39760344;WS=39760326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,31:0.39:80
chr19	39760435	rs59746524	T	C	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=4.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-4.566;NF=3;NR=5;PP=136;ReadPosRankSum=-0.120;SC=CCATTGGCTGTACCGGCTCCA;SOR=0.655;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=32;TCF=15;TCR=17;TR=8;WE=39760443;WS=39760425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,7:0.25:28
chr19	39868001	.	CTA	C	1221.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=0.000;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.883;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.708;NF=20;NR=4;PP=921;ReadPosRankSum=1.504;SC=CATGCCTTCTCTATGTGCTGG;SOR=1.251;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=65;TCF=49;TCR=16;TR=24;WE=39868010;WS=39867991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,34:0.41:82
chr19	39888449	rs519575	C	T	1048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.020;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=30;PP=684;ReadPosRankSum=0.911;SC=GCCTGAGCACCGCAGCGGGAG;SOR=1.215;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=83;TCF=35;TCR=48;TR=46;WE=39888457;WS=39888439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,49:0.53:93
chr19	39908214	rs73033371	C	T	1274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=0.662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.20;ReadPosRankSum=-0.480;SOR=0.663;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,65:0.52:125
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chr19	39913324	rs3859552	C	G	901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.798;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=14;PP=520;ReadPosRankSum=-0.327;SC=CCACCACACCCAGCTACCATG;SOR=0.845;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=57;TCR=28;TR=42;WE=39913332;WS=39913314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,48:0.49:97
chr19	39914308	rs31725	C	T	2362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.046;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=41;PP=1356;ReadPosRankSum=0.922;SC=GGTCCGGGTACGTGGTTGGCA;SOR=0.787;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=192;TCF=110;TCR=82;TR=100;WE=39914316;WS=39914298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,115:0.53:218
chr19	39914748	rs31726	G	A	4058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=421;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=86;PP=2728;ReadPosRankSum=-1.570;SC=CCTGAGCATAGAAGTCACATG;SOR=0.722;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=395;TCF=203;TCR=192;TR=177;WE=39914756;WS=39914738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:227,193:0.46:420
chr19	39915637	rs31727	G	A	1565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.696;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=29;PP=921;ReadPosRankSum=1.369;SC=ATATCAGCCAGAGCCTGGCTC;SOR=0.746;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=55;TCR=49;TR=61;WE=39915645;WS=39915627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,69:0.58:118
chr19	39915758	rs31728	C	G	1933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.073;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=38;PP=1147;ReadPosRankSum=-0.693;SC=ACCACCTCCCCCAGCCAGGCG;SOR=0.797;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=190;TCF=104;TCR=86;TR=91;WE=39915766;WS=39915748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,99:0.48:207
chr19	39916110	rs16746	GGGA	G	571.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.798;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=442;ReadPosRankSum=1.739;SC=GGATGGGGAAGGGAGGAATGT;SOR=0.086;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=11;WE=39916120;WS=39916100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr19	39923952	rs17627	G	A	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=93;ReadPosRankSum=-1.189;SC=GGGCACCAGGGCCTCCAAACT;SOR=0.293;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=7;WE=39923960;WS=39923942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr19	39924129	rs566130	T	C	2727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.422;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=49;PP=1736;ReadPosRankSum=-0.162;SC=CACACACCCATCTACCTCATG;SOR=0.656;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=278;TCF=167;TCR=111;TR=120;WE=39924137;WS=39924119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,134:0.44:307
chr19	39926551	rs199845528	C	G	450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.236;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=266;ReadPosRankSum=0.148;SC=CGAGCGTGGACTAGACAACCT;SOR=0.148;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=38;TCF=5;TCR=33;TR=17;WE=39926559;WS=39926541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr19	39932066	rs1865091	T	C	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.411;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=184;ReadPosRankSum=3.191;SC=CTGCTGGATCTCCTGGGGTCC;SOR=0.357;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=34;TCF=11;TCR=23;TR=15;WE=39932074;WS=39932056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
chr19	39936502	rs1932	G	A	3621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.661;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=71;PP=2245;ReadPosRankSum=0.325;SC=ACGCGCCAAGGCTGCTGTCTT;SOR=0.954;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=306;TCF=165;TCR=141;TR=164;WE=39936510;WS=39936492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,173:0.52:332
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chr19	39944082	rs1130180	C	T	1251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.678;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=29;PP=757;ReadPosRankSum=1.669;SC=AGGAGGAATACGATGAGGAAG;SOR=0.621;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=107;TCF=57;TCR=50;TR=58;WE=39944090;WS=39944072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,63:0.53:118
chr19	39948871	rs374640896	CCCACCA	C,CCCA	473.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=1.991;HP=2;HapScore=3;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=1.139;NF=4,4;NR=6,6;PP=299,244;ReadPosRankSum=0.200;SC=TCTGCCCTCGCCCACCACCAC;SOR=1.341;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=18;TCF=8;TCR=10;TR=10,10;WE=39948884;WS=39948861;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.74:23
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chr19	39955304	rs73035432	T	C	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.593;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=182;ReadPosRankSum=0.443;SC=GGAACACCTTTGTGTCCATGT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=9;WE=39955312;WS=39955294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
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chr19	39963828	rs45568533	T	A	3307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.175;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=56;PP=2010;ReadPosRankSum=0.689;SC=CCCCATTTGTTCTCTGCGTCC;SOR=0.882;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=270;TCF=157;TCR=113;TR=141;WE=39963836;WS=39963818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,152:0.52:294
chr19	39971401	rs62120677	C	T	1883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.583;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=48;PP=1137;ReadPosRankSum=1.639;SC=TTCCGTCCACCCGCCCCTCCC;SOR=0.612;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=163;TCF=62;TCR=101;TR=81;WE=39971409;WS=39971391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,88:0.52:170
chr19	39971622	rs2304221	C	G	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=35;ReadPosRankSum=1.834;SC=CGAGGGTGGCCCTCTGAATGT;SOR=0.368;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=4;WE=39971630;WS=39971612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr19	39972766	rs62120691	G	A	1394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.188;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=33;PP=788;ReadPosRankSum=-4.515;SC=AGCTTCTCTCGTCTTCATTCC;SOR=0.904;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=122;TCF=50;TCR=72;TR=53;WE=39972774;WS=39972756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,66:0.47:139
chr19	39976464	rs4803245	C	G	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=23;PP=548;ReadPosRankSum=-0.187;SC=CCCGGGAAACCCAGTGGGTTG;SOR=0.622;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=82;TCF=28;TCR=54;TR=36;WE=39976472;WS=39976454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,38:0.41:93
chr19	39976734	rs4803247	G	A	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-3.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.930;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=90;ReadPosRankSum=-0.298;SC=AGAGAACTCTGTTCTGGGAAT;SOR=0.045;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=10;WE=39976742;WS=39976724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr19	39976969	rs1865094	T	C	1922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=44;PP=1177;ReadPosRankSum=-0.532;SC=ATTGGTGTGGTGGGAGGCGTA;SOR=0.663;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=168;TCF=82;TCR=86;TR=88;WE=39976977;WS=39976959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,91:0.53:173
chr19	39977173	rs8112528	G	A	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.683;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=223;ReadPosRankSum=1.144;SC=GGGATTTGGCGGAGTTGGCAC;SOR=0.124;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=15;WE=39977181;WS=39977163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr19	39978610	rs74178079	GTGTA	G	982.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.296;NF=12;NR=6;PP=847;ReadPosRankSum=1.103;SC=GTGTGATGCTGTGTATGTATG;SOR=0.697;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=57;TCF=38;TCR=19;TR=18;WE=39978621;WS=39978600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,28:0.38:73
chr19	39980612	rs76609107	C	T	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=3.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=243;ReadPosRankSum=-0.560;SC=GGGTGAGGTCCGGGACTCTTG;SOR=0.859;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=14;WE=39980620;WS=39980602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr19	39990245	rs3212275	G	C	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=297;ReadPosRankSum=-0.093;SC=TCCCAGACCAGTAACTCTACC;SOR=0.501;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=40;TCF=10;TCR=30;TR=21;WE=39990253;WS=39990235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,21:0.50:42
chr19	39991237	rs2304223	C	G	2586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.094;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=59;PP=1424;ReadPosRankSum=1.450;SC=TCATCTCCCCCTTCCTTCACC;SOR=0.675;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=275;TCF=145;TCR=130;TR=120;WE=39991245;WS=39991227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,137:0.45:306
chr19	39993415	rs2278440	C	T	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.48;ReadPosRankSum=-1.322;SOR=0.648;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,36:0.47:77
chr19	39993470	rs55741253	T	A	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=13;PP=321;ReadPosRankSum=-2.666;SC=GCCTGGAGCCTGCTGGCGCGC;SOR=0.638;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=52;TCF=28;TCR=24;TR=27;WE=39993478;WS=39993460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,30:0.49:61
chr19	39993560	rs8107127	T	G	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.738;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=64;ReadPosRankSum=-0.968;SC=GAGCTGCGCTTCTCGTACCGC;SOR=2.093;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=20;TCF=8;TCR=12;TR=6;WE=39993568;WS=39993550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr19	39993591	rs8106337	C	G	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.187;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=3;PP=23;ReadPosRankSum=0.778;SC=AGCCGCCTGCCGTCGGGACCG;SOR=1.371;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=14;TCF=6;TCR=8;TR=4;WE=39993599;WS=39993581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr19	39994711	rs1110627	T	C	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.058;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=9;PP=246;ReadPosRankSum=0.700;SC=TCCCCCATAGTGGTGTGCCGA;SOR=0.972;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=58;TCF=35;TCR=23;TR=24;WE=39994719;WS=39994701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,27:0.42:65
chr19	39996027	rs2304214	C	T	1933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.125;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=32;PP=918;ReadPosRankSum=0.752;SC=ACTGCCCACCCGGTTTCCAAG;SOR=0.761;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=164;TCF=86;TCR=78;TR=76;WE=39996035;WS=39996017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,94:0.50:187
chr19	40009466	rs28596775	G	T	1848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.086;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=37;PP=1078;ReadPosRankSum=0.505;SC=GGAGAGGGGGGTGGTCAGGGA;SOR=0.614;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=188;TCF=106;TCR=82;TR=85;WE=40009474;WS=40009456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,94:0.47:201
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chr19	40030212	rs61744756	T	G	2298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.495;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=54;PP=1520;ReadPosRankSum=1.310;SC=TCTTGTATTCTGCCGGGAGCA;SOR=0.624;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=198;TCF=91;TCR=107;TR=100;WE=40030223;WS=40030202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,106:0.48:221
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chr19	40093111	rs3764843	C	A	3129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=34;PP=2095;SC=GAATGAAGCCCGAGGGCAAGG;SOR=1.547;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=71;TCR=34;TR=105;WE=40093119;WS=40093101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
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chr19	40149297	rs1860134	T	A	5527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=97;PP=2965;SC=TACGTGTGTCTCAATGAGTAT;SOR=1.167;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=172;TCF=75;TCR=97;TR=172;WE=40149305;WS=40149287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr19	40149330	rs997104	G	C	1163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.536;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=32;PP=734;ReadPosRankSum=-0.808;SC=CCAGGAGCTCGCAGTACCCAG;SOR=0.913;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=101;TCF=39;TCR=62;TR=49;WE=40149338;WS=40149320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,56:0.46:121
chr19	40169845	rs62119912	G	C	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=186;ReadPosRankSum=-0.484;SC=CCTCCGTGTCGTTTCTGCTGC;SOR=0.793;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=10;WE=40169853;WS=40169837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr19	40170053	rs8103033	G	A	1412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.563;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=32;PP=841;ReadPosRankSum=0.571;SC=CACAGAGGGAGACAACAATGT;SOR=0.399;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=151;TCF=70;TCR=81;TR=65;WE=40170061;WS=40170043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,72:0.42:172
chr19	40170103	rs11083532	A	C	1017.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.943;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=25;PP=633;ReadPosRankSum=0.627;SC=CCTTTAATAAACTCAATTCAC;SOR=0.446;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=76;TCF=25;TCR=51;TR=40;WE=40170111;WS=40170093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,45:0.52:86
chr19	40174119	rs1126159	C	T	1739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-2.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.749;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=27;PP=1011;ReadPosRankSum=-0.611;SC=TTTTCTTATGCCTTTCAGCCG;SOR=0.430;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=149;TCF=100;TCR=49;TR=72;WE=40174127;WS=40174109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,83:0.49:169
chr19	40174236	rs7258833	G	A	10563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=398;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.316;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=165;NR=185;PP=2965;ReadPosRankSum=1.389;SC=GCAACTCCAAGGAGAAACTGG;SOR=0.455;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=351;TCF=166;TCR=185;TR=350;WE=40174244;WS=40174226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,396:1.00:397
chr19	40196611	rs35541195	C	T	1194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=0.668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.008;QD=9.71;ReadPosRankSum=-1.136;SOR=0.604;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,61:0.50:123
chr19	40197924	rs4830	T	C	5280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=97;NR=82;PP=2699;SC=CATGAACAGTTGTGTGTTTGG;SOR=0.723;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=179;TCF=97;TCR=82;TR=179;WE=40197932;WS=40197914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr19	40199914	rs10755	C	G	6642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=115;NR=112;PP=2965;SC=TGCAAGTCTTCAGAGATATCT;SOR=0.785;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=228;TCF=116;TCR=112;TR=227;WE=40199922;WS=40199904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr19	40224833	rs375867	A	T	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=45;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=3;PP=348;SC=CCGGGGACAGAGGGAGTTATC;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=40224841;WS=40224823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	40224869	rs391646	T	A	1681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=46;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=7;PP=672;SC=AAGAGCTGCCTCCTGCTCTGA;SOR=2.517;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=31;WE=40224877;WS=40224859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	40224887	rs391660	T	C	2727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=10;PP=1176;SC=TGAGATCCCATGGAAGCCGGG;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=45;TCR=10;TR=55;WE=40224909;WS=40224877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr19	40224901	rs453827	G	A	3379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=20;PP=1687;SC=AGCCGGGTGCGGGGAGCTCCT;SOR=2.247;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=59;TCR=20;TR=79;WE=40224909;WS=40224877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr19	40224986	rs384138	A	G	6922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=129;NR=98;PP=2965;SC=GAAAGGGCATATTCTTGGATT;SOR=0.897;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=229;TCF=130;TCR=99;TR=227;WE=40224994;WS=40224976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
chr19	40225168	rs399641	T	A	1480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=40;PP=1098;SC=AGCAGGTCCCTTTCTTGTGGG;SOR=3.171;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=8;TCR=40;TR=48;WE=40225176;WS=40225158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr19	40225646	rs17608	G	A	5992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=101;PP=2965;SC=CAAGAAACAGGCAAGTGGTCG;SOR=0.804;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=200;TCF=99;TCR=101;TR=200;WE=40225654;WS=40225636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr19	40228802	rs403831	C	T	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=53;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GAGGCCTGTGCCTGTGATGCA;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=4;WE=40228810;WS=40228792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr19	40275185	rs17709621	G	A	1127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.637;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=18;PP=698;ReadPosRankSum=-0.229;SC=AGGCGTTATCGTCGGCCACGC;SOR=0.628;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=138;TCF=89;TCR=49;TR=48;WE=40275193;WS=40275175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,57:0.37:153
chr19	40318086	rs12977762	A	G	2696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.353;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=55;PP=1709;ReadPosRankSum=-1.602;SC=GCAGGGGTCAAGGTCATCAGG;SOR=0.616;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=286;TCF=156;TCR=130;TR=125;WE=40318101;WS=40318076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,135:0.44:310
chr19	40328339	rs62621202	C	A	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.516;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=405;ReadPosRankSum=-1.355;SC=GGGCCACCCCCAGACCCCTCA;SOR=1.295;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=22;WE=40328347;WS=40328329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,22:0.55:40
chr19	40328615	rs616650	C	T	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.130;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=152;ReadPosRankSum=1.754;SC=ATGACTATTGCTATCATGTCC;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=8;WE=40328623;WS=40328605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
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chr19	40354576	rs2302523	C	A	757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-3.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.419;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=26;PP=548;ReadPosRankSum=0.289;SC=GGCCACAGCCCCAGAATAGCT;SOR=2.964;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=2;TCR=44;TR=26;WE=40354584;WS=40354566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,29:0.57:51
chr19	40357247	rs887806	A	G	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.452;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=298;ReadPosRankSum=-0.520;SC=AAATCCAGAGACTAAACCGCA;SOR=0.141;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=14;WE=40357255;WS=40357237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr19	40357341	rs4436880	A	G	3952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.999;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=41;PP=1304;ReadPosRankSum=-0.522;SC=GCAAAAGCCCAGGGAGACATT;SOR=0.769;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=221;TCF=132;TCR=89;TR=100;WE=40357349;WS=40357331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,107:0.44:242
chr19	40357360	rs2075097	C	G	4216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.448;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=48;PP=1563;ReadPosRankSum=1.287;SC=TTCCCTACCCCCTACTCACAA;SOR=0.804;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=248;TCF=145;TCR=103;TR=113;WE=40357368;WS=40357350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,121:0.43:281
chr19	40357683	rs759120	T	G	1380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.633;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=30;PP=739;ReadPosRankSum=-1.949;SC=GGCAGCCAGCTGCCTGGCATG;SOR=0.605;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=123;TCF=55;TCR=68;TR=55;WE=40357691;WS=40357673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,65:0.46:141
chr19	40362573	rs10422312	A	G	704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=7;PP=449;ReadPosRankSum=-1.406;SC=GTGGGAGAAGAAGTTGTGTGG;SOR=0.833;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=59;TCF=42;TCR=17;TR=29;WE=40362581;WS=40362563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,32:0.50:64
chr19	40363020	rs741143	G	A	2212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.152;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=42;PP=1358;ReadPosRankSum=-1.366;SC=GGAGCCGGGCGCCCGCCATGC;SOR=0.771;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=190;TCF=100;TCR=90;TR=97;WE=40363028;WS=40363010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,103:0.51:203
chr19	40363926	rs3746013	C	G	2701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=44;PP=1728;ReadPosRankSum=1.321;SC=CGTTGGAGATCTCCAGCTGCA;SOR=0.705;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=233;TCF=137;TCR=96;TR=111;WE=40363934;WS=40363916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,123:0.47:259
chr19	40366362	rs3855679	G	C	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.568;NF=10;NR=10;PP=280;ReadPosRankSum=0.161;SC=CCACAGCCTTGAGGTCGTCTG;SOR=0.743;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=54;TCF=31;TCR=23;TR=20;WE=40366370;WS=40366352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,19:0.32:60
chr19	40366603	rs3061825	G	GGC	696.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.399;NF=1;NR=10;PP=443;ReadPosRankSum=0.258;SC=GGGGGGATGGGGCGCGGTGAG;SOR=0.650;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=11;WE=40366611;WS=40366593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,21:0.52:40
chr19	40367862	rs6508920	T	C	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.685;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-2.142;NF=16;NR=6;PP=262;ReadPosRankSum=-0.514;SC=GACAGCTGGCTGGGCAGGGTG;SOR=1.483;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=56;TCF=39;TCR=17;TR=22;WE=40367870;WS=40367852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,22:0.35:62
chr19	40368274	.	C	A	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.592;ClippingRankSum=0.000;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=31.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.63;MQRankSum=-7.830;QD=5.76;ReadPosRankSum=-0.055;SOR=2.375;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,15:0.22:69
chr19	40368280	rs62106924	A	G	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=29.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.72;MQRankSum=-6.880;QD=7.68;ReadPosRankSum=-2.590;SOR=1.659;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,24:0.31:78
chr19	40368330	rs74540349	C	T	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FS=1.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQRankSum=-3.329;QD=1.38;ReadPosRankSum=-0.121;SOR=0.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:150,30:0.17:180
chr19	40368376	rs75204711	A	C	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FS=3.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.77;MQRankSum=-1.867;QD=1.07;ReadPosRankSum=-0.440;SOR=0.834;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:201,40:0.17:241
chr19	40368395	rs28472548	C	T	3794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.653;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-1.360;NF=83;NR=84;PP=2320;ReadPosRankSum=0.368;SC=AAGAATGTCACGGTCCCCACC;SOR=0.766;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=239;TCF=120;TCR=119;TR=167;WE=40368403;WS=40368385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,174:0.69:251
chr19	40368498	rs12610683	AA	CC	6022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.04;NF=49;NR=68;PP=2947;SC=GTGCCAGATGAAAGGGGTCCG;SOR=1.213;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=118;TCF=50;TCR=68;TR=117;WE=40368507;WS=40368488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr19	40368520	rs36079378	G	C	1068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.810;HP=3;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.225;NF=16;NR=29;PP=713;ReadPosRankSum=-0.637;SC=AGAAGCCAGGGCCCTCGTACT;SOR=1.028;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=82;TCF=32;TCR=50;TR=45;WE=40368528;WS=40368510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,49:0.53:92
chr19	40374034	rs138587194	A	G	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=2.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.82;MQRankSum=-0.498;QD=6.81;ReadPosRankSum=-2.380;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,23:0.37:63
chr19	40376261	.	A	G	130	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=48.53;NF=7;NR=1;PP=130;QD=20.5964015684;SC=GGGCTGATGAACAGTGGGAGG;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=8;WE=40376269;WS=40376251;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:21,8:0.28:29
chr19	40376675	rs77872255	G	A	796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FS=0.557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.40;MQRankSum=-6.430;QD=3.78;ReadPosRankSum=1.509;SOR=0.632;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:150,61:0.29:211
chr19	40382178	rs76154158	A	G	496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.366;NF=20;NR=5;PP=444;ReadPosRankSum=-1.751;SC=CGGGAAGGAAAGTGGCCCCTG;SOR=0.544;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=25;WE=40382186;WS=40382168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,21:0.66:32
chr19	40384589	rs200138312	C	T	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=36.67;QD=19.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr19	40389581	.	G	T	88	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=46.4;NF=6;NR=0;PP=88;QD=20.4618687579;SC=TACACTACCCGCAGCCCCAGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=6;WE=40389589;WS=40389571;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr19	40392359	rs56242719	T	C	742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.13;QD=28.57;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	40392482	rs62108883	A	G	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=3.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.85;MQRankSum=-1.929;QD=2.70;ReadPosRankSum=0.694;SOR=1.581;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,8:0.20:41
chr19	40405847	rs2011817	C	T	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=52;ReadPosRankSum=-0.748;SC=CCAGTTACACCACCCTCAGCC;SOR=0.527;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=5;WE=40405855;WS=40405837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr19	40406019	rs2355719	G	A	1546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=1.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQRankSum=0.519;QD=13.00;ReadPosRankSum=1.049;SOR=0.536;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,76:0.64:119
chr19	40408146	rs56186636	G	A	1179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.346;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.869;NF=24;NR=31;PP=781;ReadPosRankSum=2.886;SC=CTGCAAGGAGGGGGTGCCGAT;SOR=1.042;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=118;TCF=59;TCR=59;TR=55;WE=40408154;WS=40408136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,55:0.44:124
chr19	40408821	rs11083543	C	G	2993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.468;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.899;NF=75;NR=54;PP=1995;ReadPosRankSum=-0.193;SC=GCCAGCACCACGGGCAGCTTC;SOR=0.805;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=253;TCF=146;TCR=107;TR=129;WE=40408843;WS=40408811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,135:0.50:271
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chr19	40408910	rs11083544	T	C	2559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.469;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=61;PP=1702;ReadPosRankSum=1.291;SC=GGTAGGACCCTAGTTCAAGCC;SOR=0.734;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=222;TCF=105;TCR=117;TR=116;WE=40408918;WS=40408900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,124:0.51:243
chr19	40419558	rs12459958	A	G	969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.751;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=16;PP=672;ReadPosRankSum=0.052;SC=ATGAATATATATAAGGCTGAG;SOR=0.807;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=95;TCF=62;TCR=33;TR=47;WE=40419566;WS=40419548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,47:0.46:103
chr19	40420087	rs12460562	G	A	3814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=84;PP=2330;ReadPosRankSum=-0.346;SC=TGCGCACGACGGCATCCCTGC;SOR=0.710;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=315;TCF=148;TCR=167;TR=159;WE=40420095;WS=40420077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,177:0.51:346
chr19	40421537	rs147566832	G	A	1644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.996;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=37;PP=860;ReadPosRankSum=-0.017;SC=CGACGAGGCCGGCACGCAGGC;SOR=0.912;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=134;TCF=60;TCR=74;TR=65;WE=40421545;WS=40421527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,80:0.50:160
chr19	40421612	rs34939346	T	C	823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=4.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.506;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=593;ReadPosRankSum=0.921;SC=CCCGGAGCAGTTGGACGGCGC;SOR=1.222;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=54;TCF=17;TCR=37;TR=29;WE=40421620;WS=40421602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,32:0.52:61
chr19	40423919	rs45498499	T	C	1828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.412;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=30;PP=1075;ReadPosRankSum=-1.029;SC=ATTAAGCAGATGCTAGGGATC;SOR=0.963;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=175;TCF=112;TCR=63;TR=87;WE=40423927;WS=40423909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,90:0.48:189
chr19	40590499	rs71889243	CT	C	74.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.40;MQRankSum=1.493;QD=2.77;ReadPosRankSum=0.129;SOR=0.489;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr19	40711333	rs892117	A	G	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.725;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=251;ReadPosRankSum=1.712;SC=CCTTTTTTGCATATTAAGAAA;SOR=1.140;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=15;WE=40711341;WS=40711323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr19	40719076	rs1129156	T	C	6732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=108;NR=127;PP=2965;SC=CCCCTGGCTTTGCCAGCCTCA;SOR=0.973;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=235;TCF=108;TCR=127;TR=235;WE=40719084;WS=40719066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
chr19	40719181	rs117163728	C	T	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=144;ReadPosRankSum=-2.868;SC=GACCAGGTTTCACTGGGCCAG;SOR=0.307;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=11;WE=40719189;WS=40719171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr19	40719410	rs3746006	C	T	1049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.770;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=12;PP=612;ReadPosRankSum=1.126;SC=AGTGATGGCCCTCTCCGGTTG;SOR=0.783;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=93;TCF=64;TCR=29;TR=40;WE=40719418;WS=40719400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,48:0.46:105
chr19	40720079	rs3746005	C	T	2280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=40;PP=1365;SC=CGCCATCGGACGGGGCGCTGG;SOR=0.763;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=42;TCR=40;TR=82;WE=40720087;WS=40720069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr19	40721877	rs8106744	G	C	557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=4;PP=405;SC=CATTCCCCCCGACCCCACACA;SOR=2.531;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=19;WE=40721885;WS=40721867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	40723747	rs73933218	C	G	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.197;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=5;PP=114;ReadPosRankSum=-1.182;SC=AAGGCTCCCCCAGAAGCCCAC;SOR=0.283;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=15;TCF=9;TCR=6;TR=11;WE=40723755;WS=40723737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr19	40723844	rs79666308	C	T	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.193;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=222;ReadPosRankSum=1.055;SC=CCCATCCCCCCACCCCCCGAC;SOR=0.416;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=22;TCF=13;TCR=9;TR=13;WE=40723852;WS=40723834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr19	40739513	rs33933140	A	G	2337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.502;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=50;PP=1412;ReadPosRankSum=1.231;SC=TAAAACCTGAATCTCCAACCG;SOR=0.631;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=188;TCF=91;TCR=97;TR=100;WE=40739521;WS=40739503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,110:0.52:213
chr19	40739721	rs2304186	G	T	2299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.466;HP=6;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=52;PP=1371;ReadPosRankSum=1.462;SC=AAGTTAGGGGGAAAAAACCAC;SOR=0.637;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=225;TCF=121;TCR=104;TR=106;WE=40739729;WS=40739711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,115:0.47:246
chr19	40742105	rs2304188	T	C	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.509;HP=2;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=232;ReadPosRankSum=1.154;SC=AACACACAGGTCTGGGGGATC;SOR=0.346;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=27;TCF=11;TCR=16;TR=14;WE=40742113;WS=40742095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr19	40742320	rs2304189	T	C	2793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=47;NR=48;PP=1263;SC=GGATCTCAGGTGCATGCTCCC;SOR=0.888;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=47;TCR=48;TR=95;WE=40742328;WS=40742310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr19	40770982	rs3730050	T	C	328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=2;PP=269;SC=GTCCACGAAATGGGGGCATAA;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=40770990;WS=40770972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	40788641	rs11880261	T	C	613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=16;PP=365;SC=TCTGATAAGATGCGGTGGAAG;SOR=1.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=23;WE=40788649;WS=40788631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	40839664	rs8103796	A	C	630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=2;PP=490;SC=TCTACCTTTGAAAATTACAGG;SOR=3.160;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=40839672;WS=40839654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	40882486	rs3745200	C	G	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-3.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=103;ReadPosRankSum=0.315;SC=CCTCTGCATCCTGCCCCACCT;SOR=0.113;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=8;WE=40882494;WS=40882476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr19	40884160	rs4635	G	A	1439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=32;PP=732;ReadPosRankSum=-0.143;SC=CTGTCCCCGCGCCCCCGCTTC;SOR=0.763;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=106;TCF=47;TCR=59;TR=58;WE=40884168;WS=40884150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,67:0.56:119
chr19	40900865	rs268674	C	T	2792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=35;PP=1671;SC=ACCACCTGCCCGGCTGTGGAC;SOR=0.969;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=49;TCR=35;TR=84;WE=40900873;WS=40900855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
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chr19	41072890	rs1165835	C	A	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.09;ReadPosRankSum=0.712;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
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chr19	41074162	rs118048177	G	A	875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.526;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=20;PP=488;ReadPosRankSum=0.395;SC=AACAGGAGATGCCCATCAGAG;SOR=0.704;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=99;TCF=56;TCR=43;TR=41;WE=41074170;WS=41074152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,46:0.41:113
chr19	41075662	rs1165837	G	C	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=1.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.99;ReadPosRankSum=-0.697;SOR=0.924;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,38:0.44:87
chr19	41075764	rs12980507	A	C	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=44;ReadPosRankSum=-1.284;SC=GACAGCATGGACTCTCAGGGT;SOR=0.743;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=5;WE=41075772;WS=41075754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr19	41077891	rs8101070	C	T	1160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.122;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=18;PP=610;ReadPosRankSum=-1.071;SC=CAGAGTGCTGCGGCTCTGCCT;SOR=0.966;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=113;TCF=69;TCR=44;TR=53;WE=41077899;WS=41077881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,60:0.46:131
chr19	41078220	rs1165841	G	C	509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.124;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=352;ReadPosRankSum=1.489;SC=CCAGATCTCTGAAGTCCTGTG;SOR=0.458;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=50;TCF=35;TCR=15;TR=23;WE=41078228;WS=41078210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,24:0.45:53
chr19	41082868	rs16974365	T	C	1893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.169;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=37;PP=1151;ReadPosRankSum=-1.222;SC=GGGAAGTCATTCATCTGAATG;SOR=0.519;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=133;TCF=75;TCR=58;TR=82;WE=41082876;WS=41082858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,89:0.62:143
chr19	41082993	rs35684786	GC	G	949.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=3;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.338;NF=4;NR=25;PP=502;ReadPosRankSum=1.011;SC=GGGTTGCTCCGCCCCCCCCCC;SOR=0.516;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=29;WE=41083002;WS=41082983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,38:0.97:39
chr19	41083444	rs2290682	C	T	4075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=409;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.521;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=89;PP=2550;ReadPosRankSum=-0.238;SC=CATCCATCCTCTGCCCCCCTT;SOR=0.648;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=366;TCF=180;TCR=186;TR=178;WE=41083453;WS=41083434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:213,196:0.48:409
chr19	41083854	.	TACACAC	TAC,T	88	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=4;MGOF=6;MMLQ=18;MQ=60.0;NF=4,4;NR=0,0;PP=88,69;QD=22.75;SC=GATTTCTCCCTACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=4,4;WE=41083867;WS=41083844;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.29:14
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chr19	41094470	rs45616834	G	A	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=333;ReadPosRankSum=-0.169;SC=GGCTCTGGACGGGCAGGCAGC;SOR=0.711;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=54;TCF=41;TCR=13;TR=22;WE=41094478;WS=41094460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,24:0.44:55
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chr19	41116455	rs33937741	C	G	1591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.848;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=35;PP=945;ReadPosRankSum=-0.116;SC=CGAGTGCCACCGCGTGCCGCC;SOR=0.843;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=160;TCF=89;TCR=71;TR=80;WE=41116463;WS=41116445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,84:0.48:176
chr19	41117624	rs2278246	T	C	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.72;ReadPosRankSum=-0.272;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr19	41117869	rs1131620	A	G	1260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.255;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=31;PP=788;ReadPosRankSum=-0.272;SC=CCAACCCAACACTGCTGGCTC;SOR=0.926;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=119;TCF=56;TCR=63;TR=55;WE=41117877;WS=41117859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,60:0.47:128
chr19	41118056	rs1051303	A	G	1499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=41;PP=963;ReadPosRankSum=3.219;SC=CCAGTGCAGGACCTGTCCTTC;SOR=0.741;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=59;TCR=89;TR=68;WE=41118064;WS=41118046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,73:0.46:159
chr19	41119273	rs12611045	G	C	2901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.001;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=43;PP=1573;ReadPosRankSum=0.929;SC=TGGGAGGCCGGGTCCCGTGAC;SOR=0.518;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=222;TCF=148;TCR=74;TR=117;WE=41119281;WS=41119263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,133:0.55:242
chr19	41120083	rs2369006	A	T	540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=5;PP=342;ReadPosRankSum=-3.199;SC=AGCCTCCCCAACTCTCCTCTA;SOR=0.606;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=56;TCF=45;TCR=11;TR=26;WE=41120091;WS=41120073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,27:0.48:56
chr19	41122671	rs10403963	C	T	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.179;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=439;ReadPosRankSum=2.055;SC=TGTTGATCTTCAGAAGCTCAG;SOR=1.352;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=44;TCF=35;TCR=9;TR=25;WE=41122679;WS=41122661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,26:0.60:43
chr19	41123093	rs59030801	A	AG	4824.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=10;NR=64;PP=2936;SC=CTCTGTGACCAGGTTACGAGG;SOR=1.398;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=84;TCF=11;TCR=73;TR=74;WE=41123101;WS=41123083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr19	41125159	rs7259237	A	G	794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.726;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=9;PP=478;ReadPosRankSum=1.397;SC=TTAAATATACACATTATATTT;SOR=1.071;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=109;TCF=76;TCR=33;TR=38;WE=41125167;WS=41125149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,45:0.37:121
chr19	41125177	rs7259554	G	C	1335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.821;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=16;PP=836;ReadPosRankSum=0.460;SC=TTTGAAAGCTGAGACTTTCGG;SOR=1.000;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=151;TCF=99;TCR=52;TR=54;WE=41125185;WS=41125167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,65:0.39:168
chr19	41128309	rs10880	C	T	686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=16;PP=416;ReadPosRankSum=-1.210;SC=TCCCCAGGCACGTTCCCAGGC;SOR=0.715;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=89;TCF=51;TCR=38;TR=34;WE=41128317;WS=41128299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,37:0.39:96
chr19	41129842	rs7367	C	T	3100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.588;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=56;PP=1734;ReadPosRankSum=0.667;SC=TCTCCCTAGACAATGACGAGT;SOR=0.966;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=309;TCF=172;TCR=137;TR=139;WE=41129850;WS=41129832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,156:0.46:339
chr19	41131675	rs2278242	C	G	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=4;PP=113;ReadPosRankSum=1.093;SC=GCAGAGGGTGCCTGGGCTGCT;SOR=0.732;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=19;TCR=12;TR=10;WE=41131683;WS=41131665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr19	41135156	rs35487927	TCA	T	1218.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.317;NF=18;NR=2;PP=848;ReadPosRankSum=0.697;SC=CTGGCCGGGCTCACACAGTTA;SOR=0.729;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=45;TCF=38;TCR=7;TR=20;WE=41135165;WS=41135146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,34:0.55:62
chr19	41173880	rs2604901	C	T	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.550;HP=1;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.312;NF=11;NR=7;ReadPosRankSum=1.629;SC=GCTGTTGCTGCTGCTGCTGCT;SOR=0.668;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=29;TCF=16;TCR=13;TR=18;WE=41173905;WS=41173870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,20:0.67:30
chr19	41173892	rs141662737	CTGCTGT	C	841.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.438;NF=2;NR=10;ReadPosRankSum=1.059;SC=GCTGCTGCTGCTGCTGTTGCT;SOR=0.693;Source=Platypus;TR=12;WE=41173905;WS=41173870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,24:0.67:36
chr19	41192610	rs112258640	T	TTGAG	208.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=271;ReadPosRankSum=2.583;SC=ATGTGAGTGTTTGTGACTCTG;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=6;WE=41192618;WS=41192600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr19	41206208	rs2246095	A	G	1002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=24;PP=530;ReadPosRankSum=-1.485;SC=GCCACCAGACAGCATACCTGG;SOR=0.751;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=125;TCF=57;TCR=68;TR=46;WE=41206216;WS=41206198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,53:0.38:139
chr19	41211056	rs3865452	T	C	2659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=33;PP=1503;SC=CTCAAAGATGTGCTGCAGCTG;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=56;TCR=33;TR=89;WE=41211064;WS=41211046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr19	41235167	rs112628847	G	A	2259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.907;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=51;PP=1354;ReadPosRankSum=0.879;SC=TGTGAGCAGCGCAGCCTGGAG;SOR=0.656;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=267;TCF=136;TCR=131;TR=107;WE=41235175;WS=41235157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,117:0.40:292
chr19	41251180	rs2369302	T	G	1269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=28;PP=843;SC=CTGGGAGTGGTCGTATCCAGG;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=15;TCR=28;TR=43;WE=41251188;WS=41251170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr19	41255500	rs2254343	C	G	1969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=32;PP=1275;SC=GAAGACATGACGGGGAGCAGG;SOR=0.840;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=67;TCF=34;TCR=33;TR=66;WE=41255508;WS=41255490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr19	41257176	rs1457141	G	C	1850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=17;PP=1188;SC=CTCCGTCCTTGCCCCTACTCC;SOR=1.508;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=61;TCF=44;TCR=17;TR=60;WE=41257184;WS=41257166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr19	41265201	rs736625	C	T	698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=2;PP=526;SC=GTGATCTGCTCGCTTTAGCCT;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=41265209;WS=41265191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	41269076	rs2305797	T	C	878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.828;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=25;PP=469;ReadPosRankSum=-0.820;SC=TTGGGTGGTCTGGGCAGGCCC;SOR=0.924;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=80;TCF=31;TCR=49;TR=40;WE=41269084;WS=41269066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,43:0.52:83
chr19	41283365	rs2233159	C	G	1539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=26;NR=24;PP=783;SC=CCCTCCTTGGCTTTATGCAAA;SOR=0.831;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=51;TCF=26;TCR=25;TR=50;WE=41283373;WS=41283355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr19	41306362	rs11547373	G	A	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.85;ReadPosRankSum=0.921;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr19	41312612	rs76443752	G	C	2470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.510;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=55;PP=1429;ReadPosRankSum=2.169;SC=GGGTGGCGCTGGGGCTAGGGC;SOR=0.612;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=201;TCF=108;TCR=93;TR=108;WE=41312631;WS=41312602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,118:0.54:218
chr19	41313202	rs3736329	C	A	3471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.842;HP=1;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=73;ReadPosRankSum=-1.877;SC=CTTCTGGAGACGCACCCAGGT;SOR=0.752;SbPval=0.56;Source=Platypus;TCR=142;TR=157;WE=41313210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,166:0.52:321
chr19	41316355	rs41530251	T	C	1443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.022;NF=16;NR=41;PP=1007;ReadPosRankSum=0.872;SC=ACAGATAACATTGGATACAGC;SOR=0.763;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=31;TCR=80;TR=57;WE=41316363;WS=41316345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,60:0.51:117
chr19	41316370	rs11552615	T	C	1116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.260;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.447;NF=6;NR=33;PP=778;ReadPosRankSum=0.005;SC=TACAGCATTATCCAGTAGCCG;SOR=0.517;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=72;TCF=10;TCR=62;TR=39;WE=41316378;WS=41316360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,43:0.54:79
chr19	41316393	rs146402068	C	T	838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.15;MQRankSum=-2.549;QD=20.46;ReadPosRankSum=-1.443;SOR=0.312;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,23:0.56:41
chr19	41316399	rs112117525	T	C	819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.60;MQRankSum=-2.779;QD=22.16;ReadPosRankSum=-1.197;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,20:0.54:37
chr19	41324832	rs2545773	T	C	31.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=36.67;QD=15.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr19	41332171	rs78011401	C	T	1645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.976;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.666;NF=25;NR=45;PP=1047;ReadPosRankSum=-2.447;SC=GGGAAGATGTCGTACAACTGG;SOR=0.902;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=149;TCF=60;TCR=89;TR=70;WE=41332179;WS=41332161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,80:0.48:168
chr19	41349636	.	G	T	632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=2;PP=322;SC=CCTCTCCCAAGCCCGGTCTTG;SOR=2.400;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=41349644;WS=41349626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	41350664	rs1809810	A	T	3276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=76;PP=2199;SC=CAGCATAGGGAACACTTCGGT;SOR=1.690;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=113;TCF=37;TCR=76;TR=113;WE=41350672;WS=41350654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr19	41354661	rs79584535	T	C	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=1.265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQRankSum=-5.482;QD=0.84;ReadPosRankSum=-1.024;SOR=0.422;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,12:0.15:81
chr19	41354712	rs8192725	A	G	554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=353;ReadPosRankSum=-0.911;SC=AGGGGGCGGCAGGGGCAGGAG;SOR=0.836;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=17;WE=41354720;WS=41354702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,21:0.95:22
chr19	41355820	rs199702575	A	G	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FS=0.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.68;MQRankSum=-2.947;QD=0.60;ReadPosRankSum=2.362;SOR=0.509;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:174,16:0.08:190
chr19	41355828	rs200582200	C	T	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FS=0.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.43;MQRankSum=-3.459;QD=0.33;ReadPosRankSum=3.043;SOR=0.489;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:190,16:0.08:206
chr19	41355849	rs2302990	A	G	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FS=0.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.98;MQRankSum=-6.888;QD=0.39;ReadPosRankSum=3.057;SOR=0.801;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:200,32:0.14:232
chr19	41356281	rs1137115	T	C	8880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=137;NR=150;PP=2965;SC=TCAAGACCATTACAGTCAGGC;SOR=0.838;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=287;TCF=137;TCR=150;TR=287;WE=41356289;WS=41356271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,322:1.00:322
chr19	41381647	rs12460590	A	C	1070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FS=26.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.62;MQRankSum=-4.434;QD=5.30;ReadPosRankSum=-2.250;SOR=2.192;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:146,56:0.28:202
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chr19	41382645	rs3865455	G	A	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=1.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.58;MQRankSum=-0.716;QD=11.40;ReadPosRankSum=-1.286;SOR=0.375;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr19	41382653	rs2388869	A	G	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.62;MQRankSum=-0.736;QD=10.46;ReadPosRankSum=-0.468;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
chr19	41382655	rs2316210	T	G	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=2.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.67;MQRankSum=-0.634;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.251;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr19	41382665	rs3852869	G	A	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=2.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.22;MQRankSum=-0.137;QD=8.34;ReadPosRankSum=-0.423;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr19	41383134	rs147847954	A	G	3386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.32;MQRankSum=-8.453;QD=14.85;ReadPosRankSum=1.028;SOR=0.726;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:135,93:0.41:228
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chr19	41383153	rs2261144	A	G	3034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=6.751;NF=66;NR=63;PP=1730;ReadPosRankSum=-0.235;SC=GGCCAAACTCATGGGGATCAC;SOR=0.664;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=204;TCF=101;TCR=103;TR=129;WE=41383161;WS=41383143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,142:0.62:229
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chr19	41384637	rs4079367	C	T	1178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.909;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-6.565;NF=37;NR=23;PP=717;ReadPosRankSum=0.952;SC=TGGCTTTGCACCTCCCCGCAC;SOR=0.427;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=149;TCF=100;TCR=49;TR=60;WE=41384645;WS=41384627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,65:0.39:166
chr19	41384675	rs4079366	T	C	2014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.361;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-9.085;NF=57;NR=38;PP=1133;ReadPosRankSum=-0.086;SC=CTCCTGCATGTGGATGAGAAA;SOR=0.953;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=219;TCF=124;TCR=95;TR=95;WE=41384683;WS=41384665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,104:0.43:243
chr19	41386136	rs4142867	A	C	1009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.886;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.695;NF=10;NR=28;PP=669;ReadPosRankSum=-1.786;SC=AGAAGGTGGGATCGATATTGG;SOR=0.948;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=85;TCF=24;TCR=61;TR=38;WE=41386144;WS=41386126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,43:0.47:92
chr19	41386282	rs3815705	G	C	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.051;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.577;NF=10;NR=6;PP=168;ReadPosRankSum=-1.965;SC=AAGTGCGGGCGCCTTTCCCCA;SOR=0.307;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=31;TCF=20;TCR=11;TR=16;WE=41386290;WS=41386272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr19	41386420	rs56081734	A	C	1945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FS=0.499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQRankSum=-3.396;QD=9.05;ReadPosRankSum=0.689;SOR=0.754;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:113,102:0.47:215
chr19	41386486	rs3815708	CA	AG	603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=2.397;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.61;MQRankSum=-6.353;QD=8.16;ReadPosRankSum=-1.840;SOR=1.140;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,19:0.26:74
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chr19	41386527	.	G	A	34	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=23;MMLQ=23;MQ=52.89;NF=1;NR=4;PP=34;QD=13.7542425094;SC=GTTGCTGAACGCCACGCCTGG;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=5;WE=41386535;WS=41386517;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:19,5:0.21:24
chr19	41386544	rs71337574	C	G	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=3.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.04;MQRankSum=-3.879;QD=5.93;ReadPosRankSum=1.227;SOR=0.090;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr19	41386547	rs74219554	G	C	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=3.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.79;MQRankSum=-3.744;QD=6.30;ReadPosRankSum=1.269;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr19	41387620	rs10425150	A	G	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=5.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.78;MQRankSum=-7.045;QD=1.20;ReadPosRankSum=-2.393;SOR=1.516;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,15:0.13:113
chr19	41387647	rs10425169	A	G	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=0.904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.00;MQRankSum=-7.279;QD=3.91;ReadPosRankSum=-0.767;SOR=0.902;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,21:0.16:131
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chr19	41397370	rs3852870	A	C	755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.789;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=432;ReadPosRankSum=0.085;SC=TCACATAGAAACTTATGACTT;SOR=1.329;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=44;TCF=11;TCR=33;TR=23;WE=41397378;WS=41397360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,31:0.60:52
chr19	41397806	rs8106551	C	A	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.794;NF=14;NR=3;PP=288;ReadPosRankSum=0.174;SC=TGTTTATATCCCTCTAAAATC;SOR=1.085;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=17;WE=41397814;WS=41397796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr19	41400906	rs10626476	C	CAGAG	1852.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.761;HP=2;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=1744;ReadPosRankSum=3.268;SC=AGAGAAAAGACAGGCTGAAAA;SOR=0.919;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=45;TCF=8;TCR=37;TR=21;WE=41400928;WS=41400896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,47:0.55:85
chr19	41400913	rs140473451	AAAAC	A	999.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.919;HP=3;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=1781;ReadPosRankSum=0.419;SC=AGACAGGCTGAAAACAAACAA;SOR=0.465;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=40;TCF=9;TCR=31;TR=21;WE=41400928;WS=41400896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,27:0.68:40
chr19	41401950	rs4803398	G	C	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.331;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.061;NF=15;NR=4;PP=276;ReadPosRankSum=3.377;SC=CTGCCTTTTCGGGGTGTTAAA;SOR=1.101;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=40;TCF=30;TCR=10;TR=19;WE=41401958;WS=41401940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,21:0.49:43
chr19	41402162	rs3956342	T	C	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.392;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.722;NF=3;NR=6;PP=169;ReadPosRankSum=-1.290;SC=TGGGTTCAAGTGATTCTCCTG;SOR=0.175;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=9;WE=41402170;WS=41402152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr19	41402579	rs6508953	A	G	2335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.897;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=54;PP=1606;ReadPosRankSum=-1.988;SC=TCTTTGATGGACATTATCGAG;SOR=0.825;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=293;TCF=152;TCR=141;TR=115;WE=41402587;WS=41402569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:198,123:0.38:321
chr19	41403325	rs7252852	T	C	2831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.691;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=67;PP=1411;ReadPosRankSum=1.592;SC=ATCCCTAAAGTGCAGAGGAGT;SOR=0.883;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=239;TCF=116;TCR=123;TR=124;WE=41403333;WS=41403315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,140:0.52:267
chr19	41403982	rs11083583	G	GT	1063.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.823;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=9;PP=626;ReadPosRankSum=-1.062;SC=AAAAACACCTGTTTTATTTTG;SOR=0.453;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=67;TCF=39;TCR=28;TR=21;WE=41403990;WS=41403972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,43:0.45:95
chr19	41404196	rs10419393	A	G	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.736;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.193;NF=5;NR=14;PP=284;ReadPosRankSum=-1.338;SC=AACATCATCCAGGACACTCAG;SOR=1.175;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=53;TCF=14;TCR=39;TR=19;WE=41404204;WS=41404186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,20:0.37:54
chr19	41405962	rs4803400	T	G	3395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.406;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=68;PP=1991;ReadPosRankSum=-1.135;SC=CTTCTCTCTATGCTCGCTGGT;SOR=0.572;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=285;TCF=156;TCR=129;TR=145;WE=41405977;WS=41405952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,160:0.51:316
chr19	41414363	rs8100418	A	T	2009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.006;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=36;PP=1269;ReadPosRankSum=-1.392;SC=CGCCGGCACCAGCACAGCCCT;SOR=0.928;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=217;TCF=129;TCR=88;TR=94;WE=41414371;WS=41414353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,99:0.43:228
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chr19	41416750	rs10419589	T	C	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.527;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=104;ReadPosRankSum=-0.711;SC=ATCTTCCTTTTCCAGCCCCCT;SOR=1.179;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=22;TCF=10;TCR=12;TR=9;WE=41416758;WS=41416740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr19	41442597	rs73038469	G	A	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.020;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=327;ReadPosRankSum=-0.792;SC=GACAGAGAGTGAGAGAGACAG;SOR=1.238;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=3;TCR=37;TR=17;WE=41442605;WS=41442587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,18:0.42:43
chr19	41447479	rs34151237	T	G	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=1.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.35;MQRankSum=-2.845;QD=4.19;ReadPosRankSum=-0.552;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,6:0.24:25
chr19	41447486	rs34013487	C	G	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQRankSum=-2.900;QD=2.56;ReadPosRankSum=1.258;SOR=0.616;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,4:0.19:21
chr19	41447492	rs73038475	T	C	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQRankSum=-2.720;QD=3.15;ReadPosRankSum=1.023;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,4:0.21:19
chr19	41447928	rs3865460	G	A	7572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=137;NR=120;PP=2965;SC=CAAGGCTACAGCCTCTCCTGA;SOR=0.721;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=257;TCF=137;TCR=120;TR=257;WE=41447936;WS=41447918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,288:1.00:288
chr19	41515702	rs2279345	T	C	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=274;ReadPosRankSum=0.566;SC=GAAACAGAGTTAGGAAGACTA;SOR=1.179;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=14;WE=41515710;WS=41515696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr19	41531487	rs11670798	A	G	1815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.727;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=38;PP=1166;ReadPosRankSum=-1.289;SC=GGGGCGTGACAGCCAGGCTGC;SOR=0.447;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=155;TCF=93;TCR=62;TR=87;WE=41531495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,90:0.56:161
chr19	41531522	rs11670865	G	T	2386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.959;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=48;PP=1473;ReadPosRankSum=-0.320;SC=CCCGTGGAGGGTGCCGTGAAC;SOR=0.482;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=191;TCF=107;TCR=84;TR=104;WE=41531530;WS=41531512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,113:0.55:205
chr19	41531656	rs7249735	A	C	1689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.562;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=38;PP=857;ReadPosRankSum=-0.419;SC=AAGGTGGGATAGATGCTGGAG;SOR=0.757;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=150;TCF=75;TCR=75;TR=74;WE=41531664;WS=41531646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,83:0.48:172
chr19	41531705	rs3745275	G	A	1051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.521;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=25;PP=680;ReadPosRankSum=-1.304;SC=GAAGGGGGTTGGGAAGAGAGT;SOR=0.467;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=95;TCF=43;TCR=52;TR=47;WE=41531713;WS=41531695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,51:0.47:108
chr19	41531825	rs3745276	A	G	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.012;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=198;ReadPosRankSum=0.660;SC=TTTCCCCACCAAGGCCCGGTC;SOR=1.493;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=33;TCF=22;TCR=11;TR=15;WE=41531833;WS=41531815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr19	41531859	rs7254767	C	G	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.614;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=394;ReadPosRankSum=1.597;SC=CGCGCGGGTTCCTCGCCCTGG;SOR=1.201;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=53;TCF=34;TCR=19;TR=25;WE=41531867;WS=41531849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,28:0.48:58
chr19	41531915	rs3745277	G	A	1062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=1.559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.93;ReadPosRankSum=-2.761;SOR=0.516;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,56:0.52:107
chr19	41532126	rs7255146	C	A	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.60;ReadPosRankSum=-0.369;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr19	41532141	rs71742418	CTCAG	C	91.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=2.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.846;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=2;PP=48;ReadPosRankSum=-0.057;SC=GAACTGCAAACTCAGTCAGAG;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=2;WE=41532152;WS=41532131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr19	41631417	rs144315434	T	C	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.88;ReadPosRankSum=0.792;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr19	41700343	rs338600	C	T	4507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.49;SOR=1.501;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr19	41700343	.	CGTA	TGTA,TGTG	914	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000,0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=79,41;NR=39,16;PP=862,914;QD=7.59975603854;SC=TGGTAGAGGGCGTAGAAGCTA;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=119;TCF=80;TCR=39;TR=118,57;WE=41700354;WS=41700333;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.99:119
chr19	41700346	rs117216419	A	G	1462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=7.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.17;ReadPosRankSum=-0.247;SOR=1.349;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,64:0.49:131
chr19	41700493	rs338599	G	C	5323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=100;PP=2965;SC=ACCTGGGACCGTGGCGGCCTG;SOR=1.014;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=183;TCF=83;TCR=100;TR=183;WE=41700501;WS=41700483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr19	41703604	.	C	CA	127	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000;HP=11;HapScore=3;MGOF=21;MMLQ=16;MQ=59.79;NF=6;NR=5;PP=127;QD=12.3636363636;SC=GATTCCGTCTCAAAAAAAAAA;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=21;TCF=13;TCR=8;TR=11;WE=41703612;WS=41703594;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:10,11:0.52:21
chr19	41703660	rs338594	T	C	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.488;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.064;NF=12;NR=11;PP=316;ReadPosRankSum=0.030;SC=GCCGGTCCCTTTTTGAGTCTA;SOR=0.537;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=47;TCF=28;TCR=19;TR=23;WE=41703668;WS=41703650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,23:0.49:47
chr19	41704304	rs338593	T	C	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=272;ReadPosRankSum=0.425;SC=TGGGTTCAGCTCCAACCTGCT;SOR=1.027;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=18;WE=41704312;WS=41704294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr19	41704832	rs338592	A	G	2918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=56;PP=1643;SC=CTGAATGGGCATGGTGACCTG;SOR=1.109;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=44;TCR=56;TR=100;WE=41704840;WS=41704822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr19	41707094	rs1628289	A	G	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=313;ReadPosRankSum=0.000;SC=TTTACTTCCCAAAGGCTGTGT;SOR=0.484;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=39;TCF=35;TCR=4;TR=21;WE=41707102;WS=41707084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,22:0.52:42
chr19	41709222	rs57934551	T	A	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.222;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=191;ReadPosRankSum=-0.952;SC=TTGGGCTCAGTGAGGGCTGGG;SOR=1.781;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=12;WE=41709230;WS=41709212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
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chr19	41743861	rs7249222	A	G	10332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=389;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=178;NR=184;PP=2965;SC=TGTGCTGTCAAACGATGGGAT;SOR=0.768;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=363;TCF=179;TCR=184;TR=362;WE=41743869;WS=41743851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,388:1.00:388
chr19	41744655	rs190377856	A	C	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.702;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=180;ReadPosRankSum=-1.030;SC=GAAGGTTCACATTCACATTCT;SOR=1.981;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=10;WE=41744663;WS=41744645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr19	41748753	rs2304234	T	C	9896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=373;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=192;NR=145;PP=2965;SC=GATCCAAGGCTTCATCCATGA;SOR=0.951;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=337;TCF=192;TCR=145;TR=337;WE=41748761;WS=41748743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,371:1.00:371
chr19	41759474	rs73045223	C	T	5891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=120;NR=73;PP=2965;SC=ACTCTGTTGACCTCTCCTCCC;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=193;TCF=120;TCR=73;TR=193;WE=41759482;WS=41759464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr19	41759631	rs3835078	ACCC	A	5204.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=63;PP=2995;SC=CCTTTCAGGGACCCCCCCCCC;SOR=1.648;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=80;TCF=4;TCR=76;TR=67;WE=41759645;WS=41759621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr19	41759637	rs116056574	C	T	5212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=62;PP=2232;SC=AGGGACCCCCCCCCCCCAACT;SOR=1.648;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=112;TCF=37;TCR=75;TR=93;WE=41759645;WS=41759621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr19	41811730	rs12745	T	C	832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=22;PP=506;SC=CACCCCCCACTGCACAGACCT;SOR=1.542;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=36;TCF=13;TCR=23;TR=35;WE=41811738;WS=41811720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	41858602	rs56281462	G	A	2423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.462;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=48;PP=1513;ReadPosRankSum=-0.590;SC=CACCGTTGTGGGTTTCCACCA;SOR=0.735;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=225;TCF=129;TCR=96;TR=112;WE=41858610;WS=41858592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,120:0.48:248
chr19	41858921	rs1800470	G	A	1490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.300;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=36;PP=946;ReadPosRankSum=-0.884;SC=TAGCAGCAGCGGCAGCAGCCG;SOR=0.571;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=138;TCF=63;TCR=75;TR=67;WE=41858929;WS=41858911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,73:0.50:147
chr19	41863777	rs11668109	A	C	995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.879;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=18;PP=595;ReadPosRankSum=-0.887;SC=CTCAGCCTGGACCCGGGTCCA;SOR=0.296;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=76;TCF=48;TCR=28;TR=43;WE=41863785;WS=41863767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,48:0.59:82
chr19	41869392	rs2241714	T	C	1764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.516;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.195;NF=42;NR=44;PP=1229;ReadPosRankSum=1.247;SC=CGCTGGCCCCTATGATCTGCC;SOR=0.772;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=198;TCF=99;TCR=99;TR=86;WE=41869400;WS=41869382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,89:0.43:205
chr19	41869468	rs2241713	G	C	979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.334;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.180;NF=20;NR=20;PP=471;ReadPosRankSum=-1.344;SC=TGTGAGGTAAGTGTATTATCT;SOR=0.456;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=103;TCF=48;TCR=55;TR=40;WE=41869476;WS=41869458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,51:0.43:120
chr19	41869487	rs3217387	C	CA	1118.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.712;HP=7;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.284;NF=4;NR=16;PP=705;ReadPosRankSum=0.753;SC=CTCCATTTGACGGGGGGGAAA;SOR=0.505;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=56;TCF=10;TCR=46;TR=20;WE=41869495;WS=41869477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,37:0.39:96
chr19	41888850	rs138731997	AGGGGACTGGGC	A	3761.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.738;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=3.114;NF=5;NR=51;PP=2972;ReadPosRankSum=-1.135;SC=TGGGACTTGGAGGGGACTGGG;SOR=0.824;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=133;TCF=11;TCR=122;TR=56;WE=41888868;WS=41888840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,100:0.46:217
chr19	41889423	rs11880674	A	T	1391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=1.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.59;ReadPosRankSum=-1.556;SOR=0.444;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,36:0.61:59
chr19	41889429	rs7259900	A	T	1391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=5.286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.09;ReadPosRankSum=-0.917;SOR=0.286;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,37:0.59:63
chr19	41889748	rs12602	T	C	1161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.430;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=24;PP=688;ReadPosRankSum=1.029;SC=TGACCCTGGCTGCCTACCTTG;SOR=0.571;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=117;TCF=57;TCR=60;TR=53;WE=41889756;WS=41889738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,57:0.45:128
chr19	41897674	rs878082	G	A	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=454;ReadPosRankSum=-2.287;SC=CTAGCAGTGAGGGTATATGTA;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=8;WE=41897696;WS=41897664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr19	41897688	rs878083	G	A	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=454;ReadPosRankSum=1.581;SC=ATATGTATCCGCCAGGAGGGA;SOR=0.914;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=10;WE=41897696;WS=41897664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr19	41903220	rs10853751	G	A	3690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.393;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=98;PP=2357;ReadPosRankSum=-0.833;SC=GTCAGTATGCGTCTCCTCCTC;SOR=0.838;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=310;TCF=134;TCR=176;TR=167;WE=41903228;WS=41903210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,174:0.53:328
chr19	41903671	rs892044	A	G	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.99;ReadPosRankSum=0.758;SOR=0.648;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr19	41903675	rs892043	A	G	1317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.60;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	41903699	rs45500792	T	G	701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.004;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=361;ReadPosRankSum=0.912;SC=CTAGCCTACGTGAGTGCCGGA;SOR=0.846;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=49;TCF=34;TCR=15;TR=27;WE=41903707;WS=41903689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,31:0.54:57
chr19	41916549	rs11549936	C	A	1202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.579;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=9;PP=890;ReadPosRankSum=-0.734;SC=CAGCACCCCCCCAGGCAGCAG;SOR=1.536;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=111;TCF=85;TCR=26;TR=51;WE=41916557;WS=41916539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,53:0.46:116
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chr19	41928765	rs284655	C	T	1923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.419;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.918;NF=52;NR=47;PP=1132;ReadPosRankSum=-1.030;SC=CAAAACATGGCCTTATCACCT;SOR=0.683;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=280;TCF=143;TCR=137;TR=99;WE=41928773;WS=41928755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:197,108:0.35:305
chr19	41928867	rs3217385	G	GC	1573.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.599;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.793;NF=5;NR=24;PP=924;ReadPosRankSum=0.240;SC=ACTCCAGGGAGCCCACACTGA;SOR=0.620;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=95;TCF=19;TCR=76;TR=29;WE=41928875;WS=41928857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,62:0.39:160
chr19	41930396	rs4674	A	G	14848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=550;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=249;NR=262;PP=2965;SC=ACCCCAACCTACTCTTCTCAG;SOR=0.761;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=511;TCF=249;TCR=262;TR=511;WE=41930404;WS=41930386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,550:1.00:550
chr19	41931454	rs113478859	A	AGGCCAGGGCCGG	896.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.437;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=4;PP=2465;ReadPosRankSum=-0.232;SC=CCAGAGGCCCAGGCCAGGTCA;SOR=1.195;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=37;TCF=17;TCR=20;TR=9;WE=41931462;WS=41931444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,20:0.34:59
chr19	41932063	rs45563938	A	G	3647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.325;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=53;PP=1361;ReadPosRankSum=0.964;SC=GCAGCAGGTCACTGTAGCGAC;SOR=0.904;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=256;TCF=124;TCR=132;TR=97;WE=41932077;WS=41932053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,110:0.39:284
chr19	41932084	rs284660	G	T	3911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.323;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=56;PP=1490;ReadPosRankSum=-0.464;SC=GGCTCTCCCAGGCCACTAGTG;SOR=0.811;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=252;TCF=128;TCR=124;TR=107;WE=41932092;WS=41932074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,119:0.43:275
chr19	41932120	rs284661	C	T	2563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.028;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=53;PP=1483;ReadPosRankSum=1.171;SC=CCGCCTCACCCACCGGAGACC;SOR=0.611;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=248;TCF=130;TCR=118;TR=109;WE=41932128;WS=41932110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,121:0.45:271
chr19	41932275	rs284662	T	C	1956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.562;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=47;PP=1154;ReadPosRankSum=1.407;SC=GAGACTTGGCTGCCACCACCT;SOR=0.577;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=230;TCF=110;TCR=120;TR=91;WE=41932283;WS=41932265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,99:0.40:250
chr19	41932612	rs284663	C	T	2259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.236;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=49;PP=1358;ReadPosRankSum=-0.132;SC=CGGATGTCCACTCGATGTACA;SOR=0.681;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=207;TCF=111;TCR=96;TR=101;WE=41932620;WS=41932602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,110:0.48:230
chr19	41937095	rs17318596	G	A	5857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=532;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.064;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=146;NR=109;PP=2962;ReadPosRankSum=0.992;SC=AGAGCTCAGCGCGGCGCCCAA;SOR=0.982;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=488;TCF=268;TCR=220;TR=255;WE=41937103;WS=41937085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:252,278:0.52:530
chr19	41939297	rs1043413	C	G	1841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=30;PP=1250;ReadPosRankSum=-2.220;SC=GTCCACGTGGCAGCAGCGCTG;SOR=0.697;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=131;TCF=79;TCR=52;TR=72;WE=41939305;WS=41939287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,81:0.54:150
chr19	41944237	rs2231940	T	C	1589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.600;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=39;PP=1035;ReadPosRankSum=0.548;SC=CTTCTTCTGATTGCCCTCTGG;SOR=0.794;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=139;TCF=63;TCR=76;TR=68;WE=41944245;WS=41944227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,75:0.48:155
chr19	41945837	rs13346603	T	A	3892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=47;PP=2884;ReadPosRankSum=-0.500;SC=AAGGGGCCGGTCTTATCCCAC;SOR=0.693;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=184;TCF=97;TCR=87;TR=96;WE=41945856;WS=41945827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,106:0.52:202
chr19	41945848	rs13344547	G	T	3831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=44;PP=2884;ReadPosRankSum=0.503;SC=CTTATCCCACGCTCCTGGTTC;SOR=0.732;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=180;TCF=97;TCR=83;TR=93;WE=41945856;WS=41945827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,101:0.52:196
chr19	41945904	rs13344563	G	C	1907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.571;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=40;PP=1112;ReadPosRankSum=-0.395;SC=TTTTCTAACCGTCCTCTTAAA;SOR=0.782;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=151;TCF=80;TCR=71;TR=83;WE=41945912;WS=41945894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,92:0.55:168
chr19	41949870	rs3745286	T	C	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.756;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=80;ReadPosRankSum=0.319;SC=CCCCTTGCTCTCTGGGGTGGC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=6;WE=41949878;WS=41949860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr19	42027500	rs4803475	A	G	9573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=117;PP=2965;SC=CCAAATCTCCATTAAGTGTAT;SOR=0.951;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=217;TCF=100;TCR=117;TR=217;WE=42027522;WS=42027490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr19	42027514	rs4803476	T	A	9485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=113;PP=2965;SC=AGTGTATTTTTTGAACAGTGA;SOR=1.025;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=204;TCF=91;TCR=113;TR=203;WE=42027522;WS=42027490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr19	42083849	rs714106	C	A	5323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=106;PP=2965;SC=GGATACTACACCCTACAAGTC;SOR=1.145;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=185;TCF=79;TCR=106;TR=185;WE=42083857;WS=42083839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr19	42085873	rs2302188	A	G	4265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=64;PP=2219;ReadPosRankSum=-1.056;SC=GTTTAACCATATGCTCACCAT;SOR=0.254;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=140;TCF=75;TCR=65;TR=139;WE=42085881;WS=42085863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,162:0.99:163
chr19	42092815	rs3745936	T	A	8965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=135;NR=169;PP=2965;SC=CTGTTTTTACTGGAATTGCTA;SOR=0.971;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=304;TCF=135;TCR=169;TR=304;WE=42092823;WS=42092805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,331:1.00:331
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chr19	42188032	rs34670266	GC	G	1664.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.666;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.541;NF=1;NR=37;PP=1148;ReadPosRankSum=-0.672;SC=GCCCTGTGTGGCCCCCTTGGT;SOR=0.591;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=78;TCF=2;TCR=76;TR=38;WE=42188040;WS=42188022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,66:0.49:134
chr19	42190859	rs8102488	A	T	2285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.564;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=43;PP=1552;ReadPosRankSum=-2.501;SC=AGGGTATAGAATCCTGCGTCA;SOR=1.000;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=201;TCF=114;TCR=87;TR=104;WE=42190867;WS=42190849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,110:0.49:225
chr19	42190880	.	C	T	2609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=0.000;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.553;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=48;PP=1441;ReadPosRankSum=0.154;SC=TTGTGGGTGACGTTCTGGATC;SOR=0.592;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=222;TCF=123;TCR=99;TR=109;WE=42190888;WS=42190870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,124:0.52:240
chr19	42191934	rs34742303	GC	G	562.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=528;ReadPosRankSum=-0.071;SC=TTCAACAGAAGCCCTTTGTCC;SOR=0.628;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=37;TCF=25;TCR=12;TR=17;WE=42191942;WS=42191924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,21:0.42:50
chr19	42212753	rs111973464	A	AGCACAGAGACTG	2391.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.177;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.88;MQRankSum=-1.546;NF=5;NR=15;PP=2954;ReadPosRankSum=-0.486;SC=GGGAGGAGGGAGCTGGGGTCT;SOR=0.765;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=65;TCF=18;TCR=47;TR=20;WE=42212761;WS=42212743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,59:0.45:130
chr19	42221607	rs7249230	A	G	9564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=359;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=160;NR=167;PP=2965;SC=AATCCAGAACAAATTAAGTGT;SOR=0.804;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=327;TCF=160;TCR=167;TR=327;WE=42221615;WS=42221597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,359:1.00:359
chr19	42231159	rs9621	G	A	3554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=69;PP=2251;ReadPosRankSum=-1.115;SC=TTCAGCATCTGGAACTTCTCC;SOR=0.697;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=260;TCF=143;TCR=117;TR=152;WE=42231167;WS=42231149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,167:0.57:292
chr19	42265866	rs28547939	C	G	2614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.335;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=19;PP=773;ReadPosRankSum=-2.567;SC=GCTTTATTCTCTTTCCTCCAG;SOR=0.871;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=132;TCF=81;TCR=51;TR=60;WE=42265874;WS=42265856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,70:0.48:145
chr19	42265889	rs11548735	G	T	3036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.800;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=31;PP=932;ReadPosRankSum=-0.057;SC=GGCCCAGATGGCCCCACCATT;SOR=0.858;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=169;TCF=93;TCR=76;TR=78;WE=42265902;WS=42265879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,91:0.49:187
chr19	42311060	rs5828129	A	AAAG	586.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.649;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=374;ReadPosRankSum=-0.145;SC=GGAGTTGGCCAAATAGGAGAT;SOR=0.120;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=38;TCF=34;TCR=4;TR=11;WE=42311068;WS=42311054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,16:0.36:44
chr19	42313803	rs3795022	T	C	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=110;ReadPosRankSum=-0.562;SC=GGGTCCTTCCTCTCTGCTCAG;SOR=0.527;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=10;WE=42313811;WS=42313793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr19	42313828	rs734108	C	A	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.574;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=205;ReadPosRankSum=2.099;SC=GATGTGGGTTCCTAAAGCCTT;SOR=0.201;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=43;TCF=35;TCR=8;TR=19;WE=42313836;WS=42313818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,24:0.46:52
chr19	42313921	rs734107	G	T	1808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=31;PP=1039;ReadPosRankSum=-0.090;SC=TGAAAATGGGGTTCCCTTCTT;SOR=0.663;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=198;TCF=118;TCR=80;TR=82;WE=42313929;WS=42313911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,93:0.42:224
chr19	42315281	rs899662	G	T	693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=17;PP=419;ReadPosRankSum=-1.022;SC=CTTAGCTTCCGCCAGGAGCTG;SOR=0.818;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=56;TCF=25;TCR=31;TR=29;WE=42315289;WS=42315271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,33:0.50:66
chr19	42315300	rs2008808	G	T	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=12;PP=274;ReadPosRankSum=0.360;SC=TGCTCCTGTGGGTTGATGGAG;SOR=0.818;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=43;TCF=20;TCR=23;TR=21;WE=42315308;WS=42315290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,23:0.47:49
chr19	42342319	rs2290695	A	G	732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=20;PP=492;ReadPosRankSum=0.000;SC=TAAAGCCCACAACTCCCCTTG;SOR=0.799;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=66;TCF=24;TCR=42;TR=31;WE=42342327;WS=42342309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,33:0.46:72
chr19	42342923	rs10414356	T	A	1577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.659;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=20;PP=996;ReadPosRankSum=1.405;SC=AGAGCAAGCATAACGAAATTG;SOR=0.788;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=127;TCF=87;TCR=40;TR=69;WE=42342931;WS=42342913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,75:0.54:140
chr19	42343155	rs4130852	G	T	830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=18;PP=579;ReadPosRankSum=0.761;SC=CTGAGCCCGTGAACTGCCAAC;SOR=0.613;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=24;TCR=34;TR=31;WE=42343163;WS=42343145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,36:0.55:66
chr19	42343526	rs3922888	G	T	777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=28;PP=631;ReadPosRankSum=1.401;SC=ATAGGCTCCCGCAGACCTTCT;SOR=0.711;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=55;TCF=7;TCR=48;TR=32;WE=42343534;WS=42343516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,31:0.56:55
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chr19	42373298	rs1366610	G	A	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.10;ReadPosRankSum=1.187;SOR=0.519;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,8:0.22:37
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chr19	42373893	rs2075751	C	T	4088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=84;PP=2468;SC=GCCCATACTTCGTCAGGTAGA;SOR=1.225;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=57;TCR=84;TR=141;WE=42373901;WS=42373883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr19	42375244	rs2075754	C	T	960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.026;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=8;PP=587;ReadPosRankSum=-0.029;SC=CCCTTGAGACCCAGTTTCCAC;SOR=0.917;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=61;TCF=47;TCR=14;TR=34;WE=42375252;WS=42375234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,40:0.56:71
chr19	42407086	.	C	CT	144	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=11;HapScore=2;MGOF=20;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=0;NR=12;PP=144;QD=13.0;SC=CGGCTCTCCTCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=12;WE=42407094;WS=42407076;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr19	42462788	rs1075728	G	A	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.862;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=247;ReadPosRankSum=1.358;SC=CCTGGGCGGTGAGAGGAGGGA;SOR=1.565;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=15;WE=42462796;WS=42462778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr19	42463447	rs735571	C	T	6868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=117;NR=111;PP=2965;SC=GCTGCCATGTCTGCGTCGTGA;SOR=0.774;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=228;TCF=117;TCR=111;TR=228;WE=42463455;WS=42463437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
chr19	42471050	rs919390	G	C	1442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=31;NR=22;PP=863;SC=CCTGGGCCTGGGGGACGGGGA;SOR=1.009;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=31;TCR=22;TR=53;WE=42471058;WS=42471040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr19	42489516	rs2217342	A	C	4777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=72;PP=2281;SC=GGTTGTCGTGAGTGCAGTCGG;SOR=0.796;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=80;TCR=72;TR=152;WE=42489524;WS=42489506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr19	42736267	rs851609	A	G	4427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=93;NR=58;PP=2807;SC=GAGGAGGGATAAGAATGGCGT;SOR=1.077;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=151;TCF=93;TCR=58;TR=151;WE=42736275;WS=42736257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr19	42793590	rs3826706	G	A	785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=24;PP=500;ReadPosRankSum=1.014;SC=ATCTTGCCCAGGACCCAGCAG;SOR=0.650;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=113;TCF=49;TCR=64;TR=42;WE=42793598;WS=42793580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,45:0.37:121
chr19	42848764	rs874002	A	G	3919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=69;NR=63;PP=2161;SC=GTGGGCCGGCAGGAGGGGGCC;SOR=0.720;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=132;TCF=69;TCR=63;TR=132;WE=42848772;WS=42848754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr19	42865283	rs73033437	G	A	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.022;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=296;ReadPosRankSum=1.030;SC=GTGAATCACCGCAGGCAGGGT;SOR=1.561;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=17;WE=42865291;WS=42865273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr19	43092949	.	C	T	3529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.345;ClippingRankSum=0.000;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.859;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=77;PP=2082;ReadPosRankSum=-0.046;SC=AGACTGTGATCATCCTGACTG;SOR=0.635;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=290;TCF=154;TCR=136;TR=160;WE=43092957;WS=43092939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,170:0.54:312
chr19	43269704	rs62112127	T	C	1750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=29;PP=1018;ReadPosRankSum=0.677;SC=TGATGCGCTGTGTGCAGGGAG;SOR=0.738;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=140;TCF=85;TCR=55;TR=75;WE=43269712;WS=43269694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,81:0.55:148
chr19	43372386	rs1064491	T	C	2415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.860;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.415;NF=58;NR=59;PP=1708;ReadPosRankSum=-0.100;SC=GCTGAAACTTTTCATTAATTG;SOR=0.855;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=299;TCF=154;TCR=145;TR=117;WE=43372394;WS=43372376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:195,123:0.39:318
chr19	43420264	rs2074856	C	T	3750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.520;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.715;NF=85;NR=74;PP=2265;ReadPosRankSum=0.713;SC=AGGGATCATGCGGAATCACTC;SOR=0.538;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=308;TCF=169;TCR=139;TR=159;WE=43420272;WS=43420254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,176:0.53:335
chr19	43420451	rs3198831	G	C	3490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.007;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.995;NF=60;NR=73;PP=2166;ReadPosRankSum=-0.765;SC=ATTTGACCGTGTACTACATAT;SOR=0.926;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=248;TCF=117;TCR=131;TR=133;WE=43420459;WS=43420441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,155:0.56:277
chr19	43433570	rs2074857	A	C	1055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.787;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.649;NF=29;NR=17;PP=808;ReadPosRankSum=1.010;SC=CAGCCTGGCTAACAGAGGAAC;SOR=0.435;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=102;TCF=70;TCR=32;TR=46;WE=43433578;WS=43433560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,45:0.43:104
chr19	43433805	rs1065178	A	G	1603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.344;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=44;PP=1155;ReadPosRankSum=-2.087;SC=CACAGGTTAAAATCACAGCCT;SOR=0.950;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=173;TCF=84;TCR=89;TR=80;WE=43433813;WS=43433795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,81:0.43:189
chr19	43439793	rs7245978	G	A	5738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=105;PP=2965;SC=TACCAGATGTGGCCAGTAAGA;SOR=1.070;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=183;TCF=78;TCR=105;TR=183;WE=43439801;WS=43439783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr19	43519362	rs11083680	C	T	3189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.438;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=63;PP=2057;ReadPosRankSum=1.383;SC=TTGGAGTAATCTGAGGGATAA;SOR=0.655;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=258;TCF=143;TCR=115;TR=138;WE=43519370;WS=43519352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,149:0.54:277
chr19	43519442	rs10414166	T	C	9655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=354;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=168;NR=157;PP=2965;SC=GGGTTAGAGTTTGCGAAGCAG;SOR=0.704;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=325;TCF=168;TCR=157;TR=325;WE=43519450;WS=43519432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,354:1.00:354
chr19	43530379	rs2526716	A	G	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.334;NF=9;NR=4;PP=456;ReadPosRankSum=-0.597;SC=TATTTTTTAGAACCCCAGGAG;SOR=0.760;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=35;TCF=24;TCR=11;TR=13;WE=43530398;WS=43530377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr19	43530390	rs2736151	C	T	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.205;NF=9;NR=5;PP=456;ReadPosRankSum=-1.236;SC=ACCCCAGGAGCCTCTCCAGGA;SOR=0.582;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=36;TCF=24;TCR=12;TR=14;WE=43530398;WS=43530377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,14:0.40:35
chr19	43530640	rs60941975	GT	G	2031.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=34;PP=1492;SC=ACTCTTCCCGGTGGAAGGAGC;SOR=1.697;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=35;WE=43530648;WS=43530630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
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chr19	43568877	rs12977426	T	C	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=5.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=404;ReadPosRankSum=-0.139;SC=GAGAATTTATTATGGTAAAGA;SOR=0.563;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=17;WE=43568885;WS=43568867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,19:0.46:41
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chr19	43708245	rs3170216	G	C	1917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.512;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=45;PP=857;ReadPosRankSum=-1.473;SC=TAATGGTAGAGGTATGTCATT;SOR=0.976;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=205;TCF=99;TCR=106;TR=83;WE=43708253;WS=43708241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,99:0.42:233
chr19	43708849	rs142232112	C	CCCCG	372.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=4;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=0;PP=137;SC=TCTGTCTTCCCCCCACGATGA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=4;WE=43708861;WS=43708839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	43708853	rs4802164	A	C	460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=4;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=3;PP=284;SC=TCTTCCCCCCACGATGACTGT;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=14;WE=43708861;WS=43708839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	43708926	rs11673307	G	T	3999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=87;NR=44;PP=2547;SC=TGGAACAGGCGGCAGACTCCT;SOR=1.481;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=87;TCR=44;TR=131;WE=43708934;WS=43708916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr19	43708968	rs11669435	T	C	7185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=136;NR=114;PP=2965;SC=GTCTCCACCCTCTGGATGTTT;SOR=0.823;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=250;TCF=136;TCR=114;TR=250;WE=43708986;WS=43708958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,277:1.00:277
chr19	43708978	rs67183694	TC	T	6753.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.128;NF=21;NR=110;PP=2951;ReadPosRankSum=1.018;SC=TCTGGATGTTTCTTTTTCCCC;SOR=0.733;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=133;TCF=21;TCR=112;TR=131;WE=43708986;WS=43708958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,255:0.99:257
chr19	43709072	rs56700032	G	A	1765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=49;PP=1341;SC=TATAGTTATTGTTATCATTTT;SOR=4.066;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=53;TCF=4;TCR=49;TR=53;WE=43709080;WS=43709062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr19	43780616	rs201953667	G	A	1075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=3.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.03;MQRankSum=-7.107;QD=6.77;ReadPosRankSum=4.418;SOR=0.410;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:123,36:0.23:159
chr19	43780619	rs199862715	C	T	1087.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=4.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.68;MQRankSum=-6.948;QD=7.16;ReadPosRankSum=3.992;SOR=0.385;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:116,36:0.24:152
chr19	43857873	rs45441892	G	C	1271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.369;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=20;PP=702;ReadPosRankSum=0.152;SC=GGTCATGAGCGCGGTATTACT;SOR=0.552;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=123;TCF=78;TCR=45;TR=54;WE=43857881;WS=43857863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,62:0.45:137
chr19	43858317	rs4803613	G	A	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.278;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=164;ReadPosRankSum=0.943;SC=GGACCCTGGAGGCCTGACCTC;SOR=0.818;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=9;WE=43858325;WS=43858307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr19	43859549	rs1962260	T	C	502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=274;SC=CAGGTGTGAGTCACCACACCC;SOR=3.383;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=43859557;WS=43859539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	43860053	rs71350665	G	A	253.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=1.210;NF=7;NR=5;PP=410;ReadPosRankSum=1.902;SC=GAGGAGGGTGGGCCTGGCTTC;SOR=0.223;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=16;TCF=10;TCR=6;TR=12;WE=43860061;WS=43860038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,10:0.91:11
chr19	43860192	rs71337594	T	G	139.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.60;QD=27.98;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	43860251	rs199668750	G	A	62.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.50;QD=31.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr19	43860255	rs200662237	T	G	62.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.50;QD=31.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr19	43864548	rs10425835	C	A	4076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=99;PP=2789;SC=GCTGCTGCTCCTAGATGTAGG;SOR=2.439;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=128;TCF=29;TCR=99;TR=128;WE=43864556;WS=43864538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr19	43865499	rs71339512	T	C	1630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.10;QD=26.30;SOR=1.234;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr19	43865840	.	G	T	492	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=5;NR=21;PP=492;QD=20.2604312518;SC=GGGAGGAGGCGCTGGGGGCCT;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=26;WE=43865848;WS=43865830;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,26:0.93:28
chr19	43866617	rs36081957	C	T	1384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.296;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=41;PP=973;ReadPosRankSum=0.670;SC=TTCATATCTACTCACCTAACA;SOR=1.112;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=92;TCF=15;TCR=77;TR=48;WE=43866625;WS=43866607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,54:0.52:104
chr19	43876891	rs7246785	G	A	2011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQ=59.98;MQRankSum=-0.780;NF=45;NR=35;PP=1165;ReadPosRankSum=0.712;SC=GGGGGAAATGGAGTTAGCAGG;SOR=0.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=131;TCF=73;TCR=58;TR=80;WE=43876909;WS=43876881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,92:0.61:150
chr19	43877394	rs3745996	C	T	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.58;MQRankSum=-0.495;QD=7.71;ReadPosRankSum=-1.125;SOR=0.690;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,28:0.42:67
chr19	43883124	rs4803622	C	T	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.229;NF=18;NR=4;PP=801;ReadPosRankSum=0.110;SC=AGTTCAGTCCCCGCAGGGACC;SOR=0.892;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=22;WE=43883134;WS=43883114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,16:0.73:22
chr19	43883126	rs62114809	G	A	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.858;NF=6;NR=2;PP=233;ReadPosRankSum=-0.630;SC=TTCAGTCCCCGCAGGGACCCC;SOR=0.465;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=8;WE=43883134;WS=43883114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr19	43883313	rs4803623	C	G	1322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.65;MQRankSum=-1.737;QD=29.39;ReadPosRankSum=1.035;SOR=0.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,44:0.98:45
chr19	43910649	rs11673673	G	T	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.097;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=223;ReadPosRankSum=1.421;SC=TCCATCTTCAGTTCCCGCATG;SOR=0.906;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=46;TCF=30;TCR=16;TR=22;WE=43910657;WS=43910639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,26:0.53:49
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chr19	43967692	rs2682583	T	C	1336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.750;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=26;PP=973;ReadPosRankSum=-0.548;SC=GCTCCACCTCTATCTTGGCAG;SOR=0.783;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=99;TCF=57;TCR=42;TR=60;WE=43967700;WS=43967682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,58:0.58:100
chr19	43969757	rs2259013	A	G	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=17;PP=366;ReadPosRankSum=-1.334;SC=TCCCCCCTGGATGTGCCGCCT;SOR=0.503;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=38;TCF=12;TCR=26;TR=26;WE=43969765;WS=43969747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,27:0.68:40
chr19	43982467	rs2682543	A	G	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.160;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=9;PP=187;ReadPosRankSum=0.411;SC=GAGACTGGGCACAGAAACTGG;SOR=1.179;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=10;WE=43982475;WS=43982457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr19	43983740	rs1133929	T	C	191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.18;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	43991436	rs78058632	G	C	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.569;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=283;ReadPosRankSum=-1.467;SC=CCGTTTATAAGAAATATCAAG;SOR=1.179;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=16;WE=43991444;WS=43991426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr19	43999292	.	G	GGTCTGAGGGAGGAGGAGACTCGGGGCAGGACCCCTGA	557.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.601;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.46;MQRankSum=4.007;QD=32.81;ReadPosRankSum=-1.462;SOR=2.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr19	43999634	rs1125030	A	C	1669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.768;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=36;PP=1104;ReadPosRankSum=0.019;SC=AGGGCAGGTGACAGGTAGCTC;SOR=0.495;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=149;TCF=81;TCR=68;TR=76;WE=43999642;WS=43999624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,82:0.51:161
chr19	44001891	rs2682549	T	C	604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.010;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=307;ReadPosRankSum=0.254;SC=AAGAACCAGATGCCATTACCT;SOR=0.879;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=55;TCF=40;TCR=15;TR=22;WE=44001899;WS=44001881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,29:0.46:63
chr19	44012005	rs2599452	G	A	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.647;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.932;NF=8;NR=0;PP=114;ReadPosRankSum=-1.948;SC=CAGGAGTCCAGGCCCCCAGCC;SOR=2.437;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=8;WE=44012013;WS=44011995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr19	44012880	rs2682578	A	G	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=12;PP=278;ReadPosRankSum=-1.903;SC=TTTACACTCCACTTTCAAAGT;SOR=0.598;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=80;TCF=45;TCR=35;TR=27;WE=44012888;WS=44012870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,29:0.33:88
chr19	44047493	.	C	CGT	87	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=87;QD=30.0;SC=TTAAATGCATCGTGTGTGTGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=3;WE=44047501;WS=44047483;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr19	44047550	rs3547	T	C	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.399;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=229;ReadPosRankSum=-0.667;SC=TACTTCAGGCTTGCGGCACCA;SOR=0.392;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=27;TCR=10;TR=18;WE=44047558;WS=44047540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr19	44047826	rs2682557	T	A	4517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=64;NR=73;PP=2345;SC=TCACTCATATTGTCCTCGAGC;SOR=1.004;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=137;TCF=64;TCR=73;TR=137;WE=44047834;WS=44047816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr19	44049881	rs25476	G	T	1155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=19;PP=799;ReadPosRankSum=0.064;SC=CACGGGGGCAGCAGTGACCCC;SOR=0.666;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=102;TCF=65;TCR=37;TR=53;WE=44049889;WS=44049871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,56:0.50:113
chr19	44050195	rs25479	C	T	873.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.295;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=20;PP=453;ReadPosRankSum=0.926;SC=CCCCCAGCCCCAGCCCTACCT;SOR=1.206;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=62;TCF=28;TCR=34;TR=35;WE=44050203;WS=44050185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,41:0.55:74
chr19	44050966	rs25484	T	C	2107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.180;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=35;PP=1263;ReadPosRankSum=0.519;SC=AGTGGGAAGTTTGGGGTGCCA;SOR=0.593;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=150;TCF=89;TCR=61;TR=83;WE=44050974;WS=44050956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,93:0.53:174
chr19	44055726	rs25487	T	C	1634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.569;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=35;PP=894;ReadPosRankSum=-0.050;SC=GCCTTACCTCTGGGAGGGCAG;SOR=0.768;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=155;TCF=85;TCR=70;TR=80;WE=44055734;WS=44055716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,83:0.50:167
chr19	44055898	rs25486	C	T	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.675;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-1.081;NF=9;NR=21;PP=430;ReadPosRankSum=-0.436;SC=CAAAGGGGAACGAGACAGGGG;SOR=0.362;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=51;TCF=13;TCR=38;TR=30;WE=44055906;WS=44055888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,30:0.56:54
chr19	44055916	.	CAG	C	38.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.850;ClippingRankSum=0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=3.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.29;MQRankSum=2.193;QD=1.43;ReadPosRankSum=0.281;SOR=0.120;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,5:0.19:27
chr19	44057227	rs915927	T	C	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.935;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=101;ReadPosRankSum=-1.494;SC=TAGGTCCTGCTGGGTCGCTGG;SOR=0.191;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=10;WE=44057235;WS=44057217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr19	44079687	rs3213245	G	A	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.703;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=359;ReadPosRankSum=-0.367;SC=AGTGGGAGGGGGCGGGGTGCG;SOR=1.207;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=53;TCF=18;TCR=35;TR=22;WE=44079695;WS=44079677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,27:0.43:63
chr19	44081288	rs2682585	A	G	1987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=16;PP=1069;SC=GTCCAGACCCACCCCTCCTCA;SOR=1.547;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=46;TCR=16;TR=62;WE=44081296;WS=44081278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
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chr19	44081601	rs3810378	G	C	196.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.200;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5731;FS=6.532;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=158;ReadPosRankSum=0.812;SC=GGGGGTCCCAGAGAAGAAAAG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=7;WE=44081609;WS=44081591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
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chr19	44116708	rs200590643	A	G	1548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.671;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=31;PP=1077;ReadPosRankSum=0.662;SC=CTGGCAGGATAAGAACTCATG;SOR=0.814;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=120;TCF=64;TCR=56;TR=66;WE=44116716;WS=44116698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,68:0.55:124
chr19	44117052	rs77545563	C	T	2568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.886;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=50;PP=1667;ReadPosRankSum=-1.051;SC=TACAGCCCCACTGAAATGTCC;SOR=0.906;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=214;TCF=115;TCR=99;TR=113;WE=44117060;WS=44117042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,122:0.52:236
chr19	44131297	rs407049	T	C	5097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=98;NR=69;PP=2688;SC=AGGATGCGTCTGACAAGGGGG;SOR=0.935;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=167;TCF=98;TCR=69;TR=167;WE=44131305;WS=44131287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr19	44172025	rs2286960	C	T	2652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.845;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=63;PP=1635;ReadPosRankSum=0.883;SC=CACGTTCTACCTCCACCCCAC;SOR=0.746;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=297;TCF=146;TCR=151;TR=123;WE=44172033;WS=44172015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:191,136:0.42:327
chr19	44223125	rs346049	C	T	3202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.877;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=70;PP=1875;ReadPosRankSum=-0.503;SC=CTTCTTCCTGCTGGTCTCCCC;SOR=0.653;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=277;TCF=143;TCR=134;TR=144;WE=44223133;WS=44223115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,155:0.52:299
chr19	44223145	rs34439296	C	T	3456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.416;HP=5;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.933;NF=77;NR=73;PP=2023;ReadPosRankSum=1.391;SC=CCCGCCGCTGCGGGGCCGTCG;SOR=0.650;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=281;TCF=145;TCR=136;TR=150;WE=44223153;WS=44223135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,162:0.53:305
chr19	44223412	rs34471331	C	T	1599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.263;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=36;PP=934;ReadPosRankSum=0.885;SC=CCTGGGAGCACGACCTGCCCT;SOR=0.571;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=133;TCF=63;TCR=70;TR=71;WE=44223420;WS=44223402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,79:0.50:157
chr19	44224161	rs346048	T	A	896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=22;PP=516;ReadPosRankSum=0.638;SC=AAATCCAAATTACCAACAAAA;SOR=0.818;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=58;TCF=22;TCR=36;TR=34;WE=44224169;WS=44224151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,40:0.62:64
chr19	44224184	rs138139029	G	C	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=371;ReadPosRankSum=-0.474;SC=GGCCGATGTGGTGAATGTGAG;SOR=0.711;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=23;WE=44224192;WS=44224174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,25:0.58:43
chr19	44248878	rs346532	A	G	1051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=8;PP=724;SC=CCCTGCTCCCAGTGGGTGCCC;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=35;WE=44248886;WS=44248868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr19	44254972	rs164070	C	T	1260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=32;PP=907;SC=CTAGACTATACGAAGTCCCTT;SOR=1.931;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=13;TCR=32;TR=45;WE=44254980;WS=44254962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr19	44268654	rs12609587	T	C	720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.18;QD=40.04;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	44268678	rs12611034	C	T	601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.68;QD=42.98;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	44268730	rs145810077	TGTC	T	277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.9990;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=1;PP=32;SC=GCTAATTTGTTGTCGTTGTCG;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=1;WE=44268740;WS=44268720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	44273516	rs347519	T	C	1447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=7;PP=1008;SC=GGCATGGACATGCACACACAC;SOR=3.080;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=39;TCR=7;TR=46;WE=44273524;WS=44273506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr19	44274041	rs2306799	G	A	450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.754;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=290;ReadPosRankSum=0.445;SC=CCTTGAACCCGCCCAACAGCC;SOR=3.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=15;WE=44274049;WS=44274031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr19	44276370	rs3760979	A	G	1175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=29;PP=808;SC=ATACCCTCCCATCCCCTTCCC;SOR=2.093;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=10;TCR=29;TR=39;WE=44276378;WS=44276360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr19	44278779	rs649540	T	G	1396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.74;ReadPosRankSum=-0.692;SOR=0.633;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,65:0.50:130
chr19	44278779	.	TAG	GAA	692	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=21;NR=27;PP=692;QD=15.5305807263;SC=CAGCTGCCGGTAGGGGGCCAA;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=114;TCF=50;TCR=64;TR=48;WE=44278789;WS=44278769;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:66,48:0.42:114
chr19	44278781	rs563995	G	A	4494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.46;SOR=1.217;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr19	44280605	.	CAGG	C	43.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.230;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.542;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=1;PP=34;ReadPosRankSum=-0.825;SC=TTACTCAGATCAGGAGGAGGA;SOR=0.098;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=2;WE=44280615;WS=44280595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,3:0.17:18
chr19	44280837	rs514328	G	A	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.657;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.932;NF=13;NR=11;PP=263;ReadPosRankSum=0.850;SC=GTCTCCCTCCGCCTGGCCCTC;SOR=0.839;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=59;TCF=26;TCR=33;TR=24;WE=44280845;WS=44280827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,28:0.48:58
chr19	44280980	.	T	G	44	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5002;HP=4;HapScore=2;MGOF=27;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=44;QD=19.6928031368;SC=CCCAGTGCGGTGGCTCACACC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=4;WE=44280988;WS=44280970;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:3,4:0.57:7
chr19	44302624	rs349053	T	C	5587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=102;NR=80;PP=2965;SC=CATTCTGCCATTGCCCTGGAA;SOR=0.869;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=182;TCF=102;TCR=80;TR=182;WE=44302632;WS=44302614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr19	44303066	rs11547806	C	G	2774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=43;NR=53;PP=1597;SC=AGCGCGTCCGCGTTCGATTGC;SOR=1.056;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=43;TCR=53;TR=96;WE=44303074;WS=44303056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr19	44306389	rs72214885	GCCCCCA	G	5654.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=31;PP=2973;SC=AGGAGTCCAGGCCCCCAGTCT;SOR=1.573;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=63;TCF=30;TCR=33;TR=60;WE=44306402;WS=44306379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr19	44351107	rs10421861	G	A	1690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=11;PP=1337;SC=AGTCAAAAACGTATGAGACCA;SOR=3.180;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=59;TCF=47;TCR=12;TR=58;WE=44351124;WS=44351097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr19	44351166	rs79626467	GGGAGAT	G	7887.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=57;PP=2945;SC=TTTTCCCAGTGGGAGATGAAG;SOR=1.468;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=96;TCF=37;TCR=59;TR=92;WE=44351179;WS=44351156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr19	44351694	rs2195980	C	T	5857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=98;NR=96;PP=2965;SC=AAAATTCATACTGGTGTGAAA;SOR=0.808;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=194;TCF=98;TCR=96;TR=194;WE=44351702;WS=44351684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr19	44351836	rs957569	G	A	4326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=65;PP=2579;SC=GTGGCTATCAGCTTACTCAGC;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=135;TCF=70;TCR=65;TR=135;WE=44351844;WS=44351826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr19	44352665	rs2356437	TG	CA	7560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=72;PP=2947;SC=GACCTTTACTTGTGGCTCAAA;SOR=1.000;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=143;TCF=68;TCR=75;TR=138;WE=44352674;WS=44352655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr19	44352688	rs2883946	G	A	3407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.878;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=64;PP=2009;ReadPosRankSum=0.088;SC=TTGTTCATGAGAGAACTCATA;SOR=0.870;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=111;TCF=47;TCR=64;TR=110;WE=44352696;WS=44352678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,126:0.99:127
chr19	44377357	rs239942	C	T	5117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=77;PP=2965;SC=GAGCCCTTACCAAAAGCCTTT;SOR=0.782;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=166;TCF=89;TCR=77;TR=166;WE=44377365;WS=44377347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr19	44419030	rs420242	A	G	9158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=349;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=169;NR=151;PP=2965;SC=TCTCTCCTGCATGAGCCCTTT;SOR=0.789;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=320;TCF=169;TCR=151;TR=320;WE=44419038;WS=44419020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,348:1.00:348
chr19	44469577	rs451601	T	G	1283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=33;PP=965;SC=TTGCCAAACTTCTTTCATAAC;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=6;TCR=33;TR=39;WE=44469585;WS=44469567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr19	44470189	rs454301	T	A	9524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=359;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=159;NR=161;PP=2965;SC=TAAACAGTCCTTCAGTGATGT;SOR=0.762;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=320;TCF=159;TCR=161;TR=320;WE=44470197;WS=44470179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,358:1.00:358
chr19	44470420	rs439676	T	C	9433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=353;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=184;NR=141;PP=2965;SC=ACCATTCAAATGTGGGCAATG;SOR=0.924;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=325;TCF=184;TCR=141;TR=325;WE=44470428;WS=44470410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,353:1.00:353
chr19	44470548	rs453640	A	G	7435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=112;NR=130;PP=2965;SC=CACAGCTTCAAGAACATCAGA;SOR=0.822;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=244;TCF=113;TCR=131;TR=242;WE=44470556;WS=44470538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,262:1.00:262
chr19	44470663	rs435590	G	C	11454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=434;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=207;NR=190;PP=2965;SC=AGGAGAAAAAGCATTCAGATG;SOR=0.769;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=398;TCF=208;TCR=190;TR=397;WE=44470671;WS=44470653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,434:1.00:434
chr19	44471209	rs365745	T	A	5719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=106;NR=82;PP=2965;SC=TACTCAGAGTTCACAACTTCA;SOR=0.844;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=188;TCF=106;TCR=82;TR=188;WE=44471217;WS=44471199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr19	44471323	rs366111	G	A	7094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=118;NR=112;PP=2965;SC=GAGGGTCCACGGGGGAGAGCG;SOR=0.724;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=230;TCF=118;TCR=112;TR=230;WE=44471331;WS=44471313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr19	44500478	rs398235	A	T	4490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=85;PP=2965;SC=TAAACAGTCCATCAGTGATGT;SOR=1.164;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=148;TCF=63;TCR=85;TR=148;WE=44500486;WS=44500468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr19	44500761	rs448921	G	A	10821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=403;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=193;NR=170;PP=2965;SC=AATGTTCATCGTAAATTACAC;SOR=0.776;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=363;TCF=193;TCR=170;TR=363;WE=44500769;WS=44500751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,402:1.00:402
chr19	44501116	rs388812	A	G	11134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=392;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=185;NR=181;PP=2965;SC=ACACAGGAGAAAAACCATATA;SOR=0.698;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=366;TCF=185;TCR=181;TR=366;WE=44501124;WS=44501106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,391:1.00:391
chr19	44501227	rs388471	A	G	9359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=139;NR=168;PP=2965;SC=AAGAATGTGGAAAGGGATTTT;SOR=0.916;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=307;TCF=139;TCR=168;TR=307;WE=44501235;WS=44501217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,325:1.00:325
chr19	44501627	rs35292176	T	C	1069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=31;PP=897;SC=TGACACATAATTGTTCATATT;SOR=4.743;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=33;WE=44501635;WS=44501617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	44503379	rs452554	C	T	2314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=33;PP=1219;SC=TACATTTCATCCAGTCCTGTA;SOR=0.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=39;TCR=33;TR=72;WE=44503387;WS=44503369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr19	44503541	rs11314755	TA	T	2215.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=31;PP=1436;SC=AGACAGACCTTAAGAGTTCAT;SOR=1.022;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=38;TCF=5;TCR=33;TR=36;WE=44503549;WS=44503531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr19	44503569	rs7252394	G	A	1064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=23;PP=672;SC=TTTACAAAACGAATCATGAAC;SOR=2.012;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=10;TCR=23;TR=33;WE=44503577;WS=44503559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr19	44503607	rs7253205	T	C	687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=43;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=18;PP=483;SC=CACTAGAATGTCAGTGACATG;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=44503615;WS=44503597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	44511202	rs2356549	A	T	6470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=118;NR=85;PP=2965;SC=TACTCAAGACACTGAAGACTC;SOR=0.925;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=203;TCF=118;TCR=85;TR=203;WE=44511231;WS=44511192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr19	44511223	rs424147	T	G	6695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=117;NR=99;PP=2965;SC=CAAAAAGTAGTAGGAAAAATG;SOR=0.768;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=216;TCF=117;TCR=99;TR=216;WE=44511231;WS=44511192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr19	44511389	rs2191566	G	T	2583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=52;PP=1575;ReadPosRankSum=-1.002;SC=TGTCTCTTTTGTGTTGACTTT;SOR=1.408;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=87;TCF=35;TCR=52;TR=86;WE=44511397;WS=44511379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,100:0.98:102
chr19	44530390	rs8101750	T	C	4655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=94;PP=2897;SC=TACATGATCTTCACAGTGGCA;SOR=1.553;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=50;TCR=95;TR=144;WE=44530398;WS=44530380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr19	44530444	rs3830527	GAC	G	1695.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=31;PP=1455;SC=ATGGGCGTGAGACACAGGTGG;SOR=4.461;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=31;WE=44530453;WS=44530434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr19	44535999	rs7258517	G	T	5708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=119;NR=67;PP=2965;SC=GATGGAGACTGTTCCAGAAGC;SOR=1.318;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=186;TCF=119;TCR=67;TR=186;WE=44536007;WS=44535989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr19	44564401	rs12610472	T	C	3264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=60;NR=59;PP=1581;SC=AAGACTTCTTTGTCGTTGGAC;SOR=0.772;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=60;TCR=59;TR=119;WE=44564409;WS=44564391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr19	44564981	rs3826941	G	A	8961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=154;NR=146;PP=2965;SC=CAACCCAAAGGGAAGGGAATT;SOR=0.717;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=301;TCF=155;TCR=146;TR=300;WE=44564989;WS=44564971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,332:1.00:332
chr19	44565125	rs4502339	A	G	2464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=51;PP=1501;SC=CCTTCCAGCTAGTGGCCCTGC;SOR=1.636;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=29;TCR=51;TR=80;WE=44565133;WS=44565115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr19	44570393	rs6509138	C	A	6123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=120;PP=2965;SC=TGAGGAAGGACTATCTATAAT;SOR=1.134;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=210;TCF=90;TCR=120;TR=210;WE=44570401;WS=44570383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr19	44570551	rs4375771	G	A	3594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=49;PP=2110;SC=ACATCTCAGCGCTTCATATTC;SOR=0.822;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=65;TCR=49;TR=114;WE=44570559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr19	44571154	rs4433920	T	C	6894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=120;NR=106;PP=2965;SC=ACTTGCACCATAGAGCCCACA;SOR=0.752;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=227;TCF=120;TCR=107;TR=226;WE=44571162;WS=44571144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr19	44580440	rs201907991	CT	C	56.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.03;ReadPosRankSum=0.407;SOR=1.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,8:0.29:28
chr19	44580758	rs57895932	T	C	589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=21;PP=470;SC=ATTTATGTTATGAGTAGAAAT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=44580766;WS=44580748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	44585159	rs4803674	T	A	4848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=59;PP=2723;SC=CATACGTTTGTTGTTGTAGGA;SOR=1.080;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=154;TCF=95;TCR=59;TR=154;WE=44585167;WS=44585149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr19	44586076	rs4553729	T	C	4428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=62;PP=2263;SC=ACCATATCAGTGTTCAAGTTC;SOR=0.897;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=147;TCF=85;TCR=62;TR=147;WE=44586084;WS=44586066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr19	44589999	rs139900131	TCTC	T	9464.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=84;PP=2965;SC=AGCTCTCAGTTCTCCACACAA;SOR=0.780;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=19;TCR=87;TR=102;WE=44590009;WS=44589989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr19	44590558	rs7255701	C	T	4715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.802;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=100;NR=70;PP=2965;ReadPosRankSum=2.111;SC=CCATGGTCCACATGCAAGAGA;SOR=0.810;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=171;TCF=100;TCR=71;TR=170;WE=44590566;WS=44590548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,179:0.99:180
chr19	44591360	rs8113249	G	A	2765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=68;PP=1966;SC=GAAGCGCTACGAGAGGCGCTT;SOR=2.069;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=26;TCR=68;TR=94;WE=44591368;WS=44591350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr19	44604914	rs62115526	T	C	5533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=107;NR=74;PP=2965;SC=CCAGGAATCATTGGTCATGAG;SOR=0.878;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=181;TCF=107;TCR=74;TR=181;WE=44604922;WS=44604904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr19	44610665	rs2068061	A	G	7372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=126;NR=111;PP=2965;SC=TCAAGACTTGATGATAAATAG;SOR=0.846;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=237;TCF=126;TCR=111;TR=237;WE=44610673;WS=44610655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr19	44610798	rs4239529	A	T	7201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=110;NR=127;PP=2965;SC=GATGTCTCCCACTTTGATTTT;SOR=0.931;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=237;TCF=110;TCR=127;TR=237;WE=44610806;WS=44610788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr19	44611066	rs7508149	T	C	11371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=417;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=-0.035;NF=197;NR=180;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.302;SC=ATGTTCATCATAAATTACACA;SOR=0.237;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=378;TCF=198;TCR=180;TR=377;WE=44611074;WS=44611056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,415:1.00:416
chr19	44611420	rs4508518	A	G	11278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=406;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=174;NR=178;PP=2965;SC=ACACGGGAGAAAAGCCATATA;SOR=0.770;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=352;TCF=174;TCR=178;TR=352;WE=44611428;WS=44611410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,405:1.00:405
chr19	44612005	rs3746321	A	G	9911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.93;QD=43.86;SOR=0.905;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr19	44612014	rs3200505	A	T	10017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.56;SOR=0.841;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr19	44612231	rs3746319	A	G	6090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=95;NR=92;PP=2965;SC=TTCATTCTCTAAAGTGCAAGA;SOR=0.752;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=187;TCF=95;TCR=92;TR=187;WE=44612239;WS=44612221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr19	44634903	rs10413195	A	G	733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=1;PP=518;SC=AACATTCCCTATATTTATTAA;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=44634911;WS=44634893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
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chr19	44652954	rs2293587	G	A	3114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-3.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.953;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=66;PP=1869;ReadPosRankSum=-0.277;SC=TGTGGCTGTGGTCTTCACTGA;SOR=0.615;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=234;TCF=113;TCR=121;TR=131;WE=44652962;WS=44652944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,144:0.55:260
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chr19	44677233	rs12459795	A	G	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.143;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=19;PP=423;ReadPosRankSum=1.080;SC=CACCCTTTGTACTGCTTGCCC;SOR=0.312;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=50;TCF=17;TCR=33;TR=31;WE=44677241;WS=44677223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,33:0.59:56
chr19	44721699	rs9304640	C	T	3088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=348;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.814;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=70;PP=1866;ReadPosRankSum=1.497;SC=CATTGCCTCTCGTTTCCTGCT;SOR=0.632;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=304;TCF=148;TCR=156;TR=139;WE=44721707;WS=44721688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:188,158:0.46:346
chr19	44739303	rs2279073	T	C	2672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.676;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=49;PP=1550;ReadPosRankSum=-1.241;SC=ATGGCTCCAATCAGAAATTAC;SOR=0.549;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=232;TCF=130;TCR=102;TR=110;WE=44739311;WS=44739293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,128:0.48:265
chr19	44739399	rs2279072	T	C	2564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.950;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=50;PP=1767;ReadPosRankSum=0.188;SC=CGAATGTTCATACAGGAGAAA;SOR=0.766;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=241;TCF=130;TCR=111;TR=110;WE=44739407;WS=44739389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,121:0.47:258
chr19	44764064	rs1233444	A	G	6602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=121;NR=94;PP=2965;SC=AGGAGGGCGAAGCAGCCGTCA;SOR=0.881;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=215;TCF=121;TCR=94;TR=215;WE=44764072;WS=44764054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr19	44769974	rs12462723	C	T	1041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=2.784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.20;ReadPosRankSum=1.300;SOR=0.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,51:0.55:93
chr19	44778405	rs1233428	A	C	4043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=63;PP=2553;SC=AGAGTTCACAAAGGAGAGAAG;SOR=0.734;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=134;TCF=71;TCR=63;TR=134;WE=44778413;WS=44778395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr19	44778795	rs59660444	CG	C	1542.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.959;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=23;PP=2123;ReadPosRankSum=0.774;SC=AGTAAGAGTTCGTTGTCTTCA;SOR=1.112;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=51;TCF=2;TCR=49;TR=24;WE=44778807;WS=44778785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,41:0.47:88
chr19	44778797	rs2884015	T	A	1551.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=4.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.04;ReadPosRankSum=0.446;SOR=1.210;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,41:0.48:86
chr19	44778797	.	TTG	ATA	2113	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=12;NR=23;PP=2113;QD=61.8990821389;SC=TAAGAGTTCGTTGTCTTCAGA;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=74;TCF=29;TCR=45;TR=35;WE=44778807;WS=44778785;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:39,35:0.47:74
chr19	44778799	rs2884016	G	A	1557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=4.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.23;ReadPosRankSum=-0.543;SOR=1.228;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,41:0.51:81
chr19	44792701	rs2125579	T	G	2886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.432;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=63;PP=1948;ReadPosRankSum=1.257;SC=GTCCTTCTCATGTGTACTACA;SOR=0.655;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=266;TCF=134;TCR=132;TR=124;WE=44792709;WS=44792691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,132:0.47:283
chr19	44792969	rs2609908	G	A	3077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=45;PP=1845;SC=AATATACATAGTTTGTTTTTC;SOR=0.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=60;TCR=45;TR=104;WE=44792977;WS=44792959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr19	44807359	rs67283809	GAT	G	108.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=1;PP=99;ReadPosRankSum=0.952;SC=GAAATTAACAGATATATATAT;SOR=0.160;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=3;WE=44807368;WS=44807349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr19	44831989	rs2609881	T	G	1928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.277;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=43;PP=1189;ReadPosRankSum=1.817;SC=TGTACACACCTCACATTTGTA;SOR=0.870;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=200;TCF=102;TCR=98;TR=85;WE=44831997;WS=44831979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,99:0.44:226
chr19	44832684	rs2609880	T	G	6546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=116;NR=106;PP=2965;SC=GTTTCTCTCCTGTGTGGACTC;SOR=0.709;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=222;TCF=116;TCR=106;TR=222;WE=44832692;WS=44832674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr19	44832875	rs2722722	A	G	8910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=156;NR=125;PP=2965;SC=CCTTGAAGATATAAATTATGG;SOR=0.803;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=281;TCF=156;TCR=125;TR=281;WE=44832883;WS=44832865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,323:1.00:323
chr19	44832992	rs2722723	C	G	7538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=117;NR=127;PP=2965;SC=CCACACTCCTCAGAATTATAT;SOR=0.908;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=244;TCF=117;TCR=127;TR=244;WE=44833000;WS=44832982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,275:1.00:275
chr19	44833506	rs4325673	C	T	6189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=115;NR=100;PP=2965;SC=GCTGATGAACCTCAGAGCTGG;SOR=0.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=215;TCF=115;TCR=100;TR=215;WE=44833514;WS=44833496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr19	44833851	rs4280359	G	C	4468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=62;PP=2684;SC=CTATATGAGTGAATATATAGT;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=132;TCF=70;TCR=62;TR=132;WE=44833859;WS=44833841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr19	44840789	rs2571104	T	C	3606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=54;PP=2446;SC=AACATCCATCTCTTGGGGTTT;SOR=1.005;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=69;TCR=54;TR=123;WE=44840797;WS=44840779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr19	44845385	rs74260472	C	T	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.443;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=301;ReadPosRankSum=-1.013;SC=TCTTCTATCCCATTTCTGGGC;SOR=1.467;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=41;TCF=14;TCR=27;TR=20;WE=44845393;WS=44845375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,25:0.54:46
chr19	44847480	rs5828194	GA	G	3575.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.470;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=63;PP=2357;ReadPosRankSum=-2.028;SC=AGGGTAATACGAAAGAAGCCA;SOR=0.804;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=155;TCF=19;TCR=136;TR=69;WE=44847488;WS=44847470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,124:0.46:269
chr19	44847615	rs984116	C	A	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=358;ReadPosRankSum=1.162;SC=CCACTTGGCTCTCCTGGCAGG;SOR=0.452;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=20;WE=44847623;WS=44847605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,20:0.69:29
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chr19	44890697	rs1836280	A	G	2380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.904;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-6.214;NF=61;NR=53;PP=1498;ReadPosRankSum=2.323;SC=CACGCTCACAATGTGTGTACT;SOR=0.637;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=272;TCF=149;TCR=123;TR=114;WE=44890705;WS=44890687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,119:0.41:290
chr19	44890801	rs12610859	T	C	2697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.390;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.052;NF=67;NR=61;PP=1860;ReadPosRankSum=0.676;SC=GGCCTCTCTCTTGTGTGGACT;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=275;TCF=142;TCR=133;TR=128;WE=44890809;WS=44890791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,133:0.45:295
chr19	44890817	rs73039937	G	A	3368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.363;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.572;NF=69;NR=68;PP=1879;ReadPosRankSum=-1.792;SC=GGACTCTGAGGTGAACATTAA;SOR=0.800;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=275;TCF=141;TCR=134;TR=137;WE=44890825;WS=44890807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,156:0.51:304
chr19	44891784	rs2571089	T	C	3160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.873;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=58;PP=1853;ReadPosRankSum=0.007;SC=TTTCCCACAGTTGGGATGTCT;SOR=0.699;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=274;TCF=145;TCR=129;TR=124;WE=44891792;WS=44891774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,145:0.48:302
chr19	44892206	rs73557001	C	A	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=465;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQRankSum=-18.133;QD=1.20;ReadPosRankSum=2.194;SOR=0.638;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:385,80:0.17:465
chr19	44892225	rs114985922	T	G	1842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=448;ExcessHet=3.0103;FS=1.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQRankSum=-17.509;QD=4.11;ReadPosRankSum=-1.559;SOR=0.546;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:375,73:0.16:448
chr19	44892228	rs117953191	G	C	1845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=446;ExcessHet=3.0103;FS=1.557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQRankSum=-17.467;QD=4.14;ReadPosRankSum=-2.969;SOR=0.528;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:373,73:0.16:446
chr19	44892333	rs2571090	A	T	680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.455;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=25;PP=508;ReadPosRankSum=0.529;SC=TGAGAAAATGAAATATGATGG;SOR=0.380;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=51;TCF=9;TCR=42;TR=31;WE=44892341;WS=44892323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,30:0.57:53
chr19	44896487	rs2571123	G	C	1562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=22;PP=1135;ReadPosRankSum=0.181;SC=CCAGTGGTCTGATGCTCAGTT;SOR=0.739;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=115;TCF=76;TCR=39;TR=66;WE=44896495;WS=44896477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,68:0.58:117
chr19	44898662	rs2571124	C	T	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.489;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.84;ReadPosRankSum=-1.664;SOR=0.120;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr19	44901526	rs2722650	A	G	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.717;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=276;ReadPosRankSum=1.289;SC=TCCTCTCACTAGATATCATCT;SOR=3.401;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=13;WE=44901534;WS=44901516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr19	44901557	rs2722651	A	G	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5267;FS=7.782;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=90;ReadPosRankSum=0.819;SC=TGAACAGACTAAACTCCCACC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=5;WE=44901565;WS=44901547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr19	44932972	rs1434579	C	T	2004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=38;PP=1151;ReadPosRankSum=-0.349;SC=AAGCCCTTTCCGCACTCTTGG;SOR=0.703;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=184;TCF=101;TCR=83;TR=82;WE=44932995;WS=44932962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,93:0.46:204
chr19	44933504	rs59505617	G	A	3131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.842;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=71;PP=1859;ReadPosRankSum=0.417;SC=GCCTCTCGCCGGTGTGTGTCT;SOR=0.826;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=273;TCF=138;TCR=135;TR=136;WE=44933512;WS=44933494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,153:0.50:303
chr19	44933706	rs57014690	C	T	2937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=61;PP=1777;ReadPosRankSum=0.883;SC=AAGCACTGAGCTGTAACTGAA;SOR=0.705;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=238;TCF=122;TCR=116;TR=122;WE=44933714;WS=44933696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,139:0.52:265
chr19	44933947	rs12151338	G	A	1530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.981;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=34;PP=911;ReadPosRankSum=0.655;SC=GGGTGGTTACGTATGTGCGTG;SOR=0.866;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=143;TCF=64;TCR=79;TR=61;WE=44933955;WS=44933937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,71:0.44:163
chr19	44934489	rs2571174	G	A	4685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=84;PP=2965;SC=ACTGTCCAGGGAATTCTCAAT;SOR=0.974;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=153;TCF=69;TCR=84;TR=153;WE=44934497;WS=44934479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr19	44934653	rs8113370	T	C	2245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.350;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=48;PP=1395;ReadPosRankSum=-2.695;SC=AGGAGAGCTCTTTGTGTGAAA;SOR=0.863;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=184;TCF=91;TCR=93;TR=90;WE=44934661;WS=44934643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,103:0.49:210
chr19	44947184	rs204547	T	C	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=43;ReadPosRankSum=-0.921;SC=GTCCAGAGCGTGACTGCTTCC;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=5;WE=44947192;WS=44947174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr19	44972036	rs139713518	C	T	771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.103;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=24;PP=525;ReadPosRankSum=0.296;SC=GACCTGTTTCCTCAAATCATC;SOR=0.988;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=63;TCF=15;TCR=48;TR=31;WE=44972044;WS=44972026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,33:0.49:67
chr19	45004042	rs12459496	T	C	396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=0;PP=328;SC=GTTCTCAAGATGTCCCCTTAC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=45004050;WS=45004041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	45004305	rs12977470	G	C	4552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=93;PP=2965;SC=GACACCAAGCGCTGCCCCACG;SOR=1.278;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=157;TCF=64;TCR=93;TR=157;WE=45004313;WS=45004295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr19	45015596	rs1004605	T	G	3971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=55;PP=2402;SC=TGCCATGAAATGTTTAGACAA;SOR=0.982;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=135;TCF=80;TCR=55;TR=135;WE=45015604;WS=45015586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr19	45016116	rs8100718	A	G	2982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=58;NR=47;PP=1747;SC=GATATATTGCAATACTCAGGA;SOR=0.800;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=58;TCR=47;TR=105;WE=45016124;WS=45016106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr19	45016990	rs5828200	CT	C	5205.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=47;PP=2951;SC=GACTGGGGTCCTTCTGTTGTT;SOR=1.187;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=80;TCF=31;TCR=49;TR=78;WE=45016998;WS=45016980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr19	45017477	rs10706694	TA	T	2192.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=33;PP=1540;SC=CGTTGGGAGGTAATCAGATTG;SOR=2.348;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=34;WE=45017494;WS=45017467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr19	45017486	rs4802229	T	C	1988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=30;PP=805;SC=GTAATCAGATTGTGGTTTTTG;SOR=2.885;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=42;TCF=9;TCR=33;TR=39;WE=45017494;WS=45017467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr19	45024581	rs12982449	C	G	1509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.438;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=19;PP=998;ReadPosRankSum=0.289;SC=CATAGGGCCCCGTGTCATTCC;SOR=0.878;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=127;TCF=91;TCR=36;TR=66;WE=45024589;WS=45024571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,73:0.53:138
chr19	45024875	rs12975863	T	C	487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.297;HP=2;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=589;ReadPosRankSum=-0.687;SC=TCCAGGAGTGTGTGCGTGTGT;SOR=0.261;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=17;WE=45024887;WS=45024865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr19	45024879	rs144346131	C	CGTGT	475.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=2;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=619;ReadPosRankSum=-1.156;SC=GGAGTGTGTGCGTGTGTGTGT;SOR=0.283;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=9;WE=45024887;WS=45024865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chr19	45028169	rs7260180	C	T	2165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.483;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=43;PP=1227;ReadPosRankSum=-1.418;SC=TGGAACACAACGGAGAGGTTG;SOR=0.755;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=208;TCF=113;TCR=95;TR=96;WE=45028177;WS=45028159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,108:0.47:229
chr19	45033379	.	GCACA	G	453.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.090;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=9.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.26;MQRankSum=0.000;QD=16.20;ReadPosRankSum=-0.136;SOR=2.613;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr19	45117157	rs140929931	C	T	969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.824;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=15;PP=571;ReadPosRankSum=1.189;SC=GCCGGGGCTGCAGACGCGACT;SOR=0.559;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=74;TCF=46;TCR=28;TR=38;WE=45117165;WS=45117147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,43:0.51:85
chr19	45121424	rs10412507	G	A	5077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=88;NR=77;PP=2965;SC=CTGCCTTCTCGGAGCTGCCCT;SOR=0.737;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=166;TCF=88;TCR=78;TR=165;WE=45121432;WS=45121414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr19	45126994	rs846857	A	G	7857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=153;NR=110;PP=2965;SC=TTCCCTGTTTACACAGACAGC;SOR=1.009;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=263;TCF=153;TCR=110;TR=263;WE=45127002;WS=45126984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,288:1.00:288
chr19	45138648	.	TTC	T	57	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=27;MQ=59.27;NF=3;NR=1;PP=57;QD=15.0;SC=ATGATTCTTATTCTCTCTCTC;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=4;WE=45138657;WS=45138638;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr19	45138676	rs375878000	GTC	G	59.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.93;ReadPosRankSum=0.696;SOR=0.336;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,5:0.16:31
chr19	45147518	rs5828211	C	CA	6252.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=43;PP=2267;SC=GTCTGGCTCCCGCTCCGCATC;SOR=0.907;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=52;TCF=8;TCR=44;TR=51;WE=45147526;WS=45147508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr19	45147542	rs439446	T	C	5243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.51;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=29;NR=41;PP=1097;SC=GCCGGGTACTTGCCCCCTTGG;SOR=1.142;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=29;TCR=41;TR=70;WE=45147550;WS=45147532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr19	45147576	rs5828212	CG	C	2127.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.49;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=21;PP=1004;SC=ACGGCCCCGCCGCGGCGCCAC;SOR=1.220;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=24;WE=45147584;WS=45147566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	45157113	rs71171278	A	AG	8693.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=53;NR=78;PP=2974;SC=AATCCCGCGTACCCCAGGCCC;SOR=0.999;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=55;TCR=81;TR=131;WE=45157121;WS=45157103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr19	45162038	rs203710	A	G	4716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=74;PP=2772;SC=ACTCAGGCATATCCCGTAACG;SOR=0.774;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=163;TCF=89;TCR=74;TR=163;WE=45162046;WS=45162028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr19	45202640	rs2119660	G	T	1883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.472;HP=1;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=31;PP=1539;ReadPosRankSum=0.984;SC=GCTTGGCAGAGTCCATAAATT;SOR=0.856;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=124;TCF=51;TCR=73;TR=54;WE=45202660;WS=45202630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,54:0.45:119
chr19	45202652	rs3948201	C	T	1746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.779;HP=2;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=27;PP=1539;ReadPosRankSum=0.863;SC=CCATAAATTGCCCAGGGTCCT;SOR=0.811;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=106;TCF=40;TCR=66;TR=46;WE=45202660;WS=45202630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,45:0.48:94
chr19	45203837	rs2919848	G	C	1055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.75;SOR=0.741;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	45206532	rs2965167	G	A	1671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=19;PP=864;SC=GGCTGGGGACGTGCCCCGAGC;SOR=1.197;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=34;TCR=19;TR=53;WE=45206540;WS=45206522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr19	45213701	rs57684876	C	T	1724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=24;PP=1106;ReadPosRankSum=0.708;SC=GGGGTGGGGGCACTGGGGACC;SOR=0.635;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=96;TCR=42;TR=78;WE=45213709;WS=45213691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,80:0.56:143
chr19	45251156	rs2965169	A	C	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=50;ReadPosRankSum=0.589;SC=GCCCCCAACGAGTGCAGAGAC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=4;WE=45251164;WS=45251147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr19	45262877	rs199642968	G	A	385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.363;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=264;ReadPosRankSum=0.747;SC=AGCTGAGGGGGATGGGGGGGC;SOR=1.022;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=40;TCF=11;TCR=29;TR=17;WE=45262885;WS=45262867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,18:0.43:42
chr19	45284669	rs191160050	A	G	1835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.008;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=45;PP=964;ReadPosRankSum=-0.665;SC=AGGAGGAAGTAGAGGGCTGAA;SOR=0.523;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=147;TCF=56;TCR=91;TR=75;WE=45284677;WS=45284659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,91:0.54:170
chr19	45324138	rs28399637	G	A	1504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=31;PP=783;ReadPosRankSum=-1.635;SC=GAGCACGCCCGTGGGCACAGG;SOR=0.665;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=126;TCF=67;TCR=59;TR=66;WE=45324146;WS=45324128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,74:0.52:143
chr19	45381917	rs3729640	C	T	2417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.576;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=61;PP=1492;ReadPosRankSum=0.394;SC=CCGGCCCTCCCGCCCCCGACC;SOR=0.620;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=176;TCF=67;TCR=109;TR=99;WE=45381926;WS=45381907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,108:0.59:184
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chr19	45404691	rs405697	A	G	2270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=49;PP=1474;SC=CCACATTACCAGGGAACACTT;SOR=1.554;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=28;TCR=49;TR=77;WE=45404699;WS=45404681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr19	45409167	rs440446	C	G	436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=10;PP=280;SC=ACCCTGGGAACCCCTGGCCTC;SOR=1.371;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=6;TCR=10;TR=16;WE=45409175;WS=45409157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	45412079	rs7412	C	T	827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=17;PP=488;ReadPosRankSum=0.716;SC=CCTGCAGAAGCGCCTGGCAGT;SOR=0.669;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=87;TCF=50;TCR=37;TR=39;WE=45412087;WS=45412069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,43:0.43:99
chr19	45430280	rs5112	C	G	1043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=2.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.67;MQRankSum=-0.613;QD=11.47;ReadPosRankSum=-0.979;SOR=1.030;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,46:0.51:91
chr19	45448036	rs1132899	T	C	753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.54;ReadPosRankSum=-0.757;SOR=0.653;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,39:0.49:79
chr19	45451620	rs5120	T	A	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.774;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=407;ReadPosRankSum=0.247;SC=GACACCGAGCTCACACAGAGC;SOR=0.293;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=51;TCF=41;TCR=10;TR=27;WE=45451628;WS=45451610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,28:0.50:56
chr19	45451656	rs10422603	T	G	1028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.750;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=12;PP=666;ReadPosRankSum=0.877;SC=CCCACCAGAGTGGGGCGTGAC;SOR=0.927;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=63;TCR=26;TR=41;WE=45451664;WS=45451646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,44:0.44:99
chr19	45452335	rs4803776	T	C	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQRankSum=-1.923;QD=8.30;ReadPosRankSum=-0.323;SOR=0.722;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,15:0.45:33
chr19	45458146	rs3760629	A	C	168.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=0;PP=134;SC=AGGGGTCAGAAGACAAGGGTG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=45458154;WS=45458138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	45458463	rs8102895	A	G	837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.004;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=23;PP=610;ReadPosRankSum=-0.388;SC=GGCTGGGAGAAAGACGAGTAC;SOR=0.941;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=63;TCF=22;TCR=41;TR=34;WE=45458471;WS=45458453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,35:0.54:65
chr19	45465363	rs35566032	GA	G	2357.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.532;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.048;NF=8;NR=44;PP=1684;ReadPosRankSum=1.061;SC=TTTGTTCACCGAAAACATTCA;SOR=0.645;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=108;TCF=14;TCR=94;TR=52;WE=45465371;WS=45465353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,91:0.48:189
chr19	45476422	rs204481	T	C	6714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=121;PP=2965;SC=CCGGAGGAGCTCCACGCGTCG;SOR=0.919;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=228;TCF=107;TCR=121;TR=228;WE=45476430;WS=45476412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr19	45477910	rs11318909	CT	C	1872.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=49;PP=1827;SC=ACTGAAGGACCTTTTCCTCCA;SOR=3.804;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=53;TCF=1;TCR=52;TR=50;WE=45477918;WS=45477900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr19	45488434	rs204472	A	G	2253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=20;PP=1526;SC=TGCAGGTGCCAGCAGGTCTCA;SOR=2.168;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=62;TCR=20;TR=82;WE=45488442;WS=45488424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr19	45488567	rs204471	T	C	6043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=92;NR=113;PP=2965;SC=TCAAGGTAAATGGGCAGGGTT;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=205;TCF=92;TCR=113;TR=205;WE=45488575;WS=45488548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr19	45489548	rs58800134	A	AG	1966.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=6;PP=1615;SC=GCTTGAGCCCAGAATTCGAGA;SOR=3.056;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=40;TCF=31;TCR=9;TR=37;WE=45489556;WS=45489538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr19	45490636	rs204468	T	C	6514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.856;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=119;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.029;SC=ACTTCCTGGGTGATGAGTTGT;SOR=0.843;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=208;TCF=89;TCR=119;TR=207;WE=45490644;WS=45490626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,242:1.00:243
chr19	45493635	rs875255	C	G	905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.966;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=10;PP=465;ReadPosRankSum=-2.187;SC=CTGGTTCCCCCCTACCCCCTG;SOR=0.456;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=68;TCF=47;TCR=21;TR=34;WE=45493643;WS=45493625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,43:0.54:79
chr19	45494247	rs11405080	A	AC	9095.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=8;NR=111;PP=2936;SC=GTCTCCAGGTACCACGTATCC;SOR=1.341;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=129;TCF=8;TCR=121;TR=119;WE=45494255;WS=45494237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr19	45494349	rs11333249	TC	T	1069.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=21;PP=1099;SC=CATAACTGCTTCCCTGGGCGA;SOR=1.839;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=29;WE=45494357;WS=45494339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	45496303	rs9193	T	C	892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.376;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=17;PP=383;ReadPosRankSum=0.335;SC=CAGCGTGTGATGTAGGGGCCG;SOR=0.587;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=100;TCF=61;TCR=39;TR=39;WE=45496311;WS=45496293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,48:0.39:123
chr19	45506772	rs7251460	T	A	1318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=0.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.651;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=28;PP=1019;ReadPosRankSum=-1.463;SC=GACAGGTAAATCTTACCACCT;SOR=0.624;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=110;TCF=57;TCR=53;TR=58;WE=45506780;WS=45506762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,68:0.53:128
chr19	45513146	rs150557566	GGCCTTC	G	980.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.118;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=1.577;NF=1;NR=17;PP=898;ReadPosRankSum=0.160;SC=AGGGGGTCTTGGCCTTCCTTG;SOR=0.495;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=2;TCR=42;TR=18;WE=45513159;WS=45513136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,27:0.46:59
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chr19	45528799	rs2288918	T	C	1149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=18;PP=743;ReadPosRankSum=2.458;SC=CCCTTCCCCGTTCCCCTGTAC;SOR=0.734;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=77;TCF=46;TCR=31;TR=42;WE=45528807;WS=45528789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,48:0.56:86
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chr19	45571903	rs36097205	G	C	562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.010;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=671;ReadPosRankSum=0.359;SC=CTCCGCTGCCGCTATGCTGGG;SOR=1.508;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=11;WE=45571911;WS=45571890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,15:0.39:38
chr19	45644720	rs66519628	AGGAAGAGGCAGCTCAGGCTCCC	A	2494.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.127;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=2.411;NF=1;NR=22;PP=2922;ReadPosRankSum=-1.023;SC=CTCGGCTTCCAGGAAGAGGCA;SOR=1.176;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=87;TCF=4;TCR=83;TR=23;WE=45644749;WS=45644710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,69:0.41:167
chr19	45649386	rs968445	A	G	2363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.849;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=1.046;NF=59;NR=41;PP=1215;ReadPosRankSum=-1.964;SC=CCTGTTGTGGACCTCAGTTTC;SOR=0.899;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=213;TCF=121;TCR=92;TR=100;WE=45649394;WS=45649376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,116:0.48:241
chr19	45649503	rs112250728	T	TGTAA	1167.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.267;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.093;NF=2;NR=17;PP=801;ReadPosRankSum=0.701;SC=TGGGGGGGCATGTAAGGTGTG;SOR=1.460;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=52;TCF=9;TCR=43;TR=19;WE=45649511;WS=45649493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,31:0.47:66
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chr19	45769386	rs2240671	G	C	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.130;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=12;PP=571;ReadPosRankSum=-0.730;SC=GTGCCTTGGGGAGGCCTGGGG;SOR=0.204;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=60;TCF=45;TCR=15;TR=37;WE=45769394;WS=45769376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,40:0.62:64
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chr19	45801337	rs138525840	T	TTCC	1261.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.18;ReadPosRankSum=0.463;SOR=0.830;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,34:0.44:78
chr19	45810035	rs4884	A	G	8039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=161;NR=117;PP=2965;SC=TCATGTCGTCAATGGACTGGC;SOR=0.955;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=278;TCF=161;TCR=117;TR=278;WE=45810057;WS=45810025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,306:1.00:306
chr19	45815248	rs10402747	T	C	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.963;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=355;ReadPosRankSum=-0.150;SC=GCCCAGGGTTTCCCCTGCTGC;SOR=0.859;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=69;TCF=22;TCR=47;TR=23;WE=45815256;WS=45815238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,28:0.36:77
chr19	45818628	rs377993	A	G	540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=1;PP=419;SC=CCCTACTTTGAAAAGCGGGGG;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=45818636;WS=45818618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	45818835	rs1133190	A	G	3738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=63;NR=49;PP=1966;SC=GCACGTAGTTAGGGTCCAGGT;SOR=0.708;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=113;TCF=63;TCR=50;TR=112;WE=45818843;WS=45818825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr19	45820927	rs12976956	G	A	516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=3;PP=252;SC=TGATACGCTCGCCTCAGCCTC;SOR=2.419;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=45820935;WS=45820917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	45850154	rs111497553	C	T	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.63;MQRankSum=0.282;QD=3.86;ReadPosRankSum=-1.383;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,2:0.22:9
chr19	45850167	.	G	C	538	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=25;MQ=57.15;NF=9;NR=13;PP=538;QD=26.0350551158;SC=TCCTTAGAATGCCACAGTCCC;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=26;TCF=10;TCR=16;TR=22;WE=45850175;WS=45850140;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:4,22:0.85:26
chr19	45856468	rs238417	G	C	3328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=53;PP=2412;SC=CCACCTCCCCGACCCCTCTCC;SOR=0.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=111;TCF=58;TCR=53;TR=111;WE=45856476;WS=45856458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr19	45858245	rs3916868	C	T	1571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.655;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=42;PP=1157;ReadPosRankSum=0.295;SC=CTCCTCCTCCCGGGCGTGTCT;SOR=1.793;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=55;TCF=13;TCR=42;TR=54;WE=45858253;WS=45858235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,59:0.95:62
chr19	45865002	rs171140	C	A	6727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=132;NR=101;PP=2965;SC=GTCTCCCCAGCCAATGAGCAC;SOR=0.904;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=233;TCF=132;TCR=101;TR=233;WE=45865010;WS=45864992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr19	45865191	rs3916823	CTTTT	C	2726.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.17;QD=43.98;SOR=2.457;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr19	45865217	rs238403	T	C	1751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=26;PP=619;SC=TTTGTTCAGATGGAGTCTTGC;SOR=2.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=33;WE=45865225;WS=45865207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	45867216	rs3916815	T	TG	1977.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=29;PP=1194;SC=GGAAAGGGACTGGGGGGCAGC;SOR=0.723;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=8;TCR=33;TR=36;WE=45867242;WS=45867206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr19	45868006	rs238405	A	T	1075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=4;PP=784;SC=GACTCACAGCAAGCAACAGAC;SOR=3.321;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=34;WE=45868014;WS=45867996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	45868309	rs238406	T	G	3114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=37;PP=2044;SC=CCTCATAGAATCGGCAGTGGG;SOR=1.015;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=56;TCR=37;TR=93;WE=45868317;WS=45868299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr19	45868478	rs238407	T	A	2106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=47;PP=1443;SC=CTTCAAACCCTGGTCTCCACA;SOR=1.778;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=21;TCR=47;TR=68;WE=45868486;WS=45868468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr19	45872036	rs1799783	C	T	1625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=26;PP=1221;SC=GGAGCTTGTGCTCATTGGAGG;SOR=0.804;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=26;TCR=26;TR=52;WE=45872044;WS=45872026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr19	45873942	rs3810366	G	C	3585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=57;NR=61;PP=2125;SC=CGCTAGGGCAGAGCCAATCGG;SOR=0.957;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=118;TCF=57;TCR=61;TR=118;WE=45873950;WS=45873932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr19	45918917	.	C	A	807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=0.000;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=22;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=17;PP=570;ReadPosRankSum=1.453;SC=AAAAAAAAAACAATTGTGGTT;SOR=0.770;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=70;TCF=36;TCR=34;TR=38;WE=45918925;WS=45918907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,40:0.51:78
chr19	45924692	rs41542613	G	A	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.67;ReadPosRankSum=-1.742;SOR=0.382;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr19	45971961	rs2282695	C	G	972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=23;PP=526;ReadPosRankSum=-0.567;SC=CCACCGCCGCCGCCTCCCAGG;SOR=0.720;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=90;TCF=40;TCR=50;TR=43;WE=45971969;WS=45971951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,49:0.48:102
chr19	45972039	rs2282696	A	C	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.14;ReadPosRankSum=1.252;SOR=0.813;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,15:0.36:42
chr19	45974369	.	G	A	1242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.237;ClippingRankSum=0.000;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.307;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=26;PP=789;ReadPosRankSum=0.056;SC=TGGCTCTTGGGGGTTCTGAAA;SOR=0.431;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=111;TCF=64;TCR=47;TR=55;WE=45974377;WS=45974359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,59:0.48:122
chr19	45974593	rs2276469	T	C	909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.890;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=24;PP=579;ReadPosRankSum=0.169;SC=AGAGGGGATGTTGAGGGGAGC;SOR=0.846;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=68;TCF=25;TCR=43;TR=36;WE=45974601;WS=45974583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,40:0.49:82
chr19	46025388	rs2301284	G	A	546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=14;NR=1;PP=343;SC=CATCCTTAGGGCCCTGATTGA;SOR=3.500;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=46025396;WS=46025378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	46027752	rs4802260	C	T	3066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=42;PP=2085;SC=CTCAATGTGACCCCTGGAATA;SOR=1.250;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=113;TCF=71;TCR=42;TR=113;WE=46027760;WS=46027742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr19	46032841	rs12971437	G	C	824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=25;PP=659;SC=GCGTGCTGGCGGGGACGCCTT;SOR=2.621;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=31;WE=46032849;WS=46032831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	46057081	rs3826860	A	G	7554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=145;NR=128;PP=2965;SC=CGCCCAGCTCAGCTGCCGCCT;SOR=0.832;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=273;TCF=145;TCR=128;TR=273;WE=46057089;WS=46057071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,289:1.00:289
chr19	46087812	rs62111684	C	G	951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.748;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=14;PP=521;ReadPosRankSum=0.754;SC=AGAAGTCCATCCCCTAAGCAA;SOR=0.595;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=90;TCF=60;TCR=30;TR=40;WE=46087820;WS=46087802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,47:0.46:102
chr19	46094597	rs3745820	G	A	4032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-3.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=407;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.518;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=85;PP=2189;ReadPosRankSum=2.081;SC=AGGCCACCCAGCCTTCCATGG;SOR=0.646;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=359;TCF=189;TCR=170;TR=175;WE=46094605;WS=46094587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:206,201:0.49:407
chr19	46118127	rs3816046	C	T	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.529;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=309;ReadPosRankSum=-0.761;SC=GGGGTCTTCACAGCCCGCAGC;SOR=1.101;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=18;WE=46118135;WS=46118117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,19:0.46:41
chr19	46119867	rs2241722	C	A	704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.304;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=24;PP=450;ReadPosRankSum=1.631;SC=TCCATCCCCTCCTCGCCCAGA;SOR=1.295;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=97;TCF=40;TCR=57;TR=38;WE=46119875;WS=46119857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,38:0.37:102
chr19	46121020	rs12985660	T	C	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=2.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.223;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=281;ReadPosRankSum=-1.088;SC=GGACATTCTCTTGCCTCAGGG;SOR=1.312;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=35;TCF=9;TCR=26;TR=16;WE=46121028;WS=46121010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr19	46127918	rs28365786	A	G	1326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=23;PP=728;ReadPosRankSum=-0.420;SC=GAAGGGAGGCAGAGCCAGGAG;SOR=0.747;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=118;TCF=71;TCR=47;TR=60;WE=46127926;WS=46127908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,67:0.51:132
chr19	46130191	rs1548026	T	G	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.339;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=279;ReadPosRankSum=0.471;SC=CGGCTGTTTGTGTTGTATGCT;SOR=0.146;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=21;WE=46130199;WS=46130181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,25:0.68:37
chr19	46130218	.	CTTTTTT	C	227.79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5142;FS=0.000;HP=20;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=0;NR=7;PP=77;SC=CTGAACTTTTCTTTTTTTTTT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=7;WE=46130231;WS=46130208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
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chr19	46141845	rs12151009	T	C	1881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.525;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=42;PP=1134;ReadPosRankSum=0.462;SC=TCTGGGATCATCATGGGCACA;SOR=0.625;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=184;TCF=91;TCR=93;TR=86;WE=46141853;WS=46141835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,94:0.48:196
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chr19	46185217	rs12709891	C	A	1889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=40;PP=1094;ReadPosRankSum=-1.145;SC=CGTGTCTGTTCAGTTAGCATG;SOR=0.716;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=187;TCF=98;TCR=89;TR=85;WE=46185225;WS=46185207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,96:0.47:205
chr19	46195051	rs61466254	G	GC	1779.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.337;HP=8;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.17;MQRankSum=1.958;NF=15;NR=30;PP=742;ReadPosRankSum=-0.628;SC=ATCTGCCCCTGCCCCCCCCGC;SOR=0.413;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=119;TCF=41;TCR=78;TR=45;WE=46195059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,82:0.44:185
chr19	46204938	rs4803847	C	T	2343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=18;PP=1778;SC=CTGGCATTCACTCTTGTTGGG;SOR=2.331;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=82;TCF=64;TCR=18;TR=81;WE=46204946;WS=46204928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr19	46205050	rs4803848	T	C	9886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=369;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=166;NR=158;PP=2965;SC=TCGCCCCCACTTCCAGAGAAG;SOR=0.699;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=325;TCF=166;TCR=159;TR=324;WE=46205058;WS=46205027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,369:1.00:369
chr19	46206098	rs62111730	G	A	2396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=24;PP=1569;SC=CTAGAGGTTGGGCTTGGGCTC;SOR=1.609;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=80;TCF=56;TCR=24;TR=78;WE=46206106;WS=46206088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr19	46206262	rs17850756	G	A	3388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.399;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=78;PP=1946;ReadPosRankSum=-1.519;SC=TACACAACTTGTGCCGCATTC;SOR=0.739;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=299;TCF=147;TCR=152;TR=153;WE=46206270;WS=46206252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,169:0.51:330
chr19	46214684	rs34505186	G	A	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.013;HP=5;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=33;PP=1029;ReadPosRankSum=-0.468;SC=GAATGGAGAAGAAAGTGAGAT;SOR=0.218;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=142;TCF=69;TCR=73;TR=68;WE=46214692;WS=46214674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,29:0.42:69
chr19	46214700	rs138545162	TA	T	569.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=1.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.04;ReadPosRankSum=1.483;SOR=0.954;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,38:0.60:63
chr19	46262286	rs725660	C	A	9303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=352;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.454;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=144;NR=163;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.109;SC=GAGTACCTGACCCAAGGTGAG;SOR=0.555;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=308;TCF=145;TCR=163;TR=307;WE=46262294;WS=46262276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,349:1.00:350
chr19	46264963	rs12982642	C	T	2340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.937;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=55;PP=1280;ReadPosRankSum=0.070;SC=CCCCCAAAGACCCTCCTGAGT;SOR=0.760;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=237;TCF=118;TCR=119;TR=109;WE=46264971;WS=46264953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,121:0.46:265
chr19	46268902	rs2341097	C	T	4671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=66;PP=2577;SC=AGCCTCAGCACGGTGTGGGGG;SOR=0.827;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=151;TCF=85;TCR=66;TR=151;WE=46268910;WS=46268892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr19	46269313	rs2014377	G	C	3752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=68;PP=2194;SC=CCCTGCTGCAGGGCCACACCC;SOR=0.857;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=133;TCF=65;TCR=68;TR=133;WE=46269321;WS=46269303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr19	46282890	rs2070737	A	T	489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=11;PP=347;SC=CCCACCTGCCACACCACGCCC;SOR=2.049;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=15;WE=46282898;WS=46282880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	46285362	rs149612963	G	GC	387.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=10;NR=8;PP=500;SC=CTGCCATCCTGCCCCCCCAAC;SOR=1.765;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=13;TCR=10;TR=18;WE=46285370;WS=46285352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	46288706	rs3760843	A	T	650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=3;PP=403;SC=GAGGTCTTGTACTGAGACACT;SOR=2.200;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=46288714;WS=46288696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	46289392	rs8110017	G	C	4743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=113;NR=56;PP=2965;SC=GGGCCAGGGGGGGGTGCGGGT;SOR=1.426;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=169;TCF=113;TCR=56;TR=169;WE=46289400;WS=46289382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr19	46289503	rs8109951	C	T	8499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=136;NR=157;PP=2965;SC=GTGGAGAGAGCGGGGCGCCCC;SOR=0.854;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=293;TCF=136;TCR=157;TR=293;WE=46289511;WS=46289493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,320:1.00:320
chr19	46294136	rs72626215	G	A	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=151;ReadPosRankSum=-0.671;SC=AGGCAGAGAAGTTGGGGGCTC;SOR=0.818;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=37;TCF=28;TCR=9;TR=12;WE=46294144;WS=46294126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,12:0.31:39
chr19	46313825	rs10407137	A	T	1866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=39;NR=20;PP=974;SC=GCCCCCACTGACCCTGATGCC;SOR=1.226;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=39;TCR=20;TR=59;WE=46313833;WS=46313815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr19	46318963	rs3810331	C	A	3135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=56;PP=1901;SC=CTCCTGGTGACCGGGGAAGGA;SOR=0.779;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=56;TCR=56;TR=112;WE=46318971;WS=46318953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr19	46319415	rs1132645	G	C	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.685;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=7;PP=134;ReadPosRankSum=1.808;SC=CTGGGGCCGGGGCCAAGGTCA;SOR=0.275;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=22;TCF=9;TCR=13;TR=14;WE=46319423;WS=46319405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr19	46320041	rs74821481	G	T	1245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=19;PP=1013;SC=GGTACCTGGTGGGGGGAAGGG;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=22;TCR=19;TR=41;WE=46320049;WS=46320031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr19	46326200	rs12976060	A	G	1643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=32;PP=995;SC=TGGGGAGCTGAGGGCAAGCTC;SOR=1.692;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=16;TCR=32;TR=48;WE=46326208;WS=46326190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr19	46327166	rs11671524	G	A	2694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=46;PP=1426;SC=CCAGACCCAGGGTGAGAGCTT;SOR=1.712;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=70;TCF=24;TCR=46;TR=69;WE=46327174;WS=46327156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr19	46327185	rs7252416	G	C	1976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=35;PP=1075;SC=TTAGGGGAGGGTCAGGTGTTG;SOR=2.461;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=11;TCR=35;TR=46;WE=46327193;WS=46327175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr19	46327209	rs11284049	CT	C	945.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=21;PP=833;SC=GGCAGGGTGGCTTGCGGGGCA;SOR=3.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=21;WE=46327217;WS=46327199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	46329438	rs7246155	G	A	921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=7;PP=623;SC=GGCCCAGAGCGCGGACACAGC;SOR=2.093;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=28;WE=46329446;WS=46329428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	46329781	rs28362500	GT	G	1805.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=40;PP=1802;SC=CTGGTCCCCAGTGCAGGAGGC;SOR=3.912;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=41;WE=46329789;WS=46329771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr19	46331302	rs4239535	C	G	814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=20;PP=546;SC=CAAGCCCCTGCTTATAAAGCT;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=25;WE=46331310;WS=46331292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	46332194	rs3745929	C	T	2466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=26;PP=1569;SC=GGAAGCCTCTCGGGGACAGGA;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=55;TCR=26;TR=81;WE=46332202;WS=46332184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr19	46333632	rs4516331	G	A	762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=20;PP=580;SC=GTGGGTAAGAGGAAGGAAGAG;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=46333640;WS=46333622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	46334955	rs4803866	C	T	1228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=27;PP=763;SC=CACAAAACCTCGTTTAAATCC;SOR=1.662;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=13;TCR=27;TR=40;WE=46334963;WS=46334945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr19	46338492	rs7256192	G	A	3879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=60;PP=2383;SC=AGGACCTGTGGGATGCCCAGG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=67;TCR=60;TR=127;WE=46338500;WS=46338482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr19	46366279	rs34086257	C	G	1473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.188;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=42;PP=902;ReadPosRankSum=-2.237;SC=GAGCCTCCTCCTTTCGTCTCC;SOR=0.565;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=174;TCF=73;TCR=101;TR=75;WE=46366287;WS=46366269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,79:0.43:183
chr19	46367901	rs1363538	T	C	2562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=53;PP=1456;SC=CTTGGGCAGCTGAGGAACTGG;SOR=1.237;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=36;TCR=53;TR=89;WE=46367909;WS=46367891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr19	46387344	rs11550348	G	A	926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.343;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=19;PP=470;ReadPosRankSum=-0.946;SC=CGCCCTGCATGAAGGCCCAGG;SOR=0.576;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=147;TCF=89;TCR=58;TR=45;WE=46387352;WS=46387334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,51:0.32:158
chr19	46387503	rs3745926	T	C	2905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.305;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=63;PP=1807;ReadPosRankSum=-1.393;SC=GGGTGTCTTCTAGCCGCTCCC;SOR=0.622;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=295;TCF=151;TCR=144;TR=134;WE=46387511;WS=46387493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:177,150:0.46:327
chr19	46394100	rs142323830	C	T	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.563;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=69;ReadPosRankSum=-0.122;SC=CCTTGGGGGCCGGTGGGGGCA;SOR=0.722;SbPval=0.1;Source=Platypus;TC=33;TCF=14;TCR=19;TR=10;WE=46394108;WS=46394090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,12:0.33:36
chr19	46394187	rs62111265	C	T	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=-1.226;NF=11;NR=4;PP=148;ReadPosRankSum=0.222;SC=GGGTTCCTGGCAGAAGGGGCA;SOR=0.804;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=41;TCF=28;TCR=13;TR=15;WE=46394195;WS=46394177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,16:0.38:42
chr19	46394322	rs114387602	G	A	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=1.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.80;ReadPosRankSum=0.586;SOR=1.218;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,12:0.33:36
chr19	46404579	rs10423899	A	G	4958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=81;PP=2965;SC=CGTAGCGCTGAGGGCAGGCGC;SOR=0.749;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=166;TCF=85;TCR=81;TR=166;WE=46404587;WS=46404569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr19	46417429	rs66529687	G	A	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=241;ReadPosRankSum=-0.776;SC=GGAGTTCTGGGGGCCAGAAAT;SOR=0.627;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=44;TCF=30;TCR=14;TR=19;WE=46417437;WS=46417419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,22:0.44:50
chr19	46443739	rs28742045	T	G	6621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=124;NR=113;PP=2965;SC=AGCCGTAACTTGCCAGCGTGT;SOR=0.701;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=238;TCF=125;TCR=113;TR=237;WE=46443747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr19	46443886	rs1047061	C	A	2121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=30;PP=1488;SC=CCGCGGCTGGCAGCACATCCG;SOR=0.807;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=37;TCR=30;TR=67;WE=46443894;WS=46443876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr19	46498353	rs892217	C	G	2316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=50;NR=22;PP=1131;SC=GCATGCACACCCGGCTCTCCC;SOR=1.338;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=50;TCR=22;TR=72;WE=46498361;WS=46498343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr19	46498827	rs746401	G	A	939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.86;SOR=2.030;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	46498835	rs55951953	C	T	859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.99;SOR=2.531;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	46511548	rs2287305	T	C	2511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.16;SOR=1.251;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr19	46511617	rs9676886	C	T	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.939;HP=5;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=154;ReadPosRankSum=1.312;SC=TCATGCACCGCGGGGCCCATG;SOR=1.524;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=11;WE=46511625;WS=46511607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,12:0.34:35
chr19	46520728	rs11669048	G	C	624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=15;PP=406;SC=GGCAATTGTAGCTCACGGCAG;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=46520736;WS=46520718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	46664168	rs2270403	G	A	5649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=101;PP=2965;SC=CCAGGGGGTCGGGGGAAGGGA;SOR=1.118;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=181;TCF=80;TCR=101;TR=181;WE=46664176;WS=46664147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr19	46733912	rs2286802	A	G	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=1.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.79;ReadPosRankSum=-1.113;SOR=0.268;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr19	46733916	rs2286803	G	A	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=1.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.79;ReadPosRankSum=-0.325;SOR=0.377;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
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chr19	46814003	rs79263603	C	G	695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.978;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=432;ReadPosRankSum=2.612;SC=TTATTGTCATCATTACTTTTT;SOR=0.551;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=18;TCR=49;TR=29;WE=46814011;WS=46813993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,33:0.42:78
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chr19	46815310	rs12461322	G	A	2428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.063;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=49;PP=1486;ReadPosRankSum=-1.650;SC=AATCCTTCTCGACATCTTGCT;SOR=0.853;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=249;TCF=136;TCR=113;TR=114;WE=46815318;WS=46815287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,125:0.47:265
chr19	46815499	rs8101480	T	C	8618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=151;NR=155;PP=2965;SC=TGGACTCCGATGCGGTCAGCA;SOR=0.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=306;TCF=151;TCR=155;TR=306;WE=46815507;WS=46815489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,327:1.00:327
chr19	46815703	rs66668057	ATATT	A	4108.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=26;PP=2051;SC=CAGTCCCCAGATATTTCTCTC;SOR=0.758;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=39;TCF=12;TCR=27;TR=38;WE=46815719;WS=46815693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr19	46815711	rs116478928	C	T	4118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=41;NR=26;PP=1121;SC=AGATATTTCTCTCCCCATTTG;SOR=0.780;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=73;TCF=46;TCR=27;TR=67;WE=46815719;WS=46815693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr19	46815969	.	GGT	G	161	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=0;NR=9;PP=161;QD=18.3333333333;SC=TGTGTGGACAGGTGTGTGTGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=9;WE=46815978;WS=46815959;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:28,9:0.24:37
chr19	46815991	.	T	TGC	212.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.678;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=5.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.60;ReadPosRankSum=-1.466;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
chr19	46815993	rs73940660	T	C	427.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.80;ReadPosRankSum=-2.300;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr19	46823702	rs3764609	A	G	8477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=136;NR=147;PP=2965;SC=TACCCCAGCCAGGTGGAAGAG;SOR=0.777;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=283;TCF=136;TCR=147;TR=283;WE=46823710;WS=46823692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,321:1.00:321
chr19	46823751	rs3764610	C	T	8453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=139;NR=150;PP=2965;SC=CGGAGCAACACTCTCGCAGAC;SOR=0.806;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=289;TCF=139;TCR=150;TR=289;WE=46823759;WS=46823741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,315:1.00:315
chr19	46828719	rs117712717	G	C	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=141;ReadPosRankSum=0.986;SC=CTACCCTTGAGCTGCAGACTG;SOR=0.264;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=10;WE=46828727;WS=46828709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr19	46857257	rs41275764	G	A	654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.346;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=19;PP=443;ReadPosRankSum=1.435;SC=GTGAGCTGGGGAGTGGGCCAG;SOR=0.269;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=49;TCF=14;TCR=35;TR=30;WE=46857265;WS=46857247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,30:0.58:52
chr19	46857286	rs2075144	G	A	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.447;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=115;ReadPosRankSum=-2.356;SC=CCTGAGCCAGGCAGATACTGA;SOR=0.214;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=10;WE=46857294;WS=46857276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr19	46878989	rs4239538	G	A	1279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.925;NF=21;NR=33;PP=645;ReadPosRankSum=0.977;SC=TGGTGGACTCGCTGGACATCG;SOR=0.669;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=129;TCF=49;TCR=80;TR=54;WE=46878997;WS=46878979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,63:0.46:138
chr19	46887007	rs1024781	G	C	6937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=147;NR=98;PP=2965;SC=CTCTCGGCCCGTCCCTCTCCG;SOR=1.106;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=245;TCF=147;TCR=98;TR=245;WE=46887015;WS=46886997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,262:1.00:262
chr19	46887199	rs4803937	A	G	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=387;ReadPosRankSum=1.087;SC=TCAGGTCTGCACAGAGTGGGA;SOR=0.741;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=52;TCF=12;TCR=40;TR=23;WE=46887207;WS=46887189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,26:0.43:60
chr19	46892111	rs759290	C	T	1415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.53;SOR=3.664;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	46892111	.	CGAACACC	TGAACACC,TGAACACG	462	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=5,2;NR=33,9;PP=462,147;QD=13.072926646;SC=AAGAACATGACGAACACCCCC;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=5;TCR=33;TR=38,11;WE=46892126;WS=46892101;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:38
chr19	46892118	rs3815505	C	G	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=2.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.76;ReadPosRankSum=0.839;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,13:0.37:35
chr19	46892168	rs8106745	T	C	306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=9;PP=187;SC=AGCCTGTGAGTGCTGACCAGC;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=46892176;WS=46892158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	46893238	rs759291	A	C	3118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.66;SOR=1.066;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr19	46893465	rs2311213	A	G	3290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=47;PP=1937;SC=GGTAAGGGGCAGGGGTAGGTT;SOR=0.941;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=64;TCR=47;TR=111;WE=46893473;WS=46893455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr19	46915702	rs35262679	C	T	3336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.818;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=77;PP=2084;ReadPosRankSum=1.271;SC=TCTTGCCCCGCCGCGGGCCCT;SOR=0.750;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=306;TCF=148;TCR=158;TR=149;WE=46915722;WS=46915692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:180,160:0.47:340
chr19	46971773	rs45575940	T	G	2472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=50;PP=1494;ReadPosRankSum=-1.063;SC=GACTTGGTACTTCTTCCTTGT;SOR=0.709;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=204;TCF=113;TCR=91;TR=111;WE=46971781;WS=46971763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,120:0.54:222
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chr19	47104678	rs201296349	C	A	879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.13;ReadPosRankSum=-1.223;SOR=0.653;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,42:0.63:67
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chr19	47109011	rs3729510	T	C	1722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=8;PP=1180;SC=GGGCCGAGGGTCTGGGCTGAG;SOR=2.794;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=43;TCR=8;TR=51;WE=47109019;WS=47109001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr19	47111663	rs3729760	T	C	7043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=132;NR=92;PP=2965;SC=AGGGAGCCTCTCTCAGGGTGA;SOR=0.947;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=224;TCF=132;TCR=92;TR=224;WE=47111671;WS=47111653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr19	47112648	rs10113	T	C	7467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=155;PP=2965;SC=CTTCCATCCATGTCTTCCAAG;SOR=1.147;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=262;TCF=107;TCR=155;TR=262;WE=47112656;WS=47112638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,284:1.00:284
chr19	47112740	rs710889	C	T	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=172;ReadPosRankSum=0.917;SC=TGGCTCTCCTCCATTTTGGTT;SOR=0.963;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=37;TCF=8;TCR=29;TR=12;WE=47112748;WS=47112730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,13:0.32:40
chr19	47124714	rs2229129	T	G	4138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=53;PP=2436;SC=CCCTCCTCCCTGAGGCGAGCT;SOR=0.875;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=81;TCR=53;TR=134;WE=47124722;WS=47124704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr19	47126614	rs12459883	C	G	1948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=45;NR=18;PP=1317;SC=CACGATGTCTCACCTCTTTTG;SOR=1.751;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=45;TCR=18;TR=63;WE=47126622;WS=47126604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr19	47127324	rs2229128	C	G	2475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=51;PP=1799;SC=CCAGTCCGGTCACCAGCACCG;SOR=1.302;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=82;TCF=31;TCR=51;TR=82;WE=47127332;WS=47127314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr19	47137481	rs3833245	GAT	G	1199.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.607;NF=2;NR=21;PP=882;ReadPosRankSum=0.364;SC=CCCGGGTGGAGATGTCACCGC;SOR=0.661;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=50;TCF=2;TCR=48;TR=23;WE=47137490;WS=47137471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,33:0.45:74
chr19	47138014	rs3745623	C	G	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.62;ReadPosRankSum=0.117;SOR=0.550;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,23:0.38:61
chr19	47151724	rs76081019	A	G	3656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=62;PP=2207;ReadPosRankSum=-0.462;SC=GGGGAGCCCAAGCAAATCCCC;SOR=0.702;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=303;TCF=183;TCR=120;TR=157;WE=47151732;WS=47151714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,173:0.53:326
chr19	47177913	rs314665	A	G	8761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=166;NR=136;PP=2965;SC=CTCCCAGCGCACGTCGTCACT;SOR=0.804;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=302;TCF=166;TCR=136;TR=302;WE=47177921;WS=47177903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,340:1.00:340
chr19	47178202	rs45445792	T	A	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=212;ReadPosRankSum=-1.206;SC=GAAACCTACATCCTTCACAAC;SOR=0.105;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=16;TCF=11;TCR=5;TR=13;WE=47178210;WS=47178192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,12:0.80:15
chr19	47193850	rs314671	T	C	3429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.979;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=43;PP=2026;ReadPosRankSum=-0.200;SC=GGCGGCCTGGTGGTTACCTGC;SOR=0.939;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=123;TCF=79;TCR=44;TR=121;WE=47193858;WS=47193840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,129:0.99:130
chr19	47200618	rs10413222	C	T	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.438;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=124;ReadPosRankSum=-0.733;SC=GCACCTACCCCACGCCGTAAC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=8;WE=47200626;WS=47200608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr19	47212593	rs10423365	A	G	1843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=41;PP=1121;ReadPosRankSum=0.921;SC=AAGAACTGGGAAGAGAAGGCC;SOR=0.675;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=142;TCF=69;TCR=73;TR=80;WE=47212601;WS=47212583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,89:0.55:161
chr19	47214411	rs432157	C	T	989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=6.667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.00;ReadPosRankSum=1.080;SOR=0.305;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,48:0.48:99
chr19	47223949	rs313841	G	A	2047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=47;PP=1197;ReadPosRankSum=0.463;SC=TGGCCTCCTCGTGCTTCTTGC;SOR=0.672;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=183;TCF=97;TCR=86;TR=96;WE=47223957;WS=47223939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,103:0.52:199
chr19	47228985	rs313844	G	C	491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.13;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	47228985	.	GCCCCT	CCCCCC,CCCCCT	154	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.05;FR=0.5000,0.5000;HP=4;HapScore=3;MGOF=4;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=0,0;NR=4,14;PP=11,154;QD=16.1169687156;SC=GGGCTTGAGGGCCCCTGTCTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=4,14;WE=47228998;WS=47228975;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.29:14
chr19	47228990	rs3848529	T	C	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.712;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.48;ReadPosRankSum=0.165;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr19	47236268	rs11666600	G	C	2565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=46;PP=1447;ReadPosRankSum=2.072;SC=GGAACAGAGAGACACACCTGC;SOR=0.699;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=234;TCF=134;TCR=100;TR=105;WE=47236276;WS=47236258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,127:0.46:275
chr19	47239919	rs2270685	G	C	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=2.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.98;ReadPosRankSum=0.056;SOR=0.375;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,26:0.46:57
chr19	47241659	rs12976352	C	T	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.613;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=232;ReadPosRankSum=-0.273;SC=GTGGAAGAAACCACTCCCTGG;SOR=0.148;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=16;WE=47241667;WS=47241649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
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chr19	47282162	rs2070246	G	A	4542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=411;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.222;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=115;PP=2675;ReadPosRankSum=-1.377;SC=CCACAGGGGCGTACCTGATCA;SOR=0.932;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=379;TCF=176;TCR=203;TR=205;WE=47282170;WS=47282152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:191,220:0.54:411
chr19	47282240	rs3745609	A	G	2667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=6.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.01;ReadPosRankSum=1.220;SOR=0.312;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,71:0.56:127
chr19	47282245	rs56385874	C	T	2600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=4.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.02;ReadPosRankSum=0.306;SOR=0.348;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,67:0.59:113
chr19	47285589	rs1644343	A	C	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.253;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=97;ReadPosRankSum=-0.013;SC=CTCTGGCAGCAGACCGACCCT;SOR=0.740;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=46;TCF=28;TCR=18;TR=13;WE=47285597;WS=47285579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,13:0.29:45
chr19	47285802	rs140908383	G	C	2370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.031;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=61;PP=1165;ReadPosRankSum=0.702;SC=CTGCCCCACGGGCACCTGTGG;SOR=0.848;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=253;TCF=123;TCR=130;TR=113;WE=47285810;WS=47285792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,125:0.46:274
chr19	47287169	rs313852	G	A	1802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=14;PP=1229;SC=AAGAGCCTGGGCACCTGGGGT;SOR=2.093;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=45;TCR=14;TR=59;WE=47287177;WS=47287159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr19	47287939	rs313853	T	C	764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.359;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=20;PP=471;ReadPosRankSum=-0.535;SC=TGCACGCAAATACAGCCCCTA;SOR=0.235;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=44;TCF=10;TCR=34;TR=28;WE=47287947;WS=47287929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,32:0.68:47
chr19	47342717	rs312186	C	T	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.002;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=9;PP=374;ReadPosRankSum=-1.069;SC=CCTCTCCCGCCGTACCTCCAC;SOR=0.985;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=73;TCF=47;TCR=26;TR=28;WE=47342725;WS=47342707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,28:0.37:75
chr19	47342867	rs312185	A	C	1871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=45;PP=1234;ReadPosRankSum=0.700;SC=AGCAACGGAGATTGCCAGGAC;SOR=0.718;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=180;TCF=86;TCR=94;TR=85;WE=47342875;WS=47342857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,92:0.46:200
chr19	47524151	.	GCC	G	210.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.166;ClippingRankSum=-0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=17.56;ReadPosRankSum=0.901;SOR=1.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr19	47543774	rs3745615	G	A	1287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.225;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=26;PP=786;ReadPosRankSum=1.276;SC=TCCACGGACAGGACGCCACGA;SOR=0.453;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=116;TCF=61;TCR=55;TR=58;WE=47543782;WS=47543764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,63:0.47:133
chr19	47545943	rs2303105	T	C	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=50;ReadPosRankSum=0.790;SC=TGTAAGTGCCTCAGGGTGGGG;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=5;WE=47545951;WS=47545935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,5:0.24:21
chr19	47548327	rs10423289	A	C,T	402.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;QD=26.85;SOR=4.047;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,8,7:0.53,0.47:15
chr19	47548678	rs889169	G	A	1234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.787;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=35;PP=798;ReadPosRankSum=-2.520;SC=GGGGCCTGGCGCCTCCCGGGG;SOR=0.990;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=91;TCF=36;TCR=55;TR=55;WE=47548686;WS=47548668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,57:0.60:95
chr19	47549155	rs889170	AT	GC	3434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.531;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=32;PP=2826;ReadPosRankSum=1.466;SC=ACACGAACCAATACTCTGCAT;SOR=0.616;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=187;TCF=115;TCR=72;TR=81;WE=47549164;WS=47549145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,89:0.44:200
chr19	47549454	rs11083857	C	T	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=14;PP=303;ReadPosRankSum=0.794;SC=GCCGCCAGGCCCACGGCGTAC;SOR=0.756;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=15;TCR=24;TR=23;WE=47549462;WS=47549444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,24:0.51:47
chr19	47549791	rs1862499	A	G	968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.41;ReadPosRankSum=0.442;SOR=0.766;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,50:0.49:103
chr19	47584699	rs3745619	C	T	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.741;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=113;ReadPosRankSum=-0.890;SC=AGGCAGGCCACAGCACTGAGG;SOR=0.275;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=8;WE=47584707;WS=47584689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr19	47585517	rs7250850	G	C	3813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=361;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.234;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=70;PP=2516;ReadPosRankSum=0.996;SC=GCTTCTTTGGGAGTTCGATGT;SOR=0.829;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=320;TCF=177;TCR=143;TR=158;WE=47585525;WS=47585507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,176:0.49:361
chr19	47585698	rs7251104	G	C	644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=22;PP=490;ReadPosRankSum=-0.518;SC=GAAGACAGGTGTAGGAAGGGC;SOR=0.522;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=4;TCR=47;TR=24;WE=47585706;WS=47585688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,25:0.45:55
chr19	47587772	rs2303107	G	A	1855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.204;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=49;PP=1211;ReadPosRankSum=0.462;SC=AGATGGGATCGGGGTTAATAA;SOR=0.804;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=160;TCF=64;TCR=96;TR=81;WE=47587780;WS=47587762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,87:0.49:176
chr19	47588202	rs7248181	G	T	618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.700;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=2;PP=471;ReadPosRankSum=1.669;SC=CAGCCCTTTGGGGGGTGGCTG;SOR=2.132;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=64;TCF=52;TCR=12;TR=26;WE=47588210;WS=47588192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,28:0.40:70
chr19	47597102	rs10408163	T	C	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=96;ReadPosRankSum=1.438;SC=GGGGATTAAATTAATACCTGA;SOR=0.275;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=8;WE=47597110;WS=47597099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr19	47634313	rs177918	T	G	2002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=34;NR=32;PP=1062;SC=TTGAGGCCGCTAGGGTCTGGA;SOR=0.920;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=34;TCR=32;TR=66;WE=47634321;WS=47634303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
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chr19	47658482	rs11670191	G	A	2494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.048;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=51;PP=1319;ReadPosRankSum=-0.827;SC=TATGTGTAACGTGGGGGCAGA;SOR=0.729;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=187;TCF=102;TCR=85;TR=105;WE=47658490;WS=47658472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,121:0.56:218
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chr19	47769803	.	C	T	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=142;ReadPosRankSum=-0.624;SC=GTGGATGTGCCTCGGGGCTTA;SOR=0.204;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=9;WE=47769811;WS=47769793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr19	47773756	rs71363731	G	A	2144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.544;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=40;PP=1254;ReadPosRankSum=-1.463;SC=CTGGGAGTCAGGGGTGGTGTG;SOR=0.636;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=165;TCF=93;TCR=72;TR=90;WE=47773764;WS=47773746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,99:0.54:182
chr19	47823038	rs4467185	G	A	5989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=128;NR=75;PP=2965;SC=TTCCCCTTAGGACTCCTTCAA;SOR=1.226;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=204;TCF=129;TCR=75;TR=203;WE=47823046;WS=47823028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr19	47823484	rs4804049	T	C	7184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=131;NR=127;PP=2965;SC=TCCGAGGGGCTGGCTTGGCCT;SOR=0.715;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=258;TCF=131;TCR=127;TR=258;WE=47823492;WS=47823474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,275:1.00:275
chr19	47823871	rs11880097	G	T	7251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=139;NR=107;PP=2965;SC=TGCTGCTGAAGAAGCTGGACT;SOR=0.903;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=246;TCF=139;TCR=107;TR=246;WE=47823879;WS=47823861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,270:1.00:270
chr19	47856336	rs12984558	C	T	3060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.479;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=59;PP=1864;ReadPosRankSum=-0.873;SC=AGACCACCACCGGGCTCCCAG;SOR=0.634;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=213;TCF=113;TCR=100;TR=123;WE=47856344;WS=47856326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,138:0.58:238
chr19	47885180	rs889167	A	G	5356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=124;NR=63;PP=2965;SC=ATTTGGGTGCAGGTAGACCTG;SOR=1.486;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=187;TCF=124;TCR=63;TR=187;WE=47885188;WS=47885170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr19	47922426	rs62130535	G	A	212.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=6;PP=128;SC=CTGACGGCCCGCGGTGTTGAC;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=47922434;WS=47922416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	47933190	rs142312177	A	AG	1817.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=17;PP=1387;SC=GACACAGAACAGGGCAATCAA;SOR=1.371;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=36;TCF=18;TCR=18;TR=35;WE=47933198;WS=47933180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr19	47933728	rs8104926	A	G	2759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=49;PP=1515;SC=CGTGTCTGCGAGGCAGAGACA;SOR=1.345;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=34;TCR=49;TR=83;WE=47933736;WS=47933718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr19	47935352	rs4801722	T	C	4390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=94;NR=51;PP=2557;SC=CACCTCATTTTGGCAGGATCC;SOR=1.421;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=145;TCF=94;TCR=51;TR=145;WE=47935360;WS=47935342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr19	47944710	rs2254560	T	C	1944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=26;PP=993;SC=GTGCAGGGGGTAAGGGGGAGG;SOR=1.011;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=54;TCF=28;TCR=26;TR=54;WE=47944718;WS=47944700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr19	47978671	rs2272295	G	A	1281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.846;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=25;PP=645;ReadPosRankSum=0.057;SC=GTGCATGGGTGCTTAAGAGGC;SOR=0.486;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=142;TCF=86;TCR=56;TR=60;WE=47978679;WS=47978661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,69:0.43:161
chr19	47980153	rs2293424	G	A	743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=15;PP=384;ReadPosRankSum=-1.133;SC=GGTCACTGCCGGGCAGGAGAA;SOR=0.635;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=74;TCF=39;TCR=35;TR=33;WE=47980161;WS=47980143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,38:0.44:86
chr19	47986924	rs16972230	A	G	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.063;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=20;PP=458;ReadPosRankSum=0.430;SC=GGCTACCGCAATGATCATGCC;SOR=0.525;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=58;TCF=16;TCR=42;TR=28;WE=47986932;WS=47986914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,32:0.49:65
chr19	47991451	rs10853789	A	G	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.838;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.56;ReadPosRankSum=1.408;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr19	47996010	rs11881195	C	T	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.726;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=14;PP=447;ReadPosRankSum=-0.529;SC=GGGAGAGAGACGGTGCTGGCA;SOR=0.833;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=107;TCF=63;TCR=44;TR=38;WE=47996018;WS=47996000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,41:0.35:117
chr19	48000071	rs72265015	CCTT	C	1638.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.904;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.303;NF=14;NR=15;PP=1169;ReadPosRankSum=2.951;SC=TCCAACCCCTCCTTCTGACAT;SOR=0.564;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=53;TCF=29;TCR=24;TR=29;WE=48000081;WS=48000061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,43:0.55:78
chr19	48017957	rs34206657	C	T	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.752;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=99;ReadPosRankSum=-1.027;SC=GTCCCCTCTGCCGCCTCAGGC;SOR=1.179;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=9;WE=48017965;WS=48017947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr19	48018257	rs71363738	G	T	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.636;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=427;ReadPosRankSum=0.697;SC=ACTCAGCCGCGGCCGGGCCGC;SOR=1.688;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=42;TCF=8;TCR=34;TR=22;WE=48018265;WS=48018247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,23:0.55:42
chr19	48032946	rs3810319	G	C	1263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.626;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=32;PP=928;ReadPosRankSum=1.368;SC=CCAGGACCAGGTGGGGGAAGA;SOR=0.804;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=130;TCF=61;TCR=69;TR=55;WE=48032954;WS=48032936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,61:0.42:144
chr19	48041602	rs200669663	G	A	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.166;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=380;ReadPosRankSum=-0.912;SC=TGCAGGGCCAGGCTCCCCAGC;SOR=1.128;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=75;TCF=51;TCR=24;TR=26;WE=48041610;WS=48041592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,30:0.35:86
chr19	48042976	rs12972658	C	T	1137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.414;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=15;PP=635;ReadPosRankSum=1.290;SC=GCCATGCTCCCTATGTGTCGG;SOR=0.343;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=79;TCF=55;TCR=24;TR=46;WE=48042984;WS=48042966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,52:0.60:86
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chr19	48047278	rs2081893	T	C	902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.81;ReadPosRankSum=0.579;SOR=0.602;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,46:0.50:92
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chr19	48182568	rs2911005	C	T	1288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.114;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=22;PP=693;ReadPosRankSum=1.367;SC=CCACCTTTCCCGGCCTGCAGC;SOR=0.513;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=127;TCF=79;TCR=48;TR=53;WE=48182576;WS=48182558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,64:0.43:149
chr19	48182946	rs2911006	T	C	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.918;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=12;PP=410;ReadPosRankSum=0.815;SC=AGGGCCCGCCTACCGTGCTGA;SOR=0.520;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=39;TCR=25;TR=30;WE=48182954;WS=48182936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,33:0.47:70
chr19	48183114	rs2914438	A	G	1232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=26;PP=736;ReadPosRankSum=-0.154;SC=CGGCGGCCACACTGGGCCTGG;SOR=0.734;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=95;TCF=47;TCR=48;TR=51;WE=48183122;WS=48183104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,58:0.55:106
chr19	48184547	rs889337	G	A	1774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.175;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=43;PP=1172;ReadPosRankSum=1.112;SC=AGCAGGGCGGGGCAAGGGAGC;SOR=0.587;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=158;TCF=81;TCR=77;TR=84;WE=48184555;WS=48184537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,88:0.50:175
chr19	48184642	rs58014830	TG	T	309.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.151;HP=8;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=147;ReadPosRankSum=0.510;SC=CTGTGGCAGCTGGGGGGGGAA;SOR=1.739;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=10;WE=48184650;WS=48184632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr19	48185147	rs2303755	G	A	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.242;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=178;ReadPosRankSum=0.857;SC=AACCCTGGGAGCGTCAATAGG;SOR=1.034;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=37;TCF=24;TCR=13;TR=16;WE=48185155;WS=48185137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr19	48197218	rs2914428	A	C	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=48;ReadPosRankSum=1.279;SC=GAGGGAGGGAAGGGCAGCCGT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=4;WE=48197226;WS=48197214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr19	48198796	rs2241613	C	G	1298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.932;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=20;PP=471;ReadPosRankSum=-0.915;SC=GGAACTGGGGCTGGCAGGGGC;SOR=0.937;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=62;TCF=28;TCR=34;TR=36;WE=48198804;WS=48198786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,39:0.57:69
chr19	48198817	rs2241612	T	A	1266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.968;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=17;PP=434;ReadPosRankSum=-0.238;SC=AGGGAGACACTGGAAGACGCG;SOR=0.850;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=55;TCF=23;TCR=32;TR=29;WE=48198825;WS=48198807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,33:0.52:63
chr19	48198833	rs2241611	G	C	1169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=15;PP=412;ReadPosRankSum=-1.741;SC=ACGCGGACAGGATGAAGCTGG;SOR=0.735;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=47;TCF=19;TCR=28;TR=26;WE=48198841;WS=48198823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,30:0.56:54
chr19	48202125	rs7248050	C	G	1128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.169;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=14;PP=813;ReadPosRankSum=-0.762;SC=AGCCGCAGGTCCACGGTGCGC;SOR=1.162;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=74;TCF=46;TCR=28;TR=41;WE=48202133;WS=48202115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,44:0.53:83
chr19	48239557	rs11669035	T	G	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.316;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.770;NF=11;NR=1;PP=165;ReadPosRankSum=-0.992;SC=GAGTGGGGCCTGCAGCCTGTG;SOR=1.721;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=12;WE=48239565;WS=48239547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,12:0.41:29
chr19	48244045	rs34197064	C	CT	103.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=1.678;NF=3;NR=0;PP=53;ReadPosRankSum=-1.850;SC=CAGCTACCCCCGAGCTTCTCC;SOR=1.075;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=3;WE=48244053;WS=48244035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr19	48244194	rs7255434	A	G	2050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.561;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=32;PP=1096;ReadPosRankSum=-0.516;SC=CGAAGCTGCTAGAGGCACTGG;SOR=0.607;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=146;TCF=91;TCR=55;TR=80;WE=48244202;WS=48244184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,96:0.55:176
chr19	48244401	rs35910701	G	A	3622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=349;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=75;PP=2368;ReadPosRankSum=-1.157;SC=TGGTGACCAAGGACAAGTCCA;SOR=0.705;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=321;TCF=173;TCR=148;TR=162;WE=48244409;WS=48244391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,174:0.50:349
chr19	48244569	rs3745758	G	A	2770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.881;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=64;PP=1571;ReadPosRankSum=0.819;SC=TGGATGATGAGGAGTTCGCGC;SOR=0.581;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=281;TCF=127;TCR=154;TR=124;WE=48244577;WS=48244559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:179,140:0.44:319
chr19	48244692	rs3833256	C	CG	302.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.083;NF=1;NR=8;PP=281;ReadPosRankSum=0.520;SC=CCGAGTGAGCCGGCCCCCCTC;SOR=1.075;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=9;WE=48244700;WS=48244682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr19	48248924	rs3181870	GC	AA	717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.365;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=9;PP=458;ReadPosRankSum=1.527;SC=CGCTGAGGCGGCGGCGGCGAG;SOR=1.047;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=45;TCF=23;TCR=22;TR=17;WE=48248933;WS=48248914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,20:0.39:51
chr19	48250320	rs2334293	G	C	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=21;PP=417;ReadPosRankSum=0.751;SC=GTGGAATGGCGGTTATTCATT;SOR=0.821;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=61;TCF=29;TCR=32;TR=38;WE=48250328;WS=48250310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,41:0.60:68
chr19	48250414	rs3745756	A	G	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.630;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=162;ReadPosRankSum=-0.483;SC=GGTCAACCTTAATATAAACAA;SOR=1.179;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=9;WE=48250422;WS=48250404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr19	48253579	rs3745754	A	G	2675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=62;PP=1597;ReadPosRankSum=-0.686;SC=CTTCTTTCCCACCAGACTCTG;SOR=0.681;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=224;TCF=99;TCR=125;TR=112;WE=48253587;WS=48253569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,128:0.52:245
chr19	48253667	rs3786780	C	G	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=286;ReadPosRankSum=-1.376;SC=GTTTGGGCTTCGGAGTGCAGA;SOR=0.760;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=37;TCF=5;TCR=32;TR=16;WE=48253675;WS=48253657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,17:0.44:39
chr19	48254392	rs10402957	T	C	942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=4.630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.99;ReadPosRankSum=-1.724;SOR=0.382;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,52:0.44:118
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chr19	48255804	rs1042558	A	G	1367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.630;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.429;NF=36;NR=25;PP=801;ReadPosRankSum=1.306;SC=CGTCCCAGGCACCCGCCGTGG;SOR=0.812;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=126;TCF=71;TCR=55;TR=61;WE=48255812;WS=48255794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,70:0.50:140
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chr19	48258578	rs10405135	A	G	1059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.592;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=26;PP=660;ReadPosRankSum=0.434;SC=CACCGGCCTGAGCCCTGACCC;SOR=0.690;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=149;TCF=81;TCR=68;TR=57;WE=48258586;WS=48258568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,61:0.37:165
chr19	48258717	rs1804994	A	G	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.693;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=141;ReadPosRankSum=1.682;SC=GCGCGGCGGCAGAGGCGGCGG;SOR=0.148;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=11;WE=48258725;WS=48258707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr19	48258772	rs11083895	G	A	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.024;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=4;PP=45;ReadPosRankSum=0.389;SC=GAAGGCTGGGGCGGCTCAAGT;SOR=0.399;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=7;WE=48258780;WS=48258762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr19	48258826	rs10411523	G	A	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.15;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr19	48260079	rs889142	T	C	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=486;ReadPosRankSum=0.314;SC=CAGGGCCCCTTCCAGAGTGTG;SOR=0.719;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=58;TCF=17;TCR=41;TR=24;WE=48260087;WS=48260069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,27:0.43:63
chr19	48282077	rs111841672	C	CGCAGCGG	3887.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.592;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=6.104;NF=10;NR=31;PP=2103;ReadPosRankSum=1.241;SC=TATTGGTAAGCCCAGCGGCCA;SOR=0.575;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=102;TCF=23;TCR=79;TR=41;WE=48282085;WS=48282065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,109:0.47:232
chr19	48282172	rs1862485	T	C	1410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.509;NF=25;NR=31;PP=859;ReadPosRankSum=0.920;SC=ATGGGAGCCCTTGTATGGGAA;SOR=0.696;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=51;TCR=64;TR=56;WE=48282188;WS=48282162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,62:0.47:131
chr19	48284025	rs34362700	C	CG	2079.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.822;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.383;NF=21;NR=15;PP=919;ReadPosRankSum=-0.371;SC=AGTGGATGCCCGGGGGGCATT;SOR=0.925;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=97;TCF=43;TCR=54;TR=36;WE=48284033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,81:0.52:157
chr19	48305651	rs62130758	G	A	213.81	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.368;HP=2;HapScore=2;MGOF=45;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-1.643;NF=5;NR=4;PP=87;ReadPosRankSum=1.255;SC=GCCTGGGATCGGGCCTGGGAT;SOR=0.061;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=24;TCF=14;TCR=10;TR=9;WE=48305659;WS=48305641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr19	48321645	.	C	CTCCA	282	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=25;MQ=64.19;NF=5;NR=2;PP=282;QD=41.5714285714;SC=CCATCCATCCCTCCATCCATC;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=7;WE=48321653;WS=48321639;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,7:0.47:15
chr19	48382516	rs11083905	C	T	1318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.650;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=37;PP=825;ReadPosRankSum=-1.993;SC=GAAACTTGGTCGAAGGGGACC;SOR=0.779;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=135;TCF=48;TCR=87;TR=56;WE=48382524;WS=48382506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,63:0.43:145
chr19	48389425	rs11083907	A	G	9427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=168;NR=150;PP=2965;SC=CCCTTATCACAAACTCATCAC;SOR=0.716;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=318;TCF=168;TCR=150;TR=318;WE=48389433;WS=48389415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,356:1.00:356
chr19	48479854	rs10404937	C	A	243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.16;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	48484150	rs10422554	G	A	1001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.717;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=20;PP=588;ReadPosRankSum=0.142;SC=GAAAAGAAACGCTAATAAAAG;SOR=0.612;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=97;TCF=57;TCR=40;TR=46;WE=48484158;WS=48484140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,50:0.47:107
chr19	48495128	rs11671612	T	C	884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.54;SOR=1.214;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	48512121	rs7249129	G	A	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=445;ReadPosRankSum=0.981;SC=AGCTGGGCGCGGTGGCTGACA;SOR=0.844;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=23;WE=48512129;WS=48512111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,23:0.64:36
chr19	48522894	rs2115100	C	G	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=154;ReadPosRankSum=2.008;SC=TGGGATAAAGCGTGGCACAGT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=9;WE=48522902;WS=48522884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr19	48523197	rs2303691	C	A	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.430;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=209;ReadPosRankSum=-0.199;SC=GCTCAACAAACACCTCCTGAA;SOR=2.049;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=12;WE=48523205;WS=48523187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr19	48525507	rs2303690	G	A	7823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=141;NR=119;PP=2965;SC=CTGCACTAACGAAGGATCAAA;SOR=0.749;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=260;TCF=141;TCR=119;TR=260;WE=48525515;WS=48525497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,292:1.00:292
chr19	48533741	rs35341698	T	G	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.490;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=322;ReadPosRankSum=-0.371;SC=CTGGGGCTTTTGGGCTTTGGT;SOR=1.167;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=43;TCF=36;TCR=7;TR=20;WE=48533749;WS=48533731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,19:0.43:44
chr19	48533856	rs35063174	A	G	3461.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FS=0.438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.42;ReadPosRankSum=1.484;SOR=0.749;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:137,166:0.55:303
chr19	48537585	rs3745746	A	G	3380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.465;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=80;PP=2201;ReadPosRankSum=-0.746;SC=CTGTAGCTCCACCAGGGTGAT;SOR=0.860;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=289;TCF=141;TCR=148;TR=149;WE=48537593;WS=48537575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,161:0.52:307
chr19	48537777	rs35163057	GT	G	51.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.39;ReadPosRankSum=-0.253;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr19	48543774	rs8102084	C	G	340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=0;PP=232;SC=TCTCCACCCCCAACTCTACTC;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=48543782;WS=48543770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
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chr19	48544753	rs3745745	G	A	2682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=58;NR=33;PP=1633;SC=GAATTTATACGGAAATGCACA;SOR=1.112;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=59;TCR=33;TR=91;WE=48544761;WS=48544743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr19	48544948	rs74807006	C	T	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=7;PP=187;ReadPosRankSum=-0.040;SC=CTCCTCCCCACGCTCTCGTGG;SOR=0.793;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=27;TCF=12;TCR=15;TR=13;WE=48544956;WS=48544938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr19	48551546	rs9226	A	T	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=382;ReadPosRankSum=0.973;SC=CCAGGTGGACATCAGGGCCCT;SOR=0.512;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=40;TCF=31;TCR=9;TR=24;WE=48551554;WS=48551536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,23:0.59:39
chr19	48558003	rs744399	A	C	501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=4;PP=326;SC=GAGGCCTCTCAATCCATGCTG;SOR=1.863;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=17;WE=48558011;WS=48557993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	48558286	rs2307281	G	A	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.886;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=13;PP=290;ReadPosRankSum=1.151;SC=GGCGGCAGTAGTCAGTGGTAG;SOR=0.240;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=39;TCF=12;TCR=27;TR=21;WE=48558294;WS=48558276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,22:0.54:41
chr19	48558342	rs3217328	TCTCCAGAAGACCC	T	164.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.242;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=2;PP=545;ReadPosRankSum=-0.703;SC=TTGCAAGACCTCTCCAGAAGA;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=2;WE=48558362;WS=48558332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr19	48565468	rs4802425	G	T	3993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=77;PP=2251;SC=GCAAGACTTGGAAATGGAAGG;SOR=1.233;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=54;TCR=77;TR=131;WE=48565476;WS=48565458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr19	48581142	rs1019786	C	T	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=69;ReadPosRankSum=-0.137;SC=ATAGAAAATACAGATTACCTG;SOR=0.495;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=29;TCF=11;TCR=18;TR=10;WE=48581150;WS=48581132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr19	48581253	rs1019785	C	G	88.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=3;PP=51;SC=TCTGTGCTCGCTGACCTCATG;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=48581261;WS=48581243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	48588148	rs431234	C	G	545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-5.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=1;PP=344;ReadPosRankSum=-1.400;SC=TGTGGTCTTCCTGGCTGCCCA;SOR=0.693;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=46;TCF=43;TCR=3;TR=23;WE=48588156;WS=48588138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,28:0.50:56
chr19	48593591	rs3745741	G	C	5782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=2.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=521;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.680;NF=132;NR=129;PP=2962;ReadPosRankSum=0.119;SC=TATCTCTAGGGTTTGACCTTT;SOR=0.714;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=486;TCF=247;TCR=239;TR=261;WE=48593599;WS=48593581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:247,274:0.53:521
chr19	48598823	rs156631	A	G	1194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.305;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=18;PP=686;ReadPosRankSum=0.125;SC=CCCAGTGCAGAGAAGCCAGCG;SOR=1.061;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=113;TCF=67;TCR=46;TR=50;WE=48598831;WS=48598813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,57:0.46:123
chr19	48598916	rs156632	A	G	2986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=56;PP=1781;SC=GGAATGTAGCAGGTATGCAGG;SOR=1.138;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=42;TCR=56;TR=98;WE=48598924;WS=48598906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr19	48601350	rs251685	T	C	1589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=10;PP=1142;SC=CACTCCGTGCTGTTCCATCCC;SOR=2.480;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=41;TCR=10;TR=51;WE=48601358;WS=48601340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	48601454	rs251684	T	C	6217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=115;NR=101;PP=2965;SC=CTGCAAATATTGGGTAGGGTA;SOR=0.702;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=216;TCF=115;TCR=101;TR=216;WE=48601462;WS=48601444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr19	48601528	rs251683	G	T	4279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=71;NR=87;PP=2557;SC=TTTGGGAGAAGGTGCCAAGAC;SOR=1.008;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=158;TCF=71;TCR=87;TR=158;WE=48601536;WS=48601518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr19	48601593	rs11432234	A	AT	580.19	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.854;HP=9;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=398;ReadPosRankSum=-0.223;SC=CGTAGGCCACATTTTTTTTTA;SOR=4.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=21;WE=48601601;WS=48601583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,25:0.89:28
chr19	48602948	rs2303744	T	C	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=9;PP=397;ReadPosRankSum=0.565;SC=TGCTTAGAGATAACCATGTAG;SOR=0.749;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=88;TCF=57;TCR=31;TR=29;WE=48602956;WS=48602938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,35:0.34:102
chr19	48608548	rs11564523	C	T	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.380;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=242;ReadPosRankSum=0.766;SC=ACAGAGGGGGCGATTCTGGGA;SOR=0.451;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=15;WE=48608556;WS=48608538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr19	48609601	rs11564519	C	T	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=337;ReadPosRankSum=-0.135;SC=CTTCTTGCCTCGGCCACCAAA;SOR=0.811;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=21;WE=48609609;WS=48609591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,22:0.52:42
chr19	48613544	rs251696	C	A	55.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.43;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr19	48613602	rs138934663	CA	C	203.92	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=4.973;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.78;MQRankSum=-3.151;QD=16.99;ReadPosRankSum=1.401;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,10:0.83:12
chr19	48613620	.	TAAATA	T	352.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.194;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.82;MQRankSum=4.913;QD=11.02;ReadPosRankSum=-2.762;SOR=0.591;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
chr19	48613701	rs11564502	G	A	1089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.23;MQRankSum=-3.910;QD=10.38;ReadPosRankSum=-1.295;SOR=0.574;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,56:0.53:105
chr19	48613788	rs138501838	T	TGCTCCGGAATCCGGTGCGGAGGCTTGG,TGGAGGCTTGG	1843.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.53;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=4;PP=463;SC=GTGGAGCTTGTGCTCCGGAAT;SOR=2.494;SbPval=0.06;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=7;WE=48613796;WS=48613778;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:26
chr19	48621036	rs13436	C	G	2300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=49;PP=1258;ReadPosRankSum=-0.477;SC=GCAGCACCAGCGCCTGCAGTG;SOR=0.668;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=184;TCF=91;TCR=93;TR=97;WE=48621044;WS=48621026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,115:0.56:207
chr19	48622375	rs3729512	C	T	566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.838;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=3;PP=345;ReadPosRankSum=-2.342;SC=GAGGCTGAGGCGCAGCCGCCA;SOR=1.270;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=42;TCF=34;TCR=8;TR=23;WE=48622383;WS=48622365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,26:0.55:47
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chr19	48622545	rs274883	A	G	1713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.294;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=38;PP=950;ReadPosRankSum=1.064;SC=CCCCCACCCCACTCTGGTCTA;SOR=0.810;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=138;TCF=64;TCR=74;TR=72;WE=48622553;WS=48622535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,82:0.55:148
chr19	48624625	rs153023	C	T	1281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.583;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=37;PP=823;ReadPosRankSum=1.697;SC=GCGCCCAAGGCGGGGCCCTCA;SOR=0.915;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=105;TCF=40;TCR=65;TR=57;WE=48624633;WS=48624615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,61:0.54:112
chr19	48630700	rs61230848	GCC	G	2064.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.289;NF=0;NR=36;PP=1413;ReadPosRankSum=1.521;SC=TCTCCCTCTCGCCCCACCTAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=36;WE=48630709;WS=48630690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,48:0.98:49
chr19	48631408	rs156641	C	T	609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=280;ReadPosRankSum=-0.322;SC=CAGGTGCACACAGATGCTTTT;SOR=0.732;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=43;TCF=15;TCR=28;TR=22;WE=48631416;WS=48631398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,29:0.59:49
chr19	48634298	rs3730994	C	T	730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.137;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=12;PP=417;ReadPosRankSum=-1.467;SC=TGACCACAGACCCTGGCAGAG;SOR=0.458;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=61;TCF=41;TCR=20;TR=33;WE=48634306;WS=48634288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,37:0.56:66
chr19	48634319	rs392891	T	A	947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=16;PP=596;ReadPosRankSum=-0.493;SC=TGCAAGTGTGTGGCAGACGCC;SOR=0.722;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=90;TCF=56;TCR=34;TR=44;WE=48634327;WS=48634309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,47:0.48:98
chr19	48636534	rs2288883	T	G	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.181;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=53;ReadPosRankSum=-0.573;SC=CCCCCGGCCTTCCTTCCAGGT;SOR=3.233;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=4;WE=48636542;WS=48636524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr19	48639235	rs2288882	G	A	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.856;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.808;HP=5;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=70;ReadPosRankSum=0.819;SC=GAAGAGGAGGGGGGAAGCCTG;SOR=1.981;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=11;TCF=5;TCR=6;TR=5;WE=48639243;WS=48639225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr19	48639472	rs3730976	T	C	2174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.564;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=51;PP=1116;ReadPosRankSum=-1.533;SC=CCTTGATGTATGTAGACCCTC;SOR=0.513;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=217;TCF=101;TCR=116;TR=101;WE=48639480;WS=48639462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,112:0.46:242
chr19	48640807	rs4987068	C	T	922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.950;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=12;PP=433;ReadPosRankSum=-0.326;SC=GGCGATGTCGCGGAACTTGCT;SOR=1.251;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=88;TCF=53;TCR=35;TR=38;WE=48640815;WS=48640797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,47:0.46:103
chr19	48646732	rs3730938	A	G	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.643;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=170;ReadPosRankSum=-1.335;SC=AAGGCAGCACAGACCGCCATG;SOR=1.292;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=14;WE=48646740;WS=48646722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr19	48646883	rs2288878	T	C	7213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=144;NR=108;PP=2965;SC=GACGCAAGAGTGACAGTGGTG;SOR=0.971;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=252;TCF=144;TCR=108;TR=252;WE=48646891;WS=48646873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,274:1.00:274
chr19	48646993	rs415465	C	T	6776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=102;NR=123;PP=2965;SC=CCCAGGGCTGCCTCTCTGTCC;SOR=0.911;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=225;TCF=102;TCR=123;TR=225;WE=48647001;WS=48646983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr19	48647241	rs3730931	T	C	2172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.161;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=54;PP=1473;ReadPosRankSum=-1.131;SC=AAAACGGAGATTGAATTGCAT;SOR=0.593;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=176;TCF=78;TCR=98;TR=99;WE=48647249;WS=48647231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,103:0.56:184
chr19	48654553	rs20580	G	T	3833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=66;NR=60;PP=2093;SC=CCTTCTCTGTGGCCACTTCAG;SOR=0.793;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=66;TCR=60;TR=126;WE=48654561;WS=48654543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr19	48660238	rs3730868	C	T	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.523;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=202;ReadPosRankSum=0.317;SC=GAAAGGCAGGCGACTGAAGGG;SOR=0.404;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=30;TCF=19;TCR=11;TR=14;WE=48660258;WS=48660228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr19	48660243	rs3730867	GAAGGGGCA	G	1448.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=11;PP=1328;SC=GCAGGCGACTGAAGGGGCAGG;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=22;TCF=10;TCR=12;TR=21;WE=48660258;WS=48660228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	48660445	rs274862	T	C	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.845;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=235;ReadPosRankSum=-0.153;SC=AAGGAGGGACTCCATTTTCCA;SOR=1.260;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=42;TCF=15;TCR=27;TR=17;WE=48660453;WS=48660435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,17:0.41:41
chr19	48664798	rs3730862	G	A	892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.723;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=29;PP=647;ReadPosRankSum=1.225;SC=GTAAAGGGGCGACTACAGCAG;SOR=1.316;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=82;TCF=24;TCR=58;TR=38;WE=48664806;WS=48664788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,40:0.47:85
chr19	48668709	rs3730850	A	G	1322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=17;PP=860;SC=CTAACGTAAGAGTTTTTGTTT;SOR=1.298;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=28;TCR=17;TR=45;WE=48668723;WS=48668699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr19	48668795	rs3730849	G	A	1528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.622;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=22;PP=992;ReadPosRankSum=0.414;SC=AGGGGCAAGGGAGGGTGCTCA;SOR=0.765;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=137;TCF=89;TCR=48;TR=66;WE=48668803;WS=48668785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,73:0.49:148
chr19	48668830	rs20579	G	A	2256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.682;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=45;PP=1263;ReadPosRankSum=-0.045;SC=GCATGTTGGCGTCAGAATTCT;SOR=0.580;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=192;TCF=109;TCR=83;TR=101;WE=48668838;WS=48668820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,107:0.51:208
chr19	48668966	rs143468290	G	GA	318.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=6.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQRankSum=0.352;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.391;SOR=2.617;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,21:0.81:26
chr19	48673304	rs73574169	T	G	610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-5.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.718;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=5;PP=432;ReadPosRankSum=-0.040;SC=CCCCCCTCCCTCTGGGAGACA;SOR=0.196;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=63;TCF=56;TCR=7;TR=31;WE=48673312;WS=48673294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,31:0.51:61
chr19	48673458	rs3730840	G	A	4295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=399;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.094;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=104;PP=2498;ReadPosRankSum=3.379;SC=CGCACCCGCCGCCCTCCGCCT;SOR=0.799;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=356;TCF=174;TCR=182;TR=197;WE=48673466;WS=48673448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:188,211:0.53:399
chr19	48685877	rs16981771	G	A	4543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=429;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=109;NR=98;PP=2924;ReadPosRankSum=-0.571;SC=CCTGCCTGCCGGTGCGCACCA;SOR=0.691;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=398;TCF=208;TCR=190;TR=207;WE=48685885;WS=48685867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:211,217:0.51:428
chr19	48686072	rs2007182	G	A	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.205;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=202;ReadPosRankSum=-0.027;SC=GGGGAAAGCCGCGCTGAAGAC;SOR=0.208;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=16;WE=48686080;WS=48686062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
chr19	48686098	rs2007183	G	T	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.560;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=110;ReadPosRankSum=1.177;SC=GGTCATTCATGCCTTCATCCG;SOR=0.399;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=7;WE=48686106;WS=48686088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr19	48689859	rs56345112	G	A	648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.878;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=10;PP=382;ReadPosRankSum=0.341;SC=CACCCGGCCTGTACATGCTGT;SOR=0.860;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=73;TCF=48;TCR=25;TR=31;WE=48689867;WS=48689849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,33:0.41:80
chr19	48691039	.	TA	T	36.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.08;ReadPosRankSum=0.020;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr19	48692832	rs10418095	C	A	76.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.28;ReadPosRankSum=-3.171;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,13:0.22:60
chr19	48693928	rs57930203	C	G	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=355;ReadPosRankSum=-0.759;SC=TCTTGGCAAGCGGCAAAAGAT;SOR=0.407;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=4;TCR=37;TR=19;WE=48693936;WS=48693918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,18:0.42:43
chr19	48697808	rs34897645	TGG	T	76.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.718;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.96;ReadPosRankSum=1.068;SOR=0.086;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr19	48697961	rs12973411	C	T	943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=20;PP=587;ReadPosRankSum=0.891;SC=GGTGTTCTTCCTGACGTCGCG;SOR=0.748;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=85;TCF=48;TCR=37;TR=44;WE=48697969;WS=48697951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,49:0.48:103
chr19	48707401	rs3745717	G	T	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.497;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=124;ReadPosRankSum=0.970;SC=GCAGTCTCTGGGTGAGGAGGC;SOR=1.414;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=10;WE=48707409;WS=48707391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,10:0.29:35
chr19	48707665	rs2015209	G	A	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.511;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=216;ReadPosRankSum=0.202;SC=GAGTGTTTTGGTGAATTCCTA;SOR=0.351;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=35;TCF=9;TCR=26;TR=16;WE=48707673;WS=48707655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
chr19	48707714	rs2015211	A	T	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=43;ReadPosRankSum=-0.210;SC=GAAATCGACAAGTTACTAGAT;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=4;WE=48707722;WS=48707704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr19	48715269	rs2008521	T	C	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=258;ReadPosRankSum=-1.088;SC=TTGAGAATCGTTCACTTACAG;SOR=0.706;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=48;TCF=15;TCR=33;TR=21;WE=48715277;WS=48715259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,24:0.47:51
chr19	48734018	rs2304134	G	A	1454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.073;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=38;PP=810;ReadPosRankSum=-1.518;SC=CACAGCCTCCGCTCACCCCAC;SOR=1.280;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=146;TCF=65;TCR=81;TR=62;WE=48734026;WS=48734008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,72:0.41:174
chr19	48735017	rs140826611	C	CTT	4009.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.656;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=38;PP=2022;ReadPosRankSum=-0.842;SC=TCAAAACAGACTTTAGAAGCA;SOR=0.660;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=124;TCF=33;TCR=91;TR=50;WE=48735025;WS=48735007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,108:0.51:212
chr19	48735287	rs4802448	A	G	929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=22;PP=631;SC=ATTCCATAAGACTTTCTGGGA;SOR=2.165;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=29;WE=48735295;WS=48735277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	48736706	rs4802449	G	A	1596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=39;PP=1040;ReadPosRankSum=0.820;SC=CGCTTTTCTCGGAAGGATTCT;SOR=0.664;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=135;TCF=55;TCR=80;TR=66;WE=48736714;WS=48736696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,73:0.49:150
chr19	48737551	rs2288877	T	C	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=254;ReadPosRankSum=0.086;SC=AGCTCATTCATTCTCCCCTGA;SOR=0.580;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=54;TCF=42;TCR=12;TR=20;WE=48737559;WS=48737541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,23:0.38:60
chr19	48737706	rs2043211	A	T	3406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.395;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=78;PP=2171;ReadPosRankSum=-3.363;SC=ACAGCACGGAACAATAATGGC;SOR=0.718;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=300;TCF=151;TCR=149;TR=153;WE=48737714;WS=48737696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,165:0.50:332
chr19	48737764	rs2288876	A	G	2283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.179;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=58;PP=1509;ReadPosRankSum=-1.383;SC=AGATGTCACAAAGGGTCTCAG;SOR=0.947;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=202;TCF=79;TCR=123;TR=90;WE=48737772;WS=48737754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,99:0.46:214
chr19	48744164	rs11670259	C	T	3283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.599;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=62;PP=1764;ReadPosRankSum=1.471;SC=TGAACTATAACGAAACACAGA;SOR=0.532;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=290;TCF=163;TCR=127;TR=142;WE=48744172;WS=48744154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,164:0.51:324
chr19	48744345	rs16981853	T	C	850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=25;PP=582;ReadPosRankSum=0.922;SC=GGAGGTTGTATTTAGGTACTT;SOR=0.853;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=63;TCF=14;TCR=49;TR=32;WE=48744353;WS=48744335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,35:0.53:66
chr19	48788904	rs140236127	GGAAAGAAA	G	455.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=2.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.99;ReadPosRankSum=0.061;SOR=1.574;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,14:0.37:38
chr19	48800338	rs7252988	A	G	1835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.304;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=31;PP=1057;ReadPosRankSum=-0.428;SC=CGCTCGAATCAGACGCTGTGC;SOR=0.585;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=126;TCF=76;TCR=50;TR=75;WE=48800346;WS=48800328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,86:0.58:148
chr19	48800751	rs61747754	C	A	854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.285;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=20;PP=560;ReadPosRankSum=-1.410;SC=TGGCGCTGCGCCTCCGCCTGC;SOR=0.865;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=123;TCF=65;TCR=58;TR=46;WE=48800759;WS=48800741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,47:0.36:130
chr19	48800791	rs2292113	A	G	1097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.331;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=24;PP=667;ReadPosRankSum=-0.525;SC=GGGAAGGTGAACTGGGCCCCG;SOR=0.701;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=129;TCF=69;TCR=60;TR=53;WE=48800799;WS=48800781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,58:0.40:145
chr19	48801047	rs73047511	T	C	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.767;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=305;ReadPosRankSum=-0.018;SC=GCCCTTCCCTTCTGGGGCACC;SOR=0.343;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=18;WE=48801055;WS=48801037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr19	48801426	rs8111947	T	C	2532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.117;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=51;PP=1431;ReadPosRankSum=0.819;SC=CTCCCTGCCGTCTCCCACCTG;SOR=0.797;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=229;TCF=123;TCR=106;TR=112;WE=48801434;WS=48801416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,128:0.51:252
chr19	48821896	rs73047547	C	A	1659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.564;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=34;PP=889;ReadPosRankSum=-1.795;SC=TCACTAAAGGCAGGACCCAGG;SOR=0.643;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=154;TCF=75;TCR=79;TR=70;WE=48821904;WS=48821886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,80:0.47:169
chr19	48830076	rs188356901	C	G	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.197;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=11;PP=438;ReadPosRankSum=-0.827;SC=TCCCCTGCTCCCCCTCCCCAG;SOR=1.202;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=83;TCF=52;TCR=31;TR=35;WE=48830084;WS=48830066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,38:0.44:87
chr19	48848702	rs146325765	C	CATTTATTT	618.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=759;SC=CAGATACTTTCATTTATTTAT;SOR=3.126;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=7;WE=48848710;WS=48848692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	48863386	rs438767	C	T	3929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=52;PP=2347;SC=CCACGTGGGCCGAGAACGCCT;SOR=1.139;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=79;TCR=52;TR=131;WE=48863394;WS=48863376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr19	48869178	rs919804	C	T	4579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=74;NR=75;PP=2298;SC=GACCATCACGCGGGTCTTCGA;SOR=0.914;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=149;TCF=74;TCR=75;TR=149;WE=48869186;WS=48869168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr19	48876661	rs2569713	A	G	3139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=26;PP=2206;SC=AAAGAGGGAGAGGTCCAGACG;SOR=2.093;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=76;TCR=26;TR=102;WE=48876669;WS=48876651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr19	48893675	rs276701	C	T	1604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.198;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=25;PP=1132;ReadPosRankSum=-1.474;SC=GGGGTGGAGCCTCTACCTTCA;SOR=1.011;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=131;TCF=85;TCR=46;TR=76;WE=48893683;WS=48893665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,74:0.55:134
chr19	48893834	.	G	GAGAGAGAGAC	1368	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=27;MQ=59.02;NF=0;NR=14;PP=1368;QD=98.3571428571;SC=GAGAGAGAGAGAGACAGACAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=0;TCR=48;TR=14;WE=48893850;WS=48893810;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:34,14:0.29:48
chr19	48908631	rs34833452	AG	A	1315.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.752;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=19;PP=781;ReadPosRankSum=2.220;SC=CTGGAATGGGAGGGGTGTGGG;SOR=0.387;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=58;TCF=9;TCR=49;TR=25;WE=48908639;WS=48908621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,48:0.48:100
chr19	48922772	rs11302654	CT	C	330.52	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.9954;FS=3.197;HP=16;HapScore=3;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.500;NF=6;NR=16;PP=218;ReadPosRankSum=0.694;SC=GTAGTTCTTTCTTTTTTTTTT;SOR=0.105;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=22;WE=48922781;WS=48922762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,18:0.90:20
chr19	48923101	rs276709	C	A	1789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=22;NR=46;PP=1255;SC=TGGGCTGGAGCTGGGGCTGGG;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=69;TCF=22;TCR=47;TR=68;WE=48923109;WS=48923091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr19	48924910	rs138030001	C	A	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=288;ReadPosRankSum=-0.626;SC=ATGTAGTGAGCGAGTGTTGAG;SOR=0.446;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=17;WE=48924918;WS=48924900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr19	48924963	rs1654671	G	A	2370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=27;PP=1532;SC=GCCAGATAGCGGGTGTGTCTC;SOR=1.504;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=54;TCR=27;TR=81;WE=48924971;WS=48924953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr19	48945880	rs62130268	T	C	502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.85;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	48946325	rs111420822	T	C	274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.98;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	48946840	.	G	A	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.38;ReadPosRankSum=-1.383;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr19	48949286	rs1643487	G	T	1803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=49;NR=14;PP=1106;SC=AGGGTCGGCGGCGCACGTGTG;SOR=2.070;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=66;TCF=49;TCR=17;TR=63;WE=48949294;WS=48949276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr19	48949764	rs3760795	G	A	3202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.013;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;PP=2962;ReadPosRankSum=1.109;SC=CAACAGGTAAGACCCGAGGCT;SOR=0.773;Source=Platypus;TCF=106;WE=48949774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,143:0.60:238
chr19	48949766	rs929743	C	G	1763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.045;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=40;ReadPosRankSum=-0.707;SC=ACAGGTAAGACCCGAGGCTTT;SOR=0.607;Source=Platypus;TCF=103;TR=80;WE=48949774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,89:0.39:228
chr19	48950001	rs141552216	TGAA	T	2531.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.126;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=4.416;NF=1;NR=33;PP=1271;ReadPosRankSum=-0.851;SC=AGGGCAGTGATGAAGAAGAAG;SOR=0.446;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=82;TCF=3;TCR=79;TR=34;WE=48950011;WS=48949991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,74:0.53:140
chr19	48954571	rs1799274	A	T	840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=25;PP=688;SC=TCCTCCTTGAATAGTTTTACA;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=27;WE=48954579;WS=48954561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	48956329	rs77441781	C	T	2331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.622;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=59;PP=1371;ReadPosRankSum=-0.388;SC=AAACTGAAGTCGAATTGGGCT;SOR=0.854;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=255;TCF=118;TCR=137;TR=106;WE=48956337;WS=48956319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,119:0.42:282
chr19	48972740	rs8106937	T	C	706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=11;PP=454;ReadPosRankSum=1.132;SC=CCGCCCCGGATTCCCCGCGGG;SOR=0.627;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=50;TCF=34;TCR=16;TR=31;WE=48972748;WS=48972730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,31:0.61:51
chr19	48972890	rs116172436	C	T	1547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.785;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=34;PP=754;ReadPosRankSum=1.573;SC=AAGCGTTCGGCTCAGTCGTAG;SOR=0.930;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=136;TCF=65;TCR=71;TR=61;WE=48972898;WS=48972880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,77:0.48:160
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chr19	48975807	rs79525710	C	T	630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=11;PP=362;ReadPosRankSum=-0.170;SC=GCAGCCTCCCCGCAGAGGGGC;SOR=0.760;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=42;TCF=24;TCR=18;TR=26;WE=48975815;WS=48975797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,29:0.64:45
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chr19	48977479	rs61748773	C	T	3360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.970;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=78;PP=1959;ReadPosRankSum=-0.730;SC=TCATGCTCAACACCAGTCTCC;SOR=0.640;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=301;TCF=159;TCR=142;TR=155;WE=48977487;WS=48977469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,166:0.51:323
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chr19	48978325	rs11083939	T	C	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=257;ReadPosRankSum=-2.440;SC=TCGACCTCTCTGAACCTCAGT;SOR=0.859;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=20;WE=48978333;WS=48978315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,25:0.53:47
chr19	48979186	rs12327611	C	A	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.439;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=315;ReadPosRankSum=-1.264;SC=TGGGCAGTTACAGTCCAGCAC;SOR=1.569;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=54;TCF=39;TCR=15;TR=20;WE=48979194;WS=48979176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,21:0.38:56
chr19	48981869	rs11882635	C	T	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-3.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.326;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=86;ReadPosRankSum=-0.319;SC=GACTCCTGGGCCTGATGGAGG;SOR=0.021;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=9;WE=48981877;WS=48981859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr19	49055524	rs16982141	C	T	2268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=39;PP=1109;ReadPosRankSum=2.745;SC=ACGGGCCCGCCGAGCCCCAGA;SOR=0.661;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=185;TCF=101;TCR=84;TR=86;WE=49055532;WS=49055514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,112:0.50:226
chr19	49055748	.	G	A	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.299;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.06;ReadPosRankSum=-1.939;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
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chr19	49096065	rs2302948	C	T	2450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.028;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=69;PP=1642;ReadPosRankSum=1.749;SC=CTACGAGGAGCTGCAGCAGGT;SOR=0.773;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=213;TCF=86;TCR=127;TR=113;WE=49096087;WS=49096055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,120:0.52:232
chr19	49102782	rs10410524	G	A	1043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=29;PP=810;SC=TCAGAGTCCCGCCCAGAGGCA;SOR=4.174;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=32;WE=49102790;WS=49102772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	49104749	.	C	T	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.498;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.141;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=58.52;MQRankSum=1.745;NF=2;NR=10;PP=216;ReadPosRankSum=-2.004;SC=CGGCCAGGCACGGTGGCTCAC;SOR=1.685;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=12;WE=49104757;WS=49104739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr19	49106995	rs3745728	G	A	1769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=20;PP=1202;SC=CACGCGGTGCGGGCTGCGGCC;SOR=1.366;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=39;TCR=20;TR=59;WE=49107003;WS=49106985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr19	49113029	rs2617803	G	C	199.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=121;SC=ACACAGATGAGAAAAGAGAGG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=8;WE=49113037;WS=49113026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	49114236	rs454715	T	G	479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=12;PP=319;SC=AAAGTTCAGGTGGGCTAAAGG;SOR=3.258;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=49114244;WS=49114226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	49116076	rs2617801	C	G	386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=3;PP=298;SC=TAGGGGTGTGCGCTTGCAAGT;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=49116084;WS=49116066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	49116134	rs2617800	T	G	1081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=8;PP=875;SC=CCCAGTCTGGTGAATGGACAC;SOR=2.242;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=36;WE=49116142;WS=49116124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr19	49116359	rs447802	T	C	4367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.86;SOR=0.808;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr19	49116359	.	TGG	CGA,CGG	1115	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000,0.5000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=22,56;NR=17,59;PP=553,1115;QD=15.5504583298;SC=TCCACATCGGTGGTGGTGGCT;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=119;TCF=58;TCR=61;TR=39,115;WE=49116369;WS=49116349;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.33:119
chr19	49116361	.	G	A	1089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.492;ClippingRankSum=0.000;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=6.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.65;ReadPosRankSum=1.056;SOR=0.641;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,50:0.40:126
chr19	49116438	rs376524	A	G	3434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=61;NR=50;PP=2027;SC=CCAAGCCCTGAACCTCATCCG;SOR=0.724;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=61;TCR=50;TR=111;WE=49116446;WS=49116428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr19	49116555	rs368654	A	G	2899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=41;PP=1600;SC=CGGAATATAGAAAGCCGGGGC;SOR=0.730;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=51;TCR=41;TR=92;WE=49116563;WS=49116545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr19	49119900	rs138568775	C	CCAGCACAGCA	1324.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.034;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=2.417;NF=2;NR=5;PP=1971;ReadPosRankSum=0.128;SC=TGAGGATGGACCAGCACAGCA;SOR=0.997;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=7;WE=49119908;WS=49119890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,29:0.42:69
chr19	49120252	rs11382518	T	TA	82.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=3.886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.11;MQRankSum=2.191;QD=0.87;ReadPosRankSum=-1.586;SOR=0.574;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,15:0.16:95
chr19	49120434	rs369880	C	T	8257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=162;NR=117;PP=2965;SC=ACCAACAGTCCAAGCTCTACG;SOR=0.997;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=279;TCF=162;TCR=117;TR=279;WE=49120442;WS=49120424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,298:1.00:298
chr19	49122248	rs3094287	T	C	2143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=54;NR=10;PP=1551;SC=CATCCCTGCTTTCCTGGCCCC;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=54;TCR=10;TR=64;WE=49122256;WS=49122238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr19	49131764	rs34630951	A	AAG	8988.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=80;PP=2930;SC=GAGCAAATGAAAGATGACCAG;SOR=0.920;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=111;TCF=26;TCR=85;TR=103;WE=49131772;WS=49131754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr19	49132634	rs3745733	G	A	3122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=50;PP=1808;SC=TGCCTCCGCTGGGCACCCCGC;SOR=1.054;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=96;TCF=46;TCR=50;TR=96;WE=49132642;WS=49132624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr19	49164952	rs281392	A	G	722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.611;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=14;PP=301;ReadPosRankSum=-2.473;SC=CCGGCCTGGGACTGGGTGTGG;SOR=0.529;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=91;TCF=46;TCR=45;TR=31;WE=49164960;WS=49164942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,39:0.36:107
chr19	49166875	rs371690	G	A	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=369;ReadPosRankSum=-0.357;SC=CCATCCCTCCGTTCCATCTTG;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=18;WE=49166883;WS=49166865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr19	49168182	rs373002	T	C	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=9;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=66;ReadPosRankSum=0.819;SC=ATTATCTTTTTTTTTTGAGAC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=4;WE=49168190;WS=49168172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr19	49183284	rs3826838	G	A	1581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.169;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=28;PP=987;ReadPosRankSum=0.300;SC=CCCCACAGCCGTCAAGGGATT;SOR=0.814;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=164;TCF=102;TCR=62;TR=73;WE=49183292;WS=49183274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,79:0.43:185
chr19	49183705	rs3826846	G	A	2313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;ReadPosRankSum=0.852;SC=CGCTGTGTCCGCCTCACGGGC;SOR=0.659;Source=Platypus;TCF=97;WE=49183713;WS=49183695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,113:0.50:226
chr19	49206603	rs281377	C	T	5006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=107;NR=79;PP=2965;SC=ACCACCTGAACGACTGGATGG;SOR=0.921;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=186;TCF=107;TCR=79;TR=186;WE=49206611;WS=49206593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr19	49216926	rs281384	A	G	2207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=21;PP=1448;SC=GCAGGAGTCCAGAACCTCAGC;SOR=2.066;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=56;TCR=21;TR=77;WE=49216934;WS=49216916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr19	49217261	rs281385	A	G	1284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=23;PP=730;SC=TATCCGCGGCACGTGGAAGAG;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=17;TCR=23;TR=40;WE=49217269;WS=49217251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr19	49217305	rs281386	A	G	686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=12;NR=12;PP=414;SC=GGCTTGACCTAGAGCAGCCAA;SOR=0.922;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=12;TCR=12;TR=24;WE=49217313;WS=49217295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	49217520	rs281387	T	C	636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=3;PP=391;SC=TTCCTACCGCTGGTCCTCGCC;SOR=1.931;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=49217528;WS=49217510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	49217605	rs281388	T	G	2946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=64;NR=32;PP=1503;SC=GTCCGCAAGCTCATAGCCCCG;SOR=1.219;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=96;TCF=64;TCR=32;TR=96;WE=49217613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr19	49244219	rs2307018	CG	AA	4314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=39;NR=42;PP=2637;SC=TTTGCTCGGCCGCTCCACTGC;SOR=0.845;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=40;TCR=43;TR=81;WE=49244228;WS=49244209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr19	49246866	rs838147	A	G	1582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=42;PP=1225;SC=CTGGGGCCAGATCATCTATGA;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=10;TCR=42;TR=52;WE=49246874;WS=49246856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr19	49247601	rs11672046	C	T	1443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=21;PP=1035;SC=AAGGAGGAGGCAGTTGGGGAA;SOR=0.818;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=25;TCR=21;TR=46;WE=49247609;WS=49247591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr19	49247693	rs8108136	C	T	3012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=38;PP=1933;SC=GGGACACCGACTCCCATCTTC;SOR=1.168;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=64;TCR=38;TR=102;WE=49247701;WS=49247683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr19	49247786	rs8108468	G	A	4408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=71;PP=2387;SC=GCTCCTTCACGAAGAGATCGC;SOR=0.874;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=70;TCR=71;TR=141;WE=49247794;WS=49247776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr19	49247900	rs8111288	G	A	789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=19;PP=503;SC=AGGAAAGGGCGCTACAACTGA;SOR=1.942;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=27;WE=49247908;WS=49247890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr19	49248640	rs12982115	A	G	2325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=39;PP=1303;SC=CACTGGGCAAAGATAGGCCTG;SOR=1.220;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=31;TCR=39;TR=70;WE=49248648;WS=49248630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr19	49248730	rs838145	G	A	1223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=10;PP=939;SC=TAGGGAAAACGGTATTTACTA;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=25;TCR=10;TR=35;WE=49248738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr19	49254573	rs838137	T	A	1393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=33;PP=951;SC=TAGCAAATGCTCTGAGGCTGA;SOR=2.256;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=11;TCR=33;TR=44;WE=49254581;WS=49254563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr19	49259529	rs838133	A	G	2770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=40;PP=1671;SC=AGCACTCAGGACTGTGGGTTT;SOR=0.836;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=53;TCR=41;TR=92;WE=49259537;WS=49259519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr19	49261368	rs739320	T	C	3637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=60;PP=2461;ReadPosRankSum=-1.810;SC=CCCCCCGCACTCCCGGAGCCA;SOR=0.781;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=126;TCF=64;TCR=62;TR=123;WE=49261376;WS=49261357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,140:0.99:142
chr19	49299533	rs557106	A	G	2200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=44;PP=1325;ReadPosRankSum=0.293;SC=AGAGCAGCACAGAAAGCCCAC;SOR=0.714;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=215;TCF=119;TCR=96;TR=98;WE=49299541;WS=49299523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,109:0.47:234
chr19	49300605	rs526744	T	C	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.275;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=19;PP=481;ReadPosRankSum=0.628;SC=TGGAGGGCAGTCTGGTTGGGT;SOR=0.387;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=57;TCF=22;TCR=35;TR=34;WE=49300613;WS=49300595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,36:0.59:61
chr19	49317098	rs78535883	C	T	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=181;ReadPosRankSum=-0.883;SC=TCATGCCCTCCTTGAAGGCTG;SOR=0.990;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=11;WE=49317106;WS=49317088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr19	49378180	.	AT	A	48.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=0.000;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=3.927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.80;ReadPosRankSum=0.748;SOR=1.705;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr19	49385570	rs146972211	G	T	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.710;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=178;ReadPosRankSum=-1.449;SC=ACAGGGGCTGGGTAAAATGAG;SOR=0.333;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=13;WE=49385578;WS=49385560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr19	49401205	.	C	CTTATTTAT	447.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.373;ClippingRankSum=0.000;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.39;MQRankSum=4.368;QD=13.57;ReadPosRankSum=0.419;SOR=0.404;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
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chr19	49422709	rs35642334	C	CTTAT	51.92	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=2;PP=113;SC=CTCTAGGACTCTTATTTATTT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=2;WE=49422717;WS=49422699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
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chr19	49458262	rs4645881	C	T	1751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.54;SOR=0.886;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
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chr19	49464971	rs704243	G	A	1176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=15;NR=26;PP=710;SC=ATTGGGGGACGTGGGCATTTT;SOR=1.662;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=42;TCF=15;TCR=27;TR=41;WE=49464979;WS=49464961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr19	49469087	rs2230267	T	C	6225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=126;NR=76;PP=2965;SC=CTTCCGCGAATTGGCCGAGGA;SOR=1.284;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=202;TCF=126;TCR=76;TR=202;WE=49469095;WS=49469077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr19	49474027	rs2270938	A	T	1417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=28;PP=811;ReadPosRankSum=-0.741;SC=GGTCTCCAGGACTCTGTGGCA;SOR=0.614;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=47;TCF=18;TCR=29;TR=46;WE=49474035;WS=49474017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,52:0.98:53
chr19	49485548	rs5464	G	A	2838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=43;PP=1726;SC=ATGCCTCCAGGAAGACGTCAG;SOR=0.892;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=54;TCR=43;TR=97;WE=49485556;WS=49485538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr19	49485758	rs2270937	C	T	579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=14;PP=463;SC=AGAGGCATCACGGGGCCTCCT;SOR=2.419;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=18;WE=49485766;WS=49485748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	49513273	rs1062708	C	T	8218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=134;NR=144;PP=2965;SC=GATCTCCAAGCTGGGCCGCTC;SOR=0.800;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=278;TCF=134;TCR=144;TR=278;WE=49513281;WS=49513263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,314:1.00:314
chr19	49513349	rs2287760	C	G	1939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.791;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=49;PP=1214;ReadPosRankSum=-0.332;SC=CCGGGATCCCCTCGCCCCCAG;SOR=0.852;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=169;TCF=78;TCR=91;TR=86;WE=49513357;WS=49513339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,94:0.50:189
chr19	49518484	rs753307	C	T	1932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=37;PP=1182;SC=TCCAGGGTTCCGATTTCATCC;SOR=0.864;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=34;TCR=37;TR=71;WE=49518492;WS=49518474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr19	49518575	rs753308	A	G	270.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=221;SC=TATAGTAGGTATCAGTAAATC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=49518583;WS=49518565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	49519058	rs749776	T	C	3735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=53;PP=2081;SC=CCATGTGGCCTTCCTTCTCCC;SOR=0.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=115;TCF=62;TCR=53;TR=115;WE=49519066;WS=49519048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr19	49519230	rs2013039	T	G	1477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.85;NF=21;NR=26;PP=976;SC=GAAAGACACCTCCAGAGTGCG;SOR=0.994;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=21;TCR=26;TR=47;WE=49519238;WS=49519220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr19	49519466	rs1056917	A	G	1309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=23;NR=17;PP=654;SC=CGGGGTCCACACCACGCGGGC;SOR=0.776;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=23;TCR=17;TR=40;WE=49519474;WS=49519456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr19	49519785	rs140502544	CT	C	107	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=0;PP=63;SC=GCATCTGCCCCTGGCCCCAGG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=2;WE=49519793;WS=49519775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr19	49519793	rs2387588	A	G	147.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.90;QD=29.58;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	49519855	rs1056914	T	G	759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=9;NR=9;PP=278;SC=TGATGCACACTGGGCAGCCCT;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=9;TCR=9;TR=18;WE=49519863;WS=49519845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	49519873	rs6521	G	C	826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=11;NR=9;PP=339;SC=CCTCCTTCTCGACAGCCAGGA;SOR=0.892;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=11;TCR=9;TR=20;WE=49519881;WS=49519863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	49519997	rs4002462	A	G	291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=8;PP=203;SC=TGCTTCACCCAGGTCTGAGAC;SOR=1.802;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=49520005;WS=49519987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	49520315	rs2387589	T	C	2299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=53.62;NF=51;NR=15;PP=1345;SC=AGGGGCCCTGTAGTCTTACCT;SOR=2.026;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=67;TCF=52;TCR=15;TR=66;WE=49520323;WS=49520305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr19	49520372	rs3752210	A	T	4463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=80;NR=67;PP=2530;SC=GTATCTGGCTATATACCTCGG;SOR=0.753;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=147;TCF=80;TCR=67;TR=147;WE=49520380;WS=49520362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr19	49520502	rs1960072	C	T	893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=21;PP=595;SC=CTCAGCAGAGCGCCCCAGCCC;SOR=1.681;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=10;TCR=21;TR=31;WE=49520510;WS=49520492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	49522106	rs8108340	G	A	653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=14;NR=10;PP=396;SC=GCAGGAGGCGGTGCCGAGCGA;SOR=0.859;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=14;TCR=10;TR=24;WE=49522114;WS=49522096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
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chr19	49529379	rs7255292	T	C	771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.021;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=304;ReadPosRankSum=0.512;SC=TCAGAGCACATGGAGACAGGG;SOR=2.330;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=19;WE=49529387;WS=49529369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,23:0.96:24
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chr19	49558690	rs55995744	T	G	472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=3.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.54;MQRankSum=-8.333;QD=4.92;ReadPosRankSum=-2.066;SOR=1.065;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,20:0.21:96
chr19	49558729	rs12461085	G	C	2094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=40;PP=1071;SC=GGAGTGAGCTGGACACTAACC;SOR=1.085;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=33;TCR=40;TR=73;WE=49558737;WS=49558719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr19	49558779	rs12461088	G	C	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.494;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=3.556;NF=4;NR=15;PP=254;ReadPosRankSum=1.969;SC=GGGAGGCACAGGAGTGGCTCA;SOR=1.044;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=34;TCF=8;TCR=26;TR=19;WE=49558787;WS=49558769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,22:0.56:39
chr19	49559329	rs3810179	G	A	1124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=5;PP=819;SC=GGAGGACATTGTCTGGACTTA;SOR=3.500;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=31;TCR=5;TR=36;WE=49559337;WS=49559319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr19	49559518	rs3810180	C	G	2002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.044;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=45;PP=1300;ReadPosRankSum=1.670;SC=GGGGCTGGCCCGGCAGGCTCC;SOR=0.541;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=139;TCF=65;TCR=74;TR=87;WE=49559526;WS=49559508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,92:0.60:154
chr19	49559693	rs79891871	T	C	2107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=35;NR=40;PP=1285;SC=GAGCTGTAGGTTTCCTGAGCC;SOR=0.968;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=35;TCR=40;TR=75;WE=49559701;WS=49559683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr19	49560461	rs3810182	G	A	1901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=26;PP=784;SC=ATACTGTGAAGGGTGGGCCAG;SOR=1.148;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=26;TCR=26;TR=52;WE=49560469;WS=49560451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr19	49560521	rs3810183	G	A	689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=10;PP=316;SC=CAAGATTGGGGGAGGAGGCAT;SOR=1.358;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=8;TCR=10;TR=18;WE=49560529;WS=49560511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	49573206	rs11083959	C	T	427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=13;NR=2;PP=329;SC=CCACTCGTTACGACTTAACCT;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=49573214;WS=49573196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	49573438	rs1017219	A	G	5530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=88;PP=2965;SC=ACAAGGCTGCATGTCCACATG;SOR=0.801;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=194;TCF=106;TCR=88;TR=194;WE=49573446;WS=49573428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr19	49574125	rs1611775	G	C	1869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=54;PP=1345;SC=GCCATTCAGCGGAGCGGGGAA;SOR=3.360;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=10;TCR=54;TR=64;WE=49574133;WS=49574115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr19	49588746	rs11539822	C	T	5536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=120;NR=70;PP=2965;SC=TGAGCAGCGGCCTGGTGCGCT;SOR=1.360;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=190;TCF=120;TCR=70;TR=190;WE=49588754;WS=49588736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr19	49604855	rs78616533	CCT	C	647.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.69;QD=40.48;SOR=5.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	49605530	rs10419811	A	G	2322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=50;PP=1491;SC=CCCTCCTCCCACCCCAGTCGC;SOR=1.583;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=28;TCR=50;TR=78;WE=49605538;WS=49605520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr19	49621964	rs2232003	T	C	6453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=113;NR=99;PP=2965;SC=AGGACAACGCTGCCTACCCTT;SOR=0.768;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=212;TCF=113;TCR=99;TR=212;WE=49621972;WS=49621954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr19	49631469	rs147391976	T	C	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=157;ReadPosRankSum=0.062;SC=GGGAGGAGTCTGGGCGAGGCT;SOR=0.495;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=10;WE=49631477;WS=49631459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr19	49632079	rs4802565	C	A	4607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=415;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=106;NR=106;PP=2797;ReadPosRankSum=-0.382;SC=GCCTCTTTTCCTTGACCCCAT;SOR=0.711;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=382;TCF=193;TCR=189;TR=212;WE=49632087;WS=49632069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:190,224:0.54:414
chr19	49632309	rs4802566	T	C	783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.188;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=20;PP=498;ReadPosRankSum=-1.888;SC=AATGGAAACCTATAGTTGACT;SOR=0.361;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=77;TCF=27;TCR=50;TR=34;WE=49632317;WS=49632299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,37:0.45:83
chr19	49632500	rs4802567	C	T	828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.95;ReadPosRankSum=1.474;SOR=0.660;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,41:0.64:64
chr19	49632772	rs1559155	C	T	662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.998;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=19;PP=415;ReadPosRankSum=-1.387;SC=GGGCTGCCCACGGGGCGGAGC;SOR=0.979;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=59;TCF=23;TCR=36;TR=29;WE=49632780;WS=49632762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,31:0.50:62
chr19	49638956	rs745124	C	G	1695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=24;PP=950;ReadPosRankSum=0.350;SC=ACCCCTGGCCCTAGGTCTGTC;SOR=0.732;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=144;TCF=95;TCR=49;TR=71;WE=49638964;WS=49638946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,82:0.51:162
chr19	49639948	rs2303052	A	G	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=120;ReadPosRankSum=-0.427;SC=GCCCCCAGCCACCTAATGTCC;SOR=0.976;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=10;WE=49639956;WS=49639938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr19	49640002	rs2303053	G	T	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=9;PP=269;ReadPosRankSum=2.412;SC=GTCTGCCCCTGCGGGCTCCAT;SOR=0.814;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=47;TCF=30;TCR=17;TR=26;WE=49640010;WS=49639992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,28:0.54:52
chr19	49643404	rs3764624	T	C	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.89;ReadPosRankSum=-1.258;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
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chr19	49644840	rs112961847	C	CGTGT	1668.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.908;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.982;NF=1;NR=30;PP=1527;ReadPosRankSum=-0.410;SC=TGTGTGTGTGCGTGTATGTGT;SOR=0.865;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=66;TCF=3;TCR=63;TR=31;WE=49644848;WS=49644830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,45:0.53:85
chr19	49644858	rs147872140	A	AGT	537.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.122;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=669;ReadPosRankSum=1.221;SC=TGTGTGTATGAGTGTGTGTGT;SOR=0.105;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=22;WE=49644866;WS=49644848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr19	49645176	rs10417260	C	G	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=243;ReadPosRankSum=-1.214;SC=TTCATAAAAGCTGCGTGTGCG;SOR=0.836;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=51;TCF=37;TCR=14;TR=18;WE=49645184;WS=49645166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,21:0.38:55
chr19	49645194	rs113859565	A	ATG	944.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.269;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=9;PP=749;ReadPosRankSum=-1.987;SC=GCGTATGTGCATGTGTGTGTG;SOR=1.130;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=49;TCF=21;TCR=28;TR=18;WE=49645202;WS=49645184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,32:0.43:74
chr19	49646006	rs4545921	A	G	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.559;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.160;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=122;ReadPosRankSum=-0.781;SC=CATCTCTCCGATTTTCTCCTC;SOR=3.477;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=7;WE=49646014;WS=49646004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr19	49649051	rs3764625	T	G	966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.968;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=12;PP=615;ReadPosRankSum=0.100;SC=TGCCCTATAATAAGAATCATT;SOR=0.527;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=46;TCR=21;TR=38;WE=49649059;WS=49649041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,42:0.59:71
chr19	49649498	rs10421292	C	T	796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.969;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=20;PP=475;ReadPosRankSum=-0.155;SC=CTGTGCACGACGCATGGATGC;SOR=0.519;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=25;TCR=34;TR=35;WE=49649506;WS=49649488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,38:0.57:67
chr19	49651790	rs4802576	G	A	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=38;ReadPosRankSum=1.264;SC=TCCTGAGGGGGTCAACAGTCA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=4;WE=49651798;WS=49651780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr19	49652128	rs112505587	GT	G	1164.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.208;HP=2;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=11;PP=1288;ReadPosRankSum=1.633;SC=CACCATAACCGTGGGGGTGGA;SOR=0.886;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=39;TCF=16;TCR=23;TR=22;WE=49652138;WS=49652118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,31:0.53:59
chr19	49652130	rs116573491	G	A	1173.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.576;HP=4;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=11;PP=1296;ReadPosRankSum=1.655;SC=CCATAACCGTGGGGGTGGAGC;SOR=0.958;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=51;TCF=30;TCR=21;TR=27;WE=49652138;WS=49652118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,31:0.53:59
chr19	49654421	rs2278004	C	T	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=320;ReadPosRankSum=-0.142;SC=CCCCGATGCCCTGAGATTCCC;SOR=0.936;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=38;TCF=27;TCR=11;TR=19;WE=49654429;WS=49654411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr19	49655174	rs1423520	A	T	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=289;ReadPosRankSum=0.112;SC=CCACCAGCCTACCGGGCCAGG;SOR=0.818;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=19;WE=49655182;WS=49655164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr19	49657710	rs66501117	ACAT	A	724.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.357;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.104;NF=4;NR=13;PP=672;ReadPosRankSum=0.838;SC=TTCAATGGAGACATCATCATC;SOR=0.421;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=55;TCF=16;TCR=39;TR=17;WE=49657723;WS=49657700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,37:0.64:58
chr19	49658209	rs3745297	A	C	3189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.360;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=65;PP=1677;ReadPosRankSum=0.053;SC=TATTCCTTGGAGACATCTTCA;SOR=0.616;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=278;TCF=149;TCR=129;TR=140;WE=49658217;WS=49658199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,153:0.51:302
chr19	49658367	rs3745298	C	T	2027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.536;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=49;PP=1180;ReadPosRankSum=-0.339;SC=GACTCCAGTGCTGTTGTTCCG;SOR=0.593;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=225;TCF=108;TCR=117;TR=96;WE=49658375;WS=49658357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,106:0.42:252
chr19	49658390	rs3745299	T	C	1618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.084;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=42;PP=1045;ReadPosRankSum=-0.153;SC=TTCTGAAGCCTAGCCCATCCC;SOR=0.585;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=194;TCF=93;TCR=101;TR=80;WE=49658398;WS=49658380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,85:0.40:214
chr19	49661112	rs3760663	G	A	687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.58;ReadPosRankSum=-1.042;SOR=0.625;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,34:0.52:65
chr19	49661582	rs3760664	T	C	4591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=107;PP=2965;SC=CCGCGGATGGTCACGCCCCAG;SOR=1.780;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=155;TCF=48;TCR=107;TR=154;WE=49661590;WS=49661572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr19	49684790	.	T	C	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.540;ClippingRankSum=0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=66.60;MQRankSum=3.144;QD=15.77;ReadPosRankSum=0.579;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr19	49685708	rs201110201	CCCATCCAT	CCCAT,C	2537.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;NF=18,18;NR=9,9;PP=1439,71;SC=CATCCATCCACCCATCCATCC;SOR=2.872;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=44;TCF=25;TCR=19;TR=27,27;WE=49685723;WS=49685698;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:59
chr19	49713868	rs76193804	G	A	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.245;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=415;ReadPosRankSum=0.894;SC=ACCAGGGGCTGGGTCTGGGAT;SOR=0.966;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=42;TCR=10;TR=25;WE=49713876;WS=49713858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,26:0.47:55
chr19	49797887	rs3214611	TA	T	191.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=167;SC=ATCTTCAAGATAAAAAAGGCT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=49797895;WS=49797877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	49838891	rs354020	C	A	7430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=141;NR=120;PP=2965;SC=GGCTACCCAGCCGGGGCCCAG;SOR=0.846;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=261;TCF=141;TCR=120;TR=261;WE=49838899;WS=49838881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,278:1.00:278
chr19	49839015	rs354021	T	C	6115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=118;PP=2965;SC=GGATCCTCATTGACAAGACCA;SOR=0.962;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=215;TCF=97;TCR=118;TR=215;WE=49839023;WS=49839005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr19	49841054	rs354026	G	T	2317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=32;PP=1722;SC=AGTACACAGAGCTAGCCATTC;SOR=0.864;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=67;TCF=35;TCR=32;TR=67;WE=49841062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr19	49903008	rs8110789	G	C	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.260;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=117;ReadPosRankSum=1.693;SC=GTGGACCAGTGCCTCCCTTCT;SOR=1.179;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=6;WE=49903016;WS=49902998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr19	49925667	rs12974629	T	G	4362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=45;PP=2538;SC=GCGCAGGAACTAGGCGCAGTC;SOR=1.470;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=96;TCR=45;TR=141;WE=49925675;WS=49925657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr19	49926530	.	CCAG	C	269.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=0.000;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.84;ReadPosRankSum=1.035;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,14:0.15:95
chr19	49930721	rs4802605	T	C	5981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=107;PP=2965;SC=GAGTCCAACGTCCCTCCTCCC;SOR=1.029;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=194;TCF=87;TCR=107;TR=194;WE=49930729;WS=49930711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr19	49930786	rs4801798	C	A	1517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.551;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=41;PP=909;ReadPosRankSum=1.224;SC=TCAGTTGGCCCCTGCCACTCT;SOR=1.367;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=125;TCF=57;TCR=68;TR=65;WE=49930794;WS=49930776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,72:0.51:140
chr19	49935927	rs5828394	A	AG	1239.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=24;PP=1177;SC=ACAGGTGTACAGGGACACTAG;SOR=1.670;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=28;WE=49935935;WS=49935917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr19	49940131	rs3826718	G	C	1545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=25;NR=31;PP=1570;SC=CCAGGATCCAGGGCAAAACCT;SOR=1.421;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=25;TCR=31;TR=56;WE=49940139;WS=49940100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr19	49944730	rs58045148	CA	C	1159.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=27;PP=1133;SC=TCCCGGGGTCCAGCCCCGGCC;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=27;WE=49944738;WS=49944720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	49949652	rs7462	G	A	5200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=98;NR=80;PP=2965;SC=AGAAGGCACCGGCAGAAGCGG;SOR=0.812;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=178;TCF=98;TCR=80;TR=178;WE=49949660;WS=49949642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr19	49950298	rs13394	C	T	6861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=132;PP=2965;SC=GGGAGGTCAACTTCGGCCAAG;SOR=1.169;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=225;TCF=93;TCR=132;TR=225;WE=49950306;WS=49950288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr19	49950356	rs12443	C	G	3094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=62;PP=1885;SC=GCTTTTCAGGCCTGAGGAGGA;SOR=1.791;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=32;TCR=62;TR=94;WE=49950364;WS=49950346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr19	49950413	rs2335090	C	G	1098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=22;PP=642;SC=GCCTGGCGTGCTGTCCCTTTT;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=31;WE=49950421;WS=49950403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr19	49954356	rs6509432	G	A	152.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=53;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=1;NR=5;PP=88;SC=CCGAGGTCTCGGCTCATTGCA;SOR=2.303;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=6;WE=49954364;WS=49954346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	49954803	rs2293013	C	T	8037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.41;SOR=0.846;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr19	49954807	rs2293012	T	G	8032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.14;SOR=0.857;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr19	49955016	rs2293011	G	T	1668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=45;PP=1227;SC=TCAAATCCGTGGGGAATATGT;SOR=3.651;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=52;TCF=7;TCR=45;TR=51;WE=49955024;WS=49955006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr19	49962892	rs62128062	G	A	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=172;ReadPosRankSum=1.422;SC=GCTGAGGGCCGTTGGAAAATG;SOR=0.593;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=12;WE=49962900;WS=49962882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr19	49964833	.	T	C	368	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=33;MMLQ=24;MQ=56.9;NF=15;NR=2;PP=368;QD=23.6924242675;SC=GAGGAGGGGCTGGGCCTGGAC;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=17;WE=49964841;WS=49964823;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,17:0.94:18
chr19	49964833	.	T	TGGGCCTGGACTCCTGGGTCTGAGGGAGGAGGGGCC	638.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.03;QD=91.25;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	49964977	rs1320303	C	G	4870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=95;NR=82;PP=2965;SC=CCTGAATGTCCTCAGTGGCCC;SOR=0.826;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=179;TCF=96;TCR=83;TR=177;WE=49964985;WS=49964967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr19	49967808	rs34601909	C	T	5128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=96;NR=68;PP=2936;SC=CGTCACCAGCCCCCCCGCCGC;SOR=0.829;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=165;TCF=96;TCR=69;TR=164;WE=49967816;WS=49967798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr19	49967981	rs11558188	T	G	4377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=89;PP=2666;SC=GCCTCGCTGTTCCCTCAACCC;SOR=1.480;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=141;TCF=51;TCR=90;TR=140;WE=49967989;WS=49967971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr19	49969085	rs10853810	C	T	7292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=127;NR=116;PP=2965;SC=CGTCTGGCAACCTCCATGGCT;SOR=0.761;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=243;TCF=127;TCR=116;TR=243;WE=49969093;WS=49969075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,273:1.00:273
chr19	49969310	rs2914668	A	G	491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=3;PP=226;SC=CCAGGATGCCAACCCCCACTG;SOR=1.292;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=49969318;WS=49969300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	50093141	rs62128117	C	A	1971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.646;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=59;PP=1162;ReadPosRankSum=0.153;SC=GCTAACTGTACCTTTGCTGTC;SOR=0.881;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=264;TCF=122;TCR=142;TR=103;WE=50093149;WS=50093131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:177,112:0.39:289
chr19	50093248	rs144521999	A	T	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=39;ReadPosRankSum=0.233;SC=AGGCCTCCCCACCTATGAGCA;SOR=0.602;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=4;WE=50093256;WS=50093238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr19	50093454	rs4429389	A	T	1534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=7;PP=1094;SC=CCCCATGCAAAGGTCTAGGGG;SOR=3.528;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=41;TCR=7;TR=48;WE=50093462;WS=50093444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr19	50149813	rs45513592	G	T	2318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=52;PP=1506;ReadPosRankSum=-0.079;SC=CAGCTTCCTCGCAGGGCTGGT;SOR=0.674;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=199;TCF=104;TCR=95;TR=104;WE=50149821;WS=50149803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,108:0.51:211
chr19	50154904	rs7251334	A	C	1312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=19;PP=777;SC=CGCCCGGCCTACACCGGCCGC;SOR=0.823;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=24;TCR=19;TR=43;WE=50154912;WS=50154894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr19	50156896	rs10401743	T	C	1005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=21;PP=497;ReadPosRankSum=-0.785;SC=GCTGCCCACGTTGCCCCCGCC;SOR=0.733;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=104;TCF=52;TCR=52;TR=43;WE=50156904;WS=50156886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,53:0.42:125
chr19	50168174	rs34739574	C	T	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.284;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.62;ReadPosRankSum=-0.852;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr19	50182891	rs116924407	G	A	1007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=0.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.28;ReadPosRankSum=1.582;SOR=0.606;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,51:0.52:98
chr19	50183980	rs1433102	TT	CC	1128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=17;PP=1046;SC=TGCTGCGCACTTCCTAGGGTC;SOR=3.611;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=19;WE=50183989;WS=50183970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
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chr19	50190041	rs141919954	G	C	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.70;ReadPosRankSum=-1.087;SOR=0.622;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr19	50195770	rs10423579	TT	CG	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.185;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=619;ReadPosRankSum=0.368;SC=CCCCTTTTTCTTAGAATTTTG;SOR=2.267;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=35;TCF=9;TCR=26;TR=13;WE=50195779;WS=50195760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,16:0.39:41
chr19	50209095	rs7249356	T	G	1046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=16;PP=642;ReadPosRankSum=2.372;SC=CTAAGAAGTATATAATAAATG;SOR=0.686;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=101;TCF=68;TCR=33;TR=47;WE=50209103;WS=50209085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,52:0.46:112
chr19	50216118	rs56405217	T	TG	7020.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=23;NR=84;PP=2974;SC=TGAGTGGAGCTGGGCGCGCTG;SOR=0.743;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=121;TCF=26;TCR=95;TR=107;WE=50216126;WS=50216108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr19	50250872	rs8109529	G	A	442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=13;PP=344;SC=CCTTGGCTAAGGGGATGGCTT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=50250880;WS=50250862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	50265230	rs1273634	C	T	1005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=6;PP=656;SC=GACCTCGGTCCTCCCCAGCGG;SOR=2.368;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=33;WE=50265238;WS=50265220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	50265549	rs3745477	T	G	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.133;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=319;ReadPosRankSum=-0.931;SC=TGGGCCCTCCTGCCTTCCTTT;SOR=0.516;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=53;TCF=15;TCR=38;TR=23;WE=50265557;WS=50265539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,25:0.43:58
chr19	50296145	rs2302518	T	C	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.264;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=153;ReadPosRankSum=0.071;SC=AAACCCCATCTTCCCGACTGC;SOR=0.275;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=8;WE=50296153;WS=50296135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr19	50304336	rs1003424	A	G	1374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.252;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=35;PP=771;ReadPosRankSum=-1.381;SC=CTCAGCCTGCAGGGGAGAACA;SOR=0.589;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=153;TCF=65;TCR=88;TR=63;WE=50304344;WS=50304326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,71:0.44:162
chr19	50304392	rs10421561	T	C	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.683;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=277;ReadPosRankSum=0.383;SC=CCCAGGGGTCTCAGGGCAGGC;SOR=0.364;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=61;TCF=15;TCR=46;TR=21;WE=50304400;WS=50304382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,22:0.35:62
chr19	50304439	rs10421754	T	C	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=3.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.846;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=138;ReadPosRankSum=-1.056;SC=TCCACCCCAATCCACCTAGCA;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=8;WE=50304447;WS=50304429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr19	50305688	rs2159984	G	C	1952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FS=6.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.00;ReadPosRankSum=-0.754;SOR=0.612;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,99:0.46:217
chr19	50308873	rs147959530	G	A	1763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.141;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=29;PP=1246;ReadPosRankSum=-0.041;SC=GGAGCCTCCGGGGTGAGGGGC;SOR=1.195;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=147;TCF=89;TCR=58;TR=81;WE=50308881;WS=50308863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,82:0.54:152
chr19	50308893	rs8101959	T	C	2022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.080;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=41;PP=1141;ReadPosRankSum=-0.755;SC=CGGGGCCTAATGGAGCCTCCC;SOR=0.598;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=197;TCF=111;TCR=86;TR=92;WE=50308901;WS=50308883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,101:0.49:208
chr19	50310775	rs62129186	C	T	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=87;ReadPosRankSum=0.442;SC=GGCCTCGGGGCTCTAGCTGGC;SOR=0.307;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=5;WE=50310783;WS=50310765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr19	50312048	rs11557714	G	A	1988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=52;PP=1093;ReadPosRankSum=-1.095;SC=CCCGCAACGGGTCCAGCAGTG;SOR=0.670;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=197;TCF=77;TCR=120;TR=89;WE=50312056;WS=50312038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,99:0.46:213
chr19	50314458	rs55810357	GA	G	319.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.84;ReadPosRankSum=0.427;SOR=0.756;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,19:0.70:27
chr19	50315423	rs8104825	G	A	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.875;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=142;ReadPosRankSum=0.245;SC=AAGTGTTGGTGGTCTGCACTC;SOR=1.329;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=10;WE=50315431;WS=50315413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr19	50315698	rs2305919	A	C	1184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.448;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=28;PP=893;ReadPosRankSum=1.291;SC=CCTCTCTCAGACCAACCTGCC;SOR=0.412;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=110;TCF=51;TCR=59;TR=56;WE=50315706;WS=50315688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,56:0.49:114
chr19	50315773	rs2305918	T	A	1570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=23;PP=888;ReadPosRankSum=-0.652;SC=CATAGCCAAATTAACAGCTGC;SOR=0.747;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=134;TCF=84;TCR=50;TR=64;WE=50315781;WS=50315763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,74:0.48:153
chr19	50316083	rs35816883	C	T	781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.891;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=16;PP=583;ReadPosRankSum=-1.126;SC=GCCCCATCCTCTTTCCATATG;SOR=0.340;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=69;TCF=41;TCR=28;TR=32;WE=50316091;WS=50316073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,33:0.43:77
chr19	50322611	.	T	TGATGGCTTGGGTGGTTGGGGTCCCTGTAAGGGGCCGTGCATGAGG	3293.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.09;QD=42.78;SOR=2.660;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr19	50322619	.	TG	T	2963	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MMLQ=28;MQ=60.09;NF=0;NR=49;PP=2963;QD=20;SC=AGTGATGGCTTGGGGTGGTTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=61;TCF=2;TCR=59;TR=49;WE=50322665;WS=50322595;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:12,49:0.80:61
chr19	50331678	rs5828413	CT	C	2443.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=11;PP=1770;SC=GATGGCAACCCTGGGGGCTGA;SOR=2.531;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=45;TCF=33;TCR=12;TR=42;WE=50331686;WS=50331668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr19	50335510	rs3745480	T	C	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.021;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=8;PP=336;ReadPosRankSum=-0.489;SC=CTGCCTCATGTCCCCGCCTCA;SOR=0.229;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=55;TCF=39;TCR=16;TR=22;WE=50335518;WS=50335500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,19:0.35:55
chr19	50338843	rs193291405	C	G	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.058;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=7;PP=366;ReadPosRankSum=1.958;SC=GAGGACCAAGCCAGGCCCTCA;SOR=0.269;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=40;TCF=31;TCR=9;TR=24;WE=50338851;WS=50338833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,23:0.55:42
chr19	50342111	rs10403127	G	A	1233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.862;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.829;NF=14;NR=38;PP=733;ReadPosRankSum=1.050;SC=ATTAACAGAAGTGGCGCGGCA;SOR=1.274;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=127;TCF=41;TCR=86;TR=52;WE=50342119;WS=50342101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,57:0.42:137
chr19	50358170	rs1290657	T	C	1115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=25;PP=1176;SC=TCCCACCCCATCCACTCTGAG;SOR=0.902;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=20;TCR=25;TR=45;WE=50358178;WS=50358160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr19	50363175	rs1290646	A	G	973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.098;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=7;PP=697;ReadPosRankSum=0.242;SC=CCACGGCATGATGCCGTGGTT;SOR=1.053;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=94;TCF=73;TCR=21;TR=41;WE=50363183;WS=50363165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,43:0.44:98
chr19	50383591	rs8109661	A	G	8236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=129;NR=146;PP=2965;SC=TTTGACCCCGACTATGAACCT;SOR=0.930;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=275;TCF=129;TCR=146;TR=275;WE=50383599;WS=50383581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,307:1.00:307
chr19	50404939	rs1290754	T	G	3134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.439;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=56;PP=1887;ReadPosRankSum=0.120;SC=CCATGGCCTTTATGGTTAGCC;SOR=0.733;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=250;TCF=143;TCR=107;TR=131;WE=50404947;WS=50404929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,145:0.53:276
chr19	50411742	rs892028	A	G	11530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=445;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=216;NR=187;PP=2965;SC=TGAGCTGTGCATCGATGTTCT;SOR=0.807;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=403;TCF=216;TCR=187;TR=403;WE=50411750;WS=50411732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,444:1.00:444
chr19	50412217	rs1062798	C	G	695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.031;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=16;PP=441;ReadPosRankSum=1.305;SC=GCTGCTGCTGCTGGTGGTGGT;SOR=0.976;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=50;TCF=24;TCR=26;TR=27;WE=50412225;WS=50412207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,30:0.54:56
chr19	50412417	rs999583	G	A	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.555;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=282;ReadPosRankSum=0.314;SC=TGGGCCCAGTGCTGGTGATGG;SOR=1.200;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=47;TCF=31;TCR=16;TR=22;WE=50412425;WS=50412407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,21:0.44:48
chr19	50435747	rs283525	T	C	1855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.498;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-1.101;NF=41;NR=52;PP=1400;ReadPosRankSum=-1.624;SC=GGAGCCTCCCTTACCCCCCGG;SOR=0.875;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=203;TCF=86;TCR=117;TR=93;WE=50435757;WS=50435736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,90:0.45:201
chr19	50435862	rs283526	C	T	838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.851;HP=3;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=16;PP=587;ReadPosRankSum=0.123;SC=GATGCCCCGCCCCTCCCACCA;SOR=0.108;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=49;TCF=22;TCR=27;TR=33;WE=50435870;WS=50435852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,35:0.71:49
chr19	50436371	rs8667	G	A	1630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.735;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=40;PP=944;ReadPosRankSum=-0.154;SC=TGTGGCTTCTGGGGGCTGGTC;SOR=0.515;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=98;TCF=35;TCR=63;TR=66;WE=50436379;WS=50436361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,73:0.67:109
chr19	50453317	rs9304690	C	T	3705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.399;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=93;PP=2437;ReadPosRankSum=-1.778;SC=TCTTGATCTCCGAGTACTCGG;SOR=0.722;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=305;TCF=134;TCR=171;TR=163;WE=50453325;WS=50453307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,173:0.52:330
chr19	50462244	rs1811375	G	A	4885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=91;PP=2965;SC=TGGGCCCCCAGTTTGGCACTG;SOR=0.929;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=173;TCF=82;TCR=91;TR=173;WE=50462252;WS=50462234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr19	50462298	rs62113133	G	C	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.482;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.019;NF=10;NR=22;PP=547;ReadPosRankSum=0.669;SC=TGTCCTGTTTGCTTGGGAAAC;SOR=1.225;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=96;TCF=35;TCR=61;TR=32;WE=50462306;WS=50462288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,29:0.31:94
chr19	50462396	rs140838254	ACTATC	A	130.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.897;NF=0;NR=4;PP=117;ReadPosRankSum=-0.139;SC=GGTAAAGGGAACTATCCTGGA;SOR=0.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=4;WE=50462408;WS=50462386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr19	50463670	rs79085301	T	G	1293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.978;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.461;NF=41;NR=28;PP=1233;ReadPosRankSum=0.685;SC=TCAGGCTTCTTAGTCAGGGCT;SOR=1.443;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=130;TCF=74;TCR=56;TR=69;WE=50463678;WS=50463660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,53:0.48:111
chr19	50463693	rs201127706	G	GT	1346.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=4.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-4.588;NF=19;NR=21;PP=1311;ReadPosRankSum=-0.017;SC=GACAGAGACCGGGTGGGAGAT;SOR=0.620;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=100;TCF=40;TCR=60;TR=40;WE=50463701;WS=50463683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,44:0.37:118
chr19	50463727	rs80184294	G	A	2200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.802;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.970;NF=58;NR=38;PP=1478;ReadPosRankSum=2.340;SC=GGGTCCCTGAGAGCCCTCTCT;SOR=0.417;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=170;TCF=107;TCR=63;TR=96;WE=50463735;WS=50463717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,98:0.58:169
chr19	50463982	rs9676436	T	G	3258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FS=23.712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.10;MQRankSum=-7.447;QD=19.06;ReadPosRankSum=0.080;SOR=0.929;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,120:0.70:171
chr19	50475017	rs12462972	G	A	2060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.480;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.380;NF=50;NR=44;PP=1248;ReadPosRankSum=1.220;SC=TGCCAAATTGGGGGCCCAGGT;SOR=0.633;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=220;TCF=119;TCR=101;TR=94;WE=50475025;WS=50475007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,103:0.44:235
chr19	50475075	rs200713500	GTC	AAT	4714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.469;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.205;NF=58;NR=54;PP=2934;ReadPosRankSum=1.536;SC=TGAGCTGCACGTCGATTCTGC;SOR=0.711;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=249;TCF=125;TCR=124;TR=112;WE=50475085;WS=50475065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,122:0.46:268
chr19	50475114	rs8111526	G	C	2696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.683;HP=1;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-8.724;NF=60;NR=57;PP=1815;ReadPosRankSum=1.010;SC=TGGAAAACCTGAGGAACGGCA;SOR=0.538;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=244;TCF=119;TCR=125;TR=117;WE=50475122;WS=50475104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,127:0.48:266
chr19	50475174	rs12462945	A	C	1868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.904;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-9.146;NF=35;NR=37;PP=1253;ReadPosRankSum=1.632;SC=TCTGTGTCACACACAGCAGCC;SOR=0.440;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=132;TCF=59;TCR=73;TR=72;WE=50475182;WS=50475164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,81:0.54:149
chr19	50475208	rs12462966	C	T	2663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=2.541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.65;MQRankSum=-5.384;QD=24.22;ReadPosRankSum=1.416;SOR=0.484;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,67:0.61:110
chr19	50475211	rs34340223	T	G	2681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=0.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.99;MQRankSum=-4.983;QD=25.06;ReadPosRankSum=1.302;SOR=0.570;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,65:0.61:107
chr19	50475215	rs12463034	G	A	2549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.23;MQRankSum=-4.435;QD=24.76;ReadPosRankSum=0.345;SOR=0.744;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,65:0.63:103
chr19	50475259	rs12463036	G	C	1425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.452;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.782;NF=24;NR=29;PP=823;ReadPosRankSum=-2.008;SC=TGGGGTCCTGGAGCTGCCTCG;SOR=1.044;SbPval=0.7;Source=Platypus;TCF=48;TR=53;WE=50475267;WS=50475249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,64:0.56:114
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chr19	50475458	rs34653225	T	A	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.89;ReadPosRankSum=-0.948;SOR=0.754;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,18:0.38:48
chr19	50475466	rs55752562	G	A	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=6.339;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.32;ReadPosRankSum=-0.195;SOR=1.999;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,12:0.32:37
chr19	50476219	rs59949051	T	C	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=213;ReadPosRankSum=0.493;SC=TCCAACCCCTTAGCAGGGCAC;SOR=1.112;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=12;WE=50476227;WS=50476209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr19	50476426	rs35238216	C	T	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.078;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=19;PP=410;ReadPosRankSum=-0.737;SC=CTGGACACCTCCCCCTCGATG;SOR=0.519;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=58;TCF=16;TCR=42;TR=28;WE=50476434;WS=50476416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,30:0.49:61
chr19	50476467	rs66855472	A	G	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.68;ReadPosRankSum=0.556;SOR=0.465;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr19	50476478	rs58165915	A	G	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.512;HP=1;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=223;ReadPosRankSum=-0.691;SC=TAACTGACTCATCACCTCCCT;SOR=0.056;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=9;WE=50476486;WS=50476457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr19	50482232	rs8104102	C	T	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=158;ReadPosRankSum=1.605;SC=GGAAGCTGGGCCCTGGTATGA;SOR=0.317;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=10;WE=50482240;WS=50482222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr19	50484130	rs10533547	AAGG	A	382.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.31;ReadPosRankSum=-0.329;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr19	50484155	rs4802645	C	G	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=1.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.38;ReadPosRankSum=0.079;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,18:0.44:41
chr19	50492860	rs10424282	C	G	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=225;ReadPosRankSum=-0.742;SC=TAAGAAGCATCTCTCTGCGGT;SOR=0.385;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=14;WE=50492868;WS=50492850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr19	50493120	rs283517	T	C	2730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=51;PP=1770;SC=ACAAACATTCTACCAAAGATG;SOR=1.561;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=29;TCR=51;TR=80;WE=50493139;WS=50493110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr19	50493131	rs2304112	G	A	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=300;ReadPosRankSum=-1.941;SC=ACCAAAGATGGCATTTTTCAC;SOR=0.782;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=18;TCR=37;TR=21;WE=50493139;WS=50493110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,28:0.40:70
chr19	50496281	rs113770287	G	GAC	1082.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=646;SC=TGCAGACCAGGAGGGAGCCCC;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=13;WE=50496289;WS=50496271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	50498604	rs201819422	GAGA	G	1655.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.096;NF=2;NR=25;PP=1018;ReadPosRankSum=0.485;SC=CTAGTTCTCAGAGAAGAAGCA;SOR=0.662;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=68;TCF=5;TCR=63;TR=27;WE=50498614;WS=50498594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,45:0.46:97
chr19	50500922	rs12459330	C	A	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=84;ReadPosRankSum=-0.879;SC=CCTCAATGACCAGGCTCCTCA;SOR=0.719;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=8;WE=50500930;WS=50500912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr19	50504149	rs147702874	C	T	728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.963;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=16;PP=431;ReadPosRankSum=-0.360;SC=GTTATAACCACGCGGAAGGTC;SOR=0.306;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=59;TCF=24;TCR=35;TR=30;WE=50504157;WS=50504139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,34:0.52:66
chr19	50504250	rs2115507	T	C	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=31;ReadPosRankSum=-0.921;SC=CTCTCACGACTTGCTGCTTCC;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=3;WE=50504258;WS=50504240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr19	50511108	rs3816033	T	C	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.947;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=19;PP=509;ReadPosRankSum=-1.895;SC=AAGAATAAAGTAAAAGCACCA;SOR=0.892;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=60;TCF=26;TCR=34;TR=31;WE=50511116;WS=50511093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,36:0.53:68
chr19	50519231	rs1469694	T	C	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=4.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.129;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=330;ReadPosRankSum=0.693;SC=CACACACGTGTATGCACCTTA;SOR=2.636;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=36;TCR=4;TR=16;WE=50519239;WS=50519221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,18:0.35:51
chr19	50519249	rs1469693	C	T	680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.901;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=5;PP=446;ReadPosRankSum=-1.925;SC=TTATTCCCACCGCAGAAACAG;SOR=1.375;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=55;TCF=45;TCR=10;TR=28;WE=50519257;WS=50519239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,30:0.44:68
chr19	50534520	rs17661933	G	A	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.310;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=176;ReadPosRankSum=1.737;SC=GCTCCCAGGCGATCTTTTTTA;SOR=1.981;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=11;WE=50534528;WS=50534510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr19	50657786	rs66651303	AG	A	6989.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=65;NR=52;PP=2966;SC=TGACCCATCCAGGGGAGTCGC;SOR=1.840;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=138;TCF=71;TCR=67;TR=117;WE=50657795;WS=50657776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr19	50720793	rs55934167	C	T	2064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.48;ReadPosRankSum=1.248;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,53:0.50:106
chr19	50720793	.	CGG	TGA	1419	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=32;NR=9;PP=1419;QD=35.9138506064;SC=GTGCAGTGCACGGCCTGCTCA;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=93;TCF=70;TCR=23;TR=41;WE=50720803;WS=50720783;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:52,41:0.44:93
chr19	50720795	rs10412634	G	A	2064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.94;ReadPosRankSum=0.952;SOR=0.634;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,55:0.50:109
chr19	50720940	rs34796700	T	C	3764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=374;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.193;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=94;PP=1963;ReadPosRankSum=-0.448;SC=CAGAAGCCATTGTGGAGATGT;SOR=0.811;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=334;TCF=159;TCR=175;TR=175;WE=50720948;WS=50720930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,189:0.51:371
chr19	50721074	rs4802666	G	A	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.231;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=220;ReadPosRankSum=0.430;SC=GCTCTTCAACGGGGGCCTGAC;SOR=0.223;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=13;WE=50721082;WS=50721064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr19	50726459	rs654877	T	C	3006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.369;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=63;PP=1709;ReadPosRankSum=-0.137;SC=GGAGCTTGCCTGAGGTCATTG;SOR=0.777;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=277;TCF=143;TCR=134;TR=133;WE=50726467;WS=50726449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,148:0.50:298
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chr19	50771609	rs3745504	G	A	1028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=20;PP=634;ReadPosRankSum=0.310;SC=AGAAGAGGCTGCAGCAGCACA;SOR=0.749;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=79;TCF=47;TCR=32;TR=47;WE=50771617;WS=50771599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,50:0.57:88
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chr19	50796352	rs651044	C	A	2042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.569;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=28;PP=1315;ReadPosRankSum=1.033;SC=CTGTAGGTTGCAGCTCATTCC;SOR=0.752;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=160;TCF=108;TCR=52;TR=84;WE=50796360;WS=50796342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,92:0.52:178
chr19	50796905	rs3745509	G	A	614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.890;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=12;PP=356;ReadPosRankSum=0.598;SC=AGAGCAACTCGGAGCTGCTCA;SOR=0.778;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=66;TCF=37;TCR=29;TR=29;WE=50796913;WS=50796895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,32:0.44:73
chr19	50796960	rs3745510	C	T	716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.928;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=16;PP=463;ReadPosRankSum=0.048;SC=CGTGATTGACCGCCCCCACCA;SOR=0.576;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=30;TCR=31;TR=32;WE=50796968;WS=50796950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,33:0.52:64
chr19	50805138	rs3826772	C	T	1129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.918;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=32;PP=710;ReadPosRankSum=0.352;SC=TAGGTGAGAGCGGAGGCCACA;SOR=1.179;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=91;TCF=36;TCR=55;TR=49;WE=50805146;WS=50805128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,52:0.53:99
chr19	50812221	rs889002	A	G	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.021;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=59;ReadPosRankSum=0.149;SC=GAGTGATGACAGTACCTGGAG;SOR=1.371;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=7;WE=50812229;WS=50812211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr19	50813263	rs627491	T	G	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=190;ReadPosRankSum=-0.107;SC=AGGGAGGCAATGACTGGAGCT;SOR=0.582;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=11;WE=50813271;WS=50813253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr19	50832152	rs375912738	T	C	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.67;ReadPosRankSum=2.020;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr19	50837859	rs56849250	C	CA	194.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.47;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	50881820	rs55652650	A	AAAC	4664.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.873;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=4.018;NF=6;NR=50;PP=2432;ReadPosRankSum=1.711;SC=GAAGATTCGGAAACAGCAGCA;SOR=0.743;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=139;TCF=30;TCR=109;TR=56;WE=50881828;WS=50881810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,126:0.50:254
chr19	50909389	rs1673041	T	G	2716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=24;PP=1946;SC=TCTTCAGGCTTATGTGACGGG;SOR=1.821;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=88;TCF=64;TCR=24;TR=87;WE=50909397;WS=50909379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr19	50919797	rs3218776	C	T	1906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=40;NR=28;PP=1098;SC=TACGGGGGCACCAGGGGACTG;SOR=0.963;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=70;TCF=40;TCR=30;TR=68;WE=50919805;WS=50919787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr19	50922370	rs2244095	A	G	430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=4;NR=9;PP=211;SC=GGAGGGGTCCACCCTGTCTCT;SOR=1.739;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=13;WE=50922378;WS=50922360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	50926126	rs61729811	C	T	3739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.412;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=88;PP=2247;ReadPosRankSum=-0.027;SC=CAGCCACCCCCTATGAAGCCT;SOR=0.806;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=272;TCF=127;TCR=145;TR=161;WE=50926134;WS=50926116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,174:0.59:297
chr19	50926264	rs1673030	TG	CC	1753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=22;PP=1349;SC=CTGGCCTCCCTGCATACCCCA;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=31;WE=50926273;WS=50926254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr19	50926742	rs3745516	A	G	609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=2;PP=416;SC=AAAGGCCAAAATCTAGGCTGT;SOR=3.056;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=50926750;WS=50926732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	50927059	rs76521311	G	T	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=95;ReadPosRankSum=0.831;SC=TGGAGATGGTGGGGGGGCTGA;SOR=0.693;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=8;WE=50927067;WS=50927049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr19	50936378	rs3765069	C	T	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=178;ReadPosRankSum=-0.448;SC=TGGGGGTTCCCGCATCAGTTT;SOR=1.148;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=11;WE=50936386;WS=50936368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr19	50938385	rs11669020	C	A	2978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=59;PP=1759;ReadPosRankSum=0.752;SC=GTGCAGACCGCATGCTCAACT;SOR=0.687;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=281;TCF=155;TCR=126;TR=129;WE=50938393;WS=50938375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,148:0.47:312
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chr19	50940594	rs2293455	G	C	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=333;ReadPosRankSum=0.811;SC=GCCCAGGCCTGAGCAAGGTTG;SOR=0.446;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=19;WE=50940602;WS=50940584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
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chr19	50967640	rs25667	G	A	4010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.738;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=80;PP=2126;ReadPosRankSum=1.549;SC=ATGGAAATCCGTGAAGATCCC;SOR=0.689;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=313;TCF=161;TCR=152;TR=169;WE=50967648;WS=50967630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,195:0.55:356
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chr19	50983930	rs10409679	C	T	1544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.622;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=35;PP=930;ReadPosRankSum=0.880;SC=TGACGCACCCCGGGGGCTGCC;SOR=0.772;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=136;TCF=71;TCR=65;TR=74;WE=50983938;WS=50983916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,77:0.55:141
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chr19	50986074	rs14031	G	A	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.679;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=100;ReadPosRankSum=1.126;SC=CTGGATGGCCGGGGGCTTCTG;SOR=1.514;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=7;WE=50986082;WS=50986064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,7:0.27:26
chr19	50986590	rs139546278	T	TC	144.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.461;NF=0;NR=7;PP=159;ReadPosRankSum=0.293;SC=TATTAAACTGTCCCCCAGATC;SOR=0.275;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=7;WE=50986598;WS=50986580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr19	51014850	rs7254387	C	T	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.497;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=320;ReadPosRankSum=-1.786;SC=TCAGAGACGCCAGGCGGTGCG;SOR=0.278;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=23;WE=51014858;WS=51014840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,24:0.69:35
chr19	51015404	rs12977172	T	C	1166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=10;PP=683;SC=CAGGAGGCTCTGCCAGAAGGC;SOR=1.556;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=27;TCR=10;TR=37;WE=51015412;WS=51015394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr19	51016342	rs188761732	C	T	769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.120;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=20;PP=426;ReadPosRankSum=-0.302;SC=CCCTCCGAGTCTACTGAGGGC;SOR=1.018;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=62;TCF=22;TCR=40;TR=29;WE=51016350;WS=51016332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,36:0.51:71
chr19	51017835	rs889131	G	A	5344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=111;PP=2965;SC=CCCAGCTCGCGTCAGCCCAGG;SOR=1.261;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=182;TCF=71;TCR=111;TR=181;WE=51017843;WS=51017825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr19	51020903	rs61751956	A	G	5801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=105;NR=98;PP=2965;SC=AGTTGAGGCCAGGCGGGCCTT;SOR=0.747;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=203;TCF=105;TCR=98;TR=203;WE=51020911;WS=51020893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr19	51021057	rs61751957	A	G	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=9;PP=370;ReadPosRankSum=0.573;SC=CCCACTGGCCACGGCGGCCGC;SOR=0.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=52;TCF=33;TCR=19;TR=25;WE=51021065;WS=51021047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,26:0.46:57
chr19	51052189	rs11880112	T	C	301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.55;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	51128661	rs16986142	T	C	1932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.681;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=47;PP=1372;ReadPosRankSum=0.266;SC=AGTCGTAGTCTACCACGGCGA;SOR=0.769;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=196;TCF=101;TCR=95;TR=92;WE=51128669;WS=51128651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,97:0.46:211
chr19	51128856	rs10426057	A	C	1161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.685;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=24;PP=593;ReadPosRankSum=-0.906;SC=ACAGAGACTCACTCCCTCAGA;SOR=0.499;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=86;TCF=40;TCR=46;TR=49;WE=51128864;WS=51128846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,56:0.58:97
chr19	51132952	.	G	A	154	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=5;HapScore=2;MGOF=18;MMLQ=19;MQ=56.05;NF=9;NR=2;PP=154;QD=17.1610193225;SC=GGGAGTCCAGGCCCCCAGCCC;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=11;WE=51132960;WS=51132942;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:13,11:0.46:24
chr19	51132979	.	G	A	298	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=27;MQ=58.38;NF=15;NR=3;PP=298;QD=18.487289586;SC=CCTCAGACCCGGGAGTCCAGA;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=38;TCF=30;TCR=8;TR=18;WE=51132987;WS=51132969;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:20,18:0.47:38
chr19	51133356	rs10407511	C	G	1212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=3.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.72;ReadPosRankSum=0.863;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,65:0.47:139
chr19	51159571	rs4801844	T	G	1908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.079;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=45;PP=1201;ReadPosRankSum=0.447;SC=ACCACCAGCTTCCCAGCCCCT;SOR=0.600;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=192;TCF=87;TCR=105;TR=84;WE=51159579;WS=51159561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,94:0.45:210
chr19	51161088	rs10404821	C	A	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.062;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=288;ReadPosRankSum=-0.235;SC=CTCCTTTGACCATAGCGACAG;SOR=0.223;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=18;WE=51161096;WS=51161078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
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chr19	51200290	rs34959666	G	GC	6499.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=21;NR=72;PP=2975;SC=ACGTTCACACGCCCCCCAGGC;SOR=0.979;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=103;TCF=22;TCR=81;TR=93;WE=51200298;WS=51200280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr19	51217550	rs3745530	G	A	1976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.023;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=43;PP=1142;ReadPosRankSum=-0.698;SC=AACCCCGTCTGAGCCATGGGC;SOR=0.604;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=205;TCF=107;TCR=98;TR=93;WE=51217558;WS=51217535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,102:0.45:228
chr19	51227977	rs114190815	T	C	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=185;ReadPosRankSum=-1.134;SC=TGCTGTGTGCTAGCGGACGGG;SOR=0.754;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=27;TCF=11;TCR=16;TR=13;WE=51227985;WS=51227967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr19	51228634	rs11084024	G	A	3535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.811;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.99;MQRankSum=1.003;NF=80;NR=81;PP=2151;ReadPosRankSum=0.085;SC=GCACGCTCGAGAACTGCGTGG;SOR=0.638;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=315;TCF=159;TCR=156;TR=161;WE=51228642;WS=51228624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,172:0.50:345
chr19	51228802	rs1053020	T	G	2696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=58;PP=1762;SC=CTCCGGAATCTCCCTTCCCTT;SOR=1.562;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=32;TCR=58;TR=90;WE=51228810;WS=51228792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr19	51262620	rs10424138	A	C	3560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=75;PP=2317;SC=CCAGTCTTTGACTTCTGCCCT;SOR=1.485;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=41;TCR=75;TR=116;WE=51262628;WS=51262610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr19	51262668	rs12983009	C	T	1372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=37;PP=1036;SC=TCTGTCATCCCGTCCCCGTGG;SOR=4.223;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=4;TCR=37;TR=41;WE=51262676;WS=51262658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr19	51274851	rs201404376	A	C	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=353;ExcessHet=3.0103;FS=15.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.99;MQRankSum=-10.821;QD=1.11;ReadPosRankSum=2.068;SOR=0.725;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:296,57:0.16:353
chr19	51321813	rs2411334	A	G	1496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.70;ReadPosRankSum=0.717;SOR=0.666;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,74:0.43:172
chr19	51321919	rs3212841	C	CCAGCCTTCGCAGGCCACACCCTGAAGCCACTCTCCACCCGCT	246.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=7.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.67;ReadPosRankSum=0.480;SOR=2.678;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,8:0.22:37
chr19	51323473	rs5516	C	G	2638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.925;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=56;PP=1515;ReadPosRankSum=-0.227;SC=TCGGGTTCCTCGGTGGGCAAC;SOR=0.853;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=203;TCF=103;TCR=100;TR=112;WE=51323481;WS=51323463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,122:0.53:229
chr19	51323501	rs1054713	A	G	1788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=34;PP=985;ReadPosRankSum=-1.687;SC=CCTTCACAGCATCTGTGATGG;SOR=0.710;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=133;TCF=68;TCR=65;TR=72;WE=51323509;WS=51323491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,85:0.53:159
chr19	51323733	rs2740505	C	T	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.67;ReadPosRankSum=-1.732;SOR=0.675;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,42:0.52:80
chr19	51323881	rs2659103	T	G	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.260;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=86;ReadPosRankSum=-0.816;SC=AGATGAAAGATTTTGAGAGTG;SOR=3.312;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=6;WE=51323889;WS=51323871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr19	51331199	rs142271509	G	GT	1175.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.35;QD=41.99;SOR=2.468;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	51331204	.	T	TTG	639	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;FR=1.0000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=60.8;NF=0;NR=18;PP=639;QD=36.9444444444;SC=GCCCTGTTTTTGTTTGTTGTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=18;WE=51331213;WS=51331189;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,18:0.95:19
chr19	51331205	.	G	T	502	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;FR=1.0000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=6;NR=16;PP=502;QD=24.3986914794;SC=CCCTGTTTTTGTTTGTTGTTG;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=22;WE=51331213;WS=51331189;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,22:0.88:25
chr19	51331205	rs372866981	G	GT	1175.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.55;SOR=2.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	51358394	rs2292186	C	T	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=251;ReadPosRankSum=-1.518;SC=CAGCCCCACTCCAAGCCCATA;SOR=0.368;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=15;WE=51358402;WS=51358384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr19	51359453	rs2271095	T	C	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=84;ReadPosRankSum=-0.854;SC=CCCCAGTTCCTCCTGTCAACC;SOR=0.307;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=6;WE=51359461;WS=51359443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,2:0.25:8
chr19	51359456	.	T	A	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.812;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.86;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,2:0.22:9
chr19	51359497	rs11573	T	C	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=3.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.10;ReadPosRankSum=0.945;SOR=1.479;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr19	51359503	rs1135766	A	G	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=3.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.19;ReadPosRankSum=-0.404;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr19	51361644	rs1810020	A	G	2007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.278;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=35;PP=1201;ReadPosRankSum=-2.359;SC=CAGGACTCCTAGGTCTGAGGG;SOR=0.441;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=155;TCF=94;TCR=61;TR=84;WE=51361652;WS=51361634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,99:0.53:186
chr19	51363026	rs2659122	C	T	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.224;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=67;ReadPosRankSum=-0.923;SC=GTCCCTTCCCCACCGGCCAGG;SOR=0.412;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=5;WE=51363034;WS=51363016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr19	51363398	rs1058205	C	T	2986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.434;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=71;PP=1752;ReadPosRankSum=0.354;SC=CCCTATCAACCCCCTATTGTA;SOR=0.734;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=258;TCF=118;TCR=140;TR=129;WE=51363406;WS=51363388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,143:0.50:285
chr19	51379893	rs198972	C	T	2865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.884;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=71;PP=1750;ReadPosRankSum=0.181;SC=TCATGCTGCTCCGCCTGTCAG;SOR=0.754;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=266;TCF=119;TCR=147;TR=126;WE=51379901;WS=51379883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,139:0.46:301
chr19	51380110	rs6070	T	A	2199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.339;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=38;PP=1212;ReadPosRankSum=-0.925;SC=CACAGCCCAGTTTTTCTCTGA;SOR=0.552;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=192;TCF=114;TCR=78;TR=90;WE=51380118;WS=51380100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,103:0.48:213
chr19	51380445	rs8105275	G	T	599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.994;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=22;PP=414;ReadPosRankSum=-0.331;SC=CAACACAAGAGGTGATTCTCA;SOR=0.134;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=55;TCF=8;TCR=47;TR=28;WE=51380453;WS=51380435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,28:0.51:55
chr19	51381777	rs198977	C	T	2649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.348;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=54;PP=1580;ReadPosRankSum=1.242;SC=GGTGCATTACCGGAAGTGGAT;SOR=0.778;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=287;TCF=160;TCR=127;TR=127;WE=51381785;WS=51381767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:179,136:0.43:315
chr19	51391121	rs66651444	A	C	1030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.698;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=26;PP=657;ReadPosRankSum=-0.853;SC=CTGGATGGCAATCACAGCATC;SOR=1.126;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=85;TCF=40;TCR=45;TR=42;WE=51391129;WS=51391111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,49:0.48:103
chr19	51410171	rs73042387	G	A	1663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=31;PP=931;ReadPosRankSum=1.869;SC=TCAATTTCATGGGTTCCCAGT;SOR=0.661;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=140;TCF=84;TCR=56;TR=75;WE=51410179;WS=51410161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,82:0.53:154
chr19	51411636	rs2569527	G	T	2039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=39;NR=21;PP=1100;SC=CCTTCTGGTCGTGCCCTCCGC;SOR=1.257;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=39;TCR=21;TR=60;WE=51411644;WS=51411626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr19	51447065	rs1701949	T	C	1083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=26;PP=672;SC=AAGGGGGGCATGAGAGAGGCA;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=10;TCR=26;TR=36;WE=51447073;WS=51447055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr19	51452250	rs183854	T	C	3852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=69;NR=69;PP=2002;SC=AGCATGAGGTTGTTAGAGTGG;SOR=0.776;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=69;TCR=69;TR=138;WE=51452258;WS=51452240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr19	51465096	rs1701950	C	G	1018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=26;PP=684;ReadPosRankSum=-0.381;SC=CACGGGACACCAGGTGGATGT;SOR=0.759;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=99;TCF=44;TCR=55;TR=46;WE=51465104;WS=51465086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,51:0.45:114
chr19	51466516	rs1654537	A	G	599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.010;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=10;PP=379;ReadPosRankSum=-1.308;SC=CACTTCCCCAAGTAGCCAGTA;SOR=0.525;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=54;TCF=35;TCR=19;TR=26;WE=51466524;WS=51466506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,29:0.49:59
chr19	51480671	rs59354651	AGGTT	A	2436.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=10;PP=1478;SC=ACAGGGCATGAGGTTGGTTTA;SOR=1.692;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=22;TCR=11;TR=30;WE=51480682;WS=51480661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr19	51482969	rs1701924	C	T	912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=6;PP=621;SC=CCCAGTCACTCGGGTCAAGCT;SOR=2.448;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=32;WE=51482977;WS=51482959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	51484984	rs1991820	C	T	971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.20;ReadPosRankSum=0.631;SOR=0.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,25:0.42:60
chr19	51484990	rs1991819	T	C	968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=1.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.38;ReadPosRankSum=-0.036;SOR=0.848;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,27:0.43:63
chr19	51485013	rs1991818	C	T	2842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=30;PP=1591;SC=GAGACTTGGGCGGCACCTACT;SOR=1.338;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=56;TCR=30;TR=86;WE=51485021;WS=51485003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr19	51485194	rs1654523	C	T	3505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=69;PP=2121;SC=TGGAGGAGCACGTGGGTAGCT;SOR=1.206;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=47;TCR=69;TR=116;WE=51485202;WS=51485184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr19	51485622	rs2659067	A	G	4356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=70;NR=78;PP=2746;SC=GATAGCAGTAAGATCTGCAGG;SOR=0.850;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=148;TCF=70;TCR=78;TR=148;WE=51485630;WS=51485612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr19	51487067	rs1275221	T	C	4113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=72;NR=61;PP=2368;SC=AGCATCACCCTCTCCCCTACA;SOR=0.745;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=133;TCF=72;TCR=61;TR=133;WE=51487075;WS=51487057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr19	51487175	rs1624358	T	G	2401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=43;PP=1413;SC=AAAATCTTCATCCCTCTGCTG;SOR=1.286;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=30;TCR=43;TR=73;WE=51487183;WS=51487165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr19	51499195	rs1612902	T	C	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.890;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=72;ReadPosRankSum=-1.761;SC=CCCCACCTAGTCTGCCAGCAG;SOR=1.096;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=6;WE=51499203;WS=51499185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,8:0.28:29
chr19	51503524	rs1701946	T	C	950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.721;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=22;PP=549;ReadPosRankSum=-1.277;SC=CCTGTAATGGTGGGGATAGTT;SOR=0.837;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=97;TCF=46;TCR=51;TR=41;WE=51503532;WS=51503514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,48:0.42:113
chr19	51504075	rs1701947	A	T	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=169;ReadPosRankSum=0.630;SC=ACAGGCCCCGAGTACTCCCAG;SOR=0.509;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=11;WE=51504083;WS=51504065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr19	51507020	rs2075802	T	G	1372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=25;PP=871;ReadPosRankSum=-0.580;SC=CCGAGATGTGTCCAGGGTATG;SOR=0.712;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=149;TCF=90;TCR=59;TR=63;WE=51507028;WS=51507010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,69:0.42:163
chr19	51518222	rs2075696	G	A	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.497;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=209;ReadPosRankSum=-0.274;SC=GGGGTGGCAGGAAGGAGAGAT;SOR=0.263;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=16;WE=51518230;WS=51518212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr19	51519114	rs2075691	C	T	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=106;ReadPosRankSum=-0.709;SC=CCTGAGGTTCCGGCCTCAGAG;SOR=1.688;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=7;WE=51519122;WS=51519104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr19	51519143	.	C	T	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.123;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=60;ReadPosRankSum=0.345;SC=CTTGCCTCTCCGGGCGGCCGT;SOR=0.527;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=8;WE=51519151;WS=51519133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr19	51519236	rs2075690	A	G	1773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.911;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=31;PP=1058;ReadPosRankSum=-1.037;SC=GCGGGGCCCCAGCACTACGGG;SOR=0.433;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=142;TCF=94;TCR=48;TR=82;WE=51519244;WS=51519226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,87:0.55:157
chr19	51519259	rs2075689	C	T	2297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.977;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=40;PP=1191;ReadPosRankSum=-1.016;SC=TGGCCAGCTTCAGCAACATGA;SOR=0.476;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=188;TCF=115;TCR=73;TR=97;WE=51519267;WS=51519249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,106:0.51:208
chr19	51519346	rs1061368	G	C	1938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.648;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=47;PP=935;ReadPosRankSum=-0.572;SC=CAGAGCGAGTGGTCCGGCGGA;SOR=0.821;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=191;TCF=94;TCR=97;TR=89;WE=51519354;WS=51519336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,99:0.45:219
chr19	51519364	rs2075688	T	G	1646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.160;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=37;PP=903;ReadPosRankSum=-0.582;SC=GGAGCTGCTCTCCCTGAAGAA;SOR=0.799;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=158;TCF=74;TCR=84;TR=69;WE=51519372;WS=51519354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,80:0.43:185
chr19	51519451	rs2075687	T	C	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.792;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=258;ReadPosRankSum=-1.088;SC=AAACCCTTCATAGGGACTGGG;SOR=0.334;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=52;TCF=20;TCR=32;TR=20;WE=51519459;WS=51519441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,24:0.40:60
chr19	51519480	rs12981039	C	A	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.112;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=172;ReadPosRankSum=1.219;SC=TGGGCAGTGACGCAGGGCCTG;SOR=0.244;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=14;WE=51519488;WS=51519470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,14:0.33:43
chr19	51520487	rs3745535	A	C	1429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=28;PP=765;ReadPosRankSum=-1.931;SC=GCGCACGGGGAGCCATAGGCT;SOR=0.739;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=121;TCF=68;TCR=53;TR=65;WE=51520495;WS=51520477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,70:0.55:128
chr19	51522286	rs2304156	C	T	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.59;ReadPosRankSum=0.382;SOR=0.831;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,13:0.21:62
chr19	51522291	rs2304157	G	C	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.32;ReadPosRankSum=1.242;SOR=0.788;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,12:0.20:61
chr19	51525703	rs1048344	T	C	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=395;ReadPosRankSum=-0.990;SC=AGAATGTTCGTAGAGGGTCTT;SOR=0.749;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=66;TCF=48;TCR=18;TR=26;WE=51525711;WS=51525693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,26:0.36:72
chr19	51530693	rs1474520	G	A	2922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=31;PP=1847;SC=CAGGCAGCCCGAGTCCAGCTG;SOR=1.483;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=69;TCR=31;TR=100;WE=51530701;WS=51530683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr19	51530741	rs61752567	C	G	1901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.523;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=38;PP=1082;ReadPosRankSum=-0.028;SC=TGCCCGATGACTTCCAGTCCC;SOR=0.635;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=181;TCF=105;TCR=76;TR=87;WE=51530749;WS=51530731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,94:0.47:198
chr19	51535130	rs3745540	A	G	2997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.363;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=71;PP=1823;ReadPosRankSum=-0.366;SC=TGGGCCCCTTACTCCGTGGGT;SOR=0.598;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=280;TCF=130;TCR=150;TR=132;WE=51535138;WS=51535120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,147:0.48:307
chr19	51535460	rs10635364	T	TCC	226.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.708;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=230;ReadPosRankSum=-0.342;SC=CCACGGACACTCAGGCGCTCC;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=6;WE=51535468;WS=51535450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr19	51563265	rs34089525	G	A	2967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.502;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=63;PP=1814;ReadPosRankSum=-0.244;SC=TATTCAGGGTGGGGGATAGAG;SOR=0.627;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=227;TCF=121;TCR=106;TR=129;WE=51563273;WS=51563255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,141:0.55:256
chr19	51563965	rs2569474	G	A	241.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=197;SC=GGTAAGGGTCGGATTATTGCC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=51563973;WS=51563955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	51566865	rs112237160	C	T	561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=373;ReadPosRankSum=2.396;SC=TTGAGGACTCCACAAGGCGTA;SOR=0.646;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=37;TCR=12;TR=24;WE=51566873;WS=51566855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,25:0.49:51
chr19	51566943	rs2736433	G	A	3760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=52;PP=2155;SC=AGGGAGTGTCGCCAGAGGAGA;SOR=0.846;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=119;TCF=67;TCR=52;TR=119;WE=51566951;WS=51566933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr19	51567176	rs2736431	G	A	3574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=67;PP=1994;SC=TAACATCTGCGTCTGTCCCCG;SOR=1.089;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=120;TCF=52;TCR=68;TR=119;WE=51567184;WS=51567166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr19	51567990	rs10500306	T	C	4095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=92;PP=2345;SC=CGCGAACCCATGTCTTTCAGC;SOR=1.478;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=53;TCR=92;TR=145;WE=51567998;WS=51567980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr19	51568029	rs2736434	G	T	1767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=43;PP=1335;SC=AGCCTTGAACGCGGGAGGGGC;SOR=2.226;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=15;TCR=43;TR=58;WE=51568037;WS=51568019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr19	51568066	rs12979090	A	G	822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=44;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=23;PP=670;SC=TGGGAGGTGAAGGGTCTGGGG;SOR=3.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=27;WE=51568074;WS=51568056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	51582217	rs113235029	C	A	2225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.525;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=64;PP=1489;ReadPosRankSum=-1.154;SC=GGCTGGGGGACACTGCAGGGT;SOR=0.750;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=198;TCF=72;TCR=126;TR=99;WE=51582225;WS=51582207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,106:0.50:211
chr19	51582994	rs11671800	G	T	569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=1.543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.25;ReadPosRankSum=-0.092;SOR=0.382;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,18:0.42:43
chr19	51583003	rs6509518	A	G	540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=5.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.90;ReadPosRankSum=1.061;SOR=0.066;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr19	51584743	rs2569489	A	G	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=61;ReadPosRankSum=-1.125;SC=AGGGCTTTAGACTCTGGAATT;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=5;WE=51584751;WS=51584733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr19	51584916	rs2569491	G	A	2459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=49;PP=1418;ReadPosRankSum=-0.379;SC=GTGCACGTATGGCCACCAATT;SOR=0.663;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=220;TCF=117;TCR=103;TR=104;WE=51584924;WS=51584906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,120:0.49:244
chr19	51584951	rs35287116	T	C	2221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.260;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=51;PP=1001;ReadPosRankSum=-0.592;SC=CTCTTGGCTCTGTGTCATGGC;SOR=0.860;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=200;TCF=97;TCR=103;TR=96;WE=51584959;WS=51584941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,114:0.51:225
chr19	51628529	rs2075803	A	G	8078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.99;NF=120;NR=143;PP=2965;SC=CCCACATACCAAGAATTGCAC;SOR=0.968;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=263;TCF=120;TCR=143;TR=263;WE=51628537;WS=51628519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,285:1.00:285
chr19	51629585	rs66544068	C	A	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=237;ReadPosRankSum=0.704;SC=CCACACACCCCCCCCTCAGCC;SOR=0.818;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=15;WE=51629593;WS=51629575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,15:0.42:36
chr19	51630482	rs2258983	C	A	3864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=66;PP=2267;SC=CTGAGGGATGCAGCTGAATTC;SOR=1.114;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=121;TCF=55;TCR=66;TR=121;WE=51630490;WS=51630472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr19	51656218	rs273661	G	C	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=1;PP=338;SC=CTATACAGAGGAATATATCCG;SOR=2.985;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=51656226;WS=51656208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	51656454	rs273662	A	T	2979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=54;PP=1816;SC=ACCTATCAGGACAAGAAGCCA;SOR=0.784;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=106;TCF=52;TCR=54;TR=106;WE=51656462;WS=51656444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr19	51728641	rs2455069	A	G	1155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.715;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;ReadPosRankSum=0.990;SC=CATTATATCCAGGGACTCTCC;SOR=0.385;SbPval=0.33;Source=Platypus;TCF=43;WE=51728649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,54:0.49:111
chr19	51767205	rs6509523	C	T	4862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=67;PP=2888;SC=CTGCTCTCCCCATCCCCACAT;SOR=1.005;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=167;TCF=100;TCR=67;TR=167;WE=51767213;WS=51767195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr19	51767485	rs875283	A	G	70.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=3;PP=49;SC=AATAATCAACATGAATTAGAC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=51767493;WS=51767475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr19	51825238	rs34297802	C	T	989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.829;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=15;PP=595;ReadPosRankSum=-0.725;SC=CAAGGACGTGCGTGTGCACAT;SOR=0.499;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=79;TCF=55;TCR=24;TR=42;WE=51825246;WS=51825228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,46:0.53:87
chr19	51828595	rs60865738	C	T	1070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.31;ReadPosRankSum=-0.110;SOR=0.579;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,53:0.61:87
chr19	51831759	rs201453907	G	A	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=50.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.79;ReadPosRankSum=1.870;SOR=5.781;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr19	51835892	rs11402251	T	TG	6969.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=79;PP=2965;SC=CTGGGGTCTGTGCCTGGAAGA;SOR=0.924;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=18;TCR=82;TR=96;WE=51835900;WS=51835882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr19	51850290	rs1130426	G	A	3514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=49;PP=1822;ReadPosRankSum=2.299;SC=CCCCTCCAGCGTCACCTGGGA;SOR=0.880;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=75;TCR=49;TR=123;WE=51850298;WS=51850280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,138:0.99:140
chr19	51853468	rs4802789	C	T	501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=1;PP=379;SC=TGAGGCAATCCGAGGGAACAG;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=51853476;WS=51853467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	51856619	rs2004309	T	C	2284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=36;PP=1085;SC=AGCCCCTCCTTCCTCAGACCC;SOR=1.649;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=18;TCR=36;TR=54;WE=51856649;WS=51856609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr19	51856631	rs3889312	G	A	1706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.76;QD=44.91;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr19	51856641	rs3889313	G	C	1546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.42;QD=51.56;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	51869346	rs3786625	G	A	730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.893;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=9;PP=450;ReadPosRankSum=-0.005;SC=CGTGACCCCGGAGGGATCGGA;SOR=0.994;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=69;TCF=48;TCR=21;TR=33;WE=51869354;WS=51869336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,37:0.46:80
chr19	51871195	rs3745403	G	A	3863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=349;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=75;PP=2196;ReadPosRankSum=2.369;SC=CGCCCTCGTCGCACCGAATCC;SOR=0.696;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=316;TCF=175;TCR=141;TR=167;WE=51871203;WS=51871185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,186:0.53:348
chr19	51874950	rs3009	G	A	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=294;ReadPosRankSum=-0.628;SC=GGGCAGATGTGGGACCAGACT;SOR=0.569;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=20;WE=51874958;WS=51874940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,22:0.51:43
chr19	51883727	rs2547318	G	A	1139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.610;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=16;PP=701;ReadPosRankSum=-0.792;SC=TCTGCCCCAGGCACTGACCTT;SOR=0.949;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=99;TCF=62;TCR=37;TR=47;WE=51883735;WS=51883717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,53:0.50:106
chr19	51919240	rs79484306	C	T	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=1.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQRankSum=-5.748;QD=6.26;ReadPosRankSum=1.616;SOR=0.690;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,17:0.23:73
chr19	51919263	rs7258951	G	T	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=2.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQRankSum=-6.087;QD=6.15;ReadPosRankSum=2.236;SOR=0.849;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,14:0.22:65
chr19	51919267	rs7258638	A	G	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=2.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQRankSum=-6.032;QD=6.25;ReadPosRankSum=1.920;SOR=0.870;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,14:0.22:64
chr19	51919279	rs200737875	A	G	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=2.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQRankSum=-6.106;QD=6.07;ReadPosRankSum=1.265;SOR=1.247;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,12:0.22:55
chr19	51919302	rs201376644	T	C	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=6.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.89;MQRankSum=-6.425;QD=3.46;ReadPosRankSum=-1.198;SOR=2.391;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,7:0.16:43
chr19	51919434	rs375392809	GA	G	126.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=7.950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.80;MQRankSum=3.939;QD=2.04;ReadPosRankSum=0.113;SOR=1.092;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,16:0.26:62
chr19	51919507	rs62114257	T	C	6508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=133;NR=99;PP=2965;SC=CCTCATCCCCTGAAGCCTTTT;SOR=0.768;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=232;TCF=133;TCR=99;TR=232;WE=51919515;WS=51919497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr19	51919949	rs9304711	G	A	521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.370;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.207;NF=17;NR=6;PP=331;ReadPosRankSum=-1.255;SC=GGTCCTCTGTGCGCTCACACC;SOR=0.424;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=23;WE=51919957;WS=51919939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,24:0.60:40
chr19	51920613	rs1010425	C	T	6496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=115;NR=108;PP=2965;SC=CTGTCCAGTCCTGTCGGGGGT;SOR=0.719;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=224;TCF=115;TCR=109;TR=223;WE=51920621;WS=51920603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
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chr19	51957556	rs3829659	T	C	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.817;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-1.253;NF=2;NR=14;PP=236;ReadPosRankSum=-0.693;SC=GATTTCTTCCTGCAGGACCTC;SOR=1.426;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=16;WE=51957564;WS=51957546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
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chr19	51988280	rs10414941	G	A	1108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.767;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=28;PP=780;ReadPosRankSum=0.233;SC=TCCATCTCAGGATCCATGGTG;SOR=0.607;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=41;TCR=50;TR=51;WE=51988288;WS=51988270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,52:0.55:95
chr19	51988326	rs10416318	T	C	609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.919;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=16;PP=376;ReadPosRankSum=-2.619;SC=TGGGTGGCGTTTACATCTGTG;SOR=0.989;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=70;TCF=35;TCR=35;TR=28;WE=51988334;WS=51988316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,30:0.38:79
chr19	51994813	rs16982733	G	T	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=199;ReadPosRankSum=1.006;SC=ATGGAGGGCTGTTAATTCTAA;SOR=1.022;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=13;WE=51994821;WS=51994803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr19	51994851	rs16982735	C	G	687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.124;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=10;PP=471;ReadPosRankSum=-0.770;SC=TTCTTTGCTGCAGGGGTCGTG;SOR=0.437;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=48;TCF=33;TCR=15;TR=29;WE=51994859;WS=51994841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,30:0.56:54
chr19	51995046	rs57043266	G	T	1052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.740;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=24;PP=556;ReadPosRankSum=0.494;SC=AGCATGGTGTGGGGGGCTGTC;SOR=0.436;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=86;TCF=37;TCR=49;TR=46;WE=51995054;WS=51995036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,51:0.53:96
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chr19	52000672	rs3829658	G	A	2036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=29;PP=1100;ReadPosRankSum=-0.761;SC=TGCCCCTAGCGTCACTCCTGA;SOR=0.725;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=162;TCF=98;TCR=64;TR=83;WE=52000680;WS=52000662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,97:0.54:178
chr19	52000904	rs2864097	T	G	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=199;ReadPosRankSum=-0.285;SC=TTTGATTAGTTTTCACCATGG;SOR=0.784;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=12;WE=52000912;WS=52000894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr19	52001485	rs11668530	G	A	2893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.470;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=57;PP=1678;ReadPosRankSum=-0.751;SC=CAGACAAGGTGCAGGGACTGG;SOR=0.923;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=235;TCF=132;TCR=103;TR=131;WE=52001493;WS=52001475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,139:0.55:255
chr19	52002291	rs73051351	A	C	306.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.34;ReadPosRankSum=1.494;SOR=0.437;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,17:0.85:20
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chr19	52002488	.	CGGAGT	AGGAGA,AGGAGT	525	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=18,40;NR=21,38;PP=525,428;QD=14.8325096119;SC=CAGAAAGACACGGAGTTCCCA;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=78;TCF=40;TCR=38;TR=39,78;WE=52002501;WS=52002478;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.50:78
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chr19	52002729	rs2009362	G	A	750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.835;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=11;PP=292;ReadPosRankSum=0.418;SC=TCATGGTCACGCCGGCCCCAG;SOR=0.481;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=72;TCF=36;TCR=36;TR=29;WE=52002737;WS=52002719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,38:0.47:80
chr19	52003058	rs10420446	C	T	998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.987;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=20;PP=686;ReadPosRankSum=-1.102;SC=CTTACTCCTCCCCTGAGCCAG;SOR=0.395;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=80;TCF=48;TCR=32;TR=42;WE=52003066;WS=52003048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,45:0.51:88
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chr19	52003090	rs45554634	C	T	1029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.246;HP=2;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=16;PP=1495;ReadPosRankSum=-0.227;SC=CTCCAACTCCCTCCCAGGATG;SOR=1.079;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=70;TCF=38;TCR=32;TR=42;WE=52003098;WS=52003079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,44:0.60:73
chr19	52003331	rs6509544	G	C	6031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=104;NR=88;PP=2965;SC=GGAATCGACCGTGGGTATCCT;SOR=0.759;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=192;TCF=104;TCR=88;TR=192;WE=52003339;WS=52003321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr19	52004469	rs3810108	C	T	1053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-1.437;NF=31;NR=17;PP=672;ReadPosRankSum=-0.013;SC=CCATCACCCCCGGCCCCCTCC;SOR=0.740;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=103;TCF=65;TCR=38;TR=48;WE=52004477;WS=52004459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,49:0.46:107
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chr19	52004743	rs3810110	G	A	3534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=358;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.799;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=60;PP=1900;ReadPosRankSum=-0.013;SC=CACTGCTCGAGCTGGGTTGTT;SOR=0.758;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=304;TCF=163;TCR=141;TR=138;WE=52004751;WS=52004733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:189,168:0.47:357
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chr19	52004903	rs16982743	G	A	3823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-3.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.277;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=79;PP=2112;ReadPosRankSum=2.682;SC=ACGGACTTCTGCATTGTCAGC;SOR=0.512;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=284;TCF=130;TCR=154;TR=154;WE=52004920;WS=52004893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,179:0.55:327
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chr19	52031162	rs897783	A	G	755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.195;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=16;PP=1228;ReadPosRankSum=-2.339;SC=CCCACTCCCTATGGAGAGTAC;SOR=0.405;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=65;TCF=29;TCR=36;TR=32;WE=52031170;WS=52031138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,35:0.48:73
chr19	52031648	rs10419617	A	G	664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=400;ReadPosRankSum=-2.013;SC=TGAACCCGGAACCAGCCTCTT;SOR=0.763;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=44;TCF=14;TCR=30;TR=25;WE=52031656;WS=52031638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,29:0.58:50
chr19	52032964	rs3976745	C	G	2849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.846;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=61;PP=1928;ReadPosRankSum=1.695;SC=TCGCGCACCTCCCCCCACACT;SOR=0.753;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=305;TCF=169;TCR=136;TR=135;WE=52032972;WS=52032953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:187,141:0.43:328
chr19	52033108	rs74352887	G	A	2503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=52;PP=1576;ReadPosRankSum=-1.405;SC=TGGGGGTGGCGTTCAGGGCGG;SOR=0.703;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=196;TCF=98;TCR=98;TR=103;WE=52033116;WS=52033098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,111:0.53:211
chr19	52033742	rs2305772	G	A	2091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.778;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=44;PP=1094;ReadPosRankSum=3.010;SC=GGAGCATCTGGGGTGGAAAGA;SOR=0.856;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=164;TCF=83;TCR=81;TR=85;WE=52033750;WS=52033732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,100:0.52:192
chr19	52034469	rs1993462	C	T	2214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.181;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=45;PP=1508;ReadPosRankSum=0.489;SC=TCCATTTGGACTTCAACCGAA;SOR=0.509;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=180;TCF=105;TCR=75;TR=97;WE=52034477;WS=52034459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,102:0.51:200
chr19	52034940	rs1551559	C	T	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.391;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=204;ReadPosRankSum=-1.611;SC=GGAAGGACTGCGGGGAGGAAC;SOR=1.832;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=34;TCF=12;TCR=22;TR=16;WE=52034948;WS=52034930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chr19	52084689	.	G	T	994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.324;ClippingRankSum=0.000;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.655;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=22;PP=680;ReadPosRankSum=-1.118;SC=CAGCAGGGAGGAGTGGCAGCA;SOR=0.748;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=123;TCF=67;TCR=56;TR=49;WE=52084697;WS=52084679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,52:0.39:135
chr19	52097401	rs35740364	T	C	7737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=140;NR=120;PP=2965;SC=TCCACTCCCATGGCTGCAGGG;SOR=0.850;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=261;TCF=141;TCR=120;TR=260;WE=52097409;WS=52097391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,285:1.00:285
chr19	52101918	rs1868947	T	C	3504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=58;PP=1976;SC=GTGCAGCACATGGTGCTTGTG;SOR=0.708;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=122;TCF=64;TCR=58;TR=122;WE=52101926;WS=52101908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr19	52104489	rs8113451	C	G	913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.168;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=12;PP=583;ReadPosRankSum=1.340;SC=ACATGGTGGACACCGTGCTCA;SOR=0.392;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=67;TCF=48;TCR=19;TR=38;WE=52104497;WS=52104479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,43:0.54:79
chr19	52104560	rs3752127	T	C	3143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=40;PP=1692;SC=GCTAGGGGGGTGCCCTTCCGC;SOR=1.003;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=104;TCF=63;TCR=41;TR=103;WE=52104568;WS=52104550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr19	52104713	rs3752126	G	C	1758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=41;PP=972;SC=TGCTGGACCTGGTGCACTCGG;SOR=1.946;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=17;TCR=41;TR=58;WE=52104721;WS=52104703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr19	52115645	rs3829655	G	C	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.935;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=10;PP=286;ReadPosRankSum=-0.138;SC=TGATCTCCGGGGCTGTCTGGC;SOR=0.971;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=76;TCF=42;TCR=34;TR=26;WE=52115653;WS=52115635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,28:0.35:81
chr19	52130637	rs1106476	TC	AA	1653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.642;HP=3;HapScore=2;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=11;PP=1128;ReadPosRankSum=-0.654;SC=CAGTCCAGCCTCTCTCTCCCA;SOR=1.501;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=58;TCF=36;TCR=22;TR=34;WE=52130646;WS=52130627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,41:0.67:61
chr19	52130788	rs8104955	G	A	1688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=35;PP=782;ReadPosRankSum=-1.729;SC=TGAGGTCGGAGCTGAGCCCCC;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=151;TCF=76;TCR=75;TR=72;WE=52130796;WS=52130778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,85:0.50:170
chr19	52130830	rs8107754	C	A	755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.998;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=22;PP=455;ReadPosRankSum=1.017;SC=TGGCCCAGGGCCCAGCTGAGC;SOR=1.042;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=81;TCF=29;TCR=52;TR=31;WE=52130838;WS=52130820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,36:0.42:86
chr19	52130925	rs8108074	G	A	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.194;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=247;ReadPosRankSum=0.426;SC=GGGGCCGGCCGGGCTCGAAAG;SOR=0.857;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=43;TCF=22;TCR=21;TR=17;WE=52130933;WS=52130915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,18:0.42:43
chr19	52132405	rs76610544	G	A	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.393;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=8;PP=146;ReadPosRankSum=0.296;SC=TACCCAAAGAGGAGCCACAGA;SOR=0.446;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=29;TCF=12;TCR=17;TR=15;WE=52132413;WS=52132395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr19	52132425	rs79955662	A	C	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=4.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.72;ReadPosRankSum=-0.273;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr19	52132524	.	TAC	T	311.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.148;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=293;ReadPosRankSum=-0.569;SC=CTGTCTTCCTTACACACACAC;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=9;WE=52132533;WS=52132514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr19	52132986	rs200975295	A	G	625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=6;PP=510;SC=ACCTGCCCCAAGTCCTACACC;SOR=1.828;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=22;WE=52132994;WS=52132976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	52148617	rs4544342	A	G	1257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=16;PP=836;SC=GGGAGCAGGAAGGACCCAGAC;SOR=1.280;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=25;TCR=16;TR=41;WE=52148625;WS=52148607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr19	52148804	rs885266	A	C	2692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=42;NR=41;PP=1370;SC=AAGATACAGCACCAGCTTCAG;SOR=1.029;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=42;TCR=41;TR=83;WE=52148812;WS=52148794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr19	52148918	rs1868952	C	G	530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=9;PP=391;SC=CACGAGTTTTCCCTGGTTATC;SOR=1.179;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=7;TCR=9;TR=16;WE=52148926;WS=52148908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	52148980	rs11424909	C	CA	443.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.23;QD=36.98;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	52148981	.	C	A	198	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;FR=1.0000;HP=5;HapScore=2;MGOF=19;MMLQ=23;MQ=44.64;NF=7;NR=5;PP=198;QD=19.3976010456;SC=ACACACACACCCCCCTCACTC;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=12;TCF=7;TCR=5;TR=12;WE=52148989;WS=52148971;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	52148981	.	C	CACACA	443.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.33;QD=36.98;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	52149165	rs71358847	G	A	352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.86;QD=25.20;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	52208277	rs11382950	G	GC	4774.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=28;NR=31;PP=2642;SC=TGGTGTCCAGGCTCCGGGACC;SOR=1.252;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=28;TCR=32;TR=59;WE=52208285;WS=52208267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr19	52208492	rs34764077	G	C	1613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.831;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=37;PP=1065;ReadPosRankSum=-1.162;SC=GTAGGAGGAGGTGCAGCAAGC;SOR=0.929;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=135;TCF=65;TCR=70;TR=68;WE=52208500;WS=52208482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,75:0.49:154
chr19	52227137	.	T	TACACACAC	152.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.27;ReadPosRankSum=0.906;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr19	52249211	rs867228	T	G	5146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=107;NR=77;PP=2965;SC=TGCCTGTAACTCCACCTCTGC;SOR=0.995;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=184;TCF=107;TCR=77;TR=184;WE=52249219;WS=52249201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr19	52249672	rs1042229	A	C	2806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.001;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.102;NF=61;NR=57;PP=1808;ReadPosRankSum=0.121;SC=CAACGGCCACATTTATCCTCT;SOR=0.740;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=216;TCF=111;TCR=105;TR=118;WE=52249680;WS=52249662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,128:0.54:235
chr19	52249702	rs2070746	G	T	2417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.467;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.956;NF=54;NR=50;PP=1439;ReadPosRankSum=0.284;SC=CGTTGGTCCAGGGCGAAAAGT;SOR=0.681;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=222;TCF=113;TCR=109;TR=104;WE=52249710;WS=52249692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,115:0.47:243
chr19	52249947	rs2070745	C	G	2431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.383;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=57;PP=1463;ReadPosRankSum=-0.933;SC=ATGGTAAAGACGAATTTGCAC;SOR=0.608;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=279;TCF=130;TCR=149;TR=110;WE=52249955;WS=52249937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,124:0.40:307
chr19	52250216	rs5030878	A	G	862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.775;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=24;PP=505;ReadPosRankSum=0.003;SC=CCCTCCAGAGATGTTCGTGGG;SOR=1.161;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=105;TCF=48;TCR=57;TR=40;WE=52250224;WS=52250206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,44:0.39:113
chr19	52376507	rs2288868	T	C	1536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.526;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=32;PP=766;ReadPosRankSum=0.513;SC=TTTCCGCATTTGCTGCATCTG;SOR=0.470;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=150;TCF=85;TCR=65;TR=67;WE=52376515;WS=52376497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,77:0.46:169
chr19	52376952	rs8107969	T	A	1547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=37;PP=994;ReadPosRankSum=1.480;SC=TACTCTGGATTACAAAACCTA;SOR=0.680;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=133;TCF=60;TCR=73;TR=67;WE=52376960;WS=52376942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,72:0.49:147
chr19	52393836	rs118021701	G	A	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=198;ReadPosRankSum=-2.205;SC=TCAGCATTCCGCTGGAGGCTA;SOR=0.910;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=11;WE=52393844;WS=52393826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr19	52395237	rs149740302	C	T	518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=355;ReadPosRankSum=0.837;SC=TGGCTTTTTACTGGAACCCCT;SOR=0.616;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=21;WE=52395245;WS=52395227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,22:0.59:37
chr19	52443377	rs10409737	A	G	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=202;ReadPosRankSum=-0.170;SC=ACTATTTGGTAAAAATGAGCA;SOR=1.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=10;WE=52443385;WS=52443367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr19	52443405	rs10411484	T	C	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=266;ReadPosRankSum=0.880;SC=GTTCTTCACATTTCTTCCATA;SOR=0.705;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=20;WE=52443413;WS=52443395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,22:0.59:37
chr19	52448669	rs11880193	G	C	2401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=3.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.591;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=42;PP=1546;ReadPosRankSum=-0.285;SC=GGGAGAGACCGTATGGATGCT;SOR=0.584;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=211;TCF=126;TCR=85;TR=97;WE=52448677;WS=52448659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,109:0.46:235
chr19	52449072	rs10688542	C	CTG	1490.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.026;NF=0;NR=27;PP=1166;ReadPosRankSum=-0.450;SC=GAGGAACAAACTGATATATTC;SOR=0.556;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=62;TCF=1;TCR=61;TR=27;WE=52449080;WS=52449062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,39:0.50:78
chr19	52468292	rs4986771	A	G	1328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.316;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=29;PP=711;ReadPosRankSum=0.075;SC=ATGTTTAATGATGTCTGAGGG;SOR=0.570;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=137;TCF=57;TCR=80;TR=54;WE=52468300;WS=52468282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,65:0.43:151
chr19	52468551	rs4986772	T	G	2651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=52;PP=1802;ReadPosRankSum=-0.921;SC=GCTTTTGCTTTGTGCTAAAGG;SOR=0.674;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=193;TCF=94;TCR=99;TR=103;WE=52468559;WS=52468541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,112:0.54:206
chr19	52471769	rs2278417	C	T	752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.016;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=12;PP=416;ReadPosRankSum=2.455;SC=CACAGCTGTGCTGCCTTCTCT;SOR=0.429;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=80;TCF=55;TCR=25;TR=33;WE=52471777;WS=52471759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,37:0.43:86
chr19	52471813	rs2278419	T	C	1399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.388;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=19;PP=782;ReadPosRankSum=-0.914;SC=TAGCCTTCTGTCTTGTGGGTT;SOR=0.846;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=122;TCF=78;TCR=44;TR=55;WE=52471821;WS=52471803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,63:0.47:135
chr19	52472295	rs4986773	A	G	1743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.148;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-0.699;NF=46;NR=32;PP=998;ReadPosRankSum=0.505;SC=CCAACATCACATCCCGGTACA;SOR=0.535;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=134;TCF=82;TCR=52;TR=78;WE=52472303;WS=52472285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,83:0.58:142
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chr19	52693297	rs201332370	C	CT	1606.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=12;PP=787;ReadPosRankSum=0.234;SC=TTGCCCCCCCCACGTTTCAGC;SOR=0.657;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=41;TCF=14;TCR=27;TR=19;WE=52693305;WS=52693287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,50:0.59:85
chr19	52704961	rs10420138	T	C	5855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=101;NR=88;PP=2965;SC=GGTGTCACCTTCATAAGACCC;SOR=0.702;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=189;TCF=101;TCR=88;TR=189;WE=52704969;WS=52704951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr19	52772768	rs2657930	T	C	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=5.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.34;ReadPosRankSum=-0.094;SOR=0.250;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,31:0.53:59
chr19	52773013	rs2560877	C	T	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=256;ReadPosRankSum=-1.260;SC=TAAATTCATGCGTCCCGTCAG;SOR=0.859;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=15;WE=52773021;WS=52773003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,16:0.73:22
chr19	52803669	rs3217319	CTG	C	3235.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.235;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.308;NF=11;NR=36;PP=1931;ReadPosRankSum=-0.661;SC=AAGAGTCATGCTGTGTGATGA;SOR=0.588;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=99;TCF=20;TCR=79;TR=47;WE=52803678;WS=52803659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,87:0.54:160
chr19	52825032	rs13343641	C	T	1433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.630;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=29;PP=803;ReadPosRankSum=-0.729;SC=TGTCAAAACCCCCATTTTTAA;SOR=0.668;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=127;TCF=63;TCR=64;TR=60;WE=52825040;WS=52825022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,69:0.50:137
chr19	52825235	rs8102373	A	G	1079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.810;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=21;PP=652;ReadPosRankSum=-0.380;SC=GTCGCAATTCACACCTTGCAG;SOR=0.686;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=43;TCR=36;TR=45;WE=52825243;WS=52825225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,50:0.57:88
chr19	52852523	rs321953	T	C	1498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.468;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=33;PP=901;ReadPosRankSum=1.531;SC=GTTCTCTCTGTTTCTTTCTGA;SOR=0.490;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=44;TCR=58;TR=58;WE=52852531;WS=52852513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,68:0.59:116
chr19	52856955	rs1961205	C	T	1131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.195;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=7;PP=669;ReadPosRankSum=0.324;SC=CATTCATGGACGTGGCCATCG;SOR=1.065;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=66;TCF=54;TCR=12;TR=39;WE=52856963;WS=52856945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,46:0.63:73
chr19	52869022	rs2241586	G	T	2918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=59;NR=42;PP=1782;SC=AACCCTTGAGGCACATCTGTC;SOR=0.892;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=59;TCR=42;TR=101;WE=52869030;WS=52869012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr19	52869278	rs321937	G	C	2756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=45;PP=1830;SC=TTTAGAGTCCGTGCAAGCCTT;SOR=0.756;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=46;TCR=45;TR=91;WE=52869286;WS=52869268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr19	52869312	rs162120	T	C	2643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=43;PP=1566;SC=TAATCCATACTGCAGAGAAAC;SOR=0.714;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=44;TCR=43;TR=87;WE=52869320;WS=52869302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr19	52869534	rs162119	G	A	3941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=69;PP=2343;SC=GAGAGTGTTCGGGACTTACTA;SOR=0.836;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=133;TCF=64;TCR=69;TR=133;WE=52869542;WS=52869524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr19	52870052	rs1054612	C	G	4053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=86;PP=2468;SC=GAATTCACACCTAGCACAACA;SOR=1.470;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=134;TCF=48;TCR=86;TR=134;WE=52870060;WS=52870042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr19	52873023	rs707312	A	G	111.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=4;NR=0;PP=85;SC=CTCTGCCGGGACACAATCTAT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=52873031;WS=52873021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	52877716	.	AT	A	250.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.952;ClippingRankSum=0.000;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.19;MQRankSum=2.445;QD=3.13;ReadPosRankSum=0.310;SOR=0.762;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,25:0.31:80
chr19	52882733	rs10445583	T	C	889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=8;PP=450;SC=ACTGCAACCTTCGCTTCCTGG;SOR=1.244;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=29;WE=52882741;WS=52882723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	52882805	rs10445584	C	T	1884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=26;NR=18;PP=618;SC=TGAGCCTCCGCGCCTGGCCTC;SOR=0.732;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=44;TCF=26;TCR=18;TR=44;WE=52882813;WS=52882795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr19	52882824	rs10445585	T	A	1391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=13;PP=415;SC=TCATTTTTAATTTTTTTAGAG;SOR=0.818;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=15;TCR=13;TR=28;WE=52882832;WS=52882814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	52887145	rs34470614	TA	T	3204.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=51;PP=2541;SC=ACAAGTCTCTTAAAAATCAAC;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=23;TCR=53;TR=73;WE=52887153;WS=52887135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr19	52887246	rs34678014	T	TCAA	3199.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=44;PP=2071;ReadPosRankSum=-0.278;SC=GAAAAACCTATCAACAATTCC;SOR=0.903;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=78;TCF=31;TCR=47;TR=69;WE=52887255;WS=52887236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,113:0.98:115
chr19	52887427	rs8104808	A	C	11650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.64;SOR=0.716;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr19	52887437	rs8104812	A	C	11764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.06;SOR=0.716;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr19	52887904	rs2042913	T	C	3580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=54;PP=2355;SC=GTAATAAATGTGGCAAGGTCT;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=65;TCR=54;TR=119;WE=52887912;WS=52887894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr19	52888070	.	T	TTTGGGAGGCCGAGGCGG	2240.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.452;ClippingRankSum=0.000;DP=214;ExcessHet=3.0103;FS=22.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQRankSum=-0.902;QD=15.14;ReadPosRankSum=2.729;SOR=2.686;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,64:0.43:148
chr19	52888074	.	G	GATCATGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAA	1196.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.175;ClippingRankSum=0.000;DP=156;ExcessHet=3.0103;FS=30.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQRankSum=-2.432;QD=9.65;ReadPosRankSum=-0.165;SOR=4.860;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,32:0.26:124
chr19	52888210	rs56151179	T	C	3431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=57;PP=1839;SC=GATTTCATACTGGAGAGAAAC;SOR=1.010;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=110;TCF=53;TCR=57;TR=110;WE=52888218;WS=52888200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr19	52888245	rs55748277	A	G	3192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=46;PP=1877;SC=GAATGTGGCAAGGACTTCACT;SOR=0.844;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=48;TCR=47;TR=93;WE=52888253;WS=52888235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr19	52888620	rs3170100	T	G	1290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=28;PP=876;SC=CAGCATGAGATAATTCATTCA;SOR=1.464;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=16;TCR=28;TR=44;WE=52888628;WS=52888610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr19	52893473	rs7253837	A	G	475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=3;PP=323;SC=TGTCCCCTGCACTGGCCCGCA;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=52893481;WS=52893463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	52905067	rs324091	A	C	3283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=61;NR=46;PP=1731;SC=CTCAGTTAGGATAAATCAGAC;SOR=0.826;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=61;TCR=46;TR=107;WE=52905075;WS=52905057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr19	52909303	rs2290745	C	T	7880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=142;NR=134;PP=2965;SC=ATAATGTCCCCTCAGAAGCCG;SOR=0.721;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=276;TCF=142;TCR=134;TR=276;WE=52909311;WS=52909293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,294:1.00:294
chr19	52909458	rs2245620	T	G	1101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=27;PP=737;SC=CTTTCTTCAGTTATTCTCCTC;SOR=2.554;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=34;WE=52909466;WS=52909448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr19	52909989	rs11668956	A	G	481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=13;PP=325;SC=TGCGGTGGCAATCATAGCTCA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=52909997;WS=52909979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	52917590	rs162124	G	A	2696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=64;PP=1917;SC=GGGACTGAACGAAGGGGGCGA;SOR=2.252;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=24;TCR=64;TR=88;WE=52917598;WS=52917580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr19	52917626	rs162123	A	G	1338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=38;PP=1081;SC=ACAAAGGTGTATATTTGGAAG;SOR=4.615;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=41;TCF=3;TCR=38;TR=41;WE=52917634;WS=52917616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr19	52920006	rs10664588	C	CTG	8126.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=79;PP=2957;SC=TCCCTACAAACTGTATGGCAA;SOR=1.136;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=100;TCF=14;TCR=86;TR=93;WE=52920014;WS=52919996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr19	52937530	rs2560997	C	T	807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=25;PP=662;SC=AAATGGTTCACGAGGTCAGGA;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=27;WE=52937538;WS=52937520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	52938361	rs11084161	C	A	7576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=136;NR=120;PP=2965;SC=CTGAGTGTTACCTCCATGTTG;SOR=0.750;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=256;TCF=136;TCR=120;TR=256;WE=52938369;WS=52938351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,286:1.00:286
chr19	52938417	rs11084162	A	G	7072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=106;NR=126;PP=2965;SC=AGTGAAAATAATAAACAATCC;SOR=0.990;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=232;TCF=106;TCR=126;TR=232;WE=52938425;WS=52938407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr19	52938459	rs11084163	A	G	4224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=85;PP=2712;SC=AGGTGTGAACACAGGTGAGAG;SOR=1.285;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=56;TCR=85;TR=141;WE=52938467;WS=52938449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr19	52940931	rs1428179	A	T	166.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=160;SC=TTTCTGTCAGACTTTAAACAT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=52940939;WS=52940921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	52941171	rs1428180	T	C	3338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=47;PP=2088;SC=ATAAGTTTTTTCAGTGTCAAA;SOR=0.800;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=53;TCR=47;TR=100;WE=52941179;WS=52941161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr19	52941540	rs1366257	G	A	3457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=59;PP=2079;SC=AAAGAATGTGGGAAAGTCTTT;SOR=0.840;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=58;TCR=59;TR=117;WE=52941548;WS=52941530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr19	52941618	rs1366258	A	C	2886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=34;PP=1898;SC=AAATGTAGTGAATGTGGCAAA;SOR=1.067;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=54;TCR=34;TR=88;WE=52941626;WS=52941608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr19	52941847	rs1366259	A	T	4169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=72;PP=2946;SC=TTCATACTGGAGAGAAACCTT;SOR=0.807;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=138;TCF=66;TCR=72;TR=138;WE=52941855;WS=52941837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr19	52942159	rs2608497	A	G	6045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=97;PP=2965;SC=CAAACCTTCAACGACATAGGA;SOR=0.730;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=206;TCF=109;TCR=97;TR=206;WE=52942167;WS=52942149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr19	52942445	rs2608498	C	T	12462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=343;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=151;NR=164;PP=2965;SC=AGAGAAGCCTCACAGTTGTAA;SOR=0.784;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=316;TCF=151;TCR=165;TR=315;WE=52942453;WS=52942435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,343:1.00:343
chr19	52942495	rs2561001	G	A	11308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=128;NR=129;PP=2965;SC=CACACCTTGCGCGACATAGGA;SOR=0.794;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=258;TCF=129;TCR=129;TR=257;WE=52942503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,290:1.00:290
chr19	52942734	rs2446079	C	T	1946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=44;PP=1258;SC=CAGTGGCTCACGTCTGTAATC;SOR=1.483;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=23;TCR=44;TR=67;WE=52942742;WS=52942724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr19	52954507	rs324104	T	C	3975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.32;SOR=0.758;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr19	53014346	rs161931	G	A	3122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.856;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=63;PP=1981;ReadPosRankSum=-1.330;SC=TGAGACTGGCGAAGCCTTTAA;SOR=0.629;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=285;TCF=153;TCR=132;TR=136;WE=53014354;WS=53014336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,148:0.47:314
chr19	53078899	rs34126621	C	G	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.82;ReadPosRankSum=0.566;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr19	53099965	rs2279151	A	G	792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.34;ReadPosRankSum=-0.504;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,21:0.51:41
chr19	53099975	rs2279152	C	G	919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=1.130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.40;ReadPosRankSum=-1.008;SOR=0.957;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,27:0.54:50
chr19	53100323	rs7250630	A	G	3665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=406;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.523;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=83;PP=2199;ReadPosRankSum=0.210;SC=TGGAGAATCCATAATGAAGAC;SOR=0.703;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=367;TCF=185;TCR=182;TR=168;WE=53100331;WS=53100313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:220,186:0.46:406
chr19	53100377	rs7250969	G	A	2783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.179;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=75;PP=1780;ReadPosRankSum=0.176;SC=TTCAGACATCGATCATATCTT;SOR=0.889;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=279;TCF=120;TCR=159;TR=124;WE=53100385;WS=53100367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,133:0.44:300
chr19	53100585	rs1802617	G	T	2424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.498;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=47;PP=1377;ReadPosRankSum=-1.828;SC=ATACTGGACAGAAATCTTACA;SOR=0.845;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=220;TCF=120;TCR=100;TR=108;WE=53100593;WS=53100575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,120:0.49:246
chr19	53209553	rs4085566	GG	AT	5442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.436;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.147;NF=57;NR=56;PP=2944;ReadPosRankSum=-0.439;SC=TCCTAAATGGGGTATCTGGTG;SOR=0.735;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=248;TCF=125;TCR=123;TR=113;WE=53209562;WS=53209543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,142:0.51:277
chr19	53270384	rs1820128	A	G	4538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=88;PP=2965;SC=TGACATCTACAATGGCATGTA;SOR=0.972;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=173;TCF=85;TCR=88;TR=172;WE=53270392;WS=53270374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr19	53270460	rs4614842	G	A	1683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.06;MQRankSum=0.150;QD=11.77;ReadPosRankSum=-0.138;SOR=0.714;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,74:0.52:143
chr19	53303527	rs8107444	A	G	5217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=81;PP=2965;SC=TTCATTACACATGTATGGTTT;SOR=0.768;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=181;TCF=100;TCR=81;TR=181;WE=53303535;WS=53303517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr19	53303705	rs10417163	T	G	2235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=45;PP=1480;ReadPosRankSum=-0.697;SC=TTGTATGGTTTCTCTGCAGTA;SOR=0.709;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=160;TCF=83;TCR=77;TR=90;WE=53303713;WS=53303695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,98:0.55:179
chr19	53303745	rs12462522	T	C	1707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.534;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=26;PP=1011;ReadPosRankSum=-1.163;SC=CAAGAGTTGATTGTTGATTAA;SOR=0.638;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=174;TCF=107;TCR=67;TR=69;WE=53303753;WS=53303735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,80:0.40:198
chr19	53311395	rs7257656	G	A	5091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=91;PP=2965;SC=CCCTGAAATGGAAACACATTT;SOR=0.920;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=169;TCF=78;TCR=91;TR=169;WE=53311403;WS=53311385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr19	53369486	.	CAT	C	423	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=23;MQ=60.47;NF=11;NR=0;PP=423;QD=39.3636363636;SC=TATGATTATACATATATATAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=11;WE=53369495;WS=53369478;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,11:0.58:19
chr19	53384185	rs6509701	C	T	1829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.959;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=42;PP=1179;ReadPosRankSum=-0.797;SC=ATGCGAGGTACGCTTTTGTAC;SOR=0.829;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=192;TCF=98;TCR=94;TR=83;WE=53384193;WS=53384175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,90:0.44:206
chr19	53453777	rs8110062	C	T	5725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=97;NR=93;PP=2965;SC=CAGTATGAATCTTCCTATGTC;SOR=0.741;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=190;TCF=97;TCR=93;TR=190;WE=53453785;WS=53453767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr19	53454475	rs33949217	C	CACT	7796.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=56;PP=2924;SC=GAGGAAGCACCGATAGACTTG;SOR=0.897;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=84;TCF=22;TCR=62;TR=77;WE=53454483;WS=53454465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr19	53454789	rs12459008	A	T	7570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=114;NR=141;PP=2965;SC=TTCTCCTGTAATACTGTGCCT;SOR=0.988;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=255;TCF=114;TCR=141;TR=255;WE=53454797;WS=53454779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,283:1.00:283
chr19	53456490	rs66502718	C	CA	336.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.05;ReadPosRankSum=-0.403;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,15:0.94:16
chr19	53456645	.	C	CAA	28	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5337;HP=11;HapScore=2;MGOF=33;MMLQ=20;MQ=60.94;NF=0;NR=2;PP=28;QD=18.5;SC=GACTCCATCTCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=2;WE=53456653;WS=53456635;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:4,2:0.33:6
chr19	53553125	rs150642692	C	T	2420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-7.218;NF=72;NR=87;PP=2030;ReadPosRankSum=-0.913;SC=ACACTGTCCCCACATGGCCAA;SOR=0.677;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=354;TCF=162;TCR=192;TR=159;WE=53553133;WS=53553115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,131:0.46:282
chr19	53553497	rs2195311	G	A	105.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=26.26;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	53553686	rs12975552	G	A	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.727;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.609;NF=8;NR=12;PP=409;ReadPosRankSum=-0.757;SC=TCTTAGCAGAGCAGGGTGGAG;SOR=0.439;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=49;TCF=23;TCR=26;TR=20;WE=53553694;WS=53553676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
chr19	53571306	rs2288421	T	C	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.914;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.136;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=97;ReadPosRankSum=-1.831;SC=AAGGAGTGAATTGTACCTAAT;SOR=0.136;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=8;WE=53571314;WS=53571298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr19	53576465	rs329734	C	G	1132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=1;PP=864;SC=ATGTAAGTGACAACATGCAGT;SOR=5.670;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=31;WE=53576473;WS=53576455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	53576589	rs329733	C	G	11864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=441;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=228;NR=176;PP=2965;SC=TGAGAACAATCTTAGAAGATA;SOR=0.908;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=404;TCF=228;TCR=176;TR=404;WE=53576597;WS=53576579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,439:1.00:439
chr19	53577419	rs8105668	G	C	3343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=41;PP=1946;SC=GACACATTCCGGCGTTCTTGG;SOR=1.285;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=65;TCR=41;TR=106;WE=53577427;WS=53577409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr19	53577668	rs167918	C	G	675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=23;PP=611;SC=TGCCTGTAATCCCAGCATTTT;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=24;WE=53577676;WS=53577658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	53589677	rs329718	C	T	4420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=87;PP=2648;SC=CACAGTCACACGCACAGATCT;SOR=1.236;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=146;TCF=59;TCR=87;TR=146;WE=53589685;WS=53589667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr19	53612311	rs4803051	T	C	6173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=108;NR=114;PP=2965;SC=ACTCTTTACATGTGTAAGGTT;SOR=0.827;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=223;TCF=108;TCR=115;TR=222;WE=53612319;WS=53612301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr19	53612720	rs1560099	T	C	4685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=81;PP=2965;SC=ATCAGTCCCATATTTATTAGA;SOR=0.768;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=77;TCR=81;TR=158;WE=53612728;WS=53612710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr19	53612745	rs1133327	T	C	5057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=82;PP=2965;SC=TGGGTTTTGATGGTAGAAGAA;SOR=0.828;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=179;TCF=97;TCR=82;TR=179;WE=53612765;WS=53612735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr19	53612757	rs1054485	T	G	5705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=107;NR=88;PP=2965;ReadPosRankSum=1.636;SC=GTAGAAGAAATTATTTGGGGT;SOR=0.278;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=196;TCF=108;TCR=88;TR=195;WE=53612765;WS=53612735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,207:1.00:208
chr19	53612989	rs1054484	A	G	6327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=113;NR=111;PP=2965;SC=AATTTCTTTCATCATCTCTCC;SOR=0.736;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=224;TCF=113;TCR=111;TR=224;WE=53612997;WS=53612979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr19	53618698	rs12609961	C	T	543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=13;PP=417;SC=AGAGAGTTCACGGAAGTCAGA;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=18;WE=53618706;WS=53618677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	53619741	rs12608974	T	A	1991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=35;PP=1065;SC=GGAGTTACCATCTTCACACAA;SOR=1.288;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=28;TCR=35;TR=63;WE=53619749;WS=53619731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr19	53626112	rs2303689	G	A	729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=18;PP=459;SC=GTCCTCTGCCGCCCACTACAC;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=53626120;WS=53626102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	53645291	rs2195310	T	C	7328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=120;NR=124;PP=2965;SC=CCACATCCATTAGATTTGTAA;SOR=0.755;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=245;TCF=120;TCR=125;TR=244;WE=53645299;WS=53645281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr19	53651845	rs10694633	T	TTC	3501.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=13;PP=2526;SC=GAATTCAAACTTGTTTTCCCA;SOR=2.925;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=56;TCF=41;TCR=15;TR=53;WE=53651853;WS=53651835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr19	53667637	rs4803054	C	T	1129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=9;PP=699;SC=GTGATCCCCCCGCCTCGGCCT;SOR=1.788;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=36;WE=53667645;WS=53667627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr19	53667804	rs4801958	C	T	6132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=110;NR=91;PP=2965;SC=CCAGTATGGACTGCCATATGG;SOR=0.793;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=201;TCF=110;TCR=91;TR=201;WE=53667812;WS=53667794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr19	53667913	rs12459469	A	G	4704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=80;PP=2835;SC=CAAGATGTGAATTTTGAGTGA;SOR=0.900;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=72;TCR=80;TR=152;WE=53667921;WS=53667903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr19	53667940	rs12459471	A	G	4670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=81;SC=TGCCACATTCATTACATTTGT;SOR=0.904;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=154;TCF=73;TCR=81;TR=154;WE=53667948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr19	53669273	rs4801959	T	C	5453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=73;PP=2965;SC=TTTCCCTTCATGTTGAAATTG;SOR=1.048;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=180;TCF=107;TCR=73;TR=180;WE=53669281;WS=53669263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr19	53669492	rs12460170	A	G	6204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=105;NR=103;PP=2965;SC=GGACAAGCCTACAGTGTCACA;SOR=0.821;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=208;TCF=105;TCR=103;TR=208;WE=53669500;WS=53669482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr19	53669653	rs12460233	C	T	449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=13;PP=348;SC=AGGTAAATAACTATTTCCCAT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=53669661;WS=53669643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	53678924	rs4289099	C	A	2196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=46;PP=1320;SC=GTTCAATTCACGTAAGCAGAC;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=23;TCR=46;TR=69;WE=53678932;WS=53678914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr19	53707289	rs7249771	C	T	1694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=24;PP=1167;ReadPosRankSum=-0.116;SC=CATTCAGGGACGTGGCCATCG;SOR=0.673;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=126;TCF=82;TCR=44;TR=68;WE=53707297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,74:0.54:138
chr19	53727591	rs10401984	T	C	1983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=1.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.017;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-8.623;NF=44;NR=56;PP=1474;ReadPosRankSum=-0.657;SC=GTGATACTTTTCAACTGGCTT;SOR=0.607;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=230;TCF=100;TCR=130;TR=100;WE=53727599;WS=53727581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,98:0.40:243
chr19	53728096	rs7248561	A	G	2054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQRankSum=-2.921;QD=16.31;ReadPosRankSum=0.084;SOR=0.748;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,54:0.43:126
chr19	53728105	rs7248883	G	C	2197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=1.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQRankSum=-2.810;QD=14.85;ReadPosRankSum=-0.166;SOR=0.830;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,65:0.44:148
chr19	53728160	rs7248781	C	T	1842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.950;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=48;PP=1091;ReadPosRankSum=-0.976;SC=TGGCTCTCTTCCAATTCCTTT;SOR=0.716;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=246;TCF=126;TCR=120;TR=99;WE=53728175;WS=53728150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,107:0.40:270
chr19	53728218	rs11666631	G	C	1239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.387;HP=5;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=40;PP=699;ReadPosRankSum=-0.384;SC=TTTGCTTTAGGGGGGTTATAC;SOR=0.936;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=181;TCF=76;TCR=105;TR=65;WE=53728226;WS=53728208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,71:0.35:204
chr19	53728280	rs7248812	A	G	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=206;ReadPosRankSum=-1.259;SC=ACTTCATGTAAAGCATCAGAT;SOR=0.659;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=48;TCF=12;TCR=36;TR=16;WE=53728288;WS=53728270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,17:0.31:54
chr19	53740822	rs8113436	T	C	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=352;ReadPosRankSum=-0.591;SC=GGCTTGAACGTTCAGCAAAGG;SOR=0.551;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=47;TCF=14;TCR=33;TR=21;WE=53740830;WS=53740812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,22:0.44:50
chr19	53741068	rs12984188	C	T	1457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.565;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=31;PP=707;ReadPosRankSum=-0.029;SC=TAGTGAGGTTCGAACACTGGT;SOR=0.756;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=143;TCF=77;TCR=66;TR=63;WE=53741076;WS=53741058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,76:0.45:170
chr19	53741188	rs12984473	C	T	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.093;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=9;PP=336;ReadPosRankSum=0.142;SC=AGTCATTACACTTGTATGATT;SOR=0.947;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=75;TCF=41;TCR=34;TR=25;WE=53741196;WS=53741178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,28:0.34:82
chr19	53754736	rs2965240	T	C	791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=3.861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.25;ReadPosRankSum=0.257;SOR=0.393;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,44:0.46:96
chr19	53760825	rs2914370	C	T	1971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=52;PP=1329;ReadPosRankSum=-0.042;SC=CCTCTGTGGACCTGAAAATTG;SOR=0.691;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=180;TCF=71;TCR=109;TR=83;WE=53760833;WS=53760815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,93:0.47:199
chr19	53761740	rs2965249	T	C	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.718;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.136;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=57;ReadPosRankSum=-1.068;SC=TAAATATCAGTGCAGCCTGGC;SOR=1.492;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=4;WE=53761748;WS=53761739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
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chr19	53784704	rs55943466	G	A	2484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=0.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQRankSum=-5.969;QD=17.88;ReadPosRankSum=-0.059;SOR=0.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,65:0.47:139
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chr19	53787375	rs113804227	C	T	2992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.330;NF=73;NR=70;PP=1926;ReadPosRankSum=1.436;SC=CGGGTCACAACGATTCACCTC;SOR=0.692;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=321;TCF=162;TCR=159;TR=143;WE=53787383;WS=53787365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,150:0.47:317
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chr19	53793574	rs2865248	A	G	5487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=87;PP=2965;SC=GCTCTTTGTTAACGGAGTACA;SOR=0.756;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=176;TCF=89;TCR=87;TR=176;WE=53793582;WS=53793564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr19	53803121	rs75059813	C	G	1195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=1.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.626;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-11.050;NF=28;NR=40;PP=1032;ReadPosRankSum=1.564;SC=CAGTTGAGGTCAATCGTTGTG;SOR=0.924;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=190;TCF=89;TCR=101;TR=68;WE=53803129;WS=53803111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,67:0.33:203
chr19	53818564	rs73055190	C	T	2558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.941;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.576;NF=58;NR=60;PP=1510;ReadPosRankSum=-1.573;SC=CTTAGCTCTCCGCTGTAAAGG;SOR=0.615;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=248;TCF=119;TCR=129;TR=118;WE=53818572;WS=53818554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,128:0.48:264
chr19	53818603	rs10439122	G	A	2325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.983;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-8.558;NF=50;NR=53;PP=1441;ReadPosRankSum=0.712;SC=AGCTTTTGGGGTTAGATATTT;SOR=0.777;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=223;TCF=109;TCR=114;TR=103;WE=53818611;WS=53818593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,112:0.46:244
chr19	53849446	rs4803089	G	A	178.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=6;NR=1;PP=127;SC=TCTGTTTCATGTTATCTGTAT;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=53849454;WS=53849436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	53849599	rs8108958	C	T	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.18;MQRankSum=-0.754;QD=6.21;ReadPosRankSum=1.050;SOR=0.722;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,23:0.38:60
chr19	53849632	rs11406858	G	GC	1153.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.49;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=10;PP=531;SC=AGCCGGCTTCGCTCTCGTGCT;SOR=0.957;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=12;WE=53849640;WS=53849622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
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chr19	53854397	rs10415799	G	C	2718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.438;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.301;NF=51;NR=56;PP=1771;ReadPosRankSum=0.398;SC=GTTTCAGACCGAAGGGAAAAT;SOR=0.742;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=251;TCF=124;TCR=127;TR=107;WE=53854405;WS=53854387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,123:0.44:279
chr19	53856349	rs55874600	A	T	1228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.388;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.701;NF=27;NR=25;PP=664;ReadPosRankSum=0.618;SC=AGTGTAATGAATGTGGCAAGA;SOR=0.831;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=112;TCF=58;TCR=54;TR=52;WE=53856357;WS=53856339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,60:0.47:128
chr19	53879561	rs72163028	GACA	G	988.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.275;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=731;ReadPosRankSum=-0.696;SC=GTCTTCTGTGGACAACAAGTA;SOR=0.402;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=17;WE=53879571;WS=53879551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,26:0.54:48
chr19	53884412	rs4438413	G	A	2790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.410;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;ReadPosRankSum=0.156;SC=TAACTATGGGGATAATTTTCT;SOR=0.723;Source=Platypus;TCF=152;WE=53884420;WS=53884402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,135:0.43:317
chr19	53888388	rs2708713	T	A	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=169;ReadPosRankSum=0.267;SC=CTTGAATATCTACATTTTTTT;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=9;WE=53888396;WS=53888378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr19	53905129	rs111753331	TA	T	498.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.69;MQRankSum=0.962;QD=11.87;ReadPosRankSum=0.814;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,33:0.79:42
chr19	53905469	rs3975046	A	G	742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=2.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.359;NF=12;NR=13;PP=284;ReadPosRankSum=-0.966;SC=CCTCCTGGGGATGTGCCCTTG;SOR=0.681;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=80;TCF=32;TCR=48;TR=25;WE=53905477;WS=53905459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,34:0.38:90
chr19	53910912	rs2061773	G	A	689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=6;PP=477;ReadPosRankSum=-1.533;SC=TTTACCATCTGTACTTAATTT;SOR=0.616;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=75;TCF=62;TCR=13;TR=32;WE=53910920;WS=53910902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,33:0.42:79
chr19	53911973	rs10425136	A	G	3319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.450;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.96;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=71;PP=2229;ReadPosRankSum=1.267;SC=TAATGAGTGTAGCAAGACCTT;SOR=0.687;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=247;TCF=124;TCR=123;TR=141;WE=53911981;WS=53911963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,150:0.56:266
chr19	53912242	rs10426347	G	A	2499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.060;NF=52;NR=48;PP=1298;ReadPosRankSum=-0.115;SC=TCAGCCGGACGTCATCCCTTA;SOR=0.708;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=201;TCF=105;TCR=96;TR=100;WE=53912250;WS=53912232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,119:0.51:233
chr19	53926318	rs36087592	T	A	843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.49;MQRankSum=-0.022;QD=16.88;ReadPosRankSum=-0.363;SOR=0.701;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,23:0.46:50
chr19	53926320	rs34818233	T	G	843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.78;MQRankSum=-0.083;QD=17.58;ReadPosRankSum=-0.345;SOR=0.512;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,22:0.46:48
chr19	53958126	rs2708743	T	G	3904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.412;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.264;NF=85;NR=78;PP=2483;ReadPosRankSum=-0.514;SC=TTGACAGGTATTACAGAACGA;SOR=0.675;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=293;TCF=148;TCR=145;TR=163;WE=53958134;WS=53958116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,177:0.55:319
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chr19	53959343	rs2708742	G	A	1782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.070;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=30;PP=1033;ReadPosRankSum=-1.356;SC=TAATGAGTGCGGCAAGACCTT;SOR=0.596;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=187;TCF=105;TCR=82;TR=72;WE=53959351;WS=53959333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,86:0.39:219
chr19	53959568	rs2617726	G	C	2755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.432;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.198;NF=58;NR=56;PP=1764;ReadPosRankSum=-1.673;SC=TCATACTGAAGAGAATCCTTA;SOR=0.742;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=255;TCF=132;TCR=123;TR=114;WE=53959576;WS=53959558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,130:0.46:285
chr19	53993670	rs2617667	G	A	2844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.847;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.650;NF=78;NR=62;PP=1813;ReadPosRankSum=-1.797;SC=CTCATCAACAGCACAAGGCAA;SOR=0.767;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=305;TCF=167;TCR=138;TR=140;WE=53993678;WS=53993660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,143:0.44:325
chr19	53995004	rs2708845	G	A	1073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.772;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=20;PP=598;ReadPosRankSum=-0.081;SC=GTTTTAATCGGAAAACACACC;SOR=0.869;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=41;TCR=42;TR=40;WE=53995012;WS=53994994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,48:0.50:96
chr19	54007145	rs72487103	G	A	4436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=3.914;NF=83;NR=90;PP=2505;ReadPosRankSum=2.615;SC=ATACTGTTCTGCTGCTGATCA;SOR=0.794;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=194;TCF=96;TCR=98;TR=173;WE=54007153;WS=54007135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:12,185:0.94:197
chr19	54072757	rs3746304	C	T	692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=22;PP=481;ReadPosRankSum=-0.367;SC=TGTTTCCCAGCTCTTTCTATT;SOR=0.673;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=44;TCF=9;TCR=35;TR=28;WE=54072765;WS=54072747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,29:0.64:45
chr19	54074747	rs3746301	G	A	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.594;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=239;ReadPosRankSum=1.149;SC=GATGTCACGGGTGTTCAGTCT;SOR=1.270;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=15;WE=54074755;WS=54074737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr19	54075076	rs6509792	A	C	1224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.508;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=33;PP=845;ReadPosRankSum=1.456;SC=AAACTAGTTGAATTTCTTCTT;SOR=0.852;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=107;TCF=42;TCR=65;TR=52;WE=54075084;WS=54075066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,56:0.48:117
chr19	54075126	rs6509793	C	T	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.401;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=301;ReadPosRankSum=-1.364;SC=TTGATGTGGCCGTGAGCACCA;SOR=0.160;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=19;WE=54075134;WS=54075116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr19	54080144	rs8109631	A	G	2059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.042;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.99;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=48;PP=1447;ReadPosRankSum=0.549;SC=ATGTCAAAAGACCTGCTACTA;SOR=0.965;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=187;TCF=90;TCR=97;TR=89;WE=54080152;WS=54080134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,93:0.47:197
chr19	54105521	.	GGTGTGTGTGTGTGT	G	382.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.794;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=2.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=31.89;ReadPosRankSum=2.167;SOR=0.197;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,10:0.83:12
chr19	54106926	rs117308056	C	T	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=55;ReadPosRankSum=-0.852;SC=CACTACAGTCCAAAAATAGTA;SOR=0.223;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=6;WE=54106934;WS=54106916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr19	54172317	rs1968439	A	G	110.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=27.51;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	54188219	rs2060230	G	A	6939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=139;NR=89;PP=2965;SC=TTAACCAGGTGAGGAAAATTC;SOR=1.122;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=228;TCF=139;TCR=89;TR=228;WE=54188227;WS=54188209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,259:1.00:259
chr19	54211903	rs7256241	T	G	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=341;ReadPosRankSum=-1.376;SC=CAGAAAACGGTCAAACAGCGA;SOR=0.743;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=79;TCF=55;TCR=24;TR=26;WE=54211911;WS=54211893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,29:0.35:84
chr19	54220019	rs11306531	GT	G	46.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=2.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.95;ReadPosRankSum=0.801;SOR=1.284;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,6:0.25:24
chr19	54224191	rs12973211	A	G	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.200;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=230;ReadPosRankSum=1.685;SC=GCTTGAACCCAGGAGGCGGAG;SOR=0.301;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=15;WE=54224199;WS=54224181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chr19	54224285	rs58416318	CA	C	3697.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FS=0.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.53;ReadPosRankSum=-1.066;SOR=0.617;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:128,167:0.57:295
chr19	54225616	rs10426037	T	A	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.869;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=248;ReadPosRankSum=-0.652;SC=TAAGACAGGGTCTCTGTGGCC;SOR=2.409;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=13;WE=54225624;WS=54225606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr19	54228742	rs10670323	G	GAAAGA	1465.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=0.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQRankSum=-4.807;QD=13.20;ReadPosRankSum=0.755;SOR=0.603;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,38:0.34:111
chr19	54234353	rs4470257	A	G	1664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=36;PP=808;ReadPosRankSum=-0.984;SC=GAAAAACAACACTGAAGCTGA;SOR=0.661;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=183;TCF=84;TCR=99;TR=71;WE=54234361;WS=54234343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,85:0.40:210
chr19	54238034	rs7255175	G	A	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=282;ReadPosRankSum=-2.097;SC=CAGAAAACAGGCAAACAGGAC;SOR=0.931;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=37;TCF=28;TCR=9;TR=19;WE=54238042;WS=54238026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,21:0.50:42
chr19	54257185	rs611356	C	G	1284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=2.959;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQRankSum=-5.537;QD=13.38;ReadPosRankSum=-0.444;SOR=1.051;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,33:0.34:96
chr19	54257190	rs62144158	AC	GA	1504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=1.660;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQRankSum=-6.307;QD=14.06;ReadPosRankSum=-1.237;SOR=0.921;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,40:0.37:107
chr19	54261644	rs3901466	C	T	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.154;HP=6;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-2.714;NF=9;NR=16;PP=332;ReadPosRankSum=0.235;SC=TGGACGGTGGCGGGGTTCTGT;SOR=0.258;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=41;TCF=12;TCR=29;TR=25;WE=54261652;WS=54261634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,27:0.63:43
chr19	54291289	rs28461391	C	T	778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.787;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=19;PP=417;ReadPosRankSum=0.603;SC=CGATTCCCAGCCGGAAACTGT;SOR=0.796;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=80;TCF=38;TCR=42;TR=36;WE=54291297;WS=54291279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,40:0.44:91
chr19	54291363	rs76038528	G	C	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.622;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=70;ReadPosRankSum=0.284;SC=GGAAGGGAAGGGGGCCTCCTG;SOR=1.251;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=33;TCF=11;TCR=22;TR=9;WE=54291371;WS=54291353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,10:0.27:37
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chr19	54314585	rs6509827	G	A	2859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=56;PP=1636;SC=CTCATCAGCAGCCTCTAATGA;SOR=1.265;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=40;TCR=56;TR=96;WE=54314593;WS=54314575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr19	54318322	rs77330585	A	G	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.385;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=68;ReadPosRankSum=-1.676;SC=ATTACGTCGAAATGCCTGCAT;SOR=0.084;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=6;WE=54318330;WS=54318312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr19	54385437	rs307942	A	C	1549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.27;SOR=1.123;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr19	54385820	rs2547362	C	T	3463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=75;PP=2334;SC=GAAAGGGGGCCCTGAGGCAGA;SOR=1.688;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=36;TCR=75;TR=111;WE=54385828;WS=54385810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr19	54387313	rs307956	A	T	1304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=29;NR=14;PP=681;SC=TGGTTTTCTCAGTGTCCGAGT;SOR=1.298;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=29;TCR=14;TR=43;WE=54387321;WS=54387303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr19	54394965	rs3745406	T	C	8184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=144;NR=141;PP=2965;SC=TGGACCCCAATGGTCTCTCTG;SOR=0.718;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=285;TCF=144;TCR=141;TR=285;WE=54394973;WS=54394955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,322:1.00:322
chr19	54395098	rs3745405	G	T	1779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=36;PP=1184;SC=AGTCTGGGGTGCAGGGAAGGC;SOR=1.430;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=21;TCR=36;TR=57;WE=54395106;WS=54395088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr19	54396006	.	GCACA	G	324.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=2;HapScore=3;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=2;PP=80;ReadPosRankSum=-1.087;SC=CCCAGCATGCGCACACACACA;SOR=1.981;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=13;TCF=6;TCR=7;TR=5;WE=54396017;WS=54395996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr19	54396012	.	A	G	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.950;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=5.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.57;ReadPosRankSum=-1.636;SOR=1.919;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr19	54396040	.	ACACACG	A	156	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=35;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=9;NR=3;PP=156;QD=14.9166666667;SC=ACACACGCACACACACGCACA;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=12;WE=54396054;WS=54396037;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:9,12:0.57:21
chr19	54396046	rs146099614	G	GCACA	272.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.920;HP=2;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=245;ReadPosRankSum=0.592;SC=GCACACACACGCACACACCCC;SOR=1.492;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=12;WE=54396054;WS=54396037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr19	54401494	rs118050662	C	T	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.419;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=180;ReadPosRankSum=1.447;SC=TAGGTTGGGCCGTTCAGGTTC;SOR=0.094;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=13;WE=54401502;WS=54401484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,14:0.39:36
chr19	54401602	rs41311973	G	C	995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=11;PP=497;ReadPosRankSum=0.229;SC=AAGGGCCTGGGATCCCGTTTC;SOR=0.691;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=70;TCF=49;TCR=21;TR=37;WE=54401610;WS=54401592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,45:0.57:79
chr19	54409783	rs73603631	G	C	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.393;HP=2;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=51;ReadPosRankSum=0.084;SC=CAATATACCTGTATGTGGGGG;SOR=0.061;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=4;WE=54409791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr19	54445594	rs11324363	AG	A	4538.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=88;PP=2951;SC=TCCTCGTCTTAGGGGGGTCTC;SOR=1.819;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=101;TCF=4;TCR=97;TR=92;WE=54445602;WS=54445584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr19	54481334	rs113021440	A	C	1159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.894;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=14;PP=744;ReadPosRankSum=-1.121;SC=GTCGGTTGTCAGTGGGGTTGC;SOR=0.556;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=88;TCF=63;TCR=25;TR=50;WE=54481342;WS=54481324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,51:0.59:87
chr19	54483306	rs11880008	G	A	2059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.652;HP=2;HapScore=3;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.993;NF=22;NR=41;PP=1738;ReadPosRankSum=0.240;SC=CCACCTGGGCGCGCACGTGTG;SOR=0.760;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=131;TCF=44;TCR=87;TR=63;WE=54483328;WS=54483296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,71:0.51:139
chr19	54483311	.	CGTGTGTGT	C,CGTGT	1639.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=0.000;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=2,2;NR=29,29;PP=625,1300;ReadPosRankSum=-1.995;SC=TGGGCGCGCACGTGTGTGTGT;SOR=0.693;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=71;TCF=3;TCR=68;TR=31,31;WE=54483328;WS=54483296;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.49:122
chr19	54483335	.	T	TGC	142.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=0.000;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.786;HP=2;HapScore=3;MGOF=48;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=29;PP=1099;ReadPosRankSum=1.535;SC=TGTGTGTGTGTGTGTGCGCGC;SOR=1.016;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=49;TCF=2;TCR=47;TR=31;WE=54483347;WS=54483325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,12:0.21:56
chr19	54483337	rs202060954	T	C	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQRankSum=1.559;QD=8.28;ReadPosRankSum=0.301;SOR=0.622;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,14:0.30:46
chr19	54483337	.	TGT	CGC	1175	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=48;MMLQ=24;MQ=60.18;NF=1;NR=14;PP=1175;QD=81.8978583241;SC=TGTGTGTGTGTGTGCGCGCGC;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=48;TCF=7;TCR=41;TR=15;WE=54483347;WS=54483325;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:33,15:0.31:48
chr19	54483339	rs12979538	T	C	2210.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=58;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=33;PP=368;SC=TGTGTGTGTGTGCGCGCGCGC;SOR=3.306;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=42;TCF=6;TCR=36;TR=37;WE=54483347;WS=54483325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr19	54496497	rs115964462	T	C	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=137;ReadPosRankSum=-0.960;SC=AGGGCTTGCGTCCCACGGACA;SOR=0.425;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=12;WE=54496505;WS=54496487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr19	54502791	rs158199	G	A	1252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.632;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=15;PP=775;ReadPosRankSum=-0.251;SC=CTCTCGTCCCGAATCTTACAT;SOR=0.990;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=100;TCF=67;TCR=33;TR=52;WE=54502799;WS=54502781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,57:0.54:105
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chr19	54544290	rs140870757	G	A	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.731;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=147;ReadPosRankSum=-0.981;SC=CAGACAGGGCGCTGGTGCTTA;SOR=1.981;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=28;TCF=12;TCR=16;TR=12;WE=54544298;WS=54544280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr19	54545186	rs73058793	C	T	4361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=89;PP=2742;SC=CCTCCTGCTCCGGAAGTTTGG;SOR=1.319;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=152;TCF=62;TCR=90;TR=151;WE=54545194;WS=54545176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr19	54545274	rs67563163	G	T	994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=19;PP=713;SC=GAGGGCAATGGAGGGGAGAGG;SOR=1.542;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=11;TCR=19;TR=30;WE=54545282;WS=54545264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	54545390	rs34610948	A	AC	3500.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=22;PP=2205;SC=TGACATGGGAATAAGTGGAGC;SOR=1.504;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=28;TCR=22;TR=50;WE=54545398;WS=54545380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr19	54545531	rs2433724	T	C	4072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=65;NR=80;PP=2184;SC=CTGAGCTCACTGTGCTGGCTG;SOR=0.984;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=145;TCF=65;TCR=80;TR=145;WE=54545539;WS=54545521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr19	54554942	rs4442924	C	A	34.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=17.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr19	54561561	rs77090474	T	C	1403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.287;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=30;PP=1004;ReadPosRankSum=3.065;SC=CCTTCTCACCTGTGACCACCA;SOR=0.965;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=194;TCF=107;TCR=87;TR=75;WE=54561569;WS=54561551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,76:0.37:205
chr19	54561792	rs11669427	G	A	2099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=37;PP=1303;ReadPosRankSum=0.963;SC=CATTGCTCTCGGCTTCAACCA;SOR=0.667;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=158;TCF=88;TCR=70;TR=84;WE=54561800;WS=54561782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,95:0.54:177
chr19	54566901	rs662850	C	T	2880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.020;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=44;PP=1735;ReadPosRankSum=-1.101;SC=ACCTGGAAGTCATTACTTCCA;SOR=0.774;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=225;TCF=143;TCR=82;TR=124;WE=54566909;WS=54566891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,132:0.55:242
chr19	54579363	rs4806706	C	A	1686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.062;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=40;PP=1075;ReadPosRankSum=1.300;SC=CCTTTCCCAGCGATTCTCCTT;SOR=0.600;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=196;TCF=108;TCR=88;TR=83;WE=54579371;WS=54579353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,90:0.41:218
chr19	54579492	rs117001579	T	C	776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.09;ReadPosRankSum=0.935;SOR=0.792;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,37:0.48:77
chr19	54598604	rs8106130	T	G	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.069;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=190;ReadPosRankSum=-0.129;SC=CCCCCGGGTGTAGTCGGAGGA;SOR=0.971;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=52;TCF=24;TCR=28;TR=18;WE=54598612;WS=54598594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,27:0.41:66
chr19	54599229	rs61742142	C	T	1667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=1.287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.12;ReadPosRankSum=-0.100;SOR=0.747;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,80:0.53:150
chr19	54600232	rs1657535	A	C	4036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=43;PP=2498;SC=GCAGCGGTAAATTCCCCCTTG;SOR=1.470;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=87;TCR=43;TR=130;WE=54600240;WS=54600222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr19	54604194	rs3760698	G	C	1984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.195;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=44;PP=1092;ReadPosRankSum=-1.071;SC=TTACGGAAGAGAGTATCGAGG;SOR=0.548;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=215;TCF=97;TCR=118;TR=86;WE=54604202;WS=54604184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,102:0.41:250
chr19	54606209	rs254260	T	G	3461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.26;SOR=0.843;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr19	54606405	rs254259	T	C	1682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.398;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=26;PP=1131;ReadPosRankSum=0.499;SC=GGGTGACGCTTCTTGCCACCC;SOR=0.284;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=118;TCF=80;TCR=38;TR=73;WE=54606413;WS=54606395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,74:0.59:125
chr19	54609027	rs254257	A	G	1148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.809;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=35;PP=878;ReadPosRankSum=-0.758;SC=GTTAGGCTCCAACCCCTACCT;SOR=0.856;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=101;TCF=29;TCR=72;TR=48;WE=54609035;WS=54609017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,50:0.46:108
chr19	54609170	rs254256	A	G	2833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FS=2.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQRankSum=1.065;QD=17.94;ReadPosRankSum=-2.179;SOR=0.868;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,75:0.47:158
chr19	54609178	rs254255	C	G	2984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.06;MQRankSum=1.084;QD=16.13;ReadPosRankSum=-1.026;SOR=0.705;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,86:0.46:185
chr19	54609692	rs254266	T	G	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.541;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.632;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=62;ReadPosRankSum=-0.230;SC=TAGCCAGGATTGTCTCGATCT;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=5;WE=54609700;WS=54609682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr19	54609746	rs8100254	G	C	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.008;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=209;ReadPosRankSum=0.481;SC=AAAGTGCTGGGATTACAGGTG;SOR=1.911;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=23;TCF=16;TCR=7;TR=14;WE=54609754;WS=54609736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr19	54609836	rs62143393	G	A	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.90;ReadPosRankSum=-2.984;SOR=1.030;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
chr19	54611287	rs621147	G	A	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.482;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=12;PP=439;ReadPosRankSum=-1.387;SC=CACTGGCGCCGGCTCTGGAGC;SOR=0.405;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=55;TCF=36;TCR=19;TR=32;WE=54611295;WS=54611277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,32:0.60:53
chr19	54611560	rs254263	C	G	1200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.692;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=26;PP=801;ReadPosRankSum=-0.534;SC=TCCTGGCAGGCAGGAGGGGGA;SOR=0.572;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=57;TCR=52;TR=53;WE=54611568;WS=54611550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,56:0.48:116
chr19	54625765	rs73062633	C	T	908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=6;PP=555;ReadPosRankSum=-0.267;SC=TGTGCCAGGCCACAAGCCAGG;SOR=0.565;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=74;TCF=60;TCR=14;TR=35;WE=54625773;WS=54625755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,39:0.50:78
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chr19	54627097	rs2303557	T	C	1028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=6;PP=712;SC=AGGCGGGAGATCCAGGAGGCT;SOR=1.681;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=27;WE=54627105;WS=54627087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
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chr19	54652203	rs43211	T	C	905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.991;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=22;PP=433;ReadPosRankSum=0.599;SC=GCAGCGGAGGTGGAGGGAGCA;SOR=0.865;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=78;TCF=42;TCR=36;TR=42;WE=54652211;WS=54652193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,48:0.54:89
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chr19	54666060	rs12978996	T	C	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=31;ReadPosRankSum=-1.699;SC=GTCAGGGGAGTGGCGGCCTGG;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=5;WE=54666068;WS=54666050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
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chr19	54671789	rs56242780	CA	C	95.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=1.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.60;ReadPosRankSum=1.159;SOR=0.481;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,12:0.20:60
chr19	54672460	rs6509847	C	T	674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.348;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.403;NF=9;NR=19;PP=467;ReadPosRankSum=-0.981;SC=CAGGACCAGCCCCTCCTACCC;SOR=1.148;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=55;TCF=20;TCR=35;TR=28;WE=54672468;WS=54672450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,30:0.52:58
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chr19	54687334	rs254283	C	G	1233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.540;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=15;PP=847;ReadPosRankSum=0.101;SC=CGGGAACACACAACAGGCACT;SOR=0.546;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=102;TCF=69;TCR=33;TR=47;WE=54687342;WS=54687324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,54:0.46:117
chr19	54691225	rs1865961	T	C	709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.801;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=23;PP=486;ReadPosRankSum=0.945;SC=GCCTTGGCCATTCACTCCACG;SOR=1.020;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=93;TCF=37;TCR=56;TR=35;WE=54691233;WS=54691215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,36:0.36:100
chr19	54697079	rs7595	C	T	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=10;PP=255;ReadPosRankSum=0.536;SC=GCTGGGCCCCCGAGGACACCA;SOR=0.595;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=61;TCF=36;TCR=25;TR=22;WE=54697087;WS=54697069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,23:0.37:62
chr19	54697602	rs36622	G	A	1685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.822;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=38;PP=956;ReadPosRankSum=2.179;SC=GGCCTGGAGGGGGGGGACTGA;SOR=0.334;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=122;TCF=46;TCR=76;TR=67;WE=54697610;WS=54697592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,77:0.57:135
chr19	54705207	rs36615	G	A	3646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.846;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=79;PP=2236;ReadPosRankSum=0.266;SC=TTAGCACGTGGATGAAGGTGC;SOR=0.636;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=283;TCF=139;TCR=144;TR=155;WE=54705215;WS=54705197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,170:0.53:320
chr19	54705619	rs36614	A	G	2535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=51;PP=1634;SC=GGCACTTGTGAAGTAGGAAAA;SOR=1.664;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=26;TCR=52;TR=77;WE=54705627;WS=54705609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr19	54711258	rs2304523	T	G	644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.820;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-1.734;NF=18;NR=16;PP=416;ReadPosRankSum=-0.230;SC=CCTTGTCGCTTCTTCCAGGGT;SOR=0.651;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=82;TCF=43;TCR=39;TR=34;WE=54711266;WS=54711248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,35:0.40:88
chr19	54722275	rs1132609	G	A	1688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=29;PP=1064;ReadPosRankSum=-0.709;SC=TGTCCTTCACGGCAGCATCTG;SOR=0.652;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=143;TCF=87;TCR=56;TR=77;WE=54722283;WS=54722265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,80:0.53:150
chr19	54723738	rs255772	G	C	1213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.935;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=21;PP=668;ReadPosRankSum=1.366;SC=CCTCACTCACGATTCTGAGGG;SOR=0.361;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=78;TCF=49;TCR=29;TR=48;WE=54723746;WS=54723728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,56:0.58:96
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chr19	54723891	.	C	CCG	1452.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.721;ClippingRankSum=0.000;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQRankSum=-2.597;QD=9.31;ReadPosRankSum=0.394;SOR=0.727;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:112,44:0.28:156
chr19	54723893	.	CACT	C	1449.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.857;ClippingRankSum=0.000;DP=155;ExcessHet=3.0103;FS=0.662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQRankSum=-2.305;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.622;SOR=0.629;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:113,42:0.27:155
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chr19	54724006	rs4806726	C	A	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-4.328;NF=11;NR=13;PP=328;ReadPosRankSum=-0.369;SC=GCGCTCCCCACGAGGCCTCAG;SOR=0.569;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=50;TCF=19;TCR=31;TR=24;WE=54724014;WS=54723996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,24:0.51:47
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chr19	54725798	rs75069054	G	T	602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.370;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.240;NF=18;NR=11;PP=312;ReadPosRankSum=1.169;SC=GTGGCTGGGGGTCACGGGGCC;SOR=0.732;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=74;TCF=39;TCR=35;TR=29;WE=54725806;WS=54725788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,31:0.48:65
chr19	54725835	.	G	C	174	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;FR=0.5000;HP=5;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=27;MQ=41.37;NF=0;NR=10;PP=174;QD=20.8771212547;SC=TGGAACCCCCGACTGTGGAGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=16;TCR=24;TR=10;WE=54725843;WS=54725825;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:30,10:0.25:40
chr19	54726784	rs201613832	A	G	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.53;BaseQRankSum=1.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.215;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.856;NF=20;NR=2;PP=276;ReadPosRankSum=-5.239;SC=TCCAAGACTCAGATCTCCCCC;SOR=1.633;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=79;TCF=55;TCR=24;TR=22;WE=54726792;WS=54726774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,10:0.15:65
chr19	54726870	rs117942579	C	G	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=1.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.43;MQRankSum=-2.178;QD=3.50;ReadPosRankSum=0.917;SOR=0.491;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,34:0.26:129
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chr19	54742738	rs448461	G	C	981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-3.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.849;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.113;NF=29;NR=12;PP=606;ReadPosRankSum=0.783;SC=CCCCTCTGGAGGTCCTAGATT;SOR=0.571;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=89;TCF=67;TCR=22;TR=41;WE=54742746;WS=54742728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,46:0.44:105
chr19	54742999	rs8100079	C	A	2004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FS=0.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-2.945;QD=10.13;ReadPosRankSum=-0.316;SOR=0.640;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:135,63:0.32:198
chr19	54743004	rs8099961	A	T	1921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FS=1.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=-3.031;QD=10.50;ReadPosRankSum=0.556;SOR=0.566;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:127,56:0.31:183
chr19	54743057	rs73053480	G	A	1438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.907;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=30;PP=819;ReadPosRankSum=0.448;SC=CCCCCCATCCGCCATTGACAG;SOR=0.573;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=29;TCR=44;TR=50;WE=54743065;WS=54743047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,60:0.70:86
chr19	54743824	rs199826565	T	G	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.66;MQRankSum=-2.245;QD=11.29;ReadPosRankSum=0.420;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr19	54744104	rs11084326	T	G	1392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.728;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-3.582;NF=38;NR=9;PP=677;ReadPosRankSum=2.168;SC=GGCCTGGGCCTGAGCTGAGCC;SOR=0.951;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=101;TCF=78;TCR=23;TR=47;WE=54744112;WS=54744094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,51:0.46:110
chr19	54744129	rs183955064	G	A	779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FS=4.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.50;MQRankSum=-10.282;QD=4.48;ReadPosRankSum=-0.478;SOR=1.193;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:144,30:0.17:174
chr19	54744133	.	G	A	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.630;ClippingRankSum=0.000;DP=189;ExcessHet=3.0103;FS=4.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.71;MQRankSum=-10.787;QD=4.09;ReadPosRankSum=0.195;SOR=1.153;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:159,30:0.16:189
chr19	54744139	.	A	G	827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.757;ClippingRankSum=0.000;DP=205;ExcessHet=3.0103;FS=1.642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.94;MQRankSum=-11.593;QD=4.04;ReadPosRankSum=-0.138;SOR=0.852;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:173,32:0.16:205
chr19	54744141	.	C	G	936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.424;ClippingRankSum=0.000;DP=208;ExcessHet=3.0103;FS=1.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.91;MQRankSum=-11.739;QD=4.50;ReadPosRankSum=-0.401;SOR=0.910;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:175,33:0.16:208
chr19	54744163	rs3193486	T	C	1305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FS=2.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.62;MQRankSum=-15.535;QD=4.11;ReadPosRankSum=-1.188;SOR=0.920;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:259,59:0.19:318
chr19	54744209	rs8105096	TA	CG	7466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=422;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.235;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-6.558;NF=121;NR=61;PP=2944;ReadPosRankSum=0.484;SC=GTTGGAGCTGTATGAGCCGTA;SOR=0.983;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=412;TCF=258;TCR=154;TR=182;WE=54744218;WS=54744199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:229,193:0.46:422
chr19	54744361	rs2361801	A	C	3636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=801;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQRankSum=-2.317;QD=4.55;ReadPosRankSum=1.610;SOR=0.708;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:588,211:0.26:799
chr19	54744387	rs71263238	C	T	2798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=601;ExcessHet=3.0103;FS=0.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQRankSum=-0.247;QD=4.66;ReadPosRankSum=1.496;SOR=0.628;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:435,165:0.28:600
chr19	54745907	rs62133127	A	G	895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.613;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.432;NF=39;NR=14;PP=627;ReadPosRankSum=0.091;SC=CTCACCTGTCATCACCAGCTC;SOR=0.514;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=158;TCF=120;TCR=38;TR=53;WE=54745915;WS=54745897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,51:0.32:159
chr19	54746051	rs620207	A	C	7671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=711;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.094;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.407;NF=173;NR=176;PP=2962;ReadPosRankSum=3.010;SC=ATTTCTGTCCAAGGGCTCTGG;SOR=0.605;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=687;TCF=329;TCR=358;TR=349;WE=54746059;WS=54746041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:341,368:0.52:709
chr19	54746611	.	T	C	447	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MMLQ=24;MQ=40.45;NF=2;NR=23;PP=447;QD=19.2708485019;SC=GGCGTCTCCTTCCGGTGACCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=94;TCF=32;TCR=62;TR=25;WE=54746619;WS=54746601;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:69,25:0.27:94
chr19	54754752	rs433291	T	C	1698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=32;PP=1192;SC=TCAAGCTGTGTAGCTGGGCGT;SOR=1.342;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=56;TCF=23;TCR=33;TR=55;WE=54754760;WS=54754742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr19	54754820	rs429425	T	G	596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.43;QD=23.87;SOR=1.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	54755911	rs12977057	C	T	1659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=42;NR=17;PP=1056;SC=AGGGGCGGGGCCTCACCCGAG;SOR=1.573;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=42;TCR=17;TR=59;WE=54755931;WS=54755901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr19	54755922	rs12977062	CA	TG	3339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=46;NR=19;PP=2537;SC=CTCACCCGAGCATCCATCTCC;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=48;TCR=20;TR=65;WE=54755931;WS=54755901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr19	54755994	rs417523	G	A	4025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQ=59.98;NF=72;NR=66;PP=2265;SC=CAAGGGGTTCGTCTCCTGGGA;SOR=0.774;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=138;TCF=72;TCR=66;TR=138;WE=54756002;WS=54755984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
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chr19	54756302	rs415860	A	G	1257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=15;PP=865;ReadPosRankSum=0.164;SC=GGGCAGTGAGAGGGCTGTGCG;SOR=1.565;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=47;TCF=32;TCR=15;TR=46;WE=54756310;WS=54756292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,51:0.96:53
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chr19	54871591	rs199781821	C	T	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.37;MQRankSum=-2.337;QD=4.22;ReadPosRankSum=2.022;SOR=1.075;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr19	54875881	rs62132211	C	T	540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.979;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.989;NF=15;NR=8;PP=285;ReadPosRankSum=0.717;SC=ACTGGGAAGACGGGACGAAGG;SOR=0.896;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=53;TCF=32;TCR=21;TR=23;WE=54875889;WS=54875871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,27:0.44:62
chr19	54876324	rs3745441	T	C	1710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.153;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-1.990;NF=51;NR=33;PP=1218;ReadPosRankSum=1.556;SC=GAGCAGGGAATTTTCCAGACC;SOR=0.828;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=178;TCF=106;TCR=72;TR=84;WE=54876332;WS=54876314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,86:0.46:189
chr19	54881850	rs77507448	G	T	1558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.040;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=-10.545;NF=56;NR=37;PP=1008;ReadPosRankSum=1.573;SC=CTGAGGGTGGGGTGGTAGCAG;SOR=0.921;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=242;TCF=132;TCR=110;TR=93;WE=54881858;WS=54881840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,89:0.39:230
chr19	54930822	rs35134302	A	G	831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.887;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=19;PP=464;ReadPosRankSum=2.050;SC=CAATTTCCACATCTGTAAACT;SOR=0.885;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=65;TCF=32;TCR=33;TR=36;WE=54930830;WS=54930812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,40:0.54:74
chr19	54937862	rs45477994	C	T	2048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=19;PP=1148;SC=GGCTGGCCTACGTCCTCCTGC;SOR=1.483;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=45;TCR=19;TR=64;WE=54937870;WS=54937852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr19	54940303	rs3745428	T	A	582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=2;PP=414;SC=CCAGATGTCCTGCTGGACATC;SOR=3.056;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=54940311;WS=54940298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	54940471	rs889149	C	T	6120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=120;NR=94;PP=2965;SC=CTGATCCTCCCTCCCCCACTC;SOR=0.841;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=214;TCF=120;TCR=94;TR=214;WE=54940479;WS=54940461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr19	54942419	rs79275620	C	G	5005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=79;NR=78;PP=2850;SC=GCCTCTGTCTCGACCCACAGA;SOR=0.738;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=157;TCF=79;TCR=78;TR=157;WE=54942427;WS=54942409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr19	54946784	rs3745420	A	G	1093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=14;PP=697;SC=TCTTCCTGCTACTCTTCTCCC;SOR=1.151;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=25;TCR=14;TR=39;WE=54946792;WS=54946774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr19	54962374	rs1035450	A	G	3345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=41;PP=1979;SC=TTTTCTGCCCAGCTTCTCTTG;SOR=1.323;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=120;TCF=79;TCR=41;TR=120;WE=54962382;WS=54962364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr19	54962467	rs1035451	G	A	7817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=142;NR=120;PP=2965;SC=TTTCTCATAGGCAGTGAAAAA;SOR=0.791;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=262;TCF=142;TCR=120;TR=262;WE=54962475;WS=54962457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,298:1.00:298
chr19	54962579	rs1035452	C	T	3548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=68;PP=2139;SC=GCGAGAGGGACGGAGGCCAGT;SOR=1.277;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=118;TCF=49;TCR=69;TR=117;WE=54962587;WS=54962569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr19	54964019	rs963352	C	T	1315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=34;PP=979;SC=GGGATGGGGCCGGGTGGTGGA;SOR=2.110;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=11;TCR=34;TR=45;WE=54964027;WS=54964009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr19	54965527	rs7247170	C	T	156.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=0;PP=54;SC=CTGTGACCACCGCGTCCTCAC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=54965535;WS=54965522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	54965860	rs3813148	G	A	8911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=338;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=149;NR=149;PP=2965;SC=ACCGCATGAAGCGTAAGTTGG;SOR=0.766;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=298;TCF=149;TCR=149;TR=298;WE=54965868;WS=54965850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,338:1.00:338
chr19	54965889	rs3813147	G	C	6155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=116;PP=2965;SC=CGTGGAGGTCGGAGCGGTTGG;SOR=0.896;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=215;TCF=99;TCR=116;TR=215;WE=54965897;WS=54965879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr19	54966579	rs889147	C	G	6458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=111;NR=114;PP=2965;SC=CTGGGAAGCCCGATGACTGGC;SOR=0.814;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=225;TCF=111;TCR=114;TR=225;WE=54966587;WS=54966569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr19	54969075	rs45605939	C	T	7130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=125;NR=119;PP=2965;SC=TCCTGCCTCCCGCTCCTTGTG;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=244;TCF=125;TCR=119;TR=244;WE=54969083;WS=54969065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
chr19	54971229	rs3745437	T	C	1732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=11;PP=1196;SC=CACCTTCCCCTCAAGGAGGCT;SOR=2.265;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=44;TCR=11;TR=55;WE=54971237;WS=54971219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
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chr19	54973988	rs140013148	GCCT	G	8108.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=80;PP=2974;SC=TGGCTTCAGTGCCTCCTCAGT;SOR=0.749;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=109;TCF=23;TCR=86;TR=96;WE=54973998;WS=54973978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr19	54974318	rs10406453	T	C	8324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=160;NR=136;PP=2965;SC=AAGGCGGCCATGGAAGCGGAA;SOR=0.805;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=297;TCF=160;TCR=137;TR=296;WE=54974326;WS=54974308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,319:1.00:319
chr19	54974460	rs149393351	C	A	3015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.671;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=70;PP=1808;ReadPosRankSum=-0.102;SC=ACCGAGAAGTCGGCGGGGTCG;SOR=0.536;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=247;TCF=113;TCR=134;TR=133;WE=54974468;WS=54974450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,147:0.54:273
chr19	54974774	rs1981829	A	T	342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=8;PP=259;SC=GCGGCTCCCCATGGATGCACC;SOR=1.445;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=12;WE=54974782;WS=54974764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	55009497	rs3865495	A	C	3344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5084;FS=3.413;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=-2.822;NF=76;NR=83;PP=2720;ReadPosRankSum=0.021;SC=CTGCTACCACACCACCCTCAG;SOR=1.155;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=181;TCF=91;TCR=90;TR=159;WE=55009505;WS=55009487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:18,144:0.89:162
chr19	55014031	rs59342471	C	T	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=247;ReadPosRankSum=0.583;SC=AGAAAGCTCTCCCTCTTGTGT;SOR=0.632;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=53;TCF=37;TCR=16;TR=22;WE=55014039;WS=55014021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,26:0.44:59
chr19	55019402	rs2277974	A	G	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.815;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=120;ReadPosRankSum=-0.480;SC=GGTGAAAGGTAAGGACGTCAC;SOR=0.072;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=7;WE=55019410;WS=55019392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr19	55043810	rs17606773	G	A	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.760;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=49;ReadPosRankSum=1.911;SC=GTTCAAGTCAGGCCTTTGTTA;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=4;WE=55043818;WS=55043800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr19	55044228	rs10553990	TTC	T	1729.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=21;PP=1825;SC=CAAGCTATTTTTCTCTCTCCT;SOR=0.823;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=47;TCF=13;TCR=34;TR=32;WE=55044263;WS=55044218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr19	55044387	rs62131628	T	C	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.402;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=194;ReadPosRankSum=0.839;SC=CAGGCTGATGTAGATGACATG;SOR=2.448;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=18;TCF=7;TCR=11;TR=12;WE=55044395;WS=55044377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr19	55048270	rs17606836	C	T	5858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.276;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.99;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=97;PP=2965;ReadPosRankSum=1.238;SC=TCCAGGCCAACTTTTCTGTGG;SOR=0.432;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=195;TCF=98;TCR=97;TR=195;WE=55048278;WS=55048260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,218:1.00:219
chr19	55049066	.	G	A	329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.15;QD=27.48;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	55049088	rs143540272	A	AAAAGAAAGAAAG,AAAAGAAAGAAAGAAAGAAAG	2580.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=62.02;QD=60.02;SOR=6.138;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,25,18:0.58,0.42:43
chr19	55049332	rs62131630	G	C	699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.157;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=376;ReadPosRankSum=-2.018;SC=CCATGACCCTGGGCTAGGCAG;SOR=0.473;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=57;TCF=13;TCR=44;TR=29;WE=55049340;WS=55049322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,34:0.52:66
chr19	55087301	.	C	T	3670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=0.000;DP=402;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=76;PP=2250;ReadPosRankSum=0.481;SC=CCCTCTCTCTCGGTGCAGCCG;SOR=0.755;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=358;TCF=192;TCR=166;TR=166;WE=55087321;WS=55087291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:216,186:0.46:402
chr19	55110880	rs7260424	C	A	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.28;ReadPosRankSum=0.859;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr19	55112396	rs45461791	C	T	1854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.650;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=49;PP=1203;ReadPosRankSum=0.244;SC=AGGGCTGATGCTATCTGGACT;SOR=0.587;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=143;TCF=47;TCR=96;TR=75;WE=55112404;WS=55112386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,82:0.53:154
chr19	55142101	rs3760861	G	A	1323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.864;NF=35;NR=25;PP=919;ReadPosRankSum=-0.213;SC=ACCCCACAACGCTGAGCTGAT;SOR=0.723;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=123;TCF=71;TCR=52;TR=60;WE=55142109;WS=55142091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,62:0.46:135
chr19	55142930	rs3843752	C	T	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=398;ReadPosRankSum=-1.680;SC=AGTTAGAATCCGACTCCTGAT;SOR=0.738;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=63;TCF=48;TCR=15;TR=23;WE=55142938;WS=55142920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,23:0.35:66
chr19	55143083	rs1061679	T	C	3046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.859;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-7.827;NF=72;NR=68;PP=2219;ReadPosRankSum=-0.944;SC=AAAACAGCACTCTGGATTACA;SOR=0.632;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=281;TCF=148;TCR=133;TR=140;WE=55143091;WS=55143073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,144:0.46:312
chr19	55143156	rs12462774	TG	CA	5170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=3.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.422;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-8.324;NF=57;NR=70;PP=2944;ReadPosRankSum=1.609;SC=CCTGGGAACATGCAGGGCGGT;SOR=0.742;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=270;TCF=127;TCR=143;TR=127;WE=55143165;WS=55143146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,137:0.46:301
chr19	55143452	rs1061680	T	C	3005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.553;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-2.007;NF=75;NR=48;PP=1667;ReadPosRankSum=1.011;SC=GGGAATGTAATCCTCCAGTGT;SOR=0.871;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=251;TCF=146;TCR=105;TR=123;WE=55143460;WS=55143442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,145:0.50:290
chr19	55143491	rs1061681	G	T	3358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.091;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-3.068;NF=80;NR=56;PP=1903;ReadPosRankSum=-0.285;SC=GATGGCTTCAGTCTGTGTAAG;SOR=0.857;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=262;TCF=144;TCR=118;TR=136;WE=55143499;WS=55143481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,159:0.52:304
chr19	55145454	rs1138736	G	A	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.043;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-3.263;NF=14;NR=13;PP=382;ReadPosRankSum=0.755;SC=CACCCCCACCGGGTCGGATCC;SOR=0.864;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=57;TCF=32;TCR=25;TR=27;WE=55145462;WS=55145444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,29:0.45:64
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chr19	55145546	rs2098952	T	G	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.620;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-5.873;NF=14;NR=10;PP=312;ReadPosRankSum=1.562;SC=CTAGGTTCAGTCTCCTCTGGA;SOR=0.953;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=54;TCF=31;TCR=23;TR=24;WE=55145554;WS=55145536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,24:0.39:61
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chr19	55146824	rs10421766	G	A	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.552;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.538;NF=6;NR=8;PP=241;ReadPosRankSum=0.060;SC=GGAAAGGGGCGCTGGCTGGAA;SOR=0.191;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=29;TCF=9;TCR=20;TR=14;WE=55146832;WS=55146814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr19	55146853	rs10422981	T	C	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.403;HP=4;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.582;NF=14;NR=7;PP=432;ReadPosRankSum=0.372;SC=GGGCTCAGGGTGAGATCATCT;SOR=1.296;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=29;TCF=16;TCR=13;TR=21;WE=55146861;WS=55146843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,21:0.70:30
chr19	55147071	rs10421688	A	G	2160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=0.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQRankSum=-4.271;QD=18.63;ReadPosRankSum=1.746;SOR=0.838;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,58:0.50:116
chr19	55147074	rs10421874	C	T	2160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=1.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQRankSum=-4.323;QD=19.47;ReadPosRankSum=1.909;SOR=0.893;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,55:0.50:111
chr19	55148331	rs8101240	C	T	2860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=61;PP=1745;ReadPosRankSum=0.298;SC=ATCCACTAGCCCAGGGGGGGA;SOR=0.689;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=230;TCF=121;TCR=109;TR=128;WE=55148341;WS=55148321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,136:0.54:254
chr19	55148378	rs8101469	G	A	1785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.088;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=47;PP=2962;ReadPosRankSum=1.733;SC=GGAATGCATGGGAGCTGCCCC;SOR=1.082;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=130;TCF=55;TCR=75;TR=77;WE=55148411;WS=55148368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,80:0.56:143
chr19	55148390	rs8101262	C	A	1404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.717;HP=6;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=39;PP=2962;ReadPosRankSum=2.274;SC=AGCTGCCCCCCCAGTGGACAC;SOR=0.822;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=106;TCF=43;TCR=63;TR=64;WE=55148411;WS=55148368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,66:0.56:117
chr19	55148403	rs111542900	T	C	1325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.850;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=36;PP=2962;ReadPosRankSum=1.002;SC=GTGGACACCATTGGACCCCAC;SOR=0.879;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=85;TCF=31;TCR=54;TR=56;WE=55148411;WS=55148368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,57:0.62:92
chr19	55175009	rs11540761	G	T	683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQRankSum=-1.235;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.516;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,36:0.56:64
chr19	55175596	rs3050015	T	TGTGGGAG	2144.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.746;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-7.090;NF=18;NR=14;PP=1727;ReadPosRankSum=0.539;SC=CTGGGGATGATGTGGGAGCCC;SOR=0.781;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=105;TCF=56;TCR=49;TR=32;WE=55175604;WS=55175586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,52:0.46:113
chr19	55175740	rs3745871	C	T	3695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=374;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=82;PP=2403;ReadPosRankSum=-1.426;SC=TGGACACTTTCCTTCTGATCA;SOR=0.687;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=334;TCF=159;TCR=175;TR=156;WE=55175748;WS=55175730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:199,173:0.47:372
chr19	55176262	rs731170	A	G	2082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.071;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=39;PP=1239;ReadPosRankSum=0.635;SC=TCCTTGGAGGATCCCAGGCCC;SOR=0.780;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=191;TCF=104;TCR=87;TR=90;WE=55176270;WS=55176252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,99:0.48:206
chr19	55176535	rs1925241	C	T	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.448;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=9;PP=239;ReadPosRankSum=-0.024;SC=CGAGCTGATGCGGGGAGCAGG;SOR=0.260;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=29;TCF=12;TCR=17;TR=17;WE=55176543;WS=55176525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr19	55178148	rs11574575	G	A	2900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.985;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.211;NF=66;NR=59;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.296;SC=ACCCCAGCAGGTGCTGCCGTG;SOR=0.624;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=220;TCF=114;TCR=106;TR=125;WE=55178170;WS=55178138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,141:0.58:245
chr19	55178162	rs11574576	A	C	2871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.532;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-1.155;NF=63;NR=59;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.049;SC=TGCCGTGAAGAACACACAGCC;SOR=0.396;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=204;TCF=96;TCR=108;TR=122;WE=55178170;WS=55178138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,137:0.60:229
chr19	55278607	rs2365247	C	T	2551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.899;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-6.266;NF=60;NR=37;PP=1324;ReadPosRankSum=1.635;SC=TCCTGGAAAACGTGAGCACCC;SOR=0.916;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=197;TCF=116;TCR=81;TR=97;WE=55278615;WS=55278597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,118:0.50:236
chr19	55278805	rs34684434	A	C	3589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=367;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.713;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.74;MQRankSum=0.988;NF=72;NR=87;PP=1962;ReadPosRankSum=-0.587;SC=CCAGATCCAAAGTTGTCTCCT;SOR=0.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=334;TCF=154;TCR=180;TR=159;WE=55278813;WS=55278795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,180:0.49:365
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chr19	55286828	rs376821145	G	A	2825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FS=22.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.73;MQRankSum=-12.950;QD=12.45;ReadPosRankSum=-0.475;SOR=1.649;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:146,81:0.36:227
chr19	55286864	rs77397437	A	C	2463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.808;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-12.922;NF=84;NR=58;PP=1949;ReadPosRankSum=1.805;SC=ATGACTCTCCATACGAGTGGT;SOR=0.786;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=314;TCF=169;TCR=145;TR=142;WE=55286872;WS=55286854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,132:0.44:303
chr19	55287015	rs367995568	C	T	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.94;MQRankSum=-0.268;QD=27.49;ReadPosRankSum=-0.869;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr19	55287019	rs371816488	G	T	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.07;MQRankSum=-0.152;QD=29.27;ReadPosRankSum=-0.177;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr19	55294252	rs143941985	C	T	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.99;MQRankSum=-2.369;QD=15.10;ReadPosRankSum=1.534;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr19	55294927	.	A	G	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.673;ClippingRankSum=0.000;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.089;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-12.297;NF=36;NR=15;PP=574;ReadPosRankSum=0.952;SC=GTTGACTTCCATCTTCTACAG;SOR=1.499;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=156;TCF=99;TCR=57;TR=51;WE=55294935;WS=55294917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,37:0.23:158
chr19	55295050	.	G	A	803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=0.000;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=5.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.93;MQRankSum=-1.429;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.846;SOR=1.453;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,36:0.47:77
chr19	55297955	rs4806560	T	C	1081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.65;MQRankSum=-0.123;QD=11.39;ReadPosRankSum=0.475;SOR=0.686;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,50:0.53:95
chr19	55315307	rs112963206	C	G	803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.84;QD=25.12;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	55328153	.	AG	CT	234	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=48;MMLQ=27;MQ=42.23;NF=1;NR=4;PP=234;QD=57.4935749724;SC=GAGTGGAGATAGGGGCCTGGG;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=5;WE=55328162;WS=55328143;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr19	55328959	rs149236621	G	T	204.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.08;QD=29.26;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	55329854	rs144994606	G	A	4577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=57;PP=2589;SC=TGTCACTATCGTCATAGGTTT;SOR=1.000;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=146;TCF=89;TCR=57;TR=146;WE=55329862;WS=55329844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr19	55329892	rs149123986	A	G	5369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=77;PP=2871;SC=CAAAGAAGACAGAATCCACAT;SOR=0.836;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=177;TCF=100;TCR=77;TR=177;WE=55329900;WS=55329882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr19	55330019	rs143159382	C	T	1432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=32;PP=967;SC=ACTGGGTGGTCGGCACCCAGC;SOR=2.400;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=10;TCR=32;TR=42;WE=55330027;WS=55330009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr19	55331419	rs143886704	C	T	1735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=40;PP=1165;SC=TACTCACACCCCCTATCAGTT;SOR=1.685;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=22;TCR=40;TR=62;WE=55331427;WS=55331409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr19	55331574	rs150226565	T	C	30.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=15.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr19	55340835	rs45459293	CA	TG	3440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=52.49;QD=44.69;SOR=0.828;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr19	55340841	rs150471749	G	C	3301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=51.80;QD=46.50;SOR=0.779;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr19	55340906	rs45542639	G	A	1753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=32;PP=937;SC=CATCTCTGGTGCTCCAACAAA;SOR=1.503;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=20;TCR=32;TR=52;WE=55340914;WS=55340896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr19	55340933	rs62124154	G	C	1547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=17;NR=29;PP=767;SC=AAGTCTCACGGGGCACAGGCC;SOR=1.651;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=17;TCR=29;TR=46;WE=55340941;WS=55340923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr19	55341027	rs45580236	A	G	363.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.42;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	55341031	rs45566438	G	C	363.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.47;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	55341575	rs1130513	G	C	5094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=66;PP=2965;SC=ACAAGACCCTGAGGAGGTGAC;SOR=0.914;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=154;TCF=88;TCR=66;TR=154;WE=55341583;WS=55341565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr19	55341753	rs12985492	A	G	2973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=50;PP=1733;SC=GGCCTTGAGGACGTCTTCTAG;SOR=1.314;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=34;TCR=50;TR=84;WE=55341761;WS=55341743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr19	55344362	.	GGCCTAGAGATGGAGTGATGAGCCTAGAAGTGGAGATCTGC	G	77.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQRankSum=-2.189;QD=11.10;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr19	55344382	.	A	G	85	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=64;MMLQ=27;MQ=55.23;NF=1;NR=3;PP=85;QD=29.9428031368;SC=TGGAGTGATGAGCCTAGAAGT;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=55344390;WS=55344372;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	55344413	.	GAGATCTGGGCCTGGAGTGA	G	77.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.94;MQRankSum=-2.189;QD=11.10;ReadPosRankSum=-2.189;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr19	55346409	rs4806584	T	A	1686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=18;PP=1032;SC=GCAGGTAGGCTCTGATGGTGA;SOR=1.493;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=35;TCR=18;TR=53;WE=55346417;WS=55346399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr19	55346629	rs139958085	C	T	352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=9;PP=222;SC=TTTCCTGAAACGGGAGGGAAG;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=55346637;WS=55346619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
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chr19	55420801	rs3765013	C	A	2567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.878;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=58;PP=1665;ReadPosRankSum=-1.380;SC=CACAGCCCACCGAGGGACATA;SOR=0.673;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=294;TCF=148;TCR=146;TR=118;WE=55420809;WS=55420791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:191,129:0.40:320
chr19	55420924	rs3765014	C	G	1103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.722;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=32;PP=740;ReadPosRankSum=1.510;SC=GCCGCCATGTCCTACCTGGAG;SOR=0.892;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=98;TCF=31;TCR=67;TR=46;WE=55420932;WS=55420914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,49:0.49:101
chr19	55423488	rs73619967	T	C	2254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.263;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=37;PP=1242;ReadPosRankSum=0.886;SC=AGTGCTGGGGTGGAGGAGGTC;SOR=0.936;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=191;TCF=116;TCR=75;TR=101;WE=55423506;WS=55423478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,106:0.53:201
chr19	55424307	rs16986072	G	A	624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=20;PP=374;ReadPosRankSum=-0.709;SC=GGCGGCGTGAGCTCTGTGTTG;SOR=0.755;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=81;TCF=32;TCR=49;TR=33;WE=55424315;WS=55424297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,34:0.39:88
chr19	55438940	.	AAAAC	A	6734.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.65;QD=43.45;SOR=1.448;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr19	55439166	rs269933	T	C	917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=22;PP=630;SC=AACATGGAAATCCACGCATTC;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=55439174;WS=55439156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	55439197	rs269934	A	C	236.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=8;PP=162;SC=TAGTGGCTCAAGCGTGTAATC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=55439205;WS=55439187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	55441769	rs269949	G	A	454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=2;PP=260;SC=GACCGAAGCCGCAGTGAGCCG;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=55441777;WS=55441759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	55441902	rs269950	T	C	4787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=105;NR=56;PP=2515;SC=GATTCTCTAATGCCTGACAGA;SOR=1.123;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=161;TCF=105;TCR=56;TR=161;WE=55441910;WS=55441892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
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chr19	55447572	rs775876	A	G	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.201;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.31;ReadPosRankSum=-0.469;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
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chr19	55453134	rs775886	G	A	2223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.070;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=54;PP=1296;ReadPosRankSum=-0.339;SC=GGGAAAAAAGGAAAAACAGTT;SOR=0.612;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=192;TCF=85;TCR=107;TR=96;WE=55453142;WS=55453110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,105:0.49:213
chr19	55458801	rs7248636	G	A	1008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.542;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=16;PP=667;ReadPosRankSum=0.782;SC=CCTTAAACGAGAAGACAAAGA;SOR=0.859;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=62;TCR=36;TR=43;WE=55458809;WS=55458791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,48:0.44:110
chr19	55481669	rs269913	T	C	2726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.440;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=68;PP=1318;ReadPosRankSum=0.841;SC=CAGAGGTGAGTGGAAATCGGT;SOR=0.733;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=247;TCF=108;TCR=139;TR=121;WE=55481677;WS=55481659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,138:0.49:280
chr19	55485786	rs703468	G	A	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.620;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=248;ReadPosRankSum=-1.313;SC=CCAGTTCTAAGTGTCATCTTT;SOR=1.077;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=38;TCF=34;TCR=4;TR=15;WE=55485794;WS=55485776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,17:0.39:44
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chr19	55488150	rs8102561	T	C	1139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=16.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.875;QD=12.39;ReadPosRankSum=2.709;SOR=1.458;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,51:0.55:92
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chr19	55511960	.	TAAA	T	92.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.054;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.43;ReadPosRankSum=1.834;SOR=0.595;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr19	55512137	rs12768	C	A	8192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=135;NR=138;PP=2965;SC=GGTTGAAAATCGATGACTTTA;SOR=0.734;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=273;TCF=135;TCR=138;TR=273;WE=55512145;WS=55512127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,300:1.00:300
chr19	55512232	rs1043673	C	A	1957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.614;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=46;PP=1250;ReadPosRankSum=-0.066;SC=CATCCCTGGGCAGAAAGGCCT;SOR=0.497;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=223;TCF=106;TCR=117;TR=92;WE=55512240;WS=55512222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,99:0.40:248
chr19	55512316	rs1043678	T	G	888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=29;PP=670;ReadPosRankSum=0.143;SC=TTCCAGGTGTTGGTGAACTGC;SOR=0.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=59;TCF=12;TCR=47;TR=36;WE=55512324;WS=55512306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,36:0.58:62
chr19	55512347	rs1043680	G	C	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=261;ReadPosRankSum=0.325;SC=TCTCCTCCCCGGCCCCTACCC;SOR=1.101;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=15;WE=55512355;WS=55512337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr19	55525388	rs10417981	G	T	3017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.24;SOR=1.121;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr19	55525497	rs1671150	A	G	2335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=41;PP=1285;SC=TTTGAGACAAAGTCAGGCTTC;SOR=1.153;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=31;TCR=41;TR=72;WE=55525505;WS=55525487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr19	55525596	rs1654412	T	C	811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=9;PP=664;SC=CTCAGCCCCCTGAGTTGCTGG;SOR=1.445;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=16;TCR=9;TR=25;WE=55525604;WS=55525586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	55525894	rs1671151	G	A	7642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=135;NR=118;PP=2965;SC=AGGGAAGCACGGGAGGATTTT;SOR=0.737;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=253;TCF=135;TCR=118;TR=253;WE=55525902;WS=55525884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr19	55526345	rs1671152	T	G	9116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=111;NR=95;PP=2962;SC=TGACCCCCGTTTGATTTCCGG;SOR=0.711;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=207;TCF=111;TCR=96;TR=206;WE=55526381;WS=55526335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr19	55526359	rs1654413	A	T	8549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=91;NR=81;PP=2818;SC=TTTCCGGGTCAGCGGGAGGGG;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=174;TCF=92;TCR=82;TR=172;WE=55526381;WS=55526335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr19	55526373	rs2304166	G	C	2509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FS=0.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.35;ReadPosRankSum=-1.482;SOR=0.641;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,116:0.62:188
chr19	55527081	rs2304167	C	T	5191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=83;PP=2965;SC=TTTGGACTGGCGGTGATACTC;SOR=0.819;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=183;TCF=100;TCR=83;TR=183;WE=55527089;WS=55527071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr19	55527189	rs1671153	G	T	3973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=63;NR=71;PP=2228;SC=ACACACATGGGGAGGCACAAT;SOR=1.007;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=134;TCF=63;TCR=71;TR=134;WE=55527197;WS=55527179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr19	55527276	rs1654484	T	C	750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=20;PP=574;SC=GAGGCTGAGGTAGGAGGCTGG;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=55527284;WS=55527266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	55529836	rs1654415	C	T	281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=131;SC=TCACCCAAAACGCTCCTCCTT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=55529844;WS=55529826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	55529933	rs1671192	A	G	2307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=15;PP=1378;SC=CGGTGAAGTGATTAAAAGCCT;SOR=1.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=51;TCR=15;TR=66;WE=55529941;WS=55529923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr19	55530035	rs1654416	C	T	6793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=133;NR=96;PP=2965;SC=GTGAAGACTTCGTTTGTGAAT;SOR=0.933;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=229;TCF=133;TCR=96;TR=229;WE=55530043;WS=55530025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr19	55536595	rs1613662	G	A	1866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=18;PP=1098;SC=CCTGCTACCGGGGAAGGTGGT;SOR=1.418;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=41;TCR=18;TR=59;WE=55536603;WS=55536585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr19	55538980	rs1654425	T	C	2157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=20;PP=1229;SC=CGCTGGGGGCTGACCACAGGT;SOR=1.493;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=50;TCR=20;TR=70;WE=55538988;WS=55538970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr19	55539061	rs892089	A	G	8696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=107;NR=76;PP=2965;SC=TGATGATGGGAAAACTAGCCC;SOR=0.916;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=183;TCF=107;TCR=76;TR=183;WE=55539080;WS=55539051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr19	55539072	rs892090	T	G	8761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=82;PP=2965;SC=AAACTAGCCCTGTACCATCTC;SOR=0.830;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=189;TCF=107;TCR=82;TR=188;WE=55539080;WS=55539051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr19	55543973	rs41275824	C	T	1046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=26;PP=619;ReadPosRankSum=-1.052;SC=CTGCTGGGCGCGGTGATAAGA;SOR=0.680;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=112;TCF=54;TCR=58;TR=48;WE=55543981;WS=55543963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,54:0.41:131
chr19	55558922	rs3745913	C	T	1093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.640;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=29;PP=647;ReadPosRankSum=0.772;SC=TGTGGCAGCCCACACCCAGCT;SOR=0.797;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=128;TCF=60;TCR=68;TR=53;WE=55558930;WS=55558912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,58:0.42:139
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chr19	55570574	rs1654447	A	G	4109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=74;NR=74;PP=2349;SC=CTGTGTTGGCACCCGTCACGA;SOR=0.743;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=150;TCF=76;TCR=74;TR=148;WE=55570582;WS=55570564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr19	55574429	rs113253419	A	AGGCGTCC	768.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.008;NF=3;NR=24;PP=1763;ReadPosRankSum=-0.747;SC=GTCAGGCGTCAGGGGTCGGCG;SOR=0.606;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=27;WE=55574440;WS=55574419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,39:0.53:73
chr19	55574431	.	G	GC	675.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=0.000;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.94;MQRankSum=-0.987;QD=9.26;ReadPosRankSum=1.129;SOR=0.789;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,34:0.47:73
chr19	55574432	.	G	A	229	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=25;MQ=61.57;NF=7;NR=10;PP=229;QD=15.5159536792;SC=AGGCGTCAGGGGTCGGCGCGG;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=37;TCF=13;TCR=24;TR=17;WE=55574440;WS=55574419;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:20,17:0.46:37
chr19	55574432	.	G	GTCCGGA	675.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=0.000;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.13;MQRankSum=-0.574;QD=9.13;ReadPosRankSum=0.785;SOR=0.720;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,35:0.47:74
chr19	55574512	rs3816043	G	A	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.94;MQRankSum=0.511;QD=10.70;ReadPosRankSum=-0.484;SOR=0.637;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,24:0.55:44
chr19	55593465	rs377304711	T	C	2548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=47;PP=1634;ReadPosRankSum=-0.087;SC=CTCAGAGGGCTTGCTGACGCT;SOR=0.706;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=227;TCF=131;TCR=96;TR=110;WE=55593473;WS=55593455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,119:0.47:251
chr19	55598724	rs1054940	A	G	955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=8;PP=554;SC=TCGCTGCAGAAGGAGGAGCTG;SOR=1.244;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=29;WE=55598732;WS=55598714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	55603388	rs10410929	T	C	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.795;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=21;PP=413;ReadPosRankSum=-1.580;SC=CCACAAGCCCTTCCCCCACGG;SOR=0.479;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=91;TCF=32;TCR=59;TR=34;WE=55603396;WS=55603378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,39:0.40:98
chr19	55614923	rs2532060	T	C	3214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=56;PP=1844;SC=GCTTGGCTGCTTCCACATCCA;SOR=0.885;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=54;TCR=56;TR=110;WE=55614931;WS=55614913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr19	55644123	rs10414711	G	C	2685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=58;NR=33;PP=1738;SC=CAAGTAACTTGTTGGTAATAA;SOR=1.132;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=58;TCR=33;TR=91;WE=55644131;WS=55644113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr19	55644325	rs890868	A	C	4554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=75;NR=74;PP=2552;SC=CTGCCCCCTTACGGCTGTAGA;SOR=0.841;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=149;TCF=75;TCR=74;TR=149;WE=55644333;WS=55644315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr19	55644442	rs891186	G	A	881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=20;PP=556;SC=TCCCTGCCCAGAGGAAGCAGT;SOR=1.911;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=9;TCR=20;TR=29;WE=55644450;WS=55644432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	55652162	rs200177206	G	GTAA	775.75	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=65.19;MQRankSum=1.515;QD=35.26;ReadPosRankSum=0.694;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,20:0.91:22
chr19	55652758	rs2560942	A	G	734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=18;PP=510;SC=TGGTGAACTGAACCGTTTCCC;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=55652766;WS=55652748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	55657041	rs2434454	C	A	741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=13;PP=480;SC=CCCCCAGGACCCCAGGGAAGG;SOR=1.220;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=10;TCR=13;TR=23;WE=55657049;WS=55657031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	55660537	rs9636153	T	C	3257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=358;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.248;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=75;PP=1617;ReadPosRankSum=0.551;SC=ACCTAGGCTGTGTCTGAGATG;SOR=0.783;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=316;TCF=160;TCR=156;TR=150;WE=55660545;WS=55660527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:189,168:0.47:357
chr19	55665410	rs3729841	C	T	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=252;ReadPosRankSum=-0.141;SC=TCTCGGTGTCCTCCTTCTTCA;SOR=0.990;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=13;WE=55665418;WS=55665400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr19	55665584	rs7252610	A	C	3775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=68;PP=2457;SC=TCTGGGGGCAAACGAGGGGGT;SOR=0.994;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=59;TCR=69;TR=127;WE=55665592;WS=55665574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr19	55665689	rs2288529	C	G	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.951;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=243;ReadPosRankSum=0.863;SC=CGAGGCCTTACCAGTCTCTTC;SOR=2.322;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=13;WE=55665697;WS=55665679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr19	55667500	rs2288528	A	T	2203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.474;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=39;PP=1243;ReadPosRankSum=1.288;SC=GGTCCCGAGCAGAAGAGGGGA;SOR=0.759;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=213;TCF=122;TCR=91;TR=94;WE=55667508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,108:0.45:239
chr19	55668197	rs2278281	T	G	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=188;ReadPosRankSum=-1.024;SC=TCTCTTCCTTTGGATAGGCAC;SOR=0.481;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=11;WE=55668205;WS=55668187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr19	55668397	rs3729837	C	T	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.10;ReadPosRankSum=0.373;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr19	55668509	rs3729836	A	T	2031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.72;SOR=0.824;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr19	55668722	rs113899745	C	CCTGT	4921.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=27;PP=2544;SC=TGGGCTGTGTCCTGTCTCCTA;SOR=1.418;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=68;TCF=39;TCR=29;TR=56;WE=55668730;WS=55668712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr19	55668805	rs11671293	T	C	7332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=132;NR=111;PP=2962;SC=TCCAGGAGTCTGACTCGCAAA;SOR=0.824;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=243;TCF=132;TCR=111;TR=243;WE=55668827;WS=55668795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,275:1.00:275
chr19	55668819	rs11667847	A	G	2336.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.906;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-1.510;NF=61;NR=54;PP=1416;ReadPosRankSum=0.842;SC=TCGCAAACCCACTTCCTCTCT;SOR=0.758;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=263;TCF=138;TCR=125;TR=115;WE=55668827;WS=55668795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,126:0.44:288
chr19	55670825	rs28377509	T	C	7027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.075;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=132;NR=117;PP=2965;ReadPosRankSum=0.748;SC=TACCTGCAGATGGGAAGCGCC;SOR=0.282;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=250;TCF=132;TCR=118;TR=249;WE=55670833;WS=55670815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,271:1.00:272
chr19	55670989	rs60176657	G	A	1813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.056;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.562;NF=35;NR=41;PP=978;ReadPosRankSum=1.564;SC=CAGAGAGGACGGAGGACAGGC;SOR=0.990;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=172;TCF=85;TCR=87;TR=76;WE=55670997;WS=55670979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,90:0.45:201
chr19	55671090	rs67301370	TG	T	1096.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.262;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.430;NF=2;NR=23;PP=811;ReadPosRankSum=0.483;SC=GTCTGGGTCCTGGGGAAAGAA;SOR=1.193;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=38;TCF=6;TCR=32;TR=25;WE=55671098;WS=55671080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,40:0.55:73
chr19	55671113	.	TCTGGACTCCTGGGTCTGAGGGAGGAGGGGCTGGGGGCCTGGACCCCTGGGTCTAAGCAAGGAGGGGCTGGGGGC	T	651.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.036;ClippingRankSum=0.000;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQRankSum=1.631;QD=21.02;ReadPosRankSum=-0.035;SOR=0.558;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr19	55671134	.	GAGGAGGGGCTGGGGGCCTGGACCCCTGGGTCTAAGCA	G	338.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.325;ClippingRankSum=0.000;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQRankSum=-1.738;QD=12.10;ReadPosRankSum=-0.810;SOR=0.775;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr19	55671337	rs890872	C	T	2948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.87;SOR=0.728;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr19	55671374	rs891187	C	T	927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.716;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=21;PP=636;ReadPosRankSum=1.155;SC=ATTCCGGGGTCGGGGCTGCTG;SOR=1.255;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=92;TCF=50;TCR=42;TR=50;WE=55671382;WS=55671364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,48:0.51:94
chr19	55671973	rs150324242	AGTCCCTGGCTTACCTGTTGTT	A	1824.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FS=3.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQRankSum=1.968;QD=12.08;ReadPosRankSum=0.008;SOR=0.773;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,52:0.34:151
chr19	55672055	rs890871	A	G	1112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=1.382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.37;ReadPosRankSum=-0.127;SOR=0.838;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,57:0.43:133
chr19	55672156	rs146442289	G	A	858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=24;PP=536;ReadPosRankSum=-0.308;SC=AACAGTAGAAGGGGCGTGGCC;SOR=0.618;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=95;TCF=36;TCR=59;TR=40;WE=55672164;WS=55672146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,44:0.44:101
chr19	55672254	rs58218194	T	C	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.545;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.447;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=94;ReadPosRankSum=0.715;SC=GCTTGGAGGATGTGAAGTGGG;SOR=1.609;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=8;WE=55672262;WS=55672244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr19	55672470	rs2365725	T	C	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.952;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=12;PP=431;ReadPosRankSum=0.455;SC=CAGGAGGCTCTCGTCGTCCGC;SOR=0.549;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=55;TCF=38;TCR=17;TR=33;WE=55672478;WS=55672460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,34:0.53:64
chr19	55672569	rs7260371	G	A	1700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FS=2.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.83;ReadPosRankSum=-0.568;SOR=0.516;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,84:0.49:173
chr19	55672601	rs74380007	C	A	1761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.563;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=33;PP=850;ReadPosRankSum=-0.255;SC=GATGTTGGGGCCCCTGACTCC;SOR=0.622;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=154;TCF=87;TCR=67;TR=76;WE=55672609;WS=55672591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,87:0.51:171
chr19	55672784	rs7260320	A	G	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=2.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.17;ReadPosRankSum=-0.053;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,31:0.53:58
chr19	55672846	rs78584250	C	T	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.808;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=201;ReadPosRankSum=-0.327;SC=GAGACCCCTACACCAGCCTCC;SOR=0.830;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=30;TCF=11;TCR=19;TR=18;WE=55672854;WS=55672836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr19	55673145	rs58824375	C	T	754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=14;PP=397;ReadPosRankSum=-0.552;SC=CCTTTCTCGCCGCCAGCCCAG;SOR=0.654;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=32;TCR=25;TR=32;WE=55673153;WS=55673135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,36:0.55:66
chr19	55673164	rs56726774	T	C	736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=14;PP=413;ReadPosRankSum=0.469;SC=AGAAGCGGAATACGGCCTCCA;SOR=0.643;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=59;TCF=32;TCR=27;TR=30;WE=55673172;WS=55673154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,35:0.49:71
chr19	55673245	rs3848617	G	A	662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=17;PP=412;ReadPosRankSum=0.711;SC=GGGATGCAGGGAGAGCGGATT;SOR=0.721;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=57;TCF=25;TCR=32;TR=29;WE=55673253;WS=55673235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,32:0.48:66
chr19	55673654	rs3848618	T	C	692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=2.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.77;ReadPosRankSum=0.929;SOR=0.590;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,41:0.34:120
chr19	55673746	rs7249414	C	A	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=271;ReadPosRankSum=0.039;SC=TCATAGTCATCTAATGAAAAC;SOR=0.616;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=35;TCF=11;TCR=24;TR=20;WE=55673754;WS=55673736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr19	55677523	rs3848619	C	T	548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=14;PP=428;SC=CTGGGATTCGCAGTCCGCAGA;SOR=1.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=19;WE=55677531;WS=55677513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	55686083	rs78345542	A	C	824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.089;HP=2;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=13;ReadPosRankSum=-2.004;SC=ACATAGAAACACTGCCTACAC;SOR=1.056;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=72;TCF=37;TCR=35;TR=32;WE=55686091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,34:0.44:77
chr19	55686138	rs2071574	A	G	2839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.28;ReadPosRankSum=1.488;SOR=0.726;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,71:0.58:122
chr19	55686148	rs75551131	T	G	3444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.26;ReadPosRankSum=-0.159;SOR=0.729;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,101:0.62:162
chr19	55686230	rs2071572	C	T	4040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.683;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=79;PP=2412;ReadPosRankSum=0.168;SC=ACACACCCCACTCCCTTGCTT;SOR=0.619;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=291;TCF=145;TCR=146;TR=167;WE=55686238;WS=55686220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,187:0.58:321
chr19	55686380	rs12459917	G	A	1073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.135;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=28;PP=671;ReadPosRankSum=-1.917;SC=GAAAGGAGAGGGGCCCATCAC;SOR=1.096;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=81;TCF=25;TCR=56;TR=39;WE=55686388;WS=55686370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,45:0.51:89
chr19	55686414	rs12459930	G	T	1051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=1.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.84;ReadPosRankSum=-0.194;SOR=0.536;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,28:0.53:53
chr19	55686417	rs12462211	T	C	1051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=1.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.91;ReadPosRankSum=-1.025;SOR=0.479;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,27:0.56:48
chr19	55686495	rs12459887	A	G	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.972;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=319;ReadPosRankSum=-2.177;SC=TGTGGGCGGGACTGGGCCTGG;SOR=0.136;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=15;WE=55686503;WS=55686485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
chr19	55686523	rs12459921	C	T	658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.025;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=366;ReadPosRankSum=0.169;SC=GCTCGGGGCGCGACCGCGCAT;SOR=0.495;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=64;TCF=52;TCR=12;TR=25;WE=55686531;WS=55686513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,32:0.43:74
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chr19	55690751	rs11672000	A	G	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=50;ReadPosRankSum=-0.556;SC=CGTGGGAACCAGCAGACCGCG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=4;WE=55690759;WS=55690741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr19	55693015	rs17458	C	T	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.245;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=6;PP=147;ReadPosRankSum=0.681;SC=CCTCCCACAGCACCCAGGAGT;SOR=0.051;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=19;TCF=12;TCR=7;TR=13;WE=55693023;WS=55693005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr19	55693123	rs2288420	T	C	674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.888;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=395;ReadPosRankSum=0.089;SC=CCTCGTCACTTAGACCTCCAA;SOR=0.886;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=63;TCF=45;TCR=18;TR=30;WE=55693131;WS=55693113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,34:0.45:76
chr19	55693244	rs2288419	T	C	2117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=32;PP=1272;SC=AACCGCAGGATGCACTGATGC;SOR=0.914;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=77;TCF=43;TCR=34;TR=75;WE=55693252;WS=55693234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr19	55693570	rs11669300	C	T	730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=20;PP=425;ReadPosRankSum=0.638;SC=TGTGAGGGTCCGGGGTCATGG;SOR=0.693;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=62;TCF=19;TCR=43;TR=30;WE=55693578;WS=55693560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,34:0.50:68
chr19	55697236	rs61735060	G	A	1103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.729;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=17;PP=735;ReadPosRankSum=-0.432;SC=GCACCTGGAGGAGCAGCAGTT;SOR=0.504;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=56;TCR=33;TR=45;WE=55697244;WS=55697226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,48:0.52:92
chr19	55699454	rs890870	T	C	4237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=59;PP=2405;SC=ACCTGGTACTTGTCTGCAAAA;SOR=1.102;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=149;TCF=90;TCR=59;TR=149;WE=55699462;WS=55699444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr19	55699575	rs3803905	T	C	4565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=67;NR=78;PP=2515;SC=AGACCGTAACTTCTTTTAATC;SOR=1.004;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=146;TCF=67;TCR=79;TR=145;WE=55699583;WS=55699565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr19	55699646	rs3803904	C	T	1213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=33;PP=893;SC=TTTGGGAGGCCGAGGCGGGTG;SOR=3.258;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=40;TCF=6;TCR=34;TR=39;WE=55699654;WS=55699636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
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chr19	55702910	rs2288523	C	A	3089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=67;NR=41;PP=1771;SC=GCTGCTTCTTCTTATTCCTGG;SOR=1.085;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=67;TCR=41;TR=108;WE=55702918;WS=55702900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr19	55703237	rs11394932	C	CG	9615.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=373;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.111;NF=41;NR=119;PP=2967;ReadPosRankSum=-0.333;SC=GAACATCACACGGTGTGAATT;SOR=0.710;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=163;TCF=41;TCR=122;TR=160;WE=55703245;WS=55703227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,363:0.99:365
chr19	55703326	rs10545294	ACCT	A	7762.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.86;SOR=1.166;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr19	55703438	rs8103223	G	A	1176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=28;PP=764;SC=GATATTCTTAGTAACATTTTT;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=10;TCR=28;TR=38;WE=55703446;WS=55703428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr19	55708557	rs2288521	A	G	8369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=162;NR=114;PP=2965;SC=AAATTGTACAACGTCCCGGGT;SOR=0.893;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=277;TCF=163;TCR=114;TR=276;WE=55708565;WS=55708547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,315:1.00:315
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chr19	55710021	rs2288518	A	G	2350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=39;PP=1286;ReadPosRankSum=-2.231;SC=CAGTGGCTGCAGTGAGGGTGC;SOR=0.677;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=191;TCF=116;TCR=75;TR=102;WE=55710029;WS=55710011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,114:0.55:208
chr19	55710074	rs16986309	G	A	3052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.415;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=64;PP=1907;ReadPosRankSum=0.235;SC=CAGACGGTGAGGTGGTACAGG;SOR=0.735;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=278;TCF=150;TCR=128;TR=140;WE=55710082;WS=55710064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,150:0.49:305
chr19	55713535	rs2288515	G	A	3362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=58;PP=2151;SC=ATGTTGGTGTGTGCTGTGCTT;SOR=1.034;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=48;TCR=58;TR=106;WE=55713543;WS=55713525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr19	55713739	rs12462430	A	G	837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.386;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.407;NF=18;NR=24;PP=457;ReadPosRankSum=0.303;SC=CTGGCCCTCAAACTTTCCAGC;SOR=0.829;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=136;TCF=58;TCR=78;TR=42;WE=55713747;WS=55713729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,49:0.32:151
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chr19	55738425	rs3745919	G	A	145.03	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.812;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5047;FS=3.010;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=61;ReadPosRankSum=1.383;SC=CGGCGGCAGCGGCGCCTGCAG;SOR=0.160;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=6;WE=55738433;WS=55738415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
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chr19	55751238	rs115694218	A	C	978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=19;PP=655;ReadPosRankSum=-0.105;SC=AGGGGCCCCGATACGAAGGCT;SOR=0.640;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=107;TCF=61;TCR=46;TR=46;WE=55751246;WS=55751228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,49:0.44:111
chr19	55751549	rs74774682	C	T	4094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FS=5.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.01;ReadPosRankSum=-1.342;SOR=0.484;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,108:0.58:186
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chr19	55751714	rs201964308	CAT	C	573.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.483;NF=0;NR=12;PP=444;ReadPosRankSum=-0.813;SC=GGTCTGCACACATGTGGGGAG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=12;WE=55751723;WS=55751704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr19	55753536	rs7507792	C	A	1527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.646;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=23;PP=794;ReadPosRankSum=0.234;SC=TCCCTCACCTCGGCCTCCTGG;SOR=0.598;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=121;TCF=78;TCR=43;TR=65;WE=55753556;WS=55753526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,75:0.54:139
chr19	55756992	rs61737174	A	G	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=20;PP=396;ReadPosRankSum=0.088;SC=CACCCAGGGCATCATTGATCT;SOR=0.809;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=63;TCF=24;TCR=39;TR=31;WE=55757000;WS=55756977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,32:0.48:67
chr19	55758535	rs11880346	C	G	2394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.947;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=56;PP=1484;ReadPosRankSum=2.087;SC=CCCCACTGGACGAGGCACTGA;SOR=0.608;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=240;TCF=115;TCR=125;TR=110;WE=55758543;WS=55758525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,119:0.45:264
chr19	55758628	rs7258327	C	T	673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=417;ReadPosRankSum=-1.201;SC=GGCCCCGCCCCGGGACTGCCC;SOR=0.671;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=65;TCF=18;TCR=47;TR=29;WE=55758636;WS=55758618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,31:0.44:70
chr19	55758684	rs139099801	C	T	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.935;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=151;ReadPosRankSum=-0.667;SC=TCCCAGTGAGCACCAGGCTCC;SOR=1.296;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=11;WE=55758692;WS=55758674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr19	55790886	rs10701478	A	AGCCGCCGCC	5276.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=15;PP=2983;SC=CCAGCCGAGGAGCCGCCGCCG;SOR=2.258;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=73;TCF=45;TCR=28;TR=49;WE=55790894;WS=55790876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr19	55791091	rs62126354	C	T	4288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=94;PP=2605;SC=GGCGGCGTTTCAGGGGAGCTC;SOR=1.780;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=142;TCF=48;TCR=94;TR=142;WE=55791099;WS=55791081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr19	55800789	rs62126358	C	G	1792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=10;PP=1209;SC=AGTGGGAGACCAGGCCCTTTG;SOR=2.765;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=63;TCF=52;TCR=11;TR=62;WE=55800797;WS=55800779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr19	55805628	rs142824115	C	T	1144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=28;PP=683;ReadPosRankSum=-1.803;SC=GAGTGAGGGGCGGATAGAGGG;SOR=0.668;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=111;TCF=54;TCR=57;TR=54;WE=55805636;WS=55805618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,58:0.49:119
chr19	55814881	rs1551562	A	G	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.665;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=329;ReadPosRankSum=0.847;SC=GCAGGCTCTGAGCTTCCAGCT;SOR=0.278;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=42;TCF=35;TCR=7;TR=18;WE=55814889;WS=55814871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,20:0.43:46
chr19	55815386	.	AT	A	199.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=0.000;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.17;MQRankSum=1.528;QD=4.16;ReadPosRankSum=-0.723;SOR=0.538;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,15:0.31:48
chr19	55815894	rs1172820	T	C	706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=13;PP=480;ReadPosRankSum=0.061;SC=TCCACTCGCTTATCTCAGTCT;SOR=0.648;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=82;TCF=51;TCR=31;TR=32;WE=55815902;WS=55815884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,36:0.38:95
chr19	55816678	rs1172821	C	T	807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=11;PP=455;ReadPosRankSum=0.036;SC=TCTCTGCCTTCCCCCTACCAG;SOR=0.622;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=59;TCF=40;TCR=19;TR=32;WE=55816686;WS=55816668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,38:0.54:70
chr19	55824332	rs7246479	T	G	1461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=28;PP=844;ReadPosRankSum=1.023;SC=AGTCAACGGCTAAGAGACCGA;SOR=0.697;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=68;TCR=50;TR=66;WE=55824340;WS=55824322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,73:0.55:133
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chr19	55832427	rs10412726	T	G	2005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=50;PP=1194;ReadPosRankSum=-0.466;SC=AGGTGAAGGATCGGGGCTGAG;SOR=0.737;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=173;TCF=73;TCR=100;TR=86;WE=55832435;WS=55832417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,95:0.50:190
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chr19	55856211	rs10405231	C	T	2480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.201;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=45;PP=1642;ReadPosRankSum=-0.840;SC=GATGGGGCACCCCGGGAGGCA;SOR=0.870;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=226;TCF=133;TCR=93;TR=112;WE=55856219;WS=55856201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,116:0.49:239
chr19	55857777	rs45480394	G	T	1825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.769;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=44;PP=1325;ReadPosRankSum=0.090;SC=GCCCAGAAACGCACCCTCGGG;SOR=0.434;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=155;TCF=64;TCR=91;TR=79;WE=55857785;WS=55857767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,80:0.50:160
chr19	55866336	.	G	GC	395.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.140;ClippingRankSum=0.000;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.84;MQRankSum=1.388;QD=5.07;ReadPosRankSum=0.295;SOR=0.672;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,25:0.32:78
chr19	55869879	rs67168196	GGCTCCTTCATCTCGCCCCATGGCT	G	4269.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.336;NF=8;NR=48;PP=2922;ReadPosRankSum=-0.785;SC=GTCCCAGGGTGGCTCCTTCAT;SOR=0.887;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=76;TCF=11;TCR=65;TR=56;WE=55869910;WS=55869869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,167:0.99:169
chr19	55870104	rs12974819	G	C	8499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=162;NR=138;PP=2965;SC=GGATTTCGAGGGCTGCTCTTT;SOR=0.737;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=300;TCF=162;TCR=138;TR=300;WE=55870112;WS=55870094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,323:1.00:323
chr19	55870289	rs12974907	C	T	7648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=124;NR=139;PP=2965;SC=CTTCAAGCTTCGCCCAGTGGG;SOR=0.829;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=263;TCF=124;TCR=139;TR=263;WE=55870297;WS=55870279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr19	55870351	rs12976922	T	C	6200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=108;PP=2965;SC=GTCACCTCCTTGGTTTGGCTA;SOR=0.851;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=205;TCF=97;TCR=108;TR=205;WE=55870359;WS=55870341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr19	55870478	rs79366553	C	T	3357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=60;PP=1815;ReadPosRankSum=2.678;SC=CCACCGGCTCCGGTTTCCCTC;SOR=0.705;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=251;TCF=140;TCR=111;TR=137;WE=55870486;WS=55870468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,157:0.56:281
chr19	55870600	rs12460416	C	G	7144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=110;NR=127;PP=2965;SC=ATCTGGTATTCGGTAGGTGAG;SOR=0.916;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=237;TCF=110;TCR=127;TR=237;WE=55870608;WS=55870590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
chr19	55870835	rs113307911	A	C	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.256;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=8;PP=198;ReadPosRankSum=-0.317;SC=TCTGGGATGGAGCAGGTACGG;SOR=0.420;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=41;TCF=26;TCR=15;TR=20;WE=55870843;WS=55870825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,20:0.48:42
chr19	55871019	rs12609732	A	G	5293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=85;PP=2965;SC=AGATGTGACAAGGCCAGATGG;SOR=0.758;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=170;TCF=85;TCR=85;TR=170;WE=55871027;WS=55871009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr19	55872191	rs897799	G	A	2158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.477;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=41;PP=1337;ReadPosRankSum=-0.068;SC=GCCACACACTGTGGCAAGGGG;SOR=0.750;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=217;TCF=126;TCR=91;TR=100;WE=55872199;WS=55872181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,111:0.46:239
chr19	55872397	rs2124918	A	G	5895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=109;PP=2965;SC=TCCTGACGTCAGCATGCTCCA;SOR=0.856;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=210;TCF=100;TCR=110;TR=209;WE=55872405;WS=55872387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr19	55872566	rs2124919	A	G	2301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=43;NR=35;PP=1259;SC=GTCTCTGAGCAGCCACCGTCT;SOR=0.761;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=43;TCR=35;TR=78;WE=55872574;WS=55872556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr19	55872591	rs2124920	C	T	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.961;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=10;PP=334;ReadPosRankSum=1.537;SC=CGGAAAGTTGCGCTCAGCAAC;SOR=0.806;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=58;TCF=32;TCR=26;TR=24;WE=55872599;WS=55872581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,26:0.40:65
chr19	55872864	rs11673515	G	C	784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.100;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=21;PP=559;ReadPosRankSum=0.291;SC=CCTACCCAGCGAGAGGCCTAG;SOR=0.449;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=25;TCR=35;TR=36;WE=55872872;WS=55872854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,37:0.55:67
chr19	55872955	rs11673554	G	C	351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=3;NR=8;PP=209;SC=CCGCTCCTCCGTCAGACCCAG;SOR=1.292;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=55872963;WS=55872945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	55873642	rs4252574	C	T	2943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=64;NR=30;PP=1524;SC=GCAGGCGCTTCGGCCAGCGGC;SOR=1.138;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=64;TCR=30;TR=94;WE=55873650;WS=55873632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr19	55877231	rs1042505	C	T	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.744;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=90;ReadPosRankSum=-1.248;SC=GGCACAGATGCCCCCCAGGCC;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=8;WE=55877239;WS=55877221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr19	55880385	rs62128183	G	T	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.763;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=96;ReadPosRankSum=-1.014;SC=TGGACTCCCGGGTCTGAGGGA;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=7;WE=55880393;WS=55880375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr19	55888537	rs370170404	G	C	760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=14;PP=339;SC=TGAGGGAGGAGGGGCTGGGGG;SOR=2.093;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=19;WE=55888545;WS=55888527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	55889451	rs77912983	G	A	8008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=144;NR=148;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.858;SC=CCAAGAAGACGCCGTCCACGG;SOR=0.423;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=296;TCF=146;TCR=150;TR=292;WE=55889459;WS=55889441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,307:0.99:310
chr19	55895588	rs1870074	G	A	364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=8;PP=187;SC=GCACCCGGCGGGCTCCCCTGC;SOR=1.473;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=5;TCR=8;TR=13;WE=55895596;WS=55895578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	55903158	rs10653185	C	CAG	2122.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=34;PP=1725;SC=CAGATGGACTCATGATCACAG;SOR=3.080;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=34;WE=55903166;WS=55903148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr19	55913038	rs7608	C	T	2000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=20;PP=1326;SC=GGGCCCGAGCCGCATACTCCT;SOR=1.751;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=45;TCR=20;TR=65;WE=55913046;WS=55913028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr19	55913286	rs11393810	T	TC	425.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=464;SC=TCATCTTTGCTCCTGTCTCCC;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=55913294;WS=55913276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	55914295	rs112400318	CT	C	186.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=1.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.96;ReadPosRankSum=0.040;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,19:0.30:63
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chr19	55967280	rs4801642	C	G	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.54;BaseQRankSum=0.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.098;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=1.788;NF=2;NR=8;PP=155;ReadPosRankSum=-1.589;SC=ACTCCTGGGTCTGAGGGAGGA;SOR=1.532;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=10;WE=55967288;WS=55967270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr19	55993260	rs34864744	A	G	3254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=44;NR=67;PP=1919;SC=CGCCCCGGGTACCGCCTCCGC;SOR=1.336;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=45;TCR=68;TR=111;WE=55993268;WS=55993250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr19	55993790	rs7254184	A	G	2518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=41;PP=1260;ReadPosRankSum=1.015;SC=GCCACGTGGAAGAGGCCGCGG;SOR=0.309;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=41;TCR=41;TR=82;WE=55993798;WS=55993780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,95:0.99:96
chr19	55993876	rs10423355	T	C	563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=11;PP=395;SC=GCCGCCCCCGTCCCGCCGCCA;SOR=0.990;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=21;TCF=10;TCR=11;TR=20;WE=55993884;WS=55993866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	55994240	rs12981044	C	T	4303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=72;NR=72;PP=2681;SC=GCCACGTGCACACTGGCGAGA;SOR=0.785;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=72;TCR=72;TR=144;WE=55994248;WS=55994230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr19	55996939	rs3745450	G	A	487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=2;PP=352;SC=GTCCTGATCTGGGAAGTGCCG;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=55996947;WS=55996929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	55999993	rs4405662	A	G	2497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=41;PP=1367;SC=TGAGTGATCCATTCTCCTTGG;SOR=0.778;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=84;TCF=43;TCR=41;TR=84;WE=56000001;WS=55999983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr19	56000243	.	G	GGGAGCACCAAAGCCGTGGTCCCCAGCCCTGACTTCAGGGGCCAGACATC	110.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=-0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.07;ReadPosRankSum=2.823;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr19	56000429	rs57080356	GCC	G	794.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=20;PP=368;SC=CCATCTGCCCGCCCCCCCCCC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=20;WE=56000438;WS=56000419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	56000492	rs11084399	C	T	99.82	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=192;SC=ACTGGGTCCCCGGCCCATCCG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=56000500;WS=56000482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	56001419	rs10716127	CG	C	50.37	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=16.79;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr19	56001802	rs5828624	C	CCCAAGCAA	4493.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=29;PP=2364;SC=CTCCCCCGACCCCAAGGCTGG;SOR=0.884;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=40;TCF=6;TCR=34;TR=32;WE=56001810;WS=56001792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr19	56001871	rs4274529	C	T	809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=18;PP=478;SC=TCTCCTTAGCCGGGGCCCTGG;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=10;TCR=18;TR=28;WE=56001879;WS=56001861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	56004901	rs889090	G	A	39.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=0;PP=22;SC=CCTGAGCATAGCTTAGTCCCC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=56004909;WS=56004892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr19	56009191	rs34794462	GT	G	593.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=3;PP=386;SC=TGGATGAAGAGTCAGGAGGCT;SOR=2.049;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=10;WE=56009199;WS=56009181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	56009215	rs7254234	G	A	701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=7;PP=427;SC=CGGCTTCCCCGACTCTAATTC;SOR=1.445;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=16;TCR=7;TR=23;WE=56009223;WS=56009205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	56009741	rs4801701	C	T	109.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=83;SC=TGTGTTATGCCCATTTTACTG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=56009749;WS=56009731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	56011091	rs4801314	G	A	564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=7;PP=423;SC=AATGGGAACTGGGTGAGTGAC;SOR=1.230;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=14;TCR=7;TR=21;WE=56011099;WS=56011081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	56011460	rs4801713	C	T	9569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=350;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=162;NR=157;PP=2965;SC=CAGACCTAACCTCACAGACCA;SOR=0.740;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=319;TCF=162;TCR=157;TR=319;WE=56011468;WS=56011450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,350:1.00:350
chr19	56012590	rs11669496	G	A	1039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.59;SOR=3.528;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	56012597	rs11669422	A	G	947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.13;SOR=3.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	56015448	rs7257434	C	T	7832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=146;NR=118;PP=2965;SC=TGGGTGGGCTCCAGCTGTGAG;SOR=0.877;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=264;TCF=146;TCR=118;TR=264;WE=56015456;WS=56015438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,293:1.00:293
chr19	56024519	rs671542	T	C	2423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=34;NR=50;PP=1321;SC=CCTCCAACTCTGAGAGTCCAT;SOR=1.305;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=34;TCR=50;TR=84;WE=56024527;WS=56024509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr19	56024563	rs514574	G	C	953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=23;PP=721;SC=CTGGGGTGAGGAGACTGGGAC;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=30;WE=56024571;WS=56024553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	56024599	rs671152	A	G	383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=45;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=11;PP=290;SC=GTAAAGAGACAGATTCCAGAC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=56024607;WS=56024589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	56029465	rs4801331	G	A	1707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.88;QD=24.75;SOR=0.781;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr19	56030428	rs10217	C	A	2889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=69;PP=1919;SC=ACAAAAAAAACCCCCAAAGTA;SOR=2.170;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=99;TCF=29;TCR=70;TR=98;WE=56030436;WS=56030409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr19	56041255	rs620251	C	G	2449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=41;PP=1532;ReadPosRankSum=0.961;SC=TCGGCCGCGGCGGCCAGGCCG;SOR=0.776;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=44;TCR=42;TR=84;WE=56041263;WS=56041244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,98:0.98:100
chr19	56047448	rs310453	A	G	5675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=105;NR=87;PP=2965;SC=CGGCCATAGCAACCCTGGCCC;SOR=0.741;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=193;TCF=106;TCR=87;TR=192;WE=56047456;WS=56047438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr19	56052008	rs34837414	C	T	1807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=22;PP=1044;SC=CTGGATCCTGCGTCTGAGAGA;SOR=1.146;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=63;TCF=40;TCR=23;TR=62;WE=56052016;WS=56051998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr19	56052337	rs55643341	A	AC	11485.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=352;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=133;PP=2966;SC=GCTCCCCAAAACCCAGGTCCC;SOR=0.933;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=168;TCF=25;TCR=143;TR=158;WE=56052345;WS=56052327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,341:1.00:341
chr19	56052770	rs654439	C	T	5154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=103;NR=78;PP=2965;SC=GGCTGCAGACCGGGTCGAAGA;SOR=0.834;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=181;TCF=103;TCR=78;TR=181;WE=56052778;WS=56052760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr19	56055436	rs694398	A	G	3468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=48;PP=1947;SC=TGGGATAAGCACTCCCAACCT;SOR=1.066;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=125;TCF=76;TCR=49;TR=124;WE=56055444;WS=56055426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr19	56056184	rs491639	A	G	1606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=29;PP=924;SC=GAGGCTGGGCAAGGAGCACGC;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=24;TCR=29;TR=53;WE=56056192;WS=56056174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr19	56089353	rs2292812	C	T	3821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=61;PP=2475;SC=GCAGGTGAGCCTTGCTGTCTA;SOR=0.963;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=83;TCR=61;TR=144;WE=56089361;WS=56089343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr19	56089908	rs113850871	C	CCCG	5890.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=16;NR=48;PP=1760;SC=CTCCGTTCTGCCCTTCTCCCC;SOR=0.756;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=65;TCF=17;TCR=48;TR=64;WE=56089916;WS=56089898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr19	56089947	rs10403008	C	G	3207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=60;PP=2021;SC=ACTCCGCCCCCTCGCCCCCCT;SOR=0.949;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=115;TCF=55;TCR=60;TR=113;WE=56089955;WS=56089937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr19	56090076	rs34164618	G	T	2424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=42;NR=40;PP=1444;SC=GGAGGTAGGAGGCGAGGCGGA;SOR=0.832;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=42;TCR=40;TR=82;WE=56090084;WS=56090066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr19	56104136	rs7247236	T	C	3029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=63;PP=2115;SC=CGGGCGGCGGTCGCCGCCTCC;SOR=1.200;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=41;TCR=63;TR=104;WE=56104144;WS=56104126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr19	56114045	rs1077806	C	T	4046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=62;PP=2467;SC=CGCACCACCACCGCGTGCACT;SOR=0.734;Source=Platypus;TCF=70;TR=132;WE=56114053;WS=56114035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr19	56114237	rs310459	G	A	2619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=52;PP=1749;SC=GGGCCGAGGAGGAGGAGGAGA;SOR=1.014;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=94;TCF=42;TCR=52;TR=93;WE=56114245;WS=56114227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr19	56153868	rs310475	G	A	5123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=85;NR=87;PP=2680;SC=CCCAGCTGCCGCTCCAGATGC;SOR=0.870;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=173;TCF=85;TCR=88;TR=172;WE=56153876;WS=56153858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr19	56160399	rs7246799	T	C	507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=3;PP=404;SC=CTGGGGTCCGTAGGAAGCCGC;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=56160407;WS=56160389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	56162776	rs2287791	C	T	1859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=35;NR=26;PP=958;SC=AAGAAGGCAGCGCCAGTGAGA;SOR=0.781;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=35;TCR=26;TR=61;WE=56162784;WS=56162766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr19	56162881	rs519856	C	T	829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=16;PP=499;SC=GTGCATGGGGCGGGCGCTGAG;SOR=1.044;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=13;TCR=16;TR=29;WE=56162889;WS=56162871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	56170771	rs537728	G	A	1095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=24;PP=737;SC=GTGTTGGCCGGCCTGTGGGTG;SOR=1.292;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=15;TCR=24;TR=39;WE=56170779;WS=56170761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr19	56171778	rs507498	A	C	808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=2;PP=557;SC=TGGAGCTTACATGGTTGCGGG;SOR=3.528;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=56171786;WS=56171769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	56175149	rs310444	G	A	1738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=34;PP=894;SC=TTCTCCCCCAGTCCTGTTCCC;SOR=1.685;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=19;TCR=34;TR=53;WE=56175157;WS=56175139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr19	56180732	rs681804	T	C	2216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=48;NR=35;PP=1364;SC=TGGGGGGGCATGTGAGGGGCC;SOR=1.048;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=48;TCR=35;TR=83;WE=56180740;WS=56180722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr19	56180968	rs617073	C	T	1979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=37;PP=1189;SC=TCGTGGAGGACGTGCGGGACG;SOR=1.257;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=27;TCR=37;TR=64;WE=56180976;WS=56180958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr19	56185250	rs664684	G	A	5689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=119;NR=78;PP=2965;SC=ACGCTGACTGGCTGTTGGGCG;SOR=1.046;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=197;TCF=119;TCR=78;TR=197;WE=56185258;WS=56185240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr19	56203985	rs66906879	A	G	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.191;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=49;ReadPosRankSum=-0.980;SC=TTTGGAGGCAATGGTCCTCCC;SOR=0.132;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=5;WE=56203993;WS=56203975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr19	56241265	rs193384	A	G	4202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=72;PP=2844;SC=AGGGATCATCAAGGCTGGTAT;SOR=0.816;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=80;TCR=72;TR=152;WE=56241273;WS=56241255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr19	56249445	rs755804	A	G	1153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=8;PP=718;SC=TCCTCGCCCCATCATCCAGCA;SOR=2.200;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=32;TCR=8;TR=40;WE=56249453;WS=56249435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr19	56249672	rs56211941	A	G	2591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.735;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=56;PP=1874;ReadPosRankSum=2.539;SC=TAAATTTCCAAAACTCTTCCT;SOR=0.539;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=241;TCF=120;TCR=121;TR=114;WE=56249680;WS=56249662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,119:0.46:258
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chr19	56392920	rs12975929	C	T	3225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.904;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=69;PP=1862;ReadPosRankSum=-0.021;SC=CCATCACAGACGACTGTGACA;SOR=0.766;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=253;TCF=124;TCR=129;TR=136;WE=56392928;WS=56392910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,152:0.54:284
chr19	56393051	rs302457	T	C	2724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=56;PP=1827;SC=AAATCATTGATACTCTGAGTT;SOR=1.514;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=32;TCR=56;TR=88;WE=56393059;WS=56393041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr19	56410340	rs302828	T	G	2849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=61;PP=1976;SC=GGGAAAGTAATTGCGTCCCGA;SOR=1.896;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=25;TCR=61;TR=86;WE=56410348;WS=56410330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr19	56413532	rs7258847	G	A	6453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=142;PP=2965;SC=CATCTGACAAGTGCTTGCAAG;SOR=1.427;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=223;TCF=81;TCR=142;TR=223;WE=56413540;WS=56413522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr19	56413583	rs302835	A	G	2018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=47;PP=1399;SC=TGCAGGGTGAAAGCCACAGAG;SOR=2.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=11;TCR=47;TR=58;WE=56413591;WS=56413573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr19	56443864	rs145915426	T	TTTTTTG	300.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=64.19;NF=0;NR=8;PP=457;SC=AGTACACTTTTTTGTTGTTGT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=56443872;WS=56443854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	56459342	rs306507	C	T	4854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=73;PP=2857;SC=TCTCATATTCCGCCCTGGACA;SOR=0.819;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=164;TCF=91;TCR=73;TR=164;WE=56459350;WS=56459332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr19	56459614	rs306506	G	C	7859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=123;NR=133;PP=2965;SC=AATGTGTGTTGTAGTCCGCAG;SOR=0.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=256;TCF=123;TCR=133;TR=256;WE=56459622;WS=56459604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,289:1.00:289
chr19	56464058	rs306501	C	G	3199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=57;PP=1778;SC=CTAAGGCAAGCCAGATTTTAA;SOR=1.150;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=45;TCR=57;TR=102;WE=56464066;WS=56464048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr19	56473645	rs11671531	A	G	402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=306;SC=CTTTATGGAGATGGTCTGTTT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=56473653;WS=56473635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	56477687	rs306497	A	G	4026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=83;PP=2578;SC=TGGAGTCCAAAGCTGTGAAGC;SOR=1.394;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=48;TCR=83;TR=131;WE=56477695;WS=56477677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr19	56477710	rs306496	T	C	2943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=67;PP=1627;SC=CTATGCAGGGTGCTGAGATCC;SOR=1.569;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=36;TCR=67;TR=103;WE=56477718;WS=56477700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr19	56487430	rs306483	G	A	376.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.86;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	56487450	rs306482	T	G	620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.80;SOR=5.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	56487603	rs306481	A	G	6218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=110;NR=94;PP=2965;SC=AATAGCCTGAAGGATGATGGG;SOR=0.773;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=204;TCF=110;TCR=94;TR=204;WE=56487611;WS=56487593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr19	56490778	rs306475	C	T	1418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=17;PP=875;SC=ACTGCCTGTTCACCTCCATCT;SOR=1.358;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=31;TCR=17;TR=48;WE=56490786;WS=56490768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr19	56499279	rs306457	G	C	5279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=106;PP=2947;SC=TTAATCCTTAGGCCGTCCAGT;SOR=1.213;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=176;TCF=70;TCR=106;TR=176;WE=56499287;WS=56499269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr19	56499345	rs306455	A	G	2193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=52;PP=1462;SC=GGCAAATACCAGGCGTTATCA;SOR=1.893;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=21;TCR=52;TR=73;WE=56499353;WS=56499335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr19	56511082	rs35427984	C	G	5712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=103;NR=96;PP=2965;SC=CTTTCCATGGCGATGTTATCA;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=199;TCF=103;TCR=96;TR=199;WE=56511090;WS=56511072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr19	56511217	rs12462690	G	A	1623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=33;PP=944;SC=CATGACACACGGATCGAATCC;SOR=2.221;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=47;TCF=13;TCR=34;TR=46;WE=56511225;WS=56511207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr19	56511233	rs12462663	C	T	1134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=25;PP=698;SC=AATCCCCTGCCCTCGCTGCTG;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=31;WE=56511241;WS=56511223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr19	56520091	rs12460573	C	T	2053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=21;PP=1395;SC=ACATTCTTATCCTTGGCTTGG;SOR=1.810;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=51;TCR=21;TR=72;WE=56520099;WS=56520081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr19	56520129	rs12460633	G	A	4096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=63;PP=2566;SC=ATTGAGGCCAGTCTCCCTTTT;SOR=1.012;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=150;TCF=87;TCR=63;TR=150;WE=56520143;WS=56520119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr19	56520150	rs12460592	C	G	5319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=106;NR=80;PP=2965;ReadPosRankSum=2.091;SC=TCTTTGTCTTCCAGGACATTC;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=188;TCF=107;TCR=81;TR=186;WE=56520158;WS=56520140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,196:0.99:198
chr19	56530664	rs306428	A	G	2359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-13.879;NF=62;NR=51;PP=1558;ReadPosRankSum=-0.014;SC=TCTCTGACTCAAATAATAAAC;SOR=0.664;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=239;TCF=133;TCR=106;TR=113;WE=56530672;WS=56530654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,121:0.46:263
chr19	56538203	rs3103612	C	A	354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=2;PP=249;SC=TGACCTCCCACAGTGCTGGGA;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=56538211;WS=56538193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	56539240	rs397977	C	T	3209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.390;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=69;PP=1831;ReadPosRankSum=-1.317;SC=CAGTGTTTGACGGTGACGACC;SOR=0.665;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=301;TCF=147;TCR=154;TR=133;WE=56539248;WS=56539230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:190,156:0.45:346
chr19	56549448	rs45624737	G	A	1206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.712;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=22;PP=833;ReadPosRankSum=-1.341;SC=AAATCCTTACGACCTCCCCCA;SOR=0.597;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=95;TCF=58;TCR=37;TR=51;WE=56549456;WS=56549438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,55:0.50:111
chr19	56561749	rs2574762	A	G	571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=5;PP=443;SC=GGGAATGAGCATCACGATCTT;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=22;WE=56561757;WS=56561739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	56561859	rs187988999	G	A	2142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.507;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=42;PP=1154;ReadPosRankSum=0.447;SC=CATGGCTGACGCACCTGAGCC;SOR=0.633;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=189;TCF=107;TCR=82;TR=96;WE=56561867;WS=56561849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,107:0.51:209
chr19	56564916	rs35553570	G	C	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=299;ReadPosRankSum=-1.048;SC=AGGAATAAAGGAAACTCCAGT;SOR=0.582;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=39;TCF=32;TCR=7;TR=19;WE=56564924;WS=56564906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,20:0.48:42
chr19	56565127	rs392801	G	A	1878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=41;PP=1046;ReadPosRankSum=-0.222;SC=GGGTTGCTGCGCTGTGCGAGG;SOR=0.685;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=145;TCF=69;TCR=76;TR=81;WE=56565135;WS=56565117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,90:0.55:165
chr19	56565164	rs3103057	G	A	2954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=53;PP=1596;SC=CAGTGTTCTGGCGAGACTCGG;SOR=1.287;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=38;TCR=53;TR=91;WE=56565172;WS=56565154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr19	56572960	rs117723733	G	C	1285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.674;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=31;PP=762;ReadPosRankSum=-1.947;SC=TTTTCTCAGAGCAAGCTATGC;SOR=0.618;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=113;TCF=42;TCR=71;TR=51;WE=56572968;WS=56572950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,61:0.47:131
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chr19	56599437	rs5828672	CTCG	C	1390.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=6;PP=729;SC=CGCCCGCGGCCTCGTCGTCGT;SOR=1.751;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=17;TCF=11;TCR=6;TR=14;WE=56599447;WS=56599427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
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chr19	56691912	rs274171	G	C	3633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=46;PP=2239;SC=CGCCTGCCCCGCTTTCTGTCT;SOR=1.146;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=126;TCF=79;TCR=47;TR=125;WE=56691920;WS=56691902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr19	56693620	rs3745833	C	G	1793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.532;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=44;PP=1090;ReadPosRankSum=1.612;SC=GGAAGGCCATCGGTGAGTGAG;SOR=0.631;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=174;TCF=76;TCR=98;TR=79;WE=56693628;WS=56693610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,89:0.45:196
chr19	56693643	rs274174	T	C	3589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=73;PP=1830;SC=GGGAGTTAGATGTCTTCTCCT;SOR=1.203;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=124;TCF=51;TCR=73;TR=123;WE=56693651;WS=56693633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr19	56694505	rs575756	C	T	2595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.493;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=46;PP=1468;ReadPosRankSum=-0.200;SC=TGTTTCTAGACGGGCTCCCCT;SOR=0.736;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=205;TCF=122;TCR=83;TR=114;WE=56694513;WS=56694495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,126:0.56:224
chr19	56702323	rs4801296	C	T	2284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.174;NF=55;NR=52;PP=1414;ReadPosRankSum=1.540;SC=TCACCTGTTACGTCAATACTC;SOR=0.697;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=239;TCF=124;TCR=115;TR=107;WE=56702331;WS=56702313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,115:0.44:262
chr19	56702440	rs112013480	C	T	1263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.719;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=34;PP=774;ReadPosRankSum=0.138;SC=TGACTGGACACACCAGACTTC;SOR=0.610;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=41;TCR=65;TR=56;WE=56702448;WS=56702430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,60:0.52:115
chr19	56717353	rs10419548	A	G	2993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.758;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=72;PP=1886;ReadPosRankSum=0.807;SC=GAGCCACCACAGTCCATGCCA;SOR=0.873;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=273;TCF=131;TCR=142;TR=132;WE=56717361;WS=56717343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,147:0.49:300
chr19	56718585	rs4801690	A	G	2458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.988;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=56;PP=1505;ReadPosRankSum=-0.473;SC=CAGGCCAGCCAAGAGCTGCAG;SOR=0.509;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=250;TCF=115;TCR=135;TR=110;WE=56718593;WS=56718575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,124:0.44:280
chr19	56719405	rs12979551	A	C	1790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=13;PP=1059;SC=ATTCTCAGGAAGAGGACTTCC;SOR=2.056;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=43;TCR=13;TR=56;WE=56719413;WS=56719395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr19	56719666	rs111847463	C	T	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.258;NF=6;NR=6;PP=236;ReadPosRankSum=1.232;SC=GCCAAAGCCTCTCCATCCCTT;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=13;TCR=12;TR=12;WE=56719674;WS=56719656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr19	56719822	rs1865101	G	T	2054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=1.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.739;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-15.142;NF=50;NR=51;PP=1446;ReadPosRankSum=1.207;SC=TTCCAGCAGGGGTGGTGGGAG;SOR=0.579;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=233;TCF=120;TCR=113;TR=101;WE=56719830;WS=56719812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,105:0.39:267
chr19	56719853	rs1865102	C	A	1490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=3.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.735;HP=6;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-14.670;NF=32;NR=44;PP=1156;ReadPosRankSum=0.650;SC=GAAGGAACCCCAAAAAAGAGC;SOR=1.010;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=210;TCF=98;TCR=112;TR=76;WE=56719861;WS=56719843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,78:0.32:242
chr19	56758938	rs35779585	G	A	2414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=60;PP=1620;SC=CAGAGGGAGTGCCCTAGATAG;SOR=3.098;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=14;TCR=60;TR=74;WE=56758946;WS=56758928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr19	56888450	rs2304124	A	G	2702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.032;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=57;PP=1675;ReadPosRankSum=-1.005;SC=TCACTCGTCAATCAACTCTCA;SOR=0.649;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=248;TCF=126;TCR=122;TR=120;WE=56888458;WS=56888440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,131:0.49:270
chr19	56901293	rs6509995	C	T	1838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=42;NR=17;PP=1020;SC=CAGGGAAGATCTTCTAAGACA;SOR=1.230;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=60;TCF=43;TCR=17;TR=59;WE=56901301;WS=56901283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr19	56918560	rs4801159	T	A	1030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=21;PP=603;SC=GAACATTTTGTTTTTCTTCCA;SOR=1.802;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=30;WE=56918582;WS=56918550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr19	56918574	rs2288862	T	C	757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=15;PP=436;SC=TCTTCCAAAATTCTGCAACCT;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=21;WE=56918582;WS=56918550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	56918598	rs2288863	T	C	420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.54;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=7;PP=210;SC=AAGGTTCCATTCATCCAGTGA;SOR=2.303;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=56918606;WS=56918588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	56935527	rs3810340	A	G	1664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=30;PP=1117;ReadPosRankSum=-0.860;SC=GTGGGAAAGCATTTAGCTATA;SOR=0.715;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=134;TCF=79;TCR=55;TR=73;WE=56935535;WS=56935517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,78:0.53:146
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chr19	56953863	rs8107758	T	C	2643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=30;PP=1784;SC=GCTTCTCTCCTGTATGAATGT;SOR=1.414;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=56;TCR=30;TR=86;WE=56953871;WS=56953853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
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chr19	57037103	rs16987303	C	G	1384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=26;PP=873;ReadPosRankSum=-0.990;SC=AGCCAAACTTCCAATCTTACT;SOR=0.747;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=52;TCR=45;TR=56;WE=57037111;WS=57037093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,61:0.58:106
chr19	57050648	rs12981980	G	A	1328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.925;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=33;PP=725;ReadPosRankSum=-1.260;SC=TTCATCTCGGGATGAGATCTG;SOR=0.986;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=143;TCF=65;TCR=78;TR=59;WE=57050656;WS=57050638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,67:0.44:153
chr19	57065189	rs145011	T	C	3408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.334;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=86;PP=1987;ReadPosRankSum=-1.091;SC=ACTATGTGTTTGGAAGGAAGC;SOR=0.574;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=318;TCF=144;TCR=174;TR=163;WE=57065197;WS=57065179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,167:0.50:337
chr19	57066013	rs10409531	C	T	2061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.773;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=46;PP=1176;ReadPosRankSum=0.405;SC=TTTGAATGTGCGGAGTGTGGA;SOR=0.844;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=168;TCF=83;TCR=85;TR=87;WE=57066021;WS=57066003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,97:0.51:191
chr19	57085769	rs10421285	G	C	3550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=72;PP=2444;ReadPosRankSum=-0.482;SC=TTAGGGTTCAGTGACTTTCAC;SOR=0.692;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=278;TCF=142;TCR=136;TR=147;WE=57085777;WS=57085759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,157:0.52:300
chr19	57087951	rs995934	G	A	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.812;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=28;ReadPosRankSum=-0.090;SC=CTAATCTTATGTAAGAACCAT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=3;WE=57087959;WS=57087949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr19	57089050	rs4801177	C	T	1902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.540;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=53;PP=1316;ReadPosRankSum=-1.677;SC=CATAAGAGAACTCATACTGGA;SOR=0.739;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=182;TCF=75;TCR=107;TR=88;WE=57089058;WS=57089040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,90:0.47:190
chr19	57089375	rs4570977	A	G	1399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.794;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=27;PP=917;ReadPosRankSum=-1.688;SC=ACCTCGCGCAACATCAGAAAA;SOR=0.661;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=100;TCF=57;TCR=43;TR=54;WE=57089383;WS=57089365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,61:0.53:115
chr19	57175121	rs115625349	G	A	3231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.875;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=69;PP=2088;ReadPosRankSum=-1.245;SC=AGAAGCTGAAGGCCTTCCCGC;SOR=0.602;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=278;TCF=148;TCR=130;TR=141;WE=57175129;WS=57175111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,151:0.49:310
chr19	57175484	rs7250003	A	G	5862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=82;PP=2965;SC=GGCAGGGGTAAGGCCGCTCTC;SOR=0.801;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=191;TCF=109;TCR=82;TR=191;WE=57175492;WS=57175474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr19	57176198	rs8108756	T	G	7528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=136;NR=117;PP=2965;SC=AGATGAACGCTGAACAGTAGC;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=253;TCF=136;TCR=117;TR=253;WE=57176206;WS=57176188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,286:1.00:286
chr19	57176304	rs12460400	T	G	5786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=111;NR=92;PP=2965;SC=CTTCGGGCTCTCCCCAGGCGC;SOR=0.894;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=203;TCF=111;TCR=92;TR=203;WE=57176312;WS=57176294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr19	57176482	rs12462469	C	T	6836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=113;NR=111;PP=2965;SC=TCCTGGTTTTCCTGCAGGTCC;SOR=0.760;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=224;TCF=113;TCR=111;TR=224;WE=57176490;WS=57176472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr19	57176820	rs12462993	C	A	1794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=37;PP=1059;SC=TCCACACTGGCTGCCAGGGAC;SOR=1.875;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=18;TCR=37;TR=55;WE=57176828;WS=57176810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr19	57176838	rs12462995	C	G	1353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=29;PP=870;SC=GACACTACCCCTCAACCCCTG;SOR=2.160;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=12;TCR=29;TR=41;WE=57176846;WS=57176828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr19	57293394	rs2286751	A	G	1633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=34;PP=1033;ReadPosRankSum=0.552;SC=CACTAAGGGAACTAAGTTCCT;SOR=0.672;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=150;TCF=83;TCR=67;TR=74;WE=57293402;WS=57293384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,79:0.49:161
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chr19	57334156	rs201188230	C	T	2178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=45;PP=1282;ReadPosRankSum=1.023;SC=CCAGCGGTCTCGTGGCTCCAT;SOR=0.672;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=216;TCF=113;TCR=103;TR=92;WE=57334164;WS=57334146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,106:0.44:242
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chr19	57641146	rs1027392	A	G	4238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=59;PP=2684;SC=TTTTCTGGCAACATGCAGAAT;SOR=0.823;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=131;TCF=71;TCR=60;TR=130;WE=57641154;WS=57641136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
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chr19	57642782	rs9973206	C	A	1066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=25;PP=746;SC=AGGGGGAATACGAAGGTGACT;SOR=2.432;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=33;WE=57642790;WS=57642772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	57646570	rs4801433	T	C	3453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=57;PP=2185;SC=TTATGTTGAATGAGGTTTTTC;SOR=0.758;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=63;TCR=57;TR=120;WE=57646578;WS=57646560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr19	57647015	rs7251328	A	G	7574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=136;NR=117;PP=2965;SC=GCTTGTAGGCATTTCCACAGT;SOR=0.796;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=253;TCF=136;TCR=117;TR=253;WE=57647023;WS=57647005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,284:1.00:284
chr19	57647236	rs7252632	T	C	6458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=115;PP=2965;SC=GATGGATTATTGCCAACTAAT;SOR=0.799;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=224;TCF=109;TCR=115;TR=224;WE=57647244;WS=57647226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr19	57648277	rs4801200	A	T	3769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=79;NR=46;PP=2234;SC=TCTTCCTCCAACCATGGCTCC;SOR=1.296;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=80;TCR=46;TR=125;WE=57648285;WS=57648267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr19	57648433	rs2370135	T	C	2715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=53;PP=1463;SC=CGTATGCTTGTGTGAATATTT;SOR=1.292;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=92;TCF=38;TCR=54;TR=91;WE=57648441;WS=57648423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr19	57649900	rs2370134	C	T	1342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=22;PP=729;ReadPosRankSum=0.321;SC=TTTCTCTGTTCGGGATTCAGC;SOR=0.741;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=98;TCF=61;TCR=37;TR=56;WE=57649908;WS=57649890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,63:0.56:113
chr19	57650144	.	A	G	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.622;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=95;ReadPosRankSum=-0.483;SC=AGACCTACTCATGACACTGCC;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=6;WE=57650152;WS=57650134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr19	57653864	rs11084488	T	C	425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=2;PP=248;SC=GTAGAGTGTGTGTTACCTTTT;SOR=2.448;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=57653872;WS=57653854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	57654065	rs58537382	T	C	5334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=87;PP=2636;SC=TGAGGGAAAATGGAAAAGAAC;SOR=0.819;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=172;TCF=84;TCR=88;TR=171;WE=57654073;WS=57654055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr19	57654104	rs59976893	T	C	4519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=77;PP=2664;SC=GCTTTGGAAGTTGGGGATCAT;SOR=0.999;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=63;TCR=78;TR=140;WE=57654112;WS=57654094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr19	57654217	rs10426157	T	G	748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.80;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	57665750	rs8108591	T	C	2766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=26;PP=1964;SC=GTCCAGTTGATATTATCAAGT;SOR=1.839;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=91;TCF=65;TCR=26;TR=91;WE=57665758;WS=57665740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr19	57666840	rs12459119	G	A	404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=4;NR=8;PP=198;SC=TTGAGACAGCGGTCTCTCTCA;SOR=1.911;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=12;WE=57666848;WS=57666830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	57703209	rs2302059	T	C	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=1.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.92;ReadPosRankSum=0.238;SOR=1.501;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,7:0.25:28
chr19	57703369	rs7250511	T	C	1392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.584;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=32;PP=978;ReadPosRankSum=1.011;SC=TGAGGCGGTTTCCGAAGTGGG;SOR=0.781;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=154;TCF=83;TCR=71;TR=66;WE=57703377;WS=57703359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,69:0.42:163
chr19	57717081	rs8110121	G	A	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.668;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.68;ReadPosRankSum=-1.068;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr19	57723007	rs2074858	G	C	3501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.42;ReadPosRankSum=-1.026;SOR=0.727;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:106,95:0.47:201
chr19	57723013	rs917340	G	A	3403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.46;ReadPosRankSum=0.304;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:106,89:0.46:195
chr19	57742472	rs11084490	G	C	3338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=243;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=50;PP=1373;SC=CTGTGTAGCAGTGAGACATCA;SOR=1.057;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=131;TCF=81;TCR=50;TR=131;WE=57742480;WS=57742462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr19	57742489	rs58264281	C	T	6200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=77;NR=50;PP=2874;SC=ATCAGTGAGGCTGCAGGACGA;SOR=1.138;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=138;TCF=80;TCR=58;TR=127;WE=57742522;WS=57742479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr19	57742493	rs142269286	AGGACGAGCAGGATT	A	6278.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=22;NR=49;PP=2971;SC=GTGAGGCTGCAGGACGAGCAG;SOR=1.123;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=74;TCF=25;TCR=49;TR=71;WE=57742522;WS=57742479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr19	57742514	rs150998448	G	GC	1426.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=49;PP=921;ReadPosRankSum=0.906;SC=GATTGGAAGCGCCCCGGCCAG;SOR=0.676;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=93;TCF=30;TCR=63;TR=72;WE=57742522;WS=57742479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,58:0.39:148
chr19	57742703	rs758097	A	G	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=292;ReadPosRankSum=-1.382;SC=GAAAGGACGCAGGGAAGGCTG;SOR=0.678;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=40;TCF=13;TCR=27;TR=22;WE=57742711;WS=57742693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,26:0.57:46
chr19	57743039	rs758098	T	C	1568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.60;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
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chr19	57743334	rs758099	C	T	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.619;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=244;ReadPosRankSum=1.058;SC=GGAGCATTGGCATCCCTGACT;SOR=1.256;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=25;TCF=14;TCR=11;TR=14;WE=57743342;WS=57743324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
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chr19	57760289	rs73629343	G	A	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.767;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=188;ReadPosRankSum=0.952;SC=CTGGTCCTGGGGCTGCAGCCT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=9;WE=57760297;WS=57760279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
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chr19	57765432	rs8100154	A	G	1414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.184;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.105;NF=36;NR=33;PP=1044;ReadPosRankSum=-0.037;SC=CCTACCTCAAAAGGCACCAGC;SOR=0.762;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=161;TCF=85;TCR=76;TR=69;WE=57765440;WS=57765422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,71:0.40:178
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chr19	57802806	rs2041109	C	T	3288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.082;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=42;PP=1026;ReadPosRankSum=-0.805;SC=TCTTGCATAACAAGAGCCACA;SOR=0.688;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=177;TCF=95;TCR=82;TR=83;WE=57802814;WS=57802796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,92:0.45:205
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chr19	57832089	rs4801461	G	T	563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=7;PP=311;SC=CGCTTTGTGCGCATTTTTCTC;SOR=1.127;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=12;TCR=7;TR=19;WE=57832104;WS=57832079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	57832257	rs4801462	T	C	981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.086;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=16;PP=565;ReadPosRankSum=-0.438;SC=GACGAGGTTTTGGCCTTGCTG;SOR=0.887;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=69;TCF=40;TCR=29;TR=42;WE=57832265;WS=57832247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,45:0.60:75
chr19	57835252	rs4801216	C	T	1574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=40;PP=1089;SC=CTCCACAGCCCACTTGTTCTG;SOR=2.876;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=9;TCR=40;TR=49;WE=57835260;WS=57835242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	57835279	rs4801467	G	A	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=39;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=202;ReadPosRankSum=-1.265;SC=CTGGCACCACGCAGGGGTGTT;SOR=0.859;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=12;WE=57835287;WS=57835269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr19	57837926	rs8110400	C	A	2252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=23;PP=1388;SC=CCCCATCCTGCAGTCCCAGAT;SOR=1.445;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=50;TCR=23;TR=73;WE=57837934;WS=57837916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr19	57838018	rs6510057	C	G	4012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=65;PP=2253;SC=TTTGTTCAAACCAGAGCTGAT;SOR=0.850;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=131;TCF=66;TCR=65;TR=130;WE=57838026;WS=57838008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr19	57839150	rs8100491	A	G	3454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=45;PP=2091;SC=CTCCAGGAACAACTGACACAA;SOR=1.153;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=124;TCF=79;TCR=45;TR=124;WE=57839158;WS=57839140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr19	57839567	rs1968090	T	A	5603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NR=97;PP=2965;SC=CTTCAGCACCTCATCATCCAC;SOR=0.886;Source=Platypus;TCR=97;WE=57839575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr19	57840547	rs10410649	A	G	3364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.821;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=75;PP=1954;ReadPosRankSum=-1.189;SC=AAGACCTTTTATGACTGCACA;SOR=0.761;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=309;TCF=151;TCR=158;TR=147;WE=57840555;WS=57840537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,163:0.48:339
chr19	57865082	rs862703	T	C	1819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=37;PP=1162;ReadPosRankSum=-0.534;SC=CAGCTGTACTTATCATGGCAG;SOR=0.668;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=214;TCF=125;TCR=89;TR=85;WE=57865090;WS=57865072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,94:0.38:246
chr19	57868336	rs862709	A	G	4794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=75;SC=TAAGTGCAACAAATGTGGGAA;SOR=0.812;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=152;TCF=77;TCR=75;TR=152;WE=57868344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr19	57890000	rs2361119	C	T	1902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.181;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=40;PP=1008;ReadPosRankSum=0.075;SC=GCCAAAATGACGAACAACACC;SOR=0.806;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=152;TCF=79;TCR=73;TR=80;WE=57890008;WS=57889990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,90:0.52:173
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chr19	57922664	rs4801480	T	C	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=226;ReadPosRankSum=2.819;SC=TGAGGCTCGGTTGAATCGGTT;SOR=0.941;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=14;WE=57922672;WS=57922654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
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chr19	57967133	rs28649880	G	A	3158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.407;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=64;PP=2081;ReadPosRankSum=0.918;SC=GAAGACCATGGAGCCACTGGC;SOR=0.600;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=270;TCF=146;TCR=124;TR=139;WE=57967141;WS=57967123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,145:0.51:287
chr19	57983457	rs10153521	A	G	928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=15;PP=598;ReadPosRankSum=-1.761;SC=ACAGGTATGGAAATATTTCTG;SOR=0.694;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=100;TCF=67;TCR=33;TR=44;WE=57983465;WS=57983447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,47:0.42:113
chr19	57984918	rs2074058	A	G	986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.702;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=19;PP=592;ReadPosRankSum=1.178;SC=CAGTATGAACACTCCAATGTT;SOR=0.605;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=105;TCF=60;TCR=45;TR=46;WE=57984926;WS=57984908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,49:0.43:114
chr19	57985460	rs2074059	T	A	2029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.035;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=37;PP=1273;ReadPosRankSum=0.738;SC=GACATCTCCATTGATTGCACA;SOR=0.925;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=196;TCF=110;TCR=86;TR=90;WE=57985468;WS=57985450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,99:0.45:220
chr19	57985566	rs2074060	G	C	1690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=39;PP=1241;ReadPosRankSum=0.332;SC=TTGCACTGAAGCAGAACTGTT;SOR=0.712;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=152;TCF=74;TCR=78;TR=73;WE=57985574;WS=57985556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,77:0.46:168
chr19	57985949	rs35044633	GT	G	3234.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.815;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.930;NF=24;NR=40;PP=2296;ReadPosRankSum=1.233;SC=CTATACGGTAGTTGGCATCTA;SOR=0.558;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=118;TCF=46;TCR=72;TR=64;WE=57985957;WS=57985939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,103:0.54:190
chr19	57986184	rs2285607	G	A	2727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.201;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=55;PP=1504;ReadPosRankSum=0.511;SC=GAAACACTAAGTACAGGCCAA;SOR=0.557;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=211;TCF=102;TCR=109;TR=111;WE=57986192;WS=57986174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,127:0.54:236
chr19	57987905	rs2067055	G	A	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.139;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=8;PP=307;ReadPosRankSum=-0.518;SC=CCAAGAGATCGGAGAGTAGCA;SOR=0.504;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=48;TCF=34;TCR=14;TR=24;WE=57987913;WS=57987895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,24:0.46:52
chr19	57988666	rs34678661	A	AGCC	2683.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.710;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.705;NF=8;NR=33;PP=1751;ReadPosRankSum=-2.519;SC=CCATCGGCTCAGCCGCCGCCA;SOR=0.503;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=125;TCF=16;TCR=109;TR=41;WE=57988675;WS=57988656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,74:0.41:180
chr19	57999182	rs8113039	A	G	2506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-4.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.630;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=42;PP=1581;ReadPosRankSum=1.177;SC=TGAGGCGACCAGCGCCGGAAG;SOR=0.245;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=177;TCF=120;TCR=57;TR=113;WE=57999190;WS=57999172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,118:0.63:187
chr19	58001512	rs11672136	T	A	716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.721;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=12;PP=404;ReadPosRankSum=-0.822;SC=TGATTTTCCATAGGTTCCTGT;SOR=1.040;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=82;TCF=48;TCR=34;TR=31;WE=58001520;WS=58001502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,38:0.39:98
chr19	58002819	rs6510085	T	A	1714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.444;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.173;NF=48;NR=37;PP=1081;ReadPosRankSum=2.604;SC=AGATAAACTCTACTCTGTCCA;SOR=0.402;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=168;TCF=101;TCR=67;TR=85;WE=58002827;WS=58002809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,86:0.49:176
chr19	58003141	rs71333245	A	G	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=40.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.41;MQRankSum=-6.995;QD=2.39;ReadPosRankSum=0.711;SOR=5.642;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,18:0.16:112
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chr19	58003580	rs2074071	A	G	3070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.433;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-6.623;NF=74;NR=68;PP=1934;ReadPosRankSum=1.017;SC=ATACCGAGAGATAGTTGGTGG;SOR=0.755;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=287;TCF=148;TCR=139;TR=142;WE=58003588;WS=58003570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,151:0.49:308
chr19	58003613	rs2074072	C	T	2313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.450;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=56;PP=1508;ReadPosRankSum=0.257;SC=GAGGTGTGAACTCAGGGATGG;SOR=0.754;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=248;TCF=121;TCR=127;TR=106;WE=58003621;WS=58003603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,117:0.44:266
chr19	58003728	rs2074073	G	A	2177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=39;PP=1059;ReadPosRankSum=0.654;SC=CTATTCTGATGTTTGACCTAG;SOR=0.692;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=190;TCF=106;TCR=84;TR=89;WE=58003736;WS=58003718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,108:0.50:214
chr19	58003873	rs2074074	C	T	922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.832;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=27;PP=549;ReadPosRankSum=-1.155;SC=TATTTGGTTGCAGTTGGTTTT;SOR=0.532;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=89;TCF=29;TCR=60;TR=41;WE=58003881;WS=58003863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,45:0.47:96
chr19	58004158	rs2074075	C	T	1499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.444;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=26;PP=880;ReadPosRankSum=2.146;SC=TTAGACACATCTGTGAGAGTG;SOR=0.570;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=110;TCF=66;TCR=44;TR=62;WE=58004166;WS=58004148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,68:0.56:122
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chr19	58004931	rs2074077	A	G	1114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.658;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.660;NF=41;NR=28;PP=1008;ReadPosRankSum=-1.240;SC=ACATCAGAGAATTCACACTGG;SOR=1.417;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=195;TCF=110;TCR=85;TR=69;WE=58004939;WS=58004921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,60:0.30:199
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chr19	58015981	rs2074061	C	T	1013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.322;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.811;NF=30;NR=13;PP=592;ReadPosRankSum=2.430;SC=GCCTAAATTCCCCAGTAAGGA;SOR=1.010;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=119;TCF=75;TCR=44;TR=43;WE=58015989;WS=58015971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,50:0.39:129
chr19	58016289	rs2074062	G	T	757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.63;BaseQRankSum=1.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=34.991;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-6.254;NF=11;NR=25;PP=571;ReadPosRankSum=-3.692;SC=AGTAGCTATTGTAATAGGCCT;SOR=1.989;SbPval=0.06;Source=Platypus;TC=107;TCF=54;TCR=53;TR=36;WE=58016297;WS=58016279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,38:0.33:116
chr19	58016329	rs142797348	T	C	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=39.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.67;MQRankSum=-7.209;QD=0.49;ReadPosRankSum=-3.031;SOR=4.038;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,15:0.13:119
chr19	58016474	rs150811873	T	C	1608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=6.148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.35;MQRankSum=-4.453;QD=10.80;ReadPosRankSum=-0.673;SOR=1.205;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,63:0.42:149
chr19	58016479	rs148826783	T	A	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.75;MQRankSum=-2.529;QD=0.33;ReadPosRankSum=0.835;SOR=0.747;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:140,22:0.14:162
chr19	58017603	rs2012431	C	T	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.541;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.40;ReadPosRankSum=-0.332;SOR=0.020;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr19	58017603	.	CTA	TTG	154	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=1;NR=3;PP=154;QD=51.8669687156;SC=CCACCAAGCGCTAGCCCCCTC;SbPval=0.09;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=4;WE=58017613;WS=58017601;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr19	58017605	rs2012426	A	G	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=12.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=16.80;ReadPosRankSum=-0.275;SOR=0.587;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr19	58017635	rs756980	G	A	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.512;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=3;PP=62;ReadPosRankSum=-0.901;SC=AGTCCCACACGCTAATTACCA;SOR=0.056;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=7;WE=58017643;WS=58017625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr19	58017659	rs57412218	C	CAT	569.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.581;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.525;NF=6;NR=3;PP=344;ReadPosRankSum=-0.198;SC=GTGTCAGACACGTGTGAGAGT;SOR=0.250;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=9;WE=58017667;WS=58017649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr19	58017753	rs61731281	CA	AG	1207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQRankSum=1.632;QD=8.45;ReadPosRankSum=1.070;SOR=0.664;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,62:0.43:143
chr19	58017758	rs55823456	G	C	2394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQRankSum=1.604;QD=16.29;ReadPosRankSum=0.823;SOR=0.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:82,65:0.44:147
chr19	58018618	rs2074064	A	G	4237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=362;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.379;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.81;MQRankSum=-2.501;NF=85;NR=84;ReadPosRankSum=2.213;SC=CTGGAGAAAAACCTTTTAAGT;SOR=0.671;SbPval=0.53;Source=Platypus;TCF=160;TR=169;WE=58018626;WS=58018608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,192:0.53:361
chr19	58018848	rs2066936	A	G	960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.047;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=28;PP=640;ReadPosRankSum=0.362;SC=GAAAGTTCACAGTGTAAAAAA;SOR=0.169;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=69;TCF=17;TCR=52;TR=41;WE=58018856;WS=58018838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,42:0.60:70
chr19	58019762	rs66526919	C	T	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.253;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=281;ReadPosRankSum=-0.965;SC=GGAGTGGTCTCGATTCAGATG;SOR=1.524;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=42;TCF=34;TCR=8;TR=19;WE=58019770;WS=58019752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,20:0.44:45
chr19	58019786	rs67448172	C	G	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.939;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=9;PP=543;ReadPosRankSum=-0.733;SC=CTCACTTTTGCTGTTCTTATG;SOR=0.914;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=71;TCF=50;TCR=21;TR=34;WE=58019794;WS=58019776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,35:0.45:77
chr19	58019892	rs67054060	G	A	1467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.411;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=36;PP=858;ReadPosRankSum=0.550;SC=CACCAGTTTGGCTGCGTAACA;SOR=0.572;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=114;TCF=51;TCR=63;TR=68;WE=58019900;WS=58019882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,71:0.55:128
chr19	58024252	rs7254394	T	C	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.221;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=133;ReadPosRankSum=1.102;SC=CGTCTTCCTCTCTGTGGATTC;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=7;WE=58024260;WS=58024242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr19	58024328	rs7254526	T	C	955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=19;PP=438;ReadPosRankSum=-0.022;SC=AGGAGCCCTCTGACCCCTTCT;SOR=0.654;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=79;TCF=46;TCR=33;TR=44;WE=58024336;WS=58024318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,48:0.56:86
chr19	58024442	rs7253945	G	A	954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=21;PP=482;ReadPosRankSum=-2.958;SC=AGTGAAGAAGGTCTGCTGGAG;SOR=0.663;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=44;TCR=44;TR=42;WE=58024450;WS=58024432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,49:0.49:101
chr19	58038964	rs12461014	T	A	3121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=63;NR=48;PP=1734;SC=GCGCTAGTGATTACGCCGCAG;SOR=0.761;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=63;TCR=48;TR=111;WE=58038972;WS=58038954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr19	58058536	rs1548476	A	G	3698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=66;PP=2129;SC=CTGGTGCTGTATGAGTTCTGA;SOR=1.043;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=56;TCR=66;TR=122;WE=58058544;WS=58058526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr19	58058739	rs10410631	T	C	2109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=44;PP=1382;ReadPosRankSum=-1.995;SC=CCTTTCGACATTGACTACACT;SOR=0.708;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=166;TCF=88;TCR=78;TR=91;WE=58058747;WS=58058729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,97:0.53:183
chr19	58116929	rs9676996	A	C	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5010;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=76;ReadPosRankSum=0.820;SC=GCTTTTTTCCACAAATTTCCA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=6;WE=58116937;WS=58116919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr19	58117083	rs9677004	A	G	1173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.467;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=20;PP=624;ReadPosRankSum=-0.800;SC=AGATGAGGGGACGCCTTCTGC;SOR=0.488;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=91;TCF=55;TCR=36;TR=47;WE=58117091;WS=58117073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,57:0.53:108
chr19	58117223	rs2360543	T	A	1809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.475;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=37;PP=1057;ReadPosRankSum=0.602;SC=TTGAGCTCCATGCCTCACCCT;SOR=0.574;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=152;TCF=84;TCR=68;TR=75;WE=58117231;WS=58117213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,85:0.50:169
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chr19	58132106	rs34034473	A	C	989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.270;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=21;PP=631;ReadPosRankSum=0.241;SC=TTATGAGTGCAGCGAATGTGG;SOR=0.779;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=119;TCF=62;TCR=57;TR=48;WE=58132114;WS=58132096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,51:0.38:134
chr19	58144715	rs9749449	A	G	1260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.018;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=16;PP=699;ReadPosRankSum=-1.888;SC=GGGGATAGCGATGCTCGGGTT;SOR=0.961;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=128;TCF=81;TCR=47;TR=49;WE=58144733;WS=58144705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,61:0.41:149
chr19	58151286	rs4801508	T	C	1892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.53;ReadPosRankSum=1.277;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,51:0.47:108
chr19	58151294	rs4801509	T	A	1859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=0.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.61;ReadPosRankSum=2.038;SOR=0.568;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,50:0.45:112
chr19	58152020	rs3746221	T	C	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=697;ReadPosRankSum=1.748;SC=AATTGCATTGTCTCCTCCTAA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=11;WE=58152041;WS=58152010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr19	58152033	rs3746220	A	G	450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=697;ReadPosRankSum=0.129;SC=CCTCCTAATAAAGGTAACATG;SOR=1.101;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=16;WE=58152041;WS=58152010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr19	58152361	rs3746219	T	A	2649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.157;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=58;PP=1656;ReadPosRankSum=-0.854;SC=ATGTGGACACTGCCTCGTTTA;SOR=0.562;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=230;TCF=110;TCR=120;TR=116;WE=58152369;WS=58152351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,126:0.52:244
chr19	58152795	rs11879465	C	T	2719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=31;PP=896;ReadPosRankSum=0.180;SC=AGGCCTTATGCGTGCCCTGAA;SOR=0.665;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=132;TCF=72;TCR=60;TR=67;WE=58152803;WS=58152785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,74:0.50:147
chr19	58152817	rs11880050	G	C	2866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.139;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=33;PP=1007;ReadPosRankSum=2.158;SC=GTGGGAAATCGTTTAGTCAGA;SOR=0.787;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=163;TCF=91;TCR=72;TR=75;WE=58152825;WS=58152807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,84:0.45:185
chr19	58153000	rs3746218	T	C	2768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FS=1.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.30;ReadPosRankSum=-0.393;SOR=0.812;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,87:0.48:181
chr19	58153009	rs3746217	C	T	3250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FS=0.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.48;ReadPosRankSum=-0.487;SOR=0.748;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,87:0.47:186
chr19	58153577	rs3746216	T	C	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=434;ReadPosRankSum=-2.620;SC=AATTTCCTTTTAGTGTAATTA;SOR=0.616;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=38;TCF=9;TCR=29;TR=23;WE=58153585;WS=58153567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,26:0.63:41
chr19	58153596	rs3746215	G	T	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.197;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=182;ReadPosRankSum=0.086;SC=TATACTGAAGGAGTACACCTG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=9;WE=58153604;WS=58153586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr19	58189287	rs9676604	C	T	2456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.913;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=42;PP=1235;ReadPosRankSum=-0.574;SC=TACAGGTCCACGTCCACATGC;SOR=0.778;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=262;TCF=155;TCR=107;TR=110;WE=58189295;WS=58189277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,125:0.44:287
chr19	58213969	rs11878316	T	G	2792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.141;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=60;PP=1806;ReadPosRankSum=1.973;SC=TTTTGCTATTTGATTGCTCCC;SOR=0.548;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=221;TCF=102;TCR=119;TR=114;WE=58213977;WS=58213959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,129:0.51:251
chr19	58231807	rs2239986	A	G	2161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FS=1.878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.88;ReadPosRankSum=0.214;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,108:0.59:182
chr19	58262454	rs11419013	C	CT	461.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-1.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.144;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=415;ReadPosRankSum=0.615;SC=ACTGCCCTCTCTCTCCTTGAG;SOR=0.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=11;WE=58262462;WS=58262444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr19	58281380	rs114411987	T	A	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=158;ReadPosRankSum=-1.057;SC=GCGGGTGGGATCCCTGTTTCC;SOR=0.829;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=12;WE=58281388;WS=58281370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr19	58288169	rs2285615	C	T	893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.425;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=26;PP=568;ReadPosRankSum=-0.483;SC=TGTTGTTGGTCGGACTGAGGT;SOR=0.176;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=81;TCF=21;TCR=60;TR=39;WE=58288177;WS=58288159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,43:0.47:91
chr19	58291228	rs2158013	A	G	2050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.968;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=52;PP=1227;ReadPosRankSum=1.061;SC=AGTTCACACCAGATCAAGGTG;SOR=0.292;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=146;TCF=49;TCR=97;TR=86;WE=58291236;WS=58291218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,96:0.59:163
chr19	58352522	rs12981244	G	A	4043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-1.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=429;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.755;NF=102;NR=87;PP=2380;ReadPosRankSum=1.634;SC=TTGTGAAGAGGTGTAAGTTGC;SOR=0.667;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=408;TCF=220;TCR=188;TR=189;WE=58352530;WS=58352512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:227,202:0.47:429
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chr19	58500271	rs11880378	T	G	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.260;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=29;ReadPosRankSum=-1.981;SC=CTCATATTTGTTATATACTCT;SOR=0.160;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=4;WE=58500279;WS=58500261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
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chr19	58549593	rs2241406	C	G	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.312;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=8;PP=348;ReadPosRankSum=-1.918;SC=CGCAGGCTTCCTGCCCCGGGC;SOR=1.495;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=84;TCF=54;TCR=30;TR=31;WE=58549601;WS=58549583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,34:0.37:92
chr19	58565431	rs8104122	C	T	628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=388;ReadPosRankSum=-0.704;SC=TGGCCAGCCTCGGGCCTCGGC;SOR=0.862;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=39;TCF=14;TCR=25;TR=22;WE=58565439;WS=58565421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,27:0.59:46
chr19	58572959	rs2288274	G	A	1012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.240;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=18;PP=539;ReadPosRankSum=0.685;SC=AGCAAGTGACGTTTGAGGACG;SOR=1.044;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=115;TCF=66;TCR=49;TR=47;WE=58572967;WS=58572949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,53:0.41:130
chr19	58572979	rs1469087	G	A	1246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.631;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=23;PP=640;ReadPosRankSum=-0.335;SC=GTGGTAGTGGGCTTCAGCCAG;SOR=0.801;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=120;TCF=66;TCR=54;TR=54;WE=58572987;WS=58572969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,63:0.45:139
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chr19	58597404	rs118084515	A	G	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=2;PP=514;ReadPosRankSum=-0.342;SC=CCTCACTCAGACACGGTGGTG;SOR=0.610;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=39;TCF=36;TCR=3;TR=23;WE=58597412;WS=58597394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,23:0.59:39
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chr19	58629878	rs8109275	G	T	176.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=172;SC=GGCCGCAGCTGCCTGGCAGCC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=58629886;WS=58629868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	58718269	rs7256349	G	A	1904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.053;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.063;NF=41;NR=38;PP=1043;ReadPosRankSum=0.965;SC=CAGTGAGCAGGTCCAACAGCA;SOR=0.434;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=172;TCF=79;TCR=93;TR=79;WE=58718277;WS=58718259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,92:0.47:194
chr19	58718360	rs59557917	A	AG	3144.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=13;NR=32;PP=2083;SC=GGTCCCCGGGAGCCCTGGACC;SOR=1.039;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=47;TCF=14;TCR=33;TR=45;WE=58718368;WS=58718350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr19	58757870	rs12972443	G	C	1758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.902;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=40;PP=1129;ReadPosRankSum=0.066;SC=GGTGTTCTGGGATGTGCTGGA;SOR=0.558;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=149;TCF=71;TCR=78;TR=78;WE=58757878;WS=58757860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,85:0.51:168
chr19	58774071	rs260462	A	G	1306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=22;PP=641;ReadPosRankSum=-2.618;SC=TTCCGGCAGCAATCTCAACTT;SOR=0.705;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=131;TCF=72;TCR=59;TR=52;WE=58774079;WS=58774061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,64:0.44:144
chr19	58790359	rs11666156	C	A	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.258;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=0;PP=460;ReadPosRankSum=0.815;SC=CATTGTCCGGCGTTCGGCGAG;SOR=3.312;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=21;WE=58790367;WS=58790349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,23:0.61:38
chr19	58790675	rs437229	T	C	1737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.252;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=52;PP=918;ReadPosRankSum=-0.115;SC=CCGTCCTGGCTGGTCAGAGAG;SOR=0.572;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=167;TCF=54;TCR=113;TR=79;WE=58790683;WS=58790665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,88:0.49:181
chr19	58790713	rs374431	G	C	836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.043;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=26;PP=536;ReadPosRankSum=0.764;SC=CAGGCGCCTGGCCCCCGAATG;SOR=0.492;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=74;TCF=16;TCR=58;TR=35;WE=58790721;WS=58790703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,39:0.48:81
chr19	58791213	rs260500	C	A	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=0.000;QD=6.08;ReadPosRankSum=-0.085;SOR=0.735;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,16:0.34:47
chr19	58791254	rs77570482	A	T	342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.37;QD=24.48;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	58797344	rs400733	A	C	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.463;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=306;ReadPosRankSum=-0.150;SC=GCCCTTTTCCATCACCATGCA;SOR=0.078;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=16;WE=58797352;WS=58797334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr19	58797583	rs59553565	C	CT	2413.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.936;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.325;NF=9;NR=20;PP=1136;ReadPosRankSum=-1.417;SC=TGAGAACCCACTATGTGGGAG;SOR=0.914;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=66;TCF=14;TCR=52;TR=29;WE=58797591;WS=58797573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,78:0.54:145
chr19	58858231	rs3214663	GC	G	2520.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=24;PP=1855;SC=TTTAAACAGAGCCTCTCTTCA;SOR=1.131;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=50;TCF=25;TCR=25;TR=45;WE=58858239;WS=58858221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr19	58858614	rs11345647	AG	A	3196.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=29;PP=2116;SC=AGCGCTAACCAGGGGTGCCCA;SOR=1.313;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=59;TCF=29;TCR=30;TR=56;WE=58858622;WS=58858604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr19	58858676	rs1265957	A	G	4926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.17;QD=25.53;SOR=0.958;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr19	58859055	rs144085420	C	CCCCAGGCCGCG	66.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.232;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.26;MQRankSum=-0.000;QD=6.67;ReadPosRankSum=1.440;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr19	58859066	rs1265959	A	G	241.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.13;QD=40.31;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	58864479	rs893184	T	C	6286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=116;NR=100;PP=2965;SC=AGTCTCCAGGTGGGCCTGGCA;SOR=0.736;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=216;TCF=116;TCR=100;TR=216;WE=58864487;WS=58864469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr19	58864867	rs2375470	A	G	3060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=52;PP=1741;SC=ATGAGGCCCCAAGGGAGGGCG;SOR=0.918;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=46;TCR=52;TR=98;WE=58864887;WS=58864857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr19	58864879	rs3833872	T	TG	2858.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=46;PP=1970;SC=GGGAGGGCGGTGGGGTGGCTC;SOR=1.338;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=56;TCF=3;TCR=53;TR=49;WE=58864887;WS=58864857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr19	58868480	rs12609654	G	T	1615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=28;PP=960;ReadPosRankSum=-1.381;SC=TGAGCTGCGAGTGCGCGCGGA;SOR=0.725;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=135;TCF=75;TCR=60;TR=64;WE=58868488;WS=58868470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,73:0.49:149
chr19	58869515	rs6146577	GTCCCC	G	1896.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.765;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.37;MQRankSum=3.536;NF=3;NR=24;PP=1034;ReadPosRankSum=-0.248;SC=TCCCTGGGTAGTCCCCTCCAC;SOR=0.761;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=90;TCF=21;TCR=69;TR=27;WE=58869527;WS=58869505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,57:0.33:172
chr19	58870003	rs10692126	T	TGAG	958.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=849;ReadPosRankSum=1.264;SC=CTAGCAGATCTGAGAAAACAA;SOR=0.656;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=53;TCF=45;TCR=8;TR=21;WE=58870011;WS=58869993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,25:0.40:62
chr19	58870087	rs11332731	TG	T	3213.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.888;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=34;PP=2136;ReadPosRankSum=-1.102;SC=CACACAGGTGTGGACTGGAGA;SOR=0.912;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=146;TCF=53;TCR=93;TR=61;WE=58870095;WS=58870077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,107:0.44:245
chr19	58871130	rs6510138	C	G	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.899;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=77;ReadPosRankSum=0.191;SC=ACGAGGTCAGCAATTCCAAGA;SOR=0.148;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=7;WE=58871138;WS=58871120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
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chr19	58920104	rs145105239	ACGGGAGTTC	A	797.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=2979;ReadPosRankSum=1.134;SC=GGCGCGGGCCACGGGAGTTCC;SOR=0.904;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=9;WE=58920120;WS=58920094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,21:0.66:32
chr19	58928302	rs10423138	T	C	1571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.862;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=32;PP=879;ReadPosRankSum=-0.734;SC=ATGGGGCAGCTTTCCCACCTG;SOR=0.703;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=122;TCF=66;TCR=56;TR=62;WE=58928310;WS=58928292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,75:0.51:147
chr19	58928786	rs7257872	A	G	1351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.867;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=29;PP=950;ReadPosRankSum=0.585;SC=CTATGAGTGTACAGAATGTGG;SOR=0.450;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=138;TCF=65;TCR=73;TR=60;WE=58928794;WS=58928776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,63:0.42:151
chr19	58929052	rs3764535	G	A	2272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.513;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=52;PP=1552;ReadPosRankSum=-1.288;SC=AGTGTGGGAAGGCCTTCAAAC;SOR=0.646;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=181;TCF=89;TCR=92;TR=100;WE=58929060;WS=58929042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,105:0.52:202
chr19	58929136	rs3764534	G	A	1430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=39;PP=966;ReadPosRankSum=-1.060;SC=CACATGGGAAGGTCGTTAGCT;SOR=0.727;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=100;TCF=39;TCR=61;TR=63;WE=58929144;WS=58929126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,65:0.62:105
chr19	58929194	rs3764533	A	G	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.826;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=279;ReadPosRankSum=1.301;SC=AAAGGAGGTTAAGGAGAGTGG;SOR=0.307;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=16;WE=58929202;WS=58929184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr19	58945962	rs9941466	C	T	5374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=84;PP=2965;SC=CAGTGTGAAACTTTTTATTAC;SOR=0.725;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=180;TCF=96;TCR=84;TR=180;WE=58945970;WS=58945952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr19	58946056	rs1465789	G	A	2703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.976;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=57;PP=1627;ReadPosRankSum=1.257;SC=CAGATGGTTGGGGAGAGTGGA;SOR=0.759;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=219;TCF=111;TCR=108;TR=113;WE=58946064;WS=58946046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,127:0.52:246
chr19	58951123	rs7259841	T	C	1634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.952;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=42;PP=1068;ReadPosRankSum=0.558;SC=ACACTCCACTTACCTGCGCCG;SOR=0.880;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=152;TCF=66;TCR=86;TR=71;WE=58951131;WS=58951113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,77:0.45:170
chr19	58962958	rs893188	C	T	2211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.891;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=53;PP=1323;ReadPosRankSum=-0.980;SC=GCAATGTGAGCTCTGGGGGCT;SOR=0.971;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=192;TCF=94;TCR=98;TR=98;WE=58962966;WS=58962948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,104:0.49:211
chr19	58963018	rs893187	C	G	898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=24;PP=552;ReadPosRankSum=-0.756;SC=CAGGCCACACCGGTGGTCTGG;SOR=0.631;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=90;TCF=37;TCR=53;TR=42;WE=58963026;WS=58963008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,45:0.46:97
chr19	58963047	rs116959667	G	T	535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.990;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=17;PP=320;ReadPosRankSum=0.685;SC=GCGCGGGTCGGGGCCCGAGGC;SOR=0.892;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=60;TCF=23;TCR=37;TR=26;WE=58963055;WS=58963037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,28:0.42:66
chr19	58966644	rs60037165	A	T	1386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.709;NF=36;NR=25;PP=835;ReadPosRankSum=-0.578;SC=GCGTCTTCCCAGTTGCCGATG;SOR=0.667;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=140;TCF=85;TCR=55;TR=61;WE=58966652;WS=58966634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,66:0.44:151
chr19	58982384	rs10418774	A	G	8041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=131;NR=124;PP=2965;SC=TCCGGCTTAGAGAAAAGACAC;SOR=0.742;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=256;TCF=131;TCR=125;TR=255;WE=58982392;WS=58982374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,289:1.00:289
chr19	58989495	rs893185	A	C	1205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.165;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=25;PP=735;ReadPosRankSum=1.338;SC=CCCTGAGGGGAACCATGGACA;SOR=0.690;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=115;TCF=60;TCR=55;TR=56;WE=58989503;WS=58989485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,62:0.48:130
chr19	58991900	rs882610	G	A	2127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.463;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=55;PP=1298;ReadPosRankSum=0.625;SC=CACCCCCGACGCTCACTCACA;SOR=0.979;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=169;TCF=74;TCR=95;TR=91;WE=58991908;WS=58991890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,96:0.54:179
chr19	59010593	rs4801274	A	G	6021.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=123;PP=2965;SC=TCCATCTGCAAGGAGGGAGCC;SOR=1.471;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=198;TCF=75;TCR=123;TR=198;WE=59010601;WS=59010583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr19	59010819	rs2278497	G	T	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.588;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=291;ReadPosRankSum=0.573;SC=AGCGTCCGTGGCCCCGCGCCA;SOR=1.134;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=54;TCF=39;TCR=15;TR=22;WE=59010827;WS=59010809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,23:0.41:56
chr19	59025685	rs4801602	A	C	1738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=47;PP=1168;SC=CCCCTGCGGAAGACAGGGCGG;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=16;TCR=47;TR=63;WE=59025693;WS=59025675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr19	59082605	rs3752109	C	T	2452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.421;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=51;PP=1342;ReadPosRankSum=-2.469;SC=CTCCTCATAGCGGAAGCACCG;SOR=0.511;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=228;TCF=130;TCR=98;TR=112;WE=59082613;WS=59082595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,126:0.48:260
chr20	76962	rs6111385	T	C	13064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=500;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=230;NR=227;PP=2965;SC=TGCCACCATCTGAGGCCACTA;SOR=0.709;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=458;TCF=230;TCR=228;TR=457;WE=76970;WS=76952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,500:1.00:500
chr20	126310	rs11467417	ACC	A	15409.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=378;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=18;NR=178;PP=2969;SC=GATGGCTCCTACCCCCGTTTC;SOR=1.127;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=204;TCF=18;TCR=186;TR=196;WE=126319;WS=126300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,350:1.00:350
chr20	138004	rs6055356	G	C	184.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=118;SC=TGGGTGGCCTGAAATTTCCTG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=138012;WS=137995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr20	138125	rs2298108	G	T	1334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=16;PP=741;SC=GAGGAAGGTAGCATAGTGTGC;SOR=1.112;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=27;TCR=16;TR=43;WE=138133;WS=138115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr20	138148	rs2298109	C	T	1830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=22;PP=1066;SC=TTCACTGGACCAAAAGCTTTG;SOR=1.249;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=35;TCR=22;TR=57;WE=138156;WS=138138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr20	139409	rs12624951	G	A	2100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=14;PP=1345;SC=TCCTTTCTGTGTATAGTAACC;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=52;TCR=14;TR=66;WE=139417;WS=139399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr20	139456	rs12624954	G	A	4608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=47;PP=2663;SC=CTATGTACAAGGACATTGCAG;SOR=1.278;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=137;TCF=90;TCR=47;TR=137;WE=139464;WS=139446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr20	139576	rs16995685	C	A	8259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=132;NR=147;PP=2965;SC=AAAGCCACCTCGTCCAAAGCC;SOR=0.838;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=279;TCF=132;TCR=147;TR=279;WE=139584;WS=139566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,309:1.00:309
chr20	139745	rs4142304	T	C	670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=18;PP=515;SC=CTTCTTCCTTTTGGTTTCTTG;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=139753;WS=139735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr20	207889	rs2298149	G	A	2010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=22;PP=1248;SC=GAGCTCAGGAGCATCAACCCA;SOR=1.577;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=42;TCR=22;TR=64;WE=207897;WS=207879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr20	208168	rs6110460	T	C	862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=20;PP=557;SC=AACTGCCAGATTGTGTCCAGT;SOR=4.332;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=208176;WS=208158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr20	210061	rs13045643	G	A	5300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=88;PP=2965;SC=AAAACTACCTGCAATATGGAA;SOR=0.823;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=176;TCF=88;TCR=88;TR=176;WE=210069;WS=210051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr20	238435	rs66489228	CTGGTCT	C	3270.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.543;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=2.985;NF=8;NR=34;PP=2018;ReadPosRankSum=-0.315;SC=GTTCCTGCTCCTGGTCTTGGC;SOR=0.800;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=101;TCF=21;TCR=80;TR=42;WE=238448;WS=238425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,88:0.48:182
chr20	238507	rs373225	A	C	1303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.454;NF=20;NR=26;PP=769;ReadPosRankSum=-0.416;SC=GGAAAGGAAAACTGGGAACGA;SOR=0.734;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=107;TCF=45;TCR=62;TR=46;WE=238515;WS=238497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,57:0.46:123
chr20	238530	rs412143	T	G	1398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.37;MQRankSum=1.933;QD=15.90;ReadPosRankSum=0.495;SOR=0.689;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,40:0.45:88
chr20	238540	rs416360	C	T	1341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.43;MQRankSum=1.866;QD=17.65;ReadPosRankSum=0.437;SOR=0.761;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,36:0.47:76
chr20	239664	rs420525	T	C	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.569;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=204;ReadPosRankSum=1.185;SC=GACGCTTTAGTAGCCCTGTGC;SOR=1.061;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=11;WE=239672;WS=239654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr20	239688	rs399083	G	A	1002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=2.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.06;ReadPosRankSum=-1.457;SOR=1.236;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,26:0.52:50
chr20	239697	rs399094	G	C	1161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=2.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.36;ReadPosRankSum=-1.806;SOR=1.204;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,33:0.55:60
chr20	252081	.	GCATACACACACA	G	1686	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=9;MMLQ=20;MQ=60.0;NF=0;NR=5;PP=1686;QD=341.4;SC=GCATACACAAGCATACACACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=5;WE=252104;WS=252071;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:19,5:0.21:24
chr20	252083	.	AT	A	469.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.248;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=2.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.42;ReadPosRankSum=0.517;SOR=0.123;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr20	252085	.	ACACACACACAC	A	466.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.776;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.45;ReadPosRankSum=0.647;SOR=0.420;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr20	256573	rs6075567	A	G	3375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=35;PP=2059;SC=TCAGAGTGTGACTGGTTTAAG;SOR=1.217;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=70;TCR=35;TR=105;WE=256581;WS=256563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr20	256727	rs3827147	T	A	2554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=51;PP=1460;SC=TGGTCAATAATCTGAGAGGAA;SOR=1.536;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=29;TCR=51;TR=80;WE=256735;WS=256717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr20	256760	rs56774790	G	GA	665.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.122;HP=2;HapScore=3;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=639;ReadPosRankSum=0.137;SC=GGAGAAGGGAGAGGCAAATGG;SOR=0.307;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=10;WE=256771;WS=256750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,19:0.40:48
chr20	256763	rs61354763	G	C	674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.122;HP=1;HapScore=3;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=630;ReadPosRankSum=0.053;SC=GAAGGGAGAGGCAAATGGCCC;SOR=0.307;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=40;TCF=8;TCR=32;TR=12;WE=256771;WS=256750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,19:0.40:48
chr20	257320	rs2277779	G	A	1081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=6;PP=739;SC=CAACACCAGAGTCAGAGACCT;SOR=2.774;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=34;WE=257328;WS=257310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr20	257733	rs2277781	A	G	8606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=157;NR=141;PP=2965;SC=GAATCTTGTCAGACAAGGATT;SOR=0.718;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=298;TCF=157;TCR=141;TR=298;WE=257741;WS=257723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,322:1.00:322
chr20	257803	rs6075583	G	C	2122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FS=1.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.30;ReadPosRankSum=-0.277;SOR=0.585;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,103:0.50:206
chr20	257812	rs6046375	T	C	7598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.51;SOR=0.853;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr20	258865	rs6046492	A	G	2722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=26;PP=1805;SC=GAAGAGAGCCAATGGGGCTGA;SOR=1.751;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=72;TCR=26;TR=98;WE=258873;WS=258855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr20	259156	rs6035505	G	A	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=203;ReadPosRankSum=-0.453;SC=GGAGTCCCCAGTCCCAACCTC;SOR=0.257;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=12;WE=259164;WS=259146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
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chr20	259969	rs7271033	G	C	5409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=120;PP=2965;SC=TCCTGAGCGAGGTCTGCGGGC;SOR=1.257;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=200;TCF=80;TCR=120;TR=200;WE=259977;WS=259959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr20	264498	rs6137055	A	C	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.222;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=171;ReadPosRankSum=0.925;SC=TGTGAGGAAGAAATGAGTCAA;SOR=0.160;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=10;WE=264506;WS=264488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr20	270414	rs11478105	TC	T	2503.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=40;PP=1720;SC=ACTTGACCTCTCCTGAGCCTC;SOR=1.863;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=2;TCR=41;TR=42;WE=270436;WS=270404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr20	270428	rs6035784	C	T	1384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=33;PP=978;SC=GAGCCTCAATCTTCTCATCTG;SOR=2.160;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=11;TCR=33;TR=44;WE=270436;WS=270404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr20	271225	rs111238388	T	A	793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=68.14;MQRankSum=2.486;QD=22.05;ReadPosRankSum=1.598;SOR=0.311;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,35:0.97:36
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chr20	278806	rs1057189	C	T	9047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.126;NF=175;NR=128;PP=2965;ReadPosRankSum=1.565;SC=TCCTGCGCTCCATCGGCATGG;SOR=0.325;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=304;TCF=176;TCR=128;TR=303;WE=278814;WS=278796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,336:1.00:337
chr20	279483	rs1046560	T	C	7391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=111;NR=141;PP=2965;SC=AGCCAGCTTATCCCTCTTAAG;SOR=1.082;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=253;TCF=111;TCR=142;TR=252;WE=279491;WS=279473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,276:1.00:276
chr20	333793	.	C	T	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.554;ClippingRankSum=-0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=148;ReadPosRankSum=-0.288;SC=CCAAGGTGATCCCTTGGCCAG;SOR=2.517;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=8;WE=333801;WS=333783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr20	334317	rs5839855	TC	T	4075.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=363;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.800;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.666;NF=14;NR=71;PP=2142;ReadPosRankSum=0.223;SC=CCTGGATCCTTCCCCCCTTCT;SOR=0.647;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=186;TCF=26;TCR=160;TR=85;WE=334325;WS=334307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:190,163:0.46:353
chr20	371958	rs138380491	G	A	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=9;PP=793;ReadPosRankSum=0.244;SC=AGCCCTGGCCGTGCTGGAGCC;SOR=0.693;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=85;TCF=58;TCR=27;TR=26;WE=371980;WS=371948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,31:0.33:95
chr20	371972	rs6051637	T	C	1824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.520;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=28;PP=2044;ReadPosRankSum=0.570;SC=TGGAGCCCTATGCGCGGCTGC;SOR=0.918;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=116;TCF=71;TCR=45;TR=77;WE=371980;WS=371948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,83:0.65:128
chr20	377226	rs6115830	C	T	1707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.064;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=38;PP=1089;ReadPosRankSum=-1.305;SC=TGCCCTTAGCCCCAACCCGAT;SOR=0.602;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=205;TCF=110;TCR=95;TR=80;WE=377234;WS=377216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,87:0.40:220
chr20	389456	rs3746792	C	T	1235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.250;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=37;PP=904;ReadPosRankSum=3.028;SC=TGGGGAACTTCCGGTGGGAAG;SOR=0.839;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=158;TCF=71;TCR=87;TR=65;WE=389464;WS=389446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,64:0.38:169
chr20	391170	rs7059	C	T	1702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.527;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=33;PP=797;ReadPosRankSum=1.141;SC=AAAAATTGTACACACTTCTTC;SOR=0.766;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=166;TCF=88;TCR=78;TR=71;WE=391178;WS=391160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,88:0.45:195
chr20	397928	rs6115906	C	T	3421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=53;NR=51;PP=1652;SC=TGGAGGCCCTCGTGTGCTGCC;SOR=0.824;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=105;TCF=53;TCR=52;TR=104;WE=397936;WS=397918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr20	398039	rs67707964	TTG	T,TTGTG	162.25	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.4998;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=44;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2,2;NR=6,6;PP=219,34;ReadPosRankSum=0.887;SC=AGACTGGGGTTTGTGTGTGTG;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=8,8;WE=398048;WS=398029;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.88:8
chr20	400504	rs67470622	AGTGACCCTGCACCTGGCT	A	328.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.691;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.319;NF=1;NR=1;PP=419;ReadPosRankSum=-0.080;SC=TGCTGCTGGCAGTGACCCTGC;SOR=2.303;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=2;WE=400529;WS=400494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr20	402710	rs2057251	A	G	952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.761;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=8;PP=664;ReadPosRankSum=1.903;SC=CATGTGAGGGATGGAGTCCCC;SOR=1.373;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=97;TCF=70;TCR=27;TR=41;WE=402718;WS=402700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,43:0.44:97
chr20	402921	rs6051905	C	G	1444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.275;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.873;NF=24;NR=40;PP=862;ReadPosRankSum=0.271;SC=CAAGTCCCAACTCCTAAGGAA;SOR=0.815;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=159;TCF=62;TCR=97;TR=64;WE=402929;WS=402911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,69:0.44:157
chr20	442937	rs708978	C	G	371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=6;PP=144;SC=CCCCCCGGGCCGCCCTCGCAG;SOR=1.112;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=6;TCR=6;TR=12;WE=442945;WS=442927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr20	467283	rs409994	G	C	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.915;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=87;ReadPosRankSum=-0.819;SC=GTAAAAAGCAGAAATAGCTTT;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=467291;WS=467273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr20	470606	rs34056933	T	TA	167.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=2.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.21;ReadPosRankSum=-0.251;SOR=1.659;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr20	476285	rs157816	C	T	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.537;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=312;ReadPosRankSum=0.949;SC=CCTGTGACAACACAAGGGATA;SOR=0.315;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=45;TCF=39;TCR=6;TR=21;WE=476293;WS=476275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,25:0.50:50
chr20	480620	.	A	T	178	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;FR=0.5000;HP=17;HapScore=2;MGOF=47;MMLQ=27;MQ=56.36;NF=2;NR=9;PP=178;QD=19.3428375043;SC=AAAAAAAAAAATTTTTTCAGA;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=11;WE=480628;WS=480610;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr20	488930	rs74119	C	T	2765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=20;PP=1900;SC=ACTCTGCTTCCTCACTGCAAA;SOR=2.687;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=66;TCR=20;TR=86;WE=488938;WS=488920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr20	590456	rs282164	A	G	2921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=66;NR=40;PP=1695;SC=TGCCCGCGGCACGGAAGCACG;SOR=1.015;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=106;TCF=66;TCR=40;TR=106;WE=590464;WS=590446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr20	590542	rs2754502	CG	GC	8047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.96;SOR=0.727;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
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chr20	656407	rs146589074	T	TGGC	309.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.021;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=114;ReadPosRankSum=1.317;SC=GGCTCGGGCTTGGCGGCGGCG;SOR=0.653;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=3;WE=656415;WS=656397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr20	741847	rs910857	A	G	2299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=48;PP=1564;SC=CCTTGACGTAACTGAGGCAGC;SOR=1.387;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=27;TCR=48;TR=75;WE=741855;WS=741837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr20	742237	rs3746801	G	A	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=3.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.21;ReadPosRankSum=-1.086;SOR=1.885;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr20	742237	.	GGT	AGC	569	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=2;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=12;NR=0;PP=569;QD=51.8723229052;SC=TTCCCGGGAGGGTCCCACAGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=12;WE=742247;WS=742235;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:12,12:0.50:24
chr20	742239	rs6054589	T	C	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=3.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.21;ReadPosRankSum=-1.086;SOR=1.885;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr20	744032	rs8122333	A	T	718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.295;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=364;ReadPosRankSum=-0.965;SC=GTGCTCCCCAAACATGTTCTT;SOR=1.061;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=51;TCF=38;TCR=13;TR=27;WE=744040;WS=744022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,33:0.53:62
chr20	744308	rs3746802	T	C	1675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.547;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=37;PP=853;ReadPosRankSum=2.014;SC=AGGGTATAGATGAAGGCCAGG;SOR=0.643;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=159;TCF=78;TCR=81;TR=73;WE=744316;WS=744298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,85:0.47:179
chr20	744382	rs3746803	G	A	1238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.594;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=27;PP=781;ReadPosRankSum=0.208;SC=GCTGTCCACCGTGCCTGCAGG;SOR=0.758;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=150;TCF=77;TCR=73;TR=56;WE=744398;WS=744372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,62:0.39:160
chr20	744415	rs3746804	G	A	1502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.920;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=30;PP=898;ReadPosRankSum=-1.167;SC=CTCTTCCCGCGGCCGGATGGA;SOR=0.577;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=157;TCF=85;TCR=72;TR=65;WE=744423;WS=744405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,73:0.43:171
chr20	744662	rs3833341	A	ACAGGTCAAT	1090.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=2957;SC=AAAGGACAAGACAGATCCCTG;SOR=3.098;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=14;WE=744670;WS=744652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr20	746098	rs3746808	G	A	2426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=51;PP=1326;ReadPosRankSum=0.409;SC=GGACCAAGAAGGCGATGCTGT;SOR=0.664;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=198;TCF=98;TCR=100;TR=103;WE=746106;WS=746088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,116:0.52:221
chr20	746423	rs11467076	GTATCTGCCC	G	2465.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.697;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.944;NF=1;NR=28;PP=2938;ReadPosRankSum=2.110;SC=GGCCATGGCGGTATCTGCCCT;SOR=0.812;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=56;TCF=3;TCR=53;TR=29;WE=746439;WS=746413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,64:0.54:119
chr20	825678	rs538094	T	C	7357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=139;NR=114;PP=2965;SC=AGCCGCTCTTTAGCCCTGAGA;SOR=0.856;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=253;TCF=139;TCR=114;TR=253;WE=825686;WS=825668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,262:1.00:262
chr20	826492	rs2282050	G	C	828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=22;PP=591;SC=GACCAGCATTGTTGGGCAAGG;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=826500;WS=826482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr20	1099329	rs2072962	A	G	544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=0;PP=378;SC=AGAGGGAAGCAGAGTTATAGC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=1099337;WS=1099328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr20	1099523	rs1803415	T	G	11071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=420;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=195;NR=195;PP=2965;SC=CACGGTTACTTCGGCTTGGGT;SOR=0.732;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=390;TCF=195;TCR=195;TR=390;WE=1099531;WS=1099513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,420:1.00:420
chr20	1099666	rs2072961	G	C	1479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=31;PP=986;SC=GTCTGGGGCAGATGGCAGCGT;SOR=2.078;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=12;TCR=31;TR=43;WE=1099674;WS=1099656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr20	1108262	rs6040024	C	G	986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=27;PP=765;SC=ATGGAAGAACCTTTTATTTCT;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=28;WE=1108270;WS=1108252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr20	1115529	rs4813939	A	G	5158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=104;NR=71;PP=2965;SC=GGTGGTAAACAAGGAGGGGCA;SOR=0.992;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=175;TCF=104;TCR=71;TR=175;WE=1115537;WS=1115519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr20	1277157	rs6109320	G	C	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=249;ReadPosRankSum=-0.380;SC=TGCAGTATGTGTTTGAGCAAA;SOR=0.936;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=14;WE=1277165;WS=1277147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr20	1286711	rs4813082	T	C	954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=26;PP=631;SC=GGGCCCATTCTGGCAGCGGCG;SOR=2.584;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=8;TCR=26;TR=34;WE=1286719;WS=1286701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr20	1291076	rs1048628	G	C	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.391;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=86;ReadPosRankSum=-0.037;SC=GCCCTGCCCTGCAGTGGCTTC;SOR=0.446;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=10;WE=1291084;WS=1291066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,13:0.37:35
chr20	1291393	rs2273956	A	G	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.901;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=13;PP=497;ReadPosRankSum=1.332;SC=CGGGAGGTGAAGGGGATGGCA;SOR=0.156;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=44;TCF=28;TCR=16;TR=27;WE=1291401;WS=1291383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,27:0.60:45
chr20	1292964	rs4814110	T	C	4459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=43;PP=2805;SC=CCCTCCCTGGTGCGGCCACCA;SOR=1.818;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=149;TCF=106;TCR=43;TR=149;WE=1292972;WS=1292954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr20	1293008	rs2273958	C	T	3412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=61;PP=2076;ReadPosRankSum=0.419;SC=TCTGCCCGTCCACCTCACACA;SOR=0.677;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=304;TCF=180;TCR=124;TR=151;WE=1293016;WS=1292998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,159:0.49:322
chr20	1293046	rs1048621	G	A	4260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=419;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.519;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=89;PP=2764;ReadPosRankSum=1.766;SC=AGCCCGTTGCGGGCCGCAGAA;SOR=0.632;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=396;TCF=216;TCR=180;TR=192;WE=1293054;WS=1293036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:211,206:0.49:417
chr20	1293247	rs2273959	C	T	4409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=481;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.521;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=101;PP=2643;ReadPosRankSum=-0.609;SC=CGAACCACCACGACAATCTTA;SOR=0.735;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=449;TCF=227;TCR=222;TR=199;WE=1293255;WS=1293237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:262,218:0.45:480
chr20	1298698	rs75445260	A	G	609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.533;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=313;ReadPosRankSum=0.256;SC=CTCCCTTCTCATCCAGCTCAG;SOR=0.386;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=44;TCF=33;TCR=11;TR=26;WE=1298706;WS=1298688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,30:0.58:52
chr20	1298794	rs6078610	G	A	4389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=60;PP=2677;SC=AGTGGTTTTCGTGAAGCCTCA;SOR=0.985;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=146;TCF=86;TCR=60;TR=146;WE=1298802;WS=1298784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr20	1298954	rs73579382	A	G	2969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.543;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=64;PP=2034;ReadPosRankSum=2.429;SC=CAGAAGCCAAATACATACACT;SOR=0.690;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=230;TCF=119;TCR=111;TR=131;WE=1298962;WS=1298944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,134:0.54:246
chr20	1350672	rs6041749	T	C	825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.32;ReadPosRankSum=2.330;SOR=0.511;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,40:0.50:80
chr20	1350709	rs8392	T	C	3887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=74;NR=48;PP=1669;SC=GATCCCTCCATGGCAGATCTG;SOR=0.895;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=74;TCR=48;TR=122;WE=1350717;WS=1350699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr20	1356261	rs6074549	G	C	12258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=454;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=213;NR=195;PP=2965;SC=TGAAAAAGACGACTGTAACAT;SOR=0.738;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=409;TCF=213;TCR=196;TR=408;WE=1356269;WS=1356251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,454:1.00:454
chr20	1424303	rs6891	G	A	1422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=36;NR=12;PP=844;SC=ACTGCTGGGTGTGCACAAGGG;SOR=1.654;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=36;TCR=12;TR=48;WE=1424311;WS=1424293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr20	1426393	rs9575	C	T	2818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=23;PP=1941;SC=TCTGATTCGTCGATTAAGATG;SOR=1.969;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=92;TCF=69;TCR=23;TR=92;WE=1426401;WS=1426383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr20	1435905	rs6042377	T	C	1022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=27;PP=808;SC=TACTGGCTAGTTGGGAACACA;SOR=4.047;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=29;WE=1435913;WS=1435895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr20	1447563	rs28372738	C	CGATGAGGGCCCAGCA	290.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.949;NF=0;NR=6;PP=1651;ReadPosRankSum=0.344;SC=GAGGCCCAGCCGATGAGGGCC;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=6;WE=1447571;WS=1447553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr20	1457045	rs6042499	T	G	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.297;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=75;ReadPosRankSum=0.933;SC=CCACGCCTCATTGCTGCCCAT;SOR=0.223;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=6;WE=1457053;WS=1457035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr20	1457910	rs6135048	C	A	1297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.922;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=27;PP=894;ReadPosRankSum=0.274;SC=CTGCTCCCTTCCCATGACCAA;SOR=0.875;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=169;TCF=95;TCR=74;TR=65;WE=1457918;WS=1457900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,67:0.38:177
chr20	1458159	rs6135050	A	G	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=44;ReadPosRankSum=-0.241;SC=CTATGTGGGTATGGGCTAGAA;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=4;WE=1458167;WS=1458149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr20	1459060	rs6042507	T	G	4204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=55;PP=2516;SC=CACCGCTGTCTCCTTGGGGTG;SOR=0.952;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=131;TCF=76;TCR=55;TR=131;WE=1459068;WS=1459050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr20	1460272	rs2873565	T	C	803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=6;PP=583;ReadPosRankSum=1.007;SC=TACAGCATGATACAGTGGATA;SOR=0.876;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=53;TCF=44;TCR=9;TR=30;WE=1460280;WS=1460262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,34:0.58:59
chr20	1520883	rs2256520	T	C	2154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.192;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=40;PP=1373;ReadPosRankSum=-0.286;SC=AGGGAATATGTTCTCTCCTAG;SOR=0.888;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=178;TCF=97;TCR=81;TR=95;WE=1520899;WS=1520873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,102:0.51:199
chr20	1532595	rs2249317	T	C	3898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=375;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.898;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=86;PP=1964;ReadPosRankSum=0.375;SC=GGTAAGGTATTGGGTACGCTG;SOR=0.631;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=334;TCF=173;TCR=161;TR=171;WE=1532603;WS=1532585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,191:0.51:374
chr20	1546742	rs2243602	T	A	1315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.952;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=25;PP=829;ReadPosRankSum=-1.016;SC=TGGGCCCTCCTGCTGGCCTTG;SOR=0.475;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=132;TCF=83;TCR=49;TR=61;WE=1546750;WS=1546732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,67:0.44:153
chr20	1546911	rs2243603	C	G	1510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=42;PP=957;ReadPosRankSum=1.735;SC=GCCAGCGCTGCTTCTGGAAAT;SOR=0.728;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=40;TCR=71;TR=66;WE=1546919;WS=1546901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,69:0.59:117
chr20	1551485	rs2254458	C	T	3044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.002;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=57;PP=1751;ReadPosRankSum=0.404;SC=CCTTCTGGTGCGCTGAGATCT;SOR=0.817;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=248;TCF=138;TCR=110;TR=131;WE=1551493;WS=1551475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,146:0.53:275
chr20	1552430	rs2253427	T	C	2726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=365;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.801;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=63;PP=1693;ReadPosRankSum=1.724;SC=TGATGTGGGCTATCTCGCAGA;SOR=0.649;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=320;TCF=172;TCR=148;TR=132;WE=1552438;WS=1552412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:219,146:0.40:365
chr20	1592120	rs1135201	G	T	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=11.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.91;MQRankSum=-5.229;QD=4.99;ReadPosRankSum=0.717;SOR=2.031;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,9:0.21:43
chr20	1592139	rs149722469	G	T	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=12.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.87;MQRankSum=-6.027;QD=5.76;ReadPosRankSum=0.690;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,9:0.19:47
chr20	1592141	rs141518677	T	C	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=14.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.77;MQRankSum=-6.288;QD=5.42;ReadPosRankSum=0.291;SOR=3.076;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,10:0.20:50
chr20	1592150	.	TGA	T	238.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.507;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=8.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.77;MQRankSum=-6.226;QD=4.87;ReadPosRankSum=-0.299;SOR=2.606;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,10:0.20:49
chr20	1592154	.	G	GAC	238.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.734;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=8.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.25;MQRankSum=-6.218;QD=4.77;ReadPosRankSum=0.581;SOR=2.268;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,9:0.18:50
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chr20	1592193	rs371465078	C	T	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.251;HP=4;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-6.635;NF=20;NR=8;PP=370;ReadPosRankSum=-1.748;SC=GGCCTTCTTTCTGATTGTAGA;SOR=1.442;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=98;TCF=62;TCR=36;TR=28;WE=1592201;WS=1592183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,31:0.29:106
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chr20	1895714	rs112912386	G	A	1209.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.789;HP=6;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-4.890;NF=16;NR=11;PP=1528;ReadPosRankSum=1.598;SC=ACGTAAGGATGAAAAAATGAC;SOR=0.540;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=99;TCF=63;TCR=36;TR=27;WE=1895722;WS=1895695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,35:0.32:109
chr20	1895794	rs1135192	G	A	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=6.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQRankSum=-9.789;QD=2.90;ReadPosRankSum=-1.605;SOR=1.394;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:125,20:0.14:145
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chr20	1895813	rs17855609	A	T	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=14.416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQRankSum=-11.773;QD=0.62;ReadPosRankSum=-1.799;SOR=2.613;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:128,12:0.09:140
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chr20	1895950	.	CCT	C	544.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.840;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=4.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.64;MQRankSum=-5.813;QD=11.84;ReadPosRankSum=0.886;SOR=0.708;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,16:0.35:46
chr20	1895963	rs17855613	A	G	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=10.588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.21;MQRankSum=-5.552;QD=10.84;ReadPosRankSum=1.956;SOR=1.267;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,12:0.32:38
chr20	1895963	.	AAC	GAA	1991	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=18;MMLQ=28;MQ=52.51;NF=7;NR=7;PP=1991;QD=146.033419633;SC=CACAAAGAGAAACAACATGGA;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=40;TCF=17;TCR=23;TR=14;WE=1895973;WS=1895947;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:26,14:0.35:40
chr20	1895965	rs17855614	C	A	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=14.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.76;MQRankSum=-5.614;QD=10.84;ReadPosRankSum=2.147;SOR=1.881;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,12:0.32:38
chr20	1895984	rs17855615	C	A	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=8.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.92;MQRankSum=-5.278;QD=9.88;ReadPosRankSum=3.248;SOR=2.359;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,11:0.31:36
chr20	1895990	rs17855616	G	A	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=3.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.26;MQRankSum=-5.421;QD=9.13;ReadPosRankSum=3.269;SOR=1.639;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,11:0.29:38
chr20	1896051	rs139878822	CCGA	C	1992.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.653;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-6.115;NF=12;NR=14;PP=2562;ReadPosRankSum=-0.817;SC=AAAGGGAGCCCCGATGACGTG;SOR=0.792;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=75;TCF=30;TCR=45;TR=26;WE=1896068;WS=1896041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,53:0.37:145
chr20	1896059	rs115287948	G	A	2158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FS=2.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQRankSum=-5.909;QD=14.11;ReadPosRankSum=-1.396;SOR=0.904;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,58:0.38:153
chr20	1896059	.	GT	AC	2543	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MMLQ=24;MQ=57.58;NF=26;NR=14;PP=2543;QD=20;SC=CCCCGATGACGTGGAGTTTAA;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=136;TCF=85;TCR=51;TR=40;WE=1896068;WS=1896041;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:96,40:0.29:136
chr20	1896060	rs114499682	T	C	2158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FS=1.305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.14;MQRankSum=-5.858;QD=13.75;ReadPosRankSum=-1.372;SOR=0.812;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:97,60:0.38:157
chr20	1896100	rs6136375	C	T	1624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.706;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.909;NF=39;NR=34;PP=869;ReadPosRankSum=0.348;SC=TGTCTGTGCGCGGTGAGTACA;SOR=0.566;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=180;TCF=100;TCR=80;TR=73;WE=1896108;WS=1896090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,87:0.41:211
chr20	1896244	rs6136376	A	G	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.45;ReadPosRankSum=-0.267;SOR=0.602;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr20	1961134	rs6045819	A	G	2497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.443;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=56;PP=1469;ReadPosRankSum=-0.674;SC=ACAGGTCCTCATGGCCCATGC;SOR=0.640;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=247;TCF=132;TCR=115;TR=119;WE=1961142;WS=1961124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,130:0.48:270
chr20	2082732	rs6112857	C	G	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=301;ReadPosRankSum=0.234;SC=TGCTCGGTCCCGGAGGCAGCC;SOR=0.749;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=12;TCR=31;TR=21;WE=2082740;WS=2082722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,24:0.51:47
chr20	2082781	rs35569160	G	C	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.035;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=4;PP=85;ReadPosRankSum=2.002;SC=GGGGCTCCAGGGGGGAAACGG;SOR=0.116;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=8;WE=2082789;WS=2082771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr20	2124604	rs76798888	C	T	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=2.807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-1.081;QD=5.60;ReadPosRankSum=-0.545;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,18:0.44:41
chr20	2290333	rs214803	C	A	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=2.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.52;ReadPosRankSum=-0.023;SOR=0.396;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,25:0.49:51
chr20	2290532	rs214804	T	G	2702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=32;NR=46;PP=1381;SC=TAGCCCTTGTTCATTCAAGGA;SOR=1.493;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=32;TCR=46;TR=78;WE=2290540;WS=2290522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr20	2290547	rs214805	C	T	1728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=32;PP=915;SC=CAAGGACTGACGGGGACCACA;SOR=1.685;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=18;TCR=32;TR=50;WE=2290555;WS=2290537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr20	2291164	rs11477461	AG	A	336.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.169;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=390;ReadPosRankSum=-1.636;SC=GATTAGGGAAAGTCCATGGGC;SOR=2.517;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=11;WE=2291172;WS=2291154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,12:0.34:35
chr20	2315929	rs2076406	C	T	1194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=30;PP=823;SC=GGTAATGGGGCTCCCCATCCT;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=9;TCR=30;TR=39;WE=2315937;WS=2315919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr20	2321105	rs214830	G	C	3819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=43;PP=2167;SC=GCCCAAGGAGGGGTCCCGGGT;SOR=1.414;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=80;TCR=43;TR=123;WE=2321113;WS=2321095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr20	2321363	rs214831	A	G	1384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=36;PP=1079;SC=ATGGACCTCCAGGCTCCAGCA;SOR=2.511;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=10;TCR=36;TR=46;WE=2321371;WS=2321353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr20	2321665	rs214832	T	C	2679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=47;PP=1514;SC=GGATGGTTAGTCACCTGCCCC;SOR=1.014;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=38;TCR=47;TR=85;WE=2321673;WS=2321655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr20	2361684	rs2422753	C	T	3188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=59;NR=48;PP=1620;SC=TCAAGAAACACGGGTCTGTGG;SOR=0.742;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=59;TCR=48;TR=107;WE=2361692;WS=2361674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
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chr20	2375262	rs2076405	A	G	1691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.63;SOR=0.886;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
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chr20	2411731	rs71329366	CAG	C	827.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.200;NF=1;NR=17;PP=654;ReadPosRankSum=-0.890;SC=GTGGATGAGCCAGAGAGAAGT;SOR=0.859;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=2;TCR=46;TR=18;WE=2411740;WS=2411721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,25:0.42:59
chr20	2413125	rs2076653	C	T	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.73;ReadPosRankSum=1.310;SOR=0.661;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,29:0.52:56
chr20	2413125	.	CC	TT	307	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=15;NR=8;PP=307;QD=15.6725162984;SC=TCTCCCCTCCCCTTCCTCCAG;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=48;TCF=33;TCR=15;TR=23;WE=2413134;WS=2413115;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:25,23:0.48:48
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chr20	2413320	rs2076652	T	C	1241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.020;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=32;PP=660;ReadPosRankSum=0.295;SC=GGGGTGGATTTGGCCCCTGTC;SOR=0.906;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=135;TCF=66;TCR=69;TR=59;WE=2413328;WS=2413310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,66:0.42:158
chr20	2442273	rs6049216	C	A	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=161;ReadPosRankSum=-0.765;SC=AAATAAAGATCCATAGGTGCA;SOR=0.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=11;WE=2442281;WS=2442263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr20	2443116	rs6036572	G	A	1553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.549;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=23;PP=1070;ReadPosRankSum=0.372;SC=TAAGAGGGGAGGTAAGCCCAA;SOR=0.876;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=61;TCR=36;TR=61;WE=2443124;WS=2443106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,66:0.59:111
chr20	2443441	rs2143862	G	A	747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.096;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=15;PP=396;ReadPosRankSum=1.163;SC=TATAGCTCAAGTGTCTATCTT;SOR=0.391;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=66;TCF=31;TCR=35;TR=33;WE=2443449;WS=2443431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,37:0.51:72
chr20	2451451	rs6049288	G	T	2186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=47;PP=1214;ReadPosRankSum=-1.581;SC=CACGTAAAATGCGGTCGGGTA;SOR=0.707;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=193;TCF=99;TCR=94;TR=98;WE=2451459;WS=2451441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,110:0.51:215
chr20	2451504	rs6049290	C	T	1041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.730;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=26;PP=558;ReadPosRankSum=0.550;SC=GGAGTTCCGGCCCCGGAGCGG;SOR=0.804;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=99;TCF=42;TCR=57;TR=44;WE=2451512;WS=2451494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,50:0.46:109
chr20	2473587	rs41308639	A	T	644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.882;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=489;ReadPosRankSum=-1.608;SC=ATTCGTCAGAATATATGGTTC;SOR=1.254;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=65;TCF=18;TCR=47;TR=29;WE=2473595;WS=2473577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,29:0.45:65
chr20	2474081	rs4815270	T	C	2550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=77;NR=40;PP=2130;SC=CGCCTTTTCCTTTCCCAAGAA;SOR=1.202;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=118;TCF=77;TCR=41;TR=117;WE=2474089;WS=2474071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr20	2474136	rs371945940	GA	G	234.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FS=3.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.11;MQRankSum=3.038;QD=1.26;ReadPosRankSum=-1.329;SOR=0.397;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:148,38:0.20:186
chr20	2539387	rs6050063	G	A	8101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=136;NR=135;PP=2965;SC=ATTCCGAGGAGGGAGGAGAAG;SOR=0.781;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=271;TCF=136;TCR=135;TR=271;WE=2539395;WS=2539377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,307:1.00:307
chr20	2542669	rs7270277	C	T	1194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.500;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=31;PP=696;ReadPosRankSum=0.337;SC=GAGCAGGCTGCGGGTCAGCCA;SOR=0.465;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=104;TCF=43;TCR=61;TR=55;WE=2542677;WS=2542659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,59:0.53:112
chr20	2552805	rs1883981	T	A	1027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=4.878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.38;ReadPosRankSum=-0.346;SOR=0.316;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,60:0.72:83
chr20	2552926	rs1883980	T	C	941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.520;HP=9;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=22;PP=473;ReadPosRankSum=-2.456;SC=GTGTGTGGGGTGGGGGCAGTG;SOR=0.370;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=65;TCF=28;TCR=37;TR=41;WE=2552934;WS=2552916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,44:0.66:67
chr20	2559778	rs6083735	G	C	1568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.887;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=32;PP=861;ReadPosRankSum=-0.228;SC=AGAGTTTTACGTCTTTTATTT;SOR=0.554;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=154;TCF=82;TCR=72;TR=68;WE=2559786;WS=2559768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,80:0.47:171
chr20	2572816	rs6050433	T	G	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.47;ReadPosRankSum=-1.611;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr20	2591005	rs1883978	A	G	833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=14;PP=388;ReadPosRankSum=-1.013;SC=GGGAGTGCAGAGATGGCAGCC;SOR=0.629;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=74;TCF=46;TCR=28;TR=35;WE=2591013;WS=2590995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,41:0.48:86
chr20	2591232	rs6050576	C	T	709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.860;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=18;PP=344;ReadPosRankSum=0.686;SC=TGATGGATGACGTCCACCTCA;SOR=0.862;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=71;TCF=30;TCR=41;TR=30;WE=2591240;WS=2591222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,37:0.45:83
chr20	2593863	rs6515646	T	C	706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=10;PP=368;ReadPosRankSum=-0.187;SC=TGACGGTGTCTGACATGCTGG;SOR=0.599;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=79;TCF=50;TCR=29;TR=30;WE=2593871;WS=2593853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,35:0.40:88
chr20	2594190	rs10485601	C	T	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.076;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=95;ReadPosRankSum=-0.878;SC=ATGTGACCTTCTATTCTAGGA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=6;WE=2594198;WS=2594180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr20	2596738	rs35949406	CT	C	1502.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=13;PP=1292;ReadPosRankSum=-0.697;SC=ACCAAACGTGCTTTTTTTTTT;SOR=0.680;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=60;TCF=32;TCR=28;TR=30;WE=2596770;WS=2596728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,41:0.59:70
chr20	2596762	rs6050622	G	A	1913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=2.568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.89;ReadPosRankSum=0.921;SOR=0.974;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,59:0.55:107
chr20	2596969	rs4621228	T	A	2032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.796;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=47;PP=1303;ReadPosRankSum=-2.027;SC=CTCTCTGAACTCCCCTCTTTC;SOR=0.555;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=181;TCF=83;TCR=98;TR=90;WE=2596977;WS=2596959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,95:0.50:189
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chr20	2597073	rs4544508	T	G	2985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=45;NR=64;PP=1934;SC=GGGAGAGGGGTTGGTGGAGGA;SOR=1.109;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=45;TCR=64;TR=109;WE=2597081;WS=2597063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
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chr20	2618094	rs6037181	G	A	3623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=52;PP=2616;SC=CCTGGGCCAGGACCAACAGTT;SOR=1.078;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=78;TCR=52;TR=130;WE=2618102;WS=2618084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
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chr20	2618308	rs6050771	C	T	1721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=42;PP=1150;SC=TATGAAACAGCGTGAAATCAG;SOR=2.381;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=13;TCR=42;TR=55;WE=2618316;WS=2618298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
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chr20	2633288	rs117836784	G	A	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.40;MQRankSum=1.792;QD=10.12;ReadPosRankSum=-0.512;SOR=1.380;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr20	2633378	rs149713688	A	AGAGCCTGGGCCT	807.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.397;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=2037;ReadPosRankSum=0.597;SC=GGCCGCAGACAGGGCCTGGGC;SOR=0.350;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=20;TCF=8;TCR=12;TR=7;WE=2633386;WS=2633368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,20:0.43:46
chr20	2633404	rs6115307	C	G	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=8;PP=315;ReadPosRankSum=1.400;SC=CCTGGGCCTGCGCCTGCGCCT;SOR=0.544;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=52;TCF=35;TCR=17;TR=21;WE=2633412;WS=2633394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,18:0.33:55
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chr20	2634167	rs6050911	C	A	750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=26;PP=531;ReadPosRankSum=-1.861;SC=AGTATTTGAGCCATACAATGT;SOR=0.582;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=53;TCF=8;TCR=45;TR=31;WE=2634175;WS=2634157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,32:0.58:55
chr20	2635012	rs3818060	T	G	2437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.552;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=51;PP=1368;ReadPosRankSum=0.734;SC=GATGTTAGAGTTGATCGTCCT;SOR=0.586;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=214;TCF=106;TCR=108;TR=104;WE=2635020;WS=2635002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,120:0.50:241
chr20	2635212	rs2273137	A	G	1325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.447;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=26;PP=763;ReadPosRankSum=0.661;SC=CATAGCTGAGATCCTGCGAGG;SOR=0.287;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=105;TCF=48;TCR=57;TR=56;WE=2635220;WS=2635202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,61:0.54:112
chr20	2637071	rs8958	T	C	2488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.320;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=45;PP=1253;ReadPosRankSum=0.023;SC=GGGGTAACACTCCAAAATATG;SOR=0.577;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=193;TCF=108;TCR=85;TR=104;WE=2637079;WS=2637061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,123:0.56:218
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chr20	2638492	rs11699380	G	A	683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.976;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=7;PP=414;ReadPosRankSum=1.057;SC=TTAACGACACGCGTTCCCCTG;SOR=0.892;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=65;TCF=47;TCR=18;TR=29;WE=2638500;WS=2638482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,32:0.44:72
chr20	2638579	rs6753	T	C	2552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.034;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-3.680;NF=63;NR=51;PP=1313;ReadPosRankSum=-1.189;SC=CTTTAGGAGATGAGTGAAAAA;SOR=0.788;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=200;TCF=109;TCR=91;TR=114;WE=2638587;WS=2638569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,125:0.56:224
chr20	2638882	rs5856	T	C	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.311;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-2.946;NF=6;NR=15;PP=396;ReadPosRankSum=1.146;SC=GAAGAGGCGGTTGGCAAGAGC;SOR=0.046;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=42;TCF=7;TCR=35;TR=21;WE=2638890;WS=2638872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,21:0.50:42
chr20	2639570	rs6037255	G	T	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.357;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=27;ReadPosRankSum=0.914;SC=GGAAATGGAAGCCAAGAATGC;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=4;WE=2639578;WS=2639560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr20	2640102	rs2235955	G	A	980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.159;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=13;PP=694;ReadPosRankSum=2.297;SC=TTCCCCAGAGGGTAGTGCCGA;SOR=0.261;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=84;TCF=62;TCR=22;TR=41;WE=2640110;WS=2640092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,45:0.48:93
chr20	2640488	rs6115368	T	C	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=158;ReadPosRankSum=1.523;SC=AGGAGGGGTATGCAGAGGCTT;SOR=0.368;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=11;WE=2640496;WS=2640478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr20	2644685	rs6107100	C	A	6187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=1.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=625;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.092;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=148;NR=134;PP=2962;ReadPosRankSum=0.614;SC=GTAAGGTCAGCTTTGAGACAT;SOR=0.757;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=577;TCF=295;TCR=282;TR=282;WE=2644693;WS=2644675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:328,295:0.47:623
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chr20	2739583	rs2073125	T	C	2580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.022;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=59;PP=1536;ReadPosRankSum=0.213;SC=CTGACAAGTTTCACTCTCCAG;SOR=0.783;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=201;TCF=94;TCR=107;TR=108;WE=2739591;WS=2739573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,125:0.55:229
chr20	2775332	rs127078	T	C	1993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.532;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=53;PP=954;ReadPosRankSum=1.761;SC=GGCAGGATAATGTGCTGTTTA;SOR=0.619;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=189;TCF=73;TCR=116;TR=91;WE=2775340;WS=2775322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,99:0.49:203
chr20	2777459	rs1985525	T	C	975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=8;PP=635;SC=GAGGAAGGGGTAGGACTGGGG;SOR=1.885;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=33;WE=2777467;WS=2777449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr20	2777828	rs742707	G	T	1304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.654;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=29;PP=826;ReadPosRankSum=-0.257;SC=ACCCTGGCCTGACTGCCCACC;SOR=0.594;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=120;TCF=58;TCR=62;TR=58;WE=2777836;WS=2777818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,62:0.48:130
chr20	2778075	rs127076	T	C	2449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=49;PP=1633;SC=CCTCCAAGCTTACTGTCTCCC;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=25;TCR=50;TR=74;WE=2778083;WS=2778065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr20	2779257	rs215541	G	C	1854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=37;PP=1143;SC=TGAGCCTAAGGTTGCTCCTGC;SOR=1.758;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=58;TCF=21;TCR=37;TR=57;WE=2779265;WS=2779247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr20	2796133	rs2073127	G	A	2760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.013;HP=2;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=59;ReadPosRankSum=1.396;SC=GTAGGCGGGCGGGCCAGTGGA;SOR=0.821;SbPval=0.39;Source=Platypus;TCF=99;TR=114;WE=2796141;WS=2796123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,127:0.61:208
chr20	2797015	rs215561	G	A	1906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.122;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=39;PP=1034;ReadPosRankSum=-0.578;SC=CTGCCAGGCCGTCCTGGGCGC;SOR=0.610;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=162;TCF=89;TCR=73;TR=86;WE=2797023;WS=2797005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,97:0.52:188
chr20	2797137	rs11469869	GCC	G	809.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=3.815;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.25;MQRankSum=-3.320;QD=31.14;ReadPosRankSum=0.820;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,24:0.92:26
chr20	2797764	rs11475330	AG	A	550.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=537;ReadPosRankSum=-0.315;SC=CTGCCTTGGCAGGGCCCAGAC;SOR=0.598;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=17;WE=2797772;WS=2797754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,20:0.48:42
chr20	2816821	rs2274669	C	T	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=3.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.63;ReadPosRankSum=-0.340;SOR=0.379;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,26:0.33:78
chr20	2821400	rs2297046	C	T	732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.10;ReadPosRankSum=1.739;SOR=0.763;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,38:0.58:66
chr20	2842685	rs6051449	A	C	1195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=0.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.27;ReadPosRankSum=-0.945;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,63:0.49:129
chr20	2845130	rs730819	G	A	1953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.998;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=36;PP=1126;ReadPosRankSum=0.455;SC=GGGCAGGGTTGTGGTGTAGCC;SOR=1.048;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=236;TCF=129;TCR=107;TR=87;WE=2845138;WS=2845120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,100:0.38:262
chr20	2846289	rs677344	G	A	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=68;ReadPosRankSum=-0.552;SC=ACACATTTGTGGGCAGGCATC;SOR=0.446;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=5;WE=2846297;WS=2846279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr20	2904143	rs633284	A	T	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.506;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.98;ReadPosRankSum=-1.021;SOR=0.120;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr20	2996423	rs1178015	T	A	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.752;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=15;PP=362;ReadPosRankSum=1.267;SC=CTGGTTGGAGTCAGACTGGAG;SOR=0.444;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=86;TCF=53;TCR=33;TR=33;WE=2996431;WS=2996413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,37:0.37:99
chr20	2996497	rs1178016	C	T	1557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.507;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=29;PP=801;ReadPosRankSum=-1.286;SC=CACCCCAGGGCTACCAAGAAA;SOR=0.822;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=171;TCF=95;TCR=76;TR=68;WE=2996505;WS=2996487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,80:0.41:194
chr20	2996589	rs1178017	G	T	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.069;HP=7;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=20;PP=436;ReadPosRankSum=1.613;SC=AATGGGTTTGGTTTTTTTCTC;SOR=0.406;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=69;TCF=25;TCR=44;TR=34;WE=2996597;WS=2996579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,36:0.50:72
chr20	3002889	rs544090	A	C	1946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.638;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=50;PP=1313;ReadPosRankSum=0.967;SC=TGACCCTTGTACCCCCACCCC;SOR=0.810;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=146;TCF=53;TCR=93;TR=79;WE=3002897;WS=3002879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,84:0.56:151
chr20	3005413	rs568235	G	A	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=76;ReadPosRankSum=0.799;SC=CTCGTACTCTGGTAACTCTCA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=3005421;WS=3005403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr20	3007193	rs6138982	T	A	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.454;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=254;ReadPosRankSum=-1.130;SC=GCTGAACATATGGGAACAGAG;SOR=0.077;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=44;TCF=41;TCR=3;TR=17;WE=3007201;WS=3007183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,19:0.39:49
chr20	3007228	rs571058	G	A	1008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.088;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=11;PP=618;ReadPosRankSum=0.232;SC=GAGAAGAGCAGTATGGAGCCA;SOR=0.400;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=93;TCF=71;TCR=22;TR=42;WE=3007236;WS=3007218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,46:0.45:102
chr20	3007492	rs599538	T	C	914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.121;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=29;PP=640;ReadPosRankSum=-1.306;SC=ACCCCTTCCATTTCTCAGGTA;SOR=1.402;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=76;TCF=19;TCR=57;TR=36;WE=3007500;WS=3007482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,39:0.46:84
chr20	3007694	rs10668644	A	AGGT	1105.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=653;ReadPosRankSum=1.244;SC=CCAGGGCCTGAGGTGGGAGCA;SOR=0.651;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=44;TCF=27;TCR=17;TR=17;WE=3007702;WS=3007684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,29:0.49:59
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chr20	3027220	rs2277757	G	A	636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.449;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=13;PP=314;ReadPosRankSum=-0.541;SC=CCTGGGAGAAGCCCGGGCCCC;SOR=0.385;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=45;TCF=22;TCR=23;TR=27;WE=3027228;WS=3027210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,29:0.58:50
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chr20	3171710	rs8120318	C	T	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=50;ReadPosRankSum=0.819;SC=CTACTCAGTGCCCCTCCTTGC;SOR=0.446;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=9;TCF=5;TCR=4;TR=4;WE=3171718;WS=3171705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
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chr20	3175556	rs2295549	C	G	1642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.245;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=41;PP=1128;ReadPosRankSum=-1.379;SC=CCCTAGCAAGCCCACAGGGTT;SOR=0.916;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=117;TCF=49;TCR=68;TR=67;WE=3175564;WS=3175533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,74:0.56:131
chr20	3175742	rs2295551	A	G	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=14.819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.92;ReadPosRankSum=-1.843;SOR=1.395;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
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chr20	3180616	rs6515777	G	A	1652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=17;PP=557;ReadPosRankSum=0.048;SC=CCTGGTCAAGGGTCAGAGGTC;SOR=0.700;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=99;TCF=60;TCR=39;TR=40;WE=3180624;WS=3180606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,47:0.41:116
chr20	3181262	rs73573863	C	T	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.444;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.674;NF=1;NR=7;PP=126;ReadPosRankSum=-0.303;SC=GCCATGAGTGCGTGTGTGTGT;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=8;WE=3181270;WS=3181252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr20	3184134	rs2295553	C	T	1741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=27;NR=29;PP=883;SC=AGCGGCAGCCCGGAAGCCTCA;SOR=0.990;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=27;TCR=29;TR=56;WE=3184142;WS=3184124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr20	3185313	rs11699145	G	A	1561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=39;PP=969;ReadPosRankSum=0.880;SC=TCCACCCTGAGGCCGGGATCT;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=123;TCF=43;TCR=80;TR=59;WE=3185321;WS=3185303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,70:0.50:140
chr20	3190039	rs45620433	C	G	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=193;ReadPosRankSum=-1.013;SC=GCCGCCACCGCGAGCCCACTC;SOR=0.507;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=11;WE=3190047;WS=3190033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,15:0.83:18
chr20	3193674	rs75402132	G	A	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.969;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=324;ReadPosRankSum=1.959;SC=CCTGAAAGCCGGGGTGAGGCC;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=7;WE=3193695;WS=3193664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr20	3193687	rs78089909	C	T	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=324;ReadPosRankSum=1.154;SC=GTGAGGCCCACAGGCCTGAGT;SOR=0.634;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=13;WE=3193695;WS=3193664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr20	3193893	rs7270101	A	C	2454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=44;PP=1482;ReadPosRankSum=-0.166;SC=GTTTTGTTTTATTTTTAAAAG;SOR=0.696;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=201;TCF=111;TCR=90;TR=99;WE=3193901;WS=3193883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,113:0.49:230
chr20	3193978	rs8362	G	A	2135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.520;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=50;PP=1248;ReadPosRankSum=0.157;SC=CGGAGTACCAGGGGGAGCCGG;SOR=0.647;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=173;TCF=79;TCR=94;TR=93;WE=3193986;WS=3193968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,105:0.52:201
chr20	3199373	rs2422861	G	A	590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=16;PP=469;SC=GGTGGTGGGAGGGGCGCCTTG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=3199381;WS=3199363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
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chr20	3204084	rs9101	G	A	1529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=33;PP=848;ReadPosRankSum=-0.156;SC=AGCTGCAGGAGTACTTTGGCA;SOR=0.729;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=110;TCF=49;TCR=61;TR=59;WE=3204092;WS=3204074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,71:0.55:129
chr20	3209371	rs2281575	G	A	2756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=58;PP=1726;ReadPosRankSum=0.050;SC=GGCCCGAGCCGCGAGTGTCAC;SOR=0.707;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=231;TCF=122;TCR=109;TR=121;WE=3209379;WS=3209361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,130:0.52:251
chr20	3210692	rs6139039	A	G	247.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=7;NR=1;PP=148;SC=TGCCAGCCCAAGGCTCCCAGA;SOR=2.093;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=3210700;WS=3210683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr20	3211064	rs3810561	A	C	704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=9;PP=532;SC=TTGGGGCAGCAATATGGTGGG;SOR=0.963;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=12;TCR=9;TR=21;WE=3211072;WS=3211062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr20	3214020	rs2144771	G	T	1357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=2;PP=1068;SC=ACATGTTTCTGACACACCCAC;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=40;TCF=38;TCR=2;TR=40;WE=3214028;WS=3214010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr20	3214126	rs3803955	C	T	3547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.403;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=60;PP=2157;ReadPosRankSum=0.439;SC=CCGGGGCCCTCCTTCTTCCCC;SOR=0.721;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=293;TCF=178;TCR=115;TR=154;WE=3214134;WS=3214116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,170:0.52:330
chr20	3214581	rs3803956	C	T	1203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.687;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=12;PP=580;ReadPosRankSum=-0.628;SC=TGCAGAGCCACGACTGCTGGT;SOR=1.203;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=97;TCF=63;TCR=34;TR=45;WE=3214589;WS=3214571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,57:0.50:114
chr20	3215046	rs6139040	C	G	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.602;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=296;ReadPosRankSum=0.605;SC=CCAGCCGCAGCAGTCCAGCCC;SOR=2.049;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=15;WE=3215054;WS=3215036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr20	3218634	rs3810562	G	C	1872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.950;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=43;PP=908;ReadPosRankSum=1.872;SC=CTCTCTCCTCGGATGCCAAGG;SOR=0.547;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=146;TCF=66;TCR=80;TR=80;WE=3218642;WS=3218624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,92:0.55:166
chr20	3219561	rs113139885	G	A	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=126;ReadPosRankSum=1.470;SC=GCGAAGCCGCGCCCGGGCCTC;SOR=0.941;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=11;WE=3219569;WS=3219551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr20	3219894	rs6107260	A	G	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.213;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=19;PP=402;ReadPosRankSum=0.187;SC=ACACACCCCCACGCCGCGCCT;SOR=1.390;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=51;TCF=16;TCR=35;TR=25;WE=3219902;WS=3219884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,26:0.48:54
chr20	3233142	rs6037516	C	G	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.969;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=170;ReadPosRankSum=0.221;SC=AGGCCTCCAGCAGAGCTGAGG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=8;WE=3233150;WS=3233132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr20	3236015	rs1569942	A	G	3208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=54;PP=1665;SC=TCTATTACACAACTAAGATCT;SOR=1.028;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=48;TCR=54;TR=102;WE=3236023;WS=3236005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr20	3240708	.	G	A	2959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.756;ClippingRankSum=0.000;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.678;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.015;NF=24;NR=50;PP=1313;ReadPosRankSum=0.926;SC=AGTACAGGCCGGGCGCGGTGG;SOR=0.632;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=40;TCR=83;TR=74;WE=3240716;WS=3240698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,86:0.61:141
chr20	3240723	rs6051685	C	T	2441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.898;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.256;NF=16;NR=38;PP=931;ReadPosRankSum=0.389;SC=CGGTGGCTCACGCCTGTAATC;SOR=0.493;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=86;TCF=24;TCR=62;TR=54;WE=3240731;WS=3240713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,61:0.62:98
chr20	3245006	rs6515783	T	C	249.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=10.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=24.97;ReadPosRankSum=1.645;SOR=4.608;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,9:0.90:10
chr20	3251248	rs6037526	T	C	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=20;ReadPosRankSum=-0.328;SC=TTCACAGTCCTGGTTAGGGGT;SOR=1.179;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=3;WE=3251256;WS=3251238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr20	3262181	rs17698336	A	G	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.859;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=111;ReadPosRankSum=-1.148;SC=AAAGAACAGCATTTACTACAT;SOR=1.350;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=44;TCF=29;TCR=15;TR=13;WE=3262189;WS=3262171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,16:0.34:47
chr20	3262493	rs6051708	T	C	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.098;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=232;ReadPosRankSum=-0.359;SC=GAATGGCTGATTGAACAAGGA;SOR=2.712;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=12;WE=3262501;WS=3262483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr20	3277359	.	G	A	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.615;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=359;ReadPosRankSum=0.621;SC=CAAGGGCACCGGCTACCTGCA;SOR=0.997;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=17;WE=3277367;WS=3277349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr20	3277602	rs2236104	C	A	2755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.266;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=75;PP=2018;ReadPosRankSum=-0.665;SC=AAGACCTAAACAAAACAGAAT;SOR=0.893;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=265;TCF=128;TCR=137;TR=136;WE=3277610;WS=3277588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,140:0.51:277
chr20	3285140	rs2422864	T	C	6274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=94;NR=108;PP=2965;SC=ATGATACTTCTATGACGACAG;SOR=0.970;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=202;TCF=94;TCR=108;TR=202;WE=3285148;WS=3285130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr20	3295863	rs17699037	G	A	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=85;ReadPosRankSum=-0.022;SC=AATTATGTCCGTCTACAAAAG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=6;WE=3295871;WS=3295853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr20	3296279	rs2236115	G	A	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=357;ReadPosRankSum=0.821;SC=CATAGTGCAAGTCTTTTAGAT;SOR=0.582;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=18;WE=3296287;WS=3296269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr20	3298881	.	CAAAA	C	185.70	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=26.53;ReadPosRankSum=1.465;SOR=3.897;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr20	3299054	rs6139071	T	C	3619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=393;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.366;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=83;PP=1864;ReadPosRankSum=0.504;SC=AAGCCTGCATTGAATGAGAAA;SOR=0.660;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=352;TCF=168;TCR=184;TR=163;WE=3299069;WS=3299044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:208,183:0.47:391
chr20	3324487	rs10582105	CGTGT	C	223.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.385;NF=1;NR=5;PP=183;ReadPosRankSum=-1.001;SC=GAGTGCACAGCGTGTGTGTGT;SOR=1.022;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=6;WE=3324498;WS=3324477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr20	3329062	rs6139087	TG	CA	1003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.729;HP=3;HapScore=3;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=773;ReadPosRankSum=0.463;SC=CTTAAAGAAATGACAAATTAG;SOR=1.270;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=20;WE=3329071;WS=3329052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,25:0.66:38
chr20	3355567	rs2208030	T	C	827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=7;PP=502;ReadPosRankSum=1.273;SC=TTGGTAAAAATAGACGAAGGG;SOR=0.616;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=59;TCF=46;TCR=13;TR=29;WE=3355575;WS=3355557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,34:0.52:66
chr20	3362033	rs6051818	T	C	991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.831;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=10;PP=643;ReadPosRankSum=-1.367;SC=TACCATCTAGTACTTCTTCAG;SOR=0.799;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=64;TCR=23;TR=37;WE=3362041;WS=3362023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,44:0.45:98
chr20	3515924	rs151518	G	A	2082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=20;PP=1057;ReadPosRankSum=1.104;SC=CTGGGTTTGTGACAGATGGAC;SOR=0.492;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=68;TCF=48;TCR=20;TR=67;WE=3515932;WS=3515914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,81:0.99:82
chr20	3515951	rs151519	C	T	3040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=66;NR=36;PP=1486;SC=ATTATAAATACAAAACGAAGT;SOR=1.085;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=66;TCR=36;TR=102;WE=3515959;WS=3515941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr20	3516100	rs60560655	GA	G	841.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=17;PP=706;SC=AACATTACTTGATAACCTTTC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=17;WE=3516108;WS=3516090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
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chr20	3624848	rs34398666	C	T	7380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=125;NR=133;PP=2965;SC=GCAACAAAGCCGCTGTCCTCT;SOR=0.798;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=258;TCF=125;TCR=133;TR=258;WE=3624856;WS=3624838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,278:1.00:278
chr20	3640467	rs635674	C	T	2098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=6;PP=1446;SC=GGTAAGCCAGCCCCTTCTCAA;SOR=3.912;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=57;TCR=6;TR=63;WE=3640475;WS=3640457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr20	3640823	rs2853208	C	T	1143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=10;PP=655;SC=GGCTGTGCTCCGGGTCTCCCT;SOR=1.347;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=25;TCR=10;TR=35;WE=3640831;WS=3640813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr20	3649713	rs628965	A	G	1118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=1.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.94;ReadPosRankSum=0.750;SOR=0.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,30:0.59:51
chr20	3649721	rs628977	T	C	1097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=2.667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.39;ReadPosRankSum=-0.752;SOR=0.392;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,29:0.64:45
chr20	3649803	rs678881	G	C	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.999;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=213;ReadPosRankSum=-0.249;SC=ATCCTGGTCTGCATGATAACC;SOR=1.244;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=37;TCF=15;TCR=22;TR=14;WE=3649811;WS=3649793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,13:0.36:36
chr20	3650066	rs630712	C	A	1542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=27;NR=30;PP=898;SC=TCAGCAGGAGCCCCTGGGGCT;SOR=0.906;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=27;TCR=30;TR=57;WE=3650074;WS=3650056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr20	3657803	rs568251	AT	GA	4086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=33;NR=43;PP=2601;SC=GGGCAAGAAAATGTGTGGAGC;SOR=1.414;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=33;TCR=44;TR=76;WE=3657812;WS=3657793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr20	3670945	rs609203	C	A	788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.878;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=17;PP=494;ReadPosRankSum=-0.391;SC=TGATTGCAGACAATGACCACA;SOR=0.573;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=67;TCF=29;TCR=38;TR=32;WE=3670953;WS=3670935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,36:0.48:75
chr20	3673445	rs3746637	C	T	2343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.170;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=49;PP=1426;ReadPosRankSum=1.282;SC=CAGGATCAGCCGGGCCCAGCC;SOR=0.425;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=174;TCF=83;TCR=91;TR=100;WE=3673453;WS=3673435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,107:0.57:189
chr20	3673815	rs2474436	A	G	1384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=29;PP=740;ReadPosRankSum=-0.499;SC=AGTCACAGGCAGCAGCCTGCA;SOR=0.624;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=91;TCF=45;TCR=46;TR=57;WE=3673823;WS=3673805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,63:0.61:103
chr20	3675333	rs3746638	G	A	1462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.022;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=24;PP=771;ReadPosRankSum=-0.626;SC=GCTGATGGGTGCAGCTAGGCT;SOR=0.382;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=135;TCF=88;TCR=47;TR=63;WE=3675341;WS=3675323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,72:0.48:149
chr20	3675498	rs709012	T	G	2759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.887;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=64;PP=1750;ReadPosRankSum=-1.462;SC=GACTCCTGTGTGTACCTGGCA;SOR=0.629;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=267;TCF=130;TCR=137;TR=126;WE=3675506;WS=3675488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,138:0.47:294
chr20	3677095	rs11471725	T	TGCTG	37.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=0;PP=72;ReadPosRankSum=0.842;SC=GGAGGCCTTCTGCTGGCTGGA;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=2;WE=3677103;WS=3677094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,2:0.40:5
chr20	3677357	rs501538	T	C	5944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=105;NR=91;PP=2965;SC=TGGCCTCAGCTTTAGCCTGGA;SOR=0.730;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=196;TCF=105;TCR=91;TR=196;WE=3677365;WS=3677347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr20	3677736	rs673114	T	G	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=302;ReadPosRankSum=0.660;SC=ACCCACAGAGTACACTCAGGA;SOR=0.793;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=33;TCR=12;TR=18;WE=3677744;WS=3677726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,19:0.40:48
chr20	3682011	rs1018493	G	A	3478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=47;PP=2100;SC=AGTCCAGGGTGGAGGTTGCAT;SOR=1.153;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=78;TCR=47;TR=125;WE=3682019;WS=3682001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr20	3682126	rs34924243	C	T	4993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=83;PP=2871;SC=ACCACTGAAGCGTGGGCTGTG;SOR=0.725;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=172;TCF=89;TCR=83;TR=172;WE=3682134;WS=3682116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr20	3682275	rs1018492	A	G	1679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=38;PP=1215;SC=TCAGGACTGGAGTGAGAGGCG;SOR=2.107;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=15;TCR=38;TR=53;WE=3682283;WS=3682265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr20	3684022	rs611847	A	G	7700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=118;NR=147;PP=2965;SC=TGGGTGCCTCATTGGGTGTGT;SOR=1.045;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=265;TCF=118;TCR=147;TR=265;WE=3684030;WS=3684012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,288:1.00:288
chr20	3684729	rs625372	T	C	2499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=63;PP=1912;SC=CTTCACACCCTTGGGGGCATC;SOR=3.202;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=12;TCR=63;TR=75;WE=3684737;WS=3684719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr20	3686436	rs6037651	C	T	5924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=107;NR=91;PP=2965;SC=TGATTGGCCACGGAGAGCTGG;SOR=0.720;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=198;TCF=107;TCR=91;TR=198;WE=3686444;WS=3686426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr20	3723091	rs611073	A	G	3642.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=71;PP=2239;SC=GAGGTGGGGAAGGTGGGGAGT;SOR=1.294;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=50;TCR=71;TR=121;WE=3723099;WS=3723081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr20	3730524	rs62206555	G	A	2600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.736;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=62;PP=1592;ReadPosRankSum=0.413;SC=GCGGCGCCCCGGTACCCAGCG;SOR=0.890;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=231;TCF=110;TCR=121;TR=111;WE=3730532;WS=3730514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,125:0.48:259
chr20	3731622	rs2474437	C	T	1798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.738;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=39;PP=997;ReadPosRankSum=-0.584;SC=AATTCCCCCCCATCAGTGCCT;SOR=0.574;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=178;TCF=89;TCR=89;TR=81;WE=3731630;WS=3731612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,91:0.46:197
chr20	3732225	rs60858447	G	A	1580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.516;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=30;PP=862;ReadPosRankSum=0.910;SC=GCTTCGCCGAGTCAGCGGTGC;SOR=0.816;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=165;TCF=90;TCR=75;TR=72;WE=3732233;WS=3732215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,82:0.43:190
chr20	3732633	rs541760	C	T	4722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=495;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=116;NR=99;PP=2868;ReadPosRankSum=-0.329;SC=TGCGCAAATGCGGCGCGCTCA;SOR=0.712;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=444;TCF=238;TCR=206;TR=215;WE=3732641;WS=3732623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:260,233:0.47:493
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chr20	3846843	rs3746660	C	T	1984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.352;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=51;PP=1139;ReadPosRankSum=-0.026;SC=TCCTGCAGTACACCTGGCCCC;SOR=0.951;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=165;TCF=75;TCR=90;TR=89;WE=3846851;WS=3846833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,98:0.52:188
chr20	3870124	rs3737084	G	C	604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.95;ReadPosRankSum=1.200;SOR=0.799;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,33:0.38:87
chr20	3915885	rs241606	A	C	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.345;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=19;PP=392;ReadPosRankSum=2.078;SC=GAAACAGGCCAAAATAGATGA;SOR=1.101;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=77;TCF=19;TCR=58;TR=25;WE=3915893;WS=3915875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,24:0.30:79
chr20	3954789	rs2143236	T	A	275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=226;SC=TTAACTGATTTAAAAAAAACA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=9;WE=3954797;WS=3954780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr20	4053254	rs6139288	A	G	3208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=56;PP=2053;SC=GAAGAAGGGAAACCAGGCAGG;SOR=0.798;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=55;TCR=56;TR=111;WE=4053262;WS=4053244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr20	4163242	rs28927676	C	T	7715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.056;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=134;NR=122;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.368;SC=TTCTGGAATTCGAGGAGCCCT;SOR=0.268;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=257;TCF=134;TCR=123;TR=256;WE=4163250;WS=4163232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,284:1.00:285
chr20	4163302	rs1051904	A	G	8524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=154;NR=135;PP=2965;SC=AGGACGAAGCAGAGAGCCACA;SOR=0.724;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=289;TCF=154;TCR=135;TR=289;WE=4163310;WS=4163292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,323:1.00:323
chr20	4164283	rs1741327	A	G	3368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=69;PP=2029;SC=TGCCGTACACAGAGAGCTCAA;SOR=1.152;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=122;TCF=52;TCR=70;TR=120;WE=4164291;WS=4164273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr20	4167234	rs6139351	C	T	212.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=173;SC=CAGCATCTTCCGAGAACCAGT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=4167242;WS=4167231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr20	4202802	rs835873	A	G	4337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=69;NR=76;PP=2570;SC=GACCGATACTATTTAGCTGCT;SOR=0.927;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=146;TCF=69;TCR=77;TR=145;WE=4202810;WS=4202792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr20	4705718	rs2245220	C	T	4859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=101;PP=2965;SC=ATCTGGCTCACGGTGAAATAA;SOR=1.442;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=161;TCF=60;TCR=101;TR=161;WE=4705726;WS=4705708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr20	4705756	rs2756263	T	C	2253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=65;PP=1537;SC=CAGTACAGAGTGCAGCAGCGA;SOR=3.456;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=12;TCR=65;TR=77;WE=4705764;WS=4705746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr20	4713176	rs2735677	A	G	8849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=156;NR=139;PP=2965;SC=GCCATGCAGTATGGGGAAGTG;SOR=0.718;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=296;TCF=157;TCR=139;TR=295;WE=4713184;WS=4713166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,324:1.00:324
chr20	4768136	rs55900827	T	C	1876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=15;PP=1197;SC=CTGCAAAAGCTGGCTTCGAGA;SOR=2.035;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=47;TCR=15;TR=62;WE=4768144;WS=4768126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr20	4768475	rs111533115	A	AAGGGACT	1375.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=18;PP=755;SC=CAGGGGTCCAAAGGCACCTTA;SOR=4.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=18;WE=4768483;WS=4768465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr20	4770440	rs2422992	G	A	335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=277;SC=ACGATACTCAGAATGTACTCC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=4770448;WS=4770430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr20	4776659	rs4549182	G	A	5494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=108;PP=2965;SC=AGCCCCCACAGAAGCCAAGAC;SOR=1.123;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=189;TCF=81;TCR=108;TR=189;WE=4776667;WS=4776649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr20	4837929	.	TACACACACACACACACAC	T	384	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=15;MQ=59.62;NF=0;NR=7;PP=384;QD=55.2857142857;SC=GTCAAACACATACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=7;WE=4837956;WS=4837919;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:23,7:0.23:30
chr20	4843370	rs3737321	C	T	1674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.130;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=30;PP=971;ReadPosRankSum=1.468;SC=AACACCATGACCCCTATTAAA;SOR=0.790;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=168;TCF=101;TCR=67;TR=75;WE=4843378;WS=4843360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,85:0.44:193
chr20	4843470	rs34073337	C	A	2573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.986;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=59;PP=1575;ReadPosRankSum=2.264;SC=CCGGAAGGGACGCAAAGAGGG;SOR=0.772;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=221;TCF=106;TCR=115;TR=111;WE=4843478;WS=4843460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,123:0.51:241
chr20	4880132	rs71993570	AGCTCAATGCCTTCTGC	A	1383.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=10;NR=1;PP=2957;SC=CAAACGGCGCAGCTCAATGCC;SOR=4.047;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=11;WE=4880155;WS=4880122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr20	4880308	rs1776964	G	A	2099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.199;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=48;PP=1246;ReadPosRankSum=0.067;SC=ACATGGCATCGGCCAACAGGA;SOR=0.813;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=158;TCF=77;TCR=81;TR=91;WE=4880316;WS=4880298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,99:0.57:173
chr20	5099636	rs25406	G	A	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.776;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=290;ReadPosRankSum=2.005;SC=TGGAGGGTAAGCGGACTGCTG;SOR=0.223;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=40;TCF=7;TCR=33;TR=21;WE=5099644;WS=5099626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,22:0.54:41
chr20	5159344	rs2295508	C	T	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.285;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=85;ReadPosRankSum=-0.153;SC=TGAGCTGTCCCGGGGGACTCA;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=6;WE=5159352;WS=5159336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
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chr20	5170373	rs41282118	T	G	1454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-4.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.582;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=24;PP=912;ReadPosRankSum=-0.151;SC=TTCCCCTGCCTCTAACAGGAC;SOR=0.448;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=105;TCF=70;TCR=35;TR=64;WE=5170381;WS=5170363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,71:0.60:118
chr20	5283256	rs3746682	C	G	2607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.125;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=57;PP=1629;ReadPosRankSum=1.013;SC=TAAAGAGGACCGTTTCTGTTG;SOR=0.572;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=233;TCF=113;TCR=120;TR=115;WE=5283264;WS=5283246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,125:0.50:248
chr20	5296488	rs910971	G	C	2883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.016;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.97;MQRankSum=1.033;NF=74;NR=55;PP=1591;ReadPosRankSum=0.665;SC=GACCAAGAATGGGGAGTCCTA;SOR=0.823;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=246;TCF=139;TCR=107;TR=129;WE=5296496;WS=5296478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,140:0.51:273
chr20	5296549	rs910972	C	T	2760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.924;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQ=59.97;MQRankSum=0.986;NF=60;NR=57;PP=1618;ReadPosRankSum=1.920;SC=GGCGCGCGCCCGGGCTGGGAC;SOR=0.612;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=234;TCF=124;TCR=110;TR=117;WE=5296557;WS=5296539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,133:0.49:272
chr20	5296651	rs910973	T	G	2641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.277;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=57;PP=1553;ReadPosRankSum=-0.909;SC=GCGGCCGCACTGTCGGCGTCT;SOR=0.587;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=245;TCF=131;TCR=114;TR=114;WE=5296659;WS=5296641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,132:0.48:275
chr20	5297172	rs4544519	T	G	927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=27;PP=589;ReadPosRankSum=-0.401;SC=TGCGCTCTGCTGCTCCGGAAG;SOR=0.629;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=82;TCF=32;TCR=50;TR=43;WE=5297180;WS=5297162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,45:0.49:92
chr20	5297193	rs4315595	A	G	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=344;ReadPosRankSum=-2.894;SC=CCGGATCGAGAGTCACAGTGT;SOR=0.804;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=48;TCF=16;TCR=32;TR=24;WE=5297201;WS=5297183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,27:0.49:55
chr20	5454400	rs606389	A	T	4065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=111;NR=101;PP=2965;SC=CTCCAGTACCACTCAAATCAG;SOR=0.826;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=212;TCF=111;TCR=101;TR=212;WE=5454408;WS=5454390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr20	5482307	rs6053447	G	A	1060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.24;MQRankSum=-0.009;QD=11.79;ReadPosRankSum=-1.066;SOR=0.658;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,50:0.56:90
chr20	5539564	rs41282126	C	T	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=138;ReadPosRankSum=0.429;SC=AGAAAACAAACGAGGCCGGGC;SOR=0.706;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=36;TCF=10;TCR=26;TR=12;WE=5539572;WS=5539554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,13:0.35:37
chr20	5539599	rs73596113	A	G	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.697;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=49;ReadPosRankSum=1.163;SC=CTGTAATCCCAACACTTTGGG;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=4;WE=5539607;WS=5539589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr20	5545484	.	TCA	T	43	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=43;QD=17.3333333333;SC=GGATTGTCACTCACACACACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=3;WE=5545493;WS=5545474;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:16,3:0.16:19
chr20	5547951	rs3736765	G	A	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.015;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=76;ReadPosRankSum=0.405;SC=AATGGTTGGAGAAGACAGCTG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=5;WE=5547959;WS=5547941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr20	5551034	rs1056244	G	C	1469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=33;PP=929;SC=AAAACAATGGGTTTTCTCTTT;SOR=3.033;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=43;TCF=7;TCR=36;TR=40;WE=5551042;WS=5551024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr20	5556753	rs74654749	A	T	59.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr20	5559292	rs6038208	T	C	1055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=25;PP=503;ReadPosRankSum=0.165;SC=ATGCAAGAAGTGGCAGAAAAG;SOR=0.754;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=48;TCR=55;TR=48;WE=5559300;WS=5559282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,55:0.47:117
chr20	5564774	rs6053517	T	C	502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=2;PP=265;SC=CATATGAGACTGCTGCTGCAC;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=5564782;WS=5564764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr20	5574134	rs1983694	T	C	773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=18;PP=517;SC=TTCACAAAACTCCTCAAATAA;SOR=2.066;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=24;WE=5574142;WS=5574124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr20	5752917	rs237420	A	G	2278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=46;PP=1370;SC=GGGGCCATTAATAAGTAAAAT;SOR=1.367;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=28;TCR=46;TR=74;WE=5752925;WS=5752907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr20	5753579	rs237422	C	T	633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=10;PP=342;ReadPosRankSum=-0.323;SC=CTGCCATCAGCGTGTGACATA;SOR=0.658;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=57;TCR=26;TR=31;WE=5753587;WS=5753569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,35:0.36:96
chr20	5843577	rs1503896	T	A	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=3.224;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=76;ReadPosRankSum=-1.989;SC=ACAGTAAGCATGTTGAACTGA;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=5;WE=5843585;WS=5843567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr20	5843710	rs41282136	C	T	1312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.807;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=31;PP=808;ReadPosRankSum=0.095;SC=ACTCCTGGACCGCTGAGAACT;SOR=0.509;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=147;TCF=81;TCR=66;TR=61;WE=5843718;WS=5843700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,68:0.43:158
chr20	5843812	rs1699233	T	C	1661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.557;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=28;PP=1014;ReadPosRankSum=0.757;SC=AAATGTTTGGTCATCCACAGC;SOR=0.741;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=159;TCF=88;TCR=71;TR=70;WE=5843820;WS=5843802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,78:0.45:173
chr20	5844121	rs1699232	C	T	924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=1.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.90;ReadPosRankSum=-0.974;SOR=0.533;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,50:0.43:117
chr20	5844121	.	CA	TG	589	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=18;NR=27;PP=589;QD=14.2770638858;SC=TGGTGCCGGGCAGTGTGCAGG;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=104;TCF=42;TCR=62;TR=45;WE=5844130;WS=5844111;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:59,45:0.43:104
chr20	5844122	rs1777353	A	G	3975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.57;SOR=1.322;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr20	5903517	rs236151	A	G	7029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=114;NR=123;PP=2965;SC=TGGAGAGGAGACAGGGAGCCA;SOR=0.862;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=237;TCF=114;TCR=123;TR=237;WE=5903525;WS=5903507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr20	5905779	rs2821	C	A	5688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=111;PP=2965;SC=CACCATTTATCTACCCAAGGG;SOR=1.071;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=196;TCF=85;TCR=111;TR=196;WE=5905787;WS=5905769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr20	5922358	rs236175	G	A	316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=262;SC=TGGGACCACAGGGCCCATCTT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=5922366;WS=5922357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr20	5923203	rs394940	TT	CC	9622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=98;NR=91;PP=2947;SC=CATTCTCTTGTTCAGAAGCCT;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=195;TCF=99;TCR=96;TR=189;WE=5923212;WS=5923193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr20	5924781	rs236178	G	C	950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=21;PP=572;SC=TTAATATTGTGGGCCTTTTAA;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=11;TCR=21;TR=32;WE=5924789;WS=5924771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr20	5926992	rs236180	C	T	2199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=14;PP=1441;SC=TAGGTGGAGGCTGAGATGTTT;SOR=2.660;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=56;TCR=14;TR=70;WE=5927000;WS=5926982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr20	5927218	rs236181	C	G	2493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=55;PP=1613;SC=AATATCTTTTCTATCCAGTAC;SOR=2.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=23;TCR=55;TR=78;WE=5927226;WS=5927208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr20	5933108	rs236110	C	A	3700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=426;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.524;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=84;PP=2152;ReadPosRankSum=1.524;SC=AAAGACCCCACAGTCAATGCA;SOR=0.744;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=374;TCF=189;TCR=185;TR=164;WE=5933116;WS=5933098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:239,185:0.44:424
chr20	5935385	rs236114	T	C	3923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=70;PP=2090;SC=ATCTTACCAATGTATTCGAGG;SOR=0.875;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=138;TCF=68;TCR=70;TR=138;WE=5935393;WS=5935375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr20	5935449	rs236115	C	T	1006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.840;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=27;PP=580;ReadPosRankSum=0.138;SC=GTTCAGACCTCAGTTCTGCCA;SOR=1.064;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=84;TCF=37;TCR=47;TR=45;WE=5935457;WS=5935439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,47:0.52:90
chr20	5948706	rs236100	A	G	2145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.92;SOR=1.519;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr20	5948712	rs236101	C	T	2045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.46;SOR=1.414;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr20	5958367	rs34729681	TATA	T	304.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=255;ReadPosRankSum=-0.076;SC=TAAATCAGGATATAATAATAC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=7;WE=5958377;WS=5958357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr20	5987267	rs2294971	A	T	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.15;ReadPosRankSum=0.674;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr20	5988095	rs4813786	A	G	1907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=48;PP=1110;ReadPosRankSum=-2.134;SC=CTCTCCTAACATTAACTTTGA;SOR=0.676;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=169;TCF=68;TCR=101;TR=81;WE=5988103;WS=5988085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,93:0.50:187
chr20	5990727	rs6117033	T	G	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.484;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=64.48;MQRankSum=2.189;QD=6.68;ReadPosRankSum=-0.180;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr20	6011882	rs2423132	G	T	780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=4;PP=458;SC=TAATGCATATGAGTACTCTTC;SOR=2.387;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=6011890;WS=6011872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr20	6033004	rs6117050	G	A	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=8;PP=237;ReadPosRankSum=-0.501;SC=AGGGCGCGGAGGCTGCTCAGC;SOR=0.567;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=15;TCR=18;TR=15;WE=6033012;WS=6032994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr20	6033025	rs1884643	T	C	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.317;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=180;ReadPosRankSum=-1.444;SC=GCGGGCCCGGTGCACGGCGGC;SOR=1.112;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=29;TCF=13;TCR=16;TR=13;WE=6033033;WS=6033015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr20	6033628	rs751681	T	G	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=215;ReadPosRankSum=0.457;SC=CTCCCCTGTCTGCTTTTGCCC;SOR=1.483;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=11;WE=6033636;WS=6033618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr20	6056918	rs6053878	T	C	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=53;ReadPosRankSum=0.366;SC=CCAGTTGGGATAGACACCTGA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=4;WE=6056926;WS=6056908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr20	6058041	rs35637712	GA	G	586.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.620;HP=9;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.049;NF=2;NR=21;PP=310;ReadPosRankSum=1.235;SC=AAGGAATGATGAAAAAAAAAG;SOR=1.262;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=40;TCF=6;TCR=34;TR=23;WE=6058049;WS=6058031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,30:0.49:61
chr20	6064839	rs2232077	T	C	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=245;ReadPosRankSum=0.786;SC=TCAACCTCTCTTCACATGCAC;SOR=0.368;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=13;WE=6064847;WS=6064829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr20	6077725	rs113592214	TTATAAA	T	1088.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.319;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.001;NF=0;NR=17;PP=796;ReadPosRankSum=0.911;SC=AACAGAAATGTTATAAATATA;SOR=1.448;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=17;WE=6077738;WS=6077715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,29:0.52:56
chr20	6090969	rs55666319	A	G	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.304;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=106;ReadPosRankSum=-0.554;SC=GGCTTTATCAACCAGAGACCG;SOR=0.582;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=6;WE=6090977;WS=6090959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr20	6093090	rs2326719	G	A	1292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.308;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=25;PP=699;ReadPosRankSum=2.496;SC=TTTACTGTACGTTCAAACAAC;SOR=0.588;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=128;TCF=75;TCR=53;TR=58;WE=6093098;WS=6093080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,66:0.46:143
chr20	6093116	rs41308641	A	G	1287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.856;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=30;PP=781;ReadPosRankSum=-0.194;SC=ACCTGTAACAAGTCTTACCTG;SOR=0.800;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=139;TCF=73;TCR=66;TR=59;WE=6093124;WS=6093106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,65:0.42:154
chr20	6096695	rs2295435	C	T	2463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.450;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=55;PP=1384;ReadPosRankSum=-1.744;SC=GATATATCTGCAAAAATGAAA;SOR=0.726;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=236;TCF=123;TCR=113;TR=112;WE=6096703;WS=6096685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,125:0.48:258
chr20	6100002	rs6038363	C	A	1947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=15;PP=1373;SC=TGGTGATGCACCAGACAGGGT;SOR=2.448;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=47;TCR=15;TR=62;WE=6100010;WS=6099992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr20	6100088	rs10373	A	G	1865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=43;PP=1108;ReadPosRankSum=1.131;SC=CTCCTCCAACATGAAGGTCTC;SOR=0.698;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=191;TCF=101;TCR=90;TR=89;WE=6100096;WS=6100078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,98:0.47:210
chr20	6100230	rs2273423	A	C	660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.235;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=19;PP=404;ReadPosRankSum=0.252;SC=CTGCTGAACAAAAAGGCAGAC;SOR=0.377;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=63;TCF=21;TCR=42;TR=31;WE=6100238;WS=6100220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,33:0.50:66
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chr20	6759115	rs235768	A	T	8048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=129;NR=146;PP=2965;ReadPosRankSum=0.830;SC=CCGTGACCAGACTTTTGGACA;SOR=0.311;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=277;TCF=129;TCR=148;TR=275;WE=6759123;WS=6759105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,294:1.00:295
chr20	6759790	.	GAAA	G	317.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.611;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.385;NF=0;NR=9;PP=201;ReadPosRankSum=0.847;SC=TTAGAAAAAAGAAAAAAACAA;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=9;WE=6759800;WS=6759780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr20	7887025	rs6055387	G	C	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.407;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=7;PP=138;ReadPosRankSum=-1.198;SC=TTAGAAATACGTTTCCAATGA;SOR=0.180;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=9;WE=7887033;WS=7887015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr20	7921106	rs376867087	GT	G	74.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.56;ReadPosRankSum=0.376;SOR=0.774;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
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chr20	7999537	rs2294247	C	A	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=379;ReadPosRankSum=-0.949;SC=ATGACATCTCCAGGTCTTCAA;SOR=0.671;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=44;TCR=15;TR=27;WE=7999545;WS=7999527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,29:0.47:62
chr20	7999642	rs2294248	G	A	2779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.993;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=55;PP=1540;ReadPosRankSum=1.127;SC=CATACTGCACGTGGATGTCAC;SOR=0.788;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=221;TCF=117;TCR=104;TR=119;WE=7999650;WS=7999632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,130:0.54:240
chr20	8637727	rs6140670	G	A	2263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.66;SOR=1.893;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr20	8678446	rs2295179	G	A	940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.832;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=24;PP=500;ReadPosRankSum=0.894;SC=GTATATGAATGTTACTAAGAG;SOR=0.511;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=77;TCF=32;TCR=45;TR=43;WE=8678454;WS=8678436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,46:0.56:82
chr20	8696722	rs2076690	C	T	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.429;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=98;ReadPosRankSum=-0.632;SC=TCAGTGCCTTCGCTGTCCATC;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=6;WE=8696730;WS=8696721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr20	8698565	rs6039243	T	C	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.551;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=213;ReadPosRankSum=1.503;SC=GGGCTGTGCGTGGTGGCTCAT;SOR=1.802;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=14;WE=8698573;WS=8698555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr20	8703145	rs6086563	C	G	3144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=71;PP=2076;SC=TGGTCACTTTCTGCCATCTAG;SOR=1.928;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=32;TCR=71;TR=103;WE=8703153;WS=8703135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr20	8703252	rs6086564	C	T	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=73;ReadPosRankSum=0.847;SC=GAAGATATGGCGTTTAGAAAA;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=8703260;WS=8703242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr20	8705496	rs6056043	A	C	1391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=37;PP=868;SC=CTTAATAGAGAGATTTATGCT;SOR=2.259;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=12;TCR=37;TR=49;WE=8705504;WS=8705486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr20	8707900	rs1015171	A	G	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.422;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=257;ReadPosRankSum=0.483;SC=ATAATTTATAACAATGAATTG;SOR=1.085;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=38;TCF=30;TCR=8;TR=17;WE=8707908;WS=8707890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
chr20	8707927	rs1015170	C	T	899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=10;PP=513;ReadPosRankSum=-1.279;SC=TCACCTTCCCCTTTTTTGTTT;SOR=0.758;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=70;TCF=51;TCR=19;TR=37;WE=8707935;WS=8707917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,41:0.53:77
chr20	8708166	rs17446441	A	G	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.960;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=296;ReadPosRankSum=-0.696;SC=TGGGGCGGATAAATAGTTTCA;SOR=0.157;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=18;WE=8708174;WS=8708156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr20	8713842	rs993670	G	A	1246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=5;PP=905;SC=CTTACCCCAAGTATAGATAAA;SOR=3.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=33;TCR=5;TR=38;WE=8713850;WS=8713832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr20	8719777	rs6039246	G	A	135.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=77;SC=CAGCCTGGGTGACACAGCAAG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=8719785;WS=8719775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr20	8737734	rs2076413	G	A	7683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=140;NR=130;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.882;SC=CAAGTGAAGCGAGAACGACTC;SOR=0.735;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=272;TCF=141;TCR=131;TR=270;WE=8737742;WS=8737724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,288:0.99:290
chr20	8741247	rs3886935	C	T	1144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=32;PP=831;SC=TAGAGACATACACTTTTAGTT;SOR=3.967;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=4;TCR=33;TR=36;WE=8741255;WS=8741237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr20	8755243	rs2235613	T	C	6017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=122;NR=77;PP=2965;SC=ACCTCGCTGCTCTGGATGCTG;SOR=1.195;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=200;TCF=123;TCR=77;TR=199;WE=8755251;WS=8755233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr20	8769180	rs2327089	C	T	5299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=94;NR=80;PP=2941;SC=GAAGTAAGCCCTCATTCCCAT;SOR=0.703;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=174;TCF=94;TCR=80;TR=174;WE=8769188;WS=8769170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr20	8769423	rs2076411	T	C	945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=3.757;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.89;ReadPosRankSum=1.087;SOR=0.840;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,37:0.97:38
chr20	8770108	rs4633993	A	C	1545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=12;PP=1153;SC=GTCTGAGATTACCATTTGTCA;SOR=2.393;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=39;TCR=12;TR=51;WE=8770116;WS=8770098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr20	8770130	rs2327090	A	G	2225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=18;PP=1530;SC=TTCTGGATGAATTGGTATAAT;SOR=2.242;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=55;TCR=18;TR=73;WE=8770138;WS=8770120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr20	8770318	rs4816086	A	G	3507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=64;PP=1913;SC=ATGCCTTGCCATAACTTTTTA;SOR=1.259;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=48;TCR=64;TR=112;WE=8770326;WS=8770308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
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chr20	8782901	rs6056128	G	C	264.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=10;PP=257;SC=GGACTTGCTCGTTTGTCCTTC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=8782909;WS=8782891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
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chr20	9417972	rs6056623	G	A	115.90	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5020;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=79;ReadPosRankSum=0.674;SC=CCCATAGGTAGTTACCTGGAC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=5;WE=9417980;WS=9417962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr20	9424810	rs6039471	A	C	1564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.872;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=19;PP=1051;ReadPosRankSum=-0.005;SC=TTTTGATTCTATTTTTCTCCC;SOR=0.832;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=87;TCF=57;TCR=30;TR=59;WE=9424818;WS=9424800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,63:0.69:91
chr20	9424904	rs6056629	C	A	2919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.812;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=56;PP=1874;ReadPosRankSum=0.155;SC=CAGTGCTCTACAGCTACTATT;SOR=0.570;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=191;TCF=106;TCR=85;TR=123;WE=9424912;WS=9424894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,130:0.65:200
chr20	9438172	rs3746548	A	G	2894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.316;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=50;PP=1725;ReadPosRankSum=0.810;SC=AGTGACTTGCAGAAGACACTT;SOR=0.890;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=217;TCF=118;TCR=99;TR=122;WE=9438180;WS=9438162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,138:0.58:237
chr20	9453567	rs2206389	T	C	994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=23;PP=669;SC=AGCCACCAGATCTCTAGCTAA;SOR=3.126;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=26;WE=9453575;WS=9453557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr20	9496285	rs148870783	T	TC	1167.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.287;HP=8;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.951;NF=4;NR=28;PP=574;ReadPosRankSum=1.223;SC=AAGGAATCTTTCCCCCCCCTC;SOR=0.336;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=71;TCF=5;TCR=66;TR=32;WE=9496293;WS=9496275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,52:0.54:97
chr20	9496360	.	GC	G	214.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=210;ReadPosRankSum=-0.631;SC=GACCTGGGTTGCCCGCCTTCT;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=9;WE=9496368;WS=9496350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr20	9496716	rs2232264	C	G	3731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.876;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=68;PP=2129;ReadPosRankSum=-0.913;SC=TGGCCACAGCCAGTCGGAGCT;SOR=0.774;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=278;TCF=153;TCR=125;TR=159;WE=9496724;WS=9496706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,180:0.58:309
chr20	9497057	rs2232267	A	G	788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.279;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=21;PP=469;ReadPosRankSum=-1.326;SC=AACTCGCAGAACAGGCTTGGA;SOR=0.498;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=51;TCF=11;TCR=40;TR=28;WE=9497065;WS=9497047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,33:0.58:57
chr20	9520142	rs12329540	G	A	1677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.569;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=32;PP=878;ReadPosRankSum=0.264;SC=TGAGGGGGACGATGCAAGACG;SOR=0.781;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=76;TCR=74;TR=64;WE=9520150;WS=9520132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,77:0.46:169
chr20	9560712	rs3746545	A	G	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-4.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.576;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=133;ReadPosRankSum=-1.266;SC=TTTACAATCCAATCGTATAAA;SOR=0.044;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=12;WE=9560720;WS=9560702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr20	9625003	rs4816157	G	A	952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.795;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=27;PP=717;ReadPosRankSum=-0.046;SC=AAATATAAATGGAAAAGAGGC;SOR=0.865;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=87;TCF=35;TCR=52;TR=42;WE=9625011;WS=9624993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,43:0.44:97
chr20	10019093	rs575534	A	G	8295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=140;NR=140;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.977;SC=CCATTAATGGACTTAGTGCTT;SOR=0.781;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=283;TCF=142;TCR=141;TR=280;WE=10019101;WS=10019083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,307:0.99:309
chr20	10026108	rs6077636	A	G	605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=454;SC=TGAATTTTCAATAGTCATACG;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=10026116;WS=10026098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr20	10030931	rs656111	C	A	2572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=63;PP=1838;SC=AAAAGATGACCGAATTTTAGT;SOR=2.441;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=20;TCR=63;TR=83;WE=10030939;WS=10030921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr20	10032641	rs6141103	G	C	183.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=148;SC=TGTCCACTGGGTTCCTGGTAC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=10032649;WS=10032631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr20	10438780	rs6104617	A	G	907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=22;NR=8;PP=602;SC=CCAAATAAAAAGAAATTTTAA;SOR=1.981;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=32;TCF=22;TCR=10;TR=30;WE=10438788;WS=10438770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr20	10439002	rs6039947	T	A	1113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=28;PP=986;ReadPosRankSum=0.593;SC=CTCTGCAAAATTTTTTTTTTT;SOR=0.746;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=53;TCF=23;TCR=30;TR=50;WE=10439010;WS=10438991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,47:0.94:50
chr20	10439037	rs6039948	A	G	764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=18;PP=506;SC=GTTCTGGGGCATGTGTGCAGG;SOR=2.066;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=25;WE=10439045;WS=10439027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
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chr20	10603750	rs6077853	G	A	2471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=49;PP=1626;ReadPosRankSum=0.243;SC=GGAAGTGATCGATTAGTCCCG;SOR=0.719;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=190;TCF=106;TCR=84;TR=106;WE=10603758;WS=10603740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,114:0.55:207
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chr20	10622080	rs55818737	C	CA	574.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=289;ReadPosRankSum=0.061;SC=ATCCACCATTCAAAAAAAAAA;SOR=0.726;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=61;TCF=28;TCR=33;TR=22;WE=10622088;WS=10622070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,29:0.43:67
chr20	10622501	rs35761929	G	C	2505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.520;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=58;PP=1234;ReadPosRankSum=-0.802;SC=GGCCCCATCTGGTATCACACT;SOR=0.827;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=218;TCF=107;TCR=111;TR=111;WE=10622509;WS=10622491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,126:0.50:252
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chr20	10624928	.	A	T	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.322;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=8.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.81;ReadPosRankSum=1.675;SOR=1.842;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,18:0.42:43
chr20	10624930	rs368807351	A	T	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=3.281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.04;ReadPosRankSum=0.052;SOR=0.643;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,9:0.18:49
chr20	10625804	rs1801140	T	G	1155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.171;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=24;PP=632;ReadPosRankSum=1.962;SC=TGTTACAGGTTGTTCCTTCCC;SOR=0.497;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=128;TCF=72;TCR=56;TR=50;WE=10625812;WS=10625794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,57:0.40:142
chr20	10629129	rs34325313	A	C	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=107;ReadPosRankSum=-2.128;SC=GGGAAAAGTAAAGGGAAGCGG;SOR=1.863;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=7;WE=10629137;WS=10629119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr20	10629872	rs6108653	T	G	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=43;ReadPosRankSum=-2.397;SC=CTGTGTGCTTTCCGTGAGATA;SOR=0.892;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=6;WE=10629880;WS=10629862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr20	10637057	rs10485741	T	C	1565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.634;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=24;PP=894;ReadPosRankSum=-0.623;SC=TGCAGTCACCTGGGAGTTTGC;SOR=1.284;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=132;TCF=79;TCR=53;TR=70;WE=10637065;WS=10637047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,74:0.53:140
chr20	10639385	rs2273060	A	G	847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.969;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=19;PP=506;ReadPosRankSum=-0.220;SC=AGACAAAGTGATGAATCATGT;SOR=0.519;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=60;TCF=24;TCR=36;TR=34;WE=10639393;WS=10639375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,38:0.57:67
chr20	10644705	rs17536052	G	A	3912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=383;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.151;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=85;PP=2133;ReadPosRankSum=0.524;SC=AAACAGGGTCGACTTTCCAAA;SOR=0.805;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=334;TCF=159;TCR=175;TR=163;WE=10644713;WS=10644695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:192,190:0.50:382
chr20	10653469	rs1051415	C	T	4379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=425;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=85;PP=2664;ReadPosRankSum=-0.979;SC=TGCAGGGCCCCCCGGCCGTGA;SOR=0.749;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=380;TCF=206;TCR=174;TR=189;WE=10653477;WS=10653459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:210,214:0.50:424
chr20	11790885	rs3036550	C	CTT	876.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=4;PP=253;SC=TTTCCTCATACTTCACCTGCC;SOR=2.948;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=12;TCF=6;TCR=6;TR=8;WE=11790893;WS=11790875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr20	11791008	rs803665	C	T	3575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=54;PP=2082;SC=CCACTAGCTTCGCCTCTGTCC;SOR=0.739;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=65;TCR=54;TR=119;WE=11791016;WS=11790998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr20	11791094	rs803664	G	A	1289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.704;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=28;PP=798;ReadPosRankSum=-1.378;SC=GAGACTGTTAGAAGGAAAGTG;SOR=0.477;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=87;TCF=41;TCR=46;TR=55;WE=11791102;WS=11791084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,58:0.60:97
chr20	11791211	rs803663	T	A	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=97;ReadPosRankSum=-1.016;SC=AAGAATGAAATCACATCTTTC;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=6;WE=11791219;WS=11791201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr20	11830180	rs33956420	CT	C	1039.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.18;ReadPosRankSum=1.250;SOR=1.565;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,42:0.98:43
chr20	11871253	rs11908312	G	C	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=208;ReadPosRankSum=-0.619;SC=CAGTTCGTGGGACAAGGACGA;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=10;WE=11871261;WS=11871248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr20	12990044	rs3761895	T	C	2375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.535;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=51;PP=1514;ReadPosRankSum=0.576;SC=TAAGAGGCACTCTCCCCTACT;SOR=0.595;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=207;TCF=107;TCR=100;TR=105;WE=12990052;WS=12990034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,117:0.48:245
chr20	13029764	rs1431433	A	C	8540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-1.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.257;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=141;NR=142;PP=2965;ReadPosRankSum=1.430;SC=AGCTGTGGAAAGAAAAGAACA;SOR=0.413;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=284;TCF=142;TCR=142;TR=283;WE=13029772;WS=13029754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,325:1.00:326
chr20	13029862	rs919604	C	T	6128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=108;PP=2965;SC=AGGTGCAGATCCTAGAAAGCA;SOR=0.934;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=203;TCF=95;TCR=108;TR=203;WE=13029870;WS=13029852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr20	13029920	rs934335	C	G	6516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=103;NR=104;PP=2965;SC=ATCTCCACCTCCTAAACCCCA;SOR=0.801;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=207;TCF=103;TCR=104;TR=207;WE=13029928;WS=13029910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr20	13053018	rs243887	T	G	4752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=75;NR=85;PP=2965;SC=TCTGTTTGATTTGATGGAGAG;SOR=0.963;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=160;TCF=75;TCR=85;TR=160;WE=13053026;WS=13053008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr20	13053035	rs243888	A	G	4712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.366;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=82;PP=2802;ReadPosRankSum=-0.754;SC=AGAGGGTATCAGACGACTATA;SOR=0.500;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=162;TCF=80;TCR=82;TR=161;WE=13053043;WS=13053025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,177:0.99:178
chr20	13055258	rs6131426	C	A	665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=18;PP=465;SC=GTGTTATAAACTGCAGAAAGA;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=13055275;WS=13055248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr20	13055267	rs150837910	G	GA	371.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=283;SC=ACTGCAGAAAGAAAAAAAAGA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=12;WE=13055275;WS=13055248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr20	13060220	rs8119959	G	A	746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=4;PP=546;SC=TGAGTAAAATGAAACTACTGA;SOR=3.014;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=23;WE=13060228;WS=13060210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr20	13060331	rs8120012	G	A	4485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=91;NR=58;PP=2797;SC=CTTCTTTTCTGGTTTGTTGCT;SOR=1.132;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=149;TCF=91;TCR=58;TR=149;WE=13060339;WS=13060321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr20	13073963	rs1030561	T	C	534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=0;PP=447;SC=CTAACTGCTATACATGATTTT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=13073971;WS=13073957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr20	13074235	rs708937	G	A	6880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.74;SOR=1.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr20	13074243	rs1011290	T	A	6548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.16;SOR=1.422;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr20	13090745	rs2236126	G	C	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.89;ReadPosRankSum=1.772;SOR=0.741;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,34:0.47:72
chr20	13134931	rs2073303	C	G	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=396;ReadPosRankSum=0.501;SC=CCACCTGTCACTCTATCAGCT;SOR=0.412;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=21;WE=13134939;WS=13134921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr20	13202315	rs113569834	G	C	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=23;ReadPosRankSum=0.589;SC=CGGGAGCCGAGGCGGGAGCCG;SOR=0.105;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=4;WE=13202323;WS=13202305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr20	13371151	.	G	C	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.216;ClippingRankSum=0.000;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.762;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=296;ReadPosRankSum=0.135;SC=GGTGTCCCTTGCCACACCCCT;SOR=1.284;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=75;TCF=25;TCR=50;TR=21;WE=13371159;WS=13371141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,22:0.28:80
chr20	13464030	rs2273480	C	A	1127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.140;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=26;PP=618;ReadPosRankSum=0.022;SC=CAGCACCGAACACCCTGCTTA;SOR=0.514;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=136;TCF=59;TCR=77;TR=50;WE=13464038;WS=13464020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,58:0.38:152
chr20	13509263	rs3761890	G	A	342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=10;PP=240;SC=TAATAATGATGTAAAACAACT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=13509271;WS=13509253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr20	13695498	rs6079146	G	A	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=79;ReadPosRankSum=-0.777;SC=GATGTATTCAGTTCAAAAATA;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=5;WE=13695506;WS=13695488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr20	13695607	rs34414644	T	G	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.11;ReadPosRankSum=-1.016;SOR=0.690;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,44:0.46:95
chr20	13695680	rs6110019	C	T	1191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=27;PP=696;ReadPosRankSum=-1.391;SC=CTTGTTCTTTCCGTTCTCTTT;SOR=0.708;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=106;TCF=55;TCR=51;TR=53;WE=13695688;WS=13695670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,59:0.48:124
chr20	13698006	rs4239710	T	C	2189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=26;PP=1281;SC=GCCTGGTGTCTATGGTTACCT;SOR=1.096;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=43;TCR=26;TR=69;WE=13698014;WS=13697996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr20	13740632	rs73100123	T	A	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.792;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=171;ReadPosRankSum=0.931;SC=AATTTCTGAATATTAAATGAA;SOR=1.204;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=11;WE=13740640;WS=13740622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr20	13743298	rs754796	A	G	343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=2;PP=215;SC=TAATAATTCTAACAGTAAGCC;SOR=2.494;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=10;WE=13743306;WS=13743288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr20	13747441	rs3180370	A	G	775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.84;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr20	13750448	rs35589194	C	CA	329.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.48;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr20	13755996	rs6079174	T	C	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.204;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=69;ReadPosRankSum=1.113;SC=AAAAATGTAATGCCTTCTGTC;SOR=0.293;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=8;WE=13756004;WS=13755986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr20	13763896	rs28372964	C	CATTA	277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=144;SC=TTTTAAAACACATTCACAATA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=13763904;WS=13763886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr20	13769127	rs6042362	A	G	1280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.478;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=17;PP=786;ReadPosRankSum=-0.607;SC=AGATGATGTAACCTTCTGGAA;SOR=0.626;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=44;TCF=26;TCR=18;TR=43;WE=13769135;WS=13769117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,48:0.98:49
chr20	13782409	rs1015517	A	G	817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=19;PP=488;SC=AGAAAACTGTATGTGTTCATG;SOR=2.546;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=24;WE=13782417;WS=13782399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr20	13794992	.	T	A	2083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.039;ClippingRankSum=0.000;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.466;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=54;PP=1297;ReadPosRankSum=0.342;SC=TCTGGGATTTTACATTTGTGG;SOR=1.030;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=211;TCF=97;TCR=114;TR=94;WE=13795000;WS=13794982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,102:0.45:226
chr20	13830179	rs62640920	G	A	2442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.342;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=60;PP=1457;ReadPosRankSum=-1.175;SC=GAACAATGAGGCCAATCACAA;SOR=0.895;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=249;TCF=118;TCR=131;TR=108;WE=13830187;WS=13830169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,119:0.43:274
chr20	13845987	rs761811	C	T	4342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=49;PP=2338;SC=AATTTTAACTCATCTTACTAG;SOR=1.079;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=127;TCF=78;TCR=49;TR=127;WE=13845995;WS=13845977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr20	13846191	rs761812	A	G	2744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=63;PP=1688;ReadPosRankSum=1.648;SC=CAAGGAGACTAGTTAGCCAGT;SOR=0.728;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=214;TCF=92;TCR=122;TR=111;WE=13846199;WS=13846181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,124:0.53:236
chr20	13847420	rs660710	A	G	8149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=122;NR=146;PP=2965;SC=AATAAATGGCAAGGGGCTGCC;SOR=0.978;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=270;TCF=123;TCR=147;TR=268;WE=13847428;WS=13847410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,300:1.00:300
chr20	13856558	rs73085418	G	A	1106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.765;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=13;PP=583;ReadPosRankSum=-0.319;SC=ACTTCTCCAGGACACAAAACT;SOR=0.557;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=104;TCF=74;TCR=30;TR=46;WE=13856566;WS=13856548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,52:0.46:113
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chr20	14066276	rs2990505	C	T	693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.023;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=9;PP=374;ReadPosRankSum=-0.303;SC=GAAGAAAATACTCAGGAAACA;SOR=1.054;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=65;TCF=41;TCR=24;TR=29;WE=14066284;WS=14066266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,34:0.48:71
chr20	14306896	rs6042672	G	A	3725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=367;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.223;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=82;PP=2268;ReadPosRankSum=-0.010;SC=TGGTATCAGAGGTGACAGACT;SOR=0.761;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=329;TCF=157;TCR=172;TR=155;WE=14306904;WS=14306886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:190,177:0.48:367
chr20	14830453	rs438632	C	T	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.587;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=7;PP=384;ReadPosRankSum=-0.024;SC=TAAGTAGTAACTCTCACATCT;SOR=0.336;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=64;TCF=51;TCR=13;TR=29;WE=14830461;WS=14830443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,33:0.47:70
chr20	14830596	rs6079581	C	G	2162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.456;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=54;PP=1337;ReadPosRankSum=1.011;SC=TTCTCCTACACCTGAAGAGAT;SOR=0.730;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=230;TCF=111;TCR=119;TR=102;WE=14830604;WS=14830586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,112:0.43:259
chr20	15480226	rs2180526	T	C	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=451;ReadPosRankSum=-0.458;SC=TCTGTACTGGTGTAGGACCAG;SOR=1.329;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=20;WE=15480234;WS=15480225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,20:0.62:32
chr20	15480308	rs2145014	G	T	2162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.524;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=42;PP=1335;ReadPosRankSum=-0.339;SC=TGTACTTATTGGTTGAACTGA;SOR=0.640;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=192;TCF=114;TCR=78;TR=100;WE=15480316;WS=15480298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,105:0.53:199
chr20	15480548	rs2145015	T	A	2423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.66;SOR=1.394;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr20	15480548	.	TTCCCCCC	ATCCCCCA,ATCCCCCC	460	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=8,25;NR=15,41;PP=334,460;QD=16.8464293418;SC=TGATGCTCAGTTCCCCCCAAA;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=66;TCF=25;TCR=41;TR=23,66;WE=15480563;WS=15480538;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.35:66
chr20	15480555	rs6079854	C	A	462.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=1.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.98;ReadPosRankSum=1.819;SOR=0.544;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,25:0.43:58
chr20	15948439	rs6043641	A	G	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=29;ReadPosRankSum=0.385;SC=CCATCTTTAGATGACACTTTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=15948447;WS=15948429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr20	15967327	rs34675181	A	G	1133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.975;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=18;PP=685;ReadPosRankSum=0.411;SC=AGCTACGGTCATGCATATCAC;SOR=1.122;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=81;TCF=49;TCR=32;TR=48;WE=15967335;WS=15967317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,55:0.59:93
chr20	16025192	.	CT	C	102.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=0.000;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=1.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.17;MQRankSum=1.962;QD=1.68;ReadPosRankSum=1.052;SOR=0.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,13:0.21:61
chr20	16223865	rs2144897	T	C	5871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=429;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.809;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=125;NR=117;PP=2955;ReadPosRankSum=-0.433;SC=GAGGTGGATCTGGTTTTGGAA;SOR=0.573;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=385;TCF=204;TCR=181;TR=242;WE=16223875;WS=16223855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,274:0.64:428
chr20	16223922	rs1541065	T	C	4955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=385;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=98;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.151;SC=ATATTTCTACTAGCAAGACAT;SOR=0.696;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=344;TCF=165;TCR=179;TR=188;WE=16223930;WS=16223912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,222:0.58:385
chr20	16224066	rs2144898	C	T	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=356;ReadPosRankSum=0.659;SC=ATTGAGGTGGCGGGAGAGGAT;SOR=0.346;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=18;WE=16224074;WS=16224056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr20	16351329	rs2144893	C	T	800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.326;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=24;PP=528;ReadPosRankSum=0.237;SC=AGCAAGTTCACGGGGCGGGGG;SOR=1.115;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=65;TCF=24;TCR=41;TR=34;WE=16351337;WS=16351319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,37:0.52:71
chr20	16359567	rs6034464	A	G	3893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.922;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=73;PP=2486;ReadPosRankSum=0.607;SC=TTCAATCTCCATGCCCAGGGT;SOR=0.772;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=270;TCF=148;TCR=122;TR=164;WE=16359575;WS=16359557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,178:0.61:291
chr20	16362265	rs41276372	T	A	5662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=414;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.563;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=132;NR=112;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.553;SC=CAGACACAGATGGAATCAGTC;SOR=0.513;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=390;TCF=218;TCR=172;TR=244;WE=16362273;WS=16362255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,261:0.64:410
chr20	16475112	rs6044027	G	A	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=257;ReadPosRankSum=-0.967;SC=AAATGAGATCGCGACTTTTAC;SOR=0.859;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=15;WE=16475120;WS=16475102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr20	16486698	rs2295115	G	A	2647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.180;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=43;PP=1811;ReadPosRankSum=-1.327;SC=CCAGAGTCACGAGGGACTTGT;SOR=0.594;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=175;TCF=106;TCR=69;TR=109;WE=16486706;WS=16486675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,117:0.62:190
chr20	16492242	rs6135772	C	T	673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.150;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=22;PP=481;ReadPosRankSum=-0.951;SC=CAACACATAACAGCAGCAACC;SOR=2.049;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=23;WE=16492250;WS=16492232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,26:0.72:36
chr20	16493533	rs6135775	T	C	5202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=384;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.230;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=117;NR=91;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.337;SC=GACTGAAGAGTCCTTCACAGA;SOR=0.763;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=351;TCF=190;TCR=161;TR=208;WE=16493541;WS=16493523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,236:0.62:383
chr20	16493580	rs6135776	A	G	5318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=413;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.527;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=114;NR=111;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.468;SC=TGCATGGGAAAGACCAATGTC;SOR=0.637;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=385;TCF=190;TCR=195;TR=225;WE=16493588;WS=16493570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,246:0.60:413
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chr20	16496415	rs6131837	T	C	960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=30;PP=734;ReadPosRankSum=0.860;SC=CTCTTAAGGATTAGACCATAT;SOR=1.931;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=30;WE=16496423;WS=16496405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,33:0.72:46
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chr20	16506971	rs6044072	A	T	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.62;ReadPosRankSum=-0.874;SOR=0.874;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
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chr20	16712280	rs6111262	C	T	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=129;ReadPosRankSum=-0.441;SC=ATGCCACAGTCCAGTATAATT;SOR=0.892;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=10;WE=16712288;WS=16712270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,11:0.26:43
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chr20	16729262	rs6080387	C	T	700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-3.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=23;PP=539;ReadPosRankSum=-0.690;SC=TGAATCTTCTCCAATGTGTAT;SOR=0.836;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=25;WE=16729270;WS=16729252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,25:0.81:31
chr20	16729654	rs10627353	A	AAGATG	7467.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=64;PP=2912;SC=CTGGCAGTGTAAGATAATTTA;SOR=1.133;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=81;TCF=9;TCR=72;TR=71;WE=16729662;WS=16729644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr20	16730464	rs6075100	T	C	1170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5053;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=4;PP=454;SC=TGATTCTCACTATCAGCAAAG;SOR=2.774;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=33;WE=16730487;WS=16730454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr20	16730466	rs6131861	T	C	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.97;ReadPosRankSum=0.547;SOR=0.635;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,7:0.18:38
chr20	16730479	rs6075101	C	T	1489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=13;PP=1001;SC=GCAAAGAGGACGCCTGCGAGT;SOR=2.024;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=39;TCR=13;TR=52;WE=16730487;WS=16730454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr20	16730522	rs6135878	T	C	3917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=36;PP=2370;SC=AGCTTTTTCCTGATTGCTATT;SOR=1.697;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=91;TCR=36;TR=127;WE=16730530;WS=16730504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr20	16732004	rs12479958	T	C	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=3.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=120;ReadPosRankSum=-0.998;SC=CTCAAATGGGTAAATTGAGAC;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=6;WE=16732012;WS=16731994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr20	17389830	rs2217182	T	C	1708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=9;PP=1197;SC=GGACTAGAAATGTTTAAAGTC;SOR=2.644;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=47;TCR=9;TR=56;WE=17389838;WS=17389820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr20	17436895	rs2021789	G	A	5036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.83;SOR=1.903;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr20	17474690	rs6105762	T	G	8152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=156;NR=108;PP=2965;SC=TGGCCCCAAATACATTTTATC;SOR=0.980;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=264;TCF=156;TCR=108;TR=264;WE=17474698;WS=17474680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,298:1.00:298
chr20	17474968	rs6080718	T	C	5328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=87;PP=2965;SC=CAGGTATAGATGGTTCCTCTG;SOR=0.788;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=178;TCF=91;TCR=87;TR=178;WE=17474976;WS=17474958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr20	17475217	rs6136118	C	T	8309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=148;NR=145;PP=2965;SC=CAGAGTCTTCCGCAACAGAAA;SOR=0.760;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=293;TCF=148;TCR=145;TR=293;WE=17475225;WS=17475207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,308:1.00:308
chr20	17477592	rs6080719	C	T	1603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=12;PP=927;SC=CCTTTCCCACCGGATCCAGTG;SOR=1.412;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=35;TCR=12;TR=47;WE=17477600;WS=17477582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr20	17477751	rs6044850	A	G	2701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=51;PP=1661;SC=AAAAATGAAAAAAAAGCTTTC;SOR=1.007;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=39;TCR=51;TR=90;WE=17477759;WS=17477741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr20	17539168	rs6044883	A	G	2147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=9;PP=1513;SC=TCAGACTACTACTGAGCCAAT;SOR=3.007;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=54;TCR=9;TR=63;WE=17539176;WS=17539158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr20	17594714	rs35586556	GC	G	407.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=0;PP=362;SC=TTCTCTCGGAGCTACCGGAAG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=17594722;WS=17594704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr20	17595329	rs7261001	G	A	575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=2;PP=379;SC=CTGCCTCCCCGGGGCTCCCGG;SOR=3.056;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=17595337;WS=17595319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr20	17596731	rs2236250	C	T	8934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=134;NR=178;PP=2965;SC=GCACAGGCACCGCTCTCTAGC;SOR=1.081;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=312;TCF=134;TCR=178;TR=312;WE=17596739;WS=17596721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,331:1.00:331
chr20	17597331	rs911347	C	T	2203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=27;PP=1361;SC=GGCCTGCACTCTTCTGGGATT;SOR=1.367;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=50;TCR=27;TR=77;WE=17597339;WS=17597321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr20	17597361	rs911348	A	G	3139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=36;PP=2006;SC=TCTGGGGACCAGCTCACCGCC;SOR=1.473;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=75;TCR=36;TR=111;WE=17597369;WS=17597351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr20	17599214	rs2328181	T	C	3876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=42;PP=2407;SC=GTCACACTCCTGGCATGGGGA;SOR=1.510;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=128;TCF=85;TCR=43;TR=127;WE=17599222;WS=17599204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr20	17600357	rs11960	G	A	9881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=377;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=183;NR=172;PP=2965;SC=CTCCAAATGCGACGTGTGCTC;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=355;TCF=183;TCR=172;TR=355;WE=17600365;WS=17600347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,376:1.00:376
chr20	17602028	rs2236253	T	C	2815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=39;PP=1595;SC=GGCCACCTCCTGCCCCATAGG;SOR=1.201;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=62;TCR=39;TR=100;WE=17602036;WS=17602018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr20	17605016	rs2236254	T	C	683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=1;PP=506;SC=TCCTAGTGCCTCTGTGTGTCC;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=17605024;WS=17605006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr20	17605240	rs6034867	A	T	4223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=77;PP=2573;SC=GGTCAGGGAGAGCAGCTTCTC;SOR=0.980;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=144;TCF=67;TCR=77;TR=144;WE=17605248;WS=17605230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr20	17606372	rs2295672	T	C	4708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=70;NR=100;PP=2965;SC=GGACGGTCCCTTCTGGCTGCC;SOR=1.166;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=170;TCF=70;TCR=100;TR=170;WE=17606380;WS=17606362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr20	17610729	rs6044917	T	C	1403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=31;PP=830;SC=CTGGTCCATGTGGGAAGGAAA;SOR=1.220;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=21;TCR=31;TR=52;WE=17610737;WS=17610719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr20	17617531	rs6044923	T	C	311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=10;PP=201;SC=CCAGCTGCAGTGGGAACGACG;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=17617539;WS=17617521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr20	17622429	rs2236255	A	G	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=42;ReadPosRankSum=0.871;SC=CTCCGAGCCCACTCAGGCTGT;SOR=0.770;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=6;WE=17622437;WS=17622419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr20	17622676	rs41276398	C	T	540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.336;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=20;PP=404;ReadPosRankSum=0.769;SC=GCAGGGGCTTCGAGTCAAGGG;SOR=1.142;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=54;TCF=12;TCR=42;TR=24;WE=17622684;WS=17622666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,24:0.45:53
chr20	17639857	.	G	T	586	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.56;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MMLQ=15;MQ=40.03;NF=32;NR=10;PP=586;QD=14.7802669654;SC=GGGCCCCCTCGGCCTTCTTGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=114;TCF=58;TCR=56;TR=42;WE=17639865;WS=17639847;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:72,42:0.37:114
chr20	17640009	rs13040917	A	C	3020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=55;NR=53;PP=1851;SC=GCCCCCTCGGACTTTTTGCCC;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=108;TCF=55;TCR=53;TR=108;WE=17640017;WS=17639999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr20	17674451	rs6080781	G	C	402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=10;PP=210;SC=TGTGTCCAGTGGGAGGAGGTG;SOR=2.049;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=14;WE=17674459;WS=17674441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr20	17705677	rs4814640	A	G	1589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=15;PP=1078;SC=GGAGATGGACAACATGTCTCC;SOR=2.226;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=42;TCR=15;TR=57;WE=17705685;WS=17705667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr20	17927980	rs78163990	G	C	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=240;ReadPosRankSum=1.222;SC=CCATGAGGATGACTGTGCATG;SOR=0.648;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=16;WE=17927988;WS=17927970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,18:0.38:47
chr20	17933368	rs145799736	T	TG	3209.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.988;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=37;PP=1866;ReadPosRankSum=0.075;SC=AAAAGAGATGTGCACATGGCA;SOR=0.497;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=153;TCF=28;TCR=125;TR=50;WE=17933376;WS=17933358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:184,111:0.38:295
chr20	17933511	rs910900	C	A	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.629;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.97;MQRankSum=0.972;NF=1;NR=12;PP=219;ReadPosRankSum=-1.199;SC=TAGTTAGATACTAAGGCAGTT;SOR=1.981;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=13;WE=17933519;WS=17933501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr20	17937801	rs3790301	T	C	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.162;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=250;ReadPosRankSum=-1.909;SC=TCAGTTGAGCTGGGCGCGGCG;SOR=1.000;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=59;TCF=17;TCR=42;TR=21;WE=17937809;WS=17937791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,23:0.37:62
chr20	18005600	rs2281543	A	C	8372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=136;NR=148;PP=2965;SC=CGAATGCCTGAAAGGATGAGG;SOR=0.818;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=285;TCF=137;TCR=148;TR=284;WE=18005608;WS=18005590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,304:1.00:304
chr20	18005678	rs373772460	TGC	TC,T	1811.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.785;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.898;NF=0;NR=32;PP=2166;ReadPosRankSum=1.033;SC=GTAAAAGTCATGCCATGACCA;SOR=1.221;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=93;TCF=2;TCR=91;TR=32;WE=18005690;WS=18005668;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.36:144
chr20	18005681	rs201416729	CA	C	1811.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=6.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.32;ReadPosRankSum=1.212;SOR=1.298;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,50:0.37:136
chr20	18005682	.	A	C	2174	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=12;NR=31;PP=2174;QD=51.3667723848;SC=AAGTCATGCCATGACCAAGGA;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=124;TCF=42;TCR=82;TR=43;WE=18005690;WS=18005668;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:81,43:0.35:124
chr20	18022171	rs1571431	C	T	14240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=535;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=246;NR=246;PP=2965;ReadPosRankSum=2.252;SC=ACGCACTCCCCGCTCACCTGT;SOR=0.391;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=496;TCF=248;TCR=248;TR=492;WE=18022187;WS=18022161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,532:0.99:535
chr20	18118740	rs1205190	T	G	9557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=358;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=172;NR=155;PP=2965;SC=GCGCGCGGCGTCGACCTGGGG;SOR=0.699;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=327;TCF=172;TCR=155;TR=327;WE=18118748;WS=18118730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,357:1.00:357
chr20	18118829	rs2295181	A	T	2212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.425;HP=5;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=60;PP=1529;ReadPosRankSum=0.520;SC=CCTGCACCCCACGCGTTTGCG;SOR=0.546;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=143;TCF=52;TCR=91;TR=95;WE=18118837;WS=18118819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,96:0.64:150
chr20	18123084	rs78016265	CT	C	319.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.270;HP=10;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.180;NF=1;NR=14;PP=157;ReadPosRankSum=1.578;SC=GTATCTTCATCTTTTTTTTTG;SOR=0.293;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=38;TCF=1;TCR=37;TR=15;WE=18123092;WS=18123074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,18:0.44:41
chr20	18131620	rs1009545	G	A	1398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.622;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=30;PP=840;ReadPosRankSum=-2.123;SC=ATACTTCAAGGAATATGTAAA;SOR=0.429;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=155;TCF=73;TCR=82;TR=65;WE=18131628;WS=18131610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,70:0.42:165
chr20	18131723	rs60535649	C	T	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.465;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=157;ReadPosRankSum=-0.802;SC=GGCTGGAGTGCAGTGGCATGA;SOR=0.177;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=12;WE=18131731;WS=18131713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr20	18142462	rs80113248	A	G	794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.718;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=12;PP=448;ReadPosRankSum=1.100;SC=ATTCTTTCTTAGCAGCCTCAA;SOR=0.466;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=120;TCF=88;TCR=32;TR=38;WE=18142470;WS=18142452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,42:0.33:127
chr20	18142924	rs3748511	G	A	7728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-4.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=582;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.531;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=155;NR=173;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.894;SC=TTGGGTATGGGCCATGGTATA;SOR=0.637;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=539;TCF=252;TCR=287;TR=328;WE=18142932;WS=18142914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:232,350:0.60:582
chr20	18143117	rs1205193	T	G	5433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=87;NR=88;PP=2965;SC=GTGGTTGGGGTCAGAAAGAAG;SOR=0.747;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=175;TCF=87;TCR=88;TR=175;WE=18143125;WS=18143107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr20	18165136	rs373697126	T	G	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=6.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.985;SOR=2.694;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
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chr20	18291064	rs2424155	C	T	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=87;ReadPosRankSum=0.669;SC=TTAATTTTCTCGGCTGTTTCA;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=7;WE=18291072;WS=18291054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr20	18296072	rs1033545	T	A	8757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=135;NR=146;PP=2965;SC=CCCAGCTCAGTCAGGGAACCC;SOR=0.772;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=281;TCF=135;TCR=146;TR=281;WE=18296080;WS=18296062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,316:1.00:316
chr20	18361603	rs1883938	T	C	7373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=133;NR=124;PP=2965;SC=AGGACAAGTCTGCAAAGCAGA;SOR=0.729;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=257;TCF=133;TCR=124;TR=257;WE=18361611;WS=18361593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,279:1.00:279
chr20	18393275	rs59695827	C	T	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=194;ReadPosRankSum=-0.076;SC=GAAGAAAGGGCATCCTCCCCC;SOR=0.610;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=12;WE=18393283;WS=18393265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,12:0.80:15
chr20	18393312	rs6075337	C	G	1099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=10;PP=739;SC=TGATGGCTGTCAGGAGGGGTT;SOR=1.730;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=27;TCR=10;TR=37;WE=18393320;WS=18393302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr20	18393499	rs6075338	C	T	2882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=51;PP=1491;SC=ACATCGGGGCCATGCGTGAGG;SOR=1.343;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=38;TCR=51;TR=89;WE=18393507;WS=18393489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr20	18395988	rs6035037	C	T	1704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.099;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=35;PP=1037;ReadPosRankSum=1.482;SC=CCACACCAGCCGCAGAAGGAC;SOR=0.608;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=187;TCF=109;TCR=78;TR=79;WE=18395996;WS=18395978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,84:0.41:203
chr20	18414356	rs6035042	A	G	5165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=86;PP=2965;SC=CACACACCACACAGATGGGAG;SOR=0.766;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=188;TCF=101;TCR=87;TR=187;WE=18414364;WS=18414346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr20	18432690	rs2424196	T	A	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.974;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=195;ReadPosRankSum=0.849;SC=CAACCATACCTGACCGTTAGA;SOR=1.251;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=12;WE=18432698;WS=18432680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr20	18445963	rs6035051	A	G	1725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.901;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.624;NF=50;NR=49;PP=1094;ReadPosRankSum=1.810;SC=GGCACTCGTAATGGTATGATC;SOR=0.706;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=294;TCF=155;TCR=139;TR=99;WE=18445971;WS=18445953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:221,104:0.32:325
chr20	18446022	.	C	CTA	657	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=74;MMLQ=28;MQ=60.48;NF=3;NR=36;PP=657;QD=17.0;SC=CTCTCTCTCTCTCTATATATA;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=83;TCF=7;TCR=76;TR=39;WE=18446032;WS=18446012;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:44,39:0.47:83
chr20	18446024	rs6111974	C	A	2515.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=74;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=-0.469;NF=44;NR=71;PP=2630;ReadPosRankSum=-0.868;SC=CTCTCTCTCTCTATATATATA;SOR=0.799;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=45;TCR=74;TR=115;WE=18446032;WS=18446012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:9,98:0.92:107
chr20	18446050	rs111987137	A	ATGTGCACTTATAGC	3265.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=36;PP=2447;SC=ATAAATTCCAATGTACACAAA;SOR=2.833;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=57;TCF=2;TCR=55;TR=38;WE=18446058;WS=18446040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr20	18448079	rs1474974	C	A	4364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=42;PP=2839;SC=TCCACTGGTTCCCCGGGTTCC;SOR=1.828;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=148;TCF=106;TCR=42;TR=148;WE=18448087;WS=18448069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr20	18460614	rs6035056	A	T	3991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=49;PP=2547;SC=CTGTTCCAAAATATAGGTGTT;SOR=1.345;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=90;TCR=49;TR=139;WE=18460622;WS=18460604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr20	18460641	rs6081160	G	A	1356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.127;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=32;PP=812;ReadPosRankSum=-1.313;SC=TTTGGAAATTGTTATCTTATA;SOR=0.514;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=210;TCF=127;TCR=83;TR=74;WE=18460649;WS=18460631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,81:0.35:230
chr20	18461237	rs57962043	GT	G	524.19	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.28;MQRankSum=0.462;QD=18.72;ReadPosRankSum=0.632;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,25:0.89:28
chr20	18462421	rs1055171	A	G	7049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=150;PP=2965;SC=TCCCTCCCACAGGTTTGGTCC;SOR=1.335;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=243;TCF=93;TCR=150;TR=243;WE=18462429;WS=18462411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr20	18462492	rs4813332	A	G	1053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=29;PP=779;SC=TTGACTGCCCACGGGTGCAAG;SOR=3.675;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=32;WE=18462500;WS=18462482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr20	18462518	rs6111983	C	G	495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=15;PP=418;SC=CATTAAGAAACAGAGCAAGCA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=18462526;WS=18462508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr20	18464110	rs3827965	T	C	1190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.69;SOR=1.455;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr20	18470664	rs3748450	A	G	1834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=28;NR=31;PP=988;SC=ATCTTTCAGTACCCATGGATA;SOR=1.054;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=28;TCR=32;TR=59;WE=18470672;WS=18470654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr20	18470980	rs2424217	A	G	12425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=458;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=245;NR=175;PP=2965;SC=TTTACAACCTAAACAGACAGC;SOR=0.996;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=420;TCF=245;TCR=175;TR=420;WE=18470988;WS=18470970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,457:1.00:457
chr20	18474566	rs17734238	C	G	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.359;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=309;ReadPosRankSum=1.224;SC=ATGACTGGAGCCCACAAAGGG;SOR=0.237;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=43;TCF=36;TCR=7;TR=20;WE=18474574;WS=18474556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,24:0.51:47
chr20	18477614	rs2247746	A	G	4372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=53;PP=2872;SC=GGGCTTTGCTAGAGGGGATTA;SOR=1.208;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=143;TCF=90;TCR=53;TR=143;WE=18477622;WS=18477604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr20	18477870	rs2247757	T	A	2937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=75;PP=2065;SC=CCCAGCCTGCTCCCGCAGGGA;SOR=2.348;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=24;TCR=75;TR=99;WE=18477878;WS=18477860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
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chr20	18505563	.	CT	C	294.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=0.000;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=6.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.09;ReadPosRankSum=-0.404;SOR=0.218;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,24:0.33:72
chr20	18506616	rs911115	T	C	4188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.74;SOR=1.718;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr20	18506616	.	TG	CA,CG	852	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=22,36;NR=40,65;PP=852,481;QD=14.6043205623;SC=ATCATACAAATGTGCTCTCAG;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=101;TCF=36;TCR=65;TR=62,101;WE=18506625;WS=18506606;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.61:101
chr20	18506617	rs1555353	G	A	1547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.47;ReadPosRankSum=-1.866;SOR=0.963;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,70:0.65:107
chr20	18511456	rs6081189	A	G	2434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.64;ReadPosRankSum=-0.041;SOR=0.394;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,84:0.99:85
chr20	18511504	rs3762201	T	C	137.79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=17.22;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr20	18513372	rs17807673	C	T	2838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=379;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.384;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=68;PP=1681;ReadPosRankSum=0.994;SC=GTGAAAGGACCGTGTGTGTCA;SOR=0.665;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=353;TCF=162;TCR=191;TR=127;WE=18513380;WS=18513362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:236,143:0.38:379
chr20	18523864	rs2295557	C	T	738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=21;PP=586;SC=TTCTGCTTTACTTTCGAGAAG;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=18523872;WS=18523854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr20	18529233	rs3736775	T	A	1633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.951;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=24;PP=1044;ReadPosRankSum=0.380;SC=CATTTCTCTTTCCGTTCTTTG;SOR=0.878;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=175;TCF=116;TCR=59;TR=75;WE=18529241;WS=18529223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,80:0.43:185
chr20	18535982	rs1555363	A	G	500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=15;PP=408;SC=GAATAACATTACTGGGCCGGA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=18535990;WS=18535972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr20	18548293	rs11475009	TC	T	6267.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=357;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.421;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=2.396;NF=15;NR=121;PP=2963;ReadPosRankSum=1.097;SC=CGATGAGAGTTCCCCGGGGGT;SOR=0.737;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=229;TCF=29;TCR=200;TR=136;WE=18548301;WS=18548283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,217:0.64:338
chr20	18548425	rs6075366	A	G	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=179;ReadPosRankSum=-0.539;SC=GGAATTATTAATACCTTGTAA;SOR=0.238;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=13;WE=18548433;WS=18548415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,14:0.34:41
chr20	18576912	rs1884875	C	G	1532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=36;PP=1043;SC=CATCCAGGAACGGGTCTTTGG;SOR=1.835;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=15;TCR=36;TR=51;WE=18576920;WS=18576902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr20	18576980	rs6081237	A	G	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.593;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=120;ReadPosRankSum=1.668;SC=CTTTTCTGGAAAGTCATTGTT;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=6;WE=18576988;WS=18576970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr20	18608945	rs3818220	G	C	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=144;ReadPosRankSum=-1.221;SC=GTCCCTGGAAGAGTCCTCGGT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=7;WE=18608953;WS=18608935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr20	18806046	rs6136525	C	T	2212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.084;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=43;PP=1250;ReadPosRankSum=0.910;SC=GTTAGCTCAGCGATAACAATA;SOR=0.437;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=170;TCF=87;TCR=83;TR=94;WE=18806054;WS=18806036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,106:0.55:191
chr20	18810705	rs6136530	C	T	6844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=507;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.134;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=133;NR=152;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.965;SC=TTTGCTTGGACCATGAAGGAA;SOR=0.802;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=464;TCF=222;TCR=242;TR=285;WE=18810713;WS=18810695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:192,314:0.62:506
chr20	19261623	rs1569767	G	A	1597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FS=0.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.71;ReadPosRankSum=-0.203;SOR=0.651;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:235,104:0.31:339
chr20	19560555	rs11087288	GA	G	10747.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=94;PP=2967;SC=GATGACAGAAGACATTATCAA;SOR=1.187;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=157;TCF=63;TCR=94;TR=156;WE=19560563;WS=19560545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,269:1.00:269
chr20	19560664	rs3790261	G	A	8622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=134;NR=179;PP=2965;SC=TGTTCTATGCGCTGGCCATTG;SOR=1.015;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=313;TCF=134;TCR=179;TR=313;WE=19560672;WS=19560654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,326:1.00:326
chr20	19634732	rs3790278	G	A	2769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.804;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=50;PP=1603;ReadPosRankSum=-0.260;SC=CCTGGTGCCTGCTGAGGGATT;SOR=0.732;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=171;TCF=93;TCR=78;TR=117;WE=19634740;WS=19634722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,128:0.68:187
chr20	19634747	rs3790279	T	C	2740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.737;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=49;PP=1640;ReadPosRankSum=-0.004;SC=GGGATTCTATTTACTACACGC;SOR=0.699;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=165;TCF=88;TCR=77;TR=111;WE=19634755;WS=19634737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,122:0.67:181
chr20	19646436	.	CGTGT	C	432.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.639;ClippingRankSum=-0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.83;MQRankSum=0.605;QD=21.64;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr20	19654454	rs1406971	A	G	3118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=70;PP=2230;SC=GAGTCACTGTAATTTTGATTA;SOR=2.063;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=26;TCR=70;TR=96;WE=19654462;WS=19654444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr20	19677615	rs113059140	AAGGGAGGGAGGG	A	2252.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.06;QD=43.32;SOR=3.830;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr20	19941538	rs199562	A	T	736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.961;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=22;PP=502;ReadPosRankSum=0.029;SC=AGCTCTGGTTATGAGATGGGC;SOR=0.227;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=50;TCF=11;TCR=39;TR=30;WE=19941546;WS=19941528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,32:0.57:56
chr20	19945493	rs6046489	T	C	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=239;ReadPosRankSum=-0.561;SC=CGGTAGTTTGTTTGAGAGTAC;SOR=0.776;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=12;WE=19945501;WS=19945483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr20	19970705	rs2076584	C	T	1844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.556;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=37;PP=1158;ReadPosRankSum=0.391;SC=TCAAGGGGCACGTGGAGGCCA;SOR=1.008;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=228;TCF=123;TCR=105;TR=86;WE=19970713;WS=19970695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,92:0.38:239
chr20	19970982	.	G	A	662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.526;ClippingRankSum=0.000;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=23;PP=439;ReadPosRankSum=0.624;SC=CCCAGGCTTCGTGCCGCTTCC;SOR=0.796;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=75;TCF=23;TCR=52;TR=32;WE=19970990;WS=19970972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,33:0.41:80
chr20	20033137	rs2255258	T	A	7802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=575;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.145;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=152;NR=185;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.062;SC=GACCTCTCGCTTGAGCCGTGA;SOR=0.822;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=537;TCF=247;TCR=290;TR=337;WE=20033145;WS=20033127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:215,358:0.62:573
chr20	20033223	rs2273056	A	T	3419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.324;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=75;PP=2011;ReadPosRankSum=-0.470;SC=GGCGTCCTGGAGCTGCGGATG;SOR=0.943;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=193;TCF=79;TCR=114;TR=124;WE=20033231;WS=20033213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,145:0.66:219
chr20	20037222	rs1509573	T	C	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=203;ReadPosRankSum=-0.629;SC=CAGTTTTGTGTGTATTATAAC;SOR=1.061;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=10;WE=20037230;WS=20037212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr20	20050397	rs200183	G	A	7624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=155;NR=112;PP=2965;SC=AGATTTTCTCGTTCTTGTCTG;SOR=0.986;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=268;TCF=155;TCR=113;TR=267;WE=20050405;WS=20050387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,285:1.00:285
chr20	20056038	rs11482118	T	TA	269.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.031;NF=9;NR=1;PP=303;ReadPosRankSum=-0.052;SC=TTAGAACAATTAAGCACAATT;SOR=0.512;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=10;WE=20056046;WS=20056028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,12:0.34:35
chr20	20056082	rs8126258	A	C	856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.816;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.856;NF=29;NR=10;PP=637;ReadPosRankSum=0.056;SC=CTGACATCCCAAATTTATTTC;SOR=0.852;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=96;TCF=70;TCR=26;TR=39;WE=20056090;WS=20056072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,41:0.37:110
chr20	20056402	rs6035543	A	G	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.664;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=7;PP=110;ReadPosRankSum=0.511;SC=TCATTTGGATATCTTTATAGT;SOR=0.276;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=12;WE=20056410;WS=20056392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr20	20071634	rs6046614	T	C	6344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=119;PP=2965;SC=AGTGACTGATTCATGTGGGAA;SOR=1.103;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=212;TCF=91;TCR=121;TR=210;WE=20071642;WS=20071624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr20	20079500	rs1883797	A	G	3214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=67;PP=2020;SC=AATTAAATCTATGCTTTATAC;SOR=1.530;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=38;TCR=67;TR=105;WE=20079508;WS=20079490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr20	20139951	rs11475376	GC	G	6807.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=61;PP=2965;SC=TTGCTCCAGAGCTTGGACTCT;SOR=1.139;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=40;TCR=61;TR=101;WE=20139959;WS=20139941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr20	20140196	rs2179823	T	C	396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=9;PP=255;SC=TCCCTGCCTGTCTCCACCAGT;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=20140204;WS=20140186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr20	20144772	rs6081901	G	A	4472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=83;NR=70;PP=2495;SC=GGCATCGCTCGTACTGCCTGA;SOR=0.778;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=153;TCF=83;TCR=70;TR=153;WE=20144780;WS=20144762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr20	20146875	rs6046679	C	T	553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=2;PP=431;SC=TACTGACATACGAAGCTTGCG;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=20146883;WS=20146865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr20	20150182	rs6112802	A	T	3490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=70;PP=2153;SC=CCCTGCTATTATAATTTAATA;SOR=1.170;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=48;TCR=70;TR=118;WE=20150190;WS=20150172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr20	20152462	rs996197	A	C	8768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=161;NR=138;PP=2965;SC=GCATCACCAGAGTGTCAAAGG;SOR=0.786;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=301;TCF=162;TCR=139;TR=299;WE=20152470;WS=20152452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,337:1.00:337
chr20	20152581	rs2328500	G	A	2676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=63;PP=1858;SC=ACAGGGAAGGGTGGAATGAGA;SOR=1.847;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=27;TCR=63;TR=90;WE=20152589;WS=20152571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr20	20168497	rs2179825	A	G	984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=1;PP=766;SC=AGTGTGATATATTACAATTCT;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=27;WE=20168505;WS=20168487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr20	20243562	rs41279010	A	G	916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.257;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=13;PP=583;ReadPosRankSum=-0.270;SC=CACTTTATCTATTATCACTGA;SOR=1.034;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=69;TCF=46;TCR=23;TR=41;WE=20243570;WS=20243552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,42:0.67:63
chr20	20257706	rs17310719	G	A	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=239;ReadPosRankSum=0.293;SC=TCCTGCAGCTGAAAAATGAGA;SOR=0.446;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=13;WE=20257714;WS=20257696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr20	20269631	rs1410263	C	G	818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=20;PP=469;ReadPosRankSum=-2.265;SC=TTAGGTATGGCTCAGCAGTCA;SOR=0.829;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=44;TCF=14;TCR=30;TR=29;WE=20269639;WS=20269621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,34:0.68:50
chr20	20350516	rs6137007	T	G	1488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=40;PP=1115;SC=CGCCCTGCACTCCCCGAACCC;SOR=3.702;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=6;TCR=40;TR=46;WE=20350524;WS=20350506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr20	20377421	rs11426947	A	AC	12950.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=422;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.05;QD=31.74;SOR=0.713;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,408:1.00:408
chr20	20445793	.	T	TCACACA	483.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.256;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=1.341;QD=32.25;ReadPosRankSum=0.072;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,12:0.80:15
chr20	20609964	.	AACAC	A,AAC	806.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.080;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.73;ReadPosRankSum=0.456;SOR=1.209;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:3,9,22:0.26,0.65:34
chr20	21106598	.	G	A	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.484;ClippingRankSum=0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.017;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-1.457;NF=7;NR=1;PP=140;ReadPosRankSum=2.036;SC=CTTCCGCCCCGTCCCTCAGCG;SOR=1.371;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=8;WE=21106606;WS=21106590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr20	21106714	rs5840900	C	CG	6970.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=34;NR=53;PP=2973;SC=CCCGGCCGAACGGCCACCCAG;SOR=1.010;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=92;TCF=35;TCR=57;TR=87;WE=21106722;WS=21106704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr20	21126194	rs6047271	C	G	2760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=26;PP=1673;SC=ATCAAACTTTCTTTATATTTA;SOR=1.562;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=59;TCR=26;TR=85;WE=21126202;WS=21126184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr20	21142454	rs73133315	A	C	995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.19;SOR=0.823;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr20	21142523	rs4815025	C	G	8276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=168;NR=112;PP=2965;SC=TTGCAGTGCACGAGGGGATTA;SOR=1.167;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=280;TCF=168;TCR=112;TR=280;WE=21142531;WS=21142513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,294:1.00:294
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chr20	21313109	rs11481754	T	TA	2211.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.235;HP=11;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.377;NF=5;NR=62;PP=768;ReadPosRankSum=-1.506;SC=GTTGCCTCATTAAAAAAAAAA;SOR=0.556;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=8;TCR=100;TR=67;WE=21313117;WS=21313099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:12,99:0.89:111
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chr20	21321294	rs202845	C	T	1395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=5;PP=1021;SC=GCCCTTCTTTCCTTTCTGTCA;SOR=3.516;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=38;TCR=5;TR=43;WE=21321302;WS=21321284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr20	21328715	rs11087351	GT	G	1624.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=7;PP=949;SC=TCTAATTTTTGTTTTTTTTAA;SOR=3.841;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=46;TCR=9;TR=42;WE=21328723;WS=21328705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr20	21336825	rs3787500	G	A	4221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=103;PP=2886;ReadPosRankSum=1.656;SC=GGTATGTTACGCAATTTGGTT;SOR=0.797;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=150;TCF=46;TCR=104;TR=149;WE=21336833;WS=21336815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,152:0.99:153
chr20	21346441	rs11467475	TATATA	T	144	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=2;PP=84;SC=TTATGCCATATATATAATATA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=2;WE=21346453;WS=21346431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr20	21362703	rs11476840	TA	T	10895.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=359;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=166;PP=2966;SC=CAGGTAATATTAAAAGTAGAC;SOR=0.952;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=194;TCF=20;TCR=174;TR=185;WE=21362711;WS=21362693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,335:1.00:335
chr20	21362758	rs6047417	T	G	4282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=91;PP=2610;SC=GGGTTTATGGTTTTTATGGAA;SOR=1.465;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=54;TCR=91;TR=145;WE=21362766;WS=21362748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr20	22562674	rs1212275	T	C	7737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.87;SOR=0.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,288:1.00:288
chr20	23016970	rs3746726	T	G	2775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=794;ExcessHet=3.0103;FS=1.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.50;ReadPosRankSum=0.067;SOR=0.801;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:597,197:0.25:794
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chr20	23017044	rs3746728	C	T	1710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=677;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.54;ReadPosRankSum=-0.608;SOR=0.724;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:532,141:0.21:673
chr20	23017082	rs2567608	T	C	1725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=624;ExcessHet=3.0103;FS=1.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.77;ReadPosRankSum=1.164;SOR=0.652;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:493,130:0.21:623
chr20	23065879	rs34170527	G	A	12022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=443;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=215;NR=209;PP=2965;SC=GTCCCAGGACGCACGTGGCCC;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=424;TCF=215;TCR=209;TR=424;WE=23065887;WS=23065869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,442:1.00:442
chr20	23401904	.	ACC	A,AC	7207.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.408;ClippingRankSum=0.000;DP=310;ExcessHet=3.0103;FS=1.288;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.14;MQRankSum=0.349;QD=25.93;ReadPosRankSum=3.338;SOR=0.608;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:9,147,122:0.53,0.44:278
chr20	23424613	rs3746736	T	C	5974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=354;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.445;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.97;MQRankSum=0.000;NF=145;NR=91;PP=2962;ReadPosRankSum=1.031;SC=GAAGATTGGCTGGACCAAATG;SOR=0.653;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=328;TCF=202;TCR=126;TR=236;WE=23424621;WS=23424603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,257:0.73:352
chr20	23472391	rs2983288	A	G	8541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=165;NR=123;PP=2965;SC=AGAATGAGACAGGGGTGCTGA;SOR=0.946;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=290;TCF=166;TCR=124;TR=288;WE=23472399;WS=23472381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,325:1.00:325
chr20	23473522	rs202213134	AT	A	59.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=5.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=2.141;QD=0.92;ReadPosRankSum=0.626;SOR=0.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,12:0.18:65
chr20	23476389	rs2273378	A	G	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-3.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.536;NF=13;NR=0;PP=197;ReadPosRankSum=0.838;SC=GACACCTAGCAACAGGACAAT;SOR=0.963;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=13;WE=23476397;WS=23476379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr20	23529377	rs3004129	G	A	1908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=15;PP=1196;SC=ACCTGTGTCCGCACCACACCC;SOR=1.981;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=61;TCF=46;TCR=15;TR=60;WE=23529396;WS=23529367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr20	23529388	rs2983611	C	T	2058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=47;NR=19;PP=1335;SC=CACCACACCCCATGCGGCATC;SOR=1.810;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=67;TCF=48;TCR=19;TR=66;WE=23529396;WS=23529367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr20	23548774	rs2983617	T	C	3710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=37;PP=2435;SC=AGACCCCCTGTCCCCACCCCA;SOR=1.592;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=126;TCF=88;TCR=38;TR=125;WE=23548782;WS=23548764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr20	23584116	rs726217	G	A	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=6;PP=344;ReadPosRankSum=-0.172;SC=TAAGGCACAAGCAGGGCAGCC;SOR=0.631;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=102;TCF=80;TCR=22;TR=29;WE=23584124;WS=23584106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,31:0.29:107
chr20	23584134	rs200905994	G	T	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=14;PP=550;ReadPosRankSum=0.424;SC=GCCTGGTACAGCCTGCTGTGG;SOR=0.741;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=140;TCF=93;TCR=47;TR=43;WE=23584142;WS=23584124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,44:0.30:148
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chr20	23586360	rs2983640	G	A	1753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=383;ExcessHet=3.0103;FS=0.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.62;ReadPosRankSum=0.228;SOR=0.651;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:271,109:0.29:380
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chr20	23731560	rs6076123	C	T	754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.181;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.595;NF=7;NR=26;PP=601;ReadPosRankSum=-0.931;SC=GGTGAGAGCCCGAGGCAGGGA;SOR=0.155;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=53;TCF=8;TCR=45;TR=33;WE=23731568;WS=23731550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,31:0.58:53
chr20	23731589	rs113896553	G	C	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.057;NF=6;NR=13;PP=355;ReadPosRankSum=-0.506;SC=CAGCAGGCAGGTGTGCATTTA;SOR=0.512;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=19;WE=23731597;WS=23731579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr20	23804864	rs67845471	C	T	1724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.024;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=53;PP=1288;ReadPosRankSum=0.765;SC=CTCACCCACCCCTGCTGAGTC;SOR=0.917;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=98;TCF=17;TCR=81;TR=64;WE=23804872;WS=23804854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,67:0.64:104
chr20	23805832	rs6036548	G	A	4679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=124;NR=22;PP=2965;SC=CCTGGGACCCGCATCAGGAAC;SOR=3.273;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=146;TCF=124;TCR=22;TR=146;WE=23805840;WS=23805822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr20	23806008	rs6106729	C	T	6415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=437;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.705;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.226;NF=100;NR=168;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.753;SC=CCCATCAGTTCATGCACTCAC;SOR=0.940;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=401;TCF=159;TCR=242;TR=268;WE=23806016;WS=23805998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,291:0.67:437
chr20	23806929	rs58314206	A	C	3045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.560;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=33;PP=2226;ReadPosRankSum=-0.794;SC=TGAAGGCCATAAGCAGAGAGT;SOR=0.530;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=165;TCF=122;TCR=43;TR=119;WE=23806937;WS=23806919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,122:0.72:170
chr20	23807028	rs4407312	A	C	16111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=604;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=285;NR=268;PP=2965;SC=GGCAACAAACAAGGCTGGGAC;SOR=0.734;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=553;TCF=285;TCR=268;TR=553;WE=23807036;WS=23807018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,602:1.00:602
chr20	23807308	rs6106731	G	C	1285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=37;PP=1017;ReadPosRankSum=-0.606;SC=GGTCTCCTCGGAGGCAGAGCA;SOR=0.730;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=79;TCF=25;TCR=54;TR=53;WE=23807316;WS=23807298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,52:0.64:81
chr20	23807360	rs6106732	G	A	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.071;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=409;ReadPosRankSum=0.764;SC=AGCCTGAGGCGGGGATCCCAG;SOR=0.218;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=23;WE=23807368;WS=23807350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,24:0.69:35
chr20	23857982	rs2071445	A	G	195.41	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.6705;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=153;ReadPosRankSum=0.157;SC=GCACATGAATACATCCTTGCA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=7;WE=23857990;WS=23857972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr20	23860178	rs1799841	A	G	6350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=418;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.903;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=137;NR=139;PP=2962;ReadPosRankSum=0.566;SC=TCCAGGGCACACTGCACACTC;SOR=0.724;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=399;TCF=202;TCR=197;TR=276;WE=23860186;WS=23860168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,290:0.69:418
chr20	24524218	rs4815274	C	G	3846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=77;PP=2443;SC=CTGGAGGTCACAGGATGTGTT;SOR=1.681;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=39;TCR=77;TR=116;WE=24524226;WS=24524208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr20	24524245	rs4813519	A	G	2331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=56;PP=1603;SC=AGGCCCTCTAAGAATGTGTGA;SOR=3.258;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=11;TCR=56;TR=67;WE=24524253;WS=24524235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr20	24565684	.	T	G	111	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=10;HapScore=2;MGOF=52;MMLQ=15;MQ=59.14;NF=0;NR=14;PP=111;QD=10.4122294677;SC=AGGGTGGGGGTGGGGGCGGCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=9;TCR=30;TR=14;WE=24565692;WS=24565674;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:25,14:0.36:39
chr20	24645939	rs2892217	G	A	10033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=379;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=194;NR=143;PP=2965;SC=TGCTTGTTCCGACTTGCTTAC;SOR=0.979;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=337;TCF=194;TCR=143;TR=337;WE=24645947;WS=24645929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,378:1.00:378
chr20	24939590	rs1056033	G	C	6757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=137;NR=84;PP=2965;SC=AATATATGCTGGAGGTGGAAA;SOR=1.102;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=221;TCF=137;TCR=84;TR=221;WE=24939598;WS=24939580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr20	24944933	rs761368	T	C	1459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=17;PP=1058;SC=CTGGATGGCCTGGCTGAACTG;SOR=1.747;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=36;TCR=17;TR=53;WE=24944941;WS=24944923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr20	24945079	rs10534910	AGGC	A	16149.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=367;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=146;PP=2948;SC=CATTTCAAATAGGCAAGGTGC;SOR=1.090;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=213;TCF=63;TCR=150;TR=206;WE=24945089;WS=24945069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,366:1.00:366
chr20	24950373	rs2064404	A	C	1788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=33;PP=1094;SC=TATGGGCCTGAAGAAGGTGAC;SOR=1.536;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=21;TCR=33;TR=54;WE=24950381;WS=24950363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr20	24954162	rs66649227	AG	A	2152.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=7;PP=1796;SC=TCCATCTACTAGATGGTCAGA;SOR=3.139;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=43;TCF=36;TCR=7;TR=42;WE=24954170;WS=24954152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
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chr20	24959385	rs6083703	A	C	2225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.47;SOR=1.877;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
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chr20	25057191	rs11427085	T	TA	293.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.643;HP=11;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-1.179;NF=2;NR=22;PP=299;ReadPosRankSum=-1.208;SC=GCATCCCTTGTAAAAAAAAAA;SOR=3.154;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=60;TCF=4;TCR=56;TR=24;WE=25057199;WS=25057181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,18:0.38:48
chr20	25057283	rs6050302	G	C	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.400;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=52;ReadPosRankSum=0.667;SC=AATCCCACTAGAATTGTCCTT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=4;WE=25057291;WS=25057273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr20	25059381	rs56157240	A	T	5159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=344;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.425;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=121;NR=100;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.095;SC=GCTATAGAGAAGGGACTGCTG;SOR=0.734;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=323;TCF=175;TCR=148;TR=221;WE=25059389;WS=25059371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,238:0.69:343
chr20	25059546	rs12480307	T	C	1783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.820;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=46;PP=986;ReadPosRankSum=-0.471;SC=CCTCGCTGAATGCCTTCTCCA;SOR=0.512;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=103;TCF=37;TCR=66;TR=74;WE=25059554;WS=25059536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,82:0.73:112
chr20	25061865	rs145972043	AATC	A	667.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=781;ReadPosRankSum=2.124;SC=AGGACCCGTCAATCATTCGAT;SOR=0.399;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=11;WE=25061883;WS=25061855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,17:0.85:20
chr20	25061875	rs61304082	T	C	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.715;HP=1;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=605;ReadPosRankSum=2.674;SC=AATCATTCGATCATTTCCGCC;SOR=0.197;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=16;WE=25061883;WS=25061855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,17:0.77:22
chr20	25062001	rs7344824	T	A	4211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.632;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=114;NR=73;PP=2860;ReadPosRankSum=0.516;SC=GGGGGAAAAATGGCCCTCTGG;SOR=0.403;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=259;TCF=165;TCR=94;TR=187;WE=25062009;WS=25061985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,191:0.71:269
chr20	25062145	rs6050306	C	T	3924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.193;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=110;PP=2573;ReadPosRankSum=0.125;SC=GGGCAGGCGGCGCAGCTCCGC;SOR=0.860;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=264;TCF=99;TCR=165;TR=172;WE=25062153;WS=25062135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,176:0.64:275
chr20	25176296	rs6083773	A	C	1424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=20;PP=730;SC=CCGCCTGCGCATGCGCGGCTG;SOR=0.841;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=49;TCF=28;TCR=21;TR=48;WE=25176304;WS=25176286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr20	25193849	rs6115089	C	A	3441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=46;PP=2219;ReadPosRankSum=-0.090;SC=CACGTGTGACCCTGTATGCTG;SOR=0.683;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=200;TCF=136;TCR=64;TR=141;WE=25193857;WS=25193839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,147:0.69:214
chr20	25195509	rs6050446	A	G	6101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=116;NR=87;PP=2965;SC=TTAGGTGAAAAAAGTATTTAA;SOR=1.025;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=204;TCF=116;TCR=88;TR=203;WE=25195517;WS=25195499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr20	25197471	rs146676409	G	A	417.56	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=3.299;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.98;ReadPosRankSum=1.200;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,17:0.89:19
chr20	25197982	rs4815394	T	C	4218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=39;PP=2965;SC=ATTGGCTCCTTATTGCCTGCT;SOR=1.908;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=140;TCF=100;TCR=40;TR=138;WE=25197990;WS=25197972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr20	25275553	rs16436	GTTAGTT	G	2113.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.718;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=1160;ReadPosRankSum=-0.863;SC=CTGCCTTTGGGTTAGTTTTAG;SOR=0.156;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=44;TCF=34;TCR=10;TR=23;WE=25275566;WS=25275543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,53:0.80:66
chr20	25284343	rs2260197	T	C	5369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=106;NR=117;PP=2724;ReadPosRankSum=1.592;SC=GGCAGGGATCTGGGTTCAGGG;SOR=0.687;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=290;TCF=136;TCR=154;TR=223;WE=25284351;WS=25284333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,245:0.79:310
chr20	25288505	rs884613	C	T	322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.34;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr20	25288632	rs6107027	G	A	5936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=123;NR=90;PP=2965;SC=TAGCTTCTTCGCGGATATTAG;SOR=0.960;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=213;TCF=123;TCR=90;TR=213;WE=25288640;WS=25288622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr20	25295787	rs2297496	T	C	1592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=45;PP=1133;ReadPosRankSum=1.703;SC=AGATGCCAACTGCCACTGCAG;SOR=3.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=3;TCR=46;TR=48;WE=25295795;WS=25295777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,58:0.98:59
chr20	25320228	rs6050544	T	A	10326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=375;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=204;NR=135;PP=2965;SC=TTGAAAGACATAGAAATAGCT;SOR=1.145;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=339;TCF=204;TCR=135;TR=339;WE=25320236;WS=25320218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,375:1.00:375
chr20	25371112	rs139848340	GGCCCCC	G	3725.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=26;PP=2366;SC=GTGAGGGACCGGCCCCCCCCC;SOR=1.416;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=44;TCF=18;TCR=26;TR=43;WE=25371133;WS=25371102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
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chr20	25371378	rs145380090	G	GGCCTCCGCC	690.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=10;PP=229;SC=GGCGCCCGCTGGCCTGCGCCG;SOR=2.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=10;WE=25371386;WS=25371368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
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chr20	25829384	.	TTA	CTG	2944	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MMLQ=28;MQ=45.4;NF=62;NR=91;PP=2944;QD=20;SC=AGTTCGCAAGTTAGGCTTCCT;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=450;TCF=185;TCR=265;TR=153;WE=25829394;WS=25829374;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:297,153:0.34:450
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chr20	26094483	rs146324498	CAT	C	16333.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=859;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.796;HP=7;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-14.766;NF=101;NR=168;PP=2973;ReadPosRankSum=-0.569;SC=ACACAAAAAACATGTGCAATT;SOR=0.882;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=583;TCF=219;TCR=364;TR=269;WE=26094492;WS=26094465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:432,426:0.50:858
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chr20	29625838	rs62198353	C	A	15650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-5.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=941;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.335;HP=1;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-16.973;NF=399;NR=300;PP=2962;ReadPosRankSum=6.317;SC=ATTTTCTCTCCGTTTTTAACT;SOR=0.442;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=1022;TCF=595;TCR=427;TR=699;WE=29625846;WS=29625828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:335,602:0.64:937
chr20	29625873	rs78003242	A	C	620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1240;ExcessHet=3.0103;FS=0.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.88;MQRankSum=-4.769;QD=0.50;ReadPosRankSum=5.441;SOR=0.619;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1066,166:0.13:1232
chr20	29625876	rs73611718	C	T	11153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.539;HP=1;HapScore=1;MGOF=40;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-11.106;NF=288;NR=236;PP=2962;ReadPosRankSum=5.777;SC=TGTACAGAATCGCCCTGAAAT;SOR=0.612;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=1282;TCF=695;TCR=587;TR=524;WE=29625907;WS=29625863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:787,454:0.37:1241
chr20	29625895	rs76435412	G	A	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1238;ExcessHet=3.0103;FS=1.703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.20;MQRankSum=-12.075;QD=0.28;ReadPosRankSum=-0.414;SOR=0.723;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1069,161:0.13:1230
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chr20	29632593	rs112146379	A	G	4989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=2.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=751;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.583;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.762;NF=183;NR=88;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.519;SC=TTTTTCAATGAAGACATTTTC;SOR=0.812;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=821;TCF=557;TCR=264;TR=271;WE=29632601;WS=29632583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:492,259:0.34:751
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chr20	29632674	rs138867112	T	TA	2210.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1496;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.64;MQRankSum=7.433;QD=1.55;ReadPosRankSum=1.027;SOR=0.663;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1216,208:0.15:1424
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chr20	29632714	rs76788819	CT	AG	11241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=990;ExcessHet=3.0103;FS=4.615;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.51;MQRankSum=-7.208;QD=11.38;ReadPosRankSum=1.647;SOR=1.000;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:682,306:0.31:988
chr20	29632726	rs138922778	CTATT	C	7747.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=5.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=768;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.631;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-13.987;NF=29;NR=190;PP=2970;ReadPosRankSum=-1.712;SC=GGACAGGTAGCTATTTATTTA;SOR=0.993;SbPval=0.01;Source=Platypus;TC=573;TCF=40;TCR=533;TR=219;WE=29632737;WS=29632697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:432,234:0.35:666
chr20	29632761	rs6057390	T	C	7107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=5.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=349;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.699;HP=2;HapScore=1;MGOF=43;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-13.005;NF=68;NR=216;PP=2962;ReadPosRankSum=0.172;SC=TTTCAGTAGCTAATAGAAATG;SOR=0.829;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=392;TCF=93;TCR=299;TR=284;WE=29632769;WS=29632739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,241:0.69:347
chr20	29633770	rs73621653	T	TAA	271.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.87;MQRankSum=-4.805;QD=10.87;ReadPosRankSum=0.154;SOR=0.163;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,7:0.28:25
chr20	29633794	rs10084493	C	A	1010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-7.330;NF=48;NR=2;PP=1038;ReadPosRankSum=-2.324;SC=ACAATAACCACAATTGAACAC;SOR=0.223;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=84;TCF=82;TCR=2;TR=50;WE=29633802;WS=29633784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,35:0.51:69
chr20	29633823	rs77782557	A	G	487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FS=4.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.64;MQRankSum=-1.932;QD=2.44;ReadPosRankSum=-0.667;SOR=1.268;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:167,33:0.17:200
chr20	29633916	rs2554494	G	T	12163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=733;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.228;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.469;NF=163;NR=159;PP=2962;ReadPosRankSum=1.313;SC=ATTGAAAGCCGACAGATACTG;SOR=0.484;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=825;TCF=444;TCR=381;TR=322;WE=29633960;WS=29633905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:406,327:0.45:733
chr20	29633927	rs62196372	C	A	12237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=723;ExcessHet=3.0103;FS=9.349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.49;MQRankSum=-3.148;QD=16.93;ReadPosRankSum=0.036;SOR=0.602;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:408,315:0.44:723
chr20	29633927	.	CAA	AAG	2944	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=27;MMLQ=27;MQ=48.07;NF=133;NR=155;PP=2944;QD=20;SC=ACAGATACTGCAAATGACTGG;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=830;TCF=423;TCR=407;TR=288;WE=29633960;WS=29633905;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:542,288:0.35:830
chr20	29633929	rs7509092	A	G	12016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=705;ExcessHet=3.0103;FS=12.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.29;MQRankSum=-3.479;QD=17.05;ReadPosRankSum=0.297;SOR=0.690;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:405,300:0.43:705
chr20	29633952	rs62196374	C	T	8773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=610;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.642;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.751;NF=94;NR=138;PP=2962;ReadPosRankSum=-3.255;SC=TTTGTTTCTGCCTTATCTTTT;SOR=1.023;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=721;TCF=336;TCR=385;TR=232;WE=29633960;WS=29633905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:386,224:0.37:610
chr20	29633966	rs61684852	GTTT	G,GT	8742.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=534;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.478;HP=11;HapScore=2;MGOF=40;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-11.393;NF=13;NR=223;PP=2434;ReadPosRankSum=-0.708;SC=ATCTTTTTGTGTTTTTTTTTT;SOR=0.969;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=408;TCF=36;TCR=372;TR=236;WE=29633976;WS=29633956;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.32,0.41:501
chr20	29633986	rs2379676	A	C	3686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=442;ExcessHet=3.0103;FS=26.173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.85;MQRankSum=-11.741;QD=8.34;ReadPosRankSum=-1.787;SOR=2.337;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:331,111:0.25:442
chr20	29634037	rs4006816	G	A	2726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.184;HP=5;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=3.171;NF=19;NR=77;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.515;SC=TGAAATTATTGTTTAGCTAGT;SOR=1.489;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=275;TCF=74;TCR=201;TR=96;WE=29634057;WS=29634027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,82:0.36:226
chr20	29634049	rs2379675	G	C	2483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.174;HP=1;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.191;NF=14;NR=60;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.334;SC=TTAGCTAGTAGCTAGTTTAAC;SOR=1.601;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=214;TCF=55;TCR=159;TR=74;WE=29634057;WS=29634027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,67:0.36:184
chr20	29634102	rs113531250	TC	T	387.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.92;MQRankSum=-5.357;QD=12.12;ReadPosRankSum=-3.903;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr20	29634104	rs56780525	C	T	396.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.08;MQRankSum=-5.253;QD=12.80;ReadPosRankSum=-4.283;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr20	29652000	rs62206780	T	C	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQRankSum=0.094;QD=1.79;ReadPosRankSum=-0.592;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,16:0.16:102
chr20	29652036	rs62206781	C	T	2824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-7.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.700;NF=105;NR=13;PP=2062;ReadPosRankSum=-0.073;SC=CAATTCCTTACAATAAACCTA;SOR=0.674;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=283;TCF=257;TCR=26;TR=118;WE=29652044;WS=29652026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,115:0.50:232
chr20	29652065	rs73611950	A	G	5779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=537;ExcessHet=3.0103;FS=1.370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-4.167;QD=10.86;ReadPosRankSum=1.907;SOR=0.856;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:378,154:0.29:532
chr20	29652083	rs66615221	C	T	7857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=765;ExcessHet=3.0103;FS=0.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-3.055;QD=10.33;ReadPosRankSum=2.246;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:550,211:0.28:761
chr20	29652099	rs74613177	G	T	8918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1025;ExcessHet=3.0103;FS=1.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-3.166;QD=8.78;ReadPosRankSum=2.315;SOR=0.790;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:751,265:0.26:1016
chr20	29652102	.	C	CT	9055.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.027;ClippingRankSum=0.000;DP=1048;ExcessHet=3.0103;FS=1.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-3.178;QD=8.71;ReadPosRankSum=1.963;SOR=0.821;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:770,270:0.26:1040
chr20	29652105	rs76299428	T	C	2721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1133;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=1.117;QD=2.42;ReadPosRankSum=1.277;SOR=0.719;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:975,151:0.13:1126
chr20	29652107	rs62206782	T	G	2685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1163;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=1.105;QD=2.32;ReadPosRankSum=1.556;SOR=0.736;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1004,152:0.13:1156
chr20	29652172	rs78862124	T	C	49811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1686;ExcessHet=3.0103;FS=1.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQRankSum=-4.880;QD=29.69;ReadPosRankSum=-0.337;SOR=0.831;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:371,1307:0.78:1678
chr20	29652172	.	TGGAGTGCCTCGGCAGCCTC	CAGAGTGCCTCAGCAGCCTT,CGGAGTGCCTCGGCAGCCTC	2962	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=48;MMLQ=28;MQ=59.52;NF=140,818;NR=169,891;PP=2924,2962;QD=20;SC=AGGCGACCCATGGAGTGCCTC;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=2087;TCF=1000;TCR=1087;TR=309,1709;WE=29652204;WS=29652162;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.15:2087
chr20	29652173	rs79057885	G	A	12216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1672;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQRankSum=2.116;QD=7.36;ReadPosRankSum=-0.132;SOR=0.681;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1259,402:0.24:1661
chr20	29652182	rs36076351	C	T	3096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1618;ExcessHet=3.0103;FS=3.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQRankSum=-2.488;QD=1.92;ReadPosRankSum=2.477;SOR=1.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1426,186:0.12:1612
chr20	29652183	rs71276709	G	A	11607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1585;ExcessHet=3.0103;FS=0.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQRankSum=3.141;QD=7.39;ReadPosRankSum=1.029;SOR=0.641;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1209,361:0.23:1570
chr20	29652190	rs76344754	T	G	3243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1483;ExcessHet=3.0103;FS=2.985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQRankSum=-2.003;QD=2.19;ReadPosRankSum=2.335;SOR=1.161;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1305,174:0.12:1479
chr20	29652191	rs62206784	C	T	37204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1474;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.843;HP=1;HapScore=1;MGOF=48;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.996;NF=572;NR=729;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.995;SC=TCGGCAGCCTCGTCATTGCAT;SOR=0.583;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=1849;TCF=818;TCR=1031;TR=1301;WE=29652204;WS=29652162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:503,961:0.66:1464
chr20	29652196	rs62206785	T	C	3331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1418;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQRankSum=-6.778;QD=2.36;ReadPosRankSum=-1.073;SOR=0.660;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1129,280:0.20:1409
chr20	29652236	rs62206786	G	C	19549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=846;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.266;HP=3;HapScore=1;MGOF=60;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-7.751;NF=210;NR=493;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.294;SC=CTGCAACCACGTTTCTACAGG;SOR=0.955;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=1020;TCF=307;TCR=713;TR=703;WE=29652244;WS=29652225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:207,635:0.75:842
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chr20	29966275	rs2223527	G	A	1063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FS=3.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.85;ReadPosRankSum=-1.228;SOR=0.939;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:206,70:0.25:276
chr20	29966362	rs2206383	A	C	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=239;ReadPosRankSum=1.010;SC=AACTGAGAGCAACCCAAGTTG;SOR=0.277;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=12;WE=29966370;WS=29966352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr20	29978104	rs117457030	G	A	1468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=15;PP=1018;ReadPosRankSum=0.985;SC=ATGATCCTGGGCAAACCTCCC;SOR=0.665;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=69;TCF=51;TCR=18;TR=56;WE=29978112;WS=29978094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,58:0.79:73
chr20	29978212	rs73108009	G	C	2077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FS=0.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.50;ReadPosRankSum=1.003;SOR=0.650;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:211,66:0.24:277
chr20	29978216	rs2206381	T	C	2104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FS=0.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.60;ReadPosRankSum=0.961;SOR=0.648;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:210,67:0.24:277
chr20	30038038	rs45520534	T	C	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=156;ReadPosRankSum=0.484;SC=TCCCACACTCTATCAATAAAC;SOR=0.242;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=9;WE=30038046;WS=30038028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,10:0.33:30
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chr20	30060720	rs111402081	G	GCA	3134.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=0.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.690;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=39;PP=2321;ReadPosRankSum=-1.258;SC=GCACACATGTGCACACACACA;SOR=0.759;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=85;TCF=24;TCR=61;TR=56;WE=30060728;WS=30060710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,145:0.84:172
chr20	30060739	.	C	CAT	753	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MMLQ=28;MQ=60.28;NF=16;NR=39;PP=753;QD=13.8;SC=CACACACACACATGCACACGA;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=113;TCF=40;TCR=73;TR=55;WE=30060747;WS=30060729;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:58,55:0.49:113
chr20	30064331	rs1006459	A	G	16007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=587;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=268;NR=291;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.438;SC=CCACGGGGCCACCAGCCTGGC;SOR=0.258;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=561;TCF=268;TCR=293;TR=559;WE=30064339;WS=30064308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,586:1.00:587
chr20	30070239	rs2233832	C	A	5992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.454;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=108;NR=144;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.232;SC=TGCCCATCATCCTCGTGGGCA;SOR=0.754;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=335;TCF=144;TCR=191;TR=252;WE=30070247;WS=30070229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,267:0.75:354
chr20	30071844	rs2233834	C	T	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.99;ReadPosRankSum=0.026;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,15:0.17:86
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chr20	30147270	rs6059981	T	G	472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.829;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=315;ReadPosRankSum=-0.186;SC=CTTTCTGCTGTCACTTGAGAG;SOR=1.039;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=52;TCR=4;TR=18;WE=30147278;WS=30147260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,20:0.33:60
chr20	30147554	rs6058103	C	A	1265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FS=0.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.07;ReadPosRankSum=0.510;SOR=0.766;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:230,81:0.26:311
chr20	30153934	rs2376862	A	G	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.81;ReadPosRankSum=-1.465;SOR=0.556;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,11:0.13:82
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chr20	30157026	rs4607	A	G	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.02;ReadPosRankSum=1.005;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,15:0.33:45
chr20	30193110	rs6060263	T	C	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=3.152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.86;ReadPosRankSum=-0.505;SOR=0.242;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,14:0.24:58
chr20	30193226	rs11545368	C	G	6577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=377;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.287;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=156;NR=120;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.156;SC=CCACCGCCGCCGCGGGCCCCA;SOR=0.488;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=345;TCF=199;TCR=146;TR=276;WE=30193234;WS=30193216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,298:0.79:376
chr20	30193538	rs15817	A	G	1211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FS=2.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.000;QD=3.95;ReadPosRankSum=0.082;SOR=0.878;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:232,75:0.24:307
chr20	30194899	rs6058197	A	G	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.761;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=156;ReadPosRankSum=1.327;SC=ACAGCTGCCGAGACACCTGCT;SOR=1.061;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=55;TCF=47;TCR=8;TR=13;WE=30194907;WS=30194889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,11:0.20:54
chr20	30195166	rs6088736	C	G	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=4.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.00;ReadPosRankSum=1.814;SOR=1.107;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,33:0.25:131
chr20	30226690	rs45557936	G	A	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FS=2.894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.45;ReadPosRankSum=1.141;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:157,52:0.25:209
chr20	30226764	rs6088857	G	C	908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.00;ReadPosRankSum=-0.867;SOR=0.706;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:238,65:0.21:303
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chr20	30232452	rs6120970	C	T	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.440;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=2;PP=510;ReadPosRankSum=-0.056;SC=ATACTTCAACCCTGGAGTATC;SOR=0.941;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=94;TCF=86;TCR=8;TR=29;WE=30232460;WS=30232442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,31:0.31:101
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chr20	30371454	rs6060943	A	C	1885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.742;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=11;PP=1339;ReadPosRankSum=0.535;SC=TTGTTTGTGAAGTTTTCATTT;SOR=1.261;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=92;TCF=76;TCR=16;TR=71;WE=30371462;WS=30371444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,73:0.77:95
chr20	30381758	rs1062794	G	C	8760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=134;NR=147;PP=2965;SC=GCCCTTTCTCGTTTGATTCTC;SOR=0.885;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=281;TCF=134;TCR=147;TR=281;WE=30381766;WS=30381748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,316:1.00:316
chr20	30382108	rs6060952	T	G	2821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=15;PP=2050;SC=TTTGAAAGGTTTCCTTCCTTA;SOR=2.783;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=71;TCR=15;TR=86;WE=30382116;WS=30382098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr20	30382315	rs3203770	A	G	888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=381;ExcessHet=3.0103;FS=0.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.33;ReadPosRankSum=0.173;SOR=0.736;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:308,73:0.19:381
chr20	30385192	rs6058463	C	T	727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FS=5.651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.87;ReadPosRankSum=0.178;SOR=1.211;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:143,45:0.24:188
chr20	30408435	rs12480305	T	C	2631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.685;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=63;PP=1763;ReadPosRankSum=-0.067;SC=TAGGCATGGTTATCATCACAT;SOR=1.175;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=139;TCF=57;TCR=82;TR=102;WE=30408443;WS=30408425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,110:0.74:149
chr20	30409452	rs6058469	T	C	7741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=466;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.090;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=154;NR=182;PP=2962;ReadPosRankSum=0.139;SC=CGAGGGGGATTGAGTTCCAGG;SOR=0.910;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=434;TCF=205;TCR=229;TR=336;WE=30409460;WS=30409442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,353:0.76:466
chr20	30409573	rs6060970	C	T	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=3.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.06;ReadPosRankSum=-2.245;SOR=0.361;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,33:0.56:59
chr20	30411427	rs6060971	T	C	5048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.101;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=108;PP=2962;ReadPosRankSum=1.602;SC=GGACAGAGAGTACACCGGGCT;SOR=0.596;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=265;TCF=122;TCR=143;TR=204;WE=30411435;WS=30411417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,217:0.77:282
chr20	30414334	rs11907651	G	A	1149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=4;PP=925;ReadPosRankSum=-1.931;SC=GCCTGTTCAAGGGTGCGGGTA;SOR=0.646;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=61;TCF=56;TCR=5;TR=41;WE=30414342;WS=30414324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,42:0.67:63
chr20	30414560	rs41293108	C	G	9657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=615;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.436;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=186;NR=204;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.885;SC=GGGGGTACCACCAGGCACGGA;SOR=0.715;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=573;TCF=284;TCR=289;TR=390;WE=30414568;WS=30414550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:204,407:0.67:611
chr20	30419051	rs4518038	A	G	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=219;ReadPosRankSum=-0.867;SC=CACCTCCCCTATCCCTCAGTC;SOR=0.619;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=43;TCF=7;TCR=36;TR=16;WE=30419059;WS=30419041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,16:0.35:46
chr20	30419954	rs6060980	A	G	6543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=386;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.433;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=119;NR=163;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.175;SC=CGCTGGATTCAGGGTGGGGAG;SOR=0.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=373;TCF=160;TCR=213;TR=282;WE=30419962;WS=30419944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,290:0.75:386
chr20	30420059	rs28763881	C	T	816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.056;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=29;PP=661;ReadPosRankSum=1.111;SC=GGGCCCTGTCCGGAAGACAGG;SOR=1.981;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=30;WE=30420067;WS=30420049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,30:0.71:42
chr20	30421459	rs6089093	C	T	1115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=343;ExcessHet=3.0103;FS=0.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.26;ReadPosRankSum=-0.903;SOR=0.601;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:261,81:0.24:342
chr20	30433352	rs6121246	C	T	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=345;ReadPosRankSum=0.000;SC=GCATGCTGGCCGGGCTGCCAG;SOR=0.620;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=102;TCF=29;TCR=73;TR=29;WE=30433360;WS=30433342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,32:0.29:109
chr20	30436088	rs8118150	G	A	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.913;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=62;ReadPosRankSum=-1.014;SC=GTGGAAGGCCGCGATCCACCT;SOR=0.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=37;TCR=2;TR=9;WE=30436096;WS=30436078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,11:0.26:42
chr20	30436641	rs12480322	G	C	7013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.496;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=99;NR=62;PP=2705;ReadPosRankSum=0.712;SC=TTGGGGTGCTGTGTGGGGCCC;SOR=0.755;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=236;TCF=144;TCR=92;TR=161;WE=30436649;WS=30436631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,177:0.68:259
chr20	30436666	rs12480325	G	A	8116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=118;NR=97;PP=2962;ReadPosRankSum=0.164;SC=CCTCCTCACCGAAGCACAGAC;SOR=0.698;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=313;TCF=171;TCR=142;TR=215;WE=30436674;WS=30436656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,234:0.69:340
chr20	30437522	rs3746599	A	G	4030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=54;PP=2670;SC=GCGCTGGGCAATGGGTCGGGG;SOR=1.058;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=86;TCR=54;TR=140;WE=30437530;WS=30437512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr20	30449181	rs12569	G	A	997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.553;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=28;PP=657;ReadPosRankSum=0.484;SC=AGTCGGAAGTGGGGAGCCACG;SOR=0.646;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=185;TCF=104;TCR=81;TR=61;WE=30449189;WS=30449171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,63:0.31:203
chr20	30449325	rs947310	C	G	3021.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=60;PP=1834;SC=AGGCGCTGCACGGTTCCCTCG;SOR=1.148;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=42;TCR=60;TR=102;WE=30449333;WS=30449315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr20	30449516	rs11417441	G	GC	373.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=4;PP=296;SC=GTCAAGGCCGGCGCGGGGCGG;SOR=0.859;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=7;WE=30449524;WS=30449506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
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chr20	30598372	rs117798563	G	A	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=1.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.99;ReadPosRankSum=-0.547;SOR=0.883;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,5:0.24:21
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chr20	30729488	rs6089193	T	C	15677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=562;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=254;NR=280;PP=2965;ReadPosRankSum=0.207;SC=CCTGTGCTCCTTGCTGCCTCA;SOR=0.838;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=536;TCF=255;TCR=281;TR=534;WE=30729496;WS=30729478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,560:1.00:562
chr20	30746248	rs6061195	T	C	7031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=125;NR=130;PP=2965;SC=TCTCGTTCTGTGGCAGCATCC;SOR=0.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=256;TCF=126;TCR=130;TR=255;WE=30746256;WS=30746238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,272:1.00:272
chr20	30747679	rs4911553	C	T	1251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=4;PP=1016;SC=GCCAGGCCCACGGGCCCTGAT;SOR=4.073;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=37;TCR=4;TR=41;WE=30747687;WS=30747669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr20	30753270	rs14316	T	C	7176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=93;NR=138;PP=2965;SC=ACGGCCAAGCTTGCTCCGTCC;SOR=1.234;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=231;TCF=93;TCR=138;TR=231;WE=30753278;WS=30753260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr20	30777800	rs11907716	T	C	4292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=67;PP=1982;SC=CGCTGGCTCCTGCCCGAGTCC;SOR=0.948;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=138;TCF=70;TCR=68;TR=137;WE=30777808;WS=30777790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr20	30777860	rs11907235	A	G	3361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=64;NR=50;PP=1857;SC=GGACCCGGCCATTTTCCAGGC;SOR=0.741;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=64;TCR=50;TR=114;WE=30777868;WS=30777850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr20	30795819	rs1923095	T	C	11546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=433;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=232;NR=179;PP=2965;SC=CGGGGATGCCTGCGGGCTCCT;SOR=0.945;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=411;TCF=232;TCR=179;TR=411;WE=30795827;WS=30795809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,433:1.00:433
chr20	30914706	rs3746606	C	T	2019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=41;PP=1188;SC=CTATTAACTTCAAGTATATTT;SOR=1.457;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=28;TCR=41;TR=69;WE=30914714;WS=30914696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr20	30954295	rs2295454	A	G	11588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=441;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=176;NR=238;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.261;SC=GTTGCTTAACATGAGGGTTTC;SOR=1.058;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=416;TCF=177;TCR=239;TR=414;WE=30954303;WS=30954285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,439:1.00:441
chr20	31016314	rs3818190	A	G	735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=18;PP=478;SC=AGCTGTGAACATGTTCAGAGA;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=31016322;WS=31016304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr20	31019024	rs2295765	C	T	15622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=572;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=276;NR=273;PP=2965;SC=GCAGATAACTCCTGGGTAGCT;SOR=0.700;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=549;TCF=276;TCR=273;TR=549;WE=31019032;WS=31019014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,572:1.00:572
chr20	31022959	rs6058694	T	C	8958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=184;NR=120;PP=2965;SC=GGTCCCATTCTGTCTCTAGTG;SOR=1.161;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=304;TCF=184;TCR=120;TR=304;WE=31022967;WS=31022949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,323:1.00:323
chr20	31024274	rs4911231	T	C	9926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=348;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=152;NR=169;PP=2965;SC=CACAGGACAGTAATTCAAATG;SOR=0.853;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=321;TCF=152;TCR=169;TR=321;WE=31024282;WS=31024264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,348:1.00:348
chr20	31025163	rs2295764	A	G	6142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=115;PP=2965;SC=CATGGGAAACATTGTATATTT;SOR=0.846;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=215;TCF=100;TCR=115;TR=215;WE=31025171;WS=31025153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr20	31025231	rs2295763	T	C	2045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=50;PP=1591;SC=ATCATTGATATAATACTCTTT;SOR=4.174;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=5;TCR=50;TR=55;WE=31025239;WS=31025221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr20	31074372	rs6141734	G	A	4583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=113;NR=41;PP=2965;SC=TGGGACTCTGGTTTGCCATTA;SOR=2.198;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=156;TCF=114;TCR=42;TR=154;WE=31074380;WS=31074362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr20	31097877	rs293566	T	C	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.858;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=65;ReadPosRankSum=0.349;SC=CTCCTGCAGCTCAAACTACTT;SOR=0.037;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=6;WE=31097885;WS=31097867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr20	31099311	rs159428	T	C	4727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=96;PP=2803;SC=GCGGGCCTGTTGCCCACATGG;SOR=0.965;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=172;TCF=76;TCR=96;TR=172;WE=31099319;WS=31099301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
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chr20	31189411	rs2029086	A	G	2036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.278;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=17;PP=1446;ReadPosRankSum=-1.676;SC=AGGGAGCATGAAGCACCTTGC;SOR=1.211;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=105;TCF=79;TCR=26;TR=74;WE=31189419;WS=31189401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,78:0.71:110
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chr20	31291161	rs9421	C	T	3519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=27;PP=2347;SC=GGAACGGGGCCAGGGGAGATG;SOR=2.283;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=114;TCF=86;TCR=28;TR=113;WE=31291169;WS=31291151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr20	31291625	rs28620238	A	G	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.49;ReadPosRankSum=-0.620;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:97,34:0.26:131
chr20	31291919	rs35093495	GGGCA	G	920.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.13;MQRankSum=1.453;NF=2;NR=19;PP=742;ReadPosRankSum=0.285;SC=GATGACAACTGGGCAAAGAAA;SOR=0.610;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=67;TCF=3;TCR=64;TR=21;WE=31291930;WS=31291909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,27:0.33:82
chr20	31292298	.	CAAAAA	C	73.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.068;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=23.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.30;ReadPosRankSum=0.910;SOR=1.394;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,7:0.22:32
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chr20	31387849	rs660291	T	C	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=74;ReadPosRankSum=-1.275;SC=ATTGAACGCATGTGATACAGT;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=6;WE=31387857;WS=31387839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr20	31446645	rs853853	A	G	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FS=1.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.43;ReadPosRankSum=1.648;SOR=0.561;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:151,48:0.24:199
chr20	31451788	rs372464707	AT	A	35.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=4.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.19;MQRankSum=2.001;QD=1.08;ReadPosRankSum=-0.089;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,7:0.21:33
chr20	31466347	rs13037174	C	T	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.757;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.279;NF=10;NR=1;PP=212;ReadPosRankSum=-1.947;SC=GACGGAGTCTCGCTCTGTCGC;SOR=2.303;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=11;WE=31466355;WS=31466338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr20	31466364	rs13037187	C	T	858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.485;NF=18;NR=3;PP=450;ReadPosRankSum=-1.520;SC=TCGCCCAGGTCGGACTGCGGA;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=21;WE=31466372;WS=31466354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,20:0.67:30
chr20	31466387	rs13037762	A	G	1150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.817;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=8;PP=565;ReadPosRankSum=0.295;SC=GCAGTGGCGCAATCTCGGCTC;SOR=0.267;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=55;TCF=45;TCR=10;TR=37;WE=31466395;WS=31466377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,36:0.69:52
chr20	31466534	rs13037496	C	T	7674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=493;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.942;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=169;NR=158;PP=2962;ReadPosRankSum=0.938;SC=TTACATGATGCGTGAGTTCCA;SOR=0.593;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=463;TCF=232;TCR=231;TR=327;WE=31466542;WS=31466524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,353:0.72:492
chr20	31473483	rs6119300	G	C	1962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.050;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=50;PP=1331;ReadPosRankSum=0.831;SC=ACACATGGGTGATTGGAGAGC;SOR=1.128;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=103;TCF=32;TCR=71;TR=71;WE=31473491;WS=31473473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,78:0.68:114
chr20	31480938	rs2377733	C	T	5176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.055;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.629;NF=129;NR=92;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.905;SC=TGAGCCACCGCGCCCAGCCCA;SOR=0.576;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=313;TCF=186;TCR=127;TR=221;WE=31480946;WS=31480928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,235:0.71:330
chr20	31480961	rs2377734	C	T	6291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=405;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.570;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=145;NR=113;PP=2962;ReadPosRankSum=0.453;SC=CAACCTCTTCCGTCTCCATCT;SOR=0.616;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=376;TCF=214;TCR=162;TR=258;WE=31480969;WS=31480951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,279:0.69:403
chr20	31484417	rs11167186	T	A	8947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=526;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.274;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=160;NR=209;PP=2962;ReadPosRankSum=0.511;SC=AAAGTGGATTTACTCCCTGGG;SOR=0.807;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=499;TCF=218;TCR=281;TR=369;WE=31484425;WS=31484407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,387:0.74:524
chr20	31486206	rs6058948	A	G	1181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.898;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=9;PP=847;ReadPosRankSum=-0.404;SC=ATCTCTGGGCACCTCCAGTCC;SOR=1.314;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=68;TCF=55;TCR=13;TR=50;WE=31486214;WS=31486196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,52:0.72:72
chr20	31494382	rs6120033	G	A	2099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=41;PP=1099;ReadPosRankSum=1.634;SC=TCAGTGCTGCGTTTAAGGAAA;SOR=0.690;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=168;TCF=93;TCR=75;TR=90;WE=31494390;WS=31494372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,99:0.53:186
chr20	31495977	rs17370942	C	T	1907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.370;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=17;PP=1261;ReadPosRankSum=-0.396;SC=CTTGGACGGACGATGTGCCCT;SOR=0.415;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=100;TCF=79;TCR=21;TR=73;WE=31495985;WS=31495967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,77:0.75:102
chr20	31505189	rs13043425	C	T	10389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=610;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.605;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=246;NR=174;PP=2962;ReadPosRankSum=1.194;SC=GGCCAAGTACCGGAACCAGTT;SOR=0.775;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=575;TCF=335;TCR=240;TR=420;WE=31505197;WS=31505179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,447:0.73:609
chr20	31505292	rs13037781	C	T	14672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=872;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.608;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=284;NR=325;PP=2962;ReadPosRankSum=1.779;SC=AGGAGCCCCTCGCCCTTGCAG;SOR=0.596;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=812;TCF=374;TCR=438;TR=609;WE=31505300;WS=31505282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:219,653:0.75:872
chr20	31518298	rs6058961	A	G	6733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=384;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.402;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=165;NR=116;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.288;SC=TCCCTCCATGAGAATGGAGGC;SOR=0.526;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=363;TCF=217;TCR=146;TR=281;WE=31518306;WS=31518288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,298:0.78:383
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chr20	31573769	rs13040459	T	G	1544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.903;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=39;PP=1033;ReadPosRankSum=0.447;SC=ATCCCACCTTTGATCCCCTGT;SOR=0.876;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=84;TCF=31;TCR=53;TR=60;WE=31573777;WS=31573759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,65:0.70:93
chr20	31577394	rs6058991	G	A	816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.98;ReadPosRankSum=1.958;SOR=0.690;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:151,54:0.26:205
chr20	31577572	rs6088057	C	T	525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=1.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQRankSum=2.503;QD=3.58;ReadPosRankSum=1.050;SOR=0.522;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,36:0.24:147
chr20	31577582	rs141745544	CAG	C	935.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.920;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.363;NF=0;NR=22;PP=1383;ReadPosRankSum=-0.747;SC=CGGGAGGTAACAGGGGGCTGC;SOR=0.546;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=82;TCF=2;TCR=80;TR=22;WE=31577591;WS=31577562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,30:0.27:112
chr20	31583384	rs2070310	A	G	1139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=533;ExcessHet=3.0103;FS=0.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.14;ReadPosRankSum=0.425;SOR=0.782;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:431,101:0.19:532
chr20	31583966	rs2070311	T	G	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.523;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=72;ReadPosRankSum=0.235;SC=CCAGAGAGAATAGGTGACTTG;SOR=0.061;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=6;WE=31583974;WS=31583956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr20	31584178	rs6141862	G	A	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.98;ReadPosRankSum=1.333;SOR=0.707;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:162,44:0.21:206
chr20	31584277	rs117098293	T	G	1119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.252;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=30;PP=718;ReadPosRankSum=-0.070;SC=TCATCCACTTTCCTGTTGACT;SOR=1.034;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=56;TCF=16;TCR=40;TR=41;WE=31584285;WS=31584267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,45:0.73:62
chr20	31585351	rs452299	C	G	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=200;ReadPosRankSum=0.038;SC=TGAGGGGCCCCATTTGGTGAG;SOR=0.565;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=56;TCF=52;TCR=4;TR=17;WE=31585359;WS=31585341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,17:0.29:58
chr20	31585415	rs190097	T	C	1403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=29;PP=737;ReadPosRankSum=1.302;SC=ACCTGTCAGCTGTGGGGCCTG;SOR=0.471;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=229;TCF=150;TCR=79;TR=75;WE=31585423;WS=31585405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,80:0.32:250
chr20	31585545	rs440139	C	T	1216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=396;ExcessHet=3.0103;FS=0.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.07;ReadPosRankSum=0.369;SOR=0.773;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:306,90:0.23:396
chr20	31587752	rs414191	G	C	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FS=3.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.34;ReadPosRankSum=0.112;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:235,44:0.16:279
chr20	31587793	rs15850	A	G	627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.99;ReadPosRankSum=-0.943;SOR=0.718;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:255,61:0.19:316
chr20	31590530	rs41305793	T	G	2624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.864;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=77;PP=2019;ReadPosRankSum=0.465;SC=TGCAGAGACCTAGGGAGCACC;SOR=1.337;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=135;TCF=33;TCR=102;TR=98;WE=31590538;WS=31590520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,99:0.72:138
chr20	31592242	rs6088062	C	T	2352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.308;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=54;PP=1398;ReadPosRankSum=-1.225;SC=TGAAAAGTGCCAAGTGGAATC;SOR=0.819;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=146;TCF=68;TCR=78;TR=97;WE=31592250;WS=31592232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,103:0.65:159
chr20	31596472	rs6088066	A	T	6637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=429;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.696;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=161;NR=114;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.775;SC=CGACTCAACAAGGCAGCATTG;SOR=0.931;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=397;TCF=223;TCR=174;TR=275;WE=31596480;WS=31596462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,294:0.69:428
chr20	31603405	.	TA	T	129.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.148;ClippingRankSum=0.000;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.41;ReadPosRankSum=-0.231;SOR=0.193;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr20	31619357	rs4911286	C	T	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.192;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=149;ReadPosRankSum=0.380;SC=CCCAGAAACACCCAGGGGGCT;SOR=1.460;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=10;WE=31619365;WS=31619347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr20	31619578	rs6059027	A	G	1235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=393;ExcessHet=3.0103;FS=0.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.15;ReadPosRankSum=-2.449;SOR=0.723;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:298,94:0.24:392
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chr20	31621583	rs2070316	G	A	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=2.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.20;ReadPosRankSum=1.472;SOR=0.220;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,9:0.16:58
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chr20	31622768	rs6059032	C	A	2389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=706;ExcessHet=3.0103;FS=0.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.41;ReadPosRankSum=-0.226;SOR=0.729;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:529,172:0.25:701
chr20	31622839	rs6059033	T	C	2991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=744;ExcessHet=3.0103;FS=0.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.05;ReadPosRankSum=0.889;SOR=0.678;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:541,197:0.27:738
chr20	31624368	rs6059035	C	T	1621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=392;ExcessHet=3.0103;FS=0.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.14;ReadPosRankSum=-0.502;SOR=0.774;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:290,102:0.26:392
chr20	31626558	rs6088078	G	C	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.90;ReadPosRankSum=-1.302;SOR=0.623;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,13:0.20:64
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chr20	31627291	rs4911287	A	G	638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=2.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.73;ReadPosRankSum=0.317;SOR=1.049;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,36:0.27:135
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chr20	31651583	rs403461	A	G	623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=18;PP=511;SC=GCAGGATCTCAGGGTCCTTTA;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=31651591;WS=31651573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr20	31652292	rs4911290	G	A	2178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=592;ExcessHet=3.0103;FS=0.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.69;ReadPosRankSum=-1.617;SOR=0.772;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:441,149:0.25:590
chr20	31652409	rs79047848	C	T	8158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=471;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=150;NR=176;PP=2962;ReadPosRankSum=3.292;SC=TAGGGGATGCCGGATCAAGGC;SOR=0.748;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=443;TCF=209;TCR=234;TR=326;WE=31652417;WS=31652399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,344:0.73:471
chr20	31656632	rs6057717	C	G	2431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=632;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.87;ReadPosRankSum=2.420;SOR=0.690;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:476,153:0.24:629
chr20	31656837	rs2424938	G	A	2987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=80;PP=2192;SC=GGGGGTGACTGTCTCCAGGAC;SOR=3.023;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=16;TCR=80;TR=96;WE=31656845;WS=31656827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr20	31660489	rs11700200	T	C	5410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.538;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=127;NR=102;PP=2962;ReadPosRankSum=1.255;SC=TCCCCACCAATGTACCTTTGT;SOR=0.507;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=307;TCF=176;TCR=131;TR=229;WE=31660497;WS=31660479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,242:0.74:325
chr20	31661650	rs7267265	G	A	868.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.6027;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=29;PP=717;ReadPosRankSum=0.849;SC=CCTGTATCTCGGTATCTCCTG;SOR=1.132;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=32;WE=31661658;WS=31661640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,31:0.89:35
chr20	31671209	rs13036385	G	C	8635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=531;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=196;NR=164;PP=2962;ReadPosRankSum=0.025;SC=TTCCATGTCCGAGGACCCCCC;SOR=0.702;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=499;TCF=271;TCR=228;TR=360;WE=31671221;WS=31671199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,379:0.72:530
chr20	31671599	rs4339026	A	G	2732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.415;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=52;PP=1576;ReadPosRankSum=-0.320;SC=CTCCTTGGTGATGGAGGACTT;SOR=0.669;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=144;TCF=76;TCR=68;TR=108;WE=31671607;WS=31671589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,120:0.76:157
chr20	31671663	rs2424945	T	C	2322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.403;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=52;PP=1175;ReadPosRankSum=2.350;SC=TCCTCAGCACTGTGCAAGGCA;SOR=0.835;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=139;TCF=66;TCR=73;TR=97;WE=31671671;WS=31671653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,106:0.70:151
chr20	31671693	rs3926669	C	T	1803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.020;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=43;PP=1032;ReadPosRankSum=-0.120;SC=AAGGAGGGGACGGGTTCTCCC;SOR=1.121;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=101;TCF=42;TCR=59;TR=71;WE=31671701;WS=31671683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,77:0.71:109
chr20	31671766	rs1547004	G	A	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=100;ReadPosRankSum=2.359;SC=GTTGCCGGAGGGAAGGTCTTC;SOR=0.892;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=7;WE=31671774;WS=31671756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr20	31673846	rs2070325	A	G	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FS=4.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.96;ReadPosRankSum=-0.151;SOR=1.038;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:219,65:0.23:284
chr20	31676622	rs2424949	G	T	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.23;ReadPosRankSum=-0.575;SOR=0.798;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,14:0.18:78
chr20	31676804	rs2889732	A	C	2321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=597;ExcessHet=3.0103;FS=0.601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.90;ReadPosRankSum=0.074;SOR=0.597;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:441,154:0.26:595
chr20	31677474	rs7271727	A	G	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.67;ReadPosRankSum=2.154;SOR=0.097;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,7:0.23:31
chr20	31677474	.	AGT	GGC	46	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=0;NR=7;PP=46;QD=14.2096964089;SC=AGGCCCTTGAAGTGAGGAGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=7;WE=31677484;WS=31677464;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:26,7:0.21:33
chr20	31677476	rs6057722	T	C	930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=31;PP=626;SC=GCCCTTGAAGTGAGGAGTGGC;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=31;WE=31677484;WS=31677464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr20	31678534	rs2070326	T	C	3799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.525;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=61;PP=2157;ReadPosRankSum=-0.318;SC=TCTGGGGATATTGGGAAGTGT;SOR=0.777;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=214;TCF=124;TCR=90;TR=151;WE=31678542;WS=31678524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,168:0.71:237
chr20	31680234	rs2070327	C	T	1247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.249;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=16;PP=832;ReadPosRankSum=0.732;SC=TTCTCCCTCCCTGTGACCCCT;SOR=1.143;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=71;TCF=48;TCR=23;TR=52;WE=31680242;WS=31680224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,56:0.73:77
chr20	31680486	rs373884591	G	T	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=0.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.22;ReadPosRankSum=-0.216;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:124,36:0.22:160
chr20	31682778	rs2024934	C	A	893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=10;PP=592;ReadPosRankSum=1.788;SC=AGGGGTCTTTCAGGGAGAGAA;SOR=0.711;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=62;TCF=46;TCR=16;TR=37;WE=31682786;WS=31682768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,39:0.61:64
chr20	31685405	rs13041016	C	T	1689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=17;PP=1125;ReadPosRankSum=0.267;SC=GTCCATCTGGCCTGGTGCCTG;SOR=0.593;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=90;TCF=69;TCR=21;TR=69;WE=31685413;WS=31685395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,72:0.77:94
chr20	31688241	rs11699009	T	C	5130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.952;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=115;NR=99;PP=2962;ReadPosRankSum=0.792;SC=GGACACAGAATTCTTGGCCTC;SOR=0.762;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=293;TCF=157;TCR=136;TR=214;WE=31688249;WS=31688231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,224:0.72:313
chr20	31688260	rs11696307	C	T	4861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.459;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=113;NR=100;PP=2946;ReadPosRankSum=0.814;SC=TCATTTTCCACAGAAGGAGAT;SOR=0.659;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=291;TCF=154;TCR=137;TR=213;WE=31688268;WS=31688250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,219:0.71:307
chr20	31688330	rs11696310	C	T	2850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.732;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=67;PP=1762;ReadPosRankSum=0.245;SC=GGGGTCCTGACGGTGCTGGTG;SOR=0.599;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=149;TCF=63;TCR=86;TR=117;WE=31688338;WS=31688320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,124:0.78:158
chr20	31811551	rs725914	C	T	3319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=27;PP=2357;SC=CCCAGGCCTCCGAATCCCAAG;SOR=2.142;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=83;TCR=27;TR=110;WE=31811569;WS=31811541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr20	31814348	rs1570033	G	A	11861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=428;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=157;NR=239;PP=2965;SC=CCGAGGGTTAGGGCATATATC;SOR=1.242;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=397;TCF=158;TCR=239;TR=396;WE=31814356;WS=31814338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,427:1.00:427
chr20	31828265	rs6059187	A	G	6292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=81;NR=126;PP=2965;SC=TGGAAAGCTGAGACAATGAGA;SOR=1.278;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=208;TCF=82;TCR=126;TR=207;WE=31828273;WS=31828255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr20	31828336	.	A	AGATG	579.27	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.724;ClippingRankSum=0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.20;MQRankSum=0.516;QD=36.20;ReadPosRankSum=-1.525;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,15:0.94:16
chr20	31829083	rs2273529	G	A	694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=2;PP=604;SC=GACAAGGCTCGGCTTTAGTGA;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=31829091;WS=31829073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr20	31873821	rs3746393	C	T	995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=2;PP=734;SC=GCCTCAGGTCCCTCTGTGCTC;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=29;WE=31873829;WS=31873811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr20	31876485	rs2295576	T	C	825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=3;PP=630;SC=AGCCTGGAGCTCCCACCAAGC;SOR=2.985;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=29;WE=31876493;WS=31876475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr20	31876681	rs1078761	A	G	11186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=431;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=215;NR=194;PP=2965;SC=CCTGAAGCACATCATCTGGTG;SOR=0.785;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=409;TCF=215;TCR=194;TR=409;WE=31876689;WS=31876671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,431:1.00:431
chr20	31877898	rs1884885	C	T	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.490;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=157;ReadPosRankSum=-0.925;SC=AAGAGAGTTCCGAGCAGAGAG;SOR=0.373;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=43;TCF=9;TCR=34;TR=15;WE=31877906;WS=31877888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,15:0.33:45
chr20	31892541	rs71338472	G	GC	2938.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.320;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.641;NF=43;NR=21;PP=2329;ReadPosRankSum=-0.155;SC=GTTCACTGGAGCCCGCACTGT;SOR=1.290;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=107;TCF=63;TCR=44;TR=64;WE=31892549;WS=31892531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,100:0.72:139
chr20	31894789	rs17856249	C	G	3726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=93;PP=2469;ReadPosRankSum=0.316;SC=TCCTCACTGACCAAGGTGAGT;SOR=0.685;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=235;TCF=93;TCR=142;TR=154;WE=31894797;WS=31894779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,164:0.66:248
chr20	31897554	rs1999663	G	C	8907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=135;NR=176;PP=2965;SC=TGGAAACCCAGCTCTCCTGTC;SOR=1.084;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=311;TCF=135;TCR=176;TR=311;WE=31897562;WS=31897544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,329:1.00:329
chr20	31954890	rs291674	C	G	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=4.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=171;ReadPosRankSum=-1.284;SC=GCACAGAGGGCGACCATGTTC;SOR=0.483;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=2;TCR=44;TR=12;WE=31954898;WS=31954880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,12:0.27:45
chr20	31981849	rs291700	T	C	1790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=662;ExcessHet=3.0103;FS=0.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.73;ReadPosRankSum=1.553;SOR=0.778;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:510,147:0.22:657
chr20	32000351	rs291694	A	G	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=1.642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.98;ReadPosRankSum=0.155;SOR=0.321;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,9:0.16:57
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chr20	32212690	rs3803939	C	T	5328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.677;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=121;NR=88;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.485;SC=TCATGAATCCCGGGGGCCAAT;SOR=0.497;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=282;TCF=168;TCR=114;TR=209;WE=32212698;WS=32212680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,223:0.74:303
chr20	32232296	rs45563732	C	T	5844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=371;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.868;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=137;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.576;SC=AGAGCCCCCACGGCCAGGGCC;SOR=0.625;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=349;TCF=147;TCR=202;TR=240;WE=32232304;WS=32232279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,254:0.69:369
chr20	32245546	rs13037669	T	C	305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=4;PP=176;SC=AGGAGACAAGTCCTGGTCTTT;SOR=1.022;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=11;WE=32245554;WS=32245538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr20	32245869	rs3746461	C	G	1113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.284;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=25;PP=610;ReadPosRankSum=2.094;SC=AGTGACCTCGCTCTCCCCACT;SOR=0.447;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=60;TCF=21;TCR=39;TR=40;WE=32245877;WS=32245859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,46:0.68:68
chr20	32248163	rs3746460	C	T	4604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.410;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=97;PP=2484;ReadPosRankSum=0.482;SC=GCAGGAAGCGCGTCACAAACT;SOR=0.885;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=242;TCF=113;TCR=129;TR=179;WE=32248171;WS=32248153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,206:0.75:274
chr20	32255233	rs3746459	T	C	175.96	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5319;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=79;ReadPosRankSum=-0.282;SC=GACTCGCCGTTGGCGCCGCCC;SOR=0.446;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=6;WE=32255241;WS=32255228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr20	32295541	rs910397	C	T	2615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.282;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=40;PP=1579;ReadPosRankSum=-0.283;SC=TTGTTATAGACGAGGAAGTCT;SOR=0.452;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=142;TCF=91;TCR=51;TR=102;WE=32295549;WS=32295531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,114:0.72:158
chr20	32298323	rs2626529	C	T	716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.366;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=8;PP=580;ReadPosRankSum=-0.378;SC=TGCTGAACCACGCCCCCTTCA;SOR=0.286;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=49;TCF=39;TCR=10;TR=34;WE=32298331;WS=32298313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,31:0.70:44
chr20	32328968	rs6087514	G	T	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=5.651;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=299;ReadPosRankSum=1.515;SC=CCTCCCAGCCGGGATCTTTGG;SOR=2.448;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=15;WE=32328976;WS=32328958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,15:0.79:19
chr20	32368929	rs2889785	T	C	2043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=8;PP=1570;SC=GAACAAGAGATGATGGCGCTC;SOR=3.816;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=56;TCR=8;TR=64;WE=32368937;WS=32368919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr20	32378732	rs2747565	G	A	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FS=1.671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.79;ReadPosRankSum=0.299;SOR=0.826;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:244,69:0.22:313
chr20	32379263	rs2626551	T	C	2637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=55;PP=1516;SC=AGCTGCAGGCTGGGGCCGAGG;SOR=1.247;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=39;TCR=55;TR=94;WE=32379271;WS=32379253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr20	32660190	rs10485504	C	T	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=472;ReadPosRankSum=-1.853;SC=GCTGCTATCACTATCCAGTTC;SOR=1.362;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=22;WE=32660198;WS=32660180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,24:0.73:33
chr20	32664864	rs10649600	C	CCAG	6588.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=33;PP=2983;SC=GGAGGTGGCGCCGGCGGCGGC;SOR=1.847;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=92;TCF=55;TCR=37;TR=83;WE=32664872;WS=32664854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr20	32891200	rs819146	G	T	8630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=111;NR=191;PP=2965;SC=TATCTTCCTCGCACTTGCATA;SOR=1.428;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=302;TCF=111;TCR=191;TR=302;WE=32891208;WS=32891190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,315:1.00:315
chr20	33037336	rs3736762	C	T	2644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=58;PP=1806;SC=TTTTTGTTCTCTTCCAATTGT;SOR=1.274;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=37;TCR=58;TR=95;WE=33037344;WS=33037326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr20	33053985	rs11480899	A	AT	1004.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=7;PP=787;SC=TGATCATGTGATTTTTTCCCC;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=25;WE=33053993;WS=33053975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr20	33057954	rs6059856	G	C	12750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=465;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=168;NR=262;PP=2965;SC=TCTCTGTACTGCCTTAACTTT;SOR=1.229;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=432;TCF=169;TCR=263;TR=430;WE=33057962;WS=33057944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,463:1.00:463
chr20	33057974	rs10716089	CT	C	11401.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=193;PP=2951;SC=TGTTGTGTTGCTTTATATTAC;SOR=1.565;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=209;TCF=11;TCR=198;TR=202;WE=33057982;WS=33057964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,322:1.00:322
chr20	33059478	rs10606931	GGTGTGTGT	G	581.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.78;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr20	33068563	rs6059861	A	T	1942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=53;PP=1509;SC=CATGTAATTTATTAAAATATA;SOR=3.056;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=12;TCR=53;TR=65;WE=33068571;WS=33068553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr20	33104592	rs2424993	G	C	7802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=165;NR=102;PP=2965;SC=GGCAACCCTGGCAACGTTTCC;SOR=1.154;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=268;TCF=166;TCR=102;TR=267;WE=33104600;WS=33104582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr20	33117533	rs111373342	CA	C	175.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.39;ReadPosRankSum=0.386;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr20	33147737	rs6059915	C	G	3112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=85;PP=2675;ReadPosRankSum=-0.237;SC=GGGAGTCGGGCGGCCCCGGTC;SOR=1.038;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=49;TCR=87;TR=133;WE=33147745;WS=33147726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,116:0.97:119
chr20	33148861	rs6059916	T	G	4301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=100;PP=2921;SC=CTGGCAGGTGTTGTTGGAAGA;SOR=1.565;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=153;TCF=52;TCR=101;TR=152;WE=33148869;WS=33148851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr20	33150503	rs6059918	C	T	1811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=46;PP=1352;SC=TGCCTGGGGCCCAGATCACTG;SOR=2.419;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=13;TCR=46;TR=59;WE=33150511;WS=33150493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr20	33297810	rs369052205	G	GCC	412.74	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=1;PP=201;SC=GCGCCCTCTAGACCCCCCGCC;SOR=2.303;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=33297819;WS=33297801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr20	33297811	rs2378257	A	C	421.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=1;PP=163;SC=CGCCCTCTAGACCCCCCGCCC;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=8;WE=33297819;WS=33297801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr20	33298242	.	G	A	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.785;ClippingRankSum=0.000;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=296;ReadPosRankSum=-2.035;SC=TTCCTTCCCCGACACCCTCAA;SOR=0.606;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=13;TCR=64;TR=23;WE=33298250;WS=33298232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,24:0.31:78
chr20	33320571	rs45465702	T	C	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.97;ReadPosRankSum=1.201;SOR=0.709;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,9:0.20:45
chr20	33326876	rs6060025	A	G	3502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=83;PP=2475;SC=GGAACATGTCAGGGAAGGGAA;SOR=1.981;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=35;TCR=83;TR=118;WE=33326884;WS=33326866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr20	33331117	rs146570094	C	A	960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.58;ReadPosRankSum=-2.416;SOR=0.674;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:202,66:0.25:268
chr20	33334540	rs910872	T	C	3500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.514;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=26;PP=2274;ReadPosRankSum=0.350;SC=ATTGTTTCCTTGAAGACATGG;SOR=2.264;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=113;TCF=85;TCR=28;TR=109;WE=33334548;WS=33334530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,120:0.98:122
chr20	33337751	rs3787220	T	C	12152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=453;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=224;NR=196;PP=2965;ReadPosRankSum=0.128;SC=CTTGCATGTTTGGAGTTGGTC;SOR=0.257;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=421;TCF=225;TCR=196;TR=420;WE=33337759;WS=33337741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,452:1.00:453
chr20	33342439	rs1884432	T	C	1705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=13;PP=1215;SC=CCAAGACTTATTACTTATCTG;SOR=2.147;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=41;TCR=13;TR=54;WE=33342447;WS=33342429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr20	33342477	rs6087625	G	A	3513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=42;PP=2237;SC=TCAAGTCTACGACACAATGCT;SOR=1.224;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=72;TCR=42;TR=114;WE=33342485;WS=33342467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr20	33346556	rs11468960	ATC	A	5626.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=36;PP=2957;SC=TTTTATAATGATCTGTGCAGA;SOR=1.397;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=33;TCR=41;TR=66;WE=33346565;WS=33346546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr20	33346832	rs11476500	GT	G	222.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=16;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=0;NR=14;PP=194;SC=TGGAAAATTTGTTTTTTTTTT;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=14;WE=33346840;WS=33346822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr20	33356511	rs2295353	C	T	1049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=34;PP=869;SC=AGTTTACCACCAGAAAAATGG;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=34;WE=33356519;WS=33356501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr20	33364584	rs6060043	C	T	7898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=150;NR=140;PP=2965;SC=AGGCAATGAACGGAAAGCCGT;SOR=0.719;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=291;TCF=151;TCR=140;TR=290;WE=33364592;WS=33364574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,306:1.00:306
chr20	33364655	rs6120723	C	T	4171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=92;PP=2766;SC=ATAGAATAGGCTCATGCCTAT;SOR=1.261;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=149;TCF=57;TCR=92;TR=149;WE=33364663;WS=33364645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr20	33470514	rs6088638	T	C	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=4.373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.23;ReadPosRankSum=-2.370;SOR=0.342;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,35:0.27:131
chr20	33470694	rs4911163	C	T	11114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=413;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=174;NR=218;PP=2965;SC=GGAAAATCTTCATTGAGTGGA;SOR=0.995;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=393;TCF=174;TCR=219;TR=392;WE=33470702;WS=33470684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,413:1.00:413
chr20	33500245	rs3787214	C	A	342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=2;PP=258;SC=CACACCACCACACCCAGCTAA;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=33500253;WS=33500235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr20	33500378	rs2378294	G	A	2241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=42;NR=38;PP=1245;SC=GAGCCACCGCGCCTGGCCAAT;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=42;TCR=38;TR=80;WE=33500386;WS=33500368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr20	33509275	rs3818273	G	A	8338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=150;NR=148;PP=2965;SC=AGTGAGTGAAGGGTACAGAAG;SOR=0.733;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=298;TCF=150;TCR=148;TR=298;WE=33509283;WS=33509265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,308:1.00:308
chr20	33509523	rs2273683	C	T	4379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=84;NR=63;PP=2965;SC=GTTCTGGGGCCCCTTGGGAGT;SOR=1.003;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=85;TCR=63;TR=147;WE=33509531;WS=33509513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr20	33533736	rs734111	A	C	3349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.539;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=44;PP=2291;ReadPosRankSum=1.843;SC=CTGGCCCCCCAATGCTTCACT;SOR=1.163;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=128;TCF=83;TCR=45;TR=127;WE=33533744;WS=33533726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,131:0.98:134
chr20	33565480	rs6060137	C	T	1251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FS=2.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.14;ReadPosRankSum=0.727;SOR=0.887;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:223,79:0.26:302
chr20	33572941	rs2425007	A	G	6062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=366;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.426;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=142;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.144;SC=CTGTGAGTCAACCCCCTGCGG;SOR=0.725;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=338;TCF=142;TCR=196;TR=245;WE=33572949;WS=33572931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,263:0.72:366
chr20	33572979	rs3746448	C	T	3109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.458;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=86;PP=2086;ReadPosRankSum=-0.719;SC=GGCCTGAGCCCGGTCACCCCA;SOR=0.427;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=168;TCF=49;TCR=119;TR=124;WE=33572987;WS=33572969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,128:0.73:175
chr20	33574022	rs2425008	G	C	2859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=72;PP=1648;ReadPosRankSum=-3.336;SC=GTACGATGAAGGGGGTGGGAG;SOR=0.686;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=186;TCF=80;TCR=106;TR=127;WE=33574030;WS=33574012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,132:0.70:189
chr20	33574765	rs3746446	T	C	12600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=804;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=264;NR=290;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.085;SC=ACAACATGAATGATGGGGAGG;SOR=0.662;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=768;TCF=361;TCR=407;TR=554;WE=33574773;WS=33574755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:221,579:0.72:800
chr20	33575347	rs3053708	C	CAT	8960.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.429;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.533;NF=57;NR=51;PP=2954;ReadPosRankSum=-1.747;SC=TTACCCCACTCGTGCCCTGCC;SOR=0.988;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=148;TCF=71;TCR=77;TR=108;WE=33575355;WS=33575337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,218:0.78:278
chr20	33578251	rs3746444	A	G	3802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.614;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=69;PP=2267;ReadPosRankSum=0.435;SC=CCACGTGAACATCACAGCAAG;SOR=0.791;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=200;TCF=110;TCR=90;TR=156;WE=33578259;WS=33578241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,170:0.79:216
chr20	33578899	rs2425009	T	C	4678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.169;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=115;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.559;SC=CCCCAACAGGTTGCTCTACAC;SOR=0.838;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=235;TCF=86;TCR=149;TR=177;WE=33578907;WS=33578889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,191:0.74:258
chr20	33581889	rs7268266	T	C	4723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.161;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=130;NR=48;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.219;SC=CTGTGCTGAGTGTCACCATTT;SOR=0.518;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=233;TCF=173;TCR=60;TR=178;WE=33581897;WS=33581879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,190:0.76:249
chr20	33583033	rs10536288	CAAA	C	232.80	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=1;PP=95;SC=AGAGCACAGCCAAACTTTGCT;SOR=1.329;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=33583045;WS=33583032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr20	33583037	rs61501849	C	G	241.84	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=1;PP=48;SC=CACAGCCAAACTTTGCTACAG;SOR=1.329;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=4;WE=33583045;WS=33583032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr20	33583114	rs2425014	T	C	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=145;ReadPosRankSum=-0.438;SC=TCCCCCAACCTGGCCCCGTTC;SOR=0.430;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=14;WE=33583122;WS=33583104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
chr20	33583331	rs2425015	A	G	7403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=134;NR=113;PP=2965;SC=TGATGACCTGAAGCTGACACT;SOR=0.730;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=247;TCF=134;TCR=113;TR=247;WE=33583339;WS=33583321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,273:1.00:273
chr20	33584304	rs41312284	G	A	6508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FS=4.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.70;ReadPosRankSum=-2.605;SOR=0.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,164:0.70:235
chr20	33584310	rs41310801	G	A	6189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FS=6.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.76;ReadPosRankSum=-2.761;SOR=0.604;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,154:0.69:223
chr20	33584501	rs199682367	C	T	1050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FS=2.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.88;ReadPosRankSum=-0.178;SOR=0.864;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:202,69:0.25:271
chr20	33584822	rs11167250	T	TG	581.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=52;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=8;NR=10;PP=576;SC=GGGGGCGTTATGGGGTCCCAG;SOR=0.793;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=8;TCR=10;TR=18;WE=33584830;WS=33584813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr20	33584864	rs11167251	C	CT	890.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=10;PP=571;SC=CCTGTGCTGGCCACCCACTCT;SOR=0.963;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=17;TCF=6;TCR=11;TR=16;WE=33584872;WS=33584854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr20	33586193	rs3746436	C	T	6596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=412;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.223;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=109;NR=157;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.807;SC=CGGACGCAAGCACGCAGCGTG;SOR=0.828;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=387;TCF=163;TCR=224;TR=266;WE=33586201;WS=33586183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,283:0.69:411
chr20	33587198	rs3746435	G	C	5029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=91;PP=2962;ReadPosRankSum=0.542;SC=GGGAGAACAAGAACCTGCAGG;SOR=0.699;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=263;TCF=132;TCR=131;TR=187;WE=33587206;WS=33587188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,214:0.73:293
chr20	33587565	.	A	C	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.760;HP=14;HapScore=4;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=29;PP=381;ReadPosRankSum=-3.154;SC=CCCCCCCCCCACCCTACCCTG;SOR=0.250;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=73;TCF=21;TCR=52;TR=35;WE=33587573;WS=33587543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr20	33588698	rs67885143	TGAGGCTGGGCAAGGGCTGTGGG	T	3115.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.894;NF=3;NR=23;PP=2962;ReadPosRankSum=1.349;SC=ATCACTGATGTGAGGCTGGGC;SOR=0.693;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=48;TCF=3;TCR=45;TR=26;WE=33588727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,78:0.78:100
chr20	33589107	rs36003887	G	A	7677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=455;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=163;NR=148;PP=2962;ReadPosRankSum=1.037;SC=AGGCCCTTAAGGGCGTGCGCA;SOR=0.657;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=424;TCF=223;TCR=201;TR=311;WE=33589115;WS=33589097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,329:0.72:454
chr20	33590096	rs4911167	A	G	1291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=36;PP=837;ReadPosRankSum=1.183;SC=TGCTGCCTTCAGCCTTCCCTG;SOR=0.631;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=70;TCF=20;TCR=50;TR=51;WE=33590104;WS=33590086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,54:0.73:74
chr20	33591197	rs11481073	A	AG	8167.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=362;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=77;PP=2933;ReadPosRankSum=1.050;SC=CACCCCCTTGAGGGTGGGGCA;SOR=0.723;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=218;TCF=96;TCR=122;TR=145;WE=33591205;WS=33591187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,275:0.77:359
chr20	33592122	rs113338276	T	C	796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.738;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=8;PP=588;ReadPosRankSum=0.204;SC=CACTGATTCCTCCTGAGCACA;SOR=0.084;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=29;WE=33592130;WS=33592112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,31:0.79:39
chr20	33592248	rs752448	C	T	5652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=344;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.994;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=132;NR=101;PP=2962;ReadPosRankSum=1.249;SC=GTGTGTCTGCCGGGGCCTCTC;SOR=0.943;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=321;TCF=177;TCR=144;TR=233;WE=33592256;WS=33592238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,248:0.72:344
chr20	33592474	rs752449	A	G	864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=26;PP=617;ReadPosRankSum=0.103;SC=CTCTGAAGCTAGGAGCTCATC;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=41;TCF=5;TCR=36;TR=30;WE=33592482;WS=33592464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,33:0.73:45
chr20	33593457	rs3746431	T	C	6530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=404;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.578;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=157;NR=108;PP=2962;ReadPosRankSum=0.497;SC=CCAGCATTCTTACCCTGCATG;SOR=0.977;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=375;TCF=215;TCR=160;TR=265;WE=33593465;WS=33593447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,278:0.69:404
chr20	33593674	rs3746430	T	C	1023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.874;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=31;PP=787;ReadPosRankSum=0.665;SC=CCCGGGGGGATAGTCACTACA;SOR=1.314;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=47;TCF=6;TCR=41;TR=35;WE=33593682;WS=33593664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,36:0.73:49
chr20	33594226	rs6060151	G	T	3904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.423;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=68;PP=2333;ReadPosRankSum=1.401;SC=CAGAGCCCTGGGTTAACTTTA;SOR=0.437;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=223;TCF=136;TCR=87;TR=165;WE=33594234;WS=33594216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,174:0.74:234
chr20	33595300	rs2273636	C	T	1615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.466;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=8;PP=1043;ReadPosRankSum=0.152;SC=GACACAGCAACGCGTGGGCTG;SOR=0.371;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=88;TCF=77;TCR=11;TR=58;WE=33595308;WS=33595290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,65:0.66:99
chr20	33600740	rs1885117	C	T	1908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.027;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=16;PP=1417;ReadPosRankSum=1.068;SC=AGGTCAGGGACCAGACAAGGA;SOR=0.894;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=99;TCF=78;TCR=21;TR=80;WE=33600748;WS=33600730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,79:0.77:103
chr20	33632600	rs3803938	C	T	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=296;ReadPosRankSum=2.366;SC=CCCTTACATACGGGGCTTAGT;SOR=1.828;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=14;WE=33632608;WS=33632590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr20	33637606	rs2281626	T	G	7070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=389;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.041;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=174;NR=106;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.570;SC=TATTATTCAGTTTTGAGAATC;SOR=0.849;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=362;TCF=222;TCR=140;TR=280;WE=33637614;WS=33637596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,296:0.76:389
chr20	33642732	rs4911462	G	T	7594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=30.62;ReadPosRankSum=0.092;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,187:0.75:248
chr20	33642737	rs4911463	G	A	7817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=30.18;ReadPosRankSum=-0.368;SOR=0.699;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,196:0.76:259
chr20	33657126	rs1998233	G	A	5351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.873;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=122;NR=112;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.393;SC=AGTCAAAAATGTAAGTATTTG;SOR=0.618;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=335;TCF=177;TCR=158;TR=234;WE=33657134;WS=33657116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,246:0.69:355
chr20	33703607	rs3746429	C	T	9979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=610;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.590;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=205;NR=215;PP=2962;ReadPosRankSum=2.210;SC=GTGATCACCGCGTCGAAGGTG;SOR=0.721;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=575;TCF=282;TCR=293;TR=420;WE=33703615;WS=33703597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,445:0.73:609
chr20	33706187	rs6088722	T	C	840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=2;PP=634;ReadPosRankSum=2.031;SC=AGGAACTAATTCTAGCTCTAC;SOR=1.556;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=38;TCF=35;TCR=3;TR=28;WE=33706195;WS=33706177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,30:0.75:40
chr20	33711624	rs6120838	T	A	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=385;ReadPosRankSum=-0.606;SC=GATGGAGCCTTGTAGAGGGGA;SOR=0.379;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=21;WE=33711632;WS=33711614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,21:0.78:27
chr20	33713963	rs2295885	T	C	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=788;ReadPosRankSum=-1.678;SC=ACTCAAGCAATTAACAAAGTA;SOR=0.760;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=15;WE=33713983;WS=33713953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr20	33713975	rs2295886	A	C	633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=6;PP=788;ReadPosRankSum=-1.281;SC=AACAAAGTACATTATTTGACT;SOR=0.846;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=27;WE=33713983;WS=33713953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,26:0.62:42
chr20	33714187	rs2295887	G	A	3392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.576;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=80;PP=2096;ReadPosRankSum=0.171;SC=CTCTGCAGTGGGGGAGATGGG;SOR=0.624;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=195;TCF=81;TCR=114;TR=141;WE=33714195;WS=33714177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,149:0.72:208
chr20	33730387	rs6120849	C	T	1386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.208;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=46;PP=1116;ReadPosRankSum=-0.306;SC=CCACTTAAGACCTCCAGTTTC;SOR=1.809;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=66;TCF=7;TCR=59;TR=50;WE=33730395;WS=33730377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,51:0.73:70
chr20	33734905	rs945959	G	C	11873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=443;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=195;NR=227;PP=2965;ReadPosRankSum=1.374;SC=GGAAAGGACCGGGTTCACGCT;SOR=0.522;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=423;TCF=196;TCR=227;TR=422;WE=33734913;WS=33734895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,442:1.00:443
chr20	33762489	rs2069948	C	T	11777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=445;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=257;NR=167;PP=2965;SC=CAGGCTGAAGCTGACTCTGCC;SOR=1.158;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=424;TCF=257;TCR=167;TR=424;WE=33762497;WS=33762479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,444:1.00:444
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chr20	33764632	rs9574	C	G	5018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=110;PP=2965;SC=CTCCAGCCCCCTCAGAAGGGG;SOR=1.371;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=177;TCF=67;TCR=110;TR=177;WE=33764640;WS=33764622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr20	33834708	rs3764733	G	A	1491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=408;ExcessHet=3.0103;FS=0.613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.66;ReadPosRankSum=0.680;SOR=0.754;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:310,98:0.24:408
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chr20	33855284	rs2425031	T	C	4326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.627;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=115;PP=2962;ReadPosRankSum=0.613;SC=CTCCCCGACATCATGGAGCTG;SOR=0.627;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=211;TCF=56;TCR=155;TR=158;WE=33855292;WS=33855274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,169:0.73:231
chr20	33857711	rs2254207	A	C	8234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=489;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.02;MQRankSum=0.599;NF=153;NR=173;PP=2962;ReadPosRankSum=1.740;SC=GGTAATGTAGACTGTGCTGTG;SOR=0.637;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=446;TCF=208;TCR=238;TR=326;WE=33857719;WS=33857701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,360:0.74:487
chr20	33859244	rs6058219	G	C	1566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.066;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=15;PP=1122;ReadPosRankSum=0.304;SC=CTCAGGCTTCGTGCCCTTCCC;SOR=0.901;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=80;TCF=59;TCR=21;TR=58;WE=33859252;WS=33859234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,61:0.73:83
chr20	33859675	rs11696548	C	T	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.456;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=192;ReadPosRankSum=0.309;SC=CATGGGGAGCCGGTTTTATGT;SOR=0.112;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=44;TCF=3;TCR=41;TR=15;WE=33859683;WS=33859665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,16:0.36:45
chr20	33867248	rs2297789	A	T	3488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=64;PP=2598;ReadPosRankSum=-0.438;SC=ATGCTCTCACACTCGAGAAGC;SOR=0.655;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=157;TCF=76;TCR=81;TR=124;WE=33867256;WS=33867238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,129:0.79:164
chr20	33867697	rs619865	A	G	4282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=54;PP=2766;SC=AACACTAGGCAAAAGGATCTG;SOR=1.292;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=155;TCF=101;TCR=54;TR=155;WE=33867705;WS=33867687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr20	33867924	rs2250205	G	A	3680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.011;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=96;PP=2340;ReadPosRankSum=-0.023;SC=TCTGTCTCCTGTCAATCAAAG;SOR=0.901;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=204;TCF=74;TCR=130;TR=148;WE=33867932;WS=33867914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,160:0.74:217
chr20	33868702	rs2425043	T	C	1651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.117;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=46;PP=1225;ReadPosRankSum=0.303;SC=AGGATACCACTCAGCCCAGCC;SOR=0.473;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=93;TCF=27;TCR=66;TR=67;WE=33868710;WS=33868692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,68:0.72:94
chr20	33872311	rs2275275	G	C	6595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=395;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.865;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.648;NF=94;NR=165;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.070;SC=GGCGGCGGAGGCGGGAGTTCA;SOR=0.761;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=374;TCF=138;TCR=236;TR=259;WE=33872319;WS=33872301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,276:0.70:394
chr20	33874720	rs2425049	C	T	8174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=473;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.603;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=174;NR=164;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.787;SC=ATCTGGTGCCCGTCTGGCAGG;SOR=0.683;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=442;TCF=229;TCR=213;TR=338;WE=33874728;WS=33874710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,356:0.75:472
chr20	33879478	rs2425050	A	G	1266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=11;PP=992;ReadPosRankSum=1.119;SC=ATAGTGCCAGAGGTGCTGGTC;SOR=0.776;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=58;TCR=16;TR=50;WE=33879486;WS=33879468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,49:0.69:71
chr20	33971914	rs4911494	C	T	12796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=479;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=241;NR=201;PP=2965;SC=ACCACATGCTCGGGACTGGCT;SOR=0.841;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=443;TCF=241;TCR=202;TR=442;WE=33971922;WS=33971904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,477:1.00:477
chr20	33972053	rs4911496	C	T	4915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=106;PP=2965;SC=CCCACTTCCCCGTGATCAGCT;SOR=1.479;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=167;TCF=61;TCR=106;TR=167;WE=33972061;WS=33972043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr20	33974051	rs6141549	T	C	1394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=41;NR=32;PP=1350;SC=AAAAATCTAGTTTCCAAACTC;SOR=0.730;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=75;TCF=43;TCR=32;TR=73;WE=33974059;WS=33974041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr20	33974163	rs6088812	T	A	2600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=36;NR=51;PP=1555;SC=ATGGAACACATGGAATGAAAA;SOR=1.274;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=36;TCR=51;TR=87;WE=33974171;WS=33974153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr20	33997291	rs6142378	T	A	1061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=14;PP=833;SC=AAAAAAAAAGTTTAAAAGGTA;SOR=1.127;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=51;TCF=37;TCR=14;TR=50;WE=33997299;WS=33997281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr20	34079200	rs224373	A	G	5676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=93;NR=98;PP=2965;SC=GGGAGTAGGGAAGAAAGGGGC;SOR=0.900;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=192;TCF=94;TCR=98;TR=191;WE=34079208;WS=34079190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr20	34099165	.	CTT	C	123.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.013;ClippingRankSum=0.000;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=4.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.38;ReadPosRankSum=-0.598;SOR=0.175;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,11:0.21:52
chr20	34144107	rs224420	T	C	5886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=128;PP=2965;SC=TCCTGCATTTTGTTCCGTCAG;SOR=1.357;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=207;TCF=79;TCR=128;TR=207;WE=34144115;WS=34144097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr20	34146770	.	A	C	8794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.028;ClippingRankSum=0.000;DP=526;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.597;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=186;NR=178;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.218;SC=CAGATGAAGAAGACAAAGGTC;SOR=0.622;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=493;TCF=255;TCR=238;TR=364;WE=34146778;WS=34146760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,388:0.74:526
chr20	34164422	rs1557202	T	C	13487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=492;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=244;NR=225;PP=2965;SC=AATTCTTCCTTCAGGGACCTG;SOR=0.760;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=469;TCF=244;TCR=225;TR=469;WE=34164430;WS=34164412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,492:1.00:492
chr20	34167382	rs8116470	G	A	5573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.611;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=133;PP=2962;ReadPosRankSum=0.645;SC=GCAAGTCCTGGGGGTGGAAGA;SOR=0.809;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=287;TCF=110;TCR=177;TR=213;WE=34167390;WS=34167372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,234:0.75:314
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chr20	34170174	rs6119628	C	A	2160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=498;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.37;ReadPosRankSum=0.467;SOR=0.639;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:355,140:0.28:495
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chr20	34328274	rs1538426	G	A	3151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=27;PP=2286;SC=TTATAAGACTGTTAGAAGATT;SOR=2.366;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=113;TCF=86;TCR=27;TR=112;WE=34328282;WS=34328264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr20	34435246	rs374986194	CT	C	90.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=1.409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQRankSum=1.844;QD=1.42;ReadPosRankSum=0.000;SOR=0.362;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,15:0.23:64
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chr20	35060420	rs149479346	G	C	2723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=729;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.75;ReadPosRankSum=-0.281;SOR=0.713;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:548,179:0.25:727
chr20	35064912	rs1275393	G	A	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=326;ReadPosRankSum=1.814;SC=TGCTTCTTGAGAGAACCCCTT;SOR=0.446;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=16;WE=35064920;WS=35064902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,17:0.81:21
chr20	35068018	rs1275396	A	G	718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.156;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=4;PP=535;ReadPosRankSum=0.285;SC=ACAGTCAAATACAAGCTGGTG;SOR=1.586;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=26;WE=35068026;WS=35068008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,26:0.76:34
chr20	35090820	rs1275391	C	G	1776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=23;PP=1209;ReadPosRankSum=2.087;SC=CTGAAGGCCCCCCTTTGAGCC;SOR=0.631;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=76;TCR=32;TR=77;WE=35090828;WS=35090810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,77:0.73:106
chr20	35127613	.	CT	C	207.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=0.000;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=11.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.21;ReadPosRankSum=-0.326;SOR=0.165;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,22:0.23:94
chr20	35414905	rs73109216	G	T	1637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.067;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=17;PP=951;ReadPosRankSum=-0.469;SC=CTGGGGGGGAGTGCCCTCTCC;SOR=0.548;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=56;TCR=22;TR=60;WE=35414915;WS=35414895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,67:0.78:86
chr20	35491033	rs1291099	A	G	1753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.867;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=24;PP=1224;ReadPosRankSum=-1.161;SC=GACCCCTGCGACCTCCCTTTC;SOR=1.046;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=107;TCF=71;TCR=36;TR=75;WE=35491041;WS=35491023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,77:0.70:110
chr20	35491551	rs6029806	A	G	2449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.06;SOR=1.029;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr20	35508959	rs1291125	T	C	5888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=129;NR=81;PP=2965;SC=TTCCCAGGTGTCCTCTAGGAT;SOR=1.205;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=211;TCF=130;TCR=81;TR=210;WE=35508967;WS=35508949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr20	35532683	rs79633688	T	C	12079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=729;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.968;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=228;NR=255;PP=2962;ReadPosRankSum=0.962;SC=CATGTTAGAATCCATTTTTCA;SOR=0.534;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=667;TCF=303;TCR=364;TR=483;WE=35532691;WS=35532673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:205,524:0.72:729
chr20	35559352	rs6072746	A	C	4462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.159;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=113;PP=2532;ReadPosRankSum=-0.268;SC=CAAGAACTTCAGTATGTTTCC;SOR=0.585;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=243;TCF=93;TCR=150;TR=184;WE=35559360;WS=35559342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,203:0.76:266
chr20	35661007	rs77052854	T	C	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=1;PP=373;ReadPosRankSum=0.466;SC=TCTGTCTCTGTTACTCAATCT;SOR=0.425;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=57;TCF=54;TCR=3;TR=23;WE=35661015;WS=35660997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,25:0.42:59
chr20	35696591	.	TA	T	194.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=0.000;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.21;MQRankSum=1.255;QD=5.73;ReadPosRankSum=-0.648;SOR=0.948;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr20	35710453	rs1892205	T	C	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.11;ReadPosRankSum=-0.234;SOR=0.632;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,20:0.25:81
chr20	35738841	rs1744759	G	C	6258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=125;PP=2965;SC=TGGGGTCAGAGACTCTATCAG;SOR=1.237;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=204;TCF=78;TCR=126;TR=203;WE=35738849;WS=35738831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr20	35740794	rs1744760	T	C	10513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=666;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=208;NR=249;PP=2962;ReadPosRankSum=1.171;SC=GTACACTTCTTGGGGCAGCTT;SOR=0.703;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=630;TCF=290;TCR=340;TR=457;WE=35740802;WS=35740784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:181,482:0.73:663
chr20	35748024	rs1780670	G	A	1908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.60;ReadPosRankSum=0.997;SOR=0.671;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,78:0.68:115
chr20	35748039	rs138010782	G	GAAAGA	7228.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=2.052;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.65;MQRankSum=0.542;QD=46.34;ReadPosRankSum=-0.948;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,152:0.97:156
chr20	35748894	rs1624888	C	G	13915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=520;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=254;NR=241;PP=2965;SC=AGCTTCTAAACAATGAGTCTT;SOR=0.740;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=496;TCF=254;TCR=242;TR=495;WE=35748902;WS=35748884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,518:1.00:518
chr20	35749079	rs8120336	T	A	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.424;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=181;ReadPosRankSum=1.024;SC=CAGAGGGCATTGTCTCAGGGC;SOR=0.346;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=65;TCF=11;TCR=54;TR=17;WE=35749087;WS=35749069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,18:0.27:67
chr20	35766337	rs8115854	A	G	1639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=371;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.42;ReadPosRankSum=1.286;SOR=0.715;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:270,101:0.27:371
chr20	35769592	rs1744769	T	C	11529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=435;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=203;NR=202;PP=2965;SC=CTGTATTTTTTGCCAAAGTTA;SOR=0.726;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=405;TCF=203;TCR=202;TR=405;WE=35769600;WS=35769582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,435:1.00:435
chr20	35769647	rs1780680	G	T	5488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.530;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=132;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.350;SC=ATGTTTCAGGGTTTTCAGGGT;SOR=1.041;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=304;TCF=128;TCR=176;TR=218;WE=35769655;WS=35769637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,236:0.71:333
chr20	35783494	rs1615246	T	C	6100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=349;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.104;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=149;NR=95;PP=2962;ReadPosRankSum=0.340;SC=GGATAGGCACTTCAGAACTTG;SOR=0.832;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=327;TCF=197;TCR=130;TR=244;WE=35783502;WS=35783484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,261:0.75:348
chr20	35786188	rs1780687	A	C	4037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=101;NR=32;PP=2965;SC=ACCACTGAATACTTCCACATT;SOR=2.152;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=134;TCF=102;TCR=32;TR=133;WE=35786196;WS=35786178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr20	35787473	rs1744775	A	G	6666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=363;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.565;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=162;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.889;SC=AGCAAGCTGGAAAGACGGTTT;SOR=0.584;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=341;TCF=131;TCR=210;TR=265;WE=35787481;WS=35787463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,281:0.78:362
chr20	35796541	rs62621241	T	C	1573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=361;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.36;ReadPosRankSum=1.366;SOR=0.699;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:262,99:0.27:361
chr20	35807790	rs11467214	G	GCTTATAGACAGGGCCCCGCGGCCGGCACT	5785.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.49;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=11;NR=6;PP=2900;SC=GTTGCGCGTGGCTTTGGGGAG;SOR=0.782;SbPval=0.05;Source=Platypus;TC=54;TCF=21;TCR=33;TR=17;WE=35807798;WS=35807780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr20	35812526	rs16986470	C	A	1216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=390;ExcessHet=3.0103;FS=4.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.14;ReadPosRankSum=-0.619;SOR=0.948;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:299,89:0.23:388
chr20	35826683	rs2076399	T	G	1909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.664;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=12;PP=1354;ReadPosRankSum=0.436;SC=ACTAAATTCATGTAGCTCATT;SOR=0.506;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=74;TCF=61;TCR=13;TR=64;WE=35826691;WS=35826673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,69:0.86:80
chr20	35827028	.	A	ATT	276	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=10;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=17;MQ=60.43;NF=0;NR=13;PP=276;QD=22.1538461538;SC=CATTCCTGTGATTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=13;WE=35827036;WS=35827018;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:7,13:0.65:20
chr20	35827682	rs2076398	G	T	481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=16;PP=390;SC=GGTCCTATCCGAAGAGGGCTC;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=35827690;WS=35827672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr20	35828696	rs6032013	A	G	835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=1;PP=628;SC=CCGGCTGCCCAGCTAATTTTT;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=28;WE=35828704;WS=35828686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr20	35828757	.	ATT	A	3194.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=50;NR=17;PP=859;SC=GCCGGTTGTAATTTTTTTTTT;SOR=3.019;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=84;TCF=55;TCR=29;TR=67;WE=35828767;WS=35828747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,97:0.97:100
chr20	35835657	rs11698281	C	T	4430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=53;PP=2799;SC=GAAACAGCTGCATTTCGCATT;SOR=1.413;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=155;TCF=102;TCR=53;TR=155;WE=35835665;WS=35835647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr20	35835889	rs1079657	A	G	8149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=118;NR=157;PP=2965;SC=CCCTCTGATTATCATTCCTAG;SOR=1.075;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=275;TCF=118;TCR=157;TR=275;WE=35835897;WS=35835879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,299:1.00:299
chr20	35838372	rs2272950	T	A	2012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=6;PP=1528;SC=TTGCAACCTATAGATAAAGCA;SOR=4.277;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=55;TCR=6;TR=61;WE=35838380;WS=35838362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr20	35838591	rs2050091	T	C	7535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=122;NR=154;PP=2965;SC=CATATTTTGGTGGGGCGCTGA;SOR=0.998;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=276;TCF=122;TCR=154;TR=276;WE=35838599;WS=35838581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,282:1.00:282
chr20	35838756	rs3817885	G	A	792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=24;PP=650;SC=TTCATTCTCTGTTTCTAGTTG;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=35838764;WS=35838746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr20	35852395	rs2076397	A	C	4803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=116;PP=2965;SC=CCACCTGATCACTCAGGGAGC;SOR=2.362;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=154;TCF=38;TCR=116;TR=154;WE=35852403;WS=35852385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr20	35852450	rs2076396	G	C	1333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=36;PP=1023;SC=ACTGAGCCCTGCAGGCATCAG;SOR=6.043;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=1;TCR=36;TR=37;WE=35852458;WS=35852440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr20	35865054	rs4608	C	T	10416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=379;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=141;NR=218;PP=2965;SC=CCTGGCCATCCTGGGCAGTGT;SOR=1.272;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=359;TCF=141;TCR=218;TR=359;WE=35865062;WS=35865044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,378:1.00:378
chr20	35869538	rs77501105	A	G	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=118;ReadPosRankSum=1.893;SC=TCTTTTGTAAAATGAGATGGG;SOR=0.839;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=35;TCF=31;TCR=4;TR=9;WE=35869546;WS=35869528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,11:0.29:38
chr20	35869619	rs2050093	C	T	6012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=121;NR=66;PP=2965;SC=GGGAGAGTACCTTAGTCTCTC;SOR=1.173;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=187;TCF=121;TCR=66;TR=187;WE=35869627;WS=35869609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr20	36030939	rs1885257	G	C	7830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=150;NR=132;PP=2965;SC=GCAAAGTGGCGGACTTTGGGC;SOR=0.740;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=282;TCF=150;TCR=132;TR=282;WE=36030947;WS=36030929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,303:1.00:303
chr20	36031097	rs2145792	A	G	8472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=160;NR=122;PP=2965;SC=TGCTTATCTAACAGAGCGGTC;SOR=0.980;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=283;TCF=160;TCR=123;TR=282;WE=36031105;WS=36031087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,298:1.00:298
chr20	36150600	rs5841264	T	TA	308.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.00;MQRankSum=0.696;QD=22.06;ReadPosRankSum=0.375;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
chr20	36375071	rs2297154	T	C	6604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=122;PP=2965;SC=CTGTTACTCTTTCTCCTGTCT;SOR=1.015;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=218;TCF=96;TCR=122;TR=218;WE=36375079;WS=36375061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr20	36488508	rs3833308	TCTCA	T	702.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=5.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.49;ReadPosRankSum=1.190;SOR=1.058;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,25:0.20:128
chr20	36488911	rs1474623	G	T	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.147;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=2.90;ReadPosRankSum=0.473;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
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chr20	36615416	rs6022212	A	G	833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.997;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=3;PP=581;ReadPosRankSum=0.661;SC=AGCAAATGCCATGCCATGCAA;SOR=1.445;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=46;TCF=41;TCR=5;TR=34;WE=36615424;WS=36615406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,36:0.75:48
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chr20	36842086	rs112401596	G	A	5014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=110;PP=2962;ReadPosRankSum=0.287;SC=TGACCCTTGAGGTCTTGTCCA;SOR=0.710;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=262;TCF=122;TCR=140;TR=204;WE=36842094;WS=36842076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,222:0.78:285
chr20	36845738	rs760998	C	T	5802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=373;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.850;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=124;NR=127;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.142;SC=TGGGTCAGCTCAGCCTGGAAG;SOR=0.716;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=360;TCF=181;TCR=179;TR=251;WE=36845746;WS=36845728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,259:0.70:372
chr20	36859711	rs1205418	G	A	1339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.433;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=33;PP=857;ReadPosRankSum=1.321;SC=GGGGCCGCCCGGCCCTGTCCC;SOR=0.343;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=81;TCF=30;TCR=51;TR=56;WE=36859719;WS=36859701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,59:0.71:83
chr20	36868191	rs1205433	C	T	2997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=75;PP=1916;ReadPosRankSum=-0.932;SC=AAGGGGAAAACGTCTCCTCTT;SOR=0.757;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=165;TCF=64;TCR=101;TR=122;WE=36868199;WS=36868181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,132:0.74:179
chr20	36869516	rs1205434	C	A	5520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.222;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=119;NR=108;PP=2962;ReadPosRankSum=1.934;SC=AGCTTTCTGGCTTTGTGCAAG;SOR=0.706;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=301;TCF=155;TCR=146;TR=227;WE=36869524;WS=36869506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,231:0.75:308
chr20	36870122	rs1205435	T	G	7335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=428;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.290;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=170;NR=142;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.192;SC=AGGCTGGCTCTGGAACAGGCT;SOR=0.584;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=410;TCF=225;TCR=185;TR=312;WE=36870130;WS=36870112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,323:0.75:428
chr20	36919616	rs6014601	G	A	2330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=16;PP=1660;SC=GTTTCCCACAGTGTGTCCCCG;SOR=2.570;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=79;TCF=63;TCR=16;TR=78;WE=36919624;WS=36919606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr20	36919675	.	A	G	4639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=0.000;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.357;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=117;NR=83;PP=2942;ReadPosRankSum=0.215;SC=TGGCCACTCCACAGCTGGGAA;SOR=0.867;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=268;TCF=154;TCR=114;TR=200;WE=36919683;WS=36919665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,207:0.74:279
chr20	36919758	rs10446011	A	G	8476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=525;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.259;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=180;NR=185;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.032;SC=CAGACAAGACAGGAGACTGGA;SOR=0.646;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=498;TCF=251;TCR=247;TR=365;WE=36919766;WS=36919748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,384:0.73:525
chr20	36932551	rs1341022	G	C	7753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=145;NR=112;PP=2965;SC=CATTTCCCCAGCCGACTCTTT;SOR=0.890;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=257;TCF=145;TCR=112;TR=257;WE=36932559;WS=36932541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,286:1.00:286
chr20	36932660	rs1341023	C	T	6942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=109;NR=128;PP=2965;SC=CCGAGATGGGCGTCCCTGATG;SOR=0.943;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=239;TCF=109;TCR=130;TR=237;WE=36932668;WS=36932650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chr20	36932676	rs1341024	G	C	5879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=123;PP=2965;SC=TGATGGTGCTGGTCGCCATAG;SOR=1.075;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=215;TCF=91;TCR=124;TR=214;WE=36932684;WS=36932666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr20	36932798	rs5741798	C	G	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=55;ReadPosRankSum=0.641;SC=CCCTGAGGAGCACTTACTTAG;SOR=0.223;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=6;WE=36932806;WS=36932788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,6:0.24:25
chr20	36937246	rs2066252	G	A	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.39;ReadPosRankSum=2.116;SOR=0.945;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,21:0.19:108
chr20	36939052	rs5743507	G	C	3592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.221;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=108;PP=2209;ReadPosRankSum=0.275;SC=AGAGCAAAGTGGGGTATGGAC;SOR=0.439;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=207;TCF=60;TCR=147;TR=157;WE=36939060;WS=36939042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,159:0.76:210
chr20	36946848	rs4358188	G	A	6031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=361;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.241;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=137;PP=2962;ReadPosRankSum=2.320;SC=TGTATCCTCCGAGCTGCAACC;SOR=0.908;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=329;TCF=147;TCR=182;TR=240;WE=36946856;WS=36946838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,261:0.72:361
chr20	36953097	rs5741806	C	T	4094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.139;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=62;PP=2676;ReadPosRankSum=1.318;SC=GTCAGCCTCTCACCCCGATAC;SOR=0.804;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=228;TCF=141;TCR=87;TR=166;WE=36953105;WS=36953087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,174:0.72:242
chr20	36959318	rs5743533	G	A	2056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=2;PP=1633;SC=GCTGTGACCCGTGGAAGGGGA;SOR=5.518;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=62;TCF=60;TCR=2;TR=61;WE=36959326;WS=36959308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr20	36959353	rs5743534	A	G	4601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=109;NR=44;PP=2965;SC=GGAAAACCAGACAGTATCCAC;SOR=1.810;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=154;TCF=110;TCR=44;TR=153;WE=36959361;WS=36959343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr20	36959566	rs2425357	A	G	6691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=122;PP=2965;SC=TCATAGGCTCAAGGCATTATT;SOR=0.930;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=229;TCF=107;TCR=122;TR=229;WE=36959574;WS=36959556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr20	36959732	rs6127771	C	T	177.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=113;SC=TCCAGACCTTCCCCACCTGAG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=36959740;WS=36959722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr20	36965617	rs1131847	A	G	4958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=105;PP=2965;SC=GCTGTCAGCCACACCTGTTCC;SOR=1.172;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=176;TCF=71;TCR=105;TR=176;WE=36965625;WS=36965607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr20	37055875	rs707578	T	C	1111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=6;PP=804;SC=AAGCATGATGTCCCCCCGCAC;SOR=3.086;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=34;WE=37055883;WS=37055865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr20	37062583	rs788347	T	C	12522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=459;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=229;NR=198;PP=2965;SC=CGCGATTTCTTTCCCTGCACT;SOR=0.789;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=429;TCF=230;TCR=199;TR=427;WE=37062591;WS=37062573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,457:1.00:457
chr20	37146131	.	CT	C	228.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.947;ClippingRankSum=0.000;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.20;MQRankSum=0.000;QD=4.67;ReadPosRankSum=-0.114;SOR=0.653;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,18:0.37:49
chr20	37230486	rs6070740	C	A	319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=7;NR=5;PP=220;SC=ACTGGGTGCGCCACGGGGGCC;SOR=1.022;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=12;TCF=7;TCR=5;TR=12;WE=37230494;WS=37230476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr20	37252210	rs6064778	C	A	5502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=71;NR=113;PP=2965;SC=GGGTGAGAGACCCTGGCGGGG;SOR=1.364;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=185;TCF=71;TCR=114;TR=184;WE=37252218;WS=37252200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr20	37255995	rs148944768	A	ATGTGTGTTGGTG	185.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.53;MQRankSum=2.015;QD=12.38;ReadPosRankSum=1.322;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr20	37257384	rs35399405	A	G	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=74;ReadPosRankSum=0.000;SC=AGCCAGCCAGACTTGGGCCCC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=6;WE=37257392;WS=37257374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr20	37257590	rs6070809	C	G	1221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.693;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=37;PP=807;ReadPosRankSum=-0.464;SC=CAGAGAATGGCGACTCCGGTA;SOR=0.486;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=262;TCF=123;TCR=139;TR=77;WE=37257598;WS=37257580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:204,80:0.28:284
chr20	37266205	rs6026964	C	A	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.155;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=3;PP=370;ReadPosRankSum=-0.924;SC=TCAAGAGGAGCGGTTTGGGTC;SOR=0.867;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=81;TCF=68;TCR=13;TR=24;WE=37266213;WS=37266195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,26:0.31:83
chr20	37272589	rs419162	G	A	1112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=32;PP=864;SC=CCCTCTGGGTGCAGCTGCCGT;SOR=3.145;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=6;TCR=32;TR=38;WE=37272597;WS=37272579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr20	37274559	rs11426603	C	CA	3818.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=58;NR=22;PP=2967;SC=GTCCCGTGTCCAACAAATGCA;SOR=2.390;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=87;TCF=60;TCR=27;TR=80;WE=37274567;WS=37274549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr20	37274861	rs117796	A	G	2833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=67;PP=2062;SC=ACAGGTGGAGAAGGGCCGAGG;SOR=2.621;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=21;TCR=67;TR=88;WE=37274869;WS=37274851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr20	37277153	rs220527	G	T	2102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=7;PP=1517;SC=TCCTTATGCTGCTTCTCCCCA;SOR=3.816;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=55;TCR=7;TR=62;WE=37277161;WS=37277143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr20	37277271	rs220526	C	T	10041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=375;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.85;SOR=0.794;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,374:1.00:374
chr20	37278558	rs6027039	C	T	1569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FS=3.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.61;ReadPosRankSum=0.631;SOR=0.946;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:224,56:0.20:280
chr20	37278569	rs6027040	A	C	1472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FS=0.592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.87;ReadPosRankSum=-0.144;SOR=0.775;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:200,51:0.20:251
chr20	37278612	rs220522	T	A	3391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=81;PP=2296;SC=ATTCCAAGGCTTCCTTTTCTG;SOR=1.903;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=34;TCR=81;TR=115;WE=37278620;WS=37278602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr20	37278823	rs220521	T	C	545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=13;NR=5;PP=380;SC=CCCTCCACCCTCCAGCCCTCC;SOR=1.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=18;WE=37278831;WS=37278813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr20	37278946	rs220520	T	C	8385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=175;NR=113;PP=2965;SC=AAAAATGCAGTACCTTTATCA;SOR=1.110;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=288;TCF=175;TCR=113;TR=288;WE=37278954;WS=37278936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,311:1.00:311
chr20	37279255	rs220519	C	T	4692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=61;PP=2965;SC=AATATGTAAACGTAATTGTTT;SOR=1.280;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=165;TCF=104;TCR=61;TR=165;WE=37279263;WS=37279245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr20	37279376	rs67738971	TGACGA	T	2099.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FS=1.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.04;MQRankSum=1.863;QD=6.95;ReadPosRankSum=2.389;SOR=0.799;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:234,68:0.23:302
chr20	37279458	rs6015551	C	T	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.789;NF=3;NR=11;PP=115;ReadPosRankSum=-0.201;SC=CCACCGGGGGCGGGAGGGCAG;SOR=0.446;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=58;TCF=11;TCR=47;TR=14;WE=37279466;WS=37279448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,15:0.25:61
chr20	37383482	rs35702444	T	G	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQRankSum=-1.319;QD=10.36;ReadPosRankSum=0.347;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr20	37383484	rs35956429	G	A	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQRankSum=-1.451;QD=10.64;ReadPosRankSum=1.082;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr20	37383487	.	TC	CT	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.023;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQRankSum=-1.666;QD=8.06;ReadPosRankSum=1.831;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,8:0.27:30
chr20	37555322	.	C	CGCG	9142.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=0.000;DP=396;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.748;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.129;NF=26;NR=67;PP=2985;ReadPosRankSum=0.043;SC=GAGAGGAGGGCGCGGCGGCGG;SOR=0.478;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=282;TCF=89;TCR=193;TR=93;WE=37555344;WS=37555312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,222:0.70:315
chr20	39609426	rs4812473	C	T	5436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=95;NR=90;PP=2965;SC=TGCGCTCTCCCTCTTCCAAGC;SOR=0.873;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=185;TCF=95;TCR=90;TR=185;WE=39609434;WS=39609416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr20	39634488	rs6016500	C	T	851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=6;PP=594;ReadPosRankSum=0.476;SC=CCTCCCAGGTCAGAGTCCTCT;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=41;TCF=33;TCR=8;TR=31;WE=39634496;WS=39634478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,33:0.79:42
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chr20	39657625	rs34282819	C	A	3729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.197;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=62;PP=2400;ReadPosRankSum=0.289;SC=CCGGAGTCCCCGTCCGCCCGC;SOR=0.824;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=205;TCF=121;TCR=84;TR=153;WE=39657633;WS=39657615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,159:0.73:218
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chr20	40714479	rs2016647	G	A	5256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.515;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=116;NR=106;PP=2933;ReadPosRankSum=-1.731;SC=TCTCAGGCCAGTACTGCATAC;SOR=0.680;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=282;TCF=147;TCR=135;TR=222;WE=40714487;WS=40714469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,240:0.79:303
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chr20	40714539	rs1569547	C	T	6002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.467;HP=8;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=82;PP=2962;ReadPosRankSum=0.974;SC=AGGCAGGGGGCGGGTATCAAA;SOR=0.845;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=174;TCF=70;TCR=104;TR=136;WE=40714548;WS=40714529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,150:0.80:187
chr20	40714540	rs1569548	G	C	1006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FS=1.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.41;ReadPosRankSum=-1.058;SOR=0.547;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:149,37:0.20:186
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chr20	40743745	rs73131125	C	T	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.782;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=112;ReadPosRankSum=-0.340;SC=TGGGGCTGGACGTAGAGCAGA;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=8;WE=40743753;WS=40743735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr20	40743829	rs2076248	A	G	5634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=129;NR=59;PP=2965;SC=ACAGCCTCCAAGAAGCTTACC;SOR=1.634;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=188;TCF=129;TCR=59;TR=188;WE=40743837;WS=40743819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr20	40863182	rs6030076	C	A	1345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.455;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=8;PP=931;ReadPosRankSum=0.177;SC=TACACTGATACCTATCCCCTG;SOR=1.085;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=60;TCF=51;TCR=9;TR=49;WE=40863190;WS=40863172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,52:0.81:64
chr20	40979160	rs2071854	T	C	1482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=9;PP=1029;ReadPosRankSum=-1.350;SC=GGAAGCTTTGTTCCTGGCCAG;SOR=0.584;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=67;TCF=56;TCR=11;TR=52;WE=40979168;WS=40979150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,58:0.78:74
chr20	41100774	rs760704	G	A	1957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-4.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.780;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=5;PP=1446;ReadPosRankSum=-0.737;SC=TTCATTGAAGGCCTAAGAAAA;SOR=0.206;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=83;TCF=78;TCR=5;TR=64;WE=41100782;WS=41100764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,70:0.76:92
chr20	41101274	rs6065487	C	A	904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.801;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=30;PP=693;ReadPosRankSum=0.289;SC=TGTTCTGCTACAACAGGGAAC;SOR=1.890;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=39;TCF=3;TCR=36;TR=32;WE=41101282;WS=41101264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,33:0.79:42
chr20	41306488	rs111229158	G	GA	312.90	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=3.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.51;MQRankSum=0.544;QD=14.90;ReadPosRankSum=0.050;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,18:0.86:21
chr20	41306600	rs2425516	A	G	4782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.430;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.500;NF=112;NR=90;PP=2814;ReadPosRankSum=-0.516;SC=CATACTCAACATCGGGGTCCA;SOR=0.649;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=299;TCF=169;TCR=130;TR=202;WE=41306608;WS=41306590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,217:0.67:325
chr20	41400229	rs6030462	G	A	4719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=88;PP=2802;SC=AATGAGATTCGACAGCCTGCA;SOR=1.275;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=152;TCF=64;TCR=88;TR=151;WE=41400237;WS=41400219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr20	41408964	rs7273962	A	G	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=10.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.25;ReadPosRankSum=0.372;SOR=0.214;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,33:0.25:134
chr20	41419718	rs208244	A	G	769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=26;NR=0;PP=598;SC=GAGGAGAAGCACAGTAAACAC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=41419726;WS=41419708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr20	41420166	rs11086852	G	A	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.294;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=66;ReadPosRankSum=0.891;SC=AAATCCTTCTGAAAATCAGTC;SOR=0.188;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=7;WE=41420174;WS=41420156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,7:0.22:32
chr20	41818289	rs2867655	C	G	509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=8;PP=263;SC=CACTCACCTGCGGCGCTCTGA;SOR=1.022;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=8;TCR=8;TR=16;WE=41818297;WS=41818279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr20	42089140	rs34934568	T	A	1328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=3;PP=983;SC=GACTTCATTGTTTTTCTCCTA;SOR=4.514;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=35;WE=42089148;WS=42089130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr20	42089511	rs2235611	T	C	11593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=424;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=233;NR=173;PP=2965;SC=CCCGATCCCCTAAAGAAAATG;SOR=1.023;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=409;TCF=234;TCR=175;TR=406;WE=42089519;WS=42089500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,423:1.00:423
chr20	42157237	rs2071972	C	T	3179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.505;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=56;PP=1802;ReadPosRankSum=1.212;SC=CAGGGGAAGCCGAAGAAAGTC;SOR=0.740;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=206;TCF=114;TCR=92;TR=128;WE=42157245;WS=42157227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,141:0.63:224
chr20	42163768	rs2071968	C	G	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.983;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=71;ReadPosRankSum=0.529;SC=AGCAGTGCTTCTGGCTACCCC;SOR=1.300;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=7;WE=42163776;WS=42163758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
chr20	42197892	rs62224803	G	T	593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.719;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=466;ReadPosRankSum=-1.080;SC=GGGAGCCATTGTGGGTGTTTG;SOR=2.027;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=40;TCF=31;TCR=9;TR=25;WE=42197900;WS=42197882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,25:0.60:42
chr20	42198173	rs3752560	G	A	669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FS=5.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.25;ReadPosRankSum=0.824;SOR=1.164;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:161,45:0.22:206
chr20	42199704	.	GGT	G	119.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.044;ClippingRankSum=0.000;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=4.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.30;ReadPosRankSum=0.733;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,12:0.23:52
chr20	42199925	rs3127060	G	A	1118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=25;PP=761;SC=CATGTACATAGGGGGCAGGGG;SOR=2.494;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=33;WE=42199933;WS=42199915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr20	42203442	rs916409	G	A	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FS=3.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.85;ReadPosRankSum=0.146;SOR=1.080;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:176,37:0.17:213
chr20	42203644	rs56150807	G	A	760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.690;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=25;PP=522;ReadPosRankSum=0.659;SC=TCCATGGCCTGGTGAGTCAGG;SOR=0.570;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=142;TCF=52;TCR=90;TR=42;WE=42203652;WS=42203634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,44:0.29:153
chr20	42208522	rs2301483	T	G	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=1.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.10;ReadPosRankSum=-0.834;SOR=0.902;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,22:0.23:97
chr20	42211728	rs72626514	C	T	472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.201;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=308;ReadPosRankSum=0.054;SC=AAACAGCCTGCATATCAAACA;SOR=0.123;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=56;TCF=49;TCR=7;TR=22;WE=42211736;WS=42211718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,23:0.38:60
chr20	42275499	rs393115	G	T	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FS=0.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.93;ReadPosRankSum=0.863;SOR=0.544;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:131,34:0.21:165
chr20	42302201	rs826949	C	T	1428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.693;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=9;PP=1083;ReadPosRankSum=0.518;SC=CATTTGAGTCCAGGAGTTCAA;SOR=0.334;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=68;TCF=58;TCR=10;TR=55;WE=42302209;WS=42302191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,54:0.81:67
chr20	42302371	rs826950	C	T	9246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=499;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=200;NR=168;PP=2962;ReadPosRankSum=1.059;SC=GTGGGCTGGCCGCTGCCTACA;SOR=0.798;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=460;TCF=247;TCR=213;TR=368;WE=42302379;WS=42302361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,400:0.80:499
chr20	42310297	rs12625831	T	C	866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FS=0.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.48;ReadPosRankSum=1.286;SOR=0.635;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:187,62:0.25:249
chr20	42310509	rs442143	T	C	1799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=50;PP=1110;ReadPosRankSum=0.339;SC=AGTACAGTCCTGCTGTGGCCC;SOR=0.880;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=27;TCR=63;TR=71;WE=42310517;WS=42310499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,76:0.79:96
chr20	42320881	rs2229036	C	T	806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.40;ReadPosRankSum=0.075;SOR=0.698;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:267,69:0.21:336
chr20	42328639	rs285162	T	C	7684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=125;NR=148;PP=2965;SC=TCCTCATCCCTGCTGTGGGTT;SOR=1.004;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=273;TCF=125;TCR=148;TR=273;WE=42328647;WS=42328629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,299:1.00:299
chr20	42328749	rs285163	A	G	920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=27;PP=745;SC=CTTCTCTCTCAGGCCCACATC;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=28;WE=42328757;WS=42328739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr20	42331457	rs2070235	A	G	1728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=743;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.33;ReadPosRankSum=-1.362;SOR=0.691;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:594,149:0.20:743
chr20	42331546	rs73116571	G	T	5301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=140;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.224;SC=CCTCCCAGGTGCGTGGACCCC;SOR=0.669;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=282;TCF=101;TCR=181;TR=217;WE=42331554;WS=42331536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,229:0.77:296
chr20	42341564	rs12625913	A	G	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=89;ReadPosRankSum=0.641;SC=GTGACCATCCATGGCCATGAC;SOR=0.307;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=36;TCF=33;TCR=3;TR=10;WE=42341572;WS=42341554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,10:0.28:36
chr20	42574442	rs4812769	T	C	2339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=55;NR=26;PP=1404;SC=CTTATACGAATGGGATGGGGG;SOR=1.504;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=57;TCR=27;TR=81;WE=42574450;WS=42574432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
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chr20	42939750	rs6073401	T	C	17072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=674;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=326;NR=318;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.474;SC=GCACCAGCGTTCCCCGCAACA;SOR=0.714;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=648;TCF=328;TCR=320;TR=644;WE=42939758;WS=42939738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,661:0.99:665
chr20	43052570	rs2273618	T	C	781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=4;PP=581;ReadPosRankSum=-1.938;SC=CCTTGTGTGATACAAGTCAGG;SOR=1.234;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=39;TCF=33;TCR=6;TR=27;WE=43052578;WS=43052560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,29:0.73:40
chr20	43058018	rs3746574	T	C	728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=4.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.386;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=2;PP=609;ReadPosRankSum=1.461;SC=GATTATCTGGTTTAATTAATT;SOR=1.819;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=39;TCF=34;TCR=5;TR=27;WE=43058026;WS=43058008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,26:0.68:38
chr20	43058096	rs3746575	C	G	4425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.682;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=119;NR=63;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.188;SC=CTTTCCCGGGCCTCTTCATTT;SOR=0.614;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=219;TCF=144;TCR=75;TR=182;WE=43058104;WS=43058086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,184:0.83:223
chr20	43254490	rs244074	A	G	771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=20;PP=591;SC=CCAGGCCCTAACATGTCCCTC;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=26;WE=43254498;WS=43254480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr20	43264927	rs394105	C	T	6612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=127;NR=106;PP=2965;SC=CATGCAGTTCCACCTGCAAGG;SOR=0.734;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=233;TCF=127;TCR=106;TR=233;WE=43264935;WS=43264917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr20	43343901	rs72400085	TGA	T	322.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.34;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
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chr20	43348735	rs2296530	C	A	5636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.991;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=117;NR=113;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.647;SC=GACCCGGTGGCCGGGGGGCCC;SOR=0.624;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=321;TCF=167;TCR=154;TR=230;WE=43348750;WS=43348725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,245:0.72:342
chr20	43534934	rs2425675	G	A	1798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.231;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=32;PP=1168;ReadPosRankSum=0.498;SC=ATTTTAAACTGTCGAGTGAGA;SOR=0.426;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=85;TCF=47;TCR=38;TR=68;WE=43534942;WS=43534924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,72:0.80:90
chr20	43538733	rs2072727	T	C	1351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.384;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=13;PP=822;ReadPosRankSum=-1.039;SC=AGCGCGGGGCTGCTGGGTGAC;SOR=0.267;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=68;TCF=52;TCR=16;TR=49;WE=43538741;WS=43538723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,55:0.74:74
chr20	43547677	rs2075960	T	G	8053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=511;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.570;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=180;NR=165;PP=2962;ReadPosRankSum=1.150;SC=GGACCTCTTCTCCCAGTTTGG;SOR=0.742;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=488;TCF=251;TCR=237;TR=345;WE=43547685;WS=43547667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,359:0.70:510
chr20	43559043	rs3746580	G	T	2048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.875;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=16;PP=1357;ReadPosRankSum=0.007;SC=GGGAGGCAGCGCAGCCCCAGG;SOR=1.378;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=104;TCF=79;TCR=25;TR=77;WE=43559051;WS=43559033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,82:0.75:109
chr20	43560914	rs3746582	T	C	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=1.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.10;ReadPosRankSum=0.764;SOR=0.862;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,35:0.26:134
chr20	43561654	rs12798	C	T	2371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=679;ExcessHet=3.0103;FS=1.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.50;ReadPosRankSum=1.558;SOR=0.919;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:577,100:0.15:677
chr20	43561660	rs12031	A	G	2464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=707;ExcessHet=3.0103;FS=2.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.50;ReadPosRankSum=1.329;SOR=0.961;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:598,107:0.15:705
chr20	43565559	rs3746583	G	C	1279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=27;PP=915;ReadPosRankSum=-0.102;SC=GTCTTAAAACGCTGGTCAGAC;SOR=0.709;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=227;TCF=139;TCR=88;TR=71;WE=43565567;WS=43565549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,73:0.30:246
chr20	43565622	rs3746584	G	A	4134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=94;PP=2583;ReadPosRankSum=-1.097;SC=TTTGAGGTTGGGAGACAGTCC;SOR=0.663;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=262;TCF=123;TCR=139;TR=178;WE=43565630;WS=43565612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,191:0.69:276
chr20	43565804	rs6094057	G	A	609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.576;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=432;ReadPosRankSum=0.069;SC=GCATCTGTGCGTTTGGTAAAT;SOR=0.283;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=24;WE=43565812;WS=43565794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,25:0.86:29
chr20	43566518	rs6031872	C	T	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.31;ReadPosRankSum=-0.571;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,4:0.16:25
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chr20	43566863	rs2273357	G	A	431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=1.609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.57;ReadPosRankSum=2.462;SOR=0.516;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:133,35:0.21:168
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chr20	43629135	rs17420378	G	A	1120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FS=1.609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.79;ReadPosRankSum=-0.670;SOR=0.680;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:220,76:0.26:296
chr20	43681951	rs2284275	C	T	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.142;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=317;ReadPosRankSum=0.577;SC=TAAATGCCTGCGGTTTTTGAC;SOR=0.988;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=83;TCF=26;TCR=57;TR=24;WE=43681959;WS=43681941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,24:0.27:90
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chr20	43803725	rs1983649	T	A	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=396;ReadPosRankSum=0.119;SC=AGGGAGCACTTCTGAAGCAGT;SOR=1.329;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=21;WE=43803733;WS=43803715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,21:0.72:29
chr20	43931857	rs2235228	C	T	505.94	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.663;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=350;ReadPosRankSum=-1.029;SC=TGGGCTCCCACCAGGGACTTA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=17;WE=43931865;WS=43931847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,19:0.90:21
chr20	43933021	rs2072788	G	T	4207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=75;PP=2646;SC=TCAATGCCGCGGGCGCGCGCC;SOR=1.088;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=59;TCR=75;TR=134;WE=43933029;WS=43933011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr20	43933163	rs2233094	T	C	6052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=129;NR=55;PP=2965;SC=CGTACTGGATTGCCAGTCCCG;SOR=1.793;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=185;TCF=130;TCR=55;TR=184;WE=43933171;WS=43933153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr20	43964407	rs2072791	G	C	1424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=31;NR=13;PP=879;SC=CGCCTGCCCAGCACACCTTCC;SOR=1.480;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=31;TCR=13;TR=44;WE=43964415;WS=43964397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr20	43976875	.	G	GC	2370	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.820;ClippingRankSum=0.000;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=9.247;HP=9;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.387;NF=37;NR=31;PP=1032;ReadPosRankSum=1.098;SC=CCCCCGATCTGCCCCCCCCCA;SOR=0.126;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=59;TCR=51;TR=68;WE=43976883;WS=43976865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,94:0.89:106
chr20	43995410	rs6032142	C	T	1268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=10;PP=897;SC=ACACTTATCTCGTCACTTCTG;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=31;TCR=10;TR=41;WE=43995418;WS=43995400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr20	44002665	rs2231626	C	G	5736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=112;PP=2965;SC=CCAGCAGAAACCTCGGTGTTA;SOR=1.212;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=191;TCF=79;TCR=112;TR=191;WE=44002673;WS=44002655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr20	44004155	rs10546815	CATT	C	5646.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.48;NF=7;NR=62;PP=2967;SC=TGGAACTCTTCATTATTTTGT;SOR=1.241;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=73;TCF=7;TCR=66;TR=69;WE=44004165;WS=44004145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr20	44006078	rs2231614	C	G	2135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;SC=AGCCAAGGGCCGGCCTGCTGG;SOR=0.832;Source=Platypus;TCF=35;WE=44006086;WS=44006068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr20	44038574	rs1127497	A	G	9386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=186;NR=142;PP=2965;SC=CTGGGCAGGGATGGACAACCA;SOR=0.981;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=329;TCF=187;TCR=142;TR=328;WE=44038582;WS=44038564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,344:1.00:344
chr20	44048065	rs3092108	C	CG	10877.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=551;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.042;HP=11;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.083;NF=67;NR=141;PP=2969;ReadPosRankSum=-0.622;SC=CAGCCGGGGGCGGGGGGTGTA;SOR=0.532;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=343;TCF=104;TCR=239;TR=208;WE=44048073;WS=44048055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,396:0.77:511
chr20	44049916	rs3092450	T	TC	1310.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=1;PP=1174;SC=GCAGGGCTGTTCCCCATCTAC;SOR=4.514;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=37;TCF=33;TCR=4;TR=31;WE=44049924;WS=44049906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr20	44052992	rs13217	G	A	16965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=618;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=309;NR=279;PP=2965;SC=CCGAGTACACGCCAGATCCTA;SOR=0.788;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=589;TCF=309;TCR=280;TR=588;WE=44053000;WS=44052982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,616:1.00:616
chr20	44053069	rs2741566	T	C	15500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=563;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=262;NR=267;PP=2965;SC=GACCTACCCTTTCTGCTGCTT;SOR=0.744;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=530;TCF=263;TCR=267;TR=529;WE=44053077;WS=44053059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,560:1.00:560
chr20	44054349	rs707577	T	C	16533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=637;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=274;NR=325;PP=2965;ReadPosRankSum=1.725;SC=CCGTGTGCTATGGCTCCTTCT;SOR=0.301;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=600;TCF=274;TCR=326;TR=599;WE=44054357;WS=44054339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,636:1.00:637
chr20	44141201	rs11470736	TCACACA	T,TCACA	2244.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.15;QD=38.05;SOR=3.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,52,7:0.88,0.12:59
chr20	44141331	rs6032259	A	G	6589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=391;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.868;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.581;NF=159;NR=119;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.154;SC=TTCTTTCCTCAAAAAGTTGTT;SOR=0.919;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=371;TCF=208;TCR=163;TR=278;WE=44141339;WS=44141321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,293:0.75:390
chr20	44144118	rs8125061	C	T	4528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.194;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=108;NR=82;PP=2852;ReadPosRankSum=0.782;SC=CCCACCACCCCGCCCCCCAGC;SOR=0.846;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=271;TCF=152;TCR=119;TR=190;WE=44144127;WS=44144108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,203:0.71:286
chr20	44163988	rs6032274	T	C	3390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=71;PP=2400;SC=GATCGCAGAATAGAGCTGTTT;SOR=1.949;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=32;TCR=71;TR=103;WE=44163996;WS=44163978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr20	44170712	rs11594	C	A	2964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=16;PP=2114;SC=CTGGAGCATCCGTCAGGTACA;SOR=2.977;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=74;TCR=16;TR=90;WE=44170720;WS=44170702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr20	44174423	rs765156	G	A	13257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=485;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=196;NR=250;PP=2965;SC=GGGAAAGAGCGGTTTTACACC;SOR=1.040;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=446;TCF=196;TCR=250;TR=446;WE=44174431;WS=44174413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,485:1.00:485
chr20	44236564	rs45528943	A	T	417.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=1.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.35;ReadPosRankSum=1.060;SOR=0.458;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,26:0.27:96
chr20	44259549	rs2272961	G	A	2030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=647;ExcessHet=3.0103;FS=1.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.14;ReadPosRankSum=0.074;SOR=0.862;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:497,150:0.23:647
chr20	44279034	rs6065851	C	T	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=63;ReadPosRankSum=1.273;SC=GGTGATACTACGAAGGTGGGT;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=7;WE=44279042;WS=44279026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,7:0.19:36
chr20	44313401	rs2072974	G	A	471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=5.784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.17;ReadPosRankSum=0.532;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,34:0.23:149
chr20	44314609	rs232729	A	G	6225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.206;NF=136;NR=78;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.746;SC=AACCAGGACAAGCAGCAGAGT;SOR=0.485;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=216;TCF=138;TCR=78;TR=214;WE=44314617;WS=44314599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,225:1.00:226
chr20	44333326	rs11361717	CT	C	280.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.66;MQRankSum=0.992;QD=11.70;ReadPosRankSum=1.466;SOR=0.910;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,19:0.79:24
chr20	44334394	rs232291	A	C	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=0;PP=552;ReadPosRankSum=1.985;SC=GGCAAGAGAAATGAGCTTCAT;SOR=1.885;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=25;WE=44334402;WS=44334384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,25:0.71:35
chr20	44334588	rs232290	C	G	8161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=479;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.96;MQRankSum=0.000;NF=156;NR=181;PP=2962;ReadPosRankSum=1.497;SC=GATTTGGTCTCGCCTTCCTCA;SOR=0.694;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=453;TCF=210;TCR=243;TR=337;WE=44334596;WS=44334578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,348:0.73:478
chr20	44350931	rs232262	C	G	5056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.639;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=132;NR=64;PP=2962;ReadPosRankSum=3.248;SC=TAGGTGAGCTCAACCGTCTCA;SOR=1.088;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=287;TCF=186;TCR=101;TR=196;WE=44350939;WS=44350921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,210:0.67:313
chr20	44351095	rs16990631	C	A	4262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.982;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=117;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.634;SC=AATAAAATTGCGGAGAAGATA;SOR=1.165;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=244;TCF=82;TCR=162;TR=168;WE=44351103;WS=44351085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,175:0.68:258
chr20	44352620	rs6017667	G	A	9969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=605;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.990;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=201;NR=208;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.070;SC=TGTCTTCTCCGGCTGTAATGG;SOR=0.604;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=569;TCF=287;TCR=282;TR=409;WE=44352628;WS=44352610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,436:0.72:604
chr20	44352740	rs1487317	G	A	4565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.661;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=111;PP=2915;ReadPosRankSum=-0.246;SC=GGTAGTAAAAGAAGAGGTTTT;SOR=0.459;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=265;TCF=99;TCR=166;TR=184;WE=44352748;WS=44352730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,198:0.70:282
chr20	44354087	rs6032473	G	C	1521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=3;PP=1103;ReadPosRankSum=-0.190;SC=CACATACTAAGCAATGATTAA;SOR=0.910;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=69;TCF=64;TCR=5;TR=52;WE=44354095;WS=44354077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,58:0.77:75
chr20	44354372	rs6032474	G	A	2462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=72;PP=1667;ReadPosRankSum=2.447;SC=TTTCCATAATGCTTTAAGCTT;SOR=0.697;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=27;TCR=89;TR=94;WE=44354380;WS=44354362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,98:0.80:122
chr20	44354387	rs232259	A	C	1841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.074;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=56;PP=1472;ReadPosRankSum=1.502;SC=AAGCTTCCATATGTTTGCTAT;SOR=2.103;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=72;TCF=6;TCR=66;TR=61;WE=44354395;WS=44354377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,61:0.85:72
chr20	44378577	rs380421	T	C	1330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.39;ReadPosRankSum=1.618;SOR=0.699;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:442,115:0.21:557
chr20	44417593	rs73122754	C	A	7408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=460;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.218;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=136;NR=161;PP=2962;ReadPosRankSum=1.314;SC=TCGGCAGATCCGACCACAGCC;SOR=0.850;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=428;TCF=201;TCR=227;TR=297;WE=44417601;WS=44417583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,320:0.70:458
chr20	44417643	rs6032537	A	G	9287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=132;NR=182;PP=2965;SC=ACAATTCATCACCCTGGCACA;SOR=1.149;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=314;TCF=132;TCR=182;TR=314;WE=44417651;WS=44417633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,341:1.00:341
chr20	44417675	rs6032538	G	C	6689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=132;PP=2965;SC=GGGTTCTTATGGGGAGGGCAT;SOR=1.151;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=229;TCF=97;TCR=132;TR=229;WE=44417683;WS=44417665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr20	44418471	rs411945	G	C	3712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=43;PP=2710;SC=CAGGGGATGAGTTCTCCTCTC;SOR=1.312;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=120;TCF=77;TCR=43;TR=120;WE=44418490;WS=44418461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr20	44418482	rs45549239	C	T	2803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.544;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=36;PP=1815;ReadPosRankSum=-1.247;SC=TTCTCCTCTCCTCTAGTCACT;SOR=1.111;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=140;TCF=88;TCR=52;TR=105;WE=44418490;WS=44418461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,116:0.75:154
chr20	44418564	rs3746493	A	G	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FS=1.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.41;ReadPosRankSum=1.501;SOR=0.771;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:238,57:0.19:295
chr20	44419678	rs73122763	G	A	2612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.997;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=57;PP=1466;ReadPosRankSum=0.979;SC=AGTCCTATGGGCAGGTACAAG;SOR=0.520;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=162;TCF=73;TCR=89;TR=107;WE=44419686;WS=44419668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,118:0.66:178
chr20	44420637	rs2664539	G	A	603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FS=0.645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.45;ReadPosRankSum=0.444;SOR=0.711;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:132,43:0.25:175
chr20	44420682	rs2664591	T	C	2973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=51;NR=52;PP=1789;SC=CGCGGGGACCTAGCGGGGCCG;SOR=0.884;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=52;TCR=53;TR=103;WE=44420690;WS=44420672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
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chr20	44425026	rs11477536	CA	C	383.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.19;ReadPosRankSum=0.564;SOR=0.638;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,29:0.47:62
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chr20	44431819	rs55794417	T	C	1257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.454;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=4;PP=855;ReadPosRankSum=1.253;SC=GTGCTTTTTTTCCCTTTGTTC;SOR=2.410;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=54;TCF=46;TCR=8;TR=38;WE=44431827;WS=44431809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,44:0.69:64
chr20	44439646	rs56261048	G	C	8999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=573;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.224;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=199;NR=185;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.131;SC=GAATGAGGCAGGGCCTACATC;SOR=0.581;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=543;TCF=288;TCR=255;TR=384;WE=44439654;WS=44439636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,406:0.71:573
chr20	44442298	rs10644382	C	CTA	3127.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.978;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.730;NF=2;NR=44;PP=1959;ReadPosRankSum=0.437;SC=GAAGTTATCTCGAACACTTCC;SOR=0.519;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=64;TCF=2;TCR=62;TR=46;WE=44442306;WS=44442288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,79:0.77:103
chr20	44451901	rs8860	T	C	4513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=113;NR=42;PP=2965;SC=CCACAAGGGGTCGCGCCTCCC;SOR=1.974;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=156;TCF=114;TCR=42;TR=155;WE=44451909;WS=44451891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr20	44452697	rs4629	C	A	2463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=643;ExcessHet=3.0103;FS=2.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.84;ReadPosRankSum=1.013;SOR=0.812;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:473,169:0.26:642
chr20	44453335	rs144529565	A	AC	305.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.71;MQRankSum=4.755;QD=3.40;ReadPosRankSum=-2.481;SOR=0.792;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,24:0.27:90
chr20	44456059	rs373018	T	C	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.026;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=240;ReadPosRankSum=0.284;SC=GGTCAGCGAGTCCCACCCCTC;SOR=1.449;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=13;WE=44456067;WS=44456049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr20	44468931	rs197669	T	C	2646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=26;PP=1392;SC=AGAGATTGGCTGGGGTTTCAG;SOR=1.420;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=78;TCF=51;TCR=27;TR=77;WE=44468939;WS=44468921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr20	44468982	rs11418101	A	AC	7231.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=49;PP=2936;SC=AGAAGAACTAATGCTCTATGG;SOR=1.395;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=98;TCF=49;TCR=49;TR=96;WE=44468990;WS=44468972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr20	44469290	rs4638862	G	A	1474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=544;ExcessHet=3.0103;FS=2.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.72;ReadPosRankSum=0.099;SOR=0.514;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:423,120:0.22:543
chr20	44470648	rs370136124	CT	C	195.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FS=6.804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.17;MQRankSum=3.802;QD=1.57;ReadPosRankSum=1.540;SOR=0.588;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,31:0.25:125
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chr20	44482691	rs201637016	GCTTTTATTTTC	G	3025.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.111;NF=2;NR=43;PP=2976;ReadPosRankSum=0.803;SC=CATAGGTTTTGCTTTTATTTT;SOR=0.778;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=87;TCF=3;TCR=84;TR=45;WE=44482709;WS=44482681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,76:0.72:106
chr20	44501458	rs6130959	A	G	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.928;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=25;PP=384;ReadPosRankSum=1.276;SC=CACTGTGCACACAATAGGTAC;SOR=0.411;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=131;TCF=32;TCR=99;TR=36;WE=44501466;WS=44501448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,36:0.26:139
chr20	44505973	rs2903808	T	C	1560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=414;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.77;ReadPosRankSum=-1.279;SOR=0.685;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:317,97:0.23:414
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chr20	44515059	rs6094224	T	C	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=3.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.00;ReadPosRankSum=0.230;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,19:0.21:90
chr20	44516444	rs7268221	A	G	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=5.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=446;ReadPosRankSum=0.490;SC=TCTTGCCCTAACCTTGAACGA;SOR=1.003;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=1;TCR=55;TR=23;WE=44516452;WS=44516434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,22:0.39:57
chr20	44517360	rs1516580	T	C	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.213;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=175;ReadPosRankSum=-1.404;SC=GGTCTGGGGCTCCAGGATGCA;SOR=0.473;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=62;TCF=46;TCR=16;TR=17;WE=44517368;WS=44517350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,16:0.25:64
chr20	44518843	rs3817731	A	T	1423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FS=2.287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.78;ReadPosRankSum=1.801;SOR=0.535;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:213,85:0.29:298
chr20	44519643	rs2868362	G	A	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=1.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.38;ReadPosRankSum=-0.616;SOR=0.858;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,33:0.25:134
chr20	44520237	rs3080212	CCTG	C	1522.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FS=1.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQRankSum=2.472;QD=7.58;ReadPosRankSum=-3.303;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:151,50:0.25:201
chr20	44522005	rs742034	A	G	979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.97;ReadPosRankSum=0.530;SOR=0.710;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:185,62:0.25:247
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chr20	44523248	rs2075962	T	C	1534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=424;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.63;ReadPosRankSum=0.240;SOR=0.643;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:317,106:0.25:423
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chr20	44540178	rs394643	A	G	7759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=115;NR=149;PP=2965;SC=CATAAGTGGGAACTAGCCTGG;SOR=1.063;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=265;TCF=115;TCR=150;TR=264;WE=44540186;WS=44540168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,288:1.00:288
chr20	44574533	rs11696196	C	T	11692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=439;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=201;NR=210;PP=2965;SC=GTAAGAGCTGCGGGGAGGAAG;SOR=0.783;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=413;TCF=202;TCR=211;TR=411;WE=44574541;WS=44574523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,439:1.00:439
chr20	44578530	rs41280272	G	A	1881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.23;ReadPosRankSum=-0.288;SOR=0.718;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:444,138:0.24:582
chr20	44578776	rs6065910	A	G	1659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=32;SC=CTGCTACTGTACCCAGTGGTG;SOR=1.402;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=19;TCR=32;TR=51;WE=44578784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr20	44580788	rs11905235	G	T	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=3.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.19;ReadPosRankSum=-0.063;SOR=1.276;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,21:0.21:100
chr20	44581174	.	G	A	1211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=0.000;DP=307;ExcessHet=3.0103;FS=1.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.95;ReadPosRankSum=0.212;SOR=0.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:230,77:0.25:307
chr20	44586036	rs3746506	G	A	352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=1;PP=279;SC=GATACCCTGCGGCCTCCGTGG;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=44586044;WS=44586030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr20	44588109	rs3746507	G	A	4670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=106;PP=2952;SC=AAGTCTGCCCGTCCCTAGCCT;SOR=1.835;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=151;TCF=45;TCR=106;TR=151;WE=44588117;WS=44588099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr20	44596207	rs6032606	C	G	6615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=122;NR=101;PP=2965;SC=TTCCTCTTGGCTCTTGGTGGA;SOR=0.834;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=224;TCF=123;TCR=101;TR=223;WE=44596215;WS=44596197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr20	44596545	rs3848719	G	A	6344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=105;NR=112;PP=2965;SC=GCACCGGGGAGCTGGGCCCAC;SOR=0.847;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=217;TCF=105;TCR=112;TR=217;WE=44596553;WS=44596535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr20	44599839	rs6017715	G	C	4515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=57;PP=2562;SC=CCGTCCAGCCGGGTCCATACC;SOR=1.112;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=154;TCF=97;TCR=57;TR=154;WE=44599847;WS=44599829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr20	44639511	rs3918253	C	T	11676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=434;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=235;NR=168;PP=2965;SC=AGCGCACAATCTGCGCAGCAG;SOR=1.081;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=403;TCF=235;TCR=168;TR=403;WE=44639519;WS=44639501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,434:1.00:434
chr20	44640959	rs3918256	G	A	12881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=476;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=199;NR=248;PP=2965;SC=CAAGGTAGGCGTGGTCCCGCG;SOR=0.977;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=447;TCF=199;TCR=248;TR=447;WE=44640967;WS=44640949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,476:1.00:476
chr20	44642406	rs2250889	G	C	4299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.97;NF=62;NR=83;PP=2270;SC=TTTGAGGAGCGGCTCTCCAAG;SOR=1.144;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=147;TCF=63;TCR=84;TR=145;WE=44642414;WS=44642396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr20	44642833	rs13969	A	C	2673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=54;NR=29;PP=1182;SC=TGGGCCTGGGAGCCGACGTGG;SOR=0.979;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=54;TCR=29;TR=83;WE=44642841;WS=44642823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr20	44645010	rs20544	C	T	7736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=115;NR=184;PP=2965;ReadPosRankSum=1.750;SC=AGGACTAGGGCTCCCGTCCTG;SOR=1.310;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=300;TCF=116;TCR=184;TR=299;WE=44645018;WS=44645000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,289:0.99:291
chr20	44663475	rs11699481	T	C	1599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=6;PP=1204;SC=AGCCCCATTTTCCCAATGCGC;SOR=3.745;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=40;TCR=6;TR=46;WE=44663483;WS=44663465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr20	44664493	rs77659338	G	T	2333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=604;ExcessHet=3.0103;FS=0.595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.87;ReadPosRankSum=1.209;SOR=0.750;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:446,157:0.26:603
chr20	44675136	rs3848727	T	C	1887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=44;PP=1318;SC=CCAATCCTCATCTTACTCCAG;SOR=2.797;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=11;TCR=44;TR=55;WE=44675144;WS=44675126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr20	44678348	rs6032635	G	A	7463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=153;NR=93;PP=2965;SC=AGCTGAAGGCGGGGAAGGGCC;SOR=1.077;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=247;TCF=153;TCR=94;TR=246;WE=44678356;WS=44678338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,273:1.00:273
chr20	44678510	rs73112831	C	A	2411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.788;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=66;PP=1548;ReadPosRankSum=-1.238;SC=ACTTTCCTTCCTCATCACCTT;SOR=1.262;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=137;TCF=48;TCR=89;TR=97;WE=44678518;WS=44678500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,105:0.67:156
chr20	44680581	rs4812988	C	T	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=233;ReadPosRankSum=1.900;SC=ACTGGATTTCCGCTCCTTTGG;SOR=0.572;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=22;TCR=59;TR=21;WE=44680589;WS=44680571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,22:0.26:84
chr20	44683697	rs73112836	A	G	1317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=38;PP=991;ReadPosRankSum=-0.216;SC=GAGAGCCTCAAACTGCTGCCA;SOR=0.730;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=11;TCR=53;TR=46;WE=44683705;WS=44683687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,49:0.71:69
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chr20	44693947	rs2903908	T	C	1797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=45;PP=1350;SC=TGTGTGTTCCTACTGATAACT;SOR=3.461;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=8;TCR=45;TR=53;WE=44693955;WS=44693937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
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chr20	44757407	rs3765459	G	A	8126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=490;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.602;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=165;NR=184;PP=2962;ReadPosRankSum=0.930;SC=GCACTGACCCGCCGTCTGGGA;SOR=0.749;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=469;TCF=223;TCR=246;TR=349;WE=44757427;WS=44757397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,363:0.74:489
chr20	44806875	rs2281335	G	A	5090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.229;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=123;PP=2962;ReadPosRankSum=0.629;SC=ACTTGGGGCCGGGGGTCAGCA;SOR=0.873;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=280;TCF=114;TCR=166;TR=204;WE=44806883;WS=44806858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,218:0.73:300
chr20	44839322	rs2425785	G	C	1072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=25;PP=637;SC=AGGGGCGGCAGGGATGTTTGG;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=11;TCR=25;TR=36;WE=44839330;WS=44839312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr20	44856463	rs733379	G	A	925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=28;PP=736;SC=TTCTGGTGGCGCAAGTGTGAC;SOR=3.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=31;WE=44856471;WS=44856453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr20	44979641	rs4810503	TA	GC	2504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=30;PP=1775;SC=ATCAAGATCTTACTGAAATCC;SOR=2.221;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=45;TCF=13;TCR=32;TR=43;WE=44979650;WS=44979631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr20	44985307	rs911435	T	G	6845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=135;PP=2965;SC=ACAGGACAGCTTGGGAGGTCC;SOR=1.188;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=232;TCF=97;TCR=135;TR=232;WE=44985315;WS=44985297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr20	44996182	rs2257495	A	G	8521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=155;NR=153;PP=2965;SC=CACTGAGGCCATCAATCCAGA;SOR=0.769;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=308;TCF=155;TCR=153;TR=308;WE=44996190;WS=44996172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,326:1.00:326
chr20	44998791	rs2261964	C	T	4733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=118;NR=40;PP=2965;SC=CAATGTTATACACTATACGAT;SOR=2.246;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=158;TCF=118;TCR=40;TR=158;WE=44998799;WS=44998781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr20	45003326	rs2261213	A	G	3491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=85;PP=2380;SC=GTCTCCGTGTATGCAGGGACC;SOR=2.100;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=30;TCR=85;TR=115;WE=45003334;WS=45003316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr20	45003788	rs2257545	T	C	739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=1;PP=614;SC=CACCATGGGGTTGGTTGTCAG;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=45003796;WS=45003778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr20	45188971	rs910062	C	A	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=2.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.25;ReadPosRankSum=-0.303;SOR=0.206;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,11:0.19:59
chr20	45194904	rs202391	C	G	3769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.431;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=59;PP=2410;ReadPosRankSum=-0.604;SC=TGATGATGGTCGCCGTGTTGC;SOR=0.430;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=212;TCF=132;TCR=80;TR=151;WE=45194912;WS=45194894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,161:0.72:224
chr20	45204266	rs1880898	G	A	1032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=378;ExcessHet=3.0103;FS=0.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.73;ReadPosRankSum=0.228;SOR=0.641;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:298,80:0.21:378
chr20	45212455	rs389905	T	G	2101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.074;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=53;PP=1405;ReadPosRankSum=-0.750;SC=ATTCTGTCCTTCAGTGCGCTC;SOR=0.461;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=101;TCF=32;TCR=69;TR=79;WE=45212463;WS=45212445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,84:0.77:109
chr20	45214403	rs73113722	A	C	2988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.100;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=72;PP=2077;ReadPosRankSum=0.260;SC=TAAAGCATCTACATTTTAGAA;SOR=1.392;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=174;TCF=75;TCR=99;TR=115;WE=45214413;WS=45214393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,122:0.65:187
chr20	45318042	rs2664523	G	A	876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=354;ExcessHet=3.0103;FS=0.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.48;ReadPosRankSum=0.062;SOR=0.740;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:279,74:0.21:353
chr20	45318069	rs2664574	C	G	962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=398;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.42;ReadPosRankSum=2.006;SOR=0.689;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:318,80:0.20:398
chr20	45354291	rs2235491	G	A	2261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=571;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.96;ReadPosRankSum=-1.609;SOR=0.678;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:421,150:0.26:571
chr20	45354606	rs139932041	G	A	3934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.515;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=62;PP=2429;ReadPosRankSum=1.062;SC=GGCCCTGTCCGTCAGTGGCAT;SOR=0.916;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=211;TCF=121;TCR=90;TR=150;WE=45354614;WS=45354596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,163:0.71:230
chr20	45355800	rs199896452	G	GTTTTACATCA	1686.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-3.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=2897;ReadPosRankSum=1.094;SC=AAACTCCCCAGGCCAGCTAAT;SOR=1.146;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=49;TCF=1;TCR=48;TR=19;WE=45355813;WS=45355790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,41:0.76:54
chr20	45355801	.	G	C	1695.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=3.734;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=35.33;ReadPosRankSum=0.420;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,35:0.73:48
chr20	45355805	rs201022621	GC	G	1309.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-3.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=2516;ReadPosRankSum=-0.031;SC=CCCCAGGCCAGCTAATGGGTG;SOR=1.094;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=19;WE=45355813;WS=45355790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,31:0.76:41
chr20	45358145	rs2425906	T	G	4066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FS=1.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.16;ReadPosRankSum=-0.929;SOR=0.588;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,183:0.77:237
chr20	45358223	rs2425907	C	T	1040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=34;PP=820;ReadPosRankSum=0.716;SC=CTTTTGCAAGCGGGCATTCCT;SOR=0.739;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=59;TCF=12;TCR=47;TR=43;WE=45358231;WS=45358213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,42:0.74:57
chr20	45629941	rs3746492	G	A	1873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=13;PP=1143;ReadPosRankSum=1.742;SC=AGCATCTGTGGTGGAGAAAGC;SOR=0.705;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=97;TCF=77;TCR=20;TR=69;WE=45629949;WS=45629931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,78:0.71:110
chr20	45630157	rs6094549	T	G	2700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.761;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=68;PP=1731;ReadPosRankSum=1.398;SC=CCACCTTTTCTTCTTTCTTGG;SOR=0.450;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=140;TCF=50;TCR=90;TR=109;WE=45630165;WS=45630146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,116:0.78:148
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chr20	45795744	rs3091782	T	C	5368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=86;NR=98;PP=2781;SC=GCATCCCTTATGACTCTTGGC;SOR=0.990;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=184;TCF=86;TCR=98;TR=184;WE=45795752;WS=45795734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
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chr20	46262994	rs6018606	G	A	1610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.836;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=56;PP=1311;ReadPosRankSum=3.052;SC=TTCTCAAAATGCTTTATTATT;SOR=2.161;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=88;TCF=11;TCR=77;TR=61;WE=46263002;WS=46262984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,61:0.68:90
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chr20	46267950	rs4810648	C	T	6276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=136;PP=2965;SC=AGTATGGGTACGTTATTTCTA;SOR=1.697;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=206;TCF=70;TCR=136;TR=206;WE=46267958;WS=46267940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr20	46268008	rs2076548	A	G	1228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.989;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=38;PP=926;ReadPosRankSum=0.666;SC=AAATACTTAAAGCCATCTAAA;SOR=2.012;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=51;TCF=3;TCR=48;TR=40;WE=46268016;WS=46267998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,43:0.80:54
chr20	46268493	rs2076546	A	G	5732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=360;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.892;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=139;NR=102;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.204;SC=CTATTCCCACATTGCCTCTTC;SOR=0.758;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=338;TCF=194;TCR=144;TR=241;WE=46268501;WS=46268483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,257:0.72:359
chr20	46279604	rs202165867	T	TA	165.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=1.451;NF=17;NR=2;PP=715;ReadPosRankSum=-0.967;SC=GAGACCCTGTTAAAAAAAAGA;SOR=0.527;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=53;TCF=49;TCR=4;TR=19;WE=46279621;WS=46279594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,10:0.34:29
chr20	46279612	.	AG	A	191	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=7;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=17;MQ=59.84;NF=17;NR=2;PP=191;QD=10.9473684211;SC=GTTAAAAAAAAGAAGGCCCTG;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=47;TCR=5;TR=19;WE=46279621;WS=46279594;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:33,19:0.37:52
chr20	46279613	rs2745724	G	A	1423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.50;QD=33.11;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr20	46279827	rs6018623	G	A	3826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.627;HP=1;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.920;NF=82;NR=133;PP=2962;ReadPosRankSum=0.839;SC=AGCAGCAGCAGCAGCAGCAAC;SOR=1.338;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=272;TCF=108;TCR=164;TR=215;WE=46279846;WS=46279817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,164:0.74:222
chr20	46279836	rs147879509	ACAG	A	115.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FS=0.872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.20;MQRankSum=2.720;QD=0.71;ReadPosRankSum=0.291;SOR=0.857;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:138,24:0.15:162
chr20	46279866	rs28529067	A	G	1300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.689;HP=1;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.315;NF=49;NR=66;ReadPosRankSum=4.140;SC=AGCAGCAGCAACAGCAACAGC;SOR=0.596;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=177;TCF=76;TCR=101;TR=115;WE=46279874;WS=46279853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,55:0.47:118
chr20	46282339	rs3092324	A	AAT	688.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=1.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.11;MQRankSum=1.769;QD=7.41;ReadPosRankSum=1.876;SOR=0.930;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,23:0.25:93
chr20	46282346	rs3092417	A	G	676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=4.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.52;ReadPosRankSum=1.755;SOR=1.915;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,21:0.23:90
chr20	46287012	rs444271	C	G	2692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=7;PP=2115;SC=CTGGCCAATACCACAGGTCTG;SOR=4.255;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=71;TCR=7;TR=78;WE=46287020;WS=46287002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr20	46311719	rs3215941	T	TG	7408.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=484;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.218;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=93;PP=2974;ReadPosRankSum=-1.573;SC=CCTGGGTCCCTGGGGGATGAC;SOR=0.602;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=290;TCF=127;TCR=163;TR=162;WE=46311729;WS=46311709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,325:0.68:479
chr20	46313135	rs2297586	C	T	2698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.970;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=26;PP=1830;ReadPosRankSum=1.710;SC=GCTGGGGGTTCGGAGCCACGC;SOR=0.915;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=119;TCF=89;TCR=30;TR=99;WE=46313143;WS=46313125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,106:0.82:129
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chr20	46386187	rs78249878	C	T	817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.15;ReadPosRankSum=0.306;SOR=0.619;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,42:0.32:133
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chr20	47247396	rs3810534	A	G	1119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.137;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=30;PP=728;ReadPosRankSum=-0.969;SC=GCCCCTACCCAGGTCTCAACT;SOR=0.947;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=60;TCF=17;TCR=43;TR=40;WE=47247404;WS=47247386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,46:0.70:66
chr20	47248808	rs4616535	C	T	3456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=62;PP=2192;ReadPosRankSum=1.635;SC=GGACCCCAGGCGGATACCTGA;SOR=0.696;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=227;TCF=130;TCR=97;TR=146;WE=47248816;WS=47248798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,154:0.65:238
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chr20	47249170	rs4487146	G	A	10778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=460;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=133;NR=150;PP=2962;ReadPosRankSum=0.594;SC=GGTAGAAGACGTTGGTGTCTG;SOR=0.682;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=441;TCF=207;TCR=234;TR=283;WE=47249178;WS=47249160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,295:0.64:460
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chr20	47249200	rs4527260	A	G	9066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.426;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=121;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.283;SC=ATGGGGCAGGATGACTCACCA;SOR=0.660;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=317;TCF=130;TCR=187;TR=208;WE=47249208;WS=47249179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,218:0.66:332
chr20	47253150	rs2664521	T	C	12902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=501;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=229;NR=238;PP=2965;SC=AGCAGCTGCTTGGAGAAGGTG;SOR=0.763;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=468;TCF=229;TCR=239;TR=467;WE=47253158;WS=47253140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,501:1.00:501
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chr20	47258613	rs4596036	G	A	5148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.526;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=144;NR=55;PP=2962;ReadPosRankSum=0.635;SC=TTCAGCAGTAGGAGGGCAGAG;SOR=0.749;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=279;TCF=200;TCR=79;TR=199;WE=47258621;WS=47258603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,204:0.71:286
chr20	47260936	rs6019344	A	G	9379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=584;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.595;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=217;NR=197;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.425;SC=GGCCGCTGCCACTCCACTCAC;SOR=0.632;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=566;TCF=298;TCR=268;TR=414;WE=47260944;WS=47260926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,430:0.74:584
chr20	47261017	rs6066802	T	C	9463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=557;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.591;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=164;NR=225;PP=2962;ReadPosRankSum=0.169;SC=GGACCGAGTCTCGATTGCTGT;SOR=0.783;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=536;TCF=230;TCR=306;TR=389;WE=47261025;WS=47261007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,402:0.72:557
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chr20	47272963	rs3091871	G	GC	16043.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=438;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.32;NF=69;NR=137;PP=2975;SC=GGCCTCCAGGGCTGGACCCCG;SOR=0.938;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=215;TCF=74;TCR=141;TR=206;WE=47272971;WS=47272953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,434:1.00:434
chr20	47273037	rs723291	C	T	1917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=387;ExcessHet=3.0103;FS=0.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.28;MQRankSum=-0.678;QD=4.96;ReadPosRankSum=-0.704;SOR=0.753;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:272,115:0.30:387
chr20	47273119	rs6066809	T	C	1916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.595;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=53;PP=1370;ReadPosRankSum=-0.889;SC=GCCCTCTTCCTCCAGAAATCC;SOR=0.347;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=91;TCF=22;TCR=69;TR=72;WE=47273127;WS=47273109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,76:0.79:96
chr20	47274895	rs11699966	G	A	1172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=38;PP=909;ReadPosRankSum=-1.716;SC=CCAGGTGGGCGAGACAGAGCA;SOR=1.214;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=51;TCF=4;TCR=47;TR=41;WE=47274903;WS=47274885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,42:0.76:55
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chr20	47292823	rs6125428	C	G	2465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.071;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=55;PP=1563;ReadPosRankSum=1.086;SC=AGAAGGTGAGCGCACAGTGAG;SOR=0.421;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=115;TCF=42;TCR=73;TR=91;WE=47292831;WS=47292813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,100:0.82:122
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chr20	47626847	rs2295580	T	C	7502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=451;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=172;NR=138;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.435;SC=TCCGCTCAGGTTGGAAGAACA;SOR=0.702;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=425;TCF=236;TCR=189;TR=310;WE=47626855;WS=47626837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,328:0.73:450
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chr20	47628434	rs2273531	T	C	11265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=671;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.613;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.579;NF=268;NR=205;PP=2962;ReadPosRankSum=0.107;SC=CCTGGTCTTATGAAAAATGTG;SOR=0.781;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=632;TCF=355;TCR=277;TR=473;WE=47628442;WS=47628424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,504:0.75:671
chr20	47630449	rs2281582	C	T	1298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=347;ExcessHet=3.0103;FS=1.495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.74;ReadPosRankSum=-0.570;SOR=0.578;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:259,88:0.25:347
chr20	47632754	rs1473718	A	G	881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FS=2.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.65;ReadPosRankSum=-1.457;SOR=0.526;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:262,71:0.21:333
chr20	47634006	rs11086275	A	AT	2022.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=455;ExcessHet=3.0103;FS=0.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQRankSum=3.515;QD=5.30;ReadPosRankSum=-1.477;SOR=0.658;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:271,111:0.29:382
chr20	47634040	rs151221957	A	T	4719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.685;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=109;PP=2962;ReadPosRankSum=1.133;SC=CAGTTTGCTGACATGGAGACC;SOR=0.959;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=247;TCF=102;TCR=145;TR=183;WE=47634048;WS=47634030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,198:0.69:285
chr20	47639464	rs2426106	G	C	1921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=12;PP=1354;SC=CCAGCCTGGAGAACGTAGTGA;SOR=2.636;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=49;TCR=12;TR=61;WE=47639472;WS=47639454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr20	47639737	rs7270848	A	G	2988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.870;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=79;PP=2061;ReadPosRankSum=0.682;SC=AGGAGGCCTCAGGAAGAGCAT;SOR=0.547;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=140;TCF=38;TCR=102;TR=110;WE=47639745;WS=47639727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,119:0.79:150
chr20	47645002	rs73623293	G	GT	2390.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.122;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=9;PP=1985;ReadPosRankSum=0.785;SC=TAGATTTCTAGTCATACACAG;SOR=0.935;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=75;TCF=59;TCR=16;TR=48;WE=47645010;WS=47644992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,73:0.73:100
chr20	47648454	rs3091900	CA	C	330.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.57;MQRankSum=1.662;QD=5.91;ReadPosRankSum=1.365;SOR=0.456;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,23:0.41:56
chr20	47649510	.	C	CA	68.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.750;ClippingRankSum=0.000;DP=189;ExcessHet=3.0103;FS=8.495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.06;MQRankSum=2.033;QD=0.39;ReadPosRankSum=-0.757;SOR=0.248;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:146,30:0.17:176
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chr20	47679655	rs10714453	AT	A	297.06	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=10;NR=0;PP=332;ReadPosRankSum=0.728;SC=TCTTTTTTTGATTTTTTTTTA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=10;WE=47679671;WS=47679645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
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chr20	47841660	rs11553387	G	T	10832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-3.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=663;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.769;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=204;NR=235;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.702;SC=GAAGCAGGAGGATTTTTTGAA;SOR=0.519;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=620;TCF=280;TCR=340;TR=439;WE=47841668;WS=47841650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:189,472:0.71:661
chr20	47842853	rs238162	C	T	1309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=4;PP=949;ReadPosRankSum=-0.639;SC=GTTTGTGGAACGAATGATTGG;SOR=0.788;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=61;TCF=57;TCR=4;TR=47;WE=47842861;WS=47842843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,50:0.78:64
chr20	47845220	rs238165	T	A	2319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.445;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=38;PP=1283;ReadPosRankSum=-0.517;SC=CTAAACTTCTTCTCATTGCTT;SOR=0.495;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=131;TCF=82;TCR=49;TR=95;WE=47845228;WS=47845210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,103:0.73:142
chr20	47846586	rs171130	T	C	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.435;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=318;ReadPosRankSum=0.847;SC=AGTGCGTTTCTGGGAAACCCA;SOR=2.712;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=15;WE=47846594;WS=47846576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr20	47850122	.	T	C	1145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.700;ClippingRankSum=0.000;DP=471;ExcessHet=3.0103;FS=1.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.43;ReadPosRankSum=-2.681;SOR=0.778;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:372,99:0.21:471
chr20	47850182	rs238148	C	T	7187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=393;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.926;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=128;NR=150;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.512;SC=TGGCTCCCTTCCTGCGGCAGG;SOR=0.779;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=362;TCF=167;TCR=195;TR=278;WE=47850190;WS=47850172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,305:0.78:393
chr20	47852822	rs238152	G	A	9645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=569;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.602;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=190;NR=203;PP=2962;ReadPosRankSum=1.017;SC=TTGCCTCTTCGCACCCCCCTT;SOR=0.628;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=530;TCF=254;TCR=276;TR=393;WE=47852830;WS=47852812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,424:0.75:567
chr20	47855655	rs79925479	G	T	7252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=418;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.585;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=132;NR=149;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.085;SC=CTGCATCCCTGCTGGTGCTGC;SOR=0.778;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=391;TCF=186;TCR=205;TR=281;WE=47855663;WS=47855645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,300:0.72:415
chr20	47856037	rs238156	T	G	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.688;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=321;ReadPosRankSum=0.145;SC=GGTGTGGGGGTTGCATTAGAT;SOR=0.278;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=18;WE=47856045;WS=47856027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
chr20	47858290	rs35759030	G	A	876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.819;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=6;PP=613;ReadPosRankSum=-0.917;SC=ACAGGCACGAGCTACTGCACT;SOR=0.361;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=44;TCF=37;TCR=7;TR=33;WE=47858298;WS=47858280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,35:0.76:46
chr20	47859015	rs238204	A	G	2567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=5.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.633;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=6;PP=1893;ReadPosRankSum=0.748;SC=ACAGAATGAAAATAGTCTTTG;SOR=1.428;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=105;TCF=96;TCR=9;TR=78;WE=47859023;WS=47859005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,86:0.75:114
chr20	47859254	rs71186444	CTTTTTTTTTTTTTT	C	6947.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=26.646;HP=22;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.439;NF=3;NR=68;PP=2997;ReadPosRankSum=1.902;SC=CCTTGGTATTCTTTTTTTTTT;SOR=2.685;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=116;TCF=4;TCR=112;TR=71;WE=47859275;WS=47859244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:6,167:0.97:173
chr20	47863282	rs8123912	G	C	6517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=367;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.945;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=154;NR=113;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.237;SC=GAAGGGGTGAGATTTGTTAAC;SOR=0.621;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=350;TCF=204;TCR=146;TR=267;WE=47863290;WS=47863272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,279:0.76:366
chr20	47863409	rs144647523	ATT	A	2956	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FS=3.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.11;MQRankSum=0.699;QD=23.84;ReadPosRankSum=1.745;SOR=1.244;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,103:0.83:124
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chr20	47865372	rs238208	G	A	11067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=612;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.315;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=228;NR=209;PP=2962;ReadPosRankSum=0.575;SC=TCTGAACACAGCTGCACACAG;SOR=0.573;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=576;TCF=306;TCR=270;TR=437;WE=47865380;WS=47865362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,463:0.76:610
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chr20	47865784	rs6512577	C	T	7709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=476;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=157;NR=158;PP=2962;ReadPosRankSum=0.269;SC=AGAGCCGGAGCATGGGGCCTA;SOR=0.740;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=441;TCF=221;TCR=220;TR=315;WE=47865792;WS=47865774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,344:0.72:476
chr20	47871197	rs56335217	G	C	1375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.268;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=45;PP=893;ReadPosRankSum=0.654;SC=CTGGAGAATGGGAAGAACCAA;SOR=0.995;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=73;TCF=18;TCR=55;TR=58;WE=47871205;WS=47871187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,60:0.80:75
chr20	47872327	rs238220	A	G	4787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.060;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=105;NR=79;PP=2834;ReadPosRankSum=-0.148;SC=TGGGTTGGCTAGATGTGGAAC;SOR=0.721;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=266;TCF=142;TCR=124;TR=184;WE=47872335;WS=47872317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,207:0.71:292
chr20	47872377	rs238221	C	G	4692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=94;PP=2814;ReadPosRankSum=-0.983;SC=TGAGGTCCAGCTGCCAAACAT;SOR=0.713;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=261;TCF=128;TCR=133;TR=186;WE=47872385;WS=47872367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,207:0.74:281
chr20	47874005	rs3021	A	G	5573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.033;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=137;NR=87;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.116;SC=CAGTGCCACAATGGTCTAGCC;SOR=0.824;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=317;TCF=191;TCR=126;TR=224;WE=47874017;WS=47873995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,233:0.70:331
chr20	47874239	rs11295162	CT	C	309.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.47;ReadPosRankSum=1.705;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,19:0.83:23
chr20	47874278	.	GC	G	570	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=27;MMLQ=16;MQ=56.49;NF=0;NR=20;PP=570;QD=30.9515449935;SC=TCGCTCTTTTGCCCAGGGTGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=20;WE=47874286;WS=47874268;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:10,20:0.67:30
chr20	47874294	.	G	A	222	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=44;MMLQ=17;MQ=58.09;NF=0;NR=13;PP=222;QD=19.7516317344;SC=GGTGGAGTGCGGTGGTGCGAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=13;WE=47874302;WS=47874284;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,13:0.65:20
chr20	47882893	rs238178	T	A	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.78;ReadPosRankSum=0.037;SOR=1.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,28:0.76:37
chr20	47886684	rs57950	G	A	5822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=368;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.411;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=118;NR=125;PP=2962;ReadPosRankSum=0.821;SC=GGGTAAAGTCGTATCTGCCCC;SOR=0.607;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=340;TCF=171;TCR=169;TR=243;WE=47886692;WS=47886674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,259:0.70:368
chr20	47892270	rs238191	T	C	2033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.215;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=24;PP=1558;ReadPosRankSum=-0.470;SC=ATTTCCTTCTTTTATTACTAG;SOR=1.221;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=111;TCF=74;TCR=37;TR=79;WE=47892278;WS=47892260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,81:0.71:114
chr20	47942174	.	C	CTGTTGTGAGGATTAAATGAAGTCATGTATGGGACTTGCTTGGTTTAGCATCCAAAGCACAATGAACGGGGTTATTAGATGGATGTTGTGAGAATTAAATGAAGTCATGTATGGGACTTGCTTGGTTTAGCATCCAAAGCACAATGAACAGGGTTATTAGATGGATGTTGTGAGAATTAAATGAAGTCATGTATGGGACTTGCTTGGTTTAGCATCCAAAGCACAATGAACGGGGTTATTAGATGGA	48839.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=0.000;DP=526;ExcessHet=3.0103;FS=113.614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=93.38;ReadPosRankSum=-6.410;SOR=5.026;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:443,80:0.15:523
chr20	47956674	.	T	TATA	113.87	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=-0.000;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=22.77;ReadPosRankSum=-1.282;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr20	48099623	rs74361372	C	T	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=4.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.44;ReadPosRankSum=-0.924;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr20	48099637	rs34725736	CTTT	C	562.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=6.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.74;MQRankSum=1.142;QD=20.84;ReadPosRankSum=-0.793;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,20:0.74:27
chr20	48129706	rs5629	G	T	849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.86;ReadPosRankSum=-0.314;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:232,65:0.22:297
chr20	48130628	rs6019879	T	C	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=220;ReadPosRankSum=0.845;SC=TGTGTGAAGATAGGAGGCTTA;SOR=0.608;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=51;TCF=48;TCR=3;TR=16;WE=48130636;WS=48130624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,16:0.30:53
chr20	48130982	rs7274202	C	T	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.75;ReadPosRankSum=0.685;SOR=0.354;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,10:0.17:60
chr20	48184462	rs6091005	C	T	204.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.60;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr20	48184654	.	C	CGCGGGGCTGGCGGGGCTG	387.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=4;PP=2019;SC=CCCAAGCCATCGCGGGGCTGG;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=4;WE=48184662;WS=48184644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr20	48184734	rs7262428	G	C	90.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=61;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=5;PP=115;SC=CCCCCACCCGGCGCGCCCCTC;SOR=1.609;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=48184742;WS=48184724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr20	48184839	rs566544	T	G	196.90	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.38;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr20	48184840	rs566542	T	G	196.90	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.38;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr20	48184845	rs5580	A	C	196.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.38;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr20	48184857	rs566508	C	G	241.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.31;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr20	48184871	rs566468	AT	GG	241.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.31;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr20	48257149	rs421801	C	T	14082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-3.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=790;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.363;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=271;NR=315;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.750;SC=CTTTCATTGCCTCTTGAAAGC;SOR=0.568;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=753;TCF=342;TCR=411;TR=586;WE=48257157;WS=48257139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,618:0.78:789
chr20	48260203	rs6122802	G	A	8114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=521;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=174;NR=194;PP=2962;ReadPosRankSum=1.571;SC=CAGAGACGGGGAAAAGGGATT;SOR=0.733;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=479;TCF=225;TCR=254;TR=368;WE=48260211;WS=48260193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,368:0.75:491
chr20	48263445	rs6125700	T	C	4840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.318;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=128;NR=61;PP=2962;ReadPosRankSum=0.898;SC=AGATCAAGAGTGCCCTCCCCT;SOR=0.853;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=236;TCF=160;TCR=76;TR=189;WE=48263453;WS=48263435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,197:0.80:247
chr20	48273299	rs4810968	T	C	10197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=358;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=128;NR=216;PP=2965;SC=TAAAAAAACATACCACATAGC;SOR=1.382;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=346;TCF=129;TCR=217;TR=344;WE=48273307;WS=48273289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,358:1.00:358
chr20	48300990	rs6019972	C	T	1717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-5.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=1;PP=1117;ReadPosRankSum=1.329;SC=GTCCCAGCTGCTGGGGAGGCT;SOR=1.802;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=62;TCR=1;TR=51;WE=48300998;WS=48300980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,63:0.83:76
chr20	48301102	rs11477014	GA	G	11109.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=601;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.373;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.152;NF=62;NR=205;PP=2980;ReadPosRankSum=0.634;SC=TCCTCAAGAAGAAAAAAAAGT;SOR=0.579;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=376;TCF=95;TCR=281;TR=267;WE=48301111;WS=48301092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,468:0.79:591
chr20	48429316	rs11281224	A	AGACGGAGG	87.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.04;ReadPosRankSum=-0.605;SOR=0.533;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,1:0.02:43
chr20	48429508	rs58677849	GG	CC	12938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=116;NR=139;PP=2947;SC=TTTCCCGGGCGGCGGAGGCGG;SOR=0.950;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=267;TCF=121;TCR=146;TR=255;WE=48429517;WS=48429498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,296:1.00:296
chr20	48456238	rs2025958	G	A	1068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=25;PP=707;SC=ATATTATTATGTTATATATCC;SOR=2.494;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=32;WE=48456246;WS=48456228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr20	48467560	rs532237	G	C	749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=21;PP=607;SC=TGAATCAAAAGTATCCTAAAG;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=48467568;WS=48467550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr20	48479356	rs3092598	TATGA	T	1513.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=28;NR=1;PP=1441;SC=TGAATGATGGTATGAATGAAT;SOR=5.728;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=33;TCF=30;TCR=3;TR=29;WE=48479367;WS=48479352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr20	48491207	rs56309244	G	A	1145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=414;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.77;ReadPosRankSum=1.550;SOR=0.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:326,88:0.21:414
chr20	48491258	rs542234	T	G	20043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=740;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=378;NR=312;PP=2965;SC=TGGCCATCCTTTTCTCAGGCA;SOR=0.891;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=690;TCF=378;TCR=312;TR=690;WE=48491266;WS=48491248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,739:1.00:739
chr20	48494650	rs6020100	A	G	1178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=6;NR=38;PP=1011;SC=TTTGTAGATCAATAAACACAT;SOR=4.565;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=6;TCR=38;TR=44;WE=48494658;WS=48494640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr20	48522124	rs78700554	T	G	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.90;ReadPosRankSum=0.682;SOR=0.824;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,23:0.23:100
chr20	48522585	rs492702	G	A	671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.46;ReadPosRankSum=-1.406;SOR=0.716;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:219,54:0.20:273
chr20	48524827	rs2769982	A	G	1347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FS=0.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.84;ReadPosRankSum=0.953;SOR=0.652;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:260,91:0.26:351
chr20	48561893	rs4810993	A	G	3770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=85;NR=40;PP=2496;SC=TCACTAACTTATGGGCTCTGA;SOR=1.470;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=126;TCF=85;TCR=41;TR=125;WE=48561901;WS=48561883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr20	48562083	rs11473738	G	GTTGGACACC	8488.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=70;PP=2900;SC=ATACAAAGAGGTTGCATGCCC;SOR=1.440;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=110;TCF=17;TCR=93;TR=86;WE=48562091;WS=48562071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr20	48562116	rs79598075	T	C	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.47;ReadPosRankSum=0.063;SOR=0.740;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:114,23:0.17:137
chr20	48562152	rs117126892	G	A	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.02;ReadPosRankSum=1.061;SOR=0.654;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,16:0.21:77
chr20	48562797	.	CTT	C	107.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.071;ClippingRankSum=0.000;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=18.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.63;ReadPosRankSum=0.914;SOR=2.794;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,8:0.20:41
chr20	48599473	rs113842434	AC	A	516.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=3;PP=352;SC=ACCCCCCACCACCCCCCCGGA;SOR=3.500;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=14;WE=48599481;WS=48599463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr20	48713049	rs6012831	G	A	7452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=152;NR=109;PP=2965;SC=GCATCAGAGGGGGTTCAAATA;SOR=1.019;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=261;TCF=152;TCR=109;TR=261;WE=48713057;WS=48713039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,273:1.00:273
chr20	48729677	rs126907	C	G	8514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=150;NR=183;PP=2965;SC=TTGCGTCGCTCTTGCTTGAAG;SOR=1.236;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=334;TCF=150;TCR=184;TR=333;WE=48729685;WS=48729667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,326:1.00:326
chr20	48746189	rs6122878	C	T	13046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=486;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=217;NR=245;PP=2965;SC=TGATAGCTGTCGGGTCAATGT;SOR=0.847;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=463;TCF=217;TCR=246;TR=462;WE=48746197;WS=48746179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,485:1.00:485
chr20	48759969	.	G	A	1027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.510;ClippingRankSum=0.000;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.244;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=12;PP=860;ReadPosRankSum=2.395;SC=ACACACACACGCGCCAGTTAC;SOR=0.465;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=79;TCF=63;TCR=16;TR=49;WE=48759977;WS=48759959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,43:0.60:72
chr20	48770159	rs232733	T	C	4100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=84;PP=2608;SC=CCCGGCCAGTTCTCGGCGCCC;SOR=1.710;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=129;TCF=44;TCR=85;TR=127;WE=48770167;WS=48770149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr20	49214156	rs6020624	A	G	2598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=429;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=65;PP=1664;ReadPosRankSum=-0.666;SC=CAGCTCATCCAGGGCGAAGTC;SOR=0.669;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=397;TCF=215;TCR=182;TR=138;WE=49214164;WS=49214146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:281,147:0.34:428
chr20	49225953	rs73615305	A	G	791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.763;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=32;PP=569;ReadPosRankSum=0.419;SC=AGGGCCTCTAACCATCCCTGC;SOR=0.440;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=141;TCF=34;TCR=107;TR=44;WE=49225961;WS=49225943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,44:0.30:148
chr20	49227294	rs4811083	T	C	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=7.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.27;ReadPosRankSum=-0.516;SOR=0.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,11:0.19:58
chr20	49227544	rs144167038	G	GGGCTTAGTGCCGGGCC	1486.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FS=2.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.69;ReadPosRankSum=-0.445;SOR=0.969;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:127,44:0.26:171
chr20	49236478	rs6122953	G	A	1124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FS=0.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.65;ReadPosRankSum=0.488;SOR=0.622;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:234,74:0.24:308
chr20	49367076	rs6020721	T	G	2285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.710;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=52;PP=1346;ReadPosRankSum=0.750;SC=GACTTGTACATTTGGCTAGTT;SOR=0.393;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=122;TCF=45;TCR=77;TR=86;WE=49367084;WS=49367066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,97:0.71:136
chr20	49434669	rs5841815	TA	T	475.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=3.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.29;MQRankSum=2.287;QD=4.53;ReadPosRankSum=1.015;SOR=0.415;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,39:0.37:105
chr20	49448800	.	CT	C	128.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.052;ClippingRankSum=0.000;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=1.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.30;ReadPosRankSum=0.249;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,13:0.33:39
chr20	49507892	rs761240	T	G	1077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=0;PP=833;SC=TCACACTGGATATCAGAGTTC;SOR=4.743;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=31;WE=49507900;WS=49507887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
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chr20	49620783	rs1054268	G	T	11770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=436;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=215;NR=196;PP=2965;SC=TGCCGCTCAGGATGCTGCTCA;SOR=0.779;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=411;TCF=215;TCR=196;TR=411;WE=49620791;WS=49620773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,436:1.00:436
chr20	49621149	rs6122993	T	C	10586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=382;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=205;NR=156;PP=2965;SC=TGCGACGGCCTGCGGCGGCGC;SOR=1.024;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=361;TCF=205;TCR=156;TR=361;WE=49621157;WS=49621139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,381:1.00:381
chr20	49621399	rs4811110	G	C	4319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=106;PP=2716;SC=AGGAAAGGAGGGCAGAAGCTC;SOR=1.777;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=157;TCF=50;TCR=107;TR=156;WE=49621407;WS=49621389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr20	49626971	rs6122994	C	T	812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=26;PP=674;SC=ATGCAGATTCCGCAGATATTC;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=49626979;WS=49626961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr20	50008006	rs71192523	A	AG	267.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=2.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.21;MQRankSum=2.530;QD=3.43;ReadPosRankSum=0.681;SOR=0.353;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,19:0.24:78
chr20	50015107	rs11086333	TAA	T,TA	170.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.357;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5172,0.4828;FS=0.000;HP=13;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-0.000;NF=10,10;NR=6,6;PP=182,7;ReadPosRankSum=-1.707;SC=ATACTTTACTTAAAAAAAAAA;SOR=0.495;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=19;TCF=12;TCR=7;TR=16,16;WE=50015116;WS=50015097;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.58:12
chr20	50015300	rs11478012	GA	G	1049.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.05;MQRankSum=0.000;QD=5.38;ReadPosRankSum=0.297;SOR=0.708;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:127,68:0.35:195
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chr20	50071258	rs228840	A	G	1438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.775;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=40;PP=983;ReadPosRankSum=1.406;SC=TCACTGTGATAAGGGGAGATG;SOR=0.161;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=69;TCF=10;TCR=59;TR=49;WE=50071266;WS=50071248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,54:0.71:76
chr20	50092027	rs6013193	T	G	2474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=25;PP=1542;SC=GCTCCAAGGGTATCTCCAGGA;SOR=1.460;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=57;TCR=25;TR=82;WE=50092035;WS=50092017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr20	50092287	rs6021231	T	C	1350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=33;PP=986;SC=TCATGGGCAGTAGAGAGACTA;SOR=2.461;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=44;TCF=10;TCR=34;TR=43;WE=50092295;WS=50092277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr20	50140627	rs3746420	G	C	1373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=401;ExcessHet=3.0103;FS=4.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.44;ReadPosRankSum=-0.885;SOR=0.966;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:306,93:0.23:399
chr20	50178965	rs2869427	G	C	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=262;ReadPosRankSum=1.008;SC=CCTGTGCGCCGAGGGCGAGCG;SOR=1.358;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=14;WE=50178973;WS=50178955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,19:0.79:24
chr20	50223975	rs2273090	G	T	4032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=38;PP=2526;SC=TTTCAGATTCGTTTCTTCTCT;SOR=1.675;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=96;TCR=38;TR=134;WE=50223983;WS=50223965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr20	50224161	rs2273089	C	T	6828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=134;PP=2965;SC=GCCGGTTTCGCGGGGGGCTCA;SOR=1.094;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=233;TCF=99;TCR=134;TR=233;WE=50224169;WS=50224151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr20	50224206	rs3818004	G	A	3333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=79;PP=2204;SC=TTATTCTCCCGCTAACGAGAT;SOR=2.183;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=28;TCR=79;TR=107;WE=50224214;WS=50224196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr20	50225206	rs3827032	G	A	6824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=161;PP=2965;SC=TGGCTGACGCGATAGGAGCTA;SOR=2.202;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=218;TCF=57;TCR=161;TR=218;WE=50225214;WS=50225196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr20	50225235	rs6021312	G	A	3795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=101;PP=2942;SC=GCCAGCCTCCGGCACCCAAGT;SOR=4.407;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=11;TCR=101;TR=112;WE=50225243;WS=50225225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr20	50230462	rs2235863	A	G	7275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=156;PP=2965;SC=CATTGTAGGAAATCTTTGAAG;SOR=1.573;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=238;TCF=81;TCR=157;TR=237;WE=50230470;WS=50230452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr20	50238545	rs2235862	A	G	6386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=146;NR=89;PP=2965;SC=GGGCCCACTCAAGGTTAGGAG;SOR=1.226;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=235;TCF=146;TCR=89;TR=235;WE=50238553;WS=50238535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr20	50241714	rs2235859	C	A	2564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=15;PP=1769;SC=CCCTTCCCTGCGGGCAGCCCG;SOR=2.888;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=64;TCR=15;TR=79;WE=50241722;WS=50241704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr20	50244098	rs2426317	T	C	7119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=143;NR=92;PP=2965;SC=GGGAGGCAGGTGGGGCTGCAA;SOR=1.105;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=237;TCF=144;TCR=93;TR=235;WE=50244106;WS=50244088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chr20	50255762	rs2426333	T	C	1266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=2;PP=1047;SC=TATATTCCCTTGTTAGTCTGG;SOR=5.031;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=36;TCR=2;TR=38;WE=50255770;WS=50255752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr20	50255849	rs6063682	A	C	8064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=164;NR=120;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.768;SC=TGGGGTACTTAAGCACTTTAA;SOR=0.957;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=286;TCF=165;TCR=121;TR=284;WE=50255857;WS=50255839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,304:0.99:306
chr20	50256107	rs2426334	T	C	870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=22;PP=670;SC=CAGGCTGTGCTATGAACACAA;SOR=4.255;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=24;WE=50256115;WS=50256097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr20	50273749	rs6021355	G	A	9391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=347;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=134;NR=189;PP=2965;SC=TTGGAGAGTGGAAGAACAGCC;SOR=1.156;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=323;TCF=134;TCR=189;TR=323;WE=50273757;WS=50273739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,347:1.00:347
chr20	50286484	rs5841856	T	TA	3262.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FS=5.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.60;MQRankSum=1.429;QD=17.54;ReadPosRankSum=-1.392;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,155:0.83:186
chr20	50287553	rs6013248	G	A	1339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=1;PP=952;SC=GCAGCAACACGCATCTCTCAT;SOR=4.664;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=38;TCF=37;TCR=1;TR=38;WE=50287561;WS=50287552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr20	50287790	rs2255342	A	G	22583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=861;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=398;NR=422;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.359;SC=CCAGGTTCACACGCAAACTAG;SOR=0.336;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=823;TCF=400;TCR=423;TR=820;WE=50287798;WS=50287780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,858:1.00:859
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chr20	50290654	rs6091346	T	C	8575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=182;NR=106;PP=2965;ReadPosRankSum=0.675;SC=GAGAAGAAGATGTCACGGCAG;SOR=0.507;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=289;TCF=183;TCR=106;TR=288;WE=50290662;WS=50290644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,313:1.00:314
chr20	50305755	rs6067898	G	A	16299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=383;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.01;SOR=1.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,379:1.00:379
chr20	50305761	rs6067899	G	A	15695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.97;SOR=1.089;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,349:1.00:349
chr20	50310466	rs6021389	T	C	6961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=79;PP=2965;SC=TGCCATCCCATGCCTGGCCCC;SOR=0.831;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=175;TCF=96;TCR=79;TR=175;WE=50310491;WS=50310456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr20	50310483	rs143733288	A	ATC	12562.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=86;PP=2957;SC=CCCCCCAGGTATGAGTTTGAG;SOR=0.752;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=133;TCF=42;TCR=91;TR=125;WE=50310491;WS=50310456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,278:1.00:278
chr20	50310709	rs6013259	G	A	3038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=70;PP=1988;SC=TCTGGGCAGCGTCTGCTCTGG;SOR=1.765;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=33;TCR=70;TR=103;WE=50310717;WS=50310699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr20	50314200	rs1205690	A	G	1843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=53;PP=1582;SC=TTCAACCGCTACAGAGGCCGT;SOR=5.856;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=55;TCF=2;TCR=53;TR=55;WE=50314208;WS=50314190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr20	50329416	rs1205698	T	C	4270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=92;NR=45;PP=2425;SC=TTCCCACACCTGCGGCCCGGG;SOR=1.349;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=137;TCF=92;TCR=45;TR=137;WE=50329424;WS=50329406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr20	50329704	rs1205699	G	A	2479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=63;PP=1814;SC=CAGGAAAGGCGAGAGGTCACT;SOR=2.698;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=18;TCR=63;TR=81;WE=50329712;WS=50329694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr20	50342555	rs1205709	C	T	2000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=57;PP=1626;SC=TGAATAACATCTAAAAACATT;SOR=4.582;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=5;TCR=57;TR=62;WE=50342563;WS=50342545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr20	50384821	rs3746416	A	G	8915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=158;NR=155;PP=2965;SC=AAAGGAAAACACGGGCCCAGG;SOR=0.699;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=315;TCF=158;TCR=157;TR=313;WE=50384829;WS=50384811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,345:1.00:345
chr20	50406985	rs13043248	G	A	13604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=833;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=302;NR=270;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.011;SC=AGATAGCGCCGGTGCTGCCGT;SOR=0.671;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=797;TCF=425;TCR=372;TR=572;WE=50406993;WS=50406975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:234,595:0.72:829
chr20	50407966	rs13038893	C	T	8478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=474;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=181;NR=162;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.623;SC=ATGTGTCTAGCGCCACAGTGG;SOR=0.692;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=443;TCF=233;TCR=210;TR=343;WE=50407974;WS=50407956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,366:0.77:473
chr20	50408482	rs6013281	A	G	12170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=458;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=216;NR=228;PP=2965;SC=GCAAGGTCACATTAGTGTTGG;SOR=0.756;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=445;TCF=216;TCR=229;TR=444;WE=50408490;WS=50408472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,456:1.00:456
chr20	50668746	rs201746789	CTTTATATTTATATA	C	253.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.19;MQRankSum=-0.000;QD=31.72;ReadPosRankSum=1.534;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr20	50705211	rs2273382	A	G	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FS=1.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.45;ReadPosRankSum=-0.361;SOR=0.525;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:170,54:0.24:224
chr20	50705584	rs973341	C	T	724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FS=1.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.46;ReadPosRankSum=-1.942;SOR=0.590;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:236,59:0.20:295
chr20	50782303	rs6021771	A	G	3203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=22;PP=2414;SC=GTAGTTTGGAACACATCCATG;SOR=2.584;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=80;TCR=22;TR=102;WE=50782311;WS=50782293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr20	51802132	rs2010156	T	C	4493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=106;NR=43;PP=2748;SC=GCACTCCAGCTGGGGATACAG;SOR=1.959;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=151;TCF=107;TCR=44;TR=149;WE=51802140;WS=51802122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr20	51870336	rs739869	G	C	1765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=0.633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.17;ReadPosRankSum=1.694;SOR=0.695;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:433,124:0.22:557
chr20	51870849	rs739870	T	C	15422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=575;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=274;NR=272;PP=2965;SC=GCGACTCCTTTGATTCCCTCC;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=548;TCF=275;TCR=273;TR=546;WE=51870857;WS=51870839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,572:1.00:572
chr20	52185814	rs4602270	C	A	2431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.043;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=61;PP=1557;ReadPosRankSum=1.608;SC=CTAAGGAAAACAACATTTTTT;SOR=0.495;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=114;TCF=39;TCR=75;TR=94;WE=52185822;WS=52185804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,101:0.82:123
chr20	52557958	.	C	CGCGCGCGTGTGTGT	1971.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.074;ClippingRankSum=0.000;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=21.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.88;MQRankSum=2.596;QD=18.96;ReadPosRankSum=1.619;SOR=2.729;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,62:0.60:104
chr20	52561702	rs4811486	C	T	2167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=4.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=68;PP=1674;ReadPosRankSum=-1.946;SC=TGCCCGGGTTCGATACCCAGT;SOR=0.653;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=14;TCR=87;TR=79;WE=52561710;WS=52561692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,82:0.75:109
chr20	52609326	rs6013860	C	G	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5005;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=415;ReadPosRankSum=0.717;SC=ACAAAACACCCTGTAAATGTT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=18;WE=52609334;WS=52609316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,19:0.83:23
chr20	52611392	rs75411871	A	G	925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.237;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=4;PP=854;ReadPosRankSum=0.306;SC=ACAACCTAACAGCACTATTAA;SOR=2.292;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=72;TCF=62;TCR=10;TR=44;WE=52611400;WS=52611382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,44:0.61:72
chr20	52611427	rs146234679	TACACACAC	T	1566.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.931;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQ=60.11;MQRankSum=1.974;NF=12;NR=22;PP=2059;ReadPosRankSum=1.490;SC=ATAGATATGATACACACACAC;SOR=0.343;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=125;TCF=55;TCR=70;TR=34;WE=52611444;WS=52611417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,55:0.31:178
chr20	52611540	rs208381	C	A	7183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=438;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.242;NF=147;NR=151;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.645;SC=TACACACTTCCAACTACCTAC;SOR=0.739;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=414;TCF=205;TCR=209;TR=298;WE=52611548;WS=52611530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,312:0.72:436
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chr20	52645534	rs466264	T	C	730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FS=3.614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.95;ReadPosRankSum=0.226;SOR=0.471;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:191,57:0.23:248
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chr20	52685084	rs290446	T	C	708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.9963;FS=3.882;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=26;PP=508;ReadPosRankSum=-1.648;SC=TCACACACATTGTCTCCTTTT;SOR=2.584;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=29;WE=52685092;WS=52685074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,30:0.88:34
chr20	52774579	rs1570670	A	G	2392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.333;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=23;PP=1531;ReadPosRankSum=-0.216;SC=TGCAAAGTGTATCTTCCAAGG;SOR=0.160;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=99;TCF=74;TCR=25;TR=81;WE=52774587;WS=52774569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,92:0.84:110
chr20	52774601	rs2274130	A	G	3457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.753;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=43;PP=2181;ReadPosRankSum=3.254;SC=TTTGTAAGGTATAGAATATAC;SOR=0.370;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=162;TCF=112;TCR=50;TR=126;WE=52774609;WS=52774591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,139:0.79:177
chr20	52774903	rs2274132	G	A	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=172;ReadPosRankSum=0.883;SC=TCTTGAGTTAGTTAAAACCCC;SOR=0.223;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=11;WE=52774911;WS=52774893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr20	52775528	rs2296239	C	T	11032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=695;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.571;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=247;NR=218;PP=2962;ReadPosRankSum=1.181;SC=CTTTTAAATACGGCATATTCC;SOR=0.748;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=653;TCF=347;TCR=306;TR=465;WE=52775536;WS=52775518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:203,492:0.71:695
chr20	52775728	rs2296240	A	G	2119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.445;HP=6;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=63;PP=1638;ReadPosRankSum=1.060;SC=TATTAGCTGAAAAAAAGGTGA;SOR=1.886;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=90;TCF=13;TCR=77;TR=72;WE=52775736;WS=52775718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,75:0.78:96
chr20	52779082	rs6127119	C	T	1143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-5.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=0;PP=966;ReadPosRankSum=-2.258;SC=GGCACCGTGGCATAGATGCTG;SOR=2.790;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=52;TCR=0;TR=43;WE=52779090;WS=52779072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,42:0.81:52
chr20	52786073	rs4809960	T	C	9225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.03;NF=201;NR=115;PP=2965;SC=AAAAGAGCCATGTTTTATCCG;SOR=1.400;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=317;TCF=201;TCR=116;TR=316;WE=52786081;WS=52786063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,336:1.00:336
chr20	52786219	rs2296241	G	A	20298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=755;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=317;NR=387;PP=2965;SC=CCATAAAATCGGCCAAGACCT;SOR=0.912;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=705;TCF=318;TCR=387;TR=704;WE=52786227;WS=52786209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,755:1.00:755
chr20	52788314	rs2259735	T	C	3804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.624;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.99;MQRankSum=-0.542;NF=54;NR=105;PP=2211;ReadPosRankSum=-0.893;SC=AAACAAACACTGAGAATCATG;SOR=0.817;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=209;TCF=71;TCR=138;TR=159;WE=52788322;WS=52788304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,170:0.77:222
chr20	52789743	rs2248137	C	G	1886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-4.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.844;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=33;PP=1417;ReadPosRankSum=-0.428;SC=GGGGACCCTCCCTGCCCAGAC;SOR=0.588;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=98;TCF=48;TCR=50;TR=71;WE=52789751;WS=52789733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,75:0.71:105
chr20	53266929	rs79858797	T	A	1184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FS=4.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.42;ReadPosRankSum=-0.328;SOR=0.466;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:261,85:0.25:346
chr20	54823779	rs13044293	G	T	8040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=169;NR=108;PP=2965;SC=AAACTCTAAGGCCAGATTGAA;SOR=1.082;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=278;TCF=169;TCR=109;TR=277;WE=54823787;WS=54823769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,300:1.00:300
chr20	54941124	rs6099114	T	C	2561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=493;ExcessHet=3.0103;FS=0.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-2.785;QD=5.20;ReadPosRankSum=-2.511;SOR=0.725;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:392,101:0.20:493
chr20	54941140	rs6099115	C	T	2241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=439;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-2.928;QD=5.11;ReadPosRankSum=-0.747;SOR=0.748;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:356,83:0.19:439
chr20	54941268	rs6099116	G	A	907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FS=0.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=0.612;QD=4.39;ReadPosRankSum=-0.480;SOR=0.748;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:152,55:0.27:207
chr20	54956707	rs6024840	A	G	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.941;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=16;PP=256;ReadPosRankSum=-0.482;SC=CAAACTCTTCATGTAAAACCA;SOR=0.520;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=88;TCF=28;TCR=60;TR=25;WE=54956715;WS=54956697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,27:0.30:91
chr20	54961463	rs1047972	T	C	7266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-0.044;NF=144;NR=98;PP=2965;ReadPosRankSum=0.932;SC=TGCAAAGGAATGCGCTGGGAA;SOR=0.407;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=244;TCF=145;TCR=99;TR=242;WE=54961471;WS=54961453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,259:1.00:260
chr20	54963149	rs67542863	C	CGACAAGACCAACCTCCATGTGGGTTTATAAATGTGAATGAGATTACAGATTATTCAATTTA	5930.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=109.83;SOR=1.567;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr20	54963303	rs6099126	C	T	1607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=502;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.22;ReadPosRankSum=-0.992;SOR=0.744;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:379,120:0.24:499
chr20	54974424	rs2426617	C	A	3252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=69;PP=2011;SC=GTATGTGAGACGTTGATGTTA;SOR=1.437;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=40;TCR=69;TR=109;WE=54974432;WS=54974414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr20	55012154	rs8117984	G	C	1158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.14;ReadPosRankSum=-0.362;SOR=1.298;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,30:0.62:48
chr20	55012160	rs77539228	A	T	1258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.89;ReadPosRankSum=-0.029;SOR=0.468;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,34:0.62:55
chr20	55012318	rs911159	G	A	10094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=644;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.220;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=227;NR=204;PP=2962;ReadPosRankSum=0.893;SC=AGCAACACGTGCCAGAAAGCG;SOR=0.788;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=600;TCF=311;TCR=289;TR=431;WE=55012326;WS=55012308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,459:0.71:644
chr20	55025512	rs6024884	C	G	2806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.884;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=27;PP=1939;ReadPosRankSum=2.417;SC=TCTACCATTACAGCATCATGA;SOR=0.563;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=126;TCF=93;TCR=33;TR=101;WE=55025520;WS=55025502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,110:0.79:139
chr20	55025762	rs6069753	G	A	2934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.097;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=75;PP=1977;ReadPosRankSum=0.785;SC=GCTAAGGTGCGGTGTTATGAA;SOR=0.354;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=140;TCF=37;TCR=103;TR=105;WE=55025770;WS=55025752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,117:0.75:155
chr20	55048496	rs11471796	T	TGAG	6398.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=56;PP=2976;SC=TAAGTGATTTTGAGAATTTTG;SOR=0.907;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=10;TCR=61;TR=65;WE=55048504;WS=55048486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr20	55070268	rs34552628	A	T	9961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=364;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=192;NR=131;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.667;SC=CTTTACATCCATCATGAACAT;SOR=0.430;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=325;TCF=193;TCR=132;TR=323;WE=55070276;WS=55070258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,363:1.00:364
chr20	55070539	rs3827107	G	C	935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=30;PP=711;SC=AGTGCTTTTGGGGGTGGGAGC;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=31;WE=55070547;WS=55070529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr20	55071639	rs6069763	A	G	2296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=9;PP=1830;SC=CAATCAATCTATCTGCTGCTG;SOR=3.675;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=59;TCR=9;TR=68;WE=55071647;WS=55071629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr20	55072472	rs6024911	A	G	15217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=547;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=273;NR=256;PP=2965;SC=TTTGCAATTTAGGGGGCCGCC;SOR=0.723;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=532;TCF=274;TCR=258;TR=529;WE=55072480;WS=55072462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,546:1.00:546
chr20	55088404	rs1059768	A	G	5925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=122;NR=86;PP=2965;SC=TGATGTCATCATGCTCAATGG;SOR=0.999;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=208;TCF=122;TCR=86;TR=208;WE=55088412;WS=55088394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr20	55108617	rs3209183	C	A	7664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=177;PP=2965;SC=TGTGATACTGCAGTGTCAAAG;SOR=1.972;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=250;TCF=73;TCR=177;TR=250;WE=55108625;WS=55108607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,270:1.00:270
chr20	55111371	rs2296130	G	A	8276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=122;NR=163;PP=2965;SC=CCGAAGTGCAGAATCTTAAAG;SOR=1.017;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=285;TCF=122;TCR=163;TR=285;WE=55111379;WS=55111361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,303:1.00:303
chr20	55206820	rs41307195	G	T	7956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=454;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.634;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=189;NR=138;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.544;SC=ACTCCTCTAGGCTCCCCCGAA;SOR=0.785;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=422;TCF=243;TCR=179;TR=327;WE=55206828;WS=55206810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,350:0.78:451
chr20	55209257	rs35023929	T	C	5370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.971;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=100;NR=130;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.749;SC=TGGACAAGATTGGGTTGAATC;SOR=0.793;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=312;TCF=137;TCR=175;TR=230;WE=55209265;WS=55209247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,241:0.74:326
chr20	55212711	rs6025024	T	G	1088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.434;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=3;PP=829;ReadPosRankSum=-1.493;SC=CCAGCCTCAGTGTAGTTGGTT;SOR=0.373;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=48;TCF=45;TCR=3;TR=39;WE=55212719;WS=55212701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,40:0.80:50
chr20	55800937	rs6070031	C	T	4417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.828;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=101;PP=2770;ReadPosRankSum=0.636;SC=TCTGCTGGAACGTGAGCTTCC;SOR=0.961;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=249;TCF=114;TCR=135;TR=178;WE=55800945;WS=55800927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,192:0.72:268
chr20	55918014	rs2236330	A	G	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=33;ReadPosRankSum=-0.706;SC=CACGACTAACATAAGTGTTGT;SOR=0.188;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=4;WE=55918022;WS=55918004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr20	55929881	rs4811837	T	C	1574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=588;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.68;ReadPosRankSum=0.025;SOR=0.664;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:463,124:0.21:587
chr20	55966904	rs117963839	C	T	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FS=2.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.86;ReadPosRankSum=-2.011;SOR=0.936;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:135,36:0.21:171
chr20	55975099	rs6014986	T	A	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=1.250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.82;ReadPosRankSum=-0.716;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,13:0.15:86
chr20	55982579	rs3764719	T	C	1760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=694;ExcessHet=3.0103;FS=1.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.54;ReadPosRankSum=-2.510;SOR=0.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:549,145:0.21:694
chr20	56089869	rs11086612	GT	G	4318.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FS=14.740;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.12;MQRankSum=0.360;QD=18.86;ReadPosRankSum=-0.701;SOR=0.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:22,207:0.90:229
chr20	56098070	rs11477755	GA	G	4989.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=44;PP=2969;SC=TGCCCATAAAGAAAAACAGCA;SOR=1.773;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=118;TCF=65;TCR=53;TR=105;WE=56098078;WS=56098060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr20	56098733	rs6025606	T	C	11993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=436;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=234;NR=172;PP=2965;SC=ATCAGTCCAGTAGTTTCAGCC;SOR=1.063;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=408;TCF=235;TCR=173;TR=406;WE=56098741;WS=56098723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,433:1.00:433
chr20	56099114	rs6070128	C	G	16508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=591;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=275;NR=279;PP=2965;SC=GAGGTACGCTCGGCCTCCAAC;SOR=0.724;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=555;TCF=275;TCR=280;TR=554;WE=56099122;WS=56099104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,589:1.00:589
chr20	56099305	rs11699220	G	A	2461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=67;PP=1925;SC=GTTTCCATAGGGGGGAGAAGG;SOR=2.948;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=15;TCR=67;TR=82;WE=56099313;WS=56099295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr20	56136536	rs1042521	A	G	13273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=483;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=203;NR=246;PP=2965;SC=TGGACAGCCTACCCCAGGCAG;SOR=0.947;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=449;TCF=203;TCR=246;TR=449;WE=56136544;WS=56136526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,483:1.00:483
chr20	56137798	rs1062600	G	A	12167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.77;SOR=0.783;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,278:1.00:278
chr20	56137807	rs1042523	A	G	12193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.39;SOR=0.744;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,281:1.00:281
chr20	56137834	rs1062601	A	G	6874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=123;NR=121;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.533;SC=TGACGGATTCACCCTACGTGG;SOR=0.239;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=246;TCF=123;TCR=123;TR=244;WE=56137842;WS=56137824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,259:1.00:260
chr20	56137895	rs707555	G	C	6275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=111;NR=99;PP=2965;SC=CCTGGAAGCAGTGGGCGATGG;SOR=0.720;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=210;TCF=111;TCR=99;TR=210;WE=56137903;WS=56137885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr20	56138040	rs2070755	G	C	7734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=154;NR=110;PP=2965;SC=GGACCCCCAAGCAGGGCCCTG;SOR=0.972;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=265;TCF=155;TCR=110;TR=264;WE=56138048;WS=56138030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,281:1.00:281
chr20	56139403	rs2070756	T	C	16887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=637;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=269;NR=323;PP=2965;SC=TAGCTTCAGGTGTCACCATCA;SOR=0.973;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=593;TCF=270;TCR=323;TR=592;WE=56139411;WS=56139393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,635:1.00:635
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chr20	56179875	rs8118279	A	G	1340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=40;PP=980;ReadPosRankSum=-0.427;SC=TGGCCTGGGCATTTCCACAGG;SOR=0.620;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=20;TCR=54;TR=55;WE=56179883;WS=56179865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,56:0.73:77
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chr20	56190634	rs2073145	C	T	5395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.527;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=129;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.161;SC=TGGGGCCTCTCGGCTGCAGAA;SOR=0.620;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=284;TCF=116;TCR=168;TR=220;WE=56190642;WS=56190624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,237:0.79:300
chr20	56191172	rs11468882	CAG	C	21946.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=563;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=244;PP=2973;SC=AACCAAGGCACAGAGAGAGGA;SOR=0.708;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=359;TCF=82;TCR=277;TR=305;WE=56191181;WS=56191162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,532:1.00:532
chr20	56227532	rs6025699	T	C	6419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=134;PP=2965;SC=AGATGGTGGGTGGCAGGTCGA;SOR=1.202;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=233;TCF=98;TCR=135;TR=231;WE=56227540;WS=56227522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr20	56228019	rs8183538	G	C	3353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=32;PP=2153;SC=AGCCCACACTGTTCCAGCCGC;SOR=1.650;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=78;TCR=32;TR=110;WE=56228027;WS=56228009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr20	56726107	rs6070358	C	T	16006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=610;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=287;NR=278;PP=2965;SC=TGGGATCGGGCAACGCGGTGG;SOR=0.706;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=565;TCF=287;TCR=278;TR=565;WE=56726115;WS=56726097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,610:1.00:610
chr20	56793546	rs583987	A	G	4307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=48;PP=2783;SC=CGTTCCCACCAGGAGCTAATG;SOR=1.524;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=150;TCF=102;TCR=48;TR=150;WE=56793554;WS=56793536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr20	56793706	rs584855	G	A	10315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=383;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=193;NR=179;PP=2965;SC=TGGTTCAGGCGGTGTGCAATG;SOR=0.741;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=372;TCF=193;TCR=179;TR=372;WE=56793714;WS=56793696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,383:1.00:383
chr20	56793764	rs1192511	G	A	7496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=111;NR=155;PP=2965;SC=TGGAGGCCCCGTGCTGGAGCA;SOR=1.134;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=267;TCF=112;TCR=155;TR=266;WE=56793772;WS=56793754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr20	56796267	rs521615	C	T	601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=1;PP=463;SC=GGGACCCTGACTGGTGGCTGA;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=56796275;WS=56796257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr20	56803676	.	C	CCCG	71	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=71;QD=47.0;SC=CCCGCCGCCGCCCGCCGCATC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=2;WE=56803684;WS=56803666;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:2,2:0.50:4
chr20	56807969	rs3818744	A	G	2804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=56;PP=1618;SC=CAAAGAAGTCATTTCAGAATC;SOR=1.300;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=95;TCF=39;TCR=56;TR=95;WE=56807977;WS=56807959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr20	56811400	rs474212	C	A	925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=41;PP=638;ReadPosRankSum=0.024;SC=GGCAAAAAAACAAAATTATTG;SOR=2.448;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=47;TCF=3;TCR=44;TR=44;WE=56811408;WS=56811382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,40:0.93:43
chr20	56820702	rs595292	G	T	7468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=181;NR=70;PP=2965;SC=CCTCTCAATGGGTATACAGTG;SOR=1.999;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=252;TCF=181;TCR=71;TR=251;WE=56820710;WS=56820692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr20	56820880	rs3746406	C	T	18221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=677;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=303;NR=336;PP=2965;SC=CTGCAAGCTACCAAGGACTTT;SOR=0.835;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=640;TCF=303;TCR=337;TR=639;WE=56820888;WS=56820870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,675:1.00:675
chr20	56821127	rs3746405	A	G	6528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=135;PP=2965;SC=AGCTTTGAGCAGGCGCTGGTC;SOR=0.961;Source=Platypus;TCF=135;WE=56821135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr20	56822236	rs1541117	C	A	2647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=17;PP=1894;SC=TTACTTTTTGCTTCTTTACAT;SOR=2.610;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=67;TCR=17;TR=84;WE=56822244;WS=56822226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr20	56822536	rs4811972	G	A	1483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=36;PP=1060;SC=TGAAGGGGCCGAGGGACTGGA;SOR=2.170;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=13;TCR=36;TR=49;WE=56822544;WS=56822526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr20	56823390	rs11471230	GTTTT	G	446.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=58;PP=1600;ReadPosRankSum=1.091;SC=AGCAGAACCTGTTTTTTTTAT;SOR=0.610;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=1;TCR=74;TR=59;WE=56823401;WS=56823380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,12:0.80:15
chr20	56825826	rs2282205	A	C	764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=1;PP=592;SC=GAAGTTATGAAATTTGAAATT;SOR=4.174;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=24;WE=56825834;WS=56825816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr20	56826934	rs6064631	T	A	6348.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=167;PP=2965;SC=TAAATTTTTTTAAAAAATCGA;SOR=1.805;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=242;TCF=75;TCR=167;TR=242;WE=56826942;WS=56826924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr20	56838389	rs6128295	A	G	1783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=6;PP=1343;SC=CTTATGGGACAGTGCCCACAG;SOR=4.277;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=58;TCR=6;TR=64;WE=56838397;WS=56838379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
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chr20	56861637	rs6026181	A	G	1049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=30;PP=814;SC=GAATCGCAACATTGAGAATTC;SOR=4.174;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=33;WE=56861645;WS=56861627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
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chr20	57292717	rs78774012	C	G	2984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.751;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=39;PP=1833;ReadPosRankSum=0.240;SC=TGAGGGCACACAGGGCTGCAC;SOR=0.424;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=142;TCF=94;TCR=48;TR=111;WE=57292725;WS=57292707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,124:0.79:156
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chr20	57293118	rs2426777	T	C	17896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=615;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.583;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.04;MQRankSum=0.904;NF=185;NR=131;PP=2962;ReadPosRankSum=1.598;SC=CCAGAACTGATGGAAAATCTC;SOR=0.786;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=490;TCF=278;TCR=212;TR=316;WE=57293132;WS=57293094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:177,436:0.71:613
chr20	57293124	rs10470038	A	AG	18489.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=2.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=648;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=2.735;NF=95;NR=140;PP=2966;ReadPosRankSum=1.175;SC=CTGATGGAAAATCTCTCCCCA;SOR=0.662;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=357;TCF=134;TCR=223;TR=235;WE=57293132;WS=57293094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:186,460:0.71:646
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chr20	57299030	rs201658287	GGAGGAGGAA	G	715.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.22;ReadPosRankSum=2.391;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,25:0.22:115
chr20	57360653	rs61349087	C	G	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.441;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=54;ReadPosRankSum=0.214;SC=AAAGAGCAAGCAAGAGAGAGA;SOR=0.033;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=5;WE=57360661;WS=57360643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
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chr20	57415110	rs1800900	A	G	2410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=9;PP=1765;SC=CTTCGGAGCCACTCTCTGCAG;SOR=3.716;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=71;TCR=9;TR=80;WE=57415118;WS=57415100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr20	57415455	rs1800902	C	T	4853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1525;ExcessHet=3.0103;FS=0.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.20;ReadPosRankSum=-0.882;SOR=0.751;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1174,345:0.23:1519
chr20	57415962	rs1800904	C	T	1791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=666;ExcessHet=3.0103;FS=0.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.70;ReadPosRankSum=2.762;SOR=0.825;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:521,143:0.22:664
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chr20	57565943	rs163782	G	C	17342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=648;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=329;NR=287;PP=2965;ReadPosRankSum=0.803;SC=TAGTAACGGGGTCTATGGTTT;SOR=0.278;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=618;TCF=331;TCR=287;TR=616;WE=57565951;WS=57565933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,644:1.00:645
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chr20	57572675	rs163785	A	G	2456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=19;PP=1548;SC=GACCATTTGCATAGATTTCTG;SOR=2.329;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=63;TCR=19;TR=82;WE=57572683;WS=57572665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr20	57572839	rs2295357	G	T	1235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.19;ReadPosRankSum=0.086;SOR=0.688;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:215,80:0.27:295
chr20	57582279	rs200474697	T	TCGGCCC	42.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=1.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.92;MQRankSum=-0.417;QD=1.42;ReadPosRankSum=0.130;SOR=1.256;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,6:0.20:30
chr20	57582285	rs71181993	C	CCGGCCT	511.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5033;FS=1.862;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.583;NF=4;NR=13;PP=269;ReadPosRankSum=-0.208;SC=GGCCTCGGCCCAGCACCCGGC;SOR=0.543;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=17;WE=57582293;WS=57582269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,24:0.80:30
chr20	57599016	rs163777	T	G	8063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=162;NR=107;PP=2965;SC=TGTCGGACACTGTGGTGGAGC;SOR=1.098;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=270;TCF=163;TCR=107;TR=269;WE=57599024;WS=57599006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,290:1.00:290
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chr20	57607449	rs16984980	C	A	1862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=48;PP=1116;ReadPosRankSum=-0.183;SC=CCGCCTCCTACCCGGCCCCGC;SOR=0.703;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=35;TCR=60;TR=76;WE=57607457;WS=57607439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,81:0.80:101
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chr20	58476841	rs13039338	G	T	686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FS=0.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.60;ReadPosRankSum=-1.110;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:148,43:0.23:191
chr20	58519514	rs144242261	C	G	1220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=417;ExcessHet=3.0103;FS=0.631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.93;ReadPosRankSum=1.086;SOR=0.796;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:323,93:0.22:416
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chr20	58587841	rs910695	A	C	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=1.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.46;ReadPosRankSum=0.212;SOR=0.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,10:0.19:54
chr20	58644995	rs6071100	T	C	3914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.789;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=102;NR=38;PP=2493;ReadPosRankSum=-0.326;SC=GAGGCTCTTCTGGGGCCAGCC;SOR=0.851;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=172;TCF=124;TCR=48;TR=140;WE=58645003;WS=58644985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,155:0.82:190
chr20	59091946	rs6064934	A	C	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=343;ReadPosRankSum=0.393;SC=AAAACACATAAAATTATATTT;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=15;WE=59091954;WS=59091936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,16:0.76:21
chr20	59224926	rs846222	C	T	1254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.906;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=9;PP=796;ReadPosRankSum=0.514;SC=GCTGGTGCTACTCTAAGAAAC;SOR=0.250;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=69;TCF=58;TCR=11;TR=48;WE=59224934;WS=59224916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,52:0.69:75
chr20	59431384	rs10485471	G	C	3431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=100;NR=32;PP=2523;ReadPosRankSum=-1.530;SC=AATAGAGTCAGAATTGGATAC;SOR=0.734;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=172;TCF=131;TCR=41;TR=132;WE=59431392;WS=59431374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,137:0.76:180
chr20	59829847	rs3752252	C	T	12726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=483;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=277;NR=184;PP=2965;SC=TTTCTGTGAACTTATTGTTTT;SOR=1.106;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=462;TCF=278;TCR=184;TR=461;WE=59829855;WS=59829837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,480:1.00:480
chr20	59908320	rs72064063	TACAC	T	1070.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.251;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=43;PP=934;ReadPosRankSum=0.829;SC=CACACACATGTACACACACAC;SOR=1.344;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=131;TCF=2;TCR=129;TR=43;WE=59908333;WS=59908310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,37:0.32:115
chr20	59908349	rs11086735	A	G	738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.664;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=29;PP=492;ReadPosRankSum=0.681;SC=ACACATGCACACACACCTGCA;SOR=1.225;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=124;TCF=23;TCR=101;TR=34;WE=59908357;WS=59908339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,34:0.27:127
chr20	60145672	rs2252560	T	G	6920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=139;NR=89;PP=2965;SC=CCTGGTGTGTTTGGGAATGGG;SOR=1.107;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=229;TCF=139;TCR=90;TR=228;WE=60145680;WS=60145662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr20	60293919	rs2892179	C	A	2018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=595;ExcessHet=3.0103;FS=0.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.39;ReadPosRankSum=2.030;SOR=0.795;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:451,144:0.24:595
chr20	60294246	rs11440327	A	AT	813.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=397;ExcessHet=3.0103;FS=1.704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.08;MQRankSum=3.121;QD=2.51;ReadPosRankSum=-0.096;SOR=0.849;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:254,70:0.22:324
chr20	60318561	rs2297193	T	C	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FS=0.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.84;ReadPosRankSum=0.157;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:213,44:0.17:257
chr20	60347928	rs76634929	C	T	1638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.927;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=5;PP=1269;ReadPosRankSum=0.482;SC=TCCCGCTTAGCTCCTTGTCCC;SOR=0.133;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=47;TCF=42;TCR=5;TR=38;WE=60347950;WS=60347918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,41:0.82:50
chr20	60347942	rs144562973	G	A	1920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.439;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=10;PP=1396;ReadPosRankSum=-0.292;SC=TTGTCCCAGCGTTACCCGCCT;SOR=0.383;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=61;TCF=50;TCR=11;TR=48;WE=60347950;WS=60347918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,54:0.81:67
chr20	60485327	rs1776237	C	T	985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=0;PP=901;SC=TGGGCTGACACGGTGTGTTCT;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=33;WE=60485335;WS=60485317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr20	60485627	rs2427240	C	T	6654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=137;PP=2965;SC=TCCGCACAGACCCCGTAACCA;SOR=1.279;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=226;TCF=89;TCR=137;TR=226;WE=60485635;WS=60485617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr20	60498832	rs11484270	A	AC	971.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=22;PP=928;SC=GTCCAGAAATACCCCATGAAA;SOR=3.477;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=23;WE=60498840;WS=60498822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr20	60503350	rs6142884	A	G	31903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=1179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=572;NR=558;PP=2965;SC=ATCTGCGAGAAGCCCAACCTG;SOR=0.709;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=1135;TCF=574;TCR=561;TR=1130;WE=60503358;WS=60503340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,1175:1.00:1175
chr20	60509209	rs3753045	C	T	7376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=154;NR=103;PP=2965;SC=GGCCGGTGGGCGCTGAGCCCC;SOR=1.032;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=260;TCF=155;TCR=105;TR=257;WE=60509217;WS=60509199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,277:1.00:277
chr20	60509387	rs3827115	TG	AA	7376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=90;PP=2947;SC=CTGCCGTGGGTGGGAGGCAGC;SOR=1.445;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=150;TCF=56;TCR=94;TR=143;WE=60509396;WS=60509377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr20	60511734	rs4925209	A	G	1287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.70;SOR=2.753;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr20	60511737	rs4925323	T	C	1287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.93;SOR=2.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr20	60572663	rs2296081	C	A	7417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=154;NR=103;PP=2965;SC=TGGGCCCGATCGCTGCTAGTG;SOR=1.110;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=257;TCF=154;TCR=103;TR=257;WE=60572671;WS=60572653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,277:1.00:277
chr20	60573983	rs2296082	A	G	1174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=1;PP=855;SC=TGAGCTCATCAGGTTGTGGCT;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=39;TCF=38;TCR=1;TR=39;WE=60573991;WS=60573973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr20	60574216	rs2296083	C	T	6898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=105;NR=147;PP=2965;SC=GCCCAGCAAGCAAAGGGGTTG;SOR=1.214;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=252;TCF=105;TCR=147;TR=252;WE=60574224;WS=60574206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,262:1.00:262
chr20	60582540	rs2281735	T	A	3037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=25;PP=1970;SC=GCACACTTGGTGCATCTGCGC;SOR=1.819;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=70;TCR=25;TR=95;WE=60582548;WS=60582530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr20	60584328	rs2296087	T	A	1078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=29;PP=815;SC=AAAAGATACATATATTTCTTC;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=30;WE=60584336;WS=60584318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr20	60639883	rs1886009	T	C	577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=9;PP=238;SC=CGGGCCCGGGTTGGCCGCTGA;SOR=2.049;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=60639891;WS=60639873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr20	60639898	rs199804789	C	A	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.6699;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=118;ReadPosRankSum=1.046;SC=CGCTGACCCCCGCGGGGCCCC;SOR=1.426;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=7;WE=60639906;WS=60639888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr20	60640305	rs200074661	TGCCAGG	T	698.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=10;PP=404;SC=CCGGCGGGCTTGCCAGGGCCA;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=10;WE=60640318;WS=60640295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr20	60699938	rs11480126	C	CT	86.82	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=14.47;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr20	60704117	rs4925345	A	G	3302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=85;PP=2495;SC=TTTCCTCCTGATTCAGAGGGC;SOR=2.522;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=24;TCR=85;TR=109;WE=60704125;WS=60704107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr20	60708216	rs6089657	G	A	1572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=4;PP=1286;SC=CAGAGCTGACGGGGCCGCCCC;SOR=4.493;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=50;TCF=46;TCR=4;TR=50;WE=60708224;WS=60708206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr20	60712174	rs3078903	CAGCAGT	C	1781.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=29;PP=1741;SC=AAGTATTAAGCAGCAGTAGCA;SOR=2.356;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=39;TCF=5;TCR=34;TR=34;WE=60712187;WS=60712164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr20	60712284	rs2057169	G	A	2564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=8;PP=1901;SC=GACGTATGGGGAGCCTCAGAA;SOR=3.967;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=66;TCR=8;TR=73;WE=60712292;WS=60712274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr20	60712347	rs2057168	G	A	10060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=352;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=228;NR=98;PP=2965;SC=GTTTCCTTCGGAACTGGTACT;SOR=1.891;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=326;TCF=228;TCR=98;TR=326;WE=60712355;WS=60712337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,352:1.00:352
chr20	60712511	rs2281740	A	G	24877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=913;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=390;NR=478;PP=2965;SC=AGGAGCATTAACCACCTTTCC;SOR=0.939;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=868;TCF=390;TCR=478;TR=868;WE=60712519;WS=60712501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,913:1.00:913
chr20	60713311	rs7076	G	A	9802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=366;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=144;NR=205;PP=2965;SC=CCAGGAACTCGCGCACTGACT;SOR=1.105;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=349;TCF=144;TCR=205;TR=349;WE=60713319;WS=60713301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,366:1.00:366
chr20	60713332	rs1135961	A	G	7397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=157;PP=2965;SC=TGGCACCCCGACCTATGGCAT;SOR=1.266;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=256;TCF=99;TCR=157;TR=256;WE=60713340;WS=60713322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,268:1.00:268
chr20	60714357	.	C	T	958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.323;ClippingRankSum=0.000;DP=314;ExcessHet=3.0103;FS=3.947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.05;ReadPosRankSum=-2.606;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:241,73:0.23:314
chr20	60718420	rs3746651	C	T	4686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=95;PP=2781;SC=ACTCACGGCCCGCGCGCACCC;SOR=1.338;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=155;TCF=60;TCR=95;TR=155;WE=60718428;WS=60718410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr20	60773041	rs6062140	G	C	752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FS=3.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.80;ReadPosRankSum=-1.410;SOR=1.098;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:155,43:0.22:198
chr20	60773684	rs4925355	C	T	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FS=1.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.75;ReadPosRankSum=-0.158;SOR=0.493;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:140,38:0.21:178
chr20	60774035	rs6142990	A	G	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FS=12.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.82;ReadPosRankSum=0.580;SOR=1.775;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:224,41:0.15:265
chr20	60808026	rs6089695	C	T	4021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.888;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=81;PP=2247;ReadPosRankSum=-0.644;SC=AAACCCATGGCGCCACCCTCA;SOR=0.814;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=204;TCF=100;TCR=104;TR=157;WE=60808034;WS=60808016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,175:0.78:223
chr20	60831300	rs6089706	G	A	5441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=125;PP=2965;SC=AGAACCAACTGGGGACGTACT;SOR=1.646;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=185;TCF=60;TCR=125;TR=185;WE=60831308;WS=60831290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr20	60847086	rs2297594	C	T	1084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.311;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=16;PP=641;ReadPosRankSum=-2.215;SC=CCAGAGGCTGCGGCTCCATGA;SOR=0.249;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=169;TCF=130;TCR=39;TR=53;WE=60847094;WS=60847076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,56:0.33:168
chr20	60848248	rs6061476	G	T	533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=1;PP=350;SC=AACTGAAAACGCACACGGAAC;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=60848256;WS=60848247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr20	60848348	rs2236526	C	T	2908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.177;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=33;PP=2042;ReadPosRankSum=0.279;SC=CCTGTCCCCCCCGTGGATTAT;SOR=1.073;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=162;TCF=112;TCR=50;TR=113;WE=60848356;WS=60848338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,122:0.70:174
chr20	60856281	rs2282213	G	A	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=181;ReadPosRankSum=2.188;SC=GGGCGAGCCGGGGAGCGTGAG;SOR=0.432;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=49;TCF=6;TCR=43;TR=14;WE=60856289;WS=60856271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,16:0.30:53
chr20	60857034	rs2274938	G	A	1406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.531;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=40;PP=949;ReadPosRankSum=-2.467;SC=CTACGTGCATGAGACGCGGGT;SOR=1.145;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=72;TCF=14;TCR=58;TR=48;WE=60857042;WS=60857024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,55:0.69:80
chr20	60859381	rs4925225	A	G	6347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=103;NR=131;PP=2965;SC=GATGAACCATATATTGTGGGT;SOR=0.997;Source=Platypus;TCF=103;TR=234;WE=60859389;WS=60859371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr20	60859430	rs11306058	AT	A	368.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=7.847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.62;MQRankSum=2.341;QD=8.19;ReadPosRankSum=0.248;SOR=2.115;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,28:0.62:45
chr20	60859486	rs4925226	A	G	327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=2;NR=13;PP=381;SC=AGGCTGGAGTACAGTGGTGCA;SOR=3.442;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=60859494;WS=60859476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr20	60861782	rs2297592	A	G	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=2.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.71;ReadPosRankSum=0.951;SOR=1.047;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,23:0.26:88
chr20	60864390	rs3746657	C	T	2914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.685;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=78;PP=1941;ReadPosRankSum=-0.710;SC=AACATGGGTGCGTCCACGCAG;SOR=1.058;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=147;TCF=48;TCR=99;TR=114;WE=60864398;WS=60864380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,122:0.77:158
chr20	60881330	rs2427273	G	A	19857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=737;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=377;NR=326;PP=2965;ReadPosRankSum=0.207;SC=TGCCTGGGGCGCTGGGGGCCA;SOR=0.428;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=704;TCF=377;TCR=327;TR=703;WE=60881340;WS=60881320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,736:1.00:737
chr20	60881643	rs2427274	T	C	1324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=20;PP=970;SC=GCGCAGGCAGTGCGGTGGGGC;SOR=0.874;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=26;TCR=20;TR=46;WE=60881651;WS=60881633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr20	60881780	rs2427275	T	C	7960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=156;NR=123;PP=2965;SC=CAGCCGGCCTTGGAGGACTGG;SOR=0.932;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=279;TCF=156;TCR=123;TR=279;WE=60881788;WS=60881770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,296:1.00:296
chr20	60882277	rs2427277	C	T	477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=4;PP=245;SC=ACCCGCCCCACGCCGCTCCTC;SOR=1.493;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=15;WE=60882285;WS=60882273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr20	60882888	rs2427278	A	G	5030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=92;PP=2965;SC=CAGCAAGGTAACGTGTGCTGT;SOR=1.030;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=169;TCF=77;TCR=92;TR=169;WE=60882896;WS=60882878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr20	60884339	rs3184293	G	A	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=3.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.41;ReadPosRankSum=-0.177;SOR=0.259;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,12:0.25:48
chr20	60885142	rs2379129	C	A	7031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=390;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.424;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=144;NR=141;PP=2962;ReadPosRankSum=1.392;SC=CAGGACCTGGCGGGGTAGGAA;SOR=0.591;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=374;TCF=191;TCR=183;TR=285;WE=60885150;WS=60885132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,297:0.76:389
chr20	60885448	rs944897	A	G	11531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=422;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=204;NR=189;PP=2965;SC=TGCCCTGCTGAGGCCTGGGAT;SOR=0.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=394;TCF=205;TCR=189;TR=393;WE=60885456;WS=60885438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,421:1.00:421
chr20	60886611	rs2297590	C	T	6325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.766;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=138;NR=132;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.760;SC=GGCGGGCAGGCGGTCAGCAGC;SOR=0.611;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=350;TCF=174;TCR=176;TR=270;WE=60886619;WS=60886601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,272:0.77:354
chr20	60887468	rs16985970	G	A	1724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=644;ExcessHet=3.0103;FS=0.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.69;ReadPosRankSum=1.853;SOR=0.792;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:505,137:0.21:642
chr20	60887581	rs944895	G	A	12194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=450;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=192;NR=234;PP=2965;SC=GGGAAGAGCCGTCGCAGGCTG;SOR=0.962;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=428;TCF=192;TCR=236;TR=426;WE=60887589;WS=60887571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,450:1.00:450
chr20	60890375	rs6062210	C	T	699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=16;PP=419;SC=CCCTATGGATCGTGTGAGACC;SOR=2.584;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=21;WE=60890383;WS=60890365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr20	60891288	rs2065578	A	G	1333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=9;NR=37;PP=1094;SC=GTCTCAGCGTAGCCTCTGTTC;SOR=2.636;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=9;TCR=37;TR=46;WE=60891296;WS=60891278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr20	60892116	rs2236521	G	A	1530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.051;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=36;PP=986;ReadPosRankSum=1.548;SC=GTGGGTAAGCGCAGACGCCCT;SOR=1.014;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=60;TCF=24;TCR=36;TR=59;WE=60892124;WS=60892106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,60:0.98:61
chr20	60892526	rs2427281	A	G	11845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=454;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=225;NR=191;PP=2965;SC=TCCGAGCCCCATCCAGGCTGG;SOR=0.794;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=417;TCF=225;TCR=192;TR=416;WE=60892534;WS=60892516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,454:1.00:454
chr20	60892692	rs6062216	C	T	3052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=57;PP=2171;SC=GATGGGGTGGCGACAGGGGCC;SOR=1.094;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=40;TCR=57;TR=97;WE=60892700;WS=60892682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr20	60892813	rs140777270	G	A	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.73;ReadPosRankSum=0.589;SOR=0.744;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:159,44:0.22:203
chr20	60893387	rs183361685	A	G	226.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.35;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr20	60895738	rs6089346	A	G	6580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=140;NR=77;PP=2965;SC=GTGGGAGGCGAAAGGTGAAGG;SOR=1.193;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=218;TCF=141;TCR=77;TR=217;WE=60895746;WS=60895728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr20	60897071	rs2274936	A	G	8606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=158;NR=148;PP=2965;SC=TGTTGAGGACACACCTTCACA;SOR=0.724;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=307;TCF=158;TCR=149;TR=306;WE=60897079;WS=60897061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,327:1.00:327
chr20	60897104	rs141208202	C	T	4649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=98;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.780;SC=GCCCACAGGCCCGCCTGGAAC;SOR=0.665;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=261;TCF=123;TCR=138;TR=185;WE=60897112;WS=60897094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,198:0.71:279
chr20	60897487	rs2274934	C	T	5997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.93;NF=99;NR=119;PP=2965;SC=CCGCAGCCATCGAAACCAAAA;SOR=0.927;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=218;TCF=99;TCR=119;TR=218;WE=60897495;WS=60897477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr20	60897721	rs3737137	C	T	979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=20;PP=641;ReadPosRankSum=-0.809;SC=TACCTGGCAGCGGTCACAGCG;SOR=0.644;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=33;TCR=26;TR=45;WE=60897729;WS=60897711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,46:0.78:59
chr20	60898505	rs2379128	C	T	2316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=20;PP=1390;SC=CCCAGCCCGACGCCTACGGGT;SOR=1.781;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=57;TCR=20;TR=77;WE=60898513;WS=60898495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr20	60899206	rs2427283	C	T	6067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=131;NR=89;PP=2965;SC=CTGCTGCTCACGAAGCCAGCC;SOR=0.977;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=220;TCF=131;TCR=89;TR=220;WE=60899214;WS=60899196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr20	60900481	rs2427284	A	G	9886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=348;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=192;NR=138;PP=2965;SC=CCTGCGCAGGAAGACAGCCGA;SOR=1.052;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=330;TCF=192;TCR=138;TR=330;WE=60900489;WS=60900471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,348:1.00:348
chr20	60900579	rs2427285	C	A	18591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=689;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=339;NR=311;PP=2965;SC=CAGTGTTGCGCGTCTCCGTAT;SOR=0.793;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=651;TCF=339;TCR=312;TR=650;WE=60900587;WS=60900569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,689:1.00:689
chr20	60902214	rs944894	G	A	1431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=11;PP=978;SC=GACAGACCCCGCTCCTGGCTC;SOR=2.256;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=36;TCR=11;TR=47;WE=60902222;WS=60902204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr20	60902490	rs944892	C	T	25268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=936;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=468;NR=434;PP=2965;SC=TGGCTGCACACGGGTGGATGC;SOR=0.780;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=902;TCF=468;TCR=434;TR=902;WE=60902498;WS=60902480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,935:1.00:935
chr20	60902544	rs944891	A	C	24097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=885;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=405;NR=455;PP=2965;SC=CCCACCTAAGACCTCCCCGAG;SOR=0.790;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=860;TCF=405;TCR=455;TR=860;WE=60902552;WS=60902534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,885:1.00:885
chr20	60902883	rs4925375	C	T	10518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=384;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=190;NR=177;PP=2965;SC=CTGATGAGGCCGGAGGGAGAG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=367;TCF=190;TCR=177;TR=367;WE=60902891;WS=60902873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,384:1.00:384
chr20	60904421	rs3065756	GCAGCC	G	1626.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=32;PP=1677;SC=CCTGGCAGCAGCAGCCCAGCC;SOR=5.031;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=0;TCR=52;TR=32;WE=60904433;WS=60904411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr20	60904853	rs2427286	T	C	8973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=155;NR=158;PP=2965;SC=CACCGGCCCTTGGGCACACGC;SOR=0.786;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=313;TCF=155;TCR=158;TR=313;WE=60904861;WS=60904843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,335:1.00:335
chr20	60905717	rs2095235	T	C	7018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=123;NR=121;PP=2965;SC=GAGCCCCTGCTGCCCCCTGGA;SOR=0.769;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=245;TCF=123;TCR=122;TR=244;WE=60905725;WS=60905707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,270:1.00:270
chr20	60905878	rs3810548	A	G	3384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=45;PP=2319;SC=AGCTGGGGACATGGCTGGAGT;SOR=1.161;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=74;TCR=45;TR=119;WE=60905886;WS=60905868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr20	60906055	rs73613564	C	T	16762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=620;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=316;NR=275;PP=2965;SC=GGCCCTCGGCCGCGCCCCTCC;SOR=0.805;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=592;TCF=317;TCR=275;TR=591;WE=60906063;WS=60906033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,619:1.00:619
chr20	60906269	rs35653162	C	T	396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=10;PP=226;SC=GGGGTGCAGGCGGTACGATGG;SOR=3.126;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=60906277;WS=60906259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr20	60907446	rs2151513	T	C	9382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=154;NR=163;PP=2965;SC=AGCGTGCCTGTTCGGCTGTGA;SOR=0.842;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=317;TCF=154;TCR=163;TR=317;WE=60907454;WS=60907436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,344:1.00:344
chr20	60907675	rs6142734	G	A	12900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=477;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=247;NR=209;PP=2965;SC=GGGTGTGCACGGCCACGCCCA;SOR=0.870;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=456;TCF=247;TCR=209;TR=456;WE=60907683;WS=60907665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,477:1.00:477
chr20	60908882	rs12481057	G	A	616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=5;PP=463;SC=GGAAGGTGGCGGGGCTTGGGA;SOR=1.721;Source=Platypus;TR=21;WE=60908900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr20	60908892	rs141833594	A	AGTGGG	45.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQRankSum=-0.636;NR=0;PP=520;ReadPosRankSum=0.615;SC=GGGGCTTGGGAGTGGGGTGGG;SOR=0.083;SbPval=1.0;Source=Platypus;TCR=1;WE=60908900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,4:0.20:20
chr20	60908908	.	G	GTGGGC	835.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.204;ClippingRankSum=0.000;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=1.123;NF=25;NR=2;PP=1096;ReadPosRankSum=1.682;SC=GTGGGGTGGGGTGGGCTGGGC;SOR=1.426;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=27;WE=60908916;WS=60908898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,29:0.78:37
chr20	60908964	rs13044266	G	A	9348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.14;QD=47.22;SOR=1.562;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr20	60908969	rs13042941	T	C	9786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.97;QD=42.00;SOR=1.529;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr20	60909060	rs13038331	A	G	17204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=671;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQ=59.99;NF=321;NR=320;PP=2965;SC=AGAAAAGGTCAGGGGAGGTCA;SOR=0.723;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=644;TCF=322;TCR=322;TR=641;WE=60909068;WS=60909050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,670:1.00:670
chr20	60909466	rs2379127	G	A	666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=17;PP=486;SC=GCGGCCCCGGGTCTCCAGGGA;SOR=2.400;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=22;WE=60909474;WS=60909456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr20	60909518	rs1105019	G	T	622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=8;PP=505;SC=GACACGGAGAGGCCCGGAGGA;SOR=1.329;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=22;TCF=14;TCR=8;TR=22;WE=60909526;WS=60909508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr20	60909809	.	C	CAGGGCTCAGGGCGAGGGCG	910.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=65.02;NF=0;NR=12;PP=2987;SC=GCTCAGGGCTCAGGGCGAGGG;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=12;WE=60909817;WS=60909799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr20	60909974	rs12625368	T	C	2726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.777;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=20;PP=2096;ReadPosRankSum=-0.234;SC=TCACCCGGGCTTCATGCTGCC;SOR=2.435;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=68;TCR=20;TR=87;WE=60909982;WS=60909964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,91:0.98:93
chr20	60911958	rs2890083	G	A	24620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=921;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=432;NR=433;PP=2965;SC=CAGCACAGGTGCCTCTCATCC;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=866;TCF=432;TCR=434;TR=865;WE=60911966;WS=60911948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,920:1.00:920
chr20	60912683	rs2427289	T	C	6114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=121;NR=94;PP=2965;SC=CGGGCACACATGTGTCACACC;SOR=0.859;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=215;TCF=121;TCR=94;TR=215;WE=60912691;WS=60912673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr20	60913495	rs2151512	T	C	9686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=342;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=188;NR=140;PP=2965;SC=CGAGCGCAGGTAGAGGTTGAG;SOR=0.983;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=328;TCF=188;TCR=140;TR=328;WE=60913503;WS=60913485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,342:1.00:342
chr20	60917294	rs4925380	G	A	997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=27;NR=6;PP=732;SC=AGGAGGCAGAGGTTGAAGTGA;SOR=2.833;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=33;WE=60917302;WS=60917284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr20	60920624	rs4925385	A	G	2334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=20;PP=1497;ReadPosRankSum=1.092;SC=CACTACACCCAGCTAATTTTT;SOR=1.028;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=64;TCR=20;TR=83;WE=60920632;WS=60920614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,90:0.99:91
chr20	60920887	rs11204472	G	A	8698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=149;NR=157;PP=2965;SC=CAATCTGGCCGGCTGGCAGCA;SOR=0.770;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=306;TCF=149;TCR=157;TR=306;WE=60920895;WS=60920877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,322:1.00:322
chr20	60920908	rs45527634	G	A	1264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FS=0.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.94;ReadPosRankSum=1.102;SOR=0.632;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:238,83:0.26:321
chr20	60921044	rs4925386	T	C	4332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;SC=CAGGATAACATGGTCCATCCC;SOR=0.903;Source=Platypus;TCF=82;WE=60921052;WS=60921034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr20	60921643	rs4925229	T	C	6490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=123;NR=103;PP=2965;SC=TTGACGCCGGTGGTGTGGTGC;SOR=0.850;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=227;TCF=124;TCR=103;TR=226;WE=60921651;WS=60921633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr20	60921701	rs4925387	A	G	10425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=391;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=225;NR=151;PP=2965;SC=GCCCCACCTCAGGGCCAGCCC;SOR=1.147;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=378;TCF=227;TCR=151;TR=376;WE=60921709;WS=60921691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,390:1.00:390
chr20	60921896	rs4925388	A	G	18845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=705;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=324;NR=347;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.013;SC=CGCCCTCCACAGGCCCGGGCA;SOR=0.767;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=677;TCF=328;TCR=349;TR=671;WE=60921904;WS=60921886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,701:1.00:703
chr20	60927349	rs483876	C	T	12150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=453;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=239;NR=189;PP=2965;SC=TGCAGATGGCCGCGTCGTCCC;SOR=0.928;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=428;TCF=239;TCR=189;TR=428;WE=60927357;WS=60927339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,452:1.00:452
chr20	60927412	rs624313	G	A	12297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=465;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=213;NR=230;PP=2965;SC=AGTCCCTCTTGGAGGCTGCGG;SOR=0.807;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=445;TCF=214;TCR=231;TR=443;WE=60927420;WS=60927402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,463:1.00:463
chr20	60927482	rs482220	G	A	4833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=113;PP=2965;SC=CGCGGTGCCCGGGCCCCTTGA;SOR=1.695;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=166;TCF=53;TCR=113;TR=166;WE=60927490;WS=60927472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr20	60927538	rs623834	C	T	2614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=47;PP=1314;SC=CAAGAGGCCGCGTGACAGAGA;SOR=2.730;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=14;TCR=47;TR=61;WE=60927559;WS=60927528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr20	60927551	rs482010	A	G	2185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=40;PP=1144;SC=GACAGAGACCACAGCTCACTG;SOR=3.702;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=6;TCR=40;TR=46;WE=60927559;WS=60927528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr20	60937597	rs477859	A	G	5569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=118;PP=2965;SC=TGCAGATGTCACAGTACTGGC;SOR=1.263;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=194;TCF=76;TCR=118;TR=194;WE=60937605;WS=60937587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr20	60962624	rs755726	T	C	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=1.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.36;ReadPosRankSum=-0.423;SOR=0.481;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,24:0.22:110
chr20	60963055	rs911077	T	C	7103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=402;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.619;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=120;NR=159;PP=2962;ReadPosRankSum=0.170;SC=GGTGCCTGAGTAGATCTGCTG;SOR=0.663;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=366;TCF=155;TCR=211;TR=279;WE=60963063;WS=60963045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,304:0.76:401
chr20	60963346	rs11315364	CT	C	2580.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FS=3.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.27;ReadPosRankSum=-0.989;SOR=0.380;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,136:0.80:169
chr20	60966318	rs6089219	G	T	5908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=103;NR=85;PP=2965;SC=GATGAGCTGCGTCACGCCGCT;SOR=0.852;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=188;TCF=103;TCR=85;TR=188;WE=60966326;WS=60966308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr20	60968547	rs41284972	A	G	693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FS=2.022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.36;ReadPosRankSum=-1.391;SOR=0.895;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:239,55:0.19:294
chr20	60969886	rs2427309	G	T	1723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=13;PP=1259;SC=GGGGGCAGCCGCACCTGGGGG;SOR=2.147;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=43;TCR=13;TR=56;WE=60969899;WS=60969876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr20	60969929	rs2427310	C	G	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=12;PP=298;ReadPosRankSum=0.744;SC=TGGGCCTGGCCGAGACCAGGC;SOR=0.702;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=120;TCF=75;TCR=45;TR=33;WE=60969937;WS=60969919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,39:0.29:133
chr20	60970123	rs2427311	A	G	910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.54;ReadPosRankSum=-1.274;SOR=0.665;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:195,62:0.24:257
chr20	60971306	rs748036	G	C	1747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-4.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=7;PP=1164;ReadPosRankSum=0.719;SC=TTGGCTGACAGGGGCAGGACC;SOR=0.719;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=82;TCF=72;TCR=10;TR=59;WE=60971314;WS=60971296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,67:0.73:92
chr20	60971327	rs748037	A	C	4367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=106;NR=23;PP=2965;SC=CCGTGGGCTTATGGAGACCAC;SOR=3.115;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=130;TCF=107;TCR=23;TR=129;WE=60971335;WS=60971317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr20	60971510	rs61744285	T	C	1817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=945;ExcessHet=3.0103;FS=0.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.01;MQRankSum=-0.482;QD=1.93;ReadPosRankSum=-0.893;SOR=0.745;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:761,179:0.19:940
chr20	60982024	rs146975578	C	T	855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.430;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=17;PP=507;ReadPosRankSum=0.374;SC=TGGGGCTGAGCAGGCCCTGGG;SOR=0.207;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=45;TCF=26;TCR=19;TR=37;WE=60982032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,39:0.81:48
chr20	60987737	rs6089366	C	T	2142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.536;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=19;PP=1459;ReadPosRankSum=2.653;SC=TGCCCGTGCTCCTGGGTGCAG;SOR=1.194;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=100;TCF=74;TCR=26;TR=78;WE=60987745;WS=60987727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,83:0.78:106
chr20	60989185	rs10888228	C	T	5202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.058;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=128;NR=97;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.729;SC=AGGCCTGCTGCGGCCAGAGCT;SOR=0.906;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=304;TCF=167;TCR=137;TR=225;WE=60989193;WS=60989175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,232:0.73:318
chr20	60989365	rs3810553	C	T	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FS=1.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.31;ReadPosRankSum=-0.949;SOR=0.563;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:159,38:0.19:197
chr20	60990075	rs911078	T	G	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=15.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.71;ReadPosRankSum=0.231;SOR=2.710;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,18:0.16:114
chr20	60990162	rs62196317	G	A	4833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.144;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=95;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.021;SC=GGGTGAGGGTGGGGCAGGCGG;SOR=0.552;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=254;TCF=134;TCR=120;TR=198;WE=60990178;WS=60990152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,215:0.78:276
chr20	60990170	rs911079	C	T	903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FS=1.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.31;ReadPosRankSum=0.394;SOR=0.634;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:206,67:0.25:273
chr20	60990606	rs3810554	A	C	777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.63;ReadPosRankSum=1.689;SOR=0.719;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:163,51:0.24:214
chr20	61039958	rs6061550	T	C	704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FS=1.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.37;ReadPosRankSum=1.554;SOR=0.830;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:235,62:0.21:297
chr20	61040453	rs6061243	C	G	873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FS=1.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.54;ReadPosRankSum=-0.247;SOR=0.598;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:186,61:0.25:247
chr20	61040951	rs6587239	C	T	496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FS=0.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.01;ReadPosRankSum=1.580;SOR=0.783;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:202,45:0.18:247
chr20	61048549	rs41305803	G	A	1090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=450;ExcessHet=3.0103;FS=1.408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.43;ReadPosRankSum=1.979;SOR=0.552;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:356,93:0.21:449
chr20	61162100	rs13040413	G	A	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=3.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.76;ReadPosRankSum=-0.168;SOR=0.138;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr20	61162267	rs6062251	T	C	943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FS=4.704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.07;ReadPosRankSum=-1.327;SOR=1.007;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:237,70:0.23:307
chr20	61162423	rs6062250	T	C	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.953;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=23;PP=466;ReadPosRankSum=0.254;SC=AGCTGGGTGCTCCTGCTTGTT;SOR=1.569;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=84;TCF=23;TCR=61;TR=28;WE=61162431;WS=61162413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,30:0.35:86
chr20	61273717	rs6122141	G	C	1411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=40;PP=958;SC=TGTGCCCTGGGGGGGAGGAGG;SOR=2.628;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=10;TCR=40;TR=50;WE=61273725;WS=61273707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr20	61288038	rs1047099	G	A	8134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=453;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.321;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=167;NR=162;PP=2962;ReadPosRankSum=0.150;SC=GGTGCGGTACGTCTCGGCCGG;SOR=0.573;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=432;TCF=214;TCR=218;TR=329;WE=61288046;WS=61288028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,348:0.77:452
chr20	61288355	rs3195701	G	T	5010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.650;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=103;PP=2962;ReadPosRankSum=2.032;SC=TGGGCACGGGGTCGCTGGTGT;SOR=0.801;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=222;TCF=105;TCR=117;TR=190;WE=61288363;WS=61288345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,208:0.84:247
chr20	61289958	rs2427369	G	A	3047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=17;PP=2202;SC=TCCCAGGCACGGGGCCCCACA;SOR=2.540;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=80;TCR=17;TR=97;WE=61289966;WS=61289948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr20	61292373	rs144381587	G	GAGCCCCC	2780.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=21;NR=10;PP=1088;SC=CCACCTCCGGGAGCCCCCAGC;SOR=2.348;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=62;TCF=42;TCR=20;TR=31;WE=61292389;WS=61292363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr20	61303264	rs118129127	C	T	3127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=871;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.60;ReadPosRankSum=0.144;SOR=0.694;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:658,212:0.24:870
chr20	61303346	rs117035894	C	T	13914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=790;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=266;NR=307;PP=2962;ReadPosRankSum=0.915;SC=TCTATTTGACCTGCAACCTTC;SOR=0.641;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=743;TCF=340;TCR=403;TR=573;WE=61303354;WS=61303336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,608:0.77:790
chr20	61326276	rs2427393	G	A	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.29;ReadPosRankSum=-1.022;SOR=0.490;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,18:0.22:81
chr20	61326380	rs2427394	C	T	13539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=513;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=244;NR=220;PP=2965;SC=TAGGATCCAGCCCTGAGCTTC;SOR=0.778;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=466;TCF=244;TCR=222;TR=464;WE=61326388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,513:1.00:513
chr20	61326746	rs60990764	G	C	767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.548;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=23;PP=583;ReadPosRankSum=-0.733;SC=TTTCCCAGAGGCACACATGTG;SOR=0.188;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=37;TCF=4;TCR=33;TR=27;WE=61326754;WS=61326736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,28:0.74:38
chr20	61331678	rs4809531	C	A	1106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FS=2.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.25;ReadPosRankSum=-1.038;SOR=0.842;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:259,82:0.24:341
chr20	61340558	rs6090405	C	T	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.68;ReadPosRankSum=-0.380;SOR=0.526;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,11:0.23:47
chr20	61341286	rs3746780	A	G	13420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=489;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=191;NR=277;PP=2965;SC=GAGCCTCAGTAACCAGCCCCG;SOR=1.144;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=468;TCF=191;TCR=277;TR=468;WE=61341303;WS=61341276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,488:1.00:488
chr20	61439696	rs41282978	C	G	1091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=602;ExcessHet=3.0103;FS=1.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.81;ReadPosRankSum=0.714;SOR=0.873;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:492,110:0.18:602
chr20	61439708	rs760276	G	A	1081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=481;ExcessHet=3.0103;FS=2.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.25;ReadPosRankSum=-0.918;SOR=0.951;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:387,94:0.20:481
chr20	61441035	rs2277772	G	A	2702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=459;ExcessHet=3.0103;FS=14.602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.94;ReadPosRankSum=5.388;SOR=0.996;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:305,150:0.33:455
chr20	61441061	rs45585738	G	A	2115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FS=58.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.08;ReadPosRankSum=4.170;SOR=1.578;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:135,98:0.42:233
chr20	61441797	rs2277771	A	G	1608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=393;ExcessHet=3.0103;FS=0.857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.11;ReadPosRankSum=1.558;SOR=0.636;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:283,108:0.28:391
chr20	61443547	rs2075776	A	G	818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FS=2.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.44;ReadPosRankSum=0.200;SOR=0.516;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:263,72:0.21:335
chr20	61452837	rs117347229	G	A	1399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=655;ExcessHet=3.0103;FS=0.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.14;ReadPosRankSum=-0.307;SOR=0.811;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:526,128:0.20:654
chr20	61459315	rs45628843	C	T	1569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=521;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.02;ReadPosRankSum=-0.924;SOR=0.687;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:403,116:0.22:519
chr20	61462004	.	A	AC	54	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;FR=0.9999;HP=10;HapScore=4;MGOF=4;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=54;QD=41.0;SC=ACAGTCCCCCACCCCCATGAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=2;WE=61462020;WS=61461994;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:11,2:0.15:13
chr20	61462005	.	CCCCCATGACAGTCCCCCAA	C	508.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.39;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr20	61462011	.	TG	CC	73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;FR=0.9999;HP=1;HapScore=4;MGOF=4;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=73;QD=63.2339374311;SC=CCCACCCCCATGACAGTCCCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=61462020;WS=61461994;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr20	61467898	rs910152	G	C	7160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=156;PP=2965;SC=AGTCAGCCACGTGCACCGGCT;SOR=1.933;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=222;TCF=66;TCR=156;TR=222;WE=61467906;WS=61467888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr20	61468571	rs2294995	T	C	1285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=396;ExcessHet=3.0103;FS=3.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.25;ReadPosRankSum=0.249;SOR=0.662;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:305,91:0.23:396
chr20	61512376	rs114534878	G	A	771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FS=1.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.81;ReadPosRankSum=-1.166;SOR=0.829;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:216,59:0.21:275
chr20	61512606	rs910148	T	C	7549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=133;NR=131;PP=2965;SC=CCGGTCTCAGTGGCCAGGCGC;SOR=0.730;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=265;TCF=133;TCR=132;TR=264;WE=61512614;WS=61512596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,277:1.00:277
chr20	61524133	rs2294998	C	T	16836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=629;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=351;NR=238;PP=2965;SC=AAGACACACACACGCACACAC;SOR=1.125;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=589;TCF=351;TCR=238;TR=589;WE=61524141;WS=61524123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,628:1.00:628
chr20	61524384	rs11362069	CT	C	534.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=26;PP=364;ReadPosRankSum=-0.806;SC=AGTAGAAAGCCTTTTTTTTTT;SOR=3.056;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=48;TCF=1;TCR=47;TR=27;WE=61524393;WS=61524374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,27:0.93:29
chr20	61526001	rs750079	C	T	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=44;ReadPosRankSum=1.638;SC=TTGAGACCCACGGGGGAGAAA;SOR=0.784;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=6;WE=61526009;WS=61525991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr20	61526023	rs1883846	T	G	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=54;ReadPosRankSum=-0.556;SC=AAGGACCATCTAATACAAGGA;SOR=1.179;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=5;WE=61526031;WS=61526013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr20	61527480	rs755740	T	C	4532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=113;NR=21;PP=2965;SC=AGAAACGTCTTAGCTTTCCTG;SOR=3.356;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=113;TCR=21;TR=134;WE=61527488;WS=61527470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr20	61527563	rs2013097	T	C	17673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=678;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=349;NR=282;PP=2965;SC=AATACTCCAATGCACCGACAC;SOR=0.922;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=632;TCF=350;TCR=282;TR=631;WE=61527571;WS=61527553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,676:1.00:676
chr20	61528074	rs910149	T	C	11358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=421;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=189;NR=203;PP=2965;SC=AGGCAGCCGTTGCCGCTGCAG;SOR=0.782;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=392;TCF=189;TCR=203;TR=392;WE=61528082;WS=61528064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,420:1.00:420
chr20	61528271	rs1883847	C	T	9845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=571;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.604;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=187;NR=205;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.958;SC=TTGCCCACCGCGGAGCCTGGA;SOR=0.649;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=534;TCF=252;TCR=282;TR=392;WE=61528279;WS=61528261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,426:0.75:571
chr20	61528306	rs1883848	A	G	10605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=398;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=162;NR=206;PP=2965;SC=TGAGGCTGCCATGGCTGCCGC;SOR=1.081;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=368;TCF=162;TCR=206;TR=368;WE=61528314;WS=61528296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,398:1.00:398
chr20	61536938	rs2295000	G	A	1816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=429;ExcessHet=3.0103;FS=1.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.000;QD=4.24;ReadPosRankSum=0.938;SOR=0.866;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:316,112:0.26:428
chr20	61538390	rs11479019	GC	G	527.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=569;ReadPosRankSum=-0.195;SC=CCACGTGTGCGCCCCCCTACA;SOR=1.609;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=21;WE=61538398;WS=61538382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,20:0.83:24
chr20	61541028	rs2295001	C	G	7547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=415;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=181;NR=115;PP=2962;ReadPosRankSum=0.863;SC=GCTGAATGCTCGTCTCAGCGG;SOR=0.657;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=393;TCF=241;TCR=152;TR=296;WE=61541036;WS=61541018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,311:0.75:414
chr20	61542001	rs2295002	C	T	1146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.373;NF=38;NR=4;PP=836;ReadPosRankSum=-0.027;SC=TCTTTTTTGACAACTTGTTCA;SOR=1.329;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=50;TCF=45;TCR=5;TR=42;WE=61542009;WS=61541991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,44:0.85:52
chr20	61577275	rs2427452	T	C	7643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=427;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=167;NR=144;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.076;SC=CATCGTCAGCTGGCTCTGCCG;SOR=0.722;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=400;TCF=212;TCR=188;TR=311;WE=61577283;WS=61577265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,331:0.78:426
chr20	61584683	rs2277770	C	T	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.89;ReadPosRankSum=-1.142;SOR=0.742;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:132,28:0.17:160
chr20	61588159	rs2245341	A	G	5090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.157;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.501;NF=142;NR=83;PP=2962;ReadPosRankSum=-3.343;SC=TGCTGGGCACATGCCTTCTGT;SOR=0.586;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=287;TCF=183;TCR=104;TR=225;WE=61588167;WS=61588149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,235:0.79:296
chr20	61588865	rs76379118	C	T	3308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.669;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=68;PP=1941;ReadPosRankSum=1.405;SC=CCCCACTGCTCGCCCACCTGA;SOR=0.618;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=165;TCF=74;TCR=91;TR=126;WE=61588873;WS=61588855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,142:0.78:182
chr20	61593994	rs371362253	G	A	1393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=397;ExcessHet=3.0103;FS=0.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.51;ReadPosRankSum=0.289;SOR=0.725;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:298,99:0.25:397
chr20	61594493	rs3729555	G	A	1488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.74;ReadPosRankSum=-1.040;SOR=0.665;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:227,87:0.28:314
chr20	61594571	rs79503248	C	T	15412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=898;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=357;NR=290;PP=2962;ReadPosRankSum=1.263;SC=CCTTTGGCAACGGGTGGCGCC;SOR=0.721;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=860;TCF=476;TCR=384;TR=647;WE=61594579;WS=61594561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:212,681:0.76:893
chr20	61594612	rs117991537	G	A	19932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=418;NR=414;PP=2962;ReadPosRankSum=0.936;SC=GTTTGAAACCGTTGCTCCCTC;SOR=0.695;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=1099;TCF=553;TCR=546;TR=832;WE=61594620;WS=61594602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:267,874:0.77:1141
chr20	61594679	rs2427463	A	G	23297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=853;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=363;NR=454;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.183;SC=TCCAGGCACAACAGAGTCCCC;SOR=0.645;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=820;TCF=364;TCR=456;TR=817;WE=61594687;WS=61594669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,851:1.00:852
chr20	61595537	rs2427464	A	G	9379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=213;NR=99;PP=2965;SC=AGATGGCCAGATGCCGGCCCT;SOR=1.713;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=313;TCF=214;TCR=99;TR=312;WE=61595545;WS=61595527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,330:1.00:330
chr20	61596468	rs151309454	TG	T	8629.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=348;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.108;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.639;NF=53;NR=98;PP=2967;ReadPosRankSum=2.096;SC=GCCCCTTCCTTGGCCTCCCCC;SOR=0.575;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=211;TCF=80;TCR=131;TR=151;WE=61596476;WS=61596458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,262:0.75:348
chr20	61597946	rs5842409	CT	C	24490.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=670;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=93;NR=298;PP=2951;SC=AGGACCTTGCCTTACCCCAGC;SOR=0.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=406;TCF=98;TCR=308;TR=391;WE=61597954;WS=61597936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,657:1.00:657
chr20	61598899	rs3746750	A	G	1462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.104;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=41;PP=1058;ReadPosRankSum=2.568;SC=CAGCAGCCCCAGGACACAGGG;SOR=1.414;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=86;TCF=27;TCR=59;TR=55;WE=61598907;WS=61598889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,60:0.65:93
chr20	61640934	rs11281878	A	AGCGGCTCCGC	219.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=61.34;NF=0;NR=3;PP=923;SC=GAGGCTGCGAAGCGGCGGAGG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=3;WE=61640942;WS=61640924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr20	61711430	rs112147947	T	C	6937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=156;NR=83;PP=2965;SC=GCCAAGGATGTGTGGGGCCAC;SOR=1.452;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=239;TCF=156;TCR=83;TR=239;WE=61711438;WS=61711420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr20	61711484	rs62206577	T	C	13040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=494;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=253;NR=218;PP=2965;SC=AGAGAGCCTGTGGAGGGAACC;SOR=0.822;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=471;TCF=253;TCR=218;TR=471;WE=61711492;WS=61711474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,494:1.00:494
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chr20	61711642	rs112169283	CT	C	2332.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=44;PP=2041;SC=CTCAGTGTCTCTCCCCCCATC;SOR=4.654;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=47;TCF=1;TCR=46;TR=45;WE=61711656;WS=61711632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
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chr20	61834695	rs6122103	G	A	12373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=741;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=228;NR=271;PP=2962;ReadPosRankSum=0.265;SC=CCGTCTTGACGGCGGAGGAGC;SOR=0.744;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=691;TCF=319;TCR=372;TR=499;WE=61834703;WS=61834685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:205,534:0.72:739
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chr20	61847068	rs6090310	C	G	3889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=50;PP=2134;SC=CCGGCCCCGACGCGCGGTCAC;SOR=0.901;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=41;TCR=50;TR=91;WE=61847076;WS=61847046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr20	61867454	rs6011691	A	G	8253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=523;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.581;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=181;NR=171;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.438;SC=CCTCCATGGGACCTAAAGACA;SOR=0.658;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=494;TCF=249;TCR=245;TR=352;WE=61867462;WS=61867444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,373:0.71:522
chr20	61867828	rs6011692	G	A	310.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=239;ReadPosRankSum=-0.362;SC=CCTTCCTGCCGTGGGCCTGGG;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=12;WE=61867836;WS=61867818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr20	61869223	rs6062855	T	C	9332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=348;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=189;NR=136;PP=2965;SC=TGGGTGGGACTTGGCTGGGGC;SOR=0.992;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=325;TCF=189;TCR=136;TR=325;WE=61869231;WS=61869213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,348:1.00:348
chr20	61869607	rs6010878	C	A	4502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.688;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=100;NR=44;PP=2965;ReadPosRankSum=0.935;SC=GGCGTCTCCACAGCAGCCCTC;SOR=1.411;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=145;TCF=100;TCR=45;TR=144;WE=61869615;WS=61869597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,155:0.99:156
chr20	61869826	rs2273487	C	T	15175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=556;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=266;NR=269;PP=2965;SC=TGCTGGGCTCCTGGGTGAGCG;SOR=0.733;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=536;TCF=266;TCR=270;TR=535;WE=61869834;WS=61869816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,555:1.00:555
chr20	61870075	rs744590	C	T	5452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=74;PP=2965;SC=GTGACGGGCACGTGACAGGGT;SOR=1.022;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=188;TCF=110;TCR=78;TR=183;WE=61870083;WS=61870065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr20	61870167	rs744591	C	A	18016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=655;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=367;NR=268;PP=2965;SC=CCCCCAGTGCCAGGCCCCATT;SOR=1.106;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=637;TCF=369;TCR=268;TR=635;WE=61870175;WS=61870146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,652:1.00:652
chr20	61870220	rs744592	T	C	22363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=836;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=408;NR=394;PP=2965;SC=GCCCATTGCCTGTCGCCATAC;SOR=0.745;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=803;TCF=408;TCR=395;TR=802;WE=61870228;WS=61870210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,835:1.00:835
chr20	61870465	rs1075557	A	G	5227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=114;NR=76;PP=2965;SC=GGGCCGGCCCAGCTTTCTCCT;SOR=1.167;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=190;TCF=114;TCR=76;TR=190;WE=61870473;WS=61870455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr20	61870605	rs3215649	T	TG	5841.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=87;PP=2974;SC=CGGGACCCCCTGGGTGAGGGC;SOR=1.121;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=117;TCF=22;TCR=95;TR=108;WE=61870613;WS=61870595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr20	61870634	rs1075556	A	G	4733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=69;PP=2965;SC=GGGAGGGCTGAGGGACCCCGA;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=146;TCF=76;TCR=70;TR=145;WE=61870642;WS=61870624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr20	61872905	rs1047826	A	G	15958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=594;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=296;NR=269;PP=2965;SC=GGGCTGGGGCAGCCACTGGGG;SOR=0.833;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=565;TCF=296;TCR=269;TR=565;WE=61872913;WS=61872895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,593:1.00:593
chr20	61873039	rs1047822	T	C	1100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=421;ExcessHet=3.0103;FS=4.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.61;ReadPosRankSum=-1.030;SOR=1.042;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:336,85:0.20:421
chr20	61873080	rs1047819	T	A	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FS=0.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.80;ReadPosRankSum=-1.631;SOR=0.830;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:169,34:0.17:203
chr20	61875497	rs2236186	A	C	3093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=74;PP=1948;SC=GGTGTCATTGAGGCGATGTGG;SOR=1.940;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=31;TCR=74;TR=105;WE=61875505;WS=61875487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr20	61875513	rs41282998	A	G	1467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=35;PP=927;ReadPosRankSum=0.005;SC=TGTGGGCCGAAGCACTGGAGC;SOR=0.824;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=76;TCF=26;TCR=50;TR=53;WE=61875521;WS=61875503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,60:0.71:85
chr20	61878632	rs2236193	G	A	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=1.405;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.71;ReadPosRankSum=-1.750;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,13:0.17:76
chr20	61878649	rs4809512	T	G	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=1.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.87;ReadPosRankSum=-0.716;SOR=0.389;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,16:0.17:92
chr20	61878950	rs872808	A	C	1162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=458;ExcessHet=3.0103;FS=0.668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.54;ReadPosRankSum=-0.543;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:368,90:0.20:458
chr20	61880073	rs78017705	G	A	5844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.463;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=144;NR=88;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.709;SC=CCCTGCCTCAGACGACAGATG;SOR=0.736;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=314;TCF=194;TCR=120;TR=232;WE=61880081;WS=61880063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,251:0.74:338
chr20	61880169	rs1129659	T	G	1908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=722;ExcessHet=3.0103;FS=2.201;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.66;ReadPosRankSum=2.198;SOR=0.807;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:565,153:0.21:718
chr20	61880274	rs2273497	A	G	8572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=113;NR=180;PP=2965;SC=ATGGGGCGGCAGCTGAACACA;SOR=1.312;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=293;TCF=113;TCR=180;TR=293;WE=61880282;WS=61880264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,313:1.00:313
chr20	61881296	rs927081	A	G	1260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=574;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.20;ReadPosRankSum=-1.405;SOR=0.692;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:457,117:0.20:574
chr20	61885452	rs34203226	G	T	1967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.551;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=40;PP=1094;ReadPosRankSum=0.517;SC=CCCGCCCGAAGGCTTCCGTCC;SOR=0.472;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=113;TCF=55;TCR=58;TR=81;WE=61885460;WS=61885442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,89:0.71:125
chr20	61907075	rs6011712	T	C	1565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=44;PP=1256;SC=AGCCTGTAGTTCTGGGACCCT;SOR=3.570;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=8;TCR=44;TR=52;WE=61907083;WS=61907065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
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chr20	61917241	rs6090342	A	G	2707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=19;PP=2106;SC=TATGGAAACAACTTGGCCCAC;SOR=2.275;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=62;TCR=19;TR=81;WE=61917249;WS=61917231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr20	61918005	rs142823159	T	G	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.571;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=270;ReadPosRankSum=0.356;SC=GAGGGGGCACTGTGGAGGCTT;SOR=1.262;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=29;TCF=18;TCR=11;TR=17;WE=61918013;WS=61917995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr20	61918164	rs6062431	C	G	984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FS=1.703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.70;ReadPosRankSum=-1.532;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:196,70:0.26:266
chr20	61926634	.	G	A	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.535;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.942;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=177;ReadPosRankSum=-0.378;SC=CCTGAGCCCCGTCTTCCTCCT;SOR=0.305;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=43;TCF=5;TCR=38;TR=14;WE=61926642;WS=61926624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,14:0.31:45
chr20	61937282	rs372429110	C	T	1196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=541;ExcessHet=3.0103;FS=0.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.22;ReadPosRankSum=-2.373;SOR=0.722;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:437,103:0.19:540
chr20	61941747	rs4809287	A	G	7978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=165;NR=121;PP=2965;SC=TGGTGGAGGGACCCGCCGCCT;SOR=0.945;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=286;TCF=165;TCR=121;TR=286;WE=61941755;WS=61941737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,300:1.00:300
chr20	61943916	rs3833299	GC	G	3513.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.894;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.840;NF=15;NR=43;PP=2353;ReadPosRankSum=0.373;SC=GTGGGGAGAGGCTGGGGCTGG;SOR=0.587;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=71;TCF=21;TCR=50;TR=58;WE=61943924;WS=61943906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,98:0.82:120
chr20	61946692	rs6090357	C	T	10023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=372;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=193;NR=150;PP=2965;SC=CCCTCCCCAGCGGTCTGTCAG;SOR=0.880;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=343;TCF=193;TCR=150;TR=343;WE=61946700;WS=61946682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,370:1.00:370
chr20	61946774	.	C	T	1387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.000;DP=440;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.17;ReadPosRankSum=-1.175;SOR=0.732;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:340,98:0.22:438
chr20	61950792	rs3746381	C	T	4979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=122;NR=85;PP=2950;ReadPosRankSum=-0.523;SC=GGTATAGGCCCGGCTGGTTGC;SOR=0.722;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=278;TCF=163;TCR=115;TR=207;WE=61950800;WS=61950782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,218:0.75:292
chr20	61951326	rs11478836	CT	C	5387.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=56;NR=42;PP=2976;SC=CTGGCCTGGCCTTGGGGGCTC;SOR=1.879;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=104;TCF=57;TCR=47;TR=98;WE=61951334;WS=61951316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr20	61951489	rs6089881	G	C	5024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=103;PP=2845;SC=CACCCGCTGCGGGCTTCGTCA;SOR=1.126;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=178;TCF=75;TCR=103;TR=178;WE=61951497;WS=61951479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr20	61951789	rs6062891	C	T	2684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=58;PP=1760;SC=GGTCACAGTGCCTGGGGTCAG;SOR=1.661;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=28;TCR=58;TR=86;WE=61951797;WS=61951779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr20	61952490	rs4809533	A	G	4599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=105;PP=2965;SC=ACCAGGGAACACTGGCCAATG;SOR=1.638;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=156;TCF=51;TCR=105;TR=156;WE=61952498;WS=61952480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr20	61953365	rs1884821	T	C	4146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=87;NR=57;PP=2605;SC=TCCTCTACCTTGGTTGGGTAG;SOR=1.134;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=144;TCF=87;TCR=57;TR=144;WE=61953373;WS=61953355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr20	61956782	rs2314251	T	C	647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FS=6.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.38;ReadPosRankSum=1.245;SOR=1.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:216,56:0.21:272
chr20	61957029	.	G	A	1496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.301;ClippingRankSum=0.000;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.862;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=25;PP=1003;ReadPosRankSum=-0.538;SC=GGGCCACCCCGGCCACCAGGG;SOR=0.820;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=88;TCF=53;TCR=35;TR=65;WE=61957037;WS=61957019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,67:0.72:93
chr20	61957213	rs76244047	C	G	624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.595;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=450;ReadPosRankSum=0.658;SC=TGCACCACCCCCTTCAGCCTG;SOR=1.179;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=42;TCF=15;TCR=27;TR=23;WE=61957221;WS=61957203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,26:0.57:46
chr20	61959436	.	G	A	2253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.752;ClippingRankSum=0.000;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=57;PP=1403;ReadPosRankSum=0.441;SC=TCCAGGGCGAGCCGCAGTCCC;SOR=0.606;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=110;TCF=37;TCR=73;TR=88;WE=61959444;WS=61959426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,95:0.81:118
chr20	61959642	rs2273494	G	A	11041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=633;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.632;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=273;NR=200;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.718;SC=TCGCATCCCCGGGTCCCCACT;SOR=0.635;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=609;TCF=356;TCR=253;TR=473;WE=61959650;WS=61959632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,492:0.78:633
chr20	61960762	rs5842416	CTG	C	707.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.21;ReadPosRankSum=-0.378;SOR=0.413;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,25:0.22:114
chr20	61981104	rs1044397	C	T	1295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.81;ReadPosRankSum=-1.131;SOR=0.672;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:254,86:0.25:340
chr20	61981134	rs1044396	G	A	982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FS=1.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.61;ReadPosRankSum=0.061;SOR=0.823;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:206,66:0.24:272
chr20	61981536	rs2229960	A	G	7206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=157;NR=107;PP=2965;SC=CCAGGGGGACACAGAAGGACG;SOR=1.130;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=264;TCF=157;TCR=107;TR=264;WE=61981544;WS=61981526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,277:1.00:277
chr20	61981554	rs2229959	C	A	1344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FS=2.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.19;ReadPosRankSum=1.210;SOR=0.560;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:234,87:0.27:321
chr20	61982085	rs1044394	A	G	22299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=821;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=445;NR=344;PP=2965;SC=AGATCTCGGCACAGCACTCGT;SOR=1.001;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=791;TCF=447;TCR=344;TR=789;WE=61982093;WS=61982075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,821:1.00:821
chr20	61982124	rs1044393	A	G	3469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1074;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.24;ReadPosRankSum=-1.619;SOR=0.707;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:814,258:0.24:1072
chr20	61982496	rs13041103	T	C	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=50;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=208;ReadPosRankSum=1.621;SC=CACGCCCACATCCACGTCCAC;SOR=1.179;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=8;WE=61982504;WS=61982486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr20	61986863	rs45473291	C	G	8217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=515;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=176;NR=177;PP=2962;ReadPosRankSum=0.315;SC=TCCAGGGCACCCTGCAGTCCA;SOR=0.673;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=484;TCF=246;TCR=238;TR=353;WE=61986871;WS=61986853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,374:0.73:511
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chr20	61987822	rs2273502	C	T	7942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=432;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=128;NR=188;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.837;SC=TTTCTCTGGCCCTAGGTTTCC;SOR=0.666;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=411;TCF=165;TCR=246;TR=316;WE=61987830;WS=61987812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,337:0.78:432
chr20	61990874	rs6090384	T	C	17608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=428;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.24;SOR=0.937;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,427:1.00:427
chr20	61990874	.	TGCAC	CGCAC,CGCAT	2944	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=225,171;NR=176,134;PP=654,2944;QD=1.7176339465;SC=TCAGTCACAGTGCACGATGGC;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=406;TCF=226;TCR=180;TR=401,305;WE=61990886;WS=61990864;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.99:406
chr20	61990878	rs2273505	C	T	7868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=446;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.68;ReadPosRankSum=-1.206;SOR=0.735;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,347:0.78:445
chr20	61990939	rs2273506	G	A	9743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=543;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.373;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=196;NR=218;PP=2962;ReadPosRankSum=0.545;SC=CGAAGCGGACGAGGACCACGT;SOR=0.566;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=524;TCF=242;TCR=282;TR=414;WE=61990947;WS=61990929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,428:0.79:543
chr20	61992285	rs11698563	A	C	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=35;ReadPosRankSum=1.117;SC=GTGCGAGCGCAGCCTGTGCGG;SOR=0.368;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=6;WE=61992293;WS=61992275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr20	61992547	rs6090387	G	C	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.55;ReadPosRankSum=0.000;SOR=0.563;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,14:0.20:69
chr20	62005458	rs35318934	G	C	4528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=112;PP=2962;ReadPosRankSum=0.593;SC=CACAGATGCCGCCATCCGTCC;SOR=0.687;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=217;TCF=80;TCR=137;TR=177;WE=62005466;WS=62005448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,187:0.82:229
chr20	62038277	rs1801475	T	G	10418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=376;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=142;NR=214;PP=2965;SC=GTCCCGCAGGTTCCCCTCGGG;SOR=1.260;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=356;TCF=142;TCR=214;TR=356;WE=62038285;WS=62038267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,376:1.00:376
chr20	62038810	rs3746363	G	C	1101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=36;PP=722;ReadPosRankSum=-0.762;SC=GGAAATGGGGGGGCCCAGGCT;SOR=0.732;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=53;TCF=11;TCR=42;TR=46;WE=62038818;WS=62038800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,49:0.88:56
chr20	62040022	rs2236197	T	C	2484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-4.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.264;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=86;PP=1699;ReadPosRankSum=0.162;SC=CAGGGGGCAGTGGGTGCCAGG;SOR=1.426;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=135;TCF=16;TCR=119;TR=96;WE=62040030;WS=62040012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,104:0.73:143
chr20	62046278	rs1801545	G	C	3133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.605;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=53;PP=1664;ReadPosRankSum=-1.014;SC=GCCGTGACGCGGCACCCTTGA;SOR=0.781;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=177;TCF=102;TCR=75;TR=127;WE=62046286;WS=62046268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,140:0.73:191
chr20	62046496	rs112006486	C	CGACAGACA	12386.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=513;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.127;NF=36;NR=140;PP=2980;ReadPosRankSum=-1.651;SC=CCACGGGAACCGACAGACAGA;SOR=0.812;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=217;TCF=37;TCR=180;TR=176;WE=62046507;WS=62046486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,444:1.00:446
chr20	62046549	rs75305929	C	T	4622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.5;BaseQRankSum=2.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=97;PP=2477;ReadPosRankSum=0.412;SC=GAACACAGGCCGTGTCTGCTC;SOR=0.703;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=210;TCF=69;TCR=141;TR=147;WE=62046557;WS=62046539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,199:0.70:283
chr20	62055417	rs6089910	G	A	2383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=616;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.88;ReadPosRankSum=1.117;SOR=0.680;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:453,162:0.26:615
chr20	62074003	rs372494294	TCAC	T	1305.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.27;MQRankSum=0.435;QD=32.64;ReadPosRankSum=1.652;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,34:0.85:40
chr20	62074009	.	CCACCAT	C	1538	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=27;MMLQ=23;MQ=55.81;NF=0;NR=29;PP=1538;QD=53.8620689655;SC=ACCATCACCACCACCATCACC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=29;WE=62074026;WS=62073990;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:10,29:0.74:39
chr20	62074015	rs370394245	TCAC	T	1304.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.37;MQRankSum=0.435;QD=32.62;ReadPosRankSum=2.112;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,34:0.85:40
chr20	62076743	rs6062939	C	A	947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=379;ExcessHet=3.0103;FS=1.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.11;MQRankSum=-1.031;QD=2.51;ReadPosRankSum=-0.238;SOR=0.820;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:298,79:0.21:377
chr20	62119588	rs71799118	GC	G	1042.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.45;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr20	62119594	rs71792296	GC	G	1407.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.92;SOR=3.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr20	62119595	.	C	G	591	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MMLQ=24;MQ=60.28;NF=21;NR=2;PP=591;QD=27.2074440238;SC=GGGGCCCGGGCCCGGGGTTCG;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=23;WE=62119603;WS=62119580;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,23:0.92:25
chr20	62119615	rs2750402	A	G	2581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=54;NR=15;PP=1245;SC=GGAGCGCGGCACCGCCGGGGA;SOR=2.272;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=69;TCF=54;TCR=15;TR=69;WE=62119623;WS=62119605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr20	62119875	rs7265428	T	C	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-4.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=170;ReadPosRankSum=0.782;SC=GCGTCGGGAATGTCCTCGGAA;SOR=0.399;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=14;WE=62119883;WS=62119865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr20	62121702	rs310607	A	G	8330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=172;NR=109;PP=2965;SC=ACAGGCGTGAACCACTGCGCC;SOR=1.171;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=282;TCF=173;TCR=109;TR=281;WE=62121710;WS=62121692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,307:1.00:307
chr20	62121726	rs310608	T	C	10196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=380;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=211;NR=139;PP=2965;SC=CCTGAGGGTCTGGTTTTCTCC;SOR=1.116;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=351;TCF=212;TCR=139;TR=350;WE=62121734;WS=62121716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,380:1.00:380
chr20	62126185	rs310617	A	G	8976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=342;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=205;NR=106;PP=2965;SC=GCATGTTGTCACCGTGCCAGC;SOR=1.442;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=312;TCF=205;TCR=107;TR=311;WE=62126193;WS=62126175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,342:1.00:342
chr20	62173029	rs310656	A	G	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=212;ReadPosRankSum=-0.416;SC=CGGTGAGGCCAGCGTCCACCC;SOR=0.693;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=11;WE=62173037;WS=62173019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,13:0.81:16
chr20	62191321	rs3810477	A	G	7871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=162;NR=126;PP=2965;SC=TGACAGCCACATTCACTTGGT;SOR=0.891;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=288;TCF=162;TCR=126;TR=288;WE=62191329;WS=62191311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,308:1.00:308
chr20	62191475	rs3810478	T	G	3696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=75;PP=2731;SC=GAGGCCCTGCTGCCGCTGCGC;SOR=1.284;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=137;TCF=62;TCR=75;TR=137;WE=62191483;WS=62191465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr20	62191558	rs3810479	G	A	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=1.578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.12;ReadPosRankSum=1.828;SOR=0.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:114,34:0.23:148
chr20	62192374	rs3810480	C	T	3611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.394;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=71;PP=2674;ReadPosRankSum=0.178;SC=ACAGGGCACCCCAGGTGGGAG;SOR=0.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=168;TCF=83;TCR=85;TR=135;WE=62192382;WS=62192364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,140:0.80:176
chr20	62193019	rs11551684	C	T	873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=396;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.21;ReadPosRankSum=0.737;SOR=0.715;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:321,74:0.19:395
chr20	62193414	rs310629	A	G	14596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=537;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=240;NR=273;PP=2965;SC=CTCCCCCGGCATGGGCCCTAC;SOR=0.857;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=513;TCF=240;TCR=273;TR=513;WE=62193422;WS=62193395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,537:1.00:537
chr20	62193445	rs3810481	G	A	1311.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=463;ExcessHet=3.0103;FS=0.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.83;ReadPosRankSum=0.903;SOR=0.746;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:361,102:0.22:463
chr20	62193587	rs3810482	T	C	2842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.649;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=63;PP=1961;ReadPosRankSum=-0.919;SC=TGAGCACTCATGCAGGGTGGG;SOR=0.764;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=182;TCF=92;TCR=90;TR=131;WE=62193595;WS=62193577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,127:0.75:170
chr20	62194030	rs3810483	G	C	7541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=120;NR=128;PP=2965;SC=TCCCAGTCCTGCGTCTGCCCG;SOR=0.789;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=248;TCF=120;TCR=128;TR=248;WE=62194038;WS=62194020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr20	62194103	rs3810484	A	G	7501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=151;NR=113;PP=2965;SC=TGCTGGGCCCAGGGCGTGGGC;SOR=0.997;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=265;TCF=152;TCR=113;TR=264;WE=62194111;WS=62194093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,268:1.00:268
chr20	62194128	rs3810485	G	A	6863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=392;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.035;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=160;NR=129;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.088;SC=CGTGGGAGCCGGCAGCCCCTC;SOR=0.381;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=387;TCF=223;TCR=164;TR=289;WE=62194136;WS=62194118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,292:0.75:390
chr20	62194713	rs3810486	A	C	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.97;ReadPosRankSum=-0.157;SOR=0.871;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:194,47:0.20:241
chr20	62195220	rs3827022	C	T	1607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=488;ExcessHet=3.0103;FS=1.339;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.32;ReadPosRankSum=0.184;SOR=0.743;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:373,111:0.23:484
chr20	62195672	rs3827023	C	T	2134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=720;ExcessHet=3.0103;FS=1.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.96;ReadPosRankSum=-0.660;SOR=0.846;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:557,163:0.23:720
chr20	62196033	rs3810487	C	T	961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.16;ReadPosRankSum=1.340;SOR=0.666;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:169,62:0.27:231
chr20	62196182	rs3810488	G	C	1300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=672;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.94;ReadPosRankSum=0.058;SOR=0.666;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:540,129:0.19:669
chr20	62196807	rs310632	T	C	22085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=838;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=370;NR=415;PP=2965;SC=GGGCTCCGCGTGCAGCAGCTT;SOR=0.841;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=785;TCF=370;TCR=415;TR=785;WE=62196815;WS=62196797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,838:1.00:838
chr20	62196884	rs310633	A	G	13860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=513;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=233;NR=246;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.594;SC=GCCTGGCGACAGTGTCCAGCA;SOR=0.248;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=480;TCF=233;TCR=247;TR=479;WE=62196892;WS=62196874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,511:1.00:512
chr20	62197905	rs310634	G	A	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.922;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.206;NF=3;NR=7;PP=112;ReadPosRankSum=-0.279;SC=GGGGATGAGCGCAGGACGCAG;SOR=1.508;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=22;TCF=8;TCR=14;TR=10;WE=62197913;WS=62197895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr20	62198236	rs415304	G	A	13681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=760;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.382;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=316;NR=254;PP=2962;ReadPosRankSum=3.198;SC=ACCTCTGCTCGCGGCCGCCCC;SOR=0.570;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=717;TCF=403;TCR=314;TR=570;WE=62198244;WS=62198226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,598:0.79:759
chr20	62198348	rs438363	C	T	20468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=746;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=332;NR=381;PP=2965;SC=CCGGTCTGGGCTGCCCGCCAC;SOR=0.858;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=713;TCF=332;TCR=381;TR=713;WE=62198356;WS=62198338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,745:1.00:745
chr20	62198662	rs367440	A	G	15067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=562;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=280;NR=260;PP=2965;SC=CGTGCGAGGCATAGGCCAGCG;SOR=0.771;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=540;TCF=280;TCR=260;TR=540;WE=62198670;WS=62198652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,561:1.00:561
chr20	62199100	rs422888	G	A	5559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=130;PP=2962;ReadPosRankSum=0.209;SC=GGCTGTCAGAGGTGAGCAGCA;SOR=0.757;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=253;TCF=105;TCR=148;TR=220;WE=62199108;WS=62199090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,232:0.87:266
chr20	62199126	rs3810491	C	G	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FS=1.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.78;ReadPosRankSum=-1.321;SOR=0.909;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:183,28:0.13:211
chr20	62200471	rs6089923	C	G	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=0.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.95;ReadPosRankSum=-0.481;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,27:0.25:106
chr20	62200575	rs1741594	T	C	5809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.75;SOR=0.819;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr20	62200575	.	TG	CA,CG	1884	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=19;MQ=60.0;NF=22,81;NR=27,85;PP=465,1884;QD=10.580977038;SC=AGTTGGTTGGTGAGATGGGGC;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=168;TCF=82;TCR=86;TR=49,166;WE=62200584;WS=62200565;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.29:168
chr20	62200576	rs6090457	G	A	869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FS=2.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.75;ReadPosRankSum=-0.718;SOR=0.907;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:130,53:0.29:183
chr20	62200860	rs1757752	A	G	22771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=859;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=401;NR=421;PP=2965;SC=CGAACGAGGCAGCCTGCACAC;SOR=0.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=822;TCF=401;TCR=421;TR=822;WE=62200868;WS=62200850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,858:1.00:858
chr20	62202240	rs402211	A	G	2956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=50;NR=51;PP=1683;SC=CAGGGAGGTCAGCAGGGCTAC;SOR=0.822;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=101;TCF=50;TCR=51;TR=101;WE=62202248;WS=62202230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr20	62202301	rs3746346	A	G	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=1.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.23;ReadPosRankSum=0.091;SOR=0.346;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,8:0.17:46
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chr20	62221364	rs2297427	G	A	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.66;ReadPosRankSum=0.091;SOR=0.280;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,5:0.17:30
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chr20	62224083	rs2236502	C	T	2557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.858;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=57;PP=1395;ReadPosRankSum=-0.850;SC=GGGCAGCCACCACAGCCACAA;SOR=0.561;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=126;TCF=54;TCR=72;TR=103;WE=62224091;WS=62224073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,115:0.83:139
chr20	62224595	rs2236503	G	A	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=3.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.65;ReadPosRankSum=-0.154;SOR=1.038;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,37:0.25:147
chr20	62227081	rs311489	A	G	14549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=562;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=284;NR=256;PP=2965;SC=AGACCTTGTCATGCTGGTAGA;SOR=0.767;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=540;TCF=284;TCR=256;TR=540;WE=62227093;WS=62227071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,562:1.00:562
chr20	62227180	rs2282157	C	G	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FS=4.579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.31;ReadPosRankSum=2.591;SOR=0.376;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:158,41:0.21:199
chr20	62229244	rs2297430	T	C	1374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=577;ExcessHet=3.0103;FS=0.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.38;ReadPosRankSum=1.871;SOR=0.788;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:464,113:0.20:577
chr20	62229337	rs414897	G	A	4168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=94;PP=2938;SC=GGCTCTGACCGGTGCAGGCCT;SOR=1.798;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=42;TCR=94;TR=136;WE=62229345;WS=62229327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr20	62234241	rs2145262	A	G	880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=5;PP=473;SC=GGATGCACTCAGCACAGCTGC;SOR=2.985;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=29;WE=62234249;WS=62234230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr20	62234273	rs766915	A	G	1940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=14;PP=1339;SC=AGTCACAGACACCATGAGGCC;SOR=2.271;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=53;TCR=14;TR=67;WE=62234281;WS=62234263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr20	62236148	rs6090471	T	C	9299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=353;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=166;NR=169;PP=2965;SC=CGGCAGCTGCTGCCGCTGCAT;SOR=0.769;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=336;TCF=166;TCR=170;TR=335;WE=62236156;WS=62236138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,353:1.00:353
chr20	62272658	rs2150910	T	C	981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=19;PP=595;SC=GAACGTGTTCTGTCGCAGGAT;SOR=0.859;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=21;TCR=19;TR=40;WE=62272666;WS=62272648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr20	62273435	rs186744824	G	A	961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=14;PP=715;ReadPosRankSum=-0.066;SC=CCCGCTCCGAGCTCCGCCCCG;SOR=0.631;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=80;TCF=56;TCR=24;TR=48;WE=62273443;WS=62273425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,44:0.61:72
chr20	62275844	rs6010986	TC	CT	2068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.277;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=34;PP=2103;ReadPosRankSum=-0.100;SC=CTTCCAGACGTCGGCACTGTC;SOR=0.518;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=66;TCF=15;TCR=51;TR=45;WE=62275853;WS=62275834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,52:0.73:71
chr20	62291008	rs6089953	A	G	2227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.030;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=67;PP=1657;ReadPosRankSum=-1.226;SC=AGGTGGGGTCAGAGAGAGGAT;SOR=1.604;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=107;TCF=23;TCR=84;TR=83;WE=62291016;WS=62290998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,84:0.77:109
chr20	62294015	rs2297434	C	T	8142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=441;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.182;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=162;NR=175;PP=2962;ReadPosRankSum=1.429;SC=GCTCAGTGTCCGACAGGCGAG;SOR=0.468;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=425;TCF=198;TCR=227;TR=337;WE=62294023;WS=62294005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,349:0.80:438
chr20	62294045	rs41298344	C	A	802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FS=1.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.49;ReadPosRankSum=-0.752;SOR=0.783;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:259,63:0.20:322
chr20	62303794	rs6062300	G	A	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5033;FS=1.918;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=396;ReadPosRankSum=-0.136;SC=CGACATCGCCGGCGCTGTTGC;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=21;WE=62303802;WS=62303784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,22:0.73:30
chr20	62309554	rs41309367	C	T	10604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=620;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.614;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=218;NR=230;PP=2962;ReadPosRankSum=2.061;SC=TTGCCCTCCCCGCCTCCTTGC;SOR=0.641;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=591;TCF=284;TCR=307;TR=448;WE=62309562;WS=62309544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,467:0.76:618
chr20	62312299	rs2297440	T	C	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=384;ReadPosRankSum=1.163;SC=CCCAGGGTGATGCTGGTGAGG;SOR=0.924;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=24;WE=62312307;WS=62312289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,28:0.76:37
chr20	62319464	rs2738785	T	C	7845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=375;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.001;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=150;NR=148;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.116;SC=AGGCCTGAGGTCCTGAGCAGT;SOR=0.441;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=352;TCF=181;TCR=171;TR=298;WE=62319472;WS=62319454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,318:0.85:375
chr20	62319561	rs2777940	C	G	8271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=506;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.259;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=172;NR=179;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.647;SC=CCAGCTGTGCCCATCCTGGAT;SOR=0.732;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=474;TCF=237;TCR=237;TR=351;WE=62319569;WS=62319551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,374:0.74:506
chr20	62319604	rs2777941	A	C	7162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=433;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=126;NR=159;PP=2962;ReadPosRankSum=0.642;SC=CTGGTAGGGAACCCTGCAGAC;SOR=0.725;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=397;TCF=178;TCR=219;TR=285;WE=62319612;WS=62319589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,313:0.72:433
chr20	62320968	rs6062302	T	C	7032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=461;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.244;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=165;NR=162;PP=2962;ReadPosRankSum=0.528;SC=AGTTCCTGGATGAGATGAAGG;SOR=0.569;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=452;TCF=223;TCR=229;TR=327;WE=62320976;WS=62320958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,334:0.73:460
chr20	62321655	rs2236506	G	A	13042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=735;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.302;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=253;NR=286;PP=2962;ReadPosRankSum=0.474;SC=AGATGCCAGCGCCGGCCCCCC;SOR=0.811;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=708;TCF=336;TCR=372;TR=539;WE=62321663;WS=62321645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,560:0.76:734
chr20	62322288	rs3208007	T	C	2452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=62;PP=1456;ReadPosRankSum=-0.165;SC=CGGGGAGCCCTGGCGAGGAGC;SOR=0.747;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=128;TCF=52;TCR=76;TR=102;WE=62322296;WS=62322278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,109:0.80:137
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chr20	62324290	rs61736615	G	A	10225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=578;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=220;NR=210;PP=2962;ReadPosRankSum=0.527;SC=CGATGACTTCGCCGCCCTGGC;SOR=0.632;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=549;TCF=283;TCR=266;TR=430;WE=62324298;WS=62324280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,449:0.78:575
chr20	62326110	rs3208008	A	C	4675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.870;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=123;NR=56;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.815;SC=CTGGCAGCCAACCACAGTGGG;SOR=0.884;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=244;TCF=165;TCR=79;TR=179;WE=62326118;WS=62326100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,187:0.74:254
chr20	62326579	rs41309931	G	T	9899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=549;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.617;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=195;NR=206;PP=2962;ReadPosRankSum=0.980;SC=AACCAGGTAGGGCACCTGCCT;SOR=0.719;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=525;TCF=259;TCR=266;TR=401;WE=62326587;WS=62326569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,417:0.76:549
chr20	62327199	rs1056990	A	G	1244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.051;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=28;PP=806;ReadPosRankSum=1.661;SC=TCTTCTGGCCAGAGCCCCAGT;SOR=0.919;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=66;TCF=29;TCR=37;TR=49;WE=62327207;WS=62327189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,53:0.75:71
chr20	62328267	rs2257440	C	T	1857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=500;ExcessHet=3.0103;FS=0.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.72;ReadPosRankSum=-0.190;SOR=0.759;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:376,124:0.25:500
chr20	62328375	rs2738787	A	G	14849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=546;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=238;NR=271;PP=2965;ReadPosRankSum=0.147;SC=GGAACTACCTAGAGCGCTGCC;SOR=0.293;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=509;TCF=238;TCR=271;TR=509;WE=62328383;WS=62328365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,544:1.00:545
chr20	62328453	rs2258056	T	C	620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.22;ReadPosRankSum=1.091;SOR=0.702;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:224,56:0.20:280
chr20	62328742	rs909341	C	T	1760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.431;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=47;PP=1151;ReadPosRankSum=-1.588;SC=CAGCCAGCAGCTCCAGCTCAG;SOR=0.732;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=297;TCF=158;TCR=139;TR=99;WE=62328750;WS=62328732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:216,105:0.33:321
chr20	62328829	rs1291205	C	G	1231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=407;ExcessHet=3.0103;FS=1.334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.03;ReadPosRankSum=1.151;SOR=0.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:315,92:0.23:407
chr20	62331989	rs1048665	T	G	1152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=365;ExcessHet=3.0103;FS=4.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.17;ReadPosRankSum=-1.381;SOR=0.568;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:278,86:0.24:364
chr20	62332436	rs2738788	A	G	1023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=9;PP=740;ReadPosRankSum=0.296;SC=TCAGTGATGGAGGCAGTCTGC;SOR=1.085;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=35;WE=62332444;WS=62332426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,36:0.97:37
chr20	62332537	rs6122147	C	T	4652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.855;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=126;NR=62;PP=2962;ReadPosRankSum=2.255;SC=ACCCCTGCCCCGTACCAGATG;SOR=1.008;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=257;TCF=167;TCR=90;TR=188;WE=62332545;WS=62332527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,195:0.72:269
chr20	62332638	rs374497353	A	AC	11947.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=527;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=130;PP=2933;ReadPosRankSum=0.839;SC=GTGAAGATTCACCTGGCCCTC;SOR=0.666;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=261;TCF=53;TCR=208;TR=169;WE=62332649;WS=62332628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,379:0.76:499
chr20	62332641	rs2257818	T	C	1557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=513;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=59;PP=2228;ReadPosRankSum=-0.598;SC=AAGATTCACCTGGCCCTCTGG;SOR=0.733;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=391;TCF=194;TCR=197;TR=120;WE=62332649;WS=62332628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:388,121:0.24:509
chr20	62333115	rs2236508	G	A	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.416;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=250;ReadPosRankSum=0.115;SC=GTGCACACCTGCTCCCCTTGC;SOR=0.407;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=68;TCF=50;TCR=18;TR=23;WE=62333123;WS=62333105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,23:0.33:69
chr20	62333350	rs59166240	GCCCC	G	415.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.57;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr20	62337622	rs1291211	A	G	1308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=5;PP=914;SC=GGTAAGGAAAACTGCTGAGGA;SOR=3.365;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=33;TCR=5;TR=38;WE=62337630;WS=62337612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr20	62340115	rs1291212	C	G	12374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=455;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=217;NR=211;PP=2965;SC=GGAAGAGCAGCTTGTTGGCCG;SOR=0.706;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=429;TCF=218;TCR=211;TR=428;WE=62340123;WS=62340105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,453:1.00:453
chr20	62364885	rs6011068	T	A	14367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=538;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=304;NR=216;PP=2965;SC=GGTGGTTCCCTTCAGTGGCAC;SOR=1.095;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=520;TCF=304;TCR=216;TR=520;WE=62364893;WS=62364875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,538:1.00:538
chr20	62366478	rs2427534	A	G	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=155;ReadPosRankSum=-1.652;SC=GGGGTCCCGCAGCCACAGCAC;SOR=0.470;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=49;TCF=41;TCR=8;TR=15;WE=62366486;WS=62366468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,18:0.33:55
chr20	62367377	rs2427535	A	G	4368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=102;PP=2965;SC=TGGGGCGTGCAGACACTGCTG;SOR=2.012;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=42;TCR=102;TR=144;WE=62367385;WS=62367367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr20	62368804	rs2236510	C	T	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=166;ReadPosRankSum=-1.084;SC=GCCCCGCAGCCGCGGGAGGTG;SOR=0.892;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=46;TCF=33;TCR=13;TR=14;WE=62368812;WS=62368794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,15:0.33:46
chr20	62369161	rs2236511	C	G	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=15.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.62;ReadPosRankSum=0.873;SOR=0.015;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,19:0.70:27
chr20	62369300	rs914559	C	G	7180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=498;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.45;ReadPosRankSum=-1.396;SOR=0.715;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:163,334:0.67:497
chr20	62369426	rs150938918	C	CGGGGCG	643.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=11.338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.23;ReadPosRankSum=-1.887;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,33:0.37:89
chr20	62369895	rs1151624	A	G	5162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.866;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=118;PP=2962;ReadPosRankSum=0.869;SC=GGGCCGGCAGATCCTCAGCAG;SOR=1.025;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=266;TCF=117;TCR=149;TR=201;WE=62369903;WS=62369885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,213:0.76:281
chr20	62370349	rs1056441	T	C	1675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=47;PP=986;ReadPosRankSum=0.261;SC=GTCCCCGGGCTGCCAGCCCGT;SOR=0.818;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=93;TCF=32;TCR=61;TR=71;WE=62370357;WS=62370339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,73:0.75:97
chr20	62372706	rs4809221	G	A	1564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.916;HP=9;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=22;PP=956;ReadPosRankSum=0.656;SC=CCCGCACCCCGCCCCCATCTC;SOR=0.494;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=89;TCF=60;TCR=29;TR=63;WE=62372714;WS=62372696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,66:0.71:93
chr20	62372813	rs2427536	G	A	7262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=131;NR=108;PP=2965;SC=TGGGGGCCCCGGTTGCAGCCT;SOR=0.785;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=239;TCF=131;TCR=108;TR=239;WE=62372821;WS=62372803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,270:1.00:270
chr20	62372956	rs2253823	C	T	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.60;ReadPosRankSum=-1.080;SOR=0.629;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,14:0.18:79
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chr20	62373983	rs2256814	G	A	1730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=459;ExcessHet=3.0103;FS=0.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.79;ReadPosRankSum=3.649;SOR=0.753;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:335,122:0.27:457
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chr20	62374441	rs6742	T	C	2189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=53;PP=1564;SC=AGGGGCTGGCTTTCACCAGCT;SOR=3.073;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=74;TCF=12;TCR=62;TR=65;WE=62374449;WS=62374431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr20	62384309	rs2281926	G	C	535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.269;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=24;PP=311;ReadPosRankSum=-0.651;SC=CCAGCAGCCAGGACGGGCTGT;SOR=0.173;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=109;TCF=22;TCR=87;TR=34;WE=62384317;WS=62384299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,34:0.30:113
chr20	62407104	rs3827026	C	T	8288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=154;NR=135;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.775;SC=CGTCGGCCTTCAGCGACAGCA;SOR=0.239;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=291;TCF=156;TCR=135;TR=289;WE=62407112;WS=62407094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,312:1.00:313
chr20	62488889	rs368004706	CT	C	209.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.38;ReadPosRankSum=-1.294;SOR=0.646;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr20	62517549	rs4809241	A	G	1550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=43;PP=1200;SC=TGGTTGCTGCATCTCAGGGAA;SOR=3.258;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=8;TCR=43;TR=51;WE=62517557;WS=62517539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr20	62559964	rs817362	G	A	2218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=56;PP=1558;SC=TGTGTAATGTGCTCCTTATAG;SOR=2.925;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=14;TCR=56;TR=70;WE=62559972;WS=62559954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr20	62571417	rs35264801	AG	A	1279.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQRankSum=0.000;QD=7.23;ReadPosRankSum=2.505;SOR=0.715;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,81:0.46:177
chr20	62576991	rs2252258	G	A	1052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=429;ExcessHet=3.0103;FS=0.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.45;ReadPosRankSum=1.438;SOR=0.612;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:338,91:0.21:429
chr20	62578077	rs111264888	A	AT	1202.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=23;PP=713;SC=CCCACAGGGCACCCCCCCCAC;SOR=2.303;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=25;WE=62578086;WS=62578067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr20	62594247	rs2275294	G	A	1663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=24;PP=1194;SC=CAGTGTGCTGGGGACATGGCT;SOR=0.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=28;TCR=24;TR=52;WE=62594255;WS=62594237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr20	62697751	rs4809251	T	C	7157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=133;NR=113;PP=2965;SC=CCTTGTGTTCTCCTCCAGTAG;SOR=0.803;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=247;TCF=133;TCR=114;TR=246;WE=62697759;WS=62697741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr20	62714783	rs6010717	C	G	11731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=436;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=206;NR=216;PP=2965;SC=CACTCTCAGTCGCCGTCACCG;SOR=0.784;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=425;TCF=207;TCR=218;TR=422;WE=62714791;WS=62714772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,435:1.00:435
chr20	62724438	rs6010719	C	G	1485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=12.041;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=44;PP=1219;ReadPosRankSum=-0.796;SC=TGTTTTTGACCCTGTCCAGGA;SOR=5.461;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=47;TCF=3;TCR=44;TR=46;WE=62724446;WS=62724428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,47:0.98:48
chr20	62729577	rs2295448	C	T	14601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=534;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=286;NR=222;PP=2965;SC=TCTGGGCCCACGTGCCCTCCA;SOR=0.963;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=509;TCF=287;TCR=222;TR=508;WE=62729585;WS=62729567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,532:1.00:532
chr20	62737139	.	GGTGA	G	2354	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;FR=0.5000;HP=5;HapScore=1;MGOF=10;MMLQ=27;MQ=55.47;NF=53;NR=28;PP=2354;QD=29.3827160494;SC=GATGATGGGGGGTGATGATGG;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=86;TCF=58;TCR=28;TR=81;WE=62737172;WS=62737129;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,81:0.94:86
chr20	62737148	.	GGGC	G	2328	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MMLQ=27;MQ=56.17;NF=55;NR=30;PP=2328;QD=27.99446676;SC=GGGTGATGATGGGCATGATGA;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=98;TCF=64;TCR=34;TR=85;WE=62737172;WS=62737129;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:13,85:0.87:98
chr20	62737164	.	G	A	2962	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;FR=1.0000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MMLQ=26;MQ=59.49;NF=172;NR=84;PP=2962;QD=20;SC=GATGATGGGGGTGATGGTGCC;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=267;TCF=181;TCR=86;TR=256;WE=62737172;WS=62737129;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:11,256:0.96:267
chr20	62737164	.	G	GTGATGATGGGGGGTGATGATGGGCGTGATGATGGGCGTGACGATGGGGGTAATGGTGGGGGTGATGATGATGGGGGTGATGATGATGATGGGGA	10487.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=52.27;MQRankSum=-0.967;QD=3495.91;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=2.225;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,2:0.67:3
chr20	62737537	rs4809400	C	A	14952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=547;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=283;NR=238;PP=2965;SC=CCAGGACCAACGTGTAGACAC;SOR=0.862;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=521;TCF=283;TCR=238;TR=521;WE=62737545;WS=62737527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,547:1.00:547
chr20	62737568	rs4809401	T	C	15971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=590;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=299;NR=262;PP=2965;SC=GAACCAGACCTGCTCGGGCCA;SOR=0.815;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=562;TCF=299;TCR=263;TR=561;WE=62737576;WS=62737558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,590:1.00:590
chr20	62744682	rs75030380	G	A	8656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=110;NR=190;PP=2965;SC=CCTGTAGGCCGGCAGTCCGTG;SOR=1.390;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=300;TCF=110;TCR=190;TR=300;WE=62744690;WS=62744672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,310:1.00:310
chr20	62891594	rs148223773	G	A	942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FS=1.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.47;ReadPosRankSum=0.666;SOR=0.559;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:155,56:0.27:211
chr20	62904542	rs6062361	A	G	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.33;ReadPosRankSum=0.570;SOR=0.544;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,19:0.20:95
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chr20	62959363	rs111569474	G	C	1768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.11;QD=34.01;SOR=6.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
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chr21	10793771	rs200837359	A	G	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.31;ReadPosRankSum=1.622;SOR=0.030;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,6:0.13:45
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chr21	10793781	rs113770789	T	G	225.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=74;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=0;PP=1183;ReadPosRankSum=0.381;SC=AGAATGGAGTTGAATGGAGCA;SOR=0.055;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=48;TCR=0;TR=47;WE=10793806;WS=10793771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,9:0.18:50
chr21	10793789	.	GCAGAATGGAA	G	180.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=0.000;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=74;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.853;NF=32;NR=0;PP=2426;ReadPosRankSum=0.630;SC=GTTGAATGGAGCAGAATGGAA;SOR=0.023;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=63;TCF=63;TCR=0;TR=32;WE=10793806;WS=10793771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,9:0.12:74
chr21	10793822	rs143361187	G	T	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=1.848;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.08;MQRankSum=4.178;QD=3.12;ReadPosRankSum=-0.444;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:108,16:0.13:124
chr21	10793825	rs139250106	T	A	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=3.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.80;MQRankSum=4.748;QD=2.90;ReadPosRankSum=-1.408;SOR=0.231;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:116,20:0.15:136
chr21	10793860	.	T	TGG	5538.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.140;ClippingRankSum=0.000;DP=412;ExcessHet=3.0103;FS=1.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.93;MQRankSum=-4.014;QD=20.36;ReadPosRankSum=-2.761;SOR=0.547;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,241:0.89:272
chr21	10793861	rs28362110	A	G,AATGGAATGGAATGGAGTG	19581.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=445;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=65;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=15;NF=225;NR=139;PP=2965;SC=GGAATGGAGTAGAATGGAATG;SOR=1.523;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=364;TCF=225;TCR=139;TR=364;WE=10793869;WS=10793851;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.10,0.90:296
chr21	10793885	rs200167075	A	T	753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=603;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQRankSum=-0.155;QD=1.26;ReadPosRankSum=0.184;SOR=0.835;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:541,58:0.10:599
chr21	10793891	rs28490105	T	G	27181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=0.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=645;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=58;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.014;NF=259;NR=209;PP=2965;ReadPosRankSum=1.108;SC=GGACACGAATTGGATGGACTT;SOR=0.587;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=470;TCF=260;TCR=210;TR=468;WE=10793899;WS=10793881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,640:1.00:641
chr21	10793906	rs146787155	G	C	1262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=702;ExcessHet=3.0103;FS=0.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.67;MQRankSum=-1.169;QD=1.81;ReadPosRankSum=-0.397;SOR=0.853;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:621,77:0.11:698
chr21	10793925	rs28641787	T	A	7345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=2.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=659;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.522;HP=1;HapScore=1;MGOF=98;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.559;NF=128;NR=128;PP=2962;ReadPosRankSum=1.092;SC=TGGAATGGGATGTCCTCGAAT;SOR=0.629;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=515;TCF=249;TCR=266;TR=256;WE=10793933;WS=10793915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:315,339:0.52:654
chr21	10793946	.	C	CGAATAGAATGGACTT	2954	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=71;MMLQ=25;MQ=61.87;NF=15;NR=119;PP=2954;QD=20;SC=GGAATGGAGTCGAATAGAATG;SbPval=0.05;Source=Platypus;TC=282;TCF=18;TCR=264;TR=134;WE=10793954;WS=10793936;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:148,134:0.48:282
chr21	10793961	.	T	TGAATGGAATGGACTC	14876.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DP=477;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=51;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=10;NR=135;PP=2971;SC=AGAATGCACTTGAATGGAATG;SOR=1.363;SbPval=0.1;Source=Platypus;TC=244;TCF=10;TCR=234;TR=145;WE=10793989;WS=10793951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,328:1.00:328
chr21	10794022	rs28971978	A	G	3624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=190;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=9;NR=93;PP=2962;SC=GAGTGTAATCAAACAGAATGG;SOR=3.634;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=9;TCR=94;TR=102;WE=10794030;WS=10793996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr21	10794047	rs28970391	G	A	2210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.34;QD=44.22;SOR=7.864;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr21	10794047	.	GTAGTG	ATAGCA,ATAGTG	1664	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=118;MMLQ=27;MQ=62.53;NF=0,0;NR=15,56;PP=696,1664;QD=50.6311916575;SC=GGATGGAATGGTAGTGGATGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=0;TCR=56;TR=15,56;WE=10794060;WS=10794037;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.27:56
chr21	10794051	rs200584440	T	C	469.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=5.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.65;MQRankSum=0.386;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.671;SOR=0.210;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,14:0.32:44
chr21	10794052	rs74672900	G	A	469.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.71;MQRankSum=0.326;QD=10.92;ReadPosRankSum=0.417;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,14:0.33:43
chr21	10862599	rs3883945	C	T	21638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=478;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=263;NR=191;PP=2965;SC=CTAGAGAAGCCCCTGAGAGCA;SOR=1.097;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=454;TCF=263;TCR=191;TR=454;WE=10862607;WS=10862589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,478:1.00:478
chr21	10862618	rs3916251	T	C	24743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=607;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=316;NR=265;PP=2965;SC=CACAGCTCCTTACCATGGACT;SOR=0.906;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=582;TCF=316;TCR=266;TR=581;WE=10862626;WS=10862608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,607:1.00:607
chr21	10862846	rs3916645	A	T	14579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=421;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.80;QD=34.63;SOR=0.906;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,421:1.00:421
chr21	10862846	.	ATCACCAG	TTCACCAA,TTCACCAG	2962	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MMLQ=27;MQ=51.35;NF=89,230;NR=58,182;PP=2230,2962;QD=15.5337950671;SC=TGGATACACCATCACCAGCTA;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=412;TCF=230;TCR=182;TR=147,412;WE=10862861;WS=10862836;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.36:412
chr21	10862853	rs1961808	G	A	3300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=440;ExcessHet=3.0103;FS=0.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.90;MQRankSum=1.254;QD=7.52;ReadPosRankSum=-0.786;SOR=0.774;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:272,167:0.38:439
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chr21	10862947	rs3883944	G	A	18785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=681;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=345;NR=309;PP=2965;SC=GCTATGCACAGAAGTTCCAGG;SOR=0.811;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=655;TCF=346;TCR=309;TR=654;WE=10862955;WS=10862937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,680:1.00:680
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chr21	10910291	rs150480	C	T	6737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=576;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-13.600;NF=173;NR=132;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.669;SC=GCAGAGGCTACTTTGTGATTA;SOR=0.709;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=556;TCF=317;TCR=239;TR=305;WE=10910299;WS=10910281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:265,310:0.54:575
chr21	10910311	rs9996	T	G	8994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=3.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=730;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-12.898;NF=208;NR=189;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.730;SC=ACTCACCGAATAGAAAAACTG;SOR=0.666;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=711;TCF=378;TCR=333;TR=397;WE=10910319;WS=10910301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:329,401:0.55:730
chr21	10910347	rs150482	A	G	14369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=801;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-6.441;NF=280;NR=325;PP=2962;ReadPosRankSum=2.729;SC=ATACAGAGGTAGACCGTCGAA;SOR=0.717;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=776;TCF=363;TCR=413;TR=605;WE=10910355;WS=10910336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,619:0.77:801
chr21	10916293	rs150483	A	G	3022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.964;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-7.082;NF=85;NR=62;PP=2184;ReadPosRankSum=-0.116;SC=CTGTATATACAACTATGAGCA;SOR=0.622;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=256;TCF=150;TCR=106;TR=147;WE=10916301;WS=10916283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,144:0.55:260
chr21	10920098	rs212146	T	C	13689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=510;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=212;NR=274;PP=2965;SC=GAAGGAGTTTTTACTCCCTGA;SOR=0.967;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=487;TCF=213;TCR=274;TR=486;WE=10920106;WS=10920088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,508:1.00:508
chr21	10935116	rs625018	T	G	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.127;NF=1;NR=16;PP=344;ReadPosRankSum=0.000;SC=CATCTTCTAGTGGAGATTCAG;SOR=0.671;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=17;WE=10935124;WS=10935106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,15:0.38:39
chr21	10942660	rs373444942	A	G	3953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=598;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.203;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.711;NF=126;NR=65;PP=2698;ReadPosRankSum=-0.628;SC=AAATACAATTACAAGAAAAAG;SOR=0.826;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=562;TCF=355;TCR=207;TR=191;WE=10942668;WS=10942650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:394,201:0.34:595
chr21	10944828	rs146327494	CAAG	C	3313.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.164;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.605;NF=3;NR=52;PP=2175;ReadPosRankSum=0.622;SC=TTCCCCCCTGCAAGAAGAGAT;SOR=0.980;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=137;TCF=14;TCR=123;TR=55;WE=10944838;WS=10944818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,89:0.44:202
chr21	10959811	rs34027183	CA	C	1710.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=593;ExcessHet=3.0103;FS=0.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQRankSum=-1.249;QD=3.41;ReadPosRankSum=-1.183;SOR=0.598;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:381,121:0.24:502
chr21	10959881	rs212112	G	A	1234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.045;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.524;NF=5;NR=49;PP=940;ReadPosRankSum=-0.827;SC=TATTTGAATAGCAAGAATCCC;SOR=1.317;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=135;TCF=18;TCR=117;TR=54;WE=10959889;WS=10959871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,55:0.40:139
chr21	10969894	.	A	AATGG	1714.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.075;ClippingRankSum=0.000;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.731;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=8.290;NF=14;NR=13;PP=1083;ReadPosRankSum=-1.384;SC=TGGATGGATGAATGGATGGAT;SOR=0.570;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=86;TCF=40;TCR=46;TR=27;WE=10969905;WS=10969884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,51:0.39:132
chr21	10971453	rs1739180	T	C	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.689;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=196;ReadPosRankSum=-0.356;SC=CTTTTATTATTCACATGTATG;SOR=0.096;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=52;TCF=2;TCR=50;TR=14;WE=10971461;WS=10971443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,14:0.24:58
chr21	10971892	rs10433039	G	A	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.186;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.921;NF=3;NR=15;PP=293;ReadPosRankSum=2.895;SC=TCTTTGTTTTGGCTGGGATTT;SOR=0.113;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=42;TCF=4;TCR=38;TR=18;WE=10971900;WS=10971882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,20:0.43:46
chr21	10973787	rs469953	T	A	5729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=378;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.748;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-14.775;NF=47;NR=128;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.351;SC=CTAGAGGATGTCAAAAGAATA;SOR=1.200;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=371;TCF=110;TCR=261;TR=175;WE=10973806;WS=10973777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:212,166:0.44:378
chr21	10973798	rs469961	T	C	5257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=8.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.771;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-15.648;NF=32;NR=113;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.230;SC=CAAAAGAATATAGTCAGACAG;SOR=1.128;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=299;TCF=72;TCR=227;TR=145;WE=10973806;WS=10973777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,135:0.45:303
chr21	10998165	rs364232	C	A	2216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.06;QD=30.37;SOR=2.995;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr21	11027085	rs6421268	A	C	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FS=0.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQRankSum=-7.111;QD=2.67;ReadPosRankSum=0.196;SOR=0.598;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:130,33:0.20:163
chr21	11027129	rs4577378	C	T	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.669;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.337;NF=2;NR=9;PP=78;ReadPosRankSum=0.227;SC=TTCTCGGTGACGACAACAACT;SOR=0.017;SbPval=0.08;Source=Platypus;TC=46;TCF=2;TCR=44;TR=11;WE=11027137;WS=11027119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,15:0.30:50
chr21	11038649	rs28565510	C	A	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.49;MQRankSum=-0.224;QD=1.71;ReadPosRankSum=-0.016;SOR=0.163;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,7:0.16:45
chr21	11038722	rs62209718	C	A	7141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=374;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.548;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.699;NF=196;NR=90;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.195;SC=ATTAAAATCACCCTACCTGTT;SOR=0.475;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=378;TCF=264;TCR=114;TR=286;WE=11038730;WS=11038712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,286:0.76:374
chr21	11038796	rs71227100	T	C	628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=913;ExcessHet=3.0103;FS=0.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.33;MQRankSum=-11.602;QD=0.69;ReadPosRankSum=3.599;SOR=0.546;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:787,126:0.14:913
chr21	11038802	rs56253511	G	A	6009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=897;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.142;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.403;NF=166;NR=151;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.747;SC=GTTTTTTGGAGTGACTGAGAT;SOR=0.612;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=890;TCF=479;TCR=411;TR=317;WE=11038810;WS=11038768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:573,324:0.36:897
chr21	11038843	rs10433076	G	C	10100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=779;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.087;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-9.235;NF=244;NR=267;PP=2962;ReadPosRankSum=1.026;SC=TTCCAGCAGAGGAACTAAGAG;SOR=0.988;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=838;TCF=421;TCR=417;TR=511;WE=11038851;WS=11038833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:309,467:0.60:776
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chr21	11098674	rs1752238	T	C	6044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=12.167;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=8.917;NF=146;NR=117;PP=2962;ReadPosRankSum=0.143;SC=ACTCAGGCTGTACTCCTACCA;SOR=0.143;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=266;TCF=147;TCR=119;TR=263;WE=11098712;WS=11098664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,260:0.93:280
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chr21	11098704	rs74415742	A	G	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FS=3.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQRankSum=-7.158;QD=1.60;ReadPosRankSum=-1.142;SOR=0.909;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:252,30:0.11:282
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chr21	11098728	rs113315187	C	T	1074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FS=9.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQRankSum=-5.656;QD=3.82;ReadPosRankSum=0.320;SOR=0.894;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:236,45:0.16:281
chr21	11098827	rs79274499	C	T	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.763;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.780;NF=8;NR=16;PP=317;ReadPosRankSum=0.624;SC=CCATCCAGAGCGAGACGAGCC;SOR=0.334;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=82;TCF=22;TCR=60;TR=24;WE=11098835;WS=11098817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,24:0.29:82
chr21	11098863	rs75318310	A	G	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.263;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.171;NF=0;NR=8;PP=113;ReadPosRankSum=-0.129;SC=CCAGCCTCCAACTCCCCCTTC;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=8;WE=11098871;WS=11098853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,8:0.26:31
chr21	14756428	.	T	TAC	256.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.23;ReadPosRankSum=-0.356;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr21	14756438	rs3126400	T	C	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.33;MQRankSum=1.104;QD=7.99;ReadPosRankSum=-0.895;SOR=0.602;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr21	14756449	.	A	ATGTG	374.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.758;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.93;MQRankSum=-1.812;QD=12.09;ReadPosRankSum=-0.401;SOR=0.750;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr21	14756794	rs2792526	G	A	2476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.651;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-7.783;NF=53;NR=50;PP=1546;ReadPosRankSum=1.686;SC=TTCTGCTCCAGAGACTCCTGC;SOR=0.566;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=211;TCF=100;TCR=111;TR=103;WE=14756802;WS=14756784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,112:0.51:219
chr21	14757043	rs2257596	T	C	5928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=-2.811;NF=141;NR=124;PP=2965;ReadPosRankSum=1.277;SC=ACATCAACATTCATTATTCCT;SOR=0.767;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=268;TCF=144;TCR=124;TR=265;WE=14757051;WS=14757033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,222:0.99:224
chr21	14760151	rs2775777	T	C	3382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=69;PP=2366;SC=ACTTATTTTTTGTTTGTTCCA;SOR=0.826;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=149;TCF=80;TCR=69;TR=149;WE=14760159;WS=14760141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr21	14760203	rs2775779	C	T	1668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.325;NF=33;NR=40;PP=1050;ReadPosRankSum=-0.400;SC=TTTAAGTTCCCTTCCTCTTTC;SOR=0.713;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=135;TCF=61;TCR=74;TR=73;WE=14760211;WS=14760193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,79:0.54:146
chr21	14766093	rs2775805	G	A	1088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=22;PP=684;SC=ATTTATTATCGGTCATAAGTA;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=18;TCR=22;TR=40;WE=14766101;WS=14766083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr21	14771323	.	TTC	T	1828.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=0.000;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=2.337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.43;MQRankSum=-0.212;QD=14.51;ReadPosRankSum=1.911;SOR=0.468;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,50:0.40:126
chr21	14771325	.	CTT	TGC	1930	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.5;FR=0.5000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=16;MQ=44.67;NF=24;NR=21;PP=1930;QD=44.299286108;SC=ATCTTCTTTTCTTCCTAATTC;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=115;TCF=54;TCR=61;TR=45;WE=14771335;WS=14771315;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:70,45:0.39:115
chr21	14771327	.	T	TGC	1828.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=0.000;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=2.337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.29;MQRankSum=-0.243;QD=14.51;ReadPosRankSum=2.277;SOR=0.468;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,50:0.40:126
chr21	14778721	rs2747232	A	T	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.00;QD=21.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr21	14780604	rs3117279	G	T	816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-2.487;NF=24;NR=17;PP=491;ReadPosRankSum=0.892;SC=TATTTTCTGAGTTAACATATA;SOR=0.710;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=75;TCF=45;TCR=30;TR=41;WE=14780612;WS=14780594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,42:0.53:79
chr21	14917181	rs62215474	C	T	5417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=105;NR=103;PP=2965;SC=CATTTCACTGCCAGTGAAGAG;SOR=0.725;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=208;TCF=105;TCR=103;TR=208;WE=14917189;WS=14917171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr21	15352253	rs56270809	A	C	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=110;ReadPosRankSum=-0.679;SC=CTCCCAACCAACTGCTCTTGA;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=8;WE=15352261;WS=15352243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr21	15373420	rs1297087	C	A	7463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=116;NR=134;PP=2965;SC=GTTGATCTTACGGTAACATGC;SOR=0.906;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=252;TCF=116;TCR=136;TR=250;WE=15373428;WS=15373410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,277:1.00:277
chr21	15481157	rs1136522	T	C	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.468;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=167;ReadPosRankSum=0.050;SC=ACTGTATGCATTTTTTATTTT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=9;WE=15481165;WS=15481147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr21	15481234	rs7279700	C	T	826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.834;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=12;PP=561;ReadPosRankSum=1.359;SC=TTGAACAGTGCATTATAAAAG;SOR=0.833;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=80;TCF=51;TCR=29;TR=37;WE=15481242;WS=15481224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,40:0.46:87
chr21	15481365	rs7278737	G	T	1069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.613;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=28;PP=752;ReadPosRankSum=0.835;SC=CTTCCTCTCTGTCTTTAAGTA;SOR=0.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=96;TCF=42;TCR=54;TR=49;WE=15481373;WS=15481355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,51:0.49:104
chr21	15516976	rs7283442	T	A	3064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=36;PP=1547;SC=TTAACATGAGTCTCTGGATCT;SOR=0.941;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=58;TCR=36;TR=94;WE=15516984;WS=15516966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr21	15524843	rs57726121	A	G	2282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=49;NR=25;PP=1269;SC=GGGATACTGAAGAAAGCAAAC;SOR=1.065;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=49;TCR=25;TR=74;WE=15524851;WS=15524833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr21	15593286	rs430245	A	G	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=58;ReadPosRankSum=-1.166;SC=AGATATGCATATATCTTCTCT;SOR=0.368;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=6;WE=15593294;WS=15593276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,5:0.23:22
chr21	15593495	rs378280	T	G	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.868;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=9;PP=201;ReadPosRankSum=0.731;SC=CTACAGGTAATTTTAAAAATA;SOR=0.298;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=44;TCF=15;TCR=29;TR=16;WE=15593503;WS=15593485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,17:0.38:45
chr21	15596683	rs379724	G	A	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=118;ReadPosRankSum=-0.482;SC=GAAAGATAGTGGTTTTTCTTA;SOR=0.602;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=10;WE=15596691;WS=15596673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr21	15596772	rs409782	T	G	1581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=34;NR=24;PP=947;SC=TGAAGAAATGTTGGTGGGCAG;SOR=0.865;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=34;TCR=24;TR=58;WE=15596780;WS=15596762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr21	15596882	rs410052	T	C	609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=15;PP=419;SC=GCATTTTATTTAGTATATAAT;SOR=2.200;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=20;WE=15596890;WS=15596872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr21	15599144	rs2822444	T	C	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=11;PP=516;ReadPosRankSum=0.492;SC=AAACTGTTAATTTTTTTTCCT;SOR=0.616;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=87;TCF=62;TCR=25;TR=37;WE=15599152;WS=15599134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,40:0.42:95
chr21	15646397	rs8129984	A	G	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=269;ReadPosRankSum=-0.632;SC=GCCAGCGGCCAGGCGCCCCGC;SOR=0.836;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=52;TCF=35;TCR=17;TR=25;WE=15646405;WS=15646387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,28:0.47:59
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chr21	15660716	rs1153305	G	A	608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=330;ReadPosRankSum=-0.066;SC=ATTTTCTTTAGTTATGTAGGT;SOR=0.650;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=39;TCR=12;TR=25;WE=15660724;WS=15660706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,29:0.49:59
chr21	15663777	rs34559607	A	AGTGT	132.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.43;MQRankSum=1.637;QD=6.03;ReadPosRankSum=1.065;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
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chr21	15755205	rs17274128	C	A	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.764;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=3;PP=416;ReadPosRankSum=0.155;SC=GCCGTCTATCCTACCTTGGCC;SOR=0.385;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=45;TCF=41;TCR=4;TR=23;WE=15755213;WS=15755195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,23:0.49:47
chr21	15755349	rs7281846	T	C	4060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=373;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.375;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=86;PP=2221;ReadPosRankSum=-0.088;SC=CAACCACCCCTGCCCACTCTG;SOR=0.654;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=337;TCF=177;TCR=160;TR=179;WE=15755357;WS=15755339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,197:0.53:373
chr21	15884949	rs3761320	A	T	1448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=2.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.13;MQRankSum=0.920;QD=20.70;ReadPosRankSum=1.816;SOR=0.967;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,39:0.56:70
chr21	15884955	rs3761321	A	T	1477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=1.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.13;MQRankSum=0.922;QD=20.52;ReadPosRankSum=1.809;SOR=0.951;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,40:0.56:72
chr21	15884974	rs10679308	C	CAAG	1194.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.199;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.804;NF=1;NR=18;PP=912;ReadPosRankSum=-0.187;SC=ATTTAATAGACACATATTTTA;SOR=0.930;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=19;WE=15884982;WS=15884964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,31:0.63:49
chr21	15893567	rs760344	A	T	1071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.699;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=27;PP=650;ReadPosRankSum=0.367;SC=AGAAAAAGCAAAGGAAACTTA;SOR=0.932;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=84;TCF=35;TCR=49;TR=44;WE=15893575;WS=15893554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,50:0.52:96
chr21	15893594	rs760345	T	C	779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.295;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=21;PP=548;ReadPosRankSum=-0.776;SC=ATTTTCACTGTCCAAACTGAT;SOR=1.061;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=54;TCF=18;TCR=36;TR=30;WE=15893602;WS=15893584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,33:0.53:62
chr21	15954528	rs2822785	G	A	6153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=120;NR=80;PP=2965;SC=GAGGAGCAGTGGTCCCAGGGT;SOR=1.085;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=200;TCF=120;TCR=80;TR=200;WE=15954536;WS=15954518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr21	15954660	rs2822787	T	C	8234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=126;NR=134;PP=2965;SC=AAGTTGCAGTTATTTAAAGTG;SOR=0.757;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=260;TCF=126;TCR=134;TR=260;WE=15954668;WS=15954650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,289:1.00:289
chr21	15964920	rs466913	C	G	2652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=45;PP=1491;SC=CATTTGACTACATAAGTATCT;SOR=1.371;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=33;TCR=45;TR=78;WE=15964928;WS=15964910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr21	15966421	rs460852	T	A	1677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=32;PP=1006;SC=GAAAAGGAAATAGAGACAACT;SOR=1.234;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=24;TCR=32;TR=56;WE=15966429;WS=15966411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr21	15974409	rs456067	T	C	1009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=22;PP=651;SC=AGAAAATCATTTTCATTTAGA;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=30;WE=15974417;WS=15974399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr21	15984864	rs1292581	G	T	1492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.785;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=25;PP=851;ReadPosRankSum=1.058;SC=TAGATTCACAGATCTAAAATG;SOR=0.941;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=142;TCF=88;TCR=54;TR=69;WE=15984872;WS=15984854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,77:0.48:162
chr21	15991786	rs1292586	C	G	334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=266;SC=GACTCATTTACGATCAAGCAT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=15991794;WS=15991776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr21	16015250	rs458292	A	G	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.263;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=298;ReadPosRankSum=0.671;SC=TGTATTAATAAGTATCATTAG;SOR=0.456;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=48;TCF=38;TCR=10;TR=21;WE=16015258;WS=16015240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,24:0.44:54
chr21	16340289	rs2229741	C	T	2354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.656;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=41;PP=1293;ReadPosRankSum=-1.300;SC=GCATGCCAGACCCCTGATATG;SOR=0.698;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=186;TCF=101;TCR=85;TR=97;WE=16340297;WS=16340279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,112:0.52:216
chr21	17102680	.	A	ACCG	1125.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.586;ClippingRankSum=0.000;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=2.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.16;ReadPosRankSum=-1.252;SOR=1.165;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,28:0.45:62
chr21	17135395	rs17275483	A	G	679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=24;PP=553;ReadPosRankSum=0.815;SC=TGGTAGTTTTAGAGATACAGG;SOR=0.495;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=49;TCF=7;TCR=42;TR=29;WE=17135403;WS=17135385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,27:0.59:46
chr21	17203597	rs55920012	T	A	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.35;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr21	17238521	.	AAT	A	129	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=20;MMLQ=17;MQ=59.24;NF=4;NR=2;PP=129;QD=22.6666666667;SC=TTGATTTACAAATATATATAT;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=6;WE=17238530;WS=17238511;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,6:0.46:13
chr21	17533027	rs34485071	C	T	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.55;MQRankSum=4.313;QD=3.78;ReadPosRankSum=3.876;SOR=0.539;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,11:0.19:59
chr21	17533030	.	CTCT	C,TTCT	709.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.58;QD=29.57;SOR=1.051;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,13,11:0.54,0.46:24
chr21	17533071	rs57492212	C	CT	272.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.96;MQRankSum=3.355;QD=6.99;ReadPosRankSum=0.844;SOR=0.714;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,11:0.28:39
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chr21	17533255	rs34726086	G	A	1712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.842;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=37;PP=1094;ReadPosRankSum=0.795;SC=CGTTATCCAAGATACTAGGGA;SOR=0.701;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=228;TCF=120;TCR=108;TR=86;WE=17533263;WS=17533245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,96:0.38:253
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chr21	18976385	rs67787603	C	A	703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.104;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=10;PP=484;ReadPosRankSum=0.313;SC=TGATCTTTCACAACTCTATTC;SOR=0.491;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=59;TCF=42;TCR=17;TR=31;WE=18976393;WS=18976375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,32:0.54:59
chr21	19167479	rs2258119	T	C	1336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.868;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=23;PP=750;ReadPosRankSum=-0.993;SC=TGATTTTCTATGTCAAAATTT;SOR=0.357;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=101;TCF=65;TCR=36;TR=60;WE=19167487;WS=19167469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,65:0.58:113
chr21	19169218	rs2824495	G	C	2339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.091;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=48;PP=1495;ReadPosRankSum=-1.067;SC=GATGCTGGGGGTTTTTAGAAC;SOR=0.803;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=176;TCF=89;TCR=87;TR=94;WE=19169226;WS=19169208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,106:0.52:202
chr21	19506651	rs2824646	G	A	1402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.201;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=19;PP=871;ReadPosRankSum=-0.951;SC=ATAAACAGTGGTGACTTCACT;SOR=0.929;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=132;TCF=88;TCR=44;TR=62;WE=19506659;WS=19506641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,66:0.46:144
chr21	19506694	rs9977750	T	G	4068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.926;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=43;PP=1367;ReadPosRankSum=0.241;SC=TGGAGGTGTTTTAAGTCAAGC;SOR=0.904;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=216;TCF=118;TCR=98;TR=100;WE=19506702;WS=19506684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,107:0.46:232
chr21	19506715	rs2824647	C	T	4312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.503;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=54;PP=1470;ReadPosRankSum=-0.169;SC=TGGCATCTCACTCTTGTAGGT;SOR=0.749;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=234;TCF=122;TCR=112;TR=115;WE=19506723;WS=19506705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,123:0.48:255
chr21	19617774	rs138183397	TCTC	T	772.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.772;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=479;ReadPosRankSum=0.595;SC=ATTGTGCTGTTCTCCTCCCTC;SOR=0.116;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=12;WE=19617784;WS=19617764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,20:0.67:30
chr21	19666526	rs6517807	C	T	545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.48;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr21	19666530	rs4395327	T	C	612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.85;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr21	19666901	rs1540000	T	A	1134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.680;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=27;PP=1661;ReadPosRankSum=-0.390;SC=AAGTGGGATATGACAACATAT;SOR=0.599;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=107;TCF=51;TCR=56;TR=50;WE=19666918;WS=19666891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,55:0.45:123
chr21	19666910	rs2824718	A	G	1204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=27;PP=1529;ReadPosRankSum=1.812;SC=ATGACAACATATTTACTTACA;SOR=0.768;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=99;TCF=42;TCR=57;TR=48;WE=19666918;WS=19666891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,57:0.50:114
chr21	19670118	rs2824721	G	A	4502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=52;NR=87;PP=2639;SC=CCATCGGTAGGGAAGATTGGC;SOR=1.442;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=52;TCR=87;TR=139;WE=19670126;WS=19670108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr21	19685405	rs7281534	A	G	5114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=99;PP=2965;SC=CTAAAGACACAGAGAGCATAA;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=168;TCF=69;TCR=99;TR=168;WE=19685413;WS=19685395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr21	19687376	rs2144203	G	A	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;BaseQRankSum=-3.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.317;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=362;ReadPosRankSum=-0.404;SC=GGTCCTAATAGACACAGTTAT;SOR=0.441;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=49;TCF=41;TCR=8;TR=25;WE=19687384;WS=19687366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,31:0.56:55
chr21	19701421	rs68023548	GCT	G	3875.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=24;NR=24;PP=2329;SC=ATTAAGAAACGCTCTTTCCAT;SOR=1.531;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=26;TCR=25;TR=48;WE=19701430;WS=19701411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr21	19704296	rs1155847	C	T	1089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=30;NR=4;PP=740;SC=ACATGATAGGCGTACCCATGT;SOR=3.442;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=34;WE=19704304;WS=19704286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr21	19770117	rs2824803	T	C	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.691;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5008;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=161;ReadPosRankSum=-0.230;SC=TTTTCCTATATATAGTGATGC;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=8;WE=19770125;WS=19770107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr21	19770734	rs2824805	G	C	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=34;ReadPosRankSum=-0.598;SC=TAGAAGTAAAGCTCTCGCCTG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=19770742;WS=19770724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr21	20058298	rs6517825	C	T	3285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=35;PP=1708;SC=CCATTAGTAACAACGTTAAAA;SOR=1.255;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=70;TCR=35;TR=105;WE=20058306;WS=20058288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr21	22371166	rs6518017	G	A	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.441;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=91;ReadPosRankSum=0.967;SC=GAGGGGAATCGGTGAGCAGGA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=5;WE=22371174;WS=22371156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr21	22643720	rs8127865	A	G	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.457;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=207;ReadPosRankSum=-0.214;SC=TGCTCCTAGCAAATAGTACAG;SOR=1.802;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=34;TCF=11;TCR=23;TR=14;WE=22643728;WS=22643710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
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chr21	22658544	rs111713483	TTTTGTGA	T	1271.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.311;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.207;NF=14;NR=4;PP=960;ReadPosRankSum=0.999;SC=GCAATGATACTTTTGTGATTT;SOR=1.729;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=55;TCF=38;TCR=17;TR=18;WE=22658558;WS=22658534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,35:0.42:84
chr21	22696837	rs232467	C	G	2504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=40;PP=1523;SC=TATGCACCCCCCTCCCTCTGG;SOR=0.757;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=48;TCR=40;TR=88;WE=22696845;WS=22696827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr21	22696881	rs11334381	TG	T	3500.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=45;PP=2061;SC=GGAACAGTATTGGGGATCTTA;SOR=0.836;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=56;TCF=8;TCR=48;TR=53;WE=22696889;WS=22696871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr21	22746187	rs232518	T	C	5158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=77;PP=2965;SC=AAACAGAGCCTGGACGGCCGT;SOR=1.044;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=183;TCF=106;TCR=77;TR=183;WE=22746195;WS=22746177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr21	22757976	rs2826822	G	A	1581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.564;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=32;PP=943;ReadPosRankSum=0.592;SC=TTTCCGAGGCGTTACTTTACT;SOR=0.626;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=151;TCF=79;TCR=72;TR=70;WE=22757984;WS=22757966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,77:0.46:167
chr21	22791034	rs76096464	A	G	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.434;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=175;ReadPosRankSum=-0.077;SC=TGGTTACCAGAGGCTTGGTAG;SOR=0.180;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=13;WE=22791042;WS=22791024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr21	22804674	rs2826833	C	T	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.260;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=202;ReadPosRankSum=0.701;SC=TTGGCTTTTTCGGTTTCCTCC;SOR=0.065;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=35;TCF=4;TCR=31;TR=15;WE=22804682;WS=22804664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr21	22840930	rs2250501	A	C	3985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=42;PP=2622;SC=AATATAGTTTATCTAGGTATC;SOR=1.543;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=128;TCF=86;TCR=42;TR=128;WE=22840938;WS=22840920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr21	22841123	rs2250508	G	A	2659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=62;PP=1727;SC=CTTGTTTATTGTCATATCATG;SOR=2.546;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=18;TCR=62;TR=80;WE=22841131;WS=22841113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr21	22910116	rs2826891	C	T	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.284;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=6.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=16.34;ReadPosRankSum=-0.470;SOR=0.053;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr21	22910123	rs9979040	T	G	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=10.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.78;ReadPosRankSum=-0.618;SOR=0.025;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr21	26959986	rs67668070	TATGA	T	2992.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.558;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=24;PP=2205;ReadPosRankSum=0.604;SC=CACAAACTTATATGAATAATT;SOR=0.991;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=110;TCF=45;TCR=65;TR=46;WE=26959997;WS=26959976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,80:0.45:179
chr21	26960189	rs2829806	T	G	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=300;ReadPosRankSum=0.317;SC=GCTTAACCAGTGTTTGTGGCA;SOR=0.368;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=17;WE=26960197;WS=26960179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr21	26961086	rs2829807	T	C	855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=15;PP=516;ReadPosRankSum=3.024;SC=TTGGTTGTTATTGGTTAATTT;SOR=0.658;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=97;TCF=59;TCR=38;TR=39;WE=26961101;WS=26961076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,44:0.40:109
chr21	26965100	rs2829809	C	A	2188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=21;PP=1228;SC=AATTGGAAGACCTAGAACTTT;SOR=1.416;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=50;TCR=21;TR=71;WE=26965108;WS=26965090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr21	26965148	rs1135638	G	A	4092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=55;PP=2243;SC=GTAAAGACACGCCCTGGAATC;SOR=0.917;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=139;TCF=84;TCR=55;TR=138;WE=26965156;WS=26965138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr21	26965205	rs1057885	T	C	4162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=69;PP=2594;SC=GAACTGCTGATACTTCATACT;SOR=0.803;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=140;TCF=71;TCR=69;TR=140;WE=26965213;WS=26965195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr21	26966317	rs13048408	A	G	620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.151;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=327;ReadPosRankSum=-0.218;SC=CAAAATATGTAAAAAGGTGTT;SOR=0.310;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=45;TCF=16;TCR=29;TR=24;WE=26966325;WS=26966307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,27:0.53:51
chr21	26969703	rs1135618	T	C	1575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=34;NR=17;PP=916;SC=CATGAGCATCTTTTGTGAAGG;SOR=1.085;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=34;TCR=17;TR=51;WE=26969711;WS=26969693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr21	26973663	rs140202502	A	ATATACT	8807.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=52;PP=2969;SC=ACAAAAAGACATATATGTATA;SOR=1.161;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=94;TCF=25;TCR=69;TR=74;WE=26973671;WS=26973653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr21	26976250	rs7278164	A	G	3191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.415;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=74;PP=1948;ReadPosRankSum=-0.895;SC=GCTTAAATCTAGAAATTTAAA;SOR=0.654;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=279;TCF=129;TCR=150;TR=140;WE=26976258;WS=26976240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,154:0.50:307
chr21	26978950	rs3989369	A	G	4307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=77;PP=2448;SC=TGAGAAGCTGACGATGTTGCT;SOR=1.201;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=135;TCF=58;TCR=77;TR=135;WE=26978958;WS=26978940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr21	26979620	rs61100311	C	T	3093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-3.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.779;HP=3;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=56;PP=2962;ReadPosRankSum=0.810;SC=CCTTCCTCTGCCCCGCGGGAC;SOR=0.532;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=227;TCF=136;TCR=91;TR=131;WE=26979640;WS=26979610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,147:0.57:260
chr21	26979628	rs9653688	G	A	2856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.184;HP=2;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=43;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.982;SC=TGCCCCGCGGGACCTCCCCGG;SOR=0.895;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=266;TCF=162;TCR=104;TR=120;WE=26979640;WS=26979610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,138:0.46:301
chr21	27056250	rs8133602	A	G	2161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=45;PP=1292;ReadPosRankSum=-0.847;SC=TCACAGCAGTAGAGTACCAAG;SOR=0.663;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=168;TCF=83;TCR=85;TR=88;WE=27056258;WS=27056240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,101:0.53:189
chr21	27078270	rs2276220	G	A	1117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=16;PP=629;ReadPosRankSum=-0.929;SC=ATATTTATGCGTAATTTATTT;SOR=0.657;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=125;TCF=86;TCR=39;TR=52;WE=27078278;WS=27078260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,58:0.43:135
chr21	27086413	rs6516687	G	A	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.445;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=7;PP=264;ReadPosRankSum=-1.142;SC=AACAGGATTTGTCTGCCTCTG;SOR=0.381;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=62;TCF=46;TCR=16;TR=24;WE=27086421;WS=27086403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,26:0.40:65
chr21	27086916	rs8134513	C	A	602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.161;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=374;ReadPosRankSum=0.121;SC=AATATGAATTCATATATTTAA;SOR=0.983;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=53;TCF=39;TCR=14;TR=26;WE=27086924;WS=27086906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,29:0.52:56
chr21	27097053	rs73161764	G	T	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=17;PP=385;ReadPosRankSum=-0.973;SC=TATGTAGAATGCTCAAGATTT;SOR=0.695;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=97;TCF=49;TCR=48;TR=34;WE=27097061;WS=27097043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,39:0.37:106
chr21	27097458	rs11909995	G	A	966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.717;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=10;PP=436;ReadPosRankSum=1.991;SC=CTGTCATTCAGTTCTCTAAAA;SOR=1.230;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=54;TCF=35;TCR=19;TR=35;WE=27097466;WS=27097448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,44:0.69:64
chr21	27101899	rs3216073	CT	C	1623.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.362;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.175;NF=6;NR=25;PP=954;ReadPosRankSum=1.080;SC=AACTTACATACTTTGAATATT;SOR=0.836;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=85;TCF=22;TCR=63;TR=31;WE=27101907;WS=27101889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,58:0.43:136
chr21	27137213	rs3216072	GT	G	177.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.464;NF=0;NR=9;PP=186;ReadPosRankSum=-0.001;SC=ACTTGTTTATGTTTTTTTCTT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=9;WE=27137221;WS=27137203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr21	27141273	rs56048433	C	CATTT	2611.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=18;PP=1498;SC=TAAGAAGTCTCATTTTTTCTG;SOR=1.532;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=16;TCR=20;TR=32;WE=27141281;WS=27141263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr21	27141292	rs7276647	A	G	785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.502;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=16;PP=495;ReadPosRankSum=-0.027;SC=TGAAGTCTCTAATTTTTTTTT;SOR=0.350;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=60;TCF=37;TCR=23;TR=35;WE=27141300;WS=27141282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,35:0.55:64
chr21	27318418	rs2409160	G	C	729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=19;PP=484;ReadPosRankSum=-0.250;SC=TTAACTGTAAGAGCTAAAACT;SOR=0.652;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=30;TCR=42;TR=33;WE=27318426;WS=27318408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,35:0.46:76
chr21	27326859	rs2829997	G	A	1123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.455;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=13;PP=674;ReadPosRankSum=0.040;SC=TCCTCTGGGGGAAAATACATG;SOR=0.368;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=76;TCF=57;TCR=19;TR=45;WE=27326867;WS=27326849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,50:0.60:83
chr21	27327100	rs417676	G	A	501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=15;PP=367;SC=ACGGAGTCTCGCTCTGTCGCC;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=27327108;WS=27327090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr21	27327862	rs2251337	G	C	830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=0;PP=616;SC=CGGAGAATGCGTGGGATCCTG;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=27327870;WS=27327852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr21	27328175	rs440666	T	C	1009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=28;PP=734;ReadPosRankSum=-1.567;SC=CATGTGAACGTACTGTGAGTC;SOR=0.672;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=96;TCF=36;TCR=60;TR=44;WE=27328183;WS=27328165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,46:0.43:107
chr21	27348372	rs3737413	A	G	916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=26;PP=558;ReadPosRankSum=-0.631;SC=TGAATTTAAAATCATCAGTTC;SOR=0.776;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=20;TCR=53;TR=36;WE=27348380;WS=27348362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,42:0.49:85
chr21	27369481	rs2051504	C	T	422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=0;PP=322;SC=GTCAATGATGCTCTTAGCCCA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=27369489;WS=27369471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr21	27382362	rs11455808	A	AG	6194.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=60;PP=2957;SC=GGGAAGACTGACATGTACACC;SOR=1.045;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=73;TCF=10;TCR=63;TR=70;WE=27382370;WS=27382352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr21	27382417	rs2409166	C	G	2005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=46;PP=1369;SC=AGCAGGCAAACAACCTACAGA;SOR=2.139;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=13;TCR=46;TR=59;WE=27382425;WS=27382407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr21	27852724	rs966410	A	G	2552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.917;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=60;PP=1581;ReadPosRankSum=-1.894;SC=CTATTCCAAAAACAATGCCCG;SOR=0.635;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=254;TCF=121;TCR=133;TR=116;WE=27852732;WS=27852714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,125:0.45:276
chr21	28210657	rs229042	T	C	3420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=65;PP=2237;SC=ATTATTTAGCTTAAAAACACA;SOR=1.217;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=44;TCR=65;TR=109;WE=28210665;WS=28210647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr21	28212760	rs436525	G	A	1909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=36;PP=1054;ReadPosRankSum=0.732;SC=TGGCTGCATCGGGGCAGTGTT;SOR=0.697;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=162;TCF=82;TCR=80;TR=75;WE=28212768;WS=28212750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,90:0.49:184
chr21	28215619	rs422381	T	C	255.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=2;PP=222;SC=CCAGGCATGATTGATTATTTG;SOR=2.093;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=28215627;WS=28215609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr21	28215826	rs373460567	C	CACA	6782.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=49;PP=2971;SC=AAGCACTGCACAGAGAGAAGG;SOR=0.719;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=72;TCF=19;TCR=53;TR=68;WE=28215844;WS=28215816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr21	28215836	rs3838077	GC	G	5013.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=16;NR=53;PP=2787;SC=CAGAGAGAAGGCCGTAGCAGG;SOR=0.801;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=70;TCF=17;TCR=53;TR=69;WE=28215844;WS=28215816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr21	28215987	rs417301	T	C	2057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=31;PP=1165;SC=TCAGCCCGCCTGGGTCAGCCT;SOR=0.920;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=39;TCR=31;TR=70;WE=28215995;WS=28215977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr21	28216038	rs422803	C	A	2304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=36;PP=1280;SC=GAACAGAGATCCTAGCGTAGC;SOR=0.717;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=38;TCR=36;TR=74;WE=28216046;WS=28216028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr21	28216059	rs400852	A	G	713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.60;ReadPosRankSum=1.303;SOR=0.682;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,33:0.40:83
chr21	28216066	rs370850	C	T	2708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.29;SOR=0.718;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr21	28216240	rs451792	G	C	2600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=37;NR=53;PP=1668;SC=GCTCCAACTCGCTAAAGGTGG;SOR=1.237;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=90;TCF=37;TCR=53;TR=90;WE=28216248;WS=28216230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr21	28216299	rs428616	T	C	859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=24;PP=685;SC=TGCTTTGCTTTAGTTTGCAGA;SOR=3.258;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=28;WE=28216307;WS=28216289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr21	28216445	rs408358	A	C	442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=340;SC=CGGACTTATGATCCTGCCTGC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=28216453;WS=28216435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr21	28216595	rs428785	C	G	3508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=68;NR=52;PP=2135;SC=GACCACTGAGCCCCTTCGTCC;SOR=0.836;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=68;TCR=52;TR=120;WE=28216603;WS=28216585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr21	28216674	rs409630	G	C	2164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=46;PP=1245;ReadPosRankSum=-0.426;SC=CGTCGTCCACGACCCCGCACG;SOR=0.710;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=193;TCF=98;TCR=95;TR=95;WE=28216682;WS=28216664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,107:0.51:209
chr21	28216692	rs445784	G	T	7326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=105;NR=89;PP=2965;SC=ACGTGCCGCCGACGTCGCCCT;SOR=0.761;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=195;TCF=106;TCR=89;TR=194;WE=28216700;WS=28216682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr21	28217178	rs434857	T	G	6186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=119;NR=88;PP=2965;SC=GCGTGGGTACTGGCCCAAAGC;SOR=0.853;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=209;TCF=120;TCR=89;TR=207;WE=28217186;WS=28217168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr21	28217320	rs402007	C	G	3296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=67;PP=2061;SC=GAGCGAGGGACCTTTAGTTCG;SOR=1.285;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=43;TCR=67;TR=110;WE=28217328;WS=28217310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr21	28302499	rs111806687	GA	G	42.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.105;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.27;ReadPosRankSum=0.497;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr21	28326276	rs233894	G	A	1281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=27;PP=797;SC=GCAAAAATTGGGCTCATTTAG;SOR=1.514;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=15;TCR=27;TR=42;WE=28326284;WS=28326266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr21	30250555	rs2205446	T	C	3591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=39;PP=2113;SC=GAATAATCCTTTTGGTGAAAG;SOR=1.281;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=68;TCR=39;TR=107;WE=30250563;WS=30250545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr21	30250615	rs2205447	T	C	5132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=78;PP=2965;SC=CCGACCATTTTTGCCACCAGC;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=164;TCF=86;TCR=78;TR=164;WE=30250623;WS=30250605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr21	30250812	rs2205448	T	C	253.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=241;SC=TCATCATTTTTTAGTGTGTAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=30250820;WS=30250802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr21	30252088	rs2205449	T	A	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=5;PP=149;ReadPosRankSum=1.058;SC=ATCAGAGTAGTCTGTGATAGC;SOR=0.551;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=21;TCF=12;TCR=9;TR=11;WE=30252096;WS=30252078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr21	30254695	rs2254507	C	T	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.619;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=21;PP=451;ReadPosRankSum=0.815;SC=AAAATTAGAACGTATTCAATA;SOR=0.374;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=10;TCR=36;TR=27;WE=30254703;WS=30254685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,27:0.64:42
chr21	30257418	rs1997605	G	A	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=344;ReadPosRankSum=-1.763;SC=TCATCTGCAAGTGGACCCCGC;SOR=0.569;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=49;TCF=38;TCR=11;TR=24;WE=30257426;WS=30257408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,27:0.51:53
chr21	30257560	rs1997606	C	G	2557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FS=2.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.22;ReadPosRankSum=0.002;SOR=0.617;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,129:0.57:228
chr21	30257568	rs1997607	T	C	8281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.81;SOR=0.702;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr21	30257729	rs2859734	A	G	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=100;ReadPosRankSum=1.975;SC=GCATGCCCTCACCCTCATGCG;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=6;WE=30257737;WS=30257719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr21	30318134	rs77917057	A	G	4118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=410;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=91;PP=2575;ReadPosRankSum=-0.374;SC=TTTACCTCCAACCAAGCCAAC;SOR=0.704;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=369;TCF=183;TCR=186;TR=182;WE=30318142;WS=30318124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:209,200:0.49:409
chr21	30318466	rs2243552	T	G	1038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.709;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=19;PP=635;ReadPosRankSum=-0.350;SC=GTATAAAGTATCACCTACCAA;SOR=0.803;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=91;TCF=55;TCR=36;TR=43;WE=30318474;WS=30318456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,49:0.44:112
chr21	30324755	rs2832146	G	A	178.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=1;NR=6;PP=127;SC=TATCCAAAGAGCTGAGAGTTT;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=30324763;WS=30324745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr21	30325875	rs2243491	A	T	101.90	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5267;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=80;ReadPosRankSum=-0.210;SC=CTGAGAATATATGTCTGATAC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=5;WE=30325883;WS=30325865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr21	30338153	.	CA	C	62.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.280;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.74;ReadPosRankSum=1.062;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,8:0.22:36
chr21	30338293	rs5843357	G	GC	2622.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=33;PP=1696;SC=ATGGGGTTTTGTATGTTGCCC;SOR=1.376;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=40;TCF=4;TCR=36;TR=37;WE=30338301;WS=30338283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr21	30339120	rs34191159	C	A	1226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.629;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=27;PP=677;ReadPosRankSum=0.348;SC=AATTCCCAGCCTTCAATCTTC;SOR=0.738;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=129;TCF=64;TCR=65;TR=52;WE=30339128;WS=30339110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,60:0.43:141
chr21	30339234	rs61735768	T	C	2570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.487;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=51;PP=1763;ReadPosRankSum=-0.707;SC=TTCAATGAGCTCTTCGGCTTC;SOR=0.731;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=253;TCF=151;TCR=102;TR=125;WE=30339242;WS=30339224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,124:0.51:245
chr21	30341891	rs2254796	A	G	895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.471;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=24;PP=576;ReadPosRankSum=0.728;SC=CGAGGACTCTAAAGAGCTGGT;SOR=1.455;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=59;TCF=22;TCR=37;TR=33;WE=30341899;WS=30341881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,39:0.54:72
chr21	30354610	rs2832150	T	C	1012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=15;PP=613;ReadPosRankSum=1.669;SC=ATCCTTAACATGAGTTACAAT;SOR=0.648;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=84;TCF=56;TCR=28;TR=46;WE=30354618;WS=30354600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,49:0.52:94
chr21	30357307	rs2245434	C	T	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.114;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=196;ReadPosRankSum=0.733;SC=CAGACATTTCCGGATATGCTA;SOR=0.250;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=13;WE=30357315;WS=30357297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
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chr21	30445961	rs2012645	G	A	1156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.799;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=34;PP=785;ReadPosRankSum=-0.677;SC=GACCGCGGAGGAAGCGAGGAG;SOR=1.158;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=98;TCF=42;TCR=56;TR=53;WE=30445969;WS=30445951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,55:0.51:107
chr21	30463974	.	C	CT	325.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.379;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.495;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr21	30481371	rs2832181	G	T	2313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.286;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=36;PP=1388;ReadPosRankSum=-0.246;SC=GTTGACATTCGTAACCTTCCT;SOR=0.955;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=181;TCF=110;TCR=71;TR=98;WE=30481379;WS=30481361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,109:0.54:201
chr21	30481612	rs2832182	G	A	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.050;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=305;ReadPosRankSum=-0.297;SC=TGCTTATTTTGTGCCCATTTA;SOR=1.371;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=52;TCF=19;TCR=33;TR=22;WE=30481620;WS=30481602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,23:0.41:56
chr21	30505836	rs9636820	T	C	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-3.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.198;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=161;ReadPosRankSum=0.019;SC=GTTGCATGCTTGCATGACCTG;SOR=0.223;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=14;WE=30505844;WS=30505826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr21	30532146	rs66780570	TA	T	309.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=5.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.26;MQRankSum=1.062;QD=7.94;ReadPosRankSum=1.323;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,23:0.59:39
chr21	30830393	rs9981313	T	G	957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.336;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=19;PP=557;ReadPosRankSum=-0.396;SC=GGGATTTCAGTTAACTTATCA;SOR=0.925;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=102;TCF=58;TCR=44;TR=46;WE=30830401;WS=30830383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,51:0.42:121
chr21	30925853	rs112669361	CT	C	74.19	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.60;ReadPosRankSum=0.366;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr21	30969901	rs363431	T	C	1445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.358;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=29;PP=655;ReadPosRankSum=-0.142;SC=CAACATCCCATGCACCATCGT;SOR=0.780;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=60;TCR=56;TR=59;WE=30969909;WS=30969891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,72:0.53:135
chr21	31002803	rs7282163	G	T	995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.568;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=13;PP=559;ReadPosRankSum=-1.542;SC=AATCAAAATAGTTCTTTAATA;SOR=0.855;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=96;TCF=64;TCR=32;TR=43;WE=31002820;WS=31002793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,50:0.45:111
chr21	31026967	rs10637196	A	AAAAG	742.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.887;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=2.664;NF=19;NR=1;PP=906;ReadPosRankSum=-0.441;SC=AAGAAAGAAAAAAAGCCTGCT;SOR=2.211;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=42;TCF=35;TCR=7;TR=20;WE=31026975;WS=31026957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,19:0.44:43
chr21	31233814	rs468206	A	G	175.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=0;PP=160;SC=TTGTAGAGACAGGGTTTTGTC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=31233822;WS=31233806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr21	31233892	.	GGGATT	G	1672.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=49.20;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr21	31233898	.	A	AACCAACACT	1762.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=51.85;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr21	31233900	rs55707309	A	G	1808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.60;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr21	31233904	rs142587327	G	GT	1757.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.9990;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=576;SC=GATTATAGGTGTGAGCCAACA;SOR=2.133;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=6;WE=31233912;WS=31233882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr21	31233994	rs468413	T	C	2566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=39;NR=40;PP=1295;SC=TGAATGAATATTGGGTTTTGC;SOR=0.914;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=39;TCR=40;TR=79;WE=31234002;WS=31233984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr21	31655212	rs1557291	A	C	2325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=50;PP=1546;SC=TACTGCAGACACCAGGATAGC;SOR=1.501;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=28;TCR=50;TR=78;WE=31655220;WS=31655202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr21	31661691	rs8127420	A	G	3754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=74;PP=2441;ReadPosRankSum=-0.805;SC=CAGGTCCTGGACACAAAATTC;SOR=0.676;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=294;TCF=157;TCR=137;TR=155;WE=31661699;WS=31661681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,169:0.52:325
chr21	31691571	rs2236427	C	A	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=36;ReadPosRankSum=0.718;SC=CAAGATAAAACATGCGAGAGA;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=5;WE=31691579;WS=31691562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr21	31709691	rs2244485	G	A	1499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.035;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=29;PP=891;ReadPosRankSum=0.970;SC=TGATTGGCACGCTGTCCTTTC;SOR=0.465;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=122;TCF=68;TCR=54;TR=63;WE=31709699;WS=31709681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,72:0.52:139
chr21	31720287	rs762377	A	G	3018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=23;PP=1990;SC=AATATTAATAAGTTTAAAACA;SOR=1.935;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=67;TCR=23;TR=90;WE=31720295;WS=31720277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr21	31744127	rs877346	A	T	1809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.162;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=40;PP=1176;ReadPosRankSum=-0.029;SC=AAGGGAAGCCACAGCTTCCAT;SOR=0.381;SbPval=0.37;Source=Platypus;TCR=78;TR=73;WE=31744135;WS=31744117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,81:0.56:144
chr21	31802768	rs2226548	G	A	5137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=74;PP=2965;SC=CTGGGAGCCCGCCAGCTGCCA;SOR=0.793;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=170;TCF=96;TCR=74;TR=170;WE=31802776;WS=31802758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr21	31803159	rs1539783	T	C	1149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=26;PP=905;SC=TCCCAATATCTTTTTATTCTT;SOR=1.387;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=14;TCR=26;TR=40;WE=31803167;WS=31803149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr21	31803210	rs1539784	C	T	330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=10;PP=233;SC=TGGCAGACTGCGAAATTAATG;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=31803218;WS=31803200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr21	31812772	rs2832873	C	A	6139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=116;NR=90;PP=2965;SC=TACCTGCCAACTGGGCTCCTC;SOR=0.824;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=206;TCF=116;TCR=90;TR=206;WE=31812780;WS=31812762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr21	31812828	rs35857034	C	T	2040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=46;PP=1257;ReadPosRankSum=-1.097;SC=CCACCAGCTGCCAGACATCCT;SOR=0.678;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=220;TCF=115;TCR=105;TR=96;WE=31812836;WS=31812818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,104:0.44:235
chr21	31869286	rs2298437	T	C	9141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;PP=2965;SC=TGGGCGGCAGTAGCCATATCC;SOR=0.749;Source=Platypus;WE=31869294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,327:1.00:327
chr21	31913981	rs5843453	AG	A	16286.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=372;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=163;PP=2976;SC=GTTTTTTAGTAGAATCCAGAG;SOR=0.721;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=202;TCF=38;TCR=164;TR=198;WE=31913989;WS=31913971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,367:1.00:367
chr21	31914000	rs1023364	T	A	15442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=357;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=155;NR=166;PP=2965;SC=AGAATCCATATCCTTCACGGC;SOR=0.792;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=321;TCF=155;TCR=166;TR=321;WE=31914008;WS=31913990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,357:1.00:357
chr21	31964916	rs9305426	A	C	3609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=71;NR=50;PP=2144;SC=GGCTTTGGCTATGGAGGCCTG;SOR=0.801;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=72;TCR=50;TR=121;WE=31964924;WS=31964906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr21	31973516	rs198915	T	A	3680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=62;PP=2094;SC=GGCTGTGGTCTTAGCGGCTAT;SOR=0.886;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=120;TCF=58;TCR=62;TR=120;WE=31973524;WS=31973506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr21	31973685	rs1961491	C	T	603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=17;PP=467;SC=AAAATTTAGCCCACATTGCCA;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=31973693;WS=31973675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr21	31992864	rs1702405	A	G	1263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=10;PP=874;SC=ATATGAAACCAAACGGCCTCA;SOR=2.400;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=45;WE=31992872;WS=31992854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr21	32201822	rs9982910	G	T	7174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=61;PP=2788;ReadPosRankSum=-1.342;SC=CATAGCAGCCGCCCAGGTTGT;SOR=0.363;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=151;TCF=90;TCR=61;TR=150;WE=32201843;WS=32201812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,163:0.99:164
chr21	32201835	rs9982675	A	C	7532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=67;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.629;SC=CAGGTTGTTGATGTTGCTACC;SOR=0.343;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=166;TCF=99;TCR=67;TR=165;WE=32201843;WS=32201812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,178:0.99:179
chr21	32201866	rs9982755	A	G	5808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.144;NF=112;NR=88;PP=2965;ReadPosRankSum=1.274;SC=TAGCCCAGGGAGCTGTAGCCA;SOR=0.280;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=203;TCF=115;TCR=88;TR=200;WE=32201874;WS=32201856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,218:1.00:219
chr21	32201951	rs9982775	A	G	7054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=80;PP=2742;SC=TGAAGGTCCCATGGAAGTTGG;SOR=0.829;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=161;TCF=79;TCR=82;TR=158;WE=32201959;WS=32201941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr21	32201969	rs35359062	GA	G	6977.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=74;PP=2951;SC=TGGTCCCATAGAATAGGGTAT;SOR=0.884;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=24;TCR=74;TR=98;WE=32201977;WS=32201959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr21	32202106	rs2833118	T	A	1263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=30;PP=897;SC=CAGGGCTTTTTATACCTCAAG;SOR=2.531;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=8;TCR=30;TR=38;WE=32202114;WS=32202096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr21	32493031	rs762194	A	G	6680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=111;NR=112;PP=2965;SC=CAGTGTCCCCACCACCGGGGG;SOR=0.856;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=223;TCF=111;TCR=112;TR=223;WE=32493044;WS=32493021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr21	32493204	rs2073371	G	A	3508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=46;NR=58;PP=1686;SC=CATGCTTTACGTGAGATGAAA;SOR=1.033;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=46;TCR=58;TR=104;WE=32493212;WS=32493194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr21	32499473	rs2070410	A	G	5786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=87;NR=103;PP=2965;SC=CTCTGCATCTAAAGAAATTAA;SOR=0.956;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=191;TCF=87;TCR=104;TR=190;WE=32499481;WS=32499463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr21	32524852	rs9305453	A	G	999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.879;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=12;PP=625;ReadPosRankSum=-1.278;SC=CCTTAGGAACAGACCCCACTG;SOR=0.882;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=78;TCF=55;TCR=23;TR=44;WE=32524860;WS=32524842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,48:0.56:85
chr21	32525302	rs723470	A	C	1721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.167;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=30;PP=1022;ReadPosRankSum=0.504;SC=TTTCAGTGTTACGCATGTCCC;SOR=0.829;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=161;TCF=94;TCR=67;TR=73;WE=32525310;WS=32525292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,84:0.46:182
chr21	32525345	rs723469	G	A	2367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=43;PP=1308;ReadPosRankSum=0.141;SC=GTCAAACCACGGTATGATGGT;SOR=0.685;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=207;TCF=115;TCR=92;TR=97;WE=32525353;WS=32525335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,112:0.47:237
chr21	32526668	rs75483199	T	A	1359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=27;PP=648;ReadPosRankSum=0.352;SC=CCCCGTGGAGTCCTGAGGAGA;SOR=0.695;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=127;TCF=69;TCR=58;TR=59;WE=32526676;WS=32526658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,71:0.49:146
chr21	32932250	rs9975287	G	C	1114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.636;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=17;PP=828;ReadPosRankSum=0.447;SC=CAGAGTAAGTGACTCGGGCAG;SOR=0.492;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=113;TCF=80;TCR=33;TR=52;WE=32932258;WS=32932240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,53:0.45:119
chr21	33057312	rs367618143	TG	T	110.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.85;ReadPosRankSum=-0.566;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr21	33068937	rs78537042	C	A	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.724;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.208;NF=13;NR=10;PP=283;ReadPosRankSum=-0.794;SC=GCAGCAGGCACGGTGGCGGTG;SOR=0.943;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=51;TCF=32;TCR=19;TR=23;WE=33068945;WS=33068927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,24:0.42:57
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chr21	33355760	rs737103	G	A	2030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=15;PP=1154;SC=CCAAGCGCTGGTTTAAAAATT;SOR=1.708;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=44;TCR=15;TR=59;WE=33355768;WS=33355750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr21	33362370	rs11909675	G	A	2882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.896;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=54;PP=1364;ReadPosRankSum=-1.081;SC=CTGCAGGGCCGTAGGGGAAGC;SOR=0.711;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=250;TCF=127;TCR=123;TR=115;WE=33362378;WS=33362360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,139:0.48:287
chr21	33368188	rs2070371	T	C	2597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.136;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=58;PP=1656;ReadPosRankSum=0.649;SC=CAGGCTCGCTTATGACACAGA;SOR=0.550;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=223;TCF=102;TCR=121;TR=109;WE=33368196;WS=33368178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,122:0.48:253
chr21	33370900	rs9305483	T	C	4350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=368;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.708;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=86;PP=2640;ReadPosRankSum=2.187;SC=TGGCTTCTTCTTCCATGGAGT;SOR=0.613;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=330;TCF=171;TCR=159;TR=176;WE=33370908;WS=33370890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,201:0.55:367
chr21	33371540	rs2070372	T	G	876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.810;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=23;PP=458;ReadPosRankSum=-0.663;SC=AAACAGCAACTGAACAGAGCT;SOR=0.600;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=83;TCF=31;TCR=52;TR=39;WE=33371548;WS=33371530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,44:0.48:91
chr21	33690293	rs2070380	C	A	612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=17;PP=431;SC=GTCAGCACTGCGGCACCCTGA;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=33690301;WS=33690283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr21	33691502	rs11402028	G	GC	1551.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=11;NR=13;PP=875;SC=GGCCAGAAGGGCCCCCTGGCG;SOR=1.201;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=27;TCF=13;TCR=14;TR=24;WE=33691510;WS=33691492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr21	33691754	rs958828	G	A	1486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=5.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.89;ReadPosRankSum=-1.142;SOR=0.424;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,73:0.58:125
chr21	33694224	rs3761342	C	G	5270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=91;NR=83;PP=2965;SC=TGCCGCAGAACGCCAAACACC;SOR=0.703;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=174;TCF=91;TCR=83;TR=174;WE=33694232;WS=33694214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr21	33710001	rs13046776	C	A	174.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=116;SC=TTATTATTTTCTTTTCTTTTT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=33710009;WS=33709991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr21	33711126	rs141550612	G	A	2228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.713;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=47;PP=1312;ReadPosRankSum=-1.616;SC=GATGAGCTTCGTGCGCACGGA;SOR=0.676;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=180;TCF=95;TCR=85;TR=95;WE=33711134;WS=33711116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,107:0.53:203
chr21	33719695	rs2070378	C	T	5247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=88;NR=80;PP=2965;SC=GGTGTCTTTCCTTCCCGGGGG;SOR=0.746;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=168;TCF=88;TCR=80;TR=168;WE=33719703;WS=33719685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr21	33721843	rs743306	T	C	947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=25;PP=697;SC=GGTTCACAGCTACCAGGCAGT;SOR=3.912;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=28;WE=33721851;WS=33721833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr21	33726201	rs2298363	C	T	2038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=21;PP=1334;SC=ACAGACTAGCCGGCCAGGTGC;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=47;TCR=21;TR=68;WE=33726209;WS=33726191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr21	33730013	rs7283283	T	C	478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.92;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr21	33740637	rs7276783	G	A	470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=336;SC=TCGGCCTCCCGAAGTGCTGGG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=33740645;WS=33740627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr21	33746113	rs117415725	A	C	1030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.662;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=27;PP=636;ReadPosRankSum=-1.181;SC=TTATTAAAAAACAAATTATGA;SOR=0.407;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=110;TCF=36;TCR=74;TR=44;WE=33746121;WS=33746103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,51:0.41:123
chr21	33749533	rs4816431	A	C	3820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=37;PP=2726;SC=AGCCTACGGGAACAGAGGCCA;SOR=1.954;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=126;TCF=89;TCR=37;TR=126;WE=33749541;WS=33749523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr21	33755763	rs2833795	G	A	2209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.532;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=43;PP=1204;ReadPosRankSum=0.454;SC=AGGGTGTACAGGGTCTTTTTA;SOR=0.633;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=173;TCF=89;TCR=84;TR=93;WE=33755771;WS=33755753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,106:0.55:192
chr21	33757947	rs58978310	A	T	3772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=385;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.768;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=76;PP=2320;ReadPosRankSum=-0.105;SC=CATCATACACATCTTCTCGTG;SOR=0.643;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=342;TCF=185;TCR=157;TR=159;WE=33757955;WS=33757937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:206,178:0.46:384
chr21	33765320	rs374019516	AGGAAGAGGCGGGGCTGGC	A	532.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=1.339;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.32;MQRankSum=2.223;QD=12.39;ReadPosRankSum=-1.117;SOR=1.015;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,17:0.40:43
chr21	33765496	rs112644530	A	C	445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=41;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=182;ReadPosRankSum=-0.440;SC=TTGGGGCTCCATGTGAGTTTG;SOR=0.693;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=12;WE=33765504;WS=33765486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr21	33765560	rs11702306	C	T	789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=12;PP=520;ReadPosRankSum=-0.628;SC=CCACGACACCCCCCGCCCCCG;SOR=0.715;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=69;TCF=42;TCR=27;TR=33;WE=33765568;WS=33765547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,36:0.49:74
chr21	33840095	rs8130653	C	T	3050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.088;NF=65;NR=73;PP=1667;ReadPosRankSum=1.681;SC=CTGCGACCTACGGCAGGAGGA;SOR=0.701;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=300;TCF=142;TCR=158;TR=138;WE=33840103;WS=33840085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:180,154:0.46:334
chr21	33949059	rs7520	G	A	1608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.631;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=32;PP=1084;ReadPosRankSum=-0.548;SC=GAGTGACACAGGTGTCCGAGG;SOR=0.919;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=171;TCF=98;TCR=73;TR=77;WE=33949067;WS=33949049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,81:0.45:179
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chr21	33964537	rs7284048	G	A	986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.698;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=22;PP=531;ReadPosRankSum=1.225;SC=AAACAAAGACGTGGCTGAAAG;SOR=0.484;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=87;TCF=49;TCR=38;TR=47;WE=33964545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,51:0.55:93
chr21	33964605	rs1783091	T	C	1279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.28;ReadPosRankSum=-0.592;SOR=0.783;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,37:0.53:70
chr21	33964612	rs7278762	G	A	1208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=2.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.89;ReadPosRankSum=-0.057;SOR=1.119;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,32:0.50:64
chr21	33974322	rs16989559	G	A	3048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.844;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=70;PP=1938;ReadPosRankSum=1.051;SC=GGCATTTCAGGAAAGTGTTTT;SOR=0.750;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=287;TCF=146;TCR=141;TR=139;WE=33974330;WS=33974312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,150:0.47:320
chr21	34117067	rs200949840	GA	G	56.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.16;ReadPosRankSum=2.380;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr21	34157235	rs35174687	GT	G	266.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=1.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.70;ReadPosRankSum=2.345;SOR=0.486;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr21	34165864	rs2231391	C	A	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.656;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=154;ReadPosRankSum=0.438;SC=GTTTCTTTTTCTTTTGTTTTT;SOR=0.061;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=15;WE=34165872;WS=34165858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,18:0.78:23
chr21	34166190	rs74617086	A	T	5595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=94;PP=2965;SC=TATATGATTTAAAGGCTGAGT;SOR=0.793;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=190;TCF=96;TCR=94;TR=190;WE=34166198;WS=34166180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr21	34166343	rs2231390	C	T	2402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.436;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=45;PP=1359;ReadPosRankSum=0.399;SC=GATGCTTGGCCTCCATGTTGA;SOR=0.739;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=252;TCF=139;TCR=113;TR=103;WE=34166351;WS=34166333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,120:0.42:286
chr21	34169181	rs762228	A	G	957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.412;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=17;PP=570;ReadPosRankSum=0.905;SC=CCTTAAAAGAAAAAAGAGGGG;SOR=0.169;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=69;TCF=44;TCR=25;TR=39;WE=34169189;WS=34169171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,43:0.58:74
chr21	34169317	rs72564613	C	CT	3075.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.587;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.760;NF=17;NR=31;PP=1750;ReadPosRankSum=1.615;SC=TATTGGTTTGCGGAACATGTG;SOR=0.824;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=126;TCF=36;TCR=90;TR=48;WE=34169325;WS=34169307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,96:0.40:243
chr21	34224040	rs62214304	C	T	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.258;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=7;PP=445;ReadPosRankSum=0.521;SC=TTCTTTACCTCATTTTCACCA;SOR=1.102;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=56;TCF=41;TCR=15;TR=29;WE=34224048;WS=34224030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,34:0.52:66
chr21	34400146	rs9982080	G	T	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.494;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=125;ReadPosRankSum=-0.904;SC=CAAGTGAGCCGACTGGCGCCG;SOR=1.085;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=27;TCF=9;TCR=18;TR=11;WE=34400154;WS=34400136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr21	34400237	rs56307226	G	C	51.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=17.09;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr21	34538065	rs11444667	C	CT	5180.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=63;PP=2936;SC=TGGCCTCCTTCTTGTATCCCC;SOR=1.032;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=77;TCF=9;TCR=68;TR=72;WE=34538073;WS=34538055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr21	34540594	rs11379155	C	CT	1490.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=5;PP=1475;SC=TGCTATAGAGCTGGAATTTAT;SOR=4.021;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=33;WE=34540602;WS=34540584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr21	34542324	.	GA	G	213.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.093;ClippingRankSum=0.000;DP=175;ExcessHet=3.0103;FS=0.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.26;ReadPosRankSum=1.468;SOR=0.730;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:139,31:0.18:170
chr21	34617213	rs2834158	T	C	5028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=77;PP=2882;SC=AGAATACAACTGTGGGTTCCA;SOR=0.715;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=167;TCF=90;TCR=77;TR=167;WE=34617221;WS=34617203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr21	34617729	rs2252639	A	G	2636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=35;PP=1505;SC=AAGTCCTGTTATCTGAGGACA;SOR=0.823;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=49;TCR=35;TR=84;WE=34617737;WS=34617719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr21	34617950	rs2252650	A	T	138.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=4;PP=108;SC=GACATAATGGATGGAGTCCTG;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=34617958;WS=34617940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr21	34624386	rs71894734	CATCT	C,CATCTATCTATCTATCTATCT	1078.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=25;NF=5,5;NR=2,2;PP=755,487;SC=AGACCCCATCCATCTATCTAT;SOR=4.407;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=7,7;WE=34624397;WS=34624376;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.43,0.57:28
chr21	34624917	rs2236757	A	G	248.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=0;PP=173;SC=ATTAAGGCCTACCTCTAAATG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=34624925;WS=34624916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr21	34635065	rs9984273	C	T	2386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=75;NR=15;PP=1398;SC=ACAGCTGATACGGACTCTCTC;SOR=2.356;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=113;TCF=75;TCR=38;TR=90;WE=34635088;WS=34635055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr21	34638859	rs2239573	G	A	1258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=3.849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.59;ReadPosRankSum=0.243;SOR=1.152;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,59:0.59:100
chr21	34648887	rs200472684	T	G	1493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.735;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=18;PP=904;ReadPosRankSum=-1.419;SC=TGACCTATCTTTTTGATTGTG;SOR=0.474;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=96;TCF=68;TCR=28;TR=57;WE=34648895;WS=34648877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,63:0.58:109
chr21	34660676	rs66527331	ACG	A	545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=3.349;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.73;ReadPosRankSum=1.039;SOR=2.200;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,21:0.91:23
chr21	34660684	.	GCGCA	G	94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=27;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=1;NR=10;PP=94;QD=10.1818181818;SC=ACACGCGCGCGCGCACACACA;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=11;WE=34660697;WS=34660674;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr21	34660686	.	G	A	392	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=32;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=4;NR=5;PP=392;QD=47.4190236164;SC=ACGCGCGCGCGCACACACACA;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=9;WE=34660697;WS=34660674;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:11,9:0.45:20
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chr21	34660709	rs66834406	CAG	C	201.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.752;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.52;ReadPosRankSum=-1.209;SOR=0.250;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr21	34660711	.	G	C	234	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=82;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=1;NR=10;PP=234;QD=24.4337465952;SC=CACACACACAGACACGCCTCT;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=34660719;WS=34660701;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
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chr21	34668747	rs3171425	A	G	2197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.436;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=49;PP=1464;ReadPosRankSum=0.054;SC=GGCAGCAAACAAGGGCCAAGA;SOR=0.749;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=262;TCF=146;TCR=116;TR=110;WE=34668755;WS=34668737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,119:0.41:287
chr21	34697197	rs55884088	G	GGTGTGTGTGTGTGTGTGT	70.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.497;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.86;ReadPosRankSum=-0.601;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr21	34697264	rs2850015	T	C	432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.067;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=8;PP=337;ReadPosRankSum=0.744;SC=GCAGCGCGTGTGCAGAGGGGC;SOR=0.970;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=53;TCF=37;TCR=16;TR=24;WE=34697272;WS=34697254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,22:0.36:61
chr21	34707808	rs2243592	T	G	1519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.149;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=23;PP=907;ReadPosRankSum=-1.314;SC=TATAATGTTCTTATTTCTTGT;SOR=0.920;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=135;TCF=87;TCR=48;TR=70;WE=34707816;WS=34707798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,77:0.52:147
chr21	34708061	rs2243594	A	G	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=34;ReadPosRankSum=-0.277;SC=TCTATTTTTTAGAAATGTTAC;SOR=0.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=4;WE=34708069;WS=34708051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr21	34721348	rs2834196	A	G	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=119;ReadPosRankSum=1.399;SC=TGGCAATTGTAAATACTTAAT;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=6;WE=34721356;WS=34721338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr21	34726127	rs2856973	T	A	861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.278;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=28;PP=663;ReadPosRankSum=0.735;SC=AACAGCTAGGTAATGAACAGA;SOR=1.381;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=48;TCF=10;TCR=38;TR=34;WE=34726135;WS=34726117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,34:0.69:49
chr21	34793706	rs2834214	C	T	730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-2.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=7;PP=460;ReadPosRankSum=0.619;SC=AATAAACCTGCGTTTTGAACA;SOR=0.670;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=84;TCF=64;TCR=20;TR=32;WE=34793714;WS=34793696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,36:0.39:92
chr21	34799350	rs11910627	C	G	2155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.062;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=43;PP=1206;ReadPosRankSum=-0.240;SC=GCAAGAGCATCTTTCTTTTTT;SOR=0.510;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=141;TCF=65;TCR=76;TR=84;WE=34799358;WS=34799340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,98:0.61:160
chr21	34804966	rs1532	T	C	1792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.719;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=34;PP=1015;ReadPosRankSum=-0.139;SC=CATTAACTGATGTTTGTGTTG;SOR=0.838;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=188;TCF=110;TCR=78;TR=81;WE=34804974;WS=34804956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,89:0.43:209
chr21	34805197	rs17883129	C	T	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.320;HP=14;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=177;ReadPosRankSum=-0.083;SC=GCACACATCTCTTTTTTTTTT;SOR=0.827;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=31;TCF=11;TCR=20;TR=12;WE=34805205;WS=34805187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr21	34809049	rs2040120	T	A	926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=1.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.26;ReadPosRankSum=1.365;SOR=0.405;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,36:0.55:65
chr21	34823252	rs2834220	C	T	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=208;ReadPosRankSum=-0.463;SC=TATGCTTTGACAGGTACTTCA;SOR=0.667;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=40;TCF=17;TCR=23;TR=20;WE=34823260;WS=34823242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,24:0.52:46
chr21	34837623	rs2248820	C	A	1161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=22;PP=616;ReadPosRankSum=1.110;SC=TTGTCAACACCCATTAACAGC;SOR=0.688;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=48;TCR=39;TR=48;WE=34837631;WS=34837613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,56:0.52:108
chr21	34837786	rs2243511	A	G	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.971;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=70;ReadPosRankSum=-0.508;SC=TTTATATAACACTTAGACGGA;SOR=0.250;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=9;WE=34837794;WS=34837776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr21	34839533	rs743334	A	G	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=2.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.567;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=18;PP=405;ReadPosRankSum=0.763;SC=TGGGCTGGGTACAGAGGCTCA;SOR=1.209;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=22;WE=34839541;WS=34839523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,26:0.59:44
chr21	34894623	rs2834234	T	C	835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=21;PP=478;ReadPosRankSum=1.262;SC=CACCTAAACGTCAGGGAAAAT;SOR=0.708;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=57;TCF=22;TCR=35;TR=34;WE=34894631;WS=34894613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,39:0.59:66
chr21	34897113	rs8788	C	T	2047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=31;PP=1144;ReadPosRankSum=-0.047;SC=CGAAAGCCGACGTCTTTCCTA;SOR=0.720;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=157;TCF=97;TCR=60;TR=85;WE=34897121;WS=34897103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,96:0.55:176
chr21	34903875	.	ATT	A	74.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.000;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=6.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.98;MQRankSum=0.659;QD=3.93;ReadPosRankSum=0.044;SOR=0.064;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr21	34915324	rs1041745	CG	GC	2907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=9;PP=2292;SC=CGAATTGGCCCGTGCGCCTCC;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=47;TCR=10;TR=52;WE=34915333;WS=34915314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr21	34925142	rs13433428	C	T	5446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=88;PP=2965;SC=GTGCCATCATCACCATCTGAA;SOR=0.787;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=178;TCF=90;TCR=88;TR=178;WE=34925150;WS=34925132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr21	34926239	.	C	G	3360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.092;ClippingRankSum=0.000;DP=331;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=62;PP=2093;ReadPosRankSum=-2.210;SC=GAAAATTTTGCCCACCAGTGA;SOR=0.676;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=297;TCF=170;TCR=127;TR=142;WE=34926247;WS=34926229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,158:0.48:331
chr21	34926260	rs13047599	C	T	3804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=358;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.796;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=69;PP=2233;ReadPosRankSum=1.241;SC=GACTAAACAGCGCACAGTATT;SOR=0.647;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=323;TCF=186;TCR=137;TR=161;WE=34926268;WS=34926250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,180:0.50:358
chr21	34945721	rs3174808	T	C	1471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.084;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=23;PP=953;ReadPosRankSum=-1.184;SC=AAGAAGGCAATAAGGAACCCA;SOR=1.022;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=129;TCF=78;TCR=51;TR=63;WE=34945729;WS=34945711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,70:0.50:140
chr21	34948684	rs34377180	G	GA	1694.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=16;PP=1394;SC=TTGAGAAATGGAGCCCTTACC;SOR=0.850;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=15;TCR=16;TR=31;WE=34948704;WS=34948674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr21	34948696	rs34373121	GA	G	1729.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=16;PP=1352;SC=GCCCTTACCAGACCCAATTGT;SOR=0.850;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=16;TCR=16;TR=32;WE=34948704;WS=34948674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr21	34954602	rs77179527	AG	A	286.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=239;ReadPosRankSum=-1.809;SC=AGTATTTAACAGGCATGCTGT;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=8;WE=34954610;WS=34954592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr21	34959776	rs7283856	G	A	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=343;ReadPosRankSum=0.122;SC=CAAATCCTATGAAAAAAAAGT;SOR=0.997;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=20;WE=34959784;WS=34959766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr21	34969423	rs3761351	G	A	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.582;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=2.81;ReadPosRankSum=0.473;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr21	35012719	rs6517185	GG	CT	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=3.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.127;HP=3;HapScore=2;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=507;ReadPosRankSum=-0.077;SC=AGTTTGAATCGGGGCTTTCCT;SOR=1.402;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=11;WE=35012728;WS=35012709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
chr21	35124253	rs2834255	A	G	1390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=32;PP=903;SC=GGTTAAGGCCATTACCTGATT;SOR=1.802;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=15;TCR=32;TR=47;WE=35124261;WS=35124243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr21	35127735	rs2154434	C	A	1947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=46;PP=1301;SC=GAAATATGATCTTTGTTTTCA;SOR=2.372;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=16;TCR=46;TR=62;WE=35127743;WS=35127725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr21	35134084	rs11444980	G	GC	4013.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=30;NR=32;PP=2531;SC=TTTTTACAAAGCCCTGCGGTA;SOR=1.316;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=76;TCF=38;TCR=38;TR=62;WE=35134092;WS=35134074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr21	35166803	rs2073368	G	T	1529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=29;PP=797;ReadPosRankSum=-0.782;SC=GGACTCATCTGGAAGGAACTT;SOR=0.720;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=149;TCF=78;TCR=71;TR=63;WE=35166811;WS=35166793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,73:0.45:163
chr21	35166945	rs2073369	A	G	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.993;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=138;ReadPosRankSum=-0.433;SC=TGCATGTATCAGTACCCTCTG;SOR=0.132;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=11;WE=35166953;WS=35166935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr21	35186058	rs149351561	T	TTTTA	85.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=177;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TTTTTTCCTCTTTTATTTATT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=3;WE=35186066;WS=35186049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr21	35190802	rs2236613	T	C	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=23;PP=541;ReadPosRankSum=1.580;SC=TCTGCTTGTATTTGATGAAAA;SOR=1.292;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=24;WE=35190810;WS=35190792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,26:0.62:42
chr21	35201281	rs2245099	G	A	2528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=53;PP=1514;ReadPosRankSum=0.093;SC=GGTCCCTCCTGTAACGTGAAA;SOR=0.676;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=205;TCF=111;TCR=94;TR=112;WE=35201289;WS=35201271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,121:0.55:220
chr21	35206880	rs2248321	A	G	1160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=32;PP=908;SC=CTAATGTGATATGGAATATGT;SOR=3.855;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=4;TCR=32;TR=36;WE=35206888;WS=35206870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr21	35228953	rs9305535	A	G	2842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=17;PP=1849;SC=AGCCCTCAGGACCCAGCAGCC;SOR=2.327;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=65;TCR=17;TR=82;WE=35228961;WS=35228943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr21	35230921	rs2073366	G	C	1094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.748;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=15;PP=716;ReadPosRankSum=0.034;SC=GCTCTCAGCGGATCGGCGTGT;SOR=0.555;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=111;TCF=78;TCR=33;TR=49;WE=35230929;WS=35230911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,54:0.45:121
chr21	35237349	rs9984732	A	G	1878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=13;PP=1281;SC=AGTGGCCCTTAAGGCTGTGCC;SOR=2.194;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=44;TCR=13;TR=57;WE=35237357;WS=35237339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr21	35237608	rs9976801	T	C	1813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=41;PP=995;SC=AGAAGACGGATGAGGCCCCAG;SOR=2.015;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=19;TCR=41;TR=60;WE=35237616;WS=35237598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr21	35247611	rs2298681	G	A	828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.394;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=14;PP=533;ReadPosRankSum=-0.553;SC=TCACAGGCCCGCCCACATTGC;SOR=0.334;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=76;TCF=52;TCR=24;TR=38;WE=35247619;WS=35247601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,41:0.47:87
chr21	35247873	rs933130	C	G	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.175;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=227;ReadPosRankSum=-0.700;SC=CAGAGCCTCGCCTGCCAGCCT;SOR=1.392;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=50;TCF=20;TCR=30;TR=18;WE=35247881;WS=35247863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,20:0.36:56
chr21	35260481	rs2073370	T	C	5575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=89;PP=2965;SC=CGGAGATCCGTGTGGCGGACA;SOR=0.791;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=188;TCF=99;TCR=89;TR=188;WE=35260489;WS=35260471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr21	35275955	rs9980730	G	A	7081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=112;NR=128;PP=2965;SC=TACAAAAGAAGTAAGACTGGA;SOR=0.915;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=241;TCF=112;TCR=129;TR=240;WE=35275963;WS=35275945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr21	35276209	rs2834293	A	G	927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=17;PP=572;ReadPosRankSum=-0.234;SC=ATAACCCGAGAAAACGTACCA;SOR=0.696;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=80;TCF=45;TCR=35;TR=39;WE=35276217;WS=35276199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,45:0.48:94
chr21	35278919	rs3831798	A	ACT	4572.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=20;PP=2743;SC=ATTATAGCCCACTATCAAGTC;SOR=2.040;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=61;TCF=37;TCR=24;TR=54;WE=35278927;WS=35278909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr21	35279500	rs62226669	G	A	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=262;ReadPosRankSum=0.214;SC=GGTCACAGAAGCTGATATAAA;SOR=0.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=14;WE=35279508;WS=35279490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,14:0.38:37
chr21	35279604	rs62226670	T	C	2596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.936;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=47;PP=1666;ReadPosRankSum=-0.562;SC=GTGACACATGTAATATCAAGG;SOR=0.626;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=248;TCF=148;TCR=100;TR=116;WE=35279612;WS=35279594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,128:0.47:271
chr21	35281393	rs4591	A	G	2513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=36;PP=1397;SC=CACTGATCAGATTGGTAGTGA;SOR=0.714;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=42;TCR=36;TR=78;WE=35281401;WS=35281383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr21	35284734	rs2211873	A	G	4208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.47;SOR=1.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr21	35446136	rs79607614	C	G	934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.915;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=23;PP=558;ReadPosRankSum=0.579;SC=GCCGCGGGACCCCGGGCCTTC;SOR=0.506;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=64;TCF=27;TCR=37;TR=41;WE=35446144;WS=35446126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,44:0.59:75
chr21	35467372	rs11295804	AC	A	426.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=0;PP=484;SC=AAAGACTTTGACCCTGCTGTG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=35467380;WS=35467362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr21	35467472	rs11295803	AG	A	6287.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=38;NR=50;PP=2965;SC=CTGTCATTGGAGCGCTATTAT;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=39;TCR=52;TR=88;WE=35467480;WS=35467462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr21	35467645	rs8129891	A	G	4685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=81;PP=2965;SC=GACCTGGGTAACAATTGGTGC;SOR=0.944;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=153;TCF=72;TCR=81;TR=152;WE=35467653;WS=35467635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr21	35469193	rs4817617	C	A	7166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=132;NR=109;PP=2965;SC=GGAACCATACCAAATGCAAGA;SOR=0.847;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=241;TCF=132;TCR=109;TR=241;WE=35469201;WS=35469183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,263:1.00:263
chr21	35469708	rs35685523	G	GA	331.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=8;PP=344;SC=GGTCTTTGGGGAAAAAAGTTA;SOR=3.611;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=9;WE=35469716;WS=35469698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr21	35774491	.	A	AT	354.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.345;ClippingRankSum=0.000;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=3.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.19;MQRankSum=1.825;QD=4.27;ReadPosRankSum=-0.272;SOR=1.131;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,28:0.34:83
chr21	35893737	rs8131131	T	C	1183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.302;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=25;PP=624;ReadPosRankSum=-0.938;SC=TACTGCTCCCTGGTGCAGGGC;SOR=0.480;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=119;TCF=70;TCR=49;TR=58;WE=35893745;WS=35893727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,62:0.49:126
chr21	35985895	rs915540	C	T	1269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=6;PP=959;SC=AGGAAAAGGTCTGAAATGCTG;SOR=3.312;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=34;TCR=6;TR=40;WE=35985903;WS=35985885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr21	36041577	rs62213788	G	A	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.462;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=245;ReadPosRankSum=0.025;SC=TCCCGGAGCCGGCGTCCTTCA;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=16;WE=36041585;WS=36041567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr21	36041638	rs73357389	T	C	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.914;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=17;PP=480;ReadPosRankSum=-0.120;SC=CCACCGACCCTTAAGCAGCGT;SOR=0.505;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=68;TCF=39;TCR=29;TR=38;WE=36041646;WS=36041628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,39:0.55:71
chr21	36041978	rs7280973	A	G	322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=6;NR=6;PP=173;SC=AGGTGCCCCAAGGAGGGGAGG;SOR=0.836;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=6;TCR=6;TR=12;WE=36041986;WS=36041968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr21	36042203	rs9680380	G	C	384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.59;QD=22.63;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr21	36042462	.	GGCGTAGAAGCGGGGGTCCCGGCGGGGGACA	G	68	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MMLQ=24;MQ=62.65;NF=1;NR=1;PP=68;QD=47.0;SC=GGCGGGGGACGGCGTAGAAGC;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=10;TCF=5;TCR=5;TR=2;WE=36042499;WS=36042452;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,2:0.20:10
chr21	36042579	rs13049028	C	G	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.01;MQRankSum=1.944;QD=17.21;ReadPosRankSum=0.418;SOR=0.730;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr21	36042584	rs13049239	G	A	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.01;MQRankSum=1.944;QD=17.21;ReadPosRankSum=0.418;SOR=0.730;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr21	36079492	rs2070367	G	A	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-2.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.652;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=308;ReadPosRankSum=-0.047;SC=TTATCAACCTGCAATGATTTT;SOR=1.063;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=18;WE=36079500;WS=36079482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,20:0.43:46
chr21	36079735	rs377729689	GCA	G	39.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.072;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=85;ReadPosRankSum=0.221;SC=CTAGTTCTCTGCACACACACA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=7;WE=36079744;WS=36079725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr21	36080204	rs6517253	A	G	1138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=10;PP=826;SC=CCAGATTCTCACGGTGGCCCA;SOR=2.110;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=46;TCF=36;TCR=10;TR=45;WE=36080212;WS=36080194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr21	36080290	rs6517254	C	T	1481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=31;PP=852;ReadPosRankSum=1.314;SC=ACCCTCCTTTCATGACTTTTG;SOR=0.719;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=140;TCF=76;TCR=64;TR=69;WE=36080298;WS=36080280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,72:0.50:143
chr21	36080398	rs2070368	T	C	1436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=34;PP=688;ReadPosRankSum=0.730;SC=GTTCATAACTTGATTGTCACT;SOR=0.523;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=119;TCF=55;TCR=64;TR=64;WE=36080406;WS=36080388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,71:0.53:133
chr21	36080908	rs2834597	G	A	808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=0;PP=678;SC=TCATTTTTATGCCCAGAGAAA;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=36080916;WS=36080898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr21	36081626	rs3819041	C	G	1914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.695;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=30;PP=1105;ReadPosRankSum=0.341;SC=GCAAACCTCTCTTTGTGATTT;SOR=0.496;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=163;TCF=103;TCR=60;TR=78;WE=36081634;WS=36081616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,88:0.49:178
chr21	36164405	rs13051066	G	T	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=3.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.880;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr21	36165041	rs11700756	T	C	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.628;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=65;ReadPosRankSum=-0.875;SC=ATGCTACTGCTGGGGAGGACG;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=6;WE=36165049;WS=36165031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr21	36193871	rs2018329	T	C	143.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=84;SC=CTGAGGGCTGTCATCTTTCTT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=36193879;WS=36193861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr21	36206932	rs11702841	G	A	636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.49;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
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chr21	36421036	rs8133634	T	C	2559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=20;PP=1505;SC=GACAGGGAACTGGCAGGCACC;SOR=2.102;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=58;TCR=20;TR=78;WE=36421044;WS=36421026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr21	36422282	rs200347085	AACACACACAC	AAC,A,AACACACACACAC	774.73	.	AC=1,0,0;AF=0.500,0.00,0.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.4995,0.5000;FS=3.261;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6,6;NR=6,6;PP=28,364;ReadPosRankSum=1.662;SC=GTACAGTCTTAACACACACAC;SOR=1.342;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=31;TCF=14;TCR=17;TR=12,12;WE=36422299;WS=36422272;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.67:39
chr21	36422478	rs2071029	C	T	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=258;ReadPosRankSum=2.301;SC=TAATTTACACCTGTAGGTAAA;SOR=1.402;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=13;WE=36422486;WS=36422468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr21	37408608	rs68024241	AACGT	A	998.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=11;PP=675;SC=TATTTCACAGAACGTACGTAC;SOR=1.708;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=13;WE=37408619;WS=37408598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr21	37412752	rs2255858	T	C	1784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.336;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=25;PP=1043;ReadPosRankSum=0.089;SC=CTCCAATGTATGACATCCCTT;SOR=1.014;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=175;TCF=115;TCR=60;TR=80;WE=37412760;WS=37412742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,86:0.45:193
chr21	37413946	rs2835243	C	T	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=279;ReadPosRankSum=-0.548;SC=TCCTCCACAACATCAAGCGCA;SOR=0.922;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=20;WE=37413954;WS=37413936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,20:0.54:37
chr21	37414194	rs11404455	C	CA	172.52	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.68;ReadPosRankSum=-0.474;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,10:0.91:11
chr21	37420650	rs8738	G	A	1799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.068;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=39;PP=1041;ReadPosRankSum=-0.641;SC=CTGTGTCCGTGGTGAGCAGGC;SOR=0.456;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=181;TCF=81;TCR=100;TR=78;WE=37420658;WS=37420640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,90:0.44:203
chr21	37420785	rs880221	C	T	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=97;ReadPosRankSum=2.007;SC=CCCACAATCACCTACCAGTAA;SOR=1.230;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=6;WE=37420793;WS=37420775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr21	37425955	rs762360	C	T	3918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=46;NR=95;PP=2536;SC=TAAATCCTACCATAACTTCAA;SOR=1.641;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=142;TCF=46;TCR=96;TR=141;WE=37425963;WS=37425945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr21	37425971	rs762361	C	T	3223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=31;NR=76;PP=2096;SC=TTCAAGGTCCCAGAGATAACT;SOR=1.883;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=109;TCF=31;TCR=78;TR=107;WE=37425979;WS=37425961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr21	37429679	rs7282629	G	C	2911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=46;NR=53;PP=1871;SC=CGCAATGACTGACTTCTGTAT;SOR=1.085;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=46;TCR=55;TR=99;WE=37429687;WS=37429669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr21	37431265	rs2051395	G	T	774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=25;PP=547;ReadPosRankSum=-0.528;SC=CTGTGGAAATGCTCAATCTAA;SOR=0.693;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=59;TCF=9;TCR=50;TR=29;WE=37431273;WS=37431255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,32:0.50:64
chr21	37442632	rs25678	G	C	1653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.527;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=32;PP=1091;ReadPosRankSum=-0.113;SC=TCCGCGCCCTGCGCGACTTCC;SOR=0.633;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=178;TCF=101;TCR=77;TR=71;WE=37442640;WS=37442622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,80:0.39:203
chr21	37443480	rs1005696	T	G	1608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.121;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=38;PP=920;ReadPosRankSum=0.572;SC=TCTGTGCTTTTTCTCCTGCCA;SOR=0.900;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=130;TCF=55;TCR=75;TR=64;WE=37443488;WS=37443470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,74:0.50:147
chr21	37443565	rs1005695	G	C	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.496;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=209;ReadPosRankSum=0.521;SC=CCTCCCTGTCGCACTGGTCTT;SOR=1.206;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=38;TCF=11;TCR=27;TR=14;WE=37443573;WS=37443555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,15:0.39:38
chr21	37444120	rs35710857	C	T	959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.808;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=13;PP=546;ReadPosRankSum=1.360;SC=CAGCATCCTGCGTACTGTCTG;SOR=0.846;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=83;TCF=54;TCR=29;TR=41;WE=37444128;WS=37444110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,47:0.52:90
chr21	37444696	rs2835265	C	T	4121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=344;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.145;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=100;PP=2599;ReadPosRankSum=0.910;SC=CACCTCTCTACGGGATTGTTG;SOR=1.026;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=316;TCF=145;TCR=171;TR=173;WE=37444704;WS=37444686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,185:0.54:343
chr21	37444973	rs20572	C	T	3124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=359;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.259;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=63;PP=1824;ReadPosRankSum=-0.497;SC=GGATCCACGCCAGGAAACTGA;SOR=0.796;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=321;TCF=169;TCR=152;TR=136;WE=37444981;WS=37444963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:209,150:0.42:359
chr21	37507501	rs8133052	G	A	4741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=64;PP=2773;SC=ATGTCGTCCTGCAGCCGCGTG;SOR=1.090;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=162;TCF=97;TCR=65;TR=161;WE=37507509;WS=37507491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr21	37507745	rs881711	C	T	6976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=131;NR=109;PP=2965;SC=GGGGGCTCAACGTACTGGTCA;SOR=0.780;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=240;TCF=131;TCR=109;TR=240;WE=37507753;WS=37507735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr21	37507769	rs881712	C	T	6414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=117;NR=106;PP=2965;SC=ACGCGGCCGTCGCCTTCAAGA;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=223;TCF=117;TCR=106;TR=223;WE=37507777;WS=37507759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr21	37509995	rs12626192	C	T	362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=1;PP=318;SC=TCACCGACCTCGTTCTTAAAA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=37510003;WS=37509993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr21	37518362	rs2835286	A	G	1278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=14;PP=707;SC=TATATTTATCATTCTGTTTCA;SOR=1.519;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=30;TCR=14;TR=44;WE=37518370;WS=37518352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
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chr21	37572810	rs9979031	G	A	1189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.579;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=36;PP=705;ReadPosRankSum=0.958;SC=GTGCGTGGGCGTCTTGTCCAG;SOR=1.028;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=111;TCF=35;TCR=76;TR=49;WE=37572818;WS=37572800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,55:0.46:120
chr21	37580881	rs2835320	C	T	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.092;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=157;ReadPosRankSum=1.602;SC=CGGCTCCCGGCGATGAGGAAG;SOR=2.448;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=11;WE=37580889;WS=37580871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr21	37586236	rs73202247	T	C	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=137;ReadPosRankSum=0.612;SC=GAAGAAAATCTGACGTGGTCT;SOR=0.313;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=8;WE=37586244;WS=37586230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr21	37586877	rs2850079	T	C	5383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=102;PP=2965;SC=ATGCTGCTTCTATCCTATGCT;SOR=1.110;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=182;TCF=80;TCR=102;TR=182;WE=37586885;WS=37586867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr21	37599824	rs7280662	T	G	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.222;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.967;NF=4;NR=0;PP=27;ReadPosRankSum=0.490;SC=CAGCCTGGGCTACAGAGCAAG;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=4;WE=37599832;WS=37599816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr21	37599842	.	C	CA	26	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=9;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=4;NR=0;PP=26;QD=10.0;SC=AAGACTCTGTCAAAAAAAAAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=4;WE=37599850;WS=37599832;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:16,4:0.20:20
chr21	37617630	rs4817788	T	G	8803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=338;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=159;NR=149;PP=2965;SC=TACAAGCTCCTGCCACACGGA;SOR=0.748;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=309;TCF=160;TCR=149;TR=308;WE=37617638;WS=37617620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,337:1.00:337
chr21	37617723	rs146069450	C	T	2575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.476;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=54;PP=1587;ReadPosRankSum=-0.948;SC=TGCACCCATCCCCATGGGGGG;SOR=0.643;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=213;TCF=101;TCR=112;TR=103;WE=37617731;WS=37617713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,118:0.50:235
chr21	37619724	rs1023367	C	T	5638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=119;NR=50;PP=2965;SC=GTGATCTCTCCCTAGTTCCTG;SOR=1.859;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=170;TCF=120;TCR=50;TR=169;WE=37619732;WS=37619714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr21	37619931	rs5843755	A	AT	2322.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.392;HP=11;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.718;NF=2;NR=70;PP=730;ReadPosRankSum=1.645;SC=AAAAAGGTAAATTTTTTTTTT;SOR=1.059;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=108;TCF=4;TCR=104;TR=72;WE=37619939;WS=37619921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:11,107:0.91:118
chr21	37623447	rs2298450	C	T	2991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=42;PP=2473;SC=ACTTTTTTTTCCCTATTTTCT;SOR=1.692;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=84;TCR=42;TR=126;WE=37623455;WS=37623428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr21	37626011	rs62232368	C	T	2993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=77;NR=33;PP=2223;SC=AAGGATGTGTCATCCTTATTT;SOR=1.699;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=111;TCF=78;TCR=33;TR=110;WE=37626019;WS=37626001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr21	37642196	rs11700664	G	A	967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=5;PP=713;SC=TTAATGGTACGTATATGCTCA;SOR=3.193;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=31;WE=37642204;WS=37642186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr21	37649170	rs7279450	A	T	387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=3;PP=322;SC=AAAAGCTGAAAGTTAACAGAG;SOR=2.985;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=37649178;WS=37649160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr21	37650182	rs2070516	C	T	228.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=1;PP=144;SC=TCAAGTGATCCGCCCTCCTCA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=37650190;WS=37650172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr21	37650235	rs2070517	T	C	1252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=9;PP=774;SC=CCGTCGCACCTGGCCAGTTTC;SOR=2.200;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=31;TCR=9;TR=40;WE=37650243;WS=37650225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr21	37653705	rs7277281	A	G	629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=22;NR=0;PP=496;SC=ATAGAATTACACTAGTATGAA;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=37653713;WS=37653695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr21	37660161	rs2268299	G	A	413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=2;PP=317;SC=GGGATTACAAGTGCGAGCCAC;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=37660169;WS=37660151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr21	37661180	rs9979272	A	G	2813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=42;PP=1469;SC=TTAGATATAGAGTTGTCTAAT;SOR=0.791;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=48;TCR=42;TR=90;WE=37661188;WS=37661170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr21	37664372	rs9977791	C	T	986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=27;NR=7;PP=669;SC=CTCTTACCAGCAGACCTGACC;SOR=2.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=34;WE=37664380;WS=37664362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr21	37664501	rs9978057	G	A	2930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.10;QD=26.40;SOR=0.825;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr21	37665503	rs3989100	CA	C	135.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=0.000;HP=15;HapScore=3;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.210;NF=11;NR=0;PP=111;ReadPosRankSum=-0.674;SC=GACTCTGTCTCAAAAAAAAAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=11;WE=37665512;WS=37665493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,8:0.89:9
chr21	37692589	rs2236433	A	T	2510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.345;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=55;PP=1429;ReadPosRankSum=0.729;SC=CCCGCGGGATACGCCTCAGCG;SOR=0.536;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=196;TCF=83;TCR=113;TR=101;WE=37692597;WS=37692579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,114:0.51:222
chr21	37728892	.	C	CTTGAA	69	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=69;QD=47.5;SC=AGAATTTTTTCTTGATTTTAT;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=2;WE=37728900;WS=37728882;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:9,2:0.18:11
chr21	37729088	rs2835339	G	C	852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.888;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=23;PP=561;ReadPosRankSum=0.136;SC=AGAGTAAAGGGATTGTACAAT;SOR=1.000;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=69;TCF=31;TCR=38;TR=39;WE=37729096;WS=37729078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,41:0.53:78
chr21	37749689	rs2850081	C	T	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.871;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=10;PP=537;ReadPosRankSum=1.333;SC=CACTTAGATACTTTTTGCTCT;SOR=0.846;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=80;TCF=57;TCR=23;TR=38;WE=37749697;WS=37749679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,41:0.47:87
chr21	37769590	rs36094135	CT	C	410.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.252;NF=7;NR=2;PP=247;ReadPosRankSum=-1.229;SC=GAGTCTCTCACTTACTGCCTG;SOR=0.560;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=9;WE=37769598;WS=37769580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,14:0.78:18
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chr21	37833751	rs219779	G	A	2243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.956;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=38;PP=1403;ReadPosRankSum=0.516;SC=CCATGAGGGCGCGGGCAGCCT;SOR=0.997;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=193;TCF=113;TCR=80;TR=96;WE=37833759;WS=37833741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,105:0.50:210
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chr21	38081562	rs2070647	T	G	6162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=117;PP=2965;SC=TAGAGCGGCCTCGCCGGGGGA;SOR=0.913;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=219;TCF=102;TCR=117;TR=219;WE=38081570;WS=38081552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr21	38081577	rs2070648	C	G	5427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=89;NR=97;PP=2965;SC=GGGGGAGGAGCGCAGCCGCCG;SOR=0.881;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=186;TCF=89;TCR=97;TR=186;WE=38081585;WS=38081567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr21	38092039	rs2070650	A	C	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=52;ReadPosRankSum=-1.282;SC=TGGCAGGGTGAGCACCTGTGA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=4;WE=38092047;WS=38092033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr21	38092247	rs145363163	GA	G	74.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=2.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQRankSum=2.291;QD=0.76;ReadPosRankSum=0.639;SOR=0.428;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:82,16:0.16:98
chr21	38113998	rs2070519	C	A	1357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=17;PP=777;SC=CTGAGGACTCCTGTCACCTTG;SOR=1.244;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=31;TCR=17;TR=48;WE=38114006;WS=38113988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr21	38114260	rs145133721	C	T	1607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.438;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=42;PP=1000;ReadPosRankSum=-0.138;SC=TTCTCTCTTTCTCAAACTGTT;SOR=0.412;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=124;TCF=47;TCR=77;TR=72;WE=38114268;WS=38114250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,72:0.58:125
chr21	38117040	rs2073416	G	A	1652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=22;PP=958;ReadPosRankSum=-0.794;SC=AATACAGCTCGTTCCAAATGG;SOR=0.680;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=138;TCF=90;TCR=48;TR=67;WE=38117048;WS=38117030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,77:0.51:152
chr21	38117308	rs2073601	C	A	3868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=396;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.626;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=87;PP=2240;ReadPosRankSum=-2.269;SC=CCTGAGCACACTGCCAGCCAG;SOR=0.669;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=351;TCF=178;TCR=173;TR=176;WE=38117316;WS=38117298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:202,193:0.49:395
chr21	38117505	rs2073602	C	T	1912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.671;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=45;PP=1135;ReadPosRankSum=1.124;SC=GCAGCCATGGCGGTGGGTGGC;SOR=0.829;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=199;TCF=101;TCR=98;TR=89;WE=38117515;WS=38117495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,95:0.44:214
chr21	38118089	rs9982519	G	C	3342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=73;PP=2137;ReadPosRankSum=0.602;SC=CCTTCTCCTGGTGGCAGGCAA;SOR=0.678;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=278;TCF=142;TCR=136;TR=152;WE=38118097;WS=38118079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,161:0.53:303
chr21	38132172	rs2073420	C	T	2495.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=58;PP=1505;ReadPosRankSum=-0.160;SC=TTAATTAAGCCGTCACAGGAC;SOR=0.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=234;TCF=108;TCR=126;TR=105;WE=38132180;WS=38132162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,118:0.44:270
chr21	38139632	rs2073421	C	A	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=272;ReadPosRankSum=3.113;SC=ATGGACACGCCCGCGGCACCA;SOR=0.667;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=42;TCF=9;TCR=33;TR=17;WE=38139640;WS=38139622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,19:0.40:47
chr21	38302543	rs140568778	CA	C	1141.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.264;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.14;MQRankSum=1.039;NF=16;NR=7;PP=721;ReadPosRankSum=-0.499;SC=GCTGAGCCCACAACTCACCTC;SOR=1.172;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=54;TCF=32;TCR=22;TR=23;WE=38302551;WS=38302533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,38:0.49:77
chr21	38308911	rs1065758	G	A	2059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.731;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=51;PP=1375;ReadPosRankSum=-0.839;SC=GCTTCACCTCGCTCTGGTCAG;SOR=0.832;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=185;TCF=88;TCR=97;TR=93;WE=38308919;WS=38308901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,97:0.49:200
chr21	38378914	rs117590420	C	G	118.03	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5064;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=38;ReadPosRankSum=0.792;SC=GCACCCCTCACGGAGCTCCTC;SOR=0.527;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=5;WE=38378922;WS=38378904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr21	38380368	rs2277786	A	G	1734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=36;PP=1011;ReadPosRankSum=-1.408;SC=TTTCAGGCAGACACTGGAACT;SOR=0.736;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=156;TCF=86;TCR=70;TR=81;WE=38380376;WS=38380358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,87:0.51:170
chr21	38380656	rs56093871	G	A	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.443;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.73;ReadPosRankSum=-0.469;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr21	38380676	rs57389032	ATGAGTAAGGT	A	34.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.79;ReadPosRankSum=0.842;SOR=0.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,2:0.33:6
chr21	38385680	rs11088373	C	T	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.148;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=7;PP=287;ReadPosRankSum=-0.745;SC=TTTTGGGCCGCGGTAACAGGA;SOR=0.223;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=44;TCF=34;TCR=10;TR=24;WE=38385688;WS=38385670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,24:0.55:44
chr21	38437763	rs7337	C	G	63.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5006;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=39;ReadPosRankSum=1.645;SC=AGAAGGTCAACTTACATTTTT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=3;WE=38437771;WS=38437753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
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chr21	38444890	rs2298682	A	G	1310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.676;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=28;PP=633;ReadPosRankSum=0.372;SC=GGCACCATTGATCCATTCTCG;SOR=0.586;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=109;TCF=44;TCR=65;TR=50;WE=38444898;WS=38444880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,63:0.49:128
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chr21	38462614	rs3787780	A	G	1525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.542;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=35;PP=823;ReadPosRankSum=0.792;SC=AAACTGGCACAGCCACTGTGG;SOR=0.626;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=171;TCF=87;TCR=84;TR=73;WE=38462622;WS=38462604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,81:0.44:186
chr21	38462716	rs2835588	A	G	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.708;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=144;ReadPosRankSum=2.065;SC=ATTGACTTCTATATTTTCCTT;SOR=1.609;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=10;WE=38462724;WS=38462706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,8:0.29:28
chr21	38466203	rs2835595	G	T	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=132;ReadPosRankSum=0.058;SC=ATATAGGACCGTTGTGGACTC;SOR=0.556;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=36;TCF=23;TCR=13;TR=14;WE=38466211;WS=38466193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,18:0.40:45
chr21	38466261	rs3753070	T	A	387.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.356;HP=8;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=8;PP=191;ReadPosRankSum=-0.105;SC=TGTTTTTTTTTAAACAAATGT;SOR=0.382;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=50;TCF=31;TCR=19;TR=18;WE=38466269;WS=38466242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,22:0.37:59
chr21	38467857	rs2251161	C	G	1021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.674;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=28;PP=657;ReadPosRankSum=0.995;SC=CCAACTTGTGCAGAATAGATT;SOR=1.007;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=94;TCF=33;TCR=61;TR=41;WE=38467865;WS=38467847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,47:0.45:104
chr21	38468958	rs2835600	A	G	831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.788;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=17;PP=385;ReadPosRankSum=-0.037;SC=GTTGGTTAAAATATCTCAACC;SOR=0.561;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=75;TCF=37;TCR=38;TR=35;WE=38468966;WS=38468948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,43:0.47:92
chr21	38469017	rs2835601	T	G	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=12;PP=239;ReadPosRankSum=0.366;SC=TTTCTGTTTTTCAGGTATACA;SOR=0.836;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=36;TCF=12;TCR=24;TR=19;WE=38469025;WS=38469007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,25:0.56:45
chr21	38469069	rs2835602	G	C	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.336;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=25;ReadPosRankSum=-1.132;SC=TACTTAAGTGGTTAAAAGAGT;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=3;WE=38469077;WS=38469059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr21	38494419	rs117879463	C	T	86.84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5103;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=58;ReadPosRankSum=1.282;SC=TTGGTCATGGCACTTGAGTTT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=4;WE=38494427;WS=38494409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr21	38495185	rs11440324	G	GT	1521.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=11;PP=979;SC=TAAATTTGAGGTCCTTACTAT;SOR=1.501;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=13;TCR=11;TR=24;WE=38495193;WS=38495175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr21	38495213	rs11440325	G	GA	2027.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=20;PP=1211;SC=AAGTAAATTTGAAATCTTTTA;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=12;TCR=20;TR=32;WE=38495221;WS=38495203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr21	38495270	rs11440326	A	AT	3543.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=29;PP=1715;SC=TGTGTGTGTGATGACTTTTAT;SOR=0.758;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=42;TCF=12;TCR=30;TR=41;WE=38495278;WS=38495259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr21	38498585	rs12185849	G	C	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=63;ReadPosRankSum=-1.006;SC=AGAAAATATTGAATATTTATT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=38498593;WS=38498575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr21	38512956	rs1133001	A	G	768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=17;PP=535;ReadPosRankSum=-0.519;SC=TTGGAAAAGTATATTTGAAAA;SOR=0.620;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=45;TCR=37;TR=37;WE=38512964;WS=38512946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,37:0.45:82
chr21	38517021	rs1344047	G	A	1438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.166;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=34;PP=834;ReadPosRankSum=1.611;SC=ATCAGGAGGCGGAGAGGTAGG;SOR=0.575;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=163;TCF=82;TCR=81;TR=70;WE=38517029;WS=38517011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,77:0.42:184
chr21	38517058	rs764175	C	T	913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.642;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=24;PP=485;ReadPosRankSum=-1.185;SC=CTCCCTTACACGCATTTCCCC;SOR=0.912;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=91;TCF=40;TCR=51;TR=40;WE=38517066;WS=38517048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,45:0.45:101
chr21	38522618	rs2257091	G	T	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.260;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=74;ReadPosRankSum=0.210;SC=AGGAAATACTGGGATGTGAGA;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=38522626;WS=38522608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr21	38523266	rs3737540	C	A	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.617;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=201;ReadPosRankSum=-1.861;SC=CTAAATTATGCCTTTTTAAAA;SOR=1.244;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=20;TCF=9;TCR=11;TR=13;WE=38523274;WS=38523256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr21	38524504	rs72557073	GAAC	G	127.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=122;ReadPosRankSum=1.282;SC=TTGGTGTAAAGAACACTGAAA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=4;WE=38524514;WS=38524494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr21	38525198	rs2051162	G	A	1800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=44;NR=19;PP=1201;SC=CTAAGTTTATGTAATTGTGAA;SOR=1.646;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=64;TCF=45;TCR=19;TR=63;WE=38525206;WS=38525188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr21	38525356	rs1053808	T	C	1374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.079;NF=28;NR=34;PP=653;ReadPosRankSum=-0.677;SC=AATACAGCCATGCTTCTCAAA;SOR=0.649;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=141;TCF=63;TCR=78;TR=62;WE=38525364;WS=38525346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,73:0.46:160
chr21	38525652	rs767998	T	G	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=281;ReadPosRankSum=-1.069;SC=CATTTTCATTTTCCTGCCATA;SOR=0.976;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=16;WE=38525660;WS=38525642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr21	38528866	rs2835635	A	G	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.670;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=311;ReadPosRankSum=-0.488;SC=GCAAACTATAATCAGCTGGCT;SOR=0.368;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=21;WE=38528880;WS=38528856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,22:0.69:32
chr21	38528872	rs10706050	TG	T	1400.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=10;PP=961;SC=TATAATCAGCTGGCTTTCAGA;SOR=1.885;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=14;TCR=10;TR=24;WE=38528880;WS=38528856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr21	38529482	rs150044803	G	A	1026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.564;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=15;PP=543;ReadPosRankSum=-0.044;SC=CAGCATCATGGGAAAGATTGC;SOR=0.904;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=93;TCF=55;TCR=38;TR=40;WE=38529490;WS=38529472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,49:0.45:108
chr21	38531863	rs4817852	T	C	838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=9;PP=571;SC=GTTTCTAAACTACACTTGTGT;SOR=1.460;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=17;TCR=9;TR=26;WE=38531871;WS=38531853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr21	38531921	rs1787365	C	A	1471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=19;PP=988;SC=TAGTATGAGGCGTTATTTTAA;SOR=0.994;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=28;TCR=19;TR=47;WE=38531929;WS=38531911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr21	38532058	rs34771928	TG	T	7420.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=81;PP=2974;SC=GTAAGTTACTTGGATCACTTG;SOR=0.734;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=108;TCF=23;TCR=85;TR=104;WE=38532076;WS=38532048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr21	38532068	rs113972351	G	GA	6734.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=82;PP=2974;SC=TGGATCACTTGAATCTTACGT;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=16;TCR=82;TR=98;WE=38532076;WS=38532048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr21	38532086	rs34586966	TG	T	7447.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=43;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=81;PP=2957;SC=CGTTCTAATCTGATGTTAAAC;SOR=0.782;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=13;TCR=81;TR=94;WE=38532094;WS=38532076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr21	38532192	rs34367119	A	AT	1258.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=26;PP=1125;SC=ACGTACTATTATTCATTAGAA;SOR=2.242;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=27;WE=38532200;WS=38532182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr21	38532901	rs5843796	G	GT	98.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=0;PP=70;SC=CTTAATTTTAGTATACATTAG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=38532918;WS=38532892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr21	38532904	rs5843798	T	TA	98.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.75;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr21	38532910	rs5843800	A	AG	131	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=0;PP=103;SC=AGTATACATTAGTATTATTAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=2;WE=38532918;WS=38532892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr21	38534228	rs11424055	A	AT	1247.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=3;PP=334;SC=AATTTTAATGATTTTTCTCTT;SOR=1.863;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=15;WE=38534242;WS=38534218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr21	38534234	rs57522570	C	T	1256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=4;PP=383;SC=AATGATTTTTCTCTTTAATGG;SOR=1.688;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=38534242;WS=38534218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr21	38539673	rs1793885	C	T	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.43;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr21	38539677	rs4988831	A	T	498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.34;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr21	38539681	rs1793886	G	A	498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.56;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr21	38539718	rs2000413	G	A	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.050;HP=1;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=173;ReadPosRankSum=-1.261;SC=ACATGTTTACGGAAAGCATGG;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=29;TCR=8;TR=10;WE=38539726;WS=38539708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,10:0.26:38
chr21	38539745	rs5843802	G	GA	1573.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=16;PP=569;SC=ATCTAAATGGGAAAAAAAACT;SOR=1.371;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=22;TCR=16;TR=38;WE=38539753;WS=38539735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr21	38539836	rs5843803	T	TA	3651.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=36;PP=2695;SC=AAGTGAATTTTATTTTTTGTT;SOR=0.738;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=23;TCR=37;TR=58;WE=38539852;WS=38539826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr21	38539844	rs2000415	G	A	993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.656;HP=10;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.438;NF=22;NR=19;PP=599;ReadPosRankSum=0.891;SC=TTTATTTTTTGTTTTGCCCAC;SOR=0.620;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=78;TCF=39;TCR=39;TR=41;WE=38539852;WS=38539826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,47:0.51:92
chr21	38563725	rs2835655	G	A	662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.759;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=12;PP=309;ReadPosRankSum=-0.547;SC=AGAAAGCAAAGGTAAGTTGTA;SOR=0.512;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=69;TCF=37;TCR=32;TR=27;WE=38563733;WS=38563715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,35:0.40:88
chr21	38567902	rs2835659	C	T	1821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.86;ReadPosRankSum=0.881;SOR=0.814;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,48:0.47:102
chr21	38567911	rs7280251	T	C	1899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=1.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.960;SOR=0.895;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,51:0.47:108
chr21	38568009	rs1053966	G	C	3436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.386;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=74;PP=2277;ReadPosRankSum=0.211;SC=GTCTTCAGGCGACGATGGCCA;SOR=0.730;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=325;TCF=171;TCR=154;TR=159;WE=38568017;WS=38567999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:180,171:0.49:351
chr21	38568308	rs6579	C	T	1815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.236;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=45;PP=1102;ReadPosRankSum=-0.451;SC=TTATTGAGCACCTGTCAGTGG;SOR=0.582;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=150;TCF=61;TCR=89;TR=77;WE=38568316;WS=38568298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,85:0.51:166
chr21	38593461	rs1888464	G	T	2810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-3.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.638;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=51;PP=1752;ReadPosRankSum=-0.917;SC=CGCCCGAGCGGCGATTCCCTC;SOR=0.555;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=258;TCF=162;TCR=96;TR=128;WE=38593469;WS=38593451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,138:0.49:284
chr21	38593609	rs2835677	C	T	4558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=458;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.521;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=99;PP=2741;ReadPosRankSum=1.263;SC=GTGAGGGCGCCGTCCTCCAGC;SOR=0.623;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=414;TCF=203;TCR=211;TR=197;WE=38593617;WS=38593592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:238,219:0.48:457
chr21	38599934	rs11300896	TG	T	4216.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=36;NR=38;PP=2948;SC=CCATGAGGGCTGGGAGGCGAG;SOR=1.266;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=79;TCF=37;TCR=42;TR=74;WE=38599942;WS=38599924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
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chr21	38604570	rs2835680	C	T	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.200;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=137;ReadPosRankSum=-0.549;SC=AAATCTCTGCCGGCTGATGAC;SOR=0.859;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=7;WE=38604578;WS=38604569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
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chr21	39089582	rs857961	A	G	730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=18;PP=573;SC=CAAATACCAGAATAGGTGTTG;SOR=2.494;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=23;WE=39089590;WS=39089572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
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chr21	39325234	rs2836061	C	T	4078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=69;PP=2279;SC=AAACTGTGCGCTCCAGGCTCT;SOR=0.974;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=62;TCR=69;TR=131;WE=39325242;WS=39325224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr21	39739478	rs62217874	A	G	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=8;PP=354;ReadPosRankSum=0.672;SC=TGCAAAGAGAAGGCCACGCTG;SOR=0.769;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=50;TCF=35;TCR=15;TR=24;WE=39739486;WS=39739468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,24:0.43:56
chr21	39739665	rs2836346	T	A	3055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=63;PP=1601;ReadPosRankSum=-1.148;SC=CTGCACAGACTTTCATCAACA;SOR=0.703;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=262;TCF=133;TCR=129;TR=133;WE=39739673;WS=39739655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,151:0.51:297
chr21	39764211	rs2836359	T	A	2505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=44;PP=1439;ReadPosRankSum=1.435;SC=AAATCACAGATTAACCACAGA;SOR=0.687;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=192;TCF=112;TCR=80;TR=108;WE=39764219;WS=39764201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,120:0.56:215
chr21	39764437	rs2836360	T	C	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=105;ReadPosRankSum=-0.923;SC=GGTTTTTTATTTGATTTTGTA;SOR=0.527;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=9;WE=39764445;WS=39764427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
chr21	39775373	rs2836373	A	G	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.395;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=106;ReadPosRankSum=0.216;SC=TCTGAAGCTCAGGTCATAAGA;SOR=0.233;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=10;WE=39775381;WS=39775363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr21	39822650	rs2211871	G	T	283.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=0;PP=234;SC=TACACCACTTGTCACATTTTA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=39822658;WS=39822640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr21	39822906	rs9305648	G	C	4673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=85;PP=2832;SC=GTTTGTGTCTGTGAATGGAAT;SOR=1.234;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=147;TCF=62;TCR=85;TR=147;WE=39822914;WS=39822896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr21	39823349	rs2051165	T	C	596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=15;PP=422;SC=GATGTGTTCATTGCAGGTGGA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=39823357;WS=39823339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr21	39870310	rs2836441	G	A	757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=21;PP=472;ReadPosRankSum=-0.019;SC=GCCATAATGCGATCAAGTTTA;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=20;TCR=43;TR=31;WE=39870318;WS=39870300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,34:0.50:68
chr21	40181937	rs3833351	CT	C	48.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=8.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.74;ReadPosRankSum=1.127;SOR=0.135;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,11:0.17:66
chr21	40189024	rs112853203	G	A	2685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.361;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=67;PP=1694;ReadPosRankSum=0.888;SC=AGGTCAGTCCGATTGATTCTG;SOR=0.613;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=283;TCF=125;TCR=158;TR=121;WE=40189032;WS=40189014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:181,134:0.43:315
chr21	40191431	rs457705	T	G	7020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=149;NR=97;PP=2965;SC=TGCCAGGGACTCCCAAAGACC;SOR=1.013;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=246;TCF=149;TCR=97;TR=246;WE=40191439;WS=40191421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,270:1.00:270
chr21	40191638	rs461155	A	G	4945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=94;PP=2965;SC=GGAGTGACCCAGTGGAGCAAG;SOR=1.112;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=164;TCF=70;TCR=94;TR=164;WE=40191646;WS=40191628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr21	40547387	rs9305670	A	G	987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=3;PP=720;SC=ACTACAATTAATTTTTTACAA;SOR=3.126;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=30;WE=40547395;WS=40547377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr21	40549289	rs2142111	G	C	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.648;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=384;ReadPosRankSum=1.324;SC=TAAAATGACAGTATACATTTA;SOR=2.535;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=20;WE=40549297;WS=40549279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,24:0.50:48
chr21	40552307	rs3171465	A	G	1940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.518;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=48;PP=1339;ReadPosRankSum=-0.552;SC=TCCAGAGTTTAGCACAACCAA;SOR=0.641;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=180;TCF=83;TCR=97;TR=87;WE=40552315;WS=40552297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,92:0.45:203
chr21	40571246	rs1041439	A	G	2956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.790;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=57;PP=2133;ReadPosRankSum=-1.542;SC=CACTGGTAATAGTTGATTTTC;SOR=0.660;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=246;TCF=124;TCR=122;TR=124;WE=40571254;WS=40571236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,130:0.48:271
chr21	40574305	rs2183573	A	G	1316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=2.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.717;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=17;PP=862;ReadPosRankSum=-0.098;SC=CTTTCTGATGATTCTGCTGAA;SOR=0.825;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=97;TCF=66;TCR=31;TR=52;WE=40574313;WS=40574295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,59:0.51:116
chr21	40574552	rs2150411	G	T	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.79;ReadPosRankSum=-1.150;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr21	40584598	rs6517529	C	T	1619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=29;PP=774;ReadPosRankSum=-1.137;SC=TTACTCTCCTCCTTCCAGAAG;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=138;TCF=77;TCR=61;TR=67;WE=40584606;WS=40584588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,81:0.50:162
chr21	40585330	rs142696785	AAAGCCAACATTTTCTTCACTTT	A	1301.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.880;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=9;PP=2922;ReadPosRankSum=1.298;SC=TTGGTACTACAAAGCCAACAT;SOR=1.060;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=47;TCF=21;TCR=26;TR=16;WE=40585359;WS=40585320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,36:0.38:94
chr21	40587003	rs11434832	G	GC	245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=1;PP=218;SC=CACCATGTTGGTACGCTGGTC;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=40587011;WS=40586993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr21	40587049	rs4818004	A	G	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.654;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=270;ReadPosRankSum=-2.039;SC=GACGGCCTTCACTTCCCAAAG;SOR=1.532;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=20;WE=40587057;WS=40587039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,21:0.70:30
chr21	40597215	rs139986112	A	AAAG	564.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.868;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=523;ReadPosRankSum=1.100;SC=TACAGATAAAAAAGCCAAAAG;SOR=2.948;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=12;WE=40597223;WS=40597205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,16:0.41:39
chr21	40600313	rs11702268	T	C	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.353;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=110;ReadPosRankSum=1.088;SC=ATATCTCTTCTGGAATTTACA;SOR=0.284;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=13;WE=40600321;WS=40600303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr21	40604429	rs2836950	C	G	1732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=42;PP=1113;ReadPosRankSum=1.082;SC=CAAATTCTACCAAGGGGAAGA;SOR=0.671;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=191;TCF=83;TCR=108;TR=75;WE=40604437;WS=40604419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,85:0.40:214
chr21	40642189	rs6517532	C	T	640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=9;PP=293;ReadPosRankSum=0.268;SC=ATTTGTTACACTGTACCAGAA;SOR=0.606;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=37;TCR=19;TR=26;WE=40642197;WS=40642179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,32:0.48:66
chr21	40646230	rs56135543	CGA	C	647.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=4.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQRankSum=2.460;QD=4.87;ReadPosRankSum=0.441;SOR=1.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,37:0.28:133
chr21	40648265	rs2836969	G	A	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.893;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=358;ReadPosRankSum=1.910;SC=GTGTTGCTTAGCCCTGTCATT;SOR=0.337;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=42;TCF=12;TCR=30;TR=25;WE=40648273;WS=40648255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,27:0.60:45
chr21	40650621	rs973521	G	A	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-1.040;QD=8.61;ReadPosRankSum=-1.428;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr21	40652040	rs2836971	A	C	1002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=7;PP=600;ReadPosRankSum=-1.182;SC=CTACATTAAAAAACAAAACCT;SOR=0.639;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=89;TCF=70;TCR=19;TR=40;WE=40652048;WS=40652030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,47:0.47:100
chr21	40670460	rs2056844	G	C	1839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.088;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=33;PP=983;ReadPosRankSum=2.343;SC=CCGATGCGCTGGCAGATTTGC;SOR=0.790;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=188;TCF=110;TCR=78;TR=84;WE=40670468;WS=40670450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,92:0.45:206
chr21	40684641	rs2272578	C	G	139.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.98;ReadPosRankSum=2.287;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr21	40684975	rs35687055	C	T	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=2.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.57;ReadPosRankSum=-0.748;SOR=0.250;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr21	40685239	rs34240248	A	G	1826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=3.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.61;ReadPosRankSum=-0.108;SOR=0.489;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,51:0.44:117
chr21	40685246	rs34436313	A	G	1813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=5.943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.19;ReadPosRankSum=0.197;SOR=0.491;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,50:0.45:112
chr21	40685284	rs35182074	A	C	879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=0.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.00;ReadPosRankSum=-0.910;SOR=0.577;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,47:0.53:88
chr21	40686020	rs35994303	C	T	3999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=399;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.362;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=75;PP=2263;ReadPosRankSum=0.422;SC=TTTCACGGACCGGTCGTCTGG;SOR=0.664;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=354;TCF=193;TCR=161;TR=165;WE=40686028;WS=40686010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:207,191:0.48:398
chr21	40686078	rs9981301	G	C	3727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=445;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.110;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=87;PP=1900;ReadPosRankSum=-1.066;SC=TTCGAGGACAGGAAAGCTTTT;SOR=0.688;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=391;TCF=202;TCR=189;TR=171;WE=40686086;WS=40686068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:252,193:0.43:445
chr21	40686327	rs4624474	T	C	2325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.504;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=55;PP=1211;ReadPosRankSum=0.595;SC=ACGGCTCGGCTGGATCCATCC;SOR=0.643;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=194;TCF=88;TCR=106;TR=102;WE=40686335;WS=40686317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,114:0.54:213
chr21	40715132	rs2070867	G	A	614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.254;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=13;PP=236;ReadPosRankSum=-0.471;SC=ACACGTTGTCGTTTTATTTAT;SOR=0.148;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=43;TCF=15;TCR=28;TR=24;WE=40715140;WS=40715122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,28:0.62:45
chr21	40769017	rs1060180	G	T	392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=274;SC=CTTTATGAGAGAGTCTTATAA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=40769025;WS=40769007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr21	40799955	rs2837028	A	C	75.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.09;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr21	40823981	rs6517549	G	A	7180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=131;NR=119;PP=2965;SC=CGCATTCCCTGACAGGGGTGT;SOR=0.761;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=250;TCF=131;TCR=119;TR=250;WE=40824002;WS=40823971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,273:1.00:273
chr21	40847249	rs760284	T	G	2656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=54;PP=1811;SC=AAATTAACATTACTTTAGTAC;SOR=1.508;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=31;TCR=54;TR=85;WE=40847257;WS=40847239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr21	40871810	rs9974333	T	C	3508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=64;NR=59;PP=1947;SC=AGTGAAGATGTGGGCAACCTC;SOR=0.723;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=123;TCF=64;TCR=59;TR=123;WE=40871818;WS=40871800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr21	40880881	rs138818478	CTTGAA	C	2533.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=16;NR=14;PP=1512;SC=TTTAAACGTACTTGAATTATG;SOR=1.532;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=19;TCR=16;TR=30;WE=40880893;WS=40880871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr21	40883671	rs3831201	G	GAGA	3904.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=28;PP=2401;SC=ACTGCAGAAGGAGAAGAGCCT;SOR=0.997;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=53;TCF=22;TCR=31;TR=46;WE=40883679;WS=40883661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr21	40969620	rs2091883	G	A	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.725;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=204;ReadPosRankSum=-0.262;SC=AATGGAAGAGGCGGGAGAGAG;SOR=0.392;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=14;WE=40969628;WS=40969610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr21	40969826	rs662571	G	C	8930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=160;NR=142;PP=2965;SC=CGTGGATCCTGCACCAGAGCT;SOR=0.718;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=302;TCF=160;TCR=142;TR=302;WE=40969834;WS=40969816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,326:1.00:326
chr21	40977826	rs506382	A	G	1267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.651;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=20;PP=798;ReadPosRankSum=-2.810;SC=TTGCAGGCACAAGACATCATT;SOR=0.402;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=111;TCF=77;TCR=34;TR=58;WE=40977834;WS=40977816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,61:0.52:118
chr21	40981430	.	GA	G	90.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.244;ClippingRankSum=0.000;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.11;ReadPosRankSum=1.168;SOR=0.536;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,10:0.23:43
chr21	41032479	rs190984353	C	T	2269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.767;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=47;PP=1507;ReadPosRankSum=1.390;SC=GGATTTTGTTCCTTTCAGATG;SOR=0.564;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=180;TCF=106;TCR=74;TR=104;WE=41032487;WS=41032469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,108:0.55:195
chr21	41032740	rs3746887	T	C	2779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.478;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=58;PP=1440;ReadPosRankSum=1.149;SC=AAAGAGAGGATGGTGAAGGGA;SOR=0.665;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=282;TCF=145;TCR=137;TR=129;WE=41032748;WS=41032730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,140:0.46:304
chr21	41032804	rs734413	G	A	2612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.501;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=55;PP=1613;ReadPosRankSum=1.253;SC=CAGCGGAAACGAAAGAGGTGG;SOR=0.593;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=233;TCF=123;TCR=110;TR=114;WE=41032812;WS=41032794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,124:0.49:255
chr21	41117368	rs403527	G	A	893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=7;PP=541;SC=ATCAGAGGAAGTAGATTCAGA;SOR=1.751;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=30;WE=41117376;WS=41117358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr21	41117533	rs425320	T	C	2258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=37;NR=46;PP=1219;SC=GCTGGGAGGTTGGGACGACAG;SOR=0.965;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=83;TCF=37;TCR=46;TR=83;WE=41117541;WS=41117523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr21	41137362	rs9784201	A	C	1508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=8;PP=1057;SC=TGGATGGACAACCTGGGGGTT;SOR=2.970;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=38;TCR=8;TR=46;WE=41137370;WS=41137352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr21	41137499	rs12626544	A	G	3804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=410;ExcessHet=3.0103;FS=1.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.28;ReadPosRankSum=-1.546;SOR=0.561;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:221,189:0.46:410
chr21	41137507	rs2205204	G	C	14575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=415;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=201;NR=174;PP=2961;SC=CAAAATGCAAGAGTCCTGAAG;SOR=0.788;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=376;TCF=202;TCR=174;TR=375;WE=41137515;WS=41137489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,415:1.00:415
chr21	41142803	rs2837199	T	C	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.356;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=5.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.75;ReadPosRankSum=-0.158;SOR=0.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr21	41142940	rs2837200	G	A	1365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.237;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=19;PP=766;ReadPosRankSum=-0.507;SC=CCCGGCTCCCGGATATTTCCT;SOR=0.963;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=117;TCF=73;TCR=44;TR=58;WE=41142948;WS=41142930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,66:0.50:132
chr21	41143246	rs62237180	G	C	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.565;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=260;ReadPosRankSum=-0.347;SC=ATCATATGGCGACCTTGATTT;SOR=1.581;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=39;TCF=9;TCR=30;TR=15;WE=41143254;WS=41143236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,15:0.38:40
chr21	41159977	rs2837218	G	C	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5341;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=118;ReadPosRankSum=0.319;SC=ATGCTCCTTGGGTCACAAATA;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=6;WE=41159985;WS=41159967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr21	41160242	rs456818	A	G	2403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=44;PP=1301;SC=ATTAAGTACCAGAGGTAGACA;SOR=1.061;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=81;TCF=37;TCR=44;TR=81;WE=41160250;WS=41160232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr21	41165301	rs464574	A	G	682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=0;PP=626;SC=CATTCTAAAGAGATGGGATCT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=41165309;WS=41165291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr21	41165462	rs2837225	C	A	4850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=417;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.524;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=107;NR=92;PP=2887;ReadPosRankSum=-0.578;SC=CTGTTGCAGACACCGCTTCTC;SOR=0.639;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=374;TCF=206;TCR=168;TR=199;WE=41165470;WS=41165452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:191,224:0.54:415
chr21	41165566	rs460504	T	C	2991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.085;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=84;PP=2102;ReadPosRankSum=0.572;SC=TTCCCCCTTTTTGGACTTTTT;SOR=0.833;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=250;TCF=93;TCR=157;TR=128;WE=41165574;WS=41165556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,137:0.50:276
chr21	41165677	rs463903	G	A	449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=13;PP=318;SC=CTCCATATCAGCTGGTCAGCA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=41165685;WS=41165667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr21	41297873	rs2037920	G	A	1051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.203;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=12;PP=633;ReadPosRankSum=1.672;SC=CTGAATCTGGGGTATTTAGAA;SOR=0.427;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=71;TCF=53;TCR=18;TR=42;WE=41297881;WS=41297863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,46:0.64:72
chr21	41297992	rs2037921	C	T	2473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.402;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=47;PP=1317;ReadPosRankSum=1.543;SC=CATTCTCTTCCTTACACACTC;SOR=0.790;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=249;TCF=136;TCR=113;TR=106;WE=41298000;WS=41297982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,127:0.43:293
chr21	41298068	rs145956420	C	T	1792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.492;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=46;PP=1167;ReadPosRankSum=0.930;SC=CCCGCCGCCCCGGGAACTGGA;SOR=0.903;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=171;TCF=79;TCR=92;TR=78;WE=41298076;WS=41298058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,87:0.44:198
chr21	41298197	rs79882024	A	G	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=152;ReadPosRankSum=0.524;SC=ATATCAGTTTAAGATATAAGT;SOR=1.302;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=8;WE=41298205;WS=41298187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr21	41434671	rs2837408	T	C	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=126;ReadPosRankSum=-1.444;SC=AAATTACAGTTTTTTCTAAAA;SOR=0.593;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=9;WE=41434679;WS=41434661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr21	41447313	rs378877	C	T	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5006;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=217;ReadPosRankSum=-1.266;SC=TATTTATTTCCCTCCCTCTGC;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=10;WE=41447321;WS=41447303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,10:0.83:12
chr21	41506058	rs403892	A	G	507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=16;PP=411;SC=TCATCTGGACACGAGAATTCT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=41506066;WS=41506048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr21	41514421	rs11701139	G	C	1044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=10;PP=718;SC=AACTAGGAGGGGTCTGCAAAT;SOR=1.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=36;WE=41514429;WS=41514411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr21	41514688	rs35155500	TA	T	2073.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=41;PP=1673;SC=AGCAAAGCAATAACCGAAAAA;SOR=2.564;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=41;WE=41514696;WS=41514678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
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chr21	42622657	rs960231	G	C	1758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=9;PP=924;SC=CATGGTTTCTGATGTGATCTT;SOR=1.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=38;TCR=9;TR=47;WE=42622665;WS=42622647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
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chr21	42694633	rs2838010	A	T	3669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.718;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=82;PP=2022;ReadPosRankSum=0.241;SC=CTTGCCCTGGAAAGCATTCCT;SOR=0.674;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=327;TCF=163;TCR=164;TR=166;WE=42694641;WS=42694623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:177,179:0.50:356
chr21	42694667	rs2838011	T	C	3383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=79;PP=1861;ReadPosRankSum=-0.760;SC=TCTCTGATACTGTCTACTTCA;SOR=0.681;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=307;TCF=147;TCR=160;TR=152;WE=42694675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,169:0.50:337
chr21	42710175	rs2158354	T	C	354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=1;PP=242;SC=TGGAAACCCTTCCCCCTCAGG;SOR=2.670;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=42710183;WS=42710165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr21	42717662	rs417708	T	C	1492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=0.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.187;SOR=0.634;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,80:0.57:141
chr21	42719137	rs11701669	C	A	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.098;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=152;ReadPosRankSum=-0.045;SC=AGTCCAGGAGCAAAGTACTTC;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=8;WE=42719145;WS=42719127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr21	42767733	rs440364	T	C	1412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=20;NR=24;PP=668;SC=TCAGGAAAGCTCTGGAATTAG;SOR=1.371;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=20;TCR=24;TR=44;WE=42767741;WS=42767723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr21	42775179	rs112479250	G	GT	1332.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=16;PP=644;ReadPosRankSum=0.740;SC=TCTCCTTTTTGCTTTTTTTGG;SOR=0.752;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=66;TCF=42;TCR=24;TR=35;WE=42775188;WS=42775169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,57:0.56:101
chr21	42775180	rs459763	C	T	3876.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=24;PP=1869;SC=CTCCTTTTTGCTTTTTTTGGT;SOR=2.170;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=98;TCF=73;TCR=25;TR=92;WE=42775188;WS=42775169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr21	42775555	rs462161	A	G	7067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.658;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=141;NR=98;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.092;SC=CTCCACCGAGAACTGGCTGGT;SOR=0.703;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=242;TCF=143;TCR=99;TR=239;WE=42775563;WS=42775545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,266:1.00:267
chr21	42808015	rs468207	A	G	2526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=57;PP=1642;SC=TACCACAGACAGGGTGGCTTA;SOR=1.688;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=28;TCR=57;TR=85;WE=42808023;WS=42808005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr21	42808054	rs468451	C	G	883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=25;PP=667;SC=TCTCACAGTTCTGGAGACTGG;SOR=3.841;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=28;WE=42808062;WS=42808044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr21	42809206	rs468646	A	C	1995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=7;NR=55;PP=1610;SC=ACATCAGGCCACGGTTCCTTC;SOR=3.947;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=7;TCR=55;TR=62;WE=42809214;WS=42809196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr21	42812891	rs467960	C	T	3591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=56;NR=71;PP=2157;SC=ATGTGGACATCGCCACCACAG;SOR=1.095;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=56;TCR=71;TR=127;WE=42812899;WS=42812881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr21	42813933	rs145807679	A	AGTGTGT,AGTGT	396.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0,0;NR=12,12;PP=57,300;SC=AGATGTGTGGAGTGTGTGTGT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=12,12;WE=42813941;WS=42813923;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:11
chr21	42817582	rs469288	A	G	699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=20;PP=538;SC=TTCCTTCTTCACTCCCCCAAG;SOR=3.352;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=42817590;WS=42817572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr21	42817612	rs469382	G	A	324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=9;PP=238;SC=AAGACATCTGGCCCGTAGCAC;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=42817620;WS=42817602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr21	42817930	rs469390	G	A	4474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=56;PP=2621;SC=TTGACAGAAAGTTAATGCCTT;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=149;TCF=93;TCR=56;TR=149;WE=42817938;WS=42817920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr21	42818106	rs467773	C	T	1709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=42;PP=1217;SC=CTGCTACAACCGAATACCTGA;SOR=2.794;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=11;TCR=42;TR=53;WE=42818114;WS=42818096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr21	42818132	rs364199	A	G	1239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=28;PP=860;SC=GGTCATTTATAAACAGTAGAA;SOR=3.202;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=34;WE=42818140;WS=42818122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr21	42823193	.	TA	T	76.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.617;ClippingRankSum=0.000;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=1.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.20;ReadPosRankSum=1.257;SOR=0.287;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr21	42824733	rs469304	G	A	5224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=73;NR=86;PP=2615;SC=GGGCTTTCCAGTCCAGCTCGG;SOR=1.029;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=159;TCF=73;TCR=86;TR=159;WE=42824741;WS=42824723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr21	42824874	rs467798	C	T	342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=9;PP=230;SC=TAGTCTTGCTCTCTCTGTAGG;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=42824882;WS=42824864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr21	42840580	rs462321	T	C	323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=8;PP=239;SC=CAGCCCTATTTTCCAGCCCTG;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=42840588;WS=42840570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr21	42842713	rs112132031	C	CCTAAGGCCTCGGG	3484.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=19;PP=2900;SC=GCGGGTATCACCTATGTCTCC;SOR=2.584;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=50;TCF=3;TCR=47;TR=21;WE=42842721;WS=42842703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr21	42843960	rs464431	A	G	2971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.03;SOR=1.681;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr21	42843960	.	AGT	GGA	2546	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=20;NR=39;PP=2546;QD=20;SC=CAGAGCTCTCAGTGGATGAAC;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=21;TCR=41;TR=59;WE=42843970;WS=42843950;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,59:0.95:62
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chr21	42860485	rs386416	G	C	2802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=51;PP=1736;SC=GCTGAGAAACGCAATGAGCCT;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=43;TCR=51;TR=94;WE=42860493;WS=42860475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
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chr21	43132878	rs11701067	T	A	1195.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.18;SOR=6.043;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
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chr21	43161357	rs3746891	T	C	5695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=92;PP=2965;SC=TCTGAGGTCATGGCCTCCTTG;SOR=0.703;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=193;TCF=101;TCR=92;TR=193;WE=43161365;WS=43161347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr21	43161805	rs2838113	G	A	3431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.385;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=70;PP=2188;ReadPosRankSum=0.520;SC=TGCTAGACTCGTCCCCGTTCT;SOR=0.724;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=329;TCF=180;TCR=149;TR=157;WE=43161813;WS=43161795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:188,167:0.47:355
chr21	43161877	rs3746893	C	T	3861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=370;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.373;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=84;PP=2344;ReadPosRankSum=-0.023;SC=TGATCTTCCGCGCCAGCAGGA;SOR=0.715;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=350;TCF=176;TCR=174;TR=173;WE=43161885;WS=43161867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:186,184:0.50:370
chr21	43161928	rs56092943	C	T	2940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=76;PP=1889;ReadPosRankSum=-0.209;SC=CGGCCATGTGCAACGGGGTGG;SOR=0.686;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=262;TCF=118;TCR=144;TR=134;WE=43161936;WS=43161918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,140:0.51:276
chr21	43162150	rs3746894	G	A	2219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.507;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=52;PP=1356;ReadPosRankSum=2.743;SC=CGTCTGTGGTGCCCAGATCTG;SOR=0.631;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=194;TCF=96;TCR=98;TR=104;WE=43162158;WS=43162140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,109:0.52:209
chr21	43162200	rs3746895	T	C	1592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.505;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=42;PP=1056;ReadPosRankSum=-0.404;SC=TGGCTGCACATCCAGGGACGT;SOR=0.895;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=115;TCF=49;TCR=66;TR=71;WE=43162208;WS=43162190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,73:0.60:122
chr21	43164232	rs2277789	C	A	1043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=24;PP=633;ReadPosRankSum=-0.406;SC=GCTGTGAGAGCAGCTCGGAGA;SOR=0.688;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=110;TCF=51;TCR=59;TR=48;WE=43164240;WS=43164222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,51:0.46:111
chr21	43164345	rs2277790	A	C	563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=17;PP=476;SC=CCTGCCATAGACCGCATGGCC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=43164353;WS=43164335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr21	43169357	rs2838114	C	T	1803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.008;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=40;PP=925;ReadPosRankSum=-0.968;SC=AGATGACGATCGCAAAGCTGG;SOR=0.618;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=207;TCF=102;TCR=105;TR=81;WE=43169365;WS=43169347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,97:0.40:240
chr21	43187043	rs6586238	C	T	3480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.308;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=74;PP=2147;ReadPosRankSum=-0.223;SC=GCAGGCTGGGCGAGCACTTGA;SOR=0.601;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=308;TCF=169;TCR=139;TR=159;WE=43187051;WS=43187033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,171:0.52:329
chr21	43187167	rs6586239	G	C	2203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.069;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=57;PP=1370;ReadPosRankSum=0.401;SC=GCGCAGCAGCGCCAGGGCCCA;SOR=0.812;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=193;TCF=80;TCR=113;TR=94;WE=43187175;WS=43187157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,106:0.49:217
chr21	43221483	rs3850706	A	G	4232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=42;PP=2805;SC=TGCGGCTGCGAGGGTGGCAAG;SOR=1.516;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=91;TCR=42;TR=133;WE=43221491;WS=43221473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr21	43221826	rs2236696	T	C	2340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.274;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=56;PP=1684;ReadPosRankSum=0.394;SC=TGATGTTGGTTAAGCCGACTG;SOR=0.881;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=205;TCF=99;TCR=106;TR=101;WE=43221834;WS=43221816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,107:0.48:225
chr21	43222779	rs2838128	A	G	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=5.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.565;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=349;ReadPosRankSum=0.574;SC=TACACTGTGTATAGTAAAAAG;SOR=2.055;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=42;TCF=37;TCR=5;TR=17;WE=43222787;WS=43222769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,20:0.43:47
chr21	43223126	rs62216222	C	T	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.915;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=79;ReadPosRankSum=0.508;SC=TAGTCGGTCACGTCAGGCAGC;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=43223134;WS=43223116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr21	43224567	rs62216227	C	T	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=146;ReadPosRankSum=0.299;SC=GCCAAGAAAACAGGGTAACCT;SOR=1.022;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=10;WE=43224575;WS=43224557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr21	43224683	rs2298687	A	G	1900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.168;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=39;PP=975;ReadPosRankSum=-0.566;SC=CTGGGGCCCCATGCTGCTCAC;SOR=0.696;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=165;TCF=87;TCR=78;TR=86;WE=43224691;WS=43224673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,93:0.52:178
chr21	43231296	rs28461265	A	T	1418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.418;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=39;PP=785;ReadPosRankSum=0.600;SC=TAGGGCCTTCAGGAGAAGGTG;SOR=0.541;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=44;TCR=82;TR=60;WE=43231304;WS=43231286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,68:0.48:141
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chr21	43236252	rs28657504	A	G	2356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=62;PP=1786;SC=CTGGGGGCCCATGCCCGAGAC;SOR=2.985;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=13;TCR=63;TR=75;WE=43236260;WS=43236242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr21	43239972	rs28477638	A	G	8232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=151;NR=127;PP=2965;SC=ACTCGCGGACATTGTCGTGCA;SOR=0.806;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=278;TCF=151;TCR=127;TR=278;WE=43239980;WS=43239962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,315:1.00:315
chr21	43242207	rs28360603	G	A	1000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=4;PP=666;SC=GCCTTGAAACGACCACCTTCC;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=32;WE=43242215;WS=43242197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
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chr21	43243852	rs73357703	G	A	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.965;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=224;ReadPosRankSum=0.804;SC=GTCTCGTGACGGGAAGGAGCC;SOR=0.368;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=15;WE=43243860;WS=43243842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
chr21	43246223	rs28559700	C	T	1730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=19;PP=1118;SC=CAAATCTTCCCTGCAATATTC;SOR=1.392;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=36;TCR=19;TR=55;WE=43246231;WS=43246213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr21	43246310	.	C	A	1972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.123;ClippingRankSum=0.000;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.530;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=35;PP=1329;ReadPosRankSum=1.241;SC=GGACTGCGAGCATTACCTTGC;SOR=0.630;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=184;TCF=112;TCR=72;TR=86;WE=43246318;WS=43246300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,91:0.45:201
chr21	43246495	rs28473463	T	G	1747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=49;PP=1137;ReadPosRankSum=-0.166;SC=GCCAGCATCCTTTCCAGCGCA;SOR=0.677;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=55;TCR=97;TR=77;WE=43246503;WS=43246485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,81:0.51:160
chr21	43254463	rs2839388	A	G	848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.349;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=3;PP=567;ReadPosRankSum=-1.668;SC=CCCATGTGCGACAGCCCTGGT;SOR=1.179;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=61;TCF=52;TCR=9;TR=29;WE=43254471;WS=43254453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,33:0.50:66
chr21	43254623	rs113774580	C	G	2293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.165;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=59;PP=1300;ReadPosRankSum=0.647;SC=CCTGGTAGGTCTCTAAGCCGA;SOR=0.560;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=227;TCF=96;TCR=131;TR=105;WE=43254631;WS=43254613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,118:0.47:249
chr21	43255359	rs2839391	G	C	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-4.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.579;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=176;ReadPosRankSum=-0.429;SC=TTACTGGAAAGTTTCCATCTG;SOR=0.031;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=14;WE=43255367;WS=43255349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,17:0.46:37
chr21	43255509	rs2839392	C	T	2872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.659;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=58;PP=1760;ReadPosRankSum=-0.758;SC=ATCCGTACCGCACAGCGGCCG;SOR=0.488;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=244;TCF=139;TCR=105;TR=125;WE=43255517;WS=43255499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,138:0.49:283
chr21	43255727	rs2839393	T	G	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.904;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=273;ReadPosRankSum=0.837;SC=TCCACGCCTGTGTCTGTTATG;SOR=2.355;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=15;WE=43255735;WS=43255717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr21	43256073	rs8129229	C	G	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=30.22;ReadPosRankSum=0.887;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr21	43256076	rs8129333	C	T	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=34.54;ReadPosRankSum=1.465;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr21	43256082	rs8132216	A	G	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=27.22;ReadPosRankSum=1.611;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr21	43256252	rs4920098	C	T	2104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.048;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=36;PP=1043;ReadPosRankSum=1.162;SC=AGGAAACGTGCTGCTTTAGGC;SOR=0.368;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=170;TCF=104;TCR=66;TR=84;WE=43256260;WS=43256242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,101:0.50:200
chr21	43256438	rs4920101	T	A	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.789;NF=2;NR=13;PP=259;ReadPosRankSum=-0.233;SC=GCTGCAGAGATGATCGCCCAC;SOR=0.676;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=15;WE=43256446;WS=43256428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,15:0.42:36
chr21	43256548	rs3216763	C	CT	180.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.368;NF=5;NR=2;PP=215;ReadPosRankSum=1.363;SC=GCCCTGGCCCCGGGCGCCAGC;SOR=0.582;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=7;WE=43256556;WS=43256538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr21	43258000	rs8127003	T	C	1105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=4;PP=774;SC=GCTGCCAGCATTGTCTGTCCA;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=33;WE=43258008;WS=43257990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr21	43258353	rs6586335	G	A	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=213;ReadPosRankSum=-0.991;SC=ACATTTACTAGTACAAACAGA;SOR=0.793;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=11;WE=43258361;WS=43258343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr21	43267260	rs2277793	C	T	1350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.054;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=21;PP=875;ReadPosRankSum=0.421;SC=ACTGGCTGGGCTCCGACTCCA;SOR=1.107;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=136;TCF=80;TCR=56;TR=60;WE=43267268;WS=43267250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,66:0.46:143
chr21	43277279	rs3833355	C	CT	2860.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.151;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.543;NF=14;NR=38;PP=1826;ReadPosRankSum=0.900;SC=TGGCAACAGCCTTTACCTTCA;SOR=0.594;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=104;TCF=30;TCR=74;TR=52;WE=43277287;WS=43277269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,104:0.56:185
chr21	43298715	rs62214725	C	T	3411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=47;PP=2157;SC=GGTAGGCACGCGTCACCTGTC;SOR=1.270;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=76;TCR=47;TR=123;WE=43298723;WS=43298705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr21	43298954	rs202107842	C	CG	551.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.65;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr21	43299261	rs112381381	G	A	1199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.08;ReadPosRankSum=0.584;SOR=0.375;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,45:0.98:46
chr21	43299327	rs185321045	C	A	1634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.95;SOR=1.467;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr21	43309191	rs2839403	A	G	187.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=1;PP=67;SC=GGTAGTTAACATGGGTGCACG;SOR=1.863;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=43309199;WS=43309181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
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chr21	43327793	rs3746904	C	T	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.770;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=383;ReadPosRankSum=0.436;SC=AGCCCAGCACCGAGCTGCCGC;SOR=0.246;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=47;TCF=35;TCR=12;TR=25;WE=43327801;WS=43327783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,26:0.53:49
chr21	43327856	rs3746906	A	G	1684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.937;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=30;PP=1070;ReadPosRankSum=0.152;SC=GCTGCTTCTTAAATAAGTCCA;SOR=0.951;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=124;TCF=68;TCR=56;TR=73;WE=43327864;WS=43327846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,79:0.57:139
chr21	43332605	rs201192263	T	TA	181.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.77;MQRankSum=0.674;QD=15.14;ReadPosRankSum=2.125;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
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chr21	43332611	rs11387061	T	TA	160.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=20.09;ReadPosRankSum=2.369;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr21	43334896	rs3746908	A	G	3098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=57;PP=1873;SC=GGAAGTAGCCACTGGACTCCT;SOR=1.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=48;TCR=57;TR=105;WE=43334904;WS=43334886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr21	43338175	rs3827223	C	T	893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.711;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=11;PP=655;ReadPosRankSum=-1.155;SC=TGGTGCCTAACGGGGTTCAGA;SOR=1.378;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=73;TCF=51;TCR=22;TR=41;WE=43338183;WS=43338165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,41:0.52:79
chr21	43338400	rs2245036	C	T	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=319;ReadPosRankSum=0.680;SC=CCCAATCTCACGTCTTCAGGT;SOR=1.044;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=20;WE=43338408;WS=43338390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,23:0.74:31
chr21	43338933	rs12483229	A	T	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.642;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=398;ReadPosRankSum=1.420;SC=TTCTCACGCCAATGGAAGAAT;SOR=0.379;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=24;WE=43338941;WS=43338923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,24:0.65:37
chr21	43338948	rs2245127	A	C	525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.363;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=352;ReadPosRankSum=1.503;SC=AAGAATCATAAAAACTTACGG;SOR=0.446;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=41;TCF=30;TCR=11;TR=23;WE=43338956;WS=43338938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,24:0.57:42
chr21	43339143	rs10681050	C	CTGTG	2314.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FS=1.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.47;ReadPosRankSum=2.189;SOR=0.851;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:97,63:0.39:160
chr21	43339154	rs2277796	T	C	2352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-1.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.079;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=23;PP=1631;ReadPosRankSum=0.758;SC=TGTGTGAGCATGTGTGTGTGC;SOR=0.891;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=119;TCF=50;TCR=69;TR=37;WE=43339162;WS=43339133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,63:0.40:158
chr21	43342046	rs3746909	G	A	1862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.501;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=34;PP=1079;ReadPosRankSum=1.110;SC=GAACTGTGACGGGTCTCATAA;SOR=0.760;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=199;TCF=118;TCR=81;TR=85;WE=43342054;WS=43342036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,96:0.44:220
chr21	43342272	rs9974090	C	T	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.292;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.10;ReadPosRankSum=0.703;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr21	43362513	rs3746910	C	G	148.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=123;SC=ATATCAGGAGCTCTGCACATC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=43362521;WS=43362503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr21	43373409	rs112301094	G	A	796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=13;PP=516;ReadPosRankSum=2.312;SC=GACGCCTCCAGGAAAGACCTC;SOR=0.586;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=68;TCF=47;TCR=21;TR=35;WE=43373417;WS=43373399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,37:0.52:71
chr21	43413553	rs871546	T	G	2856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.956;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=52;PP=1733;ReadPosRankSum=0.538;SC=TCAAGAGACTTTGCATATACC;SOR=0.470;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=224;TCF=130;TCR=94;TR=112;WE=43413561;WS=43413543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,129:0.49:261
chr21	43413651	rs871545	T	C	4224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=420;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.521;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=88;PP=2675;ReadPosRankSum=2.200;SC=CTTATTGGTATTGGCCTTGAC;SOR=0.614;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=376;TCF=190;TCR=186;TR=183;WE=43413659;WS=43413641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:216,203:0.48:419
chr21	43413731	rs915837	C	T	8098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=115;NR=146;PP=2965;SC=TTTTTCCTTGCGCTTCGTTTC;SOR=0.996;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=261;TCF=115;TCR=146;TR=261;WE=43413739;WS=43413721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,291:1.00:291
chr21	43442372	rs220217	C	T	1541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.689;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=39;PP=971;ReadPosRankSum=-0.018;SC=ACTGTCCTCCCGCTGGGCTCT;SOR=0.924;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=162;TCF=71;TCR=91;TR=65;WE=43442380;WS=43442362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,73:0.40:182
chr21	43496017	rs220285	C	G	509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.351;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=368;ReadPosRankSum=1.176;SC=GGGAGGTGTGCTCTCACTTGC;SOR=1.528;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=17;WE=43496025;WS=43496007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr21	43496381	rs220286	G	T	1522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.120;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=39;PP=875;ReadPosRankSum=-0.774;SC=GCTGGGCTGGGGCGGGGCCAC;SOR=0.425;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=129;TCF=52;TCR=77;TR=69;WE=43496389;WS=43496371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,74:0.53:139
chr21	43504228	rs7278485	T	C	2913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=57;PP=1450;ReadPosRankSum=0.540;SC=CGTCAAGACCTGGGGCCTGCC;SOR=0.675;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=233;TCF=125;TCR=108;TR=125;WE=43504236;WS=43504218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,143:0.54:267
chr21	43510427	rs67055914	T	C	1576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.61;ReadPosRankSum=0.007;SOR=0.716;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,43:0.43:101
chr21	43510437	rs17114359	A	C	1722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=1.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.25;ReadPosRankSum=-0.810;SOR=0.883;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,49:0.46:106
chr21	43513989	rs34421316	C	T	3987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.809;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=68;PP=2250;ReadPosRankSum=0.646;SC=AGCACGTGGCCTTGAGATCCA;SOR=0.755;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=319;TCF=181;TCR=138;TR=159;WE=43513997;WS=43513979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,184:0.52:351
chr21	43519032	rs220312	G	A	1042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=23;PP=499;ReadPosRankSum=0.133;SC=CTGTGCTTTCGTAGATTGTCC;SOR=0.703;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=111;TCF=60;TCR=51;TR=50;WE=43519040;WS=43519022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,56:0.46:122
chr21	43521647	rs66994219	G	A	612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.540;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=2;PP=553;ReadPosRankSum=0.057;SC=AATTGCCGCCGACCTGCTCCT;SOR=1.230;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=73;TCF=66;TCR=7;TR=30;WE=43521655;WS=43521637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,27:0.38:71
chr21	43521902	rs12483409	G	A	1472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.871;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=41;PP=930;ReadPosRankSum=1.344;SC=CCCTGATGTTGGGGGCCTGAG;SOR=1.058;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=106;TCF=27;TCR=79;TR=53;WE=43521910;WS=43521892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,60:0.53:114
chr21	43522349	rs220109	T	C	7943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=129;NR=150;PP=2965;SC=ACCGCAGCAGTGTGGAGTACC;SOR=0.902;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=279;TCF=129;TCR=150;TR=279;WE=43522357;WS=43522339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,303:1.00:303
chr21	43523941	rs220111	C	A	2962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.434;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=63;PP=1898;ReadPosRankSum=-1.318;SC=GTCGTGAAGACGTTGATGGAT;SOR=0.696;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=260;TCF=134;TCR=126;TR=136;WE=43523949;WS=43523931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,144:0.52:278
chr21	43523972	rs11701371	G	C	2788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.448;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=63;PP=1617;ReadPosRankSum=-1.101;SC=GCCTCTTCTTGGCTAGGTCGA;SOR=0.755;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=248;TCF=125;TCR=123;TR=122;WE=43523980;WS=43523962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,132:0.50:264
chr21	43529515	rs220120	G	C	684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=15;NR=4;PP=470;SC=AGGCCGTAAGGTTGTCATGAG;SOR=2.030;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=19;WE=43529523;WS=43529505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr21	43529548	rs35742122	A	AG	1817.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=11;PP=1368;SC=ATGCCCCAAAATGCCCCTGCT;SOR=1.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=19;TCR=11;TR=30;WE=43529556;WS=43529538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr21	43529642	rs8127300	A	C	1780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=31;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.120;SC=CTGTTTTCTCATGGGTTTTGA;SOR=0.668;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=173;TCF=95;TCR=78;TR=70;WE=43529668;WS=43529632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,89:0.43:205
chr21	43529652	rs11371744	A	AC	2846.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=32;PP=2933;ReadPosRankSum=0.114;SC=ATGGGTTTTGATTGTGTCTCC;SOR=0.678;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=104;TCF=24;TCR=80;TR=45;WE=43529668;WS=43529632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,87:0.42:206
chr21	43529819	rs11203186	G	A	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.239;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=281;ReadPosRankSum=-0.132;SC=GGTACGTGTCGACCCCCCTGC;SOR=4.310;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=13;WE=43529827;WS=43529809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr21	43530856	rs2051401	G	A	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.329;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=73;ReadPosRankSum=-0.819;SC=GAACGCTGGCGCCCGCCTGCG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=5;WE=43530864;WS=43530846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr21	43530897	rs220125	G	A	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.250;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=368;ReadPosRankSum=-1.498;SC=GGGATGCAGAGCAGTCCTGCT;SOR=0.963;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=48;TCF=39;TCR=9;TR=23;WE=43530905;WS=43530887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,25:0.47:53
chr21	43531008	rs220126	T	C	7555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=149;NR=117;PP=2965;SC=GTGAGCCCCATGGGCGGTGGA;SOR=0.846;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=268;TCF=151;TCR=117;TR=266;WE=43531016;WS=43530998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,293:1.00:293
chr21	43531403	rs220127	C	G	588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=8;PP=418;SC=CCCCAGCCAGCGGAGCACCAG;SOR=0.784;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=12;TCR=8;TR=20;WE=43531411;WS=43531393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr21	43531553	rs220128	A	C	2730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.443;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=47;PP=1770;ReadPosRankSum=0.661;SC=CCCGAAGGCTACTGGGTCAAC;SOR=0.733;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=264;TCF=162;TCR=102;TR=126;WE=43531561;WS=43531543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,134:0.48:277
chr21	43531632	rs220129	T	C	10033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=379;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=186;NR=169;PP=2965;SC=GGAAACTCCATCATGGAGCCA;SOR=0.742;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=355;TCF=186;TCR=169;TR=355;WE=43531640;WS=43531622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,379:1.00:379
chr21	43531848	rs220131	C	T	1592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.102;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.048;NF=21;NR=45;PP=1110;ReadPosRankSum=-0.754;SC=TGCATGGGGACTAGGACTAAT;SOR=1.094;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=137;TCF=50;TCR=87;TR=66;WE=43531856;WS=43531838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,71:0.47:151
chr21	43534075	rs55981015	C	T	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.361;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=65;ReadPosRankSum=0.032;SC=TAGGGACATCCGGCTGGCTTC;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=5;WE=43534083;WS=43534065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr21	43539293	rs220146	G	A	1554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.840;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.952;NF=46;NR=24;PP=989;ReadPosRankSum=-1.399;SC=AGTCGTCAGCGTCACCAACGG;SOR=0.927;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=149;TCF=94;TCR=55;TR=70;WE=43539301;WS=43539283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,75:0.47:160
chr21	43539523	rs220147	C	T	635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=16;PP=477;SC=TGAAAGATGTCGTGTTGTGCC;SOR=3.160;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=43539531;WS=43539513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr21	43541342	rs220150	C	T	3600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=62;PP=2023;SC=AAGGTAATGTCGTCAGAGTTT;SOR=1.016;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=115;TCF=53;TCR=62;TR=115;WE=43541350;WS=43541332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr21	43541478	.	CGT	C	185.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=5;PP=234;SC=TGTGGGTGCACGTGTGTGTGT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=5;WE=43541487;WS=43541468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr21	43546705	rs220157	T	C	788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=24;PP=587;SC=TTCCTTGAGATGGAATATACA;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=43546713;WS=43546695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr21	43547788	rs220158	T	C	2969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=36;PP=1755;SC=TCAGCTGCCCTGTGCCCAACA;SOR=1.365;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=64;TCR=36;TR=100;WE=43547796;WS=43547778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr21	43547873	rs220159	G	A	1800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.111;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=37;PP=1087;ReadPosRankSum=-1.042;SC=CTTTATCAACGACTCCATCGT;SOR=0.744;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=173;TCF=89;TCR=84;TR=81;WE=43547881;WS=43547863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,89:0.46:192
chr21	43548239	rs2839470	T	C	2440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=56;PP=1502;ReadPosRankSum=0.443;SC=CTTGCCATGATACCTAGTGCT;SOR=0.681;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=186;TCF=86;TCR=100;TR=104;WE=43548247;WS=43548229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,113:0.57:199
chr21	43557494	rs3819140	A	G	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.957;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=85;ReadPosRankSum=0.494;SC=GGCTTGCTCTATCGCATTCCT;SOR=0.169;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=6;WE=43557502;WS=43557485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr21	43557559	rs3819141	T	A	726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=391;ReadPosRankSum=0.706;SC=GTGAGCCTCCTCATGCAGAAG;SOR=0.685;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=49;TCR=17;TR=30;WE=43557567;WS=43557549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,32:0.47:68
chr21	43557736	rs220178	G	A	3252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=65;PP=1965;SC=AATAGGAGGCGCAGGCTGACA;SOR=1.290;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=107;TCF=42;TCR=65;TR=107;WE=43557744;WS=43557726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr21	43557778	.	C	T	201	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MMLQ=27;MQ=59.4;NF=6;NR=8;PP=201;QD=16.8408008962;SC=GTGGGAGGTGCAGGCTGACAG;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=33;TCF=10;TCR=23;TR=14;WE=43557786;WS=43557768;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr21	43639332	.	C	CCCGCCG	1009.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=0.000;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.613;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=582;ReadPosRankSum=-0.375;SC=AAGCCTCGTCCCCGCCGCCGC;SOR=0.325;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=53;TCF=21;TCR=32;TR=14;WE=43639340;WS=43639322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,27:0.36:76
chr21	43704650	rs2234719	C	T	3876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=47;PP=2358;SC=AGGCGTCTCACGGTGCCTCTT;SOR=1.302;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=129;TCF=82;TCR=47;TR=129;WE=43704658;WS=43704640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr21	43708431	rs2234720	G	GC	1175.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.850;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=26;PP=1012;ReadPosRankSum=1.529;SC=CGGTAAGGCTGCCCGCATCTT;SOR=0.547;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=61;TCF=3;TCR=58;TR=29;WE=43708439;WS=43708421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,44:0.51:87
chr21	43710052	rs4148137	C	T	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=236;ReadPosRankSum=-1.472;SC=CTAAGACGTGCTGTCACAGAG;SOR=0.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=13;WE=43710060;WS=43710042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr21	43710096	rs2234721	G	T	831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.286;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=5;PP=512;ReadPosRankSum=-0.021;SC=GCCGCATCCGGGTTGTTCTCT;SOR=1.134;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=73;TCF=57;TCR=16;TR=32;WE=43710104;WS=43710086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,36:0.47:77
chr21	43720525	rs1023156	A	G	640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=434;ReadPosRankSum=-0.613;SC=ACACACACATACACACACATA;SOR=0.818;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=64;TCF=45;TCR=19;TR=26;WE=43720533;WS=43720515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,29:0.41:70
chr21	43732425	rs533093	C	T	534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.673;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=20;PP=398;ReadPosRankSum=-2.040;SC=TCTCCACCCACGCTGCCCAGC;SOR=1.807;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=61;TCF=20;TCR=41;TR=25;WE=43732433;WS=43732415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,26:0.39:66
chr21	43769909	rs34333540	G	A	487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=2;PP=377;SC=GGCCTCCTCCGGCCCCTGCTC;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=43769917;WS=43769899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr21	43770926	rs5844113	CT	C	1020.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=11;NR=14;PP=395;SC=TATGGTTGTGCTTTTTTTTTT;SOR=1.845;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=28;TCF=12;TCR=16;TR=25;WE=43770934;WS=43770916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr21	43786512	rs225358	C	T	2777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=57;NR=31;PP=1517;SC=GGAAGAAGCACGCCTTACCTG;SOR=1.292;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=57;TCR=31;TR=88;WE=43786520;WS=43786502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr21	43786540	rs34795821	G	A	1959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.016;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=37;PP=1067;ReadPosRankSum=0.666;SC=CTCGGCCAGGGTGCCGAGGGC;SOR=0.329;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=150;TCF=91;TCR=59;TR=84;WE=43786548;WS=43786530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,95:0.56:170
chr21	43792869	rs13047838	C	T	1358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.428;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=38;PP=905;ReadPosRankSum=0.741;SC=TCCCCTTCCTCTTCAGGTTTT;SOR=0.772;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=169;TCF=86;TCR=83;TR=72;WE=43792877;WS=43792859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,76:0.41:184
chr21	43796913	rs1078272	T	A	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=49;ReadPosRankSum=-1.122;SC=CTCTGGTGTGTCGCAACAGCG;SOR=0.616;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=6;WE=43796921;WS=43796903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr21	43803412	rs8129105	T	C	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.139;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=92;ReadPosRankSum=0.430;SC=TCACTGCCCCTGCTCCCAGAG;SOR=0.129;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=9;WE=43803420;WS=43803402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr21	43823910	rs2277797	A	G	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-3.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.317;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=65;ReadPosRankSum=1.866;SC=CTGATATCTCATGCAAACAGG;SOR=0.039;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=9;WE=43823918;WS=43823900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr21	43824106	rs2277798	A	G	802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=19;PP=477;ReadPosRankSum=-0.678;SC=CAAGCTCAAGAGCCGCAGCAG;SOR=0.639;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=70;TCF=35;TCR=35;TR=39;WE=43824114;WS=43824096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,42:0.52:81
chr21	43824123	rs2277799	G	C	792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=16;PP=451;ReadPosRankSum=0.300;SC=GCAGCCCCTCGCTCCTGGAGC;SOR=0.633;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=61;TCF=31;TCR=30;TR=34;WE=43824131;WS=43824113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,39:0.53:73
chr21	43826344	rs3746923	C	T	4514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=485;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.728;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=118;NR=98;PP=2520;ReadPosRankSum=-0.572;SC=TGTGCAAGGCCACACCCTGCC;SOR=0.789;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=451;TCF=238;TCR=213;TR=216;WE=43826352;WS=43826334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:256,228:0.47:484
chr21	43826391	rs3746924	T	C	3754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=384;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.207;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=91;PP=2364;ReadPosRankSum=1.345;SC=CGACGTGACTTTGTGTCTGTG;SOR=0.621;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=360;TCF=164;TCR=196;TR=172;WE=43826399;WS=43826381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:199,184:0.48:383
chr21	43829758	rs11702374	G	A	1024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.052;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=26;PP=621;ReadPosRankSum=-0.348;SC=ACGGCAGCTGGAGGCATTTTT;SOR=1.060;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=75;TCF=24;TCR=51;TR=36;WE=43829766;WS=43829748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,44:0.48:91
chr21	43833228	rs145749877	C	A	2346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.475;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=60;PP=1361;ReadPosRankSum=-0.283;SC=CTCTGGCTCTCCACTCCTCCA;SOR=0.595;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=241;TCF=114;TCR=127;TR=116;WE=43833236;WS=43833218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,122:0.46:267
chr21	43846729	rs2839509	A	G	1379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.959;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=22;PP=883;ReadPosRankSum=-0.591;SC=TCAAGTACATACATGACCAGA;SOR=0.437;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=80;TCF=51;TCR=29;TR=55;WE=43846737;WS=43846719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,60:0.68:88
chr21	43852146	rs58639264	A	G	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.818;HP=2;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=839;ReadPosRankSum=0.566;SC=GAGAGCTGCCATTGGTGCAAG;SOR=2.964;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=31;TCR=5;TR=18;WE=43852168;WS=43852136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,20:0.53:38
chr21	43852160	rs2839512	A	G	676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=6;PP=839;ReadPosRankSum=0.309;SC=GTGCAAGTCCAGTGAGTTGGA;SOR=0.889;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=53;TCF=41;TCR=12;TR=30;WE=43852168;WS=43852136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,32:0.57:56
chr21	43852232	rs13052676	C	T	1715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.223;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=32;PP=1132;ReadPosRankSum=-0.357;SC=CAAGGAAGAGCGTGCTGGTGG;SOR=0.817;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=158;TCF=91;TCR=67;TR=78;WE=43852240;WS=43852222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,83:0.50:165
chr21	43852355	rs2839513	T	C	2421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.813;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=53;PP=1501;ReadPosRankSum=0.035;SC=ACACTGTAGATCTAACCAATG;SOR=0.827;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=220;TCF=114;TCR=106;TR=107;WE=43852363;WS=43852345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,119:0.49:245
chr21	43854985	rs17114925	A	C	1988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=39;PP=1163;ReadPosRankSum=-1.788;SC=GCAGTCTGCCAAGACGGAGTC;SOR=0.716;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=181;TCF=95;TCR=86;TR=84;WE=43854993;WS=43854975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,94:0.47:199
chr21	43862466	rs2254368	G	A	346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=1;PP=237;SC=TGATTTAGACGTGTGTGTGAC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=43862474;WS=43862456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr21	43863521	rs868092	A	G	3258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=54;PP=1921;SC=ACACCTGTCCACAGGACAGTA;SOR=0.812;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=54;TCR=54;TR=108;WE=43863529;WS=43863511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr21	43864519	rs4920104	G	A	382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=297;SC=CTTCTAGCCCGGGGGTCTCGC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=43864527;WS=43864515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr21	43867059	rs3827232	C	T	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.93;ReadPosRankSum=-1.910;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr21	43892775	rs11203205	G	A	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=83;ReadPosRankSum=0.466;SC=GAGCAGTGGCGCGATCTCCAC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=7;WE=43892783;WS=43892765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr21	43896143	rs117385282	C	T	3721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.429;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=74;PP=1851;ReadPosRankSum=0.315;SC=GCCTCCTCCCCGGGTTCTCCT;SOR=0.568;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=283;TCF=142;TCR=141;TR=156;WE=43896151;WS=43896133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,181:0.57:317
chr21	43897355	rs11702140	C	T	122.85	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.782;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=162;ReadPosRankSum=0.210;SC=GGGGGTGCCCCACACCCTCTG;SOR=3.590;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=9;WE=43897363;WS=43897345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr21	43905887	rs2839536	C	T	2426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=57;PP=1620;ReadPosRankSum=-0.731;SC=TGCCCGTCTCCGCGTATAAAT;SOR=0.951;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=82;TCF=24;TCR=58;TR=81;WE=43905895;WS=43905877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,86:0.99:87
chr21	43906351	rs2839537	G	C	2998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=17;PP=2010;SC=AGAAAGATTGGACCTGCCTGG;SOR=2.655;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=69;TCR=17;TR=86;WE=43906359;WS=43906341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr21	43916339	rs1573413	G	A	3152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=67;PP=2090;SC=GCCTCTAGCAGGTGGGTAGCA;SOR=1.505;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=33;TCR=67;TR=100;WE=43916347;WS=43916329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr21	43938673	rs4919990	T	C	1635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=27;PP=1006;SC=AGGTGAGGGCTACTGTGCAGG;SOR=1.009;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=22;TCR=27;TR=49;WE=43938681;WS=43938663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr21	43955427	rs228056	A	G	481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=16;NR=1;PP=340;SC=GAAACTGAACAGAAAATGCAC;SOR=4.514;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=43955435;WS=43955417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr21	43959770	rs228063	A	G	6691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=105;NR=127;PP=2965;SC=AAGGGTTTGGATCCGTGGCTC;SOR=0.937;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=232;TCF=105;TCR=127;TR=232;WE=43959778;WS=43959760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr21	43959908	rs58348531	TC	T	415.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=374;SC=ACAAAGTCCTTCCCTTTCTCT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=10;WE=43959916;WS=43959898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr21	43963401	rs228074	T	C	445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=13;NR=1;PP=374;SC=TCGCGAGTCCTGCATGGCACA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=43963409;WS=43963392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr21	43963759	rs228075	A	G	1182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=23;PP=680;SC=GAGGCCTCGGATTTCCCTGCC;SOR=1.455;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=15;TCR=23;TR=38;WE=43963767;WS=43963749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr21	43967126	rs228082	G	A	974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=7;PP=632;SC=CGGTGCTCCCGTGTTGCCCTG;SOR=2.049;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=29;WE=43967134;WS=43967116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr21	43984126	rs7282730	C	T	2238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=53;PP=1533;SC=AGGGTCAGGCCGTCACCTGGG;SOR=2.073;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=21;TCR=53;TR=74;WE=43984134;WS=43984116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr21	43985016	rs915874	G	A	399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=12;PP=290;SC=TGACAAGCCCGCTTCATTCCC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=43985024;WS=43985006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr21	43985955	rs228104	G	A	4204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=55;PP=2603;SC=CTTCTCCACCGTCAGCAAGAT;SOR=1.150;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=142;TCF=87;TCR=55;TR=141;WE=43985963;WS=43985945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr21	43986117	rs36113965	T	TC	6121.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=10;NR=84;PP=2973;SC=GCTAAAATTGTCCGTGTCCTC;SOR=1.329;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=102;TCF=10;TCR=92;TR=94;WE=43986125;WS=43986107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr21	43986175	rs4919992	C	T	1873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=46;PP=1326;SC=CTCCCCAGTGCGAGGCTTGCC;SOR=2.621;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=9;TCR=46;TR=55;WE=43986183;WS=43986165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
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chr21	43988437	rs7280392	G	A	10320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=389;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=173;NR=169;PP=2965;SC=ATGCTGTGGCGATAACTGCAC;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=343;TCF=173;TCR=170;TR=342;WE=43988445;WS=43988427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,388:1.00:388
chr21	43999983	rs453592	T	C	2897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=47;NR=47;PP=1244;SC=ATCTGCCTTCTGCACCTGGCT;SOR=1.015;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=47;TCR=47;TR=94;WE=43999991;WS=43999973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
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chr21	44000063	rs380161	T	G	1022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=22;PP=677;SC=CTTTTTCTTTTCTAATAAATA;SOR=1.885;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=10;TCR=22;TR=32;WE=44000071;WS=44000042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr21	44000078	rs453647	T	C	743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=19;PP=479;SC=TAAATACCTCTGGATGGGTTA;SOR=2.147;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=26;WE=44000086;WS=44000068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr21	44000366	rs388907	A	G	2595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=29;PP=1433;SC=GGCTCCCCATAGGATTTGCAC;SOR=1.289;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=53;TCR=29;TR=82;WE=44000374;WS=44000356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr21	44107960	rs2839573	T	A	1181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=12;PP=808;ReadPosRankSum=0.439;SC=TGGCCCCATGTGTACATTCAA;SOR=0.725;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=117;TCF=87;TCR=30;TR=49;WE=44107968;WS=44107950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,54:0.43:125
chr21	44107989	rs2839574	A	G	1885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.526;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=34;PP=1221;ReadPosRankSum=-1.396;SC=CCCAGAGCACACTATGGGCGA;SOR=0.760;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=194;TCF=121;TCR=73;TR=90;WE=44107997;WS=44107979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,96:0.47:206
chr21	44118958	rs1515755	T	A	903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=0.790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.22;ReadPosRankSum=0.403;SOR=0.832;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,43:0.44:98
chr21	44152149	rs2269153	G	A	2536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.505;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=52;PP=1530;ReadPosRankSum=1.660;SC=TCTTGTCCGTGTTCCATCTGT;SOR=0.652;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=190;TCF=101;TCR=89;TR=109;WE=44152157;WS=44152139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,120:0.57:211
chr21	44163839	rs6586344	A	G	3032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=37;PP=1671;SC=GAGATCCTCCACATTCGTCCG;SOR=1.085;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=65;TCR=37;TR=102;WE=44163847;WS=44163829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr21	44178992	rs11702144	A	G	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=98;ReadPosRankSum=0.721;SC=GAGGGGGAGAACCCACCTCCT;SOR=0.963;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=7;WE=44179000;WS=44178982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr21	44180443	rs13047953	C	T	3706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=378;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.213;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=76;PP=2303;ReadPosRankSum=1.559;SC=CGCAGTTCTGCGTCCACGACA;SOR=0.768;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=345;TCF=186;TCR=159;TR=169;WE=44180451;WS=44180433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:194,180:0.48:374
chr21	44180866	rs55905735	ACC	A	643.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=310;ReadPosRankSum=-0.994;SC=ACCCAATTCCACCCCCCCTCA;SOR=0.407;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=37;TCF=33;TCR=4;TR=15;WE=44180875;WS=44180856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr21	44180916	rs1547379	G	A	1369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=18;PP=895;ReadPosRankSum=-1.607;SC=AAACACCTACGCCCTGTTTTC;SOR=0.718;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=117;TCF=82;TCR=35;TR=62;WE=44180924;WS=44180906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,66:0.52:128
chr21	44182135	rs2269168	C	G	791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.767;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=8;PP=559;ReadPosRankSum=2.023;SC=GTTGCTCCCCCGTGCAGGTAC;SOR=0.245;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=58;TCF=46;TCR=12;TR=35;WE=44182143;WS=44182125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,37:0.61:61
chr21	44185794	rs2284970	TC	GA	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=542;ReadPosRankSum=-1.667;SC=TCCTGATGGGTCCTCCTTCAT;SOR=0.495;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=10;TCR=21;TR=15;WE=44185803;WS=44185784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr21	44188249	rs68104891	GC	G	1649.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.363;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=22;PP=1040;ReadPosRankSum=0.445;SC=GCAGCAGCAGGCCCGTGTTCT;SOR=0.578;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=84;TCF=31;TCR=53;TR=32;WE=44188257;WS=44188239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,59:0.43:137
chr21	44188485	rs2284977	T	A	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.021;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=448;ReadPosRankSum=-0.433;SC=CGAGCACGCCTGGGTGGTCCC;SOR=1.329;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=68;TCF=21;TCR=47;TR=29;WE=44188493;WS=44188475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,31:0.41:75
chr21	44188504	rs67260236	C	A	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.594;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=292;ReadPosRankSum=1.239;SC=CCGCATATTCCCCGGGCTGCC;SOR=1.179;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=50;TCF=15;TCR=35;TR=21;WE=44188512;WS=44188494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,22:0.39:56
chr21	44189166	rs1045382	T	C	2299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=5.309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.86;ReadPosRankSum=-0.724;SOR=1.134;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,60:0.41:145
chr21	44189172	rs3087994	A	C	2346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=7.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.67;ReadPosRankSum=-0.965;SOR=1.228;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,67:0.42:160
chr21	44189387	rs55990449	G	A	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=112;ReadPosRankSum=-1.487;SC=ATGCACACACGTACACAGATA;SOR=0.402;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=10;WE=44189395;WS=44189377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr21	44190680	rs2269172	C	T	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=319;ReadPosRankSum=-2.022;SC=GCAGCAGAGCCGGCACGAGGG;SOR=0.846;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=20;WE=44190688;WS=44190670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr21	44296960	rs11700660	C	T	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.200;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=261;ReadPosRankSum=-0.924;SC=CGGAGTTTCGCTCTCGTTGTC;SOR=0.301;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=15;WE=44296968;WS=44296950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chr21	44371114	rs451887	T	C	2908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=59;PP=1796;SC=TGTGATATTATTCATAATATC;SOR=1.993;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=27;TCR=59;TR=86;WE=44371122;WS=44371104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr21	44424689	rs3216136	G	GA	1152.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=29;PP=859;SC=TTCGTGTTCAGAAAAAAAGCC;SOR=2.670;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=1;TCR=38;TR=30;WE=44424697;WS=44424679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
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chr21	44449095	rs234729	G	A	391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=8;PP=199;SC=TGGTGAACGAGAGTGCGTGGT;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=44449103;WS=44449085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr21	44452455	rs378528	T	C	334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=294;SC=CTTCGGCTGCTTGCTCTTTAG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=44452463;WS=44452445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr21	44475714	rs2124459	T	C	285.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=8;NR=0;PP=206;SC=CCTTGCATTTTGGGGAAACGG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=44475722;WS=44475704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
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chr21	44475796	rs2124461	T	C	1818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.42;SOR=2.059;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr21	44476759	rs234701	A	G	322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=9;NR=2;PP=226;SC=TGGGAGGCCCAGGCATAAAGA;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=44476767;WS=44476754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr21	44480616	rs1801181	G	A	2448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=47;PP=1418;ReadPosRankSum=-0.762;SC=GCTCCTGCGCGGCCTTCACGG;SOR=0.346;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=39;TCR=48;TR=86;WE=44480624;WS=44480606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,94:0.99:95
chr21	44488033	rs234714	T	C	1663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=36;PP=1150;SC=TCCCTCCACGTTCTTGAGCCT;SOR=2.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=13;TCR=36;TR=49;WE=44488041;WS=44488023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr21	44515685	rs2839634	T	C	4098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=53;PP=2413;SC=TCGTTATACATTACAAAGTGT;SOR=0.955;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=79;TCR=53;TR=131;WE=44515693;WS=44515675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr21	44527669	rs17115876	T	G	5217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=78;NR=97;PP=2965;SC=GCCGACGCCCTCGGGAGACGT;SOR=1.049;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=175;TCF=78;TCR=97;TR=175;WE=44527677;WS=44527659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr21	44579848	rs56218428	G	A	1041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=1.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.97;ReadPosRankSum=2.424;SOR=0.468;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,50:0.57:87
chr21	44579990	rs68189421	G	A	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=81;ReadPosRankSum=0.098;SC=CACTATAGATGTACCACACAC;SOR=1.179;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=7;WE=44579998;WS=44579980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr21	44580019	.	AACACACACC	A	479	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=22;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=479;QD=246.5;SC=CCACCTATACAACACACACCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=2;WE=44580035;WS=44580009;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:4,2:0.33:6
chr21	44589215	rs872331	C	T	1942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.851;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=28;PP=1041;ReadPosRankSum=0.202;SC=TGAACATGGACGTGACCATCC;SOR=1.112;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=179;TCF=107;TCR=72;TR=82;WE=44589223;WS=44589205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,97:0.48:203
chr21	44590059	rs870137	C	T	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.35;ReadPosRankSum=0.674;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
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chr21	44837555	rs430554	G	A	10394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.05;SOR=0.916;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr21	44985202	rs9637217	G	A	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=10.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.98;MQRankSum=-5.351;QD=1.73;ReadPosRankSum=-0.084;SOR=2.284;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,10:0.15:67
chr21	44985272	rs9637218	C	T	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.444;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.541;NF=31;NR=19;PP=691;ReadPosRankSum=0.666;SC=AGGTCCACCCCGACACCGGCA;SOR=1.038;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=129;TCF=72;TCR=57;TR=50;WE=44985280;WS=44985262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,45:0.38:119
chr21	45053011	rs7277539	A	G	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=244;ReadPosRankSum=0.199;SC=ATATACGATAAGTATTCAATA;SOR=1.179;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=12;WE=45053019;WS=45053001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr21	45064296	rs2246602	C	A	1246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.758;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=34;PP=758;ReadPosRankSum=-1.974;SC=CATAAAATTACTCAAGATATT;SOR=1.212;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=102;TCF=41;TCR=61;TR=53;WE=45064304;WS=45064286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,59:0.52:113
chr21	45076373	rs2838340	A	G	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.764;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=425;ReadPosRankSum=0.789;SC=GGACTGTAAGAGTACCTTAAA;SOR=1.398;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=44;TCF=38;TCR=6;TR=21;WE=45076381;WS=45076363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,23:0.49:47
chr21	45076443	rs2838341	A	G	2412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.783;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=32;PP=1584;ReadPosRankSum=-0.775;SC=GTTACCACCAATGACTGCTGA;SOR=0.844;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=191;TCF=125;TCR=66;TR=98;WE=45076451;WS=45076433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,106:0.51:208
chr21	45077865	rs2838342	G	A	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.298;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=151;ReadPosRankSum=-0.672;SC=GTCTCCGAGCGCACGGGGCGA;SOR=0.404;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=13;WE=45077873;WS=45077855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,18:0.44:41
chr21	45078035	rs2838343	C	T	3088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.873;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=62;PP=1780;ReadPosRankSum=-1.338;SC=TGACCCCTCACGCCAGAAAGC;SOR=0.721;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=274;TCF=145;TCR=129;TR=137;WE=45078043;WS=45078025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,154:0.51:302
chr21	45089877	rs2838344	G	A	1089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.617;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=26;PP=606;ReadPosRankSum=0.491;SC=TCATGCTCCCGGGTTCTTGCT;SOR=1.346;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=84;TCF=40;TCR=44;TR=44;WE=45089885;WS=45089867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,50:0.56:90
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chr21	45092257	rs2251253	T	A	2877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.459;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=47;PP=1770;ReadPosRankSum=-0.647;SC=GTAAGTCCTGTTGTTTCTTCT;SOR=0.736;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=234;TCF=147;TCR=87;TR=124;WE=45092265;WS=45092247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,136:0.53:259
chr21	45096206	rs2155722	G	A	2248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.188;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=56;PP=1387;ReadPosRankSum=1.850;SC=AAATTGCTGCGAAGACGAAGG;SOR=0.847;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=223;TCF=101;TCR=122;TR=98;WE=45096214;WS=45096196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,111:0.46:242
chr21	45107285	rs2838348	C	G	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=225;ReadPosRankSum=1.358;SC=GAACTTTCCTCGTGGTAGAAT;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=11;WE=45107293;WS=45107275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,11:0.35:31
chr21	45107518	rs7279959	A	G	7144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=132;PP=2965;SC=GTGCAGCCCCATCCCTGGAAC;SOR=0.978;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=239;TCF=107;TCR=132;TR=239;WE=45107526;WS=45107508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,268:1.00:268
chr21	45107562	rs9306160	T	C	1207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.630;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=31;PP=653;ReadPosRankSum=0.339;SC=GCCTCTGGGCTGAAAGCCCTG;SOR=1.320;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=135;TCF=58;TCR=77;TR=48;WE=45107570;WS=45107552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,59:0.39:151
chr21	45111512	.	A	AT	143	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;FR=0.5000;HP=8;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=26;MQ=60.0;NF=1;NR=6;PP=143;QD=23.5714285714;SC=CCATTTCTTTATTTTTATTTT;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=7;WE=45111520;WS=45111502;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr21	45152382	rs190069684	GC	AA	7166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-2.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=344;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=68;PP=2944;ReadPosRankSum=-2.014;SC=TCATTTAAAAGCAGAAAATAG;SOR=0.695;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=300;TCF=163;TCR=137;TR=148;WE=45152391;WS=45152372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,181:0.53:344
chr21	45152500	rs2276528	G	A	3798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=364;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.795;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=88;PP=2059;ReadPosRankSum=1.906;SC=TTGTGTCATCGTTGCTTAATA;SOR=0.762;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=319;TCF=146;TCR=173;TR=160;WE=45152508;WS=45152490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,182:0.50:364
chr21	45153751	rs13050307	A	G	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.623;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.05;ReadPosRankSum=-0.956;SOR=0.175;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr21	45168884	rs11539534	G	A	1316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.614;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=28;PP=935;ReadPosRankSum=-0.399;SC=AGTACGTCCCGGAGGACCTCC;SOR=0.972;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=156;TCF=87;TCR=69;TR=66;WE=45168892;WS=45168874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,68:0.40:168
chr21	45169005	rs9974827	A	G	1067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-3.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.690;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=25;PP=574;ReadPosRankSum=-0.749;SC=TTATTTTTCAAGATGGGTCTC;SOR=0.199;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=72;TCF=25;TCR=47;TR=43;WE=45169013;WS=45168995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,51:0.60:85
chr21	45170285	rs1106797	A	G	5479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=120;NR=74;PP=2965;SC=GGGGATGGGGATTTCCAGAGC;SOR=1.129;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=194;TCF=120;TCR=74;TR=194;WE=45170293;WS=45170275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr21	45170614	rs3042235	A	ATG	113.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.114;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=126;ReadPosRankSum=1.349;SC=ATGTTTGTGCATGTGTGTGTG;SOR=1.609;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=8;WE=45170622;WS=45170604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr21	45172628	rs2010795	G	A	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.074;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=230;ReadPosRankSum=-0.699;SC=ATCCAGCACCGGGATGACACC;SOR=1.276;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=38;TCF=10;TCR=28;TR=15;WE=45172636;WS=45172618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,17:0.38:45
chr21	45175958	rs7527	T	C	4957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=86;NR=94;PP=2744;SC=CCCCGCCGCTTGCCCGTGACA;SOR=0.872;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=180;TCF=86;TCR=94;TR=180;WE=45175966;WS=45175948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr21	45196323	.	CGCGCGGGGCGGG	C	101.14	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=2;PP=573;SC=CAAGAAGGGACGCGCGGGGCG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=2;WE=45196342;WS=45196313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr21	45209714	rs2276245	C	T	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.216;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.331;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=7;PP=166;ReadPosRankSum=-2.186;SC=CGGCGGCGGCCGGAGCTGGGG;SOR=0.223;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=10;WE=45209722;WS=45209704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr21	45210932	rs2276246	G	A	1327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.310;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=30;PP=845;ReadPosRankSum=2.233;SC=TTAGGAAACCGTCAAGGTTCG;SOR=0.587;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=127;TCF=62;TCR=65;TR=61;WE=45210940;WS=45210922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,67:0.47:143
chr21	45214953	rs2838370	G	T	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.368;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=253;ReadPosRankSum=-0.956;SC=TGCTGGGGCCGGCAGAGGTCA;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=13;WE=45214961;WS=45214943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr21	45215046	rs2838371	T	C	7794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.80;SOR=0.947;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr21	45215046	.	TGCCAACCTC	CGCCAACCTG,CGCCAGCCTC	2944	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=52,38;NR=34,33;PP=2944,2752;QD=20;SC=CTTCTGCTAATGCCAACCTCC;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=161;TCF=94;TCR=67;TR=86,71;WE=45215063;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.53:161
chr21	45215051	rs2838372	A	G	2923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FS=0.552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.06;ReadPosRankSum=-0.298;SOR=0.620;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,79:0.43:182
chr21	45215055	rs2838373	C	G	3909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FS=1.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.69;ReadPosRankSum=1.109;SOR=0.803;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,105:0.56:189
chr21	45217456	rs2070537	G	A	2262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.515;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=40;PP=1373;ReadPosRankSum=-1.445;SC=CCGACGGGGCGGTGGAGCTGG;SOR=0.629;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=187;TCF=106;TCR=81;TR=91;WE=45217464;WS=45217446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,104:0.51:205
chr21	45217559	rs2838378	T	C	7194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=120;NR=127;PP=2965;SC=TCTGCAGAATTGCTGCCCGGA;SOR=0.791;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=247;TCF=120;TCR=127;TR=247;WE=45217567;WS=45217549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,275:1.00:275
chr21	45217753	rs2070538	C	T	1241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.867;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=18;PP=832;ReadPosRankSum=0.607;SC=TCCAGCATAACGGGCCTGCTC;SOR=0.527;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=84;TCF=57;TCR=27;TR=51;WE=45217761;WS=45217743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,54:0.61:88
chr21	45217929	rs2838379	T	C	2408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=59;PP=1157;ReadPosRankSum=-3.153;SC=CCTCTGAGGGTGGTGAGCGTG;SOR=0.672;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=191;TCF=82;TCR=109;TR=106;WE=45217937;WS=45217919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,117:0.57:206
chr21	45219524	rs4566449	T	C	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=270;ReadPosRankSum=0.300;SC=GCGGCCCCGTTCTCCAGGTGG;SOR=0.715;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=40;TCF=19;TCR=21;TR=20;WE=45219532;WS=45219514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,21:0.48:44
chr21	45220483	rs915770	A	G	1485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=37;PP=891;ReadPosRankSum=0.029;SC=CGTCTCTACAAAGTGATCCGG;SOR=0.676;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=149;TCF=62;TCR=87;TR=64;WE=45220491;WS=45220473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,73:0.46:159
chr21	45220570	rs731935	T	C	895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=27;PP=711;SC=TGGGTGCCTTTGCCTTGTCCT;SOR=3.126;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=32;WE=45220578;WS=45220560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr21	45220626	rs3216106	A	AC	567.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=7;PP=405;SC=GGACCCTGAGACCGTCCCCAG;SOR=0.804;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=10;WE=45220634;WS=45220616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr21	45220787	rs2329576	A	G	4462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=57;PP=2765;SC=GGCACTGACAATGGCACCACC;SOR=1.091;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=149;TCF=92;TCR=57;TR=149;WE=45220795;WS=45220777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr21	45222058	rs4818868	A	G	330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=0;PP=210;SC=ACACATTGTCAGGAGGTGGTG;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=45222066;WS=45222057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr21	45375174	rs733085	G	A	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.481;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=15;PP=348;ReadPosRankSum=-0.076;SC=CAGGCTGGGTGGGGAAGGACT;SOR=0.407;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=43;TCF=16;TCR=27;TR=25;WE=45375182;WS=45375164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,27:0.55:49
chr21	45405278	rs112367723	TA	T	46	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=11.50;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr21	45478904	rs71326023	C	CGTAAT	544.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=392;ReadPosRankSum=-0.158;SC=CTTTCTCTGTCGTTTAATGGC;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=8;WE=45478912;WS=45478894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr21	45482800	rs2838478	T	C	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.444;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=311;ReadPosRankSum=0.242;SC=TACATTGTTATGCTTATTTTA;SOR=1.949;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=50;TCF=36;TCR=14;TR=20;WE=45482808;WS=45482790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,21:0.38:56
chr21	45494183	rs2277805	G	A	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.549;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=207;ReadPosRankSum=-0.449;SC=CCCCTCACACGTTCGCATTTG;SOR=0.265;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=41;TCR=7;TR=19;WE=45494191;WS=45494173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,23:0.42:55
chr21	45496585	rs148758127	G	A	1908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=45;PP=1095;ReadPosRankSum=-0.386;SC=GGCCTGTTGAGTTGGGAAGGA;SOR=0.709;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=181;TCF=87;TCR=94;TR=85;WE=45496593;WS=45496575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,95:0.47:202
chr21	45499776	.	TA	T	31.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.074;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=2.64;ReadPosRankSum=0.984;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr21	45503121	rs2071152	G	A	1915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.133;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=42;PP=1131;ReadPosRankSum=1.515;SC=GGGTGCCCACGTGCTGAGGTG;SOR=0.610;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=170;TCF=86;TCR=84;TR=87;WE=45503129;WS=45503111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,93:0.51:184
chr21	45506819	rs1131999	T	C	1201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.380;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=40;PP=676;ReadPosRankSum=0.135;SC=AGAGCAGGGCTGTGGTCTACT;SOR=0.840;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=131;TCF=49;TCR=82;TR=61;WE=45506827;WS=45506809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,65:0.45:143
chr21	45509650	rs2277806	A	C	1097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=17;PP=706;ReadPosRankSum=-2.988;SC=TCTGGGCAGCAGTGGTGGTGG;SOR=0.709;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=53;TCR=30;TR=47;WE=45509658;WS=45509640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,51:0.57:89
chr21	45512094	rs3788104	G	A	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.067;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=106;ReadPosRankSum=-0.525;SC=CTGGATCGAGGCTTGCTCCTG;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=7;WE=45512102;WS=45512084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr21	45514141	rs11287102	TG	T	1558.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=18;PP=641;SC=TTTGGGAGGGTGGGGGTGAAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=18;WE=45514157;WS=45514131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr21	45514149	rs9941801	A	G	1596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=19;PP=552;SC=GGTGGGGGTGAAAAAATGAAA;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=9;TCR=19;TR=28;WE=45514157;WS=45514131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr21	45514168	rs4819371	C	T	538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=45;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=14;PP=378;SC=AAGATGGCATCATGTTCTTTA;SOR=2.419;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=18;WE=45514176;WS=45514158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr21	45514188	rs4818879	A	G	323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=65;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=269;SC=ATAATCTGAAAAACTGAATAG;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=45514196;WS=45514178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr21	45518131	rs2242950	A	T	542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.113;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=327;ReadPosRankSum=2.881;SC=ATAGGTGTCTATCCTCAGCTC;SOR=1.725;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=47;TCF=38;TCR=9;TR=22;WE=45518139;WS=45518121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,23:0.44:52
chr21	45522595	rs111964977	C	G	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.568;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=194;ReadPosRankSum=0.972;SC=TAACGACGGCCGTGACTCTCG;SOR=1.234;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=51;TCF=38;TCR=13;TR=18;WE=45522603;WS=45522585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,22:0.38:58
chr21	45527112	rs72257518	GCTC	G	836.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=5;NR=4;PP=406;SC=GGGCGACGCAGCTCCTCCTGC;SOR=2.093;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=9;WE=45527122;WS=45527102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr21	45527460	rs2850153	G	A	473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=15;PP=379;SC=CTGCGCGCCCGTGGCCTCGGG;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=45527468;WS=45527450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr21	45528919	rs2020945	G	A	2330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.987;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=54;PP=1550;ReadPosRankSum=-0.525;SC=TTTTACCTGCGATGGAAATTC;SOR=0.615;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=223;TCF=109;TCR=114;TR=105;WE=45528927;WS=45528909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,112:0.46:242
chr21	45534032	rs2243999	C	T	1823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.482;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=39;PP=1127;ReadPosRankSum=-0.868;SC=GGGGTAGCTGCGCGGTGGTGA;SOR=0.744;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=223;TCF=119;TCR=104;TR=85;WE=45534040;WS=45534022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,93:0.39:240
chr21	45538512	rs5844173	TG	T	169.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.689;NF=7;NR=0;PP=154;ReadPosRankSum=-2.018;SC=AGTGAATTGTTGGAGTCTGGT;SOR=0.752;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=7;WE=45538520;WS=45538502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr21	45538647	rs756553	T	C	3117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.940;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=64;PP=2002;ReadPosRankSum=0.871;SC=TCTGCAGCATTTCAGATCAGA;SOR=0.834;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=301;TCF=161;TCR=140;TR=145;WE=45538655;WS=45538637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,155:0.47:328
chr21	45538725	rs756554	C	A	2683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=63;PP=1679;ReadPosRankSum=0.702;SC=GTTTGTCCCCCGCCTGGGTGG;SOR=0.677;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=216;TCF=103;TCR=113;TR=120;WE=45538733;WS=45538715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,126:0.52:240
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chr21	45540919	rs2071143	A	G	3446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=430;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.523;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=82;PP=1927;ReadPosRankSum=0.936;SC=GGGACAAGACAGTGCGCCTAT;SOR=0.615;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=393;TCF=190;TCR=203;TR=166;WE=45540927;WS=45540909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:243,187:0.43:430
chr21	45544594	rs2187313	T	C	1683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.917;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=39;PP=1064;ReadPosRankSum=-1.996;SC=CAACCTGTCTTTGGACGCCAT;SOR=0.870;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=157;TCF=72;TCR=85;TR=70;WE=45544602;WS=45544584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,78:0.46:171
chr21	45547736	rs58898739	TA	T	107.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.362;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.94;MQRankSum=0.447;QD=9.81;ReadPosRankSum=0.253;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr21	45550460	rs11311220	TC	T	1134.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=9;PP=668;SC=GCATTGACCATCCCCTGTGTG;SOR=1.085;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=20;TCF=10;TCR=10;TR=17;WE=45550468;WS=45550450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr21	45553430	rs2187314	A	C	3765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=44;PP=2549;SC=CCCACCGGCGAACTCACTGGA;SOR=1.557;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=83;TCR=44;TR=127;WE=45553438;WS=45553420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr21	45553476	rs968713	A	C	3950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.860;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=100;NR=74;PP=2083;ReadPosRankSum=-0.104;SC=GGCTCCGCCCAGAAGGCTGCG;SOR=0.643;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=298;TCF=175;TCR=123;TR=174;WE=45553484;WS=45553466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,187:0.58:322
chr21	45553596	rs968714	T	C	3503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=348;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.390;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=80;PP=1972;ReadPosRankSum=-0.341;SC=GCTGTGAGGGTCCTGGTGGCC;SOR=0.718;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=307;TCF=134;TCR=173;TR=143;WE=45553604;WS=45553586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,169:0.49:347
chr21	45560331	rs2838492	C	G	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.246;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=188;ReadPosRankSum=1.169;SC=CTCACAGCTGCTTTTCTTGTT;SOR=1.609;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=11;WE=45560339;WS=45560321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr21	45560755	rs4819380	G	A	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.848;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=103;ReadPosRankSum=-1.120;SC=GCTCTTCAGCGTCTGCTGCCG;SOR=0.859;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=7;WE=45560763;WS=45560752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr21	45561039	rs1059813	T	C	4749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=498;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.521;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=109;NR=104;PP=2962;ReadPosRankSum=0.853;SC=TGTCTCCCCATCCACAGTCAC;SOR=0.697;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=440;TCF=225;TCR=215;TR=213;WE=45561047;WS=45561029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:254,240:0.49:494
chr21	45564575	rs2838496	G	C	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=358;ReadPosRankSum=-0.333;SC=CCAGGAGCGAGTTCTCCTCTT;SOR=1.143;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=17;WE=45564583;WS=45564565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr21	45565473	rs7676	C	T	1190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=26;PP=671;ReadPosRankSum=0.320;SC=AAATTGCAGCCCCTCAGCCCC;SOR=0.647;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=116;TCF=57;TCR=59;TR=53;WE=45565481;WS=45565461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,59:0.47:126
chr21	45642817	rs35694117	TA	T	170.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQRankSum=2.105;QD=1.52;ReadPosRankSum=1.634;SOR=0.774;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,21:0.19:112
chr21	45648992	rs7278940	T	C	8742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=145;NR=154;PP=2965;SC=CAGGCAGACGTCGGTTTTCTC;SOR=0.808;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=300;TCF=146;TCR=154;TR=299;WE=45649000;WS=45648982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,330:1.00:330
chr21	45649494	rs7278772	A	G	2254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=8.776;NF=31;NR=36;PP=1036;ReadPosRankSum=2.294;SC=GCCCGGACCCACTCCGGACAC;SOR=1.091;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=72;TCF=36;TCR=36;TR=67;WE=45649502;WS=45649484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,75:0.97:77
chr21	45649543	rs4818891	G	C	1214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.546;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.384;NF=9;NR=18;PP=420;ReadPosRankSum=0.514;SC=ACCCGCCCTGGACACCCCACG;SOR=1.146;SbPval=0.05;Source=Platypus;TC=57;TCF=32;TCR=25;TR=27;WE=45649551;WS=45649533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,37:0.57:65
chr21	45649666	rs4511811	G	A	4670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=58;PP=2899;SC=GGAGCGCGGGGGTCTAGCACT;SOR=1.151;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=154;TCF=96;TCR=58;TR=154;WE=45649674;WS=45649656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr21	45649778	rs4568033	A	G	7965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=146;NR=125;PP=2965;SC=AGGAAATGCCATGCGCACCAT;SOR=0.768;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=271;TCF=146;TCR=125;TR=271;WE=45649786;WS=45649768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,301:1.00:301
chr21	45649848	rs13052840	T	C	7788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=120;NR=130;PP=2965;SC=CTTTTGCCTTTTGAAAGTTTT;SOR=0.797;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=250;TCF=120;TCR=130;TR=250;WE=45649856;WS=45649838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr21	45650009	rs2236668	T	C	1893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=47;PP=1233;SC=GCAGCAGCGATGGGGGGTGTC;SOR=1.852;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=21;TCR=47;TR=68;WE=45650017;WS=45649999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr21	45651413	rs3746962	A	G	1240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=29;PP=836;SC=AAGTGTTGCAAGGAAGTATTT;SOR=2.531;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=9;TCR=29;TR=38;WE=45651421;WS=45651403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr21	45660835	rs2847224	C	A	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.009;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=5;PP=85;ReadPosRankSum=0.727;SC=GCGCTCCCGCCGCGCCCGAGG;SOR=0.399;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=5;TCR=8;TR=8;WE=45660843;WS=45660825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr21	45670770	rs7354779	T	C	614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.78;ReadPosRankSum=-1.850;SOR=0.512;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,33:0.47:70
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chr21	45708277	rs878081	C	T	4567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=445;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.521;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=103;PP=2857;ReadPosRankSum=0.653;SC=CCATGTCCTCCGGGGACGTCC;SOR=0.633;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=404;TCF=197;TCR=207;TR=207;WE=45708285;WS=45708267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:222,219:0.50:441
chr21	45709568	rs1055311	C	T	1894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.650;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=47;PP=1047;ReadPosRankSum=-1.300;SC=TCCAGGTTGGCGGGGAGTTCT;SOR=0.772;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=218;TCF=113;TCR=105;TR=91;WE=45709576;WS=45709558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,99:0.41:239
chr21	45710107	rs1003854	T	C	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=222;ReadPosRankSum=0.705;SC=AGACAGTATTTTTTTCCTGAT;SOR=0.507;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=15;WE=45710115;WS=45710097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr21	45712357	rs5844181	AC	A	256.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=0;NR=7;PP=228;SC=AGGCTGGGCCACCCCCTCCTG;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=7;WE=45712365;WS=45712347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr21	45712977	rs1800521	T	C	1195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.361;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=28;PP=785;ReadPosRankSum=-2.237;SC=ACCTGCCGGCTCCGCCTTCTG;SOR=0.809;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=121;TCF=64;TCR=57;TR=55;WE=45712985;WS=45712967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,60:0.44:137
chr21	45717550	rs1133779	T	C	1353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.140;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=31;PP=761;ReadPosRankSum=-0.518;SC=ACACCTTCGATGGCATCCTGC;SOR=0.916;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=114;TCF=58;TCR=56;TR=58;WE=45717558;WS=45717540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,68:0.49:139
chr21	45724055	rs8134520	G	A	1290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=27;PP=880;ReadPosRankSum=0.381;SC=CATTGTCTCCGGGCGTCAAAG;SOR=0.737;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=122;TCF=72;TCR=50;TR=63;WE=45724063;WS=45724045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,65:0.48:135
chr21	45725055	rs55730776	C	T	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.41;ReadPosRankSum=1.134;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,3:0.21:14
chr21	45725056	rs55828838	A	G	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.41;ReadPosRankSum=1.134;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,3:0.21:14
chr21	45725064	rs34642010	C	T	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.65;ReadPosRankSum=0.645;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,4:0.22:18
chr21	45725715	rs9975113	A	G	2162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.001;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=46;PP=1263;ReadPosRankSum=-0.829;SC=CCGCTGGGACAGACTGTTTCT;SOR=0.786;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=206;TCF=110;TCR=96;TR=99;WE=45725723;WS=45725705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,111:0.47:235
chr21	45725857	rs9977591	TC	CT	1262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.108;HP=3;HapScore=2;JOINED;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=18;PP=884;ReadPosRankSum=0.402;SC=GCAGTGCTGTTCCCTGGGTGG;SOR=0.929;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=15;TCR=35;TR=26;WE=45725866;WS=45725847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,33:0.54:61
chr21	45725910	rs67861360	C	T	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=195;ReadPosRankSum=1.151;SC=CATCTCATTGCGGAGGAAGGA;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=10;WE=45725918;WS=45725900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr21	45726504	rs55966702	A	G	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.35;ReadPosRankSum=-3.103;SOR=0.826;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,12:0.22:54
chr21	45726694	rs2070569	CC	GT	1476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=25;PP=1332;ReadPosRankSum=0.064;SC=GAGGCGCATGCCGAGGTGTGT;SOR=0.762;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=84;TCF=33;TCR=51;TR=38;WE=45726703;WS=45726684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,41:0.47:88
chr21	45726790	rs2070571	T	C	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=98;ReadPosRankSum=1.845;SC=GAGGGGGAGCTTGGGGCCAGG;SOR=1.051;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=6;WE=45726798;WS=45726780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
chr21	45732116	rs1057034	C	T	850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=25;PP=446;ReadPosRankSum=1.655;SC=ATGGCAGCCTCACAGGTGCCA;SOR=0.635;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=106;TCF=43;TCR=63;TR=41;WE=45732124;WS=45732106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,46:0.38:120
chr21	45733911	rs61750224	G	A	2404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.397;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=57;PP=1381;ReadPosRankSum=0.495;SC=TGAGGTGGGTGCCGTCCAGCC;SOR=0.697;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=278;TCF=142;TCR=136;TR=122;WE=45733919;WS=45733901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,127:0.43:295
chr21	45741555	rs190616527	A	C	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=228;ReadPosRankSum=-1.250;SC=CCTCCTGTGCAGGTTGGGGGT;SOR=0.709;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=43;TCF=30;TCR=13;TR=19;WE=45741563;WS=45741545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,21:0.47:45
chr21	45741854	rs4818904	T	C	1521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=36;PP=989;SC=AGGTGGAGGCTGAGACCTGGG;SOR=2.066;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=15;TCR=36;TR=51;WE=45741862;WS=45741844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr21	45742115	rs2277808	G	A	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=9;PP=253;ReadPosRankSum=1.925;SC=GTACCTGGGGGCAGGAGGGCC;SOR=0.743;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=31;TCF=15;TCR=16;TR=18;WE=45742123;WS=45742105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr21	45742822	rs11088947	T	C	1004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.481;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=14;PP=683;ReadPosRankSum=0.098;SC=TGCGTGTTCATGCGGATGTGT;SOR=1.452;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=73;TCF=46;TCR=27;TR=45;WE=45742830;WS=45742812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,44:0.61:72
chr21	45742946	rs144922406	ACGGACGAAAAAGCC	A	1556.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.411;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=2954;ReadPosRankSum=-0.189;SC=AGAGCTGCCCACGGACGAAAA;SOR=0.489;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=65;TCF=6;TCR=59;TR=18;WE=45742967;WS=45742936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,44:0.35:127
chr21	45743594	rs12482028	C	T	679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=6;PP=482;ReadPosRankSum=-1.021;SC=AGCCTGTCCCCGGCCCACCCT;SOR=0.892;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=52;TCF=41;TCR=11;TR=27;WE=45743602;WS=45743584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,29:0.54:54
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chr21	45755808	rs62220411	G	A	723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.010;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=22;PP=494;ReadPosRankSum=0.080;SC=TGAGGGGCACGGCCTTACTCA;SOR=0.275;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=57;TCF=17;TCR=40;TR=33;WE=45755816;WS=45755798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,34:0.56:61
chr21	45784271	rs2276252	G	A	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=93;ReadPosRankSum=-0.155;SC=GGCTGGCAAAGCTCCAGGGTG;SOR=1.179;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=8;WE=45784279;WS=45784261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr21	45789011	rs34543751	A	AG	2526.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=15;PP=1718;SC=CCTGGGTGTCAGGTGCCCCTC;SOR=2.115;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=44;TCF=27;TCR=17;TR=41;WE=45789019;WS=45789001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr21	45799164	rs2838556	T	C	624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-5.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.043;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=25;PP=432;ReadPosRankSum=0.879;SC=CCAGGACTCATGGACCGATGC;SOR=0.320;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=49;TCF=4;TCR=45;TR=28;WE=45799172;WS=45799154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,29:0.57:51
chr21	45811343	rs1556314	T	G	2224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=52;PP=1470;ReadPosRankSum=-0.040;SC=TGGTGGAGGATCCCGAGCGCC;SOR=0.694;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=163;TCF=74;TCR=89;TR=94;WE=45811351;WS=45811333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,99:0.56:176
chr21	45817620	rs1785436	T	C	1270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.611;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=30;PP=729;ReadPosRankSum=-1.641;SC=GTGGCTCCTCTGGTCCCCAGA;SOR=0.593;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=143;TCF=79;TCR=64;TR=64;WE=45817628;WS=45817610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,66:0.44:149
chr21	45821794	rs1785437	C	T	1045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=30;PP=685;ReadPosRankSum=1.403;SC=CAGCCCCACCCGCTTTTCCAC;SOR=0.614;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=86;TCF=25;TCR=61;TR=43;WE=45821802;WS=45821784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,47:0.48:97
chr21	45825975	rs1614122	G	A	805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.112;NF=10;NR=24;PP=499;ReadPosRankSum=-1.289;SC=GGTGGGCCTCGGGGAGGGCAG;SOR=0.760;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=82;TCF=26;TCR=56;TR=34;WE=45825983;WS=45825965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,38:0.44:87
chr21	45826434	rs1785454	C	T	610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.019;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=12;PP=330;ReadPosRankSum=1.202;SC=CAGTGAGCATCGGGGGCCAGG;SOR=0.523;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=51;TCF=32;TCR=19;TR=29;WE=45826442;WS=45826424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,31:0.53:58
chr21	45826462	rs1618355	C	A	604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.159;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=14;PP=329;ReadPosRankSum=2.890;SC=AGCCCACACACTCTCTGTCCT;SOR=0.374;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=72;TCF=46;TCR=26;TR=31;WE=45826470;WS=45826452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,33:0.42:78
chr21	45826744	rs1785439	A	G	95.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.97;ReadPosRankSum=-0.566;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr21	45833916	rs45498695	C	T	2344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-3.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=54;PP=1222;ReadPosRankSum=-1.600;SC=ACCTGCTCTTCACCAACATCC;SOR=0.723;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=215;TCF=95;TCR=120;TR=97;WE=45833924;WS=45833906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,114:0.47:240
chr21	45834025	rs915779	T	C	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.977;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=133;ReadPosRankSum=-2.821;SC=GCAGTGGCCATGCTGTCTCCA;SOR=0.257;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=13;WE=45834033;WS=45834015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr21	45837790	rs1785452	T	C	2821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.524;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=44;PP=1619;ReadPosRankSum=-0.463;SC=CTCGAGGTGTTGCTTTCTCCT;SOR=0.807;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=231;TCF=140;TCR=91;TR=122;WE=45837798;WS=45837780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,135:0.52:259
chr21	45843707	rs35058894	TGAG	T	418.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=3.736;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=276;ReadPosRankSum=1.888;SC=AGGAGGGCTCTGAGGAGTGAT;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=7;WE=45843717;WS=45843697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,11:0.85:13
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chr21	45844751	rs9978351	A	G	2334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=36;NR=45;PP=1471;SC=CAGACAGCCCAAGCCCTGCAC;SOR=1.030;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=36;TCR=45;TR=81;WE=45844759;WS=45844741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr21	45845807	rs762428	C	T	304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=7;PP=166;SC=ATCCTGGCTCCCAGCCACTGC;SOR=1.802;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=10;WE=45845815;WS=45845797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr21	45846823	rs8129542	T	A	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=144;ReadPosRankSum=-1.941;SC=GGGGGGGTGATCCCTCTGCCT;SOR=0.754;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=9;WE=45846831;WS=45846813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr21	45854925	rs41277556	G	A	581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=12;PP=404;ReadPosRankSum=0.428;SC=GGCTCCTGACGCCCGCTGTCC;SOR=0.616;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=49;TCF=31;TCR=18;TR=28;WE=45854933;WS=45854915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,28:0.51:55
chr21	45942111	rs233230	A	G	517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=16;PP=415;SC=ACCCACGAGGACAAGGCCAAC;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=45942119;WS=45942101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr21	45951460	rs75933048	G	GGT	469.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=100;ReadPosRankSum=-0.719;SC=ACATGAATTCGGGGGGGGCAC;SOR=1.022;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=6;WE=45951468;WS=45951450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr21	45959195	rs233316	G	A	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.121;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.783;NF=10;NR=12;PP=328;ReadPosRankSum=-2.530;SC=TCAGCAGGCCGGGCGGGAGCA;SOR=0.963;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=41;TCF=21;TCR=20;TR=22;WE=45959203;WS=45959185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,23:0.49:47
chr21	45959312	rs233317	C	T	896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.942;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-3.007;NF=22;NR=14;PP=481;ReadPosRankSum=-2.827;SC=GCAGGCGGGCCGGCATACAGG;SOR=0.224;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=60;TCF=41;TCR=19;TR=36;WE=45959320;WS=45959302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,42:0.61:69
chr21	45959386	rs233318	G	A	1126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-3.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.453;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-1.849;NF=29;NR=18;PP=572;ReadPosRankSum=0.063;SC=AAGCCGGCTGGCAGCTAGACT;SOR=0.420;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=102;TCF=67;TCR=35;TR=47;WE=45959394;WS=45959376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,56:0.47:119
chr21	45959556	.	A	ATG	3386.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-3.157;ClippingRankSum=0.000;DP=193;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=-0.724;QD=17.55;ReadPosRankSum=1.943;SOR=0.715;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,89:0.46:193
chr21	45959557	.	ATC	TGA	2897	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=17;MQ=59.85;NF=39;NR=31;PP=2897;QD=20;SC=ATGAAGAGGAATCCTCAGAGC;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=167;TCF=92;TCR=75;TR=70;WE=45959567;WS=45959547;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:97,70:0.42:167
chr21	45959557	.	ATC	A	3383.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.755;ClippingRankSum=0.000;DP=191;ExcessHet=3.0103;FS=0.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=-0.763;QD=17.72;ReadPosRankSum=2.340;SOR=0.722;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:105,86:0.45:191
chr21	45959918	rs233320	G	A	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.399;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=201;ReadPosRankSum=-1.320;SC=GCAGGGGGCCGGGGCGCAGCA;SOR=1.230;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=16;WE=45959926;WS=45959908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr21	45970483	rs233237	C	T	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=55.24;MQRankSum=-1.732;NF=3;NR=2;PP=52;ReadPosRankSum=0.303;SC=TCCTTCTGTGCTGAGCTGTGC;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=10;TCF=6;TCR=4;TR=5;WE=45970491;WS=45970473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr21	45970718	rs233238	C	T	1436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=63;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=24;PP=709;ReadPosRankSum=-0.394;SC=GCTGGCAGCACGGAGAGGAAG;SOR=0.685;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=129;TCF=78;TCR=51;TR=59;WE=45970726;WS=45970708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,71:0.48:149
chr21	45970759	rs67692969	ACTTGCAGCAGACAGG	A	2562.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.642;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=2.709;NF=8;NR=23;PP=2954;ReadPosRankSum=1.012;SC=CAGCAGATGGACTTGCAGCAG;SOR=0.475;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=99;TCF=33;TCR=66;TR=31;WE=45970781;WS=45970749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,70:0.42:167
chr21	45970993	rs233239	C	G	3256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-1.261;NF=36;NR=38;PP=1025;ReadPosRankSum=0.359;SC=CATGAAGAAGCCCCACAGCAG;SOR=0.734;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=169;TCF=84;TCR=85;TR=74;WE=45971001;WS=45970983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,91:0.46:197
chr21	45971018	rs478947	C	G	3234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FS=1.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQRankSum=-1.628;QD=16.26;ReadPosRankSum=2.383;SOR=0.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:114,85:0.43:199
chr21	45971023	rs478967	G	T	3197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FS=1.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQRankSum=-1.487;QD=16.32;ReadPosRankSum=2.400;SOR=0.601;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:113,83:0.42:196
chr21	45971299	rs233240	T	C	476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.093;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.457;NF=9;NR=8;PP=147;ReadPosRankSum=0.070;SC=TGCCAGGAGTTGGTGCAGGCG;SOR=0.495;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=38;TCF=23;TCR=15;TR=17;WE=45971307;WS=45971289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,24:0.49:49
chr21	45971380	rs6147532	A	AGTGAGTGAGTGT	291.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.808;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-2.112;NF=0;NR=5;PP=1051;ReadPosRankSum=0.706;SC=GAGGTGTGTGAGTGAGTGAGT;SOR=0.327;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=5;WE=45971388;WS=45971370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr21	45971426	.	C	T	49	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=60;MMLQ=28;MQ=58.84;NF=0;NR=3;PP=49;QD=27.9237375157;SC=TGTGTGTGAGCCTGTTGGCTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=3;WE=45971434;WS=45971416;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr21	45978499	rs377549	T	G	2004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.58;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr21	45978503	rs435424	G	A	2029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.19;SOR=1.514;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr21	46000398	rs2020221	C	T	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.909;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=208;ReadPosRankSum=-0.561;SC=GGGCAGTCGTCCACTCGCCAG;SOR=0.856;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=66;TCF=42;TCR=24;TR=23;WE=46000406;WS=46000388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,27:0.36:76
chr21	46011170	rs233302	T	C	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.327;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.077;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-0.169;NF=7;NR=4;PP=160;ReadPosRankSum=1.461;SC=GCCTGCCCCATCTTCTGAGGG;SOR=0.184;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=11;WE=46011178;WS=46011160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr21	46011298	rs113437209	G	A	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=3.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.76;MQRankSum=-3.207;QD=4.07;ReadPosRankSum=1.110;SOR=0.681;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,24:0.27:88
chr21	46011468	rs465279	G	A	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.918;NF=17;NR=13;PP=362;ReadPosRankSum=-1.154;SC=GAGGAGGAGGGTCTGCAGCAG;SOR=0.756;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=67;TCF=37;TCR=30;TR=30;WE=46011476;WS=46011458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,31:0.42:73
chr21	46012240	rs543542	A	G	323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.58;QD=24.91;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr21	46020473	rs113686885	C	CTCAT	3540.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=24;PP=2397;SC=GACTCACTCACTCACTCACTC;SOR=1.275;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=47;TCF=20;TCR=27;TR=42;WE=46020481;WS=46020463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr21	46020527	rs1211103	C	T	4131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=60;NR=58;PP=2066;SC=CCAGCATGGCCGCGTCCACTA;SOR=0.718;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=119;TCF=61;TCR=58;TR=118;WE=46020535;WS=46020517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr21	46020655	rs36208679	CCTGCTGCGCCCCCAG	C	96.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.087;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=6.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.28;MQRankSum=-0.571;QD=8.06;ReadPosRankSum=0.758;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr21	46021088	rs388827	C	T	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=15.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.04;MQRankSum=1.514;QD=23.29;ReadPosRankSum=0.186;SOR=2.067;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,17:0.85:20
chr21	46021179	rs363877	C	A	3407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=77;NR=37;PP=2230;SC=GTCTAGCTGCCAGCCGGCTTG;SOR=1.515;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=114;TCF=77;TCR=37;TR=114;WE=46021187;WS=46021169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr21	46021205	rs389167	C	T	4972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=105;NR=60;PP=2965;SC=CCTCCTCCCCCTGCCAGCAGG;SOR=1.312;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=165;TCF=105;TCR=60;TR=165;WE=46021213;WS=46021195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr21	46021370	rs437149	T	C	6932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=81;PP=2456;SC=GCTGTGTGCCTGTCTGCTCTG;SOR=1.034;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=153;TCF=72;TCR=81;TR=153;WE=46021378;WS=46021360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr21	46021390	rs446817	G	C	6096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=69;PP=2489;SC=GGGGCTTCCAGTTCATGCTGC;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=54;TCR=69;TR=123;WE=46021398;WS=46021380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr21	46021481	rs437334	T	C	3783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=33;PP=1576;SC=TCTGCCGCCCTGTGTGCAGGC;SOR=1.030;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=47;TCR=33;TR=80;WE=46021502;WS=46021471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr21	46021494	rs369720	A	G	3959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=36;PP=1818;SC=GTGCAGGCCCACCTGCTGCGT;SOR=1.029;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=88;TCF=52;TCR=36;TR=88;WE=46021502;WS=46021471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr21	46021607	rs370092	A	G	7352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=143;NR=118;PP=2965;SC=GCTCCCGCCCAGCCTGCTGTG;SOR=0.830;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=263;TCF=144;TCR=119;TR=261;WE=46021615;WS=46021597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,278:1.00:278
chr21	46021759	rs659638	A	G	978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=31;PP=835;SC=TGCAGTGGACATCAGTGGTCA;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=31;WE=46021767;WS=46021749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr21	46032094	rs411254	A	G	4645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=85;NR=66;PP=2364;SC=GACGTGGGCCATGTCAGCCGA;SOR=0.738;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=151;TCF=85;TCR=66;TR=151;WE=46032102;WS=46032084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr21	46047418	rs8126553	C	T	1682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.151;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.967;NF=41;NR=35;PP=1005;ReadPosRankSum=-0.091;SC=CTGTGTGCTGCGTGCCCGTCT;SOR=0.456;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=175;TCF=99;TCR=76;TR=76;WE=46047426;WS=46047408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,83:0.42:196
chr21	46047633	rs8127342	A	G	3068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.484;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=64;PP=2115;ReadPosRankSum=0.610;SC=CAGCAGTCCTACTGTGTGCCT;SOR=0.662;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=280;TCF=144;TCR=136;TR=135;WE=46047641;WS=46047623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,142:0.47:302
chr21	46047710	rs8131142	T	C	2829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.994;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.939;NF=55;NR=57;ReadPosRankSum=-0.455;SC=GGCTTCCTCTTTGTGCTGCCA;SOR=0.622;SbPval=0.5;Source=Platypus;TCF=102;TR=112;WE=46047718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,126:0.53:239
chr21	46047812	rs201392626	G	A	1585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.043;HP=5;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.750;NF=30;NR=39;PP=1022;ReadPosRankSum=1.707;SC=GTGCAGGCCCGCCTGCTGCGT;SOR=1.059;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=146;TCF=75;TCR=71;TR=69;WE=46047820;WS=46047802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,75:0.48:157
chr21	46047857	rs9980129	C	T	1756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-3.224;NF=42;NR=36;PP=932;ReadPosRankSum=-2.402;SC=CACCTCCTCCCGCCAGCCCAG;SOR=0.716;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=157;TCF=83;TCR=74;TR=78;WE=46047865;WS=46047847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,87:0.50:173
chr21	46047925	rs9979457	G	T	1886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.800;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=43;PP=1050;ReadPosRankSum=1.250;SC=GCTCCCGCCCGGCCTGCTACA;SOR=0.539;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=164;TCF=79;TCR=85;TR=85;WE=46047933;WS=46047915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,94:0.50:188
chr21	46047971	rs463217	T	C	1218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.406;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.951;NF=28;NR=29;PP=756;ReadPosRankSum=1.271;SC=CTGCTGACGGTCATGTCCCCC;SOR=0.408;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=106;TCF=49;TCR=57;TR=57;WE=46047979;WS=46047961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,62:0.52:120
chr21	46057393	rs2838602	T	A	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=13;PP=296;ReadPosRankSum=-0.679;SC=TGGCGGGTAGTCGACTGCCCA;SOR=0.611;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=60;TCF=30;TCR=30;TR=27;WE=46057401;WS=46057383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,30:0.45:66
chr21	46057548	rs4818947	A	C	972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=3.550;NF=24;NR=17;PP=701;ReadPosRankSum=-0.457;SC=CTCCTGCACAACCCCATGCTA;SOR=0.718;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=72;TCF=44;TCR=28;TR=41;WE=46057556;WS=46057538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,45:0.55:82
chr21	46057612	rs66931310	CCTGCTGTGTGCCTGT	C	2058.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.666;HP=2;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=4.526;NF=8;NR=21;PP=2296;ReadPosRankSum=0.461;SC=TGCCAGCAGGCCTGCTGTGTG;SOR=0.795;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=84;TCF=28;TCR=56;TR=29;WE=46057647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,57:0.45:126
chr21	46057806	rs4818950	G	A	1712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=41;ReadPosRankSum=0.960;SC=CGTCTGCTATGTGCCTGTGTG;SOR=0.737;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=163;TCF=73;TCR=90;TR=74;WE=46057814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,85:0.47:182
chr21	46057958	rs4818951	C	T	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.746;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.101;NF=7;NR=9;PP=145;ReadPosRankSum=0.340;SC=CCGTCCCCTCCTGCGGTGCCT;SOR=1.422;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=47;TCF=25;TCR=22;TR=16;WE=46057966;WS=46057948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,12:0.24:51
chr21	46066764	rs4818952	C	T	1902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.741;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=39;PP=1128;ReadPosRankSum=0.007;SC=TGCCGGCAGTCTAGCTGCCAG;SOR=0.713;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=151;TCF=78;TCR=73;TR=77;WE=46066772;WS=46066754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,85:0.52:164
chr21	46067180	rs462007	C	T	1270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.282;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=16;PP=773;ReadPosRankSum=-1.582;SC=CAGCTGCTGCCGCCCGGCCTC;SOR=1.141;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=130;TCF=83;TCR=47;TR=55;WE=46067188;WS=46067170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,59:0.42:140
chr21	46074104	rs2073437	T	C	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.158;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=3;PP=90;ReadPosRankSum=-0.784;SC=CAGTTTGCTGTGGGAGGATGT;SOR=0.252;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=7;WE=46074112;WS=46074094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr21	46074202	rs9984726	A	G	912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=14;PP=502;ReadPosRankSum=-0.489;SC=CTCAGCAGCCAGTGGGGGTGC;SOR=0.728;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=81;TCF=55;TCR=26;TR=41;WE=46074210;WS=46074192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,46:0.51:91
chr21	46077812	rs2838617	A	G	445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=9;PP=286;ReadPosRankSum=1.650;SC=CCCAGATGACAGGACCCAGGT;SOR=0.775;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=58;TCF=38;TCR=20;TR=25;WE=46077820;WS=46077802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,25:0.42:59
chr21	46077946	rs9306111	A	G	1906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=28;PP=1101;ReadPosRankSum=0.200;SC=TGCTGCATACACAGCCCCTGC;SOR=0.708;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=165;TCF=106;TCR=59;TR=82;WE=46077954;WS=46077936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,92:0.52:178
chr21	46078220	rs9306112	T	C	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=99;ReadPosRankSum=2.116;SC=GGTACACACCTGTATCCCTCC;SOR=0.602;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=8;WE=46078228;WS=46078210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr21	46086377	rs2838622	A	G	542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=2;PP=392;ReadPosRankSum=0.058;SC=CAGCAGGAAGAGATACTGTAG;SOR=0.843;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=43;TCF=39;TCR=4;TR=22;WE=46086385;WS=46086367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,25:0.53:47
chr21	46086718	rs7275281	GA	CG	4459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.640;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=69;PP=2944;ReadPosRankSum=-0.505;SC=TGCCTGGCAGGAGCTGGGCAC;SOR=0.843;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=221;TCF=78;TCR=143;TR=103;WE=46086727;WS=46086708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,118:0.49:242
chr21	46086757	rs7275298	GC	AT	2046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.556;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=39;PP=2016;ReadPosRankSum=0.045;SC=GGGGCTGGGCGCGCAGCAGGC;SOR=1.536;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=107;TCF=26;TCR=81;TR=46;WE=46086766;WS=46086747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,54:0.46:118
chr21	46191270	rs11569	C	T	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.298;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=7;PP=345;ReadPosRankSum=-0.913;SC=GCGGTGTGTGCGCGCCTGTGC;SOR=0.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=41;TCF=29;TCR=12;TR=24;WE=46191278;WS=46191260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,24:0.55:44
chr21	46207886	rs74778563	G	A	891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.655;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=16;PP=578;ReadPosRankSum=0.272;SC=GGGGCCTGTAGGGTGAGAAAA;SOR=0.721;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=84;TCF=45;TCR=39;TR=38;WE=46207894;WS=46207876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,43:0.44:97
chr21	46309430	rs377371046	G	A	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.985;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=389;ReadPosRankSum=0.821;SC=GGGGCAGCACGGCTAAGCTCC;SOR=2.189;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=19;WE=46309438;WS=46309420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
chr21	46314907	rs235330	T	A	7405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=130;NR=120;PP=2965;SC=TCTTAATGAGTTGGACCACAT;SOR=0.729;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=251;TCF=130;TCR=121;TR=250;WE=46314915;WS=46314897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,281:1.00:281
chr21	46354055	rs9974172	A	G	1234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=10;PP=852;SC=TTGGGCTGGCACCCAGGGCCT;SOR=2.352;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=34;TCR=10;TR=44;WE=46354063;WS=46354045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr21	46389017	rs12106383	C	A	2613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.38;SOR=1.125;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr21	46389189	rs12106389	C	T	319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=8;PP=193;SC=AGCGGCCGCCCGGAGTGGCGA;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=46389197;WS=46389179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr21	46393090	rs3827260	C	T	3806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=64;NR=69;PP=2039;SC=TGCTGACTCACGTGGCTTCTC;SOR=0.850;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=133;TCF=64;TCR=69;TR=133;WE=46393098;WS=46393080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr21	46396550	.	G	A	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.332;ClippingRankSum=0.000;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.050;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=202;ReadPosRankSum=-1.391;SC=GGGCTGAGGGGTCCGGGGGTT;SOR=1.042;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=61;TCF=38;TCR=23;TR=20;WE=46396558;WS=46396540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,27:0.39:70
chr21	46572572	rs420085	A	G	4035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=57;PP=2225;SC=CTTTTTCAGCATCATGGGGCG;SOR=0.788;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=131;TCF=74;TCR=57;TR=131;WE=46572580;WS=46572562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr21	46596639	rs71324410	A	G	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.073;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=221;ReadPosRankSum=-0.648;SC=ATGCTTCTAGACAGCATTTTA;SOR=0.105;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=17;WE=46596647;WS=46596629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr21	46602483	rs373179300	CT	C	189.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=6.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.41;ReadPosRankSum=0.026;SOR=0.128;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,15:0.35:43
chr21	46641968	rs1051367	G	A	10536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=408;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=183;NR=170;PP=2965;SC=AGATTACCAAGCCCAACGTGT;SOR=0.728;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=353;TCF=183;TCR=170;TR=353;WE=46641976;WS=46641958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,407:1.00:407
chr21	46685560	rs72316840	ATCACAGAGGTTCCAGAGTCAGGGAGAACTGGCG	A	718.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=7.848;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.42;ReadPosRankSum=-0.372;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,21:0.30:69
chr21	46685592	rs1006887	C	G	974.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.937;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=26;PP=2278;ReadPosRankSum=-1.751;SC=GGAGAACTGGCGTCACAGAGG;SOR=0.165;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=62;TCF=24;TCR=38;TR=44;WE=46685600;WS=46685550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,46:0.69:67
chr21	46698256	rs914215	T	C	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.259;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=75;ReadPosRankSum=0.931;SC=GGCAGGCTGCTGTCTGGCCTC;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=6;WE=46698264;WS=46698246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr21	46702506	rs2236449	C	T	850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.800;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=25;PP=515;ReadPosRankSum=1.293;SC=ACTTACTGATCGTGACTGCAG;SOR=0.250;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=58;TCF=10;TCR=48;TR=32;WE=46702514;WS=46702496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,37:0.58:64
chr21	46705345	rs2297284	G	A	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=13;PP=398;ReadPosRankSum=-0.845;SC=TAACTGAGGGGGCACAAAGCT;SOR=0.681;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=89;TCF=59;TCR=30;TR=35;WE=46705353;WS=46705335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,39:0.37:105
chr21	46705621	rs2297285	G	A	3402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=384;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.209;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=75;PP=2359;ReadPosRankSum=0.248;SC=ACTCGATGACGGGGATGTTTT;SOR=0.709;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=357;TCF=184;TCR=173;TR=157;WE=46705629;WS=46705611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:220,164:0.43:384
chr21	46825200	.	C	CGGCTGCGG	220.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.979;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.928;NF=0;NR=2;PP=251;ReadPosRankSum=1.653;SC=CGCCAAGATGCGGCTGCGGGG;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=2;WE=46825243;WS=46825190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr21	46825214	rs113272297	G	C	874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.03;QD=41.66;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr21	46825214	.	GCGGGGGTCGCGGGGCTCGGCC	CCGGGGGTCCCGGGGCTCGGCC,CCGGGGGTCCCGGGGGTCGGCT	663	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.38;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=24;MQ=61.94;NF=5,0;NR=7,2;PP=663,204;QD=59.7056562385;SC=TGCGGGGGTCGCGGGGGTCGC;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=14;TCF=7;TCR=7;TR=12,2;WE=46825243;WS=46825190;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.86:14
chr21	46825223	rs60499034	G	C	855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=53.49;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr21	46825229	.	C	G	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.92;ReadPosRankSum=-1.518;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,3:0.20:15
chr21	46825235	rs185357103	C	T	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.67;ReadPosRankSum=-1.890;SOR=1.002;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,3:0.19:16
chr21	46875564	rs914230	T	C	3578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=366;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.797;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=68;PP=1844;ReadPosRankSum=0.901;SC=ACACCAGCCATGCAGCTACCA;SOR=0.762;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=337;TCF=194;TCR=143;TR=166;WE=46875572;WS=46875554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,182:0.50:364
chr21	46917035	rs73370840	C	T	597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=2.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.54;ReadPosRankSum=0.766;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,32:0.46:70
chr21	46924425	rs149296338	CGGCCCCCCA	C	2075.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.75;MQRankSum=0.859;QD=27.31;ReadPosRankSum=0.605;SOR=0.807;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,72:0.95:76
chr21	46935077	rs11284347	TA	T	317.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.83;ReadPosRankSum=1.118;SOR=0.509;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,25:0.69:36
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chr21	46952094	rs914231	T	C	4153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=90;PP=2268;SC=CCCCACCAGGTGTTAGCAATG;SOR=1.310;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=148;TCF=58;TCR=90;TR=148;WE=46952102;WS=46952084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr21	46954343	rs2330184	T	C	3087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=26;PP=2056;SC=GGGCACAGGTTCTGCCCACAG;SOR=1.863;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=101;TCF=74;TCR=27;TR=100;WE=46954351;WS=46954333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr21	46957794	rs1051266	T	C	3553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=70;NR=51;PP=1761;SC=GCACACGAGGTGCCGCCAGGA;SOR=0.849;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=122;TCF=70;TCR=52;TR=121;WE=46957802;WS=46957784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr21	46957916	rs1131596	G	A	1097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=25;PP=762;SC=CGAAGGTGACGCTGTGCCTGG;SOR=1.730;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=12;TCR=25;TR=37;WE=46957924;WS=46957906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr21	46957982	rs13052294	G	A	410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=9;PP=296;SC=TCCCTACCCCGCAAAACGAGG;SOR=1.112;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=6;TCR=9;TR=15;WE=46957990;WS=46957972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr21	47320377	rs2075891	C	T	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=236;ReadPosRankSum=0.686;SC=CTGGTTTGCTCCTCCAGCACA;SOR=1.002;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=14;WE=47320385;WS=47320367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr21	47320425	rs7281638	T	C	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.027;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=9;PP=346;ReadPosRankSum=0.412;SC=TGGGCCAGGCTGCTCCCCACC;SOR=0.556;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=49;TCF=34;TCR=15;TR=28;WE=47320433;WS=47320415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,36:0.61:59
chr21	47320605	rs2075890	G	A	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.916;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=100;ReadPosRankSum=-2.054;SC=CCCAGGCTCTGCCCCTGCCGA;SOR=1.751;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=30;TCF=11;TCR=19;TR=9;WE=47320613;WS=47320595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr21	47320633	rs2075889	T	C	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.13;ReadPosRankSum=-0.666;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr21	47320805	rs1547240	G	A	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.814;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=240;ReadPosRankSum=0.568;SC=TTCCGTCAGCGGACAGAGGCA;SOR=0.307;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=15;WE=47320813;WS=47320795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr21	47329352	rs2277812	T	C	1567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.181;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=46;PP=891;ReadPosRankSum=1.042;SC=CCAGCCAGTGTGGGTCCCTGA;SOR=0.821;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=167;TCF=66;TCR=101;TR=73;WE=47329360;WS=47329342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,81:0.42:193
chr21	47350796	rs11089031	G	A	1003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.765;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=23;PP=524;ReadPosRankSum=1.890;SC=AACAGGCCAGGGCAGCAGAGC;SOR=0.573;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=39;TCR=45;TR=43;WE=47350804;WS=47350786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,50:0.51:99
chr21	47401760	rs7671	C	G	727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=9;PP=516;SC=CCGCAGGCCCCAGACATGAGG;SOR=1.460;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=19;TCR=9;TR=28;WE=47401768;WS=47401750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr21	47404397	rs3746993	A	G	6214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=129;PP=2965;SC=AGTGGCCCCCAGCCTCCTGCC;SOR=1.047;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=227;TCF=98;TCR=129;TR=226;WE=47404405;WS=47404387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr21	47406612	rs754507	C	A	840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=22;PP=552;SC=AGGCACCGGCCCCCCCCGGCA;SOR=2.376;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=29;WE=47406620;WS=47406602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr21	47407362	rs62215498	C	T	9057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=338;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=183;NR=127;PP=2965;SC=GTGTCCCAGCCGTATGTCCGT;SOR=1.057;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=310;TCF=183;TCR=127;TR=310;WE=47407370;WS=47407352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,337:1.00:337
chr21	47409113	rs8129814	C	T	1225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=34;PP=962;SC=GACTAGGCCTCGGAAACTTCC;SOR=3.003;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=8;TCR=34;TR=42;WE=47409121;WS=47409103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr21	47409503	rs2277814	A	G	1764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=15;PP=1311;ReadPosRankSum=1.342;SC=GTGTCTCACCATCTCCTCCTG;SOR=1.153;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=71;TCF=56;TCR=15;TR=69;WE=47409511;WS=47409493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,69:0.99:70
chr21	47410378	.	GAATGGGGC	G	2157.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;ClippingRankSum=0.000;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=8.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.08;MQRankSum=0.525;QD=39.23;SOR=1.309;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,53:0.96:55
chr21	47410380	.	ATGGGGCGAGATGGGGAGGGACGGAGTGGACGGCGTGAAGGTGACC	A	2659	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.51;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MMLQ=24;MQ=57.88;NF=1;NR=7;PP=2659;QD=20;SC=ACGAGGAGGAATGGGGCGAGA;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=8;WE=47410432;WS=47410369;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:14,8:0.36:22
chr21	47410388	.	AGATGGGGAGGGACGGAGTGGACGGCGTGAAGGTGACC	A	2087.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=0.000;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=18.940;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.91;MQRankSum=1.670;QD=28.21;ReadPosRankSum=1.310;SOR=1.410;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,51:0.69:74
chr21	47410626	rs1980981	T	G	2252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=28;PP=1298;SC=AGTCTGACAGTTGATTGGCCT;SOR=0.876;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=42;TCR=28;TR=70;WE=47410634;WS=47410616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr21	47412524	rs760439	G	A	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.006;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=3;PP=98;ReadPosRankSum=0.900;SC=CTCTGCAACCGTGGGGCATGC;SOR=0.446;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=7;WE=47412532;WS=47412515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr21	47412751	rs2850173	A	C	2906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=43;NR=53;PP=1725;SC=GGAGCTGGGAACCACCCCAGG;SOR=1.106;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=43;TCR=53;TR=96;WE=47412759;WS=47412741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr21	47412840	rs2075893	C	T	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.780;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=211;ReadPosRankSum=-0.025;SC=GGCCCCTCAACGTGGCCAGCC;SOR=0.235;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=15;WE=47412848;WS=47412830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr21	47417147	rs148786363	CCAGGCCCTTCGTG	C	76.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=0;PP=849;ReadPosRankSum=0.328;SC=ACACTTGTGCCCAGGCCCTTC;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=2;WE=47417167;WS=47417143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr21	47417206	rs11701583	A	G	1149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=7;PP=785;SC=CTCCCCCTGCACTGATGGGAC;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=33;TCR=7;TR=40;WE=47417214;WS=47417196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr21	47417303	rs2839077	T	C	2030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.015;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=48;PP=1025;ReadPosRankSum=-0.546;SC=GTGAGGCCTGTGGTCCAACGT;SOR=0.608;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=210;TCF=116;TCR=94;TR=102;WE=47417311;WS=47417293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,108:0.47:230
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chr21	47417432	rs3216137	A	AG	2311.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.895;HP=6;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.255;NF=4;NR=42;PP=1481;ReadPosRankSum=0.513;SC=CCGCCCACCCAGGGGGGCCTG;SOR=1.566;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=54;TCF=6;TCR=48;TR=46;WE=47417440;WS=47417422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,78:0.99:79
chr21	47417975	rs3737437	A	G	1430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=19;PP=898;SC=GGCCTGTGCCAGCCAGTGGGT;SOR=1.262;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=52;TCF=33;TCR=19;TR=51;WE=47417983;WS=47417965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr21	47418728	rs141212516	C	CT	4078.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=22;PP=2315;SC=CCTCTCTTATCTTTATTTTTT;SOR=1.749;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=74;TCF=41;TCR=33;TR=57;WE=47418736;WS=47418718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr21	47419520	rs75434097	G	A	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.396;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=12;PP=523;ReadPosRankSum=0.075;SC=AGCTCAGGAAGCACAGTGGGC;SOR=1.265;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=79;TCF=53;TCR=26;TR=41;WE=47419528;WS=47419510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,43:0.51:84
chr21	47419697	rs8131101	C	T	5423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=38;NR=59;PP=1748;SC=CTCCTGTAGACGCTGCTCACG;SOR=1.076;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=38;TCR=60;TR=97;WE=47419714;WS=47419687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr21	47419706	rs11464071	C	CG	5035.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=44;PP=1449;SC=ACGCTGCTCACGGGGGGGTGG;SOR=1.071;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=61;TCF=6;TCR=55;TR=49;WE=47419714;WS=47419687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr21	47419747	rs8131632	A	G	1857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=71;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=32;PP=906;SC=GCCAGGCCCTAGGGACCCGTG;SOR=1.656;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=11;TCR=32;TR=43;WE=47419755;WS=47419737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr21	47419770	rs73908116	G	A	1244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.40;QD=46.10;SOR=2.753;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr21	47419775	.	C	CGTGAAGATCATAGGGGGACGT	33.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.47;MQRankSum=-0.000;QD=6.75;ReadPosRankSum=1.036;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,2:0.40:5
chr21	47419780	rs8130255	G	A	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.63;MQRankSum=-0.000;QD=13.75;ReadPosRankSum=1.282;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr21	47419788	.	G	GA	35.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.67;MQRankSum=-0.000;QD=7.15;ReadPosRankSum=-1.282;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,2:0.40:5
chr21	47419794	rs8126900	T	C	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.77;QD=49.41;SOR=2.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr21	47419804	rs8131227	C	T	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.07;QD=46.68;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr21	47420565	rs142824931	AGGAGGGCGGCCGGGGAG	A	4713.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=33;PP=2967;SC=AGGCCGGGGAAGGAGGGCGGC;SOR=1.797;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=75;TCF=39;TCR=36;TR=71;WE=47420589;WS=47420555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr21	47420726	rs7276098	C	G	5657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=109;PP=2965;SC=TCCCGGGGGTCGGGGAGCGAG;SOR=1.195;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=189;TCF=79;TCR=110;TR=187;WE=47420734;WS=47420716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr21	47420761	rs7283989	G	A	4933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.17;SOR=1.843;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr21	47420769	rs7276782	A	G	4597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.52;SOR=2.101;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr21	47421315	rs11701124	C	T	5808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=117;PP=2965;SC=GGCCTCGCCCCGCCCGGCTTT;SOR=1.344;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=190;TCF=72;TCR=118;TR=189;WE=47421323;WS=47421305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr21	47421793	rs8132377	C	T	1867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.62;ReadPosRankSum=-0.858;SOR=0.946;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,49:0.46:106
chr21	47421797	rs8131313	G	A	1876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=1.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.18;ReadPosRankSum=0.093;SOR=0.901;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,51:0.44:116
chr21	47421864	rs8132521	C	T	2090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.484;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=49;PP=1242;ReadPosRankSum=1.244;SC=ACCCCGGTGCCGGTCCCACAG;SOR=0.632;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=217;TCF=116;TCR=101;TR=103;WE=47421872;WS=47421854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,107:0.47:228
chr21	47422412	rs35796750	C	T	9164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=164;NR=143;PP=2965;SC=GAGCAGGCTGCGCCACACCGA;SOR=0.791;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=308;TCF=165;TCR=143;TR=307;WE=47422420;WS=47422402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,340:1.00:340
chr21	47422639	rs2236485	A	G	2418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.57;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr21	47422639	.	ACCCGG	GCCCGA,GCCCGG	480	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000,0.5000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=9,23;NR=20,40;PP=480,346;QD=18.3954439608;SC=GCATGGGGCCACCCGGGCAGT;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=63;TCF=23;TCR=40;TR=29,63;WE=47422652;WS=47422629;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.46:63
chr21	47422644	rs2236486	G	A	1094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=3.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.66;ReadPosRankSum=0.462;SOR=1.193;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,34:0.55:62
chr21	47422679	rs2236487	G	A	780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.614;HP=5;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=275;ReadPosRankSum=1.235;SC=GCGCGGGGCCGCCCGGGCAGT;SOR=1.641;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=32;TCF=9;TCR=23;TR=18;WE=47422687;WS=47422669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr21	47422712	.	C	T	66	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=5;HapScore=2;MGOF=47;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=0;NR=5;PP=66;QD=20.1542425094;SC=TAGGTGCACGCGGGGCCGCCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=5;WE=47422720;WS=47422702;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr21	47423133	rs2236489	C	G	3151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=75;PP=2295;SC=TCTGAGAGGACGGGGCTCTGG;SOR=1.769;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=32;TCR=75;TR=107;WE=47423141;WS=47423123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr21	47423233	rs59769541	C	T	738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.626;HP=1;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=10;PP=535;ReadPosRankSum=0.139;SC=GGAGCTTAGACGCTCTCTGGC;SOR=0.893;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=41;TCF=24;TCR=17;TR=28;WE=47423241;WS=47423223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,30:0.67:45
chr21	47423509	rs13051496	C	T	1664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=32;PP=1105;ReadPosRankSum=-0.349;SC=GAGCGGGCGTCGCTGCAGTTC;SOR=0.671;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=169;TCF=99;TCR=70;TR=74;WE=47423517;WS=47423499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,81:0.43:188
chr21	47532544	rs1010688	C	T	1419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.652;HP=1;HapScore=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=29;PP=1633;ReadPosRankSum=0.277;SC=CACGGTGGGCCGTCCACCCAC;SOR=1.039;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=89;TCF=39;TCR=50;TR=50;WE=47532561;WS=47532534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,60:0.59:102
chr21	47532553	rs112472569	A	G	907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.079;HP=4;HapScore=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=17;PP=1601;ReadPosRankSum=-0.651;SC=CCGTCCACCCACTCCGGGCCT;SOR=0.650;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=77;TCF=38;TCR=39;TR=37;WE=47532561;WS=47532534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,39:0.44:88
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chr21	47540421	rs73159701	T	C	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=238;ReadPosRankSum=0.671;SC=TCCCTTCCCTTCCCACAGGGG;SOR=0.770;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=17;WE=47540429;WS=47540411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr21	47540573	rs743503	G	A	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=1.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.17;ReadPosRankSum=0.708;SOR=0.394;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
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chr21	47541302	rs1076850	A	G	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=163;ReadPosRankSum=-0.050;SC=GCCACAGGGAAAGGAGGAGCT;SOR=0.317;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=9;WE=47541310;WS=47541298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr21	47541553	rs1077182	A	G	882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.709;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=26;PP=557;ReadPosRankSum=1.029;SC=CTCCCCCAGCAGGACGTATTA;SOR=0.827;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=104;TCF=47;TCR=57;TR=45;WE=47541561;WS=47541543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,48:0.41:118
chr21	47541986	rs9976026	T	C	1387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.796;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=25;PP=935;ReadPosRankSum=1.022;SC=CACCCCGTCCTATGACCATGC;SOR=0.859;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=47;TCR=37;TR=56;WE=47541994;WS=47541976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,60:0.62:96
chr21	47542220	rs2070578	C	T	742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.896;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQ=59.95;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=19;PP=493;ReadPosRankSum=1.412;SC=GAGAAGGCTTCGGGTGACTCA;SOR=0.646;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=67;TCF=36;TCR=31;TR=36;WE=47542228;WS=47542210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,37:0.52:71
chr21	47542634	rs17272671	T	C	1253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.774;HP=3;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.353;NF=31;NR=17;PP=764;ReadPosRankSum=0.815;SC=TGGTCCCTTTTCAACCAAAGT;SOR=0.814;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=82;TCF=51;TCR=31;TR=48;WE=47542642;WS=47542624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,57:0.57:100
chr21	47542654	rs5844253	G	GC	3168.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=37;PP=1399;ReadPosRankSum=-1.210;SC=TTCAGGCTTTGCAAAAAAACC;SOR=1.131;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=76;TCF=35;TCR=41;TR=67;WE=47542663;WS=47542644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,118:0.98:120
chr21	47542779	rs17357592	C	T	2601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.012;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=52;PP=1382;ReadPosRankSum=2.310;SC=ACATGTGTTCCCTGTCACAGG;SOR=0.777;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=205;TCF=105;TCR=100;TR=103;WE=47542787;WS=47542769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,120:0.52:229
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chr21	47544451	rs36033678	GC	G	403.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=347;ReadPosRankSum=0.301;SC=GCACCTGTTAGCCCCCCCCCC;SOR=0.804;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=11;WE=47544462;WS=47544441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,11:0.85:13
chr21	47544454	rs369935000	C	T	412.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=179;ReadPosRankSum=0.301;SC=CCTGTTAGCCCCCCCCCCCGC;SOR=0.804;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=9;WE=47544462;WS=47544441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,11:0.85:13
chr21	47544541	rs3746995	C	G	995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=17;PP=554;ReadPosRankSum=0.861;SC=CCACTGAAGCCCACCTGTTCT;SOR=0.753;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=96;TCF=60;TCR=36;TR=47;WE=47544549;WS=47544531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,51:0.48:107
chr21	47545155	rs2839113	A	G	3839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=81;NR=49;PP=2128;SC=CGGGGGGACTACCCTGCCTGC;SOR=1.063;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=81;TCR=49;TR=130;WE=47545163;WS=47545145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr21	47545241	rs150275851	CG	C	2407.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=33;PP=1465;ReadPosRankSum=0.435;SC=GCACTGCCCACGGCAGGGTCG;SOR=0.657;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=96;TCF=19;TCR=77;TR=42;WE=47545249;WS=47545231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,80:0.43:188
chr21	47545369	rs149954350	A	AC	2878.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.440;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=44;PP=1399;ReadPosRankSum=0.350;SC=TGACCCTGCCACCCCCCCAGA;SOR=0.733;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=170;TCF=45;TCR=125;TR=63;WE=47545377;WS=47545356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,125:0.45:276
chr21	47545676	rs78764604	G	C	1686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=23;PP=1028;ReadPosRankSum=-0.067;SC=CTCTGGCAACGACCTCACGCG;SOR=0.690;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=123;TCF=78;TCR=45;TR=65;WE=47545684;WS=47545666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,74:0.55:135
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chr21	47545823	rs13052956	G	A	8185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=413;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.82;ReadPosRankSum=0.275;SOR=0.645;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:203,210:0.51:413
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chr21	47557118	rs78520472	G	A	1954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.688;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=45;PP=1230;ReadPosRankSum=1.081;SC=AGGCCCCCACGTGGGGTCCGG;SOR=0.556;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=202;TCF=109;TCR=93;TR=93;WE=47557126;WS=47557108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,96:0.45:211
chr21	47558552	rs61735841	G	A	3639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=59;PP=1970;SC=CTGTAGGGCCGCCGTGCGCCT;SOR=0.783;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=60;TCR=59;TR=119;WE=47558560;WS=47558542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr21	47558586	rs60525628	A	G	5291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.10;SOR=1.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
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chr21	47571383	rs34248722	C	CA	810.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=4;PP=661;SC=GTGCCCCATCCCCACCGACCT;SOR=2.200;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=16;WE=47571391;WS=47571373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr21	47575372	rs2277820	C	T	1335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.610;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=25;PP=666;ReadPosRankSum=2.254;SC=TGACCAGCTCCTCGGGCCTCA;SOR=0.615;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=132;TCF=75;TCR=57;TR=57;WE=47575380;WS=47575362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,68:0.46:148
chr21	47581219	rs10188	C	T	873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.835;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=10;PP=435;ReadPosRankSum=-1.613;SC=TCCGGGGGGACGCGCAGGAGG;SOR=0.951;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=71;TCF=48;TCR=23;TR=34;WE=47581227;WS=47581209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,42:0.51:83
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chr21	47581655	rs3827274	C	T	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=197;ReadPosRankSum=-0.766;SC=GTGGGGGGCTCGGGGCCCTCG;SOR=0.593;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=12;WE=47581663;WS=47581645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr21	47581835	rs113710653	C	T	2253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.790;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=33;PP=1244;ReadPosRankSum=-1.229;SC=CGCACCTGCTCGATCTTCTCG;SOR=0.870;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=169;TCF=103;TCR=66;TR=87;WE=47581843;WS=47581825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,104:0.54:194
chr21	47581949	rs113146399	C	T	2619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.252;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=65;PP=1562;ReadPosRankSum=-0.041;SC=ACCACGCGCGCGTCCTTCTCG;SOR=1.023;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=203;TCF=92;TCR=111;TR=111;WE=47581957;WS=47581939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,127:0.53:241
chr21	47582102	rs3747003	C	T	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.012;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=97;ReadPosRankSum=-0.711;SC=GCCGCCACCCCCCACTGTCTG;SOR=1.085;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=7;WE=47582110;WS=47582092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr21	47608580	rs2968	G	A	3757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=359;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.674;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=62;PP=2127;ReadPosRankSum=0.398;SC=AGTCCTCTTCGTGGAACAGGA;SOR=0.928;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=328;TCF=185;TCR=143;TR=159;WE=47608588;WS=47608570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:180,179:0.50:359
chr21	47609510	rs9717	T	C	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=272;ReadPosRankSum=3.369;SC=AGCCCTGGACTGCACACCAAG;SOR=0.544;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=18;WE=47609518;WS=47609500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,20:0.87:23
chr21	47609677	rs914247	A	G	1903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.388;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=38;PP=1201;ReadPosRankSum=0.121;SC=AAGAGCAGATAAGGAGGTATA;SOR=0.597;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=164;TCF=93;TCR=71;TR=83;WE=47609685;WS=47609667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,91:0.50:182
chr21	47612466	rs2187120	A	G	2419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FS=2.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQRankSum=-1.665;QD=15.31;ReadPosRankSum=1.318;SOR=0.890;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,64:0.41:158
chr21	47612471	rs2187121	T	C	2525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=0.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQRankSum=-2.641;QD=15.22;ReadPosRankSum=1.267;SOR=0.754;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,66:0.40:166
chr21	47612512	rs146297977	C	CTG	2525.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.910;NF=14;NR=30;PP=1738;ReadPosRankSum=-0.298;SC=GTACGTATGTCTGTGTGGCAC;SOR=0.707;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=127;TCF=35;TCR=92;TR=44;WE=47612520;WS=47612502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,69:0.34:200
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chr21	47616071	rs7282841	G	C	1041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=2.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.43;ReadPosRankSum=-1.879;SOR=0.310;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,26:0.51:51
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chr21	47633789	rs9974665	C	G	2963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.043;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=78;PP=1976;ReadPosRankSum=0.657;SC=CGCTCCAGACCCACAGCAGCC;SOR=0.924;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=252;TCF=109;TCR=143;TR=130;WE=47633797;WS=47633779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,139:0.51:271
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chr21	47635627	rs9980968	C	G	1950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.163;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=33;PP=1235;ReadPosRankSum=0.467;SC=GCCAGCTGTGCGGCGTGTACA;SOR=0.594;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=161;TCF=94;TCR=67;TR=79;WE=47635635;WS=47635617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,88:0.49:179
chr21	47635713	rs11701729	G	A	5875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=101;NR=105;PP=2965;SC=AGCTCCTGGTGGGGGCAGTGT;SOR=0.826;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=207;TCF=102;TCR=105;TR=206;WE=47635721;WS=47635703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr21	47635856	rs2839153	C	G	566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=17;PP=467;SC=GACCCCGAGGCCACATGAAGG;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=47635864;WS=47635846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr21	47639492	rs2277826	C	G	2110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=58;PP=1345;ReadPosRankSum=0.903;SC=ACCACCTGAGCGGGGAGAGAA;SOR=0.730;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=197;TCF=71;TCR=126;TR=88;WE=47639512;WS=47639482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,101:0.45:222
chr21	47641700	rs2839157	G	T	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.315;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=221;ReadPosRankSum=1.148;SC=TTTCTGTATCGCGTTTGTGAG;SOR=3.334;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=11;WE=47641708;WS=47641690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr21	47641996	rs2280959	C	G	897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.905;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=23;PP=590;ReadPosRankSum=0.714;SC=TGCTAAAATGCCTTAACCTGA;SOR=0.231;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=67;TCF=22;TCR=45;TR=38;WE=47642004;WS=47641986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,41:0.58:71
chr21	47642016	rs2280958	C	T	642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.433;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=20;PP=501;ReadPosRankSum=0.278;SC=ACATAACATGCCAACACAGGA;SOR=0.446;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=42;TCF=10;TCR=32;TR=27;WE=47642024;WS=47642006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,27:0.63:43
chr21	47642397	rs2280955	C	T	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=37;ReadPosRankSum=-1.202;SC=GCCCACTCCCCGCCTGCTAGT;SOR=0.512;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=5;WE=47642405;WS=47642387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr21	47647618	rs10550493	GAA	G	1575.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=1.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.37;MQRankSum=1.430;QD=18.32;ReadPosRankSum=-0.260;SOR=0.523;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,57:0.66:86
chr21	47648729	.	CCCCGCCCCT	C	1404	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=1404;QD=353.75;SC=TGCCGCCCAGCCCCGCCCCTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=4;WE=47648745;WS=47648719;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:13,4:0.24:17
chr21	47656712	rs2839166	T	C	1165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.712;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=21;PP=765;ReadPosRankSum=0.418;SC=TTAATTCTTATGTAAATGCCA;SOR=0.616;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=103;TCF=69;TCR=34;TR=55;WE=47656720;WS=47656702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,56:0.49:115
chr21	47662920	rs60691594	C	A	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.373;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQRankSum=-1.097;QD=3.80;ReadPosRankSum=2.253;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr21	47665116	rs150712767	GAAGA	G	2744.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.993;NF=5;NR=36;PP=1797;ReadPosRankSum=-0.613;SC=CAAAACCTGAGAAGAAAGAAG;SOR=0.743;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=9;TCR=65;TR=41;WE=47665127;WS=47665106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,72:0.57:127
chr21	47669648	rs2330353	T	A	1540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.688;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=41;PP=981;ReadPosRankSum=-0.470;SC=GCACCTGGCCTGTGCCAGGCA;SOR=0.592;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=117;TCF=41;TCR=76;TR=64;WE=47669656;WS=47669638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,69:0.53:131
chr21	47671690	rs2839984	A	G	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=217;ReadPosRankSum=-0.666;SC=AGAAGAAAGAAAAATATCACA;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=11;WE=47671698;WS=47671680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr21	47674275	rs2250213	G	A	1191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=21;PP=679;ReadPosRankSum=-1.515;SC=TCCACCTCTTGGAAACCCCAC;SOR=0.744;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=144;TCF=87;TCR=57;TR=58;WE=47674283;WS=47674265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,65:0.42:156
chr21	47676711	rs2839173	G	A	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.467;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=134;ReadPosRankSum=-0.787;SC=ACCTGGTGCAGGAGATGCCCA;SOR=0.231;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=14;WE=47676719;WS=47676701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr21	47676934	rs2839174	T	C	1027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.333;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=27;PP=682;ReadPosRankSum=-0.007;SC=CACAGAGTGTTTTCAGGGTCT;SOR=0.920;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=111;TCF=52;TCR=59;TR=48;WE=47676942;WS=47676924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,51:0.42:122
chr21	47678774	rs2839178	A	G	3994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=46;PP=2707;SC=TACAGAAACTAATAGCTCATA;SOR=1.464;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=88;TCR=46;TR=134;WE=47678788;WS=47678764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr21	47681127	rs2839180	T	C	434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=13;NR=1;PP=353;SC=GCATCGTGGCTAGGGTCAGTT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=47681135;WS=47681117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr21	47685787	rs9637172	T	C	4438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=56;PP=2750;SC=TGGGAGGCGTTCTGGTGGGAA;SOR=1.063;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=90;TCR=57;TR=145;WE=47685795;WS=47685777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr21	47685939	rs2839181	A	G	5736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=84;PP=2965;SC=ACACAGGGGTATGACGAGGGA;SOR=0.713;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=181;TCF=97;TCR=84;TR=181;WE=47685947;WS=47685929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr21	47686152	rs2839182	C	T	1358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=27;PP=723;SC=AGTGCCCTGCCGAGTACTGCA;SOR=2.368;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=35;WE=47686160;WS=47686142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr21	47686174	rs4818831	T	C	941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=19;PP=427;SC=GCCCCTTGGGTGTCACCACAG;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=22;WE=47686182;WS=47686164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr21	47692798	rs2839188	C	T	815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=25;PP=676;SC=AAGAGGCAACCGTGAGAAGGA;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=47692806;WS=47692788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr21	47695395	rs2839191	C	G	949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=25;PP=752;SC=GAGCCTCAGACAAAGAGGACT;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=47695403;WS=47695385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr21	47703455	.	CA	C	121.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.944;ClippingRankSum=0.000;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=4.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.06;ReadPosRankSum=0.772;SOR=1.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,17:0.29:59
chr21	47705237	rs17176131	T	C	3570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=81;PP=2034;SC=TTAAGTATTATGTGTACAAAA;SOR=1.525;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=129;TCF=48;TCR=81;TR=129;WE=47705245;WS=47705227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr21	47707039	rs71318058	T	TAA,TAAAAA	633.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;QD=39.61;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,5,11:0.31,0.69:16
chr21	47707050	rs61182475	T	A	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.24;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr21	47707054	rs13049893	C	T	679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.32;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr21	47711229	rs2276257	A	G	2505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=13;PP=1784;SC=CTCTAAGTCTACATTTCCTCA;SOR=2.584;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=56;TCR=13;TR=69;WE=47711237;WS=47711219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr21	47716230	rs1888539	T	C	1045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=30;PP=879;SC=ACCCTCCATCTTGACCGCCCC;SOR=6.994;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=32;WE=47716238;WS=47716220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr21	47717350	rs2839206	C	G	251.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=0;PP=207;SC=GGGCGGCCGGCTTCCCCCAAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=47717358;WS=47717349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr21	47717616	rs8651	G	A	5895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=97;NR=100;PP=2965;SC=GGTCGCACACGAATAAATAAC;SOR=0.886;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=197;TCF=97;TCR=100;TR=197;WE=47717624;WS=47717606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr21	47717686	rs2839207	G	A	2507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=32;NR=47;PP=1296;SC=GGTATTTTTCGTTATTGTAAA;SOR=1.420;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=32;TCR=47;TR=79;WE=47717694;WS=47717676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr21	47721985	rs112899928	A	ATGG	1522.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=0.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.771;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=762;ReadPosRankSum=-0.335;SC=GCCACACAGCATGGTGGTGGT;SOR=0.380;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=16;WE=47721993;WS=47721975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,39:0.87:45
chr21	47722391	rs1556337	A	G	1862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=11;PP=1021;SC=GCTGGGGGCTAAGCCTACCTG;SOR=1.721;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=41;TCR=11;TR=52;WE=47722399;WS=47722381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr21	47722578	rs1974171	G	C	2170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=39;PP=1103;SC=CCAGAGAACAGGTGTGTCTGT;SOR=1.139;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=33;TCR=39;TR=72;WE=47722586;WS=47722568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr21	47734659	rs13047478	G	A	1638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=36;NR=16;PP=905;SC=GGCGGGTCTGGGGCCAGCGGG;SOR=1.160;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=36;TCR=16;TR=52;WE=47734667;WS=47734649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr21	47744037	rs3842460	CG	C	1931.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=13;PP=1119;SC=ACAGTTGTCGCGGGGGGAGGG;SOR=2.019;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=45;TCF=29;TCR=16;TR=36;WE=47744045;WS=47744027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr21	47754510	.	A	G	240	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=24;MQ=53.03;NF=14;NR=5;PP=240;QD=14.4616427656;SC=CCAGAACAGCATGGGATGTTC;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=64;TCF=43;TCR=21;TR=19;WE=47754518;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:45,19:0.30:64
chr21	47777063	rs2839223	G	A	3349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=49;PP=1920;SC=AATTTGTATGGGAAGTTGCAG;SOR=0.760;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=59;TCR=49;TR=108;WE=47777071;WS=47777053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr21	47777222	rs2839224	A	G	516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=15;PP=389;SC=AGTGCTGTACATGGCACATTT;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=47777230;WS=47777212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr21	47783796	rs8131546	T	C	2516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=41;NR=46;PP=1201;SC=GGGAGCTTGCTGCGCTCCACG;SOR=1.007;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=41;TCR=46;TR=87;WE=47783804;WS=47783786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr21	47786449	rs9637173	T	A	4548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=50;PP=2797;SC=GCAAGGGTCATTGCTTCCTGA;SOR=1.497;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=152;TCF=102;TCR=50;TR=152;WE=47786457;WS=47786439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr21	47786494	rs2839226	C	T	7633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=160;NR=98;PP=2965;SC=ACTTTGTTGCCGCAGGTTTTT;SOR=1.158;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=258;TCF=160;TCR=98;TR=258;WE=47786502;WS=47786484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,278:1.00:278
chr21	47786817	rs2839228	C	G	3741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=50;PP=2464;SC=CCTGTTACCTCTCTGAATTTC;SOR=0.912;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=120;TCF=70;TCR=50;TR=120;WE=47786825;WS=47786807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr21	47787002	rs6518289	T	C	4243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=90;PP=2358;SC=CGAACCGAAGTGAGCACAGAG;SOR=1.493;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=54;TCR=90;TR=144;WE=47787010;WS=47786992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr21	47852151	rs5844270	A	AG	518.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=10;PP=505;SC=CTGCCGGCGGACGTCCACACC;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=12;WE=47852159;WS=47852141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr21	47858272	rs2051190	T	C	732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=15;PP=449;SC=TGCTTAACTCTTACCTGCCTC;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=47858280;WS=47858262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr21	47860217	rs2073377	C	T	1605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=40;PP=1095;SC=TCTCGTCTGCCGGGTGTAGCA;SOR=2.262;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=13;TCR=40;TR=53;WE=47860225;WS=47860207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr21	47862624	rs2839262	A	G	2511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=52;PP=1627;SC=ATTCCGTCAGAGCAGTCGTCC;SOR=1.389;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=30;TCR=52;TR=82;WE=47862632;WS=47862614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr21	47864560	rs143709505	CTTT	C	216.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.65;MQRankSum=0.319;QD=27.09;ReadPosRankSum=-0.157;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
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chr21	47931245	rs1029262	A	G	1884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=14;PP=1250;SC=TTAAAAAACAATATTATAAAC;SOR=2.093;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=45;TCR=14;TR=59;WE=47931253;WS=47931235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr21	47953725	rs3747010	G	A	415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=11;PP=347;SC=TTCATGTCTCGACCTGTACTG;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=47953733;WS=47953715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr21	47958657	rs2839313	C	T	2075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=47;PP=1308;SC=TTCTATGACACGGAACATCTT;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=23;TCR=47;TR=70;WE=47958665;WS=47958647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr21	47961634	rs2070434	T	C	2531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=22;PP=1517;SC=TTCATCCCCCTCGTCAGTTAA;SOR=1.531;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=77;TCF=55;TCR=22;TR=76;WE=47961642;WS=47961624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr21	47970581	rs2255397	G	A	2448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.704;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=44;PP=1312;ReadPosRankSum=0.414;SC=TGGAAGGGACGCTGCACCCGT;SOR=0.573;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=182;TCF=103;TCR=79;TR=100;WE=47970589;WS=47970571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,115:0.56:207
chr21	47971539	rs2255526	G	A	3509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=68;NR=50;PP=1967;SC=GAGTTCCCCCGTTTCTAGAGG;SOR=0.854;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=68;TCR=50;TR=118;WE=47971547;WS=47971529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr21	47974582	rs1107065	A	G	1525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FS=2.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.29;ReadPosRankSum=0.521;SOR=0.516;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,80:0.43:184
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chr21	47978321	rs34920477	G	GC	6064.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=30;NR=52;PP=2966;SC=GGTGCCTGGGGCTGCGGTTCT;SOR=0.756;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=33;TCR=55;TR=82;WE=47978329;WS=47978311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr21	47980570	rs2070429	A	G	4256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=52;PP=2594;SC=ATGCAGCTGTACCTGTAGAAA;SOR=1.157;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=87;TCR=52;TR=139;WE=47980578;WS=47980560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr21	47980760	rs2839324	T	G	1892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.266;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=45;PP=1063;ReadPosRankSum=0.085;SC=AAACCAGGTCTGCACTGACTA;SOR=0.561;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=150;TCF=62;TCR=88;TR=80;WE=47980768;WS=47980750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,90:0.55:164
chr21	47983657	rs762253	G	A	2250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=57;NR=16;PP=1387;SC=GACCTGACATGAGCACATCAG;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=57;TCR=16;TR=73;WE=47983665;WS=47983647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
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chr21	47987167	rs2839337	T	C	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=137;ReadPosRankSum=-1.162;SC=TGGCCTTAAATAGCTGTGTGA;SOR=0.392;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=8;WE=47987175;WS=47987157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr21	48022230	rs1051169	C	G	2659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.585;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=50;PP=1735;ReadPosRankSum=1.599;SC=TGAGCTCCTTCAGTTCGGATT;SOR=0.803;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=216;TCF=120;TCR=96;TR=115;WE=48022238;WS=48022220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,122:0.53:231
chr21	48022375	rs2186358	C	A	1009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.760;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=32;PP=685;ReadPosRankSum=0.269;SC=ATACCTCATCCTAAAACATTT;SOR=1.407;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=106;TCF=39;TCR=67;TR=45;WE=48022383;WS=48022365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,48:0.42:115
chr21	48063476	rs10854485	C	G	561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=12;PP=401;ReadPosRankSum=0.036;SC=GCAGTGAGGCCGGTCTCCTGC;SOR=0.760;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=51;TCF=27;TCR=24;TR=26;WE=48063484;WS=48063466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,28:0.51:55
chr21	48069930	rs2839373	T	C	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.884;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=62;ReadPosRankSum=0.674;SC=TCTGTAAAAATCCTGTGCCTA;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=4;WE=48069938;WS=48069920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr21	48072916	rs2839376	G	A	644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.695;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=23;PP=486;ReadPosRankSum=0.016;SC=GATCTCCATTGCACATTTGGT;SOR=0.169;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=39;TCF=3;TCR=36;TR=26;WE=48072924;WS=48072906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,26:0.67:39
chr21	48081912	.	G	A	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=2.225;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr21	48083526	rs77930122	T	C	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=216;ReadPosRankSum=0.189;SC=GAGACAGGCCTGGGTGGTGGT;SOR=0.946;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=16;WE=48083534;WS=48083516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr22	16157603	rs370790235	G	C	71.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.24;QD=17.76;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr22	16157622	rs374192809	G	C	71.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.24;QD=17.76;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr22	16157827	.	C	G	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.84;MQRankSum=1.415;QD=4.08;ReadPosRankSum=-2.260;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr22	16157883	rs368849066	T	C	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.54;MQRankSum=-3.351;QD=2.08;ReadPosRankSum=1.373;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,5:0.24:21
chr22	17054276	.	A	T	814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.219;ClippingRankSum=0.000;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.283;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.074;NF=28;NR=12;PP=429;ReadPosRankSum=-0.442;SC=TCGGCCATGCAGAAACTGAAC;SOR=0.991;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=134;TCF=83;TCR=51;TR=40;WE=17054284;WS=17054266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,44:0.30:146
chr22	17055458	rs35893428	G	A	1266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.536;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.054;NF=33;NR=28;PP=788;ReadPosRankSum=-0.263;SC=TAGGCAAGTCGAGGCAATGGA;SOR=0.626;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=181;TCF=92;TCR=89;TR=61;WE=17055466;WS=17055448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,70:0.33:211
chr22	17055569	rs3729688	T	G	1092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-1.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.837;NF=14;NR=24;PP=550;ReadPosRankSum=-1.428;SC=TTCACTGCAGTGGGGCAGAGT;SOR=0.664;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=58;TCF=20;TCR=38;TR=38;WE=17055577;WS=17055559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,48:0.69:70
chr22	17063359	rs2006108	A	G	2076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=15;PP=1396;SC=TGGCAGGGAAAGGTTGCTGTC;SOR=2.517;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=49;TCR=15;TR=64;WE=17063367;WS=17063349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr22	17072483	rs2236639	A	G	7756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=160;NR=138;PP=2965;SC=ATCTCCATCCAAGACCTAGCT;SOR=0.823;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=298;TCF=160;TCR=138;TR=298;WE=17072491;WS=17072473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,292:1.00:292
chr22	17073066	rs5747988	A	G	5040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=66;PP=2856;SC=GAGGCAGGCCAGCCTTCAGCA;SOR=1.064;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=172;TCF=106;TCR=66;TR=172;WE=17073074;WS=17073056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr22	17156061	rs8142573	A	G	1373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.906;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.306;NF=37;NR=22;PP=885;ReadPosRankSum=-0.134;SC=TTTCTTTTAAAAGAGTGCATT;SOR=0.515;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=88;TCF=57;TCR=31;TR=59;WE=17156069;WS=17156051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,62:0.70:89
chr22	17325892	rs74846257	CA	C	1166.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=19;PP=849;SC=CCCTCATCCCCATATCAGCTG;SOR=2.019;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=17325900;WS=17325882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr22	17327068	rs165588	A	G	565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=15;PP=393;SC=CCGGGCACTGACCAAGCTCCC;SOR=2.948;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=17327076;WS=17327058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr22	17445502	rs5748765	A	C	480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=346;SC=TGCCTGATACACCTGTGCTCA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=17445510;WS=17445493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr22	17446991	rs4819925	C	T	1527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=10;PP=1061;SC=AAGACTTACCCTTCTGGTTAG;SOR=2.540;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=47;TCF=37;TCR=10;TR=46;WE=17446999;WS=17446981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr22	17449076	rs5748768	C	G	1705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=10;PP=1134;SC=ACCTAGGCAGCCTCCTAGGAG;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=42;TCR=10;TR=52;WE=17449084;WS=17449066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr22	17449115	rs5748769	G	C	1878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=27;PP=1234;ReadPosRankSum=-0.474;SC=TGGGGGATGTGCTTTTAGTTC;SOR=0.687;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=113;TCF=75;TCR=38;TR=77;WE=17449123;WS=17449105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,83:0.64:129
chr22	17469026	rs5992604	G	A	996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.888;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-1.282;NF=24;NR=21;PP=536;ReadPosRankSum=-1.183;SC=AGCAGAGGCCGTGACTGGCTG;SOR=0.569;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=38;TCR=33;TR=45;WE=17469034;WS=17469016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,48:0.63:76
chr22	17469049	rs28502153	C	A	801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.032;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.063;NF=16;NR=20;PP=534;ReadPosRankSum=-0.030;SC=GAAATGTTTCCCAGGAAGCCT;SOR=0.940;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=64;TCF=31;TCR=33;TR=36;WE=17469057;WS=17469039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,37:0.54:68
chr22	17488727	rs5748800	A	C	98.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=0;PP=37;SC=AGTCGCCTCCACCCGCAGCTC;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=17488735;WS=17488723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr22	17488823	rs11378060	C	CG	2248.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=14;PP=498;SC=CCCCACTGCCCCACTCACAAA;SOR=1.071;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=9;TCR=14;TR=23;WE=17488831;WS=17488813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr22	17565888	rs13053694	C	A	1370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.531;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=28;PP=820;ReadPosRankSum=1.337;SC=CAAAGTGGAGCCGACTCGAAC;SOR=0.650;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=182;TCF=109;TCR=73;TR=66;WE=17565896;WS=17565878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,74:0.35:209
chr22	17565932	rs917864	T	C	7059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=121;NR=110;PP=2965;SC=AGAACGTTCGTTCGCTGCGTC;SOR=0.701;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=232;TCF=122;TCR=110;TR=231;WE=17565940;WS=17565922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,263:1.00:263
chr22	17565974	rs917865	G	C	5262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=92;PP=2965;SC=CGCGACGCCAGCCGGGCCATG;SOR=0.919;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=175;TCF=83;TCR=92;TR=175;WE=17565991;WS=17565964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr22	17566206	rs2270241	G	T	155.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=6;PP=118;SC=GGGACTACGCGCCCGGGCTGG;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=17566214;WS=17566196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr22	17566229	rs2270242	T	A	119.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=3;PP=77;SC=AGGCAGGAAGTCCGCGCCGCG;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=5;WE=17566237;WS=17566219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr22	17582776	rs17807076	C	T	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=40;ReadPosRankSum=1.192;SC=GGGCCACCTGCGGACAGGCTC;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=5;WE=17582784;WS=17582766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,4:0.20:20
chr22	17586471	rs2241046	C	T	1065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.280;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=27;PP=603;ReadPosRankSum=1.910;SC=TTCCTCTGTTCTCATTGCAGA;SOR=0.552;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=68;TCR=73;TR=53;WE=17586479;WS=17586461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,60:0.36:165
chr22	17586583	rs2241047	C	G	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=134;ReadPosRankSum=0.997;SC=GCCAGGCAGACAAGGCTGAAC;SOR=0.518;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=10;WE=17586591;WS=17586573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,10:0.31:32
chr22	17586609	rs144979983	GT	G	208.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=3;PP=170;ReadPosRankSum=-1.015;SC=CCAGCCCGGGGTGGGGGGTGA;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=3;WE=17586622;WS=17586599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr22	17586614	rs35078252	G	C	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=4;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=3;PP=161;ReadPosRankSum=-1.157;SC=CCGGGGTGGGGGGTGAGACCA;SOR=0.437;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=5;WE=17586622;WS=17586599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr22	17586631	rs4819959	G	A	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.205;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.463;HP=4;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=2;PP=44;ReadPosRankSum=-1.063;SC=ACCATGGTTTGTCGTGGTGGG;SOR=0.760;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=12;TCF=6;TCR=6;TR=5;WE=17586639;WS=17586621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr22	17586715	rs56736183	ATCAC	A	244.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=2;PP=144;ReadPosRankSum=-0.768;SC=GCCCCGCCGCATCACTCACGC;SOR=0.473;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=15;TCF=9;TCR=6;TR=4;WE=17586726;WS=17586705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
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chr22	17601466	rs75243280	T	C	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=125;ReadPosRankSum=-0.397;SC=GGCGCCGACCTCTGCGGCCGG;SOR=0.829;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=52;TCF=18;TCR=34;TR=13;WE=17601474;WS=17601456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,19:0.29:65
chr22	17601748	rs9606620	C	T	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.66;ReadPosRankSum=0.862;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,29:0.57:51
chr22	17602839	rs5992629	G	A	3674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=54;PP=2020;SC=CCCTGGGGTCGCGAGCCATCT;SOR=0.768;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=124;TCF=70;TCR=54;TR=124;WE=17602847;WS=17602829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr22	17603477	rs5748871	A	G	1194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=11;PP=695;SC=TTGCAGCGTGATAACACCATG;SOR=1.455;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=24;TCR=11;TR=35;WE=17603485;WS=17603467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr22	17623880	rs34058953	G	GC	903.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=5;PP=568;SC=TGACTCCAAGGCCCCTTGCTG;SOR=1.863;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=16;WE=17623888;WS=17623870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr22	17629544	rs3214349	G	GA	496.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.020;NF=3;NR=10;PP=342;ReadPosRankSum=0.071;SC=CCTAGGGAAGGAAAAAACCCG;SOR=0.520;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=13;WE=17629552;WS=17629534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,20:0.69:29
chr22	17630389	rs1034858	G	C	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.629;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=206;ReadPosRankSum=-0.085;SC=GCTCCATTAGGAACCAGGTCC;SOR=1.880;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=11;WE=17630397;WS=17630379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr22	17630486	rs1034859	C	A	1335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.771;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=20;PP=761;ReadPosRankSum=-1.435;SC=GTAAGATGTTCCCAGCATTTG;SOR=1.004;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=93;TCF=57;TCR=36;TR=57;WE=17630494;WS=17630476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,61:0.63:97
chr22	17640045	rs7287672	G	A	567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.908;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=9;PP=263;ReadPosRankSum=-0.383;SC=TAGCACCTGCGGGCGGGGCGG;SOR=0.751;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=63;TCF=36;TCR=27;TR=25;WE=17640053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,30:0.42:72
chr22	17640176	.	GC	G	184.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.685;ClippingRankSum=0.000;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=3.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.74;ReadPosRankSum=1.156;SOR=1.163;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,14:0.36:39
chr22	17640399	rs148919630	G	GGGC	180.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=4.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.65;ReadPosRankSum=-1.415;SOR=1.656;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,7:0.22:32
chr22	17662679	rs41282461	C	T	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.971;HP=7;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=92;ReadPosRankSum=-1.156;SC=TGGAAGGAGGCGGGGGACCTG;SOR=0.250;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=10;WE=17662687;WS=17662669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr22	17662699	rs58754958	A	G	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.581;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=204;ReadPosRankSum=-0.512;SC=GGGAGGACACAGGACACTCAC;SOR=0.215;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=16;WE=17662707;WS=17662689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr22	17662793	rs7289170	A	G	796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.722;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=14;PP=426;ReadPosRankSum=-0.785;SC=CATAGAAATCATAGGACAAGC;SOR=0.922;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=79;TCF=47;TCR=32;TR=37;WE=17662801;WS=17662783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,42:0.47:90
chr22	17662917	rs3764846	G	C	1088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.868;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=23;PP=683;ReadPosRankSum=0.516;SC=CAGCACCTGCGCAATAGGAGG;SOR=0.446;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=34;TCR=36;TR=45;WE=17662925;WS=17662907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,49:0.60:82
chr22	17669151	rs2231496	C	T	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=382;ReadPosRankSum=0.927;SC=TAGGCTCTAACCCTGAGGCAT;SOR=0.465;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=22;WE=17669159;WS=17669141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,24:0.63:38
chr22	17669199	rs7284498	G	A	851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.440;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=9;PP=524;ReadPosRankSum=-0.610;SC=GACCACCTCCGCTGCCTCTGC;SOR=1.295;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=96;TCF=64;TCR=32;TR=36;WE=17669207;WS=17669189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,42:0.39:109
chr22	17669306	rs2231495	T	C	1275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.807;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=36;PP=641;ReadPosRankSum=-1.492;SC=CTTGTAGTCATGCAAGGAGTG;SOR=0.871;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=179;TCF=84;TCR=95;TR=65;WE=17669314;WS=17669296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,74:0.37:202
chr22	17669406	rs9619005	G	C	1074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=29;PP=868;SC=GCGCGCCCTGGAGCCTGTGCA;SOR=4.680;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=31;WE=17669414;WS=17669396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr22	17671133	rs2286348	C	G	4012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=69;PP=2270;SC=TATCAAAGACCCTTGCTGGCT;SOR=0.875;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=136;TCF=67;TCR=69;TR=136;WE=17671153;WS=17671123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr22	17680306	rs144627322	T	TCCTCCCTCCCCTCCTCTATCCTCTTCC	721.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=120.29;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr22	17680519	rs17807317	A	C	3455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=68;PP=2314;SC=TGGGATCGCCATTTGAGGTGG;SOR=1.082;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=117;TCF=49;TCR=68;TR=117;WE=17680527;WS=17680509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr22	17690409	rs362129	G	A	1934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=31;PP=1143;SC=CCTCCTTGGTGTTCAGCACCA;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=28;TCR=31;TR=59;WE=17690417;WS=17690399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr22	17956759	rs4819593	C	G	3068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=58;PP=1754;SC=CATTTCTTGCCCCAAGAACTA;SOR=1.336;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=42;TCR=58;TR=100;WE=17956767;WS=17956749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr22	17978600	rs7284169	G	C	2268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=52;PP=1086;ReadPosRankSum=-0.825;SC=TTCAGTGTTAGGGCATGATAG;SOR=0.703;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=143;TCF=64;TCR=79;TR=97;WE=17978608;WS=17978590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,110:0.66:166
chr22	17990852	rs5747211	G	A	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=0.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.44;ReadPosRankSum=-0.063;SOR=0.561;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,35:0.25:139
chr22	18018509	rs2300686	T	C	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=65;ReadPosRankSum=-0.520;SC=ATATATATATTTTGATACGTT;SOR=0.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=6;WE=18018517;WS=18018499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,6:0.19:31
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chr22	18062982	rs186179778	T	C	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.094;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.75;ReadPosRankSum=-1.812;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
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chr22	18077443	rs116576310	C	T	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=2.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.08;MQRankSum=1.658;QD=3.80;ReadPosRankSum=-1.122;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:97,36:0.27:133
chr22	18084001	rs5747254	T	G	2609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=41;NR=46;PP=1498;SC=AGTCGGCTCATAACCCACTGT;SOR=0.914;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=41;TCR=46;TR=87;WE=18084009;WS=18083991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr22	18084033	rs3747023	C	T	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=2.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.27;ReadPosRankSum=1.049;SOR=0.430;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,18:0.25:72
chr22	18096199	rs17809319	G	A	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.658;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=212;ReadPosRankSum=-2.112;SC=ATATAAAACAGAAAATTTATT;SOR=1.525;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=13;WE=18096207;WS=18096189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,14:0.40:35
chr22	18111431	rs7751	T	C	1008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FS=0.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.39;ReadPosRankSum=-0.321;SOR=0.688;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:163,67:0.29:230
chr22	18171650	rs5013026	C	T	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=45;ReadPosRankSum=0.098;SC=TCTCCTGCCTCAGCCTCCTGA;SOR=0.188;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=4;WE=18171658;WS=18171640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr22	18178859	rs2257083	C	T	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=0.904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.58;ReadPosRankSum=-0.199;SOR=0.531;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,27:0.25:110
chr22	18209613	rs4488761	A	G	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=21;PP=513;ReadPosRankSum=0.015;SC=TGTCACTGTCAGCTAGCCAGA;SOR=0.693;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=123;TCF=64;TCR=59;TR=41;WE=18209621;WS=18209590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,42:0.30:142
chr22	18209920	rs9306198	C	T	2075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.155;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=29;PP=1260;ReadPosRankSum=-2.630;SC=GACAAGGGAACCTGACACAGA;SOR=0.920;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=133;TCF=82;TCR=51;TR=82;WE=18209928;WS=18209910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,92:0.62:148
chr22	18218464	rs181382	T	C	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.958;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=134;ReadPosRankSum=-0.639;SC=TGCAAAAACATGTTCTCCAGA;SOR=1.259;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=7;WE=18218483;WS=18218454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,9:0.30:30
chr22	18218475	rs181383	C	G	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=3;PP=134;ReadPosRankSum=0.054;SC=GTTCTCCAGACCCCTGAAGTC;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=3;WE=18218483;WS=18218454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,4:0.21:19
chr22	18222263	rs181390	A	G	985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=29;PP=560;ReadPosRankSum=-0.889;SC=ATCTGTGTTCAGGCAGGGGCG;SOR=0.698;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=163;TCF=75;TCR=88;TR=53;WE=18222271;WS=18222253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,58:0.33:178
chr22	18257138	rs443912	T	G	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=3.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.64;ReadPosRankSum=0.813;SOR=0.425;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,30:0.35:85
chr22	18291791	rs423710	C	G	3033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=40;NR=56;PP=1804;SC=AGGGGAAACACAGGAGTTGCC;SOR=1.274;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=40;TCR=56;TR=96;WE=18291799;WS=18291781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr22	18293650	rs436590	A	G	1459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=31;PP=896;SC=CAGCAGGCCAACAGGGGCCTG;SOR=1.893;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=14;TCR=31;TR=45;WE=18293658;WS=18293640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr22	18310700	.	T	TAC	360.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.846;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.839;NF=0;NR=13;PP=540;ReadPosRankSum=-1.111;SC=TGCACATGTATACACACACAC;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=13;WE=18310708;WS=18310690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr22	18324564	rs750559	C	T	1747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=28;PP=994;SC=GGCGGGTGGGCGCCCTGCAGC;SOR=0.976;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=27;TCR=28;TR=55;WE=18324572;WS=18324554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr22	18347851	rs201769834	TTTTATTTA	TTTTA,T	214.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;NF=0,0;NR=5,5;PP=70,282;SC=TGGTTTTAAATTTTATTTATT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=5,5;WE=18347866;WS=18347841;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:4
chr22	18347916	rs9605418	A	G	109.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=95;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=5;PP=84;SC=CCTTGCTGGCACCCAGGCTGG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=18347924;WS=18347906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr22	18368548	rs2289718	G	A	2612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=23;PP=1553;SC=CGAACGCTGGGGTCTGTGACA;SOR=1.847;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=57;TCR=23;TR=80;WE=18368556;WS=18368538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr22	18369916	rs4819644	A	G	5118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=70;PP=2908;SC=CATTCTAGCAATTCCCCAAGT;SOR=0.924;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=163;TCF=93;TCR=70;TR=163;WE=18369924;WS=18369906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr22	18370066	rs4819472	C	A	3979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=65;PP=2388;SC=CTTTGCAGCCCATCAAGAGAC;SOR=0.852;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=133;TCF=68;TCR=65;TR=133;WE=18370074;WS=18370056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr22	18372020	rs3747032	A	G	2068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=44;PP=1262;SC=CAAGGAAAACATATCAAGATA;SOR=2.115;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=16;TCR=44;TR=60;WE=18372028;WS=18372010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr22	18374150	rs2075453	T	C	1295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=6;PP=793;SC=TATCTTACTATGTACCTCATT;SOR=2.885;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=32;TCR=6;TR=38;WE=18374158;WS=18374140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr22	18378002	rs2034113	T	C	1510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=12;PP=1024;SC=GAATTCTCATTGGTCCTGCAG;SOR=2.215;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=36;TCR=12;TR=48;WE=18378010;WS=18377992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr22	18379160	rs3213927	T	A	1280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=19;NR=26;PP=761;SC=ATAATTAAAATATAACACACC;SOR=1.112;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=19;TCR=26;TR=45;WE=18379168;WS=18379150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr22	18389548	rs11913706	G	C	958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.865;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=28;PP=546;ReadPosRankSum=1.565;SC=ACATGAGCTGGGTTCATGGTC;SOR=0.586;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=74;TCF=28;TCR=46;TR=45;WE=18389556;WS=18389538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,47:0.58:81
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chr22	18893902	rs408469	G	C	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=55;ReadPosRankSum=-0.752;SC=AGCGCTACGCGGGCGCCTTGG;SOR=0.784;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=21;TCF=14;TCR=7;TR=7;WE=18893910;WS=18893892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr22	18893995	rs409155	C	G	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.90;ReadPosRankSum=1.792;SOR=0.700;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,31:0.23:132
chr22	18896169	rs426065	C	T	1198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.853;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.010;NF=37;NR=22;PP=1006;ReadPosRankSum=0.089;SC=AGATGCCGCCCCATCATTCTG;SOR=0.555;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=92;TCF=60;TCR=32;TR=59;WE=18896177;WS=18896159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,51:0.57:89
chr22	18896189	rs425576	T	C	1458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=2.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.182;NF=42;NR=26;PP=1164;ReadPosRankSum=-0.815;SC=GTGAGCACTTTCTTGCTTTCT;SOR=0.641;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=118;TCF=74;TCR=44;TR=68;WE=18896197;WS=18896179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,61:0.53:116
chr22	18898289	rs441862	G	C	1811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=29;PP=945;ReadPosRankSum=1.363;SC=GGAGAGGCCTGGGTGTGGTGA;SOR=0.774;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=104;TCF=63;TCR=41;TR=74;WE=18898297;WS=18898279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,81:0.71:114
chr22	18899016	rs428224	G	A	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQRankSum=-0.050;QD=8.23;ReadPosRankSum=2.297;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr22	18900669	rs383964	A	G	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=114;ReadPosRankSum=0.319;SC=GCTGGAGGCTAAGGGTGTGCT;SOR=0.859;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=7;WE=18900677;WS=18900659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr22	18900750	rs372055	G	A	974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.117;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=15;PP=529;ReadPosRankSum=-0.402;SC=AGCCACAGCAGCTGCCGCTCC;SOR=0.521;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=52;TCF=32;TCR=20;TR=37;WE=18900758;WS=18900740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,44:0.73:60
chr22	18901004	rs450046	C	T	2242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.220;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=45;PP=1150;ReadPosRankSum=1.537;SC=AAAGTACACCCGGTGGTCAGC;SOR=0.500;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=130;TCF=60;TCR=70;TR=87;WE=18901012;WS=18900994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,101:0.67:151
chr22	18901090	rs385440	A	G	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=323;ReadPosRankSum=1.546;SC=CACTGTCCCCAGTGCAGGGAT;SOR=0.551;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=18;WE=18901098;WS=18901080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,20:0.62:32
chr22	18904414	rs455072	A	G	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.938;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-6.599;NF=28;NR=14;PP=616;ReadPosRankSum=0.860;SC=TGCGCAGTGCAAAGCGCACTG;SOR=0.853;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=69;TCF=47;TCR=22;TR=42;WE=18904422;WS=18904404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,42:0.58:72
chr22	18904606	rs375115	T	G	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.121;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=39;ReadPosRankSum=-0.275;SC=GATCCATCCATTGAGCTGGCT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=4;WE=18904614;WS=18904596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr22	19077049	rs2800960	C	T	379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=316;SC=TGGCAGTAGGCCAGCAAACCA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=19077057;WS=19077039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr22	19109753	rs11550628	A	G	722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.933;HP=2;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=10;PP=478;ReadPosRankSum=0.319;SC=GGGCGGCTGGAAGGCCGGACC;SOR=0.530;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=77;TCF=37;TCR=40;TR=21;WE=19109772;WS=19109743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,23:0.28:83
chr22	19109764	rs11550626	A	G	713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=2.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.50;ReadPosRankSum=-1.290;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,22:0.32:68
chr22	19109812	rs11550627	A	G	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=80;ReadPosRankSum=0.277;SC=GGTCAGGCGGAGCTGAACCTG;SOR=0.399;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=9;TCR=19;TR=9;WE=19109820;WS=19109802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,8:0.29:28
chr22	19122498	rs2240110	C	T	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=151;ReadPosRankSum=-1.270;SC=TGCCTCCACACGGTCAGGGCA;SOR=0.527;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=10;WE=19122506;WS=19122488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr22	19124865	rs17743887	C	T	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=1.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.33;ReadPosRankSum=-0.203;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,31:0.27:116
chr22	19127119	rs200628856	A	G	4452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=82;PP=2671;ReadPosRankSum=0.679;SC=GAGGCCCGCCACTTACCCTCT;SOR=0.707;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=248;TCF=134;TCR=114;TR=180;WE=19127127;WS=19127109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,203:0.72:282
chr22	19163577	rs35359423	C	CAT	247.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.478;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=2;PP=105;ReadPosRankSum=-1.607;SC=GCACTGGAATCGTGAGACAAA;SOR=0.076;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=5;WE=19163585;WS=19163567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr22	19165264	rs201261311	G	C	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=3.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.978;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=88;ReadPosRankSum=-0.041;SC=TGGGGCACACGACCACCACGG;SOR=1.179;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=7;WE=19165272;WS=19165254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr22	19172006	rs1018764	T	C	1024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=24;PP=540;ReadPosRankSum=1.385;SC=TCTCCCCCGCTGGCATGCTGC;SOR=0.669;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=163;TCF=95;TCR=68;TR=57;WE=19172014;WS=19171996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,62:0.32:194
chr22	19184095	rs1061325	T	C	647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.448;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=21;PP=317;ReadPosRankSum=0.829;SC=TCAGTGAACATGCCCATGTGG;SOR=1.019;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=118;TCF=53;TCR=65;TR=35;WE=19184103;WS=19184085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,41:0.31:132
chr22	19187375	rs9605957	G	A	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.579;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=333;ReadPosRankSum=-0.825;SC=GGGCAAGCGTGAGGGTCCCCA;SOR=1.211;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=56;TCF=24;TCR=32;TR=26;WE=19187383;WS=19187365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,28:0.47:60
chr22	19187427	rs2236759	C	G	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.304;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=103;ReadPosRankSum=0.449;SC=ACAAGGCACACAGTTGCAAAT;SOR=1.609;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=7;WE=19187435;WS=19187417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr22	19189003	rs11386977	A	AC	5010.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=11;NR=53;PP=2873;SC=GCGGTCTCCAACTACGGATAA;SOR=0.816;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=67;TCF=12;TCR=55;TR=64;WE=19189011;WS=19188993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
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chr22	19318622	rs1210690	T	C	204.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=2;PP=129;SC=AGCAGCATGGTGCCTGCAGCA;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=19318630;WS=19318612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr22	19349590	rs916594	G	C	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=152;ReadPosRankSum=0.221;SC=TGCCTCAAAAGTAAAGGAGAA;SOR=0.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=4;WE=19349603;WS=19349580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr22	19349595	rs41277615	G	A	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=519;ReadPosRankSum=0.957;SC=CAAAAGTAAAGGAGAAATAAT;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=11;WE=19349603;WS=19349580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr22	19419093	rs8140291	A	G	1019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=29;PP=799;SC=CTCCCGCGCCACCCGCCCTCC;SOR=4.680;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=31;WE=19419101;WS=19419083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr22	19455376	rs5746742	C	T	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.102;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=92;ReadPosRankSum=-1.238;SC=AGAAGAACTCCGCTTATTTGA;SOR=0.082;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=7;WE=19455384;WS=19455366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr22	19455836	rs756658	A	G	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=3.314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.11;ReadPosRankSum=-0.202;SOR=1.198;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,21:0.19:108
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chr22	19462466	rs5746744	C	G	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=35;ReadPosRankSum=0.180;SC=ATGCCCTCCACGGACAATTCA;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=4;WE=19462474;WS=19462456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr22	19467652	rs5748232	T	C	1210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=25;PP=614;ReadPosRankSum=0.836;SC=CGGGTCGCCGTGTTCAGCCGG;SOR=0.720;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=177;TCF=96;TCR=81;TR=56;WE=19467660;WS=19467642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,67:0.34:197
chr22	19468655	rs5993650	C	T	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=3.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.63;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,10:0.26:38
chr22	19471609	rs737858	A	G	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.161;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=288;ReadPosRankSum=-1.865;SC=CTGCCAGGCCAAGGTGTACTG;SOR=0.511;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=52;TCF=13;TCR=39;TR=19;WE=19471617;WS=19471599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,21:0.37:57
chr22	19492692	rs8136840	C	G	91.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=4;NR=0;PP=66;SC=CACACCCCCCCGCTCCATCCA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=19492700;WS=19492690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr22	19495967	rs2073736	G	A	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=5.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.39;ReadPosRankSum=-0.370;SOR=2.030;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,5:0.15:33
chr22	19504318	rs2073733	G	A	1532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.054;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=34;PP=1013;ReadPosRankSum=0.471;SC=CCTGGCCCCCGACATGTCTTG;SOR=0.788;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=224;TCF=127;TCR=97;TR=79;WE=19504326;WS=19504308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,83:0.35:238
chr22	19504470	rs2073732	T	C	1896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.950;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=49;PP=1217;ReadPosRankSum=-0.895;SC=TTTGAGGCTATTGCAGGCCCT;SOR=0.770;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=261;TCF=121;TCR=140;TR=90;WE=19504478;WS=19504460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:187,100:0.35:287
chr22	19506456	rs2073760	G	T	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.941;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=18;PP=320;ReadPosRankSum=-0.027;SC=GTTCTGCAGGGGTGGCTGCAG;SOR=0.961;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=80;TCF=30;TCR=50;TR=27;WE=19506464;WS=19506446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,29:0.33:88
chr22	19511925	rs885985	G	A	1190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=25;PP=620;ReadPosRankSum=0.211;SC=CGCACCTCCTGGGTCTGCCAG;SOR=0.724;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=143;TCF=78;TCR=65;TR=55;WE=19511933;WS=19511915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,65:0.40:164
chr22	19702168	.	C	CTGCCCGCG	694.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=0.000;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.461;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=461;ReadPosRankSum=1.004;SC=AGCCCAGCGCCTGCCCGCGTG;SOR=1.100;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=37;TCF=14;TCR=23;TR=8;WE=19702176;WS=19702158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,17:0.30:57
chr22	19712094	rs1059196	C	T	143.18	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5210;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=3;PP=87;ReadPosRankSum=0.157;SC=TGGACCGGTCCCCGCCTCCTC;SOR=0.330;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=7;WE=19712102;WS=19712084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr22	19747082	rs737868	G	C	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.413;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=131;ReadPosRankSum=0.514;SC=TGGTTGCAGCGGAGGCGGCGG;SOR=1.061;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=40;TCF=28;TCR=12;TR=11;WE=19747090;WS=19747072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,13:0.30:44
chr22	19751829	rs2301558	C	T	4768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.412;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=99;NR=93;PP=2781;ReadPosRankSum=-2.792;SC=GACCAACAACCTACTGGACGA;SOR=0.611;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=287;TCF=144;TCR=143;TR=192;WE=19751837;WS=19751819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,219:0.68:323
chr22	19794366	rs737860	C	A	1723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=40;PP=1149;SC=GCGATTAGCCCGGGCTGCTGT;SOR=2.342;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=54;TCF=13;TCR=41;TR=53;WE=19794374;WS=19794356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
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chr22	19870831	rs2239893	C	T	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=367;ReadPosRankSum=-0.546;SC=GCCCTGGTCCCGGGACGCATG;SOR=0.892;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=22;WE=19870839;WS=19870821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,26:0.76:34
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chr22	19956262	rs362204	G	GC	550.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.199;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.58;MQRankSum=1.685;NF=1;NR=14;PP=326;ReadPosRankSum=-1.857;SC=GGCCCTGACTGCCCCCCCGGC;SOR=0.521;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=40;TCF=3;TCR=37;TR=15;WE=19956270;WS=19956252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,24:0.53:45
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chr22	19959366	rs165824	G	A	2139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=22;PP=1388;SC=CCCTAGACACGGGGCCTCACC;SOR=1.493;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=49;TCR=22;TR=71;WE=19959374;WS=19959356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr22	19959473	rs165815	C	T	6232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=110;NR=101;PP=2965;SC=CCGCTCCCTCCGGTCCACCGT;SOR=0.727;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=211;TCF=110;TCR=101;TR=211;WE=19959481;WS=19959463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr22	19959955	rs2073744	A	G	3544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=69;PP=2166;SC=GGAGGAGGAGACGGGCTGCAT;SOR=1.517;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=40;TCR=69;TR=109;WE=19959963;WS=19959945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
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chr22	19960198	rs71313932	G	C	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=2.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.31;ReadPosRankSum=1.227;SOR=1.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,23:0.72:32
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chr22	19964418	rs2240718	T	G	1519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=33;PP=1094;SC=CCACCAGGGGTACAAGAAGAG;SOR=1.402;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=17;TCR=33;TR=50;WE=19964426;WS=19964408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
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chr22	19967808	rs55812801	G	T	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=4.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.24;ReadPosRankSum=-3.563;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr22	19968971	rs2073748	G	A	1068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.428;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=20;PP=741;ReadPosRankSum=-1.133;SC=ACCAGGGCCTGGGCCAAGGGG;SOR=0.450;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=59;TCF=29;TCR=30;TR=42;WE=19968979;WS=19968961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,44:0.70:63
chr22	19969075	rs2073747	A	G	2240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=35;PP=1215;ReadPosRankSum=-1.583;SC=AGCCACCCCCACTGCTGAGGT;SOR=0.654;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=148;TCF=93;TCR=55;TR=93;WE=19969083;WS=19969065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,108:0.62:174
chr22	19969106	rs2240717	A	G	2310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.535;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=41;PP=1208;ReadPosRankSum=0.226;SC=GAGTGTGGCCACTGGGCCACC;SOR=0.635;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=165;TCF=95;TCR=70;TR=96;WE=19969114;WS=19969096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,113:0.59:193
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chr22	19974654	rs7292055	G	A	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=16;PP=366;ReadPosRankSum=-0.419;SC=AGCAGCGGGGGAGGCGGTGGC;SOR=0.803;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=20;TCR=26;TR=29;WE=19974662;WS=19974644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,31:0.63:49
chr22	19978022	rs4819527	C	T	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.061;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=14;PP=485;ReadPosRankSum=-1.446;SC=AATAAGCGAGCGCATGCTGGC;SOR=0.534;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=55;TCF=35;TCR=20;TR=36;WE=19978030;WS=19978012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,40:0.67:60
chr22	20020889	rs9605051	T	C	1737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=46;PP=1104;SC=CTGCTGCCCCTGCACCCTGGC;SOR=2.730;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=12;TCR=46;TR=58;WE=20020897;WS=20020879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr22	20043370	rs174876	C	T	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-2.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=34;ReadPosRankSum=-2.084;SC=CTGCGCACATCGCTAGCCTCC;SOR=0.188;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=5;WE=20043378;WS=20043360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr22	20093967	rs113088659	G	A	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=130;ReadPosRankSum=0.783;SC=GGCCTGAATCGGGCGTGTGGA;SOR=1.402;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=8;WE=20093975;WS=20093957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr22	20100158	rs447017	G	C	518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=12;PP=330;ReadPosRankSum=0.335;SC=GAGCTGGAGGGCTGTGGGGCC;SOR=0.631;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=74;TCF=42;TCR=32;TR=28;WE=20100166;WS=20100148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,30:0.37:81
chr22	20104301	rs395446	T	C	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=3.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.47;ReadPosRankSum=1.317;SOR=1.635;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,9:0.20:44
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chr22	20136263	rs175181	G	A	1309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.047;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=23;PP=677;ReadPosRankSum=1.025;SC=GGTTCACCACGTACACGTAGG;SOR=0.430;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=78;TCF=48;TCR=30;TR=56;WE=20136271;WS=20136253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,61:0.73:84
chr22	20255020	rs854929	T	C	871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=4;PP=627;SC=CTGCAGATGGTGGGCGTTGCT;SOR=2.910;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=28;WE=20255028;WS=20255010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr22	20302276	rs1056804	A	T	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=2;PP=33;ReadPosRankSum=-0.127;SC=CCAGGGCTGCATTCCCTGCCC;SOR=0.586;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=24;TCF=16;TCR=8;TR=5;WE=20302284;WS=20302266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,7:0.24:29
chr22	20303616	.	G	A	647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.424;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQ=59.08;MQRankSum=-0.475;NF=16;NR=9;PP=393;ReadPosRankSum=0.557;SC=GAGCTGGGCCGGCCACCCTGC;SOR=0.997;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=18;TCR=10;TR=25;WE=20303624;WS=20303606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,28:0.88:32
chr22	20303664	rs113468394	G	A	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQRankSum=0.852;QD=1.09;ReadPosRankSum=-0.266;SOR=0.768;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,12:0.18:66
chr22	20303854	rs5993964	G	A	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.740;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.73;MQRankSum=-1.383;NF=4;NR=5;PP=64;ReadPosRankSum=0.675;SC=GGTGTCTGCAGTGGGGAGGAT;SOR=1.192;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=20;TCF=10;TCR=10;TR=9;WE=20303862;WS=20303844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr22	20305357	rs12627754	A	G	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.229;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.633;NF=1;NR=5;PP=52;ReadPosRankSum=-0.389;SC=TTAGTAAACTACATACATCTT;SOR=0.039;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=6;WE=20305365;WS=20305347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr22	20307346	rs142800099	G	GC	547.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.53;ReadPosRankSum=1.771;SOR=0.762;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,29:0.24:121
chr22	20385706	rs79640249	G	T	301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.01;QD=23.21;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr22	20385739	rs146242498	TTGTC	T	1222.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.44;QD=43.67;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr22	20394502	rs201085493	C	T	144.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.86;QD=28.98;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr22	20394526	rs201289136	C	T	119.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.40;QD=19.97;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr22	20718525	rs2277833	T	C	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=3.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.22;MQRankSum=0.097;QD=3.61;ReadPosRankSum=-0.398;SOR=0.086;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,6:0.23:26
chr22	20743771	rs361766	C	T	1088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=6;PP=709;SC=GCGCCTGGGGCATGACTGCCC;SOR=3.086;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=34;WE=20743779;WS=20743761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr22	20745201	rs362125	A	G	1561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=39;PP=1098;SC=ACAGTGAGGCACACACACACA;SOR=2.480;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=12;TCR=39;TR=51;WE=20745209;WS=20745191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr22	20754039	rs361860	G	A	159.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5040;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=3;PP=37;ReadPosRankSum=-0.282;SC=CACCCCACCCGGCCTTGCTAT;SOR=1.179;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=6;WE=20754047;WS=20754029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr22	20779604	rs7286419	T	G	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.266;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=53;ReadPosRankSum=-0.773;SC=GCGTGGGAGGTGTGGGGTGGC;SOR=0.412;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=6;WE=20779612;WS=20779594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr22	20779627	.	G	A	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.712;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=202;ReadPosRankSum=-0.975;SC=GCGGCGCTGCGAAGCTGAGGG;SOR=1.329;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=11;WE=20779635;WS=20779617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr22	20779768	rs874101	G	C	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.781;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=195;ReadPosRankSum=0.106;SC=GGTCTCAGGCGCGGGCAAGTC;SOR=1.177;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=50;TCF=29;TCR=21;TR=17;WE=20779776;WS=20779758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,21:0.34:61
chr22	20779822	rs874100	G	C	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=1.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.94;ReadPosRankSum=0.070;SOR=0.889;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,19:0.38:50
chr22	20779946	rs759612	CG	GC	1051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.82;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr22	20779973	rs5844418	C	CG	459.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=7;PP=332;SC=GAGGCAGCCTCGGCGCGCTTC;SOR=0.976;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=20779981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr22	20780024	rs5844420	G	GC	893.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=7;PP=577;SC=AGAGGCCGGGGCGCGGCGCGC;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=15;TCF=8;TCR=7;TR=14;WE=20780039;WS=20780014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr22	20780029	rs370015834	G	GC	1031.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.86;SOR=2.400;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr22	20780031	rs2329378	G	C	1040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.37;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr22	20780091	rs759610	C	G	4256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.34;SOR=1.190;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr22	20780097	rs759609	G	C	4232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.64;SOR=1.156;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr22	20785639	rs361566	G	A	1436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.057;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=27;PP=905;ReadPosRankSum=-1.370;SC=CACCAGCCGGGCTCACAGCGG;SOR=0.427;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=81;TCF=44;TCR=37;TR=54;WE=20785647;WS=20785629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,59:0.69:86
chr22	20795757	rs1153427	C	T	1878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=19;PP=1159;SC=TTCCTGGGGACGCAGCTTGGG;SOR=1.512;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=44;TCR=19;TR=63;WE=20795765;WS=20795747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr22	20811930	rs362087	C	A	295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=237;SC=CTCATGGGGCCTCATCAATGC;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=20811938;WS=20811926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
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chr22	20891568	rs2269831	G	A	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.589;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=19;PP=429;ReadPosRankSum=-0.325;SC=GAACCCCTCTGTTGGGTGTCC;SOR=0.334;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=37;TCF=10;TCR=27;TR=27;WE=20891576;WS=20891558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,29:0.73:40
chr22	20907303	rs165829	T	C	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=335;ReadPosRankSum=-0.213;SC=CCCCCAGTAGTGGGGAGTACT;SOR=0.789;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=50;TCF=37;TCR=13;TR=23;WE=20907311;WS=20907293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,26:0.43:61
chr22	20920813	rs361923	A	ACAG	193.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=1;HapScore=3;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.985;NF=2;NR=1;PP=85;ReadPosRankSum=1.274;SC=AACAACAGCAACAGCAGCAGC;SOR=1.565;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=3;WE=20920823;WS=20920803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr22	20929286	rs165842	C	G	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=96;ReadPosRankSum=-0.284;SC=GCTGCCCAAGCTTTCCTTGCC;SOR=0.627;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=9;WE=20929294;WS=20929276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,9:0.26:34
chr22	20937601	rs165643	C	T	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.052;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=190;ReadPosRankSum=1.310;SC=TTAGTGTGTACCCTCTTCTGT;SOR=1.079;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=75;TCF=35;TCR=40;TR=20;WE=20937609;WS=20937591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,24:0.30:80
chr22	20938775	rs165747	T	C	2840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=46;PP=1376;SC=CTGGGAGTGCTGCTGAGAGGG;SOR=0.912;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=47;TCR=46;TR=93;WE=20938783;WS=20938765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr22	20938905	rs9608160	G	A	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=138;ReadPosRankSum=-0.326;SC=CTCTGTCTACGGCCCCCGTGG;SOR=1.802;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=8;WE=20938913;WS=20938895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr22	20940794	rs93173	G	A	1396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.77;ReadPosRankSum=-2.004;SOR=0.704;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:158,84:0.35:242
chr22	21034809	rs28668558	G	A	474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=2;PP=213;SC=GAATCAAAGAGCTCCTCAACC;SOR=1.863;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=21034817;WS=21034799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr22	21045651	rs5760036	C	T	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=3.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=5;PP=93;ReadPosRankSum=0.787;SC=CCTCCCGGGACGAAAGCGGAA;SOR=0.859;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=24;TCR=19;TR=11;WE=21045659;WS=21045641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,11:0.21:53
chr22	21062268	rs13471	G	T	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=140;ReadPosRankSum=1.311;SC=CAGGGAGGTCGCAGGGCTCCA;SOR=0.430;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=12;WE=21062276;WS=21062258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr22	21064120	rs146546335	G	A	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.038;NF=8;NR=1;PP=132;ReadPosRankSum=1.144;SC=TACATGAAAGGTACCTATCTT;SOR=0.569;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=9;WE=21064128;WS=21064110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr22	21064356	rs5760149	A	C	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.780;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.530;NF=3;NR=9;PP=118;ReadPosRankSum=-0.251;SC=AGTCCTGTGGACTGGCTGATG;SOR=0.230;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=49;TCF=10;TCR=39;TR=12;WE=21064364;WS=21064346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,11:0.23:47
chr22	21068850	rs5760167	T	G	942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FS=0.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.16;MQRankSum=-0.446;QD=4.43;ReadPosRankSum=-0.170;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:152,61:0.29:213
chr22	21069073	rs2276011	C	A	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5164;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=39;ReadPosRankSum=-1.036;SC=ATGTTACATGCGTGTCCACCC;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=21069081;WS=21069063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr22	21073122	rs1807692	G	A	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.789;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=239;ReadPosRankSum=1.297;SC=TGCCAAGGAAGCAAAGAGGCT;SOR=1.528;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=56;TCF=23;TCR=33;TR=18;WE=21073130;WS=21073112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,19:0.31:61
chr22	21080721	rs11462205	T	TG	1262.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.473;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=16;PP=918;ReadPosRankSum=-0.332;SC=GGGCACAAGCTGGTGTGGAAC;SOR=0.551;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=84;TCF=39;TCR=45;TR=29;WE=21080729;WS=21080711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,48:0.36:134
chr22	21081964	rs4820583	C	T	1201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=8;PP=604;SC=AGTTGCCAAGCGGCTGTTTTT;SOR=1.828;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=29;TCR=8;TR=37;WE=21081972;WS=21081954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr22	21087860	rs368649547	G	T	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.89;MQRankSum=-0.291;QD=5.11;ReadPosRankSum=-1.052;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr22	21088146	rs17819969	C	G	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.718;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.842;NF=1;NR=4;PP=80;ReadPosRankSum=-0.566;SC=GAGGGAGCCCCGGACCCAGTT;SOR=0.223;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=5;WE=21088154;WS=21088136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr22	21106055	rs5751852	G	A	1925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.534;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=41;PP=1026;ReadPosRankSum=0.364;SC=TGCACCAAGAGCCAGCTCTCA;SOR=0.637;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=226;TCF=117;TCR=109;TR=90;WE=21106063;WS=21106045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,103:0.41:251
chr22	21106141	rs73160984	T	C	700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.962;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=19;PP=447;ReadPosRankSum=0.225;SC=CCATATCTGCTTCAGGCCAGC;SOR=0.304;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=63;TCF=22;TCR=41;TR=31;WE=21106149;WS=21106131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,34:0.47:72
chr22	21107153	rs2329583	T	C	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.150;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=406;ReadPosRankSum=-0.309;SC=GAAGTTTATATACATACACAC;SOR=1.410;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=66;TCF=44;TCR=22;TR=26;WE=21107161;WS=21107143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,26:0.37:70
chr22	21118918	rs165764	T	G	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=26;ReadPosRankSum=-0.015;SC=GGTGTTACTATACGTGGTGTC;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=3;WE=21118926;WS=21118909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
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chr22	21141300	rs4675	T	C	630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.766;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=19;PP=396;ReadPosRankSum=-2.333;SC=TCTACGAGCATCGCACCAGCT;SOR=0.590;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=103;TCF=42;TCR=61;TR=33;WE=21141308;WS=21141290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,36:0.31:118
chr22	21147293	rs165793	A	G	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.803;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=77;ReadPosRankSum=0.332;SC=GGAGTGAAGGATGTGCCATGG;SOR=0.256;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=39;TCF=31;TCR=8;TR=10;WE=21147301;WS=21147283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,11:0.28:40
chr22	21150340	rs165924	T	C	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=36;ReadPosRankSum=1.419;SC=ACAAAGAAAGTGCCATATTCC;SOR=0.307;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=6;WE=21150348;WS=21150330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr22	21150704	rs739523	C	G	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.006;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=21;ReadPosRankSum=-1.292;SC=CAGGCCCAGCCTGCCTTACCA;SOR=0.204;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=5;WE=21150712;WS=21150694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr22	21161564	rs5760728	G	C	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=118;ReadPosRankSum=1.391;SC=CAGAAAGTGAGTACCAGTCTG;SOR=0.473;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=8;WE=21161572;WS=21161554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr22	21167605	rs362114	G	GACA	1661.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.762;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=9;PP=848;ReadPosRankSum=-1.270;SC=CAATTTTACTGACATATCCAT;SOR=0.557;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=66;TCF=33;TCR=33;TR=20;WE=21167613;WS=21167595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,45:0.40:113
chr22	21167787	rs165854	G	A	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.005;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=13;PP=178;ReadPosRankSum=-0.945;SC=CATCGGGCAAGCAGGAGGCTG;SOR=0.533;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=70;TCF=24;TCR=46;TR=21;WE=21167795;WS=21167777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,23:0.31:74
chr22	21174798	rs73162824	T	C	671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.22;ReadPosRankSum=-0.101;SOR=0.681;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,36:0.33:108
chr22	21178484	rs165733	C	G	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=34;ReadPosRankSum=-1.342;SC=GGTCTGCTGTCAACAGGATGA;SOR=0.175;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=4;WE=21178492;WS=21178474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr22	21188732	rs165729	C	A	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=189;ReadPosRankSum=0.990;SC=CAGTTGTTTCCCAGCCAGGAG;SOR=0.709;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=49;TCF=35;TCR=14;TR=16;WE=21188740;WS=21188722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,15:0.30:50
chr22	21188964	rs5760899	T	C	795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=22;PP=535;ReadPosRankSum=-2.205;SC=ATAAGAAGAATAATAAATTAG;SOR=0.725;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=43;TCR=61;TR=38;WE=21188972;WS=21188954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,41:0.37:111
chr22	21213380	rs1061063	C	T	3470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=50;PP=2018;ReadPosRankSum=0.276;SC=TTTCCCAGACCGAGAGCCGCG;SOR=0.711;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=216;TCF=134;TCR=82;TR=135;WE=21213388;WS=21213370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,155:0.64:241
chr22	21213416	rs1061064	A	G	5343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=371;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.397;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=118;NR=93;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.369;SC=CTTACCCTAAAAGCTACAATC;SOR=0.658;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=332;TCF=184;TCR=148;TR=211;WE=21213424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,240:0.65:368
chr22	21311531	rs81027	C	T	1281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=13;PP=724;SC=TTACCTGGGGCTGGGGAGGTG;SOR=1.426;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=29;TCR=13;TR=42;WE=21311539;WS=21311521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr22	21311721	rs178251	T	G	3996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=71;NR=58;PP=2272;SC=TTTACTCATGTCCCCGCATCG;SOR=0.763;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=129;TCF=71;TCR=58;TR=129;WE=21311729;WS=21311711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr22	21322325	rs11334069	TC	T	2261.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.00;ReadPosRankSum=1.711;SOR=2.356;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,77:0.99:78
chr22	21322351	rs178254	T	C	2038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=57;PP=1756;SC=CTGCACTCGGTAGGCCTCCGA;SOR=4.648;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=6;TCR=57;TR=63;WE=21322359;WS=21322341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr22	21322376	rs74610147	T	G	1667.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.89;SOR=5.031;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr22	21322377	rs75810376	C	G	1667.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.07;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr22	21322380	rs71317868	A	G	1591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.48;SOR=4.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr22	21322383	rs432390	A	G	1501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=48.44;SOR=5.486;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr22	21327834	rs178265	C	G	620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=8;NR=16;PP=440;SC=TGCCTGGGAGCGGGGATCAGG;SOR=1.329;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=8;TCR=16;TR=24;WE=21327842;WS=21327824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr22	21329123	rs733455	A	G	550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=16;PP=427;SC=GGGTGGGGCAAGTAGGGACCC;SOR=2.093;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=21;WE=21329131;WS=21329113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr22	21330787	rs7285694	C	T	3631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.009;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=72;PP=2151;ReadPosRankSum=-1.095;SC=TGAGGCTGGCCCGAGGCCGCA;SOR=0.800;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=212;TCF=106;TCR=106;TR=140;WE=21330795;WS=21330777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,160:0.64:251
chr22	21331043	rs178269	A	T	3134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=43;PP=2093;SC=GCGTGGGTCGAGCCCTCATGA;SOR=0.951;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=102;TCF=58;TCR=44;TR=101;WE=21331051;WS=21331033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr22	21331918	rs178275	C	G	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=34;ReadPosRankSum=1.611;SC=CAAGCGCATGCTGTAGGGTGT;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=4;WE=21331926;WS=21331908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr22	21331950	rs178276	C	G	852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=7;PP=601;SC=ACGCAGAAGGCAGGGACAGGG;SOR=2.019;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=28;WE=21331958;WS=21331940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr22	21332122	rs178277	G	A	2355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.268;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=33;PP=1414;ReadPosRankSum=0.920;SC=AGTGGCAGGAGGTTCAGGTCA;SOR=0.814;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=149;TCF=92;TCR=57;TR=92;WE=21332130;WS=21332112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,103:0.62:165
chr22	21334873	rs13057408	G	C	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.12;ReadPosRankSum=-2.384;SOR=0.743;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,7:0.23:31
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chr22	21335259	rs178278	C	A	2802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.169;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=49;PP=1371;ReadPosRankSum=1.149;SC=TGTCTTGACCCCTCCTCCCCT;SOR=0.800;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=173;TCF=96;TCR=77;TR=114;WE=21335267;WS=21335249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,135:0.68:200
chr22	21337266	rs178280	G	A	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=180;ReadPosRankSum=1.299;SC=TTCCTTGGGTGCCCCCCAGGA;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=18;TCR=10;TR=14;WE=21337274;WS=21337256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr22	21337415	rs178281	C	G	2014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=32;NR=35;PP=1127;SC=GGACCAGGTACGGAGAAGTAC;SOR=0.855;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=67;TCF=32;TCR=35;TR=67;WE=21337423;WS=21337405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr22	21340088	rs178287	T	C	790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.655;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=14;PP=394;ReadPosRankSum=2.198;SC=CACTGCAGAGTAGACCTGGCT;SOR=0.484;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=99;TCF=64;TCR=35;TR=36;WE=21340096;WS=21340078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,41:0.38:108
chr22	21342169	rs178289	G	C	798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=4;PP=499;SC=GCAGCAGGTCGTTCCGGGGCT;SOR=2.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=22;WE=21342177;WS=21342159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr22	21342509	rs2269779	C	T	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=237;ReadPosRankSum=-0.368;SC=CCTGAGGGCACGCAATAGCAG;SOR=0.941;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=14;WE=21342517;WS=21342499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr22	21343992	.	GGGCGCA	G	687.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=0.000;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.92;MQRankSum=4.444;QD=8.71;ReadPosRankSum=0.700;SOR=0.614;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,22:0.28:79
chr22	21344001	.	TAGAGGAGGTGAGGGGCACGGGGAGCCAGGGC	T	700.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.963;ClippingRankSum=0.000;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.04;MQRankSum=4.181;QD=9.73;ReadPosRankSum=1.077;SOR=0.576;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,22:0.31:72
chr22	21344018	.	AC	GT	154	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MMLQ=20;MQ=61.61;NF=2;NR=7;PP=154;QD=23.0519860958;SC=GGTGAGGGGCACGGGGAGCCA;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=40;TCF=10;TCR=30;TR=9;WE=21344040;WS=21344008;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:31,9:0.22:40
chr22	21344032	.	C	T	173	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=17;MMLQ=28;MQ=62.73;NF=2;NR=8;PP=173;QD=20.7771212547;SC=GGAGCCAGGGCGCAGGTGGAG;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=10;WE=21344040;WS=21344008;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr22	21344884	rs2073989	C	T	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.871;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=18;PP=302;ReadPosRankSum=1.552;SC=ATATGAAGAACGCCTCTTGCA;SOR=0.954;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=91;TCF=33;TCR=58;TR=27;WE=21344892;WS=21344874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,30:0.29:102
chr22	21344905	rs178290	A	G	1505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=34;PP=928;SC=CCTGGTGGCCATGGTAACCAT;SOR=2.259;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=12;TCR=34;TR=46;WE=21344913;WS=21344895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr22	21344920	rs17820542	G	C	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=140;ReadPosRankSum=2.266;SC=AACCATCCTTGTGAGCTCTGC;SOR=0.960;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=10;WE=21344928;WS=21344910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,11:0.29:38
chr22	21346485	rs112544	T	C	468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=3;PP=237;SC=CTCATGCCCATGTGTCTCCCC;SOR=1.493;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=21346493;WS=21346475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr22	21346719	rs756876	A	C	1224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.112;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=29;PP=587;ReadPosRankSum=-0.581;SC=TGTGATCAACACCTCTCACAC;SOR=0.589;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=184;TCF=89;TCR=95;TR=58;WE=21346727;WS=21346709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,73:0.33:219
chr22	21348084	rs178291	T	C	1026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=17;PP=768;SC=CTGCTGTGCCTGGGCAGTGGG;SOR=0.804;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=17;TCR=17;TR=34;WE=21348092;WS=21348074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr22	21349037	rs178292	A	G	3353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.188;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=44;PP=1832;ReadPosRankSum=-0.513;SC=GGGTCAGCGCAATCAGGGTTG;SOR=0.378;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=63;TCR=45;TR=107;WE=21349045;WS=21349027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,124:0.99:125
chr22	21349579	rs178293	C	T	2376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=41;PP=1241;ReadPosRankSum=0.414;SC=GCACCTCTTTCGGGCTAGGAT;SOR=0.687;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=139;TCF=79;TCR=60;TR=94;WE=21349587;WS=21349569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,106:0.68:156
chr22	21349676	rs412470	TC	AT	3949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.247;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=46;PP=2456;ReadPosRankSum=0.104;SC=TTCCCCCAGCTCTCCCTGGGG;SOR=0.817;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=143;TCF=64;TCR=79;TR=79;WE=21349690;WS=21349666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,103:0.61:168
chr22	21350461	rs178294	A	G	175.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=7;PP=167;SC=CACCCACCTCAGGTGGCTTTG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=21350469;WS=21350451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr22	21350880	rs178295	T	C	804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=5.539;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=2;PP=529;ReadPosRankSum=0.177;SC=TTGGAGAGCATGCTGGCGTGG;SOR=2.303;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=27;WE=21350888;WS=21350870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,30:0.79:38
chr22	21350936	rs11704198	G	A	953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.577;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=8;PP=578;ReadPosRankSum=-0.574;SC=TCCCTGGGAGGGTGCGGGCGG;SOR=1.221;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=146;TCF=102;TCR=44;TR=44;WE=21350944;WS=21350926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,50:0.31:161
chr22	21354970	rs426938	C	G	1217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.712;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=26;PP=737;ReadPosRankSum=-0.909;SC=CTGACTTCAGCGGGGCCAGGT;SOR=0.928;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=236;TCF=133;TCR=103;TR=68;WE=21354978;WS=21354960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:205,77:0.27:282
chr22	21356538	rs368989	A	T	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=2.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.33;ReadPosRankSum=0.583;SOR=1.038;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,18:0.24:74
chr22	21357006	rs4822808	C	T	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-3.719;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=84;ReadPosRankSum=0.459;SC=CGGCTCACTGCAAACTCCGCC;SOR=0.818;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=6;WE=21357014;WS=21356996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr22	21372405	rs2073598	G	T	4891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.476;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=107;PP=2851;ReadPosRankSum=-0.178;SC=CAGCCCCAGGGGGCCACCCGT;SOR=0.908;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=246;TCF=111;TCR=135;TR=190;WE=21372413;WS=21372395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,214:0.77:278
chr22	21372467	rs2073599	C	G	1644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.493;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=49;PP=1163;ReadPosRankSum=0.661;SC=TGCTCGGTGTCCCCCAGGCAC;SOR=2.147;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=85;TCF=19;TCR=66;TR=59;WE=21372475;WS=21372457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,63:0.67:94
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chr22	21377958	rs929671	A	C	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.48;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
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chr22	21385985	rs402931	C	T	973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.332;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=25;PP=481;ReadPosRankSum=-0.703;SC=TCAGGTCCAGCGTGGACAGGC;SOR=0.563;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=141;TCF=64;TCR=77;TR=48;WE=21385993;WS=21385975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,55:0.35:155
chr22	21388605	rs2541956	T	C	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=138;ReadPosRankSum=-0.100;SC=GAGGCTGAGGTGAGAGGATCA;SOR=0.330;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=10;WE=21388613;WS=21388595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr22	21400282	rs12170538	G	C	1278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=6.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.18;ReadPosRankSum=-1.629;SOR=0.424;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,60:0.62:97
chr22	21401570	rs73164868	G	A	1035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.467;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=14;PP=600;ReadPosRankSum=0.914;SC=AGGCCAGGTAGTGACACAGGG;SOR=0.200;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=58;TCF=41;TCR=17;TR=41;WE=21401578;WS=21401560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,45:0.73:62
chr22	21401833	rs73164869	C	T	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.702;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=338;ReadPosRankSum=2.144;SC=GGAGAGGCCTCGGGAGACAGC;SOR=1.189;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=20;WE=21401841;WS=21401823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
chr22	21403226	rs73164871	G	C	552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.283;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=11;PP=301;ReadPosRankSum=1.534;SC=CCGAGGAGTGGTTCTGTCCCC;SOR=0.561;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=36;TCF=20;TCR=16;TR=23;WE=21403234;WS=21403216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,27:0.66:41
chr22	21403375	rs28504593	CC	AT	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.52;MQRankSum=-1.263;QD=9.68;ReadPosRankSum=-0.331;SOR=0.829;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,7:0.27:26
chr22	21411598	rs46148	T	C	836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=20;PP=625;SC=CCCTGCCCAGTTACACAGCGT;SOR=2.147;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=27;WE=21411606;WS=21411588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr22	21576361	rs200542750	T	C	58.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=19.43;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr22	21800042	rs467181	T	C	1269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.563;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=24;PP=733;ReadPosRankSum=-1.158;SC=CGGCCTCTGCTCCTCCCGTTG;SOR=0.622;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=159;TCF=91;TCR=68;TR=57;WE=21800050;WS=21800032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,68:0.37:183
chr22	21800444	rs128477	T	C	1047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FS=0.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.21;ReadPosRankSum=-0.318;SOR=0.740;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:135,66:0.33:201
chr22	21983853	rs861856	G	A	6025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=113;PP=2965;SC=AGCTCTGGGGGTCCTCGCGAG;SOR=1.042;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=199;TCF=86;TCR=113;TR=199;WE=21983861;WS=21983843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr22	21984205	rs710177	A	G	321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=6;PP=143;SC=CGCTGGTCACAGCCCCGGCCA;SOR=1.179;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=10;WE=21984213;WS=21984195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr22	21988524	rs861854	C	T	869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.428;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=20;PP=492;ReadPosRankSum=0.185;SC=GGCGACTGAGCGCATGGCTGC;SOR=0.556;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=120;TCF=58;TCR=62;TR=43;WE=21988532;WS=21988514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,48:0.36:134
chr22	21988599	rs371513	G	A	1851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.275;HP=1;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=34;PP=2308;ReadPosRankSum=-1.682;SC=GCCAAGTGGTGGACGGCGGGC;SOR=0.425;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=118;TCF=65;TCR=53;TR=72;WE=21988610;WS=21988589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,81:0.62:131
chr22	21988602	rs861853	C	T	1054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.224;HP=2;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=19;PP=1680;ReadPosRankSum=1.396;SC=AAGTGGTGGACGGCGGGCACA;SOR=1.000;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=117;TCF=65;TCR=52;TR=46;WE=21988610;WS=21988589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,51:0.39:132
chr22	21991072	rs861852	T	C	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=2.683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.37;ReadPosRankSum=-0.827;SOR=0.458;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,33:0.28:117
chr22	22007143	rs395006	G	A	244.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=1;PP=171;SC=GAAGACCCCAGGGACGCACCC;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=22007151;WS=22007133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr22	22007370	rs372150	T	C	1351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.65;ReadPosRankSum=1.120;SOR=0.743;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,63:0.64:99
chr22	22007528	rs861843	C	G	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.719;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=132;ReadPosRankSum=0.490;SC=GCAGAGGCCCCGCCCCAGCCA;SOR=1.179;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=22;TCF=14;TCR=8;TR=11;WE=22007536;WS=22007518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr22	22024150	rs2247115	C	T	535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.780;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=9;PP=287;ReadPosRankSum=0.423;SC=CCAAAGACTTCGTCCTCTTTA;SOR=0.939;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=96;TCF=64;TCR=32;TR=30;WE=22024158;WS=22024140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,33:0.32:102
chr22	22024507	rs402225	G	A	894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=3;PP=630;SC=ATAAGTAAATGAAATACAAAA;SOR=3.334;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=25;WE=22024515;WS=22024497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr22	22025462	rs1647705	A	G	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.49;ReadPosRankSum=0.519;SOR=0.754;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,31:0.24:127
chr22	22036832	rs1669112	T	C	2241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=52;PP=1275;SC=GTCCCCTGCCTGCCTGCCCCA;SOR=2.010;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=23;TCR=52;TR=75;WE=22036840;WS=22036822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr22	22036883	.	G	GCTGCCTCCTCAGTCTAGCTCTTACATCTCCTCCCCGATC	281.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.555;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.06;ReadPosRankSum=1.059;SOR=0.746;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
chr22	22039199	rs861833	C	T	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.448;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=70;ReadPosRankSum=-0.016;SC=ACAAGCTGAACGCTGTGAGTG;SOR=1.002;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=40;TCF=16;TCR=24;TR=9;WE=22039207;WS=22039189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,9:0.21:42
chr22	22040713	rs861831	G	A	951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FS=0.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.02;ReadPosRankSum=-0.898;SOR=0.759;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,55:0.35:158
chr22	22042079	rs741617	G	T	690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=21;PP=515;ReadPosRankSum=1.380;SC=CGGGGGCTGGGTGGGCTTGTC;SOR=0.968;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=26;WE=22042087;WS=22042069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,27:0.73:37
chr22	22042318	rs861829	C	T	1254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.576;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=26;PP=760;ReadPosRankSum=1.695;SC=CGGTGGGCCTCGGGTCTCAGA;SOR=0.632;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=152;TCF=90;TCR=62;TR=60;WE=22042326;WS=22042308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,66:0.38:173
chr22	22042440	rs861828	C	T	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.324;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=230;ReadPosRankSum=0.304;SC=TTGGCTGCTCCGTGGGGCATG;SOR=0.984;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=54;TCF=10;TCR=44;TR=17;WE=22042448;WS=22042430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,18:0.30:61
chr22	22042918	rs2278118	C	T	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.697;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=272;ReadPosRankSum=0.116;SC=CTGCCCCAGGCTGGGCTCAGC;SOR=0.399;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=18;WE=22042926;WS=22042908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr22	22048770	rs2070504	C	G	205.56	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5436;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=123;ReadPosRankSum=-0.282;SC=TGCCCAAGGACCACCAGGCCA;SOR=0.859;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=7;WE=22048778;WS=22048760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr22	22049369	rs861820	G	T	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=74;ReadPosRankSum=-0.721;SC=CGTGAGTGCCGCGGGGCTGGC;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=6;WE=22049377;WS=22049359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,6:0.24:25
chr22	22055280	rs710172	A	G	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=1.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.23;ReadPosRankSum=0.247;SOR=0.465;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,16:0.24:68
chr22	22055394	rs1860	A	G	1125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.450;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=29;PP=617;ReadPosRankSum=0.711;SC=AACAGCATTCAAAGGAGAAGG;SOR=0.578;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=204;TCF=101;TCR=103;TR=62;WE=22055402;WS=22055384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,71:0.31:232
chr22	22057997	.	C	CGG	561.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.205;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.75;ReadPosRankSum=0.234;SOR=1.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr22	22058000	rs861814	C	G	1404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=4;PP=795;SC=AAACTCCCGGCGGGGGGATGG;SOR=3.675;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=34;WE=22058008;WS=22057987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr22	22058586	rs861813	T	C	1566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=40;PP=1071;SC=AGTTCAGATGTGCTCACGCTG;SOR=2.066;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=15;TCR=40;TR=55;WE=22058594;WS=22058576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr22	22221530	rs9610504	G	A	1009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.189;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=15;PP=666;ReadPosRankSum=1.802;SC=GCCTGAGGCCGAGGCGCGGGC;SOR=1.004;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=59;TCF=38;TCR=21;TR=44;WE=22221538;WS=22221520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,44:0.73:60
chr22	22287862	rs2027789	G	A	5601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=105;NR=86;PP=2965;SC=GGCGGGCAGCGTTGGTGTGCA;SOR=0.856;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=191;TCF=105;TCR=86;TR=191;WE=22287870;WS=22287852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr22	22287964	rs2027790	T	C	5108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=105;PP=2860;SC=GGTGGGGATGTGGTGGGAGTC;SOR=1.083;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=183;TCF=78;TCR=105;TR=183;WE=22287972;WS=22287954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr22	22288011	rs9607409	G	A	1283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=36;PP=843;ReadPosRankSum=0.624;SC=CCAGTGGGGCGTGGCGCCAGG;SOR=0.725;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=93;TCF=30;TCR=63;TR=53;WE=22288019;WS=22288001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,56:0.59:95
chr22	22288309	rs94194	T	C	398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=12;NR=2;PP=293;SC=TCAGCCTTGGTGGGCAGCTCT;SOR=3.912;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=22288317;WS=22288299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr22	22288560	rs9610645	G	A	1590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.840;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=28;PP=961;ReadPosRankSum=-0.737;SC=TCCCAAAGGCGGTTAAAGAAA;SOR=0.785;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=101;TCF=56;TCR=45;TR=67;WE=22288568;WS=22288550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,71:0.67:106
chr22	22312315	rs71316717	C	T	685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.704;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-6.433;NF=17;NR=31;PP=613;ReadPosRankSum=0.417;SC=GCTACTCTGGCGGCAGCAGGA;SOR=0.999;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=123;TCF=48;TCR=75;TR=48;WE=22312323;WS=22312305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,38:0.34:111
chr22	22312350	rs2187583	GG	CC	614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=6.175;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.38;MQRankSum=-5.101;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.658;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,19:0.34:56
chr22	22312790	rs4638895	C	G	533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=10.752;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.937;NF=18;NR=5;PP=339;ReadPosRankSum=0.447;SC=AGAGTCCAGCCTGGTGCAAGG;SOR=2.030;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=23;WE=22312798;WS=22312780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,24:0.86:28
chr22	22313669	rs2266972	G	A	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=130;ReadPosRankSum=1.330;SC=TCCGCAACACGTGGTCAAGGG;SOR=0.512;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=8;WE=22313677;WS=22313659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr22	22313829	rs239918	A	C	539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=1;PP=445;SC=GGTGTCACTGACCTGGCCTAC;SOR=3.611;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=22313837;WS=22313819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr22	22316631	rs239915	G	A	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.606;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=89;ReadPosRankSum=-1.217;SC=GGGGATGCCCGCTGTGGACCT;SOR=0.283;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=7;WE=22316639;WS=22316629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr22	22317337	rs239914	C	T	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.053;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=9;PP=152;ReadPosRankSum=1.148;SC=CCAGTACTCTCGCTCGAGCAG;SOR=0.510;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=55;TCF=25;TCR=30;TR=18;WE=22317345;WS=22317327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,20:0.33:60
chr22	22318538	rs9610728	C	T	2300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=39;PP=1485;ReadPosRankSum=-0.101;SC=CTCACCGTGTCGGCCCAGTAG;SOR=0.751;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=132;TCF=74;TCR=58;TR=89;WE=22318546;WS=22318528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,99:0.68:146
chr22	22318671	rs9610729	G	A	1759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=44;PP=956;ReadPosRankSum=0.762;SC=TCTGCATGGCGTGCTGCGGCC;SOR=0.716;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=45;TCR=67;TR=74;WE=22318679;WS=22318661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,82:0.66:124
chr22	22322138	rs9610750	G	A	1460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.507;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=39;PP=1007;ReadPosRankSum=1.295;SC=GTCTCCAGGTGAGCCCAACGC;SOR=0.882;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=106;TCF=46;TCR=60;TR=65;WE=22322146;WS=22322128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,69:0.58:118
chr22	22322192	rs9607460	C	A	636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=19;PP=412;ReadPosRankSum=0.851;SC=GTCTGGGAGCCAAATAGCCCT;SOR=0.824;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=45;TCF=15;TCR=30;TR=28;WE=22322200;WS=22322182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,29:0.62:47
chr22	22324542	rs139881270	A	AGTGAGG	547.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.226;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=559;ReadPosRankSum=-1.043;SC=GCTGAGGGAGAGTGAGGGTGT;SOR=2.235;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=10;WE=22324550;WS=22324532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr22	22325624	rs34239349	G	A	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.388;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.83;ReadPosRankSum=-0.832;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr22	22329851	rs9610773	G	C	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=141;ReadPosRankSum=0.601;SC=GCCAGGAGTGGAAGCAAATGC;SOR=0.627;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=8;WE=22329859;WS=22329841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr22	22330082	rs239927	T	C	2383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=35;PP=1197;SC=CAGTCTTCATTTTGTCTCGGT;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=69;TCF=34;TCR=35;TR=69;WE=22330090;WS=22330072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr22	22330107	rs762474	T	G	1020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.849;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=23;PP=587;ReadPosRankSum=-2.191;SC=CACACTCCAGTTTCGGGGCAC;SOR=0.816;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=65;TCF=31;TCR=34;TR=40;WE=22330115;WS=22330097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,47:0.59:80
chr22	22453513	rs9611014	C	T	4582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=86;PP=2731;ReadPosRankSum=-0.174;SC=GGTCCCTGATCGCTTCTCTGG;SOR=0.675;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=278;TCF=148;TCR=130;TR=184;WE=22453521;WS=22453503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,202:0.66:304
chr22	22516883	rs34221567	TC	T	1938.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.153;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.05;MQRankSum=1.514;NF=10;NR=25;PP=1157;ReadPosRankSum=-2.203;SC=TCGCATGGCATCAGCAGCAGC;SOR=0.775;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=35;TCR=89;TR=35;WE=22516891;WS=22516873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,65:0.31:212
chr22	22516998	rs2073453	C	T	2092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.453;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQ=60.01;MQRankSum=-0.712;NF=51;NR=45;PP=1084;ReadPosRankSum=-0.450;SC=TGGGGCTGACCGCTACCTCAC;SOR=0.594;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=242;TCF=123;TCR=119;TR=96;WE=22517006;WS=22516988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,112:0.40:283
chr22	22517026	rs738885	T	C	6953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=105;NR=113;PP=2965;SC=AACCTCCAGTTTGAGGATGAG;SOR=0.924;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=218;TCF=105;TCR=113;TR=218;WE=22517034;WS=22517016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chr22	22517136	rs737840	C	G	1012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=26;PP=670;ReadPosRankSum=1.277;SC=GGCTATTGTTCAGTGACAATT;SOR=0.726;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=11;TCR=36;TR=34;WE=22517144;WS=22517126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,39:0.74:53
chr22	22517162	rs737841	T	A	487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=323;ReadPosRankSum=-0.569;SC=TTTTAAAACATTTTCTGTATG;SOR=0.544;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=17;WE=22517170;WS=22517152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,19:0.83:23
chr22	22550339	rs9623052	G	C	5774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=107;NR=85;PP=2965;SC=CATCTCTCCCGACTGATCTCT;SOR=0.750;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=192;TCF=107;TCR=85;TR=192;WE=22550347;WS=22550329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr22	22550401	rs11705157	C	G	2246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.204;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=48;PP=1380;ReadPosRankSum=1.818;SC=TGACTCAGCCCCACTCTGTGT;SOR=0.840;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=153;TCF=73;TCR=80;TR=91;WE=22550409;WS=22550391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,102:0.58:175
chr22	22550450	rs2073447	C	G	1142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=29;PP=752;ReadPosRankSum=1.959;SC=CTCCTGCACCCGCAGCAGTGG;SOR=0.724;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=160;TCF=82;TCR=78;TR=59;WE=22550458;WS=22550440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,63:0.37:171
chr22	22550510	rs2073448	T	G	6710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=127;NR=97;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.940;SC=CCCGGGCAGTTCCCCCACCAC;SOR=0.341;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=224;TCF=127;TCR=97;TR=224;WE=22550518;WS=22550500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,246:1.00:247
chr22	22550760	rs5757323	A	G	1602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=37;PP=1062;SC=TGTCTCCACCAGAGAGGGTAG;SOR=1.961;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=16;TCR=37;TR=53;WE=22550768;WS=22550750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr22	22556270	rs5995639	T	C	645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=6.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.09;ReadPosRankSum=0.381;SOR=0.807;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,41:0.26:158
chr22	22556368	rs9306341	C	T	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FS=2.790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.88;ReadPosRankSum=-1.203;SOR=0.574;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:127,27:0.18:154
chr22	22556662	rs2330029	A	T	737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.996;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=23;PP=460;ReadPosRankSum=-1.589;SC=CATTAAATACAGGATTGTTGT;SOR=0.854;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=18;TCR=51;TR=31;WE=22556670;WS=22556652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,34:0.45:75
chr22	22569448	rs5750741	T	A	5966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=107;NR=84;PP=2965;SC=AACAGCAACATTGTTGGCAAC;SOR=0.777;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=191;TCF=107;TCR=84;TR=191;WE=22569456;WS=22569438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr22	22569554	rs6001413	C	A	3331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.334;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=73;PP=1817;ReadPosRankSum=0.615;SC=CAGAGAGATTCTCTGCATCCA;SOR=0.884;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=204;TCF=98;TCR=106;TR=134;WE=22569562;WS=22569544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,153:0.65:236
chr22	22569640	rs6001415	T	G	1943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=41;PP=1188;SC=TGCTCAGCATTGGACAGCAGC;SOR=1.643;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=23;TCR=41;TR=64;WE=22569648;WS=22569630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr22	22577741	rs199930025	C	T	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.80;MQRankSum=-2.772;QD=6.12;ReadPosRankSum=-0.908;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr22	22577869	rs201277699	A	G	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.396;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.85;MQRankSum=-1.769;QD=2.44;ReadPosRankSum=0.432;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr22	22578408	rs9623095	C	T	931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=17;PP=455;SC=GCTACTCTGGCGGCAGCAGGA;SOR=1.308;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=33;TCF=15;TCR=18;TR=30;WE=22578416;WS=22578398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr22	22578443	rs76789895	GG	CC	965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=1.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;JOINED;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.243;NF=10;NR=11;PP=606;ReadPosRankSum=-0.594;SC=TCTCACTCCCGGGGCAGCCTG;SOR=1.051;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=29;TCF=15;TCR=14;TR=21;WE=22578452;WS=22578433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,24:0.86:28
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chr22	22707299	rs34503659	A	C	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=9.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQRankSum=-3.579;QD=4.56;ReadPosRankSum=2.376;SOR=0.124;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,17:0.29:58
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chr22	22707557	rs201334749	C	G	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FS=1.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQRankSum=-3.903;QD=0.52;ReadPosRankSum=-1.994;SOR=0.900;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:177,24:0.12:201
chr22	22707564	.	G	C	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.452;ClippingRankSum=0.000;DP=184;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQRankSum=-5.106;QD=0.19;ReadPosRankSum=-2.822;SOR=0.690;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:164,19:0.10:183
chr22	22712021	.	C	CCGGGGA	490.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.80;QD=49.07;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr22	22712027	rs66722503	GA	G	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.26;MQRankSum=0.995;QD=26.65;ReadPosRankSum=0.538;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,10:0.83:12
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chr22	22712276	rs5757971	A	G	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=5.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.00;MQRankSum=0.000;QD=4.94;ReadPosRankSum=0.152;SOR=0.462;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,11:0.28:40
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chr22	22730530	.	C	T	1101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.442;ClippingRankSum=0.000;DP=366;ExcessHet=3.0103;FS=1.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQRankSum=-14.844;QD=3.01;ReadPosRankSum=3.715;SOR=0.791;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:316,50:0.14:366
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chr22	22730566	rs61731380	G	C	733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FS=0.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQRankSum=-14.498;QD=2.13;ReadPosRankSum=-3.289;SOR=0.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:303,42:0.12:345
chr22	22730583	.	G	A	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.332;ClippingRankSum=0.000;DP=297;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQRankSum=-14.924;QD=2.25;ReadPosRankSum=-4.415;SOR=0.742;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:266,31:0.10:297
chr22	22730584	rs1985918	T	G	3375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.457;HP=1;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=70;PP=2103;ReadPosRankSum=1.931;SC=GACTCAGCCGTCTTCCCTCTC;SOR=0.635;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=265;TCF=126;TCR=139;TR=141;WE=22730592;WS=22730574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,154:0.59:263
chr22	22730586	.	T	C	662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.066;ClippingRankSum=0.000;DP=298;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQRankSum=-13.964;QD=2.22;ReadPosRankSum=-5.285;SOR=0.636;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:263,35:0.12:298
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chr22	22730619	rs61731379	TC	AT	1205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FS=1.326;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQRankSum=-8.878;QD=4.86;ReadPosRankSum=-0.979;SOR=0.547;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:204,44:0.18:248
chr22	22730696	rs79492832	C	T	2504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQRankSum=-2.176;QD=20.04;ReadPosRankSum=-0.117;SOR=0.645;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,65:0.52:125
chr22	22730702	rs61731373	A	G	2491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQRankSum=-2.120;QD=20.76;ReadPosRankSum=-0.371;SOR=0.730;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,64:0.53:120
chr22	22730787	rs201218283	GG	AA	1927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.382;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.837;NF=28;NR=16;PP=2944;ReadPosRankSum=-1.464;SC=AAGATGCTTCGGCCAATGCAG;SOR=0.537;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=137;TCF=89;TCR=48;TR=44;WE=22730808;WS=22730777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,54:0.36:152
chr22	22730799	rs199678761	GA	CC	2039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQRankSum=-4.443;QD=11.66;ReadPosRankSum=-0.819;SOR=0.701;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,57:0.33:175
chr22	22730829	rs140157920	G	A	3752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FS=4.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQRankSum=-4.212;QD=13.26;ReadPosRankSum=-1.000;SOR=0.949;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:181,102:0.36:283
chr22	22730849	.	GTA	G	4603.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.941;ClippingRankSum=0.000;DP=340;ExcessHet=3.0103;FS=3.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQRankSum=-4.113;QD=13.54;ReadPosRankSum=-0.037;SOR=0.864;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:215,125:0.37:340
chr22	22730853	.	G	GCC	4912.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=0.000;DP=343;ExcessHet=3.0103;FS=3.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQRankSum=-3.893;QD=14.32;ReadPosRankSum=-0.086;SOR=0.881;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:217,126:0.37:343
chr22	22730860	rs117244515	C	T	5241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=365;ExcessHet=3.0103;FS=1.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQRankSum=-3.527;QD=14.36;ReadPosRankSum=0.241;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:226,139:0.38:365
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chr22	22731041	.	C	T	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.094;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.03;MQRankSum=-5.135;QD=8.53;ReadPosRankSum=1.433;SOR=0.458;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,7:0.25:28
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chr22	22731059	rs375005175	AAAAC	A	166.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.272;NF=0;NR=2;PP=92;ReadPosRankSum=0.964;SC=TCAGTAAAACAAAACAAAACA;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=2;WE=22731070;WS=22731040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
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chr22	22735735	rs200574153	T	TG	1779.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.635;HP=3;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-6.379;NF=4;NR=25;PP=2238;ReadPosRankSum=2.429;SC=TCCAGGCCAATAGGGAACTGA;SOR=0.968;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=56;TCF=5;TCR=51;TR=29;WE=22735744;WS=22735722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,47:0.47:99
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chr22	22842957	rs2236729	T	G	5022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=87;PP=2965;SC=CAATTCATTTTCCCTATCAAG;SOR=0.861;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=78;TCR=87;TR=165;WE=22842965;WS=22842947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr22	22843118	rs2236730	C	T	3200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=50;PP=1953;SC=CTGAAGGGAACGAAGCTGAAG;SOR=0.744;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=57;TCR=50;TR=106;WE=22843126;WS=22843108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
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chr22	22868493	rs361666	G	T	6523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.30;SOR=0.809;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
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chr22	22869649	rs361721	G	C	4634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=70;PP=2465;SC=ACAGAGAAACGGGCATGATGG;SOR=0.777;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=152;TCF=82;TCR=70;TR=152;WE=22869657;WS=22869639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr22	22869742	rs361959	C	A	5090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=69;PP=2965;SC=TTCTTCTTGACTTTGAGCCTG;SOR=0.982;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=168;TCF=99;TCR=69;TR=168;WE=22869750;WS=22869732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr22	22891081	rs2072049	G	T	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.959;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=14;PP=313;ReadPosRankSum=-0.820;SC=AATAGACAAAGCAGTTAGTGC;SOR=0.201;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=53;TCF=17;TCR=36;TR=25;WE=22891089;WS=22891071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,27:0.47:57
chr22	22898414	.	AT	A	93.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=-0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.52;ReadPosRankSum=-0.349;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr22	22899234	rs1129172	A	G	757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.68;ReadPosRankSum=0.213;SOR=0.724;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:113,49:0.30:162
chr22	22899363	rs8139318	GA	AG	807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;JOINED;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=14;PP=757;ReadPosRankSum=0.531;SC=CCAAAAAGAAGAATACATGTA;SOR=0.751;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=82;TCF=34;TCR=48;TR=23;WE=22899372;WS=22899353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,25:0.26:96
chr22	22899414	rs2283800	A	G	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=137;ReadPosRankSum=0.725;SC=AAACCTCCGCAAATACTGCTG;SOR=1.075;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=9;WE=22899422;WS=22899404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
chr22	22930770	rs6002909	A	G	5378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=89;PP=2965;SC=CCTCTGAGCTAATGCTTGGTC;SOR=0.703;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=182;TCF=93;TCR=89;TR=182;WE=22930778;WS=22930760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr22	22989256	rs2904923	A	G	742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FS=2.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQRankSum=-10.651;QD=3.70;ReadPosRankSum=-3.046;SOR=0.791;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:147,54:0.27:201
chr22	23010943	rs406876	G	A	912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=25;PP=571;ReadPosRankSum=-0.233;SC=CTGGCAATGCGTCCTTTGTCC;SOR=0.748;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=152;TCF=79;TCR=73;TR=52;WE=23010951;WS=23010933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,54:0.33:163
chr22	23029263	rs443102	T	C	4678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=95;NR=61;PP=2965;SC=TCTCCCCCTCTTCACTCTCTG;SOR=1.106;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=156;TCF=95;TCR=61;TR=156;WE=23029271;WS=23029253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr22	23029374	rs451369	G	A	6368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=106;NR=113;PP=2965;SC=AAGCCCAGACGCAGCCTCTGG;SOR=0.816;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=219;TCF=106;TCR=113;TR=219;WE=23029382;WS=23029364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr22	23029698	rs443756	T	C	6621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=114;NR=117;PP=2965;SC=AGGCAGAAGATGAGGCTGACT;SOR=0.750;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=231;TCF=114;TCR=117;TR=231;WE=23029706;WS=23029688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr22	23029846	rs200665672	T	C	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.377;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.316;NF=6;NR=11;PP=164;ReadPosRankSum=-1.858;SC=AAGCCATGAGTAGGCTTGGCC;SOR=0.086;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=56;TCF=11;TCR=45;TR=17;WE=23029854;WS=23029836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,17:0.27:62
chr22	23029871	.	C	T	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.483;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.371;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.534;NF=1;NR=5;PP=33;ReadPosRankSum=-0.627;SC=TCACCCAAATCTGAACCCCCA;SOR=0.061;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=6;WE=23029879;WS=23029861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,6:0.20:30
chr22	23029876	.	C	T	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.689;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=6.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQRankSum=-3.187;QD=5.94;ReadPosRankSum=-1.895;SOR=0.021;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,5:0.24:21
chr22	23040362	rs5996349	A	G	610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=1;PP=446;SC=CTCTGAGGCAAAGGGGATAAG;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=23040370;WS=23040352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr22	23040389	rs6003229	G	C	1038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=10;PP=698;SC=CTGGGGCAGGGCCAGTGCTGG;SOR=1.670;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=24;TCR=10;TR=34;WE=23040397;WS=23040379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr22	23040462	rs1312	T	C	2476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=51;NR=30;PP=1430;SC=TGCTCCTCACTCTCCTCACTC;SOR=1.095;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=51;TCR=30;TR=81;WE=23040470;WS=23040452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr22	23040586	rs150422907	T	C	1082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.59;MQRankSum=2.008;QD=14.63;ReadPosRankSum=-1.959;SOR=0.540;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,47:0.64:74
chr22	23040767	rs5751516	G	T	2279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=31;PP=1207;SC=ATTTATGAGGGCAGTAAGCGG;SOR=0.716;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=40;TCR=31;TR=71;WE=23040775;WS=23040757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr22	23055331	rs1972840	T	C	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.521;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=119;ReadPosRankSum=1.565;SC=ACCTCTCTCTTATTTATTTAT;SOR=0.193;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=9;WE=23055339;WS=23055321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr22	23055421	rs1985790	G	A	1188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.503;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.577;NF=18;NR=16;PP=362;ReadPosRankSum=0.396;SC=AGCCACCCTCGGTGTCAGTGG;SOR=0.480;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=117;TCF=69;TCR=48;TR=34;WE=23055429;WS=23055411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,37:0.28:131
chr22	23055440	rs1008910	C	A	1269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.665;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-2.805;NF=21;NR=18;PP=478;ReadPosRankSum=-0.383;SC=GGCCCCAGGACAGACGGCCAG;SOR=0.602;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=134;TCF=75;TCR=59;TR=39;WE=23055448;WS=23055430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,43:0.28:155
chr22	23055533	rs4446155	G	A	1875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=0.615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=-4.273;QD=11.30;ReadPosRankSum=0.733;SOR=0.770;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:114,52:0.31:166
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chr22	23089941	rs3087123	ACT	A	688.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.694;NF=4;NR=12;PP=556;ReadPosRankSum=-0.568;SC=CCCCCTCCTCACTCTCTGCAC;SOR=0.691;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=15;TCR=48;TR=16;WE=23089950;WS=23089931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,23:0.26:87
chr22	23090423	rs34605189	G	C	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=0.985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQRankSum=-7.148;QD=1.67;ReadPosRankSum=-2.258;SOR=0.862;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,19:0.16:120
chr22	23090438	rs56223989	A	G	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=2.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQRankSum=-8.134;QD=1.00;ReadPosRankSum=-2.402;SOR=1.241;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,12:0.13:93
chr22	23101247	rs4822303	GC	AT	576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.274;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-8.676;NF=11;NR=6;PP=486;ReadPosRankSum=-0.942;SC=GGGCTCTGCTGCTCCTCACCC;SOR=1.029;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=65;TCF=44;TCR=21;TR=17;WE=23101256;WS=23101237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,18:0.23:78
chr22	23101280	rs1894244	C	T	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=2.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQRankSum=-8.351;QD=6.20;ReadPosRankSum=2.248;SOR=1.101;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,20:0.21:94
chr22	23101301	rs4822305	A	G	723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=0.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.49;MQRankSum=-6.808;QD=6.83;ReadPosRankSum=1.205;SOR=0.826;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,27:0.25:106
chr22	23101347	rs1894245	G	A	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.51;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.899;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.114;NF=12;NR=10;PP=189;ReadPosRankSum=0.318;SC=CAGGCTCACCGGGGCCCAGCA;SOR=0.572;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=78;TCF=43;TCR=35;TR=22;WE=23101355;WS=23101337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,24:0.29:84
chr22	23101523	rs3737543	G	A	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=5.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQRankSum=-0.556;QD=3.78;ReadPosRankSum=1.092;SOR=1.316;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,17:0.26:66
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chr22	23114239	rs8138758	T	C	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=153;ReadPosRankSum=0.054;SC=CATCATGGGCTGTTCTCTCCA;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=30;TCR=11;TR=14;WE=23114247;WS=23114229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,14:0.32:44
chr22	23114285	rs8138785	T	C	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=0.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.70;ReadPosRankSum=-0.526;SOR=0.539;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,33:0.34:98
chr22	23114327	rs6003299	T	C	1454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=2.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.39;ReadPosRankSum=1.491;SOR=0.581;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:97,43:0.31:140
chr22	23114350	rs5996382	A	G	1460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.643;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=22;PP=436;ReadPosRankSum=-0.369;SC=TCTCCTCCTCAGCCTCCTCGC;SOR=0.744;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=144;TCF=77;TCR=67;TR=45;WE=23114358;WS=23114340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,48:0.31:156
chr22	23114993	rs2073451	G	A	1625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.454;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=42;PP=915;ReadPosRankSum=0.643;SC=AGGGAACACCGCCACCCTAAC;SOR=0.651;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=266;TCF=143;TCR=123;TR=87;WE=23115001;WS=23114983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:190,96:0.34:286
chr22	23135588	rs2016511	G	A	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.254;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=183;ReadPosRankSum=-0.778;SC=CCCTGTGCAAGGGGCTTCCTG;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=9;WE=23135596;WS=23135578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr22	23165839	rs5844528	G	GC	3817.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=42;PP=2080;SC=GGGCTCTCAGGCCCCTTCTTG;SOR=0.856;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=10;TCR=42;TR=52;WE=23165847;WS=23165829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr22	23223070	rs378183	G	A	628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=19;PP=317;ReadPosRankSum=1.681;SC=CAGGGCCCCCGCCTGTGGTGG;SOR=0.681;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=34;TCR=60;TR=30;WE=23223078;WS=23223060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,35:0.35:99
chr22	23247028	rs464478	A	G	1335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=8;PP=763;SC=TCTGTGGGTTAAGTGTGGGGG;SOR=2.252;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=36;WE=23247036;WS=23247018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr22	23247082	rs2009433	C	T	2828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=53;NR=37;PP=1409;SC=GGACCACTGGCCCCAGCTTCC;SOR=0.956;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=90;TCF=53;TCR=37;TR=90;WE=23247090;WS=23247072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr22	23248758	rs1059142	G	A	974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.75;QD=24.37;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr22	23248839	rs7117	A	T	273.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.76;QD=30.42;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr22	23256464	rs463185	G	C	6231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=113;NR=100;PP=2965;SC=GTGAGGGGACGGAGCTGACCG;SOR=0.761;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=215;TCF=113;TCR=102;TR=213;WE=23256472;WS=23256454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr22	23260276	rs139283039	GGC	G	417.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=18;PP=378;ReadPosRankSum=-1.189;SC=GGGGTTGGGGGGCGGGGTGGC;SOR=0.824;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=38;TCF=19;TCR=19;TR=33;WE=23260287;WS=23260266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,23:0.40:57
chr22	23260278	rs59884698	CGG	C	699.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.048;HP=10;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=18;PP=375;ReadPosRankSum=1.547;SC=GGTTGGGGGGCGGGGTGGCCT;SOR=0.526;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=38;TCF=19;TCR=19;TR=33;WE=23260287;WS=23260266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,34:0.59:58
chr22	23260507	rs410521	T	A	1107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=14;NR=25;PP=710;SC=CTGGCCCCAATTTCCTCCAGC;SOR=1.402;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=14;TCR=25;TR=39;WE=23260515;WS=23260497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr22	23262162	rs375081	C	A	90.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.51;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr22	23263602	rs373405	C	T	1602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=34;NR=18;PP=825;SC=CAGCTGACCGCCCTCGGTAAG;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=34;TCR=18;TR=52;WE=23263610;WS=23263592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr22	23263708	rs737885	T	G	565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.065;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=401;ReadPosRankSum=1.314;SC=CCTGTCTGGATGTCTGGAATC;SOR=1.655;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=35;TCF=13;TCR=22;TR=21;WE=23263716;WS=23263698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,23:0.59:39
chr22	23438191	rs1805058	C	T	1340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=3.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.688;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=37;PP=836;ReadPosRankSum=-0.427;SC=GCGCCTACGACGCTGTGCAGC;SOR=0.829;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=219;TCF=100;TCR=119;TR=65;WE=23438212;WS=23438181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:177,75:0.30:252
chr22	23482460	rs4822360	A	G	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=4.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.39;ReadPosRankSum=1.515;SOR=1.688;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,7:0.16:45
chr22	23482483	rs35211242	G	A	1239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=15;PP=678;ReadPosRankSum=-0.325;SC=TTTCTGCCTCGTCTGGAGGTC;SOR=0.638;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=55;TCF=38;TCR=17;TR=47;WE=23482491;WS=23482473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,50:0.83:60
chr22	23482718	rs4822361	C	T	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.823;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=38;ReadPosRankSum=-1.851;SC=TACTTCTCATCTGATCCTCCA;SOR=1.751;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=4;WE=23482726;WS=23482708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr22	23497998	rs5759607	G	A	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.301;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=42;ReadPosRankSum=0.920;SC=GGAGCTGGGGGTAGGGACATC;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=4;WE=23498006;WS=23497988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr22	23501286	rs2246716	T	G	978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=20;PP=668;ReadPosRankSum=-0.560;SC=GGCAGCTGCCTATCCCCCTGG;SOR=0.739;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=87;TCF=52;TCR=35;TR=46;WE=23501294;WS=23501276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,47:0.49:95
chr22	23502987	rs9612252	A	G	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.393;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=123;ReadPosRankSum=-0.329;SC=AGGGTAGGCTAGCCTGGCTTT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=7;WE=23502995;WS=23502977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr22	23503008	rs9612253	T	C	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=206;ReadPosRankSum=-0.262;SC=CACACCCAGATGCATTAAGGG;SOR=0.914;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=15;TCR=8;TR=15;WE=23503016;WS=23502998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr22	23503121	rs5759611	G	A	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.73;ReadPosRankSum=-2.327;SOR=0.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,26:0.21:124
chr22	23503170	rs5759612	A	G	2625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.526;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=46;PP=1405;ReadPosRankSum=-1.834;SC=CCAGGTCGGCAATGGAGACCT;SOR=0.406;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=134;TCF=77;TCR=57;TR=104;WE=23503178;WS=23503160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,117:0.76:154
chr22	23503205	rs5759613	G	C	2450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.393;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=47;PP=1166;ReadPosRankSum=-0.583;SC=GGTGTGACTGGGTTGGGCTGG;SOR=0.752;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=129;TCF=68;TCR=61;TR=96;WE=23503213;WS=23503195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,111:0.74:150
chr22	23503266	rs5759614	G	A	1767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.662;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=33;PP=902;ReadPosRankSum=0.728;SC=GTCACCTGAGGCCTTGCCATT;SOR=0.186;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=94;TCF=43;TCR=51;TR=70;WE=23503274;WS=23503256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,79:0.75:105
chr22	23503319	rs5759615	A	G	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.968;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=18;PP=390;ReadPosRankSum=-0.642;SC=CCCTCCTCTCAGGGTGTCACT;SOR=0.177;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=37;TCF=10;TCR=27;TR=27;WE=23503327;WS=23503309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,30:0.75:40
chr22	23503533	rs5759617	G	T	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.714;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=2;PP=433;ReadPosRankSum=-1.726;SC=GTGCCTGGAAGGCCCTCTCTT;SOR=2.387;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=22;WE=23503541;WS=23503523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,23:0.74:31
chr22	23503569	rs10775764	T	C	1082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.481;HP=1;HapScore=3;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=12;PP=1657;ReadPosRankSum=1.123;SC=ATTCAGGCCTTGAACAGCAGG;SOR=1.133;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=62;TCF=43;TCR=19;TR=42;WE=23503588;WS=23503559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,44:0.69:64
chr22	23503580	rs9608085	C	T	1285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.259;HP=2;HapScore=3;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=15;PP=1656;ReadPosRankSum=1.949;SC=GAACAGCAGGCCCAGAAGCTT;SOR=1.129;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=81;TCF=55;TCR=26;TR=51;WE=23503588;WS=23503559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,56:0.65:86
chr22	23503651	rs713682	C	T	3127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.755;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=56;PP=1772;ReadPosRankSum=-2.645;SC=TACAGGATTCCTGGTTGATGC;SOR=0.829;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=185;TCF=101;TCR=84;TR=124;WE=23503659;WS=23503641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,141:0.66:214
chr22	23503756	rs737818	G	A	1665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=1.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.799;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=39;PP=1060;ReadPosRankSum=-0.347;SC=TGCTAACTGGGGCCTGCGTGG;SOR=0.914;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=86;TCF=33;TCR=53;TR=60;WE=23503764;WS=23503746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,70:0.69:101
chr22	23503819	rs737819	T	C	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-3.195;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=127;ReadPosRankSum=0.221;SC=GACTGTGGTGTGGAGACTGGA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=8;WE=23503827;WS=23503809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr22	23504862	rs5759619	C	T	4765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.441;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=79;PP=2812;ReadPosRankSum=0.619;SC=AGCCCCAGGCCCCTGTCACCT;SOR=0.746;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=272;TCF=153;TCR=119;TR=183;WE=23504870;WS=23504852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,212:0.68:313
chr22	23504916	rs5759620	G	A	3685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.510;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=75;PP=2098;ReadPosRankSum=0.787;SC=GTTGCTTCCCGTAGATGGCGA;SOR=0.765;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=237;TCF=121;TCR=116;TR=147;WE=23504924;WS=23504906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,167:0.63:265
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chr22	23505084	rs5751594	G	C	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.468;HP=6;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=324;ReadPosRankSum=-1.094;SC=ATTTTTTGTAGTTTTTTATAT;SOR=0.136;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=23;WE=23505092;WS=23505074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
chr22	23523630	rs5751602	C	A	895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.83;ReadPosRankSum=0.027;SOR=0.497;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:170,64:0.27:234
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chr22	23540609	rs4822371	A	G	3163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=55;NR=46;PP=1647;SC=AAGGTTGGTGACCCCCAAAGA;SOR=0.853;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=101;TCF=55;TCR=46;TR=101;WE=23540617;WS=23540599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr22	23541488	rs2071436	C	T	857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.129;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=27;PP=559;ReadPosRankSum=1.169;SC=GAGGAAGCATCGGAGACTGGG;SOR=0.888;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=141;TCF=65;TCR=76;TR=46;WE=23541496;WS=23541478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,51:0.31:165
chr22	23585132	rs1004040	A	G	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.524;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=183;ReadPosRankSum=0.932;SC=CCTGGTGACAACATCTCTCCA;SOR=0.368;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=39;TCF=10;TCR=29;TR=14;WE=23585140;WS=23585122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,13:0.33:39
chr22	23610800	rs17533177	C	T	1257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.861;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=31;PP=784;ReadPosRankSum=0.136;SC=AAGATCTGGTCGTGAACCCCA;SOR=0.174;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=80;TCF=25;TCR=55;TR=52;WE=23610808;WS=23610790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,56:0.61:92
chr22	23615346	rs5759671	G	A	1023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.410;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=24;PP=674;ReadPosRankSum=1.257;SC=CCTCTGGACCGGGACCAAAAC;SOR=0.765;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=119;TCF=63;TCR=56;TR=49;WE=23615354;WS=23615336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,53:0.40:131
chr22	23615801	rs12233352	A	G	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.653;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=19;PP=470;ReadPosRankSum=1.590;SC=GTCTAACTCAAGTCTTTCTTC;SOR=0.621;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=147;TCF=88;TCR=59;TR=42;WE=23615809;WS=23615791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,43:0.26:166
chr22	23627369	rs140504	A	G	960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=23;PP=618;SC=CAGATCAAGAATGACATCCAG;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=31;WE=23627377;WS=23627359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr22	23627441	rs131675	T	C	174.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=5;PP=140;SC=GTGGCAGCAGTCCCCGCACAC;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=23627449;WS=23627431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr22	23629476	rs5759680	G	C	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=163;ReadPosRankSum=2.157;SC=GTGAGCGCCTGCTGTTCCGGC;SOR=0.813;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=13;WE=23629484;WS=23629466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr22	23631639	rs11090228	T	C	525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.579;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=10;PP=332;ReadPosRankSum=-0.988;SC=GGAGGTCCAGTGGGAGGGGCC;SOR=0.342;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=85;TCF=62;TCR=23;TR=29;WE=23631647;WS=23631629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,28:0.32:88
chr22	23631801	rs2227939	T	C	1244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.537;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=2.804;NF=21;NR=31;PP=1960;ReadPosRankSum=2.136;SC=TGACCATCAATAAGGAAGGTG;SOR=0.638;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=183;TCF=78;TCR=105;TR=52;WE=23631831;WS=23631791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,72:0.34:211
chr22	23631813	rs113087899	G	GC	1807.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FS=0.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.24;MQRankSum=2.659;QD=12.30;ReadPosRankSum=1.152;SOR=0.581;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,54:0.37:147
chr22	23631823	rs62219796	T	C	1717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=1.499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.45;ReadPosRankSum=0.648;SOR=0.522;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,49:0.36:138
chr22	23632513	rs16802	A	G	626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.630;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=12;PP=388;ReadPosRankSum=-0.189;SC=GACCTCTTTGATCTCTTGCGC;SOR=0.990;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=104;TCF=61;TCR=43;TR=33;WE=23632521;WS=23632503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,35:0.30:116
chr22	23632636	rs5759683	C	A	748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=23;PP=492;ReadPosRankSum=2.284;SC=TTGCAGCGGCCGAGCCAGGGT;SOR=0.746;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=109;TCF=48;TCR=61;TR=39;WE=23632644;WS=23632626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,42:0.34:123
chr22	23657477	rs180810	A	G	495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=56.57;NF=8;NR=0;PP=143;SC=CCCCACCCCCATCTCACTGTA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=23657485;WS=23657467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr22	23657495	rs180811	C	G	979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQ=58.88;NF=21;NR=6;PP=587;SC=GTAAGGGGTTCATGACACCAG;SOR=2.019;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=27;WE=23657503;WS=23657485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr22	23657735	rs180812	G	A	158.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=3;PP=83;SC=TCCTGGAGGCGGACAGATGGC;SOR=2.303;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=23657743;WS=23657725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr22	23735649	rs8135826	C	A	715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.93;QD=24.68;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr22	23779599	rs5996543	G	C	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=324;ReadPosRankSum=-1.738;SC=GGGTGTGCCTGGGACTTTAGG;SOR=0.537;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=35;TCF=24;TCR=11;TR=21;WE=23779607;WS=23779589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,26:0.63:41
chr22	23915652	rs73157031	G	A	2640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-1.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.575;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.646;NF=47;NR=45;PP=1287;ReadPosRankSum=-1.019;SC=TGCCTTCCAGGTCACCGTCAA;SOR=0.757;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=147;TCF=77;TCR=70;TR=92;WE=23915660;WS=23915642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,115:0.65:178
chr22	23959752	rs148388475	G	A	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FS=2.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.23;MQRankSum=-16.980;QD=1.89;ReadPosRankSum=-1.814;SOR=0.533;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:243,60:0.20:303
chr22	23961742	rs5844566	G	GGCACCCATAA	1436.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=20;PP=1460;SC=CCAGCATGGAGGTATCACAGA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=20;WE=23961750;WS=23961732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr22	23964282	rs10564183	GCAT	G	3278.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.53;MQRankSum=-2.414;QD=40.48;ReadPosRankSum=0.365;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,79:0.98:81
chr22	23967147	rs2877164	C	T	6936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=124;NR=107;PP=2965;SC=GCTGCACCCCCTACACAGATC;SOR=0.765;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=231;TCF=124;TCR=107;TR=231;WE=23967155;WS=23967137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chr22	23982724	rs56397271	T	C	8881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.65;QD=44.19;SOR=0.786;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr22	23982727	rs28645846	A	G	8906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.65;QD=44.53;SOR=0.754;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr22	23982792	rs9620294	T	C	3716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=56;NR=63;PP=2013;SC=TCTGAAGCTGTTGGTGCTGAT;SOR=0.907;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=120;TCF=57;TCR=63;TR=119;WE=23982800;WS=23982782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr22	24035970	rs2070446	C	T	3742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=52;PP=2123;SC=GGTGGTGCTCCACGAATGCTT;SOR=0.965;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=73;TCR=52;TR=125;WE=24035978;WS=24035960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr22	24037306	rs12170464	T	G	982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=29;PP=777;SC=GTTATTTTGTTTGGTTTTGAC;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=31;WE=24037314;WS=24037296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr22	24038847	rs1007298	T	C	1629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=30;NR=28;PP=938;SC=CCCCAGAGAGTCCAGATGAGG;SOR=0.790;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=30;TCR=28;TR=58;WE=24038855;WS=24038837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr22	24040194	rs141192221	A	AGT	4440.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=38;PP=1988;SC=GACCTATCCCAGGAGAAAATG;SOR=0.884;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=45;TCF=3;TCR=42;TR=41;WE=24040202;WS=24040184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr22	24086107	rs5759985	A	G	3298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.77;SOR=1.051;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr22	24094912	rs4820566	T	C	3424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.020;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=60;PP=2078;ReadPosRankSum=-0.016;SC=GCCAGGATCTTATGACCCTCA;SOR=0.509;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=220;TCF=133;TCR=87;TR=142;WE=24094920;WS=24094902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,156:0.64:243
chr22	24096464	rs45587437	C	T	922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.014;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=7;PP=570;ReadPosRankSum=0.934;SC=CTGTTCCCCACCCCACACCCA;SOR=1.426;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=58;TCF=45;TCR=13;TR=37;WE=24096472;WS=24096454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,40:0.61:66
chr22	24096726	rs45548434	T	A	1070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.922;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=27;PP=687;ReadPosRankSum=0.090;SC=TCTTCCCAAATGTCAGGGTCC;SOR=0.519;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=73;TCF=28;TCR=45;TR=45;WE=24096734;WS=24096716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,48:0.62:77
chr22	24106674	rs140181	G	A	5738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=109;NR=86;PP=2965;SC=GGCCCTGTCCGGCCTCCCACC;SOR=0.928;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=196;TCF=109;TCR=87;TR=195;WE=24106682;WS=24106664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr22	24107666	rs142829188	C	T	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=4.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.82;ReadPosRankSum=0.553;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,29:0.27:107
chr22	24107801	rs61117377	T	C	281.31	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.6715;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=178;ReadPosRankSum=-0.517;SC=TCAGATGCCCTTGGGATCACC;SOR=0.477;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=11;TCF=5;TCR=6;TR=10;WE=24107809;WS=24107791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr22	24108288	rs140182	C	G	2573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=33;PP=1489;SC=TCCCCCTCCCCGCCTGAGTCG;SOR=0.914;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=55;TCR=33;TR=88;WE=24108296;WS=24108278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr22	24108412	rs80027270	G	A	876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=25;PP=632;SC=GCCTGATCTCGTAGGCGCAGG;SOR=3.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=29;WE=24108420;WS=24108402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr22	24109550	rs131444	T	C	155.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=1;PP=82;SC=TCTCTTGGACTCGCTGCTCAC;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=24109558;WS=24109540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr22	24109774	rs179468	T	G	177.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=3;PP=130;SC=AGGGCGCGGCTGGGCGGCTGC;SOR=0.941;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=7;WE=24109782;WS=24109764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr22	24121378	rs738792	C	T	2607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=47;NR=41;PP=1473;SC=GCCTAGGACGCCCACCACCTC;SOR=0.713;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=47;TCR=41;TR=88;WE=24121386;WS=24121368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr22	24123730	.	GGA	G	95.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=-0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.393;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=132;ReadPosRankSum=-0.932;SC=GGGGGCCGAGGGAGAGAGAGT;SOR=0.061;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=4;WE=24123739;WS=24123720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr22	24125565	rs2877173	G	A	2344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=25;PP=1174;SC=CCCAGTGTCCGCTCGCCCAGG;SOR=1.259;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=49;TCR=25;TR=74;WE=24125573;WS=24125555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr22	24129553	rs55705149	GGC	G,GGCGC	570.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.93;QD=31.71;SOR=5.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,6,12:0.33,0.67:18
chr22	24143502	rs738797	C	G	4250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=78;PP=2402;SC=CTCTCTGGCCCCTCAAGTGGA;SOR=1.164;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=133;TCF=54;TCR=79;TR=132;WE=24143510;WS=24143492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr22	24145395	rs5760030	A	G	2513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=28;PP=1677;SC=GGTTTGCAGAAGCCTGCTGTG;SOR=1.434;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=53;TCR=28;TR=81;WE=24145403;WS=24145385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr22	24145675	rs5751738	G	C	639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=4;NR=17;PP=452;SC=GAACAGTCCCGTTTCCTGCCA;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=24145683;WS=24145665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr22	24158899	rs2070457	C	A	2195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.082;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=22;PP=1342;ReadPosRankSum=-0.784;SC=TGAGGGAGGCCGGTCCATGCC;SOR=1.188;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=112;TCF=78;TCR=34;TR=78;WE=24158907;WS=24158889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,92:0.72:127
chr22	24176677	rs5030614	GCAACAGGTCATGTTCAATTTCTT	G	2140.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.433;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.505;NF=1;NR=18;PP=2920;ReadPosRankSum=1.677;SC=TAAATAAAAGGCAACAGGTCA;SOR=0.773;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=59;TCF=4;TCR=55;TR=19;WE=24176707;WS=24176667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,57:0.47:120
chr22	24176959	rs35305666	CA	C	3766.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=36;PP=2205;SC=AGGCTCAGGGCAAGAGGCTCT;SOR=0.952;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=57;TCF=17;TCR=40;TR=52;WE=24176967;WS=24176949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr22	24179922	rs3177243	G	C	2264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.682;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=41;PP=1332;ReadPosRankSum=-1.331;SC=ACGGTGCCTGGAAAGTGAGCA;SOR=0.628;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=70;TCR=57;TR=90;WE=24179930;WS=24179912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,101:0.71:143
chr22	24199262	rs9680524	G	T	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.851;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=5.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.81;ReadPosRankSum=0.093;SOR=0.086;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr22	24204158	rs2275979	A	G	139.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=0;PP=105;SC=TCTGTGCCTCACTTTCCTCAT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=24204166;WS=24204157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
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chr22	24285057	rs201546417	TAAAACAAAAACA	T	1317.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=17;PP=2988;SC=AAGGAAATACTAAAACAAAAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=17;WE=24285076;WS=24285047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr22	24323131	rs55716339	C	T	3341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.275;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-7.082;NF=84;NR=74;PP=2246;ReadPosRankSum=3.746;SC=TGACTTCTTCCTCTTCAGGGC;SOR=0.474;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=301;TCF=169;TCR=132;TR=158;WE=24323139;WS=24323121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,161:0.53:304
chr22	24323227	rs76498342	G	A	1946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=4.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.165;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-8.216;NF=37;NR=70;PP=1405;ReadPosRankSum=0.781;SC=TGACCGAAAGGTGCCCTCCTT;SOR=1.283;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=290;TCF=124;TCR=166;TR=107;WE=24323235;WS=24323217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,104:0.36:287
chr22	24325062	rs78284383	G	A	1366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.64;MQRankSum=3.311;QD=22.04;ReadPosRankSum=-1.154;SOR=1.009;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:6,56:0.90:62
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chr22	24340938	rs140290	A	G	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.950;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-3.195;NF=7;NR=13;PP=239;ReadPosRankSum=-2.658;SC=CATGGGCTGTAGATAGACGAA;SOR=0.829;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=66;TCF=28;TCR=38;TR=20;WE=24340946;WS=24340928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,23:0.29:80
chr22	24345691	rs140302	A	C	760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.95;QD=26.23;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr22	24376322	rs4630	G	A	1140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=11;PP=849;SC=GCAAGTCTTAGGCAAGCCATT;SOR=1.666;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=28;TCR=11;TR=39;WE=24376330;WS=24376312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr22	24377034	rs140308	A	G	226.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=7;PP=172;SC=GAGTTACTGGAGTAGGGAGTT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=24377042;WS=24377024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr22	24383954	rs140313	C	T	2121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=35;PP=1086;SC=TGGGGAGCCCCGACTCTTGGA;SOR=1.031;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=27;TCR=35;TR=62;WE=24383962;WS=24383944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr22	24439340	rs202056514	T	G	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.830;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=219;ReadPosRankSum=1.457;SC=GTGTGTGTGTTTGCCCTCTGC;SOR=0.368;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=13;WE=24439348;WS=24439330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr22	24452885	rs2070467	A	G	1407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=32;PP=853;SC=TACACCATCAATAACATTTCT;SOR=1.702;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=14;TCR=32;TR=46;WE=24452893;WS=24452875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr22	24459438	rs762273	T	C	5648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=113;NR=83;PP=2965;SC=CTCGGAACTGTCCTGCTGGTA;SOR=0.882;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=196;TCF=113;TCR=83;TR=196;WE=24459446;WS=24459428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr22	24472270	rs2283807	A	G	1284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=28;PP=843;SC=CTGCCAGTGCAGGGCAGGGCT;SOR=1.880;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=42;TCF=13;TCR=29;TR=41;WE=24472278;WS=24472260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr22	24480503	rs4820581	G	A	4270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=47;PP=2525;SC=TGAATGTGTTGCTAATCTGCC;SOR=1.565;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=142;TCF=95;TCR=47;TR=141;WE=24480511;WS=24480493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr22	24492061	rs2236622	T	C	2152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=41;PP=1381;SC=TAGCACCCTTTAGGCGACCCC;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=29;TCR=41;TR=70;WE=24492069;WS=24492051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr22	24621491	rs12627971	C	T	640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.362;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=13;PP=400;ReadPosRankSum=0.140;SC=TTGTGGACCCCGGGTGGGAAG;SOR=1.091;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=91;TCF=51;TCR=40;TR=33;WE=24621499;WS=24621481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,35:0.36:96
chr22	24621691	rs189178297	G	A	638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.885;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=16;PP=327;ReadPosRankSum=-1.297;SC=TACCCTGCACGCTTTGCAGGA;SOR=0.293;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=33;TCF=10;TCR=23;TR=24;WE=24621699;WS=24621681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,28:0.78:36
chr22	24622648	rs2275984	T	C	1092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.591;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=24;PP=744;ReadPosRankSum=2.275;SC=CCTCTGCCCCTTGGCAAACTT;SOR=0.771;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=159;TCF=95;TCR=64;TR=58;WE=24622656;WS=24622638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,61:0.35:175
chr22	24629912	rs116976546	G	A	1204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=26;PP=692;ReadPosRankSum=0.871;SC=TGACGACGCTGGTGCAGACCA;SOR=0.646;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=68;TCF=28;TCR=40;TR=46;WE=24629920;WS=24629902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,53:0.68:78
chr22	24717850	rs204710	A	G	3842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=50;PP=2217;SC=ATCACCCCTGATAACCAGAGC;SOR=0.818;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=118;TCF=67;TCR=51;TR=117;WE=24717858;WS=24717840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr22	24730587	rs5760351	C	T	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=64;ReadPosRankSum=1.344;SC=CGGTTGTGTTCACTTACCTTA;SOR=0.798;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=31;TCF=10;TCR=21;TR=7;WE=24730595;WS=24730577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,8:0.24:34
chr22	24742932	.	T	C	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.493;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.26;ReadPosRankSum=0.146;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,4:0.22:18
chr22	24759172	rs138948001	ATTACT	A	1672.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.827;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.505;NF=14;NR=14;PP=1231;ReadPosRankSum=1.733;SC=TTGTACCTTTATTACTTTAAA;SOR=1.305;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=89;TCF=35;TCR=54;TR=28;WE=24759184;WS=24759162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,49:0.31:158
chr22	24761467	rs204718	G	A	4187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=57;PP=2320;SC=TAGTGAAGAAGTGAAACGGGA;SOR=0.875;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=136;TCF=79;TCR=57;TR=136;WE=24761475;WS=24761457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr22	24837301	rs5751876	T	C	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=14;PP=300;ReadPosRankSum=0.791;SC=CCAATGGCTATGCCCTGGGGC;SOR=0.783;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=76;TCF=36;TCR=40;TR=25;WE=24837309;WS=24837291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,28:0.35:81
chr22	24891292	rs2070474	C	G	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=123;ReadPosRankSum=1.272;SC=GGGCGCCTGACCGGGCCTGGG;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=7;WE=24891300;WS=24891282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr22	24891355	rs2070475	A	T	1069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.855;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=10;PP=672;ReadPosRankSum=1.574;SC=GGACACAAGCACTGGCGGACC;SOR=0.346;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=65;TCF=50;TCR=15;TR=39;WE=24891363;WS=24891345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,45:0.63:71
chr22	24936970	rs9704	A	G	8020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=132;NR=141;PP=2965;SC=CTATTCTAACAATTTTACCAG;SOR=0.805;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=273;TCF=132;TCR=141;TR=273;WE=24936978;WS=24936960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,300:1.00:300
chr22	24938908	rs8139822	A	G	1030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=29;NR=9;PP=683;SC=GGGCCAGGGCATCCTGAGCGG;SOR=1.923;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=38;WE=24938916;WS=24938898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr22	24944053	rs4822506	C	T	2531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=38;NR=42;PP=1211;SC=TGCAGGTAGACGAGCTGGGGA;SOR=1.132;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=38;TCR=42;TR=80;WE=24944061;WS=24944043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr22	24944782	rs1003580	A	G	2374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=31;PP=1355;SC=AGCCCCAACCAAAGATAGCTA;SOR=1.061;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=82;TCF=51;TCR=31;TR=82;WE=24944790;WS=24944772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr22	24953479	.	C	CT	106	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=12;HapScore=2;MGOF=24;MMLQ=15;MQ=61.07;NF=6;NR=1;PP=106;QD=16.0;SC=AGGAGCTGAGCTTTTTTTTTT;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=7;WE=24953487;WS=24953469;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,7:0.70:10
chr22	24953571	rs5760472	A	G	3393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;MQRankSum=0.183;NF=80;NR=52;PP=2057;ReadPosRankSum=0.196;SC=GATGTGTGCCACATGCCTTTT;SOR=1.129;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=133;TCF=80;TCR=53;TR=132;WE=24953579;WS=24953561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,135:0.99:137
chr22	24964128	rs4597	T	C	4351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=77;NR=81;PP=2727;SC=GAAAAGCTGCTATTCTCAAGG;SOR=0.845;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=77;TCR=81;TR=158;WE=24964136;WS=24964118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr22	25124095	rs738827	C	T	3286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=45;PP=1814;SC=AAGAGAATCTCAAGTTTTATT;SOR=0.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=101;TCF=56;TCR=45;TR=101;WE=25124103;WS=25124085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr22	25129964	rs5760612	A	G	400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=9;NR=0;PP=147;SC=CAGGAAACCAACAACAACATT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=25129972;WS=25129954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr22	25145453	rs1892723	C	T	1914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=36;PP=1199;SC=AATTCTTTCACAATGCTATAA;SOR=1.263;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=24;TCR=36;TR=60;WE=25145461;WS=25145443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr22	25145471	rs1892722	A	G	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=9;PP=166;ReadPosRankSum=-0.852;SC=TAATCTTTACATATTTCATCT;SOR=0.698;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=50;TCF=22;TCR=28;TR=16;WE=25145479;WS=25145461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,20:0.35:57
chr22	25151638	rs6004259	T	C	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=2.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.291;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=137;ReadPosRankSum=0.723;SC=ACTCTCTTAATACATGAGGAC;SOR=1.068;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=50;TCF=39;TCR=11;TR=13;WE=25151646;WS=25151628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,17:0.25:67
chr22	25151890	rs5760623	CA	AC	246.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=8.129;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.36;ReadPosRankSum=-0.097;SOR=0.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,16:0.35:46
chr22	25158326	rs5751975	A	G	993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.632;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=20;PP=534;ReadPosRankSum=-0.863;SC=GTACAGGCACATATCTCTTGC;SOR=0.603;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=147;TCF=91;TCR=56;TR=54;WE=25158334;WS=25158316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,59:0.38:154
chr22	25246112	rs139670	G	A	1480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=12;PP=1214;SC=GCTTGCTAGCGGCAATATGGG;SOR=2.348;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=40;TCR=12;TR=52;WE=25246120;WS=25246102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr22	25250787	rs139680	A	G	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.16;ReadPosRankSum=-1.604;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr22	25251891	rs1079763	T	C	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=156;ReadPosRankSum=0.495;SC=CATCCATCCATCCACCCATCT;SOR=0.569;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=9;WE=25251899;WS=25251881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr22	25252116	rs73155761	T	C	1232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=36;PP=733;ReadPosRankSum=-0.332;SC=TCTCACTTCATTGATTCAGCA;SOR=0.664;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=195;TCF=79;TCR=116;TR=61;WE=25252124;WS=25252106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,71:0.32:225
chr22	25252192	rs139681	A	G	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=137;ReadPosRankSum=0.017;SC=CTCATGGCCAATATTTCTTGA;SOR=0.223;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=35;TCF=2;TCR=33;TR=11;WE=25252200;WS=25252182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,13:0.33:39
chr22	25255580	rs56318899	A	G	1069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=16;PP=654;ReadPosRankSum=-0.408;SC=GATTAACCCAACCTCTTAGTT;SOR=0.638;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=75;TCF=48;TCR=27;TR=42;WE=25255588;WS=25255570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,47:0.55:86
chr22	25263240	rs5996780	G	A	941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.972;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=22;PP=523;ReadPosRankSum=-1.864;SC=GACACCCCATGTTACCTGTGC;SOR=0.477;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=70;TCF=31;TCR=39;TR=42;WE=25263248;WS=25263230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,45:0.61:74
chr22	25263273	rs5996781	C	T	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.725;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=14;PP=296;ReadPosRankSum=-0.131;SC=GCGACCTCACCGCTCTGTGCC;SOR=0.286;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=46;TCF=19;TCR=27;TR=28;WE=25263281;WS=25263263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,27:0.60:45
chr22	25270455	rs9624633	G	C	1547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.846;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=37;PP=1027;ReadPosRankSum=-0.028;SC=CTGCAGGCCGGTCCATGCTGG;SOR=0.979;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=86;TCF=36;TCR=50;TR=60;WE=25270463;WS=25270445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,64:0.67:95
chr22	25275393	rs737769	T	C	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=241;ReadPosRankSum=0.160;SC=TGTGTTTGGATCTATTCTAAG;SOR=0.653;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=20;WE=25275401;WS=25275383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,24:0.80:30
chr22	25282572	rs11914101	C	T	1408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.555;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=31;PP=783;ReadPosRankSum=-0.849;SC=CACAGAGTTACGAGGAGCAGG;SOR=0.508;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=153;TCF=87;TCR=66;TR=64;WE=25282580;WS=25282562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,70:0.40:174
chr22	25282711	rs16979179	T	C	916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.96;ReadPosRankSum=-1.759;SOR=0.709;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:128,57:0.31:185
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chr22	25289335	rs3765480	G	C	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.130;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=158;ReadPosRankSum=0.340;SC=TTCCACGTTGGTCTGGCCCTC;SOR=0.460;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=52;TCF=33;TCR=19;TR=17;WE=25289343;WS=25289325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,18:0.33:55
chr22	25291095	rs5760713	C	A	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.279;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=43;ReadPosRankSum=1.425;SC=AATAGAGATGCAACTAGACTT;SOR=0.412;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=5;WE=25291103;WS=25291085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr22	25466323	rs6519550	G	C	3599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=43;PP=1642;SC=ATAACCTCTGGGTGCTGGAAA;SOR=0.953;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=66;TCR=43;TR=108;WE=25466331;WS=25466313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr22	25466395	rs6004422	G	T	2969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=46;PP=1754;SC=TGAGTGGCGGGGGGCAGTGCA;SOR=0.751;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=45;TCR=46;TR=91;WE=25466403;WS=25466385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr22	25466553	rs6004423	G	A	828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=19;PP=504;SC=AAAAGGAAACGGGCTTGGTTT;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=25;WE=25466561;WS=25466543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr22	25573431	rs12168578	G	A	4904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=69;PP=2931;SC=GTGAGTCCGAGAGCAGATCAC;SOR=1.014;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=170;TCF=101;TCR=69;TR=169;WE=25573439;WS=25573421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr22	25573514	rs1009989	C	T	4632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=77;NR=77;PP=2273;SC=CTCTCCTCCTCAGATAGCACA;SOR=0.897;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=154;TCF=77;TCR=77;TR=154;WE=25573522;WS=25573504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr22	25573618	rs35952412	A	AT	284.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=146;ReadPosRankSum=0.248;SC=TAGGAAACTGATTTTTTTTTT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=9;WE=25573626;WS=25573608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
chr22	25597331	rs2269672	T	C	2718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=50;NR=35;PP=1387;SC=AACCATTTTCTTTTGGTTTGA;SOR=0.793;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=86;TCF=51;TCR=35;TR=85;WE=25597339;WS=25597321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr22	25601196	rs9608378	C	G	6694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=114;NR=99;PP=2965;SC=GGATAGTCCACATCACAAGCT;SOR=0.750;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=213;TCF=114;TCR=99;TR=213;WE=25601204;WS=25601186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr22	25603008	rs13055430	C	T	5104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=93;NR=75;PP=2641;SC=CTTGGTCTCCCGGCAGGTGGG;SOR=0.814;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=168;TCF=93;TCR=75;TR=168;WE=25603016;WS=25602998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr22	25617602	rs739315	A	G	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=209;ReadPosRankSum=-0.316;SC=ACACAGTTGGAGCTGATACTG;SOR=0.610;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=13;WE=25617610;WS=25617592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr22	25624049	rs5760923	G	A	838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=23;PP=670;SC=ACCAGGAAGGGGCCCGCCCCT;SOR=3.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=27;WE=25624057;WS=25624039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr22	25625554	rs55700037	G	A	3031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=70;PP=1998;SC=ACGTAAGTGCGTTGCCAGCCC;SOR=1.336;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=112;TCF=42;TCR=70;TR=111;WE=25625562;WS=25625544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr22	25713933	rs133156	A	G	315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=31.58;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr22	25714110	rs2064141	T	C	3487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FS=0.496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQRankSum=-2.099;QD=15.71;ReadPosRankSum=-0.608;SOR=0.633;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:128,94:0.42:222
chr22	25714113	rs2330574	A	G	3486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FS=0.495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQRankSum=-2.091;QD=15.71;ReadPosRankSum=-0.863;SOR=0.644;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:128,94:0.42:222
chr22	25714218	rs2072869	A	T	3649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=56;PP=2307;SC=TGCCCCTCACACCCAGCAGGT;SOR=0.756;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=63;TCR=56;TR=119;WE=25714226;WS=25714208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr22	25716068	rs133162	C	G	1430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.00;SOR=1.287;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr22	25750814	rs141812512	C	CAGGGCA	1895.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=26;PP=1740;SC=CTGGATGGGCCAGGGCCATGC;SOR=3.417;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=39;TCF=1;TCR=38;TR=27;WE=25750822;WS=25750804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr22	25753231	rs133194	G	A	1304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=11;PP=930;SC=CCTCGATCTTGTCTGTCTTGG;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=32;TCR=11;TR=43;WE=25753239;WS=25753221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr22	26157068	rs61734946	C	G	2739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.163;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=57;PP=1631;ReadPosRankSum=0.055;SC=GCATGGCCATCTCATCACGCC;SOR=0.589;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=178;TCF=90;TCR=88;TR=117;WE=26157076;WS=26157058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,126:0.65:195
chr22	26157144	rs17623980	A	G	1564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=42;PP=1031;ReadPosRankSum=1.041;SC=GCAGGGACTGACTCGACCCTC;SOR=0.675;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=92;TCF=34;TCR=58;TR=65;WE=26157152;WS=26157134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,68:0.68:100
chr22	26159129	rs133884	C	CTT	812.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.617;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=719;ReadPosRankSum=-0.436;SC=CCATCACAAACTTTGAAGGGC;SOR=0.446;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=34;TCF=8;TCR=26;TR=18;WE=26159137;WS=26159119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,22:0.71:31
chr22	26159289	rs133885	G	A	1466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.761;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=30;PP=906;ReadPosRankSum=0.038;SC=CTGGTCCGGGGGACTGAAAAA;SOR=0.550;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=99;TCF=48;TCR=51;TR=61;WE=26159297;WS=26159279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,65:0.62:104
chr22	26163996	rs133901	T	C	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=5;PP=462;ReadPosRankSum=0.822;SC=AAGTGAACAATGAAATGAATG;SOR=0.765;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=49;TCF=39;TCR=10;TR=28;WE=26164004;WS=26163986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,30:0.56:54
chr22	26164079	rs133902	C	T	2382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=38;PP=1375;ReadPosRankSum=-2.582;SC=TTCTTTCTCCCAGATCCCAGA;SOR=0.714;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=165;TCF=101;TCR=64;TR=101;WE=26164087;WS=26164069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,111:0.60:185
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chr22	26181594	rs13053299	T	C	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.136;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=58;ReadPosRankSum=0.026;SC=GTGGAAGAGTTGGCACTGCCT;SOR=1.179;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=6;WE=26181602;WS=26181584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr22	26193824	rs2877299	C	T	710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.046;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=11;PP=461;ReadPosRankSum=0.330;SC=AAATGACCCCCGCATTCCTTC;SOR=0.540;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=36;TCR=18;TR=32;WE=26193832;WS=26193814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,33:0.57:58
chr22	26193982	rs738642	C	G	1422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=26;PP=712;ReadPosRankSum=1.649;SC=TGGAGATGCTCGGCATCTCAG;SOR=0.700;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=80;TCF=40;TCR=40;TR=53;WE=26193990;WS=26193972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,65:0.71:91
chr22	26194045	rs738643	T	C	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.067;HP=4;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=17;PP=329;ReadPosRankSum=-1.834;SC=ACCACCTGGGTGCGGCGGGGG;SOR=0.502;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=53;TCF=21;TCR=32;TR=30;WE=26194053;WS=26194035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,32:0.56:57
chr22	26194093	rs738644	G	A	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=134;ReadPosRankSum=0.743;SC=GCTCACCTGGGAGGGCAGCTG;SOR=1.781;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=22;TCF=8;TCR=14;TR=10;WE=26194101;WS=26194083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr22	26219412	rs5752226	T	C	1000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=5;PP=785;SC=TCCTCTCGGGTGTTCATTCAC;SOR=3.193;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=34;WE=26219420;WS=26219402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr22	26219605	rs4820658	G	A	3048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=64;PP=1832;ReadPosRankSum=0.639;SC=TGACGTTTGGGCCAAGCCGAT;SOR=0.706;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=188;TCF=87;TCR=101;TR=118;WE=26219613;WS=26219595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,134:0.63:213
chr22	26219723	.	C	CT	79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=6;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=5;PP=79;QD=20.8;SC=CATTCTTTAACTTTTTTATCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=5;WE=26219731;WS=26219713;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:20,5:0.20:25
chr22	26222454	rs9624909	C	T	796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.613;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=21;PP=430;ReadPosRankSum=-0.451;SC=GCTGTGGTCTCACTCATCAAC;SOR=0.528;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=92;TCF=38;TCR=54;TR=39;WE=26222462;WS=26222444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,43:0.40:107
chr22	26222505	rs2331162	G	A	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.376;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=366;ReadPosRankSum=-0.262;SC=TTGGCCTCTTGCAGGTGCACA;SOR=1.093;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=23;WE=26222513;WS=26222495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,28:0.61:46
chr22	26224632	rs3848861	G	A	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=224;ReadPosRankSum=-0.450;SC=AGGTCACACAGCCTGTAAGAG;SOR=0.874;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=35;TCF=31;TCR=4;TR=14;WE=26224640;WS=26224622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,14:0.35:40
chr22	26228757	rs35045598	TA	T	1643.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=23;NR=15;PP=1041;SC=TGCCAAAATTTAAAAAAACGA;SOR=1.942;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=44;TCF=25;TCR=19;TR=38;WE=26228765;WS=26228747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr22	26228797	rs3859879	A	G	3743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=51;PP=2094;SC=GGTGATGGAAATCCTCTCCGC;SOR=1.016;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=125;TCF=73;TCR=52;TR=124;WE=26228805;WS=26228787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr22	26239850	rs5761268	C	A	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=251;ReadPosRankSum=-0.052;SC=AGGTCCTGCACCAGTCAAAAA;SOR=0.689;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=60;TCF=21;TCR=39;TR=21;WE=26239858;WS=26239840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,23:0.34:68
chr22	26239906	rs5761269	A	G	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=91;ReadPosRankSum=-1.434;SC=CATTGGAGGCACTGTGTTTTC;SOR=0.473;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=8;WE=26239914;WS=26239896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr22	26242226	.	G	A	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.116;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=124;ReadPosRankSum=-0.952;SC=GGAAAGCCCCGTGCTCCCAGA;SOR=0.714;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=25;TCF=10;TCR=15;TR=10;WE=26242234;WS=26242216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr22	26247456	rs5996988	G	A	3879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=52;PP=2154;SC=ACCACATGGGGCTCACTCGCT;SOR=1.027;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=128;TCF=76;TCR=52;TR=127;WE=26247464;WS=26247446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
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chr22	26272244	rs35578357	C	T	1333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.881;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=31;PP=772;ReadPosRankSum=-1.984;SC=CTGCTTGGTTCCCTCCAGCCT;SOR=0.871;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=74;TCF=31;TCR=43;TR=52;WE=26272252;WS=26272234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,59:0.68:87
chr22	26273834	rs4822666	A	C	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.66;ReadPosRankSum=0.548;SOR=0.726;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,27:0.21:127
chr22	26273836	rs4822667	G	T	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.51;ReadPosRankSum=-0.010;SOR=0.685;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,29:0.22:130
chr22	26273850	rs695428	G	C	385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=0.753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.64;ReadPosRankSum=0.436;SOR=0.587;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:114,32:0.22:146
chr22	26273893	rs4822668	G	C	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.31;ReadPosRankSum=-0.364;SOR=0.651;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:137,44:0.24:181
chr22	26294513	rs2066935	A	G	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=115;ReadPosRankSum=-1.580;SC=AGGTTCTCCTAACTCCCTCAC;SOR=0.627;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=7;WE=26294521;WS=26294503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr22	26298754	rs2072016	G	A	2045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=40;PP=1322;SC=GCTAAATCTCGGGAAACTGCA;SOR=1.061;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=31;TCR=41;TR=71;WE=26298762;WS=26298744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr22	26298874	rs2072017	T	C	149.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=217;SC=TGGTGGCTGGTAAATTGATAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=26298882;WS=26298864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr22	26298891	rs5761306	T	G	114.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=3;PP=27;SC=ATAATCAGACTTTGAGCAAGA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=3;WE=26298899;WS=26298881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr22	26317155	rs739284	A	G	2120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.21;SOR=1.430;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr22	26317155	.	ATTCCG	GTTCCA,GTTCCG	503	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=11,36;NR=7,19;PP=265,503;QD=17.6926597146;SC=AGGGAACCTGATTCCGGAAAA;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=55;TCF=36;TCR=19;TR=18,55;WE=26317168;WS=26317145;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.33:55
chr22	26317160	rs739285	G	A	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.81;ReadPosRankSum=-1.254;SOR=0.631;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,25:0.37:68
chr22	26342056	rs4820662	C	T	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.95;ReadPosRankSum=2.161;SOR=0.502;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr22	26343805	rs2072007	A	G	755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.663;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=17;PP=447;ReadPosRankSum=0.159;SC=GTAGTGAATGAGACCTTGGTG;SOR=0.527;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=84;TCF=42;TCR=42;TR=37;WE=26343813;WS=26343795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,40:0.42:96
chr22	26346311	rs10600754	AT	A	611.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=1.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.23;ReadPosRankSum=-1.447;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,32:0.64:50
chr22	26388548	rs9613067	A	G	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=168;ReadPosRankSum=0.488;SC=CTGGGGCCACATTCACTGGGA;SOR=0.509;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=11;WE=26388556;WS=26388538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr22	26688388	rs35377445	A	C	1471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.661;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=27;PP=794;ReadPosRankSum=-0.082;SC=TTCCCGAGGGAGATGCTAGCC;SOR=1.058;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=204;TCF=115;TCR=89;TR=71;WE=26688396;WS=26688378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,81:0.35:233
chr22	26769234	rs1076660	T	G	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=3.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=50;ReadPosRankSum=-0.084;SC=CTTCTCTTGGTAACTTAGGAA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=4;WE=26769242;WS=26769224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr22	26777795	rs482902	A	T	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.655;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=60;ReadPosRankSum=-0.481;SC=ACAGACGGGCACAGTGGCATT;SOR=0.096;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=7;WE=26777803;WS=26777785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,7:0.24:29
chr22	26830285	rs34902186	A	G	2430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.115;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=37;PP=1283;ReadPosRankSum=-0.370;SC=TACTTGGTCAATCAGGGGGTT;SOR=0.826;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=134;TCF=73;TCR=61;TR=86;WE=26830293;WS=26830275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,104:0.66:157
chr22	26830478	rs3788398	A	G	2671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=54;PP=1680;SC=GTATGTTGCAAGGACAGGGGT;SOR=1.298;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=89;TCF=34;TCR=55;TR=88;WE=26830486;WS=26830468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr22	26853905	rs1894704	C	A	1858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=33;PP=1028;SC=AGCGGCGATCCTGCGGGGTGG;SOR=1.163;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=28;TCR=33;TR=61;WE=26853913;WS=26853895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr22	26853980	rs1894705	T	C	454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=12;PP=263;SC=AGTTACCTTCTGCCCTCCCAC;SOR=1.863;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=17;WE=26853988;WS=26853970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr22	26854441	rs1894706	G	A	5160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=77;PP=2817;SC=CGGTCGTAATGTGTGAAGTTG;SOR=0.809;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=177;TCF=100;TCR=77;TR=177;WE=26854449;WS=26854431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr22	26854682	rs4822722	T	C	509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=15;PP=333;SC=CAGTGCTTTGTGAGACCGAGG;SOR=2.200;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=20;WE=26854690;WS=26854672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr22	26859942	rs5752330	C	T	2820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=29;PP=1775;SC=AGGGACAGCACCAGCCCTTTG;SOR=1.436;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=65;TCR=29;TR=94;WE=26859950;WS=26859932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr22	26860269	rs2014410	G	C	1796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=32;PP=1118;ReadPosRankSum=-1.537;SC=TGGTCTTCGAGCTGCTCTTGG;SOR=0.715;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=99;TCF=53;TCR=46;TR=68;WE=26860277;WS=26860259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,77:0.69:112
chr22	26861545	rs3213583	A	G	1772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=34;PP=1092;SC=TATGAACAGGACTTTCCCCTG;SOR=1.467;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=21;TCR=34;TR=55;WE=26861553;WS=26861535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr22	26862153	rs739289	C	A	4886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=80;PP=2801;SC=CATAAAAGACCGCCGTTCTCA;SOR=0.953;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=153;TCF=73;TCR=80;TR=153;WE=26862161;WS=26862143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr22	26862212	rs713998	T	C	2532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=47;PP=1572;SC=CGGGGCATCCTCTCCCGTAGG;SOR=1.531;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=30;TCR=47;TR=77;WE=26862220;WS=26862202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr22	26864658	rs739290	A	G	5196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=92;PP=2877;SC=AATTTTAAAGATGCCTAACAG;SOR=1.081;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=164;TCF=72;TCR=92;TR=164;WE=26864666;WS=26864648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr22	26867490	rs5761549	G	A	150.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5341;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=113;ReadPosRankSum=-1.068;SC=TGGAGCCTCCGGAGCTGCTGA;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=6;WE=26867498;WS=26867480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr22	26868490	rs17401652	C	T	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5007;FS=2.345;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=287;ReadPosRankSum=-0.592;SC=GGAAACTGACCGGAAGGGAGG;SOR=1.659;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=14;WE=26868498;WS=26868480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr22	26875370	rs9613187	C	T	671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.754;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=21;PP=363;ReadPosRankSum=-0.611;SC=CCAGTGATCACGGCATTTAAA;SOR=0.784;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=103;TCF=41;TCR=62;TR=32;WE=26875378;WS=26875360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,37:0.30:122
chr22	26877539	rs739291	C	T	395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=1;PP=271;SC=CGATGGCTCACGTGCTTGATT;SOR=2.985;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=26877547;WS=26877529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr22	26879823	rs968425	C	A	451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.10;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr22	26879946	rs66831137	GGAGGCGGCGCCCCGGGGGAGA	G	600.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.968;NF=3;NR=8;PP=2525;ReadPosRankSum=-0.450;SC=CGCGGCGGAGGGAGGCGGCGC;SOR=0.846;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=20;TCF=7;TCR=13;TR=11;WE=26879974;WS=26879936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,26:0.93:28
chr22	26884039	rs4820682	G	A	4328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=89;NR=48;PP=2528;SC=ACAACTGAAGGCCCCTGTGGG;SOR=1.285;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=137;TCF=89;TCR=48;TR=137;WE=26884047;WS=26884029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr22	26886953	rs34878449	GT	G	1992.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.425;NF=21;NR=24;PP=857;ReadPosRankSum=2.086;SC=TAATCATGGTGTTTTTTTTTT;SOR=1.305;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=27;TCR=32;TR=45;WE=26886961;WS=26886943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,81:0.96:84
chr22	26887099	rs4820683	T	A	4310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=61;NR=84;PP=2425;SC=AATTCTATCTTTCTTTACAGG;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=146;TCF=61;TCR=85;TR=145;WE=26887107;WS=26887089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr22	26887829	rs1045523	A	G	320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=2;PP=217;SC=GCATTGTCCCATTTTACATCC;SOR=1.981;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=26887837;WS=26887819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr22	26894985	rs2187956	C	T	4713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=66;PP=2544;SC=GGCTCTCCAGCCCTCCCTGCC;SOR=0.727;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=86;TCR=66;TR=152;WE=26894993;WS=26894975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr22	26895061	rs2157586	G	A	3714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=59;PP=2201;SC=GATTTTCCCAGCAACTCACTT;SOR=0.769;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=120;TCF=61;TCR=59;TR=120;WE=26895069;WS=26895051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr22	26895337	rs1008530	G	A	5860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=107;NR=98;PP=2965;SC=TCTCCAGCTCGTGGAAGAGGT;SOR=0.748;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=206;TCF=108;TCR=98;TR=205;WE=26895345;WS=26895327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr22	26895736	rs6005060	T	A	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=132;ReadPosRankSum=-0.637;SC=GGCAGTGTTGTAAAGTGGGAA;SOR=0.804;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=7;WE=26895744;WS=26895726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr22	26899474	rs134136	T	C	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.852;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.62;ReadPosRankSum=-0.464;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr22	26932150	rs3752523	G	A	1015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=0.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.016;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=21;PP=512;ReadPosRankSum=0.541;SC=CAGATGACCAGGAATTGAGAG;SOR=0.883;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=139;TCF=75;TCR=64;TR=46;WE=26932158;WS=26932140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,56:0.32:176
chr22	26936897	rs12169509	G	A	1338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.580;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=32;PP=908;ReadPosRankSum=0.810;SC=TACACAGGCAGGCACTTCTCC;SOR=0.612;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=150;TCF=84;TCR=66;TR=68;WE=26936905;WS=26936887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,71:0.43:165
chr22	26937321	rs17851532	G	A	1249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=1.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.36;ReadPosRankSum=0.683;SOR=0.938;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,36:0.33:110
chr22	26937327	rs4822735	C	G	1268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=1.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.33;ReadPosRankSum=1.837;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,37:0.33:112
chr22	26951185	rs4822739	C	G	878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.52;ReadPosRankSum=2.750;SOR=0.481;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,42:0.65:65
chr22	27004089	rs5761626	A	C	1996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=51;PP=1563;SC=AGCCCTGAGGACAGTAGGAAA;SOR=2.694;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=12;TCR=51;TR=63;WE=27004097;WS=27004079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr22	27019128	rs2071860	C	T	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=247;ReadPosRankSum=0.824;SC=GATCCTGGGGCGAGCCCCCAA;SOR=0.668;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=18;WE=27019136;WS=27019118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr22	27021425	rs4276	A	G	645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=0.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.82;ReadPosRankSum=2.843;SOR=0.779;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:125,44:0.26:169
chr22	27021457	rs5761637	T	C	5316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=79;PP=2607;SC=GGGTGGGCTTTGAGCATGCTG;SOR=0.774;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=175;TCF=96;TCR=79;TR=175;WE=27021465;WS=27021447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr22	28316591	rs75321888	T	TG	2298.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=18;PP=1287;SC=AGGCAGTCCCTGGAGTCACCG;SOR=1.000;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=17;TCR=21;TR=33;WE=28316599;WS=28316581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr22	28379868	rs138636	A	G	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.214;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=18;PP=341;ReadPosRankSum=-0.220;SC=GGCCCCAAGGACAGTTAGAAT;SOR=1.097;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=78;TCF=30;TCR=48;TR=26;WE=28379876;WS=28379858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,28:0.32:87
chr22	28385947	.	A	T	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=0.000;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.775;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=23;PP=387;ReadPosRankSum=0.669;SC=GCTGATGCCAAGTCCTGCTCC;SOR=1.104;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=119;TCF=48;TCR=71;TR=34;WE=28385955;WS=28385937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,36:0.28:130
chr22	28389453	rs470101	T	C	763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.108;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=27;PP=448;ReadPosRankSum=0.049;SC=TCTGCTGGGATGTGTACATGG;SOR=1.092;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=168;TCF=83;TCR=85;TR=47;WE=28389461;WS=28389443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,49:0.28:177
chr22	28397591	rs138654	G	T	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=126;ReadPosRankSum=2.096;SC=GCAGGCAGGGGTTTCAGGCAC;SOR=0.582;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=9;WE=28397599;WS=28397581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr22	28424993	rs9625387	C	T	690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.52;ReadPosRankSum=-0.324;SOR=0.768;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,38:0.36:106
chr22	28504183	rs9625408	G	A	1077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.561;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=29;PP=604;ReadPosRankSum=-1.125;SC=CCTGTGAGGCGCGGTCATTCA;SOR=0.621;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=172;TCF=85;TCR=87;TR=57;WE=28504191;WS=28504173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,64:0.33:195
chr22	28504258	rs9625409	A	G	910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=22;PP=516;ReadPosRankSum=-0.310;SC=TGCCCAGGGCATTGTAGGCAT;SOR=0.670;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=65;TCR=57;TR=46;WE=28504266;WS=28504248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,50:0.37:135
chr22	29130300	rs1033667	C	T	1166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=8;PP=688;SC=AAAACCTGGACAACTCCAATC;SOR=2.093;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=35;WE=29130308;WS=29130290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
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chr22	29413785	rs4823005	A	G	894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=5;PP=722;ReadPosRankSum=-0.104;SC=GTCAACCAGGATGAGTGCAGA;SOR=0.572;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=44;TCF=38;TCR=6;TR=34;WE=29413793;WS=29413775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,33:0.75:44
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chr22	29659960	rs879580	C	T	713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.782;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=15;PP=323;ReadPosRankSum=1.778;SC=GGCGGTGTCCCTCCCCAGCCA;SOR=0.794;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=40;TCR=35;TR=31;WE=29659968;WS=29659950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,37:0.44:85
chr22	29682881	.	CT	C	62.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.052;ClippingRankSum=0.000;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.76;ReadPosRankSum=0.029;SOR=0.655;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,16:0.19:83
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chr22	29755888	rs2072051	T	C	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.776;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=16;PP=413;ReadPosRankSum=1.380;SC=AGAGGTATACTAGCTTCTTCA;SOR=0.665;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=89;TCF=50;TCR=39;TR=34;WE=29755896;WS=29755878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,34:0.35:98
chr22	29833639	rs174718	C	G	806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=9;PP=596;SC=ACCAATAAAACGCCCTCATGT;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=19;TCR=9;TR=28;WE=29833647;WS=29833629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr22	29833782	rs117525765	T	C	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=59;ReadPosRankSum=-0.956;SC=GGTTATGCCTTGGGGGATGAA;SOR=0.593;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=28;TCF=11;TCR=17;TR=9;WE=29833790;WS=29833772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
chr22	29837537	rs3804076	T	C	2440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.158;NF=62;NR=39;PP=1242;ReadPosRankSum=0.022;SC=ACAGTGGATATGACCTTGGAT;SOR=0.667;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=170;TCF=104;TCR=66;TR=101;WE=29837545;WS=29837527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,117:0.60:194
chr22	29837566	rs71324764	TTCC	T	5053.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.008;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.199;NF=14;NR=46;PP=2442;ReadPosRankSum=-0.071;SC=AGCCAACAACTTCCTCCTCAT;SOR=0.775;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=121;TCF=25;TCR=96;TR=60;WE=29837576;WS=29837556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,131:0.56:234
chr22	29881884	rs4823040	G	A	2016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=32;PP=925;SC=TTGTGTTCCTGCGAGACGCTA;SOR=1.121;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=29;TCR=32;TR=61;WE=29881892;WS=29881874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr22	29885567	rs147489453	A	AAAGTCCCCTGAGAAGGCC	6263.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=-0.973;NF=4;NR=43;PP=2900;ReadPosRankSum=-0.394;SC=AGGAGGAAGCAAAGTCCCCTG;SOR=0.223;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=75;TCF=9;TCR=66;TR=47;WE=29885575;WS=29885557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,144:0.99:145
chr22	29885861	rs165923	T	C	6798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=123;NR=105;PP=2965;SC=AGGAAGAAGCTAAGTCCCCAG;SOR=0.776;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=228;TCF=123;TCR=105;TR=228;WE=29885869;WS=29885851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr22	29886413	rs165625	A	G	1401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=15;PP=842;SC=AGACAGAGGTAGCCAAGAAGG;SOR=0.823;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=25;TCR=15;TR=40;WE=29886421;WS=29886403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr22	29886893	rs1061373	G	T	374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=11;PP=242;SC=CCTGCCCCCAGGCCCTCCCCA;SOR=3.126;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=29886901;WS=29886883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr22	29908072	rs1049534	C	T	1245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.684;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=20;PP=662;ReadPosRankSum=0.834;SC=AGCTGGAAAACAGGTGGGATG;SOR=0.824;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=108;TCF=67;TCR=41;TR=55;WE=29908080;WS=29908062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,61:0.51:120
chr22	29908154	rs2007668	G	T	2281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=34;NR=42;PP=1276;SC=GGGGAAATGCGCAGTTCTAAG;SOR=1.127;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=76;TCF=34;TCR=42;TR=76;WE=29908162;WS=29908144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr22	29912885	rs12161054	G	A	521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=259;ReadPosRankSum=-0.025;SC=TTGCTGAACAGGCTCTCACGA;SOR=0.976;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=17;WE=29912893;WS=29912875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,22:0.73:30
chr22	29912968	rs2074949	T	C	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=0.783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.80;ReadPosRankSum=-1.027;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:113,30:0.21:143
chr22	29912993	rs2074950	C	T	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FS=1.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.71;ReadPosRankSum=-0.241;SOR=0.937;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:122,32:0.21:154
chr22	29913272	rs737976	C	T	4316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=65;PP=2501;SC=TCATGGGCAACTGTCACCCAT;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=76;TCR=65;TR=141;WE=29913280;WS=29913262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr22	29913380	rs117052421	G	A	760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.557;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=19;PP=395;ReadPosRankSum=-0.059;SC=GACAGATGACGTCACAGGTAG;SOR=0.539;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=105;TCF=48;TCR=57;TR=37;WE=29913388;WS=29913370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,42:0.37:115
chr22	29915144	rs2072301	C	T	1045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-4.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.846;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=31;PP=692;ReadPosRankSum=0.257;SC=CACGTGTGCTCCCCCATCCCT;SOR=0.303;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=66;TCF=13;TCR=53;TR=40;WE=29915152;WS=29915134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,45:0.65:69
chr22	29916963	rs2072303	G	A	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=2.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.73;ReadPosRankSum=-1.159;SOR=0.950;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,24:0.29:82
chr22	29921795	rs144084290	G	A	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.374;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=109;ReadPosRankSum=0.412;SC=TCCCCATCCCGCACGTCATTG;SOR=0.159;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=10;WE=29921803;WS=29921785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr22	29924212	rs5763297	T	C	1019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;ReadPosRankSum=0.407;SC=GTCATAGCAATCTCCCCTTCC;SOR=0.670;Source=Platypus;TCF=90;WE=29924220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,63:0.29:219
chr22	29925221	rs2302140	C	T	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.539;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=18;PP=373;ReadPosRankSum=0.146;SC=CCACAGATAACGTCTTATCTG;SOR=0.850;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=104;TCF=50;TCR=54;TR=34;WE=29925229;WS=29925211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,40:0.33:122
chr22	29925284	rs2302141	T	C	685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.109;HP=2;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=487;ReadPosRankSum=0.724;SC=TGCTAAGCAGTGTGAGTAGGC;SOR=0.445;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=55;TCF=20;TCR=35;TR=20;WE=29925304;WS=29925274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,21:0.36:59
chr22	29925296	rs2302142	A	G	620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.609;HP=2;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=487;ReadPosRankSum=-0.927;SC=TGAGTAGGCCAGCTCTGGGGC;SOR=0.358;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=46;TCF=17;TCR=29;TR=18;WE=29925304;WS=29925274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,20:0.40:50
chr22	29938677	rs2240637	C	T	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.717;NF=7;NR=0;PP=113;ReadPosRankSum=0.304;SC=TGCTTGAACCCGGGAGGTGGA;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=7;WE=29938685;WS=29938667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr22	29952016	rs148052790	CAG	C	2368.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.984;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.030;NF=2;NR=29;PP=1305;ReadPosRankSum=-0.122;SC=AGAGGTCACACAGGGGGCTCA;SOR=0.535;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=43;TCF=3;TCR=40;TR=31;WE=29952025;WS=29952006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,60:0.75:80
chr22	29957570	rs1058642	G	A	2490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=47;PP=1491;ReadPosRankSum=0.129;SC=AGCTGAACTCGAGGAGCAGCT;SOR=0.651;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=74;TCR=67;TR=99;WE=29957578;WS=29957560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,110:0.71:155
chr22	29957911	rs469295	T	C	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.329;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=246;ReadPosRankSum=-0.717;SC=GATGACCTCCTCAAGGTTGGC;SOR=1.521;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=33;TCF=12;TCR=21;TR=17;WE=29957919;WS=29957901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr22	29966083	rs456285	C	T	1238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.758;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=17;PP=649;ReadPosRankSum=-1.648;SC=GAGGATGTTCCGCAAATTTGC;SOR=0.815;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=88;TCF=57;TCR=31;TR=50;WE=29966091;WS=29966073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,57:0.56:101
chr22	30038041	rs143701873	T	TA	105.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.852;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.81;ReadPosRankSum=-0.887;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr22	30038152	rs2530664	A	C	748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.466;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=13;PP=562;ReadPosRankSum=-0.474;SC=CCTCACTTCCACTCACAGAGT;SOR=1.056;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=112;TCF=72;TCR=40;TR=39;WE=30038160;WS=30038142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,41:0.30:135
chr22	30077361	rs140086	G	A	360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=8;NR=1;PP=151;SC=CTTGTGGGCCGCAGAGCACCT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=30077369;WS=30077351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr22	30124614	rs140096	A	T	2615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=21;PP=1610;SC=CTGTGCCTCCACCAGGTGATG;SOR=1.916;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=61;TCR=21;TR=82;WE=30124622;WS=30124604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr22	30124833	rs140097	T	C	2986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=62;PP=1885;SC=GGATGACCACTTCAGGCTTGT;SOR=1.902;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=30;TCR=62;TR=92;WE=30124841;WS=30124823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr22	30127472	rs5752956	G	T	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=45;ReadPosRankSum=1.675;SC=TTTCTGGAAGGCAGAGCCTCG;SOR=0.434;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=6;WE=30127480;WS=30127462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,7:0.25:28
chr22	30138548	rs140120	T	C	3163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=54;PP=1846;SC=CACAGGGGCATATGGACCCTT;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=48;TCR=54;TR=102;WE=30138556;WS=30138538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr22	30138689	rs140121	C	T	320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=7;PP=164;SC=TCCCACCCCACGCAGGACGGG;SOR=3.442;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=30138697;WS=30138679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr22	30184950	rs7954	A	G	1251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=9;PP=805;SC=CGATGGGAGCACGGCCTGGTG;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=42;WE=30184958;WS=30184940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr22	30200893	rs2074706	G	C	2586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=42;NR=50;PP=1629;SC=TCCCTCCCCAGCATCTGACCA;SOR=0.992;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=93;TCF=42;TCR=51;TR=92;WE=30200901;WS=30200883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr22	30200936	rs36572	T	C	1297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=31;PP=890;SC=CTGGGCTATATCTAAGTGGTA;SOR=1.708;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=47;TCF=15;TCR=32;TR=46;WE=30200944;WS=30200926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr22	30202774	rs737945	G	C	1601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=21;PP=935;SC=GAGGCAATTCGTGAGGGCTTA;SOR=0.836;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=28;TCR=21;TR=49;WE=30202782;WS=30202764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr22	30212194	rs713656	C	G	651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=15;PP=407;SC=GCAGCTAGGACCTAGGACGAG;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=30212202;WS=30212184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr22	30217827	rs2057882	A	T	527.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.11;ReadPosRankSum=-0.083;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,24:0.96:25
chr22	30217992	rs5763521	C	T	87.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=3;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=8;PP=126;SC=TGTCTTTTTTCTTTTTTTTTG;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=20;TCF=9;TCR=11;TR=14;WE=30218000;WS=30217980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr22	30221201	rs1894473	G	A	1385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.220;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=39;PP=822;ReadPosRankSum=1.525;SC=GGGACATAGCGCAGGTAGGAG;SOR=0.546;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=247;TCF=137;TCR=110;TR=81;WE=30221209;WS=30221191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,85:0.31:270
chr22	30221826	rs9306465	T	A	733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=22;PP=572;SC=GAGGGCCCATTTGCCAACCCA;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=25;WE=30221834;WS=30221816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr22	30223796	.	T	TCTC	754	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=80;MMLQ=21;MQ=60.0;NF=0;NR=11;PP=754;QD=75.4522051278;SC=GGCTACTCATTCTGACACACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=30223804;WS=30223786;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr22	30229399	rs3958025	C	G	547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=0;PP=403;SC=AAGAATAGAACGACATGAGAA;SOR=4.294;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=30229407;WS=30229389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr22	30234192	rs10559800	TGCC	T,TGCCGCCGCC	1625.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=24;NF=6,6;NR=5,5;PP=328,767;SC=ACCGGCTCTGTGCCGCCGCCG;SOR=1.845;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=11,11;WE=30234202;WS=30234182;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.27,0.73:41
chr22	30366924	rs34749290	C	CT	131.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.97;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr22	30374281	rs9306468	T	C	30.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr22	30374621	rs997913	T	A	360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=12;PP=317;SC=TATATATATATAACATACATG;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=30374629;WS=30374611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr22	30374872	rs372775454	CT	C	53.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=5.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.49;ReadPosRankSum=-1.215;SOR=0.097;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,9:0.25:36
chr22	30384572	rs5763671	G	A	1411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=28;PP=823;SC=TGGTATGTTTGTGTTGCTGTT;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=21;TCR=28;TR=49;WE=30384580;WS=30384562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr22	30394623	rs5763689	T	C	134.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=0;PP=76;SC=CAGAGTGGAATCCTGTCTCAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=30394631;WS=30394620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr22	30660517	rs1476576	A	C	4666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.81;SOR=1.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr22	30660521	rs75951407	C	T	4568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.79;SOR=1.212;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr22	30681797	rs6147585	T	TCTGCCCCAGCCCTTGGTGCTCCCC	2179.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQRankSum=1.040;QD=21.80;ReadPosRankSum=-1.845;SOR=0.631;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,49:0.49:100
chr22	30685560	rs1860217	G	C	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=430;ReadPosRankSum=-0.143;SC=CGGGGGTGGTGCCCGAGCCTT;SOR=0.951;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=21;WE=30685568;WS=30685540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,24:0.69:35
chr22	30691631	rs2097919	G	A	2613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.141;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=38;PP=1627;ReadPosRankSum=-2.124;SC=TGGGGGCACCGAGCTTCTAAA;SOR=0.516;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=161;TCF=105;TCR=56;TR=108;WE=30691639;WS=30691621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,117:0.68:172
chr22	30714684	rs740219	A	C	3447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.829;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=58;PP=1826;ReadPosRankSum=-0.700;SC=TGAACCAAGCACTAATGATTT;SOR=0.539;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=192;TCF=111;TCR=81;TR=135;WE=30714692;WS=30714674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,158:0.71:222
chr22	30736147	rs2074732	G	A	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=141;ReadPosRankSum=-0.351;SC=GCTGTAATTCGGAGACTACCA;SOR=0.914;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=10;WE=30736155;WS=30736137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr22	30738161	rs9608885	C	T	2597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=42;PP=1473;ReadPosRankSum=-1.008;SC=CCTGGCTCCCCATCTGGAGTC;SOR=0.731;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=137;TCF=80;TCR=57;TR=102;WE=30738169;WS=30738151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,112:0.74:151
chr22	30738737	rs5753080	G	A	1846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.652;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=17;PP=916;ReadPosRankSum=-0.727;SC=ACTGTTTTCAGACATAAAACA;SOR=1.329;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=98;TCF=66;TCR=32;TR=65;WE=30738745;WS=30738727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,81:0.70:115
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chr22	30782089	rs5997629	A	G	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.269;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=295;ReadPosRankSum=1.682;SC=TCAGGATGAGAAGAAGCAGGG;SOR=0.969;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=37;TCF=13;TCR=24;TR=21;WE=30782097;WS=30782079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,25:0.58:43
chr22	30793137	rs757660	G	A	2603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.084;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=49;PP=1458;ReadPosRankSum=-1.256;SC=CTGAGCCCCAGGCAGAAGGAG;SOR=0.602;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=182;TCF=95;TCR=87;TR=107;WE=30793145;WS=30793127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,121:0.58:208
chr22	30793270	rs887098	G	A	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.315;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=241;ReadPosRankSum=-1.164;SC=GGCGGGCGGCGGAGGGAACAG;SOR=3.334;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=11;WE=30793278;WS=30793260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
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chr22	30812549	rs5997642	C	G	912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=22;PP=602;ReadPosRankSum=1.381;SC=AGAAATCTAGCCTTGGAGACT;SOR=0.622;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=47;TCF=16;TCR=31;TR=34;WE=30812557;WS=30812539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,38:0.75:51
chr22	30822920	rs5844906	T	TG	4016.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=52;PP=2487;SC=AAAGTCCCTGTGGACACTCCA;SOR=1.377;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=63;TCF=5;TCR=58;TR=57;WE=30822928;WS=30822910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
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chr22	30823196	rs5753130	T	C	2937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.953;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=52;PP=1469;ReadPosRankSum=1.885;SC=CCAGGGTGACTGTGGCTGTGG;SOR=0.495;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=164;TCF=96;TCR=68;TR=121;WE=30823204;WS=30823186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,133:0.73:182
chr22	30856121	rs35764129	G	A	1344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.646;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=27;PP=702;ReadPosRankSum=1.052;SC=TTGTCGAAGCGTAGGACATCT;SOR=0.529;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=92;TCF=47;TCR=45;TR=57;WE=30856129;WS=30856111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,64:0.63:102
chr22	30856154	rs200146605	C	A	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.915;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=278;ReadPosRankSum=1.055;SC=GAAAGAGGGGCATTGGGCTTG;SOR=0.826;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=70;TCF=31;TCR=39;TR=24;WE=30856162;WS=30856144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,26:0.34:76
chr22	30857373	rs2240345	A	C	2598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.241;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=42;PP=1436;ReadPosRankSum=-0.699;SC=TGGGTAGAACATCTGTCATCT;SOR=0.574;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=153;TCF=88;TCR=65;TR=100;WE=30857381;WS=30857363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,118:0.66:178
chr22	30857448	rs5749104	A	G	3270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.791;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=51;PP=1635;ReadPosRankSum=1.284;SC=TGTCCGCACCATCAGATGAGA;SOR=0.831;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=181;TCF=102;TCR=79;TR=124;WE=30857456;WS=30857438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,150:0.69:217
chr22	30857611	rs201703799	G	A	1096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.206;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=31;PP=710;ReadPosRankSum=0.323;SC=GATCTGCACCGAGTGCTCGTA;SOR=0.834;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=178;TCF=88;TCR=90;TR=58;WE=30857619;WS=30857601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,62:0.32:194
chr22	30860830	rs2269961	C	T	2419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=48;PP=1334;ReadPosRankSum=-0.593;SC=AATTTTCCTGCGAGTGTCCTC;SOR=0.689;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=69;TCR=70;TR=95;WE=30860838;WS=30860820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,108:0.68:160
chr22	30862146	rs1047917	C	A	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.959;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=250;ReadPosRankSum=-0.521;SC=TAAGGCCAACCCTAGAAGTTA;SOR=2.059;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=15;WE=30862154;WS=30862136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr22	30862400	rs1057995	T	A	1806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.512;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.763;NF=24;NR=44;PP=1050;ReadPosRankSum=0.322;SC=CCAAGAGAGATCCCTTCAGAG;SOR=0.887;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=111;TCF=41;TCR=70;TR=68;WE=30862408;WS=30862390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,79:0.62:127
chr22	30863163	rs5997653	C	T	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=71;ReadPosRankSum=0.477;SC=TTCTAGACCCCGACTCTGTCC;SOR=0.859;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=7;WE=30863171;WS=30863153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr22	30864692	rs4820854	G	A	4665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.903;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=93;PP=2800;ReadPosRankSum=-0.769;SC=ACCTGGGCATGAAAAGATGCA;SOR=0.725;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=293;TCF=150;TCR=143;TR=188;WE=30864700;WS=30864682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,212:0.64:329
chr22	30864817	rs2269963	A	G	901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=25;PP=597;ReadPosRankSum=3.262;SC=AGACAGTGCTATTGTCTCAGG;SOR=0.796;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=53;TCF=12;TCR=41;TR=33;WE=30864825;WS=30864807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,36:0.64:56
chr22	30867139	rs5997658	GC	TT	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=146;ReadPosRankSum=-1.242;SC=AGGTGTGGTGGCACATGCCTG;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=4;WE=30867148;WS=30867129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr22	30886272	.	G	A	750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.832;ClippingRankSum=0.000;DP=177;ExcessHet=3.0103;FS=3.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.24;ReadPosRankSum=0.087;SOR=0.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:129,48:0.27:177
chr22	30927975	rs5749118	C	T	4816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=75;NR=87;PP=2875;SC=TTTCTCCACCCTCTTCCCCAG;SOR=0.965;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=163;TCF=75;TCR=88;TR=162;WE=30927983;WS=30927965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr22	30973268	rs41282481	G	A	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=394;ReadPosRankSum=0.131;SC=ACTTCATGGTGAGAAAACATG;SOR=0.976;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=23;WE=30973276;WS=30973258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,23:0.70:33
chr22	30987861	rs737953	G	C	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=2.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.02;ReadPosRankSum=0.114;SOR=0.952;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,35:0.25:139
chr22	30988382	rs13053923	G	A	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=22;ReadPosRankSum=0.901;SC=TCGCGGTTATGCGGCTAAAAT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=4;WE=30988390;WS=30988372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr22	31009118	rs11703570	T	A	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.789;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=251;ReadPosRankSum=0.338;SC=CTTTGGGTTTTCTCCCCAGGC;SOR=0.315;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=16;WE=31009126;WS=31009108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,16:0.39:41
chr22	31010242	rs5749134	G	C	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=4.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.128;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=209;ReadPosRankSum=1.004;SC=CCAAAAGAGCGTGTTGGAAAG;SOR=2.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=11;WE=31010250;WS=31010232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr22	31010556	rs5997703	C	G	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-2.559;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=123;ReadPosRankSum=0.124;SC=CACTGATGACCTCCATACCCT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=7;WE=31010564;WS=31010546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr22	31011504	rs139588634	CAG	C	1459.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.25;MQRankSum=4.098;QD=6.95;ReadPosRankSum=-0.136;SOR=0.700;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:161,49:0.23:210
chr22	31011557	rs2267163	T	C	992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.17;MQRankSum=3.481;QD=4.02;ReadPosRankSum=-1.987;SOR=0.860;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:185,62:0.25:247
chr22	31011610	rs1801198	G	C	1294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=2.997;NF=41;NR=31;PP=730;ReadPosRankSum=0.422;SC=TCCCCCATGCGTGGGGCAGAA;SOR=0.686;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=229;TCF=124;TCR=105;TR=72;WE=31011618;WS=31011600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:177,80:0.31:257
chr22	31011882	rs4820021	A	T	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=5.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.660;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=316;ReadPosRankSum=0.909;SC=TCAGCACAAGATTGTGGGTGT;SOR=3.383;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=15;WE=31011890;WS=31011872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,15:0.45:33
chr22	31011906	rs5749135	C	T	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.776;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=107;ReadPosRankSum=0.273;SC=TGGGACACAGCAGCCAAAATG;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=7;WE=31011914;WS=31011896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr22	31013549	rs740235	G	A	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=68;ReadPosRankSum=0.114;SC=GGTCACAGAAGAGACGGGGAA;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=5;WE=31013557;WS=31013539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr22	31018777	rs2301956	G	A	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.37;ReadPosRankSum=1.545;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,3:0.23:13
chr22	31018817	rs2301957	C	T	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=5.300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.72;ReadPosRankSum=-3.193;SOR=0.207;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,12:0.27:44
chr22	31018884	rs2301958	G	C	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=0.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.39;ReadPosRankSum=1.178;SOR=0.563;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,36:0.29:126
chr22	31022272	rs2072194	G	A	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.680;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=62;ReadPosRankSum=2.198;SC=GGAACCCTGTGGGAAGCTGAG;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=5;WE=31022280;WS=31022262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr22	31032920	rs5997714	A	G	1728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.103;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=53;PP=1173;ReadPosRankSum=-2.243;SC=GCCACCACCCACTTCAGTTGG;SOR=0.854;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=266;TCF=121;TCR=145;TR=92;WE=31032928;WS=31032910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:191,97:0.34:288
chr22	31059250	rs2240002	T	G	34.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.59;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr22	31060029	rs1005887	G	C	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.982;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=184;ReadPosRankSum=0.792;SC=AGCGAAGCACGAAGGCTGCGT;SOR=1.228;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=39;TCF=14;TCR=25;TR=12;WE=31060037;WS=31060019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,13:0.28:47
chr22	31089958	.	G	GA	121	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;FR=0.5081;HP=13;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=15;MQ=58.73;NF=5;NR=5;PP=121;QD=12.6;SC=TCTCAAAAAGGAAAAAAAAAA;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=27;TCF=18;TCR=9;TR=10;WE=31089966;WS=31089948;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:17,10:0.37:27
chr22	31266546	rs2301816	T	C	5846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=109;PP=2965;SC=AGCACGGCGCTGCACTCCAGC;SOR=0.936;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=206;TCF=97;TCR=109;TR=206;WE=31266554;WS=31266536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr22	31266777	rs4820909	T	C	328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=12;PP=265;SC=CCATTTCCTGTGGTTCCACGG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=31266785;WS=31266767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr22	31285680	rs5749186	G	A	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.818;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=169;ReadPosRankSum=-0.690;SC=TTTCCTGTGCGTGGATGAGCA;SOR=1.105;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=56;TCF=7;TCR=49;TR=15;WE=31285688;WS=31285670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,18:0.30:60
chr22	31301734	rs10625967	A	AGG	1143.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=4;PP=761;SC=GCGACCCGGGAGGAGACACCG;SOR=2.387;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=17;WE=31301742;WS=31301724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr22	31302125	rs3804084	C	G	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.245;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=128;ReadPosRankSum=-1.399;SC=GCCGCAGGGACGGATTCCGGG;SOR=2.599;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=32;TCF=23;TCR=9;TR=9;WE=31302133;WS=31302115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,10:0.27:37
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chr22	31342376	rs2072132	G	C	1271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=18;PP=515;ReadPosRankSum=-0.565;SC=GGAAGAGGCAGGTCATGGTGT;SOR=0.712;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=117;TCF=72;TCR=45;TR=53;WE=31342384;WS=31342366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,62:0.48:128
chr22	31342594	rs5753403	C	T	575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=15;PP=385;SC=CCACAGCCCTCGTTCCCTCTC;SOR=3.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=31342602;WS=31342584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr22	31354653	rs737924	G	A	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.598;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=246;ReadPosRankSum=1.046;SC=GTTCAGCAAGGGCACCAAACA;SOR=1.247;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=73;TCF=29;TCR=44;TR=20;WE=31354661;WS=31354643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,22:0.27:81
chr22	31486291	rs2074738	G	C	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=32;ReadPosRankSum=0.754;SC=TGCAGTCCCTGATACTGCACC;SOR=0.368;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=5;WE=31486299;WS=31486281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr22	31486911	rs2074737	C	G	1958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.236;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=39;PP=1019;ReadPosRankSum=-2.639;SC=AGACCCTGTCCCACCCAGTTG;SOR=0.770;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=224;TCF=118;TCR=106;TR=90;WE=31486919;WS=31486901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,106:0.41:260
chr22	31491295	rs3205187	G	C	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=280;ReadPosRankSum=-0.368;SC=GCAGATGGAAGCAGAGCCAGC;SOR=0.772;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=19;WE=31491303;WS=31491285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,22:0.67:33
chr22	31493273	rs149678046	T	C	1989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.576;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=34;PP=977;ReadPosRankSum=-0.720;SC=GGCAGCACCATGATGCAAACC;SOR=0.603;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=143;TCF=85;TCR=58;TR=81;WE=31493281;WS=31493263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,96:0.57:168
chr22	31493460	rs5753458	T	C	333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=14;PP=284;SC=GAGGCCGAGGTGGGCGGATCA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=31493468;WS=31493450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr22	31494568	rs33991833	A	AC	366.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.631;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=216;ReadPosRankSum=0.581;SC=GTGCTACAAGACCCCCCCTCC;SOR=0.333;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=28;TCF=17;TCR=11;TR=10;WE=31494576;WS=31494558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr22	31494866	rs4281997	G	T	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.833;HP=1;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=26;PP=631;ReadPosRankSum=0.761;SC=GGGGCGGGGCGTGATAGGCAG;SOR=1.389;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=46;TCF=14;TCR=32;TR=33;WE=31494874;WS=31494856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,24:0.65:37
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chr22	31497054	rs5753459	A	C	2868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=46;NR=52;PP=1523;SC=CGCCGCCTCTACCACCTGCCC;SOR=0.970;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=99;TCF=46;TCR=53;TR=98;WE=31497062;WS=31497044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr22	31497110	rs35657209	G	T	877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.809;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=25;PP=576;ReadPosRankSum=0.400;SC=GGTCCAGGGAGGCGGGTGGGG;SOR=0.446;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=42;TCF=11;TCR=31;TR=35;WE=31497118;WS=31497100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,37:0.86:43
chr22	31501788	rs11705137	T	C	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.288;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=20;PP=535;ReadPosRankSum=1.014;SC=GGCTAGACTCTCAGCCTAGGC;SOR=2.002;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=37;TCF=13;TCR=24;TR=27;WE=31501796;WS=31501778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,27:0.73:37
chr22	31501909	.	A	C	1251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.701;ClippingRankSum=0.000;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.169;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=19;PP=766;ReadPosRankSum=-1.712;SC=TCTTCCTTCAAACTCACCTCC;SOR=0.452;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=68;TCF=44;TCR=24;TR=49;WE=31501917;WS=31501899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,56:0.73:77
chr22	31503560	rs13053829	C	T	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.033;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.579;NF=3;NR=5;PP=63;ReadPosRankSum=-0.830;SC=CGTCTGGGCCCCCAGGCTGGC;SOR=0.569;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=8;WE=31503568;WS=31503550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr22	31518824	rs8137317	A	T	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=59;ReadPosRankSum=0.751;SC=CTCAGCAGCCAGTTTGAAGGA;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=5;WE=31518832;WS=31518814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr22	31521266	.	G	A	2403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.092;ClippingRankSum=0.000;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.660;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQ=60.07;MQRankSum=0.656;NF=47;NR=51;PP=1345;ReadPosRankSum=-1.535;SC=GCCAACACTGGCAGCCTCTGG;SOR=0.775;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=140;TCF=68;TCR=72;TR=98;WE=31521274;WS=31521256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,107:0.71:151
chr22	31521850	rs2240431	A	C	1849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=31;PP=1050;ReadPosRankSum=-0.752;SC=GGCTTGGCACACAGAGTACAG;SOR=0.718;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=55;TCR=45;TR=69;WE=31521858;WS=31521840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,79:0.70:113
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chr22	31528932	rs2413027	A	T	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=1.901;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=418;ReadPosRankSum=0.972;SC=AGGGCTTGGTATTTATACTAG;SOR=1.609;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=25;WE=31528940;WS=31528922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,26:0.79:33
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chr22	31533796	rs2072193	G	C	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=184;ReadPosRankSum=0.464;SC=TGTTGGCTTTGCTGGGGCGCT;SOR=0.765;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=42;TCF=29;TCR=13;TR=14;WE=31533804;WS=31533786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,15:0.31:48
chr22	31533967	rs2074739	G	A	1327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=21;NR=18;PP=599;SC=GCACTGTGCCGTACATCCTAC;SOR=0.994;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=21;TCR=18;TR=39;WE=31533975;WS=31533957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr22	31535872	rs2074735	G	C	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.916;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=15;PP=318;ReadPosRankSum=0.157;SC=CCACACCACAGTGTGCCAGGC;SOR=0.947;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=76;TCF=39;TCR=37;TR=29;WE=31535880;WS=31535862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,30:0.38:79
chr22	31536133	rs2232176	A	C	4255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=57;PP=2380;SC=CAGCTACATGACTGCAGCCTC;SOR=0.813;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=75;TCR=57;TR=132;WE=31536141;WS=31536123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr22	31556103	rs5997893	A	G	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=13;PP=269;ReadPosRankSum=-1.373;SC=TTAGAGCTTCAGCCATGGAAA;SOR=0.846;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=42;TCF=20;TCR=22;TR=24;WE=31556111;WS=31556093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,29:0.59:49
chr22	31583007	rs5997902	A	G	356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=298;SC=GCAGAAATGGACAGTCAAGAG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=31583015;WS=31583005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr22	31592964	.	G	A	660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.309;ClippingRankSum=0.000;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.759;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.410;NF=16;NR=17;PP=370;ReadPosRankSum=1.564;SC=GGCCAGAGCCGGAGAATAGAG;SOR=0.582;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=45;TCR=50;TR=33;WE=31592972;WS=31592954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,37:0.34:109
chr22	31600460	rs2413035	T	C	3141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.97;NF=40;NR=56;PP=1856;SC=TGTTTTCTCCTTTCTGTCTCT;SOR=1.149;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=40;TCR=56;TR=96;WE=31600468;WS=31600450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr22	31602139	rs3208937	A	G	481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=14;PP=355;SC=TGCATAGTTTATGGAAACAAA;SOR=3.383;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=18;WE=31602147;WS=31602129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr22	31602187	rs13158	C	T	131.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=26.38;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr22	31658281	rs2073857	A	G	3018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=56;PP=1788;SC=AGATCCTCTGAGAAATCAGGC;SOR=1.189;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=41;TCR=56;TR=97;WE=31658289;WS=31658271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr22	31663842	rs2228619	C	G	4789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=77;PP=2943;SC=AGCTGAACCTCCTGACAGAGT;SOR=0.774;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=169;TCF=92;TCR=77;TR=169;WE=31663850;WS=31663832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr22	31664032	rs5997929	C	T	1224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=18;PP=870;ReadPosRankSum=0.239;SC=TGAGCATACACAGGGAGGCTT;SOR=0.614;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=58;TCF=35;TCR=23;TR=44;WE=31664040;WS=31664022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,47:0.80:59
chr22	31664395	rs144757660	AAAGGCAAACAGGGCACGGAC	A	59.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.98;MQRankSum=0.967;QD=6.64;ReadPosRankSum=-0.992;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr22	31669267	rs2040532	A	G	734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=2;PP=531;SC=GTTCACCTACAGCTGAGGAAG;SOR=3.690;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=27;WE=31669275;WS=31669257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr22	31672676	rs59315359	G	A	135.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.64;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr22	31672752	rs5997933	A	C	348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.72;QD=24.91;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr22	31679110	rs2040533	G	C	1481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=13;PP=926;SC=AAGGGGGGTGGTGCCCTCCTG;SOR=1.697;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=34;TCR=13;TR=47;WE=31679118;WS=31679100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr22	31685458	rs5753543	G	A	5838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=99;PP=2965;SC=GAATCCCAACGAGGGCAGGGG;SOR=0.820;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=196;TCF=97;TCR=99;TR=195;WE=31685466;WS=31685448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr22	31687142	rs5753544	G	C	5754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=102;PP=2965;SC=CCAGCCCCGGGGCCGTCCCCC;SOR=0.869;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=197;TCF=95;TCR=102;TR=195;WE=31687150;WS=31687132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr22	31687313	rs4820044	A	G	4254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=62;NR=69;PP=2189;SC=CGGACACAGAATAGCGGGCAG;SOR=0.985;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=62;TCR=69;TR=131;WE=31687321;WS=31687303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr22	31724972	rs131207	CA	C	2893.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=49;PP=2060;SC=CTCCTTCCCCCAACTCCTCTC;SOR=2.103;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=51;TCF=1;TCR=50;TR=50;WE=31724980;WS=31724962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr22	31739023	rs145232999	TAC	T	127.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=1.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.41;ReadPosRankSum=1.055;SOR=0.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,9:0.17:53
chr22	31795866	rs4820047	T	C	1076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=25;PP=730;SC=TCTGCCACGATTAGGAGTCCC;SOR=2.964;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=31;WE=31795874;WS=31795856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr22	31838085	rs5997988	G	A	2339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.339;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=49;PP=1370;ReadPosRankSum=0.132;SC=TGGGTACAGAGCTGGATGACA;SOR=0.587;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=135;TCF=59;TCR=76;TR=88;WE=31838093;WS=31838075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,101:0.66:154
chr22	31844293	rs738658	A	C	5146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=95;PP=2965;ReadPosRankSum=1.666;SC=TTAATGCATGACATTTCTTGC;SOR=0.377;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=168;TCF=71;TCR=97;TR=166;WE=31844301;WS=31844283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,191:0.99:192
chr22	31844373	rs2012451	A	C	596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=308;ReadPosRankSum=-1.339;SC=GTGCCCCAACAGTGGGCTATG;SOR=0.876;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=12;TCR=30;TR=24;WE=31844381;WS=31844363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,29:0.57:51
chr22	31846079	rs144780466	C	CT	464.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=446;ReadPosRankSum=-0.682;SC=ACTTTGTCAACTTTTTTAGCC;SOR=0.749;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=16;WE=31846087;WS=31846069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,19:0.70:27
chr22	31854370	rs4820048	A	G	661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.602;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=3;PP=506;ReadPosRankSum=-0.746;SC=AAACCCCAAAAGCATCTAGCA;SOR=1.308;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=42;TCF=36;TCR=6;TR=25;WE=31854378;WS=31854360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,26:0.60:43
chr22	31854434	rs11293411	AT	A	4089.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=42;PP=2272;SC=TTAACCACACATTTTTTAAGT;SOR=1.147;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=77;TCF=30;TCR=47;TR=71;WE=31854442;WS=31854424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr22	31859859	rs5753627	A	G	898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.226;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=20;PP=479;ReadPosRankSum=0.012;SC=GCCGGGAGCTAACAGCGGCTG;SOR=0.397;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=123;TCF=58;TCR=65;TR=42;WE=31859867;WS=31859849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,51:0.35:146
chr22	31904170	rs2413054	A	G	1434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=33;NR=15;PP=863;SC=GAGCTGGCATATAGTTCAGAA;SOR=1.244;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=33;TCR=15;TR=48;WE=31904178;WS=31904160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr22	31926725	rs3818134	C	T	647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=16;PP=369;ReadPosRankSum=-2.682;SC=AGGCATTTGCCGGCCATTTTA;SOR=0.804;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=35;TCF=13;TCR=22;TR=25;WE=31926733;WS=31926715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,28:0.70:40
chr22	31942829	rs148360145	A	AT	273.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=10.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.97;ReadPosRankSum=0.454;SOR=2.261;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,19:0.28:69
chr22	31942938	rs200364231	C	T	939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=21;PP=443;ReadPosRankSum=-0.827;SC=ACTCTGTGTTCGAGCTGACTG;SOR=0.713;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=152;TCF=80;TCR=72;TR=44;WE=31942946;WS=31942928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,55:0.32:174
chr22	31971172	rs10657905	A	ATCT	2531.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=8;PP=1523;SC=TTTCCAGCTCATCTAACCTTA;SOR=1.919;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=32;TCF=21;TCR=11;TR=27;WE=31971180;WS=31971162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr22	31971258	rs5753700	T	C	2854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=48;NR=47;PP=1709;SC=GCTCCAGATATACTTCTGTGA;SOR=0.712;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=48;TCR=47;TR=95;WE=31971266;WS=31971248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr22	31976451	rs11347644	AC	A	483.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-2.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.423;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.318;NF=0;NR=9;PP=330;ReadPosRankSum=-0.263;SC=TTTTAAAAAAACTTTTTGTGC;SOR=0.191;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=9;WE=31976459;WS=31976441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,19:0.37:51
chr22	31983287	rs112798271	A	ATTTGTTTTGT	5069.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=28;PP=2982;SC=ATGCCAATTTATTTGTTTTGT;SOR=1.412;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=7;TCR=69;TR=31;WE=31983295;WS=31983277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr22	31998612	rs2006771	G	A	2052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.579;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=37;PP=1090;ReadPosRankSum=0.740;SC=CACGCAGAGCGACAGCTTCTG;SOR=0.521;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=108;TCF=62;TCR=46;TR=81;WE=31998620;WS=31998602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,91:0.73:125
chr22	32001037	rs8142376	C	T	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.854;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.10;ReadPosRankSum=1.068;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr22	32002294	rs5753723	T	C	2193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=46;NR=19;PP=1551;SC=TCTGCCTTCCTCGCACCCATG;SOR=1.842;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=46;TCR=19;TR=65;WE=32002302;WS=32002284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr22	32011225	rs12171042	T	C	713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=2.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.04;ReadPosRankSum=-0.569;SOR=0.432;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,37:0.47:79
chr22	32012634	rs738684	C	T	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=2.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.86;ReadPosRankSum=0.824;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr22	32012675	.	C	G	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.015;ClippingRankSum=0.000;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.40;ReadPosRankSum=1.567;SOR=0.823;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,20:0.34:59
chr22	32015406	rs14034	T	C	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.10;ReadPosRankSum=0.365;SOR=0.260;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr22	32015450	rs9956	T	G	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.186;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=289;ReadPosRankSum=-0.430;SC=GAACAGGTGGTAGCCGAATCA;SOR=0.976;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=45;TCF=33;TCR=12;TR=19;WE=32015458;WS=32015440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,23:0.45:51
chr22	32021836	rs11556539	C	T	1086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=31;PP=681;ReadPosRankSum=0.183;SC=GAGGCTCACTCGATCACTCCC;SOR=0.661;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=155;TCF=78;TCR=77;TR=61;WE=32021844;WS=32021826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,64:0.38:169
chr22	32097775	rs6518754	T	C	1120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=31;PP=655;ReadPosRankSum=-1.144;SC=AGAAGAAAGATGGTCAAGCTG;SOR=0.723;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=65;TCF=21;TCR=44;TR=45;WE=32097783;WS=32097765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,49:0.68:72
chr22	32099737	rs181607540	G	C	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.19;MQRankSum=-0.479;QD=2.55;ReadPosRankSum=-2.228;SOR=0.813;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,12:0.21:56
chr22	32110163	rs140078	G	A	1104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=26;PP=593;ReadPosRankSum=0.952;SC=GCAAGACATCGACTCTTTTGA;SOR=0.681;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=193;TCF=102;TCR=91;TR=58;WE=32110171;WS=32110153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,68:0.30:225
chr22	32112461	rs140081	T	C	1091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FS=0.557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.03;ReadPosRankSum=-1.273;SOR=0.754;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:156,61:0.28:217
chr22	32121626	rs5753766	G	C	813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=3.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.98;ReadPosRankSum=-2.005;SOR=0.437;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,47:0.35:136
chr22	32156764	rs184825947	T	C	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=1.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.81;ReadPosRankSum=-0.062;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,6:0.21:28
chr22	32161092	rs74331125	C	T	610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FS=2.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.77;ReadPosRankSum=0.084;SOR=0.935;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:123,39:0.24:162
chr22	32179850	rs138286	G	C	2349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=16;PP=1714;SC=AACTGAAACTGTATATGGCAT;SOR=2.599;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=57;TCR=16;TR=73;WE=32179858;WS=32179840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
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chr22	32205632	rs5998135	A	C	1957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.623;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=47;PP=1257;ReadPosRankSum=-2.322;SC=GCCGTGATACATGTGAGTATT;SOR=0.434;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=113;TCF=43;TCR=70;TR=79;WE=32205640;WS=32205622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,86:0.69:125
chr22	32205703	rs76200772	C	T	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=106;ReadPosRankSum=-1.049;SC=CAGTGGCTCACGCCTATAATC;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=7;WE=32205711;WS=32205693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr22	32222476	rs17761491	C	G	1480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-0.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.472;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=34;PP=722;ReadPosRankSum=0.451;SC=ATAGGTTCCTCTCTATAGAAT;SOR=0.695;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=225;TCF=117;TCR=108;TR=71;WE=32222484;WS=32222466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:186,87:0.32:273
chr22	32229977	rs55645350	G	A	1596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.519;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=36;PP=995;ReadPosRankSum=0.588;SC=GTAAGAGGGGGCAGCTGACTG;SOR=0.700;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=105;TCF=53;TCR=52;TR=68;WE=32229985;WS=32229967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,73:0.62:117
chr22	32230185	rs9621346	G	A	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.501;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5004;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=170;ReadPosRankSum=-0.493;SC=AGGTGATTCAGGGGCACCTGG;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=8;WE=32230193;WS=32230175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr22	32239781	rs201146392	C	T	915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=23;PP=559;ReadPosRankSum=-0.705;SC=TCTGTTCTGCCGGCTCTGAAG;SOR=0.827;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=60;TCF=25;TCR=35;TR=39;WE=32239789;WS=32239771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,42:0.66:64
chr22	32243020	rs3216829	TC	T	771.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.319;NF=4;NR=20;PP=784;ReadPosRankSum=0.503;SC=AGTGCCCTGTTCCCTTGAGGG;SOR=0.804;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=41;TCF=5;TCR=36;TR=24;WE=32243028;WS=32243010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,27:0.55:49
chr22	32266546	rs5994441	A	T	1483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=16;PP=863;SC=TATTTTTGGAATCAAGTATTC;SOR=1.487;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=36;TCR=16;TR=52;WE=32266554;WS=32266536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr22	32275353	rs5994443	T	C	643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=2;PP=486;SC=TTTGCCTATTTGCTACGTTTC;SOR=3.160;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=32275361;WS=32275343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr22	32275789	rs3213524	G	A	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.626;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=356;ReadPosRankSum=-2.444;SC=GGGTGGCTGCGGGAAAGTAGT;SOR=0.148;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=18;WE=32275797;WS=32275779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,19:0.73:26
chr22	32334021	rs1984388	T	A	1787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.829;NF=41;NR=45;PP=1227;ReadPosRankSum=0.532;SC=TGTCTTTTGATGCAGCCCTGT;SOR=0.719;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=199;TCF=98;TCR=101;TR=86;WE=32334029;WS=32334011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,90:0.41:218
chr22	32334203	rs3788442	C	T	1005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.368;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=26;PP=622;ReadPosRankSum=-2.059;SC=CCAGCTTTCCCGGACCATGCA;SOR=0.500;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=107;TCF=40;TCR=67;TR=43;WE=32334211;WS=32334193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,51:0.39:130
chr22	32334229	rs3788443	A	C	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=296;ReadPosRankSum=0.332;SC=GCCCCTCCCAACCCAGCCCAC;SOR=0.657;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=17;TCR=42;TR=20;WE=32334237;WS=32334219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,24:0.33:72
chr22	32340837	rs71845980	CG	C	89.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.97;ReadPosRankSum=-1.437;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr22	32435409	rs130262	G	C	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=34;ReadPosRankSum=0.828;SC=CTGCTTCTCTGGGCTTTCCAC;SOR=0.754;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=21;TCF=14;TCR=7;TR=5;WE=32435417;WS=32435399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr22	32435511	rs7285301	G	A	915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.023;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=15;PP=420;ReadPosRankSum=-0.558;SC=TGAAGAAGGCGGCCCGGGTCA;SOR=0.606;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=41;TCF=23;TCR=18;TR=33;WE=32435519;WS=32435501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,41:0.80:51
chr22	32463875	rs135110	G	A	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.775;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=176;ReadPosRankSum=1.356;SC=TTTTTCTGCAGCAGCTGAGGG;SOR=1.352;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=12;WE=32463883;WS=32463865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,12:0.41:29
chr22	32478972	rs131880	A	AG	4533.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=34;PP=2685;SC=GAAGGCCAGCAGAAGTAGAGG;SOR=1.207;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=61;TCF=26;TCR=35;TR=59;WE=32478980;WS=32478962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr22	32482321	rs5998233	T	G	1387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.051;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=31;PP=806;ReadPosRankSum=-1.470;SC=AATGGTGAGATTCTTTCTTGG;SOR=0.435;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=78;TCF=32;TCR=46;TR=54;WE=32482329;WS=32482311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,61:0.67:91
chr22	32545849	rs58570639	C	CA	3747.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=45;PP=2336;SC=CACTTGGTGACGTAGAAAACA;SOR=1.085;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=53;TCF=6;TCR=47;TR=51;WE=32545857;WS=32545839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr22	32546946	rs2019949	C	T	1781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-3.261;NF=44;NR=41;PP=1204;ReadPosRankSum=-0.071;SC=GTCAACTACACGTAAATAAAG;SOR=0.682;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=135;TCF=70;TCR=65;TR=85;WE=32546954;WS=32546936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,83:0.61:136
chr22	32547012	rs3888536	G	A	1187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-4.411;NF=28;NR=34;PP=753;ReadPosRankSum=-0.616;SC=ATTTCCTGCAGTAAGAGAAAA;SOR=0.743;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=102;TCF=44;TCR=58;TR=62;WE=32547020;WS=32547002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,57:0.58:98
chr22	32547086	rs2019952	C	T	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.831;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.178;NF=0;NR=10;PP=194;ReadPosRankSum=1.011;SC=TTTTATTCACCTGGTGAAATA;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=10;WE=32547094;WS=32547076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr22	32547626	rs5998254	T	C	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.911;NF=2;NR=18;PP=354;ReadPosRankSum=-1.716;SC=GGGGCTGGAGTGTGTGGAGGT;SOR=0.509;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=20;WE=32547634;WS=32547616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,23:0.74:31
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chr22	32548421	rs9609456	G	A	1017.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.98;MQRankSum=-5.263;QD=21.65;ReadPosRankSum=0.242;SOR=0.917;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,27:0.57:47
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chr22	32554860	rs8141332	G	A	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=199;ReadPosRankSum=0.906;SC=GCTATGGGCAGGAGGGAGCTG;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=9;WE=32554868;WS=32554850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
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chr22	32554997	rs78036098	G	A	2114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.658;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=28;PP=1180;ReadPosRankSum=1.845;SC=CATCTTCGGCGTCTTCGGGAG;SOR=0.936;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=109;TCF=69;TCR=40;TR=80;WE=32555005;WS=32554975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,90:0.73:124
chr22	32579550	rs136428	T	C	4292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FS=5.610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.67;ReadPosRankSum=1.178;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,108:0.62:174
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chr22	32579676	rs136430	A	G	1271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.283;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=24;PP=631;ReadPosRankSum=0.000;SC=AAGAATCACTATATTTATCAG;SOR=0.369;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=73;TCF=31;TCR=42;TR=44;WE=32579684;WS=32579666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,57:0.63:90
chr22	32579742	rs1297809	C	T	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQRankSum=-0.600;QD=25.51;ReadPosRankSum=0.000;SOR=0.622;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
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chr22	32586632	rs136466	C	T	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=225;ReadPosRankSum=2.006;SC=AGATTAAGTACAATCAAGAAA;SOR=1.179;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=13;WE=32586640;WS=32586623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,14:0.78:18
chr22	32586854	rs136467	C	T	710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=3.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=20.678;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-7.583;NF=12;NR=23;PP=570;ReadPosRankSum=-1.247;SC=TTAGGTGGAACTGAAGGAGCC;SOR=2.164;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=109;TCF=52;TCR=57;TR=35;WE=32586862;WS=32586844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,36:0.31:117
chr22	32586875	rs136468	G	A	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=31.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.10;MQRankSum=-9.431;QD=6.19;ReadPosRankSum=-0.946;SOR=3.249;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,22:0.21:106
chr22	32586878	rs136469	A	G	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=21.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.29;MQRankSum=-9.530;QD=6.37;ReadPosRankSum=-1.296;SOR=2.624;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:82,21:0.20:103
chr22	32586926	rs136470	T	C	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=0.994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.62;MQRankSum=-7.731;QD=2.48;ReadPosRankSum=-0.043;SOR=0.503;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,18:0.18:101
chr22	32587023	rs55974778	C	G	4835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FS=10.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.34;MQRankSum=-5.412;QD=24.30;ReadPosRankSum=0.625;SOR=1.332;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,120:0.60:199
chr22	32587027	rs136472	G	C	4960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FS=10.244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.71;MQRankSum=-5.680;QD=22.86;ReadPosRankSum=1.749;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,129:0.59:217
chr22	32587478	rs136473	T	C	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=4.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=187;ReadPosRankSum=-0.715;SC=CTTCATGAGGTAACTTCCCTG;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=9;WE=32587486;WS=32587468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr22	32589023	rs136478	C	T	6063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.447;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.698;NF=82;NR=70;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.516;SC=CATGGAAGAGCAACAGCAAAG;SOR=0.638;Source=Platypus;TCF=134;TR=152;WE=32589042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,157:0.58:272
chr22	32589034	rs136479	T	C	6207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.670;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.635;NF=83;NR=76;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.517;SC=AACAGCAAAGTAGATCCTCCC;SOR=0.576;SbPval=0.5;Source=Platypus;TCF=133;TR=159;WE=32589042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,161:0.59:273
chr22	32589090	rs8135276	C	T	3330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=1.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-9.570;NF=77;NR=74;PP=2278;ReadPosRankSum=0.367;SC=AGGCAGACGGCGCATCCACAC;SOR=0.711;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=251;TCF=129;TCR=122;TR=151;WE=32589098;WS=32589080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,152:0.57:268
chr22	32590449	rs108211	G	A	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.632;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.873;NF=5;NR=13;PP=284;ReadPosRankSum=1.112;SC=ACTGGGTCACGCCCTTCCACA;SOR=1.981;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=18;WE=32590457;WS=32590439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,19:0.76:25
chr22	32590522	rs136484	T	C	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=57.99;MQRankSum=0.792;NF=0;NR=4;PP=66;ReadPosRankSum=-0.180;SC=ACTGGTGATATATCTCCAGTT;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=32590530;WS=32590512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr22	32617062	rs5998317	G	A	2265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.934;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=53;PP=1239;ReadPosRankSum=0.102;SC=GTTTGCAATAGTATAATAGAA;SOR=0.349;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=129;TCF=51;TCR=78;TR=92;WE=32617070;WS=32617052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,103:0.72:143
chr22	32621619	rs2294208	C	T	3048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=50;PP=1740;ReadPosRankSum=0.114;SC=AGCAGGGAAACTTTTTTTCCA;SOR=0.701;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=176;TCF=103;TCR=73;TR=124;WE=32621627;WS=32621609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,141:0.70:201
chr22	32626908	rs2068209	G	A	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.263;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=341;ReadPosRankSum=-0.952;SC=CTCGAGGCCCGTCTTAGACAG;SOR=0.078;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=21;WE=32626916;WS=32626898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,23:0.74:31
chr22	32633505	.	G	T	25	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=25;QD=19.9237375157;SC=CCCTTGCCTTGCCCTGATTCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=3;WE=32633513;WS=32633495;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr22	32753961	rs147764109	C	A	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.551;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=352;ReadPosRankSum=0.987;SC=AATAGAACTTCAAATCTCTGA;SOR=0.346;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=50;TCF=40;TCR=10;TR=21;WE=32753969;WS=32753951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,21:0.40:52
chr22	32756652	rs201161881	A	G	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FS=14.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.18;MQRankSum=-11.476;QD=0.70;ReadPosRankSum=-1.866;SOR=1.745;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:216,33:0.13:249
chr22	32756684	rs61729165	C	A	683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FS=3.148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.35;MQRankSum=-15.596;QD=2.28;ReadPosRankSum=-0.011;SOR=0.878;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:236,64:0.21:300
chr22	32756703	rs73166367	C	T	869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FS=0.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.53;MQRankSum=-15.200;QD=2.66;ReadPosRankSum=2.038;SOR=0.625;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:251,76:0.23:327
chr22	32766927	rs12168441	A	G	631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FS=0.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.23;ReadPosRankSum=-0.531;SOR=0.742;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:229,54:0.19:283
chr22	32791003	rs2072818	A	C	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=363;ReadPosRankSum=0.741;SC=ACAAACGTAGAGCTACGTACT;SOR=1.519;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=16;WE=32791011;WS=32790993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
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chr22	32795837	rs75755200	C	T	134.41	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5047;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=60;ReadPosRankSum=-0.180;SC=GAGAAAAACTCGACATTTACT;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=5;WE=32795845;WS=32795827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr22	32796294	rs117998014	T	C	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.008;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=16;PP=1143;ReadPosRankSum=-0.393;SC=GCACCTCCATTTTGAAGCTGA;SOR=1.022;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=80;TCF=27;TCR=53;TR=24;WE=32796312;WS=32796284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,27:0.30:89
chr22	32796304	rs139377669	A	AGGTACAC	1717.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.067;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=2466;ReadPosRankSum=2.191;SC=TTTGAAGCTGAGGTACACGTA;SOR=0.545;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=0;TCR=47;TR=23;WE=32796312;WS=32796284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,44:0.67:66
chr22	32804313	rs5754073	G	A	1542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=36;PP=987;SC=ACTGTATAACGTGAAGAGGTA;SOR=1.569;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=19;TCR=36;TR=55;WE=32804321;WS=32804303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr22	32804656	rs2076043	G	A	5506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.89;SOR=1.773;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr22	32804665	rs2076044	T	C	5959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.97;SOR=1.660;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr22	32811952	rs5998478	A	G	1021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=22;PP=545;ReadPosRankSum=-0.771;SC=TGTGGATTGGACAGAGGAAAT;SOR=0.754;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=33;TCR=39;TR=41;WE=32811960;WS=32811942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,48:0.61:79
chr22	32831540	rs2076050	C	T	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=47;ReadPosRankSum=0.243;SC=ATGTTCACTCCACAATTCCCT;SOR=0.132;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=5;WE=32831548;WS=32831536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr22	32875190	rs11107	G	A	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.81;ReadPosRankSum=-0.646;SOR=0.744;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:145,33:0.19:178
chr22	32886998	rs738982	T	C	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=111;ReadPosRankSum=1.214;SC=ACCATGTTGATTGGGTTTGGC;SOR=0.512;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=7;WE=32887006;WS=32886988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr22	32887150	rs9726	C	T	1120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.005;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=25;PP=628;ReadPosRankSum=-0.906;SC=GTATCCTCTTCTGGCTTTTAC;SOR=0.689;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=126;TCF=69;TCR=57;TR=50;WE=32887158;WS=32887140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,57:0.39:145
chr22	32934274	rs2239766	T	G	948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=24;PP=651;SC=TTTCCCTTCATGCTGTTTGCC;SOR=2.049;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=33;WE=32934282;WS=32934264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr22	32937740	rs135479	T	C	5145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=82;NR=92;PP=2653;SC=ACCCACCCCGTGTTCACTGAG;SOR=0.963;SbPval=0.53;Source=Platypus;TCR=93;TR=174;WE=32937748;WS=32937730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr22	33229685	rs242077	T	C	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.023;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=232;ReadPosRankSum=2.675;SC=TGGCATGCTATGTCCACCACT;SOR=0.850;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=71;TCF=51;TCR=20;TR=21;WE=33229693;WS=33229675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,23:0.29:79
chr22	33229793	rs180730028	G	A	1617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.035;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=39;PP=2439;ReadPosRankSum=1.062;SC=GGGCCCTAGTGAGGCTCAAAT;SOR=0.739;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=217;TCF=113;TCR=104;TR=78;WE=33229812;WS=33229783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,87:0.37:237
chr22	33229804	rs11703156	G	A	3512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=74;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.856;SC=AGGCTCAAATGGGAAAATCCA;SOR=0.705;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=227;TCF=112;TCR=115;TR=147;WE=33229812;WS=33229783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,160:0.64:250
chr22	33229830	rs242076	A	G	1164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.535;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=33;PP=702;ReadPosRankSum=0.168;SC=AGCATTTAGCACTGATCATGC;SOR=0.768;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=195;TCF=91;TCR=104;TR=59;WE=33229838;WS=33229820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,69:0.31:221
chr22	33253280	rs9862	T	C	3106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=45;PP=1726;SC=AGTACATCCATACGGAAGCTT;SOR=0.802;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=51;TCR=45;TR=96;WE=33253288;WS=33253270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr22	33562887	rs9609729	G	T	1462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=37;PP=1014;SC=TCTATGCAATGATACTGGCTA;SOR=3.126;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=8;TCR=37;TR=45;WE=33562895;WS=33562877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr22	33832735	rs713740	A	G	306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=11;PP=297;SC=CCAGCATGCCAACAGATAGCC;SOR=1.981;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=33832743;WS=33832725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr22	34022284	rs86487	G	A	2282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.500;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=54;PP=1508;ReadPosRankSum=0.636;SC=CATTGTATCCGGCGCAGACAA;SOR=0.568;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=53;TCR=76;TR=92;WE=34022292;WS=34022274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,97:0.70:138
chr22	35478486	rs2899241	A	C	3022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=32;PP=2113;SC=GGCCACTGACACAACTTGGAC;SOR=1.502;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=70;TCR=32;TR=102;WE=35478494;WS=35478476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr22	35478688	rs725267	C	T	3221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=72;PP=2058;SC=CCTCAGCCCCCAGCCTCCATG;SOR=1.777;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=36;TCR=72;TR=108;WE=35478696;WS=35478678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr22	35481776	rs3810619	T	C	1536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=39;PP=1176;SC=GGAAATCGATTTCACAATCCA;SOR=2.215;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=13;TCR=39;TR=52;WE=35481784;WS=35481766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr22	35658225	rs4820189	A	G	561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=4;PP=386;SC=CCTTCCAGTCAGCCCTTGGAT;SOR=2.400;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=22;WE=35658233;WS=35658215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr22	35660875	rs1053593	G	T	3645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=72;NR=45;PP=2021;SC=GAGGATGGTGGCTCCCACAAA;SOR=1.011;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=117;TCF=72;TCR=45;TR=117;WE=35660883;WS=35660865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr22	35679951	rs2272789	T	C	4819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=70;PP=2879;SC=CTATGCGGCATTAGCCAAAAA;SOR=0.894;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=163;TCF=93;TCR=70;TR=162;WE=35679959;WS=35679926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr22	35680095	rs2272790	G	A	1618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=33;PP=940;SC=GAAGCAGTGCGATTAATTTCT;SOR=1.823;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=16;TCR=33;TR=49;WE=35680103;WS=35680085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr22	35681893	rs1543303	G	C	105.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=0;PP=51;SC=TTAAATATGAGCTTCAAAACC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=35681901;WS=35681883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr22	35683238	rs741995	T	C	494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=1;PP=447;SC=GCCCGCCTCTTACTATTGCCT;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=35683246;WS=35683228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr22	35684533	rs5750093	G	C	251.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=8;PP=207;SC=TCTCAGGATGGCGTAACATAG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=35684541;WS=35684523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr22	35695802	rs4461	G	A	410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=2;PP=325;SC=CGAGCTTCGCGGTGCCACCGC;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=35695810;WS=35695792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr22	35696077	rs138728	G	C	623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=14;PP=339;SC=GGGAGGGCAAGGAGGCTGGCG;SOR=1.802;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=7;TCR=14;TR=21;WE=35696085;WS=35696067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr22	35741863	rs133399	A	G	793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.547;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=17;PP=347;ReadPosRankSum=-1.044;SC=GGGTAGACTTATATAGCATAT;SOR=0.923;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=96;TCF=49;TCR=47;TR=33;WE=35741871;WS=35741853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,43:0.37:117
chr22	35742925	rs743810	T	G	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=308;ReadPosRankSum=0.945;SC=CTTCCCAGGGTAATGATGCGG;SOR=0.655;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=60;TCF=43;TCR=17;TR=25;WE=35742933;WS=35742915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,30:0.43:69
chr22	35743124	rs2071745	G	C	1391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=28;PP=720;ReadPosRankSum=-0.241;SC=CAGCTGAGGGGCCCCCGGGTC;SOR=0.686;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=183;TCF=96;TCR=87;TR=62;WE=35743132;WS=35743114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,76:0.36:212
chr22	35785668	rs3216831	C	CT	44.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=0;PP=24;SC=AACTTCTGACCCGTGATGTGC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=35785676;WS=35785658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr22	35797333	rs743815	T	C	630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=10;PP=300;ReadPosRankSum=0.777;SC=TAGGATTCACTTCACTTCGCT;SOR=0.650;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=95;TCF=61;TCR=34;TR=30;WE=35797341;WS=35797323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,37:0.32:115
chr22	35799542	rs713618	C	T	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.47;ReadPosRankSum=-0.337;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,5:0.19:27
chr22	35810052	rs80433	T	C	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.479;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=106;ReadPosRankSum=1.848;SC=CTCTGGGTCCTCAGGACACCT;SOR=2.406;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=7;WE=35810060;WS=35810042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,8:0.28:29
chr22	35817553	rs2071744	C	T	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=187;ReadPosRankSum=-1.303;SC=CAGTGTGTGTCTTGCTTCTCT;SOR=0.814;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=64;TCF=25;TCR=39;TR=18;WE=35817561;WS=35817543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,23:0.30:76
chr22	35817597	rs133431	C	A	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=8;PP=165;ReadPosRankSum=-1.390;SC=TTCTTTTTGCCATAAGACCCC;SOR=0.730;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=49;TCF=23;TCR=26;TR=15;WE=35817605;WS=35817587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,20:0.33:61
chr22	36006923	rs35171458	G	GC	411.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=474;SC=CCCAGGCTCTGCTCCTACCTC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=11;WE=36006931;WS=36006913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr22	36007045	rs7292	G	A	4584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=59;PP=2681;SC=CGGTGAGCACGGTGGCACCAT;SOR=0.996;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=149;TCF=90;TCR=59;TR=149;WE=36007053;WS=36007035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr22	36007075	rs7293	C	T	4179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=61;PP=2372;SC=AGTCCTCAGACGCCTTCATCT;SOR=0.798;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=137;TCF=76;TCR=61;TR=137;WE=36007083;WS=36007065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr22	36114047	rs4821438	C	T	4287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.45;SOR=1.306;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr22	36114054	rs2899256	C	T	4078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.32;SOR=1.434;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr22	36116493	rs34534260	T	TCTAA	945.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.966;HP=1;HapScore=3;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=12;PP=629;ReadPosRankSum=0.033;SC=TTTGTTGTATTCTTTTTTTTT;SOR=0.889;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=48;TCF=26;TCR=22;TR=27;WE=36116503;WS=36116483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,44:0.59:74
chr22	36116535	rs33921037	A	G	2379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.181;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.901;NF=60;NR=43;PP=1567;ReadPosRankSum=-0.142;SC=TTAGACAGCCAACTTTCCCGG;SOR=0.906;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=146;TCF=82;TCR=64;TR=103;WE=36116543;WS=36116525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,119:0.72:166
chr22	36122517	rs17723764	T	C	1719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=353;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.382;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=51;PP=1214;ReadPosRankSum=-0.359;SC=ACGAGTTGCTTACCAAGACCA;SOR=0.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=322;TCF=155;TCR=167;TR=99;WE=36122525;WS=36122507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:248,105:0.30:353
chr22	36122930	rs2076671	C	T	2113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.263;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=43;PP=1375;ReadPosRankSum=-1.378;SC=CCTTTCTGGACGGCTAGAGGG;SOR=0.702;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=146;TCF=76;TCR=70;TR=90;WE=36122938;WS=36122920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,95:0.60:159
chr22	36123083	rs2076672	C	T	729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.291;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=20;PP=354;ReadPosRankSum=0.021;SC=GGGGCAAGGACGGAGACAGCA;SOR=1.027;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=126;TCF=63;TCR=63;TR=37;WE=36123091;WS=36123073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,44:0.31:143
chr22	36124860	rs2076673	C	G	1562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=24;PP=793;ReadPosRankSum=0.047;SC=AGGACAGTCTCTGCCCCAAGG;SOR=0.737;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=97;TCF=53;TCR=44;TR=56;WE=36124868;WS=36124850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,67:0.61:110
chr22	36424450	rs9607299	A	C	197.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=5;PP=149;SC=GAGGCGGCTGATGCGGCTGGG;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=36424458;WS=36424440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr22	36537500	rs132618	A	T	2781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.326;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=51;PP=1722;ReadPosRankSum=-0.795;SC=CTGCTTGACCACCACTTCCAG;SOR=0.744;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=154;TCF=80;TCR=74;TR=109;WE=36537508;WS=36537490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,119:0.71:168
chr22	36537893	rs3827346	A	G	1140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.154;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=25;PP=692;ReadPosRankSum=-1.150;SC=TGGACACCACATTGGAGATGG;SOR=0.602;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=217;TCF=141;TCR=76;TR=66;WE=36537901;WS=36537883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,69:0.30:229
chr22	36541461	rs35695019	CA	C	1043.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=10;PP=777;ReadPosRankSum=-0.019;SC=AAAACTAGCCCAGGGGAGATC;SOR=0.687;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=35;TCF=18;TCR=17;TR=22;WE=36541469;WS=36541451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,32:0.63:51
chr22	36541725	rs1807672	G	T	143.84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.035;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5013;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=85;ReadPosRankSum=-0.549;SC=GGTGGTTCGAGGTTAATCCTC;SOR=0.368;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=7;WE=36541733;WS=36541715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr22	36545137	rs132642	A	T	1792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=24;PP=1125;SC=GAGACTTTCCATGGAGCTCTC;SOR=1.078;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=35;TCR=24;TR=59;WE=36545145;WS=36545127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr22	36545780	rs7290574	C	T	535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=256;ReadPosRankSum=0.242;SC=GACTGGGCTCCACTCCCTTAA;SOR=0.569;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=21;WE=36545788;WS=36545770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,25:0.54:46
chr22	36545826	rs132644	T	C	2290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=31;PP=1325;SC=TACATGCTTATTGTAAATGAC;SOR=0.972;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=46;TCR=31;TR=77;WE=36545834;WS=36545816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr22	36550537	rs66799354	CAAG	C	1453.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.839;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.699;NF=24;NR=4;PP=1168;ReadPosRankSum=0.339;SC=TTGGTTTTAACAAGAAGAGCA;SOR=0.387;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=42;TCF=36;TCR=6;TR=28;WE=36550547;WS=36550527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,37:0.70:53
chr22	36550782	rs9610413	T	C	987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.970;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=27;PP=714;ReadPosRankSum=1.412;SC=TGTCTAAGTATAGACAGAAAC;SOR=0.970;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=64;TCF=25;TCR=39;TR=42;WE=36550790;WS=36550772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,43:0.61:70
chr22	36553181	rs132649	A	G	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.994;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=18;PP=308;ReadPosRankSum=1.179;SC=TTGTACGAGGAGAAAGAAAAA;SOR=0.425;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=92;TCF=28;TCR=64;TR=29;WE=36553189;WS=36553171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,33:0.32:103
chr22	36556823	rs132653	G	T	5387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=93;NR=84;PP=2965;SC=CGTTCTCCAGGCTCTGAGATA;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=179;TCF=95;TCR=84;TR=177;WE=36556831;WS=36556813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr22	36556964	rs916334	C	T	471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.510;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=12;PP=187;ReadPosRankSum=-1.908;SC=CACCCTTGGTCCCACCCTCCT;SOR=0.363;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=62;TCF=24;TCR=38;TR=22;WE=36556972;WS=36556954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,27:0.39:69
chr22	36587202	rs6000172	G	A	1179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=19;PP=710;ReadPosRankSum=1.125;SC=CTGCCTCAGCGACTCAGCAGA;SOR=0.727;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=67;TCF=38;TCR=29;TR=45;WE=36587210;WS=36587192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,51:0.69:74
chr22	36587223	rs6000173	G	T	1246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.934;HP=5;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=19;PP=694;ReadPosRankSum=0.033;SC=CTCGGATTTTGCCCCCTTGTG;SOR=0.696;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=68;TCF=39;TCR=29;TR=47;WE=36587231;WS=36587213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,54:0.70:77
chr22	36587279	rs6000174	A	G	1786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.685;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=29;PP=967;ReadPosRankSum=0.585;SC=CCAGCACAACAAGGACACCTG;SOR=0.588;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=113;TCF=69;TCR=44;TR=73;WE=36587287;WS=36587269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,84:0.65:130
chr22	36587486	rs2227167	A	G	2861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.978;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=54;PP=1834;ReadPosRankSum=-1.594;SC=CAAGTGCAAAAGAAAGCACAT;SOR=0.872;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=202;TCF=110;TCR=92;TR=124;WE=36587494;WS=36587476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,132:0.58:229
chr22	36587511	rs2227168	C	T	2641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.025;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=53;PP=1578;ReadPosRankSum=3.015;SC=TGTGATGTCACGCAGAATGTC;SOR=0.789;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=200;TCF=107;TCR=93;TR=114;WE=36587519;WS=36587501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,122:0.54:226
chr22	36587845	rs3075364	A	ACT	10037.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.51;BaseQRankSum=-1.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=373;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.326;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.973;NF=19;NR=83;PP=2927;ReadPosRankSum=0.452;SC=ATTTGAGGAAACTTTCAAAAA;SOR=0.609;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=168;TCF=29;TCR=139;TR=102;WE=36587853;WS=36587835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,250:0.68:367
chr22	36587952	rs2227169	C	T	1398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.935;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=34;PP=820;ReadPosRankSum=-0.482;SC=GAGCATCTGCCTCTTCCCTGT;SOR=1.068;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=83;TCF=30;TCR=53;TR=50;WE=36587960;WS=36587942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,59:0.61:96
chr22	36591380	rs2007468	A	G	1780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.268;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=35;PP=1074;ReadPosRankSum=-0.857;SC=CCACACGCACAAATCTCTTCC;SOR=0.885;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=118;TCF=60;TCR=58;TR=69;WE=36591388;WS=36591370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,78:0.60:131
chr22	36593628	rs112900962	A	AC	1201.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.414;NF=4;NR=11;PP=687;ReadPosRankSum=1.658;SC=AACAGCTGTAACCCCCCATGA;SOR=0.684;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=57;TCF=17;TCR=40;TR=15;WE=36593648;WS=36593618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,35:0.34:103
chr22	36593640	rs6000178	A	T	1222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQRankSum=1.494;QD=9.86;ReadPosRankSum=1.373;SOR=0.725;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,39:0.31:124
chr22	36597877	rs132734	G	A	1526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=1.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.32;ReadPosRankSum=0.197;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,38:0.66:58
chr22	36597881	rs132735	G	T	1523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.40;ReadPosRankSum=0.421;SOR=0.779;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,39:0.65:60
chr22	36598049	rs80587	C	G	3627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=2.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=-1.561;QD=24.35;ReadPosRankSum=0.078;SOR=0.901;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,93:0.62:149
chr22	36598058	rs132736	T	C	3676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=1.351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=-1.533;QD=25.01;ReadPosRankSum=-1.231;SOR=0.834;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,93:0.63:147
chr22	36598187	rs132737	G	C	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.587;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=105;ReadPosRankSum=-0.247;SC=CCGTTTTGCTGTGTCACCCAG;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=6;WE=36598195;WS=36598177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr22	36623731	rs132760	T	C	7178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=108;NR=126;PP=2965;SC=CGCCCAATGATATGCGGGGGT;SOR=0.918;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=234;TCF=108;TCR=126;TR=234;WE=36623739;WS=36623721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr22	36629466	rs2010499	T	A	2392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.221;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=66;PP=1537;ReadPosRankSum=-1.267;SC=AGCTTCCTCTTCCCTCACTCT;SOR=0.910;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=151;TCF=55;TCR=96;TR=101;WE=36629474;WS=36629456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,105:0.66:158
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chr22	36633452	rs1557535	C	A	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.93;ReadPosRankSum=-1.656;SOR=0.601;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,13:0.18:72
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chr22	36657596	rs713929	A	G	6287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=126;NR=97;PP=2965;SC=GCTGTTATGCACTCCCACACT;SOR=0.974;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=223;TCF=126;TCR=97;TR=223;WE=36657604;WS=36657586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr22	36657628	rs136163	T	G	8182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=144;NR=139;PP=2965;SC=TTATCCTTTCTTCTTTCCAAC;SOR=0.725;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=283;TCF=144;TCR=139;TR=283;WE=36657636;WS=36657618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,315:1.00:315
chr22	36657789	rs136164	T	C	2698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=56;PP=1773;SC=TGGGGTTACCTCCATTGGGCA;SOR=1.561;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=31;TCR=56;TR=87;WE=36657797;WS=36657779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
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chr22	36661152	rs28480494	G	A	1204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.65;QD=41.54;SOR=1.942;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr22	36661330	rs2239785	G	A	4736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=66;PP=2965;SC=GTTGAAAAGTGAGCTTGAGGA;SOR=0.882;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=154;TCF=88;TCR=66;TR=154;WE=36661338;WS=36661320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr22	36661536	rs136174	C	A	8265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=131;NR=143;PP=2965;SC=GAATCACAGCCGCTTTGACCG;SOR=0.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=275;TCF=131;TCR=144;TR=274;WE=36661544;WS=36661526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,304:1.00:304
chr22	36661566	rs136175	G	A	7176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=123;PP=2965;SC=GCAGTACCATGGACTACGGAA;SOR=0.894;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=231;TCF=108;TCR=123;TR=231;WE=36661574;WS=36661556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr22	36661646	rs136176	G	A	5479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=93;NR=87;PP=2965;SC=AAGGAGGTGAGGGAGTTTTTG;SOR=0.713;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=180;TCF=93;TCR=87;TR=180;WE=36661654;WS=36661636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr22	36661733	rs150685787	G	A	1150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=31;PP=714;ReadPosRankSum=1.102;SC=AAGGACATCCGTGCCCTCAGA;SOR=0.724;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=174;TCF=84;TCR=90;TR=58;WE=36661741;WS=36661723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,65:0.33:197
chr22	36661842	rs136177	G	A	3492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=51;PP=2205;SC=AGGTGGAGAGGGTTAATGAAC;SOR=0.743;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=57;TCR=51;TR=108;WE=36661850;WS=36661832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr22	36682707	rs13053731	G	A	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.322;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=11;PP=259;ReadPosRankSum=1.615;SC=AAAGCCCCACGCTGCCACCTG;SOR=0.350;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=67;TCF=42;TCR=25;TR=27;WE=36682715;WS=36682697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,30:0.42:72
chr22	36684354	rs2269529	T	C	1474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=1.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.33;ReadPosRankSum=-0.188;SOR=0.535;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:114,44:0.28:158
chr22	36684358	rs2269530	C	A	1441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=1.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.13;ReadPosRankSum=0.298;SOR=0.565;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:114,44:0.28:158
chr22	36690113	rs4821478	G	A	766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=8;PP=498;ReadPosRankSum=3.307;SC=CACTGCCCGCGCCAGGGTCCT;SOR=0.596;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=37;TCR=12;TR=32;WE=36690121;WS=36690103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,33:0.63:52
chr22	36691153	rs56063322	C	G	2536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=57;PP=1623;ReadPosRankSum=0.022;SC=AGAGTGGAGGCCGGGGATGCT;SOR=0.674;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=150;TCF=68;TCR=82;TR=103;WE=36691161;WS=36691143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,112:0.69:163
chr22	36691607	rs710181	A	C	935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=12;PP=530;SC=CTGTTTTCAGAGCCTCTAGCT;SOR=1.148;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=18;TCR=12;TR=30;WE=36691615;WS=36691597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr22	36695173	rs2187776	C	T	1537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=29;PP=848;SC=GCCCGGAAATCTGGGGCTGAA;SOR=1.528;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=18;TCR=29;TR=47;WE=36695181;WS=36695163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr22	36695247	rs4821480	G	T	246.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=6;PP=130;SC=GGATAATTTTGAAAGGTCACG;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=36695255;WS=36695237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr22	36705529	rs1557529	A	G	1907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=52;PP=1423;SC=AACCCCATGCATGGAAAAGTC;SOR=3.091;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=10;TCR=52;TR=62;WE=36705537;WS=36705519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr22	36708049	rs3842715	CTCCTGTGA	C	307.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.282;HP=2;HapScore=2;MGOF=39;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=807;ReadPosRankSum=0.784;SC=GACTCCACCTCTCCTGTGAAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=5;WE=36708064;WS=36708039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
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chr22	36710183	rs3752462	T	C	2710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.869;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=52;PP=1641;ReadPosRankSum=-0.080;SC=GCAAGCCTGGTACTCACTGGC;SOR=0.549;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=174;TCF=96;TCR=78;TR=112;WE=36710191;WS=36710173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,125:0.65:192
chr22	36712472	rs5756152	A	G	1398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=17;PP=910;SC=AGATCGATGCAGGACCATGAG;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=35;TCR=17;TR=52;WE=36712480;WS=36712462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr22	36716202	rs3833922	C	CT	2658.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.369;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=16;PP=2446;ReadPosRankSum=-1.005;SC=CCTGATGCCCCGAGGCCGTGG;SOR=0.941;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=73;TCF=36;TCR=37;TR=36;WE=36716217;WS=36716192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,64:0.52:122
chr22	36716209	rs3752463	G	A	2785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.383;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.912;NF=40;NR=21;PP=2445;ReadPosRankSum=-1.308;SC=CCCCGAGGCCGTGGGTACCAG;SOR=0.884;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=116;TCF=74;TCR=42;TR=61;WE=36716217;WS=36716192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,77:0.55:139
chr22	36722490	rs8136069	C	A	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=438;ReadPosRankSum=-0.312;SC=ATGGGCCCAGCCTCTGCTTCA;SOR=0.540;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=11;WE=36722511;WS=36722480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr22	36722503	rs56029857	C	T	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.481;HP=3;HapScore=4;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=585;ReadPosRankSum=-0.643;SC=CTGCTTCATTCCCCAAAGCAT;SOR=0.444;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=20;WE=36722511;WS=36722480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,22:0.59:37
chr22	36722534	rs8136336	G	A	1676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=16;PP=925;SC=AGCTGAAGCCGGGACCACTAA;SOR=1.270;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=38;TCR=16;TR=54;WE=36722542;WS=36722524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr22	36722838	rs11316214	CG	C	815.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=767;ReadPosRankSum=-1.832;SC=TGGCAGAAAACGGGACTGCCA;SOR=0.919;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=23;WE=36722846;WS=36722828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,27:0.73:37
chr22	36723697	rs5756157	T	G	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.238;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=7;PP=137;ReadPosRankSum=1.254;SC=AGGAGCATCTTCGGGGGAGAG;SOR=0.180;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=9;WE=36723705;WS=36723687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr22	36744886	rs56147525	GC	G	1554.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.064;HP=15;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=13;PP=1509;ReadPosRankSum=-2.089;SC=GGGAAGACCCGCCCCCCCCCC;SOR=1.993;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=45;TCF=22;TCR=23;TR=24;WE=36744898;WS=36744876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,56:0.95:59
chr22	36744888	rs56084634	C	G	1620.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=7.064;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.47;ReadPosRankSum=-1.865;SOR=1.993;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,56:0.95:59
chr22	36744888	.	CCC	GCT	1460	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5000;HP=11;HapScore=1;MGOF=3;MMLQ=24;MQ=59.64;NF=28;NR=11;PP=1460;QD=38.8068685862;SC=GAAGACCCGCCCCCCCCCCCC;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=60;TCF=42;TCR=18;TR=39;WE=36744898;WS=36744876;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:21,39:0.65:60
chr22	36744890	rs55932404	C	T	1620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=7.324;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.57;ReadPosRankSum=-1.769;SOR=2.080;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,58:0.95:61
chr22	36745146	rs147122501	G	A	1520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.911;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=46;PP=1020;ReadPosRankSum=-0.305;SC=TCCTCCTTGAGGCTGGCTGGC;SOR=0.903;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=241;TCF=118;TCR=123;TR=83;WE=36745154;WS=36745136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,87:0.33:262
chr22	36864687	rs12158096	G	A	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=176;ReadPosRankSum=0.901;SC=CAGGAGGATCGCTTGAGCCTG;SOR=0.610;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=13;WE=36864695;WS=36864677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr22	36864767	rs34760321	CA	C	265.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.80;ReadPosRankSum=1.223;SOR=0.752;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,19:0.27:70
chr22	36872750	rs2281082	T	G	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.75;ReadPosRankSum=-2.021;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,7:0.21:33
chr22	36900271	rs2277841	T	C	1416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.526;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=27;PP=817;ReadPosRankSum=0.786;SC=CTGGTTGGTGTTGGCTTCTTC;SOR=0.624;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=181;TCF=106;TCR=75;TR=61;WE=36900279;WS=36900261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,76:0.36:212
chr22	36912724	rs2076083	C	T	850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.286;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=22;PP=440;ReadPosRankSum=-1.136;SC=CCAGTCTGGCCACAATACCCA;SOR=0.426;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=123;TCF=56;TCR=67;TR=44;WE=36912732;WS=36912714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,49:0.36:136
chr22	36914663	rs146405226	AAAGAGTGTG	A	202.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.722;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=1256;ReadPosRankSum=-0.339;SC=CCTAACCTCTAAAGAGTGTGG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=5;WE=36914679;WS=36914653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,7:0.28:25
chr22	36919447	rs2076084	C	T	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.287;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=226;ReadPosRankSum=0.135;SC=CTTTAAACTACGAAAAATGGG;SOR=0.130;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=43;TCF=8;TCR=35;TR=18;WE=36919455;WS=36919437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,18:0.40:45
chr22	36920062	rs12157889	T	C	1220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.187;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=26;PP=667;ReadPosRankSum=1.762;SC=TGTTAAAATCTTGGAGATTTG;SOR=0.582;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=164;TCF=93;TCR=71;TR=59;WE=36920070;WS=36920052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,68:0.37:185
chr22	36962353	rs2267338	C	G	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=17;PP=432;ReadPosRankSum=-0.162;SC=TGAGCACCCACACCCCAGCCT;SOR=0.626;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=110;TCF=63;TCR=47;TR=37;WE=36962361;WS=36962343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,40:0.33:123
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chr22	36983428	rs2235682	G	A	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.619;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=240;ReadPosRankSum=0.383;SC=GGGCCTCTAGGTAGGCCTGGT;SOR=1.165;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=41;TCF=33;TCR=8;TR=15;WE=36983436;WS=36983418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,15:0.36:42
chr22	37159819	rs739002	T	C	1589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=14;PP=942;SC=GGCTGCTAAGTGGCAGGGCCA;SOR=1.823;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=37;TCR=14;TR=51;WE=37159827;WS=37159809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr22	37163329	rs1048012	C	T	6831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=111;NR=113;PP=2965;SC=CTGAGTTCCCCTGGGTAAAGG;SOR=0.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=224;TCF=111;TCR=113;TR=224;WE=37163337;WS=37163319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chr22	37171611	rs2009667	A	G	2238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.989;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=33;PP=1364;ReadPosRankSum=-0.170;SC=CCTTTGGGAGAGAGAAAGGAA;SOR=1.030;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=134;TCF=78;TCR=56;TR=84;WE=37171619;WS=37171601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,96:0.64:151
chr22	37196871	rs3484	G	A	1803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.683;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=35;PP=1133;ReadPosRankSum=0.726;SC=GGAGGGTGGCGAGAGGGGCCG;SOR=0.625;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=120;TCF=67;TCR=53;TR=77;WE=37196882;WS=37196861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,82:0.65:127
chr22	37196971	rs2001063	C	A	1777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.500;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=36;PP=937;ReadPosRankSum=-0.473;SC=TTCTGCAGAACAAAATGACAA;SOR=0.859;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=103;TCF=50;TCR=53;TR=67;WE=37196979;WS=37196961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,82:0.66:125
chr22	37266322	rs2075938	A	G	519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=3;PP=392;SC=TAAACAACGCATTTCTGTTAT;SOR=2.531;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=37266330;WS=37266312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr22	37267767	rs2072708	A	G	1898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=31;PP=929;SC=CCCCGCCCCCACGCTGGCCAG;SOR=1.276;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=58;TCF=27;TCR=31;TR=58;WE=37267775;WS=37267757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr22	37268257	rs5756374	C	T	1794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=20;PP=1117;SC=CTTATTCTCCCCAAGCCTCAG;SOR=1.437;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=41;TCR=20;TR=61;WE=37268265;WS=37268247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr22	37268501	rs2072710	A	G	1717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=29;PP=1069;SC=GGTGAGATTGAAGGTGAGGTT;SOR=1.421;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=22;TCR=29;TR=51;WE=37268509;WS=37268491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr22	37268555	rs2072711	A	G	775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.71;SOR=1.382;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr22	37271882	rs2075939	T	C	6701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=102;NR=121;PP=2965;SC=CTACGACCACTGCCCCTCACA;SOR=0.969;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=223;TCF=102;TCR=121;TR=223;WE=37271890;WS=37271872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr22	37318426	rs2280976	C	T	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=10;PP=269;ReadPosRankSum=0.446;SC=CGCCAGCCCTCCTCCTGCTCC;SOR=0.713;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=21;TCR=25;TR=19;WE=37318434;WS=37318416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,19:0.40:47
chr22	37318446	rs2075940	G	A	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=2.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.74;ReadPosRankSum=1.185;SOR=0.557;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr22	37318515	rs2075941	T	C	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.602;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=5;PP=98;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TCATCCTGTCTTGGAAAGTCC;SOR=0.346;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=8;WE=37318523;WS=37318505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr22	37319425	rs2072713	G	T	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=1.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.000;QD=3.97;ReadPosRankSum=0.332;SOR=0.519;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:102,36:0.26:138
chr22	37319947	rs4437064	C	G	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=16;PP=335;ReadPosRankSum=-1.062;SC=CTCTCCCAGGCCCCCCCTCCG;SOR=0.768;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=100;TCF=52;TCR=48;TR=32;WE=37319955;WS=37319937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,39:0.33:118
chr22	37328751	rs2075936	A	G	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=147;ReadPosRankSum=-1.795;SC=AGACACGGGGAATGTTCCGTT;SOR=0.368;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=10;WE=37328759;WS=37328741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr22	37328966	rs1534879	G	C	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.530;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=22;PP=1103;ReadPosRankSum=-1.422;SC=TTTGCCCAGGGAGGGGAGAAA;SOR=0.940;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=113;TCF=46;TCR=67;TR=35;WE=37328976;WS=37328956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,38:0.30:128
chr22	37328968	rs4339047	G	C	1902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.637;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=44;PP=2417;ReadPosRankSum=1.511;SC=TGCCCAGGGAGGGGAGAAACA;SOR=0.446;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=111;TCF=45;TCR=66;TR=77;WE=37328976;WS=37328956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,88:0.70:125
chr22	37329999	rs1801117	C	T	2265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.974;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=50;PP=1342;ReadPosRankSum=0.126;SC=GGATCTGGAGCGAGTGGAGTG;SOR=0.761;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=157;TCF=82;TCR=75;TR=99;WE=37330007;WS=37329989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,107:0.64:168
chr22	37330082	rs2075937	T	C	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.705;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=18;PP=436;ReadPosRankSum=0.095;SC=GACCAGCTCATAGTTTCTCAC;SOR=0.526;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=96;TCF=38;TCR=58;TR=32;WE=37330090;WS=37330072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,35:0.35:100
chr22	37331305	rs2239749	A	G	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.931;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=265;ReadPosRankSum=-0.095;SC=CGGGGTCTTAAGGAATACTGC;SOR=0.807;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=78;TCF=53;TCR=25;TR=22;WE=37331313;WS=37331295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,24:0.29:84
chr22	37333794	rs131840	A	G	1829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=21;PP=968;SC=CGATGGGACCAGGACAGGCCG;SOR=1.073;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=39;TCR=21;TR=60;WE=37333802;WS=37333784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr22	37453259	rs710184	A	G	410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=1;PP=334;SC=GGTGCCTGGTAAATGCCTGGT;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=37453267;WS=37453249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr22	37453452	rs710185	C	T	2757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=52;PP=1605;SC=CACCCAAGCACGTGTACCGCG;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=47;TCR=52;TR=99;WE=37453460;WS=37453442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr22	37458586	rs116956945	C	T	950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=14;PP=432;ReadPosRankSum=-1.647;SC=CAGAGGCACCCGGATGTGAGG;SOR=0.685;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=50;TCF=29;TCR=21;TR=34;WE=37458594;WS=37458576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,44:0.70:63
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chr22	37578488	rs145370378	A	C	3045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=50;PP=1596;ReadPosRankSum=-2.538;SC=TTGAGGCTGAAGAAGTAGATG;SOR=0.696;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=169;TCF=100;TCR=69;TR=124;WE=37578496;WS=37578478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,139:0.70:198
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chr22	37581383	rs7290488	C	T	1366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=22;PP=774;ReadPosRankSum=1.122;SC=CCGTTGGCAGCCGCTGGCCAC;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=93;TCF=56;TCR=37;TR=57;WE=37581391;WS=37581373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,64:0.60:106
chr22	37581422	rs229526	G	C	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=0.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.70;ReadPosRankSum=-0.048;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,37:0.38:97
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chr22	37602583	rs11406761	G	GC	5910.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=51;PP=2936;SC=CTTTCCCCAGGCCCTACAGGT;SOR=0.969;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=94;TCF=36;TCR=58;TR=80;WE=37602591;WS=37602573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr22	37622999	rs62235085	C	T	250.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=192;SC=CCATACACCCCTCCCACGCCA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=9;WE=37623007;WS=37622989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr22	37627845	rs8135343	G	A	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.947;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=70;ReadPosRankSum=-0.191;SC=GCCCTGGTTGGCACTGGGGAC;SOR=0.859;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=7;WE=37627853;WS=37627835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr22	37628053	rs11374583	A	AG	2928.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.573;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.203;NF=3;NR=43;PP=1783;ReadPosRankSum=1.620;SC=AGAGCAAGCGAGGTTGCTAGT;SOR=1.106;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=67;TCF=7;TCR=60;TR=46;WE=37628061;WS=37628043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,96:0.68:141
chr22	37628145	rs2285110	A	G	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=201;ReadPosRankSum=-0.952;SC=CACCCCAGGGAATGCTGGGGA;SOR=0.784;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=11;WE=37628153;WS=37628135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
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chr22	37678565	rs3213557	G	A	1904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=19;PP=1030;SC=CAGCTGGGTCGGCAAGCGACA;SOR=1.195;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=61;TCF=42;TCR=19;TR=60;WE=37678573;WS=37678541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
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chr22	37678837	rs5995411	C	T	131.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5130;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=3;PP=92;ReadPosRankSum=0.508;SC=GACGCTGTTTCCCCCTTCATA;SOR=0.941;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=6;WE=37678845;WS=37678827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr22	37691907	rs2269590	A	G	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=43;ReadPosRankSum=-1.343;SC=GGTGGTTCCCATGCAGGACCC;SOR=0.752;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=6;WE=37691915;WS=37691897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,5:0.22:23
chr22	37695057	.	C	T	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.036;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,2:0.40:5
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chr22	37695256	rs2301435	T	C	757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.737;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=19;PP=517;ReadPosRankSum=0.948;SC=CCCTTCCGCCTCCTCCCCCAG;SOR=0.564;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=99;TCF=56;TCR=43;TR=40;WE=37695264;WS=37695246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,42:0.38:110
chr22	37699377	rs2239822	T	C	1828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=357;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.919;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=47;PP=993;ReadPosRankSum=-0.326;SC=GGCCGCCTTTTGAGCGCTTTG;SOR=0.644;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=320;TCF=156;TCR=164;TR=96;WE=37699385;WS=37699353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:250,106:0.30:356
chr22	37700177	rs2284050	T	C	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=134;ReadPosRankSum=0.881;SC=CTGGAAGTCTTCACAGAGGAG;SOR=0.826;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=54;TCF=40;TCR=14;TR=14;WE=37700185;WS=37700167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,16:0.26:61
chr22	37708004	rs2269593	T	C	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=31;ReadPosRankSum=-0.320;SC=CTGAGCCTCCTGGAGGGCCCA;SOR=0.693;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=5;WE=37708012;WS=37707994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr22	37770066	rs8142615	G	T	1294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.451;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=32;PP=797;ReadPosRankSum=1.166;SC=TGCGCACCTCGATATAGTTGC;SOR=0.694;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=198;TCF=99;TCR=99;TR=65;WE=37770074;WS=37770056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,73:0.33:220
chr22	37770357	rs7292751	A	G	1485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=38;PP=932;ReadPosRankSum=-0.065;SC=TAACCATGCCAAAGAGGCAGC;SOR=0.707;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=185;TCF=84;TCR=101;TR=69;WE=37770365;WS=37770347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,76:0.37:203
chr22	37770630	rs2071856	G	A	3901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.579;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=77;PP=2070;ReadPosRankSum=0.055;SC=AGGGGTGTGGGATGATGACCA;SOR=0.857;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=259;TCF=128;TCR=131;TR=148;WE=37770638;WS=37770620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,181:0.61:297
chr22	37771158	rs2071857	G	A	765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FS=0.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.18;ReadPosRankSum=-0.153;SOR=0.781;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:136,47:0.26:183
chr22	37876862	rs41280025	C	T	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=0.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.14;ReadPosRankSum=-1.151;SOR=0.840;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,31:0.23:132
chr22	37887510	rs9622628	G	C	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=1.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.32;ReadPosRankSum=-1.751;SOR=0.520;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,22:0.35:62
chr22	37888868	rs5756696	G	C	2017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=36;PP=1106;SC=ATACCAGCTCGTCGATACCCC;SOR=1.134;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=28;TCR=36;TR=64;WE=37888876;WS=37888858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr22	37891710	rs2295155	C	A	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=10;PP=242;ReadPosRankSum=-0.327;SC=GAGAGCACCCCCATCTGAGCC;SOR=0.688;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=72;TCF=38;TCR=34;TR=23;WE=37891718;WS=37891700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,27:0.34:79
chr22	37892090	rs5750442	A	T	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=51;ReadPosRankSum=0.786;SC=GGTGGGGCCAAAGACATGGCC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=5;WE=37892098;WS=37892080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr22	37892370	rs5756701	A	G	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=71;ReadPosRankSum=1.447;SC=GTCCCTTCTCAGGTCCTTGGT;SOR=0.665;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=7;WE=37892378;WS=37892360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr22	37892955	rs55977141	CA	C	149.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=184;ReadPosRankSum=1.269;SC=CTTGATCCACCAAATTAAGGG;SOR=0.223;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=6;WE=37892963;WS=37892945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr22	37899101	rs5756705	A	G	684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=10;PP=378;ReadPosRankSum=-0.695;SC=TGCAGGCCAAAGGTAGCGCAG;SOR=0.685;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=96;TCF=64;TCR=32;TR=32;WE=37899109;WS=37899091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,37:0.35:105
chr22	37899925	rs3817799	T	C	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.04;ReadPosRankSum=-0.275;SOR=0.024;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
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chr22	37900006	rs3817801	T	C	855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=0.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.69;ReadPosRankSum=1.651;SOR=0.807;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,29:0.23:128
chr22	37900276	rs3817803	A	G	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.737;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=166;ReadPosRankSum=-2.358;SC=TGGAGAGCCGATTGATCTCCT;SOR=1.241;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=51;TCF=18;TCR=33;TR=15;WE=37900284;WS=37900266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,17:0.31:54
chr22	37900607	rs3817804	G	A	1445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.522;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=27;PP=772;ReadPosRankSum=0.544;SC=CTATAGCAGTGTCCCCCCTTA;SOR=0.741;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=186;TCF=113;TCR=73;TR=72;WE=37900615;WS=37900597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,79:0.38:210
chr22	37900762	rs3817805	G	A	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.31;ReadPosRankSum=-1.739;SOR=0.662;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,31:0.24:130
chr22	37902500	rs1997674	C	T	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=82;ReadPosRankSum=-1.126;SC=CTATCACTTACTGAGCACTGT;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=7;WE=37902508;WS=37902490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,8:0.25:32
chr22	37904957	rs932326	C	G	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.88;ReadPosRankSum=0.393;SOR=0.738;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,34:0.23:149
chr22	37906308	rs113275238	GCTCCTT	G	699.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=2.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.00;ReadPosRankSum=2.723;SOR=1.002;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,21:0.30:70
chr22	38015671	rs8138728	T	C	1457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.191;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=11;PP=914;ReadPosRankSum=-0.442;SC=GCGTGAGCCATGGCCTCCGGC;SOR=1.038;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=78;TCF=61;TCR=17;TR=54;WE=38015679;WS=38015661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,58:0.68:85
chr22	38025375	rs2071766	T	C	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=334;ReadPosRankSum=1.057;SC=CAGAAAGGGGTAGGGAGCCCC;SOR=0.631;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=16;WE=38025383;WS=38025365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,17:0.85:20
chr22	38035851	rs13055139	A	G	1133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=3.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.83;ReadPosRankSum=-0.150;SOR=0.428;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,55:0.67:82
chr22	38037240	rs76166598	G	A	1249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.286;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=22;PP=657;ReadPosRankSum=0.858;SC=GCAGAGGGCCGGGGCGGGGAC;SOR=0.344;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=69;TCF=40;TCR=29;TR=44;WE=38037248;WS=38037230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,55:0.63:87
chr22	38039128	rs74516928	A	G	2667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=46;PP=1399;ReadPosRankSum=-0.566;SC=CCATCCTCAAACACAAGAAAA;SOR=0.696;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=158;TCF=87;TCR=71;TR=101;WE=38039136;WS=38039118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,122:0.65:187
chr22	38039634	rs1894528	C	G	2241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.176;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=43;PP=1179;ReadPosRankSum=0.397;SC=ACCAGCTCACCTTGGGATCAT;SOR=0.505;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=157;TCF=88;TCR=69;TR=92;WE=38039642;WS=38039624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,107:0.57:189
chr22	38039708	rs1894529	T	C	1829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.586;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=37;PP=994;ReadPosRankSum=0.998;SC=GCAGCCCGGGTAGTCACAGCC;SOR=0.749;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=129;TCF=63;TCR=66;TR=72;WE=38039716;WS=38039698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,83:0.53:157
chr22	38040842	rs713977	C	T	2154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.642;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=42;PP=1347;ReadPosRankSum=1.648;SC=TCAGCTTCCCCCACTTCCGCT;SOR=0.619;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=133;TCF=74;TCR=59;TR=89;WE=38040850;WS=38040832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,96:0.66:146
chr22	38042982	rs45529337	G	A	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.473;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=6;PP=144;ReadPosRankSum=-0.301;SC=GGGGGAGGGGGTGCAGTGGCT;SOR=0.510;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=26;TCF=13;TCR=13;TR=13;WE=38042990;WS=38042972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr22	38043062	rs78338419	T	A	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.913;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=188;ReadPosRankSum=1.009;SC=CTCGGGTTCTTAATGTGGGGT;SOR=1.270;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=17;TCF=8;TCR=9;TR=11;WE=38043070;WS=38043052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr22	38043579	rs12165814	A	G	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=29;ReadPosRankSum=-1.465;SC=AGCCCAGCTGAGGTCACGGAC;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=38043587;WS=38043569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr22	38046718	rs762987	A	G	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-0.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=226;ReadPosRankSum=-1.148;SC=TGGCTTCAGCAGCTACCAAGG;SOR=0.534;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=14;WE=38046726;WS=38046708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr22	38051999	rs12483880	C	T	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=2.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.17;ReadPosRankSum=-0.327;SOR=1.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,21:0.47:45
chr22	38071707	rs12403	A	G	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=7;PP=209;ReadPosRankSum=0.285;SC=CCTGGACTCAATCATGGCTTG;SOR=0.593;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=33;TCF=21;TCR=12;TR=18;WE=38071715;WS=38071697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr22	38074434	rs9622682	G	A	3143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.044;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=55;PP=1884;ReadPosRankSum=-0.138;SC=CAGATTAGTCGGTCAGTGGGG;SOR=0.444;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=179;TCF=103;TCR=76;TR=120;WE=38074442;WS=38074424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,138:0.65:211
chr22	38075834	rs41283239	G	A	869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.201;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=27;PP=587;ReadPosRankSum=-1.358;SC=GTGCTTGTGCGTGTGTGTGTA;SOR=1.007;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=55;TCF=16;TCR=39;TR=37;WE=38075842;WS=38075824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,38:0.67:57
chr22	38086574	rs9610834	C	T	618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=2;PP=498;SC=GAAGCCTTCTCTAGTCCCAAC;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=38086582;WS=38086564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr22	38109115	rs13055217	G	T	411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=11;NR=2;PP=276;SC=CCACACCAGCGTGTGGGCCCC;SOR=2.448;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=38109123;WS=38109105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr22	38122462	rs739138	A	G	1120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=22;PP=640;SC=GGCCGCACCCACAGCCCTGGC;SOR=1.402;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=15;TCR=22;TR=37;WE=38122470;WS=38122452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr22	38130459	rs8140207	G	T	6353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=104;PP=2965;SC=GCCAAGCAGAGCCCCCTCATC;SOR=0.789;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=208;TCF=103;TCR=105;TR=206;WE=38130480;WS=38130449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr22	38130472	rs8140958	T	C	6474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=105;NR=107;PP=2965;SC=CCCTCATCCTTGGAGTCCTGA;SOR=0.813;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=212;TCF=105;TCR=107;TR=212;WE=38130480;WS=38130449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr22	38142468	rs5756803	A	G	173.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=4;PP=117;SC=AGGCCGGGAGAAGGGCGACGA;SOR=0.941;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=7;WE=38142476;WS=38142458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr22	38146847	rs6519081	T	C	342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=6;PP=239;SC=CACCGCCCACTCCACTGAGCC;SOR=1.022;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=11;TCF=5;TCR=6;TR=11;WE=38146855;WS=38146837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr22	38150852	.	A	G	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.956;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=97;ReadPosRankSum=0.318;SC=ACAATCACACACACTGGCTCT;SOR=0.583;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=31;TCF=20;TCR=11;TR=13;WE=38150860;WS=38150842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr22	38155317	rs5756810	C	G	5931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=111;NR=91;PP=2965;SC=CAGATTTCTGCTTGCCGTGTT;SOR=0.804;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=202;TCF=111;TCR=91;TR=202;WE=38155325;WS=38155307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr22	38164106	rs4821708	C	T	4904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=81;PP=2965;SC=AGAAGGCCTACCAGGAAGAGC;SOR=0.796;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=163;TCF=82;TCR=81;TR=163;WE=38164114;WS=38164096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr22	38165223	rs34979986	CG	C	2050.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=27;PP=1500;SC=TGGGGGGACACGGGTGGGTCC;SOR=0.796;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=39;TCF=12;TCR=27;TR=38;WE=38165231;WS=38165213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr22	38168508	rs762984	T	C	866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=23;NR=8;PP=678;SC=TGAAGCGAGGTATCTGCGGGG;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=31;WE=38168516;WS=38168498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr22	38204259	rs2071910	C	T	197.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=158;SC=GCGGCTCCTACACTCTTAGCT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=38204267;WS=38204249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr22	38205894	rs2285177	T	C	1326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=12;PP=947;SC=CTGTAGCTGTTGAATTTGGTG;SOR=2.110;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=34;TCR=12;TR=46;WE=38205902;WS=38205884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr22	38205989	rs2285178	T	C	4527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=57;PP=2221;SC=GGCCTGCCCTTGCCCCACCTG;SOR=0.857;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=82;TCR=57;TR=139;WE=38205997;WS=38205979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr22	38273749	rs9466	T	C	4474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.48;SOR=0.884;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr22	38307909	rs6519091	T	C	3943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=79;NR=66;PP=2465;SC=CGCCCCTATTTCCCAGTCACC;SOR=0.830;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=147;TCF=80;TCR=67;TR=145;WE=38307917;WS=38307899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr22	38308048	.	ATGTGTG	A,ATG	2237.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.36;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=1,1;NR=31,31;PP=1252,202;SC=GGCTCTGTGTATGTGTGTGTG;SOR=1.412;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=53;TCF=3;TCR=50;TR=32,32;WE=38308061;WS=38308038;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.16,0.84:56
chr22	38308291	rs1003689	C	T	675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=5;PP=446;SC=GCTGAGGGGTCGCCCCCTAAC;SOR=2.494;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=23;WE=38308299;WS=38308281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr22	38323507	rs9610875	G	T	2084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=47;NR=21;PP=1286;SC=GTCTGAGAGCGCCAGCCAGAC;SOR=1.402;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=47;TCR=21;TR=68;WE=38323515;WS=38323497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr22	38382762	.	G	A	1029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.148;ClippingRankSum=0.000;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.985;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=18;PP=668;ReadPosRankSum=0.798;SC=GTGTGGTTGGGGCCCCTGCTG;SOR=0.481;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=60;TCF=33;TCR=27;TR=41;WE=38382770;WS=38382752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,44:0.66:67
chr22	38453679	rs5845366	A	AG	723.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=0;PP=675;SC=GTCCCGTATGAGGTGGTGGAG;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=17;WE=38453687;WS=38453669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr22	38477342	rs4289289	T	A	948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.854;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=20;PP=551;ReadPosRankSum=1.079;SC=GGCCGGACCCTGGGGGATGCC;SOR=0.888;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=73;TCF=39;TCR=34;TR=41;WE=38477350;WS=38477332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,45:0.56:80
chr22	38477930	rs2235573	G	A	1233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.312;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=25;PP=749;ReadPosRankSum=-0.864;SC=AGAGCTCCAGGAGGCGCGTGG;SOR=0.307;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=96;TCF=44;TCR=52;TR=51;WE=38477938;WS=38477920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,58:0.56:104
chr22	38481516	rs9610902	G	A	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=38;ReadPosRankSum=1.803;SC=TCCTTGCCCCGCTTCATCTTT;SOR=0.892;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=5;WE=38481524;WS=38481506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr22	38482352	rs66500630	GTGCGGGAGCGGGACTGGCCATCCCAGTACTCCGAGGGTGCTA	G	300.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=2.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.336;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=2;PP=1042;ReadPosRankSum=0.756;SC=CCGGCTTGGGGTGCGGGAGCG;SOR=1.142;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=2;WE=38482401;WS=38482342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,11:0.21:53
chr22	38483155	rs142739979	T	TTCATGGGTG	941.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=3.293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.77;MQRankSum=3.493;QD=12.07;ReadPosRankSum=0.847;SOR=0.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,27:0.35:78
chr22	38485064	rs62235125	C	G	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.986;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=11;PP=278;ReadPosRankSum=0.709;SC=CCCCGCGCCTCTCCCGGCCCT;SOR=0.540;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=49;TCF=25;TCR=24;TR=23;WE=38485072;WS=38485054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,27:0.46:59
chr22	38490056	rs4373009	C	T	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=5.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.84;ReadPosRankSum=0.690;SOR=0.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,15:0.38:39
chr22	38494005	rs147676763	CGGTCTCGCCCCGA	C	667.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=6.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.62;MQRankSum=1.358;QD=19.08;ReadPosRankSum=0.431;SOR=2.118;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr22	38503847	rs6001006	C	T	5169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=86;PP=2965;SC=GGCCCTGGGGCCTGATACTCA;SOR=0.745;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=175;TCF=89;TCR=86;TR=175;WE=38503855;WS=38503837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr22	38503968	rs13054158	C	T	781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=2.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.96;ReadPosRankSum=0.889;SOR=1.781;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,20:0.69:29
chr22	38503972	rs56076229	C	T	781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=2.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.96;ReadPosRankSum=0.889;SOR=1.781;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,20:0.69:29
chr22	38504372	rs5750540	T	C	2409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=38;PP=1101;SC=GGGACAGGTCTGGTCCAGCCC;SOR=0.804;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=80;TCF=42;TCR=38;TR=79;WE=38504380;WS=38504362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr22	38505347	rs6001008	G	A	1576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.54;SOR=1.157;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr22	38505347	.	GGCCCATCTA	AGCCCATCTA,AGCCCATCTG	376	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000,0.5000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=26;MQ=60.0;NF=18,5;NR=25,6;PP=376,102;QD=9.55281889645;SC=GACTTTGGGGGGCCCATCTAC;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=18;TCR=25;TR=43,11;WE=38505364;WS=38505337;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:43
chr22	38505356	rs6001009	A	G	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.11;ReadPosRankSum=-1.045;SOR=0.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,15:0.35:43
chr22	38506509	rs4820313	A	G	2659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.33;SOR=0.839;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr22	38512402	rs11089863	G	A	650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.369;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=20;PP=337;ReadPosRankSum=-0.263;SC=CTGGAGGAGTGTCAGATTGGT;SOR=1.026;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=126;TCF=61;TCR=65;TR=36;WE=38512410;WS=38512392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,41:0.28:144
chr22	38512562	rs12167576	G	A	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=40;ReadPosRankSum=-0.733;SC=CACTGCAGACGTTAGAAAAAG;SOR=0.770;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=6;WE=38512570;WS=38512552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr22	38530956	rs2272831	G	A	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=185;ReadPosRankSum=0.997;SC=TGCGGGGCCCGGCCCCCTGCC;SOR=0.929;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=14;WE=38530964;WS=38530946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,18:0.69:26
chr22	38535946	rs12329956	G	A	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.737;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=10;PP=429;ReadPosRankSum=0.576;SC=CAGGAGAGCTGGAGCCCAGCA;SOR=0.836;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=120;TCF=86;TCR=34;TR=38;WE=38535954;WS=38535936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,44:0.33:135
chr22	38539041	rs4375	T	C	1409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=3;PP=940;SC=CACCTGAGCCTAGGGGCCCAA;SOR=3.865;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=35;TCR=3;TR=38;WE=38539049;WS=38539031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
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chr22	38564041	rs9622746	C	G	746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.660;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=26;PP=575;ReadPosRankSum=0.856;SC=CTTCCAGACGCAGAGTAGCTC;SOR=0.815;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=141;TCF=63;TCR=78;TR=44;WE=38564049;WS=38564031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,45:0.28:161
chr22	38617333	rs2235265	T	C	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.638;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=23;ReadPosRankSum=-0.157;SC=CCTCTGGAAGTGACATGTGAG;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=3;WE=38617341;WS=38617323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr22	38626556	rs5756982	G	T	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=190;ReadPosRankSum=0.589;SC=GGGTGCTGGGGGCCTGGGGTG;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=11;WE=38626564;WS=38626549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr22	38627339	rs61737782	G	A	846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=1.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.37;ReadPosRankSum=0.094;SOR=0.720;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,46:0.35:133
chr22	38699050	rs3830720	GAGGC	G	4615.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=17;NR=57;PP=2973;SC=TCAGGGGTCAGAGGCAGGCAG;SOR=1.211;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=87;TCF=21;TCR=66;TR=74;WE=38699061;WS=38699040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr22	38822698	rs1063134	C	T	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.243;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.15;ReadPosRankSum=-0.464;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr22	38823136	rs196059	T	C	5072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=75;PP=2361;SC=TGTGAAAACGTGAGTAGTCCA;SOR=0.768;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=157;TCF=81;TCR=76;TR=156;WE=38823144;WS=38823126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr22	38823654	.	C	T	5094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.295;ClippingRankSum=0.000;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.954;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=109;NR=94;PP=2938;ReadPosRankSum=0.278;SC=GAGTCGATGACGCAGCCCACG;SOR=0.620;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=283;TCF=155;TCR=128;TR=203;WE=38823662;WS=38823644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,227:0.72:316
chr22	38875549	rs401933	C	T	1905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=16;PP=959;SC=GTAAATAGGCCGGGAAATGAC;SOR=1.284;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=37;TCR=16;TR=53;WE=38875557;WS=38875539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
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chr22	39079920	rs139107203	A	AT	37.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=6.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.98;MQRankSum=2.179;QD=2.52;ReadPosRankSum=-0.062;SOR=0.636;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr22	39267312	rs1122771	C	T	208.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=0;PP=139;SC=TGGCTGAGGCCTGCCATCAGG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=39267320;WS=39267302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr22	39381826	rs2076109	A	G	3419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=75;NR=44;PP=2021;SC=GGTGTATTTCAAGCCTCAGTA;SOR=1.066;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=119;TCF=75;TCR=44;TR=119;WE=39381834;WS=39381816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr22	39381999	rs2076111	T	C	2433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.16;QD=27.66;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr22	39382079	rs5995649	C	A	4246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=80;PP=2939;SC=GCCCGCGTGACGATCATGGAC;SOR=0.732;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=157;TCF=77;TCR=80;TR=157;WE=39382087;WS=39382069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr22	39387558	rs1065184	C	T	5848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=102;NR=98;PP=2965;SC=TCTATGATTACGACCCCCTAT;SOR=0.757;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=200;TCF=102;TCR=98;TR=200;WE=39387566;WS=39387548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr22	39387655	rs34124580	G	T	1098.88	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.194;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=-0.381;NF=20;NR=33;PP=767;ReadPosRankSum=1.675;SC=GTTCAGGTGGGGTGGGGTGGG;SOR=0.148;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=26;TCR=42;TR=53;WE=39387663;WS=39387645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,46:0.92:50
chr22	39388207	rs5757413	G	A	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.13;MQRankSum=-3.940;QD=1.86;ReadPosRankSum=-0.179;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,4:0.17:23
chr22	39413668	rs1969643	C	T	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.043;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=196;ReadPosRankSum=1.799;SC=AATAAGGAAACGGCCCGGGGC;SOR=1.634;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=12;WE=39413676;WS=39413658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr22	39414166	rs4820361	A	G	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=192;ReadPosRankSum=2.030;SC=GGACCGGGCCAGCGCCCACTG;SOR=0.593;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=15;WE=39414174;WS=39414156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr22	39414224	rs4821854	A	G	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.021;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=9;PP=230;ReadPosRankSum=1.778;SC=GCCCAGGGCCAGGAGAGAGGC;SOR=0.459;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=64;TCF=41;TCR=23;TR=21;WE=39414232;WS=39414214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,22:0.31:71
chr22	39419112	rs71326743	CTATT	C	169.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;QD=56.58;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr22	39440149	rs5750728	C	T	2365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=2.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.042;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=54;PP=1371;ReadPosRankSum=0.935;SC=GGCCAGTGCGCCCCACCACAT;SOR=0.919;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=143;TCF=61;TCR=82;TR=91;WE=39440157;WS=39440139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,107:0.64:168
chr22	39441096	rs2020390	G	T	1030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.829;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-6.900;NF=20;NR=27;PP=819;ReadPosRankSum=-1.768;SC=CGAATTCCTGGCTGAGCACCC;SOR=1.135;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=107;TCF=51;TCR=56;TR=47;WE=39441104;WS=39441086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,45:0.42:108
chr22	39441203	rs4821862	C	T	1888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.366;NF=39;NR=40;PP=1054;ReadPosRankSum=1.015;SC=CAGGGGCCCGCGTGAAGATTA;SOR=0.716;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=130;TCF=64;TCR=66;TR=79;WE=39441211;WS=39441193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,88:0.60:146
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chr22	39445554	rs2076101	G	A	2091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=1.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.820;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=46;PP=1111;ReadPosRankSum=-0.551;SC=CCACTCACCTGTCTCCTGGAA;SOR=0.927;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=137;TCF=61;TCR=76;TR=82;WE=39445562;WS=39445544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,97:0.60:163
chr22	39448711	rs6001402	C	A	1430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=32;PP=791;ReadPosRankSum=0.273;SC=GGGGTCTCCCCGGGCCTCATG;SOR=0.634;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=102;TCF=41;TCR=61;TR=55;WE=39448719;WS=39448701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,63:0.55:115
chr22	39448750	rs5757451	T	C	812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=24;PP=551;ReadPosRankSum=1.845;SC=CCTGCTCATGTTGTGCAGGCC;SOR=0.648;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=58;TCF=15;TCR=43;TR=32;WE=39448758;WS=39448740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,34:0.56:61
chr22	39477123	rs5757465	T	C	4304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.667;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=85;PP=2227;ReadPosRankSum=-0.582;SC=TGACCATCTTTGTTGCCCGCC;SOR=0.629;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=228;TCF=115;TCR=113;TR=167;WE=39477131;WS=39477113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,189:0.72:263
chr22	39496199	rs139291	T	C	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=182;ReadPosRankSum=0.000;SC=AAGAGTTGGGTTTGAAAAGTG;SOR=0.527;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=57;TCF=40;TCR=17;TR=18;WE=39496207;WS=39496189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,18:0.31:58
chr22	39496322	rs140936762	TAAC	T	1170.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.06;MQRankSum=1.881;QD=6.69;ReadPosRankSum=-0.543;SOR=0.713;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:136,39:0.22:175
chr22	39496336	rs139293	G	T	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.06;MQRankSum=1.917;QD=2.75;ReadPosRankSum=-0.176;SOR=0.657;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:134,37:0.22:171
chr22	39496412	rs139294	G	C	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQRankSum=2.028;QD=2.49;ReadPosRankSum=-2.419;SOR=0.699;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,18:0.20:90
chr22	39497181	rs9611092	T	A	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=19.18;ReadPosRankSum=-0.924;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr22	39497404	rs139297	G	C	630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.767;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=20;PP=319;ReadPosRankSum=-0.157;SC=TCTGAACCTGGGCATCTTCGC;SOR=0.855;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=94;TCF=43;TCR=51;TR=34;WE=39497412;WS=39497394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,38:0.36:107
chr22	39497452	rs139298	A	G	732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=2.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.01;ReadPosRankSum=-0.008;SOR=1.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,21:0.34:61
chr22	39497452	.	AAG	GAC	396	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=6;NR=10;PP=396;QD=28.0917421789;SC=GCCCCAGCAGAAGGGGCTGCG;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=50;TCF=20;TCR=30;TR=16;WE=39497462;WS=39497442;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:34,16:0.32:50
chr22	39497454	rs139299	G	C	732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=2.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.63;ReadPosRankSum=-0.291;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,21:0.36:58
chr22	39497509	rs139300	A	G	478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=13;PP=347;SC=GGGCTTCCCAAGTAGGAAAGA;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=39497517;WS=39497499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr22	39497811	rs139301	A	G	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-1.412;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=94;ReadPosRankSum=1.304;SC=AGAATTCCCCAGACAGAGCAA;SOR=1.781;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=7;WE=39497819;WS=39497803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr22	39498038	rs139302	G	C	944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.635;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=25;PP=533;ReadPosRankSum=0.408;SC=GACGGCTTGAGAGGATAAAGG;SOR=0.788;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=137;TCF=59;TCR=78;TR=41;WE=39498046;WS=39498028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,52:0.32:162
chr22	39498373	rs139304	TA	T	726.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=671;SC=AGGCTGGTCTTAGAACTCTTG;SOR=4.514;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=39498381;WS=39498363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr22	39499575	rs139313	G	T	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=80;ReadPosRankSum=0.657;SC=CAGGCCTTCTGGGCCCTTCTG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=6;WE=39499583;WS=39499565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr22	39499604	rs139314	T	C	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.639;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=149;ReadPosRankSum=0.073;SC=TCTTTTCTCTTCCTAATGATC;SOR=0.382;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=10;WE=39499612;WS=39499594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,14:0.36:39
chr22	39499653	rs139315	C	T	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.675;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=13;PP=324;ReadPosRankSum=0.698;SC=CTGTGGTGTCCCACCAGTTGG;SOR=0.491;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=103;TCF=69;TCR=34;TR=33;WE=39499661;WS=39499643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,39:0.34:114
chr22	39499763	rs139316	T	C	1039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.21;ReadPosRankSum=-2.464;SOR=0.669;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:181,66:0.27:247
chr22	39499902	rs139317	C	T	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=30;ReadPosRankSum=-0.566;SC=AGAAGACCTTCCTTTCCTCCT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=3;WE=39499910;WS=39499892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr22	39626024	rs2239769	C	T	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.197;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=158;ReadPosRankSum=0.043;SC=ATTTTTAAGACCGGCCCCTGC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=9;WE=39626032;WS=39626014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr22	39626375	rs4821874	A	C	287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=11;PP=237;SC=GTGGGGCAAAAGCTTTGGCCC;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=39626383;WS=39626365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr22	39629329	rs11704525	C	A	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=323;ReadPosRankSum=1.979;SC=GTGGGGGGAACGGGAGTTGTA;SOR=0.976;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=18;WE=39629337;WS=39629319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr22	39636899	.	GTC	G	81.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.153;ClippingRankSum=0.000;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=2.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.12;MQRankSum=-1.298;QD=2.04;ReadPosRankSum=1.905;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,7:0.17:40
chr22	39636930	rs5757576	A	G	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.48;MQRankSum=2.392;QD=10.16;ReadPosRankSum=2.761;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr22	39639853	rs1800817	G	T	2371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.565;HP=7;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=41;PP=1510;ReadPosRankSum=2.987;SC=GGTCAGAAGGGGGGGGCGAAG;SOR=0.785;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=179;TCF=106;TCR=73;TR=104;WE=39639861;WS=39639843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,109:0.60:182
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chr22	39710244	rs137621	G	A	1278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.954;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=21;PP=627;ReadPosRankSum=-0.123;SC=TAAGGCTGGGGCATTAGGGAC;SOR=0.580;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=64;TCF=38;TCR=26;TR=48;WE=39710252;WS=39710234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,57:0.72:79
chr22	39711351	rs2076125	A	G	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FS=0.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.55;ReadPosRankSum=-0.007;SOR=0.785;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:130,41:0.24:171
chr22	39712981	rs137623	A	G	3616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=69;PP=2305;SC=CTTTTCCACCAGCAAGCGGAG;SOR=0.898;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=59;TCR=69;TR=128;WE=39712989;WS=39712971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr22	39713105	rs470081	C	T	826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=20;PP=598;SC=CCTTTCTGCCCTGGGGAAGCC;SOR=1.536;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=11;TCR=20;TR=31;WE=39713113;WS=39713095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr22	39713128	rs2072872	A	G	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.767;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=165;ReadPosRankSum=0.345;SC=CTCAGTGATGAAGGAAATGGG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=9;WE=39713136;WS=39713118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr22	39714490	rs6509	C	T	1896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.048;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.465;NF=30;NR=46;PP=1376;ReadPosRankSum=-0.368;SC=CCGGCTTGGACGGGTCATCCT;SOR=0.335;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=122;TCF=42;TCR=80;TR=76;WE=39714498;WS=39714480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,78:0.61:127
chr22	39714704	rs1569498	C	T	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=123;ReadPosRankSum=1.110;SC=AGAATCCTGACCAGACACCCA;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=7;WE=39714712;WS=39714694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr22	39714908	rs137625	A	G	2110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=17;PP=1324;SC=GCAGCTTTATATGCCAATTAG;SOR=2.030;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=49;TCR=17;TR=66;WE=39714916;WS=39714898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr22	39715140	rs470082	C	T	1608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.246;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=43;PP=1118;ReadPosRankSum=1.421;SC=CTCCAGAGGCCTTCGGAGTGC;SOR=1.093;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=82;TCF=28;TCR=54;TR=63;WE=39715148;WS=39715130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,65:0.76:86
chr22	39746168	rs3747177	C	A	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=2.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQRankSum=-0.574;QD=3.35;ReadPosRankSum=-1.526;SOR=0.420;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,32:0.26:123
chr22	39746186	rs142884306	ACCGACC	A	1555.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.579;NF=1;NR=28;PP=1305;ReadPosRankSum=0.797;SC=GCGCGCCCGGACCGACCCCGA;SOR=1.064;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=49;TCF=4;TCR=45;TR=29;WE=39746199;WS=39746176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,39:0.78:50
chr22	39770597	rs4821888	A	G	4446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=70;PP=2595;SC=CACAGAGTCTACAGAGGGCTG;SOR=0.810;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=147;TCF=76;TCR=71;TR=146;WE=39770605;WS=39770587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr22	39770780	rs4820377	G	A	461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=12;PP=299;SC=GCAGGGGAGCGTGGATGGGAT;SOR=2.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=16;WE=39770788;WS=39770770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr22	39777822	rs149306472	C	CCAA	9329.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=76;PP=2924;SC=TACGTGGAGCCCACTGGGCCG;SOR=1.022;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=93;TCF=13;TCR=80;TR=87;WE=39777830;WS=39777812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr22	39795683	rs4821892	G	C	193.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=0;PP=114;SC=CCCTCTTCGGGCGTGGGGTGG;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=39795691;WS=39795673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr22	39812986	rs6001585	C	A	1140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=23;PP=673;SC=GAGCAACAGGCGTTAGGGAGC;SOR=1.402;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=15;TCR=23;TR=38;WE=39812994;WS=39812976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr22	39994105	rs760546	A	G	4051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=51;PP=2322;SC=GGTGCACCCCAGCCCCCACGG;SOR=1.129;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=89;TCR=51;TR=140;WE=39994113;WS=39994095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr22	40054428	rs136848	T	G	490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.146;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=342;ReadPosRankSum=-0.496;SC=CTGAAACAATTATCGAAATAG;SOR=1.655;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=39;TCF=11;TCR=28;TR=21;WE=40054436;WS=40054418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,21:0.51:41
chr22	40054948	rs5757761	T	C	1874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.373;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=30;PP=1012;ReadPosRankSum=0.504;SC=TCTGGGAGATTGTGGGGCAGG;SOR=0.958;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=116;TCF=68;TCR=48;TR=77;WE=40054956;WS=40054938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,84:0.64:132
chr22	40055304	rs136850	T	C	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.740;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=207;ReadPosRankSum=0.896;SC=TCAGTGTTCATCTCTGTAAAA;SOR=0.172;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=13;WE=40055312;WS=40055294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,16:0.76:21
chr22	40055896	rs136851	T	C	1292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.103;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=37;PP=982;ReadPosRankSum=0.889;SC=CCCCACAGGGTCTGCGAAAGA;SOR=1.044;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=74;TCF=21;TCR=53;TR=51;WE=40055904;WS=40055886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,50:0.69:72
chr22	40057273	rs136852	T	C	1030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=1.777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.99;ReadPosRankSum=0.015;SOR=0.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,51:0.59:86
chr22	40058186	rs136853	A	G	1688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.327;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=39;PP=972;ReadPosRankSum=1.046;SC=CGCCCACCACATTCATCACGG;SOR=0.581;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=129;TCF=59;TCR=70;TR=76;WE=40058194;WS=40058176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,83:0.57:145
chr22	40058999	rs136854	C	T	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5005;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=285;ReadPosRankSum=0.424;SC=CGGACCCTCCCGGCCCAGAGG;SOR=0.859;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=15;WE=40059007;WS=40058989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,15:0.83:18
chr22	40061683	rs136855	A	G	2277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=50;PP=1537;ReadPosRankSum=0.619;SC=GGGAAAAGGAAGTCTCAGACA;SOR=0.651;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=131;TCF=58;TCR=73;TR=89;WE=40061691;WS=40061665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,94:0.67:140
chr22	40075400	rs2294369	G	A	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=189;ReadPosRankSum=-1.004;SC=GGCGGGCGGCGGGGGCGACAC;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=12;WE=40075408;WS=40075390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr22	40075473	rs7288746	T	C	141.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=3;PP=67;SC=TGGAGAGGTGTGAGGGTCGCC;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=5;WE=40075481;WS=40075463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
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chr22	40161598	rs140918120	G	T	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.332;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.98;MQRankSum=0.764;NF=13;NR=19;PP=346;ReadPosRankSum=0.307;SC=TATTTTCTGAGAGAGTAGGCA;SOR=0.364;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=89;TCF=32;TCR=57;TR=32;WE=40161606;WS=40161588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,33:0.35:93
chr22	40415140	rs2071771	C	T	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=292;ReadPosRankSum=-2.103;SC=GTGTAGACACCGTGTGCCTCA;SOR=0.990;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=15;WE=40415148;WS=40415130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
chr22	40417780	rs5995793	C	T	3789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.663;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=87;PP=2235;ReadPosRankSum=-0.316;SC=CCAGCCGAAACGGCATGGGAG;SOR=1.104;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=247;TCF=117;TCR=130;TR=153;WE=40417788;WS=40417770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,174:0.62:280
chr22	40417820	rs5995794	A	G	2384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.545;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=53;PP=1453;ReadPosRankSum=-0.469;SC=CGCCCCCGCCAGGCGCTTCAG;SOR=0.774;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=170;TCF=79;TCR=91;TR=96;WE=40417828;WS=40417810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,110:0.58:189
chr22	40545797	rs34190441	T	TA	58.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.42;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr22	40545998	rs35899845	C	CA	2051.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=21;PP=1029;SC=TGAAAGCCAACAAAAAATTGA;SOR=1.146;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=35;TCF=14;TCR=21;TR=34;WE=40546006;WS=40545988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr22	40546041	rs35629137	C	CA	3119.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=30;PP=1559;SC=AAAGTAGAGTCAAAAAGGTTT;SOR=0.914;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=43;TCF=11;TCR=32;TR=41;WE=40546049;WS=40546031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr22	40546153	rs5995826	G	A	630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=17;PP=463;SC=AGGCCAAGGCGGGCAGATCAC;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=40546161;WS=40546143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr22	40574170	rs6001827	T	A	3543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=72;NR=43;PP=1867;SC=CAATTTTTTTTAACCAATTGA;SOR=1.011;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=72;TCR=43;TR=115;WE=40574178;WS=40574160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr22	40641963	rs145191448	G	A	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=1.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.25;ReadPosRankSum=0.206;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,24:0.46:52
chr22	40649823	rs138047404	CCTT	C	245.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.233;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=100;ReadPosRankSum=-1.235;SC=CTGTAAATCTCCTTCTTCTTC;SOR=0.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=3;WE=40649833;WS=40649813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr22	40669648	rs733381	A	G	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=96;ReadPosRankSum=-1.085;SC=TCGCTCTGAGAAGGCAGAACT;SOR=0.495;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=10;WE=40669656;WS=40669638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,10:0.28:36
chr22	40673999	rs2413621	C	T	1020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=26;PP=715;ReadPosRankSum=-0.181;SC=TCTTTATTTTCCAGAGTCAGA;SOR=0.710;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=155;TCF=81;TCR=74;TR=52;WE=40674007;WS=40673989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,57:0.33:174
chr22	40677001	rs929070	T	C	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.715;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=158;ReadPosRankSum=-1.215;SC=ATTCCATCCTTGGTTATTGCT;SOR=0.042;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=10;WE=40677009;WS=40676991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr22	40681788	rs6001862	C	T	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.659;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=24;PP=492;ReadPosRankSum=-0.578;SC=AGCAATTTTACGTTCCTGTGA;SOR=0.761;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=117;TCF=53;TCR=64;TR=41;WE=40681796;WS=40681778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,48:0.34:140
chr22	40697176	rs10617561	TGCA	T	1636.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.968;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=1064;ReadPosRankSum=-0.155;SC=GTGAGTGCACTGCAGCAGCAG;SOR=1.314;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=44;TCF=29;TCR=15;TR=23;WE=40697189;WS=40697166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,41:0.72:57
chr22	40697377	rs5995843	A	G	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.51;ReadPosRankSum=-0.593;SOR=0.646;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,30:0.25:122
chr22	40706681	rs151179426	G	A	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=79;ReadPosRankSum=0.241;SC=GCTGAGTCTCGAATGCAACCT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=5;WE=40706689;WS=40706671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr22	40708679	rs2072858	T	C	1136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.886;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=30;PP=687;ReadPosRankSum=0.134;SC=GCATCTCTTATATGTTCAACA;SOR=0.857;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=172;TCF=83;TCR=89;TR=56;WE=40708687;WS=40708669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,64:0.33:194
chr22	40711227	rs3830738	A	AT	598.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=459;ReadPosRankSum=-0.389;SC=ACTCATGTGTATTTGTCAACA;SOR=0.941;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=15;WE=40711235;WS=40711217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,21:0.49:43
chr22	40803186	rs2018393	G	T	2810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.139;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=47;PP=1460;ReadPosRankSum=-1.209;SC=TGGTCACCATGGTTCTCTGGG;SOR=0.795;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=182;TCF=105;TCR=77;TR=116;WE=40803194;WS=40803176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,132:0.65:203
chr22	40805569	rs74371979	C	G	3769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.349;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=68;PP=2272;ReadPosRankSum=1.138;SC=ACTGATGGAGCTGCCCAAACC;SOR=0.500;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=202;TCF=104;TCR=98;TR=146;WE=40805577;WS=40805559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,162:0.72:225
chr22	40814636	rs4821944	C	T	944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=0.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.85;ReadPosRankSum=0.893;SOR=0.581;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,53:0.38:138
chr22	40832230	rs62239076	C	A	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.030;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=267;ReadPosRankSum=0.551;SC=CTAGGCCTCACATTATTCTCA;SOR=0.494;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=62;TCF=45;TCR=17;TR=22;WE=40832238;WS=40832220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,26:0.35:75
chr22	40915718	rs5757976	C	T	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5032;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=32;ReadPosRankSum=0.253;SC=TTCTGAAAAGCACAATAATGG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=40915726;WS=40915708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr22	41075543	rs133072	A	G	1097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=17;PP=620;ReadPosRankSum=-0.798;SC=CCCCCTTCCCAACTGCGGGGC;SOR=0.630;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=62;TCF=37;TCR=25;TR=43;WE=41075551;WS=41075533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,49:0.70:70
chr22	41075695	rs133073	C	T	1980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.702;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=40;PP=1153;ReadPosRankSum=0.595;SC=CTGGTCCCAACGCCAGCAACA;SOR=0.807;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=119;TCF=60;TCR=59;TR=81;WE=41075703;WS=41075685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,89:0.68:130
chr22	41170063	rs2076674	T	C	2254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.396;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=50;PP=1420;ReadPosRankSum=0.361;SC=ACTGTTGCTGTTTTTTAAAAT;SOR=0.489;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=127;TCF=53;TCR=74;TR=88;WE=41170071;WS=41170053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,98:0.70:141
chr22	41172351	rs6002128	A	G	973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=23;PP=741;SC=GAGTGCTTCAAAAAAGCTAAA;SOR=2.448;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=30;WE=41172359;WS=41172341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr22	41175263	rs5758077	C	T	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.519;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=231;ReadPosRankSum=-0.423;SC=GGTAAGGTGTCTCTTTGTGCC;SOR=2.448;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=12;WE=41175271;WS=41175253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr22	41194947	.	CAAA	C	34.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.032;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=4.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.26;MQRankSum=-0.307;QD=0.89;ReadPosRankSum=0.416;SOR=1.953;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,5:0.13:39
chr22	41195142	.	C	CT	89.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=0.000;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.49;ReadPosRankSum=-0.397;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,10:0.28:36
chr22	41302973	rs5995963	A	T	2247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=23;PP=1420;SC=ACCAAGCCCCATTATGGTCAC;SOR=1.367;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=50;TCR=23;TR=73;WE=41302981;WS=41302963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr22	41513094	rs2144342	G	T	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5013;FS=3.468;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=240;ReadPosRankSum=0.960;SC=GAGTGAGGTTGGGAAATGACA;SOR=2.303;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=12;WE=41513102;WS=41513084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr22	41537234	rs6002267	G	T	2785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=50;PP=1602;SC=CTAGTAAGTGGTTTTTGTTAT;SOR=1.284;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=34;TCR=50;TR=84;WE=41537242;WS=41537224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr22	41550954	rs4822011	C	T	1238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-3.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.078;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=11;PP=801;ReadPosRankSum=-0.077;SC=TAAAGTTCTTCTGCTTAATTG;SOR=0.270;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=64;TCR=19;TR=48;WE=41550962;WS=41550944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,51:0.65:79
chr22	41551039	rs20552	T	A	3763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FS=0.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.35;ReadPosRankSum=-1.859;SOR=0.779;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:108,174:0.62:282
chr22	41568480	rs2076577	T	C	793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=0.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.957;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=418;ReadPosRankSum=-0.616;SC=GAAATTCCTATATGTACATGC;SOR=0.073;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=24;WE=41568488;WS=41568470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,32:0.71:45
chr22	41569609	rs2076578	C	T	1524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.354;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=4;PP=587;ReadPosRankSum=1.393;SC=TTCTTGTCTCCTTTGTGCTAC;SOR=0.495;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=52;TCF=44;TCR=8;TR=32;WE=41569617;WS=41569599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,38:0.63:60
chr22	41569633	rs374162524	A	G	2153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-3.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.386;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=17;PP=872;ReadPosRankSum=-0.961;SC=GCAGGTGACCAAGGGAGACAG;SOR=0.338;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=91;TCF=65;TCR=26;TR=57;WE=41569641;WS=41569623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,68:0.65:104
chr22	41574510	.	TCAG	T	5343.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=0.000;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.055;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.259;NF=15;NR=56;PP=2945;ReadPosRankSum=-1.534;SC=AGCGACTCCTTCAGCAACAGA;SOR=0.731;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=132;TCF=30;TCR=102;TR=71;WE=41574520;WS=41574500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,138:0.62:223
chr22	41604353	rs139431	C	T	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.83;ReadPosRankSum=0.736;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr22	41604399	rs4820432	G	A	431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-1.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5008;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=204;ReadPosRankSum=0.373;SC=CTCCCAAAGTGCTGGGATTAC;SOR=0.653;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=20;TCF=13;TCR=7;TR=16;WE=41604407;WS=41604389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,20:0.74:27
chr22	41605635	rs139437	T	C	997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.02;ReadPosRankSum=0.153;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,28:0.34:83
chr22	41605639	rs139438	C	T	1015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.68;ReadPosRankSum=-0.316;SOR=0.748;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,30:0.34:87
chr22	41606030	rs139439	A	C	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.450;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=40;ReadPosRankSum=-1.282;SC=AGAGCCATCCAGATGTAAAAG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=41606038;WS=41606020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr22	41609859	rs139450	T	C	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.688;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=8;PP=141;ReadPosRankSum=-0.279;SC=TTTGAGGTGGTCATATCGGGT;SOR=0.501;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=55;TCF=33;TCR=22;TR=16;WE=41609867;WS=41609849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,21:0.32:66
chr22	41610024	rs139451	G	A	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.336;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=7;PP=109;ReadPosRankSum=-0.738;SC=TCTTGGCTAGGTTACAGGTGA;SOR=0.430;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=53;TCF=23;TCR=30;TR=14;WE=41610032;WS=41610014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,18:0.28:64
chr22	41612965	rs85220	T	G	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.22;ReadPosRankSum=-0.328;SOR=0.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr22	41617160	rs139471	T	TG	240.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.391;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=152;ReadPosRankSum=-1.567;SC=TCAGTGGAGGTTTGTCAGTCT;SOR=0.223;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=6;WE=41617168;WS=41617150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr22	41617318	rs139472	G	C	805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.628;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=21;PP=562;ReadPosRankSum=-0.721;SC=TAACTGATGTGCCTCCTTCCG;SOR=0.592;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=156;TCF=87;TCR=69;TR=47;WE=41617326;WS=41617308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,49:0.29:170
chr22	41635425	rs139495	C	T	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.873;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=285;ReadPosRankSum=2.010;SC=CCACTCTGTGCCTGTGCTCCT;SOR=0.874;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=83;TCF=55;TCR=28;TR=27;WE=41635433;WS=41635415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,29:0.31:93
chr22	41645500	rs139500	TG	T	1240.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.853;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.408;NF=1;NR=34;PP=667;ReadPosRankSum=-0.934;SC=CAAAGTCACCTGGGGGGGCCC;SOR=0.929;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=105;TCF=8;TCR=97;TR=35;WE=41645508;WS=41645490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,58:0.34:171
chr22	41645757	rs71948	C	G	966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.586;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=23;PP=615;ReadPosRankSum=0.637;SC=TGTGCACGAGCAGCCTGGTGA;SOR=0.748;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=165;TCF=91;TCR=74;TR=54;WE=41645765;WS=41645747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,57:0.32:178
chr22	41652345	rs470112	C	G	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=339;ReadPosRankSum=-0.097;SC=GGCCAGGACACCAGGTTCTAC;SOR=0.577;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=25;TCR=37;TR=24;WE=41652353;WS=41652335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,25:0.37:68
chr22	41652733	rs139509	G	A	784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FS=2.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.342;SOR=0.516;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:109,49:0.31:158
chr22	41660964	rs139520	A	G	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.632;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=27;ReadPosRankSum=0.505;SC=TGCAGAACCAACACAGACACA;SOR=1.432;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=4;WE=41660972;WS=41660954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,4:0.19:21
chr22	41676559	rs35821769	C	CAGCT	238.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=90;ReadPosRankSum=-0.401;SC=GGGAAAGCTGCAGCTATTCCC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=4;WE=41676567;WS=41676549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr22	41829794	rs6609	C	G	1135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.70;QD=32.45;SOR=1.308;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr22	41833116	rs202641	C	T	10351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=382;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=175;NR=177;PP=2965;SC=CATCTTCCACCGCCAGGCCAC;SOR=0.769;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=352;TCF=175;TCR=177;TR=352;WE=41833124;WS=41833106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,382:1.00:382
chr22	41864216	rs505533	A	C	4499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=83;PP=2726;SC=GGAGAAGTACATCCTCGAGCT;SOR=1.053;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=146;TCF=63;TCR=83;TR=146;WE=41864224;WS=41864206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr22	41911525	rs1799932	C	T	1310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.70;SOR=0.732;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr22	42016699	rs2267437	C	G	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.190;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=267;ReadPosRankSum=0.351;SC=CCTCGGCCAGCCGCCACCCTC;SOR=0.169;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=17;WE=42016707;WS=42016689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr22	42059768	rs132788	G	T	487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.174;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.023;NF=8;NR=12;PP=280;ReadPosRankSum=0.027;SC=TGAAGAGTGGGCTGAAGAAGC;SOR=1.082;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=38;TCF=18;TCR=20;TR=20;WE=42059776;WS=42059758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
chr22	42076381	rs5758405	C	A	2445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=43;PP=1416;SC=ATGGGGGGGACATAAAAATAT;SOR=1.014;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=38;TCR=43;TR=81;WE=42076389;WS=42076371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr22	42089623	rs739134	T	C	6398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=123;NR=91;PP=2965;SC=CCAGGAATCATGGGCCCAGAA;SOR=0.903;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=214;TCF=123;TCR=91;TR=214;WE=42089631;WS=42089613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr22	42109917	rs5758431	A	G	834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=4;PP=610;SC=GCAAATCACTATCCTGCACTG;SOR=2.670;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=42109925;WS=42109907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr22	42111896	rs9306355	A	T	1169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=5;PP=766;SC=CCAGTGGGGGAGCTGGACACT;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=31;TCR=5;TR=36;WE=42111904;WS=42111886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr22	42139054	rs5751147	G	A	1150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=12;PP=658;SC=TTGCCTTACCGTGAACCTGCT;SOR=1.455;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=28;TCR=12;TR=40;WE=42139062;WS=42139044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr22	42139078	rs5751148	A	G	1812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=22;PP=994;SC=GTCTCTCTGGATGCAGGAAGG;SOR=1.054;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=40;TCR=22;TR=62;WE=42139086;WS=42139068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr22	42140792	rs56663311	G	A	152.03	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.01;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr22	42140793	rs62236786	C	T	152.03	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.01;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr22	42140798	rs56138604	G	A	152.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.01;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr22	42140800	rs58323591	C	CTTTG	143	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=0;PP=40;SC=CCGCGCCCGGCCTATGATTTT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=2;WE=42140808;WS=42140786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr22	42148467	rs715498	G	A	3063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=37;PP=1839;SC=CTAGACAGTGGTGGAGTACAT;SOR=1.315;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=65;TCR=37;TR=102;WE=42148475;WS=42148457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr22	42150146	rs1534932	C	T	1917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=27;NR=29;PP=870;SC=AGTACAGCCACGAGATTTCTT;SOR=1.148;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=27;TCR=29;TR=56;WE=42150154;WS=42150136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr22	42154230	.	C	T	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.170;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=4.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.17;ReadPosRankSum=-1.013;SOR=0.072;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,6:0.21:28
chr22	42159229	rs2050033	G	T	4977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=97;NR=69;PP=2965;SC=TCCTCCTGTCGCTGCAGGACC;SOR=1.093;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=166;TCF=97;TCR=69;TR=166;WE=42159237;WS=42159219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr22	42190309	rs738247	A	G	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=368;ReadPosRankSum=1.149;SC=CAATAGGAGAAGGTCCTCTTG;SOR=0.988;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=22;WE=42190317;WS=42190299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,25:0.64:39
chr22	42289096	rs143974765	A	G	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=327;ReadPosRankSum=-1.116;SC=CCTTGGTGTTACCCCTGGTCC;SOR=0.730;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=16;WE=42289104;WS=42289086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr22	42301712	rs2157590	T	C	1080.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.850;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=29;PP=728;ReadPosRankSum=0.031;SC=TTTCTCTCTCTCCCCCTCAGC;SOR=0.582;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=84;TCF=35;TCR=49;TR=48;WE=42301720;WS=42301702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,53:0.57:93
chr22	42334953	rs1047997	C	G	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5105;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=289;ReadPosRankSum=-1.007;SC=CCAGCCACGGCGGGCTGAGCC;SOR=0.906;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=18;WE=42334961;WS=42334943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,22:0.85:26
chr22	42336172	rs5758511	G	A	1505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FS=1.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.97;ReadPosRankSum=3.009;SOR=0.864;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,78:0.41:189
chr22	42336237	rs73165147	A	G	1422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=32;PP=762;ReadPosRankSum=2.105;SC=TACTTCCTTCAGGTCTTTATT;SOR=0.688;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=120;TCF=55;TCR=65;TR=59;WE=42336245;WS=42336227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,71:0.51:140
chr22	42339516	rs3752591	A	G	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.507;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=179;ReadPosRankSum=1.562;SC=CTCGGATACTAAGTCCTTCGA;SOR=0.818;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=9;WE=42339524;WS=42339506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr22	42341308	rs7293091	A	G	3157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.062;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=63;PP=1878;ReadPosRankSum=0.297;SC=TGTTCTGGAGACTGGGGTGGC;SOR=0.617;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=207;TCF=103;TCR=104;TR=131;WE=42341316;WS=42341298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,145:0.64:226
chr22	42343091	rs6002555	G	A	1782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.679;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=30;PP=921;ReadPosRankSum=0.791;SC=CACAGCCGCAGGACCAACCGT;SOR=0.613;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=107;TCF=55;TCR=52;TR=67;WE=42343099;WS=42343081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,81:0.63:128
chr22	42354389	rs62240996	A	C	5177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=82;NR=99;PP=2965;SC=CTTGGGCCAGACCAGCCGCAC;SOR=0.958;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=181;TCF=82;TCR=99;TR=181;WE=42354397;WS=42354379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr22	42354487	rs149263017	G	GGAGA,GGAGAGA	601.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=19;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=0,0;NR=12,12;PP=158,220;ReadPosRankSum=0.633;SC=GGGTTGGTGAGGAGAGAGAGA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=12,12;WE=42354495;WS=42354477;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.50,0.39:18
chr22	42388826	rs56234624	A	G	2959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=59;PP=1782;SC=GTCACCATTTATTAAGCATCT;SOR=1.220;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=42;TCR=59;TR=101;WE=42388834;WS=42388816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr22	42388841	rs133299	G	A	2384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=52;PP=1388;SC=GCATCTATAGGTCAAGGCACT;SOR=1.414;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=32;TCR=52;TR=84;WE=42388849;WS=42388831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr22	42390209	rs7290907	G	A	7623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=67;PP=2776;SC=AAATGCCTCCGTGACCCAAAC;SOR=0.988;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=157;TCF=90;TCR=67;TR=156;WE=42390217;WS=42390199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr22	42390225	rs7290655	C	G	8190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=98;NR=78;PP=2965;SC=CAAACAGAAGCTCACCTCCTG;SOR=0.879;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=177;TCF=99;TCR=78;TR=176;WE=42390233;WS=42390215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr22	42390887	.	CTG	C	236	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=15;MQ=59.8;NF=0;NR=11;PP=236;QD=21.7272727273;SC=AGCATCTTGTCTGTGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=11;WE=42390900;WS=42390877;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:28,11:0.28:39
chr22	42392811	rs1062753	G	A	3648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=69;NR=54;PP=2068;SC=TGGCACCCCTGAACCATGATC;SOR=0.844;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=69;TCR=54;TR=123;WE=42392819;WS=42392801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr22	42418185	rs133341	T	C	1054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=5;PP=845;SC=GTTAATTGTTTAGTTGATATC;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=34;WE=42418193;WS=42418175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr22	42423110	rs2301521	G	C	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=0.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.30;ReadPosRankSum=-1.886;SOR=0.796;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,27:0.23:116
chr22	42458827	rs55715427	G	C	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.644;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=12;PP=370;ReadPosRankSum=-1.316;SC=CCACACCCTAGTACCTTGTGA;SOR=0.930;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=108;TCF=63;TCR=45;TR=30;WE=42458835;WS=42458817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,34:0.27:125
chr22	42461918	rs2854827	G	A	4687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=80;NR=85;PP=2759;SC=ATGTCGAGGGGAAGGCAGAGT;SOR=0.887;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=80;TCR=85;TR=165;WE=42461926;WS=42461908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr22	42463366	rs133367	C	T	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=301;ReadPosRankSum=0.127;SC=TATCTGACCCCGTCCCATTAA;SOR=0.572;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=77;TCF=27;TCR=50;TR=26;WE=42463374;WS=42463356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,26:0.31:85
chr22	42463689	rs133368	T	C	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=116;ReadPosRankSum=0.617;SC=ATCTCAATCATGTAAGTGAGC;SOR=0.473;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=9;WE=42463697;WS=42463679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr22	42463814	rs133369	C	T	1139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.575;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=27;PP=722;ReadPosRankSum=-0.405;SC=GCTTGGGATCCGGCATCAGGC;SOR=0.782;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=165;TCF=92;TCR=73;TR=60;WE=42463822;WS=42463804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,63:0.34:183
chr22	42474138	rs1807494	C	G	1021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.101;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=20;PP=536;ReadPosRankSum=2.252;SC=AAATGTTTACCCATTTCCAAG;SOR=1.047;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=49;TCF=20;TCR=29;TR=32;WE=42474146;WS=42474128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,43:0.69:62
chr22	42475703	rs2269524	T	G	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=2.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=368;ReadPosRankSum=1.151;SC=CGGGCGGCTTTCTTCCCGAGG;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=16;WE=42475711;WS=42475696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,15:0.79:19
chr22	42486723	rs1801311	G	A	3963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.517;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=76;PP=2302;ReadPosRankSum=0.132;SC=GGTAGAAGTAGCTTGGCGGAC;SOR=0.701;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=268;TCF=134;TCR=134;TR=160;WE=42486731;WS=42486713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,183:0.60:306
chr22	42523528	rs1058172	C	T	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FS=3.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQRankSum=-1.312;QD=1.20;ReadPosRankSum=1.540;SOR=0.974;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:208,40:0.16:248
chr22	42523805	rs28371725	C	T	1321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.548;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=24;PP=752;ReadPosRankSum=0.364;SC=CTGTACCCTTCCTCCCTCGGC;SOR=0.583;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=93;TCF=53;TCR=40;TR=53;WE=42523813;WS=42523795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,61:0.56:109
chr22	42523943	rs16947	A	G	679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=3.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=-2.101;QD=5.04;ReadPosRankSum=-0.461;SOR=0.781;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,42:0.31:135
chr22	42524696	rs58440431	T	C	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.108;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.69;MQRankSum=-1.465;QD=4.82;ReadPosRankSum=0.217;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr22	42524947	rs3892097	C	T	727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.49;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.613;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.372;NF=14;NR=20;PP=477;ReadPosRankSum=-0.353;SC=AAGGGGCGTCCTGGGGGTGGG;SOR=0.841;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=71;TCF=35;TCR=36;TR=34;WE=42524955;WS=42524937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,35:0.49:72
chr22	42525180	rs61736507	G	A	3280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.479;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=66;PP=1935;ReadPosRankSum=0.881;SC=AGCGCGCCAGGAACACCCCTG;SOR=0.644;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=218;TCF=118;TCR=100;TR=138;WE=42525188;WS=42525170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,153:0.62:246
chr22	42525416	rs143170489	G	C	2879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.750;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=62;PP=1559;ReadPosRankSum=0.535;SC=AAGACCCCGCGGGCCCCGCGC;SOR=0.431;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=206;TCF=100;TCR=106;TR=130;WE=42525424;WS=42525406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,137:0.63:219
chr22	42525798	rs28371705	G	C	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.798;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.132;NF=14;NR=14;PP=852;ReadPosRankSum=-0.067;SC=GGCGGTCGGCGGTGTCCTCGC;SOR=0.862;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=46;TCR=42;TR=28;WE=42525829;WS=42525788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,32:0.30:105
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chr22	42526694	rs1065852	G	A	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.789;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=18;PP=426;ReadPosRankSum=-0.483;SC=GGGCCTGGTGGGTAGCGTGCA;SOR=1.079;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=88;TCF=43;TCR=45;TR=32;WE=42526702;WS=42526684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,36:0.37:97
chr22	42536263	rs1058174	G	A	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.95;MQRankSum=-2.483;QD=1.24;ReadPosRankSum=0.185;SOR=0.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,6:0.18:33
chr22	42536313	rs2743456	G	A	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQRankSum=-0.416;QD=2.18;ReadPosRankSum=-2.016;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,12:0.22:55
chr22	42537023	rs2860372	T	C	170.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=135;SC=GGACCCCCCATCCAAGCGGGG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=42537031;WS=42537013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr22	42537196	rs56404506	T	C	3108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=59;NR=42;PP=1436;SC=TTCGATGTCATGGGATGTCAT;SOR=0.853;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=59;TCR=42;TR=101;WE=42537204;WS=42537186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr22	42537404	rs2854741	G	C	2445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=40;NR=38;PP=1497;SC=ACTCTCCTTCGTCCTGTGTTG;SOR=0.760;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=40;TCR=38;TR=78;WE=42537412;WS=42537394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr22	42538029	rs1058167	A	G	1143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.442;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-8.195;NF=30;NR=33;PP=660;ReadPosRankSum=2.424;SC=TGGGATGTGCAGGAGGACGGG;SOR=0.899;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=208;TCF=105;TCR=103;TR=63;WE=42538037;WS=42538018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,71:0.30:236
chr22	42538071	rs2267444	G	C	1490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.104;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-6.356;NF=20;NR=29;PP=1018;ReadPosRankSum=-3.046;SC=CAGACAGAACGGGGTCTCAAT;SOR=0.923;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=147;TCF=67;TCR=80;TR=49;WE=42538092;WS=42538061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,54:0.32:167
chr22	42538084	rs2267446	C	T	1162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.769;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.005;NF=12;NR=21;PP=1018;ReadPosRankSum=-1.371;SC=GTCTCAATCCCTCCTGTGCTC;SOR=0.843;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=116;TCF=47;TCR=69;TR=33;WE=42538092;WS=42538061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,34:0.26:131
chr22	42538508	rs3021082	A	G	2711.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.26;QD=44.46;SOR=0.725;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr22	42538508	.	AG	GA	1664	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=48.64;NF=26;NR=20;PP=1664;QD=37.3362581492;SC=CTCCTCCTTCAGTCCCTCCTG;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=51;TCF=26;TCR=25;TR=46;WE=42538522;WS=42538498;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,46:0.90:51
chr22	42538509	rs56023519	G	A	2711.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.26;QD=44.46;SOR=0.725;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr22	42538514	.	T	TC	2711.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=22;PP=1262;SC=CTTCAGTCCCTCCTGAGCTAG;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=30;WE=42538522;WS=42538498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr22	42538876	rs3020732	A	T	5362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.18;SOR=0.789;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr22	42538876	.	ACACCCCTGG	TCACCCCTGG,TCACCCCTGT	1158	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=26;MQ=59.92;NF=74,21;NR=64,17;PP=1158,367;QD=8.64326965614;SC=CGCGACAGGAACACCCCTGGG;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=74;TCR=64;TR=138,38;WE=42538893;WS=42538866;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:138
chr22	42538885	rs2743460	G	T	803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=1.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.36;ReadPosRankSum=-2.233;SOR=0.822;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:102,48:0.32:150
chr22	42546852	rs59390354	G	A	771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=4.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQRankSum=-0.018;QD=5.25;ReadPosRankSum=-0.593;SOR=0.480;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,47:0.32:147
chr22	42609148	rs5758651	T	C	1462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=39;PP=846;ReadPosRankSum=0.838;SC=GGAAAGCCACTGACATTTCGT;SOR=0.718;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=179;TCF=92;TCR=87;TR=78;WE=42609156;WS=42609138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,79:0.41:195
chr22	42610099	rs34030679	T	C	3237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=63;PP=2062;ReadPosRankSum=-0.359;SC=CTGGAACCCATAGGCACACTG;SOR=0.679;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=218;TCF=113;TCR=105;TR=132;WE=42610107;WS=42610089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,146:0.61:240
chr22	42783019	rs45551335	G	A	1974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=6.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.11;ReadPosRankSum=-2.507;SOR=0.338;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,95:0.68:140
chr22	42807314	rs2247576	T	C	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.729;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=9;PP=382;ReadPosRankSum=-1.054;SC=TGTGAGCCACTGCGCCTGGCC;SOR=1.302;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=45;TCF=28;TCR=17;TR=27;WE=42807322;WS=42807304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,28:0.61:46
chr22	42807351	rs2072863	C	T	1198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.763;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=17;PP=674;ReadPosRankSum=-0.170;SC=ATCCAAAGTCCCAAACTGCCA;SOR=0.904;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=84;TCF=52;TCR=32;TR=50;WE=42807359;WS=42807341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,55:0.61:90
chr22	42914033	rs146723886	T	C	3342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=74;PP=2051;ReadPosRankSum=-0.903;SC=TGGGGGCACATTGAGGACAAA;SOR=0.735;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=184;TCF=83;TCR=101;TR=133;WE=42914041;WS=42914023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,146:0.71:205
chr22	42967235	rs137046	C	T	1998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.673;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=-4.088;NF=35;NR=49;PP=1188;ReadPosRankSum=-0.590;SC=TCCCCTTCAGCCACCCGCCAA;SOR=0.627;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=127;TCF=53;TCR=74;TR=84;WE=42967243;WS=42967225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,92:0.66:139
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chr22	42969877	rs137054	G	A	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.225;NF=14;NR=7;PP=365;ReadPosRankSum=0.440;SC=CCCTGACCCCGGGGCCCATGG;SOR=0.892;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=38;TCF=25;TCR=13;TR=21;WE=42969885;WS=42969867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,22:0.61:36
chr22	42970032	rs137055	T	C	2080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-3.583;NF=52;NR=46;PP=1162;ReadPosRankSum=-1.373;SC=CTTCTTACAGTGCACACACAT;SOR=0.706;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=145;TCF=75;TCR=70;TR=98;WE=42970040;WS=42970022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,100:0.70:143
chr22	42970680	rs137058	C	T	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5013;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.96;MQRankSum=-0.410;NF=12;NR=6;PP=306;ReadPosRankSum=1.395;SC=GCAGGCCCTGCCTCACCTCAT;SOR=0.910;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=23;TCF=15;TCR=8;TR=18;WE=42970688;WS=42970670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,19:0.79:24
chr22	42970736	rs137059	G	A	885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=1.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.49;MQRankSum=-1.928;QD=26.05;ReadPosRankSum=1.925;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,22:0.65:34
chr22	42970745	rs137060	G	C	885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=1.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.06;MQRankSum=-2.070;QD=25.31;ReadPosRankSum=1.199;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,23:0.66:35
chr22	42971987	rs137064	T	C	970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.68;MQRankSum=-3.624;QD=13.30;ReadPosRankSum=-1.177;SOR=0.699;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,48:0.66:73
chr22	42972485	rs137068	C	T	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=1.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.480;HP=1;HapScore=4;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-2.600;NF=7;NR=3;PP=495;ReadPosRankSum=2.351;SC=ACACGGGCGACGCGGGGCTCG;SOR=1.068;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=38;TCF=24;TCR=14;TR=10;WE=42972506;WS=42972475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,9:0.22:41
chr22	42972498	rs137069	C	T	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.89;MQRankSum=-2.964;QD=4.63;ReadPosRankSum=-0.751;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,13:0.28:47
chr22	42972515	rs137070	T	TA	441.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=6.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.43;MQRankSum=-3.395;QD=8.49;ReadPosRankSum=-3.506;SOR=1.714;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,17:0.33:52
chr22	42972590	rs137071	A	G	610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.61;MQRankSum=-3.431;QD=8.25;ReadPosRankSum=2.566;SOR=0.544;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,31:0.42:74
chr22	42973201	rs137073	G	A	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.869;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.758;NF=1;NR=12;PP=244;ReadPosRankSum=-0.723;SC=CTACACCAGGGGAGACGGTGC;SOR=2.012;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=13;WE=42973209;WS=42973191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr22	42976828	rs137077	C	A	126.98	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.11;MQRankSum=-1.465;QD=18.14;ReadPosRankSum=1.465;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr22	42981138	rs137085	T	C	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=13;PP=416;ReadPosRankSum=-2.608;SC=TTCCTCTGGGTGGAGACGACA;SOR=0.518;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=35;TCF=16;TCR=19;TR=25;WE=42981146;WS=42981128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,26:0.72:36
chr22	42981167	rs137086	G	A	720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.227;HP=1;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=10;PP=527;ReadPosRankSum=-0.036;SC=CAAGCCAAGAGCTTAGATAGA;SOR=1.256;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=41;TCF=25;TCR=16;TR=30;WE=42981175;WS=42981157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,30:0.73:41
chr22	42981349	rs137087	C	T	2264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=38;PP=1201;ReadPosRankSum=-0.213;SC=CACCAGGGCTCTCCATCCCCT;SOR=0.629;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=120;TCF=64;TCR=56;TR=85;WE=42981357;WS=42981339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,100:0.74:136
chr22	42981890	rs137088	G	A	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=1.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.91;ReadPosRankSum=1.028;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,22:0.59:37
chr22	42987826	rs137097	G	A	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=56;ReadPosRankSum=-1.611;SC=GAGACTGCACGGCAGTTCCTG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=5;WE=42987834;WS=42987816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr22	42988117	rs137098	T	C	540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.256;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=18;PP=307;ReadPosRankSum=0.618;SC=GGGTTGGGATTGGGGAAGGAT;SOR=0.456;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=45;TCF=14;TCR=31;TR=27;WE=42988125;WS=42988107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,27:0.59:46
chr22	43010817	rs28627172	G	A	3877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=77;PP=2195;ReadPosRankSum=1.081;SC=TCCTTTCGCCGCCGCCCCGCG;SOR=0.704;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=242;TCF=123;TCR=119;TR=160;WE=43010825;WS=43010807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,177:0.67:264
chr22	43015716	rs137124	T	C	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.195;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=29;ReadPosRankSum=-0.812;SC=GGGAGGTGACTGGGTGAGCGT;SOR=0.804;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=5;WE=43015724;WS=43015711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr22	43024410	rs137139	C	T	271.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=193;SC=GGCCTTCTCCCGTGGAGCCCC;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=43024418;WS=43024400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr22	43026792	rs5758820	A	G	661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=4;PP=517;SC=TGCACAGGGCAGGAGCGGGAG;SOR=3.014;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=26;WE=43026800;WS=43026782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr22	43027356	rs743889	G	A	2024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.653;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=48;PP=1180;ReadPosRankSum=0.688;SC=GCCGGGCTCCGAATGGGCCCA;SOR=0.662;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=257;TCF=131;TCR=126;TR=101;WE=43027364;WS=43027346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,111:0.40:277
chr22	43032742	rs5996200	C	T	2235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.741;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=25;PP=1369;ReadPosRankSum=0.689;SC=TGAGCCGCAGCGGGTACTTGA;SOR=0.831;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=129;TCF=92;TCR=37;TR=90;WE=43032750;WS=43032732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,98:0.71:139
chr22	43035849	rs59947151	CTT	C	261.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.98;QD=26.17;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr22	43088549	rs3747194	C	T	1699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=19;PP=1045;SC=CCCTTAGCACCGGCCTCTGCC;SOR=1.536;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=39;TCR=19;TR=58;WE=43088557;WS=43088539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr22	43435668	rs2072883	G	A	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.260;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=63;ReadPosRankSum=0.080;SC=AAGTGCCTTCGTTTATTTACA;SOR=0.072;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=6;WE=43435676;WS=43435663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr22	43442599	rs5759111	T	C	624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=20;PP=760;ReadPosRankSum=0.240;SC=GAAAGACCCATGTTCCTCACC;SOR=0.784;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=78;TCF=31;TCR=47;TR=33;WE=43442617;WS=43442589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,36:0.41:88
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chr22	43455665	rs5759126	A	G	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=162;ReadPosRankSum=-0.391;SC=GCAAACATCCAGACCCCTGCC;SOR=0.527;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=12;WE=43455673;WS=43455655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr22	43459846	rs1052160	G	A	1005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.629;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=17;PP=603;ReadPosRankSum=1.880;SC=CGACGTTGGTGAGATGAACGA;SOR=0.756;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=134;TCF=84;TCR=50;TR=48;WE=43459854;WS=43459836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,55:0.36:151
chr22	43466033	.	C	A	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.924;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.798;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=167;ReadPosRankSum=-1.508;SC=AGGGACAGGCCGGGACCCAAG;SOR=0.301;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=11;WE=43466041;WS=43466023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,11:0.33:33
chr22	43520258	rs4988417	A	C	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.838;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.90;ReadPosRankSum=-0.618;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr22	43520263	rs2076079	A	G	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.667;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.90;ReadPosRankSum=-1.139;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr22	43523921	rs4988434	A	ACT	127.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.680;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=125;ReadPosRankSum=-0.132;SC=GTGCCTTGACACTGGGGCTAT;SOR=1.483;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=4;WE=43523929;WS=43523911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
chr22	43524487	rs4988438	CCT	C	860.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=6;PP=454;ReadPosRankSum=-0.423;SC=GTCCCCCCATCCTCTTTGTCT;SOR=0.604;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=39;TCF=22;TCR=17;TR=12;WE=43524496;WS=43524477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,25:0.38:66
chr22	43529029	rs7402	C	T	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.351;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=106;ReadPosRankSum=-1.035;SC=AGGGGGTCATCGCATTTGAGC;SOR=0.967;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=44;TCF=33;TCR=11;TR=11;WE=43529037;WS=43529019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,15:0.29:52
chr22	43529314	rs13815	G	C	2168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=46;PP=1474;ReadPosRankSum=-0.667;SC=GTATCTATGCGCGTGGACGTT;SOR=0.678;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=232;TCF=124;TCR=108;TR=100;WE=43529322;WS=43529304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,106:0.41:256
chr22	43529517	rs2066910	C	T	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.234;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=9;PP=166;ReadPosRankSum=-0.845;SC=AGGTTTCAGCCGAGCAATGTC;SOR=0.412;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=43;TCF=19;TCR=24;TR=16;WE=43529525;WS=43529507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,16:0.34:47
chr22	43555194	rs3937387	C	G	2799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=33;PP=1531;SC=ATGCCCTCACCCAGCCCTGTC;SOR=1.127;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=60;TCR=33;TR=93;WE=43555202;WS=43555184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr22	43558926	rs6971	A	G	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=10;PP=227;ReadPosRankSum=-1.036;SC=GCTGGCCTTCACGACCACACT;SOR=0.623;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=79;TCF=49;TCR=30;TR=24;WE=43558934;WS=43558916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,30:0.30:99
chr22	43558972	rs6972	G	A	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=12;PP=265;ReadPosRankSum=2.206;SC=CATGGCTGGCGTGGGGGACGG;SOR=0.690;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=94;TCF=57;TCR=37;TR=27;WE=43558980;WS=43558962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,32:0.28:113
chr22	43559137	rs6973	G	T	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.422;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=122;ReadPosRankSum=0.518;SC=CTTCAGAGGTGGCCCCACCTG;SOR=1.745;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=39;TCF=16;TCR=23;TR=10;WE=43559145;WS=43559127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,11:0.23:47
chr22	43564963	rs138931	C	G	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=85;ReadPosRankSum=-1.942;SC=TCAGAACAGCCTCTCAAGAGG;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=8;WE=43564971;WS=43564953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr22	43565703	rs2071727	C	T	534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=1.567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.79;ReadPosRankSum=-0.797;SOR=0.541;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:107,34:0.24:141
chr22	43568512	rs34074034	C	T	1543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FS=2.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.78;ReadPosRankSum=0.450;SOR=0.709;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:227,96:0.30:323
chr22	43570463	rs2269525	A	G	573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.551;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=13;PP=341;ReadPosRankSum=0.567;SC=AGTGCCTAGAAGCCCTGACTG;SOR=0.956;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=115;TCF=65;TCR=50;TR=32;WE=43570471;WS=43570453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,35:0.27:128
chr22	43570659	rs2269526	A	C	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.393;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=110;ReadPosRankSum=-0.103;SC=CCCGGCTCCCAAGTGTCCAAG;SOR=1.515;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=37;TCF=14;TCR=23;TR=9;WE=43570667;WS=43570649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,11:0.24:45
chr22	43572540	rs56878018	A	G	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=128;ReadPosRankSum=-0.081;SC=GCTCGAGACCAGCCTGGCCAA;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=8;WE=43572548;WS=43572530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr22	43575774	rs138945	A	C	3042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=47;PP=1594;SC=CCAAGACATGAGTGCCCATCA;SOR=0.710;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=103;TCF=56;TCR=47;TR=103;WE=43575782;WS=43575764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr22	43575935	rs33970602	C	T	1610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.489;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=38;PP=913;ReadPosRankSum=-1.556;SC=CGAAGCTGGGCACGTCCGCGT;SOR=0.602;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=270;TCF=153;TCR=117;TR=88;WE=43575943;WS=43575925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:200,96:0.32:296
chr22	43576067	rs34630477	C	T	1286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.733;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=37;PP=786;ReadPosRankSum=-1.143;SC=AACTCCCTTCCGGAACCCAGA;SOR=0.568;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=205;TCF=86;TCR=119;TR=66;WE=43576075;WS=43576057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,75:0.32:232
chr22	43576904	rs2071723	G	A	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=12.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.58;ReadPosRankSum=-1.256;SOR=0.079;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,18:0.31:58
chr22	43583051	rs146647114	G	A	423.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.95;ReadPosRankSum=-1.008;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,21:0.84:25
chr22	43600000	rs8141806	C	T	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.81;ReadPosRankSum=-0.955;SOR=0.681;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,27:0.25:110
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chr22	43603665	rs72619549	G	A	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=251;ReadPosRankSum=0.325;SC=GGGGCTTGAGGCCCACGTGCT;SOR=0.876;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=17;WE=43603673;WS=43603655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
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chr22	43606143	rs5759217	C	T	2850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.169;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=56;PP=1643;ReadPosRankSum=-2.358;SC=TTGGGGGAGGCGCGATGTGCC;SOR=0.596;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=172;TCF=95;TCR=77;TR=121;WE=43606151;WS=43606124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,131:0.66:197
chr22	43608531	rs7284575	C	T	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=8;PP=223;ReadPosRankSum=1.168;SC=CAGGCTGGTACGTGCCCACGG;SOR=0.765;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=65;TCF=39;TCR=26;TR=22;WE=43608539;WS=43608521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,26:0.33:78
chr22	43608673	rs138989	C	T	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=7;PP=100;ReadPosRankSum=-1.171;SC=TCTCAGGCCCCGCTCTTGGCC;SOR=0.703;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=33;TCF=13;TCR=20;TR=13;WE=43608681;WS=43608663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr22	43608690	rs7284854	C	T	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=57;ReadPosRankSum=-1.156;SC=GGCCCTTGCCCGGCCCTGGAA;SOR=0.754;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=7;WE=43608698;WS=43608680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr22	43610207	rs138993	A	G	3269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=61;NR=51;PP=1846;SC=GGCATACATGACACACACTGG;SOR=0.709;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=112;TCF=61;TCR=51;TR=112;WE=43610215;WS=43610197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr22	43614588	rs5759218	A	G	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.691;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=201;ReadPosRankSum=0.943;SC=ACATTCTCACAACAGTCCTGG;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=9;WE=43614596;WS=43614578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr22	43618632	rs139005	CG	C	114.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=2.492;NF=6;NR=1;PP=99;ReadPosRankSum=-1.018;SC=ATGGACAGGCCGGGGGGGTTA;SOR=0.458;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=7;WE=43618640;WS=43618622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,8:0.26:31
chr22	43619200	rs6003114	G	A	801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FS=1.321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.66;ReadPosRankSum=-0.152;SOR=0.716;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:122,50:0.29:172
chr22	43619404	rs6003115	C	G	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.186;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=55;ReadPosRankSum=-0.212;SC=ATGCTGGGCCCAGACAGCTGG;SOR=0.368;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=6;WE=43619412;WS=43619394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr22	43623353	rs129414	G	A	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.575;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=184;ReadPosRankSum=-0.894;SC=GCAGGGGAGGGGCCAGCAGCA;SOR=2.373;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=12;WE=43623361;WS=43623343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,12:0.25:48
chr22	43623395	rs129415	C	G	633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.386;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=11;PP=408;ReadPosRankSum=0.158;SC=CAATCCTTCCCGTTCCAGTGG;SOR=1.272;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=94;TCF=60;TCR=34;TR=35;WE=43623403;WS=43623385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,35:0.34:102
chr22	43623612	rs55853243	G	A	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.627;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=354;ReadPosRankSum=-0.107;SC=CCACCGAGTCGGACAGCATCA;SOR=0.203;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=20;WE=43623620;WS=43623602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,22:0.76:29
chr22	43654225	rs199908092	C	T	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.189;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=151;ReadPosRankSum=-2.809;SC=GCCTACTTACCGATGCACGTG;SOR=1.365;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=55;TCF=43;TCR=12;TR=14;WE=43654233;WS=43654215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,14:0.24:58
chr22	43813942	rs117231932	C	A	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.581;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=281;ReadPosRankSum=0.903;SC=TTCCTCAGAACGCCGCAGCGG;SOR=1.755;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=17;WE=43813950;WS=43813932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr22	43830848	rs6519374	C	T	228.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=211;SC=TGGATCTGAGCGGGATTGATG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=43830856;WS=43830838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr22	43830996	rs2413761	C	T	7668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=145;NR=114;PP=2965;SC=CTCCAGGCTACACCCGCTTCG;SOR=0.852;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=259;TCF=145;TCR=114;TR=259;WE=43831004;WS=43830986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,296:1.00:296
chr22	43831056	rs4331615	C	T	8198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=136;NR=144;PP=2965;ReadPosRankSum=1.808;SC=AGATGCCGTACGGCGACGTGC;SOR=0.822;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=282;TCF=137;TCR=145;TR=280;WE=43831064;WS=43831046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,311:0.99:313
chr22	43894151	.	G	A	1669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=1.472;ClippingRankSum=0.000;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.056;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=49;PP=918;ReadPosRankSum=-0.750;SC=TCAACCTCCCGCGAGGCCAAG;SOR=1.185;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=260;TCF=128;TCR=132;TR=85;WE=43894159;WS=43894141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:197,97:0.33:294
chr22	43976396	rs9614382	G	A	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=9;PP=294;ReadPosRankSum=-0.221;SC=CTTCCTCACAGCCTCCTGTGG;SOR=0.651;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=80;TCF=52;TCR=28;TR=24;WE=43976404;WS=43976386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,22:0.26:84
chr22	43976675	rs4823114	G	A	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.310;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=81;ReadPosRankSum=0.643;SC=TTCGCTGTACGTGCAGACATG;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=7;WE=43976683;WS=43976665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr22	44028174	rs200314912	CTTTTTTTTTT	C	200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.46;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr22	44030935	rs56335524	G	A	1016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.942;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=15;PP=528;ReadPosRankSum=-0.356;SC=GACATGCAGTGTCACCCAGGA;SOR=0.555;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=44;TCR=22;TR=44;WE=44030943;WS=44030925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,49:0.65:75
chr22	44083442	rs5764214	T	C	673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=2.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.21;ReadPosRankSum=-1.115;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,36:0.71:51
chr22	44112845	rs5764234	C	T	2520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=46;PP=1388;SC=GATTCTCCAACGAGACCTCTG;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=39;TCR=46;TR=85;WE=44112853;WS=44112835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr22	44178103	rs74957153	T	C	3505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=60;PP=2169;ReadPosRankSum=0.111;SC=TCCTTGAATATACTCTACACG;SOR=0.658;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=208;TCF=121;TCR=87;TR=141;WE=44178111;WS=44178093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,159:0.67:238
chr22	44229492	rs138069	G	C	2628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=52;NR=33;PP=1309;SC=CAGGGCACCCGGAGGACAGCT;SOR=1.122;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=52;TCR=33;TR=85;WE=44229500;WS=44229482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr22	44236005	rs4149443	G	A	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=2;PP=51;ReadPosRankSum=0.703;SC=AGGAAGGGGTGGGGTTCAGGG;SOR=0.582;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=9;TCF=5;TCR=4;TR=5;WE=44236013;WS=44235995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr22	44258036	rs2269601	G	C	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=4;PP=95;ReadPosRankSum=0.320;SC=CGGCGTCTACGCGGCCGCGCT;SOR=0.435;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=10;WE=44258044;WS=44258026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr22	44280394	rs5764010	C	T	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.883;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=7;PP=121;ReadPosRankSum=0.224;SC=CTGCGCTCATCGTTGTCCGTG;SOR=0.368;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=9;WE=44280402;WS=44280384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr22	44280412	rs5764011	G	T	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.922;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=7;PP=124;ReadPosRankSum=-0.875;SC=GTGAGACAAGGGGTGTATGCC;SOR=0.582;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=9;WE=44280420;WS=44280402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr22	44282276	rs739231	A	G	1880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=43;PP=1094;ReadPosRankSum=-0.006;SC=CCCCCCTTCCAGCGTTGGTCA;SOR=0.645;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=120;TCF=52;TCR=68;TR=77;WE=44282284;WS=44282266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,87:0.64:137
chr22	44282307	rs739232	G	A	1104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=29;PP=643;ReadPosRankSum=-1.712;SC=CCCAGTTTCCGTCAGCCGGGG;SOR=0.772;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=71;TCF=25;TCR=46;TR=44;WE=44282315;WS=44282297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,50:0.62:81
chr22	44283556	rs5764380	A	G	1253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=22;PP=702;ReadPosRankSum=1.809;SC=GGCAAGGGTGAGATGGGCAAG;SOR=0.711;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=83;TCF=45;TCR=38;TR=49;WE=44283564;WS=44283546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,56:0.60:93
chr22	44283676	.	G	GAC	1585.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.621;ClippingRankSum=0.000;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=1732;ReadPosRankSum=2.954;SC=AGGGCTCAGGGCAGGAGCCTG;SOR=0.796;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=20;WE=44283697;WS=44283666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,40:0.68:59
chr22	44283677	.	CAGGAG	C	1582.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=0.000;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.38;ReadPosRankSum=2.662;SOR=0.711;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,40:0.67:60
chr22	44283687	rs143992164	GGCA	G	1473.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.202;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=1886;ReadPosRankSum=2.354;SC=CAGGAGCCTGGGCAGGACCTT;SOR=0.936;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=20;WE=44283697;WS=44283666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,37:0.73:51
chr22	44285667	rs713864	G	A	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=154;ReadPosRankSum=-1.108;SC=CGGGGTTCCAGAGTGCACTCA;SOR=0.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=13;WE=44285675;WS=44285657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr22	44285765	rs2017461	A	G	1053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=14;PP=472;ReadPosRankSum=-2.769;SC=AAGAGTCAGCAGGAACACAAC;SOR=0.665;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=68;TCF=41;TCR=27;TR=39;WE=44285773;WS=44285755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,50:0.62:81
chr22	44287062	rs2071884	A	G	1397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.895;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=24;PP=739;ReadPosRankSum=-0.048;SC=GGGGCAGAGCATCCTGCAGCT;SOR=0.545;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=47;TCR=34;TR=57;WE=44287070;WS=44287052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,62:0.71:87
chr22	44287629	rs74445350	G	A	2686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=55;PP=1349;ReadPosRankSum=0.325;SC=AACCGTAGATGCGGCGGGCGC;SOR=0.682;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=152;TCF=72;TCR=80;TR=104;WE=44287637;WS=44287612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,121:0.70:174
chr22	44324676	rs139051	A	G	4387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=65;PP=2484;SC=GCTCTCGCCTATAACTTCTCT;SOR=0.782;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=145;TCF=80;TCR=65;TR=145;WE=44324684;WS=44324666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr22	44341986	rs2294917	T	C	1461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=14;PP=759;SC=GACTGCACACTGCAGCAGCGG;SOR=1.358;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=28;TCR=14;TR=42;WE=44341994;WS=44341976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr22	44342116	rs2294918	A	G	4500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=62;PP=2572;SC=CTGCTCCCCCAAGGGCTGTCC;SOR=0.845;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=148;TCF=86;TCR=62;TR=147;WE=44342124;WS=44342106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr22	44351351	rs2294920	T	C	1898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.01;SOR=1.032;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr22	44364594	rs5764434	C	T	4696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=94;NR=61;PP=2658;SC=CCTTGTTTTTCTTCCCCCATT;SOR=0.932;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=155;TCF=94;TCR=61;TR=155;WE=44364602;WS=44364584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr22	44364794	rs2273031	T	C	149.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=6;PP=114;SC=AGCAGAGCACTGCTCCCTGCT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=44364802;WS=44364784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr22	44368039	rs6006595	T	C	2844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=37;PP=1564;SC=CAGATTGCTTTTTGTCTTTTT;SOR=0.853;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=54;TCR=37;TR=91;WE=44368047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr22	44368204	rs3177036	A	G	1325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=23;PP=702;SC=CCATGGTTGGAAACAATGAAG;SOR=1.345;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=17;TCR=23;TR=40;WE=44368212;WS=44368194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr22	44372069	rs2073084	G	A	4926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=71;PP=2712;SC=TTTCGGTAACGGTTTCTCTTA;SOR=0.715;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=157;TCF=86;TCR=71;TR=157;WE=44372077;WS=44372059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr22	44372190	rs2073085	C	T	875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=24;PP=656;SC=TCCACAGTGGCGGCCCCCACT;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=26;WE=44372198;WS=44372180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr22	44372632	rs14315	C	T	4862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=80;NR=71;PP=2454;SC=TCTTTCAGCACGCCATGGTCA;SOR=0.808;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=151;TCF=80;TCR=71;TR=151;WE=44372640;WS=44372622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr22	44377442	rs4823182	A	G	572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=18;PP=480;SC=TTAGGAGAGCATAGTATTTCA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=44377450;WS=44377432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr22	44379822	rs10452	T	C	5984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=104;PP=2965;SC=GGTTTTACCTTGGGGGACCCA;SOR=0.958;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=197;TCF=93;TCR=104;TR=197;WE=44379830;WS=44379812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
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chr22	44384881	rs16991288	G	C	1133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=10;PP=819;SC=CTCCAGCACTGTGTGGCGTTG;SOR=1.923;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=36;WE=44384889;WS=44384871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
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chr22	44395451	rs1007863	T	C	4637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=75;PP=2459;SC=TTCCTGCAGCTGGGGCCTGTG;SOR=0.728;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=162;TCF=86;TCR=76;TR=160;WE=44395459;WS=44395441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr22	44420118	rs111806469	C	G	71.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=17.76;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr22	44420156	rs112388263	T	A	236.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=1;PP=135;SC=GCCCTCGGCCTCTCCCCGGGG;SOR=2.093;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=44420164;WS=44420146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr22	44465036	rs73888833	C	T	814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=15;PP=485;ReadPosRankSum=-1.029;SC=CTGCACCCTCCTCGCCAGTGA;SOR=0.584;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=53;TCF=31;TCR=22;TR=34;WE=44465044;WS=44465026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,37:0.63:59
chr22	44489868	rs1983609	T	C	2854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=56;PP=1462;SC=CCCGCCCTGGTGGATGTTCAC;SOR=1.423;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=38;TCR=56;TR=94;WE=44489876;WS=44489858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr22	44489896	rs738479	T	C	2065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=43;PP=1082;SC=ACACCCAGCTTGGTACGGGGG;SOR=1.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=24;TCR=43;TR=67;WE=44489904;WS=44489886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr22	44514809	rs5764541	C	T	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=36;ReadPosRankSum=1.068;SC=GCTGTGGTCCCGGTGGTGGCT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=4;WE=44514817;WS=44514799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr22	44515806	rs761166	G	C	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.304;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=58;ReadPosRankSum=0.465;SC=GGCAAAGAACGGAAGAGCAGA;SOR=0.859;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=6;WE=44515814;WS=44515796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr22	44559645	rs139079	C	T	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=92;ReadPosRankSum=-0.632;SC=TGCAGAGGCTCGGTCCTGTCC;SOR=0.593;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=10;WE=44559653;WS=44559635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr22	44559842	rs139081	A	G	899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.092;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=22;PP=550;ReadPosRankSum=-0.153;SC=CCCCCGGGAGAGGTGCGCACG;SOR=0.438;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=132;TCF=61;TCR=71;TR=43;WE=44559850;WS=44559832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,50:0.34:149
chr22	44564297	rs139095	A	C	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.050;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=115;ReadPosRankSum=0.481;SC=AGCTCTCACAAAACCTGTGTG;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=7;WE=44564305;WS=44564288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr22	44564402	rs6006687	G	A	1154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.930;HP=1;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=20;PP=1749;ReadPosRankSum=-1.756;SC=GTGTCATGCTGGAGACGTGGC;SOR=0.906;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=77;TCF=48;TCR=29;TR=52;WE=44564415;WS=44564392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,53:0.67:79
chr22	44564407	rs139096	C	T	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.947;HP=1;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=9;PP=772;ReadPosRankSum=1.510;SC=ATGCTGGAGACGTGGCTTCTG;SOR=0.453;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=83;TCF=51;TCR=32;TR=24;WE=44564415;WS=44564392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,27:0.31:88
chr22	44582499	rs79478	T	C	5616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=91;PP=2965;SC=GGACACCATCTGTGGTCTTGC;SOR=0.773;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=182;TCF=91;TCR=91;TR=182;WE=44582507;WS=44582489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr22	44586522	rs2272942	C	T	2965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.220;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=77;PP=1901;ReadPosRankSum=-1.283;SC=CAACCAACGTCCAGGTGGAGG;SOR=0.942;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=205;TCF=85;TCR=120;TR=129;WE=44586530;WS=44586512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,136:0.63:217
chr22	44589857	rs139142	T	G	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=-1.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=218;ReadPosRankSum=-1.095;SC=TTGTCCCTCTTTCTGTCTGTC;SOR=0.504;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=38;TCF=9;TCR=29;TR=17;WE=44589865;WS=44589847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,20:0.45:44
chr22	44594476	rs139151	T	C	4729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=57;PP=2965;SC=TTCCATGTGATTGTCTCCAGT;SOR=1.329;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=161;TCF=104;TCR=57;TR=161;WE=44594484;WS=44594466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr22	44594584	rs139152	C	G	3991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=87;PP=2519;ReadPosRankSum=1.622;SC=ACCTCACTCCCAACTCTCCTG;SOR=0.691;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=278;TCF=134;TCR=144;TR=170;WE=44594592;WS=44594574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,187:0.60:314
chr22	44601499	rs139184	C	G	663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=8;PP=447;ReadPosRankSum=-1.426;SC=TGGTCGTGGTCAGGGATGCCC;SOR=0.659;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=49;TCR=18;TR=29;WE=44601507;WS=44601489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,31:0.43:72
chr22	44602001	rs139185	G	T	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.943;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=91;ReadPosRankSum=0.336;SC=ATTCAGAGGAGGACTGGCCAG;SOR=0.693;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=7;WE=44602009;WS=44601991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr22	44602172	rs3842785	T	C	2309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.248;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=49;PP=1179;ReadPosRankSum=0.781;SC=CCTGACTGGCTGCCCTGCCCT;SOR=0.814;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=147;TCF=74;TCR=73;TR=96;WE=44602180;WS=44602162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,108:0.64:169
chr22	44602229	rs139186	A	C	3822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=70;PP=2129;SC=GAGCACACTGAGGGTGCTCTA;SOR=0.934;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=132;TCF=61;TCR=71;TR=131;WE=44602237;WS=44602219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr22	44681418	.	TGGGGCCCGCTGACCCGGCCGA	T	1942.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.221;ClippingRankSum=0.000;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.810;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.883;NF=6;NR=13;PP=2963;ReadPosRankSum=-0.326;SC=GCTGCGGCTGTGGGGCCCGCT;SOR=0.727;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=52;TCF=18;TCR=34;TR=19;WE=44681446;WS=44681408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,50:0.57:87
chr22	44681612	rs135388	A	G	1947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.221;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=51;PP=1349;ReadPosRankSum=-0.536;SC=ACTCCCAACAAGGCGGTGTAA;SOR=1.048;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=133;TCF=54;TCR=79;TR=81;WE=44681620;WS=44681602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,83:0.60:138
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chr22	44967767	rs138596	C	G	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.506;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=150;ReadPosRankSum=0.659;SC=AGAGAAATAACGAGGCCCGAA;SOR=0.105;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=10;WE=44967775;WS=44967757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,11:0.35:31
chr22	45075738	rs763213	T	C	885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.646;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=21;PP=401;ReadPosRankSum=-0.090;SC=CCGGAAAAGATGCCGGCGCAG;SOR=0.630;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=63;TCR=60;TR=43;WE=45075746;WS=45075728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,51:0.37:139
chr22	45127435	rs2269572	G	T	188.56	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.221;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5210;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=81;ReadPosRankSum=0.967;SC=TAAGCAGTGGGCCCAGGGCCA;SOR=0.859;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=6;WE=45127443;WS=45127425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr22	45128232	rs8141631	T	C	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.48;ReadPosRankSum=-1.239;SOR=0.828;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,18:0.26:70
chr22	45128288	rs5764979	G	C	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.783;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=3;PP=59;ReadPosRankSum=-0.870;SC=ACAGTGGGCAGAGGGTCGGGC;SOR=0.577;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=22;TCF=11;TCR=11;TR=8;WE=45128296;WS=45128278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr22	45128449	rs5764980	G	T	106.88	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5103;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=66;ReadPosRankSum=-0.210;SC=AGCTGTGGGTGCAGGAGAGCT;SOR=0.941;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=5;WE=45128457;WS=45128439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr22	45131053	rs2269573	G	A	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.46;ReadPosRankSum=1.608;SOR=0.619;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,14:0.26:54
chr22	45132687	rs36082900	G	A	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.842;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=11;PP=382;ReadPosRankSum=0.156;SC=CTCGGGGGACGTGCTGGCCAA;SOR=0.576;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=78;TCF=53;TCR=25;TR=33;WE=45132695;WS=45132677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,36:0.42:86
chr22	45133238	rs3329	A	G	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=29;ReadPosRankSum=1.465;SC=CGCCAGCCCTATCGGCCTCGT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=3;WE=45133246;WS=45133228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr22	45182157	rs9614930	C	G	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.494;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=22;ReadPosRankSum=0.240;SC=TCGGCTGAGGCAGGGCGCCTA;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=3;WE=45182165;WS=45182149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr22	45182165	rs9614931	C	A	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.044;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.72;ReadPosRankSum=-0.229;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr22	45182186	.	CAGGGCGCGTAGTGGGTGCACGGCTGAGGT	C	483.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.884;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=4.672;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.75;ReadPosRankSum=-0.406;SOR=1.510;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,16:0.36:45
chr22	45182321	rs67401095	ATCT	A	995.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.777;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=679;ReadPosRankSum=-0.471;SC=ACTTCCTTTAATCTTCTTTGC;SOR=1.675;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=53;TCF=11;TCR=42;TR=19;WE=45182343;WS=45182311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,29:0.35:82
chr22	45198009	rs2239813	A	G	2699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=57;PP=1567;ReadPosRankSum=0.849;SC=GCCGGATGCCACCCTCCCACG;SOR=0.655;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=163;TCF=76;TCR=87;TR=107;WE=45198017;WS=45197999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,122:0.65:187
chr22	45204520	rs35386894	AT	A	55.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.614;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=2.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.64;ReadPosRankSum=0.236;SOR=0.707;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr22	45204587	.	T	G	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.180;ClippingRankSum=-0.000;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.97;ReadPosRankSum=1.068;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr22	45218223	rs136662	C	T	3232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=45;PP=1761;SC=CCTAATCGTTCTTTATTCTCT;SOR=0.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=60;TCR=45;TR=104;WE=45218231;WS=45218213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr22	45221423	rs3209476	A	T	2167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.964;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=28;PP=1101;ReadPosRankSum=1.716;SC=CCAAGACACCACCGCCGCGGC;SOR=0.950;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=134;TCF=83;TCR=51;TR=82;WE=45221431;WS=45221413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,99:0.64:155
chr22	45221663	rs117124773	G	A	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.397;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=110;ReadPosRankSum=1.510;SC=GGGGGGGCGCGTGCTCGCTGC;SOR=0.175;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=8;WE=45221671;WS=45221653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr22	45241303	rs16992952	C	T	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.066;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=182;ReadPosRankSum=1.326;SC=GGATCCTGAGCACCCACAAGC;SOR=0.283;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=14;WE=45241311;WS=45241293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,16:0.70:23
chr22	45244930	rs2269543	C	T	1377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.429;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=31;PP=726;ReadPosRankSum=0.520;SC=AGCAGATTCTCGGGATCACCT;SOR=0.410;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=160;TCF=72;TCR=88;TR=61;WE=45244938;WS=45244920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,73:0.40:182
chr22	45255769	rs11704168	C	T	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.391;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=646;ReadPosRankSum=1.489;SC=CCCTCCCATGCTGGGCCCGCA;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=32;TCF=12;TCR=20;TR=20;WE=45255779;WS=45255759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,22:0.63:35
chr22	45255771	rs2213529	G	C	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=258;ReadPosRankSum=-1.311;SC=CTCCCATGCTGGGCCCGCATG;SOR=0.443;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=31;TCF=11;TCR=20;TR=10;WE=45255779;WS=45255759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,11:0.35:31
chr22	45258324	rs2071762	C	T	3472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.528;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=62;PP=2068;ReadPosRankSum=0.678;SC=TTCAGCACCCCGGAGGCACCT;SOR=0.773;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=205;TCF=112;TCR=93;TR=142;WE=45258332;WS=45258314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,154:0.69:224
chr22	45258457	rs8881	A	G	806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.899;NF=21;NR=25;PP=465;ReadPosRankSum=1.400;SC=CCCTGATGGCAGCCAGAAGAC;SOR=0.699;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=156;TCF=73;TCR=83;TR=46;WE=45258465;WS=45258447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,54:0.29:186
chr22	45258491	rs66912386	GTATA	G	3467.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.987;NF=2;NR=42;PP=2095;ReadPosRankSum=2.761;SC=CGAACACTCTGTATATTTCGA;SOR=0.699;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=66;TCF=3;TCR=63;TR=44;WE=45258502;WS=45258481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,87:0.68:128
chr22	45258539	rs2071763	G	A	899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.972;HP=5;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=24;PP=527;ReadPosRankSum=-0.646;SC=TGTATGTTTTGTAAACTTGGC;SOR=0.170;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=44;TCF=12;TCR=32;TR=35;WE=45258547;WS=45258529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,39:0.80:49
chr22	45316507	rs4823420	T	A	444.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=16;PP=375;ReadPosRankSum=0.825;SC=TTATGATTTTTAAAAAATCAC;SOR=0.836;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=36;TCF=11;TCR=25;TR=24;WE=45316515;WS=45316497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,21:0.62:34
chr22	45404595	.	C	A	644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.394;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=343;ReadPosRankSum=1.261;SC=ACGGGCGGGGCCGGCCGCAGC;SOR=1.109;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=10;TCR=17;TR=23;WE=45404603;WS=45404585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,27:0.84:32
chr22	45577372	rs372438307	TCAAGTGGAACAGGAAAGAATTCTTGGCCAGTTTATTTA	TTGGAACAGGAAAGAATTCTTGGCCAGTTTATTTA,T	1089.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.51;BaseQRankSum=-1.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.501;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=3;PP=2261;ReadPosRankSum=-0.922;SC=TTGCCTGCTCTCAAGTGGAAC;SOR=0.352;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=4;WE=45577419;WS=45577362;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.76:37
chr22	45577377	rs376698610	TGGAACAGGAAAGAATTCTTGGCCAGTTTATTTAA	T	1084.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-3.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=30.13;ReadPosRankSum=-1.107;SOR=0.420;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,28:0.78:36
chr22	45577411	.	A	T	442	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.51;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=1;NR=3;PP=442;QD=119.192803137;SC=AGTTTATTTAAAAATCCAGTT;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=4;WE=45577419;WS=45577362;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr22	45579422	rs6006950	A	G	1760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.398;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=32;PP=1088;ReadPosRankSum=2.453;SC=TTTTTCAGTTAGCACAAAATC;SOR=0.780;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=110;TCF=62;TCR=48;TR=75;WE=45579430;WS=45579412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,80:0.65:124
chr22	45595721	rs5765217	A	G	4492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.38;SOR=0.727;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr22	45598833	rs732373	C	T	938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.528;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=14;PP=529;ReadPosRankSum=0.340;SC=GTGAACTTGACGGATGGGAGC;SOR=1.047;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=100;TCF=60;TCR=40;TR=42;WE=45598841;WS=45598823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,47:0.42:112
chr22	45622014	rs6007506	C	T	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=125;ReadPosRankSum=1.870;SC=AGAGAGCACGCGGCAGCCTCT;SOR=0.495;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=10;WE=45622022;WS=45622004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr22	45685002	rs1135360	A	G	4125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=64;NR=66;PP=2121;SC=CCCTGTGGTCAGACCCCATCC;SOR=0.853;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=130;TCF=64;TCR=66;TR=130;WE=45685010;WS=45684992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr22	45691594	rs1057356	A	G	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=263;ReadPosRankSum=1.172;SC=GCAAGCTCCAAGACTGAGCCC;SOR=0.798;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=84;TCF=40;TCR=44;TR=24;WE=45691602;WS=45691584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,23:0.25:92
chr22	45718922	rs34063912	C	CTG	45.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=147;ReadPosRankSum=0.908;SC=TCAGAGGGGACTGTGTGTGTG;SOR=1.112;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=6;WE=45718931;WS=45718912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr22	45723854	rs9615108	C	G	5407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=91;NR=90;PP=2965;SC=GCGCCATGGTCCTGACCACCA;SOR=0.796;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=181;TCF=91;TCR=90;TR=181;WE=45723862;WS=45723844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr22	45723960	rs9614638	G	A	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.00;MQRankSum=2.054;QD=24.52;ReadPosRankSum=-1.877;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr22	45723968	rs28412847	C	T	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.77;MQRankSum=1.299;QD=26.90;ReadPosRankSum=-1.169;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr22	45724248	.	C	T	556	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.61;FR=0.5108;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MMLQ=27;MQ=40.04;NF=23;NR=17;PP=556;QD=14.7692803137;SC=CCATGGAGTCCCTGGACTTGA;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=45;TCF=25;TCR=20;TR=40;WE=45724256;WS=45724238;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,40:0.89:45
chr22	45726345	rs7285172	A	G	809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=1;PP=678;SC=TTTTGAAGGTATAAGTGTAAA;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=24;WE=45726353;WS=45726335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr22	45731182	rs738176	C	T	1952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=20;PP=1336;SC=CCGAGGAGGACGAGCTCTTGG;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=46;TCR=20;TR=66;WE=45731190;WS=45731172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr22	45732328	rs11704481	G	A	3218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=59;PP=1970;SC=GAGCTGCCTCGGGTCTCTCTT;SOR=1.290;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=40;TCR=59;TR=99;WE=45732336;WS=45732318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr22	45736153	rs3827393	G	A	274.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=227;SC=GGTTTTCAAAGTCTTCCGTAC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=45736161;WS=45736143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr22	45736485	rs2064068	C	T	870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=25;PP=679;SC=AGGAGGGTGACGCGGACACAT;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=45736493;WS=45736475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr22	45741537	rs56343022	T	G	1521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=5.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.63;ReadPosRankSum=-1.206;SOR=1.306;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,64:0.62:104
chr22	45741543	rs5765260	G	C	3503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.50;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr22	45748284	rs11375006	C	CT	3964.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=27;PP=2043;SC=GGAAGGTCCCCTGGCTTCTGC;SOR=1.049;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=23;TCR=28;TR=49;WE=45748292;WS=45748274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr22	45748339	rs5765275	A	G	3574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=47;PP=1942;SC=ACCTGTGCACAGCAAACAGGA;SOR=0.953;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=59;TCR=47;TR=106;WE=45748347;WS=45748329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr22	45749983	rs5764698	G	T	7148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=125;NR=114;PP=2965;SC=TGCCTACACAGTCTGGCTTCC;SOR=0.700;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=239;TCF=125;TCR=114;TR=239;WE=45749991;WS=45749973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,275:1.00:275
chr22	45754517	rs5764701	G	T	626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=17;NR=2;PP=343;SC=AAAATGATTCGGTAAGATTTA;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=45754525;WS=45754507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr22	45754558	rs5765281	A	G	930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=9;PP=549;SC=GTGATAAACAACAGAAAGCTT;SOR=1.483;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=23;TCR=9;TR=32;WE=45754566;WS=45754548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr22	45755666	rs1012493	C	T	7294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=144;NR=97;PP=2965;SC=ACATATTTTACAGTCATTTGC;SOR=1.084;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=241;TCF=144;TCR=97;TR=241;WE=45755674;WS=45755656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,269:1.00:269
chr22	45757987	rs5764704	C	T	441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=253;SC=TATGTGCTACCTGACCTTCCA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=45757995;WS=45757977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr22	45758758	rs719925	T	C	4296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=64;PP=2655;SC=TACCCATTATTAATTACCTTC;SOR=0.733;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=135;TCF=71;TCR=64;TR=135;WE=45758766;WS=45758748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr22	45789642	rs136603	A	C	1835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=35;PP=1091;SC=TCTTCATTAAATTCAGACATT;SOR=1.437;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=20;TCR=35;TR=55;WE=45789650;WS=45789632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr22	45810278	rs59404993	A	AC	5830.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=58;PP=2936;SC=TAGACATGAAACTTTGGTGAG;SOR=0.811;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=8;TCR=59;TR=66;WE=45810286;WS=45810268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr22	45897997	rs3810631	T	C	1145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=29;NR=5;PP=797;SC=CCCAGTGGCGTTCCTATGCGT;SOR=3.442;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=34;WE=45898005;WS=45897987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr22	45898074	rs3810632	T	C	5063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=102;NR=69;PP=2965;SC=ATAAATCTACTTGTGGTTCCA;SOR=0.967;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=171;TCF=102;TCR=69;TR=171;WE=45898082;WS=45898064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr22	45898117	rs3810633	T	C	7331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=136;NR=116;PP=2965;SC=CCCCGGTAGCTATGAATTCCT;SOR=0.745;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=252;TCF=136;TCR=116;TR=252;WE=45898138;WS=45898107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,277:1.00:277
chr22	45898130	rs3810634	A	T	7067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=130;NR=116;PP=2965;SC=GAATTCCTATACAAGAGGCTC;SOR=0.716;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=246;TCF=130;TCR=116;TR=246;WE=45898138;WS=45898107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,269:1.00:269
chr22	45898252	rs3810635	T	G	1077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=32;PP=892;SC=ATTTTGGTTGTTTGTTGGCCT;SOR=4.235;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=35;WE=45898260;WS=45898242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr22	45914714	rs147635694	G	C	906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.407;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=25;PP=562;ReadPosRankSum=-1.652;SC=TGTTCCTTTAGAGAAAAGTGG;SOR=0.474;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=110;TCF=47;TCR=63;TR=45;WE=45914722;WS=45914704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,48:0.38:125
chr22	45918877	rs2018279	A	T	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.416;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=9;PP=465;ReadPosRankSum=0.301;SC=AGAAAGTAATAAGTCCGTCTG;SOR=1.095;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=50;TCF=32;TCR=18;TR=30;WE=45918885;WS=45918867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,33:0.62:53
chr22	45923827	rs136730	A	G	4034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=60;PP=2329;SC=CAGGTCTTCCAGGCATGCTGT;SOR=0.816;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=138;TCF=78;TCR=60;TR=138;WE=45923835;WS=45923817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr22	45924001	rs136731	T	TG	214.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=6;PP=212;SC=CATGTGATCGTGGGGCTGGCA;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=45924009;WS=45923991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr22	45929190	rs2071936	C	T	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.183;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=94;ReadPosRankSum=0.280;SC=TTCTCGTGTTCGCTGGAGTTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=6;WE=45929198;WS=45929180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr22	45929577	rs105199	T	C	2275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=26;PP=1485;SC=CACATTCCTTTCTAGGATGTA;SOR=1.347;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=51;TCR=26;TR=77;WE=45929585;WS=45929567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr22	45929594	rs3216851	TG	T	2505.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=25;PP=1660;ReadPosRankSum=-1.013;SC=TGTATTAGGATGGGTCGTTCT;SOR=0.635;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=67;TCF=31;TCR=36;TR=46;WE=45929602;WS=45929584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,81:0.71:114
chr22	45931262	rs2071938	C	T	1156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=28;PP=763;SC=CCAGGAGGGGCCAGCGACCTA;SOR=2.038;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=11;TCR=28;TR=39;WE=45931270;WS=45931252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr22	45961213	rs1118	C	T	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=69;ReadPosRankSum=-1.148;SC=CTTTGAGCTGCACCTGCCCCA;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=7;WE=45961221;WS=45961203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr22	46096333	rs190007232	G	A	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=73;ReadPosRankSum=0.420;SC=TATAAAGTTCGAAAACAGGAA;SOR=0.582;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=7;WE=46096341;WS=46096323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,8:0.29:28
chr22	46114244	rs2071852	C	T	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.226;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=277;ReadPosRankSum=-0.207;SC=GGGCATGTCTCTTTTACTATG;SOR=1.105;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=71;TCF=52;TCR=19;TR=20;WE=46114252;WS=46114234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,26:0.32:80
chr22	46114398	rs138156	G	T	1161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.472;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=30;PP=609;ReadPosRankSum=-2.238;SC=AGCGTGGTCTGGAGTATTTAG;SOR=0.983;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=179;TCF=82;TCR=97;TR=52;WE=46114406;WS=46114388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,66:0.33:201
chr22	46156234	rs9614515	C	T	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.362;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.393;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=20;ReadPosRankSum=-0.210;SC=TATTCAACATCGTTCCCTTTA;SOR=0.061;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=4;WE=46156242;WS=46156224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr22	46189432	rs11431850	A	AT	450.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.985;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=457;ReadPosRankSum=0.915;SC=AAGCTCTTCAATCTTTCTGTG;SOR=1.236;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=12;WE=46189440;WS=46189422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,17:0.35:49
chr22	46207701	rs9614521	T	C	713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.452;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=24;PP=389;ReadPosRankSum=1.499;SC=ATTCATTCAGTGTCATGATCT;SOR=0.881;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=125;TCF=60;TCR=65;TR=39;WE=46207709;WS=46207691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,44:0.31:143
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chr22	46931838	rs1009155	G	A	3540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.571;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=66;PP=2030;ReadPosRankSum=0.306;SC=CCGCCCGTGTGCTCACCACGC;SOR=0.617;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=183;TCF=94;TCR=89;TR=134;WE=46931846;WS=46931828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,153:0.73:210
chr22	47033628	rs138469	A	AT	159.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.944;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=138;ReadPosRankSum=0.992;SC=TCCCTTTCACATGCCACTGCT;SOR=0.160;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=4;WE=47033636;WS=47033618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr22	47057191	rs2076707	C	T	4885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=0.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.26;ReadPosRankSum=-0.306;SOR=0.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,121:0.72:167
chr22	47057197	rs2076708	C	T	5066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FS=0.614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.69;ReadPosRankSum=0.811;SOR=0.605;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,129:0.70:183
chr22	47058992	rs2542040	T	C	3313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=53;PP=1734;SC=ACGAGCGGTTTGGGGAGTACG;SOR=0.774;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=114;TCF=60;TCR=54;TR=113;WE=47059000;WS=47058982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr22	47059597	rs2542035	A	G	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-3.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.715;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=172;ReadPosRankSum=-0.936;SC=GTGCATGGCCATTCTGTGCAC;SOR=0.197;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=12;WE=47059605;WS=47059587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,17:0.77:22
chr22	47064164	rs2748338	C	A	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.363;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=97;ReadPosRankSum=-0.189;SC=CGCCGGCCTCCGCTGCTGCCT;SOR=1.609;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=7;WE=47064172;WS=47064154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr22	47064665	rs9616088	C	T	1450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.945;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=52;PP=1320;ReadPosRankSum=-2.293;SC=CTGCGGCGCCCGCCCGGCCTG;SOR=0.973;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=122;TCF=40;TCR=82;TR=72;WE=47064673;WS=47064655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,69:0.63:110
chr22	47064837	rs2076711	A	C	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.388;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.282;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=55;ReadPosRankSum=-0.494;SC=CTGTAGCTTCAGGAGGAGGGA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=5;WE=47064845;WS=47064827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr22	47068929	rs11350999	TG	T	94.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=3.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.92;ReadPosRankSum=-0.972;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr22	47068935	rs135662	G	T	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=5.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.12;ReadPosRankSum=-1.112;SOR=0.027;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr22	47070432	rs2073275	G	C	750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.474;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=499;ReadPosRankSum=-1.771;SC=CTCACTGTGGGTGTGACGTGA;SOR=0.052;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=39;TCF=31;TCR=8;TR=30;WE=47070440;WS=47070422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,31:0.77:40
chr22	47070747	rs34212133	G	T	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.769;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=56;ReadPosRankSum=0.778;SC=AGGTTTTCCTGAGTGGTGGCC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=5;WE=47070755;WS=47070737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr22	47071531	rs2073276	T	C	1791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=46;PP=1233;ReadPosRankSum=-0.628;SC=CCCTATAGACTTCTGCCAGCC;SOR=0.761;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=94;TCF=33;TCR=61;TR=70;WE=47071539;WS=47071521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,74:0.74:100
chr22	47072477	rs2236028	G	A	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.65;ReadPosRankSum=0.843;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,43:0.49:87
chr22	47095235	rs13057352	C	A	5572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=419;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.538;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=126;NR=104;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.935;SC=TGGCAAGACCCAACCACCGTT;SOR=0.634;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=379;TCF=210;TCR=169;TR=230;WE=47095243;WS=47095225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,258:0.62:419
chr22	47095409	rs6007953	C	G	1030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=29;PP=838;SC=CCTCCAGCCCCGCCCCATCCA;SOR=5.549;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=31;WE=47095417;WS=47095399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr22	47134147	.	G	GGCGGGCT	370.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.64;QD=46.34;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr22	47185265	rs801606	G	T	3603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=36;PP=2109;SC=CTCGTGATCCGCCCGCCTCGG;SOR=1.420;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=75;TCR=36;TR=111;WE=47185273;WS=47185255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr22	47274638	rs131869	C	T	1706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=36;PP=1119;SC=CACCGCACCGCCCATCAGCGC;SOR=1.536;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=21;TCR=36;TR=57;WE=47274646;WS=47274628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr22	47311404	rs738935	A	T	2240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=36;PP=1443;SC=TGCAGCTGCCAGTGGCACTAG;SOR=0.718;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=42;TCR=36;TR=78;WE=47311412;WS=47311394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr22	47370060	rs4436	A	G	1183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=16;PP=759;SC=TCATTTAGCTAGACTGATGAG;SOR=1.127;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=22;TCR=16;TR=38;WE=47370068;WS=47370050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr22	47857656	rs202008662	TTA	T	533.06	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.875;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=23.18;ReadPosRankSum=2.838;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,20:0.87:23
chr22	47859199	rs2294230	C	T	1580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=27;PP=840;SC=CTCAGTGCCGCGGAGAAAAGA;SOR=1.123;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=23;TCR=27;TR=50;WE=47859207;WS=47859189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr22	47859284	.	T	TG	115.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.097;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=87;ReadPosRankSum=0.175;SC=TTCTGAGTCCTGGGGGGCATT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=47859292;WS=47859274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr22	48023241	rs8137874	G	T	2115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=15;PP=1438;SC=TGCAGAAGTGGGTCTGGCCCA;SOR=2.211;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=56;TCR=15;TR=71;WE=48023249;WS=48023231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr22	48896580	rs10460766	G	A	550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=2;PP=389;SC=CCAGCCTGCCGTCGCCGCCTC;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=48896588;WS=48896570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr22	48940553	rs4823540	T	C	6041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=105;NR=99;PP=2965;SC=CACTCCGGGCTGCGGGGAGGC;SOR=0.702;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=204;TCF=105;TCR=99;TR=204;WE=48940561;WS=48940543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr22	48940644	rs9615919	C	T	4318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=73;NR=80;PP=2639;SC=TGGGGTCCCACGCTGCCTCTG;SOR=0.836;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=153;TCF=73;TCR=80;TR=153;WE=48940652;WS=48940634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr22	48942566	rs739155	G	A	484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=16;PP=436;SC=TGCAGTTCTGGAAAGGCTCAC;SOR=5.549;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=48942574;WS=48942556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr22	48972204	rs139257794	C	T	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=164;ReadPosRankSum=1.658;SC=AGCGGGCGGCCGCGGAGGCTG;SOR=0.616;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=9;WE=48972212;WS=48972194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr22	48972536	rs147114256	C	G	55.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.43;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr22	49042294	rs9617472	C	T	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.044;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=181;ReadPosRankSum=-1.294;SC=GAAGCGGTCTCCCTGCCCTGT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=9;WE=49042302;WS=49042284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr22	49042316	rs9617407	T	C	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=55;ReadPosRankSum=0.292;SC=GCCTGGCTGCTGGGGGCCCCT;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=7;WE=49042324;WS=49042306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr22	49103380	rs130147	A	G	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=25;ReadPosRankSum=0.692;SC=CCCTGGGCCCAGTGTCCCTGT;SOR=0.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=4;WE=49103388;WS=49103370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
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chr22	49246723	rs28394186	A	C	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.980;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=116;ReadPosRankSum=1.004;SC=GCCCAGCCAGAGCCCCCCACA;SOR=0.818;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=9;WE=49246731;WS=49246713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr22	49246747	rs28556787	T	C	137.84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5020;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=93;ReadPosRankSum=0.366;SC=TCGCAGCGGATAGCTAAAGAG;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=6;WE=49246755;WS=49246737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr22	49667985	rs7289562	G	A	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.411;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=227;ReadPosRankSum=-0.254;SC=GAAAGTCCCCGGGCAAACAGG;SOR=1.112;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=51;TCF=36;TCR=15;TR=17;WE=49667993;WS=49667975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,18:0.29:62
chr22	49834624	rs11705513	A	G	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=195;ReadPosRankSum=-0.239;SC=CCCTGTGAGCATCTTTCAGGG;SOR=0.874;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=12;WE=49834632;WS=49834617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr22	49834747	rs1016809	C	T	3680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.963;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=68;PP=2090;ReadPosRankSum=-0.748;SC=CTAGTACCGTCTCCTTCTCCC;SOR=0.778;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=242;TCF=129;TCR=113;TR=150;WE=49834755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,169:0.63:269
chr22	50014002	rs135877	A	G	441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=1;PP=451;SC=CTGCTGTCCCAAGCTTGTCAC;SOR=4.294;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=50014010;WS=50013992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr22	50017234	rs916362	A	G	2787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=64;PP=1673;ReadPosRankSum=-0.668;SC=CACGTGCTGCAGAGCTCAGGG;SOR=0.723;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=180;TCF=81;TCR=99;TR=116;WE=50017242;WS=50017224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,128:0.65:197
chr22	50018045	rs763128	G	A	1718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=9;PP=694;SC=AGTGATGCTCGGGGCTGCTGA;SOR=1.445;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=25;TCR=10;TR=34;WE=50018053;WS=50018035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr22	50018069	rs2011097	A	G	2094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=15;PP=958;SC=TTGTGGGGAGAGCACAGTGAT;SOR=1.445;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=31;TCR=15;TR=46;WE=50018077;WS=50018059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr22	50018497	rs5770594	G	A	3984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=62;NR=59;PP=2051;SC=TGCCTCTGATGACACCCACCT;SOR=0.881;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=121;TCF=62;TCR=59;TR=121;WE=50018505;WS=50018487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr22	50018639	rs4524218	G	A	1044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=18;PP=499;SC=CCCTGACGCCGGGCTGACGGC;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=25;WE=50018662;WS=50018629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr22	50018651	rs135879	C	T	894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.09;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr22	50018654	rs135880	T	A	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.43;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr22	50051007	rs6009803	A	G	1809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.61;SOR=1.263;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr22	50169157	rs138823	A	G	784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.383;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=11;PP=521;ReadPosRankSum=1.552;SC=GACGCTGCTCACCACAGGGAC;SOR=0.398;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=47;TCF=34;TCR=13;TR=35;WE=50169165;WS=50169147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,36:0.73:49
chr22	50169205	rs916418	G	A	1546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=26;PP=995;ReadPosRankSum=0.456;SC=AACCACCCCAGCCGGTCCCCG;SOR=0.703;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=96;TCF=60;TCR=36;TR=65;WE=50169213;WS=50169195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,68:0.67:102
chr22	50169421	rs916419	T	C	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.648;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=298;ReadPosRankSum=0.969;SC=GCTGAGGTCATTGTGAGGCTC;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=13;WE=50169429;WS=50169411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr22	50192174	rs6009878	C	T	5161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=94;PP=2838;ReadPosRankSum=-0.654;SC=GTCACACATGCGGCAGGACAG;SOR=0.713;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=281;TCF=140;TCR=141;TR=188;WE=50192182;WS=50192164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,225:0.69:328
chr22	50277835	rs910796	T	C	4753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=72;PP=2746;SC=AAAATGGCAGTGTGTCTGCCG;SOR=0.728;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=151;TCF=79;TCR=72;TR=151;WE=50277843;WS=50277825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr22	50277883	rs910797	A	G	5404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=77;PP=2965;SC=TGCTTCCACCACAGCCTGCGG;SOR=0.764;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=174;TCF=97;TCR=77;TR=174;WE=50277891;WS=50277873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr22	50278438	rs910798	A	G	3791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=61;PP=2160;SC=CCTCGTCTCCAGTAAAGCCGG;SOR=0.969;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=53;TCR=61;TR=114;WE=50278446;WS=50278428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr22	50278568	rs910799	A	G	4638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=70;PP=2611;SC=TTCCGATGACATAGGGGAGGC;SOR=0.929;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=155;TCF=85;TCR=70;TR=155;WE=50278576;WS=50278558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr22	50278642	rs910800	C	T	5344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=94;PP=2965;SC=TTGAATCTGGCGCCATCTTCC;SOR=0.914;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=174;TCF=80;TCR=94;TR=174;WE=50278650;WS=50278632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr22	50280136	rs5770755	T	C	6868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=128;PP=2965;SC=CCTTCGAGGCTGCGAGCCGGG;SOR=0.910;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=237;TCF=109;TCR=128;TR=237;WE=50280144;WS=50280117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,262:1.00:262
chr22	50312548	.	T	TTTC	1448.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.326;ClippingRankSum=0.000;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.912;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.946;NF=6;NR=15;PP=922;ReadPosRankSum=0.572;SC=TTTAACCAGGTGGGAAGGGGC;SOR=0.699;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=21;WE=50312556;WS=50312538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,38:0.54:70
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chr22	50356302	rs28691713	C	T	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.781;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=260;ReadPosRankSum=-1.844;SC=GGCTCTGCCTCTGTGGTGGGC;SOR=0.050;SbPval=0.1;Source=Platypus;TC=52;TCF=45;TCR=7;TR=18;WE=50356310;WS=50356292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,19:0.36:53
chr22	50356555	rs4078443	T	C	657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.671;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=21;PP=428;ReadPosRankSum=0.153;SC=CTCGCCCTGCTTGGGCCCTCC;SOR=0.911;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=103;TCF=46;TCR=57;TR=34;WE=50356563;WS=50356545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,36:0.32:111
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chr22	50356850	rs1801645	C	T	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.774;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=3;PP=23;ReadPosRankSum=-0.941;SC=CCCTGACTTTCTCCTGCGTGG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=3;WE=50356858;WS=50356840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,3:0.23:13
chr22	50435480	rs5771069	A	G	1207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.853;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=16;PP=631;ReadPosRankSum=-0.822;SC=GGAAGGCAAAAGCAGGGGCGG;SOR=0.514;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=75;TCF=49;TCR=26;TR=45;WE=50435488;WS=50435470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,54:0.64:85
chr22	50436846	rs79102851	G	GTCC	1852.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=24;PP=1361;SC=GTCCAGCGCAGTCCTATGGGT;SOR=1.666;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=26;WE=50436854;WS=50436836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr22	50439194	rs9617090	C	T	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=9;PP=203;ReadPosRankSum=-0.280;SC=TGCTGCCCCCCCTGCTGCCGG;SOR=0.730;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=81;TCF=44;TCR=37;TR=23;WE=50439202;WS=50439178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,29:0.30:98
chr22	50439430	rs137845	A	G	856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=15;PP=539;ReadPosRankSum=0.896;SC=AGGCCGCCCAAGGTTTGATGG;SOR=0.665;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=43;TCF=25;TCR=18;TR=35;WE=50439438;WS=50439420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,37:0.80:46
chr22	50439755	rs137846	G	GCA	121.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.697;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=2;PP=43;ReadPosRankSum=-0.652;SC=CCCTGGGGCTGCAGTCTTTGC;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=2;WE=50439763;WS=50439745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr22	50468907	rs738333	C	G	648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=8;PP=486;SC=GTCTTCAGGCCCCGCAGCACA;SOR=1.697;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=27;WE=50468915;WS=50468897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr22	50471620	rs5845912	AC	A	4127.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=27;NR=35;PP=2516;SC=CAGGTCGCCCACCGCACTGAC;SOR=1.179;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=68;TCF=31;TCR=37;TR=62;WE=50471628;WS=50471610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr22	50479856	rs9617137	A	C	408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=10;PP=269;SC=GACAGACACCACAATACTCAA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=50479864;WS=50479846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr22	50480108	rs9628315	C	T	3545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=42;PP=1980;SC=GTGAGGTCCTCCACGGCATCT;SOR=1.061;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=115;TCF=73;TCR=42;TR=115;WE=50480116;WS=50480098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr22	50483850	rs8138121	T	C	3989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=74;PP=2410;ReadPosRankSum=-0.215;SC=GCCCTATCTGTCCGAGCCAGG;SOR=0.873;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=144;TCF=69;TCR=75;TR=142;WE=50483858;WS=50483840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,155:0.99:157
chr22	50483889	rs8137790	A	G	2293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=46;PP=1339;ReadPosRankSum=-0.078;SC=GGCCAGGGCCACGGAGGCTCC;SOR=0.446;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=34;TCR=47;TR=80;WE=50483897;WS=50483879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,88:0.99:89
chr22	50483926	rs8138277	T	C	1218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=27;PP=835;SC=CCCGCCCTCATAGCCGATGGG;SOR=2.247;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=10;TCR=27;TR=37;WE=50483934;WS=50483916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr22	50485793	rs137906	T	C	1248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=16;NR=30;PP=732;SC=TGGGATGGAGTGAGGCAACCA;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=16;TCR=30;TR=46;WE=50485801;WS=50485783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr22	50487567	rs137911	T	C	304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=2;PP=233;SC=GGCTTTGCCCTCGCCGGGCTG;SOR=1.445;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=50487575;WS=50487557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr22	50499964	rs137919	T	C	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.055;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=612;ReadPosRankSum=0.741;SC=TGCGTTTCCATGCTTGGGGCC;SOR=2.215;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=14;WE=50499975;WS=50499954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr22	50499967	rs2072873	T	C	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.302;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=236;ReadPosRankSum=-0.155;SC=GTTTCCATGCTTGGGGCCAGG;SOR=0.091;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=9;WE=50499975;WS=50499954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr22	50512617	rs2038048	C	T	847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.686;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.777;NF=26;NR=14;PP=553;ReadPosRankSum=0.386;SC=CCCAGAGCGGCGGCGGGCGGG;SOR=0.451;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=101;TCF=70;TCR=31;TR=40;WE=50512625;WS=50512607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,43:0.39:111
chr22	50515766	rs2076137	C	T	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=8;PP=248;ReadPosRankSum=-1.917;SC=CTGAGACCCACCTCGCTCACC;SOR=0.664;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=45;TCR=21;TR=24;WE=50515774;WS=50515756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,29:0.38:77
chr22	50515808	rs2072874	C	T	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=12;PP=330;ReadPosRankSum=1.226;SC=CCCTGCCCTGCGGGGTCAGAA;SOR=0.679;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=51;TCR=35;TR=29;WE=50515816;WS=50515798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,35:0.35:101
chr22	50518239	rs2235349	T	C	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=84;ReadPosRankSum=-1.710;SC=TCACGAGCTGTGAATAACATT;SOR=0.340;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=6;WE=50518247;WS=50518229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr22	50518723	rs79301	A	G	2115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=24;PP=1271;SC=ACTGTCTGTCAGCCCCTCCGG;SOR=1.473;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=76;TCF=52;TCR=24;TR=75;WE=50518731;WS=50518713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr22	50528569	rs12628964	A	T	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=3.405;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.25;MQRankSum=2.151;QD=1.41;ReadPosRankSum=-0.483;SOR=1.089;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,8:0.19:43
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chr22	50552736	rs4240525	T	C	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.684;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=108;ReadPosRankSum=1.348;SC=AGATTAGGTTTTGTGTTTTAT;SOR=0.473;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=7;WE=50552744;WS=50552726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
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chr22	50553514	rs742183	A	T	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=5.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.88;ReadPosRankSum=0.345;SOR=1.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,20:0.21:95
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chr22	50555619	rs138222	C	T	3499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=69;NR=40;PP=1843;SC=TCCTTTTGCTCTGTTTTTCCG;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=69;TCR=40;TR=109;WE=50555627;WS=50555609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr22	50555635	rs882753	C	T	962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FS=2.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.09;ReadPosRankSum=-0.608;SOR=0.883;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,54:0.34:158
chr22	50555686	rs760749	A	C	2124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=0.630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.98;ReadPosRankSum=-1.605;SOR=0.773;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,99:0.65:152
chr22	50555825	rs4838804	T	A	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=28;ReadPosRankSum=0.253;SC=GGCAGTTTTATCTGTGAAGGA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=50555833;WS=50555815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr22	50563708	rs2272833	C	T	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.093;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=209;ReadPosRankSum=1.172;SC=ATCGCCCCACCTGGGGGGCCA;SOR=1.609;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=13;WE=50563716;WS=50563698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr22	50564413	.	A	G	24	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=3;HapScore=2;MGOF=24;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=24;QD=29.3856062736;SC=AGTAGAGATGAGGTTTCGCCG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=50564421;WS=50564403;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr22	50564510	rs9617089	T	C	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.491;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=108;ReadPosRankSum=-0.710;SC=CATGAGCCACTGCACCCAGCC;SOR=0.358;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=32;TCF=22;TCR=10;TR=13;WE=50564518;WS=50564500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr22	50564535	rs5771077	T	C	741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.776;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=450;ReadPosRankSum=-0.202;SC=CCCAGTAACGTTTTATTGAAC;SOR=1.270;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=43;TCF=28;TCR=15;TR=27;WE=50564543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,31:0.66:47
chr22	50564618	rs3830747	A	AT	1197.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.319;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.07;MQRankSum=1.389;NF=15;NR=10;PP=584;ReadPosRankSum=-0.268;SC=ATGGTAATATATTTTTTAACT;SOR=0.865;SbPval=0.07;Source=Platypus;TC=93;TCF=37;TCR=56;TR=25;WE=50564626;WS=50564608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,56:0.35:162
chr22	50566781	rs4838809	T	G	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.862;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=284;ReadPosRankSum=1.804;SC=TTTGATGATGTGTCGCTAGAT;SOR=1.230;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=14;WE=50566789;WS=50566771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr22	50566835	rs13055917	C	T	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.315;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=12;PP=284;ReadPosRankSum=-0.799;SC=ATTGTTTGTTCCTTTTTTAGA;SOR=0.520;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=64;TCF=35;TCR=29;TR=24;WE=50566843;WS=50566825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,27:0.39:70
chr22	50572269	rs146629621	G	A	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.450;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=52;ReadPosRankSum=1.068;SC=CACCGCGCCCGTCCTCTCTAG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=4;WE=50572277;WS=50572262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr22	50572406	rs3736686	A	G	3036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=55;PP=1786;ReadPosRankSum=0.983;SC=ATGTAAGGTTAGTTATTTTAT;SOR=0.718;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=182;TCF=102;TCR=80;TR=123;WE=50572414;WS=50572396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,141:0.66:215
chr22	50572473	rs2340601	G	A	1499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=37;PP=738;ReadPosRankSum=1.083;SC=ACTTGAACACGTCATCCACTT;SOR=0.682;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=211;TCF=110;TCR=101;TR=75;WE=50572481;WS=50572463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,87:0.37:237
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chr22	50588153	rs2272840	G	A	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.81;ReadPosRankSum=0.288;SOR=0.752;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,14:0.24:58
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chr22	50591683	rs738337	G	A	3313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.162;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=72;PP=2068;ReadPosRankSum=-0.350;SC=TGACCGTGTCGGGTAAGGACA;SOR=0.563;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=231;TCF=113;TCR=118;TR=143;WE=50591691;WS=50591673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,155:0.61:254
chr22	50596318	rs34785258	C	CATT	43.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=0;PP=67;ReadPosRankSum=0.967;SC=GCCATTTCATCATTTAACATA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=2;WE=50596326;WS=50596317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr22	50599111	rs2272841	T	C	887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.267;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=7;PP=505;ReadPosRankSum=1.631;SC=CTCTGTGTGCTTTTAGGTACG;SOR=0.296;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=46;TCF=36;TCR=10;TR=31;WE=50599119;WS=50599101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,37:0.73:51
chr22	50599466	rs2272843	C	A	995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.412;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=30;PP=616;ReadPosRankSum=0.080;SC=TTACCTCCTGCACTGCAGTCT;SOR=0.870;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=128;TCF=53;TCR=75;TR=49;WE=50599474;WS=50599456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,53:0.37:143
chr22	50616656	rs7286904	T	C	457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.09;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr22	50616806	rs5771206	A	G	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.674;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=169;ReadPosRankSum=-1.716;SC=ACTGTGGGCTAGGCCTGGCCC;SOR=0.445;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=20;TCF=12;TCR=8;TR=14;WE=50616814;WS=50616796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
chr22	50632869	rs4838813	C	T	1073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.529;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=29;PP=718;ReadPosRankSum=0.951;SC=TGGCTGAGGACGGGAGCAGGG;SOR=0.618;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=201;TCF=114;TCR=87;TR=65;WE=50632877;WS=50632859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,70:0.31:227
chr22	50633048	rs730559	T	G	680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=23;PP=550;ReadPosRankSum=-1.787;SC=ACCGCAGGCCTCCTGCTTCAA;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=24;WE=50633056;WS=50633038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,24:0.83:29
chr22	50635848	rs2272844	C	G	2169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.033;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=39;PP=1084;ReadPosRankSum=-1.233;SC=GGGGTTCCCACTGCTCCCCAA;SOR=0.494;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=136;TCF=78;TCR=58;TR=88;WE=50635860;WS=50635838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,101:0.66:154
chr22	50637597	rs8238	G	C	4616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=77;PP=2842;SC=TCCAAAGGGAGAGAATTCGTG;SOR=0.789;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=153;TCF=76;TCR=77;TR=153;WE=50637605;WS=50637587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr22	50646936	rs5771102	G	C	1799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.003;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=33;PP=1264;ReadPosRankSum=1.797;SC=TCAGGTTTGGGCTGTTGACGC;SOR=0.387;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=112;TCF=70;TCR=42;TR=83;WE=50646944;WS=50646926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,86:0.74:116
chr22	50648577	rs2294401	C	T	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=334;ReadPosRankSum=-0.085;SC=GGCAGGACCCCGAGGAGGGAG;SOR=0.593;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=21;WE=50648585;WS=50648567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,21:0.62:34
chr22	50655098	rs2272851	A	G	756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=19;NR=8;PP=377;SC=GCTACCTCCCAGACACCCTGG;SOR=1.214;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=27;WE=50655106;WS=50655088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr22	50656053	rs2281116	T	A	3765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.599;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=74;PP=2146;ReadPosRankSum=-1.673;SC=CGAGTCTGTCTCTGTGGTCAT;SOR=0.617;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=233;TCF=119;TCR=114;TR=154;WE=50656061;WS=50656043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,171:0.67:255
chr22	50656096	rs2038050	A	G	5640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=92;PP=2965;SC=CTCAGCCCCCACCCAGGAGAG;SOR=0.854;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=186;TCF=94;TCR=92;TR=186;WE=50656104;WS=50656086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr22	50656647	rs149152116	G	A	2157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.334;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=35;PP=1125;ReadPosRankSum=-0.258;SC=GGTACTCTGCGTGCGCACGCT;SOR=0.745;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=131;TCF=71;TCR=60;TR=83;WE=50656655;WS=50656637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,96:0.64:149
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chr22	50657065	rs370144692	G	A	932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.402;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=26;PP=480;ReadPosRankSum=-0.517;SC=AGGAGGCGTGGCTCAGCAGGC;SOR=0.886;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=126;TCF=56;TCR=70;TR=45;WE=50657073;WS=50657055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,53:0.38:139
chr22	50658053	rs6537642	A	G	2479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=51;NR=32;PP=1450;SC=CTCCCTGCCAACAGCAACTGC;SOR=1.014;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=51;TCR=32;TR=83;WE=50658061;WS=50658043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
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chr22	50658698	rs5771107	T	A	2562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.803;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=46;PP=1545;ReadPosRankSum=0.829;SC=TCAGAGACACTGTCTCCCGGG;SOR=0.838;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=175;TCF=95;TCR=80;TR=105;WE=50658706;WS=50658688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,116:0.60:192
chr22	50664612	rs4838865	A	G	4068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.925;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=78;PP=2620;ReadPosRankSum=-0.326;SC=TGTCCAGTACAACTTATCTAA;SOR=0.760;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=266;TCF=141;TCR=125;TR=169;WE=50664620;WS=50664602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,184:0.63:290
chr22	50678683	rs150035136	G	A	566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=9;PP=334;ReadPosRankSum=-0.014;SC=AGGTAAGTGCGGCTTCCCACA;SOR=0.610;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=95;TCF=67;TCR=28;TR=29;WE=50678691;WS=50678673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,32:0.32:99
chr22	50682061	.	AAAG	A	255.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.191;ClippingRankSum=0.000;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.84;ReadPosRankSum=0.714;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr22	50684296	rs13058062	T	C	948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.460;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=19;PP=534;ReadPosRankSum=1.140;SC=ACTGGTCCTTTCCCTCGTCCC;SOR=0.607;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=29;TCR=27;TR=39;WE=50684304;WS=50684286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,43:0.72:60
chr22	50684708	rs2294404	G	A	1109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.786;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=13;PP=786;ReadPosRankSum=1.474;SC=CTGCCTTGCCGCGTGGCATGG;SOR=1.492;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=56;TCF=37;TCR=19;TR=45;WE=50684716;WS=50684698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,46:0.78:59
chr22	50685508	rs4838866	A	G	474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=17;PP=395;SC=TCAGCCACACATCTTCTTACA;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=50685516;WS=50685498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr22	50688235	rs738334	T	C	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.969;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=8;PP=200;ReadPosRankSum=-0.278;SC=CCTCCTGCGCTGCCCCTTGCT;SOR=0.355;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=33;TCF=21;TCR=12;TR=15;WE=50688243;WS=50688225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr22	50688348	rs1555048	A	G	1269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.068;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.99;MQRankSum=-1.023;NF=35;NR=24;PP=748;ReadPosRankSum=0.391;SC=TGTTGAACACACAGAACCCGT;SOR=0.998;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=121;TCF=70;TCR=51;TR=59;WE=50688356;WS=50688338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,66:0.48:137
chr22	50689030	rs909688	A	G	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=18;PP=392;ReadPosRankSum=-0.389;SC=CCTGGGATTCATGGTGGGAGT;SOR=0.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=22;WE=50689038;WS=50689020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,21:0.60:35
chr22	50691920	.	T	G	424	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000;HP=12;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=15;MQ=59.32;NF=0;NR=23;PP=424;QD=19.9465744586;SC=CTGGCGGGGGTGGGGGGGCGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=71;TCF=34;TCR=37;TR=23;WE=50691928;WS=50691910;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:48,23:0.32:71
chr22	50693479	rs5771281	A	G	644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=4.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.31;ReadPosRankSum=2.748;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr22	50693521	rs5771282	C	T	1273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.69;ReadPosRankSum=0.203;SOR=0.644;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,32:0.70:46
chr22	50693534	rs6010218	A	G	1554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=1.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.27;ReadPosRankSum=-0.047;SOR=1.057;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,37:0.67:55
chr22	50693538	rs6010219	G	A	1587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=1.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.91;ReadPosRankSum=0.430;SOR=1.067;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,39:0.66:59
chr22	50693554	rs6010220	A	G	2049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.721;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=11;PP=717;ReadPosRankSum=-1.531;SC=CCCAACTCACAGGTCCACACA;SOR=1.276;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=79;TCF=58;TCR=21;TR=53;WE=50693562;WS=50693544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,64:0.71:90
chr22	50694297	rs1129880	A	G	2027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.632;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=42;PP=1237;ReadPosRankSum=-1.936;SC=TGCAGCCCACAGACCAGATGT;SOR=0.670;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=136;TCF=73;TCR=63;TR=87;WE=50694305;WS=50694287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,94:0.64:148
chr22	50695270	rs5771284	A	C	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.298;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=329;ReadPosRankSum=-0.797;SC=GTGGCTCAGCACCCAGACCCC;SOR=0.169;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=21;WE=50695278;WS=50695260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,20:0.67:30
chr22	50695651	rs148564423	G	A	1027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=29;PP=726;ReadPosRankSum=-0.978;SC=CGCTGTCAGCGGACAGAGCCA;SOR=0.719;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=69;TCF=24;TCR=45;TR=45;WE=50695659;WS=50695641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,45:0.65:69
chr22	50696648	rs2235355	C	T	2889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.008;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=49;PP=1563;ReadPosRankSum=-1.208;SC=TCGTGCCCAGCGGCCAGCCCA;SOR=0.776;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=204;TCF=116;TCR=88;TR=116;WE=50696656;WS=50696638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,137:0.58:237
chr22	50699487	rs2272856	G	C	46.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=1;PP=117;SC=ACCCCCGCCCGGCCCCACAGC;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=50699495;WS=50699479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr22	50699668	rs2272857	A	G	5052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=90;NR=75;PP=2706;SC=CGGACTGGAAAGGCCGATACA;SOR=0.703;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=165;TCF=90;TCR=75;TR=165;WE=50699676;WS=50699658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr22	50703572	rs10626765	C	CAG	1547.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=23;PP=1396;SC=AGCCTCAGCACAGTCTGGGAG;SOR=2.303;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=29;WE=50703580;WS=50703562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr22	50704661	rs2076139	T	C	4903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=62;PP=2425;SC=TCACGTGTTCTGAGGAGATTT;SOR=0.941;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=159;TCF=97;TCR=62;TR=159;WE=50704669;WS=50704651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr22	50705059	rs742185	A	G	7071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=131;NR=103;PP=2965;SC=GGGCGAGGGGACCTCCATCAG;SOR=0.831;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=234;TCF=131;TCR=103;TR=234;WE=50705067;WS=50705049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr22	50705304	rs760747	C	T	2548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.160;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=45;PP=1699;ReadPosRankSum=1.011;SC=GCATGCAGAGCCAGTCGAGGG;SOR=0.903;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=150;TCF=83;TCR=67;TR=104;WE=50705312;WS=50705294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,111:0.69:160
chr22	50705466	rs760748	A	G	5977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=109;PP=2965;SC=GCGCCAGCCCAAAATCCAGGA;SOR=0.757;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=217;TCF=108;TCR=109;TR=216;WE=50705474;WS=50705456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
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chr22	50714491	rs6010224	A	C	515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=5;NR=13;PP=392;SC=CTCCCCGGGGAAGCAGCTGGG;SOR=1.863;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=18;WE=50714499;WS=50714481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
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chr22	50724190	.	G	T	32	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=17;MQ=55.55;NF=3;NR=1;PP=32;QD=16.6928031368;SC=CTCCGCACCTGAGCCTGCCTG;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=4;WE=50724198;WS=50724180;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
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chr22	50724733	rs55709850	G	T	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=127;ReadPosRankSum=-0.170;SC=ACAGCAGAGGGGGAGGTGTCA;SOR=0.699;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=16;TCR=26;TR=15;WE=50724741;WS=50724723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,18:0.34:53
chr22	50725553	rs28513473	T	C	542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=11;PP=281;ReadPosRankSum=-0.587;SC=GGCCTGGCGGTGTGACGGGGA;SOR=0.589;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=73;TCF=48;TCR=25;TR=28;WE=50725561;WS=50725543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,29:0.35:83
chr22	50727921	rs28578714	T	C	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-1.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.576;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=108;ReadPosRankSum=0.277;SC=GTCCGGGCCCTGCGAGAACAC;SOR=0.126;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=13;WE=50727929;WS=50727911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr22	50728062	rs28379706	T	C	944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FS=0.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.13;ReadPosRankSum=-0.878;SOR=0.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:126,58:0.32:184
chr22	50750879	rs73439304	G	A	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.17;ReadPosRankSum=1.362;SOR=0.653;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,37:0.25:148
chr22	50751529	rs67248662	G	C	1293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.22;ReadPosRankSum=-2.593;SOR=0.723;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,65:0.71:91
chr22	50751791	rs148649824	C	CT	443.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.275;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=339;ReadPosRankSum=0.640;SC=CAGCCACAGCCTCCTGCTCCA;SOR=1.085;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=29;TCF=17;TCR=12;TR=10;WE=50751799;WS=50751781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,17:0.33:51
chr22	50751926	rs373757895	C	T	1074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=20;PP=481;ReadPosRankSum=-0.284;SC=CCATGTAGTGCTCCTGGGTGG;SOR=0.800;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=50;TCF=21;TCR=29;TR=33;WE=50751934;WS=50751916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,47:0.69:68
chr22	50752150	rs68178377	C	T	3557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.756;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=28;PP=904;ReadPosRankSum=1.021;SC=TTCTTCTGCACGCCCTGCAGG;SOR=0.604;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=105;TCF=66;TCR=39;TR=76;WE=50752158;WS=50752140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,91:0.73:124
chr22	50752169	rs73891220	G	A	3732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=35;PP=1137;ReadPosRankSum=1.500;SC=GGGGAGAGAGGGCCAGGCCCT;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=68;TCR=46;TR=86;WE=50752177;WS=50752159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,100:0.76:132
chr22	50752705	rs144775109	C	T	1221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.041;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=24;PP=690;ReadPosRankSum=1.399;SC=AGGTCTCCTACGAGACACGCC;SOR=0.543;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=139;TCF=84;TCR=55;TR=56;WE=50752713;WS=50752695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,63:0.40:157
chr22	50753334	rs73439311	G	A	2143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=46;PP=1307;SC=ATATGAGTCAGCACAGGCCGG;SOR=1.493;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=26;TCR=46;TR=72;WE=50753342;WS=50753324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr22	50753973	rs62241228	T	C	434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=1;PP=262;SC=CTGCCTCCCTTGGGCAGTCCC;SOR=2.448;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=50753981;WS=50753963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr22	50754052	rs71964200	TACTC	T	2357.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=15;PP=1415;SC=CGCACACACATACTCACACAC;SOR=1.329;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=30;TCF=15;TCR=15;TR=27;WE=50754063;WS=50754042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr22	50754363	rs35812349	A	G	391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=3;PP=328;SC=GGGTGAACCAAGGAAGCAGGT;SOR=1.981;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=12;WE=50754371;WS=50754362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr22	50754445	rs80243206	A	T	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=217;ReadPosRankSum=-2.112;SC=CCTCCGCCTCAGCTCCCACCT;SOR=0.659;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=50;TCF=35;TCR=15;TR=18;WE=50754453;WS=50754435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,18:0.33:54
chr22	50754466	rs62241230	C	T	1187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=18;PP=611;ReadPosRankSum=0.662;SC=CTTGGTCAAACTGCTTCGGAG;SOR=0.705;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=53;TCR=29;TR=50;WE=50754474;WS=50754456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,56:0.62:90
chr22	50754648	rs11553141	T	C	6452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=125;NR=88;PP=2965;SC=TCTGCCCAGGTGCAGGCGCCG;SOR=0.910;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=213;TCF=125;TCR=88;TR=213;WE=50754656;WS=50754638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr22	50754772	rs73439316	C	T	1433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.085;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=37;PP=848;ReadPosRankSum=1.480;SC=GATGAGACCACGATGGCCACG;SOR=0.737;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=288;TCF=149;TCR=139;TR=84;WE=50754780;WS=50754762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:226,90:0.28:316
chr22	50755907	rs73439318	G	C	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.08;ReadPosRankSum=1.069;SOR=1.123;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,5:0.15:34
chr22	50756452	rs73439320	A	G	1536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=43;PP=1046;ReadPosRankSum=0.661;SC=AAGGCAGCCTAAGAAGGGGCA;SOR=0.713;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=206;TCF=100;TCR=106;TR=81;WE=50756460;WS=50756442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,84:0.37:226
chr22	50757470	rs67488807	T	C	3492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=59;PP=2090;ReadPosRankSum=1.674;SC=ACACCATCTGTCCGAGGAGGC;SOR=0.971;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=114;TCF=54;TCR=60;TR=112;WE=50757478;WS=50757460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,128:0.98:130
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chr22	50860583	rs12163230	T	C	1241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=11.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.35;ReadPosRankSum=0.944;SOR=2.645;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,34:0.67:51
chr22	50869692	rs55712763	G	C	1474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.541;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=32;PP=923;ReadPosRankSum=0.294;SC=TGCCCGTGAGGAGAGGACAGA;SOR=0.744;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=163;TCF=89;TCR=74;TR=71;WE=50869700;WS=50869682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,78:0.42:186
chr22	50870620	rs2076712	G	T	1490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=29;PP=880;ReadPosRankSum=0.611;SC=GCCCTGCCCAGTCCAGGGATG;SOR=0.662;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=89;TCF=46;TCR=43;TR=61;WE=50870628;WS=50870610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,67:0.68:98
chr22	50876077	rs9306550	T	C	3311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=61;NR=55;PP=1686;SC=CGGCTCTCCCTGCTGCTGAGC;SOR=0.756;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=61;TCR=55;TR=116;WE=50876085;WS=50876067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr22	50876235	rs5770779	T	C	6624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=127;NR=83;PP=2965;SC=GCAGTGGGCCTGGAGGAACGC;SOR=1.151;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=210;TCF=127;TCR=83;TR=210;WE=50876243;WS=50876225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr22	50876357	rs5770890	C	G	5603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=114;PP=2965;SC=TGTGGGGTGCCGCCACCCTTT;SOR=1.190;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=192;TCF=78;TCR=114;TR=192;WE=50876365;WS=50876347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr22	50876662	rs11555194	T	G	945.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FS=1.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.92;ReadPosRankSum=-0.331;SOR=0.715;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:177,64:0.27:241
chr22	50876755	rs2070273	C	T	1155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=34;PP=795;ReadPosRankSum=-0.333;SC=CCCCACAAAGCCTCTGCCGAG;SOR=0.824;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=15;TCR=46;TR=45;WE=50876763;WS=50876745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,48:0.74:65
chr22	50877166	rs4824131	G	C	4213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=77;NR=67;PP=2301;SC=AGAAGGAAGCGCCCCCTGTGG;SOR=0.705;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=144;TCF=77;TCR=67;TR=144;WE=50877174;WS=50877156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr22	50877244	rs45581534	T	C	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.292;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=214;ReadPosRankSum=0.198;SC=CAGGACATGGTACCCCGGCCT;SOR=0.994;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=44;TCF=13;TCR=31;TR=15;WE=50877252;WS=50877234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,18:0.37:49
chr22	50882752	rs59017944	CT	C	186.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.83;ReadPosRankSum=1.860;SOR=0.657;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr22	50885775	rs1053744	A	G	1436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.024;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQ=60.04;MQRankSum=1.360;NF=44;NR=34;PP=838;ReadPosRankSum=1.063;SC=TCTCGTCCACAGTCTTAGGGG;SOR=0.770;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=219;TCF=120;TCR=99;TR=78;WE=50885783;WS=50885765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,86:0.35:243
chr22	50885893	rs56853707	CCA	C	1257.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.747;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.507;NF=3;NR=24;PP=865;ReadPosRankSum=2.700;SC=CTGGAGGAGGCCACAGAGTCA;SOR=0.781;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=74;TCF=7;TCR=67;TR=27;WE=50885902;WS=50885883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,37:0.31:119
chr22	50886944	rs74598385	G	A	5030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=347;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=110;NR=99;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.231;SC=CACGCCCACCGTGGACGCTCA;SOR=0.677;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=318;TCF=168;TCR=150;TR=209;WE=50886952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,230:0.66:346
chr22	50894849	rs2076713	G	A	738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.654;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=22;PP=412;ReadPosRankSum=1.145;SC=GACAAGTCCCGTGAGACACAT;SOR=0.448;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=95;TCF=37;TCR=58;TR=38;WE=50894857;WS=50894839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,41:0.39:106
chr22	50895020	rs5771001	C	T	1669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=36;NR=20;PP=789;SC=GTGGGGCCAGCGCGTCTCTGC;SOR=1.127;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=36;TCR=20;TR=56;WE=50895028;WS=50895010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr22	50895133	rs4824117	A	G	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=10;PP=204;ReadPosRankSum=0.484;SC=AAGCACCCAAAGGGGGCCAGG;SOR=0.745;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=71;TCF=40;TCR=31;TR=21;WE=50895141;WS=50895123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,26:0.29:89
chr22	50898026	rs58335489	G	A	1054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=21;PP=543;ReadPosRankSum=1.316;SC=GGTTCTGGCGGTAGCAGCGGG;SOR=0.745;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=77;TCF=38;TCR=39;TR=43;WE=50898034;WS=50898016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,47:0.56:84
chr22	50898619	rs2073278	G	A	2693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=56;PP=1660;ReadPosRankSum=-0.400;SC=TGGTCATCACGGGGCCACTCC;SOR=0.672;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=193;TCF=102;TCR=91;TR=115;WE=50898627;WS=50898609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,127:0.59:214
chr22	50899755	rs35628474	AG	A	1193.27	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQRankSum=0.644;QD=14.92;ReadPosRankSum=1.790;SOR=0.850;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,63:0.79:80
chr22	50901009	rs5771037	C	T	835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.055;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=13;PP=479;ReadPosRankSum=-2.419;SC=CCAGGTCCTCCGTGGGCTCCA;SOR=0.869;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=50;TCF=31;TCR=19;TR=35;WE=50901017;WS=50900999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,37:0.66:56
chr22	50901259	rs9617014	G	A,C	2081.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;NF=32,15;NR=21,11;PP=852,285;SC=CACCAGGAAGGGGGGGCTGGG;SOR=0.917;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=79;TCF=47;TCR=32;TR=53,26;WE=50901267;WS=50901249;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.66,0.34:87
chr22	50901534	rs5771039	A	G	405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=10;PP=257;SC=CCCAGGCCCCAGCACCTGCCC;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=50901542;WS=50901524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr22	50902751	rs5771041	C	T	1176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.848;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=17;PP=727;ReadPosRankSum=1.184;SC=GCCTGCACAGCCCTCACCTTC;SOR=0.883;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=80;TCF=50;TCR=30;TR=48;WE=50902759;WS=50902741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,54:0.61:88
chr22	50903221	rs2076714	C	T	1421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.789;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=32;PP=793;ReadPosRankSum=1.344;SC=GGCGGTACGACGCCCTCCCGT;SOR=1.006;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=84;TCF=38;TCR=46;TR=56;WE=50903229;WS=50903211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,65:0.67:97
chr22	50913394	rs373485644	CGCG	C	277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=6;PP=282;SC=TGGTTCGCTCCGCGGCGGCGG;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=50913404;WS=50913384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr22	50913429	rs4824154	T	C	286.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=6;PP=148;SC=GCGGCCCAGGTTCCCGCCGCC;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=50913437;WS=50913419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr22	50925672	rs2232878	T	C	1248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=5;PP=776;SC=GATGATGGCGTGGGAGAGGCT;SOR=2.356;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=33;TCR=5;TR=38;WE=50925680;WS=50925662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr22	50925997	rs3747273	C	A	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.807;HP=4;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=204;ReadPosRankSum=1.542;SC=GGAACTCCCACCCCCATCACA;SOR=1.179;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=38;TCF=20;TCR=18;TR=13;WE=50926005;WS=50925987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,13:0.32:41
chr22	50927447	rs139170143	C	CGTCCCTCCT	589.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQRankSum=1.928;QD=9.21;ReadPosRankSum=0.162;SOR=0.504;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,14:0.22:64
chr22	50928005	rs2232884	G	A	1798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=38;PP=1108;ReadPosRankSum=-0.852;SC=CCTGGCACACGGGCCGCGACT;SOR=0.722;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=108;TCF=55;TCR=53;TR=74;WE=50928013;WS=50927995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,79:0.66:119
chr22	50928026	rs2232885	G	A	750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=1.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.70;ReadPosRankSum=-1.646;SOR=0.540;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,42:0.38:112
chr22	50941985	rs6009975	T	C	830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=16;PP=498;ReadPosRankSum=-0.500;SC=CTAGCAGGGCTTGCACAAATC;SOR=0.671;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=68;TCF=34;TCR=34;TR=31;WE=50941993;WS=50941975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,38:0.47:81
chr22	50942121	rs13056405	C	T	796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.315;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=9;PP=572;ReadPosRankSum=-0.406;SC=GCGAGGTGGGCTTTTCTCCTG;SOR=1.379;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=54;TCF=37;TCR=17;TR=36;WE=50942129;WS=50942111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,36:0.65:55
chr22	50942709	.	C	CCT	460	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=5;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=27;MQ=54.72;NF=12;NR=0;PP=460;QD=40.5833333333;SC=CCACACCCCCCGGTGCCCGGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=12;WE=50942717;WS=50942699;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,12:0.63:19
chr22	50942761	.	A	G	491	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=24;MQ=59.79;NF=26;NR=10;PP=491;QD=14.6047559041;SC=CCCGGTGCCCAGCCTTACCCC;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=39;TCR=15;TR=36;WE=50942769;WS=50942751;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:18,36:0.67:54
chr22	50943004	rs762671	C	A	2238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.97;ReadPosRankSum=-0.330;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,56:0.67:83
chr22	50943010	rs762670	G	A	2328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.31;ReadPosRankSum=1.432;SOR=0.618;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,60:0.65:92
chr22	50943232	rs8136495	G	A	3429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=74;PP=1770;ReadPosRankSum=-0.520;SC=AGGGCTCACCGTCCAGTGGTG;SOR=0.709;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=191;TCF=92;TCR=99;TR=143;WE=50943240;WS=50943222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,160:0.75:213
chr22	50943423	rs762669	G	A	2063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.677;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=32;PP=1137;ReadPosRankSum=-2.051;SC=CCTGGAGACAGGTGGGAGGTT;SOR=0.803;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=121;TCF=73;TCR=48;TR=80;WE=50943431;WS=50943413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,93:0.67:138
chr22	50944128	rs743615	G	A	771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.123;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=19;PP=560;ReadPosRankSum=-0.678;SC=TGCGGCTGCCGTGGCCAGGCT;SOR=0.911;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=159;TCF=93;TCR=66;TR=47;WE=50944136;WS=50944118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,50:0.29:174
chr22	50946965	rs131823	T	C	275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=6;NR=6;PP=188;SC=CGCCCCACCGTCTCCACGCCT;SOR=1.022;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=6;TCR=6;TR=12;WE=50946973;WS=50946955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr22	50957520	rs3091397	G	A	484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=3;PP=333;SC=TCTGGGCTCCGTGACTAAAGC;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=50957528;WS=50957510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr22	50960101	rs131814	G	A	2985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=53;PP=1818;ReadPosRankSum=-1.140;SC=GGCATGAGGTGGGGGGGTGGG;SOR=0.661;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=172;TCF=96;TCR=76;TR=119;WE=50960109;WS=50960091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,131:0.70:187
chr22	50960682	rs140524	C	T	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.07;ReadPosRankSum=0.071;SOR=0.701;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:154,57:0.27:211
chr22	50961169	rs131813	A	G	3113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=48;PP=1992;SC=GGTTAGAGGGAGACGGGGAGG;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=53;TCR=48;TR=101;WE=50961177;WS=50961159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr22	50961854	rs2782	T	C	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=280;ReadPosRankSum=1.763;SC=AGGAGCCGTGTGTCTGCTCCT;SOR=0.941;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=16;WE=50961862;WS=50961844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr22	50961980	rs201538137	TCA	T	32.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=2.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.17;ReadPosRankSum=0.526;SOR=0.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,4:0.14:28
chr22	50962078	rs112793292	G	T	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=6.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.25;ReadPosRankSum=1.061;SOR=1.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,23:0.24:96
chr22	50962208	rs12148	T	G	2789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.555;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=56;PP=1607;ReadPosRankSum=0.804;SC=CCTTGGGGCCTGCATTGTAGT;SOR=0.669;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=176;TCF=97;TCR=79;TR=120;WE=50962216;WS=50962198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,130:0.66:196
chr22	50962782	rs140523	C	G	2456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.165;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=43;PP=1546;ReadPosRankSum=-1.216;SC=AGGGAGGACCCGAGGCTTGAG;SOR=0.466;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=144;TCF=86;TCR=58;TR=101;WE=50962790;WS=50962772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,112:0.70:159
chr22	50964153	rs131805	T	C	2171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=31;PP=1287;SC=CCCTGGATCCTTCCGCTCCCG;SOR=0.872;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=42;TCR=31;TR=73;WE=50964161;WS=50964143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr22	50964236	rs11479	G	A	1064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.462;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=24;PP=647;ReadPosRankSum=1.335;SC=TGCGAAGGGCGAGGGGGCGGC;SOR=0.487;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=96;TCF=47;TCR=49;TR=48;WE=50964244;WS=50964226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,52:0.48:109
chr22	50964862	rs131804	G	A	604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.223;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=11;PP=303;ReadPosRankSum=1.688;SC=CAGCGCCCTGGGCCTGAGTCC;SOR=0.666;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=36;TCF=21;TCR=15;TR=24;WE=50964870;WS=50964852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,28:0.64:44
chr22	50966914	rs470119	T	C	1759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.724;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=25;PP=1050;ReadPosRankSum=-0.037;SC=CAACCTGGATTAATGACTGAT;SOR=0.786;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=103;TCF=65;TCR=38;TR=69;WE=50966922;WS=50966904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,77:0.66:117
chr22	50968826	.	CAG	C	383.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.172;ClippingRankSum=0.000;DP=190;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.31;ReadPosRankSum=-0.585;SOR=0.762;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:137,29:0.17:166
chr22	50969536	.	CAGGGTGGTCCCAGCTCCCGG	C	2934.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=0.000;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.448;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=4.114;NF=9;NR=24;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.799;SC=CGGACAGGCGCAGGGTGGTCC;SOR=0.883;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=69;TCF=17;TCR=52;TR=33;WE=50969563;WS=50969526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,78:0.61:128
chr22	50987287	rs5770886	A	G	783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.93;ReadPosRankSum=-0.249;SOR=0.675;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:109,50:0.31:159
chr22	50988062	rs140519	G	T	4919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.435;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=98;PP=2763;ReadPosRankSum=0.723;SC=GCGACATCGTGGCACTGGGGG;SOR=0.710;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=289;TCF=151;TCR=138;TR=202;WE=50988075;WS=50988052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,226:0.69:327
chr22	50988193	rs131779	A	G	3546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=89;PP=2962;SC=GCCCCACTGCACTGCACCACC;SOR=1.502;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=155;TCF=66;TCR=89;TR=151;WE=50988201;WS=50988183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr22	51008121	rs12160714	G	A	1125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=34;PP=791;ReadPosRankSum=0.871;SC=GAAGGGTGAAGAAGGCATAAA;SOR=0.727;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=235;TCF=119;TCR=116;TR=70;WE=51008129;WS=51008111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:188,72:0.28:260
chr22	51009953	rs470117	C	T	2378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=53;PP=1387;ReadPosRankSum=1.436;SC=TAGGAACTCTCGATGACCGCC;SOR=0.704;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=137;TCF=63;TCR=74;TR=93;WE=51009961;WS=51009943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,106:0.66:160
chr22	51010788	rs131761	T	A	2339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=50;PP=1454;SC=TGTCCAGAGGTGCCTGACCTG;SOR=1.473;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=30;TCR=50;TR=80;WE=51010796;WS=51010778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr22	51011936	rs131760	T	C	3174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=32;PP=1902;SC=AGTCCCTTCCTAGAGGCCAAT;SOR=1.322;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=70;TCR=32;TR=102;WE=51011944;WS=51011926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr22	51015210	rs140515	G	C	832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.313;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=12;PP=557;ReadPosRankSum=1.084;SC=TGCCTCTCCCGTCTAGCTCAG;SOR=0.446;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=26;TCR=16;TR=31;WE=51015218;WS=51015200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,33:0.72:46
chr22	51015481	rs131759	G	A	496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=346;ReadPosRankSum=-0.998;SC=AGAGGGGCAAGGGCTGCAGGG;SOR=0.638;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=9;TCR=28;TR=20;WE=51015489;WS=51015471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,21:0.54:39
chr22	51018579	rs140514	A	G	1044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.877;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=25;PP=617;ReadPosRankSum=-0.262;SC=CAAGAGCCCTATGGGAACAGA;SOR=1.044;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=71;TCF=34;TCR=37;TR=41;WE=51018587;WS=51018569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,48:0.56:86
chr22	51020668	rs86337	C	A	777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=2.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.35;ReadPosRankSum=0.675;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,38:0.60:63
chr22	51041663	rs41282359	C	A	1099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.928;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=29;PP=619;ReadPosRankSum=0.538;SC=ACAGCCTCTCCCTGGGGCGCT;SOR=0.961;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=142;TCF=66;TCR=76;TR=51;WE=51041671;WS=51041653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,58:0.36:159
chr22	51042513	rs140511	C	CG	3872.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.11;QD=39.93;SOR=0.845;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr22	51043278	rs3219201	G	A	820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=13;PP=493;SC=TGGTGGATGAGCACACGCAGC;SOR=1.071;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=12;TCR=13;TR=25;WE=51043286;WS=51043268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr22	51045190	rs1140555	C	T	1380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.077;HP=2;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=29;PP=720;ReadPosRankSum=-0.393;SC=GAGGAGGGCCCGAGGTGGGAG;SOR=0.994;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=72;TCF=32;TCR=40;TR=53;WE=51045198;WS=51045180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,59:0.73:81
chr22	51045433	rs131736	C	T	1389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.876;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=32;PP=746;ReadPosRankSum=-1.491;SC=AGAGTCTGACCGTCCCCGAGT;SOR=0.587;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=34;TCR=47;TR=56;WE=51045442;WS=51045423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,62:0.70:89
chr22	51045480	rs131735	G	A	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=203;ReadPosRankSum=0.080;SC=GAGTCCAACCGCCCCCTGAGT;SOR=0.569;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=16;WE=51045488;WS=51045470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
chr22	51048400	rs2269380	A	G	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.54;ReadPosRankSum=-0.089;SOR=0.681;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,36:0.24:153
chr22	51048514	rs2269379	C	T	922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.417;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=19;PP=503;ReadPosRankSum=0.804;SC=TTGTGCGACCCCCACACTCCT;SOR=0.481;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=101;TCF=55;TCR=46;TR=40;WE=51048522;WS=51048504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,46:0.39:119
chr22	51048781	rs5770941	T	G	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.859;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=20;PP=466;ReadPosRankSum=-0.680;SC=GGGTGCAGGGTTACGGAGGTG;SOR=0.097;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=45;TCF=9;TCR=36;TR=27;WE=51048789;WS=51048771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,29:0.62:47
chr22	51048812	rs9616798	G	C	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.231;HP=4;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=170;ReadPosRankSum=-0.605;SC=GTGAGCAGGTGGGGGCAGGAG;SOR=0.223;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=14;WE=51048820;WS=51048802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr22	51063987	rs762674	G	C	5703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=113;NR=91;PP=2965;SC=CGGGGGGAGGGATCCACGGGG;SOR=0.898;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=204;TCF=113;TCR=91;TR=204;WE=51063995;WS=51063977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
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chr22	51064141	rs762673	G	A	2697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=58;PP=1660;SC=ACGGGGCGGGGCAGGCCCCAA;SOR=1.516;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=92;TCF=34;TCR=58;TR=91;WE=51064149;WS=51064131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr22	51064416	rs2071421	T	C	611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.667;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=9;PP=429;ReadPosRankSum=-0.886;SC=CAAGGTGACATTGGGCAGTGG;SOR=0.252;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=28;WE=51064424;WS=51064406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,28:0.62:45
chr22	51064818	rs762672	T	C	713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=21;PP=537;SC=GTGCCCAGCATGAGCCCGGCA;SOR=2.670;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=26;WE=51064826;WS=51064808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr22	51064915	rs6151419	G	A	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=2;PP=57;ReadPosRankSum=0.903;SC=GCATCTCCTGGCACCCCCTCA;SOR=1.492;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=5;WE=51064923;WS=51064910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr22	51065229	rs6151416	G	A	868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FS=2.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.11;ReadPosRankSum=0.167;SOR=0.896;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:121,49:0.29:170
chr22	51113001	.	CCG	C	341.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.97;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr22	51117137	rs9616914	G	A	3557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.902;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=65;PP=2270;ReadPosRankSum=-0.646;SC=GAGTGGAGTCGGGGAGGGGCA;SOR=0.616;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=230;TCF=121;TCR=109;TR=144;WE=51117145;WS=51117127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,156:0.63:249
chr22	51117580	rs9616915	T	C	2850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=59;PP=1843;ReadPosRankSum=-0.982;SC=CAGCTGGGGATCACCGACGAG;SOR=0.677;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=181;TCF=93;TCR=88;TR=120;WE=51117588;WS=51117570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,128:0.63:203
chr22	51133518	rs13055562	G	A	832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=25;PP=645;ReadPosRankSum=1.337;SC=TGGGAGGGTGGGGTGCCGGGA;SOR=0.807;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=45;TCF=8;TCR=37;TR=31;WE=51133526;WS=51133508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,31:0.74:42
chr22	51135545	rs9616818	T	C	400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=5;PP=179;SC=AGTGGAGGAGTGAGAGCTCAG;SOR=0.941;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=13;WE=51135553;WS=51135535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr22	51135595	rs28735993	A	T	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=4;PP=76;ReadPosRankSum=1.189;SC=GAAGGTGGGCATCACGCAGTG;SOR=0.593;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=11;TCR=10;TR=8;WE=51135603;WS=51135585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr22	51137094	rs9616942	G	A	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=89;ReadPosRankSum=0.141;SC=CCCCACTGACGGCCTGTCTGG;SOR=0.534;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=20;TCR=11;TR=11;WE=51137102;WS=51137084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,10:0.31:32
chr22	51137249	rs1557620	T	C	3471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=64;NR=49;PP=1972;SC=ACCCCACGGCTCCCCGGGCAG;SOR=0.856;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=64;TCR=49;TR=113;WE=51137257;WS=51137239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr22	51171497	rs2301584	G	A	1384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.783;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=24;PP=700;ReadPosRankSum=-0.470;SC=AGTTCCATCCGGGGGGTTTCA;SOR=0.598;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=84;TCF=44;TCR=40;TR=53;WE=51171505;WS=51171487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,62:0.64:97
chr22	51178090	rs2285395	G	A	751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.791;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=14;PP=466;ReadPosRankSum=-0.392;SC=TTGTCCAGCCGGTTGTGACCT;SOR=0.420;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=92;TCF=61;TCR=31;TR=36;WE=51178098;WS=51178080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,39:0.38:102
chr22	51179000	rs2283675	C	A	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.712;NF=15;NR=5;PP=283;ReadPosRankSum=-0.410;SC=GGAAGGGGACCGGTGGTTGGT;SOR=0.598;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=47;TCF=36;TCR=11;TR=20;WE=51179008;WS=51178990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,16:0.36:45
chr22	51182399	rs56238942	A	G	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.565;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.83;MQRankSum=-0.998;QD=7.31;ReadPosRankSum=1.324;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr22	51182485	rs6009961	A	G	3102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=76;NR=43;PP=2185;SC=TGGTCTGACTATAGCCCCCAG;SOR=1.524;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=76;TCR=43;TR=119;WE=51182493;WS=51182475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr22	51183255	rs5771002	A	G	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.80;MQRankSum=-0.701;QD=19.53;ReadPosRankSum=-0.113;SOR=0.586;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,35:0.81:43
chr22	51208005	rs144874090	GTC	G	1345.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FS=1.349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.70;MQRankSum=-6.508;QD=6.80;ReadPosRankSum=0.870;SOR=0.853;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:154,44:0.22:198
chr22	51215028	rs143621081	C	G	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.378;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.652;NF=11;NR=3;PP=213;ReadPosRankSum=-1.334;SC=TATGAACCTTCCCTCACCTCC;SOR=1.061;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=14;WE=51215036;WS=51215018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,13:0.34:38
chr22	51215185	rs185382477	C	T	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=1.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.13;MQRankSum=0.377;QD=3.91;ReadPosRankSum=-0.103;SOR=0.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,28:0.27:105
chr22	51219006	rs28729663	G	A	754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-6.742;NF=31;NR=15;PP=471;ReadPosRankSum=0.565;SC=CTTGAGTCCAGTCAAAACTGA;SOR=0.631;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=133;TCF=89;TCR=44;TR=46;WE=51219014;WS=51218996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,44:0.33:135
chrX	2699898	rs60233760	C	CT	286.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.555;NF=11;NR=0;PP=193;ReadPosRankSum=0.762;SC=AAACGGAAACCTTTTTTTTTA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=11;WE=2699906;WS=2699892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
chrX	2700202	rs5939320	A	G	3402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=76;PP=2331;SC=CTCTTTCTCAATCTGGTTTGA;SOR=1.817;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=36;TCR=76;TR=112;WE=2700210;WS=2700192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chrX	2715425	rs4484858	A	G	2482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.13;SOR=0.757;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chrX	2724760	rs3749988	T	C	3876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=89;NR=35;PP=2432;SC=GGCTATAGACTCAACTCTCGT;SOR=1.841;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=124;TCF=89;TCR=35;TR=124;WE=2724768;WS=2724750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chrX	2726396	rs6567645	A	G	1239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=29;PP=882;SC=GTATGTATATAAAGTAGCTCC;SOR=3.912;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=33;WE=2726404;WS=2726386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
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chrX	2732356	rs34201156	C	CT	1781.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=19;PP=449;ReadPosRankSum=1.798;SC=TTTAATAAGACTTTTTTTTTT;SOR=0.733;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=45;TCF=21;TCR=24;TR=38;WE=2732364;WS=2732346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,73:0.96:76
chrX	2748051	rs57068689	T	C	3329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=28;PP=2079;SC=GGGGTGACACTGGCGGGGCCT;SOR=1.951;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=108;TCF=80;TCR=28;TR=107;WE=2748059;WS=2748041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chrX	2748253	rs6642032	G	C	5437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=102;PP=2965;SC=AGCTCAAGCTGCTTCAGTTCA;SOR=1.110;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=181;TCF=79;TCR=102;TR=181;WE=2748261;WS=2748243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chrX	2748292	rs6641656	C	G	2603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=57;PP=1802;SC=GCTTGGGTGACAGATTGGTCT;SOR=2.049;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=82;TCF=24;TCR=58;TR=81;WE=2748300;WS=2748282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chrX	2761050	rs11797037	C	T	576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=3;PP=426;SC=GACAGAGTTTCACCATGGTGC;SOR=2.948;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=2761058;WS=2761040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chrX	2774478	rs5939132	A	G	5717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=117;NR=85;PP=2965;SC=CACATCTCGCATTCTTGGAGT;SOR=0.992;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=203;TCF=118;TCR=85;TR=202;WE=2774486;WS=2774468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chrX	2793725	rs72232490	CTA	C	1852.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=6;PP=1421;SC=TGCCCCAGTCCTATCCCATAT;SOR=3.365;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=31;WE=2793734;WS=2793715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chrX	2828122	rs12846104	C	T	4050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=85;PP=2502;SC=CACAGCCACCCGGATGCACAC;SOR=1.530;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=48;TCR=85;TR=133;WE=2828130;WS=2828112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chrX	2832742	rs211648	G	C	5015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=74;PP=2965;SC=AAGACAGCGTGTCTGCATTGT;SOR=0.795;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=164;TCF=89;TCR=75;TR=163;WE=2832750;WS=2832732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chrX	2833506	rs211649	G	C	699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=2;PP=565;SC=TTTATTGCAAGTTGGTTCATA;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=23;WE=2833514;WS=2833496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chrX	2833552	rs115030126	C	G	1716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=16;PP=1147;ReadPosRankSum=1.679;SC=TATGTTCAAACCTGAGGCCGA;SOR=0.876;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=59;TCF=43;TCR=16;TR=58;WE=2833560;WS=2833542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,62:0.98:63
chrX	2833856	rs211650	T	C	391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=300;SC=CCTTCTGAGTTCATCAGTGGG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=11;WE=2833864;WS=2833846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chrX	2836037	rs211653	G	C	6911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=110;NR=111;PP=2965;SC=CGCGGAGACAGAGAAGAAACC;SOR=0.795;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=222;TCF=111;TCR=111;TR=221;WE=2836045;WS=2836027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chrX	2843818	rs2302077	A	G	5373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=78;PP=2965;SC=TGGAGAGAAAAGCGAAACACA;SOR=0.777;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=172;TCF=94;TCR=78;TR=172;WE=2843826;WS=2843808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chrX	2847133	rs3747394	A	G	1272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=17;PP=838;SC=TACATTTTGGAGACTACAAGG;SOR=1.270;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=31;TCR=17;TR=48;WE=2847141;WS=2847123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chrX	2847157	rs3747395	C	G	1776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=39;NR=25;PP=1040;SC=CGGACACAACCACGCCCTTTA;SOR=0.980;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=39;TCR=25;TR=64;WE=2847165;WS=2847147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chrX	2853283	rs55974713	G	A	648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=18;PP=442;SC=AGGGTGCCTTGCTGGAGAATG;SOR=2.494;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=23;WE=2853291;WS=2853273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chrX	2928125	rs79487908	C	T	3157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=43;PP=1679;SC=CCCAGCATCTCGCAGCTGCTT;SOR=0.763;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=57;TCR=43;TR=100;WE=2928133;WS=2928115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chrX	2928170	rs77183343	C	T	2703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=47;PP=1563;SC=CCTTCCTGACCGGCCGGTACC;SOR=1.007;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=86;TCF=38;TCR=48;TR=85;WE=2928178;WS=2928160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chrX	2945477	rs61751925	C	T	4435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=69;PP=2440;SC=ATCTATCCGACGCTGTCTTAT;SOR=0.717;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=148;TCF=79;TCR=69;TR=148;WE=2945485;WS=2945467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chrX	2947190	.	T	TTCC	3719.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.487;ClippingRankSum=0.000;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=44.82;ReadPosRankSum=0.376;SOR=0.872;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,82:0.99:83
chrX	3019114	rs11798999	G	A	4742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=65;PP=2863;SC=CTTGTCTCTTGTATATTATTT;SOR=1.141;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=165;TCF=100;TCR=65;TR=165;WE=3019122;WS=3019104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chrX	3021798	rs1869561	T	C	5569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=98;NR=80;PP=2965;SC=TGCATTGTCTTATAGGTGGAA;SOR=0.776;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=181;TCF=100;TCR=81;TR=178;WE=3021814;WS=3021788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chrX	3030403	rs1052638	C	T	10350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=384;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=174;NR=169;PP=2965;SC=AGAGCCCCTCCATGATTTTGT;SOR=0.797;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=344;TCF=175;TCR=169;TR=343;WE=3030411;WS=3030393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,383:1.00:383
chrX	3238014	rs113639501	CA	C	282.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=2.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.10;ReadPosRankSum=1.805;SOR=0.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,24:0.35:69
chrX	3530512	rs7066317	A	C	1690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=53;PP=1313;SC=CATTTATGAAAGCGGCAATCT;SOR=4.840;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=57;TCF=4;TCR=53;TR=57;WE=3530520;WS=3530502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chrX	3592847	rs7880937	C	T	1641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=38;PP=1099;SC=TTAAGTCTTCCGACAAAGGAA;SOR=2.221;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=15;TCR=38;TR=53;WE=3592855;WS=3592837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chrX	3631167	rs3752362	A	G	3816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=66;PP=2288;SC=CAGGCTGTACACAGGCGGCTC;SOR=0.720;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=135;TCF=69;TCR=66;TR=135;WE=3631175;WS=3631157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chrX	3736489	rs1133336	C	T	4871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=64;PP=2872;SC=TCACCAACAGCGTATAAGCAA;SOR=1.117;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=166;TCF=102;TCR=64;TR=166;WE=3736497;WS=3736479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chrX	6975782	rs868756	C	G	6002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=111;NR=82;PP=2965;SC=CAGTTGATTACACAGAAGGAG;SOR=0.969;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=193;TCF=111;TCR=82;TR=193;WE=6975790;WS=6975772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chrX	6995315	rs2379206	C	T	2870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=33;PP=1666;SC=GGAAGATGTCCGGGTCTGGCT;SOR=1.314;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=61;TCR=33;TR=94;WE=6995323;WS=6995305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chrX	6995438	rs1803675	C	T	6932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=122;NR=107;PP=2965;SC=AGCTGGTGGCCAGTGCAAAGG;SOR=0.716;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=229;TCF=122;TCR=107;TR=229;WE=6995446;WS=6995428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,263:1.00:263
chrX	7066051	rs1473666	A	C	5083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=82;PP=2965;SC=CCACGCCCACACAAGACCGCC;SOR=0.747;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=173;TCF=91;TCR=82;TR=173;WE=7066059;WS=7066041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chrX	8270569	.	A	AAAAG	2101.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.686;ClippingRankSum=0.000;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=4.314;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.80;MQRankSum=0.968;QD=42.03;ReadPosRankSum=0.654;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,47:0.94:50
chrX	8467201	.	A	AAG	1450.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.30;SOR=3.026;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chrX	8467239	rs372703313	AAAAG	A	4602.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.28;QD=42.23;SOR=1.546;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chrX	8475698	rs2098137	T	G	528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=61;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=16;NR=1;PP=347;SC=AATGAAAGAATAAAGAAAAAG;SOR=3.611;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=17;WE=8475706;WS=8475688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chrX	8475724	rs202057305	C	CAAAGAAAGAAAAAG	2442.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=64.05;QD=56.81;SOR=1.954;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chrX	8653598	rs200643100	AGAAG	A	617.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.83;QD=41.18;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chrX	8653642	rs6640215	A	G	196.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=49.23;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chrX	8700168	rs1236390	A	C	122.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=4;PP=102;SC=GACCAGGCAGACGCCGCGACT;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=8700176;WS=8700158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chrX	8761553	rs5978272	T	G	242.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=200;SC=ATGTTAAATTTGGAACAATAC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=8761561;WS=8761545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chrX	8761625	rs2188935	G	A	1720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=7;PP=1183;SC=CCATACATTCGGAAACAAACA;SOR=3.037;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=44;TCR=7;TR=51;WE=8761633;WS=8761615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chrX	8766291	rs2018496	T	C	2035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=40;PP=1167;SC=TGGGAAGATATGTCTTATGTG;SOR=1.079;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=30;TCR=40;TR=70;WE=8766299;WS=8766281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chrX	9000594	rs200449273	TG	T	542.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=6.886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=0.000;QD=5.17;ReadPosRankSum=1.561;SOR=0.400;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,33:0.31:105
chrX	9711595	rs3788938	G	C	2040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=47;NR=16;PP=1173;SC=ATATATAGAAGAAAGGTTACC;SOR=1.673;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=64;TCF=48;TCR=16;TR=63;WE=9711603;WS=9711585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chrX	9859098	rs6640543	A	G	4373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=86;NR=67;PP=2512;SC=CGGCCTCCCCATTCACCTCCA;SOR=0.859;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=153;TCF=86;TCR=67;TR=153;WE=9859106;WS=9859088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chrX	9859197	rs6640544	A	G	6895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=127;NR=113;PP=2965;SC=AGCCTTCTGCAGGGAGCGCAC;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=240;TCF=127;TCR=113;TR=240;WE=9859205;WS=9859187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
chrX	9907484	rs3216890	AG	A	1878.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=35;PP=1585;SC=ATCCTGCCCCAGCGCAGACCC;SOR=3.080;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=36;WE=9907492;WS=9907474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chrX	9914667	rs2073941	A	G	3130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=32;PP=1981;SC=CCAGTGCCCCAGCTTTCATCC;SOR=1.733;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=69;TCR=32;TR=101;WE=9914675;WS=9914657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chrX	9914947	rs2073942	G	C	3001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=60;PP=1596;SC=AGTGCTTATTGGACAGCCTTC;SOR=1.322;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=40;TCR=60;TR=100;WE=9914955;WS=9914937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chrX	9935526	rs5934730	G	T	9189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=178;NR=123;PP=2965;SC=AAGACACCTCGCTCTACCCCC;SOR=1.065;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=302;TCF=178;TCR=124;TR=301;WE=9935534;WS=9935516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,331:1.00:331
chrX	9935844	rs5934731	C	T	6183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=103;NR=102;PP=2965;SC=TCCAGAACTACGATGCCGTCA;SOR=0.818;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=205;TCF=103;TCR=102;TR=205;WE=9935852;WS=9935834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chrX	10062079	rs5934746	T	A	3463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=31;PP=2100;SC=TAATAAATAATGCAGCAGACC;SOR=1.590;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=110;TCF=78;TCR=32;TR=109;WE=10062087;WS=10062069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chrX	10062163	rs5934747	G	C	5483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=111;NR=74;PP=2965;SC=TTGTCTCATTGTGTTCCAGAG;SOR=0.977;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=186;TCF=112;TCR=74;TR=185;WE=10062171;WS=10062153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chrX	10085674	rs6530368	T	C	6660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=115;NR=117;PP=2965;SC=TCCCCGGGGATGGGGAAGGGC;SOR=0.824;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=232;TCF=115;TCR=117;TR=232;WE=10085682;WS=10085664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chrX	10166198	rs2240019	A	C	1007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=26;PP=745;SC=TTTTACTTCTACTAACTCATT;SOR=2.584;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=32;WE=10166206;WS=10166188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chrX	11313027	rs946252	T	C	4278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=85;PP=2712;ReadPosRankSum=-0.946;SC=AAAAATCTGCTCATAGTTGGT;SOR=1.261;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=55;TCR=86;TR=139;WE=11313035;WS=11313017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,156:0.99:158
chrX	11778471	rs6530452	G	T	697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=7;PP=397;SC=ACTTTTAGTCGTTGTTTCATA;SOR=1.136;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=14;TCR=7;TR=21;WE=11778479;WS=11778461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chrX	11778783	rs113260622	C	CCTT	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=3;PP=470;SC=TTCTAAATAACAGTGTTTTCA;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=9;WE=11778791;WS=11778773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chrX	11779538	rs2107422	A	G	2978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=40;PP=1724;SC=AGTAGCACCCACACTACACGT;SOR=1.112;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=63;TCR=40;TR=103;WE=11779546;WS=11779528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chrX	11786839	rs2525868	T	C	1866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=36;PP=1122;SC=ATGGTTCCTTTATTTGTGATT;SOR=1.839;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=17;TCR=36;TR=53;WE=11786847;WS=11786829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chrX	12516777	rs111618469	CT	C	114.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=5.844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.47;ReadPosRankSum=0.587;SOR=0.680;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,16:0.21:78
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chrX	12628049	rs2304604	T	C	1251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=31;PP=969;SC=TCTGCCACACTCTGCCAGAAT;SOR=2.948;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=37;WE=12628057;WS=12628026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chrX	12633034	rs6654760	T	C	1481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=28;PP=939;SC=CCTGTTCTGCTTTGAAGGCTG;SOR=1.358;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=17;TCR=28;TR=45;WE=12633042;WS=12633024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chrX	12722616	rs4469660	C	G	4606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=86;PP=2691;SC=TATCACATTTCCATCTTAAAA;SOR=1.234;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=62;TCR=86;TR=148;WE=12722624;WS=12722606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chrX	12809661	rs1731469	G	A	6672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=118;NR=113;PP=2965;SC=ATCAGGACCTGTCCCAGCGCG;SOR=0.822;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=232;TCF=118;TCR=114;TR=231;WE=12809669;WS=12809651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,262:1.00:262
chrX	12828084	rs201390974	CAAAAG	C	895.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=1;PP=691;SC=TTTAAAAAAACAAAAGAAAAC;SOR=3.160;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=15;WE=12828096;WS=12828074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chrX	12837558	rs5935399	C	T	857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=1;PP=640;SC=GCTACATTCCCAAAATACAAC;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=12837566;WS=12837548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chrX	12838934	rs917580	A	G	6231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=115;PP=2965;SC=TACTGTCTATACACCAAAGGC;SOR=1.214;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=199;TCF=84;TCR=115;TR=199;WE=12838942;WS=12838924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chrX	12903659	rs179008	A	T	2804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=24;PP=1845;SC=CTGAAGAGACAAATTCTTATC;SOR=1.784;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=63;TCR=24;TR=87;WE=12903667;WS=12903649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chrX	12924697	rs3764879	C	G	2089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=16;PP=1535;SC=ACACACGCTACGTTCTGCTGA;SOR=2.206;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=51;TCR=16;TR=67;WE=12924705;WS=12924687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chrX	12924826	rs3764880	A	G	6124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=111;NR=96;PP=2965;SC=CAACAGAAACATGGTAAGCCA;SOR=0.719;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=207;TCF=111;TCR=96;TR=207;WE=12924834;WS=12924816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chrX	12937513	rs2159377	C	T	7615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=128;NR=123;PP=2965;SC=ATATCACAGACGGGGCATTCC;SOR=0.760;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=251;TCF=128;TCR=123;TR=251;WE=12937532;WS=12937503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,277:1.00:277
chrX	12937804	rs5744080	C	T	12465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=471;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=220;NR=207;PP=2965;SC=CTCTTTCACACGTGCCACCCA;SOR=0.737;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=427;TCF=220;TCR=207;TR=427;WE=12937812;WS=12937794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,468:1.00:468
chrX	12939112	rs2407992	G	C	7819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=120;NR=119;PP=2965;SC=TTAATAGGCTGAAGCACATCC;SOR=0.815;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=241;TCF=121;TCR=120;TR=239;WE=12939120;WS=12939102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,276:1.00:276
chrX	12939412	rs3747414	C	A	13134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=480;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=218;NR=219;PP=2965;SC=TAAAAACAATCAACAAATCCG;SOR=0.710;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=437;TCF=218;TCR=219;TR=437;WE=12939420;WS=12939402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,480:1.00:480
chrX	12939928	rs2109135	T	C	6331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=114;NR=106;PP=2965;SC=GGGATTGGGATCCGGGATTGG;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=220;TCF=114;TCR=106;TR=220;WE=12939936;WS=12939918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chrX	13056654	rs4830483	T	C	1070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=14;PP=539;SC=GTGATTAAAATTGGGTAAATT;SOR=0.741;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=18;TCR=14;TR=32;WE=13056662;WS=13056644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chrX	13637306	rs139523577	A	G	10189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=384;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=191;NR=171;PP=2965;SC=GAAGCAGGTGAATTCGGCCTG;SOR=0.775;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=364;TCF=192;TCR=172;TR=362;WE=13637314;WS=13637296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,381:1.00:381
chrX	13680580	rs141411768	G	A	1710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=13;PP=1246;SC=GACTAGCAACGGCAAACTTAA;SOR=2.226;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=45;TCR=13;TR=58;WE=13680588;WS=13680570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chrX	13681679	rs5935650	G	T	2499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=57;PP=1692;SC=TGGGTGTGCTGGTAACTGTAA;SOR=2.168;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=20;TCR=57;TR=77;WE=13681687;WS=13681669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chrX	13956661	rs3833419	CG	C	3392.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=6;NR=36;PP=1604;SC=GTGAGGGCTGCGGGGCGTTCG;SOR=0.733;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=45;TCF=6;TCR=39;TR=42;WE=13956669;WS=13956651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chrX	14038772	rs56403225	C	CT	687.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=15;PP=681;SC=TAAATACCTACCTACATGAGG;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=16;WE=14038780;WS=14038762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chrX	14599230	rs2074210	A	G	645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=4;PP=481;SC=AATCAGGGAGAAGAATGAGAG;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=14599238;WS=14599220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chrX	14599572	rs2074211	A	G	1966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=50;PP=1457;SC=CCATTTCTCCACTAATGTAGA;SOR=1.897;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=20;TCR=50;TR=70;WE=14599580;WS=14599562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chrX	14627144	rs2229963	T	C	3169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=57;NR=50;PP=1682;SC=TCAAGTTTCATCTGGAACGCC;SOR=0.758;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=58;TCR=50;TR=107;WE=14627152;WS=14627134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chrX	14868806	rs2905223	A	G	842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=14;PP=409;SC=TCTAAAAAAAAAAGTTTAAAT;SOR=1.402;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=30;TCF=14;TCR=16;TR=28;WE=14868814;WS=14868796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chrX	14930353	rs11400370	C	CT	743.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;MQRankSum=0.371;NF=19;NR=3;PP=435;ReadPosRankSum=1.503;SC=AATAGTTATCCTTTTTTTTTG;SOR=3.126;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=22;WE=14930361;WS=14930343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,29:0.97:30
chrX	15262814	.	TA	T	57.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.174;ClippingRankSum=0.000;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=1.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.09;ReadPosRankSum=-0.013;SOR=0.397;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,11:0.21:53
chrX	15333842	rs4830529	T	A	262.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=9;PP=213;SC=GTTACCGAGATCTCTGTAGGT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=15333850;WS=15333832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
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chrX	15373247	.	T	TA	61.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.165;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=1.495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.62;ReadPosRankSum=-1.310;SOR=1.012;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,8:0.21:38
chrX	15408419	rs2317326	T	C	1321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=33;PP=832;SC=GGCTTATTTTTGAAGATCAAA;SOR=1.958;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=48;TCF=14;TCR=34;TR=47;WE=15408427;WS=15408409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chrX	15408516	rs3833896	C	CA	75.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=106;SC=TTCTGTGCAACACTCAATATA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=15408524;WS=15408506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chrX	15415583	rs8094	C	T	6651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=125;NR=87;PP=2965;SC=TGTTCTCCACCTGGACACTGT;SOR=0.968;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=212;TCF=125;TCR=87;TR=212;WE=15415591;WS=15415573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chrX	15415780	rs3829989	C	T	410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=285;SC=CTTAGTAATTCCCTTGAATCT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=15415788;WS=15415770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	15498034	rs5935986	T	C	1480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=32;PP=952;SC=GCAAGCCTCATTGAAAACTAC;SOR=1.101;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=23;TCR=32;TR=55;WE=15498042;WS=15498024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chrX	15552564	rs1877752	T	C	1376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=29;PP=695;SC=TAGGGAACCATGAAAGTAGGA;SOR=1.567;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=14;TCR=29;TR=43;WE=15552581;WS=15552554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chrX	15552573	rs34879154	G	GA	1133.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=23;PP=757;SC=ATGAAAGTAGGAAAAAATCCT;SOR=2.073;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=15552581;WS=15552554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chrX	15554602	rs28505625	T	G	814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=7;NR=31;PP=791;SC=ATTTTTTATTTAAATATATGG;SOR=3.690;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=7;TCR=31;TR=38;WE=15554610;WS=15554592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chrX	15554625	.	CAA	C	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.000;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.29;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chrX	15596143	rs113691336	C	CATAAG	1566.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=3;PP=940;SC=ATATTTCCTACATAATAAATA;SOR=2.985;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=17;WE=15596151;WS=15596133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chrX	15607650	rs971249	T	C	313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.38;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chrX	15662935	rs5936000	T	C	1034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=2;PP=738;SC=TAATAAATAATTCATGTATGA;SOR=4.743;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=30;WE=15662943;WS=15662925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chrX	15706830	rs4060	C	A	870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.27;QD=24.88;SOR=0.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chrX	15711209	rs1996225	C	T	3986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=92;PP=2581;SC=CTTTAAATGACGTGTTGTATT;SOR=1.659;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=138;TCF=46;TCR=92;TR=138;WE=15711217;WS=15711199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chrX	15793563	rs17301840	C	G	124.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=2;PP=25;SC=AGAAAACTTGCCATTTATGAT;SOR=1.981;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=15793571;WS=15793553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chrX	15794764	rs5980183	G	A	697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=7;PP=359;SC=CCTGAGAACCGTCACCTCGGC;SOR=1.445;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=14;TCR=7;TR=21;WE=15794772;WS=15794754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chrX	15794815	rs5936050	G	A	1984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=26;PP=1218;SC=ATAATGACTCGGTTATCTCTT;SOR=1.061;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=41;TCR=26;TR=67;WE=15794823;WS=15794805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chrX	15808795	rs4830994	T	C	1562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=41;PP=1219;SC=TGGTGCGCGCTCTGGTGCCCT;SOR=2.746;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=8;TCR=41;TR=49;WE=15808803;WS=15808785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chrX	15817963	rs5980192	A	G	3766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=45;PP=2286;SC=GATTTGCAGCACTCAGTTTAA;SOR=1.187;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=128;TCF=83;TCR=45;TR=128;WE=15817971;WS=15817953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chrX	15818114	rs62985661	AT	A	2601.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=46;PP=1911;SC=GAATGAAGTTATTTTATTGGA;SOR=1.759;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=53;TCF=3;TCR=50;TR=49;WE=15818122;WS=15818104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chrX	15822013	rs5936060	C	T	4240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.99;SOR=1.779;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chrX	15822022	rs5934280	C	T	3949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.88;SOR=2.049;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chrX	15826162	rs57639759	CA	C	304.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=197;SC=GACCCTGTCTCAAAAAAAAAA;SOR=3.767;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=11;WE=15826170;WS=15826152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	15826556	rs5936061	T	C	287.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=238;SC=ACAAACTTTATTGATGAACAA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=15826564;WS=15826546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chrX	15827524	rs5980193	T	G	2089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=34;PP=1261;SC=GAGAGGCGCATGTTTCCATTT;SOR=1.061;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=30;TCR=34;TR=64;WE=15827532;WS=15827514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chrX	15827563	rs6629131	C	T	1069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=22;PP=692;SC=CATCTGCTGCCTTCTTGCTGC;SOR=1.493;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=14;TCR=22;TR=36;WE=15827571;WS=15827553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chrX	15836648	rs5936062	T	G	5086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=57;PP=2953;SC=CAAACAACATTTGATGAATGG;SOR=1.088;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=162;TCF=105;TCR=57;TR=161;WE=15836656;WS=15836638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chrX	15838366	rs2301724	C	T	6464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=135;NR=86;PP=2965;SC=CTCTGTTTAACGGACGATGGT;SOR=1.127;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=222;TCF=136;TCR=86;TR=221;WE=15838374;WS=15838350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chrX	16168467	rs4986945	T	C	4857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=69;PP=2965;SC=TCCAGGCCTCTCATGCCCTGA;SOR=0.865;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=157;TCF=88;TCR=69;TR=157;WE=16168475;WS=16168457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chrX	16168677	rs4986946	T	C	9861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=361;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=174;NR=153;PP=2965;SC=TCTACGTCATTCCACTGTCGA;SOR=0.744;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=328;TCF=174;TCR=154;TR=327;WE=16168685;WS=16168667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,361:1.00:361
chrX	16189670	rs12839379	G	A	532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=18;PP=456;SC=TGTCTACCGCGTGTTCCTTTG;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=16189678;WS=16189660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chrX	16608793	rs1527805	G	A	5238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=108;NR=62;PP=2965;SC=CCTGTGAGGCGAGTCCTATAA;SOR=1.251;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=170;TCF=108;TCR=62;TR=170;WE=16608801;WS=16608783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chrX	16762002	rs4830562	A	G	1567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=38;PP=1074;SC=CATGGCCTCCATTATGTGCTC;SOR=1.733;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=17;TCR=38;TR=55;WE=16762010;WS=16761992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chrX	16887655	rs67984110	C	T	7275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=130;NR=117;PP=2965;SC=AGGGGCTGCGCGACCCAGTCG;SOR=0.722;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=247;TCF=130;TCR=117;TR=247;WE=16887663;WS=16887645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,276:1.00:276
chrX	17070688	rs933946	G	A	783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=21;PP=544;SC=GACTACAGGAGTGAATACAAC;SOR=3.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=25;WE=17070696;WS=17070678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chrX	17080492	rs713355	G	A	719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=3;PP=563;SC=GCACAGAAAAGCTGATGGGAA;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=24;WE=17080500;WS=17080482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chrX	17086436	.	C	CA	34.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.706;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.58;ReadPosRankSum=-0.849;SOR=0.157;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chrX	17092152	rs1346246	G	T	3164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=25;PP=1823;SC=ACATTTACCTGTTGATGTGTT;SOR=1.877;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=90;TCF=65;TCR=25;TR=90;WE=17092160;WS=17092142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chrX	17122102	rs714070	C	T	351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=293;SC=AGAAAGTTTCCTCAATAAGCC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=17122110;WS=17122092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chrX	17157148	rs1946395	T	A	2050.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=46;PP=1039;SC=AGCTTTTTTTTAATTTAATAG;SOR=1.547;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=71;TCF=24;TCR=47;TR=69;WE=17157156;WS=17157138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chrX	17705850	rs5901624	C	CT	9986.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=88;PP=2971;SC=CGCCCTGTTTCTTGTCTTGCA;SOR=0.789;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=143;TCF=45;TCR=98;TR=126;WE=17705858;WS=17705840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,283:1.00:283
chrX	17819377	rs6527818	T	C	7728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=130;NR=131;PP=2965;SC=CTCTGAGGCATCGGGATGGGG;SOR=0.756;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=261;TCF=130;TCR=131;TR=261;WE=17819385;WS=17819367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,291:1.00:291
chrX	18671795	rs56396491	AT	GA	2536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=34;PP=2143;SC=TGTTGTTAAGATCAAAAACCA;SOR=1.692;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=15;TCR=34;TR=49;WE=18671804;WS=18671785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chrX	18779721	rs2269584	A	G	2139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=42;PP=1302;SC=CTAAATATTAACATTTTTCTT;SOR=1.379;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=70;TCF=28;TCR=42;TR=69;WE=18779729;WS=18779711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chrX	18824794	rs2239437	T	G	542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=13;PP=361;SC=CAACAAAATGTAAATAGTTCC;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=18824802;WS=18824784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chrX	18844012	rs2273247	G	A	2110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=43;PP=1340;SC=TGTATGTTGGGGATACAAAAT;SOR=1.252;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=29;TCR=43;TR=72;WE=18844020;WS=18844002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chrX	18929128	rs11291764	CT	C	640.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.947;NF=2;NR=32;PP=349;ReadPosRankSum=1.615;SC=AAGAACAACACTTTTTTTTTT;SOR=0.999;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=59;TCF=5;TCR=54;TR=34;WE=18929137;WS=18929118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,34:0.79:43
chrX	19041592	rs5909263	C	T	3416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=65;NR=52;PP=2020;SC=ACAAAAAACACGTATACACAT;SOR=0.772;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=117;TCF=65;TCR=52;TR=117;WE=19041600;WS=19041582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chrX	19058405	rs6633185	C	T	487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=5;NR=11;PP=289;SC=TAAAATTGTACTATATTAAGG;SOR=1.863;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=16;WE=19058413;WS=19058395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chrX	19363863	rs10616757	TCC	T	294.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=1.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.56;ReadPosRankSum=1.093;SOR=0.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,14:0.26:53
chrX	19443722	rs56212339	T	C	6862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=115;NR=114;PP=2965;SC=GCCAGCATGCTGACGCTGAAG;SOR=0.741;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=229;TCF=115;TCR=114;TR=229;WE=19443730;WS=19443712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
chrX	19478294	rs5909118	T	A	1762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=40;PP=1089;SC=AAACACAAAATCCTCCAGTCA;SOR=1.839;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=19;TCR=40;TR=59;WE=19478302;WS=19478284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chrX	19478336	rs61014139	C	CA	413.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=13;PP=487;SC=GTCTTGCGCCCAAAATGGTTC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=13;WE=19478344;WS=19478326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chrX	19482476	rs5909299	C	T	5406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=85;PP=2965;SC=AAATAATCAGCGCACGGTGTC;SOR=0.713;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=175;TCF=90;TCR=85;TR=175;WE=19482484;WS=19482466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chrX	19504766	rs41309579	A	G	396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=10;PP=330;SC=GCAAGAATTAATCATGTGAAA;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=19504774;WS=19504756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chrX	19688957	.	CAA	C	167.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.483;ClippingRankSum=0.000;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=3.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.37;MQRankSum=-0.900;QD=5.08;ReadPosRankSum=0.939;SOR=0.275;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,10:0.30:33
chrX	19905613	.	TGCTGCTGCC	T	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=4;PP=1110;SC=CTGCCTCTGCTGCTGCTGCCG;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=4;WE=19905629;WS=19905603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chrX	20070824	rs41311495	G	A	3984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=64;PP=2216;SC=GCCGTGCCACGTTCCAAAGTC;SOR=0.915;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=64;TCR=64;TR=128;WE=20070832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chrX	20204548	.	TAA	T	98.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=-0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.10;ReadPosRankSum=1.068;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chrX	21861434	rs3213451	A	G	5595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=106;PP=2965;ReadPosRankSum=2.686;SC=TGCTTTACCAATGGTATTCTT;SOR=1.057;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=193;TCF=87;TCR=106;TR=192;WE=21861442;WS=21861424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,209:0.99:211
chrX	21875821	rs11339991	TA	T	476.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=15;PP=261;SC=CTAAGAGTTTTAAAAAAAAAT;SOR=4.514;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=15;WE=21875829;WS=21875811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chrX	21985464	rs3747276	C	T	4945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=93;NR=74;PP=2569;SC=GTTCTTCATACCTGGTCACTT;SOR=0.757;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=167;TCF=93;TCR=74;TR=167;WE=21985472;WS=21985454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chrX	21997285	rs60262050	C	G	386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=291;SC=TCCAGATTCTCTGAATTAAAT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=21997293;WS=21997275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	23398214	rs5926304	T	C	5501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=81;PP=2965;SC=CCATCCTGTGTTGCTCTATGC;SOR=0.725;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=167;TCF=85;TCR=82;TR=166;WE=23398222;WS=23398204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chrX	23739857	rs5970601	A	G	569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=17;NR=0;PP=396;SC=CCCACCATCCATATGACATGA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=23739865;WS=23739849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chrX	23748501	rs12388535	C	T	406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=1;PP=286;SC=TGAGCCACCACGCCCGGCCGA;SOR=3.126;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=23748509;WS=23748491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chrX	23801593	rs3764885	A	G	733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=20;PP=600;SC=CGTTTCCCAGAGTGGGGTGAT;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=23801601;WS=23801583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chrX	23801702	rs3764884	G	C	715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=3;PP=549;SC=GCCCCATTCCGTTCCCCTGAG;SOR=2.925;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=23801710;WS=23801692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chrX	23928489	rs2707164	C	T	1941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=29;PP=1212;SC=ACAAAAAGTTCGCAGAGTACA;SOR=0.874;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=38;TCR=29;TR=67;WE=23928497;WS=23928479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chrX	23934202	rs2520230	A	G	251.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=207;SC=TTCATTACCAATTCTTTACAT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=23934210;WS=23934192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chrX	23945611	rs2707144	G	T	328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.40;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chrX	24073761	rs36018672	C	T	7981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=136;NR=138;PP=2965;SC=CACTTTCACACGAAGTTATCA;SOR=0.761;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=274;TCF=136;TCR=138;TR=274;WE=24073769;WS=24073751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,302:1.00:302
chrX	24075985	.	G	GT	182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=209;SC=TGGTTTTGTTGTTTTTCCATT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=6;WE=24075993;WS=24075975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chrX	24536954	rs71925765	GCACA	G,GCA	515.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;QD=27.14;SOR=2.049;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,12,7:0.63,0.37:19
chrX	24580746	rs1882403	A	G	705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=22;PP=580;SC=ACCTACACTCATACCACATCC;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=24580754;WS=24580736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chrX	24593453	rs3833417	GA	G	2114.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;MQRankSum=0.028;NF=3;NR=69;PP=1016;ReadPosRankSum=0.938;SC=AAGTTTACAGGAAAAAAAAAA;SOR=0.539;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=90;TCF=4;TCR=86;TR=72;WE=24593462;WS=24593441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:7,94:0.93:101
chrX	24593513	rs3747401	T	G	811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=24;PP=649;SC=CACATTAAAGTTCATATTTTA;SOR=3.767;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=29;WE=24593521;WS=24593503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chrX	24665381	rs140304068	A	AC	455.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=15;PP=558;SC=TAAAGAGGTTACCCCCCGCCC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=15;WE=24665400;WS=24665371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chrX	24665391	.	CCT	C	147.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.722;ClippingRankSum=-0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=3;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.335;NF=0;NR=12;PP=230;ReadPosRankSum=0.913;SC=ACCCCCCGCCCCTCTCTCTCT;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=24665400;WS=24665371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chrX	24751958	rs4058344	T	C	2499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=40;PP=1596;SC=ATATGAAGCATCTGTTTGTTT;SOR=0.780;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=86;TCF=46;TCR=40;TR=85;WE=24751966;WS=24751948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chrX	24760276	rs113389943	AC	A	180.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=1.413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.28;MQRankSum=2.408;QD=3.69;ReadPosRankSum=-0.077;SOR=1.158;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,16:0.33:49
chrX	24766651	rs3764770	G	A	879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=24;PP=673;SC=GAGTAAACAGGATGCTGGGCA;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=24766659;WS=24766641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chrX	26157079	.	C	A	1645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=13;PP=920;SC=GCACTATTGTCTGTAGTCCCT;SOR=1.688;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=35;TCR=13;TR=48;WE=26157087;WS=26157069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chrX	27479339	rs12842916	A	G	6537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=111;NR=98;PP=2965;SC=TGGCATAACTACTTCTCCTGC;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=209;TCF=111;TCR=98;TR=209;WE=27479347;WS=27479329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chrX	27480677	rs138981902	G	A	3387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=59;PP=2093;SC=CTTGAACTTCGCATCGTTGGT;SOR=0.828;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=56;TCR=59;TR=115;WE=27480685;WS=27480667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chrX	27765399	.	AGAGGAGGAGGAG	A,AGAG	2293.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=61.33;QD=38.23;SOR=1.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,13,47:0.22,0.78:60
chrX	27839572	rs1368769	T	C	5166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=93;NR=70;PP=2965;SC=AAGGATGTTTTCCAGAGTTCA;SOR=0.871;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=163;TCF=93;TCR=70;TR=163;WE=27839580;WS=27839562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chrX	27839617	rs12557898	G	A	6070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=114;NR=91;PP=2965;SC=CATGGACTTCGGGAAGCCCAA;SOR=0.862;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=205;TCF=114;TCR=91;TR=205;WE=27839639;WS=27839607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chrX	28807345	rs12009069	G	A	203.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=164;SC=TCATTGCACCGATCATGTTTG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=28807353;WS=28807335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chrX	28807442	rs6526806	G	A	2437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=25;PP=1346;SC=TTTAGGGAACGGCCTTTAAGA;SOR=1.191;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=51;TCR=25;TR=76;WE=28807450;WS=28807432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chrX	29417510	rs4829347	C	A	296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=215;SC=GATATTTTTACTCTCTAAAGA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=29417518;WS=29417500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chrX	30236878	rs2529541	G	A	5815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=98;NR=94;PP=2965;SC=CATTCCCCAGGAGCCTCAGAG;SOR=0.732;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=192;TCF=98;TCR=94;TR=192;WE=30236886;WS=30236868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chrX	30254376	rs2071309	T	C	5125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=77;PP=2965;SC=GACCCTCTAATCATGAAGACA;SOR=0.714;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=168;TCF=90;TCR=78;TR=167;WE=30254384;WS=30254366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chrX	30261002	rs2071311	A	G	4878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;PP=2965;SC=AAGATCTGGTACAGGAAAAAT;SOR=0.887;Source=Platypus;TCF=87;WE=30261010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chrX	30261158	rs2856733	G	C	10269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=377;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=174;NR=169;PP=2965;SC=ACTTCCCACTGCTTTATGAAG;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=344;TCF=174;TCR=170;TR=343;WE=30261166;WS=30261148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,376:1.00:376
chrX	30323948	rs3788890	T	G	1965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=22;PP=1241;SC=TTAATGATGATTGCAATCATT;SOR=1.244;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=63;TCF=41;TCR=22;TR=62;WE=30323956;WS=30323938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chrX	30327367	rs6150	G	A	8791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=142;NR=163;PP=2965;SC=AACAGCCCCAGCACTGATCCA;SOR=0.840;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=305;TCF=142;TCR=163;TR=305;WE=30327375;WS=30327357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,333:1.00:333
chrX	30671896	rs12854653	G	C	866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=22;PP=676;SC=GGATGCCCCAGCCAGGCCTGG;SOR=2.226;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=28;WE=30671904;WS=30671886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chrX	30709444	rs55895067	G	A	894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=22;PP=668;SC=TCTTTTTCCCGGATAATTGAG;SOR=2.621;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=28;WE=30709452;WS=30709434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chrX	30712796	rs5927587	G	C	857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=22;PP=637;SC=AACAGGAGAAGTTTTCAGCTT;SOR=3.180;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=25;WE=30712804;WS=30712786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chrX	30715827	rs2035432	C	T	9188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=347;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.56;SOR=0.841;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,346:1.00:346
chrX	30725794	rs4617310	C	T	585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=7;NR=12;PP=316;SC=TACTATTAAACAACTTTTAGT;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=19;WE=30725802;WS=30725784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chrX	30742592	rs75486718	GA	G	951.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=20;NR=8;PP=452;SC=TCTTCTTAATGAAAAAAAAAA;SOR=1.923;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=33;TCF=22;TCR=11;TR=28;WE=30742600;WS=30742582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chrX	30745790	rs5927596	A	T	1143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=27;PP=758;SC=GAAAATCAATAAAAGGTCTAA;SOR=1.900;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=10;TCR=27;TR=37;WE=30745798;WS=30745780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chrX	30872602	rs5927629	A	G	8288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=149;NR=130;PP=2965;SC=TGTTGATTCCATGGAGATGGT;SOR=0.719;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=279;TCF=149;TCR=130;TR=279;WE=30872610;WS=30872592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,308:1.00:308
chrX	30877477	rs137921689	C	CCA	229.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=311;ReadPosRankSum=0.358;SC=AAATCCTGCTCCACACACACA;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=8;WE=30877485;WS=30877472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chrX	31165310	rs1484852	C	T	2427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=22;PP=1554;SC=GCTTGTTGCACCTATAAAAAG;SOR=1.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=58;TCR=22;TR=80;WE=31165318;WS=31165300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chrX	31165667	rs200534475	AAAAG	A	1752.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.44;QD=42.75;SOR=0.954;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chrX	31191589	rs2404496	C	T	2277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=16;PP=1343;SC=TTTAAAATATCATAGGTTAGC;SOR=1.893;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=49;TCR=16;TR=65;WE=31191597;WS=31191579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chrX	31224684	rs2293668	A	G	6013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=119;NR=75;PP=2965;SC=TACAGCATTAATATACACGAC;SOR=1.173;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=196;TCF=120;TCR=76;TR=194;WE=31224692;WS=31224674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chrX	31224881	rs2293667	G	A	2585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=60;PP=1770;SC=GAAAAATAAAGGAGTAAAGTG;SOR=1.927;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=25;TCR=60;TR=85;WE=31224889;WS=31224871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chrX	31496350	rs1800280	C	T	5589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=106;NR=84;PP=2965;SC=TTGAAGTTCCCGGAGTCTTTC;SOR=0.905;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=190;TCF=106;TCR=84;TR=190;WE=31496358;WS=31496340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chrX	31526200	rs3788893	C	T	489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=0;PP=379;SC=ATTTAATACACATTTTTAGGC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=31526208;WS=31526196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chrX	31837916	rs17341004	A	G	518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=0;PP=376;SC=AACACTTTGAATCAGAGTCAA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=31837924;WS=31837908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chrX	31854782	rs1379871	G	C	5688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=117;NR=73;PP=2965;SC=GTACAACAGGGGAAGCATAAC;SOR=1.173;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=190;TCF=117;TCR=73;TR=190;WE=31854790;WS=31854772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chrX	31893307	rs1800275	T	G	1847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=8;PP=1245;ReadPosRankSum=1.594;SC=TTCCCTACCTTAACGTCAAAT;SOR=1.432;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=57;TCF=49;TCR=8;TR=56;WE=31893315;WS=31893297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,62:0.98:63
chrX	31986430	rs3761604	C	A	1670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=13;PP=1212;SC=AAAATGTTTTCATTCCTATTA;SOR=2.507;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=44;TCR=13;TR=57;WE=31986438;WS=31986420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chrX	32360138	rs3833416	CTT	C	1439.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.27;QD=35.99;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chrX	32363964	rs10626188	A	AAG	586.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=0;PP=518;SC=TCTGATGACTAAGTCTGAAGC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=12;WE=32363972;WS=32363954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	32380996	rs1801187	C	T	4253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=65;PP=2386;SC=GTGGTCACCGCGGTTTGCCAT;SOR=0.814;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=136;TCF=70;TCR=66;TR=135;WE=32381004;WS=32380986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chrX	32459169	rs41303185	G	A	379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=287;SC=CAAAGTACCAGTGCTGAGTGA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=32459177;WS=32459159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chrX	32503194	rs228406	T	C	5933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=108;PP=2965;SC=AGGTTGAAGATCTGATAGCCG;SOR=0.943;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=197;TCF=89;TCR=108;TR=197;WE=32503202;WS=32503184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chrX	32563488	rs115571	A	C	1461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=33;PP=840;SC=AGACATTGCTAGAAAGACTTC;SOR=1.412;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=19;TCR=33;TR=52;WE=32563496;WS=32563478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chrX	32868070	rs3764763	C	T	650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=17;PP=448;SC=CCGAAGATGACGGATGAAAAA;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=32868078;WS=32868060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chrX	35820265	rs5928990	C	T	7118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=138;NR=102;PP=2965;SC=TTCTTCATTGCCTGCCCTCCT;SOR=0.917;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=240;TCF=138;TCR=102;TR=240;WE=35820273;WS=35820255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chrX	35820425	rs1410961	C	T	8414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=144;NR=143;PP=2965;SC=GGAGAAGACCCTCCTCTCCTC;SOR=0.772;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=287;TCF=144;TCR=143;TR=287;WE=35820433;WS=35820415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,314:1.00:314
chrX	35820696	rs1410962	G	A	4185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=69;PP=2347;SC=CTGCACAAGTGTCAGATGAAA;SOR=0.718;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=148;TCF=78;TCR=70;TR=146;WE=35820704;WS=35820686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chrX	35820795	rs5973488	A	G	3483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=53;PP=2040;SC=GCTTCTGAGCACCTAGAGATG;SOR=0.772;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=59;TCR=53;TR=112;WE=35820803;WS=35820785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chrX	35821055	rs4829390	AT	GA	6260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=54;PP=2947;SC=AGAGCCCAGAATGCTCATCAC;SOR=0.796;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=70;TCR=55;TR=121;WE=35821064;WS=35821045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chrX	35821127	rs4829392	C	T	4316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=58;PP=2735;SC=TGATCCTGCACGATATGAATT;SOR=0.970;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=137;TCF=79;TCR=58;TR=137;WE=35821135;WS=35821117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chrX	35821302	rs4829393	C	G	4236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.80;SOR=1.586;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chrX	35821308	rs4829394	C	T	4014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.11;SOR=1.718;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chrX	36156447	rs376682738	AT	A	90.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.74;ReadPosRankSum=0.771;SOR=0.581;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,12:0.23:52
chrX	36303871	rs6629068	T	C	7050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=110;NR=135;PP=2965;SC=TCATAGACTCTGTCATTTTGT;SOR=1.043;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=245;TCF=110;TCR=135;TR=245;WE=36303879;WS=36303861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,276:1.00:276
chrX	36371719	rs41309695	T	A	5128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=93;PP=2922;SC=TTTTTCGGATTTAGTCTTACT;SOR=1.014;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=168;TCF=75;TCR=93;TR=168;WE=36371727;WS=36371709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chrX	36385156	rs6632593	A	G	7060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=126;NR=114;PP=2965;SC=TCGCTACTGAACCTGATACGG;SOR=0.716;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=240;TCF=126;TCR=114;TR=240;WE=36385164;WS=36385146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chrX	36403036	rs6527569	A	G	9121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=348;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.98;NF=145;NR=171;PP=2965;SC=GTCCGTCCACATAATTTTGTC;SOR=0.950;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=316;TCF=145;TCR=171;TR=316;WE=36403044;WS=36403026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,346:1.00:346
chrX	37515166	rs5963876	G	T	831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=21;PP=638;SC=GTCATTACTAGTCATTTAATA;SOR=3.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=25;WE=37515174;WS=37515156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chrX	37518806	rs12009345	C	T	5837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=100;NR=91;PP=2965;SC=TATGGCAGAGCGTGGACTTTC;SOR=0.748;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=191;TCF=100;TCR=91;TR=191;WE=37518814;WS=37518796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chrX	37526763	.	C	CT	35	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.6253;HP=12;HapScore=2;MGOF=19;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=35;QD=14.6666666667;SC=CTTTATGGGTCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=37526771;WS=37526753;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chrX	37527659	rs28503960	T	C	6009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=116;NR=79;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.572;SC=GAACATCTGCTGTATACCAGA;SOR=0.358;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=196;TCF=117;TCR=79;TR=195;WE=37527667;WS=37527649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,227:1.00:228
chrX	37587804	rs2230148	A	T	1982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=48;PP=1346;SC=CACAGGGAACAAGGCAGGAAG;SOR=2.235;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=16;TCR=48;TR=64;WE=37587812;WS=37587794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chrX	37641526	rs4422908	C	A	961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=27;PP=818;SC=ATTTTAAATACATATTCTGAC;SOR=4.479;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=29;WE=37641534;WS=37641516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chrX	37696553	rs7055948	T	C	90.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=1;PP=25;SC=GAGGCAGAGGTTGCAGTGAGC;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=37696561;WS=37696543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chrX	37699978	rs3138880	C	T	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=52;ReadPosRankSum=-0.293;SC=TATATATATACACACACACAC;SOR=0.850;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=6;WE=37699986;WS=37699968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chrX	37701208	rs5964203	A	G	4278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=92;PP=2783;SC=TTGTTCAAAAAGAACAATTTT;SOR=1.421;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=53;TCR=92;TR=145;WE=37701216;WS=37701198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chrX	37706211	.	T	C	3774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=47;PP=1920;SC=CATGGGTTTCTGGTGAGGGTT;SOR=1.187;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=76;TCR=47;TR=123;WE=37706219;WS=37706201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chrX	37883200	rs73463468	A	G	935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=21;NR=7;PP=503;SC=TAAAAGTAATAGCAAAAACTG;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=28;WE=37883208;WS=37883190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chrX	37932886	rs4827330	A	G	2798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=41;PP=1693;SC=GCCAGGATGCAGAAAAGTCAG;SOR=1.049;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=60;TCR=41;TR=101;WE=37932894;WS=37932876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chrX	37935776	rs5917525	G	T	2207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=15;PP=1470;SC=ATTTTTAAATGCTTTCTTTCT;SOR=2.242;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=71;TCF=55;TCR=16;TR=70;WE=37935784;WS=37935766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chrX	37935994	rs5918468	T	A	2378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=55;PP=1520;SC=TAGCCTGAGGTTAAGGTTGAT;SOR=1.995;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=22;TCR=55;TR=77;WE=37936002;WS=37935984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chrX	37948832	rs4827331	A	G	1953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.830;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=52;PP=1425;ReadPosRankSum=0.020;SC=GACCTCAGTCATCAGTAGAGT;SOR=2.472;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=71;TCF=18;TCR=53;TR=69;WE=37948840;WS=37948822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,71:0.97:73
chrX	37961512	rs151146415	TGAAA	T	1732.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=3;PP=1299;SC=CAAATATTTATGAAAGAAAGT;SOR=4.021;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=27;WE=37961523;WS=37961502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chrX	37962139	rs56132111	A	T	856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=2;PP=613;SC=GTCCTTTCTTACTTTAGTGTT;SOR=4.332;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=24;WE=37962147;WS=37962129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chrX	37967868	rs5918476	T	C	4288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=94;NR=59;PP=2788;SC=TCAAGTCATATCTTCTTCCTG;SOR=1.116;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=153;TCF=94;TCR=59;TR=153;WE=37967876;WS=37967858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chrX	37979767	rs4827334	A	C	2721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=66;PP=1624;SC=TGTTTCTAGAAGTGTGGTAGT;SOR=2.078;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=90;TCF=24;TCR=66;TR=90;WE=37979775;WS=37979757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chrX	37981474	rs56406900	T	A	9227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=159;NR=154;PP=2965;SC=AAGGGGTAACTTTGTTTTAGC;SOR=0.759;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=313;TCF=159;TCR=154;TR=313;WE=37981482;WS=37981464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,345:1.00:345
chrX	38080703	rs7877137	G	T	6596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=111;NR=115;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.678;SC=CCATACTACAGATTTTTTGTT;SOR=0.323;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=227;TCF=111;TCR=116;TR=226;WE=38080711;WS=38080693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,255:1.00:256
chrX	38158290	rs1801686	C	T	5565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=78;PP=2965;SC=GCAGAAAAGTCGCCACAGATA;SOR=0.944;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=186;TCF=108;TCR=78;TR=186;WE=38158298;WS=38158280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chrX	38169777	rs35587043	T	TA	4066.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=38;PP=2133;ReadPosRankSum=0.388;SC=CTTACCACAATAAAAAAATGA;SOR=0.600;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=88;TCF=41;TCR=47;TR=73;WE=38169799;WS=38169767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,133:0.99:134
chrX	38178019	rs3810692	G	A	3602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=43;PP=2189;SC=GGTTTACTGAGTTGGCATATA;SOR=1.162;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=76;TCR=43;TR=119;WE=38178027;WS=38178009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chrX	38535174	rs4826996	A	G	1737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=46;PP=1256;SC=GGGCTTTTTTATTTCCATGAA;SOR=3.500;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=6;TCR=46;TR=52;WE=38535182;WS=38535164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chrX	39921860	rs55700604	C	A	412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=2;PP=285;SC=AGAAGACATGCTCCTCTAGGA;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=39921868;WS=39921852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	39922359	rs3810694	A	G	153.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.97;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chrX	40456961	rs3112299	G	C	3374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=74;PP=2331;SC=ATTAATTTCCGTCTTTTTAAA;SOR=1.781;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=33;TCR=74;TR=107;WE=40456969;WS=40456951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chrX	40499403	.	C	T	70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=3;NR=1;PP=70;QD=26.1928031368;SC=GGCAACAAAGCAAGACTCCCA;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=40499411;WS=40499393;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chrX	40506697	rs6610447	A	G	6491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=120;NR=102;PP=2965;SC=CGCAGCAGTAACAGGCAGTGG;SOR=0.864;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=222;TCF=120;TCR=102;TR=222;WE=40506705;WS=40506687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chrX	40514322	rs11266293	G	A	2180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=43;PP=1402;SC=ACTATTTTGAGGGGGAAAAAT;SOR=1.124;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=33;TCR=43;TR=76;WE=40514330;WS=40514312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chrX	40556492	rs5918029	C	G	1184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=22;PP=677;SC=TTATCTGTGCCCTATCGATTT;SOR=1.900;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=12;TCR=22;TR=34;WE=40556500;WS=40556482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chrX	41002844	rs5918122	T	C	416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=11;PP=332;SC=CAGGAATCTTTTTGAAATAAC;SOR=1.911;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=15;WE=41002852;WS=41002834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chrX	41010474	rs11298138	CT	C	152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=126;SC=CATCTACCTCCTTTTTTTTTA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=41010482;WS=41010464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chrX	41012486	rs55649554	TAA	T	457.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=445;SC=GCCAGCAGTTTAAGAGTCTTC;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=41012495;WS=41012476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chrX	41043944	rs5918130	T	C	2560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=47;PP=1503;SC=ACAGACTTTTTAAAAATCCTT;SOR=1.485;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=32;TCR=48;TR=78;WE=41043952;WS=41043934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chrX	41055311	rs6520734	G	C	2378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=50;PP=1716;SC=CCTGGACATAGAGCTTAAGTT;SOR=1.552;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=27;TCR=50;TR=77;WE=41055319;WS=41055301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chrX	41084534	rs2302378	G	C	1537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=46;PP=1102;SC=GTAAATAACAGGTTCTCCCCT;SOR=2.998;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=9;TCR=46;TR=55;WE=41084542;WS=41084524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chrX	41383001	rs5918194	C	T	486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=0;PP=409;SC=TGGGATGCCTCGGTCCTGGTG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=41383009;WS=41382994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chrX	41383297	rs199560653	G	GA	135.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.54;MQRankSum=1.457;QD=7.14;ReadPosRankSum=-0.858;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chrX	41530655	rs199561120	A	AT	3388.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=-2.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5852;FS=0.719;HP=12;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.882;NF=32;NR=52;PP=1071;ReadPosRankSum=-0.317;SC=GTTTTGAAGAATTTTTTTTTT;SOR=0.825;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=45;TCR=74;TR=84;WE=41530663;WS=41530645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,158:0.81:194
chrX	43591036	rs6323	G	T	8719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=146;NR=147;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.275;SC=TAATTCAGCGGCTTCCAATGG;SOR=0.274;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=294;TCF=146;TCR=148;TR=293;WE=43591044;WS=43591026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,327:1.00:328
chrX	43595428	rs2235186	A	G	4841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=66;PP=2898;SC=CAGCTCTTAAAATAAACAGCT;SOR=0.849;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=158;TCF=92;TCR=66;TR=158;WE=43595436;WS=43595418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chrX	43601142	rs979606	C	T	931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=3;PP=671;SC=ATTATTGACTCGCAGCATTTC;SOR=3.407;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=27;WE=43601150;WS=43601132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chrX	43601363	rs979605	A	G	6927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=105;NR=137;PP=2965;SC=GCAGAGTTCAATGCAAATTCT;SOR=1.083;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=242;TCF=105;TCR=137;TR=242;WE=43601371;WS=43601353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chrX	43603391	rs1137070	T	C	4040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=65;PP=2628;SC=CCGAGAAAGATATCTGGGTAC;SOR=0.792;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=136;TCF=71;TCR=65;TR=136;WE=43603399;WS=43603381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chrX	43741616	rs1181251	G	C	1453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=26;PP=855;SC=CCAGTCCTGCGTGCCAGCCAG;SOR=1.287;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=20;TCR=26;TR=46;WE=43741624;WS=43741606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chrX	44202890	rs5902346	G	GC	9038.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=89;PP=2965;SC=GCAGGCAGCGGCGCCTCCCGG;SOR=0.859;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=107;TCF=16;TCR=91;TR=104;WE=44202898;WS=44202880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
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chrX	44949951	.	GT	G	40.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.230;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=7.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.87;ReadPosRankSum=-0.298;SOR=0.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,9:0.19:47
chrX	45011340	rs4824527	T	C	1017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=23;PP=611;SC=CGGTGGCTCATGCCTGTAATC;SOR=1.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=13;TCR=23;TR=36;WE=45011348;WS=45011330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chrX	45013523	rs72059118	CCTAT	C	37.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.771;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=213;ReadPosRankSum=1.834;SC=TATCTATCTCCCTATCTATCT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=45013534;WS=45013513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chrX	46387921	rs56160764	G	A	7667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=120;NR=137;PP=2965;SC=TATTAATGCTGAGGAATTCCA;SOR=0.865;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=257;TCF=120;TCR=137;TR=257;WE=46387929;WS=46387911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,287:1.00:287
chrX	46388442	rs2003665	G	A	1580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=35;PP=1157;SC=TGCCCTTTGAGGTCCTTTACA;SOR=2.701;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=46;TCF=11;TCR=35;TR=45;WE=46388450;WS=46388432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chrX	46388458	rs5906232	T	G	1022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=25;PP=824;SC=TTACATGTACTAAAGATTTCA;SOR=2.517;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=32;WE=46388466;WS=46388448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chrX	46466775	rs1883255	G	A	360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=242;SC=AGCCTCTAGCGTGGTAACTGG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=46466783;WS=46466765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chrX	46472666	rs6611276	C	T	294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=2;PP=214;SC=CTTCTTCCTACGTAAGACACT;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=46472674;WS=46472656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chrX	46472826	rs3208940	G	A	1694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=36;NR=21;PP=905;SC=TGGGCTTCAGGTAACTTTAAA;SOR=0.966;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=36;TCR=21;TR=57;WE=46472834;WS=46472816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chrX	46618321	rs1056846	C	G	3356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=64;PP=2100;SC=TGCTGTCCTCCGCCGCCGCCC;SOR=0.916;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=118;TCF=54;TCR=64;TR=118;WE=46618329;WS=46618311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chrX	46893249	rs5906311	G	A	961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=22;PP=626;SC=GTTCCCCACAGCATTCAGACT;SOR=2.049;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=30;WE=46893257;WS=46893239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chrX	46944155	rs6611328	A	C	601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=16;PP=448;SC=GAGTTCGATAACTGCCTGGGC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=46944163;WS=46944145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chrX	46949403	rs6611330	C	T	2863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=36;NR=61;PP=1667;SC=ATGTATTTTTCATTATTTGTC;SOR=1.544;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=97;TCF=36;TCR=61;TR=97;WE=46949411;WS=46949393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chrX	46951004	rs5906327	G	T	464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=1;PP=346;SC=GAGAGCTCTCGGTTTGATTCT;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=46951012;WS=46950994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chrX	46952219	rs4480242	A	G	1054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=8;PP=752;SC=GTATATTACTACAAATCATAA;SOR=2.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=35;WE=46952227;WS=46952209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chrX	47036113	rs375726080	GTC	G	32.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.903;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.27;ReadPosRankSum=-0.536;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chrX	47057647	rs4468050	A	G	2357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=27;PP=1465;SC=TCCCGCCGCCATCCCTGGGAT;SOR=1.270;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=53;TCR=27;TR=80;WE=47057655;WS=47057637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chrX	47061018	rs4239964	C	G	3515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=67;PP=2189;SC=GGGTGAGCTGCGACCATGGGG;SOR=1.649;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=37;TCR=67;TR=104;WE=47061026;WS=47061008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chrX	47086347	rs6417923	G	A	6273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=114;NR=89;PP=2965;SC=GGAGACACACGGGGAGGACCT;SOR=0.845;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=203;TCF=114;TCR=89;TR=203;WE=47086355;WS=47086337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chrX	47229909	rs3810666	G	A	1686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=14;PP=1033;SC=ACATTGTGGCGTGAATGTGGG;SOR=1.942;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=40;TCR=14;TR=54;WE=47229917;WS=47229899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chrX	47229935	rs3810665	T	C	2795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=35;PP=1534;SC=ACTGATGATATGGATACTGTC;SOR=1.336;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=98;TCF=63;TCR=35;TR=97;WE=47229943;WS=47229925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chrX	47230204	rs6608713	T	C	481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=12;PP=328;SC=TTAGTTAAATTTATATTTTGA;SOR=2.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=16;WE=47230212;WS=47230194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chrX	47269516	rs6608717	A	G	1008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=4;PP=783;SC=GAGCTGTTCCAGGTACCCCCC;SOR=3.855;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=36;WE=47269524;WS=47269506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chrX	47372920	rs3748519	C	T	159.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=3;NR=3;PP=42;SC=TCCCTCCCGCCCACTCCCGCA;SOR=1.179;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=6;WE=47372928;WS=47372910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chrX	47430611	rs377351122	GGT	G	218.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.639;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=206;ReadPosRankSum=-1.677;SC=GGGACTGTTGGGTGTGTGTGT;SOR=0.387;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=32;TCF=20;TCR=12;TR=9;WE=47430622;WS=47430601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,13:0.36:36
chrX	47487912	rs11436787	T	TG	9446.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=90;PP=2957;SC=ATTGGAAGGCTGCATGGCCAA;SOR=0.741;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=33;TCR=91;TR=122;WE=47487920;WS=47487902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chrX	47755110	rs11796175	C	T	245.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=1;PP=186;SC=TCCTCCTTGACTTGTCTGAGA;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=47755118;WS=47755100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chrX	47755164	rs3949810	C	A	865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=24;NR=5;PP=608;SC=CTCAGTTCCCCATGAAATGTG;SOR=2.376;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=29;WE=47755172;WS=47755154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chrX	47757758	rs5906510	T	G	4294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=79;PP=2679;SC=TCACTGGGAGTGGGCAGTCTC;SOR=0.938;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=149;TCF=70;TCR=79;TR=149;WE=47757766;WS=47757748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chrX	47920356	rs727079	A	G	5188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=91;PP=2928;SC=CAATCTGCTCATTCTGGTCAT;SOR=0.927;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=173;TCF=82;TCR=91;TR=173;WE=47920364;WS=47920346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chrX	47927554	rs199852662	AGAAG	A	287.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.50;QD=35.97;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chrX	48049666	rs5906557	C	T	3423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=71;PP=2110;SC=GCACTCCCTTCGAATCATTTC;SOR=1.360;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=119;TCF=46;TCR=73;TR=117;WE=48049674;WS=48049656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chrX	48053521	rs4239967	T	C	5016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-0.765;NF=104;NR=56;PP=2965;ReadPosRankSum=0.634;SC=TGAAAAGCAGTTGCGCTTGAG;SOR=0.614;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=160;TCF=104;TCR=56;TR=160;WE=48053529;WS=48053511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,177:0.99:178
chrX	48054294	.	GA	G	66.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.089;ClippingRankSum=0.000;DP=244;ExcessHet=3.0103;FS=2.604;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.30;ReadPosRankSum=-0.424;SOR=0.436;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:193,30:0.13:223
chrX	48054740	rs4824675	C	G	8776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=166;NR=122;PP=2965;SC=TGCATCTTCTCTGGTATTTGA;SOR=0.950;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=288;TCF=166;TCR=122;TR=288;WE=48054748;WS=48054730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,321:1.00:321
chrX	48116786	rs7886344	C	G	3845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=79;PP=2556;SC=GTCCAGGGGACAGAGTAGGGT;SOR=1.335;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=127;TCF=48;TCR=79;TR=127;WE=48116794;WS=48116776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chrX	48123139	rs56131009	G	A	792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=0;PP=538;SC=GGTAATGCATGTGAAGACGCT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=48123147;WS=48123136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chrX	48158947	rs41310647	T	C	2240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=17;PP=1404;SC=TGGAGCTGGGTGAGCTCCTCA;SOR=1.966;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=53;TCR=17;TR=70;WE=48158955;WS=48158937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chrX	48163105	rs4598385	A	G	10477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=405;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=168;NR=191;PP=2965;SC=CCTGTATTACACATGAAAGGT;SOR=0.900;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=361;TCF=169;TCR=192;TR=359;WE=48163113;WS=48163095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,402:1.00:402
chrX	48163717	rs3901052	C	T	4990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=92;NR=58;PP=2895;SC=TGATTTTCTCCGAGGATTTCA;SOR=1.210;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=150;TCF=92;TCR=58;TR=150;WE=48163725;WS=48163707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chrX	48163886	rs3885827	G	A	4626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=93;PP=2965;SC=ATGATATTCCGTCCTGGTTGA;SOR=1.373;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=149;TCF=56;TCR=93;TR=149;WE=48163894;WS=48163873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chrX	48164138	rs5906631	A	G	1584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=16;PP=1239;SC=CAGTATCTCTATCCTCCCCTC;SOR=1.656;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=33;TCR=16;TR=49;WE=48164146;WS=48164129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chrX	48319482	rs199506070	A	G	2220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=44;PP=1332;SC=CCTGAGGTGTAGAGGTCGTGG;SOR=1.320;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=32;TCR=44;TR=76;WE=48319490;WS=48319472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chrX	48382174	rs3048	G	T	1584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=36;NR=14;PP=1008;SC=CTACCAACGCGGGCCCCTTGC;SOR=1.528;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=36;TCR=14;TR=50;WE=48382182;WS=48382164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chrX	48418126	rs2293948	A	G	6391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=113;NR=96;PP=2965;SC=CAGCGAGCGAACCCTGAGGAC;SOR=0.745;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=209;TCF=113;TCR=96;TR=209;WE=48418134;WS=48418116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chrX	48418659	rs235836	G	A	6744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=112;NR=120;PP=2965;SC=AGTGGCAGACGCTGGTTTTGG;SOR=0.801;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=232;TCF=112;TCR=120;TR=232;WE=48418667;WS=48418635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chrX	48432791	rs2661105	T	C	665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=2;PP=489;SC=ACCACTCCGCTCCTGCTGGCC;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=48432799;WS=48432781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chrX	48435402	rs926152	T	C	8169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=31.54;ReadPosRankSum=-0.517;SOR=1.261;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,257:0.99:259
chrX	48435405	rs926153	C	T	8227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=30.59;ReadPosRankSum=-0.484;SOR=1.235;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,267:0.99:269
chrX	48435928	rs235829	C	T	2484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=49;PP=1450;SC=GGAGCTGCACCGAAGCATCTT;SOR=1.460;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=30;TCR=49;TR=79;WE=48435936;WS=48435918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chrX	48459102	rs57467079	C	G	3407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=82;PP=2428;SC=GGAGGGACAGCCAGGGGGGGC;SOR=2.342;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=122;TCF=39;TCR=83;TR=121;WE=48459110;WS=48459092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chrX	48460314	rs235842	A	G	5385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=95;PP=2965;SC=GGTGATGACCATGGCAGTGTC;SOR=0.911;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=183;TCF=88;TCR=95;TR=183;WE=48460322;WS=48460304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chrX	48460625	rs235841	G	C	2822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=71;PP=1783;SC=TCCTGGAGACGGAGGACCTGC;SOR=1.697;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=104;TCF=33;TCR=71;TR=104;WE=48460633;WS=48460615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chrX	48544650	rs235423	A	G	260.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=8;PP=201;SC=ATGGACGAGCAGGTGCATGGA;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=48544658;WS=48544640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chrX	48649426	rs139472040	A	AG	1883.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.25;QD=43.81;SOR=1.775;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chrX	48649449	rs62600348	T	G	2650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.19;QD=45.70;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chrX	48649456	rs66717003	T	G	2766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.17;QD=43.23;SOR=1.214;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chrX	48690416	rs6520383	G	T	373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=9;NR=2;PP=137;SC=GCTGGGCTGCGAGGGCGGCAG;SOR=1.473;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=48690424;WS=48690406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chrX	48690538	rs186964289	G	A	2379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=47;NR=30;PP=1138;SC=CAGACGCGCAGCAGCTGCGCC;SOR=0.832;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=47;TCR=30;TR=77;WE=48690546;WS=48690528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chrX	48768695	.	G	GCA	644.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.138;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=623;ReadPosRankSum=0.249;SC=CTGACAATGTGCACACACACA;SOR=0.960;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=32;TCF=21;TCR=11;TR=19;WE=48768704;WS=48768685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,25:0.66:38
chrX	48771474	rs138305860	G	A	2444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=47;NR=32;PP=1402;SC=GTACATCCTCGGCTGGTGTTT;SOR=0.959;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=47;TCR=32;TR=79;WE=48771482;WS=48771464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chrX	48774940	rs3027514	A	G	3624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=48;PP=2376;SC=GTATAAATGGACTGGCAGTAT;SOR=1.153;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=129;TCF=81;TCR=48;TR=129;WE=48774948;WS=48774930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chrX	48775681	.	GAC	G	47	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=47;QD=27.5;SC=CACGGACACGGACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=2;WE=48775690;WS=48775673;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:14,2:0.12:16
chrX	48830568	rs183351125	G	A	1007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=10;PP=752;SC=ATCCTAGGGGGTAGGAAGGGG;SOR=2.242;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=27;TCR=10;TR=37;WE=48830580;WS=48830558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chrX	48834882	rs3027478	G	A	699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=17;PP=487;SC=TTGAGCCCCAGTACCCCTGAG;SOR=2.494;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=48834890;WS=48834872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chrX	48837546	rs3027477	G	T	425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=324;SC=CTGAGGAAGAGGCAGGACTAA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=48837554;WS=48837536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chrX	48838048	rs35608115	T	G	5417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=82;PP=2965;SC=GCAGTCCCGCTCCTCCTGGGC;SOR=0.882;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=188;TCF=106;TCR=82;TR=188;WE=48838056;WS=48838038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chrX	48891336	rs3027471	G	T	5210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=99;NR=85;PP=2927;SC=CTGAGCACAGGAAGGCAAGAA;SOR=0.765;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=184;TCF=99;TCR=85;TR=184;WE=48891344;WS=48891326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chrX	48898183	rs7056903	C	G	1027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=12;NR=26;PP=777;SC=AGACAGAGAGCGGGGGAGAAC;SOR=1.730;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=12;TCR=26;TR=38;WE=48898191;WS=48898173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chrX	48900900	rs4824738	T	G	1073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=23;PP=628;SC=GGGCGGCGTCTGGGAGATGGG;SOR=1.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=11;TCR=23;TR=34;WE=48900908;WS=48900890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chrX	48922314	.	G	A	2444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=55;PP=1535;SC=GGCCCAACCCGTGAGAAGAGT;SOR=1.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=80;TCF=25;TCR=55;TR=79;WE=48922322;WS=48922304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chrX	48972196	rs144980507	G	A	5418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=86;PP=2965;SC=GAGGTAGGGGGGCCCAGTCCC;SOR=0.735;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=178;TCF=92;TCR=86;TR=178;WE=48972204;WS=48972186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chrX	49021052	rs12843494	C	T	7824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQ=59.99;NF=150;NR=126;PP=2965;SC=CAGCTGTTAGCGTGCTGGACT;SOR=0.815;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=277;TCF=151;TCR=126;TR=276;WE=49021060;WS=49021042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,293:1.00:293
chrX	49021256	rs5906744	A	G	7910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=127;NR=143;PP=2965;SC=GGTAAGGCACATAGTGCTCCG;SOR=0.873;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=270;TCF=127;TCR=143;TR=270;WE=49021264;WS=49021246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,299:1.00:299
chrX	49021537	rs5905720	G	C	8580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=145;NR=149;PP=2965;SC=GGTCGGGGACGTCGTGCTCCA;SOR=0.806;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=295;TCF=145;TCR=150;TR=294;WE=49021545;WS=49021527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,317:1.00:317
chrX	49022276	rs5953269	C	G	1546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=48.34;SOR=4.680;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chrX	49022286	rs72619037	C	G	1861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=48.99;SOR=5.031;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chrX	49022291	.	GT	G	2410.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.34;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=1;PP=947;SC=CAGAACGCCTGTCAAGGGAGA;SOR=5.549;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=22;WE=49022319;WS=49022266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chrX	49022293	rs75416104	C	G	2481.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.73;SOR=5.058;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chrX	49022293	.	CAA	GAG	1411	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=27;NR=1;PP=1411;QD=52.3024241022;SC=GAACGCCTGTCAAGGGAGATT;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=54;TCF=48;TCR=6;TR=28;WE=49022319;WS=49022266;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:26,28:0.52:54
chrX	49022295	rs138365388	A	G	2436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.51;SOR=5.211;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chrX	49022309	rs73634213	C	A	3617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.22;SOR=3.202;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chrX	49022309	.	CAA	AAG	1421	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=59;NR=10;PP=1421;QD=21.3690996357;SC=AGATTTCTCTCAAGGTCAGGG;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=76;TCF=64;TCR=12;TR=69;WE=49022319;WS=49022266;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:7,69:0.91:76
chrX	49022311	rs7880193	A	G	3617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.12;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chrX	49022700	rs4824462	T	C	1690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=27;PP=981;SC=GGCAGCGCAGTTCGCTCAGGA;SOR=0.976;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=25;TCR=27;TR=52;WE=49022708;WS=49022690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chrX	49061742	rs33910054	C	T	6122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=107;NR=88;PP=2965;SC=CAGCGTCAGGCGACACGCATC;SOR=0.784;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=195;TCF=107;TCR=88;TR=195;WE=49061750;WS=49061732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chrX	49077072	rs5906756	G	A	3052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=51;NR=56;PP=1807;SC=AATAATAGGGGAAAGAATAGG;SOR=0.941;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=107;TCF=51;TCR=56;TR=107;WE=49077080;WS=49077062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chrX	49099264	rs141687124	G	A	3616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=47;PP=2265;SC=TCTGGATGGGGGTCAGGAGTG;SOR=1.153;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=121;TCF=74;TCR=47;TR=120;WE=49099272;WS=49099254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chrX	49104815	rs2280882	T	C	808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=3;PP=610;SC=CAGGGTGGGGTGGGGTGGGGT;SOR=2.694;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=36;TCF=25;TCR=11;TR=28;WE=49104823;WS=49104805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chrX	49105610	rs2294021	T	C	8205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=166;NR=122;PP=2965;SC=GGCTCATGGCTGCCATGGTGT;SOR=0.899;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=289;TCF=166;TCR=123;TR=288;WE=49105618;WS=49105600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,318:1.00:318
chrX	49458624	.	GAC	G	221.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.98;QD=22.17;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chrX	49459184	rs189036534	T	C	418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=0;PP=359;SC=CTTATTTTTTTAATCAGCATG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=49459192;WS=49459174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chrX	49767832	rs456615	A	G	3785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.54;SOR=1.233;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chrX	49767835	rs456617	A	G	3785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.07;SOR=1.275;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chrX	49767904	rs149259	A	G	1105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=23;PP=726;ReadPosRankSum=0.897;SC=AAGGGAGGTAAACCCTCTCTT;SOR=0.732;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=12;TCR=23;TR=35;WE=49767912;WS=49767894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,38:0.97:39
chrX	49774447	rs149202543	C	T	1414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=28;PP=824;SC=ATCTGTATGTCACCTCTCAGC;SOR=1.077;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=50;TCF=21;TCR=29;TR=49;WE=49774455;WS=49774437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chrX	50118957	rs4074321	C	T	1766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=16;PP=1117;SC=GGCTCCACTTCTTTCCCTTTC;SOR=1.802;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=40;TCR=16;TR=56;WE=50118965;WS=50118947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chrX	50119085	rs4074320	C	T	7609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=143;NR=120;PP=2965;SC=TAAAATATATCATTCAGGATG;SOR=0.817;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=263;TCF=143;TCR=120;TR=263;WE=50119093;WS=50119075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,289:1.00:289
chrX	50120032	rs4590578	G	A	728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=23;PP=628;SC=ACAGTGGGTAGAGGGGAAGGA;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=26;WE=50120040;WS=50120022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chrX	50121146	rs11415594	A	AG	3650.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=36;PP=2079;SC=AATTTTGATAAGCCTGGTCTC;SOR=0.842;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=49;TCF=10;TCR=39;TR=46;WE=50121154;WS=50121136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chrX	50121849	rs5915424	A	T	1207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=32;PP=884;SC=TCAGAAAGCCAATCTGGGAAA;SOR=3.312;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=5;TCR=32;TR=37;WE=50121857;WS=50121839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chrX	50122509	rs4275357	A	C	1824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=14;PP=1112;SC=AGGTTCTCGGACCACCTCCTC;SOR=1.721;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=42;TCR=14;TR=56;WE=50122517;WS=50122499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chrX	50122932	rs4489439	A	T	5756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=106;NR=87;PP=2965;SC=AGGCCATGAGATTTCCTTTCT;SOR=0.874;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=193;TCF=106;TCR=87;TR=193;WE=50122940;WS=50122922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chrX	50129369	rs5961179	A	G	5991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=91;PP=2965;SC=GTTCAACTTGAAATATGATGA;SOR=0.768;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=195;TCF=104;TCR=91;TR=195;WE=50129377;WS=50129359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chrX	50130544	rs7883609	G	A	5758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=121;NR=69;PP=2965;SC=AAAGGAATGGGAACTTACTTT;SOR=1.228;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=190;TCF=121;TCR=69;TR=190;WE=50130552;WS=50130534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chrX	50130717	rs67155896	T	C	4399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=96;PP=2514;SC=TTCTCTCTTATGTCATCAGTC;SOR=1.459;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=153;TCF=57;TCR=96;TR=153;WE=50130725;WS=50130707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chrX	50134383	rs1934192	G	A	1433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=6;PP=991;SC=GAGATGATGTGAGTGATGTGG;SOR=3.126;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=40;TCR=6;TR=46;WE=50134391;WS=50134373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chrX	50135327	rs17328222	C	A	4126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=85;NR=53;PP=2218;SC=ACTGAGTCATCCAGGGACTTA;SOR=1.094;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=138;TCF=85;TCR=53;TR=138;WE=50135335;WS=50135317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chrX	50143965	rs1934190	G	C	855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=2;PP=719;SC=TAATTGCAGTGCTTCTTCCCA;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=26;WE=50143973;WS=50143955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chrX	50146570	rs4143304	C	T	6563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=121;NR=107;PP=2965;SC=TCAAAGCACACAATCTGTGAG;SOR=0.733;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=228;TCF=121;TCR=107;TR=228;WE=50146578;WS=50146560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chrX	50147273	rs182539034	G	A	1115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=28;PP=767;SC=GTCTAAAATGGCCTGCTGTAT;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=11;TCR=28;TR=39;WE=50147281;WS=50147263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chrX	50165595	rs59226442	A	AACAC	140.14	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.71;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chrX	50341598	rs2295544	G	A	5460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=83;NR=93;PP=2905;SC=ACTGATTTGTGCCTGTAACCT;SOR=0.962;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=176;TCF=83;TCR=93;TR=176;WE=50341606;WS=50341588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chrX	50341675	rs2295543	G	C	1612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=40;PP=1163;SC=GGAAACTTGGGCAAGTCATGA;SOR=3.788;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=6;TCR=40;TR=46;WE=50341683;WS=50341665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chrX	50350671	.	CTCT	C	34.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.095;ClippingRankSum=0.000;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.68;ReadPosRankSum=0.999;SOR=0.646;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,5:0.10:51
chrX	50350674	rs3747282	T	C	1230.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=28;PP=1311;ReadPosRankSum=-1.030;SC=GCAGCTCCTCTTCCTCCTCCT;SOR=0.743;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=25;TCR=31;TR=51;WE=50350697;WS=50350661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,46:0.90:51
chrX	50350728	rs143151534	T	TTCC	1892.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=2.651;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=36.40;ReadPosRankSum=0.118;SOR=0.163;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,49:0.94:52
chrX	50350758	rs201922875	C	CTGCTGCTGCTGT	1994.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.174;HP=3;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=18;PP=809;ReadPosRankSum=0.726;SC=CCTGTTGCTTCTGCTGCTGCT;SOR=1.536;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=54;TCF=24;TCR=30;TR=34;WE=50350780;WS=50350748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,62:0.94:66
chrX	50648880	.	CA	C	50.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.834;ClippingRankSum=0.000;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=1.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.96;ReadPosRankSum=0.890;SOR=1.143;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,10:0.19:53
chrX	50653775	rs3810682	C	G	4712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=76;PP=2881;SC=GAACACTAAGCCTTTCAAGAT;SOR=0.762;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=166;TCF=90;TCR=76;TR=166;WE=50653783;WS=50653765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chrX	50654091	rs41308602	A	G	2927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=50;PP=1535;SC=CCCTTGACCAATGTGGCAAGG;SOR=0.951;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=96;TCF=46;TCR=50;TR=96;WE=50654099;WS=50654081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chrX	51075841	rs2625875	A	G	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=396;ExcessHet=3.0103;FS=9.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQRankSum=-10.302;QD=0.56;ReadPosRankSum=3.940;SOR=0.817;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:336,57:0.15:393
chrX	51150788	.	C	T	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.313;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=51;ReadPosRankSum=2.334;SC=CGCGATTCTGCGCCAGGCTCT;SOR=0.610;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=6;WE=51150796;WS=51150778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,7:0.23:31
chrX	51239295	.	ATCCTCGAGGCAGCC	A	3805.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.043;ClippingRankSum=0.000;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=-1.050;NF=16;NR=48;PP=2957;ReadPosRankSum=2.324;SC=TTTGCACTTCATCCTCGAGGC;SOR=0.818;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=94;TCF=17;TCR=77;TR=64;WE=51239316;WS=51239285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,134:0.99:136
chrX	51486659	rs974285	C	T	528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=16;NR=0;PP=368;SC=ACCCCGCCGGCGGAGCCCGCT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=51486667;WS=51486649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chrX	51637705	.	AT	A	131.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.039;ClippingRankSum=0.000;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQRankSum=1.713;QD=1.94;ReadPosRankSum=-0.100;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,15:0.22:68
chrX	52825471	rs2806837	A	G	1931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=17;PP=1340;SC=CTAGGTCTTCATCCTCCTGTG;SOR=2.206;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=48;TCR=17;TR=65;WE=52825479;WS=52825461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
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chrX	52891512	rs78471253	AC	TT	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.23;ReadPosRankSum=-0.521;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
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chrX	52891565	rs79831867	A	G	961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.797;HP=2;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=10;PP=559;ReadPosRankSum=-0.044;SC=TCTTTGGAGAAAGCTGCAAAA;SOR=0.989;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=108;TCF=74;TCR=34;TR=36;WE=52891573;WS=52891555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,36:0.32:112
chrX	52891584	rs5943751	C	A,T	4739.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;NF=40,68;NR=15,37;PP=832,1581;SC=AAGTTTATTTCGATATTTTTA;SOR=1.595;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=160;TCF=108;TCR=52;TR=55,105;WE=52891592;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.33,0.67:165
chrX	52891619	.	GT	G	2293.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=0.000;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.562;HP=4;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.489;NF=31;NR=27;PP=1717;ReadPosRankSum=0.711;SC=GATAAAAACAGTTTTGTGTTG;SOR=0.977;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=171;TCF=76;TCR=95;TR=58;WE=52891627;WS=52891609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:191,87:0.31:278
chrX	52891645	rs75808475	A	G	3936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=353;ExcessHet=3.0103;FS=3.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.03;MQRankSum=1.463;QD=11.15;ReadPosRankSum=1.262;SOR=0.878;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:240,113:0.32:353
chrX	52891653	rs73206488	C	T	4041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=364;ExcessHet=3.0103;FS=3.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.03;MQRankSum=1.459;QD=11.10;ReadPosRankSum=1.387;SOR=0.898;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:247,117:0.32:364
chrX	52891732	rs201414570	G	A	4222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=348;ExcessHet=3.0103;FS=1.894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.03;MQRankSum=1.405;QD=12.20;ReadPosRankSum=1.879;SOR=0.822;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:229,117:0.34:346
chrX	52891736	rs75971120	G	T	4288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FS=0.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.03;MQRankSum=1.368;QD=12.84;ReadPosRankSum=1.158;SOR=0.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:217,117:0.35:334
chrX	52891738	rs79449844	CA	TG	4267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FS=0.888;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.03;MQRankSum=1.346;QD=13.05;ReadPosRankSum=0.614;SOR=0.763;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:210,117:0.36:327
chrX	52891818	rs73488230	G	A	801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=27;PP=1435;ReadPosRankSum=0.709;SC=CATTCAGTTAGACCTCTGTAG;SOR=0.623;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=12;TCR=66;TR=32;WE=52891840;WS=52891808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,34:0.41:83
chrX	52891832	rs66491662	CT	C	621.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.020;HP=3;HapScore=4;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=1420;ReadPosRankSum=0.770;SC=TCTGTAGAGACTTTGAAGATA;SOR=1.257;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=0;TCR=50;TR=21;WE=52891840;WS=52891808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,23:0.43:54
chrX	52895579	.	GGT	G	1220.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.429;ClippingRankSum=0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.329;NF=3;NR=12;PP=665;ReadPosRankSum=-0.366;SC=TGGAACCAGGGGTGTGTGTGT;SOR=0.306;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=15;WE=52895590;WS=52895569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,40:0.98:41
chrX	53114737	rs145331118	G	A	5558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=104;NR=95;PP=2965;SC=TGCTTCCCCAGTTACTTCCCA;SOR=0.712;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=199;TCF=104;TCR=95;TR=199;WE=53114745;WS=53114727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chrX	53222043	rs146836963	A	AC	1092.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=28;PP=649;SC=AGGGATGGCCACCCCCCTACC;SOR=3.442;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=41;TCF=9;TCR=32;TR=30;WE=53222052;WS=53222033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chrX	53225751	rs1536247	A	G	1168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=8;PP=726;SC=GGGGAGAGTCAATACAGTAAC;SOR=2.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=36;WE=53225759;WS=53225741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chrX	53228148	rs1977364	C	A	7603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=124;NR=123;PP=2965;SC=TCCAGAAAGGCCCATGCTCAC;SOR=0.729;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=248;TCF=125;TCR=123;TR=247;WE=53228156;WS=53228138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,281:1.00:281
chrX	53265835	rs2296541	T	C	870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=19;PP=607;SC=GACCAGCCCTTGTCTCCCCCA;SOR=1.839;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=9;TCR=19;TR=28;WE=53265843;WS=53265825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chrX	53271147	rs2274307	T	G	1007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=27;PP=818;SC=GCTTCAGGCCTCCTGGCACCT;SOR=3.193;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=33;WE=53271155;WS=53271137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chrX	53280421	rs7886988	G	A	2760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=40;NR=57;PP=1755;SC=AGGGAAGAATGGTGGAAGGTG;SOR=1.125;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=100;TCF=40;TCR=60;TR=97;WE=53280429;WS=53280411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chrX	53436232	rs1264008	G	T	2886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=40;PP=1828;SC=GAGTTACTCCGGCTGGTGAGA;SOR=0.713;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=46;TCR=40;TR=86;WE=53436240;WS=53436222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chrX	53449336	rs11462431	A	AG	990.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=4;PP=932;SC=GGAACCCGTAAGGTCCGCGAC;SOR=2.833;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=23;WE=53449344;WS=53449329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chrX	53449568	rs1264011	G	A	10707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=396;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=174;NR=195;PP=2965;SC=CGGCGCCGGCGGCAGTAGGAC;SOR=0.844;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=369;TCF=174;TCR=195;TR=369;WE=53449576;WS=53449558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,396:1.00:396
chrX	53457622	rs1264013	T	C	8343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=146;NR=127;PP=2965;SC=AAAGCCAGACTATGAGCTCAG;SOR=0.713;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=273;TCF=146;TCR=127;TR=273;WE=53457630;WS=53457612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,303:1.00:303
chrX	53461359	rs1264014	G	C	2280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=41;PP=1301;SC=CCGAGGCGAAGCGGCGGAAGG;SOR=1.522;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=25;TCR=42;TR=66;WE=53461367;WS=53461349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chrX	53563589	rs426298	A	G	2603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=48;NR=52;PP=1639;SC=GCAGGAGCCCACCAGCATCCT;SOR=0.859;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=48;TCR=52;TR=100;WE=53563597;WS=53563579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chrX	53601990	rs35473057	A	C	826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=4;PP=665;SC=GAGAAAGTTCACTTAGACCAG;SOR=3.258;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=27;WE=53601998;WS=53601980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chrX	53617273	.	T	G	828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=3.047;ClippingRankSum=0.000;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.842;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=9;PP=598;ReadPosRankSum=-0.230;SC=AGATTTGAATTCTATCAATTA;SOR=1.015;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=81;TCF=55;TCR=26;TR=36;WE=53617281;WS=53617263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,38:0.40:95
chrX	53629649	.	AAT	A	65.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.871;ClippingRankSum=0.000;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.00;ReadPosRankSum=1.701;SOR=0.260;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,8:0.12:66
chrX	53641647	rs6638360	T	C	2139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=43;PP=1319;SC=CCTTCTGGATTGATGGCTTCT;SOR=1.048;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=38;TCR=43;TR=81;WE=53641655;WS=53641637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chrX	53652844	rs198501	G	A	3094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.21;QD=40.19;SOR=1.012;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chrX	53652852	.	T	TGCCGGG	3226.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=20;PP=2219;SC=CCGGGGCCGGTGCCGGGACTG;SOR=0.844;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=56;TCF=20;TCR=36;TR=35;WE=53652860;WS=53652834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chrX	53654500	rs370583659	GTA	G	216.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.25;ReadPosRankSum=2.231;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,11:0.22:51
chrX	53659047	rs6638409	C	T	3925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=50;PP=1968;SC=TCAAACAATACAAAATGACCA;SOR=0.850;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=75;TCR=50;TR=125;WE=53659055;WS=53659037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chrX	54028862	rs73210479	A	G	516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=5;PP=399;SC=TAACTTGCCCAAAGTCAAATA;SOR=1.863;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=18;WE=54028870;WS=54028852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chrX	54107692	rs2516098	T	C	6471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=136;NR=76;PP=2965;SC=TAGGCATTTTTCCAAGGAGGC;SOR=1.425;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=213;TCF=137;TCR=76;TR=212;WE=54107700;WS=54107682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chrX	54117740	rs2495797	C	A	3326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=74;NR=38;PP=2051;SC=GGTACATGAACTCACCTTGAG;SOR=1.274;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=74;TCR=38;TR=112;WE=54117748;WS=54117730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chrX	54161859	rs4826523	C	T	1249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=9;PP=818;SC=ATATATAGCCCTGACAGTCTA;SOR=1.954;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=39;WE=54161867;WS=54161849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chrX	54209387	rs2495783	A	G	1751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=23;PP=1219;SC=ATGGTGCCGAATCGGCCCCGC;SOR=0.950;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=32;TCR=23;TR=55;WE=54209395;WS=54209377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chrX	54209683	.	G	T	882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=23;PP=594;SC=GATAGGCGACGATCTGGGCGC;SOR=2.376;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=30;WE=54209691;WS=54209673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chrX	54781359	rs34779123	T	C	1487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=15;PP=1109;SC=AATACATTACTTCCCTCTGGT;SOR=1.747;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=34;TCR=15;TR=49;WE=54781367;WS=54781349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chrX	54800637	.	CAAAAAA	C	53.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.58;ReadPosRankSum=1.292;SOR=0.013;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,3:0.20:15
chrX	54836361	rs1043031	A	G	3785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.522;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=54;PP=2283;ReadPosRankSum=0.966;SC=CCCAGGCCTCATCTACTACTC;SOR=0.616;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=127;TCF=72;TCR=55;TR=126;WE=54836369;WS=54836351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,143:0.99:144
chrX	54836505	rs1043034	A	G	8197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=151;NR=119;PP=2965;SC=TGGCTGATACAAAGGTCAATA;SOR=0.906;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=270;TCF=151;TCR=119;TR=270;WE=54836513;WS=54836495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,308:1.00:308
chrX	54837340	rs1043044	C	T	2901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=33;PP=1701;SC=TCTCAAAGGCCCTAATGGCCT;SOR=0.973;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=56;TCR=33;TR=89;WE=54837348;WS=54837330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chrX	54838077	rs2071932	C	T	4689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=86;NR=76;PP=2589;SC=CAGGCTATTCCTTGGAGAAGG;SOR=0.738;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=162;TCF=86;TCR=76;TR=162;WE=54838085;WS=54838067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chrX	54838437	rs2071934	G	A	452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=0;PP=335;SC=CATTTGCAGCGTGTTTACCGG;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=54838445;WS=54838434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chrX	54840013	rs763183	C	T	4556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=76;PP=2549;SC=GTTCATGTGTCCCATGCATTT;SOR=0.829;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=153;TCF=76;TCR=77;TR=152;WE=54840021;WS=54840003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chrX	54841737	rs11555927	G	A	6385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=99;PP=2965;SC=CGATGGAAGCGGATTTGAAGG;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=208;TCF=108;TCR=100;TR=207;WE=54841745;WS=54841727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chrX	54972134	.	CGT	C	43.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=0.000;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.44;MQRankSum=2.451;QD=1.33;ReadPosRankSum=-0.301;SOR=0.457;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,5:0.15:33
chrX	55116466	rs1845444	C	G	3455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=50;PP=1889;SC=GAGTGAGCTTCTAAGAGCAAG;SOR=0.788;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=115;TCF=65;TCR=50;TR=115;WE=55116474;WS=55116456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chrX	55173732	rs11327722	TA	T	12162.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=136;PP=2951;SC=GGTCACACAGTAACACTGTCC;SOR=0.756;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=185;TCF=45;TCR=140;TR=179;WE=55173740;WS=55173722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,326:1.00:326
chrX	55246827	.	TCCG	T	322.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=6;NR=0;PP=236;SC=CTTCGTTCTTTCCGCCATCTT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=6;WE=55246837;WS=55246826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chrX	55246965	rs5914272	C	T	1906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=27;PP=1153;SC=GGACAGGTCCCGTGGCACAGT;SOR=0.849;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=37;TCR=27;TR=64;WE=55246973;WS=55246955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chrX	55247030	rs5914273	C	G	1590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=29;PP=983;SC=CCCCCAGGTCCTGATGCAGGC;SOR=0.906;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=27;TCR=29;TR=56;WE=55247038;WS=55247020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chrX	55248320	rs5914274	G	A	10095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=383;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=146;NR=196;PP=2965;SC=TGAAGGGAGAGTGGAGAATAA;SOR=1.063;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=343;TCF=147;TCR=196;TR=342;WE=55248328;WS=55248310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,383:1.00:383
chrX	55286887	rs3761559	G	T	1191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=2;PP=936;SC=ATTAGCAGTAGTGGTACCTCT;SOR=5.136;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=36;TCR=2;TR=38;WE=55286895;WS=55286877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chrX	55287031	rs3761560	T	G	10362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=393;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=185;NR=167;PP=2965;SC=TAGGACCATCTCCACGTTCAC;SOR=0.761;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=352;TCF=185;TCR=167;TR=352;WE=55287039;WS=55287021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,393:1.00:393
chrX	55289593	rs2148981	C	T	2912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=33;PP=1803;SC=CTTTCTATTGCTTTTTTCCTC;SOR=1.358;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=96;TCF=62;TCR=34;TR=95;WE=55289601;WS=55289583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chrX	55289774	rs4826381	T	C	3381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=66;PP=2236;SC=AGCTGGTCATTACTGGGCAGC;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=42;TCR=66;TR=108;WE=55289797;WS=55289764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chrX	55479299	rs11545211	G	A	5597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=74;PP=2965;SC=TCTTCTGGGGGCCCCGAGCAC;SOR=0.894;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=174;TCF=99;TCR=75;TR=173;WE=55479307;WS=55479289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chrX	55651001	rs2375465	T	C	4738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.354;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=80;PP=2965;ReadPosRankSum=0.163;SC=GAGACTCGTGTCTTAGCCTTT;SOR=0.492;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=153;TCF=72;TCR=81;TR=151;WE=55651009;WS=55650991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,170:0.99:171
chrX	55748820	rs1473761	A	G	345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=287;SC=GAGGTTGGGGAATTTGTTATG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=11;WE=55748828;WS=55748810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chrX	55757744	rs5960480	T	G	1494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=14;PP=994;SC=AGGCTATAAGTAGGAGTGATT;SOR=1.702;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=32;TCR=14;TR=46;WE=55757752;WS=55757734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chrX	56291516	rs1033565	T	G	216.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=177;SC=ATTCCTTCCATGTGAAATGAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=56291524;WS=56291506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chrX	56295245	rs3747284	T	C	4942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=98;NR=61;PP=2965;SC=TAATAAGGAATATTTGACAGC;SOR=1.172;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=159;TCF=98;TCR=61;TR=159;WE=56295253;WS=56295235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chrX	56295438	.	AACAC	A,AAC	2405.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.174;ClippingRankSum=0.000;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.34;ReadPosRankSum=1.038;SOR=0.558;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:5,13,64:0.16,0.78:82
chrX	56295958	rs200952140	ATG	A	572.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;QD=31.82;SOR=5.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chrX	56296488	rs12862304	G	C	1162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=0;PP=844;SC=TTTCTTTTTGGGGGGACCTAG;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=31;WE=56296496;WS=56296478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chrX	57010920	.	CA	C	283.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=0.000;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.78;ReadPosRankSum=-0.391;SOR=0.588;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,23:0.31:75
chrX	57405163	rs4826543	T	C	4717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=90;NR=69;PP=2853;SC=CTATGTGCCGTTATGCTGAAG;SOR=0.880;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=159;TCF=90;TCR=69;TR=159;WE=57405171;WS=57405153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chrX	57474943	rs1821118	A	T	1176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=9;PP=841;SC=TTGATATATGATATCATTCTG;SOR=2.476;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=31;TCR=9;TR=40;WE=57474951;WS=57474933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chrX	57475132	rs1367830	T	C	9218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=143;NR=161;PP=2965;SC=TAACACGGCCTTTCAACTTTG;SOR=0.851;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=305;TCF=143;TCR=162;TR=304;WE=57475140;WS=57475122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,339:1.00:339
chrX	57619648	rs1057328	G	T	7728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=158;NR=138;PP=2965;SC=ACTTCGAACCGGAGAGGCCTT;SOR=0.789;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=297;TCF=159;TCR=138;TR=296;WE=57619656;WS=57619638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,283:1.00:283
chrX	62974288	.	AT	A	132.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=0.000;DP=210;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.03;MQRankSum=0.000;QD=0.91;ReadPosRankSum=-1.264;SOR=0.742;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:122,24:0.16:146
chrX	65393658	rs5918591	A	G	5289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=113;PP=2965;SC=AGGTCCCAAGAATAAGCTATG;SOR=1.440;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=179;TCF=66;TCR=113;TR=179;WE=65393666;WS=65393648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chrX	65420609	rs1264215	A	G	699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=18;PP=524;SC=GTGCCTTAGCAGCTGGCCCTA;SOR=2.494;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=23;WE=65420617;WS=65420599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chrX	65478922	rs11433175	T	TA	630.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=14;PP=581;SC=AACAATTAGTTAAAGAGCAGA;SOR=2.093;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=15;WE=65478930;WS=65478912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chrX	65486172	rs2054180	C	T	3268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=33;PP=2060;SC=TAAGGACAGGCCTCCTGTCCT;SOR=1.669;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=113;TCF=79;TCR=34;TR=112;WE=65486180;WS=65486162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chrX	65819223	rs4827499	A	G	693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=1;PP=420;SC=ACTCCTAGTGAATAATACTAT;SOR=2.833;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=65819231;WS=65819213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chrX	65819286	rs11379040	G	GT	2522.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=18;PP=1238;SC=TGCTTTTTTTGTTTTTTTCTG;SOR=1.745;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=35;TCR=24;TR=44;WE=65819294;WS=65819276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chrX	65819930	rs190538880	C	T	4364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=71;PP=2537;SC=AGAAAATAATCAATTTCTCTA;SOR=0.718;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=76;TCR=71;TR=147;WE=65819938;WS=65819920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chrX	65822607	rs1385698	T	C	2167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=47;PP=1557;SC=ACTGTGGGTGTATCTGCCTCC;SOR=1.547;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=24;TCR=47;TR=71;WE=65822615;WS=65822597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chrX	65824986	rs1385699	C	T	3724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=67;NR=53;PP=2000;SC=ACTCTGACATCTGTGGTGGCC;SOR=0.735;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=120;TCF=67;TCR=53;TR=120;WE=65824994;WS=65824976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chrX	66941597	rs1337076	T	G	563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=3;PP=420;SC=TGGCGAGGGATGGCAATCAGA;SOR=2.833;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=66941605;WS=66941596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chrX	67331903	.	G	GCACA	166.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=0;NR=5;PP=184;SC=ATGCACACATGCACACACACA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=5;WE=67331911;WS=67331884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chrX	67331932	rs5919521	G	C	225.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=47;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=1;NR=4;PP=79;SC=CACACACACAGAGAGAGATTC;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=67331940;WS=67331922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chrX	67412906	rs1191948	G	A	4494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=86;PP=2752;SC=GGTACACTAGGGTCAATTCAG;SOR=1.273;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=144;TCF=58;TCR=86;TR=144;WE=67412914;WS=67412896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chrX	67429834	rs57516402	CT	C	453.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.45;QD=22.69;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chrX	67431814	rs2225124	A	G	2052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=8;PP=1471;SC=TATACTAAATATTTGTGATCC;SOR=3.442;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=50;TCR=8;TR=58;WE=67431822;WS=67431804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chrX	67719085	rs12843249	G	T	2314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=55;PP=1633;SC=GGCCCTTCTTGTACCCGATGC;SOR=1.501;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=27;TCR=55;TR=82;WE=67719093;WS=67719075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chrX	68890248	rs5936723	C	T	667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=18;PP=467;SC=TAACTGTTTGCGAACTTTTGA;SOR=2.400;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=68890256;WS=68890238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chrX	68890298	rs5980833	C	G	142.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=112;SC=CCCAAGACTTCGGAAGTTGTC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=68890306;WS=68890288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chrX	69080840	rs1203003	G	A	3743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=73;PP=2279;SC=CTGTTAAATGGACATTTATAT;SOR=1.114;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=130;TCF=57;TCR=73;TR=130;WE=69080848;WS=69080830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chrX	69247896	rs10579679	CCT	C	502.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=5;PP=206;SC=GGTGAGTTCCCCTGTCTCTCC;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=69247905;WS=69247886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chrX	69249435	rs140058036	G	C	3524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=62;PP=2263;SC=AAAGCCACAGGCTAGAGCCAC;SOR=0.912;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=55;TCR=62;TR=117;WE=69249443;WS=69249425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chrX	69262423	rs2296767	T	C	1010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=19;PP=598;SC=GGGAGCAAAGTAGCAGTAAGC;SOR=1.675;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=10;TCR=19;TR=29;WE=69262431;WS=69262413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chrX	69368853	rs650028	T	C	1009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=30;PP=717;SC=CTGAGGTGGGTGGATCACCTG;SOR=3.145;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=36;WE=69368861;WS=69368843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chrX	69459945	rs1152194	C	T	2170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=16;PP=1341;SC=AAGAGGAGGTCCTAACACTTT;SOR=2.093;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=48;TCR=16;TR=64;WE=69459953;WS=69459935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chrX	69495817	rs5936871	G	A	387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=1;PP=305;SC=GTGAGCCACCGCGCCCAGCCA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=69495825;WS=69495807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	69496228	rs1572732	T	C	1750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=39;NR=20;PP=962;SC=CCATTTCTTTTGTATTTGTTT;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=39;TCR=20;TR=59;WE=69496236;WS=69496218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chrX	69500852	.	TG	T	340.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.095;ClippingRankSum=0.000;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=6.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.39;MQRankSum=1.790;QD=6.43;ReadPosRankSum=0.700;SOR=1.786;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,21:0.40:53
chrX	69510335	rs1199470	C	T	862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=3;PP=663;SC=AGGGAATTCCCGTAAGAGTGG;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=26;WE=69510343;WS=69510325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chrX	69607212	.	C	CT	1153.75	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=0.000;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=1.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.52;MQRankSum=0.931;QD=19.23;ReadPosRankSum=-0.806;SOR=1.036;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,52:0.87:60
chrX	69626739	rs10482161	C	T	1270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=3;PP=902;SC=ACCTTTTTTCCTAGCCAAAAC;SOR=4.565;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=33;TCR=3;TR=36;WE=69626747;WS=69626729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chrX	69637865	rs5980934	G	T	7800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=144;NR=118;PP=2965;SC=GTAGGATCAGGGCTGTTTCCT;SOR=0.808;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=262;TCF=144;TCR=118;TR=262;WE=69637873;WS=69637855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,292:1.00:292
chrX	69639698	rs1886892	G	T	5398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=92;NR=99;PP=2957;SC=TTATCTATGAGAGACCAGTAG;SOR=0.890;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=192;TCF=93;TCR=99;TR=191;WE=69639706;WS=69639688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chrX	69639832	rs5980700	C	T	767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=12;PP=608;SC=GGGAGTATGTCGAGCATCTAT;SOR=1.136;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=14;TCR=12;TR=26;WE=69639840;WS=69639822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chrX	69645230	rs45513993	C	T	6044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=104;PP=2965;SC=TTGGCCTGCTCTTCCTCACCT;SOR=0.929;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=199;TCF=95;TCR=104;TR=199;WE=69645238;WS=69645220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chrX	69645372	rs5980938	G	C	897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=21;PP=586;SC=CCTGGGACCCGGGGGTGGCCC;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=34;TCF=12;TCR=22;TR=33;WE=69645380;WS=69645362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chrX	69645983	rs73216706	A	G	2558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=51;PP=1644;SC=ATGGGAGTGCATGGGAGAGGG;SOR=1.053;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=39;TCR=51;TR=90;WE=69645991;WS=69645973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chrX	69647169	rs5980939	T	C	7984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=149;NR=119;PP=2965;SC=TCAGCTCCGATGGGGTCCCCT;SOR=0.886;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=268;TCF=149;TCR=119;TR=268;WE=69647177;WS=69647159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,292:1.00:292
chrX	69652762	rs2296542	A	G	5521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=110;NR=73;PP=2965;SC=CTCCCCACAGAAGATTTGTTA;SOR=1.004;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=184;TCF=110;TCR=74;TR=183;WE=69652770;WS=69652752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chrX	69668463	rs2281868	A	G	5415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=90;NR=93;PP=2965;SC=GAACCCTGAGACACTGAAGCA;SOR=0.808;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=184;TCF=90;TCR=94;TR=183;WE=69668471;WS=69668453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chrX	69672462	rs12850410	G	C	1018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=23;NR=9;PP=536;SC=AGGGGAGAGAGAGAGGAGCTA;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=23;TCR=9;TR=32;WE=69672470;WS=69672452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chrX	69672655	rs12010766	T	C	3143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=50;PP=1906;ReadPosRankSum=-0.842;SC=AGGGAGGGAGTCTCGCCCCTG;SOR=0.744;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=111;TCF=60;TCR=51;TR=109;WE=69672663;WS=69672645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,119:0.98:121
chrX	69673811	rs2274309	T	C	182.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=148;SC=GGACCGGGACTAGACTTATCT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=69673819;WS=69673801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chrX	69718314	rs1886890	C	T	4119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=84;NR=58;PP=2340;SC=ACGGGGAGTACTGTACAGAAG;SOR=1.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=142;TCF=84;TCR=58;TR=142;WE=69718322;WS=69718304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chrX	69718533	rs3215810	CTCAT	C	592.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=10;PP=497;SC=GAAGGCTTGACTCATGGCACA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=10;WE=69718544;WS=69718523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chrX	69749852	rs1536250	AT	GA	5827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=63;PP=2947;SC=TAGTCTTTCTATAATCCAAGA;SOR=1.136;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=120;TCF=52;TCR=68;TR=112;WE=69749861;WS=69749842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chrX	69774517	rs4844240	A	T	6352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=129;NR=84;PP=2965;SC=TTGTTTCAAAAGTTTTAGTTT;SOR=1.130;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=214;TCF=130;TCR=84;TR=213;WE=69774525;WS=69774507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chrX	69825109	rs17301881	A	G	771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=23;NR=3;PP=551;SC=GGAATTAGCCATTACAAACTT;SOR=3.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=26;WE=69825117;WS=69825099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chrX	69826685	rs12014919	C	T	182.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=1;PP=104;SC=TTCCTGCTTACATATATATTA;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=69826693;WS=69826675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chrX	69827014	rs73216791	T	C	148.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=5;PP=118;SC=GTTTAAACAATTAACTTTAGG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=69827022;WS=69827004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chrX	69964084	rs5902674	G	GA	582.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=0.000;HP=8;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.775;NF=0;NR=13;PP=227;ReadPosRankSum=-0.338;SC=CATTAAAAAGGAAAAAAAATA;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=13;WE=69964092;WS=69964074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,24:0.92:26
chrX	70148927	rs5936605	T	A	3249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=73;PP=2019;SC=AGTCCCTGCCTTTTTCACCTA;SOR=1.991;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=30;TCR=73;TR=103;WE=70148935;WS=70148917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chrX	70149360	rs5936606	G	A	390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=14;NR=1;PP=334;SC=CAGCAAACCCGCACATTTAGG;SOR=3.912;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=15;WE=70149368;WS=70149357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chrX	70149404	rs5936607	C	T	2048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.963;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=17;PP=1459;ReadPosRankSum=0.347;SC=ATAAAGAATACTTCCACCCAG;SOR=2.225;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=57;TCR=18;TR=72;WE=70149412;WS=70149394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,74:0.99:75
chrX	70149828	.	C	T	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.776;ClippingRankSum=0.000;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.18;ReadPosRankSum=1.750;SOR=0.624;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,30:0.23:128
chrX	70469182	rs2341539	G	A	3375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=40;PP=2088;SC=AAAACATAACGGATACAATTG;SOR=1.323;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=113;TCF=72;TCR=41;TR=112;WE=70469190;WS=70469172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chrX	70603910	rs199653335	A	G	5464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=83;PP=2965;SC=TTATTCTTGCAGAATATAGTG;SOR=0.796;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=183;TCF=99;TCR=84;TR=180;WE=70603918;WS=70603900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chrX	70609368	rs151185299	T	TA,TAA	1405.90	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.4998,0.5002;FS=1.487;HP=10;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=21,21;NR=16,16;PP=17,359;ReadPosRankSum=-0.410;SC=TTGTATTCAGTAAAAAAAAAA;SOR=1.118;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=52;TCF=28;TCR=24;TR=37,37;WE=70609376;WS=70609358;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:0.89:71
chrX	70617443	rs5980760	A	G	703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=22;PP=592;SC=AGTGATTCTCATGCCTCAACT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=70617451;WS=70617433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chrX	70774984	.	TTG	T	61.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=2;PP=75;ReadPosRankSum=0.725;SC=GAGTTACATTTTGTGTGTGTG;SOR=0.048;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=2;WE=70774993;WS=70774974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chrX	71357093	rs6625949	G	A	2254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=54;PP=1585;SC=CACCACAGCTGATTCCCCAGT;SOR=2.185;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=21;TCR=54;TR=75;WE=71357101;WS=71357083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chrX	71357160	rs6625950	G	T	456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=13;PP=367;SC=TGTGGTGATGGGGAACAGGAA;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=71357168;WS=71357150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chrX	71360100	rs7061150	C	T	7234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=119;NR=126;PP=2965;SC=ACTTCACCAACCTTGGCTATG;SOR=0.820;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=245;TCF=119;TCR=126;TR=245;WE=71360108;WS=71360090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chrX	71363415	rs6624597	C	T	7659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=131;NR=128;PP=2965;SC=CCGATAACCCCAGTACCTAAG;SOR=0.779;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=259;TCF=131;TCR=128;TR=259;WE=71363423;WS=71363405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,288:1.00:288
chrX	71364479	rs11094247	A	C	3233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=70;PP=2336;SC=CTGTTCCAAAAACCAAGAACA;SOR=1.915;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=101;TCF=29;TCR=72;TR=98;WE=71364487;WS=71364469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chrX	71401607	rs6525589	G	A	1257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.92;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chrX	71401614	rs7058353	C	A	1336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.51;SOR=1.751;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chrX	71406301	rs6525591	T	C	4203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=80;PP=2602;SC=CTGTCATCTCTTCTCTAAAGG;SOR=1.240;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=135;TCF=55;TCR=80;TR=135;WE=71406309;WS=71406291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chrX	71495388	rs34563981	T	TCTA	15698.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.49;DB;DP=362;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=113;PP=2967;SC=ATTTAAAACTTCTTACCCATG;SOR=0.860;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=151;TCF=29;TCR=122;TR=138;WE=71495396;WS=71495378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,351:1.00:351
chrX	71521867	rs3012627	G	C	3826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=65;PP=2597;SC=GTTTCTGCAGGTGCATACTAG;SOR=0.708;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=133;TCF=68;TCR=65;TR=133;WE=71521875;WS=71521857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chrX	71522126	rs2984343	C	T	795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=17;PP=467;SC=ACCATAGTAACCCTGCTCCTG;SOR=2.147;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=23;WE=71522134;WS=71522116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chrX	71933512	.	TCACA	T,TCA	1824.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.415;ClippingRankSum=0.000;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=5.412;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.53;ReadPosRankSum=2.090;SOR=1.786;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:11,22,48:0.27,0.59:81
chrX	72299295	.	AGCCGCCACCTCG	A	299.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.309;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=4.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.99;MQRankSum=-3.057;QD=13.03;ReadPosRankSum=0.498;SOR=2.115;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chrX	73043817	rs1620574	T	C	4407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=72;PP=2423;SC=CTGTAGGCTTTGTAAATCTAC;SOR=0.718;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=149;TCF=77;TCR=72;TR=149;WE=73043825;WS=73043807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chrX	73045740	rs1794213	A	C	7551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=141;NR=116;PP=2965;SC=GAAAGTATTAAACATGCTCAA;SOR=0.798;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=258;TCF=141;TCR=117;TR=257;WE=73045748;WS=73045730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,278:1.00:278
chrX	73071939	.	AT	A	755	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;FR=0.5000;HP=4;HapScore=3;MGOF=30;MMLQ=15;MQ=59.1;NF=11;NR=40;PP=755;QD=15.3137254902;SC=GCAAGGAAAAATAAAAAAAAA;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=171;TCF=49;TCR=122;TR=51;WE=73071948;WS=73071924;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:120,51:0.30:171
chrX	73071940	.	TA	T	142.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.325;ClippingRankSum=0.000;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=13.241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.68;ReadPosRankSum=0.183;SOR=2.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,19:0.22:85
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chrX	74375871	rs1039123	G	C	3005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=31;PP=1909;SC=CCCGAGGTCAGGAGGGCAACC;SOR=1.675;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=71;TCR=31;TR=102;WE=74375879;WS=74375861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chrX	74376420	rs5981325	C	T	3851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=38;PP=2367;SC=AACGAATCATCTCTTCGTGCG;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=89;TCR=38;TR=127;WE=74376428;WS=74376410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chrX	74494470	rs4892396	T	G	8420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=126;NR=149;PP=2965;SC=CCATCATCCGTGACAAGTAAG;SOR=0.979;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=275;TCF=126;TCR=149;TR=275;WE=74494491;WS=74494460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,307:1.00:307
chrX	74494483	rs5981831	A	G	7162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=137;PP=2965;SC=CAAGTAAGCCAAGAGCGGAAG;SOR=1.161;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=236;TCF=99;TCR=137;TR=236;WE=74494491;WS=74494460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chrX	74511202	rs5981834	G	C	1633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=16;PP=1044;SC=TTATCAGATAGAAGATAATTA;SOR=1.571;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=38;TCR=16;TR=54;WE=74511210;WS=74511192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chrX	74517585	rs41307373	C	T	385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=278;SC=AACTACAGAGCGTATTCCCTA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=74517593;WS=74517575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	74523367	rs972561	A	G	1359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=32;PP=901;SC=TAAAATAATTATCTTATGTAA;SOR=1.911;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=14;TCR=32;TR=46;WE=74523375;WS=74523357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chrX	74598903	rs5937369	G	A	2198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=18;PP=1518;SC=CTCCCAAGCCGCCTTCTTAGC;SOR=2.043;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=54;TCR=18;TR=72;WE=74598911;WS=74598893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chrX	74961968	rs5938183	G	A	3349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=54;PP=1791;SC=GTTCCTTATCGTTTCCATCAT;SOR=0.862;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=58;TCR=54;TR=112;WE=74961976;WS=74961958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chrX	75395172	rs2301863	T	C	954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=2;PP=382;SC=TGATTTCATCTAGGATGTAGA;SOR=2.531;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=75395180;WS=75395162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chrX	75395187	rs2301862	C	T	1190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=5;PP=492;SC=TGTAGACTGTCGACACTTCCT;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=25;WE=75395195;WS=75395177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chrX	75650802	.	G	A	4992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=80;PP=2827;SC=TGAGGAGATCGTAGACAGTCC;SOR=0.831;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=162;TCF=82;TCR=80;TR=162;WE=75650810;WS=75650792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chrX	76139959	rs232961	C	T	353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=11;PP=279;SC=TTTTTTAAGACGCATGTGTAG;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=76139967;WS=76139949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chrX	76937963	rs3088074	G	C	5038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=74;PP=2965;SC=GTAAAACTCTGCTCTTTCCCA;SOR=0.857;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=160;TCF=86;TCR=74;TR=160;WE=76937971;WS=76937953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chrX	76940534	rs35268552	A	G	2340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=58;PP=1782;SC=AATTTAATTCAAAATTGATAA;SOR=2.026;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=21;TCR=58;TR=79;WE=76940542;WS=76940524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chrX	77086467	.	TTTTTA	T	235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=5;PP=247;SC=ATACTTTCTTTTTTTATTTTA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=5;WE=77086479;WS=77086457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chrX	77254265	.	G	GT	803.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=22;PP=904;SC=TTGTAACTATGTTATGATTCT;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=22;WE=77254273;WS=77254255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chrX	77268502	rs2227291	G	C	8446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=140;NR=129;PP=2965;SC=TATTCTTCTAGTTGCAATGTA;SOR=0.719;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=270;TCF=140;TCR=130;TR=269;WE=77268510;WS=77268492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,312:1.00:312
chrX	77276413	rs113968994	C	A	1408.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=13;PP=818;SC=GCTTCTTCTTCTTATTATTGT;SOR=2.038;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=33;TCR=13;TR=46;WE=77276421;WS=77276403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chrX	77295697	rs372964672	GCC	G	155.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.17;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chrX	77296047	rs5913631	G	C	4674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=103;NR=56;PP=2853;SC=TCTCCTTTCAGTATATTCCAA;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=159;TCF=103;TCR=56;TR=159;WE=77296055;WS=77296037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chrX	77298857	rs4826245	G	A	2197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=27;PP=1268;SC=CTTATCAAGAGAGACAGTCAA;SOR=1.124;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=43;TCR=27;TR=70;WE=77298865;WS=77298847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chrX	77381002	rs2073177	A	G	2165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=37;PP=1262;SC=GAGTGGAGAAAGTTAGAAGGT;SOR=1.068;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=30;TCR=37;TR=67;WE=77381022;WS=77380992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chrX	77381014	rs2073178	G	A	1864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=33;PP=1036;SC=TTAGAAGGTAGTGTTGTCATT;SOR=1.263;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=23;TCR=33;TR=56;WE=77381022;WS=77380992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chrX	78616787	rs3747363	G	A	6414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=118;NR=93;PP=2965;SC=CTTCCACTGTGTAACACAGGG;SOR=0.855;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=211;TCF=118;TCR=93;TR=211;WE=78616795;WS=78616777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chrX	78617053	rs1736662	A	G	514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=18;PP=453;SC=TAAAAGTGCAAGTTTGTTACT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=78617061;WS=78617043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chrX	78617999	rs1751133	T	C	617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=3;PP=425;SC=TTTGGACAAATTCATTATTTT;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=78618007;WS=78617989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chrX	78618050	rs1751134	A	G	2403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=17;PP=1491;SC=AAATGCTTATATAAAAATTTG;SOR=2.055;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=53;TCR=17;TR=70;WE=78618058;WS=78618040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chrX	79277627	rs3048712	GGTTTT	G	412.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.27;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chrX	79283388	rs7877748	T	C	2261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=11;PP=1642;SC=AAAAGAGAAATATTTAAAATA;SOR=3.228;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=58;TCR=11;TR=69;WE=79283396;WS=79283378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chrX	79283630	rs76000388	TC	T	3241.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=61;PP=2487;SC=AATAACAACATCCGGAACCCT;SOR=2.967;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=64;TCF=0;TCR=64;TR=61;WE=79283638;WS=79283620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chrX	79937084	rs3122406	G	A	793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=22;PP=555;SC=CCATATCTCTGTTATTTTATT;SOR=4.332;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=24;WE=79937092;WS=79937074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chrX	79942599	rs3029738	GTATA	G	469.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=682;SC=CTGTATGTGTGTATATATATA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=9;WE=79942610;WS=79942589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chrX	79943569	rs3122407	T	C	8643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=128;NR=147;PP=2965;SC=TTTACTCACCTTTCTTCCAGA;SOR=0.903;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=275;TCF=128;TCR=147;TR=275;WE=79943577;WS=79943559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,323:1.00:323
chrX	79989018	rs4240018	C	G	2439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=40;PP=1262;SC=ACAGATTTTTCGTTAAAATGG;SOR=0.929;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=78;TCF=36;TCR=42;TR=76;WE=79989026;WS=79989008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chrX	79999796	rs58601634	T	TCAC	1151.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=26;PP=1391;SC=AAGCAGAAATTCACAATACCC;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=26;WE=79999804;WS=79999786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chrX	80064635	rs59358158	T	C	4014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=67;PP=2597;SC=ACCGTTTGACTAGTCAAGGCC;SOR=0.721;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=137;TCF=70;TCR=67;TR=137;WE=80064657;WS=80064625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chrX	80064802	rs139071237	C	T	5694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=105;NR=96;PP=2965;SC=GGTAATACAGCTCTGGGGAAG;SOR=0.780;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=201;TCF=105;TCR=96;TR=201;WE=80064810;WS=80064792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chrX	80185266	rs5959744	G	T	5502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=114;NR=65;PP=2965;SC=TGGAAGATCAGCTTGCACGTG;SOR=1.162;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=180;TCF=115;TCR=65;TR=179;WE=80185274;WS=80185256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chrX	82764040	rs5921978	A	G	9920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.09;SOR=0.702;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chrX	82764040	.	AGG	GGC	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=99;NR=97;PP=2947;QD=20;SC=GCAGGTTCGAAGGCTTGCAGC;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=206;TCF=105;TCR=101;TR=196;WE=82764050;WS=82764030;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:10,196:0.95:206
chrX	82764042	rs5921979	G	C	9920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.09;SOR=0.702;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chrX	83119939	rs5922000	T	C	1129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=27;PP=792;SC=TTGAATAGCCTAAAAACTTAG;SOR=4.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=29;WE=83119947;WS=83119929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chrX	83124802	rs5968237	A	T	226.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=142;SC=GATAGATTACATAAAAAAATA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=83124810;WS=83124792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chrX	83319457	rs35061036	TA	T	950.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.33;ReadPosRankSum=1.143;SOR=0.572;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,52:0.84:62
chrX	83352970	rs10521366	T	C	688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=18;PP=511;SC=AAAACTTCAATCATTTTATGC;SOR=2.124;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=24;WE=83352978;WS=83352960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chrX	83362842	.	A	T	357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.784;ClippingRankSum=0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=287;ReadPosRankSum=0.259;SC=GAAGACTAACAATTTCATAGT;SOR=2.448;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=14;WE=83362850;WS=83362832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
chrX	83403178	rs1539517	G	C	1009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=31;PP=994;SC=CACATTTCTAGTCATTCTTGC;SOR=3.145;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=50;TCF=19;TCR=31;TR=47;WE=83403186;WS=83403168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chrX	83588660	rs5922965	A	G	79.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.76;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chrX	83591866	rs5922966	C	T	4769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=74;NR=78;PP=2724;SC=TTGCATCATTCGGAACAACTT;SOR=0.894;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=74;TCR=78;TR=152;WE=83591874;WS=83591856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chrX	84189813	rs6623210	A	G	8422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=125;NR=158;PP=2965;SC=AGAATAGCTAAAGACTGGACT;SOR=1.068;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=283;TCF=125;TCR=158;TR=283;WE=84189821;WS=84189803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,310:1.00:310
chrX	84362298	rs146446228	A	G	2034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=23;PP=1220;SC=CCCTACACCAATGCCATGAGG;SOR=1.319;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=69;TCF=45;TCR=24;TR=68;WE=84362306;WS=84362288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chrX	84534383	rs2227090	A	C	3746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FS=1.663;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.56;ReadPosRankSum=2.817;SOR=0.314;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:6,153:0.96:159
chrX	84562295	.	A	G	733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=15;PP=472;SC=AGAAGCATAAATTATTTATTA;SOR=1.528;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=9;TCR=15;TR=24;WE=84562303;WS=84562285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chrX	85166221	rs374586671	AAT	A	75.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.707;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=7.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.88;ReadPosRankSum=-0.542;SOR=3.244;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chrX	85994683	rs6623765	G	T	856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=22;NR=6;PP=464;SC=TTCAAATGTAGAGACTCAACC;SOR=1.681;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=28;WE=85994691;WS=85994673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chrX	86071151	rs12837683	C	G	2177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=37;NR=37;PP=1177;SC=TATGTGACCCCTGGGGATGAG;SOR=0.872;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=37;TCR=37;TR=74;WE=86071159;WS=86071141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chrX	86082914	rs183091443	A	G	1397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=34;PP=970;SC=TTTGTTCATTACTGATAAATA;SOR=3.516;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=6;TCR=34;TR=40;WE=86082922;WS=86082904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chrX	88008423	rs5940915	A	C	2653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=27;PP=1609;SC=AGGATGAGTTATCCTACTAAA;SOR=1.251;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=54;TCR=27;TR=81;WE=88008431;WS=88008413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chrX	88009322	rs5984613	A	G	2535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=53;PP=1645;SC=TGGGAATTAAATTAAATTGGG;SOR=1.559;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=30;TCR=53;TR=83;WE=88009330;WS=88009312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chrX	91456467	rs4252207	C	A	8947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=138;NR=169;PP=2965;SC=ATGGCAAAAGCCCTATGATTT;SOR=0.949;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=308;TCF=138;TCR=170;TR=307;WE=91456482;WS=91456457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,339:1.00:339
chrX	92927634	rs1045686	G	C	8092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=135;NR=130;PP=2965;SC=ATTTCTTTAGGAACTTCCTTT;SOR=0.778;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=266;TCF=136;TCR=130;TR=265;WE=92927642;WS=92927624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,292:1.00:292
chrX	96194485	rs11795730	A	G	111.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.38;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chrX	96196880	rs1494130	A	G	281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=1;PP=177;SC=TTGTCCTAAGAAAGTGTAGTG;SOR=2.303;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=96196888;WS=96196870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chrX	96197175	rs5920973	G	A	1425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=30;PP=878;SC=ATTGTGTTTTGTGCCTTCTGT;SOR=1.524;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=18;TCR=30;TR=48;WE=96197183;WS=96197165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chrX	96213213	rs5966792	T	C	1321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=10;NR=32;PP=954;SC=TGTGTACACATTGTATAATGT;SOR=2.636;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=10;TCR=32;TR=42;WE=96213221;WS=96213203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chrX	96684809	.	CAA	C	98.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=0.000;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQRankSum=0.713;QD=3.95;ReadPosRankSum=1.061;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,7:0.28:25
chrX	99849017	rs2073162	G	A	5864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=126;PP=2965;SC=CATTGGAAGTGCACGACTTTA;SOR=1.449;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=198;TCF=72;TCR=126;TR=198;WE=99849025;WS=99849007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chrX	99849051	rs2073163	T	C	3289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=70;PP=2309;SC=GATGTTTTCCTCCTAAGGCTT;SOR=1.807;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=32;TCR=70;TR=102;WE=99849059;WS=99849041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chrX	99919733	rs2022475	G	A	2004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=21;PP=1235;SC=CCAGATAGTCGCACAAGCCAC;SOR=1.394;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=47;TCR=21;TR=67;WE=99919741;WS=99919723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chrX	99930886	.	T	TACACACAC	413.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;QD=37.61;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chrX	99930892	rs4828041	T	C	592.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.34;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chrX	99941705	rs2022039	T	C	5989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=107;NR=93;PP=2965;SC=AGTGGATTAATAGTGTCCCGC;SOR=0.787;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=200;TCF=107;TCR=93;TR=200;WE=99941713;WS=99941695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chrX	99943244	rs5921627	G	C	2613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=24;PP=1614;SC=CCTGAAAAGAGTGACTAGGAT;SOR=1.661;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=60;TCR=24;TR=84;WE=99943252;WS=99943234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chrX	99956157	rs5967170	T	C	785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=11;PP=617;SC=GTTAAGATGCTACCAGTCAGA;SOR=0.941;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=13;TCR=11;TR=24;WE=99956165;WS=99956147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chrX	100212432	rs12842818	C	G	4832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=83;PP=2965;SC=TAAATGAGGCCTCTCGCTCCC;SOR=0.704;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=171;TCF=87;TCR=84;TR=170;WE=100212440;WS=100212422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chrX	100242305	rs5921702	G	A	903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=1;PP=769;SC=CTCTTTGAATGAGAGTGACTG;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=30;WE=100242313;WS=100242295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chrX	100243459	rs3934462	G	T	2669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=64;PP=1762;SC=CTAGGAGAATGAGAGCTCAGA;SOR=2.069;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=91;TCF=27;TCR=64;TR=90;WE=100243467;WS=100243449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chrX	100245606	rs6523438	A	G	9139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=160;NR=153;PP=2965;SC=GATGGCATCCATTGAGAATGA;SOR=0.722;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=313;TCF=160;TCR=153;TR=313;WE=100245614;WS=100245596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,345:1.00:345
chrX	100265552	rs5921705	T	A	1643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=20;PP=931;SC=AATAGCCTGCTGTCTTCTAGG;SOR=1.057;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=35;TCR=20;TR=55;WE=100265560;WS=100265542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chrX	100357474	rs200797522	T	TTA	51.92	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.98;ReadPosRankSum=-1.150;SOR=0.916;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,3:0.75:4
chrX	100383616	rs112057339	G	A	842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=5;PP=565;SC=ACCATGCCCAGCCTATTTTTG;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=27;WE=100383624;WS=100383606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chrX	100383840	rs7884828	A	C	3650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=56;NR=74;PP=1891;SC=GAATTGAGTGAGGATGGACCA;SOR=1.155;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=56;TCR=74;TR=130;WE=100383848;WS=100383830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chrX	100395547	rs2273379	T	G	544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=0;PP=463;SC=GTTCAAAATTTGATGTGGTCA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=16;WE=100395555;WS=100395540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chrX	100400023	rs2295376	A	G	2987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=24;PP=1849;SC=TTGCTACTCTATATCTGAATG;SOR=2.078;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=90;TCF=66;TCR=24;TR=90;WE=100400031;WS=100400013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chrX	100416757	rs112993398	A	G	385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=10;PP=249;SC=TATCTAGGATATAACTTTTGA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=100416765;WS=100416747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	100490933	rs7066252	G	C	1782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=22;PP=1117;SC=GAACGGGTCTGTTGGTGCCTC;SOR=1.306;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=38;TCR=22;TR=60;WE=100490941;WS=100490923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chrX	100505617	rs3747280	G	C	2059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=47;PP=1228;SC=GTTGCAGGAAGGGTGGGAAGA;SOR=1.552;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=25;TCR=47;TR=72;WE=100505625;WS=100505607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chrX	100511098	rs3213505	C	T	1385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=10;PP=854;SC=TTTCCCCACACCCATGCAGAG;SOR=1.958;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=45;WE=100511106;WS=100511088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chrX	100514986	rs5967281	G	A	3123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=57;NR=39;PP=1742;SC=GAGTCTGTCAGAGTAAGGTCA;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=57;TCR=39;TR=96;WE=100514994;WS=100514976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chrX	100531204	rs3761514	T	C	849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=3;PP=673;SC=GATAACTTCTTGAGCTTAGCT;SOR=3.611;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=25;WE=100531212;WS=100531194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chrX	100532621	rs35899692	T	C	3131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=61;NR=44;PP=1573;SC=TGCTTGTGGCTGCTCATTCCC;SOR=0.963;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=61;TCR=44;TR=105;WE=100532629;WS=100532611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chrX	100532924	rs3788765	A	G	2200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=9;PP=1728;SC=CATTTCAAAGAATCTTAAGTT;SOR=3.675;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=59;TCR=9;TR=68;WE=100532932;WS=100532914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chrX	100532985	rs3788764	T	C	5607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=89;PP=2965;SC=TTCGTCAGCATGTACAAATGG;SOR=0.843;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=198;TCF=109;TCR=89;TR=198;WE=100532993;WS=100532975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chrX	100537154	rs5991927	G	A	670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=3;PP=350;SC=GATTACAAGCGTGAGCCACCG;SOR=2.584;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=22;WE=100537162;WS=100537144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
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chrX	100604757	rs700	T	G	2723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=17;PP=1732;SC=AGGGGCCTTTTTGTATTGAGT;SOR=2.520;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=61;TCR=17;TR=78;WE=100604765;WS=100604747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chrX	100609547	rs2071223	G	A	4160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=47;PP=2549;SC=GATTAAAACTGTAACACCTAC;SOR=1.406;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=142;TCF=95;TCR=47;TR=142;WE=100609555;WS=100609537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chrX	100615025	rs5951412	G	T	482.22	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5083;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=9;PP=455;ReadPosRankSum=1.032;SC=TATATATATAGAGAGAGAGAG;SOR=1.179;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=37;WE=100615033;WS=100615013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,20:0.91:22
chrX	100615478	rs2855259	C	T	1714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=8;PP=1111;SC=ATGCTGATCACGGGAATTATG;SOR=3.076;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=44;TCR=8;TR=52;WE=100615486;WS=100615468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chrX	100617372	rs2071222	T	C	355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=7;PP=203;SC=TCACATAGCTTGGAGAGCAGA;SOR=1.179;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=11;WE=100617380;WS=100617362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	100742551	rs2361298	G	A	3363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=44;PP=2054;SC=TGTTCTACCAGGGACTCGGTT;SOR=0.998;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=67;TCR=44;TR=111;WE=100742559;WS=100742541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chrX	100743037	rs963618	C	T	2745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=47;NR=48;PP=1658;SC=TTAGGGTGTACTGCCAAGAGA;SOR=0.836;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=47;TCR=48;TR=95;WE=100743045;WS=100743027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chrX	100743546	rs6621080	C	T	3990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=66;NR=62;PP=2152;SC=CTCTACCATACCTTGTTCGTG;SOR=0.790;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=66;TCR=62;TR=128;WE=100743554;WS=100743536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chrX	100743826	rs5951332	A	G	5923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=91;NR=110;PP=2965;SC=AAGTGGGCCTAGGGCTGAAGT;SOR=1.008;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=201;TCF=91;TCR=110;TR=201;WE=100743834;WS=100743816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chrX	100745825	rs5951333	T	C	6642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=114;NR=96;PP=2965;SC=TCTGCCCGGCTCCAGGCTGTG;SOR=0.808;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=210;TCF=114;TCR=96;TR=210;WE=100745833;WS=100745815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chrX	100748078	rs5991911	A	G	2945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=46;PP=1939;SC=TCCTGGGCTGACACTGGGGAC;SOR=0.712;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=99;TCF=53;TCR=46;TR=98;WE=100748086;WS=100748068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chrX	100749127	rs5951336	A	G	1155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=11;PP=730;SC=TGGGGCTGGGATTTGGTCCTG;SOR=1.402;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=28;TCR=11;TR=39;WE=100749135;WS=100749117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chrX	100749585	rs3174476	C	T	5982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=103;NR=95;PP=2965;SC=AGTTTGCACACCAAAGTGAGG;SOR=0.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=200;TCF=103;TCR=97;TR=198;WE=100749593;WS=100749575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chrX	100807909	rs6616255	A	G	5491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=105;NR=72;PP=2965;SC=TGTCCCAGCTATACCATGGGC;SOR=0.971;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=177;TCF=105;TCR=72;TR=177;WE=100807917;WS=100807899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chrX	100871148	rs35319186	T	C	2074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.09;QD=30.97;SOR=3.360;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chrX	100911066	rs3850315	C	T	2768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=42;PP=1898;SC=CAAGCAGGTGCTGGTAGTCAT;SOR=0.823;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=47;TCR=42;TR=89;WE=100911074;WS=100911056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chrX	100912186	.	A	C	789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.961;ClippingRankSum=0.000;DP=361;ExcessHet=3.0103;FS=2.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.19;ReadPosRankSum=1.126;SOR=0.762;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:293,68:0.19:361
chrX	101138792	rs5944882	T	C	7153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=136;NR=118;PP=2965;SC=CTGATGTTTCTGTTTATGACC;SOR=0.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=255;TCF=136;TCR=119;TR=254;WE=101138800;WS=101138782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,272:1.00:272
chrX	101141776	rs67953349	AC	A	545.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=413;SC=TTAGAACTGGACCAAAAATTT;SOR=2.049;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=101141784;WS=101141766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chrX	101141793	rs5944778	G	A	441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=10;PP=289;SC=ATTTATTAGAGACCATCTACT;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=15;WE=101141801;WS=101141783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chrX	101395780	rs11408120	T	TG	2163.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.77;QD=32.29;SOR=1.828;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chrX	101437635	rs5945049	A	G	13642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=521;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=243;NR=227;PP=2965;SC=ATTTATCTCCAGGTAAGATTC;SOR=0.752;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=470;TCF=243;TCR=227;TR=470;WE=101437643;WS=101437625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,521:1.00:521
chrX	101623586	.	ATGG	A	1060.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=0.000;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQRankSum=1.184;QD=20.01;ReadPosRankSum=-0.263;SOR=0.541;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,32:0.60:53
chrX	102320931	.	ATGTGTG	A	291	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;FR=1.0000;HP=2;HapScore=3;MGOF=14;MMLQ=15;MQ=59.98;NF=0;NR=8;PP=291;QD=36.75;SC=CAATTTATATATGTGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=8;WE=102320944;WS=102320921;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:30,8:0.21:38
chrX	102339606	rs1029305	T	C	2918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=34;PP=1797;ReadPosRankSum=-0.856;SC=TTTCACTGGCTGGTACATTCC;SOR=0.701;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=95;TCF=61;TCR=34;TR=93;WE=102339614;WS=102339596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,106:0.97:109
chrX	102342405	rs5945935	G	A	2099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=31;PP=1501;SC=AAAATCTGAAGACATTTGTGA;SOR=0.750;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=63;TCF=32;TCR=31;TR=63;WE=102342413;WS=102342395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chrX	102755551	rs1180895	T	A	4642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=76;PP=2938;SC=CCCCCCGAGATGGCTGTACGG;SOR=0.934;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=145;TCF=69;TCR=76;TR=145;WE=102755559;WS=102755541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chrX	102831217	rs221946	C	T	755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=0;PP=554;SC=GTAAATATTTCAGGCTTTGTG;SOR=4.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=102831225;WS=102831207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chrX	102840421	rs221931	G	T	430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=1;PP=306;SC=GGAACTCCTGGGCTGCGGCAT;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=102840429;WS=102840411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chrX	102842041	rs11010	T	C	7325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=126;NR=123;PP=2965;SC=AGGCCATACATGATATGAATT;SOR=0.759;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=251;TCF=127;TCR=124;TR=249;WE=102842049;WS=102842031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,281:1.00:281
chrX	102863960	rs139687459	C	A	5432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=132;NR=53;PP=2965;SC=CATTCCCATCCCCCAGGACAG;SOR=1.772;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=187;TCF=132;TCR=55;TR=185;WE=102863968;WS=102863950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chrX	102864442	.	A	G	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.048;ClippingRankSum=0.000;DP=148;ExcessHet=3.0103;FS=2.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.40;MQRankSum=-8.940;QD=2.23;ReadPosRankSum=-1.826;SOR=0.416;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,30:0.20:148
chrX	102978806	rs5945807	G	C	3336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=45;PP=1668;SC=GCATCGTGCAGGTCTGGATGT;SOR=0.902;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=61;TCR=45;TR=106;WE=102978814;WS=102978796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chrX	102979486	rs4907817	T	C	4379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=53;PP=1939;SC=GTCTTGGTGATGGAGCTGAAA;SOR=0.791;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=79;TCR=54;TR=131;WE=102979494;WS=102979476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chrX	102979992	rs2239814	A	G	221.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=6;PP=166;SC=GAGGCCAGTTATGTGCTGCAC;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=102980000;WS=102979982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chrX	103031700	rs11371342	A	AG	1244.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.55;QD=31.92;SOR=1.552;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chrX	103036412	rs521895	A	G	1384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=35;PP=1036;SC=TTGCCCACACAACTTCGTTAT;SOR=4.174;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=4;TCR=35;TR=39;WE=103036420;WS=103036402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chrX	103042882	rs1126707	T	C	2875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=56;PP=1507;SC=TCTGTGCTGATGCCAGAATGT;SOR=1.042;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=103;TCF=47;TCR=56;TR=103;WE=103042890;WS=103042872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chrX	103295543	rs3213517	A	C	4249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=83;PP=2743;SC=TATATGGCTAAATAAAATTTT;SOR=1.371;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=53;TCR=83;TR=136;WE=103295551;WS=103295533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chrX	104464276	rs375033944	CA	C	7823.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=67;PP=2951;SC=CCACAACCTCCAACATCCCCT;SOR=0.728;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=89;TCF=21;TCR=68;TR=87;WE=104464289;WS=104464266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chrX	104464281	rs367644904	TC	T	7823.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=67;PP=2966;SC=ACCTCCAACATCCCCTCTGCT;SOR=0.740;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=86;TCF=17;TCR=69;TR=82;WE=104464289;WS=104464266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chrX	105139356	.	C	CAGAA	4087.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.492;ClippingRankSum=0.000;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.421;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.462;NF=20;NR=25;PP=2203;ReadPosRankSum=-0.254;SC=AGAACTGTACCAGAAAGAAAG;SOR=1.157;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=103;TCF=43;TCR=60;TR=45;WE=105139375;WS=105139346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,95:0.91:104
chrX	105153001	rs209372	A	G	7447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=124;NR=117;PP=2965;ReadPosRankSum=1.499;SC=TGAAGGCTAAAGCCTCTAAAC;SOR=0.238;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=242;TCF=124;TCR=118;TR=241;WE=105153009;WS=105152991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,269:1.00:270
chrX	105192769	rs113490419	CT	C	112.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=6.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.23;MQRankSum=1.381;QD=4.18;ReadPosRankSum=1.057;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chrX	105278361	rs1804495	C	A	7643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=139;NR=137;PP=2965;ReadPosRankSum=1.750;SC=TTGGAACAAACAAGTCAACCC;SOR=0.777;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=278;TCF=140;TCR=138;TR=276;WE=105278369;WS=105278350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,296:0.99:298
chrX	105912591	.	GA	G	65.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.644;ClippingRankSum=0.000;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.17;ReadPosRankSum=-0.660;SOR=0.594;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,11:0.20:56
chrX	106028279	.	GTT	G	36.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.338;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.41;ReadPosRankSum=0.605;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,4:0.15:26
chrX	106841056	.	TGAG	T	40.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.046;ClippingRankSum=0.000;DP=219;ExcessHet=3.0103;FS=3.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.22;ReadPosRankSum=1.550;SOR=0.851;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:170,14:0.08:184
chrX	107169296	.	CT	C	101.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.84;ReadPosRankSum=1.456;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chrX	107310234	rs138849840	C	T	10084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=378;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=184;NR=161;PP=2965;SC=CAGGGTCCAACGATCCAGGTA;SOR=0.770;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=345;TCF=184;TCR=161;TR=345;WE=107310242;WS=107310224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,378:1.00:378
chrX	107328436	rs807178	G	A	3269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=73;PP=2116;SC=TAGGTAGTCTGAAGTGCATAT;SOR=2.411;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=25;TCR=73;TR=98;WE=107328444;WS=107328426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chrX	107415595	.	G	A	172	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;FR=0.8821;HP=26;HapScore=2;MGOF=15;MMLQ=27;MQ=50.8;NF=0;NR=5;PP=172;QD=41.3542425094;SC=GCCTAAAAAAGAAAAAAAAAA;SbPval=0.03;Source=Platypus;TC=13;TCF=7;TCR=6;TR=5;WE=107415603;WS=107415585;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,5:0.38:13
chrX	107415825	rs2881142	T	C	2357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=51;PP=1616;SC=CCCTCTTACTTCCTCACCCCT;SOR=1.759;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=25;TCR=51;TR=76;WE=107415833;WS=107415815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chrX	107418281	rs2295914	C	T	2273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=49;NR=27;PP=1306;SC=TATGAAGCCTCTCTTGAGCAT;SOR=1.101;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=77;TCF=50;TCR=27;TR=76;WE=107418289;WS=107418271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chrX	107418906	rs4623610	A	G	5568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=88;PP=2965;SC=GAGTACCAGCACGTCCAGATG;SOR=0.804;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=190;TCF=102;TCR=88;TR=190;WE=107418914;WS=107418896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chrX	107422058	rs143895379	C	T	5090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=78;NR=100;PP=2965;SC=CCTAGTAAGCCAGGCTTCCCG;SOR=1.018;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=179;TCF=78;TCR=101;TR=178;WE=107422066;WS=107422048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chrX	107423674	.	TACACAC	T,TAC	3243.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.439;ClippingRankSum=0.000;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=3.568;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.75;MQRankSum=0.428;QD=37.28;ReadPosRankSum=-0.167;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:2,15,70:0.17,0.80:87
chrX	107430579	rs1266715	G	A	2108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=50;PP=1574;SC=TCTGACTACAGGAAAGAGGTA;SOR=1.885;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=20;TCR=50;TR=70;WE=107430587;WS=107430569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chrX	107433688	rs1042065	A	G	7837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=155;NR=113;PP=2965;SC=GGGAACCCTGACTCTTTGTTG;SOR=0.943;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=268;TCF=155;TCR=113;TR=268;WE=107433696;WS=107433678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,293:1.00:293
chrX	107437848	rs1266719	G	C	5940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=110;NR=80;PP=2965;SC=CCACTAAGTGGAAAGTATGAG;SOR=0.882;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=190;TCF=110;TCR=80;TR=190;WE=107437856;WS=107437838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chrX	107438119	rs1266720	G	T	526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=7;PP=313;SC=GGCAAGGCACGGAATTTGACA;SOR=0.804;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=9;TCR=7;TR=16;WE=107438127;WS=107438115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chrX	107448639	rs1266730	G	T	7988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=134;NR=143;PP=2965;SC=GCATATGGAAGGCAGACTGTA;SOR=0.827;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=277;TCF=134;TCR=143;TR=277;WE=107448647;WS=107448629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,301:1.00:301
chrX	107450101	rs1266732	T	G	2223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=50;PP=1443;SC=AAGGCTAGAGTTTATATCATT;SOR=1.367;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=29;TCR=50;TR=79;WE=107450109;WS=107450091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chrX	107455014	rs1266736	C	T	1305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=37;PP=983;SC=CACACACTTACAGTCTTTTTA;SOR=2.352;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=11;TCR=37;TR=48;WE=107455022;WS=107455004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chrX	107463090	rs201304389	CCCATATTGTATT	C	2270.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=28;PP=2966;SC=TACCCCCCTCCCCATATTGTA;SOR=2.584;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=29;WE=107463109;WS=107463080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chrX	107976940	rs1801164	G	C	7478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=124;NR=114;PP=2965;SC=GGGGGCTCATGATCTGAAGGC;SOR=0.724;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=240;TCF=124;TCR=116;TR=238;WE=107976948;WS=107976930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,262:1.00:262
chrX	107978342	rs80131334	TC	AT	11070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=96;PP=2947;SC=GCAGTCTTCCTCGCCTGGAGT;SOR=0.701;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=211;TCF=111;TCR=100;TR=204;WE=107978351;WS=107978332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chrX	107979437	rs73253702	G	A	5221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=88;PP=2965;ReadPosRankSum=1.838;SC=AAGACGACCCGGTCCCAATGA;SOR=0.317;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=166;TCF=77;TCR=89;TR=165;WE=107979445;WS=107979427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,189:0.99:190
chrX	107979475	rs1801162	G	A	4817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=80;PP=2648;SC=GAGGAAAGAAGCGGGGTGGTC;SOR=0.885;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=157;TCF=77;TCR=80;TR=157;WE=107979483;WS=107979465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chrX	107979512	rs2073114	C	T	3678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=66;PP=2090;SC=CTGCCGCTGCCGCCGCTGCTG;SOR=1.105;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=120;TCF=54;TCR=66;TR=120;WE=107979520;WS=107979502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chrX	108904729	rs839408	C	T	1541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=14;PP=893;SC=TTTTGACTTACGAAACAAAAA;SOR=1.692;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=36;TCR=14;TR=50;WE=108904737;WS=108904719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chrX	108917757	rs5942830	T	C	681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=17;PP=524;SC=AAACATGTTGTAATTCAAGTA;SOR=2.030;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=23;WE=108917765;WS=108917747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chrX	108917773	rs5943413	A	G	377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=2;NR=11;PP=292;SC=AAGTATTAATAACAAATACAG;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=108917781;WS=108917763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	109416688	rs34813944	AT	A	551.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=3.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.33;MQRankSum=0.000;QD=14.15;ReadPosRankSum=0.453;SOR=0.827;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,31:0.79:39
chrX	109419165	rs2795995	G	A	1260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=33;NR=9;PP=773;SC=TATCTGCCCTGTGCCGGCCCT;SOR=2.110;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=42;WE=109419173;WS=109419155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chrX	109694685	rs2073787	T	A	6375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=111;NR=93;PP=2965;SC=CTTCTGGAGGTACATCACCCC;SOR=0.873;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=204;TCF=111;TCR=93;TR=204;WE=109694693;WS=109694675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chrX	109931799	rs5943052	A	G	7730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=149;NR=119;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.578;SC=GTCAACCAAAAGCAGGGCCTC;SOR=0.290;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=268;TCF=149;TCR=119;TR=268;WE=109931807;WS=109931789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,294:1.00:295
chrX	109931856	rs5943053	T	C	8809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=148;NR=158;PP=2965;SC=CCTTGCAGCATTTTCCGTCTA;SOR=0.788;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=306;TCF=148;TCR=158;TR=306;WE=109931864;WS=109931846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,329:1.00:329
chrX	111698036	rs6568050	T	C	4540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=62;PP=2890;SC=ATTCTGCGGCTTCAAATGCAG;SOR=0.961;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=153;TCF=91;TCR=62;TR=152;WE=111698044;WS=111698026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chrX	111698895	rs140461317	G	A	4085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=86;PP=2774;SC=AGTAAGAGGAGACCAGGAAAG;SOR=1.435;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=137;TCF=51;TCR=86;TR=137;WE=111698903;WS=111698885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chrX	113965679	rs377148142	GT	G	45.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=3.878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.78;ReadPosRankSum=-1.112;SOR=0.213;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,10:0.17:59
chrX	114082535	rs5946005	G	A	3104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=30;PP=2053;SC=TTTGGATGACGTGTTCTTGTC;SOR=1.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=76;TCR=30;TR=106;WE=114082543;WS=114082525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chrX	114400318	rs4361922	T	G	910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=10;PP=679;SC=TGTAAGAGTTTGCTAAAGACA;SOR=1.329;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=19;TCR=10;TR=29;WE=114400326;WS=114400308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chrX	114425181	.	A	AGAGGCCGCTCGCCCAACGCCCACAGCG	10913.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.58;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=40;PP=2957;SC=CGAGGAGTACAGAGGCCGCTC;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=82;TCF=19;TCR=63;TR=51;WE=114425189;WS=114425171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chrX	114425400	rs12857270	G	A	7039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=115;NR=106;PP=2965;SC=CGACTGCTGCGGAGGAGGAGG;SOR=0.701;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=221;TCF=115;TCR=106;TR=221;WE=114425408;WS=114425390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chrX	114426171	rs5946294	C	T	10403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=380;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=178;NR=173;PP=2965;SC=CAGCGGAGGCCGCTCGCCTGA;SOR=0.704;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=351;TCF=178;TCR=173;TR=351;WE=114426179;WS=114426161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,380:1.00:380
chrX	114426917	rs4911809	C	T	6088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=107;NR=90;PP=2965;SC=TCAAGAGTTACGGCCTGAGCG;SOR=0.759;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=197;TCF=107;TCR=90;TR=197;WE=114426925;WS=114426907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chrX	115568092	rs2312054	A	T	1115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=30;PP=890;SC=AAGAAAGAAAAGCTCTTACTC;SOR=2.554;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=9;TCR=30;TR=39;WE=115568100;WS=115568082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chrX	115575989	rs12391221	A	C	855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=0;PP=737;SC=ATACAATATTAATGAAGCTTC;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=115575997;WS=115575979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chrX	115584402	rs6608646	C	G	994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=24;PP=664;SC=CCTATTACCCCCTCTAGCTGT;SOR=1.547;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=11;TCR=24;TR=35;WE=115584410;WS=115584392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chrX	115585678	rs12559530	C	G	619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.79;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chrX	115586700	rs10521578	A	G	1478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=29;PP=922;SC=TTAATAATTCACATTGAAGAC;SOR=1.220;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=20;TCR=29;TR=49;WE=115586708;WS=115586690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chrX	117530912	.	GT	G	45.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.414;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=9.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.33;MQRankSum=1.668;QD=1.43;ReadPosRankSum=-1.448;SOR=0.055;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,9:0.28:32
chrX	117695200	rs5909545	G	C	113.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=87;SC=TGAAGATAATGATAATTCCTA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=117695208;WS=117695190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chrX	117700141	rs2286977	A	G	3799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=79;PP=2413;ReadPosRankSum=-0.754;SC=TAGAAACAGCACAAGGTCAGA;SOR=0.715;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=124;TCF=44;TCR=80;TR=123;WE=117700149;WS=117700131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,135:0.99:136
chrX	117742356	rs5910394	C	T	4837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=86;PP=2566;SC=CAAAAGCAGCCATAGACACAC;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=168;TCF=81;TCR=87;TR=167;WE=117742364;WS=117742346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chrX	117762101	.	G	T	361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=327;SC=TTGCCAACAAGGGCTTGACTT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=117762109;WS=117762096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chrX	117810831	rs5957040	C	T	1020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=28;PP=728;SC=AAAGAAAGAACAGGGGCTTTG;SOR=2.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=35;WE=117810839;WS=117810821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chrX	117817266	rs4372173	C	T	2551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=60;PP=1608;SC=TCAAAATGCACAACCTTAAAG;SOR=1.847;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=26;TCR=60;TR=86;WE=117817274;WS=117817256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chrX	117874898	rs2246663	T	C	1442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=8;PP=1120;SC=TACTGTCTTGTCCTCTAGGAC;SOR=3.033;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=39;TCR=8;TR=47;WE=117874906;WS=117874888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chrX	118143043	rs2168379	A	G	3366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=38;PP=2242;SC=GCTGATTGCTACGTATTACCT;SOR=1.402;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=113;TCF=74;TCR=39;TR=112;WE=118143051;WS=118143033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chrX	118147233	rs2290514	G	T	1231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=30;PP=852;SC=AAAGATAGTTGTGAAAGGATT;SOR=1.828;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=14;TCR=30;TR=44;WE=118147241;WS=118147223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chrX	118148229	rs2278954	A	G	6528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=140;NR=92;PP=2965;SC=ATCAGCAAGCATCATTGTGGT;SOR=1.161;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=232;TCF=140;TCR=92;TR=232;WE=118148237;WS=118148219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chrX	118250710	rs5957111	A	C	1118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=17;NR=24;PP=598;SC=ATGAGAGGAAAGAGGACCATG;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=17;TCR=24;TR=41;WE=118250718;WS=118250700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chrX	118281538	rs5910522	C	A	1527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=28;PP=916;SC=CACTGCAGTGCCACAAAAGCA;SOR=1.009;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=24;TCR=28;TR=52;WE=118281546;WS=118281528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chrX	118281635	rs11405916	G	GC	264.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=323;SC=CTAAGAGCTAGCCCTGGGCCA;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=9;WE=118281643;WS=118281625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chrX	118533299	rs217975	A	G	232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=3;PP=139;SC=GGGGCCCGCCACCTCCGCCCG;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=9;WE=118533307;WS=118533289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chrX	118533366	rs217976	G	A	913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=9;PP=430;SC=GTCGGGGCTCGATGGCTACGT;SOR=1.002;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=19;TCR=9;TR=28;WE=118533374;WS=118533356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chrX	118544448	rs16274	T	C	772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=10;NR=17;PP=515;SC=TGACTGCTCATAAATACTGTG;SOR=1.382;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=27;TCF=10;TCR=17;TR=27;WE=118544456;WS=118544438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chrX	118560403	rs217997	G	C	1120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=29;PP=840;SC=AATAAGTACTGTCAATAATGC;SOR=3.383;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=34;WE=118560411;WS=118560393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chrX	118587003	rs3810755	C	T	5426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=104;PP=2965;SC=ACGAGAAAACCGAAGCCTAAA;SOR=1.261;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=174;TCF=70;TCR=104;TR=174;WE=118587011;WS=118586993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chrX	118603742	rs148294496	A	C	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=7.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQRankSum=-9.631;QD=0.88;ReadPosRankSum=0.822;SOR=0.490;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:106,11:0.09:117
chrX	118603747	rs141428607	A	T	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=7.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQRankSum=-9.372;QD=1.14;ReadPosRankSum=0.434;SOR=0.491;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,11:0.10:111
chrX	118603844	rs371749	T	G	3095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.989;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=7.811;NF=50;NR=58;PP=1766;ReadPosRankSum=1.477;SC=CAGTTTTGGCTCTACTTTGCA;SOR=0.153;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=51;TCR=61;TR=108;WE=118603852;WS=118603834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,120:0.98:122
chrX	118604436	rs12390	T	C	2702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.67;QD=25.74;SOR=0.967;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chrX	118604553	rs3216181	T	TA	3200.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=45;PP=1992;SC=TACATACCTTTAAAATGGCTG;SOR=1.007;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=55;TCF=4;TCR=51;TR=49;WE=118604561;WS=118604543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chrX	118673939	.	A	G	627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=20;PP=560;SC=CACATACACAAAAAATGCTAT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=118673947;WS=118673929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chrX	118678364	rs5910611	G	A	2302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.78;SOR=1.259;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chrX	118699320	rs5910616	A	G	13722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=518;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=257;NR=224;PP=2965;SC=TTTCGGCATGATTCCCAAGAG;SOR=0.798;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=482;TCF=258;TCR=224;TR=481;WE=118699328;WS=118699310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,518:1.00:518
chrX	118709567	rs56726502	T	TAA	392.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;QD=32.73;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chrX	118754064	rs59071899	CA	C	180.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.90;QD=18.07;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chrX	118759507	.	CTTTT	C	22	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.4991;HP=17;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=27;MQ=61.07;NF=0;NR=2;PP=22;QD=12.5;SC=CACTGATACTCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=2;WE=118759518;WS=118759497;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,2:0.22:9
chrX	118783881	rs6603539	G	A	8231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=170;NR=108;PP=2965;SC=CAAATGGTCAGGAAATTGCTC;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=278;TCF=170;TCR=108;TR=278;WE=118783889;WS=118783871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,303:1.00:303
chrX	118787022	rs5957203	A	T	1232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=37;PP=1070;SC=GAGAGCAGGGACAGAGGCGGA;SOR=3.967;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=4;TCR=37;TR=41;WE=118787030;WS=118787012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chrX	118827317	rs17261138	A	C	462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=389;SC=CTATGGCCAGACCAGTTCCAG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=118827325;WS=118827307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chrX	118893390	rs12841259	A	G	4789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=76;PP=2961;SC=CAGCGGGTGCACCAACCTGAA;SOR=0.773;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=168;TCF=92;TCR=76;TR=168;WE=118893398;WS=118893380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chrX	118921215	rs45555441	G	C	760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=4;PP=531;SC=CTCCCAAAGAGTTGAGATTAC;SOR=2.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=25;WE=118921223;WS=118921205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chrX	118974507	rs2285552	A	C	7583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=135;NR=106;PP=2965;SC=AGGGGTTTTCAACAAGTAACA;SOR=0.898;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=241;TCF=135;TCR=106;TR=241;WE=118974529;WS=118974497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,276:1.00:276
chrX	118977332	rs2496213	A	G	428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=12;PP=329;SC=CATTATCTACAATACTGATTT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=118977340;WS=118977322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	118985598	rs2428212	C	T	2840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=40;NR=52;PP=1500;SC=TAAATGTACTCGCAGGTGTCT;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=40;TCR=52;TR=92;WE=118985606;WS=118985588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chrX	119054001	rs3829719	C	T	4836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=95;PP=2794;SC=AGCAGTTGCGCAACAACAGAT;SOR=1.272;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=160;TCF=65;TCR=95;TR=160;WE=119054009;WS=119053991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chrX	119065893	rs194302	G	A	5417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=101;NR=74;PP=2848;SC=ACACACTGCTGCTTACTTCAA;SOR=0.849;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=175;TCF=101;TCR=74;TR=175;WE=119065901;WS=119065883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chrX	119070411	rs194307	T	A	1998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=39;PP=1311;SC=AAGTACAAATTAAAAAATTAT;SOR=0.927;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=73;TCF=34;TCR=39;TR=73;WE=119070419;WS=119070401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chrX	119070567	rs194308	A	T	822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=12;PP=563;ReadPosRankSum=1.885;SC=CCCTTTTTTTAAAAATACCTT;SOR=0.346;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=17;TCR=12;TR=29;WE=119070575;WS=119070557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,30:0.97:31
chrX	119387833	rs201958171	C	CTGA	11317.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=-1.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.152;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.382;NF=44;NR=63;PP=2988;ReadPosRankSum=1.621;SC=GTTACCGATTCTGATGATGAT;SOR=0.497;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=139;TCF=54;TCR=85;TR=107;WE=119387841;WS=119387823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:12,262:0.96:274
chrX	119394904	rs3752341	G	T	950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=16;NR=18;PP=485;SC=AAAAGAAAACGTTAGTTTAGG;SOR=1.022;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=16;TCR=18;TR=34;WE=119394912;WS=119394894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chrX	119402264	rs41300936	A	C	1726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=32;PP=1137;SC=CACAAATTAGAAACAACATAA;SOR=1.493;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=19;TCR=32;TR=51;WE=119402272;WS=119402254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chrX	119421163	.	T	TACACACACACAC	386.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.15;QD=35.16;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chrX	119445015	rs3810749	C	T	1523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=8;PP=1096;SC=TCCCGCTCTCCGGCTTTTGGG;SOR=2.925;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=39;TCR=8;TR=47;WE=119445023;WS=119445005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chrX	119510144	rs3213723	C	G	558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=1;PP=468;SC=CCTGAGGAAGCATGACTGGGA;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=119510152;WS=119510134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chrX	119510456	rs3213724	G	C	492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=13;PP=384;SC=TTTCCAGAAAGCATTCAATTC;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=119510464;WS=119510446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chrX	119590533	rs12097	T	A	1149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.55;SOR=1.038;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chrX	119675354	.	C	CA	47.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.616;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=1.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.29;ReadPosRankSum=0.196;SOR=1.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,8:0.22:37
chrX	119760629	rs17261572	A	T	6565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=115;NR=103;PP=2965;SC=CTCTATACTTATCAAAGGCGT;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=219;TCF=116;TCR=103;TR=218;WE=119760637;WS=119760619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chrX	120008979	rs871733	T	C	970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=11;PP=676;SC=CCTCGCCTTCTGGGGCTGCAG;SOR=1.352;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=20;TCR=11;TR=31;WE=120008987;WS=120008969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chrX	121376076	.	C	T	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.798;ClippingRankSum=0.000;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=4.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.25;ReadPosRankSum=0.009;SOR=0.275;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,16:0.25:64
chrX	121376242	rs1970367	A	G	3353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=68;PP=2143;SC=TCAACTGTTGAAAAAGAATTT;SOR=1.402;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=112;TCF=44;TCR=68;TR=112;WE=121376250;WS=121376232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chrX	122250996	rs6648942	G	T	10881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=399;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=198;NR=164;PP=2965;SC=TAAAGAGTATGTGGCCTTGTT;SOR=0.832;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=362;TCF=198;TCR=164;TR=362;WE=122251004;WS=122250986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,398:1.00:398
chrX	122318386	rs58044961	A	AG	5389.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=15;NR=57;PP=2957;SC=TTTTAGGCGTACATGGCCAGG;SOR=0.816;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=75;TCF=15;TCR=60;TR=72;WE=122318394;WS=122318376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chrX	122336600	rs11452643	T	TG	2476.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.367;NF=14;NR=37;PP=1514;ReadPosRankSum=-0.590;SC=GTTCACCAGGTGGGCCCGCCA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=15;TCR=39;TR=51;WE=122336610;WS=122336590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,94:0.98:96
chrX	122805471	rs140825546	T	C	3833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=76;NR=55;PP=2238;SC=TCCTCTTCCCTACCCTTGGGA;SOR=0.889;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=131;TCF=76;TCR=55;TR=131;WE=122805479;WS=122805461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chrX	123034511	rs5956583	A	C	5013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=88;NR=82;PP=2965;SC=GACAGTATGCAAGATGAGTCA;SOR=0.746;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=170;TCF=88;TCR=82;TR=170;WE=123034519;WS=123034501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chrX	123204978	.	CT	C	60.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.138;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.04;ReadPosRankSum=1.467;SOR=0.922;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
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chrX	123498362	rs60637596	GT	G	636.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5211;FS=0.000;HP=12;HapScore=4;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=77;ReadPosRankSum=0.348;SC=AAGCGATACAGTTTTTTTTTT;SOR=0.507;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=7;WE=123498370;WS=123498345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,19:0.95:20
chrX	123498379	rs57958188	C	G	441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=8;PP=192;SC=TTTTTTGAGACAATCTCGCTC;SOR=2.670;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=123498387;WS=123498369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chrX	123526031	rs2076165	T	C	8747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=154;NR=139;PP=2965;SC=ATCCCGAAGGTGAATATGTGA;SOR=0.743;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=294;TCF=154;TCR=140;TR=293;WE=123526039;WS=123526021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,328:1.00:328
chrX	123540315	rs960869	G	T	1950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=48;PP=1313;SC=ACGTTGCATTGGTCAGGTGTC;SOR=2.049;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=19;TCR=48;TR=67;WE=123540323;WS=123540305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chrX	123615545	rs10656532	G	GTATATA,GTATA	545.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.4963;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;NF=3,3;NR=1,1;PP=35,9;SC=TGACCCAAGGGTATATATATA;SOR=2.494;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=4,4;WE=123615553;WS=123615535;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:0.88:16
chrX	123615807	rs145896600	G	A	7163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=115;NR=118;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.654;SC=TTGTGAGCAGGACTTGTGCTA;SOR=0.259;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=234;TCF=115;TCR=119;TR=233;WE=123615815;WS=123615797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,263:1.00:264
chrX	123630790	rs3788774	G	A	714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=3;PP=517;SC=TCTACTGGCAGTGCTTTGTCT;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=123630798;WS=123630780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chrX	125299932	.	AGCG	A	124	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=124;QD=43.3333333333;SC=GATCTGCAGCAGCGGCGGCGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=3;WE=125299942;WS=125299922;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:15,3:0.17:18
chrX	125953932	rs5931715	A	G	3981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=65;NR=68;PP=2233;SC=ACAGGGATGAATGGGTTGGAG;SOR=0.883;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=133;TCF=65;TCR=68;TR=133;WE=125953940;WS=125953922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chrX	125955428	rs2269777	G	A	7001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=125;NR=112;PP=2965;SC=CTCCTCCTCCGATATTTGGTC;SOR=0.709;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=237;TCF=125;TCR=112;TR=237;WE=125955436;WS=125955418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chrX	125955644	rs2269776	A	T	1086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=30;PP=870;SC=ACTTGAAACCACGTACCCTCC;SOR=3.026;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=36;WE=125955652;WS=125955634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chrX	128630976	rs201352836	GCA	G	36.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.352;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=100;ReadPosRankSum=0.319;SC=ACACACACGTGCACACACACA;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=3;WE=128630985;WS=128630966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chrX	128875978	rs5975146	G	A	2860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=21;PP=1782;SC=AGCTTCGTGCGTTTCAAAGGA;SOR=2.054;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=67;TCR=21;TR=88;WE=128875986;WS=128875968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chrX	128948893	rs5932686	T	C	521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.09;SOR=1.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chrX	128957640	rs2275605	T	C	6324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=106;NR=98;PP=2965;SC=GCAATGTCCCTGTAGTTTTAC;SOR=0.726;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=204;TCF=106;TCR=98;TR=204;WE=128957648;WS=128957630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chrX	129147079	rs4830173	T	C	6867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=123;NR=110;PP=2965;SC=GGCTGAGGGCTTCTTGGTGCC;SOR=0.804;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=233;TCF=123;TCR=110;TR=233;WE=129147087;WS=129147069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chrX	129162905	.	T	G	86	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;FR=0.5000;HP=11;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=15;MQ=58.12;NF=0;NR=11;PP=86;QD=10.9792011407;SC=AGGAGGGGGGTGGGGGATGGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=4;TCR=28;TR=11;WE=129162913;WS=129162895;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:21,11:0.34:32
chrX	129267464	.	TA	T	48.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=0.000;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=2.538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.68;ReadPosRankSum=-0.179;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,7:0.24:29
chrX	129751476	.	TTTTCTTTCTTTCTTTC	T	597	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5051;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MMLQ=17;MQ=58.14;NF=4;NR=0;PP=597;QD=151.75;SC=TGCTTTATGTTTTTCTTTCTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=4;WE=129751499;WS=129751466;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:3,4:0.57:7
chrX	130217020	rs5932835	G	C	1200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=9;PP=699;SC=TTCGCCCGCTGGGCAGAGCTC;SOR=1.721;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=35;WE=130217028;WS=130217010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chrX	130408030	rs45609931	G	T	4720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=91;NR=63;PP=2954;SC=GTTCACAGAAGGGGGCCATAA;SOR=1.075;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=154;TCF=91;TCR=63;TR=154;WE=130408038;WS=130408020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chrX	130408745	rs6529473	G	A	4720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=64;PP=2965;SC=CATGTTCTAGGACAAATTCAA;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=153;TCF=89;TCR=64;TR=153;WE=130408753;WS=130408735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chrX	130412178	rs4524963	C	G	1622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=35;PP=999;SC=CTCAGGGTCACTTTGTCAGCA;SOR=1.692;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=17;TCR=35;TR=52;WE=130412186;WS=130412168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chrX	130415818	rs1128617	T	C	7551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=112;NR=125;PP=2965;SC=CCAGAGAAAATTCCAGTACTG;SOR=0.919;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=237;TCF=112;TCR=125;TR=237;WE=130415826;WS=130415808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,272:1.00:272
chrX	130416958	rs5932877	C	T	7350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=142;NR=114;PP=2965;SC=TCTTACCAGTCACCCAGATTT;SOR=0.822;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=256;TCF=142;TCR=114;TR=256;WE=130416966;WS=130416948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,279:1.00:279
chrX	130420006	rs5930458	T	C	2728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=56;PP=1522;SC=TCCACAACTCTGGTTGAGGGT;SOR=1.374;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=36;TCR=56;TR=92;WE=130420014;WS=130419996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chrX	130420415	rs4495600	T	C	5620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=110;NR=77;PP=2965;SC=ACTTACCTATTGATGTCATAC;SOR=0.868;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=187;TCF=110;TCR=77;TR=187;WE=130420423;WS=130420405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chrX	130423050	rs5932879	G	A	4908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=54;PP=2965;SC=TGAAGCGGGTGGGGGGACAGA;SOR=1.506;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=156;TCF=102;TCR=54;TR=156;WE=130423084;WS=130423040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chrX	130433683	rs12010062	T	C	1803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=24;PP=1224;SC=ACCCAGGAGGTTGAAGCTGCA;SOR=1.385;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=42;TCR=24;TR=66;WE=130433691;WS=130433673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chrX	130678467	rs499030	A	G	6004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=95;NR=91;PP=2965;SC=ATGGCCCAGTATGTGTCTGCT;SOR=0.722;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=186;TCF=95;TCR=91;TR=186;WE=130678475;WS=130678457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chrX	130678844	rs655415	A	C	8094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=137;NR=127;PP=2965;SC=TCCAAGTCCTACCCTGACCAG;SOR=0.707;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=264;TCF=137;TCR=127;TR=264;WE=130678852;WS=130678834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,294:1.00:294
chrX	131189505	rs5933055	C	T	4851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=98;NR=67;PP=2870;SC=TAGCAGACACCTGAAGTTCCA;SOR=0.950;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=166;TCF=98;TCR=68;TR=165;WE=131189513;WS=131189495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chrX	131212512	rs5977623	A	G	5987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=82;PP=2965;SC=CCTCTGCTCTAATTGGGGACC;SOR=0.742;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=184;TCF=102;TCR=82;TR=184;WE=131212520;WS=131212502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chrX	131212642	rs6637934	C	T	10937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=406;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=192;NR=164;PP=2965;ReadPosRankSum=0.154;SC=CTTTGCTGGACGCACTTTGCT;SOR=0.408;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=357;TCF=192;TCR=165;TR=356;WE=131212650;WS=131212632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,405:1.00:406
chrX	131231257	rs2064650	G	A	4496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=54;PP=2636;SC=TGATTCTTAAGTAACATCATG;SOR=1.250;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=90;TCR=54;TR=144;WE=131231265;WS=131231247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chrX	131231430	rs57806249	T	TAC	342.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.90;ReadPosRankSum=1.805;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chrX	131233677	rs5933072	A	G	292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=204;SC=ACAAACAGCAATGTCAAATAG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=131233685;WS=131233667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chrX	131516423	rs5933151	T	C	814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=22;PP=538;SC=ATCATAACGATGAATACATCA;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=31;WE=131516431;WS=131516413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chrX	131518737	rs3736748	C	T	1840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=31;NR=31;PP=891;SC=CTGTACACCACGCAGAAAAGC;SOR=0.840;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=31;TCR=31;TR=62;WE=131518745;WS=131518727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chrX	131803352	rs10550199	ATC	A	246.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=24.67;ReadPosRankSum=0.366;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,9:0.90:10
chrX	132351002	rs111884715	TA	T	146.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=4.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.06;ReadPosRankSum=0.506;SOR=0.201;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chrX	133379551	rs2428577	C	T	6792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=112;NR=112;PP=2965;SC=GAACAGAAATCTAAAAGAAGC;SOR=0.758;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=224;TCF=112;TCR=112;TR=224;WE=133379559;WS=133379541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chrX	133511988	rs5978001	G	A	527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=6;PP=415;SC=GTTTTACTGTGATTAATTTAT;SOR=1.493;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=18;WE=133511996;WS=133511978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chrX	133528116	rs6529627	A	C	939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=25;PP=719;SC=AGAATTGAGAAAAGTGTTAGG;SOR=5.283;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=26;WE=133528124;WS=133528106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chrX	133594186	rs193054558	C	G	1209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=8;PP=711;SC=GCGGGGCCTGCTTCTCCTCAG;SOR=1.662;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=31;TCR=8;TR=39;WE=133594194;WS=133594176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chrX	133699960	rs1982	T	G	499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=0;PP=392;SC=GCTATAGGTTTCTCTTTCTCA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=133699968;WS=133699950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chrX	133948733	.	CAA	C	102.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=-0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.77;MQRankSum=0.674;QD=8.56;ReadPosRankSum=1.668;SOR=1.144;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chrX	134025744	rs6529648	A	G	1634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=38;PP=1111;SC=AACACTGGCCACCACAGACCA;SOR=2.387;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=13;TCR=38;TR=51;WE=134025752;WS=134025734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chrX	134155904	rs62599865	G	T	1739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=35;PP=1120;SC=GGCTGAGCTGGCACGAGAGGG;SOR=1.162;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=27;TCR=35;TR=62;WE=134155912;WS=134155894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chrX	134155953	rs74634293	A	G	837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=21;PP=629;SC=CAGGGGCGGCAGCAGGAGCCT;SOR=1.942;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=29;WE=134155961;WS=134155943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chrX	134156121	rs2475853	G	C	2350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=57;NR=24;PP=1369;SC=CCAGAGCACCGGTCCCCAGGC;SOR=1.429;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=57;TCR=24;TR=81;WE=134156129;WS=134156111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chrX	134185997	rs2498776	T	A	1517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=18;PP=1063;SC=ATGTAGGAGCTCGTCTGCACG;SOR=1.036;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=29;TCR=18;TR=47;WE=134186005;WS=134185987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chrX	134421168	rs1129093	C	T	2804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=41;NR=46;PP=1610;SC=ATAAGCTACACGTATAAGGCT;SOR=0.952;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=41;TCR=46;TR=87;WE=134421176;WS=134421158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chrX	134480966	rs140129178	C	A	436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=2;PP=305;SC=CCCTCCCACCCCAACGATTTC;SOR=3.126;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=134480974;WS=134480956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chrX	134493747	rs4829778	A	T	2550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=31;PP=1560;SC=CTGTCCAAGAAATCAGCCTAA;SOR=1.227;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=59;TCR=31;TR=90;WE=134493755;WS=134493737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chrX	134703108	rs1937729	T	G	235.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=1;PP=180;SC=ATATATAATTTTGGTAAATAG;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=134703116;WS=134703098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chrX	134715274	rs3737330	G	A	106.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.51;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
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chrX	135055694	rs6635201	T	C	779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=1;PP=646;SC=CCCTTAGAAGTGCGCCCACAC;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=135055702;WS=135055684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
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chrX	135106506	.	G	T	782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.007;ClippingRankSum=0.000;DP=242;ExcessHet=3.0103;FS=4.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.26;ReadPosRankSum=-0.469;SOR=0.722;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:184,56:0.23:240
chrX	135252234	rs3215593	AC	A	2460.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=49;PP=2011;SC=CTTTATTTGTACCAGGAGGTT;SOR=2.799;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=52;TCF=1;TCR=51;TR=50;WE=135252242;WS=135252224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chrX	135290250	rs2236003	G	A	795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=20;PP=551;SC=TATTATTCCCGTTTTACAGAT;SOR=2.753;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=25;WE=135290258;WS=135290240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chrX	135292022	rs2076705	C	T	515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=1;PP=445;SC=CTTTTTTTTTCCCCCCAGGGT;SOR=3.383;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=16;WE=135292030;WS=135292012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chrX	135307049	rs5929742	G	A	4008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=89;PP=2741;SC=TCTATTTAAAGGAAAATAAAA;SOR=1.528;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=135;TCF=46;TCR=89;TR=135;WE=135307057;WS=135307039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chrX	135310765	rs2273220	G	A	2517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=33;PP=1533;SC=GTATAGGAAGGAAGACTTTGT;SOR=0.929;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=82;TCF=49;TCR=33;TR=82;WE=135310773;WS=135310755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chrX	135310785	rs2273221	T	C	3313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=43;PP=1846;SC=TGCTGACCTTTGCTGCATTTC;SOR=0.853;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=65;TCR=43;TR=107;WE=135310793;WS=135310775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chrX	135313034	rs1055497	T	G	11928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=442;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=196;NR=209;PP=2965;SC=ACAAGCATTTTCAGGAGATGA;SOR=0.828;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=405;TCF=196;TCR=209;TR=405;WE=135313042;WS=135313024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,440:1.00:440
chrX	135322440	rs5975706	A	T	656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=1;PP=492;SC=TTCTGAAATAAACATAAATGT;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=135322448;WS=135322430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chrX	135323452	rs5975707	G	A	2094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=48;PP=1274;SC=TAAAATAAAAGCCAACATATT;SOR=2.463;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=17;TCR=48;TR=65;WE=135323460;WS=135323442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chrX	135338312	rs5975709	C	T	1522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=16;PP=1010;SC=CTCCTCTCGTCGCTCACTCTT;SOR=1.835;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=36;TCR=16;TR=52;WE=135338320;WS=135338302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chrX	135390818	rs5930928	T	A	1903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=45;NR=23;PP=1186;SC=CTTTAAGCAATAGGAAAAAAC;SOR=1.362;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=45;TCR=23;TR=68;WE=135390826;WS=135390808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chrX	135426693	rs4829829	A	G	7296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=122;NR=105;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.620;SC=GCATACCTATATTTGCAACTG;SOR=0.263;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=228;TCF=123;TCR=105;TR=227;WE=135426701;WS=135426683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,260:1.00:261
chrX	135426968	rs5930931	C	A	7338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=125;NR=137;PP=2965;SC=TTTCAACCACCTACACCTTCT;SOR=0.825;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=262;TCF=125;TCR=137;TR=262;WE=135426976;WS=135426958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,273:1.00:273
chrX	135429503	rs4829830	C	A	6840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=122;NR=92;PP=2965;SC=GTTGATGAGACCACACCCTCA;SOR=0.885;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=214;TCF=122;TCR=92;TR=214;WE=135429511;WS=135429493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chrX	135430044	rs877761	T	C	11285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=428;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=199;NR=180;PP=2965;SC=CTCCCAGGACTGTGGAAATGA;SOR=0.741;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=379;TCF=199;TCR=180;TR=379;WE=135430052;WS=135430034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,428:1.00:428
chrX	135430483	rs912002	T	C	10723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=385;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=188;NR=163;PP=2965;SC=AACTAAATCTTCTAAAACAAT;SOR=0.774;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=351;TCF=188;TCR=163;TR=351;WE=135430491;WS=135430473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,385:1.00:385
chrX	135431236	rs5930932	T	C	10354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=362;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=190;NR=142;PP=2965;SC=CACCAATTGCTTTTCTTCTAA;SOR=0.979;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=332;TCF=190;TCR=142;TR=332;WE=135431244;WS=135431226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,362:1.00:362
chrX	135431358	rs5930933	C	T	12995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=470;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=188;NR=228;PP=2965;SC=CAACTCTACCCTCTTTGACAT;SOR=0.908;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=416;TCF=188;TCR=228;TR=416;WE=135431366;WS=135431348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,470:1.00:470
chrX	135435475	rs5903915	AT	A	1961.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=11;PP=946;SC=ACTAAAACTGATTTTTTTTTG;SOR=2.712;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=57;TCF=42;TCR=15;TR=48;WE=135435483;WS=135435465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chrX	135438388	rs6635268	A	G	1403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=25;PP=828;SC=ATGTAAGTCAATAGCTCTTCC;SOR=1.473;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=17;TCR=25;TR=42;WE=135438396;WS=135438378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chrX	135474420	rs1329546	C	A	4891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=103;NR=60;PP=2882;SC=CATTAACCACCTATGTTGTGA;SOR=1.141;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=163;TCF=103;TCR=60;TR=163;WE=135474428;WS=135474410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chrX	135474444	rs34255702	AGAT	A	10843.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.31;NF=42;NR=87;PP=2967;SC=CCAGCATTTCAGATGATATGT;SOR=1.052;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=146;TCF=50;TCR=96;TR=129;WE=135474454;WS=135474434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chrX	135480126	rs5974595	T	C	8167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=144;NR=133;PP=2965;SC=CCTCCATTTTTCTGGGAGTTG;SOR=0.740;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=277;TCF=144;TCR=133;TR=277;WE=135480134;WS=135480116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,303:1.00:303
chrX	135496398	rs5930942	G	A	8979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=167;NR=130;PP=2965;SC=AACTGTTGACGCCATCTCTCA;SOR=0.893;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=297;TCF=167;TCR=130;TR=297;WE=135496406;WS=135496388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,337:1.00:337
chrX	135829842	rs585356	G	A	137.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.58;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chrX	135956506	rs77794331	C	G	2057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.498;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-5.310;NF=39;NR=58;PP=1201;ReadPosRankSum=-1.278;SC=GTAACTGTCTCGACTTCCACC;SOR=0.750;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=217;TCF=88;TCR=129;TR=97;WE=135956514;WS=135956496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,104:0.46:227
chrX	135956571	.	T	TGG	336.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=0.000;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=16.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.26;MQRankSum=-9.437;QD=3.51;ReadPosRankSum=-3.428;SOR=2.885;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,16:0.17:96
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chrX	135958704	rs112089728	G	C	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=5.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.41;MQRankSum=-4.182;QD=2.15;ReadPosRankSum=-1.850;SOR=0.155;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,10:0.14:70
chrX	136112707	rs5931046	A	G	5637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=96;NR=90;PP=2965;SC=ACTGGGTGGGAGGCTCTCCGG;SOR=0.813;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=186;TCF=96;TCR=90;TR=186;WE=136112715;WS=136112697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
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chrX	138067202	rs34825181	A	G	7165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=143;NR=92;PP=2965;SC=TTCCTCCTGAAGAACTCAAAT;SOR=1.183;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=235;TCF=143;TCR=92;TR=235;WE=138067210;WS=138067192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chrX	138067368	rs5974786	G	A	2847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=70;PP=1902;SC=TAAATGTTTCGCAGATTTACA;SOR=2.279;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=97;TCF=26;TCR=71;TR=96;WE=138067376;WS=138067358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chrX	138712135	.	G	C	479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=343;SC=TCCTCTGCTAGAGAAATATGG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=138712143;WS=138712125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chrX	138724725	rs926563	G	A	4980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=78;NR=95;PP=2794;SC=TCAACGCAACGTTGATGAAAT;SOR=1.029;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=173;TCF=78;TCR=95;TR=173;WE=138724733;WS=138724715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chrX	138774209	rs4824861	C	T	4687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=89;PP=2781;SC=GTGCAGCCATCTGGGTTCTGG;SOR=0.988;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=160;TCF=71;TCR=89;TR=160;WE=138774217;WS=138774199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chrX	138811003	rs2094702	G	A	2635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=55;NR=32;PP=1420;SC=AGTGTGTTGCGTATCAAGTAT;SOR=1.167;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=55;TCR=32;TR=87;WE=138811011;WS=138810993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chrX	138825675	rs1268015	T	C	548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=1;PP=364;SC=GAAAGTATTATAAAAACAGTA;SOR=2.948;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=138825683;WS=138825665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chrX	138882172	rs10717380	AC	A	1150.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=6.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.65;ReadPosRankSum=1.156;SOR=0.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,61:0.56:108
chrX	138897130	rs2491014	A	C	2110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=38;PP=1206;ReadPosRankSum=1.239;SC=TGTGTCTCAGACAATCCTCAT;SOR=0.359;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=33;TCR=39;TR=71;WE=138897138;WS=138897120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,79:0.99:80
chrX	139099429	rs5907565	T	G	3509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=74;NR=39;PP=2138;SC=TGGGTATACATAAGGAGGTCA;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=113;TCF=74;TCR=39;TR=113;WE=139099437;WS=139099419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chrX	139099699	rs5909001	C	T	345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.73;QD=31.43;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chrX	139099828	rs5909002	T	A	3906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=110;NR=60;PP=2965;SC=TCATAAAGGTTAAAAAACCCC;SOR=1.195;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=170;TCF=110;TCR=60;TR=170;WE=139099836;WS=139099818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chrX	139100148	rs181753036	A	C	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.602;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=4.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.06;MQRankSum=-1.922;QD=20.25;ReadPosRankSum=-2.362;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chrX	139100153	rs202135269	T	C	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.967;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chrX	139298295	rs396467	C	T	5886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.65;MQRankSum=-1.254;QD=26.76;ReadPosRankSum=-1.452;SOR=0.364;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,219:1.00:220
chrX	139298612	rs411420	T	C	2154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=47;PP=1351;SC=AGAAGGACATTGGTTAAGGGG;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=27;TCR=47;TR=74;WE=139298620;WS=139298602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chrX	139866477	rs41299075	T	C	13616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=600;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=233;NR=216;PP=2965;ReadPosRankSum=1.310;SC=AACAAAGGTATGTCTTCCAAC;SOR=0.242;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=452;TCF=235;TCR=217;TR=449;WE=139866485;WS=139866467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,569:1.00:570
chrX	140008385	rs5907732	G	T	3304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.65;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chrX	140008515	rs5907733	C	T	736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=17;PP=463;SC=AGTGAATATACAGACTTTAAT;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=140008523;WS=140008505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chrX	140271268	rs2038375	G	C	2023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.11;SOR=1.073;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chrX	140983031	rs176023	A	G	2101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=23;PP=1387;SC=AGGAGGCCCCACCCCACGCTG;SOR=1.788;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=55;TCR=23;TR=78;WE=140983039;WS=140983021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chrX	140983064	rs176024	G	A	3556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=47;PP=2304;SC=GCCCTGGTCAGCCTTGGCAGG;SOR=1.234;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=77;TCR=47;TR=124;WE=140983072;WS=140983054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chrX	140983103	rs176025	C	T	5581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=116;NR=83;PP=2965;ReadPosRankSum=0.365;SC=CCGACTTGCACTGTGGGAGTC;SOR=0.344;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=200;TCF=117;TCR=83;TR=199;WE=140983111;WS=140983093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,208:1.00:209
chrX	140983127	rs176026	G	A	6489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=126;NR=102;PP=2965;SC=AGGACCTGAAGCATTTTGCGA;SOR=0.834;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=228;TCF=126;TCR=102;TR=228;WE=140983135;WS=140983117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chrX	140993264	rs176036	G	A	7786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=152;NR=104;PP=2965;SC=CCTCAGAGTTGTCCTGAGGGG;SOR=1.062;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=256;TCF=152;TCR=104;TR=256;WE=140993272;WS=140993254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,295:1.00:295
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chrX	140993877	.	C	A	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=26;MMLQ=27;MQ=52.39;NF=39;NR=66;PP=2962;QD=20;SC=AGGGTTTTGCCCAGTCTCCTC;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=192;TCF=78;TCR=114;TR=105;WE=140993885;WS=140993842;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:87,105:0.55:192
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chrX	140994085	.	C	G	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.49;FR=0.5006;HP=4;HapScore=1;MGOF=27;MMLQ=27;MQ=43.16;NF=105;NR=67;PP=2962;QD=20;SC=TGAGGGTTTTCCCCAGTCTCC;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=208;TCF=126;TCR=82;TR=172;WE=140994093;WS=140994075;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:36,172:0.83:208
chrX	140994171	rs176047	C	G	9999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=364;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=194;NR=168;PP=2965;SC=AGAGAACTCACAGTACTTTTG;SOR=0.917;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=363;TCF=195;TCR=168;TR=362;WE=140994179;WS=140994161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,363:1.00:363
chrX	140994591	rs176048	C	G	9406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=160;NR=144;PP=2965;SC=AGAGAACTCACAGTACTTTTG;SOR=0.730;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=304;TCF=160;TCR=144;TR=304;WE=140994599;WS=140994581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,328:1.00:328
chrX	141290865	rs3765272	C	T	7220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQ=59.94;NF=118;NR=128;PP=2965;SC=AATGGGCTCTCGGACCCCACA;SOR=0.785;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=246;TCF=118;TCR=128;TR=246;WE=141290873;WS=141290855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,272:1.00:272
chrX	142121729	rs4825148	T	C	1252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=6;PP=943;SC=CATTCCTTCTTATAAAGCCCC;SOR=2.948;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=33;TCR=6;TR=39;WE=142121737;WS=142121719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chrX	142795225	rs3859898	G	A	4287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=64;NR=89;PP=2690;SC=CCAGGTCTTCGTCCTCCTGTG;SOR=1.258;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=153;TCF=64;TCR=89;TR=153;WE=142795233;WS=142795215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chrX	142803571	rs851092	A	G	486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=1;PP=335;SC=GGCATTAAGCAGGTCCCCCAC;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=142803579;WS=142803563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chrX	142967468	rs237520	T	G	6922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=109;NR=114;PP=2965;SC=AGAATAAGTTTAGATATTTTG;SOR=0.760;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=223;TCF=109;TCR=114;TR=223;WE=142967476;WS=142967458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chrX	144904882	rs2748588	T	C	6157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=106;PP=2965;SC=GTCCAACTCCTCGAGTGACTG;SOR=0.946;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=198;TCF=92;TCR=106;TR=198;WE=144904890;WS=144904872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chrX	146312362	rs5905008	A	G	4774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=75;PP=2959;SC=TGGTGGTGGCACTGACCATCT;SOR=0.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=164;TCF=89;TCR=75;TR=164;WE=146312370;WS=146312352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chrX	146312603	rs144088020	A	AAT	4962.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=55;PP=1659;SC=CACAGCGGAAAATGTCCCTCA;SOR=1.336;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=61;TCF=4;TCR=57;TR=58;WE=146312611;WS=146312587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chrX	146312673	rs5905009	G	C	656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=18;PP=521;SC=GCAGAATATAGTCAATAGATT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=146312691;WS=146312663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chrX	146312683	rs375595449	TA	T	331.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=16;PP=254;SC=GTCAATAGATTAAAAAAAAAA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=146312691;WS=146312663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chrX	146340338	rs36092315	CT	C	3853.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.56;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=24;PP=2939;SC=ATGATTGCCACTGTCTGCAGT;SOR=2.608;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=74;TCF=47;TCR=27;TR=69;WE=146340346;WS=146340328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chrX	146354025	rs5904728	GT	AC	8594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=93;PP=2947;SC=GTAAGTGGCCGTTGGCATTTA;SOR=1.501;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=153;TCF=57;TCR=96;TR=150;WE=146354034;WS=146354015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chrX	147003564	rs1270092	T	C	1791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=32;PP=1115;SC=GCTAATTCTATTCTTCATTTT;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=25;TCR=32;TR=57;WE=147003572;WS=147003554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chrX	147014960	rs4824232	C	T	1375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=26;NR=19;PP=769;SC=TCTAAAAAGTCCCAAAGCTAG;SOR=0.853;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=26;TCR=19;TR=45;WE=147014968;WS=147014950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chrX	147015021	rs4824233	C	T	1010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=16;PP=525;SC=TAGTAATTCTCCATTTTGACT;SOR=1.121;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=30;TCF=14;TCR=16;TR=30;WE=147015029;WS=147015011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chrX	147026330	rs11293471	AC	A	141.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=9;NR=0;PP=377;SC=GCTTCTGTTAACCCTCTTTTT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=9;WE=147026343;WS=147026320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chrX	147733265	rs5904246	G	GA	2592.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=28;PP=1797;SC=CAAGGGAAGAGATTTTGCTTT;SOR=0.721;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=40;WE=147733273;WS=147733255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chrX	147891558	rs11117555	T	C	667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=16;PP=492;SC=GGAATCCTGATATTCTACTTC;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=21;WE=147891566;WS=147891548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chrX	147919063	rs375432534	CAGTTA	C	1718.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=3;PP=1494;SC=AGTATTAGGTCAGTTAAGTTA;SOR=4.514;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=29;WE=147919075;WS=147919053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chrX	148037055	rs16994868	G	C	972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=2;PP=699;SC=GCTTTTAGTAGTAGTCTCTGT;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=29;WE=148037063;WS=148037045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chrX	148055144	rs5980615	A	G	4176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=70;PP=2269;SC=TCAGGTGAATAGCCTTTCTGC;SOR=0.994;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=66;TCR=70;TR=136;WE=148055152;WS=148055134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chrX	148582699	rs74514769	A	AG	5222.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=72;PP=2966;SC=CATCTACAAAAGTCCCCTCTA;SOR=1.527;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=88;TCF=11;TCR=77;TR=82;WE=148582707;WS=148582689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chrX	148619842	rs374287912	AG	A	691.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.98;QD=36.41;SOR=5.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chrX	148622730	rs3747443	G	A	1906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.42;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chrX	148622745	rs3747442	T	A	2280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.34;SOR=0.832;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chrX	148627384	rs145921071	A	G	1469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.11;QD=32.66;SOR=2.687;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chrX	148628490	.	A	T	583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.84;QD=30.72;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chrX	148685623	rs5936308	G	C	1166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=13;PP=706;SC=TAAAAAAGAAGTTTATTTAAG;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=23;TCR=13;TR=36;WE=148685631;WS=148685613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chrX	149013727	rs5983916	A	G	7825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=150;NR=127;PP=2965;SC=TCTGGGAAGCATTGAGTGTGA;SOR=0.776;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=277;TCF=150;TCR=127;TR=277;WE=149013735;WS=149013717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,300:1.00:300
chrX	149613617	rs6526057	T	C	480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=1;PP=320;SC=AGGAATGTGGTTGACTCCACA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=149613625;WS=149613607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chrX	149630848	rs507156	T	C	181.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=1;PP=151;SC=GCTAGTCTCCTGCACTCCACA;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=149630856;WS=149630838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chrX	149862214	rs222346	A	C	124.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=4;PP=65;SC=GCGCGAGGCCAGCCCGCCCCC;SOR=1.329;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=7;WE=149862222;WS=149862204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chrX	149887056	rs526164	C	T	1102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=20;HapScore=1;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=0;PP=611;SC=GTTTGGTGTCCTTTTTTTTTT;SOR=5.728;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=30;TCR=8;TR=28;WE=149887064;WS=149887046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chrX	149904115	rs5970468	A	T	1092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=47;PP=1253;SC=CTTCTTTTTTAAAAAAAACTT;SOR=6.043;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=3;TCR=47;TR=50;WE=149904123;WS=149904105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chrX	149931106	rs16995747	C	T	2891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=53;PP=1597;SC=GTGTGGAGGGCCTACAGCGGG;SOR=1.118;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=39;TCR=54;TR=92;WE=149931114;WS=149931096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chrX	149937428	rs41311370	C	T	1090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=8;PP=700;SC=ACAGCAGCTGCGGGTCCAAAT;SOR=1.788;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=36;WE=149937436;WS=149937418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chrX	150067115	.	G	C	820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=0.000;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=19;PP=699;ReadPosRankSum=-1.850;SC=GAGAGCGCCCGAAGGGGAGGC;SOR=1.022;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=35;TCF=15;TCR=20;TR=33;WE=150067123;WS=150067104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,33:0.94:35
chrX	150348228	rs1202874	C	T	2106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=21;PP=1373;SC=CTCCCTCCCTCGATATGTTTT;SOR=1.519;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=49;TCR=21;TR=70;WE=150348236;WS=150348218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chrX	150349871	rs13440581	A	G	5702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=87;NR=112;PP=2965;SC=TGTCGTGGTTATTGATGTTGA;SOR=1.018;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=199;TCF=87;TCR=112;TR=199;WE=150349879;WS=150349861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chrX	150565330	rs176451	G	C	10068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=379;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=189;NR=167;PP=2965;SC=GTCTCCTTGCGGCCCCCAGCT;SOR=0.793;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=358;TCF=190;TCR=168;TR=356;WE=150565339;WS=150565320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,376:1.00:376
chrX	150565560	rs176452	G	T	536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=13;PP=335;SC=CCCCCGCGCCGGCAACAGCCC;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=150565568;WS=150565550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chrX	150789334	rs5904324	T	TA	1711.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=14;PP=958;SC=TTAACACAGATAAAAAAGTTT;SOR=1.302;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=35;TCF=19;TCR=16;TR=29;WE=150789342;WS=150789324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chrX	150789950	rs945815	C	T	1409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=13;PP=871;SC=TCTCTTTTTACTAGAAACACA;SOR=1.702;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=34;TCR=13;TR=47;WE=150789958;WS=150789940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chrX	150794129	rs142544047	A	AC	366.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=10;PP=400;SC=AAAAAGAAACAAACGGGCCAG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=150794137;WS=150794119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chrX	150817094	rs5924658	C	G	6145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=112;NR=79;PP=2965;SC=TAGTAGCTCTCAAGGTCAAAG;SOR=0.836;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=191;TCF=112;TCR=79;TR=191;WE=150817102;WS=150817084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chrX	150840597	rs7886849	G	A	1339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=11;PP=954;ReadPosRankSum=0.717;SC=TGTTAAATAAGTTTCTGGGAG;SOR=1.217;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=47;TCF=36;TCR=11;TR=46;WE=150840605;WS=150840587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,47:0.98:48
chrX	150840916	rs41299110	C	T	3842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=51;PP=2505;SC=GAAGCAGCAGCTGCAAGAGCA;SOR=1.082;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=130;TCF=79;TCR=51;TR=130;WE=150840924;WS=150840906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chrX	150841144	rs17319678	C	G	1368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=35;PP=1008;SC=GTAAGACATGCATGGAATGGT;SOR=3.467;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=6;TCR=35;TR=41;WE=150841152;WS=150841134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chrX	150867321	rs5925008	C	T	4906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=88;NR=86;PP=2660;SC=TGGGCAGAGCCGTGGAGGGCC;SOR=0.876;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=174;TCF=88;TCR=86;TR=174;WE=150867329;WS=150867311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chrX	150869267	rs4323608	A	G	6770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=126;PP=2965;SC=GAGGCAGCGAACAGCCCCCAG;SOR=1.217;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=221;TCF=95;TCR=126;TR=221;WE=150869275;WS=150869257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chrX	150873651	rs3761541	G	T	806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=3;PP=469;SC=ACTCTACTCCGTTATTTATCC;SOR=3.098;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=22;WE=150873659;WS=150873641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chrX	150907240	rs7066992	T	C	2930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=45;PP=1831;SC=CTGGGTCAATTCTGCTCTTTT;SOR=0.751;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=48;TCR=45;TR=93;WE=150907248;WS=150907230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chrX	150911512	.	GT	AC	165	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=9;NR=2;PP=165;QD=19.8607158966;SC=ACATATATATGTATATATATA;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=11;WE=150911521;WS=150911502;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,11:0.85:13
chrX	151092126	rs1047246	C	G	4307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=83;PP=2837;SC=GCTGCCCTGACCAGAGTCATC;SOR=1.355;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=50;TCR=83;TR=133;WE=151092134;WS=151092116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chrX	151092220	rs1047248	A	G	2461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=30;PP=1791;SC=TGGTGGGTGCACAGGCTCCTA;SOR=1.408;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=55;TCR=30;TR=85;WE=151092228;WS=151092210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chrX	151092653	rs1047251	G	A	5773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=94;PP=2965;SC=AGTGGACCCCGCCAGCAACAC;SOR=0.712;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=193;TCF=99;TCR=94;TR=193;WE=151092661;WS=151092643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chrX	151125971	rs763539	A	G	3644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=65;PP=2210;SC=GCAATTTAAGACACTTCTAAT;SOR=1.162;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=47;TCR=65;TR=112;WE=151125979;WS=151125961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chrX	151142982	rs7341952	G	T	5525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=117;NR=54;PP=2965;SC=GAGCCGTCCCGGCTCCCGGGG;SOR=1.683;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=171;TCF=117;TCR=54;TR=171;WE=151142990;WS=151142972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chrX	151303393	rs210586	C	T	5934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=93;PP=2965;SC=TCTATGAAGACTATGCTTAGG;SOR=0.750;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=197;TCF=104;TCR=93;TR=197;WE=151303401;WS=151303383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chrX	151303596	rs210585	C	T	10204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=367;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=168;NR=157;PP=2965;SC=TTCATAATTTCTTATGACACT;SOR=0.699;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=325;TCF=168;TCR=157;TR=325;WE=151303604;WS=151303586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,367:1.00:367
chrX	151899760	rs2515830	A	G	1799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=3;PP=1358;SC=TGGGCCTCATATCACACGAGG;SOR=5.097;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=45;TCR=3;TR=47;WE=151899768;WS=151899750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chrX	151899789	rs3005	G	A	3417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=18;PP=2328;SC=ACTAATGGATGGGGCCTTGGA;SOR=3.017;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=83;TCR=18;TR=101;WE=151899797;WS=151899779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chrX	151899818	rs2233056	C	T	6213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=130;NR=58;PP=2965;SC=TGGCCCAGACCCCCTCCCACT;SOR=1.734;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=188;TCF=130;TCR=58;TR=188;WE=151899826;WS=151899808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chrX	151899913	rs2233055	T	C	14173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=531;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=234;NR=255;PP=2965;SC=AAATGTGAGGTCCTCCACTGA;SOR=0.788;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=489;TCF=234;TCR=255;TR=489;WE=151899921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,530:1.00:530
chrX	151904488	rs2515838	C	A	2586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=18;PP=1718;SC=GCACAGCAGCCCAAATTTGCT;SOR=2.610;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=64;TCR=18;TR=82;WE=151904496;WS=151904478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chrX	151904609	rs2471781	T	C	7090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=106;NR=140;PP=2965;SC=CTCCTCTATGTATGTCAAGCT;SOR=1.065;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=246;TCF=106;TCR=140;TR=246;WE=151904617;WS=151904599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,262:1.00:262
chrX	151996539	rs201526841	CT	C	94.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.844;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=7.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.92;ReadPosRankSum=0.884;SOR=0.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chrX	152018832	rs5969919	T	G	2279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=47;NR=28;PP=1275;SC=CAGTGATCGGTGGCTCTGGAT;SOR=1.065;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=47;TCR=28;TR=75;WE=152018840;WS=152018822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chrX	152089039	rs2071258	G	A	2121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=40;PP=1357;SC=ATGAAAGGGTGGGTGGAGAGA;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=33;TCR=40;TR=73;WE=152089047;WS=152089029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chrX	152090551	rs2071259	T	C	2107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=12;PP=1507;SC=CAGTATGCTGTCCTTATCCTG;SOR=2.770;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=54;TCR=12;TR=66;WE=152090559;WS=152090541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chrX	152091153	rs2071261	A	C	3775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=40;PP=2115;SC=TGGCAGTAGCATGCCATTGTC;SOR=1.204;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=119;TCF=79;TCR=40;TR=119;WE=152091161;WS=152091143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chrX	152105091	rs41302156	C	T	1820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=37;PP=1143;SC=GTGCCCTATCCCATTGCCAGA;SOR=1.802;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=18;TCR=37;TR=55;WE=152105099;WS=152105081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chrX	152226542	rs6526155	T	C	5108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=75;PP=2965;SC=AGTTTTGATGTGAGGCCTTCC;SOR=0.935;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=169;TCF=93;TCR=76;TR=168;WE=152226550;WS=152226532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chrX	152482017	rs41301313	G	C	1879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=9;PP=1253;SC=GAAGCTGCTGGACGCGGCCCT;SOR=2.494;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=46;TCR=9;TR=55;WE=152482025;WS=152482007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chrX	152482796	rs2008144	C	T	12606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=464;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=211;NR=218;PP=2965;SC=TTGCCTCTGTCGAGTGAAGTT;SOR=0.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=429;TCF=211;TCR=218;TR=429;WE=152482804;WS=152482786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,464:1.00:464
chrX	152482917	rs2008160	T	C	6152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=118;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.122;SC=GAGGAGGAGGTGGCAGCCTGC;SOR=0.582;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=220;TCF=99;TCR=121;TR=215;WE=152482925;WS=152482893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,236:0.99:239
chrX	152483030	rs717105	G	A	3363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=48;PP=2291;SC=CGTCAGGGCAGCAGGCAGGAG;SOR=0.853;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=63;TCR=48;TR=111;WE=152483038;WS=152483020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chrX	152609450	rs3213462	T	C	2041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=15;PP=1345;SC=TGCCCTGGCTTGTCATTCAGC;SOR=2.406;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=51;TCR=15;TR=66;WE=152609458;WS=152609440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chrX	152609668	rs3213463	T	C	3399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=59;PP=2025;SC=GCCAGAGGCCTAGGTGAGCTG;SOR=1.188;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=48;TCR=59;TR=107;WE=152609676;WS=152609658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chrX	152610051	rs1467880	A	T	1058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=5;PP=649;SC=TCACCTCTTGACCCTGGCATT;SOR=2.494;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=32;WE=152610059;WS=152610041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chrX	152610108	rs1467881	G	C	3427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=46;PP=2170;SC=AAAGACTGATGAGCCCTGGGA;SOR=1.039;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=68;TCR=46;TR=114;WE=152610116;WS=152610098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chrX	152610224	rs35024993	CGTGACCTCT	C	4073.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=47;PP=2957;SC=ATTATGGGAACGTGACCTCTG;SOR=1.485;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=56;TCF=2;TCR=54;TR=49;WE=152610240;WS=152610214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chrX	152610294	rs1467882	A	G	795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=220;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=25;PP=584;SC=GGGGCAGGGGACACATGGCTA;SOR=3.611;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=30;WE=152610302;WS=152610284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chrX	152610947	rs3213465	T	C	3225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=36;PP=1818;SC=CTCTGGCTGTTGCCATAACCA;SOR=1.188;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=67;TCR=36;TR=103;WE=152610955;WS=152610937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chrX	152610985	rs3213466	T	C	3972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=74;NR=62;PP=1939;SC=CAGGCGTTCCTGTTTTAAATC;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=136;TCF=74;TCR=62;TR=136;WE=152610993;WS=152610975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chrX	152611190	.	GGGGGTCCCAGCTGAGCTCTTGGAGTTGAGGTTAGGGTTT	G	981	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;FR=1.0000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MMLQ=27;MQ=64.9;NF=1;NR=6;PP=981;QD=144.571428571;SC=GGTTAGGGTTGGGGGTCCCAG;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=7;WE=152611236;WS=152611180;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,7:0.78:9
chrX	152613112	rs7066295	C	T	5401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=111;NR=69;PP=2965;SC=CCTACGCCTGCGGCCAGTGCG;SOR=1.037;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=180;TCF=111;TCR=69;TR=180;WE=152613120;WS=152613102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chrX	152728003	rs3020967	T	C	1185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=6;PP=818;SC=GCCAGCACCATGAGGTTCCCT;SOR=3.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=32;TCR=6;TR=38;WE=152728011;WS=152727993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chrX	152751332	rs116117083	G	C	6053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=104;NR=97;PP=2965;SC=CACATCGAGCGCATCCCTGGC;SOR=0.737;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=201;TCF=104;TCR=97;TR=201;WE=152751340;WS=152751322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chrX	152751497	rs56165949	G	A	2379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=48;PP=1384;SC=GCCATCCCACGCGGCCTCCTG;SOR=1.127;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=36;TCR=48;TR=84;WE=152751505;WS=152751487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chrX	152770230	rs4833	G	A	11762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=434;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=197;NR=198;PP=2965;SC=CTGACACCTCGGGCGTCCTGG;SOR=0.740;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=395;TCF=197;TCR=198;TR=395;WE=152770238;WS=152770220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,434:1.00:434
chrX	152770402	rs2980053	A	G	1667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=43;PP=1219;SC=TCTGAAGGGGACACATGCTGG;SOR=2.147;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=13;TCR=43;TR=56;WE=152770410;WS=152770392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chrX	152771214	rs11363938	GA	G	293.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=231;SC=AGCATGGACTGAACCTCCTCG;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=152771222;WS=152771208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chrX	152807425	rs762733	G	A	1414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=33;PP=968;SC=AAGGAAGCTCGGCTCCTGCTT;SOR=1.958;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=14;TCR=33;TR=47;WE=152807433;WS=152807415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chrX	152807665	rs2980012	A	G	806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=1;PP=680;SC=GTTCCCCAGAAGGAGGAGGGC;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=152807673;WS=152807655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chrX	152807923	rs2980013	G	C	6061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=130;PP=2965;SC=GCCACCCTCCGGGCCAGCCTG;SOR=1.422;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=208;TCF=78;TCR=130;TR=208;WE=152807931;WS=152807913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chrX	152815089	rs3020949	A	G	9862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=370;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=177;NR=145;PP=2965;SC=CCTACCTAGGAGACACCCACT;SOR=0.819;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=322;TCF=177;TCR=145;TR=322;WE=152815097;WS=152815079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,370:1.00:370
chrX	152815886	rs2285035	C	T	547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=16;PP=390;SC=TTCACAATATCATGCAACCGT;SOR=3.056;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=152815894;WS=152815876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chrX	152818435	rs2239682	G	A	5481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=118;NR=78;PP=2965;SC=TGTGACCAGCGCTGTTCCTTG;SOR=1.098;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=196;TCF=118;TCR=78;TR=196;WE=152818443;WS=152818425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chrX	152821887	rs3020957	C	T	750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=20;PP=555;SC=GTAGCCGAGCCCCCACACCCC;SOR=2.670;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=25;WE=152821895;WS=152821877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chrX	152823728	rs2269415	G	C	4946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=84;PP=2965;SC=TGGTGGCTGTGATCGTGGCCT;SOR=1.090;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=67;TCR=85;TR=151;WE=152823736;WS=152823718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chrX	152825414	rs3020959	G	T	2081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=22;NR=48;PP=1312;SC=GGCTGGCCAGGGGCACCCGGG;SOR=1.734;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=22;TCR=48;TR=70;WE=152825422;WS=152825404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chrX	152825433	rs2980018	A	G	1454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=37;PP=1020;SC=GGAGGACTTCAGGACACTGTT;SOR=2.540;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=11;TCR=37;TR=48;WE=152825441;WS=152825423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chrX	152830322	rs4243536	A	G	2495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=18;PP=1847;SC=GGGACCTTACACCAGGCAGAT;SOR=2.833;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=73;TCR=18;TR=91;WE=152830330;WS=152830312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chrX	152834736	rs6643626	T	C	5368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=89;PP=2965;ReadPosRankSum=0.522;SC=GGTTGAGAACTATGAAGTACT;SOR=0.818;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=178;TCF=88;TCR=90;TR=176;WE=152834744;WS=152834726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,202:0.99:204
chrX	152834891	rs6643736	G	C	300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=9;PP=254;SC=GCTGGCCTCAGTCAGGGCCCT;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=152834899;WS=152834881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chrX	152864477	rs199537978	G	GC	298.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=4;PP=280;SC=GGCGCCGGCTGCCCTCCGGGC;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=8;WE=152864485;WS=152864467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chrX	152864513	rs200645137	G	GC	555.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=7;PP=311;SC=CCCCTCCGCCGCCTCCGGGGC;SOR=0.804;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=152864521;WS=152864503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chrX	152864609	rs201833882	G	GC	406.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.67;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=5;PP=158;SC=CGCGGCGGGCGTGCCGCCCCA;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=152864617;WS=152864599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chrX	152938409	rs10542443	TAC	T	559.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.226;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=2.287;NF=6;NR=15;PP=647;ReadPosRankSum=-0.953;SC=CTCACACAGGTACACACACAC;SOR=0.401;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=72;TCF=26;TCR=46;TR=21;WE=152938420;WS=152938399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,30:0.33:91
chrX	152954025	rs384573	A	G	989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.05;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chrX	153034752	rs2266877	C	T	221.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=166;SC=CTAGGGCCAACGGGTGGTGTG;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=153034760;WS=153034742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chrX	153035798	rs2266879	G	A	3586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=62;PP=2181;SC=CCCAGACCACGTCACTGTGCC;SOR=0.801;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=126;TCF=64;TCR=62;TR=126;WE=153035806;WS=153035788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chrX	153037275	rs6643644	C	T	363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=11;NR=2;PP=228;SC=CAGAGTGGAGCGTGGGTGCGG;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=153037283;WS=153037265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chrX	153037594	rs11156607	C	G	3696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=46;PP=2528;SC=GCTGTCCCCTCCGTCCCTGAG;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=120;TCF=73;TCR=47;TR=119;WE=153037602;WS=153037584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chrX	153037808	rs2266882	G	A	4392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=82;PP=2435;ReadPosRankSum=1.429;SC=AAGGACAGGCGCCTAGTAAGG;SOR=1.158;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=65;TCR=83;TR=146;WE=153037816;WS=153037798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,164:0.99:166
chrX	153037999	rs2266883	G	C	272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=5;PP=228;SC=GAGCAGTGAGGGCAGGGGTGG;SOR=0.693;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=11;TCF=6;TCR=5;TR=11;WE=153038007;WS=153037989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chrX	153038516	rs5945161	C	G	1347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=29;PP=941;SC=CACTCCCATACGCCTCAGTGG;SOR=1.514;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=16;TCR=29;TR=45;WE=153038524;WS=153038506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chrX	153038661	rs2266885	G	C	3780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=46;PP=2279;SC=GCCGAGATGAGAGACCCCACT;SOR=1.108;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=78;TCR=46;TR=124;WE=153038669;WS=153038651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chrX	153039502	rs6643791	G	C	6370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=103;NR=119;PP=2965;SC=TCAGCCGCGAGGGGCCTGCCC;SOR=0.844;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=223;TCF=103;TCR=120;TR=222;WE=153039510;WS=153039492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chrX	153039615	rs1543781	A	G	5820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=105;NR=97;PP=2965;SC=GGGGGCCAGCAGCTTAGGCTC;SOR=0.730;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=202;TCF=105;TCR=97;TR=202;WE=153039623;WS=153039605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chrX	153041544	rs5987155	T	C	4228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=63;PP=2057;SC=AGCAGCGAGATGCAGCGCGTG;SOR=0.731;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=140;TCF=77;TCR=63;TR=140;WE=153041552;WS=153041534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chrX	153042237	rs1894294	G	A	62.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=0;PP=41;SC=AGGCGAGGCAGGGCAGGGCGG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=153042245;WS=153042230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chrX	153042419	rs34966902	G	A	2390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=30;PP=1240;SC=TGGCCCAGAGGTGCCCCTTGG;SOR=0.911;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=77;TCF=46;TCR=31;TR=75;WE=153042427;WS=153042409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chrX	153047809	rs1981439	A	G	760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=21;PP=569;SC=CCCCGCCCCCAGGTAACTGTG;SOR=4.174;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=153047817;WS=153047799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chrX	153048647	rs201302475	GT	G	83.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.409;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.30;ReadPosRankSum=1.710;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chrX	153048648	.	T	C	135.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.409;ClippingRankSum=-0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.09;ReadPosRankSum=-1.668;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chrX	153048656	rs201877372	CA	C	82.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.242;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.19;ReadPosRankSum=1.465;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chrX	153048657	rs2314343	A	C	135.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.242;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.09;ReadPosRankSum=-1.437;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chrX	153052661	rs2269482	A	G	1201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=29;PP=807;SC=ACAGTCAGCCAGAGGGACGGG;SOR=2.476;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=9;TCR=29;TR=38;WE=153052669;WS=153052651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chrX	153073752	rs3761532	T	C	3149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=31;PP=2100;SC=AGGTGGCCTGTCCTCTCTGGA;SOR=1.739;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=74;TCR=31;TR=105;WE=153073760;WS=153073742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chrX	153149708	rs77883713	G	GC	4757.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=7;NR=46;PP=2454;SC=ACTGCCCATCGTGGGATCCTG;SOR=1.127;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=55;TCF=8;TCR=47;TR=53;WE=153149723;WS=153149698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chrX	153149715	rs6643650	C	G	4637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=44;PP=1487;SC=ATCGTGGGATCCTGAGCGCCT;SOR=1.134;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=25;TCR=44;TR=69;WE=153149723;WS=153149698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chrX	153151277	rs56026845	C	G	1625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=8;NR=13;PP=396;SC=CATCTGGGGCCCCGCAGGTTA;SOR=0.927;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=22;TCF=9;TCR=13;TR=21;WE=153151292;WS=153151267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chrX	153151280	rs143464562	G	GCC	1611.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=11;PP=697;SC=CTGGGGCCCCGCAGGTTACCC;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=12;WE=153151292;WS=153151267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chrX	153151284	rs199975679	GT	G	792.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=0.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=475;ReadPosRankSum=1.322;SC=GGCCCCGCAGGTTACCCCTCA;SOR=0.756;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=11;WE=153151292;WS=153151267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,31:0.94:33
chrX	153151423	rs58566947	G	GCGGC	637.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=5;PP=267;SC=ACCGGGCCGGGACTCCCTGGT;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=153151431;WS=153151413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chrX	153151456	rs12837217	T	G	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.43;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chrX	153151461	rs12837218	T	G	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.43;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chrX	153151467	rs199929222	CG	C	254.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.67;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=4;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=2;PP=84;SC=GTGGTGTCGCCGGGGGATCGC;SOR=0.693;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=153151475;WS=153151446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chrX	153151491	rs36095229	GT	G	164.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=49;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=2;PP=41;SC=CGCGGCCCGGGTCGCACGGGG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=153151499;WS=153151481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chrX	153170447	rs55712963	G	GC	1044.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=6;NR=8;PP=612;SC=TACTGCCACCGACACGTGCAC;SOR=1.220;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=15;TCF=6;TCR=9;TR=14;WE=153170455;WS=153170437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chrX	153170980	rs56689668	T	G	1395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=13;PP=816;SC=CCCGACTCCTTCCCAGCTGTG;SOR=1.562;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=29;TCR=13;TR=42;WE=153170988;WS=153170970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chrX	153174819	rs11394527	T	TG	14040.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=397;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=120;PP=2936;SC=CCACTCCCACTGGCCAAAGCC;SOR=0.827;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=154;TCF=33;TCR=121;TR=153;WE=153174827;WS=153174809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,395:1.00:395
chrX	153174867	rs11405331	T	TG	12221.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DB;DP=365;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=27;NR=133;PP=2967;SC=AGCACACGTGTGGCCCCCTGA;SOR=0.800;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=166;TCF=29;TCR=137;TR=160;WE=153174875;WS=153174857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,352:1.00:352
chrX	153175053	rs56015121	G	GC	1121.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=8;NR=15;PP=1050;SC=AGGGCCAGCAGCTCCGCGCCA;SOR=1.044;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=23;WE=153175061;WS=153175043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chrX	153176254	rs2070097	A	G	2715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=42;NR=44;PP=1473;SC=AGTCCAGGTCATGGGCAGTGC;SOR=0.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=42;TCR=44;TR=86;WE=153176262;WS=153176244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chrX	153178459	rs5904376	G	GC	3587.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=45;PP=2373;SC=CAGGGCCCCAGCCCTCAGGGA;SOR=0.912;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=62;TCF=12;TCR=50;TR=56;WE=153178467;WS=153178449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chrX	153186412	rs34153599	A	AG	2383.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=30;PP=1937;SC=CTAGGGAGAGAGGCCTTTGCC;SOR=0.752;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=17;TCR=30;TR=47;WE=153186420;WS=153186402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chrX	153186484	rs11428457	T	TC	4413.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=41;PP=2364;SC=GCGGTGTTCCTCCCCACTGTG;SOR=0.836;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=71;TCF=23;TCR=48;TR=60;WE=153186492;WS=153186474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chrX	153202650	rs66465414	AAAAT	A	58.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=1;PP=32;ReadPosRankSum=-1.269;SC=CCCTGTCTCAAAAATAAATAA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=1;WE=153202661;WS=153202640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,3:0.23:13
chrX	153207147	.	T	G	28	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=10;HapScore=2;MGOF=19;MMLQ=15;MQ=54.94;NF=0;NR=4;PP=28;QD=15.6928031368;SC=GGGCGGGGGGTGGGGTTGAGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=4;WE=153207155;WS=153207137;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,4:0.36:11
chrX	153208197	rs11372702	T	TG	597.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=0;PP=764;SC=CTTCCCCAGGTGGGACATCCC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=20;WE=153208205;WS=153208196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chrX	153210179	rs146096296	T	TG	2552.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.213;NF=7;NR=44;PP=1601;ReadPosRankSum=-0.134;SC=CCGCTGGGCCTGGGGCGGGGC;SOR=1.090;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=57;TCF=7;TCR=50;TR=51;WE=153210187;WS=153210168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,99:0.98:101
chrX	153210195	.	G	GGC	3468.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=38;PP=2065;SC=GGGGCTTTGAGCCCGACCCCC;SOR=1.193;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=6;TCR=38;TR=44;WE=153210207;WS=153210185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chrX	153210199	rs377619070	GA	G	3284.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=6;NR=32;PP=1607;SC=CTTTGAGCCCGACCCCCGCAC;SOR=1.276;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=6;TCR=32;TR=38;WE=153210207;WS=153210185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chrX	153215839	rs3027875	G	A	4905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=98;NR=75;PP=2943;SC=GGCTGGGCCCGCAGTACACCC;SOR=0.867;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=175;TCF=100;TCR=75;TR=173;WE=153215847;WS=153215829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chrX	153277889	rs2239673	C	T	237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=1;PP=157;SC=GGCTGCCCCACGCCCTCAGCG;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=153277897;WS=153277887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chrX	153278829	rs1059703	G	A	4974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=86;NR=77;PP=2951;SC=GGCGGCCTCCGAATGCCCGGG;SOR=0.704;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=163;TCF=86;TCR=77;TR=163;WE=153278837;WS=153278819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chrX	153279858	rs5945174	G	A	358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=46;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=15;PP=394;SC=ATGGGGTCTCGCTTTGTTGGC;SOR=5.283;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=153279866;WS=153279848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	153284192	rs1059702	A	G	5833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=121;PP=2965;SC=GCAAAACGGAAAGGGGCGGGC;SOR=1.348;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=197;TCF=75;TCR=122;TR=196;WE=153284200;WS=153284173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chrX	153284483	rs1059701	G	A	3386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=72;NR=43;PP=2072;SC=CAGGGCTTGGGACCAGGCCGA;SOR=1.170;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=72;TCR=43;TR=115;WE=153284491;WS=153284473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chrX	153482563	rs138416189	G	C	361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.81;QD=30.15;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chrX	153577132	rs201431046	C	CCA	2212.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=16;NR=14;PP=1490;SC=CCAGGGCGGCCTGGGCCGGGG;SOR=1.426;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=35;TCF=16;TCR=19;TR=30;WE=153577141;WS=153577122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chrX	153577133	.	T	G	2221.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.16;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=14;PP=851;SC=CAGGGCGGCCTGGGCCGGGGT;SOR=1.519;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=47;TCF=32;TCR=15;TR=37;WE=153577141;WS=153577122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chrX	153578299	rs2070819	A	G	2945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=37;PP=1847;SC=GCCACCCAGCACAGGCTTGTC;SOR=0.967;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=55;TCR=37;TR=92;WE=153578307;WS=153578289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chrX	153579448	rs2070822	A	G	1104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=25;PP=707;SC=GGGGTGCTTGAGCCAGGGCAA;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=34;WE=153579456;WS=153579438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chrX	153581932	rs2070825	A	G	3982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=54;PP=2200;SC=CTGTGACCCGAGCAGTGAAGG;SOR=0.780;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=115;TCF=61;TCR=54;TR=115;WE=153581940;WS=153581922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chrX	153582198	rs2070826	T	C	1062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=21;PP=900;SC=GGGAGCCCCATTCAGGAGTAT;SOR=1.751;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=12;TCR=21;TR=33;WE=153582206;WS=153582188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chrX	153582703	rs2070827	G	A	5488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=98;NR=97;PP=2965;SC=CATTGGCACAGTCTGGCCTCC;SOR=0.762;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=196;TCF=99;TCR=97;TR=195;WE=153582711;WS=153582693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chrX	153592314	rs148985076	AC	A	8438.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=83;PP=2951;SC=GTGTGCCACAACCACTTGAAA;SOR=1.058;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=134;TCF=50;TCR=84;TR=131;WE=153592322;WS=153592304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chrX	153595246	rs4898478	G	C	4502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=101;PP=2512;SC=GCCAACCACGGGCCAGCTGTT;SOR=1.623;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=155;TCF=54;TCR=101;TR=155;WE=153595267;WS=153595236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chrX	153595259	rs4898479	G	A	3698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=84;PP=2411;SC=CAGCTGTTAAGGCCACAGCCT;SOR=1.999;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=120;TCF=36;TCR=84;TR=120;WE=153595267;WS=153595236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chrX	153596477	rs2070817	C	T	1109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=28;PP=761;SC=AGAAGAGTGGCCACGCTGGGC;SOR=2.554;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=36;WE=153596485;WS=153596467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chrX	153599180	rs5987249	A	G	2474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=20;PP=1832;SC=CCGCCCGGGGAGATGGAAGGA;SOR=2.275;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=82;TCF=62;TCR=20;TR=81;WE=153599188;WS=153599170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chrX	153609616	rs17426	GC	CT	659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.24;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chrX	153609632	.	T	G	33	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000;HP=10;HapScore=2;MGOF=33;MMLQ=16;MQ=58.7;NF=0;NR=4;PP=33;QD=16.9428031368;SC=GCAGTGGGGGTGGGGGTGGGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=4;WE=153609640;WS=153609622;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:11,4:0.27:15
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chrX	153663372	rs113612593	G	A	2746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=18;PP=1999;SC=TCTTCAGGTGGCTGCAAGGAC;SOR=2.783;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=71;TCR=18;TR=89;WE=153663380;WS=153663362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chrX	153665794	rs189578067	A	C	600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=17;PP=375;SC=CTGCTCCCCCAGCGACGTCGC;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=153665802;WS=153665784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chrX	153666533	rs73638281	C	G	4720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=93;NR=76;PP=2685;SC=GTGTTTTATCCGCCTTTTTGT;SOR=0.793;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=169;TCF=93;TCR=76;TR=169;WE=153666541;WS=153666523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chrX	153667176	rs4834	T	C	7584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=136;NR=135;PP=2965;SC=GAGACTGGAATGTTGACCTGA;SOR=0.735;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=271;TCF=136;TCR=135;TR=271;WE=153667184;WS=153667166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,294:1.00:294
chrX	153668022	.	CA	C	67	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;FR=1.0000;HP=12;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=18;MQ=60.0;NF=3;NR=2;PP=67;QD=14.6;SC=GACTCCATCTCAAAAAAAAAA;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=9;TCF=5;TCR=4;TR=5;WE=153668030;WS=153668012;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,5:0.56:9
chrX	153668172	rs68141802	A	G	2961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=44;PP=1798;SC=AAAAAGGGTGAAGAGGTTAAC;SOR=0.806;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=55;TCR=44;TR=99;WE=153668180;WS=153668162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chrX	153672533	.	T	C	1541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=10;PP=767;SC=CCGCTGTCGCTGTCGCCGCCG;SOR=1.781;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=44;TCF=34;TCR=10;TR=43;WE=153672541;WS=153672523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chrX	153677700	rs2070643	T	C	3392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=72;PP=1875;SC=GGCTCCAGCCTGGGTGCCAGA;SOR=1.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=110;TCF=38;TCR=72;TR=110;WE=153677708;WS=153677690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chrX	153677896	rs45463798	A	G	433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=4;PP=305;SC=TCACTAAACCATGGAGCTTCC;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=14;WE=153677904;WS=153677886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chrX	153678706	rs2070644	C	T	8077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=145;NR=146;PP=2965;SC=AAGTTGGGGACGGCAGCCAGC;SOR=0.780;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=291;TCF=145;TCR=146;TR=291;WE=153678714;WS=153678696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,309:1.00:309
chrX	153714027	rs200846089	TG	T	4532.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.425;HP=11;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.398;NF=29;NR=84;PP=1888;ReadPosRankSum=-1.186;SC=GGGCTGCCAGTGGGGGGGGGG;SOR=0.368;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=145;TCF=37;TCR=108;TR=113;WE=153714036;WS=153714016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:8,172:0.96:180
chrX	153880830	rs4326559	A	C	10152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=387;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=166;NR=189;PP=2965;SC=GTCGGGGGAGAGGTGCGGCAT;SOR=0.891;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=355;TCF=166;TCR=189;TR=355;WE=153880838;WS=153880820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,385:1.00:385
chrX	153881525	rs17328091	G	C	11707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=442;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=211;NR=189;PP=2965;SC=GGATACAACTGAAGCAGGCGG;SOR=0.773;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=400;TCF=211;TCR=189;TR=400;WE=153881533;WS=153881515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,441:1.00:441
chrX	153994596	rs2728532	G	T	3617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=66;NR=56;PP=2102;SC=ACAGTGGTACGCTGGATCCCA;SOR=0.723;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=66;TCR=56;TR=122;WE=153994604;WS=153994586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chrX	154009617	rs11318110	AG	A	971.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.25;QD=29.45;SOR=0.880;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chrX	154009644	.	GA	G	62.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=0.000;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=10.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.74;ReadPosRankSum=0.057;SOR=0.868;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,8:0.22:36
chrX	154130223	rs4074307	A	G	1339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=9;PP=930;SC=AATGATGTAAACTTGTATTTA;SOR=2.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=34;TCR=9;TR=43;WE=154130231;WS=154130213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chrX	154132090	rs4898352	A	T	487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=0;PP=433;SC=GTCTGCTTTGATCACTGATTG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=154132098;WS=154132080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chrX	154158285	rs1800291	G	C	6079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=94;NR=91;PP=2965;SC=CATATGCCCCGTCATATGAAC;SOR=0.790;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=185;TCF=94;TCR=91;TR=185;WE=154158293;WS=154158275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chrX	154185347	rs375945299	C	T	3183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=60;PP=1861;SC=GGTCAGGCACCGAGGATCTGA;SOR=1.034;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=49;TCR=60;TR=109;WE=154185355;WS=154185337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chrX	154194989	rs7058826	C	T	4341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=88;PP=2689;SC=CAAACAATGTCAGAGTGTCTT;SOR=1.044;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=154;TCF=66;TCR=88;TR=154;WE=154194997;WS=154194979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chrX	154456644	rs57301248	AT	A	206.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FS=6.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.06;MQRankSum=2.236;QD=1.29;ReadPosRankSum=-0.233;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:128,32:0.20:160
chrX	154456747	rs572013	A	G	5438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.93;QD=27.06;SOR=1.184;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chrX	154774663	rs2305517	G	A	602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=0;PP=451;SC=TTCTTACCACGATTTTATCAT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=154774671;WS=154774653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chrX	154774707	rs2305518	C	T	1548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=13;PP=932;SC=CCAAAGCAAACATTTCTTACC;SOR=1.961;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=51;TCF=37;TCR=14;TR=50;WE=154774715;WS=154774697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chrY	13309574	rs79963642	T	C	218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.37;QD=21.88;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chrY	13311491	rs74359393	C	T	62.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.00;QD=31.37;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chrY	13311501	rs74890084	G	A	109.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.10;QD=27.26;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chrY	14475389	.	G	A	62.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.37;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chrY	14475392	.	C	T	62.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.37;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chrY	14475397	.	G	T	62.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.37;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chrY	21154323	rs10465459	G	A	244.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=201;SC=AGATGGGGAAGTTTAGAAGAC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=21154331;WS=21154313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chrY	21154426	rs52812045	G	A	606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=3.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.46;ReadPosRankSum=-2.824;SOR=1.384;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,29:0.50:58
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chrY	21154569	rs17855271	A	G	87.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.76;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chrY	21154603	.	A	C	27	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.64;FR=0.9998;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=2;NR=2;PP=27;QD=15.4428031368;SC=CATGTCCCCTACGTCGGTGCG;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=4;WE=21154611;WS=21154593;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4